##fileformat=VCFv4.1
##FILTER=<ID=GOF,Description="Variant fails goodness-of-fit test.">
##FILTER=<ID=HapScore,Description="Too many haplotypes are supported by the data in this region.">
##FILTER=<ID=MQ,Description="Root-mean-square mapping quality across calling region is low.">
##FILTER=<ID=Q20,Description="Variant quality is below 20.">
##FILTER=<ID=QD,Description="Variants fail quality/depth filter.">
##FILTER=<ID=QualDepth,Description="Variant quality/Read depth ratio is low.">
##FILTER=<ID=REFCALL,Description="This line represents a homozygous reference call">
##FILTER=<ID=SC,Description="Variants fail sequence-context filter. Surrounding sequence is low-complexity">
##FILTER=<ID=alleleBias,Description="Variant frequency is lower than expected for het">
##FILTER=<ID=badReads,Description="Variant supported only by reads with low quality bases close to variant position, and not present on both strands.">
##FILTER=<ID=hp10,Description="Flanking sequence contains homopolymer of length 10 or greater">
##FILTER=<ID=strandBias,Description="Variant fails strand-bias filter">
##FORMAT=<ID=AD,Number=.,Type=Integer,Description="Allelic depths for the ref and alt alleles in the order listed">
##FORMAT=<ID=AF,Number=A,Type=Float,Description="Allelic frequency for the alt alleles in the order listed">
##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read depth">
##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
##GATKCommandLine.CombineVariants=<ID=CombineVariants,Version=3.4-0-g7e26428,Date="Mon Apr 02 22:18:25 EDT 2018",Epoch=1522721905204,CommandLineOptions="analysis_type=CombineVariants input_file=[] showFullBamList=false read_buffer_size=null phone_home=AWS gatk_key=null tag=NA read_filter=[] disable_read_filter=[] intervals=null excludeIntervals=null interval_set_rule=UNION interval_merging=ALL interval_padding=0 reference_sequence=/data/MoCha/patidarr/ref/ucsc.hg19.fasta nonDeterministicRandomSeed=false disableDithering=false maxRuntime=-1 maxRuntimeUnits=MINUTES downsampling_type=BY_SAMPLE downsample_to_fraction=null downsample_to_coverage=10000 baq=OFF baqGapOpenPenalty=40.0 refactor_NDN_cigar_string=false fix_misencoded_quality_scores=false allow_potentially_misencoded_quality_scores=false useOriginalQualities=false defaultBaseQualities=-1 performanceLog=null BQSR=null quantize_quals=0 disable_indel_quals=false emit_original_quals=false preserve_qscores_less_than=6 globalQScorePrior=-1.0 validation_strictness=SILENT remove_program_records=false keep_program_records=false sample_rename_mapping_file=null unsafe=null disable_auto_index_creation_and_locking_when_reading_rods=false no_cmdline_in_header=false sites_only=false never_trim_vcf_format_field=false bcf=false bam_compression=null simplifyBAM=false disable_bam_indexing=false generate_md5=false num_threads=10 num_cpu_threads_per_data_thread=1 num_io_threads=0 monitorThreadEfficiency=false num_bam_file_handles=null read_group_black_list=null pedigree=[] pedigreeString=[] pedigreeValidationType=STRICT allow_intervals_with_unindexed_bam=false generateShadowBCF=false variant_index_type=DYNAMIC_SEEK variant_index_parameter=-1 logging_level=INFO log_to_file=null help=false version=false variant=[(RodBindingCollection [(RodBinding name=HC source=/lscratch/65341216//HC.vcf)]), (RodBindingCollection [(RodBinding name=Platypus source=/lscratch/65341216//PL.vcf)])] out=/gpfs/gsfs6/users/MoCha/processedDATA/BL0479/20170910/BL0479~F1894~M23~WES/calls/BL0479~F1894~M23~WES.merged.vcf genotypemergeoption=PRIORITIZE filteredrecordsmergetype=KEEP_IF_ANY_UNFILTERED multipleallelesmergetype=BY_TYPE rod_priority_list=HC,Platypus printComplexMerges=false filteredAreUncalled=false minimalVCF=false excludeNonVariants=false setKey=set assumeIdenticalSamples=false minimumN=1 suppressCommandLineHeader=false mergeInfoWithMaxAC=false filter_reads_with_N_cigar=false filter_mismatching_base_and_quals=false filter_bases_not_stored=false">
##INFO=<ID=AC,Number=A,Type=Integer,Description="Allele count in genotypes, for each ALT allele, in the same order as listed">
##INFO=<ID=AF,Number=A,Type=Float,Description="Allele Frequency, for each ALT allele, in the same order as listed">
##INFO=<ID=AF,Number=A,Type=Float,Description="Allele frequency, for each ALT allele, in the same order as listed">
##INFO=<ID=ALERT,Number=0,Type=Flag,Description="Variant is adjacent to other variants, but case was too complex for joinAdjacentSNPs to handle. Please review.">
##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total number of alleles in called genotypes">
##INFO=<ID=BRF,Number=1,Type=Float,Description="Fraction of reads around this variant that failed filters">
##INFO=<ID=BaseQRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score from Wilcoxon rank sum test of Alt Vs. Ref base qualities">
##INFO=<ID=ClippingRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score From Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref number of hard clipped bases">
##INFO=<ID=DB,Number=0,Type=Flag,Description="dbSNP membership">
##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Combined depth across samples">
##INFO=<ID=END,Number=1,Type=Integer,Description="Stop position of the interval">
##INFO=<ID=ExcessHet,Number=1,Type=Float,Description="Phred-scaled p-value for exact test of excess heterozygosity">
##INFO=<ID=FR,Number=.,Type=Float,Description="Estimated population frequency of variant">
##INFO=<ID=FS,Number=.,Type=Float,Description="Fisher's exact test for strand bias (Phred scale)">
##INFO=<ID=HP,Number=1,Type=Integer,Description="Homopolymer run length around variant locus">
##INFO=<ID=HapScore,Number=.,Type=Integer,Description="Haplotype score measuring the number of haplotypes the variant is segregating into in a window">
##INFO=<ID=InbreedingCoeff,Number=1,Type=Float,Description="Inbreeding coefficient as estimated from the genotype likelihoods per-sample when compared against the Hardy-Weinberg expectation">
##INFO=<ID=JOINED,Number=0,Type=Flag,Description="Variant is the result of joining adjacent SNPs/MNPs. Please use caution when interpreting sample-specific values.">
##INFO=<ID=MGOF,Number=.,Type=Integer,Description="Worst goodness-of-fit value reported across all samples">
##INFO=<ID=MLEAC,Number=A,Type=Integer,Description="Maximum likelihood expectation (MLE) for the allele counts, for each ALT allele, in the same order as listed">
##INFO=<ID=MLEAF,Number=A,Type=Float,Description="Maximum likelihood expectation (MLE) for the allele frequency, for each ALT allele, in the same order as listed">
##INFO=<ID=MMLQ,Number=1,Type=Float,Description="Median minimum base quality for bases around variant">
##INFO=<ID=MQ,Number=1,Type=Float,Description="RMS Mapping Quality">
##INFO=<ID=MQRankSum,Number=1,Type=Float,Description="Z-score From Wilcoxon rank sum test of Alt vs. Ref read mapping qualities">
##INFO=<ID=NF,Number=.,Type=Integer,Description="Total number of forward reads containing this variant">
##INFO=<ID=NR,Number=.,Type=Integer,Description="Total number of reverse reads containing this variant">
##INFO=<ID=PP,Number=.,Type=Float,Description="Posterior probability (phred scaled) that this variant segregates">
##INFO=<ID=QD,Number=1,Type=Float,Description="Variant-quality/read-depth for this variant">
##INFO=<ID=ReadPosRankSum,Number=.,Type=Float,Description="Mann-Whitney Rank sum test for difference between in positions of variants in reads from ref and alt">
##INFO=<ID=SC,Number=1,Type=String,Description="Genomic sequence 10 bases either side of variant position">
##INFO=<ID=SOR,Number=1,Type=Float,Description="Symmetric Odds Ratio of 2x2 contingency table to detect strand bias">
##INFO=<ID=START,Number=.,Type=Integer,Description="Start position of reference call block">
##INFO=<ID=SbPval,Number=.,Type=Float,Description="Binomial P-value for strand bias test">
##INFO=<ID=Size,Number=.,Type=Integer,Description="Size of reference call block">
##INFO=<ID=Source,Number=.,Type=String,Description="Was this variant suggested by Playtypus, Assembler, or from a VCF?">
##INFO=<ID=TC,Number=1,Type=Integer,Description="Total coverage at this locus">
##INFO=<ID=TCF,Number=1,Type=Integer,Description="Total forward strand coverage at this locus">
##INFO=<ID=TCR,Number=1,Type=Integer,Description="Total reverse strand coverage at this locus">
##INFO=<ID=TR,Number=.,Type=Integer,Description="Total number of reads containing this variant">
##INFO=<ID=WE,Number=1,Type=Integer,Description="End position of calling window">
##INFO=<ID=WS,Number=1,Type=Integer,Description="Starting position of calling window">
##INFO=<ID=set,Number=1,Type=String,Description="Source VCF for the merged record in CombineVariants">
##SentieonCommandLine.Haplotyper=<ID=Haplotyper,Version="sentieon-genomics-201711",Date="2018-04-03T02:09:45Z",CommandLine="/data/MoCha/patidarr/sentieon/sentieon-genomics-201711/libexec/driver -t 26 -r /data/MoCha/patidarr/ref/ucsc.hg19.fasta -i BL0479/20170910/BL0479~F1894~M23~WES/BL0479~F1894~M23~WES.bwa.final.bam --interval /data/MoCha/patidarr/ref/design/Sureselect.v5.refseq.ensembl.noUTR.notfound.targetbp.hg19.bed --algo Haplotyper -d /data/MoCha/patidarr/ref/dbsnp_138.hg19.vcf --min_base_qual 20 --min_map_qual 30 /lscratch/65340476//BL0479~F1894~M23~WES.HC_DNASeq.raw.vcf">
##contig=<ID=chrM,length=16571,assembly=hg19>
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##fileDate=2018-04-02
##joinAdjacentSNPs_command=/data/MoCha/patidarr/ngs_pipeline/scripts/joinAdjacentSNPs.py -v BL0479/20170910/BL0479~F1894~M23~WES/calls/BL0479~F1894~M23~WES.HC_DNASeq.raw.vcf -o /lscratch/65341216//HC.vcf.tmp 1 BL0479/20170910/BL0479~F1894~M23~WES/BL0479~F1894~M23~WES.bwa.final.bam /data/MoCha/patidarr/ref/ucsc.hg19.2bit
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##reference=file:///data/MoCha/patidarr/ref/ucsc.hg19.fasta
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#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO	FORMAT	BL0479~F1894~M23~WES
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chr1	762589	rs71507461	G	C	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.51;QD=40.31;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	762592	rs71507462	C	G	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.51;QD=40.31;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	762601	rs71507463	T	C	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.27;QD=38.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	762632	rs61768173	T	A	44.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.00;QD=22.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	792263	rs1044922	A	G	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.90;QD=29.38;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	792480	rs2905036	C	T	1828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=42;PP=1568;SC=TTGTGTTCAACATATTTCATT;SOR=1.107;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=23;TCR=42;TR=65;WE=792488;WS=792470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	866319	rs9988021	G	A	279.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=231;SC=GTGGCCCAGCGGGGCACTGAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=866327;WS=866309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	866511	.	C	CCCCT	276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=5;PP=262;SC=GGCCGTGACTCCCCTCCCTCC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=866519;WS=866501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	871334	rs4072383	G	T	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=381;SC=GAGGACGGTGGCGTCTCCACT;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=871342;WS=871324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	876499	rs4372192	A	G	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=5;PP=646;SC=AGCCGGGGGGATCACTGCTGT;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=876507;WS=876489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	877831	rs6672356	T	C	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.98;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	879676	rs6605067	G	A	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=362;SC=TCAAAGGAAAGGAACAAATTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=879695;WS=879666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	879687	rs2839	T	C	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=363;SC=GAACAAATTTTCAAAGACTTG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=879695;WS=879666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	880238	rs3748592	A	G	3763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=57;PP=2917;SC=AGCCAGCCTTAGAGGTTACTC;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=56;TCR=57;TR=113;WE=880246;WS=880228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	881627	rs2272757	G	A	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=9;PP=898;SC=TACAAGGTCAGGGGTGTCCCC;SOR=2.242;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=35;WE=881635;WS=881617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	883625	rs4970378	A	G	1533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=26;PP=1252;SC=GAAGAGCAGGAGAGAGGGCCG;SOR=0.909;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=22;TCR=26;TR=48;WE=883633;WS=883615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	884091	.	C	G	1980	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=4;NR=38;PP=1980;QD=47.9707431559;SC=CACCTGGCTGCACCCTGGTCA;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=89;TCF=15;TCR=74;TR=42;WE=884109;WS=884081;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:47,42:0.47:89
chr1	884091	.	C	CACCCTGGTCCCCCTGGTCCCTTTGGCCCTGCACCTGGCTGG	3037.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.78;SOR=2.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	884101	.	A	C	1860	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=8;NR=28;PP=1860;QD=52.6325336819;SC=CACCCTGGTCACCCTGGTCCT;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=79;TCF=12;TCR=67;TR=36;WE=884109;WS=884081;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:43,36:0.46:79
chr1	886788	rs10465242	G	A	2044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=54;PP=1674;SC=TGGGGCTGCAGGTACCTTACC;SOR=4.479;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=4;TCR=54;TR=58;WE=886796;WS=886778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	886817	rs10465241	C	T	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=35;PP=1018;SC=AGCTTTATTTCAACACGGTGG;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=37;WE=886825;WS=886807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	887560	rs3748595	A	C	3205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=68;PP=2464;SC=CCAGGCTGACAAGTCAGGCTG;SOR=1.679;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=33;TCR=68;TR=101;WE=887568;WS=887550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	887801	rs3828047	A	G	1746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=16;PP=1483;SC=CCTTCTTGCGAGTGGTCATGG;SOR=1.938;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=54;WE=887809;WS=887791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	888639	rs3748596	T	C	5520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=80;PP=2965;SC=GCAGAGACTCTTCCCCAGTGC;SOR=0.824;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=89;TCR=80;TR=168;WE=888647;WS=888629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr1	888659	rs3748597	T	C	5185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=82;PP=2965;SC=CTCCATACGATCACCATTCTC;SOR=0.766;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=74;TCR=82;TR=156;WE=888667;WS=888649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr1	889158	rs13303056	GA	CC	1161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=1187;SC=ACTGGGCCACGAACCTTGAGC;SOR=3.611;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=21;WE=889167;WS=889148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	889638	rs13303206	G	C	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=633;SC=AGGGGCTTAGGAGGACCCTCT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=22;WE=889646;WS=889628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	892745	rs13303227	G	A	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=14;PP=579;SC=CTTCACAAGGGTTACCAACTA;SOR=1.358;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=23;WE=892753;WS=892735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	894573	rs13303010	G	A	2410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=48;PP=1763;SC=AGGCCAAATCGGCCCTCGGAC;SOR=1.670;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=74;TCF=25;TCR=49;TR=73;WE=894581;WS=894563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	897325	rs4970441	G	C	6292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=123;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.800;SC=TTGCCGATGCGCACTCCTGCA;SOR=0.554;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=197;TCF=72;TCR=125;TR=194;WE=897333;WS=897315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,202:1.00:203
chr1	897564	rs13303229	T	C	5374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=66;PP=2965;SC=CCGAGACCTTTCTGGATCTGG;SOR=1.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=167;TCF=100;TCR=67;TR=166;WE=897572;WS=897554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr1	898323	rs6605071	T	C	2761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=34;PP=2166;SC=CGTTTCCCTCTTGCCCTGTGC;SOR=1.005;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=49;TCR=34;TR=83;WE=898331;WS=898313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	899814	rs368669536	C	T	1867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=23;PP=1347;SC=CTGTACGTGGCAGGGGGCAAC;SOR=1.214;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=36;TCR=23;TR=58;WE=899822;WS=899804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	899928	rs6677386	G	C	1454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.56;SOR=3.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	899937	rs143296006	GG	TC	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.09;SOR=3.477;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	899942	rs71509448	G	A	1195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.86;SOR=2.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	900285	rs4970435	CA	TG	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=1154;SC=TTTTGTGGTGCAGCCCCTCCC;SOR=5.058;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=20;WE=900294;WS=900275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	909073	rs3892467	C	T	1227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=34;PP=1032;SC=CAGCCTGAGGCTGGGGAGGTC;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=37;WE=909081;WS=909063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	909238	rs3829740	G	C	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=7;PP=420;SC=CAGAGTGCACGTGGACCCACG;SOR=1.292;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=18;WE=909246;WS=909228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	909768	rs2340593	A	G	3861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=58;PP=2965;SC=CTGCCTCCTGAGGTGAGTGCC;SOR=0.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=58;TCR=58;TR=116;WE=909776;WS=909758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr1	911595	rs7417106	A	G	1271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=22;PP=984;SC=CCCTTGCCCCACCTGCCGGCG;SOR=0.823;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=25;TCR=22;TR=47;WE=911603;WS=911585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	912049	rs9803103	T	C	1485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=53;PP=1162;SC=CACTCAGAGATGGCCCCGCAC;SOR=5.247;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=56;TCF=3;TCR=53;TR=56;WE=912057;WS=912039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	912103	.	G	A	267	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=31;MMLQ=27;MQ=57.31;NF=0;NR=10;PP=267;QD=30.1771212547;SC=CACCAACCCCGGGAACCGCCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=912111;WS=912093;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	912125	.	CG	C	114	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=5;HapScore=4;MGOF=20;MMLQ=26;MQ=50.47;NF=0;NR=3;PP=114;QD=46.6666666667;SC=CCACTCCCCCCGCCAACCCCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=912135;WS=912115;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	912127	.	C	A	53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=4;MGOF=20;MMLQ=26;MQ=50.47;NF=0;NR=3;PP=53;QD=29.2570708491;SC=ACTCCCCCCGCCAACCCCGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=912135;WS=912115;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	914192	rs2340595	G	C	80.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=27;SC=GCGGCCCCCTGCTTGGCCAAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=914200;WS=914182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	914333	rs13302979	C	G	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=6;PP=747;SC=CCCGCCCCCTCGGAGGCCGAC;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=914341;WS=914323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	914852	rs13303368	G	C	4402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=34;PP=2756;SC=GCTGAGGCCTGTCCTGAGCCT;SOR=1.413;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=64;TCR=34;TR=98;WE=914860;WS=914842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	914876	rs13302983	T	C	5059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=35;PP=2955;SC=TTATTGGGGCTGGGCCCAGCC;SOR=1.769;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=82;TCR=35;TR=116;WE=914884;WS=914866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	914940	rs13303033	T	C	5358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=73;PP=2965;ReadPosRankSum=0.384;SC=CCAGTGCGGGTGCCCCAGAGC;SOR=1.063;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=102;TCR=74;TR=174;WE=914948;WS=914930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,181:0.99:183
chr1	915227	rs13303355	A	G	1858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=25;PP=1513;SC=TCCGTGTCCAATTGTGGCTTG;SOR=0.728;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=55;WE=915235;WS=915217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	916549	rs6660139	A	G	3966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=43;PP=2965;SC=GGCTCCATCCATGCCCTGAAA;SOR=1.731;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=94;TCR=43;TR=137;WE=916557;WS=916539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	935222	rs2298214	C	A	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=20;PP=521;SC=CGGTCGCCCCCCTCACGCCCG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=935230;WS=935212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	948846	rs3841266	T	TA	1113.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=2;PP=1032;SC=GCCTCAGGCTTATAATAGGGC;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=20;WE=948854;WS=948836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	948870	rs4615788	C	G	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=6;PP=617;SC=TGCTGCCTGCCGAAGCCGGCG;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=948878;WS=948860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	948921	rs15842	T	C	1689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=24;PP=1162;SC=TACAGGAGCTTGTGCCGTGGC;SOR=0.914;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=32;TCR=24;TR=56;WE=948929;WS=948911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	949654	rs8997	A	G	3292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=40;PP=2652;SC=CCTACGAGGTACGGCTGACGC;SOR=1.051;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=97;TCF=56;TCR=41;TR=96;WE=949662;WS=949644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	949925	rs2799070	C	T	2264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=52;PP=1792;SC=GAGAAATGGCCGCCTCTGTGT;SOR=2.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=14;TCR=52;TR=66;WE=949933;WS=949915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	976491	.	CG	C	69	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=7;HapScore=2;MGOF=29;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=69;QD=41.0;SC=CGGAGCGGGGCGGGAGCGGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=976499;WS=976481;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	976514	rs79290478	C	A	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.58;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	977330	rs2799066	T	C	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=6;PP=629;SC=CACCCCTGCGTCCTAGACCAG;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=977338;WS=977320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	977570	rs2710876	G	A	1458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=35;PP=1121;SC=GAGGCCAGGCGGGGTGGGCTG;SOR=2.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=45;WE=977578;WS=977560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	978603	rs35881187	CCT	C	1389.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.34;NF=20;NR=6;PP=1194;SC=CCACTGAGCCCCTGTGTCCTT;SOR=2.765;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=26;WE=978612;WS=978593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	981087	rs3128098	A	G	4404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=81;PP=2965;SC=TGCGGACATCACGTTCCTCCC;SOR=1.270;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=54;TCR=81;TR=135;WE=981095;WS=981077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr1	981931	rs2465128	A	G	2464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=30;PP=2009;SC=CGCCCTCATCACGACCTCGGA;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=55;TCR=30;TR=85;WE=981939;WS=981921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	982941	rs3128102	T	C	5715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=96;PP=2965;SC=CCTTGCCTACTCCCTGCCACA;SOR=1.043;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=73;TCR=96;TR=169;WE=982949;WS=982931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr1	982994	rs10267	T	C	5481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=95;PP=2965;SC=AGAAGGATTTTCGGAGTGTCC;SOR=1.114;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=69;TCR=95;TR=164;WE=983002;WS=982984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr1	984147	rs199866572	CAAAAAAAAAAA	C	1540.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=20;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=21;PP=2904;SC=AACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=0.846;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=29;WE=984180;WS=984137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	984171	rs140904842	CAG	C	1999.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=26;PP=1769;SC=AAAAAAAAAGCAGGGGGCGGT;SOR=1.085;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=35;WE=984180;WS=984137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	984302	rs9442391	T	C	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=9;PP=269;SC=CCTTCCCCACTCTCCGCGCCT;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=984310;WS=984292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	985266	rs2275813	C	T	3528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=45;PP=2714;SC=GTCCCGGTCCCGTCTTCCTCC;SOR=1.061;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=63;TCR=45;TR=108;WE=985274;WS=985256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	985446	rs2275812	G	T	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.99;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	985449	rs2799067	G	A	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.04;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	986443	rs2710887	C	T	3393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=61;PP=2572;SC=GCCTCTCATCCGCTCACCGTC;SOR=1.077;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=106;TCF=44;TCR=62;TR=105;WE=986451;WS=986433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	987200	rs9803031	C	T	2239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=39;PP=1867;SC=CGAGAGGTAACGTGCCATCCT;SOR=0.874;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=30;TCR=39;TR=69;WE=987208;WS=987190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	988932	rs2710871	G	C	1365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=22;PP=1094;SC=CCTCCCGCCCGTCTCTCTGAT;SOR=0.883;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=44;WE=988940;WS=988922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	990280	rs4275402	C	T	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=3;PP=334;SC=GCTTGCGGGACGTGGTGGTGG;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=990288;WS=990270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	990517	rs2710872	C	T	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=4;PP=113;SC=GACCTAGTGCCGAGGGATGGA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=990525;WS=990507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	1007203	rs4633229	A	G	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=2;PP=534;SC=GGCCCTAATTATCAGTCAGAG;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=1007211;WS=1007193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	1007432	rs4333796	G	A	1816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.79;SOR=1.123;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	1018144	rs9442395	T	C	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=406;SC=GCGGAGGGACTCAGAGCCGAG;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=1018152;WS=1018134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	1019175	rs2298215	C	G	953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.35;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	1019180	rs9442396	T	C	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.39;SOR=3.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	1021415	rs3737728	A	G	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=24;PP=664;SC=ACCGCTGAGCAGACGGGCAGG;SOR=5.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=1021423;WS=1021405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	1026707	rs4074137	C	A	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=4;PP=779;SC=CCCCTCTGACCCCAGCAGTGG;SOR=3.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=1026715;WS=1026697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	1026801	rs4562563	T	A	1620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=32;PP=1225;SC=CCCACCGCCCTCCACAGAGGC;SOR=1.220;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=20;TCR=32;TR=52;WE=1026809;WS=1026791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	1158631	rs6603781	A	G	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=13;PP=1129;SC=CACTTTCCTCATCCACTTTGA;SOR=2.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=49;WE=1158639;WS=1158621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	1196863	rs6659787	T	C	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=11;PP=303;SC=GTTGGGGGAGTAGCTCATCTC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=1196871;WS=1196853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	1229680	rs2477781	G	T	3280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=43;PP=2858;SC=GGGACCGAACGTGGTCCCCAC;SOR=0.992;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=56;TCR=43;TR=99;WE=1229688;WS=1229670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	1239339	rs11260584	T	G	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=8;PP=1413;SC=GACCAGGACCTGGAGCACCAC;SOR=3.500;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=61;TCF=53;TCR=8;TR=60;WE=1239347;WS=1239329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	1242707	rs2274262	A	G	3441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=68;PP=2836;SC=CACGTTTCCAAGCACCCTACC;SOR=1.380;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=38;TCR=68;TR=106;WE=1242715;WS=1242697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr1	1243896	rs61766198	C	T	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=0;PP=20;SC=TGGCGCGGTGCCACCGCGCAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=1243904;WS=1243892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	1245368	rs11590283	G	A	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=785;SC=ACAGCTGGAGGGGATTCGCCC;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=1245376;WS=1245358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	1246004	rs2296474	A	G	1369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=15;PP=1023;SC=ACAGGTACGTATTTTTCCAGG;SOR=1.312;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=27;TCR=15;TR=42;WE=1246012;WS=1245994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	1247494	rs12103	T	C	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=16;PP=548;SC=CAGAGCCGTCTGGGAGGTGCT;SOR=1.519;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=24;WE=1247502;WS=1247484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	1249187	rs12142199	G	A	5912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=96;PP=2965;SC=TCCTCTGCACGAAAGTCTTGC;SOR=0.842;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=182;TCF=86;TCR=96;TR=181;WE=1249195;WS=1249177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr1	1254136	rs4970432	G	A	2545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=12;PP=2106;SC=ACCTAATATAGTTTCAAGAAA;SOR=3.345;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=66;TCR=12;TR=78;WE=1254144;WS=1254126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	1254436	rs1886773	A	G	6256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.69;SOR=0.844;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	1254443	rs1886772	G	A	6446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.86;SOR=0.821;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	1254841	rs10907179	C	G	1959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=46;PP=1523;SC=TGTAGATGGGCCCGTCGTAGC;SOR=2.948;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=10;TCR=46;TR=56;WE=1254849;WS=1254831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	1260168	rs61766199	C	A	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=7;PP=168;SC=GAGGGCGGGGCGGTGGGCGGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=1260176;WS=1260158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	1262591	rs2296472	C	T	2219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=12;PP=1729;SC=CAGGCCTGGGCGAGGACTCGA;SOR=2.864;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=58;TCR=12;TR=69;WE=1262599;WS=1262581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	1262966	rs307349	C	T	2254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=27;PP=1805;SC=TCGTGCGCCGCGCCGTCACCG;SOR=1.308;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=44;TCR=27;TR=71;WE=1262974;WS=1262956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	1263144	rs307350	G	A	2209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=49;PP=1639;SC=CCTGCCCTAGGGGCGGGAAGC;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=17;TCR=50;TR=66;WE=1263152;WS=1263134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	1268847	rs307378	T	G	7115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=108;NR=107;PP=2965;SC=GCCCACAGGGTACAAGACGAA;SOR=0.739;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=215;TCF=108;TCR=107;TR=215;WE=1268855;WS=1268837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr1	1269554	rs307377	T	C	2541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=24;PP=1995;SC=CCAGCCGGGCTGCTACAACCG;SOR=1.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=58;TCR=24;TR=82;WE=1269562;WS=1269544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	1273116	rs307371	A	G	2004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=39;PP=1509;SC=CCCCATTCACACTGGCTCCTG;SOR=1.131;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=66;WE=1273124;WS=1273106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	1273278	rs307370	A	G	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=7;NR=6;PP=308;SC=GTGGGGTGGAACTGGGGGCGG;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=13;WE=1273286;WS=1273268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	1275264	.	A	ACAGCCGCATGTCCCCCAGCAGCCCCCACAGACCCACCCG	911.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.64;SOR=6.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	1275291	.	G	A	556	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5021;HP=6;HapScore=1;MGOF=14;MMLQ=27;MQ=59.1;NF=1;NR=24;PP=556;QD=23.6308485019;SC=AGCAGCCCCCGCAGACCCACC;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=25;WE=1275299;WS=1275281;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,25:0.86:29
chr1	1275329	.	TA	CG	176	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=4;HapScore=3;MGOF=23;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=1;NR=5;PP=176;QD=38.2446458104;SC=CAGCAGCCCCTACAGACCCAC;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=6;WE=1275338;WS=1275319;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,6:0.50:12
chr1	1276973	rs145370195	G	GACAC	7555.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=44;PP=2975;SC=ACCTCATGCAGACACATGCAC;SOR=1.897;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=157;TCF=106;TCR=51;TR=137;WE=1276981;WS=1276963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr1	1277533	rs307362	T	C	1206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=35;PP=927;SC=TGGCCACATTTGGGCTGTGCA;SOR=3.109;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=42;WE=1277541;WS=1277523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	1278237	rs307361	T	C	1162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=36;PP=981;SC=GCCCACACAATGTCACTCTGT;SOR=3.664;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=42;WE=1278245;WS=1278227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	1284490	rs150789461	G	A	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=23;PP=624;SC=GCCCGGCCCGGGGCTCGGACG;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=1284498;WS=1284480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	1288471	rs3766183	C	T	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=498;SC=GGGGAGCTCTCGGTGGCAGGC;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=1288479;WS=1288464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	1288583	rs3845295	C	G	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=15;PP=1173;SC=TCCCAGCCCCCGACGAGCAGA;SOR=1.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=50;WE=1288591;WS=1288573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	1288823	rs2296471	A	G	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=20;PP=704;SC=AGCCCCTGGGAGAGGGGTGTG;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=1288831;WS=1288813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	1289367	rs140777846	CTG	C	1928.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=17;PP=1615;SC=CAGCCCGGGACTGGGAGCCGC;SOR=0.990;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=37;TCF=20;TCR=17;TR=35;WE=1289376;WS=1289357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	1289911	rs4970365	G	A	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=34;PP=1126;SC=GCGGGGTCGGGGCGGCGTCAG;SOR=3.967;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=38;WE=1289919;WS=1289901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	1293764	rs34841888	G	C	1852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=8;PP=1463;SC=TCAGATGGGCGGTTTTGTCCG;SOR=3.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=49;TCR=8;TR=57;WE=1293772;WS=1293754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	1296691	rs2765025	C	G	2921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=67;PP=2328;SC=CGTTTGCTGACCACCTCCTGG;SOR=2.354;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=18;TCR=67;TR=85;WE=1296699;WS=1296681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	1310074	rs2765035	C	G	1666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=28;PP=1351;SC=CGCCCCCGCGCGGCTTCCTAC;SOR=0.994;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=22;TCR=28;TR=50;WE=1310082;WS=1310064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	1323078	rs12729599	A	G	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=22;PP=872;SC=ACAAGAAACCACCTCAGGGTG;SOR=1.542;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=33;WE=1323086;WS=1323068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	1323143	rs35654872	CCT	C	1928.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=7;PP=1800;SC=CTGGGTGCGCCCTGAGGCACA;SOR=3.160;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=37;WE=1323152;WS=1323133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	1323945	rs111530797	GTC	G	344.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=4;PP=340;SC=GTGAGTGTGTGTCTCTCTCTC;SOR=1.270;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=8;WE=1323954;WS=1323935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	1387667	rs1781144	C	G	6532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=112;PP=2965;ReadPosRankSum=0.546;SC=CTGTGTCAAGCCCTCACCCTC;SOR=0.341;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=200;TCF=87;TCR=113;TR=199;WE=1387675;WS=1387657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,205:1.00:206
chr1	1398010	.	G	A	1969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.059;ClippingRankSum=0.000;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.346;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.209;NF=41;NR=36;PP=1416;ReadPosRankSum=1.191;SC=TTGACTACGGGAGGAAGTGCT;SOR=0.766;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=129;TCF=67;TCR=62;TR=77;WE=1398018;WS=1398000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,80:0.58:139
chr1	1417696	rs819970	C	G	176.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.95;QD=25.26;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	1418531	rs819973	G	A	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=18;PP=651;SC=AAAAAGAAAAGAATTAGCTGG;SOR=1.460;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=28;WE=1418539;WS=1418521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	1454424	rs147532057	C	T	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.70;QD=31.87;SOR=5.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	1469289	rs28370384	G	C	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.39;MQRankSum=-3.461;QD=31.34;ReadPosRankSum=-0.628;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr1	1469546	rs3128344	G	A	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=15;PP=471;SC=ATGCTCCTGGGTGGGGACTGG;SOR=1.931;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=22;WE=1469554;WS=1469536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	1534710	rs79079518	G	C	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=2;PP=434;SC=GGGCGGCCTCGCGCTTCAGGG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=1534718;WS=1534700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	1552097	rs28502067	G	A	1919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=44;PP=1502;SC=GTCTGAGCATGCATGCGAGTG;SOR=2.265;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=11;TCR=44;TR=55;WE=1552105;WS=1552087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	1564712	rs61774907	G	T	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=27;PP=926;SC=GGACGGCGGGGATGGGGTCCG;SOR=1.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=37;WE=1564720;WS=1564702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	1566068	rs28730454	A	G	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.86;SOR=5.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	1571829	rs147836863	A	G	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.732;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.877;NF=8;NR=21;PP=1131;ReadPosRankSum=-2.472;SC=TTTTCTCACTAGGGGTCCCCA;SOR=1.208;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=104;TCF=45;TCR=59;TR=29;WE=1571849;WS=1571819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,16:0.17:93
chr1	1572004	.	C	G	5717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.012;ClippingRankSum=0.000;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.456;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=2.026;NF=97;NR=73;PP=2965;ReadPosRankSum=0.247;SC=TGCAACTCCTCCACAACCCCA;SOR=0.703;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=172;TCF=97;TCR=75;TR=170;WE=1572012;WS=1571994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,179:0.99:181
chr1	1572893	.	G	A	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=0.000;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=9.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.38;MQRankSum=-2.841;QD=0.41;ReadPosRankSum=-3.547;SOR=2.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,15:0.11:134
chr1	1573181	.	C	A	830	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=40.8;NF=39;NR=21;PP=830;QD=14.4128535425;SC=TCTCCCTCAGCGACGTGATCG;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=176;TCF=96;TCR=80;TR=60;WE=1573189;WS=1573171;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:116,60:0.34:176
chr1	1573811	rs144744578	A	G	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.27;MQRankSum=-0.253;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.842;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr1	1575616	rs80012316	T	C	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.75;QD=30.35;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	1575784	rs200227742	C	T	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=14.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.63;MQRankSum=-2.332;QD=4.10;ReadPosRankSum=-0.994;SOR=2.532;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr1	1575836	rs72468213	C	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=16.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.36;MQRankSum=-3.686;QD=2.85;ReadPosRankSum=-0.661;SOR=0.868;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,13:0.23:56
chr1	1575863	rs142965371	A	T	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=10.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.19;MQRankSum=-3.188;QD=2.42;ReadPosRankSum=0.291;SOR=0.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,14:0.27:52
chr1	1576586	.	C	G	229	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=29;MQ=43.96;NF=1;NR=12;PP=229;QD=20.2900932729;SC=AATGGATATGCAGGCCGGGCG;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=13;WE=1576594;WS=1576576;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr1	1581558	rs117719933	C	T	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.37;QD=27.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	1582106	rs79942991	T	C	1122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.30;QD=32.08;SOR=2.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	1582961	rs61774949	G	C	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.89;QD=29.28;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	1583601	rs142739440	G	C	252.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=270;SC=AAATCAATATGACAGCCCAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=1583609;WS=1583591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	1585597	rs7531938	A	G	3153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=18;PP=2429;SC=CCATTATACCATAATTTCTGG;SOR=3.160;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=91;TCR=18;TR=109;WE=1585605;WS=1585587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr1	1585642	rs3936009	G	T	5482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=58;PP=2965;SC=CCTGATGACGGATACGAGCTA;SOR=1.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=176;TCF=117;TCR=59;TR=175;WE=1585650;WS=1585632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr1	1586752	rs11486023	T	C	1787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=4;PP=1433;SC=GTTGTCACAGTGACCCTAGGA;SOR=4.654;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=49;TCR=4;TR=52;WE=1586760;WS=1586742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	1599812	rs12729295	C	T	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=31.20;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	1599888	rs2072923	A	G	952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.23;MQRankSum=-1.394;QD=26.47;ReadPosRankSum=-0.753;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr1	1602787	rs4639697	G	T	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=58.06;NF=8;NR=0;PP=203;SC=AAACTTACCTGCCGGGGATAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=1602795;WS=1602777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	1607726	rs79383320	C	T	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.84;QD=21.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	1635004	rs874516	T	C	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.92;QD=40.31;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	1635011	rs1059811	A	G	312.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.19;QD=39.10;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	1635022	rs1136978	A	G	262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.77;QD=26.28;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	1635108	rs11488590	G	A	2428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.627;NF=72;NR=4;PP=2172;ReadPosRankSum=-0.713;SC=GTGGCCCACAGTGTTGGCACC;SOR=4.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=73;TCR=4;TR=76;WE=1635116;WS=1635098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,72:0.99:73
chr1	1635193	rs11486026	T	C	5236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.822;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.619;NF=113;NR=54;PP=2965;ReadPosRankSum=1.125;SC=CCAGCACCTGTGCGCCCCGCA;SOR=1.496;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=168;TCF=113;TCR=55;TR=167;WE=1635201;WS=1635183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,172:0.99:173
chr1	1635565	rs11488591	C	T	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=14;PP=753;SC=CGTACTCCCGCGCCAGCCCAA;SOR=0.880;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=33;TCF=18;TCR=15;TR=32;WE=1635573;WS=1635555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	1635619	rs2076329	T	C	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=19;PP=847;SC=TGGGTGGGCCTGGGCGGGTCA;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=18;TCR=19;TR=37;WE=1635627;WS=1635609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	1635928	rs2072922	G	A	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.85;MQRankSum=-1.691;QD=28.22;ReadPosRankSum=-0.573;SOR=0.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr1	1635943	rs1534950	A	C	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.69;MQRankSum=-1.677;QD=29.81;ReadPosRankSum=-1.023;SOR=0.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr1	1635979	rs1534951	G	C	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.73;MQRankSum=-1.617;QD=28.61;ReadPosRankSum=1.735;SOR=0.311;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr1	1636044	rs1059822	G	A	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.35;QD=32.14;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	1636112	rs4288535	G	A	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.92;MQRankSum=0.742;QD=27.59;ReadPosRankSum=-0.463;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,24:0.96:25
chr1	1638780	rs374384253	C	T	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=321;SC=GGCCAGGCTTCGCTCAGCCCC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=1638788;WS=1638770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	1638925	rs200982240	C	T	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.28;QD=30.32;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	1638994	rs139262276	C	T	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.95;QD=32.39;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	1639046	rs138369165	C	G	279.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.89;QD=31.09;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	1639062	rs149613000	T	C	218.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.08;QD=31.26;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	1639073	rs376287692	A	T	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.70;QD=27.98;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	1639490	.	G	C	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.00;QD=19.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	1639570	rs141165289	C	T	55.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.68;QD=18.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	1639687	rs200014331	G	A	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=23.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	1647722	rs114460890	G	T	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.24;ReadPosRankSum=0.930;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr1	1647725	rs368680882	G	A	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.99;ReadPosRankSum=0.914;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr1	1647726	rs80025558	T	G	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.55;ReadPosRankSum=0.591;SOR=0.504;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr1	1647729	.	C	T	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.641;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.40;ReadPosRankSum=0.294;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr1	1647730	.	A	G	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.454;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.97;ReadPosRankSum=1.055;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr1	1647745	rs72634830	G	A	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.73;ReadPosRankSum=0.301;SOR=1.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,26:0.41:64
chr1	1647753	rs74045984	C	T	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.49;ReadPosRankSum=-0.238;SOR=1.099;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,28:0.41:69
chr1	1647778	rs72901773	C	G	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.253;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=3;PP=681;ReadPosRankSum=-2.552;SC=TGACCCAGCCCACTCACCTTT;SOR=1.406;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=99;TCF=86;TCR=13;TR=42;WE=1647786;WS=1647768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,46:0.45:103
chr1	1647814	rs72901775	T	C	1635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=13;PP=1229;ReadPosRankSum=0.553;SC=CCCTTGCCATTTCCCTTCTCT;SOR=0.857;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=142;TCF=107;TCR=35;TR=60;WE=1647822;WS=1647804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,68:0.44:153
chr1	1647871	rs72909014	T	C	2211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.135;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=39;PP=1655;ReadPosRankSum=-1.380;SC=CTTCTCGATGTCGTTTCCGAC;SOR=0.587;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=171;TCF=83;TCR=88;TR=78;WE=1647879;WS=1647861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,89:0.47:188
chr1	1647893	rs144636354	C	CTTTCTT	2726.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.618;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=42;PP=2970;ReadPosRankSum=-0.413;SC=TTCGTGCTCTCTTTCTTTCAC;SOR=0.771;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=141;TCF=31;TCR=110;TR=51;WE=1647901;WS=1647883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,71:0.45:158
chr1	1647968	rs146207119	C	CAT	1116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=4.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQRankSum=-2.739;QD=17.18;ReadPosRankSum=0.533;SOR=1.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,30:0.46:65
chr1	1647971	rs77394327	G	A	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=2.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQRankSum=-2.826;QD=18.69;ReadPosRankSum=0.845;SOR=1.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,26:0.45:58
chr1	1647983	rs74429813	T	A	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.61;MQRankSum=-2.416;QD=15.83;ReadPosRankSum=0.177;SOR=1.392;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr1	1647990	rs76519969	C	T	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.75;MQRankSum=-1.633;QD=15.89;ReadPosRankSum=1.257;SOR=0.380;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr1	1648002	rs77107184	C	T	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=3.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.72;MQRankSum=-1.456;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.298;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr1	1648018	rs79409185	C	T	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.44;MQRankSum=-1.930;QD=9.13;ReadPosRankSum=-0.912;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr1	1648027	rs61776857	T	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.71;MQRankSum=-2.313;QD=8.20;ReadPosRankSum=-0.912;SOR=0.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr1	1650657	.	C	G	256	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=12;NR=0;PP=256;QD=24.2309343789;SC=CTTTCAGCTACAGTTTGCTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=12;WE=1650665;WS=1650654;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr1	1650787	rs1137003	T	C	1781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=5.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.73;ReadPosRankSum=0.956;SOR=1.261;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,51:0.36:140
chr1	1650797	rs1059830	A	G	2035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=6.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.85;ReadPosRankSum=0.250;SOR=1.265;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,54:0.37:147
chr1	1650801	rs1137004	T	C	1995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=7.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.020;SOR=1.348;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,57:0.37:156
chr1	1650832	rs72909030	A	G	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.728;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=1186;ReadPosRankSum=0.042;SC=TCTGTGATGAACTTTTTCTTT;SOR=1.328;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=141;TCF=81;TCR=60;TR=53;WE=1650840;WS=1650822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,55:0.37:148
chr1	1650920	rs36191908	G	A	2388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.028;HP=1;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=39;PP=1320;ReadPosRankSum=-1.205;SC=ACAGCACTGCGTCATGCTTGA;SOR=0.870;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=147;TCF=63;TCR=84;TR=65;WE=1650928;WS=1650910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,68:0.44:154
chr1	1650938	.	CGG	C	2295.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.211;ClippingRankSum=0.000;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=7.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.62;ReadPosRankSum=1.927;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,62:0.42:147
chr1	1650942	.	A	AAG	2409.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.093;ClippingRankSum=0.000;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=4.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.59;ReadPosRankSum=1.968;SOR=1.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,60:0.44:137
chr1	1650960	rs72634834	G	A	2508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=6.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.08;ReadPosRankSum=0.122;SOR=1.309;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,62:0.52:119
chr1	1650967	rs75384210	T	C	2106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=1.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.15;ReadPosRankSum=1.175;SOR=1.010;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,55:0.50:110
chr1	1650996	rs74223875	T	C	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=1.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.76;ReadPosRankSum=1.279;SOR=0.392;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,32:0.42:76
chr1	1651003	rs76941027	G	A	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.77;ReadPosRankSum=0.150;SOR=0.639;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,28:0.40:70
chr1	1651047	.	C	T	402	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=39;MMLQ=28;MQ=59.14;NF=0;NR=18;PP=402;QD=24.2650673637;SC=TCTCCAACTTCAGGCATCTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=18;WE=1651055;WS=1651037;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr1	1823922	rs6688000	A	G	4253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=77;PP=2965;SC=ACCTGTCCGCATCATTTCTGG;SOR=0.850;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=66;TCR=77;TR=143;WE=1823930;WS=1823912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr1	1853615	rs113294876	T	TCTGA	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=2;PP=547;SC=CCTATTGGAATCTGGCAGAGG;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=9;WE=1853623;WS=1853605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	1854321	rs2250833	A	G	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=9;PP=691;SC=CCCGGCTGTCAGGACAAGCCC;SOR=1.382;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=27;WE=1854329;WS=1854311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	1855450	rs28423370	A	G	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=463;SC=ATAGAGCTCTACACCCTGCCC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=1855458;WS=1855440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	1856098	rs752965	C	T	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=171;SC=CGCCAGCACACGTGGCGGTTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=1856106;WS=1856088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	1859131	rs4648734	C	T	4826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=75;PP=2965;SC=GCTCGAAGAACGGAGAATGAC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=77;TCR=75;TR=152;WE=1859139;WS=1859121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr1	1870210	rs2803323	G	A	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=1;PP=548;SC=GGTCAGGGGCGGGGATGTGGT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=1870218;WS=1870200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	1873625	rs12758705	G	A	1943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=36;PP=1576;SC=CACTGGGTCAGGTGCCACAGT;SOR=1.234;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=23;TCR=36;TR=59;WE=1873633;WS=1873615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	1886519	.	C	A	86	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=86;QD=30.1928031368;SC=ACCGGAAGTGCGGCTCACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=1886527;WS=1886509;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	1886859	rs3795290	C	T	2652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=17;PP=2096;SC=CCGCCCTGTGCGGCTCCGCCC;SOR=2.732;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=70;TCR=17;TR=86;WE=1886867;WS=1886849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	1887019	rs28548017	A	G	3515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=71;PP=2787;SC=TCGAAGGCCTAGGAAAATTCT;SOR=1.675;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=32;TCR=71;TR=103;WE=1887027;WS=1887009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	1887091	rs139735565	CG	C	2177.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=26;PP=1969;SC=AGGCCCTCACCGCCCGCCCAC;SOR=0.266;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=23;TCR=29;TR=47;WE=1887099;WS=1887081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,59:0.98:60
chr1	1887111	rs3838975	GC	G	2083.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.729;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=1986;ReadPosRankSum=0.264;SC=CCCTGGCTTGGCCTGGCAGCC;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=50;WE=1887119;WS=1887101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr1	1887245	rs28575980	G	A	1536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=1249;ReadPosRankSum=-0.802;SC=AGCTGGTGGCGGCTTTGTCAT;SOR=0.275;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=23;TCR=24;TR=46;WE=1887253;WS=1887235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr1	1888193	rs3820011	C	A	3074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=57;PP=2379;SC=ACGTAGCTGCCGAAGTCAATG;SOR=1.237;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=38;TCR=57;TR=95;WE=1888201;WS=1888183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	1888330	rs28535696	C	T	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=378;SC=AGCATTTGTGCGCGTTGTGCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=1888338;WS=1888320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	1895177	rs7523728	C	T	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=7;PP=541;SC=CTGTCTGAGCCGTCCTCTTAC;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=22;WE=1895185;WS=1895167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	1896440	rs16824585	G	A	2231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=36;PP=1879;SC=GTGCGCTCCAGGATGTCCTTG;SOR=0.752;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=33;TCR=36;TR=69;WE=1896448;WS=1896430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	1896553	rs28625839	C	T	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=34;PP=1021;SC=ACCTGGGCGGCGCCGGTGGCA;SOR=3.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=39;WE=1896561;WS=1896543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	1897753	rs4648600	C	G	1755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=9;PP=1469;SC=AGGTGGCGAGCCGGCGACAGA;SOR=3.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=42;TCR=9;TR=51;WE=1897761;WS=1897743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	1900024	rs56985589	TG	T	448.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=497;SC=AGGCCCCACCTGCCCTCCACA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=1900032;WS=1900014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	1900106	rs145742571	T	TCTC	1473.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=7;PP=1265;SC=ACTGTGGTCTTCTTGCAAAAG;SOR=2.448;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=29;WE=1900114;WS=1900096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	1900232	rs16824588	T	C	1520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=27;PP=1124;SC=ATCCGACTGATGATCTCCTGC;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=25;TCR=27;TR=52;WE=1900240;WS=1900222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	1900339	rs56126097	A	G	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=24;PP=658;SC=CAGATGAGACAGTGCCCGGCG;SOR=4.003;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=26;WE=1900347;WS=1900329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	1903357	rs13303329	G	C	1402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=2;PP=1215;SC=AGGAGCAGGGGCCCAGGGACG;SOR=5.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=44;WE=1903365;WS=1903347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	1905790	rs16824603	A	G	137.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=5;PP=107;SC=GCTCTGAGTCACCCAGACACT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=1905798;WS=1905780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	1918488	rs4350140	A	G	2697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=43;PP=2146;SC=GAACAGGGAAACAAAGGTCAG;SOR=0.717;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=38;TCR=43;TR=81;WE=1918496;WS=1918478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	1920434	rs144487103	TA	T	47.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.55;MQRankSum=2.556;QD=1.70;ReadPosRankSum=-0.186;SOR=0.927;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr1	1922303	rs13303195	C	T	1489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=14;PP=961;SC=CTGAAACTTCCGTTACTGTGA;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=26;TCR=14;TR=40;WE=1922311;WS=1922293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	2005740	rs2459986	T	C	1034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=30;PP=771;SC=CTGGTGGATGTGTGGCGGTGG;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=36;WE=2005748;WS=2005730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	2075560	rs427811	T	G	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.67;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	2075570	rs377283	T	C	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.24;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	2076055	rs384726	G	A	2325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=37;PP=1854;ReadPosRankSum=0.831;SC=TCAGTGGGTCGGAGGTAAGGT;SOR=0.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=39;TCR=38;TR=75;WE=2076063;WS=2076045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,77:0.97:79
chr1	2077409	rs385039	A	G	4552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=34;PP=2965;SC=CAGAAGCTACATTGTAACACC;SOR=2.665;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=122;TCR=34;TR=156;WE=2077417;WS=2077399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr1	2082458	rs262670	C	T	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=10;PP=285;SC=CCCGGGAACGCGCTGCCCTGG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=2082466;WS=2082448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	2082489	rs262669	G	A	220.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=213;SC=GGGCTTTAGCGGAATTAATCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=2082497;WS=2082479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	2106840	rs12135175	T	C	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=8;PP=205;SC=ACCCCAATATTCACCCAACCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=2106848;WS=2106830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	2106896	rs12135178	T	C	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=2;PP=55;SC=AACCCCAAATTCATCCAACCC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=2106904;WS=2106886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	2113565	rs262688	T	G	3727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=45;PP=2922;ReadPosRankSum=-1.641;SC=GTTAGTAGAATGGATGTGGGC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=117;TCF=70;TCR=47;TR=113;WE=2113573;WS=2113555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,118:0.98:121
chr1	2118539	rs2503699	T	C	1890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=10;PP=1471;SC=TGCGTGGGCGTGGTGCGGGGC;SOR=3.150;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=49;TCR=10;TR=59;WE=2118547;WS=2118529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	2121118	rs2503701	C	T	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=22;PP=1481;SC=GTCCGGGCGCCGCACTCTGCG;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=59;TCF=37;TCR=22;TR=58;WE=2121126;WS=2121108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	2144982	rs2480714	G	T	1725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=44;PP=1397;SC=TCGCCTGGCTGCTTCCTCCCG;SOR=3.830;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=49;WE=2144990;WS=2144972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	2235378	rs140889128	C	T	2662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=63;NR=26;PP=1921;SC=CGTGTGCCGCCGCCGTCTCCC;SOR=1.836;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=63;TCR=26;TR=89;WE=2235386;WS=2235368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr1	2252759	rs35513983	A	G	171.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=132;SC=GAGCAGAGTCACGCAAGCAGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=2252767;WS=2252749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	2286947	rs1039100	A	G	1175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=25;PP=893;SC=TGGGGCTTCTAGCCACCAGCT;SOR=2.242;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=33;WE=2286955;WS=2286937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	2288852	rs2645087	G	A	1150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=3;PP=952;SC=CCCCCAACTGGTTTGTGAGCT;SOR=4.174;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=33;WE=2288860;WS=2288842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	2328714	rs2645081	A	G	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=424;SC=CCTGGGCGTGATGTTTGTGGG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=2328722;WS=2328704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	2332391	rs12037485	C	T	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=27;PP=1411;SC=TAATTCTTCACGGTATTTGAA;SOR=0.787;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=33;TCR=27;TR=60;WE=2332399;WS=2332381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	2338126	rs3795269	C	A	2481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=55;PP=2050;ReadPosRankSum=1.110;SC=GCCCAGGACACCCCCAGCCCC;SOR=0.676;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=85;TCF=28;TCR=57;TR=83;WE=2338134;WS=2338116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,84:0.99:85
chr1	2340200	rs2494598	T	C	3307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=49;PP=2325;SC=CGGCATGCAGTGTCACCAGCA;SOR=0.922;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=108;TCF=59;TCR=49;TR=107;WE=2340208;WS=2340190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	2399119	rs2494632	A	G	2785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=41;PP=1498;SC=GGCAGGTGGGATCCCAGAAGG;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=21;TCR=41;TR=62;WE=2399127;WS=2399109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	2399149	rs2494631	A	G	2515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=38;PP=1300;SC=TGGTCCCCGTAGGGAGCCCAG;SOR=1.649;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=55;WE=2399157;WS=2399139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	2409892	rs12727342	A	G	1379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=15;PP=985;SC=CTCCGCTGACAGCCGTGTCTC;SOR=1.426;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=45;WE=2409900;WS=2409882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	2411451	rs10797428	A	G	2140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=40;PP=1754;SC=ATGCAGACCCAGGGACCGGCC;SOR=0.934;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=32;TCR=40;TR=72;WE=2411459;WS=2411441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	2418935	rs10910082	C	T	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=8;PP=384;SC=TTCTGTGTCCCTCACTGAGCA;SOR=0.818;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=15;WE=2418943;WS=2418932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	2420590	rs10752744	T	C	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=558;SC=GAGGTGGGGCTTACCCATCCT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=2420598;WS=2420580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	2420913	rs6668720	A	G	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=454;SC=CATGCCATCCATGGGCATATC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=2420921;WS=2420903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	2422614	rs2477699	G	A	1743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=14;PP=1325;SC=CAACAGGCCGGCCTCTGGCTC;SOR=2.262;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=40;TCR=14;TR=54;WE=2422622;WS=2422604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	2426766	rs3001347	A	G	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=258;SC=TCGAGAGGGCACCGAGGAGGC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=2426774;WS=2426756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	2428874	rs2477706	T	C	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=4;PP=647;SC=CGTGTGGTGGTGGGTGGGCGG;SOR=3.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=25;WE=2428882;WS=2428864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	2430617	rs2296442	C	T	1794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=32;PP=1342;SC=ACGATCCCATCGGGCGTGACT;SOR=0.865;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=25;TCR=32;TR=57;WE=2430625;WS=2430607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	2433900	rs12736998	C	T	2333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=34;PP=1774;SC=GTGCGGCCCCCGCGTGTCCTG;SOR=0.955;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=41;TCR=34;TR=75;WE=2433908;WS=2433890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	2444414	rs7535528	G	A	2573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=42;PP=1708;SC=CCAGCCCAGCGCGTCCAGGGA;SOR=0.739;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=40;TCR=42;TR=82;WE=2444422;WS=2444404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	2452569	rs2985862	T	C	1007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=4;PP=833;SC=CGATGAGGTCTTTGAACTTGT;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=2452577;WS=2452559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	2518186	rs10752746	A	G	109.85	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=1;PP=87;SC=CGGCGGCAGCAAGAAAGGCGG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=2518194;WS=2518176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	2522392	rs2296443	G	A	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=176;SC=TCCGAGCAGCGGGTGGGCGTG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=2522400;WS=2522382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	2527678	rs2260976	A	G	1904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=56;PP=1650;SC=TGGGCCTCTCAGGTGAGGTGT;SOR=4.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=4;TCR=56;TR=60;WE=2527686;WS=2527668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	2528133	rs2843401	T	C	2534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=56;PP=1804;SC=CAGCGCCTGGTGGGGCCACCC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=28;TCR=56;TR=84;WE=2528141;WS=2528123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	2530341	rs34705971	A	AG	560.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=709;SC=ATAAGAGAGAAGTGCAGGTAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=15;WE=2530349;WS=2530331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	2560735	rs4648657	A	G	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=1;PP=278;SC=GAGAGCGGGCACGGGGACAGG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=2560743;WS=2560725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	2560882	rs4648658	G	A	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=15;PP=621;SC=CTGCACGGCCGGCGCTCTCCA;SOR=1.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=22;WE=2560890;WS=2560872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	2560903	rs4648659	T	G	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=13;PP=529;SC=CCATCCCCACTGGGCCTTCGG;SOR=1.230;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=21;WE=2560911;WS=2560893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	2573199	rs4648662	A	G	1490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=22;PP=1151;SC=AACTCCTGCAACTCGGCCAGG;SOR=0.823;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=24;TCR=22;TR=46;WE=2573207;WS=2573189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	2575775	.	G	A	1065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=12;PP=752;SC=CATCCACCTCGGCCAGGCTCT;SOR=1.418;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=31;WE=2575783;WS=2575765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	2700117	rs4648502	C	G	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=4;PP=583;SC=TCCCCCACCCCTGCTTGCCCA;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=2700125;WS=2700107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	2984087	rs2297829	C	A	4114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=1.666;SC=CCCAGCGCACCGCCGCCGCCA;SOR=1.124;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=130;TCF=32;TCR=98;TR=129;WE=2984095;WS=2984077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,130:0.99:131
chr1	2985885	rs7413494	C	G	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.96;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	3310928	rs145881072	C	CCG	272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=0;PP=159;SC=TCCAGGAGGGCCGCCCAGCCC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=4;WE=3310936;WS=3310918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	3311212	rs2493253	C	G	279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=8;PP=229;SC=ACCTGCCCCACGGGCATCAGC;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=3311220;WS=3311202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	3311261	rs6702992	C	T	170.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=135;SC=TCCACTTGCGCCTGCTACAAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=3311269;WS=3311251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	3312963	rs12726710	C	T	3530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=77;PP=2803;SC=GGCCGAGCTGCGTCCACAGTG;SOR=1.856;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=33;TCR=77;TR=109;WE=3312971;WS=3312953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	3328358	rs870124	T	C	6118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=89;PP=2965;SC=ACCTCCCACATCGCTGCTCAA;SOR=0.766;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=186;TCF=97;TCR=89;TR=186;WE=3328366;WS=3328348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr1	3328659	rs2493292	C	T	8067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=122;PP=2965;SC=GACAGCGACCCTGACAAGGAC;SOR=0.726;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=239;TCF=117;TCR=122;TR=239;WE=3328667;WS=3328649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr1	3329384	rs2493291	C	T	1067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=26;PP=850;SC=ACCCCAGCCTCACTGGCTCTC;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=3329392;WS=3329374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	3342109	rs41303861	G	T	2640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=69;NR=9;PP=2151;SC=ATGCAGAGCCGGGGCCTGCAC;SOR=3.638;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=69;TCR=9;TR=78;WE=3342117;WS=3342099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	3350173	rs2493271	T	C	1365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=2;PP=1135;SC=CCTGCCTGTCTGGGATGGCCC;SOR=5.186;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=40;WE=3350181;WS=3350163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	3380057	rs3806164	G	A	4103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=70;PP=2965;SC=TGACATGGACGTGGACAAGGA;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=57;TCR=70;TR=127;WE=3380065;WS=3380047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	3380337	rs41315270	G	A	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=28;PP=828;SC=GGCAGCTGCCGTTAGTAAGCA;SOR=4.548;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=3380345;WS=3380327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	3383898	rs6424078	A	G	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=35;PP=1077;SC=GCCAGCTCCCAGAGGTAGCGC;SOR=3.664;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=40;WE=3383906;WS=3383888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	3385256	rs1891143	A	G	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=1;PP=495;SC=AAGGCGGGTTACACAGAGAGG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=3385264;WS=3385246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	3385330	rs2493249	T	C	1839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=14;PP=1287;SC=ACCTGAGCCCTGTGGGGTGGC;SOR=2.194;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=44;TCR=14;TR=58;WE=3385338;WS=3385320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	3390219	rs12563698	C	T	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=31;PP=1076;SC=GTAATAGTTACGATCCTAAGA;SOR=1.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=43;WE=3390227;WS=3390209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	3390238	rs2493323	T	A	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=24;PP=886;SC=GATGGCTTTATTAACCAGGAT;SOR=1.547;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=36;WE=3390246;WS=3390228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	3394456	rs4638054	T	C	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=3;PP=944;SC=CACTGATCTCTGCCTCCCGGT;SOR=4.174;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=33;WE=3394464;WS=3394446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	3394674	rs4534324	T	C	1260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=38;PP=938;SC=TACAGGGAGTTGGCCCTGAGC;SOR=4.271;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=41;WE=3394682;WS=3394664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	3395229	rs4553117	T	C	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=28;PP=681;SC=ATTAGCTCCATGGGGACCGGG;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=3395237;WS=3395219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	3397103	rs375505302	G	A	2895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=55;PP=2432;SC=TGGCCGTGGAGGGCAATGTCC;SOR=1.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=34;TCR=55;TR=89;WE=3397111;WS=3397093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	3397188	rs2487677	T	C	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=25;PP=730;SC=ACAGCCTGTCTCCAATCAGCA;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=3397196;WS=3397178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	3407007	rs2821039	G	A	2073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=32;PP=1617;SC=CTCTGGGCCCGTGAAGTGTCC;SOR=0.754;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=31;TCR=32;TR=63;WE=3407015;WS=3406997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	3407680	rs56356910	G	A	264.41	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.603;NF=0;NR=12;PP=263;ReadPosRankSum=-0.775;SC=GGGAAGGAACGGGGGCGGGAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=3407688;WS=3407670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr1	3410221	rs7548716	C	G	822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=2;PP=651;SC=GCAGAGGCAACAAGAGGGGTT;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=3410229;WS=3410211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	3410410	rs61910697	C	T	2966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=58;PP=2285;ReadPosRankSum=0.832;SC=GGTGCCCCCCCGTCACAGTCA;SOR=0.484;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=33;TCR=59;TR=91;WE=3410418;WS=3410400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,96:0.99:97
chr1	3410973	rs12075570	C	T	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=830;ReadPosRankSum=0.632;SC=GGGGCCGCAGCGGCAGGTGCC;SOR=0.818;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=35;WE=3410981;WS=3410963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr1	3412418	rs41315290	G	A	1526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=19;PP=1206;SC=TCTCTGTGAAGGGCCTGTGAG;SOR=1.157;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=29;TCR=19;TR=48;WE=3412426;WS=3412408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	3412644	rs41315292	G	A	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=16;PP=522;SC=GGTCAACCCCGGAGTGGGGAT;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=3412652;WS=3412634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	3412726	rs72633383	C	T	169.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=134;SC=AACTCTCATGCACCCACCCTG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=3412734;WS=3412716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	3413426	rs12405358	A	G	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=14;PP=607;SC=GGCAGCTCTCATGAGACCCCC;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=24;WE=3413434;WS=3413416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	3417211	rs61742846	G	A	1320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=1046;ReadPosRankSum=0.828;SC=CTCGCACCGCGGGCCCACGTA;SOR=0.295;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=42;TCF=22;TCR=20;TR=41;WE=3417219;WS=3417201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr1	3418565	.	T	C	1172	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MMLQ=24;MQ=59.59;NF=11;NR=47;PP=1172;QD=20.8064002163;SC=GGGCTCCTGGTGAGTGTGCCC;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=59;TCF=12;TCR=47;TR=58;WE=3418573;WS=3418555;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr1	3418613	.	CCG	C	973	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=26;MQ=51.16;NF=1;NR=17;PP=973;QD=55.2222222222;SC=GTGTGCCCCCCCGGCGCCTCC;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=3418626;WS=3418597;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:0,18:1.00:18
chr1	3418616	.	GCG	ACA	567	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=27;MQ=51.39;NF=0;NR=14;PP=567;QD=44.3191339187;SC=TGCCCCCCCGGCGCCTCCTCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=14;WE=3418626;WS=3418597;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,14:0.64:22
chr1	3421658	rs2821009	A	T	876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.97;NF=24;NR=2;PP=727;SC=GGGCTTAGGCAAAGGGGGCCG;SOR=4.332;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=26;WE=3421666;WS=3421648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	3424388	rs947345	G	A	4788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=61;PP=2965;SC=ACTGACACCCGGGGGGCAGCG;SOR=0.959;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=143;TCF=82;TCR=61;TR=143;WE=3424396;WS=3424378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr1	3428160	rs2820999	T	G	2764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=29;PP=2165;SC=CGCGGGGACATGTGCACAGGG;SOR=1.637;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=86;TCF=57;TCR=29;TR=85;WE=3428168;WS=3428150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	3428424	rs4648391	G	T	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.53;SOR=4.351;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	3428428	rs4648514	C	T	1579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.88;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	3428608	rs11585362	G	A	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=9;PP=600;SC=CTCATAGCCCGCGTGACACAC;SOR=1.136;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=24;WE=3428616;WS=3428598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	3440647	rs2794322	T	C	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=0;PP=323;SC=TAGGGATGGCTGAAGCCAGGA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=3440655;WS=3440637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	3440943	rs12049449	A	C	263.53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.9988;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=214;ReadPosRankSum=1.036;SC=TGAGCCCCTCACCCACATCTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=9;WE=3440951;WS=3440933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr1	3496328	rs2821051	T	C	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=2;PP=288;SC=CGACACATCCTCGCCCCTTGC;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=3496336;WS=3496318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	3496479	rs2794340	T	C	912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=11;PP=624;SC=AAACAGAGGCTGGCGCTGCAT;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=27;WE=3496487;WS=3496469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	3511880	.	G	A	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=3;PP=1204;SC=AGGGAGGGCGGGGAGGCGCAG;SOR=4.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=42;TCR=3;TR=45;WE=3511888;WS=3511870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	3511934	rs7513275	A	G	2091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=58;NR=15;PP=1669;SC=GGGCTGCTGCATCCACCCTCG;SOR=2.743;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=74;TCF=59;TCR=15;TR=73;WE=3511942;WS=3511924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	3519179	rs2794330	C	T	1345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=31;PP=1044;SC=AACAGAGACACGGAGAGTCAG;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=41;WE=3519187;WS=3519169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	3527944	rs10797402	C	G	831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=16;PP=646;SC=CCCGCGCCCGCTCCGCGGAGC;SOR=1.302;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=26;WE=3527952;WS=3527934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	3528082	rs10797403	T	C	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=11;PP=362;SC=TGCCCCGGACTCAGAGCCTGG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=3528090;WS=3528072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	3542106	rs3838971	T	TG	1298.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=23;PP=1301;SC=CTCTCCTTGGTGGGGGGACTC;SOR=0.941;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=39;WE=3542114;WS=3542096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	3542186	rs139992228	G	A	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=14;PP=762;SC=GGCGCCCCGTGCCGCCCCTGC;SOR=0.811;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=17;TCR=14;TR=31;WE=3542194;WS=3542176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	3563428	rs76161888	C	T	2115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=48;PP=1674;SC=TTAAACGCAGCGGAGACCCGA;SOR=2.015;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=69;TCF=19;TCR=50;TR=67;WE=3563436;WS=3563418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	3563512	rs34514629	GC	G	973.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=1047;SC=CTTAAAACCAGCAGAGACCCG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=3563520;WS=3563502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	3566706	rs2251098	G	A	495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=413;SC=AGCGCCGCCGGCTTCCGCGCG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=3566714;WS=3566696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	3607520	rs3765730	G	A	1809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=23;PP=1260;SC=TAGGTGTGACGCGCCATTCAT;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=58;WE=3607528;WS=3607510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	3638674	rs1801174	C	T	7095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=127;PP=2965;SC=CCCCAGGCACCGCCATCCGGG;SOR=0.936;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=225;TCF=98;TCR=127;TR=225;WE=3638682;WS=3638664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr1	3640085	rs6424091	C	G	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=34;PP=1013;SC=CTGTACGGGTCGGGGGAGGGG;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=3640093;WS=3640075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	3640134	rs35939665	TCTGC	T	342.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=339;SC=AGTTGGCTGATCTGCCTGCCT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=8;WE=3640145;WS=3640124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	3644085	rs10910017	G	A	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=3;PP=553;SC=TGTGGTGACCGAGGGCTCTCA;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=3644093;WS=3644075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	3644349	rs2181486	A	G	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=28;PP=798;SC=GCGGCCGGCCAGGGGAACTGG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=3644357;WS=3644339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	3644374	rs2146657	A	G	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=24;PP=663;SC=GTGTGGGAGGAGAAGGGGACA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=3644382;WS=3644364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	3645835	rs2254530	C	A	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.09;SOR=3.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	3645844	rs2096224	G	A	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.51;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	3646137	rs11589885	C	T	2980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=49;PP=2454;SC=GCAGCAGGGTCCAGAGCAGAG;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=44;TCR=49;TR=93;WE=3646145;WS=3646127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	3646192	rs1885867	G	A	4008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=51;PP=2470;SC=AGCACTTGGGGCTGCCCTGGG;SOR=0.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TCF=44;TR=94;WE=3646200;WS=3646182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	3646214	rs1885866	T	C	4086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=52;PP=2325;SC=CCCTGGGTCATGGCCCTTGCT;SOR=0.734;Source=Platypus;TCF=48;TR=100;WE=3646222;WS=3646204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	3646291	rs1885865	G	A	2580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=52;PP=2084;SC=GGTGGCCAGAGTGACCATGAC;SOR=1.292;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=32;TCR=52;TR=84;WE=3646299;WS=3646281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	3647962	rs1745813	T	C	996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=10;PP=751;SC=CTCTCAGAGATGGGGGCTCGC;SOR=1.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=33;WE=3647970;WS=3647952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	3680345	rs144028564	C	T	1586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=22;PP=1192;SC=GAAAATGAGACGCTGCAGAAG;SOR=0.909;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=26;TCR=22;TR=48;WE=3680353;WS=3680335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	3683690	rs1181873	A	C	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=0;PP=678;SC=GGCGTGAGCCACTGCACCTGG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=3683698;WS=3683680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	3701491	rs2996426	A	G	204.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=161;SC=CCCAGGAGGCAGAGGCTGCAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=3701499;WS=3701481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	3703337	rs2368537	G	C	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=356;SC=CGGACACGCTGGCCTCAGGAT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=3703345;WS=3703329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	3732103	rs4648409	T	C	2299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=57;PP=1800;SC=GCACAGGACCTGCATTAGGAG;SOR=1.854;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=82;TCF=25;TCR=57;TR=81;WE=3732111;WS=3732093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	3732172	rs4233019	C	T	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=39;PP=1105;SC=CCAGCAACAACGTCCCAGGCC;SOR=5.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=41;WE=3732180;WS=3732162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	3732639	rs6702916	T	A	198.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=159;SC=CACAGCCAGTTTGCAGGTGGA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=3732647;WS=3732629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	3732707	rs6702935	T	C	274.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=225;SC=AACCAGAACATGAAGACAGGC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=3732715;WS=3732697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	3732782	rs6703035	T	C	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=5;PP=687;SC=CGGGGATGCTTTTTTGAATAA;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=3732790;WS=3732772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	3743109	rs2275834	A	G	2810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=9;PP=1645;SC=AAAAGGTAGCATGTTTTCCAT;SOR=3.360;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=56;TCR=9;TR=65;WE=3743117;WS=3743099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	3743132	rs4648344	T	C	3570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=6;PP=2404;SC=AGCTGGGAGATGGCTGAGGTG;SOR=4.664;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=80;TCR=6;TR=86;WE=3743140;WS=3743122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	3743319	rs6663840	G	A	6574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=141;PP=2965;SC=CTAAGACACAGAAACAGTGAG;SOR=1.987;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=58;TCR=141;TR=199;WE=3743327;WS=3743309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr1	3743433	rs5772126	T	TG	1402.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=34;PP=1484;SC=TTCTACTGGCTGGCAAGGTGG;SOR=4.565;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=34;WE=3743441;WS=3743423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	3745787	rs2275832	T	C	2672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=20;PP=2169;ReadPosRankSum=-1.217;SC=CAAAATACATTTCAGCTAAAA;SOR=0.709;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=83;TCF=63;TCR=20;TR=80;WE=3745795;WS=3745777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,83:0.98:85
chr1	3746589	rs2275826	C	G	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=19;PP=730;SC=TCTTGTTACTCATTCTTAAAA;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=3746597;WS=3746579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	3747603	rs6413779	T	C	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=288;SC=ACGCGAGGTCTGCTTACCTTC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=3747611;WS=3747593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	3751728	rs34966926	G	GT	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=307;ReadPosRankSum=-0.870;SC=TGAAGGCTTTGTTTTTTTTTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=16;WE=3751736;WS=3751718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr1	3753013	rs12746541	G	C	376.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5380;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.183;NF=14;NR=1;PP=334;ReadPosRankSum=-0.960;SC=ATATAGACTAGCCTCCCCTCT;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=15;WE=3753021;WS=3753003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,15:0.88:17
chr1	3755675	rs1891941	T	C	7596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=139;PP=2965;SC=TCCCAAGGCGTTCACCAACCT;SOR=1.188;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=229;TCF=90;TCR=139;TR=229;WE=3755683;WS=3755665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr1	3759784	rs10797347	A	G	1156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=28;PP=1093;SC=TGGCAAGGGAACCACTGTCCC;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=37;WE=3759792;WS=3759774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	3761465	rs72848418	T	A	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=9;PP=798;SC=GGAGCAGGACTCTTACCTGGC;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=3761473;WS=3761455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	3761650	rs2275821	A	G	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=12;PP=434;SC=GCAAGGTTCAATGATCCTCAT;SOR=2.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=3761658;WS=3761640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	3769033	rs3819006	AA	TT	3828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=60;PP=1971;SC=GGAATTCACTAACACATGGAC;SOR=2.503;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=15;TCR=61;TR=75;WE=3769042;WS=3769023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	3774130	rs34891610	A	G	2434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.09;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	3774138	rs12723005	T	C	2495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.03;SOR=1.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	3774296	rs12722891	A	G	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=17;PP=472;SC=CCGCTGGGCTAGGCGGGGACG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=3774304;WS=3774286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	3774312	rs12726906	T	C	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=15;PP=401;SC=GGACGGCCCGTCGGGGAGGCG;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=3774320;WS=3774302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	3775454	rs4376673	C	G	1349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=34;PP=1125;SC=TGGCACTCTCCGAGGTCCTGG;SOR=3.365;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=40;WE=3775462;WS=3775444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	3786146	rs35969031	C	G	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=495;SC=ACCAGGCTCACCGACGTTCCT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=3786154;WS=3786136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	3786245	rs12738235	G	A	1932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=21;PP=1542;ReadPosRankSum=-0.702;SC=ATGTGCCAGAGGCTCCGGTCC;SOR=0.585;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=62;WE=3786253;WS=3786235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr1	3786410	rs10909811	G	A	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=714;ReadPosRankSum=-0.807;SC=GGGGCGAGGCGGGTGGGGACC;SOR=1.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=27;WE=3786418;WS=3786400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr1	3807593	rs4274008	G	C	3224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=59;PP=2604;SC=GGACGTTCGCGTGTCTGTGGC;SOR=1.167;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=35;TCR=59;TR=94;WE=3807601;WS=3807583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	4772717	rs242056	G	A	3024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=65;PP=2372;SC=CAGCAACAACGGGGAAGTCAC;SOR=2.204;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=26;TCR=65;TR=91;WE=4772725;WS=4772707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	4834606	rs389959	T	C	1790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=52;PP=1432;SC=AGACGCCGTGTGTCTGTTTCA;SOR=2.566;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=67;TCF=15;TCR=52;TR=66;WE=4834614;WS=4834596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	4847845	rs4654460	G	A	4204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=71;PP=2965;SC=CTTGGCCCACGGGGCACGGGC;SOR=0.966;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=59;TCR=71;TR=130;WE=4847853;WS=4847835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	5623965	rs9439613	C	T	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=1;PP=656;SC=TATGTGGCTCCAGCCCCAGGT;SOR=4.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=5623973;WS=5623955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	5922687	rs139449567	G	A	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=1;PP=368;SC=GACTGCTGCCGTCTCAGAGCC;SOR=4.174;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=15;WE=5922695;WS=5922677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	5937168	rs3747992	G	A	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=0;PP=619;SC=CGCTCGTCCCGCGCCGGCCCA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=5937176;WS=5937158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	5937391	rs3747989	C	T	2004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=45;PP=1660;SC=GTCAGGTAGACGTGCAGTGTC;SOR=2.231;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=15;TCR=45;TR=60;WE=5937399;WS=5937381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	5937413	rs3747988	A	C	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=32;PP=1010;SC=GCCTTCCAGGAGCAGACACCA;SOR=2.059;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=44;WE=5937421;WS=5937403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	5939544	rs11121915	T	G	2350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=22;PP=1947;SC=CAACATAGGGTACTTCAACTT;SOR=1.949;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=54;TCR=22;TR=76;WE=5939552;WS=5939534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	5948677	rs2282281	G	A	3687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=82;NR=33;PP=2930;SC=TCTCCTTTAGGGAACAGCCAA;SOR=2.001;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=82;TCR=33;TR=115;WE=5948685;WS=5948667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	5964991	rs3737234	T	C	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=29;PP=664;SC=GAGGCTGCCGTGGTCACCAAT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=5964999;WS=5964981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	6027167	rs875574	C	A	220.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=150;SC=TCCCTCAGGGCTGGTGTGTTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=6027175;WS=6027157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	6027252	rs875573	A	G	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=4;SC=TTAGCTAAGCAGATAGCAGTT;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=6027260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	6029086	rs34702999	CA	C	326.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;QD=19.22;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	6038583	rs4908639	G	C	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=18;PP=574;SC=ATATCAGCACGCTGGTTTCCT;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=6038591;WS=6038573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	6100458	rs12566866	G	A	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=9;PP=708;SC=GGGGCTCCCCGATGCCCTGAA;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=26;WE=6100466;WS=6100448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	6145365	rs2294936	A	G	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=499;SC=GAACTATCCCAGGGTCAGCCT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=6145373;WS=6145355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	6147407	rs4908763	C	T	1883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=4;PP=1506;SC=TTTCATGCCCCAGGCTCCTGG;SOR=4.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=51;TCR=4;TR=55;WE=6147415;WS=6147397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	6154417	rs2294932	C	T	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=5;PP=525;SC=GGCCCTGAGCCCTGGCTGCCC;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=6154425;WS=6154407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	6155332	rs1555144	T	C	282.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=236;SC=CCCGGCAGCCTCCCGCCTGCT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=6155340;WS=6155322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	6157434	rs2311802	C	T	3830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=52;PP=2965;SC=GTGAGAGGCCCTGCTGGGCAG;SOR=0.997;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=65;TCR=52;TR=117;WE=6157442;WS=6157424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	6158562	rs2229002	A	G	2663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=38;PP=1994;SC=CGAAACTGTCATCTTCCATTA;SOR=1.167;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=56;TCR=38;TR=94;WE=6158570;WS=6158552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	6162054	rs6696489	T	C	1476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=43;PP=1367;SC=CTGGCGCGCCTTGCACCCAGC;SOR=5.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=45;WE=6162062;WS=6162044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	6170353	rs2281303	C	T	1481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=8;PP=1079;SC=CCCAGGTACACGGGGAGGGGT;SOR=3.126;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=48;WE=6170361;WS=6170343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	6170424	rs78789357	CG	C	2535.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=33;PP=2202;SC=CTCCCTGCCCCGTGCAGCCCT;SOR=0.854;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=51;WE=6170432;WS=6170414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	6172875	rs4908515	G	A	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=523;SC=CCAAGGGGACGGCGCCTGGGA;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=6172883;WS=6172865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	6173649	rs2785580	A	G	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=442;SC=TGGAACTTGGAGCTGTGTCTC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=6173657;WS=6173639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	6184092	rs2843493	A	G	1981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=19;PP=1489;SC=ACCTCGCCCGACTTCTTCCCC;SOR=1.911;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=64;WE=6184100;WS=6184082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	6184286	rs2273040	A	G	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=349;SC=GGTAGCTGCTACCTCCGCCCA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=6184294;WS=6184276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	6184728	.	T	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.68;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr1	6186961	rs2746060	A	G	281.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=232;SC=TGATCACCCCAGCCCTAGCTA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=6186969;WS=6186951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	6239937	rs70981314	C	CG	999.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=0;PP=1108;SC=GCCCGCGCTCCGCCCTGGGCC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=26;WE=6239945;WS=6239927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	6272137	rs709208	A	G	1548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=30;NR=21;PP=1269;SC=GATCTGCCGGAGGGGGGAGAT;SOR=1.051;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=54;TCF=31;TCR=23;TR=51;WE=6272145;WS=6272127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	6305292	rs61760836	C	A	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=6;PP=331;SC=CCCCCTGGTGCCCGAGAGCGC;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=16;WE=6305311;WS=6305282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	6305303	rs61760837	C	A	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=6;PP=486;SC=CCGAGAGCGCCGCCGGCAGCA;SOR=1.708;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=6305311;WS=6305282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	6309319	rs1883608	C	G	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.89;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	6313938	rs12735670	C	T	2348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=45;PP=1951;SC=GAAGGCGCGGCGGTCGGCCTG;SOR=1.091;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=78;WE=6313946;WS=6313928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	6314349	rs6696630	A	G	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=19;PP=622;SC=CCAGTGTGGCAGGGCCTTGTT;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=6314357;WS=6314339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	6314479	rs12740426	C	T	597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=2;PP=504;SC=ACAGCAGCCCCTCCTGAGCCT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=6314487;WS=6314469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	6314822	rs11590458	T	C	2715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=51;PP=2054;SC=TGGCCGCGAGTGTACACAGCA;SOR=1.038;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=35;TCR=51;TR=86;WE=6314830;WS=6314812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	6453520	rs76483502	C	CG	326.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=9;PP=359;SC=GCGCCGGGGGCAATCGAACGC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=6453528;WS=6453510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	6530965	rs111312565	C	CG	1571.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=32;PP=1815;SC=GGAGTGGGGGCGGGCTCAGGG;SOR=2.352;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=42;WE=6530973;WS=6530955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	6579607	rs1556035	C	T	1236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=34;PP=1037;SC=CTGCCTGGACCTCCAGCCACA;SOR=4.351;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=36;WE=6579615;WS=6579597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	6585804	rs13513	C	T	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=508;SC=AACACTGTTGCTAATAAGGGC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=6585812;WS=6585794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	6586070	rs7548042	C	T	3207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.856;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=68;PP=2459;ReadPosRankSum=-1.340;SC=CACGCTGAAACGGAAACACAG;SOR=1.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=101;TCF=33;TCR=68;TR=100;WE=6586078;WS=6586060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,103:0.99:104
chr1	6591937	rs932112	T	C	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=252;SC=GAGCGAGGAGTTATGTAGTGG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=6591945;WS=6591927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	6601773	rs3761927	T	C	186.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=151;SC=GACCATGAGTTTGGTAGGCGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=6601781;WS=6601771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	6609559	rs11122091	C	A	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=564;SC=AAGACAACATCCTACATAGTC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=6609567;WS=6609549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	6609851	rs10864622	A	G	2522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=58;PP=1924;SC=AACTATAAACATTAGGAGAGT;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=19;TCR=58;TR=77;WE=6609859;WS=6609841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	6609896	rs11579888	G	A	1398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=40;PP=1119;SC=TCAGGGGGCCGTACTACATAC;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=41;WE=6609904;WS=6609886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	6610366	rs2063805	T	C	209.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=1;PP=111;SC=GCTGGGATTATAGGCGTGAGC;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=6610374;WS=6610363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	6610382	rs2063806	C	T	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=259;SC=TGAGCCACCGCGCCTGGCCCT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=6610390;WS=6610372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	6614391	rs6693391	A	C	822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=5;PP=577;SC=TCCACGCCGGACGCCTGGGCT;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=6614399;WS=6614381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	6614415	rs6693400	A	G	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=6;PP=506;SC=AGTAACCGCCACCGTAGGCGC;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=6614423;WS=6614405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	6614535	rs4908923	G	A	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=14;PP=452;SC=CAGGAACCCCGCTTTAGCAGC;SOR=2.200;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=18;WE=6614543;WS=6614525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	6614653	rs4908924	C	G	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=139;SC=GAGGGGCCTCCGAGCCGCCGG;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=6614661;WS=6614643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	6615690	rs925745	A	G	972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.22;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	6615695	rs925744	C	T	972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.32;SOR=6.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	6635231	rs10864628	A	G	2883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=21;PP=2331;SC=GGCAGACAAGAAGGCCCCTAG;SOR=2.093;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=82;TCF=61;TCR=21;TR=81;WE=6635239;WS=6635221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	6645867	rs6682920	G	A	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=347;SC=TTAACCAGCCGGTGTCACCTG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=6645875;WS=6645857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	6645903	rs6697222	A	T	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=572;SC=CTTAGAAGGGACCCAGAGGGG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=6645911;WS=6645893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	6646959	rs3833475	GCCTGCCTTC	G	4481.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=48;PP=2986;SC=CTGTCAGGGAGCCTGCCTTCC;SOR=1.022;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=95;TCF=27;TCR=68;TR=69;WE=6646975;WS=6646949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	6659505	rs2232460	G	A	1753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=42;PP=1389;SC=GGGAGCCATCGGACCCACCTG;SOR=2.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=54;WE=6659513;WS=6659495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	6662913	rs6674407	G	A	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.65;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	6677064	rs10779795	A	G	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=11;PP=368;SC=GTCTGGCAGAAATCTGTTTCT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=6677072;WS=6677054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	6681744	rs3747994	C	T	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=31;PP=874;SC=GAAGCGACCGCGGGCTTTTTT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=6681752;WS=6681734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	6685442	rs12746591	A	G	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=2;PP=51;SC=CGGGAGGCCCAAAGGCGTGCG;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=6685450;WS=6685432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	6690140	rs742394	A	G	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=281;SC=CACTCTGACCATGATTTGAGG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=6690148;WS=6690136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	6693097	rs3174820	A	G	1065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=29;PP=897;SC=AAAGGGCACCAGGGACTCCAG;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=33;WE=6693105;WS=6693087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	6694207	rs12727844	A	G	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=20;PP=560;SC=TGAACACACAATACACGGAAG;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=6694215;WS=6694197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	6694574	rs6804	G	A	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=6;PP=682;SC=GGGGCCCCCCGCGCCAGCTGT;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=6694582;WS=6694564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	6695802	rs6577583	A	G	3006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=75;PP=2229;ReadPosRankSum=0.584;SC=GAAGGTGGCCATTCCCATGCA;SOR=1.479;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=96;TCF=19;TCR=77;TR=94;WE=6695810;WS=6695792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
chr1	6704635	rs200458	A	G	2912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=49;PP=2423;SC=TGAGAGAAACACCCTGTGGAA;SOR=0.713;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=51;TCR=49;TR=100;WE=6704643;WS=6704625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	6705944	rs12137794	C	T	3823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=53;PP=2849;SC=AGGTAGCCCACGGTGTTCTTG;SOR=0.848;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=61;TCR=53;TR=114;WE=6705952;WS=6705934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	6711146	rs12145525	T	C	1816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=1309;ReadPosRankSum=1.765;SC=GAGTGTGACATGGCAGCAGCA;SOR=0.790;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=33;TCR=30;TR=61;WE=6711154;WS=6711136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,63:0.97:65
chr1	6845603	.	G	C	732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=11;PP=507;SC=GTGGCGCGCGGAGGGGAAATG;SOR=0.776;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=23;WE=6845611;WS=6845593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	6866978	rs660880	G	A	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=0;PP=594;SC=GTGAACATTGGTTATTGTTAT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=6866986;WS=6866968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	7289777	rs4243824	G	A	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=19;PP=950;SC=CACAGAGGGCGGGGGTTGGGC;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=23;TCR=19;TR=42;WE=7289785;WS=7289767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	7527996	rs1201529	T	C	970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=31;PP=765;SC=CTTCTGTCTCTGGTGCTCGGG;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=7528004;WS=7527986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	7723588	rs3737906	C	T	4305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=67;PP=2965;SC=AGAAGAGGAACGGCAAGGTGG;SOR=0.753;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=62;TCR=67;TR=129;WE=7723596;WS=7723578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr1	7723957	rs12128526	G	A	6468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=123;NR=66;PP=2965;SC=CGGGCAGCTCGGAGAGCCTGT;SOR=1.633;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=189;TCF=123;TCR=66;TR=189;WE=7723965;WS=7723947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr1	7725284	rs4908671	C	A	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=13;PP=507;SC=CTGCCACCACCTGTCACCTCC;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=20;WE=7725292;WS=7725274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	7792411	rs2301488	C	T	205.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=166;SC=AAGTTACGGACGGCATTTGGA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=7792419;WS=7792401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	7796641	rs2071985	A	G	402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=305;SC=AGCCTCGCACATCCTCGCTCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=7796649;WS=7796631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	7797734	rs1417986	T	A	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=31;PP=855;SC=TACATTTCAGTTTTTTTGTTA;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=7797742;WS=7797724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	7807897	rs12133253	A	G	3937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=68;PP=2965;SC=AGGCCACTGAAGATCCTGGTT;SOR=0.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=53;TCR=68;TR=121;WE=7807905;WS=7807887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	7807966	rs34083763	GT	G	968.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.93;MQRankSum=0.079;QD=20.18;SOR=3.306;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr1	7809728	rs60799863	C	CT	710.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=0;PP=450;ReadPosRankSum=-0.962;SC=GCCAGGTTGCCTTTTTTTTTT;SOR=2.780;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=31;WE=7809736;WS=7809718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,34:0.81:42
chr1	7811014	rs1573753	G	A	1370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=7;PP=1076;SC=AGAAGGGCAAGATATTTTGAT;SOR=3.056;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=40;WE=7811022;WS=7811004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	7811215	rs10779689	A	G	3101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=55;PP=2609;SC=GAGCCCGTGCAGCCCCTGTTG;SOR=0.813;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=47;TCR=55;TR=102;WE=7811223;WS=7811205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	7812398	rs9919223	A	G	185.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=146;SC=CATCTTTAACATATGCTGTTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=7812406;WS=7812388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	7838113	rs697675	A	C	2318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=2;PP=1812;SC=ATATTATATAATACTCTTCAA;SOR=5.699;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=66;TCF=64;TCR=2;TR=66;WE=7838121;WS=7838103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	7845695	rs228729	T	C	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=32;PP=1029;SC=CCAGGACTCATACAAGCAGCC;SOR=5.610;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=34;WE=7845703;WS=7845685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	7847362	rs35115980	C	CT	268.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=2;PP=277;SC=TTTAGTATATCTTTTTTAATC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=7847370;WS=7847352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	7847614	rs697685	G	A	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=16;PP=447;SC=TAAAGCTAGAGAGGAAAGTAT;SOR=3.816;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=7847622;WS=7847604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	7861304	rs707465	T	C	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=283;SC=TAAATATAAATGTGAAGAAGA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=7861312;WS=7861294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	7869915	rs228668	G	C	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=6;PP=498;SC=CATTTGAACAGCCAGCAATTC;SOR=1.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=7869923;WS=7869905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	7870048	rs228669	T	C	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=11;PP=558;SC=GTGAGGCCAGTGGGCACCGTG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=22;WE=7870056;WS=7870038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	7870144	rs228670	A	C	1266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=21;PP=1004;SC=CTCGGTTCTGAATGTGGTGAC;SOR=0.741;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=20;TCR=21;TR=41;WE=7870152;WS=7870134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	7879627	rs10462018	C	T	171.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=136;SC=CTAACACATACGCTGAACATT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=7879635;WS=7879617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	7887248	rs2859387	G	A	2367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=16;PP=1971;SC=AGAAGCTGCCGGAGCCGCCAG;SOR=2.537;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=56;TCR=16;TR=72;WE=7887256;WS=7887238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	7887493	rs228696	T	C	7931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=154;NR=115;PP=2965;SC=CTGCATGGGCTGCCCTTGTCC;SOR=1.027;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=269;TCF=154;TCR=115;TR=269;WE=7887501;WS=7887483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr1	7889804	rs228701	C	G	1224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=1;PP=959;SC=GTAACTGAAACTACAGAAAGC;SOR=4.863;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=7889812;WS=7889794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	7890264	rs1773135	A	G	3537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=86;PP=2815;SC=CCAATGCCAGACATTCACTAT;SOR=3.432;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=15;TCR=86;TR=101;WE=7890272;WS=7890254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	7906476	rs172932	G	T	2863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=28;PP=2247;SC=TAGGGTAAACGCTCTGAGACC;SOR=1.688;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=59;TCR=28;TR=87;WE=7906484;WS=7906466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	7907007	rs697694	G	A	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=483;SC=CAGAAACCAAGGAGCATCAGA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=7907015;WS=7906997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	7907984	rs4908485	A	G	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=34;PP=979;SC=AAAAAAACAGATAAGTTACCA;SOR=4.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=36;WE=7907992;WS=7907974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	7913029	rs34305100	A	G	2865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=41;PP=2180;SC=TAAGAATCCTATGAAAAGCAA;SOR=0.852;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=48;TCR=41;TR=89;WE=7913037;WS=7913019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	7913445	rs13306061	C	T	2150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=32;PP=1679;SC=TTTATGAGTCCGAGCAGAAGT;SOR=0.754;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=31;TCR=32;TR=63;WE=7913453;WS=7913435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	7998963	rs226476	T	G	2011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=50;PP=1591;SC=AAGTTTACAATAAAATAAGAT;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=12;TCR=50;TR=62;WE=7998971;WS=7998953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	8022772	rs144768319	CAG	C	472.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=496;SC=TGGGGTATCTCAGGGTTGCAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=8022781;WS=8022762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	8029494	rs2641116	T	G	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=33;PP=1113;SC=TATACCTCAATAAAGCTGGGG;SOR=2.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=41;WE=8029502;WS=8029484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	8029509	rs2640906	GG	AA	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;JOINED;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=28;PP=1721;SC=CTGGGGGGGGGGAAAAACTAA;SOR=3.912;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=31;WE=8029518;WS=8029499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	8029644	rs35540656	CTT	C	100	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=49;SC=TTAACTCAAACTTTTTTTTTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=8029653;WS=8029634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	8384268	rs6702047	T	C	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=9;PP=815;SC=TTTCGGGGGATGGTGTTTGAC;SOR=2.419;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=38;WE=8384276;WS=8384258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	8390246	rs12565834	T	C	2320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.751;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=9;PP=1887;ReadPosRankSum=-0.892;SC=AGAAGGGAACTCAAACCCTGT;SOR=3.780;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=74;TCF=64;TCR=10;TR=73;WE=8390254;WS=8390236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,74:0.99:75
chr1	8390888	rs2289731	G	A	1695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=24;PP=1356;SC=CCTCTAAGCCGAGGTCATCAG;SOR=0.853;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=26;TCR=24;TR=50;WE=8390896;WS=8390878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	8395441	rs2305016	T	C	3734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.97;NF=104;NR=11;PP=2965;SC=GAGCAGGGTCTGCGCTGTGTG;SOR=4.174;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=105;TCR=11;TR=115;WE=8395449;WS=8395431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr1	8415235	rs1889854	C	T	2099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=48;PP=1573;SC=CAGGCAGTCACGCAGGCTGGA;SOR=2.483;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=15;TCR=48;TR=63;WE=8415243;WS=8415225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	8415290	rs1889853	C	A	1208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=31;PP=1020;SC=CCCAAGCCCGCAGCCTCCTGT;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=8415298;WS=8415280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	8418644	rs11121172	C	A	3562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.53;SOR=0.908;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	8418650	rs1058766	T	C	3565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.48;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	8421203	rs13596	T	C	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=21;PP=880;SC=TGGGAGCCTGTGGCTGGTTAG;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=38;WE=8421211;WS=8421193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	8422676	rs2252865	T	C	1800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=13;PP=1497;SC=TGATCACGAATACCAGCAAAC;SOR=2.507;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=46;TCR=13;TR=59;WE=8422684;WS=8422666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	8424985	.	A	G	160	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=6;HapScore=2;MGOF=31;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=6;PP=160;QD=32.4618687579;SC=GGGAGGGGGGAACACCTGTGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=8424993;WS=8424975;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr1	8616404	rs12122737	C	A	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=2;PP=743;ReadPosRankSum=0.852;SC=CGGACACTGGCATGTTCACTG;SOR=2.448;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=27;WE=8616412;WS=8616394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr1	8926752	rs2781065	T	C	151.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=152;SC=GAGACAGGGTTTCACTATACT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=8926760;WS=8926742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	8928125	rs2071412	G	T	1371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=32;PP=1088;SC=TTCTACGAGGGAGAGGGGAGA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=46;WE=8928133;WS=8928115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	8930369	rs2781060	T	C	302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=248;SC=ATGTCATGCATGGATTGTTCT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=8930377;WS=8930359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	8930385	rs2765511	G	A	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=3;PP=404;SC=GTTCTCGTGCGTGACAGGGAA;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=8930393;WS=8930375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	8935149	rs2038904	A	G	729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=21;PP=590;SC=GAAAGCAGTGAGAATTCTCCT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=8935157;WS=8935139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	9063602	rs4908804	G	C	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=39;PP=989;SC=GAGAAAGACAGGAGGGGGCAG;SOR=4.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=42;WE=9063610;WS=9063592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	9063646	rs4908805	T	C	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=28;PP=839;SC=GCTGAGCACGTTGGCTCATGC;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=9063654;WS=9063636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	9073801	rs7537425	C	T	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=19;PP=658;SC=GTTGGGGACCCTGGGACAGGA;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=9073809;WS=9073791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	9074861	rs12402973	C	T	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=29;PP=1057;SC=GCGCTCGGCCCGGGCCTCCGC;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=40;WE=9074869;WS=9074851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	9074932	rs1556757	G	A	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=12;PP=363;SC=TCAGAGCTGCGGAAAGCAGAA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=9074940;WS=9074922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	9075369	rs12410702	G	C	280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=9;PP=237;SC=CACTGTGCTCGGAAGGTCACG;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=11;WE=9075377;WS=9075359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	9084924	rs2027222	T	C	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=4;PP=1158;SC=GGCAAGATGGTGCCTCCTACA;SOR=4.317;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=40;TCR=4;TR=44;WE=9084932;WS=9084914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	9098742	rs11121306	G	A	1261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=1078;ReadPosRankSum=-0.847;SC=CAGGACACACGGTCCCCAGAT;SOR=0.627;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=42;WE=9098750;WS=9098732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr1	9165868	rs1705303	A	G	275.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=10;PP=233;SC=GGTGGAGCCCAGATCCTTCTC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=9165876;WS=9165858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	9306849	rs2310925	T	C	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=0;PP=853;SC=GGAGGTCACTTGCAAGTTTTT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=9306857;WS=9306839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	9307033	rs7524046	G	A	4275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=67;PP=2965;SC=AGGCTGTGGCGCAGATCCTGC;SOR=0.707;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=68;TCR=68;TR=135;WE=9307041;WS=9307023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr1	9307138	rs11121350	T	C	3227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=74;PP=2280;SC=CCGTGGATGCTGAAGGTGTGT;SOR=1.672;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=33;TCR=74;TR=107;WE=9307146;WS=9307128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr1	9307230	rs12032814	T	A	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=799;SC=CAGAGGGAGGTTTTCTGTGGG;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=9307238;WS=9307220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	9323910	rs6688832	G	A	5436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=107;NR=63;PP=2965;SC=AGCCCTGTGCGGGAGCGGGAC;SOR=1.302;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=107;TCR=63;TR=170;WE=9323918;WS=9323900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr1	9630445	.	GTC	G	3533.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=39;PP=2920;SC=TGAAGAGAGGGTCTCTCTCTC;SOR=0.859;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=73;TCF=21;TCR=52;TR=59;WE=9630454;WS=9630435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	9658465	rs9430181	T	G	2165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=9;PP=1882;SC=AGGCAGCTCATCCACCCCTGC;SOR=3.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=56;TCR=9;TR=65;WE=9658473;WS=9658455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	9658492	rs79894047	C	G	2863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=26;PP=2238;SC=CGAGCCTGTTCCCCCAACCCC;SOR=1.942;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=61;TCR=26;TR=87;WE=9658500;WS=9658482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	9658707	rs9430182	G	A	1334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=36;PP=1109;SC=TCCACAGGGCGGGGGTGGGGG;SOR=3.664;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=41;WE=9658715;WS=9658697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	9661061	rs9430184	A	G	1880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=1;PP=1613;SC=AGGATGTGTGAGAACATGGGT;SOR=6.593;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=54;TCF=53;TCR=1;TR=54;WE=9661069;WS=9661051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	9670483	rs4244632	T	A	2665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=15;PP=2143;SC=AATAGAAGAATGCCCCCAGAA;SOR=2.948;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=65;TCR=15;TR=80;WE=9670491;WS=9670473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	9670834	rs4926472	C	T	1154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=28;PP=904;SC=CCCCGGAAGCCGCCCCTGCAG;SOR=2.494;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=36;WE=9670842;WS=9670824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	9671257	rs70979767	CT	C	993.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.084;NF=1;NR=43;PP=533;ReadPosRankSum=0.578;SC=TGTAGATTTCCTTTTTTTTTT;SOR=3.664;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=74;TCF=6;TCR=68;TR=44;WE=9671267;WS=9671247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr1	9781412	rs12735071	C	G	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=22;PP=869;SC=GGCTTGCTCCCTCCTGCCTGG;SOR=1.483;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=34;WE=9781420;WS=9781402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	9782556	rs11589267	C	T	2783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=45;PP=2134;ReadPosRankSum=-0.805;SC=CAGAAACTCACGCTTCTCCTC;SOR=0.223;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=46;TCR=45;TR=89;WE=9782564;WS=9782546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,92:0.99:93
chr1	9792105	rs377673198	G	GA	584.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=404;SC=GAAAAGGACAGAAAAAAAAAT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=19;WE=9792113;WS=9792095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	9816620	rs6680090	T	C	3989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=61;PP=2965;SC=AGAATGAAGATGGAATACACT;SOR=0.851;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=70;TCR=62;TR=131;WE=9816628;WS=9816610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr1	10001235	rs137978085	TTTCG	T	1466.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=32;PP=1526;SC=CTTTTCTTTCTTTCGTTCGTT;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=32;WE=10001246;WS=10001225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	10027540	rs2890358	G	A	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=9;PP=289;SC=AAAGCAAAGCGAGAAATAAAT;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=10027548;WS=10027530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	10093770	rs187355549	C	T	2990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=36;PP=2158;SC=GGTTGGGGGACACCTTGAGGG;SOR=1.190;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=57;TCR=36;TR=93;WE=10093778;WS=10093760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	10335315	rs6685773	G	A	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=2;PP=482;SC=AAATTACCTTGTTGCGTGAGT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=10335323;WS=10335305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	10351146	.	G	C	2038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=33;PP=1514;SC=TTAGGAATCAGAGAAGATCAT;SOR=1.000;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=24;TCR=33;TR=57;WE=10351154;WS=10351136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	10357206	rs199617049	AT	A	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=2.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.31;ReadPosRankSum=-1.583;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr1	10502307	rs33919161	AT	A	539.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=330;SC=ATAAATACAGATTTTTTTTTT;SOR=4.804;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=17;WE=10502315;WS=10502297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	10511330	rs3838398	AT	A	113.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=111;SC=CTTTTAGATCATTTTTTTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=10511338;WS=10511320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	10511544	rs628462	C	T	1554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=36;PP=1190;SC=GAGAGGAAGCCCGGGAGGTGG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=53;WE=10511552;WS=10511534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	10511589	rs666103	T	C	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=29;PP=710;SC=CCCAGCAATCTGCGCGCCGGG;SOR=2.649;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=36;WE=10511597;WS=10511579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	10529194	rs2781233	T	C	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=2;PP=745;SC=ATGGATGCTGTACTGCATAGG;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=10529202;WS=10529184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	10555257	rs622623	C	T	2004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=13;PP=1634;SC=CGTTTGAGAACGGAACATCTT;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=49;TCR=13;TR=62;WE=10555265;WS=10555247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	10596388	rs2480779	A	G	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=32;PP=976;SC=AGCACGGCCTACAGGGGGACT;SOR=2.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=40;WE=10596396;WS=10596378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	10683242	rs2242289	C	T	2906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.92;SOR=1.464;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	10689924	rs2128414	C	T	2024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=40;PP=1526;SC=GCCATGTGGACGAGGAGGACT;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=27;TCR=40;TR=67;WE=10689932;WS=10689914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	10699066	rs184511437	G	C	141.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=66.18;NF=5;NR=0;PP=111;SC=CGCCAAGGCCGGGGTCCGCGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=10699074;WS=10699056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	10699140	rs201089181	CTCGTCG	C	1276.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=5;PP=1136;SC=TGCGCAGGTCCTCGTCGTCGT;SOR=2.694;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=20;WE=10699153;WS=10699130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	10708142	rs778228	A	G	1541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=24;PP=1266;SC=CCGAGGCCGGAAAGGCAGCCT;SOR=0.874;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=45;WE=10708150;WS=10708132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	10709309	rs284300	C	G	2828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=64;NR=26;PP=2337;SC=TGCGGGGGGACGATGGGTGGA;SOR=1.828;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=65;TCR=26;TR=90;WE=10709317;WS=10709299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	10709441	rs284299	C	T	2546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=62;PP=2056;SC=GGCTCCCCTCCGCTTCCGCCT;SOR=3.316;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=12;TCR=62;TR=74;WE=10709449;WS=10709431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	10710849	rs3215814	G	GC	3439.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=66;PP=2936;SC=AGCTCAGACGGCCGGGGCCTG;SOR=1.633;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=19;TCR=69;TR=84;WE=10710857;WS=10710839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	10713765	rs284294	T	C	4025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=64;PP=2896;SC=CCAGGGGGATTGAGCCAGGCA;SOR=0.752;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=134;TCF=70;TCR=64;TR=134;WE=10713773;WS=10713755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	10714294	rs56322140	G	C	2124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=50;PP=1732;SC=GACATTGGGAGCCTGTCATGA;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=15;TCR=50;TR=65;WE=10714302;WS=10714284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	10714330	rs35746667	A	AC	1456.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=33;PP=1610;SC=CCACCCTGCTACACCATGGCC;SOR=3.611;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=35;WE=10714338;WS=10714320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	10714402	rs56229092	C	T	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=12;PP=1135;SC=GGGCCTGAGCCGTCCCACGAG;SOR=1.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=39;WE=10714410;WS=10714392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	10719645	rs475980	A	G	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=0;PP=506;SC=GTGGATGTGTATAAGGTGTGA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=10719653;WS=10719635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	10725193	rs116460699	G	A	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=10;PP=962;SC=TGCCCCGTCCGAATCCTTCTC;SOR=2.242;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=38;WE=10725201;WS=10725183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	10725387	rs17035539	T	C	4731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=89;NR=64;PP=2965;SC=TCTCGATCACTGCCCGTCTCT;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=89;TCR=64;TR=153;WE=10725395;WS=10725377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr1	11036050	rs79323519	T	C	208.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=0;PP=142;SC=TGCCGCTTCCTTGTTGGGAGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=11036058;WS=11036040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	11042201	rs56848003	C	CAG	586.86	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5743;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.63;MQRankSum=0.516;NF=1;NR=12;PP=591;ReadPosRankSum=0.435;SC=GTGCAGGTCTCGGGTCACTCA;SOR=2.712;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=13;WE=11042209;WS=11042191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,15:0.94:16
chr1	11079077	rs2273348	A	G	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=19;PP=543;SC=CCCTTAGTGCATGCTGAATAT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=11079085;WS=11079067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	11080723	rs143130606	T	TG	1130.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=30;PP=1359;SC=CCCAGCACTTTGGAGGCCGAG;SOR=5.610;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=31;WE=11080731;WS=11080713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	11086097	rs3215616	A	AT	1931.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=33;PP=2035;SC=CTTATTTCTAATGCCACTTTT;SOR=1.791;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=45;WE=11086105;WS=11086087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	11087524	rs1782455	G	A	5132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=91;PP=2965;SC=TGTCCAGGGCGGATGCATCAT;SOR=1.314;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=58;TCR=92;TR=149;WE=11087532;WS=11087514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr1	11087835	rs1782454	T	C	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=549;SC=GGTGGGTGACTACCTATACAG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=11087843;WS=11087825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	11090916	rs12711521	C	A	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=9;PP=266;SC=CTGGGTAGATCATCAGGAGGG;SOR=1.329;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=11090924;WS=11090906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	11094665	rs11121684	G	A	145.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=0;PP=115;SC=TGAGGCAGGAGGATTGCTTAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=11094673;WS=11094660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	11094757	rs70977538	G	GA	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.728;NF=5;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=1.026;SC=CCCTGTCTCAGAAAAAAAAAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=5;WE=11094765;WS=11094747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr1	11095039	rs6695096	C	T	97.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=71;SC=GCTCTCACAGCAGTTCCTATT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=11095047;WS=11095029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	11104845	rs9430347	T	C	241.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=1;PP=167;SC=CAGAGACACGTGGCAGCAGGT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=11104853;WS=11104835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	11105106	rs2273345	C	T	1473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=15;PP=964;SC=GCTGCCCACGCCCCAGAGCAC;SOR=0.927;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=35;WE=11105114;WS=11105096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	11105122	rs2273344	C	T	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=14;PP=897;SC=AGCACTGGCCCGTCCCACAGT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=29;WE=11105130;WS=11105112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	11119899	rs7545802	T	C	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=42;PP=1100;SC=CCACCTGCAGTGACAGGGCCT;SOR=2.080;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=14;TCR=42;TR=56;WE=11119907;WS=11119889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	11126569	rs2791659	C	A	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=1;PP=455;SC=TCACCATAACCCCCGGAGCAC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=11126577;WS=11126559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	11126941	rs6701726	C	T	962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=28;PP=825;SC=GAGAACTCGGCGGCCCACCAG;SOR=5.421;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=29;WE=11126949;WS=11126931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	11128001	rs2791657	A	G	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=1;PP=598;SC=CCCACGGACCACACCACGCAG;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=11128009;WS=11127991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	11128329	rs2791656	A	G	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=14;PP=373;SC=GAACAGGAGCACCCCAAAGCA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=11128337;WS=11128319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	11128654	rs2791655	G	A	2489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=11;PP=2051;SC=GAGGAGGTCAGAAACAGGCGC;SOR=3.316;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=65;TCR=11;TR=76;WE=11128662;WS=11128644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	11129848	rs2791653	A	G	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=8;PP=250;SC=AGGGAACTCCACCGGCCTCAG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=11129856;WS=11129838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	11132217	rs1130683	G	A	1607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=26;PP=1202;SC=CCAGCTTCCAGCGGTTGCTGA;SOR=0.994;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=22;TCR=26;TR=48;WE=11132225;WS=11132207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	11134157	rs2748876	T	G	1304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=18;PP=1091;SC=TGCTGGTGCCTTGTCAGCGTC;SOR=1.105;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=24;TCR=18;TR=42;WE=11134165;WS=11134147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	11137778	rs2259886	C	T	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=172;SC=CAGTCTCCAGCGCTGACTGTA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=11137786;WS=11137768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	11140621	rs58972264	AC	A	68.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQRankSum=-0.450;QD=5.29;ReadPosRankSum=3.044;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr1	11140623	.	ACACAC	A	68.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.244;ClippingRankSum=-0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQRankSum=-0.450;QD=5.29;ReadPosRankSum=2.736;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr1	11141187	rs2258621	C	G	2510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=44;PP=1937;SC=GCAGCTGCACCGGCTGCCCGT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=43;TCR=44;TR=87;WE=11141195;WS=11141177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	11151779	rs1148482	A	G	255.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=211;SC=GCAGTGGCGCAATCTTGCCTC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=11151787;WS=11151769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	11187893	rs1770344	T	C	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=11;PP=421;SC=GAGAGAAGCATCAAGAATCAG;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=11187901;WS=11187883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	11205058	rs1057079	C	T	6242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=79;NR=109;PP=2965;SC=CTCCTGCCATCGCAGTTAATT;SOR=1.081;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=79;TCR=109;TR=188;WE=11205066;WS=11205048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr1	11288758	rs1064261	G	A	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=2;PP=974;SC=CTCGAATGACGTTAAGGAACG;SOR=4.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=35;WE=11288766;WS=11288748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	11292666	rs10864495	T	A	176.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=81;SC=GCACGGTGGCTCATGCCTGTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=11292674;WS=11292656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	11294474	rs718206	T	A	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=408;SC=AGCAACAGACTTTTCTGCAAC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=11294482;WS=11294464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	11298790	rs2024627	T	C	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=512;SC=TTCAACTAGATATTGATCAAT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=11298798;WS=11298780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	11298823	.	C	CT	62	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=27;MQ=59.55;NF=0;NR=4;PP=62;QD=16.5;SC=CGGAACTCTTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=11298831;WS=11298813;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,4:0.57:7
chr1	11301714	rs1135172	A	G	1548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=20;PP=1105;SC=AGACTGTGGCATCCACCTGCA;SOR=1.159;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=30;TCR=20;TR=50;WE=11301722;WS=11301704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	11317320	rs2092642	C	T	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=8;PP=201;SC=CGGCCAGGCACGGTGGCTCAA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=11317328;WS=11317310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	11318763	rs2076657	C	G	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=13;PP=359;SC=TAGTTCAAACCAAAGAAGACA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=11318771;WS=11318753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	11319587	rs4845988	A	G	214.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=175;SC=CTTGTCAGGCAGGGGATTCTA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=11319595;WS=11319577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	11574366	rs10864515	C	G	1653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=8;PP=1338;SC=GCTCCTGATACTCCTCTACAT;SOR=2.925;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=48;WE=11574374;WS=11574356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	11575331	rs41274530	A	G	1444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=3;PP=1191;SC=GGTTGGGGAGAAGAGACAGGA;SOR=4.615;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=41;WE=11575339;WS=11575321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	11579344	rs2072995	G	A	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=412;SC=GATCCTCAGGGCCCTGCCCCA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=11579352;WS=11579334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	11579504	rs2072993	G	C	2403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=31;PP=2059;SC=CCTGCCCAGGGCCCCATACCC;SOR=1.136;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=48;TCR=31;TR=79;WE=11579512;WS=11579494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	11584164	rs2076469	A	G	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=15;PP=648;SC=CTAGGGTTGAAGGCCCTGTAA;SOR=1.270;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=24;WE=11584172;WS=11584154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	11586585	rs2817636	C	G	294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=236;SC=GCTCTGTCCCCAACTCCGAGG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=11586593;WS=11586575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	11586677	rs2745260	T	C	942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=8;PP=720;SC=CCCCGAGTCATGTGTCTTGTC;SOR=2.165;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=32;WE=11586685;WS=11586667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	11589911	rs2076468	G	A	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=16;PP=973;SC=GCGGGAAGCCGGCGGTGCGGC;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=39;WE=11589919;WS=11589901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	11590919	rs2244397	C	A	2134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=18;PP=1626;SC=ACTGAGTCCCCGTCTCACTGA;SOR=1.946;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=46;TCR=18;TR=64;WE=11590927;WS=11590909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	11593793	rs113116961	T	TGCACACACGCAC	1050.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=3;PP=711;SC=CAGACACGCATGCACACACAC;SOR=3.056;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=16;WE=11593801;WS=11593783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	11594400	rs2235663	T	C	3286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=26;PP=2464;SC=TGGGCCACAGTCCCTGCCTGT;SOR=2.108;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=72;TCR=26;TR=98;WE=11594408;WS=11594390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr1	11594681	rs2817628	C	T	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=23;PP=716;SC=CGGCCTGAGTCACAATCTCCA;SOR=3.180;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=11594689;WS=11594671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	11596762	rs2235666	C	T	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=26;PP=774;SC=GGGCTCTGGACACTTGCACCT;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=11596770;WS=11596752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	11708736	rs1055547	T	C	2119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=27;PP=1564;SC=TGGGGGAGAGTGGAGGCAGGG;SOR=1.148;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=69;WE=11708744;WS=11708726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	11709051	rs56192923	A	AG	563.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.36;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	11709052	.	C	G	372	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=31;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=9;NR=5;PP=372;QD=29.0550866105;SC=GCCCAGCCCACCCCAGCCCAG;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=14;WE=11709060;WS=11709042;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	11709052	.	C	CCCAG	563.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.36;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	11709979	rs139935373	C	T	3609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=52;PP=2725;SC=CCCTTCCCACCTCCTCCACCC;SOR=0.856;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=112;TCF=60;TCR=52;TR=111;WE=11709987;WS=11709969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	11714368	rs2272983	T	G	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=28;PP=849;SC=GGTCCAGGCGTCGGCTACCTG;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=32;WE=11714376;WS=11714358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	11740329	rs151210857	AGGCGTGAGCCAC	A	2441.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=4;PP=2937;SC=CTAGGATTACAGGCGTGAGCC;SOR=3.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=34;WE=11740348;WS=11740319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	11782814	rs7414943	G	A	1396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=28;PP=1141;SC=TATGCTCCAGGAAAACTATTT;SOR=1.280;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=45;WE=11782822;WS=11782804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	11782885	.	CCT	C	205.86	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=66.93;MQRankSum=1.221;QD=22.87;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,8:0.89:9
chr1	11796168	rs146190997	CGGGCG	C	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.80;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	11805930	rs145175838	C	T	3618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=69;PP=2785;SC=GTGTCTCCTGCGGTCTCAGGG;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=39;TCR=69;TR=108;WE=11805938;WS=11805920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	11807426	rs12752700	C	T	1741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=18;PP=1385;SC=GGCCCTGAGACGCCGGAGCAG;SOR=1.823;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=54;WE=11807434;WS=11807416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	11808706	rs11121819	T	G	726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=24;PP=617;SC=CACCGCTCCCTTCTCTCCCTT;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=11808714;WS=11808696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	11824242	rs4845876	A	C	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=550;SC=GAGAGGAGCCACTGAGAGACC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=11824250;WS=11824232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	11824303	rs4845877	T	C	1250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=12;PP=995;SC=CAAGAGCAGCTAGGAGTACTG;SOR=1.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=39;WE=11824311;WS=11824293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	11824346	rs4845878	G	A	1897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=16;PP=1526;SC=AGAATGGGGTGGGGTTGAATG;SOR=2.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=42;TCR=16;TR=58;WE=11824354;WS=11824336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	11824556	rs4845879	A	G	1492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=40;PP=1212;SC=CTGGATGGGCAGTTACAGGAG;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=46;WE=11824564;WS=11824546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	11824575	rs10864536	T	C	1303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.46;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	11824578	rs11121825	C	T	1335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.06;SOR=5.353;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	11825851	rs10218813	G	C	1255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=10;PP=1045;SC=GAGGCCTGGAGAGCTTCGCCT;SOR=2.133;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=39;WE=11825859;WS=11825841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	11826630	rs6668699	C	T	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=15;PP=907;SC=CCAGGAACCCCCCGGTGCTGT;SOR=0.818;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=16;TCR=15;TR=31;WE=11826638;WS=11826620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	11827180	rs6540995	A	G	2199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=46;NR=21;PP=1778;SC=GGTAGGGGGTAGGAGGTGTTG;SOR=1.576;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=46;TCR=21;TR=67;WE=11827188;WS=11827170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	11827304	rs6540996	A	G	3296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=68;PP=2448;SC=TCACAGCCCCAGAGTCTGAGG;SOR=1.445;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=38;TCR=68;TR=106;WE=11827312;WS=11827294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	11827355	rs6540997	A	G	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=44;PP=1461;SC=CAGGGGTTGGAGTTGGGGGAC;SOR=3.300;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=7;TCR=44;TR=51;WE=11827363;WS=11827345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	11828238	rs4845880	G	A	1589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=21;PP=1220;SC=CAGCTGTTGCGAAAGTGCCTT;SOR=1.262;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=34;TCR=21;TR=55;WE=11828246;WS=11828228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	11828319	rs4845881	G	A	1862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=29;PP=1530;SC=CTGCTGGTCCGGAGCTTCCGA;SOR=0.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=26;TCR=29;TR=55;WE=11828327;WS=11828309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	11831615	rs6667720	C	T	1773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=30;PP=1345;SC=GATTGCTCAGCGGCTTCTGTC;SOR=0.831;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=27;TCR=30;TR=57;WE=11831623;WS=11831605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	11831756	rs6680385	A	G	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=428;SC=CCTGAGCTCCACACTGGGCAG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=11831764;WS=11831746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	11832100	rs11121827	T	A	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=5;PP=731;SC=TCCCATCTGCTTACTCTCTCT;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=31;WE=11832108;WS=11832090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	11832311	rs10779764	G	C	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=550;SC=GAGCTTGGCTGTGCAGGTAGG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=11832319;WS=11832301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	11836441	rs6699669	TG	CA	2094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=10;PP=2270;SC=AAGAGGGGCCTGAGGCAGCAG;SOR=1.981;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=39;WE=11836450;WS=11836431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	11836628	rs6699881	T	C	1013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=28;PP=834;SC=GGATGCCTGCTGGACACTGGC;SOR=2.432;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=36;WE=11836636;WS=11836618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	11836682	rs7538516	C	T	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=19;PP=685;SC=GCTTTTCCAGCGCCAGTGGGC;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=11836690;WS=11836672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	11838848	rs6697244	G	T	2699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=44;PP=2183;SC=CTGAGCAGCAGCACACTCCAA;SOR=0.843;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=38;TCR=44;TR=82;WE=11838856;WS=11838838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	11839966	rs4846043	G	A	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=4;PP=165;SC=GGCCTGTGGCGTCAGCGGCTG;SOR=0.892;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=11839974;WS=11839956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	11839998	rs4846044	T	C	96.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=3;PP=52;SC=GCTGGTGGAGTGGTGGGCCCA;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=11840006;WS=11839988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	11842144	rs10864542	C	G	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=4;PP=338;SC=GTGGCCTCCTCTGTTCCCACC;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=11842152;WS=11842134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	11845113	rs11587953	G	A	1318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=3;PP=991;SC=GGCTGGGCCCGGAAGGCCCCC;SOR=4.021;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=37;WE=11845121;WS=11845103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	11845169	rs11586659	T	G	2034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=16;PP=1537;SC=TCCTGGCCTTTATGGCCCTGG;SOR=2.231;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=62;WE=11845177;WS=11845159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	11847334	rs35134728	G	GGAA	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=140;SC=GGGAATGGGTGGAAGAGGCCG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=11847342;WS=11847324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	11847759	rs3737966	C	T	174.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=139;SC=TCTCTTTGGGCGGCAGGCAGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=11847767;WS=11847749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	11848879	rs2077360	A	G	1139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=28;PP=860;SC=TGCCACAGCCACGCACCGTGG;SOR=2.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=11848887;WS=11848869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	11849447	rs868014	A	G	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=16;PP=799;SC=GGAAGCCGCCAGAGCACCGCG;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=16;TCR=16;TR=32;WE=11849455;WS=11849437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	11851219	rs45529133	C	T	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=4;PP=834;SC=TCCCTCCCCACGGTTTTCCAG;SOR=3.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=11851227;WS=11851209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	11854457	rs4846051	G	A	4648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=54;PP=2965;SC=GGTAAAGAACGAAGACTTCAA;SOR=1.209;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=85;TCR=54;TR=139;WE=11854465;WS=11854447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr1	11854755	rs1994798	G	A	1913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=24;PP=1580;SC=GAACAAAGATGTATTTGCAAG;SOR=1.292;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=38;TCR=24;TR=62;WE=11854763;WS=11854745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	11867044	rs3737964	T	C	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=413;SC=CCCTCACCCCTGAAAGGTTTT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=11867052;WS=11867034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	11876020	rs141827185	A	AT	1771.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.250;NF=7;NR=42;PP=1213;ReadPosRankSum=0.933;SC=TTAACATGGCATTTTTTTTCT;SOR=1.358;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=64;TCF=7;TCR=57;TR=49;WE=11876028;WS=11876010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr1	11884555	rs198400	A	G	2094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=38;PP=1668;SC=CTCTTCGTGGAGAAGGAAGGC;SOR=1.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=25;TCR=38;TR=63;WE=11884563;WS=11884545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	11888384	rs198401	A	G	1379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=26;PP=1183;SC=ACTTCCAGGGACACATCTCAC;SOR=1.206;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=41;WE=11888392;WS=11888374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	11900035	rs198410	G	A	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=0;PP=895;SC=TTGGCCTCCAGTGTGTGAGCC;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=30;WE=11900043;WS=11900025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	11918927	rs35519114	T	TCTG	1644.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.9995;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.840;NF=4;NR=29;PP=1736;ReadPosRankSum=0.266;SC=TGCTGCTGCTTCTGCTGCTGC;SOR=1.329;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=66;TCF=6;TCR=60;TR=33;WE=11918935;WS=11918917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,40:0.95:42
chr1	11982544	rs2639453	T	C	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=5;PP=718;SC=AAAACACTTGTGCGCGCTCTC;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=11982552;WS=11982534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	12033113	rs3737961	A	G	1548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.02;SOR=7.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	12033120	rs3820190	G	C	1446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.21;SOR=6.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	12056440	rs2236056	C	T	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=484;SC=CGTTGTGACACGGCTGACCTC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=12056448;WS=12056430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	12062205	rs2236057	A	G	1672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=38;PP=1280;SC=CTGCCGAGACAAGGGTGCTCC;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=48;WE=12062213;WS=12062195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	12071680	rs1042842	A	G	423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=281;SC=CCTAAGTGCCATGTGGGCTCC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=12071688;WS=12071670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	12082926	rs2295283	A	G	1950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=49;PP=1560;ReadPosRankSum=-0.662;SC=TGCAGTTCCTAAGAGGAGCTG;SOR=2.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=6;TCR=50;TR=55;WE=12082934;WS=12082916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr1	12091210	rs946461	T	C	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=562;SC=AGGCCCTGCCTTGGTGGGGGC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=12091218;WS=12091200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	12144662	rs11569821	T	A	1165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.18;SOR=6.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	12144667	rs11569822	C	T	1092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.71;SOR=6.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	12175729	rs1763642	C	T	3694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=43;PP=2757;SC=CACCAACTCCCGTGCCCGCTG;SOR=1.159;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=63;TCR=43;TR=106;WE=12175737;WS=12175719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	12198635	rs6419481	T	C	255.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=6;PP=213;SC=TTCACCCCAATTGAAGTTTCT;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=12198643;WS=12198625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	12250888	rs5746014	T	C	1832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=8;PP=1373;ReadPosRankSum=-1.127;SC=TCTGAGGAATTGGAACTCCAC;SOR=1.519;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=57;TCF=49;TCR=8;TR=55;WE=12250896;WS=12250878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,58:0.97:60
chr1	12252378	.	G	T	236.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=192;SC=GGGTGGAGGTGCAGACAGAGC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=12252386;WS=12252368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	12327081	.	G	A	1919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=41;PP=1543;SC=ATGTACAACAGTTGGATAGTT;SOR=1.942;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=16;TCR=41;TR=57;WE=12327089;WS=12327071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	12401868	rs28551666	A	C	1968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=12;PP=1684;SC=GCCGGCAGCCATTTGTCCCCT;SOR=2.683;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=57;WE=12401876;WS=12401858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	12418700	rs10864552	T	C	1090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=35;PP=858;SC=AACCATTGGCTGATGACCTCA;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=38;WE=12418708;WS=12418690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	12470019	rs41279470	T	G	1678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=34;PP=1319;SC=GGGAGAAAGGTGAAGAAGCCA;SOR=1.445;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=53;TCF=18;TCR=35;TR=52;WE=12470027;WS=12470009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	12567232	rs7554257	A	G	1987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=20;PP=1421;SC=CTCAGCAGGAACTCATTTAGG;SOR=1.270;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=53;WE=12567240;WS=12567222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	12638964	rs2275875	T	C	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=25;PP=830;SC=CCAGCATACGTGGCAGGAAGG;SOR=1.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=35;WE=12638972;WS=12638954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	12639168	rs3128461	A	G	1945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=19;PP=1539;SC=AGTCTGATGTATCCTAGAGCT;SOR=1.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=62;WE=12639176;WS=12639158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	12776218	rs3000860	A	C	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=2;PP=287;SC=CAGCAGCCTGAGTGTTCTCAC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=12776226;WS=12776208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	12776344	rs3000859	A	T	1928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=13;PP=1469;SC=TGCTGTTGACATGGGTGAGTT;SOR=2.147;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=53;WE=12776352;WS=12776334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	12779560	rs3010876	T	C	2085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=31;PP=1619;SC=TAAAGTATGATCCCGATGTTG;SOR=0.787;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=31;TCR=31;TR=62;WE=12779568;WS=12779550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	12779618	rs3010877	T	C	1686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=41;PP=1410;SC=GCTGTACCAATCCAAGGCATC;SOR=3.171;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=8;TCR=41;TR=49;WE=12779626;WS=12779608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	12785093	rs4361998	T	G	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=400;SC=TTTCACAAAGTGAAGTGAATG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=12785101;WS=12785083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	12785494	rs7513079	G	T	4924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.659;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=130;PP=2965;ReadPosRankSum=0.759;SC=ATCTGCTACTGTTTTTTTCAA;SOR=1.690;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=64;TCR=132;TR=193;WE=12785502;WS=12785483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,181:0.99:183
chr1	12786070	rs3000930	A	G	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=114;SC=GCTAGGGAGGAGGTAGAGGTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=12786078;WS=12786060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	12820870	rs1132185	T	C	2420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=60;PP=2134;SC=CCTGCATCCTTTCCCACACTT;SOR=2.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=13;TCR=60;TR=73;WE=12820878;WS=12820860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	12835868	rs1812242	T	C	2386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=55;PP=1751;SC=AAGAATGGGATGCTGGATGAA;SOR=1.882;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=23;TCR=55;TR=78;WE=12835876;WS=12835858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	12837634	rs848578	T	A	1677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=24;PP=1347;SC=AGCCCAAGATTATTGTGTTCA;SOR=0.846;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=29;TCR=24;TR=53;WE=12837642;WS=12837624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	12837840	rs848577	G	C	120.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=4;PP=90;SC=CAATGTGAACGGGAAAGGAAA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=12837848;WS=12837830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	12854428	rs1769774	C	T	2223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=7;PP=2035;SC=CATGTCCTGGCCACGTCTGAT;SOR=4.174;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=70;TCR=7;TR=77;WE=12854436;WS=12854418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	12854530	rs1063776	C	G	3955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=83;PP=2965;SC=TAATGAACTCCAAGGACGGTT;SOR=0.988;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=59;TCR=83;TR=142;WE=12854552;WS=12854520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr1	12854544	rs1063778	T	C	3435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=86;PP=2909;SC=GACGGTTAGTTGCCAAATTCA;SOR=1.349;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=46;TCR=86;TR=132;WE=12854552;WS=12854520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	12888601	rs113914674	G	GC	763.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=19;PP=848;SC=AGCAGGCTCCGCCCGCAAGCT;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=21;WE=12888609;WS=12888591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
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chr1	12907284	rs149796618	TG	CC	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=6.668;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.15;MQRankSum=-6.434;QD=11.68;ReadPosRankSum=-1.664;SOR=0.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,32:0.33:98
chr1	12907316	rs112607517	T	C	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.962;HP=3;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-9.844;NF=22;NR=23;ReadPosRankSum=0.907;SC=TTCCTCAGCCTCTTTTTCATC;SOR=0.786;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=131;TCF=77;TCR=54;TR=45;WE=12907324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,38:0.29:129
chr1	12907350	rs2359486	CA	TG	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.370;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-9.822;NF=14;NR=21;PP=1304;ReadPosRankSum=1.241;SC=TCCAGCTGGTCATCCCCCTGA;SOR=1.378;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=112;TCF=57;TCR=55;TR=35;WE=12907359;WS=12907340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,32:0.29:110
chr1	12907370	rs2076063	A	T	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=19.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.44;MQRankSum=-7.913;QD=5.62;ReadPosRankSum=1.022;SOR=2.084;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,24:0.21:113
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chr1	12907385	rs150590256	G	A	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=43.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.86;MQRankSum=-6.555;QD=3.06;ReadPosRankSum=-0.313;SOR=5.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,16:0.14:113
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chr1	12907781	rs28441396	T	C	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=60.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.47;MQRankSum=-9.759;QD=7.67;ReadPosRankSum=-0.360;SOR=6.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,39:0.23:171
chr1	12907798	rs150096254	A	C	1799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=73.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.38;MQRankSum=-10.147;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.789;SOR=5.564;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,51:0.27:191
chr1	12907802	rs138087690	CC	TT	1787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=74.272;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.29;MQRankSum=-9.829;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.429;SOR=5.007;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,54:0.27:199
chr1	12907837	rs1736811	C	T	2523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=5.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=36.868;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.532;NF=86;NR=30;PP=2338;ReadPosRankSum=-1.985;SC=CGTACATCTCCGCTGCTGATC;SOR=2.147;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=258;TCF=158;TCR=100;TR=116;WE=12907845;WS=12907827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,103:0.42:245
chr1	12907885	rs848418	T	C	2628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=25.200;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.472;NF=44;NR=71;PP=1955;ReadPosRankSum=-0.850;SC=CTTTTGGCTCTGCAGCCAGGT;SOR=1.296;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=274;TCF=127;TCR=147;TR=115;WE=12907893;WS=12907875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,118:0.44:267
chr1	12907980	rs374398056	C	T	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=1.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.80;MQRankSum=0.233;QD=6.14;ReadPosRankSum=0.464;SOR=0.523;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,58:0.30:195
chr1	12908236	rs1736809	G	T	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.00;MQRankSum=-3.882;QD=10.58;ReadPosRankSum=-3.369;SOR=0.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr1	12908243	rs1736808	A	G	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=5.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.95;MQRankSum=-2.490;QD=9.77;ReadPosRankSum=0.732;SOR=0.045;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,15:0.31:49
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chr1	13183511	rs72864546	T	C	2159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=78.865;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.649;NF=25;NR=51;PP=1319;ReadPosRankSum=-0.523;SC=GTACATCCCATCATAATAATC;SOR=2.510;SbPval=0.02;Source=Platypus;TC=193;TCF=104;TCR=89;TR=76;WE=13183519;WS=13183501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,65:0.37:178
chr1	13183528	rs76937665	A	C	1940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=101.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.84;MQRankSum=-9.133;QD=11.69;ReadPosRankSum=-0.975;SOR=4.570;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,52:0.31:166
chr1	13183532	rs77505369	CC	TT	1715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=128.876;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.92;MQRankSum=-9.335;QD=10.79;ReadPosRankSum=-0.761;SOR=7.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,47:0.30:159
chr1	13183567	rs78160026	C	T	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=80.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.37;MQRankSum=-8.360;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.519;SOR=6.803;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,29:0.18:164
chr1	13183573	rs76669210	G	T	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=77.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.26;MQRankSum=-8.185;QD=4.60;ReadPosRankSum=-0.652;SOR=6.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,26:0.17:156
chr1	13183780	rs116484938	A	C	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.83;QD=28.40;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	13183973	rs3929664	G	A	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.05;QD=24.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	13910417	rs355025	C	T	5465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=77;PP=2965;SC=CTCCGGCCCCCCCACCGTCGC;SOR=0.731;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=158;TCF=80;TCR=78;TR=157;WE=13910425;WS=13910407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr1	13910741	rs150088145	CGGA	C	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=2;PP=70;SC=GGCTGAGCGCCGGAGGAGGAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=13910751;WS=13910731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	13940864	rs2486188	C	G	2750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=24;PP=2148;SC=TTCATTGGTGCAATCATCGTT;SOR=1.809;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=57;TCR=24;TR=81;WE=13940872;WS=13940854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	14109408	rs35153743	CT	C	209.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=1.113;QD=5.83;ReadPosRankSum=0.706;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr1	14143003	rs1046331	A	G	3642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=59;PP=2510;SC=TCAAAGCTCCAGCTGCAGCCC;SOR=0.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=61;TCR=59;TR=120;WE=14143011;WS=14142993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr1	14149505	rs2697970	C	A	592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=1;PP=448;SC=TCACTGTGAACATTCATCAAG;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=14149513;WS=14149495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr1	14149622	rs2697968	T	C	1614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=21;PP=1275;SC=GTGTGCTTACTGTTATTATTT;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=31;TCR=21;TR=52;WE=14149630;WS=14149612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
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chr1	14925400	.	A	C	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.231;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=9.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQRankSum=-5.199;QD=8.41;ReadPosRankSum=1.190;SOR=2.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,25:0.27:94
chr1	14925417	.	GGGT	G	1263.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=4.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQRankSum=-4.616;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.796;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,37:0.31:119
chr1	14925423	.	C	CA	1278.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=0.000;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=8.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQRankSum=-4.851;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.760;SOR=1.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,37:0.29:128
chr1	14925429	.	G	GGCCA	1566.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQRankSum=-4.437;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.872;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,45:0.33:138
chr1	14925441	.	C	CGT	1732.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=0.000;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=0.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQRankSum=-1.502;QD=10.76;ReadPosRankSum=0.333;SOR=0.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,51:0.32:161
chr1	14925611	.	C	T	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MMLQ=24;MQ=60.68;NF=5;NR=51;PP=2962;QD=20;SC=ACTGGCGGAACTGAGCGGCGG;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=159;TCF=21;TCR=138;TR=56;WE=14925627;WS=14925601;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:103,56:0.35:159
chr1	14925619	.	C	CGGA	2979	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MMLQ=23;MQ=60.72;NF=0;NR=43;PP=2979;QD=20;SC=AACTGAGCGGCGGCGGCGGCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=124;TCF=3;TCR=121;TR=43;WE=14925627;WS=14925601;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:81,43:0.35:124
chr1	15287168	rs41301991	C	T	2855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=30;PP=2026;SC=ACCCTGTGCCCTTCTCCCCTA;SOR=1.321;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=52;TCR=30;TR=82;WE=15287176;WS=15287158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	15427934	rs10927676	C	T	1027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=3;PP=831;SC=CCTCCCCCAACCCCATTGCTT;SOR=4.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=33;WE=15427942;WS=15427924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	15427982	rs502918	G	A	1735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=12;PP=1356;SC=CTGCCCGTCCGTCTGTTTCTG;SOR=2.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=43;TCR=12;TR=55;WE=15427990;WS=15427972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	15428358	rs477953	T	C	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=538;SC=GTCCACCCACTACCCGTCTAT;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=15428366;WS=15428348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	15439083	rs140963536	A	AAGGTCTTTTTTTTCTTCTCCCAGCGGC	1373.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.37;SOR=2.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	15490962	rs11582684	A	G	4268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=88;PP=2965;SC=AGAATCCTACAAAGGTGAAGT;SOR=1.276;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=54;TCR=88;TR=142;WE=15490970;WS=15490952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr1	15495110	rs78615461	A	G	2287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=43;PP=1777;SC=CGAAGGCCATAGAGTTCTTCA;SOR=1.148;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=28;TCR=43;TR=71;WE=15495118;WS=15495100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	15497727	rs6429722	T	C	1761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=29;PP=1302;SC=GCCTGGAAGATCGCTGTTTGA;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=28;TCR=29;TR=57;WE=15497735;WS=15497717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	15497844	rs10429935	T	A	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=24;PP=753;SC=TAGGAATTAGTTCTTATGCAT;SOR=2.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=15497852;WS=15497834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	15541537	rs3753314	C	T	1133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=2;PP=789;SC=GCCTTGTATACATTTATTTTC;SOR=4.294;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=32;WE=15541545;WS=15541527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	15654759	.	C	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.666;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=57.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQRankSum=-3.096;QD=1.59;ReadPosRankSum=-2.726;SOR=6.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,20:0.36:56
chr1	15668276	rs763821	G	A	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=6;PP=731;SC=CTTTACTGCAGGAAAAGCTGC;SOR=2.066;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=15668284;WS=15668266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	15668319	rs12126178	G	A	1179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=10;PP=977;SC=GAAGCTGAACGAGGAGAGGCT;SOR=2.012;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=37;WE=15668327;WS=15668309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	15671483	rs486089	G	A	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=381;SC=AGGGGAGTGCGGTGAGGAGTG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=15671491;WS=15671473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	15687059	rs4661330	A	G	2049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=21;PP=1546;ReadPosRankSum=-0.825;SC=CACGGGTTTGAAGAAGAGATC;SOR=0.784;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=44;TCR=21;TR=64;WE=15687067;WS=15687049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,68:0.99:69
chr1	15714809	rs4661625	G	C	43.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	15714831	.	C	T	333	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=13;NR=0;PP=333;QD=28.2900932729;SC=CTCCCTCCCTCCCCTCCCCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=15714839;WS=15714821;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	15769876	rs35149641	G	GC	1028.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=3;PP=1235;SC=TGGGGCCAGGGCCTCCTGCCC;SOR=3.841;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=29;WE=15769884;WS=15769866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	15783096	rs5772641	GA	G	3693.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=5.653;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.88;MQRankSum=-0.059;QD=25.13;ReadPosRankSum=1.650;SOR=2.020;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,146:0.99:147
chr1	15783117	rs5772642	C	CA	7245.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=57;PP=2967;SC=TATTTGGACACAGCTCTTTTT;SOR=1.683;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=168;TCF=107;TCR=61;TR=160;WE=15783125;WS=15783107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr1	15783222	rs2303195	C	T	4848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=115;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.862;SC=TCCAGGGCCACGCTTACAGAA;SOR=1.305;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=148;TCF=31;TCR=117;TR=146;WE=15783230;WS=15783212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,152:0.99:153
chr1	15788269	rs3737696	A	C	1614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=27;PP=1342;SC=TAACCACTATACTGGCTGAGA;SOR=0.770;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=25;TCR=27;TR=52;WE=15788277;WS=15788259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	15792426	rs2901964	C	G	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=335;SC=AAACCTAAGACGGGTCCATCA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=15792434;WS=15792422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	15792800	rs60125415	G	A	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=309;SC=GCTCACACCTGTAATCCCAGC;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=15792808;WS=15792790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	15793913	rs1042010	G	A	4840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=59;PP=2965;SC=ACTGTCAGGCGTCTGACGGCC;SOR=1.171;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=91;TCR=59;TR=150;WE=15793921;WS=15793903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr1	15802925	rs72643675	G	T	1883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=43;PP=1504;SC=CTGCTTCCTGGACTCAAGACC;SOR=1.727;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=19;TCR=43;TR=62;WE=15802933;WS=15802915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	15803016	rs145776598	G	A	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=2;NR=19;PP=550;SC=GTGAAGAAGCGAGGCCCAACA;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=15803024;WS=15803006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	15812432	rs6429745	A	G	1760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=11;PP=1368;SC=AAGCAGGGCCAGTTGCTGGTT;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=51;TCR=11;TR=62;WE=15812440;WS=15812422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	15813751	rs2011159	C	T	3120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=87;NR=9;PP=2664;SC=CCTCCCACTTCAACTCCCTAT;SOR=4.525;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=87;TCR=9;TR=96;WE=15813759;WS=15813741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	15813969	rs3737704	A	C	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=39;PP=1228;SC=CAAGGCACTGACCTGCTCACC;SOR=4.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=42;WE=15813977;WS=15813959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	15820576	rs2020900	T	A	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=17;PP=528;SC=CCATGCACGCTGGCTCGGGCG;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=15820584;WS=15820566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	15820618	rs2020898	A	G	271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=209;SC=CATACATCCAACAGGAGCAGC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=15820626;WS=15820608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	15833345	rs4646037	C	T	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=8;PP=1257;SC=AAGATACTTCCCCACCCACTG;SOR=2.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=47;WE=15833353;WS=15833335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	15850483	rs4645985	G	A	176.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=3;PP=119;SC=CCACAGGGAAGGCTAGGCTCC;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=15850491;WS=15850473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	15890355	rs6429750	A	G	372.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=67.45;MQRankSum=4.002;QD=23.31;ReadPosRankSum=1.366;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr1	15892277	rs139308799	GA	G	507.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=1;PP=629;SC=CACCCGCCAAGAAAAGCTCTG;SOR=4.294;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=17;WE=15892285;WS=15892267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	15892415	rs2236215	A	C	2705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=32;PP=2061;SC=TGGTTTTAGGAGGGAAATGAT;SOR=1.434;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=59;TCR=32;TR=91;WE=15892423;WS=15892405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	15909547	rs6429756	G	A	272.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=164;SC=TAAAATAAATGAATTACAATG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=15909555;WS=15909537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	15909624	rs111921608	TGAGTACAG	T	1135.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=4;PP=2444;SC=CTCAAGCCCCTGAGTACAGGA;SOR=2.387;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=14;WE=15909639;WS=15909614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	15909744	rs11580170	C	T	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=15;PP=676;SC=CTCTTGAATTCGCCGGCAGCT;SOR=0.906;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=14;TCR=15;TR=29;WE=15909752;WS=15909734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	15909850	rs6429757	C	G	927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=15;PP=691;SC=TTGACTGTCCCAAGCATCACT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=16;TCR=15;TR=31;WE=15909858;WS=15909840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	15909895	rs6429758	A	G	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=13;PP=419;SC=CCGAATCTGCAGAAGGAAGAA;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=15909903;WS=15909885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	15911031	rs10927808	T	G	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=642;SC=AGGGTCCAGGTAAATCAACCA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=15911039;WS=15911021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	15911131	rs59475085	G	A	1752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=20;PP=1323;SC=TGCTTTCCATGCCCGACAGCC;SOR=1.382;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=55;WE=15911139;WS=15911121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	15911493	rs6687474	A	G	49.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=2;PP=21;SC=TCACCGACCAAACCGCCCGCG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=15911501;WS=15911483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	15944384	rs75354298	G	A	2165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=53;PP=1745;SC=TTTGCTACTGGTGAAGAATTG;SOR=2.173;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=16;TCR=53;TR=69;WE=15944392;WS=15944374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	15956769	rs72647120	G	T	2773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=16;PP=2315;SC=TCCTTCAAGTGCTTGTTTTTG;SOR=2.753;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=68;TCR=16;TR=84;WE=15956777;WS=15956759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	15959886	rs3795762	C	G	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=1;PP=657;SC=TACTGATAAACGTTGAAAATA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=15959894;WS=15959876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	15959977	rs3795763	C	T	2172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=28;PP=1726;SC=AGGACCGAGCCCGGAGAGAGC;SOR=1.163;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=71;TCF=42;TCR=29;TR=70;WE=15959985;WS=15959967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	15986547	rs3766163	T	C	2443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=47;PP=1950;SC=TTCAGCTGAATTCCAGCTAAA;SOR=1.349;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=72;WE=15986555;WS=15986537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	15987602	rs35549389	A	G	3455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.102;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=39;PP=2810;ReadPosRankSum=0.463;SC=AGTGTCCACAAGTCTCCTTTC;SOR=1.028;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=102;TCF=62;TCR=40;TR=101;WE=15987610;WS=15987592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,107:0.99:108
chr1	16011005	.	G	GGGC	1231.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.30;QD=42.47;SOR=3.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	16011192	.	G	GGCGACCCTGCTGCCGCAGGGACTC	1304.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.38;QD=44.99;SOR=5.353;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	16042724	rs66610224	TC	T	584.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.901;HP=8;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.062;NF=17;NR=20;PP=547;ReadPosRankSum=0.390;SC=TGTTTTTTTTTCTTTCAGTTG;SOR=0.731;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=17;TCR=20;TR=37;WE=16042732;WS=16042713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,27:0.84:32
chr1	16042766	rs12091750	T	C	1180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=23;PP=981;SC=GAGGATGAGATCCCTGCCATC;SOR=1.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=36;WE=16042774;WS=16042756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	16043157	rs2280115	G	A	848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=3;PP=647;SC=AGCTTCCCAGGGTGGCCCCAT;SOR=3.180;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=16043165;WS=16043147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	16044401	rs16851970	G	A	1703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=8;PP=1288;SC=GTGCCTGGCTGTACCTGGCCC;SOR=2.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=43;TCR=8;TR=51;WE=16044409;WS=16044391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	16044929	rs35757484	A	G	1351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=11;PP=1079;SC=TCCAAGGTGGAGGACATCACG;SOR=2.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=43;WE=16044937;WS=16044919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	16044945	rs12091644	G	A	1607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=14;PP=1211;SC=TCACGTGTCAGATTTCAACAC;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=51;WE=16044953;WS=16044935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	16047726	rs12734937	T	C	217.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=1;PP=163;SC=TCTCCTATTTTCTCCCCATGT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=16047734;WS=16047716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	16048005	rs12091326	A	G	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=27;PP=796;SC=TAATAAAGCCAAGTTTGGTGT;SOR=4.680;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=16048013;WS=16047995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	16048038	rs12092485	T	C	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=250;SC=AATTCTGCAGTGGGAAAACTC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=16048046;WS=16048028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	16053493	rs41393951	G	A	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=6;PP=757;SC=CACTCTCCCCGTCGTTACTGT;SOR=2.621;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=30;WE=16053501;WS=16053483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	16055039	rs12724755	C	T	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=212;SC=GAGCACTCCACGCCATTCTCC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=16055047;WS=16055029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	16055732	rs6429772	C	T	1180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=23;PP=855;SC=AGTTCGCAGCCGCCCATAGGT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=36;WE=16055740;WS=16055722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	16056364	rs3817269	G	A	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=20;PP=811;SC=GCATCCTGACGGATGCCACCA;SOR=1.352;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=31;WE=16056372;WS=16056354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	16058698	rs77293491	CA	C	1217.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=27;PP=1337;SC=TCAGAGGCATCACCCCCATCC;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=33;WE=16058706;WS=16058688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	16064411	rs937592	T	C	1572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=14;PP=1247;SC=CCGTGTCCTCTCTGCTCCCAT;SOR=1.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=48;WE=16064419;WS=16064401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	16069644	rs11584945	C	T	2429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=60;PP=1868;SC=TCGTGGTGCTCGAGTTCTCCC;SOR=2.985;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=13;TCR=60;TR=73;WE=16069652;WS=16069634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	16097237	rs10803398	G	A	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=22;PP=637;SC=GAAGGCGATTGGTTTCCTAGG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=16097245;WS=16097227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	16242620	rs12063905	C	A	6048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=9.169;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=145;NR=38;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.424;SC=ATTCCACTTACAGAAACAGAA;SOR=2.627;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=186;TCF=146;TCR=40;TR=183;WE=16242628;WS=16242610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,189:0.98:192
chr1	16245362	rs848201	G	A	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=2;PP=386;SC=TATGGACTTGGTTCATTCTAA;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=16245370;WS=16245352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	16255644	rs848208	C	T	1847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=29;PP=1489;SC=GAGCAGCCTGCAGATGGGGTA;SOR=0.922;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=24;TCR=30;TR=53;WE=16255652;WS=16255634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	16256007	rs848209	T	C	3391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=42;PP=2775;SC=CTGGGAGAACTAGCAGGTGAA;SOR=1.103;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=58;TCR=42;TR=99;WE=16256015;WS=16255997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	16259813	rs848210	A	G	3776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.487;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=51;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.744;SC=CCCTGAATCCAACCAAGCTCA;SOR=0.595;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=69;TCR=52;TR=119;WE=16259821;WS=16259803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,124:0.99:125
chr1	16260916	rs848211	C	T	2957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=45;PP=2434;SC=CAGTCAATGCCGCTGCGAGTG;SOR=0.809;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=42;TCR=45;TR=87;WE=16260924;WS=16260906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	16262404	rs61749277	C	T	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=23;PP=732;SC=CACCAGCCAGCAAGGCCCCTC;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=16262412;WS=16262394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	16264264	rs848213	G	A	3164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=33;PP=2624;SC=ATGGCTCAGCGAGGGGCCATG;SOR=1.469;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=63;TCR=33;TR=96;WE=16264272;WS=16264254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	16265422	rs848214	A	G	3930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=93;PP=2965;SC=GGTGGGGCTGATCAGGGTAGG;SOR=2.481;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=28;TCR=93;TR=121;WE=16265430;WS=16265412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	16271180	rs848216	T	C	1352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=19;PP=1039;SC=GGAGGCCGGCTTGGGGCAGTA;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=41;WE=16271188;WS=16271170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	16272250	rs848217	A	G	2462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=28;PP=2071;SC=CAGCTTCTGCAGCAGCCATGC;SOR=1.809;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=61;TCR=29;TR=89;WE=16272258;WS=16272240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	16272933	rs61782258	A	C	999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=828;SC=TCATTCACCAAATTATTCACA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=16272941;WS=16272923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	16274769	rs698891	C	T	3159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=31;PP=2287;SC=AGCTCAGCCCCAGCCCTGACG;SOR=1.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=61;TCR=31;TR=92;WE=16274777;WS=16274759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	16330816	rs1763617	C	T	1937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=35;PP=1599;SC=CGTCAGAAGACCCCAGGGACT;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=26;TCR=35;TR=61;WE=16330824;WS=16330806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	16330937	rs1763615	C	T	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=23;PP=719;SC=GGGCCAGGTGCGGTGCCTCAT;SOR=3.611;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=16330945;WS=16330927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	16332679	rs3738646	T	C	2306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=35;PP=1930;SC=GCAGAGGGTCTGTGGCCTCAG;SOR=0.832;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=38;TCR=35;TR=73;WE=16332687;WS=16332669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	16344466	rs3738640	C	T	2051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=29;PP=1623;SC=CATCCACGGACGGCGCCGGGC;SOR=0.886;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=63;WE=16344474;WS=16344456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	16344684	rs56783248	G	A	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=25;PP=752;SC=CTGACAGCCCGACACGCAGGC;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=16344692;WS=16344674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	16344730	rs945418	T	C	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=287;SC=CATTCCAGGCTGATCACAGCA;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=16344738;WS=16344720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	16349336	rs61771056	C	T	2609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.436;NF=19;NR=61;PP=2164;ReadPosRankSum=-0.825;SC=GACATGACTGCCCAAAGTCTC;SOR=1.094;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=19;TCR=62;TR=80;WE=16349344;WS=16349326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,82:0.99:83
chr1	16351486	rs41269165	C	G	3020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=83;PP=2496;SC=CCTCATTTCTCAAGCCCAGAA;SOR=4.977;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=5;TCR=83;TR=88;WE=16351494;WS=16351476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	16353400	rs9442216	T	C	249.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=7;PP=205;SC=TCAGCCCCGCTTTGGGTATAG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=16353408;WS=16353390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	16354590	rs12126269	A	T	4044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=94;PP=2965;SC=ACCAATCGGTACAGCTCCAAA;SOR=2.124;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=34;TCR=94;TR=128;WE=16354598;WS=16354580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	16355425	rs45451292	A	G	4848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=112;PP=2965;SC=TACCCTCAGCACCCCACCAGG;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=35;TCR=112;TR=147;WE=16355433;WS=16355415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr1	16358148	rs2015509	T	C	2620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=17;PP=2100;ReadPosRankSum=0.922;SC=ATCCCCTTGCTGGCCTGGGTC;SOR=1.496;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=67;TCR=17;TR=83;WE=16358156;WS=16358138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr1	16358685	rs6669935	C	G	3346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=61;PP=2632;SC=CCCTCTCCCTCTCTACTTGCC;SOR=1.148;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=43;TCR=61;TR=104;WE=16358693;WS=16358675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	16358932	rs10803407	T	C	4187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.97;NF=94;NR=36;PP=2965;SC=TCTTCCCCACTCCCAGCAGTG;SOR=1.964;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=95;TCR=36;TR=130;WE=16358940;WS=16358922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr1	16359052	rs10927893	A	G	3000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=74;PP=2372;SC=TGACACACGCAGCCCCCGGGG;SOR=2.232;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=24;TCR=74;TR=98;WE=16359060;WS=16359042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	16359123	rs9442217	A	G	903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=30;PP=850;SC=CGCCCCGCCCATCTTATCCTG;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=16359131;WS=16359113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	16361875	rs11807054	A	G	149.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.36;QD=29.98;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	16361916	rs11811753	G	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.79;MQRankSum=0.207;QD=19.73;ReadPosRankSum=0.524;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr1	16361919	rs148785270	G	A	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.73;MQRankSum=0.659;QD=4.55;ReadPosRankSum=-0.785;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr1	16362621	rs2009044	G	A	181.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.80;QD=30.31;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	16362661	rs3978493	A	C	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.86;MQRankSum=-1.645;QD=11.95;ReadPosRankSum=-1.645;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr1	16363132	rs1889787	C	T	172.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=1;PP=111;SC=CCTCACTGAGCTTATCCGGAG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=16363140;WS=16363122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	16363148	rs150833594	AG	A	205.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=382;SC=CGGAGGCAGCAGTAATGCTCG;SOR=2.303;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=6;WE=16363166;WS=16363138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	16363158	.	G	A	112	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=20;MMLQ=27;MQ=47.17;NF=2;NR=1;PP=112;QD=48.9237375157;SC=AGTAATGCTCGTCCTCAGCTG;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=3;WE=16363166;WS=16363138;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,3:0.30:10
chr1	16363243	rs35030434	A	G	191.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.50;MQRankSum=0.431;QD=21.30;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr1	16371932	rs6604909	A	C	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=324;SC=ACCCCAGAGTATACCACCAAG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=16371940;WS=16371922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	16372282	rs67016480	GT	G	811.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=22;PP=966;SC=GTTGGGGGGGGTGCTCTGGGT;SOR=4.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=23;WE=16372290;WS=16372272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	16373124	rs5257	A	G	2714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=32;PP=2086;SC=CTTTCTCTTCAGGCTTCTCTC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=63;TCR=32;TR=95;WE=16373132;WS=16373114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	16373199	rs35820664	CCTT	C	4315.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=45;PP=2948;SC=CTGGCCAAAACCTTCTCAGAT;SOR=0.992;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=76;TCF=28;TCR=48;TR=70;WE=16373209;WS=16373189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	16373282	rs2095540	A	G	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=42;PP=1284;ReadPosRankSum=-1.661;SC=TGGCTTGCCCAAAGGGACACA;SOR=6.316;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=42;WE=16373290;WS=16373272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,46:0.98:47
chr1	16374533	rs2014562	G	C	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=37;PP=1657;SC=TCTTCCTCGGGAAAGTGGTAT;SOR=1.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=26;TCR=37;TR=63;WE=16374541;WS=16374523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	16374622	rs2863440	C	G	1547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=30;PP=1315;SC=ACGAAAGCTGCGTCAGAGGGG;SOR=1.251;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=47;WE=16374630;WS=16374612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	16374656	rs2902490	A	G	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=21;PP=1321;SC=CCTGCCTTCCAGGAACTCAGT;SOR=1.201;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=30;TCR=21;TR=51;WE=16374664;WS=16374646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	16374994	rs1889788	C	T	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=34.02;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	16375063	rs1889789	CA	GC	1618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=25;PP=1625;SC=ACAGTCTTTGCAGCTCCCTTC;SOR=1.802;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=35;WE=16375072;WS=16375053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	16376191	rs7367494	C	T	848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=30.31;SOR=6.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	16376230	rs59006537	A	AT	2962.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=6;PP=2110;SC=TGAGAGTCCAAAAGGCATTCC;SOR=3.750;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=47;TCR=6;TR=52;WE=16376246;WS=16376220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	16376232	rs59924562	A	T	2971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.96;QD=43.70;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	16376238	rs34589727	TC	T	2216.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=7;PP=1764;SC=CAAAAGGCATTCCCCCCAAGG;SOR=3.489;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=64;TCF=57;TCR=7;TR=58;WE=16376246;WS=16376220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	16376278	rs7365182	G	A	3614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=28;PP=2858;SC=TACTGGGGTCGGGCTCTGGGC;SOR=2.183;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=85;TCR=28;TR=113;WE=16376286;WS=16376268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr1	16376319	rs7368151	T	C	4179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=58;PP=2965;SC=GGGGTCTCTGTGGCATCCTGG;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=133;TCF=75;TCR=58;TR=133;WE=16376327;WS=16376309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr1	16376458	rs7368166	T	C	1653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=44;PP=1282;SC=AGCTCCCCCCTCACCGTACTC;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=44;WE=16376466;WS=16376448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	16376494	.	C	G	679	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MMLQ=24;MQ=56.97;NF=0;NR=24;PP=679;QD=29.7404671895;SC=AAGCTCTACCCGCCACCTGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=16376502;WS=16376484;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	16378649	rs2297726	C	G	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=422;SC=TAACATGAGGCTGGCCCCTGG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=16378657;WS=16378639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	16379008	rs2050522	C	T	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=446;SC=TAGCTGACCTCGGACATGGGG;SOR=4.174;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=16;WE=16379023;WS=16378998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	16379015	rs199907733	G	GGGGGCTGGGA	456.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=2969;SC=CCTCGGACATGGGGGCTGACA;SOR=3.442;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=9;WE=16379023;WS=16378998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	16380196	rs5253	T	C	2308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=62;PP=1745;SC=GCCAAGGACATGCCACTGGAG;SOR=2.777;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=17;TCR=62;TR=79;WE=16380204;WS=16380186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	16380243	rs2275166	A	G	2041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.07;QD=44.39;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	16380252	rs2275167	C	T	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.77;QD=47.34;SOR=6.043;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	16381718	rs1414498	T	C	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.82;SOR=6.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	16381722	rs12691552	C	T	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.82;SOR=6.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	16381792	rs12047858	T	A	1995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=8;PP=1609;SC=AAGTTTCCTGTCCTTTATAAT;SOR=3.575;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=51;TCR=8;TR=59;WE=16381800;WS=16381782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	16381816	rs12029508	C	T	2615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=20;PP=2040;SC=TGACAATAGTCACAATAGCCC;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=60;TCR=20;TR=80;WE=16381824;WS=16381806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	16382086	rs2297727	C	T	2185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=19;PP=1684;SC=GAGAGGGGCCCGCTGATATCC;SOR=1.875;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=60;WE=16382094;WS=16382076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	16382730	rs12030469	C	T	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=1;PP=1131;SC=CCTGCGGCCCCGCCCAGACCC;SOR=6.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=41;WE=16382738;WS=16382725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	16382791	rs12023153	G	C	3430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=67;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.99;NF=94;NR=2;PP=2965;SC=TTGCAGGCCTGGGTCTCTTGT;SOR=6.953;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=96;TCF=94;TCR=2;TR=96;WE=16382799;WS=16382781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	16382827	rs77508204	CTCT	C	7363.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.99;NF=85;NR=9;PP=2971;SC=GGCCCCGCCCCTCTTCCTGGC;SOR=3.421;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=101;TCF=89;TCR=12;TR=94;WE=16382842;WS=16382817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr1	16382831	rs61769890	T	A	7408.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.99;QD=45.45;SOR=3.300;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr1	16382834	rs61769891	T	A	7562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.99;QD=44.49;SOR=3.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr1	16382877	rs7517792	A	G	7002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.97;NF=140;NR=102;PP=2965;SC=TGGGCTGGGCACCTTCTACCC;SOR=1.025;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=243;TCF=140;TCR=103;TR=242;WE=16382885;WS=16382867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr1	16383329	rs138507185	T	TC	717.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=4;PP=275;SC=CTCCTCTACATCCCCCCGCAC;SOR=1.371;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=13;WE=16383344;WS=16383319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	16383336	rs12746138	G	C	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=12;NR=5;PP=450;SC=ACATCCCCCCGCACCTCCACC;SOR=1.493;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=16383344;WS=16383319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	16383448	rs10803415	A	C	1193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.68;QD=32.26;SOR=1.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	16383581	rs1057844	G	T	951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.65;QD=41.38;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	16383605	rs1057845	A	G	931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.45;QD=40.51;SOR=4.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	16383668	rs6660218	T	G	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=15;PP=1501;SC=TATCTGCCAGTTGCTCAGTGA;SOR=2.352;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=45;TCR=15;TR=60;WE=16383676;WS=16383658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	16383742	rs1057857	C	G	2174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=49;PP=1773;SC=GGCACAGATGCCTTCTGGGGT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=23;TCR=49;TR=72;WE=16383750;WS=16383732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	16385175	rs17853748	G	A	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.53;MQRankSum=1.126;QD=5.06;ReadPosRankSum=1.050;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	16385178	rs80297394	G	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.53;MQRankSum=-1.126;QD=16.98;ReadPosRankSum=-1.050;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr1	16385323	rs77017249	A	G	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.08;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	16385330	rs3978476	G	T	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.08;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	16385797	rs3978478	C	G	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.890;NF=45;NR=0;PP=1055;ReadPosRankSum=-1.714;SC=TGTGCTCACTCTCTCCTTCCT;SOR=0.652;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=95;TCF=95;TCR=0;TR=45;WE=16385805;WS=16385787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,46:0.49:94
chr1	16385874	rs3978464	T	C	3597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.670;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-8.059;NF=98;NR=50;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.659;SC=TGAAGAAACTTAGGCTGAGAA;SOR=0.553;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=299;TCF=203;TCR=96;TR=148;WE=16385882;WS=16385864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,143:0.47:305
chr1	16385980	rs3884058	G	A	7876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=184;PP=2965;SC=TGGACCCTCTGGGCTGTACCT;SOR=2.423;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=240;TCF=56;TCR=184;TR=240;WE=16385988;WS=16385970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr1	16386008	rs2863452	T	C	6293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=164;PP=2965;SC=GGACGATGCCTTGGGGGCTGT;SOR=4.059;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=186;TCF=21;TCR=165;TR=185;WE=16386016;WS=16385998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr1	16386065	rs61769893	T	A	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.97;MQRankSum=-0.443;QD=8.72;ReadPosRankSum=-1.048;SOR=0.253;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,21:0.34:61
chr1	16386416	rs9442230	G	A	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=4;PP=227;SC=AGTAATGCTCGTCCTCAGCTG;SOR=1.445;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=16386424;WS=16386406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	16386447	rs11576236	G	C	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=4;PP=180;SC=CCAGCCTGCCGGCTGGGCACT;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=9;WE=16386455;WS=16386437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	16386495	rs71510977	C	T	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=29.26;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	16388556	rs2863455	C	T	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.97;QD=39.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	16388565	rs7524413	C	G	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.97;QD=39.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	16388646	rs2863456	T	C	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=50.01;NF=6;NR=6;PP=208;SC=CGGGGCGGGATCTGGAGTCGG;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=12;WE=16388654;WS=16388636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	16388709	rs28570004	G	T	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.83;QD=26.75;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	16388766	rs3978469	C	T	274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=7;PP=199;SC=CACCCATCCCCGTCTCCCAGC;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=16388774;WS=16388756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	16451767	rs3754334	G	A	2758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=66;PP=2223;SC=GGCTGTAGGCGATGCGCTTCT;SOR=2.330;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=21;TCR=66;TR=87;WE=16451775;WS=16451757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr1	16464673	rs2230597	G	A	1952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=20;PP=1661;SC=GTGGGGCGGAGGGGGGTCCTG;SOR=1.238;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=55;WE=16464681;WS=16464663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	16474839	rs35127370	AC	A	3214.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.232;NF=62;NR=26;PP=2969;ReadPosRankSum=-1.105;SC=GGAATGCAGAACCCCCTTCCC;SOR=1.027;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=97;TCF=67;TCR=30;TR=88;WE=16474847;WS=16474829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
chr1	16475123	rs6678616	C	T	5571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.22;SOR=0.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	16475126	rs6678618	C	T	5571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.53;SOR=0.790;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	16525056	rs451260	G	T	1164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=11;PP=869;SC=AGGCATGGAGGTGGGGTCCTA;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=38;WE=16525064;WS=16525046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	16525549	rs221032	C	T	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=1;PP=643;SC=GGCAGATCAACACTTGCAGAA;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=16525557;WS=16525539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	16528233	rs221037	G	A	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=7;PP=630;SC=GAGAGCGGGCGAGGGTCCAGC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=23;WE=16528241;WS=16528223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	16528469	rs58225172	GCCTACCCTAGGGAC	GTACCCTAGGGAC,G	492.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=2457;SC=TAGGACCCAGGCCTACCCTAG;SOR=2.670;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=7;WE=16528492;WS=16528459;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:12
chr1	16528472	rs200243292	TACCCTAGGGACC	T	492.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.06;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	16528484	.	C	T	210	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=1;NR=6;PP=210;QD=34.9673160782;SC=CCCTAGGGACCCATGTCTGCC;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=16528492;WS=16528459;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	16528823	rs71574165	GCCATGGGGACGGGGTGCCCA	G	520.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=1264;SC=AGGGGTGCCCGCCATGGGGAC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=16528850;WS=16528813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	16529117	rs221039	T	C	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=20;PP=578;SC=GCCCTGGCTCTAGGCACCCAC;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=16529125;WS=16529107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	16532803	rs221050	G	A	3002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=20;PP=2469;SC=TGTGGATGTAGGAGGCCTCGG;SOR=2.546;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=69;TCR=20;TR=89;WE=16532811;WS=16532793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	16532848	rs221051	A	G	3513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=29;PP=2622;ReadPosRankSum=-0.760;SC=GAGGGAGGGCACACACGGGGT;SOR=1.135;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=91;TCR=29;TR=119;WE=16532856;WS=16532838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,123:0.99:124
chr1	16533022	rs221052	C	T	3010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=85;PP=2485;SC=CAAGCCTTTCCTGTCCTCGAT;SOR=4.317;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=8;TCR=86;TR=93;WE=16533030;WS=16533012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	16533817	rs170234	T	C	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=8;PP=321;SC=GGTTCGGATATCTGGACACAG;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=12;WE=16533825;WS=16533807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	16534002	rs221056	C	G	1796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=55;NR=12;PP=1438;SC=TCCCAGGGACCCCCCTCCCAC;SOR=2.939;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=55;TCR=12;TR=67;WE=16534010;WS=16533992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	16534255	rs221057	C	G	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=26;PP=830;SC=CTTCGAGCCTCCATTCCAGAT;SOR=3.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=16534263;WS=16534245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	16534646	rs221058	C	G	2020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=40;PP=1618;SC=ACTACCTGGCCAGGCTCTAGG;SOR=1.376;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=24;TCR=40;TR=64;WE=16534654;WS=16534636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	16534730	rs221059	G	A	1065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=26;PP=873;SC=CCTAGGGTTGGGGGCAAGGAG;SOR=3.545;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=16534738;WS=16534720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	16543175	rs221024	A	C	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=26;PP=731;SC=GCTTACCCTGAGCCAAACCCT;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=32;WE=16543183;WS=16543165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	16731510	rs525409	C	G	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=12;PP=1196;SC=GCCAGCGTCACAGAGAAGCCC;SOR=1.931;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=43;WE=16731518;WS=16731500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	16731646	rs3106498	T	C	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=24;PP=605;SC=TTCTTGTTTCTGTCATTCATC;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=16731654;WS=16731636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	16775582	rs61769455	C	T	1236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=21;PP=938;SC=CATGTTCTCTCCCCAGGTGGG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=21;TCR=21;TR=42;WE=16775590;WS=16775572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	16778265	rs279782	G	T	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=26;NR=2;PP=750;SC=GGCCCTCCTTGTGGGGTTTTC;SOR=3.841;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=16778273;WS=16778255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	16785154	.	TA	T	226.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.72;QD=20.61;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	16802890	rs696095	G	A	219.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=105;SC=GGTGCACAGCGTACCTGGGTG;SOR=1.863;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=16802898;WS=16802880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	16803267	rs156846	T	C	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.80;QD=27.78;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	16862296	rs1759227	G	C	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.56;MQRankSum=-2.646;QD=7.16;ReadPosRankSum=-0.454;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,15:0.31:48
chr1	16862454	rs71248115	T	G	7492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=8.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.21;MQRankSum=-6.277;QD=30.09;ReadPosRankSum=0.021;SOR=1.219;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,181:0.73:249
chr1	16862461	rs145386412	T	A	7731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FS=7.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.48;MQRankSum=-8.359;QD=28.74;ReadPosRankSum=1.231;SOR=1.167;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,193:0.72:269
chr1	16862502	rs141629643	A	G	5643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FS=3.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.34;MQRankSum=-6.353;QD=19.73;ReadPosRankSum=0.387;SOR=0.530;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,195:0.68:286
chr1	16862638	rs369070338	A	G	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=4.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.073;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.562;NF=3;NR=54;PP=1077;ReadPosRankSum=-0.474;SC=GCCTCCGCTGACTAGATACAT;SOR=1.332;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=178;TCF=18;TCR=160;TR=57;WE=16862646;WS=16862628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,44:0.31:144
chr1	16862708	rs1762987	T	G	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.76;MQRankSum=-3.067;QD=14.67;ReadPosRankSum=-1.187;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr1	16862712	rs61769538	G	T	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.57;MQRankSum=-2.893;QD=17.61;ReadPosRankSum=-1.585;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr1	16862714	rs61769539	T	G	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.39;MQRankSum=-2.888;QD=17.43;ReadPosRankSum=-1.619;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr1	16863144	.	C	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.729;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.22;MQRankSum=-3.304;QD=4.03;ReadPosRankSum=-2.942;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,5:0.18:28
chr1	16863146	.	A	C	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.710;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.22;MQRankSum=-3.304;QD=3.71;ReadPosRankSum=-2.927;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,5:0.18:28
chr1	16863152	.	C	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.247;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.68;MQRankSum=-3.566;QD=2.70;ReadPosRankSum=-1.342;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,5:0.15:34
chr1	16863159	.	C	G	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.628;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.53;MQRankSum=-3.772;QD=2.05;ReadPosRankSum=0.042;SOR=0.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,5:0.13:39
chr1	16863165	.	G	C	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.25;MQRankSum=-4.037;QD=1.80;ReadPosRankSum=0.998;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,5:0.12:41
chr1	16863173	rs915327	T	C	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.69;MQRankSum=-4.238;QD=1.80;ReadPosRankSum=1.576;SOR=0.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,5:0.12:41
chr1	16863213	rs74057444	C	G	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=4.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQRankSum=-7.928;QD=0.66;ReadPosRankSum=0.601;SOR=1.639;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,8:0.11:71
chr1	16863257	.	A	G	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.647;ClippingRankSum=0.000;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=6.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.73;MQRankSum=-5.731;QD=1.27;ReadPosRankSum=-1.664;SOR=2.088;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,9:0.08:107
chr1	16863259	rs114741004	T	G	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=9.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.33;MQRankSum=-6.182;QD=2.35;ReadPosRankSum=-2.778;SOR=2.522;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,11:0.10:109
chr1	16863266	.	A	T	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.554;ClippingRankSum=0.000;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=13.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.73;MQRankSum=-6.958;QD=2.74;ReadPosRankSum=-4.023;SOR=3.272;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,18:0.15:121
chr1	16863304	rs61769542	T	C	1424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=19.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.94;MQRankSum=-6.502;QD=8.43;ReadPosRankSum=1.147;SOR=2.452;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,42:0.25:169
chr1	16863308	rs112689425	G	T	1661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=10.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.27;MQRankSum=-5.701;QD=9.34;ReadPosRankSum=1.212;SOR=1.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,48:0.27:178
chr1	16863313	rs76539488	C	T	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=4.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.21;MQRankSum=-4.343;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.099;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,46:0.26:179
chr1	16863314	rs74927161	A	G	1811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=8.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.33;MQRankSum=-5.553;QD=9.74;ReadPosRankSum=1.148;SOR=1.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,54:0.29:186
chr1	16863328	rs61769543	T	G	1537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.528;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.401;NF=97;NR=44;PP=2962;ReadPosRankSum=0.476;SC=AAGAAAGGCGTCGAGTCCTGT;SOR=1.378;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=288;TCF=191;TCR=97;TR=141;WE=16863336;WS=16863294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,71:0.33:216
chr1	16863352	rs61769544	C	T	1883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.647;HP=4;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.848;NF=95;NR=69;PP=2880;ReadPosRankSum=-0.914;SC=GTTGGGTAGGCGGAAGAGAGA;SOR=1.500;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=315;TCF=171;TCR=144;TR=164;WE=16863360;WS=16863337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,93:0.38:247
chr1	16863398	rs61769545	A	C	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-6.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.055;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.081;NF=48;NR=91;PP=2207;ReadPosRankSum=1.377;SC=GGGAGGTTTCAGGATCTAAAG;SOR=0.301;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=271;TCF=82;TCR=189;TR=139;WE=16863406;WS=16863388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,83:0.38:220
chr1	16946535	rs437905	T	C	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=57.15;MQRankSum=-0.431;NF=2;NR=2;PP=50;ReadPosRankSum=0.524;SC=GGGCCAGGACTGGACGCGTGT;SOR=0.105;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=4;WE=16946543;WS=16946525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	16948473	rs446948	CC	TG	1616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=10;PP=1410;SC=AAGTCCTCCTCCTGGGCTGCC;SOR=1.432;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=32;WE=16948482;WS=16948463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	16950251	rs55674375	AG	A	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=51.67;MQRankSum=1.579;NF=3;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=0.328;SC=ACTGGAACCCAGGCCAGCCAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=3;WE=16950259;WS=16950241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr1	16950346	rs9663015	A	C	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.055;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.797;NF=12;NR=2;PP=296;ReadPosRankSum=-0.352;SC=GTTCCCCCCAAGTCCCCAGCC;SOR=2.807;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=14;WE=16950354;WS=16950336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr1	16969246	rs11260857	G	A	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.059;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.982;NF=31;NR=1;PP=570;ReadPosRankSum=0.015;SC=AGGAGGGGCCGCCCACCCAGC;SOR=2.660;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=90;TCF=79;TCR=11;TR=32;WE=16969254;WS=16969236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,30:0.35:85
chr1	16969381	rs9727604	C	T	1989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=6.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.195;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-10.081;NF=32;NR=55;PP=1866;ReadPosRankSum=-1.873;SC=AAGGGCCACACGATGAGTGCA;SOR=0.948;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=58;TCR=97;TR=87;WE=16969389;WS=16969371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,73:0.52:141
chr1	16971948	rs2209174	C	G	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=57.52;MQRankSum=0.972;NF=6;NR=1;PP=107;ReadPosRankSum=1.542;SC=TTGCAACTGACCTGTGGGACC;SOR=0.569;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=7;WE=16971956;WS=16971938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	16973606	rs76859932	G	T	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.084;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.151;NF=16;NR=45;PP=1134;ReadPosRankSum=0.947;SC=AAATCCTGCCGGGTGGGTAAG;SOR=1.186;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=192;TCF=58;TCR=134;TR=61;WE=16973614;WS=16973596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,35:0.27:128
chr1	16974256	.	G	C	138	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=40.94;NF=9;NR=0;PP=138;QD=19.1968013941;SC=GCTCGGGGCCGGACCTATCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=9;WE=16974264;WS=16974246;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:23,9:0.28:32
chr1	16974511	rs58679574	G	A	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.64;MQRankSum=0.107;QD=5.26;ReadPosRankSum=0.108;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,40:0.26:152
chr1	16974637	rs16854791	T	C	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=15.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.13;MQRankSum=-0.962;QD=2.82;ReadPosRankSum=-0.323;SOR=2.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,16:0.21:75
chr1	16974662	rs28460410	C	A	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=6.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.69;MQRankSum=-1.517;QD=1.65;ReadPosRankSum=-2.267;SOR=1.959;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,9:0.16:55
chr1	16974869	rs4570422	G	C	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.028;NF=21;NR=5;PP=601;ReadPosRankSum=-1.455;SC=TGCCAGCGCGGGTCCGCTGAG;SOR=0.681;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=26;WE=16974877;WS=16974859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr1	16975230	rs2761535	G	C	6353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.63;QD=31.93;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr1	16975278	rs111244008	A	AC	557.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=41.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.41;MQRankSum=-6.558;QD=4.04;ReadPosRankSum=-0.771;SOR=5.438;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,34:0.25:138
chr1	16976032	rs2483047	A	C	1301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.963;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.711;NF=37;NR=23;PP=1122;ReadPosRankSum=0.031;SC=TATGTGGACAACCTGGGAGGG;SOR=1.371;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=172;TCF=92;TCR=80;TR=60;WE=16976040;WS=16976022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,55:0.36:151
chr1	16976585	rs1135350	C	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.63;MQRankSum=-0.524;QD=6.18;ReadPosRankSum=-1.644;SOR=0.888;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr1	16976620	rs55885953	A	G	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=2.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.09;MQRankSum=-2.336;QD=9.76;ReadPosRankSum=-2.153;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,29:0.43:68
chr1	16976641	rs1057417	C	T	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=1.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.71;MQRankSum=-3.956;QD=4.30;ReadPosRankSum=1.337;SOR=0.934;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,13:0.17:75
chr1	16976649	rs1057333	C	T	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=2.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.73;MQRankSum=-3.904;QD=3.40;ReadPosRankSum=1.805;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,13:0.15:87
chr1	16976679	rs1065528	G	A	1537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.24;MQRankSum=3.547;QD=21.97;ReadPosRankSum=1.631;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,60:0.86:70
chr1	16976681	rs3175284	G	T	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.20;MQRankSum=-3.497;QD=0.75;ReadPosRankSum=-1.758;SOR=0.805;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,10:0.14:69
chr1	17017675	rs2743471	C	A	3489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=68;PP=2585;ReadPosRankSum=-0.756;SC=CAGTCAAGACCCGCTGCCAGG;SOR=0.348;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=54;TCR=70;TR=122;WE=17017683;WS=17017665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,124:0.99:125
chr1	17022840	.	G	A	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=582;SC=AGGAGGTCCCGAGGTTGGTGT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=17022848;WS=17022830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	17022952	rs557690	C	A	1593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=26;PP=1244;SC=TCCTCCTCCTCCATCTTCAGC;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=27;TCR=26;TR=53;WE=17022960;WS=17022942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	17023126	rs2610633	C	G	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=18;PP=954;SC=AACCCCGCAGCTGGCGGTGTG;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=19;TCR=18;TR=37;WE=17023134;WS=17023116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	17023511	rs563144	C	A	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=446;SC=TTCCCAACTCCAGATTGGATG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=17023519;WS=17023501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	17029257	rs12125112	T	C	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=30;PP=862;SC=CATGTAGATGTCAGCTGCCTG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=40;WE=17029265;WS=17029247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	17034041	rs2743505	T	C	256.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=56.68;NF=0;NR=8;PP=213;SC=CGCGCTGACCTCTAGCTCCCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=17034049;WS=17034031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	17044511	rs2773185	T	C	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=351;SC=TCCCAGCTGCTCTTCCTGCAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=17044519;WS=17044501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	17044695	rs2773186	A	G	180.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=6;PP=153;SC=CCAGCGCCCAATCACACACAG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=17044703;WS=17044685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	17046361	rs3856291	A	T	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=1;PP=296;SC=TGGAGGGATCATTGCCCTGGA;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=17046369;WS=17046351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	17046456	rs3856292	T	C	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=6;PP=522;SC=GGAGTGATCTTACTCAGGGTA;SOR=1.708;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=17046464;WS=17046446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	17046595	rs3856293	T	C	1428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=19;PP=998;SC=TTCACCACCTTGGGGTGGCCA;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=25;TCR=19;TR=44;WE=17046603;WS=17046585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	17046613	rs3856294	C	T	1493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=29;PP=1079;SC=CCAAAGCGGGCAGTCAGATGC;SOR=0.931;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=21;TCR=29;TR=50;WE=17046621;WS=17046603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	17046698	rs3982089	C	G	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=24;PP=761;SC=GTTGCTGCCCCGCCCCTGGCT;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=17046706;WS=17046688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	17083778	rs28455793	C	T	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.70;QD=27.78;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	17083807	rs9286084	T	C	55.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.81;QD=18.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	17084968	rs2761533	G	C	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=5.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.02;MQRankSum=-0.518;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.975;SOR=1.635;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,24:0.35:68
chr1	17085165	rs2490828	G	C	1904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.75;QD=34.01;SOR=4.731;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	17085412	rs872964	C	T	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=6.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.02;MQRankSum=1.547;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.764;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,16:0.26:62
chr1	17085427	rs2002186	T	C	2126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.61;QD=32.22;SOR=0.957;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	17085502	rs2329006	T	C	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=8.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.56;MQRankSum=-4.319;QD=17.93;ReadPosRankSum=-0.507;SOR=2.457;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,31:0.65:48
chr1	17085542	rs2261754	G	A	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=2.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.88;MQRankSum=0.952;QD=3.99;ReadPosRankSum=-1.460;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr1	17085564	rs3851921	A	G	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=2.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.61;MQRankSum=-1.428;QD=1.71;ReadPosRankSum=0.246;SOR=1.480;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,4:0.14:28
chr1	17085671	rs3863806	C	G	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.38;MQRankSum=-2.429;QD=19.80;ReadPosRankSum=0.054;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	17085677	rs3863805	G	A	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.16;MQRankSum=-3.195;QD=16.85;ReadPosRankSum=-0.054;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr1	17085712	rs3863803	C	T	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.863;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.93;MQRankSum=-3.560;QD=11.99;ReadPosRankSum=0.755;SOR=0.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr1	17085834	rs2005622	G	T	1303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=17;PP=1097;SC=CGGGCCGCAGGGTGAAGCACC;SOR=1.280;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=46;WE=17085842;WS=17085824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	17085995	.	G	GC	478.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=-0.841;NF=3;NR=15;PP=493;ReadPosRankSum=-0.091;SC=CCCAACGCCCGCCCCCCCGCC;SOR=1.609;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=18;WE=17086003;WS=17085985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr1	17086052	rs1057286	T	C	121.03	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.24;MQRankSum=-0.792;QD=17.29;ReadPosRankSum=-1.465;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr1	17087299	rs2179162	T	C	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=33.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQRankSum=-8.501;QD=3.37;ReadPosRankSum=-1.936;SOR=5.135;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,12:0.11:108
chr1	17087305	rs12046578	G	C	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=48.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.64;MQRankSum=-8.374;QD=3.20;ReadPosRankSum=-2.241;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,19:0.16:120
chr1	17087365	rs2446556	C	G	3796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=69;NR=58;PP=2965;SC=TGTAGTGGAACGCCCTGGAGA;SOR=0.997;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=69;TCR=59;TR=127;WE=17087373;WS=17087355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	17087465	rs11260924	G	A	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.844;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.724;NF=16;NR=31;PP=972;ReadPosRankSum=0.365;SC=GTCCATTAAGGGCCCACAGCG;SOR=0.580;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=35;TCR=68;TR=47;WE=17087473;WS=17087455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,39:0.43:91
chr1	17087541	rs113982165	GGTGCT	G	608.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.882;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.840;NF=3;NR=18;PP=1013;ReadPosRankSum=-0.418;SC=GCATGTAGCAGGTGCTGTAGC;SOR=1.795;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=73;TCF=20;TCR=53;TR=21;WE=17087553;WS=17087531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,19:0.28:68
chr1	17087582	rs10907280	G	A	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.711;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.813;NF=6;NR=23;PP=497;ReadPosRankSum=-0.055;SC=GAAGTCATTCGATGGCGAGCG;SOR=2.099;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=70;TCF=22;TCR=48;TR=29;WE=17087590;WS=17087572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,19:0.31:61
chr1	17087640	rs200412600	A	C	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.342;NF=1;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=0.058;SC=GTGGGCATACATGTCAGTAAT;SOR=0.336;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=9;WE=17087648;WS=17087630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr1	17197563	rs7556482	G	T	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=35.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.47;MQRankSum=-7.574;QD=0.43;ReadPosRankSum=1.132;SOR=5.267;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,14:0.08:168
chr1	17197595	rs201521253	A	C	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=26.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.51;MQRankSum=-4.842;QD=2.02;ReadPosRankSum=-3.008;SOR=1.654;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:162,30:0.16:192
chr1	17197609	rs150993810	T	C	1283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=9.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.25;MQRankSum=-3.573;QD=6.76;ReadPosRankSum=-3.570;SOR=0.564;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,41:0.22:190
chr1	17197615	rs146936960	C	A	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=11.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.30;MQRankSum=-3.015;QD=6.62;ReadPosRankSum=-1.826;SOR=0.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,41:0.22:187
chr1	17197619	rs113661539	A	G	1212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=9.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.23;MQRankSum=-2.690;QD=6.59;ReadPosRankSum=-0.534;SOR=0.441;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:144,40:0.22:184
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chr1	17197771	rs139655267	G	A	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.74;MQRankSum=-4.083;QD=3.82;ReadPosRankSum=-1.252;SOR=0.053;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,6:0.17:35
chr1	17197777	rs149102001	T	G	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.54;MQRankSum=-4.040;QD=4.02;ReadPosRankSum=-1.202;SOR=0.057;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,6:0.18:34
chr1	17197779	rs138448635	G	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.48;MQRankSum=-3.700;QD=4.51;ReadPosRankSum=-0.866;SOR=0.048;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,5:0.16:31
chr1	17248532	rs6586566	A	G	1922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=20;PP=1424;SC=GGGGCTGGCGAGGGCACAGGA;SOR=1.503;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=41;TCR=20;TR=61;WE=17248540;WS=17248522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	17265327	rs4269813	A	G	2124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=22;PP=1455;SC=CCCCAGCCTCACCTGGGCGTC;SOR=1.824;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=52;TCR=22;TR=74;WE=17265335;WS=17265317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	17266648	rs11203455	C	T	162.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=146;SC=GGGCATAACACCAGTCAAGCC;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=17266656;WS=17266638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	17267302	rs6586577	A	G	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=13;PP=609;SC=GCTCACTGTAACCTGGAACTC;SOR=1.085;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=22;WE=17267310;WS=17267292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	17273493	rs7537563	A	C	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=327;SC=GCAGGTGGGCAAAGCTGTGTG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=17273501;WS=17273483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	17280022	rs78911909	A	T	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=27.35;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr1	17280025	rs78271317	T	C	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=27.35;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr1	17280045	rs74875673	T	C	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr1	17280051	.	T	C	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=1;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=52.77;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:0,1:1.00:1
chr1	17281759	rs151046905	C	CG	1353.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=16;PP=1149;SC=CCCAGCTTGACGGGGGGGTCC;SOR=1.312;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=25;TCR=20;TR=38;WE=17281767;WS=17281749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	17282425	rs2143808	G	A	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=2;PP=233;SC=TGGAGGAGACGGCTTTTGTGT;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=17282433;WS=17282415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	17282573	rs2273114	G	A	2000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=9;PP=1748;SC=AGGAGGCCGGGGAGCTGCGAA;SOR=3.187;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=57;TCR=9;TR=66;WE=17282581;WS=17282563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	17285022	rs12097969	A	G	44.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=0;PP=57;SC=CTTGGGCCAGAACTGGGAGGG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=17285030;WS=17285012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	17285298	rs41300134	C	T	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=11;PP=346;SC=CAGCAGGAAGCAGGTGGGCAC;SOR=1.765;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=15;WE=17285306;WS=17285288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	17287639	rs2273112	C	T	112.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=1;PP=86;SC=AGGGCAGTGCCGCGCGCAGGG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=17287647;WS=17287629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	17295679	rs4920574	T	C	1767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=32;PP=1467;SC=GGGCCCTGGCTAAGGTGGAGG;SOR=1.220;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=21;TCR=32;TR=53;WE=17295687;WS=17295669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	17299014	.	A	C	387	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=10;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=13;PP=387;QD=30.1265151819;SC=CAGCCCCCCCACCCAGAGCCC;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=17299022;WS=17299004;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	17312743	rs3170740	C	T	1876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=36;PP=1532;SC=CGGGCAGCGGCGGCCAGGGCT;SOR=1.092;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=26;TCR=36;TR=62;WE=17312751;WS=17312733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	17326767	rs56367069	C	T	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=2;PP=1098;SC=CACGCACACCCGCATGGACAA;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=38;WE=17326775;WS=17326757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	17331676	rs3738814	A	G	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=27;PP=803;SC=AAGGCTATGGAGAGCCCTCCA;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=32;WE=17331684;WS=17331666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	17359676	rs1022580	C	A	932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=26;PP=818;SC=ATTTATGTAACGTTCAACCTC;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=17359684;WS=17359666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	17380497	rs2746462	G	T	1621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=41;PP=1244;SC=TCAAGGAGAGGGCGACCACCG;SOR=2.522;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=53;WE=17380505;WS=17380487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	17402347	rs2647205	C	T	1974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=39;PP=1574;SC=GGAGTTTCAGCAAATTACCCA;SOR=1.539;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=61;WE=17402355;WS=17402337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	17402420	rs2647204	A	G	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=25;PP=737;SC=CCAGAGTGACATCAGCAGAGA;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=17402428;WS=17402410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	17406015	rs2057093	C	T	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=477;SC=TGTGGGCACCCAGTTTCCAGG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=17406023;WS=17406005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	17409017	rs2076617	G	A	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=2;PP=654;SC=TGCTCCACCCGCAAGTGGCCC;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=17409025;WS=17409007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	17409241	rs2235925	G	A	1170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=32;PP=1001;SC=CACAAAGGAAGAAGAACGTCT;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=17409249;WS=17409231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	17413121	rs2076615	A	C	2778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=28;PP=2102;ReadPosRankSum=-0.735;SC=CCGCGGAGCCACCCGTGTACT;SOR=0.557;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=56;TCR=28;TR=83;WE=17413129;WS=17413111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
chr1	17418883	rs2647184	A	G	1092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=1;PP=837;SC=TCTAGGCTGGACTGGGCTGGG;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=17418891;WS=17418873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	17431618	rs11203300	A	G	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.45;NF=2;NR=10;PP=324;SC=GAGGGGCTTCAAGAGGAGACT;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=17431626;WS=17431608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	17431681	rs2647172	C	A	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=7;PP=236;SC=TGAGCCCAGGCGTTTGAGACC;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=17431689;WS=17431671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	17550097	.	T	C	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=289;ReadPosRankSum=0.866;SC=CCGTGCAGGCTTAGGGCTATG;SOR=0.876;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=16;WE=17550105;WS=17550087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr1	17550121	rs2293912	G	A	1672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=15;PP=1204;SC=TGCAGGTGAGGGTCTCCTACT;SOR=1.835;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=50;WE=17550129;WS=17550111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	17550225	rs3003481	T	C	1518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=30;PP=1097;SC=TCTATCCCTTTGCCCCTCCAG;SOR=1.220;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=21;TCR=30;TR=51;WE=17550233;WS=17550215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	17550314	rs2293914	G	A	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=17;PP=593;SC=GAGGGGCTTGGATTCCTCGGG;SOR=2.147;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=17550322;WS=17550304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	17563967	rs2977306	T	C	3007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=62;PP=2354;ReadPosRankSum=1.820;SC=CGTCCCCTCCTTCCCTGCCTG;SOR=0.960;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=85;TCF=22;TCR=63;TR=84;WE=17563975;WS=17563957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,90:0.99:91
chr1	17564990	rs2977310	T	C	247.31	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.9785;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=169;ReadPosRankSum=1.645;SC=GGCTGGGGTGTAGACCGAGTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=17564998;WS=17564980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr1	17570466	rs2293921	T	C	3761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=38;SC=ACAGCACTTATAGCCAGACAG;SOR=1.512;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=74;TCR=38;TR=112;WE=17570474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	17575645	rs3763589	A	C	3148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=44;PP=2316;SC=GTCGCTGCAGAGAATCGTGCG;SOR=1.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=58;TCR=44;TR=102;WE=17575653;WS=17575635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr1	17586010	rs45438395	G	A	2260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=15;PP=1786;SC=TTGAGCCAAAGCTCAAACATC;SOR=2.406;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=64;WE=17586018;WS=17586000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	17586134	rs3750300	A	G	3916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=59;PP=2965;SC=GGACATCTACATCTCTCCCAA;SOR=0.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=72;TCR=59;TR=131;WE=17586142;WS=17586124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr1	17593144	rs2272628	C	G	2870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=24;PP=2312;SC=AGGCCAGGCTCGGGTTCCTGG;SOR=2.102;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=65;TCR=24;TR=89;WE=17593152;WS=17593134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	17593316	rs2272629	G	A	2830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=67;PP=2285;ReadPosRankSum=-0.820;SC=TGACCAGCACGTGCACTGCCT;SOR=1.140;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=90;TCF=22;TCR=68;TR=89;WE=17593324;WS=17593306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,92:0.99:93
chr1	17597721	rs4595409	A	G	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=322;SC=CATCCTGGAGAGAGAGGCCTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=17597729;WS=17597711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	17601083	rs2293917	C	T	2654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=24;PP=2098;ReadPosRankSum=-0.787;SC=TGGTTCAGGCCCTTCCTGGTA;SOR=0.931;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=88;TCF=64;TCR=24;TR=86;WE=17601091;WS=17601073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,85:0.99:86
chr1	17657534	rs11203366	G	A	3939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=66;PP=2965;SC=TATTGCCCACGGCCCTCCAGC;SOR=0.845;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=59;TCR=66;TR=125;WE=17657542;WS=17657524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	17657616	rs11203367	T	C	2619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=62;PP=1990;SC=ACGATGAAAGTGGCCAGTGGT;SOR=1.635;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=30;TCR=63;TR=92;WE=17657624;WS=17657606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	17660499	rs874881	G	C	1818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=25;PP=1478;SC=TACCTCACCGGGGTGGGTAAG;SOR=1.107;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=37;TCR=25;TR=62;WE=17660507;WS=17660489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	17660660	rs874882	G	A	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=450;SC=CTGGGAGTTCGAAATATTCCA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=17660668;WS=17660650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	17660697	rs1548323	T	C	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=273;SC=CACAAAGAAATACAATGTGGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=17660705;WS=17660687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	17661128	rs1555658	A	C	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=13;PP=496;SC=TCAAATATCTATAACAAAAAG;SOR=2.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=17661136;WS=17661118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	17661659	rs71575828	C	CAT	156.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=276;SC=TATACACACACATATATATAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=17661667;WS=17661649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	17661805	rs1635594	A	G	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=17;PP=819;SC=AATCCTTACAACAATCCAGTG;SOR=0.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=31;WE=17661813;WS=17661795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	17662541	rs1748034	A	C	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=428;SC=AGAGGGGCTCACACTATGGGT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=17662549;WS=17662531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	17662639	rs2240340	T	C	1354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=10;PP=1138;SC=CTCCTCTTACTTGATGGGATT;SOR=2.038;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=37;WE=17662647;WS=17662629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	17662662	rs1748033	T	C	1790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=12;PP=1526;SC=AGAAATCTCCTTGTGCGCAGA;SOR=2.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=52;WE=17662670;WS=17662652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	17662751	rs1621005	C	G	2748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=49;PP=2076;SC=TCCTTTCCTACTTCTACTGGA;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=36;TCR=49;TR=85;WE=17662759;WS=17662741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	17662804	rs1748032	C	T	2005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=52;PP=1643;SC=CAAATGCTGGCCTGTCCCACG;SOR=4.139;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=6;TCR=52;TR=58;WE=17662812;WS=17662794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	17662907	rs1748031	A	T	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=319;SC=CAAAATCAGAATTTCACCAAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=17662915;WS=17662897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	17664329	rs1748025	C	G	66.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=1;PP=76;SC=AGAATCACTTCAACCTGGGGG;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=17664337;WS=17664327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	17664770	rs1635586	A	G	285.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=236;SC=CTTGTTGGCAAATCTGTTTTA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=17664778;WS=17664760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	17668270	rs1748021	A	G	149.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=119;SC=TCCCAGCTAGAACTTCAGTCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=17668278;WS=17668263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	17674402	rs2240336	C	T	2353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=6;PP=2001;SC=CCAGGCAGCACGCGCAACAGC;SOR=4.615;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=70;TCR=6;TR=76;WE=17674410;WS=17674392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	17674537	rs2240335	C	A	5992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=96;PP=2965;SC=CCATCAAACGCGTGATGGTAC;SOR=0.776;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=186;TCF=89;TCR=97;TR=185;WE=17674545;WS=17674527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr1	17685718	.	A	C	56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5026;HP=10;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=17;MQ=57.88;NF=5;NR=0;PP=56;QD=18.1542425094;SC=ACTGTCCCCCACCCCCACCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=5;WE=17685726;WS=17685708;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr1	17707739	rs1204898	T	C	1083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=24;PP=844;SC=TCCAGACTAATTTTCTCCACC;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=17707747;WS=17707729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	17707798	rs10788668	C	T	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=14;PP=398;SC=GCTGATCAAACCTTTTGTCCT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=17707806;WS=17707788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	17708349	rs7556072	G	A	1630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=0;PP=1439;SC=GCAAAAGGCAGGGGGTCCTTG;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=50;WE=17708357;WS=17708339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	17714864	rs6696295	T	C	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=1;PP=579;SC=CCATCCCTTCTTTCTCTCCTA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=17714872;WS=17714854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	17715081	rs2526842	C	T	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=692;ReadPosRankSum=1.573;SC=GATGGGTCCTCAGACTAGGAT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=27;WE=17715089;WS=17715071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr1	17715135	rs2526841	T	C	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=13;PP=536;SC=GGGCAGAGCTTGAGGTTTGCT;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=21;WE=17715143;WS=17715125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	17715475	rs2800688	T	C	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=7;PP=216;SC=CTAGGACCTCTCACCAGGAGA;SOR=1.402;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=17715483;WS=17715465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	17718671	rs10709483	AG	A	2353.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=35;PP=2124;SC=AGCAACAGCCAGGGTGGCATC;SOR=0.990;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=52;WE=17718679;WS=17718661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	17718750	rs12737852	C	T	1169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=30;PP=893;SC=ACCCACCTGTCGGGGAGGGGT;SOR=3.442;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=35;WE=17718758;WS=17718740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	17720439	rs6695849	T	C	1871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=18;PP=1383;SC=GATGTGTGACTGGCAAACAAT;SOR=1.888;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=61;WE=17720447;WS=17720429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	17720545	rs12073549	C	T	2571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=37;PP=1913;SC=CTCAGGCCGCCGATCTCGATG;SOR=0.717;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=38;TCR=37;TR=75;WE=17720553;WS=17720535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	17720615	rs10458537	A	C	2145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=35;PP=1659;SC=AGCTCAGTCCAATCTCTCAGG;SOR=1.146;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=26;TCR=35;TR=61;WE=17720623;WS=17720605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	17720686	rs34075690	AG	A	1998.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=22;PP=1766;SC=GTGGCCTCTGAGGGGGGAGGG;SOR=1.503;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=68;TCF=40;TCR=28;TR=56;WE=17720694;WS=17720676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	17721388	rs6691485	C	T	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=22;SC=CACCAAGTGGCGGGTGACCAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=17721396;WS=17721381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	17721695	rs35197313	GT	G	844.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=17;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=14;PP=308;SC=GCTTTTTCTTGTTTTTTTTTT;SOR=2.636;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=15;WE=17721715;WS=17721685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	17721707	rs12239645	T	G	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.31;SOR=2.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	17725358	rs2244936	C	G	2590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=66;PP=2103;SC=GGGGCGACTGCGCATCCCTGG;SOR=3.202;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=13;TCR=66;TR=79;WE=17725366;WS=17725348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	17738570	rs71014950	AC	A	3278.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=60.11;NR=33;SC=GCCATGAGCCACCCTGACTGG;SOR=1.085;Source=Platypus;TCR=38;WE=17738578;WS=17738560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	17739820	rs1075535	T	C	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=27;PP=692;SC=GTGGCGTGCCTGTGCAGTCCT;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=17739828;WS=17739810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	17740357	rs2003871	G	A	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=243;SC=AGCCGGGCACGGTGGTTCACA;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=17740365;WS=17740347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	17914057	rs34417109	G	A	5114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=66;PP=2965;SC=GAGGACACCAGCGCAGCCCTG;SOR=0.995;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=90;TCR=66;TR=156;WE=17914065;WS=17914047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr1	17914846	rs1193343	C	T	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=0;PP=305;SC=CTGTCTGCGGCGCCCCTGGGG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=17914854;WS=17914836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	17929980	rs1193338	C	G	1743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=15;PP=1280;SC=CGGTGGTGCTCTCTCTCCCCA;SOR=1.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=52;WE=17929988;WS=17929970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	17949562	rs55693639	C	T	2073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=21;PP=1636;ReadPosRankSum=1.719;SC=TGGTGTTCTTCCGCGTGAAGG;SOR=0.715;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=67;WE=17949570;WS=17949552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,68:0.99:69
chr1	17961345	rs34725104	C	T	1958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=5;PP=1533;SC=AGCTGGAGATCAGCAGCCTGG;SOR=4.479;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=52;TCR=5;TR=57;WE=17961353;WS=17961335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	17991052	rs6695710	T	C	2365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=34;PP=1800;SC=CTGTGGGCCCTGGGTCACTGT;SOR=1.058;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=46;TCR=34;TR=80;WE=17991060;WS=17991042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	18017522	rs871087	T	C	2539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=18;PP=1996;SC=AACAATTTATTGCACTTCCTT;SOR=2.542;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=64;TCR=18;TR=82;WE=18017530;WS=18017512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	18017558	rs871088	A	G	3367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=41;PP=2626;SC=TTCCACTCGCATACTCGACTG;SOR=1.476;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=77;TCR=41;TR=118;WE=18017566;WS=18017548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	18017704	rs871089	C	T	2901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=80;PP=2406;SC=TGAACACTGCCGCATTAAGTC;SOR=4.223;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=8;TCR=80;TR=88;WE=18017712;WS=18017694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	18021406	rs905389	T	C	2364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=24;PP=1850;SC=AATGCATCCGTATGGCAGCCC;SOR=1.704;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=75;TCF=51;TCR=24;TR=74;WE=18021414;WS=18021396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	18021444	rs41267491	G	T	2930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=38;PP=2362;SC=AACTGAGGCTGGTTAGGGGAG;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=54;TCR=38;TR=92;WE=18021452;WS=18021434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	18023290	rs2270979	C	T	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=6;PP=625;SC=CAGGTGCTTCCCTTAATGCGC;SOR=2.226;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=18023298;WS=18023280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	18023365	rs2270978	C	T	1795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=20;PP=1410;SC=TCTCACTCAACGGGCACTGTG;SOR=1.382;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=37;TCR=20;TR=57;WE=18023373;WS=18023355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	18023509	rs2270977	T	C	1348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=20;PP=1023;SC=CCATGCCCGATAGCCACGTGG;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=21;TCR=20;TR=41;WE=18023517;WS=18023499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	18023690	rs2270976	A	G	3021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=55;PP=2360;SC=CGACCCCGACATCTGGGTGCG;SOR=0.791;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=50;TCR=55;TR=105;WE=18023698;WS=18023680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr1	18023997	rs3835471	G	GC	367.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=4;PP=530;SC=AACTACTTGGGCAGAGCAAAG;SOR=1.270;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=18024005;WS=18023987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	18149510	rs694214	G	T	2627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=9;PP=2178;ReadPosRankSum=-1.278;SC=CGCCATGGCTGCAAGAACCGT;SOR=1.462;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=84;TCF=74;TCR=10;TR=80;WE=18149518;WS=18149500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,82:0.98:84
chr1	18149566	rs2296035	C	A	6203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=142;NR=57;PP=2965;ReadPosRankSum=1.859;SC=GCACGGCCGGCTGGAATGAGC;SOR=0.876;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=200;TCF=143;TCR=57;TR=199;WE=18149574;WS=18149556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,200:1.00:201
chr1	18554345	rs61762155	T	C	2931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=19;PP=2366;ReadPosRankSum=1.256;SC=GCCCAGCCCCTCTGATCTGCT;SOR=1.508;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=73;TCR=19;TR=91;WE=18554364;WS=18554335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,93:0.99:94
chr1	18554356	rs3738087	C	T	3081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=27;PP=2553;SC=CTGATCTGCTCGTGCCCTTAC;SOR=2.141;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=73;TCR=27;TR=100;WE=18554364;WS=18554335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	18702988	rs10796450	T	C	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=21;PP=459;SC=ACTCTTCCTTTGATCCCCAGC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=18702996;WS=18702978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	18807897	rs2992755	C	G	3378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=37;PP=2533;SC=CCTTGCTGCCCCAGCCAGGAA;SOR=1.550;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=74;TCR=37;TR=110;WE=18807905;WS=18807887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	18807953	rs11261022	C	A	5231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=105;NR=52;PP=2965;SC=CCATTTCCCCCGCTTGGGCAG;SOR=1.565;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=105;TCR=52;TR=157;WE=18807961;WS=18807943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr1	18808292	rs2992753	C	A	4742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=70;NR=74;PP=2965;SC=AATGGAGGAGCATTTCATACA;SOR=0.734;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=70;TCR=74;TR=144;WE=18808300;WS=18808282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	18808465	rs3007718	T	A	2734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=58;PP=2316;SC=GAACAGGGGCTGCCTCGGGAG;SOR=1.455;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=31;TCR=58;TR=89;WE=18808473;WS=18808455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	18808526	rs2992752	A	C	2783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=43;PP=2262;SC=CTCCCCGCAGACAGGGCCGTG;SOR=0.791;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=39;TCR=43;TR=82;WE=18808534;WS=18808516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	18809896	rs2992745	A	T	2116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=50;PP=1435;SC=TTCTAGGCAAACAGGCAACCC;SOR=7.978;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=50;WE=18809904;WS=18809886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	18810344	rs2992740	G	T	1486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=3;PP=1176;SC=GGCCAGGAAGGAGCCGAGGGA;SOR=4.849;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=42;TCR=3;TR=45;WE=18810352;WS=18810334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	19071153	.	C	CGGAT	490	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=27;MQ=55.67;NF=14;NR=0;PP=490;QD=35.5714285714;SC=GTAGACAGGACGGATGGATGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=14;WE=19071161;WS=19071143;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,14:0.67:21
chr1	19071179	rs140528968	GATAA	G	105	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.06;QD=26.25;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	19071183	.	AATGG	A	743	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MMLQ=28;MQ=57.15;NF=16;NR=0;PP=743;QD=46.6875;SC=TGGATGGATAAATGGATGGAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=16;WE=19071194;WS=19071173;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,16:0.80:20
chr1	19071187	.	G	GATAA	105.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.91;QD=26.27;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	19166100	rs9988418	C	T	1801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=18;PP=1498;SC=GCACTAGTCCCTCCTCATGGT;SOR=1.773;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=58;WE=19166108;WS=19166090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	19166894	rs11805253	G	A	2702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=39;PP=2163;SC=AGCCCAGGGCGGCCAGCAGGG;SOR=0.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=45;TCR=39;TR=84;WE=19166902;WS=19166884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	19168158	rs9988403	G	C	1488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=2;PP=1038;SC=AAGCCCTAGAGACTCCAGGGG;SOR=4.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=37;WE=19168166;WS=19168148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	19168181	rs139650135	AG	A	1991.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=3;PP=1866;SC=GGGCAGGGGCAGGGCAGGGGC;SOR=4.935;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=46;TCR=3;TR=45;WE=19168189;WS=19168171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	19168478	.	G	A	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=6.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.400;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr1	19186129	rs9701796	G	C	3162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=47;PP=2347;SC=GAACAGGGAGGAGATGGTCTT;SOR=0.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=46;TCR=47;TR=93;WE=19186137;WS=19186119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	19186260	rs9700646	C	T	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=32;PP=956;SC=GTCCTGCCACCGACTGTGGGG;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=19186268;WS=19186250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	19186320	rs9701803	G	C	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=16;PP=482;SC=GGAAAGGAGGGTGGAATTATG;SOR=4.514;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=19186328;WS=19186310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	19199473	rs28700162	T	A	2095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=43;PP=1482;SC=ACACTTCTGTTTTTCTCTGAA;SOR=1.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=26;TCR=43;TR=69;WE=19199481;WS=19199463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	19200908	rs28529092	G	C	4130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=59;PP=2965;SC=AACATCTAGGGTCTCCCACCA;SOR=0.854;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=68;TCR=59;TR=127;WE=19200916;WS=19200898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	19201184	rs6665917	G	C	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=17;PP=395;SC=AGGTTCAACAGGAGGCCGAGT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=19201192;WS=19201174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	19201956	rs2230708	A	G	2046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=30;PP=1600;SC=TGTACTTGTCATCCGGGTAGA;SOR=1.073;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=41;TCR=30;TR=71;WE=19201964;WS=19201946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	19202770	rs7550822	T	C	1915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=34;PP=1591;SC=TCCGGTGGGATTGTCCTCCTC;SOR=0.899;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=28;TCR=34;TR=62;WE=19202778;WS=19202760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	19202917	rs7550938	T	C	1594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.97;SOR=1.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	19202926	rs2230706	T	C	1510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.78;SOR=1.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	19204154	rs6426813	G	A	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=8;PP=276;SC=TGGCTCCCCCGGTTGCCCAGG;SOR=1.179;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=12;WE=19204162;WS=19204144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	19205672	rs28497538	T	G	1212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=16;PP=892;SC=GCAGTGCTGGTGCCTGAAATG;SOR=1.151;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=24;TCR=16;TR=40;WE=19205680;WS=19205662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	19205729	.	T	C	1413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=28;PP=1188;SC=CTCCCTCCTCTTTCATAATGG;SOR=1.230;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=46;WE=19205737;WS=19205719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	19208145	rs112548638	G	GGGTTGCCT	1916.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=7;PP=2236;SC=CAGGTGAGCAGGTGAACGTCC;SOR=2.531;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=29;WE=19208153;WS=19208135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	19208944	rs28566028	A	G	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=275;SC=GCTGGGCTGCACCTCCCCCAC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=13;WE=19208952;WS=19208934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	19209543	rs6426611	A	G	952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=5;PP=745;SC=CAAGGGGCTCAGGGTGGCCTC;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=19209551;WS=19209533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	19215834	rs941495	T	C	5563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=107;NR=61;PP=2965;SC=GGGGCTGAGCTCTGCCCACCC;SOR=1.334;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=108;TCR=61;TR=168;WE=19215842;WS=19215824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr1	19223379	rs184659760	G	C	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.319;NF=26;NR=0;PP=801;ReadPosRankSum=0.136;SC=AGAGTGAGACGATGTCTCAAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=26;WE=19223394;WS=19223369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr1	19238001	.	T	TTTTA	806.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.94;QD=42.46;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	19243589	rs3748586	A	G	1500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=38;PP=1147;SC=CTAGGATGGAAGGTAGGGGTG;SOR=2.124;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=51;WE=19243597;WS=19243579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	19282981	rs1886768	A	C	221.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=8;PP=157;SC=GCCTCCGCAGAGACGGCAGGA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=19282989;WS=19282971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	19401405	rs2281748	G	A	3200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=45;PP=2591;SC=AAAGCACAACGGGCAGAGGTG;SOR=1.051;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=56;TCR=45;TR=101;WE=19401413;WS=19401395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	19411129	rs1043905	A	G	2309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=44;PP=1843;SC=GTTTGATGTCATGGATGTTGA;SOR=1.121;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=30;TCR=44;TR=74;WE=19411137;WS=19411119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	19412464	rs2274009	C	T	251.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=176;SC=TTGAGTAAGCCTCCATCCCCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=19412472;WS=19412460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	19413261	rs12584	T	A	2291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=36;PP=1877;SC=TTATTCTCCATCTCCTCCAAG;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=39;TCR=36;TR=75;WE=19413269;WS=19413251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	19413420	rs2274008	T	G	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=402;SC=ATGCCTTGGGTTTCAGGTTGC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=19413428;WS=19413410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	19415304	rs1043899	C	T	1137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=3;PP=910;SC=TGGCCATGCGCTTCTTCTCTG;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=35;WE=19415312;WS=19415294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	19420392	rs1106839	G	A	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=323;SC=GACCTAGTTCGGCGTTTTAGT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=19420400;WS=19420382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	19426071	.	A	C	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.814;ClippingRankSum=0.000;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.666;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=901;ReadPosRankSum=-1.082;SC=ACACCTCCAAACGAGAAAGCA;SOR=0.392;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=104;TCF=58;TCR=46;TR=50;WE=19426079;WS=19426061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,51:0.49:104
chr1	19426199	rs2236377	G	A	1503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=44;PP=1305;SC=TGAAGCTGTTGTTCCAAATAA;SOR=4.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=5;TCR=44;TR=49;WE=19426207;WS=19426189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	19431270	.	C	G	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=280;ReadPosRankSum=-0.583;SC=GTTACATCTTCTTAATCGAAC;SOR=0.760;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=14;WE=19431278;WS=19431260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr1	19433449	rs6426677	A	G	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=360;SC=TGAGGGCCTCAACGGGGACAT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=19433457;WS=19433439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	19440107	rs9661719	A	G	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=332;SC=CTGGACTGCTAGATGAGAGAG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=19440115;WS=19440097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	19441594	rs56030256	C	G	270.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=7;PP=223;SC=ACTTAAGCAGCCAGGTAACAA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=19441602;WS=19441584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	19444552	rs17392444	G	A	367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=315;SC=AAGGACACAGGAGAAATCCCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=19444560;WS=19444542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	19447819	rs35802543	T	C	2003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=27;PP=1094;SC=AGGCTGCCAGTGCAGCGAGCA;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=45;WE=19447827;WS=19447809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	19447843	rs1044010	C	G	2133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=27;PP=1353;SC=TGCTGCCGCACAGAGCACAGG;SOR=0.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=23;TCR=27;TR=50;WE=19447851;WS=19447833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	19448326	rs6681662	C	T	1892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=10;PP=1429;SC=ATCTTGTTCACAGCTATATCT;SOR=2.948;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=46;TCR=10;TR=56;WE=19448334;WS=19448316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	19448608	rs7535738	C	G	77.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=57;SC=TTGGACTACACCTGAACATGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=19448616;WS=19448598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	19450938	rs6681943	G	A	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=623;SC=TCTGCAAGGGGAAATACCAAG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=19450946;WS=19450928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	19474975	rs2296108	T	G	2415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=23;PP=1771;SC=TTCTTTAGCTTCGAGGCCTCA;SOR=1.673;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=71;WE=19474983;WS=19474965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	19483209	rs10799710	A	G	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=7;PP=789;SC=GGGGAGAGAAAATGACTAGAA;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=19483217;WS=19483199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	19486839	rs946419	T	C	999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=34;PP=819;ReadPosRankSum=0.592;SC=GGATAATACTTGTAAAAATCA;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=37;WE=19486847;WS=19486829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr1	19487656	rs3748759	T	C	2370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=49;PP=1713;SC=GGACAGAAAATGTCAGAGTCC;SOR=1.367;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=29;TCR=49;TR=78;WE=19487664;WS=19487646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	19491514	rs12133185	G	C	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=9.031;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=453;ReadPosRankSum=0.456;SC=CAAGAGGCCAGGGTCAGTAAA;SOR=3.989;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=21;WE=19491522;WS=19491504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr1	19491857	rs3748757	T	C	3641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=88;PP=2720;SC=GGAGGCAAGATGGGAGAAAAA;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=39;TCR=90;TR=126;WE=19491865;WS=19491847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	19499835	rs951908	G	C	4522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=85;PP=2965;SC=TTTAGGAGATGACTATAGGCA;SOR=1.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=47;TCR=85;TR=131;WE=19499843;WS=19499825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr1	19499873	rs952789	G	T	2896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=60;PP=2232;ReadPosRankSum=-1.727;SC=AAATTTAAAAGCTCCAGTAAG;SOR=1.634;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=29;TCR=61;TR=88;WE=19499881;WS=19499863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,95:0.98:97
chr1	19499954	rs952790	G	A	2325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=41;PP=1780;SC=TGACATAGGAGCTGATCCGGA;SOR=1.179;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=71;TCF=30;TCR=41;TR=68;WE=19499962;WS=19499944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	19500729	rs6694521	G	A	1684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=6;PP=1298;SC=CAATAAACTGGTTACATTTCA;SOR=3.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=46;WE=19500737;WS=19500719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	19510394	rs3762396	A	G	4627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=41;PP=2965;SC=GATGAACCTTAAAGACAAGTA;SOR=1.785;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=92;TCR=41;TR=133;WE=19510402;WS=19510384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	19513570	rs59833909	TTA	T	610.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=475;SC=CAAGAAAGTTTTATATATATA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=19513579;WS=19513560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	19518659	rs11588032	G	A	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=4;PP=929;SC=CAAAATATAAGTTATAATCAA;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=19518667;WS=19518649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	19519782	rs10799734	C	T	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=0;PP=1068;SC=AAGCTGGATGCCTACCTCTTA;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=37;WE=19519790;WS=19519772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	19526363	rs12122656	A	G	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=19;PP=515;SC=ACAATTATTCAGAGCCAAAAA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=19526371;WS=19526353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	19554099	rs7515397	T	G	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=423;SC=AGTGGCTCATTCTTGTAATCC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=19554107;WS=19554089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	19557281	rs12128595	G	C	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=0;PP=682;SC=TAGCCAAATGGCCAGGAAACA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=19557289;WS=19557271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	19557713	rs2275403	G	C	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=12;PP=439;SC=GCCCCAAACCGGACTCCGCTA;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=19557721;WS=19557703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	19558018	rs55748756	C	T	1075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=27;PP=837;SC=TGTGGGGGTTCTCTAGTCTTT;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=30;WE=19558026;WS=19558008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	19559729	rs16862625	A	G	147.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=118;SC=CCTCTGGAGCAATAAAGTCCA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=19559737;WS=19559719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	19565338	rs709682	C	T	5712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.34;SOR=1.591;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	19565344	rs709683	C	G	5863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.42;SOR=1.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	19568722	rs710866	G	C	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=350;SC=ACACTCCATGGAACACCAACA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=19568730;WS=19568712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	19568972	rs710865	A	G	1019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=25;PP=847;SC=TGGAAACTGAACACAAGTACA;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=32;WE=19568980;WS=19568962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	19570426	rs2294944	C	G	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=3;PP=490;SC=AATGGAGACACGGGAGGACTC;SOR=2.925;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=19570434;WS=19570416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	19578192	rs2294942	G	A	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=2;PP=303;SC=GCGGCGGCTTGGCAGGGAGAG;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=19578200;WS=19578182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	19582563	rs1557133	G	A	1509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=35;PP=1148;SC=GGCAGGGGGAGGAAGGCCCTT;SOR=1.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=47;WE=19582571;WS=19582553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	19583400	rs1774075	A	G	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=3;PP=693;SC=AAGGGACCCCAACGTGGGGAC;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=19583408;WS=19583390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	19583734	rs4912057	G	A	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=9;PP=361;SC=TTGGCAGGCCGGAGGCTCAGG;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=19583742;WS=19583724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	19595137	rs2235795	C	T	1987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=11;PP=1646;SC=GCGCCATACGCGGCCTGCAGG;SOR=2.948;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=51;TCR=11;TR=61;WE=19595145;WS=19595127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	19595892	rs6665423	G	A	2337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=63;PP=1955;ReadPosRankSum=-0.759;SC=ATCAGCCCCCGGGCCCAGAGT;SOR=2.613;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=7;TCR=64;TR=70;WE=19595900;WS=19595882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
chr1	19596124	rs2235794	C	T	512.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.457;NF=18;NR=1;PP=441;ReadPosRankSum=-0.536;SC=GTGCCTGAGGCAGGGGAAGAG;SOR=3.160;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=19;WE=19596132;WS=19596114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr1	19596156	rs6665756	G	T	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.337;NF=28;NR=4;PP=812;ReadPosRankSum=-0.671;SC=CCTGCCGGGTGGTGGCGCTGT;SOR=2.242;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=32;WE=19596164;WS=19596146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chr1	19597420	rs12046875	G	T	2388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=46;PP=1813;SC=GGCCTTGGTAGCAATTTTCAC;SOR=1.379;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=29;TCR=46;TR=75;WE=19597428;WS=19597410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	19609254	rs1738025	T	C	4827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=70;NR=85;PP=2965;SC=CATTCGTGAGTAACCAAATGC;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=70;TCR=85;TR=155;WE=19609262;WS=19609244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr1	19609437	rs12070508	T	C	200.41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.50;MQRankSum=-1.534;QD=25.05;ReadPosRankSum=0.489;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr1	19609522	rs140599506	G	A	164.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.80;MQRankSum=-1.465;QD=23.44;ReadPosRankSum=1.465;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr1	19611241	rs1738023	T	C	4934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=113;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.628;SC=TGTTTCCCATTCTTGTCCTCA;SOR=1.240;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=148;TCF=34;TCR=114;TR=147;WE=19611249;WS=19611231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,151:0.99:152
chr1	19638309	rs2227295	A	G	309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=3;PP=167;SC=GAGGATCTGCAGCTACTGTTA;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=19638317;WS=19638299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	19652132	rs214315	T	G	75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=6;PP=156;SC=GGGGCAGTTGTGGGGGGGGGC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=19652140;WS=19652122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	19652874	rs41264079	G	A	1816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=14;PP=1458;SC=GTGGAGTCGGGCAGCAAGGTG;SOR=2.221;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=40;TCR=14;TR=54;WE=19652882;WS=19652864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	19683301	rs169957	G	T	1565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=38;PP=1127;SC=AGTGGCCCCTGGAATTCAGGG;SOR=3.958;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=43;WE=19683309;WS=19683291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	19923313	rs4912130	T	A	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=54;SC=CGCAAACCCATAGGCGCAGCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=19923321;WS=19923307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	19935118	rs138778783	T	TA	1134.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=18;PP=937;SC=AAAAAATAAATAAAAAAAGTG;SOR=0.793;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=32;WE=19935126;WS=19935108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	20097285	rs41311997	T	G	732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=21;PP=590;SC=TTAAATCCACTTACTTTCCCT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=20097293;WS=20097275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	20097822	rs11551819	G	A	1326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=26;NR=16;PP=1111;SC=CCGTCGGGTCGTCCTTCAAGA;SOR=1.364;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=42;WE=20097830;WS=20097812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	20097941	rs10917536	G	T	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=19;PP=533;SC=TCCAGCCACTGCACCAGGCCT;SOR=2.925;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=20097949;WS=20097931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	20305065	rs10732279	C	T	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=12;PP=690;SC=TGGGGTTCTGCGCCCTCCCTC;SOR=0.846;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=14;TCR=12;TR=26;WE=20305073;WS=20305055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	20446170	rs11298078	GT	G	800.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.60;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	20637043	rs12726937	C	T	1733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=2;PP=1406;SC=CCTCTTCCCACTTCCTGCCCT;SOR=5.709;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=50;TCF=48;TCR=2;TR=50;WE=20637051;WS=20637033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	20637374	rs10916761	T	C	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=44;PP=1453;SC=AATGGTGAGATTCTTTCTGCT;SOR=4.849;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=47;WE=20637382;WS=20637364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	20649814	rs4655194	T	C	3419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=25;PP=2539;SC=CTCTTGACCCTGATTGCCCAA;SOR=2.615;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=83;TCR=25;TR=108;WE=20649822;WS=20649804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	20657352	rs2072753	T	C	2377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=32;PP=1904;SC=CTCTTCTCCCTTTCCGCCAGG;SOR=0.984;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=40;TCR=32;TR=72;WE=20657360;WS=20657342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	20659380	.	G	C	2371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=49;PP=2014;SC=CTCTTCCCTGGAGAACGGCTG;SOR=1.547;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=25;TCR=49;TR=74;WE=20659388;WS=20659370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	20671833	rs10799629	C	A	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=566;SC=TTAAAGGCTTCTTTAATCCCA;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=20671841;WS=20671823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	20671961	rs11582960	G	A	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=22;PP=798;SC=TCCAACCGCCGCTACCAAGTG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=32;WE=20671969;WS=20671951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	20672101	rs4655200	C	T	389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=10;PP=313;SC=GGCAGGCGAGCGGCCGGGGGC;SOR=1.329;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=20672109;WS=20672091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	20676597	rs41264539	G	A	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=1;PP=466;SC=GAGGGGATGGGAGGCGAGGAA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=20676605;WS=20676587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	20676932	rs179471	T	A	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=576;SC=CACAGAGTACTCTGGTGACAG;SOR=4.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=20676940;WS=20676922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	20677490	rs80211240	C	A	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=442;ReadPosRankSum=-0.708;SC=TGGGGTTTTCCCTGACTTGGA;SOR=1.893;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=19;WE=20677498;WS=20677480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr1	20678394	rs41265045	G	A	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=0;PP=809;SC=CAGTTGCTTCGAGCCCATGTT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=20678402;WS=20678384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	20680718	rs2072751	G	A	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=1028;ReadPosRankSum=1.591;SC=TGAGAATCTCGAGTTCAATAT;SOR=0.409;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=42;WE=20680726;WS=20680708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr1	20680760	rs230180	A	G	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=9;NR=17;PP=614;SC=TGTGTAGTTGAGTGACGGGGA;SOR=1.688;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=26;WE=20680768;WS=20680750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	20829560	rs2641114	G	A	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=521;SC=TAATCTTAGCGATCACAAAGC;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=20829568;WS=20829550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	20940258	rs488991	T	A	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=3;PP=588;SC=ACAGACCGAGTCTCAGGGCCT;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=20940266;WS=20940248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	20964328	rs2298298	A	G	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=2;PP=438;SC=TTCTTTTCTCATCACAGGCAA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=20964336;WS=20964318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	20971875	rs3131712	G	A	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=58.45;NF=8;NR=2;PP=278;SC=CCAGCTACTCGGGAGGCTGAG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=20971883;WS=20971870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	20972048	rs3131713	G	A	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=14;PP=725;SC=TCCCCTCTCCGCCAGCTATCC;SOR=0.760;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=27;WE=20972056;WS=20972038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	20977221	rs686658	A	T	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=822;SC=CTAAAAGAACATGGCATCCTC;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=20977229;WS=20977211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	20978832	rs6893	T	C	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=2;PP=672;SC=ACCCCCCTCCTTGCCCCGTCT;SOR=4.332;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=20978840;WS=20978822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	20979307	rs11428148	G	GT	3266.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.274;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.212;NF=43;NR=47;PP=2936;ReadPosRankSum=-0.714;SC=GCCTGGGGCCGTTTCTGGCAG;SOR=0.447;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=99;TCF=44;TCR=55;TR=90;WE=20979315;WS=20979297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
chr1	20980880	rs607254	G	A	1993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=28;PP=1552;SC=AACAAAACGAGGCTGTGACCC;SOR=1.033;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=39;TCR=28;TR=67;WE=20980888;WS=20980870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	20981806	rs592851	G	A	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=2;PP=509;SC=ACTCGGCCTTGATATAACAAA;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=20981814;WS=20981796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	20982631	rs4704	G	A	2954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=41;PP=2218;ReadPosRankSum=1.741;SC=CACTGCCTCCGCCGTCAATAA;SOR=0.340;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=53;TCR=41;TR=93;WE=20982639;WS=20982621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,98:0.99:99
chr1	20987873	rs537816	G	C	1985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=32;PP=1581;ReadPosRankSum=-0.784;SC=GACCCAGCACGTGCACACCGG;SOR=0.622;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=22;TCR=33;TR=53;WE=20987881;WS=20987863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr1	20992606	rs630484	G	T	2308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=20;PP=1825;ReadPosRankSum=0.580;SC=CTCCGAGAGGGAAAGGAGTTT;SOR=0.693;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=77;TCF=57;TCR=20;TR=74;WE=20992614;WS=20992596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,78:0.98:80
chr1	20992819	rs631357	G	C	2393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=57;PP=1827;SC=TGTAGCGGTCGTCCTCCTGCC;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=11;TCR=57;TR=68;WE=20992827;WS=20992809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	21024901	rs522496	C	T	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=14;PP=1008;SC=TCGGCCTCCACGTCATGCTGG;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=21;TCR=14;TR=35;WE=21024909;WS=21024891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	21040079	rs10799661	C	A	1323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=25;PP=1002;SC=GAACCTAGACCTCAGAGCTCG;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=42;WE=21040087;WS=21040069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	21042157	rs61778523	C	T	2027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=34;PP=1537;SC=GGCAGGACCCCGTGCTCAGTG;SOR=0.957;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=26;TCR=34;TR=60;WE=21042165;WS=21042147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	21042300	rs554111	C	G	285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=193;SC=GGAGTTGACTCTCTGGTGGGG;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=21042308;WS=21042290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	21043913	rs604659	T	C	2362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=62;NR=8;PP=1855;SC=CCCTGGGGACTCTCGGGGCGG;SOR=4.003;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=62;TCR=8;TR=70;WE=21043934;WS=21043903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	21043926	rs604645	T	C	2959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=76;NR=14;PP=2296;SC=CGGGGCGGCCTCATGCCCTGC;SOR=3.407;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=76;TCR=14;TR=90;WE=21043934;WS=21043903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	21044161	rs601329	A	G	2460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=54;PP=1874;SC=GGTTCATGGGACGGCAGCGCA;SOR=1.996;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=21;TCR=55;TR=75;WE=21044169;WS=21044151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	21044219	rs601392	A	C	975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=26;PP=750;SC=CCCAGGACCAACGGGACCAGA;SOR=3.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=21044227;WS=21044209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	21050958	rs592060	C	T	3847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=87;PP=2965;SC=TCTGAGAGAGCTGATCACGGC;SOR=2.323;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=27;TCR=87;TR=114;WE=21050966;WS=21050948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr1	21052693	rs10916852	G	T	249.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=205;SC=CTTCACATGGGCCCTGGGGCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=21052701;WS=21052683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	21074221	rs76336624	T	C	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=572;ReadPosRankSum=1.186;SC=CACAAACAGATGCCCATCAAT;SOR=5.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=25;WE=21074229;WS=21074211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr1	21099846	rs589755	A	G	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=496;SC=AGGAAGCAGAACAAGATTTAT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=21099854;WS=21099836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	21143772	.	A	AAT	1042.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.45;SOR=6.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	21143780	.	TA	T	1135.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.06;SOR=6.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	21167404	rs2230573	A	G	1409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=14;PP=1074;SC=TGATAGAGTAATTGGCCCATG;SOR=1.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=43;WE=21167412;WS=21167394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	21175855	rs7525082	C	A	598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=502;SC=CCAAGTTATTCTATACTATCA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=21175863;WS=21175845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	21176042	rs74654140	A	C	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=7;NR=32;PP=1144;SC=GAGGCCCCCCAAAAAAAGTAA;SOR=4.680;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=39;WE=21176050;WS=21176032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	21179969	rs7542882	G	A	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=3;PP=451;SC=CATAAGGATTGCTATCAAAAC;SOR=3.160;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=21179977;WS=21179959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	21180013	rs3767244	C	T	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=6;PP=575;SC=TACTGGCAAGCGGGCCAGCCT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=21180021;WS=21180003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	21267707	rs140407848	GCAA	G	908.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=1002;SC=TGAGGCAATAGCAACAACAAC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=22;WE=21267717;WS=21267697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	21295864	rs2271115	C	T	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=1;PP=340;SC=TGCGAGACAACTGATGGAAAT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=21295872;WS=21295854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	21299363	rs6700718	C	A	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=114;SC=AGTGGTGTGACTATAAGGGAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=21299371;WS=21299359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	21307733	rs199719743	GA	G	290.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.63;MQRankSum=1.047;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.691;SOR=0.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr1	21324191	rs41265977	A	C	1825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=35;PP=1417;SC=ACCACAACAAAAACCAAAATT;SOR=1.217;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=56;WE=21324199;WS=21324181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	21325360	rs885363	C	A	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=23;NR=5;PP=746;SC=ATTTAAGGAGCAAAAATATAT;SOR=2.985;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=21325368;WS=21325350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	21327637	rs1395508	C	T	3950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=102;NR=15;PP=2965;SC=GTCAAAAATACTAAGTGCCAG;SOR=3.686;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=102;TCR=15;TR=117;WE=21327645;WS=21327627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr1	21329128	rs2174689	T	C	4426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=27;PP=2965;SC=GTAAAAATATTTGCCAAAGAA;SOR=3.160;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=139;TCF=111;TCR=28;TR=138;WE=21329136;WS=21329118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr1	21377314	rs6426663	C	T	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=3;PP=580;SC=AAAATGATGCCTTTACAGGGA;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=21377322;WS=21377304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	21494634	rs61779121	C	T	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=320;SC=TGGTGGCTCACGCCTGTAATC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=21494642;WS=21494624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	21548068	rs2076281	A	G	296.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.9988;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=212;ReadPosRankSum=-0.551;SC=CTTCACTGGTACTTTGGGCCC;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=21548076;WS=21548058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr1	21554319	rs6426676	A	G	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=484;SC=CTGCAACCTGAAGCACTGGGG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=21554327;WS=21554309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	21671943	rs2072654	T	G	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=2;PP=49;SC=CCGGGTTCCCTGCTCCCAGCC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=21671951;WS=21671933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr1	21752752	rs142857455	G	A	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.78;QD=40.43;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	21752762	rs144559882	T	A	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.55;QD=40.98;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	21753468	rs200991536	T	A	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.31;MQRankSum=-2.218;QD=2.34;ReadPosRankSum=1.083;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr1	21754774	.	G	C	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.78;QD=27.51;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	21754996	rs12024079	C	T	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.98;QD=30.48;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	21755142	rs45527539	C	T	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=26.26;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	21795432	rs35175190	G	GA	2660.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=54;PP=2651;SC=GATGAATGATGTCCTGTCTTC;SOR=4.080;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=61;TCF=5;TCR=56;TR=58;WE=21795440;WS=21795422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	21799489	rs1971327	T	C	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=20;PP=469;SC=CTGGCATCTATGATGGGCCGA;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=21799497;WS=21799479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	21799823	rs1971328	A	G	643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=557;SC=CTGGTGTCCAATCCCTCTGTG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=21799831;WS=21799813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	21800185	rs7520015	T	G	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=816;SC=TCTATTATGGTATTCTTAACA;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=21800193;WS=21800175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	21801346	rs7531217	G	A	1225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=0;PP=994;SC=GTCATATGTGGAGTGTGAATT;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=21801354;WS=21801336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	21804815	rs7535654	T	G	794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=25;PP=663;SC=GTACTCCATTTTGAAGGTGAT;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=21804823;WS=21804805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	21805730	rs2316504	A	G	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=644;SC=AAAGTCTCCTATTCTCACACT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=21805738;WS=21805720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	21806525	rs41290414	A	T	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=18;NR=0;PP=541;SC=CTTATTCTTTACTTTTCCTAC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=21806533;WS=21806515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	21806751	rs12083322	C	T	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=728;SC=TAAGACTCCACCTGGTCCTCC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=21806759;WS=21806741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	21808159	rs71512991	G	A	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.62;QD=26.62;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	21809750	rs202069483	T	C	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.60;QD=33.55;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	21880818	rs142935969	C	CATAT	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=242;SC=ACTCTTTTCCCATATATATAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=21880826;WS=21880808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	21889635	rs1780316	T	C	2294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=32;PP=1574;SC=TCCCTGACAGTGCCGGCACCG;SOR=0.798;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=39;TCR=32;TR=71;WE=21889643;WS=21889625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	21890464	rs1767428	A	G	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.53;SOR=3.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	21900420	rs2275370	A	G	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=29;PP=971;SC=TTAGGAGAATAGGTTGTGGAA;SOR=3.086;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=34;WE=21900428;WS=21900410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	21904108	rs3200256	G	T	2747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=75;PP=2244;SC=TGCTGCTCGCGCTGGCCCTCT;SOR=6.568;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=77;TCF=2;TCR=75;TR=77;WE=21904116;WS=21904098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	21925108	.	T	C	25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;FR=0.9998;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=25;QD=29.8856062736;SC=ACCCGTACCCTCTGCGAGGAG;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=21925116;WS=21925098;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	21926187	rs1767445	C	T	256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=7;PP=176;SC=CCTTGCCCTCCCCAACCCGGG;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=21926195;WS=21926177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	21929260	rs829368	A	G	2537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=29;PP=2086;SC=AGGGATGGGGATGCAGGGGAA;SOR=1.252;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=47;TCR=29;TR=76;WE=21929268;WS=21929250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	21929456	rs3215988	GC	G	472.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=328;SC=GAGCCCCAGTGCCCCCCCCAC;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=14;WE=21929464;WS=21929446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	21930542	rs3767111	C	T	483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=12;PP=387;SC=AGGAAGAGAACGGTGCAGGAG;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=21930550;WS=21930532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	21932530	rs1767443	C	A	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=4;PP=376;SC=AGGGAGGGGCCGGGGCCTGGG;SOR=2.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=21932538;WS=21932520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	21932625	rs2275365	G	A	1103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=23;NR=15;PP=857;SC=TGGTGGACACGGTGTTGGGCT;SOR=1.121;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=38;WE=21932633;WS=21932615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	21934678	rs3736386	C	G	2533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=32;PP=1907;SC=TCCCTGCTCCCCGGCCAGTTA;SOR=1.204;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=52;TCR=32;TR=84;WE=21934686;WS=21934668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	21935433	rs861212	G	T	1192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=24;PP=943;SC=CAGGCCCCTGGAAACTCCCAG;SOR=1.292;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=40;WE=21935441;WS=21935423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	21940555	rs2275363	C	T	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=27;PP=866;SC=CCGAGGGCAGCGTCCAGTGAG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=21940563;WS=21940545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	21943781	rs2275361	C	A	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=4;PP=754;SC=AGCCCCGCTGCACCAGCCGGC;SOR=3.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=21943789;WS=21943771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	21946415	rs1681255	G	A	1601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=0;PP=1285;SC=CTGTCCTCAGGGAGGTGAAGG;SOR=7.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=44;WE=21946423;WS=21946405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	21953304	rs1531829	G	A	5648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=127;NR=47;PP=2965;SC=CAGGGCTACCGCTATTACGAA;SOR=2.089;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=128;TCR=48;TR=174;WE=21953312;WS=21953294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr1	21953436	rs829412	A	G	4671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=102;PP=2965;SC=CCCACTTTACAGACAGGACCC;SOR=2.505;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=136;TCF=34;TCR=102;TR=136;WE=21953444;WS=21953426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr1	21961091	rs829380	C	T	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=1;PP=604;SC=CACATGGGGCCGCCACCCTCG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=21961099;WS=21961081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	21961339	rs10799706	A	T	4054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=88;PP=2965;SC=CACCCCACCGAGGACTTCAGT;SOR=1.628;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=131;TCF=43;TCR=88;TR=130;WE=21961347;WS=21961329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	22013561	rs829420	C	A	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=311;SC=TCTACTGTAACAATATGTGGA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=22013569;WS=22013551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	22013771	rs10493008	G	A	3045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=36;NR=54;PP=2263;SC=CCACAAGGGAGAGGGAGTCTG;SOR=1.122;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=36;TCR=54;TR=90;WE=22013779;WS=22013761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	22016678	rs11422483	T	TA	193.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQRankSum=-0.348;QD=13.84;ReadPosRankSum=0.390;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr1	22032472	rs11426922	A	AT	1243.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=12;PP=1429;SC=TATTCATTTAATTAATAGAAA;SOR=1.432;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=34;WE=22032480;WS=22032462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	22050649	rs2275668	C	A	2294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=62;PP=1899;SC=CTAAGTGATACATTCATTTTT;SOR=5.136;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=4;TCR=62;TR=66;WE=22050657;WS=22050639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	22063149	rs10753517	G	A	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=14;PP=456;SC=TAAAAGAAACGTTGGATAACA;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=22063157;WS=22063139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	22082923	rs10458384	G	A	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=0;PP=1051;SC=GCAGTGAACCGAGATGGCGCC;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=35;WE=22082931;WS=22082913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	22082967	rs35545280	CA	C	593.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQRankSum=-0.525;QD=15.22;ReadPosRankSum=0.399;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,36:0.92:39
chr1	22109370	rs10917042	G	A	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=13;PP=508;SC=CGGTCTCGATGTGCTCCTGCG;SOR=0.770;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=11;TCR=13;TR=24;WE=22109378;WS=22109360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	22141206	rs10917051	A	C	3312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=70;PP=2684;SC=TGCGGCCTGAACATCCCGGTG;SOR=2.040;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=23;TCR=70;TR=93;WE=22141214;WS=22141196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	22147764	rs6684152	A	G	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=258;SC=GAGCCAGACCATGTGAGTTCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=22147772;WS=22147759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	22148164	rs6695528	G	A	1273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=30;PP=1038;SC=TAGGTGATGGGGACGGGGCAG;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=22148172;WS=22148154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	22149935	rs897467	T	C	2658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=46;PP=2210;ReadPosRankSum=-0.545;SC=CTGTGATGCCTGAGGAGAATC;SOR=0.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=98;TCF=51;TCR=47;TR=97;WE=22149943;WS=22149925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,91:0.99:92
chr1	22150118	rs1138469	C	T	3814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=65;PP=2965;SC=CCGATGTAGACGCTGCCCTTG;SOR=0.724;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=67;TCR=65;TR=132;WE=22150126;WS=22150108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	22154845	rs2228347	A	G	4161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=91;PP=2965;ReadPosRankSum=0.137;SC=ATGGGGAGCTATCATAGCATT;SOR=0.774;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=130;TCF=38;TCR=92;TR=129;WE=22154853;WS=22154835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,134:0.99:135
chr1	22154987	rs10917052	G	A	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=19;PP=743;SC=TACCAGCAGGGAGAAGAATGC;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WE=22154995;WS=22154977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	22157689	rs3736355	G	A	4914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=101;PP=2965;SC=GCCAGGTGGTGTGTGGGGTGT;SOR=1.344;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=57;TCR=101;TR=158;WE=22157697;WS=22157679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr1	22163402	rs41310390	G	A	2968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=39;PP=2298;SC=GGAACTCAACGCTGGCCCCAA;SOR=1.053;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=54;TCR=39;TR=93;WE=22163410;WS=22163392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	22170712	rs147114700	C	A	1901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=21;PP=1528;SC=CCGGGCACCACGCACTTCAGA;SOR=1.316;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=56;WE=22170720;WS=22170702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	22170879	rs75613822	G	A	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=17;PP=550;SC=TAGGACCAGAGGCCATTTGGG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=22170887;WS=22170869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	22174380	rs113578258	T	C	3666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.479;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=54;PP=2755;ReadPosRankSum=-1.070;SC=GAGATAACAGTGATGGCACCG;SOR=0.589;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=72;TCR=55;TR=126;WE=22174388;WS=22174370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,126:0.99:127
chr1	22174426	rs2290501	T	G	4458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=76;PP=2965;ReadPosRankSum=1.489;SC=CACTTGTCTGTACCCCCTGCC;SOR=0.854;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=68;TCR=77;TR=143;WE=22174434;WS=22174416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,145:0.99:147
chr1	22174600	rs3767138	A	G	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=24;PP=897;SC=CAGGAAGCAGATGGCAGGAGG;SOR=2.165;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=22174608;WS=22174590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	22180548	rs12117402	T	C	3763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=54;PP=2939;SC=TCAACCTCCTTCTCTCTCTGA;SOR=0.781;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=58;TCR=54;TR=112;WE=22180556;WS=22180538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	22183471	rs12024579	A	C	1701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=15;PP=1408;SC=TGGGGGAGAGACAGGAGGGGA;SOR=1.893;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=48;WE=22183479;WS=22183461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	22186234	rs10917056	A	G	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=25;PP=997;SC=AGCCCCATGCACAAGGACAGC;SOR=1.501;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=38;WE=22186242;WS=22186224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	22191454	rs897471	G	A	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=38;PP=1309;SC=GATGCTGGCCGCCAGCGGCAC;SOR=2.348;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=51;WE=22191462;WS=22191444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	22199081	rs2501266	A	T	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=4;PP=420;SC=AGGTGGCAACACCGCCTGGGG;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=22199089;WS=22199071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	22199821	rs2454290	G	A	2213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=20;PP=1773;SC=CTCCGCCCTAGGGACTCTGGG;SOR=2.015;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=47;TCR=20;TR=67;WE=22199829;WS=22199811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	22200082	rs2445136	T	C	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=33;PP=833;SC=AGCAGGGACGTGCCCTGGACC;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=36;WE=22200090;WS=22200072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	22200835	rs2445135	C	G	184.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=151;SC=CTGGATGAAGCGGGTGTGGGA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=22200843;WS=22200828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	22201331	rs2290494	C	T	2085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=34;PP=1626;SC=GGAGAAGGAGCGGGAAGCACC;SOR=0.849;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=28;TCR=34;TR=62;WE=22201339;WS=22201321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	22202109	rs2501265	C	T	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=5;PP=944;SC=CCTCCTGCCCCGGCTCCAGAC;SOR=3.383;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=35;WE=22202117;WS=22202099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	22204630	rs7513608	G	A	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=344;SC=CCTCCCAGCTGTGGTGCTGGG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=22204638;WS=22204620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	22205408	rs2454294	T	C	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=3;PP=274;SC=CCAAGTCTCCTGCCTCCCTGC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=22205416;WS=22205403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	22205466	rs2454293	T	C	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=2;PP=450;SC=AAACCCCCCCTGACCCGGAGC;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=22205474;WS=22205456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	22206649	rs989994	T	C	2552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=15;PP=1973;SC=GCCATTGCAATTGCAACCAGA;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=57;TCR=15;TR=72;WE=22206657;WS=22206639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	22206942	rs1874793	G	A	3600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=57;PP=2965;SC=GTCCCACGCTGGCCATCTTGG;SOR=0.806;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=52;TCR=57;TR=109;WE=22206950;WS=22206932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	22207235	rs1874792	T	C	1461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=35;PP=1145;SC=CCGGCACCCATGAGGACCACG;SOR=1.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=51;WE=22207243;WS=22207225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	22207804	rs139046040	ACCCAGGGTGGCAG	A	1699.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=13;PP=2970;SC=TTCTTTCCCCACCCAGGGTGG;SOR=0.850;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=16;WE=22207824;WS=22207794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	22208030	rs921847	C	T	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=116;SC=AGGGCTGCAGCCTGGGCCTGC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=22208038;WS=22208020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	22211217	rs2290493	G	A	4750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.82;SOR=2.487;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	22211222	rs4654994	T	C	4819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.82;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	22214127	rs2229478	A	G	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=21;PP=1038;SC=TCGTCTCCACAAGGAGAGAGA;SOR=0.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=23;TCR=21;TR=44;WE=22214135;WS=22214117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	22215088	rs2445140	T	C	1441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=13;PP=1115;SC=CGTGAGCCCCTGCACCCGGCC;SOR=2.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=47;WE=22215096;WS=22215078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	22216279	rs3767141	C	T	1157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=4;PP=932;SC=TCGGGTCTAACGGGTATGTGC;SOR=3.442;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=36;WE=22216287;WS=22216269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	22217108	rs2501260	G	A	2952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=52;PP=2453;SC=ACACCTCTCGGAACTCTCTGG;SOR=0.953;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=96;TCF=44;TCR=52;TR=94;WE=22217116;WS=22217098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	22303702	rs4415533	C	A	1377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=42;PP=1194;SC=TCAGCTTGTACCCGGGGGCAT;SOR=4.271;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=46;WE=22303710;WS=22303692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	22307340	rs7528228	C	T	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.84;QD=30.73;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	22307358	rs7528300	C	G	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=408;SC=TCTACCACACCTGTGGCGGTA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=22307366;WS=22307348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	22307538	rs7528405	C	T	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=22;PP=913;SC=CAGGAGCTCCCGGACCTACCA;SOR=1.418;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=34;WE=22307546;WS=22307528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	22310080	rs10799723	G	A	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=1;PP=695;SC=TTTGGAGGGTGAAGGAGCTGG;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=22310088;WS=22310070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	22310139	rs10733031	T	G	2207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.41;QD=44.16;SOR=2.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	22310145	rs10733032	C	T	2218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.53;QD=44.38;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	22310262	rs10733033	G	C	1389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.14;QD=29.57;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	22310411	rs28468423	A	G	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.73;QD=50.10;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	22310411	.	AGA	GGG	1131	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=41.08;NF=7;NR=11;PP=1131;QD=65.8037708257;SC=CACCAAGACCAGACCTTGTAC;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=18;WE=22310421;WS=22310401;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,18:0.82:22
chr1	22310413	rs7549398	A	G	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.33;QD=42.94;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	22310662	rs6426735	G	T	6046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=115;PP=2965;SC=CCCCTGACTCGGTGCTTTTTA;SOR=1.167;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=189;TCF=74;TCR=115;TR=189;WE=22310682;WS=22310652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr1	22310674	rs7538207	C	T	5497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=117;PP=2965;SC=TGCTTTTTATCGCTGCAGCCA;SOR=1.650;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=54;TCR=117;TR=171;WE=22310682;WS=22310652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr1	22310725	rs3820287	G	C	2872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=85;PP=2099;SC=CCCTGCTGCCGGTGGTGGACT;SOR=3.193;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=15;TCR=85;TR=100;WE=22310733;WS=22310715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	22310824	rs1803531	T	C	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=19;PP=418;SC=CCGGCTGCAATGTGAGTCAGC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=22310832;WS=22310814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	22313161	rs1803530	T	C	1983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=52;PP=1537;SC=CCGCCTTCATTGACTGGATTG;SOR=1.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=24;TCR=52;TR=76;WE=22313169;WS=22313151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	22313371	rs34262568	G	A	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=28.58;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	22313469	rs3806296	G	C	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=27.98;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	22313521	rs71638814	G	T	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=24.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	22315662	rs12082371	C	T	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=5.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.35;MQRankSum=0.049;QD=14.71;ReadPosRankSum=-0.650;SOR=0.234;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,22:0.42:53
chr1	22315666	rs55665598	G	A	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=2.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.99;MQRankSum=0.507;QD=15.14;ReadPosRankSum=-0.329;SOR=0.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr1	22315710	rs12071902	G	A	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.75;MQRankSum=0.824;QD=11.06;ReadPosRankSum=0.208;SOR=1.296;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr1	22315738	rs4655006	C	T	853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.12;MQRankSum=0.030;QD=18.97;ReadPosRankSum=-0.248;SOR=2.935;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:8,37:0.82:45
chr1	22324705	rs7534936	T	C	4579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=3.440;NF=51;NR=102;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.707;SC=TGATTCACCGTGAACACTGGC;SOR=0.658;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=51;TCR=104;TR=153;WE=22324713;WS=22324695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,165:0.99:166
chr1	22328279	rs12751986	C	T	2595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=59;PP=2222;SC=ATCTACCACTCGCTCTGAGTC;SOR=2.026;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=22;TCR=59;TR=81;WE=22328287;WS=22328269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	22329041	rs71016961	GC	G	1248.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.14;MQRankSum=-4.083;QD=21.16;ReadPosRankSum=1.046;SOR=0.251;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr1	22329062	rs143337942	CC	GT	1904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=1.580;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.04;MQRankSum=-5.174;QD=21.65;ReadPosRankSum=-0.559;SOR=1.298;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,49:0.56:88
chr1	22329220	rs55638883	G	A	1466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.654;NF=7;NR=64;PP=1510;ReadPosRankSum=0.987;SC=AGGGCTCATCGAGGGCCAGGC;SOR=1.037;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=151;TCF=16;TCR=135;TR=71;WE=22329228;WS=22329210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,56:0.47:118
chr1	22329346	rs200212152	G	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.208;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.435;NF=0;NR=13;PP=210;ReadPosRankSum=1.543;SC=AATGTTCACTGTTCATATGTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=13;WE=22329354;WS=22329337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr1	22329407	rs12756442	G	C	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=1;PP=820;SC=CACACAGCCAGTTGAAGGCAT;SOR=4.479;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=22329415;WS=22329397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	22329645	rs4543768	T	C	290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=26.43;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	22333688	rs3820289	T	C	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=8;PP=719;SC=TGTTTTGGTATCTTCTGTGTG;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=22333696;WS=22333685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	22336277	rs3820285	C	G	1831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=35;PP=1436;SC=TTTGTTTCTGCCTTTGGCTGC;SOR=1.316;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=57;WE=22336285;WS=22336267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	22336305	rs9187	C	T	2421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.64;QD=44.03;SOR=1.487;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	22336308	rs12908	G	A	2360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.44;QD=45.40;SOR=1.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	22405398	.	G	A	388	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;FR=1.0000;HP=18;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=29;MQ=57.71;NF=0;NR=14;PP=388;QD=30.1979437534;SC=TTTTTTTTTTGATATTTTGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=22405406;WS=22405388;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	22408106	rs2501282	G	A	2547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=23;PP=1862;SC=GGATGGACTAGGGGACGATTA;SOR=1.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=46;TCR=23;TR=69;WE=22408114;WS=22408096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	22447148	rs12756110	G	C	261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=184;SC=CCTCCTCTTAGGAATTACGCG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=22447156;WS=22447138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	22447645	rs41420150	C	CTG	1120.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=0;PP=1045;SC=GTGGGAGAGTCTGGGGCCCTG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=24;WE=22447653;WS=22447635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	22453842	rs6678992	T	C	2122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=19;PP=1600;SC=CATGGGGTCCTGAGTACCCAC;SOR=1.897;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=49;TCR=19;TR=67;WE=22453850;WS=22453832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	22453975	rs2235527	C	G	1865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.132;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=47;PP=1450;ReadPosRankSum=1.606;SC=GCTTTGCCACCTGCCAAGAAA;SOR=2.908;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=57;TCF=10;TCR=47;TR=56;WE=22453983;WS=22453965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,61:0.98:62
chr1	22454001	rs2235526	T	C	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=42;PP=1011;ReadPosRankSum=1.997;SC=CAATGAGCCATGAACCTTGCC;SOR=2.428;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=47;WE=22454009;WS=22453991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr1	22846709	rs209720	G	A	2420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=48;PP=1740;SC=GGAGCGGCACGTGGTGACCCA;SOR=1.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=25;TCR=48;TR=73;WE=22846717;WS=22846699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	22919904	rs209696	C	T	2909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=47;PP=2350;SC=AGCAGCCGAACGGCATCATCC;SOR=0.734;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=49;TCR=47;TR=95;WE=22919912;WS=22919894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	22920079	.	C	T	2647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=51;PP=2099;SC=CCGTCTCCGGCCTCAAGCCGG;SOR=1.582;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=28;TCR=51;TR=79;WE=22920087;WS=22920069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	22922546	rs209692	G	A	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=3;PP=712;SC=TTGGGGTCAGGTCCCGGGCTA;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=22922568;WS=22922536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	22922560	rs209691	G	A	825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=5;PP=718;SC=CGGGCTAGGGGTGGCCTGGCC;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=22922568;WS=22922536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	22924464	rs12404556	T	C	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=29;SC=CCCTGTCCTCTTGGTTCAGGT;SOR=3.383;Source=Platypus;TCR=29;TR=33;WE=22924472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	22925292	rs664340	C	G	2402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=65;NR=19;PP=1746;SC=CAGGCGCCTCCCCGGGCTTTC;SOR=2.557;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=65;TCR=19;TR=84;WE=22925300;WS=22925282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr1	22927314	rs209702	A	G	4023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=66;PP=2965;SC=GTGAGTGCCAAGCCCTGGCAG;SOR=0.916;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=121;TCF=55;TCR=66;TR=121;WE=22927334;WS=22927304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr1	22927326	rs209701	T	G	3417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=57;PP=2692;SC=CCCTGGCAGGTCCGCGGGCGG;SOR=0.956;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=46;TCR=57;TR=103;WE=22927334;WS=22927304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	22927672	rs12126436	G	A	2588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=45;PP=2101;SC=CCTGACACTAGGACCAGGCCC;SOR=1.136;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=30;TCR=45;TR=75;WE=22927680;WS=22927662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	22928265	rs209700	A	G	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=341;SC=GGCAGCCACCAAGCCCACCCC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=22928273;WS=22928255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	22928349	rs209699	A	G	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=83;SC=CCCTCCTCTCAGGTGCTGGAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=22928357;WS=22928339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	22965438	rs172378	A	G	3943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.99;NF=80;NR=43;PP=2965;SC=GCCCCCTCGGAGCCCGTGGCA;SOR=1.463;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=80;TCR=43;TR=123;WE=22965446;WS=22965428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	22970642	rs15940	C	T	1669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=24;PP=1344;SC=CCGGCCTGCCCGGGGCACCAG;SOR=0.853;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=27;TCR=24;TR=50;WE=22970650;WS=22970632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	22970828	rs666656	G	T	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=389;SC=CAGGGCAGAGGTGGACTCTCA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=22970836;WS=22970818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	22974297	rs9434	C	A	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=22;PP=597;SC=TGCGCTCGAGCCCCACGGGCC;SOR=5.211;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=23;WE=22974305;WS=22974287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	22987958	rs10580	A	G	464.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=391;ReadPosRankSum=-0.718;SC=CCCTTGCCCAACCAATGCACA;SOR=1.292;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=15;WE=22987966;WS=22987948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr1	23107832	rs3738296	A	G	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.09;QD=30.06;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	23219493	rs309472	T	C	4129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=60;PP=2965;SC=CCGTGGCAGGTTACGGGCGCT;SOR=0.822;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=66;TCR=60;TR=126;WE=23219501;WS=23219483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	23221855	rs77501996	A	G	2229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=0;PP=1860;SC=AGGGGCAGGAACAGAGTCTAG;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=64;TCR=0;TR=64;WE=23221863;WS=23221845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	23289568	rs10799777	T	C	765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=7;PP=583;SC=GCCCAGCCCATATGCCCAGTT;SOR=1.893;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=24;WE=23289576;WS=23289558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	23291582	rs4655138	G	A	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=406;SC=TTTTATACACGAGGACATCGA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=23291590;WS=23291572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	23342193	rs10917344	C	G	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=340;SC=CATAGATGAACCTTGAGGACA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=23342201;WS=23342183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	23342362	rs681648	A	G	1646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=33;PP=1188;SC=TGTTTAATGTATACAGAATTT;SOR=1.199;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=55;TCF=21;TCR=34;TR=54;WE=23342370;WS=23342352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	23380198	rs579785	A	G	1077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=0;PP=848;SC=TTTTAAAGATAGTCAAATAAC;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=23380206;WS=23380188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	23399932	rs967605	C	T	1275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=33;PP=1079;SC=ATTGCACATGCCTTTGAGAGG;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=40;WE=23399940;WS=23399922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	23405794	rs2072945	A	C	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=15;PP=442;SC=TTGTGACATCAGGGCTGAGGC;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=23405802;WS=23405784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	23405865	rs72657829	A	C	277.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=2;PP=228;SC=ATATGGACTTAGTCTTATGGG;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=23405873;WS=23405859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	23409538	rs2235546	G	A	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=0;PP=1165;SC=GAGACTCTTCGATAGAATGAT;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=41;WE=23409546;WS=23409528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	23418153	rs10799790	C	T	3010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=57;PP=2524;SC=TCTGGCCTGTCCTTCAGGGGC;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=33;TCR=57;TR=90;WE=23418161;WS=23418143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	23419261	rs477717	G	A	3197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=64;PP=2443;SC=CCTTCAGTCCGCTCTCGGTGC;SOR=1.380;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=38;TCR=64;TR=102;WE=23419269;WS=23419251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr1	23419374	rs3765407	G	T	4426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.64;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	23419383	rs477830	C	T	4629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.68;SOR=1.189;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	23419855	rs1983965	T	C	2184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=32;PP=1665;SC=GTTTGATTTGTGTCTTAAGTT;SOR=0.898;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=38;TCR=32;TR=70;WE=23419863;WS=23419845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	23664511	rs11586100	T	G	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=398;SC=GTGCCAGAGATTGGAGCAGAC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=23664519;WS=23664501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	23688933	rs2849028	A	G	2556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=30;PP=2048;SC=TCTGACTGAAATTCTTCCCAC;SOR=1.108;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=45;TCR=30;TR=75;WE=23688941;WS=23688923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	23693422	rs2849025	T	C	1119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=0;PP=899;SC=GTCAAGCCAATATCCAATTAA;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=23693430;WS=23693412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	23696152	rs665977	G	A	1569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=38;PP=1221;SC=GAGGCTGGCCGAGAAACCACC;SOR=2.701;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=48;WE=23696160;WS=23696142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	23710805	rs605468	A	G	1437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=14;PP=1032;SC=GTATGTGGATAACAGGGAAGG;SOR=1.562;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=40;WE=23710813;WS=23710795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	23713952	rs676363	T	G	1170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=21;PP=833;SC=CTGAGGAGTTTCAGGGGCCCT;SOR=1.040;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=14;TCR=21;TR=35;WE=23713960;WS=23713942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	23720260	rs2486078	T	G	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=361;SC=GAGGCTGGTTTGAAAAGCTCC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=23720268;WS=23720250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	23724183	rs2275355	C	T	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=13;PP=876;SC=TGTTCCTGTACCATCCCTTGG;SOR=1.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=18;TCR=13;TR=31;WE=23724191;WS=23724173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	23735241	rs1198423	G	T	915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=20;PP=668;SC=AAATTGGCAAGGAGACTGCTT;SOR=2.019;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=23735249;WS=23735231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	23743581	rs2156087	C	G	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=336;SC=AGTCTAACATCTGGTTGAGCC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=23743589;WS=23743571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	23751140	rs71514235	G	T	3154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.55;SOR=2.256;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	23755513	rs1198430	T	C	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.49;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=16;PP=439;SC=CCATCAACCCTGACTATTCCT;SOR=2.165;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=23755521;WS=23755503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	23758134	rs1198434	A	G	77.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=1;PP=25;SC=AAATCAATGGATGCTCAGAGA;SOR=1.179;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=23758142;WS=23758129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	23760596	.	G	A	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=342;SC=TTTTACAGATGAGGAAGCTGA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=23760604;WS=23760586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	23763039	rs377109548	G	C	3942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=60;PP=2965;SC=CCCTCTCTCTGAGAATCCCCT;SOR=0.726;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=118;TCF=58;TCR=60;TR=117;WE=23763047;WS=23763029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	23763449	rs115515935	G	A	1123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=10;PP=823;SC=GTGACTGCATGCGCGAAAAGC;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=34;WE=23763457;WS=23763439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	23765472	rs1767148	A	G	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=21;PP=625;SC=CAAGGATGTGAAGTGTAGACT;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=23765480;WS=23765462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	23810658	rs71514236	G	A	271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.18;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	23836364	rs2075993	A	G	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=14;PP=796;SC=GGGGGCAGGCAGGGCCACTCA;SOR=1.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=36;WE=23836372;WS=23836354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	23847464	rs2075995	C	A	1896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=39;PP=1480;SC=TCTGGATGAGCTGGTCCAAGG;SOR=1.812;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=57;WE=23847472;WS=23847454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	23885498	rs11574	T	C	2996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=30;PP=2398;SC=AGTTCCGGAGTGAGCTCGGCT;SOR=1.808;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=71;TCR=30;TR=101;WE=23885506;WS=23885488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	23955186	.	T	TTTATTATTATTATTATTATTA	1068.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.88;QD=44.53;SOR=4.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	23965517	rs61777309	G	A	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=500;SC=GTGGGCAGGTGCCAGGAATTT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=23965525;WS=23965507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	23965704	rs10917403	A	C	2646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=48;PP=2052;SC=GCTTAATGTTAATCTCTCCAA;SOR=1.367;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=28;TCR=48;TR=76;WE=23965712;WS=23965694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	23965829	rs10917404	C	T	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=19;PP=672;SC=AAGGAAAGAACGAATCGATGA;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=23965837;WS=23965819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	23966837	rs1317329	C	T	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=605;ReadPosRankSum=-0.267;SC=AAATGACAGACGCTACCATCA;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=26;WE=23966845;WS=23966827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr1	23966894	rs3072132	T	TAAG	1460.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=11;PP=1348;SC=GGTGGCTTTGTAAGAAGAAAA;SOR=1.418;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=18;TCR=13;TR=26;WE=23966902;WS=23966884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	24018224	rs3753270	C	T	3791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=36;PP=2859;SC=TCCTCGTCTTCATCTCTGTGG;SOR=1.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=77;TCR=36;TR=113;WE=24018232;WS=24018214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	24018277	rs10917413	C	G	4551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=69;PP=2965;SC=ATAAGGCCCTCGGCCGGAAGC;SOR=0.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=70;TCR=69;TR=139;WE=24018285;WS=24018267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr1	24077451	rs2235541	C	T	2269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=36;PP=1873;SC=TGGAAAGCCACGGGGAGCCGA;SOR=0.720;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=37;TCR=36;TR=73;WE=24077459;WS=24077441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	24082269	rs371132818	CA	C	244.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQRankSum=2.197;QD=4.71;ReadPosRankSum=-0.767;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr1	24083649	rs2076346	T	C	1905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=41;PP=1467;ReadPosRankSum=0.087;SC=CAAATATTATTTCAGCACTAG;SOR=1.082;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=21;TCR=44;TR=61;WE=24083657;WS=24083639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,63:0.95:66
chr1	24106510	rs3831910	A	AT	1192.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=34;PP=1401;SC=GAATAGTATCATTTTCTTCTT;SOR=5.943;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=34;WE=24106518;WS=24106500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	24122986	rs760941	C	T	200.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.10;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	24133612	rs1018396	G	A	2228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=32;PP=1711;SC=TGTCCTGAGCGTGATCAGGAT;SOR=0.869;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=38;TCR=32;TR=70;WE=24133620;WS=24133602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	24134721	rs719400	T	C	1811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=28;PP=1360;SC=TGACAGCAGATAGCATGTCTT;SOR=0.865;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=31;TCR=28;TR=59;WE=24134729;WS=24134711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	24143932	rs2076344	A	G	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=6;PP=668;SC=TTTCATCCCTAGAGAAAGGCC;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=24143940;WS=24143922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	24200903	rs2229586	G	C	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=222;SC=TCAGCAAAAAGGGGTCCGTGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=24200911;WS=24200893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	24200921	rs2229585	T	C	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=395;SC=TGTCTAGGTGTCTGGGACTGG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=24200929;WS=24200911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	24200969	rs2229584	T	C	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=25;NR=8;PP=846;SC=CCTCTCTCTCTTCCAGGGAGT;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=24200991;WS=24200959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	24200983	rs2229583	C	T	2207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=14;PP=1310;SC=AGGGAGTGAACTGATTTCTGA;SOR=2.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=52;WE=24200991;WS=24200959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	24201094	rs2229581	G	C	3234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=28;PP=1795;SC=CCTCTGTCTCGGTGACTGAGG;SOR=1.121;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=44;TCR=29;TR=71;WE=24201102;WS=24201084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	24201109	rs2229580	C	T	3171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=26;PP=2126;SC=CTGAGGATCTCGGGGCTTCTT;SOR=1.488;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=47;TCR=26;TR=73;WE=24201117;WS=24201099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	24201262	rs2502993	A	G	4122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=66;PP=2965;SC=TGGAGCAGAAAGCAAAGGCCT;SOR=0.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=56;TCR=66;TR=122;WE=24201270;WS=24201252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr1	24201357	rs4649124	A	G	2791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=38;PP=2330;SC=AGCACAGCCAACACTAGCCCT;SOR=0.843;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=46;TCR=38;TR=84;WE=24201365;WS=24201347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	24201448	rs3003336	C	T	1942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=36;PP=1580;SC=ACAAGCTGGCCACATGCTGAT;SOR=1.392;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=58;WE=24201456;WS=24201438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	24201643	rs2501431	G	A	2205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=37;PP=1764;SC=CCCACATGATGCCCAGGGTCA;SOR=0.910;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=68;TCF=31;TCR=37;TR=66;WE=24201651;WS=24201633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	24201919	rs2502992	TT	CC	4462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=49;PP=2947;SC=TCCGGCGGAGTTGGTGGGAGG;SOR=1.134;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=92;TCF=39;TCR=53;TR=86;WE=24201928;WS=24201909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	24388371	rs4649168	T	C	1077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=6;PP=764;SC=ACTGACCCAGTGTGCCCAGAC;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=30;WE=24388379;WS=24388361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	24400584	rs6660949	G	C	1488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=14;PP=1120;SC=TTGCTGACCTGTGTGGGCATT;SOR=1.464;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=42;WE=24400592;WS=24400574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	24400633	rs10903083	C	G	2027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=30;PP=1557;SC=TGGCAGGGAGCGGGGTAGGTG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=29;TCR=30;TR=59;WE=24400641;WS=24400623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	24416059	rs4393101	T	C	1448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=7;PP=1246;SC=TGGTGCTCTGTCCCGGGGGCT;SOR=2.935;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=47;TCF=40;TCR=7;TR=46;WE=24416067;WS=24416049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	24416628	rs72648548	T	C	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=45;PP=1414;SC=GAAGGGAGCATGGGAGGGTGG;SOR=1.371;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=25;TCR=45;TR=70;WE=24416636;WS=24416618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	24434595	rs11249170	T	C	2323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=55;PP=1943;SC=TAAATGGCTCTTGCAGGATTG;SOR=2.472;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=72;TCF=17;TCR=55;TR=71;WE=24434603;WS=24434585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	24447214	rs3795300	G	A	1350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=1;PP=1050;SC=AGTGTGTGGCGTGGGCAGGCA;SOR=5.186;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=39;WE=24447222;WS=24447204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	24447943	rs34967816	G	A	3215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=47;PP=2473;SC=ATGGGGGCCCGACCTCAGGGG;SOR=0.752;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=53;TCR=47;TR=100;WE=24447951;WS=24447933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	24454688	rs16829204	C	T	2496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=36;PP=1977;SC=CAGGTGGGAACGCAAATCATG;SOR=0.796;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=41;TCR=36;TR=77;WE=24454696;WS=24454678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	24460797	rs17852649	T	G	1876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=25;PP=1442;SC=CTGCACGGATTGGCGTGGGGG;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=55;WE=24460805;WS=24460787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	24463563	rs4486393	C	T	1211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=0;PP=1072;SC=CATCCCACCCCGCAAACACCT;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=24463571;WS=24463553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	24463854	rs41268137	C	T	1374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=33;PP=1174;SC=CAGCGCTAGGCCTGTGGCTTA;SOR=2.780;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=41;WE=24463862;WS=24463844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	24484108	rs72648587	G	A	3325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=28;PP=2647;SC=GCCTCCGAGTGCCCTGGAGCC;SOR=2.093;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=79;TCR=28;TR=106;WE=24484116;WS=24484098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	24484441	rs946671	A	G	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=36;PP=1169;SC=CATAATTATCATCATCTGAAT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=54;WE=24484449;WS=24484431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	24485518	rs10751769	T	C	729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=0;PP=438;SC=CCCCACCTGCTGCACACCCCC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=24485526;WS=24485508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	24485813	rs4649194	T	C	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=19;PP=518;SC=AACCAAGGTTTGGGGCATTAT;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=24485821;WS=24485803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	24495839	rs72648600	T	C	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=548;SC=ACAGAACCACTGAGCACTGAG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=24495847;WS=24495829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	24496085	rs34654982	G	A	1490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=35;PP=1224;SC=GTCTACGGGTGGGAGAGCTGG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=45;WE=24496093;WS=24496075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	24513768	rs4090311	G	A	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=5;PP=166;SC=CCCCGCCCGGGCCCAGGTCCC;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=10;WE=24513776;WS=24513758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	24671287	rs4648859	C	T	2904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=32;PP=1980;SC=ATTCTCCCCACCTCCCACCAA;SOR=1.496;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=63;TCR=32;TR=94;WE=24671295;WS=24671277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	24671464	.	ACCCTCCACACCTGTGCC	A	458.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=1.667;NF=1;NR=9;PP=885;SC=ACACCTGTGCACCCTCCACAC;SOR=1.739;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=10;WE=24671488;WS=24671454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,13:0.87:15
chr1	24673247	rs6702097	G	A	346.56	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=289;ReadPosRankSum=0.797;SC=ACCCCTTGGAGCTAGGTTTAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=24673255;WS=24673237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr1	24673866	rs6691722	A	G	1820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=9;PP=1465;SC=AGCAGAAGTCAATCTTCAAGT;SOR=3.511;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=57;TCR=9;TR=65;WE=24673874;WS=24673856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	24684116	rs7527465	G	A	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=3;PP=762;SC=GGTATCTGGCGGGGTTAATGT;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=24684124;WS=24684106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	24684728	rs11249092	G	A	1893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=44;NR=18;PP=1596;SC=GCAGGGAGTCGTGCCGGAAGG;SOR=1.942;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=44;TCR=18;TR=62;WE=24684736;WS=24684718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	24687653	rs532147	T	C	172.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=153;SC=GTCACGGCACTGGGGCAGAGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=24687661;WS=24687643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	24718075	rs2294520	T	C	2537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=50;PP=2022;SC=ATCTCTTGGCTTGACTATTGA;SOR=1.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=24;TCR=50;TR=74;WE=24718097;WS=24718065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	24727678	rs2078445	C	T	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=464;SC=CCTAAAGCCACCTATTTGGTA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=24727686;WS=24727668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	24746205	rs12125143	C	T	2935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=66;PP=2274;ReadPosRankSum=-0.712;SC=CATTGGCTAACAGATATGTAT;SOR=1.052;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=24;TCR=67;TR=90;WE=24746213;WS=24746195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,95:0.99:96
chr1	24766622	.	G	C	1397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=19;PP=1046;SC=CCCCTGGCTTGTGCCCAAATC;SOR=0.929;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=24;TCR=19;TR=43;WE=24766630;WS=24766612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	24768778	rs4648863	G	C	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=335;SC=CAGAGTGCCAGCGCCAGGATC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=24768786;WS=24768768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	24779855	rs2272934	T	C	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=480;SC=TCTCGCCTACTTCTGTGGTCC;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=24779863;WS=24779845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	24780521	rs56978150	C	CT	757.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=1.489;HP=15;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.609;NF=6;NR=23;PP=319;ReadPosRankSum=-1.148;SC=TTAATTTTTCCTTTTTTTTTT;SOR=0.411;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=67;TCF=13;TCR=54;TR=29;WE=24780529;WS=24780511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,43:0.75:57
chr1	24784139	rs10903089	A	G	762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=676;SC=AAGAGGCTAGAAAGTGGCGGA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=24784147;WS=24784129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	24784197	rs195718	T	C	1535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=6;PP=1229;SC=ATGCCCTCACTGCTCTGCTCT;SOR=3.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=46;WE=24784205;WS=24784187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	24785393	rs2272935	C	T	1757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=33;PP=1346;ReadPosRankSum=0.147;SC=TGAGTCAAGCCTCACAGATGT;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=50;WE=24785401;WS=24785383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,55:0.96:57
chr1	24792617	rs195725	T	A	4545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.994;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=1.628;SC=AAAAATGAGATCGAGAAACAG;SOR=0.947;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=56;TCR=87;TR=142;WE=24792625;WS=24792607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,147:0.99:148
chr1	24840768	rs196403	G	A	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=300;SC=TTTGGTCTTCGGAGTTTTACC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=24840776;WS=24840758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	24859617	rs196429	G	A	1205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=5;PP=1008;SC=ATCTCCTGCCGCCCCAGCCTG;SOR=3.500;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=37;WE=24859625;WS=24859607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	24859665	rs196430	G	A	1938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=22;PP=1587;SC=CCTCTCCCCCGGTGGGGTGGA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=43;TCR=22;TR=65;WE=24859673;WS=24859655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	24861704	rs196432	G	A	2268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=40;PP=1801;SC=TTGCCCAGACGAGGCGCCCCG;SOR=1.002;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=29;TCR=40;TR=69;WE=24861712;WS=24861694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	24922056	rs12353957	T	C	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=31;PP=833;SC=ACCAGTGTCATGGTCATAGTG;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=38;WE=24922064;WS=24922046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	24922129	rs10903095	G	A	341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=254;SC=GTTCTGCCACGTGCCAACTGC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=24922137;WS=24922119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	24989762	rs4649011	G	T	2426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=57;PP=1942;SC=GTCAAAAATTGTAGTGACTTA;SOR=2.395;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=17;TCR=57;TR=74;WE=24989770;WS=24989752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	24998484	.	C	G	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=2;PP=401;SC=CATATGTATACATGTGCCATG;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=14;WE=24998492;WS=24998474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	25098245	rs9332415	T	C	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=2;PP=1161;SC=ATTGGGGTTTTGTAACTAGCT;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=40;WE=25098253;WS=25098235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	25098341	rs7548438	C	T	4061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=54;PP=2965;SC=GGTTCAAGTCCTATGTGTATC;SOR=1.033;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=74;TCR=54;TR=128;WE=25098349;WS=25098331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr1	25153692	rs4649022	G	A	1733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=35;PP=1493;SC=TTATAAATGAGTACTTTAGAG;SOR=1.302;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=57;WE=25153700;WS=25153682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	25254317	rs7517302	C	T	1655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=47;PP=1407;SC=GCAGCTCCCCCAGGTCCCAGG;SOR=4.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=4;TCR=47;TR=51;WE=25254325;WS=25254307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	25256444	rs71514255	G	A	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=15;PP=389;SC=CTCGGCCGCCGCTGCCGCGAG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=25256452;WS=25256434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	25570550	rs5773124	A	AT	193.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.6135;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.696;NF=10;NR=0;PP=136;ReadPosRankSum=-0.312;SC=TAGATACAGCATTTTTTTTTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=10;WE=25570558;WS=25570540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr1	25572984	rs34484514	T	G	5399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=85;PP=2965;SC=TCGTCCTGGATCTGTCCCTCC;SOR=0.740;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=84;TCR=85;TR=169;WE=25572992;WS=25572974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr1	25611035	rs2301153	G	C	3427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-1.075;NF=84;NR=31;PP=2965;ReadPosRankSum=1.230;SC=CTTCCCCCTCGTCCTTCTCGC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=120;TCF=87;TCR=33;TR=115;WE=25611043;WS=25611025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,106:0.99:107
chr1	25629766	rs201798270	TTCTC	T	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=41.89;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	25634143	rs2427766	T	C	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.13;QD=30.47;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	25678002	rs66744254	TA	T	503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5762;FS=0.000;HP=14;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.474;NF=24;NR=1;PP=298;ReadPosRankSum=-1.774;SC=CCTGTATCTTTAAAAAAAAAA;SOR=2.494;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=25;WE=25678011;WS=25677992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,27:0.93:29
chr1	25678238	rs3093616	T	A	2059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=52;PP=1661;SC=TTAAGATGAGTATTTCACATG;SOR=4.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=5;TCR=52;TR=57;WE=25678246;WS=25678228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	25687308	rs8876	C	G	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=108;SC=TGAGTGTAGTCTCAGCTTAAA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=25687316;WS=25687298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	25711351	.	G	A	218.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.58;QD=31.26;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	25780668	rs34006994	C	T	1436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=0;PP=1170;SC=AAGTTACTGTCGTCAAATTAG;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=41;WE=25780676;WS=25780658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	25780889	rs141203814	A	ATG	859.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5346;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.733;NF=0;NR=14;PP=527;ReadPosRankSum=-0.217;SC=TATTACATAAATGTATGTGTG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=14;WE=25780901;WS=25780879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr1	25780893	rs61775167	A	G	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.733;NF=0;NR=24;PP=721;ReadPosRankSum=-0.145;SC=ACATAAATGTATGTGTGTGTG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=25780901;WS=25780879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr1	25783066	.	A	G	631	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=25;NR=2;PP=631;QD=24.6581930573;SC=TTTTTAAGCCATAGGTATTCT;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=25783074;WS=25783065;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	25785451	rs35530120	A	G	1841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=53;PP=1541;SC=ACATACTCCCATATGGGCCTG;SOR=5.247;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=56;TCF=3;TCR=53;TR=56;WE=25785459;WS=25785441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	25889342	rs10687390	CAG	C	1716.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=28;PP=1501;SC=CTTCACCGCTCAGAGTCTCGG;SOR=3.967;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=32;WE=25889351;WS=25889332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	25889422	rs12096438	C	T	1058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=9;PP=806;SC=AACTGACATCCGAAAGGTTTC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=25889430;WS=25889412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	25889632	rs6687605	T	C	1303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.91;NF=6;NR=33;PP=1030;SC=CTGCACCCCCTCCTTGAAGAG;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=39;WE=25889640;WS=25889622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	25889672	rs6688931	G	A	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=26;PP=733;SC=AGGGGGATTGGCCATGCGGTG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=25889680;WS=25889662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	25890050	rs6661159	A	G	2307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=5;PP=1979;SC=GGCCTGGGCAAGGCCACATCA;SOR=4.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=63;TCR=5;TR=68;WE=25890058;WS=25890040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	25890189	rs28969504	A	G	4642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=93;PP=2965;SC=TAGAGGAGACAGCTAAGGCCC;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=63;TCR=93;TR=156;WE=25890197;WS=25890179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr1	26089977	.	CAA	C	224.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=33.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.53;MQRankSum=-2.643;QD=10.22;ReadPosRankSum=0.170;SOR=4.797;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr1	26090003	.	T	C	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.698;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=51.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.97;MQRankSum=-4.334;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.752;SOR=5.131;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,12:0.26:46
chr1	26127020	rs13373825	G	A	55.10	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=13.77;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	26127425	rs6659086	G	A	1195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=4;PP=978;SC=CACTGGGAGAGCTCAGGAAGA;SOR=3.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=34;WE=26127433;WS=26127415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	26131654	rs7349185	G	A	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=5;PP=790;ReadPosRankSum=0.633;SC=GCGGCCAGCTGCGAGGAGGAG;SOR=2.476;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=34;WE=26131662;WS=26131644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr1	26135116	rs115852080	G	A	1593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=17.076;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=0;PP=1237;ReadPosRankSum=0.368;SC=GACAGCCGCCGCCTCACCAAG;SOR=7.864;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=50;TCR=1;TR=50;WE=26135124;WS=26135106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr1	26138136	rs760598	C	A	2830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=48;PP=2304;SC=CCTGAGGATTCTTGCCCATCT;SOR=0.807;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=43;TCR=48;TR=91;WE=26138144;WS=26138126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	26138262	rs760597	T	C	1385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=39;PP=1245;SC=GCCACCTGCCTTCAGGGGAGC;SOR=3.417;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=45;WE=26138270;WS=26138252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	26139137	rs10902685	C	T	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=1;PP=407;SC=GGACCCTGGCCGCTTTGATGA;SOR=4.047;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=15;WE=26139145;WS=26139127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	26139392	rs3738451	A	G	966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=26;PP=785;SC=TGAGGGCCTCAGGGACTGCCC;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=26139400;WS=26139382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	26139444	rs10751726	G	A	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=303;SC=TTTCTGTGCTGAGCCCAGAGG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=26139452;WS=26139434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	26139919	rs6676509	C	T	169.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=134;SC=AGTACAAGCACGGTGAGTGTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=26139927;WS=26139909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	26140573	rs2294228	C	A	3873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=58;PP=2953;SC=CACAGAACAACCAGGAGAACT;SOR=0.725;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=61;TCR=58;TR=119;WE=26140581;WS=26140563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	26146884	rs984412	C	G	1728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=36;PP=1394;SC=AGGCGGCGAGCACTTGGCCGA;SOR=2.494;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=47;WE=26146892;WS=26146874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	26150023	rs11247758	C	T	1428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=14;PP=1217;SC=TAGAGAGTGCCCTGTCCCTAG;SOR=1.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=41;WE=26150031;WS=26150013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	26152666	rs6598923	T	C	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=3;PP=1088;ReadPosRankSum=-0.918;SC=AGGAACCTTCTTCTGCCCCCT;SOR=3.209;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=39;WE=26152674;WS=26152656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr1	26152758	rs6598924	A	G	2538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=38;PP=1795;ReadPosRankSum=0.805;SC=TCATCATGGCATCTGTAAATG;SOR=0.906;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=48;TCR=39;TR=85;WE=26152766;WS=26152748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,91:0.98:93
chr1	26310394	rs2275102	A	G	1229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=7;PP=914;SC=GTAGGGAGAGAACAGGCTCAT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=36;WE=26310402;WS=26310384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	26314564	rs2245979	T	C	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=0;PP=257;SC=AAAGGCCTTCTGGGGAAGGTG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=26314572;WS=26314554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	26349967	rs1938405	C	T	1249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=32;PP=980;SC=CTGGAATAGACGCAAGCCCAA;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=38;WE=26349975;WS=26349957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	26357656	rs2736831	C	A	5939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=99;PP=2965;SC=AACATCAGCTCACCCCTCACT;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=186;TCF=87;TCR=99;TR=186;WE=26357664;WS=26357646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr1	26357855	rs2802321	A	G	3178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=30;PP=2457;SC=TCCAAGCCCTAACATTTTTCC;SOR=1.469;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=62;TCR=30;TR=92;WE=26357863;WS=26357845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	26358752	rs5773143	T	TA	2698.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=7;PP=2936;SC=TGGATCCAACTAACCCTTCTC;SOR=4.147;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=66;TCR=7;TR=71;WE=26358760;WS=26358742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	26365374	rs4659404	T	G	260.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=229;SC=TGGTAGAACATTTGCTGAGGA;SOR=4.407;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=26365382;WS=26365364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	26365549	rs2997452	C	T	1292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=12;PP=1115;SC=ACCTGGTTTACAACACAGCTG;SOR=1.666;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=41;WE=26365557;WS=26365539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	26372144	rs6686190	A	G	745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=636;SC=CAGGGGTCAGAATCTGGGCTG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=26372152;WS=26372134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	26496383	rs2232647	G	T	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=1;PP=387;SC=GCCCCCCGGCGTGGCCTGACG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=26496391;WS=26496373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	26510336	rs115982258	C	T	1939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=62;PP=1633;SC=CTTCCCCTGCCGCCCCCCGAC;SOR=6.091;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=2;TCR=62;TR=64;WE=26510344;WS=26510326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	26511139	rs2297711	G	A	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=15;PP=537;SC=GGGTTCCCCTGTTTGAGGAGC;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=26511147;WS=26511129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	26511700	rs2783680	A	G	2005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=36;PP=1555;SC=ACACAAAAACAGGTAGGCAAG;SOR=0.910;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=31;TCR=36;TR=67;WE=26511708;WS=26511690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	26515956	rs1045105	C	A	7893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=124;NR=122;PP=2965;SC=ACAGTCCCCCCACTCCCTGCC;SOR=0.701;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=247;TCF=124;TCR=123;TR=246;WE=26515964;WS=26515946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr1	26517667	rs11247864	T	C	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=1;PP=389;SC=TCTCAGATGATTTCCCCCCTC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=26517675;WS=26517657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	26524706	rs9970046	A	G	1864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=26;PP=1419;SC=GCGTTCATTTACATGACATTT;SOR=0.728;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=26;TCR=26;TR=52;WE=26524714;WS=26524696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	26527863	rs17163674	C	T	1161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=13;PP=898;SC=AGGAGGTGCGCGCAATCCGCT;SOR=1.552;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=38;WE=26527871;WS=26527853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	26597435	rs4659419	G	A	2500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=22;PP=2029;SC=TGTGCAATAAGTAGCAGAACC;SOR=1.795;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=55;TCR=22;TR=77;WE=26597443;WS=26597425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	26597673	rs11247894	G	A	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=340;SC=GGAGGGATACGTGAATTCTTG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=26597681;WS=26597663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	26608769	rs35567724	C	T	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=8;PP=775;SC=GGCGGAGCAGCGGGTTGAGGG;SOR=2.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=26608777;WS=26608759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	26608814	rs6672357	A	G	1643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=7;PP=683;SC=GACTGGGTCCAGGACAGGGAC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=31;WE=26608822;WS=26608804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	26608843	.	C	A	202	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=50;MMLQ=28;MQ=56.14;NF=7;NR=4;PP=202;QD=21.5246556861;SC=GGACCGGGACCGGGACTGGGG;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=11;WE=26608851;WS=26608833;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:18,11:0.38:29
chr1	26608865	.	ACC	A	2010.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.570;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.76;MQRankSum=0.061;QD=39.43;ReadPosRankSum=1.632;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr1	26608868	.	GGGACTGGGGCCGGGACCGGGACCGGGAC	G	2011.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.76;MQRankSum=0.061;QD=39.45;ReadPosRankSum=1.428;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr1	26608877	.	GCCGGGA	G	1296	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=23;MQ=58.76;NF=20;NR=6;PP=1296;QD=50.5384615385;SC=CGGGACTGGGGCCGGGACCGG;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=26;WE=26608904;WS=26608867;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:15,26:0.63:41
chr1	26608896	.	C	G	1442	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=58.76;NF=30;NR=10;PP=1442;QD=36.9192803137;SC=GGGACCGGGACAGGGACCAGG;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=40;WE=26608904;WS=26608867;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr1	26609093	rs72872912	A	T	5334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=70;NR=95;PP=2965;SC=CAGGCTGGGCAGTGGGACCAG;SOR=1.066;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=70;TCR=95;TR=165;WE=26609101;WS=26609083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr1	26609307	rs6598952	G	T	4280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=80;PP=2965;SC=CCATCAGCACGCGGTGACCCA;SOR=1.323;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=47;TCR=81;TR=126;WE=26609315;WS=26609297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	26610891	rs4332350	A	C	1988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=33;PP=1503;SC=CTTGTGCATCAGCTGCCTGCC;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=31;TCR=34;TR=64;WE=26610899;WS=26610881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	26612042	rs11247898	A	G	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=16;PP=479;SC=GCTGCAAGGGAAGAGGAAAAG;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=26612050;WS=26612032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	26620846	rs3832184	C	CA	2570.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=51;PP=2652;SC=GGGGGAGATGCGGGGCACCGT;SOR=2.973;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=60;TCF=8;TCR=52;TR=59;WE=26620854;WS=26620836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	26623382	rs116029080	C	T	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=7;PP=991;SC=GCTGGCTGCCCGCATCCCCCG;SOR=2.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=26623390;WS=26623372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	26627478	rs2276712	T	C	8682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.228;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=162;NR=148;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.694;SC=TCTTTTCTTCTGAGCCACACC;SOR=0.393;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=318;TCF=163;TCR=155;TR=310;WE=26627486;WS=26627468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,306:1.00:307
chr1	26629465	rs11803933	G	C	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=14;PP=328;SC=CCAAGCCCAGGGGGTAGCCTG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=26629473;WS=26629455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	26646574	rs112252579	G	A	1829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=0;PP=1545;SC=TCGCATCACTGCAGTCCAGCC;SOR=8.121;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=57;TCR=0;TR=57;WE=26646582;WS=26646564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	26646726	rs1071849	A	G	7273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.56;SOR=1.756;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr1	26646730	rs17645	A	G	7139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.97;SOR=2.151;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr1	26648551	rs11247913	G	C	4763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=58;PP=2965;SC=CGGCCTCCTGGGGGTGGGATG;SOR=1.255;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=89;TCR=58;TR=146;WE=26648559;WS=26648541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr1	26648826	rs60799739	G	A	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.587;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=44;PP=1295;ReadPosRankSum=0.360;SC=TGAGGCCCCAGGAGGTCATCA;SOR=4.091;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=51;TCF=6;TCR=45;TR=49;WE=26648834;WS=26648816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,50:0.96:52
chr1	26654937	rs11589684	G	C	1367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=33;PP=1114;SC=TTCTCCCATGGAGGGATTCCT;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=40;WE=26654945;WS=26654927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	26655208	rs11247916	C	T	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=5;PP=1363;SC=GCACCCATGCCTCCCCTCAGC;SOR=4.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=44;TCR=5;TR=49;WE=26655216;WS=26655198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	26655462	rs12057290	C	T	913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=25;PP=746;SC=ATCTGTATGTCAGGCCTTCTT;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=26655470;WS=26655452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	26662774	rs7517559	C	T	3160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=71;NR=25;PP=2638;SC=GGGAAAGGTCCGAAATGAGGG;SOR=2.006;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=71;TCR=25;TR=96;WE=26662782;WS=26662764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	26663362	rs10751735	C	T	1642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=20;PP=1250;SC=GGCCTGTGTGCTGGGGCCGTG;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=24;TCR=20;TR=44;WE=26663370;WS=26663352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	26670752	rs11247923	C	T	3806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=68;PP=2965;SC=TGGCAGGCAGCGTGGCGTACA;SOR=1.028;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=119;TCF=51;TCR=68;TR=118;WE=26670760;WS=26670742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr1	26671084	rs12562454	G	T	3456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.455;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=64;PP=2857;ReadPosRankSum=-0.982;SC=GATGAGATGGGGCTCCCTTCA;SOR=0.574;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=112;TCF=48;TCR=64;TR=111;WE=26671092;WS=26671074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr1	26671248	rs57268417	A	G	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=22;PP=1051;SC=TGGGCCCTGGACAACCTCAGT;SOR=0.843;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=18;TCR=22;TR=40;WE=26671256;WS=26671238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	26673076	rs11247924	G	A	4495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=112;PP=2965;SC=GTGGGGGGCCGCTGCCGCCAT;SOR=2.468;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=147;TCF=34;TCR=113;TR=146;WE=26673084;WS=26673066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr1	26673108	rs11247925	C	T	3511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=92;PP=2802;SC=ACTTACCACTCGGGCCTTGGC;SOR=3.473;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=15;TCR=93;TR=107;WE=26673116;WS=26673098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	26673220	rs11247926	A	G	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=371;SC=AGGAATAAGAAAGATGAGGGT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=26673228;WS=26673210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	26688181	rs11583897	G	C	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=6;PP=766;SC=GGGGAGTCCCGGCACTGCTCA;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=26688189;WS=26688171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	26694245	rs10794531	T	C	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=12;PP=628;SC=GGATGGGCCATGAGCATCCAC;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=15;TCR=12;TR=27;WE=26694253;WS=26694235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	26694260	rs10794532	T	C	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=17;PP=747;SC=ATCCACCATGTCTGGAAGTGG;SOR=0.818;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=32;WE=26694268;WS=26694250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	26698884	rs11247936	T	C	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=0;PP=979;SC=ACATGAGTCTTGAGGGAGGCA;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=26698892;WS=26698874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	26698938	rs6703878	A	G	2568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=18;PP=1986;SC=CAAATACTTAATTCCAACCTC;SOR=2.455;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=75;TCF=57;TCR=18;TR=74;WE=26698946;WS=26698928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	26699103	rs11584185	T	C	3371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=82;PP=2686;SC=CTTGCACAACTTCTCTGTTAG;SOR=3.589;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=14;TCR=82;TR=96;WE=26699111;WS=26699093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	26699157	rs11247937	T	C	1262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=32;PP=959;SC=CTTCCCAACCTACTCTGGTGA;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=26699165;WS=26699147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	26700577	rs79556900	C	T	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=268;SC=CCCCCAACTCCTCAGTGGCCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=26700585;WS=26700567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	26700648	rs58364802	G	C	2031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=14;PP=1549;SC=TCCCTAAAAGGAAGAGCCCTC;SOR=2.376;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=48;TCR=14;TR=62;WE=26700656;WS=26700638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	26700795	rs7520030	T	C	2844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=53;PP=2206;SC=CCAGCTGTGCTCCCTCCTGGC;SOR=1.216;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=35;TCR=53;TR=88;WE=26700803;WS=26700785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	26737335	rs201666290	A	T	1428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=1;PP=1233;SC=CTCCGGGGCCAGCAGCCGCCC;SOR=6.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=40;WE=26737343;WS=26737325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	26752992	rs4659441	T	C	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=36;PP=865;SC=CAGGAAGTTTTGAGGAGCAGG;SOR=3.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=43;WE=26753000;WS=26752982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	26856462	rs11800553	T	G	166.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=4;PP=107;SC=AGCTAGTGCCTCTGGACCCGG;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=26856470;WS=26856452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	26869610	rs921893	G	A	4301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=28;PP=2965;SC=AGCAGAAGTAGGAAGAGTAAC;SOR=2.558;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=105;TCR=28;TR=133;WE=26869618;WS=26869600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr1	26870730	rs1466286	C	G	2062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=42;PP=1562;SC=CTGCCTACCTCTGTCTGTGGT;SOR=1.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=23;TCR=42;TR=65;WE=26870738;WS=26870720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	26872554	rs12723936	A	G	1007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=19;PP=814;SC=TCTGGTCCTGACCTGGCTGTG;SOR=0.880;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=34;WE=26872562;WS=26872544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	26879376	rs7543005	T	C	3372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=38;PP=2645;ReadPosRankSum=-0.996;SC=CCCCCTCTATTCCCATCTATA;SOR=1.094;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=61;TCR=39;TR=97;WE=26879384;WS=26879366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,104:0.98:106
chr1	26879792	rs4970489	T	C	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=402;SC=CCAGGGTGGCTCTTCAGGACC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=26879800;WS=26879790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	26879920	rs4970490	T	C	3503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=28;PP=2715;SC=TTTACCTGGCTGAGCTGGCTC;SOR=2.100;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=82;TCR=28;TR=109;WE=26879928;WS=26879910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	26880155	rs142081450	C	G	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=19;PP=570;SC=TGCCCAGTCACTAATGCTACC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=26880163;WS=26880145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	26880989	rs873151	T	C	1336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=3;PP=1089;SC=ATGGGGGTGATGCCTTCTGGC;SOR=4.664;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=41;WE=26880997;WS=26880979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	26881806	rs897641	C	A	1986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=40;PP=1565;SC=CCTGCCTCAGCTACCCTCTCT;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=23;TCR=40;TR=63;WE=26881814;WS=26881796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	26887150	rs34062688	A	G	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=1;PP=676;SC=CCAAGACCTTAGGTCCTGGGG;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=26887158;WS=26887140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	26887592	rs1064196	T	C	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=11;PP=511;SC=TTCTGCGGTATGGCCAGCACC;SOR=1.101;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=25;WE=26887600;WS=26887582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	26898142	rs188158	A	G	2553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=63;PP=2147;ReadPosRankSum=0.456;SC=GTGAGGGGGAATTGGAGGCCT;SOR=1.321;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=83;TCF=18;TCR=65;TR=81;WE=26898150;WS=26898132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,80:0.99:81
chr1	26898956	rs282176	T	C	288.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=271;SC=ACCACCTCCGTACCTTGTTGG;SOR=3.056;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=26898964;WS=26898946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	26899671	rs2296399	C	G	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=1;PP=1162;ReadPosRankSum=-0.883;SC=GGGGCCTGCTCCCCTGCAGCC;SOR=4.664;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=40;WE=26899679;WS=26899661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr1	26899687	rs282178	C	A	1367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=5;PP=1107;ReadPosRankSum=0.490;SC=CAGCCCTCCCCCAACCCCCTT;SOR=1.781;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=43;WE=26899695;WS=26899677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,44:0.96:46
chr1	27210721	rs3170660	T	C	3750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=72;PP=2784;SC=TCTTGGGCTCTGAAACAGTAT;SOR=1.044;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=54;TCR=72;TR=126;WE=27210729;WS=27210711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	27260783	rs7545442	C	T	1679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=10;PP=1338;SC=AAATGCCAGACGCTAATAAAA;SOR=2.712;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=55;TCF=45;TCR=10;TR=54;WE=27260791;WS=27260773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	27272600	rs145685168	A	ATCT	3751.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=49;PP=2957;SC=GAGCTGTTTCATCTTGCTTCC;SOR=1.995;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=68;TCF=13;TCR=55;TR=60;WE=27272612;WS=27272590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	27276778	rs76083564	C	A	1468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=41;PP=1150;SC=GGCTGGATGACCCACTCAGTT;SOR=6.229;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=42;WE=27276786;WS=27276768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	27277212	.	C	G	3254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=40;PP=2534;SC=GCGATGGCATCTGCAGTCGTC;SOR=1.146;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=61;TCR=40;TR=101;WE=27277220;WS=27277202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	27278671	rs17162368	C	T	4066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=70;NR=54;PP=2965;SC=ACTCAAGGGCCGGCTCAGCAG;SOR=0.937;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=71;TCR=54;TR=124;WE=27278679;WS=27278661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	27320356	rs6689941	T	C	1511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=13;PP=1051;SC=GCCGCCGCCCTGGGATCCCAT;SOR=1.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=47;WE=27320364;WS=27320346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	27321072	rs112999545	T	G	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=15;PP=526;SC=AAGAGGCAGTTGGGGGCCAGG;SOR=1.136;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=25;WE=27321080;WS=27321062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	27339087	rs116726456	C	T	250.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=8;PP=261;SC=CCGTGGCCACCGCCGTGGCCG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=27339095;WS=27339077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	27426796	rs4266911	T	C	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=20;PP=1170;SC=CTGGCCCTGGTGTTACTGCCC;SOR=1.244;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=31;TCR=20;TR=51;WE=27426804;WS=27426786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	27427041	rs4418629	T	C	5244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=99;PP=2965;SC=CCTTCAGCTCTTCATTCACCA;SOR=1.264;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=58;TCR=99;TR=157;WE=27427049;WS=27427031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr1	27609980	rs6670124	T	G	1785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.87;NF=13;NR=43;PP=1521;SC=AAGCCACAGATCAAGCACAAG;SOR=2.265;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=13;TCR=43;TR=56;WE=27609988;WS=27609970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	27632599	rs72880901	C	G	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=0;PP=449;SC=GTGTATTTCCCTCCCCCTCCC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=27632607;WS=27632589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	27660568	rs35771571	G	A	4272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=21;PP=2965;SC=GGGCGGCACCGGCACTCCCCA;SOR=3.155;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=103;TCR=21;TR=124;WE=27660576;WS=27660558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	27676737	rs7552152	G	A	6551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.252;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=94;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.779;SC=GTTATTGGGAGGCGTGCGATT;SOR=0.416;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=196;TCF=101;TCR=95;TR=195;WE=27676745;WS=27676727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,202:1.00:203
chr1	27680108	rs7525750	C	T	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=5;PP=219;SC=AGGGTGGTAACGGGGGACAGT;SOR=0.859;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=10;WE=27680116;WS=27680106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	27680292	rs8533	A	G	1808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=28;PP=1447;SC=AGCCGTGCGAATGGGTGGATG;SOR=0.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=28;TCR=28;TR=56;WE=27680300;WS=27680282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	27682440	rs36035221	T	TG	2047.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=17;PP=2051;SC=GAGGGCACAGTAGAAGAGCAG;SOR=1.480;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=28;TCR=17;TR=44;WE=27682448;WS=27682430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	27686063	rs7521552	G	C	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=27;PP=904;SC=GCCAGCAGAAGTAGACCCTCT;SOR=3.981;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=30;WE=27686071;WS=27686053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	27686176	rs72882735	T	C	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=3;PP=478;SC=TGACAATTGGTTTGGCTTCAG;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=27686184;WS=27686166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	27686314	rs45616532	T	C	1454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=19;PP=1157;SC=CCCGCCACCCTCAGCAGATGA;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=26;TCR=19;TR=45;WE=27686322;WS=27686304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	27689360	rs150334965	C	T	6645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=95;PP=2965;ReadPosRankSum=0.782;SC=GGCCTGCTCCCGGTGCCCAGC;SOR=0.235;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=202;TCF=107;TCR=95;TR=200;WE=27689368;WS=27689350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,211:1.00:212
chr1	27690322	rs72882739	G	A	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=427;SC=AGCCACCAGTGAGCAAGTGGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=27690330;WS=27690318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	27690644	rs12727507	A	G	2477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=48;PP=1816;SC=CCAGCCCACCATACCCTCACC;SOR=1.127;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=34;TCR=48;TR=82;WE=27690652;WS=27690634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	27690669	rs72882742	G	T	2722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=52;PP=2128;SC=CCCTCCTGGAGCACCCTCCCT;SOR=1.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=32;TCR=52;TR=84;WE=27690677;WS=27690659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr1	27696011	rs10218730	C	T	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=50;PP=1408;SC=CCCAGCACCACGCCTGGCACC;SOR=7.864;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=50;WE=27696019;WS=27696001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	27697474	rs3813800	G	C	289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=207;SC=CTGGGGGAGGGGGGGCACAGC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=27697482;WS=27697464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	27709020	rs2504779	T	C	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=23;PP=592;SC=TGCTCCCACATGCAGCTGGAG;SOR=3.056;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=28;WE=27709028;WS=27709010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	27720178	rs2504786	T	C	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=475;SC=GCATTGGGACTCTATCAGGTA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=27720186;WS=27720168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	27720967	rs734852	G	A	3093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=52;PP=2534;ReadPosRankSum=1.914;SC=ATCGTCTGCCGCCATGCCCAG;SOR=0.247;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=51;TCR=53;TR=103;WE=27720975;WS=27720957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,103:0.99:104
chr1	27875824	rs4908364	C	T	2867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=39;PP=2218;SC=CAGTCTGAAGCGGCTGGAGTT;SOR=0.901;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=90;TCF=50;TCR=40;TR=89;WE=27875832;WS=27875814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	27876482	rs2076457	C	A	2529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=48;PP=2106;SC=CAGTAAGGCCCGGGCCCCCGA;SOR=1.409;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=29;TCR=48;TR=77;WE=27876490;WS=27876472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	27944000	rs1292089	T	A	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=576;SC=GTAGGTGCCCTGCAAAGGTTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=27944008;WS=27943990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	28086955	rs10902671	C	A	1198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=5;PP=934;SC=TGAAAAATAGCTTATATCCTG;SOR=2.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=35;WE=28086963;WS=28086945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	28261593	rs3737809	T	C	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=3;PP=799;ReadPosRankSum=1.287;SC=GACAAGGAGTTCTGCTCAGGC;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=30;WE=28261601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr1	28261658	rs3831926	T	TG	2222.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=9;PP=2495;SC=CAACAGTGCCTGAGAATCCCA;SOR=2.985;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=56;TCF=47;TCR=9;TR=54;WE=28261666;WS=28261648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	28261902	rs3737807	C	A	835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=677;SC=AGCTAGTGGGCCTTAGCAAGT;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=28261910;WS=28261892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	28268573	rs10902678	C	T	448.88	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=360;ReadPosRankSum=0.952;SC=CACCCTTCAGCAGTATGTGCC;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=16;WE=28268581;WS=28268566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr1	28268706	rs4908341	G	A	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=12;PP=1059;SC=ACGTCAAAGGGGCCAAACTGC;SOR=1.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=39;WE=28268714;WS=28268696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	28268833	rs11386058	C	CG	2127.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.400;NF=15;NR=10;PP=1039;ReadPosRankSum=0.349;SC=AGGGCCTCCCCCAACATCCAT;SOR=0.286;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=35;TCF=16;TCR=19;TR=25;WE=28268843;WS=28268823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr1	28268835	rs5018921	A	C	2136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.341;NF=20;NR=10;PP=775;ReadPosRankSum=1.063;SC=GGCCTCCCCCAACATCCATCC;SOR=0.296;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=43;TCF=21;TCR=22;TR=30;WE=28268843;WS=28268823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr1	28282189	rs142191764	T	A	748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=4;PP=649;SC=AACCCCTCCCTTGTAGGTGTA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=28282197;WS=28282179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	28282819	rs4908381	T	C	1739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=49;PP=1486;SC=CTGTCACAGCTTCATACCTGG;SOR=5.018;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=52;WE=28282827;WS=28282809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	28290231	rs4373781	C	G	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=21;PP=604;SC=GGCTGGCCCCCCTGTCGTGGC;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=28290239;WS=28290221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	28657257	rs76452396	T	C	1819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=22;PP=1426;SC=GTAAGTGAACTAGGGAACTTG;SOR=1.238;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=33;TCR=22;TR=55;WE=28657265;WS=28657247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	28696392	rs6703793	C	G	2549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=54;PP=2049;SC=CAGGCTGCGGCCTCCTCTCAG;SOR=1.423;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=30;TCR=54;TR=84;WE=28696400;WS=28696382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	28733775	.	A	G	70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=15;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=70;QD=26.1928031368;SC=AAAAAAAAAAACTATCATTTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=28733783;WS=28733766;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	28733993	rs12091029	G	T	1235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=23;PP=895;SC=CACCTACATTGTTCTTAGTAA;SOR=1.292;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=36;WE=28734001;WS=28733983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	28800380	rs61785974	C	A	2153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=34;PP=1686;SC=ATCCTTAGATCTACACCAGGA;SOR=0.814;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=31;TCR=34;TR=65;WE=28800388;WS=28800370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	28817597	rs10915235	A	G	1274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=35;PP=1089;SC=AAATGAATTCACAGCTGGGCA;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=37;WE=28817605;WS=28817587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	28859308	.	T	TTTG	2412.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.88;QD=42.33;SOR=4.768;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	28887031	rs10915245	A	G	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=2;PP=269;SC=TCAGTGATCCACCTGCCTTGG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=28887039;WS=28887021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	29037240	rs11415888	C	CT	125.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.8427;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=97;ReadPosRankSum=-1.221;SC=GTTGGGGTAACTTTTTTTTTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=8;WE=29037248;WS=29037230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr1	29063559	rs6697540	A	C	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=5;PP=613;SC=GCTCCCGCAGACGGGGCTCAT;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=29063567;WS=29063549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	29138975	rs1042114	G	T	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=5;PP=450;SC=CCTAGCGCCTGCCCCAGCGCT;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=29138983;WS=29138965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	29323595	rs12354050	T	C	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=35;NR=1;PP=1076;SC=GCCCAGGAGGTTGAGGCTGCA;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=36;WE=29323603;WS=29323585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	29345009	rs5773229	C	CTT	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=487;SC=AGTTTAAACACAACATGGTAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=29345017;WS=29344999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	29345027	rs2985334	T	G	135.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=105;SC=TATTGGTTCATTGTTTGCCTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=29345035;WS=29345017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	29379992	rs2788888	G	A	1486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=44;PP=1324;SC=AAATATTTTCGTAGAGTTATG;SOR=6.229;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=45;WE=29380000;WS=29379982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	29385486	rs2153165	G	C	1284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=34;PP=1065;SC=GTTGTTAATAGTTTCAAATAA;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=36;WE=29385494;WS=29385476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	29605646	rs72651203	C	T	1601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=26;PP=1276;ReadPosRankSum=0.713;SC=GGGTTTGGGACCCTATTACAG;SOR=0.282;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=27;TCR=27;TR=53;WE=29605654;WS=29605636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,53:0.98:54
chr1	29605928	rs115259153	G	T	3191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=25;PP=2541;ReadPosRankSum=1.017;SC=GGGATGCTCTGACCATCCAGT;SOR=1.234;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=101;TCF=76;TCR=25;TR=100;WE=29605936;WS=29605918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
chr1	29609502	rs111595207	TG	T	789.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.37;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	29630554	rs61733825	T	C	202.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=52.83;NF=1;NR=7;PP=159;SC=AGCAGGAGTATGAGGTGCACG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=29630562;WS=29630544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	29631236	rs3831903	C	CTA	9948.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.142;NF=84;NR=89;PP=2930;ReadPosRankSum=-1.456;SC=GGAAGGGGCCCTCAGTGAGGG;SOR=0.951;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=86;TCR=91;TR=173;WE=29631244;WS=29631226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,224:0.99:226
chr1	29631782	rs2235935	C	T	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=303;SC=TGCCCTATCCCCTAGCCTCCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=29631790;WS=29631772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	29631909	rs2235937	A	G	2805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=31;PP=2202;SC=GGAGACCCCAATGCCGACTAC;SOR=1.434;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=58;TCR=31;TR=89;WE=29631917;WS=29631899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	29696060	rs56203706	T	C	2668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=13;PP=2151;SC=CCCGGGGCCATGGAGCCCTGT;SOR=3.180;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=69;TCR=13;TR=82;WE=29696068;WS=29696050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	29696146	rs74833085	C	T	5328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=78;NR=93;PP=2965;SC=GCCCCCGGGACACGGCGTTTC;SOR=0.899;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=78;TCR=93;TR=171;WE=29696154;WS=29696136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr1	29842261	rs10915168	A	T	309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=4;PP=245;SC=ATCCTCCTCCACTTCCTCCCC;SOR=1.270;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=29842269;WS=29842251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	29842354	rs111593358	C	CT	347.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=4.102;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.57;MQRankSum=-0.106;QD=19.32;ReadPosRankSum=1.368;SOR=1.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr1	29843392	rs4995377	T	C	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=17;PP=639;SC=CCATGGACTCTTCCTCTTCCT;SOR=1.255;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=28;WE=29843400;WS=29843382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	29843442	.	T	TCTTCCTCCTTCTTCCTTCTCCTTCTCCTC	315.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=52.62;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	31196255	rs45601237	G	A	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=6;PP=320;SC=CAGTGCTGAGGGTCAGGGCCC;SOR=0.836;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=13;WE=31196263;WS=31196245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	31214369	rs3748602	G	T	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=171;SC=TCTCCAGAACGCAGGTGGGAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=31214377;WS=31214359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	31215364	rs1050663	T	C	5095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=64;PP=2965;SC=CCACCTCTACTGAGTGCTCGA;SOR=1.267;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=169;TCF=105;TCR=64;TR=169;WE=31215372;WS=31215354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr1	31230668	rs2273979	C	T	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=34;PP=1039;SC=GAAGGGGAAGCTGCTGGCTGC;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=37;WE=31230676;WS=31230658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	31347515	rs140962870	G	C	822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=23;PP=671;SC=GCCCTGGGGGGCTAACACTTA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=31347523;WS=31347505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	31413957	.	C	T	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=4;PP=746;SC=ACTACTAATCCTCTCTTCTGG;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=31413965;WS=31413947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	31440921	rs4317854	G	A	174.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=139;SC=ATCTATCCCTGATTCTGAAAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=31440929;WS=31440911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	31445932	rs2491135	C	G	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=415;SC=CGTCTCAAAACAAATTTATTT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=31445940;WS=31445922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	31465512	.	A	AATCTTTGACGTCTGCATCAATCCCATTCTG	254.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.346;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=11.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.63;ReadPosRankSum=-1.759;SOR=1.498;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,13:0.13:97
chr1	31478638	rs66522510	AAGAGAGAGAG	A	1740.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.23;QD=41.45;SOR=3.365;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	31479951	.	T	TC	201.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.699;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=4.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.48;ReadPosRankSum=-3.225;SOR=0.102;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,9:0.20:45
chr1	31479952	.	G	GCCCATAGCTCTCCCTTC	201.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.192;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=8.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.39;ReadPosRankSum=-2.727;SOR=0.068;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,8:0.17:46
chr1	31656832	rs12063290	T	C	1135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=32;PP=873;SC=GGTGCAGGGATGTGTTGAAGG;SOR=3.003;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=39;WE=31656840;WS=31656822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	31732390	rs6425725	G	A	49.14	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.38;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	31732602	rs59591825	CA	C	134.37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=10.414;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.22;SOR=4.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr1	31733153	rs76752296	T	C	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=281;SC=TCTAATATCATGAGGATGACT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=31733161;WS=31733143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	31733926	rs12121460	A	G	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=382;SC=AGTGGCTCACACCTGTAATCC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=31733934;WS=31733916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	31744505	rs113021667	A	AT	488.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.64;MQRankSum=0.000;QD=23.27;ReadPosRankSum=0.747;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr1	31761989	rs1532859	G	A	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=1;PP=1123;SC=TGTTATGGGAGATGACTGCTA;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=39;WE=31761997;WS=31761979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	31762374	rs1532858	C	T	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=450;SC=CACTGACCTGCTGTGCTACGC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=31762382;WS=31762364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	31764930	rs10733007	T	C	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=18;PP=541;SC=AGTTCTCAGGTCAGGCACGGT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=31764938;WS=31764920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	31769752	rs41412349	T	G	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=570;ReadPosRankSum=-0.944;SC=TCGGATAGTCTCTTGTTATTG;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=21;WE=31769760;WS=31769742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr1	31783151	rs78423071	A	G	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=39;PP=1148;SC=AACATCTGGCAATCACATGTG;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=40;WE=31783159;WS=31783141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	31819467	rs12240113	C	T	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=6;PP=664;SC=GGCCGGCAGTCGGTATCTTTT;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=31819475;WS=31819457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	31838905	.	ATGTATG	A	154.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=1.465;NF=1;NR=4;PP=245;ReadPosRankSum=1.465;SC=GGCTATATGTATGTATGTGTG;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=5;WE=31838918;WS=31838895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr1	31882582	rs4012494	G	GGCCTCA	1131.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=7;PP=959;SC=CATAAGGGATGGCCCTGCTCT;SOR=1.802;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=15;WE=31882590;WS=31882572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	31883295	rs6701521	T	C	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=12;PP=487;SC=GAGTTATGCCTTCCATGCTGG;SOR=1.292;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=19;WE=31883303;WS=31883285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	31886101	rs34555734	G	C	1974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=57;NR=1;PP=1588;SC=CCCGAAGCCGGGAGCCGCCGC;SOR=6.837;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=58;TCF=57;TCR=1;TR=58;WE=31886109;WS=31886091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	31886833	rs10914377	T	C	910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=13;PP=720;SC=TCGCCCCGGATCATCTGGGCC;SOR=1.143;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=17;TCR=13;TR=30;WE=31886841;WS=31886823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	31897493	rs1320585	A	G	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=2;PP=793;SC=GTTCTGTGAGAGGTGGGGCTT;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=31897501;WS=31897483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	31899684	rs10454445	A	T	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=22;PP=657;SC=AGCCTGCCTGACCCCCCCTGG;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=31899692;WS=31899674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	31899704	rs10454446	C	T	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=16;PP=521;SC=GCCTGAAGCCCGGCCCCTTAG;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=31899712;WS=31899694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	31902418	rs10047085	A	G	2900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=71;PP=2252;SC=GGGAAGGATCATGATTGAGGG;SOR=2.352;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=22;TCR=71;TR=93;WE=31902426;WS=31902408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	31905889	rs3050461	A	ACAG	2643.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=12;PP=2182;SC=TAGACGCCACACAGCAGCAGC;SOR=2.644;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=58;TCF=42;TCR=16;TR=46;WE=31905897;WS=31905879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	31906882	rs11587589	A	G	2691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=22;PP=2093;SC=ACTGGGCACCAGGCTCATGGG;SOR=2.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=68;TCR=22;TR=90;WE=31906890;WS=31906872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	32044641	.	G	A	301	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=34;MMLQ=28;MQ=55.05;NF=12;NR=0;PP=301;QD=27.9809343789;SC=TTCAGTTATAGTTTAATTTCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=32044649;WS=32044631;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	32044641	.	G	GTTTAATTTCAGTGAGAGCTGGTGTGTCTATGTGTGTGTGTGTGTGATGTCTTCAGTTATAA	371.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=35.36;QD=185.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	32119347	.	A	AAC	368	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5167;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.588;NF=6;NR=5;PP=455;ReadPosRankSum=-0.931;SC=GATTACTTGAAACACACACAC;SOR=0.643;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=11;WE=32119355;WS=32119337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr1	32128355	rs141404150	G	A	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=80;SC=AAGGGTCCTGGTGACTGCTGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=32128363;WS=32128345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	32145009	rs4949461	C	T	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=3;PP=563;SC=TGACAGCTGACGCAACAGTGC;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=32145017;WS=32144999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	32148571	rs10737358	A	G	2509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=24;PP=1931;SC=GAGGTCCCACAGGTCCGGTGG;SOR=2.076;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=65;TCR=24;TR=89;WE=32148579;WS=32148561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	32149263	rs142678689	A	AT	2762.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=29;PP=2927;SC=TAGCTGGCTAATGGAAGTGCT;SOR=1.209;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=67;TCF=36;TCR=31;TR=64;WE=32149271;WS=32149253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	32155284	rs2297682	T	C	2498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.84;SOR=0.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	32155287	rs182114587	C	G	2498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.43;SOR=0.884;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	32155367	rs35791190	T	C	1990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=33;PP=1615;SC=ATCACCAGGCTCCCCTTTGGG;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=29;TCR=33;TR=62;WE=32155375;WS=32155357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	32155463	rs75020493	G	A	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=6;NR=28;PP=891;SC=CTAGCAGAAGGGAGAGGCAGT;SOR=2.899;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=32155471;WS=32155453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	32155929	rs2297681	G	A	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=568;SC=AGGGGGTCCCGTTCCCACCCC;SOR=4.712;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=21;WE=32155937;WS=32155919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	32156869	rs10798884	A	T	6159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=97;PP=2965;SC=TCCAGGGACCACTCGCTACAG;SOR=0.725;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=91;TCR=98;TR=188;WE=32156877;WS=32156859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr1	32157317	rs75205816	C	A	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=466;ReadPosRankSum=-0.843;SC=GAGGTGAATGCCCACCTGTCC;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=19;WE=32157325;WS=32157307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr1	32157531	rs2297676	T	C	3163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=72;NR=31;PP=2594;SC=GGGGGCTGGATTCCCGAAGGT;SOR=1.848;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=72;TCR=31;TR=103;WE=32157539;WS=32157521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	32158374	rs3818788	T	C	3109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=68;PP=2431;SC=TTACCTGAAGTGGGGCATCCG;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=38;TCR=68;TR=106;WE=32158382;WS=32158364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	32159588	rs2275097	A	C	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=5;PP=455;SC=ACACACACAAACCCCTGCTTT;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=32159596;WS=32159578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	32160918	rs6656079	A	G	877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=23;PP=685;SC=CATCACACATATCTTGAGTGG;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=32160926;WS=32160908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	32164206	rs2228550	T	G	1419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=38;PP=1181;SC=GGGAATACTCTTCTGGAGATG;SOR=3.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=45;WE=32164214;WS=32164196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	32167526	rs1815465	G	C	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=426;SC=CGAAGACACAGGCACACACAC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=32167534;WS=32167516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	32167663	rs148409245	A	T	3782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=39;PP=2965;SC=CAAGGACCCCAGCACCCCAGG;SOR=1.629;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=79;TCR=39;TR=118;WE=32167671;WS=32167653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	32193647	rs1127100	T	C	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=4;PP=547;SC=TCCGCTCGGCTGCCCCACCCG;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=32193655;WS=32193637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	32196647	rs909001	C	G	1847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=44;PP=1497;SC=GGGTCCCCTCCGGCCGGGCCC;SOR=1.926;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=63;WE=32196655;WS=32196637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	32202408	rs112521624	C	T	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=27;PP=758;SC=CGCTGCTGGGCGCTGCCACAG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=32202416;WS=32202398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	32204063	rs2280387	C	G	3671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=50;PP=2846;SC=TCCCAGGATACGTTCTTGACC;SOR=0.960;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=64;TCR=50;TR=114;WE=32204071;WS=32204053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr1	32207581	rs2297600	T	G	3685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=74;PP=2884;SC=GTGGGAGAGGTGAGGCATATG;SOR=1.417;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=39;TCR=74;TR=113;WE=32207589;WS=32207571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	32222294	.	G	A	1712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=27;PP=1358;SC=AGGCCCCGTAGAGCACACCCG;SOR=0.813;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=21;TCR=27;TR=48;WE=32222302;WS=32222284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	32224845	rs11800536	C	T	2840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=35;PP=2117;SC=GGAGTTAACACGCACACACAG;SOR=1.203;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=90;TCF=55;TCR=35;TR=89;WE=32224853;WS=32224835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	32266026	rs552124	A	G	2696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=27;PP=1994;SC=ATTAAATGACATCACTTGTTC;SOR=1.896;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=67;TCR=27;TR=94;WE=32266034;WS=32266016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	32280610	rs6664445	T	C	3687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=56;PP=2888;SC=CTCCCCTGAGTAGGCACCGAG;SOR=0.728;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=55;TCR=56;TR=111;WE=32280618;WS=32280600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr1	32541440	.	GGT	G	70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=70;QD=37.0;SC=ACCCAACAAGGGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=2;WE=32541449;WS=32541430;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,2:0.22:9
chr1	32557486	rs744455	A	G	2598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=45;PP=2088;ReadPosRankSum=0.917;SC=GCTGCCTGTCACCCAGCCTCA;SOR=0.223;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=42;TCR=46;TR=87;WE=32557494;WS=32557476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
chr1	32566349	rs72878678	G	A	2574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=63;PP=2115;SC=CAGCTCGGCCGGGCATGGTGG;SOR=2.862;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=15;TCR=63;TR=78;WE=32566357;WS=32566339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	32568149	rs6686994	C	T	4340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=68;PP=2965;SC=GACCATCTCGCTGGCCCTCAT;SOR=0.735;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=67;TCR=68;TR=134;WE=32568157;WS=32568139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr1	32658062	rs79952364	G	GGT	1790.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=27;PP=1649;SC=TTGGGGTGGGGGTGGGAGGAG;SOR=2.038;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=36;WE=32658070;WS=32658052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	32686594	.	A	G	240	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=9;NR=0;PP=240;QD=30.5301347275;SC=AGAGAAGAGGATAGTAAGAGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=32686602;WS=32686593;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	32689417	rs16834930	G	A	283.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=234;SC=AACAAATGAGGATGCCTTTAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=32689425;WS=32689414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	32689857	rs589034	A	G	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=8;PP=389;SC=CTCTTCACTGACTGAGGAAAC;SOR=0.941;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=14;WE=32689865;WS=32689847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	32745167	rs11810505	C	T	1107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=1;PP=922;SC=TTCAATCTTCCTTTTCACATG;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=32745175;WS=32745157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	32745925	rs11576035	T	C	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=17;PP=549;SC=CTCCTCTATCTTCTCAGGGGT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=32745933;WS=32745915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	32768067	rs74064094	C	T	230.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=20;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.709;NF=21;NR=0;PP=304;ReadPosRankSum=0.872;SC=TTTTTTTTTTCTTTTGGAGTT;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=21;WE=32768075;WS=32768057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,15:0.88:17
chr1	32798134	rs6697130	A	G	118.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=1;PP=88;SC=CTGGGAAACCAGTCCAACCTG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=32798142;WS=32798124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	32801532	rs8176775	G	A	112.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=1;PP=56;SC=GGGCCGGCCGGGCCAAGCGTA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=32801540;WS=32801522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	32860161	rs547329	T	C	2239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=64;PP=1873;SC=CATCATTAGGTCCCGCCTCCC;SOR=8.380;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=0;TCR=64;TR=64;WE=32860169;WS=32860151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	33065947	rs704886	G	C	4994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=69;PP=2965;SC=GATGGGTCTGGTGATCTGGTC;SOR=0.852;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=78;TCR=69;TR=146;WE=33065955;WS=33065937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	33099798	rs704877	A	G	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=25;PP=711;SC=TCAATTTAACAGCACTGCAAC;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=33099806;WS=33099788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	33117071	rs583114	T	G	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=12;PP=399;SC=CCGCGGGGCGTGCTAACGGCT;SOR=2.712;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=33117079;WS=33117061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	33127730	rs1085416	T	C	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=1;PP=144;SC=TGCGATCTGCTAGCCTTGGCC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=33127738;WS=33127720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	33133968	rs2762904	T	C	2318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=28;PP=1821;SC=ATGTTCTTGTTTTTGACTATA;SOR=1.226;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=41;TCR=28;TR=68;WE=33133976;WS=33133958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	33134038	rs141143280	A	G	2347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=49;PP=1781;SC=ATGAGTCACTATAGAAATACA;SOR=1.802;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=21;TCR=49;TR=69;WE=33134046;WS=33134028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	33134989	rs359956	A	G	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=11;PP=459;SC=TAGAAAACATAATTTCTCTAG;SOR=1.022;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=19;WE=33134997;WS=33134979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	33160878	rs360042	C	T	3621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=45;PP=2770;SC=CAGCACTTCCCGGAAATCGGC;SOR=0.990;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=60;TCR=45;TR=105;WE=33160886;WS=33160868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr1	33161212	rs360041	T	C	8490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=164;NR=105;PP=2965;SC=TTCTCCTCCATGCTGGGGCTC;SOR=1.199;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=269;TCF=164;TCR=105;TR=269;WE=33161220;WS=33161202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr1	33233323	rs360523	A	G	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=5;PP=1103;SC=CCTTGCCGTGAGACCTGTGCC;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=39;WE=33233331;WS=33233313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	33234136	rs360522	T	C	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=377;SC=GCGGAGGTTGTGGTGAGCCAA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=33234144;WS=33234126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	33234153	rs3737993	G	A	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=3;PP=419;SC=CCAAGATTTCGCTACTGCACT;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=33234161;WS=33234143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	33276424	rs4951787	G	A	2163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=25;PP=1688;SC=CCTCCAACCTGTCTCCTCCAG;SOR=1.385;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=44;TCR=25;TR=68;WE=33276432;WS=33276414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	33293748	rs10753266	T	C	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=424;SC=TCTTCCCCTCTCCAGTTTCCT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=14;WE=33293756;WS=33293738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	33299816	rs4951773	A	T	255.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=270;SC=TTGTTTATTGATAATTTATAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=33299824;WS=33299806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	33318561	rs702836	T	C	186.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=153;SC=TTGTGATAATTGTAAGTATAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=33318569;WS=33318551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	33318634	rs785274	G	A	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=5;PP=441;SC=GTTGGCTGACGTAGTTCACTC;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=33318642;WS=33318624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	33330432	rs1284368	A	G	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=16;PP=495;SC=CAGAGGCCAGAGCCTGGGTTC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=33330440;WS=33330422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	33403963	rs139374693	T	C	2802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=30;PP=2248;ReadPosRankSum=-0.777;SC=AACGAAAAAATGCAACCTCTC;SOR=0.648;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=63;TCR=30;TR=92;WE=33403971;WS=33403953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,94:0.99:95
chr1	33430102	.	T	G	32	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=32;QD=22.2570708491;SC=GGGCGGCGGCTGCGCAGCCGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=33430110;WS=33430092;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	33476353	rs66599471	C	T	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQRankSum=-6.039;QD=2.78;ReadPosRankSum=0.227;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,7:0.18:38
chr1	33476385	rs76881767	C	G	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=4.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQRankSum=-7.653;QD=1.76;ReadPosRankSum=2.803;SOR=1.789;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,7:0.12:60
chr1	33476387	rs201842558	C	T	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=4.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQRankSum=-7.653;QD=1.41;ReadPosRankSum=2.598;SOR=1.789;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,7:0.12:60
chr1	33485789	.	AAC	A	117.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=-0.748;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.640;SOR=0.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr1	33497070	rs1012884	G	A	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=662;ReadPosRankSum=-0.823;SC=GGTCTGTCACGTAACTGAGCA;SOR=5.058;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=25;WE=33497078;WS=33497060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,24:0.96:25
chr1	33560338	rs804428	A	G	2199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=53;PP=1742;SC=TGGGAGTGTCATGCTGGGCTC;SOR=2.899;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=13;TCR=53;TR=66;WE=33560346;WS=33560328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	33641932	rs604941	A	G	2364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=31;PP=1929;SC=CCAGAGCCGAAATTTGAACCT;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=43;TCR=31;TR=74;WE=33641940;WS=33641922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	33642152	rs643402	C	T	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=22;PP=622;SC=GAACCTGAGACGGCCAGAGAG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=33642160;WS=33642142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	33646950	rs622407	A	G	1502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=23;PP=1233;SC=GGCAGAAGTAATGCTCGCAGC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=22;TCR=24;TR=45;WE=33646958;WS=33646940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	33735988	rs72889809	A	G	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=403;SC=AGTGACATGAATCATGACATA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=33735996;WS=33735978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	33742228	rs4475712	T	C	63.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=42;SC=GCGGGGCCGGTGAGGACTGGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=33742236;WS=33742218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	33746163	rs10914676	T	C	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=14;PP=319;SC=CCCTTAGGGCTGAGGGGCAGG;SOR=3.500;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=16;WE=33746171;WS=33746153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	33760743	rs4641276	T	C	4652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=40;PP=2965;SC=GCTGTGCCCCTACAGTCTCAC;SOR=2.124;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=112;TCR=40;TR=152;WE=33760751;WS=33760733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr1	33777524	rs6679416	T	C	1928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=2;PP=1453;SC=GCAAGAAGTGTTGTCTTTGCT;SOR=6.701;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=52;TCF=50;TCR=2;TR=51;WE=33777532;WS=33777514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	33778063	rs60103055	G	A	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=11;PP=734;SC=TGTAGGGTTTGGGGGTGCCCT;SOR=1.255;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=30;WE=33778071;WS=33778053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	33778226	rs12563102	G	A	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=11;PP=341;SC=GCAGGCAGCCGTGAGAAGCAT;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=13;WE=33778234;WS=33778216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	33778591	rs6664593	T	C	248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=179;SC=TCCAGCCAGCTGGTTCTTCTG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=33778599;WS=33778581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	33832865	rs6425816	A	G	1046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=24;PP=869;SC=TGGCACCTGCAGGGGAAGCCT;SOR=1.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=34;WE=33832873;WS=33832855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	33836519	rs7511731	A	G	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=3;PP=357;SC=TCCAGCCATGATGCTACATGG;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=33836527;WS=33836509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	33836796	rs7545416	C	G	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=412;SC=GTGTTAAGGACAACAGCCTCT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=33836804;WS=33836786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	33957152	rs4403594	T	G	4352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.96;NF=73;NR=56;PP=2965;SC=CAGGCTCGGGTATAGTGACGC;SOR=0.945;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=73;TCR=56;TR=129;WE=33957160;WS=33957142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	33960062	rs9943259	A	G	4710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=79;PP=2965;SC=TGTACCTTGCAGAGAAACCCT;SOR=0.706;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=76;TCR=79;TR=155;WE=33960070;WS=33960052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr1	33961147	rs3795420	T	G	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=27;PP=786;SC=ATGCTAGAGATAAACTTTCCA;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=33961155;WS=33961137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	33985353	rs2641959	C	G	2999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=53;PP=2392;SC=TGCGGGGGGCCCTGGAGGGAG;SOR=0.909;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=45;TCR=53;TR=98;WE=33985361;WS=33985343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	34011960	rs72889004	T	C	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=215;SC=TACCTGCACATGCTCCTGCCT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=34011968;WS=34011950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	34033512	rs6703172	G	C	359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=301;SC=CTCTCCCTGAGAGTAGCAATC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=34033520;WS=34033502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	34043169	rs11291100	TC	T	928.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=29;PP=791;SC=CCCTTTCGTCTCCCCCCCATC;SOR=5.486;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=29;WE=34043177;WS=34043159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	34052272	rs16835645	C	T	1730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=43;PP=1362;SC=TCATTAGTACCTTGAACCCAC;SOR=2.958;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=53;WE=34052280;WS=34052262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	34052305	rs12727575	C	T	996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=30;PP=845;SC=TAATCAGAGGCGGGTCATGTT;SOR=5.486;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=32;WE=34052313;WS=34052295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	34052605	rs7526990	A	G	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=315;SC=GATAAGGTCCACTGGCCCGAC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=34052613;WS=34052595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	34189917	rs519370	C	T	1579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=35;PP=1144;SC=CAGAGAGCTACAGAAGGAGTG;SOR=2.170;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=45;WE=34189925;WS=34189907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	34189957	rs11346874	AG	A	1303.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=29;PP=1322;SC=AGAGGGCCTCAGGGGAGCACC;SOR=2.613;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=35;WE=34189965;WS=34189947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	34254108	rs34557326	C	CA	55.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=13.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.30;MQRankSum=0.659;QD=2.42;ReadPosRankSum=-2.354;SOR=0.591;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr1	34270498	rs10737374	G	A	2779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=66;PP=2102;SC=GTCTCCTCCCGCCTGGATCAG;SOR=2.597;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=18;TCR=66;TR=84;WE=34270506;WS=34270488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	34276210	rs11418676	T	TA	184.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	34285342	rs17342512	G	A	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=7;PP=868;SC=GGTCGCTCCAGGCCGCAAACA;SOR=2.376;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=33;WE=34285350;WS=34285332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	34285381	rs11578857	C	T	1296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=17;PP=1152;ReadPosRankSum=-0.719;SC=AGGTGATCCGCTTGGACCCTT;SOR=0.446;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=44;WE=34285389;WS=34285371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr1	34285995	rs3795414	G	A	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=387;SC=CCTGCAGGAAGGCCAGCCCCT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=34286003;WS=34285985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	34286189	rs3843294	A	C	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=23.222;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.19;MQRankSum=-0.494;QD=28.08;ReadPosRankSum=2.372;SOR=5.992;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,19:0.90:21
chr1	34329897	rs911218	T	C	3349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=25;PP=2525;SC=CAAATACCTATGTTGGCTTTA;SOR=2.281;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=78;TCR=25;TR=103;WE=34329905;WS=34329887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	34330067	rs10379	A	C	6867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=109;PP=2965;SC=GATCCCCAGGAACCCAGACGG;SOR=0.731;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=209;TCF=100;TCR=109;TR=209;WE=34330075;WS=34330057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr1	34383662	rs12029535	T	C	1567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=15;PP=1239;SC=TTGCAGAGAATAGGGTAGGAA;SOR=1.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=49;WE=34383670;WS=34383652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	34684463	rs705207	G	A	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=12;PP=394;SC=GGAAAAGCAAGGTTCTGACCA;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=34684471;WS=34684453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	35135315	rs2147385	C	T	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=9;PP=234;SC=GTAGTATATTCGACTATTACA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=35135323;WS=35135305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	35183838	rs683589	A	C	1353.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=3;PP=1074;SC=CAGGAAAAAAAAAACAAACAA;SOR=3.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=41;WE=35183846;WS=35183828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	35184033	rs693582	C	T	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=28;PP=848;SC=AAAGGGAGCACGGAGGGACAA;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=32;WE=35184041;WS=35184023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	35184084	rs693852	C	T	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=312;SC=CCACTACTCACAACTTAACAC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=35184092;WS=35184074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	35332926	rs1001616	G	C	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=16;PP=456;SC=TGGGAGACAGGGGGACAAGAG;SOR=3.160;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=35332934;WS=35332916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	35561510	rs2101973	G	A	1227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=19;PP=814;SC=AATTATTTAAGTTAGTTATGT;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=17;TCR=19;TR=36;WE=35561518;WS=35561500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	35562965	rs2971408	G	A	4484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=73;NR=62;PP=2965;SC=ATCATCTGGCGTGAATAAAAT;SOR=0.796;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=73;TCR=62;TR=135;WE=35562973;WS=35562955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr1	35563206	rs6658571	C	G	1958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=54;PP=1649;SC=TATTTCCCTACCTTGTTCTTG;SOR=4.103;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=6;TCR=54;TR=60;WE=35563214;WS=35563196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	35576145	rs2935955	C	T	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=404;SC=CAAATTAAACCGACTTTTAAA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=35576153;WS=35576135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	35925861	rs2819002	C	A	2773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=19;PP=2364;SC=CCACGAGAGGCAAAAAAATGG;SOR=2.531;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=66;TCR=19;TR=85;WE=35925869;WS=35925851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	36205166	rs577483	A	G	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=33;PP=978;SC=AAATGCAACAATGAATATACT;SOR=4.351;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=36;WE=36205174;WS=36205156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	36213712	rs516992	G	T	2037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=49;PP=1705;SC=ACAAATGTCAGTCATTGTCAT;SOR=2.457;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=14;TCR=49;TR=63;WE=36213720;WS=36213702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	36216835	rs535638	C	T	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=4;PP=399;SC=AACAAAACAACGTAATTGCCA;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=36216843;WS=36216825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	36226816	.	G	C	2213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.359;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=59;PP=1875;ReadPosRankSum=0.645;SC=CTATAAAATGGAATAAAACAA;SOR=2.802;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=75;TCF=15;TCR=60;TR=73;WE=36226824;WS=36226806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,72:0.97:74
chr1	36307412	rs5773512	CAT	C	362.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.671;NF=0;NR=11;PP=386;ReadPosRankSum=0.862;SC=TATATATGCACATATATATAT;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=11;WE=36307421;WS=36307402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr1	36316418	rs11403763	C	CA	1369.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=2.442;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.58;MQRankSum=0.259;QD=22.83;ReadPosRankSum=-0.242;SOR=1.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:5,55:0.92:60
chr1	36316571	rs4652895	A	C	1660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=49;PP=1310;SC=GCACTCGCTCAGTCTCTATTC;SOR=3.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=9;TCR=49;TR=58;WE=36316579;WS=36316561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	36384028	rs61751004	G	T	3313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=63;PP=2613;SC=CATCCAGGTAGCTGGGCTTTA;SOR=1.222;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=39;TCR=63;TR=102;WE=36384036;WS=36384018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr1	36553673	rs399393	A	G	1482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=22;PP=1259;SC=GCATGGACACACGGCGCAAGC;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=26;TCR=22;TR=48;WE=36553681;WS=36553663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	36556779	rs67749899	CA	C	2012.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.15;QD=28.35;SOR=2.206;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	36563158	rs3738360	C	A	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=3;PP=674;SC=GCAGCAGGACCCCCCCCGCGG;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=36563166;WS=36563148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	36565584	rs274753	C	G	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=1;PP=425;SC=TCTGATGGCTCTCAGGGAGGC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=36565592;WS=36565574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	36565617	rs274754	G	A	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=6;PP=484;SC=GGCTGGGAGCGATTTGAGGCA;SOR=1.828;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=36565625;WS=36565607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	36602943	rs2231318	C	T	912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=26;PP=742;ReadPosRankSum=-0.865;SC=AGTGGGAAAACGAAGGGGTAG;SOR=3.126;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=28;WE=36602951;WS=36602933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr1	36752152	rs2242428	C	T	3570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.210;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=50;ReadPosRankSum=-0.864;SC=ATGGAAACTACCGCTCAAATT;SOR=0.398;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=104;TCF=53;TCR=51;TR=103;WE=36752160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,110:0.99:111
chr1	36752433	rs6425977	C	T	3706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=65;PP=2965;SC=GGAGATGAGGCCAAGGAGCAG;SOR=1.230;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=45;TCR=66;TR=110;WE=36752441;WS=36752423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr1	36762396	rs1566589	C	T	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=36;PP=1019;SC=GTTACCCCTTCCAGACTCTTA;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=38;WE=36762404;WS=36762386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	36767400	rs882799	C	T	1433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=39;PP=1138;SC=ATTAAATGTACGTGCAGGATT;SOR=4.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=42;WE=36767408;WS=36767390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	36773819	rs11263871	C	G	1468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=31;PP=1134;SC=AGGTGTGAGACGAACAGGGTG;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=41;WE=36773827;WS=36773809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	36787888	rs58971913	G	A	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=3;PP=433;SC=AGCGGGAGCCGGGGCCCATCA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=36787896;WS=36787878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	36788356	rs7536394	A	G	621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=12;PP=524;SC=GGTCACGGAGAGGCCCGGACG;SOR=1.292;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=19;WE=36788364;WS=36788346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	36883946	rs16822888	T	C	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=31;PP=799;SC=TTTTGTCCCATGACTGATATG;SOR=2.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=36883954;WS=36883936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	36884473	rs57413616	A	G	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=319;SC=AAGTTGCGGTAAGCTGAGATC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=36884481;WS=36884471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	36884530	.	G	A	595	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=15;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=29;MQ=55.36;NF=18;NR=3;PP=595;QD=29.9891053594;SC=CCTGTCTCAAGAAAAAAAAAA;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=21;WE=36884538;WS=36884517;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr1	36886117	rs2275477	C	T	1706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=17;PP=1244;SC=AACCGGAATCCGGGCTCAGGG;SOR=1.697;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=51;WE=36886125;WS=36886107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	36886364	rs2275478	C	G	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=16;PP=472;SC=TAGAAAGCAGCCTTAACCAAA;SOR=4.514;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=36886372;WS=36886354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	36887702	rs2236565	C	T	1685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=11;PP=1306;SC=TGTAGACTTCCGTATCTAGAG;SOR=2.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=40;TCR=11;TR=51;WE=36887710;WS=36887692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	36889197	rs11263892	T	C	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=276;SC=AGGGAGAGGCTGGGCGCAGTG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=36889205;WS=36889187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	36898067	rs34409118	T	C	1261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=7;PP=1128;SC=TGCAGGATGGTTGGGGAGTCT;SOR=3.003;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=42;WE=36898075;WS=36898057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	36898332	rs61772386	C	T	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=32;PP=910;SC=TCACTTATCACCCAAACCAAG;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=36898340;WS=36898322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	36927733	rs7065	G	A	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=7;PP=889;SC=GCAGCGTAGAGGGAGGTGGGT;SOR=2.517;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=33;WE=36927741;WS=36927723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	36929673	rs2275473	C	T	2793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=29;PP=2144;ReadPosRankSum=-0.949;SC=TCCCCTACTCCTGTGCTTCCT;SOR=1.511;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=60;TCR=30;TR=88;WE=36929681;WS=36929663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,93:0.98:95
chr1	36937059	rs3917981	A	G	1320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=20;PP=1109;SC=AGACCACCGGAGTGGGACGAG;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=21;TCR=20;TR=41;WE=36937067;WS=36937049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	36945307	rs3832027	AG	A	355.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=402;SC=ATGCAAGTCAAGGGCTTTTCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=36945315;WS=36945297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	37282884	rs3012032	C	T	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=38;PP=1303;ReadPosRankSum=-0.705;SC=AGACCCTGGGCGAAGAGAGGA;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=13;TCR=39;TR=51;WE=37282892;WS=37282874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr1	37285555	rs61769768	C	T	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=287;SC=GCCGCCTCAGCGTCAATATCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=37285563;WS=37285545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	37319270	.	C	A	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=50.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.80;ReadPosRankSum=-3.560;SOR=3.009;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr1	37324683	rs3738081	A	C	1789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=2;PP=1540;SC=GGGAGACAACACTGGTGGGGG;SOR=5.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=55;TCF=53;TCR=2;TR=55;WE=37324691;WS=37324673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	37324935	rs12067006	T	C	1365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=34;PP=1090;ReadPosRankSum=1.560;SC=TTCTCCTCCCTTGCCACAGGT;SOR=3.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=36;WE=37324943;WS=37324925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr1	37325477	rs6691840	A	C	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=8;PP=996;SC=CCAGACTCGGACCGGGGAGCT;SOR=2.376;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=35;WE=37325485;WS=37325467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	37335237	rs143263603	C	T	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=3;PP=879;SC=CCCCTACAGCCTGAGGAAGCT;SOR=4.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=33;WE=37335245;WS=37335227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	37335458	rs577094	A	G	900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=21;PP=710;SC=AGCCCTCCCCACATCCCCACC;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=29;WE=37335466;WS=37335448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	37335485	rs509284	A	G	1107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.61;SOR=4.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	37335494	rs577813	G	T	1041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.29;SOR=4.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	37959450	rs215210	T	C	3570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=87;PP=2701;SC=AGCAACTTGCTGGGATTACAA;SOR=2.019;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=31;TCR=87;TR=118;WE=37959458;WS=37959440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	37959470	rs215211	C	G	3258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=77;PP=2641;SC=ACATTGTCTTCATCTTCCTGC;SOR=3.000;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=15;TCR=77;TR=92;WE=37959478;WS=37959460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	37961290	.	AAAAAAAACAAAAAACAAAAAAAAAAAAAAAC	A	2181.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=8;NR=0;PP=2992;SC=TCTCTCAAAAAAAAAAAACAA;SOR=5.018;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=8;WE=37961328;WS=37961280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	37975279	rs215214	C	T	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=196;SC=ATGCTGAACACAGAAAGCAAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=37975287;WS=37975269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	37975312	rs2036637	T	C	216.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=177;SC=ATGGTACATGTCCCACTGTGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=37975320;WS=37975302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	37978999	rs72657778	A	C	3716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=43;PP=2690;SC=GCACAATAGGAACACTACAGG;SOR=1.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=66;TCR=43;TR=109;WE=37979007;WS=37978989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	37980444	rs140274410	G	C	602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=22;PP=496;SC=CGCGGCTTCCGGAGACGCGTG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=37980452;WS=37980434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	38006359	rs2174769	A	G	2249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=54;PP=1767;SC=TCACGCTCCTAAAATTCAAAC;SOR=3.160;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=10;TCR=54;TR=64;WE=38006367;WS=38006349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	38018150	rs72657793	T	C	1885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=4;PP=1578;ReadPosRankSum=-0.789;SC=TACGTGCACATGTGTGCACAC;SOR=3.126;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=57;TCR=4;TR=57;WE=38018158;WS=38018140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr1	38023148	rs72657795	T	C	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=1;PP=724;SC=AGGTTGGGGATGTGTGGAGCT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=38023156;WS=38023138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	38025103	rs41267309	T	C	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=9;PP=392;SC=TTTTGGTGAGTGAGCCAGGTG;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=18;WE=38025111;WS=38025093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	38030609	rs41267315	C	T	2662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=62;PP=2127;SC=ATTAATGGAGCTTGTTTTTGT;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=83;TCF=20;TCR=63;TR=81;WE=38030617;WS=38030599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	38033217	rs41307894	G	C	1794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=13;PP=1558;SC=AGTGGGTCTTGACAACTGGAG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=55;WE=38033225;WS=38033207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	38046920	rs2360010	G	T	3031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=22;PP=2395;SC=TAACTAAATAGACAAATTCAA;SOR=2.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=74;TCR=22;TR=96;WE=38046928;WS=38046910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	38047062	rs112076625	C	G	3261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=81;PP=2639;SC=AACCAGAGGACATAGAAGCTG;SOR=3.375;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=15;TCR=81;TR=96;WE=38047070;WS=38047052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	38049552	rs6426024	C	G	2907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=57;PP=1980;SC=AGAAAGCACCCCAAATGAGCA;SOR=1.896;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=25;TCR=57;TR=82;WE=38049560;WS=38049542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	38052799	rs11582642	C	T	682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=494;SC=ACCTGGGAAGCGGAGGTTGCA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=20;WE=38052807;WS=38052789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	38061572	rs6697632	G	T	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=13;PP=397;SC=CGTCCCTCTCGGCCTCAGAGC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=38061580;WS=38061562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	38080065	rs11588571	C	A	299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=189;SC=TTCCCCTCATCCCCAGCCCCA;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=38080073;WS=38080055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	38082381	rs45577433	G	C	2459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=49;PP=1973;ReadPosRankSum=-0.706;SC=GAAGGCGGCTGTGGAGAGAAC;SOR=0.823;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=71;TCF=21;TCR=50;TR=70;WE=38082389;WS=38082371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr1	38095036	rs34565418	A	G	291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=187;SC=AGTCATCTACAGAGTGGGTAA;SOR=3.442;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=38095044;WS=38095026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	38148765	rs684260	A	G	2035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=10;PP=1785;SC=CAACTGTGGTACCCGTGGTCT;SOR=3.150;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=52;TCR=10;TR=62;WE=38148773;WS=38148755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	38149076	rs34250208	G	A	2927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=51;PP=2247;ReadPosRankSum=1.718;SC=CTCCCCACTGGATAGACGAAA;SOR=0.322;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=39;TCR=52;TR=90;WE=38149084;WS=38149066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,94:0.99:95
chr1	38149193	rs686083	C	T	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=28;PP=836;SC=CAGAGGGAGCCATAAAAGTGA;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=38149201;WS=38149183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	38155265	rs586252	G	C	1189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=12;PP=869;ReadPosRankSum=0.876;SC=AACAGCACTAGGGAGCTGCTT;SOR=0.765;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=39;WE=38155273;WS=38155255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr1	38158600	.	G	C	3885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=44;PP=2965;SC=CAAGCAAATTGAGTCAGACAG;SOR=1.059;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=66;TCR=44;TR=110;WE=38158608;WS=38158590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	38161694	rs615530	A	G	1446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=32;PP=1140;SC=CAACTAATAGATGCTTACTGT;SOR=1.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=45;WE=38161702;WS=38161684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	38164724	rs557290	C	G	4496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=109;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.176;SC=GCTCAGGCAGCGCCTTGTTGG;SOR=2.088;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=21;TCR=110;TR=130;WE=38164732;WS=38164714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,137:0.99:138
chr1	38166022	rs513826	T	C	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=8;PP=698;SC=CTTAAGATTGTGTACATTTTA;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=27;WE=38166030;WS=38166012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	38166327	rs661460	A	T	174.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=6;PP=167;SC=ATGACAAAAGAGATAATTGAC;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=38166335;WS=38166317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	38167361	rs34342214	A	C	268.28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQRankSum=2.558;QD=20.64;ReadPosRankSum=1.095;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr1	38174185	rs557897	G	T	763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=20;PP=619;SC=AGACGTGCTAGTCCCACACCA;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=38174193;WS=38174175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	38184316	rs609437	T	C	1822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=54;PP=1427;SC=GCCTTGACCTTGGTGCCTTGG;SOR=3.682;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=7;TCR=54;TR=61;WE=38184324;WS=38184306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	38184470	rs610213	C	G	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=11;PP=455;SC=AGGCACGGTCCGCTAGTGGGG;SOR=1.371;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=17;WE=38184478;WS=38184460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	38184641	.	C	T	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=6;PP=201;SC=ACTGTGCATTCGTGAAGAAGC;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=38184649;WS=38184631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	38185337	rs518583	T	C	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=11;PP=282;SC=GCATATGGTGTGTGCACACAC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=38185345;WS=38185327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	38186189	rs6671088	C	T	3005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=67;PP=2238;SC=AGGCAGCAACCCCATCAGTTG;SOR=2.030;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=23;TCR=67;TR=90;WE=38186197;WS=38186179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	38186294	rs1008879	C	T	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=10;PP=400;SC=GACACCAGGGCGGTCACCTAG;SOR=1.371;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=7;TCR=10;TR=17;WE=38186302;WS=38186284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	38187447	rs579908	A	G	1261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=13;PP=1032;SC=CCCTCAGCATATGCACGGCTA;SOR=1.730;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=40;WE=38187455;WS=38187437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	38187989	rs12123842	T	C	2064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=54;PP=1655;ReadPosRankSum=-0.992;SC=GGACAGGGCATATGCCAGCAC;SOR=4.615;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=57;TCF=2;TCR=55;TR=56;WE=38187997;WS=38187979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,61:0.98:62
chr1	38188841	rs12121777	G	A	2711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.366;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=40;PP=2347;ReadPosRankSum=1.472;SC=GACTTTGACTGGGAGAGAAAG;SOR=0.518;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=87;TCF=46;TCR=41;TR=86;WE=38188849;WS=38188831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
chr1	38192604	rs6699887	G	A	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=395;SC=CACATGAACAGTGAGCTGGGG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=38192612;WS=38192594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	38293992	rs9329568	C	T	1081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=30;PP=887;SC=TTCTTTTGTTCTGAGACAGAG;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=32;WE=38294000;WS=38293982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	38332074	rs149926262	TCTCTCACACA	TCA,T	457.75	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24,24;NR=5,5;PP=764,34;ReadPosRankSum=2.136;SC=TCTCTCTCTCTCTCTCACACA;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=29,29;WE=38332091;WS=38332047;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.84:19
chr1	38423853	rs9293	G	C	907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=0;PP=716;SC=CTACATCCCTGAACACTAGAG;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=38423861;WS=38423843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	38425724	rs17531342	T	C	288.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=4;PP=269;SC=TTTCACCTCCTTTCTACATGG;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=38425732;WS=38425714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	38425895	rs28675056	T	C	992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=18;PP=664;SC=GAACATCTGTTGGGTATCCAG;SOR=0.869;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=15;TCR=18;TR=33;WE=38425903;WS=38425885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	38442547	rs10890216	G	A	4832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=96;PP=2965;SC=TCAGCAGTCAGTCACTTACCC;SOR=1.579;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=148;TCF=52;TCR=96;TR=147;WE=38442555;WS=38442537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr1	38444749	rs7555461	T	C	1335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=30;PP=1099;SC=AGAGAAAAATTACAATATTAC;SOR=2.191;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=40;WE=38444757;WS=38444739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	38447615	rs7533079	G	T	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=167;SC=GCTAATTTTGGTTTTTTTTGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=38447623;WS=38447605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	38449910	rs11210870	T	C	2716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=69;NR=15;PP=2125;SC=CATATCCCTCTTCATCTGTGA;SOR=3.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=69;TCR=15;TR=84;WE=38449918;WS=38449900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	38450367	rs6680796	A	G	3954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=69;PP=2965;SC=TGAAATTTTCACCCCTACTTA;SOR=0.925;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=57;TCR=69;TR=126;WE=38450375;WS=38450357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	38453576	rs10890285	A	C	2513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=67;PP=1865;SC=GCAAACAACAAGGGTTCTCCA;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=21;TCR=67;TR=88;WE=38453584;WS=38453566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	38455389	rs3935867	C	T	931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=25;PP=786;SC=CTCTGGGGCTCCGGACCCCGG;SOR=3.334;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=29;WE=38455397;WS=38455379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	38462898	rs4274021	T	A	2297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.19;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	38462905	rs12724533	C	G	2431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.21;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	38463504	rs7366048	C	T	4486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.935;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=84;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.775;SC=CTCGATGCCACGGCTGATCAC;SOR=0.906;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=56;TCR=84;TR=139;WE=38463512;WS=38463494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,145:0.99:146
chr1	38464639	rs4570384	C	G	4759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=98;NR=43;PP=2965;SC=AGCCCCTGAACACATACCAGG;SOR=1.798;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=98;TCR=43;TR=141;WE=38464647;WS=38464629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr1	39325063	rs1925678	T	C	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=9;PP=266;SC=GGCGGGGGACTGGGCGCAGCC;SOR=1.473;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=39325071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	39339164	rs41270781	G	A	1281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=7;NR=36;PP=1110;SC=CTGAGCCGAGGGAGGCTGCGT;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=43;WE=39339172;WS=39339154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	39339449	rs12127091	C	T	1634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=19;PP=1248;SC=TTGCAGTAGCCGAGGAGGGTG;SOR=1.244;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=31;TCR=19;TR=50;WE=39339457;WS=39339439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	39340282	rs880303	C	T	3328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=43;PP=2632;ReadPosRankSum=0.961;SC=AGGGACACTACGTGATTTGGA;SOR=0.435;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=64;TCR=43;TR=106;WE=39340290;WS=39340272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,107:0.99:108
chr1	39352271	rs2147914	G	T	3811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=40;PP=2901;SC=GGATCTTTCAGCAGTGCTTTA;SOR=1.426;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=75;TCR=40;TR=115;WE=39352279;WS=39352261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	39352492	rs3790441	G	A	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=21;PP=612;SC=CTAGGGGTAAGGCAAAAGAGA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=39352500;WS=39352482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	39361615	rs9438984	G	A	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=7;PP=932;ReadPosRankSum=-0.778;SC=TAAGAGACTCGTGGACTCCAT;SOR=1.280;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=35;WE=39361623;WS=39361605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr1	39385086	rs7522863	A	C	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=529;SC=AAAGTTTTCTATGTAATTGTT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=39385094;WS=39385076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	39457293	rs111311750	T	C	77.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=2;PP=56;SC=CTGCTCTGGGTTTGGCAGGAA;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=39457301;WS=39457283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	39466626	rs11205525	A	G	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=6;PP=855;SC=GCCCAAACTCACTTTTTCTTT;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=36;WE=39466634;WS=39466616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	39466786	rs10888613	C	G	3318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=53;PP=2572;ReadPosRankSum=-0.766;SC=CAGGTAGGCCCAGGCAGTGAC;SOR=0.237;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=57;TCR=54;TR=109;WE=39466794;WS=39466776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,114:0.99:115
chr1	39494666	rs35464164	C	CT	1005.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=12.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=0.612;QD=15.71;ReadPosRankSum=-2.705;SOR=0.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,49:0.77:64
chr1	39494687	rs3768323	G	A	3192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=77;PP=2329;SC=TTTTTGAGACGAAGTCTCACT;SOR=4.752;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=3;TCR=78;TR=80;WE=39494695;WS=39494677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	39549983	rs3736890	G	A	6733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=119;PP=2965;SC=GCGAGCGGTCGGGGAGCCTGT;SOR=0.959;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=212;TCF=93;TCR=119;TR=212;WE=39549991;WS=39549973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr1	39550210	rs260972	C	T	643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=19;PP=536;SC=CTCACCAGGGCCTCTGACAAA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=39550218;WS=39550200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	39568249	rs6667815	A	G	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=202;SC=ATAACACATTAGAGGCGCTGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=39568257;WS=39568239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	39568765	rs2282232	T	C	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=31;PP=877;SC=TTAGAGAAGCTCTCTAGCCAC;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=31;WE=39568773;WS=39568755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	39717566	rs2490948	T	C	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=10;PP=318;SC=GCCCTCCTGGTGCCATACAAA;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=7;TCR=10;TR=17;WE=39717574;WS=39717556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	39748921	rs2275188	G	A	1987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=19;PP=1377;SC=ATCTGGAACAGGCTTTTGAAG;SOR=1.647;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=38;TCR=19;TR=57;WE=39748929;WS=39748911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	39758993	rs6688708	C	G	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=313;SC=TTGTACAAAACTTGAATCCAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=39759001;WS=39758985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	39763242	rs2275187	G	A	3274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=22;PP=2645;SC=TTAATATTCCGGTGTTCTAAT;SOR=2.471;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=76;TCR=22;TR=98;WE=39763250;WS=39763232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	39766055	rs2275186	C	T	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=766;SC=AGAAAGGGTACCTCTGGGCCA;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=39766063;WS=39766045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	39806610	rs3116396	C	T	3662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=83;PP=2965;SC=TGAACCTCTGCCTCCAACAGT;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=28;TCR=83;TR=111;WE=39806618;WS=39806600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	39812620	rs2490944	G	T	1314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=5;PP=1005;SC=GGTTTTTTGTGTTTTGTTTCC;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=39812628;WS=39812610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	39812822	rs2761764	C	A	1481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=35;PP=1190;SC=AACAGACTGCCGCTCAGGTGG;SOR=2.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=46;WE=39812830;WS=39812812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	39894839	rs645061	A	G	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=611;SC=TTTAAATTTGATCTCTTAAAG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=39894847;WS=39894829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	39914363	rs668556	G	C	5092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=90;PP=2965;SC=CCCGAAGATAGTCAGAAACTT;SOR=1.036;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=68;TCR=90;TR=158;WE=39914371;WS=39914353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr1	39927507	rs783820	G	A	1809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=4;PP=1530;SC=ACCGCCAACCGAACAAGTACC;SOR=4.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=51;TCR=4;TR=55;WE=39927515;WS=39927497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	39929240	rs7554206	T	C	3589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=81;NR=23;PP=2885;SC=AATAGGAAGTTTTGCTCTACC;SOR=2.531;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=105;TCF=82;TCR=23;TR=104;WE=39929248;WS=39929230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	39957913	rs4660269	A	G	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=10;NR=3;PP=318;SC=GTACCACGCCATGGCTGGCGA;SOR=2.670;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=39957921;WS=39957903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	39958080	rs10888798	C	G	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=58.04;NF=0;NR=11;PP=277;SC=GTGCCGGGCCCTGGCCGAACG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=39958088;WS=39958070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	39981596	rs199956449	A	G	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.00;QD=31.14;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	39988708	rs2889739	A	G	973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=6;PP=752;SC=AAGGCTACTCAGCCTATTACT;SOR=3.026;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=35;WE=39988716;WS=39988698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	39991474	rs11583829	AG	CA	3565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=26;PP=1432;SC=CCACTGAGTCAGCCCGCCCAG;SOR=0.897;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=72;TCF=39;TCR=33;TR=64;WE=39991483;WS=39991464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	39991588	rs3738676	G	T	1339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=36;PP=1042;SC=CCTCACTCTCGGTGCCTACTT;SOR=5.186;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=38;WE=39991596;WS=39991578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	40030823	rs12127094	C	T	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=4;PP=887;SC=CAGGCTGGAACTGATTTAAGA;SOR=3.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=34;WE=40030831;WS=40030813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	40092089	rs2695320	T	C	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=251;SC=AGCCAGTCCATGAAGCAAAGC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=40092097;WS=40092079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	40098328	rs784625	T	C	1535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=22;PP=1014;SC=CACCCCTCTGTGTTTCTTCCT;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=27;TCR=22;TR=49;WE=40098336;WS=40098318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	40149515	rs784633	A	G	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=3;PP=590;SC=GGGGAGCAGCAGGGAGGCCCC;SOR=3.407;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=40149523;WS=40149512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	40149551	rs11206617	G	C	1386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=4;PP=1115;SC=CGCGGAGGCAGGGGCGGGGAT;SOR=3.816;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=38;TCR=4;TR=42;WE=40149559;WS=40149541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	40149642	rs784634	G	T	3109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=30;SC=GGCGCGTGATGCGCCCGTCGC;SOR=1.634;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=67;TCR=30;TR=96;WE=40149650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	40149870	rs113763288	C	G	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=18;PP=538;SC=GCCCCGCCCACCCCGCCCCCA;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=40149878;WS=40149860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	40149926	.	C	T	31	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=2;NR=3;PP=31;QD=13.1542425094;SC=CCTCCTCCCACCCCGGGTGCC;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=5;WE=40149934;WS=40149916;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr1	40149926	.	C	CCCCGGGTGCCTCGCCTCCTCCCAT	543.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.31;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	40150370	rs2746058	C	T	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=2;PP=80;SC=ACACACAGGGCGGGGTTGCAG;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=40150378;WS=40150360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	40235448	.	C	T	169	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=29;MQ=41.8;NF=12;NR=6;PP=169;QD=11.3206229193;SC=TTTTTGATGTCGTCCACCGTC;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=68;TCF=50;TCR=18;TR=18;WE=40235456;WS=40235438;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:50,18:0.26:68
chr1	40363054	rs3134614	G	C	1919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=18;PP=1592;SC=TTAGTAGCCAGTGAGGTATGC;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=61;WE=40363062;WS=40363044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	40367592	rs804719	A	G	288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=6;PP=200;SC=CCGCACTCACAAGCGCGCCCC;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=40367600;WS=40367582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	40526003	rs3122419	T	C	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=268;SC=GAGTTCAGTCTAGCCACAGAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=40526011;WS=40525993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	40528445	rs111329903	T	TTGTGTG	186.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=205;SC=TCAAAAAACATTGTGTGTGTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=40528453;WS=40528435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	40533266	rs11207440	T	G	3476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=35;PP=1912;SC=TGCCGGATCATGTCCTCCTCC;SOR=0.867;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=82;TCF=46;TCR=36;TR=81;WE=40533274;WS=40533256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	40533287	rs6665926	T	G	3475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=73;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=42;NR=41;PP=1937;SC=CCCTCCACCATGCCCCCCTCC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=42;TCR=41;TR=83;WE=40533295;WS=40533277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	40533315	rs6665933	T	G	3093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.95;QD=43.57;SOR=1.276;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	40533320	rs6665936	T	G	3056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.77;QD=45.62;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	40533326	rs6665937	T	G	2761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.78;QD=44.54;SOR=1.647;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	40533347	rs6665944	T	G	2415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=78;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=38;PP=1381;SC=TTCCCGCTCATCACTGTTCGC;SOR=1.919;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=16;TCR=38;TR=54;WE=40533355;WS=40533337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	40536074	rs58190778	C	CT	3877.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=55;PP=2965;SC=TAAAGTTACACGTTGACACAC;SOR=0.992;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=30;TCR=57;TR=85;WE=40536082;WS=40536064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	40545964	rs3122428	T	G	2372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=8;PP=1943;SC=TCTTTCCTAGTGTCTGCCCAG;SOR=3.973;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=62;TCR=8;TR=69;WE=40545972;WS=40545954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	40555321	rs3131651	C	T	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=300;SC=GAAAATAAAGCGCAGAGAACT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=40555329;WS=40555311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	40556922	rs3122439	T	C	2379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=10;PP=2009;SC=TGTGCAAATATAGTTCCTAGA;SOR=3.797;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=66;TCR=10;TR=76;WE=40556930;WS=40556912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	40557656	rs6672053	G	A	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=3;PP=1191;SC=GGATTTATCTGAATAAAAGAA;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=42;TCR=3;TR=45;WE=40557664;WS=40557646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	40558256	rs4481840	C	G	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=17;PP=517;SC=AGGCCTCAAACAGCATTATCA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=40558264;WS=40558246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	40733658	rs7516571	A	G	1290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=38;PP=1081;SC=CTCTGTTTGCATAGTCCTTGG;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=39;WE=40733666;WS=40733648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	40737516	rs6677717	T	G	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=664;SC=ATAAAGAATGTTTTTTCTTTA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=40737524;WS=40737506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	40840270	rs10645094	T	TGC	162.06	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.157;NF=25;NR=3;PP=1012;ReadPosRankSum=0.157;SC=CGTGCGTGCGTGTGTGTGTGT;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=28;WE=40840278;WS=40840260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr1	40840353	rs1003710	A	G	3242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.344;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.278;NF=65;NR=36;PP=2562;ReadPosRankSum=-1.524;SC=GATGGCGGAAAGGAAAACTGC;SOR=0.148;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=68;TCR=37;TR=101;WE=40840361;WS=40840343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,107:0.97:110
chr1	40879808	rs209605	G	T	5675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=43;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.731;SC=CTTATTTCTTGCTATAACATA;SOR=0.986;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=124;TCR=43;TR=166;WE=40879816;WS=40879798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,174:0.99:175
chr1	40881041	rs209606	C	G	2453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=45;PP=2030;ReadPosRankSum=-0.844;SC=CTTCTTCTTCCGGTTCCAGAA;SOR=0.336;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=39;TCR=46;TR=84;WE=40881049;WS=40881031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,84:0.99:85
chr1	40923019	rs2272994	G	A	3937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.109;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=64;PP=2951;ReadPosRankSum=1.643;SC=TAAGCAGGATGTCAGCTTTCC;SOR=0.320;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=63;TCR=64;TR=126;WE=40923027;WS=40923009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,132:0.99:133
chr1	40955156	rs10789144	A	T	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=5;PP=672;SC=TGGTTCTTAGACATCAGCATA;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=40955164;WS=40955146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	41101572	rs2253835	A	G	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=2;PP=261;SC=GGACCACAGCACGGGGCTGCA;SOR=2.448;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=41101580;WS=41101562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	41107239	rs7535398	G	A	1548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=0;PP=1354;SC=ACTGGACCTAGAACAGCACCT;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=47;WE=41107247;WS=41107229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	41107360	rs491619	T	C	5023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=80;PP=2965;SC=CTCTACCCCGTGATGTCCCAT;SOR=0.870;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=172;TCF=92;TCR=80;TR=172;WE=41107368;WS=41107350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr1	41204569	rs1057925	C	T	1680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=16;PP=1303;SC=CCCAGCAAAGCCTACAGTCGT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=52;WE=41204577;WS=41204559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	41215075	rs3818758	T	A	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=209;SC=TTTCTCCCTGTTACCTGCTTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=41215083;WS=41215065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	41228898	rs4660454	G	A	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=3;PP=168;SC=ATATATGTATGTCTCTATATA;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=41228906;WS=41228888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	41229180	rs4660455	G	A	179.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=144;SC=CACTATGCCCGGCTGATTTTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=41229188;WS=41229170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	41232253	rs374525886	C	T	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=1;PP=662;SC=CTCTTTGTCTCTGCCCCTGCC;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=41232261;WS=41232243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	41232545	.	G	C	3556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=55;PP=2825;SC=GTGGTAATTGGAACATTAGAT;SOR=0.749;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=47;TCR=55;TR=102;WE=41232553;WS=41232535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	41235177	rs10889608	G	C	1650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=44;PP=1400;SC=TAGGGCAACTGTCCTGTCCTC;SOR=4.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=48;WE=41235185;WS=41235167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	41235946	rs3754176	G	A	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=1;PP=340;SC=CAGATATTCTGAGAAAAGAAG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=41235954;WS=41235936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	41284366	rs2361660	G	C	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=20;PP=639;SC=AGGCCTGCAAGCCGCGCGCGG;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=41284374;WS=41284356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	41284406	rs2361659	A	G	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=13;PP=333;SC=GGGCACGACCAGAGCGGGCAG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=41284414;WS=41284396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	41285087	rs4660468	T	C	4145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.98;NF=64;NR=80;PP=2965;SC=TCTACCTGGCTGAGAAGGACG;SOR=0.901;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=64;TCR=80;TR=144;WE=41285095;WS=41285077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr1	41289993	rs3767940	T	C	2691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=55;PP=2027;SC=ATTCTCTGTCTTCATCCTCTC;SOR=1.637;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=28;TCR=55;TR=83;WE=41290001;WS=41289983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	41453286	rs5773721	GT	G	1490.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=36;PP=1516;SC=TAAGGGCACAGTTAACAGTCA;SOR=4.565;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=37;WE=41453294;WS=41453276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	41461513	rs12047657	G	C	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=0;PP=370;SC=ATTTTTACAAGGTCACGTAGC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=41461521;WS=41461503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	41462986	rs12047078	T	C	1008.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=0;PP=920;SC=TGGTTTTTTTTCCCTTGAAAT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=41462994;WS=41462976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	41466550	rs12735455	T	A	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.85;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	41466803	rs12718433	G	A	999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=22;PP=776;SC=AGTAGAGTTCGCTGCCTTGGG;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=41466811;WS=41466793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	41468963	rs78935427	A	G	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=463;SC=CTGGGTTCCTAGCACCTCATG;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=41468971;WS=41468953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	41474400	rs35044078	C	G	3001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=37;PP=2400;SC=AGGATTCCAGCTTGCTGGTAC;SOR=1.154;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=50;TCR=37;TR=87;WE=41474408;WS=41474390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	41475085	rs12144160	A	G	1575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=5;PP=1266;SC=AACCTTCACAATGAAGCTGTT;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=45;WE=41475093;WS=41475075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	41486408	rs3738369	G	A	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=12;PP=311;SC=TGTTCTCAGTGTGGCTTAAGG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=41486416;WS=41486398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	41493811	rs1140227	C	T	2498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=25;PP=1947;SC=CCCCTCATTCCTAGAAGAATG;SOR=1.730;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=81;TCF=55;TCR=26;TR=80;WE=41493819;WS=41493801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	41494222	rs11578697	G	T	2750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=29;PP=2136;SC=TCTCCACACAGGTTCCTACTG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=57;TCR=29;TR=86;WE=41494230;WS=41494212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	41540853	rs2011981	A	T	3277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.29;SOR=4.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	41540861	rs2011982	T	C	3510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.88;SOR=3.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	41582429	rs34477858	T	TA	170.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=0;PP=156;SC=CCTTATAGTCTAATATATTCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=41582437;WS=41582419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	41618442	rs213768	A	T	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-5.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.049;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=38;PP=954;ReadPosRankSum=-1.438;SC=CACTGAATGAAGAAATCTAAA;SOR=0.495;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=92;TCF=16;TCR=76;TR=47;WE=41618450;WS=41618432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,48:0.51:94
chr1	41651952	rs12408956	G	A	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=425;ReadPosRankSum=-0.820;SC=GGAGGAAGGAGAAGAACATTT;SOR=0.368;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=20;WE=41651960;WS=41651942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr1	41949595	rs2759256	G	A	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=2;PP=528;SC=ATATTAGCCAGTGCCTCCATC;SOR=4.294;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=41949603;WS=41949585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	41949628	rs2759257	A	C	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=4;PP=726;SC=GAGAGATGGAATGTGTCAACG;SOR=3.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=41949636;WS=41949618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	41950312	rs2984691	T	C	2640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=71;PP=2125;SC=GAGCAGGGAGTGCCTGTTGCC;SOR=2.229;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=24;TCR=71;TR=95;WE=41950320;WS=41950302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	41976017	rs678110	C	T	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=362;ReadPosRankSum=-1.050;SC=AGCTCCTGGACGGAGGGACAG;SOR=1.508;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=16;WE=41976025;WS=41976007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr1	41976328	rs9439043	T	C	2010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=25;PP=1702;SC=TCGGGGTTGGTCGGTGCACGC;SOR=0.899;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=39;TCR=25;TR=63;WE=41976336;WS=41976318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	41976429	.	G	A	1947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.970;ClippingRankSum=0.000;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=26;PP=1517;ReadPosRankSum=0.349;SC=GGGGCTGTGCGTGGGTGTGGG;SOR=0.640;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=145;TCF=97;TCR=48;TR=80;WE=41976437;WS=41976419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,79:0.54:146
chr1	41978566	rs2991344	T	G	2388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=38;PP=1882;SC=AACCCGTGGGTCCAGCCCCAA;SOR=0.828;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=34;TCR=38;TR=71;WE=41978574;WS=41978556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	41978825	rs2483689	C	G	5927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=137;NR=37;PP=2965;SC=CAAGGGAGAGCGCCCATGCCC;SOR=2.604;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=174;TCF=137;TCR=37;TR=174;WE=41978833;WS=41978815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr1	41979156	rs615177	A	G	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.446;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=785;ReadPosRankSum=1.349;SC=TGCCTCGTGTAGCCTCCGTGC;SOR=0.317;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=83;TCF=29;TCR=54;TR=36;WE=41979164;WS=41979146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,36:0.42:86
chr1	41983912	rs2810547	C	A	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=1;PP=1397;SC=TTGTCTGATACTTGGGAGAAC;SOR=6.399;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=47;WE=41983920;WS=41983902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	42041436	.	C	T	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.812;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=7.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.85;ReadPosRankSum=-0.746;SOR=2.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,27:0.24:111
chr1	42041479	rs1815257	A	C	1941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=52;PP=1609;SC=TGCAATCTTCACACTCCCCCA;SOR=5.283;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=3;TCR=52;TR=55;WE=42041487;WS=42041469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	42046812	rs2810565	C	T	4569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.796;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.880;SC=AGGAAGGGGGCTGCCTGAAGG;SOR=0.809;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=62;TCR=88;TR=148;WE=42046820;WS=42046802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,150:0.99:151
chr1	42048745	rs2810566	T	C	5990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=101;PP=2965;SC=GTGACTGCTGTGGCTCAGGGC;SOR=0.764;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=195;TCF=94;TCR=101;TR=195;WE=42048753;WS=42048735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr1	42049032	rs2984694	G	A	5546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=118;PP=2965;SC=TGTCGATCTCGCTGGTGTCCA;SOR=1.778;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=54;TCR=119;TR=171;WE=42049040;WS=42049022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr1	42049140	rs2475842	C	G	6485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=137;NR=54;PP=2965;SC=CTTCGGTGGACAGGGGCAGGA;SOR=1.975;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=137;TCR=54;TR=191;WE=42049148;WS=42049130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr1	42050055	rs61773680	G	T	3808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-8.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.586;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=39;PP=2803;ReadPosRankSum=0.602;SC=TCTGAGGATGGAGCCCAGGGG;SOR=0.585;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=281;TCF=205;TCR=76;TR=141;WE=42050063;WS=42050045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,150:0.51:294
chr1	42619152	rs2297567	C	A	1706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=26;PP=1185;ReadPosRankSum=-0.387;SC=AGGGCTCCTGCCAGGAGTGGC;SOR=0.679;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=138;TCF=87;TCR=51;TR=69;WE=42619160;WS=42619142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,72:0.51:142
chr1	42619377	rs2297566	G	A	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=161;ReadPosRankSum=-0.346;SC=GTGGGTGGGGGCAGCCAGATG;SOR=1.214;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=9;WE=42619385;WS=42619367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr1	42629040	rs2232224	A	G	1785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=6;PP=1535;SC=GTATTCCCGAACCCCACCAAT;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=48;TCR=6;TR=54;WE=42629048;WS=42629030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	42630364	rs2071499	G	A	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.117;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=605;ReadPosRankSum=-1.366;SC=GCACAGTGCGGAGAGCAGGAA;SOR=2.019;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=28;WE=42630372;WS=42630354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr1	42654364	rs554500	G	A	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.712;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=8;PP=979;ReadPosRankSum=-0.596;SC=AATTTCGTACGAATGAGAAAA;SOR=0.195;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=95;TCF=84;TCR=11;TR=52;WE=42654372;WS=42654354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,54:0.53:101
chr1	42656868	rs1085252	C	G	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=371;ReadPosRankSum=-0.567;SC=AGCAAGGAAACAGATGTAAAG;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=18;WE=42656876;WS=42656858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr1	42657196	rs1139978	T	G	2891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.341;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=38;PP=2339;ReadPosRankSum=0.663;SC=GATGGCTGTGTGTGCATCTGG;SOR=0.426;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=197;TCF=137;TCR=60;TR=112;WE=42657204;WS=42657186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,112:0.55:202
chr1	42693597	rs343376	A	G	2364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.380;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=52;PP=1799;ReadPosRankSum=-0.473;SC=AGTAGGCAGCACATCTTCCTT;SOR=0.523;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=203;TCF=96;TCR=107;TR=102;WE=42693605;WS=42693587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,103:0.50:208
chr1	42846786	rs11210626	G	C	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.13;ReadPosRankSum=-1.111;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	42880516	rs1055055	T	C	2640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.429;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=36;PP=2048;ReadPosRankSum=-2.134;SC=CTACCTCTAGTGAAAGTGAGC;SOR=0.465;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=196;TCF=133;TCR=63;TR=101;WE=42880524;WS=42880506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,105:0.52:201
chr1	42898843	rs1034268	A	G	2767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=25;PP=2232;ReadPosRankSum=-1.114;SC=AGGTAGTAAAACATGACCAGG;SOR=0.732;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=185;TCF=137;TCR=48;TR=99;WE=42898851;WS=42898833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,103:0.53:193
chr1	42915727	rs12047095	C	G	1531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-7.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.569;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=1079;ReadPosRankSum=-0.848;SC=GATGTACCACCCCACTGACAA;SOR=0.712;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=163;TCF=82;TCR=81;TR=70;WE=42915735;WS=42915717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,72:0.42:172
chr1	42915753	rs11210647	T	C	1539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.242;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=31;PP=1207;ReadPosRankSum=-0.422;SC=ACATAGACTTTATGATCTTTA;SOR=0.800;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=155;TCF=76;TCR=79;TR=60;WE=42915761;WS=42915743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,64:0.39:163
chr1	42948585	rs6656344	C	A	2008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.302;NF=0;NR=68;PP=1737;ReadPosRankSum=0.227;SC=CACTGAGAAACAAGTCTTTAA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=128;TCF=0;TCR=128;TR=68;WE=42948593;WS=42948575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,69:0.54:128
chr1	43002744	rs4660643	G	A	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-4.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=420;ReadPosRankSum=0.142;SC=CCATAGCACTGTAGAATACGT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=18;WE=43002752;WS=43002734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr1	43011030	rs11210668	A	G	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=226;ReadPosRankSum=-1.159;SC=TTTCACAGCTATAAATAAAAG;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=11;WE=43011038;WS=43011021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
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chr1	43023713	rs71798684	G	GA	686.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.606;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=513;ReadPosRankSum=0.099;SC=TATATGGTGGGAAAAAAAATA;SOR=0.453;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=60;TCF=51;TCR=9;TR=28;WE=43023721;WS=43023703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,32:0.57:56
chr1	43042703	rs12049046	C	T	2272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.371;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=25;PP=1691;ReadPosRankSum=1.057;SC=AAAGATTGAACTAAAGCATGC;SOR=0.536;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=162;TCF=118;TCR=44;TR=87;WE=43042711;WS=43042693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,90:0.53:169
chr1	43047057	rs12037518	A	G	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.738;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=736;ReadPosRankSum=-0.433;SC=GGAAATTAGAACATGCTCATA;SOR=0.341;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=29;WE=43047065;WS=43047047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr1	43054909	rs7527588	T	C	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.226;NF=22;NR=0;PP=419;ReadPosRankSum=-0.241;SC=AAAAAAAAAATCCCTTGTGAT;SOR=1.284;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=22;WE=43054917;WS=43054907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr1	43055243	rs10789417	C	G	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=399;ReadPosRankSum=0.668;SC=TTTACTAAACCTAATCCTTTA;SOR=0.850;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=19;WE=43055251;WS=43055233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr1	43076555	rs34595968	CT	C	193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=0.797;QD=4.51;ReadPosRankSum=-0.342;SOR=0.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr1	43102844	rs16829822	T	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=30;ReadPosRankSum=-0.286;SC=AAGGTGCATATTGAGGATGCA;SOR=0.193;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=4;WE=43102852;WS=43102834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr1	43110276	rs7523056	G	A	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=307;ReadPosRankSum=1.065;SC=TCTAAGATCCGGGGCCAGTGG;SOR=1.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=15;WE=43110284;WS=43110266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr1	43119661	rs16829829	C	A	2998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.849;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=91;PP=2394;ReadPosRankSum=2.236;SC=GAAGGAGACACATGGTATACA;SOR=1.167;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=199;TCF=31;TCR=168;TR=105;WE=43119669;WS=43119651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,108:0.52:207
chr1	43124701	rs6600419	A	G	1335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.131;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=38;PP=1072;ReadPosRankSum=-0.036;SC=TGATTCCTCCATGCATTGCTC;SOR=0.187;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=118;TCF=26;TCR=92;TR=54;WE=43124709;WS=43124691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,55:0.45:121
chr1	43124859	rs3738494	C	T	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=28;PP=1317;ReadPosRankSum=-1.965;SC=ACGACTGTGACATCATAGTGA;SOR=0.725;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=159;TCF=92;TCR=67;TR=69;WE=43124867;WS=43124849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,69:0.43:160
chr1	43132393	rs35844708	G	GA	1114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.317;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.586;NF=0;NR=39;PP=1401;ReadPosRankSum=0.934;SC=AAAGGGAAGAGAACCACCTAA;SOR=0.250;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=90;TCF=0;TCR=90;TR=39;WE=43132401;WS=43132383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,41:0.45:91
chr1	43159338	rs41269507	A	G	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=105;ReadPosRankSum=0.227;SC=TAGCATGCTTAAAAATGTATA;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=43159346;WS=43159328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	43162182	rs113762321	GC	G	1085.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.538;NF=17;NR=22;PP=642;ReadPosRankSum=0.766;SC=ACGCAGTTGCGCCCCCCCCCC;SOR=0.489;Source=Platypus;TR=39;WE=43162190;WS=43162172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr1	43200855	rs74885359	G	A	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=29;PP=657;ReadPosRankSum=-0.509;SC=CTGTGGGGTCGGGGGCAGGGG;SOR=0.943;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=4;TCR=63;TR=31;WE=43200863;WS=43200845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr1	43201534	rs4660658	G	A	1208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.127;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=962;ReadPosRankSum=-0.410;SC=CAGGGCAGGCGGAGCTCAGAC;SOR=0.373;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=76;TCF=34;TCR=42;TR=46;WE=43201542;WS=43201524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,46:0.59:78
chr1	43201614	rs9660973	C	T	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=2.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.411;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=26;PP=647;ReadPosRankSum=0.084;SC=TCTCTGGCTCCGGGCATGTGC;SOR=2.636;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=56;TCF=16;TCR=40;TR=31;WE=43201622;WS=43201604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
chr1	43212291	rs13871	G	A	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=398;ReadPosRankSum=1.538;SC=CTGCAGCCCCGAGGGGCTGGC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=19;WE=43212299;WS=43212288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr1	43212431	rs4660662	A	G	4237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=62;PP=2965;SC=GTTCGGGGGGACCCTGCTGGG;SOR=0.862;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=76;TCR=62;TR=138;WE=43212439;WS=43212421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr1	43212926	rs67014447	G	A	2560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.163;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=69;PP=2007;ReadPosRankSum=0.544;SC=GCTCTCACCCGCTCGAGCTGC;SOR=0.822;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=208;TCF=63;TCR=145;TR=99;WE=43212934;WS=43212916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,104:0.49:212
chr1	43213285	rs72661349	C	T	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=441;ReadPosRankSum=-0.398;SC=GGAAGGGTACCGCCCACTGGG;SOR=0.610;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=45;TCR=10;TR=21;WE=43213293;WS=43213275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,22:0.39:56
chr1	43223489	rs6700677	C	T	2947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=6.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.696;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=14;PP=2332;ReadPosRankSum=0.129;SC=TGTTCTTCTCCAAGCATAGCT;SOR=0.775;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=210;TCF=179;TCR=31;TR=103;WE=43223497;WS=43223479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,107:0.50:213
chr1	43228189	rs2816593	T	A	2669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=65;PP=2063;ReadPosRankSum=-0.675;SC=TCACATCCAATCTCTGAACGT;SOR=2.030;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=78;TCF=11;TCR=67;TR=76;WE=43228197;WS=43228179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,84:0.99:85
chr1	43232504	rs55716016	C	A	2559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.504;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=45;PP=2013;ReadPosRankSum=-3.186;SC=TCCCCGCGCGCGTAGGCTGCG;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=207;TCF=109;TCR=98;TR=97;WE=43232512;WS=43232494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,101:0.48:211
chr1	43239395	rs2760075	G	A	1609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.477;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=59;PP=1339;ReadPosRankSum=0.162;SC=GTTTATAATCGTTGTGACTTT;SOR=0.434;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=6;TCR=121;TR=62;WE=43239403;WS=43239385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,62:0.48:128
chr1	43296354	rs12727498	G	T	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=608;ReadPosRankSum=-0.203;SC=GGCTCTGTCCGTCCCCGGGAT;SOR=0.591;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=57;TCF=12;TCR=45;TR=27;WE=43296362;WS=43296344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,27:0.44:61
chr1	43300663	rs4660672	T	C	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=619;SC=TGCCAGAAGCTCTTAGACATC;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=22;WE=43300671;WS=43300653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	43300921	rs4660673	C	G	1355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=35;PP=1084;SC=CCTGACACTTCTCCATAGGTT;SOR=3.417;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=41;WE=43300929;WS=43300911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	43393245	rs11282849	G	GGGTGAGAAAT	1031.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=2970;SC=TCATGCGTGCGGGTGAGTATA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=12;WE=43393253;WS=43393235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	43409179	rs12718444	G	T	1236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-6.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=24;PP=923;ReadPosRankSum=-0.648;SC=CTGACTTCAAGATACTGGGCT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=43;TCR=50;TR=45;WE=43409187;WS=43409169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,48:0.50:96
chr1	43409364	rs34964576	T	C	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=178;ReadPosRankSum=0.603;SC=AGCCCTCCTATGCGAGGGGGC;SOR=0.132;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=12;WE=43409372;WS=43409354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr1	43418026	rs2297972	C	T	1963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=28;PP=1531;SC=CACTCAGGCCCACACTCAGCC;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=34;TCR=28;TR=62;WE=43418034;WS=43418016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	43418056	rs3216016	AT	A	1124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.883;NF=12;NR=19;PP=1070;ReadPosRankSum=1.378;SC=GCTGGAGGAGATTCCCGTAGA;SOR=0.527;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=31;WE=43418064;WS=43418046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,36:0.58:62
chr1	43610910	rs626842	T	G	2216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=28;PP=1668;SC=TGCAGGGCCATTGACAGAGAA;SOR=1.103;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=40;TCR=28;TR=68;WE=43610918;WS=43610900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	43611005	rs627263	G	A	1643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=35;PP=1344;SC=TCAAGTGAGTGCAACCCCTGA;SOR=1.567;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=55;WE=43611013;WS=43610995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	43613786	rs519666	G	T	4195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=119;PP=2965;ReadPosRankSum=1.106;SC=GGGGAAGGGCGAGAGCGGGAG;SOR=2.554;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=137;TCF=17;TCR=120;TR=136;WE=43613794;WS=43613776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,140:0.99:141
chr1	43613850	rs34514362	C	CA	1666.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=48;PP=1929;SC=GCGGTCCCAGCAAAAACTCTT;SOR=8.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=1;TCR=58;TR=48;WE=43613858;WS=43613840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	43618596	rs12074551	G	A	5868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.092;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.052;NF=89;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=0.432;SC=GGGACTTAGAGCCCTTGGTAA;SOR=0.164;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=179;TCF=89;TCR=90;TR=176;WE=43618604;WS=43618586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,183:0.99:185
chr1	43632536	rs7163	C	T	8797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=148;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.003;SC=TGCCTTCTTGCGCTGTGCCAG;SOR=0.882;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=278;TCF=126;TCR=152;TR=272;WE=43632544;WS=43632526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,287:0.99:291
chr1	43632815	rs1749438	TT	GC	14954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.745;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=174;NR=129;PP=2947;ReadPosRankSum=-0.813;SC=CGTTCCCCTATTAGAGATGTA;SOR=0.762;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=315;TCF=178;TCR=137;TR=303;WE=43632824;WS=43632805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,333:1.00:334
chr1	43632997	rs1691302	A	G	3926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=108;PP=2965;SC=GATTAATACCACTACCCTCTG;SOR=6.273;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=4;TCR=108;TR=112;WE=43633005;WS=43632987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	43634867	rs11210797	C	T	1204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=34;PP=965;SC=AGCACTTTACCAAAAGTGCCA;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=43634875;WS=43634857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	43636484	rs1049276	C	G	4413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=88;PP=2965;SC=TGGGTCGCTTCGTAGGGACTT;SOR=1.435;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=49;TCR=88;TR=137;WE=43636492;WS=43636474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr1	43637549	rs1691289	A	G	1569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=53;NR=4;PP=1283;SC=CCCTGTGCCCACGCTCACCAC;SOR=4.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=57;TCF=53;TCR=4;TR=57;WE=43637557;WS=43637539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	43637845	rs11559314	A	G	6636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=528;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=131;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.693;SC=CCGAGACCCAAGCGGCTAGCA;SOR=0.648;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=518;TCF=242;TCR=276;TR=249;WE=43637853;WS=43637835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:268,255:0.49:523
chr1	43637932	rs9519	T	C	11193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=227;PP=2965;SC=ACCGAATCGCTCCAGCGCCAG;SOR=1.637;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=339;TCF=110;TCR=229;TR=336;WE=43637940;WS=43637922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,344:1.00:344
chr1	43638185	rs1782383	A	G	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=730;SC=TACAAAGGAAAAGGCAGAAAA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=43638193;WS=43638175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	43638334	rs2934883	A	T	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=0;PP=672;SC=GGGGAGGGCGAGTCCGGGCCG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=43638342;WS=43638328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	43638410	rs1782386	G	C	1755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=7;PP=1537;SC=CAGCAGAACTGTTTGGCGGGA;SOR=3.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=53;WE=43638418;WS=43638400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	43638457	rs1782387	T	A	3416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=22;PP=2832;SC=CGCTGCATGTTTTTGGTCTTC;SOR=2.792;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=90;TCR=22;TR=112;WE=43638465;WS=43638447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	43642988	rs12094101	G	T	1394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=34;PP=1026;SC=CACCATGTGGGGTGGAAGCAG;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=41;WE=43642996;WS=43642978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	43649508	rs663824	A	G	2132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=50;PP=1787;SC=GGAACCTACCAATGGCTCAAA;SOR=1.852;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=20;TCR=50;TR=70;WE=43649516;WS=43649498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	43650741	rs598336	T	C	2617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=76;NR=2;PP=2223;SC=CCAGTGACAGTCTTCTTTCTC;SOR=6.492;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=78;TCF=76;TCR=2;TR=78;WE=43650749;WS=43650731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	43652305	rs1976284	G	A	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=164.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.22;MQRankSum=-7.527;QD=7.43;ReadPosRankSum=-5.191;SOR=8.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,88:0.59:149
chr1	43652369	rs6413971	T	C	7442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=113;NR=98;PP=2965;SC=TGTTTTGCATTTTGGGCAGAT;SOR=0.814;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=113;TCR=98;TR=211;WE=43652377;WS=43652359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr1	43663376	rs513009	A	G	5011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=122;PP=2965;ReadPosRankSum=1.281;SC=AAGGAATGAAAGGCTTGCCTA;SOR=1.432;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=157;TCF=34;TCR=123;TR=156;WE=43663384;WS=43663366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,158:0.99:159
chr1	43664119	rs603560	A	G	2496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=5;PP=2109;ReadPosRankSum=-0.831;SC=TAGTGAGCTAAGCTTACAATT;SOR=3.500;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=65;TCR=5;TR=69;WE=43664127;WS=43664109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,72:0.99:73
chr1	43664218	rs603123	C	T	5281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=76;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.033;SC=CATCTGGACACTTCATTGTAG;SOR=0.880;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=86;TCR=77;TR=161;WE=43664226;WS=43664208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,173:0.99:175
chr1	43664319	rs10711519	TA	T	2128.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=65;PP=1280;SC=TGCGGAGAGGTAAAAAAAAAA;SOR=4.830;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=81;TCF=6;TCR=75;TR=68;WE=43664327;WS=43664309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	43665255	rs143705230	AAG	A	689.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=739;SC=AGGTGAACAAAAGAGAGATGG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=16;WE=43665264;WS=43665245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	43675467	rs2453412	G	A	6500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=135;NR=63;PP=2965;SC=TTGTCATCTCGCATTCTGGAC;SOR=1.656;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=199;TCF=135;TCR=64;TR=198;WE=43675475;WS=43675457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr1	43680839	rs34721748	T	TG	613.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=0;PP=583;SC=CAGGATTGCATGGGGGGAAGC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=18;WE=43680847;WS=43680829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	43680855	rs4233492	G	A	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=0;PP=763;SC=GAAGCCTTGCGCAACAGCTGG;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=43680863;WS=43680845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	43681184	rs612626	C	T	1826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=47;PP=1559;SC=CCTGGCTACACCCTATGCCCA;SOR=4.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=5;TCR=47;TR=52;WE=43681192;WS=43681174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	43688550	rs150404479	T	C	2476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=31;PP=1911;ReadPosRankSum=-0.143;SC=AAGAAGCAGATTGAGGAAGAT;SOR=0.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=224;TCF=150;TCR=74;TR=95;WE=43688558;WS=43688540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,101:0.44:228
chr1	43688743	rs11585059	G	A	2359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=63;PP=1915;SC=TGGACTGACCGGCCTGGGGGT;SOR=6.244;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=66;TCF=3;TCR=63;TR=65;WE=43688751;WS=43688733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	43697968	rs3120045	G	A	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.586;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=595;ReadPosRankSum=0.093;SC=GTGGAAACACGTGATGCTGGT;SOR=0.847;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=60;TCF=30;TCR=30;TR=28;WE=43697976;WS=43697958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr1	43699813	rs3820588	A	G	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.160;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=283;ReadPosRankSum=-0.633;SC=TATGCCCAGTATGGCCCCTGG;SOR=0.105;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=14;WE=43699821;WS=43699803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr1	43699935	rs2477561	C	T	4667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=39;PP=2965;SC=CAGAAGGAAACGTCTCTGATT;SOR=2.272;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=111;TCR=39;TR=150;WE=43699943;WS=43699925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr1	43700140	rs2483688	A	G	2549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.487;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=64;PP=2030;ReadPosRankSum=0.264;SC=CCTCTCCCTCACTGAGAATCT;SOR=0.732;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=221;TCF=88;TCR=133;TR=105;WE=43700148;WS=43700130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,109:0.47:230
chr1	43738340	rs10890247	A	C	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=8;PP=607;SC=CTGTGATCTGAACCCTCTGAC;SOR=1.697;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=43738348;WS=43738330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	43774878	rs2282226	C	T	1724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=42;PP=1437;SC=ACCCCCTAGTCCCTCAGAACT;SOR=3.215;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=6;TCR=42;TR=48;WE=43774886;WS=43774868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	43777852	rs1999595	C	T	4127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=89;PP=2965;SC=GTTACTTTCCCGTCGACCCCA;SOR=2.152;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=30;TCR=89;TR=119;WE=43777860;WS=43777842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr1	43784956	rs1199039	A	G	4233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=36;PP=2965;SC=GAGAGAACCTAGCCTCCAAGA;SOR=1.981;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=126;TCF=90;TCR=36;TR=125;WE=43784964;WS=43784946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	43812075	rs1760670	G	A	2104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=7;PP=1708;SC=TTAGTCTCTGGGGCAGGCCTG;SOR=3.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=53;TCR=7;TR=60;WE=43812083;WS=43812065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	43814864	rs839995	T	C	3317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=9;PP=2686;SC=GGGGCCAGAGTAGGGGCTGGC;SOR=4.240;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=88;TCR=9;TR=96;WE=43814872;WS=43814854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	43825644	rs839763	T	C	3710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=38;PP=2953;SC=CCACAGGTTATCAGAACAGAC;SOR=1.569;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=77;TCR=38;TR=115;WE=43825652;WS=43825634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr1	43826312	rs710251	C	A	14216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=492;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.189;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=246;NR=221;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.231;SC=TGCCCACCCTCCCCTTGACTG;SOR=0.315;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=475;TCF=247;TCR=228;TR=467;WE=43826320;WS=43826302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,481:0.99:486
chr1	43855546	rs839752	A	G	6965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=147;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.138;SC=CCCTCCCACCAACTTCCGGTT;SOR=1.599;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=224;TCF=76;TCR=148;TR=222;WE=43855554;WS=43855536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,228:0.99:230
chr1	43855578	rs839753	G	C	5432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.514;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=124;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.230;SC=CCGAGGTAGCGAGGTCAGGGG;SOR=2.260;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=41;TCR=125;TR=164;WE=43855586;WS=43855568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,167:0.99:169
chr1	43869235	rs710249	G	C	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=10;PP=1172;SC=GGGATACTTCGCTGATCCTTT;SOR=2.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=42;WE=43869243;WS=43869225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	43886494	rs2782643	C	T	5257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=105;NR=54;PP=2965;SC=GGCTATGGCACCCTGGCCCCT;SOR=1.581;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=105;TCR=54;TR=159;WE=43886502;WS=43886484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr1	43887146	rs2782644	G	A	1093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=32;PP=935;SC=CCCCGGGGAAGAGGAGGATCT;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=43887154;WS=43887136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	43888112	rs182232163	G	A	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.645;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=16;PP=1066;ReadPosRankSum=0.747;SC=CAAGCCTGGGGCCTGGAGGTC;SOR=0.508;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=110;TCF=78;TCR=32;TR=52;WE=43888120;WS=43888102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,57:0.49:116
chr1	43888602	rs2782645	G	A	3257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=82;PP=2742;SC=TAGGGTGTAGGATAGCTCCCT;SOR=3.958;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=11;TCR=83;TR=93;WE=43888610;WS=43888592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	43892189	rs2782646	G	A	15352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=492;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=182;NR=296;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.896;SC=GAGGTGCTGCGGCGGACCTGC;SOR=0.484;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=480;TCF=182;TCR=298;TR=478;WE=43892197;WS=43892179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,488:1.00:489
chr1	43898784	.	C	A	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.319;ClippingRankSum=0.000;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.681;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=868;ReadPosRankSum=-0.576;SC=TCTCAGGCCTCCCTGGGCCCT;SOR=0.933;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=95;TCF=35;TCR=60;TR=46;WE=43898792;WS=43898774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,49:0.49:99
chr1	43900185	rs41270355	C	T	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.524;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=689;ReadPosRankSum=-0.301;SC=CAGACCCGGACACACAGAGCA;SOR=1.552;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=75;TCF=32;TCR=43;TR=36;WE=43900193;WS=43900175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,39:0.48:81
chr1	43901011	rs2039531	A	C	3104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=84;PP=2614;SC=GTGAGATCCCACCCAGGAGCC;SOR=4.502;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=8;TCR=84;TR=92;WE=43901019;WS=43901001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	43903589	rs2782648	G	T	2845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=82;PP=2379;ReadPosRankSum=0.230;SC=GTCTGAGGAGGGGGTAGGGGA;SOR=4.271;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=4;TCR=83;TR=86;WE=43903597;WS=43903579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,87:0.99:88
chr1	43906896	rs2027130	A	G	2075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=13;PP=1610;SC=GTAAAACAGAATGTGGGGATT;SOR=2.694;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=52;TCR=13;TR=65;WE=43906904;WS=43906886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	43909265	rs2255632	T	C	2370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=8.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.350;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=64;PP=1916;ReadPosRankSum=1.458;SC=TTTACTCTCATAGCGGCGCCA;SOR=1.167;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=212;TCF=63;TCR=149;TR=87;WE=43909273;WS=43909255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,91:0.41:221
chr1	43912590	rs2782650	A	G	1701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=17;PP=1269;SC=CAGTGCAGCCATACCTTAACC;SOR=1.812;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=58;WE=43912598;WS=43912580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	43916642	rs6954	T	C	6443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.208;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=136;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.783;SC=GAAGCACTTGTGGCCACCGTC;SOR=1.086;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=221;TCF=84;TCR=137;TR=219;WE=43916650;WS=43916632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,223:1.00:224
chr1	43917409	rs2251804	T	C	8056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=99;NR=149;PP=2965;SC=GGATACTACATTCCGAGACCC;SOR=1.192;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=249;TCF=99;TCR=150;TR=248;WE=43917417;WS=43917399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr1	43917637	rs2251802	G	A	8368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=160;NR=99;PP=2965;SC=AGTACTGGGGGTCAGTGATGC;SOR=1.235;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=259;TCF=160;TCR=99;TR=259;WE=43917645;WS=43917627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr1	43917888	rs41270373	C	G	2205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-6.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.512;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=44;PP=1704;ReadPosRankSum=-1.057;SC=GAGCCAAAACCCCAGCTGCAT;SOR=0.630;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=121;TCR=90;TR=101;WE=43917896;WS=43917878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,99:0.47:209
chr1	43919413	rs6692611	A	G	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=15;PP=466;SC=GGGAGGCCGGAGAGCTCGGGG;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=43919421;WS=43919403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	43998397	rs11350891	GT	G	1318.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=45;PP=1295;SC=GAAAATCCCTGTTTTTTTACT;SOR=4.935;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=61;TCF=2;TCR=59;TR=47;WE=43998405;WS=43998387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	44010571	rs6695915	A	G	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=281;ReadPosRankSum=1.019;SC=GCACAGCCCAAGTGGGGGGCT;SOR=0.622;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=12;WE=44010579;WS=44010561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr1	44035472	rs943513	G	A	1774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=48;PP=1551;SC=CAGGGGTCAAGGGGCCATGCA;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=5;TCR=48;TR=53;WE=44035480;WS=44035462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	44070691	rs17371903	A	G	1985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=39;PP=1568;SC=GGCCACGGCCAGCTGAGCCTG;SOR=1.376;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=24;TCR=39;TR=63;WE=44070699;WS=44070681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	44071221	rs631248	G	A	4279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=100;PP=2965;SC=TTGTTGTGGTGCCCATTGACC;SOR=2.218;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=33;TCR=100;TR=133;WE=44071229;WS=44071211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr1	44072420	rs539096	A	G	2056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=19;PP=1731;SC=CTCCAGGATTAATAGGCAGAG;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=47;TCR=19;TR=66;WE=44072428;WS=44072410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	44074966	.	TG	T	1109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=4.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=1.706;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.068;SOR=1.246;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:158,55:0.26:213
chr1	44075227	rs517622	T	C	2939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=102;PP=2369;SC=CCTGTGGGTCTGTTCTGCAGG;SOR=7.092;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=104;TCF=1;TCR=103;TR=103;WE=44075235;WS=44075217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr1	44078384	rs499257	T	C	6262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=154;NR=28;PP=2965;SC=TTAACGGGCTTTCTTTTCTTG;SOR=3.436;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=182;TCF=154;TCR=28;TR=182;WE=44078392;WS=44078374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr1	44078602	rs3791151	C	A	5895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=151;PP=2965;SC=TCTTCTCCCCCAATCCCACTG;SOR=3.429;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=27;TCR=151;TR=178;WE=44078610;WS=44078592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr1	44079411	rs603542	T	C	4108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=114;PP=2965;SC=CCCCCTACCATGTGCCTGGCC;SOR=2.865;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=27;TCR=114;TR=141;WE=44079419;WS=44079401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr1	44083110	rs571862	C	T	4292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=14;PP=2965;ReadPosRankSum=1.077;SC=TCTCCATTCTCTGCAGTCCAT;SOR=2.770;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=112;TCR=14;TR=125;WE=44083118;WS=44083100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,129:0.99:130
chr1	44083507	rs641365	T	C	5422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=120;PP=2965;SC=AGACCATGGGTGATTTCTGGA;SOR=1.525;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=181;TCF=61;TCR=120;TR=181;WE=44083527;WS=44083497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr1	44083519	rs641351	G	A	5707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=119;PP=2965;SC=ATTTCTGGAGGATGGTGTGGG;SOR=1.877;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=48;TCR=119;TR=167;WE=44083527;WS=44083497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr1	44084739	rs1143701	C	T	6172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=87;PP=2965;SC=GTGAGAAGCGCGAGCTGCGTC;SOR=0.786;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=193;TCF=106;TCR=87;TR=191;WE=44084747;WS=44084729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr1	44086080	rs568639	T	C	7391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=94;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.429;SC=ACCCCTCCCCTATTCCTTCTC;SOR=0.391;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=222;TCF=128;TCR=94;TR=221;WE=44086088;WS=44086070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,234:1.00:235
chr1	44086831	rs1143702	C	T	6073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=115;PP=2965;SC=GCATGCGCTACGAGGGCGTGG;SOR=1.208;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=71;TCR=116;TR=186;WE=44086839;WS=44086821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr1	44087496	rs673485	C	T	4334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=114;NR=21;PP=2965;SC=GGGTCCAGCACCTGCTCTTGG;SOR=3.275;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=136;TCF=115;TCR=21;TR=135;WE=44087504;WS=44087486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr1	44121557	rs2274465	C	G	973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=26;PP=738;SC=TGGCTCTGTTCTAGCTGTCTC;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=44121565;WS=44121547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	44133641	.	G	T	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-4.538;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.386;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=457;ReadPosRankSum=-2.173;SC=GTGCCCAGAGGAGGACATGGA;SOR=0.358;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=61;TCF=10;TCR=51;TR=24;WE=44133649;WS=44133631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
chr1	44137257	rs586339	C	A	5599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=82;NR=89;PP=2965;SC=GAAGAACAAGCAGCAGCTGCC;SOR=0.752;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=82;TCR=89;TR=171;WE=44137265;WS=44137247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr1	44280381	rs37468	A	T	2495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=1;PP=2064;SC=AACTTGGTCCATCACAAAACA;SOR=7.168;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=69;TCF=68;TCR=1;TR=69;WE=44280389;WS=44280371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	44280425	rs3791064	T	G	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.440;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=16;PP=1300;ReadPosRankSum=0.878;SC=TTTATGTATTTAGTTACGTTC;SOR=0.243;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=120;TCF=94;TCR=26;TR=62;WE=44280433;WS=44280415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,64:0.50:127
chr1	44290530	rs37458	A	G	3536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.372;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=78;PP=2762;ReadPosRankSum=-1.263;SC=GAGCGAGGACACAGCCTTTGC;SOR=0.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=373;TCF=187;TCR=186;TR=158;WE=44290538;WS=44290520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:227,161:0.41:388
chr1	44303786	rs67028312	C	CAAAAAAAA	2195.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.36;MQRankSum=-0.051;QD=51.06;ReadPosRankSum=-1.293;SOR=2.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr1	44323736	rs2906465	T	C	1965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=10;PP=1554;SC=AACAGGTTTTTGAAGTGAATA;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=47;TCR=10;TR=57;WE=44323744;WS=44323726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	44363940	.	A	G	2972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.148;ClippingRankSum=0.000;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.630;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=80;PP=2327;ReadPosRankSum=1.670;SC=TCAGTCACCAAAGAGTACCGC;SOR=1.373;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=227;TCF=69;TCR=158;TR=106;WE=44363948;WS=44363930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,111:0.47:238
chr1	44386305	rs3120802	C	T	1473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=31;PP=1174;SC=GTGGGTGGGGCAGTGCTTCTG;SOR=1.426;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=46;WE=44386313;WS=44386295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	44386615	rs3120803	A	G	2663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=66;PP=2063;ReadPosRankSum=-0.939;SC=GGGGCTGGGTATGGGGGCAAT;SOR=1.587;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=17;TCR=67;TR=83;WE=44386623;WS=44386605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,87:0.99:88
chr1	44395786	rs2108202	C	T	3144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=61;PP=2516;SC=CAACTGATCACTTCATCTCTC;SOR=1.103;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=42;TCR=61;TR=103;WE=44395794;WS=44395776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	44401384	rs2242637	A	G	4866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=89;PP=2965;SC=TGGCCTAGGCAGCAGGTGAGT;SOR=0.874;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=75;TCR=90;TR=164;WE=44401392;WS=44401374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr1	44415415	rs2240447	C	T	12217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=206;NR=168;PP=2965;SC=TGATGCCTGACGCTTGGCCAT;SOR=0.877;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=374;TCF=206;TCR=168;TR=374;WE=44415423;WS=44415405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,389:1.00:389
chr1	44426025	rs2301993	G	A	1659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=30;PP=1359;SC=CTTGCCCTCCGCTCCCATAGT;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=22;TCR=30;TR=52;WE=44426033;WS=44426015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	44426948	rs2906596	G	A	10856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=13.096;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=265;PP=2965;ReadPosRankSum=0.623;SC=GGTCCTGACCGGGGTCTCTGC;SOR=2.544;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=342;TCF=76;TCR=266;TR=339;WE=44426956;WS=44426938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,344:0.99:346
chr1	44432500	rs4660759	C	G	5672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=123;PP=2965;SC=CCAGTGCCCTCCCCTGCCCAG;SOR=2.261;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=168;TCF=43;TCR=125;TR=166;WE=44432508;WS=44432490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr1	44442521	rs12410334	A	C	1746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=44;PP=1495;SC=GTATGAATGCAAAATGCTGGG;SOR=3.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=5;TCR=44;TR=49;WE=44442529;WS=44442511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	44451115	rs78433362	A	G	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=2;PP=285;SC=TGGGGGGGGGAGGGGGGGTGC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=44451132;WS=44451105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	44451124	.	G	T	525	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=20;NR=2;PP=525;QD=25.4441460249;SC=GAGGGGGGGTGCAGACTGGGT;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=22;WE=44451132;WS=44451105;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,22:0.92:24
chr1	44457215	rs12403025	G	A	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=0;PP=610;SC=ACCAAACACGGGAGGGGGCGG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=21;WE=44457223;WS=44457205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	44457305	rs12403036	G	A	2370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=17;PP=1763;SC=CCCACTGCCTGGTTTCTGGGC;SOR=2.215;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=55;TCR=17;TR=72;WE=44457313;WS=44457295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	44457739	rs11376967	T	TC	897.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=12;PP=1093;SC=ATTTCCCACCTCTGCGGGTCC;SOR=0.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=24;WE=44457747;WS=44457729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	44594966	rs2485653	G	A	1854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.926;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=9;PP=1466;ReadPosRankSum=-2.267;SC=TGGGGATGAAGAGGAGGAACA;SOR=0.535;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=167;TCF=148;TCR=19;TR=73;WE=44594974;WS=44594956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,73:0.44:167
chr1	44595113	rs2429051	G	C	4500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.371;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=93;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.145;SC=GGCCTACCAAGCATTCAGCAC;SOR=0.660;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=373;TCF=169;TCR=204;TR=174;WE=44595121;WS=44595103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:206,178:0.46:384
chr1	44595410	rs2485652	A	G	4399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.662;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=69;PP=2561;ReadPosRankSum=-0.027;SC=ATGCCCCCCAATGGGCTGCCA;SOR=1.159;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=210;TCF=94;TCR=116;TR=116;WE=44595418;WS=44595400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,117:0.54:217
chr1	44595426	rs2429050	G	A	4509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.810;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=63;PP=2612;ReadPosRankSum=-1.030;SC=TGCCAGTCTCGGCTTCCACTG;SOR=0.783;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=202;TCF=99;TCR=103;TR=115;WE=44595434;WS=44595416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,116:0.56:209
chr1	44595995	rs35084281	G	GC	661.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.539;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.755;NF=1;NR=25;PP=690;ReadPosRankSum=-0.463;SC=AGCTAGACTGGCCCCCCGACT;SOR=1.795;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=61;TCF=3;TCR=58;TR=26;WE=44596003;WS=44595985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr1	44596379	rs34057178	CCAA	C	8066.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=468;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.542;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.751;NF=31;NR=121;PP=2975;ReadPosRankSum=0.125;SC=GACCCACAGGCCAACAACAAC;SOR=0.652;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=377;TCF=82;TCR=295;TR=152;WE=44596389;WS=44596369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,210:0.50:423
chr1	44679556	rs803369	A	G	2599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.781;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=55;PP=1997;ReadPosRankSum=0.665;SC=GAAAGCGTTGACTAGGGGAGG;SOR=0.493;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=217;TCF=94;TCR=123;TR=103;WE=44679564;WS=44679546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,105:0.47:222
chr1	44680719	rs4660780	G	C	3184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.490;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=47;PP=2450;ReadPosRankSum=-0.129;SC=AATGCATGCAGAGTAGGACTC;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=257;TCF=155;TCR=102;TR=122;WE=44680727;WS=44680709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,125:0.47:267
chr1	44686322	rs12419	T	C	2323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.595;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=63;PP=1768;ReadPosRankSum=-0.370;SC=GACGCTGTTATGTAAATAGAG;SOR=0.466;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=180;TCF=61;TCR=119;TR=99;WE=44686330;WS=44686312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,100:0.54:184
chr1	44788398	rs161721	A	T	2107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=30;PP=1617;SC=ACTTCTTACCATCCCATATTG;SOR=1.011;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=39;TCR=30;TR=69;WE=44788406;WS=44788388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	44878509	rs11210991	C	G	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=188;ReadPosRankSum=1.209;SC=CCAACTACTTCCCTTTCACTA;SOR=0.165;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=10;WE=44878517;WS=44878499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr1	45088629	rs28453885	G	A	1759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=52;PP=1385;SC=CTAGGGCTGCGCCGTGTGTGT;SOR=8.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=1;TCR=52;TR=52;WE=45088637;WS=45088619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	45205598	rs3820586	T	C	2445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.453;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=52;PP=1888;ReadPosRankSum=-0.844;SC=CCTTGCTGACTCTCCGAATGG;SOR=0.513;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=195;TCF=84;TCR=111;TR=95;WE=45205606;WS=45205588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,97:0.48:201
chr1	45212979	.	CA	C	135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.703;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.31;MQRankSum=0.975;QD=2.95;ReadPosRankSum=0.845;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,14:0.30:46
chr1	45216038	rs12566610	C	G	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=83;ReadPosRankSum=-0.892;SC=TCACCTTGTACAGAAACTTGG;SOR=0.223;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=5;WE=45216046;WS=45216028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr1	45218895	rs3795713	A	T	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.641;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=678;ReadPosRankSum=-1.705;SC=ATTCCATCCGAGGCAGCTCTT;SOR=0.178;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=35;WE=45218903;WS=45218885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,36:0.50:72
chr1	45223901	rs111920953	TATTAGCTG	T	752.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.868;NF=0;NR=13;PP=2473;ReadPosRankSum=0.314;SC=GCCAAAAACCTATTAGCTGAT;SOR=1.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=13;WE=45223916;WS=45223891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr1	45224998	rs4342887	A	C	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.282;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=42;PP=1192;ReadPosRankSum=0.110;SC=CATCAAGATGATCGACATGGG;SOR=1.549;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=109;TCF=35;TCR=74;TR=55;WE=45225006;WS=45224988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,55:0.51:107
chr1	45226084	rs1140279	G	A	2986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.246;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=47;PP=2453;ReadPosRankSum=-0.806;SC=AGCGAGGCGCGGACACTTCCA;SOR=0.482;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=208;TCF=129;TCR=79;TR=117;WE=45226092;WS=45226074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,117:0.56:210
chr1	45228140	rs41269071	G	A	2039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=38;PP=1583;ReadPosRankSum=-1.061;SC=ACCAGGATGCGGCCAAGCAAG;SOR=0.650;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=149;TCF=70;TCR=79;TR=70;WE=45228148;WS=45228130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,76:0.49:156
chr1	45241113	rs11211031	T	C	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=495;ReadPosRankSum=-1.124;SC=GAGACCCTCCTAGGCTCGTGG;SOR=0.902;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=23;WE=45241121;WS=45241103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr1	45241285	rs12120833	C	G	2447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.360;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=58;PP=1800;ReadPosRankSum=0.555;SC=GAGTGTCGCTCTGCATTGAGG;SOR=1.031;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=176;TCF=76;TCR=100;TR=95;WE=45241293;WS=45241275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,100:0.55:182
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chr1	45266832	rs17881698	A	G	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=584;ReadPosRankSum=0.250;SC=AAGGTGAAAGATGGTGATTCC;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=32;WE=45266840;WS=45266822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,32:0.50:64
chr1	45270024	rs11211036	G	C	2411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.237;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=45;PP=1864;ReadPosRankSum=-0.348;SC=AACAGAACCCGGCCCCCCTGG;SOR=0.557;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=227;TCF=127;TCR=100;TR=102;WE=45270032;WS=45270014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,103:0.44:234
chr1	45271097	rs17883049	G	A	3010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.479;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=39;PP=2374;ReadPosRankSum=2.190;SC=GAGGCCCAGGGTGCTGGGGAG;SOR=0.651;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=237;TCF=153;TCR=84;TR=110;WE=45271105;WS=45271087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,116:0.47:249
chr1	45271912	rs17886118	G	A	1517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=44;PP=1201;ReadPosRankSum=0.939;SC=GCGCGGCCTCGTCGCTGGAGT;SOR=0.600;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=17;TCR=75;TR=54;WE=45271920;WS=45271902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,56:0.60:94
chr1	45272422	.	T	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.248;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=135;ReadPosRankSum=-0.137;SC=TGCTCAGTGATGTCAAGGGTT;SOR=1.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=10;WE=45272430;WS=45272412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr1	45291908	rs11211040	G	A	2622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.588;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=25;PP=2039;ReadPosRankSum=-1.436;SC=CCTCCCCGGGGTGCCCGTGCT;SOR=0.755;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=191;TCF=140;TCR=51;TR=100;WE=45291916;WS=45291898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,102:0.52:196
chr1	45293518	rs7525308	A	G	2191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.625;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=34;PP=1609;ReadPosRankSum=0.529;SC=GTCTTACCTTAGCATGTGACT;SOR=0.596;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=85;TCR=61;TR=80;WE=45293526;WS=45293508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,84:0.57:148
chr1	45293752	rs2295997	T	C	3189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.147;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.98;MQRankSum=-1.021;NF=61;NR=57;PP=2586;ReadPosRankSum=-0.114;SC=GGCTGCTGGCTTCACAGTGGG;SOR=0.724;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=235;TCF=120;TCR=115;TR=118;WE=45293760;WS=45293742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,119:0.49:245
chr1	45294156	rs2273940	T	C	1817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.311;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=37;PP=1365;ReadPosRankSum=-1.138;SC=CACCCTGAGCTGCCCCGTGTG;SOR=0.557;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=143;TCF=75;TCR=68;TR=76;WE=45294164;WS=45294146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,76:0.52:145
chr1	45295289	rs11573579	C	A	1783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.659;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=27;PP=1394;ReadPosRankSum=-0.336;SC=TACCGACCTGCACAAAGCGCC;SOR=0.589;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=128;TCF=78;TCR=50;TR=64;WE=45295297;WS=45295279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,65:0.49:132
chr1	45296752	rs2295998	C	T	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=46;ReadPosRankSum=-0.789;SC=GGGTCAGGGACGAAAACCCAG;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=45296760;WS=45296742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr1	45297753	rs2295999	A	G	2242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.737;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=56;PP=1805;ReadPosRankSum=0.113;SC=CAGCAGAAGAAGGGGATTCCC;SOR=1.126;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=164;TCF=60;TCR=104;TR=82;WE=45297761;WS=45297743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,83:0.50:165
chr1	45307506	rs3795720	G	A	1877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.911;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=38;PP=1462;ReadPosRankSum=0.305;SC=TATGGCCAGTGTCCACAACTT;SOR=0.446;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=139;TCF=72;TCR=67;TR=72;WE=45307514;WS=45307496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,76:0.53:144
chr1	45308409	rs6696675	G	A	2247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.230;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=18;PP=1922;ReadPosRankSum=-0.069;SC=TTGCGGTGCTGGCTCTCACTT;SOR=1.925;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=177;TCF=128;TCR=49;TR=92;WE=45308417;WS=45308399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,89:0.50:178
chr1	45340282	rs9988451	C	T	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=0;PP=748;ReadPosRankSum=-1.266;SC=TAAAATTAACCTTCCTTCAGA;SOR=1.101;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=30;WE=45340290;WS=45340272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr1	45362992	rs263978	T	C	1346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=10;PP=1140;ReadPosRankSum=-2.284;SC=GCTTGTTAAGTACTGTAGGTT;SOR=0.804;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=108;TCF=89;TCR=19;TR=54;WE=45363000;WS=45362982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,52:0.50:105
chr1	45443894	rs2487367	T	C	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=1;PP=946;ReadPosRankSum=0.362;SC=CAGAGCGAGGTTCTGTCTCAA;SOR=0.281;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=75;TCF=74;TCR=1;TR=41;WE=45443902;WS=45443884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,41:0.54:76
chr1	45444038	rs11556200	G	A	4221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.258;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=74;PP=2962;ReadPosRankSum=1.198;SC=CCATGTCAGCGTCATCAGGAA;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=346;TCF=193;TCR=153;TR=169;WE=45444046;WS=45444028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,171:0.48:356
chr1	45469176	rs12749251	A	T	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.444;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=4;PP=727;ReadPosRankSum=0.355;SC=ACTCCTCCCAAGGGCTCATGT;SOR=0.412;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=91;TCF=83;TCR=8;TR=38;WE=45469184;WS=45469166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,38:0.42:90
chr1	45470130	rs7528534	T	C	1982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=49;PP=1707;SC=TGTGGCCTTTTAGCAGCAGAA;SOR=4.029;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=6;TCR=50;TR=55;WE=45470138;WS=45470120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	45472798	rs147908761	TTGTGTGTG	T,TTGTG	1522.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=13,13;NR=17,17;PP=778,917;SC=CCTCGAGCAGTTGTGTGTGTG;SOR=0.850;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=67;TCF=21;TCR=46;TR=30,30;WE=45472813;WS=45472788;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.61,0.36:44
chr1	45474008	rs7541207	T	C	1212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=854;ReadPosRankSum=-0.126;SC=CATGGGTAGATAGACTGCAGC;SOR=0.723;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=120;TCF=58;TCR=62;TR=50;WE=45474016;WS=45473998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,53:0.42:126
chr1	45474157	rs2298006	G	A	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.952;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=743;ReadPosRankSum=0.326;SC=AGACACACAAGGCTCAATGTT;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=22;TCR=43;TR=32;WE=45474165;WS=45474147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
chr1	45474750	rs2275599	A	T	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.505;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr1	45474755	rs2275598	C	G	1130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.24;ReadPosRankSum=0.307;SOR=0.498;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
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chr1	45476489	rs3806405	A	G	1768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=21;PP=1398;ReadPosRankSum=0.956;SC=TACAGGGGAGAAAAGGCAAAC;SOR=0.739;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=130;TCF=89;TCR=41;TR=65;WE=45476497;WS=45476479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,66:0.49:136
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chr1	45796269	rs3219493	G	C	4131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=73;PP=2965;SC=GGCACTTTTTGCAAAAGAGAT;SOR=1.112;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=52;TCR=74;TR=125;WE=45796277;WS=45796259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr1	45797228	rs36053993	C	T	1347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.062;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=19;PP=1103;ReadPosRankSum=0.243;SC=TGCCAGCAGACCTGAGAGGGA;SOR=1.067;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=115;TCF=61;TCR=54;TR=50;WE=45797236;WS=45797218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,52:0.44:118
chr1	45798555	rs3219487	T	C	9791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.214;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=151;NR=164;PP=2965;ReadPosRankSum=1.589;SC=GTCCCTCTATTGTTCCTATTT;SOR=0.382;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=316;TCF=152;TCR=164;TR=315;WE=45798563;WS=45798545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,326:1.00:327
chr1	45805566	rs3219468	G	C	6670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=97;NR=121;PP=2965;SC=CCCACTACCCGCTACCCGCGG;SOR=0.876;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=219;TCF=97;TCR=122;TR=218;WE=45805574;WS=45805556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr1	45810865	rs17853159	G	A	4784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.385;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=106;PP=2962;ReadPosRankSum=0.420;SC=GGCAAGGAACGCCACCGGCGA;SOR=0.668;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=358;TCF=163;TCR=195;TR=197;WE=45810873;WS=45810855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,200:0.56:357
chr1	45961955	rs937290	A	G	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.366;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=217;ReadPosRankSum=0.788;SC=TCATGGGCTCAGGTGGAACCA;SOR=1.536;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=14;WE=45961963;WS=45961945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
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chr1	45965340	rs7546268	T	C	1584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=7.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=56;PP=1413;ReadPosRankSum=-1.116;SC=CTTGCTCTCCTAGCGGGGGAT;SOR=0.475;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=102;TCF=3;TCR=99;TR=58;WE=45965348;WS=45965330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,56:0.54:103
chr1	45973928	rs2275276	G	A	2121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.729;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=39;PP=1660;ReadPosRankSum=1.297;SC=ACTACGAGGTGCACCCCAACC;SOR=0.672;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=167;TCF=82;TCR=85;TR=86;WE=45973936;WS=45973918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,87:0.52:168
chr1	45980777	rs35286958	T	G	2466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-6.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=80;PP=1885;ReadPosRankSum=-0.403;SC=AAGACTGTTTTTTTTCCGTTT;SOR=0.734;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=170;TCF=20;TCR=150;TR=91;WE=45980785;WS=45980767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,94:0.53:177
chr1	45981512	rs2356559	T	C	3251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.804;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=98;PP=2241;ReadPosRankSum=-1.549;SC=GGTTAGCATTTGACACAGACT;SOR=0.874;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=266;TCF=91;TCR=175;TR=146;WE=45981520;WS=45981502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,145:0.53:272
chr1	46027355	rs512083	T	C	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.957;NF=44;NR=13;PP=1072;ReadPosRankSum=0.602;SC=GGATTACAGGTGTGAGCCACT;SOR=0.761;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=86;TCR=25;TR=57;WE=46027363;WS=46027345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,59:0.51:115
chr1	46050004	rs57257530	TTCGG	T	2119.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=45;PP=2300;SC=GCTGTCGCTGTTCGGGAAGGC;SOR=6.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=45;WE=46050015;WS=46049994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	46057144	rs2991981	A	G	43.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	46065998	rs3014211	T	C	7664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=181;NR=54;PP=2965;SC=AGATAATGAGTATTTTCATCA;SOR=2.433;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=236;TCF=182;TCR=54;TR=235;WE=46066006;WS=46065988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr1	46073489	rs2230657	G	A	2025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=43;NR=22;PP=1681;SC=CTTTAGACCCGACAGTCAAGC;SOR=1.573;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=43;TCR=22;TR=65;WE=46073497;WS=46073479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	46078630	rs2050376	A	G	184.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=181;SC=TGAAGGTCTGACCCATAGACT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=46078638;WS=46078620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	46078854	rs2230658	A	G	2231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=32;PP=1824;SC=CTGAAGGCTCAGAAGAGGATG;SOR=0.927;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=40;TCR=32;TR=72;WE=46078862;WS=46078844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	46078884	rs2230659	C	T	2410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=34;PP=1891;SC=ATGATAAGACCGAAGAAATGC;SOR=0.798;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=40;TCR=34;TR=74;WE=46078892;WS=46078874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	46080530	rs2991985	T	C	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.284;NF=26;NR=1;PP=592;ReadPosRankSum=0.194;SC=TTAAAAGTCATTTTGACTTTC;SOR=0.420;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=27;WE=46080538;WS=46080520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr1	46080947	rs1972410	A	C	11945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=200;NR=178;PP=2965;SC=TTCTTTTTTGAGCCATTACTA;SOR=0.806;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=378;TCF=200;TCR=178;TR=378;WE=46080955;WS=46080937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,389:1.00:389
chr1	46081940	rs2356581	T	A	3528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=4;PP=2735;SC=GGTGATGGGTTCCTGTTACAA;SOR=5.747;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=96;TCR=4;TR=100;WE=46081948;WS=46081930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	46081960	rs2253862	C	T	3962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=18;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.785;SC=AGGCTGTGGGCGGCCTGGGTT;SOR=2.206;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=122;TCF=104;TCR=18;TR=118;WE=46081968;WS=46081950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,125:0.99:126
chr1	46082431	rs2991988	C	A	5145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=126;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.107;SC=CATTTTTAATCCCTTTCCTAT;SOR=0.768;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=165;TCF=37;TCR=128;TR=163;WE=46082439;WS=46082421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,167:0.99:169
chr1	46085852	rs2275085	C	T	1165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=0;PP=975;SC=TGCTTCTAGACCCAATGTCAG;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=35;WE=46085860;WS=46085843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	46085879	rs2275086	C	G	2032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=1;PP=1727;SC=GAGTAGTAAACCTGTAGGTCT;SOR=6.736;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=57;TCF=56;TCR=1;TR=57;WE=46085887;WS=46085869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	46086077	rs3014246	C	T	3321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=71;PP=2589;SC=GGTGAGGAAGCTGGCTTCCAG;SOR=2.004;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=26;TCR=71;TR=97;WE=46086085;WS=46086067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	46086329	rs11590549	C	T	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.703;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=561;ReadPosRankSum=-0.711;SC=AAAGGCTGGCCGTTAGCCATA;SOR=0.184;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=26;WE=46086337;WS=46086319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr1	46086913	rs3014245	C	T	1217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=7;PP=1006;SC=TAAGCCTCAACTGTGGCAGAG;SOR=2.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=46086921;WS=46086903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	46087577	rs3014242	G	A	12907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=411;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=166;NR=230;PP=2965;SC=TGGTGGCAGCGGTGGTGCCAC;SOR=1.070;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=397;TCF=166;TCR=231;TR=396;WE=46087585;WS=46087567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,408:1.00:408
chr1	46087879	rs3014241	A	G	7950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=168;NR=65;PP=2965;SC=GGGAGAGATAAGTGGGATGGG;SOR=2.011;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=233;TCF=168;TCR=65;TR=233;WE=46087887;WS=46087869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr1	46089225	rs3014240	C	G	7803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=156;NR=76;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.958;SC=GTAGGTAGCTCTACCTCCTCT;SOR=0.732;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=234;TCF=158;TCR=76;TR=232;WE=46089233;WS=46089215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,238:1.00:239
chr1	46095130	rs113420988	C	CG	186.25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.253;NF=7;NR=0;PP=114;ReadPosRankSum=0.842;SC=AGGTAATCCCCCCCCCCCCCA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=7;WE=46095138;WS=46095121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr1	46124663	rs6671802	A	G	1684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.587;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=15;PP=1246;ReadPosRankSum=1.227;SC=AAACCCTCTCATATTTGAGAA;SOR=0.533;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=173;TCF=142;TCR=31;TR=78;WE=46124671;WS=46124653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,78:0.45:174
chr1	46347875	rs56242896	A	T	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQRankSum=-0.598;QD=21.85;ReadPosRankSum=2.168;SOR=1.562;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,32:0.67:48
chr1	46347878	rs201525530	AT	A	1013.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQRankSum=-0.223;QD=22.53;ReadPosRankSum=1.780;SOR=1.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,31:0.69:45
chr1	46347879	rs10890362	T	A	227.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQRankSum=0.273;QD=5.06;ReadPosRankSum=-1.706;SOR=0.199;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr1	46347910	rs6665193	G	A	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.795;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=2;PP=1076;ReadPosRankSum=2.180;SC=AGAAAAAGTTGTTATTTAGAA;SOR=1.243;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=101;TCF=97;TCR=4;TR=54;WE=46347918;WS=46347900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,54:0.53:101
chr1	46379518	rs4256763	A	G	1798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.660;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=41;PP=1340;ReadPosRankSum=1.870;SC=AAACGGAGGCAAGAGAGACTG;SOR=0.399;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=161;TCF=64;TCR=97;TR=73;WE=46379526;WS=46379508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,77:0.46:167
chr1	46424964	rs4460582	G	A	2417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=10;PP=1899;SC=GCGGCCCGTGGAATGGTGTCC;SOR=3.228;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=61;TCR=10;TR=71;WE=46424972;WS=46424954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	46466721	rs11589562	T	C	3946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FS=0.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.998;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:157,176:0.53:333
chr1	46476587	rs11211247	T	G	1405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=35;PP=1200;ReadPosRankSum=-1.002;SC=AACTTCAAGATAATTTGGAGA;SOR=0.762;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=101;TCF=36;TCR=65;TR=54;WE=46476595;WS=46476577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,54:0.52:103
chr1	46485548	rs946529	G	T	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=180;ReadPosRankSum=-0.887;SC=CAAATGTATGGTCCTGAGGGG;SOR=0.507;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=10;WE=46485570;WS=46485538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr1	46485562	rs946528	C	T	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=701;SC=TGAGGGGATGCGGCAGGGAGA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=46485570;WS=46485538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	46487552	rs2275426	G	A	2031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=2.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.54;ReadPosRankSum=1.187;SOR=0.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,82:0.51:162
chr1	46487560	rs946524	A	G	6575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=147;NR=31;PP=1903;SC=CTGTAAAACCAAAGATGCCAG;SOR=2.989;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=147;TCR=31;TR=178;WE=46487568;WS=46487542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr1	46491635	rs785478	C	T	1337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=41;PP=1149;SC=AGTTCTCTAGCCCCCCGACCA;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=41;WE=46491643;WS=46491625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	46493460	rs1707336	T	G	2153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.502;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=32;PP=1699;ReadPosRankSum=0.728;SC=TGTCCAAAATTGGCCTCATGA;SOR=0.230;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=143;TCF=96;TCR=47;TR=79;WE=46493468;WS=46493450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,81:0.55:148
chr1	46495024	rs3795318	G	A	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=7;PP=771;ReadPosRankSum=1.012;SC=GCTTTCAGGGGCTCCAGGCTG;SOR=0.758;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=60;TCF=47;TCR=13;TR=34;WE=46495032;WS=46495014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr1	46495434	rs2236560	G	A	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=10;PP=901;SC=CTGGCTTCTTGCTAGATTTGC;SOR=1.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=34;WE=46495442;WS=46495424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
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chr1	46495564	.	C	T	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=20;PP=1126;ReadPosRankSum=0.616;SC=CAGGACTTCTCCGCCAGAAGG;SOR=0.623;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=75;TCR=44;TR=55;WE=46495572;WS=46495554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,54:0.45:119
chr1	46496709	rs925524	A	G	3532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=53;PP=2766;SC=TGTCTGAGTCATCCCACACAG;SOR=0.920;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=70;TCR=53;TR=123;WE=46496717;WS=46496699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	46498375	rs1622208	A	G	3581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=72;PP=2732;SC=CGGAGGTGGTAGAGCTGATCC;SOR=1.441;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=42;TCR=72;TR=114;WE=46498383;WS=46498365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr1	46500613	rs17855317	T	C	3998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.830;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=75;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.005;SC=AGCTAGCCACTTCTCGCAAGC;SOR=0.762;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=321;TCF=165;TCR=156;TR=153;WE=46500621;WS=46500603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,155:0.47:333
chr1	46500993	rs1052610	A	G	2061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.757;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=41;PP=1562;ReadPosRankSum=1.248;SC=CCGTCCAGAGACCCTAGGAGC;SOR=0.839;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=194;TCF=93;TCR=101;TR=77;WE=46501001;WS=46500983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,81:0.40:201
chr1	46511487	rs2297883	G	C	2051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=0;PP=1630;SC=ATGGGTCCTCGTTACTGTACA;SOR=8.222;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=54;TCR=0;TR=54;WE=46511495;WS=46511477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	46521517	rs785468	G	A	3931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=61;PP=2965;SC=CAGGTTTGATGCTATTCATTT;SOR=0.820;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=69;TCR=61;TR=130;WE=46521525;WS=46521507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	46521559	rs785467	A	T	3997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.505;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=71;PP=2965;ReadPosRankSum=0.890;SC=CCAAAGCTTGATTCTTCAAAT;SOR=0.607;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=127;TCF=56;TCR=71;TR=125;WE=46521567;WS=46521549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,129:0.99:130
chr1	46546208	rs1768803	T	C	1043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.118;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.000;NF=37;NR=1;PP=792;ReadPosRankSum=1.352;SC=GCTGGGATTATAGGCATGAGC;SOR=0.196;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=77;TCF=76;TCR=1;TR=38;WE=46546216;WS=46546198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,40:0.49:82
chr1	46598269	rs1707304	C	A	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.17;ReadPosRankSum=1.429;SOR=0.662;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,42:0.49:85
chr1	46598273	rs1707303	A	C	3217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=63;NR=24;PP=855;SC=AACCAACCCGACCGCACCAAC;SOR=1.927;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=63;TCR=24;TR=87;WE=46598281;WS=46598259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr1	46641741	rs11211261	A	G	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.763;NF=9;NR=0;PP=171;ReadPosRankSum=0.092;SC=TAGAGATGGGATTTCACCGTG;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=9;WE=46641749;WS=46641737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr1	46641837	rs12752892	G	A	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.610;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.960;NF=31;NR=4;PP=715;ReadPosRankSum=-0.461;SC=ATGAGCCACCGCACCCAGCCT;SOR=1.450;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=69;TCF=59;TCR=10;TR=35;WE=46641845;WS=46641827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,38:0.51:75
chr1	46655158	rs6659553	T	C	3400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=40;PP=2731;SC=ACCCCCACCATCAGGAAGTGG;SOR=1.158;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=64;TCR=40;TR=104;WE=46655166;WS=46655148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr1	46810530	rs3737744	A	G	5907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=82;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.879;SC=TTTTGACATGACTTACAGTGT;SOR=0.918;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=102;TCR=84;TR=182;WE=46810538;WS=46810520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,185:0.98:189
chr1	46827214	rs324414	A	C	966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=1;PP=797;SC=GCTCACTAGTAACTGCTTCTG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=46827222;WS=46827204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	46870852	rs201436846	G	A	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.540;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=36;PP=848;ReadPosRankSum=-0.525;SC=GGCCTCCATCGTCCCCTCCAT;SOR=0.346;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=68;TCF=8;TCR=60;TR=42;WE=46870860;WS=46870842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,44:0.62:71
chr1	46871986	rs324419	T	C	5773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=57;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.799;SC=CCCTGCTGTGTGAGGACATGT;SOR=0.717;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=186;TCF=129;TCR=57;TR=185;WE=46871994;WS=46871976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,190:0.99:191
chr1	46976837	rs1886116	C	T	6873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=143;PP=2965;SC=AGTCAGCCCCCGAGGATCAGC;SOR=1.577;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=66;TCR=145;TR=209;WE=46976845;WS=46976827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr1	47013180	rs10890404	A	G	7291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.550;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=129;NR=88;PP=2965;ReadPosRankSum=1.187;SC=GCGTCCGGCGACACCTTGCTC;SOR=0.628;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=220;TCF=130;TCR=90;TR=217;WE=47013188;WS=47013170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,230:1.00:231
chr1	47013364	rs1258041	T	C	2205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=62;PP=1722;SC=GCAGGCAGGATGGGAGGGCAG;SOR=2.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=17;TCR=62;TR=79;WE=47013372;WS=47013354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	47014821	.	A	AAAAAG	5319.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.60;QD=42.22;SOR=3.373;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,125:0.99:126
chr1	47059934	rs1258021	T	C	7186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=142;PP=2965;SC=AGTTCTCCATTGGCCTCTGAC;SOR=1.169;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=233;TCF=91;TCR=142;TR=233;WE=47059942;WS=47059924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr1	47099346	rs723333	C	A	1128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=3;PP=900;SC=ACACATTTATCCATGGACACA;SOR=4.294;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=35;WE=47099354;WS=47099336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	47108828	rs736188	T	C	1175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=6;PP=982;SC=TTCAGTGCCATGAGGTAAATC;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=38;WE=47108836;WS=47108818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	47109089	rs1745377	A	G	2640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=67;PP=2126;SC=TTGGGTGGCTAGTGAGTTGGA;SOR=3.428;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=11;TCR=67;TR=78;WE=47109097;WS=47109079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	47110668	rs1258054	G	C	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=1;PP=268;SC=ATTGAGGAGGGCCTAGAAAAC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=47110676;WS=47110658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	47110712	rs1258053	C	T	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=2;PP=456;SC=AATTCATCTGCGCCACAATAA;SOR=3.098;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=47110720;WS=47110702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	47110766	rs3215990	G	GC	2006.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=11;PP=1790;SC=TTGAGCCTCAGCAAGGGTTTC;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=37;WE=47110774;WS=47110756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	47123898	rs3214697	T	TA	62.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=1.782;QD=2.73;ReadPosRankSum=-0.492;SOR=0.141;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr1	47133811	rs11211337	T	C	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=10;NR=10;PP=401;SC=ACCCCGCTGCTGTCGGCGCCC;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=20;WE=47133819;WS=47133801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	47138444	rs616249	C	T	1078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=0;PP=890;SC=GTGGATGGAGCGATTGATGCA;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=38;WE=47138452;WS=47138434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	47138460	rs142214573	T	G	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=388;ReadPosRankSum=-0.677;SC=ATGCATGGGTTAAGTGAAAGA;SOR=0.540;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=20;WE=47138468;WS=47138450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr1	47264724	rs2297813	G	T	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=428;ReadPosRankSum=-1.750;SC=AGGCAGGTCAGATGAAGGCTA;SOR=0.358;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=21;WE=47264732;WS=47264714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr1	47276728	rs2297812	G	C	2159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.399;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=38;PP=1669;ReadPosRankSum=0.178;SC=TAAGTCTGCGGAGCTGAGGTT;SOR=0.527;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=179;TCF=86;TCR=93;TR=80;WE=47276736;WS=47276718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,83:0.46:182
chr1	47279055	rs45560837	G	C	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=4;PP=1268;ReadPosRankSum=-1.584;SC=GCTTGGTGGTGGAGGATAGGC;SOR=0.871;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=112;TCF=103;TCR=9;TR=56;WE=47279063;WS=47279045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,57:0.49:116
chr1	47279789	rs2297811	C	T	1947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.670;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=47;PP=1595;ReadPosRankSum=0.139;SC=CTCCTCCTGGCCCCTCTATGC;SOR=1.125;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=170;TCF=68;TCR=102;TR=75;WE=47279797;WS=47279779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,76:0.44:171
chr1	47279954	rs45463299	C	T	1380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.464;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=43;PP=1093;ReadPosRankSum=-0.373;SC=ACCGGAGGCACCTGGACTTCC;SOR=1.183;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=99;TCF=18;TCR=81;TR=50;WE=47279962;WS=47279944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,51:0.51:100
chr1	47280746	rs3215983	GAT	G	2324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.647;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.519;NF=23;NR=27;PP=2080;ReadPosRankSum=-0.694;SC=CCTAACCCAGGATGAAGATGA;SOR=0.781;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=101;TCF=43;TCR=58;TR=50;WE=47280755;WS=47280736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,62:0.47:132
chr1	47280859	rs2297810	G	A	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.110;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=31;PP=980;ReadPosRankSum=-1.737;SC=TCTACTGCATGGCCCTGTACC;SOR=1.695;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=87;TCF=32;TCR=55;TR=45;WE=47280867;WS=47280849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,48:0.52:93
chr1	47280884	rs4646491	C	T	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.167;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=916;ReadPosRankSum=0.400;SC=GCACCAGCATCGTTGTAGAGA;SOR=1.192;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=78;TCF=29;TCR=49;TR=42;WE=47280892;WS=47280874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,43:0.52:83
chr1	47282772	rs2297809	C	T	2833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=67;PP=2130;ReadPosRankSum=-1.723;SC=GGAGAGCTTCCGCCTCTACCC;SOR=0.682;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=207;TCF=73;TCR=134;TR=102;WE=47282780;WS=47282762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,110:0.50:218
chr1	47282888	rs35333582	C	T	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=29;PP=658;ReadPosRankSum=0.859;SC=GAAAAGGAGTCCCTGCATGCT;SOR=0.822;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=70;TCF=9;TCR=61;TR=33;WE=47282896;WS=47282878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,35:0.48:73
chr1	47348573	rs202002284	C	G	322.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.88;QD=40.35;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	47348578	rs199844718	T	C	351.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.88;QD=43.97;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	47366050	rs12032026	G	T	1475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-6.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.332;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.315;NF=29;NR=30;PP=1086;ReadPosRankSum=0.117;SC=ACATGCAGAGGAGGATCAGCA;SOR=0.448;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=136;TCF=73;TCR=63;TR=59;WE=47366058;WS=47366040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,61:0.47:129
chr1	47395973	rs1126743	G	A	2324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.185;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.332;NF=18;NR=71;PP=1838;ReadPosRankSum=-0.908;SC=ATTGTTTCCCGATGCAGTTCC;SOR=0.926;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=194;TCF=44;TCR=150;TR=89;WE=47395981;WS=47395963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,91:0.46:197
chr1	47398743	rs3890011	G	C	3146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.960;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.389;NF=51;NR=68;PP=2544;ReadPosRankSum=-0.156;SC=TGGAAACAGAGAGAAGACCAA;SOR=1.032;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=244;TCF=112;TCR=132;TR=119;WE=47398751;WS=47398733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,121:0.49:248
chr1	47399967	rs28451040	G	A	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.81;MQRankSum=-0.773;QD=13.45;ReadPosRankSum=-1.524;SOR=0.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,52:0.51:102
chr1	47400059	rs71500102	A	G	1032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.86;MQRankSum=-1.695;QD=32.27;ReadPosRankSum=-1.641;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr1	47401424	rs2269231	A	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.627;NF=0;NR=7;PP=91;ReadPosRankSum=1.992;SC=TTCCTGTAGCATGCAGATATC;SOR=0.089;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=7;WE=47401432;WS=47401414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr1	47402487	rs67512144	TTGTG	T,TTGTGTG	2155.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13,13;NR=37,37;PP=1543,2213;ReadPosRankSum=1.089;SC=GAATGTGTGTTTGTGTGTGTG;SOR=0.717;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=129;TCF=50;TCR=79;TR=50,50;WE=47402500;WS=47402477;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.54,0.42:74
chr1	47495822	rs12141009	C	T	1985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.739;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=53;PP=1445;ReadPosRankSum=0.347;SC=AGGGGGAAAGCTCTGGGACCT;SOR=0.482;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=127;TCF=25;TCR=102;TR=67;WE=47495830;WS=47495812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,75:0.56:135
chr1	47496983	rs12041262	C	A	1799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.247;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=5;PP=1450;ReadPosRankSum=-1.571;SC=AGGAAGTAAGCCCTGGGCTCT;SOR=0.476;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=149;TCF=140;TCR=9;TR=67;WE=47496991;WS=47496973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,68:0.44:154
chr1	47515563	rs11448645	G	GA	182.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.416;NF=9;NR=0;PP=222;ReadPosRankSum=-0.456;SC=GCATTTGGTGGAAAAATATCA;SOR=0.289;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=9;WE=47515571;WS=47515553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
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chr1	47581122	rs7547893	A	T	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.131;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.058;NF=38;NR=5;PP=930;ReadPosRankSum=0.697;SC=GTATAATTTTAAAAAAAAAGT;SOR=0.283;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=87;TCF=79;TCR=8;TR=43;WE=47581130;WS=47581112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,45:0.52:87
chr1	47582195	rs10890464	G	A	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=161;ReadPosRankSum=1.943;SC=TCCAGACATTGTAAGTTCCTA;SOR=0.191;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=9;WE=47582203;WS=47582185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr1	47582242	rs145561171	ATTTCGT	A	870.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.080;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.149;NF=16;NR=3;PP=769;ReadPosRankSum=-0.195;SC=ATATCTATGGATTTCGTTTTT;SOR=0.177;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=50;TCF=45;TCR=5;TR=19;WE=47582255;WS=47582232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr1	47582246	rs1295463	C	T	851.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.080;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=4.169;NF=32;NR=1;PP=1417;ReadPosRankSum=0.338;SC=CTATGGATTTCGTTTTTGTTT;SOR=1.819;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=58;TCF=54;TCR=4;TR=33;WE=47582255;WS=47582232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
chr1	47582292	rs10890465	T	G	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.364;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.270;NF=33;NR=8;PP=884;ReadPosRankSum=0.040;SC=GCTGGAGGGATTAGGACTGGG;SOR=1.170;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=83;TCF=64;TCR=19;TR=41;WE=47582300;WS=47582282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,41:0.49:84
chr1	47583415	rs6664496	G	T	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.946;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.796;NF=30;NR=4;PP=706;ReadPosRankSum=-1.655;SC=TAGATGCCATGTTTTCTTTCT;SOR=0.292;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=55;TCF=50;TCR=5;TR=34;WE=47583423;WS=47583405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,35:0.61:57
chr1	47607851	rs2056899	A	T	2020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.512;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-11.059;NF=16;NR=67;PP=1611;ReadPosRankSum=1.133;SC=AGCCTTCCACAATGACATCCT;SOR=1.083;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=164;TCF=36;TCR=128;TR=83;WE=47607859;WS=47607841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,80:0.50:161
chr1	47609091	rs146396590	G	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.36;MQRankSum=-1.476;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.998;SOR=3.477;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	47609489	rs10789501	T	C	2733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.461;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.074;NF=63;NR=43;PP=1761;ReadPosRankSum=-0.408;SC=GGTTTTTTGCTGTATGAGGAA;SOR=0.926;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=238;TCF=132;TCR=106;TR=106;WE=47609497;WS=47609479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,118:0.46:256
chr1	47609668	rs911909	T	C	1991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.092;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=56;PP=1500;ReadPosRankSum=2.292;SC=GCAGAGAAGGTCCCTAGTAAT;SOR=0.309;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=169;TCF=38;TCR=131;TR=77;WE=47609676;WS=47609658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,79:0.46:171
chr1	47609944	rs200578397	C	A	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.87;MQRankSum=0.982;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.383;SOR=1.488;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr1	47610293	rs968322	C	T	2720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=15.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.80;MQRankSum=-0.368;QD=16.69;ReadPosRankSum=1.521;SOR=0.199;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,97:0.60:163
chr1	47614185	rs760440	G	C	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.482;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.647;NF=14;NR=2;PP=292;ReadPosRankSum=0.937;SC=TGAATGTCCAGCTCAGGGCTG;SOR=0.195;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=43;TCF=40;TCR=3;TR=16;WE=47614193;WS=47614179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr1	47614485	rs72684327	A	G	2057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.380;NF=19;NR=75;PP=1766;ReadPosRankSum=0.437;SC=TCCACCTGCCATCCTGTCTTC;SOR=0.832;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=209;TCF=49;TCR=160;TR=94;WE=47614493;WS=47614475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,88:0.44:200
chr1	47652870	rs10549554	CCTTGAG	CAG,C	3067.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=2;PP=2554;SC=GTTTCCCTTCCCTTGAGCCTC;SOR=5.549;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=43;WE=47652887;WS=47652860;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:66
chr1	47652875	rs10549555	AGC	A	3172.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.98;SOR=5.640;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	47652877	.	CCT	ACA	2532	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=59.97;NF=42;NR=2;PP=2532;QD=20;SC=TTCCCTTGAGCCTCAGGGGGA;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=65;TCF=61;TCR=4;TR=44;WE=47652887;WS=47652860;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:21,44:0.68:65
chr1	47652879	rs60327556	T	A	3181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.19;SOR=5.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	47655599	rs11801079	C	T	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=327;ReadPosRankSum=0.464;SC=GGCTGAGGGCCGACATGGCTG;SOR=0.587;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=18;WE=47655607;WS=47655589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr1	47655816	rs2248907	A	G	992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=25;PP=779;SC=GAGCTGCCAGACCTGGCCTCC;SOR=3.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=27;WE=47655824;WS=47655806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	47685455	rs927462	T	C	4258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=78;PP=2965;SC=GGGCCGTGTGTTTGGGCGCGG;SOR=1.628;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=41;TCR=78;TR=119;WE=47685463;WS=47685445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	47685569	rs144117146	G	A	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.03;ReadPosRankSum=-0.665;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr1	47689842	rs34087210	C	G	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=26;PP=684;SC=CTTAGGGATCCTCCCCACATG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=47689850;WS=47689832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	47691568	rs145295250	GCAGA	G	672.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.055;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.109;NF=5;NR=12;PP=782;ReadPosRankSum=-0.837;SC=CATCCTGTGGGCAGACAGACA;SOR=0.497;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=17;WE=47691579;WS=47691558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,21:0.32:66
chr1	47717189	rs2758735	A	G	11091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=182;NR=174;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.810;SC=CAAGCTGTTCAGGTATGGACC;SOR=0.232;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=358;TCF=184;TCR=174;TR=356;WE=47717197;WS=47717179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,375:1.00:376
chr1	47717590	.	AC	CA	3546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.105;ClippingRankSum=0.000;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=60;PP=2944;ReadPosRankSum=-0.326;SC=ATGCATGCCAACACACTGAAA;SOR=0.667;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=182;TCF=54;TCR=128;TR=84;WE=47717599;WS=47717580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,93:0.49:191
chr1	47735280	rs2742104	T	C	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=4;PP=1364;SC=GAAAGTAGGATGAAAGACTAA;SOR=4.575;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=47;TCR=4;TR=51;WE=47735288;WS=47735270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	47753405	rs12125261	G	A	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=32;PP=923;SC=TAGATGAAAAGTAGCTCTGAA;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=38;WE=47753413;WS=47753395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	47768071	.	A	C	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.163;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=5.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.47;ReadPosRankSum=2.660;SOR=2.485;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,33:0.43:76
chr1	47770786	rs6692734	T	A	1843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=53;PP=1458;SC=TTTGTAATTTTCAAAGAGTTT;SOR=8.121;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=53;WE=47770794;WS=47770776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	47841038	rs3214951	G	GA	1162.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=60.25;NF=0;NR=35;PP=1029;SC=GGGTAAGCAGGAAAAAAAGAA;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=35;WE=47841046;WS=47841028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	47841109	rs2253511	T	C	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=12;PP=418;SC=TGGCTCATGCTTGTAATCCCA;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=47841117;WS=47841099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	47842431	rs3125648	G	A	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=22;PP=1121;SC=TAAACCTGAAGGCATCCTTGA;SOR=0.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=20;TCR=22;TR=42;WE=47842439;WS=47842421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	47883019	rs6666370	T	C	175.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.18;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	47883024	rs2820969	A	G	143.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	47904668	rs3046924	T	TCCGCAC	1093.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=11;PP=1120;SC=CGGCCCCGCATCCGCACCCGC;SOR=0.846;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=17;WE=47904676;WS=47904658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	47904909	rs2405913	G	C	1315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=15;PP=1048;SC=AGCCTTCTACGCGGCGTCCCT;SOR=1.347;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=40;WE=47904917;WS=47904899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	48459907	rs3814006	C	T	4388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.371;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=65;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.242;SC=CCCAGTTGCCCGCGATGGCAT;SOR=0.535;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=232;TCF=136;TCR=96;TR=153;WE=48459915;WS=48459897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,160:0.67:240
chr1	48695081	rs212989	G	A	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.841;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=518;ReadPosRankSum=-0.085;SC=GAGGATCCAGGTGTACATGTC;SOR=0.547;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=40;TCR=45;TR=29;WE=48695089;WS=48695071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,30:0.33:91
chr1	48696227	rs376212176	G	C	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=172;ReadPosRankSum=0.841;SC=CAACCCTACTGAGGGCCTCGG;SOR=0.941;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=9;WE=48696235;WS=48696217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr1	48697733	rs212991	T	G	5285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=104;PP=2965;SC=CTTTCCACATTCTTCGGGACC;SOR=1.398;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=59;TCR=104;TR=163;WE=48697741;WS=48697723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr1	48697751	rs61997212	C	T	2573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.002;HP=5;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=66;PP=1926;ReadPosRankSum=0.327;SC=ACCCTGTGAGCGGGGACATCC;SOR=1.192;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=132;TCF=43;TCR=89;TR=94;WE=48697759;WS=48697741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,99:0.72:138
chr1	48701567	rs6694372	C	T	1179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.187;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=43;PP=965;ReadPosRankSum=-1.198;SC=CCGGCCCCTCCTTCCCTCCTT;SOR=0.929;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=113;TCF=11;TCR=102;TR=47;WE=48701575;WS=48701557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,47:0.40:118
chr1	48707838	rs705430	A	G	1651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=47;PP=1391;SC=GTCCAGCCTCATTTGCCTCAG;SOR=5.018;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=50;WE=48707846;WS=48707828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	48708228	rs850763	G	T	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=26;ReadPosRankSum=-0.450;SC=GCCAGCCGGGGAGTGCCCTGC;SOR=1.022;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=6;WE=48708236;WS=48708218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr1	48764419	rs1056042	C	T	1663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;PP=1244;ReadPosRankSum=0.992;SC=AGCAGAACTACAGGCCTTTTT;SOR=0.994;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=144;TCF=78;TCR=66;TR=64;WE=48764427;WS=48764409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,69:0.45:153
chr1	48821318	rs147569864	C	CA	368.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.686;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=245;ReadPosRankSum=-0.775;SC=AAATAGTCTTCAAAAAAAAAT;SOR=1.236;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=16;WE=48821326;WS=48821308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr1	48869288	rs3738309	T	A	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=-0.524;SC=CACACCAAGCTCTTCATTCTC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=48869296;WS=48869278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	48902552	rs78784453	G	A	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=7.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.539;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-8.836;NF=16;NR=31;PP=1097;ReadPosRankSum=1.656;SC=AAAAATTCCCGGTCAGGTGTA;SOR=2.088;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=107;TCF=42;TCR=65;TR=47;WE=48902560;WS=48902542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,41:0.39:104
chr1	48902977	rs2261674	G	C	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.32;QD=34.51;SOR=7.054;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	48937691	rs2275309	A	T	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.694;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.088;NF=4;NR=18;PP=401;ReadPosRankSum=-0.301;SC=CCGTGCGGGGAGGGGCGGCGG;SOR=1.528;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=48;TCF=13;TCR=35;TR=22;WE=48937699;WS=48937681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr1	49052569	.	G	A	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.337;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=5;PP=946;ReadPosRankSum=-0.634;SC=CCTCACCTGAGAGTCTCAGCC;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=70;TCF=61;TCR=9;TR=42;WE=49052577;WS=49052559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,43:0.61:71
chr1	49052933	rs2803277	T	C	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=267;ReadPosRankSum=-2.092;SC=TCAGCTTCACTGTCTGAAGAG;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=17;WE=49052941;WS=49052923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr1	49056695	rs7543402	T	C	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.203;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.96;MQRankSum=-1.152;NF=6;NR=40;PP=698;ReadPosRankSum=0.826;SC=AAGTCTGGGCTGTAGAGCTTG;SOR=0.405;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=106;TCF=12;TCR=94;TR=46;WE=49056703;WS=49056685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,46:0.42:109
chr1	49100332	rs319983	C	T	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=768;ReadPosRankSum=0.458;SC=AGCTTCTCACCTGTCAAAATA;SOR=0.711;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=81;TCF=19;TCR=62;TR=36;WE=49100340;WS=49100322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,40:0.46:87
chr1	49113319	rs319953	T	C	2203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.586;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=42;PP=1602;ReadPosRankSum=1.757;SC=TTCATATTGTTGTACGGAGAT;SOR=0.604;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=77;TCR=79;TR=84;WE=49113327;WS=49113309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,90:0.56:161
chr1	49128720	rs320007	C	T	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.494;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=183;ReadPosRankSum=1.873;SC=CATTAAATTTCCATTTAAGAT;SOR=1.085;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=13;WE=49128728;WS=49128710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr1	49193394	rs1385152	G	T	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=0;PP=508;SC=GCCATCTGTCGTCTTTGGAGT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=49193402;WS=49193384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	49224584	rs1128934	G	T	3993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=83;NR=40;PP=2965;SC=CTGCCAAGCCGCAGGAGCAGC;SOR=1.812;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=83;TCR=40;TR=123;WE=49224592;WS=49224574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr1	49332724	rs6703833	A	C	2254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.566;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=16;PP=1754;ReadPosRankSum=0.571;SC=GGGGAGGAGAAGAATCATTCA;SOR=1.212;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=178;TCF=140;TCR=38;TR=88;WE=49332732;WS=49332714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,89:0.50:179
chr1	49332969	rs61785986	A	G	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=41;PP=955;ReadPosRankSum=0.261;SC=TTAGCAGGTCAGGGCGGACAA;SOR=0.934;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=0;TCR=72;TR=41;WE=49332977;WS=49332959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,40:0.56:72
chr1	49511424	rs3934240	A	G	2006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=58;PP=1555;ReadPosRankSum=-1.213;SC=AGTTCTTCCTATGGTCCGGGC;SOR=0.651;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=191;TCF=58;TCR=133;TR=82;WE=49511432;WS=49511414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,85:0.44:195
chr1	49711281	rs7528510	C	T	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=153;ReadPosRankSum=-1.383;SC=TAAGTCTGATCCCCAGCTGTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=8;WE=49711289;WS=49711271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr1	50331725	rs10788920	T	C	2936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=76;PP=2403;SC=GGAGACAAGATTAGAGAAAGA;SOR=4.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=6;TCR=76;TR=82;WE=50331733;WS=50331715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	50572096	rs12138061	C	A	2058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.294;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=47;PP=1597;ReadPosRankSum=0.046;SC=CTGGCAGCCCCACAGTGCTGG;SOR=0.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=148;TCF=59;TCR=89;TR=76;WE=50572104;WS=50572086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,78:0.51:153
chr1	50575675	rs148666401	CTG	C	140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.43;ReadPosRankSum=-1.746;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,10:0.17:58
chr1	50661411	rs2480683	C	T	8180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=154;PP=2965;SC=ACCAGTCCCCCAACCGGCGCT;SOR=1.214;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=255;TCF=101;TCR=154;TR=255;WE=50661419;WS=50661401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr1	50666515	rs2494876	C	T	2376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=12;PP=1912;SC=TTCTGCTTGTCCCCCCAGGTT;SOR=2.995;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=58;TCR=12;TR=70;WE=50666523;WS=50666505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	50884778	rs2746610	G	A	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.17;ReadPosRankSum=-0.843;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr1	50956163	rs143167159	AAAGG	A	7666.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.83;QD=45.91;SOR=6.982;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr1	50956212	rs149582773	C	CAAATACAGTGG	17193.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=159;NR=33;PP=2900;SC=GCTTCAGTATCAAATACAACC;SOR=3.314;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=235;TCF=179;TCR=56;TR=192;WE=50956220;WS=50956202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,330:1.00:330
chr1	50957509	rs1149790	A	T	3453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=106;PP=2926;SC=TTTGACATATAACTTTTTTTT;SOR=6.593;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=109;TCF=2;TCR=107;TR=108;WE=50957517;WS=50957499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	51078089	rs17387761	G	A	1334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.097;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=939;ReadPosRankSum=-1.406;SC=GAGAGCTACTGTATTAATCAG;SOR=0.443;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=71;TCF=40;TCR=31;TR=48;WE=51078097;WS=51078079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,51:0.69:74
chr1	51121039	rs11585301	T	C	2249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.818;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=11;PP=1790;ReadPosRankSum=-1.681;SC=ATTGTGCTTATTATCAAAGCC;SOR=1.310;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=125;TCF=104;TCR=21;TR=77;WE=51121047;WS=51121029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,80:0.62:128
chr1	51180660	rs17384533	A	G	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=183;ReadPosRankSum=0.825;SC=TGTAACAGATATAAAGTAAAA;SOR=0.470;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=15;WE=51180668;WS=51180650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,15:0.28:54
chr1	51767912	rs375305601	GC	G	212.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.73;ReadPosRankSum=1.740;SOR=0.710;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,23:0.19:123
chr1	51767923	rs201705883	G	C	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=174.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.35;ReadPosRankSum=-4.472;SOR=7.427;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,40:0.27:146
chr1	51767928	.	CAGTCTAT	C	342.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.165;ClippingRankSum=0.000;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=136.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.08;ReadPosRankSum=-7.373;SOR=6.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,31:0.19:165
chr1	51808567	rs12072333	C	T	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=133;ReadPosRankSum=0.497;SC=TTAGCGTCTACCTCCCATTCC;SOR=0.446;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=7;WE=51808575;WS=51808557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	51826921	rs17567	T	C	1474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.578;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=39;PP=1100;ReadPosRankSum=-1.207;SC=GATCACAAAATATTTCAGGAT;SOR=0.274;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=152;TCF=40;TCR=112;TR=59;WE=51826929;WS=51826911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,61:0.40:154
chr1	51866769	rs11590272	T	C	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=128;ReadPosRankSum=-0.140;SC=AGGAATGTCATTGACCTTATG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=51866777;WS=51866759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
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chr1	51873951	rs1065754	G	A	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=31;PP=653;ReadPosRankSum=-0.871;SC=ATTCTTCTTCGTAAGTGGAGA;SOR=0.706;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=26;TCR=80;TR=41;WE=51873959;WS=51873941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,42:0.39:109
chr1	51888878	rs72696106	A	G	1405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=8.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.17;ReadPosRankSum=0.860;SOR=1.291;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,62:0.27:228
chr1	51924226	rs6672300	C	T	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.852;NF=12;NR=16;PP=480;ReadPosRankSum=0.274;SC=CTGGCAAACACGGCGAAACGC;SOR=0.616;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=50;TCF=20;TCR=30;TR=28;WE=51924234;WS=51924216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr1	51926909	rs72696156	G	A	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.144;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=710;ReadPosRankSum=-0.457;SC=TATGAGCTAGGAATGGTGGCT;SOR=0.259;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=30;WE=51926917;WS=51926899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
chr1	51929504	rs5774101	TA	T	741.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.481;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.818;NF=0;NR=20;PP=697;ReadPosRankSum=0.151;SC=AGTTAAATAATAAGAGAAAAG;SOR=0.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=20;WE=51929512;WS=51929494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr1	51984984	.	G	A	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.289;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=66;ReadPosRankSum=-0.001;SC=GGGAGCGGCCGCAGGCGAGGC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=51984992;WS=51984974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	52179818	rs56708609	GT	G	619.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=4.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=1.190;QD=7.04;ReadPosRankSum=1.037;SOR=0.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,39:0.44:88
chr1	52211190	rs59914789	C	G	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.568;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=528;ReadPosRankSum=-1.297;SC=AGATTTATTGCAAATTCTCTT;SOR=0.335;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=89;TCF=61;TCR=28;TR=29;WE=52211198;WS=52211180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,30:0.33:91
chr1	52215444	rs112311838	C	CAG	466.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.827;NF=0;NR=13;PP=605;ReadPosRankSum=0.166;SC=GAGGCTGAGACGGGGATCGCT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=13;WE=52215452;WS=52215434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr1	52218109	rs57978189	C	T	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.019;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=28;PP=778;ReadPosRankSum=-0.064;SC=TTCGTGGCCTCGTATCACTAG;SOR=0.468;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=156;TCF=66;TCR=90;TR=50;WE=52218117;WS=52218099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,53:0.33:161
chr1	52218226	rs59146623	A	G	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=192;ReadPosRankSum=-0.997;SC=ATTAGTCTGCATGGGCTGCCA;SOR=0.343;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=12;WE=52218234;WS=52218216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr1	52231560	rs61739207	C	T	1391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=20;PP=1081;ReadPosRankSum=1.504;SC=TCTCCAAATACAGTCCCAGAG;SOR=0.728;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=181;TCF=120;TCR=61;TR=60;WE=52231568;WS=52231550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,65:0.34:191
chr1	52238187	rs72900021	C	T	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.952;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=10;PP=1332;ReadPosRankSum=0.601;SC=GACTCCATCTCAAACAAACAA;SOR=0.437;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=147;TCF=126;TCR=21;TR=59;WE=52238195;WS=52238177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,62:0.40:156
chr1	52242432	rs57902123	CT	C	290.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=1.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.93;ReadPosRankSum=0.417;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr1	52249762	rs58267586	A	G	2133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.155;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=61;PP=1593;ReadPosRankSum=0.183;SC=TGGCTAGACTAGATGTCATTG;SOR=0.598;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=240;TCF=66;TCR=174;TR=86;WE=52249770;WS=52249752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,89:0.36:245
chr1	52264064	rs1770791	A	G	2846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.009;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=65;PP=2170;ReadPosRankSum=1.566;SC=GCATATTCCAAGATTAAAAGC;SOR=0.821;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=273;TCF=127;TCR=146;TR=114;WE=52264072;WS=52264054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,116:0.41:284
chr1	52266350	rs2273198	C	T	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-7.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=38;PP=875;ReadPosRankSum=1.243;SC=TGAGCTGAAACAGTAGCTAAA;SOR=0.793;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=112;TCF=15;TCR=97;TR=43;WE=52266358;WS=52266340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,47:0.41:116
chr1	52279650	rs2982846	T	G	1729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.994;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=36;PP=1319;ReadPosRankSum=-1.870;SC=GAACAATGTCTACACCAGCTT;SOR=0.979;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=205;TCF=106;TCR=99;TR=83;WE=52279658;WS=52279640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,85:0.41:209
chr1	52289220	rs67976949	TGTATTAAGGTCAA	T	349.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=2074;ReadPosRankSum=0.192;SC=TCCTTTACTTTGTATTAAGGT;SOR=0.653;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=7;WE=52289240;WS=52289210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr1	52293570	rs2077725	G	A	2812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.467;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=100;PP=2216;ReadPosRankSum=1.761;SC=TGGCATTTCCGTTTTTGTTCA;SOR=0.553;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=276;TCF=34;TCR=242;TR=115;WE=52293578;WS=52293560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,115:0.41:280
chr1	52293638	rs706495	G	A	3943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=112;PP=2965;SC=TGGAGATTTAGTTCACAATCC;SOR=8.172;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=113;TCF=1;TCR=112;TR=113;WE=52293646;WS=52293628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	52303005	rs12944	G	A	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-5.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=0;PP=742;ReadPosRankSum=1.150;SC=GTCAGAAAATGAGTGTGTTTT;SOR=1.814;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=32;WE=52303013;WS=52302995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,33:0.70:47
chr1	52306063	rs35723519	ATCT	A	1460.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.471;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.427;NF=20;NR=17;PP=1371;ReadPosRankSum=-1.155;SC=CTTCATCATCATCTTCTTCTT;SOR=0.855;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=110;TCF=48;TCR=62;TR=37;WE=52306073;WS=52306053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,42:0.42:99
chr1	52399021	rs2230325	A	G	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.558;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=9;PP=599;ReadPosRankSum=-1.300;SC=GGCCCTTCTCAGTGGGAACAA;SOR=1.078;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=151;TCF=110;TCR=41;TR=45;WE=52399029;WS=52399011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,49:0.31:157
chr1	52402856	rs10888741	T	G	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=2;PP=1164;SC=CTGAGGCCAGTAACCATGTCT;SOR=4.565;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=37;WE=52402864;WS=52402846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	52402956	rs10888742	G	A	6977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=162;NR=48;PP=2965;SC=AATGAATATGGGTCTCATACC;SOR=2.391;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=163;TCR=48;TR=210;WE=52402964;WS=52402946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr1	52489322	rs2783178	G	A	7986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=179;PP=2965;SC=CTGGTACATCGGGCCCTCTGG;SOR=2.225;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=242;TCF=63;TCR=179;TR=241;WE=52489330;WS=52489312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr1	52490418	rs4926906	C	T	1318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=37;PP=1140;SC=TGTCCTACCCCTTGTTAAGTC;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=38;WE=52490426;WS=52490408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	52517412	rs7529324	A	G	8870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=184;NR=87;PP=2965;SC=TTCTTAATGAAAACAGTAGAG;SOR=1.618;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=272;TCF=185;TCR=87;TR=271;WE=52517420;WS=52517402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr1	52703448	rs61753387	A	G	3422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=85;PP=2691;ReadPosRankSum=0.875;SC=AAGAGAAACTATAGTTGGGAT;SOR=0.700;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=244;TCF=85;TCR=159;TR=130;WE=52703456;WS=52703438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,130:0.52:248
chr1	52729432	rs3833531	C	G	2311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=38.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.43;ReadPosRankSum=5.997;SOR=0.018;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,95:0.80:119
chr1	52820226	rs2820334	G	A	8328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=130;NR=132;PP=2965;SC=CATTCAGTGCGTATTGGCTCT;SOR=0.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=263;TCF=130;TCR=133;TR=262;WE=52820234;WS=52820216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr1	52878300	rs4319263	T	A	2211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.277;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.940;NF=51;NR=39;PP=1650;ReadPosRankSum=-1.742;SC=TGAGAAGGTCTGGCACCTGAG;SOR=0.839;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=168;TCF=88;TCR=80;TR=90;WE=52878308;WS=52878280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,94:0.53:179
chr1	52882406	rs6677047	A	G	2070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.509;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=48;PP=1730;ReadPosRankSum=1.218;SC=CTGTGGATATAAGGATATCTG;SOR=1.210;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=184;TCF=85;TCR=99;TR=80;WE=52882414;WS=52882396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,82:0.43:189
chr1	52912122	rs55749039	T	TA	349.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.73;ReadPosRankSum=-0.451;SOR=0.661;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,22:0.36:61
chr1	52947711	rs17107242	T	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.509;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=146;ReadPosRankSum=-0.533;SC=CAATGAAAAATATAAGGAATA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=52947719;WS=52947701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr1	52961339	rs56251001	C	T	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=204;ReadPosRankSum=0.463;SC=TCTAACTGATCTATAGAATAA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=10;WE=52961347;WS=52961329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr1	52991638	rs12123698	C	T	3278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=7.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.127;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=58;PP=2584;ReadPosRankSum=-0.018;SC=CGGCTTTCACCGGTGAATTAG;SOR=0.690;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=302;TCF=148;TCR=154;TR=121;WE=52991646;WS=52991628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,125:0.41:308
chr1	53072454	rs1970951	T	C	3020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.894;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=46;PP=2400;ReadPosRankSum=0.492;SC=CCCACCACTTTAACGTGCTCG;SOR=0.400;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=268;TCF=171;TCR=97;TR=114;WE=53072462;WS=53072444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,118:0.43:273
chr1	53158524	rs200725979	A	C	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=190.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.26;ReadPosRankSum=-2.035;SOR=7.700;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,46:0.33:139
chr1	53192187	rs269298	C	T	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=1;PP=82;SC=CTGCTACGCTCCTAGCTTGAG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=53192195;WS=53192177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	53237526	rs1571979	G	A	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=559;ReadPosRankSum=-1.080;SC=ATGAATGTCTGTAATATATGG;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=0;TCR=59;TR=27;WE=53237534;WS=53237516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,27:0.44:62
chr1	53245472	rs9661082	A	T	2297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-5.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.514;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=14;PP=1848;ReadPosRankSum=-0.606;SC=ACACATGATAATTAGATAGAG;SOR=1.006;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=182;TCF=149;TCR=33;TR=89;WE=53245480;WS=53245462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,92:0.50:185
chr1	53250650	rs6588443	G	A	2706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.053;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=73;PP=2180;ReadPosRankSum=-0.868;SC=TTGCTGCAGGGATGCCTGTCC;SOR=1.120;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=175;TCF=49;TCR=126;TR=97;WE=53250658;WS=53250640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,99:0.56:178
chr1	53271225	rs487453	T	C	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=450;ReadPosRankSum=1.179;SC=ATTTGTGGGTTGGGTGCAGTG;SOR=0.724;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=28;WE=53271233;WS=53271215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr1	53308665	rs532242	C	G	1993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.914;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=56;PP=1478;ReadPosRankSum=0.876;SC=GGGGTGCGGGCGGCGACGCGG;SOR=0.888;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=23;TCR=89;TR=70;WE=53308673;WS=53308655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,74:0.64:116
chr1	53320274	rs480299	G	T	2182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=44;PP=1660;ReadPosRankSum=0.322;SC=AAGTAGCCGAGCGATTTCTCA;SOR=0.689;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=157;TCF=74;TCR=83;TR=83;WE=53320282;WS=53320264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,85:0.54:158
chr1	53323492	rs10788945	C	A	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=477;ReadPosRankSum=0.510;SC=ATAGACCAGACTTTTTACTAG;SOR=0.936;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=73;TCF=7;TCR=66;TR=26;WE=53323500;WS=53323482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,29:0.37:78
chr1	53333116	rs557847	A	G	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-7.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=1;PP=730;ReadPosRankSum=0.704;SC=GACTGTTTTCATTATAGGATT;SOR=1.209;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=89;TCF=86;TCR=3;TR=43;WE=53333124;WS=53333106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,46:0.50:92
chr1	53364976	rs576891	A	G	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.733;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=42;PP=974;ReadPosRankSum=0.728;SC=GCTTTGTTTTAAAGGAGGGAG;SOR=1.290;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=112;TCF=21;TCR=91;TR=49;WE=53364984;WS=53364966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,51:0.44:116
chr1	53387379	rs7552139	G	C	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=311;ReadPosRankSum=-1.099;SC=GTGCTTCTCCGGCCCTGCACC;SOR=2.124;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=18;WE=53387387;WS=53387369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr1	53535478	rs1288386	G	A	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=161;ReadPosRankSum=0.135;SC=CACAGGTTCCGTCAGCCCTGG;SOR=0.795;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=13;WE=53535486;WS=53535468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr1	53537266	rs1769316	G	A	5201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=425;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.222;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=134;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.948;SC=GGCTGGAGACGCTGAACCTGC;SOR=0.999;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=415;TCF=156;TCR=259;TR=204;WE=53537274;WS=53537256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,208:0.50:418
chr1	53543112	rs946590	C	G	3165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=88;PP=2611;SC=GCCCACATGGCCACAGGTGCT;SOR=5.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=92;TCF=4;TCR=88;TR=92;WE=53543120;WS=53543102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	53544439	rs1288388	G	A	11386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=244;PP=2965;SC=TCACCAGCCCGCAGGTGCACC;SOR=1.799;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=357;TCF=111;TCR=246;TR=355;WE=53544447;WS=53544429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,368:1.00:368
chr1	53544597	rs1288389	T	C	1429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=43;PP=1086;SC=GGGGCGCTGGTGGGCATGGCT;SOR=3.788;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=50;TCF=6;TCR=44;TR=48;WE=53544605;WS=53544587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	53553702	rs1288400	A	G	1701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=18;PP=1341;SC=TCTCCAGCTCACTGATCTGGA;SOR=1.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=42;TCR=18;TR=60;WE=53553710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	53553754	rs1288401	T	C	2357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=21;PP=1750;SC=CTCCTCATCCTGCTCCACTTG;SOR=1.734;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=52;TCR=21;TR=72;WE=53553762;WS=53553744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	53555783	rs1288403	A	C	2556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=60;PP=2099;SC=CACAGTCCTGAAGCCCCATGG;SOR=2.524;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=15;TCR=60;TR=75;WE=53555791;WS=53555773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	53558270	rs1288406	A	G	5550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=141;NR=50;PP=2965;SC=GCAGGATGCCACGGATGAAGA;SOR=2.242;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=191;TCF=141;TCR=50;TR=191;WE=53558278;WS=53558260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr1	53559310	rs11206091	T	C	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=40;PP=1158;SC=ATGGCTGGCTTCCCAGCAGCC;SOR=4.615;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=43;WE=53559318;WS=53559300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	53571288	rs1288422	C	G	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=4;PP=681;SC=CCACCTCCAGCAGACAGCGTG;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=24;WE=53571296;WS=53571278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	53574123	rs1769289	C	T	784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=664;SC=CCTTCCTTAACAGAAGTCCTA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=25;WE=53574131;WS=53574113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	53676448	rs1799821	G	A	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.817;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=18;PP=1234;ReadPosRankSum=1.685;SC=CTCTACTGCCGTCCACTTTGA;SOR=0.533;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=93;TCF=64;TCR=29;TR=51;WE=53676456;WS=53676438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,51:0.53:96
chr1	53683921	rs12140585	C	G	1441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.037;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=40;PP=1073;ReadPosRankSum=-0.052;SC=TCCATACCCTCGCCCCAGCCA;SOR=1.212;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=115;TCF=32;TCR=83;TR=52;WE=53683929;WS=53683911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,56:0.46:121
chr1	53684324	rs3736118	A	G	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=400;ReadPosRankSum=0.347;SC=TGAGGAAAATAAAAAAAGGGC;SOR=0.368;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=18;WE=53684332;WS=53684314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr1	53684525	rs436887	C	G	1334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.473;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=13;PP=1066;ReadPosRankSum=-0.081;SC=GGGGGTTGGGCGGGGAACAGT;SOR=1.293;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=90;TCF=62;TCR=28;TR=48;WE=53684533;WS=53684515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,48:0.53:90
chr1	53686383	rs1679913	C	G	208.89	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.6715;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=142;ReadPosRankSum=2.672;SC=TTCTGCGCGCCGCTGCTCGCC;SOR=0.293;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=11;WE=53686391;WS=53686373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr1	53694388	rs2275087	T	C	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=121;ReadPosRankSum=-0.574;SC=TCCTCAAAAATAATTTGGGGT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=53694396;WS=53694378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr1	53712727	rs5174	C	T	6219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=127;PP=2965;SC=TAATGCCACTCGCTGGGGAGA;SOR=1.562;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=61;TCR=128;TR=188;WE=53712735;WS=53712717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr1	53716416	rs3737983	G	A	11060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=140;NR=205;PP=2965;SC=GCTCATCTTCGTCTTCTTCTT;SOR=1.144;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=346;TCF=141;TCR=205;TR=345;WE=53716424;WS=53716406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,365:1.00:365
chr1	53723190	rs869987	G	T	2016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=51;PP=1632;SC=GTTGCCTAAGGTATTGCCTCT;SOR=4.103;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=6;TCR=51;TR=57;WE=53723198;WS=53723180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	53732315	rs2297660	G	T	1873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=51;PP=1610;SC=ATGGGCTCTTGCCAGCTGTCA;SOR=3.990;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=6;TCR=51;TR=57;WE=53732323;WS=53732305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	53736613	rs7542607	A	G	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=498;SC=GTGTGCGCACATGTACACGCC;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=53736621;WS=53736609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	53738183	rs7546246	A	G	4436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=122;NR=8;PP=2965;SC=GGCCATGCATATAGCTGGTCT;SOR=5.203;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=123;TCR=8;TR=130;WE=53738191;WS=53738173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	53742506	rs56300220	A	G	1486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=35;PP=1258;SC=CGGGGCCCGGACGGCCGCAGA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=46;WE=53742514;WS=53742496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	53755151	rs12035577	T	C	1100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.831;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=11;PP=878;ReadPosRankSum=0.348;SC=TTCAACTGGTTACCTCTCCTG;SOR=0.850;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=116;TCF=86;TCR=30;TR=44;WE=53755159;WS=53755141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,44:0.38:117
chr1	53792651	rs3820198	A	C	3199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.179;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=90;PP=2500;ReadPosRankSum=2.300;SC=CCTTTTCGCAATCCTTGGCCG;SOR=0.374;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=226;TCF=43;TCR=183;TR=116;WE=53792659;WS=53792641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,120:0.52:230
chr1	53793511	rs4926972	T	C	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.654;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.052;NF=7;NR=11;PP=236;ReadPosRankSum=-0.977;SC=ATGCTGGAGCTGCAGCAGCAG;SOR=0.257;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=18;WE=53793521;WS=53793501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr1	53930551	rs943514	G	A	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.454;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=506;ReadPosRankSum=-0.232;SC=CAGCTTCAGCGAGAGCCAGGG;SOR=0.368;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=29;WE=53930559;WS=53930541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr1	53974987	rs10749691	G	T	1500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=28;PP=1115;SC=CAGGGGCCGCGTTCACAAAGG;SOR=1.464;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=43;WE=53974995;WS=53974977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	53990321	rs541224	C	T	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=600;ReadPosRankSum=1.672;SC=AACGGACGAACGGATGGACGA;SOR=0.277;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=48;TCF=47;TCR=1;TR=26;WE=53990329;WS=53990311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr1	54060016	rs35227000	G	C	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=35;PP=1429;ReadPosRankSum=-0.027;SC=CACCCTGCCTGCCAGGCCCAG;SOR=0.501;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=127;TCF=49;TCR=78;TR=60;WE=54060024;WS=54060006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,61:0.48:128
chr1	54060248	rs4307514	T	C	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.299;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=24;PP=921;ReadPosRankSum=-0.420;SC=AGATCTCCCGTCAGAGGGGGG;SOR=0.633;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=110;TCF=58;TCR=52;TR=45;WE=54060256;WS=54060238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,48:0.43:111
chr1	54252939	rs370214243	GA	G	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=2.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQRankSum=1.973;QD=1.61;ReadPosRankSum=0.445;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,9:0.21:42
chr1	54331763	rs1883453	A	G	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=0;PP=1400;SC=GTGAGCCAACATGCCCAGCCC;SOR=8.121;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=59;TCR=0;TR=59;WE=54331771;WS=54331753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	54344282	rs2272928	C	A	4092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=26;PP=2965;SC=TCTCCTTTACCCGTAAAAGGA;SOR=2.629;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=124;TCF=98;TCR=26;TR=123;WE=54344290;WS=54344272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	54370264	rs2294511	A	T	1921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=1;PP=1669;SC=AGAATTGAACATAGGAGTGAA;SOR=6.666;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=57;TCF=56;TCR=1;TR=56;WE=54370272;WS=54370254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	54395673	rs56847995	CA	C	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.99;ReadPosRankSum=-1.720;SOR=0.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr1	54483694	rs34764952	C	T	2614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=15;PP=2150;SC=GGACAGCTCTCACCTGGGGAC;SOR=3.056;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=64;TCR=15;TR=79;WE=54483702;WS=54483684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	54561916	rs7555099	C	T	5565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=141;NR=29;PP=2965;SC=TTAATCCTTACGCAATGTAAG;SOR=2.998;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=141;TCR=30;TR=170;WE=54561924;WS=54561906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr1	54605319	rs36013100	G	GC	5395.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=57;PP=2983;SC=GACCATTCATGGGGGGGGCAG;SOR=1.016;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=126;TCF=69;TCR=57;TR=119;WE=54605327;WS=54605309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	54606804	rs3766465	C	T	4814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=94;NR=49;PP=2965;SC=CCACGGCCTCCGATGTTGAAG;SOR=1.594;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=95;TCR=49;TR=143;WE=54606812;WS=54606794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr1	54607051	rs671103	A	G	8131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=118;NR=145;PP=2965;SC=AGTTGTTGGGATACTCAGGAC;SOR=0.927;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=263;TCF=118;TCR=145;TR=263;WE=54607059;WS=54607041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr1	54607157	rs671539	G	A	4009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=110;PP=2965;SC=GTGGCTCCCAGTTTCCTCCCT;SOR=2.904;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=24;TCR=110;TR=134;WE=54607165;WS=54607147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	54618435	rs7528345	A	T	9331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=199;NR=81;PP=2965;SC=CTGGCTTCCCATGTAGAAACT;SOR=1.908;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=280;TCF=199;TCR=81;TR=280;WE=54618443;WS=54618425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr1	54636977	rs10493175	T	C	1730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.272;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=36;PP=1350;ReadPosRankSum=1.298;SC=GGCGGTGGCATACAAAAAGTC;SOR=0.814;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=148;TCF=69;TCR=79;TR=65;WE=54636985;WS=54636967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,68:0.44:153
chr1	54637167	rs625643	T	C	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=34;PP=635;ReadPosRankSum=0.259;SC=GAAGTGACGTTGGTAAACATG;SOR=1.238;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=0;TCR=55;TR=34;WE=54637175;WS=54637157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,35:0.61:57
chr1	54681920	rs13571	G	C	3775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=68;PP=2965;SC=GACCTGGACTGTAACGAGGGT;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=48;TCR=68;TR=116;WE=54681928;WS=54681910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	54686374	rs612711	T	C	2485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.258;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=49;PP=1796;ReadPosRankSum=-2.516;SC=GCAGCGGAACTTGAGGGCCTC;SOR=0.812;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=217;TCF=106;TCR=111;TR=91;WE=54686382;WS=54686364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,101:0.44:229
chr1	54686464	rs613158	C	T	2918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.617;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=47;PP=2291;ReadPosRankSum=-0.884;SC=GAGAGTGCTGCGCCGGGTCAT;SOR=0.943;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=222;TCF=110;TCR=112;TR=115;WE=54686472;WS=54686454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,115:0.51:224
chr1	54690954	rs3088379	T	C	3142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=63;PP=2437;ReadPosRankSum=0.483;SC=GAACACAGAATTTGCAGGCCC;SOR=0.683;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=263;TCF=120;TCR=143;TR=117;WE=54690962;WS=54690944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,121:0.45:267
chr1	54694214	rs2297026	G	A	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=499;ReadPosRankSum=-0.732;SC=GTCTCCCCTCGTCCTGGGCTC;SOR=0.307;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=24;WE=54694222;WS=54694204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr1	54706733	rs2297027	A	G	2315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.491;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=72;PP=1864;ReadPosRankSum=0.288;SC=TGCTCGCCCCAGGCCCAGCCG;SOR=1.124;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=210;TCF=54;TCR=156;TR=92;WE=54706741;WS=54706723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,96:0.44:218
chr1	54871566	.	ACCGC	A	107.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.524;NF=4;NR=0;PP=117;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CCTGCCTCCCACCGCCCGCCC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=54871577;WS=54871556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr1	54871709	.	T	TCGCCGC	660.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=0.693;QD=33.04;ReadPosRankSum=-0.175;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr1	55014099	rs299874	C	T	1604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=36;PP=1320;SC=TTAACTCAGACGCTCTGCATC;SOR=1.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=52;WE=55014107;WS=55014089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	55014160	rs299872	C	T	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=21;PP=633;SC=AAGGAGAAATCGCAGAACCCC;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=55014168;WS=55014150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	55066759	rs1655534	T	C	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=119;ReadPosRankSum=-0.623;SC=AGTGTGTGTGTGCATACATGT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=55066767;WS=55066752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	55066789	.	CAT	C	294	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=8;NR=0;PP=294;QD=39.375;SC=TGTGTGCATACATGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=8;WE=55066798;WS=55066779;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr1	55066813	.	C	CAT	839	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MMLQ=28;MQ=60.32;NF=16;NR=0;PP=839;QD=53.25;SC=TGTGTGCATACGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=16;WE=55066821;WS=55066803;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,16:0.59:27
chr1	55069986	rs746503	T	C	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=276;ReadPosRankSum=0.945;SC=AGGAAGGGGGTGGGGTAGTGG;SOR=1.127;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=14;WE=55069994;WS=55069976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr1	55072726	rs1616691	T	C	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=456;ReadPosRankSum=1.062;SC=GGCACTGCAGTGTGGCAGGGC;SOR=0.465;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=20;WE=55072734;WS=55072716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr1	55074840	rs1617287	T	A	2343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.045;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=77;PP=1949;ReadPosRankSum=-0.307;SC=CCCCAAGGACTCACATACAGT;SOR=2.337;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=118;TCF=9;TCR=109;TR=81;WE=55074848;WS=55074830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,82:0.70:117
chr1	55074922	rs2289016	G	A	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.973;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=367;ReadPosRankSum=0.179;SC=AGGTCCGCTGGCCCACCACCC;SOR=0.504;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=47;TCR=30;TR=23;WE=55074930;WS=55074912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,23:0.31:75
chr1	55075452	rs1368883	G	A	1935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=39;PP=1493;ReadPosRankSum=-0.646;SC=TGCGGGCTCCGCTATTTGCAA;SOR=0.665;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=105;TCF=45;TCR=60;TR=68;WE=55075460;WS=55075442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,72:0.65:111
chr1	55078046	rs1655528	T	C	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=0;PP=583;SC=GCATGAGCACTGGCAGGGGTT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=55078054;WS=55078036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	55080612	rs147772009	GGTGT	G,GGTGTGTGTGT	1289.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=2.534;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.065;NF=6,6;NR=25,25;PP=2300,1754;ReadPosRankSum=1.576;SC=AAGCAGAGCGGGTGTGTGTGT;SOR=1.714;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=56;TCF=10;TCR=46;TR=31,31;WE=55080643;WS=55080602;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.44,0.49:43
chr1	55080629	rs1702015	A	G	1484.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=2.611;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.20;MQRankSum=0.064;QD=33.74;ReadPosRankSum=0.070;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,41:0.93:44
chr1	55080629	.	ATGTGCG	GTGTGCA,GTGTGCG	1740	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=60.22;NF=4,7;NR=17,32;PP=1740,1234;QD=85.4032321363;SC=GTGTGTGTGCATGTGCGTGCA;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=21,39;WE=55080643;WS=55080602;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.54:39
chr1	55080635	rs1655525	G	A	934.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=5.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQRankSum=-1.357;QD=21.24;ReadPosRankSum=-0.107;SOR=0.175;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr1	55081814	.	A	T	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.027;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.790;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=218;ReadPosRankSum=1.283;SC=GCCCTTCTACATTGACGTCAG;SOR=1.284;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=54;TCF=23;TCR=31;TR=14;WE=55081822;WS=55081804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,13:0.22:58
chr1	55085499	rs11206396	T	C	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.198;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=126;ReadPosRankSum=-0.073;SC=TCTCTATCCCTTGCCCTGGCC;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=55085507;WS=55085489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr1	55085562	rs114883650	C	G	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.269;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=248;ReadPosRankSum=-0.925;SC=TCATGGCTTTCTTGCTGTTGG;SOR=0.276;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=12;WE=55085570;WS=55085552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr1	55085608	rs115445569	C	T	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.784;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=317;ReadPosRankSum=0.709;SC=GGCATCTCGCCGGCTGATCTG;SOR=0.324;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=16;WE=55085616;WS=55085598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr1	55089163	rs114566617	G	A	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.483;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=456;ReadPosRankSum=-1.482;SC=GGAGCTCCCAGCAGCACCTAA;SOR=1.555;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=68;TCF=15;TCR=53;TR=24;WE=55089171;WS=55089153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,24:0.33:72
chr1	55100328	rs6588520	T	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.351;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.046;NF=6;NR=1;PP=89;ReadPosRankSum=0.068;SC=AAAATAATAATTTGGGGTAGA;SOR=0.037;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=7;WE=55100336;WS=55100318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr1	55118566	rs1655520	C	G	3259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=35;PP=2522;SC=TGGAGAGAAGCGGGCACTGGC;SOR=1.454;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=62;TCR=35;TR=97;WE=55118574;WS=55118556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	55119515	rs1655519	T	G	6258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=95;PP=2965;SC=TGGCTCCAGCTATGGTATCAG;SOR=0.782;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=108;TCR=95;TR=202;WE=55119523;WS=55119505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr1	55119546	rs1655518	A	G	7016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=102;NR=116;PP=2965;SC=AGCACCCATGAGCCCAACTCC;SOR=0.825;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=218;TCF=102;TCR=116;TR=218;WE=55119554;WS=55119536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr1	55130946	rs6703113	G	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.121;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=168;ReadPosRankSum=0.198;SC=AGCTGACTGTGCTGGGATACT;SOR=0.064;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=12;WE=55130954;WS=55130936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr1	55130976	rs200141664	AC	A	125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=135;ReadPosRankSum=1.591;SC=CCAACCCCCTACCCCCCAGCC;SOR=0.569;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=7;WE=55130984;WS=55130966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr1	55134379	rs627095	C	T	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=325;ReadPosRankSum=1.970;SC=CCACCCCAAGCTCCCCTTGTG;SOR=0.295;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=16;WE=55134387;WS=55134369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,16:0.36:44
chr1	55136067	rs2251719	T	G	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.392;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=323;ReadPosRankSum=-1.286;SC=CACTTGAGGGTATGCTGGCTG;SOR=2.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=46;TCR=4;TR=17;WE=55136075;WS=55136058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,16:0.33:49
chr1	55136356	rs627226	C	T	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.965;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=278;ReadPosRankSum=1.865;SC=CCCCACCCCTCGCCCGGTGCC;SOR=3.219;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=14;WE=55136364;WS=55136346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr1	55139741	rs570218	A	G	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.481;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=67;ReadPosRankSum=-1.396;SC=CTCATCCTTCACATTGGGGAT;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=6;WE=55139749;WS=55139731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,6:0.19:32
chr1	55139912	rs12122650	T	G	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=21;ReadPosRankSum=1.001;SC=AGCCTTGGCATTAAGGCACTG;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=3;WE=55139920;WS=55139902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
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chr1	55166842	rs1065173	C	T	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=735;ReadPosRankSum=-0.816;SC=CCCTCCTGCCCTCCATGGTGA;SOR=0.489;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=30;WE=55166850;WS=55166832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,30:0.77:39
chr1	55167773	rs646356	T	A	1667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=32;PP=1354;SC=GCACGAGAGGTCGTGCGCTCC;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=21;TCR=32;TR=53;WE=55167781;WS=55167763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	55174819	rs12028701	C	T	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.942;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=546;ReadPosRankSum=2.115;SC=CAGTGGGTAACAGGGAAAGGG;SOR=0.855;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=84;TCF=24;TCR=60;TR=31;WE=55174827;WS=55174809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,31:0.36:85
chr1	55174882	rs145713883	TTTTG	T	287.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.953;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=328;ReadPosRankSum=-0.067;SC=TGTACTAGTTTTTTGTTTGTT;SOR=3.076;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=8;WE=55174893;WS=55174872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr1	55182300	rs1147990	T	A	1879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=32;PP=1505;SC=CCTATTTATGTCGAGAGCGCC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=31;TCR=32;TR=63;WE=55182308;WS=55182290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	55197149	rs3815226	T	C	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=0.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.22;ReadPosRankSum=-1.270;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:144,51:0.26:195
chr1	55199420	.	ATTTTTTTT	A	631	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=20;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=18;MQ=59.2;NF=0;NR=5;PP=631;QD=126.8;SC=TATGGAATTAATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=5;WE=55199435;WS=55199410;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:13,5:0.28:18
chr1	55224131	rs2270004	T	C	5084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.846;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=64;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.690;SC=CCCTAGCTTGTTGAACAGGCT;SOR=0.842;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=93;TCR=65;TR=157;WE=55224139;WS=55224121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,159:0.99:160
chr1	55224751	rs11577368	C	A	4581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.221;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=92;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.276;SC=AGTGGTGAAACCTGCAAGGAA;SOR=1.101;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=57;TCR=92;TR=148;WE=55224759;WS=55224741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,147:0.99:148
chr1	55251689	rs586462	T	C	1780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=4;PP=1487;SC=GCCAGTTGAGTTCTGGATCTC;SOR=4.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=48;TCR=4;TR=52;WE=55251697;WS=55251679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	55253575	rs665118	T	C	1268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=33;PP=1042;SC=TGCCCAGGCCTGTGGTGGTGG;SOR=2.409;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=44;WE=55253583;WS=55253565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	55266797	rs671108	G	C	3152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.205;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=90;PP=2268;ReadPosRankSum=1.102;SC=TCGTCGATGAGGGCGTCTAGA;SOR=0.593;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=212;TCF=69;TCR=143;TR=135;WE=55266805;WS=55266787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,138:0.65:213
chr1	55266845	rs1147984	C	T	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.088;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=33;PP=697;ReadPosRankSum=-0.906;SC=ATGACTGCTCCCTCTGCTCCC;SOR=1.378;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=121;TCF=17;TCR=104;TR=36;WE=55266853;WS=55266835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,36:0.29:123
chr1	55271774	rs757581	A	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=2.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.58;ReadPosRankSum=-0.059;SOR=0.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,23:0.40:58
chr1	55273422	rs671022	A	T	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.588;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=14;PP=727;ReadPosRankSum=-0.892;SC=TGTCCATTGCAGCTGCTCTGT;SOR=0.198;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=29;WE=55273430;WS=55273412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr1	55273580	rs9782980	G	T	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.289;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=626;ReadPosRankSum=-0.691;SC=GCTGGGCCCCGGCTCCTACAA;SOR=1.480;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=122;TCF=64;TCR=58;TR=39;WE=55273588;WS=55273570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,42:0.34:125
chr1	55277430	rs10788986	T	A	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=319;ReadPosRankSum=-0.916;SC=CAAGGAGTGGTTCTGACAGCC;SOR=0.874;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=15;WE=55277438;WS=55277420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr1	55277599	rs600499	T	C	4873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=58;PP=2965;SC=CCCCCGGCCTTATCAGGTACC;SOR=1.134;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=89;TCR=58;TR=147;WE=55277607;WS=55277589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr1	55279345	rs149536795	CCCGGCCT	C	547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=0;PP=460;SC=TTGAGGCTGGCCCGGCCTCCG;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=8;WE=55279359;WS=55279335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	55279486	rs200062276	G	GA	872.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.250;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=621;ReadPosRankSum=0.362;SC=CTTTTTCTTAGAAAAAAAAGC;SOR=0.412;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=75;TCF=52;TCR=23;TR=34;WE=55279494;WS=55279476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,38:0.61:62
chr1	55282556	rs733168	A	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=136;ReadPosRankSum=-0.099;SC=ACACAATTCAACTCATAACAG;SOR=0.437;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=9;WE=55282564;WS=55282546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,9:0.25:36
chr1	55307501	rs41297871	A	G	2423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.052;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=42;PP=1842;ReadPosRankSum=-0.468;SC=TTACTAAGGGAAAGTGCCCTC;SOR=0.528;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=135;TCF=69;TCR=66;TR=82;WE=55307509;WS=55307491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,89:0.62:143
chr1	55307640	rs59138759	C	T	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=496;ReadPosRankSum=-1.167;SC=AGTGGGGTGTCTTAGAGAAAG;SOR=0.551;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=22;WE=55307648;WS=55307630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr1	55318108	rs667222	C	T	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=26;PP=602;ReadPosRankSum=0.771;SC=ACACGGAACGCGAGGCGTGAG;SOR=0.582;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=28;WE=55318116;WS=55318098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr1	55319008	rs631749	T	C	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=391;ReadPosRankSum=0.112;SC=GTTGATAGGCTTGGGGCTCCT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=18;WE=55319016;WS=55318998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr1	55319902	rs718265	A	G	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.955;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=17;PP=574;ReadPosRankSum=-1.203;SC=CAAAGGGGATAATGTCCTGGA;SOR=0.543;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=108;TCF=41;TCR=67;TR=35;WE=55319910;WS=55319892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,36:0.33:109
chr1	55330966	rs611057	T	C	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=3;PP=560;SC=TACAGAAACCTAAGCCTCACC;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=55330974;WS=55330956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	55336950	rs608458	C	G	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=249;ReadPosRankSum=-1.082;SC=GGTCAGGATACGGGAACCGGC;SOR=0.299;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=13;WE=55336958;WS=55336940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr1	55446664	rs2253467	G	C	2187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.58;SOR=5.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	55446671	rs2253466	C	T	2255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.38;SOR=5.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	55446697	rs2253465	G	A	2059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=6;PP=1654;SC=ACCTGCGCCCGGCTCCCTGCG;SOR=4.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=55;TCR=6;TR=61;WE=55446705;WS=55446687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	55457710	rs2500326	G	A	3431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=79;PP=2840;SC=CCGTTTCTGCGGAGACGACAC;SOR=2.618;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=20;TCR=79;TR=99;WE=55457718;WS=55457700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	55457815	rs2495513	C	T	1216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=30;PP=967;SC=ACAAAAATGCCGTGCCTTCTC;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=55457823;WS=55457805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	55464743	rs2500340	T	C	1556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=2;PP=1366;SC=CTTGAAGCCTTGAGTTGCAGC;SOR=5.376;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=46;WE=55464751;WS=55464733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	55464790	rs2500341	C	G	2666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=8;PP=2301;SC=AAGCCTGTCTCGGTGTTTAGG;SOR=4.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=69;TCR=8;TR=77;WE=55464798;WS=55464780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	55505732	rs2495482	A	G	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=14;PP=433;SC=GGGTGTAGGGATGGGAGGCCG;SOR=2.093;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=55505740;WS=55505722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	55516781	rs599037	G	T	3004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=23;PP=2302;SC=GGGAATTTGTGACCGAAGCCA;SOR=2.135;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=67;TCR=23;TR=90;WE=55516789;WS=55516771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	55517861	rs613855	C	G	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=0;PP=889;SC=TTCACCAGTGCCTGGGATGTG;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=55517869;WS=55517851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	55517883	rs624612	C	G	1422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=2;PP=1129;SC=TCTGTAGTTTCTGTGTGTTAA;SOR=5.186;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=38;WE=55517891;WS=55517873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	55518166	rs625619	G	A	1991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=32;PP=1657;SC=ACCCCAGAGCGTTGCAGCTGT;SOR=0.865;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=60;TCF=28;TCR=32;TR=60;WE=55518174;WS=55518156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	55518190	rs45597632	AC	A	1362.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=17;PP=972;SC=CCTGGGTTGCACCCCCCCCAG;SOR=1.203;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=54;TCF=28;TCR=26;TR=43;WE=55518198;WS=55518180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	55518528	rs494198	C	A	1089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=29;PP=850;SC=GTGGCTTGGGCTGGGCCCAGG;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=34;WE=55518536;WS=55518518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	55521899	rs201349983	GGGGCGGA	G	144.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.24;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	55523033	rs509504	A	G	3271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=49;PP=2630;SC=CCAATGCCCAAGACCAGCCGG;SOR=0.820;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=45;TCR=49;TR=94;WE=55523041;WS=55523023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	55524116	rs585131	C	T	46.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=2;NR=0;PP=29;SC=CTAAAGATTTCTGTGGAGGTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=55524124;WS=55524106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	55524237	rs562556	G	A	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=1;PP=22;SC=GGCCACAGCCGTCGCCCGCTG;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=55524245;WS=55524227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	55525400	rs483462	G	A	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=3;PP=77;SC=CCCACTGCCCGCGAGGCTTGG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=55525408;WS=55525390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	55527323	rs630431	G	A	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=46;PP=1325;SC=ATACCGCCATGCATCAGGGTG;SOR=5.464;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=48;WE=55527331;WS=55527313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	55529187	rs505151	G	A	1978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=37;PP=1607;SC=ACCAGCGAAGGGGCCGTGACA;SOR=1.392;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=21;TCR=37;TR=58;WE=55529195;WS=55529177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	55538385	rs654674	T	C	2069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=5;PP=1657;SC=TATTCAGTTCTAGAGATTTTT;SOR=4.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=54;TCR=5;TR=59;WE=55538393;WS=55538375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	55541174	rs487230	A	G	1348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=26;PP=1058;SC=GACTCGCTCTACTTGTATAGG;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=42;WE=55541182;WS=55541164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	55546895	rs683880	T	C	1912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=0;PP=1580;SC=TAGCAAGTAGTCGAATGAGAA;SOR=8.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=54;TCR=0;TR=54;WE=55546903;WS=55546885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	55555285	rs548852	G	A	1157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=1;PP=929;SC=TTAATTAAAAGACTCCAACAC;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=33;WE=55555293;WS=55555275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	55557859	rs34673217	A	ATT	806.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=626;SC=ATTATTACACAGTTACGAACT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=13;WE=55557872;WS=55557849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	55557864	rs3736992	C	T	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=320;SC=TACACAGTTACGAACTAAATT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=55557872;WS=55557849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	55558661	rs585203	A	G	336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=353;SC=ATTTCTAATGATATGTAAAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=55558669;WS=55558651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	55560796	rs503495	T	C	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=505;SC=GGATTTATTTTCTTTTTGGAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=55560804;WS=55560787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	55562125	rs580485	G	T	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=541;SC=TATAGAAAACGATAAATAAAA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=55562133;WS=55562115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	55566411	rs67540253	TTAGTC	T	2291.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=0;PP=2256;SC=TGGCAAGAGATTAGTCTAAAG;SOR=7.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=41;WE=55566423;WS=55566401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	55567143	rs1165282	T	C	1484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=1;PP=1272;SC=ACTAAAGAATTGCAAGTTATG;SOR=6.138;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=42;WE=55567151;WS=55567133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	55567410	rs615652	A	G	4919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=94;PP=2965;SC=AGCAGAGGAGAAGAATGAGCA;SOR=1.658;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=140;TCF=45;TCR=95;TR=139;WE=55567418;WS=55567400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr1	55571953	rs41301092	T	C	1277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=33;PP=953;ReadPosRankSum=0.567;SC=TAGAGCATAATATTCATGTTG;SOR=0.849;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=58;TCF=11;TCR=47;TR=40;WE=55571961;WS=55571943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,45:0.70:64
chr1	55572867	rs594226	G	A	1985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=9;PP=1397;SC=GGCAATAACCGAGCACTGAAG;SOR=3.187;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=47;TCR=9;TR=56;WE=55572875;WS=55572857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	55575670	rs534741	A	C	292.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=212;SC=ATGACTGGTTATGTAACAGAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=55575678;WS=55575660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	55612551	rs79090253	G	T	2483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.719;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=6;PP=2061;ReadPosRankSum=1.134;SC=CAGAAAAAGTGAAATATTTAA;SOR=0.337;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=122;TCF=115;TCR=7;TR=86;WE=55612559;WS=55612541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,87:0.70:124
chr1	55614036	rs34030121	CAT	C	1641.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=0;PP=1551;SC=CATCAATAAACATAAAGATAG;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=34;WE=55614045;WS=55614026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	55619422	rs1165230	G	A	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=400;SC=TAGACATCAAGTTTAATATGA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=55619430;WS=55619415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	55638075	rs1165222	G	A	4140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=87;NR=38;PP=2965;SC=CAGGAGACCAGTGGGAATTGG;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=87;TCR=38;TR=125;WE=55638083;WS=55638065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	55643837	rs11350615	TA	T	1876.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=54;PP=2141;SC=AAAAAGCAAATAAAACTAATT;SOR=6.770;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=59;TCF=1;TCR=58;TR=55;WE=55643845;WS=55643827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	57185818	rs857141	A	G	1794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=13;PP=1511;SC=AGAATGAAATATTATGAAAGA;SOR=2.093;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=40;TCR=13;TR=52;WE=57185826;WS=57185808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	57347030	rs1754519	A	G	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.329;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.960;NF=19;NR=2;PP=292;ReadPosRankSum=-0.130;SC=AACGTGTGCCATGGTGGTTTA;SOR=0.250;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=46;TCF=43;TCR=3;TR=21;WE=57347038;WS=57347020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr1	57347323	rs11804514	G	T	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=218;ReadPosRankSum=-0.721;SC=TCTGAACAGAGGGGCTCTGAG;SOR=0.260;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=12;WE=57347331;WS=57347313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr1	57349119	rs199851044	T	C	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.002;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=0;PP=789;ReadPosRankSum=1.267;SC=TGGCTCTATGTGCACAAAGCT;SOR=1.974;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=85;TCF=83;TCR=2;TR=37;WE=57349127;WS=57349109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,38:0.44:86
chr1	57351488	rs856847	G	C	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=125;ReadPosRankSum=-2.000;SC=CTCCCAAAATGCTGGGATTAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=7;WE=57351496;WS=57351482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr1	57372591	rs619545	C	T	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=6.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.259;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=32;PP=691;ReadPosRankSum=-1.074;SC=ACTGCATAGACGCTAAATACC;SOR=0.174;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=67;TCF=1;TCR=66;TR=33;WE=57372599;WS=57372581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,34:0.47:72
chr1	57378149	rs1620075	GC	TT	2505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=24;PP=2500;ReadPosRankSum=-2.739;SC=AACCTGCGCCGCGCCTTGGAC;SOR=0.649;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=137;TCF=84;TCR=53;TR=57;WE=57378158;WS=57378139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,66:0.46:142
chr1	57378198	rs1754533	T	C	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.969;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=59.98;MQRankSum=-1.113;NF=36;NR=33;PP=1348;ReadPosRankSum=-0.010;SC=GATGTGGGCCTTGCTTCAACA;SOR=0.703;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=158;TCF=78;TCR=80;TR=69;WE=57378206;WS=57378188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,71:0.44:161
chr1	57378334	rs1754534	T	G	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.695;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=560;ReadPosRankSum=1.152;SC=TTCCAGCCTGTCCCAGCTCAA;SOR=0.283;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=25;WE=57378342;WS=57378324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr1	57383315	rs1342440	G	C	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.955;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=693;ReadPosRankSum=0.112;SC=AAGGAGAAGAGAGTGTGACAA;SOR=0.771;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=66;TCF=33;TCR=33;TR=36;WE=57383323;WS=57383305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr1	57395251	rs605648	T	C	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.890;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=606;ReadPosRankSum=0.116;SC=AGAAGGTCAATAAGCATCAAT;SOR=1.008;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=78;TCF=46;TCR=32;TR=37;WE=57395259;WS=57395241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,36:0.45:80
chr1	57397301	rs683824	G	A	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=508;ReadPosRankSum=-0.311;SC=ATAATGAAATGCATAACAATC;SOR=0.919;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=24;WE=57397309;WS=57397291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr1	57415200	rs706481	C	T	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=418;ReadPosRankSum=0.069;SC=ACAACATATACGTTTAAAAGC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=20;WE=57415208;WS=57415190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr1	57417633	.	G	GGGATGTGTCCAAGGTCACACA	1373	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.72;NF=4;NR=0;PP=1373;QD=368.25;SC=AAGAGAAAAGGGCTAGCAGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=4;WE=57417641;WS=57417632;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	57422484	rs1013579	C	T	5215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=92;PP=2965;SC=ACTTGACTTCCGCATGGTCTG;SOR=1.085;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=157;TCF=64;TCR=93;TR=156;WE=57422492;WS=57422474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr1	57477034	rs697580	G	C	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.912;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=460;ReadPosRankSum=-1.897;SC=TGCTTATATTGAAGTCAAATC;SOR=2.348;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=19;WE=57477042;WS=57477024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
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chr1	57537062	rs12754054	G	A	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=311;ReadPosRankSum=0.738;SC=TTTGGGTCCTGTAATTTACAC;SOR=0.563;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=18;WE=57537070;WS=57537052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
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chr1	59125683	rs232777	C	T	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.518;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=546;ReadPosRankSum=0.547;SC=ATTAACAATTCCTTTGTACAG;SOR=2.331;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=62;TCF=55;TCR=7;TR=26;WE=59125691;WS=59125673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr1	59125894	rs12092264	A	G	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=6.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.28;ReadPosRankSum=0.423;SOR=3.005;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
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chr1	59126676	rs232779	A	C	2672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=0;PP=2358;SC=GGCAACAAAAAACGTTACTAA;SOR=8.814;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=82;TCF=82;TCR=0;TR=82;WE=59126684;WS=59126666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	59127024	rs4912364	T	G	2074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=7.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.468;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=53;PP=1653;ReadPosRankSum=0.814;SC=CTCTGAAACATAATTTAATGA;SOR=1.168;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=182;TCF=68;TCR=114;TR=77;WE=59127032;WS=59127014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,80:0.41:193
chr1	59127207	rs232780	T	C	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.295;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=569;ReadPosRankSum=0.835;SC=AAGAAGCACATTGTCATCAAC;SOR=2.526;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=24;WE=59127215;WS=59127197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr1	59131088	rs516956	AA	GC	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=1;PP=1451;ReadPosRankSum=-0.829;SC=AAATAATTTTAAACAGTTGCA;SOR=0.446;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=65;TCF=60;TCR=5;TR=29;WE=59131097;WS=59131078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr1	59131311	rs232790	G	T	3345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=82;PP=2601;SC=ACTCTACAATGACAAGAAAAA;SOR=3.111;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=18;TCR=82;TR=100;WE=59131319;WS=59131301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr1	59133024	rs232794	T	G	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=218;ReadPosRankSum=-0.032;SC=AATACCACAGTTGCCTTTAAC;SOR=0.089;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=11;WE=59133032;WS=59133014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr1	59134586	rs11207284	G	C	2583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.528;NF=42;NR=57;PP=2059;ReadPosRankSum=0.150;SC=TACGGAAAAAGAGTAAGCATT;SOR=0.667;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=203;TCF=89;TCR=114;TR=99;WE=59134594;WS=59134576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,100:0.47:211
chr1	59134607	rs57822474	C	CAG	8765.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=113;PP=2974;SC=TCCTGTTTGACGGGGAAGCGG;SOR=1.214;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=168;TCF=53;TCR=115;TR=166;WE=59134615;WS=59134597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr1	59137783	rs539141	A	G	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=440;SC=ATGTAGAAAGACTGGACAGTA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=59137791;WS=59137773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	59139223	rs2064370	C	G	7112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=146;NR=66;PP=2965;SC=CATGGATGAGCCATTTGAAAG;SOR=1.731;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=213;TCF=147;TCR=66;TR=212;WE=59139231;WS=59139213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr1	59142713	rs579110	T	C	2360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=49;PP=1899;SC=TTAAGTATTTTGGTTTGCATA;SOR=1.358;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=27;TCR=49;TR=76;WE=59142721;WS=59142703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	59147420	rs11207292	G	A	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=2;PP=1173;SC=AGAATATCACGTTTTAAAACA;SOR=5.186;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=41;WE=59147428;WS=59147410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	59147926	rs12139511	T	C	5889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=97;NR=80;PP=2965;SC=CTGTCAGAAGTAATGAATTCT;SOR=0.822;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=97;TCR=80;TR=177;WE=59147934;WS=59147916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr1	59148118	rs17118103	A	T	3225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.906;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=59;PP=2477;ReadPosRankSum=-0.548;SC=CCCCTTAAACATGATGGTGTC;SOR=0.373;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=304;TCF=131;TCR=173;TR=121;WE=59148126;WS=59148108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,129:0.41:315
chr1	59150941	rs2206764	G	A	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=23;PP=929;SC=ATTAAAATGGGAAAAAAAATT;SOR=0.927;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=39;WE=59150949;WS=59150931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	59150997	rs5774421	TA	T	256.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;MQRankSum=0.555;NF=0;NR=17;PP=221;ReadPosRankSum=0.376;SC=ACTACCACATTAAAAAAAAAA;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=17;WE=59151005;WS=59150987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr1	59156155	rs12076049	C	T	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=15;PP=546;SC=ATTACTTATACAAAACGTGTG;SOR=1.828;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=21;WE=59156163;WS=59156145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	59158632	rs12097333	T	C	1625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=41;PP=1298;ReadPosRankSum=1.661;SC=TATTTGTCTTTTTATTTATTG;SOR=2.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=46;WE=59158640;WS=59158622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr1	59160724	rs66629118	TA	T	664.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.667;HP=13;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.590;NF=28;NR=1;PP=411;ReadPosRankSum=-0.403;SC=GCACTAAGTTTAAAAAAAAAA;SOR=4.680;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=29;WE=59160732;WS=59160714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,32:0.94:34
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chr1	59844471	rs835435	G	A	4010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=72;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.379;SC=TTGATCTCCCGGACTTCTTAT;SOR=0.686;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=321;TCF=173;TCR=148;TR=157;WE=59844479;WS=59844461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,160:0.49:327
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chr1	60280749	rs113730234	GT	G	5836.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=67;NR=59;PP=2970;SC=GTAGGAGGGAGTGTGAAGGTG;SOR=1.088;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=67;TCR=60;TR=126;WE=60280757;WS=60280739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	60280962	rs41287714	A	G	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=351;ReadPosRankSum=-0.131;SC=GTCCCGGCGCACCCTGCCCTT;SOR=0.368;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=16;WE=60280970;WS=60280952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr1	60299820	rs618716	C	G	7005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=133;PP=2965;SC=GGCTTTAATCCGTTTCGGTGG;SOR=1.063;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=233;TCF=100;TCR=133;TR=233;WE=60299828;WS=60299810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr1	60305840	rs12405073	G	C	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=250;ReadPosRankSum=0.245;SC=TGTTGTAAGAGTCATTTCTTA;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=12;WE=60305848;WS=60305835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr1	60314613	rs2294948	A	G	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=67;ReadPosRankSum=-0.180;SC=CAAGTATTTAAAATTAGACTG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=60314621;WS=60314603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	60314648	rs2294947	A	C	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.127;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=141;ReadPosRankSum=0.556;SC=ATATTTATTCATAATCAGTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=8;WE=60314656;WS=60314638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr1	60328613	rs2235798	T	C	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=26;PP=623;ReadPosRankSum=0.608;SC=GATCATGATGTCCAAATTAAT;SOR=0.210;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=27;WE=60328621;WS=60328603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,29:0.50:58
chr1	60330511	rs11207527	G	A	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=134;ReadPosRankSum=0.795;SC=TACTACCCCCGTTCCAAACTC;SOR=0.250;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=9;WE=60330519;WS=60330501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr1	60338654	rs28532535	A	G	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.72;ReadPosRankSum=1.288;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,35:0.39:90
chr1	60373666	rs2271800	A	C	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=32;PP=773;ReadPosRankSum=-2.021;SC=CCGTAACACAAAGGGGCTTCA;SOR=1.218;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=69;TCF=3;TCR=66;TR=33;WE=60373674;WS=60373656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,36:0.50:72
chr1	60456565	rs7537647	A	C	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=248;ReadPosRankSum=0.091;SC=AAACAGAGAAAACTATATATT;SOR=1.022;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=11;WE=60456573;WS=60456555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr1	60466814	rs626251	T	C	3152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=48;PP=2412;SC=GCAGGGGCTTTCTTTTCATTC;SOR=0.811;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=105;TCF=56;TCR=49;TR=104;WE=60466822;WS=60466804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	60466911	rs67112814	ACAG	A	1088.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.861;NF=3;NR=27;PP=1101;ReadPosRankSum=-1.255;SC=GGCAACAACAACAGCAACAAC;SOR=0.976;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=30;WE=60466921;WS=60466901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
chr1	60475930	rs616949	C	G	5111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=132;NR=16;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.023;SC=TTTTCCTTCACTGGGGAGCTA;SOR=1.901;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=150;TCF=134;TCR=16;TR=148;WE=60475938;WS=60475920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,153:0.99:155
chr1	60505578	rs680390	A	G	3022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=1;PP=2483;SC=CCAATAGTACAATTGCCATAC;SOR=7.130;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=105;TCF=104;TCR=1;TR=104;WE=60505586;WS=60505568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr1	61743160	rs332827	G	A	2650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.954;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=50;PP=2055;ReadPosRankSum=-0.348;SC=TGCAGACCCTGTAATTTTTGG;SOR=0.510;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=224;TCF=120;TCR=104;TR=103;WE=61743168;WS=61743150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,106:0.46:229
chr1	61818422	rs7528918	A	G	2028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=50;PP=1481;SC=ATGTGGCAAGATTAAATACAC;SOR=6.556;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=54;TCF=1;TCR=53;TR=51;WE=61818436;WS=61818412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	61818428	rs200638269	T	TAC,TACAC	1908.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=20;NF=0,0;NR=21,21;PP=577,362;SC=CAAGATTAAATACACACACAC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=21,21;WE=61818436;WS=61818412;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.48,0.52:23
chr1	61872541	rs10889221	G	A	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=38;PP=853;ReadPosRankSum=0.284;SC=TTGCCAGACCGAGAATCAAAG;SOR=0.538;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=80;TCF=0;TCR=80;TR=38;WE=61872549;WS=61872531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,37:0.46:81
chr1	61892301	rs5774558	T	TG	7621.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.35;NF=93;NR=82;PP=2966;SC=ACTTGTCTTTTGCACAAAAGG;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=189;TCF=101;TCR=88;TR=175;WE=61892309;WS=61892291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr1	61921185	rs11423561	A	AT	717.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=1.959;QD=6.90;ReadPosRankSum=0.448;SOR=0.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,43:0.41:104
chr1	62149237	rs12134205	C	G	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.998;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=548;ReadPosRankSum=0.247;SC=GACAAAATTTCAAAATTATTC;SOR=0.896;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=26;WE=62149245;WS=62149227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr1	62160525	.	T	TTATA	216.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.75;ReadPosRankSum=-0.050;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr1	62160542	rs1151765	A	G	739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=19;PP=556;SC=TATATATCACACTCTTTATAT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=62160550;WS=62160532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	62231924	rs141761262	T	TTGA	928.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=929;ReadPosRankSum=-0.684;SC=TAGATTTCTGTTGATTCTTTT;SOR=0.823;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=23;WE=62231938;WS=62231914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr1	62232031	rs1286835	C	T	5001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=37;PP=2965;SC=ATGGTTCCATCACTAATGGAA;SOR=2.303;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=148;TCF=111;TCR=37;TR=148;WE=62232039;WS=62232021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr1	62261168	rs7516332	A	G	7802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=124;NR=112;PP=2965;SC=TGTGAAAAGTATAATACCTGG;SOR=0.813;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=237;TCF=125;TCR=112;TR=236;WE=62261176;WS=62261158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr1	62330080	rs2799627	T	G	6802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=111;NR=91;PP=2965;SC=AAAGAGAAATTCTTGTTGATG;SOR=0.847;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=111;TCR=91;TR=202;WE=62330088;WS=62330070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr1	62340855	rs12753462	G	C	1356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=3;PP=1155;SC=TTGATCAACTGTACAGTAATA;SOR=4.514;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=40;WE=62340863;WS=62340845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	62341157	rs4598521	T	C	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=25;PP=594;SC=TTTGAATTTATGTCTGCTTAA;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=62341165;WS=62341147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	62350123	.	GTTTTTT	G	1493.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.77;MQRankSum=0.000;QD=36.43;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr1	62365217	rs1412622	C	T	4889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=119;NR=24;PP=2965;SC=TGAGTATGCCCTAAAATTGTG;SOR=3.064;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=119;TCR=24;TR=143;WE=62365225;WS=62365207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	62365461	rs10889269	G	A	1272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=37;PP=1051;SC=GCTGGCCTACGTTTTGGTTTC;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=37;WE=62365469;WS=62365451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	62374267	rs2151122	T	C	942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=842;SC=CCAAACTATATTTAAAGTATG;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=62374275;WS=62374257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	62380158	rs2499007	T	A	1461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.686;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.971;NF=44;NR=4;PP=1141;ReadPosRankSum=-2.023;SC=AATGTAATGATTGAAAAAAAA;SOR=0.297;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=98;TCF=92;TCR=6;TR=48;WE=62380166;WS=62380148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,53:0.50:105
chr1	62380195	rs2482858	A	G	2093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.776;HP=7;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=8;PP=1639;ReadPosRankSum=2.649;SC=GTCAAGAGAAAAAAAAGGAAT;SOR=0.961;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=181;TCF=158;TCR=23;TR=73;WE=62380203;WS=62380185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,79:0.42:189
chr1	62380223	rs11585422	G	T	2585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=9.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.348;HP=4;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=16;PP=2043;ReadPosRankSum=-0.585;SC=TCGTTTAAACGTTTTCTTCCC;SOR=0.850;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=242;TCF=200;TCR=42;TR=97;WE=62380231;WS=62380213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,100:0.40:247
chr1	62380270	rs1134766	C	T	8100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=139;NR=119;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.654;SC=TCATTCCTAACGTACATAACA;SOR=0.307;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=259;TCF=140;TCR=119;TR=258;WE=62380278;WS=62380260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,262:1.00:263
chr1	62380298	rs1056513	G	A	8733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=107;NR=155;PP=2965;SC=CAAAATCACCGGTAACCAGAA;SOR=1.133;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=264;TCF=108;TCR=156;TR=262;WE=62380306;WS=62380288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr1	62393394	rs2251182	A	G	9649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=223;NR=104;PP=2965;SC=CAAATTTTGCATCTTCAGAGG;SOR=1.646;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=327;TCF=223;TCR=104;TR=327;WE=62393402;WS=62393384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
chr1	62417951	.	A	AG	195.87	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.14;QD=27.98;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	62417952	.	A	G	875	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MMLQ=29;MQ=58.68;NF=30;NR=0;PP=875;QD=30.3257070849;SC=GAGAGAGAGAAAAATAGGCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=62417960;WS=62417942;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	62417952	.	A	AGAGAGAGAGAGAG	194.87	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.49;QD=27.84;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	62456014	rs1134767	G	A	6485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=143;PP=2965;SC=GGACGAATGCGTATTGGAGAT;SOR=1.998;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=198;TCF=55;TCR=143;TR=198;WE=62456022;WS=62456004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr1	62456048	rs12730210	G	A	1800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.723;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=55;PP=1320;ReadPosRankSum=1.446;SC=TGAGAAGCATGTGTTTTTAAC;SOR=0.886;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=144;TCF=24;TCR=120;TR=65;WE=62456056;WS=62456038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,70:0.46:151
chr1	62483415	rs140898379	A	G	515.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.77;MQRankSum=0.632;QD=23.44;ReadPosRankSum=-0.973;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr1	62483599	rs34726576	G	A	4557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.507;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=74;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.691;SC=CCCCATCAAAGGTCAAGCTGG;SOR=0.605;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=136;TCF=62;TCR=74;TR=135;WE=62483607;WS=62483589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,147:0.99:148
chr1	62483623	rs41313250	A	G	1822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.220;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=40;PP=1267;ReadPosRankSum=0.453;SC=TCATCAGGTAAGATTGCTAGA;SOR=0.410;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=130;TCF=46;TCR=84;TR=65;WE=62483631;WS=62483613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,73:0.51:142
chr1	62516683	rs2498982	G	C	11339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=137;NR=203;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.802;SC=AGATGGCAGCGTCGAAGTTGG;SOR=0.456;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=343;TCF=138;TCR=205;TR=340;WE=62516691;WS=62516673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,356:1.00:357
chr1	62545085	rs17379217	C	T	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.908;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=6;PP=963;ReadPosRankSum=0.805;SC=TACCTTTCTCCTTTTTGATAT;SOR=0.326;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=90;TCF=81;TCR=9;TR=43;WE=62545093;WS=62545075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,45:0.48:94
chr1	62566018	rs41289424	T	C	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.144;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=399;ReadPosRankSum=-0.723;SC=TCCAAGAGCATGGAGCCAGCA;SOR=1.609;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=56;TCF=51;TCR=5;TR=22;WE=62566026;WS=62566008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,24:0.42:57
chr1	62579672	rs1475564	A	C	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=0;PP=800;SC=GCAGACAGAGAAGGCAGAGAC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=62579680;WS=62579662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	62579823	rs1475563	G	A	4999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=59;PP=2965;SC=ATAGAGATGAGGCACACTACC;SOR=1.186;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=96;TCR=59;TR=155;WE=62579831;WS=62579813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr1	62587014	rs4019806	T	TA	3912.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=16.390;HP=12;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.471;NF=15;NR=125;PP=1976;ReadPosRankSum=0.884;SC=TTACCCAAATTAAAAAAAAAA;SOR=2.863;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=199;TCF=23;TCR=176;TR=140;WE=62587022;WS=62587004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:12,163:0.93:175
chr1	62593893	rs2481664	T	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=139;ReadPosRankSum=1.888;SC=GAGGGCAAGATGCATTAGATA;SOR=0.430;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=10;WE=62593901;WS=62593883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr1	62594395	rs41300322	C	T	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=274;ReadPosRankSum=-1.041;SC=ACGGTAGTAACGCAGAATCCT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=13;WE=62594403;WS=62594385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr1	62594593	rs2476194	C	T	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.559;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=37;PP=1281;ReadPosRankSum=-0.797;SC=TGCTGAAGAACGCCTACGGGC;SOR=0.542;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=112;TCF=40;TCR=72;TR=60;WE=62594601;WS=62594583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,60:0.52:115
chr1	62594677	rs2481665	T	C	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=29;PP=722;ReadPosRankSum=-0.820;SC=GCAAAAAAGATTGAGCGTCAC;SOR=0.646;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=62;TCF=8;TCR=54;TR=35;WE=62594685;WS=62594667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,35:0.53:66
chr1	62644118	rs2481703	A	G	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=498;ReadPosRankSum=1.346;SC=TGCCCAATGGATTCACCTTGC;SOR=1.121;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=23;WE=62644126;WS=62644108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr1	62672546	rs2457829	G	A	4024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=64;PP=2965;SC=CAGTTTTAGGGGGAAAAGCTA;SOR=0.776;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=120;TCF=56;TCR=64;TR=119;WE=62672554;WS=62672536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	62673037	rs7542665	T	C	7278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=128;PP=2965;SC=CTTACCCTGGTAGCCGACCTT;SOR=1.163;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=214;TCF=85;TCR=129;TR=213;WE=62673045;WS=62673027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr1	62673225	rs7533274	G	A	3609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=78;PP=2847;SC=AAAATCTTCTGTGAAAGAATT;SOR=1.849;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=33;TCR=78;TR=110;WE=62673233;WS=62673215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	62675426	rs143484043	C	CT	584.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=390;ReadPosRankSum=0.453;SC=ACAAATAACTCTTTTTTTTCT;SOR=0.838;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=20;WE=62675434;WS=62675416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr1	62675619	rs4625314	C	T	1760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=22;PP=1193;SC=ATGAAGAGGCCTCAGGGATGG;SOR=0.846;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=21;TCR=22;TR=43;WE=62675627;WS=62675609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	62675644	.	ACCTCAGGGCTGGAGGAGGAGGAGGAAGAGC	A	1467.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=6.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.97;ReadPosRankSum=-1.001;SOR=1.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,38:0.54:70
chr1	62675892	rs2481694	A	G	8785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.042;QD=30.94;ReadPosRankSum=-0.353;SOR=0.797;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,282:0.99:284
chr1	62676091	rs11207933	C	A	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=742;ReadPosRankSum=0.197;SC=AACTGGCACACCCTGTCTGAC;SOR=0.798;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=31;TCR=34;TR=35;WE=62676099;WS=62676081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,38:0.58:66
chr1	62676284	rs2886644	C	T	2095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.304;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=39;PP=1596;ReadPosRankSum=-1.830;SC=ACAGAGGAAACAGAAGAAAAC;SOR=0.687;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=141;TCF=71;TCR=70;TR=80;WE=62676292;WS=62676274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,83:0.56:148
chr1	62676612	rs66958136	A	G	2131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.660;NF=36;NR=37;PP=1611;ReadPosRankSum=0.732;SC=ACATAATTAAAGAAATAATTG;SOR=0.698;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=158;TCF=79;TCR=79;TR=73;WE=62676620;WS=62676602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,78:0.48:164
chr1	62677048	rs1056517	G	T	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=21;PP=732;SC=ACCTTAGCACGCCAGGGTGAC;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=62677056;WS=62677038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	62677118	rs12130050	A	G	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=38;ReadPosRankSum=0.288;SC=TAAAACGAAAATACACTTCTA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=62677126;WS=62677108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	62704134	rs41289438	A	G	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.823;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=27;PP=639;ReadPosRankSum=-1.267;SC=TTGGGAGTAGAGGGTATGCCT;SOR=2.219;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=58;TCF=10;TCR=48;TR=30;WE=62704142;WS=62704124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr1	62713224	rs2941679	C	G	2960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=33;PP=1797;SC=TGACAGGCCACCATGAGGGCC;SOR=0.914;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=43;TCR=33;TR=76;WE=62713232;WS=62713214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	62713246	rs10889315	G	A	1449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.767;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=1046;ReadPosRankSum=0.193;SC=AGGATCCATCGTGGTCCTGCA;SOR=0.495;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=41;TCR=45;TR=53;WE=62713254;WS=62713236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,56:0.62:90
chr1	62728784	rs2666472	A	G	1209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=10;PP=971;SC=CAGCAGCTTCACGATGGAGAA;SOR=2.409;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=44;WE=62728792;WS=62728774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	62728838	rs2258470	T	C	3544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=22;PP=2060;ReadPosRankSum=-1.337;SC=GTTCCCGTTGTGATCGGCCAA;SOR=0.941;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=83;TCF=61;TCR=22;TR=82;WE=62728846;WS=62728828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,82:0.99:83
chr1	62728861	rs2260581	T	C	4875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=28;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.042;SC=TGACAAGCAGTTTCAGGAAGT;SOR=1.255;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=96;TCR=28;TR=123;WE=62728869;WS=62728851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,123:0.99:124
chr1	62728918	rs2262110	G	A	5191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.929;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=51;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.457;SC=CCACCACGGCGGGGCTAGACG;SOR=1.566;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=111;TCR=52;TR=162;WE=62728926;WS=62728908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,167:0.99:168
chr1	62729015	rs2262106	G	A	5509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=128;PP=2965;SC=ATTCCAAGAGGTTCCCCGGCC;SOR=2.028;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=50;TCR=128;TR=178;WE=62729023;WS=62729005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr1	62733939	rs11207950	G	A	985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=0;PP=804;SC=AAGTGCCCGCGTTTGTGTCCA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=62733947;WS=62733929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	62737372	rs4609464	A	C	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-6.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.025;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=382;ReadPosRankSum=-1.500;SC=TGGAGAGGTAAGGAGGGACAG;SOR=2.012;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=2;TCR=53;TR=24;WE=62737380;WS=62737362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,27:0.44:61
chr1	62738904	rs7516290	T	C	1360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=14;PP=1156;SC=AGGAGGCCGGTGGCTCCTTGG;SOR=1.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=46;WE=62738912;WS=62738894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	62739198	rs17855078	G	A	1925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.145;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=35;PP=1515;ReadPosRankSum=1.373;SC=TCTTTCTGTCGCTGCCCCACA;SOR=0.788;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=180;TCF=95;TCR=85;TR=76;WE=62739206;WS=62739188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,77:0.41:187
chr1	62740065	rs12127930	A	G	7104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.289;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=131;NR=109;PP=2965;ReadPosRankSum=0.130;SC=CCTTCACCACACCCTCTGGAG;SOR=0.668;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=243;TCF=132;TCR=111;TR=240;WE=62740073;WS=62740055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,243:0.99:246
chr1	62740446	rs2666506	T	C	5901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.75;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr1	62740449	rs2666507	T	C	5762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.67;SOR=0.840;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr1	62939634	rs1168007	C	T	1640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=8;PP=1435;SC=AAGATCTTTACGCAGAAAGCC;SOR=2.790;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=49;WE=62939642;WS=62939624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	62943264	rs1168008	C	T	1886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=0;PP=1779;SC=GAGTAGTTTACTTGGCAAGAT;SOR=8.121;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=61;TCR=0;TR=61;WE=62943272;WS=62943254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	62945418	rs1183260	A	G	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.026;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.794;NF=14;NR=20;PP=583;ReadPosRankSum=-0.530;SC=ACAGTGGTGCAACCACAGCTC;SOR=0.515;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=23;TCR=34;TR=34;WE=62945426;WS=62945408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,35:0.59:59
chr1	62945503	rs187995477	T	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=176;ReadPosRankSum=-0.692;SC=TACAGAAGCATGCCACCACAC;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=9;WE=62945511;WS=62945493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr1	62953183	rs1168025	C	T	2377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=62;PP=1880;SC=TCTCCACAAACAGAAGACAGC;SOR=3.228;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=11;TCR=63;TR=73;WE=62953191;WS=62953173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	62954372	rs57650980	G	GA	226.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=137;ReadPosRankSum=-2.170;SC=ATTCAAAAATGAAAAAAAAAA;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=12;WE=62954380;WS=62954362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr1	62960101	rs10889335	A	G	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.795;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=806;ReadPosRankSum=-0.770;SC=AACCAGGTCAATCGCAGATCT;SOR=0.544;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=100;TCF=37;TCR=63;TR=50;WE=62960109;WS=62960091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,50:0.52:97
chr1	62960250	rs1168041	T	C	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=213;ReadPosRankSum=-0.882;SC=GTGCACAACCTACTTAGTTTT;SOR=0.346;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=9;WE=62960258;WS=62960240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr1	62961145	.	A	G	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.968;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=110;ReadPosRankSum=0.197;SC=ATGTAAATAAAGAAAAATCAC;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=6;WE=62961153;WS=62961138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	62961928	rs1168038	T	C	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=226;SC=CCAGCAAAAATCAACTTTTGA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=62961936;WS=62961918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	62970184	rs1168027	T	C	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=39;ReadPosRankSum=0.947;SC=AGATAGCCTATGATTAGACTA;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=62970192;WS=62970178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr1	62973795	rs1184865	A	G	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=215;ReadPosRankSum=-1.688;SC=AAAAGACTTAAGGATGCATAG;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=10;WE=62973803;WS=62973785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr1	62976472	rs1168043	T	G	1445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=42;PP=1230;SC=CAGTACAAGTTGAAAAACCTG;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=42;WE=62976480;WS=62976462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	63001120	rs1168018	A	C	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=6;PP=810;ReadPosRankSum=1.904;SC=TCCACTGTTCAAAATCAAACT;SOR=0.397;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=82;TCF=70;TCR=12;TR=38;WE=63001128;WS=63001110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,40:0.46:87
chr1	63027411	rs5774610	AG	A	1997.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=41;PP=1991;SC=CAGATGCTTAAGTAGATTATG;SOR=3.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=5;TCR=41;TR=46;WE=63027419;WS=63027401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	63044464	rs11207993	C	T	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=103;ReadPosRankSum=-1.892;SC=ATTATTTTAGCTCTTTGATCT;SOR=0.074;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=6;WE=63044472;WS=63044454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	63050598	rs3850634	T	G	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=27;PP=700;ReadPosRankSum=0.364;SC=GTTTGTTAGGTAAACAATAAA;SOR=1.067;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=5;TCR=46;TR=30;WE=63050606;WS=63050588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr1	63070537	rs67461605	AGTTAATGTG	A	921.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.647;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.573;NF=0;NR=21;PP=2938;ReadPosRankSum=1.067;SC=CCTCATTCCAAGTTAATGTGG;SOR=2.139;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=21;WE=63070553;WS=63070527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr1	63085483	rs34571440	T	TA	296.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.329;NF=15;NR=0;PP=165;ReadPosRankSum=0.787;SC=GCCAGATAAATAAAAAAAAAA;SOR=0.326;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=15;WE=63085491;WS=63085473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr1	63090858	rs6587980	C	T	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=0;PP=962;ReadPosRankSum=-0.711;SC=ATAGTACAATCACTACCTTTC;SOR=0.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=80;TCF=80;TCR=0;TR=40;WE=63090866;WS=63090848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,41:0.49:83
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chr1	63113511	rs746735	C	A	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.477;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=542;ReadPosRankSum=1.004;SC=TTATCTTTTTCAGAACTTACT;SOR=2.000;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=24;WE=63113519;WS=63113501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr1	63113689	rs1168088	T	C	1392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=2;PP=1168;SC=TGCTTTATCCTCTACATTTTG;SOR=5.235;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=40;WE=63113697;WS=63113681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	63113719	rs1168089	T	C	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=1;PP=719;ReadPosRankSum=0.554;SC=ATATCAATCATAATCCCAAAA;SOR=0.722;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=66;TCF=64;TCR=2;TR=33;WE=63113727;WS=63113709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,36:0.51:71
chr1	63153953	rs4344355	C	T	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.015;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.118;NF=10;NR=27;PP=699;ReadPosRankSum=0.462;SC=GCGGCGACGGCGACGGCGGCG;SOR=0.952;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=69;TCF=20;TCR=49;TR=37;WE=63153961;WS=63153943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,38:0.54:70
chr1	63269580	rs12125325	A	G	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=460;ReadPosRankSum=-1.382;SC=GAAATATTTGACAATATTTAT;SOR=0.387;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=21;WE=63269588;WS=63269570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr1	63270772	rs1927486	C	T	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=250;ReadPosRankSum=0.084;SC=TAAAAGAAAACGCTGCTAGAC;SOR=0.627;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=13;WE=63270780;WS=63270762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr1	63271010	rs10789128	T	C	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=4.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=174;ReadPosRankSum=-0.821;SC=TAGATTAATCTACTTTTGCAG;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=63271018;WS=63271000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr1	63285033	rs3737891	T	C	1208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.110;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=40;PP=974;ReadPosRankSum=-0.529;SC=ATCTTTCTTCTTGTGACAGAG;SOR=0.859;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=103;TCF=13;TCR=90;TR=45;WE=63285041;WS=63285023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,46:0.43:107
chr1	63300855	rs59745958	T	TA	86.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQRankSum=-0.728;QD=8.67;ReadPosRankSum=2.037;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr1	63881552	rs4630153	C	T	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.167;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=403;ReadPosRankSum=0.567;SC=AGCTTTTGTTCTACGTTTTTG;SOR=2.022;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=20;WE=63881560;WS=63881542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,23:0.37:62
chr1	63915343	rs3790867	A	G	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.471;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=340;ReadPosRankSum=1.333;SC=ACATTAATGTATATTTGTGCT;SOR=0.436;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=19;WE=63915351;WS=63915333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr1	63920515	rs17319708	C	G	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=126;ReadPosRankSum=1.817;SC=ACACTTCTTTCATTTTATCCT;SOR=0.446;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=6;WE=63920523;WS=63920505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr1	63975830	rs6588047	T	C	483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=6;PP=333;SC=CATTGCACTCTAGCCTGGGCA;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=15;WE=63975838;WS=63975820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	63975859	rs67405755	C	CA	207.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.123;HP=10;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=1.049;NF=3;NR=9;PP=159;ReadPosRankSum=0.176;SC=AAAACTGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=1.802;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=12;WE=63975867;WS=63975849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr1	63991140	rs9436686	T	C	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=0;PP=628;SC=TTTTCTTCTATGTATAAAATC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=63991148;WS=63991130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	63997564	.	G	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.860;ClippingRankSum=0.000;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=1.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.32;ReadPosRankSum=-1.094;SOR=0.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,28:0.14:194
chr1	64095042	rs855313	G	T	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=6.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.991;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=9;PP=879;ReadPosRankSum=-1.413;SC=GTTTCTGAGCGGTGACTCTGG;SOR=0.181;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=100;TCF=85;TCR=15;TR=42;WE=64095050;WS=64095032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,43:0.42:103
chr1	64095111	rs855314	A	G	2604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.059;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=35;PP=1948;ReadPosRankSum=1.414;SC=TCGCTTGGTTATCGGACAGAA;SOR=0.974;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=197;TCF=118;TCR=79;TR=95;WE=64095119;WS=64095101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,98:0.48:203
chr1	64097432	rs1126728	C	T	4837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.100;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=96;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.390;SC=ACTGAAGATCCGTATTGATGC;SOR=0.592;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=388;TCF=201;TCR=187;TR=193;WE=64097440;WS=64097422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,196:0.49:401
chr1	64100478	rs6588052	A	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=168;ReadPosRankSum=0.536;SC=TTCTGCATACATTTATTCCAT;SOR=1.022;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=9;WE=64100486;WS=64100468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr1	64102114	rs2269248	A	G	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.565;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=296;ReadPosRankSum=-0.030;SC=AGTCTTCACCATACCCTTCAC;SOR=2.133;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=14;WE=64102122;WS=64102104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr1	64125544	rs10909	C	T	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=149;ReadPosRankSum=0.852;SC=AGAGGACCTGCGGGCTTAGAT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=9;WE=64125552;WS=64125534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr1	64515379	rs1772626	C	T	3320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=21;PP=2676;SC=ACCTGACCCTCGATGAACCAA;SOR=2.595;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=77;TCR=21;TR=98;WE=64515387;WS=64515369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	64608329	rs2762833	G	T	4226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=75;PP=2965;SC=ACATCCCAGCGTGCGGTAAAT;SOR=1.055;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=54;TCR=75;TR=129;WE=64608337;WS=64608319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr1	64624612	rs4362024	G	A	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=0;PP=1097;SC=GTAATATTATGCATGTTACTT;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=64624620;WS=64624602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	64624842	rs6668545	A	G	2928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.575;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=72;PP=2282;ReadPosRankSum=-0.576;SC=GTCAAAATGTAGAGATGTCAA;SOR=0.811;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=245;TCF=88;TCR=157;TR=109;WE=64624850;WS=64624832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,116:0.45:256
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chr1	64669567	rs2806529	A	T	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.152;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=412;ReadPosRankSum=2.061;SC=TCATTGTTATATCCCAACTTT;SOR=2.655;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=19;WE=64669575;WS=64669557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr1	64680682	rs825174	C	G	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.061;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=396;ReadPosRankSum=-0.196;SC=TTGGGAGGCTCAGGTGGGTGG;SOR=1.316;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=19;WE=64680690;WS=64680672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr1	64698411	rs2029868	T	C	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.314;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=138;ReadPosRankSum=-0.210;SC=CAAAGACTAATTGACACACAT;SOR=0.074;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=8;WE=64698419;WS=64698401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr1	64707243	rs825189	G	C	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.26;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	64709891	rs10789152	A	G	3211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.914;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=91;PP=2477;ReadPosRankSum=-0.186;SC=GAAATTCTTAACCACTCTGAA;SOR=0.867;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=225;TCF=52;TCR=173;TR=115;WE=64709899;WS=64709881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,119:0.52:228
chr1	64726149	rs59424600	C	CTCAG	89.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.90;ReadPosRankSum=-0.594;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr1	64726414	rs705542	A	C	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.132;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=649;ReadPosRankSum=-0.133;SC=GCTTTTATAAATAACATATTA;SOR=1.347;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=30;WE=64726422;WS=64726404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,31:0.61:51
chr1	65016177	.	C	G	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=156;ReadPosRankSum=-0.223;SC=AATTTTTTTTCTACTAGATTC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=8;WE=65016185;WS=65016167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr1	65016264	.	C	G	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.000;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=6;PP=1143;ReadPosRankSum=0.769;SC=TGTTCATTTTCTTTTCATTGC;SOR=0.714;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=113;TCF=99;TCR=14;TR=53;WE=65016272;WS=65016254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,55:0.47:116
chr1	65016349	rs2164571	A	T	6482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=82;NR=110;PP=2965;SC=GGTAAGAGGCAATGAGTACTT;SOR=0.986;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=192;TCF=82;TCR=110;TR=192;WE=65016357;WS=65016339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr1	65016447	.	C	G	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.085;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.021;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=28;PP=647;ReadPosRankSum=1.782;SC=TTCTTTCTCTCTGTATAATTT;SOR=0.182;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=70;TCF=6;TCR=64;TR=32;WE=65016455;WS=65016437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,32:0.44:72
chr1	65045602	rs5774708	TA	T	562.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=17;PP=363;SC=AGCCAGATGTTAAAAAAAAAA;SOR=1.802;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=23;WE=65045610;WS=65045592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	65068638	rs6665437	T	C	1541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=48;PP=1297;SC=TGTATTCTACTGCATTCAAGT;SOR=2.876;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=59;TCF=11;TCR=48;TR=58;WE=65068646;WS=65068628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	65095054	rs17383227	G	A	2137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.941;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=32;PP=1544;ReadPosRankSum=-0.437;SC=CAGACAACCTGAAATCCAACC;SOR=0.541;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=168;TCF=107;TCR=61;TR=81;WE=65095062;WS=65095044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,86:0.49:176
chr1	65099699	rs373496679	TG	T	507.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.899;NF=18;NR=5;PP=493;ReadPosRankSum=0.228;SC=ACAAGTTTGGTGGTTTTTTTT;SOR=0.836;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=23;WE=65099709;WS=65099689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr1	65099716	rs75667111	C	T	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=34.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=0.015;QD=3.32;ReadPosRankSum=-1.268;SOR=5.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr1	65099978	rs2118102	G	A	2471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=70;PP=1986;SC=TAGAGGCATAGTAGATAAAGA;SOR=5.004;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=5;TCR=70;TR=75;WE=65099986;WS=65099968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	65107372	rs6664905	C	T	2848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=83;NR=4;PP=2417;SC=CAGCATCAAACAGGAGGGACT;SOR=5.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=87;TCF=83;TCR=4;TR=87;WE=65107380;WS=65107362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	65113351	rs7534210	T	C	730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=0;PP=562;SC=GTCCAGAGTCTATGTGGTCTC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=65113359;WS=65113341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	65113568	rs6588100	T	C	4290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=91;PP=2965;SC=CCAGACCGGATGGCCTTGCCT;SOR=1.103;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=152;TCF=61;TCR=91;TR=151;WE=65113576;WS=65113558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr1	65129233	rs11289872	GA	G	107.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.51;MQRankSum=-1.923;QD=2.29;ReadPosRankSum=-0.643;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,13:0.28:47
chr1	65141676	rs67286337	TTAATAATAATAATAATAATAA	T,TTAATAATAATAATAA	1951.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=26;NF=1,1;NR=20,20;PP=1591,2710;SC=GGTAAAATAATTAATAATAAT;SOR=5.549;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=58;TCF=5;TCR=53;TR=21,21;WE=65141704;WS=65141666;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.73,0.27:49
chr1	65146901	.	G	C	3276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.000;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.979;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=10;PP=2575;ReadPosRankSum=-0.138;SC=GATTTTGTTTGATTAAATAGT;SOR=0.588;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=187;TCF=171;TCR=16;TR=109;WE=65146909;WS=65146891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,113:0.59:192
chr1	65301669	rs2254002	C	A	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-5.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=0;PP=638;ReadPosRankSum=-0.568;SC=GTGACATTTTCCATTATAATA;SOR=1.034;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=52;TCR=0;TR=28;WE=65301677;WS=65301659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr1	65310489	rs2230588	T	C	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=18;PP=1244;ReadPosRankSum=-0.281;SC=GCTTGATGAATGGGCCACACT;SOR=0.771;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=120;TCF=87;TCR=33;TR=67;WE=65310497;WS=65310479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,70:0.56:126
chr1	65311116	rs2780821	GC	CT	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.653;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=1;PP=1620;ReadPosRankSum=-0.606;SC=TAGCTGCTTGGCTAGCACCTC;SOR=0.211;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=49;TCF=47;TCR=2;TR=31;WE=65311125;WS=65311106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,35:0.69:51
chr1	65316675	rs310216	G	A	1455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.431;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=48;PP=1153;ReadPosRankSum=0.815;SC=AGCCGGGGCCGTGGGACCGGT;SOR=1.065;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=91;TCF=8;TCR=83;TR=52;WE=65316683;WS=65316665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,54:0.57:94
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chr1	65325970	rs310224	C	T	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.975;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=722;ReadPosRankSum=0.172;SC=GAAATTCCCACGGTTACATCA;SOR=1.044;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=79;TCF=30;TCR=49;TR=37;WE=65325978;WS=65325960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,39:0.47:83
chr1	65326095	rs200014012	TTGCA	T	103.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.65;MQRankSum=3.195;QD=7.98;ReadPosRankSum=-1.957;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	65326098	.	CATGCATTTATTTATTT	C	149	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.87;NF=0;NR=4;PP=149;QD=44.25;SC=ATACCCCTTGCATGCATTTAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=65326121;WS=65326088;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr1	65523343	rs11583739	G	A	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=5.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.264;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.145;NF=32;NR=6;PP=745;ReadPosRankSum=-0.799;SC=CTGCACTCCCGTGTGGGCAAC;SOR=1.010;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=87;TCF=72;TCR=15;TR=38;WE=65523361;WS=65523333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,42:0.44:95
chr1	65684425	rs11208611	C	T	1847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=31;PP=1441;ReadPosRankSum=0.351;SC=TTGTTTTGTTCTTTGCATTTA;SOR=0.691;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=85;TCR=59;TR=75;WE=65684433;WS=65684415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,76:0.52:145
chr1	65690461	rs4915685	G	A	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=5.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.172;NF=21;NR=0;PP=437;ReadPosRankSum=-0.244;SC=CTGGTGAACCGTTAGTCCAGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=21;WE=65690469;WS=65690451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr1	65830608	rs1570868	T	C	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=32;PP=768;ReadPosRankSum=-0.618;SC=AGAAATGTCATTGAAGACATA;SOR=0.588;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=0;TCR=66;TR=32;WE=65830616;WS=65830598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr1	65844963	rs3818449	A	G	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.383;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=5;PP=743;ReadPosRankSum=0.239;SC=TGTTCCCACTATTCCTATCTA;SOR=0.415;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=72;TCF=63;TCR=9;TR=35;WE=65844971;WS=65844953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,35:0.47:74
chr1	65858088	rs6588144	T	C	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.330;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=312;ReadPosRankSum=-0.326;SC=GCAACTAATCTCTTATGGTAT;SOR=0.236;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=18;WE=65858096;WS=65858078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr1	65858145	rs4325172	G	A	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.137;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=722;ReadPosRankSum=-0.043;SC=TCTGTGAGGAGGACCACGCTG;SOR=1.027;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=60;TCF=27;TCR=33;TR=32;WE=65858153;WS=65858135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,32:0.52:61
chr1	65860687	rs4582839	A	C	3458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=73;PP=2576;ReadPosRankSum=0.947;SC=TTCTCCAGCCAACAAGAAGTC;SOR=0.540;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=245;TCF=102;TCR=143;TR=129;WE=65860695;WS=65860677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,134:0.53:254
chr1	65867391	rs4592284	C	G	1720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.007;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=17;PP=1263;ReadPosRankSum=-0.671;SC=CTGAATTTCACAATTCAGCCT;SOR=0.387;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=116;TCF=89;TCR=27;TR=62;WE=65867399;WS=65867381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,66:0.55:121
chr1	65886398	rs3790435	T	C	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=12;PP=1099;ReadPosRankSum=-1.483;SC=GCGGCCCCAGTTCGGGAGACA;SOR=0.715;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=88;TCF=66;TCR=22;TR=49;WE=65886406;WS=65886388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,51:0.57:90
chr1	65886448	rs3790434	T	C	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.495;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=27;PP=1088;ReadPosRankSum=1.597;SC=CCGGCTCGCTTGTCGTGTGGT;SOR=0.374;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=124;TCF=74;TCR=50;TR=60;WE=65886456;WS=65886438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,62:0.49:127
chr1	65887013	rs12145690	A	C	2577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.672;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=29;PP=1953;ReadPosRankSum=0.820;SC=ATGGACAGAGAAGAAACCAGT;SOR=0.453;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=184;TCF=132;TCR=52;TR=92;WE=65887021;WS=65887003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,98:0.50:195
chr1	66036501	rs2186248	G	T	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=30;PP=876;SC=CATTAGCTATGTTTTAAATGT;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=66036509;WS=66036491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	66037984	rs70940803	T	G	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.43;MQRankSum=-0.512;QD=5.30;ReadPosRankSum=2.417;SOR=1.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr1	66058513	rs1137101	A	G	1906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=59;PP=1504;ReadPosRankSum=1.429;SC=GTAATTTTCCAGTCACCTCTA;SOR=0.685;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=170;TCF=44;TCR=126;TR=78;WE=66058521;WS=66058503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,79:0.45:177
chr1	66064293	rs3762273	A	C	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.11;ReadPosRankSum=0.180;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr1	66067109	rs1805134	T	C	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.089;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=381;ReadPosRankSum=-0.586;SC=TTCTGACAAGTGTTGGGTCTA;SOR=2.280;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=18;WE=66067117;WS=66067099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr1	66618316	rs146526475	TACACAC	TAC,T	411.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=0,0;NR=10,10;PP=485,55;SC=TATATGTGTATACACACACAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=10,10;WE=66618329;WS=66618306;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:11
chr1	66731886	rs6588193	G	C	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=30;ReadPosRankSum=0.431;SC=GCTCTCAAAAGTATGTCTCTT;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=66731894;WS=66731876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr1	66732386	rs6588194	G	A	1451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.504;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=21;PP=1129;ReadPosRankSum=0.935;SC=GGTGTGTTGAGAGCTGCAGAG;SOR=1.056;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=107;TCF=61;TCR=46;TR=55;WE=66732394;WS=66732376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,56:0.50:111
chr1	66732529	rs6701329	A	T	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.150;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=394;ReadPosRankSum=1.349;SC=TTCCCTACTAATGTAGCAGTA;SOR=2.531;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=15;WE=66732537;WS=66732519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr1	66829262	rs783039	A	G	2960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=79;PP=2451;SC=GACGTGAGTAATTATGACCTG;SOR=3.118;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=13;TCR=79;TR=92;WE=66829270;WS=66829252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	66831322	rs7538869	T	G	2889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=7.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.412;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=22;PP=2161;ReadPosRankSum=-0.512;SC=ATTGGATGTGTAGTTAAATGT;SOR=1.098;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=207;TCF=152;TCR=55;TR=98;WE=66831330;WS=66831312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,108:0.49:221
chr1	66831370	rs783036	G	A	3443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.287;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=42;PP=2554;ReadPosRankSum=-0.055;SC=CAGATTTGGAGATCCTGGCTG;SOR=0.972;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=250;TCF=158;TCR=92;TR=125;WE=66831378;WS=66831360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,132:0.50:262
chr1	67000103	rs1445578	A	G	5401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=110;PP=2965;SC=TTTGGGCAGAACAGCATTAAA;SOR=1.596;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=54;TCR=110;TR=164;WE=67000111;WS=67000093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr1	67000162	rs1445579	T	G	2713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=68;PP=2167;SC=TGGTTGCCAATGTTTTGCAAG;SOR=3.638;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=10;TCR=68;TR=78;WE=67000170;WS=67000152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	67094171	rs12402181	G	A	5083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=97;PP=2965;SC=AGGCATTATAGGACTCATATA;SOR=1.475;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=150;TCF=53;TCR=97;TR=149;WE=67094179;WS=67094161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr1	67101778	rs149719377	AAC	A	1065.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.583;NF=0;NR=24;PP=940;ReadPosRankSum=-0.509;SC=AAATTTGGAAAACACAGTAGT;SOR=0.152;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=0;TCR=66;TR=24;WE=67101787;WS=67101768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr1	67101802	rs7546825	A	G	1877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=45;PP=1320;SC=CATTTACTCCATTTAAGAAAA;SOR=7.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=45;WE=67101810;WS=67101792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	67109335	rs7526812	A	G	7237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=161;NR=55;PP=2965;SC=GACATTCTTAAGAATGCTGCA;SOR=2.097;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=217;TCF=162;TCR=55;TR=216;WE=67109343;WS=67109325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr1	67126114	rs12094526	A	G	11109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=220;NR=116;PP=2965;SC=GTTATCCTGAACCTTGACCTG;SOR=1.454;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=337;TCF=221;TCR=116;TR=336;WE=67126122;WS=67126104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,341:1.00:341
chr1	67126164	rs41305636	T	C	4636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.786;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=95;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.299;SC=TCATTTTCTCTTTATTCTTCC;SOR=0.491;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=383;TCF=181;TCR=202;TR=188;WE=67126172;WS=67126154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,188:0.49:387
chr1	67136537	rs6686606	C	T	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=3;PP=549;SC=CAATTTCCTACTTAAATGCGG;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=67136545;WS=67136527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	67145322	rs10889644	C	A	9798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=222;NR=80;PP=2965;SC=ACTTAGGAAGCACATGACCAA;SOR=2.138;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=302;TCF=222;TCR=80;TR=302;WE=67145330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr1	67149706	rs10749764	G	C	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=364;SC=AGCCCTAAATGCTTTTTGGCC;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=67149714;WS=67149696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	67154730	.	CAAA	C,CA	3985.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.000;DP=239;ExcessHet=3.0103;FS=4.497;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.27;MQRankSum=0.412;QD=26.75;ReadPosRankSum=-0.650;SOR=2.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:8,55,86:0.37,0.58:149
chr1	67160336	rs2146904	A	G	2529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=69;PP=2028;SC=ACTGTTCATCATGGAACTCGT;SOR=4.202;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=80;TCF=10;TCR=70;TR=79;WE=67160344;WS=67160326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	67266756	rs549148	T	A	2458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=36;PP=1632;SC=GATCCCCTCCTGATGCCTTCT;SOR=0.855;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=66;WE=67266764;WS=67266746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	67288045	rs482082	C	T	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.664;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=15;PP=845;ReadPosRankSum=0.451;SC=GAGTCTTACCCGGCCAGTTTC;SOR=0.752;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=166;TCF=117;TCR=49;TR=51;WE=67288053;WS=67288035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,52:0.31:170
chr1	67292473	rs34718535	A	AT	1865.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.974;NF=37;NR=3;PP=2859;ReadPosRankSum=1.003;SC=TGCTTCTACTAAAATTTATGC;SOR=0.768;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=60;TCF=56;TCR=4;TR=40;WE=67292486;WS=67292463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,45:0.69:65
chr1	67292478	rs36067642	T	A	1932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.693;NF=43;NR=3;PP=2857;ReadPosRankSum=0.269;SC=CTACTAAAATTTATGCAAGAA;SOR=0.784;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=68;TCF=64;TCR=4;TR=46;WE=67292486;WS=67292463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,50:0.69:72
chr1	67303303	rs6698076	A	G	1606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=2;PP=1347;ReadPosRankSum=-1.636;SC=AATTTTCTAGACTTTATTTAA;SOR=1.127;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=75;TCF=72;TCR=3;TR=53;WE=67303311;WS=67303293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,53:0.69:77
chr1	67359195	rs3008881	T	A	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=425;ReadPosRankSum=0.567;SC=GAAAAAAGATTAGTATAATGC;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=17;WE=67359203;WS=67359185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr1	67390416	rs3008858	G	C	4991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=1.933;SC=GGGGAGTGGTGCACCACCCCT;SOR=0.951;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=277;TCF=112;TCR=165;TR=184;WE=67390424;WS=67390406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,184:0.66:278
chr1	67390468	rs1886686	C	G	3985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.088;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=106;PP=2962;ReadPosRankSum=0.465;SC=CCAAGCTCCTCCGTTAGCGGC;SOR=1.058;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=198;TCF=55;TCR=143;TR=143;WE=67390476;WS=67390458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,144:0.71:202
chr1	67396222	rs3008861	T	G	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=472;ReadPosRankSum=0.166;SC=AACAGGCCATTCTCTGGGCGG;SOR=1.255;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=20;WE=67396230;WS=67396212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr1	67425311	rs2985794	T	G	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=401;ReadPosRankSum=0.420;SC=ATATGTAGATTTAGACAGGAT;SOR=0.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=17;WE=67425319;WS=67425301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr1	67425494	rs35465377	A	AT	324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=203;ReadPosRankSum=-0.081;SC=TCGTGTAATTATTTTTTTTTT;SOR=1.255;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=17;WE=67425502;WS=67425484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr1	67438535	rs12131222	A	T	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.117;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=439;ReadPosRankSum=-0.043;SC=ATATGCAATAATTGGGGGAAT;SOR=0.867;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=100;TCF=84;TCR=16;TR=29;WE=67438543;WS=67438525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,29:0.28:103
chr1	67442210	rs11208978	C	T	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=140;ReadPosRankSum=-0.394;SC=TTTCAAACTTCAGATGTTTAT;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=9;WE=67442218;WS=67442200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr1	67442275	rs11208979	C	T	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.995;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=354;ReadPosRankSum=-0.198;SC=TTGTTTCTTACAGGTCCGAAC;SOR=1.626;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=85;TCF=55;TCR=30;TR=26;WE=67442283;WS=67442265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,29:0.32:90
chr1	67447450	rs12039172	A	G	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=1.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.08;ReadPosRankSum=0.088;SOR=0.262;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,29:0.27:107
chr1	67452322	rs17497828	G	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=119;ReadPosRankSum=-0.219;SC=CCCAAACAGTGTTAAAAGCCA;SOR=0.247;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=8;WE=67452330;WS=67452312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr1	67474977	rs2755271	C	T	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	67487119	rs2065002	C	A	1336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.934;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=3;PP=1113;ReadPosRankSum=-0.341;SC=TAGGCTGACACACTCAGGAGA;SOR=1.347;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=70;TCF=65;TCR=5;TR=48;WE=67487127;WS=67487109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,47:0.69:68
chr1	67487374	rs146592108	TCCAACACAGACACAGACACAGACA	T	971.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.404;HP=4;HapScore=3;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=5.406;NF=2;NR=21;PP=605;ReadPosRankSum=-1.173;SC=CGAGTCTGCCTCCAACACAGA;SOR=0.430;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=62;TCF=4;TCR=58;TR=23;WE=67487415;WS=67487364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr1	67487439	rs12036898	C	T	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.101;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=11;PP=174;ReadPosRankSum=-0.469;SC=CACACACACACACAGGTATAT;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=11;WE=67487447;WS=67487429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr1	67508080	rs10546548	CCACT	C	1379.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.867;NF=2;NR=25;PP=1231;ReadPosRankSum=-0.426;SC=GTACAAAATACCACTCAAACT;SOR=0.519;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=55;TCF=4;TCR=51;TR=27;WE=67508091;WS=67508070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,36:0.59:61
chr1	67512903	rs1024229	G	T	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.056;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=350;ReadPosRankSum=-2.053;SC=GAATTGACATGCCAACATCAG;SOR=2.233;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=18;WE=67512911;WS=67512893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr1	67512920	rs1024230	A	C	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.559;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=488;ReadPosRankSum=-1.777;SC=TCAGTACACAACTGTTAAAGC;SOR=1.615;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=23;WE=67512928;WS=67512910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,23:0.70:33
chr1	67516316	rs2815383	T	A	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=-0.126;SC=TAATTTATGGTTAAACCCCTG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=67516324;WS=67516306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr1	67558739	rs6588237	C	T	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=4;PP=1031;SC=TATCCAGTGGCGTTACATTAT;SOR=3.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=38;WE=67558747;WS=67558729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	67558756	rs41313272	C	T	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.86;ReadPosRankSum=-1.317;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
chr1	67558763	rs41299551	A	G	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=2.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.562;SOR=1.139;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,19:0.30:64
chr1	67560856	rs72933967	G	A	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=174;ReadPosRankSum=1.007;SC=AAATATATGGGTGATTCCCAT;SOR=0.188;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=10;WE=67560864;WS=67560846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr1	67560897	rs10889653	A	G	1932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=6;PP=1456;SC=TTTACTTAACAATAGATGATA;SOR=4.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=54;TCR=6;TR=60;WE=67560905;WS=67560887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	67560956	rs11208997	C	T	2795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=33;PP=2079;SC=CTAACGTTGACTATCTTGGCA;SOR=1.371;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=55;TCR=33;TR=88;WE=67560964;WS=67560946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	67561090	rs72933970	T	C	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-4.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.890;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=163;ReadPosRankSum=-1.079;SC=ATCGTTCATCTGTGGAGATTT;SOR=0.052;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=13;WE=67561098;WS=67561080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr1	67561909	rs11801593	G	A	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=282;ReadPosRankSum=0.200;SC=ACAGAACAAAGTATTAAGCAT;SOR=0.582;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=61;TCF=49;TCR=12;TR=18;WE=67561917;WS=67561899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,17:0.27:62
chr1	67562106	rs6670381	G	T	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=496;ReadPosRankSum=0.369;SC=CATATGGAAAGTACCTAGTAT;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=22;WE=67562114;WS=67562096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr1	67562146	rs11805123	A	T	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=63;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTACCCAGTAAATATTTCTTG;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=5;WE=67562154;WS=67562136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr1	67569128	rs148512971	ATAAT	A	226.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.558;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=290;ReadPosRankSum=0.958;SC=ATATTAATAAATAATTTATGC;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=8;WE=67569139;WS=67569118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr1	67577367	rs6588240	A	T	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=811;ReadPosRankSum=0.511;SC=CTATTAAGTTACTTCTAATTA;SOR=0.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=52;TCF=22;TCR=30;TR=39;WE=67577375;WS=67577357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,42:0.75:56
chr1	67577444	.	C	CA	484.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.463;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=815;ReadPosRankSum=0.797;SC=ATTTTATTTACTTACATATGC;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=13;WE=67577453;WS=67577434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr1	67577445	.	T	C	493.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.713;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=844;ReadPosRankSum=0.943;SC=TTTTATTTACTTACATATGCA;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=13;WE=67577453;WS=67577434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr1	67579245	rs2144655	G	A	154.41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.6699;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=117;ReadPosRankSum=-0.792;SC=ACAGGGTTTCGCCATGTTGGT;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=67579253;WS=67579235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr1	67579386	rs2144656	A	G	1572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.95;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	67579386	.	ATGAGAATCC	GTGAGAATCC,GTGAGAATCT	659	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=25,6;NR=20,4;PP=659,169;QD=15.4171380566;SC=ACTAAGTACAATGAGAATCCG;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=25;TCR=20;TR=45,10;WE=67579403;WS=67579376;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:45
chr1	67579395	rs17129659	C	T	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.68;ReadPosRankSum=-0.401;SOR=0.850;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,14:0.28:50
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chr1	67672911	rs7539643	C	T	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=47;ReadPosRankSum=1.658;SC=ATTTTAGATTCGGGGGCACAT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=67672919;WS=67672901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
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chr1	67852141	rs12138812	A	G	2055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=1;PP=1758;SC=AATTTACCTTATTCTTGAGCA;SOR=6.770;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=59;TCF=58;TCR=1;TR=59;WE=67852149;WS=67852131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
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chr1	67861520	rs2229546	C	A	6595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=128;NR=64;PP=2965;SC=ACCCAAAGCCCGAAAACCCAG;SOR=1.528;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=192;TCF=128;TCR=64;TR=192;WE=67861528;WS=67861510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
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chr1	68603731	rs1831297	A	G	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=176;ReadPosRankSum=-0.412;SC=TGTGGGAAACATGAAGGGCCA;SOR=1.012;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=12;WE=68603739;WS=68603721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,14:0.29:49
chr1	68614013	rs2566789	A	G	3678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=93;PP=2965;SC=ACATTACAGAAATCCTAAAGA;SOR=5.097;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=7;TCR=93;TR=100;WE=68614021;WS=68614003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
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chr1	68652184	rs5774920	T	TA	769.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.904;HP=13;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=2;PP=421;ReadPosRankSum=-1.065;SC=CACGAAAAGTTAAAAAAAAAA;SOR=0.199;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=83;TCF=80;TCR=3;TR=35;WE=68652192;WS=68652174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,38:0.64:59
chr1	68903942	rs12145904	C	T	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=465;ReadPosRankSum=-0.305;SC=TTTTTTTCACCTCTTCCCAGT;SOR=0.527;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=14;TCR=57;TR=24;WE=68903950;WS=68903920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,24:0.33:72
chr1	68904513	rs12138573	A	G	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=159;ReadPosRankSum=2.202;SC=TGACTCTCACATAACTCTTGC;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=11;WE=68904521;WS=68904503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
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chr1	68915479	rs3125907	A	T	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=304;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTTCCTAAACAGGTCATTAAT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=14;WE=68915487;WS=68915469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr1	68943436	rs1924542	G	A	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=1.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.369;SOR=0.711;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,40:0.33:122
chr1	68943442	rs3790476	A	G	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.664;SOR=0.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,39:0.33:118
chr1	68943665	rs12119046	T	G	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=174;ReadPosRankSum=0.139;SC=TCTGTAGTGATCAAAATGATA;SOR=1.101;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=11;WE=68943673;WS=68943655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,13:0.25:52
chr1	68947318	rs3833522	C	CA	5527.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.279;NF=31;NR=108;PP=2979;ReadPosRankSum=-1.539;SC=AATACCCCCCCAAAAATCATC;SOR=0.557;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=152;TCF=36;TCR=116;TR=139;WE=68947326;WS=68947308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,178:0.99:179
chr1	68949139	rs10789263	T	C	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.181;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=28;PP=715;ReadPosRankSum=-0.474;SC=TTGAGTTCAATTGACAACAGT;SOR=0.070;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=33;WE=68949147;WS=68949129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,33:0.66:50
chr1	68952564	rs144376749	AACAC	A,AACACAC	412.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.272;NF=8,8;NR=0,0;PP=324,336;ReadPosRankSum=-0.625;SC=CTATCAATATAACACACACAC;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=8,8;WE=68952575;WS=68952554;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.61:18
chr1	68960476	rs4926345	T	G	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=68;ReadPosRankSum=0.947;SC=TTAATTCACATCTGATTATAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=68960484;WS=68960466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr1	70034370	rs11280966	C	CCAGCCGCGTG	4289.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=64.54;QD=47.66;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	70226125	rs12407496	T	C	1599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.520;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=49;PP=1275;ReadPosRankSum=-0.078;SC=TATTTCATAATTTTCAAATAC;SOR=2.049;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=79;TCF=7;TCR=72;TR=52;WE=70226133;WS=70226115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,54:0.66:82
chr1	70481939	.	A	AT	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=24;ReadPosRankSum=0.385;SC=CATGTTAAACATTTTTTATTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=2;WE=70481947;WS=70481929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	70587360	rs641909	C	T	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=314;SC=TAAAAACTGACAACTTTTTGT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=70587368;WS=70587350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	70904523	rs112004441	T	TTG,TTGTG	2318.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=1,1;NR=46,46;PP=207,1529;SC=AGTCTTATTATTGTGTGTGTG;SOR=6.556;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=101;TCF=5;TCR=96;TR=47,47;WE=70904531;WS=70904513;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.17,0.83:53
chr1	70904800	rs1021737	G	T	5462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=71;PP=2965;SC=CCAAGTGGAAGTCACAGCTAG;SOR=1.088;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=94;TCR=71;TR=165;WE=70904808;WS=70904790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr1	71331498	rs1409986	A	G	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=16;PP=1059;SC=ATCACAGTAGAGGTGGGAAGA;SOR=1.236;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=25;TCR=16;TR=41;WE=71331506;WS=71331488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	71334870	rs1536537	C	T	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.167;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=387;ReadPosRankSum=0.313;SC=GTATGTGTGTCGGGGCAGGGG;SOR=0.863;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=66;TCF=54;TCR=12;TR=21;WE=71334878;WS=71334860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,23:0.31:74
chr1	71419499	rs571705	C	T	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=568;SC=ACAGTATAAGCTTGCTATAAT;SOR=4.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=71419507;WS=71419489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	71440217	rs2072947	C	T	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=391;SC=CTCATTTCTACTTCCATGCTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=71440225;WS=71440207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	71531596	rs17090778	A	G	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=520;SC=ATGCAGAGAAACAAGACTGTG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=71531604;WS=71531586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	71533287	rs66461782	A	T	150.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=5;NR=0;PP=151;SC=TTTTTTCTTCACTTGTATATT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=71533295;WS=71533277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	71537943	rs11209745	A	G	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=15;PP=626;SC=TCCAAACTAGAGAAAAACAAT;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=27;WE=71537951;WS=71537933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	71544079	rs10574763	CAAG	C	2116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.571;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.759;NF=44;NR=1;PP=1809;ReadPosRankSum=-2.041;SC=GTAATATAAACAAGTAGTGGC;SOR=0.284;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=71;TCF=70;TCR=1;TR=45;WE=71544089;WS=71544069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,57:0.71:80
chr1	71873154	rs41289154	T	G	2079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.542;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=26;PP=1519;ReadPosRankSum=0.889;SC=ATTCTTCAGGTAGAATATGCT;SOR=1.122;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=118;TCF=72;TCR=46;TR=74;WE=71873162;WS=71873144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,81:0.63:128
chr1	72058367	rs1334004	C	T	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=1;PP=426;SC=GTAAGGATTGCGTGATGTATA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=72058375;WS=72058357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	72058405	rs1334005	T	C	940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=4;PP=826;SC=GGTTGAGTTTTAAAATGAACG;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=72058413;WS=72058395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	72058552	rs1413368	G	A	2268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=31;PP=1760;SC=CAGCCACACAGGTATAATTGC;SOR=0.898;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=38;TCR=31;TR=69;WE=72058560;WS=72058542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	72242039	rs6424448	G	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=279;ReadPosRankSum=-1.004;SC=GTTGAAGTACGTATGATTAAT;SOR=0.631;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=14;WE=72242047;WS=72242029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr1	72747844	rs3101341	C	T	1189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=1;PP=908;SC=CGGGCCGGGGCTCCGGGAAGA;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=35;WE=72747852;WS=72747834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	74507711	rs7538410	T	G	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=167;SC=ATAAGAACCTTTTATTTACTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=74507719;WS=74507701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	74575182	rs1340472	C	T	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=19;PP=803;SC=ATCCATTTTGCTTCATATCCT;SOR=0.984;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=34;WE=74575190;WS=74575172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	74646514	rs6701961	C	T	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=46;PP=1390;SC=AATAAATATTCTTCAAAAAGG;SOR=4.977;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=3;TCR=46;TR=49;WE=74646522;WS=74646504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	74648182	rs1047127	A	C	1036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.996;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=800;ReadPosRankSum=-0.318;SC=TTTCCCTTTTATACATTTAAT;SOR=0.320;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=57;TCF=46;TCR=11;TR=34;WE=74648190;WS=74648172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,36:0.61:59
chr1	74664149	rs4422957	T	C	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=5.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.762;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=40;PP=1389;ReadPosRankSum=0.258;SC=TTCTCATCTGTAGGCCTATGA;SOR=0.932;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=94;TCF=32;TCR=62;TR=58;WE=74664157;WS=74664139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,61:0.61:100
chr1	74665441	.	A	C	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=0.000;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=5.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.268;SOR=1.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:169,64:0.27:233
chr1	74665493	rs792310	G	A	3684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.122;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=91;PP=2926;ReadPosRankSum=-0.441;SC=ACGTTTTTGTGGATCCTGCTG;SOR=0.486;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=180;TCF=52;TCR=128;TR=131;WE=74665501;WS=74665483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,133:0.71:188
chr1	74666344	rs35329584	A	AC	289.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.319;NF=6;NR=2;PP=304;ReadPosRankSum=-0.183;SC=GACTGCCACCAGCCTGGCTAA;SOR=0.368;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=8;WE=74666352;WS=74666334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr1	74666507	rs9804006	T	C	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.147;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=305;ReadPosRankSum=-0.326;SC=TCTGAGGTACTCAAGAGTTAA;SOR=0.440;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=52;TCF=20;TCR=32;TR=18;WE=74666515;WS=74666497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,18:0.34:53
chr1	74669973	rs9425024	T	G	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=468;SC=TATCGTTAAATATATTTTGAT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=74669981;WS=74669963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	74670172	rs12046751	A	G	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=2.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.00;ReadPosRankSum=-0.256;SOR=0.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,19:0.22:86
chr1	74671519	rs571848	A	G	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.828;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=439;ReadPosRankSum=0.835;SC=TGATGTAGAGATATTTTAAAT;SOR=0.098;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=21;WE=74671527;WS=74671509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr1	74701295	rs505508	T	A	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=456;SC=GCAGCATGTTTTGTGAAAGTC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=74701303;WS=74701285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	74705494	rs41289182	G	T	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-6.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.920;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=3;PP=948;ReadPosRankSum=-0.162;SC=AAGACAGAAAGAGCTAAATAG;SOR=1.609;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=63;TCF=57;TCR=6;TR=41;WE=74705502;WS=74705484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,42:0.66:64
chr1	74716515	rs67159904	CT	C	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=5.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=1.788;QD=0.79;ReadPosRankSum=1.205;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,9:0.20:45
chr1	74801871	rs138935678	G	C	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=330;ReadPosRankSum=-0.429;SC=GCTATCATTTGCTTTATGTAT;SOR=0.504;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=16;WE=74801879;WS=74801861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,18:0.38:48
chr1	74819077	rs6424586	T	G	3569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=66;PP=2837;SC=ACTAGTTCTATATGCTTATCA;SOR=1.253;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=41;TCR=66;TR=107;WE=74819085;WS=74819067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	74841173	rs2880795	A	C	649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=490;SC=CTGAAAGATTAGAAACCTCCC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=74841181;WS=74841163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	75006027	rs3895907	A	G	2949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=60;PP=2361;SC=AGGTTTGTTAAGAAAACTACC;SOR=1.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=28;TCR=60;TR=88;WE=75006035;WS=75006017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	75006076	rs3845348	G	A	1808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=48;PP=1547;SC=AAGGGAGAAAGCATTGCATAT;SOR=4.654;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=4;TCR=48;TR=52;WE=75006084;WS=75006066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	75036783	rs9326115	T	C	3637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=27;PP=2965;SC=TTAAACTCACTGTCTGCCAGC;SOR=2.448;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=90;TCR=27;TR=117;WE=75036791;WS=75036773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	75036812	rs9326116	C	T	4696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=42;PP=2965;SC=TAGACCTGCACGTTGTTGGGG;SOR=1.934;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=104;TCR=42;TR=146;WE=75036820;WS=75036802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr1	75037845	rs12723334	A	G	4509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.888;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=90;PP=2965;ReadPosRankSum=0.799;SC=CTCTGGCTTCACTCAGTCTTT;SOR=0.870;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=150;TCF=60;TCR=90;TR=148;WE=75037853;WS=75037835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,151:0.99:153
chr1	75038228	rs11580409	A	C	8462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.147;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=129;PP=2965;ReadPosRankSum=1.744;SC=TCTCTTGCTAAATCTAATTCC;SOR=0.336;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=249;TCF=120;TCR=129;TR=248;WE=75038236;WS=75038218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,257:1.00:258
chr1	75042626	.	TA	T	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=5.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=-1.634;QD=1.66;ReadPosRankSum=-1.248;SOR=0.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,9:0.23:39
chr1	75097426	rs11210490	G	C	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.569;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=14;PP=1165;ReadPosRankSum=0.021;SC=AAGCCATTTGGAGCAGTGGTT;SOR=1.300;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=87;TCF=62;TCR=25;TR=54;WE=75097434;WS=75097416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,55:0.60:91
chr1	75108863	rs623171	A	C	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=547;ReadPosRankSum=-1.552;SC=ATTCCAACAGATAACTATATT;SOR=0.516;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=23;WE=75108871;WS=75108853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr1	75172001	rs7527057	T	A	4243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.743;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=26;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.739;SC=GAATCATTTTTCCAGTAGCCC;SOR=2.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=108;TCR=27;TR=134;WE=75172009;WS=75171991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,136:0.99:137
chr1	75172756	rs71695861	TAA	T	2448.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=21;NR=44;PP=1094;SC=ATTAAAGTGGTAAAAAAAAAA;SOR=1.209;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=85;TCF=26;TCR=59;TR=65;WE=75172778;WS=75172746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	75190452	rs1051122	C	T	2731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=42;PP=2096;SC=GGACTTCTGGCCCACCAAATT;SOR=0.855;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=49;TCR=42;TR=91;WE=75190460;WS=75190442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	75199152	rs277373	C	T	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=42;PP=1228;SC=TGCGAAACTTCAGGAGCCCTG;SOR=3.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=6;TCR=42;TR=48;WE=75199160;WS=75199142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	75214390	rs749690	G	C	2426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=21;PP=2034;SC=CAGATGATCTGGTTACCCACA;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=54;TCR=21;TR=75;WE=75214398;WS=75214380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	75602384	rs71500673	G	T	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.069;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=541;ReadPosRankSum=0.054;SC=GGTGAGTGCGGAGGGGCTCGC;SOR=0.156;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=24;WE=75602392;WS=75602374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,28:0.80:35
chr1	75603055	rs1526503	A	G	1314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=32;PP=1054;SC=GTTCTGGGTGAAGGTTGTAGG;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=38;WE=75603063;WS=75603045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	75603101	rs6695423	A	G	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=334;ReadPosRankSum=-0.103;SC=AGGGCAACTCATGCGGTGGGA;SOR=0.512;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=16;WE=75603109;WS=75603091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr1	75614380	rs35220110	CT	C	2202.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=8.195;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.16;MQRankSum=0.215;QD=22.25;ReadPosRankSum=1.016;SOR=3.477;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,98:0.99:99
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chr1	75680433	rs687715	G	A	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=2.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.10;ReadPosRankSum=-1.020;SOR=0.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,26:0.29:90
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chr1	75681511	rs595009	T	C	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.666;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=593;ReadPosRankSum=-0.287;SC=TCAGGCAGCATTGTAGGAATT;SOR=0.468;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=108;TCF=50;TCR=58;TR=34;WE=75681519;WS=75681501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,34:0.31:110
chr1	75685403	rs600734	T	C	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=9.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.10;ReadPosRankSum=1.404;SOR=1.601;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,47:0.29:163
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chr1	75766186	rs623850	G	A	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=250;ReadPosRankSum=0.708;SC=AAAGACAACAGTCAATAATAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=11;WE=75766194;WS=75766176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr1	75823084	rs1249833	C	T	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=234;SC=TCTCTGAGCACTGAGTAGAAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=75823092;WS=75823074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	76143443	rs7513363	A	G	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.725;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.062;NF=9;NR=24;PP=497;ReadPosRankSum=0.032;SC=CAAGGGAGGAACCAAGATGGC;SOR=0.900;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=119;TCF=36;TCR=83;TR=33;WE=76143451;WS=76143433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,37:0.30:122
chr1	76143458	rs7516122	T	C	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.054;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.822;NF=8;NR=24;PP=490;ReadPosRankSum=-0.380;SC=GATGGCCGAATAGGAACAGCT;SOR=0.439;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=102;TCF=23;TCR=79;TR=32;WE=76143466;WS=76143448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,34:0.33:104
chr1	76143505	rs1746748	T	C	1076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=37;PP=837;SC=ACGCAGAAGATGGGTGATTTC;SOR=7.378;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=38;WE=76143513;WS=76143495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	76190569	rs1251075	C	G	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.507;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=212;ReadPosRankSum=1.057;SC=GCAGGGGGCCCTGGGCCAAAA;SOR=1.656;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=13;WE=76190577;WS=76190559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,13:0.26:50
chr1	76194054	rs7524467	C	G	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.183;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=359;ReadPosRankSum=0.308;SC=TTTAACTTATCAAATTTATTT;SOR=0.105;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=47;TCF=41;TCR=6;TR=19;WE=76194062;WS=76194044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr1	76194229	rs11316888	GT	G	1209.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=32;PP=1346;SC=AGCTTTATATGTTTTGTTTGG;SOR=4.461;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=35;WE=76194237;WS=76194219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	76194306	rs1146572	A	G	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=317;SC=TCCACAGATAATTTACAATAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=76194314;WS=76194296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	76198436	rs2275378	T	C	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.024;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=311;ReadPosRankSum=-0.169;SC=AGTAGGTATATACATTTTAAA;SOR=0.492;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=18;WE=76198444;WS=76198426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,21:0.30:69
chr1	76198785	rs3818855	G	A	1502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.851;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=40;PP=1129;ReadPosRankSum=-0.014;SC=ACCTAGATGCGTTTTTCCTTC;SOR=0.435;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=246;TCF=103;TCR=143;TR=74;WE=76198793;WS=76198775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,75:0.30:251
chr1	76199345	rs2153126	C	G	1500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.540;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=52;PP=1278;ReadPosRankSum=1.462;SC=CTACCTAACTCAGCTCTTGTT;SOR=0.427;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=177;TCF=33;TCR=144;TR=67;WE=76199353;WS=76199335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,66:0.36:184
chr1	76205643	rs12127402	C	A	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=246;ReadPosRankSum=-2.804;SC=AATTTCATTTCTCTTGTTTTT;SOR=0.349;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=49;TCF=44;TCR=5;TR=16;WE=76205651;WS=76205633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,17:0.33:52
chr1	76227022	rs1061337	A	G	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.729;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=436;ReadPosRankSum=-0.624;SC=AATATCCTGTAGAAAAACTAA;SOR=0.180;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=77;TCF=14;TCR=63;TR=26;WE=76227030;WS=76227012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,26:0.34:77
chr1	76228487	rs17848065	G	A	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=593;ReadPosRankSum=0.036;SC=TAGAACACAAGCCACTGTTTC;SOR=0.586;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=31;WE=76228495;WS=76228477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,35:0.81:43
chr1	76234886	rs1146593	A	G	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=19;PP=874;SC=TCACCTTCCAACATCATTGAA;SOR=0.984;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=32;WE=76234894;WS=76234876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	76235001	rs1826978	A	G	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=117;ReadPosRankSum=0.015;SC=GTGAAAATGGACTAATACAGT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=76235009;WS=76234991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	76252011	rs1146634	G	A	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.063;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=174;ReadPosRankSum=0.465;SC=CAGACAGGGTGGAGTAGGGTT;SOR=0.480;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=17;WE=76252019;WS=76252001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,20:0.33:61
chr1	76252183	rs35505941	G	A	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=253;ReadPosRankSum=-0.778;SC=TGTAGGGAGGGCCTGTTAAGA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=13;WE=76252191;WS=76252173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
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chr1	76257892	rs12703	A	T	3304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=73;NR=24;PP=2566;SC=GATTTCTGGCAATTACAAGTC;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=73;TCR=24;TR=97;WE=76257900;WS=76257882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	76260837	rs11161626	C	T	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=31;ReadPosRankSum=0.737;SC=AATCTACCATCTTAAAATGGG;SOR=0.120;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=4;WE=76260845;WS=76260827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr1	76261059	rs72482955	CTG	C	728.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=660;ReadPosRankSum=0.585;SC=GACAGAATCTCTGTTGCCCAG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=14;WE=76261068;WS=76261049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr1	76269372	rs5745323	T	C	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.96;ReadPosRankSum=0.219;SOR=0.073;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,7:0.20:35
chr1	76272654	rs5745328	A	T	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=6;PP=1007;ReadPosRankSum=-0.224;SC=TTCTTTATTTAAAAATTTACA;SOR=0.883;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=53;TCR=9;TR=40;WE=76272662;WS=76272644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,40:0.62:64
chr1	76276353	rs12122939	T	C	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=142;ReadPosRankSum=-1.072;SC=AAGCTTTATTTAAGAAATTGT;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=8;WE=76276361;WS=76276343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr1	76280543	rs1144339	A	G	220.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=149;SC=ACTTAGCAAGAATAATCATTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=76280551;WS=76280533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	76313874	rs2047435	C	T	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.550;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=627;ReadPosRankSum=0.185;SC=TAAATACTCACATTTGTTTGT;SOR=1.272;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=28;WE=76313882;WS=76313864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr1	76314000	rs41291514	A	G	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.708;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=733;ReadPosRankSum=-1.061;SC=ATTATTATACATTATTTGATG;SOR=0.070;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=34;WE=76314008;WS=76313990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,36:0.77:47
chr1	76333163	rs5745433	T	G	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=814;ReadPosRankSum=-0.285;SC=TAAATATTTATGGTGTCCATC;SOR=0.569;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=19;WE=76333181;WS=76333153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr1	76333173	rs5745434	C	T	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=1162;ReadPosRankSum=-0.666;SC=TGGTGTCCATCCAAATTTGGG;SOR=0.668;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=25;WE=76333181;WS=76333153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr1	76342858	rs5745442	T	G	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=57;ReadPosRankSum=0.475;SC=ATAAGTAGAATAAATAGGGTA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=76342866;WS=76342848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr1	76344011	rs1493367	C	A	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=33;PP=850;ReadPosRankSum=-1.002;SC=CAGGTAATTTCTTTATTTGAT;SOR=0.693;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=52;TCF=6;TCR=46;TR=38;WE=76344019;WS=76344001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,40:0.71:56
chr1	76344711	rs5745449	A	T	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.471;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=722;ReadPosRankSum=0.117;SC=AATATAGTCTACCTTTAAGGA;SOR=0.379;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=61;TCF=37;TCR=24;TR=35;WE=76344719;WS=76344701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,38:0.59:64
chr1	76344856	rs5745451	T	C	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.368;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=372;ReadPosRankSum=0.226;SC=TCTGATTTTATAGAATTACAT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=15;WE=76344864;WS=76344846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr1	76344920	rs5745453	G	A	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=198;SC=TGAATGTTCTGTATCTTCTCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=76344928;WS=76344910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	76346920	rs5745466	C	CAT	1616.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=4;PP=1419;SC=TCTTACCAAACGTGTTTTCAG;SOR=3.442;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=76346928;WS=76346910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	76378360	.	T	TA	281.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.81;ReadPosRankSum=1.469;SOR=0.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,18:0.24:74
chr1	76378361	rs5020911	T	A	1456.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.86;ReadPosRankSum=1.086;SOR=0.583;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,66:0.67:98
chr1	76378362	rs2881857	T	A	366.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=2.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.63;ReadPosRankSum=1.645;SOR=1.011;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,29:0.29:101
chr1	76378502	rs5745549	G	A	2500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.651;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=62;PP=2003;ReadPosRankSum=-0.534;SC=ATATATTTAAGTAACCTCAAG;SOR=1.135;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=135;TCF=47;TCR=88;TR=92;WE=76378510;WS=76378492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,93:0.68:137
chr1	76608691	rs12064337	G	T	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.059;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=36;PP=839;ReadPosRankSum=-0.458;SC=GCAAAGGAGGGATTACTTTCT;SOR=1.403;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=79;TCF=14;TCR=65;TR=42;WE=76608699;WS=76608681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,43:0.52:82
chr1	76608777	rs184095	C	T	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=623;SC=AAATTGAACTCACCCTGTTTA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=76608785;WS=76608767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	76771475	rs10782610	G	T	2648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=76;NR=5;PP=2218;SC=ATCAGTTAGAGAATTATTTAT;SOR=4.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=76;TCR=5;TR=81;WE=76771483;WS=76771465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	76773440	rs76783328	T	G	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=291;ReadPosRankSum=-0.512;SC=ATTTTGTGGTTAAAGACTACT;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=13;WE=76773448;WS=76773430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
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chr1	77627096	rs839825	G	A	1163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=23;PP=1003;SC=TGATGCTATGGAAAGGGGGAA;SOR=1.675;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=35;WE=77627104;WS=77627086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	77634948	rs1779199	G	A	3400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=85;NR=15;PP=2718;SC=AATTTACCTCGTAACTTCTAT;SOR=3.507;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=101;TCF=86;TCR=15;TR=100;WE=77634956;WS=77634938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr1	77747982	rs116049705	G	A	3277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.020;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=47;PP=2441;ReadPosRankSum=0.985;SC=GCGCCCCAAGGCACGCGCGGC;SOR=0.535;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=178;TCF=110;TCR=68;TR=120;WE=77747990;WS=77747972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,125:0.68:184
chr1	77763542	rs1167206	G	A	1831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=41;PP=1589;SC=CAGAGATAAAGCAAAAATTGA;SOR=2.107;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=56;WE=77763550;WS=77763532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	78001881	rs10873948	T	C	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=10;PP=367;SC=CACAGTGGCTTATGCCTGTAA;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=78001889;WS=78001871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	78024284	rs6675743	T	C	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=3;PP=633;SC=CTTTTAAATATAGATAAATGC;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=78024292;WS=78024274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	78024345	rs79671213	C	CTAT	1903.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=9;PP=1644;SC=GCTATTGACTCTATTTTCTGA;SOR=2.093;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=35;WE=78024353;WS=78024335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	78031994	rs7552291	A	G	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=31;PP=891;SC=GGACAGTAATATAACACACAA;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=78032002;WS=78031984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	78033981	rs145860524	AAAATG	A	999.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=5;PP=1110;SC=ATAAATAAATAAAATGAAATG;SOR=2.494;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=23;WE=78033993;WS=78033971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	78045369	rs1565852	G	A	1979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=53;PP=1630;SC=TTAAATATTGGATTTCTAAAT;SOR=6.736;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=54;TCF=1;TCR=53;TR=54;WE=78045377;WS=78045359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	78046496	rs112924481	T	C	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=426;ReadPosRankSum=-0.106;SC=TTTGTATTTTTAGTAGGGTTT;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=15;WE=78046504;WS=78046486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr1	78179032	rs71075758	AT	A	220.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=152;ReadPosRankSum=-0.669;SC=CATTAAACTCATTTTTTTTTT;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=11;WE=78179040;WS=78179022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr1	78281002	rs11162386	T	C	268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=222;SC=GTCTGTCTTATGTAATAATAG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=11;WE=78281010;WS=78280992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	78383467	rs1749913	G	A	1931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=51;PP=1538;SC=CTTTATTCTCGTGAAAATATT;SOR=3.187;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=10;TCR=51;TR=61;WE=78383475;WS=78383457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	78392446	rs1166698	G	A	1298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=7.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.851;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=9;PP=951;ReadPosRankSum=0.097;SC=ACTTTCTCCCGGAAAATTGAA;SOR=0.523;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=146;TCF=121;TCR=25;TR=50;WE=78392454;WS=78392436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,53:0.35:150
chr1	78399207	rs4483454	C	G	1791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=50;PP=1478;SC=ATTTATTAAGCTAAATATTTT;SOR=5.784;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=52;TCF=1;TCR=51;TR=51;WE=78399215;WS=78399197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	78430689	rs11409017	A	AG	7303.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.85;NF=80;NR=103;PP=2967;SC=TATTAACAAAAGAAGTGGACA;SOR=0.787;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=192;TCF=88;TCR=104;TR=183;WE=78430697;WS=78430679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr1	78471060	rs11384806	T	TC	351.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.31;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	78478675	rs3790586	G	A	1350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=2;PP=1162;ReadPosRankSum=1.854;SC=TACAGTTTTTGAAAGTTTAAC;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=44;WE=78478683;WS=78478665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr1	78481640	rs1039863	G	A	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=3;PP=798;SC=GGTAAAATTTGTGCTTAGATT;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=78481648;WS=78481630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	78560583	rs565164	G	A	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=184;ReadPosRankSum=0.126;SC=TGAGATTGGTGCATTCATTAC;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=10;WE=78560591;WS=78560573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr1	78578177	rs6666954	T	C	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.618;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=380;ReadPosRankSum=1.284;SC=ATGTTGAAATTATGGTCTCTG;SOR=0.059;SbPval=0.06;Source=Platypus;TC=65;TCF=16;TCR=49;TR=23;WE=78578185;WS=78578167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,26:0.38:69
chr1	78585086	rs540742	T	C	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.196;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.458;NF=34;NR=17;PP=848;ReadPosRankSum=1.251;SC=GAAATAGAGCTGAGGTCAAAG;SOR=0.512;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=165;TCF=114;TCR=51;TR=51;WE=78585094;WS=78585076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,56:0.32:177
chr1	78591740	rs139844601	TAAC	T	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=29;ReadPosRankSum=0.674;SC=CTTTTGAAGATAACAATATTT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=78591750;WS=78591730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
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chr1	79095526	rs3820093	G	A	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.274;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=39;PP=964;ReadPosRankSum=-0.145;SC=TTTCAATTCAGTCAAGTCTAT;SOR=0.955;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=151;TCF=49;TCR=102;TR=54;WE=79095534;WS=79095516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,55:0.35:156
chr1	79095581	rs987495	T	C	2052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.121;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=61;PP=1658;ReadPosRankSum=-0.112;SC=GGGTCTGATATCACCAGCATA;SOR=0.445;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=116;TCF=17;TCR=99;TR=73;WE=79095589;WS=79095571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,74:0.63:117
chr1	79102726	rs1981071	C	T	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.792;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=499;ReadPosRankSum=2.029;SC=GTTTAATTCCCGTAAACCAAT;SOR=0.247;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=105;TCF=74;TCR=31;TR=32;WE=79102734;WS=79102716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,32:0.30:107
chr1	79106899	rs273252	T	C	2238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=44;PP=1701;SC=TATATGTGCTTACAGAGTGTA;SOR=1.576;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=64;WE=79106907;WS=79106889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	79128320	rs11577395	A	G	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=264;ReadPosRankSum=-1.409;SC=TATTGCTTTCATAATTTATAC;SOR=0.446;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=15;WE=79128328;WS=79128310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr1	79128570	.	G	GT	3141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.179;ClippingRankSum=0.000;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.954;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=68;PP=2933;ReadPosRankSum=0.600;SC=ATAGGTAGATGGTTTGGTGGT;SOR=1.198;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=119;TCF=16;TCR=103;TR=76;WE=79128578;WS=79128560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,89:0.65:137
chr1	79355596	rs1061728	A	G	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=31;PP=926;SC=TGAGATCAAAATCACTGCTTA;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=38;WE=79355604;WS=79355586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	79357360	rs2275902	G	C	2596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.607;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=59;PP=2171;ReadPosRankSum=-0.797;SC=AAGAGCGAGGGCTCCTCTTGC;SOR=0.198;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=131;TCF=39;TCR=92;TR=90;WE=79357368;WS=79357350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,91:0.68:133
chr1	79383300	rs5775467	CA	C	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=47;ReadPosRankSum=0.536;SC=ATTGTAATAACAATTTTATAT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=3;WE=79383308;WS=79383290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr1	79383458	rs12569007	A	T	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.350;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=240;ReadPosRankSum=0.299;SC=TTATCAAAGAAATGCAAAGCA;SOR=0.352;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=17;WE=79383466;WS=79383448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,17:0.31:54
chr1	79387242	rs3811440	C	T	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=2;PP=811;ReadPosRankSum=-0.547;SC=TCGAATGATGCGGAAAAAAAA;SOR=0.337;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=58;TCF=56;TCR=2;TR=38;WE=79387250;WS=79387232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,39:0.67:58
chr1	79392756	rs12754818	C	A	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.225;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=147;ReadPosRankSum=-0.731;SC=TTATAATATACAAATGCAACT;SOR=0.048;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=9;WE=79392764;WS=79392746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr1	79401927	rs61770681	A	G	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.741;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=156;ReadPosRankSum=0.147;SC=TGCATGATAAATATTTATTGC;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=9;WE=79401935;WS=79401917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr1	79403750	rs189378914	CT	TG	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.951;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=1002;ReadPosRankSum=-0.405;SC=AAATTCAAAGCTCAATTATAT;SOR=0.838;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=64;TCF=35;TCR=29;TR=21;WE=79403759;WS=79403740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,24:0.35:68
chr1	79411888	rs723898	T	C	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.49;ReadPosRankSum=0.851;SOR=0.072;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
chr1	79472141	rs1571992	C	A	2361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=11;PP=1830;SC=TTGGAATATTCAACTTTAGAG;SOR=2.925;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=61;TCR=11;TR=72;WE=79472149;WS=79472131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	81967466	rs111927236	T	TCAG,TCAGCAGCAG	317.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=5.017;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.990;NF=20,20;NR=5,5;PP=375,592;ReadPosRankSum=0.864;SC=TGGAGCCACTTCAGCAGCAGC;SOR=0.117;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=25,25;WE=81967474;WS=81967456;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.36:28
chr1	81967495	.	A	AGC	1582.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=3.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.30;MQRankSum=-2.451;QD=26.83;ReadPosRankSum=1.215;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,37:0.63:59
chr1	81967496	.	A	G	2210	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MMLQ=28;MQ=50.92;NF=34;NR=7;PP=2210;QD=54.7505173792;SC=AGCAGCAGCAACAGCAGCAGC;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=60;TCF=49;TCR=11;TR=41;WE=81967516;WS=81967486;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:19,41:0.68:60
chr1	81967496	.	A	AGCAGCAG	1504.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=4.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.70;MQRankSum=-2.031;QD=24.27;ReadPosRankSum=3.476;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,40:0.65:62
chr1	81967508	rs114868480	A	G	1649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.622;NF=36;NR=9;PP=1896;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGCAGCAGCAACAGAAGCAGC;SOR=0.588;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=53;TCR=13;TR=45;WE=81967516;WS=81967486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,42:0.66:64
chr1	81967772	rs4083533	C	T	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.79;QD=29.69;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	81969071	rs4650561	A	T	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.15;MQRankSum=0.731;QD=22.86;ReadPosRankSum=-0.179;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,36:0.78:46
chr1	82302600	rs12064537	T	C	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=8;PP=879;SC=GACTGATGGTTTTGATGAAGC;SOR=2.165;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=32;WE=82302608;WS=82302590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	82415814	rs9438715	T	C	1579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=4;PP=1303;SC=CATGTGTGCATGACTGTATGT;SOR=4.534;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=46;TCR=4;TR=50;WE=82415822;WS=82415804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	82416220	rs2148630	G	A	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=702;SC=AGTAGGTTCTGTATTACAGTG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=82416228;WS=82416210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	82417552	rs7413275	T	G	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=607;SC=TCGCAAATTTTTTTCACCACA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=82417560;WS=82417542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	82421596	rs11163397	C	T	6727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=119;NR=84;PP=2965;SC=TTCTGAGACCCGAAGCTTTGG;SOR=1.111;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=119;TCR=84;TR=203;WE=82421604;WS=82421586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr1	84355734	rs71826512	AAGAACTTCAAGGAT	A	3434.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.483;NF=8;NR=44;PP=2966;ReadPosRankSum=-1.012;SC=GCGACTGCAGAAGAACTTCAA;SOR=0.766;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=105;TCF=15;TCR=90;TR=52;WE=84355755;WS=84355724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,88:0.58:151
chr1	84383079	rs17534614	G	A	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=288;ReadPosRankSum=-0.384;SC=ACTGTCATCAGGAAAATAACC;SOR=0.293;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=13;WE=84383087;WS=84383069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr1	84640691	rs582201	T	G	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=17;PP=748;SC=TTTAATCATTTTCTAATTTAT;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=35;WE=84640699;WS=84640681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	84640834	rs12132002	T	G	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=108;SC=TTATATATTTTTAAGTATATC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=84640842;WS=84640824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	84641304	rs2812001	A	C	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=71;ReadPosRankSum=-0.476;SC=ATAAACTTTAAAATCTGATTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=6;WE=84641312;WS=84641294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr1	84765340	.	GTA	G	310.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=4.86;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,13:0.20:64
chr1	84765344	.	A	G	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.000;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.61;ReadPosRankSum=3.460;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,13:0.19:67
chr1	84791239	rs315555	T	C	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=172;SC=GAAAGGCCTGTCCCAGAAGAC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=84791247;WS=84791229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	84810396	rs315528	A	C	1504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=0;PP=1226;ReadPosRankSum=-0.871;SC=GTGTGCCTCAAAATGCTTCCT;SOR=6.316;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=42;WE=84810404;WS=84810386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,46:0.98:47
chr1	84810815	rs315527	A	G	8658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=154;NR=130;PP=2965;SC=TGTAAGCAGCAGACTGAGAAA;SOR=0.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=284;TCF=154;TCR=130;TR=284;WE=84810823;WS=84810805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr1	84853957	rs665074	A	T	2656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=13;PP=2004;SC=AAATTTTGCAATAAAGGATAA;SOR=3.180;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=65;TCR=13;TR=78;WE=84853965;WS=84853947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	84864256	rs3738573	G	C	1034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=5.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.696;SOR=0.989;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,52:0.26:197
chr1	84867610	rs3754274	G	A	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.990;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=4;PP=604;ReadPosRankSum=-1.200;SC=TTACCTAAAAGACAAAACAAG;SOR=1.415;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=86;TCF=69;TCR=17;TR=31;WE=84867618;WS=84867600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,32:0.36:90
chr1	84874242	rs3116406	C	G	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.322;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=50;PP=1160;ReadPosRankSum=1.092;SC=TACTGGAAATCAACAATTTCT;SOR=0.389;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=183;TCF=22;TCR=161;TR=59;WE=84874250;WS=84874232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,58:0.31:185
chr1	84876711	rs3216015	C	CA	1179.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=7.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.880;SOR=0.202;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,40:0.28:143
chr1	84876731	rs1506700	T	G	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.596;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.471;NF=0;NR=37;PP=735;ReadPosRankSum=-0.485;SC=GTTGAAGAAATGATTTGGAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=112;TCF=2;TCR=110;TR=37;WE=84876739;WS=84876721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,37:0.32:115
chr1	84880380	rs3768250	T	C	1453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.382;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=37;PP=1011;ReadPosRankSum=0.601;SC=ATCAAGATCATGCCAAGTGGT;SOR=0.690;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=231;TCF=121;TCR=110;TR=70;WE=84880388;WS=84880370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,75:0.31:239
chr1	84944989	rs2292191	A	G	1504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=15;PP=1283;SC=GGATAAGAGCAGCAGCAGCGG;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=54;WE=84944997;WS=84944979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	84946745	rs7413066	C	T	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=36;PP=1133;SC=TAGGGAATCCCTCCTGATATT;SOR=2.409;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=46;WE=84946753;WS=84946735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	84967676	.	GA	G	891.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.244;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.110;NF=14;NR=12;PP=784;ReadPosRankSum=-0.483;SC=AAGAGGGGGGGAAGTGCCAGA;SOR=1.163;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=87;TCF=34;TCR=53;TR=26;WE=84967684;WS=84967666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,34:0.31:108
chr1	84986213	rs5775789	AT	A	171.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=159;SC=ACATCAATTGATTTTTTTTTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=84986221;WS=84986203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	84986520	rs191519564	T	A	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=1.180;SC=ATGAATACTATCAATATATAG;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=84986528;WS=84986510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr1	85113203	rs2994949	T	C	5028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=93;PP=2965;SC=CAGGTCTTGATGCCACACTCC;SOR=0.861;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=170;TCF=77;TCR=93;TR=170;WE=85113211;WS=85113193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr1	85113229	rs1057746	A	G	4488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=95;PP=2965;SC=TGATTTGTACATTCTCCTCCA;SOR=1.594;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=49;TCR=95;TR=144;WE=85113237;WS=85113219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr1	85121255	rs4537578	A	G	3973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=79;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.754;SC=TAAAACACTTAGCAGGAGAAA;SOR=0.595;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=42;TCR=80;TR=120;WE=85121263;WS=85121245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,127:0.99:128
chr1	85128262	rs2911563	A	G	3266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=86;PP=2680;SC=ATGCTTAAGCATCTAAAACTC;SOR=3.347;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=16;TCR=86;TR=102;WE=85128270;WS=85128252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	85128280	rs2994437	T	C	3067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=77;PP=2476;SC=CTCTAATGCATTCTATACACG;SOR=4.011;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=10;TCR=77;TR=87;WE=85128288;WS=85128270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	85128305	rs11164033	G	C	1981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=56;PP=1695;SC=TGGTGAAAGTGAACCTGGTAT;SOR=6.701;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=57;TCF=1;TCR=56;TR=57;WE=85128313;WS=85128295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	85131641	rs2911566	G	C	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=507;SC=GGGTTCCTGAGCTTCCAGTTA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=19;WE=85131649;WS=85131631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	85131982	rs3096445	T	G	2180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=60;PP=1799;SC=ATCCTTAAAATATCAGTAACA;SOR=8.318;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=0;TCR=60;TR=60;WE=85131990;WS=85131972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	85331808	rs146269415	G	GAGA	5874.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=108;PP=2965;SC=ATTCATTGTGGAGAAGTGAAC;SOR=4.648;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=7;TCR=125;TR=114;WE=85331816;WS=85331798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	85392324	rs6681025	C	T	2341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=48;PP=1849;SC=TCTGCTCAGCCGCTGGATAAG;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=27;TCR=48;TR=75;WE=85392332;WS=85392314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	85397286	rs34793286	G	C	1787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.696;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=59;PP=1415;ReadPosRankSum=-0.174;SC=TTCTGAAATAGAGTATTCTAA;SOR=0.805;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=212;TCF=38;TCR=174;TR=71;WE=85397294;WS=85397276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,74:0.33:222
chr1	85418307	rs677476	C	G	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=4.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.379;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=320;ReadPosRankSum=0.515;SC=AGGTTACTTACGGAGTTTCAA;SOR=0.026;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=51;TCF=2;TCR=49;TR=18;WE=85418315;WS=85418297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,18:0.35:52
chr1	85488030	rs2028304	G	A	5071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=86;PP=2965;SC=CAAGCCACACGAGCATGGTAG;SOR=1.094;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=63;TCR=86;TR=149;WE=85488038;WS=85488020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr1	85488154	rs2039814	G	C	1495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=41;PP=1262;SC=ATTGAGGTAAGTATGAGTAAG;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=41;WE=85488162;WS=85488144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	85537502	rs4907131	T	A	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=690;SC=CCAGGGTAAATCTTAGAAAAC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=85537510;WS=85537492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	85537522	rs4907132	T	C	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=0;PP=873;ReadPosRankSum=-0.939;SC=CATATTCTTATGTTTATTAAA;SOR=5.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=31;WE=85537530;WS=85537512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chr1	85538655	rs28417745	A	G	270.53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.48;MQRankSum=2.167;QD=18.04;ReadPosRankSum=-0.872;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,12:0.80:15
chr1	85547945	rs7534574	T	C	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=2;PP=574;SC=TGAATGACCATTGAACATTAA;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=85547953;WS=85547935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	85550156	rs146215625	A	AAT	539.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.6748;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=617;ReadPosRankSum=-1.352;SC=TTTGTTGCAAAATATATATAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=14;WE=85550164;WS=85550146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr1	85551468	rs111823967	A	ATCAGTTTTTCT	715.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=2;PP=2967;SC=TTGCCTACACATCAGGGACTT;SOR=2.833;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=10;WE=85551476;WS=85551458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	85555672	rs1417351	A	C	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=484;SC=AATTCAATGTATATAATTTAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=85555680;WS=85555662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	85589939	rs11356964	GT	G	8838.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=143;PP=2951;SC=GTTATGGTAAGTTGCCTGCAA;SOR=1.303;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=208;TCF=58;TCR=150;TR=200;WE=85589947;WS=85589929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr1	85592126	rs817474	G	T	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=0;PP=795;SC=TTAATGAACAGCATGGTGAAT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=85592134;WS=85592116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	85595645	rs1020770	C	T	4033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=61;PP=2965;SC=CTGCCTGTCACCCTCTCATGG;SOR=0.740;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=63;TCR=61;TR=124;WE=85595653;WS=85595635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr1	85598527	rs36118758	TC	T	2827.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=76;NR=8;PP=1961;SC=TTGTTTTTCTTCCCCCCCCAG;SOR=4.548;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=104;TCF=95;TCR=9;TR=84;WE=85598535;WS=85598517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	85624549	rs709786	C	T	2131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=14;PP=1604;SC=GTAGACTCAACTGTCTGCATT;SOR=1.999;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=46;TCR=14;TR=60;WE=85624557;WS=85624539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	85624864	rs817412	G	A	4562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=98;PP=2965;SC=TTCTGCCTCAGATAATTCAGA;SOR=1.956;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=37;TCR=98;TR=135;WE=85624872;WS=85624854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	85647713	rs817444	T	C	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=448;SC=ACCTTGAATTTCTTCCCCCAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=85647721;WS=85647703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	85648620	rs817443	C	T	2353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=30;PP=1941;SC=GTATGATGAACTTCTCGGCAG;SOR=0.992;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=42;TCR=30;TR=72;WE=85648628;WS=85648610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	85648905	rs11161539	T	C	1356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=33;PP=1065;SC=GAAAGAAAAATACGTTATAAA;SOR=3.664;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=37;WE=85648913;WS=85648895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	85666156	rs12121540	T	G	2738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.345;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=63;PP=2106;ReadPosRankSum=-0.512;SC=GGGGCCTTCCTGGCGGTCTCC;SOR=0.498;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=188;TCF=73;TCR=115;TR=108;WE=85666164;WS=85666146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,112:0.57:196
chr1	85723318	rs17382844	A	G	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=171;ReadPosRankSum=-0.396;SC=TACAGATTGGATAAGAATGTG;SOR=0.145;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=13;WE=85723326;WS=85723308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,14:0.27:51
chr1	85725032	rs75231029	G	T	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.192;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=25;PP=1244;ReadPosRankSum=0.759;SC=ACGGGGTCGGGGACCTCACCT;SOR=1.402;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=94;TCF=58;TCR=36;TR=72;WE=85725040;WS=85725022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,73:0.74:98
chr1	85725353	rs112918702	GCCGGAAA	G	213.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=234;ReadPosRankSum=0.112;SC=TCCGCCGGAAGCCGGAAACCG;SOR=2.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=4;WE=85725367;WS=85725343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	85725401	.	G	GC	140	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=0;NR=6;PP=140;QD=28.1666666667;SC=CCCTCGCGTGGCCCCGCCCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=85725409;WS=85725391;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,6:0.46:13
chr1	85733374	rs3768235	C	T	1490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.785;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=21;PP=1209;ReadPosRankSum=-0.923;SC=TGCACAAGTTCCTTCTTCTTC;SOR=0.938;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=92;TCF=55;TCR=37;TR=57;WE=85733382;WS=85733364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,56:0.62:91
chr1	85741921	rs2735594	G	C	1903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=21;PP=1503;SC=TTCCGCTTTCGTCTCCCGCTG;SOR=1.421;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=58;WE=85741929;WS=85741911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	85742155	rs78416998	G	A	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=70;ReadPosRankSum=-1.965;SC=GGAGCGGGTCGGGAGAAAGAC;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=5;WE=85742163;WS=85742145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr1	85787114	rs233116	A	T	2007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.88;SOR=4.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	85787114	.	AACCG	TACCC,TACCG	762	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=12,47;NR=2,4;PP=238,762;QD=20.8191339187;SC=TCTTGCCGGCAACCGGGGGGG;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=51;TCF=47;TCR=4;TR=14,51;WE=85787126;WS=85787104;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.27:51
chr1	85787118	rs3087894	G	C	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.56;ReadPosRankSum=1.072;SOR=0.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,16:0.27:59
chr1	85787323	rs1498375	T	A	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.241;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=596;ReadPosRankSum=-0.517;SC=GGAGAATCAATTTGATTTGTA;SOR=0.187;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=64;TCF=5;TCR=59;TR=17;WE=85787342;WS=85787313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,17:0.26:66
chr1	85787334	rs1498374	C	T	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.628;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=596;ReadPosRankSum=1.524;SC=TTGATTTGTACATCTAGGCTT;SOR=0.105;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=52;TCF=4;TCR=48;TR=14;WE=85787342;WS=85787313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,14:0.26:54
chr1	85790633	rs1498373	G	A	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=226;ReadPosRankSum=1.208;SC=AAGGAAGGCAGTGTGGTAGGA;SOR=1.234;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=12;WE=85790641;WS=85790623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr1	85816134	rs2230820	T	C	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.082;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=335;ReadPosRankSum=1.179;SC=TAGACCCAATTGCGATCAGGT;SOR=0.431;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=82;TCF=55;TCR=27;TR=27;WE=85816142;WS=85816124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,26:0.31:83
chr1	85816224	rs41301261	G	A	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=440;ReadPosRankSum=0.017;SC=AGTCCTACGTGGACAATAGAA;SOR=0.643;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=77;TCF=24;TCR=53;TR=27;WE=85816232;WS=85816214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,26:0.33:79
chr1	85817295	rs2076699	G	A	1360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.267;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=35;PP=831;ReadPosRankSum=-1.231;SC=TAGTGAGCAGGTGGCACCAGT;SOR=0.334;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=193;TCF=59;TCR=134;TR=56;WE=85817303;WS=85817285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,66:0.33:203
chr1	85824387	rs146143220	G	A	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.929;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=367;ReadPosRankSum=-1.145;SC=TACAAGCCAAGTATTAAAAAT;SOR=3.033;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=17;WE=85824395;WS=85824377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr1	85930272	rs4001153	GAC	G	486.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=1.471;NF=2;NR=18;PP=707;ReadPosRankSum=0.975;SC=CTGACTCTCTGACACACACAC;SOR=1.096;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=62;TCF=8;TCR=54;TR=20;WE=85930281;WS=85930253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr1	86046561	rs2297140	C	A	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=310;ReadPosRankSum=-0.613;SC=CCCACCGGGCCCACCGCGCCG;SOR=0.287;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=15;WE=86046569;WS=86046551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr1	86047311	rs9658584	G	C	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=118;ReadPosRankSum=-0.498;SC=AGTCCCCATAGTCCAGAAGTT;SOR=0.653;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=12;WE=86047319;WS=86047301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,13:0.27:48
chr1	86119898	rs2274738	A	G	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.919;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=532;ReadPosRankSum=-0.918;SC=ACAGGGACACACAAACCGCGT;SOR=0.340;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=24;WE=86119906;WS=86119888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr1	86167957	rs1764298	C	T	1032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.32;SOR=2.694;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	86173298	rs1539444	C	T	4971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=30;PP=2965;ReadPosRankSum=0.509;SC=TAAATGGAATCCCCCATGCCC;SOR=0.854;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=148;TCF=118;TCR=30;TR=146;WE=86173306;WS=86173288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,155:0.99:157
chr1	86200363	rs148891875	C	T	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=162;ReadPosRankSum=-0.167;SC=CTCTAATTATCCTAATTTTAT;SOR=0.111;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=11;WE=86200371;WS=86200353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,11:0.24:45
chr1	86202016	rs1481200	C	T	4845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=93;NR=60;PP=2965;SC=GTCATGGAAACAACTAGAGTC;SOR=1.261;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=153;TCF=93;TCR=60;TR=153;WE=86202024;WS=86202006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr1	86210241	rs11387251	G	GT	1142.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=36;NR=0;PP=1474;SC=TTCTGCCAGGGTTTTATCAAA;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=36;WE=86210249;WS=86210231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	86210546	rs7547023	G	A	2247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=64;PP=1910;SC=AATTATATAAGCAAAAAAATC;SOR=5.640;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=3;TCR=65;TR=67;WE=86210554;WS=86210536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	86211325	rs10747324	G	A	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=329;SC=TAACTCTTACGGTTAGACAGA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=86211333;WS=86211315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	86246849	rs313722	A	C	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.627;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=449;ReadPosRankSum=0.485;SC=ATATTCTAGAAATAGAATTAA;SOR=0.203;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=21;WE=86246857;WS=86246839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,22:0.76:29
chr1	86249063	rs313724	C	T	1996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=5;PP=1600;SC=TGAGTTTCTACCTTAAAAGTC;SOR=4.548;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=55;TCR=5;TR=60;WE=86249071;WS=86249053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
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chr1	86249911	rs313725	A	G	4741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=102;PP=2965;SC=TGTAGAATAAATGCTTGGTGA;SOR=1.826;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=145;TCF=42;TCR=103;TR=144;WE=86249919;WS=86249901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr1	86252025	rs12746325	A	G	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.535;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=13;PP=1022;ReadPosRankSum=0.293;SC=TTGGAACAAAATATTAAAGTA;SOR=1.535;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=68;TCF=46;TCR=22;TR=46;WE=86252033;WS=86252015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,46:0.67:69
chr1	86308225	rs1010058	C	A	165.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.42;ReadPosRankSum=-1.593;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr1	86334070	rs313775	T	A	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=-1.795;SC=TCCTTCTCTCTAGCCACAGTT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=7;WE=86334078;WS=86334060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr1	86334316	rs17411495	T	C	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.355;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=162;ReadPosRankSum=-2.218;SC=CTCCCTGTAATGCAATAAAAA;SOR=1.355;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=13;WE=86334324;WS=86334306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr1	86340193	rs11161696	G	T	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=82;SC=GCTTTTGAAAGTATGAAATGA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=86340201;WS=86340183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	86340262	rs12136023	C	A	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.890;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=95;ReadPosRankSum=-0.663;SC=TTGAGTGTTTCGAATAATAAG;SOR=0.569;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=7;WE=86340270;WS=86340252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	86340523	rs1564518	T	C	62.74	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	86340524	rs1564517	G	A	62.74	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	86340794	rs1564516	T	C	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=0;PP=872;ReadPosRankSum=-0.671;SC=CCAAATAGGTTGGGGACTGCT;SOR=5.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=31;WE=86340802;WS=86340784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chr1	86340880	rs1564515	A	G	2003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.759;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=23;PP=2962;ReadPosRankSum=0.706;SC=GTTAGCAAATATAGGGGATTC;SOR=0.810;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=107;TCF=70;TCR=37;TR=69;WE=86340900;WS=86340870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,73:0.64:114
chr1	86340892	rs7536101	A	G	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.729;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=1443;ReadPosRankSum=-0.016;SC=AGGGGATTCAATGGTAGCAAA;SOR=0.803;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=111;TCF=68;TCR=43;TR=40;WE=86340900;WS=86340870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,43:0.36:118
chr1	86341153	rs12122234	G	A	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=369;ReadPosRankSum=1.686;SC=TAGCATAAGAGCAGATTCTTT;SOR=0.428;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=17;WE=86341161;WS=86341143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr1	86375654	rs1502657	C	G	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=27;PP=1043;ReadPosRankSum=-0.175;SC=TTTCTCCCTGCGGACCTAGTG;SOR=0.727;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=177;TCF=96;TCR=81;TR=60;WE=86375662;WS=86375644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,59:0.33:179
chr1	86375840	rs41306625	G	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=104;ReadPosRankSum=-0.886;SC=CAAATTTGGCGCTTTATCTTA;SOR=0.064;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=9;WE=86375848;WS=86375830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,8:0.19:42
chr1	86435850	rs7538391	T	C	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.385;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,10:0.22:46
chr1	86453409	rs589698	C	T	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.935;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=235;ReadPosRankSum=-1.504;SC=ATAAAATTCCCTTTGCTATTC;SOR=0.191;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=12;WE=86453417;WS=86453399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr1	86482922	rs557928	A	T	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=500;ReadPosRankSum=-0.897;SC=GTATAAACATAAACTTAATAA;SOR=0.503;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=25;WE=86482930;WS=86482912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr1	86487914	rs11161721	C	A	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.344;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.634;NF=22;NR=18;PP=650;ReadPosRankSum=-0.202;SC=AGCAAAAGTTCAAACCTACTG;SOR=0.667;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=143;TCF=68;TCR=75;TR=40;WE=86487922;WS=86487904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,40:0.25:157
chr1	86487981	rs516213	G	A	3265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=76;PP=2568;SC=AGCACCCTAAGAGAAGAGAAT;SOR=3.352;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=14;TCR=76;TR=90;WE=86488000;WS=86487971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	86487992	rs5775882	A	AACAG	3663.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=63;PP=2918;SC=AGAAGAGAATAACAGAAGAGA;SOR=4.830;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=78;TCF=5;TCR=73;TR=65;WE=86488000;WS=86487971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	86488232	rs641712	G	A	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=851;ReadPosRankSum=-0.860;SC=TTGTCTCCAGGATACCCGGGT;SOR=0.719;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=67;TCF=47;TCR=20;TR=38;WE=86488240;WS=86488222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,39:0.57:68
chr1	86497769	rs582141	C	G	566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=541;SC=TCCTGAGAAGCACAAACCTAT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=86497777;WS=86497759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	86512536	rs60891279	C	T	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.210;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=419;ReadPosRankSum=0.005;SC=CTTCTTTCCACGGATCCCAGG;SOR=1.136;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=81;TCF=31;TCR=50;TR=27;WE=86512544;WS=86512526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,28:0.34:83
chr1	86554821	rs12405791	G	A	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.94;ReadPosRankSum=0.250;SOR=1.222;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,35:0.67:52
chr1	86557967	rs11161732	G	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.421;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=266;ReadPosRankSum=-0.309;SC=CCAGGAACAGGTTGACCTGGG;SOR=1.058;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=14;WE=86557975;WS=86557957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr1	86578449	rs2039602	A	C	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.94;ReadPosRankSum=1.705;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr1	86578453	rs11161738	C	T	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.80;ReadPosRankSum=1.623;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
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chr1	86591837	rs11161747	G	A	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=41;PP=940;ReadPosRankSum=0.269;SC=TACAGCAGTCGCTGGTGATGA;SOR=0.653;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=182;TCF=48;TCR=134;TR=56;WE=86591845;WS=86591827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,57:0.30:188
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chr1	86621992	rs1999747	C	A	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=320;ReadPosRankSum=0.271;SC=GTTGGTCTAACCCCTACCCTA;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=7;WE=86622000;WS=86621976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr1	86814368	rs113732309	T	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.884;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=-0.637;SC=TATTTATTTTTTTACCCAATC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=86814376;WS=86814358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	86820267	rs1182098	C	T	2478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.589;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=40;PP=1859;ReadPosRankSum=0.583;SC=ATGCTGTATACTCTGCAGATT;SOR=0.438;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=123;TCF=69;TCR=54;TR=89;WE=86820275;WS=86820257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,92:0.72:128
chr1	86820385	rs150379514	G	T	1456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=37;PP=1074;ReadPosRankSum=-1.440;SC=TCTTTTTACAGAAAACATATA;SOR=0.748;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=21;TCR=52;TR=52;WE=86820393;WS=86820375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,55:0.71:77
chr1	86838158	rs421105	C	T	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=142;ReadPosRankSum=-0.495;SC=TTTTTTCTATCACAATTTTCT;SOR=1.085;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=9;WE=86838166;WS=86838148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr1	86842103	.	TA	T	595.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.619;NF=1;NR=24;PP=340;ReadPosRankSum=-0.223;SC=TTCTAAGCTCTAAAAAAAAAA;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=25;WE=86842111;WS=86842093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,29:0.76:38
chr1	86890931	rs1158505	T	A	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.093;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=21;ReadPosRankSum=0.153;SC=AAATATTTCATTGTCTTTTAT;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=3;WE=86890939;WS=86890921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr1	86894231	rs55736627	C	T	3294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.643;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=75;PP=2484;ReadPosRankSum=-0.386;SC=GATAACTTAACAGCTGGCTAC;SOR=0.633;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=62;TCR=106;TR=119;WE=86894239;WS=86894221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,126:0.72:175
chr1	86896354	rs4292929	G	A	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=0;PP=742;SC=CTTTTTTATGGTGGTAGGTGG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=86896362;WS=86896347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	86896488	rs12076908	G	C	2141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.430;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=20;PP=1629;ReadPosRankSum=0.908;SC=TCACTAGTTAGCAAGGCACAT;SOR=0.347;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=109;TCF=82;TCR=27;TR=74;WE=86896496;WS=86896478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,78:0.69:113
chr1	86896706	rs3737673	C	A	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=477;ReadPosRankSum=-0.317;SC=TCTAAAATTGCTTATAACTTA;SOR=0.462;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=54;TCF=6;TCR=48;TR=23;WE=86896714;WS=86896696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr1	86897970	rs12407985	T	A	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=5.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.62;ReadPosRankSum=1.116;SOR=0.045;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr1	86897973	rs1334150	T	C	679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=280;SC=ATCCTTGTAATAATTATATAA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=86897981;WS=86897964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	86900332	rs17449526	T	C	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.418;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=15;PP=651;ReadPosRankSum=0.097;SC=TTCCCATGAATGGGACTGAGC;SOR=1.397;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=132;TCF=72;TCR=60;TR=43;WE=86900340;WS=86900322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,46:0.34:134
chr1	86900372	rs17409304	C	G	963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=27;PP=754;ReadPosRankSum=-0.895;SC=CTCGCTTGTACAGGCTGGTGA;SOR=0.831;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=145;TCF=60;TCR=85;TR=43;WE=86900380;WS=86900362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,43:0.30:143
chr1	86900491	rs56408800	C	T	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.909;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=205;ReadPosRankSum=0.898;SC=TCTTTATTATCTCAATTTATT;SOR=0.048;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=51;TCF=6;TCR=45;TR=15;WE=86900499;WS=86900481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,16:0.31:52
chr1	86906114	rs1981082	T	C	726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=19;PP=621;SC=AATACAGAAATTGTTTTTAAA;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=86906122;WS=86906104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	86909703	rs3820039	T	C	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=32;PP=746;SC=AGGTAGGTGTTGTGAGTTTGT;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=86909711;WS=86909693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	86920731	rs191317100	G	T	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=440;ReadPosRankSum=0.641;SC=TATACTCAAAGTGACTTAATT;SOR=1.044;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=18;WE=86920739;WS=86920721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr1	86939130	rs2145412	C	T	1796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=26;PP=1391;SC=TCTGTATCTGCTTGAAGCTAC;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=29;TCR=26;TR=55;WE=86939138;WS=86939120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	86939390	rs2180762	G	A	3516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=23;PP=2965;SC=TGTGATGATAGAAACTTTTTC;SOR=2.415;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=83;TCR=23;TR=106;WE=86939398;WS=86939380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr1	86952324	rs2734705	A	G	3083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=35;PP=2657;SC=CATGTACAAAATGAACTCATA;SOR=1.216;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=56;TCR=35;TR=91;WE=86952332;WS=86952314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
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chr1	86956772	rs2753341	G	A	402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=305;SC=AAAATAAATAGGTTAAAAAAA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=86956793;WS=86956762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr1	86959796	rs1321689	C	T	2028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=5;PP=1632;SC=AGGGTTTTCCCGTACGTGACA;SOR=4.443;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=51;TCR=5;TR=56;WE=86959804;WS=86959786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
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chr1	87045896	rs4001061	TCCTACA	T	11783.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=121;PP=2973;SC=ATGACATTGATCCTACACCTA;SOR=0.788;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=234;TCF=99;TCR=135;TR=211;WE=87045909;WS=87045886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr1	87190079	rs140791791	T	C	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.061;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=290;ReadPosRankSum=1.698;SC=CTGCAGAAACTAGAAATTCAG;SOR=0.859;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=18;WE=87190087;WS=87190069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr1	87458695	rs10873810	G	A	1572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=11;PP=1138;SC=CTCCCAGTGTGGGGAGGGTAC;SOR=2.004;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=45;WE=87458703;WS=87458685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	87538182	rs34124612	TTG	T	2679.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=21;PP=2176;SC=CATGCAATCTTTGTGTGTTTG;SOR=1.355;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=54;TCF=31;TCR=23;TR=47;WE=87538191;WS=87538172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	87538200	rs10782592	G	A	2771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=26;PP=1675;SC=TTGAGAATTAGTTCAGGCTGT;SOR=1.162;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=39;TCR=26;TR=65;WE=87538208;WS=87538190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	87549858	rs2798675	A	G	1001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=4;PP=762;SC=TATATAATGAATGTGTTCTCC;SOR=3.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=87549866;WS=87549848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	87558066	rs66709085	CCACATA	C	424.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=62.89;NF=7;NR=0;PP=309;SC=TTCCCAATCGCCACATACACA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=87558079;WS=87558056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	87563668	rs1199677	G	A	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=25;PP=720;SC=TATTATCTCTGTAATCTGTGT;SOR=3.545;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=87563676;WS=87563658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	87570398	rs1621247	G	A	6021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=131;PP=2965;SC=TGTGACTATTGGATTCTTGAA;SOR=2.603;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=38;TCR=131;TR=169;WE=87570406;WS=87570388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr1	87598117	rs6686259	T	G	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.518;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=14;PP=952;ReadPosRankSum=-0.734;SC=CGCGGCGGCCTCGGGAGGCCC;SOR=0.423;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=70;TCF=52;TCR=18;TR=49;WE=87598125;WS=87598107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,50:0.71:70
chr1	87599697	rs6576865	G	A	2156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=63;PP=1539;ReadPosRankSum=0.252;SC=CTCTGGCCACGCTTGCACCCT;SOR=0.997;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=145;TCF=34;TCR=111;TR=78;WE=87599705;WS=87599687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,85:0.55:154
chr1	87633761	rs10782593	C	T	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=509;SC=CAGTCCCAAACGCCAGCAGCT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=87633769;WS=87633751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	87633929	rs17129860	A	G	2659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=44;PP=2036;ReadPosRankSum=0.740;SC=TTTGAACCAGAACTGTGGAGG;SOR=0.707;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=75;TCR=64;TR=95;WE=87633937;WS=87633919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,97:0.68:142
chr1	89280989	.	C	G	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.110;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=671;ReadPosRankSum=1.603;SC=AACTCCAAATCTGAAAGTACC;SOR=0.787;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=32;WE=89280997;WS=89280979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,31:0.74:42
chr1	89322982	rs2794318	G	A	4482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=55;PP=2965;SC=ACCAAGTCCAGTTCCACAGCT;SOR=1.092;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=75;TCR=55;TR=130;WE=89322990;WS=89322972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	89426902	rs3738055	G	A	4275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=32;PP=2965;SC=AAACCTCATCGCTGATGCAGA;SOR=2.215;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=92;TCR=32;TR=124;WE=89426910;WS=89426892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr1	89427252	rs10922530	G	A	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=11;PP=330;SC=TCTTACAAACGAATAACCTAA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=89427260;WS=89427242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	89430420	rs1536259	A	G	2385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.81;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	89473624	rs61766155	G	A	2674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.599;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=84;PP=2056;ReadPosRankSum=-0.415;SC=GATTTATTTAGTACTTAGTTT;SOR=1.163;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=131;TCF=14;TCR=117;TR=93;WE=89473632;WS=89473614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,97:0.71:137
chr1	89474818	rs17433780	A	G	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=630;ReadPosRankSum=-0.456;SC=GCTTTTACACATTCCACTGTG;SOR=0.882;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=32;WE=89474826;WS=89474808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,33:0.60:55
chr1	89475135	rs10493821	C	T	2394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-3.837;NF=46;NR=46;PP=1953;ReadPosRankSum=-0.653;SC=GCATCGGTCACAGACTCCTTG;SOR=0.659;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=69;TCR=70;TR=92;WE=89475143;WS=89475125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,92:0.65:142
chr1	89475230	rs4142706	T	G	1959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.813;NF=13;NR=61;PP=1554;ReadPosRankSum=1.066;SC=GTAAGCAGGTTTTCCTGTTCT;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=19;TCR=88;TR=74;WE=89475238;WS=89475220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,73:0.68:108
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chr1	89479063	rs4656077	G	A	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.538;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=1565;ReadPosRankSum=-0.825;SC=AAGAACTTCCGGATACAGAGT;SOR=0.545;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=132;TCF=50;TCR=82;TR=36;WE=89479082;WS=89479053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,39:0.28:138
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chr1	89522788	.	T	G	2897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.938;ClippingRankSum=0.000;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.724;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=44;PP=2301;ReadPosRankSum=1.471;SC=CTGATGGCATTGACGTAGGTC;SOR=1.098;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=169;TCF=94;TCR=75;TR=109;WE=89522796;WS=89522778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,109:0.64:171
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chr1	89650850	rs623134	A	T	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=125;ReadPosRankSum=0.052;SC=GCTATAACACATATACTTACA;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=6;WE=89650858;WS=89650840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr1	89652071	rs561042	TC	CT	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.915;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=-4.393;QD=6.08;ReadPosRankSum=-0.426;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,22:0.21:104
chr1	89652078	rs608339	A	T	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQRankSum=-5.477;QD=5.69;ReadPosRankSum=-0.808;SOR=0.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,18:0.17:104
chr1	89652087	rs1142890	CC	TG	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=5.857;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQRankSum=-7.185;QD=4.64;ReadPosRankSum=-2.583;SOR=1.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,15:0.16:94
chr1	89652090	rs1142888	T	G	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=7.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQRankSum=-7.413;QD=4.63;ReadPosRankSum=-3.166;SOR=1.573;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,16:0.17:96
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chr1	89652097	rs1142886	C	T	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=9.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQRankSum=-7.949;QD=3.92;ReadPosRankSum=-3.062;SOR=2.008;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,16:0.16:99
chr1	89652102	rs655260	A	T	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=12.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQRankSum=-7.773;QD=3.90;ReadPosRankSum=-2.801;SOR=2.268;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,16:0.17:95
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chr1	89661228	rs650448	T	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.337;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=96;ReadPosRankSum=0.377;SC=GTTGTTTCCATCTCAGGCAGG;SOR=0.070;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=6;WE=89661236;WS=89661218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr1	89726592	rs535351	G	A	1167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=34;PP=954;SC=TACAGTAGCAGTAAACAGTTC;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=89726600;WS=89726582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	89730723	rs9628688	C	T	3264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=81;PP=2606;SC=TTTCTGAGAACGTACATTTAA;SOR=3.258;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=15;TCR=81;TR=96;WE=89730731;WS=89730713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	89731959	rs12729209	G	A	1725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=0;PP=1400;SC=ACAATGCAAGGATAATCTTAT;SOR=7.903;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=48;WE=89731967;WS=89731949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	89733273	rs6690597	T	C	1961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=49;PP=1723;SC=TATTTAAAAATAGGCTCTTGT;SOR=3.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=9;TCR=49;TR=58;WE=89733281;WS=89733263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	89844035	rs35837853	T	C	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=578;ReadPosRankSum=0.357;SC=CCTGATGGAGTAGAAGATTCC;SOR=0.752;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=46;TCR=50;TR=32;WE=89844043;WS=89844025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,33:0.32:103
chr1	89845926	rs11361992	GT	G	3632.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=88;NR=26;PP=2306;SC=TATATTCTCTGTTTTTTTTTA;SOR=2.593;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=131;TCF=96;TCR=35;TR=114;WE=89845934;WS=89845916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	89847372	rs4658359	G	T	4993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=84;PP=2965;SC=GCAGAGGGCAGCTGACTACTA;SOR=0.972;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=63;TCR=84;TR=147;WE=89847380;WS=89847362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr1	89847411	rs4658360	C	T	3997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=67;PP=2965;SC=GCGAGTGAAGCTCCCCACAGA;SOR=0.876;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=58;TCR=67;TR=125;WE=89847419;WS=89847401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr1	89847444	rs4658146	A	G	3565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=55;PP=2812;SC=GCTGCTGGACATGCATGCGGC;SOR=0.796;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=62;TCR=55;TR=117;WE=89847452;WS=89847434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	89849201	rs928652	C	G	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=11;PP=872;SC=GCTTTTTCTTCCTTCCATAGG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=34;WE=89849209;WS=89849191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	89849268	rs41288387	T	C	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.215;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=94;ReadPosRankSum=-0.113;SC=GGAATCCATCTTGCAGTCAGA;SOR=1.198;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=38;TCF=16;TCR=22;TR=9;WE=89849276;WS=89849258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,9:0.22:40
chr1	89849350	rs928653	G	A	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=16;PP=570;SC=GGAGGGGTACGTTTATACAAT;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=89849358;WS=89849340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	89849441	rs928654	T	G	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=11;PP=400;SC=TGCTAAATCTTAAAATAACAA;SOR=1.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=89849449;WS=89849431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	89849574	rs928655	G	A	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=196;ReadPosRankSum=0.546;SC=TTCAGATTTGGTTTAGTCTCA;SOR=0.184;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=11;WE=89849582;WS=89849564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr1	89849742	rs959460	A	T	2485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=40;PP=1909;SC=GAGGCTCAAGATAAGAGTCGC;SOR=0.788;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=46;TCR=40;TR=86;WE=89849750;WS=89849732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	89851100	rs369061637	G	GT	354.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=0.074;QD=14.78;ReadPosRankSum=0.819;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,19:0.79:24
chr1	89885854	rs6673154	G	A	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=25;PP=859;SC=GCTGGACACCGAGGGTCTGGG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=34;WE=89885862;WS=89885844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	89888530	rs4261099	C	T	4169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=115;NR=12;PP=2965;SC=ATCATCAGATCGTTGCTCAGC;SOR=4.668;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=115;TCR=12;TR=127;WE=89888538;WS=89888520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr1	89888552	rs4282800	T	A	6112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=49;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=151;NR=34;PP=2965;SC=TTACTTCAGGTCATTTTCAGT;SOR=3.185;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=187;TCF=153;TCR=34;TR=185;WE=89888560;WS=89888542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr1	89888585	rs4415545	C	G	10792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.35;QD=44.78;SOR=1.961;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr1	89888588	rs4506445	G	T	10817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.68;QD=43.27;SOR=1.850;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr1	89889456	rs59415285	T	C	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=13.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQRankSum=-6.735;QD=2.27;ReadPosRankSum=1.442;SOR=0.870;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,20:0.18:114
chr1	90058242	rs34096201	G	GT	410.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=3.897;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.88;MQRankSum=0.674;QD=15.77;ReadPosRankSum=2.356;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,22:0.85:26
chr1	90171835	rs6657969	C	T	2031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=4;PP=1479;SC=AAGCTGCCTTCGTTTATATGT;SOR=4.514;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=49;TCR=4;TR=53;WE=90171843;WS=90171825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	90178336	rs142843076	G	A	2204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.230;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=48;PP=1820;ReadPosRankSum=0.280;SC=CTTCCCTTTCGAATGTCTCTC;SOR=0.661;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=272;TCF=143;TCR=129;TR=93;WE=90178344;WS=90178326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,94:0.34:277
chr1	90178743	rs474536	A	G	5136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=88;PP=2965;SC=GGTCCAGAAGACAGCCTGGTC;SOR=1.036;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=156;TCF=68;TCR=88;TR=155;WE=90178751;WS=90178733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr1	91447985	rs358691	C	T	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=18;PP=570;SC=CATGAATAACCATAGCTACAA;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=91447993;WS=91447975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr1	91728053	rs585898	G	A	1553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=22;PP=1090;SC=CTGCATTTCCGGCTTGTTGAG;SOR=0.732;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=25;TCR=22;TR=47;WE=91728061;WS=91728043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	91728202	rs555432	T	C	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=338;SC=AAAAACCATTTTAATTTGGAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=91728210;WS=91728192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	91739208	rs281964	C	T	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=3;PP=618;SC=TAACACTACTCGTCAATTCAA;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=91739216;WS=91739198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	91739414	rs281963	G	A	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=576;SC=AGAAAATATGGAAATTAATCT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=91739422;WS=91739404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	91742055	rs281959	T	C	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=62;ReadPosRankSum=-0.158;SC=TTATGAATAATGGTAATATTC;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=5;WE=91742063;WS=91742045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr1	91781304	rs281991	T	C	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=386;SC=TATTTTTTTTTCAGTAGAATT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=91781312;WS=91781294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	91781413	rs281992	T	G	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.068;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=576;ReadPosRankSum=-2.178;SC=CTGCGTCACCTATGATTAAGG;SOR=1.329;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=32;WE=91781421;WS=91781403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,32:0.70:46
chr1	91781644	rs11589490	C	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=155;ReadPosRankSum=-0.669;SC=ATCTAAGAAACAGAAAATATT;SOR=0.776;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=24;TCR=17;TR=12;WE=91781652;WS=91781634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr1	91782031	rs11584478	T	C	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=212;ReadPosRankSum=-1.336;SC=GACAATGTTATACCTGTGGAA;SOR=0.839;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=13;WE=91782039;WS=91782021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr1	91784887	rs10493845	G	A	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=0.602;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.051;SOR=0.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,51:0.26:196
chr1	91793877	rs281972	T	C	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=3;PP=336;SC=CAACCCTGAATCAAGCTTTAG;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=91793885;WS=91793867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	91813184	rs281936	C	T	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=550;SC=TAAATATCCACAGAAACAATG;SOR=4.332;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=91813192;WS=91813174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	91841301	rs282036	T	C	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=52;PP=1584;SC=AACACAAAAATATGTGCATTA;SOR=4.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=3;TCR=52;TR=55;WE=91841309;WS=91841291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	91846374	rs282033	C	A	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=5;PP=508;SC=TGTGGCAGTGCAGACATAAAG;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=18;WE=91846382;WS=91846364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	91846595	rs5776097	T	TA	1120.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=29;PP=1299;SC=TAGTTACTTTTATTTTAAAAC;SOR=4.680;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=29;WE=91846603;WS=91846585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	91846654	rs282032	A	T	216.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=177;SC=TGAGGTTTTAACATTTGCTAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=91846662;WS=91846644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	91851253	rs282026	T	C	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=21;PP=1365;SC=ACTGAAATTTTTGCTTACTAT;SOR=0.919;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=26;TCR=21;TR=47;WE=91851261;WS=91851243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	91859795	rs282009	T	C	3107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.44;SOR=0.987;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	91859795	.	TATGTGA	CATGTGA,CATGTGG	954	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=33,14;NR=44,16;PP=954,641;QD=12.8411845785;SC=TTGCCAGCAATATGTGATAAG;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=78;TCF=34;TCR=44;TR=77,30;WE=91859809;WS=91859785;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.99:78
chr1	91859801	rs11165778	A	G	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=1.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.05;ReadPosRankSum=-0.895;SOR=0.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,34:0.41:82
chr1	91973557	rs553606	T	G	1518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=37;PP=1266;SC=TTTTCCTTTTTTAGTCTTGGT;SOR=2.256;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=11;TCR=37;TR=48;WE=91973565;WS=91973547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	91978963	rs13447511	T	TAA	754.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=629;SC=ACTTATAATTTAAAAAACTTT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=17;WE=91978971;WS=91978953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	91980447	rs483532	A	G	5887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=70;PP=2965;SC=CTATTTCTACAAAAGTTATGA;SOR=1.396;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=121;TCR=70;TR=191;WE=91980455;WS=91980437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr1	91989572	rs488126	T	G	2895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=76;NR=4;PP=2389;SC=TTTTTCTGTTTTTGTTTTTTC;SOR=5.186;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=77;TCR=4;TR=80;WE=91989580;WS=91989562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	92108274	rs142096840	T	TA	538.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=1.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.35;MQRankSum=0.783;QD=14.96;ReadPosRankSum=0.405;SOR=1.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,27:0.75:36
chr1	92108899	rs2493202	C	T	10640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=147;NR=179;PP=2965;SC=TCTCCTCCATCTGTTGAACGA;SOR=0.883;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=326;TCF=147;TCR=179;TR=326;WE=92108907;WS=92108889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,331:1.00:331
chr1	92174260	rs284878	A	G	2770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=54;PP=2287;SC=CAAGGGGCTTAGTGAACGTCT;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=31;TCR=54;TR=85;WE=92174268;WS=92174250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	92181678	rs2029355	T	G	313.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.22;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	92184744	rs4658261	C	T	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=1;PP=1001;SC=AGAACTGACACTTGGCTTTCT;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=35;WE=92184752;WS=92184734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	92195601	rs10783002	G	A	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=22;PP=654;SC=GAAGGAGGGTGACAGTGAAAC;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=92195609;WS=92195591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	92200593	rs11165376	A	G	2830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=77;PP=2476;SC=GTACTTCTCAAATCGAAGTGC;SOR=4.307;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=8;TCR=77;TR=85;WE=92200601;WS=92200583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	92200627	rs10874913	T	C	1148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=41;PP=947;SC=CTCTTCCCTTTGTTATACAAG;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=41;WE=92200635;WS=92200617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	92224067	rs3738441	C	T	1264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.030;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=3;PP=977;ReadPosRankSum=-0.023;SC=TGGACTCTGGCATTATTTCAG;SOR=1.458;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=66;TCF=61;TCR=5;TR=46;WE=92224075;WS=92224057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,48:0.71:68
chr1	92262874	rs2810904	T	C	1838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=16;PP=1394;SC=GCCCCTGGCCTGCAGTGCGGA;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=60;WE=92262882;WS=92262864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	92327045	rs1805110	G	A	3659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=88;NR=22;PP=2965;SC=GGCTAAACAGGAGCTCATCAG;SOR=2.670;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=88;TCR=22;TR=110;WE=92327053;WS=92327035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	92327126	rs1805109	C	T	4768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=82;PP=2965;SC=CCAGTCACTTCAGCCTGCTCA;SOR=0.909;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=68;TCR=83;TR=150;WE=92327134;WS=92327116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr1	92428495	rs10783071	C	A	3706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=76;PP=2902;SC=TGTGAAACTACAGTTGCCTGT;SOR=2.024;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=31;TCR=76;TR=107;WE=92428503;WS=92428485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	92442039	rs57536714	AT	A	95.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=2.000;QD=1.65;ReadPosRankSum=-0.676;SOR=0.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,12:0.21:58
chr1	92446112	rs11165911	T	C	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=372;SC=ACAAAAGACATTCTTGACTTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=92446120;WS=92446102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	92446398	rs2303967	T	A	1827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.147;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=21;PP=1441;ReadPosRankSum=0.269;SC=TATGATAGCTTATTAAGACAA;SOR=0.305;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=86;TCF=60;TCR=26;TR=64;WE=92446406;WS=92446388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,65:0.75:87
chr1	92447004	rs10875104	A	G	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=17;PP=574;SC=GTCTTGTGATATTGCCCAGGC;SOR=2.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=92447012;WS=92446994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	92457843	rs10747493	C	T	1736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=10;PP=1206;SC=GAATGCATACCGCCTGAAGGA;SOR=1.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=45;WE=92457851;WS=92457833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	92459613	rs74101067	G	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=191;ReadPosRankSum=-2.082;SC=TTAAAACTAAGTGATAACTTT;SOR=0.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=42;TCR=1;TR=12;WE=92459621;WS=92459603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,13:0.28:47
chr1	92467730	rs74101071	A	G	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.886;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=608;ReadPosRankSum=-0.896;SC=TTTTTTTCTAACAAATCTTGA;SOR=0.478;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=110;TCF=25;TCR=85;TR=35;WE=92467738;WS=92467720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,38:0.32:119
chr1	92467852	rs74101072	G	A	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.033;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=108;ReadPosRankSum=0.517;SC=TTTTGAAAAAGTACTTCTGAG;SOR=0.148;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=8;WE=92467860;WS=92467842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr1	92568263	rs527412	A	G	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=256;ReadPosRankSum=0.685;SC=TTATAGCCGTAAAAATAATTA;SOR=0.990;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=13;WE=92568271;WS=92568253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr1	92613457	rs150451351	C	T	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.84;ReadPosRankSum=0.444;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr1	92646021	rs1483022	G	A	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.547;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=798;ReadPosRankSum=-0.298;SC=ATCAGTCAAAGAAAGGTGAAA;SOR=0.519;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=146;TCF=45;TCR=101;TR=42;WE=92646029;WS=92646011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,44:0.29:150
chr1	92647223	rs560389	A	G	1330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.982;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=10;PP=1032;ReadPosRankSum=0.619;SC=AAGCAAAGTAATAATGATCTT;SOR=1.483;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=144;TCF=99;TCR=45;TR=51;WE=92647231;WS=92647213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,53:0.35:150
chr1	92647532	rs565156	C	A	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=451;ReadPosRankSum=-0.953;SC=TTTTCTGCAACTAAAAAGTTT;SOR=0.742;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=103;TCF=63;TCR=40;TR=28;WE=92647540;WS=92647522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,30:0.28:107
chr1	92711067	rs3131827	A	T	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=74;ReadPosRankSum=-1.859;SC=ATTTCTGTAAATAATGCTGCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=6;WE=92711075;WS=92711057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr1	92711235	rs74948025	A	G	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.071;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=182;ReadPosRankSum=0.241;SC=AAATTAGAGTACCAACTTAAT;SOR=1.630;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=11;WE=92711243;WS=92711225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr1	92712266	rs974924	C	T	1293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=26;PP=926;SC=AAGCAAAACACAGAAAAGATT;SOR=1.280;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=17;TCR=26;TR=43;WE=92712274;WS=92712256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	92712598	rs35752451	GAA	G	1922.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=2.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.661;SOR=0.509;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,56:0.31:179
chr1	92735359	rs1487540	T	C	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=157;ReadPosRankSum=-1.986;SC=AACAAATATATATATTATACA;SOR=0.846;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=9;WE=92735367;WS=92735349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr1	92755943	rs3103178	G	A	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=104;ReadPosRankSum=0.538;SC=AAGAAGGCATGTATCGACAAA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=6;WE=92755951;WS=92755933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr1	92763091	rs372630078	CA	C	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=2.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.89;ReadPosRankSum=-0.552;SOR=2.247;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
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chr1	92765848	rs1542685	A	T	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=76;ReadPosRankSum=-0.488;SC=ATCTTGTATTACTTGTACCAA;SOR=0.402;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=7;WE=92765856;WS=92765838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
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chr1	92946479	rs11164605	G	A	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=31;NR=11;PP=1069;SC=GGGCGGGTTCGCAGAAGAGGC;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=42;WE=92946487;WS=92946469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
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chr1	92979432	rs41286809	G	A	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.647;SOR=0.711;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,31:0.26:120
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chr1	93029479	rs68039687	A	T	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr1	93089823	rs7514716	T	C	1742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=31;PP=1393;SC=TCAGTTCATCTTGTAACTCAT;SOR=0.970;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=24;TCR=31;TR=55;WE=93089831;WS=93089813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	93101670	rs41286811	C	T	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=521;ReadPosRankSum=0.820;SC=ATAAAAACACCAAGTCAATTA;SOR=1.209;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=22;WE=93101678;WS=93101660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr1	93128854	rs10747450	A	G	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=7;PP=734;SC=ACCACCCAAAAAATTATTTCT;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=93128862;WS=93128844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	93160002	rs34202284	G	A	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=462;ReadPosRankSum=1.712;SC=CAACAAAAACGAGTCATTTGA;SOR=0.569;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=18;WE=93160010;WS=93159992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr1	93160902	rs2391199	T	C	3281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=55;PP=2665;SC=CTTGTTGCAATTGGTAGTGGA;SOR=0.979;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=45;TCR=55;TR=100;WE=93160910;WS=93160892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	93163385	rs7418336	A	G	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=82;ReadPosRankSum=-0.476;SC=ATATAAAGGCAATATGCCTTT;SOR=0.321;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=9;WE=93163393;WS=93163375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,9:0.23:39
chr1	93163633	rs1017008	C	T	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=391;SC=CAGCCAACCACAAACATTGTT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=93163641;WS=93163623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	93167610	rs10218567	C	T	309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=2;PP=248;SC=TATCCACTTACATTTAATAAA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=10;WE=93167618;WS=93167600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	93167854	rs10218670	A	G	2301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=58;PP=1827;SC=GGCAAGACAGACAGATTAAAA;SOR=3.321;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=11;TCR=58;TR=69;WE=93167862;WS=93167844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	93311065	.	GAAA	G	154.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=8.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.32;ReadPosRankSum=3.067;SOR=1.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	93312142	rs12746956	A	G	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=22;PP=580;SC=TTTAGCTATCATAAATAATGT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=93312150;WS=93312132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	93312592	rs12062315	C	T	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=2;PP=168;SC=TGAGCCACCACGCCCGGCCTC;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=93312600;WS=93312582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	93426866	rs945629	T	C	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.95;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	93426869	rs1415069	G	C	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.42;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	93426874	rs116489989	G	T	1266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.68;SOR=5.353;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	93545157	rs2815419	G	A	2738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=62;PP=2183;SC=AGGAAGAAAGGAAGCAAGTAT;SOR=2.387;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=81;TCF=18;TCR=63;TR=80;WE=93545165;WS=93545147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	93580581	rs2815427	G	C	1851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=30;PP=1372;SC=CATATTGATTGCAGTGTGATT;SOR=0.997;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=22;TCR=30;TR=52;WE=93580589;WS=93580571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	93580992	rs566843	C	T	2813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=70;NR=10;PP=2284;SC=AAATTTTAGCCTTCACTCTTT;SOR=3.509;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=70;TCR=10;TR=80;WE=93581000;WS=93580982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	93581024	rs2295423	T	C	3946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=90;NR=23;PP=2965;SC=CCCTCTAATGTAGAGGGGTGG;SOR=2.664;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=114;TCF=91;TCR=23;TR=113;WE=93581032;WS=93581014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	93602194	rs2281524	C	T	3542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=83;NR=22;PP=2853;SC=TAAAAAAGCTCAGTAGACAAT;SOR=2.812;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=83;TCR=22;TR=105;WE=93602202;WS=93602184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr1	93620393	rs1060622	G	A	5937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.98;NF=81;NR=105;PP=2965;SC=TCTAAGCAGAGTTTGTATGTG;SOR=0.915;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=186;TCF=81;TCR=105;TR=186;WE=93620401;WS=93620383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr1	93621483	rs1057257	A	G	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=462;SC=ACCACAAAATAGTTGTGAAAT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=93621491;WS=93621473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	93646207	rs2297707	T	C	5212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=73;NR=72;PP=2965;SC=CCCCGCGCCTTCGGCGGCGCC;SOR=0.759;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=75;TCR=72;TR=145;WE=93646215;WS=93646197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr1	93646418	rs10874763	C	T	4897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.493;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=109;PP=2962;ReadPosRankSum=1.454;SC=GGGTGGGTCTCTCCCCAGCGA;SOR=0.810;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=282;TCF=113;TCR=169;TR=178;WE=93646426;WS=93646408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,181:0.63:289
chr1	93646503	.	C	T	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.000;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.967;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=38;PP=899;ReadPosRankSum=-0.114;SC=TCCTTTCCCTCCCGGCACCTT;SOR=0.971;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=126;TCF=24;TCR=102;TR=45;WE=93646511;WS=93646493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,47:0.36:130
chr1	93649732	rs6682670	A	G	2337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=66;PP=2020;SC=ATCTAGTTAAAAGAAGTTTTG;SOR=7.024;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=67;TCF=1;TCR=66;TR=67;WE=93649740;WS=93649722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	93659350	rs2815411	A	T	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=572;SC=AATAAAAGGAAATATTACCTA;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=93659358;WS=93659340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	93672723	rs2815413	A	C	2322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=14;PP=1734;SC=GCAGTGAAAAATTCAGAAGTC;SOR=2.537;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=51;TCR=14;TR=65;WE=93672731;WS=93672713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	93676314	rs555161	A	G	1055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=0;PP=895;SC=AAGCAAATGCATCTCATTTAC;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=38;WE=93676322;WS=93676304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	93676578	rs797676	A	G	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=18;PP=600;SC=TCATGCCTGTAATCCCAACAC;SOR=4.514;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=93676586;WS=93676568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	93711782	rs3754186	T	A	7456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=160;PP=2965;SC=CTTGATTATATTTTAATGGAG;SOR=1.817;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=231;TCF=71;TCR=160;TR=231;WE=93711790;WS=93711772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr1	93998640	rs34814765	AT	A	1822.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=44;PP=1867;SC=GTGCTAAATAATTATCTTTGA;SOR=4.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=1;TCR=46;TR=44;WE=93998648;WS=93998630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	94012287	rs237425	G	A	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=467;SC=TTAAAAAGATGTGACTCTACT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=94012295;WS=94012277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	94041787	rs25569	G	GAC	1694.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=30;PP=1681;SC=CGATGGCGTGGACACTTTATG;SOR=3.611;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=33;WE=94041795;WS=94041777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	94312482	rs5776191	T	TC	8409.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=81;PP=2969;SC=ACCCCGTTTTTCGAACCCCGC;SOR=1.061;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=75;TCR=84;TR=154;WE=94312490;WS=94312472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr1	94312528	rs147446599	G	GC	6853.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.33;QD=43.93;SOR=1.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr1	94312533	rs202198870	G	GC	6869.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.38;QD=47.38;SOR=1.094;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr1	94312542	.	G	GC	6217.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.31;QD=50.14;SOR=0.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	94312544	.	G	GC	6352.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.21;QD=51.23;SOR=1.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	94312554	.	A	AG	6037.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.96;QD=47.54;SOR=1.972;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr1	94312558	.	G	GC	2564.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=0.000;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=3.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.232;QD=27.00;ReadPosRankSum=-0.199;SOR=0.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,64:0.67:95
chr1	94312559	.	CGGCTGGGTCGGGCG	C	901.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=5.229;ClippingRankSum=0.000;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=2.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.201;QD=8.51;ReadPosRankSum=0.361;SOR=1.042;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,31:0.29:106
chr1	94312566	rs2391318	G	T	2575.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=2.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.228;QD=26.55;ReadPosRankSum=-0.666;SOR=0.388;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,66:0.68:97
chr1	94312567	rs2391319	T	C	2722.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=5.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=2.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-0.107;QD=28.97;ReadPosRankSum=-0.250;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,63:0.67:94
chr1	94312571	.	G	GC	2450.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.111;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=1.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=-0.701;QD=26.07;ReadPosRankSum=0.081;SOR=0.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,63:0.67:94
chr1	94312573	.	G	GC	2417.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.867;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=-0.972;QD=27.17;ReadPosRankSum=0.952;SOR=0.586;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,58:0.65:89
chr1	94312576	.	G	GC	4732.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.23;QD=52.01;SOR=3.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	94312579	.	G	GT,GC	3971.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.15;QD=47.85;SOR=4.281;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,31,52:0.37,0.63:83
chr1	94312584	rs200230769	G	GC	3785.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=295;SC=CGGCGGCCGGGCGCGAGGGAA;SOR=4.487;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=94312592;WS=94312574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	94336498	rs57384286	C	CA	96.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQRankSum=-1.162;QD=6.05;ReadPosRankSum=0.054;SOR=0.340;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr1	94341137	rs2273166	C	T	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=195;ReadPosRankSum=1.047;SC=AGTCTTTTACCAAGGACTAAT;SOR=0.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=10;WE=94341145;WS=94341127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr1	94341267	rs2273165	A	G	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.832;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=14;PP=588;ReadPosRankSum=-0.029;SC=TATCTGCATTAAAATTAATAT;SOR=0.482;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=90;TCF=54;TCR=36;TR=33;WE=94341275;WS=94341257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,32:0.36:90
chr1	94342564	rs3747965	C	A	1631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-7.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.275;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=51;PP=1128;ReadPosRankSum=1.521;SC=TTTCTTTCCCCTCATCTGTTA;SOR=0.958;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=193;TCF=42;TCR=151;TR=63;WE=94342572;WS=94342554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,69:0.33:206
chr1	94343023	rs2391322	A	G	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.605;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=928;ReadPosRankSum=-0.638;SC=TTTTTTCTGTAGGAAGCACAA;SOR=0.699;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=168;TCF=86;TCR=82;TR=53;WE=94343031;WS=94343013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,53:0.31:173
chr1	94343233	rs3789457	T	C	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=2.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.97;ReadPosRankSum=-0.539;SOR=0.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,46:0.28:164
chr1	94344716	rs2235971	C	T	2622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.203;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=60;PP=1950;ReadPosRankSum=-0.413;SC=TTTCCGGCTCCCTCGCGACCA;SOR=0.600;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=390;TCF=181;TCR=209;TR=115;WE=94344724;WS=94344706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:284,120:0.30:404
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chr1	94466659	rs1801555	A	G	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.046;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=518;ReadPosRankSum=-0.203;SC=TGGTGGGCTCATCCTGGGGGG;SOR=0.298;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=76;TCF=16;TCR=60;TR=30;WE=94466667;WS=94466649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,30:0.39:76
chr1	94467221	rs4147865	G	A	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=5.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.914;SOR=1.312;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,40:0.27:149
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chr1	94467407	rs17110761	C	T	1704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.010;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=44;PP=1241;ReadPosRankSum=-1.396;SC=CCCAAGCCCGCAGTTACCAGC;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=268;TCF=121;TCR=147;TR=80;WE=94467415;WS=94467397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,83:0.30:278
chr1	94467447	rs1801359	G	A	1839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.084;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=51;PP=1418;ReadPosRankSum=0.406;SC=CAATGAGTGCGATGGCTGTGG;SOR=0.786;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=245;TCF=88;TCR=157;TR=78;WE=94467455;WS=94467437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,80:0.32:249
chr1	94471075	rs1762114	A	G	3113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.661;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=71;PP=2258;ReadPosRankSum=1.828;SC=GCAGCTCATCAATTGCATCAA;SOR=0.992;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=176;TCF=64;TCR=112;TR=108;WE=94471083;WS=94471065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,118:0.63:187
chr1	94471223	rs2275028	C	T	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=247;ReadPosRankSum=0.172;SC=CTTCTGCCAACGGGAAAAGGA;SOR=0.434;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=13;WE=94471231;WS=94471213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr1	94476555	rs537831	G	A	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=44;PP=1301;SC=CCACAGCACAGGGCCCACTAG;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=45;WE=94476563;WS=94476545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	94480037	rs2275033	C	T	1067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=7;PP=909;SC=TGGCTCTGCTCGACCAACACA;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=94480045;WS=94480027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	94484059	rs3838275	AT	A	859.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=886;ReadPosRankSum=1.035;SC=CTGGTTTTGTATTGTTAAGTG;SOR=0.658;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=98;TCF=34;TCR=64;TR=29;WE=94484067;WS=94484049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,33:0.29:112
chr1	94487354	rs472908	G	A	6058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=63;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.710;SC=ATTCATGGTAGTTAAGCAAGT;SOR=0.626;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=186;TCF=123;TCR=63;TR=185;WE=94487362;WS=94487344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,190:0.99:191
chr1	94495930	rs547806	T	C	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=2;PP=1162;SC=AACCCACCGTTGGGTCCTCCC;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=41;WE=94495938;WS=94495920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	94496253	rs2297671	G	A	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=25;PP=708;SC=CTGAACACTCGCAGTGGTCTG;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=94496261;WS=94496243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	94511533	rs3789398	G	A	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.257;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=401;ReadPosRankSum=-0.617;SC=TGAGAGATCCGCGCAGAGCCC;SOR=2.062;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=4;TCR=60;TR=22;WE=94511541;WS=94511523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,21:0.32:66
chr1	94528363	rs4147833	C	T	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-5.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=37;PP=856;ReadPosRankSum=-1.538;SC=AGCTCACTCACACCTCCCGAC;SOR=0.957;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=63;TCF=7;TCR=56;TR=42;WE=94528371;WS=94528353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,41:0.68:60
chr1	94544135	rs4147887	A	AC	1056.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=28;NR=6;PP=1115;SC=CCATCCTCCAACCCCCCTTAC;SOR=3.383;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=34;WE=94544143;WS=94544125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	94544233	rs4147831	G	A	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.781;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=1508;ReadPosRankSum=-1.390;SC=ACTTCCTAACGTGTTCCAGTT;SOR=0.889;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=127;TCF=95;TCR=32;TR=35;WE=94544242;WS=94544223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,37:0.26:141
chr1	94544234	rs3112831	T	C	2808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.841;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=24;PP=2962;ReadPosRankSum=0.998;SC=CTTCCTAACGTGTTCCAGTTC;SOR=0.569;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=127;TCF=95;TCR=32;TR=93;WE=94544242;WS=94544223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,105:0.74:141
chr1	94544276	rs4147830	G	A	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.314;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=759;ReadPosRankSum=1.936;SC=AAACCAGACAGAGATCAAGAC;SOR=0.569;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=91;TCR=71;TR=47;WE=94544284;WS=94544266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,50:0.28:181
chr1	94544326	rs3215952	GT	G	734.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=1.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.518;SOR=0.440;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,33:0.22:153
chr1	94544805	rs139796930	T	TCA	482.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.066;NF=13;NR=0;PP=565;ReadPosRankSum=0.604;SC=CACATCTCTCTCACACACACA;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=13;WE=94544813;WS=94544795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr1	94545160	rs2275035	C	T	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=77;ReadPosRankSum=1.761;SC=AGGCTGTACCCCACCAATAAC;SOR=0.114;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=7;WE=94545168;WS=94545150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr1	94549029	rs526016	A	G	2225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=5.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.61;ReadPosRankSum=0.223;SOR=0.207;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,79:0.77:103
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chr1	94568491	rs4847278	A	G	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=407;ReadPosRankSum=0.927;SC=AAGAAGAAAAAAGCCAATATA;SOR=0.389;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=18;WE=94568499;WS=94568481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
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chr1	94639337	rs1330858	A	G	2337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=0;PP=2021;SC=TATACAAAAGAGGCCCTGTCA;SOR=8.468;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=67;TCF=67;TCR=0;TR=67;WE=94639345;WS=94639327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	94639447	rs1999272	C	T	9114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=188;NR=110;PP=2965;SC=TGGAATTTCACCTTCGAGGTC;SOR=1.434;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=299;TCF=189;TCR=110;TR=298;WE=94639455;WS=94639437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr1	94643531	rs1048854	T	C	1072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=0.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.89;ReadPosRankSum=1.442;SOR=0.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,47:0.26:182
chr1	94667430	rs5776210	G	GA	702.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=558;SC=AAATATCACAGAAAAAAAAAT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=26;WE=94667438;WS=94667420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr1	94670784	rs10443184	T	C	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.442;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=527;ReadPosRankSum=1.550;SC=GGTAAGTATATGTTAAATGTG;SOR=1.949;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=29;WE=94670792;WS=94670774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,28:0.70:40
chr1	94674723	rs6684237	G	A	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=9;PP=627;SC=TTAATACTTCGTTTCCCATGT;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=28;WE=94674731;WS=94674713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	94924046	rs2147794	A	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=117;ReadPosRankSum=-0.941;SC=TCTCACTATGATGTGAAAAAG;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=7;WE=94924054;WS=94924036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr1	94930345	rs16946	G	A	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.610;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=23;PP=1114;ReadPosRankSum=-0.693;SC=AGGGGAAAAAGGAGCGAGCTG;SOR=0.801;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=159;TCF=97;TCR=62;TR=62;WE=94930353;WS=94930335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,61:0.38:161
chr1	94941376	rs681187	G	A	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=369;SC=AATTGATTTTGTGGACATAAC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=94941384;WS=94941366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	94980671	rs3118109	C	G	2446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=22;PP=1730;SC=CTCTGTTACTCATTAAACCTA;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=48;TCR=22;TR=70;WE=94980679;WS=94980661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	95001600	rs698946	A	C	1769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=34;PP=1559;SC=CATTCCCTGCAGGGTAGGAGA;SOR=0.950;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=27;TCR=34;TR=60;WE=95001608;WS=95001590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	95211285	rs6541364	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=121;ReadPosRankSum=1.214;SC=TTAGGGGACTCTGGCATAGTA;SOR=0.202;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=8;WE=95211293;WS=95211275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr1	95211525	rs1333953	G	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=6.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.94;ReadPosRankSum=0.023;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,16:0.23:71
chr1	95286094	rs10782992	G	T	2063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=33;PP=1579;SC=CGAGTCCCCCGCCTTCACGCA;SOR=0.781;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=36;TCR=33;TR=69;WE=95286102;WS=95286084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	95286658	rs6676991	C	A	1677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=123;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=33;PP=1204;SC=TGTGTGTGCACGTCTGGAAAT;SOR=1.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=49;WE=95286666;WS=95286648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	95286675	rs11274910	GTCCCAAATGTAAA	G	2066.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=21;PP=2957;SC=AAATAACTCTGTCCCAAATGT;SOR=2.560;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=24;WE=95286695;WS=95286665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	95290003	rs6687749	C	T	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=3;PP=536;SC=GGGCACTGTGCGCTCAGCCCT;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=95290011;WS=95289993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	95290305	rs6541372	T	C	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=268;SC=CAGCCTATTTTATAAAAAGGA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=95290313;WS=95290295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	95291366	rs10874894	A	G	2222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=10;PP=1820;SC=CTAATTACGGAGCATTTTCTC;SOR=3.360;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=56;TCR=10;TR=65;WE=95291374;WS=95291356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	95330372	rs859098	G	A	2121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.250;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=33;PP=1792;ReadPosRankSum=0.677;SC=TCAAGGAACCGTTGTGAAAGG;SOR=0.512;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=137;TCF=86;TCR=51;TR=83;WE=95330380;WS=95330362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,81:0.59:137
chr1	95332814	rs74104711	C	T	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=211;ReadPosRankSum=0.448;SC=ACTGTGTTTCCTCAGAAACTG;SOR=0.954;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=11;WE=95332822;WS=95332804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr1	95332864	rs12137650	C	T	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=637;ReadPosRankSum=-0.518;SC=TGACTCTGTTCCTTTGTTCTC;SOR=0.486;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=29;WE=95332872;WS=95332854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,29:0.67:43
chr1	95333068	rs859096	G	T	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.080;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=764;ReadPosRankSum=1.628;SC=TCTCTAAGGGGCTAAATTGTG;SOR=1.051;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=68;TCF=22;TCR=46;TR=38;WE=95333076;WS=95333058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,41:0.55:74
chr1	95358096	rs859063	A	G	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=35;PP=1209;SC=TTCATTTCCAATTGCAATCTC;SOR=1.848;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=49;WE=95358104;WS=95358086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	95367108	rs10605235	ACC	A	517.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=296;SC=TATAAACTACACCCCCCCCCC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=14;WE=95367117;WS=95367104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	95367136	rs859059	G	A	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=0;PP=596;SC=TAGTACTTCTGTCTATTCTTA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=95367144;WS=95367126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	95367649	rs859058	T	C	4538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=44;PP=2965;SC=GGGAATCTGTTAACCAGCCAT;SOR=1.712;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=95;TCR=44;TR=139;WE=95367657;WS=95367639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr1	95367894	rs859057	A	C	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=26;PP=819;SC=GTCTTCATAAACAGTTATAAG;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=95367902;WS=95367884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	95368574	.	TA	T	39.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.61;ReadPosRankSum=-0.654;SOR=0.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,12:0.18:65
chr1	95369198	rs11165268	G	C	1398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=42;PP=1146;ReadPosRankSum=0.639;SC=TGTAGTAAATGACACTCAATA;SOR=0.984;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=64;TCF=7;TCR=57;TR=47;WE=95369219;WS=95369188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,48:0.73:66
chr1	95369211	rs859054	T	G	1818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=48;PP=1838;SC=ACTCAATAGATCTCAATGGCA;SOR=5.097;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=3;TCR=48;TR=51;WE=95369219;WS=95369188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	95392593	rs11540278	C	T	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=3.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.39;ReadPosRankSum=-0.117;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr1	95427041	rs3831103	AT	A	472.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=0.470;QD=10.28;ReadPosRankSum=0.197;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr1	95428414	rs2766005	G	A	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=425;ReadPosRankSum=1.520;SC=CAACCCTGAAGTACATGCTGG;SOR=1.528;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=18;WE=95428422;WS=95428404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr1	95530591	rs12751061	A	T	2794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.503;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=56;PP=1989;ReadPosRankSum=0.787;SC=AAATATCAGAAGTCCTAAGAT;SOR=0.406;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=137;TCF=58;TCR=79;TR=101;WE=95530599;WS=95530581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,107:0.74:145
chr1	95530709	rs6674467	G	A	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=634;ReadPosRankSum=1.878;SC=GAAGACACAAGGAACATTTGA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=25;WE=95530717;WS=95530699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,27:0.79:34
chr1	95614215	rs76921353	G	A	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=12;PP=738;ReadPosRankSum=1.757;SC=AAATTTTATTGCAAAGAATCT;SOR=0.622;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=37;WE=95614223;WS=95614205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,38:0.70:54
chr1	95615678	rs76086699	T	C	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.851;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=188;ReadPosRankSum=-1.195;SC=AAAGCAATTTTATTATATTTA;SOR=1.609;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=10;WE=95615686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr1	95615888	rs35206271	T	C	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=202;ReadPosRankSum=1.781;SC=ACAAAGAATATATAGTCTATG;SOR=1.609;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=10;WE=95615896;WS=95615878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr1	95705615	rs640527	G	A	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.315;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=27;PP=636;ReadPosRankSum=1.260;SC=CCTCCTTATAGGGACCCTTGT;SOR=1.028;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=83;TCF=11;TCR=72;TR=30;WE=95705623;WS=95705605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,30:0.36:84
chr1	95709821	rs259358	T	C	5374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=86;PP=2965;SC=TTTATGGATGTGGATATACCT;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=180;TCF=94;TCR=86;TR=179;WE=95709829;WS=95709811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr1	95709939	rs2296308	T	G	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.591;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=24;PP=1194;ReadPosRankSum=-1.054;SC=TGAAAGAGAATTTACTTGAGC;SOR=0.625;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=183;TCF=114;TCR=69;TR=62;WE=95709947;WS=95709929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,62:0.34:183
chr1	95712050	rs148395594	TGAGACTCA	T	502.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=1160;ReadPosRankSum=0.936;SC=ACTGGGACTTTGAGACTCAGA;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=10;WE=95712065;WS=95712040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr1	97189091	rs3762411	G	A	3078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=35;PP=2532;SC=AATAACAGGAGGTTGAAACTA;SOR=1.361;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=98;TCF=63;TCR=35;TR=97;WE=97189099;WS=97189081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	97236130	rs3762409	G	A	272.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=223;SC=TTCTAATTCTGCTTATCAGAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=97236138;WS=97236128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	97272456	rs6699932	A	G	4369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=71;PP=2965;ReadPosRankSum=0.279;SC=TGAAGATTTTATACAATAAGA;SOR=0.240;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=68;TCR=72;TR=139;WE=97272464;WS=97272446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,143:0.99:144
chr1	97278804	rs273886	G	A	1621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=17;PP=1340;ReadPosRankSum=1.372;SC=TGTATGAAGTGTCTAATTTTA;SOR=0.665;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=51;WE=97278812;WS=97278794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr1	97547831	rs290854	G	A	3367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=96;NR=3;PP=2822;SC=GCTTTCTGCCGTAAAAACAAG;SOR=5.933;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=97;TCR=3;TR=99;WE=97547839;WS=97547821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	97770920	rs1801160	C	T	1459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.600;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=26;PP=1169;ReadPosRankSum=0.533;SC=GTGGCTGTAACGCCATTGGCA;SOR=0.625;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=154;TCF=91;TCR=63;TR=60;WE=97770928;WS=97770910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,61:0.38:162
chr1	97771947	rs7556439	C	A	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=575;ReadPosRankSum=-0.216;SC=ACGTGCAAGACAAATCCAACT;SOR=1.259;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=24;WE=97771955;WS=97771937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr1	97838972	rs1879374	A	G	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.666;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=164;ReadPosRankSum=0.478;SC=CTTTTTAAACACTAAATATTT;SOR=2.642;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=12;WE=97838980;WS=97838962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr1	97839016	rs1890138	A	G	1712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=17;PP=1313;SC=CTAGCCAGTCATCTGATCCAT;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=60;WE=97839024;WS=97839006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
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chr1	98349390	rs111231337	C	CA	1210.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.706;NF=13;NR=37;PP=579;ReadPosRankSum=-0.882;SC=TTAGGAATCACAAAAAAAAAA;SOR=0.920;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=66;TCF=16;TCR=50;TR=50;WE=98349398;WS=98349380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,52:0.91:57
chr1	98511733	.	G	GCCGCTGCCGCTGCTA	164.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=41.18;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
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chr1	99127392	rs9728148	T	C	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=7;PP=603;SC=CGGGCAGCAGTGGCTCTTCCG;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=25;WE=99127400;WS=99127382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	99150635	rs9433747	G	A	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=777;ReadPosRankSum=-0.100;SC=TAAACATTTGGTGAATATTTT;SOR=0.735;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=56;TCF=31;TCR=25;TR=38;WE=99150643;WS=99150625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,39:0.70:56
chr1	99156904	rs183435886	T	A	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.71;ReadPosRankSum=1.501;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr1	99225627	rs2019213	G	A	5018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=64;PP=2965;SC=CTACGTGGGAGTCATTCCTTA;SOR=1.003;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=90;TCR=64;TR=154;WE=99225635;WS=99225617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr1	99387628	rs34854879	T	TA	2903.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=91;PP=2313;SC=AAACATTCAATAAAAAAAATG;SOR=5.221;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=109;TCF=4;TCR=105;TR=93;WE=99387636;WS=99387618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	99418948	.	T	TGTGTGTGA	948.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5036;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.849;NF=0;NR=20;PP=734;ReadPosRankSum=0.728;SC=TGTGTGTGTGTGTGAATTTCA;SOR=3.334;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=20;WE=99418956;WS=99418938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,25:0.86:29
chr1	99470117	rs144194271	G	T	4463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.383;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=78;PP=2962;ReadPosRankSum=0.193;SC=GCACGTTCACGGTGAACGTGT;SOR=0.537;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=234;TCF=124;TCR=110;TR=160;WE=99470125;WS=99470107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,163:0.68:238
chr1	99470269	rs12057990	T	C	2205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=64;PP=2046;SC=GAGCGGGCGGTCGACGCGGTG;SOR=5.549;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=3;TCR=64;TR=67;WE=99470277;WS=99470259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	99753631	rs35121076	G	A	2591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.719;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=29;PP=1993;ReadPosRankSum=-0.590;SC=TTAGCATGCCGTACATTGAAC;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=93;TCR=43;TR=94;WE=99753639;WS=99753621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,96:0.68:141
chr1	100155199	rs11166298	G	A	2682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=6.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.036;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=43;PP=2016;ReadPosRankSum=1.104;SC=CAGAGAAACCGTCCTACCACC;SOR=0.505;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=292;TCF=182;TCR=110;TR=106;WE=100155207;WS=100155189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,113:0.37:306
chr1	100159418	rs12130813	T	C	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=32;ReadPosRankSum=1.150;SC=TAGCTTATTATTTCTACTATC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=3;WE=100159426;WS=100159408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr1	100159552	rs58405312	C	CT	197.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.209;NF=7;NR=4;PP=156;ReadPosRankSum=0.877;SC=TTATAACTCTCTTTTTTTTTC;SOR=0.936;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=11;WE=100159560;WS=100159542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr1	100174670	rs12145706	C	T	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=601;ReadPosRankSum=0.495;SC=TTTTTAAAAGCATGACCCTGA;SOR=0.605;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=114;TCF=36;TCR=78;TR=36;WE=100174678;WS=100174660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,39:0.33:118
chr1	100177526	rs12141159	G	A	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=67;ReadPosRankSum=-1.062;SC=GGATTTCAACGTTTAAGGCTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=5;WE=100177534;WS=100177516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr1	100181379	rs181269870	A	C	252.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=3.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.99;ReadPosRankSum=-0.802;SOR=0.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr1	100181380	.	GA	G	243.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.476;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=3.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.802;SOR=0.144;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr1	100194305	rs7522921	C	G	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.321;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=27;PP=499;ReadPosRankSum=-0.764;SC=GATCGTATGTCCATGCTTTGT;SOR=0.020;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=93;TCF=2;TCR=91;TR=29;WE=100194313;WS=100194295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,29:0.31:94
chr1	100203501	rs7537095	C	T	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.799;NF=4;NR=0;PP=41;ReadPosRankSum=-0.932;SC=GTTTCACCATCTCGGCCAGGC;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=4;WE=100203509;WS=100203499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr1	100203571	rs7548709	A	G	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.875;NF=11;NR=3;PP=203;ReadPosRankSum=-1.618;SC=TGCTGGGATTACAGGCATGAG;SOR=0.527;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=14;WE=100203579;WS=100203561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr1	100203597	rs7513916	G	A	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=296;ReadPosRankSum=-0.351;SC=ATGCCTAGCCGTGATTCTCCT;SOR=0.522;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=19;WE=100203605;WS=100203587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,20:0.36:56
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chr1	100203693	rs7514021	G	A	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=464;ReadPosRankSum=-1.172;SC=TACTGGGGCCGCTCATTTCAA;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=32;TCR=44;TR=28;WE=100203701;WS=100203683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,29:0.38:76
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chr1	100316765	rs663848	C	T	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=28;PP=852;SC=TTTTAAAGCTCTAAGATAAAT;SOR=3.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=31;WE=100316773;WS=100316755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	100327026	rs2307129	C	T	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.295;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=637;ReadPosRankSum=0.122;SC=TTAAGTCCTACGATGAGTTTA;SOR=1.493;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=29;WE=100327034;WS=100327016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr1	100329889	rs535461	G	C	4825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=128;NR=13;PP=2965;SC=TTCATTTTAGGCTGGTTTTGT;SOR=4.528;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=129;TCR=13;TR=141;WE=100329897;WS=100329879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr1	100335977	rs17121403	A	G	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.046;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=483;ReadPosRankSum=0.355;SC=AAATGGATCCAGGAACATCCA;SOR=0.431;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=106;TCF=84;TCR=22;TR=34;WE=100335985;WS=100335967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,36:0.32:111
chr1	100336361	rs2230306	C	T	2322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=26;PP=1667;SC=AGCTTAAACTCTGGGAATTTT;SOR=1.379;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=46;TCR=26;TR=72;WE=100336369;WS=100336351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	100340225	rs634880	G	A	2783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=18;PP=2140;ReadPosRankSum=1.732;SC=TTAAGGTATCGTCTTTTCTTT;SOR=1.502;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=86;TCF=68;TCR=18;TR=84;WE=100340233;WS=100340215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
chr1	100353760	rs145604857	A	G	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.816;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=41;PP=1060;ReadPosRankSum=-0.383;SC=GAGTATGCCTACTTGGGTTGC;SOR=0.444;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=66;TCF=4;TCR=62;TR=45;WE=100353768;WS=100353750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,46:0.67:69
chr1	100436133	rs11166383	A	G	3036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=8;PP=2507;SC=GTAGGCACAGATGCACCCGAC;SOR=4.455;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=78;TCR=8;TR=86;WE=100436141;WS=100436123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	100472604	rs534252	A	G	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=10;PP=1139;SC=CGTATCAGTTAAAAATTCTTA;SOR=2.511;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=44;WE=100472612;WS=100472594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	100476815	rs12121705	T	G	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=0;PP=805;SC=GTCCCAAAAATGATATTGGTT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=100476823;WS=100476807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	100481062	rs3835492	AG	A	710.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=23;PP=820;SC=TACTGATGTGAGGGGGAAAAG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=23;WE=100481070;WS=100481052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	100488177	rs482466	C	T	1825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=54;PP=1538;SC=AAGGATAAGACATGTGTATAT;SOR=6.701;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=55;WE=100488185;WS=100488167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	100503892	rs80339334	G	C	7868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=113;NR=168;PP=2965;SC=GTTCCGCGCCGGCGAGCGTCC;SOR=1.138;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=282;TCF=114;TCR=168;TR=281;WE=100503900;WS=100503882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr1	100503993	rs1395332	A	C	2227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=78;PP=1857;SC=ACCCTGTCCGAGCTGCCGGTG;SOR=5.084;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=5;TCR=78;TR=83;WE=100504001;WS=100503983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	100524336	rs12119548	C	T	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=607;ReadPosRankSum=1.948;SC=TACACATACACGCACACGGAT;SOR=5.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=23;WE=100524344;WS=100524326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr1	100542638	rs6699449	G	A	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=394;SC=GTAGAAAAGTGCCAATAGTCC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=100542646;WS=100542628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	100584746	rs6662945	A	C	1015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=779;SC=ATATGTAATAATTTTGATTAG;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=100584754;WS=100584736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	100598299	rs11166405	A	G	5165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.669;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=40;PP=2965;ReadPosRankSum=1.521;SC=GATGACGCGGACCTTACCTCT;SOR=2.028;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=157;TCF=116;TCR=41;TR=155;WE=100598307;WS=100598289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,165:0.99:166
chr1	100623922	rs12122948	T	C	2677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=57;PP=2004;SC=TAGTAAGCAGTCCTATAAAAA;SOR=2.168;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=20;TCR=57;TR=77;WE=100623930;WS=100623912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	100680593	.	CT	C	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=1.565;QD=2.96;ReadPosRankSum=0.198;SOR=0.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr1	100733207	rs60634058	G	GT	1948.52	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=8.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.71;MQRankSum=0.712;QD=20.73;ReadPosRankSum=0.707;SOR=2.133;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,77:0.82:94
chr1	100740606	rs71800610	GAACTT	G	1149.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=1309;ReadPosRankSum=-1.807;SC=ATTATTGAGAGAACTTAACAT;SOR=5.353;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=26;WE=100740618;WS=100740596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr1	100817384	rs28361189	A	G	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=374;ReadPosRankSum=0.469;SC=GAGGAAACCAATACATGTACT;SOR=0.654;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=41;TCR=55;TR=27;WE=100817392;WS=100817374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,27:0.28:98
chr1	100818464	rs594529	T	C	1205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=7;PP=923;SC=GGCGAGTGACTTCAGCTGGCC;SOR=2.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=100818472;WS=100818454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	100856479	rs28361213	C	T	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=2.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.563;SOR=0.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,41:0.26:158
chr1	100908324	rs584350	A	G	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=490;SC=TCTTAATGCAATATAACCAGT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=100908332;WS=100908317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	100908577	rs78861171	A	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=340;ReadPosRankSum=-0.416;SC=TTTTTTTTACAAAACATAATT;SOR=0.567;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=26;TCR=40;TR=19;WE=100908585;WS=100908567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,19:0.29:65
chr1	100949860	rs2270694	G	A	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.461;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=52;ReadPosRankSum=1.411;SC=AACAAGCATCGTTGTGGGTCC;SOR=0.418;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=8;WE=100949868;WS=100949850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr1	100961779	rs149672640	ATT	A	965.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.21;NF=0;NR=28;PP=378;SC=CATGAAAAGGATTTTTTTTTT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=28;WE=100961789;WS=100961769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,32:0.91:35
chr1	100970346	rs10875295	T	C	1777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=23;PP=1328;ReadPosRankSum=-1.957;SC=ACCTTGCTTATTCTCTTGTTT;SOR=0.545;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=239;TCF=173;TCR=66;TR=78;WE=100970354;WS=100970336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,79:0.33:240
chr1	101005090	rs2809819	G	A	1398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=32;PP=1177;SC=GCCACCGCGAGTCCACTACCC;SOR=2.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=45;WE=101005098;WS=101005080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	101005425	rs201200849	G	A	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=600;ReadPosRankSum=0.361;SC=AGCCACTGGTGTGGGTGAGCC;SOR=1.292;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=27;WE=101005433;WS=101005415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr1	101190173	rs2392221	C	T	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=2.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.51;ReadPosRankSum=0.905;SOR=0.413;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,35:0.24:144
chr1	101194965	rs68164684	G	GT	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.17;ReadPosRankSum=-0.914;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr1	101199979	.	A	G	554	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=18;NR=1;PP=554;QD=30.9879585551;SC=CAGGGAAGCTATTGTTGATGT;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=101199987;WS=101199978;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	101203827	rs3176879	G	A	1612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=25;PP=1166;SC=AAGCACAGAAGTCAAAAGTGT;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=50;WE=101203835;WS=101203817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	101342497	rs2295280	T	C	1563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=43;PP=1374;SC=ATAGTGTCTATATAGATCATT;SOR=6.229;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=44;WE=101342505;WS=101342487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	101372607	rs4908106	C	A	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=31;PP=885;SC=GACTTGTTACCAATTGAACAC;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=101372615;WS=101372597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	101377845	rs10493940	A	G	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=426;ReadPosRankSum=-0.680;SC=GGTTTCTGTCATAATTATTTA;SOR=1.371;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=18;WE=101377853;WS=101377835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr1	101438051	rs17408707	A	G	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=113;ReadPosRankSum=-1.755;SC=TTTCTTTGTTATTGCCTTGGG;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=101438059;WS=101438041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr1	101475199	.	GC	G	2906.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.000;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=60.08;MQRankSum=0.679;NF=14;NR=59;PP=2803;ReadPosRankSum=0.282;SC=TTCCAATCTTGCCTGGCAGTA;SOR=0.728;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=108;TCF=19;TCR=89;TR=73;WE=101475207;WS=101475189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,89:0.70:128
chr1	101475901	rs7521424	T	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=78;ReadPosRankSum=0.480;SC=TAAGATAGTGTGTATCAACTG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=101475909;WS=101475891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	101476786	rs34915449	G	A	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.51;ReadPosRankSum=-2.322;SOR=1.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr1	101476800	rs35409691	CA	C	240.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.16;ReadPosRankSum=-0.605;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr1	101476814	rs17123612	C	T	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.13;ReadPosRankSum=0.747;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr1	101491108	rs7521668	C	A	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.223;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=28;PP=784;ReadPosRankSum=-0.399;SC=ACCAAAGTAGCACAAGAGAAG;SOR=0.336;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=54;TCF=9;TCR=45;TR=35;WE=101491116;WS=101491098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,38:0.66:58
chr1	101704532	rs3737577	G	T	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.020;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=1;PP=687;ReadPosRankSum=1.734;SC=GGGACACAGGGTTGGCACCAT;SOR=3.598;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=30;WE=101704540;WS=101704522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
chr1	102271774	rs4907955	G	A	3367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.556;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=76;PP=2724;ReadPosRankSum=0.398;SC=TTAGGTGAACGCAGCCAATGA;SOR=0.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=197;TCF=79;TCR=118;TR=125;WE=102271782;WS=102271764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,124:0.63:196
chr1	102462446	rs67744758	GTCAGT	G	2030.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.093;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.14;MQRankSum=0.672;NF=6;NR=34;PP=2029;ReadPosRankSum=-0.415;SC=CCTTTCCCTCGTCAGTTGCAC;SOR=0.348;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=9;TCR=52;TR=40;WE=102462458;WS=102462436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,51:0.71:72
chr1	103347416	rs12140745	A	G	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.259;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr1	103354115	rs17127203	T	C	1474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.083;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=1098;ReadPosRankSum=0.028;SC=AACATCACTCTTGTTAACATA;SOR=0.441;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=68;TCF=42;TCR=26;TR=47;WE=103354123;WS=103354105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,52:0.67:78
chr1	103354138	rs1676486	A	G	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.095;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=263;ReadPosRankSum=0.627;SC=CTTACTGGAGACCCAGGAGGC;SOR=1.426;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=67;TCF=38;TCR=29;TR=20;WE=103354146;WS=103354128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,23:0.32:71
chr1	103354428	rs1763347	A	G	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.183;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=322;ReadPosRankSum=1.169;SC=TTACTGGTAAACCTGGAGGAC;SOR=0.430;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=18;WE=103354436;WS=103354418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,19:0.40:48
chr1	103356107	rs11164634	A	G	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.877;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=30;PP=772;ReadPosRankSum=-0.794;SC=CAGAGTAGGTATGAATTAGAG;SOR=1.378;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=56;TCF=14;TCR=42;TR=38;WE=103356115;WS=103356097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,38:0.67:57
chr1	103356168	rs1085	A	C	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.371;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=67;ReadPosRankSum=0.684;SC=TACGGAGTTGAAAATAGTAAT;SOR=0.061;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=6;WE=103356176;WS=103356158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr1	103379870	rs28648038	A	C	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.14;ReadPosRankSum=-0.089;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,16:0.28:57
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chr1	103380379	rs34228277	T	TA	237	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.86;MQRankSum=0.692;QD=14.81;ReadPosRankSum=-1.035;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,14:0.88:16
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chr1	103381296	rs12120961	T	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=2.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.72;ReadPosRankSum=0.250;SOR=0.182;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,10:0.14:69
chr1	103388990	rs147848946	TA	T	259.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.30;MQRankSum=2.179;QD=4.40;ReadPosRankSum=-1.120;SOR=0.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,18:0.31:59
chr1	103399906	rs11164640	G	A	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=143;ReadPosRankSum=-1.253;SC=AAGTTCTTACGTAGAAAAAAA;SOR=1.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=8;WE=103399914;WS=103399896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr1	103400491	rs11164641	GA	AT	1835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=3;PP=2141;SC=ATTTAAATTTGATTTAATGTC;SOR=5.235;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=40;WE=103400500;WS=103400481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	103405892	rs17127270	G	A	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.352;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=270;ReadPosRankSum=0.906;SC=CCTTGTCTCCGTCTTCCCCAG;SOR=3.782;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=43;TCR=8;TR=17;WE=103405900;WS=103405882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
chr1	103427844	rs55682104	T	A	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.477;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=202;ReadPosRankSum=-1.848;SC=ATAAACATCGTCAAGACAGAT;SOR=0.399;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=12;WE=103427852;WS=103427834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,14:0.34:41
chr1	103428389	rs1841834	G	A	1756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=43;PP=1424;SC=CTCAAAAACAGTATTATTACA;SOR=3.952;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=6;TCR=43;TR=49;WE=103428397;WS=103428379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	103435626	rs2061710	G	A	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=313;SC=ATATATATATGTATATTTCAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=103435634;WS=103435616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	103444679	rs11164649	T	G	3575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=71;PP=2866;ReadPosRankSum=-0.687;SC=GACAGTTCAATTTCAATATGC;SOR=0.467;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=44;TCR=72;TR=114;WE=103444687;WS=103444669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,115:0.99:116
chr1	103449598	rs2615978	G	C	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=1;PP=303;SC=AAGTACTCATGATAATATAGA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=103449606;WS=103449588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	103455217	rs1463034	C	T	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=18;PP=479;SC=GTGCTGATAACGAGGGAAAAT;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=103455225;WS=103455207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	103461508	rs2622867	T	A	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=9;PP=806;SC=AACATTTCACTTTGAAAGTAA;SOR=1.681;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=30;WE=103461516;WS=103461498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	103462473	rs2786125	A	G	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=0;PP=1367;SC=ACATAGTCTAATTTCTAAAAT;SOR=6.316;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=44;WE=103462481;WS=103462463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	103463976	rs2622870	G	T	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.98;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	103467615	rs2929162	C	T	1767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=52;PP=1446;SC=CTATAGTACACAGTGAGTTAT;SOR=8.015;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=0;TCR=52;TR=52;WE=103467623;WS=103467605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	103468609	rs2251895	A	G	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.34;SOR=4.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	103468855	.	TAA	T	1087.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.736;NF=6;NR=28;PP=444;ReadPosRankSum=0.422;SC=ACGCCTTTATTAAAAAAAAAA;SOR=0.804;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=64;TCF=15;TCR=49;TR=34;WE=103468864;WS=103468845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,37:0.63:59
chr1	103471456	rs71752747	CCAT	C	3003.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.479;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.964;NF=13;NR=45;PP=2734;ReadPosRankSum=0.251;SC=CCCTGTAAAACCATCATCATC;SOR=1.372;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=117;TCF=36;TCR=81;TR=58;WE=103471466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,78:0.77:101
chr1	103471734	rs71592255	A	AAAATAAAT,AAAATAAATAAAT	4665.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=4.935;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.17;MQRankSum=0.000;QD=57.60;ReadPosRankSum=-0.813;SOR=1.587;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,55,25:0.68,0.31:81
chr1	103483514	rs945748	C	T	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=17;PP=493;SC=CTAGTCCTATCGAAGAGTTCG;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=103483522;WS=103483504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	103487394	rs35291481	CT	C	1697.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.11;MQRankSum=0.241;QD=23.58;ReadPosRankSum=0.372;SOR=4.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
chr1	103496620	rs7523441	G	T	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=711;SC=ACTGCACTGCGATGTCCATAT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=103496628;WS=103496610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	103496805	rs36076089	GA	G	843.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.349;NF=5;NR=32;PP=562;ReadPosRankSum=-0.738;SC=GTCCCCCTGGGAAAAAAAAAA;SOR=1.659;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=37;WE=103496826;WS=103496795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,39:0.98:40
chr1	103548319	rs11164662	C	G	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=618;ReadPosRankSum=1.382;SC=AGTGTAATAACTTTTAGTAAT;SOR=0.616;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=24;WE=103548327;WS=103548309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr1	103573547	rs6691654	G	A	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=3;PP=420;SC=AGAGCGGGGAGGAAGGGTAAA;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=103573555;WS=103573537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	104086145	rs10785725	A	G	1205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=32;PP=962;SC=ATAATGTTTCATATTTTAGTA;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=104086153;WS=104086135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	107946324	rs71897263	CA	C	1208.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=0.904;QD=8.95;ReadPosRankSum=1.365;SOR=0.661;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,81:0.60:135
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chr1	108023589	rs4915045	A	C	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.083;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=350;ReadPosRankSum=-0.407;SC=CAAACTAAGAAGGCCTAACTG;SOR=0.509;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=21;TCR=30;TR=29;WE=108023597;WS=108023579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr1	108139003	rs3748702	C	T	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=30;PP=772;ReadPosRankSum=0.983;SC=GATAAGGATACTTTTGTTCTC;SOR=1.662;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=32;WE=108139011;WS=108138993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,32:0.76:42
chr1	108152332	rs1328208	T	A	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=330;ReadPosRankSum=1.181;SC=ATTATCAGTCTAGGGCACTGG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=15;WE=108152340;WS=108152322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr1	108152364	rs112516584	C	T	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=5.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=266;ReadPosRankSum=2.520;SC=CACACACACCCCCCTCGCAGA;SOR=0.250;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=14;WE=108152372;WS=108152354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,15:0.34:44
chr1	108152630	rs2296877	G	T	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=369;ReadPosRankSum=0.617;SC=TTACATAAGGGAAGCTTTTAG;SOR=0.770;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=58;TCF=4;TCR=54;TR=20;WE=108152638;WS=108152620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,21:0.34:62
chr1	108160260	rs5776894	GA	G	2347.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.199;HP=12;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.344;NF=27;NR=66;PP=999;ReadPosRankSum=0.889;SC=CTGCCCTAAGGAAAAAAAAAA;SOR=0.592;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=182;TCF=54;TCR=128;TR=93;WE=108160269;WS=108160250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,121:0.64:190
chr1	108185301	rs12403266	C	G	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=1.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.35;ReadPosRankSum=0.698;SOR=0.498;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,18:0.31:59
chr1	108185309	rs12410676	G	A	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=2.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.65;ReadPosRankSum=0.084;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,18:0.30:61
chr1	108292260	rs6672483	A	G	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.74;ReadPosRankSum=1.614;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,8:0.18:44
chr1	108299775	rs34437461	ATG	A	520.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.10;QD=30.63;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	108299809	rs12138353	G	A	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.351;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.031;NF=8;NR=1;PP=190;ReadPosRankSum=-0.183;SC=GTGTGTGTGTGTATGCAATTT;SOR=0.120;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=9;WE=108299817;WS=108299799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,10:0.26:38
chr1	108307642	rs7514025	C	T	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=539;ReadPosRankSum=0.901;SC=TAAAGAGGAACACATTGCTTT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=24;WE=108307650;WS=108307632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr1	108307727	rs7528153	T	A	1919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.215;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=16;PP=1526;ReadPosRankSum=-0.385;SC=TCTTCTTTTGTCTTAGAAATG;SOR=0.377;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=106;TCF=83;TCR=23;TR=69;WE=108307735;WS=108307717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,70:0.64:109
chr1	108313258	rs6583048	C	T	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.955;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=662;ReadPosRankSum=-0.526;SC=GATGACTTACCTTTTCTATTG;SOR=0.685;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=35;TCR=33;TR=32;WE=108313266;WS=108313248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr1	108315256	rs7416884	G	C	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-5.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=0;PP=799;ReadPosRankSum=-0.810;SC=AGCAAGCAAAGGTTAAAAAAA;SOR=2.110;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=34;WE=108315264;WS=108315246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,34:0.74:46
chr1	108315305	rs4611048	C	T	3241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=95;NR=5;PP=2792;SC=TGTTAATTAGCCTTTCCTAAT;SOR=5.549;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=96;TCR=5;TR=100;WE=108315313;WS=108315295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	108507541	rs71796067	GGCC	G	1044.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=0;NR=20;PP=948;SC=GCAAGGATGCGGCCGCCGCCG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=20;WE=108507551;WS=108507531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	108679532	rs17513812	C	T	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=460;ReadPosRankSum=-0.928;SC=CAATTATGACCCAGAATGATA;SOR=1.675;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=20;WE=108679540;WS=108679522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr1	108681600	rs34563977	T	C	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=487;ReadPosRankSum=-0.595;SC=ACAGTCTGCATCTTAGTAGAA;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=22;WE=108681608;WS=108681590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,24:0.77:31
chr1	108700316	rs829002	G	C	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=398;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTTTAGAGAAGAATCATGTTA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=16;WE=108700324;WS=108700306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,17:0.85:20
chr1	108724518	rs490680	A	G	1810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.001;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=13;PP=1400;ReadPosRankSum=0.068;SC=TCTAATGCAGAATATTAAAGT;SOR=0.558;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=86;TCF=68;TCR=18;TR=57;WE=108724526;WS=108724508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,63:0.66:95
chr1	108724693	rs491785	G	A	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.293;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=594;ReadPosRankSum=2.212;SC=CTCAGAACTGGTAAGAACCAC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=25;WE=108724701;WS=108724683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr1	108728347	rs694667	T	C	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=195;ReadPosRankSum=-1.272;SC=AAATAATAATTATCATCTAAA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=108728355;WS=108728337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr1	108728484	rs862493	T	C	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.956;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=21;PP=1116;ReadPosRankSum=-0.143;SC=TAAATGCCAATTTCATTTTCT;SOR=1.120;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=84;TCF=49;TCR=35;TR=54;WE=108728492;WS=108728474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,56:0.63:89
chr1	108734993	rs521545	G	C	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=201;SC=GCTGGTCAACGACCTGAACAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=108735001;WS=108734986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	108766424	rs3879436	A	G	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.204;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.404;NF=9;NR=32;PP=670;ReadPosRankSum=-0.409;SC=GGTCCACCTGATGGCTGAGTC;SOR=0.293;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=23;TCR=83;TR=41;WE=108766432;WS=108766414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,34:0.39:88
chr1	109010230	rs201618980	G	A	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=4.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.04;MQRankSum=-0.955;QD=3.98;ReadPosRankSum=-1.982;SOR=0.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,19:0.24:78
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chr1	109241669	rs2297563	G	A	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=20;ReadPosRankSum=0.195;SC=AATGATTCTTGACATGGCCTT;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=3;WE=109241677;WS=109241659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr1	109255513	rs3006864	G	T	2907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=21;PP=2328;SC=AAGAGGACCCGGATTGCTTTG;SOR=2.435;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=71;TCR=21;TR=91;WE=109255521;WS=109255503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	109260357	rs4970804	G	A	4842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=120;NR=25;PP=2965;SC=AGTCATCCTCGTAGGTATCTT;SOR=3.167;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=120;TCR=25;TR=145;WE=109260365;WS=109260347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr1	109260477	rs141252453	G	C	1812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=48;PP=1327;ReadPosRankSum=-0.703;SC=ACAGTGCCGGGTGCCACCAGT;SOR=0.954;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=229;TCF=88;TCR=141;TR=74;WE=109260485;WS=109260467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,77:0.34:229
chr1	109261509	rs17553619	A	G	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=14;PP=611;ReadPosRankSum=0.691;SC=CTCCGTGTCCATTATGCGAGC;SOR=0.634;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=141;TCF=97;TCR=44;TR=46;WE=109261517;WS=109261499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,45:0.32:141
chr1	109265029	rs4423040	G	T	1495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=9;PP=1211;SC=TCCTGGGCACGGGCAGAAGGA;SOR=2.687;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=44;WE=109265037;WS=109265019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	109268573	rs4494160	T	C	1927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=51;PP=1445;ReadPosRankSum=0.117;SC=AGTGTTTTTGTCTATAACAAG;SOR=0.914;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=105;TCF=29;TCR=76;TR=68;WE=109268581;WS=109268563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,73:0.66:110
chr1	109301082	.	T	C	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=360;ReadPosRankSum=-0.810;SC=AGGTAACATATTTAAATTAAT;SOR=1.214;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=18;WE=109301090;WS=109301072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr1	109337572	rs1149158	A	C	1037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=21;PP=711;SC=AACAAATTTCAAGGATAAACT;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=29;WE=109337580;WS=109337562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	109339414	rs35138668	GT	G	1236.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=52;PP=872;SC=TGTATTAACTGTTTTTTTTTT;SOR=6.556;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=80;TCF=0;TCR=80;TR=52;WE=109339423;WS=109339404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr1	109342716	rs1277239	A	G	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=2;PP=701;SC=CAAAGAAAAGACTAATCTTAT;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=109342724;WS=109342706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	109351501	rs1149154	A	G	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=43;PP=1284;SC=GATGAATAGCATTTCTTTTTG;SOR=4.534;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=3;TCR=43;TR=46;WE=109351509;WS=109351491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	109363075	rs1333128	T	C	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=7;PP=584;SC=ATCTAGGTTATCTTGGGGTAG;SOR=1.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=24;WE=109363083;WS=109363065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	109363140	rs1333129	T	C	1167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=911;ReadPosRankSum=-0.863;SC=AGAAATATTTTGTTACTGATA;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=41;TCF=24;TCR=17;TR=40;WE=109363148;WS=109363130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr1	109363232	rs1333130	T	C	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=858;ReadPosRankSum=1.223;SC=AACAGATCCGTTTGGGTTTTA;SOR=0.655;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=35;WE=109363240;WS=109363222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr1	109372968	rs1277221	T	G	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=0;PP=567;SC=TTGTAAAATCTCCCATGGTGA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=109372976;WS=109372966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	109377053	rs946242	G	A	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.453;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=401;ReadPosRankSum=-0.951;SC=GCCAGGCCCCGGCTGCAGGAC;SOR=0.248;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=71;TCF=52;TCR=19;TR=26;WE=109377061;WS=109377043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,27:0.36:74
chr1	109377157	rs5776950	TA	T	2237.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.565;HP=13;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.332;NF=47;NR=43;PP=1425;ReadPosRankSum=0.849;SC=GTAACTAATTTAAAAAAAAAA;SOR=0.657;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=119;TCF=65;TCR=54;TR=90;WE=109377166;WS=109377147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,99:0.99:100
chr1	109391486	rs1149142	G	A	1696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=16;PP=1322;SC=TTTCTCATGTGTGAATTTGGT;SOR=1.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=52;WE=109391494;WS=109391476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	109394564	rs17030016	T	C	2515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.670;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=49;PP=1853;ReadPosRankSum=-0.431;SC=TGCCTGAATTTGCTTTTTCAG;SOR=0.746;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=267;TCF=136;TCR=131;TR=104;WE=109394572;WS=109394554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,110:0.39:280
chr1	109395105	rs1277207	C	T	4219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.235;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=85;PP=2962;ReadPosRankSum=0.958;SC=ACAAGTCTCACTATGCATAGC;SOR=0.545;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=237;TCF=97;TCR=140;TR=147;WE=109395113;WS=109395095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,155:0.62:251
chr1	109428249	rs10857987	G	A	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=266;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTATTTTAAAGTGTTTTTAAC;SOR=1.101;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=15;WE=109428257;WS=109428239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr1	109444298	rs10494102	A	G	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=158;ReadPosRankSum=-0.269;SC=TTAGGCTCTCAGAGATTTAAA;SOR=0.080;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=13;WE=109444306;WS=109444288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr1	109461131	rs3754456	A	G	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.987;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=201;ReadPosRankSum=-0.045;SC=TCTCTCCCCCAATAGTAAATA;SOR=1.891;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=59;TCR=4;TR=16;WE=109461139;WS=109461121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,16:0.25:63
chr1	109465165	rs35029887	ACTT	A	2403.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.906;NF=14;NR=40;PP=2132;ReadPosRankSum=-0.165;SC=TTCAACAACAACTTCTTCCAC;SOR=0.702;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=164;TCF=45;TCR=119;TR=54;WE=109465175;WS=109465155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,67:0.36:187
chr1	109474221	rs1769740	C	T	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=62;ReadPosRankSum=-0.239;SC=AGAGTCATAACCTGGAATTAA;SOR=0.735;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=7;WE=109474229;WS=109474211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
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chr1	109483975	rs193139	T	C	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.759;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=551;ReadPosRankSum=-0.018;SC=TCTATGTTCTTTCATTCTCAG;SOR=0.233;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=68;TCF=52;TCR=16;TR=26;WE=109483983;WS=109483965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,28:0.37:75
chr1	109486196	rs338466	A	G	6133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=131;NR=71;PP=2965;SC=TCCACAGCTCAGTAGCCACTA;SOR=1.488;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=131;TCR=71;TR=202;WE=109486204;WS=109486186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr1	109486240	rs3215062	TA	T	7130.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=107;PP=2966;SC=AGAAGTACCTTAAAACAGAGA;SOR=0.720;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=193;TCF=77;TCR=116;TR=179;WE=109486248;WS=109486230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr1	109486269	rs41336244	C	A	1192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=1.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=0.753;QD=5.90;ReadPosRankSum=-0.438;SOR=0.552;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:148,54:0.27:202
chr1	109490457	rs839543	T	C	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=28;PP=941;SC=TTTGATCAAGTTTGCATTTAT;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=109490465;WS=109490447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	109493134	rs34131552	G	GTTA	615.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.332;NF=0;NR=14;PP=553;ReadPosRankSum=0.421;SC=TGGGTTTTGGGTTATTATTAT;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=14;WE=109493142;WS=109493124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr1	109524584	rs487901	C	A	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.846;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=528;ReadPosRankSum=1.427;SC=GTGGCTCATGCCTATAATCCC;SOR=0.223;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=24;WE=109524592;WS=109524574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr1	109529322	rs61696019	T	TAA	2828.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=49;PP=2664;SC=GAATGAATATTAGTTATCCTA;SOR=5.486;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=63;TCF=3;TCR=60;TR=51;WE=109529330;WS=109529312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	109545046	rs184606	C	T	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=506;SC=TAGAAAAAAACATATATATTT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=109545054;WS=109545036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	109547483	rs12135936	G	A	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.441;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=196;ReadPosRankSum=0.907;SC=CGCAATCTCCGCTCACTGCAA;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=10;WE=109547491;WS=109547473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr1	109648843	.	C	T	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.246;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.95;ReadPosRankSum=0.356;SOR=0.095;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr1	109704390	rs643197	C	G	1271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=0;PP=1020;SC=GCTCCCTGCCCGGGGTCCCAG;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=44;WE=109704398;WS=109704380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	109704618	rs678238	A	G	3550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=91;PP=2848;SC=GCCTGACCCCATCAAGGGCAC;SOR=3.493;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=15;TCR=91;TR=106;WE=109704626;WS=109704608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	109727475	rs649531	T	C	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=12;NR=0;PP=323;SC=AAAGGGAAGCTTGAGCAGGGT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=109727483;WS=109727465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	109734157	rs606066	T	C	1316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=28;PP=993;SC=ATCTGCCCCATTGGTGTGTCC;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=109734165;WS=109734147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	109734225	rs643785	G	T	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=435;ReadPosRankSum=0.258;SC=AGACTGACCAGCAGGGACTTC;SOR=0.525;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=19;WE=109734233;WS=109734221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr1	109734541	rs645128	C	T	1579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=44;PP=1281;ReadPosRankSum=1.435;SC=CCCAGGAGGACTCCTAGCATT;SOR=3.570;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=47;WE=109734549;WS=109734531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr1	109735298	rs658779	T	C	3938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=63;PP=2939;SC=TTATGAATGGTGTGGCCTCCT;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=134;TCF=70;TCR=64;TR=133;WE=109735306;WS=109735288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr1	109735416	rs659543	A	C	3329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=67;PP=2736;SC=CTCCTGCCCCACTAACACAAT;SOR=1.336;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=38;TCR=67;TR=105;WE=109735424;WS=109735406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr1	109735504	rs659659	T	C	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=36;PP=1103;SC=AAGGTACCTGTAGTCTGGCAT;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=109735512;WS=109735494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	109737063	rs2359246	C	T	2104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=13;PP=1662;ReadPosRankSum=1.216;SC=TGTGCTACAACGATTGCACCT;SOR=1.666;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=57;TCR=13;TR=69;WE=109737071;WS=109737053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr1	109737090	rs2359245	G	A	2869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=23;PP=2137;ReadPosRankSum=-0.664;SC=GCAACACTCCGACCAGGACTT;SOR=1.015;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=66;TCR=23;TR=88;WE=109737098;WS=109737080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,93:0.99:94
chr1	109737132	rs2359244	T	C	3321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=52;PP=2343;SC=TGGCAAACACTGTCACTCTTG;SOR=0.820;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=57;TCR=52;TR=109;WE=109737140;WS=109737122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr1	109737172	rs2359243	C	T	3124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.674;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=64;PP=2392;ReadPosRankSum=-1.213;SC=TTCCAAAGGGCTGAAATACTT;SOR=1.705;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=31;TCR=65;TR=94;WE=109737180;WS=109737162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,101:0.98:103
chr1	109737314	rs2359242	T	C	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.06;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	109737320	rs2359241	G	A	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.65;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	109740310	rs113482805	A	AGAGAGAGTGTGT	444.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.133;NF=0;NR=22;PP=886;ReadPosRankSum=0.793;SC=CTTGTTTGAGAGTGTGTGTGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=22;WE=109740318;WS=109740300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr1	109740473	rs3818508	C	T	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=220;ReadPosRankSum=-0.313;SC=CTTGTTTCACCCTTTCATAAG;SOR=0.412;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=10;WE=109740481;WS=109740463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr1	109740548	rs2296696	G	T	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=9;PP=961;ReadPosRankSum=-0.234;SC=GAATTGAAGTGGTTGCCAGCT;SOR=0.880;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=65;TCF=51;TCR=14;TR=45;WE=109740556;WS=109740538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,48:0.71:68
chr1	109742452	rs913178	C	T	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=355;SC=AGTGAGAGCTCAGGTCTCTTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=109742460;WS=109742442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	109742485	rs913179	G	A	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=519;SC=GAACGTGCTCGGATGGGACCT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=109742493;WS=109742475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	109743622	rs3736956	C	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=80;ReadPosRankSum=0.117;SC=GGATGGGCACCCTGCTCCCCA;SOR=0.859;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=7;WE=109743630;WS=109743612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr1	109745618	rs1052878	T	C	1717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=42;PP=1441;SC=TCAGGAGGCCTAGACATGGAC;SOR=3.215;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=8;TCR=42;TR=50;WE=109745626;WS=109745608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	109771063	rs683182	T	C	5387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=108;PP=2965;SC=CTGTAAGTTATAGTTCTTTTC;SOR=1.595;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=56;TCR=108;TR=164;WE=109771071;WS=109771053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr1	109771881	rs657511	G	T	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=1;PP=827;SC=GTGTGTGAAGGAAATCTCAGT;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=109771889;WS=109771871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	109773705	rs141018095	ATT	A	84.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.06;ReadPosRankSum=-1.576;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr1	109778577	rs658092	T	C	1467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.085;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=8;PP=1256;ReadPosRankSum=-0.887;SC=CTGTCACCGTTTCCTTGGGTC;SOR=2.895;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=44;WE=109778585;WS=109778567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
chr1	109779556	rs631927	T	A	2396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=53;PP=2004;SC=CCAAGTCAGGTGCTTGAAAGG;SOR=2.271;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=72;TCF=18;TCR=54;TR=71;WE=109779564;WS=109779546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	109779621	rs11439617	T	TC	1045.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=1189;SC=AGGGCCCAACTCTCAGAATAC;SOR=5.353;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=25;WE=109779629;WS=109779611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	109792735	rs144034706	A	ACGC	662.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQRankSum=2.170;QD=10.69;ReadPosRankSum=-1.261;SOR=0.612;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,19:0.31:62
chr1	109794252	rs454107	T	C	13503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=476;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=145;NR=306;PP=2965;SC=TCCTGGAGAGTGTCCCCTTAG;SOR=1.650;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=451;TCF=145;TCR=306;TR=451;WE=109794260;WS=109794242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,471:1.00:471
chr1	109795026	rs413380	T	C	5724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=95;PP=2965;SC=AGCTGGACTATGAAGACCAAG;SOR=0.724;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=186;TCF=91;TCR=95;TR=186;WE=109795034;WS=109795016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr1	109795608	rs437444	T	C	5653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=86;PP=2965;SC=CTGAGGTCTTTCAGCTGGACA;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=85;TCR=86;TR=171;WE=109795616;WS=109795598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr1	109796053	rs2359414	C	T	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.645;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=544;ReadPosRankSum=0.000;SC=GGGTAGCTCGCGGGGATGGTC;SOR=0.303;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=25;WE=109796061;WS=109796043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr1	109804646	rs4970833	G	A	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=301;ReadPosRankSum=0.920;SC=GGAAGGGAGCGGCTGGGAAGG;SOR=1.119;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=14;WE=109804654;WS=109804636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr1	109806442	rs1337248	C	A	1524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=45;PP=1293;SC=GGCCATAGGGCCCTGGTAGCC;SOR=6.316;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=46;WE=109806450;WS=109806432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	109806834	rs6698843	C	T	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.540;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=687;ReadPosRankSum=0.374;SC=GCGGGGGGCCCGGCCATGCCA;SOR=0.476;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=83;TCR=43;TR=41;WE=109806842;WS=109806824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,44:0.34:128
chr1	109807099	rs6689614	G	A	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.861;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=13;PP=563;ReadPosRankSum=-2.687;SC=GCGATACGCCGGAGGGGGTTA;SOR=0.170;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=99;TCF=71;TCR=28;TR=34;WE=109807107;WS=109807089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,37:0.37:101
chr1	109810183	rs61761209	C	T	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.100;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=5;PP=530;ReadPosRankSum=0.370;SC=CTGCTGTGCGCCACTGTGATG;SOR=0.515;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=74;TCR=14;TR=31;WE=109810191;WS=109810173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,32:0.37:87
chr1	109813020	rs3895559	G	A	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=4.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.641;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=447;ReadPosRankSum=-0.348;SC=GGCCCCGGTCGCTGACCTGCC;SOR=0.243;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=59;TCF=52;TCR=7;TR=24;WE=109813028;WS=109813010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chr1	109813236	rs111491315	TTCCCAGTCTTGGGG	T	1148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=1.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.18;ReadPosRankSum=0.252;SOR=0.897;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,37:0.23:160
chr1	109813510	rs41279716	A	T	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.542;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=524;ReadPosRankSum=0.822;SC=CAGGCCCCTCATCACCCCTCC;SOR=0.307;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=24;WE=109813518;WS=109813500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,24:0.80:30
chr1	109813719	rs17035665	C	T	2015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=45;PP=1554;ReadPosRankSum=-0.447;SC=TGTCCTCCTGCTGCTGGGGCC;SOR=0.678;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=89;TCF=29;TCR=60;TR=66;WE=109813727;WS=109813709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,72:0.77:93
chr1	109816176	rs441853	A	C	2384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=84;PP=1926;SC=GCAGCCGGGGAGGCCCCCCTC;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=84;TCF=0;TCR=84;TR=84;WE=109816184;WS=109816166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	109825360	rs643457	C	T	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=403;SC=AGATCTGAGCCGGAGAGAAAC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=109825368;WS=109825350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	109836835	rs3738777	A	G	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.267;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=39;PP=2962;ReadPosRankSum=0.723;SC=TACCTTTGTCAGAGTACCATG;SOR=0.340;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=220;TCF=93;TCR=127;TR=80;WE=109836850;WS=109836825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,78:0.35:220
chr1	109836842	rs646335	C	G	3513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.103;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=83;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.597;SC=GTCAGAGTACCATGCCTTCTT;SOR=1.003;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=213;TCF=88;TCR=125;TR=134;WE=109836850;WS=109836825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,137:0.64:215
chr1	109838833	rs616899	T	C	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=0;PP=740;SC=CTCAGCACAGTGCCCCCCAGA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=109838841;WS=109838823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	109838918	rs629001	C	T	2583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=22;PP=1982;SC=GTAGTGCAGTCGGCCAGAGGC;SOR=2.084;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=56;TCR=22;TR=78;WE=109838926;WS=109838908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	109839392	rs604349	A	G	2172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=12;PP=1722;SC=CATGATCCCCATGCCTCCCTT;SOR=3.316;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=66;TCR=12;TR=78;WE=109839400;WS=109839382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	109839433	rs1278285	A	G	3826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=43;PP=2865;SC=CGAGGTCCGTAGTGATGGGGG;SOR=1.426;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=75;TCR=44;TR=118;WE=109839441;WS=109839423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	109839738	rs3850615	C	A	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.714;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=809;ReadPosRankSum=-0.583;SC=TATCTTGGGGCGGTGTCCATT;SOR=0.585;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=123;TCF=60;TCR=63;TR=41;WE=109839746;WS=109839728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,40:0.32:125
chr1	109839954	rs603624	G	C	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=22;PP=781;SC=GAGCCTTGCCGCAGCTTCCCC;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=109839962;WS=109839944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	109856842	rs372331171	TG	T	132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=7.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQRankSum=3.684;QD=1.54;ReadPosRankSum=1.165;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,16:0.19:86
chr1	109883576	rs3217347	C	CAT	3961.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=66;PP=2971;SC=TAACCACACACGATTACCTGC;SOR=4.199;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=83;TCF=3;TCR=80;TR=69;WE=109883584;WS=109883566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	109884775	rs2228604	T	G	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=12;PP=402;SC=TCCTTCTTGTTGTATCCTAGA;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=109884783;WS=109884765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	109897103	rs11142	A	G	3949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=49;PP=2965;SC=CTGATGATCTAAAGATTCTTC;SOR=1.010;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=117;TCF=67;TCR=50;TR=116;WE=109897111;WS=109897093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr1	109898266	.	C	CCCG	157	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;FR=1.0000;HP=2;HapScore=3;MGOF=8;MMLQ=15;MQ=64.79;NF=0;NR=13;PP=157;QD=17.9210966466;SC=ACATTCCACCCGCCCCCCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=13;WE=109898275;WS=109898256;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,13:0.76:17
chr1	109898267	rs12027996	G	C	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=68.12;QD=38.38;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	109898269	rs12030746	C	G	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=67.64;QD=47.97;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	109958035	rs1465607	T	C	748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=646;SC=ATAACTGTCTTACATACTCAC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=109958043;WS=109958025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	110009434	rs2787015	A	C	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=5;PP=658;SC=GAGCCAAGCCACCACGCCGCG;SOR=2.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=26;WE=110009442;WS=110009424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	110009654	rs138525393	AC	A	1685.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=37;PP=1535;SC=CACCGCCCTGACCCCCCGGCC;SOR=1.835;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=49;WE=110009662;WS=110009644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	110018148	rs530565	C	T	2160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=0;PP=1828;SC=GGTTAGTTCTCGACTTTGGCC;SOR=8.349;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=62;TCR=0;TR=62;WE=110018156;WS=110018138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	110086451	rs17575798	G	A	3738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=72;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.498;SC=TCACCAGCTCGGGGGCCCCCC;SOR=0.698;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=197;TCF=84;TCR=113;TR=124;WE=110086459;WS=110086441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,132:0.64:205
chr1	110091271	rs3737182	C	T	359.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5105;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=288;ReadPosRankSum=-0.764;SC=ATAGACGGTGCCTCAGCCTGC;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=13;WE=110091279;WS=110091261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr1	110141421	rs1889470	T	C	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.208;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=177;ReadPosRankSum=-0.259;SC=ACAGAAATGTTTTCATGCTTT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=8;WE=110141429;WS=110141411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr1	110148974	rs1799875	C	T	1977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.506;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=26;PP=1450;ReadPosRankSum=-0.054;SC=CAATGATGCCCGTGGTTTTGA;SOR=0.755;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=245;TCF=161;TCR=84;TR=82;WE=110148982;WS=110148964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,87:0.34:259
chr1	110153198	rs6658641	G	A	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=534;ReadPosRankSum=-0.337;SC=GATGGCCTGGGAGAAGTCAGA;SOR=1.362;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=24;WE=110153206;WS=110153188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,24:0.73:33
chr1	110155524	rs2304355	T	C	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.283;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=32;PP=1073;ReadPosRankSum=-0.416;SC=TTCAGGCCCCTAATCCTCTCT;SOR=0.387;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=82;TCF=22;TCR=60;TR=45;WE=110155532;WS=110155514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,46:0.53:86
chr1	110163076	rs6669802	A	G	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=251;ReadPosRankSum=-0.775;SC=GGAAAAATCCAAAGAGGCTAG;SOR=0.616;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=12;WE=110163084;WS=110163066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr1	110168888	rs493972	C	G	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=669;ReadPosRankSum=-1.878;SC=TGCGGAGCTGCAGCCTGCCCT;SOR=0.747;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=167;TCF=79;TCR=88;TR=47;WE=110168896;WS=110168878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,49:0.29:169
chr1	110169957	rs524998	A	G	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.536;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=455;ReadPosRankSum=-0.264;SC=GGTGTGGTGCATGTTGGGGGG;SOR=0.524;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=149;TCF=100;TCR=49;TR=42;WE=110169965;WS=110169947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,42:0.27:155
chr1	110170896	rs863978	T	C	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=372;ReadPosRankSum=-0.371;SC=TGGATGTGCATGCGGTCTGTG;SOR=0.608;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=47;TCR=33;TR=26;WE=110170904;WS=110170886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,26:0.31:83
chr1	110171705	rs523786	A	C	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.209;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=457;ReadPosRankSum=-0.215;SC=TGACTTGCACATACCTGCATG;SOR=0.892;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=69;TCF=55;TCR=14;TR=24;WE=110171713;WS=110171695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,24:0.36:67
chr1	110172346	rs5776989	T	TG	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=4.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.39;MQRankSum=2.002;QD=2.42;ReadPosRankSum=-0.420;SOR=0.072;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr1	110172362	rs2269341	C	T	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.770;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.545;NF=12;NR=1;PP=189;ReadPosRankSum=-1.035;SC=TCAGGGGCTCCGGTGAGCCCA;SOR=0.183;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=13;WE=110172370;WS=110172352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr1	110199172	rs60189163	CTG	C	68.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=0.605;QD=6.25;ReadPosRankSum=0.303;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	110199225	rs140231844	TG	T	196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=5.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.93;ReadPosRankSum=-1.124;SOR=0.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr1	110200360	rs560018	T	C	3297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.069;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=47;PP=2502;ReadPosRankSum=1.814;SC=TGGGGTGCTATGCTCAGAGTG;SOR=1.067;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=178;TCF=96;TCR=82;TR=117;WE=110200368;WS=110200350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,125:0.67:187
chr1	110201580	rs650985	C	T	6342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=100;NR=98;PP=2965;SC=ATACATCCTACGTTACAGAGA;SOR=0.733;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=198;TCF=100;TCR=98;TR=198;WE=110201588;WS=110201570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr1	110201699	rs506008	T	C	3408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=82;PP=2848;SC=TGGACGCCTTTCCAAATCTGA;SOR=3.523;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=14;TCR=82;TR=96;WE=110201707;WS=110201689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	110201809	rs562996	G	T	3040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.41;QD=46.78;SOR=1.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	110201812	rs563003	A	G	3041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.58;QD=43.45;SOR=1.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	110210780	rs530021	C	G	2774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=59.97;NF=26;NR=61;PP=2142;SC=CGGGGTGAGCCAGGGTCCGCT;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=26;TCR=61;TR=87;WE=110210788;WS=110210770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	110210818	rs2073483	C	T	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=192;ReadPosRankSum=-2.663;SC=TGCGTGGGGGCGGGGAAGTGT;SOR=0.818;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=14;WE=110210826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr1	110212293	rs3819350	C	A	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.684;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=221;ReadPosRankSum=-2.371;SC=CTGGTGAGTTCTTGGTCTTGC;SOR=0.195;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=13;WE=110212301;WS=110212283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
chr1	110232983	rs140584594	A	G	44.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=0;PP=27;SC=GTTTGCAGGAAACAAGGTAAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=110232991;WS=110232973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	110252010	rs1292098	T	C	4329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=76;NR=59;PP=2965;SC=CTCTGTTCTGTTTTTTGCCCC;SOR=1.032;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=76;TCR=59;TR=135;WE=110252018;WS=110252000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr1	110252091	rs35677255	G	A	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.885;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.381;NF=10;NR=30;PP=641;ReadPosRankSum=-0.729;SC=CTTAATAAAAGCTTGCTGGTT;SOR=1.094;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=116;TCF=34;TCR=82;TR=40;WE=110252099;WS=110252081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,40:0.33:122
chr1	110255167	rs12736389	G	C	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=342;ReadPosRankSum=0.497;SC=ACTAGGGGCTGGCCTGGTGCA;SOR=0.560;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=18;WE=110255175;WS=110255157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,17:0.34:50
chr1	110256075	rs2479390	A	G	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.476;NF=51;NR=0;PP=1339;ReadPosRankSum=1.098;SC=TGGTGGCCCAACTGAGCTTCC;SOR=1.550;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=77;TCF=76;TCR=1;TR=51;WE=110256083;WS=110256065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,51:0.66:77
chr1	110256220	rs7536162	A	C	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.536;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.370;NF=26;NR=37;PP=730;ReadPosRankSum=0.860;SC=TGCGGGGGGAAGGTGACCTCC;SOR=0.739;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=217;TCF=94;TCR=123;TR=63;WE=110256228;WS=110256210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,67:0.30:225
chr1	110257831	rs2227963	T	C	1444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQRankSum=-7.849;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.059;SOR=0.979;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,43:0.29:147
chr1	110257835	rs78183574	CT	TC	1468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=1.559;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQRankSum=-7.739;QD=10.49;ReadPosRankSum=-0.753;SOR=0.897;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,42:0.30:140
chr1	110257947	rs7539980	A	C	1484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.801;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=20;PP=1188;ReadPosRankSum=-0.626;SC=GAGCTACACAAAGAATAACTC;SOR=0.966;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=184;TCF=116;TCR=68;TR=62;WE=110257955;WS=110257937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,63:0.34:185
chr1	110280252	rs36120609	ATCC	A	2187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.405;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=4.243;NF=15;NR=36;PP=1829;ReadPosRankSum=-2.231;SC=ATAGAGAAGTATCCTCTTCTT;SOR=1.048;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=180;TCF=61;TCR=119;TR=51;WE=110280262;WS=110280242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,65:0.32:206
chr1	110281941	rs10735234	G	A	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.12;ReadPosRankSum=-1.839;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr1	110282972	rs1332018	G	T	1750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.352;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=63;PP=1319;ReadPosRankSum=-0.885;SC=CTTTATACCCGACATAAGGGG;SOR=0.865;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=222;TCF=47;TCR=175;TR=78;WE=110282980;WS=110282962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,78:0.35:226
chr1	110293989	rs45612540	A	G	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.310;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=24;PP=924;ReadPosRankSum=-1.036;SC=ATCAGGGGGAACCAGGGATCA;SOR=0.792;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=129;TCF=65;TCR=64;TR=47;WE=110293997;WS=110293979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,48:0.36:132
chr1	110294577	rs2274536	A	G	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.549;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=221;ReadPosRankSum=-0.862;SC=AGCTCCCACCAACCACCACCT;SOR=1.152;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=17;WE=110294585;WS=110294567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,17:0.33:52
chr1	110295643	rs1887546	G	T	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.307;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=170;ReadPosRankSum=1.895;SC=CCAGTGTTAGGTCACACTAGT;SOR=2.461;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=11;WE=110295651;WS=110295633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr1	110295772	rs1887547	T	C	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.707;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=550;ReadPosRankSum=-0.107;SC=GCCAGTCATCTGAGAATGTGG;SOR=0.610;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=73;TCR=56;TR=39;WE=110295780;WS=110295762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,41:0.32:127
chr1	110295890	rs1887548	C	G	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.416;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=536;ReadPosRankSum=-1.231;SC=GGGACGCGGACAGGGAGGGGA;SOR=0.462;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=59;TCF=8;TCR=51;TR=26;WE=110295898;WS=110295880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr1	110299550	rs2094469	A	G	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=274;ReadPosRankSum=-0.253;SC=CTGGTTTGTGACAACATAGAG;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=42;TCR=1;TR=15;WE=110299558;WS=110299540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr1	110300441	rs3818562	G	A	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.137;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=5;PP=576;ReadPosRankSum=1.394;SC=TTGAAGCTGTGCTTGATCTTC;SOR=1.954;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=114;TCF=81;TCR=33;TR=36;WE=110300449;WS=110300431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,37:0.32:115
chr1	110300504	rs10776700	A	G	4778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=71;PP=2965;SC=AGGGGCCAAGACGGTGGGCCA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=76;TCR=72;TR=147;WE=110300512;WS=110300494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr1	110301766	.	AGTGTGT	A,AGTGT	626.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.36;MQRankSum=0.246;QD=24.11;ReadPosRankSum=1.070;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,6,19:0.23,0.73:26
chr1	110304176	.	G	A	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.366;ClippingRankSum=0.000;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.463;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=938;ReadPosRankSum=0.788;SC=TACTCCTTCCGGTGCACTACA;SOR=0.635;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=117;TCF=60;TCR=57;TR=48;WE=110304184;WS=110304166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,49:0.40:121
chr1	110466338	rs333970	C	A	4277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.991;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=70;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.107;SC=TAACTGGTACCGCCTTGCCCA;SOR=0.150;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=60;TCR=72;TR=130;WE=110466346;WS=110466328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,137:0.99:139
chr1	110466709	rs333971	T	C	2238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=48;PP=1840;SC=GAGGGATCCTTCAGCCCGCAG;SOR=1.643;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=71;WE=110466717;WS=110466699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	110467745	rs333972	A	G	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=2;PP=331;SC=GATGTCTAATACCAGCCCTGT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=110467753;WS=110467735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	110558276	rs11384766	A	AC	564.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.548;NF=1;NR=15;PP=665;ReadPosRankSum=-0.306;SC=ATTAGATAAAATTTTGAGTTT;SOR=1.981;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=110558284;WS=110558266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr1	110603286	rs144523285	A	AGGTGCTTCCTCCGTGGTGTCCAGGCAGG	1462.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=2;PP=670;SC=TTGGAGGCAGAGGTGGGCTGG;SOR=4.804;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=7;WE=110603294;WS=110603276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	110607154	.	C	G	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=518;SC=AGATCACTTTCTGGTCACTGT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=110607162;WS=110607144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	110612925	rs2274568	G	A	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=105;SC=AGAGAGGGTCGGGCTGCGCGC;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=110612933;WS=110612915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	110709719	rs7527375	TG	CA	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=11;PP=539;SC=AGGAGCTGGATGCAGAGGACC;SOR=0.693;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=28;TCF=14;TCR=14;TR=25;WE=110709728;WS=110709709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	110716511	rs12747833	C	T	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=0;PP=360;SC=ATGGCGCTGCCGACGTGCTGG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=110716519;WS=110716501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	110882536	rs139502540	A	G	2092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=23;PP=1678;ReadPosRankSum=-0.531;SC=GCGGAATACAAGACTCTGAAG;SOR=1.508;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=45;TCR=24;TR=67;WE=110882544;WS=110882526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,67:0.97:69
chr1	111059812	rs3841846	C	CGA	755.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=0.572;QD=27.99;ReadPosRankSum=0.281;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,22:0.81:27
chr1	111060669	rs1281175	T	C	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=19;PP=1016;SC=TGACCACCTTTAGCTCCCTAT;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=21;TCR=19;TR=40;WE=111060677;WS=111060659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	111061062	rs1281174	T	C	2244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=45;PP=1756;SC=GCATCCTTTTTTCCCGGTCTC;SOR=1.512;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=67;WE=111061070;WS=111061052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	111144526	rs4839071	T	G	185.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=119;SC=AAATTGCCCTTTGTCAAAAAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=111144534;WS=111144516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	111390624	.	ATT	A	128.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=3.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQRankSum=0.313;QD=2.48;ReadPosRankSum=1.955;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,10:0.19:52
chr1	111436857	rs1578956	TC	GT	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-4.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.137;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=895;ReadPosRankSum=0.426;SC=CACCCTGTACTCGTGCAAATG;SOR=0.995;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=87;TCF=68;TCR=19;TR=24;WE=111436866;WS=111436847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,23:0.27:86
chr1	111437129	rs1343817	A	C	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=128;ReadPosRankSum=0.999;SC=TAGAGATAGAAATGAAGTGGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=7;WE=111437137;WS=111437119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	111441829	rs1803259	C	T	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=758;ReadPosRankSum=0.367;SC=CTGCAGTAGTCCTGTGGTGAA;SOR=0.881;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=133;TCF=59;TCR=74;TR=46;WE=111441837;WS=111441819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,47:0.35:136
chr1	111441858	rs12030938	G	A	2631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.266;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=56;PP=2049;ReadPosRankSum=-1.251;SC=TTTCATCTCCGGAAATGCAAA;SOR=0.423;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=144;TCF=52;TCR=92;TR=92;WE=111441866;WS=111441848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,95:0.64:148
chr1	111661413	rs325916	T	C	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.427;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=13;PP=843;ReadPosRankSum=0.444;SC=AAATCTAATATTGTGCCTTCT;SOR=0.934;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=124;TCF=84;TCR=40;TR=45;WE=111661421;WS=111661403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,48:0.37:130
chr1	111661528	rs325917	T	C	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.822;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=36;PP=729;ReadPosRankSum=1.030;SC=CCCTGAGTGATGGGAAAAAAA;SOR=0.489;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=122;TCF=26;TCR=96;TR=47;WE=111661536;WS=111661518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,47:0.37:128
chr1	111662723	rs325918	G	A	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=217;ReadPosRankSum=0.735;SC=CACAGCAGTGGTACTGTAAAA;SOR=0.384;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=12;WE=111662731;WS=111662713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr1	111726026	rs2243393	G	A	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=217;ReadPosRankSum=-0.852;SC=ATGATTTACTGTGTAGTTCAC;SOR=0.619;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=15;WE=111726034;WS=111726016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
chr1	111726213	rs694180	A	G	972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=25;PP=773;SC=TGCCCTGGTAAGTATTGTACT;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=111726221;WS=111726203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	111726288	rs2275122	T	G	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=20;ReadPosRankSum=0.038;SC=GACCCAGTCATGAAAGATCGT;SOR=0.027;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=3;WE=111726296;WS=111726278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr1	111726869	rs3795823	G	A	3284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.984;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=77;PP=2531;ReadPosRankSum=-0.683;SC=ATCAGATTGCGTCTCACCTGC;SOR=1.362;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=198;TCF=76;TCR=122;TR=114;WE=111726877;WS=111726859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,125:0.59:211
chr1	111731215	rs2297702	G	A	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=439;ReadPosRankSum=-0.287;SC=TAGGCCTCTAGGGCTGGTCTA;SOR=0.741;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=20;WE=111731223;WS=111731205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr1	111737183	rs660173	C	T	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=4;PP=707;SC=GGTGAGCCGTCCAGGGGCTGG;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=111737191;WS=111737173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	111737398	rs9970286	G	A	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=375;ReadPosRankSum=-0.367;SC=GCAAGATCATGCAGACCCCGA;SOR=0.906;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=18;WE=111737406;WS=111737388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr1	111739771	rs3833538	G	GCAGGACAAA	7985.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=57;PP=2900;SC=TGGAATATGGGCAGGCCCTGA;SOR=0.872;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=125;TCF=52;TCR=73;TR=96;WE=111739779;WS=111739761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr1	111742838	rs639306	G	C	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=1;PP=272;SC=ACTAGCCCCAGAGAGGGCATG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=111742846;WS=111742828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	111770423	rs755467	T	G	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.701;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=310;ReadPosRankSum=-0.064;SC=CAGCAGGAAATTTGGTGAGGA;SOR=1.288;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=69;TCF=31;TCR=38;TR=20;WE=111770431;WS=111770413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,20:0.29:70
chr1	111772328	rs371879454	G	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.920;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.61;MQRankSum=-3.440;QD=5.67;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	111773568	rs2255089	G	C	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=2.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.67;ReadPosRankSum=0.536;SOR=0.499;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,46:0.27:173
chr1	111773830	rs2147789	A	T	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=509;ReadPosRankSum=0.025;SC=CAGCCAGAAAATAAATAATCA;SOR=0.585;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=72;TCR=24;TR=31;WE=111773838;WS=111773820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,31:0.32:97
chr1	111778187	rs2251715	A	G	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.48;ReadPosRankSum=-0.240;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr1	111778241	rs2764544	C	T	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=3;PP=627;SC=TATTGCACCTCGTTTCTTTGT;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=111778249;WS=111778231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	111778468	rs961364	G	A	1661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.567;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=32;PP=1389;ReadPosRankSum=0.420;SC=TGACGGATGAGGGGAGGAGGA;SOR=0.433;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=103;TCF=45;TCR=58;TR=59;WE=111778476;WS=111778458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,60:0.56:107
chr1	111778824	rs2251608	T	C	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.612;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=77;ReadPosRankSum=0.033;SC=GGGGTGGGGCTGGGGAGAGTC;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=10;WE=111778832;WS=111778814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,11:0.28:40
chr1	111783982	rs13721	C	A	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=412;ReadPosRankSum=0.568;SC=CAAGATCACGCGGCTCCAGGA;SOR=0.749;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=69;TCF=46;TCR=23;TR=24;WE=111784004;WS=111783972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,26:0.36:72
chr1	111783996	rs2494007	A	G	3003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=34;PP=2684;SC=TCCAGGATCAACAGGTTCCCT;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=55;TCR=34;TR=89;WE=111784004;WS=111783972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	111784138	rs942694	T	C	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.73;ReadPosRankSum=0.470;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,25:0.38:65
chr1	111784148	rs2764551	T	G	2276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=10;NR=46;PP=1706;SC=TGTTCAAAGATAGAAGCTTCT;SOR=2.948;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=10;TCR=46;TR=56;WE=111784166;WS=111784128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	111784158	rs942693	T	C	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=3.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.23;ReadPosRankSum=1.401;SOR=0.309;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,20:0.36:56
chr1	111784227	rs2182114	C	T	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=89;ReadPosRankSum=-0.234;SC=CTCTATGTCACACCCGCGAGC;SOR=0.495;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=7;WE=111784235;WS=111784217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr1	111785929	rs8535	C	A	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=888;ReadPosRankSum=0.394;SC=CCTTGCCAGGCTGGCCTTTGG;SOR=1.371;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=21;WE=111785938;WS=111785919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,24:0.80:30
chr1	111785930	rs1056825	T	C	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=239;ReadPosRankSum=-0.250;SC=CTTGCCAGGCTGGCCTTTGGA;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=6;WE=111785938;WS=111785919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr1	111825883	rs4406629	T	C	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.804;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.646;NF=29;NR=9;PP=624;ReadPosRankSum=0.147;SC=ATCAGAATGATTTTAAATCCT;SOR=0.779;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=138;TCF=104;TCR=34;TR=38;WE=111825891;WS=111825873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,41:0.28:144
chr1	111826007	rs58982671	C	T	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=16.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.10;MQRankSum=0.081;QD=6.87;ReadPosRankSum=-1.355;SOR=0.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,33:0.31:107
chr1	111826106	rs146591607	C	T	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.706;NF=0;NR=13;PP=217;ReadPosRankSum=0.836;SC=GCACAAAAGGCATCATAAGTT;SOR=0.646;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=13;WE=111826114;WS=111826096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr1	111833441	rs11102235	G	A	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=0.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.71;ReadPosRankSum=-0.796;SOR=0.626;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,53:0.25:208
chr1	111833488	rs34698010	C	CCT	2086.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FS=0.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.03;ReadPosRankSum=-0.154;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,63:0.30:208
chr1	111833517	rs12026825	G	A	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.073;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.655;NF=22;NR=32;PP=690;ReadPosRankSum=0.665;SC=ACAGGTGGCCGACTCTGGAGC;SOR=0.390;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=181;TCF=62;TCR=119;TR=54;WE=111833525;WS=111833507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,55:0.29:188
chr1	111854755	rs4423003	A	C	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.85;NF=25;NR=0;PP=725;SC=CAAAACTCACAGCACACTTCA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=111854763;WS=111854749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	111857087	rs2786151	C	T	1530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=12;PP=1330;ReadPosRankSum=-0.863;SC=CCAGATCCAACACTAAAGCAA;SOR=1.078;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=47;WE=111857095;WS=111857077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr1	111857154	rs2786152	T	C	2634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.574;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=27;PP=2116;ReadPosRankSum=0.975;SC=CTATCCTTTGTTTTACAGGAA;SOR=1.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=82;TCF=54;TCR=28;TR=81;WE=111857162;WS=111857144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,85:0.99:86
chr1	111858291	rs2786155	T	C	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=2;PP=1189;SC=GAACCATAACTCATTTCATCT;SOR=5.235;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=41;WE=111858299;WS=111858281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	111858444	rs2786156	C	T	5116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=86;PP=2965;SC=GCAGTTTGGCCACAGAGTCCA;SOR=0.834;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=74;TCR=86;TR=160;WE=111858452;WS=111858434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr1	111858499	rs6661725	A	G	3651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=54;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=75;PP=2228;SC=TACTGAGTACATATTCTGTGG;SOR=2.322;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=26;TCR=75;TR=101;WE=111858507;WS=111858489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	111858525	rs371155945	TAAATATAAGAATAAGA	T	3424.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.32;QD=45.06;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	111858526	.	AAATATAAGAATAAGACACTATCCTTGGCTT	CAATATAAGAATAAGACACTATCCTTGGCTT	2915	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=1.0000,1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=40;MMLQ=28;MQ=64.78;NF=0,0;NR=8,8;PP=2915,288;QD=20;SC=TTGTCAGGCTAAATATAAGAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8,8;WE=111858563;WS=111858516;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr1	111858526	.	AAATATAAGAATAAGACACTATCCTTGGCTT	A	2915	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=1.0000,1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=40;MMLQ=28;MQ=64.78;NF=0,0;NR=8,8;PP=2915,288;QD=20;SC=TTGTCAGGCTAAATATAAGAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8,8;WE=111858563;WS=111858516;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr1	111858542	rs376128132	CACTATCCTTGGCTT	C	3420.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.37;QD=44.43;SOR=3.471;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	111858589	rs2786157	G	T	1586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=85;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=40;PP=1038;SC=AAGACTGAAAGAATATGAACA;SOR=5.507;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=41;WE=111858611;WS=111858579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	111858603	rs2786158	G	T	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=85;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=38;PP=1123;SC=ATGAACAATGGCAATGCATTG;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=39;WE=111858611;WS=111858579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	111861714	rs2786161	T	A	4092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=17;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.774;SC=TAACATTTAATAGATTTGAAT;SOR=2.206;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=103;TCR=17;TR=119;WE=111861722;WS=111861704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,125:0.99:126
chr1	111861841	rs2275253	A	G	5334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=0.747;SC=CTATGACAACATCAAGAGCTT;SOR=0.232;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=175;TCF=86;TCR=89;TR=173;WE=111861849;WS=111861831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,182:0.99:183
chr1	111861974	rs2275254	T	C	3753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.798;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=84;PP=2965;ReadPosRankSum=0.738;SC=CACAACAAATTTGGAGGCGCC;SOR=2.114;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=28;TCR=84;TR=111;WE=111861982;WS=111861964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,113:0.99:114
chr1	111862952	rs2256721	T	G	3271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.160;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=31;PP=2517;ReadPosRankSum=-0.764;SC=TTCTGTGCTGTCAGAGCCAAC;SOR=1.722;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=101;TCF=69;TCR=32;TR=100;WE=111862960;WS=111862942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,104:0.99:105
chr1	111892905	rs3820443	T	C	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=305;ReadPosRankSum=-1.659;SC=TCATAGGTATTAGGGACTCTT;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=59;TCF=8;TCR=51;TR=19;WE=111892913;WS=111892895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,21:0.33:63
chr1	111893708	rs10158004	G	A	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=201;ReadPosRankSum=-0.408;SC=AGATGATAAAGGGTAGATGTA;SOR=0.277;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=12;WE=111893716;WS=111893703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr1	111893958	rs1668	A	G	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.176;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=29;PP=618;ReadPosRankSum=0.442;SC=GAGCGGCTGTAACTACCTTCA;SOR=1.639;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=117;TCF=32;TCR=85;TR=35;WE=111893966;WS=111893948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,35:0.28:123
chr1	112020222	rs3831358	GC	G	1470.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=6;PP=1147;SC=CTTCCGCCCTGCCCCCCACCC;SOR=2.165;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=24;WE=112020246;WS=112020212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	112020224	rs115634476	C	A	1479.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=6;PP=761;SC=TCCGCCCTGCCCCCCACCCAC;SOR=2.235;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=26;WE=112020246;WS=112020212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	112020238	rs2211494	A	C	1838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=7;PP=1188;SC=CACCCACCTGACAACACCTCC;SOR=2.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=41;WE=112020246;WS=112020212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	112106342	rs1591711	C	T	1466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=5;PP=1002;SC=CTATTTTACACGCTAGGACAA;SOR=2.985;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=38;WE=112106350;WS=112106332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	112106444	rs1591712	G	A	3343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=40;PP=2251;SC=CCTCCCAGCAGCTATATTTTC;SOR=0.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=53;TCR=40;TR=93;WE=112106452;WS=112106434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr1	112234068	rs506070	T	A	1313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.230;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=36;PP=1040;ReadPosRankSum=-0.615;SC=TGTAACTGATTAATATAATAC;SOR=1.449;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=83;TCF=23;TCR=60;TR=47;WE=112234076;WS=112234058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,49:0.55:89
chr1	112240038	rs34219774	C	CT	242.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=2.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-1.440;QD=2.09;ReadPosRankSum=-0.141;SOR=0.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,27:0.23:116
chr1	112251902	rs563083	C	T	5130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.100;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=97;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.240;SC=ATGCTAAAAGCAGAACAAGTG;SOR=0.553;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=289;TCF=151;TCR=138;TR=198;WE=112251910;WS=112251892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,204:0.69:297
chr1	112269872	rs197434	G	A	1848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.726;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=30;PP=1342;ReadPosRankSum=-0.446;SC=CTGTCAGGGCGAACCTGCGGC;SOR=0.462;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=278;TCF=188;TCR=90;TR=83;WE=112269880;WS=112269862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,85:0.30:284
chr1	112298378	rs28372703	T	C	2714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.032;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=44;PP=2137;ReadPosRankSum=-1.099;SC=GCCACATTTTTTGTGTGTCTG;SOR=0.397;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=124;TCF=60;TCR=64;TR=90;WE=112298386;WS=112298368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,93:0.74:126
chr1	112298582	rs197392	A	G	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.214;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=152;ReadPosRankSum=-0.146;SC=GAGCCTTAGCAGCAGTGGCGA;SOR=0.418;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=52;TCF=21;TCR=31;TR=13;WE=112298590;WS=112298572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,14:0.25:55
chr1	112298829	rs197393	T	C	78.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	112302208	rs560170	G	T	2091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=50;PP=1551;ReadPosRankSum=-1.547;SC=AACAATGCCTGTTGGTAACCA;SOR=1.017;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=102;TCF=32;TCR=70;TR=71;WE=112302227;WS=112302198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,77:0.71:109
chr1	112302219	rs538779	G	A	3188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=67;PP=2661;SC=TTGGTAACCAGGGCTTTTAAG;SOR=2.117;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=25;TCR=67;TR=92;WE=112302227;WS=112302198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	112305406	.	TA	T	788.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=0.000;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=2.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=-0.070;QD=6.21;ReadPosRankSum=1.548;SOR=0.429;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,59:0.46:127
chr1	112308953	rs197412	T	C	5774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=88;PP=2965;SC=AATAAAGTTATTGAACAGAGA;SOR=0.816;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=167;TCF=78;TCR=89;TR=165;WE=112308961;WS=112308943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr1	112308972	rs197413	G	A	5551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=81;PP=2965;SC=GAGTCCCTGTGTTGGCAAGTA;SOR=0.827;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=170;TCF=89;TCR=81;TR=169;WE=112308980;WS=112308962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr1	112321032	rs640029	T	A	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.189;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=812;ReadPosRankSum=0.133;SC=GAGAAAAACATCAATTGAATT;SOR=1.021;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=135;TCF=80;TCR=55;TR=47;WE=112321040;WS=112321022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,51:0.36:143
chr1	112329551	rs3738298	G	T	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=192;ReadPosRankSum=1.169;SC=CCGCTTCCCTGCGTCTGAGGC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=10;WE=112329559;WS=112329541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr1	112329838	rs11587284	G	T	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=354;ReadPosRankSum=1.165;SC=TTCAGCAATTGCTTAGAGTAT;SOR=0.446;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=15;WE=112329846;WS=112329828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr1	112991698	rs2256883	T	C	2601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.731;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=40;PP=1916;ReadPosRankSum=0.467;SC=TCTGCACAAATCCACTCTCTA;SOR=0.779;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=74;TCF=34;TCR=40;TR=73;WE=112991706;WS=112991688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,84:0.99:85
chr1	112999227	rs1175641	G	A	6270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=85;PP=2965;SC=TAGAAAACCAGGTGCCTCCAC;SOR=0.758;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=183;TCF=97;TCR=86;TR=182;WE=112999235;WS=112999217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr1	112999832	.	G	C	6040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.372;ClippingRankSum=0.000;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.343;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=104;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.197;SC=ACCATCCCCAGAGCTGAGAGA;SOR=0.614;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=342;TCF=186;TCR=156;TR=224;WE=112999840;WS=112999822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,220:0.65:341
chr1	113063125	rs910697	A	G	2331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.616;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=48;PP=1856;ReadPosRankSum=-0.018;SC=GGCTGGACCAAACCTGAACAC;SOR=1.034;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=128;TCF=59;TCR=69;TR=85;WE=113063133;WS=113063115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,86:0.68:127
chr1	113068577	rs35147679	C	T	2959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.756;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=37;PP=2316;ReadPosRankSum=0.147;SC=TGTCACTTTACAGATGCTGTT;SOR=0.259;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=161;TCF=114;TCR=47;TR=111;WE=113068585;WS=113068567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,113:0.69:163
chr1	113083439	rs10745330	C	T	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.848;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=295;ReadPosRankSum=-1.974;SC=TCAGTGTTTTCATTTTTGGGA;SOR=0.169;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=16;WE=113083447;WS=113083429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr1	113113167	.	G	GTATA	256.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=-0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQRankSum=-2.128;QD=11.16;ReadPosRankSum=-1.483;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr1	113113194	rs60579835	C	T	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.972;NF=24;NR=1;PP=501;ReadPosRankSum=2.066;SC=TATATATATACACACACACAT;SOR=0.098;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=51;TCF=50;TCR=1;TR=25;WE=113113202;WS=113113184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,8:0.23:35
chr1	113140583	rs12049572	T	C	1275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=8;PP=946;ReadPosRankSum=-0.524;SC=TGAACAGATATGATACATACC;SOR=0.877;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=64;TCF=54;TCR=10;TR=47;WE=113140591;WS=113140573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,47:0.73:64
chr1	113162494	rs41283062	G	A	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.629;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=443;ReadPosRankSum=-0.125;SC=TCGTGTGTCGGATGAGGAGAA;SOR=1.012;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=78;TCF=40;TCR=38;TR=26;WE=113162502;WS=113162484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,27:0.34:79
chr1	113162638	.	A	T	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.329;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=277;ReadPosRankSum=-1.440;SC=CGCTCTCCGCAGTCGGGACGC;SOR=0.307;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=14;WE=113162646;WS=113162628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr1	113196197	rs2932528	A	T	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.21;MQRankSum=-0.320;QD=22.35;ReadPosRankSum=1.740;SOR=2.891;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr1	113202417	rs2932536	G	A	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=208;ReadPosRankSum=-0.339;SC=ATTCCAACATGTTTATAGACT;SOR=0.852;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=31;TCR=21;TR=18;WE=113202425;WS=113202407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
chr1	113202571	rs12120956	G	A	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=171;ReadPosRankSum=-0.493;SC=GAGCTATTCTGAGTTGATAAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=9;WE=113202579;WS=113202561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr1	113234456	rs2932532	G	A	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.543;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=583;ReadPosRankSum=0.223;SC=GCACTCTCCCGTCTTTTACCT;SOR=0.501;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=134;TCF=50;TCR=84;TR=39;WE=113234464;WS=113234446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,41:0.30:137
chr1	113236681	rs3748656	C	T	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-4.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.135;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=13;PP=1000;ReadPosRankSum=0.329;SC=TGCTACGGGGCGACCACCTGT;SOR=0.420;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=96;TCF=76;TCR=20;TR=54;WE=113236689;WS=113236671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,55:0.58:95
chr1	113237171	rs883593	A	G	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.986;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=745;ReadPosRankSum=2.722;SC=TGGAGCTGACAGGGCGCTGGC;SOR=0.325;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=67;TCF=51;TCR=16;TR=39;WE=113237179;WS=113237161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,41:0.59:70
chr1	113238665	rs71584764	T	TA	173.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=160;ReadPosRankSum=0.115;SC=CCGTCTCAATTAAAAAAAATA;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=9;WE=113238673;WS=113238655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr1	113239382	rs17030651	G	A	1953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.773;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=47;PP=1495;ReadPosRankSum=-0.378;SC=CACTGCTGGAGCGGCTGCTCA;SOR=0.597;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=41;TCR=73;TR=74;WE=113239390;WS=113239372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,73:0.66:111
chr1	113239478	rs2999158	T	C	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=3.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.88;ReadPosRankSum=0.824;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,10:0.24:42
chr1	113240790	rs12133583	G	T	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.351;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=632;ReadPosRankSum=1.250;SC=CCCACTGAAGGTGCAGCCCCT;SOR=0.148;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=30;WE=113240798;WS=113240780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr1	113241052	rs2306940	T	C	2093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.196;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=54;PP=1641;ReadPosRankSum=1.381;SC=AGGGCAAAGCTCGCCTGAGCC;SOR=1.132;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=97;TCF=25;TCR=72;TR=71;WE=113241060;WS=113241042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,74:0.73:101
chr1	113242488	rs3013431	C	T	1777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.873;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=42;PP=1340;ReadPosRankSum=-0.539;SC=CTCTTCCCTCCCATGACCACA;SOR=0.868;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=228;TCF=111;TCR=117;TR=77;WE=113242496;WS=113242478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,80:0.34:236
chr1	113243048	rs6679	C	T	2886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.649;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=42;PP=2251;ReadPosRankSum=-1.323;SC=GGCCCCACAGCCATGACTACC;SOR=0.602;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=150;TCF=89;TCR=61;TR=100;WE=113243056;WS=113243038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,106:0.68:156
chr1	113244433	rs2279500	T	C	2280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=63;PP=1894;SC=AATGCCTCCTTCTCCAGCCCT;SOR=4.205;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=7;TCR=63;TR=70;WE=113244441;WS=113244423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	113246229	rs937053	T	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=127;ReadPosRankSum=-1.108;SC=GGGGGCGGGGTCTCAGGGTGG;SOR=1.022;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=9;WE=113246237;WS=113246219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr1	113246506	rs2306937	C	T	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=305;ReadPosRankSum=0.921;SC=CCCAAACCTCCCTGGAAACCG;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=13;WE=113246514;WS=113246496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr1	113248365	rs954679	A	G	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=220;ReadPosRankSum=0.569;SC=CCTGTTTTGTAAAGATGGGCT;SOR=0.909;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=11;WE=113248373;WS=113248355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr1	113254125	rs12040903	G	A	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.221;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=725;ReadPosRankSum=-0.183;SC=TGTGCCACACGTTATTCTAAT;SOR=1.785;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=32;WE=113254133;WS=113254115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,34:0.68:50
chr1	113254484	rs4839258	A	G	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=373;SC=TTCCCAGTAAAGTGCTTTCTG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=113254492;WS=113254474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	113255389	rs10857971	C	T	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=1;PP=347;SC=GCATTCTCAACGGCCCCCACT;SOR=3.912;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=13;WE=113255397;WS=113255379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	113456546	rs1049434	A	T	1078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.536;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=16;PP=791;ReadPosRankSum=0.524;SC=TGGGCCCTCCATCTGTGTCTT;SOR=0.538;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=133;TCF=91;TCR=42;TR=49;WE=113456554;WS=113456536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,49:0.36:138
chr1	113460676	rs199817200	CAATAAATA	C	32.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.67;MQRankSum=0.431;QD=10.95;SOR=2.225;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr1	113616382	rs56062000	G	GA	419.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=376;SC=CCTAAGCTCTGAAGGAAACTG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=10;WE=113616390;WS=113616372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	113636924	rs1216802	T	C	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=0;PP=907;SC=TTTATTTTACTAAATTTTTTC;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=113636932;WS=113636914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	113657092	rs1216793	A	C	4220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=47;PP=2965;SC=AGACAGTAACACGAGGTGAAA;SOR=1.284;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=82;TCR=47;TR=128;WE=113657100;WS=113657082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr1	113657538	rs17442872	G	A	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=27;ReadPosRankSum=0.828;SC=TTGTACTTCAGTCAAGAATGT;SOR=0.478;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=5;WE=113657546;WS=113657528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,5:0.17:29
chr1	113658887	rs1216791	G	A	1146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=5;PP=936;SC=ACCTTTGAGAGTTAAAAATGT;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=113658895;WS=113658877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	113659065	rs10541977	ACT	A	5306.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=69;PP=2965;SC=GACGGTAATGACTCTGTTGTT;SOR=1.590;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=88;TCF=14;TCR=74;TR=83;WE=113659074;WS=113659055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	113666351	rs1728222	G	T	140.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.66;ReadPosRankSum=-0.765;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr1	114137013	rs3834733	C	CAT	1588.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=0;PP=1472;SC=GTTCAAACATCATGTCTTTTA;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=34;WE=114137021;WS=114137003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	114161116	rs1217200	C	A	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=0;PP=115;SC=ACTCATATCACCTCTTTATTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=114161124;WS=114161106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	114196364	rs2359174	T	G	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=488;SC=AAACTGAATTTTTCTGTGAGA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=114196372;WS=114196354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	114196495	rs2359173	A	G	2105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=26;PP=1664;SC=TCATTTCAACACAGAATGGAT;SOR=1.426;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=45;TCR=26;TR=71;WE=114196503;WS=114196485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	114224782	rs11438160	A	AT	1015.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=19.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.21;MQRankSum=4.563;QD=7.36;ReadPosRankSum=-1.448;SOR=0.077;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,69:0.50:138
chr1	114240319	rs3835263	T	TA	6558.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.004;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.241;NF=58;NR=88;PP=2936;ReadPosRankSum=-0.604;SC=TCCAGGCATTTACTCAGCTTA;SOR=0.139;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=160;TCF=58;TCR=102;TR=146;WE=114240327;WS=114240309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,177:0.99:179
chr1	114242122	rs3752954	T	C	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=71;ReadPosRankSum=-0.726;SC=CCACTCTTTGTCCTTAATCTT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=5;WE=114242130;WS=114242112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr1	114242250	rs3752953	C	T	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=14;PP=1038;SC=GTATCATCTGCCATTTAATGT;SOR=1.387;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=38;WE=114242258;WS=114242240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	114249382	rs6698586	C	T	3302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=90;PP=2740;SC=TATCCATGCCCTCTTGCCTCC;SOR=5.221;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=5;TCR=90;TR=95;WE=114249390;WS=114249372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	114267347	rs1230640	C	T	2965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=16;PP=2408;SC=GTAAACACTACGTGAATACAA;SOR=3.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=76;TCR=16;TR=92;WE=114267355;WS=114267337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	114280717	rs2273758	A	C	3277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=91;NR=5;PP=2791;SC=TGCTTATTCCAATTTCTCCAA;SOR=5.486;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=92;TCR=5;TR=96;WE=114280725;WS=114280707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	114339956	rs34169583	C	CTAAA	2681.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=3;PP=2957;SC=ATCGTATTTACTAATTTTTAA;SOR=5.174;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=52;TCR=3;TR=52;WE=114339964;WS=114339946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	114357750	rs1217413	G	A	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=3;PP=52;SC=TAAAGGGATTGTAGTAATCTA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=114357758;WS=114357740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	114372332	rs57877024	TA	T	360.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=12;PP=267;SC=CTGCATACCTTAAAAAAAAAA;SOR=2.049;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=15;WE=114372340;WS=114372322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	114377093	rs1599971	A	G	2455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.164;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=68;PP=2132;ReadPosRankSum=1.598;SC=TCGGTTCTTAAGAATAGTATT;SOR=4.921;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=75;TCF=6;TCR=69;TR=73;WE=114377101;WS=114377083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,74:0.97:76
chr1	114377568	rs2476601	A	G	4811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=82;PP=2965;SC=TCAGGTGTCCATACAGGAAGT;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=81;TCR=83;TR=163;WE=114377576;WS=114377558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr1	114400195	rs11386228	G	GA	670.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=0;PP=555;SC=ATTCTTAGGAGAAAAAAAAAA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=27;WE=114400203;WS=114400185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	114401231	rs1217418	A	G	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=262;SC=GGTGACTACAAATAATACCCT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=114401239;WS=114401221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	114401904	rs1217419	T	G	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=5;PP=304;SC=CAGTAAGCAATGGGTACAAAG;SOR=0.836;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=11;WE=114401912;WS=114401894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	114424601	rs1217381	C	T	1676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=33;PP=1280;SC=TCCACAGTGTCCTGGAGTATA;SOR=1.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=47;WE=114424609;WS=114424591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	114472218	rs1217441	A	G	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=346;ReadPosRankSum=-0.463;SC=GGGTTGAGGGACGGCCGCTCG;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=15;WE=114472226;WS=114472208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr1	114512939	rs3811018	A	T	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=666;ReadPosRankSum=1.787;SC=TCTTAAAGAGACCTTAATTCA;SOR=1.414;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=28;WE=114512947;WS=114512929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr1	114515717	rs2358996	G	A	4742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.265;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=74;PP=2962;ReadPosRankSum=0.340;SC=GGCAGCAGGCGTTTGTGGCCC;SOR=1.013;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=239;TCF=135;TCR=104;TR=177;WE=114515725;WS=114515707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,177:0.74:239
chr1	114522285	rs12728679	A	G	1666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=39;PP=1346;ReadPosRankSum=-1.244;SC=AGCCCCGCCTAGAAGGATTCC;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=29;TCR=59;TR=58;WE=114522293;WS=114522275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,60:0.67:90
chr1	114523465	rs3789614	A	G	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.899;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=3;PP=553;ReadPosRankSum=-0.762;SC=GGAGGCAACCACTGGGCAAAT;SOR=1.863;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=30;WE=114523473;WS=114523455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,31:0.67:46
chr1	114680310	rs41274114	G	A	4267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.936;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=72;PP=2962;ReadPosRankSum=1.171;SC=CTCATCAAAGGTGGGGTTCAG;SOR=0.527;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=205;TCF=110;TCR=95;TR=150;WE=114680318;WS=114680300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,156:0.74:212
chr1	114940215	rs147717859	T	TG	342.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQRankSum=0.109;QD=17.14;ReadPosRankSum=0.152;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr1	114940632	rs5777192	CA	C	310.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=6.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQRankSum=1.073;QD=7.58;ReadPosRankSum=0.791;SOR=0.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr1	114948281	rs6537825	A	G	6931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=96;PP=2965;SC=TGCAGGTTCAATTTTCACATG;SOR=0.830;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=207;TCF=111;TCR=96;TR=207;WE=114948289;WS=114948271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr1	114951220	rs6672519	C	T	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	114951390	rs71662879	T	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=8.921;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=196;ReadPosRankSum=-1.180;SC=AAAATGAATATCAATGCATAT;SOR=1.644;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=10;WE=114951398;WS=114951380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr1	114969925	rs36115645	GA	G	2124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.737;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.998;NF=11;NR=67;PP=1886;ReadPosRankSum=2.059;SC=ATCTTAAAGGGAAAAAAATCC;SOR=0.962;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=126;TCF=20;TCR=106;TR=78;WE=114969933;WS=114969915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,91:0.67:135
chr1	114973360	rs80326582	T	A	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.376;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=295;ReadPosRankSum=1.098;SC=TCAATAAACATTAAAAACAGC;SOR=0.368;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=16;WE=114973368;WS=114973350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr1	114973429	rs12083584	T	C	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.053;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=892;ReadPosRankSum=0.819;SC=CCTCTAGCTGTTGTAAGAGAG;SOR=0.317;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=66;TCF=31;TCR=35;TR=45;WE=114973437;WS=114973419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,45:0.68:66
chr1	115006230	rs34437690	TA	T	205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=0.693;QD=12.10;ReadPosRankSum=-1.757;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr1	115053748	.	T	TCGC	124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.79;ReadPosRankSum=1.282;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	115128087	rs222493	A	G	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=149;SC=ATCCTCCTCTAACAGCCTGAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=115128095;WS=115128077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	115144304	rs12730318	C	T	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=6.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=36;PP=847;ReadPosRankSum=-0.684;SC=CTCTTTAGTACGGAGCAGTAA;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=0;TCR=56;TR=36;WE=115144312;WS=115144294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,40:0.66:61
chr1	115144703	rs28398	A	G	9058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=192;NR=82;PP=2965;SC=TGACTCAATTATTCCTTGACC;SOR=1.841;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=277;TCF=193;TCR=84;TR=274;WE=115144711;WS=115144693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr1	115161140	rs12145066	C	T	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=207;ReadPosRankSum=-0.101;SC=TTAAGACCAACACCCAAAAGT;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=10;WE=115161148;WS=115161130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr1	115165472	.	T	A	49	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=49;QD=27.9237375157;SC=AAACAAAAATTAAAAAAACTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=115165480;WS=115165462;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	115166350	rs148413143	ATTGT	A	788.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=686;SC=TATTTGTTTGATTGTTTGTTT;SOR=4.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=15;WE=115166361;WS=115166340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	115168097	rs12136548	T	C	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.462;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=818;ReadPosRankSum=0.283;SC=TTCTGAAGAGTCACAATGTTC;SOR=0.487;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=121;TCF=48;TCR=73;TR=41;WE=115168105;WS=115168087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,42:0.34:123
chr1	115168600	rs7541738	A	T	1698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.313;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=48;PP=1334;ReadPosRankSum=-1.779;SC=AAAAACCAACATCCATGTTCC;SOR=1.148;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=94;TCF=22;TCR=72;TR=61;WE=115168608;WS=115168590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,63:0.65:97
chr1	115222434	rs761755	G	A	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=18;PP=511;SC=GGAAATAATTGTTGGAACAAA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=115222442;WS=115222424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	115276978	rs57342611	GA	G	2867.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.50;MQRankSum=0.270;QD=23.70;ReadPosRankSum=0.940;SOR=5.926;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,120:0.99:121
chr1	115279332	.	G	GA	205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.091;NF=5;NR=4;PP=130;ReadPosRankSum=-0.197;SC=ATGGAGGGGGGAAAAAAAAAC;SOR=0.409;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=9;WE=115279340;WS=115279322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr1	115284056	rs7537232	G	T	4760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=40;PP=2965;SC=AAGGTGAGTCGGCAAGATATT;SOR=2.072;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=104;TCR=40;TR=144;WE=115284064;WS=115284046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	115398044	rs60659641	GC	G	1411.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=10;PP=1035;SC=TTCCCCTCCCGCCCCCCCGGG;SOR=2.560;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=38;WE=115398052;WS=115398034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	115399940	rs360614	T	G	1352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=23;PP=1205;SC=GTTTAGGTAATGAACTGCTTA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=34;WE=115399948;WS=115399930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	115401136	rs360615	G	A	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=1;PP=365;SC=TAGAATTTTGGACAATTAATT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=115401144;WS=115401126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	115420843	rs371256659	A	G	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.773;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=23;PP=434;ReadPosRankSum=-0.031;SC=TATATAAGATAATATAATGTG;SOR=1.888;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=86;TCF=32;TCR=54;TR=29;WE=115420851;WS=115420833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,29:0.33:89
chr1	115420905	rs360636	T	C	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.662;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=40;PP=1112;ReadPosRankSum=1.195;SC=ATTACAAGTTTGTTGTAATGC;SOR=2.649;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=49;WE=115420913;WS=115420895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr1	115437986	rs6661511	G	A	1587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=18;PP=1190;SC=TCCCTTTTGCGTAGTATTATG;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=31;TCR=19;TR=48;WE=115437994;WS=115437976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	115524216	rs12026343	C	T	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=401;SC=TCTGGCATCACGCACACATAT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=115524224;WS=115524206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	115576023	rs10776792	A	G	4150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=28;PP=2965;SC=TTTTGGCCTTACATGTGGGCA;SOR=2.321;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=96;TCR=28;TR=124;WE=115576031;WS=115576013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr1	115576482	rs28566771	C	G	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=0;PP=988;SC=CAATTCTTTCCCAGTTGTATT;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=42;WE=115576490;WS=115576472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	115601615	rs7523818	A	G	4092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=97;PP=2965;SC=GAAGAAATACAAGGAAAAATG;SOR=2.815;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=22;TCR=97;TR=119;WE=115601623;WS=115601605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr1	115603168	rs189737200	G	A	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=33;PP=1018;ReadPosRankSum=-1.386;SC=AACTGTAGAGGAGAGAAAATA;SOR=0.642;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=16;TCR=49;TR=44;WE=115603176;WS=115603158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,48:0.69:70
chr1	115615358	rs753189	T	C	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=2;PP=472;SC=AGCAGACAACTCGGAGGGCTA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=115615366;WS=115615353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	115631924	rs4240540	C	T	1594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=12;PP=1250;SC=TCGGGGACCCCGGCCCCGCGC;SOR=2.256;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=47;WE=115631932;WS=115631914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	116224925	rs10923176	G	A	3462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=100;NR=3;PP=2904;SC=AGGATTTTTCGTTTAGGACCT;SOR=6.498;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=103;TCF=100;TCR=3;TR=103;WE=116224933;WS=116224915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr1	116224940	rs10754330	C	A	4034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=9;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.808;SC=GGACCTGCTTCTTCAGTGAAA;SOR=3.360;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=113;TCR=9;TR=120;WE=116224948;WS=116224930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,125:0.99:126
chr1	116225180	rs10923177	A	C	3576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=97;PP=2965;SC=ACTATTTAAGATTCATGGTAC;SOR=7.844;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=98;TCF=1;TCR=97;TR=98;WE=116225188;WS=116225170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	116228220	rs12145661	C	T	1843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=53;PP=1517;SC=TGAATTATAGCGTGTTACTAG;SOR=8.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=53;WE=116228228;WS=116228210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	116234083	rs3811013	T	A	643.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=519;ReadPosRankSum=0.970;SC=GTGTCTTTTTTAAAAATTCTT;SOR=1.206;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=22;WE=116234091;WS=116234073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr1	116243877	rs7413162	G	A	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=1;PP=739;ReadPosRankSum=0.262;SC=CATCATCATCGTCATCACTGT;SOR=0.600;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=31;WE=116243885;WS=116243867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr1	116245655	rs12402684	G	C	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.116;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=774;ReadPosRankSum=0.525;SC=AGCAGGCAGAGGGCATTCTCT;SOR=0.426;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=37;TCR=30;TR=46;WE=116245663;WS=116245645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,45:0.64:70
chr1	116245809	rs6667224	C	T	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=202;ReadPosRankSum=1.850;SC=AAAGATGACACAGCATAAATT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=10;WE=116245817;WS=116245799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr1	116260532	rs2997741	A	T	1847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.595;HP=1;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=2156;ReadPosRankSum=0.489;SC=GAGAAAAGTAACAAAAGTTAC;SOR=0.307;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=86;TCF=28;TCR=58;TR=47;WE=116260552;WS=116260522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,50:0.54:93
chr1	116260544	rs3811001	C	T	1832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.862;HP=2;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=2156;ReadPosRankSum=0.567;SC=AAAAGTTACACTTCCAGCTGG;SOR=0.123;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=79;TCF=22;TCR=57;TR=45;WE=116260552;WS=116260522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,49:0.58:84
chr1	116260604	rs2997742	G	A	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.872;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=25;PP=649;ReadPosRankSum=0.761;SC=GCTGGAATGGGAATAGGAGAG;SOR=0.347;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=29;WE=116260612;WS=116260594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,33:0.69:48
chr1	116268178	.	GAA	G	86.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=-0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQRankSum=-1.207;QD=7.23;ReadPosRankSum=1.242;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	116283343	rs9428083	A	G	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=7.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=543;ReadPosRankSum=1.111;SC=GTGTATAAATACTTACATCCA;SOR=0.645;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=95;TCF=72;TCR=23;TR=27;WE=116283351;WS=116283333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,28:0.29:96
chr1	116283526	rs7538337	G	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=323;ReadPosRankSum=1.036;SC=AGGTCTGGCTGAGGGTTTCTG;SOR=0.638;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=1;TCR=49;TR=16;WE=116283534;WS=116283516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,16:0.31:52
chr1	116287682	rs9428211	T	C	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=66;ReadPosRankSum=-1.609;SC=AAAGGAAATGTATTCTTGTCC;SOR=0.321;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=5;WE=116287690;WS=116287672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr1	116311198	rs4074537	T	C	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=35;PP=919;SC=CCAAATATGCTGTGTGCAGAA;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=38;WE=116311206;WS=116311188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	116534952	rs10923941	GC	TT	1295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=25;PP=1431;SC=TTAAATATCAGCCACATTTTC;SOR=5.421;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=26;WE=116534961;WS=116534942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	116569530	rs2488429	G	C	1163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=7;PP=879;SC=TTGGCGGCCTGTTCTTTGCAG;SOR=2.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=116569538;WS=116569520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	116577981	rs1935828	G	A	1467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=39;PP=1180;SC=GAAGTGCACCGTAGAGAATGC;SOR=4.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=42;WE=116577989;WS=116577971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	116607254	rs1281748	G	T	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=29;PP=865;SC=GTGAACCTTGGCCCTTTTAGA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=116607262;WS=116607244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	116609126	rs3833541	TC	T	3619.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=45;PP=2966;SC=TTCATTCCACTCCCCGCCTCT;SOR=0.961;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=98;TCF=42;TCR=56;TR=84;WE=116609134;WS=116609116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr1	117041471	rs17576615	A	G	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=605;ReadPosRankSum=1.405;SC=CGTGGAATATATCTCCTGTTC;SOR=0.620;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=94;TCF=26;TCR=68;TR=34;WE=117041479;WS=117041461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,36:0.38:96
chr1	117121865	rs12066192	G	A	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-6.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=0;PP=709;ReadPosRankSum=-0.135;SC=GAACTAATATGTCCAATCCCA;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=58;TCR=0;TR=32;WE=117121873;WS=117121855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,32:0.55:58
chr1	117122285	.	G	GTCC	3561.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.212;ClippingRankSum=0.000;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.112;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.228;NF=38;NR=62;PP=2989;ReadPosRankSum=0.141;SC=CGTCGTCGTCGTCGTCCTCCT;SOR=0.335;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=152;TCF=61;TCR=91;TR=100;WE=117122296;WS=117122275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,85:0.99:86
chr1	117122288	rs647711	G	C	5734.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.112;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.228;NF=71;NR=85;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.363;SC=CGTCGTCGTCGTCCTCCTCCT;SOR=0.335;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=74;TCR=90;TR=156;WE=117122296;WS=117122275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,134:0.99:135
chr1	117142531	rs631461	G	A	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.056;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.714;NF=9;NR=2;PP=218;ReadPosRankSum=-0.392;SC=CAGGCAGCATGGGCACATAGC;SOR=0.154;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=11;WE=117142539;WS=117142521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr1	117236970	rs614477	G	C	2318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=68;PP=2044;SC=GGACAGTGCTGCTGCCATGTG;SOR=7.054;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=69;TCF=1;TCR=68;TR=69;WE=117236978;WS=117236960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	117487710	rs10159095	AT	GA	5075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=77;PP=2947;SC=TGATCCAGCCATCAGGTGAGC;SOR=2.657;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=23;TCR=80;TR=99;WE=117487719;WS=117487700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	117527645	rs36119404	GTCT	G	2100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.047;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=60.32;MQRankSum=1.321;NF=6;NR=35;PP=1672;ReadPosRankSum=0.803;SC=GTTTGGGAATGTCTTCTTCTT;SOR=0.914;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=82;TCF=10;TCR=72;TR=41;WE=117527655;WS=117527635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,54:0.64:84
chr1	117552560	rs7554376	T	C	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.921;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=579;ReadPosRankSum=-1.228;SC=TTGGCTGCAATGTAACTGGCC;SOR=1.426;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=28;WE=117552568;WS=117552550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr1	117554421	rs3754112	A	G	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.158;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=494;ReadPosRankSum=0.163;SC=GTACAGCTCAACAAACTGGGA;SOR=1.109;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=84;TCF=50;TCR=34;TR=27;WE=117554429;WS=117554411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,27:0.31:88
chr1	117555898	rs2764849	G	A	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=363;SC=TTTACCTACCGCTATAGAATT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=117555906;WS=117555893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	117559726	rs2249265	A	G	4467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=61;PP=2965;SC=AAGTGTGGTCATGTCTACCAA;SOR=1.060;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=88;TCR=61;TR=149;WE=117559734;WS=117559716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr1	117560058	rs17235773	C	G	1441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.040;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=37;PP=1022;ReadPosRankSum=1.649;SC=GAGATCTGAGCTGGACTCAGA;SOR=0.907;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=72;TCF=18;TCR=54;TR=48;WE=117560066;WS=117560048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,54:0.69:78
chr1	117602960	rs2244501	C	A	3933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=18;PP=2965;SC=ACTTGGGGGACCCAGCGAAAT;SOR=3.389;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=105;TCR=18;TR=122;WE=117602968;WS=117602950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	117603188	rs2244406	G	T	1530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=46;PP=1281;SC=GAGTAGGTCTGGAGCTGGGCC;SOR=6.316;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=47;WE=117603196;WS=117603178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	117605130	rs35553508	CT	C	60.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=1.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.12;ReadPosRankSum=0.709;SOR=0.313;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,13:0.24:54
chr1	117617705	rs998532	A	G	1837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.763;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=40;PP=1541;ReadPosRankSum=-1.017;SC=CGATCAAAAGAAAGAACAGAA;SOR=0.468;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=267;TCF=115;TCR=152;TR=81;WE=117617713;WS=117617695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:201,81:0.29:282
chr1	117618067	rs1289673	C	T	951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=722;ReadPosRankSum=-0.734;SC=AGTACACGAACTGGGAGGCTA;SOR=0.529;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=161;TCF=50;TCR=111;TR=46;WE=117618075;WS=117618057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,46:0.28:165
chr1	117618722	rs1289672	T	C	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=0;PP=728;SC=AGAGTTTGGGTGTTTCAGGCT;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=117618730;WS=117618712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	117622286	rs2801939	A	G	1589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.683;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=52;PP=1206;ReadPosRankSum=-0.680;SC=GTGTGGTATTATAAGAGTCAG;SOR=1.076;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=203;TCF=62;TCR=141;TR=70;WE=117622294;WS=117622276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,71:0.34:209
chr1	117628869	.	A	ATG	170.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=62.13;MQRankSum=0.549;NF=6;NR=0;PP=267;ReadPosRankSum=-0.035;SC=TACCTCCAAAATGTGTGTGTG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=117628877;WS=117628867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr1	117631391	rs1555792	T	C	2949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=25;PP=2496;SC=TTTTCCCATATTGTGGCTGGA;SOR=2.229;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=71;TCR=25;TR=96;WE=117631399;WS=117631381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	117633366	rs2296447	T	C	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=0.366;SC=TGGATGTCTGTATTCCCTTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=117633374;WS=117633356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr1	117639828	rs11330257	TA	T	733.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.97;ReadPosRankSum=0.186;SOR=2.256;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,37:0.76:49
chr1	117655093	rs41301281	G	A	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.354;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=548;ReadPosRankSum=1.268;SC=GGACAAAGAGGAAAGGACAAA;SOR=1.071;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=22;WE=117655101;WS=117655083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr1	117656088	rs1289658	A	G	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=173;ReadPosRankSum=-0.379;SC=TCTCCTCACCATCACAGTGAA;SOR=0.346;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=12;WE=117656096;WS=117656078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr1	117660608	rs1289655	C	T	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=1;PP=485;SC=TCACACACCACCTCCCTGTCC;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=117660616;WS=117660598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	117660754	rs749902	C	T	2325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.840;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=21;PP=1720;ReadPosRankSum=-0.107;SC=CTCCTGAGGACAGAAGCGTAT;SOR=0.512;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=122;TCF=94;TCR=28;TR=83;WE=117660762;WS=117660744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,86:0.68:126
chr1	117690272	rs10754339	G	A	1676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=6;PP=1478;SC=TTTTGTGGCCGAGGCACATTA;SOR=3.830;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=47;TCR=6;TR=53;WE=117690280;WS=117690262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	117699714	rs145887761	G	GAT	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.622;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=72;ReadPosRankSum=1.922;SC=CAATCATTTTGATATATATAT;SOR=0.016;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=3;WE=117699722;WS=117699704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr1	117715026	rs6657810	C	T	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.716;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=550;ReadPosRankSum=0.074;SC=TCCTCTTTTCCCACACCTCAG;SOR=1.949;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=95;TCF=63;TCR=32;TR=30;WE=117715034;WS=117715016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,32:0.31:102
chr1	117715987	rs140251705	A	AAC	98.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.49;ReadPosRankSum=-1.184;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr1	117957288	rs1289948	A	G	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=656;SC=GAGAACAGGAACCTAAAGGGA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=117957296;WS=117957278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr1	117985030	rs34782879	AT	A	342.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=291;ReadPosRankSum=-0.810;SC=TCACCCCCACATTTTTTTTAA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=1;TCR=49;TR=19;WE=117985038;WS=117985020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr1	118057263	rs45526845	G	T	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=359;ReadPosRankSum=-1.556;SC=TCTGTTAGTGGCTTTGTCCAT;SOR=2.400;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=17;WE=118057271;WS=118057259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr1	118057278	rs78560755	C	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=47;ReadPosRankSum=0.939;SC=GTCCATAAAACATCAATAGTA;SOR=0.090;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=6;WE=118057286;WS=118057268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr1	118057646	rs12117874	T	C	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=429;ReadPosRankSum=1.507;SC=GTATATGAAATGTATACTCTA;SOR=0.829;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=24;WE=118057654;WS=118057636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr1	118065541	rs41296190	G	A	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.787;NF=9;NR=15;PP=391;ReadPosRankSum=0.403;SC=GTTACATTTAGCCAACACCAC;SOR=0.908;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=64;TCF=25;TCR=39;TR=24;WE=118065549;WS=118065531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,24:0.36:66
chr1	118065919	rs12120771	T	A	2040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.774;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=49;PP=1683;ReadPosRankSum=0.575;SC=GTCAAGAATATAGAGCACCTT;SOR=1.017;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=36;TCR=74;TR=72;WE=118065927;WS=118065909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,73:0.66:110
chr1	118165691	rs1630312	C	T	4417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=83;PP=2965;SC=TCAAAGTGCACGACGTCCGGC;SOR=1.171;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=51;TCR=83;TR=134;WE=118165699;WS=118165681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	118320644	rs1780028	A	G	31.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.68;QD=15.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	118320859	rs1775749	T	A	1513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.09;QD=33.64;SOR=6.229;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	118321119	rs114485606	T	C	3490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=100;PP=2965;SC=TACCTCTCTCTACCACCCATC;SOR=2.419;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=25;TCR=100;TR=125;WE=118321127;WS=118321109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	118424269	rs10923444	C	T	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=165;ReadPosRankSum=0.831;SC=CCCACAAAGGCGCTGGAGTCA;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=9;WE=118424277;WS=118424259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr1	118429438	rs3054231	G	GACA	936.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=696;ReadPosRankSum=0.646;SC=CTACTCTGCAGACAACACCTA;SOR=1.675;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=15;WE=118429446;WS=118429428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr1	118484265	rs10733098	G	A	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=311;SC=CCAAGGTAATGCAACTACTAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=118484273;WS=118484255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	118491215	.	G	GT	46	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.9985;HP=15;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=17;MQ=61.07;NF=0;NR=4;PP=46;QD=12.25;SC=AAAGCCTGAGGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=118491223;WS=118491205;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr1	118526592	rs4347199	G	A	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=595;SC=TTCAACTGTCGCAAATATGTT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=118526600;WS=118526582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	118565953	rs10923472	G	A	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=737;ReadPosRankSum=-0.875;SC=AATCTCAGATGGTATCGTTTC;SOR=1.230;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=30;WE=118565961;WS=118565943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr1	118583408	rs10923477	G	A	3254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=59;PP=2557;SC=AAGGATACAGGTAGTAATTTG;SOR=1.168;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=42;TCR=59;TR=101;WE=118583416;WS=118583398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr1	118617274	rs1935993	C	T	6504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=123;PP=2965;SC=TTGTTCTTGCCCTGCTGGTTA;SOR=1.281;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=201;TCF=77;TCR=124;TR=200;WE=118617282;WS=118617264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr1	118623681	rs56768861	TACACAC	T	936.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5042;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=1;PP=930;SC=AATAGTGTCTTACACACACAC;SOR=4.804;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=16;WE=118623694;WS=118623671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	118644430	rs10754367	A	G	1983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=18;PP=1472;SC=TCACTGGTGCATTTGCCTCAG;SOR=2.206;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=50;TCR=18;TR=68;WE=118644438;WS=118644420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	118727597	.	G	A	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.307;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=0.074;SC=GGAGAGATACGGAAGAGAGGG;SOR=0.138;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=4;WE=118727605;WS=118727587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr1	119466275	rs4659129	A	G	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=38;PP=1138;SC=AGGAACCTACATTTTGTTCTC;SOR=4.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=42;WE=119466283;WS=119466265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	119683063	rs3934789	G	A	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.95;ReadPosRankSum=0.907;SOR=0.404;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,6:0.13:46
chr1	119683390	rs12096448	G	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=49;ReadPosRankSum=-1.299;SC=AGCCGCTATCGGGCGGACTGC;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=5;WE=119683398;WS=119683380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr1	119923531	rs2224995	A	C	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.503;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=496;ReadPosRankSum=0.737;SC=TTACTCTCTGACTTCTGGCTT;SOR=1.547;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=68;TCF=10;TCR=58;TR=25;WE=119923539;WS=119923521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,27:0.36:76
chr1	119923724	rs2275607	T	C	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=5.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.56;ReadPosRankSum=-1.547;SOR=0.296;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,26:0.24:110
chr1	119923772	.	C	G	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=0.000;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.22;ReadPosRankSum=-1.194;SOR=0.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,37:0.25:146
chr1	119925403	rs1341007	C	T	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=215;ReadPosRankSum=1.131;SC=TCTCAGCCAACTGAACCCACC;SOR=1.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=12;WE=119925411;WS=119925393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr1	119925464	rs2298027	G	A	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.814;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=520;ReadPosRankSum=-1.170;SC=GAATCAGGGGGGTCCACCCCA;SOR=1.276;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=60;TCF=48;TCR=12;TR=27;WE=119925472;WS=119925449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,28:0.44:63
chr1	119927680	rs6667679	A	G	1811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.382;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=60;PP=1317;ReadPosRankSum=-0.932;SC=TAAAAAGGTAAGAAAGATACC;SOR=1.091;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=234;TCF=62;TCR=172;TR=77;WE=119927688;WS=119927670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,81:0.34:241
chr1	119935400	rs193128553	C	T	1576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=41;PP=1166;ReadPosRankSum=-0.681;SC=AGACCCTTTCCTGATGTGGTA;SOR=0.658;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=25;TCR=63;TR=57;WE=119935408;WS=119935390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,61:0.66:93
chr1	119935507	rs10802092	A	T	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=120;ReadPosRankSum=1.238;SC=AAGATCATTGACAGCTCTGGG;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=7;WE=119935515;WS=119935497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr1	119936263	rs3765949	G	A	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=6.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=2;PP=568;ReadPosRankSum=-0.063;SC=ACAGAATTACGTTATTCATTC;SOR=0.633;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=89;TCF=83;TCR=6;TR=31;WE=119936271;WS=119936253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,32:0.36:90
chr1	119962319	rs36022499	T	A	2701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.864;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=75;PP=2180;ReadPosRankSum=-0.300;SC=CTTGGCCAAGTGCCTTTGCTG;SOR=0.840;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=138;TCF=24;TCR=114;TR=90;WE=119962327;WS=119962309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,93:0.66:141
chr1	120057158	rs6203	C	T	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.899;NF=13;NR=52;PP=1207;ReadPosRankSum=1.045;SC=TCAGCGAGATCTGGCGTATAA;SOR=0.625;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=200;TCF=37;TCR=163;TR=65;WE=120057166;WS=120057148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,69:0.33:212
chr1	120057246	rs1047303	C	A	1935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=55;PP=1587;SC=CACAAGGAGACCCTGAAGTCC;SOR=5.926;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=58;TCF=2;TCR=56;TR=57;WE=120057254;WS=120057236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	120165826	rs12076924	C	T	8027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.96;NF=109;NR=146;PP=2965;SC=CACAGCCGTGCGGCTTCTCGC;SOR=1.019;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=255;TCF=109;TCR=146;TR=255;WE=120165834;WS=120165816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr1	120166681	rs12067843	G	A	7575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=124;PP=2965;SC=CAGCTACACCGGATTGGTCAT;SOR=0.876;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=226;TCF=102;TCR=124;TR=226;WE=120166689;WS=120166671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr1	120263643	rs550174	T	C	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=2;PP=920;ReadPosRankSum=0.779;SC=CTAGTGAGTATACCAAAGATA;SOR=0.560;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=70;TCF=68;TCR=2;TR=41;WE=120263651;WS=120263633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,40:0.57:70
chr1	120267505	rs483180	C	G	1451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=38;PP=1143;ReadPosRankSum=1.135;SC=AAAGGTGCATCAAAACTAGGA;SOR=0.671;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=156;TCF=60;TCR=96;TR=61;WE=120267513;WS=120267495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,62:0.40:156
chr1	120267597	rs3838425	GC	G	649.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.902;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=589;ReadPosRankSum=-0.946;SC=GAGTGTGGGTGCCTATATGTA;SOR=0.307;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=53;TCF=8;TCR=45;TR=19;WE=120267605;WS=120267587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,23:0.40:58
chr1	120285546	rs543703	G	A	2460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.803;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=23;PP=1867;ReadPosRankSum=-0.463;SC=AAGGCACTACGCCTGTACTGC;SOR=0.960;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=120;TCF=86;TCR=34;TR=84;WE=120285554;WS=120285536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,88:0.71:124
chr1	120293352	rs667226	T	C	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.466;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=6;PP=757;ReadPosRankSum=0.460;SC=CCACCTTCTCTCTCTGTGTTG;SOR=1.198;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=74;TCF=59;TCR=15;TR=37;WE=120293360;WS=120293342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,38:0.49:77
chr1	120293367	rs667246	T	C	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=18;PP=1152;ReadPosRankSum=-1.330;SC=GTGTTGTTACTCAGAGGAAGA;SOR=0.743;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=99;TCF=67;TCR=32;TR=58;WE=120293375;WS=120293357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,60:0.58:103
chr1	120293568	rs668156	G	A	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.641;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=486;ReadPosRankSum=-2.423;SC=CTCACAAAGAGTTATATGAGT;SOR=0.372;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=48;TCF=13;TCR=35;TR=24;WE=120293576;WS=120293558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr1	120296033	.	AAC	A	703.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.73;QD=26.06;SOR=5.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	120336785	rs1052972	C	T	2317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=38;PP=1785;ReadPosRankSum=0.515;SC=TAAACCTTCCCATGGCCAAAG;SOR=0.713;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=122;TCF=65;TCR=57;TR=83;WE=120336793;WS=120336775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,85:0.68:125
chr1	120336876	rs699778	T	G	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=508;ReadPosRankSum=-1.015;SC=GCTGAAGGGGTCTAGAAGCTT;SOR=0.573;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=56;TCF=8;TCR=48;TR=23;WE=120336884;WS=120336866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
chr1	120337384	rs947270	T	C	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=277;ReadPosRankSum=1.429;SC=GGTGTTTTTCTTGGAAGCATA;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=14;WE=120337392;WS=120337374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr1	120337403	rs947271	A	G	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=275;ReadPosRankSum=0.213;SC=TAGATAAGGCAATATGATGGT;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=13;WE=120337411;WS=120337393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr1	120341256	rs71672737	G	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.409;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=273;ReadPosRankSum=-1.067;SC=GAAGTGTACAGCTCAGCAACC;SOR=0.223;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=16;WE=120341264;WS=120341246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr1	120378678	rs3009182	C	T	2064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=26;PP=1725;SC=TGGCTACATCCTGAGCAGAGC;SOR=1.044;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=35;TCR=26;TR=61;WE=120378686;WS=120378668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	120380008	rs3009184	T	A	1715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=45;PP=1400;SC=GAAGAGCAGGTCATATTATGC;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=50;WE=120380016;WS=120379998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	120381686	rs5777416	G	GT,GTGTGAGTCA	2403.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=1;PP=2900;SC=GTGATTATATGGAGCACCTAG;SOR=6.229;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=27;WE=120381695;WS=120381681;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:45
chr1	120381687	.	G	C	752	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=53.08;NF=26;NR=1;PP=752;QD=29.1396745388;SC=TGATTATATGGAGCACCTAGC;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=27;WE=120381695;WS=120381681;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:23,27:0.54:50
chr1	120381687	rs34302627	G	GTGAGTCAC	2403.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.03;QD=53.42;SOR=6.229;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	120384205	rs2994820	A	G	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=29;PP=869;SC=CCTGAGAGTGAACCAGGACTT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=120384213;WS=120384195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	120387120	rs12405228	G	A	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=23;PP=692;SC=TGGCAGAAGAGGTGGAGCCAG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=120387128;WS=120387110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	120458270	rs75831573	G	C	2195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=49;PP=1761;ReadPosRankSum=0.180;SC=TCCTGCTGGGGCATCATGGCA;SOR=0.696;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=227;TCF=104;TCR=123;TR=91;WE=120458278;WS=120458260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,90:0.39:229
chr1	120467876	rs41302079	G	A	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.83;ReadPosRankSum=1.545;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr1	120478285	rs5025718	T	C	2159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=54;PP=1503;SC=AAACAGACCATGAGAGCTAGT;SOR=1.795;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=23;TCR=54;TR=77;WE=120478293;WS=120478275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	120480394	rs2453057	T	C	280.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=207;SC=TCCCTCTTATTCCACAAAAAA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=120480402;WS=120480390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	120512104	rs2493409	T	C	1685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=2;PP=1520;SC=GCCCCTTCCCTGTTTCTAGAT;SOR=5.630;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=54;TCF=51;TCR=3;TR=53;WE=120512112;WS=120512094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	120534260	.	A	G	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.29;MQRankSum=-1.383;QD=12.44;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr1	120539331	rs2124109	C	T	1632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQRankSum=-6.816;QD=4.51;ReadPosRankSum=-1.331;SOR=0.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:270,92:0.25:362
chr1	120611554	rs75248693	TT	CG	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.06;MQRankSum=-4.632;QD=2.78;ReadPosRankSum=0.739;SOR=0.664;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,15:0.12:126
chr1	120611758	rs61790276	G	A	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQRankSum=-0.908;QD=2.52;ReadPosRankSum=1.397;SOR=0.398;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,14:0.17:84
chr1	120611830	rs61790277	G	A	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.726;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.213;NF=6;NR=6;PP=108;ReadPosRankSum=-0.905;SC=GAGTGGCCTCGCTCCGCGCCG;SOR=0.320;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=12;WE=120611838;WS=120611820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,8:0.22:37
chr1	120611876	rs11801062	C	T	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=14.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.68;MQRankSum=0.881;QD=3.81;ReadPosRankSum=-1.703;SOR=3.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr1	120611964	rs11810554	G	C	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.337;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.504;NF=6;NR=6;PP=124;ReadPosRankSum=-1.267;SC=CGGGGGCCGCGCAGCACAGCC;SOR=0.399;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=12;WE=120611972;WS=120611954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,12:0.27:44
chr1	120612006	rs4021006	G	A	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQRankSum=1.488;QD=1.26;ReadPosRankSum=1.974;SOR=0.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,7:0.14:49
chr1	120612040	.	T	TCCTCCGCCG	1092	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MMLQ=23;MQ=50.3;NF=6;NR=5;PP=1092;QD=100.363636364;SC=CGCCTCCTCCTCCGCCGCCGC;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=42;TCF=18;TCR=24;TR=11;WE=120612053;WS=120612027;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:31,11:0.26:42
chr1	120612154	rs56375229	C	G	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.14;MQRankSum=-1.778;QD=5.83;ReadPosRankSum=-0.135;SOR=0.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,9:0.21:42
chr1	120612163	rs55899574	C	A	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.02;MQRankSum=-2.416;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.909;SOR=0.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,9:0.20:44
chr1	121115761	rs150166046	T	G	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.26;MQRankSum=0.180;QD=11.35;ReadPosRankSum=-0.405;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr1	121116647	rs2772072	T	A	538.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-5.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.853;HP=9;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-5.542;NF=34;NR=1;PP=772;ReadPosRankSum=0.337;SC=AGCCCCCCTTTAAAAAAAAAG;SOR=1.118;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=95;TCF=91;TCR=4;TR=35;WE=121116655;WS=121116634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,31:0.33:93
chr1	121116678	rs61806689	C	T	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.11;MQRankSum=-0.466;QD=5.97;ReadPosRankSum=0.641;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,28:0.21:133
chr1	121116688	rs61806690	A	G	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=2.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.16;MQRankSum=-1.395;QD=6.46;ReadPosRankSum=-0.535;SOR=1.026;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,35:0.24:148
chr1	121116733	rs61806691	A	G	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=63.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.01;MQRankSum=-7.256;QD=2.62;ReadPosRankSum=0.316;SOR=3.596;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:148,33:0.18:181
chr1	121116933	rs79097880	T	C	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.320;NF=0;NR=8;PP=113;ReadPosRankSum=2.752;SC=ATTAGGAAGATAGCAGCCATG;SOR=0.075;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=8;WE=121116941;WS=121116923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr1	121116953	rs78187610	A	G	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.238;NF=0;NR=8;PP=129;ReadPosRankSum=-1.327;SC=GATCCATCAGAGTGCTTGCCA;SOR=0.157;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=8;WE=121116961;WS=121116943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr1	121306584	.	T	A	2363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DP=377;ExcessHet=3.0103;FS=0.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQRankSum=-1.148;QD=6.32;ReadPosRankSum=-0.647;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:265,109:0.29:374
chr1	121310385	rs146140447	A	C	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.091;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=194;ReadPosRankSum=1.812;SC=TTATGCATATAAGCTAACTTT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=9;WE=121310393;WS=121310375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr1	144013853	rs6600697	T	C	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=8;PP=1700;ReadPosRankSum=1.715;SC=TGCATGGTGGTTTATTTAGGG;SOR=0.625;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=129;TCF=104;TCR=25;TR=38;WE=144013873;WS=144013843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,41:0.30:135
chr1	144013865	rs6600696	T	G	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=12;PP=1700;ReadPosRankSum=0.964;SC=TATTTAGGGCTGTCTTTCTGA;SOR=0.633;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=115;TCR=38;TR=47;WE=144013873;WS=144013843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,51:0.32:160
chr1	144014051	rs1884147	G	A	1505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.621;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=47;PP=1026;ReadPosRankSum=0.567;SC=CTGGCAGAACGCTTCCTGGCC;SOR=0.763;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=177;TCF=51;TCR=126;TR=65;WE=144014059;WS=144014041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,69:0.38:182
chr1	144014068	rs1884146	T	C	2212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=68;PP=1523;ReadPosRankSum=-0.351;SC=GGCCAAGACATGCAGCACCAA;SOR=0.642;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=144;TCF=36;TCR=108;TR=92;WE=144014076;WS=144014058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,96:0.65:147
chr1	144854454	rs2274129	A	C	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.450;NF=1;NR=3;PP=62;ReadPosRankSum=-1.242;SC=TTCTCATCTGAAGCACAAGTG;SOR=1.609;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=4;WE=144854462;WS=144854444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr1	144854491	rs2798856	T	G	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.30;MQRankSum=1.054;QD=5.68;ReadPosRankSum=-0.264;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr1	144854497	rs2653676	A	G	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.88;MQRankSum=0.812;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.549;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,2:0.22:9
chr1	144854597	rs3851873	T	C	52.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr1	144854597	.	TC	CT	62	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;FR=0.5001;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MMLQ=30;MQ=57.9;NF=1;NR=1;PP=62;QD=57.7339374311;SC=TCTGAAGGAGTCGCTCCTGTT;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=2;WE=144854606;WS=144854587;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:1,2:0.67:3
chr1	144854598	rs3863691	C	T	52.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr1	144859720	rs678786	G	C	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=653;SC=GTGATCTCCCGACTGGCCAAG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=144859728;WS=144859710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	144860026	rs1699819	G	C	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.422;NF=4;NR=17;PP=422;ReadPosRankSum=-1.450;SC=TGGTAACATTGACCCAAGTAT;SOR=0.722;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=62;TCF=12;TCR=50;TR=21;WE=144860034;WS=144860016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,23:0.35:65
chr1	144865850	rs1613780	G	T	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.970;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.488;NF=21;NR=45;PP=1310;ReadPosRankSum=-0.790;SC=GTCTTCGATTGTCTTCCCTGA;SOR=1.348;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=142;TCF=57;TCR=85;TR=66;WE=144865858;WS=144865840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,63:0.44:143
chr1	144866509	rs924667	G	A	1386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.382;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.298;NF=53;NR=2;PP=1050;ReadPosRankSum=0.457;SC=CATAAGGAGCGAGTGAAGTAA;SOR=0.456;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=131;TCF=125;TCR=6;TR=55;WE=144866517;WS=144866499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,57:0.44:131
chr1	144866643	rs1620560	G	A	5685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=471;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.193;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=115;PP=2962;ReadPosRankSum=0.349;SC=TCCCGTAGGCGGTCATTGATG;SOR=0.501;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=465;TCF=219;TCR=246;TR=228;WE=144866651;WS=144866633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:240,230:0.49:470
chr1	144866662	rs1064044	T	C	5443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=448;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=124;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.562;SC=TGCAGATGGATTCCTCCAGGC;SOR=0.672;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=439;TCF=181;TCR=258;TR=212;WE=144866670;WS=144866652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:231,216:0.48:447
chr1	144868170	rs1628310	C	T	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-7.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=45;PP=1068;ReadPosRankSum=0.353;SC=ACAGTGCTGGCACCTGGGCAG;SOR=0.812;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=87;TCF=2;TCR=85;TR=46;WE=144868178;WS=144868160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,47:0.53:89
chr1	144868204	rs1747951	A	C	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=724;ReadPosRankSum=-0.235;SC=TAAGAAGCAAATGGGGTGTCA;SOR=0.659;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=27;WE=144868212;WS=144868194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr1	144871738	rs1698605	C	A	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.896;NF=20;NR=0;PP=434;ReadPosRankSum=1.873;SC=TCCTGCTGAGCCTCAGCCAAG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=20;WE=144871746;WS=144871728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr1	144871755	rs1778159	A	T	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.400;NF=22;NR=2;PP=471;ReadPosRankSum=0.899;SC=CAAGGAGACCACTGGTGTCTC;SOR=0.342;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=49;TCF=46;TCR=3;TR=24;WE=144871763;WS=144871745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr1	144871782	rs1778158	A	G	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.337;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.425;NF=31;NR=4;PP=739;ReadPosRankSum=0.705;SC=GCCAAGGAGGAGAGGGCCAGT;SOR=1.128;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=70;TCF=60;TCR=10;TR=35;WE=144871790;WS=144871772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,35:0.49:71
chr1	144871889	rs1698606	A	C	1916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.785;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=40;PP=1406;ReadPosRankSum=1.377;SC=AGCCTAGGAAAAGAAAGTTAA;SOR=0.888;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=150;TCF=74;TCR=76;TR=70;WE=144871897;WS=144871879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,76:0.47:160
chr1	144873794	.	C	T	328	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=16;NR=1;PP=328;QD=21.339483091;SC=CCCTAACAGTCCAAACCTCTG;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=17;WE=144873802;WS=144873793;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr1	144873818	rs1610566	A	G	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.99;MQRankSum=-1.155;NF=28;NR=1;PP=662;ReadPosRankSum=0.885;SC=TTGAAGAAAAATCAAACAGGC;SOR=0.115;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=69;TCF=68;TCR=1;TR=29;WE=144873826;WS=144873808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
chr1	144873840	rs1627335	A	G	1272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.781;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.628;NF=43;NR=2;PP=1047;ReadPosRankSum=-1.371;SC=GCAGAGAAAGAGGAGATGAAG;SOR=0.072;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=98;TCF=96;TCR=2;TR=45;WE=144873848;WS=144873830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,47:0.46:102
chr1	144873887	rs1699787	C	T	1898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.188;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.692;NF=58;NR=14;PP=1521;ReadPosRankSum=-0.415;SC=CTGAATGGGCCTGGTTGGCCT;SOR=0.265;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=169;TCF=144;TCR=25;TR=72;WE=144873895;WS=144873877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,75:0.43:175
chr1	144873962	rs11341221	CT	C	3621.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.443;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.250;NF=37;NR=57;PP=2966;ReadPosRankSum=-0.134;SC=CCTTAGCCCCCTGAGATGCAC;SOR=0.675;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=243;TCF=97;TCR=146;TR=94;WE=144873970;WS=144873952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,112:0.39:285
chr1	144874038	rs1419160	T	C	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.844;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.408;NF=7;NR=45;PP=1045;ReadPosRankSum=0.256;SC=ATCTATAAAATCCATGAATGA;SOR=0.806;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=153;TCF=23;TCR=130;TR=52;WE=144874046;WS=144874028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,55:0.34:163
chr1	144874070	rs1610565	C	T	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-7.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.149;NF=1;NR=39;PP=799;ReadPosRankSum=-1.543;SC=TGATGTTCTACAGAGAACTGG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=2;TCR=94;TR=40;WE=144874078;WS=144874060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,40:0.40:101
chr1	144874088	rs1419158	G	C	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.011;NF=1;NR=32;PP=691;ReadPosRankSum=-0.124;SC=TGGAATCCTGGCCTTATGTTT;SOR=0.844;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=73;TCF=2;TCR=71;TR=33;WE=144874096;WS=144874078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,33:0.43:77
chr1	144874641	rs1610771	G	C	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-4.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.337;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.818;NF=13;NR=1;PP=231;ReadPosRankSum=-0.823;SC=TCTCCACTCAGCCTAGACAAA;SOR=0.075;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=14;WE=144874649;WS=144874631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
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chr1	144874950	rs1747957	G	A	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=418;ReadPosRankSum=0.478;SC=GGTCACCGAAGCCAACCTGTC;SOR=0.784;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=47;TCF=8;TCR=39;TR=23;WE=144874958;WS=144874940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr1	144877176	rs2762875	C	T	1897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.214;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.966;NF=61;NR=7;PP=1512;ReadPosRankSum=0.852;SC=TTTTGCATGCCGGGTGATAAG;SOR=0.086;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=123;TCF=115;TCR=8;TR=68;WE=144877184;WS=144877166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,68:0.53:128
chr1	144877366	rs1807092	A	G	2449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.775;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.093;NF=14;NR=82;PP=1941;ReadPosRankSum=0.990;SC=CTATGAGAACATCTCTAAGGA;SOR=0.555;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=192;TCF=26;TCR=166;TR=96;WE=144877374;WS=144877356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,97:0.49:200
chr1	144877390	rs1807093	G	A	2156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.290;NF=1;NR=73;PP=1760;ReadPosRankSum=0.000;SC=CCCCCAAGCTGAATTCTGGCA;SOR=0.259;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=139;TCF=1;TCR=138;TR=74;WE=144877398;WS=144877380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,75:0.52:143
chr1	144879264	rs2798901	A	G	2325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.508;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.874;NF=58;NR=44;PP=1616;ReadPosRankSum=0.319;SC=CTCAGCTTCCAGGGTCTTTCC;SOR=0.914;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=248;TCF=134;TCR=114;TR=102;WE=144879272;WS=144879254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,108:0.43:252
chr1	144879375	rs1747958	T	C	2183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.216;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=42;PP=1702;ReadPosRankSum=0.459;SC=TTCAGATCTTTGATGTCCTTT;SOR=0.577;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=81;TCR=84;TR=84;WE=144879383;WS=144879365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,86:0.52:165
chr1	144881711	rs937714	T	G	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.037;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.138;NF=0;NR=22;PP=450;ReadPosRankSum=0.152;SC=CCTGTGGACTTTACTCAAGTC;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=2;TCR=47;TR=22;WE=144881719;WS=144881701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr1	144882581	rs1699836	A	G	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.377;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.567;NF=33;NR=21;PP=1094;ReadPosRankSum=-1.222;SC=TTATTCTTTCAATGGTGCTGG;SOR=1.077;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=116;TCF=62;TCR=54;TR=54;WE=144882589;WS=144882571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,53:0.45:119
chr1	144882823	rs1698647	C	T	4867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=424;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.614;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=129;PP=2962;ReadPosRankSum=1.355;SC=TCAGACATTGCTTCTCCCATC;SOR=0.872;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=397;TCF=133;TCR=264;TR=188;WE=144882831;WS=144882813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:223,192:0.46:415
chr1	144882912	rs1698646	G	T	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.051;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=59;PP=1366;ReadPosRankSum=0.375;SC=TGAGGGCTAGGTCTGGTCCTC;SOR=1.417;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=128;TCF=3;TCR=125;TR=60;WE=144882920;WS=144882902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,61:0.46:132
chr1	144886063	rs1625285	T	C	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=546;ReadPosRankSum=-0.796;SC=CCTCATGACCTGCAAGCTCCC;SOR=0.784;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=26;WE=144886071;WS=144886053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr1	144886092	rs1343472	C	T	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=663;ReadPosRankSum=0.868;SC=GGAAGAATGTCCTACCTGATG;SOR=0.624;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=34;WE=144886100;WS=144886082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,36:0.49:74
chr1	144886197	rs1698624	A	T	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=799;ReadPosRankSum=0.367;SC=TGCTGGTGGAACTCAGCCCTC;SOR=0.728;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=91;TCF=52;TCR=39;TR=35;WE=144886205;WS=144886187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,37:0.38:98
chr1	144886409	rs1620507	A	C	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=267;ReadPosRankSum=-1.342;SC=AGGCAGTTTTAAATGAGAACA;SOR=0.404;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=12;WE=144886417;WS=144886399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr1	144890833	rs11447	T	C	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.521;NF=43;NR=1;PP=1049;ReadPosRankSum=0.010;SC=CTTGTTAACTTATAATTACAC;SOR=0.897;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=81;TCF=79;TCR=2;TR=44;WE=144890841;WS=144890823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,47:0.55:86
chr1	144892089	rs1614098	G	T	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-2.194;NF=7;NR=1;PP=118;ReadPosRankSum=-1.092;SC=TCCCAAGCAGGTCCTCCGCCC;SOR=0.536;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=8;WE=144892097;WS=144892079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr1	144892149	rs1698709	G	A	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.031;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.756;NF=14;NR=4;PP=309;ReadPosRankSum=-0.282;SC=TCTGTGGTGCGTTTCAGTTAC;SOR=1.301;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=18;WE=144892157;WS=144892139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,21:0.35:60
chr1	144909956	rs638260	G	A	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.644;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=266;ReadPosRankSum=0.833;SC=CTGTGTCCAAGTCTCCTAAAA;SOR=1.112;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=15;WE=144909964;WS=144909946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr1	144910082	rs638780	A	G	2246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=49;PP=1800;SC=CATACACACAAGTTGTTCTTT;SOR=2.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=15;TCR=49;TR=64;WE=144910090;WS=144910072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	144912153	rs1628172	A	G	1063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=20;PP=928;SC=TTTCCAAGACAGCCAGTGGGG;SOR=1.002;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=16;TCR=20;TR=36;WE=144912161;WS=144912143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	144912233	rs1629011	C	T	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.209;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.259;NF=13;NR=5;PP=334;ReadPosRankSum=-1.194;SC=TAAATATTGGCGCAGGGCCTG;SOR=0.914;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=46;TCF=31;TCR=15;TR=18;WE=144912241;WS=144912223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,18:0.38:48
chr1	144915561	rs1778111	G	A	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.328;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.699;NF=10;NR=41;PP=1000;ReadPosRankSum=1.594;SC=CTTTCCTTTCGCTGTAGACGC;SOR=1.192;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=93;TCF=21;TCR=72;TR=51;WE=144915569;WS=144915551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,50:0.54:93
chr1	144915624	rs1778112	G	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.157;NF=0;NR=14;PP=277;ReadPosRankSum=0.024;SC=TTGCAGAGCAGTGTTGCACTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=14;WE=144915632;WS=144915614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr1	144916676	rs1698683	C	T	1939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=43;PP=1567;ReadPosRankSum=-0.504;SC=TTCTTTCAGCCACTGGAGGTT;SOR=0.707;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=180;TCF=87;TCR=93;TR=83;WE=144916684;WS=144916666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,81:0.45:182
chr1	144916748	rs1747930	C	G	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.126;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=36;PP=860;ReadPosRankSum=0.697;SC=ACTCTCCATACTCTACAGCCA;SOR=0.460;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=103;TCF=18;TCR=85;TR=45;WE=144916756;WS=144916738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,47:0.44:106
chr1	144917546	rs1698682	A	G	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.703;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=37;PP=1138;ReadPosRankSum=0.455;SC=AGTCTCTCTAAGTCATGATCT;SOR=1.070;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=104;TCF=35;TCR=69;TR=53;WE=144917554;WS=144917536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,55:0.51:107
chr1	144917827	rs11295415	CA	C	972.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.462;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.492;NF=35;NR=0;PP=2287;ReadPosRankSum=-0.316;SC=ACCTCCAGAGCAACAGCTTTA;SOR=3.078;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=66;TCR=3;TR=35;WE=144917849;WS=144917817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,32:0.51:63
chr1	144917841	rs1698681	T	C	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.274;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.668;NF=38;NR=1;PP=2301;ReadPosRankSum=-0.824;SC=AGCTTTATCATGTATTCGCTG;SOR=1.445;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=70;TCF=67;TCR=3;TR=39;WE=144917849;WS=144917817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,36:0.54:67
chr1	144918034	rs2655804	A	G	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.757;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=305;ReadPosRankSum=0.133;SC=AGATGTGATCACTCTCCTCAA;SOR=0.114;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=15;WE=144918042;WS=144918024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr1	144918957	rs1061308	T	A	3611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.410;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.819;NF=77;NR=69;PP=2469;ReadPosRankSum=-1.222;SC=ATTCTGCAATTCTTCTTGTAG;SOR=0.657;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=299;TCF=161;TCR=138;TR=146;WE=144918965;WS=144918947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,156:0.50:313
chr1	144919008	rs11296953	AC	A	3246.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.492;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.644;NF=19;NR=73;PP=2948;ReadPosRankSum=1.313;SC=TAAACATATTACCTTTTTAAA;SOR=0.760;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=208;TCF=45;TCR=163;TR=92;WE=144919016;WS=144918998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,112:0.45:248
chr1	144919094	rs1698680	C	T	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-6.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=34;PP=710;ReadPosRankSum=0.206;SC=GAAAGAGGAGCAGAGGGTGCC;SOR=1.262;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=82;TCF=1;TCR=81;TR=34;WE=144919102;WS=144919084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,38:0.44:87
chr1	144922109	rs1343469	A	G	7063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=9.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=529;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.546;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=162;NR=88;PP=2962;ReadPosRankSum=0.135;SC=CACAAAGACTAAAAATAAAAT;SOR=0.900;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=515;TCF=323;TCR=192;TR=250;WE=144922117;WS=144922099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:266,260:0.49:526
chr1	144922171	rs1343470	C	T	8171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=656;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.894;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=165;NR=149;PP=2962;ReadPosRankSum=0.004;SC=TCCTGTCCTACGTGACCCTCA;SOR=0.656;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=624;TCF=308;TCR=316;TR=314;WE=144922179;WS=144922161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:317,328:0.51:645
chr1	144922523	rs2455994	C	T	4765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=406;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.623;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=133;NR=58;PP=2962;ReadPosRankSum=0.480;SC=TGTTACCTCACGTTCCCTGCT;SOR=0.887;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=399;TCF=267;TCR=132;TR=191;WE=144922531;WS=144922513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,193:0.48:401
chr1	144922583	rs1359300	G	A	5291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=453;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.779;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=126;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.392;SC=CTTTTGAGACGACTCCTGAGC;SOR=0.830;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=432;TCF=173;TCR=259;TR=206;WE=144922591;WS=144922573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:232,212:0.48:444
chr1	144923823	rs11268079	TAGGAAGAAACGGCA	T	9463.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=111;PP=2957;SC=AGTCATGGGCTAGGAAGAAAC;SOR=2.049;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=161;TCF=30;TCR=131;TR=133;WE=144923844;WS=144923813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr1	144923887	rs12140706	T	A	1236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.421;HP=9;HapScore=1;MGOF=130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.698;NF=3;NR=52;PP=936;ReadPosRankSum=-1.192;SC=GCCAACAAAATTTTTTTTTTG;SOR=1.662;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=169;TCF=18;TCR=151;TR=55;WE=144923895;WS=144923876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,56:0.34:167
chr1	144930571	rs2762866	C	A	1326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.063;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=13;PP=1017;ReadPosRankSum=-0.391;SC=CACTATGTAGCCGTTTTGTAT;SOR=0.428;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=89;TCF=68;TCR=21;TR=50;WE=144930579;WS=144930561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,52:0.57:91
chr1	144930596	rs2762867	C	A	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.734;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=19;PP=1334;ReadPosRankSum=0.881;SC=GGACCCGGAGCGGCAAATAAT;SOR=0.836;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=117;TCF=81;TCR=36;TR=64;WE=144930604;WS=144930586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,67:0.55:122
chr1	144930940	rs2147326	T	C	4119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.127;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=105;PP=2962;ReadPosRankSum=0.478;SC=TCCTCATCTTTCTGTTGTGGA;SOR=0.566;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=295;TCF=84;TCR=211;TR=148;WE=144930948;WS=144930930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,157:0.51:308
chr1	144931330	rs2762745	C	T	4923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-7.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=400;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.183;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=114;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.441;SC=TGGAGCAGTGCAGAGTATCTC;SOR=0.489;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=386;TCF=150;TCR=236;TR=195;WE=144931338;WS=144931320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,198:0.50:396
chr1	144931392	rs2798893	G	A	2967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.763;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=78;PP=2454;ReadPosRankSum=-0.311;SC=CTTGATCTCCGCGCCAGAGTC;SOR=0.895;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=267;TCF=101;TCR=166;TR=121;WE=144931400;WS=144931382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,121:0.45:271
chr1	144931727	rs2985363	G	A	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=30;PP=672;ReadPosRankSum=-0.723;SC=CTAGCGGGTGGCAAGCTTCCC;SOR=0.412;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=58;TCF=3;TCR=55;TR=32;WE=144931735;WS=144931717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr1	144946510	rs2488977	C	T	3652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=3;PP=2965;SC=TTTAAACTGCCAAGTTTGTAG;SOR=6.518;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=101;TCR=3;TR=103;WE=144946518;WS=144946500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	144946768	rs2762733	G	A	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=58;PP=1264;ReadPosRankSum=0.520;SC=AGTAAGGACAGTAATTATGAT;SOR=0.596;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=121;TCF=10;TCR=111;TR=64;WE=144946776;WS=144946758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,65:0.52:126
chr1	144946876	rs2798887	C	T	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.57;ReadPosRankSum=1.024;SOR=0.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr1	144951973	rs77471170	T	C	2561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.653;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.926;NF=84;NR=29;PP=2474;ReadPosRankSum=0.929;SC=TAAGTGAATCTATGTCTCTTG;SOR=1.162;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=187;TCF=137;TCR=50;TR=113;WE=144951981;WS=144951963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,97:0.58:168
chr1	144952078	rs71220421	C	A	1410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.363;NF=45;NR=43;PP=1478;ReadPosRankSum=0.310;SC=CGGTTGTGGGCCCATAAAGTC;SOR=0.619;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=292;TCF=151;TCR=141;TR=88;WE=144952086;WS=144952068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,71:0.29:243
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chr1	144994902	rs4649499	G	A	2342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.78;ReadPosRankSum=1.423;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:294,111:0.27:405
chr1	145014103	rs1778711	G	C	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.432;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=13;PP=887;ReadPosRankSum=1.302;SC=CAGGCTGGCTGGCCTTTGGAG;SOR=0.105;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=114;TCF=94;TCR=20;TR=47;WE=145014111;WS=145014093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,48:0.41:118
chr1	145014186	.	G	GAAA	1329.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.000;DP=324;ExcessHet=3.0103;FS=0.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-2.915;QD=4.94;ReadPosRankSum=-0.978;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:211,58:0.22:269
chr1	145014210	rs1778710	G	A	3319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=3.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.01;MQRankSum=2.241;QD=7.81;ReadPosRankSum=0.546;SOR=1.044;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:309,116:0.27:425
chr1	145014218	rs1778709	G	A	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=1.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.01;MQRankSum=2.784;QD=2.38;ReadPosRankSum=-0.350;SOR=0.921;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:399,84:0.17:483
chr1	145014263	rs1778708	C	T	5390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=598;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.144;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.754;NF=140;NR=90;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.486;SC=CACAGCTGTTCGGAGGTTTAG;SOR=0.794;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=586;TCF=344;TCR=242;TR=230;WE=145014271;WS=145014253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:357,233:0.39:590
chr1	145014394	rs1107089	C	T	2466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=6.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.977;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=69;PP=1483;ReadPosRankSum=-0.799;SC=CTTAGGCACACGTTATATGGT;SOR=0.431;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=202;TCF=19;TCR=183;TR=77;WE=145014402;WS=145014384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,78:0.37:213
chr1	145014411	rs1778707	T	C	2079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.717;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=57;PP=1281;ReadPosRankSum=1.220;SC=TGGTGCATATTCTTTGCCCAC;SOR=1.404;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=152;TCF=2;TCR=150;TR=57;WE=145014419;WS=145014401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,58:0.36:160
chr1	145015792	rs202245925	T	C	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=1.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.04;ReadPosRankSum=0.033;SOR=0.973;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:174,24:0.12:198
chr1	145015877	rs77741369	G	T	1449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=2.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.73;ReadPosRankSum=-0.378;SOR=0.521;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:433,99:0.19:532
chr1	145016020	rs657162	T	G	12328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=290;PP=2965;SC=AGCTGTCAATTAAACAGAACA;SOR=2.651;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=368;TCF=76;TCR=292;TR=366;WE=145016043;WS=145016010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,373:1.00:373
chr1	145016035	rs80291027	A	C	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FS=3.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.33;ReadPosRankSum=0.292;SOR=0.367;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:249,61:0.20:310
chr1	145017784	rs11300211	CT	C	91.37	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.98;MQRankSum=0.210;QD=15.23;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr1	145018023	rs2799192	G	T	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.836;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.361;NF=10;NR=24;PP=662;ReadPosRankSum=-0.641;SC=AGAAAAAATTGGAAGACAGGG;SOR=0.911;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=95;TCF=30;TCR=65;TR=34;WE=145018031;WS=145018013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,34:0.36:95
chr1	145018102	.	G	GAGAA	94.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=5.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.79;MQRankSum=4.215;QD=2.43;ReadPosRankSum=-0.721;SOR=0.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,6:0.15:39
chr1	145021024	rs1778692	G	C	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-8.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.345;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=4;PP=693;ReadPosRankSum=-0.228;SC=TCCATAGTGAGAGAGTGAGAC;SOR=0.406;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=144;TCF=134;TCR=10;TR=49;WE=145021042;WS=145021014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,50:0.34:148
chr1	145021034	rs674066	C	A	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.66;ReadPosRankSum=-0.207;SOR=0.363;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,19:0.11:168
chr1	145021089	rs1613515	G	A	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=467;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.49;ReadPosRankSum=-0.649;SOR=0.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:408,51:0.11:459
chr1	145021265	rs673110	A	G	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FS=2.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.37;ReadPosRankSum=1.570;SOR=1.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:227,26:0.10:253
chr1	145038736	rs1663882	C	G	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.014;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=2;PP=360;ReadPosRankSum=-1.449;SC=GTGTTTGTACCGTCTTCACTC;SOR=0.019;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=72;TCF=70;TCR=2;TR=26;WE=145038744;WS=145038726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,29:0.38:77
chr1	145038815	rs2442664	A	G	5788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=62;PP=2965;SC=AGATGGAAGCATATCTGTTAT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=192;TCF=129;TCR=63;TR=191;WE=145038823;WS=145038805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr1	145038952	rs1663881	C	T	1953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.512;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=45;PP=1549;ReadPosRankSum=-0.126;SC=TAAAGTGTGTCTGGGGGAAGG;SOR=0.285;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=254;TCF=106;TCR=148;TR=89;WE=145038960;WS=145038942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,88:0.34:256
chr1	145039026	rs1663880	T	C	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=2.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.76;ReadPosRankSum=-0.124;SOR=0.347;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,32:0.25:129
chr1	145039562	rs1663878	C	T	2891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=31;PP=2224;ReadPosRankSum=1.748;SC=AAGTCTGGAGCGCGGCGAGAA;SOR=0.662;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=293;TCF=222;TCR=71;TR=121;WE=145039574;WS=145039552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,124:0.42:294
chr1	145039566	.	G	T	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.160;ClippingRankSum=0.000;DP=320;ExcessHet=3.0103;FS=2.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.179;SOR=0.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:258,61:0.19:319
chr1	145039633	rs2762750	C	T	1613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.11;ReadPosRankSum=1.308;SOR=0.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:420,99:0.19:519
chr1	145074882	rs3845334	G	T	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.15;ReadPosRankSum=-1.577;SOR=0.441;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,7:0.13:52
chr1	145074919	rs2289798	A	G	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=2.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.46;ReadPosRankSum=-1.067;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,19:0.22:87
chr1	145074939	rs1663854	T	C	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.716;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=646;ReadPosRankSum=0.488;SC=TTTATGTTACTGCTGCTACAC;SOR=0.970;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=112;TCF=76;TCR=36;TR=40;WE=145074947;WS=145074929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,39:0.34:115
chr1	145075208	rs6424335	T	A	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.39;ReadPosRankSum=0.081;SOR=0.290;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,10:0.12:85
chr1	145075519	rs2596337	G	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.537;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=95;ReadPosRankSum=0.363;SC=TCTTCAGTCCGGGGCCCCAGC;SOR=0.157;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=8;WE=145075527;WS=145075509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr1	145075683	rs2762779	C	T	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=21;PP=930;ReadPosRankSum=-0.338;SC=CCGCTGCTGCCCAGCTCCCGG;SOR=0.668;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=85;TCR=54;TR=54;WE=145075691;WS=145075673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,54:0.38:141
chr1	145075854	rs1663853	G	C	1993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.065;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=43;PP=1459;ReadPosRankSum=1.071;SC=CGCTGTCTGTGCCCTTCATGG;SOR=0.612;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=219;TCF=97;TCR=122;TR=81;WE=145075862;WS=145075844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,85:0.38:222
chr1	145075903	rs2596336	C	T	1306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.628;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=35;PP=923;ReadPosRankSum=0.700;SC=AGCTACGGTTCCTGCTTGTTT;SOR=0.612;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=177;TCF=57;TCR=120;TR=53;WE=145075911;WS=145075893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,57:0.31:183
chr1	145075923	rs6656135	C	T	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=2.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.40;ReadPosRankSum=-1.619;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,30:0.18:166
chr1	145103844	rs2590144	G	A	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.807;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:160,59:0.27:219
chr1	145103928	rs2596251	G	A	2089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=410;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.21;ReadPosRankSum=-0.961;SOR=0.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:296,105:0.26:401
chr1	145103947	rs2794062	T	C	2345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=421;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.69;ReadPosRankSum=0.353;SOR=0.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:299,113:0.27:412
chr1	145104035	rs368277598	T	G	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=2.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=-0.571;QD=5.12;ReadPosRankSum=-0.206;SOR=1.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:169,57:0.25:226
chr1	145104052	.	AGT	A	1223.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.537;ClippingRankSum=0.000;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=14.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=1.710;QD=8.10;ReadPosRankSum=1.363;SOR=0.070;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,39:0.26:151
chr1	145104075	rs4145928	G	A	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-7.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=39;PP=661;ReadPosRankSum=-0.567;SC=GTAACAGAATGCCTGATAAAA;SOR=0.173;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=128;TCF=0;TCR=128;TR=39;WE=145104083;WS=145104065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,39:0.30:130
chr1	145109430	rs2442653	A	T	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.728;SOR=0.401;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,38:0.26:149
chr1	145109468	rs2442652	A	G	10364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=250;NR=24;PP=2965;SC=GCTTTAAACTATTGTCAGTGC;SOR=4.553;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=274;TCF=250;TCR=24;TR=274;WE=145109476;WS=145109446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr1	145109493	rs2442651	C	T	2004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FS=6.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.13;ReadPosRankSum=-2.619;SOR=0.381;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:287,104:0.27:391
chr1	145109549	rs2596331	G	T	4431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=646;ExcessHet=3.0103;FS=3.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.87;ReadPosRankSum=1.457;SOR=0.969;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:449,196:0.30:645
chr1	145109583	rs2794053	C	A	8548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=10.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=837;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.160;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=224;NR=117;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.779;SC=TTCCCTAAGACGTTGGCTTTT;SOR=0.847;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=821;TCF=520;TCR=301;TR=341;WE=145109591;WS=145109573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:485,348:0.42:833
chr1	145109809	rs2596327	T	A	1341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-8.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.089;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=57;PP=1010;ReadPosRankSum=0.746;SC=TAGCTTCTGCTTCCTTTTCCA;SOR=1.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=184;TCF=4;TCR=180;TR=57;WE=145109817;WS=145109799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,60:0.32:190
chr1	145112287	rs2794042	T	C	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.528;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=3;PP=670;ReadPosRankSum=0.419;SC=TGAGCCACCGTGCCTGGCCAA;SOR=0.259;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=141;TCF=134;TCR=7;TR=40;WE=145112295;WS=145112277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,39:0.27:145
chr1	145112313	rs2596302	T	C	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=9.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.33;ReadPosRankSum=-0.285;SOR=0.088;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:165,63:0.28:228
chr1	145112414	rs2590131	T	C	7128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=773;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.32;ReadPosRankSum=-1.256;SOR=0.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:550,215:0.28:765
chr1	145112428	rs2794040	C	T	7462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=868;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.836;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:624,235:0.27:859
chr1	145112485	rs2794039	C	T	4402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=784;ExcessHet=3.0103;FS=2.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.67;ReadPosRankSum=-0.704;SOR=0.944;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:567,209:0.27:776
chr1	145115658	.	TATTTTTAA	T	801.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.17;ReadPosRankSum=-0.290;SOR=0.298;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,29:0.19:155
chr1	145115810	rs2655557	A	G	4093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-7.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=571;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.886;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=88;PP=2544;ReadPosRankSum=-0.275;SC=TTGAACATGCATTCCACTTAT;SOR=0.713;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=542;TCF=267;TCR=275;TR=177;WE=145115828;WS=145115800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:385,181:0.32:566
chr1	145139088	rs150935736	C	CG	2785.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.08;QD=38.16;SOR=8.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	145209330	rs1738644	G	C	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.45;MQRankSum=1.100;QD=1.37;ReadPosRankSum=-0.501;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,10:0.17:59
chr1	145209612	.	GCCCCGCCAACCGCCGGGGTT	G	1187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.477;ClippingRankSum=0.000;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQRankSum=1.398;QD=23.29;ReadPosRankSum=-0.090;SOR=0.936;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,31:0.61:51
chr1	145248811	rs199902817	A	G	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.20;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr1	145273345	rs75987820	T	C	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=5.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQRankSum=-0.328;QD=0.17;ReadPosRankSum=-1.071;SOR=1.379;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:509,56:0.10:565
chr1	145273431	rs17421312	A	G	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=484;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.31;MQRankSum=-6.141;QD=3.18;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.637;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:385,98:0.20:483
chr1	145273473	rs202082259	T	C	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FS=3.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.43;MQRankSum=-5.241;QD=1.14;ReadPosRankSum=0.654;SOR=0.427;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:344,52:0.13:396
chr1	145281247	rs74721027	T	A	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.50;MQRankSum=-0.491;QD=1.28;ReadPosRankSum=0.727;SOR=0.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,4:0.17:24
chr1	145281361	rs147539840	TC	T	489.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FS=4.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.40;MQRankSum=-12.801;QD=1.55;ReadPosRankSum=0.552;SOR=1.350;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:276,40:0.13:316
chr1	145281408	rs201164506	C	T	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=497;ExcessHet=3.0103;FS=2.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.96;MQRankSum=-8.481;QD=0.64;ReadPosRankSum=0.477;SOR=0.962;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:438,59:0.12:497
chr1	145281543	rs8002	C	T	3866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=413;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.558;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.983;NF=62;NR=119;PP=2962;ReadPosRankSum=0.284;SC=CATGGTGGCACCTGCCTCAAC;SOR=0.666;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=479;TCF=164;TCR=315;TR=181;WE=145281551;WS=145281533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:254,159:0.38:413
chr1	145281613	rs12120756	C	A	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FS=7.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.02;MQRankSum=-0.215;QD=1.51;ReadPosRankSum=0.144;SOR=0.253;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:243,29:0.11:272
chr1	145281633	rs28576333	C	A	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=5.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.44;MQRankSum=-1.671;QD=2.46;ReadPosRankSum=-1.332;SOR=0.271;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:218,31:0.12:249
chr1	145281656	rs4649852	A	T	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=6.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.86;MQRankSum=-2.157;QD=2.01;ReadPosRankSum=0.657;SOR=1.452;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:165,23:0.12:188
chr1	145282093	rs199946317	G	A	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.32;MQRankSum=-8.819;QD=0.92;ReadPosRankSum=0.697;SOR=0.391;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:191,25:0.12:216
chr1	145456732	rs375314716	GA	G	402.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FS=4.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=3.710;QD=1.78;ReadPosRankSum=-0.895;SOR=0.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:171,55:0.24:226
chr1	145457555	.	C	T	1745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.470;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=1479;ReadPosRankSum=0.554;SC=CACGTTCCTTCTGTAGCTTCC;SOR=0.390;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=82;TCF=39;TCR=43;TR=64;WE=145457563;WS=145457545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,63:0.75:84
chr1	145517561	rs4471211	C	T	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=5.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=30;PP=739;ReadPosRankSum=1.193;SC=AGTAATTAGGCGGACTGGAGA;SOR=0.960;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=30;WE=145517569;WS=145517551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,33:0.73:45
chr1	145530254	rs74119688	C	T	2748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=51;PP=2241;SC=CTCAGTGTTCCCCTTCCTTCT;SOR=1.090;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=37;TCR=51;TR=88;WE=145530262;WS=145530244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr1	145531980	rs4384171	T	C	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=0;PP=562;SC=GGCAAGATGCTTGACCTCAGG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=145531988;WS=145531970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	145532010	.	C	CTG	591.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.81;MQRankSum=0.000;QD=22.76;ReadPosRankSum=1.448;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,23:0.88:26
chr1	145532052	rs28369274	A	G	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=10.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.82;MQRankSum=-3.786;QD=2.78;ReadPosRankSum=1.941;SOR=3.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,14:0.30:46
chr1	145532549	rs1328584	T	C	4174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=76;NR=56;PP=2965;SC=AGCGATTCTTTTTCAATGTCA;SOR=0.994;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=76;TCR=56;TR=132;WE=145532557;WS=145532539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr1	145532885	.	C	G	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.228;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.422;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=638;ReadPosRankSum=0.140;SC=CAGATAACTTCAACCACAGGG;SOR=1.445;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=26;WE=145532893;WS=145532875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr1	145532994	rs34834904	GT	G	1566.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.985;HP=8;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.082;NF=31;NR=5;PP=1675;ReadPosRankSum=0.088;SC=CTCCTGGAACGTTTTTTTTCT;SOR=1.656;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=63;TCF=49;TCR=14;TR=36;WE=145533009;WS=145532984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,40:0.65:62
chr1	145533001	rs35103913	T	C	1575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.838;HP=7;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.105;NF=33;NR=5;PP=1658;ReadPosRankSum=0.486;SC=AACGTTTTTTTTCTCTTTATT;SOR=1.565;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=61;TCF=50;TCR=11;TR=38;WE=145533009;WS=145532984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,40:0.63:63
chr1	145533175	rs11590105	T	C	2010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.062;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=41;PP=1593;ReadPosRankSum=-1.738;SC=CCCCCCTGCATTGCAGAACCA;SOR=1.140;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=95;TCF=40;TCR=55;TR=68;WE=145533183;WS=145533165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,70:0.71:98
chr1	145533314	rs2274619	T	C	2887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=26;PP=2324;ReadPosRankSum=-1.008;SC=TGACCTCTGGTTACTTCCCTT;SOR=0.657;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=166;TCF=125;TCR=41;TR=101;WE=145533322;WS=145533304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,104:0.60:172
chr1	145535818	rs199533163	G	A	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=7;PP=589;ReadPosRankSum=-0.417;SC=TGTAGGCGGCGAGGCCAAGAG;SOR=0.654;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=107;TCF=85;TCR=22;TR=35;WE=145535826;WS=145535808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,37:0.33:111
chr1	145535921	rs2274617	T	C	7285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.849;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=131;NR=86;PP=2965;ReadPosRankSum=1.368;SC=TAAAATGCATTACAGGCAACT;SOR=0.220;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=220;TCF=133;TCR=87;TR=217;WE=145535929;WS=145535911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,227:0.99:229
chr1	145538664	rs1109216	A	G	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=9;PP=848;SC=TGCTGATCATATGCCCCTGTG;SOR=2.073;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=36;WE=145538672;WS=145538654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	145555653	rs6424379	C	T	5338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=52;PP=2965;SC=CACACTACCCCCATGCCCTAT;SOR=1.552;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=102;TCR=52;TR=154;WE=145555661;WS=145555643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr1	145556986	rs56110740	C	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.229;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.990;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=133;ReadPosRankSum=-1.769;SC=GCCTTCCCTCCCTGTGAGTCA;SOR=0.048;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=7;WE=145556994;WS=145556976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	145558565	rs11801520	C	G	1127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=28;PP=883;SC=GGCTGCTGCTCTCTCTCAGCT;SOR=2.649;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=145558573;WS=145558555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	145558593	rs115170004	T	C	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=117;ReadPosRankSum=-1.582;SC=CCAACTTCCATGACCTAGGGC;SOR=0.458;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=8;WE=145558601;WS=145558583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr1	145558824	rs17352281	A	C	1988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.532;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=23;PP=1505;ReadPosRankSum=0.094;SC=CTCTTCCTACAATCTGTGCAG;SOR=0.442;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=117;TCF=82;TCR=35;TR=69;WE=145558832;WS=145558814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,76:0.60:127
chr1	145562087	rs41315701	G	A	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.387;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=838;ReadPosRankSum=-0.557;SC=CCTGGGGCTCGAGGAGAGCCT;SOR=0.768;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=132;TCF=69;TCR=63;TR=44;WE=145562095;WS=145562077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,48:0.34:143
chr1	145562293	rs11579366	G	C	5261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.328;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=89;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.873;SC=GCCCAAGCCAGAGGCGCAGGT;SOR=0.474;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=166;TCF=76;TCR=90;TR=164;WE=145562301;WS=145562283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,169:0.99:170
chr1	145585317	rs4128488	A	G	2049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=10;PP=1558;SC=TGGGGAAGTCAGGATTGAGAT;SOR=3.352;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=57;TCR=10;TR=67;WE=145585325;WS=145585307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	145588536	rs9286836	C	T	9121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=151;NR=132;PP=2965;SC=TTTGCTTGCCCCTCCCTCAGC;SOR=0.824;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=284;TCF=151;TCR=133;TR=283;WE=145588544;WS=145588526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr1	145597116	rs9728311	C	T	2179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=62;PP=1812;SC=TTCCCAGTCACAGATGGGGTG;SOR=4.174;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=7;TCR=62;TR=69;WE=145597124;WS=145597106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	145598459	rs9729715	T	C	4481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=38;PP=2965;SC=AGGAGGATGATACTAGGTATC;SOR=2.015;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=139;TCF=101;TCR=38;TR=138;WE=145598467;WS=145598449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	145601861	rs9286837	G	A	5182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=108;PP=2965;SC=GGCTGAGGAAGAGATTTAGAG;SOR=1.839;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=153;TCF=45;TCR=108;TR=153;WE=145601869;WS=145601851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr1	145826770	rs34955113	G	A	1271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=3;PP=1021;SC=CAGAGTGACTGGCGCAGGACG;SOR=4.461;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=36;WE=145826778;WS=145826760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	146514576	rs34026136	T	C	2109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.971;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.066;NF=41;NR=58;PP=1696;ReadPosRankSum=-0.776;SC=TAAGGCCTCATTGAGCCGACT;SOR=0.783;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=305;TCF=133;TCR=172;TR=99;WE=146514584;WS=146514566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,93:0.33:283
chr1	146633933	rs1036852	G	A	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=8;PP=884;ReadPosRankSum=-0.444;SC=CACCTCTGTAGTAATCCTAAC;SOR=0.550;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=70;TCF=58;TCR=12;TR=43;WE=146633941;WS=146633923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,44:0.62:71
chr1	146643555	rs1348316	A	G	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.388;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=553;ReadPosRankSum=2.119;SC=AACTGCGGGCATGGGACGCTT;SOR=1.315;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=52;TCF=21;TCR=31;TR=31;WE=146643563;WS=146643545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr1	146656292	rs4950385	A	G	1303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=35;PP=1012;SC=CATACTATCAATGTGACTTAT;SOR=3.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=41;WE=146656300;WS=146656282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	146672906	rs894469	C	T	4888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=87;NR=66;PP=2965;SC=CTTCCAGAAACGGAAAGTCAA;SOR=0.948;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=87;TCR=66;TR=153;WE=146672914;WS=146672896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr1	146673178	rs6683215	A	G	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=31;PP=976;SC=AGGTAAACAGAATGCCAATAA;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=146673186;WS=146673168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	146680262	rs2354433	A	G	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=514;SC=CCGCCTCCCAAAGTGCTGGGA;SOR=3.500;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=146680270;WS=146680252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	146684095	rs58351438	T	C	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.910;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=37;PP=960;ReadPosRankSum=0.684;SC=CCTTTGAACTTCTCAATTCCT;SOR=0.563;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=92;TCF=20;TCR=72;TR=48;WE=146684103;WS=146684085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,49:0.52:95
chr1	146685121	rs1530336	G	A	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=23;PP=642;SC=GATATCACAGGCACTATCACA;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=146685129;WS=146685111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	146687250	rs1822312	A	T	1512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=0;PP=1234;SC=AAGTAAACATAGGTAACTGAA;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=43;WE=146687258;WS=146687240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	146714255	rs1890040	A	G	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=51;ReadPosRankSum=1.732;SC=CGCCTCGCTCATAGGTGGGCC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=146714263;WS=146714245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr1	146714281	rs1890041	C	G	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=90;ReadPosRankSum=-0.443;SC=GCGCAGTCGCCCGCCCCCGCG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=7;WE=146714289;WS=146714271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr1	146714392	rs1890042	G	C,T	1297.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=10,21;NR=4,10;PP=188,699;SC=GGGGCCAAGCGCCTGGCTTCT;SOR=1.765;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=14,31;WE=146714400;WS=146714382;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.30,0.70:46
chr1	146714588	rs1890043	C	T	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.393;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=115;ReadPosRankSum=0.826;SC=GTTTACCCGCCCGCGCCAGGG;SOR=0.010;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=8;WE=146714596;WS=146714578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr1	146724093	rs1890037	A	G	1496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=25;PP=1360;SC=GAATAAGTCTACTCAAAAAGT;SOR=0.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=21;TCR=25;TR=46;WE=146724101;WS=146724083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	146727388	rs17160051	G	T	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=244;ReadPosRankSum=-1.323;SC=ATCCTCCCATGAAATGTAATT;SOR=1.863;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=11;WE=146727396;WS=146727378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr1	146728162	rs61409326	T	TA	2762.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=16;PP=2625;SC=CCAGCCTTTATACGTGTCTTC;SOR=2.537;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=65;TCF=47;TCR=18;TR=60;WE=146728170;WS=146728152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	146736092	rs4950315	C	T	1386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.998;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=14;PP=1104;ReadPosRankSum=0.785;SC=TCTCAGTAGTCTTCAGTCTCC;SOR=0.337;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=74;TCF=56;TCR=18;TR=51;WE=146736100;WS=146736082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,51:0.69:74
chr1	146739277	rs4143738	T	C	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=5.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.924;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=51;PP=1114;ReadPosRankSum=-1.312;SC=CTTACTTTGTTTACTTTGTTT;SOR=1.170;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=184;TCF=10;TCR=174;TR=52;WE=146739285;WS=146739267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,56:0.30:187
chr1	146740502	rs17356233	C	G	2106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.800;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=19;PP=1697;ReadPosRankSum=0.335;SC=GGAAGCTTCACCTGCTGGATA;SOR=0.859;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=80;TCR=30;TR=69;WE=146740510;WS=146740492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,73:0.62:118
chr1	146740576	rs11576360	G	A	4797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=84;PP=2965;SC=TGAGCTAATGGCTGTTAAAAC;SOR=0.998;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=67;TCR=84;TR=151;WE=146740584;WS=146740566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr1	146747153	rs6680778	T	C	3483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=85;PP=2913;SC=TTTTCTGCTTTCTTGGCTTGC;SOR=3.442;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=14;TCR=85;TR=99;WE=146747161;WS=146747143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
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chr1	146748008	rs3831929	CAGCCA	C	328.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.690;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.144;NF=1;NR=7;PP=371;ReadPosRankSum=-0.459;SC=CAGCACTCACCAGCCACTCTC;SOR=0.061;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=8;WE=146748020;WS=146747998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr1	146748072	rs7534963	A	G	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=5;PP=173;SC=AGTGCTGGCTATGTGCAGGGT;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=146748080;WS=146748062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	146751782	rs7547279	A	C	1285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=19;PP=970;ReadPosRankSum=0.340;SC=TGGAGTCCATACTGGGAGAAA;SOR=0.295;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=22;TCR=20;TR=41;WE=146751790;WS=146751772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr1	146756222	rs146052781	AAAAC	A	658.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=724;ReadPosRankSum=0.182;SC=CTCTCATTCTAAAACAAACAA;SOR=0.169;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=3;TCR=69;TR=19;WE=146756233;WS=146756212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,20:0.29:68
chr1	146759306	rs6703892	T	C	1271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=13;PP=985;ReadPosRankSum=-0.459;SC=TTCTCTTTCTTCAAACAGATG;SOR=0.759;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=85;TCF=62;TCR=23;TR=49;WE=146759314;WS=146759296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,50:0.57:87
chr1	146759528	rs12755465	A	G	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=394;ReadPosRankSum=1.048;SC=ACCAGTTGGGAACTGAATTCT;SOR=0.821;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=1;TCR=58;TR=20;WE=146759536;WS=146759518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,21:0.35:60
chr1	146763089	rs10900333	G	A	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=0.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.32;ReadPosRankSum=-0.839;SOR=0.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,38:0.26:145
chr1	146763415	rs3737854	T	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.765;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=135;ReadPosRankSum=-2.245;SC=TTCTGGAGGCTGAAAGTCCAA;SOR=0.091;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=49;TCF=2;TCR=47;TR=13;WE=146763423;WS=146763405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,13:0.24:55
chr1	146766069	rs71083827	C	CAT	2456.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=5;PP=2281;SC=TGAGTGAAGACGTGTTCTTCT;SOR=3.690;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=46;WE=146766077;WS=146766059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	146767149	rs4950394	G	T	1002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=11;PP=790;SC=TGTCCTTCATGCACAGTCTTC;SOR=1.044;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=29;WE=146767157;WS=146767139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	146767320	rs6537	A	G	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=47;ReadPosRankSum=-0.728;SC=CTGAGTTTCAATTTGGTTCTC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=146767328;WS=146767310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr1	147085066	rs35669952	G	A	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=37;PP=984;ReadPosRankSum=1.206;SC=TCTGACATTCGACAGAGGCCA;SOR=0.862;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=54;TCF=5;TCR=49;TR=41;WE=147085074;WS=147085056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,41:0.76:54
chr1	147086504	rs7512513	A	C	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=670;ReadPosRankSum=-1.403;SC=TTTTATTATCACCTAAAGTTA;SOR=0.538;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=28;WE=147086512;WS=147086494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,29:0.81:36
chr1	147087721	rs3737843	T	A	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=644;ReadPosRankSum=-1.363;SC=TTTCAGAAACTGAGTAATGGT;SOR=0.631;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=20;TCR=77;TR=33;WE=147087729;WS=147087711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,36:0.36:99
chr1	147091972	rs3820129	C	T	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.822;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=439;ReadPosRankSum=1.107;SC=CCACATGGAGCCTGGGAATAA;SOR=0.578;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=40;TCR=50;TR=27;WE=147091980;WS=147091962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,31:0.33:95
chr1	147096794	rs867270	A	G	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=33;PP=1012;SC=TCCTTGTCAAAATGAGATTCC;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=40;WE=147096802;WS=147096784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	147096828	rs946902	C	G	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=22;PP=640;SC=TGCTTTGAGGCAGTTCCAGGA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=147096836;WS=147096818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	147119273	rs1344	G	A	4275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=66;PP=2965;SC=AGCAGAGTGCGTGGTATTTTT;SOR=0.812;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=60;TCR=66;TR=126;WE=147119281;WS=147119263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	147121977	rs6593795	C	T	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=6;PP=1054;SC=GCAGAGTCCACGGCTTTCAGC;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=38;WE=147121985;WS=147121967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	147124310	rs2153463	T	G	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=17;PP=964;SC=TCGATCATCCTTGCAAATCTC;SOR=1.524;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=50;WE=147124318;WS=147124300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	147131465	rs6674938	T	C	1747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=4;PP=1433;SC=TATCCTCATGTTCAAGACCTT;SOR=4.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=49;TCR=4;TR=53;WE=147131473;WS=147131455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	147131501	rs34675044	A	T	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.496;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=367;ReadPosRankSum=-0.368;SC=TCCCCTTTCAAGTGACTCACA;SOR=0.266;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=73;TCF=59;TCR=14;TR=22;WE=147131509;WS=147131491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,22:0.30:74
chr1	147131945	rs2275552	T	C	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=487;SC=TTGAAATGTATAGCATTAACA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=147131953;WS=147131935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	147142296	rs2883202	T	C	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.526;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=168;ReadPosRankSum=-0.876;SC=CATCCAGCCCTTCAGCAAGCA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=8;WE=147142304;WS=147142286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr1	147230217	rs1692141	T	C	2084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=51;NR=11;PP=1697;SC=CACGTCTTTCTTCTCTGAGCC;SOR=3.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=51;TCR=11;TR=62;WE=147230225;WS=147230207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	147381444	rs1532399	A	C	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=301;ReadPosRankSum=1.642;SC=ATGAAAGGAAAAGGTGCCAAC;SOR=0.919;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=3;TCR=60;TR=17;WE=147381452;WS=147381434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,17:0.27:62
chr1	147400513	.	C	T	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.987;NF=14;NR=0;PP=279;ReadPosRankSum=-0.152;SC=CGCAGCTTGACGGCGTCGGGC;SOR=1.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=14;WE=147400521;WS=147400503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr1	147400824	.	A	C	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.496;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.047;NF=1;NR=26;PP=679;ReadPosRankSum=-0.047;SC=ACTCTGGCACACAGAGAGGGT;SOR=0.793;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=27;WE=147400832;WS=147400814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr1	147415585	rs142935665	T	C	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.00;MQRankSum=0.000;QD=15.61;ReadPosRankSum=1.483;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,33:0.67:49
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chr1	147806874	rs2999607	G	C	1733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.29;SOR=5.186;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	147806880	rs537191	T	C	1593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=53.13;SOR=4.548;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	149290881	rs144019609	C	T	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.14;MQRankSum=-0.152;QD=17.59;ReadPosRankSum=-1.850;SOR=0.936;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,38:0.64:59
chr1	149376972	rs199868473	C	T	31.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.34;MQRankSum=-0.967;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr1	149379694	rs79328769	C	T	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.276;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.578;NF=3;NR=7;PP=179;ReadPosRankSum=-0.185;SC=ACCTGGCGGCCGTCTGTGGAG;SOR=1.535;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=10;WE=149379702;WS=149379684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr1	149379780	rs79713217	C	T	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.150;NF=5;NR=5;PP=143;ReadPosRankSum=0.156;SC=GAGAGGAGGACTGGTAGATCA;SOR=0.735;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=10;WE=149379788;WS=149379770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr1	149676401	rs146138154	A	G	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.747;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.047;NF=9;NR=58;PP=1327;ReadPosRankSum=-1.561;SC=GCAGACAACCAGAGGGAGAGC;SOR=1.517;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=169;TCF=52;TCR=117;TR=67;WE=149676409;WS=149676391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,46:0.38:122
chr1	149676508	rs142083788	A	T	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.84;MQRankSum=-1.073;QD=3.33;ReadPosRankSum=0.709;SOR=0.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,9:0.20:45
chr1	149676532	rs138339323	A	G	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.78;MQRankSum=-1.650;QD=4.35;ReadPosRankSum=-0.027;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr1	149676574	rs149550720	G	C	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.838;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.56;ReadPosRankSum=0.017;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr1	149764429	rs371458276	CCGAGT	C	71.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.65;MQRankSum=1.036;QD=14.35;ReadPosRankSum=-1.036;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr1	149821912	rs138035086	CGGAG	C	2114.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=40;PP=2187;SC=CGGCGACCCGCGGAGGGAGGG;SOR=3.215;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=70;TCF=14;TCR=56;TR=47;WE=149821923;WS=149821902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	149881070	rs373763552	C	T	2105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=33;PP=1647;ReadPosRankSum=-0.338;SC=TCCCTGTGTCCGACTGGATCT;SOR=0.666;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=73;TCR=51;TR=79;WE=149881078;WS=149881060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,79:0.64:123
chr1	149881173	rs55909843	A	C	2987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.68;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	149881183	rs56351279	C	T	2773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.47;SOR=6.837;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	149900985	rs71664710	CA	C	80.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=23.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.98;ReadPosRankSum=1.323;SOR=4.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,17:0.21:82
chr1	149905279	rs72692821	G	A	2347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=18;PP=1903;SC=TGAGGGTTAGGGGTCAAAGGT;SOR=2.115;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=52;TCR=18;TR=70;WE=149905287;WS=149905269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	149908108	rs1868992	A	G	2873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=66;PP=2203;SC=CCGGCATCCTATTTTCCTGGA;SOR=2.662;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=17;TCR=66;TR=83;WE=149908116;WS=149908098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	149931541	rs4926400	G	A	1814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=3;PP=1602;ReadPosRankSum=1.588;SC=TAGACACTGGGCTGTGGAAGC;SOR=3.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=56;TCR=3;TR=58;WE=149931549;WS=149931531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr1	150049934	rs72692897	A	G	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.880;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=34;PP=698;ReadPosRankSum=-0.425;SC=GGAAGTAAAAACATGGTCCAT;SOR=1.211;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=92;TCF=5;TCR=87;TR=35;WE=150049942;WS=150049924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,35:0.37:95
chr1	150049982	rs72692898	C	T	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=303;ReadPosRankSum=0.679;SC=CTTGGTTTTGCTTTGTATTTC;SOR=0.080;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=15;WE=150049990;WS=150049972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr1	150122369	rs189274971	A	G	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=37;ReadPosRankSum=0.414;SC=CCCGCGGGGAAGGAGCCCCCG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=4;WE=150122377;WS=150122359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr1	150122493	rs4553237	T	C	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=12;PP=274;SC=TGCGCTTGCCTGCCCTGCGGC;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=150122501;WS=150122483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	150128425	rs1545762	C	T	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=517;ReadPosRankSum=-0.183;SC=CCACCTTGGCCGCTGGAACAT;SOR=0.427;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=46;TCF=3;TCR=43;TR=25;WE=150128433;WS=150128415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr1	150129267	rs10749675	G	A	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=25;PP=732;SC=AACAGCTGTGGCCCACTGAAG;SOR=4.047;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=150129275;WS=150129257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	150130982	rs143570918	G	GC	1340.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.492;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.072;NF=29;NR=2;PP=1825;ReadPosRankSum=1.346;SC=CCTGATGACAGGTTCCCCACT;SOR=1.160;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=113;TCF=94;TCR=19;TR=31;WE=150130991;WS=150130972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,39:0.32:121
chr1	150130983	rs34773647	G	T	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.863;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.109;NF=31;NR=2;PP=1854;ReadPosRankSum=1.527;SC=CTGATGACAGGTTCCCCACTC;SOR=1.297;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=119;TCF=98;TCR=21;TR=33;WE=150130991;WS=150130972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,39:0.31:124
chr1	150193165	rs58395667	G	A	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.445;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=433;ReadPosRankSum=0.456;SC=GGCCTAGCACGGTGGCTCACA;SOR=0.072;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=60;TCF=1;TCR=59;TR=22;WE=150193173;WS=150193155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,23:0.36:64
chr1	150199123	rs7522034	G	T	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.491;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.495;NF=9;NR=25;PP=650;ReadPosRankSum=0.250;SC=CATCTTCATCGCCATCTTTAA;SOR=1.310;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=110;TCF=38;TCR=72;TR=34;WE=150199131;WS=150199113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,34:0.30:112
chr1	150201305	rs148013046	A	AT	486.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=1.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.12;ReadPosRankSum=1.090;SOR=0.471;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,30:0.32:95
chr1	150249101	rs11205354	C	A	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=219;ReadPosRankSum=0.566;SC=ACGTGGAATACATAGAGGGCT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=1;TCR=46;TR=13;WE=150249109;WS=150249091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr1	150255587	rs2147324	T	C	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=73;ReadPosRankSum=0.124;SC=CCTTAAACTCTGGTTTCAAAC;SOR=0.752;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=5;WE=150255595;WS=150255577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr1	150256413	.	T	TTTATTATTATTATTATTATTA	207.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.272;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=-2.105;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.710;SOR=0.202;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr1	150256879	rs137955605	G	A	2339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.716;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=35;PP=1789;ReadPosRankSum=0.786;SC=ACAGGATCCAGCGTATTGTAG;SOR=0.439;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=115;TCF=68;TCR=47;TR=82;WE=150256887;WS=150256869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,86:0.72:119
chr1	150258838	rs1122967	C	G	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.942;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=570;ReadPosRankSum=2.516;SC=TCTCCCCTCTCTAGCATTTTC;SOR=0.903;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=97;TCF=72;TCR=25;TR=32;WE=150258846;WS=150258828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,32:0.32:100
chr1	150280550	rs4845	G	A	1877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.420;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=35;PP=1565;ReadPosRankSum=1.706;SC=CCATGCCGCCGGCGACAGAGG;SOR=0.441;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=116;TCF=61;TCR=55;TR=70;WE=150280558;WS=150280540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,69:0.59:117
chr1	150281202	rs580060	A	C	2365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=1;PP=1977;SC=ACTGGGGAGGAAGAGGTTGCA;SOR=7.112;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=66;TCF=65;TCR=1;TR=65;WE=150281210;WS=150281192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	150281343	rs71622690	C	T	5969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=87;NR=102;PP=2965;SC=CTTAATGCCACTGAACTATAC;SOR=0.857;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=87;TCR=102;TR=189;WE=150281351;WS=150281333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr1	150284311	rs11580234	C	T	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=7.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.66;ReadPosRankSum=0.472;SOR=0.886;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,49:0.26:186
chr1	150298192	rs11205362	G	A	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=4.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=114;ReadPosRankSum=-0.172;SC=CCCTACCACCGCCTTTCTTCC;SOR=0.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=8;WE=150298200;WS=150298182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr1	150300727	rs834225	T	C	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=21;NR=3;PP=683;SC=TAATTCTTCCTTTCTCCCCAC;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=150300735;WS=150300717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	150307270	rs1260408	T	G	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=2;PP=319;SC=TAACTCCTGGTCTCAAGTGAT;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=150307278;WS=150307260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	150310827	rs11806171	A	C	1507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.050;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=46;PP=1258;ReadPosRankSum=0.000;SC=GTACCTTTTTAAAAAAACAGT;SOR=1.458;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=76;TCF=12;TCR=64;TR=53;WE=150310835;WS=150310817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,52:0.69:75
chr1	150319081	rs16836143	T	A	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=19;PP=523;SC=TAGATAGTGTTCAGGAATTTT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=150319089;WS=150319071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	150325231	rs41300865	A	G	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=42;ReadPosRankSum=0.431;SC=CACAAATGTTACTAGGTCTTC;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=5;WE=150325239;WS=150325221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr1	150337289	rs72696841	G	T	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.691;SOR=0.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,19:0.21:92
chr1	150389964	.	GA	G	528.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=389;SC=ATCCATGTAAGAAAAAAAAAA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=22;WE=150389972;WS=150389954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	150415631	rs3862206	T	G	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=0;PP=796;SC=TATCTTTAACTATAGAGCTAA;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=150415639;WS=150415621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	150416621	rs74124686	G	C	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=199;ReadPosRankSum=1.188;SC=TAAGCTTTAGGGTGTTTGTTT;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=10;WE=150416629;WS=150416611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr1	150416913	rs16836940	A	G	1023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=30;PP=845;SC=TCATTTTTCCAGTAATCATAC;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=150416921;WS=150416903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	150429944	rs41273537	A	G	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.622;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=30;PP=721;ReadPosRankSum=1.808;SC=GTCACCAACCATGGAGAGTGA;SOR=0.800;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=161;TCF=72;TCR=89;TR=51;WE=150429952;WS=150429934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,52:0.32:165
chr1	150432870	.	G	GGTT	119.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.70;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr1	150437215	rs66513313	A	G	1550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=38;PP=1184;SC=TAACTGACATATGCCAGAGGG;SOR=2.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=47;WE=150437223;WS=150437205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	150459715	rs34001546	T	C	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.923;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.668;NF=14;NR=1;PP=334;ReadPosRankSum=-1.456;SC=GTGTTACATTTTCGGTCTTCC;SOR=2.584;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=15;WE=150459723;WS=150459705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr1	150468842	rs1343965	A	G	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=2;PP=638;SC=TACTGGTGGGATTGTTGTCAA;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=150468850;WS=150468832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	150470296	rs11588874	G	A	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=37;PP=1137;SC=GGCCGGGCACGGTGGCTCACG;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=40;WE=150470304;WS=150470286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
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chr1	150471848	rs34802685	A	AT	635.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=24;PP=473;SC=GATACAAAGAATTTTTTTTTT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=24;WE=150471856;WS=150471838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	150477085	rs35866586	A	AC	1645.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.890;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=37;PP=1364;ReadPosRankSum=0.406;SC=CATTCCATCCACCCCCCCCTT;SOR=1.017;SbPval=0.62;Source=Platypus;TR=63;WE=150477093;WS=150477072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,69:0.66:104
chr1	150480473	rs141248191	G	A	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=0;PP=762;ReadPosRankSum=0.025;SC=GTGACTTTGGGAGGAGTGGCT;SOR=2.964;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=30;WE=150480481;WS=150480463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,29:0.83:35
chr1	150480571	rs12724450	G	A	1866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.740;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=18;PP=1533;ReadPosRankSum=0.864;SC=AGAAGAGCTGGTCCTGAAGCT;SOR=0.511;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=113;TCF=84;TCR=29;TR=68;WE=150480579;WS=150480561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,69:0.61:114
chr1	150482255	rs41264469	A	G	1213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.268;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=32;PP=874;ReadPosRankSum=2.059;SC=TCACCATCCCATGCCCTCCTC;SOR=0.320;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=194;TCF=72;TCR=122;TR=58;WE=150482263;WS=150482245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,60:0.30:198
chr1	150483236	rs9661040	A	C	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=3;PP=652;SC=TCTCATTTCCACTATATCCTC;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=150483244;WS=150483232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	150483840	rs4970979	C	T	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=17;PP=1379;SC=CAACCACTGTCTCTTCTTTAT;SOR=1.426;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=47;WE=150483848;WS=150483830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	150484004	rs11801190	G	A	1723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.669;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=24;PP=1393;ReadPosRankSum=0.954;SC=GGTGCTGCACGCGGCAGGGGG;SOR=0.491;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=104;TCF=68;TCR=36;TR=64;WE=150484012;WS=150483994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,64:0.60:106
chr1	150484395	rs149815479	ACC	A	298.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=6;PP=196;SC=CCATCCATGTACCCCCCCTGC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=7;WE=150484404;WS=150484385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	150485566	rs12031973	T	G	1060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.43;SOR=5.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	150485571	rs12031974	T	C	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.74;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	150522471	rs10668635	C	CTG	4781.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=80;NR=17;PP=2974;SC=GTGGAGGGCTCTGAGGGCCCG;SOR=3.035;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=80;TCR=17;TR=97;WE=150522479;WS=150522461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr1	150526044	rs41317515	G	C	8615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=117;NR=140;PP=2965;SC=AGGGGAAGAGGCTATTCCGTC;SOR=0.846;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=257;TCF=117;TCR=140;TR=257;WE=150526052;WS=150526034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr1	150526406	rs6681639	C	T	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.536;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=629;ReadPosRankSum=0.097;SC=GCCAGCAGGGCCAAGGGCCTT;SOR=1.108;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=136;TCF=56;TCR=80;TR=41;WE=150526414;WS=150526396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,41:0.29:143
chr1	150528090	rs146160043	G	GACAC	1544.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.990;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=1436;ReadPosRankSum=-1.240;SC=TATGCACACAGACACATGCCC;SOR=2.857;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=29;WE=150528098;WS=150528080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr1	150528118	rs149100901	T	TACAC	1120.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=11.461;HP=1;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=29;PP=1244;ReadPosRankSum=0.620;SC=CATACACATGTACACACATAT;SOR=5.207;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=30;WE=150528126;WS=150528108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr1	150528175	rs35233292	GCA	G	454.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=63;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=13;PP=397;SC=ACGCATATGCGCACAGACACA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=150528184;WS=150528165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	150528208	rs9728540	C	T	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	150529322	rs34379037	T	TAA	2540.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=27;PP=2269;SC=CTGTTCCCTCTGGGCAGAGCT;SOR=0.970;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=58;TCF=28;TCR=30;TR=51;WE=150529330;WS=150529312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	150531008	rs10888382	T	C	5483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=49;PP=2965;SC=TTGGGAACAATGGTGATGAAG;SOR=1.846;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=179;TCF=130;TCR=49;TR=178;WE=150531016;WS=150530998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr1	150531050	rs10749657	G	A	6522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=145;NR=61;PP=2965;SC=CAGGCCCCCCGCAGCCCCCCA;SOR=1.701;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=146;TCR=61;TR=206;WE=150531058;WS=150531040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr1	150531170	rs10749658	C	T	7378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=151;PP=2965;SC=TGGGTAACCACGCCCAGGACA;SOR=1.389;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=236;TCF=84;TCR=152;TR=235;WE=150531178;WS=150531160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr1	150531380	rs11204664	T	C	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=20;PP=812;SC=GCCCCCCTACTGTCCCTTGTG;SOR=1.085;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=14;TCR=20;TR=34;WE=150531388;WS=150531370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	150550019	rs11428742	T	TA	2231.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=53;PP=2625;SC=TCTGCTCTCTTACAACACTAC;SOR=3.877;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=3;TCR=56;TR=56;WE=150550027;WS=150550009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	150595325	.	C	G	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=590;ReadPosRankSum=-1.550;SC=CAGCATCATTCAACTTGGCCA;SOR=0.760;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=32;WE=150595333;WS=150595315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr1	150600181	rs2280078	C	T	1056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=30;PP=901;SC=CTTGTAAATACGCTATCTCTA;SOR=4.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=33;WE=150600189;WS=150600171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	150676485	rs12403609	T	C	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=514;SC=AAATATTGAATTTTATTCTAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=150676493;WS=150676475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	150676674	rs367543855	TA	T	146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=1.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.97;ReadPosRankSum=2.213;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr1	150686633	rs34593358	A	T	2251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=55;PP=1902;SC=TTTAGACTGAATGCATTTCCA;SOR=2.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=14;TCR=55;TR=69;WE=150686641;WS=150686623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	150687296	rs10888388	C	T	113.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=87;SC=GGGTCTCACTCTATCACCCAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=150687304;WS=150687286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	150737220	rs41271951	A	G	1267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.623;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=26;PP=903;ReadPosRankSum=1.007;SC=CACCAAGAGCACACAAACCAG;SOR=0.860;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=158;TCF=79;TCR=79;TR=63;WE=150737228;WS=150737210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,63:0.39:161
chr1	150771703	rs10788796	T	C	5768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=81;PP=2965;SC=CTGCCAAAACTGCATGGTTCA;SOR=0.896;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=184;TCF=102;TCR=82;TR=183;WE=150771711;WS=150771693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr1	150779401	rs12746973	G	A	1170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=33;PP=948;ReadPosRankSum=-0.768;SC=TGATAGTCAGGAGGGGCCTGT;SOR=0.642;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=5;TCR=44;TR=37;WE=150779409;WS=150779391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,41:0.76:54
chr1	150779755	rs6587522	C	T	6398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=93;NR=86;PP=2965;SC=TAAGTTTTGCCTCCTGATCAT;SOR=0.822;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=179;TCF=93;TCR=86;TR=179;WE=150779763;WS=150779745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr1	150790289	rs35672926	C	CAA	97.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=23.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQRankSum=-0.804;QD=3.62;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.944;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr1	150801466	rs3738483	T	C	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=2;PP=918;SC=CTCTTTTTCTTAACTGAGGTT;SOR=4.743;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=33;WE=150801474;WS=150801456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	150804401	rs34083816	GA	G	984.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=1.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=1.295;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.735;SOR=0.574;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,65:0.71:91
chr1	150849071	rs34415707	AC	A	48.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.08;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	150914922	.	CA	C	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.45;MQRankSum=-0.527;QD=2.61;ReadPosRankSum=-0.554;SOR=0.202;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr1	150936528	.	C	T	1959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.879;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=45;PP=1488;ReadPosRankSum=0.479;SC=CCATGATCTTCGCTTCCCCTG;SOR=0.922;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=97;TCF=35;TCR=62;TR=68;WE=150936536;WS=150936518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,72:0.72:100
chr1	150936903	rs1045628	T	C	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.329;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=32;PP=971;ReadPosRankSum=-1.358;SC=GTCTTCCTGATTGTTGAACCC;SOR=1.981;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=36;WE=150936911;WS=150936893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,39:0.83:47
chr1	150938616	rs267739	G	A	1857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=12;PP=1452;SC=GGCAGCTGGAGTAATGGTTCA;SOR=2.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=57;WE=150938624;WS=150938606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	150940625	rs267738	T	G	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-5.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.899;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=9;PP=598;ReadPosRankSum=0.583;SC=GAACCAACGCTCTACCTGGCG;SOR=1.011;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=114;TCF=86;TCR=28;TR=43;WE=150940633;WS=150940615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,42:0.37:115
chr1	150944541	rs267737	A	G	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=6;PP=173;SC=TGCCTGCAAAACAGGGGGTGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=150944549;WS=150944531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	150956623	rs41310861	G	A	3984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.076;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=35;PP=2962;ReadPosRankSum=1.341;SC=AGCAACAGCCGCTGAGGCCAG;SOR=1.556;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=203;TCF=141;TCR=62;TR=139;WE=150956631;WS=150956613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,141:0.68:206
chr1	150969992	rs2925740	T	C	4678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.233;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=71;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.022;SC=GGGGAAGGACTCTGAGAGAAG;SOR=0.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=252;TCF=139;TCR=113;TR=165;WE=150970000;WS=150969982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,169:0.66:257
chr1	150970577	rs2925741	G	T	2904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=15;PP=2296;ReadPosRankSum=-0.465;SC=CTGCAGCTGCGTTTCTGGGGA;SOR=1.654;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=72;TCR=15;TR=86;WE=150970585;WS=150970567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,90:0.99:91
chr1	150970836	rs1673160	T	A	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.928;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=33;PP=872;ReadPosRankSum=0.530;SC=GCATGTGGACTTTTTTTTTCT;SOR=0.169;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=49;TCF=6;TCR=43;TR=39;WE=150970844;WS=150970826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,41:0.79:52
chr1	150972538	rs708909	G	A	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=13;PP=201;SC=CTACAACCCTGTGATGAATGG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=150972547;WS=150972528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	150972539	rs12079970	T	G	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.29;ReadPosRankSum=-0.919;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	150974081	rs12096801	C	T	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=82;ReadPosRankSum=1.347;SC=CCCATAGACCCTTACCCTCCC;SOR=0.395;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=8;WE=150974089;WS=150974071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr1	150974162	rs771204	G	A	2175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=22;PP=1494;SC=TAGCTCTGGAGCCCCTTGGGT;SOR=1.545;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=64;WE=150974170;WS=150974152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	150974971	rs41310885	T	A	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=31;PP=854;ReadPosRankSum=0.225;SC=CATCAGCATCTCTTGCATCTG;SOR=0.667;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=175;TCF=78;TCR=97;TR=56;WE=150974979;WS=150974961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,59:0.32:183
chr1	150975108	rs771205	T	C	1976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=50;PP=1452;SC=AAAAGGGACTTGGCTGAGGGG;SOR=1.981;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=70;TCF=18;TCR=52;TR=68;WE=150975116;WS=150975098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	150990825	rs3738480	A	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.241;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=146;ReadPosRankSum=1.019;SC=CTGGGTACTTATGGCTTTGAG;SOR=0.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=7;WE=150990833;WS=150990815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr1	150990913	rs7526955	G	C	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=501;ReadPosRankSum=0.575;SC=ATAAAACCTTGTGATACCTTC;SOR=0.556;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=62;TCF=53;TCR=9;TR=25;WE=150990921;WS=150990903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,26:0.42:62
chr1	150991221	rs11204758	A	G	1391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.108;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=42;PP=1126;ReadPosRankSum=-0.688;SC=AAAGAGAGGAAGAAAGAGTTT;SOR=0.354;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=74;TCF=10;TCR=64;TR=50;WE=150991229;WS=150991211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,50:0.68:73
chr1	150991285	rs6664220	A	G	1065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=31;PP=914;SC=TTGGGAGGCCAAGGCGGGCGG;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=150991293;WS=150991275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	150997940	rs3738478	T	C	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=0;PP=615;ReadPosRankSum=-0.088;SC=TTCTGGTGGTTGTGTGTGAAG;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=63;TCR=0;TR=28;WE=150997948;WS=150997930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,27:0.44:62
chr1	150998221	rs55774303	AT	A	272.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=2.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=0.025;QD=3.84;ReadPosRankSum=0.756;SOR=1.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,23:0.32:71
chr1	150999737	rs11204762	A	G	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.934;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=560;ReadPosRankSum=-0.228;SC=TGCTGAGAAAAGACCAGAAGA;SOR=0.223;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=27;WE=150999745;WS=150999727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
chr1	150999863	rs55717234	A	G	1266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=27;PP=897;SC=CATGTTATGCATGTGGCCTTG;SOR=1.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=150999871;WS=150999853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	151006539	rs3738476	C	A	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=59.99;MQRankSum=-1.543;NF=15;NR=13;PP=530;ReadPosRankSum=1.646;SC=TGATTTCTGGCCTGAGTCAAG;SOR=0.735;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=98;TCF=47;TCR=51;TR=28;WE=151006547;WS=151006529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,29:0.29:100
chr1	151009984	rs12070288	C	G	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.822;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=158;ReadPosRankSum=-0.115;SC=TTCTTCATTTCAATTATTCTT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=8;WE=151009992;WS=151009974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr1	151011543	rs955955	G	A	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.818;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=622;ReadPosRankSum=0.608;SC=AGAAGTAGAGGCTAGAGCTAA;SOR=0.439;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=99;TCF=32;TCR=67;TR=37;WE=151011551;WS=151011533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,39:0.36:107
chr1	151015868	rs12068365	G	A	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.351;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=770;ReadPosRankSum=0.048;SC=CTACCCAGAAGCAGCATCCCC;SOR=0.429;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=154;TCF=50;TCR=104;TR=45;WE=151015876;WS=151015858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,48:0.30:159
chr1	151016150	rs144766190	C	G	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.100;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=14;PP=867;ReadPosRankSum=-0.363;SC=CAAGCAGGGCCCAAGTTCCAC;SOR=0.993;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=66;TCF=45;TCR=21;TR=46;WE=151016158;WS=151016140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,51:0.73:70
chr1	151019180	rs6587553	A	G	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.830;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=33;PP=802;ReadPosRankSum=1.974;SC=ACTGGATAAAAGGCCTTAGAA;SOR=0.540;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=124;TCF=28;TCR=96;TR=44;WE=151019188;WS=151019170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,43:0.34:126
chr1	151026815	rs2902810	C	T	1306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.828;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=37;PP=958;ReadPosRankSum=0.754;SC=AAAACAGATGCGAGACACCTT;SOR=1.062;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=174;TCF=63;TCR=111;TR=55;WE=151026823;WS=151026805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,60:0.32:185
chr1	151028234	rs11204767	G	T	4924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=116;PP=2965;SC=GCTTCACTCCGCTGTCTGAGG;SOR=2.584;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=33;TCR=116;TR=149;WE=151028242;WS=151028224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr1	151039609	rs3738481	A	G	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.61;ReadPosRankSum=1.242;SOR=0.173;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr1	151062957	rs11204774	G	A	1168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.237;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=39;PP=890;ReadPosRankSum=-1.174;SC=TCGAGCAGGTGTTAGCAGGGA;SOR=0.986;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=165;TCF=50;TCR=115;TR=53;WE=151062965;WS=151062947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,54:0.32:167
chr1	151070252	rs35034487	CA	C	308.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQRankSum=0.952;QD=6.30;ReadPosRankSum=0.020;SOR=0.509;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr1	151104598	rs4971005	A	G	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr1	151105824	rs4971006	C	G	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.056;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=414;ReadPosRankSum=-0.251;SC=GCGGGAGCCCCGGAGTCTCGA;SOR=0.478;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=62;TCF=25;TCR=37;TR=28;WE=151105832;WS=151105814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,30:0.46:65
chr1	151108137	rs4971007	T	G	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.748;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=20;PP=1008;ReadPosRankSum=-0.069;SC=CCACCTGGGGTCAGCACCTTC;SOR=0.910;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=192;TCF=122;TCR=70;TR=60;WE=151108145;WS=151108127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,63:0.32:199
chr1	151114882	rs11464219	C	CT	521.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.174;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=624;ReadPosRankSum=1.478;SC=TGTTAGCTTCCTGAGGCTGGG;SOR=1.609;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=16;WE=151114890;WS=151114872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr1	151134579	rs11459817	T	TA	297.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=240;SC=TGTTCCATCTTAAAAAAAAAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=11;WE=151134587;WS=151134569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	151140732	rs1115	G	A	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.649;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=12;PP=892;ReadPosRankSum=1.660;SC=CCCACAGGCCGAGGAGTCAGC;SOR=1.385;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=120;TCF=82;TCR=38;TR=48;WE=151140740;WS=151140722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,47:0.38:123
chr1	151143016	rs143662204	T	C	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.606;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=32;PP=871;ReadPosRankSum=1.960;SC=TTTCGGGTCATGGCCTGGGCT;SOR=0.471;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=181;TCF=77;TCR=104;TR=60;WE=151143024;WS=151143006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,62:0.33:188
chr1	151143166	rs6689566	C	T	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-4.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.696;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=426;ReadPosRankSum=-1.118;SC=CAAAAGCTGACAGTCACCCTC;SOR=0.358;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=56;TCF=6;TCR=50;TR=23;WE=151143174;WS=151143156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,23:0.40:57
chr1	151146186	rs7552226	C	G	1013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=21;PP=758;SC=TAGAATGCTGCGTCACGAAGG;SOR=2.376;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=151146194;WS=151146176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	151146276	rs7521416	T	C	125.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=143;SC=AGTGCGGGGCTGGGCGCTGTG;SOR=1.981;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=151146284;WS=151146266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	151149601	rs6656261	A	G	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=15;PP=511;SC=AGTGGCTCACACCTGTAATTC;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=20;WE=151149609;WS=151149591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	151158054	.	C	CT	849.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.33;ReadPosRankSum=0.106;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,21:0.28:75
chr1	151158055	.	C	CTCAGAAA	849.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=2.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.246;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,22:0.29:76
chr1	151205303	rs7544947	A	G	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=32;PP=973;SC=CAGGCCAGGCACGGTGGCTCA;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=151205311;WS=151205293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	151209063	rs12407426	C	T	5765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=114;NR=66;PP=2965;SC=TAATGGATTACAGCCTCTTGA;SOR=1.414;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=114;TCR=66;TR=180;WE=151209071;WS=151209053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr1	151210789	rs7532935	C	T	9533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=142;NR=157;PP=2965;SC=ATACAGATAACCAGTCACGTT;SOR=0.795;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=299;TCF=142;TCR=157;TR=299;WE=151210797;WS=151210779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr1	151212399	rs141190258	C	CCTT	3506.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=4;PP=2967;SC=TGCCGGGCCTCCTAACTCTAT;SOR=4.725;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=74;TCF=69;TCR=5;TR=68;WE=151212407;WS=151212389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	151227371	rs3811405	A	G	564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=15;PP=431;SC=GGTGGGGGCCAGGGGCTCATG;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=151227379;WS=151227361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	151237589	rs3216063	TC	T	1109.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=24;NR=8;PP=875;SC=GCGGGTCCTTTCCCCCCCTCG;SOR=2.303;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=32;WE=151237597;WS=151237579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	151238222	rs2275900	G	A	1249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=39;PP=1037;SC=TCCTTTTGCCGCCTCTTCCCT;SOR=6.043;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=40;WE=151238230;WS=151238212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	151239051	rs7489	T	C	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=43;PP=1458;SC=TGGACACATCTGAGCCAGCCA;SOR=1.961;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=60;TCF=17;TCR=43;TR=59;WE=151239059;WS=151239041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	151239570	rs10888408	C	T	1229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=28;PP=1062;SC=CCTCTGGCAGCGGCATGCTCC;SOR=1.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=39;WE=151239578;WS=151239560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	151254041	rs3811406	T	C	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=7;PP=734;ReadPosRankSum=0.308;SC=ATTCCTTCCATGCTCCAAATC;SOR=0.680;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=57;TCF=46;TCR=11;TR=35;WE=151254049;WS=151254031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,36:0.62:58
chr1	151263677	rs145032688	G	GACA	2082.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.070;NF=6;NR=35;PP=1938;ReadPosRankSum=-0.684;SC=GGCTGTTGGGGACAACTAGTC;SOR=0.634;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=69;TCF=8;TCR=61;TR=41;WE=151263685;WS=151263667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,53:0.74:72
chr1	151263782	rs10788803	A	G	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=204;ReadPosRankSum=-0.931;SC=ATTAACATTAATATTTTGTTA;SOR=3.014;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=9;WE=151263790;WS=151263772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr1	151280400	rs1536617	C	G	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=26;PP=636;ReadPosRankSum=0.350;SC=TCCAGGAAAGCAGCTGCTTTT;SOR=0.976;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=27;WE=151280408;WS=151280390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr1	151288172	rs1056847	G	A	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=9;PP=868;ReadPosRankSum=-0.777;SC=ACAGCCCTGTGTCAGGGGCCG;SOR=0.855;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=46;TCR=14;TR=39;WE=151288180;WS=151288162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,39:0.66:59
chr1	151288391	rs1752379	A	G	4232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=72;PP=2965;SC=CATCACCCACATCCTCATCCA;SOR=0.707;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=68;TCR=72;TR=140;WE=151288399;WS=151288381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	151314379	rs1752387	T	C	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=246;ReadPosRankSum=-0.696;SC=CTAACCTATATATTCATCATA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=12;WE=151314387;WS=151314374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr1	151316161	rs1752386	G	A	1726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=22;PP=1436;SC=ACACACCAGCGAGCCCCATGG;SOR=1.118;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=33;TCR=22;TR=55;WE=151316169;WS=151316151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	151337788	rs10788804	A	G	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=317;ReadPosRankSum=-0.281;SC=TATAAGGAGGACCATAGTGGG;SOR=0.756;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=16;WE=151337796;WS=151337778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr1	151340928	.	T	C	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.597;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=61;ReadPosRankSum=-0.834;SC=ACTCTCCCTGTGGGAATATGA;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=6;WE=151340936;WS=151340918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr1	151341728	rs35093538	G	GC	550.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.301;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=698;ReadPosRankSum=-0.230;SC=TGGAAGAGGCGCCCTGTGGAC;SOR=1.814;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=19;WE=151341736;WS=151341718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr1	151372138	rs7172	G	A	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=344;ReadPosRankSum=0.993;SC=ACCGCATTCCGTCCACTCCCG;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=36;TCR=44;TR=24;WE=151372146;WS=151372128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,26:0.31:85
chr1	151372770	rs2495390	A	G	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=19;PP=604;SC=GGGGGACTGGAAGAGTTGTTG;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=151372778;WS=151372760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	151373200	rs2495391	T	C	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=37;PP=1478;SC=CTAAGATGAATCTAAGGTGAA;SOR=1.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=19;TCR=37;TR=56;WE=151373208;WS=151373190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	151374025	rs4603	T	C	2299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.383;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=30;PP=1897;ReadPosRankSum=-1.176;SC=CAGTTTCAAATCGCCACTGTC;SOR=0.936;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=128;TCF=81;TCR=47;TR=83;WE=151374033;WS=151374015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,84:0.64:132
chr1	151377248	rs6667714	T	C	1637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=7;PP=1295;SC=GTTCCCACCCTCACTCCACAC;SOR=3.486;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=45;TCR=7;TR=52;WE=151377256;WS=151377238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	151379250	rs2274535	G	A	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=51;ReadPosRankSum=-0.206;SC=ACTTCAGGTCGGAAGGTTTCT;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=5;WE=151379258;WS=151379240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr1	151380505	.	AAAG	A	699.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.27;QD=31.81;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	151380727	rs2025899	A	G	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.858;HP=10;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.962;NF=3;NR=34;PP=818;ReadPosRankSum=-0.167;SC=CTGTGGGGGAAAAAAAAAAAG;SOR=1.353;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=79;TCF=10;TCR=69;TR=37;WE=151380735;WS=151380715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,39:0.49:79
chr1	151381320	rs3831142	GA	G	634.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=3.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQRankSum=2.551;QD=5.67;ReadPosRankSum=-1.347;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,36:0.32:112
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chr1	151384733	rs3748550	G	A	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.804;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=554;ReadPosRankSum=0.342;SC=TCTTCCTGAGGGCAAAACTGC;SOR=0.481;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=109;TCF=74;TCR=35;TR=34;WE=151384741;WS=151384723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,34:0.31:110
chr1	151395782	rs2274533	T	C	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=163;ReadPosRankSum=-0.565;SC=GTTACCCACATGTAAATAAAT;SOR=0.622;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=11;WE=151395790;WS=151395772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,12:0.30:40
chr1	151396037	rs2274534	A	C	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.926;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=30;PP=448;ReadPosRankSum=-2.066;SC=TCTGTAATAAAGCACAAAGAG;SOR=0.855;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=111;TCF=24;TCR=87;TR=37;WE=151396045;WS=151396027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,37:0.33:113
chr1	151400942	rs11204811	A	C	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=410;ReadPosRankSum=1.452;SC=CACCTATAACACATTCTCCCT;SOR=0.458;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=57;TCF=4;TCR=53;TR=21;WE=151400950;WS=151400932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,21:0.36:58
chr1	151402045	rs6587577	A	G	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.419;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=4;PP=452;ReadPosRankSum=-0.431;SC=TCTGGATGCCAGTTTATTCCA;SOR=0.392;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=85;TCF=76;TCR=9;TR=31;WE=151402053;WS=151402035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,33:0.37:89
chr1	151495796	rs2337359	T	C	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.676;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=228;ReadPosRankSum=0.245;SC=GTCCTAAGTATAGTGTCTATC;SOR=0.352;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=16;WE=151495804;WS=151495786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr1	151497376	rs1573129	G	A	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=27;ReadPosRankSum=1.440;SC=TGTGACAAGAGCAGGGTCTGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=151497384;WS=151497366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	151499635	rs2298168	C	T	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.398;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=404;ReadPosRankSum=-0.283;SC=GAACACCTGCCTTACCTCTCC;SOR=0.157;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=18;WE=151499643;WS=151499625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr1	151501698	rs2096232	A	G	258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=253;SC=AGAAACTGCCAAACTACTTTC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=151501706;WS=151501688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	151501737	rs6678068	T	C	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=350;SC=TTTTATTCCCTTGGCAGTGTA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=151501745;WS=151501727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	151504778	rs6673116	C	T	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=138;ReadPosRankSum=-1.085;SC=GAGAGGGCTGCCTTGTCAGGA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=151504786;WS=151504768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr1	151508061	rs11204842	A	C	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=204;ReadPosRankSum=-0.609;SC=TGGTCCTCTCACCCATCCCCA;SOR=0.914;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=10;WE=151508069;WS=151508051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr1	151518484	rs71580387	T	TTC	688.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=2.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.05;MQRankSum=3.992;QD=10.76;ReadPosRankSum=1.071;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,23:0.36:64
chr1	151534142	rs4132646	A	C	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.582;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=411;ReadPosRankSum=-0.031;SC=TAGTTCAGGAAGAATATGCTA;SOR=0.275;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=21;WE=151534150;WS=151534132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr1	151538507	rs11405272	T	TC	215.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.97;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	151542099	rs3748610	G	T	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=395;ReadPosRankSum=-0.555;SC=AGAAACTTGAGGGCTTCCCCT;SOR=0.531;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=20;WE=151542107;WS=151542089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr1	151546931	rs6660238	A	G	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=25;PP=759;SC=AGGGGCCTGCAGGTGGATCGA;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=151546939;WS=151546921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	151551320	rs3748608	G	A	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.335;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=277;ReadPosRankSum=0.270;SC=GGGCTGGTTTGTAACCTGCCC;SOR=0.491;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=17;WE=151551328;WS=151551310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr1	151552301	.	TG	T	28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=28;QD=27.0;SC=GTCTTTGTCATGTCTTGCTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=2;WE=151552309;WS=151552291;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,2:0.18:11
chr1	151554503	rs1891592	T	C	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=2.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.92;ReadPosRankSum=0.600;SOR=0.163;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,7:0.14:51
chr1	151634512	rs3831367	A	AT	236.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=247;ReadPosRankSum=-0.839;SC=AAATGTATTGATTTTTTTCCC;SOR=0.558;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=56;TCR=3;TR=15;WE=151634520;WS=151634502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr1	151634803	rs11808761	G	A	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=374;ReadPosRankSum=0.133;SC=AAGGAAGATAGATTAAATAAG;SOR=0.189;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=0;TCR=62;TR=20;WE=151634811;WS=151634793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,20:0.31:65
chr1	151655751	rs73000088	C	T	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.964;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=187;ReadPosRankSum=1.590;SC=TCTGAAAATGCGTCTGTGTCT;SOR=2.494;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=10;WE=151655759;WS=151655741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr1	151675618	rs1308150	T	C	2474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=19;PP=1966;SC=AAACGCTGGGTACAGAAGGCC;SOR=2.012;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=54;TCR=19;TR=72;WE=151675626;WS=151675608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	151679441	rs1308152	T	C	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.667;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=301;ReadPosRankSum=1.563;SC=GTCGCTTCACTGCTCTACACC;SOR=0.264;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=14;WE=151679449;WS=151679436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr1	151679900	rs10888428	C	T	1739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.136;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=14;PP=1467;ReadPosRankSum=0.208;SC=TCCCAGACCCCGAGGCTTCCC;SOR=0.564;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=82;TCF=64;TCR=18;TR=61;WE=151679908;WS=151679890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,60:0.74:81
chr1	151686983	rs939592	T	A	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.615;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=13;PP=938;ReadPosRankSum=-0.766;SC=GAGGTGGAAATTATGCTCAGT;SOR=0.368;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=61;TCF=44;TCR=17;TR=44;WE=151686991;WS=151686973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,46:0.72:64
chr1	151700189	rs72506285	C	CCTG	2092.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=38;PP=1667;SC=CAGGATTCTCCCAGAGTCTGG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=38;WE=151700197;WS=151700179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	151701210	rs41263710	A	G	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.905;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=3;PP=830;ReadPosRankSum=1.458;SC=CTTTGGGTATAGATGATGTCT;SOR=0.362;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=56;TCF=52;TCR=4;TR=36;WE=151701218;WS=151701200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,36:0.64:56
chr1	151732700	rs10888433	A	G	2988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.708;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=74;PP=2319;ReadPosRankSum=1.270;SC=CAGTCAGGTAAGTAAGATTTA;SOR=1.188;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=150;TCF=49;TCR=101;TR=107;WE=151732708;WS=151732690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,109:0.72:152
chr1	151733162	rs79198441	G	A	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.708;NF=35;NR=0;PP=809;ReadPosRankSum=-1.435;SC=TGGGAGGATCGCTTGAACCCA;SOR=1.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=57;TCR=0;TR=35;WE=151733170;WS=151733152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,38:0.64:59
chr1	151733327	rs74228558	T	C	4364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FS=4.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.39;ReadPosRankSum=0.101;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,161:0.64:251
chr1	151733335	rs8480	T	G	5927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=3.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.07;ReadPosRankSum=-0.308;SOR=0.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,144:0.66:219
chr1	151733874	rs75061466	C	G	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.934;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=15;PP=1119;ReadPosRankSum=-0.862;SC=GCCTCCTTTCCAGAGGCAGCT;SOR=1.133;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=104;TCF=76;TCR=28;TR=63;WE=151733882;WS=151733864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,63:0.61:103
chr1	151734690	rs16833538	G	C	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.266;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=456;ReadPosRankSum=0.648;SC=ATGTTAAATAGCATCAAACTA;SOR=1.751;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=19;WE=151734698;WS=151734680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr1	151735007	rs56289123	G	A	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.610;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=540;ReadPosRankSum=-0.882;SC=AGGGGAATTAGAACCATCTAG;SOR=1.064;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=27;WE=151735015;WS=151734997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr1	151735441	rs74905404	G	A	4024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.726;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=67;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.405;SC=CAGCCTGAGAGGAAGCGCCTC;SOR=0.572;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=217;TCF=119;TCR=98;TR=144;WE=151735449;WS=151735431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,150:0.67:225
chr1	151740479	rs1196457	C	A	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=629;SC=GACACACCCCCATCTGCCTGA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=151740487;WS=151740475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	151740666	rs2495397	T	C	3925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=59;PP=2965;SC=TCGACTCTTCTTGGATATCCC;SOR=0.726;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=59;TCR=59;TR=118;WE=151740674;WS=151740656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr1	151742550	.	GGAGAGA	G	1005.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.000;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=-6.168;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.557;SOR=0.189;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,31:0.31:99
chr1	151742565	rs140076465	GGGAGACCATGGGGAGACGGAGAC	G	1104.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=3.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQRankSum=-6.338;QD=7.78;ReadPosRankSum=-0.612;SOR=1.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,37:0.26:142
chr1	151742798	rs3748612	T	C	1366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=7.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=45;PP=1146;ReadPosRankSum=0.089;SC=TTTTCCTTTATAGGAGACCCT;SOR=1.068;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=76;TCF=0;TCR=76;TR=45;WE=151742806;WS=151742788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,46:0.58:79
chr1	151747043	rs1123855	C	T	1618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.283;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=42;PP=1266;ReadPosRankSum=-0.533;SC=GCAATGCCAGCGAGGCTCAAA;SOR=0.883;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=202;TCF=102;TCR=100;TR=74;WE=151747051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,74:0.36:207
chr1	151747733	rs1781421	C	T	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.444;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=232;ReadPosRankSum=0.491;SC=ACTTTAAAGACATTCCTTTGG;SOR=0.403;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=14;WE=151747741;WS=151747723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr1	151747799	rs1781419	G	A	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.353;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=143;ReadPosRankSum=1.022;SC=GGTTTCTGAGGAAGAAAAAGT;SOR=0.439;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=45;TCF=27;TCR=18;TR=11;WE=151747807;WS=151747789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,11:0.24:45
chr1	151748425	rs3923394	C	A	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.739;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=240;ReadPosRankSum=0.991;SC=TTGCTGCTTTCAGAAAGAACC;SOR=1.247;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=61;TCF=9;TCR=52;TR=15;WE=151748433;WS=151748415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,14:0.23:61
chr1	151748552	.	G	A	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.951;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=561;ReadPosRankSum=0.268;SC=AGTTGGGATTGAGCTGACCTC;SOR=0.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=24;WE=151748560;WS=151748542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,25:0.76:33
chr1	151751081	rs1996729	G	A	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.648;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=141;ReadPosRankSum=-1.138;SC=AGACTGAGAAGGCATTCCTTC;SOR=0.180;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=11;WE=151751089;WS=151751071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr1	151752383	rs12754510	G	A	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.765;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=11;PP=1207;ReadPosRankSum=-0.219;SC=GAGGGGCAAAGGTAAAGAATA;SOR=0.328;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=78;TCF=63;TCR=15;TR=53;WE=151752391;WS=151752373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,53:0.68:78
chr1	151753805	rs11355113	AT	A	811.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.14;QD=40.59;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	151753807	rs36118417	AT	A	812.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.57;MQRankSum=0.439;QD=36.94;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr1	151754112	rs35077383	T	C	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.957;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=30;PP=697;ReadPosRankSum=-0.403;SC=CACCCAAAGCTAGTATAACTA;SOR=1.378;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=111;TCF=29;TCR=82;TR=38;WE=151754120;WS=151754102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,38:0.32:117
chr1	151780177	rs3828057	C	T	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.508;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=212;ReadPosRankSum=0.619;SC=GAAGTCCGCTCATTCTTCCTG;SOR=0.990;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=52;TCF=11;TCR=41;TR=14;WE=151780185;WS=151780167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,14:0.27:51
chr1	151789588	rs151171878	C	CTG,CTGTGTGTG	1491.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=46.62;SOR=6.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,21,11:0.66,0.34:32
chr1	151789609	rs56273334	C	T	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.39;SOR=6.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	151789609	.	CGC	TGT	734	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=42;MMLQ=28;MQ=59.52;NF=28;NR=0;PP=734;QD=28.1238526737;SC=TGTGTGTGTGCGCGCGCGCGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=28;WE=151789619;WS=151789597;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:18,28:0.61:46
chr1	151789611	rs55841824	C	T	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.39;SOR=6.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	151789647	rs12144914	T	G	2473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=16;PP=1930;SC=CACACATGCATGCATACACAT;SOR=2.524;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=57;TCR=16;TR=73;WE=151789655;WS=151789637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	151810590	.	G	A	3936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.000;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.062;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=70;PP=2925;ReadPosRankSum=-0.345;SC=CGAGCCCGTCGAAAAAGAAAT;SOR=0.727;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=216;TCF=106;TCR=110;TR=136;WE=151810598;WS=151810580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,144:0.64:225
chr1	151811226	rs6673556	G	A	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=1;PP=450;SC=GAGGCAGCGAGCAGGTCGCGG;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=151811234;WS=151811216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	151819691	.	AGGAGGCAGGAGGCAGGCAGGGGAGGCAGGAGGCAGGAGGCAGGCAGG	A	394.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.09;QD=49.34;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	151819736	.	AGG	A	32	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=30;MQ=55.62;NF=1;NR=3;PP=32;QD=16.5;SC=GGAGGCAGGCAGGGGAGGCAG;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=4;WE=151819745;WS=151819726;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,4:0.21:19
chr1	151820298	rs6587624	G	C	2556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=44;PP=1885;SC=ATCTTGTCCAGTTCTACGTCC;SOR=0.839;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=39;TCR=44;TR=83;WE=151820306;WS=151820288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	151820324	rs6587625	T	C	2206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=48;PP=1595;SC=AACCAGAGAGTCCACGGGGAT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=24;TCR=48;TR=72;WE=151820332;WS=151820314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	151825991	rs7556386	G	T	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.776;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=380;ReadPosRankSum=-0.708;SC=CCTCAAGAAGGCCTCTGTGGT;SOR=0.472;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=88;TCF=37;TCR=51;TR=30;WE=151825999;WS=151825981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,34:0.37:93
chr1	151862661	rs1060870	G	A	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.815;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=489;ReadPosRankSum=1.123;SC=GATTATAGGCGTGAGCCACAG;SOR=0.775;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=119;TCF=92;TCR=27;TR=32;WE=151862669;WS=151862651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,40:0.30:133
chr1	151867560	rs3762427	G	A	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.892;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.021;NF=26;NR=8;PP=619;ReadPosRankSum=0.405;SC=TCCAGGAGCCGTCTTCACATT;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=77;TCR=24;TR=34;WE=151867568;WS=151867550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,35:0.33:105
chr1	151881885	rs3748805	A	C	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.60;ReadPosRankSum=-1.665;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr1	152009530	rs3811422	T	C	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=11;PP=415;SC=CTCAGACAGCTTCCGCGCCTG;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=152009538;WS=152009520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	152079823	rs1131473	C	G	1859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=23;PP=1481;ReadPosRankSum=0.560;SC=TTCCCGTGCTCGAAGCTTTGG;SOR=0.621;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=107;TCF=74;TCR=33;TR=70;WE=152079831;WS=152079813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,69:0.65:106
chr1	152079989	rs1131471	T	G	6153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.302;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=177;NR=36;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.016;SC=TCTTGGGATTTTATCTCCCCG;SOR=1.098;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=321;TCF=259;TCR=62;TR=213;WE=152079997;WS=152079979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,210:0.65:321
chr1	152081921	rs2496253	G	C	3849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.439;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=60;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.591;SC=CTGTCGCGCAGCTGGGAATCT;SOR=0.898;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=212;TCF=116;TCR=96;TR=139;WE=152081929;WS=152081911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,143:0.65:220
chr1	152084175	.	T	TTGCTGCTCGCGCCTCTCC	5452.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.000;DP=261;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-1.190;QD=34.29;ReadPosRankSum=-0.884;SOR=0.729;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,108:0.68:159
chr1	152085505	rs2515663	A	C	4373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=84;PP=2965;SC=ATTACTGTCAAGATCCAGAAG;SOR=1.121;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=61;TCR=85;TR=144;WE=152085513;WS=152085495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr1	152128066	rs72995312	G	A	9279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=543;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.551;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=192;NR=154;PP=2962;ReadPosRankSum=1.174;SC=GGCCTTGTCCGTCTGGCTGAC;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=529;TCF=292;TCR=237;TR=346;WE=152128074;WS=152128056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,352:0.65:540
chr1	152128212	rs143744326	C	G	8006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-7.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=444;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.176;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.734;NF=125;NR=168;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.622;SC=CCTTGTCTGTCTGTCTGACCA;SOR=0.794;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=443;TCF=192;TCR=251;TR=293;WE=152128220;WS=152128202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,294:0.67:440
chr1	152129065	.	GTGGTGGGAATCTCTGTCTTGTTTCTCAGACTGACCA	G	8708.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.925;ClippingRankSum=0.000;DP=539;ExcessHet=3.0103;FS=2.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=-6.585;QD=20.11;ReadPosRankSum=0.693;SOR=0.858;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:204,229:0.53:433
chr1	152130178	.	CAG	C	544.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.324;NF=11;NR=0;PP=409;ReadPosRankSum=-0.719;SC=GTGCAGGTGTCAGAGTCATTC;SOR=0.334;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=11;WE=152130187;WS=152130168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr1	152185500	rs12726613	C	G	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=1;PP=1723;SC=TCATAGATGACTTTCCTATTT;SOR=6.736;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=55;TCF=54;TCR=1;TR=55;WE=152185508;WS=152185490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	152185750	rs12729662	G	A	7296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=80;NR=135;PP=2965;SC=CATGTTGGCCGTAGCTGGAAG;SOR=1.364;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=215;TCF=80;TCR=135;TR=215;WE=152185758;WS=152185740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr1	152192555	rs41266134	T	C	7041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=126;NR=93;PP=2965;SC=ATGCTGACCATAGCTGGAAGA;SOR=1.063;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=219;TCF=126;TCR=93;TR=219;WE=152192563;WS=152192545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr1	152192687	rs6587648	T	C	9852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=140;NR=156;PP=2965;SC=AGAGGAATGCTCTGAGCTAGA;SOR=0.885;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=296;TCF=140;TCR=156;TR=296;WE=152192695;WS=152192677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,305:1.00:305
chr1	152192978	rs6587649	T	C	8786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=125;PP=2965;SC=AGATCCATGTTGTCCCTGGCT;SOR=0.857;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=275;TCF=150;TCR=125;TR=275;WE=152192986;WS=152192968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr1	152193052	rs6587650	A	G	7959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.97;NF=84;NR=165;PP=2965;SC=AGCCAGACTCATGTTGCCCAA;SOR=1.512;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=249;TCF=84;TCR=165;TR=249;WE=152193060;WS=152193042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr1	152193547	rs6587653	G	A	6175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=94;PP=2965;SC=AAGACTGATGGGAGTCGGAGT;SOR=0.906;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=81;TCR=94;TR=175;WE=152193555;WS=152193537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr1	152195579	rs74127901	G	A	5973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=150;NR=35;PP=2965;SC=CCATCCTGGCGTGGAGTTCTT;SOR=2.846;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=187;TCF=152;TCR=35;TR=185;WE=152195587;WS=152195569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr1	152195728	rs34061715	AT	A	2710.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.146;NF=7;NR=92;PP=1615;ReadPosRankSum=-1.591;SC=GAGTTTAGGCATTTTTTTTTT;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=136;TCF=10;TCR=126;TR=99;WE=152195737;WS=152195718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,113:0.99:114
chr1	152276149	rs77422831	C	T	4077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=43;PP=2965;SC=CTGCTCGTGGCGGGATCCTTG;SOR=1.646;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=87;TCR=43;TR=129;WE=152276157;WS=152276139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr1	152276671	rs7518080	C	T	1777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=53.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.17;MQRankSum=-1.280;QD=29.63;ReadPosRankSum=-0.558;SOR=7.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,47:0.78:60
chr1	152276699	rs12728605	A	G	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=101.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.98;MQRankSum=-1.637;QD=0.60;ReadPosRankSum=2.309;SOR=1.212;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,15:0.14:110
chr1	152276772	rs72697000	C	A	6870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=9.430;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=4.056;NF=148;NR=57;PP=2965;ReadPosRankSum=1.480;SC=TCCTGCTTGTCCTGGGCCCCG;SOR=1.401;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=210;TCF=148;TCR=62;TR=205;WE=152276780;WS=152276762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,228:0.99:230
chr1	152276871	rs3126066	A	G	7069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=140;PP=2965;SC=GCCTGGAGCCATCTCCTGATT;SOR=1.346;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=224;TCF=82;TCR=142;TR=222;WE=152276879;WS=152276861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr1	152276889	rs3126067	A	G	6169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=63;NR=129;PP=2965;SC=ATTGTTCGTCATTACGAGTTT;SOR=1.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=193;TCF=63;TCR=130;TR=192;WE=152276897;WS=152276879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr1	152277168	rs3091276	A	G	5093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=136;NR=77;PP=2965;SC=GCCCATGGGCAGACTCAGACT;SOR=2.211;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=213;TCF=136;TCR=77;TR=213;WE=152277176;WS=152277158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr1	152277345	rs2065956	C	T	9218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=114;NR=161;PP=2965;SC=TATCACTGGCCTGACTACCAC;SOR=1.061;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=275;TCF=114;TCR=161;TR=275;WE=152277353;WS=152277335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr1	152277396	rs6681433	T	C	7611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=159;PP=2965;SC=CAGATGAAGCTTGTCCACGCG;SOR=1.966;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=223;TCF=64;TCR=159;TR=223;WE=152277404;WS=152277386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr1	152277717	rs9436066	C	A	2155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.72;QD=34.22;SOR=6.059;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	152277822	rs3126069	T	C	1175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.54;QD=43.55;SOR=6.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	152277826	rs2065957	A	C	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.53;QD=43.91;SOR=6.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	152278689	rs57672167	C	A	10906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.04;QD=33.35;SOR=1.905;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr1	152278814	rs2184952	C	T	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=652;ExcessHet=3.0103;FS=1.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQRankSum=-13.478;QD=1.07;ReadPosRankSum=0.362;SOR=0.858;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:552,93:0.14:645
chr1	152278856	rs11582087	T	G	3889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-8.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.614;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.102;NF=43;NR=132;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.013;SC=CTGCTTGCACTTCTGGATCCT;SOR=0.848;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=470;TCF=132;TCR=338;TR=175;WE=152278864;WS=152278846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,164:0.44:372
chr1	152279019	rs57670307	G	A	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=4.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.73;MQRankSum=-6.261;QD=6.83;ReadPosRankSum=-0.655;SOR=1.138;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,48:0.37:130
chr1	152279729	rs3126072	C	T	11626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.190;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.844;NF=194;NR=174;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.845;SC=TGCGAGTGTCCAGAGCTGTCG;SOR=0.363;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=369;TCF=194;TCR=175;TR=368;WE=152279737;WS=152279719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,370:1.00:371
chr1	152279841	rs3126074	G	C	5993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=143;PP=2965;SC=TGGATCCTGAGTGCCCATGGG;SOR=2.481;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=185;TCF=41;TCR=144;TR=184;WE=152279849;WS=152279831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr1	152280573	rs76471961	C	A	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=9.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQRankSum=-9.755;QD=0.30;ReadPosRankSum=0.068;SOR=2.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:144,16:0.10:160
chr1	152280736	rs78974621	T	C	9107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-8.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=665;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.737;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-14.529;NF=130;NR=65;PP=2962;ReadPosRankSum=2.128;SC=TTCATGATGATGCGACCCTGA;SOR=0.486;SbPval=0.02;Source=Platypus;TC=595;TCF=287;TCR=308;TR=195;WE=152280744;WS=152280726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:410,253:0.38:663
chr1	152280759	rs2338554	A	G	9996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-7.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=647;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.804;HP=2;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-13.185;NF=126;NR=82;PP=2962;ReadPosRankSum=1.749;SC=GCCTAGAGCCATCTCCTGATT;SOR=0.302;SbPval=0.02;Source=Platypus;TC=562;TCF=243;TCR=319;TR=208;WE=152280767;WS=152280749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:364,280:0.43:644
chr1	152280782	rs2184953	A	G	20490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.22;QD=38.96;SOR=1.839;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,526:1.00:526
chr1	152280782	.	ATGTTTT	GTGTTTG,GTGTTTT	2962	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MMLQ=28;MQ=57.14;NF=67,153;NR=86,295;PP=2944,2962;QD=20;SC=TCCTTGTCATATGTTTTTCTG;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=448;TCF=153;TCR=295;TR=153,448;WE=152280796;WS=152280772;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.34:448
chr1	152280788	rs66954353	T	G	5449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=4.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.61;MQRankSum=-6.653;QD=10.94;ReadPosRankSum=1.545;SOR=0.393;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:278,220:0.44:498
chr1	152280864	rs2184954	A	G	8242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=162;PP=2965;SC=GGCTGTGATGAGACCCTGAGT;SOR=1.783;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=238;TCF=76;TCR=162;TR=238;WE=152280872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr1	152280900	rs74129452	T	G	2470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-9.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.782;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.776;NF=59;NR=47;PP=1916;ReadPosRankSum=0.330;SC=CCGATTGCTCTTGGTGGGACC;SOR=0.751;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=245;TCF=126;TCR=119;TR=106;WE=152280908;WS=152280890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,108:0.42:255
chr1	152281007	rs7512553	AA	GG	6688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.858;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.959;NF=105;NR=53;PP=2944;ReadPosRankSum=-0.101;SC=GCCTGATCATAATGGGATCCT;SOR=1.098;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=349;TCF=217;TCR=132;TR=158;WE=152281016;WS=152280997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,174:0.48:361
chr1	152281039	rs7522925	G	A	4558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.766;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.133;NF=103;NR=78;PP=2962;ReadPosRankSum=0.920;SC=AGTGCTGGGCGCAGACTGTCC;SOR=0.641;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=385;TCF=218;TCR=167;TR=181;WE=152281047;WS=152281029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,183:0.47:390
chr1	152281228	rs7546186	C	G	3744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=386;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.243;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.125;NF=51;NR=104;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.901;SC=CTCACTGTCACTGGCCTGACT;SOR=1.303;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=381;TCF=146;TCR=235;TR=155;WE=152281236;WS=152281218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:230,154:0.40:384
chr1	152281523	rs80059102	A	C	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=83.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.64;MQRankSum=-10.911;QD=7.95;ReadPosRankSum=-0.007;SOR=3.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,46:0.26:179
chr1	152281534	rs113544881	A	T	1373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=127.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.23;MQRankSum=-9.250;QD=7.12;ReadPosRankSum=-0.752;SOR=4.259;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:148,45:0.23:193
chr1	152281690	rs12407748	C	T	13715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=439;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=2.287;NF=199;NR=218;PP=2965;ReadPosRankSum=0.393;SC=GCTGTCGGCCCGAGAGGAAGC;SOR=0.271;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=421;TCF=200;TCR=221;TR=417;WE=152281698;WS=152281680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,434:1.00:435
chr1	152281948	rs12405241	G	A	4307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=54;PP=2965;SC=CTCTTGGGACGCTGAGTGCCT;SOR=1.237;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=85;TCR=54;TR=139;WE=152281956;WS=152281938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr1	152282267	rs12405278	G	A	4632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=106;PP=2965;SC=TCTTGTCTGCGCCCAGTGCCT;SOR=2.147;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=37;TCR=106;TR=143;WE=152282275;WS=152282257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr1	152282311	rs12407807	C	T	3885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.477;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=84;ReadPosRankSum=1.803;SC=CTGCTGGTGGCGGGATCCATG;SOR=1.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=32;TCR=85;TR=115;WE=152282319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,119:0.99:120
chr1	152282917	rs11204978	G	T	4708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.056;NF=99;NR=58;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.765;SC=ACCGTCTTGGGATGCTGAGTG;SOR=0.506;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=158;TCF=100;TCR=58;TR=157;WE=152282925;WS=152282907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,158:0.99:159
chr1	152283236	rs11581433	T	C	3585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=68;PP=2965;SC=GAAGCTTGTCTGTGCCCAATG;SOR=0.762;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=58;TCR=69;TR=126;WE=152283244;WS=152283226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	152283283	rs11586631	C	T	3084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=46;PP=2581;SC=CTGCTGGTGGCGGGATCCATG;SOR=0.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=51;TCR=46;TR=97;WE=152283291;WS=152283273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	152283975	rs66831674	A	G	5079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=137;NR=52;PP=2965;SC=GCCCATGGGCAGACTCAGACT;SOR=2.716;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=137;TCR=52;TR=189;WE=152283983;WS=152283965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr1	152284854	rs3120653	A	G	4567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=52;PP=2965;SC=TGTCCTGACCATCTTGGGATG;SOR=1.406;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=100;TCR=52;TR=151;WE=152284862;WS=152284844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr1	152285099	rs74129461	C	T	7547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=83;NR=141;PP=2965;SC=TCTGAGTCTTCTGAATGTCCC;SOR=1.264;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=225;TCF=84;TCR=141;TR=224;WE=152285107;WS=152285089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr1	152285930	rs11584340	G	A	6338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=124;NR=66;PP=2965;SC=GCAGAGTCAGGCTGTTCATGA;SOR=1.459;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=124;TCR=67;TR=190;WE=152285938;WS=152285920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr1	152286002	rs2011331	T	C	7799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=143;NR=102;PP=2965;SC=CGGCCACGTGTGGACTCTTGG;SOR=1.071;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=248;TCF=144;TCR=104;TR=245;WE=152286010;WS=152285992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr1	152286032	rs11588170	C	T	8406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=134;NR=121;PP=2965;SC=TGTCTCAGCCCAGCCTTTCCG;SOR=0.814;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=255;TCF=134;TCR=121;TR=255;WE=152286040;WS=152286022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr1	152286367	rs41267154	C	A	2890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=30;PP=2507;SC=GTGTCTGGAGCCATCTCTTGA;SOR=1.504;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=84;WE=152286375;WS=152286357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr1	152287341	rs34224823	CT	C	790.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=459;SC=GGGACAAAATCTTTTTTTTTT;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=28;WE=152287349;WS=152287331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	152287777	.	CT	C	698.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=10;PP=706;ReadPosRankSum=1.289;SC=TATCTTTGGTCTTGTCAGAGA;SOR=0.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=70;TCF=38;TCR=32;TR=22;WE=152287785;WS=152287767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,26:0.33:79
chr1	152323132	rs12568784	G	T	5231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=51;PP=2965;SC=TGTTGACCATGAAAGGTGAGA;SOR=1.427;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=102;TCR=51;TR=153;WE=152323140;WS=152323122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr1	152325732	rs12022217	G	A	11981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=206;NR=153;PP=2965;SC=AGCCCCCTGAGTGCACTTCAC;SOR=1.018;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=360;TCF=207;TCR=153;TR=359;WE=152325740;WS=152325722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,373:1.00:373
chr1	152327469	rs76514540	C	T	9546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=180;PP=2965;SC=AGCCAGATGACTGACTTGAGC;SOR=1.741;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=253;TCF=73;TCR=180;TR=253;WE=152327477;WS=152327459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr1	152327502	rs138997916	A	G	3471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=68;PP=2214;SC=GGCCATAGCTAGACTGATGTG;SOR=5.640;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=8;TCR=68;TR=76;WE=152327510;WS=152327492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	152328411	rs6679449	A	G	12243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.93;QD=35.18;SOR=1.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,348:1.00:348
chr1	152329435	rs2282303	C	T	11476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=195;NR=142;PP=2965;ReadPosRankSum=1.523;SC=TGCATGACTTCGCCTCCCACT;SOR=0.395;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=339;TCF=196;TCR=143;TR=337;WE=152329443;WS=152329425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,352:1.00:353
chr1	152331240	rs3818831	G	A	4393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=34;PP=2965;SC=ACTGGATGAAGCTCTTTCTCC;SOR=2.165;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=100;TCR=34;TR=134;WE=152331248;WS=152331230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr1	152382062	rs10888486	C	T	1745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=5;PP=1391;SC=ACATTGGAGTCGGGGAAGTCA;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=44;TCR=5;TR=49;WE=152382070;WS=152382052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	152382120	rs3829868	C	T	4579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=20;PP=2965;SC=GCTGTGATGCCTCGCTTCTCT;SOR=3.160;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=109;TCR=20;TR=129;WE=152382128;WS=152382110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr1	152384498	rs3215709	G	GT	314.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=249;SC=AATTCCCCAGGCAAGGCCTCT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=152384506;WS=152384496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	152384759	rs7521839	A	G	3822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=76;PP=2936;SC=AGGCTCCATAATCAACCTCAG;SOR=1.311;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=47;TCR=76;TR=123;WE=152384767;WS=152384749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	152384833	rs1923492	T	C	1688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=48;PP=1452;SC=TGTTTTTAGTTTTCCTTTGTC;SOR=7.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=48;WE=152384841;WS=152384823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	152484129	rs2105117	G	A	9855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=208;PP=2965;ReadPosRankSum=1.023;SC=CCTCCCCAGTGTTCAGCCCCA;SOR=0.942;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=319;TCF=109;TCR=210;TR=316;WE=152484137;WS=152484119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,323:0.99:326
chr1	152487979	rs2282296	C	T	1148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=27;PP=976;SC=CCTCCTGCTGCGGCTCCGGCA;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=35;WE=152487987;WS=152487969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	152488063	rs1053588	C	T	551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=10;PP=378;SC=GGAGACGCCGCCGACAGCGGA;SOR=1.493;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=152488071;WS=152488053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	152538358	rs17659359	G	C	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.818;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=10;PP=940;ReadPosRankSum=-0.655;SC=GGCCTCTTGGGATTCTTGTTT;SOR=0.153;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=63;TCF=52;TCR=11;TR=46;WE=152538366;WS=152538348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,47:0.73:64
chr1	152552197	rs138761139	G	A	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.055;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.076;NF=27;NR=21;PP=1050;ReadPosRankSum=-2.507;SC=CACTGCCCCTGTCACAGGAGT;SOR=0.919;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=67;TCF=37;TCR=30;TR=48;WE=152552205;WS=152552187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,47:0.72:65
chr1	152552285	rs512208	C	A	4178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-1.037;NF=105;NR=34;PP=2965;ReadPosRankSum=0.847;SC=AGGGCCACAGCCCCCAGAGCT;SOR=1.292;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=141;TCF=107;TCR=34;TR=139;WE=152552293;WS=152552275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,134:0.99:135
chr1	152659266	rs57291980	G	T	3635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.549;NF=106;NR=1;PP=2965;ReadPosRankSum=1.356;SC=TCCTTGGTTTGAAATATTTAA;SOR=6.574;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=110;TCF=109;TCR=1;TR=107;WE=152659274;WS=152659256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,107:0.99:108
chr1	152659471	rs3737859	T	G	6186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=157;PP=2965;SC=TGTGGTCCCATCTCTGGGGGC;SOR=3.234;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=30;TCR=157;TR=187;WE=152659479;WS=152659461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr1	152681543	rs1332496	T	C	10263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.99;NF=242;NR=64;PP=2965;SC=TTATCGAAATTCCACCAAGAT;SOR=2.641;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=306;TCF=242;TCR=64;TR=306;WE=152681551;WS=152681533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
chr1	152681680	rs6143428	C	CAGCTCTGGGGGCTGCTGT	1338.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FS=3.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=-4.197;QD=6.97;ReadPosRankSum=-0.967;SOR=1.064;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,52:0.27:192
chr1	152681689	.	G	GGGCTGCTGTAGCTCTGGC	3764.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.004;ClippingRankSum=0.000;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.383;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=4.550;NF=13;NR=81;PP=2142;ReadPosRankSum=3.123;SC=CCAGCTCTGGGGGCTGTGGTT;SOR=0.558;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=233;TCF=45;TCR=188;TR=94;WE=152681697;WS=152681670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,152:0.70:218
chr1	152681835	rs10888510	G	T	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.529;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=34;PP=1121;ReadPosRankSum=1.573;SC=TGCTGCTCTGGAGGGGGCTGT;SOR=0.187;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=91;TCF=35;TCR=56;TR=60;WE=152681843;WS=152681825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,59:0.65:91
chr1	152691943	rs1332499	G	A	2212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=12;PP=1727;SC=AAACCTTCCTGGTTTTACAGT;SOR=2.964;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=58;TCR=12;TR=70;WE=152691951;WS=152691933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	152692074	rs1332500	G	C	5882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=114;NR=67;PP=2965;SC=GGGCAGGGTAGCAATGGTGCC;SOR=1.329;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=116;TCR=67;TR=181;WE=152692082;WS=152692064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr1	152692472	rs873775	A	C	9610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=142;NR=152;PP=2965;SC=GTACTGTGTCACTGACCCATG;SOR=0.756;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=294;TCF=142;TCR=152;TR=294;WE=152692480;WS=152692462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,295:1.00:295
chr1	152692588	rs944682	A	G	7389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=139;PP=2965;SC=ACACAGGATCATCTGGCTGCT;SOR=1.089;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=241;TCF=102;TCR=139;TR=241;WE=152692596;WS=152692578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr1	152692781	rs3814350	G	T	1426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=37;PP=1140;SC=AGAATGCACTGCCCCGCTACC;SOR=3.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=44;WE=152692789;WS=152692771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	152692862	rs3814351	G	C	185.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=121;SC=TCATCACTTTGCCTCTGTGCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=152692870;WS=152692852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	152732436	rs4845480	G	C	4797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=66;PP=2965;SC=AGTGCGAAGCGTCACAACCTG;SOR=0.778;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=73;TCR=66;TR=139;WE=152732444;WS=152732426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr1	152733301	rs4329520	T	A	9958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=164;NR=141;PP=2965;SC=CCCAGAACCATGCATAAGTCT;SOR=0.814;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=305;TCF=164;TCR=141;TR=305;WE=152733309;WS=152733291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
chr1	152759950	rs11205106	A	G	1971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-1.452;NF=20;NR=46;PP=1525;ReadPosRankSum=-0.736;SC=CTCTGGGGGCAGCTGTGGCTC;SOR=0.892;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=68;TCF=20;TCR=48;TR=66;WE=152759958;WS=152759947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr1	152760075	rs201660535	A	G	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=9.748;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQRankSum=-4.254;QD=1.95;ReadPosRankSum=0.307;SOR=3.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,4:0.15:27
chr1	152760093	rs112600788	T	C	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=6.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQRankSum=-4.816;QD=1.27;ReadPosRankSum=-0.047;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,3:0.12:25
chr1	152760096	rs115864544	A	T	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=9.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQRankSum=-4.924;QD=2.18;ReadPosRankSum=-1.365;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,4:0.15:26
chr1	152770589	rs11485496	A	G	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.020;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-4.432;NF=7;NR=4;PP=122;ReadPosRankSum=0.062;SC=TGGGGGCAGCAGCCAGCACTC;SOR=1.447;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=11;WE=152770597;WS=152770579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr1	152770613	rs41268500	T	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.434;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.847;NF=4;NR=8;PP=197;ReadPosRankSum=0.153;SC=AGGCTGCTGCTGAAGTGGACC;SOR=1.626;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=12;WE=152770621;WS=152770603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr1	152777868	rs36107483	A	G	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.946;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.174;NF=9;NR=16;PP=377;ReadPosRankSum=1.338;SC=ACTTTGGGGGACACTTTGGGG;SOR=0.947;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=82;TCF=34;TCR=48;TR=25;WE=152777876;WS=152777858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,26:0.32:82
chr1	152777964	rs17624493	G	A	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.714;NF=13;NR=11;PP=347;ReadPosRankSum=-0.486;SC=TCTTGGTGGCGGATTCAGGAG;SOR=0.659;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=77;TCF=40;TCR=37;TR=24;WE=152777972;WS=152777954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,26:0.32:81
chr1	152944594	rs3170863	C	T	6783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=142;PP=2965;SC=CCTCCAAGAGCAAACAGAAGT;SOR=1.513;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=216;TCF=74;TCR=142;TR=216;WE=152944602;WS=152944584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr1	152957573	rs1611760	T	C	831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=0;PP=736;SC=AATGGGGGAGTTAAGGGAGAT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=152957581;WS=152957563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	152957832	rs1611762	C	A	4432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=76;PP=2965;SC=AGCCCTGCCACCCCAAGGTGC;SOR=0.949;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=58;TCR=76;TR=134;WE=152957840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	152957887	rs1611764	G	A	4778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=93;NR=48;PP=2965;SC=CCAGCCCAAGGTTCCAGAGCC;SOR=1.577;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=93;TCR=48;TR=141;WE=152957895;WS=152957877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr1	152975495	rs2075739	G	A	3769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=31;PP=2887;SC=ATCCTTTGAAGCATGAGTTCT;SOR=1.971;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=83;TCR=31;TR=114;WE=152975503;WS=152975485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	152975658	rs67156933	AGAGCCAGGCTGTACCAAGGTCCCT	A	697.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.01;QD=33.23;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	152975763	rs1977734	C	A	1550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.569;NF=24;NR=17;PP=1150;ReadPosRankSum=1.322;SC=CTGAGCCAGGCTGTACCAAGG;SOR=0.729;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=43;TCF=26;TCR=17;TR=41;WE=152975771;WS=152975753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr1	152975829	rs1970328	A	G	2612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=31;PP=1885;SC=AGGTCCCTGAACCAGGCAGCA;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=38;TCR=31;TR=69;WE=152975837;WS=152975819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	152975941	rs1055935	C	G	3691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=43;PP=2879;ReadPosRankSum=0.701;SC=CTACACAAAGCTACCAGAGCC;SOR=0.441;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=112;TCF=69;TCR=43;TR=111;WE=152975949;WS=152975931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,120:0.99:121
chr1	153004721	rs1334848	A	T	1755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=1;PP=1506;SC=GAAAGAACATAGCTTTTTAAG;SOR=6.479;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=52;TCF=51;TCR=1;TR=51;WE=153004729;WS=153004711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	153004778	rs3820141	C	T	2928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=20;PP=2403;SC=TTATTCTCTGCTTAAATCATC;SOR=2.546;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=71;TCR=20;TR=91;WE=153004786;WS=153004768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	153004809	rs3181787	T	C	3366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=40;PP=2680;SC=CCAGGACCAGTCACTGTTGCA;SOR=1.343;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=68;TCR=40;TR=108;WE=153004817;WS=153004799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	153004848	rs3795381	T	C	6151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.96;QD=44.90;SOR=0.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr1	153004853	rs3795382	C	T	6256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.96;QD=44.37;SOR=0.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr1	153004983	rs12195	C	T	3614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=44;PP=2965;SC=CCAAAGTGCCCGAGCCCTGCC;SOR=1.008;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=64;TCR=44;TR=108;WE=153004991;WS=153004973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr1	153005156	rs2711	C	T	4902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=127;PP=2965;SC=TCCCATTCTGCGTATGAGTCC;SOR=2.804;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=159;TCF=32;TCR=127;TR=159;WE=153005164;WS=153005146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr1	153122310	rs510277	G	A	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=1;PP=675;SC=AGTCCTGGGAGTAAGAAGAGC;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=153122318;WS=153122300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	153190590	rs35221508	G	GT	79.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.615;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=93;ReadPosRankSum=2.285;SC=CGAATCTTGTGTTTTTTTCAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=7;WE=153190598;WS=153190580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr1	153233488	rs150026164	C	CGGCGGT	1165.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=4.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.67;ReadPosRankSum=-0.228;SOR=1.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,33:0.36:92
chr1	153233510	rs6661601	A	G	1721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.269;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.686;NF=10;NR=56;PP=1544;ReadPosRankSum=-1.151;SC=TGGCGGCGGCAGCGGCGGTGG;SOR=0.309;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=98;TCF=13;TCR=85;TR=66;WE=153233518;WS=153233500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,66:0.67:99
chr1	153233701	rs1143390	A	C	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.900;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=587;ReadPosRankSum=0.092;SC=AGTACTCCGGAGGCGGCGGCT;SOR=0.880;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=73;TCF=37;TCR=36;TR=33;WE=153233709;WS=153233691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
chr1	153233991	rs11275959	A	ACTCTGGCGGCGG	1882.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=18;PP=2965;SC=GTCTGCGGCTACTCTGGCGGC;SOR=1.329;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=35;TCF=14;TCR=21;TR=25;WE=153233999;WS=153233981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	153234295	rs12043009	G	A	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.331;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=609;ReadPosRankSum=-0.240;SC=GTGGCTCCGGGAGTGGCAAGG;SOR=0.187;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=84;TCF=71;TCR=13;TR=33;WE=153234303;WS=153234285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,35:0.40:88
chr1	153279462	rs66966700	TAAG	T	2871.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=5;PP=2888;SC=GCGCAGAAAATAAGAGCCACA;SOR=4.680;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=57;TCR=5;TR=62;WE=153279472;WS=153279452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	153283004	rs821423	C	T	7005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=1.333;SC=TGAAAGCACTCGGATGGGTTT;SOR=0.309;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=215;TCF=119;TCR=96;TR=214;WE=153283012;WS=153282994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,225:1.00:226
chr1	153283179	rs3006473	A	G	1683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=45;PP=1408;ReadPosRankSum=-0.704;SC=TGTGGACGGCAGCCCTGGAAG;SOR=2.546;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=52;WE=153283187;WS=153283169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,53:0.98:54
chr1	153314153	rs3006448	C	A	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=7;PP=400;SC=CTCGCCTTTCCCAAGAAGTGG;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=17;WE=153314161;WS=153314143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	153314347	rs3006449	C	T	271.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=8;PP=223;SC=AGCCCCTGCACAGCTGATGGA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=153314355;WS=153314337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	153315467	rs5777858	T	TAAG	1087.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=950;SC=ATGAGAAGGATAAGACAGCAG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=19;WE=153315475;WS=153315457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	153315579	rs3014863	A	G	1674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=18;PP=1338;SC=TCTTAGTGCCAAAGAAGGCAA;SOR=1.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=58;WE=153315587;WS=153315569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	153315784	rs1865234	T	C	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=30;PP=902;SC=GGACTGAAGCTATGTTCACTA;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=32;WE=153315792;WS=153315774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	153320334	rs3006457	T	C	3557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=35;PP=2768;SC=CTCGGTTGCTTTTTGGCCCAG;SOR=1.480;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=67;TCR=35;TR=102;WE=153320342;WS=153320324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	153320372	rs3006458	T	G	4239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=51;PP=2965;SC=CAGGCCTGGATACCCAGAGCA;SOR=0.933;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=70;TCR=51;TR=120;WE=153320380;WS=153320362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	153320581	rs3006459	T	C	1616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=44;PP=1328;SC=CAGCACCTGCTTCAGTCTTCT;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=44;WE=153320589;WS=153320571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	153431406	rs3014837	C	G	2653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=14;PP=2136;SC=GGCTTGGCTTCTCAATCTTGT;SOR=2.542;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=64;TCR=14;TR=78;WE=153431414;WS=153431396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	153509890	rs3795393	T	C	2161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.693;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=48;PP=1566;ReadPosRankSum=-1.223;SC=CTTCATCAAGTCATCGATGCT;SOR=0.467;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=117;TCF=41;TCR=76;TR=78;WE=153509898;WS=153509880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,82:0.68:120
chr1	153587256	rs11548102	A	T	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=568;ReadPosRankSum=2.211;SC=TGCAGAGATGAGGACAGGTGC;SOR=1.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=25;WE=153587264;WS=153587246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr1	153587308	rs11548104	C	T	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=3;PP=802;ReadPosRankSum=-1.208;SC=CAAGTTTTATCTCCAGGCCCA;SOR=0.504;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=52;TCF=49;TCR=3;TR=33;WE=153587316;WS=153587298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,36:0.63:57
chr1	153588208	rs9792963	G	A	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=2;PP=784;ReadPosRankSum=2.042;SC=TGCAGGGCAAGGCCAAGGTGA;SOR=0.409;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=47;TCF=45;TCR=2;TR=33;WE=153588216;WS=153588198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,33:0.70:47
chr1	153588279	rs9792967	G	A	2186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.791;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=26;PP=1768;ReadPosRankSum=-2.063;SC=TGTGGGAGCAGAAAGGCCAGG;SOR=0.854;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=81;TCR=39;TR=80;WE=153588287;WS=153588269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,79:0.67:118
chr1	153588340	rs11548103	C	T	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.441;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=797;ReadPosRankSum=-0.837;SC=CCCATGGTGCCCACTGTGTCT;SOR=0.639;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=136;TCF=64;TCR=72;TR=44;WE=153588348;WS=153588330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,45:0.33:136
chr1	153600778	rs3806233	G	A	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.017;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=464;ReadPosRankSum=-0.868;SC=TTCCAGCCCAGGAGACAGAGG;SOR=1.609;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=21;WE=153600786;WS=153600768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr1	153604029	rs1046379	C	T	4832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=72;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.653;SC=CCCTCAAGACCTTTGAGGAGG;SOR=0.274;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=72;TCR=74;TR=144;WE=153604037;WS=153604019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,153:0.99:154
chr1	153604112	rs1046381	G	A	3344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=53;PP=2624;SC=CCACCCCCTTGCCTCTGACTC;SOR=0.730;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=105;TCF=50;TCR=55;TR=103;WE=153604120;WS=153604102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	153609039	rs4845557	T	C	1789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=14;PP=1398;SC=TACGTATTGTTCTTTGTAGAT;SOR=1.981;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=51;WE=153609047;WS=153609029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	153615958	rs41305058	T	C	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.736;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=118;ReadPosRankSum=1.957;SC=TGTCTTGTTTTGTTATTTGAA;SOR=0.141;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=8;WE=153615966;WS=153615948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr1	153631943	rs8532	G	A	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.037;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=7;PP=561;ReadPosRankSum=-2.082;SC=GCATAAATGAGGATCAGAAGG;SOR=1.122;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=125;TCF=93;TCR=32;TR=35;WE=153631951;WS=153631933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,35:0.27:128
chr1	153632139	rs6692298	G	C	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=37;PP=664;ReadPosRankSum=1.969;SC=TTGGGGAAAGGGAAATTCACT;SOR=0.525;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=12;TCR=92;TR=42;WE=153632147;WS=153632129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,42:0.39:109
chr1	153635425	rs3795396	G	A	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=13;PP=735;SC=ACCATATTCCGCTTTGCCTGC;SOR=0.765;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=27;WE=153635433;WS=153635417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	153636432	rs10598064	TTACTAC	TTAC,T	46.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23,23;NR=0,0;PP=251,836;ReadPosRankSum=0.238;SC=AATTTCAGAGTTACTACTACT;SOR=0.048;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=23,23;WE=153636445;WS=153636423;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.16:31
chr1	153636465	.	CTA	C	1663.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.83;ReadPosRankSum=0.976;SOR=2.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,45:0.73:62
chr1	153636468	.	CTACT	C	1658.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.768;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=6.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.39;ReadPosRankSum=0.778;SOR=2.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,48:0.71:68
chr1	153636472	.	T	C	1090	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MMLQ=28;MQ=59.6;NF=43;NR=1;PP=1090;QD=25.5629821033;SC=CTACTACTACTAGTAAATAAG;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=64;TCF=61;TCR=3;TR=44;WE=153636480;WS=153636462;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:20,44:0.69:64
chr1	153636860	rs4351684	A	G	5077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=56;PP=2965;SC=AAATGGTTAGAGAGGGACTCA;SOR=1.451;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=99;TCR=56;TR=155;WE=153636868;WS=153636850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr1	153637617	rs3862047	G	A	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.632;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=375;ReadPosRankSum=-0.646;SC=ATAGCAACAAGCTAAGTAAAC;SOR=0.273;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=17;WE=153637625;WS=153637607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr1	153640827	rs7536700	C	T	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.01;ReadPosRankSum=0.315;SOR=0.603;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,24:0.27:88
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chr1	153658139	rs5777877	C	CA	222.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=5.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.71;ReadPosRankSum=-0.034;SOR=1.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,15:0.25:60
chr1	153658187	rs3891075	A	T	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.611;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=60.09;MQRankSum=1.362;NF=28;NR=13;PP=729;ReadPosRankSum=-1.361;SC=AAGATAAGGCAGGATAAGGCA;SOR=0.968;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=112;TCF=73;TCR=39;TR=41;WE=153658195;WS=153658177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,41:0.36:115
chr1	153658767	rs60349054	A	AG	119.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=159;ReadPosRankSum=0.839;SC=GAGGGACCTCAGGGTACCCCA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=7;WE=153658775;WS=153658757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr1	153659860	rs28730729	C	G	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=226;ReadPosRankSum=0.086;SC=AACCTAACACCTGCCCCCAGC;SOR=0.250;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=15;WE=153659868;WS=153659850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
chr1	153660514	rs11295572	AC	A	473.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.939;NF=14;NR=2;PP=355;ReadPosRankSum=0.058;SC=CAGCTCCTCTACCCCCCCAAT;SOR=1.371;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=16;WE=153660522;WS=153660504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr1	153660636	.	G	A	2020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.212;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=23;PP=1483;ReadPosRankSum=-0.499;SC=GTGCTGGGCTGAGGACCCACA;SOR=0.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=98;TCF=66;TCR=32;TR=69;WE=153660644;WS=153660626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,74:0.72:103
chr1	153661374	rs34402066	CG	C	1610.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.227;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=60.14;MQRankSum=0.708;NF=35;NR=9;PP=1586;ReadPosRankSum=-0.263;SC=CGGGCGCTCACGGTAGGCTGT;SOR=1.405;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=67;TCF=51;TCR=16;TR=44;WE=153661382;WS=153661364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,50:0.68:73
chr1	153661845	rs28730731	C	T	1829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=40;PP=1443;ReadPosRankSum=0.112;SC=TCCCACCAGACCTGCCTTCTG;SOR=0.662;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=237;TCF=108;TCR=129;TR=77;WE=153661853;WS=153661835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,82:0.33:251
chr1	153662340	rs35240348	G	A	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.666;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=314;ReadPosRankSum=-0.232;SC=CGGAACGGGCGGCTACACGCC;SOR=1.282;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=23;WE=153662348;WS=153662330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,21:0.34:61
chr1	153662584	.	GTCTCTCTC	G	54.52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.42;QD=27.26;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	153665919	rs5777879	T	TC	598.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.57;NF=0;NR=18;PP=734;SC=CCTCCACACCTCCCTACCCTG;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=153665927;WS=153665909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	153701376	rs12074957	G	C	79.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=2;NR=1;PP=58;SC=CAAGTTTTTTGTGAAGTAACA;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=153701384;WS=153701366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	153732973	rs12097043	G	A	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=54;ReadPosRankSum=-0.138;SC=TTGACTGAGAGCAGAAATGGT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=153732981;WS=153732963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	153737199	rs200736215	C	T	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.418;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=328;ReadPosRankSum=1.993;SC=AGCCTCTGTACCTAATATTTA;SOR=0.951;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=20;WE=153737207;WS=153737189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,19:0.35:55
chr1	153741512	rs74115713	C	A	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=58;ReadPosRankSum=-0.057;SC=GCTCTCCCTCCAGGCCTGCAG;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=5;WE=153741520;WS=153741502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr1	153742437	rs12070179	T	C	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=46;ReadPosRankSum=0.128;SC=GGGGAGAGAATTGTACTCCAC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=5;WE=153742445;WS=153742427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr1	153742469	rs12068901	A	G	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=75;ReadPosRankSum=-0.664;SC=CTGGGGCAGTATCTTTCTGGA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=153742477;WS=153742459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	153742612	.	T	G	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.02;MQRankSum=3.696;QD=2.70;ReadPosRankSum=-1.147;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr1	153743289	rs12068256	C	G	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=4.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.72;ReadPosRankSum=0.762;SOR=1.499;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,14:0.19:72
chr1	153743316	.	C	CAT	1563.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.353;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=1123;ReadPosRankSum=0.146;SC=TTTTTCCTGTCGTTAACATCT;SOR=0.105;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=26;WE=153743325;WS=153743306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,40:0.80:50
chr1	153743317	rs4345834	G	A,T	1999.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=0,8;NR=11,23;PP=235,1131;SC=TTTTCCTGTCGTTAACATCTG;SOR=3.171;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=11,31;WE=153743325;WS=153743306;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.20,0.80:50
chr1	153744496	rs149826958	CGGT	C	363.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=-0.378;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.179;SOR=1.140;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr1	153745128	rs6663011	G	C	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.597;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=29;PP=740;ReadPosRankSum=0.597;SC=TTAGCCAGACGCCAATTCTCC;SOR=1.333;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=114;TCF=34;TCR=80;TR=36;WE=153745136;WS=153745118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,36:0.31:116
chr1	153747616	rs6682411	C	T	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.581;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=30;PP=849;ReadPosRankSum=-2.091;SC=AGCCGAGAAACAACTTAGAAG;SOR=0.771;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=170;TCF=79;TCR=91;TR=55;WE=153747624;WS=153747606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,61:0.34:178
chr1	153748161	rs34527123	G	C	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.792;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=153;ReadPosRankSum=-1.191;SC=GGTCCCGAGGGGGGCTGCAGC;SOR=0.792;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=15;WE=153748169;WS=153748151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,15:0.34:44
chr1	153748219	rs36064263	C	T	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.671;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=11;PP=470;ReadPosRankSum=1.362;SC=CCGCGCACACCTTTCTCATTC;SOR=0.311;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=67;TCF=42;TCR=25;TR=25;WE=153748227;WS=153748209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,24:0.36:66
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chr1	153750214	rs374974027	TC	T	1304.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=1.711;QD=8.00;ReadPosRankSum=0.528;SOR=0.840;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,42:0.26:163
chr1	153784666	rs11264420	CT	C,CTT	42.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.4860,0.5140;FS=3.812;HP=18;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.379;NF=3,3;NR=8,8;PP=10,138;ReadPosRankSum=-1.980;SC=ACCCAATTTCCTTTTTTTTTT;SOR=1.739;Source=Platypus;TCF=12;TR=11,11;WE=153784674;WS=153784656;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.24:33
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chr1	153791165	rs147317448	AGAG	A	1070.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.354;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.431;NF=24;NR=3;PP=1039;ReadPosRankSum=-0.443;SC=CTACGGACCCAGAGAAGAAAT;SOR=0.422;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=65;TCR=8;TR=27;WE=153791175;WS=153791155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,32:0.34:93
chr1	153800931	rs144104082	TACACACAC	T	200.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=300;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CTCTCACACATACACACACAC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=5;WE=153800946;WS=153800921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	153902773	.	C	T	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.600;ClippingRankSum=0.000;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.260;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=610;ReadPosRankSum=-0.186;SC=CTTAAGGTCTCTAGCATTCTG;SOR=0.180;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=126;TCF=81;TCR=45;TR=38;WE=153902781;WS=153902763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,40:0.31:129
chr1	153903129	rs55874907	C	T	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.253;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=28;PP=1025;ReadPosRankSum=0.154;SC=GTGTGGAGCCCCGGACAGACC;SOR=0.505;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=137;TCF=56;TCR=81;TR=50;WE=153903137;WS=153903119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,52:0.37:139
chr1	153904574	rs11264620	T	C	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.635;NF=20;NR=4;PP=469;ReadPosRankSum=0.106;SC=TGAGCCACCGTGCCTGGCCAG;SOR=0.430;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=24;WE=153904582;WS=153904564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr1	153904820	.	C	T	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.530;ClippingRankSum=0.000;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.521;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=538;ReadPosRankSum=0.611;SC=GCCAGCACCTCACTGCCCTCG;SOR=1.078;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=136;TCF=59;TCR=77;TR=38;WE=153904828;WS=153904810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,39:0.28:138
chr1	153904847	.	C	A	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.318;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.01;ReadPosRankSum=-0.134;SOR=0.794;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,24:0.26:92
chr1	153906397	rs11264621	A	G	1839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.936;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=49;PP=1475;ReadPosRankSum=0.059;SC=CTCTGCACCAACTTCCCCTTT;SOR=1.033;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=29;TCR=66;TR=71;WE=153906405;WS=153906387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,70:0.71:99
chr1	153907278	rs3835302	CCTGCTGCTG	C	2828.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=13;PP=2993;SC=GACACCTGCTCCTGCTGCTGC;SOR=2.799;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=51;TCR=15;TR=57;WE=153907294;WS=153907268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	153909069	rs1043608	G	C	1503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=8;PP=1191;SC=GCACATGGTAGGCTGTGTGCA;SOR=2.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=47;WE=153909077;WS=153909059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	153911321	rs80093879	A	T	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=4;PP=811;ReadPosRankSum=0.550;SC=TTGGGGCAACAGAGACAATGA;SOR=1.200;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=50;TCF=44;TCR=6;TR=36;WE=153911329;WS=153911311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,36:0.72:50
chr1	153912263	.	CC	TT	2444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.66;ReadPosRankSum=0.423;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,67:0.37:179
chr1	153912266	.	C	T	2447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.529;ClippingRankSum=0.000;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=0.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.48;ReadPosRankSum=-0.177;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,66:0.39:169
chr1	153912501	.	C	G	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.653;ClippingRankSum=0.000;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.919;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=522;ReadPosRankSum=1.629;SC=GAATCTCCCTCAGTTCCACCA;SOR=2.311;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=86;TCF=69;TCR=17;TR=25;WE=153912509;WS=153912491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,26:0.30:88
chr1	153913699	rs1110165	T	G	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.243;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=327;ReadPosRankSum=0.144;SC=CACAATCTGATCACATACCTG;SOR=2.833;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=15;WE=153913707;WS=153913689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr1	153913770	rs2252508	A	G	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.024;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=777;ReadPosRankSum=0.499;SC=AGACATCTGGAAGGGAAGAAG;SOR=1.344;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=66;TCF=39;TCR=27;TR=40;WE=153913778;WS=153913760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,43:0.63:68
chr1	153915616	.	G	A	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.675;ClippingRankSum=0.000;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.582;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=26;PP=690;ReadPosRankSum=0.512;SC=CCTTGGCACAGAGAGCAAAGA;SOR=0.432;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=127;TCF=42;TCR=85;TR=42;WE=153915624;WS=153915606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,44:0.33:135
chr1	153917369	rs6680140	C	T	365.22	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=275;ReadPosRankSum=0.726;SC=TAAGAGGACCCCATGGGTTTC;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=153917377;WS=153917366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr1	153920564	rs10559	A	G	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=3;PP=599;ReadPosRankSum=1.292;SC=GGCCAAGAAGAGGGATGGTGA;SOR=0.551;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=26;WE=153920572;WS=153920554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr1	153921483	rs111395902	AC	A	1305.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.716;NF=21;NR=20;PP=1380;ReadPosRankSum=-0.200;SC=CCCACCACCCACCCCACCTAG;SOR=0.757;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=75;TCF=41;TCR=34;TR=41;WE=153921491;WS=153921473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,45:0.68:66
chr1	153926078	rs11264680	T	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=113;ReadPosRankSum=1.383;SC=CCCCAGGCCATCGTCCTGGGG;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=153926086;WS=153926068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr1	153941514	rs11264743	C	T	1809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.545;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=35;PP=1398;ReadPosRankSum=0.574;SC=CTCTGAGGACCCCTGCCATCC;SOR=1.362;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=85;TCF=37;TCR=48;TR=57;WE=153941522;WS=153941504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,61:0.68:90
chr1	153954646	rs2230324	C	T	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=122;ReadPosRankSum=-1.076;SC=GGCTTGTTGCCGTTTCCCTAG;SOR=0.495;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=11;WE=153954654;WS=153954636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr1	153954674	rs10908578	T	C	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.512;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=431;ReadPosRankSum=-1.124;SC=AGGGCACAGGTGTCATGGTGT;SOR=0.793;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=35;TCF=19;TCR=16;TR=26;WE=153954682;WS=153954664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,27:0.75:36
chr1	153964396	rs34521811	C	CAA	6010.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.109;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.650;NF=70;NR=34;PP=2927;ReadPosRankSum=-1.384;SC=AGGAAGTAACCAGTGATACAA;SOR=0.440;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=167;TCF=117;TCR=50;TR=104;WE=153964404;WS=153964386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,147:0.71:207
chr1	153974621	rs6701341	C	T	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=377;ReadPosRankSum=-0.395;SC=TTGGCCACTACGAGGAGGATG;SOR=0.602;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=16;WE=153974629;WS=153974611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr1	153994647	rs11264875	C	T	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=15;PP=1068;ReadPosRankSum=1.067;SC=ATATCTCCAACAAAGGTAAGC;SOR=0.656;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=83;TCF=59;TCR=24;TR=50;WE=153994655;WS=153994637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,52:0.60:87
chr1	154027381	rs3834774	AT	A	1183.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=2.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=-0.249;QD=12.33;ReadPosRankSum=-0.835;SOR=0.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,66:0.69:96
chr1	154029450	rs11264964	G	C	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=250;ReadPosRankSum=-0.764;SC=ATTTTCAGGTGAGAAAGATTT;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=12;WE=154029458;WS=154029440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr1	154033329	rs72070929	ATAAG	A	428.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.388;NF=11;NR=1;PP=464;ReadPosRankSum=1.011;SC=TTTTCAACACATAAGTAAGTT;SOR=0.277;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=12;WE=154033340;WS=154033319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr1	154061855	rs2066135	T	G	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=8;PP=681;SC=AAGCACGGAATATAAAAGTGC;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=27;WE=154061863;WS=154061845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	154076366	rs7521047	T	C	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=25;ReadPosRankSum=-0.126;SC=TAGACTATAATTGGTAGTTTC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=154076374;WS=154076359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr1	154091017	rs6661101	G	C	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-4.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=514;ReadPosRankSum=-0.822;SC=TATAATTTTGGTTGTCACCAA;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=22;WE=154091025;WS=154091007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr1	154108387	rs3001361	G	A	3988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=94;PP=2965;SC=AATGAGACCCGTTAAGTGCAA;SOR=2.852;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=24;TCR=94;TR=118;WE=154108395;WS=154108377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	154110733	rs11318139	GA	G	1623.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=0.631;QD=15.18;ReadPosRankSum=-1.031;SOR=0.533;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,78:0.73:107
chr1	154112167	rs2500223	A	C	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=-0.364;QD=16.23;ReadPosRankSum=0.403;SOR=1.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr1	154141908	rs4845364	A	G	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.568;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=40;PP=1144;ReadPosRankSum=1.021;SC=CAGAGTGAAGAGTTTCAGAAG;SOR=0.359;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=80;TCF=15;TCR=65;TR=51;WE=154141916;WS=154141898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,51:0.64:80
chr1	154178185	rs370938534	CT	C	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=6.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.962;QD=0.41;ReadPosRankSum=-2.003;SOR=0.084;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,12:0.16:77
chr1	154186918	rs12408458	G	C	2167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.509;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=37;PP=1617;ReadPosRankSum=-0.489;SC=AGCATTCCAAGAGCTTGCCAC;SOR=0.371;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=103;TCF=55;TCR=48;TR=73;WE=154186926;WS=154186908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,79:0.73:108
chr1	154192143	rs9803862	G	A	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=0;PP=721;ReadPosRankSum=1.813;SC=GCACTGAGCAGGTAAGCCAAG;SOR=1.559;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=30;WE=154192151;WS=154192133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,30:0.67:45
chr1	154192463	rs34176728	G	GT	542.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.366;SOR=1.347;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr1	154208877	rs3762339	A	G	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.051;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=252;ReadPosRankSum=-0.118;SC=GTTTTGCTCTATTGCCTAGGC;SOR=3.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=11;WE=154208885;WS=154208867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr1	154218550	rs11301778	CT	C	93	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=161;SC=CATTTCAAGGCTTTTGTGTTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=154218558;WS=154218544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	154218639	rs4040743	TTCAG	T	269.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.692;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=100;ReadPosRankSum=-0.188;SC=TGTTAGCGTGTTCAGTCATTC;SOR=0.368;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=4;WE=154218650;WS=154218629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr1	154227239	rs1194604	C	A	1500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.224;NF=49;NR=0;PP=1259;ReadPosRankSum=1.020;SC=AATAAAGCTGCATCAGTGCTA;SOR=2.165;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=66;TCR=0;TR=49;WE=154227247;WS=154227229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,49:0.74:66
chr1	154227292	rs11412846	G	GT	712.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.88;MQRankSum=0.000;QD=9.14;ReadPosRankSum=-1.059;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,45:0.58:78
chr1	154228287	rs1194603	T	C	1509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.499;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=54;PP=1143;ReadPosRankSum=0.441;SC=ACTGTCCAACTGTAAGATTGT;SOR=1.134;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=94;TCF=15;TCR=79;TR=63;WE=154228295;WS=154228277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,64:0.67:96
chr1	154243115	rs1044013	C	T	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=115;ReadPosRankSum=-1.861;SC=GACCCCCAAACATATATCAGC;SOR=0.250;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=8;WE=154243123;WS=154243105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr1	154243246	rs7554027	G	T	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=12.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQRankSum=2.670;QD=14.24;ReadPosRankSum=-2.823;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr1	154243457	rs12354278	A	T	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=527;ReadPosRankSum=0.405;SC=ATAAAATGAAATCTTCGCCCT;SOR=0.747;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=74;TCF=12;TCR=62;TR=26;WE=154243465;WS=154243447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,27:0.36:75
chr1	154245917	rs13796	T	C	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.027;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=319;ReadPosRankSum=-1.413;SC=GGTTCCATAGTCCTCAGCACC;SOR=0.374;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=66;TCF=40;TCR=26;TR=21;WE=154245925;WS=154245907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,23:0.32:73
chr1	154285052	rs11265530	G	A	1965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=34;PP=1603;SC=GGTAGGTAGGGTCACTGGGGG;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=30;TCR=34;TR=64;WE=154285060;WS=154285042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	154285078	rs11581043	T	G	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=37;PP=1354;SC=AAGAAGGGGGTTGGGCAAAAG;SOR=1.848;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=53;WE=154285086;WS=154285068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	154293675	rs6668968	G	A	2307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=25;PP=1623;SC=GGCCACCTCCGGATACGCAGC;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=46;TCR=25;TR=71;WE=154293683;WS=154293665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	154294656	rs1194607	T	C	2850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=72;PP=2331;SC=TTGAACAGTGTCCCAGACTGA;SOR=3.391;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=13;TCR=72;TR=85;WE=154294664;WS=154294646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr1	154295592	rs6685323	C	T	3932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=57;PP=2965;ReadPosRankSum=1.536;SC=TGTTCTCTACCATGGTGACAG;SOR=0.334;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=72;TCR=57;TR=129;WE=154295600;WS=154295582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,129:0.99:130
chr1	154303705	rs12727865	C	T	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=35;PP=1110;SC=CCACCTTCATCCAGCACAATT;SOR=5.031;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=36;WE=154303713;WS=154303695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	154303976	rs6702754	T	C	1625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=14;PP=1316;SC=TGCTGATCAATGGAATGTGAG;SOR=1.893;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=51;WE=154303984;WS=154303966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	154305010	rs1209264	A	G	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=1;PP=580;SC=CTCCAGCCTGAGCAGCAGAGC;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=154305018;WS=154305000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	154305190	rs12077870	G	C	3543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=64;PP=2746;SC=AATTTTGGAGGAGCAGCCTGA;SOR=1.138;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=108;TCF=42;TCR=66;TR=106;WE=154305198;WS=154305180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	154307262	rs61808683	C	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=-0.663;SC=ACTTCAGGAACGTGCATGAAT;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=154307270;WS=154307252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr1	154310223	rs11448687	G	GA	615.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.758;NF=2;NR=23;PP=426;ReadPosRankSum=-1.455;SC=CTGTATTAGAGAAAAAAAAAT;SOR=0.616;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=45;TCF=4;TCR=41;TR=25;WE=154310231;WS=154310213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,28:0.67:42
chr1	154313232	rs1194588	T	C	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.895;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=114;ReadPosRankSum=1.054;SC=TCTCCGTTCTTGTCTCTCCCC;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=6;WE=154313240;WS=154313222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	154313689	rs34968830	G	A	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.501;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=261;ReadPosRankSum=1.035;SC=GGCCAGGCACGGTGGCTCATG;SOR=1.871;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=14;WE=154313697;WS=154313679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr1	154316434	rs2274988	C	T	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.952;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=558;ReadPosRankSum=-0.832;SC=AAGAGTACTACGAGGAGTGGG;SOR=0.298;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=63;TCF=52;TCR=11;TR=28;WE=154316442;WS=154316424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr1	154317281	rs9660850	G	A	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.517;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=577;ReadPosRankSum=-0.489;SC=GCTATCCTTAGCTTGGGCAGT;SOR=0.172;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=28;WE=154317289;WS=154317271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr1	154318172	rs1979575	A	G	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=23;PP=1328;ReadPosRankSum=0.143;SC=AAGGAGCCTCAGAAAATTTCT;SOR=0.776;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=55;TCR=30;TR=66;WE=154318180;WS=154318162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,67:0.78:86
chr1	154320942	rs2297607	A	G	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.440;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=470;ReadPosRankSum=-1.519;SC=TGCTCACCACAGTCGTCTGCA;SOR=1.533;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=95;TCF=22;TCR=73;TR=28;WE=154320950;WS=154320932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,30:0.31:97
chr1	154321072	rs1194591	A	G	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=15;PP=484;SC=GAAAGGCCTCATGTGAACACT;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=154321092;WS=154321062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	154401972	rs6694817	T	C	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.732;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=32;PP=803;ReadPosRankSum=0.412;SC=AAATGAGGCTTTGTGCATTCC;SOR=0.559;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=145;TCF=41;TCR=104;TR=46;WE=154401980;WS=154401962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,47:0.31:150
chr1	154407419	rs7518199	A	C	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.269;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=112;ReadPosRankSum=0.624;SC=GGGCTTCTCTACACTATATTT;SOR=0.182;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=7;WE=154407427;WS=154407409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr1	154407713	rs7521458	T	C	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.322;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=124;ReadPosRankSum=-1.316;SC=AGGCCAGGCATGGTGGCTCAC;SOR=0.117;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=12;WE=154407721;WS=154407703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,13:0.27:48
chr1	154409893	rs71586015	A	AT	473.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.64;MQRankSum=3.698;QD=4.93;ReadPosRankSum=-1.129;SOR=0.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,32:0.33:96
chr1	154420402	rs7512646	G	C	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.674;NF=2;NR=1;PP=37;ReadPosRankSum=0.598;SC=GTTGGTCAGGGTGGTCTCGAA;SOR=0.132;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=3;WE=154420410;WS=154420395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	154422619	rs57636717	T	TGTGTG	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQRankSum=-1.611;QD=6.84;ReadPosRankSum=-0.732;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr1	154426970	rs2228145	A	C	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.877;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=107;ReadPosRankSum=1.974;SC=CTAGTGCAAGATTCTTCTTCA;SOR=1.314;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=45;TCF=28;TCR=17;TR=12;WE=154426978;WS=154426960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
chr1	154437896	rs2229238	T	C	3614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=98;PP=2965;SC=CTGTGGATGATAAAACACAAA;SOR=7.073;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=99;TCF=1;TCR=98;TR=99;WE=154437904;WS=154437886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	154442960	rs11265621	G	A	4016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=24;NR=96;PP=2965;SC=TACAGGGCAGGGGCAGGAAAC;SOR=2.833;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=24;TCR=96;TR=120;WE=154442968;WS=154442950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	154459197	rs4845633	C	G	2168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=48;PP=1757;SC=CAGGCCACTGCGGTGACCCAT;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=19;TCR=48;TR=67;WE=154459205;WS=154459187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	154474131	rs4845635	C	G	4240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=94;PP=2965;SC=CCTCCGTGGCCCGGGAGTTTT;SOR=1.869;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=134;TCF=40;TCR=94;TR=134;WE=154474139;WS=154474121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr1	154474557	rs6703672	T	C	242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=10;PP=189;SC=GGCTGCTCCGTGCGCCCCCGG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=154474565;WS=154474547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	154479657	rs10654618	C	CAT	1562.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=6;PP=1694;SC=ATGCCTGACACGTTTCCTTTT;SOR=3.026;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=154479678;WS=154479647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	154479670	rs6664608	C	T	1214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=5;PP=995;SC=TTCCTTTTGTCGGAGTCTGAG;SOR=3.383;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=35;WE=154479678;WS=154479647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	154492702	rs10908842	G	A	2000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=5;PP=1608;SC=CAGACTAGCTGGCTGGGGATC;SOR=4.582;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=56;TCR=5;TR=61;WE=154492710;WS=154492692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	154493721	rs6684225	T	C	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=3;PP=536;SC=CCTTCCAGCTTGGGCTTGGTG;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=20;WE=154493729;WS=154493711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	154514331	rs4845647	C	A	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=2;PP=635;SC=CTCAGGATGCCGTGAGGATGG;SOR=3.528;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=24;WE=154514339;WS=154514321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	154516571	rs6678164	T	C	5086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=103;PP=2965;SC=TTTTCTGGGCTATGCACGTCA;SOR=1.853;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=44;TCR=103;TR=147;WE=154516579;WS=154516561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr1	154523215	rs4520411	C	T	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=628;SC=ATCGGTGATACGATCATTTTG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=23;WE=154523223;WS=154523205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	154523588	rs10908849	T	G	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=399;SC=CTCCCAGCACTGTGGTCTAGT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=154523596;WS=154523578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	154528086	rs4078519	T	C	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=26;PP=873;SC=GCTCTTAGTTTGGGCCCCACA;SOR=2.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=35;WE=154528094;WS=154528076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	154561261	rs9427095	G	C	1309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=35;PP=1068;SC=TGTTGCAGACGTTTCACAGTT;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=154561269;WS=154561251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	154561925	rs1127309	C	T	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=308;ReadPosRankSum=2.947;SC=AATCTCCTTTCACACAGCGAT;SOR=0.779;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=55;TCF=26;TCR=29;TR=19;WE=154561933;WS=154561915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,20:0.34:58
chr1	154562624	rs201932953	CG	C	87.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=3.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=-0.776;QD=5.48;ReadPosRankSum=1.613;SOR=0.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr1	154562625	rs7532276	G	C	138.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.942;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=3.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=0.776;QD=8.67;ReadPosRankSum=-1.680;SOR=2.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr1	154562788	.	G	A	2131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=5.306;ClippingRankSum=0.000;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.626;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=38;PP=1715;ReadPosRankSum=1.271;SC=ATCAAGACACGGAGAGCCGCA;SOR=0.754;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=137;TCF=71;TCR=66;TR=79;WE=154562796;WS=154562778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,79:0.57:139
chr1	154571174	rs143817514	T	TGGA	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=451;SC=TTTTCACTTGTGGAGATGAAG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=154571182;WS=154571164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	154573967	rs2229857	T	C	4650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.018;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=96;PP=2962;ReadPosRankSum=1.368;SC=TGCGTTTCTTTTGGTCTCAGG;SOR=0.443;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=235;TCF=85;TCR=150;TR=157;WE=154573975;WS=154573957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,160:0.68:237
chr1	154574820	rs1466731	T	C	4722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=79;PP=2965;SC=CCCTGACTTCTGAGATGCACG;SOR=0.744;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=80;TCR=79;TR=159;WE=154574828;WS=154574810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr1	154575040	rs1802645	C	T	2394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=42;PP=1950;SC=GCTGCTGGTACCTGAGCTGTC;SOR=1.134;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=30;TCR=43;TR=72;WE=154575048;WS=154575030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	154580348	rs71586026	G	GAC	1710.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FS=0.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=2.830;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.347;SOR=0.625;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:230,73:0.24:303
chr1	154580458	rs58655370	C	A	5947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.049;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=170;PP=2962;ReadPosRankSum=1.191;SC=CCAAGGCCGGCCCGGCTTACC;SOR=1.304;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=353;TCF=109;TCR=244;TR=233;WE=154580466;WS=154580448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,238:0.67:356
chr1	154600372	rs6426859	A	G	1354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=8;PP=1225;SC=ACACCCGGAGACTGCCAGTGC;SOR=2.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=42;WE=154600380;WS=154600362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	154600533	rs28411375	A	G	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.899;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=404;ReadPosRankSum=1.036;SC=TTTGCGCTCTAGGAAATTAAG;SOR=1.068;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=100;TCF=42;TCR=58;TR=27;WE=154600541;WS=154600523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,30:0.29:103
chr1	154709682	rs35539682	TG	T	480.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=14;PP=265;SC=ATAGAAAATTTGGGGGGGGGG;SOR=2.948;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=17;WE=154709690;WS=154709672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	154744807	rs1051614	C	G	7635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=192;PP=2965;SC=GGCTGATGTACAGGATGCGCT;SOR=3.601;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=224;TCF=31;TCR=193;TR=223;WE=154744815;WS=154744797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr1	154744852	rs1131820	A	G	3539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=95;PP=2848;SC=CATCCGCGCCATTGTCGATCA;SOR=4.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=7;TCR=95;TR=102;WE=154744860;WS=154744842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	154744937	rs11589471	C	T	621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=16;PP=490;SC=CCAGGCAGGACAGGTGGGGCA;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=19;WE=154744945;WS=154744927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	154832304	rs4845397	T	C	1323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=25;PP=827;SC=GAGTGTCCTTTAAGCTGACTT;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=154832312;WS=154832294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	154832322	rs1218586	A	C	1239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=21;PP=712;SC=CTTTCCTGTTAATTTGACACT;SOR=3.690;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=154832330;WS=154832312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	154841415	rs57846577	TCTCTCTCTCTCACA	T	2899.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=0;PP=2985;SC=TCTCTCTCAATCTCTCTCTCT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=42;WE=154841436;WS=154841405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	154842199	.	G	GGCTGCTGCTGCTGCT,GGCTGCTGCTGCTGCTGCT	1378.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.70;QD=106.06;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,6,7:0.46,0.54:13
chr1	154917701	rs906594	A	G	1603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=40;PP=1279;SC=AGCAGGCACCACCAAGCATAT;SOR=2.393;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=53;WE=154917709;WS=154917691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	154919080	rs2061690	C	T	4355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=98;PP=2965;SC=TGGGCCTCTACCCCCACTGAG;SOR=2.053;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=39;TCR=98;TR=136;WE=154919088;WS=154919070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr1	154983539	rs6686021	C	T	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=503;SC=TGCCTGTGTCCCAGGCCCATA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=154983547;WS=154983529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	154987526	rs11264295	C	T	3340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.525;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=58;PP=2776;ReadPosRankSum=-0.634;SC=TGCTGGAGATCCCGTGTGTCA;SOR=0.620;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=203;TCF=112;TCR=91;TR=125;WE=154987534;WS=154987516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,125:0.61:206
chr1	154988957	rs2242195	A	G	5152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=74;NR=97;PP=2965;SC=CCCACTACCCACCACCCTCTA;SOR=0.996;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=171;TCF=74;TCR=97;TR=171;WE=154988965;WS=154988947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr1	155001929	rs10908452	T	C	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=515;ReadPosRankSum=0.232;SC=GTCCACCAGATCCCAGTTCTT;SOR=1.418;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=22;WE=155001937;WS=155001919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr1	155003954	rs11582128	G	A	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.398;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=69;ReadPosRankSum=-1.915;SC=CCCTCTAATCGTCCTCCTGAG;SOR=1.609;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=5;WE=155003962;WS=155003944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr1	155006091	rs10908453	A	G	5845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.761;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=89;PP=2962;ReadPosRankSum=0.799;SC=CCAGGGTAAAACCTCCCACGC;SOR=0.851;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=294;TCF=157;TCR=137;TR=204;WE=155006099;WS=155006081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,213:0.70:304
chr1	155006999	rs6680600	C	T	3023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.140;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=53;PP=2413;ReadPosRankSum=-0.584;SC=TCACTGCTCTCCTGCTGGGGG;SOR=0.666;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=157;TCF=79;TCR=78;TR=111;WE=155007007;WS=155006989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,111:0.70:158
chr1	155007293	rs4845404	C	T	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.86;ReadPosRankSum=0.795;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr1	155007302	rs4845405	C	A	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=34.16;ReadPosRankSum=0.718;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr1	155019710	rs11264300	A	C	1303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.952;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=9;PP=1009;ReadPosRankSum=1.122;SC=GGGAGACTCCATGCTAGCCCG;SOR=1.781;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=71;TCF=55;TCR=16;TR=46;WE=155019718;WS=155019700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,48:0.65:74
chr1	155026114	rs6660884	C	T	1228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=32;PP=952;SC=ATTGTCCTCACTTTATACATG;SOR=3.855;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=34;WE=155026122;WS=155026104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	155026871	rs11548311	G	T	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.458;SOR=0.561;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,34:0.25:135
chr1	155026942	rs6427128	A	C	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.813;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,33:0.25:134
chr1	155028522	rs11264302	G	A	1904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.290;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=19;PP=1394;ReadPosRankSum=1.623;SC=CCTGACCATGGCAACCCCTCT;SOR=1.166;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=239;TCF=168;TCR=71;TR=78;WE=155028530;WS=155028512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,82:0.33:246
chr1	155030557	rs11264303	A	C	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FS=5.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.65;ReadPosRankSum=1.657;SOR=1.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:228,88:0.28:316
chr1	155033308	rs11589479	G	A	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.168;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=1608;ReadPosRankSum=-0.032;SC=GAGGCACTAAGGTGAGTCCTG;SOR=0.163;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=59;TCF=13;TCR=46;TR=37;WE=155033325;WS=155033298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,42:0.68:62
chr1	155033317	rs11264304	T	C	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.193;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=802;ReadPosRankSum=0.679;SC=AGGTGAGTCCTGGATGCCAGA;SOR=3.343;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=53;TCF=8;TCR=45;TR=18;WE=155033325;WS=155033298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,17:0.31:55
chr1	155057499	rs3766918	A	G	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.257;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=4;PP=575;ReadPosRankSum=0.368;SC=GGGGCTGCGGAGCGGTCAGAT;SOR=0.283;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=95;TCF=87;TCR=8;TR=31;WE=155057507;WS=155057489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,33:0.33:100
chr1	155106054	rs4390169	A	G	3611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=55;PP=2953;SC=AGTGAGTGTCAGAGCCCTGTG;SOR=0.779;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=62;TCR=55;TR=117;WE=155106062;WS=155106044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	155106227	rs4745	A	T	4469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=82;PP=2965;SC=CAGGCCCATGACAATCCACAG;SOR=1.006;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=63;TCR=82;TR=145;WE=155106235;WS=155106217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr1	155160105	.	G	A	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.667;ClippingRankSum=0.000;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.033;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=27;PP=605;ReadPosRankSum=-1.437;SC=CGCCCCTCCCGCTGCCAGCAC;SOR=0.836;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=82;TCF=14;TCR=68;TR=32;WE=155160113;WS=155160095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,33:0.39:85
chr1	155205669	rs28559737	G	T	4219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=96;PP=2965;SC=AGACAAAGGCGCAACACTGGG;SOR=2.019;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=52;TCR=96;TR=148;WE=155205677;WS=155205659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	155280104	.	CT	C	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=0.711;QD=2.48;ReadPosRankSum=-0.708;SOR=0.173;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr1	155294274	rs914616	A	G	2998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=79;PP=2383;SC=GCGCTGGGCTACACCTCCCTC;SOR=3.732;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=11;TCR=79;TR=90;WE=155294282;WS=155294264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	155294772	rs4971075	A	G	3175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=48;PP=2564;SC=GCTTCCGAATAAACTGCCCTT;SOR=0.826;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=41;TCR=48;TR=89;WE=155294780;WS=155294762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	155313047	rs4971051	T	C	1615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=1;PP=1315;SC=GCTGGGATTATCAGCGTGAGC;SOR=6.399;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=45;WE=155313055;WS=155313037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	155408635	rs4971053	T	C	4479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=90;PP=2965;SC=GAGTCACTTGTGACTGCAGGC;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=57;TCR=90;TR=147;WE=155408643;WS=155408625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr1	155532316	rs12403379	T	C	6245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.25;QD=45.26;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	155532325	rs12403380	T	C	6681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.17;QD=47.39;SOR=0.996;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr1	155532332	rs34869594	T	C	6402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.12;QD=46.74;SOR=1.043;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr1	155532341	rs61812107	T	C	6301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.32;QD=45.34;SOR=1.510;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr1	155560839	rs61742466	C	T	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.169;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.089;NF=9;NR=8;PP=282;ReadPosRankSum=-1.889;SC=CCTGTGGCAGCGCCAGCAGTG;SOR=0.657;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=48;TCF=22;TCR=26;TR=17;WE=155560847;WS=155560829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr1	155618415	rs5777949	CT	C	3798.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=65;PP=2966;SC=ACTCATGCGCCTTTTCAGATG;SOR=0.816;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=119;TCF=53;TCR=66;TR=114;WE=155618423;WS=155618405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	155701789	.	C	G	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.209;ClippingRankSum=0.000;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=393;ReadPosRankSum=-0.190;SC=CTTTAAGCCCCGGAAAGCCTA;SOR=0.752;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=100;TCF=50;TCR=50;TR=33;WE=155701797;WS=155701779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,33:0.33:101
chr1	155737385	rs849712	C	T	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.41;QD=29.43;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	155746340	rs60525991	CT	C	283.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=11;PP=203;SC=CCAGAGAGATCTTTTTTTTTT;SOR=2.833;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=13;WE=155746348;WS=155746330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	155755097	rs822021	G	A	3186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=71;PP=2423;ReadPosRankSum=1.581;SC=TTAAAATCCCGTGTTCTCACT;SOR=1.161;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=23;TCR=72;TR=94;WE=155755105;WS=155755087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
chr1	155785578	rs148569012	CAACT	C	3455.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=23;PP=2887;SC=CAAATATTACCAACTAACATT;SOR=1.923;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=67;TCF=43;TCR=24;TR=59;WE=155785589;WS=155785568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	155785776	.	G	GA	32.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.56;ReadPosRankSum=0.741;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr1	155822971	rs822490	C	T	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=567;SC=AAATCAATATCCCCTTTCAGA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=155822979;WS=155822961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	155823002	rs822491	T	C	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=0;PP=942;SC=TGTAAAGGTATCCAGAAATAG;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=35;WE=155823010;WS=155822992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	155829360	rs1749412	C	A	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=1;PP=300;SC=CTTAGCTCAGCGCATCCCCGG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=155829368;WS=155829352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	155837865	rs822522	G	C	4650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=35;PP=2965;SC=AGAAGAAGCAGAAGAACCCAC;SOR=2.416;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=112;TCR=35;TR=147;WE=155837873;WS=155837855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr1	155838267	rs822521	T	C	5918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=77;PP=2965;SC=AGGAGGCCCATGGGCTGCCAG;SOR=1.226;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=201;TCF=123;TCR=78;TR=200;WE=155838275;WS=155838257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr1	155850558	rs822508	T	C	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=34;PP=807;SC=CTCTTCCTGATGAGTATCTAC;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=155850566;WS=155850548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	155850811	rs822509	G	A	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=2;PP=296;SC=CATCCAGGCAGGCAGACTCAC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=155850819;WS=155850806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	155870416	rs1749409	G	A	3325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=60;PP=2681;SC=TGACCTTTAAGGGCAAAATGT;SOR=0.849;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=49;TCR=61;TR=109;WE=155870424;WS=155870406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	155880573	rs493446	C	G	4490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=97;PP=2965;SC=GGGCCTTCCTCGGTTGCCCCG;SOR=2.215;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=34;TCR=97;TR=131;WE=155880581;WS=155880563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr1	155880760	rs5777961	C	CA	723.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=845;SC=AGAAACCCCCCCATCTTCACC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=155880768;WS=155880750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	155891045	rs625658	A	C	1758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=0;PP=1442;SC=AGGAACACAGAAGACAGCAGG;SOR=7.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=52;TCR=0;TR=52;WE=155891053;WS=155891035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	155891877	rs4020747	C	CAG	1897.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=41;PP=2193;SC=TTTTTTGAGACAGTCTTGCTC;SOR=5.283;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=43;WE=155891885;WS=155891867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	155899020	rs539602	A	T	6911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=159;NR=39;PP=2965;SC=ACCTAAGGATAAAAAACATGA;SOR=2.757;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=159;TCR=39;TR=198;WE=155899028;WS=155899010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr1	155903310	rs4661150	T	C	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=1;PP=758;SC=CTCCTGACCTTGTGATCCACC;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=155903318;WS=155903300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	155903408	rs4661151	C	T	2043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.635;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=21;PP=1642;ReadPosRankSum=0.160;SC=AGTGGAGACCCTTCAACTTCA;SOR=0.315;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=40;TCR=22;TR=59;WE=155903416;WS=155903398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,63:0.97:65
chr1	155904177	rs2275079	T	C	13068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=420;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=238;NR=161;PP=2965;SC=CGACCGCTTCTACTCAACCAC;SOR=1.212;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=400;TCF=239;TCR=161;TR=399;WE=155904185;WS=155904167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,414:1.00:414
chr1	155904392	rs2275081	G	A	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=43;PP=1220;SC=GATGGCTGCTGTGCCTACTAT;SOR=7.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=43;WE=155904400;WS=155904382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	155912486	rs2152051	T	C	5114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=115;PP=2965;SC=GATCTGCGGTTGAGGCTGTGG;SOR=1.746;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=54;TCR=115;TR=169;WE=155912494;WS=155912476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr1	155917880	rs1010033	T	A	5650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=136;PP=2965;SC=GACTAATGCCTCCCCATCTGC;SOR=2.044;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=51;TCR=136;TR=187;WE=155917888;WS=155917870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr1	155920280	rs61751626	A	G	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.505;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=23;PP=611;ReadPosRankSum=1.353;SC=TGGGCTGTGGACAGTGGGCAG;SOR=0.534;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=123;TCF=51;TCR=72;TR=43;WE=155920288;WS=155920270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,45:0.35:129
chr1	155928232	rs2364404	T	C	2104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.10;SOR=2.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	155928242	rs2886069	C	T	2086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.37;SOR=2.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	155931368	rs4661175	G	A	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=9.700;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=2;PP=678;ReadPosRankSum=0.673;SC=ACCCGGCCAAGAGAGGTTGAT;SOR=4.322;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=26;WE=155931376;WS=155931358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr1	155954084	rs78716403	C	G	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.348;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=252;ReadPosRankSum=-0.067;SC=AGGAATGATTCAGGAAGCAGG;SOR=0.941;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=16;WE=155954092;WS=155954074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,16:0.31:52
chr1	155955076	rs4661216	A	G	2020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=25;PP=1596;SC=GCAACAAGATATATAGGGGAA;SOR=1.127;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=40;TCR=25;TR=65;WE=155955084;WS=155955066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	155981489	rs1475766	C	G	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=446;SC=CCAAAAAACACACAGGGCAAG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=155981497;WS=155981485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	156011444	rs2297792	T	C	2514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.160;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.255;NF=52;NR=30;PP=1918;ReadPosRankSum=1.428;SC=GGGTCCGGGATATCCCAAAGG;SOR=1.074;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=53;TCR=31;TR=82;WE=156011452;WS=156011434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,85:0.99:86
chr1	156133038	rs7555253	T	C	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=41;ReadPosRankSum=0.736;SC=TAGCTGCCTATATTCCACATG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=156133046;WS=156133028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	156146218	rs12401573	C	T	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=5.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.12;ReadPosRankSum=-0.593;SOR=0.983;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,29:0.26:113
chr1	156169610	rs2072499	A	G	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=5.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=4;PP=782;ReadPosRankSum=0.613;SC=ATCCCTCCATACTGCTCAAAT;SOR=0.866;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=56;TCF=48;TCR=8;TR=33;WE=156169618;WS=156169600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr1	156182710	rs2241107	T	C	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=374;ReadPosRankSum=0.509;SC=GACGTTCTACTGCTTCCAATC;SOR=1.528;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=17;WE=156182718;WS=156182700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr1	156202173	rs1052053	A	G	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=1162;ReadPosRankSum=0.876;SC=ATGACACAGCAAATCTATGAC;SOR=0.650;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=39;TCR=48;TR=57;WE=156202181;WS=156202163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,56:0.65:86
chr1	156202300	rs2251615	C	T	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=367;ReadPosRankSum=-1.671;SC=TGGCCCCACCCTCTACACCTC;SOR=0.582;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=16;WE=156202308;WS=156202290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr1	156214974	.	C	T	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.316;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.989;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=553;ReadPosRankSum=0.786;SC=AATGGATAGGCGAAGGCTCCT;SOR=1.381;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=28;WE=156214982;WS=156214964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,29:0.52:56
chr1	156215562	rs2075166	G	A	2361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=37;PP=1983;SC=TCCCGCGCCTGTCCGGCTCAC;SOR=0.798;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=41;TCR=37;TR=78;WE=156215570;WS=156215552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	156215899	rs2075165	G	A	3085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=33;PP=2400;SC=GGCCTGGGGCGGAGCCTCCCC;SOR=1.426;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=62;TCR=33;TR=94;WE=156215907;WS=156215889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	156220056	rs1043165	T	C	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=0;PP=1400;SC=CAAGAACCCATTCCAGTGAAA;SOR=7.903;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=51;WE=156220064;WS=156220046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	156230429	rs12139321	A	G	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=35;PP=1102;SC=TGGGCAGAAGAAGGACACATA;SOR=4.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=39;WE=156230437;WS=156230419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	156233143	rs2273832	A	G	1549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.451;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=6;PP=1357;ReadPosRankSum=1.311;SC=CCCTCCTCCAAGACCCTGGGA;SOR=3.637;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=48;WE=156233151;WS=156233133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr1	156233189	rs2273833	C	T	2461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.638;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=17;PP=1933;ReadPosRankSum=-0.790;SC=GACACACCTGCGCACACACGA;SOR=2.617;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=83;TCF=65;TCR=18;TR=82;WE=156233197;WS=156233179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,82:0.99:83
chr1	156236592	.	C	T	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.673;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=2.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQRankSum=-1.983;QD=1.16;ReadPosRankSum=-0.288;SOR=1.942;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr1	156244559	rs12122180	G	A	3404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=62;PP=2610;SC=CCGAGATGTAGAGACTAAGAA;SOR=1.158;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=41;TCR=62;TR=103;WE=156244567;WS=156244549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr1	156246792	rs2277870	C	T	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=279;SC=CTGGCTGGGTCGCAAGCTACA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=156246800;WS=156246782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	156248609	rs10752615	T	C	5700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=142;NR=33;PP=2965;SC=TCAGAGACCATTAAGGTACCA;SOR=2.925;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=175;TCF=142;TCR=33;TR=175;WE=156248617;WS=156248599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr1	156252291	rs3806409	A	G	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=1;PP=439;SC=CTCCTTCCTCACCCGCACCTC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=156252299;WS=156252281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	156255456	rs6684514	G	A	8201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=153;PP=2965;ReadPosRankSum=1.816;SC=AGACCTTATCGTGCGCTGTGA;SOR=1.123;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=260;TCF=106;TCR=154;TR=258;WE=156255464;WS=156255446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,264:0.99:266
chr1	156255833	rs2842883	G	C	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=34;PP=1049;SC=GCAGGGCCTGGCTGGTGTGGG;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=36;WE=156255841;WS=156255823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	156263097	rs10908494	A	G	4059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=56;PP=2965;SC=CCCGGCCCAAACCCTGGCTCT;SOR=0.743;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=58;TCR=56;TR=114;WE=156263105;WS=156263087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr1	156263940	rs10908495	T	C	2269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=15;PP=1808;SC=GAGGCTCCAATCAGGGCCACC;SOR=2.505;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=54;TCR=15;TR=69;WE=156263948;WS=156263930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	156264000	rs10908496	G	A	4146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=34;PP=2965;SC=GGTTGGGCTGGTCGGCTGGAC;SOR=1.918;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=92;TCR=34;TR=126;WE=156264008;WS=156263990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	156279176	rs10908499	G	C	3457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=86;PP=2804;ReadPosRankSum=-0.211;SC=TCACCTAGATGCTACTATGGA;SOR=1.870;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=18;TCR=87;TR=104;WE=156279184;WS=156279166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,106:0.99:107
chr1	156279210	rs3001784	T	C	2693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=73;PP=2264;SC=CTGAAATCTATCTTTTCAGTC;SOR=6.466;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=75;TCF=2;TCR=73;TR=75;WE=156279218;WS=156279200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	156280671	rs10908500	A	T	2778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=23;PP=2261;SC=TAGCCAGATAAGAATCTTCCC;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=55;TCR=23;TR=78;WE=156280679;WS=156280661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	156281020	rs12132794	G	C	2367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=48;PP=1957;SC=TGAAGCCAAAGCTTGATGACT;SOR=1.319;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=26;TCR=49;TR=74;WE=156281028;WS=156281010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	156287403	rs2296374	T	C	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=17;PP=627;SC=AAGGGTCATATTATACTCCTT;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=156287411;WS=156287393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	156304782	rs3762281	A	G	794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=23;PP=679;SC=AGTAATAGGGAAAAGGGGCAT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=156304790;WS=156304772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	156308031	rs139949895	GGA	G	3163.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.11;NF=2;NR=65;PP=2979;SC=AGAACCTTCTGGAGAGAGAGA;SOR=4.434;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=84;TCF=3;TCR=81;TR=67;WE=156308040;WS=156308021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	156309372	.	G	C	196	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=9;NR=0;PP=196;QD=25.6412458386;SC=AACAGTTCAAGAACAGTCACC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=156309380;WS=156309371;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	156347131	rs2245623	G	A	1395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FS=1.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.39;ReadPosRankSum=-1.238;SOR=0.855;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:190,69:0.27:259
chr1	156351066	rs942679	C	A	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.531;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=509;ReadPosRankSum=0.390;SC=GATTTGCCTGCAGTTATACAA;SOR=0.195;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=99;TCF=81;TCR=18;TR=30;WE=156351074;WS=156351056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,32:0.31:104
chr1	156351699	rs3748569	G	A	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.504;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=27;PP=1252;ReadPosRankSum=0.582;SC=CTTCTTGGCTGGGACTGTCTC;SOR=0.573;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=92;TCF=49;TCR=43;TR=62;WE=156351707;WS=156351689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,62:0.66:94
chr1	156351792	rs3748568	G	A	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=868;ReadPosRankSum=0.937;SC=CTTTCCTCCCGCCTCTCCAAC;SOR=0.828;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=66;TCF=29;TCR=37;TR=42;WE=156351800;WS=156351782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,42:0.65:65
chr1	156352153	rs150615574	G	A	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.239;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.91;ReadPosRankSum=-0.911;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	156354293	rs6668731	A	G	3788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.662;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=82;PP=2962;ReadPosRankSum=2.132;SC=GAGAAGCCTCACAGATCCTCC;SOR=0.775;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=199;TCF=93;TCR=106;TR=145;WE=156354301;WS=156354283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,146:0.72:203
chr1	156354347	rs11303415	TC	T	2971.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=9;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.569;NF=35;NR=63;PP=1803;ReadPosRankSum=-1.226;SC=CTTTCTGGACTCCCCCCCCAG;SOR=0.759;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=178;TCF=53;TCR=125;TR=98;WE=156354355;WS=156354337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,118:0.62:189
chr1	156354367	rs6668857	A	G	2750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.555;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.659;NF=47;NR=67;PP=2280;ReadPosRankSum=-1.814;SC=GACTCCCAGCACTACGAGGAC;SOR=0.614;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=188;TCF=74;TCR=114;TR=114;WE=156354375;WS=156354357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,113:0.60:189
chr1	156374256	rs3431	C	T	1541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=1;PP=1132;ReadPosRankSum=0.520;SC=GTCCTCCCCACTTCATTCTGC;SOR=1.473;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=79;TCF=77;TCR=2;TR=49;WE=156374264;WS=156374246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,55:0.65:85
chr1	156376680	rs6662064	A	G	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=427;SC=GGGGCACAGAAGGGGAATTTC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=156376688;WS=156376674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	156446242	rs2274316	C	A	2692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=14;PP=2088;SC=CAGAGCAATACCCAGAATTCA;SOR=2.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=67;TCR=14;TR=81;WE=156446250;WS=156446232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	156446450	rs12131289	C	T	978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=30;PP=851;SC=AGCTCTCCACCGTCCTGACTC;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=156446458;WS=156446440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	156446903	rs2274317	T	C	2857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=27;PP=2151;SC=TAGGTGGGGGTGGAGACTTGG;SOR=1.584;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=90;TCF=63;TCR=27;TR=88;WE=156446911;WS=156446893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	156450740	rs1925950	G	A	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=11;PP=449;SC=TGTCGCAGCCGTTGAAGCCCT;SOR=1.371;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=17;WE=156450748;WS=156450730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	156452870	rs2282286	G	A	2336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=69;NR=3;PP=2045;SC=CAAGAGCTGCGAAGAGGTTGG;SOR=5.699;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=69;TCR=3;TR=72;WE=156452878;WS=156452860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	156496188	rs6427315	A	G	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=3;PP=548;SC=CCTGAGCTCTAGGTGTCTGCA;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=156496196;WS=156496178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	156498673	rs1171564	T	A	2293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.928;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=20;PP=1820;ReadPosRankSum=-0.352;SC=GAGAAGTCACTCGTAACCTTC;SOR=1.244;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=132;TCF=97;TCR=35;TR=84;WE=156498681;WS=156498663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,85:0.62:137
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chr1	156505061	rs942965	C	T	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=32;PP=849;ReadPosRankSum=1.917;SC=GAAACAGGTGCGCGTGGCTGT;SOR=1.034;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=69;TCF=19;TCR=50;TR=42;WE=156505069;WS=156505051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,46:0.62:74
chr1	156509552	rs1171570	C	G	1726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=5;PP=1487;SC=TGGTGCCAAACGCACAGACAA;SOR=4.450;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=43;TCR=5;TR=48;WE=156509560;WS=156509542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	156518379	rs744224	G	A	2311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.507;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=52;PP=1663;ReadPosRankSum=0.285;SC=TTACCTGGACGCTGTTTCTTT;SOR=0.922;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=127;TCF=51;TCR=76;TR=84;WE=156518387;WS=156518369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,89:0.67:133
chr1	156520173	rs1778819	T	A	2121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=37;PP=1706;SC=AAAAAAGATGTGACCCCAAGC;SOR=0.910;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=31;TCR=37;TR=68;WE=156520181;WS=156520163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	156520320	rs1778818	C	T	213.56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.6715;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=166;ReadPosRankSum=1.593;SC=TTCCCTGGGACGCGGCCAGGC;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=8;WE=156520328;WS=156520310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr1	156524221	rs6694580	G	T	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.562;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=43;PP=1032;ReadPosRankSum=-1.139;SC=CAAGTGGGCAGGTGAAGGGTC;SOR=1.981;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=71;TCF=3;TCR=68;TR=44;WE=156524229;WS=156524211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,45:0.62:73
chr1	156526234	rs2489139	C	T	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=4;PP=822;SC=CATCTCATATCGCACTCACAA;SOR=3.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=156526242;WS=156526224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	156526305	rs182217684	C	T	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.588;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=452;ReadPosRankSum=0.194;SC=CAGAGCTAGACCCACATTTCT;SOR=0.255;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=77;TCF=53;TCR=24;TR=29;WE=156526313;WS=156526295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,30:0.38:80
chr1	156526387	rs11264498	C	G	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.223;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=343;ReadPosRankSum=0.066;SC=ACAGGGTACACTGGAGGCAGC;SOR=1.653;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=22;WE=156526395;WS=156526377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,22:0.32:68
chr1	156526444	rs2488269	T	C	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=33;PP=1164;SC=GCCGCCACTCTCCTCCGGATG;SOR=2.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=43;WE=156526452;WS=156526434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	156526564	rs2489138	C	A	274.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.8387;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=194;SC=CTAGGCTCCGCCGGGGGATCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=156526572;WS=156526554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	156531871	rs1171545	A	G	2013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=53;PP=1631;SC=CTAGGAATCTACCCTCTTCTT;SOR=3.407;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=9;TCR=53;TR=62;WE=156531879;WS=156531861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	156532344	rs7548309	T	G	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.57;ReadPosRankSum=0.716;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,17:0.26:66
chr1	156532908	rs16837492	C	A	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.056;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=421;ReadPosRankSum=0.041;SC=GTCCCTGCAACCCAAGACTAC;SOR=1.146;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=91;TCF=51;TCR=40;TR=27;WE=156532916;WS=156532898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,29:0.32:92
chr1	156532977	rs1171547	T	C	3141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=48;PP=2673;SC=CCAGCATCTCTTGGTAGACGG;SOR=0.757;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=46;TCR=48;TR=94;WE=156532985;WS=156532967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	156534525	rs4661184	A	C	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=95;ReadPosRankSum=-0.700;SC=GGGAACCTTTAAGCACCACCA;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=156534547;WS=156534515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr1	156536123	rs2066378	T	C	1619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.78;SOR=5.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	156536133	rs4382715	A	G	1682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.15;SOR=5.943;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	156536221	rs2066377	G	C	2663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=29;PP=1991;SC=TCTTCTTCAAGGGAACCACGG;SOR=1.295;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=56;TCR=29;TR=85;WE=156536229;WS=156536211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	156536251	rs947662	T	C	3702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=46;PP=2965;SC=AACAGTGGCCTAGCTTGGCCA;SOR=0.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=61;TCR=46;TR=107;WE=156536259;WS=156536241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	156536353	rs947663	A	G	4177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=72;PP=2965;SC=GAACATGAGAACACCTTCTCA;SOR=0.978;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=56;TCR=72;TR=128;WE=156536361;WS=156536343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr1	156536480	rs947664	T	C	1249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=35;PP=1019;SC=TCCAACTCCCTTCTCTGCCCA;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=38;WE=156536488;WS=156536470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	156539154	rs6427319	T	C	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=8;PP=798;SC=TCCATCTTCCTGGACTCCGCT;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=156539162;WS=156539144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	156551848	rs6682716	A	G	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.077;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=506;ReadPosRankSum=-0.029;SC=AGGAGCACTGAGAGGCGACTG;SOR=0.256;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=94;TCF=33;TCR=61;TR=31;WE=156551856;WS=156551838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,31:0.33:95
chr1	156553102	rs34924172	AG	A	2217.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.204;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.597;NF=56;NR=17;PP=2647;ReadPosRankSum=1.111;SC=AAGTCATGAAAGGACCTTCCA;SOR=0.403;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=106;TCF=84;TCR=22;TR=73;WE=156553110;WS=156553092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,75:0.71:105
chr1	156553762	rs11264502	A	C	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=42;PP=1214;SC=GTAAGCAGAGACGCTGTTCCC;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=42;WE=156553770;WS=156553752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	156556321	rs10796961	G	A	4675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=115;NR=34;PP=2965;SC=CCATGGAGTCGGGCATCTGCA;SOR=2.432;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=115;TCR=34;TR=149;WE=156556329;WS=156556311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr1	156561414	rs6698493	T	C	97.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=2;PP=71;SC=GAATCCCAAGTGGAAGGGAAG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=4;WE=156561422;WS=156561404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	156561557	rs149629319	G	GGGGCCGGGCC,GGGGTCGGGCC	1090.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=23;NF=12;NR=0;PP=2979;SC=CACATGCGCCGGGGCCGGGCC;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=12;WE=156561565;WS=156561547;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.48,0.52:23
chr1	156561651	rs7516274	G	C	2533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=26;PP=2108;SC=GGGCTCGCGCGTGCCGCGGAT;SOR=1.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=51;TCR=26;TR=77;WE=156561659;WS=156561641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	156562008	rs1925949	G	A	1984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=53;PP=1654;SC=CAAGGTCAGTGGCACAACTCT;SOR=4.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=57;TCF=4;TCR=53;TR=57;WE=156562016;WS=156561998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	156562143	rs942959	G	A	1007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=1;PP=914;SC=AACCACCCTTGACTCTGCCTT;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=34;WE=156562151;WS=156562133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	156563375	rs6427321	G	A	3168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=69;PP=2703;SC=GTGGGGTGGGGGAGATTGGGG;SOR=1.896;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=99;TCF=30;TCR=69;TR=98;WE=156563383;WS=156563365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	156563726	rs6427322	A	C	2945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=32;PP=2325;SC=ACTTGCTCATATCCCTCACAG;SOR=1.312;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=50;TCR=32;TR=82;WE=156563734;WS=156563716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	156563813	rs6668178	G	A	3216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=64;PP=2524;SC=CTGCTCTGGAGAAGAAGTACC;SOR=1.563;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=31;TCR=64;TR=95;WE=156563821;WS=156563803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	156563852	rs942963	C	T	2179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=49;PP=1665;SC=ACCCTGACACCGAGTGTGTCT;SOR=2.372;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=15;TCR=49;TR=64;WE=156563860;WS=156563842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	156563898	rs1270	T	C	854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=630;SC=TGGGTATTCTTCCCAATAAAG;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=156563906;WS=156563888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	156564640	rs3795732	G	A	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=314;ReadPosRankSum=1.105;SC=AGCAGCTGACGTCCCAGAGAT;SOR=0.379;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=16;WE=156564648;WS=156564630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr1	156564922	rs3795733	C	T	1465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.754;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=18;PP=1000;ReadPosRankSum=0.779;SC=CTAGCCCCGCCATCCTTCTCA;SOR=1.130;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=188;TCF=122;TCR=66;TR=61;WE=156564930;WS=156564912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,64:0.33:194
chr1	156565049	rs72559129	A	AAC	10438.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=131;PP=2966;SC=CACCACCTAAAAGTTTCCTCA;SOR=1.130;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=209;TCF=70;TCR=139;TR=196;WE=156565057;WS=156565039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr1	156565834	rs12024215	G	C	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.077;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=5;PP=951;ReadPosRankSum=-0.150;SC=GGTCAAAGGTGGGGAGAAAAG;SOR=1.347;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=75;TCF=62;TCR=13;TR=43;WE=156565842;WS=156565824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,45:0.58:78
chr1	156567496	rs879461	C	T	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=140;ReadPosRankSum=2.110;SC=TCCAGATAATCTCTCAGGTCT;SOR=0.250;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=7;WE=156567504;WS=156567486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr1	156594364	rs12405992	T	C	1871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.841;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=39;PP=1521;ReadPosRankSum=-0.628;SC=TGACGCCTCTTATCCCCGACC;SOR=0.554;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=36;TCR=59;TR=63;WE=156594372;WS=156594354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,65:0.67:97
chr1	156626920	rs7524611	T	C	6082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=70;NR=158;PP=2965;SC=GAGGGGCCCCTGCCATATGCT;SOR=1.555;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=229;TCF=71;TCR=158;TR=228;WE=156626928;WS=156626910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr1	156639000	rs1046650	A	G	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-4.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=121;ReadPosRankSum=0.793;SC=GCCAGAAACCATATGTCAAGA;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=10;WE=156639008;WS=156638990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr1	156639636	rs11549292	G	A	1637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.506;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=40;PP=1318;ReadPosRankSum=1.040;SC=AGCTACTCAGGGCCTGGAGGC;SOR=0.648;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=242;TCF=113;TCR=129;TR=74;WE=156639644;WS=156639626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,75:0.31:244
chr1	156639753	rs11582300	G	A	7712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.202;SC=CAAACCCATCGGACTCCCCAT;SOR=0.806;SbPval=0.54;Source=Platypus;TCR=112;TR=236;WE=156639761;WS=156639743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,241:0.99:243
chr1	156640156	rs3748570	G	A	9545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=169;NR=125;PP=2965;SC=TTCCTCCTGGGGGCCCTCGGG;SOR=1.012;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=295;TCF=170;TCR=125;TR=294;WE=156640164;WS=156640146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr1	156640308	rs3748571	C	T	2203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.510;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=49;PP=1623;ReadPosRankSum=-0.934;SC=TCGGGGTGTACGTTGGGCTGG;SOR=0.588;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=278;TCF=123;TCR=155;TR=93;WE=156640316;WS=156640298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,97:0.34:287
chr1	156640503	rs3828043	C	T	1569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.777;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=33;PP=1271;ReadPosRankSum=-1.249;SC=CTCTGCTCTTCCCAGGCAGCT;SOR=0.552;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=221;TCF=122;TCR=99;TR=70;WE=156640511;WS=156640493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,70:0.32:222
chr1	156640678	rs2886443	G	A	2530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=59;PP=2089;ReadPosRankSum=-0.903;SC=CCCCTGCCCCGGGCCTGGCTC;SOR=1.354;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=18;TCR=60;TR=77;WE=156640686;WS=156640668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,77:0.99:78
chr1	156646668	rs4278369	A	G	1714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=21;PP=1201;SC=CAGCTCTGCCACCTGGCTACT;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=59;WE=156646676;WS=156646658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	156670545	rs4661213	C	T	748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=16;PP=662;SC=CCCCCACCACCACCTAGGGAT;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=25;WE=156670553;WS=156670535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	156697056	rs3795737	T	C	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.813;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=707;ReadPosRankSum=0.904;SC=TGGGTGGCTATTGATCTTTGG;SOR=0.582;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=98;TCF=42;TCR=56;TR=34;WE=156697064;WS=156697046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,33:0.34:96
chr1	156699213	.	CT	C	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.612;ClippingRankSum=-0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQRankSum=-0.152;QD=3.48;ReadPosRankSum=-0.587;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr1	156705593	rs4311877	G	C	4544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=62;PP=2965;SC=TCAGGCCCACGTGGCCCAGGA;SOR=0.889;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=141;TCF=78;TCR=63;TR=140;WE=156705601;WS=156705583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr1	156706559	rs8658	A	G	729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=19;PP=610;SC=AGCCTGAGGAAACATCTCAGA;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=156706567;WS=156706549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	156707128	rs140737064	AAG	A	79.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=0;PP=65;ReadPosRankSum=-1.530;SC=GCATCTGAAAAAGAAGTGCCT;SOR=0.120;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=3;WE=156707137;WS=156707118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr1	156707775	rs6670122	T	G	2034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=9;PP=1649;SC=ACAGCACTTTTTGGACCCAGA;SOR=3.370;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=52;TCR=9;TR=61;WE=156707783;WS=156707765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	156713512	rs4437869	C	T	1982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.65;QD=32.50;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	156713558	rs4399146	G	A	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.408;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.803;NF=18;NR=8;PP=652;ReadPosRankSum=0.361;SC=GGGCTCAGAGGGGGTGCTATT;SOR=1.546;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=45;TCF=27;TCR=18;TR=26;WE=156713566;WS=156713548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr1	156737523	rs143792441	C	T	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=371;ReadPosRankSum=0.253;SC=CTCAAGTAGGCCTCATCTGCC;SOR=2.531;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=16;WE=156737531;WS=156737513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr1	156761618	rs2644615	C	T	2839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=47;PP=2108;ReadPosRankSum=-1.934;SC=CCATCTTTGACCGCTGGGCAC;SOR=0.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=156;TCF=84;TCR=72;TR=104;WE=156761626;WS=156761608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,110:0.65:168
chr1	156767253	rs6701637	C	T	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=-0.073;SC=TTTTAGCAGGCATCCTCTCCT;SOR=0.054;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=7;WE=156767261;WS=156767243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr1	156785617	rs1800601	G	A	3201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.083;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=33;PP=2602;ReadPosRankSum=0.117;SC=TGGGCAACTCGGCGCATGAAG;SOR=1.378;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=172;TCF=115;TCR=57;TR=115;WE=156785625;WS=156785607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,115:0.67:172
chr1	156785779	rs1800600	G	A	3093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.406;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=69;PP=2414;ReadPosRankSum=-0.187;SC=CCACGCTGCCGCCCCAGGTTT;SOR=1.136;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=149;TCF=55;TCR=94;TR=105;WE=156785787;WS=156785769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,110:0.71:155
chr1	156841674	rs1410082	G	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=168;ReadPosRankSum=0.773;SC=CCTCCCAGCTGTTTCCAGATT;SOR=0.184;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=9;WE=156841682;WS=156841664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr1	156845492	.	AGT	A,AGTGTGTGTGT	1530.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.60;QD=30.61;SOR=4.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,14,36:0.28,0.72:50
chr1	156846233	rs6334	G	A	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.533;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=390;ReadPosRankSum=-0.490;SC=AGGACTTCCAGCGTGAGGCTG;SOR=1.136;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=103;TCF=53;TCR=50;TR=28;WE=156846241;WS=156846223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,28:0.26:109
chr1	156848909	rs1799770	CA	C	803.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=781;ReadPosRankSum=-0.027;SC=TTTTCTTGTTCACAGATCCCA;SOR=0.598;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=20;WE=156848917;WS=156848899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,23:0.77:30
chr1	156849775	rs12076232	T	C	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.629;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=649;ReadPosRankSum=-0.551;SC=ATTGATGCAGTGTCCGCCCGT;SOR=1.786;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=28;WE=156849783;WS=156849765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,29:0.62:47
chr1	156851141	rs61813797	C	T	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=316;ReadPosRankSum=-0.830;SC=GAAGCCCAGACGAGTAGTGTG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=14;WE=156851149;WS=156851131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr1	156873727	rs12407843	G	A	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.706;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=5;PP=754;ReadPosRankSum=0.080;SC=CAATGTCACCGCCTCTGTGTC;SOR=2.368;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=125;TCF=95;TCR=30;TR=43;WE=156873735;WS=156873717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,44:0.34:130
chr1	156874874	rs78436112	TGG	T	701.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.590;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=310;ReadPosRankSum=1.348;SC=CCTGTGGGGTTGGGGGGGGGG;SOR=1.928;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=19;WE=156874883;WS=156874864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr1	156875037	rs6676171	T	G	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=2;PP=705;SC=TGGTGCCCCTTCCCTGGCCTC;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=156875045;WS=156875027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	156875377	rs2644591	G	C	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=22;ReadPosRankSum=0.852;SC=CCCCAGGATGGGGATCAGCAC;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=156875385;WS=156875367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr1	156875935	rs41267435	T	C	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=5.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.07;ReadPosRankSum=-0.128;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,7:0.17:41
chr1	156875985	rs2644593	G	A	2273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=23;PP=1928;SC=TGGTTTTGGAGGAAGGTGGGG;SOR=1.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=70;WE=156875993;WS=156875975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	156876206	rs6688345	G	A	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.329;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=226;ReadPosRankSum=-0.896;SC=TGCCTTCAGGGCCACAGGACC;SOR=0.259;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=68;TCF=13;TCR=55;TR=18;WE=156876214;WS=156876196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,16:0.24:66
chr1	156876221	rs6688349	G	A	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=4.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.149;SOR=0.176;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,11:0.19:58
chr1	156876237	rs6664765	C	T	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-4.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.778;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=117;ReadPosRankSum=-1.147;SC=CCCTCCCTACCAGGGCACAGG;SOR=0.117;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=47;TCF=8;TCR=39;TR=11;WE=156876245;WS=156876227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,11:0.24:46
chr1	156876260	rs6664770	C	T	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.212;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=136;ReadPosRankSum=-0.448;SC=CTTAGGACCCCAGGGCGATTA;SOR=0.184;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=10;WE=156876268;WS=156876250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,11:0.28:39
chr1	156876373	rs6677442	A	G	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=267;ReadPosRankSum=1.361;SC=AGAGACGGGGAGGCTGGGGAT;SOR=0.743;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=15;WE=156876381;WS=156876363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr1	156876729	rs735953	T	C	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.796;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=109;ReadPosRankSum=-0.411;SC=GCCACACAGATCTATGTGGGG;SOR=0.330;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=8;WE=156876737;WS=156876719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr1	156877249	rs6680819	A	G	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.14;ReadPosRankSum=-0.392;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,10:0.19:54
chr1	156877457	rs1952294	T	C	6615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=129;PP=2965;SC=CAGCACCCATTCTTGCCAAAA;SOR=1.586;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=192;TCF=62;TCR=130;TR=191;WE=156877465;WS=156877447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr1	156877797	rs77235035	C	A	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=2.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.34;ReadPosRankSum=0.522;SOR=0.509;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:169,60:0.26:229
chr1	156877884	rs150532135	T	TG	1040.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.485;NF=27;NR=17;PP=1412;ReadPosRankSum=0.449;SC=AGGGAGGAGGTGGGGCGCCGC;SOR=0.645;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=150;TCF=86;TCR=64;TR=44;WE=156877892;WS=156877874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,44:0.32:139
chr1	156878531	rs11264580	T	C	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.206;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=156;ReadPosRankSum=1.265;SC=AGGACACGCATGGGCCAGGGT;SOR=0.239;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=12;WE=156878539;WS=156878521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr1	156878737	rs6671392	T	C	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.950;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=31;PP=840;ReadPosRankSum=-1.456;SC=TTTGTCCTCCTGACACCTACG;SOR=0.389;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=180;TCF=78;TCR=102;TR=66;WE=156878745;WS=156878727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,65:0.36:183
chr1	156878887	rs11810027	G	A	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.168;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=513;ReadPosRankSum=0.828;SC=GAAGAAGGGAGAGTCCAAGAG;SOR=0.267;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=65;TCF=10;TCR=55;TR=25;WE=156878895;WS=156878877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,25:0.37:67
chr1	156879395	rs72698693	C	T	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=218;ReadPosRankSum=1.856;SC=CATCAAATAACTCATAAGCTT;SOR=1.206;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=12;WE=156879403;WS=156879385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr1	156879504	rs41273205	A	G	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=21;PP=937;ReadPosRankSum=-0.231;SC=CAGGAAGGGAAATGGGTCCCC;SOR=0.660;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=134;TCF=81;TCR=53;TR=54;WE=156879512;WS=156879494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,55:0.41:135
chr1	156880288	rs146834392	C	G	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.149;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=483;ReadPosRankSum=-2.103;SC=TACCCCCGGTCTCTTCCTCTG;SOR=0.127;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=22;WE=156880296;WS=156880278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr1	156881959	rs41273215	C	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=0.628;SC=GAGCTAAAGGCTTCAGTGATG;SOR=0.193;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=5;WE=156881967;WS=156881957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr1	156882950	rs61813832	C	T	6542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.130;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=136;NR=105;PP=2962;ReadPosRankSum=0.550;SC=TCCTGCCCATCGCTGAGCTCA;SOR=0.966;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=351;TCF=191;TCR=160;TR=241;WE=156882958;WS=156882940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,246:0.68:360
chr1	156882996	rs822441	G	C	10053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.638;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=133;NR=173;PP=2965;ReadPosRankSum=1.649;SC=ATGTCCCTCCGAGCTACAGTC;SOR=0.687;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=307;TCF=134;TCR=173;TR=306;WE=156883004;WS=156882986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,311:1.00:312
chr1	156883215	rs822442	C	A	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.438;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=837;ReadPosRankSum=0.031;SC=GCCTGCAGAACCCTGAGCGGC;SOR=0.491;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=121;TCF=44;TCR=77;TR=45;WE=156883223;WS=156883205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,46:0.37:124
chr1	156883617	rs61813833	G	A	3824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=61;PP=2962;ReadPosRankSum=0.072;SC=GCCTCCATGCGGCCTGACTTC;SOR=0.655;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=200;TCF=111;TCR=89;TR=138;WE=156883625;WS=156883607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,140:0.68:206
chr1	156884365	rs749256	T	C	3544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=5;PP=2927;SC=AGGAGAGGAGTGCAGTGGGAG;SOR=5.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=101;TCR=5;TR=105;WE=156884373;WS=156884355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	156894006	.	C	G	116	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=2;NR=3;PP=116;QD=30.1542425094;SC=TGTGAGTCGGCGGTATTCGAC;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=156894014;WS=156893996;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	156902259	rs822430	G	A	1830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=4;PP=1356;SC=TCCTCGCCACGGTGCAGTATC;SOR=4.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=46;TCR=4;TR=50;WE=156902267;WS=156902249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	156907081	rs945508	T	C	3425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=55;PP=2544;SC=CTCAATGGTATGGAAGATCAT;SOR=0.798;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=61;TCR=55;TR=116;WE=156907089;WS=156907071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	156907115	rs868188	T	C	3531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=62;PP=2886;SC=AGGGCCAGGCTTGGAGGAGAG;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=45;TCR=62;TR=107;WE=156907123;WS=156907105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	156914240	rs5778015	CCATT	C	1676.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=1452;SC=TAAGGAGACACCATTCATTCA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=27;WE=156914251;WS=156914230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	156929023	rs16837847	C	T	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=20;PP=629;SC=GGCATTTCAGCTCCCTATGAC;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=156929031;WS=156929013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	156939175	rs1336149	C	T	1232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=24;PP=969;SC=GTTTCTATAACACAGAAGGAG;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=19;TCR=24;TR=43;WE=156939183;WS=156939165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	157485561	rs3811035	G	A	2476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=40;PP=2018;SC=AACCCTAGGAGGCAAGAGCAC;SOR=0.832;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=34;TCR=40;TR=74;WE=157485569;WS=157485551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	157485720	rs1002967	T	C	369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=12;PP=278;SC=TCTTCCCTTGTGCCTGCGCTG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=157485728;WS=157485710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	157491173	rs6427383	T	A	1763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=46;PP=1430;SC=AAAAGTCATATCTCAATCTTG;SOR=3.383;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=8;TCR=46;TR=54;WE=157491181;WS=157491163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	157497263	rs3761961	T	C	3636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=100;NR=1;PP=2965;SC=ATACAAAACTTAGAGATGGAG;SOR=7.903;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=101;TCF=100;TCR=1;TR=101;WE=157497271;WS=157497253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	157508882	rs6427384	C	T	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=2;PP=927;SC=TTACCAGTGACGGAGAGGCTC;SOR=4.294;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=33;WE=157508890;WS=157508872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	157509025	rs2012199	C	T	4285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=65;PP=2965;SC=CAGGGCAGCACCCTCATGATG;SOR=0.768;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=133;TCF=68;TCR=65;TR=133;WE=157509033;WS=157509015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr1	157514097	rs6679793	A	G	3222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=36;PP=2515;ReadPosRankSum=0.810;SC=ATGACGCTGTAAGGCATTGTT;SOR=0.470;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=60;TCR=36;TR=95;WE=157514105;WS=157514087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr1	157514314	.	C	T	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.769;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=562;ReadPosRankSum=0.396;SC=AGCTGGCTCTCAGCACTGGAC;SOR=0.655;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=26;WE=157514322;WS=157514304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr1	157550066	rs10489673	T	C	7391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=125;PP=2965;SC=TTGCATATTGTGTACTCGGGA;SOR=0.725;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=245;TCF=119;TCR=126;TR=244;WE=157550074;WS=157550056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr1	157557701	rs2777962	G	A	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=6;PP=1168;SC=CATCATTCTCGTCTCCATATC;SOR=4.073;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=43;WE=157557709;WS=157557691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	157559122	rs11582663	C	T	3210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.507;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=49;PP=2428;ReadPosRankSum=-0.145;SC=CCAGTAGTGCCGATGATACCA;SOR=0.515;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=141;TCF=77;TCR=64;TR=105;WE=157559130;WS=157559112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,112:0.75:150
chr1	157567751	rs1361889	A	G	1975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=40;PP=1478;SC=CTGCTCCAGGATTGGAGAAGG;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=23;TCR=40;TR=63;WE=157567759;WS=157567741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	157718283	rs6696643	A	T	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=7;PP=697;ReadPosRankSum=1.190;SC=CTCTATTGCAAACAATGCATC;SOR=0.730;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=134;TCF=107;TCR=27;TR=42;WE=157718291;WS=157718273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,42:0.31:135
chr1	157771880	rs4971154	C	T	6230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=113;PP=2965;ReadPosRankSum=1.169;SC=AGTACAGGATCGGAGGAGAGC;SOR=0.475;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=72;TCR=114;TR=185;WE=157771888;WS=157771870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,190:0.99:191
chr1	157802877	rs2765500	T	C	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=313;SC=AGCAGCTTCATGGCGCTTGTG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=157802885;WS=157802873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	157802979	rs2261295	C	T	2036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=6;PP=1645;SC=CTGTAGGACTCACCTGAGCAG;SOR=3.841;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=51;TCR=6;TR=57;WE=157802987;WS=157802969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	157806006	rs2765503	G	A	2481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=52;PP=1996;SC=CCTTAGGCATGTACTCAGTCA;SOR=1.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=25;TCR=52;TR=77;WE=157806014;WS=157805996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	157811392	rs2260040	G	A	3299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.504;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=28;PP=2706;ReadPosRankSum=-0.719;SC=CCAGGTTGGCGGGGAGAAAGT;SOR=1.937;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=73;TCR=29;TR=101;WE=157811400;WS=157811382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,102:0.99:103
chr1	158056299	rs7367384	C	G	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.781;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.719;NF=19;NR=0;PP=268;ReadPosRankSum=-0.236;SC=CCCCTCCAGCCCAAGCCCATC;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=50;TCR=2;TR=19;WE=158056307;WS=158056289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
chr1	158057420	rs7514301	A	T	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=4;PP=892;SC=ACTGGAGCCGATACACTGCAA;SOR=3.383;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=158057428;WS=158057410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	158058109	rs6427419	C	A	3097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=34;PP=2489;SC=CTTCTTTCTCCCTCACAGTTG;SOR=1.408;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=65;TCR=34;TR=99;WE=158058117;WS=158058099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	158066834	rs6427420	A	G	2041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=33;PP=1571;SC=TTTTAACTTCACAGGAAGTCT;SOR=0.779;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=35;TCR=33;TR=68;WE=158066842;WS=158066824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	158067047	rs874844	A	C	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.07;NF=0;NR=10;PP=278;SC=ATTTTCACAAAAACCAGAAAC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=158067068;WS=158067037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	158067060	rs11339854	TG	T	190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=228;SC=CCAGAAACCATGGGGGAATCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=158067068;WS=158067037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	158153996	rs426336	T	C	1960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=54;PP=1704;SC=CTCAGGTTCCTAAGACTTCAG;SOR=5.283;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=3;TCR=54;TR=57;WE=158154004;WS=158153986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	158224575	rs71084271	CTGTGTGTGTGTGTGTGTG	C,CTGTGTGTGTG	1075.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=57.91;MQRankSum=-0.563;QD=16.55;ReadPosRankSum=-1.456;SOR=5.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:8,47,10:0.72,0.15:65
chr1	158224595	.	G	C	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.936;ClippingRankSum=0.000;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=4.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.61;MQRankSum=-2.471;QD=2.01;ReadPosRankSum=1.457;SOR=1.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,22:0.18:125
chr1	158224825	rs411089	C	T	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=217;ReadPosRankSum=1.153;SC=CTCTCTCCATCCTCTTTCTCA;SOR=0.481;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=12;WE=158224833;WS=158224815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr1	158226667	rs1042388	C	T	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.530;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.754;NF=9;NR=14;PP=427;ReadPosRankSum=0.020;SC=ACCCAAAGCCCGTGTGGGTGA;SOR=1.153;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=66;TCF=31;TCR=35;TR=23;WE=158226675;WS=158226657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,23:0.34:68
chr1	158298693	rs75664720	A	C	2391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.000;QD=16.38;ReadPosRankSum=-1.496;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,93:0.64:146
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chr1	158326447	rs35184522	C	CT	417.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=1.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=1.547;QD=4.49;ReadPosRankSum=0.402;SOR=0.908;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,28:0.30:93
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chr1	158450382	rs1418843	C	T	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=6.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.092;SOR=1.262;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,44:0.29:153
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chr1	158507160	rs2051666	T	G	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=2.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.336;SOR=1.202;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,32:0.32:101
chr1	158507184	rs2051068	A	G	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=9;PP=723;ReadPosRankSum=-1.216;SC=ACAGGTATAGATTATATGTCA;SOR=0.629;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=121;TCF=89;TCR=32;TR=39;WE=158507192;WS=158507174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,41:0.31:133
chr1	158507222	rs5778082	GA	G	934.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=1.427;QD=5.77;ReadPosRankSum=0.046;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,54:0.33:162
chr1	158507398	rs2051067	G	T	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=396;ReadPosRankSum=-0.937;SC=GTCAGGCTCTGAATGTAGGCA;SOR=0.177;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=68;TCF=0;TCR=68;TR=22;WE=158507406;WS=158507388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,21:0.30:70
chr1	158517142	rs41273491	C	T	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.868;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=502;ReadPosRankSum=0.721;SC=AGAATTACGACGGTCAGGTGG;SOR=0.871;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=81;TCF=48;TCR=33;TR=28;WE=158517150;WS=158517132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,30:0.36:84
chr1	158517353	rs16840314	G	A	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.193;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=21;PP=833;ReadPosRankSum=-0.050;SC=CACAAAAGTAGTGATTGATCT;SOR=0.278;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=169;TCF=109;TCR=60;TR=49;WE=158517361;WS=158517343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,52:0.30:172
chr1	158532405	rs7526514	T	G	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=182;ReadPosRankSum=-1.539;SC=CTATTAAGATTCTGCTATTTT;SOR=0.336;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=10;WE=158532413;WS=158532395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr1	158532614	rs41273499	G	A	1658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.084;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=33;PP=1258;ReadPosRankSum=-0.771;SC=GCCCGGGGCCGTGCATAGGTG;SOR=0.376;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=89;TCF=39;TCR=50;TR=61;WE=158532622;WS=158532604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,63:0.69:91
chr1	158533140	rs12080815	A	G	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.729;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=705;ReadPosRankSum=0.927;SC=CCTGGGTAAGAAAGGCTGCCA;SOR=1.041;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=135;TCF=70;TCR=65;TR=39;WE=158533148;WS=158533130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,40:0.29:138
chr1	158533224	rs12081915	A	G	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=23;PP=716;ReadPosRankSum=0.025;SC=AGTACATGGGACGATGAAGGC;SOR=0.652;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=59;TCR=82;TR=40;WE=158533232;WS=158533214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,42:0.30:142
chr1	158549264	rs863360	G	A	920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.376;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=623;ReadPosRankSum=-0.281;SC=GAGGGTTACAGATGGCCAGGA;SOR=1.371;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=103;TCF=62;TCR=41;TR=38;WE=158549272;WS=158549254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,42:0.38:112
chr1	158549420	rs863361	C	T	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.85;ReadPosRankSum=-0.385;SOR=0.727;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,33:0.25:132
chr1	158549492	rs863362	C	T	1424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.294;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=20;PP=1126;ReadPosRankSum=-0.832;SC=ACCTGTCCACCCAAGTTAGAC;SOR=0.572;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=202;TCF=143;TCR=59;TR=63;WE=158549500;WS=158549482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,64:0.32:203
chr1	158549511	rs863363	A	G	1894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.554;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=23;PP=1442;ReadPosRankSum=-1.695;SC=ACCCATGATGATCAGATTACC;SOR=0.634;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=230;TCF=163;TCR=67;TR=76;WE=158549519;WS=158549501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,80:0.34:232
chr1	158577109	rs857685	A	C	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.847;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=26;PP=664;ReadPosRankSum=0.440;SC=AGTCTAAGGAATAGGGCTATA;SOR=1.127;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=103;TCF=42;TCR=61;TR=39;WE=158577117;WS=158577099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,39:0.38:103
chr1	158582426	rs2518489	G	A	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=59;ReadPosRankSum=0.391;SC=ACCACAGTACGTTTTTGAGTT;SOR=0.114;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=7;WE=158582434;WS=158582420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr1	158582543	rs2251963	G	A	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=1.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.717;SOR=0.532;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,37:0.24:152
chr1	158582552	rs2251964	G	A	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.06;ReadPosRankSum=0.577;SOR=0.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,40:0.24:168
chr1	158582646	rs2251969	T	C	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=7.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.71;ReadPosRankSum=-1.285;SOR=0.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,31:0.24:130
chr1	158584091	rs952094	A	G	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=1.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.17;ReadPosRankSum=-1.331;SOR=1.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,9:0.20:46
chr1	158584103	rs373704896	G	GAA	179.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-2.237;QD=4.08;ReadPosRankSum=0.289;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,7:0.16:44
chr1	158585230	rs2518491	C	T	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.067;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=139;ReadPosRankSum=0.127;SC=AATTAGTTGCCCAGGTTACCA;SOR=3.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=10;WE=158585238;WS=158585220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr1	158587390	rs857716	C	T	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.563;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=659;ReadPosRankSum=-1.063;SC=TAGTTAAGAACCGAAGGAAAT;SOR=0.868;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=147;TCF=102;TCR=45;TR=41;WE=158587398;WS=158587380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,42:0.28:149
chr1	158587784	rs857717	T	G	2057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=9;PP=1629;SC=AATTCTTCCATAATAATATAA;SOR=3.407;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=51;TCR=9;TR=60;WE=158587792;WS=158587774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	158607788	rs2518492	T	G	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=5;PP=1007;SC=TACTCGCTTGTATTATCCACA;SOR=3.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=36;WE=158607796;WS=158607778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	158607935	rs857725	T	G	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=458;ReadPosRankSum=1.074;SC=AGGAAACGCTTGTTGACATTA;SOR=0.781;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=90;TCF=50;TCR=40;TR=29;WE=158607943;WS=158607925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,30:0.30:100
chr1	158612236	rs863931	A	G	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.536;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=30;PP=623;ReadPosRankSum=2.065;SC=CAAGCGCTACACTCAATCAGG;SOR=1.723;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=134;TCF=43;TCR=91;TR=38;WE=158612244;WS=158612226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,39:0.28:138
chr1	158612548	rs857721	T	A	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.495;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=3;PP=611;ReadPosRankSum=0.045;SC=GTGATGACTATCCAACCAACA;SOR=1.455;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=85;TCF=72;TCR=13;TR=31;WE=158612556;WS=158612538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,31:0.37:84
chr1	158618223	rs857677	C	T	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.624;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=116;ReadPosRankSum=-0.329;SC=AAAAAGAGAACCAAAGAAGAG;SOR=0.072;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=10;WE=158618231;WS=158618213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,10:0.23:44
chr1	158618455	rs2246434	G	A	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.456;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=77;ReadPosRankSum=0.621;SC=TGGTATACAAGAGAGTAGAGA;SOR=0.163;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=7;WE=158618463;WS=158618445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr1	158619728	rs2482965	A	C	4666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=60;PP=2965;SC=CCCCAGCGGGAATTCAATTCC;SOR=1.052;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=83;TCR=60;TR=143;WE=158619736;WS=158619718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	158619822	rs857689	A	C	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.295;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=30;PP=644;ReadPosRankSum=1.016;SC=AAGATTTAAAACATAGTTGTT;SOR=1.178;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=113;TCF=25;TCR=88;TR=36;WE=158619830;WS=158619812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,37:0.32:116
chr1	158626378	rs857691	C	T	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.467;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=20;PP=846;ReadPosRankSum=-1.159;SC=CCTGATTCCGCAGAGCTTTCA;SOR=0.902;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=123;TCF=67;TCR=56;TR=48;WE=158626386;WS=158626368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,48:0.38:126
chr1	158631171	rs2518493	A	C	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.664;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=955;ReadPosRankSum=-0.076;SC=GCCTATTCAGAAGCTTTTTGG;SOR=0.611;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=150;TCF=52;TCR=98;TR=50;WE=158631179;WS=158631161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,50:0.32:155
chr1	158637865	rs140998442	GAAA	G	341.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=3.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=1.634;QD=8.14;ReadPosRankSum=1.520;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,12:0.29:42
chr1	158639601	rs2298801	A	G	3299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=79;PP=2692;SC=ATAAAAATGAATGCTTTTCCT;SOR=3.023;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=17;TCR=79;TR=96;WE=158639609;WS=158639591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	158644105	rs703116	T	A	2625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.099;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=11;PP=2008;ReadPosRankSum=-1.419;SC=ACAAACTCTGTTAAACTAGAT;SOR=0.317;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=121;TCF=107;TCR=14;TR=84;WE=158644113;WS=158644095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,89:0.70:127
chr1	158647495	rs325996	A	T	5035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=88;PP=2965;SC=CACTCATGACAGCAAGATTTC;SOR=1.044;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=67;TCR=88;TR=155;WE=158647503;WS=158647485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr1	158647522	rs703121	A	G	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.735;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=33;PP=718;ReadPosRankSum=-0.404;SC=GTCCCTTGTGACTGTGAAACA;SOR=0.768;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=126;TCF=38;TCR=88;TR=46;WE=158647530;WS=158647512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,46:0.35:132
chr1	158647631	rs325995	T	A	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=25;PP=803;SC=ATCCCTGCAGTCATTAACAAG;SOR=2.517;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=32;WE=158647639;WS=158647621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	158647669	rs703122	T	C	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=101;ReadPosRankSum=1.641;SC=ATAGCAAGCATTACAGGGCAA;SOR=0.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=7;WE=158647677;WS=158647659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr1	158654786	rs385096	C	T	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=0;PP=1007;ReadPosRankSum=-0.734;SC=TGTTTCTAAACGGAATCTAAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=38;WE=158654794;WS=158654776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,39:0.98:40
chr1	158654852	rs857937	A	G	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.730;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=282;ReadPosRankSum=0.853;SC=TTCCTTCTCTAGAGATCTTAG;SOR=1.117;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=71;TCF=65;TCR=6;TR=18;WE=158654860;WS=158654842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,19:0.24:78
chr1	158655036	rs435080	G	A	4638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=79;PP=2965;SC=CCCTCTCAGCGACCCGCTCCT;SOR=1.011;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=60;TCR=80;TR=139;WE=158655044;WS=158655026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr1	158655162	rs2564859	C	A	3057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=70;PP=2316;SC=GATTCTGTTACTTGCTAGTTC;SOR=2.376;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=21;TCR=71;TR=91;WE=158655170;WS=158655152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	158656281	rs2564858	T	C	1274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=12;PP=998;SC=AATATGTACTTACGGTTTCCT;SOR=1.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=40;WE=158656289;WS=158656271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	158656347	rs111674514	C	CAG,CAGAG	1726.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=7,7;NR=25,25;PP=135,1182;SC=TAAAATGTGTCAGAGAGAGAG;SOR=1.455;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=32,32;WE=158656355;WS=158656337;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.16,0.84:43
chr1	158656432	rs367824971	G	GA	71.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.477;NF=0;NR=7;PP=70;ReadPosRankSum=0.050;SC=GTATGTGGGGGAAAAAAAAAA;SOR=2.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=7;WE=158656440;WS=158656422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr1	158687163	rs28568406	G	A	1599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.251;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=30;PP=1262;ReadPosRankSum=-0.431;SC=AAAGAATATCGGGAAGACCAT;SOR=0.955;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=226;TCF=123;TCR=103;TR=71;WE=158687171;WS=158687153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,71:0.31:229
chr1	158687224	rs857703	G	A	1691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.365;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=37;PP=1305;ReadPosRankSum=0.059;SC=TCAGAAGAGGGAATCCTCAAT;SOR=0.693;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=236;TCF=119;TCR=117;TR=72;WE=158687232;WS=158687214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,75:0.31:245
chr1	158724537	rs34126693	T	C	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=363;ReadPosRankSum=0.319;SC=GAGGTAAAGCTTAAGAGATAT;SOR=1.519;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=16;WE=158724545;WS=158724527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr1	158735595	rs857824	C	T	2546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=35;PP=1993;SC=CTCCTTGTTGCGCAAGCTGTA;SOR=1.013;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=48;TCR=35;TR=83;WE=158735603;WS=158735585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	158735691	rs857825	T	C	2913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=44;PP=2172;SC=CTTCTTCAGCTGCACATACAT;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=43;TCR=44;TR=87;WE=158735699;WS=158735681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	158735740	rs857826	A	G	2712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=44;PP=2189;SC=ACCACAGTGAAGTGGGAGGCA;SOR=1.075;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=34;TCR=44;TR=78;WE=158735748;WS=158735730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	158735892	rs857827	A	G	3475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=35;PP=2660;SC=TAGGACATTTATAGACGTATC;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=68;TCR=35;TR=103;WE=158735900;WS=158735882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	158736117	.	G	T	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.607;ClippingRankSum=0.000;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.770;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=639;ReadPosRankSum=0.706;SC=CCTATCGTAGGCCATAGCTGT;SOR=0.608;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=96;TCF=56;TCR=40;TR=39;WE=158736125;WS=158736107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,40:0.41:97
chr1	158736215	rs6666753	G	A	3475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=60;PP=2776;SC=TTTTCTCACTGAGCAAGTTTG;SOR=1.002;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=47;TCR=60;TR=107;WE=158736223;WS=158736205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	158736445	rs1864346	C	T	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=487;ReadPosRankSum=0.296;SC=ATGAATTCTGCTACCTGGCTC;SOR=0.693;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=81;TCF=14;TCR=67;TR=26;WE=158736453;WS=158736435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,28:0.33:86
chr1	158736517	rs1864347	A	T	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=122;ReadPosRankSum=1.399;SC=GAAGGATAGGAAAGAAAGTTG;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=8;WE=158736525;WS=158736507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr1	158813819	rs857870	A	G	3345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.066;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=41;PP=2568;ReadPosRankSum=-1.494;SC=GTAAGCCCCCAGGTCCCTCAG;SOR=1.076;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=184;TCF=122;TCR=62;TR=132;WE=158813827;WS=158813809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,134:0.72:186
chr1	158909164	rs2325704	C	A	1844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-5.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.003;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=19;PP=1495;ReadPosRankSum=-0.099;SC=ACTGAGAATTCACTGCATTTT;SOR=0.396;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=101;TCF=75;TCR=26;TR=65;WE=158909172;WS=158909154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,66:0.63:104
chr1	158913525	rs856082	A	G	1958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.68;SOR=3.958;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	158913525	.	ATATGCAC	GTATGCAC,GTATGCAT	832	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=41,30;NR=4,2;PP=187,832;QD=4.92824916772;SC=AGACTTTCCTATATGCACGGT;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=42;TCR=4;TR=45,32;WE=158913540;WS=158913515;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.98:46
chr1	158913532	rs4656498	C	T	1022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=2.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.67;ReadPosRankSum=1.452;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,37:0.71:52
chr1	158943295	rs144676333	T	TCA	454.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=796;ReadPosRankSum=-0.429;SC=AAAGGGATTTTCACACACACA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=16;WE=158943303;WS=158943285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,17:0.85:20
chr1	158946629	rs145608153	A	AATATATGTAT	1356.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=2975;SC=CACAGAAAATAATATATGTAT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=13;WE=158946637;WS=158946619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	158946658	rs145640162	CTATATATATATATATATATATATATATA	C	952.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.64;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	158984322	rs12738378	G	A	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=93;ReadPosRankSum=-1.025;SC=ACATTTGGTCGTTGAGTCCTT;SOR=0.132;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=5;WE=158984330;WS=158984312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	158985652	rs4262539	T	C	1206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.673;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=935;ReadPosRankSum=-0.676;SC=TAAAATTGAATCTATTCCAGT;SOR=0.580;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=120;TCF=73;TCR=47;TR=53;WE=158985660;WS=158985642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,55:0.41:133
chr1	158985831	rs66519738	C	T	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=114;ReadPosRankSum=-1.269;SC=AGCTCTGCTACGGCTCTTCCA;SOR=0.134;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=9;WE=158985839;WS=158985821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,10:0.26:38
chr1	158986477	rs866484	G	C	4664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.103;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=69;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.935;SC=CCACCCAACAGTTCTTCAACT;SOR=0.908;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=231;TCF=129;TCR=102;TR=160;WE=158986485;WS=158986467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,167:0.69:243
chr1	158986561	rs16841500	C	T	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.692;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=48;PP=1049;ReadPosRankSum=1.763;SC=TCACCGGTTACTTAAAAATTG;SOR=0.765;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=179;TCF=41;TCR=138;TR=61;WE=158986569;WS=158986551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,64:0.34:187
chr1	158987941	rs856046	A	G	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=592;ReadPosRankSum=0.040;SC=GCCCTGTGTTATACTGAGGTC;SOR=1.675;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=26;WE=158987949;WS=158987931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr1	158988270	rs11539423	T	C	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.905;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=239;ReadPosRankSum=-1.056;SC=ATTTGGAATATGATAGTCTCC;SOR=0.834;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=86;TCF=43;TCR=43;TR=23;WE=158988278;WS=158988260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,24:0.27:89
chr1	158990247	rs1057024	A	G	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=2.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.27;ReadPosRankSum=0.480;SOR=0.968;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,27:0.25:109
chr1	159002222	rs861318	A	G	1910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=1;PP=1560;SC=AGACCTATTAAAATCTAATAA;SOR=6.593;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=49;WE=159002230;WS=159002212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	159002301	rs2518553	T	C	5398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=141;NR=25;PP=2965;SC=AAACAGAAAATGAATACTTTC;SOR=3.409;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=168;TCF=142;TCR=26;TR=166;WE=159002309;WS=159002291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr1	159002377	rs1057027	C	A	8857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=126;NR=140;PP=2965;SC=CCAGGAACAGCGTCAGCTTCC;SOR=0.814;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=266;TCF=126;TCR=140;TR=266;WE=159002397;WS=159002367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr1	159002389	rs1057028	T	A	8488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=106;NR=154;PP=2965;SC=TCAGCTTCCATATCCTTCAGA;SOR=1.109;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=260;TCF=106;TCR=154;TR=260;WE=159002397;WS=159002367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr1	159174824	rs863001	G	C	13679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=445;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=234;NR=190;PP=2965;SC=CTCATTTCCCGTGCTGTTTGC;SOR=0.947;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=424;TCF=234;TCR=190;TR=424;WE=159174832;WS=159174814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,438:1.00:438
chr1	159174885	rs7550207	T	C	1698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FS=3.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;QD=4.94;ReadPosRankSum=-1.490;SOR=0.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:245,99:0.29:344
chr1	159175004	rs17838198	CT	C	242.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.642;NF=1;NR=13;PP=370;ReadPosRankSum=0.330;SC=CTCTTGGTGCCTTTTCCTTCT;SOR=0.533;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=14;WE=159175012;WS=159174994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,13:0.28:46
chr1	159175354	rs12075	G	A	2349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.610;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=32;PP=1744;ReadPosRankSum=-0.277;SC=GGAGACTATGGTGCCAACCTG;SOR=0.586;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=263;TCF=178;TCR=85;TR=96;WE=159175362;WS=159175344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,100:0.37:269
chr1	159402584	rs11419544	G	GT	3265.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=74;PP=2967;SC=CTATCAAGGAGTTATTACTTT;SOR=3.282;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=92;TCF=14;TCR=78;TR=87;WE=159402592;WS=159402574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	159409196	rs6691297	T	C	3845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=35;PP=2808;SC=TGAGAACCTCTGAGTGTAATA;SOR=1.990;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=87;TCR=35;TR=122;WE=159409204;WS=159409186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	159409479	rs12145616	T	G	1303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.963;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=11;PP=929;ReadPosRankSum=1.437;SC=GATTTGTAACTGAGAACTATT;SOR=1.739;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=44;WE=159409487;WS=159409469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,51:0.78:65
chr1	159409533	rs10908721	G	A	3674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=88;NR=14;PP=2940;SC=TGCTTTACTGGGACTATGTGA;SOR=3.611;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=88;TCR=14;TR=102;WE=159409541;WS=159409523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	159409734	rs10908722	G	T	8846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=140;NR=128;PP=2965;SC=TCATCCGAATGGATCTTCATC;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=268;TCF=140;TCR=128;TR=268;WE=159409742;WS=159409724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr1	159409884	rs12118628	G	A	2701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.651;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=64;PP=2103;ReadPosRankSum=-0.623;SC=CCACACAGATGTTCTTTTTTG;SOR=0.771;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=149;TCF=48;TCR=101;TR=93;WE=159409892;WS=159409874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,99:0.63:157
chr1	159410340	rs12409540	T	A	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.296;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=15;PP=1013;ReadPosRankSum=-1.496;SC=ACTACAGCTGTGCCTCCATTG;SOR=1.073;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=147;TCF=95;TCR=52;TR=50;WE=159410348;WS=159410330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,51:0.33:153
chr1	159504784	rs78292198	T	G	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.255;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=331;ReadPosRankSum=-0.140;SC=AATATTATATTTGATGAATTT;SOR=0.922;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=19;WE=159504792;WS=159504774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,19:0.36:53
chr1	159505297	rs4656837	C	T	3481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.273;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=73;PP=2794;ReadPosRankSum=1.172;SC=TGCCACAGAACGGCAAATTGA;SOR=0.989;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=198;TCF=92;TCR=106;TR=130;WE=159505305;WS=159505287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,129:0.65:199
chr1	159558258	rs2808661	A	G	3714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=69;PP=2965;SC=GTTACTTTGTAGAAGCTCAGC;SOR=1.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=42;TCR=69;TR=111;WE=159558266;WS=159558248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	159684047	rs113155790	CCACACACA	C	819.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=3000;SC=CAGTTACACACCACACACACA;SOR=3.611;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=18;WE=159684062;WS=159684037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	159778699	rs12042065	G	A	2217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.779;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=9;PP=1797;ReadPosRankSum=0.902;SC=AGCCTCCTGGGGCTTCATCAT;SOR=0.268;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=118;TCF=107;TCR=11;TR=78;WE=159778707;WS=159778689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,80:0.67:120
chr1	159779135	.	G	C	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=257;ReadPosRankSum=-0.027;SC=CCCAGGAGAGGAGGGAGCCAG;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=26;TCF=13;TCR=13;TR=13;WE=159779143;WS=159779125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr1	159785284	rs4411129	C	G	1848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.574;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=31;PP=1478;ReadPosRankSum=0.150;SC=CTCACCCTCTCTCTTACATTT;SOR=0.872;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=105;TCF=56;TCR=49;TR=68;WE=159785292;WS=159785274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,69:0.64:108
chr1	159799599	rs11422063	C	CA	3684.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=91;NR=13;PP=2972;SC=CAGATGCATGCAAAGAAGGAT;SOR=4.057;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=113;TCF=98;TCR=15;TR=104;WE=159799607;WS=159799589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	159824967	rs2501340	G	C	1947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=22;PP=1602;SC=TCGACCTACTGTCCTTTGTGA;SOR=1.392;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=38;TCR=22;TR=60;WE=159824975;WS=159824957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	159825061	rs2501339	G	C	2206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=34;PP=1845;SC=CGTATCTGGAGAGCCCTGCAG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=37;TCR=34;TR=71;WE=159825069;WS=159825051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	159826561	rs111861505	C	CCA,CCACA	740.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=32.21;ReadPosRankSum=0.226;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,11,11:0.48,0.48:23
chr1	159827416	rs4477268	C	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=146;ReadPosRankSum=-0.814;SC=GAGGGAGGGTCTCCCACAGGG;SOR=0.113;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=9;WE=159827424;WS=159827414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr1	159827456	rs2494503	A	G	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=340;ReadPosRankSum=0.896;SC=GGCACTGATAACCCAAGGAAA;SOR=0.627;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=14;WE=159827464;WS=159827446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr1	159827475	rs11584200	G	A	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=283;ReadPosRankSum=2.590;SC=AACCCCAACAGGTCCCAGAGT;SOR=0.293;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=14;WE=159827483;WS=159827465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr1	159828128	rs2494504	A	G	1846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=47;PP=1442;SC=CAGAGCCAAGAAGGGCCATGT;SOR=3.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=7;TCR=47;TR=54;WE=159828136;WS=159828118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
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chr1	159828746	rs2501337	G	A	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.501;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=135;ReadPosRankSum=-1.321;SC=AGCAGAAGCAGGGCTTCAGGA;SOR=1.214;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=9;WE=159828754;WS=159828736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,9:0.24:37
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chr1	159842088	rs2494518	T	A	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=400;SC=GTTCCCCCCATCCTATTTTAC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=159842096;WS=159842078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	159842103	rs11265289	C	T	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=2.044;SC=TTTTACTCCACCTTCAGTACC;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=7;WE=159842111;WS=159842093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr1	159842684	rs79596930	C	A	1581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=17;PP=2694;ReadPosRankSum=-0.225;SC=GTGGTGCCATCTCTTTGCGGG;SOR=0.655;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=90;TCF=65;TCR=25;TR=58;WE=159842699;WS=159842674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,61:0.64:95
chr1	159842691	rs4460634	C	G	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.875;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=1418;ReadPosRankSum=0.554;SC=CATCTCTTTGCGGGAGGGAAG;SOR=0.898;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=95;TCF=67;TCR=28;TR=33;WE=159842699;WS=159842674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,35:0.35:101
chr1	159854392	rs2501325	C	A	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=585;SC=TTAGAAACCCCGGGTCCACAT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=159854400;WS=159854382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	159858290	rs3795334	T	A	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.763;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=628;ReadPosRankSum=1.045;SC=GGGAACACTGTCACAAGAATA;SOR=1.334;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=30;WE=159858298;WS=159858280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,32:0.82:39
chr1	159860488	rs3820100	A	G	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.695;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=627;ReadPosRankSum=-0.442;SC=TCAAGGATAGAGCAGCGTGAT;SOR=1.739;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=26;WE=159860496;WS=159860478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr1	159889686	rs2252815	G	A	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.827;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=142;ReadPosRankSum=-0.324;SC=AGCTCAGCGTGCACCACCCTC;SOR=0.247;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=11;WE=159889694;WS=159889676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr1	159897126	rs13052	C	T	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5007;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=462;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGCCTCACATCAGGGATGTTC;SOR=1.802;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=19;WE=159897134;WS=159897116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,18:0.86:21
chr1	159897388	rs1934074	C	T	1347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.049;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=35;PP=1032;ReadPosRankSum=0.224;SC=ATGTGAAGCTCGCTAGGCCCT;SOR=1.068;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=79;TCF=25;TCR=54;TR=50;WE=159897396;WS=159897378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,51:0.61:83
chr1	159897681	rs142211405	TAA	T,TA	1730.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.38;MQRankSum=0.221;QD=23.71;ReadPosRankSum=-1.682;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:2,50,21:0.68,0.29:73
chr1	159898100	rs3747615	A	G	1756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=32;PP=1434;ReadPosRankSum=-0.456;SC=TGCCTCGCCCACTGCTCTGGC;SOR=0.658;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=93;TCF=48;TCR=45;TR=68;WE=159898108;WS=159898090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,67:0.71:94
chr1	159898913	rs7543462	A	G	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.454;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=513;ReadPosRankSum=0.554;SC=CAGAGCTAGGAAGAACAAGCG;SOR=0.889;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=30;TCF=15;TCR=15;TR=22;WE=159898921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,23:0.74:31
chr1	159902520	rs75376900	G	C	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.21;ReadPosRankSum=1.455;SOR=0.588;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,37:0.73:51
chr1	159902526	rs3827531	T	C	1405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.91;ReadPosRankSum=0.953;SOR=0.682;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,35:0.74:47
chr1	159904539	rs35702833	A	G	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.796;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=38;PP=903;ReadPosRankSum=-1.139;SC=ATGCCTCAGCATGGCAGGCCA;SOR=1.292;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=77;TCF=16;TCR=61;TR=46;WE=159904547;WS=159904529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,47:0.59:79
chr1	159906517	rs115405346	C	G	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=668;ReadPosRankSum=-0.298;SC=CTCTATATGGCTCACTCTGTC;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=27;WE=159906525;WS=159906507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,28:0.72:39
chr1	159906849	rs10797055	A	G	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=303;ReadPosRankSum=0.839;SC=CACCCTGTCTACTGCACCCAG;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=14;WE=159906857;WS=159906839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr1	159907362	rs7524321	A	G	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.47;ReadPosRankSum=-0.898;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr1	159907367	rs7526647	T	C	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.94;ReadPosRankSum=-1.982;SOR=0.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr1	159913053	rs41264841	C	T	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.981;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=10;PP=739;ReadPosRankSum=1.705;SC=CTGGAGAAACCCCCAGTTCAG;SOR=0.412;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=125;TCF=97;TCR=28;TR=40;WE=159913061;WS=159913043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,40:0.31:128
chr1	159922369	rs2840583	C	T	1875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=50;PP=1526;SC=AATCAGGGATCGGGTCTGTTT;SOR=4.768;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=5;TCR=51;TR=55;WE=159922377;WS=159922359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	159923111	rs2789417	T	G	1939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=18;PP=1619;SC=TAGACACATATATTGTACTGC;SOR=1.727;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=45;TCR=18;TR=63;WE=159923119;WS=159923101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	159923904	rs145274502	A	C	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=20;PP=1009;ReadPosRankSum=-0.367;SC=GCAGGAGAAGAAGCAGCCAAG;SOR=0.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=49;TCR=31;TR=51;WE=159923912;WS=159923894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,51:0.61:83
chr1	160000435	rs12409352	A	T	1635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.242;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=24;PP=1236;ReadPosRankSum=-0.952;SC=CCTGCCCTATAAACCATAACA;SOR=0.999;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=198;TCF=120;TCR=78;TR=71;WE=160000443;WS=160000425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,74:0.36:208
chr1	160061934	rs12408242	T	C	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=170;ReadPosRankSum=-1.393;SC=GGGCTGGAAGTTGGATTTTTT;SOR=0.180;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=9;WE=160061942;WS=160061929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr1	160061959	rs12401728	C	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=175;ReadPosRankSum=-1.767;SC=CTTCATGTGACATAATGTGGA;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=10;WE=160061967;WS=160061949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr1	160062472	rs2295622	C	T	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.708;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=538;ReadPosRankSum=0.541;SC=ATGCCACAGCCTCCAGCACCA;SOR=0.732;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=97;TCF=48;TCR=49;TR=31;WE=160062480;WS=160062462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,32:0.30:108
chr1	160062727	rs2295621	A	G	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.703;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=18;PP=626;ReadPosRankSum=0.089;SC=CCTCCCGCACATGTACAGGGA;SOR=0.566;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=131;TCF=81;TCR=50;TR=44;WE=160062735;WS=160062717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,44:0.33:134
chr1	160068068	rs12046504	A	C	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.679;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=80;ReadPosRankSum=-1.938;SC=GCGCAGCTGGACGCCGACCCC;SOR=0.093;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=6;WE=160068076;WS=160068058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr1	160085868	rs2854244	A	C	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=292;ReadPosRankSum=-1.641;SC=TCTCCTCTGCACGCCCCAGCC;SOR=1.739;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=13;WE=160085876;WS=160085858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr1	160090674	rs2854246	T	C	1355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=4;PP=1070;SC=CCTGACTCTCTGGCTCTCCCT;SOR=3.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=41;WE=160090692;WS=160090664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	160090681	rs67915591	CCCTT	C	1731.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=4;PP=1545;SC=CTCTGGCTCTCCCTTCCTCCC;SOR=3.611;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=32;WE=160090692;WS=160090664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	160093222	rs2820581	C	T	2704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=45;PP=2051;SC=CCCACACGCCCGACCCGGGAA;SOR=1.065;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=80;TCF=35;TCR=45;TR=79;WE=160093230;WS=160093212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	160093648	rs41265763	G	A	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.131;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=315;ReadPosRankSum=0.638;SC=CATCTTGGATGGCACTGCCTG;SOR=0.979;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=52;TCF=21;TCR=31;TR=20;WE=160093656;WS=160093638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr1	160093911	rs2820582	T	C	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=20;PP=646;SC=AGCTCATCTTTTGTCAGCTCC;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=160093919;WS=160093901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	160093927	rs2854248	T	A	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=15;PP=421;SC=GCTCCCAGGCTCTAAGATAGA;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=160093935;WS=160093917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	160094343	rs1023420	T	C	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.602;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=149;ReadPosRankSum=-1.056;SC=ACCATGCCTATGCCCCTGCTA;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=9;WE=160094351;WS=160094333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr1	160097666	rs6695366	G	A	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=481;ReadPosRankSum=-0.678;SC=TCTTTCCTCAGAGTGATAGAG;SOR=0.758;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=67;TCF=17;TCR=50;TR=28;WE=160097674;WS=160097656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,28:0.41:69
chr1	160098263	rs112766586	A	G	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.08;ReadPosRankSum=-0.709;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,37:0.25:148
chr1	160098927	rs5778151	A	AG	335.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.478;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=1.388;NF=3;NR=9;PP=375;ReadPosRankSum=2.643;SC=GTGTCTCCAAAGCCTCTTGCT;SOR=0.136;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=12;WE=160098935;WS=160098917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr1	160109668	rs111510835	C	T	1482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.852;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=31;PP=1074;ReadPosRankSum=1.055;SC=TGACACTCTCCTCCATTGCTT;SOR=0.608;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=194;TCF=104;TCR=90;TR=61;WE=160109676;WS=160109658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,65:0.32:204
chr1	160124875	rs6427504	G	A	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=11;PP=1129;SC=CTGACTCGAGGTGGACCCAAT;SOR=2.200;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=44;WE=160124883;WS=160124865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	160128671	rs4656888	G	A	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=430;ReadPosRankSum=0.466;SC=GAATGATGTGGTGGGTGACAG;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=21;WE=160128679;WS=160128661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr1	160128994	rs10908764	C	T	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.050;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=390;ReadPosRankSum=-0.691;SC=ACACCTGGGCCGTTAGAGAAA;SOR=0.257;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=17;WE=160129002;WS=160128984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr1	160134056	rs17368402	G	A	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FS=0.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.192;SOR=0.640;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:263,79:0.23:342
chr1	160134205	rs11265338	C	T	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-6.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=38;PP=871;ReadPosRankSum=-0.818;SC=GGCTGTTGGCCACAGTCACTG;SOR=0.628;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=59;TCF=1;TCR=58;TR=39;WE=160134213;WS=160134195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,43:0.66:65
chr1	160136350	rs7529215	G	A	1350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.993;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.644;NF=50;NR=2;PP=1193;ReadPosRankSum=1.636;SC=AGCGCATGGCGCGGAAGAACT;SOR=2.215;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=83;TCF=77;TCR=6;TR=52;WE=160136358;WS=160136340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,49:0.61:80
chr1	160137300	rs4656889	A	C	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=326;ReadPosRankSum=2.540;SC=CACCTCGGAGAAGCAGAGGAG;SOR=0.865;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=16;WE=160137308;WS=160137290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr1	160140998	rs1209804	G	A	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.034;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=181;ReadPosRankSum=-1.616;SC=CTGATCCTTGGTCTCTCCTCC;SOR=1.375;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=10;WE=160141006;WS=160140988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr1	160141196	rs625549	C	T	5130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=104;NR=58;PP=2962;SC=AAAATGCCTACTTAGAACTGG;SOR=1.363;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=104;TCR=58;TR=162;WE=160141218;WS=160141186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr1	160141210	.	G	T	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.360;ClippingRankSum=0.000;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=10.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.45;ReadPosRankSum=-0.246;SOR=1.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,43:0.27:158
chr1	160141285	rs669162	CC	TG	1694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=3.772;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.74;ReadPosRankSum=0.057;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,52:0.27:194
chr1	160141636	rs1891265	C	T	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=342;ReadPosRankSum=-1.439;SC=TGCTTAATACCCTTAGTTTAA;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=17;WE=160141644;WS=160141626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr1	160146173	rs881291	T	C	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=624;ReadPosRankSum=-0.247;SC=CAAGATGGATTGAGGCTGCGT;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=85;TCF=46;TCR=39;TR=33;WE=160146181;WS=160146163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,34:0.40:86
chr1	160147502	rs731852	T	G	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=3.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.20;ReadPosRankSum=-0.388;SOR=1.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr1	160147510	rs731853	G	A	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=1.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.427;SOR=0.951;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,13:0.28:46
chr1	160151421	rs11265350	G	C	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.230;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=358;ReadPosRankSum=-0.470;SC=AGAAGCCTTAGGGTGTACAGA;SOR=0.440;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=97;TCF=75;TCR=22;TR=26;WE=160151429;WS=160151411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,27:0.29:93
chr1	160151450	rs7519748	T	C	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=4.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.814;SOR=1.239;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,32:0.28:116
chr1	160151624	rs36097870	G	GC	1616.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FS=1.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.12;ReadPosRankSum=-0.634;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:192,72:0.27:264
chr1	160156027	rs12131640	C	G	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.575;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=230;ReadPosRankSum=-1.296;SC=TCTGGCATCTCTCTCTCCTGC;SOR=2.373;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=14;WE=160156035;WS=160156017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,13:0.27:48
chr1	160163446	rs3747621	C	T	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.027;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=76;ReadPosRankSum=0.102;SC=GATTATCAAACGGGCTGTGGC;SOR=0.012;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=6;WE=160163454;WS=160163436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr1	160163509	rs3747623	C	T	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=418;ReadPosRankSum=-0.185;SC=GCTCACTACCCCACCCCTGCG;SOR=0.598;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=21;WE=160163517;WS=160163499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr1	160164668	rs1186693	T	C	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=308;SC=GCACATGCAATCCCCCACACA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=13;WE=160164676;WS=160164658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	160165095	rs2275703	A	C	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.626;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=3;PP=920;ReadPosRankSum=-0.030;SC=CCAGACAAGCACCTCCAGTAT;SOR=0.158;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=61;TCF=58;TCR=3;TR=39;WE=160165103;WS=160165085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,40:0.65:62
chr1	160165451	rs10908769	C	T	506.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=498;ReadPosRankSum=1.904;SC=TGCCCCCCCCCCCGGCTCCTC;SOR=1.508;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=17;WE=160165459;WS=160165432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr1	160168368	rs822450	G	A	1971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=12;PP=1677;SC=ACAAAATTGAGGTTCAATGAA;SOR=2.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=47;TCR=12;TR=59;WE=160168376;WS=160168358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	160169473	rs959166	T	C	214.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=145;SC=TCCTCTTTTGTTGTTTAGTTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=160169481;WS=160169463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	160178356	rs667306	A	G	2398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=26;PP=1807;SC=TTTCTCCACGAGCCCTAAGGA;SOR=1.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=44;TCR=26;TR=70;WE=160178364;WS=160178346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	160275434	rs2066320	A	G	3890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=75;PP=2965;SC=ATCGGGGTGGAAGGGAATGGT;SOR=1.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=39;TCR=75;TR=114;WE=160275442;WS=160275424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	160303542	rs72706684	C	A	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=46;PP=1047;ReadPosRankSum=0.857;SC=AATCATTTTTCTCTAAAGAAC;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=76;TCF=3;TCR=73;TR=48;WE=160303550;WS=160303532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,49:0.64:77
chr1	160318940	rs6669689	A	G	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=535;ReadPosRankSum=1.266;SC=CTGCTGGGAAAACATCCATAG;SOR=0.515;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=83;TCF=18;TCR=65;TR=29;WE=160318948;WS=160318930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,32:0.37:87
chr1	160318984	rs16831846	T	C	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.019;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=171;ReadPosRankSum=0.351;SC=CTCACACTTATTAGTGAAAAC;SOR=0.153;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=11;WE=160318992;WS=160318974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr1	160319055	rs12239946	T	C	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=303;ReadPosRankSum=-0.191;SC=GAAGGAAAGGTGTACCATCAA;SOR=0.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=15;WE=160319063;WS=160319045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr1	160458782	rs3795327	A	G	3362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=33;PP=2731;SC=TCCTCCCCTCAGTGGTCATTT;SOR=2.001;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=80;TCR=33;TR=113;WE=160458790;WS=160458772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	160580015	rs1061217	A	G	2465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=22;PP=1777;SC=TTCACCCTTCAGCCTCTATTC;SOR=2.076;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=64;TCR=22;TR=86;WE=160580023;WS=160580005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	160582213	rs2025515	C	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.589;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=79;ReadPosRankSum=0.179;SC=AAAAAAAAAACTTCCTCATTT;SOR=0.399;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=7;WE=160582221;WS=160582203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr1	160582248	rs11265449	C	G	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.152;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=249;ReadPosRankSum=1.230;SC=TATTCCCTCTCTACGGAGAGT;SOR=0.509;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=16;WE=160582256;WS=160582238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr1	160585554	rs149160	C	G	6988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=150;NR=63;PP=2965;SC=CTGATGATGACTGTCCTTATA;SOR=1.889;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=213;TCF=150;TCR=63;TR=213;WE=160585562;WS=160585544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr1	160585706	rs151607	C	T	3239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=86;PP=2634;SC=GGATTTTCTCCTAAAGCCTCC;SOR=4.615;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=7;TCR=86;TR=93;WE=160585714;WS=160585696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	160593841	rs76675713	A	T	1979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.813;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=16;PP=1417;ReadPosRankSum=0.610;SC=TCCCCTGCTTACCACAGAGAG;SOR=0.568;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=82;TCR=28;TR=62;WE=160593849;WS=160593831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,71:0.59:120
chr1	160650913	rs4656926	A	G	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=3;PP=357;SC=AGGAGGCTGAATAGGACCCCC;SOR=2.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=13;WE=160650921;WS=160650903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	160681653	rs57782077	G	GA	518.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.13;MQRankSum=0.911;QD=21.61;ReadPosRankSum=-1.270;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,22:0.92:24
chr1	160717872	rs527733	T	G	284.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=208;SC=TCCAGGAGGTTGTTGTGTTGG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=160717880;WS=160717862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	160722064	rs527342	A	G	1337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=35;PP=1124;SC=GCTTAACTTCATCTTAATGGT;SOR=3.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=40;WE=160722072;WS=160722054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	160786670	rs560681	A	G	1682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.022;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=48;PP=1330;ReadPosRankSum=0.179;SC=CTCCATCTCTATTTACTCAGG;SOR=0.909;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=86;TCF=18;TCR=68;TR=59;WE=160786678;WS=160786660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,61:0.68:90
chr1	160789196	rs537540	A	C	3161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=82;PP=2661;SC=GCTATGGGGTATCTGGTCCAA;SOR=4.106;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=9;TCR=82;TR=91;WE=160789204;WS=160789186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr1	160793442	rs474131	A	G	3210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.629;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=51;PP=2462;ReadPosRankSum=0.260;SC=GATATGAGGTATTTGACCAGG;SOR=0.292;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=176;TCF=102;TCR=74;TR=110;WE=160793450;WS=160793432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,117:0.65:181
chr1	160793560	rs509749	A	G	2720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.464;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=69;PP=1943;ReadPosRankSum=-1.155;SC=AGAGAACACCATGTATGCACA;SOR=0.467;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=146;TCF=40;TCR=106;TR=98;WE=160793568;WS=160793550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,106:0.68:157
chr1	160793962	rs506081	G	C	1396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.753;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=6;PP=1116;ReadPosRankSum=-0.929;SC=TGCTGTTGGTGTGTTACAGGG;SOR=2.283;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=87;TCF=69;TCR=18;TR=50;WE=160793970;WS=160793952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,50:0.58:86
chr1	160797323	rs577453	T	G	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.021;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=428;ReadPosRankSum=2.112;SC=TCTTGTGTTGTCCTTGCAGAG;SOR=3.716;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=18;WE=160797331;WS=160797313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr1	160797514	rs576334	C	G	3034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.806;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=56;PP=2287;ReadPosRankSum=-1.140;SC=TAACCATATTCTTTTGTGGAT;SOR=0.694;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=163;TCF=79;TCR=84;TR=107;WE=160797522;WS=160797504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,114:0.66:174
chr1	160797684	rs574610	A	G	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=26;PP=621;ReadPosRankSum=-0.606;SC=CCTGGGGCTCACAGACAGAAG;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=28;WE=160797692;WS=160797674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,29:0.67:43
chr1	160801046	rs480104	C	G	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=361;ReadPosRankSum=1.511;SC=AGACTAGGAACTGTTCTATAG;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=15;WE=160801054;WS=160801036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr1	160805914	rs151216658	G	A	1424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.573;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=1116;ReadPosRankSum=0.343;SC=ATTCAATGGTGTGAGTTTCAG;SOR=0.256;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=52;WE=160805922;WS=160805904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,53:0.79:67
chr1	160832212	rs11265500	A	G	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=546;ReadPosRankSum=-0.301;SC=AGGGCCAGATACCCCTCTCAC;SOR=2.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=22;WE=160832220;WS=160832202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,23:0.79:29
chr1	160849030	rs3766358	T	A	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=230;ReadPosRankSum=0.728;SC=CTCAACACACTCACACATACC;SOR=0.507;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=12;WE=160849038;WS=160849020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr1	160849060	rs3766359	G	A	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=5.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=383;ReadPosRankSum=-1.166;SC=GGACAAACTCGACCTTACTCA;SOR=1.284;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=20;WE=160849068;WS=160849050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr1	160849082	rs3820094	A	G	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.445;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=2;PP=393;ReadPosRankSum=-0.482;SC=AGGTCCCTGCAGTCCCCACAG;SOR=1.739;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=63;TCF=54;TCR=9;TR=26;WE=160849090;WS=160849072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,27:0.42:65
chr1	160849367	rs2274905	G	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=72;ReadPosRankSum=-0.363;SC=CTACATCCTGGCCTCAAACTT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=160849375;WS=160849357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	160850280	rs4656957	G	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=222;ReadPosRankSum=0.566;SC=AACATTACAGGAGAGAACCAA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=12;WE=160850288;WS=160850270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr1	160850936	rs2236515	T	C	2176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.313;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.397;NF=62;NR=34;PP=1518;ReadPosRankSum=1.276;SC=GCCAGCAGCCTTCTGTACCTG;SOR=0.481;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=297;TCF=200;TCR=97;TR=96;WE=160850944;WS=160850926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,103:0.34:306
chr1	160851619	.	A	G	134	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=15;MQ=60.24;NF=8;NR=0;PP=134;QD=21.0964015684;SC=AAAAAAAGATATAAGTATTTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=8;WE=160851627;WS=160851609;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr1	160851826	rs2274907	A	T	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.563;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.028;NF=10;NR=12;PP=350;ReadPosRankSum=-1.116;SC=CTCTGGGTAGACTGCTTTGCT;SOR=0.351;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=75;TCF=30;TCR=45;TR=22;WE=160851834;WS=160851816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,21:0.27:78
chr1	160851894	rs2274908	G	A	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.051;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.683;NF=9;NR=5;PP=223;ReadPosRankSum=-0.127;SC=TGTCATTCTCGTGCACGCTGG;SOR=0.283;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=58;TCF=42;TCR=16;TR=14;WE=160851902;WS=160851884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,14:0.24:59
chr1	160852022	rs2274909	C	T	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=0.000;QD=4.52;ReadPosRankSum=-1.766;SOR=0.572;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,34:0.26:132
chr1	160852046	rs2274910	T	C	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=449;ReadPosRankSum=-0.797;SC=GAGGGTTCATTTCAGCCCCAT;SOR=0.665;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=106;TCF=38;TCR=68;TR=29;WE=160852054;WS=160852036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,31:0.27:113
chr1	160854526	rs2297559	G	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=134;ReadPosRankSum=-0.143;SC=TGCATCTCAAGGACATGCTCT;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=9;WE=160854534;WS=160854516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr1	160920813	rs790059	A	G	2938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=40;PP=2419;SC=TCACCCAAGTAGGAGAGAAGT;SOR=0.953;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=52;TCR=40;TR=92;WE=160920821;WS=160920803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr1	160969008	rs3831190	T	TG	266.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.030;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=375;ReadPosRankSum=2.059;SC=CAGGTATGGGTGGGGTAACAG;SOR=1.609;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=13;WE=160969016;WS=160968998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr1	160969585	rs790056	C	T	1958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FS=3.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.50;ReadPosRankSum=0.961;SOR=0.890;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:257,99:0.28:356
chr1	160971146	rs790055	A	G	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.949;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=355;ReadPosRankSum=-0.139;SC=CAGGGAGCCTAAGGAGAAAGA;SOR=1.040;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=51;TCF=27;TCR=24;TR=17;WE=160971154;WS=160971136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,18:0.34:53
chr1	160990875	rs28365980	TC	CA	2150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=10.993;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.024;SOR=1.422;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:148,63:0.30:211
chr1	160990878	rs28365978	C	T	2147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=5.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.38;ReadPosRankSum=0.050;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,62:0.30:207
chr1	161009645	rs185784991	G	A	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.359;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=131;ReadPosRankSum=0.413;SC=AAAGGGGCACGGGATTAGGCT;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=8;WE=161009653;WS=161009635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr1	161010774	rs2516841	A	G	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=298;ReadPosRankSum=-0.575;SC=TATGGTAGCTAGGTGTGGTGT;SOR=1.051;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=15;WE=161010782;WS=161010764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr1	161010791	rs2073657	C	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.054;NF=0;NR=9;PP=180;ReadPosRankSum=-0.819;SC=GTGTCTCACACCTGTAATCCC;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=9;WE=161010799;WS=161010781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr1	161011051	.	C	CA	34.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.16;MQRankSum=-1.150;QD=8.71;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,1:0.25:4
chr1	161011716	rs2774276	G	C	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.190;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=287;ReadPosRankSum=-2.222;SC=GCTTCTATCCGTTGGGGTGGT;SOR=0.420;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=17;WE=161011724;WS=161011706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr1	161011736	rs144100508	GGA	G	90.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=1.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.67;ReadPosRankSum=0.469;SOR=1.096;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,7:0.21:34
chr1	161013121	rs2516839	C	T	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.099;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=184;ReadPosRankSum=1.572;SC=GTCTTTGTATCTCCTGATTCA;SOR=0.145;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=12;WE=161013129;WS=161013111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,15:0.28:53
chr1	161017556	rs2774279	C	T	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=19;PP=894;ReadPosRankSum=0.190;SC=ATGCATATGACCTGCGCTGAG;SOR=0.683;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=78;TCR=49;TR=48;WE=161017564;WS=161017546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,48:0.37:129
chr1	161019040	rs3813609	G	C	1829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-7.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.049;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=38;PP=1299;ReadPosRankSum=-0.211;SC=GCGGAGTCCAGGGAACAGCAG;SOR=0.607;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=221;TCF=123;TCR=98;TR=85;WE=161019048;WS=161019030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,87:0.38:231
chr1	161022380	rs4396136	G	A	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.225;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=30;PP=637;ReadPosRankSum=-0.660;SC=CATGAAGGTCGGTGCAGGGGA;SOR=0.291;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=122;TCF=21;TCR=101;TR=38;WE=161022388;WS=161022370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,38:0.30:126
chr1	161023252	rs377178223	TTCTCTC	T	80.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=1.282;NF=0;NR=2;PP=93;ReadPosRankSum=1.960;SC=AAATACCTTATTCTCTCTCTC;SOR=0.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=2;WE=161023265;WS=161023242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	161043735	rs4656285	A	C	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=109;ReadPosRankSum=-1.017;SC=GGTGGCAGTGAGGCTGAAGAG;SOR=1.075;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=9;WE=161043743;WS=161043725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr1	161043764	rs4656978	G	A	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=105;ReadPosRankSum=-1.044;SC=TGCTGTGTGCGTGTGCATACT;SOR=0.418;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=7;WE=161043772;WS=161043754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr1	161047125	rs60601836	CTATA	C	241.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=326;ReadPosRankSum=-0.217;SC=CTGTCACATACTATATATAGC;SOR=0.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=7;WE=161047136;WS=161047117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr1	161049358	rs3820097	G	A	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.747;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=177;ReadPosRankSum=1.224;SC=GGCTCAGACCGTACCCAGAGA;SOR=2.215;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=13;WE=161049366;WS=161049348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,13:0.28:47
chr1	161049383	rs77444104	G	T	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.694;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=268;ReadPosRankSum=-0.354;SC=CGCTTACCCAGCACTCGGAGC;SOR=1.509;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=64;TCF=41;TCR=23;TR=20;WE=161049391;WS=161049373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,20:0.31:64
chr1	161088292	rs138523655	A	G	4537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.002;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=59;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.913;SC=CCCGGAGATGACTTTTGGACT;SOR=0.791;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=263;TCF=165;TCR=98;TR=163;WE=161088300;WS=161088282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,170:0.63:270
chr1	161088583	rs41270017	T	G	1212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.766;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=964;ReadPosRankSum=0.420;SC=CAGGCTGGGCTTCATCACCAG;SOR=0.588;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=86;TCF=42;TCR=44;TR=51;WE=161088591;WS=161088573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,51:0.59:86
chr1	161089450	rs111473243	C	CTAAACT	1353.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.662;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=1437;ReadPosRankSum=1.105;SC=GCTCTTCTACCTAGATTCTCC;SOR=0.080;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=23;WE=161089458;WS=161089440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,33:0.73:45
chr1	161092761	rs17389237	A	G	2182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=19;PP=1633;ReadPosRankSum=-0.474;SC=AATGGCAATCAAAGTGAATCT;SOR=0.634;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=137;TCF=108;TCR=29;TR=87;WE=161092769;WS=161092751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,89:0.64:139
chr1	161094190	rs1135783	A	G	2979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.201;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=76;PP=2095;ReadPosRankSum=0.217;SC=TGTACAGCCCATGTTCCTGCT;SOR=1.280;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=141;TCF=44;TCR=97;TR=108;WE=161094198;WS=161094180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,116:0.76:152
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chr1	161126975	rs12031437	C	G	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.796;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=20;PP=1414;ReadPosRankSum=-0.527;SC=GGCTGGTGGCCTAAGCCAAGA;SOR=0.614;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=117;TCF=86;TCR=31;TR=74;WE=161126983;WS=161126965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,74:0.64:116
chr1	161132777	rs17356051	G	A	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=634;ReadPosRankSum=-0.434;SC=AACCGCCGAGGCCGCCGGGCT;SOR=0.637;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=108;TCF=59;TCR=49;TR=38;WE=161132785;WS=161132767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,41:0.37:110
chr1	161136843	rs2301287	C	G	2702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.604;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=34;PP=2213;ReadPosRankSum=-0.695;SC=TGACCTCTCGCCGGCGGCTAC;SOR=0.891;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=123;TCF=73;TCR=50;TR=89;WE=161136851;WS=161136833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,92:0.72:127
chr1	161139738	rs36013429	G	A	1745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.266;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=50;PP=1361;ReadPosRankSum=1.768;SC=CCTCTGGCTCGTGCCCTGAGT;SOR=1.179;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=110;TCF=26;TCR=84;TR=64;WE=161139746;WS=161139728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,66:0.58:114
chr1	161143351	rs377565818	A	T	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=127;ReadPosRankSum=-0.101;SC=GAGGACAGGGATCCAGACTGG;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=8;WE=161143359;WS=161143341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr1	161143801	rs3813619	G	A	1574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.110;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=35;PP=1196;ReadPosRankSum=-0.185;SC=GCACCCCAACGTTCAACAGTT;SOR=0.177;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=69;TCF=20;TCR=49;TR=52;WE=161143809;WS=161143791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,56:0.76:74
chr1	161143969	rs11265561	A	G	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.639;NF=1;NR=8;PP=190;ReadPosRankSum=-0.421;SC=AGGCCAAGGCAGGCAGATCAC;SOR=0.527;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=9;WE=161143977;WS=161143959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr1	161145005	rs3813620	C	T	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.494;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=33;PP=930;ReadPosRankSum=0.077;SC=TAAAGGACACCGACACAGGAC;SOR=0.262;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=76;TCF=15;TCR=61;TR=43;WE=161145013;WS=161144995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,49:0.60:82
chr1	161161284	rs41270041	G	C	1964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=33;PP=1382;ReadPosRankSum=-0.186;SC=CGGTGGCCAGGGTTTCCCTGC;SOR=0.742;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=69;TCR=59;TR=72;WE=161161292;WS=161161274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,80:0.58:139
chr1	161162173	rs7512012	G	A	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=493;SC=GGTGAGTGCCGGCCACCATGT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=161162181;WS=161162163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	161163037	rs4233367	T	C	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=14;PP=1156;SC=GCCCAGTGCCTGGGCCTGGCA;SOR=1.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=47;WE=161163045;WS=161163027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	161163633	rs3813622	C	T	4339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=69;PP=2965;SC=AGGCACAGAACGGAAGTGGGG;SOR=0.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=61;TCR=70;TR=130;WE=161163641;WS=161163623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	161167698	rs4589131	T	G	1007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=2;PP=829;SC=GCCAGAAGTGTAAGTGGGTGG;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=161167706;WS=161167688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	161168004	rs33941127	C	T	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.338;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=813;ReadPosRankSum=-0.037;SC=GAGATGCCACCGACTCCGGAT;SOR=1.385;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=138;TCF=82;TCR=56;TR=45;WE=161168012;WS=161167994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,46:0.33:141
chr1	161172233	rs11538340	C	A	1595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=1262;ReadPosRankSum=0.117;SC=GGTGCTGCGGCCTGGGGCTGG;SOR=0.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=45;TCR=36;TR=59;WE=161172241;WS=161172223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,59:0.73:81
chr1	161176137	rs4656993	A	G	1205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=5;PP=1024;SC=ACTCCTTGCTATCTTTTGGGG;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=36;WE=161176145;WS=161176127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	161179877	rs4656994	G	A	2127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=16;PP=1674;SC=GCCACATTCAGTAGCACTTCC;SOR=2.200;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=48;TCR=16;TR=64;WE=161179885;WS=161179867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	161191339	rs12721035	C	T	1680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=14;PP=1304;SC=TCCCCTGGCTCAGAAGGGAAA;SOR=2.137;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=51;WE=161191347;WS=161191329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	161191455	rs17244530	T	C	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=2.793;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.05;MQRankSum=4.797;QD=22.99;ReadPosRankSum=-0.329;SOR=0.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,21:0.91:23
chr1	161191522	rs685	A	G	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=443;SC=GTGCAGTGGCACGATGTCAGC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=161191530;WS=161191512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	161192316	rs6413453	G	A	1297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=25;PP=950;SC=GTAAGACCTGGATAGGTGAGG;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=36;WE=161192324;WS=161192306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	161192845	.	CCACACACACA	C	1516.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;QD=37.92;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	161196166	rs3813628	A	C	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=232;SC=GACCATGTGGAAGTTTCTGAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=161196174;WS=161196156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	161200487	rs4073054	C	A	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=473;SC=CTAGACCCCACGATACCTGAA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=161200495;WS=161200483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	161202556	rs2307420	T	C	1964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=21;PP=1471;SC=TACAATTTACTGAAGTGTTTG;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=62;WE=161202564;WS=161202546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	161205608	rs141260451	G	C	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=5;PP=959;SC=GCAGTCAATGGATTCTTGAGA;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=36;WE=161205616;WS=161205598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	161254302	rs114515215	C	T	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=698;SC=CCTTCACCTTCATGCTGGTCC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=26;WE=161254310;WS=161254292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	161276434	rs6674383	A	G	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=14;PP=585;SC=CCCCCAACCTATCAGTCCTCC;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=21;WE=161276442;WS=161276424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr1	161495885	rs404508	T	C	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.469;NF=28;NR=23;PP=1007;ReadPosRankSum=-0.947;SC=TAGAGGTGACTTTTGACATTG;SOR=0.680;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=143;TCF=79;TCR=64;TR=51;WE=161495893;WS=161495875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,50:0.35:144
chr1	161514542	rs396991	A	C	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=1.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.72;MQRankSum=-4.527;QD=3.69;ReadPosRankSum=0.591;SOR=0.983;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,16:0.21:77
chr1	161518214	rs148181339	T	C	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=2.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.81;MQRankSum=-1.713;QD=2.70;ReadPosRankSum=1.231;SOR=1.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,11:0.19:58
chr1	161518333	rs10127939	A	T	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=7.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.76;MQRankSum=-0.693;QD=3.35;ReadPosRankSum=1.627;SOR=0.504;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,38:0.21:177
chr1	161518336	rs77144485	C	T	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=19.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.98;MQRankSum=-6.776;QD=0.41;ReadPosRankSum=0.584;SOR=2.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:162,22:0.12:184
chr1	161559256	rs114945036	C	T	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=391;SC=TTGGTGCCCCCAGTAGGCCTA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=161559264;WS=161559246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	161559327	rs3933769	A	G	1718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=10;PP=1348;SC=TCTTCCTCACACTACCTCCTC;SOR=2.910;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=48;TCR=10;TR=57;WE=161559335;WS=161559317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	161559571	rs138747765	C	T	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.30;MQRankSum=0.259;QD=31.53;ReadPosRankSum=0.810;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr1	161561287	rs151302833	A	G	35.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.67;QD=17.87;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	161563281	rs149146947	A	AG	147.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.867;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.648;NF=2;NR=4;PP=191;ReadPosRankSum=-0.468;SC=AGGTGAGTACAGGTTGTCTCA;SOR=0.544;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=6;WE=161563289;WS=161563271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr1	161563386	rs72700089	C	T	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5019;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=113;ReadPosRankSum=0.112;SC=GAGGGAGCAGCGGTGGGAGGA;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=7;WE=161563394;WS=161563376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr1	161565314	rs79316700	C	T	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=2.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.91;MQRankSum=0.494;QD=0.72;ReadPosRankSum=0.513;SOR=1.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,10:0.11:88
chr1	161565324	rs61801822	C	T	3957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.58;QD=35.66;SOR=4.097;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr1	161565381	rs76277413	A	G	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FS=16.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.29;MQRankSum=-5.271;QD=2.92;ReadPosRankSum=-0.753;SOR=1.794;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:215,48:0.18:263
chr1	161565479	rs111504845	G	A	4163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.326;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.450;NF=43;NR=110;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.311;SC=AATGGAGACTGGGCCTGAAAA;SOR=0.557;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=216;TCF=58;TCR=158;TR=153;WE=161565487;WS=161565469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,147:0.70:209
chr1	161569419	rs430178	C	G	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.17;QD=34.34;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	161569569	rs138731942	C	T	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=3.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.78;MQRankSum=-3.580;QD=19.24;ReadPosRankSum=1.075;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,58:0.70:83
chr1	161577657	rs61802306	G	A	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=13.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.16;MQRankSum=-7.335;QD=3.59;ReadPosRankSum=0.363;SOR=1.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,26:0.20:129
chr1	161577669	rs61802307	G	A	4191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=56;PP=2962;SC=GGCTGAGGATGAGGCCCAGAG;SOR=1.051;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=75;TCR=56;TR=131;WE=161577677;WS=161577647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	161594226	rs61803008	C	T	1930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=10;PP=1953;SC=CTCTTATTACCCCCATGGGAT;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=59;TCR=10;TR=69;WE=161594234;WS=161594216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	161594246	rs61803009	G	T	2512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.133;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-1.742;NF=72;NR=17;PP=2355;ReadPosRankSum=1.339;SC=TGGGGGTCATGTGTCTTGAGG;SOR=2.325;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=90;TCF=72;TCR=18;TR=89;WE=161594254;WS=161594236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,77:0.99:78
chr1	161594525	rs61803010	GT	CG	1316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.96;QD=43.89;SOR=6.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	161596283	rs418215	G	A	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.36;QD=30.72;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	161599693	rs76714703	T	C	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=1.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.76;MQRankSum=-2.596;QD=19.41;ReadPosRankSum=-2.571;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr1	161600995	rs34085961	C	T	3370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.379;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.655;NF=58;NR=65;PP=2589;ReadPosRankSum=0.007;SC=CCACCCATCTCTGTCACCTGC;SOR=0.321;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=179;TCF=78;TCR=101;TR=123;WE=161601003;WS=161600985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,126:0.69:182
chr1	161601118	rs61803026	G	C	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.395;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.124;NF=1;NR=23;PP=582;ReadPosRankSum=-0.468;SC=GTGGGTGGGTGTGCCCCCTTT;SOR=2.232;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=24;WE=161601126;WS=161601108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
chr1	161601133	rs61803027	T	C	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=25;PP=799;SC=CCCTTTACTCTCCCAAAGGTC;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=161601141;WS=161601123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	161644976	rs1674758	C	A	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.180;NF=5;NR=1;PP=91;ReadPosRankSum=1.981;SC=CCAACCCTGGCCCTGGTCCTT;SOR=0.527;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=6;WE=161644984;WS=161644966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr1	161645259	rs1674759	T	G	125.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=119;SC=GGTCAGCTCTTAGTCTAACTC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=161645267;WS=161645249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	161676904	rs1340977	T	C	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=195;SC=CAAATCTGAATGATGAAAGCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=161676912;WS=161676894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	161676970	rs1340978	A	G	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=8;PP=593;SC=GAGACAGTTAAATTTACTTCC;SOR=1.426;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=23;WE=161676978;WS=161676960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	161680258	rs6427618	G	A	2508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=40;PP=2180;SC=CTGGTTTCCCGTACCAGCAGC;SOR=0.881;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=85;TCF=44;TCR=41;TR=84;WE=161680266;WS=161680248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	161680704	.	TGA	T	352.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.223;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=287;ReadPosRankSum=1.286;SC=TGTCCTATGGTGAGGTCCTGG;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=8;WE=161680713;WS=161680694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr1	161682975	rs6688140	G	T	4311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=84;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.229;SC=CTCTGCCTCCGCCGCCAACCC;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=56;TCR=85;TR=139;WE=161682983;WS=161682965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,138:0.99:140
chr1	161695639	rs7520519	G	T	1537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=19;PP=1376;SC=TGCCCTATGCGCCAGTGTTCG;SOR=1.298;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=51;WE=161695647;WS=161695629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	161696088	rs1417582	T	C	7816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=115;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.785;SC=CCGACGCACATCCTGGCTTCT;SOR=0.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=235;TCF=120;TCR=115;TR=234;WE=161696096;WS=161696078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,242:1.00:243
chr1	161697319	rs34868416	G	A	5138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=77;PP=2965;SC=CTGCTCAAAGGCCTTCTGAGC;SOR=0.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=83;TCR=77;TR=159;WE=161697327;WS=161697309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr1	161721351	rs7540096	A	G	623.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=531;ReadPosRankSum=1.629;SC=TTGAGAAGCAAAAATGAAGTG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=19;WE=161721359;WS=161721341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr1	161721707	rs1063178	C	T	1372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=33;PP=1098;SC=CAATGGGATACGAAGTGGATA;SOR=2.356;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=41;WE=161721715;WS=161721697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	161722779	rs35439833	C	CAAA	2305.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=47;NR=1;PP=521;SC=GACTCTGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=7.614;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=76;TCF=73;TCR=3;TR=48;WE=161722787;WS=161722769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	161822959	rs2340717	C	T	566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=479;SC=GGTGAAACATCCATTTCTATG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=161822967;WS=161822949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	161954448	rs12726227	C	T	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=378;SC=GAAGGGGGACCGCTCTCCAAG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=161954456;WS=161954438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	161967681	rs2499836	A	G	4575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.033;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=81;PP=2965;ReadPosRankSum=0.665;SC=GTTGTTCCCCACCCAGCAGGA;SOR=0.113;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=77;TCR=83;TR=158;WE=161967689;WS=161967671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,161:0.99:163
chr1	161976234	rs12022536	A	G	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.710;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.601;NF=21;NR=22;PP=675;ReadPosRankSum=-0.275;SC=TGATTTGTTCATTTTCCTTGG;SOR=0.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=56;TCR=61;TR=43;WE=161976242;WS=161976224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,43:0.37:116
chr1	161976272	rs34863451	G	GA	2016.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.558;NF=25;NR=50;PP=1089;ReadPosRankSum=0.598;SC=TCCTGAGAAGGAAAAAAAAAA;SOR=0.586;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=96;TCF=36;TCR=60;TR=75;WE=161976280;WS=161976262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:7,83:0.92:90
chr1	161987385	rs16839677	G	A	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=434;ReadPosRankSum=-2.108;SC=CTGGGGGCTCGACAGGAAAGC;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=18;WE=161987393;WS=161987375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr1	162302635	rs347306	T	C	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=0;PP=707;ReadPosRankSum=0.147;SC=TTGTGGAATCTGTTGAAAGTG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=30;WE=162302643;WS=162302625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr1	162302689	rs347307	C	T	2405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=12;PP=1893;ReadPosRankSum=-0.408;SC=AGAAGACTTTCTGTAATAACT;SOR=0.844;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=125;TCF=106;TCR=19;TR=82;WE=162302697;WS=162302679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,84:0.65:129
chr1	162313518	rs3751285	A	G	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=522;ReadPosRankSum=-0.362;SC=GCATATCTGAACAACTTTAGA;SOR=0.713;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=84;TCF=74;TCR=10;TR=27;WE=162313526;WS=162313508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,28:0.33:85
chr1	162313597	rs347278	T	C	4577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=61;PP=2965;SC=TCCTCACCCATCCTGTTCTTC;SOR=0.952;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=80;TCR=61;TR=140;WE=162313605;WS=162313587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr1	162313735	rs3751284	C	T	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.19;ReadPosRankSum=-0.176;SOR=0.485;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,29:0.24:121
chr1	162335424	rs1964052	T	C	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=10;PP=337;SC=GTCACTTTCCTTAAGTTTTTG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=162335432;WS=162335414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	162343774	rs7512126	A	G	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.868;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=12;PP=589;ReadPosRankSum=1.301;SC=TGGGAAGGACAGCAGGCTGTG;SOR=0.423;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=126;TCF=95;TCR=31;TR=42;WE=162343782;WS=162343764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,42:0.32:130
chr1	162344102	rs2282397	C	T	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.015;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=21;PP=891;ReadPosRankSum=0.708;SC=CTGGGTGCCACCTGGAAGCCA;SOR=1.102;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=154;TCF=87;TCR=67;TR=55;WE=162344110;WS=162344092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,55:0.35:157
chr1	162344390	rs164159	A	G	2705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=75;PP=2149;SC=CGTGCTGGGTATCCCCCAAGC;SOR=4.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=5;TCR=75;TR=80;WE=162344398;WS=162344380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	162345091	rs164181	G	A	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=10;PP=1339;SC=TGGTGAGAGCGCTGTGTTCTG;SOR=2.970;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=43;TCR=10;TR=52;WE=162345099;WS=162345081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	162345294	rs3737312	G	T	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.984;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=607;ReadPosRankSum=2.329;SC=GTACTTCAAGGCATCTCAACG;SOR=0.286;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=25;WE=162345302;WS=162345284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr1	162346433	rs150155141	CA	C	530.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.916;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.13;MQRankSum=1.329;NF=14;NR=11;PP=371;ReadPosRankSum=0.447;SC=TTAAAAGCTTCAAAAAAAACC;SOR=0.968;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=68;TCF=29;TCR=39;TR=25;WE=162346441;WS=162346423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,30:0.37:81
chr1	162348662	rs164188	C	T	258.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=246;SC=CACCACTCCTCGTAGCAGGTC;SOR=3.056;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=162348670;WS=162348652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	162367071	rs17852003	C	T	2272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.411;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.04;MQRankSum=-0.795;NF=61;NR=34;PP=1751;ReadPosRankSum=-0.325;SC=GCCTTATCTTCAAGGCAAGAC;SOR=1.093;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=238;TCF=140;TCR=98;TR=95;WE=162367079;WS=162367061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,95:0.39:242
chr1	162367103	rs34001279	G	T	4022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.706;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.04;MQRankSum=0.797;NF=67;NR=77;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.012;SC=CGCTGTTACTGTTCTTTGGAG;SOR=0.612;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=237;TCF=120;TCR=117;TR=144;WE=162367123;WS=162367093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,151:0.62:245
chr1	162367235	rs164124	G	A	1549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=54;PP=1212;ReadPosRankSum=1.312;SC=CCTGAAAGTTGTATCTTTAAA;SOR=1.044;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=97;TCF=4;TCR=93;TR=56;WE=162367243;WS=162367225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,58:0.57:101
chr1	162467014	rs10919549	C	G	1735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.172;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=4;PP=1421;ReadPosRankSum=-0.194;SC=CCTCCAGGTACCAGGCTTCCA;SOR=1.734;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=72;TCF=66;TCR=6;TR=56;WE=162467022;WS=162467004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,57:0.78:73
chr1	162470961	rs5778280	A	AT	169.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.9971;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=131;ReadPosRankSum=-0.349;SC=ATTTATGATGATTTTTTTTTT;SOR=1.179;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=9;WE=162470969;WS=162470951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr1	162546863	rs12129762	T	C	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=42;ReadPosRankSum=-0.187;SC=CACAGACATATTTCTTGTTAC;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=4;WE=162546871;WS=162546853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr1	162722846	rs1632311	C	G	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=7;PP=664;SC=AAAAATAAAACCATGTCCTCT;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=25;WE=162722854;WS=162722836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	162725655	rs1115570	A	C	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=228;SC=TCAACCAATCAGTATTTATTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=162725663;WS=162725645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	162737116	rs2298258	C	G	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=385;ReadPosRankSum=0.869;SC=TCATCATCCTCTGGAGGCAGT;SOR=1.044;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=19;WE=162737124;WS=162737106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,24:0.77:31
chr1	162737241	rs75932087	A	G	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=1.579;SC=AATTGCAAACATTTATTAATG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=3;WE=162737249;WS=162737231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr1	162740327	rs1780003	T	C	6202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=133;PP=2965;SC=GTGGGCAGGGTGTCAAGGGAG;SOR=1.489;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=206;TCF=73;TCR=133;TR=204;WE=162740335;WS=162740317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr1	162741794	rs3738807	C	T	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=159;ReadPosRankSum=1.536;SC=AATGAGGGCTCGTTGCCCTTG;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=9;WE=162741802;WS=162741784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr1	162742180	rs1704762	T	C	1514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=38;PP=1172;SC=CCTCTGGATTTCAGTATTGGG;SOR=4.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=41;WE=162742188;WS=162742170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	162743418	rs1355287	G	T	2920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=70;PP=2440;SC=TTTTCCTTTAGGTATTTCATC;SOR=2.783;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=18;TCR=70;TR=88;WE=162743426;WS=162743408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	162748588	rs907074	C	A	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=716;SC=GCAAGTCCTGCCTTAGCAGGA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=162748596;WS=162748578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	162754049	rs11338	G	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.319;NF=17;NR=1;PP=354;ReadPosRankSum=-0.125;SC=TTCCAAGGAAGTATGCTGAAA;SOR=0.559;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=18;WE=162754057;WS=162754039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr1	162754244	rs61812969	T	G	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.96;QD=33.75;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	162760551	rs1704754	C	T	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.71;MQRankSum=0.585;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.526;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,27:0.38:72
chr1	162760554	rs71519246	T	C	2801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=77;NR=4;PP=1066;SC=GCAGCGGCGGTGTTTGCTTCA;SOR=5.892;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=84;TCF=79;TCR=5;TR=81;WE=162760562;WS=162760541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	162765475	rs2684884	G	C	1065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.61;QD=33.31;SOR=2.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	162766476	rs1780019	C	T	1698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.428;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.084;NF=17;NR=50;PP=1349;ReadPosRankSum=0.153;SC=AGGTAATTTTCGTTTTATGGA;SOR=1.262;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=171;TCF=52;TCR=119;TR=67;WE=162766484;WS=162766466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,68:0.39:173
chr1	162822771	rs2684878	A	C	868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=0;PP=802;SC=ATGCCTATTCATGTTGGCCCA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=162822779;WS=162822761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	162824553	rs78851184	G	A	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=561;ReadPosRankSum=0.347;SC=TATGTTAAACGGTTAGAGAGG;SOR=0.626;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=79;TCR=27;TR=34;WE=162824561;WS=162824543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,35:0.33:107
chr1	162825258	rs12036026	T	C	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.009;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;ReadPosRankSum=1.754;SC=CAAGGTAATATAGGTGGGAAT;SOR=1.673;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=22;WE=162825266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr1	162825457	rs77227460	C	A	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.805;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=818;ReadPosRankSum=0.923;SC=TGTGCTTCTGCCTTCCCTGTG;SOR=0.558;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=130;TCF=72;TCR=58;TR=49;WE=162825465;WS=162825447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,51:0.40:129
chr1	163117351	rs3768560	G	T	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.692;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=324;ReadPosRankSum=0.315;SC=TTGATGAGGGGTGAAGAGGGA;SOR=0.241;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=18;WE=163117359;WS=163117341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
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chr1	163142537	rs10917691	G	A	273.56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5971;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=241;ReadPosRankSum=-0.657;SC=GGAGTTCATTGTTCAGGGAAT;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=11;WE=163142545;WS=163142527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr1	163172574	rs2292270	G	C	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=965;ReadPosRankSum=-0.835;SC=AAATAACTTGGTTCTCACCTT;SOR=0.664;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=72;TCF=47;TCR=25;TR=47;WE=163172582;WS=163172564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,48:0.66:73
chr1	163187263	rs2814368	G	A	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=402;ReadPosRankSum=0.347;SC=AGTCTTTCCTGTAAATTATAA;SOR=0.593;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=17;WE=163187271;WS=163187253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr1	163307944	rs2175015	T	C	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=312;ReadPosRankSum=0.928;SC=GAATTGTAAGTAGTATTTTAC;SOR=0.874;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=13;WE=163307952;WS=163307934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr1	163308027	rs11330875	TA	T	42.15	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.43;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr1	163309219	rs1509022	A	T	3519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=61;PP=2624;ReadPosRankSum=0.419;SC=TTTCAGATGGAATTCAGGAGC;SOR=0.672;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=208;TCF=110;TCR=98;TR=131;WE=163309227;WS=163309209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,142:0.64:222
chr1	163309302	rs2999852	C	T	3938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=101;PP=2965;SC=CTTTAAAAAACAAAATTTGTT;SOR=3.258;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=18;TCR=101;TR=119;WE=163309310;WS=163309292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	163315350	rs10753611	G	C	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=92;ReadPosRankSum=0.062;SC=TAATTGTTCCGTGCTCTTAAG;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=6;WE=163315358;WS=163315340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr1	164532325	rs4657364	T	C	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=10;NR=0;PP=181;ReadPosRankSum=-0.385;SC=GGACTCTGTATATTAAGTCAT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=10;WE=164532333;WS=164532315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr1	164789444	rs1538488	A	G	1091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=28;PP=904;SC=CCAATATGTCACCAGGTGAAT;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=164789452;WS=164789434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	165173216	rs1354509	A	G	2701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.98;NF=22;NR=59;PP=2012;SC=CTAGGAAACAATCACCCAGGT;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=22;TCR=59;TR=81;WE=165173224;WS=165173206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	165175374	rs4656435	G	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=243;ReadPosRankSum=0.431;SC=GGGATGAGGTGACATCAGTGG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=10;WE=165175382;WS=165175364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr1	165180089	rs1532815	T	A	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=391;ReadPosRankSum=-1.593;SC=TATATAATACTTGAGGAGGCC;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=20;WE=165180097;WS=165180079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr1	165375895	rs283697	A	C	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=1;PP=386;SC=CCGCTAGCCCAATGGAATTAA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=165375903;WS=165375885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	165376043	rs283696	T	C	1164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=14;PP=919;SC=GCCAGCACTGTCTCACCTGCC;SOR=1.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=36;WE=165376051;WS=165376033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	165376227	rs111545739	C	CCG	793.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.78;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	165376231	.	CTG	C	719.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.34;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	165377389	rs283692	T	C	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=456;SC=GGAGGACCAATAACATGGGAG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=165377397;WS=165377379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	165377552	rs2134095	G	A	3458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.326;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=61;PP=2710;ReadPosRankSum=-1.037;SC=GCTCAGTTAGGACTCTGTTAA;SOR=0.417;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=196;TCF=109;TCR=87;TR=129;WE=165377560;WS=165377542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,131:0.66:199
chr1	165378729	rs66800417	TACAC	T,TAC	1842.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.62;QD=40.95;SOR=2.935;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,13,32:0.29,0.71:45
chr1	165378733	rs12406497	C	T	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=0.000;QD=26.33;ReadPosRankSum=0.438;SOR=0.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,32:0.67:48
chr1	165378733	.	CAC	TAT	1457	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MMLQ=28;MQ=59.63;NF=17;NR=3;PP=1457;QD=75.5233937431;SC=TGTGTATACACACACACACAC;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=20;WE=165378743;WS=165378719;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr1	165378735	rs138671935	C	T	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=0.000;QD=24.78;ReadPosRankSum=1.248;SOR=0.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,32:0.63:51
chr1	165380027	rs185905	C	T	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.132;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=9;PP=812;ReadPosRankSum=-1.423;SC=TGAAAAGCTGCTTGTCAGCAG;SOR=1.646;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=134;TCF=95;TCR=39;TR=47;WE=165380035;WS=165380017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,47:0.34:138
chr1	165386567	rs2281986	C	T	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.830;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.150;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=152;ReadPosRankSum=1.014;SC=ATCACTTGGGCATTGGGACAG;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=165386575;WS=165386557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr1	165389129	rs1128977	G	A	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.755;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=6;PP=906;ReadPosRankSum=0.996;SC=CTCCACAGATGGCACAGATGT;SOR=0.330;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=58;TCF=51;TCR=7;TR=42;WE=165389137;WS=165389119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,46:0.74:62
chr1	165389285	rs157870	C	G	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=3.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.464;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,36:0.25:144
chr1	165398115	rs113471	T	C	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=547;ReadPosRankSum=-0.586;SC=CTGGGGTATCTGTGTAGCTGG;SOR=0.660;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=105;TCF=51;TCR=54;TR=40;WE=165398123;WS=165398105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,39:0.35:110
chr1	165513439	rs285446	A	C	256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=5;PP=172;SC=TTCTTTCCAGAGCCCCTCCCC;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=10;WE=165513447;WS=165513429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	165513456	rs285445	A	T	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.90;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	165513463	rs285444	C	G	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.43;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	165601365	rs4147596	T	C	2202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=28;PP=1712;SC=AGCTACATAATAGCGTCGGGG;SOR=1.042;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=69;TCF=40;TCR=29;TR=68;WE=165601373;WS=165601355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	165601466	rs9333378	G	A	2097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=37;PP=1533;SC=TTCCTTCCCTGGGGACAGGAG;SOR=1.098;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=27;TCR=38;TR=64;WE=165601474;WS=165601456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	165621149	.	T	A	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.927;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=6.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.55;MQRankSum=-3.304;QD=17.04;ReadPosRankSum=-2.366;SOR=3.111;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr1	165621150	.	T	A	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.484;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=6.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQRankSum=-3.226;QD=16.83;ReadPosRankSum=-3.562;SOR=2.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr1	165621151	.	C	A	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=6.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQRankSum=-3.280;QD=16.83;ReadPosRankSum=-4.002;SOR=2.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr1	165621153	.	T	A	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.367;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=5.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQRankSum=-3.235;QD=16.73;ReadPosRankSum=-4.166;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr1	165624799	rs8133	G	T	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=160;ReadPosRankSum=-0.615;SC=TTTATTTCCAGTTACATTTTT;SOR=0.375;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=9;WE=165624807;WS=165624789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr1	165630475	rs7544840	C	T	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=32;ReadPosRankSum=-0.216;SC=TGAAAAGATACATAATTTTAT;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=5;WE=165630483;WS=165630465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr1	165630495	rs7511691	T	C	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.543;NF=7;NR=0;PP=80;ReadPosRankSum=-1.517;SC=TATATAGGCATAAAATATCAC;SOR=0.155;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=7;WE=165630503;WS=165630485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr1	165630698	rs6667681	A	G	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=100;ReadPosRankSum=-0.955;SC=CCTGGGCCACACTGGAAGAAG;SOR=0.446;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=8;WE=165630706;WS=165630688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr1	165634425	rs3820362	C	G	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.279;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=529;ReadPosRankSum=-0.454;SC=ACTACTTTAACAGGAAAAGTT;SOR=0.100;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=58;TCF=4;TCR=54;TR=24;WE=165634433;WS=165634415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chr1	165636749	rs2176151	A	G	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=227;ReadPosRankSum=0.445;SC=CACCACCCCCAGCTAATTTTT;SOR=1.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=1;TCR=49;TR=14;WE=165636757;WS=165636739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,16:0.29:55
chr1	165648559	rs4646897	T	G	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=258;ReadPosRankSum=0.607;SC=GAATTCTTTGTACTATTTGTG;SOR=0.622;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=13;WE=165648567;WS=165648549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr1	165648886	rs4646896	G	A	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.494;SOR=0.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr1	165648894	rs4646895	C	G	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.72;ReadPosRankSum=-0.515;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr1	165651153	rs2882006	T	A	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=409;ReadPosRankSum=0.754;SC=TGTACAACCTTAACTATAAGC;SOR=2.124;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=18;WE=165651161;WS=165651151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr1	165651502	rs1913844	G	C	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=196;ReadPosRankSum=-0.736;SC=AGGAGTAAAGGAGGATGCAGG;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=9;WE=165651510;WS=165651492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr1	165652273	rs1143659	A	G	2032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.895;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=20;PP=1587;ReadPosRankSum=0.008;SC=AGGAAATGTCAATGTCCAAGC;SOR=1.217;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=132;TCF=96;TCR=36;TR=84;WE=165652281;WS=165652263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,86:0.64:135
chr1	165652445	rs4233407	A	G	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=40;PP=1039;ReadPosRankSum=-1.076;SC=TTTAAAACTAAAAATAGCTTT;SOR=2.393;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=0;TCR=51;TR=40;WE=165652453;WS=165652435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,40:0.77:52
chr1	165667781	rs12408101	T	G	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.124;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=516;ReadPosRankSum=1.651;SC=CGGCCAGGCCTGCTCGGAGAA;SOR=0.283;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=26;WE=165667789;WS=165667771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
chr1	165721223	rs7512095	T	C	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=0;PP=566;SC=CTTGCAACTTTTCTTTAAGTT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=20;WE=165721231;WS=165721213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	165727274	rs71678704	CTCT	C	1913.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.626;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.361;NF=10;NR=29;PP=1562;ReadPosRankSum=0.333;SC=TGTCTGCATTCTCTTCTTCAT;SOR=0.629;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=137;TCF=45;TCR=92;TR=39;WE=165727284;WS=165727264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,54:0.36:152
chr1	165737704	rs2790053	C	G	7073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=93;PP=2965;SC=CCACAAATACCCAAGTGAAAT;SOR=1.063;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=228;TCF=135;TCR=93;TR=228;WE=165737712;WS=165737694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr1	165859630	rs477033	C	G	3781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=75;PP=2962;SC=GGGTATGTATCTGTATTGGTG;SOR=1.441;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=41;TCR=76;TR=115;WE=165859648;WS=165859620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr1	165859640	rs138035087	G	GTGT	2608.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.250;NF=9;NR=41;PP=1907;ReadPosRankSum=-0.847;SC=CTGTATTGGTGTGTTGGGGGG;SOR=0.478;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=97;TCF=20;TCR=77;TR=50;WE=165859648;WS=165859620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,66:0.67:99
chr1	166029970	rs4353067	T	C	1666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=27;PP=1459;SC=TGTCATTCCCTAAAAGCAGAT;SOR=0.952;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=25;TCR=27;TR=52;WE=166029978;WS=166029960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	166124134	rs896402	A	G	6837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=142;PP=2965;SC=TGTAAGTTAAAAATGATTCTG;SOR=1.799;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=206;TCF=64;TCR=142;TR=206;WE=166124142;WS=166124124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr1	166590254	rs558874	A	G	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.346;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=45;PP=984;ReadPosRankSum=0.764;SC=TTGCATAGTAAATGTGTGTGT;SOR=0.406;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=142;TCF=10;TCR=132;TR=49;WE=166590262;WS=166590244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,48:0.34:142
chr1	166591043	rs530513	T	C	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=335;ReadPosRankSum=-0.941;SC=TACTCAGACTTATGGGGTTTT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=50;TCR=1;TR=18;WE=166591051;WS=166591033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,20:0.36:55
chr1	166826773	rs6675153	C	T	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=22;ReadPosRankSum=1.596;SC=TCAATGAATTCGGTGAGGGTC;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=4;WE=166826781;WS=166826763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr1	166827674	rs6691431	T	C	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=209;ReadPosRankSum=-1.268;SC=GTAATTTTAATTTTTAAAGGC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=10;WE=166827682;WS=166827664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr1	166831703	rs35181816	C	CA	154.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=236;ReadPosRankSum=0.117;SC=AAACAAGACACAAAGTAAACT;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=8;WE=166831711;WS=166831693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr1	166833199	rs2272793	C	A	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.983;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=32;PP=903;ReadPosRankSum=-0.701;SC=AAAATAATGACAACTGATAAC;SOR=0.434;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=96;TCF=21;TCR=75;TR=43;WE=166833207;WS=166833189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,44:0.42:105
chr1	166896213	.	C	G	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=292;ReadPosRankSum=-0.540;SC=CCTGCAAGCTCAGGGCTGCCC;SOR=0.627;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=13;WE=166896221;WS=166896203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr1	166944273	rs67253020	TCACA	T	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=2;PP=452;SC=TCTCTCTCTCTCACACACACA;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=8;WE=166944284;WS=166944263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	167059336	rs2281964	C	T	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=0;PP=1214;SC=GGCACTGGTCCGGAATGTGTA;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=167059344;WS=167059333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	167059462	rs2281963	G	C	5869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=62;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.823;SC=GGGCACTGGAGAGAAAAGGGG;SOR=0.610;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=177;TCF=115;TCR=62;TR=175;WE=167059470;WS=167059452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,185:0.99:186
chr1	167059575	rs28384507	G	T	5445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.253;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=121;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.816;SC=GCAGCCTCCAGACAGGTCTGA;SOR=1.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=53;TCR=122;TR=173;WE=167059583;WS=167059565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,180:0.99:181
chr1	167082869	rs12122365	G	A	4377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=113;NR=13;PP=2965;SC=TAAAATCAAAGCCAGGTTTCT;SOR=4.174;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=113;TCR=13;TR=126;WE=167082877;WS=167082859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr1	167095163	rs267745	G	C	1960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=27;PP=1610;SC=ACCCCAATGAGGGCTTCCTGA;SOR=0.886;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=34;TCR=27;TR=61;WE=167095171;WS=167095153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	167095445	rs147722091	C	T	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=304;ReadPosRankSum=0.696;SC=AGGGGCAGGGCCTCCTCTCAG;SOR=0.706;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=37;TCR=33;TR=21;WE=167095453;WS=167095435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,22:0.31:72
chr1	167097567	rs61748784	G	A	4973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.294;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=82;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.786;SC=CAGGTCCAGGGACTGGGAAGA;SOR=0.451;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=68;TCR=82;TR=149;WE=167097575;WS=167097557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,157:0.99:158
chr1	167097739	rs2281959	C	A	2506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.087;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=48;PP=1933;ReadPosRankSum=1.239;SC=CGGAGAAGCACTGACAGGGAG;SOR=1.026;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=32;TCR=48;TR=79;WE=167097747;WS=167097729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,81:0.99:82
chr1	167353258	rs35617253	AT	A	622.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=3.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.214;QD=7.16;ReadPosRankSum=0.526;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,36:0.41:87
chr1	167367193	rs7524019	C	T	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.828;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=3;PP=623;ReadPosRankSum=0.411;SC=TCACTGTGCTCAGCTAATTTT;SOR=1.508;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=107;TCF=91;TCR=16;TR=34;WE=167367201;WS=167367183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,33:0.31:108
chr1	167370850	.	A	G	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=2;PP=29;ReadPosRankSum=0.682;SC=GTTTTGGGTTATTATAAGAGT;SOR=0.412;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=3;WE=167370858;WS=167370840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr1	167382374	rs10753757	A	C	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.704;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=401;ReadPosRankSum=-0.113;SC=CTTTTTCTTAATTTGGTGGCA;SOR=0.330;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=21;WE=167382382;WS=167382364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,21:0.38:55
chr1	167382399	rs67647055	AGTGT	A	212.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.315;NF=0;NR=8;PP=309;ReadPosRankSum=-0.258;SC=CGTGTGTGTGAGTGTGTGTGT;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=8;WE=167382410;WS=167382389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr1	167385186	.	A	C	2377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.882;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.174;HP=14;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.647;NF=62;NR=20;PP=2259;ReadPosRankSum=2.888;SC=GAGAAAAAAAAAAAAAAACCA;SOR=1.426;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=107;TCF=78;TCR=29;TR=82;WE=167385194;WS=167385168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,86:0.79:109
chr1	167403504	rs952962	A	G	407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=13;PP=354;SC=CACCCCCCTCATCCTCAGCCC;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=167403512;WS=167403494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	167404078	rs3108156	G	A	1210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=16;PP=968;SC=GACATTACTCGATCCAAGAAG;SOR=0.968;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=38;WE=167404086;WS=167404068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	167407799	rs56199250	A	T	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=3.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.44;ReadPosRankSum=1.042;SOR=0.327;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,23:0.23:102
chr1	167408670	rs840016	C	T	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.010;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=47;PP=1260;ReadPosRankSum=0.221;SC=CGTTACTGCTCCGCGAGGGCG;SOR=0.994;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=92;TCF=20;TCR=72;TR=59;WE=167408678;WS=167408660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,60:0.65:93
chr1	167487880	rs3820390	C	T	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=453;ReadPosRankSum=-1.231;SC=TCGCACTCCCCCTTTCGGTTC;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=19;WE=167487888;WS=167487870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,21:0.81:26
chr1	167599583	rs3738221	G	A	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.308;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=621;ReadPosRankSum=-1.159;SC=ACGGCCGGGAGCGGAGGGGAC;SOR=0.070;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=28;WE=167599591;WS=167599573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,30:0.61:49
chr1	167653002	rs56169660	G	A	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-6.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=2;PP=704;ReadPosRankSum=0.145;SC=GTCCTTGAATGCAGGAGCCAG;SOR=0.289;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=52;TCF=50;TCR=2;TR=33;WE=167653010;WS=167652992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,34:0.65:52
chr1	167654581	rs7532689	T	C	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=0;PP=744;ReadPosRankSum=0.506;SC=CCAGTTTCCATTTCCTTGCTC;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=30;WE=167654589;WS=167654571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,31:0.70:44
chr1	167673738	rs34762939	T	TA	426.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=383;ReadPosRankSum=-0.478;SC=AGTCAATGCATAAAAAAAACT;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=19;WE=167673746;WS=167673728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr1	167778843	rs3213588	G	A	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.897;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=603;ReadPosRankSum=-1.466;SC=GAGTGGGCCAGCCACGGAGAA;SOR=2.833;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=25;WE=167778851;WS=167778833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr1	167779865	rs74486783	A	C	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=467;ReadPosRankSum=3.073;SC=ATATTTTGTTAATGGCAGCCT;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=19;WE=167779873;WS=167779855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr1	167793670	rs1476074	C	T	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=105;ReadPosRankSum=0.959;SC=CTCAATAATACGGCCTCCTCC;SOR=0.165;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=8;WE=167793678;WS=167793660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr1	167805439	rs7550383	G	A	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=378;ReadPosRankSum=-0.526;SC=GGGTGCTGTCGGGAATATACA;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=17;WE=167805447;WS=167805429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr1	167806642	rs35986349	C	G	1338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=6.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.09;ReadPosRankSum=1.656;SOR=0.257;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,53:0.56:95
chr1	167806647	rs1034463	T	A	3731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=72;PP=895;SC=TGTTCCCTTTTCGGAGTTGTT;SOR=2.535;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=18;TCR=72;TR=90;WE=167806655;WS=167806632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	167806696	rs1034464	T	C	1441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=34;PP=1113;SC=GTCCCCATTGTATCTTAGGTG;SOR=3.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=39;WE=167806704;WS=167806686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	167806714	rs1034465	G	A	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=46;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=586;ReadPosRankSum=-1.308;SC=GTGAAGCCACGTGATGAGTTC;SOR=1.132;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=24;WE=167806722;WS=167806704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,29:0.76:38
chr1	167814733	rs73039577	T	G	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=190;ReadPosRankSum=-0.352;SC=CCACACCCACTCCTTCTAGAT;SOR=0.420;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=13;WE=167814741;WS=167814723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr1	167815167	rs2269678	T	C	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.590;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=9;PP=868;ReadPosRankSum=0.712;SC=ATAGGTCAATTCTTTGATCTA;SOR=1.306;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=101;TCF=71;TCR=30;TR=42;WE=167815175;WS=167815157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,41:0.41:100
chr1	167815610	rs2269679	C	A	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=426;ReadPosRankSum=0.542;SC=GTTCTTGTTGCAAGAAACTCA;SOR=1.341;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=1;TCR=46;TR=20;WE=167815618;WS=167815600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr1	167817639	rs203795	A	G	1956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=34;PP=1573;SC=TCAGTCTGACACCACTTGTGA;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=32;TCR=34;TR=66;WE=167817647;WS=167817629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	167823455	rs12760577	A	G	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=510;ReadPosRankSum=0.609;SC=ATCGGATCCAATAATTCCTGG;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=20;WE=167823463;WS=167823448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr1	167823512	rs3738236	T	C	2118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=8;PP=1728;SC=GTGGAATAGCTCATTTTTGCT;SOR=3.784;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=58;TCR=8;TR=64;WE=167823520;WS=167823502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	167825485	rs2071921	T	C	5927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=132;PP=2965;SC=ACTGCACCAATGACAATGTAG;SOR=1.433;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=204;TCF=72;TCR=132;TR=203;WE=167825493;WS=167825475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr1	167825606	rs2071922	A	G	1774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.908;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=45;PP=1334;ReadPosRankSum=0.336;SC=GCTTCTCCATAAATCTCCAGG;SOR=1.189;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=106;TCF=34;TCR=72;TR=63;WE=167825614;WS=167825596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,65:0.60:109
chr1	167825718	rs7537851	C	T	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=112;ReadPosRankSum=0.828;SC=CACCATAGGACGTCAGGTTTT;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=7;WE=167825726;WS=167825708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr1	167830006	rs7518237	G	C	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.971;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=560;ReadPosRankSum=1.919;SC=TCTGGATACTGCAGATATACA;SOR=2.808;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=23;WE=167830014;WS=167829996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr1	167839578	rs67878347	G	A	1971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=48;PP=1573;SC=CATACATTAAGACTTGGCTGC;SOR=2.948;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=11;TCR=48;TR=59;WE=167839586;WS=167839568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	167844553	rs203826	C	A	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=33;PP=977;SC=CCCTGACTCACGGGTCGCAAA;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=167844561;WS=167844543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	167844582	rs203827	C	G	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=23;PP=653;SC=GAAGGAGAAACGAGAAGGTCT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=167844590;WS=167844572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	167849318	rs203847	A	G	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=323;SC=CTGTGTTTGCAGAAAGAAAGC;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=167849326;WS=167849308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	167849414	rs203849	A	G	1409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=23;PP=1110;SC=CACTGGCAACACCGATGGATA;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=27;TCR=23;TR=50;WE=167849422;WS=167849404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	167889094	rs17556487	T	A	2101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=0;PP=1831;SC=ATGAATCTTTTAAAAAAATTA;SOR=8.349;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=64;TCR=0;TR=64;WE=167889102;WS=167889084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	167889393	rs34646997	A	C	1289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=37;PP=967;ReadPosRankSum=0.506;SC=GTGAATACTTAATATTGAGTA;SOR=2.001;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=37;WE=167889401;WS=167889383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,42:0.72:58
chr1	167893759	rs9618	G	A	996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=12;PP=795;SC=GAGCCCAGAAGAAAACTGTTC;SOR=1.244;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=31;WE=167893767;WS=167893749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	167893905	.	T	C	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.25;ReadPosRankSum=-0.108;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr1	167906239	rs203788	A	C	1494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=22;PP=1215;SC=TGCGGAGTCGATACCTGGGTG;SOR=0.909;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=28;TCR=22;TR=50;WE=167906247;WS=167906229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	167971979	rs436256	GC	TG	726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=868;SC=GTGGAATGGCGCAGTCACTGG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=167971988;WS=167971969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	167973976	rs1060041	C	T	7430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=120;NR=120;PP=2965;SC=CTTCTCCAGACAGTGAACAAA;SOR=0.744;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=240;TCF=120;TCR=120;TR=240;WE=167973984;WS=167973966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr1	167985326	rs3831959	TG	T	782.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=785;SC=TCCTTGCATATGGGTGGTATT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=20;WE=167985334;WS=167985316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	167988653	rs202255	A	G	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=1;PP=809;SC=AAAGGCCCCCATAAGGTTGAT;SOR=4.317;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=35;WE=167988661;WS=167988643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	167992344	rs201541	T	A	2215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=59;PP=1848;SC=GCAATGCATATACTAAGCTCT;SOR=4.112;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=6;TCR=59;TR=65;WE=167992352;WS=167992334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	168035104	rs380095	G	C	1281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=32;PP=945;SC=TGACTAGGCAGCAGTAGAGTC;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=32;WE=168035112;WS=168035094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	168056724	rs275143	A	G	4956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=130;NR=13;PP=2965;SC=TGGAGCCCTGATATATTCCGG;SOR=4.543;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=130;TCR=13;TR=143;WE=168056732;WS=168056714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	168059866	rs275149	A	G	2019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=31;PP=1511;SC=GGGGCTGTCCACCTGCCATGA;SOR=1.240;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=87;TCF=42;TCR=45;TR=73;WE=168059874;WS=168059856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	168073601	rs2294817	C	A	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=91;ReadPosRankSum=-0.739;SC=TGGTCATCCTCCCCCAGCAAG;SOR=0.250;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=7;WE=168073609;WS=168073591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr1	168074145	rs6427119	G	A	2086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=56;PP=1702;SC=GGAAAGATAAGGCAGGACCAG;SOR=4.943;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=3;TCR=56;TR=59;WE=168074153;WS=168074135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	168106716	rs6664903	T	C	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.464;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=42;PP=1114;ReadPosRankSum=-0.269;SC=AGTGAATTCGTCCCGAAGCCA;SOR=1.106;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=66;TCF=10;TCR=56;TR=49;WE=168106724;WS=168106706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,55:0.76:72
chr1	168106783	rs41271651	C	T	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=377;ReadPosRankSum=-0.580;SC=CCCTGCACTCCCTCGGAACCA;SOR=1.931;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=15;WE=168106791;WS=168106773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr1	168153090	rs2038035	A	T	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=2;PP=692;ReadPosRankSum=0.357;SC=AGAAACAAAAATGCCAACAGC;SOR=0.573;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=55;TCR=3;TR=33;WE=168153098;WS=168153080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr1	168153370	rs2038034	A	G	1662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=49;PP=1274;ReadPosRankSum=-1.475;SC=AGGTTAAACAAAAGAGAAAAG;SOR=0.745;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=86;TCF=11;TCR=75;TR=56;WE=168153378;WS=168153360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,60:0.66:91
chr1	168165767	rs35234155	CT	C	529.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=5.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=0.696;QD=12.61;ReadPosRankSum=0.693;SOR=0.097;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,31:0.74:42
chr1	168262522	.	AGTGTGT	A,AGTGTGTGT	264.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=9.031;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.29;MQRankSum=-0.314;QD=16.55;ReadPosRankSum=-0.080;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:2,5,9:0.31,0.56:16
chr1	168274201	rs4656579	G	A	1180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=9;PP=992;SC=TTTGGTGTGGGAGTTCACAGA;SOR=2.242;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=37;WE=168274209;WS=168274191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	168278264	rs1883148	G	A	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=32;PP=909;SC=TGGCAACAGGGTGGAGTTCTT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=168278272;WS=168278254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	168282261	rs3885717	T	A	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.244;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=30;PP=1005;ReadPosRankSum=0.723;SC=AGGAGCCTCTTTGCACAGCGA;SOR=0.161;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=81;TCF=31;TCR=50;TR=54;WE=168282269;WS=168282251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,53:0.65:82
chr1	168510122	rs470733	T	A	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.76;QD=32.92;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	168511155	rs76400946	T	C	1056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=2;PP=907;SC=TTCCTGAGGATGGCAGCATTT;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=34;WE=168511163;WS=168511145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	168545758	.	C	T	731	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=40.59;NF=27;NR=0;PP=731;QD=28.361896761;SC=CATGATCCTACACCCACCTCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=168545766;WS=168545757;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	168545949	rs34933908	G	A	3811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=82;PP=2965;SC=AAGTGGAGAAGCTGTCTGTGA;SOR=1.553;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=44;TCR=82;TR=126;WE=168545957;WS=168545939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	168549422	rs6427130	C	T	2878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=64;PP=2393;SC=TAATGTGAGTCTGCCTCCTCA;SOR=1.954;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=23;TCR=64;TR=87;WE=168549430;WS=168549412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	168550535	rs79981832	A	G	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.089;NF=0;NR=27;PP=573;ReadPosRankSum=1.006;SC=GTTTATACTCACCTTTTATGA;SOR=0.384;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=0;TCR=63;TR=27;WE=168550543;WS=168550525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,25:0.40:62
chr1	168698173	rs1052591	C	T	4561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=108;NR=37;PP=2965;SC=GGCTCTGTGGCGTGGGCATGC;SOR=2.115;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=146;TCF=108;TCR=38;TR=145;WE=168698181;WS=168698163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr1	169076212	rs1200128	G	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.436;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.421;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=5;PP=110;ReadPosRankSum=1.087;SC=GATCTTTCCCGGGCGGCGCAT;SOR=0.056;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=9;WE=169076220;WS=169076202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr1	169080837	rs1200138	C	T	1620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=46;PP=1414;ReadPosRankSum=-0.891;SC=ATAATGTAGTCTTAAAGCAAC;SOR=2.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=6;TCR=47;TR=52;WE=169080845;WS=169080827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr1	169094100	rs968304	T	A	1526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.241;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=10;PP=1070;ReadPosRankSum=1.189;SC=CCTACTAATGTTTTTCTCTCT;SOR=1.091;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=70;TCF=54;TCR=16;TR=48;WE=169094108;WS=169094090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,55:0.73:75
chr1	169099061	rs1200157	G	A	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.278;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=198;ReadPosRankSum=-0.639;SC=TTTCATTTCAGCAAAATCACA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=9;WE=169099069;WS=169099051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr1	169101280	rs184990529	G	T	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=39.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.18;MQRankSum=-1.932;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.617;SOR=5.278;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr1	169102223	rs61803315	G	C	3584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=98;PP=2965;SC=GCTCCAGTTTGAAGTTCCATT;SOR=5.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=6;TCR=98;TR=104;WE=169102231;WS=169102213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	169138027	rs10919082	A	G	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.803;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=727;ReadPosRankSum=-0.250;SC=GTATCTATATATATGTTATGC;SOR=0.961;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=50;TCF=26;TCR=24;TR=36;WE=169138035;WS=169138017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,39:0.72:54
chr1	169138307	rs4656656	C	A	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.421;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=1640;ReadPosRankSum=-0.010;SC=TGTATGCCAACCAGAAAAAAA;SOR=0.426;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=33;WE=169138326;WS=169138297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,34:0.61:56
chr1	169138318	rs4656657	T	A	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=1640;ReadPosRankSum=0.849;SC=CAGAAAAAAATATCTAAATTC;SOR=0.660;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=37;TCR=20;TR=34;WE=169138326;WS=169138297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,35:0.58:60
chr1	169138868	rs3737681	C	T	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=556;ReadPosRankSum=0.934;SC=CTATATGAAACGCTAACTTAT;SOR=1.230;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=25;WE=169138876;WS=169138858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,28:0.61:46
chr1	169159866	rs7526721	G	T	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.237;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=617;ReadPosRankSum=0.517;SC=AAAAATGTTTGATTTTAATAC;SOR=1.675;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=21;WE=169159874;WS=169159856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr1	169160037	.	T	TAAGAAAACAACCAGAAAAATGGTGAAGTGC	205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.86;ReadPosRankSum=1.510;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	169200111	rs10800420	C	T	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.969;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=546;ReadPosRankSum=-0.929;SC=TTAACTCTCCCCTTTTAATTG;SOR=0.377;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=25;WE=169200119;WS=169200101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr1	169216412	rs2040445	C	G	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=54;PP=1572;SC=AAATAAAGTACGGTACTGAGT;SOR=6.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=0;TCR=54;TR=54;WE=169216420;WS=169216402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	169256501	rs4589164	C	T	1574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.389;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=3;PP=1231;ReadPosRankSum=0.130;SC=CATTGCTCTCCTATTAACAAA;SOR=2.879;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=86;TCF=75;TCR=11;TR=51;WE=169256509;WS=169256491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,53:0.60:88
chr1	169272299	rs10919130	A	T	1085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.409;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=793;ReadPosRankSum=2.167;SC=ATTATTCTCAAGTAATAAATT;SOR=0.291;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=38;WE=169272307;WS=169272289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,39:0.74:53
chr1	169272451	rs10800427	A	T	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.51;SOR=4.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	169272451	.	AGG	TGA	786	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=12;PP=786;QD=69.9556562385;SC=ATAATCAAAAAGGCAATAGTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=12;WE=169272461;WS=169272441;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,12:0.71:17
chr1	169272453	rs10800428	G	A	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=51.32;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	169279196	rs34054662	T	TA	329.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.850;NF=14;NR=0;PP=331;ReadPosRankSum=-0.171;SC=CTGAAAATGATAAAAAAATTA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=14;WE=169279204;WS=169279186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr1	169279442	rs79453021	G	A	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=26;ReadPosRankSum=-0.160;SC=TAATTGTATAGAAAAGTGTAT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=169279450;WS=169279432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr1	169293721	rs1140523	G	A	1912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.616;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=58;PP=1652;ReadPosRankSum=-0.013;SC=CAATGAAAACGAATCTTTCAC;SOR=1.996;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=95;TCF=16;TCR=79;TR=66;WE=169293729;WS=169293711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,65:0.68:95
chr1	169345704	rs12563090	G	A	1529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=3;PP=1285;SC=TTGAATATAGGGTATAGCATG;SOR=4.849;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=44;TCR=3;TR=47;WE=169345712;WS=169345694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	169349608	rs3830533	C	CTA	1053.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=961;SC=AGTAACTATACTGTTAAATCT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=23;WE=169349616;WS=169349599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	169351596	rs3905328	A	G	1013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=29;PP=854;SC=CATGGAAAGCATTTGGCATTA;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=169351604;WS=169351586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	169390957	rs35107735	A	T	1308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=23;PP=1060;ReadPosRankSum=-0.828;SC=GGAGGCAAAAACCCCTGACTG;SOR=0.312;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=38;WE=169390965;WS=169390947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr1	169391154	rs3820059	A	G	1944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=26;PP=1670;SC=ATAATTTTTAAAAGTAGTAGT;SOR=0.871;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=32;TCR=26;TR=58;WE=169391162;WS=169391144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	169394226	rs10919168	A	G	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=14;PP=531;SC=TGTTATGCCCACTCTAGAGGA;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=23;WE=169394234;WS=169394216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	169435027	rs2678166	C	T	2228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=3;PP=1946;SC=AAAAATCAAACACATCCAGGC;SOR=5.610;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=66;TCR=3;TR=69;WE=169435035;WS=169435017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	169455435	rs2056926	G	C	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=3.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.161;SOR=1.106;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,35:0.27:130
chr1	169483561	rs6027	T	C	2264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.043;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=33;PP=1720;ReadPosRankSum=-0.669;SC=CTAGTAAATATCACAGCCAAA;SOR=1.516;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=262;TCF=147;TCR=115;TR=97;WE=169483569;WS=169483551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,99:0.37:271
chr1	169483762	rs2227243	T	G	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=251;ReadPosRankSum=0.881;SC=TTGTTTTTGTTTTTTTTTAGA;SOR=0.214;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=0;TCR=56;TR=18;WE=169483770;WS=169483752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,20:0.32:62
chr1	169484552	rs3820060	T	G	2957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=81;NR=1;PP=2554;SC=CCAGGCACCTTAAGAACTAAG;SOR=7.476;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=83;TCF=82;TCR=1;TR=82;WE=169484560;WS=169484542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	169487821	rs6013	G	T	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.004;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=468;ReadPosRankSum=-0.819;SC=GAAAAGTAACGTGATTAATTA;SOR=0.468;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=72;TCF=19;TCR=53;TR=27;WE=169487829;WS=169487811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,30:0.38:78
chr1	169492676	rs9332643	C	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.849;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=157;ReadPosRankSum=2.119;SC=CAGCTTTCTTCAGAACTAAAG;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=169492684;WS=169492666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	169493895	rs9332639	A	G	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.178;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,11:0.27:41
chr1	169494196	rs2301515	C	T	2610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=74;PP=2233;SC=AAAATATATACAATAAAGTAA;SOR=5.473;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=4;TCR=74;TR=78;WE=169494204;WS=169494186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	169498834	rs6009	T	C	2298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=6;PP=1931;SC=GATCAAAGTCTGAGGAAAATA;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=63;TCR=6;TR=69;WE=169498842;WS=169498824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	169498975	rs6030	T	C	4591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=75;PP=2965;SC=CTCATGTCCATAGGCATGTTG;SOR=0.871;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=63;TCR=75;TR=138;WE=169498983;WS=169498965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr1	169499190	rs2157581	A	G	309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=226;SC=AATGAATGGCATAATAAGCCT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=169499198;WS=169499180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	169499951	rs9332620	C	T	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.951;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=595;ReadPosRankSum=1.228;SC=GAAATAACCCCGACTCTTCCA;SOR=1.645;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=26;WE=169499959;WS=169499941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,26:0.70:37
chr1	169509483	rs9332609	T	G	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.752;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=429;ReadPosRankSum=-0.533;SC=GCTACTTTTTTCAGCAGTAAT;SOR=0.312;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=65;TCF=59;TCR=6;TR=24;WE=169509491;WS=169509473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,25:0.38:65
chr1	169510348	rs1800595	T	C	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FS=0.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQRankSum=0.239;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.984;SOR=0.729;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:192,72:0.27:264
chr1	169510380	rs9287090	G	A	5438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.151;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.820;NF=94;NR=98;PP=2962;ReadPosRankSum=0.919;SC=GCATCTGACCGAGGGCTGGGG;SOR=0.572;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=262;TCF=132;TCR=130;TR=192;WE=169510388;WS=169510370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,195:0.74:263
chr1	169510524	rs1800594	A	G	5229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=78;NR=101;PP=2965;SC=CGAGGGCTGGAGAAAGGTTTG;SOR=0.800;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=179;TCF=78;TCR=101;TR=179;WE=169510532;WS=169510514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr1	169510841	.	G	A	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.356;ClippingRankSum=0.000;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.840;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=37;PP=1089;ReadPosRankSum=0.174;SC=AAGGACTTGTGACTTCGGTCA;SOR=1.483;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=143;TCF=59;TCR=84;TR=54;WE=169510849;WS=169510831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,53:0.37:144
chr1	169511555	rs6032	T	C	4055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.908;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=59;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.402;SC=GGAGGGTCCTTCCAGGGCCTC;SOR=1.068;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=214;TCF=117;TCR=97;TR=140;WE=169511563;WS=169511545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,142:0.65:219
chr1	169511734	rs4525	T	C	4309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.502;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=1.050;SC=GGGTCCCTTATGCTTAGCATG;SOR=0.757;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=257;TCF=92;TCR=165;TR=174;WE=169511742;WS=169511724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,179:0.68:264
chr1	169511755	rs4524	T	C	4535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=91;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.907;SC=TTCTTGACTTTTGAATTCTCC;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=225;TCF=91;TCR=134;TR=152;WE=169511763;WS=169511745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,155:0.67:230
chr1	169511870	.	G	C	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.611;ClippingRankSum=0.000;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.52;ReadPosRankSum=2.219;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,46:0.33:141
chr1	169511878	rs6018	T	G	1725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.98;ReadPosRankSum=1.017;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,50:0.35:144
chr1	169512027	rs6021	T	C	4006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.687;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=44;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.609;SC=TATCTGTGTTTGAAGAAACGA;SOR=1.122;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=241;TCF=162;TCR=79;TR=146;WE=169512047;WS=169512017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,152:0.61:250
chr1	169512039	rs6024	T	C	2305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.053;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=41;PP=2962;ReadPosRankSum=1.973;SC=AAGAAACGAATTCAGTGCCAT;SOR=0.413;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=269;TCF=167;TCR=102;TR=97;WE=169512047;WS=169512017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,99:0.36:276
chr1	169512093	rs6017	A	G	4897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.596;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=91;PP=2962;ReadPosRankSum=0.772;SC=CTTCTTCCTGATTCAATGATG;SOR=0.505;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=261;TCF=119;TCR=142;TR=173;WE=169512101;WS=169512083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,179:0.67:268
chr1	169512120	rs6016	G	A	4916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.674;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=99;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.356;SC=GGAATGACCTGATTCCTAATG;SOR=0.465;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=248;TCF=96;TCR=152;TR=168;WE=169512128;WS=169512110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,175:0.68:256
chr1	169513436	rs9287092	C	A	282.31	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=230;ReadPosRankSum=1.897;SC=CAGGGAGATACATAGAGGAGC;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=169513444;WS=169513426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr1	169513583	rs6037	G	T	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.853;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=197;ReadPosRankSum=1.004;SC=TGGGGAAGAGGGTCAAGGTGT;SOR=2.462;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=62;TCF=42;TCR=20;TR=16;WE=169513591;WS=169513573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,16:0.26:62
chr1	169515726	rs6036	C	T	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=1.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.24;ReadPosRankSum=-0.063;SOR=0.897;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,42:0.30:142
chr1	169515874	rs13306345	T	A	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=418;ReadPosRankSum=1.884;SC=AACAGACGCATAGACCAATGG;SOR=1.044;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=18;WE=169515882;WS=169515864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr1	169515916	rs13306344	G	A	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.391;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=200;ReadPosRankSum=-0.736;SC=ATAAGGCTGCGCACCTACAAC;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=169515924;WS=169515906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr1	169519049	rs6025	T	C	2191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=15;PP=1752;SC=CTGTATTCCTTGCCTGTCCAG;SOR=2.338;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=50;TCR=15;TR=65;WE=169519057;WS=169519039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	169519894	rs6015	G	A	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=948;ReadPosRankSum=-0.552;SC=TGAAAGAAGAGTTGACTTCAT;SOR=0.698;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=167;TCF=97;TCR=70;TR=53;WE=169519902;WS=169519884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,53:0.30:175
chr1	169521853	rs6033	A	G	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.052;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=173;ReadPosRankSum=-0.055;SC=ATCTTCTTTCATATTGGGATT;SOR=0.252;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=14;WE=169521861;WS=169521843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,14:0.30:46
chr1	169572547	.	G	C	592	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=13;MMLQ=28;MQ=55.98;NF=2;NR=15;PP=592;QD=36.8688948557;SC=CTCTCTCTCTGTGTGTGTGTG;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=17;WE=169572555;WS=169572535;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:22,17:0.44:39
chr1	169580717	rs3917731	T	C	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=574;ReadPosRankSum=-1.326;SC=AGGTTGCTAATGAAAAATCCT;SOR=1.230;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=28;WE=169580725;WS=169580707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,30:0.77:39
chr1	169580972	rs3917730	C	CAT	2186.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.931;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.481;NF=10;NR=42;PP=2384;ReadPosRankSum=-0.709;SC=AAAAGCCACACAGAGAGCAAT;SOR=1.835;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=75;TCF=16;TCR=59;TR=52;WE=169580980;WS=169580962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,54:0.66:82
chr1	169599254	rs732314	T	C	3370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.513;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=45;ReadPosRankSum=-1.626;SC=CTGACTTTACTCCATACCACT;SOR=0.893;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=157;TCF=98;TCR=59;TR=122;WE=169599262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,122:0.76:161
chr1	169660781	rs12938	A	G	3258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=28;PP=2470;SC=ACTGTTGGTCAGGTAGAAATC;SOR=2.167;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=87;TCR=28;TR=115;WE=169660789;WS=169660771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	169665551	rs4987358	G	T	1651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=7;PP=1283;SC=CTGGTCATTTGGATGAGGACC;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=49;WE=169665559;WS=169665541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	169665632	rs2223286	T	C	2683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=42;PP=1930;SC=AAGTAGAGAATGAATCAGCAG;SOR=0.947;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=52;TCR=43;TR=94;WE=169665640;WS=169665622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	169672595	rs201137167	G	A	190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=15.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=-0.636;QD=4.44;ReadPosRankSum=-0.486;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr1	169676486	rs1131498	A	G	4365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=48;PP=2965;SC=GACTTACCAAACTGACACTGG;SOR=1.301;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=129;TCF=80;TCR=49;TR=128;WE=169676494;WS=169676476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr1	169679553	rs4987280	C	T	3362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.344;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=32;PP=2697;ReadPosRankSum=0.800;SC=ATAGACTTAGCGATATATAAA;SOR=1.877;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=110;TCF=76;TCR=34;TR=106;WE=169679561;WS=169679543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,112:0.97:116
chr1	169695815	rs3917459	G	A	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=5;PP=505;ReadPosRankSum=0.000;SC=AAACATTTTTGAAGTACATTC;SOR=0.729;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=82;TCF=67;TCR=15;TR=30;WE=169695823;WS=169695805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,30:0.35:85
chr1	169698825	rs1534904	T	G	5148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=92;PP=2965;SC=CTGAGGATTTTAAAGAGCACC;SOR=1.158;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=65;TCR=92;TR=157;WE=169698833;WS=169698815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr1	169698921	rs2076059	C	T	1858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=51;PP=1544;SC=AAGGGTAGATCCCAAAGTCCT;SOR=6.593;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=1;TCR=51;TR=52;WE=169698929;WS=169698911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	169699819	rs3917419	G	A	1873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=52;PP=1554;ReadPosRankSum=-1.251;SC=AAGAACACTGGAAACTAGAAC;SOR=2.049;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=9;TCR=53;TR=61;WE=169699827;WS=169699809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr1	169768033	rs6680938	T	C	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=426;SC=ATTACTATGATACTAGTATCT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=169768041;WS=169768023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	169768080	rs6668114	C	A	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=16;PP=1067;SC=AACATTCTGACAGTTGGATTG;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=25;TCR=16;TR=41;WE=169768088;WS=169768070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	169795214	rs57068023	CT	C	513.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=386;SC=TTTAAAACAACTTTTTTTTTC;SOR=3.816;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=20;WE=169795222;WS=169795204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	169795276	rs6682137	A	C	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.17;NF=1;NR=13;PP=398;SC=TGCAATGGCGAAATCTCGGCT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=169795284;WS=169795266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	169819605	rs6664099	A	G	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=25;PP=804;SC=TGCTGAGCACAGTGCTGACGA;SOR=2.517;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=32;WE=169819613;WS=169819595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	169823660	rs1062976	C	T	5378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=99;PP=2965;SC=CTTGTGATGACACTTTTGGCG;SOR=1.101;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=170;TCF=71;TCR=99;TR=170;WE=169823668;WS=169823650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr1	169823718	rs4656197	T	C	4677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=77;PP=2965;SC=GCTAATCTTTTGGGGTAAGCT;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=149;TCF=71;TCR=78;TR=148;WE=169823726;WS=169823708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr1	169831690	rs5778632	CTCTT	C	547.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=390;ReadPosRankSum=1.159;SC=ACCTCCAAAACTCTTTCTTTC;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=9;WE=169831701;WS=169831680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,14:0.93:15
chr1	169831993	rs7525259	A	G	1680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=41;PP=1259;SC=TTTCAGTGAAAAGTATTAAGC;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=47;WE=169832001;WS=169831983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	169835950	rs12133843	A	C	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=178;SC=AACCAAATATATGACTCATCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=169835958;WS=169835940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	169838278	rs17603022	G	A	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=39;PP=1078;SC=ACCTGTAAAAGCCCAAACAAA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=40;WE=169838286;WS=169838268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	169847683	rs6683056	G	A	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=226;SC=CAATTTCTATGAACACCATAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=169847691;WS=169847673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	169890933	rs518928	A	G	4716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=48;NR=98;PP=2965;SC=CTAAAAAAGAAAAAAAAGAAT;SOR=1.674;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=48;TCR=98;TR=146;WE=169890941;WS=169890923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr1	169891056	rs3838393	CT	C	622.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=24;PP=444;SC=ATATCATTAACTTTTTTTTTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=24;WE=169891064;WS=169891046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	169941761	rs511443	A	T	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=13;PP=375;SC=TGGTTAAAGAAACAAACTACA;SOR=3.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=169941769;WS=169941751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	169947146	rs11396984	C	CA	409.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=13;NR=2;PP=283;SC=TCAACATTTGCAAAAAAAAAA;SOR=4.174;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=15;WE=169947154;WS=169947136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	169951748	rs638486	A	G	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=271;SC=TTTTCCTAACATAATAATAGT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=169951756;WS=169951738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	169952385	rs2057249	G	T	2240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=1;PP=1884;SC=CAGTCTATTTGAATAGAAAGC;SOR=6.963;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=64;TCF=63;TCR=1;TR=64;WE=169952393;WS=169952375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	170115156	rs550297	G	A	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=4.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.95;ReadPosRankSum=-0.270;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,33:0.25:133
chr1	170135669	rs6427234	C	T	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=785;ReadPosRankSum=-0.623;SC=GAACAGACTGCGCCTTGGACT;SOR=0.675;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=38;WE=170135677;WS=170135659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,42:0.66:64
chr1	170135760	rs6427235	T	C	3020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=5.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.17;ReadPosRankSum=-0.732;SOR=0.333;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,77:0.62:125
chr1	170135765	rs6669514	T	C	2995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=5.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.96;ReadPosRankSum=-0.309;SOR=0.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,74:0.62:120
chr1	170501385	rs7531125	A	C	1934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=24;PP=1483;SC=GTTGGGCAGGATTCTCTGAGG;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=36;TCR=24;TR=60;WE=170501393;WS=170501375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	170502517	rs1412892	A	G	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=273;SC=AGGCTAAGCTATGTAGTTAAC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=170502525;WS=170502507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	170502819	.	A	G	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.256;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.807;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=35;PP=931;ReadPosRankSum=0.017;SC=ATAAAAATCTAAATTAAACAA;SOR=2.906;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=58;TCF=8;TCR=50;TR=38;WE=170502827;WS=170502809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,40:0.66:61
chr1	170521376	rs913257	G	A	7116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=105;PP=2965;SC=ATTGCTACACGAACAAGAAGT;SOR=0.731;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=203;TCF=97;TCR=106;TR=202;WE=170521384;WS=170521366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr1	170633186	rs11286665	AT	A	298.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=2;PP=107;SC=CTCTTTTCCAATTTTTTTTTT;SOR=3.056;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=170633194;WS=170633176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	170927615	rs17563089	A	G	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.054;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=757;ReadPosRankSum=0.737;SC=CATAAAGTTAACAGCCTATTG;SOR=0.506;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=55;TCF=25;TCR=30;TR=35;WE=170927623;WS=170927605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,35:0.62:56
chr1	170927803	rs17563130	T	C	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=137;ReadPosRankSum=-1.677;SC=CATAATTTGGTGACTACTATT;SOR=0.412;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=10;WE=170927811;WS=170927793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr1	170928516	.	A	AAAATAAAT	294.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.253;NF=2;NR=0;PP=259;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ACTCTGTCTCAAAATAAATAA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=2;WE=170928524;WS=170928506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr1	170931197	rs17563350	A	G	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=447;ReadPosRankSum=1.058;SC=CTCATTTGCTATATTTGCATC;SOR=0.856;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=22;WE=170931205;WS=170931187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr1	170931249	rs17563376	G	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=176;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CTTTACCACAGAAGAGTGAAA;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=8;WE=170931257;WS=170931239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr1	170934394	rs16863872	T	C	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.393;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=15;PP=874;ReadPosRankSum=-0.396;SC=AGTCAGAAAATACGTAAGTCA;SOR=0.877;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=166;TCF=111;TCR=55;TR=51;WE=170934402;WS=170934384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,52:0.30:172
chr1	170955670	rs16863907	C	T	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.715;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=0;PP=818;ReadPosRankSum=1.632;SC=GTGAGTAAGGCCTGAGGTCAT;SOR=3.937;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=59;TCR=3;TR=38;WE=170955678;WS=170955660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,38:0.61:62
chr1	170955954	rs148378467	T	C	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.136;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=42;PP=1093;ReadPosRankSum=-0.691;SC=TTTCTTGTCATTGTTCATTAT;SOR=3.111;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=1;TCR=59;TR=42;WE=170955962;WS=170955944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,43:0.69:62
chr1	170959029	rs16863922	C	T	5725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=66;PP=2965;SC=TTACAGGCAACTGTGTGATAA;SOR=1.312;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=105;TCR=67;TR=171;WE=170959037;WS=170959019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr1	170959088	rs28634500	C	T	6252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=100;PP=2965;SC=TGTTGACATGCACTTCACCCA;SOR=0.785;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=192;TCF=92;TCR=100;TR=192;WE=170959096;WS=170959078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr1	170959225	rs140210961	C	T	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-5.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=45;PP=1023;ReadPosRankSum=-0.198;SC=GTTCAACTCTCAATCTACCAT;SOR=1.646;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=67;TCF=2;TCR=65;TR=46;WE=170959233;WS=170959215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,45:0.67:67
chr1	170961433	rs139893602	G	A	1423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.750;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.96;MQRankSum=-0.748;NF=34;NR=22;PP=1049;ReadPosRankSum=-1.546;SC=GAAGGGAAACGTTTCTCTCTT;SOR=1.084;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=90;TCF=49;TCR=41;TR=56;WE=170961441;WS=170961423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,59:0.63:94
chr1	170985569	rs7882102	C	T	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=299;ReadPosRankSum=-0.186;SC=ACAGAATAAGCCAATAGGAGA;SOR=0.507;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=13;WE=170985577;WS=170985559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr1	170993442	.	G	GGTGTGTGTGT	552	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=56.17;NF=11;NR=0;PP=552;QD=53.2727272727;SC=ATATTTATATGGGGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=11;WE=170993452;WS=170993432;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr1	170993443	.	G	GT	593.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQRankSum=-1.806;QD=19.79;ReadPosRankSum=0.256;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr1	170993444	.	GG	TG	897	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=7;MMLQ=26;MQ=56.61;NF=11,16;NR=0,0;PP=897,551;QD=81.8181818182;SC=ATTTATATGGGGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=11,16;WE=170993452;WS=170993432;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr1	170993444	rs3077629	GG	GGTG	806.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=11,16;NR=0,0;PP=897,551;ReadPosRankSum=-0.842;SC=ATTTATATGGGGTGTGTGTGT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=11,16;WE=170993452;WS=170993432;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.91:11
chr1	171080080	rs1736557	G	A	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.402;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=609;ReadPosRankSum=-0.592;SC=CTGGTTGTACGTGAAGCAGAT;SOR=1.209;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=27;WE=171080088;WS=171080070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr1	171112490	rs1736565	C	T	1762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.627;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=55;PP=1423;ReadPosRankSum=0.068;SC=AAGATACATACAGTTTGAGGT;SOR=1.952;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=88;TCF=10;TCR=78;TR=60;WE=171112498;WS=171112480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,63:0.69:91
chr1	171130598	rs145126383	CACACA	C	1111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.71;ReadPosRankSum=1.639;SOR=1.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,30:0.67:45
chr1	171154959	rs2020870	A	G	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=738;ReadPosRankSum=-0.069;SC=AGAACTGAAGATATTGGAGGA;SOR=0.836;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=34;WE=171154967;WS=171154949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,37:0.63:59
chr1	171155103	rs6657314	C	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=221;ReadPosRankSum=2.556;SC=TTTATTTCTACTTATTGATGT;SOR=0.527;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=10;WE=171155111;WS=171155093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr1	171168584	rs2020862	CA	TG	2407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=37;PP=2520;ReadPosRankSum=-1.277;SC=ATGGGAAACTCAGGCTCAGAT;SOR=1.150;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=86;TCF=22;TCR=64;TR=49;WE=171168593;WS=171168574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,61:0.64:95
chr1	171168693	rs7542361	C	T	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=228;ReadPosRankSum=-1.078;SC=CTGGAGAACCCCAGCCATATA;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=10;WE=171168701;WS=171168683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr1	171177119	rs2075989	T	C	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=214;ReadPosRankSum=-0.582;SC=GCGATTCTTATACATACTAGG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=171177127;WS=171177109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr1	171227216	rs10912675	T	C	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=1.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.46;ReadPosRankSum=1.058;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,13:0.23:56
chr1	171244759	rs2076320	A	C	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=64;ReadPosRankSum=-0.624;SC=TAAAGTTGGGAGGTAGGAGGA;SOR=0.175;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=7;WE=171244767;WS=171244749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr1	171254794	rs12954	C	T	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=78;ReadPosRankSum=-0.932;SC=ATAGTAAAGGCCACCCTCTCG;SOR=0.157;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=6;WE=171254802;WS=171254784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr1	171293502	.	G	C	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.000;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.920;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=44;PP=1098;ReadPosRankSum=1.483;SC=TAAACTTATTGATTTGCAGTT;SOR=0.324;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=134;TCF=15;TCR=119;TR=51;WE=171293510;WS=171293492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,50:0.36:137
chr1	171301033	rs2294483	C	G	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=159;ReadPosRankSum=-0.982;SC=TGCAGACACACAGTAAGTGGG;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=9;WE=171301051;WS=171301023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr1	171301043	rs71103398	G	GA	98.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.05;ReadPosRankSum=1.311;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr1	171303925	rs3820170	C	T	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=7.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.474;SOR=1.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,37:0.24:156
chr1	171306323	rs3737924	C	T	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=140;ReadPosRankSum=-1.918;SC=GTGAACTGGGCGGGGAATTTT;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=9;WE=171306331;WS=171306313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr1	171311003	rs1042772	A	C	4697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=100;PP=2965;SC=AGGGTTACACAAAGTCATGCT;SOR=2.143;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=37;TCR=101;TR=137;WE=171311011;WS=171310993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr1	171482686	rs2294292	A	T	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.222;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=753;ReadPosRankSum=0.620;SC=TATCTCCAGCATTGAAACTGC;SOR=1.371;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=15;WE=171482707;WS=171482676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr1	171482699	rs2294293	G	C	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=753;ReadPosRankSum=0.837;SC=GAAACTGCCTGATGTTTCATA;SOR=0.770;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=13;WE=171482707;WS=171482676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr1	171483717	rs1055417	A	C	1756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.487;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=35;PP=1186;ReadPosRankSum=0.756;SC=CTGGGGTTGCAGCTCCCCCAG;SOR=0.638;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=116;TCF=59;TCR=57;TR=68;WE=171483725;WS=171483707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,74:0.61:121
chr1	171491411	.	A	C	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=430;ReadPosRankSum=0.840;SC=AAGGCTATTAAATGATTAAAG;SOR=0.382;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=55;TCF=24;TCR=31;TR=25;WE=171491419;WS=171491401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,27:0.44:61
chr1	171496895	rs10753126	A	G	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=228;ReadPosRankSum=-0.537;SC=ACTGTCTCCAAAATAATAAGA;SOR=0.387;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=10;WE=171496903;WS=171496885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr1	171505524	rs12139715	G	A	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=444;ReadPosRankSum=-0.460;SC=TTAAACCTCCGATTTTTAATC;SOR=1.688;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=19;WE=171505532;WS=171505514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr1	171509327	rs760644	G	A	2994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.861;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=47;PP=2382;ReadPosRankSum=1.485;SC=GACCTTATCCGCTCCTCAAGA;SOR=0.485;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=176;TCF=105;TCR=71;TR=114;WE=171509335;WS=171509317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,115:0.66:175
chr1	171511039	rs1687064	C	G	4360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.638;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=66;PP=2962;ReadPosRankSum=0.181;SC=GGGATATTTCCGGGAATAAGA;SOR=0.829;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=260;TCF=159;TCR=101;TR=174;WE=171511047;WS=171511029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,175:0.67:261
chr1	171514731	rs235468	C	G	3362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=45;PP=2296;ReadPosRankSum=0.531;SC=TCCAAAGATTCTACTGGGAAA;SOR=0.644;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=102;TCR=72;TR=108;WE=171514739;WS=171514721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,123:0.65:189
chr1	171514848	.	TTTTATTTATTTA	T,TTTTATTTATTTATTTATTTA	974.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.11;QD=38.99;SOR=6.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,13,12:0.52,0.48:25
chr1	171519487	rs235470	A	C	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=185;ReadPosRankSum=-0.972;SC=TCATTATTCAAGTGTTAAAAG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=11;WE=171519495;WS=171519477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr1	171526570	rs1687057	G	A	8326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=8.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=491;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.805;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=129;NR=172;PP=2962;ReadPosRankSum=3.663;SC=CTCCACTTCCGGCAACCTTAA;SOR=0.868;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=494;TCF=220;TCR=274;TR=301;WE=171526578;WS=171526560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,300:0.61:490
chr1	171527322	rs235482	A	G	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=36;PP=894;ReadPosRankSum=0.216;SC=GGAATGGCATAGGAATACTGA;SOR=0.954;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=59;TCF=5;TCR=54;TR=39;WE=171527330;WS=171527312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,43:0.68:63
chr1	171548868	rs235489	T	C	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=554;ReadPosRankSum=-1.191;SC=TAGTATTAATTTTACTCTTTT;SOR=0.653;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=22;WE=171548876;WS=171548858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr1	171553778	rs235495	A	G	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=214;ReadPosRankSum=1.854;SC=GATGGTTTTTAAACTGTTCAC;SOR=0.446;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=10;WE=171553786;WS=171553768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr1	171556165	rs235501	G	C	3001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.643;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=41;PP=2339;ReadPosRankSum=0.638;SC=TACCAGCATCGCAGCTTTCCT;SOR=0.596;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=155;TCF=96;TCR=59;TR=105;WE=171556173;WS=171556155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,110:0.68:161
chr1	171558516	rs235503	C	T	1881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.853;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=35;PP=1473;ReadPosRankSum=-0.063;SC=AGATTCTCTCCCAGCCTAACC;SOR=0.553;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=46;TCR=50;TR=68;WE=171558524;WS=171558506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,70:0.72:97
chr1	172011059	rs3736791	G	A	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=195;ReadPosRankSum=0.367;SC=ACCTGGAAAAGGATTCTAAGG;SOR=1.234;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=11;WE=172011067;WS=172011049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr1	172038079	rs12760234	T	C	1840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=31;PP=1440;SC=GGCAGGGAGATTGTGGGAGGT;SOR=0.914;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=26;TCR=32;TR=57;WE=172038087;WS=172038069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	172308238	rs6697844	C	T	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.862;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=419;ReadPosRankSum=-0.402;SC=GAACATCTCACTGTGAAATAT;SOR=0.801;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=79;TCF=34;TCR=45;TR=27;WE=172308246;WS=172308228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,29:0.36:81
chr1	172356437	rs6688654	A	G	2527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=72;PP=2155;SC=ACATCAGCACAGCCACCGTGT;SOR=4.202;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=8;TCR=72;TR=80;WE=172356445;WS=172356427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	172376809	rs9425600	T	C	1545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.423;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=3;PP=1225;ReadPosRankSum=0.401;SC=CTGGCCTGTATGTGCATGAGC;SOR=0.139;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=89;TCF=86;TCR=3;TR=56;WE=172376817;WS=172376799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,56:0.62:90
chr1	172399346	rs200979934	TAA	T	2602.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.786;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.899;NF=42;NR=15;PP=2111;ReadPosRankSum=-1.311;SC=GGTTTAAATATAAGAGACTGA;SOR=0.525;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=70;TCR=25;TR=57;WE=172399355;WS=172399336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,69:0.59:117
chr1	172410967	rs1063412	G	A	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.987;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=526;ReadPosRankSum=-0.611;SC=AGGTAGAATGGACACAGACAT;SOR=1.161;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=121;TCF=81;TCR=40;TR=33;WE=172410975;WS=172410957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,35:0.27:129
chr1	172411496	rs2230471	A	G	708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=8;PP=543;SC=AAGAAGCCAGACCAGTCCCTA;SOR=0.990;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=11;TCR=8;TR=19;WE=172411504;WS=172411486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	172411768	rs13932	T	C	2689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.247;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=64;PP=2133;ReadPosRankSum=0.507;SC=TACATTATCCTTTCATTCAAA;SOR=1.104;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=140;TCF=47;TCR=93;TR=90;WE=172411776;WS=172411758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,96:0.63:152
chr1	172417781	rs2157451	A	G	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=448;SC=TACACCATCAATGTTCAATAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=172417789;WS=172417771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	172422209	rs2285175	C	T	1411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.172;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=10;PP=999;ReadPosRankSum=0.377;SC=ATGTTTGCGTCGCCTTTAAAG;SOR=0.934;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=52;TCR=15;TR=44;WE=172422217;WS=172422199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,50:0.69:72
chr1	172425529	rs2285170	C	G	1562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-7.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.076;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=40;PP=1107;ReadPosRankSum=0.313;SC=ATTTCCTCACCTCTCTCTGTC;SOR=0.293;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=213;TCF=85;TCR=128;TR=77;WE=172425537;WS=172425519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,78:0.36:216
chr1	172425640	rs78728841	G	A	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.249;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=631;ReadPosRankSum=0.181;SC=GTAGGCAAGGGGGAAGACAGA;SOR=0.915;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=12;TCR=58;TR=30;WE=172425648;WS=172425630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,29:0.42:69
chr1	172431210	rs4916261	G	A	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=1;PP=626;SC=AAGGATGTATGAAGGACTTTG;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=172431218;WS=172431200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	172434309	rs9425328	G	A	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=2;PP=692;SC=GGCAACAAGCGCAAAAACTCC;SOR=4.332;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=172434317;WS=172434299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	172434375	rs2901655	G	A	6120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=163;NR=11;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.864;SC=ATGTATAAAGGCACATTTCTT;SOR=3.488;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=164;TCR=11;TR=174;WE=172434383;WS=172434365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,182:0.99:183
chr1	172434812	rs2901656	C	T	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.269;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=1000;ReadPosRankSum=-0.875;SC=ATAAAAGTTCCCCTATTGGCA;SOR=0.385;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=148;TCF=57;TCR=91;TR=51;WE=172434820;WS=172434802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,53:0.35:150
chr1	172437592	rs1129942	G	A	2580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=32;PP=1995;SC=CATCCAGAAAGCATTCACTAC;SOR=1.139;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=50;TCR=32;TR=82;WE=172437600;WS=172437582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	172501643	rs2239816	T	C	2391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.676;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=32;PP=1849;ReadPosRankSum=0.317;SC=CCCCTTTCTATCTACCAATCA;SOR=0.809;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=134;TCF=81;TCR=53;TR=84;WE=172501651;WS=172501633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,88:0.64:138
chr1	172502340	rs2285143	T	C	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=-1.440;SC=AGCCGGTGGCTGCAGCGGCGG;SOR=2.800;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=3;WE=172502348;WS=172502330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	172502479	rs2285144	T	C	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=5;PP=1306;SC=TCGGTCACATTCTCGCGCTCC;SOR=3.657;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=47;WE=172502487;WS=172502469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	172502727	rs55696309	TA	T	1056.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.233;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.260;NF=0;NR=30;PP=1129;ReadPosRankSum=-0.331;SC=TTTTGGCTTTTAGGGTCCGGG;SOR=4.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=3;TCR=43;TR=30;WE=172502735;WS=172502717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,31:0.67:46
chr1	172522602	rs1159378	G	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=77;ReadPosRankSum=0.289;SC=TGTGTGTATTGTTAGTTTTTT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=172522610;WS=172522592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	172544877	rs76108041	A	C	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.559;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=63;ReadPosRankSum=0.098;SC=ACTACACTATACCACTTAATA;SOR=0.061;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=6;WE=172544885;WS=172544867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr1	172547465	rs2285664	A	G	2763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.920;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=43;PP=2126;ReadPosRankSum=1.214;SC=TGGTGGAAGAATATGAAGAAA;SOR=0.368;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=166;TCF=102;TCR=64;TR=101;WE=172547473;WS=172547455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,103:0.61:170
chr1	172548301	rs41264544	C	G	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=53;ReadPosRankSum=-0.134;SC=ACCATTGGAGCTAGATCTCAG;SOR=0.148;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=6;WE=172548309;WS=172548291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr1	172554867	rs10752995	T	A	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=505;ReadPosRankSum=0.449;SC=CTTTGATTTTTTAAGAAAAAG;SOR=1.688;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=22;WE=172554875;WS=172554859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr1	172557847	.	C	G	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.314;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=161;ReadPosRankSum=0.921;SC=TAACATATTTCAACTTTAGAC;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=8;WE=172557855;WS=172557837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr1	172558524	rs41264546	A	G	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=40;PP=1233;ReadPosRankSum=-0.205;SC=GACATATACCATCACCAGTGA;SOR=0.714;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=229;TCF=110;TCR=119;TR=76;WE=172558532;WS=172558514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,81:0.35:233
chr1	172634734	rs2639653	T	C	1772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=45;NR=4;PP=1387;SC=CTATTCCTTGTTGAAAGCTCC;SOR=4.615;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=46;TCR=4;TR=49;WE=172634742;WS=172634724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	173157541	rs17346501	T	C	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=344;SC=TGGGATTTAATTGGAATTTAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=173157549;WS=173157538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	173457017	rs78495657	C	T	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.452;NF=0;NR=11;PP=242;ReadPosRankSum=-0.811;SC=CTTGGAGAAGCTGGTGCTGTG;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=11;WE=173457025;WS=173457007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr1	173470105	rs12065426	A	G	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.052;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=533;ReadPosRankSum=-1.274;SC=CTGTTTCAGTAGCTTCTAAGT;SOR=0.160;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=25;WE=173470113;WS=173470095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr1	173475964	rs41264568	C	G	1799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.818;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=14;PP=1461;ReadPosRankSum=0.277;SC=CCGTGAAGAGCAAGAGACTCT;SOR=0.934;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=111;TCF=84;TCR=27;TR=64;WE=173475972;WS=173475954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,66:0.59:111
chr1	173490407	rs200616970	TAA	T,TA	1102.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.15;MQRankSum=0.331;QD=22.50;ReadPosRankSum=0.375;SOR=2.004;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:2,37,10:0.76,0.20:49
chr1	173490616	rs146332693	CTATATA	C	505.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=3.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.07;ReadPosRankSum=-0.293;SOR=0.144;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr1	173493312	rs10912633	A	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=151;ReadPosRankSum=-0.619;SC=AAGGAAATCTAAATAAACTAC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=173493320;WS=173493302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr1	173494210	rs6696443	C	A	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=28;PP=705;ReadPosRankSum=0.264;SC=GGTCAGCAGGCAAAGAGTTAT;SOR=0.271;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=52;TCF=1;TCR=51;TR=29;WE=173494218;WS=173494200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
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chr1	173606207	rs12067170	T	A	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=410;ReadPosRankSum=-0.512;SC=GCTTAGTCAATTATAGATATC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=19;WE=173606215;WS=173606197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr1	173638537	rs58611776	CA	C	138.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=1.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=0.964;QD=1.65;ReadPosRankSum=2.010;SOR=0.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,19:0.23:84
chr1	173794587	.	C	CATTATTATT	238.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=-0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=-0.549;QD=19.89;ReadPosRankSum=0.923;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	173808809	.	G	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=130;ReadPosRankSum=1.343;SC=TGTTACCTTCGTTGTTACAGA;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=8;WE=173808817;WS=173808799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr1	173819421	rs201467171	C	CA	96.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.61;ReadPosRankSum=0.835;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr1	173839907	rs36119794	C	T	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.793;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=557;ReadPosRankSum=0.008;SC=TAGTGCTGTGCTGGATATCAG;SOR=0.546;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=100;TCF=48;TCR=52;TR=31;WE=173839915;WS=173839897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,33:0.31:105
chr1	173855208	rs16846520	A	G	2501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.037;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=56;PP=1833;ReadPosRankSum=1.209;SC=AGGAAGAGACAGTTGCTCCTG;SOR=0.457;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=152;TCF=61;TCR=91;TR=96;WE=173855216;WS=173855198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,101:0.64:157
chr1	173912431	.	G	C	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=33;ReadPosRankSum=0.054;SC=GATAAAATCGGAAGGTAGCCC;SOR=0.169;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=4;WE=173912439;WS=173912421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr1	173939791	.	C	A	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.213;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.148;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=149;ReadPosRankSum=1.020;SC=TGTGTAATAACCCCCCACAAA;SOR=0.096;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=60;TCF=7;TCR=53;TR=15;WE=173939799;WS=173939781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,17:0.27:64
chr1	173941617	rs11579488	T	C	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.728;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=9;PP=715;ReadPosRankSum=-2.179;SC=CCACAGTGGGTTAACTCTAAG;SOR=0.317;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=122;TCF=101;TCR=21;TR=42;WE=173941625;WS=173941607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,45:0.34:132
chr1	173961839	.	G	C	311	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=58.41;NF=16;NR=2;PP=311;QD=19.2095118082;SC=CACACACACAGAGAGAGAGAG;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=50;TCF=44;TCR=6;TR=18;WE=173961847;WS=173961827;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:32,18:0.36:50
chr1	174188285	rs2103640	G	A	1938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=30;PP=1361;ReadPosRankSum=0.349;SC=AGAGAAGTTTGCAGAACTGAA;SOR=0.719;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=114;TCF=65;TCR=49;TR=72;WE=174188293;WS=174188275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,75:0.63:119
chr1	174221887	rs11351373	GT	G	310.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=276;ReadPosRankSum=-1.377;SC=GATGTAACTGGTTTCATTGAA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=9;WE=174221895;WS=174221877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr1	174274062	rs2142864	A	G	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=332;ReadPosRankSum=0.244;SC=TTATTTAAATACTATCTTTCA;SOR=0.527;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=14;WE=174274070;WS=174274052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr1	174274349	rs2860909	T	G	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=275;ReadPosRankSum=0.000;SC=GTGTTGTGGGTAGAAGTGGTG;SOR=0.368;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=13;WE=174274357;WS=174274339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr1	174362965	.	T	C	178	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;FR=0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=9;NR=0;PP=178;QD=23.6412458386;SC=AATAAAAAAATTGAAGATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=9;WE=174362973;WS=174362964;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,9:0.64:14
chr1	174417231	rs7516240	G	A	2553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=22;PP=1966;SC=GTCTGCAGGTGTCTTTAAATT;SOR=2.414;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=65;TCR=22;TR=87;WE=174417239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	174418179	rs143410373	T	C	4212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.652;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=86;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.049;SC=TAAGTAATAGTTTTTGTAACT;SOR=0.934;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=203;TCF=85;TCR=118;TR=145;WE=174418187;WS=174418169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,145:0.69:209
chr1	174516999	rs41266050	C	T	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=480;ReadPosRankSum=-0.144;SC=TAGTCTTACACCGAGACAGAC;SOR=1.085;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=21;WE=174517007;WS=174516989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr1	174927388	rs10798329	G	C	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=684;SC=TGATATTTGAGTTAAAGTATG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=174927396;WS=174927378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	174945171	rs142125254	CTGTATGACTGTGA	C	1868.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=2.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.874;SOR=0.962;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,56:0.28:202
chr1	174969271	rs1046439	C	T	2434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=19;PP=1904;SC=TCCTGTTCCTCCTTCTGCGCG;SOR=1.936;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=54;TCR=19;TR=73;WE=174969279;WS=174969261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	174984074	rs7540740	C	T	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.75;QD=28.74;SOR=3.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	175046488	rs2072033	G	A	1935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=5;PP=1641;ReadPosRankSum=-0.884;SC=GCACATCTCCGTGGCTTTCTT;SOR=3.126;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=55;TCR=5;TR=59;WE=175046496;WS=175046478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr1	175046789	rs2072032	A	G	4707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=76;PP=2965;ReadPosRankSum=0.631;SC=GGGGGAGGCCAGGGAGGAACA;SOR=0.243;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=79;TCR=76;TR=154;WE=175046797;WS=175046779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,159:0.99:160
chr1	175052828	rs2072031	G	A	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=522;ReadPosRankSum=1.673;SC=GCCTGTCACAGAACCTTGGAA;SOR=1.308;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=21;WE=175052836;WS=175052818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr1	175053098	rs11577778	T	C	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.16;ReadPosRankSum=-1.152;SOR=0.586;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,45:0.35:127
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chr1	175054548	rs1573758	C	T	2051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=11;PP=1574;SC=CAGGTCTGCACCCGGGGACTG;SOR=3.293;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=65;TCF=53;TCR=12;TR=63;WE=175054556;WS=175054538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
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chr1	175087677	rs6656284	G	A	5987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.630;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.177;NF=128;NR=67;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.995;SC=GTGCATATTGGTCAGCATTTT;SOR=0.324;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=198;TCF=131;TCR=67;TR=195;WE=175087691;WS=175087667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,198:0.99:200
chr1	175087683	rs149150350	A	AT	1032.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=8.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-2.998;QD=5.44;ReadPosRankSum=-1.427;SOR=1.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,59:0.31:190
chr1	175087729	rs6696455	T	C	6529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.100;NF=98;NR=127;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.313;SC=GGTCACTGACTGGGTGACAGA;SOR=0.365;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=226;TCF=98;TCR=128;TR=225;WE=175087737;WS=175087719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,226:1.00:227
chr1	175092674	rs2285215	C	T	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=707;ReadPosRankSum=-2.273;SC=AGGGAGGTTCCGGTGGGGAAG;SOR=0.739;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=102;TCF=64;TCR=38;TR=34;WE=175092682;WS=175092664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,35:0.33:105
chr1	175092707	rs10798333	C	T	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.514;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=18;PP=643;ReadPosRankSum=0.688;SC=ACTGTCCTGACGGGCCTGAGA;SOR=0.485;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=119;TCF=70;TCR=49;TR=39;WE=175092715;WS=175092697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,40:0.34:119
chr1	175092840	rs2072041	T	C	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.772;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=31;PP=749;ReadPosRankSum=-1.513;SC=CTCACACTTATCAGGAGAGAA;SOR=0.579;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=117;TCF=35;TCR=82;TR=45;WE=175092848;WS=175092830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,45:0.38:118
chr1	175096333	rs2072040	A	G	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=37;PP=855;ReadPosRankSum=0.133;SC=ATCTTTACTGATCACATTGCT;SOR=0.668;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=38;WE=175096341;WS=175096323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,39:0.67:58
chr1	175097331	rs10912891	G	A	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=34;PP=1420;SC=CTGAACGACCGTGCAATGAGA;SOR=1.140;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=23;TCR=34;TR=57;WE=175097339;WS=175097321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	175097349	rs7547567	C	T	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.009;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=863;ReadPosRankSum=0.255;SC=AGAACCAGCACCGGAAAGCCT;SOR=0.307;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=21;WE=175097365;WS=175097339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,21:0.37:57
chr1	175097357	rs2269652	C	G	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=1563;ReadPosRankSum=0.733;SC=CACCGGAAAGCCTAGCAAAGG;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=31;WE=175097365;WS=175097339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr1	175097864	rs12022593	G	A	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=34;PP=1018;ReadPosRankSum=1.252;SC=ACATGGAAACGGACGGAGGTG;SOR=0.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=13;TCR=50;TR=43;WE=175097872;WS=175097854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,45:0.70:64
chr1	175104796	rs4651324	G	T	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=430;SC=GGCATACTACGGTACATATAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=175104804;WS=175104786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	175105880	rs2072037	G	A	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=657;SC=GGTTCTGAAAGCCTCAGACAC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=175105888;WS=175105870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	175105942	rs4650703	G	A	2437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=16;PP=1676;SC=TTGGAATTCCGTTTTTTATTT;SOR=2.362;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=56;TCR=16;TR=72;WE=175105950;WS=175105932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	175113578	rs10912897	T	C	2406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=31;PP=1798;SC=ACAGAGACAATGATATCGCAC;SOR=1.124;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=47;TCR=31;TR=78;WE=175113586;WS=175113568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	175116046	rs11450833	C	CT	417.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.582;NF=15;NR=7;PP=231;ReadPosRankSum=-2.711;SC=CTTGATGTGGCTTTTTTTTTT;SOR=0.880;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=59;TCF=35;TCR=24;TR=22;WE=175116054;WS=175116036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr1	175116252	rs4651335	C	G	1046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=30;PP=868;SC=CCAGCTGTGGCAGCTTGGGGC;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=175116260;WS=175116242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	175129945	rs60195884	TC	T	259.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.28;ReadPosRankSum=2.380;SOR=2.517;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr1	175129946	rs2072035	C	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.81;ReadPosRankSum=-2.839;SOR=0.084;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr1	175129947	.	TTCTTCTTG	T	259.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=6.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.43;ReadPosRankSum=2.839;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr1	175293424	rs2213635	T	C	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=280;SC=GCTTTTAAAATATAAAGCTAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=175293432;WS=175293420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	175299301	rs2027867	T	C	2945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=73;NR=16;PP=2402;SC=AGGCGGCCTCTTGGCCATCCC;SOR=3.019;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=73;TCR=16;TR=89;WE=175299309;WS=175299291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	175324518	rs55715761	GCA	G	1196.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.794;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=1507;ReadPosRankSum=0.388;SC=AAGCTGATGAGCAATCCTTGT;SOR=0.245;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=23;WE=175324529;WS=175324508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,31:0.63:49
chr1	175324521	rs55973835	A	T	1205.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.847;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=1515;ReadPosRankSum=0.860;SC=CTGATGAGCAATCCTTGTGGA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=24;WE=175324529;WS=175324508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr1	175324651	rs2228359	A	G	2214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=45;PP=1580;ReadPosRankSum=0.407;SC=TGCGGCTTCCATCGGTGGATT;SOR=0.687;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=55;TCR=66;TR=84;WE=175324659;WS=175324641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,91:0.71:129
chr1	175335336	rs114472790	C	A	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.491;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=36;PP=939;ReadPosRankSum=-0.384;SC=TATTTATTGGCCTGCTTTGTG;SOR=1.255;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=64;TCF=10;TCR=54;TR=42;WE=175335344;WS=175335326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,42:0.65:65
chr1	175335412	rs1385540	A	C	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=336;SC=ACACTTATCTAATATTTTGCT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=175335420;WS=175335402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	175336530	rs6697701	T	C	1547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=39;PP=1323;SC=CCTATTCATATCTTGTGTTTA;SOR=3.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=48;WE=175336538;WS=175336520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	175336619	rs6697801	T	C	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=18;PP=402;SC=GTCAATAGGATGAACCAGCCC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=175336627;WS=175336609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	175348723	rs859427	C	T	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.212;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=423;ReadPosRankSum=1.134;SC=ACCAATGCCCCTGGGGACCAG;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=18;WE=175348731;WS=175348713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr1	175355128	rs859436	C	G	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=1.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.44;ReadPosRankSum=0.541;SOR=1.155;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,48:0.62:77
chr1	175355391	rs859437	A	G	2984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=58;PP=2253;SC=CAAAAGCCACAGTGTCCGAGA;SOR=1.134;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=39;TCR=58;TR=97;WE=175355399;WS=175355381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	175360690	rs859444	C	T	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5021;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=497;ReadPosRankSum=0.209;SC=AAAATGGGGGCGATGTCTCTT;SOR=1.609;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=20;WE=175360698;WS=175360680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,22:0.76:29
chr1	175362736	rs3752517	G	A	375.41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.9975;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=320;ReadPosRankSum=0.613;SC=TCAGCAGGTCGTTACCACATA;SOR=1.127;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=15;WE=175362744;WS=175362733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr1	175365663	rs859446	G	A	1966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=18;PP=1652;ReadPosRankSum=-0.605;SC=GAAGCAGGACGGGGAAATGGT;SOR=0.458;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=122;TCF=95;TCR=27;TR=73;WE=175365671;WS=175365653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,75:0.59:127
chr1	175375334	rs859400	C	T	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=534;ReadPosRankSum=1.683;SC=GACCACGCTGCGAGCTCCCGG;SOR=0.516;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=24;WE=175375342;WS=175375324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
chr1	175375469	rs2239819	C	A	2598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=29;PP=2031;ReadPosRankSum=0.358;SC=GCTGAACTGGCACATGGACAG;SOR=0.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=102;TCR=47;TR=92;WE=175375477;WS=175375459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,97:0.61:159
chr1	175375683	rs859399	T	C	2655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.698;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=41;PP=1982;ReadPosRankSum=-0.695;SC=CTTTGCTGGATGTGTTGTAGT;SOR=0.961;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=146;TCF=81;TCR=65;TR=102;WE=175375691;WS=175375673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,105:0.70:151
chr1	175375802	rs859398	T	C	3554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.617;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=66;PP=2762;ReadPosRankSum=1.524;SC=ATCAGGTTGATGCCAATGAGC;SOR=0.616;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=176;TCF=89;TCR=87;TR=130;WE=175375810;WS=175375792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,138:0.74:186
chr1	175911119	rs61820919	G	C	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.965;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=412;ReadPosRankSum=0.934;SC=GCAACATAGCGAGACCCTGTC;SOR=0.180;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=17;WE=175911127;WS=175911109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr1	175916267	rs6674353	T	C	1682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=3;PP=1400;SC=GGTGTATTTCTATAATCCTGT;SOR=4.493;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=46;TCR=3;TR=49;WE=175916275;WS=175916257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	175937540	rs4534339	C	T	3104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=16;PP=2424;SC=AAAGGCTGTACGGAGGGGAAC;SOR=2.857;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=76;TCR=16;TR=92;WE=175937548;WS=175937530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	175951347	rs10798430	T	A	2440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=0;PP=1975;ReadPosRankSum=1.786;SC=TAAAATTAGGTTACAGAAAAA;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=68;TCF=68;TCR=0;TR=67;WE=175951355;WS=175951337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
chr1	176012495	rs72713273	G	A	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=256;ReadPosRankSum=0.297;SC=TCAATTTATTGTTACGGGGAG;SOR=0.796;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=15;WE=176012503;WS=176012485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,15:0.34:44
chr1	176012807	rs4233165	G	A	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=1;PP=703;SC=CAAACCAAATGTATGATTCAT;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=176012815;WS=176012797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	176050430	rs56720201	GA	G	83.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=3.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.58;ReadPosRankSum=0.764;SOR=0.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,15:0.28:53
chr1	176103053	rs34010407	TAC	T	787.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=13;PP=861;SC=GATAACAATATACACAGACCA;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=19;WE=176103062;WS=176103043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	176118219	rs3748618	G	A	999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=22;PP=670;SC=TCCTACAATAGAAAATTATAA;SOR=1.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=33;WE=176118227;WS=176118209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	176153658	rs791744	T	C	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=2;PP=533;SC=AAAAAAAATATGACTGTAACA;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=176153666;WS=176153648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	176659463	rs10913241	C	T	2863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=69;PP=2150;ReadPosRankSum=-1.134;SC=ACACCGCCCCCACTCCCAAGA;SOR=0.678;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=159;TCF=55;TCR=104;TR=104;WE=176659471;WS=176659453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,110:0.66:166
chr1	176664842	rs12138725	C	A	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.212;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=647;ReadPosRankSum=0.485;SC=GGACTCTCCTCATCTCCCATC;SOR=0.502;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=30;WE=176664850;WS=176664832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,31:0.65:48
chr1	176665102	.	ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	A	619	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MMLQ=18;MQ=56.92;NF=0;NR=3;PP=619;QD=207.333333333;SC=ATGTATGTGTATGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=176665129;WS=176665092;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr1	176671912	rs369562585	TGAGAGAGA	T	490.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=58.58;MQRankSum=0.138;NF=2;NR=11;PP=1041;ReadPosRankSum=0.346;SC=TGTGTGTGTGTGAGAGAGAGA;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=13;WE=176671927;WS=176671902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr1	176681165	rs66731142	ATG	A	581.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.846;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.641;NF=0;NR=20;PP=785;ReadPosRankSum=-1.008;SC=GTGTAAGCATATGTGTGTGTG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=0;TCR=54;TR=20;WE=176681174;WS=176681155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr1	176734756	rs3737759	C	T	1610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=8;PP=1237;SC=CTCCTCCTTACTGGTTCTCAA;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=43;TCR=8;TR=51;WE=176734764;WS=176734746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	176769358	rs10913256	T	C	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.266;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=26;PP=692;ReadPosRankSum=-0.500;SC=TAGGACCTGGTCCCTCTCCTA;SOR=1.508;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=51;TCF=10;TCR=41;TR=31;WE=176769366;WS=176769348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,34:0.63:54
chr1	176809368	rs12118034	C	T	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=36;PP=1181;ReadPosRankSum=-0.823;SC=GCCACTATGACGGGGGAGACT;SOR=0.637;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=97;TCF=35;TCR=62;TR=56;WE=176809376;WS=176809358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,59:0.58:101
chr1	176845528	rs2076341	C	T	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=1;PP=392;SC=GGAAAGGCAACGCTCCTGTAC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=176845536;WS=176845518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	176857347	rs2072935	A	G	1429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=28;PP=1001;SC=AGAGCTGCATAAGAGAACAGG;SOR=1.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=176857355;WS=176857337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	176863836	rs2281180	G	C	2979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=23;PP=2312;SC=GTCCCTTGCTGTGGCACTCCA;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=60;TCR=23;TR=83;WE=176863844;WS=176863826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	176863867	rs2228956	T	C	3800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=48;PP=2748;SC=AGCCGCCATGTGCTTGGTGCC;SOR=1.196;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=74;TCR=48;TR=122;WE=176863875;WS=176863857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr1	176913215	rs35968661	AT	A	100.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=104;SC=CTTACTGAGCATTTTTTTTTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=8;WE=176913223;WS=176913205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	176992553	rs172917	A	G	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.282;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=23;PP=909;ReadPosRankSum=-1.811;SC=TTTCGGGGTCACATTGGTGTT;SOR=0.788;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=80;TCF=40;TCR=40;TR=53;WE=176992561;WS=176992543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,55:0.68:81
chr1	176992676	rs10798496	C	T	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=424;ReadPosRankSum=-0.289;SC=TGGCATCCAGCTGGCTCCCCT;SOR=0.941;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=20;WE=176992684;WS=176992666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr1	176998368	rs10753142	T	A	154.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5268;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=116;ReadPosRankSum=0.566;SC=CTTGCCTAGCTCAAACCCAAG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=176998376;WS=176998358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr1	177199323	rs3176442	C	T	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=34;PP=909;ReadPosRankSum=-1.213;SC=TCCCTAAGAACCCAACCTGCA;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=16;TCR=55;TR=44;WE=177199331;WS=177199313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,45:0.61:74
chr1	177247854	rs3176443	C	G	1640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-5.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.260;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=52;PP=1369;ReadPosRankSum=1.413;SC=CCATCGGATCCTACGCCGGCT;SOR=1.109;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=100;TCF=18;TCR=82;TR=63;WE=177247862;WS=177247844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,63:0.62:101
chr1	177902388	rs3813647	G	A	1923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.631;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=21;PP=1480;ReadPosRankSum=-1.471;SC=CGTCTCCAGCGGGGGATGCGT;SOR=0.322;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=110;TCF=81;TCR=29;TR=70;WE=177902396;WS=177902378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,73:0.65:113
chr1	177913980	rs532842	T	C	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=370;ReadPosRankSum=1.436;SC=AGTGTTTCACTTCCTCTCCCT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=14;WE=177913988;WS=177913970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr1	177915474	rs842192	A	C	1654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.982;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=36;PP=1226;ReadPosRankSum=0.488;SC=AAAATGAAAAATGGATCCATA;SOR=1.139;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=95;TCF=41;TCR=54;TR=60;WE=177915482;WS=177915464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,64:0.65:99
chr1	177929379	rs16828594	C	T	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.844;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=3;PP=1005;ReadPosRankSum=-0.294;SC=ATATTTTTTTCCAAGGAAACC;SOR=0.421;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=63;TCF=59;TCR=4;TR=41;WE=177929387;WS=177929369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,41:0.66:62
chr1	177929554	rs10913472	C	T	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.777;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=592;ReadPosRankSum=-0.359;SC=ATAAAACAATCAGATTTTGTG;SOR=0.569;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=105;TCF=40;TCR=65;TR=35;WE=177929562;WS=177929544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,37:0.34:109
chr1	177929940	rs7413442	G	A	951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.471;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=2;PP=754;ReadPosRankSum=-1.303;SC=ATGCTGTGCAGTTCAACAAGG;SOR=2.271;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=56;TCF=48;TCR=8;TR=32;WE=177929948;WS=177929930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,34:0.59:58
chr1	177929987	rs12040910	T	C	2376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=23;PP=1845;SC=GGGACCTACATGCACCAGCTG;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=53;TCR=23;TR=76;WE=177929995;WS=177929977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	177930642	rs945640	G	A	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=0;PP=791;SC=ATGATCCATCGTAAGGCTGAC;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=177930650;WS=177930632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	177930894	rs945641	C	T	1205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=28;PP=977;SC=CAAAAACACACAGGAAGAAGT;SOR=1.923;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=39;WE=177930902;WS=177930884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	177933443	rs3813651	G	A	2031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=42;PP=1555;SC=AGCAGTGAGCGGGGTCCTGGG;SOR=1.410;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=23;TCR=42;TR=65;WE=177933451;WS=177933433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	177933505	rs3813652	C	T	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.560;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=385;ReadPosRankSum=0.213;SC=TGCTCCAAAGCGTGGGCAGGT;SOR=0.148;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=21;WE=177933513;WS=177933495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr1	177934351	rs72703030	G	T	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-7.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.319;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=32;PP=735;ReadPosRankSum=0.815;SC=TCCTGTTTCTGAAAGTTCTTA;SOR=0.374;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=124;TCF=19;TCR=105;TR=40;WE=177934359;WS=177934341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,41:0.32:129
chr1	177935050	rs1889981	T	A	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.518;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=236;ReadPosRankSum=-0.467;SC=GCAGCCACTGTGGGTGTCCAT;SOR=1.099;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=46;TCF=25;TCR=21;TR=15;WE=177935058;WS=177935040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,16:0.31:52
chr1	177935203	rs954502	A	G	1421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=31;PP=1070;SC=GAAACCAATGAAGAACTTGAC;SOR=2.409;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=41;WE=177935211;WS=177935193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	177935275	rs1415085	A	G	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=444;SC=TGAAAGCCACAGTTAATTCTA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=177935283;WS=177935265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	178483231	rs10913563	G	A	5593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=74;PP=2965;SC=CCCTTTTGAGGCCATGCAGGC;SOR=1.042;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=104;TCR=74;TR=178;WE=178483239;WS=178483221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr1	178484834	rs10798611	A	G	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=1;PP=585;SC=GAGCCAGTGCACCTGGTCTAT;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=178484842;WS=178484824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	178489978	rs3813636	T	G	2304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=47;PP=1932;SC=CAGGGCTCACTGGATCCCCTT;SOR=1.300;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=28;TCR=47;TR=75;WE=178489986;WS=178489968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	178492447	rs7527160	T	A	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=7;PP=393;SC=GTATATACGCTGCAGTGGGAC;SOR=1.127;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=18;WE=178492455;WS=178492437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	178514203	rs12044868	C	A	1336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.909;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=32;ReadPosRankSum=0.978;SC=AACTGAGCTCCCAATGCATTT;SOR=1.284;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=67;TCF=23;TCR=44;TR=47;WE=178514211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,48:0.71:68
chr1	178514560	rs34632529	A	AT	3098.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.561;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.769;NF=37;NR=57;PP=2963;ReadPosRankSum=-0.086;SC=TTGAAGGTTGATTTTGACTAC;SOR=0.788;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=63;TCR=100;TR=94;WE=178514568;WS=178514550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,115:0.62:185
chr1	178514622	rs12568310	C	T	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.862;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.099;NF=22;NR=37;PP=1178;ReadPosRankSum=-0.370;SC=CCCATGATCCCTGTGAGGGGT;SOR=0.961;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=162;TCF=66;TCR=96;TR=59;WE=178514630;WS=178514612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,64:0.38:169
chr1	178515135	rs4650992	A	T	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.503;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=519;ReadPosRankSum=-0.876;SC=GAAAACTAAGACCTTCCCACT;SOR=3.019;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=24;WE=178515143;WS=178515125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr1	178646752	rs2773075	A	C	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.76;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	178745798	rs11323887	CT	C	593.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=0.364;QD=13.19;ReadPosRankSum=0.281;SOR=0.633;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,32:0.71:45
chr1	178776985	rs6690324	G	A	176.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=170;SC=TTTCATAGTCGTTGTGCTCTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=178776993;WS=178776980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	178780650	rs12131426	A	G	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=371;ReadPosRankSum=1.270;SC=GAAAAATAAGACTCATTGATA;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=17;WE=178780658;WS=178780640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr1	178820159	rs1544124	C	A	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=192;ReadPosRankSum=-0.426;SC=TAAAAACTTTCTGTGTAGAAA;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=10;WE=178820167;WS=178820149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr1	178852800	rs76381760	T	A	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=429;ReadPosRankSum=0.874;SC=TTAAAATCTGTCCTTTCTGGG;SOR=0.293;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=21;WE=178852808;WS=178852790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr1	178854162	rs6425503	C	T	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=404;ReadPosRankSum=-1.642;SC=TTTCAAGGGACTGAAAAATAA;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=19;WE=178854170;WS=178854152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr1	178858711	rs10798635	C	A	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=630;ReadPosRankSum=-1.405;SC=TTTATTTTTACATTGTGAAAT;SOR=0.560;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=28;WE=178858719;WS=178858701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,29:0.71:41
chr1	178858759	rs3753534	G	A	1278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.601;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=15;PP=1011;ReadPosRankSum=0.875;SC=TAAAAAATAGGATAACTTTTC;SOR=0.350;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=64;TCF=46;TCR=18;TR=46;WE=178858767;WS=178858749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,46:0.70:66
chr1	178861278	rs114815547	G	T	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=408;ReadPosRankSum=0.253;SC=ATTACAAGAAGAAACTATTAT;SOR=1.708;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=16;WE=178861286;WS=178861268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr1	178871217	rs2275100	G	A	2530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=6.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.231;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=8;PP=1918;ReadPosRankSum=-1.508;SC=TTCTGTTTCCGCTAATTATCT;SOR=0.471;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=123;TCF=112;TCR=11;TR=83;WE=178871225;WS=178871207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,90:0.69:130
chr1	178876054	rs116065010	A	G	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=617;ReadPosRankSum=-1.090;SC=GAACATATGTAAAAGAGTTCC;SOR=0.509;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=29;WE=178876062;WS=178876044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,29:0.67:43
chr1	179023879	rs12735672	T	G	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=377;ReadPosRankSum=-0.640;SC=AAGAACTCAGTGGAATACAAA;SOR=0.760;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=16;WE=179023887;WS=179023869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr1	179036188	.	G	T	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.232;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=677;ReadPosRankSum=-0.198;SC=CCAAAGCTCAGAATTCATCTC;SOR=3.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=28;WE=179036196;WS=179036178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,31:0.89:35
chr1	179040930	rs10913689	T	C	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=290;ReadPosRankSum=1.387;SC=AAAGCAAAAATTATTTAGTTA;SOR=0.368;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=15;WE=179040938;WS=179040920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr1	179041011	rs3820163	A	G	1569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.142;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=24;PP=1128;ReadPosRankSum=0.820;SC=GATAATGAGAAGTTTTATGTA;SOR=1.138;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=87;TCF=50;TCR=37;TR=59;WE=179041019;WS=179041001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,62:0.70:89
chr1	179051300	rs2296377	T	C	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=498;ReadPosRankSum=-0.974;SC=TTGGCTCTTTTTCCTGCTGCT;SOR=0.779;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=22;WE=179051308;WS=179051290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,22:0.76:29
chr1	179052006	rs2274227	G	T	2205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.797;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=45;PP=1835;ReadPosRankSum=1.341;SC=AAGTTGTGTGGCAAGGTTGCC;SOR=0.836;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=108;TCF=47;TCR=61;TR=79;WE=179052014;WS=179051996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,81:0.72:112
chr1	179054692	rs912758	T	G	3136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.573;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=62;PP=2465;ReadPosRankSum=1.033;SC=CTTGGTTTCTTGGCTGTTGGC;SOR=0.940;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=171;TCF=81;TCR=90;TR=111;WE=179054700;WS=179054682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,115:0.64:179
chr1	179067071	rs10913690	C	A	1957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=47;PP=1470;ReadPosRankSum=-0.701;SC=ATTCCCCATGCTTTTACTCAC;SOR=0.758;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=125;TCF=46;TCR=79;TR=74;WE=179067079;WS=179067061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,77:0.59:130
chr1	179087934	rs2171959	T	C	2363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=89;PP=1821;ReadPosRankSum=-0.650;SC=TTTTTATTAGTGTACATTCAA;SOR=0.776;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=125;TCF=9;TCR=116;TR=97;WE=179087942;WS=179087924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,98:0.77:127
chr1	179089213	rs1858551	C	T	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=3;PP=876;ReadPosRankSum=-0.247;SC=GACAACAGAGCGAGACCCTGT;SOR=0.527;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=66;TCF=62;TCR=4;TR=42;WE=179089221;WS=179089203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,42:0.64:66
chr1	179089475	rs9726961	C	G	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.333;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=30;PP=779;ReadPosRankSum=-0.778;SC=AAAATCATTTCATTCATCTCA;SOR=0.126;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=49;TCF=3;TCR=46;TR=33;WE=179089483;WS=179089465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,36:0.68:53
chr1	179089491	rs9728480	A	C	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.648;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=31;PP=820;ReadPosRankSum=-0.867;SC=TCTCACAATCATAAAGCTTCA;SOR=0.212;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=49;TCF=2;TCR=47;TR=33;WE=179089499;WS=179089481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,37:0.69:54
chr1	179089518	rs9727252	C	G	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=462;ReadPosRankSum=1.149;SC=AAAGTAAAAACTATCTTTTGA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=21;WE=179089526;WS=179089508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr1	179292442	rs2902277	G	A	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=385;SC=CCATGCTGTCGTGTTTTATGG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=179292450;WS=179292432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	179304892	rs1034269	T	C	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=534;SC=CACCCTGGTGTCACTTTCTAT;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=179304900;WS=179304882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	179308803	rs3753524	G	A	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=360;ReadPosRankSum=-0.780;SC=CAGATTTGAGGGTGATATTCC;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=17;WE=179308811;WS=179308793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr1	179310262	rs11576517	C	T	2612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.111;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=33;PP=2064;ReadPosRankSum=-1.080;SC=TTTCAGTTCCCTATTTTCTGT;SOR=1.375;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=150;TCF=88;TCR=62;TR=93;WE=179310270;WS=179310252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,95:0.62:152
chr1	179310439	rs7547733	C	T	1213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=37;PP=937;ReadPosRankSum=-0.311;SC=TCATTATATTCGAGCAGGTAA;SOR=0.636;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=154;TCF=47;TCR=107;TR=55;WE=179310447;WS=179310429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,56:0.35:162
chr1	179312102	rs4651024	T	C	5429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=91;PP=2965;SC=GAACCAGAAATGTGGTAAACA;SOR=0.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=85;TCR=91;TR=176;WE=179312110;WS=179312092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr1	179312249	rs11350945	AT	A	1567.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=39;PP=1631;SC=GTCTAATTTGATTATAGTAAT;SOR=6.138;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=39;WE=179312257;WS=179312239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	179317895	rs200924427	ATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	A	789.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.56;SOR=4.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	179319351	rs41296202	A	C	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=328;ReadPosRankSum=1.455;SC=TGCCTTTGGCATATAATTTTA;SOR=0.175;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=66;TCR=0;TR=19;WE=179319359;WS=179319341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,20:0.30:67
chr1	179319580	rs3753527	T	C	4603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=114;PP=2965;ReadPosRankSum=1.584;SC=AGTATCTTGGTATGCTGTGAG;SOR=2.011;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=137;TCF=22;TCR=115;TR=136;WE=179319588;WS=179319570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,138:0.99:139
chr1	179320665	rs13306732	A	G	4437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=112;PP=2965;SC=GTTGGTGGGCAATGTTGAGGA;SOR=3.895;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=15;TCR=112;TR=127;WE=179320673;WS=179320655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr1	179339334	rs6666358	G	A	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=137;SC=AAAATTTACAGTATCTTTGAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=179339342;WS=179339324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	179347832	rs10798674	T	C	3267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=37;PP=2482;SC=AGAAGGCAGTTTGTCCCCCAC;SOR=1.190;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=57;TCR=38;TR=94;WE=179347840;WS=179347822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	179351606	rs4625243	G	C	250.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=207;SC=GCCATGTCCCGATGATTATTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=179351614;WS=179351601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	179354304	rs7541905	A	G	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=456;SC=CATTCAAGGTATTAACCTCCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=179354312;WS=179354294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	179364391	rs61173288	A	G	2526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=70;PP=2251;SC=AGAAGCTTATATAGCTTCTGA;SOR=3.528;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=9;TCR=72;TR=79;WE=179364399;WS=179364381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr1	179380472	rs5779024	GT	G	607.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.811;NF=0;NR=25;PP=449;ReadPosRankSum=-0.148;SC=TTTAAAATTTGTTTTTTTTGT;SOR=1.364;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=3;TCR=50;TR=25;WE=179380480;WS=179380462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,29:0.63:46
chr1	179380519	rs10798676	G	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=53;ReadPosRankSum=0.609;SC=TCACTCTGTTGCTTAGGCTGG;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=5;WE=179380527;WS=179380509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr1	179401503	rs12097041	G	A	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FS=0.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQRankSum=0.252;QD=5.34;ReadPosRankSum=-1.248;SOR=0.755;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:210,76:0.27:286
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chr1	179437827	rs7514278	G	A	172.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=137;SC=CTAAAGGTTTGTTGCAATACA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=179437835;WS=179437817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	179452194	rs6668035	C	T	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=1;PP=506;SC=AACTCTTTCTCATAGCTGATA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=179452202;WS=179452184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	179452275	rs10494520	G	A	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.290;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=347;ReadPosRankSum=1.682;SC=TACTCCAAGCGTATATATTTA;SOR=0.407;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=63;TCF=50;TCR=13;TR=21;WE=179452283;WS=179452265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,21:0.33:64
chr1	179452522	rs12407885	G	C	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=43;PP=1297;SC=TTTTAAAGCAGAATGTTTCTG;SOR=6.273;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=44;WE=179452530;WS=179452512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	179462149	rs7549194	A	G	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=415;SC=AGATTTTTGAAGTTCAATTGA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=179462157;WS=179462139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	179494665	rs4620484	C	T	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=416;SC=AGGGTCCTGCCCTGTCACCCA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=179494673;WS=179494655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	179497359	rs6698201	T	C	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=2;PP=733;SC=AAATGGAAAATGTAAGCTTCC;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=179497367;WS=179497349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	179503806	rs6425572	G	A	394.28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5743;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=268;ReadPosRankSum=-1.004;SC=AATGAGTTTCGAAATCAAAAA;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=12;WE=179503814;WS=179503796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr1	179504025	rs141228272	AAAG	A	3144.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=1.159;QD=24.38;ReadPosRankSum=1.593;SOR=0.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,78:0.60:129
chr1	179504043	rs6658180	C	G	3424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.674;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.181;NF=56;NR=24;PP=2962;ReadPosRankSum=1.614;SC=AGAAGAACAACAAGAAGAAGA;SOR=0.781;Source=Platypus;TCF=108;TR=80;WE=179504051;WS=179504015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,91:0.59:153
chr1	179504130	rs6425574	G	A	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.711;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=49;PP=1495;ReadPosRankSum=0.349;SC=CTTTATTCAGGTTGTATTTAT;SOR=0.626;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=126;TCF=37;TCR=89;TR=70;WE=179504138;WS=179504120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,74:0.56:131
chr1	179544898	rs1079292	T	C	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.201;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=383;ReadPosRankSum=-3.822;SC=GCCCGCGGCCTCCGCCGCTCC;SOR=1.003;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=82;TCF=28;TCR=54;TR=22;WE=179544906;WS=179544888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,21:0.26:82
chr1	179544941	rs74315344	G	A	1655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.853;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=35;PP=1111;ReadPosRankSum=-0.553;SC=CTCCTTGTGCGGAGTCCTGCC;SOR=0.811;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=87;TCF=35;TCR=52;TR=57;WE=179544949;WS=179544931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,62:0.69:90
chr1	179561645	rs4652418	A	C	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=38;ReadPosRankSum=1.051;SC=TTAAAACTGGAGTCTCAGTTA;SOR=0.175;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=5;WE=179561653;WS=179561635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr1	179561683	rs4652419	A	T	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=227;ReadPosRankSum=0.115;SC=GTTTTTTTTTAAATCTTTTTT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=13;WE=179561691;WS=179561673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,11:0.26:42
chr1	179562792	rs77758448	G	A	4197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.832;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=82;PP=2962;ReadPosRankSum=1.320;SC=GGACCTGTTGGCGTTATCTCC;SOR=0.845;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=228;TCF=108;TCR=120;TR=151;WE=179562800;WS=179562782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,158:0.66:238
chr1	179604864	rs4628468	C	T	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.791;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=945;ReadPosRankSum=-0.899;SC=TCCCGCCAGACGCTGTGCCGA;SOR=0.711;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=206;TCF=103;TCR=103;TR=64;WE=179604872;WS=179604854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,69:0.32:217
chr1	179609589	rs16854429	G	T	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.454;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=607;ReadPosRankSum=1.087;SC=AGGTATGTTTGCTTGTCTCCC;SOR=0.947;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=120;TCF=51;TCR=69;TR=36;WE=179609597;WS=179609579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,40:0.31:127
chr1	179782860	rs116039137	A	G	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.841;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=229;ReadPosRankSum=0.800;SC=TCAAAAATGCATGGGGCGGGG;SOR=0.183;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=16;WE=179782868;WS=179782850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr1	179852074	rs1281378	T	C	5092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=125;PP=2965;SC=TCTCCTGTTATGACCAGGAGA;SOR=1.746;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=56;TCR=125;TR=181;WE=179852082;WS=179852064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr1	179852552	rs605807	T	G	963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=0;PP=857;SC=GATCTAACCTTTCAGTCTTTT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=179852560;WS=179852542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	179858333	rs1300068	C	T	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=514;SC=ACTTCTCTAGCGTAAATAAAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=179858352;WS=179858323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	179858344	rs146247532	G	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=81;ReadPosRankSum=-2.183;SC=GTAAATAAAAGCTCTGTAAAC;SOR=0.770;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=6;WE=179858352;WS=179858323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr1	179858444	rs2245425	G	A	1623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=14;PP=1189;SC=TCCTATATTAGCAGTGAGTGA;SOR=2.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=49;WE=179858452;WS=179858434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
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chr1	179887125	rs627897	G	A	8971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=163;NR=111;PP=2965;SC=ATGAAAACGCGGCCTTCAAAG;SOR=1.130;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=274;TCF=163;TCR=111;TR=274;WE=179887133;WS=179887115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr1	179955469	rs148839351	T	G	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=63;ReadPosRankSum=-0.842;SC=TAAATGAAAATTATACCTATG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=179955477;WS=179955459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	179983665	rs2501607	G	A	2379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.486;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=68;PP=1860;ReadPosRankSum=1.604;SC=ATATACAAAGGAGAGTCATTC;SOR=0.047;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=112;TCF=8;TCR=104;TR=76;WE=179983673;WS=179983655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,80:0.69:116
chr1	179989742	rs2477120	G	C	2691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.401;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=49;PP=2052;ReadPosRankSum=0.286;SC=TCCCAAACCAGAAGGGCTACT;SOR=0.553;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=137;TCF=60;TCR=77;TR=90;WE=179989750;WS=179989732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,96:0.66:145
chr1	179990238	rs193210669	C	T	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=184;ReadPosRankSum=0.322;SC=ACACATTTTTCGTTGAGTGGA;SOR=0.299;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=10;WE=179990246;WS=179990228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr1	179992076	rs2477117	A	G	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=25;PP=683;SC=AGTTTTGCTCATTTAAAAATA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=179992084;WS=179992066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	179993793	rs4622030	T	C	84.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=3;PP=58;SC=ATGATTTGATTGCATAAGAAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=179993801;WS=179993783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	180010702	rs4652461	T	C	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=529;SC=TTTTTTACTATGAATAAGACA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=180010710;WS=180010692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	180022343	rs9425854	T	G	1691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.304;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=52;PP=1392;ReadPosRankSum=-1.541;SC=GTTGTGGATATGTTCTCTCAA;SOR=1.515;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=90;TCF=14;TCR=76;TR=59;WE=180022351;WS=180022333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,60:0.66:91
chr1	180047817	rs74895300	A	C	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.120;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=168;ReadPosRankSum=0.153;SC=CATGTAAGTTAATGTATATTT;SOR=1.352;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=11;WE=180047825;WS=180047807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr1	180059736	rs67852047	GACATACCT	G	1123.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=2916;ReadPosRankSum=-0.126;SC=GACATAGATTGACATACCTAC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=24;WE=180059751;WS=180059726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr1	180059811	rs10798729	A	C	1823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.437;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=15;PP=1495;ReadPosRankSum=-0.890;SC=TTATTATAGTAATATGTTTAT;SOR=0.347;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=107;TCF=86;TCR=21;TR=67;WE=180059819;WS=180059801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,67:0.62:108
chr1	180080115	rs3767202	T	G	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=3;PP=800;ReadPosRankSum=-2.212;SC=CTAACCTTATTGTCTTCTAAA;SOR=1.038;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=56;TCF=51;TCR=5;TR=36;WE=180080123;WS=180080105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,38:0.64:59
chr1	180144291	rs71118443	C	CA	569.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;MQRankSum=2.060;NF=12;NR=4;PP=272;ReadPosRankSum=-0.057;SC=GACTCTGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=2.494;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=16;WE=180144299;WS=180144281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,20:0.91:22
chr1	180145088	rs2298206	A	G	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=28;PP=1234;SC=ACGTGCAGACACTGCGGGAGA;SOR=0.853;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=52;WE=180145096;WS=180145078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	180155376	rs2298207	C	G	276.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=183;SC=AGTGTGCGTTCCTGTAAGGCT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=180155390;WS=180155366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	180155382	rs3216058	AG	A	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=204;SC=CGTTCCTGTAAGGCTGGGCAC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=180155390;WS=180155366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	180158973	rs3888269	C	T	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=134;ReadPosRankSum=-0.713;SC=ATTGAGCTCTCTATGCGCACA;SOR=0.202;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=7;WE=180158981;WS=180158963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr1	180159797	rs3215795	TC	T	455.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=60.72;NF=1;NR=13;PP=510;SC=GCAGGGAAGCTCCCTTGAATT;SOR=3.912;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=14;WE=180159805;WS=180159787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	180180669	rs164980	A	G	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=464;ReadPosRankSum=0.000;SC=TAACTCGTGCATAGTGGCAGG;SOR=0.681;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=24;WE=180180677;WS=180180659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr1	180240752	rs3845397	C	T	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=623;ReadPosRankSum=0.018;SC=CATCAGCTCACGGGTGGTTGG;SOR=0.788;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=28;WE=180240760;WS=180240742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,28:0.74:38
chr1	180243524	rs7536561	A	G	4004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.587;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=84;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.590;SC=CCTTTGCTCAATGGGCTGGAT;SOR=0.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=197;TCF=77;TCR=120;TR=136;WE=180243532;WS=180243514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,141:0.71:198
chr1	180257692	rs2254465	A	C	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=15;PP=370;SC=AAGTTTACCAAGAGACAGAGA;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=180257700;WS=180257682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	180283659	rs2764433	T	C	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=83;SC=GGATTACAGGTGTGAGCCCTC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=180283667;WS=180283649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	180471054	rs12723183	C	A	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQRankSum=-1.104;QD=20.67;ReadPosRankSum=-3.908;SOR=1.839;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr1	180471059	.	C	A	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.014;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQRankSum=-1.911;QD=16.51;ReadPosRankSum=-2.116;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr1	180757056	rs3761904	A	G	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=181;ReadPosRankSum=-0.495;SC=ATCATTGTTTAAACTTCTGAT;SOR=0.479;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=10;WE=180757064;WS=180757046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr1	180757117	rs34984251	G	GT	609.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=709;SC=CACTTAAGAGGATTTTCTTGA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=180757125;WS=180757107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	180803922	rs2271669	T	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=0.847;SC=TCAACTAAAGTAATCATGCTG;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=5;WE=180803930;WS=180803912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr1	180849494	rs10914123	T	C	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.125;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=147;ReadPosRankSum=-0.326;SC=TTGGGTAGCATGTAAGCTAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=180849502;WS=180849484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr1	180885430	rs10732273	T	C	7033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=142;NR=94;PP=2965;SC=ACATCCAGCCTGATGGCCCCC;SOR=1.159;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=236;TCF=142;TCR=94;TR=236;WE=180885438;WS=180885420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr1	180886810	rs3761905	C	G	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.98;ReadPosRankSum=-1.755;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr1	180897521	rs7544551	C	T	4194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=43;PP=2965;SC=CGTTATTTTCCTCTAATCCCT;SOR=1.573;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=84;TCR=43;TR=127;WE=180897529;WS=180897511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	180897792	rs35197779	ATGC	A	1196.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=27;PP=1374;SC=ATCTAGCCAAATGCTGCTGCT;SOR=5.283;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=28;WE=180897802;WS=180897782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	180905352	rs3795505	C	T	2108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FS=12.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.33;ReadPosRankSum=1.111;SOR=1.264;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:289,107:0.27:396
chr1	180905448	rs3795504	G	T	2565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.110;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=56;PP=2012;ReadPosRankSum=-0.565;SC=CAGCTTCCTTGTGTCCTGAAG;SOR=0.373;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=334;TCF=139;TCR=195;TR=109;WE=180905456;WS=180905438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:224,109:0.33:333
chr1	180905694	rs3795503	C	T	2234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.256;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=60;PP=1568;ReadPosRankSum=-1.797;SC=ACTGCAACAACAGCGCACCTC;SOR=0.937;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=146;TCF=47;TCR=99;TR=86;WE=180905702;WS=180905684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,91:0.60:152
chr1	180913597	rs2331995	A	G	5417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=82;PP=2965;SC=CAGCAAGGGGAACCGGTCCAG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=81;TCR=82;TR=163;WE=180913605;WS=180913587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr1	180933498	rs4652543	C	T	1900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=1;PP=1550;SC=GTCCAGGCCCCGGTTCCTGGG;SOR=6.666;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=53;TCF=52;TCR=1;TR=53;WE=180933506;WS=180933488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	180953853	rs3747957	A	G	3864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=62;PP=2810;SC=TCTTCATCACATTGTCCAGCC;SOR=0.723;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=64;TCR=62;TR=126;WE=180953861;WS=180953843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr1	180962282	rs1411478	A	G	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=1;PP=272;SC=GAGCCCAGAGAAGAAGACCAG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=180962290;WS=180962272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	180991665	rs12565758	C	G	3808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=47;PP=2788;SC=ACTGTTCCCCCTCCCCAGCTC;SOR=1.575;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=89;TCR=47;TR=136;WE=180991673;WS=180991655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr1	181018258	rs3863720	G	A	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.124;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-6.988;NF=11;NR=23;PP=643;ReadPosRankSum=0.363;SC=AATTTATTTCGGTTGGGTACG;SOR=0.426;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=107;TCF=36;TCR=71;TR=34;WE=181018266;WS=181018248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,22:0.24:93
chr1	181058313	rs3747955	G	A	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=7;PP=395;SC=CCCGCCGCTCGTGCCTCTTGG;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=17;WE=181058321;WS=181058303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	181058618	rs1416829	C	G	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=12;PP=468;SC=CGCGACCCCCCGCGCTGCCTG;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=181058626;WS=181058608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	181058643	rs1361365	A	G	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=6;PP=562;SC=TGCGCGCCGCAACCAGCGGAG;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=181058651;WS=181058633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	181548341	rs17443123	A	G	3841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.979;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=76;PP=2779;ReadPosRankSum=-0.104;SC=TACATCGAGCATGCTTCATGA;SOR=0.752;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=248;TCF=122;TCR=126;TR=149;WE=181548349;WS=181548331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,160:0.62:259
chr1	181680082	rs17743547	G	A	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=0.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.06;ReadPosRankSum=-0.098;SOR=0.561;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,36:0.24:153
chr1	181684605	rs12407563	A	G	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=23;ReadPosRankSum=1.548;SC=ATTCAAAAGGAGAGAAAGAAA;SOR=0.297;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=4;WE=181684613;WS=181684595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,4:0.19:21
chr1	181686216	rs7540850	T	C	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.09;ReadPosRankSum=0.093;SOR=0.504;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,22:0.34:64
chr1	181689112	rs72735230	C	T	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=380;ReadPosRankSum=0.788;SC=TATCCCTTCCCTGCCCCACCC;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=18;WE=181689120;WS=181689102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr1	181690038	rs187650141	G	A	1840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.803;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=49;PP=1465;ReadPosRankSum=0.600;SC=GGGTCCCTTGGACTGCACACT;SOR=1.075;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=112;TCF=32;TCR=80;TR=66;WE=181690046;WS=181690028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,66:0.59:112
chr1	181701799	rs35737760	T	A	2539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.342;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=55;PP=1968;ReadPosRankSum=-0.413;SC=TCAAGGGGGATGGAGGGGACC;SOR=1.355;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=126;TCF=50;TCR=76;TR=86;WE=181701807;WS=181701789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,90:0.70:128
chr1	181702616	rs41304253	G	A	1885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=25;PP=1526;ReadPosRankSum=-0.145;SC=GCTGGCAGGAGGCCTTGATGA;SOR=0.638;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=99;TCF=63;TCR=36;TR=67;WE=181702624;WS=181702606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,67:0.68:98
chr1	181706685	rs34488539	C	T	2735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.313;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=31;PP=2216;ReadPosRankSum=-0.632;SC=GCCACTACATCGTGAACCTGC;SOR=0.446;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=159;TCF=114;TCR=45;TR=101;WE=181706693;WS=181706675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,102:0.64:160
chr1	181708168	rs73045109	A	G	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=204;ReadPosRankSum=-1.930;SC=AGGTCCTAGCATAGGGTTGGT;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=12;WE=181708176;WS=181708158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr1	181714466	rs375841404	AT	A	177.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=2.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.87;ReadPosRankSum=-0.690;SOR=0.435;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,23:0.24:95
chr1	181725110	rs4652678	T	C	2403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=39;PP=1760;SC=ATGTAGATCATGAGAAAAACA;SOR=0.791;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=43;TCR=39;TR=82;WE=181725118;WS=181725100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	181726413	rs704330	G	A	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=304;SC=CATTAAATAAGCATTTTCCAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=181726421;WS=181726403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	181727030	rs12564606	A	T	2308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=27;PP=1860;SC=AGAGCCTGCCATGGTAGATCT;SOR=1.394;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=46;TCR=27;TR=73;WE=181727038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	181731667	rs149636359	T	TC	3848.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.34;QD=33.76;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,112:0.98:114
chr1	181732695	rs72735265	A	G	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=16;PP=564;SC=ATCCTCTCTGAGGGTTGTCAT;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=181732703;WS=181732685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	181741301	rs199930	C	T	1766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.234;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=41;PP=1353;ReadPosRankSum=0.505;SC=AGAACGAGAACGAACGCTGCG;SOR=0.592;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=265;TCF=140;TCR=125;TR=81;WE=181741309;WS=181741291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,83:0.31:270
chr1	181745580	rs199932	G	A	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.280;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=53;ReadPosRankSum=-0.487;SC=CTGTGACAGGGTTTTCCCTTT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=6;WE=181745588;WS=181745570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr1	181750469	rs704328	G	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.782;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=83;ReadPosRankSum=2.200;SC=TCTCCTATCTGTCTGCATCCT;SOR=0.591;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=5;WE=181750477;WS=181750464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr1	181752923	rs36163765	AAGCTT	A	740.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.896;NF=3;NR=14;PP=907;ReadPosRankSum=0.981;SC=TGCCAAAGGTAAGCTTAGCTT;SOR=0.582;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=17;WE=181752935;WS=181752913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr1	181759657	rs704326	G	A	2092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.776;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=33;PP=1727;ReadPosRankSum=1.917;SC=TATGGACCCCGCCGATGACGG;SOR=1.090;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=131;TCF=72;TCR=59;TR=81;WE=181759665;WS=181759647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,79:0.61:129
chr1	182369078	rs6698722	G	A	3638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=48;PP=2965;SC=AGCCAGAGACGGGTCTGTATA;SOR=1.028;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=65;TCR=48;TR=113;WE=182369086;WS=182369068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr1	182429295	rs10572829	CTG	C	134.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.344;NF=0;NR=5;PP=248;ReadPosRankSum=0.437;SC=ATGCGTGTGTCTGTGTGTGTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=5;WE=182429304;WS=182429285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr1	182429728	rs266508	T	C	1355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=10;PP=1087;SC=AATTTGTCTCTTTGCTTTTGC;SOR=2.531;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=42;WE=182429736;WS=182429718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	182443462	rs649437	T	C	4386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.771;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=71;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.824;SC=CTGGCAGGACTTGCAGCATTT;SOR=0.740;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=221;TCF=114;TCR=107;TR=150;WE=182443470;WS=182443452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,151:0.68:221
chr1	182491107	rs607269	A	C	1159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.42;SOR=6.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	182491107	.	AGTGT	CGTGC,CGTGT	388	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=17,28;NR=0,0;PP=388,200;QD=25.9686985213;SC=CTTATAATATAGTGTTCTCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=17,28;WE=182491119;WS=182491097;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.61:28
chr1	182491111	rs12142736	T	C	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.76;ReadPosRankSum=1.251;SOR=1.143;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr1	182496829	rs7535533	A	G	1213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.785;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=42;PP=869;ReadPosRankSum=0.707;SC=GAAGATCAGTATAGAGACCAA;SOR=1.462;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=167;TCF=49;TCR=118;TR=53;WE=182496837;WS=182496819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,56:0.33:172
chr1	182501933	rs266534	C	A	2105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.594;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=45;PP=1627;ReadPosRankSum=0.241;SC=GAAAGTAAGTCATTTCTGTAT;SOR=0.496;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=261;TCF=141;TCR=120;TR=93;WE=182501941;WS=182501923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,94:0.36:260
chr1	182502033	rs266535	G	T	3876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=99;PP=2965;SC=GCAGCCTGGAGTCTAGCAAAA;SOR=3.433;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=15;TCR=99;TR=114;WE=182502041;WS=182502023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr1	182509269	rs266531	G	A	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.270;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=2;PP=767;ReadPosRankSum=0.419;SC=GACTATTTCAGTAGGCCAAAA;SOR=1.659;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=46;TCF=42;TCR=4;TR=30;WE=182509277;WS=182509259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,34:0.67:51
chr1	182509598	rs76889128	T	C	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=218;ReadPosRankSum=-0.485;SC=GAAAATGACTTTTCATCCTTA;SOR=0.238;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=12;WE=182509606;WS=182509588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr1	182517642	rs10911094	C	A	2570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.654;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=71;PP=2032;ReadPosRankSum=1.253;SC=GCATTTCCCCCACAAGGACAA;SOR=0.155;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=145;TCF=23;TCR=122;TR=89;WE=182517650;WS=182517632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,92:0.63:147
chr1	182522552	rs266544	C	T	1707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.915;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=17;PP=1370;ReadPosRankSum=-0.791;SC=TAGGAGTTGTCGCAGGTGTTT;SOR=0.905;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=87;TCF=62;TCR=25;TR=60;WE=182522560;WS=182522542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,61:0.67:91
chr1	182523591	.	A	C	170	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=6;NR=1;PP=170;QD=29.2530303639;SC=GCATAGAAACAAGGTCTCCTG;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=182523599;WS=182523590;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	182544815	rs11807829	T	C	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=22;PP=520;SC=TGATTTCTATTGCAGAATGAA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=182544823;WS=182544805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	182549019	rs533259	A	G	1902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=21;PP=1485;SC=TCACAGCTTCATGTAGTGGTG;SOR=1.574;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=41;TCR=21;TR=62;WE=182549027;WS=182549009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	182551337	rs627928	A	C	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.100;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=543;ReadPosRankSum=-2.165;SC=GAGCTTTCAGATCCTCAAATG;SOR=0.349;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=111;TCF=66;TCR=45;TR=31;WE=182551345;WS=182551327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,31:0.28:111
chr1	182554557	rs486907	C	T	2246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.009;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=47;PP=1623;ReadPosRankSum=1.079;SC=CAGGACATTTCGGGCAAATTC;SOR=0.799;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=300;TCF=153;TCR=147;TR=98;WE=182554565;WS=182554547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,102:0.33:312
chr1	182569626	rs1144566	T	C	3418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=84;PP=2528;SC=CGTCAGCTCGTGGGTCTCATG;SOR=1.923;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=33;TCR=85;TR=117;WE=182569634;WS=182569616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr1	182571003	rs610367	C	T	150.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=3.332;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=112;ReadPosRankSum=0.566;SC=GGCCCTTCTACCTCTACACCT;SOR=2.303;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=6;WE=182571011;WS=182570993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr1	182571277	rs569790	C	T	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.241;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=1011;ReadPosRankSum=-0.449;SC=TCTGGGGTTGCGGGAAAGAAG;SOR=0.429;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=26;TCR=43;TR=44;WE=182571285;WS=182571267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,44:0.66:67
chr1	182573227	rs509476	T	C	3408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=72;NR=36;PP=2653;SC=TCAAGTGCGCTTCTACCTCTC;SOR=1.902;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=72;TCR=36;TR=108;WE=182573235;WS=182573217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	182778348	.	C	T	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=5.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.56;ReadPosRankSum=0.086;SOR=1.341;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,25:0.22:115
chr1	182778367	rs971040	G	A	3550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=66;PP=2683;SC=CAAAGTAGACGGAGTAGCTTT;SOR=1.428;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=38;TCR=66;TR=104;WE=182778375;WS=182778357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	182821635	.	C	A	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.478;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=245;ReadPosRankSum=-2.141;SC=ATTACCAGATCATTTATTTTT;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=14;WE=182821643;WS=182821625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr1	182850727	rs6677840	T	C	2252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=44;PP=1874;SC=TAAGAATGACTTGGGAAGCCA;SOR=1.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=64;WE=182850735;WS=182850717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	182854017	rs3130492	G	A	1229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=33;PP=1090;SC=TAGAATTCCTGAAGTTAGTGA;SOR=3.855;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=37;WE=182854025;WS=182854007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	182993025	rs10911194	C	T	6915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.767;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=86;PP=2965;ReadPosRankSum=0.476;SC=TCAACGCCGCCTTCAACGTGA;SOR=0.782;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=211;TCF=124;TCR=87;TR=209;WE=182993033;WS=182993015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,218:1.00:219
chr1	183072590	rs2296288	T	C	4225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=79;PP=2965;SC=GTGGTTCCTGTGAGAACACCT;SOR=1.011;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=60;TCR=79;TR=139;WE=183072598;WS=183072580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr1	183077296	rs3835273	A	AG	2285.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=0;PP=2058;SC=ATTTAGTGCTAAAGAGGGCGT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=55;TCR=0;TR=50;WE=183077304;WS=183077286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	183077615	rs3765521	C	T	1692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.40;SOR=7.378;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	183077618	rs3765522	C	T	1692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.55;SOR=7.328;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	183079509	rs2296291	C	T	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=0;PP=1128;SC=GCTCAGTTCCCCAGTTTACAC;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=37;WE=183079517;WS=183079499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	183079853	rs6672093	T	C	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=280;SC=GAAGAAGGAATGGGTGACTTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=183079861;WS=183079843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	183084607	rs3736888	AC	GA	2457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=10;PP=2495;ReadPosRankSum=-0.728;SC=GATTTTACTTACGTATCTGGC;SOR=1.542;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=50;WE=183084616;WS=183084597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr1	183085611	rs10689020	C	CA	335.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=261;ReadPosRankSum=1.097;SC=GACTCTGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=17;WE=183085619;WS=183085602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr1	183085696	rs6424888	A	G	2899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=21;PP=2284;SC=TGTTTTATCCATTTTTCATTG;SOR=2.595;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=79;TCR=21;TR=100;WE=183085704;WS=183085686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	183085755	rs20563	A	G	4422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=66;PP=2965;ReadPosRankSum=0.009;SC=TGAATGTAATATTGAAACAGG;SOR=0.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=68;TCR=68;TR=133;WE=183085763;WS=183085745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,138:0.99:140
chr1	183086757	rs2296292	A	C	2902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=58;PP=2175;SC=GCCTCTCTGCAGAAGACCTTG;SOR=1.284;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=36;TCR=58;TR=94;WE=183086765;WS=183086747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	183093875	rs20557	T	C	2538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=41;PP=2115;SC=TCGATCCCAATGCAGTTGGAA;SOR=0.741;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=41;TCR=41;TR=82;WE=183093883;WS=183093865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	183094547	rs20558	T	C	3295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=36;PP=2507;SC=AATTGCAATCTGTATGGGACC;SOR=1.567;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=73;TCR=36;TR=108;WE=183094555;WS=183094537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	183094802	rs10797850	G	A	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=432;SC=GCCTAATGTAGGCAAGGCATC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=183094810;WS=183094792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	183095185	rs55856623	TAA	T	2120.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=47;NR=7;PP=913;SC=AGTGCTATACTAAAAAAAAAA;SOR=3.841;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=72;TCF=60;TCR=12;TR=54;WE=183095197;WS=183095175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	183095234	rs1886501	A	G	3518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.817;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.185;NF=64;NR=45;PP=2711;ReadPosRankSum=-0.587;SC=TGCCTGAGAAATGTCCTGTGT;SOR=0.829;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=110;TCF=64;TCR=46;TR=109;WE=183095242;WS=183095224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,117:0.99:118
chr1	183095477	rs2296293	G	A	1416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=43;PP=1146;SC=GACTTTGACAGCCTCAGTCTA;SOR=5.421;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=45;WE=183095485;WS=183095467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	183096253	rs3066017	T	TATA	130	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=0;PP=179;SC=TCAAAAAAATTATGACAGTAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=183096261;WS=183096243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	183096634	rs1413390	G	A	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=533;ReadPosRankSum=1.470;SC=GGTGAACAAGGTAGATGTGGT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=21;WE=183096642;WS=183096624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr1	183096668	rs1413389	C	T	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=348;SC=GACTTATGTTCCAGTTGGGAG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=183096676;WS=183096658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	183097956	rs34133998	G	GTTA	2030.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.405;NF=5;NR=34;PP=1871;ReadPosRankSum=0.389;SC=CTAAAGCAAGGTTAGTATAGT;SOR=1.609;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=39;WE=183097964;WS=183097946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr1	183098001	rs10797851	A	G	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=421;SC=TAAACTACTCATAGATTATAA;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=183098009;WS=183097991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	183099380	.	T	C	894	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=34;NR=0;PP=894;QD=27.316800369;SC=AAAGTTGCGATGTTTAGAAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=34;WE=183099388;WS=183099379;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr1	183099701	rs2296300	G	A	2082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=58;PP=1677;SC=GATTGCAAACGTCTGAGGTGG;SOR=5.518;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=3;TCR=58;TR=61;WE=183099709;WS=183099691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	183100555	rs2333620	T	C	4271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.34;QD=41.88;SOR=7.034;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	183100562	.	G	GT	4591.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.56;QD=51.59;SOR=9.000;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	183100563	rs55951405	G	GTGTGT,GTGTGTGT	4537.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=56.87;QD=206.26;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,8,14:0.36,0.64:22
chr1	183100596	rs2333619	A	G	2792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.55;QD=45.04;SOR=8.287;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	183100596	.	ATT	GTG	2012	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MMLQ=28;MQ=52.49;NF=0;NR=36;PP=2012;QD=57.3741076351;SC=GTGTGTGTGTATTGTCTTATC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=36;WE=183100606;WS=183100584;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:12,36:0.75:48
chr1	183100598	rs4047797	T	G	2603.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.61;QD=48.22;SOR=7.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	183101427	rs148796825	AAAT	A	1032.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=955;SC=ACTCCATTTCAAATAATAATA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=17;WE=183101459;WS=183101422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	183101444	rs12071514	A	C	1806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.22;QD=46.33;SOR=5.943;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	183101451	rs12066735	T	G	2017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.19;QD=45.86;SOR=7.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	183101471	rs12061219	G	A	2480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=0;PP=1688;SC=AGCATTACCTGAATTTTACTT;SOR=8.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=59;TCR=0;TR=59;WE=183101479;WS=183101461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	183101686	rs12095664	G	A	5377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=119;PP=2965;SC=AGTATAATTTGAAAGTGGTTT;SOR=2.075;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=46;TCR=119;TR=165;WE=183101694;WS=183101676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr1	183104013	rs2296299	G	A	4313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=108;PP=2965;SC=GGTCTGTGATGATGCCGTACT;SOR=3.811;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=16;TCR=108;TR=124;WE=183104021;WS=183104003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	183104340	rs35182436	AT	A	2770.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=79;PP=1694;SC=CACTAGAGTGATTTTTTTTTT;SOR=1.786;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=123;TCF=22;TCR=101;TR=97;WE=183104349;WS=183104330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	183105399	rs2296296	C	G	1180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=0;PP=981;SC=AGCCCATGCTCTCTTCCATTT;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=183105407;WS=183105389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	183105534	rs20560	T	C	5128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=41;PP=2965;ReadPosRankSum=0.824;SC=TTGATAGGCGTGTGAACGATA;SOR=1.022;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=162;TCF=121;TCR=41;TR=160;WE=183105542;WS=183105524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,163:0.99:164
chr1	183105705	rs20561	G	A	4238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=119;PP=2965;SC=AGAGGATCGCGAGCGCTGTCC;SOR=6.391;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=4;TCR=119;TR=123;WE=183105713;WS=183105695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	183106739	rs10797854	G	A	1965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=0;PP=1628;ReadPosRankSum=-0.823;SC=TATAAAAGGAGCGGGAGCATA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=57;TCR=0;TR=56;WE=183106747;WS=183106729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,59:0.98:60
chr1	183155482	rs684527	C	A	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.039;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=274;ReadPosRankSum=0.178;SC=GCGGCCCGGCCCCGCCATGCC;SOR=2.531;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=16;WE=183155490;WS=183155472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr1	183155700	rs6678888	C	A	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.299;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=291;ReadPosRankSum=0.505;SC=CCTTCTCCTCCCCTATCTGGG;SOR=0.910;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=62;TCF=11;TCR=51;TR=19;WE=183155708;WS=183155690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,21:0.31:68
chr1	183155715	rs60707856	CT	C	528.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.191;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=749;ReadPosRankSum=0.325;SC=TCTGGGGCTCCTCCAGAGACG;SOR=1.284;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=4;TCR=41;TR=13;WE=183155725;WS=183155705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,17:0.29:58
chr1	183155717	rs61418038	C	A	537.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.223;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=745;ReadPosRankSum=0.079;SC=TGGGGCTCCTCCAGAGACGGA;SOR=1.329;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=52;TCF=11;TCR=41;TR=14;WE=183155725;WS=183155705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,17:0.30:57
chr1	183177218	rs647347	A	G	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=91;ReadPosRankSum=1.152;SC=GCTGAAAAGGACGGAAAGAGG;SOR=1.038;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=6;WE=183177226;WS=183177208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr1	183184690	rs11586699	C	T	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=877;ReadPosRankSum=0.334;SC=CACATGCTCACGGATGCGGGG;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=61;TCF=35;TCR=26;TR=43;WE=183184698;WS=183184680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,43:0.69:62
chr1	183212499	rs41314547	A	G	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.363;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=714;ReadPosRankSum=-1.591;SC=ACCTGCCCCCAGGCTGCTACA;SOR=0.862;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=157;TCF=71;TCR=86;TR=49;WE=183212507;WS=183212489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,50:0.32:154
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chr1	183253959	rs603850	T	G	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.806;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=781;ReadPosRankSum=1.736;SC=AGGGACAGAGTGGGAGAGAAC;SOR=0.293;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=33;WE=183253967;WS=183253949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,34:0.74:46
chr1	183441977	rs3905118	C	T	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=38;ReadPosRankSum=-1.559;SC=CCCTACCGCCCGGGCTGAGCT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=183441985;WS=183441967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr1	183471295	rs789193	G	T	112.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=0;PP=107;SC=CCTTTCACATGAAGTCATTTC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=183471303;WS=183471285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	183486859	rs789169	G	A	8916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.620;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=154;NR=123;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.746;SC=TCACAACACTGCAAGGCCAGG;SOR=0.675;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=279;TCF=155;TCR=124;TR=277;WE=183486867;WS=183486849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,289:1.00:290
chr1	183496658	rs2877978	A	G	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=214;ReadPosRankSum=0.162;SC=TTAATATTGCAATAGGAATGA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=13;WE=183496666;WS=183496648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr1	183516100	rs699246	G	C	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=36;ReadPosRankSum=-0.284;SC=ATTTCAGAGCGTTTTTTCTCT;SOR=0.846;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=4;WE=183516108;WS=183516090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr1	183516440	rs2702182	G	A	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=42;ReadPosRankSum=-0.464;SC=CTGCTTCTCTGAGATACTGTA;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=183516448;WS=183516430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr1	183525452	rs699244	T	G	4158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=100;PP=2965;SC=ATTTGTTATCTGTCACCCTTC;SOR=2.780;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=27;TCR=100;TR=127;WE=183525460;WS=183525442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	183532580	rs17849502	G	T	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.340;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=521;ReadPosRankSum=0.523;SC=TCAGCTTAGTGTGTTCCAGCC;SOR=1.211;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=78;TCF=26;TCR=52;TR=29;WE=183532588;WS=183532570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,31:0.38:81
chr1	183534935	rs2296164	C	T	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.362;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=147;ReadPosRankSum=-0.717;SC=CAGGGAGCGACGGTCAGAACC;SOR=0.283;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=10;WE=183534943;WS=183534925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr1	183542323	rs17849501	C	T	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.929;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=194;ReadPosRankSum=-1.196;SC=CACCTACCGTCGCCTTGCCTA;SOR=0.105;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=12;WE=183542331;WS=183542313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,12:0.27:44
chr1	183542387	rs2274064	T	C	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=426;ReadPosRankSum=0.337;SC=TCGAAACAGCTTGCCCACAGG;SOR=0.492;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=90;TCF=63;TCR=27;TR=31;WE=183542395;WS=183542377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,32:0.33:96
chr1	183592416	rs2761573	G	T	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=6;PP=1029;SC=TATTTATGTTGATTACTCTTA;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=38;WE=183592424;WS=183592406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	183592570	rs17488675	C	T	2571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=58;PP=2051;SC=GTGGGCTTCCCGGGCCTCCTC;SOR=2.055;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=21;TCR=58;TR=79;WE=183592578;WS=183592560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	183604905	rs2767305	A	G	4030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=118;PP=2965;SC=TTCCGCTCTGAGGCGTCGCCG;SOR=7.395;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=121;TCF=2;TCR=119;TR=120;WE=183604913;WS=183604895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr1	183616926	rs1174657	T	C	4706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.577;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=0.053;SC=CCAAGGTCCTTGGTTTCCTGG;SOR=0.242;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=163;TCF=49;TCR=114;TR=160;WE=183616934;WS=183616916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,168:0.98:171
chr1	183617105	rs1174658	A	G	3587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=38;PP=2941;ReadPosRankSum=2.030;SC=CATTTGAAAAAACTGTCCAGG;SOR=1.423;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=69;TCR=40;TR=106;WE=183617113;WS=183617095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,109:0.98:111
chr1	183852914	rs10797919	G	C	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.270;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=378;ReadPosRankSum=-1.863;SC=TTCCATATGTGAACAGATGGG;SOR=0.427;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=62;TCF=50;TCR=12;TR=20;WE=183852922;WS=183852904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,22:0.33:66
chr1	183861007	rs3814329	G	A	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=146;ReadPosRankSum=-0.842;SC=TCTCTCCACAGGGGTGGCCAA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=183861029;WS=183861003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr1	183861021	rs75352181	C	T	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=245;ReadPosRankSum=0.226;SC=TGGCCAAGTCCACCTTAAAAG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=183861029;WS=183861003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	183866849	rs12031722	G	T	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.001;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=3;PP=798;ReadPosRankSum=-0.933;SC=CGAGAGTTATGCAGGGTTGTG;SOR=1.254;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=111;TCF=98;TCR=13;TR=42;WE=183866857;WS=183866839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,44:0.40:110
chr1	183871637	rs4604659	G	A	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.561;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=282;ReadPosRankSum=1.458;SC=TGTGACCTACGACAACATATG;SOR=1.162;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=15;WE=183871645;WS=183871627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,16:0.33:49
chr1	183876182	rs11591089	C	T	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.602;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=43;PP=1098;ReadPosRankSum=-0.882;SC=CAGCTGCTGACGCCAGCACCA;SOR=0.605;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=193;TCF=61;TCR=132;TR=63;WE=183876190;WS=183876172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,66:0.33:199
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chr1	183895435	rs4382680	A	C	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=29;PP=750;ReadPosRankSum=0.546;SC=GAAGGGAGGGACCAGTGGCCC;SOR=0.616;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=5;TCR=52;TR=32;WE=183895443;WS=183895425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
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chr1	183913540	rs17504460	C	T	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=77;ReadPosRankSum=0.775;SC=TAAAAAGTCACGAGTCTAGTA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=6;WE=183913548;WS=183913530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr1	183942950	rs2296714	C	T	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=37;PP=890;ReadPosRankSum=0.077;SC=GAGAATAACCCAGCCCTTCTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=0;TCR=52;TR=37;WE=183942958;WS=183942940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,37:0.67:55
chr1	183944089	rs2077202	A	C	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=300;ReadPosRankSum=-0.791;SC=CAAAAATTTCATTGTGCCTTT;SOR=0.776;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=13;WE=183944097;WS=183944082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr1	183944444	rs2378795	C	T	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=299;ReadPosRankSum=-0.817;SC=TTCTATCAATCCCAGGAAGTA;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=13;WE=183944452;WS=183944434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr1	183947757	rs3833521	G	GA	190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=167;ReadPosRankSum=1.410;SC=GCTACTCCTGGAAAAAAAATT;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=10;WE=183947765;WS=183947747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr1	184006128	rs74767794	A	G	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=252;SC=CCGCCCCTCCAGCGGCTCCCT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=184006136;WS=184006120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	184006513	.	C	A	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.561;HP=6;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=159;ReadPosRankSum=-0.488;SC=AGGCGGGCGGCGGGGAAGTCC;SOR=2.303;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=9;WE=184006521;WS=184006503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr1	184006549	rs114661926	C	G	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=12;PP=401;SC=GCTGGGCTGCCTGAGGGCGGC;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=184006557;WS=184006539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	184020945	rs2274432	G	A	2184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=16;PP=1730;SC=CTGGGTCCGGGCGGTGTTCGC;SOR=2.439;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=52;TCR=16;TR=67;WE=184020953;WS=184020935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	184023529	rs1046934	A	C	6496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=146;NR=54;PP=2965;SC=ATGCCACCCAAGTTTATGTAG;SOR=1.975;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=200;TCF=146;TCR=54;TR=200;WE=184023537;WS=184023519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr1	184042058	rs11549003	T	C	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.032;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=408;ReadPosRankSum=-0.215;SC=ATCTTTTATCTCAGAAATAGG;SOR=0.278;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=20;WE=184042066;WS=184042048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr1	184476621	rs9633308	T	C	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=260;ReadPosRankSum=-0.530;SC=AGGCCACAGGTGAAAGGGTCT;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=11;WE=184476629;WS=184476611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr1	184662181	rs1061508	C	T	2150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.136;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=10;PP=1648;ReadPosRankSum=-1.011;SC=AACCACAGTTCTATCATGGCT;SOR=1.026;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=114;TCF=96;TCR=18;TR=71;WE=184662189;WS=184662171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,76:0.63:120
chr1	184663581	rs9425634	T	C	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=469;ReadPosRankSum=-0.055;SC=CAGAGGATGGTTGTTCTTCAT;SOR=1.247;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=22;WE=184663589;WS=184663571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,23:0.68:34
chr1	184663643	rs34236444	TA	T	197.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=205;ReadPosRankSum=0.391;SC=GCTACTTCTCTAAAAAAATGT;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=9;WE=184663651;WS=184663633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr1	184671909	rs10911637	C	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=171;ReadPosRankSum=0.140;SC=ATTAATATTACGCTGCATAAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=184671917;WS=184671899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr1	184677464	rs3736757	G	A	2025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.301;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=57;PP=1652;ReadPosRankSum=-0.085;SC=CTTCAGCGTCGATTGAACTAG;SOR=1.426;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=106;TCF=28;TCR=78;TR=74;WE=184677472;WS=184677454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,72:0.70:103
chr1	184681081	rs7525074	A	G	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.698;NF=0;NR=34;PP=839;ReadPosRankSum=-0.276;SC=TTTTTTTTGAAATGGAGTCTC;SOR=1.436;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=34;WE=184681089;WS=184681071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,33:0.65:51
chr1	184688237	rs61823883	C	T	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=274;ReadPosRankSum=-1.402;SC=TATATGTGTACGTGTGTGTGT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=13;WE=184688245;WS=184688227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr1	184695571	rs10752941	C	T	1278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=40;PP=998;ReadPosRankSum=0.976;SC=AGACAATGACCTTCTGATAAG;SOR=1.850;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=0;TCR=57;TR=40;WE=184695579;WS=184695561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,43:0.70:61
chr1	184702008	rs41264582	G	A	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=17.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.627;SOR=1.984;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,44:0.24:182
chr1	184706212	rs10711907	GT	G	1602.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.945;NF=7;NR=32;PP=1423;ReadPosRankSum=0.586;SC=AGAAACAAGCGTTAACAAGAT;SOR=0.701;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=61;TCF=13;TCR=48;TR=39;WE=184706220;WS=184706202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,50:0.70:71
chr1	184706306	rs16823413	G	A	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=301;ReadPosRankSum=-0.833;SC=CTATAAATTAGTACTTCCATG;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=14;WE=184706314;WS=184706296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr1	184718601	rs16823421	G	A	369.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=326;ReadPosRankSum=-0.579;SC=TGTATTGTAGGTTTCAAAATT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=13;WE=184718609;WS=184718591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr1	184718750	rs35957626	GAAA	G	314.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.21;ReadPosRankSum=0.158;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
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chr1	184863330	rs78908040	G	A	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.988;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=542;ReadPosRankSum=1.160;SC=AGTTCCAGGCGCCAATGGTGG;SOR=0.485;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=80;TCF=17;TCR=63;TR=34;WE=184863338;WS=184863320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,37:0.44:85
chr1	184868251	rs3753575	G	A	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.811;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=3;PP=1020;ReadPosRankSum=-0.497;SC=TCAGAAATACGGCTGTGCTAT;SOR=1.503;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=68;TCF=63;TCR=5;TR=45;WE=184868259;WS=184868241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,45:0.64:70
chr1	185061018	rs12408074	G	A	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.24;NF=3;NR=10;PP=309;SC=CACGATCTTGGCTCACTGCAA;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=185061026;WS=185061008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	185094277	rs7523448	G	T	759.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.163;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=579;ReadPosRankSum=0.236;SC=AACTGGGTTTGAAAAATGTTT;SOR=2.066;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=26;WE=185094285;WS=185094267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,27:0.93:29
chr1	185119794	rs1544051	C	T	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=591;SC=GTAATTGTTGCAGCACATGAT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=185119802;WS=185119784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	185135745	rs950327	A	G	2032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=43;PP=1648;SC=CTACTAGTTCATCTTCTATAA;SOR=1.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=26;TCR=44;TR=69;WE=185135753;WS=185135735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	185137454	rs58809696	T	TAAATGATAGAC	2415.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=10;PP=2979;SC=TTATGTGTCCTTTTTTTATTT;SOR=0.929;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=14;WE=185137472;WS=185137444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	185137461	rs56166198	A	T	2086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=10;PP=422;SC=TCCTTTTTTTATTTATTTCAG;SOR=0.976;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=15;WE=185137472;WS=185137444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	185137464	.	T	TAA	2085.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=731;SC=TTTTTTTATTTATTTCAGAAA;SOR=0.976;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=13;WE=185137472;WS=185137444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	185137628	rs10797999	C	T	219.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=149;SC=AAGAGGACTGCTTTGCATGCA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=185137636;WS=185137618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	185143721	rs10489579	A	G	4034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=49;PP=2965;SC=TGACCATGGAATTAAAAGCCT;SOR=1.143;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=70;TCR=49;TR=119;WE=185143729;WS=185143711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	185144347	rs6696591	T	G	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.29;QD=29.37;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	185153545	rs76544683	G	GT	909.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=20;PP=876;SC=TAACAATGATGGGCTTTTTTT;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=185153553;WS=185153535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	185171869	rs6698109	A	G	3542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=57;PP=2523;SC=GAGTTATTACACTTATCTCTG;SOR=0.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=56;TCR=57;TR=113;WE=185171877;WS=185171859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	185176015	rs2146328	A	G	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=356;SC=AATCATTTATACTTCTAATTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=185176023;WS=185176005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	185240474	rs12041704	A	G	2739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=52;PP=2152;SC=CCCAAACAGTAATTATCAAGA;SOR=1.501;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=28;TCR=52;TR=80;WE=185240482;WS=185240464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	185259731	rs2378909	A	G	1282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=1;PP=1175;SC=ATTAAAATGTAAAATAAAATG;SOR=5.031;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=36;WE=185259739;WS=185259721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	185267114	rs10174	A	G	2121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=1;PP=1805;SC=GTGTACCTCTACTAACCATAA;SOR=6.837;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=59;TCF=58;TCR=1;TR=59;WE=185267122;WS=185267104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	185984517	rs6665753	T	C	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.705;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=37;PP=851;ReadPosRankSum=-0.401;SC=ATACGTGTCATGTAGCCAATG;SOR=0.565;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=41;TCR=92;TR=54;WE=185984525;WS=185984507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,57:0.42:137
chr1	185988567	rs11290212	CT	C	250.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=172;ReadPosRankSum=1.907;SC=TAGGGATTTGCTTTTTTTTTT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=13;WE=185988575;WS=185988558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr1	186022032	rs10911808	T	G	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=4.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=0;PP=790;ReadPosRankSum=2.086;SC=TAAACTGTTATGAGAATTCTA;SOR=1.390;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=29;WE=186022040;WS=186022022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr1	186026474	rs12129650	T	C	3643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.045;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=62;PP=2873;ReadPosRankSum=-0.697;SC=CTGCCTTCCATAACCTGGTTC;SOR=0.788;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=218;TCF=116;TCR=102;TR=134;WE=186026482;WS=186026464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,139:0.61:228
chr1	186030902	rs10737266	G	T	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=432;ReadPosRankSum=0.747;SC=AATTTTTACCGAAATTGAGCA;SOR=1.044;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=17;WE=186030910;WS=186030892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr1	186031041	rs7522627	C	T	2037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.849;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=44;PP=1577;ReadPosRankSum=0.073;SC=AATATACTTGCGTTGTAAGGA;SOR=0.854;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=113;TCF=52;TCR=61;TR=78;WE=186031049;WS=186031031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,82:0.69:119
chr1	186039006	rs761905	C	T	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=384;ReadPosRankSum=1.596;SC=TTTATACTCACCATTAAAGAC;SOR=1.893;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=15;WE=186039014;WS=186038996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
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chr1	186055371	rs6425017	A	G	1474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=13;PP=1104;ReadPosRankSum=-0.724;SC=TATATTTACTATTATAGTTCC;SOR=0.701;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=64;TCR=21;TR=53;WE=186055379;WS=186055361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,55:0.63:87
chr1	186057181	rs10911816	T	C	3229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=62;PP=2476;ReadPosRankSum=-1.718;SC=CTTTTTCCCCTAGATATGCAA;SOR=0.769;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=67;TCR=99;TR=104;WE=186057189;WS=186057171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,114:0.63:182
chr1	186064760	rs1022671	A	T	952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.37;ReadPosRankSum=0.869;SOR=1.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,40:0.65:62
chr1	186077463	rs1555495	A	G	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=313;ReadPosRankSum=-0.191;SC=GTTTGTAATTATCTAGGCTAT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=16;WE=186077471;WS=186077454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr1	186081918	rs7555520	C	T	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.533;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=10;PP=861;ReadPosRankSum=1.331;SC=ATTTTAACGGCAAATTTCTTT;SOR=1.283;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=81;TCF=60;TCR=21;TR=46;WE=186081926;WS=186081908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,46:0.57:81
chr1	186086578	rs10157742	G	A	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=2.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.39;ReadPosRankSum=-1.227;SOR=1.065;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,49:0.60:82
chr1	186113852	rs17531405	G	C	3752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=91;PP=2771;ReadPosRankSum=-0.354;SC=GTTGGAAATAGTGAGTCAACA;SOR=0.699;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=183;TCF=53;TCR=130;TR=127;WE=186113860;WS=186113842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,135:0.71:191
chr1	186135231	rs78002252	A	C	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.69;ReadPosRankSum=-0.755;SOR=1.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr1	186135236	rs6425021	G	A	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.35;ReadPosRankSum=-0.434;SOR=1.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr1	186141301	rs4651302	G	A	3243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=83;PP=2413;ReadPosRankSum=0.103;SC=AGATCAGTTTGCCGTCAACAA;SOR=0.652;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=172;TCF=53;TCR=119;TR=120;WE=186141309;WS=186141291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,125:0.69:180
chr1	186151493	rs16825040	C	G	1583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=44;PP=1227;ReadPosRankSum=-0.577;SC=AGTTTTTTTTCAATAATCATT;SOR=0.788;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=78;TCF=15;TCR=63;TR=54;WE=186151501;WS=186151483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,56:0.69:81
chr1	186265948	rs1293987	T	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=2.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.11;ReadPosRankSum=1.140;SOR=1.577;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,15:0.22:68
chr1	186270894	rs1547084	A	G	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.548;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=25;PP=611;ReadPosRankSum=-1.980;SC=AGATCTGTGCACCTACCTTAG;SOR=1.739;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=66;TCF=18;TCR=48;TR=31;WE=186270902;WS=186270884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr1	186273994	rs2273779	C	T	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.572;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=18;PP=1065;ReadPosRankSum=0.037;SC=TTCAACAATTCGGAAAATCAA;SOR=1.311;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=90;TCF=53;TCR=37;TR=52;WE=186274002;WS=186273984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,52:0.58:90
chr1	186276661	rs61831150	A	G	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.052;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.971;NF=25;NR=32;PP=964;ReadPosRankSum=-0.099;SC=TGCACCCACCACTCCCAAAGA;SOR=0.815;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=88;TCF=40;TCR=48;TR=57;WE=186276669;WS=186276651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,58:0.67:86
chr1	186277088	rs68069719	G	C	8480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=117;NR=148;PP=2965;SC=TCCACCACCTGTGACAAGCCC;SOR=1.002;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=267;TCF=118;TCR=149;TR=265;WE=186277096;WS=186277078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr1	186277989	rs3737940	A	G	6488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.388;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=137;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.155;SC=TGAGAAAACCAAAGACGACAC;SOR=0.665;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=373;TCF=160;TCR=213;TR=240;WE=186277997;WS=186277979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,246:0.64:383
chr1	186282016	rs80196755	C	A	1759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.771;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=39;PP=1348;ReadPosRankSum=-0.097;SC=ATTACTATGCCTTTTCTAAAG;SOR=0.579;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=104;TCF=38;TCR=66;TR=64;WE=186282024;WS=186282006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,67:0.62:108
chr1	186305914	rs12085497	A	C	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5021;FS=3.736;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=265;ReadPosRankSum=-1.015;SC=TAACTTATTAATTTGCTTTTT;SOR=2.494;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=11;WE=186305922;WS=186305904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr1	186310524	.	A	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=131;ReadPosRankSum=-0.894;SC=GCAGTTACCTAAACATTTCAA;SOR=0.307;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=8;WE=186310532;WS=186310514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr1	186313249	rs2950829	A	G	4642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=114;PP=2965;SC=TATCAGAATAACAGATTTTCC;SOR=3.500;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=16;TCR=114;TR=130;WE=186313257;WS=186313239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr1	186316656	rs3753564	G	C	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=44;PP=1149;ReadPosRankSum=-1.274;SC=CTGTTATAAAGAGCTTATGAA;SOR=2.265;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=0;TCR=59;TR=44;WE=186316664;WS=186316646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,46:0.75:61
chr1	186329869	rs2026187	C	G	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.510;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=856;ReadPosRankSum=0.012;SC=AGTATTTCAACTCACTAACAA;SOR=0.361;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=40;WE=186329877;WS=186329859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,38:0.75:51
chr1	186330643	rs10494586	T	C	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=652;ReadPosRankSum=-2.610;SC=TACCTAATTCTGTCCCAAATA;SOR=1.788;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=26;WE=186330651;WS=186330633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,28:0.70:40
chr1	186352347	rs4651309	A	T	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.291;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=373;ReadPosRankSum=1.444;SC=GCTAGAATCAAGAAGATTTAG;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=16;WE=186352355;WS=186352337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr1	186357523	rs1290390	T	C	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=3;PP=488;SC=TCAACACTCATCTTTTTTTTT;SOR=2.531;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=186357531;WS=186357513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr1	186363119	rs12084264	C	G	1259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.233;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=987;ReadPosRankSum=0.369;SC=ACTAGTCATTCTTTTGATGTC;SOR=1.024;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=57;TCF=23;TCR=34;TR=44;WE=186363127;WS=186363109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,46:0.78:59
chr1	186418600	rs12407957	C	T	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=518;ReadPosRankSum=1.674;SC=ATTTTAGGGACTGGATTTGAT;SOR=0.582;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=27;WE=186418608;WS=186418590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr1	186645488	rs4648276	A	G	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.352;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=1;PP=711;ReadPosRankSum=1.986;SC=TGTATATAGAATGTGTGAGTT;SOR=2.406;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=46;TCF=42;TCR=4;TR=27;WE=186645496;WS=186645478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr1	186645927	rs2066826	C	T	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=420;ReadPosRankSum=0.603;SC=TGGGTATAAGCGGTAATAACT;SOR=1.106;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=21;WE=186645935;WS=186645917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,23:0.77:30
chr1	186649221	rs2745557	A	G	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=451;ReadPosRankSum=-0.809;SC=AGTTCTTTCGAACTCTAGCGG;SOR=0.643;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=20;WE=186649229;WS=186649211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr1	186823456	rs143655675	T	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.61;ReadPosRankSum=0.110;SOR=0.980;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,12:0.21:57
chr1	186901738	rs12720584	TTCTTCTTTTAAAA	T	247.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=1735;ReadPosRankSum=-0.506;SC=CGGCCTTATTTTCTTCTTTTA;SOR=1.347;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=5;WE=186901758;WS=186901728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr1	186908385	rs2307200	C	T	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=349;ReadPosRankSum=-0.252;SC=TCAATCTACACTGCTTTTATA;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=15;WE=186908393;WS=186908375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr1	186919732	rs4650709	A	T	2069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.34;SOR=6.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	186919993	rs969357	G	A	3654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=108;PP=2965;ReadPosRankSum=0.655;SC=GTAGCTTTCTGTTGAGAGAGA;SOR=4.407;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=5;TCR=109;TR=113;WE=186920001;WS=186919983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr1	186925168	rs5007825	A	G	1169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.71;QD=37.73;SOR=5.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	186925168	.	AG	GG,GT	337	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=24;MQ=58.25;NF=25,16;NR=1,0;PP=146,337;QD=6.95273894412;SC=CACCGTGCCCAGCCCAAAGAT;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=26,16;WE=186925177;WS=186925165;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.93:28
chr1	186925169	rs35183959	G	T	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=4.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQRankSum=1.067;QD=16.38;ReadPosRankSum=-0.155;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr1	186925194	rs5007824	T	C	1316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=1;PP=1091;SC=TTTAAACATGTATTTTGGAGT;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=37;WE=186925202;WS=186925184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	186925552	rs2307199	T	C	3013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=80;PP=2462;SC=GCATTTTAATTATTATTAACA;SOR=5.307;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=84;TCF=3;TCR=81;TR=83;WE=186925560;WS=186925542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	186946912	rs2307198	G	A	3362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=81;PP=2711;SC=AGAAAGTACAGGGCTCCAGGT;SOR=3.193;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=14;TCR=81;TR=95;WE=186946920;WS=186946902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	187610698	rs10157987	C	A	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.233;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=797;ReadPosRankSum=-0.474;SC=GAAACCATGCCCCCACCCCTA;SOR=0.515;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=127;TCF=76;TCR=51;TR=53;WE=187610706;WS=187610688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,56:0.42:134
chr1	187610777	rs61822202	C	G	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.479;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=806;ReadPosRankSum=1.035;SC=CTGCCACTGTCCCCTCCCTGC;SOR=0.507;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=128;TCF=69;TCR=59;TR=42;WE=187610785;WS=187610767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,41:0.32:130
chr1	187610852	rs10159182	A	C	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=6.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.585;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=638;ReadPosRankSum=1.070;SC=CCATGTGCCCATGGAATCTCC;SOR=0.555;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=122;TCF=65;TCR=57;TR=34;WE=187610860;WS=187610842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,35:0.27:128
chr1	192128183	rs4454527	G	A	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=0;PP=747;ReadPosRankSum=-0.544;SC=AAACATTTTCGTATGTTACCC;SOR=1.954;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=31;WE=192128191;WS=192128173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,31:0.72:43
chr1	192129370	rs4329489	G	A	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=0.366;SC=TAATGTAAATGCAATTTTCAT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=192129378;WS=192129360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr1	192129667	rs143042454	CTGAT	C	718.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.765;NF=0;NR=15;PP=669;ReadPosRankSum=0.394;SC=AAATTTTTGTCTGATTGTTAA;SOR=0.643;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=15;WE=192129678;WS=192129657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr1	192335271	rs59139714	C	CTAAT	2022.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=33;PP=2053;SC=TAAAAGTTAACTAATCACTAT;SOR=4.317;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=34;WE=192335279;WS=192335261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	192544795	rs2984920	A	G	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=1;PP=638;SC=CACCAAGAAAAGGGGAACTTC;SOR=4.294;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=192544803;WS=192544785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	192545099	rs7535818	G	A	2356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=67;PP=1878;ReadPosRankSum=1.294;SC=ATTTTAACAAGTTATCTTTAA;SOR=4.407;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=3;TCR=69;TR=70;WE=192545107;WS=192545089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,74:0.99:75
chr1	193039658	.	CT	C	92.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=2.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.41;ReadPosRankSum=1.971;SOR=0.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,16:0.24:66
chr1	193051685	rs2275444	G	A	1484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=6;PP=1209;SC=CTTTTGTTCCGAATTAGATCC;SOR=3.306;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=45;WE=193051693;WS=193051675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	193054154	rs10921309	G	A	1575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=27;PP=1277;SC=TGAATAATACGTGTGTACCTA;SOR=0.952;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=20;TCR=27;TR=47;WE=193054162;WS=193054144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	193074371	rs10801175	A	G	200.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=148;SC=ACGCCGCGGCACTCCTGCCCG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=193074379;WS=193074361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	193074651	rs10921310	T	A	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=14;PP=645;SC=GGTCACCTCCTCGCAGCTGAG;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=25;TCF=11;TCR=14;TR=24;WE=193074659;WS=193074641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	193090865	rs10737621	C	A	4553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=69;NR=76;PP=2965;SC=GGTACGCGCGCACCTGACGCC;SOR=0.883;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=69;TCR=77;TR=145;WE=193090873;WS=193090855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	193094375	rs4466634	T	C	3484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=89;PP=2928;SC=TACTTATCTATCTATTTATCA;SOR=4.283;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=10;TCR=89;TR=99;WE=193094383;WS=193094365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr1	193104827	rs10921318	G	A	182.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=147;SC=TTTTTTTCTGGAAAAATTTTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=193104835;WS=193104817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	193105537	rs142142810	TA	T	32.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.91;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr1	193111228	rs147167392	TGA	T	42.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.02;ReadPosRankSum=-0.591;SOR=0.141;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,6:0.14:42
chr1	193202001	rs10921328	C	G	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.16;QD=25.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	193205272	rs3738244	T	A	2149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=15;PP=1693;SC=ATAAGACTCTTTCACATGAAT;SOR=2.200;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=49;TCR=15;TR=64;WE=193205280;WS=193205262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	193218843	rs11583414	C	G	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=1;PP=1057;ReadPosRankSum=-1.199;SC=GATAACTTCTCTCCACCCTCT;SOR=1.032;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=54;TCR=1;TR=41;WE=193218851;WS=193218833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,43:0.74:58
chr1	196227526	rs977157	A	G	2322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=39;PP=1921;SC=GGTCCGACTGATCACTGGATG;SOR=0.934;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=34;TCR=40;TR=73;WE=196227534;WS=196227516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	196242764	rs558895	T	G	951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=24;PP=693;SC=ATTTCTCGTATGGCTTTTGAA;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=196242772;WS=196242754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	196251522	rs2477357	T	C	1246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.63;SOR=4.921;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	196254970	rs2477360	C	T	3509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=100;PP=2939;SC=TGTTGACATACGTAAAAAGTT;SOR=7.073;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=102;TCF=2;TCR=100;TR=102;WE=196254978;WS=196254960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	196311513	rs6658788	G	A	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=219;ReadPosRankSum=-0.650;SC=GTCTGAAGATGACATTATATG;SOR=0.576;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=12;WE=196311521;WS=196311503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr1	196395023	rs74382287	A	G	5041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.591;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=89;PP=2962;ReadPosRankSum=1.404;SC=CTGAACCTTGAAGGTAGATAA;SOR=0.629;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=261;TCF=131;TCR=130;TR=173;WE=196395031;WS=196395013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,180:0.67:269
chr1	196398619	rs1538684	T	C	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=294;ReadPosRankSum=1.494;SC=GTTAGATAAATAAGCCACTTT;SOR=0.234;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=52;TCR=0;TR=16;WE=196398627;WS=196398609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,18:0.33:54
chr1	196398974	rs12121250	T	A	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-4.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=288;ReadPosRankSum=-1.374;SC=CCAAAGCACATTTCATAAAGC;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=15;WE=196398982;WS=196398964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr1	196461513	rs4607811	C	T	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=368;SC=ATGCAAGCAACCATATCTTTA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=196461521;WS=196461503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	196654324	rs1061147	A	C	9639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.284;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=157;NR=141;PP=2965;ReadPosRankSum=1.927;SC=GAAATACAGCAAAATGCACAA;SOR=0.434;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=300;TCF=158;TCR=142;TR=298;WE=196654332;WS=196654314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,310:1.00:311
chr1	196658497	rs482934	G	T	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=3;PP=914;SC=TCTAATATGAGTGTTTATTAC;SOR=4.235;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=33;WE=196658505;WS=196658487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	196658905	rs12029785	G	A	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=21;PP=570;SC=TATTATGAGGGTTTCTTCTTG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=196658913;WS=196658895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	196659237	rs1061170	C	T	3953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.99;NF=82;NR=38;PP=2965;SC=TAATCAAAATCATGGAAGAAA;SOR=1.769;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=82;TCR=38;TR=120;WE=196659245;WS=196659227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	196682947	rs2274700	G	A	5986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=134;NR=53;PP=2965;SC=AAGAAAAAGCGAAATATCAAT;SOR=1.938;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=134;TCR=53;TR=187;WE=196682955;WS=196682937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr1	196684574	rs6664877	CA	TG	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;JOINED;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=280;SC=TTTACGACAACAAATTCTCAC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=196684583;WS=196684567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	196684625	rs203674	G	T	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=400;SC=TTTATTAGTAGATCTAATCAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=196684633;WS=196684615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	196705926	rs375046	C	A	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.61;SOR=6.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	196710916	rs16840522	T	C	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=574;SC=ATTGATTCTATATATCGCTAT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=196710924;WS=196710911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	196874356	rs10801578	G	T	6066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=118;NR=70;PP=2965;SC=CAACAGCAGAGGGAAATTCTT;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=118;TCR=70;TR=188;WE=196874364;WS=196874346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
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chr1	196887181	rs1971579	T	G	149.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=88;SC=TATTATATTTTTGAAATGCTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=196887189;WS=196887171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	196887274	rs3795341	G	A	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.168;NF=15;NR=2;PP=332;ReadPosRankSum=2.244;SC=TACTCATTAGGATGCATTTTA;SOR=0.719;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=17;WE=196887282;WS=196887264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr1	196920178	rs3828032	C	T	3447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.887;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=74;PP=2640;ReadPosRankSum=-0.720;SC=ATGTTGTTCTCTCAGATGCTG;SOR=1.546;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=35;TCR=74;TR=108;WE=196920186;WS=196920168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,113:0.99:114
chr1	196926956	rs3748556	C	T	1941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=5;PP=1541;SC=GCCTTGTTTGCATTTGCCTTA;SOR=4.548;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=55;TCR=5;TR=60;WE=196926964;WS=196926946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	196926973	rs3748555	C	A	2730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=10;PP=2209;SC=CTTATTTGAACTTGTATTTTT;SOR=3.860;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=71;TCR=10;TR=81;WE=196926981;WS=196926963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	196928188	rs41310132	A	G	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.265;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=444;ReadPosRankSum=0.188;SC=AAACTGGTATATCCCAGTTGT;SOR=1.519;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=33;TCF=14;TCR=19;TR=21;WE=196928196;WS=196928178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr1	196951925	rs76977292	A	G	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=0.089;SC=ATGAAAAACAAAACTATAAAT;SOR=0.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=5;WE=196951933;WS=196951915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr1	197008597	rs5990	A	C	1734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.548;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=39;PP=1393;ReadPosRankSum=-0.804;SC=TCAGGTGTTAATTACAATCTC;SOR=1.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=18;TCR=40;TR=56;WE=197008605;WS=197008587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr1	197009798	rs5998	A	G	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=9;PP=536;SC=TGTGTGGTCTATTGTCAAAAT;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=20;WE=197009806;WS=197009788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	197026672	rs1759009	A	G	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=9;PP=225;SC=AATATTCATCATGTCAAGCAT;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=197026680;WS=197026662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	197029345	rs1332661	G	A	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=285;SC=AAAGATTGCTGAAAATAGCAC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=197029353;WS=197029335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	197030201	rs5997	T	C	2935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=102;PP=2503;SC=GAGCCAAACATGTTTCTAAAA;SOR=6.518;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=105;TCF=3;TCR=102;TR=105;WE=197030209;WS=197030191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	197030237	rs17549277	CT	C	1193.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.42;QD=27.76;SOR=7.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	197031021	rs6003	C	T	3710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=80;PP=2791;ReadPosRankSum=-0.799;SC=GCAACCATAACGCATGTTCTC;SOR=0.743;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=117;TCF=35;TCR=82;TR=115;WE=197031029;WS=197031011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,122:0.99:123
chr1	197053373	rs12677	G	A	1446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=0;PP=1177;SC=AGTTGTACACGGAGAGCAAAA;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=41;WE=197053381;WS=197053363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	197053561	rs200839523	T	TA	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=0.571;QD=0.88;ReadPosRankSum=0.145;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,7:0.20:35
chr1	197055925	rs10754213	T	C	1211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=14;PP=948;SC=CTATATTTAATTGCTTACCTT;SOR=1.292;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=39;WE=197055933;WS=197055915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	197059878	rs4915315	G	A	1173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=0;PP=995;SC=CGGCTAATGCGTTAGCTTTTT;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=35;WE=197059900;WS=197059868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	197059892	rs10754214	A	G	1315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=0;PP=1137;SC=GCTTTTTAAAATGGTAACTAT;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=37;WE=197059900;WS=197059868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	197059928	rs4915316	A	G	2169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=0;PP=1783;SC=GATATCATGTAGATGAATTGC;SOR=8.287;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=58;TCR=0;TR=58;WE=197059936;WS=197059918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	197070815	rs1412640	T	C	4546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=61;PP=2965;SC=TTTCTCTTTGTAATTTTGCAG;SOR=0.871;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=133;TCF=71;TCR=62;TR=132;WE=197070823;WS=197070805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr1	197070901	rs964201	A	G	4562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=64;PP=2965;SC=TATGTTCTGTACATCCTGAAA;SOR=0.796;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=71;TCR=64;TR=135;WE=197070909;WS=197070891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr1	197091537	rs4915337	A	T	3410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=27;PP=2732;ReadPosRankSum=-0.770;SC=ATGCTTTAAGAGACATATCCA;SOR=1.022;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=104;TCF=77;TCR=27;TR=102;WE=197091545;WS=197091527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,108:0.99:109
chr1	197094030	rs6676084	C	T	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=1;PP=657;SC=TCCAAAGCAACCTGAGAGTTT;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=197094038;WS=197094020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	197101621	rs3737111	T	C	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=459;SC=AATACACTTATAGTCTTAAAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=197101629;WS=197101611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	197104149	rs35659894	TA	T	783.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=853;SC=TATGTATAATTAAAGAATGAC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=22;WE=197104157;WS=197104139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	197109042	rs1332663	C	T	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=543;SC=CATTAAAATACAAATTCCCTA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=197109050;WS=197109032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	197112533	rs6677082	G	A	6029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=66;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.761;SC=TAACATTTACGGAATTAAAGG;SOR=0.476;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=111;TCR=66;TR=175;WE=197112541;WS=197112523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,185:0.99:186
chr1	197113073	rs1571964	G	A	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=28;NR=10;PP=931;SC=ATCACAGAATGGTTAAAACAT;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=38;WE=197113081;WS=197113063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	197141243	rs6428389	A	C	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=3;PP=411;SC=CACTATATATATCTCTCTCTA;SOR=2.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=18;WE=197141251;WS=197141233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	197316435	rs1337167	T	C	2707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=10;PP=2184;SC=TCAATATGACTAAGAGTTGAC;SOR=3.834;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=71;TCR=10;TR=81;WE=197316443;WS=197316425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	197325908	rs2786098	T	G	2297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=8;PP=1791;SC=AGGCAAATGCTCTATAATTCA;SOR=3.808;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=81;TCF=72;TCR=9;TR=79;WE=197325916;WS=197325898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	197390368	rs3902057	A	G	4084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=74;PP=2965;SC=TCAGCTGCCTATGTCCATCTG;SOR=1.135;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=51;TCR=74;TR=125;WE=197390376;WS=197390358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	197407942	rs980371	A	G	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=340;SC=TTCAGACAGAATGAAACAATA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=197407950;WS=197407932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	197482167	rs2013617	C	G	980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=25;PP=734;SC=AATGTGATTTCATAAGAAACA;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=197482175;WS=197482157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	197510025	rs3902061	G	T	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=599;SC=TTCTAATTTGGAAGTATAAAC;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=197510033;WS=197510015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	197510299	rs3850628	G	A	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=393;SC=TCAGGGATACGCATATCACTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=197510307;WS=197510289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	197515253	rs11276673	ATGTTCAG	A	458.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=580;SC=AAATTATTTCATGTTCAGTGT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=197515267;WS=197515243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	197515715	rs4303099	G	A	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=53;SC=AACTATAAACGTAAAATAAGA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=197515723;WS=197515705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	197515777	rs4316386	A	T	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=3;PP=920;SC=TCAAATAAACAGCATAAGTAT;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=36;WE=197515785;WS=197515767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	197576307	rs11411505	A	AT	503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=611;SC=TTCACTCTCTATAAAAAAAAC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=197576315;WS=197576297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	197741951	rs2477067	C	A	1719.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=11;PP=1748;SC=GATCTTGTCCCAAAAAAAAGA;SOR=2.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=53;TCR=11;TR=64;WE=197741959;WS=197741941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr1	197742171	rs2488396	C	T	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=503;SC=ATACATTTCACGTGACTGTAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=197742179;WS=197742161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	197744098	rs117405403	G	C	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=1;PP=109;SC=GCCTAGCGCCGTCCCGCCGGC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=197744106;WS=197744093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	197872019	rs4539165	G	T	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.207;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=261;ReadPosRankSum=1.113;SC=GACAGATCGCGGAGCTGCACG;SOR=0.478;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=59;TCF=14;TCR=45;TR=17;WE=197872027;WS=197872009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,17:0.27:64
chr1	197876533	rs1546244	C	A	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=554;SC=GCACATTGATCGTTATTTTCC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=197876541;WS=197876523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	197890422	rs12122995	C	G	2904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=6;PP=2495;SC=TGACTCAACTCTTTCCTTCCA;SOR=4.855;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=79;TCR=6;TR=85;WE=197890430;WS=197890412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	197898023	rs10664707	C	CAA	825.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.6815;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;NF=27;NR=0;PP=269;SC=AAACCTATATCAAAAAAAAAA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=27;WE=197898031;WS=197898013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	198687114	rs34800651	AC	A	643.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=908;ReadPosRankSum=-0.579;SC=CTTATTTATAACCCCCAAGCT;SOR=1.931;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=16;WE=198687133;WS=198687104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr1	198687125	rs12407767	A	G	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=1000;ReadPosRankSum=-0.663;SC=CCCCCAAGCTAACACTTAAAA;SOR=2.226;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=22;WE=198687133;WS=198687104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,22:0.76:29
chr1	198701289	rs1932433	T	C	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=167;ReadPosRankSum=1.549;SC=ATCTTAATTTTGATTACTCTA;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=198701297;WS=198701286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr1	199998304	rs60535681	G	A	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-6.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.079;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=60;PP=1094;ReadPosRankSum=2.359;SC=CGCGTCCGGGGCCGCAGCTAG;SOR=1.900;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=190;TCF=3;TCR=187;TR=60;WE=199998312;WS=199998294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,61:0.31:194
chr1	200013123	rs2737636	C	A	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.171;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=363;ReadPosRankSum=-0.628;SC=TTTAAAGACTCAACTAAAAAT;SOR=0.246;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=56;TCF=4;TCR=52;TR=18;WE=200013131;WS=200013113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr1	200014762	rs2817008	A	G	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=440;ReadPosRankSum=-0.013;SC=CAAGGACATGAACTGTAAAAC;SOR=2.595;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=3;TCR=43;TR=20;WE=200014770;WS=200014752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr1	200014790	rs2817009	A	G	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=242;ReadPosRankSum=-0.667;SC=TACTTATAGCATGGTAACATT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=13;WE=200014798;WS=200014780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr1	200017586	rs2821368	C	G	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=8.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.03;ReadPosRankSum=-0.584;SOR=1.350;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,51:0.29:178
chr1	200080462	rs111949351	A	AT	580.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=285;ReadPosRankSum=-0.766;SC=GAGTGTAGAGACCAAAAAAAA;SOR=1.244;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=5;WE=200080472;WS=200080452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
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chr1	200143281	rs1060060	C	T	3568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=59;PP=2781;SC=AGCACCTGAACGGGGATGTGC;SOR=0.798;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=53;TCR=59;TR=112;WE=200143289;WS=200143271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	200143442	rs1060061	T	C	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=106;ReadPosRankSum=-0.520;SC=CTGCTCCAAGTAACGCTAATT;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=7;WE=200143450;WS=200143432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr1	200182654	rs6427805	T	C	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.99;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	200182654	.	TCGGAACGACC	CCGGAACGACC,CCGGAACGACT	192	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=17;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=13,7;NR=4,2;PP=111,192;QD=8.57477720866;SC=TCTCCTTCCGTCGGAACGACC;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17,9;WE=200182672;WS=200182644;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:17
chr1	200182664	rs6427806	C	T	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.27;ReadPosRankSum=-0.327;SOR=0.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr1	200182721	rs61826220	G	C	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.09;ReadPosRankSum=2.330;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr1	200182725	rs76632737	G	A	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.09;ReadPosRankSum=2.730;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr1	200182732	rs116503230	AC	GT	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.46;ReadPosRankSum=2.490;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr1	200182834	rs12028402	A	G	2003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.680;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.801;NF=65;NR=16;PP=1613;ReadPosRankSum=-0.428;SC=CTAGGGATGCAGTCCATTCCC;SOR=1.222;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=100;TCF=79;TCR=21;TR=81;WE=200182842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,81:0.82:99
chr1	200183398	rs10919847	C	A	1368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.173;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.309;NF=13;NR=35;PP=1041;ReadPosRankSum=-0.363;SC=ATCATTGATACTATTGTGTCT;SOR=0.542;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=65;TCF=16;TCR=49;TR=48;WE=200183406;WS=200183388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,50:0.72:69
chr1	200183460	rs10919848	C	T	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.531;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-2.428;NF=2;NR=17;PP=451;ReadPosRankSum=-1.489;SC=AGGCCCTGGCCCAGGCCTGCC;SOR=2.030;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=19;WE=200183468;WS=200183450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr1	200311868	rs2790109	C	G	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.082;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=30;PP=1166;ReadPosRankSum=-0.937;SC=CTTCTCTTCTCCTGTCTCAAA;SOR=0.704;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=81;TCF=40;TCR=41;TR=58;WE=200311876;WS=200311858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,58:0.73:80
chr1	200311910	rs2225986	T	A	1389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.931;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=32;PP=1043;ReadPosRankSum=0.605;SC=TGTCATTGGATTTAGGGCCCA;SOR=1.417;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=48;WE=200311918;WS=200311900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,51:0.73:70
chr1	200522566	rs12120084	G	C	2212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=25;PP=1707;SC=CTCACTGCTGGGGATGAGCCA;SOR=1.394;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=74;TCF=49;TCR=25;TR=73;WE=200522574;WS=200522556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	200523514	rs7548174	A	G	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=328;SC=GCGAGACTCCATCTCAAAAAA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=200523522;WS=200523504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	200534248	rs7543730	C	T	4702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=52;PP=2965;SC=CTTGTCTCAACTCATCCTCAA;SOR=1.375;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=95;TCR=52;TR=147;WE=200534256;WS=200534238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr1	200538885	rs10800711	C	T	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=0;PP=706;SC=ATTTTTGAAGCGGAAGGGGTC;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=200538893;WS=200538875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	200549590	rs10753877	T	C	643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=548;SC=TGGGGTAGAATAATTTCCCTA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=200549598;WS=200549580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	200555482	rs6691410	C	T	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=88;ReadPosRankSum=-1.465;SC=ATTTATATACCCCATAACATT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=200555490;WS=200555472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr1	200558363	rs6665951	T	C	2289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=22;PP=1826;SC=TAGCCAATGTTTCCATTTCTA;SOR=1.810;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=51;TCR=22;TR=73;WE=200558371;WS=200558353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	200569392	rs2809357	C	A	5671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=128;NR=44;PP=2965;SC=TAAGGAAGGTCGGAAAAATAC;SOR=2.250;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=128;TCR=45;TR=172;WE=200569400;WS=200569382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr1	200578093	rs2794409	G	A	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=28;PP=962;SC=AATTTATTTTGATGTTTTGCA;SOR=2.191;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=37;WE=200578101;WS=200578083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	200594240	rs2809350	G	A	1846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=51;PP=1446;SC=GAGGTATTAGGTGATCTCAAT;SOR=5.856;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=1;TCR=51;TR=52;WE=200594248;WS=200594230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	200610525	rs5780032	TA	T	275.76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.45;MQRankSum=0.516;QD=17.23;ReadPosRankSum=0.436;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr1	200618238	rs6665604	T	C	1812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=21;PP=1430;SC=GCGACTTCTCTGAATGTATAG;SOR=1.421;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=59;WE=200618246;WS=200618228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	200619530	rs2809365	T	C	2120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=2;PP=1764;SC=CCATAAAACATAGTTAACTGC;SOR=6.154;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=64;TCF=62;TCR=2;TR=63;WE=200619538;WS=200619520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	200816521	rs2172666	G	T	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.17;ReadPosRankSum=-1.276;SOR=1.075;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
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chr1	200882764	rs78470138	G	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.313;NF=0;NR=8;PP=66;ReadPosRankSum=-0.719;SC=GTAACTCTGCGCCCCACGCTG;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=8;WE=200882772;WS=200882754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr1	200943793	rs71991687	CAGGA	C	3192.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=7;PP=2896;SC=CTGCCCACACCAGGAAGGAGA;SOR=3.973;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=70;TCF=56;TCR=14;TR=56;WE=200943804;WS=200943783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	200944840	rs296563	T	G	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=3;NR=19;PP=547;SC=AGTGGGAGGATGGAAGGCAGG;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=200944848;WS=200944830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	200952336	rs12562818	C	G	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=54;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TCTCTTCCAGCGGAGCAGAGA;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=5;WE=200952344;WS=200952326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
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chr1	200956288	rs2275485	A	G	1187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.042;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=35;PP=855;ReadPosRankSum=0.189;SC=CCAGGCACTCAGCCGACACAG;SOR=1.197;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=169;TCF=70;TCR=99;TR=54;WE=200956296;WS=200956278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,58:0.33:176
chr1	200957691	rs2297912	G	C	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=4.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.94;ReadPosRankSum=-0.085;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
chr1	200959052	rs57758014	T	G	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=369;ReadPosRankSum=-0.389;SC=CCCCTGCCCATGTACGCTCCC;SOR=0.646;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=89;TCF=65;TCR=24;TR=23;WE=200959060;WS=200959042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,28:0.29:95
chr1	200959302	rs2297911	G	A	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.908;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=28;PP=877;ReadPosRankSum=-0.048;SC=TGGCCTGGCAGTCGGTGATGC;SOR=0.409;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=161;TCF=91;TCR=70;TR=57;WE=200959310;WS=200959292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,57:0.35:163
chr1	200960886	rs12123633	C	T	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.073;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=597;ReadPosRankSum=0.115;SC=GGGCTCCACACTCAGGCACCT;SOR=0.504;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=15;WE=200960906;WS=200960876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,19:0.31:62
chr1	200960898	rs12145860	A	T	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.376;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=597;ReadPosRankSum=-0.417;SC=CAGGCACCTTAGCCCTCTCTG;SOR=1.189;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=55;TCF=22;TCR=33;TR=16;WE=200960906;WS=200960876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,20:0.34:59
chr1	200960915	rs12142447	T	C	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.234;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=233;ReadPosRankSum=-0.876;SC=TCTGTCTGTGTACAGGCTGGC;SOR=0.990;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=13;WE=200960923;WS=200960905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,17:0.36:47
chr1	200965377	.	C	T	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.866;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=212;ReadPosRankSum=0.879;SC=AGCTCCCTCTCGTAGCGCGAC;SOR=0.132;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=10;WE=200965385;WS=200965367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr1	200965601	rs10920088	G	A	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=48;ReadPosRankSum=-1.097;SC=AAGGGGGAACGCAGGAACCCT;SOR=0.346;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=6;WE=200965609;WS=200965591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr1	200968879	rs16847508	G	A	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.794;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=366;ReadPosRankSum=1.288;SC=ATATAAGGAAGTACAAGGATC;SOR=1.528;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=17;WE=200968887;WS=200968869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr1	200969921	rs6692427	G	A	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.932;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=429;ReadPosRankSum=0.173;SC=GGAGTGGGACGGCGGGAAGAA;SOR=0.832;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=96;TCF=27;TCR=69;TR=27;WE=200969929;WS=200969911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,27:0.27:101
chr1	200969942	rs6667956	A	G	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.208;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=412;ReadPosRankSum=-0.311;SC=GGGTGCGATAAAGAAGATAAA;SOR=0.445;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=80;TCF=15;TCR=65;TR=24;WE=200969950;WS=200969932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,24:0.29:82
chr1	200969983	rs6656481	T	C	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=201;ReadPosRankSum=-0.291;SC=GACCTATAATTCCAGCACTTT;SOR=0.941;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=12;WE=200969991;WS=200969973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr1	200971521	rs56770229	G	A	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.24;ReadPosRankSum=1.078;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,34:0.31:110
chr1	200971528	rs41269929	G	T	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.89;ReadPosRankSum=-0.204;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,32:0.33:96
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chr1	201009182	rs12139527	A	G	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=34;PP=727;ReadPosRankSum=-0.691;SC=ATCAGCTGCCAAGGTGCCCAG;SOR=0.665;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=18;TCR=104;TR=40;WE=201009190;WS=201009172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,40:0.32:124
chr1	201009897	rs6427875	T	C	621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=21;PP=467;SC=CCAGGAGCCCTGAGTCAACAG;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=201009905;WS=201009887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
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chr1	201016646	rs2297905	C	T	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.162;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=311;ReadPosRankSum=-0.300;SC=CCCAAAGTAGCACCTACCTCC;SOR=0.869;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=71;TCF=55;TCR=16;TR=21;WE=201016654;WS=201016636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,22:0.29:75
chr1	201017687	rs35713982	C	CT	1346.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.243;NF=24;NR=11;PP=1274;ReadPosRankSum=-0.620;SC=AAGGAGGGGGCTCACATTGGA;SOR=0.617;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=93;TCF=61;TCR=32;TR=35;WE=201017695;WS=201017677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,44:0.40:110
chr1	201017805	rs79011683	A	C	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=28.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.89;ReadPosRankSum=-3.760;SOR=4.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,24:0.32:74
chr1	201020105	rs6702590	A	G	1435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=10;PP=1079;SC=GGCCCTCAGCATCTCACCAGG;SOR=2.215;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=49;WE=201020113;WS=201020095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	201021619	rs12029212	C	G	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=91;ReadPosRankSum=-0.219;SC=CTCCAGTGCACATTAGAACAG;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=7;WE=201021627;WS=201021609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr1	201030668	rs2297904	G	A	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=5.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=395;ReadPosRankSum=0.258;SC=GGGAAGGATGGGCTTTATCCC;SOR=0.478;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=18;WE=201030676;WS=201030658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr1	201030988	rs61614423	C	T	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=460;ReadPosRankSum=0.442;SC=GCAGTAGCACCGTGGGGGCTG;SOR=0.572;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=64;TCF=61;TCR=3;TR=23;WE=201030996;WS=201030978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,24:0.36:66
chr1	201031307	rs2297903	A	C	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=529;ReadPosRankSum=-0.689;SC=GGGGAGTGTGAAGGAGAAATG;SOR=0.610;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=22;WE=201031315;WS=201031297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr1	201035098	rs4564170	A	G	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.772;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=545;ReadPosRankSum=0.466;SC=GCCAATGGGGACTGGGGGTGC;SOR=0.852;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=116;TCF=62;TCR=54;TR=36;WE=201035106;WS=201035088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,33:0.28:116
chr1	201035429	rs16847623	G	A	1708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FS=5.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.06;ReadPosRankSum=0.161;SOR=0.429;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:203,79:0.28:282
chr1	201038687	rs7415038	A	G	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.262;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=855;ReadPosRankSum=0.662;SC=TGAAGTTGGTAAACCAGGTGG;SOR=0.955;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=148;TCF=58;TCR=90;TR=47;WE=201038695;WS=201038677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,47:0.30:156
chr1	201060865	rs2296383	G	A	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.951;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=32;PP=1023;ReadPosRankSum=1.199;SC=CCAGCAGGGCGATGTGAAAGA;SOR=0.918;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=73;TCF=25;TCR=48;TR=48;WE=201060873;WS=201060855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,51:0.65:79
chr1	201079514	rs55651815	C	T	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.472;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=152;ReadPosRankSum=-0.938;SC=GCTGGACAGGCTCATGGACGC;SOR=0.067;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=10;WE=201079522;WS=201079504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr1	201081283	rs112984935	AC	A	561.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.246;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=2.210;NF=24;NR=0;PP=271;ReadPosRankSum=-0.615;SC=CATGACGCACACCCCCCCCCA;SOR=2.631;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=78;TCF=72;TCR=6;TR=24;WE=201081291;WS=201081273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,27:0.39:69
chr1	201112981	rs8158	A	G	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=624;ReadPosRankSum=0.686;SC=GTTGCTCAGTATATGCATCCG;SOR=0.914;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=28;WE=201112989;WS=201112971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,29:0.74:39
chr1	201113118	rs3738266	A	G	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.314;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=1009;ReadPosRankSum=-0.666;SC=CCATTATCTGAGGCCAGGGCT;SOR=0.421;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=47;WE=201113126;WS=201113108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,49:0.71:69
chr1	201116018	rs3752979	C	G	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=374;ReadPosRankSum=0.267;SC=AGGGCCACCACGTCTTAGAGC;SOR=0.504;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=19;WE=201116026;WS=201116008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr1	201120730	rs2068152	C	A	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.166;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=117;ReadPosRankSum=1.758;SC=AGACAGTTGACAACTATGAAA;SOR=0.399;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=6;WE=201120738;WS=201120720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr1	201122784	rs6684980	C	T	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.264;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=1;PP=761;ReadPosRankSum=0.392;SC=CTCTGTGCCCCACCCTTCCTC;SOR=2.331;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=57;TCF=53;TCR=4;TR=33;WE=201122792;WS=201122774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr1	201122947	rs1925361	T	G	1818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.702;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=47;PP=1355;ReadPosRankSum=-2.151;SC=GGCCGTGCACTGTGGTCGTGA;SOR=0.105;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=116;TCF=27;TCR=89;TR=68;WE=201122955;WS=201122937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,73:0.61:120
chr1	201163191	rs1107128	G	T	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=2;PP=1187;SC=TCTTGCTCCTGGGGTGAGTGG;SOR=5.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=41;WE=201163199;WS=201163181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	201164930	rs4915219	A	G	2136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.235;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=9;PP=1604;ReadPosRankSum=-0.023;SC=CCCTCTCCCAACTTGTCAGTC;SOR=1.368;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=101;TCF=86;TCR=15;TR=69;WE=201164938;WS=201164920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,74:0.70:106
chr1	201166281	rs7533096	C	T	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=533;ReadPosRankSum=0.659;SC=AACACATAGCCGTGTCTAGTA;SOR=0.657;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=86;TCF=59;TCR=27;TR=27;WE=201166289;WS=201166271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,28:0.31:91
chr1	201166383	rs4915221	G	A	4791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=78;PP=2965;ReadPosRankSum=0.544;SC=GATCTGTACCGCTGCACAGCA;SOR=0.798;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=70;TCR=79;TR=147;WE=201166391;WS=201166373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,158:0.99:160
chr1	201166435	rs11589317	T	C	3835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=75;PP=2706;SC=TGAGACTCACTGTCATCGAAG;SOR=1.136;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=50;TCR=75;TR=125;WE=201166443;WS=201166425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr1	201168499	rs1534057	G	A	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.613;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=34;PP=1003;ReadPosRankSum=1.028;SC=ACAGGGAACCGCAGGAAGGTA;SOR=1.283;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=74;TCF=23;TCR=51;TR=47;WE=201168507;WS=201168489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,49:0.64:76
chr1	201168589	rs1534056	T	C	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=443;ReadPosRankSum=-1.052;SC=CTGGTTGAGCTACCATGAACA;SOR=0.527;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=19;WE=201168597;WS=201168579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr1	201169554	rs2365299	T	G	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=534;ReadPosRankSum=-0.310;SC=CTCACCCCATTCCCACCCCTC;SOR=0.556;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=24;WE=201169562;WS=201169544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr1	201170772	rs10157730	A	G	1288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=1;PP=1072;SC=ATGGTACCAGAGCCTATGAGG;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=37;WE=201170780;WS=201170762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	201170824	rs10158976	C	G	2859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=16;PP=2154;ReadPosRankSum=-0.805;SC=AGCTCTCCTGCTGGGTGTTTG;SOR=1.588;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=71;TCR=16;TR=86;WE=201170832;WS=201170814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,92:0.99:93
chr1	201173104	rs832160	C	T	1704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=45;PP=1397;SC=GTTGGTGCAACGTGTGTGTTG;SOR=4.133;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=4;TCR=45;TR=49;WE=201173112;WS=201173094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	201174215	rs11584104	C	A	2102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.535;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=24;PP=1626;ReadPosRankSum=-0.242;SC=GGCAGCCATCCCCCCAAGAGT;SOR=0.097;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=106;TCF=80;TCR=26;TR=79;WE=201174223;WS=201174205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,81:0.74:109
chr1	201175227	rs832156	C	A	1339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=14;PP=1085;ReadPosRankSum=-0.875;SC=AGGATAAAGACCTTCAGTCCA;SOR=0.732;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=53;TCR=21;TR=50;WE=201175235;WS=201175217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,50:0.67:75
chr1	201175274	rs9651057	A	G	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-6.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.834;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=472;ReadPosRankSum=-2.559;SC=CAAGGAGCCCAGGCATCAGGA;SOR=0.840;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=91;TCF=58;TCR=33;TR=33;WE=201175282;WS=201175264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,35:0.38:93
chr1	201175715	rs1341631	G	T	1904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.830;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=43;PP=1416;ReadPosRankSum=0.752;SC=GGGTCCAGTCGGCTTCAGGCT;SOR=1.070;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=100;TCF=38;TCR=62;TR=67;WE=201175723;WS=201175705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,72:0.69:105
chr1	201175768	rs116753369	G	C	2060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=38;PP=1615;ReadPosRankSum=-0.289;SC=GCACAGAGGGGACAGTGGAAG;SOR=0.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=38;TCR=50;TR=67;WE=201175776;WS=201175758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,71:0.76:94
chr1	201176018	rs10753895	A	G	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.530;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=14;PP=749;ReadPosRankSum=0.603;SC=GAAGCTGGAGACAGCAATGGG;SOR=1.151;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=54;TCF=32;TCR=22;TR=38;WE=201176026;WS=201176008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,40:0.71:56
chr1	201176711	rs12568690	G	T	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=531;ReadPosRankSum=-0.083;SC=CCAGGCCTGGGTGCTCAGGGA;SOR=0.889;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=122;TCF=69;TCR=53;TR=35;WE=201176719;WS=201176701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,35:0.29:122
chr1	201178788	.	A	G	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MMLQ=28;MQ=51.85;NF=101;NR=36;PP=2962;QD=20;SC=ATGGTTTAGGAGGTTCTGGAG;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=345;TCF=193;TCR=152;TR=137;WE=201178796;WS=201178778;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:208,137:0.40:345
chr1	201181223	rs12070919	A	G	7394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.466;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=117;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.790;SC=GGTGACACGAACTCCAAGGAT;SOR=0.568;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=218;TCF=101;TCR=117;TR=217;WE=201181231;WS=201181213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,230:1.00:231
chr1	201183424	rs41304263	G	A	2207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.383;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=44;PP=1673;ReadPosRankSum=-0.044;SC=TAAGGATGGCGTCAAGGTACT;SOR=0.954;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=118;TCF=56;TCR=62;TR=80;WE=201183432;WS=201183414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,84:0.66:128
chr1	201184097	rs4915496	G	A	2745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=34;PP=2277;SC=AAGGAACTGGGATGGGAGTGG;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=57;TCR=34;TR=91;WE=201184105;WS=201184087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	201187764	rs10920144	T	C	2589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=25;PP=1983;SC=CATCGGATGCTGTCTTTGCTC;SOR=1.872;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=85;TCF=60;TCR=25;TR=84;WE=201187772;WS=201187754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	201187828	rs3738268	T	C	2470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=48;PP=1793;SC=GAGGTGAGCATGGGATAGCCC;SOR=0.997;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=37;TCR=49;TR=85;WE=201187836;WS=201187818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	201187954	rs6667020	C	T	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=682;SC=TGAGCCACATCTTAGGGGCCC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=201187962;WS=201187944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	201190732	rs3738269	G	A	2791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=39;PP=2342;SC=CGTGCCATGTGGGCACCGTGC;SOR=0.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=49;TCR=39;TR=88;WE=201190740;WS=201190722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	201193668	rs6687494	G	T	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=425;SC=TTTTCTTGTCGACGTTGTGTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=201193676;WS=201193664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	201195119	rs3738270	C	T	5267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=59;PP=2965;SC=CGACCGCATCCACACCAACCG;SOR=1.377;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=102;TCR=59;TR=161;WE=201195127;WS=201195109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr1	201197358	rs3753972	G	C	1281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=0;PP=1117;SC=CTTTGCCCAAGCTTAGAGAGC;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=201197366;WS=201197348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	201197471	rs3753973	T	C	6498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=145;NR=68;PP=2965;ReadPosRankSum=0.841;SC=CAGGGTGGGGTGGCTGCCCCT;SOR=0.766;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=214;TCF=146;TCR=68;TR=213;WE=201197479;WS=201197461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,215:1.00:216
chr1	201253119	rs12083583	C	G	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=29;PP=845;SC=CACGCATCCCCGGGGATGAGG;SOR=6.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=201253127;WS=201253109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	201282167	rs1772860	C	G	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=6.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.907;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=387;ReadPosRankSum=0.087;SC=GTTCCTTCCACGCCAAACATT;SOR=0.053;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=64;TCF=63;TCR=1;TR=20;WE=201282175;WS=201282157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,21:0.32:65
chr1	201285712	rs7514146	C	T	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.715;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=530;ReadPosRankSum=1.230;SC=GTGCAGTGGGCTGACCATCCC;SOR=0.337;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=45;TCF=27;TCR=18;TR=29;WE=201285720;WS=201285702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,32:0.67:48
chr1	201285759	rs1779297	A	G	1775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=28;PP=1371;SC=AGGATGAGAAATACCAGGCCA;SOR=0.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=28;TCR=28;TR=56;WE=201285767;WS=201285749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	201285909	rs1534051	A	G	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=13;PP=370;SC=GAGATGGGTGAGGGCATCTGC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=201285917;WS=201285899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	201286614	rs11336457	GA	G	1854.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.585;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.636;NF=24;NR=14;PP=1610;ReadPosRankSum=-1.364;SC=TTTTTGGTCTGAAAAAAAAAA;SOR=0.137;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=110;TCF=84;TCR=26;TR=38;WE=201286636;WS=201286604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,52:0.43:120
chr1	201286628	rs1772823	C	G	1920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.948;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.744;NF=34;NR=16;PP=1586;ReadPosRankSum=0.557;SC=AAAAAAATCACCTTTGAGTAG;SOR=0.168;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=126;TCF=98;TCR=28;TR=50;WE=201286636;WS=201286604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,53:0.40:132
chr1	201287811	.	G	A	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.05;ReadPosRankSum=-0.709;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr1	201288898	rs1722759	A	C	3126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=30;PP=2370;SC=CCACCCCCAGATCCACTTCTG;SOR=1.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=65;TCR=30;TR=95;WE=201288906;WS=201288888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	201289545	rs6427898	G	A	2499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.899;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=68;PP=1945;ReadPosRankSum=-0.319;SC=TGACCCCTAGGCCCAGCCCCC;SOR=0.412;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=140;TCF=30;TCR=110;TR=89;WE=201289553;WS=201289535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,95:0.66:145
chr1	201290968	rs1779292	T	G	2823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=3;PP=2273;SC=CCCAGGCTGATAGTGTGGTGG;SOR=5.969;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=74;TCR=3;TR=77;WE=201290976;WS=201290958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	201290985	rs12122545	C	T	1785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.135;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=3;PP=1400;ReadPosRankSum=-0.011;SC=GTGGTGCCTGCGCTCATCTTT;SOR=1.901;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=99;TCF=91;TCR=8;TR=63;WE=201290993;WS=201290975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,65:0.64:101
chr1	201291066	rs2071960	C	T	1995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.227;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=29;PP=1506;ReadPosRankSum=-0.305;SC=CCTGTCGGGCCGGGCAGAGGC;SOR=0.459;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=232;TCF=162;TCR=70;TR=83;WE=201291074;WS=201291056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,85:0.36:233
chr1	201292092	rs74525695	C	T	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.636;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=3;PP=713;ReadPosRankSum=1.942;SC=GGGTTGTGTCCTCTCACAAGG;SOR=1.381;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=54;TCF=47;TCR=7;TR=30;WE=201292100;WS=201292082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr1	201292110	rs1779288	T	C	2681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=12;PP=1931;SC=AGGCTCCCCATTGACCCCCCT;SOR=3.198;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=74;TCF=62;TCR=12;TR=73;WE=201292118;WS=201292100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	201293512	rs36076398	TG	T	128.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.586;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=157;ReadPosRankSum=-0.876;SC=CCATGGTGCCTGGGAAGCCAC;SOR=1.345;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=8;WE=201293520;WS=201293502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr1	201293970	rs1620046	C	T	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=7;PP=548;SC=GCTCAGAGCCCGGCAGAAGGC;SOR=1.292;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=20;WE=201293978;WS=201293960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	201293985	rs854505	G	A	564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=537;ReadPosRankSum=-0.790;SC=GAAGGCTATCGAAGAGTGTGG;SOR=0.446;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=20;WE=201293993;WS=201293975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr1	201295107	rs16848334	C	T	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=246;ReadPosRankSum=-0.873;SC=ACAGCGTCTACGTGAAAATGA;SOR=0.412;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=10;WE=201295115;WS=201295097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr1	201328824	rs2275863	G	A	1896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.396;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=51;PP=1467;ReadPosRankSum=-0.115;SC=AAAGAGCAACGCTGGAGCTGA;SOR=1.581;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=123;TCF=41;TCR=82;TR=69;WE=201328832;WS=201328814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,73:0.56:131
chr1	201328913	rs45509695	G	C	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=396;ReadPosRankSum=-0.638;SC=GGAGGAGCATGGAAGAGTAGG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=23;WE=201328921;WS=201328903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr1	201331554	rs1104859	T	G	3429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=69;NR=32;PP=2650;SC=GAGAGGCCCATAGAAAAAGAC;SOR=1.655;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=69;TCR=32;TR=101;WE=201331562;WS=201331544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr1	201331664	rs2365652	C	A	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=202;ReadPosRankSum=-0.300;SC=GCCGGGTTTACTAGGACGTGG;SOR=0.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=15;TCR=57;TR=18;WE=201331672;WS=201331654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,18:0.25:73
chr1	201334382	rs3729547	G	A	5220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=100;PP=2965;SC=AGTGAGCCTCGATCAGCGCCT;SOR=1.192;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=65;TCR=100;TR=165;WE=201334390;WS=201334372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr1	201335899	rs1573230	C	T	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=1;PP=889;SC=TACTGCACCCCGTTCCATCAT;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=201335907;WS=201335889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	201337170	rs3729842	A	G	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=8;PP=861;SC=AATCTTAGTCAATAGGAGAGT;SOR=2.554;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=36;WE=201337178;WS=201337168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	201337486	rs3753999	G	A	2963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=73;PP=2189;ReadPosRankSum=-2.160;SC=GAATTTGGGGGCAACCAACGT;SOR=0.734;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=172;TCF=60;TCR=112;TR=111;WE=201337494;WS=201337476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,116:0.66:177
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chr1	201338586	rs10920183	A	G	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=424;ReadPosRankSum=0.258;SC=CCCAGCATGGAACACTGGGGT;SOR=0.058;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=69;TCF=1;TCR=68;TR=22;WE=201338594;WS=201338576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,24:0.33:72
chr1	201338896	rs10920184	T	C	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=505;ReadPosRankSum=-1.031;SC=AGGCTGCACTTGGGACAGCAG;SOR=0.624;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=113;TCF=74;TCR=39;TR=38;WE=201338904;WS=201338886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,39:0.32:120
chr1	201339043	rs12049476	C	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=327;ReadPosRankSum=0.853;SC=AGAGAGCCCGCGGCAGGAGCA;SOR=0.563;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=20;WE=201339051;WS=201339033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,21:0.38:55
chr1	201341175	rs45533739	CAGAAG	C	1129.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.084;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.663;NF=16;NR=8;PP=1028;ReadPosRankSum=0.454;SC=TGCTTCTGCTCAGAAGAGAAG;SOR=0.976;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=76;TCF=50;TCR=26;TR=24;WE=201341187;WS=201341165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,33:0.37:89
chr1	201341341	rs868407	C	T	2299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=64;PP=1880;SC=CAAACACACACGCCTGCACAC;SOR=4.205;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=7;TCR=64;TR=71;WE=201341349;WS=201341331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	201352510	.	T	G	2677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.000;ClippingRankSum=0.000;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.147;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=47;PP=2089;ReadPosRankSum=-0.773;SC=GGGAGCTTCATGCTGGCACTG;SOR=0.455;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=143;TCF=75;TCR=68;TR=96;WE=201352518;WS=201352500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,98:0.67:147
chr1	201353827	rs10920189	G	C	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.830;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=319;ReadPosRankSum=0.487;SC=GTGCCCTACCGCACAGCCTGG;SOR=0.358;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=16;WE=201353835;WS=201353817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr1	201355522	rs4128458	T	C	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.934;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=486;ReadPosRankSum=0.900;SC=GCCCCCTGCTTTGCCAAAGAG;SOR=0.830;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=81;TCF=57;TCR=24;TR=26;WE=201355530;WS=201355512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,28:0.33:84
chr1	201355943	rs2799677	C	T	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.490;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=743;ReadPosRankSum=-0.702;SC=GCATGGAGGACTTCTCCAAGA;SOR=0.941;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=105;TCF=53;TCR=52;TR=42;WE=201355951;WS=201355933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,43:0.39:109
chr1	201356428	rs4915230	C	A	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=158;ReadPosRankSum=1.221;SC=AGGCCCTGGCCTCCCCGGCTC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=201356436;WS=201356418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr1	201360281	rs2719184	A	G	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.659;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=33;PP=768;ReadPosRankSum=-0.649;SC=TTTCAGATGGAAAGAGCTTCG;SOR=1.305;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=114;TCF=24;TCR=90;TR=39;WE=201360289;WS=201360271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,40:0.34:119
chr1	201368463	rs28364652	G	GT	886.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=6.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.17;ReadPosRankSum=0.462;SOR=0.111;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr1	201383616	rs2026593	A	G	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=2;PP=455;SC=CTCCAGCCCCACCCTGCCCCG;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=201383624;WS=201383606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	201383643	rs2026594	A	C	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=6;PP=790;SC=CTGCCAGGCTAACCTGCAGGG;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=201383651;WS=201383633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	201434740	rs1053592	G	A	2257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.972;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=29;PP=1792;ReadPosRankSum=0.060;SC=GGGAAGATGCGTAGAGGTGGG;SOR=1.137;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=109;TCF=67;TCR=42;TR=80;WE=201434748;WS=201434730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,81:0.74:110
chr1	201435069	rs1053582	C	A	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.786;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=526;ReadPosRankSum=-0.712;SC=CCTATGCCAGCTCCCCCTCAT;SOR=1.001;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=102;TCF=60;TCR=42;TR=33;WE=201435077;WS=201435059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,33:0.32:102
chr1	201453289	rs576697	T	C	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=25;PP=581;SC=CCTAGGACCCTGCCTGCATGC;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=201453297;WS=201453279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	201454385	rs41304273	C	A	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.573;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=27;PP=958;ReadPosRankSum=0.456;SC=GCCTCCTGACCCTCAATTAGA;SOR=0.763;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=102;TCR=75;TR=63;WE=201454393;WS=201454375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,62:0.33:190
chr1	201458143	rs752756	C	T	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.914;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=145;ReadPosRankSum=-1.804;SC=GGTGAGGTGACTTACACTGTA;SOR=0.050;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=9;WE=201458151;WS=201458133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr1	201687451	rs11576721	A	G	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=8;PP=1073;ReadPosRankSum=2.136;SC=GCTGGGGTGCATGTGAGGGGA;SOR=0.641;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=103;TCF=90;TCR=13;TR=61;WE=201687459;WS=201687441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,61:0.59:103
chr1	201749520	rs529581	G	C	1715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=28;PP=1390;ReadPosRankSum=0.008;SC=CTGTTTTAACGATTGACCTTC;SOR=0.661;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=187;TCF=113;TCR=74;TR=69;WE=201749528;WS=201749510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,71:0.36:198
chr1	201752429	rs527725	A	C	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=136;ReadPosRankSum=-0.983;SC=CTCTGTGCTTAGCAAATAGGC;SOR=0.138;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=9;WE=201752437;WS=201752419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr1	201755469	rs12563363	C	G	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.129;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=92;ReadPosRankSum=0.340;SC=TCTCCTGGCTCCAGCCTAGTT;SOR=0.250;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=9;WE=201755477;WS=201755459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr1	201763184	rs564440	T	C	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.546;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=5;PP=1015;ReadPosRankSum=0.591;SC=TCCCAATTCCTTGCCCTTCTC;SOR=0.455;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=72;TCF=65;TCR=7;TR=44;WE=201763192;WS=201763174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,45:0.62:73
chr1	201763499	rs567185	C	T	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.315;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.079;NF=7;NR=5;PP=239;ReadPosRankSum=-0.886;SC=GAACTCCTGACCTCAGGTGAT;SOR=0.662;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=12;WE=201763507;WS=201763489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
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chr1	201816639	rs146207613	ATCTTTT	A	1203.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.090;NF=18;NR=7;ReadPosRankSum=0.258;SC=TGTGAAAAAAATCTTTTTCTT;SOR=0.495;Source=Platypus;TR=25;WE=201816652;WS=201816629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,31:0.74:42
chr1	201821443	rs1400875	T	C	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.357;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=608;ReadPosRankSum=-0.685;SC=CTGACAAAGATCTGGATCTGA;SOR=3.649;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=24;WE=201821451;WS=201821433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr1	201826340	rs2172935	C	T	3159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.556;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=79;PP=2437;ReadPosRankSum=0.292;SC=TACCTTGATACTTCAGCCACA;SOR=0.901;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=35;TCR=117;TR=103;WE=201826348;WS=201826330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,112:0.67:167
chr1	201826482	rs2132363	C	T	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.301;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=364;ReadPosRankSum=-1.954;SC=AAATTCGAGACTCAGAAATTC;SOR=1.463;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=17;WE=201826490;WS=201826472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr1	201827919	rs72742073	C	G	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.028;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=342;ReadPosRankSum=-1.760;SC=AATCTTGTTTCCTCAAATATT;SOR=1.831;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=17;WE=201827927;WS=201827909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr1	201832864	rs2494115	G	C	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.478;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=32;PP=752;ReadPosRankSum=-0.251;SC=GTGAATGTTGGAAGGACAGGG;SOR=1.751;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=55;TCF=3;TCR=52;TR=33;WE=201832872;WS=201832854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr1	201837934	rs34353605	CGT	C	1269.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=23;PP=1596;SC=GGTAAGTGGCCGTGTGTGTGT;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=33;WE=201837943;WS=201837924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	201838107	rs2820310	G	A	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=231;ReadPosRankSum=1.481;SC=TTGGCTTGGCGCGGTGGCTCA;SOR=1.911;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=12;WE=201838115;WS=201838097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr1	201840059	rs150361248	GTTATT	G	2123.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=26;PP=1761;SC=TTGGTCCTGAGTTATTTTATT;SOR=2.608;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=35;WE=201840071;WS=201840049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	201840464	rs2644124	T	C	2151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=50;PP=1675;SC=AGGTAGAACCTCATCTTTCTT;SOR=3.187;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=8;TCR=50;TR=58;WE=201840472;WS=201840454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	201844128	rs2678203	G	A	2500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=44;PP=1916;SC=GATCCCAACAGTGGGGTACCC;SOR=1.096;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=32;TCR=44;TR=76;WE=201844136;WS=201844118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	201860626	rs2250377	A	G	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=2.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=0.000;QD=5.71;ReadPosRankSum=-0.663;SOR=0.469;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,36:0.27:134
chr1	201865763	rs8028	A	G	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.738;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=34;PP=737;ReadPosRankSum=-0.450;SC=GTGCAGTGGGACTGACAGTGA;SOR=0.563;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=33;TCR=89;TR=47;WE=201865771;WS=201865753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,51:0.40:128
chr1	201869257	rs2820312	G	A	5358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.475;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=96;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.533;SC=GCCACTGGGCGTCTGTTTCTC;SOR=0.691;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=266;TCF=130;TCR=136;TR=188;WE=201869265;WS=201869247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,198:0.70:281
chr1	201938482	rs58623305	C	T	307.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=250;ReadPosRankSum=-0.903;SC=AGGGTTATAGCTTTAATTTAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=201938490;WS=201938476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,11:0.92:12
chr1	201952574	rs4950806	T	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=147;ReadPosRankSum=-0.582;SC=TTTCTAACATTTTCCGTGGCT;SOR=0.378;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=10;WE=201952582;WS=201952564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,10:0.22:46
chr1	201952598	rs56768485	G	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=238;ReadPosRankSum=-0.453;SC=TAGATGACCTGTTGTTCATGC;SOR=0.734;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=60;TCF=48;TCR=12;TR=16;WE=201952606;WS=201952588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,16:0.26:62
chr1	201952755	rs4950807	T	A	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.958;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=358;ReadPosRankSum=-1.757;SC=GTTAAAGCTCTTATCTTTGTT;SOR=1.386;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=55;TCF=12;TCR=43;TR=19;WE=201952763;WS=201952745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,19:0.35:55
chr1	201958312	rs35164608	C	G	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.898;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=527;ReadPosRankSum=-0.336;SC=TTAAATTCTTCCACCTACTGA;SOR=1.519;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=22;WE=201958320;WS=201958302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr1	201966774	rs10920300	T	C	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.411;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=426;ReadPosRankSum=0.529;SC=AGAATACAAGTGGGTGTGAAG;SOR=2.226;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=22;WE=201966782;WS=201966764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,23:0.74:31
chr1	201970562	rs4332408	T	C	4730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=93;PP=2965;SC=TCTGCTTTGTTTCATACCTGG;SOR=1.577;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=47;TCR=94;TR=140;WE=201970570;WS=201970552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr1	201970986	rs35227221	C	CA	766.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.202;NF=0;NR=23;PP=851;ReadPosRankSum=-1.333;SC=GATGGGAAAACACTGGGTCAG;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=2;TCR=60;TR=23;WE=201970994;WS=201970976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,27:0.42:64
chr1	201973565	rs3820439	G	A	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.086;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=34;PP=710;ReadPosRankSum=-0.453;SC=GGGCCAAATCGTCCTTAAGAA;SOR=1.464;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=104;TCF=25;TCR=79;TR=41;WE=201973573;WS=201973555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,41:0.38:107
chr1	201980119	rs2819361	C	G	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=334;SC=CTTGAAGAGACGGTGTCCGCA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=201980127;WS=201980109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	201981862	rs2819362	T	C	2694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=60;PP=2063;SC=CCCCCTCCCCTGGCAGCTCTG;SOR=1.489;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=33;TCR=60;TR=93;WE=201981870;WS=201981852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
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chr1	202092360	rs3795595	G	A	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.515;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=16;PP=908;ReadPosRankSum=0.216;SC=CCTAACCCCGGCAAGGATGGG;SOR=0.479;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=133;TCF=94;TCR=39;TR=50;WE=202092368;WS=202092350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,50:0.37:135
chr1	202092415	rs3795596	A	G	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.568;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=30;PP=956;ReadPosRankSum=-0.507;SC=ATCTGACAGGAGCACCAGGGC;SOR=0.610;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=180;TCF=100;TCR=80;TR=65;WE=202092423;WS=202092405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,66:0.35:186
chr1	202092580	rs7516762	T	C	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.358;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=459;ReadPosRankSum=0.415;SC=ACCTGAAGAGTGCCTGGAACT;SOR=0.831;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=168;TCF=66;TCR=102;TR=47;WE=202092588;WS=202092570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,48:0.27:175
chr1	202096815	rs3820380	G	A	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.863;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=15;PP=648;ReadPosRankSum=-0.264;SC=GTCCTTCCTTGTCCCCATAGA;SOR=0.374;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=112;TCF=80;TCR=32;TR=43;WE=202096823;WS=202096805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,45:0.38:119
chr1	202103802	rs4342901	G	A	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=-0.269;SC=GGAAGCTCAGGTGAGAGGATT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=202103810;WS=202103792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr1	202107198	.	A	G	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.714;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=766;ReadPosRankSum=-1.749;SC=TAGCCTCAGTAGTGGGCAGGC;SOR=0.247;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=55;TCF=14;TCR=41;TR=37;WE=202107206;WS=202107188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,37:0.66:56
chr1	202113835	rs4989100	T	G	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=295;ReadPosRankSum=-0.357;SC=CGAGCGCGGCTGCCGACGACT;SOR=0.195;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=0;TCR=57;TR=18;WE=202113843;WS=202113825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,18:0.31:58
chr1	202122783	rs11590076	C	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=0.516;SC=TAGTGAAGAGCCAGCCTGAGT;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=202122791;WS=202122773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr1	202130754	rs3934648	T	C	1818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=54;PP=1439;SC=GCCCCCAACATGCACAATCCA;SOR=2.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=13;TCR=54;TR=67;WE=202130762;WS=202130744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	202152859	rs2993441	A	C	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=5.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.264;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.582;NF=0;NR=17;PP=324;ReadPosRankSum=-0.064;SC=TGCAGGCCACACTGGCCTTTG;SOR=2.959;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=7;TCR=56;TR=17;WE=202152867;WS=202152849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,18:0.28:65
chr1	202155331	.	CTGCCCCCTTGCCCCCT	C	1537.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;MQRankSum=0.493;NF=9;NR=7;PP=2340;SC=CAGGGCCCCTCTGCCCCCTTG;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=16;WE=202155354;WS=202155321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr1	202155543	rs2993432	A	C	2582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=6.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.711;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=57;PP=2085;ReadPosRankSum=-0.345;SC=ATCCTGGTGCACTGCAGGAGG;SOR=0.301;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=117;TCF=31;TCR=86;TR=81;WE=202155551;WS=202155533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,87:0.70:124
chr1	202156135	rs139095833	C	CCCTCGCT	776.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.021;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.583;NF=2;NR=7;PP=523;ReadPosRankSum=1.252;SC=CTGCAGGCCCCCCTCGCTCCT;SOR=0.293;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=9;WE=202156143;WS=202156125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr1	202156482	rs3010088	G	A	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=3;PP=612;ReadPosRankSum=1.031;SC=GAAGGAGTACGAGGTACACTT;SOR=1.129;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=30;WE=202156490;WS=202156472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr1	202156628	rs3010089	A	C	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.081;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.642;NF=4;NR=33;PP=901;ReadPosRankSum=-1.217;SC=GCTGGCTCTTACGCACCCCTG;SOR=2.353;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=54;TCF=9;TCR=45;TR=37;WE=202156636;WS=202156618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,39:0.68:57
chr1	202156715	.	G	A	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.421;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=194;ReadPosRankSum=-1.181;SC=GGCCAGCATGGGCTGGGGGCC;SOR=0.250;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=9;WE=202156723;WS=202156705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr1	202163364	rs2077598	C	G	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=63;ReadPosRankSum=2.189;SC=CCTGGTCCTGCGGGCTGCTGG;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=202163372;WS=202163354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	202163516	rs1812761	C	A	2139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.683;NF=68;NR=6;PP=1710;ReadPosRankSum=-0.090;SC=AAATACCAGGCGAGCAGGGAG;SOR=0.959;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=112;TCF=102;TCR=10;TR=74;WE=202163524;WS=202163506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,75:0.67:112
chr1	202163621	rs3120747	G	A	3176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.275;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=77;PP=2431;ReadPosRankSum=1.446;SC=TGGACCCTGAGCGGGAGGGCG;SOR=0.826;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=183;TCF=60;TCR=123;TR=113;WE=202163629;WS=202163611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,118:0.64:184
chr1	202183394	rs199949491	C	T	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.801;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=394;ReadPosRankSum=0.553;SC=TGCCGAGCTCCGGAAAGTTCC;SOR=2.341;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=67;TCF=20;TCR=47;TR=22;WE=202183402;WS=202183384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,22:0.31:70
chr1	202194441	rs3010067	G	C	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.914;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=475;ReadPosRankSum=-1.903;SC=GGCCTGGTGGGGGGTACTGTG;SOR=3.014;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=19;WE=202194449;WS=202194431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr1	202194508	rs149459287	AG	A	2087.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.071;NF=32;NR=14;PP=1757;ReadPosRankSum=-1.095;SC=AGATGGCCCAAGTGGGGAGTT;SOR=0.622;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=72;TCF=51;TCR=21;TR=46;WE=202194516;WS=202194498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,60:0.65:93
chr1	202196931	rs1452070	G	A	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.355;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=7;PP=1475;ReadPosRankSum=0.187;SC=AGTATTAAACGCATCGTAGAT;SOR=1.109;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=79;TCR=10;TR=61;WE=202196939;WS=202196921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,63:0.69:91
chr1	202266547	rs788827	C	T	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.229;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=5;PP=954;ReadPosRankSum=-1.629;SC=TCTCCCTGGCCAAGCCCAGAG;SOR=2.098;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=72;TCF=60;TCR=12;TR=43;WE=202266555;WS=202266537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,45:0.60:75
chr1	202266607	rs788826	C	T	1768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.720;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=29;PP=1370;ReadPosRankSum=0.740;SC=AAGCCTTTGCCCTAATGACTG;SOR=0.616;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=96;TCF=50;TCR=46;TR=63;WE=202266615;WS=202266597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,65:0.64:101
chr1	202274936	rs705762	T	C	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=909;ReadPosRankSum=-1.137;SC=GCAAGTCCTGTAGGGAGGTGT;SOR=0.589;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=71;TCF=31;TCR=40;TR=46;WE=202274944;WS=202274926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,51:0.67:76
chr1	202276494	rs896551	C	T	2772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.555;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=60;PP=2071;ReadPosRankSum=2.216;SC=CCATCCACCCCGAGGCCTTCT;SOR=0.466;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=131;TCF=48;TCR=83;TR=96;WE=202276502;WS=202276484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,102:0.73:140
chr1	202287206	rs788795	T	C	2262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.523;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=41;PP=1614;ReadPosRankSum=1.590;SC=GGCGGGCCTGTCCCCCTGCCC;SOR=0.539;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=119;TCF=58;TCR=61;TR=82;WE=202287214;WS=202287196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,87:0.69:127
chr1	202287537	rs788794	G	A	2070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.611;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=22;PP=1577;ReadPosRankSum=-0.837;SC=TGGCCGCCGCGCTGCCCCTGG;SOR=1.011;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=114;TCF=77;TCR=37;TR=72;WE=202287545;WS=202287527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,78:0.63:123
chr1	202287813	rs788793	T	C	3174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.086;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=70;PP=2416;ReadPosRankSum=-0.798;SC=TCCTCAGCTTTGCCTCCATGC;SOR=0.594;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=210;TCF=91;TCR=119;TR=125;WE=202287821;WS=202287803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,128:0.60:214
chr1	202304868	rs14451	T	C	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=227;ReadPosRankSum=0.325;SC=TCTTCAGACGTGAAGCTCTCT;SOR=0.573;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=52;TCF=32;TCR=20;TR=16;WE=202304876;WS=202304858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
chr1	202318316	rs930734	A	C	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.840;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=39;PP=735;ReadPosRankSum=-0.405;SC=CCTACAGATGAGCCTTTGACC;SOR=1.569;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=63;TCF=6;TCR=57;TR=42;WE=202318324;WS=202318306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,41:0.65:63
chr1	202386075	rs2843413	T	C	3109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=75;PP=2516;SC=TGTGGCTTTGTAGTATTTGTA;SOR=3.516;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=90;TCF=14;TCR=76;TR=89;WE=202386083;WS=202386065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	202399707	.	GAT	G	449.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.701;NF=11;NR=0;PP=388;ReadPosRankSum=-0.324;SC=AGACCCAACTGATATGTTTCT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=11;WE=202399716;WS=202399697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr1	202457784	rs3820374	T	A	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.194;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.695;NF=4;NR=23;PP=600;ReadPosRankSum=-2.064;SC=TGTCATTTTGTGTATCTACCC;SOR=1.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=27;WE=202457792;WS=202457774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,26:0.72:36
chr1	202531741	rs2249811	C	T	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=1;PP=715;ReadPosRankSum=0.354;SC=GCCCTGAGGTCTGGGAACGCT;SOR=0.664;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=31;WE=202531749;WS=202531731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,33:0.67:49
chr1	202536848	rs2292489	C	T	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.812;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=3;PP=682;ReadPosRankSum=2.305;SC=CTAGACTGGGCGTTCTACTGG;SOR=1.426;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=52;TCF=46;TCR=6;TR=32;WE=202536856;WS=202536838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,34:0.63:54
chr1	202565948	rs504261	G	A	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.763;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=642;ReadPosRankSum=1.208;SC=GCCACTGGGCGATGGGCCTCC;SOR=0.391;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=118;TCF=46;TCR=72;TR=38;WE=202565956;WS=202565938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,38:0.32:119
chr1	202572105	rs55968420	GCC	G	4513.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.675;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.568;NF=41;NR=49;PP=2413;ReadPosRankSum=2.600;SC=CCCCCACTCTGCCCCCCCACA;SOR=0.820;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=147;TCF=72;TCR=75;TR=90;WE=202572114;WS=202572095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,122:0.75:163
chr1	202574784	rs1968583	G	A	2503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.753;NF=37;NR=58;PP=1917;ReadPosRankSum=0.665;SC=TGTCCTCCTGGCTCTCCCCAG;SOR=0.733;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=155;TCF=62;TCR=93;TR=95;WE=202574792;WS=202574774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,97:0.63:154
chr1	202703053	rs4310498	G	A	3338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=78;PP=2586;SC=TGTCCGAGATGGCTTGGCCTT;SOR=2.618;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=20;TCR=78;TR=98;WE=202703061;WS=202703043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	202705455	rs1141109	G	C	2026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=28;PP=1446;SC=TCAGATGTACGGGGATAGATC;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=35;TCR=28;TR=63;WE=202705463;WS=202705445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	202715244	rs3216061	G	GA	3531.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.063;NF=79;NR=27;PP=2613;ReadPosRankSum=1.596;SC=TTTTCCATAGGAAAAAAAATC;SOR=1.300;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=140;TCF=102;TCR=38;TR=106;WE=202715252;WS=202715234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,126:0.99:127
chr1	202715284	rs1141108	G	A	6665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=145;NR=50;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.440;SC=ATTTATATTTGTAAGGAGGAC;SOR=1.095;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=146;TCR=51;TR=195;WE=202715292;WS=202715274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,212:1.00:213
chr1	202718028	rs1892163	A	G	1339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=0;PP=1154;SC=ATTTTACTAAATAATACCCAA;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=38;WE=202718036;WS=202718018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	202718202	rs1892164	G	A	7917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.238;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=126;NR=116;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.714;SC=TCATCTCATCGTGGGAAAACA;SOR=0.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=243;TCF=126;TCR=117;TR=242;WE=202718210;WS=202718192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,254:1.00:255
chr1	202722277	rs4950742	G	A	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=14;PP=420;SC=TTTCAGACTCGGCTTTGTAAG;SOR=3.258;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=15;WE=202722285;WS=202722267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	202731986	rs140328663	C	CCTCAA	2150.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=40;PP=2431;SC=TTCTCCACTTCCTCATCATCT;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=40;WE=202731994;WS=202731976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	202733238	rs3196669	C	T	1968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=35;PP=1421;SC=TTCTGGCTTCCGTTGTCTCCT;SOR=1.127;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=60;TCF=24;TCR=36;TR=59;WE=202733246;WS=202733228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	202735751	rs12140729	T	C	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=34;PP=1221;SC=CAACGCCAATTTTGTGAGGGT;SOR=2.256;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=45;WE=202735759;WS=202735741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	202827191	rs6663182	G	A	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=113;ReadPosRankSum=-1.244;SC=TCAGCCTCCCGACCAGAGACC;SOR=0.142;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=7;WE=202827199;WS=202827181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
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chr1	202889207	rs7520522	T	C	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=545;SC=TTTGAGAGGCTAAGGCAGGCA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=202889215;WS=202889197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	202897431	rs10800882	A	G	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=2.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=-0.297;QD=5.86;ReadPosRankSum=0.397;SOR=0.155;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr1	202934762	rs374266770	TTTC	T	286.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=11.461;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.63;MQRankSum=-0.832;QD=20.48;ReadPosRankSum=0.000;SOR=5.279;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr1	202976622	rs199910238	G	T	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.911;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.20;MQRankSum=-1.352;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.194;SOR=2.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	202978032	rs1418444	C	G	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=682;SC=AGATATAAGACGTGATACCAG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=202978040;WS=202978022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	202987770	rs782788	T	C	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=14;PP=623;SC=TCTGTTTGTGTTGCTATAACA;SOR=0.846;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=26;WE=202987778;WS=202987760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	202987796	rs782787	G	A	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=14;PP=523;SC=ACAGATTCTGGGTAACTTAAA;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=202987804;WS=202987786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	202990110	rs140916058	CTTT	C	850.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=8.451;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.24;MQRankSum=0.447;QD=34.03;ReadPosRankSum=1.325;SOR=3.698;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,24:0.96:25
chr1	203003870	rs782800	G	A	2964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=38;PP=2179;SC=AGGGAAGGCCGAGGGGAGCTG;SOR=0.947;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=51;TCR=38;TR=89;WE=203003878;WS=203003860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	203004627	rs5780134	A	AC	789.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.77;QD=30.37;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	203006243	rs782805	A	G	4831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=50;PP=2965;SC=AACTTTCCTCAGATCTAGACC;SOR=1.795;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=119;TCR=50;TR=169;WE=203006251;WS=203006233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr1	203008174	rs61821060	G	C	6061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=108;PP=2965;SC=GAGGGGGACCGCCTGGGTCCC;SOR=0.921;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=83;TCR=108;TR=190;WE=203008182;WS=203008164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr1	203008286	rs10920553	C	G	3218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=70;PP=2381;SC=GTCAGGAGACCTTGGCGGCCA;SOR=1.654;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=34;TCR=71;TR=103;WE=203008294;WS=203008276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	203012705	rs7547566	C	G	1479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.107;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=46;PP=1233;ReadPosRankSum=-0.089;SC=ACACCTTGACCAAGAGAGCAG;SOR=1.621;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=75;TCF=12;TCR=63;TR=52;WE=203012713;WS=203012695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,52:0.68:76
chr1	203012906	rs4950908	G	A	1842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=2;PP=1524;SC=CAGTTGGGGCGGGAGCTCTGT;SOR=5.820;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=54;TCF=52;TCR=2;TR=54;WE=203012914;WS=203012896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	203013663	rs4950909	A	G	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.533;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=171;ReadPosRankSum=1.069;SC=GTTTCTTGTCAGATTTCTCCC;SOR=0.399;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=12;WE=203013671;WS=203013653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr1	203018190	rs6696772	G	C	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=63;ReadPosRankSum=-1.040;SC=TAACGCTGCTGCTCTGATACC;SOR=0.859;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=7;WE=203018198;WS=203018180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr1	203030207	rs2270544	G	A	863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=634;ReadPosRankSum=0.874;SC=GGTTGGGACTGATACTCCCAT;SOR=1.127;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=31;WE=203030215;WS=203030197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,33:0.72:46
chr1	203030261	rs17508518	C	T	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=157;ReadPosRankSum=0.602;SC=GGGCTGCCATCGATCTCACGT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=9;WE=203030269;WS=203030251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr1	203040673	rs9803710	A	G	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=250;SC=AGCAGCTTCAAAAAGGTGTGT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=203040681;WS=203040663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	203040740	rs11583155	T	C	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.892;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=509;ReadPosRankSum=0.400;SC=CTTGGACCCTTGGAAAATGGT;SOR=0.116;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=24;WE=203040748;WS=203040730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr1	203040816	rs2270540	G	C	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=18;PP=1188;ReadPosRankSum=-0.183;SC=TCTATGGACTGCAGGCACGCC;SOR=0.668;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=58;TCR=31;TR=52;WE=203040824;WS=203040806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,57:0.60:95
chr1	203044777	rs12130501	G	A	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=406;ReadPosRankSum=0.048;SC=CCACGGTCGCGGCGGCATGCT;SOR=0.818;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=57;TCF=34;TCR=23;TR=24;WE=203044785;WS=203044767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
chr1	203053768	rs903356	T	C	2170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=32;PP=1727;SC=AGTCAGGCCTTACTTACCCCC;SOR=0.787;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=30;TCR=32;TR=62;WE=203053776;WS=203053758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	203055101	rs4950877	A	G	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.827;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=689;ReadPosRankSum=0.264;SC=GGGTCGGAAAAGGCTTGTTCC;SOR=0.304;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=144;TCF=29;TCR=115;TR=40;WE=203055109;WS=203055091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,40:0.27:147
chr1	203137784	rs35823777	A	ACT	4249.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=14;PP=2957;SC=TCCTCCCGTGACTTCAGTGTG;SOR=2.761;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=86;TCF=68;TCR=18;TR=77;WE=203137792;WS=203137774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr1	203137881	.	C	CA	2806.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=0.000;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.709;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=51;PP=2775;ReadPosRankSum=-1.431;SC=CCCTCTTCTACACCTGTCCAC;SOR=0.815;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=111;TCF=27;TCR=84;TR=66;WE=203137889;WS=203137871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,86:0.65:133
chr1	203143395	rs3737872	T	C	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=1;PP=520;SC=CTGAGGAACCTGGAACTTTCT;SOR=4.514;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=19;WE=203143403;WS=203143385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	203148633	rs4950927	A	G	2331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=38;PP=1854;SC=GATCCTGGCCACAGAAGGAGC;SOR=0.744;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=37;TCR=38;TR=75;WE=203148641;WS=203148623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	203152801	rs880633	T	C	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.156;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=10;PP=966;ReadPosRankSum=1.825;SC=TGTTTGTCTCTCCGTCCAGGG;SOR=0.963;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=41;WE=203152809;WS=203152791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,43:0.66:65
chr1	203153555	rs12128727	C	T	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=1;PP=698;ReadPosRankSum=-0.809;SC=CTTTGCTACACATCAGGCAGG;SOR=0.960;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=28;WE=203153563;WS=203153545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,33:0.73:45
chr1	203153634	rs2071579	C	G	3379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.946;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=24;PP=2493;ReadPosRankSum=-0.540;SC=ACAGTGGATGCGGGAGACCCA;SOR=1.141;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=155;TCF=119;TCR=36;TR=113;WE=203153642;WS=203153624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,122:0.74:165
chr1	203154532	rs1538372	A	G	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=307;ReadPosRankSum=0.922;SC=GAAGTCTGGGATGGGGCCCGG;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=14;WE=203154540;WS=203154522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr1	203155882	rs4950928	G	C	1367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=39;PP=1167;SC=TCCACTCCCCGACGCGGCAAA;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=40;WE=203155890;WS=203155872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	203174864	rs4950932	T	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=102;ReadPosRankSum=-0.062;SC=CAGGGTTGGGTGAAGTAGCTC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=6;WE=203174872;WS=203174854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr1	203174921	rs2486951	A	G	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.564;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=188;ReadPosRankSum=1.991;SC=GTGGGCACAGATAAGCCACAT;SOR=0.412;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=11;WE=203174929;WS=203174911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr1	203175107	rs2494296	A	C	992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=26;PP=862;SC=GTTTGGGTGGACTGGCTCCCC;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=203175115;WS=203175097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	203186093	rs1065761	G	C	1874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.953;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=22;PP=1418;ReadPosRankSum=2.014;SC=CAGCCGCCCCGCTGCACAGCT;SOR=0.966;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=94;TCF=62;TCR=32;TR=67;WE=203186101;WS=203186083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,69:0.72:96
chr1	203186950	rs150192398	C	CAGACCATGGCCCCGCCCAGTCCCT	588.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.378;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.49;ReadPosRankSum=-0.150;SOR=0.373;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr1	203187341	rs142759151	T	TGGTCAA	545.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=7.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=1.367;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.840;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr1	203188692	rs2486958	A	C	1796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=11;PP=1428;SC=ATTCTCTGCAATTGGCATCCT;SOR=2.604;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=47;TCR=11;TR=57;WE=203188700;WS=203188682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	203191262	rs2244385	C	G	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=-0.623;SC=CCTCGGGGCTCAAAAGAAGCC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=4;WE=203191270;WS=203191252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr1	203192448	rs3216011	GC	G	273.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.538;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=260;ReadPosRankSum=-0.187;SC=GCCCCTGTGAGCCCCAGGTAG;SOR=0.105;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=10;WE=203192456;WS=203192438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr1	203192820	rs10920586	C	T	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.766;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=30;PP=788;ReadPosRankSum=0.074;SC=TAAGGGCCGGCCTTGGACCAG;SOR=1.828;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=36;WE=203192828;WS=203192810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,37:0.74:50
chr1	203194186	rs2297950	C	T	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.385;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=499;ReadPosRankSum=1.645;SC=TTCTGAGTGCCGAAATTCCAG;SOR=0.184;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=22;WE=203194194;WS=203194176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr1	203311736	rs1891180	T	C	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=393;ReadPosRankSum=-2.037;SC=AAGTTGGGGATGGAGGGCAGA;SOR=0.412;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=21;WE=203311744;WS=203311726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,22:0.79:28
chr1	203317162	rs7543148	C	T	3584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=49;PP=2870;SC=GGCAGTCGCACTCCTGGGGGC;SOR=0.884;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=58;TCR=49;TR=107;WE=203317170;WS=203317152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	203465396	rs2242199	T	C	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=23;PP=441;ReadPosRankSum=1.458;SC=CTACATTCCCTGCATGACACT;SOR=0.385;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=29;WE=203465404;WS=203465386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,29:0.74:39
chr1	203652444	rs1419114	A	G	3430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=51;PP=2619;SC=AGCTGCGTTCAAGGGATGCAC;SOR=0.856;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=59;TCR=51;TR=110;WE=203652452;WS=203652434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	203667409	rs2228445	T	C	3709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=57;PP=2800;SC=ATGTCACGCTTATCATCCTGG;SOR=0.820;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=48;TCR=57;TR=105;WE=203667417;WS=203667399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr1	203667577	rs139986068	TA	T	167.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=266;ReadPosRankSum=-1.314;SC=GGTTATAGCTTAAAACATTTC;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=9;WE=203667585;WS=203667567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr1	203677250	rs3753036	G	A	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.386;SOR=0.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,49:0.26:189
chr1	203679934	rs2032018	A	G	2659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=23;PP=2049;SC=TTGCCAAAATACCTGTCAATG;SOR=1.845;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=56;TCR=23;TR=79;WE=203679942;WS=203679924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
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chr1	203740615	rs3737976	T	C	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=5.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.29;ReadPosRankSum=0.754;SOR=1.322;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,26:0.21:124
chr1	203741368	rs3737973	C	A	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=151;ReadPosRankSum=1.386;SC=TCACTGCAAACAAACAGCATG;SOR=0.536;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=7;WE=203741376;WS=203741358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr1	203742915	rs6697274	G	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.230;NF=11;NR=0;PP=233;ReadPosRankSum=-0.303;SC=TTTTTTTTCAGAATATGCCAG;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=11;WE=203742923;WS=203742905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr1	203743122	rs3820194	G	A	2585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.429;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=45;PP=2051;ReadPosRankSum=-0.516;SC=TCACTCCCTCGGCACACTGCA;SOR=0.566;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=143;TCF=77;TCR=66;TR=96;WE=203743130;WS=203743112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,96:0.68:141
chr1	203743653	rs3766748	C	T	2334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.672;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=41;PP=1762;ReadPosRankSum=-0.101;SC=ATTATGCAGACTTTCAGCCAT;SOR=0.786;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=62;TCR=63;TR=82;WE=203743661;WS=203743643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,88:0.66:134
chr1	203766827	rs872032	T	C	2227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.394;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=50;PP=1603;ReadPosRankSum=-1.341;SC=CAAAACAGCCTGCTAAAAAGA;SOR=0.605;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=329;TCF=183;TCR=146;TR=109;WE=203766835;WS=203766817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:220,110:0.33:330
chr1	203787700	rs4951260	T	C	2241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=6;PP=1773;SC=GTTTACAGGGTGACAGCTGCC;SOR=4.438;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=61;TCR=6;TR=67;WE=203787708;WS=203787690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	203803016	rs6694647	A	G	2076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=51;PP=1715;SC=TTTCTTTTCTACTTGTTTGTG;SOR=2.904;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=12;TCR=51;TR=63;WE=203803024;WS=203803006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	203818973	rs41299639	C	A	2448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.603;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.753;NF=36;NR=55;PP=1861;ReadPosRankSum=-0.322;SC=GAGATGTAGCCTCTTGCAATA;SOR=0.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=61;TCR=92;TR=91;WE=203818981;WS=203818963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,93:0.59:158
chr1	203819177	rs11808915	T	C	2808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.652;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=74;PP=2256;ReadPosRankSum=0.700;SC=ATACTGTGTATTGCTTTAGGT;SOR=0.939;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=140;TCF=34;TCR=106;TR=96;WE=203819185;WS=203819167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,99:0.67:147
chr1	203821200	rs7512877	G	A	2509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=4;PP=2112;SC=CTTTGTGTCCGTGAGACTAGG;SOR=5.367;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=71;TCR=4;TR=75;WE=203821208;WS=203821190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	203821314	rs41264265	G	A	3074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.611;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.698;NF=64;NR=63;PP=2672;ReadPosRankSum=-1.327;SC=CCTCACCCCCGGAGGTGTCTG;SOR=0.641;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=176;TCF=87;TCR=89;TR=127;WE=203821322;WS=203821304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,116:0.69:168
chr1	204006538	rs4951291	T	C	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=15;NR=3;PP=502;SC=ATCACCTTCCTCTCATGCTGC;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=204006546;WS=204006528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	204006597	rs4951039	G	A	1320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=5;PP=1097;SC=ACAAGCCCGCGCGATGGGAGT;SOR=3.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=40;WE=204006605;WS=204006587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	204010389	rs10437107	G	T	3221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=91;PP=2876;SC=GGAATCGGGCGGAGTGATTAG;SOR=6.316;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=93;TCF=2;TCR=91;TR=93;WE=204010397;WS=204010379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	204081655	rs374243810	A	ACACACT,ACACACACACT	902.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=64.69;QD=75.23;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,7,5:0.58,0.42:12
chr1	204081892	rs2250538	C	T	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.565;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=361;ReadPosRankSum=0.874;SC=TGTGGGTTCACAAGTAAGCTT;SOR=0.321;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=17;WE=204081900;WS=204081882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr1	204082002	rs2293336	C	T	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=199;ReadPosRankSum=-0.990;SC=CAGAAGTTTACGACTGGGGAC;SOR=0.983;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=13;WE=204082010;WS=204081992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,15:0.32:47
chr1	204085609	rs7551756	A	G	3831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.500;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=74;PP=2962;ReadPosRankSum=1.141;SC=AAAAGTCTCAATGGGGTCTGT;SOR=0.738;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=214;TCF=95;TCR=119;TR=132;WE=204085617;WS=204085599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,140:0.62:226
chr1	204091245	rs2692018	G	A	1606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=6.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.768;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=14;PP=1304;ReadPosRankSum=-0.611;SC=CTCCTTCTGCGTCCACTTTTC;SOR=0.125;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=98;TCF=80;TCR=18;TR=56;WE=204091253;WS=204091235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,59:0.57:104
chr1	204094963	rs12566764	C	T	1474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.809;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=5;PP=1065;ReadPosRankSum=0.063;SC=CATCCATCACCGTTCCCCTTC;SOR=0.037;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=89;TCF=84;TCR=5;TR=49;WE=204094971;WS=204094953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,53:0.56:94
chr1	204103618	rs2293335	G	A	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=468;ReadPosRankSum=0.262;SC=TTTTCTCCACGTCCCACCATC;SOR=0.616;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=58;TCF=48;TCR=10;TR=27;WE=204103626;WS=204103608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr1	204108961	rs11799485	A	G	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=429;ReadPosRankSum=0.530;SC=GCATGTTACTATACTGAATAC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=18;WE=204108969;WS=204108958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr1	204110334	rs10793755	A	G	4965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=56;PP=2965;SC=GACCTAAATCAAGGTCTAACT;SOR=1.650;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=172;TCF=116;TCR=56;TR=172;WE=204110342;WS=204110324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr1	204120881	.	C	A	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.634;ClippingRankSum=0.000;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.963;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=34;PP=720;ReadPosRankSum=1.021;SC=GCGCTGGCCGCCGCCTTCTCC;SOR=1.234;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=150;TCF=48;TCR=102;TR=45;WE=204120889;WS=204120871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,44:0.30:149
chr1	204129671	rs5707	A	C	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.579;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=2;PP=492;ReadPosRankSum=-1.170;SC=CAGATGACCTAGGGCGGCCCA;SOR=1.863;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=99;TCF=84;TCR=15;TR=30;WE=204129679;WS=204129661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,30:0.30:100
chr1	204130376	rs2272237	G	C	1478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-7.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.842;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=6;PP=1163;ReadPosRankSum=-0.995;SC=ATGCACAGTAGGGCAGGGGGA;SOR=0.204;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=84;TCF=78;TCR=6;TR=55;WE=204130384;WS=204130366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,55:0.65:85
chr1	204159542	.	G	C	62	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5002;HP=10;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=2;NR=1;PP=62;QD=32.2570708491;SC=CTACGTCCCCGCCCCCCGCCC;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=3;WE=204159550;WS=204159532;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,3:0.60:5
chr1	204159787	rs4889	G	C	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.845;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=217;ReadPosRankSum=-1.205;SC=CGGCTGCTGGGGGCTCCCGGA;SOR=1.096;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=67;TCF=34;TCR=33;TR=18;WE=204159795;WS=204159777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,18:0.26:70
chr1	204214975	.	TAC	T	135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-2.103;QD=5.22;ReadPosRankSum=-1.726;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr1	204228936	rs56066023	G	C	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.176;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=316;ReadPosRankSum=-1.058;SC=GGGGGTGCCAGACTGGGAAGA;SOR=0.255;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=16;WE=204228944;WS=204228926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr1	204234222	rs4076020	T	C	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=1.843;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.79;ReadPosRankSum=-1.122;SOR=0.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr1	204234225	rs4073136	G	A	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.88;ReadPosRankSum=-1.224;SOR=0.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,19:0.35:54
chr1	204237416	rs10900571	C	T	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.504;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=650;ReadPosRankSum=0.434;SC=CCAAAGGCGACGGCTTTGCGG;SOR=0.320;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=97;TCF=29;TCR=68;TR=39;WE=204237424;WS=204237406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,42:0.42:101
chr1	204379617	rs3014626	T	C	4347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=70;NR=58;PP=2965;SC=TTGCCCCTTGTTAGCCTGTTG;SOR=0.908;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=129;TCF=70;TCR=59;TR=128;WE=204379625;WS=204379607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	204409281	rs3014631	C	G	2581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=1;PP=2194;SC=ATAAGCAAAGCGGTCCCCTCC;SOR=6.466;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=74;TCF=73;TCR=1;TR=74;WE=204409289;WS=204409271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	204413297	rs2292459	C	T	5373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.93;SOR=0.856;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	204413297	.	CGG	TGA	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=55;NR=50;PP=2947;QD=20;SC=GGGCCTGTTTCGGAGAAAGGG;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=57;TCR=51;TR=105;WE=204413307;WS=204413287;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,105:0.97:108
chr1	204413299	rs2292460	G	A	5373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.16;SOR=0.853;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	204418889	rs2999492	C	T	369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=333;SC=TCTCCCAAGGCGCACTGGCCA;SOR=2.670;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=204418897;WS=204418879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	204418939	rs3014637	C	T	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=20;NR=4;PP=593;SC=CCCTCCTCCCCTTCCAAGGCC;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=204418947;WS=204418929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	204419217	rs371889705	C	CAGGCTG	1059.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.694;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.995;NF=1;NR=16;PP=948;ReadPosRankSum=-1.995;SC=CCCAGGAAGTCAGGCTGAGGC;SOR=0.207;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=50;TCF=4;TCR=46;TR=17;WE=204419225;WS=204419207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr1	204426052	rs2999490	A	C	81.18	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=2;NR=1;PP=51;SC=ACACACACACACCAGCCGAAC;SOR=2.303;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=204426060;WS=204426042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	204429212	rs5013460	AT	TG	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.29;SOR=2.191;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	204429215	rs5013458	TA	AG	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.63;SOR=2.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	204429285	rs2999485	A	G	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=12;PP=428;SC=AGAGGGAAGAAATGAAACATG;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=204429293;WS=204429275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	204429838	rs2271414	C	G	1284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=17;PP=980;SC=GACTCAGTGGCAAGGGAGATA;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=20;TCR=17;TR=37;WE=204429846;WS=204429828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	204433093	rs2271415	A	C	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=2;PP=1010;SC=CCCCCTCACAATCTTACTACC;SOR=5.084;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=38;WE=204433101;WS=204433083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	204433511	rs11455991	T	TC	552.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=679;SC=GGAAATCGAGTCAAAACACAG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=204433519;WS=204433501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	204434277	rs2942149	T	C	1417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=2;PP=1188;SC=AAAGAAAGTTTGGAAATGGAT;SOR=5.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=40;WE=204434285;WS=204434267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	204438334	rs1124777	C	T	4405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=94;PP=2965;SC=GCAGTTTGCCCGGCAATTGTT;SOR=1.772;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=42;TCR=94;TR=136;WE=204438342;WS=204438324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr1	204438643	rs1553921	G	T	3915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=50;PP=2965;SC=CCTGTGGGGAGAGTGAGTTGT;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=75;TCR=50;TR=125;WE=204438651;WS=204438633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	204494756	.	G	GT	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.822;ClippingRankSum=0.000;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=3.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=0.195;QD=0.89;ReadPosRankSum=-1.112;SOR=0.201;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,23:0.18:126
chr1	204505976	rs35493922	GA	G	372.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.693;NF=13;NR=2;PP=333;ReadPosRankSum=-0.456;SC=ATAAGACAATGAAAAAAATTA;SOR=1.426;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=15;WE=204505984;WS=204505966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr1	204506107	rs4245738	C	T	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=32;PP=1303;ReadPosRankSum=-1.097;SC=ATCCAGATTTCAAGATCCCAT;SOR=0.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=79;TCF=37;TCR=42;TR=60;WE=204506115;WS=204506097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,59:0.75:79
chr1	204512100	rs4252717	T	C	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=34;PP=1001;ReadPosRankSum=0.202;SC=AGGGAAGTGGTTTTTTTTCTT;SOR=0.574;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=46;TCF=5;TCR=41;TR=39;WE=204512108;WS=204512090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,41:0.87:47
chr1	204515863	rs2290855	C	T	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=0;PP=791;ReadPosRankSum=0.709;SC=TTTTTGCTTTCAGTTAATTAG;SOR=1.755;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=32;WE=204515871;WS=204515853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,34:0.69:49
chr1	204516025	rs2290854	A	G	5826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.992;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=84;PP=2962;ReadPosRankSum=0.046;SC=TTTAGCAAGAACTATTTTGCA;SOR=0.867;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=327;TCF=183;TCR=144;TR=199;WE=204516033;WS=204516015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,212:0.62:342
chr1	204518842	rs4245739	C	A	1470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.095;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=47;PP=1171;ReadPosRankSum=1.902;SC=GCATTTATTCCGTTCACTTAC;SOR=3.535;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=74;TCF=2;TCR=72;TR=47;WE=204518850;WS=204518832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,49:0.64:76
chr1	204587145	rs34771052	A	G	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.924;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=375;ReadPosRankSum=-1.678;SC=CCTCCCACCCACACCCTTCCT;SOR=0.856;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=76;TCF=43;TCR=33;TR=24;WE=204587153;WS=204587135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,25:0.32:77
chr1	204587240	rs3747632	G	A	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.767;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=1079;ReadPosRankSum=-0.678;SC=GCCCAGGACGGTCCCCTAAGG;SOR=0.671;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=85;TCF=42;TCR=43;TR=51;WE=204587248;WS=204587230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,55:0.61:90
chr1	204913271	rs12061847	C	G	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=3;PP=670;SC=GGGGGCTCTTCGGTCCTCCAA;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=204913279;WS=204913261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	204915393	rs2595960	A	G	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=14;PP=1160;SC=ATGCACCAGGAAGTGAGCTAA;SOR=1.559;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=43;WE=204915401;WS=204915383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	204917680	rs2068667	C	T	3189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=16;PP=2593;SC=CTGGCTCGCTCACCTCTCTGG;SOR=3.166;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=76;TCR=16;TR=92;WE=204917688;WS=204917670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	204926980	rs7519658	C	T	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.517;SOR=0.378;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,17:0.20:86
chr1	204931077	rs12740109	G	A	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=188;ReadPosRankSum=-0.592;SC=TTCACTGAGCGTATTGCCTTT;SOR=0.336;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=10;WE=204931085;WS=204931067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr1	204943285	rs2595945	A	T	4602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=34;PP=2965;SC=GGCACTCGAGATTGCTTCTCT;SOR=2.319;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=108;TCR=34;TR=142;WE=204943293;WS=204943275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	204943947	rs2246662	C	A	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.211;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=34;PP=1040;ReadPosRankSum=2.066;SC=GCCTGGAGGTCAAAGGTAAAG;SOR=0.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=18;TCR=44;TR=48;WE=204943955;WS=204943937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,48:0.76:63
chr1	204943991	rs2246661	C	T	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.99;ReadPosRankSum=-0.494;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,30:0.81:37
chr1	204943991	.	CA	TG	688	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=7;NR=23;PP=688;QD=24.7155958287;SC=TGGAGAGGGACAAGGAGGCCA;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=30;WE=204944000;WS=204943981;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,30:0.83:36
chr1	204943992	rs2794861	A	G	1547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.83;SOR=2.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	204945338	rs34566896	CTA	C	610.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.756;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.313;NF=7;NR=8;PP=569;ReadPosRankSum=1.442;SC=CCTCCCCTCTCTATAGGAGAC;SOR=0.155;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=15;WE=204945347;WS=204945328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr1	204960239	rs3820336	C	T	1380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=1;PP=1151;ReadPosRankSum=-2.161;SC=GACCGTGAACCCTGAATGCCA;SOR=0.968;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=61;TCF=60;TCR=1;TR=45;WE=204960247;WS=204960229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,46:0.73:63
chr1	204966428	rs2802808	C	G	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.429;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=20;PP=924;ReadPosRankSum=-0.094;SC=CTACCACCATCGCCACCACCA;SOR=0.542;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=156;TCF=97;TCR=59;TR=49;WE=204966436;WS=204966418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,48:0.31:154
chr1	204966690	rs2794858	G	A	3981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=99;PP=2965;SC=ACCCGTGACTGGATGCTCAGT;SOR=3.277;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=19;TCR=99;TR=118;WE=204966698;WS=204966680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	204966749	rs2595944	A	G	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=30;PP=798;ReadPosRankSum=0.422;SC=TGACACACACACACTCCTTGG;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=31;WE=204966757;WS=204966739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,32:0.74:43
chr1	204978445	rs3839001	G	GCTT	8786.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.922;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.515;NF=61;NR=112;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.142;SC=TCAACCTTCTGCTTATTTGCT;SOR=0.635;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=267;TCF=96;TCR=171;TR=173;WE=204978453;WS=204978435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,217:0.69:315
chr1	204978533	rs1530745	A	G	7206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.213;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.186;NF=124;NR=107;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.417;SC=GTCCTTTAGCAGGGTAGTTTG;SOR=0.385;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=232;TCF=124;TCR=108;TR=231;WE=204978541;WS=204978523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,240:1.00:241
chr1	204978643	rs1530744	C	A	2220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.661;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=50;PP=1752;ReadPosRankSum=0.838;SC=CCATCTCCCCCATGAAATCAT;SOR=0.484;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=315;TCF=174;TCR=141;TR=102;WE=204978651;WS=204978633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:230,104:0.31:334
chr1	204978704	rs55678495	G	A	1845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FS=3.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.03;ReadPosRankSum=0.319;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:221,85:0.28:306
chr1	205028883	rs35182846	CAG	C	1434.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=29;PP=1346;SC=TGAGGGCAGGCAGAGTCAGGG;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=29;WE=205028892;WS=205028873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	205034852	rs143128501	A	ATGGCCTGCTGCACTGGTCAGGGCCGGTGGTC	1544.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=102.98;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	205038731	rs2305275	C	T	1491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=45;PP=1350;SC=CCTCCCTGACCCCTCTCCCGC;SOR=3.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=7;TCR=45;TR=52;WE=205038739;WS=205038721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	205039288	rs12134724	T	C	2180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=48;PP=1812;ReadPosRankSum=1.116;SC=CTCAGTTCCATAGGAGGAGGT;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=16;TCR=49;TR=64;WE=205039296;WS=205039278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr1	205040943	rs12117194	C	G	285.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=265;SC=ATGATCTAGTCTCCAGGTTCT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=205040951;WS=205040933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	205041015	rs11240349	G	A	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=609;SC=TGTGGGGGCCGGGGCAGCCCT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=205041023;WS=205041005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
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chr1	205053219	rs4951168	C	T	4383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=48;PP=2965;SC=TTCTAAGCGCCGAGTCTGACA;SOR=1.441;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=83;TCR=48;TR=131;WE=205053227;WS=205053209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr1	205063949	rs3738154	C	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.153;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=325;ReadPosRankSum=1.751;SC=TCAAGGGCTACACAAAGCAAG;SOR=0.083;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=16;WE=205063957;WS=205063939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr1	205065733	rs11577406	G	T	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=323;ReadPosRankSum=-0.766;SC=CGCTCAAACAGGAAATTACCA;SOR=1.931;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=15;WE=205065741;WS=205065723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr1	205069404	rs11240356	G	A	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.763;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=28;PP=587;ReadPosRankSum=0.794;SC=AAGCAACTACGGGAAGGATAA;SOR=0.976;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=106;TCF=32;TCR=74;TR=37;WE=205069412;WS=205069394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,39:0.34:115
chr1	205074424	rs3738155	C	T	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=3.453;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=123;ReadPosRankSum=0.804;SC=TTTTGTTCCACGTATACTCAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=205074432;WS=205074414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr1	205083865	rs11240360	T	C	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=403;ReadPosRankSum=-0.117;SC=TGCAAATATATAGTCATCATT;SOR=0.250;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=18;WE=205083873;WS=205083855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr1	205084120	rs7515178	G	A	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=494;ReadPosRankSum=1.199;SC=AAGAATAGAGGCAACAATAGC;SOR=1.493;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=23;WE=205084128;WS=205084110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr1	205090885	rs61822619	C	G	3074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.098;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=36;PP=2403;ReadPosRankSum=0.441;SC=CATAGCCGAACAGTGTCCCTA;SOR=0.517;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=170;TCF=118;TCR=52;TR=108;WE=205090893;WS=205090875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,111:0.63:177
chr1	205091105	rs12033568	G	C	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=234;ReadPosRankSum=1.965;SC=GAAGAGACTGGCGCAAGCTCC;SOR=1.012;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=14;WE=205091113;WS=205091095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,14:0.29:49
chr1	205116635	rs11367	A	T	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=488;ReadPosRankSum=0.896;SC=CATGGCCAAAAGGTGAGGGGG;SOR=0.689;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=83;TCR=22;TR=32;WE=205116643;WS=205116625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,32:0.29:111
chr1	205119981	rs3851295	C	T	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.867;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=265;ReadPosRankSum=0.931;SC=AGCACTGCTGCGTACCTAAGC;SOR=1.368;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=15;WE=205119989;WS=205119971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr1	205130386	rs142986970	G	A	1346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=18;PP=1038;ReadPosRankSum=-0.510;SC=CCAGACTCACGATGAAGCAAG;SOR=0.671;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=48;TCR=28;TR=49;WE=205130394;WS=205130376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,50:0.65:77
chr1	205130413	rs3851294	A	G	2366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=40;PP=1771;SC=TGTAAAGAACAGCTTTCCAGA;SOR=0.742;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=39;TCR=40;TR=79;WE=205130421;WS=205130403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	205225457	rs1172147	G	A	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.982;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=414;ReadPosRankSum=2.495;SC=ATTGTCCTCAGCTGTGGACCT;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=17;WE=205225465;WS=205225447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr1	205238275	rs1768586	A	G	4516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=79;PP=2962;ReadPosRankSum=0.101;SC=ACAATGTGGCAGAGTATCTGA;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=264;TCF=147;TCR=117;TR=177;WE=205238283;WS=205238265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,180:0.67:269
chr1	205238530	rs1779411	C	T	1976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.480;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=49;PP=1599;ReadPosRankSum=2.076;SC=GCTTTGGGGGCGGCGTGGTGG;SOR=1.095;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=120;TCF=43;TCR=77;TR=73;WE=205238538;WS=205238520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,74:0.60:124
chr1	205239031	rs1668870	C	G	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=30;PP=691;ReadPosRankSum=1.132;SC=CTGCCCACCCCCTCCTGCAGC;SOR=0.634;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=47;TCF=1;TCR=46;TR=31;WE=205239039;WS=205239021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,32:0.67:48
chr1	205240251	rs1668867	C	T	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=301;ReadPosRankSum=-0.917;SC=CCGCCAGGTACGAGCGGCTGG;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=14;WE=205240259;WS=205240241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr1	205240913	rs9659978	A	G	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=0;PP=618;SC=TCCTGAGCGCACACATGCCAG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=205240921;WS=205240903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	205272926	rs1106201	C	T	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=10.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.78;ReadPosRankSum=0.502;SOR=1.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,41:0.27:151
chr1	205272983	rs1106202	C	G	1421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.651;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=24;PP=1084;ReadPosRankSum=0.194;SC=GATGGAGGAGCAGCCCTGAAG;SOR=0.901;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=201;TCF=120;TCR=81;TR=63;WE=205272991;WS=205272973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,65:0.32:204
chr1	205274174	rs10793728	A	G	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=61;ReadPosRankSum=0.278;SC=CAGAGGTCTCAACATTGGACA;SOR=0.346;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=8;WE=205274182;WS=205274165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr1	205275206	rs4951195	AG	TT	2253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=10;PP=1110;SC=GAGGCTTGAGAGTTGTGCTCT;SOR=2.701;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=48;WE=205275215;WS=205275196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	205275421	rs4951197	A	G	2409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=54;PP=1889;SC=GGTTGGAGAGACCGAAGTCAG;SOR=1.863;Source=Platypus;TCF=25;TR=79;WE=205275429;WS=205275411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	205306590	rs3210952	G	A	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.303;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=462;ReadPosRankSum=-0.533;SC=CACCTCCCACGGCGAGGAGGC;SOR=1.410;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=23;WE=205306598;WS=205306580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr1	205312280	rs7549293	C	G	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=410;ReadPosRankSum=0.160;SC=CAGCAAATGCCTGTTGGTTTC;SOR=0.409;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=59;TCR=2;TR=26;WE=205312288;WS=205312270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,27:0.42:65
chr1	205312767	rs7526603	G	T	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=456;ReadPosRankSum=-1.249;SC=GCCGGGAGAGGTGCGAGCGCG;SOR=0.593;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=20;WE=205312775;WS=205312757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr1	205325609	rs2298250	C	A	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=741;ReadPosRankSum=0.337;SC=ACCAGCAGGCCCTCAGAATGC;SOR=0.672;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=139;TCF=71;TCR=68;TR=51;WE=205325617;WS=205325599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,50:0.35:143
chr1	205353492	rs2274702	A	C	1424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.863;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=38;PP=1132;ReadPosRankSum=-1.098;SC=GCCTCAGGCCACTGATAAACA;SOR=1.382;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=77;TCF=29;TCR=48;TR=58;WE=205353500;WS=205353482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,56:0.75:75
chr1	205385498	rs6688045	C	T	5292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=101;PP=2965;SC=ACATCAATCACCAGGGTGAAT;SOR=1.240;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=65;TCR=101;TR=166;WE=205385506;WS=205385488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr1	205389460	rs16855560	T	C	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=428;ReadPosRankSum=-0.183;SC=TCTTTGTGGTTTTCTGTTTTC;SOR=1.445;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=18;WE=205389468;WS=205389450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr1	205492756	rs7529442	A	G	3609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=53;PP=2929;SC=CCATGGAGGTAAGGGCCTCTG;SOR=0.711;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=52;TCR=53;TR=105;WE=205492764;WS=205492746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	205495392	rs2297837	A	G	6223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=97;PP=2965;SC=AGCTGGGGGTAGAGGATCATT;SOR=0.783;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=186;TCF=89;TCR=97;TR=185;WE=205495400;WS=205495382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr1	205495976	rs1544154	A	G	3857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=78;PP=2965;SC=GTGAGGCCTCAGGGGCAGGGT;SOR=1.259;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=52;TCR=79;TR=130;WE=205495984;WS=205495966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	205498021	rs7531230	T	C	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=3;PP=517;SC=AGAGCCACGATCCCTGCAGCC;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=18;WE=205498029;WS=205498011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	205499577	rs6668356	C	G	977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.432;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;ReadPosRankSum=-0.352;SC=GAGGCCCCAGCCCCAGCAGAG;SOR=0.351;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=68;TCF=23;TCR=45;TR=34;WE=205499585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,36:0.51:71
chr1	205499660	rs41264895	C	T	1510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=16;PP=1223;ReadPosRankSum=0.601;SC=GGAAATGAGACGCTGCCTCGA;SOR=0.719;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=76;TCF=52;TCR=24;TR=53;WE=205499668;WS=205499650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,55:0.68:81
chr1	205500543	rs11240507	T	C	3579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=59;PP=2699;ReadPosRankSum=-0.719;SC=GGACAAGAGATCACATGGAGC;SOR=0.664;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=207;TCF=117;TCR=90;TR=134;WE=205500551;WS=205500533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,138:0.65:213
chr1	205500586	rs146709978	C	G	1437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.593;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=43;PP=1051;ReadPosRankSum=-0.711;SC=CTGTGTGGCCCTCGGAGGACT;SOR=0.775;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=165;TCF=63;TCR=102;TR=68;WE=205500594;WS=205500576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,69:0.40:171
chr1	205549122	rs77822322	T	A	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.664;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=292;ReadPosRankSum=-0.570;SC=GGGGAGGGCATGGGAGCTCCC;SOR=1.931;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=16;WE=205549130;WS=205549112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
chr1	205554085	rs7526132	G	C	7886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=4.159;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=42.63;ReadPosRankSum=0.438;SOR=1.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,184:0.99:185
chr1	205554095	rs7515820	A	C	7434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=4.451;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=43.73;ReadPosRankSum=1.254;SOR=1.253;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,169:0.99:170
chr1	205555145	rs7531623	G	A	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=60;ReadPosRankSum=0.652;SC=GCTCAACAGCGCCCGGTCTCT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=205555153;WS=205555135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	205561372	rs7529077	C	T	1656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=38;PP=1357;ReadPosRankSum=0.320;SC=GCAGCACCTTCCCCAGCATGC;SOR=0.743;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=25;TCR=55;TR=55;WE=205561380;WS=205561362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,58:0.68:85
chr1	205561494	rs72128490	CTCT	C	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.057;NF=0;NR=4;PP=55;ReadPosRankSum=1.484;SC=TCTCTCTGTGCTCTTTTTTTT;SOR=0.250;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=4;WE=205561504;WS=205561484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,3:0.17:18
chr1	205561511	rs6593956	T	A	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.92;QD=32.81;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	205568213	rs2282449	C	T	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=526;ReadPosRankSum=-0.275;SC=ACACCTTCCACGTGAAGTTTT;SOR=0.659;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=106;TCF=85;TCR=21;TR=33;WE=205568221;WS=205568203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,34:0.32:106
chr1	205568390	rs2282450	T	A	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.522;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=294;ReadPosRankSum=1.006;SC=GTAAGGAAAGTATCTGTTTCT;SOR=0.269;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=62;TCF=15;TCR=47;TR=19;WE=205568398;WS=205568380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,19:0.30:63
chr1	205568438	rs2282451	G	T	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.258;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=275;ReadPosRankSum=0.573;SC=GTCGGGGAGCGGGGGAGCAGG;SOR=0.193;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=18;WE=205568446;WS=205568428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr1	205600653	rs6593957	C	T	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=1;PP=23;SC=CCGGCCCCCGCCCCCACTTCC;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=205600661;WS=205600643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	205615947	rs4951250	C	A	679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.131;NF=0;NR=38;PP=541;ReadPosRankSum=-1.973;SC=AAAAAAAAAACACCTTTTTAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=38;WE=205615955;WS=205615936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,29:0.94:31
chr1	205628308	rs17347787	G	A	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.721;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=215;ReadPosRankSum=-2.176;SC=TAACAGGAGCGGGGAGCTGGG;SOR=0.069;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=43;TCF=40;TCR=3;TR=14;WE=205628316;WS=205628298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr1	205630893	rs3761916	A	G	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=111;ReadPosRankSum=0.684;SC=GCATTCTCCAAAGTTGCTTGC;SOR=0.465;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=8;WE=205630901;WS=205630883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,8:0.22:37
chr1	205686523	rs34305872	G	GT	744.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.118;HP=13;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=1.391;NF=0;NR=35;PP=475;ReadPosRankSum=-1.547;SC=AAATTCTAGGGTTTTTTTTTT;SOR=2.143;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=68;TCF=4;TCR=64;TR=35;WE=205686531;WS=205686513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,35:0.81:43
chr1	205687348	rs71709139	CTTTTTTCTTT	C	1636.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.49;QD=43.07;SOR=5.031;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	205689807	rs823094	T	G	2704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=65;PP=2199;SC=TACCATGATATAATGATTAAA;SOR=3.912;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=9;TCR=66;TR=74;WE=205689815;WS=205689797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	205696671	rs1772147	G	A	1388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=0;PP=1106;SC=TTGTATACTCGAGCACAGCCT;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=39;WE=205696679;WS=205696661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	205718967	rs186075993	G	A	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=202;ReadPosRankSum=-0.734;SC=GGCCCCGAAAGGGAGGAGGCC;SOR=0.569;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=51;TCF=42;TCR=9;TR=14;WE=205718975;WS=205718957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,16:0.30:54
chr1	205739396	rs823139	T	G	2972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=16;PP=2270;SC=TTAATAAAATTGTCAGGTGGG;SOR=2.910;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=67;TCR=16;TR=83;WE=205739404;WS=205739386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	205744138	rs708725	G	T	3769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.806;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=84;PP=2965;ReadPosRankSum=1.442;SC=GGGATCGGGGGTCGCTCGTTT;SOR=1.492;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=125;TCF=41;TCR=84;TR=124;WE=205744146;WS=205744128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,123:0.99:124
chr1	205764640	rs823156	G	A	2281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=47;PP=1798;SC=GACACAGACAGAGGTCAGAGG;SOR=1.819;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=68;WE=205764648;WS=205764630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	205766159	rs5780304	CA	C	3474.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=49;PP=2951;SC=CAAAATGACGCAAAGACCACT;SOR=0.754;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=86;TCF=35;TCR=51;TR=79;WE=205766167;WS=205766149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	205767885	rs708727	G	A	7131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=118;PP=2965;SC=GTGTGGCCACGTTGTCTGGGT;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=219;TCF=101;TCR=118;TR=218;WE=205767893;WS=205767875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr1	205801872	rs1361754	A	G	5312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=95;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.833;SC=ATCAGCCACAATGTTCTTCGT;SOR=0.399;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=162;TCF=66;TCR=96;TR=161;WE=205801880;WS=205801862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,166:0.99:167
chr1	205809642	rs10900525	G	C	262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=208;SC=GAGCTGAAGGGGTGTCTCTGC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=205809650;WS=205809632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	205814497	rs1891460	T	C	7300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=132;PP=2965;SC=CCATAGATGATGCCATCACGC;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=250;TCF=118;TCR=132;TR=249;WE=205814505;WS=205814487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr1	205890679	rs12759719	T	C	1950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=19;PP=1522;SC=TGCTTGCTGTTCCCGAGGGCC;SOR=1.727;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=59;WE=205890687;WS=205890669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	205896293	rs73082393	T	G	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=388;ReadPosRankSum=-1.530;SC=GGGATTGTTCTTATTGGAGTC;SOR=0.436;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=26;WE=205896301;WS=205896283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr1	205896475	rs7366204	C	T	1831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=31;SC=TCTTGATTTACTTCCAATCCA;SOR=0.762;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=60;TCF=29;TCR=31;TR=59;WE=205896483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	205896948	rs3811424	A	G	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.018;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=222;ReadPosRankSum=-2.075;SC=CCTCAGCCCAATGATCTCCCC;SOR=0.015;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=10;WE=205896956;WS=205896938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr1	205901788	rs3811423	G	T	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=90;ReadPosRankSum=-0.792;SC=CCCATCCTTGGGGTCTGGGTC;SOR=0.634;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=7;WE=205901796;WS=205901778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr1	205902242	rs41305064	G	A	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.926;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=188;ReadPosRankSum=-0.035;SC=ATTTCCAGTCGGCTCTGCATG;SOR=0.207;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=54;TCF=13;TCR=41;TR=14;WE=205902250;WS=205902232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,16:0.26:61
chr1	206327510	rs61742539	T	C	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.883;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=11;PP=1021;ReadPosRankSum=-1.728;SC=AGCTGATTTTTGGAGGCTACG;SOR=0.307;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=80;TCF=64;TCR=16;TR=47;WE=206327518;WS=206327500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,50:0.60:84
chr1	206328647	rs28694519	G	C	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=640;ReadPosRankSum=2.366;SC=CATTTGAGAGGCCAAAAAAGA;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=25;WE=206328655;WS=206328637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,26:0.70:37
chr1	206328803	rs41302235	T	C	3123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.129;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=52;PP=2446;ReadPosRankSum=-2.540;SC=TCACTGGCCCTTCCGACAAGA;SOR=0.357;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=160;TCF=90;TCR=70;TR=108;WE=206328811;WS=206328793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,113:0.68:167
chr1	206516159	rs199928990	C	T	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.160;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.17;ReadPosRankSum=-0.666;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr1	206516261	rs201036189	C	T	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.77;MQRankSum=1.146;QD=11.37;ReadPosRankSum=-1.092;SOR=0.521;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,42:0.45:93
chr1	206566860	rs11361942	TA	T	384.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.52;MQRankSum=-6.256;QD=6.01;ReadPosRankSum=-1.224;SOR=1.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,26:0.41:64
chr1	206566904	rs2919105	T	C	2021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.770;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-11.185;NF=80;NR=15;PP=2053;ReadPosRankSum=-0.425;SC=CTTTTCAGCGTCAAGCCAAGT;SOR=0.836;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=205;TCF=174;TCR=31;TR=95;WE=206566912;WS=206566894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,75:0.41:182
chr1	206567100	rs2480377	C	T	1641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=7.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.639;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.087;NF=6;NR=64;PP=1283;ReadPosRankSum=0.447;SC=AGACATTCCCCGATACTATTG;SOR=1.290;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=204;TCF=26;TCR=178;TR=70;WE=206567108;WS=206567090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,71:0.33:212
chr1	206567165	rs2480376	T	A	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.453;NF=0;NR=23;PP=390;ReadPosRankSum=1.001;SC=CCATGATCCATCAGGGTGCTT;SOR=0.656;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=80;TCF=1;TCR=79;TR=23;WE=206567173;WS=206567155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,25:0.32:79
chr1	206623685	rs12725078	G	T	2615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.871;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=31;PP=2028;ReadPosRankSum=0.368;SC=GACAAGAATTGTATGAGCACA;SOR=0.212;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=85;TCF=54;TCR=31;TR=83;WE=206623693;WS=206623675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,84:0.98:86
chr1	206623866	rs11809494	C	T	719.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=553;ReadPosRankSum=-1.286;SC=CAGAAGGAAGCGATTATATAT;SOR=2.019;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=23;WE=206623874;WS=206623856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,24:0.92:26
chr1	206626607	rs11120575	G	A	2138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.260;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=26;PP=1641;ReadPosRankSum=-0.760;SC=CCCGAGAGCTGTCCTTTAAGA;SOR=1.148;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=42;TCR=27;TR=68;WE=206626615;WS=206626597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
chr1	206626779	rs2483059	A	G	1190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=32;PP=994;SC=CTCTATGGGAATGAGACTTCA;SOR=3.855;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=36;WE=206626787;WS=206626769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	206626828	rs2483058	C	G	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=15;PP=442;SC=GCCAACCCCTCGGGGGTCCAG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=206626836;WS=206626818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	206631518	rs10864212	G	T	708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=602;SC=GTTACAGTCTGTTTGGAAAAA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=206631540;WS=206631508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	206631532	rs12565311	T	A	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=0;PP=737;SC=GGAAAAAGAGTCATGCTAAAA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=206631540;WS=206631508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	206646427	rs1930437	C	A	2105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=1;PP=1908;ReadPosRankSum=-0.679;SC=TGTGGAATGGCCACATGGAGC;SOR=5.486;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=65;TCF=64;TCR=1;TR=64;WE=206646435;WS=206646417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr1	206647742	rs1539242	A	G	2940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=41;PP=2298;SC=GCGAGGTGCAAGTGAGGGAGT;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=45;TCR=41;TR=85;WE=206647750;WS=206647732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	206647787	rs1539243	T	C	3044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=55;PP=2174;SC=ACCAGAACATTGTCAAGCTCT;SOR=0.967;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=45;TCR=55;TR=100;WE=206647795;WS=206647777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr1	206648378	rs1059704	G	A	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=31;PP=929;SC=TCAGACCAGCGGCAGGCCTGG;SOR=3.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=206648386;WS=206648368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr1	206651315	.	C	G	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.578;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.916;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=163;ReadPosRankSum=1.613;SC=ATGCTGCAGGCTTGGGCACAC;SOR=0.245;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=12;WE=206651323;WS=206651305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr1	206665896	rs2336940	C	G	4043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=54;PP=2965;SC=CGAGGGCTGACCTCCAACCCC;SOR=0.945;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=69;TCR=54;TR=122;WE=206665904;WS=206665886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr1	206667441	rs2184030	G	A	2506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=58;PP=1983;ReadPosRankSum=1.373;SC=GTCCATTTTCGAAGAAGCCCT;SOR=1.584;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=74;TCF=15;TCR=59;TR=73;WE=206667449;WS=206667431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,77:0.99:78
chr1	206670827	rs12754274	G	T	2796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=15;PP=2238;SC=TGTGTGCTTCGAAGCGTGAAG;SOR=3.030;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=67;TCR=15;TR=82;WE=206670835;WS=206670817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	206680983	rs2095124	A	C	1427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=19;PP=1079;SC=ACCCGCTACTATTGGACCCCG;SOR=1.426;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=27;TCR=19;TR=46;WE=206680991;WS=206680973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	206758077	rs4418597	T	A	3767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=92;PP=2885;SC=AAGCCCACCCTCTAAAACTCC;SOR=2.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=28;TCR=92;TR=120;WE=206758085;WS=206758067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	206758092	rs117617854	G	A	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.517;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=447;ReadPosRankSum=2.085;SC=AACTCCTGCCGGCCTTGGGTG;SOR=1.609;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=88;TCF=11;TCR=77;TR=25;WE=206758100;WS=206758082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,24:0.26:92
chr1	206766799	.	GGAGA	G	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.18;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr1	206766825	rs144194477	CGA	C	199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=7;NR=0;PP=279;SC=AGAGAGAGCGCGAGAGAGAGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=206766834;WS=206766815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	206766892	.	A	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=11.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=0.058;QD=6.99;ReadPosRankSum=-2.983;SOR=3.456;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr1	206766893	.	T	TGTGTG	179.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=11.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=0.058;QD=6.66;ReadPosRankSum=-3.298;SOR=3.456;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr1	206769047	rs11584983	T	C	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.409;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=6;PP=1204;ReadPosRankSum=-0.843;SC=TCCTTGAACATTGTGTCTTTC;SOR=1.222;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=79;TCF=69;TCR=10;TR=55;WE=206769055;WS=206769037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,58:0.71:82
chr1	206770283	rs11284613	AC	A	117.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=0.486;SC=TGTTCCAAAGACCCCCCCAAA;SOR=0.250;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=7;WE=206770291;WS=206770273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr1	206772194	rs373767533	ACT	A	181.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.68;ReadPosRankSum=1.421;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr1	206772753	rs4845116	A	G	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=1;PP=272;SC=CACTACTCAGATTGAGAGGAA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=206772761;WS=206772743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	206773659	rs6662929	A	G	3901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=74;PP=2965;SC=GTCGTCCTTCAGGGCTGATGG;SOR=1.127;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=52;TCR=74;TR=126;WE=206773667;WS=206773649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	206776200	rs6668054	C	T	1318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.96;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	206776203	rs6675741	T	C	1318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.54;SOR=5.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	206778642	rs4077413	A	C	159.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5387;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=173;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TGGGCTTAGCAACTTGCTTAA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=206778650;WS=206778632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr1	206779027	rs80043056	C	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.175;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=-0.444;SC=AGATTATGTACAAATATTACT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=206779035;WS=206779017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr1	206810946	rs17013271	C	T	1435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=0;PP=1143;ReadPosRankSum=-0.131;SC=ACATAGGATTCTATATTCTTC;SOR=1.457;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=73;TCF=73;TCR=0;TR=46;WE=206810954;WS=206810936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,48:0.65:74
chr1	206943351	rs3024494	T	C	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=23;PP=560;SC=CCAAATGCCTTGCCTCACAGC;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=206943359;WS=206943341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	206944233	rs1554286	A	G	3431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=69;NR=36;PP=2912;SC=GCAAGGGAAAAAACTGATCTG;SOR=1.542;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=69;TCR=36;TR=105;WE=206944241;WS=206944223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	206944645	rs1518111	T	C	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=3;PP=443;SC=GGAAGCAGAGTCTCCCTTCCC;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=206944653;WS=206944635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	206944861	rs1518110	A	C	1042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=25;PP=855;SC=TTTTTTAAATAAAATTGGCTC;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=32;WE=206944869;WS=206944851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	207009910	rs2243170	T	C	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=443;SC=TCCTCCCGGCTTGCCTTCGAG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=207009918;WS=207009904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	207014472	rs2243188	A	C	2403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=53;PP=1748;SC=GAGGTAGATCAGGAGGGTGCC;SOR=1.666;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=81;TCF=26;TCR=55;TR=79;WE=207014480;WS=207014462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr1	207015957	rs2243191	T	C	2492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=40;PP=1977;SC=GAAGTAATGTTCTCAGCTTGA;SOR=0.914;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=72;TCF=32;TCR=40;TR=71;WE=207015965;WS=207015947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	207040659	rs2232360	G	A	838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=0;PP=691;SC=TAGAGTTTCTGCCTGCTTCAT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=207040667;WS=207040649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	207072959	rs1150255	C	T	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=324;ReadPosRankSum=-2.058;SC=GAGTCCTTCACAGCTTGCTAA;SOR=1.708;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=15;WE=207072967;WS=207072949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr1	207074905	rs1150258	T	C	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=621;ReadPosRankSum=-0.797;SC=TTTCAAAAACTACCACAATAG;SOR=0.557;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=27;WE=207074913;WS=207074895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
chr1	207075171	rs291107	T	C	1494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=2;PP=1189;ReadPosRankSum=-1.722;SC=TTAAAGGAGGTAGCCCCTTTC;SOR=1.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=67;TCF=64;TCR=3;TR=46;WE=207075179;WS=207075161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,51:0.71:72
chr1	207086969	rs291083	A	G	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=314;ReadPosRankSum=0.032;SC=TTTCATATGGATCTCAATCAT;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=14;WE=207086977;WS=207086959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr1	207087435	rs167082	C	T	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.344;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=48;PP=1286;ReadPosRankSum=0.144;SC=TCAGGGCCCCCGATACTGCAG;SOR=1.072;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=10;TCR=71;TR=55;WE=207087443;WS=207087425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,57:0.69:83
chr1	207091138	.	AT	A	116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.714;QD=5.08;ReadPosRankSum=0.317;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr1	207108191	rs72570603	CAT	C	966.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.599;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.178;NF=0;NR=26;PP=1127;ReadPosRankSum=-0.233;SC=ATGTCATATACATATATATAT;SOR=2.964;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=3;TCR=46;TR=26;WE=207108200;WS=207108181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,30:0.81:37
chr1	207109116	rs2275531	C	T	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=41;PP=1175;ReadPosRankSum=0.037;SC=GCCACAGAGCCTCCTGCCACC;SOR=0.747;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=16;TCR=60;TR=52;WE=207109124;WS=207109106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,56:0.67:84
chr1	207109167	rs6695632	G	A	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=580;ReadPosRankSum=0.115;SC=GTGGACTCTGGAAGCACAGAC;SOR=1.270;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=24;WE=207109175;WS=207109157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr1	207110363	rs748140	A	G	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=5.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.829;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=2;PP=696;ReadPosRankSum=-0.338;SC=ATTGATGAATACACTCAGAGG;SOR=0.230;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=50;TCF=48;TCR=2;TR=31;WE=207110371;WS=207110353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr1	207110936	rs291096	T	C	2175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.747;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=40;PP=1678;ReadPosRankSum=-2.563;SC=AGTTGGGATTTACATAACCAC;SOR=0.798;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=113;TCF=55;TCR=58;TR=76;WE=207110944;WS=207110926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,78:0.68:114
chr1	207111257	rs291095	G	T	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=29;ReadPosRankSum=1.282;SC=GCTTGACAGCGGTCTTCTCCA;SOR=0.132;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=3;WE=207111265;WS=207111247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr1	207113755	rs2007272	G	C	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.974;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=430;ReadPosRankSum=0.787;SC=TCTGATTTTAGTGTCCCCAGG;SOR=0.337;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=22;WE=207113763;WS=207113745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr1	207132345	rs7556372	A	G	1541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.072;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=44;PP=1231;ReadPosRankSum=0.526;SC=GGGCTTTGCCAAAGGGGGAAA;SOR=1.142;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=103;TCF=30;TCR=73;TR=59;WE=207132353;WS=207132335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,60:0.58:103
chr1	207135389	rs12121714	C	T	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=234;ReadPosRankSum=0.195;SC=TTGAAGGCAGCCTTCTTCTGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=11;WE=207135397;WS=207135387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr1	207135546	rs1572808	G	A	2164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.064;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=35;PP=1679;ReadPosRankSum=1.257;SC=CCCATCAGCCGTCAGCTCATA;SOR=0.232;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=100;TCF=59;TCR=41;TR=77;WE=207135554;WS=207135536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,79:0.77:102
chr1	207135991	rs11119925	C	T	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=328;ReadPosRankSum=0.179;SC=AATTAGGGGTCAAGTCAGAAA;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=14;WE=207135999;WS=207135981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr1	207143422	rs1856746	A	G	1437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=16;PP=1140;ReadPosRankSum=0.760;SC=AGGAGAAAGCATCATTTCACC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=61;TCR=23;TR=59;WE=207143430;WS=207143412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,60:0.67:89
chr1	207195779	rs2842726	A	G	4405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=64;PP=2965;SC=TTAGGGATAGAAATTGGCATA;SOR=0.822;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=59;TCR=64;TR=123;WE=207195787;WS=207195769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	207237233	.	GGT	G	132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.74;ReadPosRankSum=0.382;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr1	207243851	rs923109	A	G	656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=9;PP=341;SC=CCCTGTCTCCACTCAAATTAG;SOR=1.426;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=16;WE=207243859;WS=207243841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	207245045	rs11120137	T	C	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.530;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=102;ReadPosRankSum=0.111;SC=TACGTCCAAATGTAGTTTGCT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=10;WE=207245053;WS=207245035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr1	207269919	rs8942	C	T	3620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=48;PP=2818;ReadPosRankSum=-0.859;SC=AAGGAAATAACTTCACCTTAG;SOR=0.277;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=56;TCR=48;TR=103;WE=207269927;WS=207269909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,113:0.99:114
chr1	207287580	rs370737185	C	T	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.357;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=375;ReadPosRankSum=0.779;SC=TCAACTCAGACGCTTACCTGT;SOR=0.407;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=22;WE=207287588;WS=207287570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr1	207288897	rs12031629	T	C	2021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=9.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.22;ReadPosRankSum=-0.666;SOR=0.088;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,70:0.70:100
chr1	207297484	rs2842707	G	C	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.332;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=33;PP=1230;ReadPosRankSum=-0.311;SC=TGATGCCTTCGCTGAGTATTT;SOR=0.246;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=50;WE=207297492;WS=207297474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,54:0.66:82
chr1	207297680	rs1126618	T	C	4071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.070;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=69;PP=2928;ReadPosRankSum=-1.140;SC=AAACAATAGGTGTTTGGAGAC;SOR=0.289;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=138;TCF=69;TCR=69;TR=137;WE=207297688;WS=207297670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,145:0.99:146
chr1	207300259	rs2491393	A	G	3155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=81;PP=2504;SC=GGACTGTGACAGAATTTCAAT;SOR=3.148;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=16;TCR=82;TR=97;WE=207300267;WS=207300249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	207304900	rs4844573	T	C	3060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=17;PP=2395;SC=GATAGTTGTATTAATTTACCA;SOR=2.954;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=78;TCR=17;TR=95;WE=207304908;WS=207304890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	207500293	rs4844591	C	T	1756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=49;PP=1498;SC=GCAAACCCACCTTTCAATATA;SOR=4.654;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=4;TCR=49;TR=53;WE=207500301;WS=207500283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	207504669	rs2184476	G	A	3401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=95;PP=2774;SC=TTATATTTTTGCTTTATTCTT;SOR=5.058;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=7;TCR=96;TR=102;WE=207504677;WS=207504659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	207510289	rs2490257	T	C	7587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=189;PP=2965;SC=ACCAACACCTTAGAAACCCAC;SOR=3.122;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=227;TCF=37;TCR=190;TR=226;WE=207510297;WS=207510279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr1	207510548	rs10746462	A	G	2318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=1;PP=1836;SC=ACAGCCCAAAAATTCACCACA;SOR=6.154;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=57;TCF=56;TCR=1;TR=57;WE=207510556;WS=207510538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	207510596	rs10746463	G	A	5356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=140;NR=15;PP=2965;SC=TCAGCAGCACGTAAGTCCACT;SOR=4.341;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=140;TCR=15;TR=155;WE=207510604;WS=207510586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr1	207512577	rs10641442	T	TTAA	547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=410;SC=CTTGATTAAGTTAATGTGTAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=9;WE=207512585;WS=207512567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	207520610	rs368894631	AT	A	70.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=1.667;QD=1.73;ReadPosRankSum=-2.114;SOR=0.408;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,10:0.24:41
chr1	207627693	rs3813946	T	C	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.522;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=70;ReadPosRankSum=-1.073;SC=TGCTCCAGCCTTGCCCTCCCA;SOR=0.036;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=9;WE=207627701;WS=207627683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,9:0.24:37
chr1	207641840	rs2063143	C	T	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=392;ReadPosRankSum=0.693;SC=CATCATCTGACGGCTTTTTTT;SOR=0.422;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=20;WE=207641848;WS=207641830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr1	207642295	rs1507764	G	A	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.277;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=322;ReadPosRankSum=-0.757;SC=TTGTGTGTGCGTGGTGTGGAC;SOR=0.292;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=53;TCF=9;TCR=44;TR=19;WE=207642303;WS=207642285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,19:0.34:56
chr1	207646322	rs1048971	G	A	4105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=60;PP=2965;SC=CTGCTCCCCTGTGTAAACTTT;SOR=0.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=60;TCR=60;TR=120;WE=207646330;WS=207646312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	207646462	rs17615	G	A	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.664;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=574;ReadPosRankSum=0.077;SC=TTGAAGGGCAGTAGTCAGATT;SOR=0.415;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=118;TCF=64;TCR=54;TR=33;WE=207646470;WS=207646452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,36:0.29:125
chr1	207646898	rs4308977	T	C	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.840;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=463;ReadPosRankSum=-0.894;SC=AGGCTGCCAGTCACCTCCTGG;SOR=0.121;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=74;TCF=69;TCR=5;TR=25;WE=207646906;WS=207646888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,25:0.34:74
chr1	207646923	rs17616	G	A	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=5;PP=562;ReadPosRankSum=2.406;SC=CACCATGGTCGTCATACAGGT;SOR=0.619;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=97;TCR=15;TR=36;WE=207646931;WS=207646913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,35:0.31:112
chr1	207651456	rs182850977	C	T	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=223;ReadPosRankSum=1.602;SC=AACTGGCTAACGGAGAGAAGA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=12;WE=207651464;WS=207651446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr1	207653178	rs12032512	C	G	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=0;PP=695;ReadPosRankSum=-0.443;SC=TATGATTATTCAGGAATTCAG;SOR=0.950;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=85;TCF=84;TCR=1;TR=32;WE=207653186;WS=207653168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,33:0.38:87
chr1	207653395	rs17617	C	A	5355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=94;PP=2965;SC=AAACACAGAGCACGGTAAGTT;SOR=1.118;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=161;TCF=67;TCR=94;TR=161;WE=207653403;WS=207653385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr1	207653444	rs17258996	T	A	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.455;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=30;PP=611;ReadPosRankSum=-0.912;SC=GCACAAGTGGTTTCGGCTTCT;SOR=0.926;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=146;TCF=46;TCR=100;TR=42;WE=207653452;WS=207653434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,44:0.29:152
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chr1	207680090	.	G	A	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.145;ClippingRankSum=0.000;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.712;NF=39;NR=28;PP=1045;ReadPosRankSum=-2.584;SC=CAGATCCTGTGAATGGCATGG;SOR=0.665;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=200;TCF=119;TCR=81;TR=67;WE=207680098;WS=207680080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,69:0.33:209
chr1	207760773	rs3737002	C	T	2335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.308;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=34;PP=1658;ReadPosRankSum=-1.750;SC=GCCAGTCCTACGATCCCAATT;SOR=0.997;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=125;TCF=73;TCR=52;TR=86;WE=207760781;WS=207760763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,90:0.67:135
chr1	207780585	rs115988205	C	A	2674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.206;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=19;PP=1995;ReadPosRankSum=0.766;SC=ATTTTCTATCCTTTGCTTTAG;SOR=0.994;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=173;TCF=136;TCR=37;TR=95;WE=207780593;WS=207780575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,102:0.56:181
chr1	207782916	rs4844609	A	T	6474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=112;PP=2965;SC=GAGTTTCTTTACCCTCACTGA;SOR=1.000;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=196;TCF=84;TCR=112;TR=196;WE=207782924;WS=207782906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr1	207784968	rs3818361	A	G	9167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=147;NR=135;PP=2965;SC=ATAAGATATAACAAAGGAAAT;SOR=0.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=283;TCF=147;TCR=136;TR=282;WE=207784976;WS=207784958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr1	207795320	rs2296160	A	G	2247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.96;NF=47;NR=23;PP=1664;SC=CCTTTTAGGTACACATGATGC;SOR=1.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=47;TCR=23;TR=70;WE=207795328;WS=207795310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	207804073	.	G	C	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=108;ReadPosRankSum=0.956;SC=TGATACCAAAGAATTTAGAAA;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=8;WE=207804081;WS=207804063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr1	207888739	rs7553211	G	T	3123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=80;PP=2507;SC=TCCAGTGTGTGAACGTGAGTA;SOR=3.477;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=14;TCR=80;TR=94;WE=207888747;WS=207888729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	207941191	rs2724374	G	T	2501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=58;PP=2026;SC=CCTGCTTATAGTTTTTCAAAA;SOR=3.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=12;TCR=58;TR=70;WE=207941199;WS=207941181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	207943822	rs146655610	G	A	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.431;NF=0;NR=6;PP=109;ReadPosRankSum=-0.601;SC=ATAGGTATACGTGTGCCATGT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=207943830;WS=207943812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	207959122	.	CTTT	C,CTT	624.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.29;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=169;SC=TGCATGCTATCTTTTTTTTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=11;WE=207959144;WS=207959112;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:13
chr1	207959136	rs373519619	T	TAA	703.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.40;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	208050301	rs17009221	A	G	2072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.597;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=32;PP=1588;ReadPosRankSum=1.419;SC=ATTCAAGAATATCACTGGAAA;SOR=1.059;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=232;TCF=134;TCR=98;TR=85;WE=208050309;WS=208050291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,86:0.36:239
chr1	208050360	rs17009223	G	A	1984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=62;PP=1525;ReadPosRankSum=-0.866;SC=TCCCAGAAACGGTAATGAATG;SOR=0.672;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=220;TCF=56;TCR=164;TR=82;WE=208050368;WS=208050350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,84:0.37:225
chr1	208061530	rs2235766	A	G	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.491;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=662;ReadPosRankSum=1.138;SC=CAGCTCCCGCAGGAAAACGGG;SOR=1.624;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=30;WE=208061538;WS=208061520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,35:0.76:46
chr1	208062260	rs2745952	T	C	2201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=51;PP=1797;SC=GCTCCAGCCCTCTGTGTGTGA;SOR=2.372;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=16;TCR=51;TR=67;WE=208062268;WS=208062250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	208062973	rs2745953	A	T	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=7.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.37;ReadPosRankSum=1.180;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,47:0.24:196
chr1	208063067	rs2179634	G	A	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.010;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.179;NF=22;NR=18;PP=618;ReadPosRankSum=0.798;SC=TACCCCGTCCGCAAGAAGGAT;SOR=0.499;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=134;TCF=57;TCR=77;TR=40;WE=208063075;WS=208063057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,45:0.32:142
chr1	208063100	rs5780411	G	GA	1520.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=2.479;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.35;MQRankSum=0.411;QD=23.76;ReadPosRankSum=0.847;SOR=0.286;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,60:0.94:64
chr1	208200737	rs659192	C	G	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.103;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=898;ReadPosRankSum=2.109;SC=TAGAAGACACCATTTTCTGGA;SOR=0.994;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=44;WE=208200745;WS=208200727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,47:0.73:64
chr1	208204794	rs76190764	CTGTT	C	1143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=1029;ReadPosRankSum=-0.085;SC=CATATGTGCACTGTTTGTTCC;SOR=0.846;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=24;WE=208204805;WS=208204784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr1	208207839	rs3736963	G	A	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.173;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=299;ReadPosRankSum=-1.197;SC=GGTTCTCACCGTATCTGCTGA;SOR=0.941;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=18;WE=208207847;WS=208207829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,19:0.34:56
chr1	208208124	rs6540448	C	A	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=116;ReadPosRankSum=-1.180;SC=ATAACCCAATCAAATAGCTAC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=208208132;WS=208208114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr1	208211887	rs905100	T	C	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=462;ReadPosRankSum=-1.648;SC=TGTCTCCCGATTGCACCTTCT;SOR=0.844;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=20;WE=208211895;WS=208211877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr1	208212056	rs79129786	C	T	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=304;ReadPosRankSum=-0.505;SC=GCATTTCACACGGGCCTCAGC;SOR=0.346;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=59;TCF=56;TCR=3;TR=17;WE=208212064;WS=208212046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,18:0.30:61
chr1	208212115	rs72739448	T	C	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=7.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.52;ReadPosRankSum=0.565;SOR=1.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,33:0.25:131
chr1	208212122	rs80345877	C	T	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=3.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.07;ReadPosRankSum=-2.206;SOR=1.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,40:0.29:138
chr1	208212397	rs2767566	A	G	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=418;ReadPosRankSum=-0.767;SC=GAGGGTCAGGACCTCAGAATC;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=17;WE=208212405;WS=208212387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr1	208213125	rs1751580	A	G	5574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=87;PP=2965;SC=GTGGGCACAGACAGGGCAGGA;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=172;TCF=85;TCR=87;TR=171;WE=208213133;WS=208213115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr1	208213241	rs41283118	C	T	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.203;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=709;ReadPosRankSum=-2.095;SC=TTCCTGCTCCCGAGGGAGGGG;SOR=1.342;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=97;TCF=47;TCR=50;TR=35;WE=208213249;WS=208213231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,36:0.35:102
chr1	208219164	rs1536471	A	C	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=397;ReadPosRankSum=0.918;SC=GCCAGGAGCGAGGGGCGCCCT;SOR=0.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=50;TCR=2;TR=20;WE=208219172;WS=208219154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr1	208219545	rs74152180	T	C	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.485;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=194;ReadPosRankSum=-0.210;SC=CCACCCTCTCTCTGCTTTTGT;SOR=0.136;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=10;WE=208219553;WS=208219535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr1	208224638	.	G	A	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.527;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.707;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=417;ReadPosRankSum=-0.276;SC=CGCTGGACCCGAGGGTCATCT;SOR=1.385;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=21;WE=208224646;WS=208224628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr1	208225909	rs841865	G	A	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.962;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=28;PP=650;ReadPosRankSum=-0.027;SC=CATTCTGGGCGTGGTGGTACT;SOR=0.290;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=58;TCF=11;TCR=47;TR=37;WE=208225917;WS=208225899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,37:0.63:59
chr1	208233998	rs2251465	C	T	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=3;PP=586;ReadPosRankSum=-0.725;SC=TCTGAAGCTCCCATGGGAAAA;SOR=0.593;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=80;TCF=72;TCR=8;TR=31;WE=208234006;WS=208233988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,29:0.37:78
chr1	208252777	rs17011882	G	C	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.867;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=153;ReadPosRankSum=1.550;SC=CCGCTGGGCTGCACACTTGTA;SOR=1.942;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=11;WE=208252785;WS=208252767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr1	208255877	rs6540453	T	C	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.377;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=512;ReadPosRankSum=-2.691;SC=GGCAGAGGCATGGGGCTCATG;SOR=0.059;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=49;TCF=5;TCR=44;TR=30;WE=208255885;WS=208255867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr1	208270244	rs3818517	A	C	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=1.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.25;ReadPosRankSum=-0.819;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,12:0.21:56
chr1	208270325	rs6695694	C	G	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.25;ReadPosRankSum=-0.037;SOR=0.095;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr1	208276399	rs10654695	C	CCTCT	5221.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=21;PP=2973;SC=GAGGACAATTCCTCTCTCTGC;SOR=2.368;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=100;TCF=67;TCR=33;TR=80;WE=208276407;WS=208276389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	208390155	rs4844657	C	T	7187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.56;SOR=0.861;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr1	208390162	rs4844658	T	C	7023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.90;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr1	209778737	rs2235455	G	A	1235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=1;PP=968;SC=GACTGGAGTAGTCTGCTGGCA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=35;WE=209778745;WS=209778727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	209778771	rs35508847	G	C	1712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=10;PP=1266;SC=AGTTCATGGGGGCCTGCCTGT;SOR=2.564;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=52;WE=209778779;WS=209778761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	209779126	rs11119313	C	A	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=168;SC=GGACTAGTGACTCCCAAGGCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=209779134;WS=209779116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	209779652	rs35498535	T	G	8040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=120;NR=128;PP=2965;SC=ACTACATATTTTTTCTCCTAC;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=248;TCF=120;TCR=128;TR=248;WE=209779660;WS=209779642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr1	209781125	rs760833	T	C	4192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=79;NR=56;PP=2965;SC=ACCTCTTCTCTAAGCCTGGCC;SOR=1.129;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=79;TCR=56;TR=135;WE=209781133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr1	209781417	rs143460578	TACAC	T	144	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=2;PP=106;SC=GGCACACGGGTACACACACAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=2;WE=209781428;WS=209781407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	209782343	rs11119314	A	G	2627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=23;PP=1919;SC=GATACCCCCCATTCTATGAAG;SOR=2.059;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=64;TCR=24;TR=86;WE=209782351;WS=209782333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	209784663	rs10746421	A	C	1390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=0;PP=1130;SC=CACAGAGGAGACCTGCTTGCA;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=39;WE=209784671;WS=209784653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	209785957	rs2272879	T	G	603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=1;PP=516;SC=CAGAAGGAAGTGTAGGGGGGC;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=209785965;WS=209785947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	209786078	rs2272880	G	A	2666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=26;PP=2133;SC=CTGCCCCATCGACTCTTCTTC;SOR=1.809;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=55;TCR=26;TR=81;WE=209786086;WS=209786068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	209788514	rs2566	G	A	1795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=5;PP=1456;SC=ACTTTAGGCTGCATGAAAGTC;SOR=3.990;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=57;TCF=51;TCR=6;TR=56;WE=209788522;WS=209788504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	209792015	rs5780528	A	AC	3240.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.23;NF=10;NR=68;PP=2967;SC=CTGGAAGACAACACGCATTTG;SOR=3.109;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=85;TCF=10;TCR=75;TR=78;WE=209792023;WS=209792005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
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chr1	209801351	rs75181751	C	T	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.610;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=4;PP=949;ReadPosRankSum=0.907;SC=GCCCACCCCACGTCATGCTGG;SOR=1.968;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=69;TCF=59;TCR=10;TR=42;WE=209801359;WS=209801341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,42:0.61:69
chr1	209804095	rs4844863	G	A	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.695;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=548;ReadPosRankSum=-0.309;SC=GAGGGGGACCGTCAGCCATCA;SOR=0.283;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=25;WE=209804103;WS=209804085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr1	209811829	rs2076355	A	T	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.528;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=444;ReadPosRankSum=0.859;SC=CATCCGTCTTATCCTGTGGAG;SOR=1.242;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=20;WE=209811837;WS=209811819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr1	209823354	rs2228339	G	A	3825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=79;PP=2965;SC=TCAGTCCACAGGTAGATGAAG;SOR=2.107;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=26;TCR=79;TR=105;WE=209823362;WS=209823344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr1	209849002	rs3817870	T	C	2251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=13;PP=1837;SC=CTGCAGGTCATTCCCGCCTCC;SOR=2.932;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=71;TCF=57;TCR=14;TR=70;WE=209849010;WS=209848992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	209849399	rs3830766	AG	A	1078.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=19;PP=925;SC=ACAGACCGAGAGAGGAATGGA;SOR=3.014;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=209849414;WS=209849389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	209849406	rs1473683	T	G	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=19;PP=593;SC=GAGAGAGGAATGGAGAGACAG;SOR=2.925;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=209849414;WS=209849389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	209936466	rs7548219	A	G	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.572;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=797;ReadPosRankSum=-0.099;SC=TGAAGGGGTCAAATCAGAAAG;SOR=1.425;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=133;TCF=61;TCR=72;TR=48;WE=209936474;WS=209936456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,51:0.37:138
chr1	209950681	rs649275	T	C	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=8;PP=852;SC=ATATTGGCCCTTCCTCCTCCT;SOR=2.049;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=209950689;WS=209950671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	209950760	rs669694	C	G	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=17;PP=1163;SC=TGAGCACCAGCAACTGCAGGC;SOR=1.055;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=42;WE=209950768;WS=209950750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	209953706	rs11590807	C	T	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	209965587	rs2235375	G	C	4188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=36;PP=2965;SC=GCAGAAGACCGAGCAAGAAAG;SOR=1.869;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=92;TCR=36;TR=128;WE=209965595;WS=209965577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr1	209968684	rs2013162	C	A	2876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=56;PP=2303;SC=CATGGTGCTGCGACTGATCCA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=29;TCR=56;TR=85;WE=209968692;WS=209968674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	209969902	rs7552506	G	C	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=303;SC=CCAGGCCTGAGAACAAGAAAC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=209969910;WS=209969892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	210001543	rs12404886	A	T	2372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=59;PP=1914;SC=AGGGCTCCCCAGTCGCCAGAG;SOR=2.660;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=16;TCR=59;TR=75;WE=210001551;WS=210001533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	210003402	rs599649	T	C	980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=0;PP=745;SC=GACCTTTTCCTAATTTCTACA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=210003410;WS=210003392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	210004199	rs585627	C	G	3598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=32;PP=2908;ReadPosRankSum=1.586;SC=GAGTGAACCACAACAAGTTTC;SOR=1.112;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=73;TCR=33;TR=102;WE=210004207;WS=210004189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,108:0.97:111
chr1	210006437	rs655712	GC	AT	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=0;PP=1463;SC=ATCAATGAACGCTATTGTTGG;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=25;WE=210006446;WS=210006427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	210006603	rs656566	C	T	5536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=100;NR=56;PP=2965;SC=AAACATCCCCCGAAGAGTTCA;SOR=1.311;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=100;TCR=57;TR=156;WE=210006611;WS=210006593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr1	210008367	rs685248	C	G	3515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.66;SOR=8.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	210008374	rs41274838	C	T	3683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.34;SOR=6.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	210008673	rs686582	T	G	1705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=49;PP=1397;SC=TGGGGCACAGTTGTAGCTAGA;SOR=7.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=49;WE=210008681;WS=210008663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	210012102	rs1962735	A	G	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=2;PP=747;ReadPosRankSum=1.398;SC=TGTTGAGCCAAGCCCTGCGCA;SOR=2.985;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=28;WE=210012110;WS=210012092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr1	210015568	rs10570454	GCT	G	540.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=495;SC=ACATGTAAATGCTCTCAGTCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=210015577;WS=210015558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	210111733	rs12025114	G	A	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=2.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.90;ReadPosRankSum=-0.968;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,9:0.17:53
chr1	210267893	rs144713062	TGAA	T	4584.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.194;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=60.39;MQRankSum=1.876;NF=20;NR=68;PP=2968;ReadPosRankSum=0.224;SC=ATAAAGGATATGAAGAAGATG;SOR=0.934;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=160;TCF=39;TCR=121;TR=88;WE=210267903;WS=210267883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,116:0.67:172
chr1	210334081	rs17188183	T	C	2133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=14;PP=1647;ReadPosRankSum=-1.212;SC=TAGATACATATGTTAAGTTAA;SOR=0.678;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=111;TCF=91;TCR=20;TR=75;WE=210334089;WS=210334071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,79:0.67:118
chr1	210406940	rs624270	T	C	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=107;ReadPosRankSum=0.045;SC=GCAGCAGAGCTGCGCTGCGGG;SOR=0.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=8;WE=210406948;WS=210406930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr1	210407031	rs624706	G	T	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=98;ReadPosRankSum=2.400;SC=TCCGCCTCTCGCTTCCCTTCC;SOR=0.693;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=10;WE=210407039;WS=210407021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,9:0.22:40
chr1	210407337	.	TTT	AAA	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.307;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.60;ReadPosRankSum=1.157;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr1	210411281	rs201870831	C	T	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=20.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.21;ReadPosRankSum=0.081;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr1	210502580	rs10863819	A	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=138;ReadPosRankSum=1.095;SC=TGCGCGCCCGAGGGCGGGACA;SOR=0.563;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=10;WE=210502588;WS=210502570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr1	210536078	rs2294848	C	G	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.985;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=445;ReadPosRankSum=-0.473;SC=CGTGCCTGCACCTTAGTCCAC;SOR=0.274;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=88;TCF=76;TCR=12;TR=27;WE=210536086;WS=210536068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,28:0.31:91
chr1	210577873	rs2066721	G	C	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=105;ReadPosRankSum=0.540;SC=TTCGCTGCCTGTACTACACCA;SOR=0.646;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=8;WE=210577881;WS=210577863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr1	210591742	rs3215542	TG	T	702.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.722;NF=0;NR=26;PP=691;ReadPosRankSum=0.472;SC=GGAGCTGGAGTGGGGGGTGAG;SOR=1.730;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=26;WE=210591750;WS=210591732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,27:0.69:39
chr1	210686570	rs4545340	A	G	1307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=32;PP=1082;SC=ACATTGAATAACATGTCTATT;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=38;WE=210686578;WS=210686560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	210761344	rs145923092	C	T	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.127;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=32;PP=878;ReadPosRankSum=-1.066;SC=ATGGCGGCTACGACTACCTCT;SOR=0.922;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=160;TCF=65;TCR=95;TR=51;WE=210761352;WS=210761334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,54:0.33:165
chr1	210761462	rs4297293	G	C	1390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=41;PP=1206;SC=GATCCTTGCTGCTGTGTTAGG;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=42;WE=210761470;WS=210761452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	210847514	rs1934615	A	T	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=644;ReadPosRankSum=-1.263;SC=CAGACTTTCCAGGAGGCCTTT;SOR=0.874;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=26;WE=210847522;WS=210847504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,26:0.72:36
chr1	210856585	rs3135473	G	T	1515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=5;PP=1301;SC=GGCAGGGTTGGAGGTATCTGT;SOR=4.450;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=45;TCR=5;TR=50;WE=210856593;WS=210856575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	210856604	rs34689382	T	G	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.079;HP=8;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.803;NF=20;NR=8;PP=431;ReadPosRankSum=0.372;SC=GTCTCTGACTTTTTTTTTAAA;SOR=0.101;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=75;TCF=61;TCR=14;TR=28;WE=210856612;WS=210856594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,27:0.38:72
chr1	210857457	rs1135317	A	G	2323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=56;PP=1833;SC=CACGTTTCACATCGCTGATCT;SOR=1.966;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=22;TCR=57;TR=78;WE=210857465;WS=210857447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	211280724	rs111658240	TA	T	1891.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;MQRankSum=0.815;NF=10;NR=68;PP=985;ReadPosRankSum=1.990;SC=TAGTATCTGTTAAAAAAAAAA;SOR=0.449;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=116;TCF=14;TCR=102;TR=78;WE=211280733;WS=211280714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,90:0.96:94
chr1	211380770	rs7525401	T	C	1380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.797;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.445;NF=37;NR=28;PP=978;ReadPosRankSum=0.710;SC=CAGGACGCCCTGCTGGGCCGA;SOR=0.851;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=201;TCF=110;TCR=91;TR=65;WE=211380778;WS=211380760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,69:0.32:215
chr1	211432798	.	T	TCTC	183.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.184;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=2;PP=111;ReadPosRankSum=0.555;SC=GCCGCCGCCGTCTCCTCCTCC;SOR=0.116;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=4;WE=211432806;WS=211432788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr1	211444382	rs36104032	G	A	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQRankSum=-0.349;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.718;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr1	211447435	rs5780634	CT	C	171.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=140;SC=GTGCCTTTGGCTTTTTTTTTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=8;WE=211447443;WS=211447432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	211447625	rs11580084	G	A	1484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.955;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=1111;ReadPosRankSum=-1.117;SC=AAACACTTCAGTAGTAAGGCT;SOR=0.172;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=72;TCF=43;TCR=29;TR=49;WE=211447633;WS=211447615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,53:0.70:76
chr1	211451393	rs72088513	TATC	T	574.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.914;SOR=0.151;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,18:0.28:64
chr1	211451467	rs11577985	T	C	1087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=5;PP=899;ReadPosRankSum=-0.227;SC=AGCTTCCAGATAAGACAATTG;SOR=0.798;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=125;TCF=111;TCR=14;TR=48;WE=211451475;WS=211451457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,48:0.37:130
chr1	211452529	rs10708960	TA	T	115.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.253;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.493;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr1	211452678	rs3767377	G	A	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.674;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=431;ReadPosRankSum=0.328;SC=ATCACTAGAAGTACTTGTGAT;SOR=0.246;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=21;WE=211452686;WS=211452668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr1	211452728	rs3767378	G	A	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=307;ReadPosRankSum=-0.058;SC=ACAGTACTTCGTATTAAGAAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=14;WE=211452736;WS=211452718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr1	211527609	rs7530570	C	A	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=0;PP=653;SC=TACAGGAGGCCCCTTCTGGGT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=211527617;WS=211527599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	211652755	rs11119749	T	A	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.775;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=238;ReadPosRankSum=1.400;SC=GGGCTGCCCGTGCATCCTCAT;SOR=2.338;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=12;WE=211652763;WS=211652745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr1	211832096	rs146064437	GA	G	201.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.66;QD=22.42;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	212142054	rs11322485	GA	G	829.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.854;NF=0;NR=38;PP=472;ReadPosRankSum=0.391;SC=AGCTGCCTGGGAAAAAAAAAA;SOR=5.186;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=38;WE=212142062;WS=212142044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,39:0.95:41
chr1	212209367	rs3215984	T	TC	1383.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=40;PP=1718;SC=CAGGGCCGACTCCAATTCTGA;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=40;WE=212209375;WS=212209357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	212217971	rs35704923	C	CTT	2332.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=43;NR=5;PP=2337;SC=TTGTGTTACTCTATATATTTT;SOR=3.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=44;TCR=5;TR=48;WE=212217979;WS=212217961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	212220847	rs2970592	G	A	1421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=43;PP=1216;SC=CCTTTCCCCTGTCAAAGTTAC;SOR=6.184;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=44;WE=212220855;WS=212220837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	212236157	rs4951436	G	T	2271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=1;PP=1976;SC=TCTACAAAATGTAAACTGAAA;SOR=6.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=66;TCF=65;TCR=1;TR=66;WE=212236165;WS=212236147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	212241714	.	TAA	T,TA	1174.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=2.335;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.25;MQRankSum=0.284;QD=16.78;ReadPosRankSum=0.564;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:8,14,48:0.20,0.69:70
chr1	212250820	rs17656453	T	C	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	212251103	rs6658972	A	G	277.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=169;SC=ATCTGAAGATATATATGCTGT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=212251111;WS=212251093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	212251367	rs5780675	GT	G	1474.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=0;PP=1069;SC=GAAATCTGTTGTTTTTTTTTT;SOR=8.155;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=63;TCR=0;TR=56;WE=212251375;WS=212251357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	212273639	rs3135474	C	T	4886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=92;PP=2965;SC=GCCCCCAGGGCAAAGTGCAAT;SOR=1.082;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=63;TCR=92;TR=155;WE=212273647;WS=212273629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr1	212274413	rs6540718	A	C	1736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=41;PP=1460;SC=AGCGGAAAGAAATTGCCAAGC;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=10;TCR=41;TR=51;WE=212274421;WS=212274403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	212502630	.	G	T	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.398;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=9.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.21;ReadPosRankSum=-1.914;SOR=0.896;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,8:0.13:61
chr1	212515613	rs1774249	C	T	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.331;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=350;ReadPosRankSum=1.589;SC=ATCAGAAATTCGTACAACAGG;SOR=0.384;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=70;TCF=22;TCR=48;TR=22;WE=212515621;WS=212515603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,23:0.31:75
chr1	212521639	rs701908	T	G	1685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=6.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.699;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=14;PP=1308;ReadPosRankSum=-1.144;SC=GATTGAAGCATAGCACTGTTC;SOR=0.418;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=176;TCF=145;TCR=31;TR=66;WE=212521647;WS=212521629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,67:0.37:179
chr1	212526288	rs792442	C	T	1271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.645;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=29;PP=925;ReadPosRankSum=0.994;SC=TGGGAAAATACCATTCCATTG;SOR=0.903;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=172;TCF=89;TCR=83;TR=52;WE=212526296;WS=212526278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,57:0.32:180
chr1	212530192	rs792439	T	C	1533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=32;PP=1198;SC=ATTTTTTTGCTTATTGTATAC;SOR=2.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=40;WE=212530200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	212553111	rs701905	G	C	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=81;ReadPosRankSum=1.123;SC=TCCTGGGCCAGTGGGTCATCT;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=6;WE=212553119;WS=212553101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr1	212560327	rs792449	A	G	6162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=118;PP=2965;SC=GGTAGACCAGAAAGACGGCCA;SOR=1.306;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=72;TCR=118;TR=190;WE=212560335;WS=212560317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr1	212588206	rs518793	C	G	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.288;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=323;ReadPosRankSum=0.201;SC=GAGGCGAAACCGGTCCGGAGG;SOR=0.080;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=18;WE=212588214;WS=212588196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
chr1	212791288	rs3839030	CGT	C	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.77;MQRankSum=1.020;QD=5.06;ReadPosRankSum=-0.053;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	212799870	rs3122713	A	G	3213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=36;PP=2633;SC=CAGAGATGTGAACGTCATGGC;SOR=1.345;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=62;TCR=36;TR=98;WE=212799878;WS=212799860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	212799949	rs3795842	C	T	4682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=51;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.721;SC=GGGCTGGAGACGGTTGGTTCT;SOR=0.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=94;TCR=51;TR=144;WE=212799957;WS=212799939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,152:0.99:153
chr1	212870292	rs2233925	C	T	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=6;PP=1200;ReadPosRankSum=1.676;SC=TTGCCCCTACCACGGTCTCAC;SOR=0.861;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=77;TCF=67;TCR=10;TR=51;WE=212870300;WS=212870282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,50:0.68:74
chr1	212872852	rs73079851	T	C	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=482;ReadPosRankSum=0.555;SC=TCGCCCCCATTCCCCAACATC;SOR=0.160;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=22;WE=212872860;WS=212872842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr1	212873074	rs2202683	C	T	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=271;ReadPosRankSum=1.000;SC=CTCTGCAGGACGCTGCCGGCG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=14;WE=212873082;WS=212873064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr1	212873096	rs2202682	T	C	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.6715;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=179;ReadPosRankSum=0.282;SC=CCGGGAGCCCTTGCGACATGC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=212873104;WS=212873086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr1	212900434	rs3835160	C	CG	228.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=231;ReadPosRankSum=-1.039;SC=CTTCATCTTGCCAGTTCACCA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=8;WE=212900442;WS=212900424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr1	212900487	rs2244935	A	G	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=246;ReadPosRankSum=0.569;SC=TTCTCTCCTAAACTGCCCCTA;SOR=1.055;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=12;WE=212900495;WS=212900477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr1	212911836	rs15702	T	C	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=620;ReadPosRankSum=0.949;SC=TTCAGTACCATGTCAGAGGTT;SOR=0.709;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=128;TCF=85;TCR=43;TR=40;WE=212911844;WS=212911826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,40:0.29:136
chr1	212912108	rs67229635	ATT	A	263.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=4.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=1.445;QD=7.54;ReadPosRankSum=-0.162;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
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chr1	212970375	rs1284800	A	G	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=0;PP=1069;SC=ACCATGCCCGACCTCTACTTA;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=212970383;WS=212970365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	212985466	rs12130945	C	T	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.071;NF=4;NR=1;PP=59;ReadPosRankSum=0.380;SC=TGAGCCACCGCGCCCAGCCTA;SOR=0.784;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=5;WE=212985474;WS=212985456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr1	213009469	rs10864004	A	G	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.145;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=25;PP=537;ReadPosRankSum=-0.479;SC=CATTATTTCAATGGTTCTGTT;SOR=0.438;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=86;TCF=15;TCR=71;TR=31;WE=213009477;WS=213009459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,32:0.35:92
chr1	213031948	rs11120047	G	C	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=339;ReadPosRankSum=1.032;SC=GGTGAATGGGGCCCCCCGGGA;SOR=1.085;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=66;TCF=36;TCR=30;TR=21;WE=213031956;WS=213031938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,22:0.33:66
chr1	213032568	rs12023052	T	A	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=99;ReadPosRankSum=-0.313;SC=GTCAGATCCTTAAAAGACCGG;SOR=0.627;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=30;TCF=12;TCR=18;TR=9;WE=213032576;WS=213032558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr1	213056819	rs2644547	A	G	2002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=33;PP=1543;SC=GCCTGGCCAAAAATTTTTCTT;SOR=1.000;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=60;TCF=26;TCR=34;TR=59;WE=213056827;WS=213056809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	213056892	rs12125982	A	G	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=173;ReadPosRankSum=0.876;SC=TTGCTATCAAATATTTACATT;SOR=0.919;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=12;WE=213056900;WS=213056882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr1	213058852	rs7536716	T	A	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=272;ReadPosRankSum=1.242;SC=AAGATACGGATTCTAAACACT;SOR=0.327;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=15;WE=213058860;WS=213058842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr1	213061308	rs17677416	T	C	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.589;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=273;ReadPosRankSum=1.366;SC=ACCTTAGATATATTATCATCG;SOR=0.387;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=17;WE=213061316;WS=213061298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr1	213062017	rs112024320	T	TTTG	139.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=3.066;QD=3.68;ReadPosRankSum=-0.358;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,7:0.18:38
chr1	213068595	rs3207090	C	T	1034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.432;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=834;ReadPosRankSum=-0.922;SC=GAACCAAAAACGGTTATGTTG;SOR=0.874;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=151;TCF=97;TCR=54;TR=48;WE=213068603;WS=213068585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,48:0.31:157
chr1	213139748	rs3738805	T	G	1473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=35;PP=1137;SC=CAATGGGGCTTGTTGTGCCTT;SOR=3.209;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=42;WE=213139756;WS=213139738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	213140362	rs10779597	G	A	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=187;ReadPosRankSum=-1.390;SC=GTTGAGATTAGAGGCAGGAGC;SOR=0.430;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=11;WE=213140370;WS=213140352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr1	213140398	rs10779598	A	C	1680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.373;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=6;PP=1335;ReadPosRankSum=-0.800;SC=GCCAGGGAAAATTCTAAGAGT;SOR=3.590;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=52;WE=213140406;WS=213140388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr1	213146944	rs7511930	A	G	1554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=44;PP=1345;SC=CTGGTTTCTGAGGCAATAGAG;SOR=5.507;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=46;WE=213146952;WS=213146934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	213173457	rs3738806	C	T	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.548;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=0.699;SC=GAAACTGAACCTCAGAGATGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=213173465;WS=213173447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	213178340	rs11120076	G	A	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=0;PP=796;ReadPosRankSum=0.408;SC=GAGCAACTATGTCCACTCCCT;SOR=1.848;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=33;WE=213178348;WS=213178330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,36:0.71:51
chr1	213224719	rs4951476	T	C	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=5.740;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.60;ReadPosRankSum=0.295;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,32:0.67:48
chr1	213341122	rs78772049	G	A	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=418;ReadPosRankSum=2.107;SC=AACAAGCAGTGTATTGGGTAG;SOR=0.757;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=67;TCF=66;TCR=1;TR=22;WE=213341130;WS=213341112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,24:0.34:71
chr1	213405414	rs11271079	GGCAACTGAGGAT	G	1257.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.632;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.525;NF=19;NR=1;PP=2934;ReadPosRankSum=-0.701;SC=AGGCTCCAAAGGCAACTGAGG;SOR=0.335;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=52;TCF=46;TCR=6;TR=20;WE=213405433;WS=213405404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr1	214576482	rs4636427	C	T	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=458;SC=TGTTATAACACGGCTCTCCAT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=214576490;WS=214576472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	214625431	rs7355177	A	G	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=148;ReadPosRankSum=-1.209;SC=CAGCCCATATATAAGATCCAG;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=8;WE=214625439;WS=214625421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr1	214638172	rs10864100	C	T	2369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=6.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.360;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=77;PP=1987;ReadPosRankSum=0.290;SC=GGACGCCGCCCGCCTATCCTG;SOR=1.546;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=117;TCF=9;TCR=108;TR=83;WE=214638180;WS=214638162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,83:0.72:115
chr1	214826196	rs335524	G	A	1444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=9;PP=1143;SC=CAGACATACCGAGAGAAATTG;SOR=2.511;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=43;WE=214826204;WS=214826186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	214826364	rs335523	G	A	1579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=39;PP=1260;SC=TCATGATTTCGAATGGTTTAT;SOR=2.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=48;WE=214826372;WS=214826354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	214826810	rs11303309	CT	C	2235.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=48;PP=1043;SC=GATCATAGAACTTTTTTTTTT;SOR=0.250;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=167;TCF=67;TCR=100;TR=88;WE=214826820;WS=214826800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,107:0.99:108
chr1	214828812	rs435043	A	G	4651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=113;PP=2965;SC=AACATATGGTATGCGTGCATA;SOR=2.817;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=28;TCR=113;TR=141;WE=214828820;WS=214828802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr1	214830617	rs438034	A	G	9129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=159;NR=119;PP=2965;SC=GGAGAATGGTAGAGGACCAAC;SOR=1.001;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=279;TCF=159;TCR=120;TR=278;WE=214830625;WS=214830607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr1	214837110	rs7289	C	G	2613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=73;PP=2143;SC=TGGAGTCCAACGGCAGTGAGA;SOR=5.084;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=5;TCR=73;TR=78;WE=214837118;WS=214837100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	215260152	rs11586565	A	T	1614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=40;PP=1384;SC=TTGCCTTAACATATAGCTCTT;SOR=3.306;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=47;WE=215260160;WS=215260142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	215345263	rs3834061	GTCTCTC	G	1043.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.36;QD=41.75;SOR=6.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	215793834	rs14137	G	A	2003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.425;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=40;PP=1496;ReadPosRankSum=2.167;SC=CCTATCTGGCGTCATCACCAA;SOR=0.871;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=112;TCF=51;TCR=61;TR=69;WE=215793842;WS=215793824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,75:0.60:124
chr1	215848587	rs2797234	T	C	4663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.346;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=91;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.477;SC=TATACATAAATGTATTCCTTT;SOR=0.687;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=255;TCF=127;TCR=128;TR=174;WE=215848595;WS=215848577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,183:0.69:266
chr1	215848641	rs2797235	T	C	7977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=131;NR=133;PP=2965;SC=CGGCCTGGATTGTCTGATTTC;SOR=0.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=265;TCF=131;TCR=134;TR=264;WE=215848649;WS=215848631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr1	215853748	rs5780842	GT	G	1015.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=42;PP=683;SC=TTAAGTTGTTGTTTTTTTTTT;SOR=4.712;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=77;TCF=10;TCR=67;TR=43;WE=215853768;WS=215853737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	215901492	rs2820718	C	T	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=2.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.44;ReadPosRankSum=0.612;SOR=0.475;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,23:0.24:97
chr1	215916713	.	C	CATATAT	201.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-1.847;QD=5.17;ReadPosRankSum=0.928;SOR=0.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,8:0.21:39
chr1	215916728	.	ATG	A	332.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.407;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQRankSum=1.230;QD=12.32;ReadPosRankSum=1.337;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr1	215916732	rs4053764	G	A	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.930;NF=0;NR=19;PP=648;ReadPosRankSum=2.198;SC=ATATATATGTGTGTGTGTGTG;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=19;WE=215916742;WS=215916718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr1	215916750	.	G	GTATATATA	119.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQRankSum=-0.864;QD=5.44;ReadPosRankSum=-1.413;SOR=0.404;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr1	215916758	.	G	A	182	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=39;MMLQ=28;MQ=57.1;NF=0;NR=9;PP=182;QD=24.085690283;SC=GTGTGTGTGTGTATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=9;WE=215916766;WS=215916748;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,9:0.35:26
chr1	215931928	rs12095085	T	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=72;ReadPosRankSum=1.191;SC=ACTTCTTTTTTTTTTTTACCT;SOR=0.113;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=9;WE=215931936;WS=215931918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr1	215956304	rs7518466	A	G	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=258;ReadPosRankSum=-0.881;SC=TAGACAGGGAAGTTTCTCTTA;SOR=0.622;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=17;WE=215956312;WS=215956294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,19:0.33:58
chr1	215960153	.	A	C	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.204;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=2.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.13;ReadPosRankSum=2.167;SOR=1.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
chr1	215960167	rs10864198	T	G	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.19;ReadPosRankSum=1.667;SOR=0.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,10:0.20:51
chr1	215963374	rs11120629	G	A	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=289;ReadPosRankSum=0.569;SC=TCAAATCAGCGCCTCCGAGAG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=54;TCR=0;TR=17;WE=215963382;WS=215963364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,17:0.33:52
chr1	216172380	rs10864219	A	G	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.025;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=254;ReadPosRankSum=-0.225;SC=AATCCCACTTATTTTTCTTGG;SOR=2.153;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=51;TCF=8;TCR=43;TR=15;WE=216172388;WS=216172370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
chr1	216219781	rs6657250	A	G	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.158;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=232;ReadPosRankSum=0.234;SC=ACCTGTGACTATGTAGTTCTC;SOR=0.504;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=15;WE=216219789;WS=216219771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,15:0.25:60
chr1	216246675	rs35944387	AG	A	1768.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=42;PP=1826;SC=TATCGCATAAAGGGCTTGAGT;SOR=4.133;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=44;WE=216246683;WS=216246665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	216258194	rs56110889	G	T	1652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=48;PP=1409;SC=CCTTGAGACAGCCCACAAAAC;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=50;WE=216258202;WS=216258184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	216370108	rs447102	C	T	2316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=53;PP=1571;SC=CAATGAATGTCGTCCCTATAT;SOR=4.443;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=5;TCR=53;TR=58;WE=216370116;WS=216370098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	216370130	rs386851	T	G	1811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=37;PP=1112;SC=TTTTTAAATTTAATTCACACA;SOR=6.043;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=37;WE=216370138;WS=216370120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	216371934	rs646094	A	C	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=29;PP=889;SC=TTCCTAGAGAAATTAAATAGT;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=216371942;WS=216371924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	216495191	rs7515253	T	G	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=1;PP=1002;SC=CTACTATTTTTTTTTTAGATT;SOR=5.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=35;WE=216495199;WS=216495181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	216495400	rs2089947	A	G	4195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=106;PP=2965;SC=TATATGCATTATGTGAATTTA;SOR=3.460;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=17;TCR=107;TR=123;WE=216495408;WS=216495390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr1	216496947	rs1805050	G	A	3743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=60;PP=2894;SC=GAAGAGATGGGGTATTATAGA;SOR=0.918;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=51;TCR=61;TR=111;WE=216496955;WS=216496937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr1	216500830	rs1339963	G	C	1323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=1;PP=1163;SC=TTGCCAAATGGTATAAAGATA;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=38;WE=216500838;WS=216500820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	216692477	rs11572818	T	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=156;ReadPosRankSum=1.071;SC=TAACAATGACTATGTCAGTAT;SOR=0.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=7;WE=216692485;WS=216692467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr1	216824505	rs10863261	C	G	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=311;ReadPosRankSum=0.583;SC=AAGGCAATGTCAACTCTATTA;SOR=0.749;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=15;WE=216824513;WS=216824495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr1	217604777	rs7520483	G	A	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.435;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=25;PP=714;ReadPosRankSum=1.007;SC=CTATGAAAACGATGTTCTCCT;SOR=0.113;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=29;WE=217604785;WS=217604767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,29:0.67:43
chr1	217671771	rs724803	C	G	2174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.239;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=31;PP=1609;ReadPosRankSum=-1.240;SC=TTAGAGGGAACCTAACTAAAA;SOR=0.521;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=74;TCR=53;TR=74;WE=217671779;WS=217671761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,80:0.60:134
chr1	217804325	rs944730	G	A	9033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=127;NR=138;PP=2965;SC=AACGACACCCGGGAGCCTGGC;SOR=0.773;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=266;TCF=127;TCR=139;TR=265;WE=217804333;WS=217804315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr1	217822135	rs12140261	G	A	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=695;SC=TATCATCTTGGAAGAAATTAA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=217822143;WS=217822125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	217856626	rs12068167	G	A	1284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=6;PP=869;SC=GAGGCTATAGGGTTCGGAAGT;SOR=2.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=217856634;WS=217856616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	217856803	rs12073566	T	C	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=25;PP=698;SC=TTGTTTTAGATGGAGTCTTGC;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=217856811;WS=217856793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	217915324	rs34347452	C	T	9312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=205;NR=82;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.296;SC=CAGGAAGGCACTGGAGGAGTT;SOR=0.522;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=289;TCF=207;TCR=82;TR=287;WE=217915332;WS=217915314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,294:0.99:296
chr1	217947738	rs6604561	G	A	4671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=86;NR=52;PP=2965;SC=TGCAATTACAGAAGGCAAAGC;SOR=1.260;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=86;TCR=52;TR=138;WE=217947746;WS=217947728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr1	217975289	rs55773207	C	T	217.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=178;SC=ACAATTAAGACCTTTATGGTA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=217975297;WS=217975279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	218458551	rs946213	T	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=164;ReadPosRankSum=-0.328;SC=CCCGGAACTCTGGGCTAGACG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=218458565;WS=218458541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr1	218458557	rs3831934	AG	A	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=166;ReadPosRankSum=-0.652;SC=ACTCTGGGCTAGACGACCCCG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=3;WE=218458565;WS=218458541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr1	218475533	rs2251169	C	T	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=91;ReadPosRankSum=0.468;SC=ACCCCCCTTGCAAAAATGGGG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=7;WE=218475541;WS=218475523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr1	219366400	rs35359058	T	TG	653.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.37;QD=27.24;SOR=2.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	219383848	rs5781096	A	ACTTTTT	1160.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=2;PP=1272;SC=TATGTATTCTACTTTTAAGTA;SOR=2.753;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=19;WE=219383856;WS=219383838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	219383867	rs940571	T	C	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=12;PP=893;SC=TATGTTTTTGTTTTTAGGAGG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=36;WE=219383875;WS=219383857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	219383905	rs940570	A	G	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=22;PP=1122;SC=GCATGGCAATACATTTAGCAT;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=23;TCR=22;TR=45;WE=219383913;WS=219383895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	219706428	rs10746385	T	C	11656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=405;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=223;NR=161;PP=2965;SC=TGGGTTTTTATGCATAGAAGG;SOR=1.078;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=386;TCF=224;TCR=162;TR=384;WE=219706436;WS=219706418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,400:1.00:400
chr1	219783279	rs79789352	T	A	2337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.39;QD=30.76;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr1	220089352	rs2231734	A	C	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=23;PP=515;SC=ATGGAACTACAGGAGGGATAT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=220089360;WS=220089342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	220142023	rs1061248	C	T	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=63;ReadPosRankSum=0.919;SC=AATAATTGTCCTGTGTGACTT;SOR=0.117;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=6;WE=220142031;WS=220142013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr1	220142070	rs1061242	C	T	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.830;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=194;ReadPosRankSum=-1.494;SC=AATCATAAAACGGTCTGTATC;SOR=1.085;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=14;WE=220142078;WS=220142060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,14:0.29:48
chr1	220145371	rs2795315	T	G	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=4;PP=623;SC=ACAATTTACTTAAATATTCTT;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=220145379;WS=220145361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	220145584	rs1982986	C	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.36;ReadPosRankSum=1.173;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,8:0.21:38
chr1	220151808	rs3215088	C	CAA	229.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=228;ReadPosRankSum=1.083;SC=TGAGAAACCTCGTTTTATAAA;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=7;WE=220151816;WS=220151798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr1	220153332	rs34917248	T	TAA	3373.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=3;PP=2469;SC=ACTTATTTTTTAAGAGTCTAC;SOR=5.255;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=76;TCF=72;TCR=4;TR=62;WE=220153340;WS=220153322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	220154246	rs35193743	AT	A	688.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=3.009;NF=0;NR=32;PP=441;ReadPosRankSum=0.151;SC=GAGCTTTTCAATTTTTTTTTT;SOR=4.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=32;WE=220154255;WS=220154236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,33:0.94:35
chr1	220154659	rs10595099	TAAA	T	1045.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.46;MQRankSum=0.887;QD=27.52;ReadPosRankSum=0.793;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,31:0.82:38
chr1	220154768	rs1061160	C	T	3554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.859;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=57;PP=2829;ReadPosRankSum=1.041;SC=CTCTGTGTGACTGTACCCATT;SOR=0.893;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=215;TCF=116;TCR=99;TR=136;WE=220154776;WS=220154758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,136:0.62:219
chr1	220156090	rs2647462	T	C	4014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=48;PP=2965;SC=GAGCATTCTCTTGCACTCCAA;SOR=1.033;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=70;TCR=48;TR=118;WE=220156098;WS=220156080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr1	220156427	rs1391566	T	C	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=252;ReadPosRankSum=-1.074;SC=AACTTTTTAATAAAAATGGCT;SOR=0.324;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=13;WE=220156435;WS=220156419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr1	220156704	rs5030752	T	C	2591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-7.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=64;PP=1363;ReadPosRankSum=-0.043;SC=CAGCCACTTATGTCATGGTAT;SOR=1.066;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=109;TCF=13;TCR=96;TR=72;WE=220156712;WS=220156694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,75:0.66:114
chr1	220156729	rs5030754	C	T	2158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.744;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=48;PP=1236;ReadPosRankSum=0.810;SC=TCATTTCTGACTTTGTGATGA;SOR=2.173;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=73;TCF=6;TCR=67;TR=51;WE=220156737;WS=220156719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,56:0.72:78
chr1	220160360	rs2647435	A	G	1177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=0;PP=948;SC=ATCTGCTGACATTGTAGCTTT;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=41;WE=220160368;WS=220160350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	220160433	rs2647434	A	G	3849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=16;PP=2965;SC=ACTATTAAGAATTGAATTAAT;SOR=3.180;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=93;TCR=16;TR=108;WE=220160441;WS=220160423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	220162195	rs2254494	T	C	1779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=48;PP=1469;ReadPosRankSum=-0.934;SC=GAGATATTTATAAAACTTTGG;SOR=5.136;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=50;TCF=1;TCR=49;TR=49;WE=220162203;WS=220162185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,52:0.98:53
chr1	220178717	rs5781162	T	TA	1579.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=31;PP=1644;SC=AAAGATGATATAAACCAAAGT;SOR=1.426;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=41;WE=220178725;WS=220178707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	220184150	rs34170326	CA	C	918.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=17;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=323;ReadPosRankSum=-0.579;SC=GACTACGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=4.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=47;TCR=1;TR=25;WE=220184175;WS=220184140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr1	220184164	rs28570471	A	G	1310.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=34.49;ReadPosRankSum=-0.911;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr1	220191932	rs35962858	G	GA	249.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.82;QD=19.21;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	220192192	rs34320023	TA	T	424.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQRankSum=0.000;QD=17.70;ReadPosRankSum=1.741;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr1	220192495	rs2245457	C	G	3060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=86;PP=2587;SC=GATACTTAATCAATAATAAAT;SOR=8.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=86;TCF=0;TCR=86;TR=86;WE=220192503;WS=220192485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	220197545	rs2577159	C	T	2078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=1;PP=1760;SC=AAAGAAATCACGTTCTACTAA;SOR=6.963;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=63;TCF=62;TCR=1;TR=63;WE=220197553;WS=220197535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	220197625	rs2230301	G	T	5239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=115;NR=48;PP=2965;SC=TATGTTTAGAGTCTATCCTCT;SOR=1.925;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=115;TCR=48;TR=163;WE=220197633;WS=220197615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr1	220205943	rs2789816	G	A	2115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=60;PP=1791;SC=GTGACTAATTGAAGTAATTGA;SOR=6.837;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=62;TCF=1;TCR=61;TR=61;WE=220205951;WS=220205933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	220205980	rs2577138	A	C	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=751;SC=GCTTCTAAAGAAAATGAAATG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=220205988;WS=220205970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	220207017	rs2647456	C	T	1152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=28;PP=843;SC=ACATAAAAGACAGAAAAGAAA;SOR=2.774;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=34;WE=220207025;WS=220207007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	220208154	rs2789817	C	A	877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=0;PP=742;SC=CTGTTAATATCCTTAAGTAGA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=25;WE=220208162;WS=220208144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	220239448	rs1146773	T	C	3315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=84;PP=2820;SC=TTAACTGCTGTTTTTCATTGT;SOR=3.398;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=14;TCR=84;TR=98;WE=220239456;WS=220239438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	220280586	.	G	A	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=47;PP=1232;ReadPosRankSum=0.028;SC=TACTTTAACAGAAACAAAAAA;SOR=0.995;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=1;TCR=64;TR=48;WE=220280594;WS=220280576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,47:0.73:64
chr1	220332646	.	A	C	1043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.857;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=726;ReadPosRankSum=-0.582;SC=TAAAAGGCAAAGTTCACCTAT;SOR=0.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=30;TCR=21;TR=39;WE=220332654;WS=220332636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,41:0.75:55
chr1	220362857	rs35162828	AT	A	198.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.60;MQRankSum=0.230;QD=13.25;ReadPosRankSum=1.393;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr1	220374047	rs12129903	A	C	96.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=63;ReadPosRankSum=-0.431;SC=CTAGCAAAAAAGTAGACACAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=220374055;WS=220374037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr1	220603310	rs10553491	TGTGA	T	776.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.582;NF=69;NR=0;PP=1806;ReadPosRankSum=1.903;SC=TGTGTGTGTGTGTGAGAGAGA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=74;TCF=73;TCR=1;TR=69;WE=220603321;WS=220603298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,33:0.77:43
chr1	220607685	rs1361256	G	A	2819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=35;PP=2300;SC=GGTACTACCCGAAGAAGAAAA;SOR=1.065;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=50;TCR=35;TR=85;WE=220607693;WS=220607675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	220607891	rs1338767	A	G	2195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=10;PP=1778;SC=TTAGCCCTTTAAGAAAAAAGT;SOR=3.021;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=50;TCR=10;TR=60;WE=220607899;WS=220607881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
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chr1	220808921	rs10746403	T	C	6511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=139;PP=2965;SC=TCTTCCCAAATTTGTGTTTTT;SOR=1.879;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=197;TCF=56;TCR=141;TR=195;WE=220808929;WS=220808911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr1	220825523	rs3737296	A	G	1634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=39;PP=1307;SC=CATTTTGTTCATTAAGAGTTT;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=12;TCR=39;TR=51;WE=220825531;WS=220825513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
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chr1	220970028	rs2642438	A	G	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=23;PP=1596;ReadPosRankSum=1.136;SC=TGGCGAGGCCACCGCCCAGTG;SOR=0.719;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=126;TCF=92;TCR=34;TR=81;WE=220970036;WS=220970018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,80:0.63:127
chr1	220986516	rs12144830	C	T	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=112;ReadPosRankSum=0.862;SC=TGAGCTTTGACGGGATGGTGC;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=6;WE=220986524;WS=220986506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr1	220986546	rs17650107	G	A	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=280;ReadPosRankSum=1.518;SC=CTGTGCGTGCGGAGGCCCTGT;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=13;WE=220986554;WS=220986536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr1	221053545	rs12141189	T	C	1725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.382;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=21;PP=1319;ReadPosRankSum=-0.514;SC=GTCTCCGCTCTCAGCCGCCTA;SOR=1.238;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=85;TCF=53;TCR=32;TR=61;WE=221053553;WS=221053535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,63:0.72:87
chr1	221054761	rs17597773	C	G	2098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.644;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=58;PP=1611;ReadPosRankSum=-1.283;SC=AGCCGACTAACAGTCAGAAAT;SOR=0.142;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=97;TCF=12;TCR=85;TR=69;WE=221054769;WS=221054751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,71:0.73:97
chr1	221507141	rs7555947	C	T	1876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=2;PP=1569;SC=TGTGAACATACTTTCATAGGC;SOR=5.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=57;TCF=55;TCR=2;TR=57;WE=221507149;WS=221507131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	221876126	rs2280340	A	G	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=306;ReadPosRankSum=1.809;SC=TATAGAAATAATGAATTAAAA;SOR=1.201;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=15;WE=221876134;WS=221876116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr1	221912472	rs138642178	C	T	2664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-7.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=48;PP=2008;ReadPosRankSum=-1.588;SC=TGCCCTGCTGCAGTCTCCGCC;SOR=0.668;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=144;TCF=73;TCR=71;TR=99;WE=221912480;WS=221912462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,101:0.68:148
chr1	222721288	rs4846382	C	T	3251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=55;PP=2570;SC=CCACCTGGCCCAACAAGAATA;SOR=0.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=45;TCR=55;TR=100;WE=222721296;WS=222721278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr1	222732027	rs76003336	T	C	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.029;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=326;ReadPosRankSum=0.326;SC=TACAATACTGTATTTTTTCAC;SOR=1.292;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=46;TCF=26;TCR=20;TR=18;WE=222732035;WS=222732017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,19:0.39:49
chr1	222734803	rs1134898	G	C	4901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=87;PP=2965;SC=TGAAATGAAAGCCTGGCCACC;SOR=1.329;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=143;TCF=55;TCR=88;TR=142;WE=222734811;WS=222734793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr1	222737265	rs35877231	G	T	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=4;PP=479;SC=AGACAATACAGAAACAGATGG;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=222737273;WS=222737255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	222737568	rs3008640	C	T	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=481;SC=TAATATGCTCCCTTTAAATTT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=222737576;WS=222737558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	222742676	rs4846766	T	C	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=8;PP=488;SC=CAGGGGATAGTGTGGATGATA;SOR=1.519;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=23;WE=222742684;WS=222742666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	222743013	rs148553032	A	G	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.558;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=383;ReadPosRankSum=-2.120;SC=TCCAGCATCTATATAAAATAA;SOR=0.404;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=62;TCF=7;TCR=55;TR=23;WE=222743021;WS=222743003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,24:0.36:66
chr1	222751034	rs2936033	T	C	2098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=53;PP=1730;SC=TAGATAACCATTAGTCAAAAA;SOR=3.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=7;TCR=53;TR=60;WE=222751042;WS=222751024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr1	222798106	rs3008617	G	A	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=27;PP=1195;SC=ATTCTTTTGTGTAGGTTGGAC;SOR=0.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=20;TCR=27;TR=47;WE=222798114;WS=222798096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	222802006	rs2936053	A	G	5296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=60;PP=2965;SC=GGTACAAGATAAGACAGAATT;SOR=1.130;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=95;TCR=60;TR=155;WE=222802014;WS=222801996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr1	222802803	rs3748626	T	G	5703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=63;PP=2965;SC=AAAAAAACCCTGGGAATCAGG;SOR=1.526;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=125;TCR=63;TR=188;WE=222802811;WS=222802793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr1	222802926	rs3008620	C	T	8132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=135;PP=2965;SC=TTTTGGATAGCGAAAAAACAA;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=246;TCF=111;TCR=135;TR=246;WE=222802934;WS=222802916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr1	222821211	rs61824282	C	T	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.742;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=570;ReadPosRankSum=0.415;SC=ATTCCTATAACAATGGTATTA;SOR=1.688;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=28;WE=222821219;WS=222821201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr1	222823529	rs17465637	A	C	1285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=6;PP=1036;SC=CTGAGAAGTTATTTTTTGTCA;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=39;WE=222823537;WS=222823519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	222823743	rs67180937	T	G	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.06;SOR=4.849;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	222825403	rs3002150	G	A	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=13;PP=744;SC=AAAGCTGACTGTAATTCCTGC;SOR=0.976;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=29;WE=222825411;WS=222825393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	222825717	rs10495198	T	C	9055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=184;PP=2965;SC=AATAGAGAACTCAGTATCATA;SOR=1.697;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=269;TCF=85;TCR=184;TR=269;WE=222825725;WS=222825707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr1	222825761	rs2936019	G	A	5497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=136;PP=2965;SC=TCTATTTTTAGGGTAATATAT;SOR=4.068;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=17;TCR=136;TR=153;WE=222825769;WS=222825751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr1	222826481	rs2291832	G	A	2858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=43;PP=2421;SC=ATGTAAGTGCGTTCATGAATA;SOR=0.809;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=91;TCF=47;TCR=44;TR=90;WE=222826489;WS=222826471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	222832295	rs2291834	T	C	1363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=36;PP=1081;SC=AAAAACTAAATTTTAAGTTAA;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=222832303;WS=222832285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	222833538	rs2291835	C	G	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.415;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=572;ReadPosRankSum=0.214;SC=GCCAGAATGGCTCTTTTGGCC;SOR=1.337;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=127;TCF=56;TCR=71;TR=36;WE=222833546;WS=222833528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,38:0.29:133
chr1	222833601	rs3002153	T	C	2312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=61;PP=1816;SC=TGGAGCCACCTGTGAGACCTC;SOR=2.777;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=17;TCR=61;TR=78;WE=222833609;WS=222833591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	222837594	rs2270707	G	A	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=21;PP=569;SC=CAATGCAGCAGTGAAGCTGAT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=222837602;WS=222837584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	222838216	rs2936026	C	T	1718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=38;PP=1417;SC=ATCTATCTCTCTTTTTCAGAT;SOR=2.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=50;WE=222838224;WS=222838206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr1	222846882	rs12138316	G	A	1060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=33;PP=901;SC=ACTTTGGGAGGCCGAGGCGGG;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=222846890;WS=222846872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	222860734	rs3008638	C	T	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=58.77;NF=12;NR=1;PP=359;SC=GATAGCGCCACTGCATGCCAG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=222860742;WS=222860724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	222867687	rs74330139	A	C	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=397;ReadPosRankSum=0.011;SC=TTTATTAATAAAAGATCCATA;SOR=0.760;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=19;WE=222867695;WS=222867677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,19:0.39:49
chr1	222886119	rs3811465	A	G	5315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=109;PP=2965;SC=CTCGGTAGCTATCATGGCCGC;SOR=1.624;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=49;TCR=110;TR=158;WE=222886127;WS=222886109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr1	222919854	rs111682421	CCT	C	274.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=266;ReadPosRankSum=1.298;SC=CCTAAGGTGCCCTGTTTTTAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=222919863;WS=222919844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr1	222919895	rs2378607	T	G	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.781;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=217;ReadPosRankSum=1.347;SC=ATTATGGAGATTGACGGTTTC;SOR=0.153;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=12;WE=222919903;WS=222919885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr1	222922168	rs17011714	A	C	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.542;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=261;ReadPosRankSum=-0.072;SC=AGGAATCAGAAAGTCCTATAA;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=61;TCR=3;TR=17;WE=222922176;WS=222922158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,17:0.27:63
chr1	222923001	rs2068814	A	G	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=332;ReadPosRankSum=2.565;SC=CCACCTGGTCATATGTACTAT;SOR=0.602;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=19;WE=222923009;WS=222922991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr1	222923351	rs6683071	A	G	1380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=32;PP=1157;SC=GCTGGGGTCCAAGAGTATGGA;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=43;WE=222923359;WS=222923341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	223116109	rs75109669	C	T	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=291;ReadPosRankSum=-1.304;SC=TATTTGCCTGCCTGACTGTAA;SOR=0.155;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=58;TCR=0;TR=17;WE=223116117;WS=223116099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,17:0.28:60
chr1	223116240	rs61746477	G	A	4672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.516;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=61;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.622;SC=CTGCTAACCCGAGTCCCCTCA;SOR=0.625;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=244;TCF=155;TCR=89;TR=165;WE=223116248;WS=223116230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,171:0.68:251
chr1	223152868	rs1815607	G	A	1518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=2;PP=1292;SC=GGTGAATTATGTGGTATATGA;SOR=5.421;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=43;TCR=2;TR=45;WE=223152876;WS=223152858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	223156280	rs10626845	C	CTT	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.748;NF=6;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=-0.175;SC=AATAGATTGCCTTTTTTTTTT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=6;WE=223156288;WS=223156270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	223156382	rs2926159	C	T	1856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=4;PP=1415;SC=TTATGATGCTCTGTTTTTGAT;SOR=4.332;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=49;TCR=4;TR=53;WE=223156390;WS=223156372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	223168213	rs2609359	T	C	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.993;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=150;ReadPosRankSum=1.644;SC=TCCTTTTTTTTTTCATATCAC;SOR=0.132;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=10;WE=223168221;WS=223168203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr1	223176275	rs61738819	G	A	1355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.292;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=37;ReadPosRankSum=-1.943;SC=TAGCCATTGTGATTGTCCTTT;SOR=0.387;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=166;TCF=53;TCR=113;TR=59;WE=223176283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,59:0.35:168
chr1	223177574	rs2609355	A	G	2041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=41;PP=1572;ReadPosRankSum=0.624;SC=AGTTTTATAAAGAGGTGGACT;SOR=0.458;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=103;TCF=39;TCR=64;TR=68;WE=223177582;WS=223177564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,72:0.67:108
chr1	223178478	rs9441940	G	A	1686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.557;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=30;PP=1260;ReadPosRankSum=-0.619;SC=TGAAAGTGACGCTGGCTCTGC;SOR=0.756;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=182;TCF=107;TCR=75;TR=70;WE=223178486;WS=223178468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,72:0.38:189
chr1	223178561	rs9441941	A	C	1539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.447;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=38;PP=1102;ReadPosRankSum=-0.413;SC=GTAGCTGCCCAGATGCCTACA;SOR=0.489;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=256;TCF=144;TCR=112;TR=77;WE=223178569;WS=223178551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,81:0.31:264
chr1	223283910	rs7512943	A	G	4200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=79;NR=44;PP=2965;SC=ACATCCTGGAAATCCTCAGGC;SOR=1.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=79;TCR=44;TR=123;WE=223283918;WS=223283900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
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chr1	223715248	rs36108579	GT	G	1298.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=18;PP=1157;SC=ACAAGATTGAGTTCTTGGCTT;SOR=0.927;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=28;WE=223715256;WS=223715238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	223716349	rs4072246	G	A	5319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=129;NR=26;PP=2965;SC=GCCACAGAACGTGCATGGTAT;SOR=3.121;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=129;TCR=26;TR=155;WE=223716357;WS=223716339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr1	223717379	rs61823524	A	C	1781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=4;PP=1536;SC=CCCTGCCCCAACTTGCACCTT;SOR=4.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=51;TCR=4;TR=55;WE=223717387;WS=223717369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	223717484	rs34158997	G	A	3971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=65;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.724;SC=AGTTGATGCCGAGCTTGCTGC;SOR=0.248;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=127;TCF=62;TCR=65;TR=126;WE=223717492;WS=223717474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,129:0.99:130
chr1	223718462	rs61823525	G	A	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=1;PP=613;SC=TTGTTCCTTCGTGACCAATGT;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=223718470;WS=223718452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	223718518	rs61823552	C	A	2763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=15;PP=2159;SC=TGTGGTCAGACTACAATGGAC;SOR=2.780;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=66;TCR=15;TR=81;WE=223718526;WS=223718508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr1	223718651	rs61823553	G	A	3997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=75;PP=2965;SC=CAAAGTGCCCGTTCCATTGCT;SOR=1.196;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=48;TCR=75;TR=123;WE=223718659;WS=223718641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr1	223718670	rs61823554	G	A	3611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=71;PP=2908;SC=CTCTAGGCACGTTAAAGACCA;SOR=1.449;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=37;TCR=71;TR=108;WE=223718678;WS=223718660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr1	223722646	rs34630115	T	TA	707.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=0;PP=475;ReadPosRankSum=-0.168;SC=CGGACGAAAGTAAAAAAAAAA;SOR=5.486;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=29;WE=223722654;WS=223722636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr1	223722780	rs34606532	G	A	4082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=60;PP=2965;SC=AGTGGGAATCGGATCATTTGA;SOR=0.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=59;TCR=60;TR=119;WE=223722788;WS=223722770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	223813586	rs35539373	G	T	1679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=42;PP=1332;SC=GGCTGCACTGGAGACCTGCGT;SOR=2.221;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=54;WE=223813594;WS=223813576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	223814671	rs61825208	A	T	1714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=9;PP=1398;SC=GTGGGGCAGTAGAGAAGCCAT;SOR=3.139;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=48;TCR=9;TR=57;WE=223814679;WS=223814661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	223815575	rs34187970	G	A	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=1;PP=743;SC=CTCTCTCTCCGGCTCATGGGG;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=223815583;WS=223815565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	223816322	rs66602040	A	G	3482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=26;PP=2746;SC=AGCCCTAAGAATACGGAAAAC;SOR=2.259;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=78;TCR=26;TR=104;WE=223816330;WS=223816312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	223816347	rs61825210	A	G	3940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=45;PP=2965;SC=ACAAAGGGCCAGAGCAGAGCA;SOR=1.559;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=89;TCR=45;TR=134;WE=223816355;WS=223816337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr1	223900408	rs25655	C	G	4306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=85;NR=56;PP=2965;SC=GCTCCCACGACAGGGCCATCA;SOR=1.038;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=142;TCF=85;TCR=57;TR=141;WE=223900416;WS=223900398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr1	223931648	rs1222137	T	C	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=316;SC=CCAAACCCTCTGACCCAACCC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=223931656;WS=223931638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	223934720	rs17600	G	A	2625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=23;PP=2019;SC=GCTATGAAGCGCTATCAGGGG;SOR=1.638;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=52;TCR=23;TR=75;WE=223934728;WS=223934710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	223949158	rs6687003	G	A	708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=652;SC=TCCCCCCACCGCAGCCCTGCC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=223949166;WS=223949148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	223951985	rs737066	C	A	1464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=39;PP=1113;ReadPosRankSum=1.012;SC=AATCTTTCCCCCTCCATGTCT;SOR=1.366;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=11;TCR=40;TR=50;WE=223951993;WS=223951975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr1	223957335	.	T	A	235	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=7;NR=1;PP=235;QD=33.7214015684;SC=AGCAACCAGATTCGGCAGGGA;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=223957343;WS=223957334;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	223959796	rs1153950	G	A	3717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=63;PP=2965;SC=ATGGTGGTCAGTGAAGTCAGT;SOR=0.984;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=50;TCR=63;TR=113;WE=223959804;WS=223959786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr1	223959959	rs1153949	G	A	1161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=960;ReadPosRankSum=1.333;SC=AGCAGGCCCCGCCTTGCTTCT;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=40;WE=223959967;WS=223959949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr1	223980207	rs1153936	G	C	4372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=97;PP=2965;SC=CATCATTGGGGAGGCTTGGGT;SOR=2.470;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=29;TCR=98;TR=126;WE=223980215;WS=223980197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	223984306	rs28364803	G	GA	337.76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.516;NF=0;NR=14;PP=251;ReadPosRankSum=0.544;SC=ATTGGAAAAGGAAAAAAAAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=14;WE=223984314;WS=223984296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr1	223989966	rs1153933	C	T	3960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=74;PP=2965;SC=GCATAGTAGACGACTGGATAT;SOR=1.135;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=51;TCR=74;TR=125;WE=223989974;WS=223989956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	224008913	rs3738370	G	A	1496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=2;PP=1275;ReadPosRankSum=-0.778;SC=GGCTGTCAGCGTCTCTCACCA;SOR=4.047;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=45;TCR=2;TR=46;WE=224008921;WS=224008903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,46:0.98:47
chr1	224302047	rs73124414	C	T	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.416;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=570;ReadPosRankSum=-0.096;SC=TCGTAGCCATCGAGAACATCC;SOR=0.278;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=43;TCF=20;TCR=23;TR=30;WE=224302055;WS=224302037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
chr1	224302154	rs3066024	T	TGAG	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=421;SC=GTCTGGGAGATGAGAAGGGAG;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=8;WE=224302162;WS=224302144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	224318151	rs3065998	T	TTTG	2143.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=6;PP=1855;SC=GTTATTGATTTTTGTTCTTTT;SOR=3.033;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=41;WE=224318159;WS=224318141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	224321984	rs1472167	C	T	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=24;PP=723;SC=TTATGAATTTCTGATTTTAGA;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=224321992;WS=224321974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	224345012	rs7543762	G	A	1262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=0;PP=1116;SC=CTGGTAGAGAGACATTTTAAG;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=39;WE=224345020;WS=224345002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	224370985	.	GC	TT	1690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.204;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.866;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=4;PP=1909;ReadPosRankSum=0.561;SC=CCACCTCTGAGCAGCCGGCTG;SOR=2.229;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=39;WE=224370994;WS=224370975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,42:0.75:56
chr1	224379893	.	CT	C	45.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=-0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-0.000;QD=3.52;ReadPosRankSum=1.755;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	224380234	rs908804	A	G	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=448;ReadPosRankSum=0.099;SC=ATAAAATGGAATTTTTGCATT;SOR=0.613;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=23;WE=224380242;WS=224380224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr1	224418830	.	G	A	104	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=48.04;NF=5;NR=0;PP=104;QD=27.7542425094;SC=GCAAGACTCCGTCTCAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=224418842;WS=224418820;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,5:0.62:8
chr1	224444628	rs10799556	C	T	5096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=119;NR=33;PP=2965;SC=ATTCAGATTCCTTCTACATCC;SOR=2.540;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=119;TCR=33;TR=152;WE=224444636;WS=224444618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr1	224444901	rs2897055	G	C	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=21;PP=640;SC=AAGAGAAAGTGCATTCACTCA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=21;WE=224444909;WS=224444891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	224468921	rs79564051	C	T	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.857;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=703;ReadPosRankSum=-1.200;SC=ACAAATAAGACCAATACACAG;SOR=0.374;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=57;TCF=11;TCR=46;TR=36;WE=224468929;WS=224468911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,40:0.66:61
chr1	224468979	.	C	CTGTG	519.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQRankSum=-0.729;QD=19.99;ReadPosRankSum=-0.054;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr1	224468986	.	CG	TG	347	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000,0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=14;MMLQ=23;MQ=59.48;NF=1,2;NR=7,14;PP=289,347;QD=36.5;SC=ACTCTGTGTGCGTGTGTGTGT;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=8,16;WE=224468994;WS=224468976;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr1	224468986	.	CG	CGTG	347	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000,0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=14;MMLQ=23;MQ=59.48;NF=1,2;NR=7,14;PP=289,347;QD=36.5;SC=ACTCTGTGTGCGTGTGTGTGT;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=8,16;WE=224468994;WS=224468976;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr1	224468986	rs112070546	C	CGT,T	638.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.54;QD=30.42;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,4,17:0.19,0.81:21
chr1	224473849	rs16846031	A	C	1703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.982;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=42;PP=1444;ReadPosRankSum=0.030;SC=ATAATGATACAAACGGCGATC;SOR=0.890;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=83;TCF=26;TCR=57;TR=60;WE=224473857;WS=224473839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,60:0.71:84
chr1	224473917	rs11341380	GT	G	113.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=-0.783;QD=6.32;ReadPosRankSum=0.537;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr1	224482216	rs2404783	T	C	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=152;ReadPosRankSum=-2.708;SC=TTACAGATTTTGACAGCAACA;SOR=0.984;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=11;WE=224482224;WS=224482206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr1	224484410	rs16846214	C	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=111;ReadPosRankSum=-0.996;SC=AAAAAATCTTCAAGGTCAAGG;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=224484418;WS=224484400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr1	224492381	rs7522125	C	T	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=17;NR=3;PP=593;SC=TAGGCTTTTTCCTCATAACTG;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=224492389;WS=224492371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	224492746	rs3754090	C	T	10707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=128;NR=216;PP=2965;SC=CTTTCTTTTGCAGGACAGCTT;SOR=1.360;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=345;TCF=128;TCR=217;TR=344;WE=224492754;WS=224492736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,352:1.00:352
chr1	224495852	rs7534447	C	T	5997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=95;PP=2965;SC=TGGAACTTATCCGTGGTGTTG;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=78;TCR=95;TR=173;WE=224495860;WS=224495842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr1	224500881	rs6684300	A	G	243.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=17.404;HP=21;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.230;NF=0;NR=9;PP=241;ReadPosRankSum=2.362;SC=AAAAAAAAAAAACAAGCAAAT;SOR=4.606;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=9;WE=224500889;WS=224500871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,9:0.82:11
chr1	224505570	rs3066969	T	TAA	1174.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=16;PP=1118;SC=GCTCTAACAATAAGACTCACC;SOR=1.445;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=24;WE=224505578;WS=224505560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	224505719	rs4436353	T	G	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=143;SC=AAATAAATTTTCATGAATATT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=224505727;WS=224505709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	224514275	rs4653578	G	A	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=23;PP=623;SC=TAAACTCTTCGTTAATAAAGT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=224514283;WS=224514265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	224517842	rs2896990	C	T	2027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=42;PP=1615;SC=CGTCGGTCTTCCAAGCCACAG;SOR=1.385;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=67;WE=224517850;WS=224517832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	224517907	rs4146965	A	T	1380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=41;PP=1182;SC=GCCCGCCGCGATCGCCGGGCC;SOR=6.138;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=42;WE=224517915;WS=224517897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	224548374	rs1857042	C	T	77.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=56;SC=CATGTTGTCTCTTATTCATTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=224548382;WS=224548364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr1	224586836	.	G	GT	156.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=-0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=1.139;NF=0;NR=8;PP=96;ReadPosRankSum=0.654;SC=TTAGTAACAGGTTTTTTTTTT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=8;WE=224586844;WS=224586826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr1	224588825	rs7518109	T	A	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=468;SC=TCTAAAGGAATTATGTGAGAA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=224588833;WS=224588815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr1	224606249	rs10495219	C	G	251.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=7;PP=207;SC=AGAAGTTCTGCGTTATGCGAT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=224606257;WS=224606239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	224621368	rs2405033	G	C	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=2;PP=387;SC=TCACCAGCTGGCGGTAAGGGA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=224621376;WS=224621358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	225111228	rs16858299	T	A	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=248;ReadPosRankSum=-0.190;SC=TTTGCTCTTCTGTTTTAGAAG;SOR=1.244;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=12;WE=225111236;WS=225111218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr1	225117561	rs2501078	T	C	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.099;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=523;ReadPosRankSum=-0.717;SC=CGTCTTCCTGTCAGCGGTCGG;SOR=0.105;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=24;WE=225117569;WS=225117551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr1	225156457	rs16858926	G	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=81;ReadPosRankSum=-1.338;SC=GCTTTATTTTGTAGGTTATTA;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=6;WE=225156465;WS=225156447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr1	225230425	rs74146615	C	T	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=157;ReadPosRankSum=0.792;SC=CAGTGTTACTCGGTTATACTG;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=7;WE=225230433;WS=225230415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr1	225230608	rs2501107	C	T	2719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=35;PP=2096;SC=TAAATCTATGCTTGAGAATTC;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=46;TCR=35;TR=81;WE=225230616;WS=225230598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr1	225237850	rs2501086	A	C	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=255;SC=GTCATGGATAATTTTGAAGTG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=225237858;WS=225237840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	225266966	rs3105559	C	G	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=4;PP=725;SC=AGAAGAATTTCTGGAGCATTT;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=225266974;WS=225266956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	225268343	rs3128651	A	G	8720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.72;SOR=0.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr1	225268346	rs3128652	G	A	8819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.23;SOR=1.144;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr1	225270409	rs3128655	A	T	1333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=33;PP=994;SC=GCTTGATAAAAACTGTAAAGT;SOR=2.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=42;WE=225270417;WS=225270399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	225273248	rs3128658	G	T	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=4;PP=979;SC=CATTTTAGATGTTTCAGTATG;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=37;WE=225273256;WS=225273238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	225273633	rs3105565	T	A	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=365;SC=TATTTACTAGTTTGAATACCA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=225273641;WS=225273623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	225285006	rs60266138	A	G	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=3.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=163;ReadPosRankSum=-1.097;SC=ATTTTCTTTAATTCTTGAGAA;SOR=2.093;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=9;WE=225285014;WS=225284996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr1	225305681	rs74147113	G	A	2470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.635;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=50;PP=1851;ReadPosRankSum=0.899;SC=CTGCTGAAGGGGAAGGTCTCG;SOR=0.629;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=64;TCR=78;TR=91;WE=225305689;WS=225305671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,93:0.64:146
chr1	225311154	rs74147114	C	T	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=1415;ReadPosRankSum=0.204;SC=CCTGTGACCTCGTCATGCTTG;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=25;WE=225311168;WS=225311144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr1	225311160	rs16844054	G	C	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=842;ReadPosRankSum=-0.920;SC=ACCTCGTCATGCTTGGTCATT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=47;TCR=1;TR=19;WE=225311168;WS=225311144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr1	225346975	rs1480101	C	G	2337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=15;PP=1806;SC=GAGCAGACTCCCTAATTTGTT;SOR=2.948;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=66;TCR=15;TR=81;WE=225346983;WS=225346965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	225355525	rs12754116	G	T	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=254;SC=AAAAAATCAAGAATTACTATC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=225355533;WS=225355515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	225373072	rs61851487	C	T	2596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=53;PP=1997;ReadPosRankSum=1.417;SC=AAAGCATTAACGCTATTACCA;SOR=0.433;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=89;TCF=34;TCR=55;TR=87;WE=225373080;WS=225373062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,87:0.99:88
chr1	225393587	rs12097990	C	T	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=563;SC=GAAAATATGTCCTAAGTAAAA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=225393595;WS=225393577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	225394645	rs1466468	A	T	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=1;PP=320;SC=TTTACATAAGATTATATTTTG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=225394653;WS=225394635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	225439988	rs630120	T	C	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=23;PP=1018;ReadPosRankSum=1.526;SC=TTGAATTTATTATTTTCGGTT;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=38;WE=225439996;WS=225439978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr1	225445652	rs670255	G	T	3781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.189;NF=108;NR=7;PP=2965;ReadPosRankSum=0.230;SC=TTTTTAAAATGTTAACTTAGG;SOR=3.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=109;TCR=7;TR=115;WE=225445660;WS=225445642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr1	225460626	rs656649	T	A	1261.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=0;PP=1348;SC=TAATTTTTTTTAAAAAAACGT;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=46;WE=225460634;WS=225460616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
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chr1	225463772	rs581675	A	G	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=19;PP=519;SC=GTTGGGTTCAATTTCTTTGGA;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=225463780;WS=225463762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	225477869	rs36116837	A	G	220.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=6;PP=181;SC=TTTGAAAAGAAAACAAGAAAA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=225477877;WS=225477859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	225506262	rs4653418	G	A	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.902;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=7;PP=681;ReadPosRankSum=1.143;SC=ATATGTGTTTGGGGACCTATA;SOR=0.813;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=122;TCF=97;TCR=25;TR=38;WE=225506270;WS=225506252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,39:0.31:126
chr1	225506427	rs12403278	A	G	1789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.623;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=61;PP=1459;ReadPosRankSum=0.563;SC=AGAAAAAAACATAAATTCATG;SOR=1.988;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=99;TCF=5;TCR=94;TR=63;WE=225506435;WS=225506417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,65:0.64:101
chr1	225512402	rs75859387	GT	G	1163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.449;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.515;NF=31;NR=15;PP=1201;ReadPosRankSum=-2.709;SC=TAAACCCGACGTTTTTGACAC;SOR=0.474;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=157;TCF=114;TCR=43;TR=46;WE=225512410;WS=225512392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,56:0.33:172
chr1	225528183	rs3856145	C	A	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.072;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=5;PP=602;ReadPosRankSum=0.646;SC=CAGAAATAGACAACCCCCATT;SOR=1.360;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=112;TCF=85;TCR=27;TR=34;WE=225528191;WS=225528173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,34:0.31:111
chr1	225533684	rs6667999	A	G	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-7.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=7;PP=572;ReadPosRankSum=-2.298;SC=AGATGATGACAAAATTGTAGA;SOR=0.588;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=151;TCF=131;TCR=20;TR=45;WE=225533692;WS=225533674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,46:0.29:156
chr1	225534219	rs7527925	T	C	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.474;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=242;ReadPosRankSum=0.405;SC=CTTTGCACTGTAATCATGCAA;SOR=1.569;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=14;WE=225534227;WS=225534209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,16:0.32:50
chr1	225534348	rs7535953	G	A	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.43;ReadPosRankSum=0.955;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr1	225539665	rs3856150	T	A	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=145;ReadPosRankSum=-0.552;SC=ATGTCGTACATTATCTTACAT;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=9;WE=225539673;WS=225539655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr1	225541372	rs6676935	A	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=-0.000;SC=AATAAAGCTCACTTTAAAAGT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=225541380;WS=225541363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr1	225545301	rs142111235	A	AATATGTGATAT	219.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.31;ReadPosRankSum=1.550;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr1	225545580	rs12745950	A	C	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=2.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr1	225545588	rs34993311	A	G	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=5.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.24;ReadPosRankSum=-1.200;SOR=0.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,14:0.34:41
chr1	225546172	rs9659299	C	G	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.354;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr1	225552624	rs10495239	G	A	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=150;ReadPosRankSum=-1.313;SC=CAGATTTAATGTTGACTGAGG;SOR=0.551;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=8;WE=225552632;WS=225552614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr1	225552650	rs12563830	C	T	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.020;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=76;ReadPosRankSum=-0.079;SC=TGTTTGAATGCAAGTCATCTT;SOR=0.293;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=225552658;WS=225552640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	225555512	rs11578981	C	T	2946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=38;PP=2303;ReadPosRankSum=0.556;SC=TCAAGATTGCCGTGGAATCTC;SOR=0.371;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=55;TCR=38;TR=92;WE=225555520;WS=225555502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,94:0.99:95
chr1	225555602	rs12737248	T	G	2948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=65;PP=2406;ReadPosRankSum=-0.783;SC=TATTTGAAAATCCTGACTGTG;SOR=1.015;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=25;TCR=66;TR=90;WE=225555610;WS=225555592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,93:0.99:94
chr1	225562385	rs10915816	C	T	3373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=25;PP=2600;SC=ATGGGTTTTCCAAAGGTTGCC;SOR=2.131;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=78;TCR=25;TR=103;WE=225562393;WS=225562375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	225565015	rs3856154	T	C	2377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=35;PP=1961;ReadPosRankSum=1.702;SC=GATGATGACCTTCCCGAGGTC;SOR=0.257;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=75;TCF=40;TCR=35;TR=73;WE=225565023;WS=225565005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr1	225565073	rs3856155	C	T	2154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=32;PP=1762;SC=AGACCCAGGGCGAAAAGTTTA;SOR=0.874;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=72;TCF=40;TCR=32;TR=71;WE=225565081;WS=225565063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr1	225569241	rs950210	T	G	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=32;PP=1199;SC=GAGGAAATATTTAACTCTTTT;SOR=1.358;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=49;WE=225569249;WS=225569231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	225576058	rs6679430	T	C	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=3;PP=713;SC=AAAAATGATGTGACTGTCTTT;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=225576066;WS=225576048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	225576311	rs10753405	A	G	1257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=34;PP=1081;SC=TGAATTAAGCAAGGGAGGGAT;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=38;WE=225576319;WS=225576301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	225577648	rs12134158	C	T	1737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=52;PP=1530;SC=TGTCACTCACCCTTTCCTCCT;SOR=6.518;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=53;TCF=1;TCR=52;TR=53;WE=225577656;WS=225577638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	225600351	.	TA	T	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.932;QD=1.38;ReadPosRankSum=-0.072;SOR=0.350;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,11:0.23:47
chr1	225601647	rs3766928	C	T	4368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=36;PP=2965;SC=TAACACAAGACTACTTAGAAA;SOR=1.939;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=94;TCR=36;TR=130;WE=225601655;WS=225601637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr1	225603103	rs6702433	C	T	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=505;SC=TACACACACACATATATATAT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=18;WE=225603111;WS=225603093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	225607144	rs2230419	C	T	980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=26;PP=785;SC=TTGTGACAAACTGAATTTTTC;SOR=4.479;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=225607152;WS=225607134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	225609884	rs1056608	A	G	1230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=29;PP=980;SC=GTGGTCGACCAGGGGATCGGG;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=225609892;WS=225609874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	225611661	rs1056607	C	T	4313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=103;NR=22;PP=2965;SC=CTTTATACTTCACAGTGTAAA;SOR=3.056;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=103;TCR=22;TR=125;WE=225611669;WS=225611651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	225611845	rs1340867	C	T	2373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=67;PP=1976;SC=TTTATGTATTCGTCTTTTTCC;SOR=8.554;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=67;TCF=0;TCR=67;TR=67;WE=225611853;WS=225611835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr1	225685621	rs145776060	TAAG	T	808.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=672;SC=CTCACAGTAATAAGAAGATTA;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=15;WE=225685631;WS=225685611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	225707271	rs34432111	G	GA	158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=-1.350;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.651;SOR=1.276;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr1	225840539	rs116481763	C	G	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=104;ReadPosRankSum=-1.467;SC=GGGGGCTACACCATCTCCTCG;SOR=0.527;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=8;WE=225840547;WS=225840529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,8:0.23:35
chr1	225970793	.	T	TAA	116	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=116;QD=49.0;SC=TCCAACTTTTTAAGTCTTAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=225970801;WS=225970792;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr1	226016381	rs41266229	G	A	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=92;ReadPosRankSum=1.815;SC=TGTCAGGGCCGGGCTGGGCGG;SOR=0.784;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=6;WE=226016389;WS=226016371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr1	226016397	rs41266231	G	A	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.022;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=126;ReadPosRankSum=-0.022;SC=GGCGGGCTCCGTTGTTAATGG;SOR=0.236;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=9;WE=226016405;WS=226016387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr1	226019633	rs1051740	T	C	3737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=62;PP=2758;SC=TCTCAACAGATACCCTCACTT;SOR=0.882;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=57;TCR=62;TR=119;WE=226019641;WS=226019623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr1	226019774	rs2260863	G	C	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=815;SC=AATTATAGGTGACTGAGATGT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=226019782;WS=226019764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	226026406	rs2234922	A	G	1100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-7.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.655;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=16;PP=844;ReadPosRankSum=0.635;SC=CCCGCAGGCCATACCCCGAAG;SOR=0.778;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=170;TCF=121;TCR=49;TR=58;WE=226026414;WS=226026396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,57:0.33:173
chr1	226032229	rs1051741	C	T	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.139;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=33;PP=1014;ReadPosRankSum=-0.237;SC=TGCTGACCAACGTCATGCTCT;SOR=0.814;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=221;TCF=105;TCR=116;TR=63;WE=226032237;WS=226032219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,66:0.30:223
chr1	226036309	rs360063	A	G	5889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=90;PP=2965;ReadPosRankSum=1.880;SC=CTCTGTGAACAAACACCCTCC;SOR=0.291;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=195;TCF=104;TCR=91;TR=193;WE=226036317;WS=226036299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,199:1.00:200
chr1	226044489	rs60955535	G	GC	1168.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=14;PP=1450;SC=TGCTCTATGTGCCCCAGTGAG;SOR=1.121;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=24;TCR=18;TR=34;WE=226044497;WS=226044479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	226044766	rs9919303	G	A	2454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=58;PP=1856;SC=CGTGGGCCACGCGGCTCTGAG;SOR=2.690;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=14;TCR=58;TR=72;WE=226044774;WS=226044756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	226053805	rs7515156	G	A	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=22;PP=826;SC=TTCTGTGGCCGGGGGAGCCCC;SOR=2.376;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=29;WE=226053813;WS=226053795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	226054333	rs45492299	G	A	1632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.521;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=32;PP=1241;ReadPosRankSum=-0.576;SC=CCCACAGTGAGGAAGAGGTAA;SOR=0.478;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=77;TCF=38;TCR=39;TR=58;WE=226054341;WS=226054323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,62:0.76:82
chr1	226054681	rs360085	T	A	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=521;SC=GCTCAACAACTCACTAGCTGC;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=226054689;WS=226054671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	226054714	rs2292563	G	A	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=1;PP=947;SC=GATACCAGCCGGCCCCCTTTG;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=34;WE=226054722;WS=226054704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	226055595	rs2292564	G	A	1934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=16;PP=1498;SC=TACCCAGCAAGTCCCCTGAGA;SOR=2.119;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=42;TCR=16;TR=58;WE=226055603;WS=226055585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	226074563	rs360057	T	G	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=2.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQRankSum=-1.084;QD=5.53;ReadPosRankSum=1.058;SOR=0.394;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,20:0.25:79
chr1	226125385	rs2295418	G	A	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.020;NF=11;NR=14;PP=457;ReadPosRankSum=0.231;SC=CAGGAAGCCCGGGGGCTCCAG;SOR=0.775;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=76;TCF=35;TCR=41;TR=25;WE=226125393;WS=226125375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,28:0.35:79
chr1	226125543	rs60825997	G	GA	321.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=8;PP=312;SC=GGTCATCTGGGAGGCTGAAGT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=226125551;WS=226125533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	226180807	rs201197753	ACTTT	A	110.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.84;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr1	226180816	rs67548369	C	T	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.666;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.40;ReadPosRankSum=-3.712;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
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chr1	226346856	rs113921278	A	G	1587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.163;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=13;PP=1252;ReadPosRankSum=-0.120;SC=ACTCTCTCTAAGGCTGAATTC;SOR=0.473;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=84;TCF=68;TCR=16;TR=57;WE=226346864;WS=226346846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,58:0.64:90
chr1	226352498	rs2306120	T	G	6718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=139;NR=68;PP=2965;SC=ACCTTTTTTTTTCTTGCTCTT;SOR=1.632;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=210;TCF=140;TCR=70;TR=207;WE=226352506;WS=226352488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr1	226353521	rs2306121	T	A	1385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.710;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=11;PP=1100;ReadPosRankSum=1.497;SC=TTGCCAACATTATCCTCATTA;SOR=0.595;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=192;TCF=155;TCR=37;TR=61;WE=226353529;WS=226353511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,62:0.32:194
chr1	226411317	rs10915962	C	T	1163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=14;PP=892;SC=GCCTTCCCAGCCCCTGGCCCG;SOR=1.387;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=38;WE=226411325;WS=226411307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	226420722	rs2306119	A	G	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=24;ReadPosRankSum=1.391;SC=ACAAATATGCATAATTCTTAA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=5;WE=226420730;WS=226420712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr1	226438449	rs6678137	T	C	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=0;PP=611;SC=AAGGTTTCCTTCCATAGATAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=226438457;WS=226438439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	226474132	rs10799347	G	A	2106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=49;PP=1678;SC=GACATACACAGAAGTCATTAT;SOR=2.105;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=18;TCR=49;TR=66;WE=226474140;WS=226474122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	226485327	rs11390947	A	AT	1447.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=3;PP=1427;SC=AAACTTGTAAATTTTTTACTG;SOR=4.450;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=49;TCF=44;TCR=5;TR=42;WE=226485335;WS=226485317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	226488826	rs11577454	A	G	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=221;ReadPosRankSum=-0.422;SC=TTAATTTAACAAATTAGACTT;SOR=0.735;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=14;WE=226488834;WS=226488816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr1	226550924	rs747657	G	C	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=27;PP=977;SC=CCAACAGTTTGATTAGGAGAA;SOR=1.923;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=38;WE=226550932;WS=226550914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	226553485	rs118165556	A	C	401.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.24;QD=44.64;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	226553486	rs146042055	C	A	401.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.24;QD=44.64;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	226553490	rs34917861	C	A	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.30;QD=45.78;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	226553494	rs11378196	C	CA	448.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.40;QD=37.39;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	226556094	rs1805400	T	C	2123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=50;PP=1758;SC=GCTTTCTCTTTTAGCAGGTGG;SOR=3.370;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=8;TCR=50;TR=58;WE=226556102;WS=226556084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	226566726	rs907190	A	C	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=319;SC=CTCTGTGATTAGATTTCATTC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=226566734;WS=226566716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	226570840	rs1805415	T	C	1354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=18;PP=1033;SC=TACGGTCCTGTTTTTTAACCT;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=19;TCR=18;TR=37;WE=226570848;WS=226570830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	226825341	rs2236604	G	A	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=584;ReadPosRankSum=-0.102;SC=GTTGGCACGCGCAGCATTCTG;SOR=0.704;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=77;TCF=54;TCR=23;TR=34;WE=226825349;WS=226825331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,36:0.46:78
chr1	226836590	rs2298169	A	G	4020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=103;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.804;SC=AGGGCCCTTGACGGGCTCTGA;SOR=2.782;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=117;TCF=12;TCR=105;TR=115;WE=226836598;WS=226836580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,121:0.99:122
chr1	226895570	.	A	AC	1750.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.000;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.972;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.842;NF=12;NR=31;PP=1778;ReadPosRankSum=0.450;SC=TTGGTATTGGACGTTGCCCCA;SOR=0.405;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=78;TCF=22;TCR=56;TR=43;WE=226895578;WS=226895560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,55:0.60:92
chr1	226923146	rs11337528	GT	G	1195.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.528;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.617;NF=21;NR=10;PP=1135;ReadPosRankSum=-0.652;SC=TGTGTAGAAAGTTAAGAAAAA;SOR=0.393;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=31;WE=226923154;WS=226923136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,37:0.76:49
chr1	226923264	rs708775	G	A	1493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.168;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=1105;ReadPosRankSum=0.268;SC=TATGCAGGAAGGCTGAGTTGG;SOR=0.568;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=64;TCF=32;TCR=32;TR=50;WE=226923272;WS=226923254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,52:0.79:66
chr1	226923505	rs708776	G	T	7089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=115;PP=2965;SC=AGGCTTGTCCGGATCTTGGGG;SOR=0.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=216;TCF=101;TCR=115;TR=216;WE=226923513;WS=226923495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr1	226923938	rs6667260	A	C	5769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=84;PP=2965;SC=CAGCTCAGGGAATCAGAGGAC;SOR=0.728;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=84;TCR=84;TR=168;WE=226923946;WS=226923928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr1	226924642	rs3754415	C	T	1774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.800;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=26;PP=1283;ReadPosRankSum=-0.824;SC=GGAGGGCGAGCGAGCCCTGCC;SOR=0.842;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=210;TCF=130;TCR=80;TR=73;WE=226924650;WS=226924632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,77:0.37:210
chr1	226924875	rs147889095	ACTGCCGCTG	A	1986.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.620;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.721;NF=10;NR=26;PP=2976;ReadPosRankSum=0.452;SC=TGCTCACGCTACTGCCGCTGC;SOR=0.046;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=82;TCF=12;TCR=70;TR=36;WE=226924891;WS=226924865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,50:0.72:69
chr1	227069677	rs11405	T	C	3081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=58;PP=2240;SC=TAATGTCGGCTGAGAGCCCCA;SOR=1.077;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=42;TCR=58;TR=100;WE=227069685;WS=227069667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr1	227069737	rs6759	C	T	1768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=50;PP=1480;SC=ATGGAGAGAACACTGCCCAGT;SOR=4.731;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=54;WE=227069745;WS=227069727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	227071364	rs1295643	G	A	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=378;SC=ATAGGCTGCCGTGGGGGACAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=227071385;WS=227071354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	227071377	rs1295644	T	C	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=468;SC=GGGGACATTCTGCGGCCCTCA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=227071385;WS=227071354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	227071525	rs1046240	C	T	2614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=42;PP=1944;SC=GAGCGAAGCACGTGATCATGC;SOR=0.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=38;TCR=42;TR=80;WE=227071533;WS=227071515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr1	227073410	rs2236910	G	C	3223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=71;PP=2526;SC=CTCCAGCCACGCTTCTCTCCG;SOR=2.670;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=16;TCR=72;TR=87;WE=227073418;WS=227073400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	227078955	rs2802267	T	C	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=5;PP=823;SC=CCGCCTGAGATGTGAACCTTT;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=227078963;WS=227078945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	227079222	rs2236915	C	G	1614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=29;PP=1396;SC=CTTGAAGATTCAGCAAGTGTT;SOR=1.251;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=48;WE=227079230;WS=227079212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	227081622	rs10753428	A	G	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=1;PP=925;SC=GGGCAAGAGCAGCTGGGCCTT;SOR=5.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=39;WE=227081630;WS=227081612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	227081850	rs2855562	G	A	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=41;PP=1175;SC=GATGCGTCCAGCTGCCTCGTG;SOR=3.611;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=6;TCR=42;TR=47;WE=227081858;WS=227081840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	227085155	rs11802358	G	A	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=322;ReadPosRankSum=-1.401;SC=TTAGGGTGAAGTGTTAAGACT;SOR=0.426;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=49;TCF=47;TCR=2;TR=17;WE=227085163;WS=227085145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,17:0.32:53
chr1	227170298	rs2297412	A	G	205.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=1;PP=161;SC=TGGCCAGGGCATCCCAGGAGT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=227170306;WS=227170288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	227170543	rs2297413	C	G	1903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=29;PP=1514;SC=GGGCTTCTCCCGGTGGCCCAG;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=63;WE=227170551;WS=227170533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr1	227171584	rs3215919	GT	G	605.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=13;PP=703;SC=CCCCTTGCGTGTTTGCACCAG;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=18;WE=227171592;WS=227171574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	227171737	rs1574184	G	T	1702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.66;QD=43.66;SOR=5.084;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	227171737	.	GGG	TGT	1181	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=59.69;NF=41;NR=2;PP=1181;QD=28.7085552294;SC=GGTGTGTGTGGGGGGGGGGAC;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=46;TCF=43;TCR=3;TR=43;WE=227171747;WS=227171727;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,43:0.93:46
chr1	227171739	rs1574185	G	T	1701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.66;QD=43.64;SOR=5.084;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	227172290	rs12593	C	T	8056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=144;PP=2965;SC=GGGAGCTGTTCGAGTTCCACT;SOR=0.952;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=255;TCF=111;TCR=144;TR=255;WE=227172298;WS=227172280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr1	227172903	rs2297415	G	A	1462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=9;PP=1255;SC=CTGGGATGTCGGGAGCTGAGC;SOR=2.687;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=46;WE=227172911;WS=227172893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	227172935	rs2297416	C	G	1722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=11;PP=1457;SC=CCCACGGTCCCCTCCTGTGCC;SOR=2.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=50;TCR=11;TR=61;WE=227172943;WS=227172925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	227174145	rs7552783	T	C	5161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=132;NR=16;PP=2965;SC=CCTTCCTCTCTTGCCCCAGGT;SOR=4.217;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=148;TCF=132;TCR=16;TR=148;WE=227174153;WS=227174135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr1	227174210	rs3738725	T	C	11579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=245;NR=123;PP=2965;SC=CCTTCGCCTCTGATGAGCCTT;SOR=1.591;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=368;TCF=245;TCR=123;TR=368;WE=227174218;WS=227174200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,382:1.00:382
chr1	227181923	rs3795451	C	T	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=30;NR=2;PP=760;SC=TGAGAGGAGGCGAGTGGCAGG;SOR=4.548;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=32;WE=227181931;WS=227181913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	227182033	rs2802269	G	A	3270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=37;PP=2619;SC=TCGGGGTGAAGCTGGGCTTGG;SOR=1.458;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=66;TCR=37;TR=103;WE=227182041;WS=227182023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr1	227182575	rs1045247	A	G	3195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=25;PP=2348;SC=CCATGCCTCCAGAGGACAAAG;SOR=2.522;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=81;TCR=25;TR=105;WE=227182583;WS=227182565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr1	227182754	rs2297419	G	A	2443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=59;PP=1991;SC=ACAGACTGCTGAGCTGACAGG;SOR=3.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=10;TCR=59;TR=69;WE=227182762;WS=227182744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr1	227192579	rs2297418	A	C	932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=0;PP=705;SC=CACTGCAGCCACTTGAGAATG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=227192587;WS=227192569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	227204557	rs17600747	T	C	2058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=9;PP=1603;ReadPosRankSum=-1.021;SC=CCAAATCAAATATAGTATCAT;SOR=2.043;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=66;TCF=57;TCR=9;TR=63;WE=227204565;WS=227204547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr1	227210820	rs11580229	G	A	895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=2;PP=654;SC=GAATGTGATAGTGGCCAACAT;SOR=4.332;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=227210828;WS=227210810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	227210888	rs11578479	A	T	1835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=22;PP=1339;SC=ACTTATTATTAATGTGACCTT;SOR=1.071;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=57;WE=227210896;WS=227210878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	227213968	rs7535826	G	T	1230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=38;PP=1077;SC=AAATCCTATGGGGCTATCATA;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=39;WE=227213976;WS=227213958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	227216662	rs1929861	T	C	7147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.879;SC=CTTGAATTTCTTTAAATTTTC;SOR=0.242;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=225;TCF=114;TCR=111;TR=224;WE=227216670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,223:1.00:224
chr1	227216775	rs1929860	C	T	6545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=100;PP=2965;SC=CCAGAAGTTACGGTTTGACAC;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=197;TCF=97;TCR=100;TR=197;WE=227216783;WS=227216765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr1	227218069	rs5781458	C	CAT	1181.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=6;PP=1146;SC=TTTTTTAACACGATTTAAAAT;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=24;WE=227218077;WS=227218059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	227219314	rs1319103	A	G	255.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=211;SC=CCAATAAAATAAGCATTCATT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=227219322;WS=227219304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	227221123	rs11582863	G	A	2667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=49;PP=2092;SC=ATCCCTGAACGAAAAGCAAAG;SOR=1.248;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=30;TCR=49;TR=79;WE=227221131;WS=227221113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr1	227222515	rs113874316	G	GACAA	4239.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=70;PP=2972;SC=GTTTTAGACAGACAAACAGCC;SOR=2.560;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=102;TCF=15;TCR=87;TR=80;WE=227222523;WS=227222505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	227239562	rs34111989	G	C	2740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=46;PP=2001;SC=TTGGGGAGCAGGGATGCTCCA;SOR=0.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=45;TCR=46;TR=91;WE=227239570;WS=227239552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	227288655	rs2104863	G	A	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=255;SC=CAGGTACTCAGTAAGTATTTA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=227288663;WS=227288645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	227330759	rs12139502	A	G	4633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.762;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=91;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.072;SC=TAAGAAATAGATAGCTATATG;SOR=0.261;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=148;TCF=55;TCR=93;TR=146;WE=227330767;WS=227330749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,151:0.99:153
chr1	227381326	rs6696485	C	T	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=597;SC=CAAATAATAACAACAACAAAG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=227381334;WS=227381323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	227381373	rs3768436	G	T	2301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=0;PP=1955;SC=AATTTTTTTTGGTTGACGATA;SOR=8.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=64;TCR=0;TR=64;WE=227381381;WS=227381363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr1	227387143	rs3768435	A	G	288.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=270;SC=CTTACCCTGTATGAAATGCAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=227387151;WS=227387133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	227387361	rs3768434	A	G	1485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=36;PP=1240;SC=TGTCTGAAACACAAAAAGAAA;SOR=2.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=46;WE=227387369;WS=227387351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	227834228	rs79145640	AT	A	1283.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.531;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=19;PP=1867;ReadPosRankSum=0.381;SC=ATACGTGTGTATTTTTCCCCC;SOR=1.122;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=181;TCF=114;TCR=67;TR=63;WE=227834241;WS=227834218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,73:0.36:202
chr1	227920103	rs3087908	G	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=-0.138;SC=CTATGGGGCCGCAGCAGCATC;SOR=0.395;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=7;WE=227920111;WS=227920093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr1	227920447	rs751748	C	T	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.565;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=315;ReadPosRankSum=-1.141;SC=ACCCGACATGCGCCCAGTCCC;SOR=0.412;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=17;WE=227920455;WS=227920437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr1	227922918	rs2295994	A	C	1022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=0.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.71;ReadPosRankSum=1.167;SOR=0.817;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,50:0.28:179
chr1	227923081	rs7419238	G	A	6916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=140;PP=2965;SC=TTTCTGCCCCGCCAGCGCCTG;SOR=1.316;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=228;TCF=86;TCR=142;TR=226;WE=227923089;WS=227923071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr1	227935280	rs2236361	C	T	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=132;ReadPosRankSum=1.130;SC=GAGTCAGCCACGTGCTGCAGC;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=10;WE=227935288;WS=227935270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,11:0.28:40
chr1	227935355	rs2236360	T	C	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.082;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=242;ReadPosRankSum=-0.953;SC=CTCCAGTCCATGGGTGACGGC;SOR=0.863;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=77;TCF=56;TCR=21;TR=20;WE=227935363;WS=227935345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,20:0.26:77
chr1	227935444	rs2236359	A	G	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=539;ReadPosRankSum=-2.206;SC=ACAGATGAGCAGGGATGTCTG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=69;TCR=67;TR=40;WE=227935452;WS=227935434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,42:0.30:138
chr1	227963491	rs754224	G	T	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=253;ReadPosRankSum=0.917;SC=GCTCTGCAGGGCTTCCGGCCT;SOR=0.773;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=15;WE=227963499;WS=227963481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr1	227968107	rs10799448	G	A	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.887;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=286;ReadPosRankSum=-0.105;SC=CTGCTGGCTCGCAGATGGCAT;SOR=1.536;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=74;TCF=61;TCR=13;TR=21;WE=227968115;WS=227968097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,22:0.29:76
chr1	228033197	rs9426581	A	G	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=4;PP=1071;SC=GCTGCAGGAGATGCAGCTCCC;SOR=3.664;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=39;WE=228033205;WS=228033187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	228113163	rs3795768	A	G	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=655;ReadPosRankSum=-0.169;SC=GCGCCTGGGCAGCCGCCTCTG;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=32;WE=228113171;WS=228113153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,32:0.76:42
chr1	228289328	.	C	G	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=90;ReadPosRankSum=-1.876;SC=GTTACGTAGTCACGTGGCCAG;SOR=0.293;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=5;WE=228289336;WS=228289318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr1	228294300	rs12564763	T	C	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=383;SC=CACTGAGCTCTCTCTGTGCTT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=14;WE=228294308;WS=228294290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	228352160	rs4348717	T	C	2844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=69;PP=2143;SC=TAGCAGTGTGTGGTTCCTGCC;SOR=2.030;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=23;TCR=69;TR=92;WE=228352168;WS=228352150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	228391808	rs11800309	G	T	2614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=47;PP=2058;SC=ACAGATTTTGGTATATGCGGG;SOR=1.151;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=31;TCR=47;TR=78;WE=228391816;WS=228391798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	228399482	rs11804508	C	G	732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=2;PP=552;SC=CGCCGCCACCCTCATGGATCA;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=228399490;WS=228399472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	228399766	rs55971985	T	C	1974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=40;PP=1350;SC=CCTTCGCTGCTGTGGGCCTGC;SOR=1.054;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=28;TCR=41;TR=68;WE=228399774;WS=228399756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	228400646	rs3121192	T	C	1918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.61;SOR=3.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	228400653	rs3121191	A	T	1882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.83;SOR=3.365;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	228402047	rs1620111	A	G	6458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=114;PP=2965;SC=GCCACACACTAACCATCTCCC;SOR=1.133;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=84;TCR=114;TR=198;WE=228402055;WS=228402037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr1	228402121	rs1771487	A	G	4470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=105;PP=2965;SC=ACGTCCACCCAGTTCTGCGTG;SOR=2.206;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=37;TCR=106;TR=141;WE=228402129;WS=228402111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr1	228405118	rs5781507	G	GA	797.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=31;PP=639;SC=AGTGTCAACTGAAAAAAAAAA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=228405126;WS=228405108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	228431095	rs1771455	A	G	3303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=69;PP=2550;SC=CAGGCAAGACAGATGCCGGGG;SOR=1.449;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=40;TCR=69;TR=109;WE=228431103;WS=228431085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr1	228431930	rs10916293	C	T	5835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=69;PP=2965;ReadPosRankSum=0.981;SC=GAATCTTCAGCGCCTGTGAAA;SOR=0.488;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=115;TCR=69;TR=183;WE=228431938;WS=228431920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,192:0.99:193
chr1	228433217	rs2487384	A	G	3200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=59;PP=2590;SC=AGCCCCAGACAGAGGTGACGT;SOR=0.994;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=44;TCR=59;TR=103;WE=228433225;WS=228433207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	228434395	rs7517088	T	C	7344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=124;PP=2965;SC=GCATAGAGGCTGCGGGCTGCA;SOR=0.750;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=242;TCF=118;TCR=124;TR=242;WE=228434403;WS=228434385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr1	228434467	rs7517108	T	C	5533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=116;PP=2965;SC=CCTGTGAGGCTGGGGGCCAGC;SOR=1.512;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=61;TCR=116;TR=177;WE=228434475;WS=228434457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr1	228437603	rs6426494	T	C	1855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=12;PP=1569;SC=GGCCTTGTCTTCCCAGTGCTG;SOR=2.794;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=57;WE=228437611;WS=228437593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	228438045	rs12737540	G	A	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=750;SC=TTCATGTCTCGGGCTTCCCAT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=228438053;WS=228438035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	228444318	rs7532144	T	G	1694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=16;PP=1312;SC=GACCTAGATGTTGGTGGTCAC;SOR=1.835;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=51;WE=228444326;WS=228444308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr1	228444565	rs7532342	T	A	4105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=61;NR=75;PP=2965;SC=GGCCAGGCGGTCGCCGGGGAG;SOR=0.980;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=61;TCR=76;TR=136;WE=228444573;WS=228444555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	228444741	rs3795780	C	T	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=620;SC=TCCACTTCTCCATGCCCTCAC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=228444749;WS=228444731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr1	228451826	rs453140	C	T	3195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=43;PP=2492;ReadPosRankSum=-0.749;SC=GAGCCCAAGGCGGTGTTTGCC;SOR=0.409;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=102;TCF=59;TCR=43;TR=99;WE=228451834;WS=228451816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,107:0.99:108
chr1	228456147	rs878388	T	C	7853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=158;PP=2965;SC=CCTACTTTCTTGTCTAGGCCC;SOR=1.192;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=258;TCF=100;TCR=158;TR=257;WE=228456155;WS=228456137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr1	228461129	rs1188724	A	G	3563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=52;PP=2804;SC=TCAAAAGTGCACATGGAGGCC;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=69;TCR=52;TR=121;WE=228461137;WS=228461119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	228461408	rs11398292	A	AG	1334.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=11;PP=1523;SC=GTGGCCCTGAAGGGAGCGGGG;SOR=2.303;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=39;WE=228461416;WS=228461398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	228463433	rs510931	C	T	888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=3;PP=661;SC=CGAGGGCCGCCGTGACCTCCC;SOR=3.334;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=228463441;WS=228463423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	228464248	rs1188721	T	G	4545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=53;PP=2965;SC=CGGACGTGGATGGCAGCTGGA;SOR=1.211;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=83;TCR=53;TR=136;WE=228464256;WS=228464238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr1	228464276	rs1188722	T	C	5118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=71;PP=2965;SC=CGGTCTGCGGTTCCAGCAGGG;SOR=0.850;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=84;TCR=71;TR=155;WE=228464284;WS=228464266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr1	228464842	rs936885	C	G	4834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=76;PP=2965;SC=GTGCCTGACTCGGCCTCTGCC;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=64;TCR=76;TR=140;WE=228464850;WS=228464832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr1	228465370	rs867599	T	G	4361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=88;PP=2965;SC=CCAGGAAGGTTCGAGGACAGG;SOR=1.663;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=131;TCF=43;TCR=88;TR=131;WE=228465378;WS=228465360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr1	228467072	rs185248802	C	G	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=34;PP=925;ReadPosRankSum=0.801;SC=TGCGGCGGACCTGCTCCACCA;SOR=0.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=17;TCR=53;TR=45;WE=228467080;WS=228467062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,48:0.65:74
chr1	228468458	rs1188697	G	A	1779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=10.492;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=47;PP=1417;ReadPosRankSum=-0.790;SC=CACCTGCCACGTGGGCTCCGA;SOR=4.686;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=53;TCF=5;TCR=48;TR=51;WE=228468466;WS=228468448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr1	228470995	rs1150906	G	T	2208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=57;PP=1845;SC=GGTAAATGCCGCAGGAGCCCC;SOR=4.310;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=6;TCR=57;TR=63;WE=228471003;WS=228470985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	228475848	rs437129	G	A	8509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=137;PP=2965;ReadPosRankSum=1.496;SC=GCTGAGCAAGGCAGCCCCTGT;SOR=0.817;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=263;TCF=124;TCR=139;TR=259;WE=228475856;WS=228475838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,272:0.99:276
chr1	228480282	rs1150908	A	G	5666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=70;PP=2965;SC=AAGGGGCCACAGCTGTGCTGC;SOR=1.227;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=109;TCR=70;TR=179;WE=228480290;WS=228480272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr1	228482010	rs449133	C	T	10932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=195;NR=146;PP=2965;SC=TGAGGCAGGACGGGTCCAGGT;SOR=1.004;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=341;TCF=195;TCR=146;TR=341;WE=228482018;WS=228482000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,343:1.00:343
chr1	228482285	rs1150909	T	C	2332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=53;PP=1922;SC=CAGGAGGTGTTCTCATGCTCA;SOR=3.426;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=9;TCR=53;TR=62;WE=228482293;WS=228482275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	228492044	rs1150910	G	A	7703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=121;NR=101;PP=2965;SC=CAAACCAGGAGGCCAGAGAAG;SOR=0.876;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=223;TCF=122;TCR=101;TR=222;WE=228492052;WS=228492034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr1	228494382	rs1150911	T	G	5201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=146;PP=2965;SC=AGCGCAGTTCTTGTGCTTTGG;SOR=5.657;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=7;TCR=147;TR=153;WE=228494390;WS=228494372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr1	228494790	rs435776	G	A	3789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=50;PP=2965;SC=GCTGGTACGCGGAGTGGAGCA;SOR=1.096;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=69;TCR=50;TR=119;WE=228494798;WS=228494780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr1	228495664	.	T	A	257	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=10;NR=1;PP=257;QD=26.5246556861;SC=TTGTGAGCACTTCGGGACAAA;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=228495672;WS=228495663;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	228495696	rs419173	T	C	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=1;PP=817;SC=ACAGATGGGCTATGGCAAAAG;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=228495704;WS=228495686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	228497053	rs379620	A	G	4080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=43;PP=2965;SC=CTCCATTCAGAAAGGCCTTCC;SOR=1.285;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=74;TCR=43;TR=117;WE=228497061;WS=228497043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr1	228503677	rs1150912	A	G	3421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=97;NR=28;PP=2795;SC=GAACCCGTGCACACCTCGGAG;SOR=2.419;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=97;TCR=28;TR=125;WE=228503685;WS=228503667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	228504472	rs1188732	T	C	2718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=37;PP=2075;SC=CGCACAGGCATGCTTCACCTG;SOR=1.014;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=53;TCR=37;TR=89;WE=228504480;WS=228504462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr1	228504670	rs11810627	C	T	643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=18;PP=516;SC=GGCCTCTGCGCGGCTCACCGT;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=21;WE=228504678;WS=228504660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	228504701	rs111792077	G	GCTCC	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=517;SC=TGGTGGGCGAGCTTTTCCCTC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=228504709;WS=228504691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	228505668	rs1188729	C	G	3930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=73;NR=46;PP=2965;SC=GAAGATGTCTCTCTGGAGCTT;SOR=1.236;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=73;TCR=46;TR=119;WE=228505676;WS=228505658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr1	228505699	rs1188728	T	C	4365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=60;PP=2965;SC=CTGAGGCTGGTGAGGTCATCT;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=82;TCR=60;TR=142;WE=228505707;WS=228505689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr1	228509427	rs373610	A	G	5433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=73;PP=2965;SC=ACTGGCCTGGACCGTGCTGAT;SOR=0.900;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=162;TCF=88;TCR=74;TR=161;WE=228509435;WS=228509417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr1	228520763	rs384553	G	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=297;ReadPosRankSum=1.811;SC=CCTTCCTCCAGGCCCTGGCGG;SOR=0.631;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=15;WE=228520771;WS=228520753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr1	228520880	rs416564	C	T	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.222;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=57;ReadPosRankSum=1.843;SC=TTATGGCTGACCCCTTTTCTG;SOR=1.206;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=6;WE=228520888;WS=228520870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr1	228520973	rs369909	C	G	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.702;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=218;ReadPosRankSum=0.756;SC=GCTGAGAGACCTCCAGGTGGC;SOR=1.216;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=18;WE=228520981;WS=228520963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr1	228522029	rs57891072	TA	T	529.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=554;SC=CCTGAGTGTGTAGAGTTCCAG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=228522037;WS=228522022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	228522047	rs520552	A	T	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.44;ReadPosRankSum=-0.425;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr1	228523005	.	T	TG	52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.9998;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=52;QD=39.0;SC=GGGCCGTGAGTGGGGGTGGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=228523013;WS=228522995;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	228523412	rs12061733	G	A	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=443;ReadPosRankSum=-0.224;SC=TCAGGGCTTCGGAGGGACCCA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=19;WE=228523420;WS=228523402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr1	228523442	rs1684868	T	C	2213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.12;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	228523442	.	TGTGCTG	CGTGCCA,CGTGCCG	663	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=8,36;NR=0,8;PP=47,663;QD=13.8084843578;SC=TGGAATCAGATGTGCTGGGGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=8,44;WE=228523456;WS=228523432;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.18:45
chr1	228523447	rs10799473	T	C	2179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.60;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	228523448	rs1757161	G	A	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.09;ReadPosRankSum=1.111;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,10:0.19:52
chr1	228523618	rs1757160	G	A	1892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=30;PP=1629;SC=AGGAGTGGGGGACAGGACAGC;SOR=0.800;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=27;TCR=30;TR=57;WE=228523626;WS=228523608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	228524919	rs3795807	G	A	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.014;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=485;ReadPosRankSum=-0.301;SC=AGGCAGGCCAGGGTGTCATGA;SOR=1.402;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=108;TCF=45;TCR=63;TR=29;WE=228524927;WS=228524909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,31:0.28:110
chr1	228524961	rs3795808	C	A	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.717;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=598;ReadPosRankSum=-0.201;SC=TGCAGGTGCCCGGAGGTGACA;SOR=0.395;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=119;TCF=47;TCR=72;TR=35;WE=228524969;WS=228524951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,37:0.29:126
chr1	228525022	rs374602554	C	T	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.510;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=509;ReadPosRankSum=0.809;SC=TGGCCGATCACGGCCATCCTC;SOR=0.320;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=90;TCF=33;TCR=57;TR=33;WE=228525030;WS=228525012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,35:0.37:95
chr1	228525627	rs1757127	C	A	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.372;NF=26;NR=16;PP=700;ReadPosRankSum=0.350;SC=CACTTCAGCACCCCCATCCCT;SOR=0.640;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=119;TCF=75;TCR=44;TR=42;WE=228525635;WS=228525617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,42:0.34:123
chr1	228525898	rs1188717	C	G	2859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=25;PP=2343;SC=AGGCCCCTAGCAGGGTCGTCC;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=54;TCR=25;TR=79;WE=228525906;WS=228525888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr1	228526486	rs58480216	G	A	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=211;ReadPosRankSum=1.270;SC=TGGGGGCCTCGTGGCCCACAG;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=11;WE=228526494;WS=228526476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr1	228526665	rs505629	T	C	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=34;PP=898;SC=TGCCCATAGCTGTGGCCGGCC;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=40;WE=228526673;WS=228526655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	228526742	.	CCA	C	84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=17;MQ=58.33;NF=0;NR=3;PP=84;QD=29.0;SC=GTGGGTGGGGCCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=228526751;WS=228526732;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr1	228528412	rs1150916	G	A	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.650;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=26;PP=838;ReadPosRankSum=1.007;SC=CCTGACCTTCGCCCCGGCCCC;SOR=0.405;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=129;TCF=57;TCR=72;TR=55;WE=228528420;WS=228528402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,54:0.41:133
chr1	228528563	rs1188710	C	G	2388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=54;PP=1953;SC=AGGCACCCTGCAGGCCCTGGG;SOR=2.062;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=16;TCR=54;TR=70;WE=228528571;WS=228528553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	228529129	rs3795810	C	A	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.084;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=864;ReadPosRankSum=0.188;SC=CACCCTCCCCCACCCACAGCT;SOR=0.662;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=62;TCF=32;TCR=30;TR=38;WE=228529137;WS=228529119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,40:0.62:65
chr1	228529429	rs141828109	A	AGACGGCTCAGCCAGCCTGTGGCATGG,AGACGGCTCAGCC	938.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=3;PP=69;SC=TTCCTGGGACAGACGGCTACA;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=3;WE=228529437;WS=228529419;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:17
chr1	228537824	.	C	T	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.118;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=27;PP=528;ReadPosRankSum=1.523;SC=GGCCCAGCTGCGGCGGGGTGG;SOR=0.531;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=84;TCF=3;TCR=81;TR=28;WE=228537832;WS=228537814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,29:0.35:82
chr1	228538470	rs12031395	C	G	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=3;PP=827;ReadPosRankSum=-0.376;SC=GTGTCTGTCTCTGTCTCTCTG;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=53;TCF=47;TCR=6;TR=36;WE=228538478;WS=228538460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,36:0.67:54
chr1	228539300	rs3795812	G	A	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=107;ReadPosRankSum=0.854;SC=CACCATACCCGCTGCTACACC;SOR=0.269;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=6;WE=228539308;WS=228539290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr1	228543800	rs3795814	C	T	1741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.561;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=5;PP=1408;ReadPosRankSum=1.709;SC=TAGCTCAGCCCCTAGCACTGG;SOR=1.675;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=86;TCF=77;TCR=9;TR=59;WE=228543808;WS=228543790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,59:0.70:84
chr1	228547256	rs12027720	G	A	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=702;ReadPosRankSum=-0.911;SC=AATCCTGGGCGCTGTGCCCAT;SOR=0.627;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=37;WE=228547264;WS=228547246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,38:0.76:50
chr1	228548197	rs10158354	G	A	2566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.756;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=41;PP=2069;ReadPosRankSum=2.526;SC=CCTGAGCCCCGTGGGGCGTCA;SOR=0.813;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=124;TCF=67;TCR=57;TR=91;WE=228548205;WS=228548187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,92:0.74:125
chr1	228550426	rs35155240	C	T	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.461;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=556;ReadPosRankSum=0.533;SC=CGGCTCCCAGCCCCCAGTCAC;SOR=0.223;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=25;WE=228550434;WS=228550416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr1	228552571	rs541959	T	C	1890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.107;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=17;PP=1305;ReadPosRankSum=0.604;SC=TGTCCTGCTCTGGCCATGACC;SOR=0.434;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=102;TCF=79;TCR=23;TR=69;WE=228552579;WS=228552561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,71:0.68:105
chr1	228553651	rs572442	T	C	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.727;HP=7;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=500;ReadPosRankSum=-2.248;SC=CTGCGGGGGGTGTTCAGTTGC;SOR=3.767;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=24;WE=228553659;WS=228553641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,26:0.79:33
chr1	228553675	rs573128	C	T	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.153;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=1;PP=739;ReadPosRankSum=1.927;SC=CAGTGTATCTCAGGGTCTCAC;SOR=2.851;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=46;TCF=43;TCR=3;TR=32;WE=228553683;WS=228553665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,35:0.71:49
chr1	228556403	rs35711644	C	T	2266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.007;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=15;PP=1643;ReadPosRankSum=-1.458;SC=CTCTCACCCACTCCCAACTCT;SOR=1.135;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=128;TCF=100;TCR=28;TR=81;WE=228556411;WS=228556393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,87:0.64:137
chr1	228558892	rs35186354	C	T	2106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.756;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=47;PP=1669;ReadPosRankSum=-1.336;SC=CCCATTTGCCCGGGCTAAGTC;SOR=0.447;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=110;TCF=38;TCR=72;TR=74;WE=228558900;WS=228558882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,76:0.67:113
chr1	228559007	rs376162832	C	T	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.629;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=29;PP=1124;ReadPosRankSum=-0.469;SC=GAGCGCTCCACCGAGGCCCCA;SOR=0.662;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=79;TCF=38;TCR=41;TR=52;WE=228559015;WS=228558997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,53:0.66:80
chr1	228559994	rs500049	C	T	3215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.111;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=71;PP=2490;ReadPosRankSum=0.491;SC=CAGGAACAGGCGACCATGCGC;SOR=0.411;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=166;TCF=60;TCR=106;TR=116;WE=228560002;WS=228559984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,121:0.70:172
chr1	228560139	rs498382	A	G	1432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=23;PP=1155;SC=TGTCCCAGTCAGAGGAGGAGG;SOR=0.823;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=24;TCR=23;TR=47;WE=228560147;WS=228560129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
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chr1	228564884	rs56174824	G	A	4127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=109;PP=2962;ReadPosRankSum=0.347;SC=AAGGGCCTGCGCCACCCGCAC;SOR=0.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=236;TCF=72;TCR=164;TR=156;WE=228564892;WS=228564874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,163:0.67:243
chr1	228565445	rs3738687	C	A	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-4.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.140;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=695;ReadPosRankSum=-1.539;SC=GGGACCTCACCTGGGGCGGGG;SOR=0.112;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=36;WE=228565453;WS=228565435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,36:0.67:54
chr1	228588654	rs35670307	G	A	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=1;PP=624;ReadPosRankSum=-0.183;SC=GCTGCTCCCCGCCCAGCTCAC;SOR=1.609;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=28;WE=228588662;WS=228588644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,28:0.76:37
chr1	228588680	rs11555960	A	C	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.569;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=2;PP=947;ReadPosRankSum=0.839;SC=GCAGCCCCAGAGCAGGCAGCT;SOR=0.297;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=56;TCF=54;TCR=2;TR=41;WE=228588688;WS=228588670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,42:0.72:58
chr1	228597130	rs61827276	G	A	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=3.802;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=126;ReadPosRankSum=-0.000;SC=AGACAGGGACGGAGGGTGGGG;SOR=2.584;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=7;WE=228597138;WS=228597120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr1	228601638	rs472594	T	C	2285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=50;PP=1857;ReadPosRankSum=-0.568;SC=GCGATCCCCCTACCTCCTGCC;SOR=0.662;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=143;TCF=57;TCR=86;TR=84;WE=228601646;WS=228601628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,86:0.59:147
chr1	228602660	rs503203	G	C	1818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.291;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=26;PP=1470;ReadPosRankSum=-0.589;SC=GCTGGATGCAGGCTCGGCAGA;SOR=1.226;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=102;TCF=60;TCR=42;TR=70;WE=228602668;WS=228602650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,72:0.69:105
chr1	228612838	rs2230656	G	T	1543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-6.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.515;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=35;PP=1255;ReadPosRankSum=-0.087;SC=GCAACTTGCGGATTAGCAGCT;SOR=0.518;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=215;TCF=121;TCR=94;TR=73;WE=228612846;WS=228612828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,71:0.33:215
chr1	228613052	rs1188474	T	C	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=433;ReadPosRankSum=-1.173;SC=GGCCCCGCGGTGTCCTCTGCC;SOR=0.770;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=115;TCF=42;TCR=73;TR=34;WE=228613060;WS=228613042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,33:0.27:121
chr1	228645063	rs10916317	A	G	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.343;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=3;PP=729;ReadPosRankSum=-0.757;SC=TTCTCGAGATAGTAGGTGGCT;SOR=0.931;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=88;TCF=79;TCR=9;TR=35;WE=228645071;WS=228645053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,36:0.40:89
chr1	228646356	rs34241565	CGTGT	CGTGTGT,C	285.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.319;NF=0,0;NR=15,15;PP=85,358;ReadPosRankSum=-0.921;SC=GAATCTGAGCCGTGTGTGTGT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=15,15;WE=228646367;WS=228646346;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.50:12
chr1	228873640	rs3215603	GT	G	96.76	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=101;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CAGGGGCCAGGTTATTGGCCG;SOR=0.693;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=228873648;WS=228873630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr1	229385407	rs9435867	G	C	1346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=9;PP=1055;ReadPosRankSum=-0.514;SC=CATGAAAGTTGAACACGTCAT;SOR=0.635;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=116;TCR=21;TR=58;WE=229385415;WS=229385397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,58:0.42:138
chr1	229422088	rs237763	A	G	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.021;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=122;ReadPosRankSum=-2.076;SC=AAGTCAACATATGTATTGTCA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=229422096;WS=229422078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	229422193	rs237764	T	C	1503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=12;PP=1183;ReadPosRankSum=1.469;SC=TTCACAGCACTATTTTGAAGT;SOR=1.107;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=47;WE=229422201;WS=229422183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr1	229438828	rs237787	G	A	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=747;SC=TGAAAAAGAGGGGATCCCAGC;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=229438836;WS=229438818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	229461024	rs2282083	C	T	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.418;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=636;ReadPosRankSum=-0.067;SC=CTGTCATCCACGGGTTCTCTG;SOR=0.425;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=131;TCF=72;TCR=59;TR=40;WE=229461032;WS=229461014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,42:0.31:135
chr1	229567660	rs201427429	C	CG	1892.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=34;PP=2143;ReadPosRankSum=-0.976;SC=CTGGGGACCGCGGCGGGGAGC;SOR=0.781;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=10;TCR=57;TR=40;WE=229567671;WS=229567650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,47:0.69:68
chr1	229567663	rs6673359	C	G	1929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=6;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=35;PP=2656;ReadPosRankSum=-1.283;SC=GGGACCGCGGCGGGGAGCGTG;SOR=0.973;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=70;TCF=16;TCR=54;TR=46;WE=229567671;WS=229567650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,49:0.70:70
chr1	229567683	rs59228224	TC	T	1511.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=33;PP=1577;ReadPosRankSum=0.434;SC=GAGCAGAAGCTCGGGGCGCCG;SOR=0.893;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=61;TCF=12;TCR=49;TR=40;WE=229567691;WS=229567673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,45:0.67:67
chr1	229568231	rs527621	T	G	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=16;SC=GAGGCTAGGCTCTCAGCGCTA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=229568239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	229568632	rs11803533	A	G	6032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.45;ReadPosRankSum=-0.068;SOR=0.647;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,153:0.65:237
chr1	229568637	rs41271481	C	G	6047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FS=2.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.41;ReadPosRankSum=0.047;SOR=0.537;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,155:0.65:238
chr1	229568934	rs57214022	AG	A	700.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.636;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=510;ReadPosRankSum=0.078;SC=TCTCAGCGGCAGGGGGGGGTA;SOR=0.257;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=28;WE=229568942;WS=229568924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,28:0.72:39
chr1	229580593	rs67514588	C	CA	296.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.6316;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.941;NF=11;NR=0;PP=245;ReadPosRankSum=0.963;SC=GACTCCGTCTCAAAAAAAAAC;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=11;WE=229580601;WS=229580583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
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chr1	229623131	rs6678721	G	C	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.53;ReadPosRankSum=-0.412;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
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chr1	229623338	rs1065674	T	C	2262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.383;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.144;NF=24;NR=71;PP=1488;ReadPosRankSum=-0.138;SC=GACCGTCAACTGACACAAAAT;SOR=1.430;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=156;TCF=47;TCR=109;TR=95;WE=229623346;WS=229623328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,100:0.61:164
chr1	229623409	rs10653575	A	ATTTG	1502.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.325;NF=0;NR=27;PP=1186;ReadPosRankSum=-1.516;SC=AAACAAAAATATTTGTATGAT;SOR=0.880;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=73;TCF=0;TCR=73;TR=27;WE=229623417;WS=229623399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,37:0.54:68
chr1	229631193	rs3818237	T	C	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.767;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=227;ReadPosRankSum=0.738;SC=CATCAACTTATTTTTTCCAAA;SOR=0.039;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=10;WE=229631201;WS=229631183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr1	229631734	rs11805194	T	C	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.962;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=593;ReadPosRankSum=0.042;SC=CATTTACTGATGTTTGAACTC;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=29;TCR=35;TR=40;WE=229631742;WS=229631724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,46:0.66:70
chr1	229635521	rs10916495	A	G	2832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.217;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=34;PP=2225;ReadPosRankSum=-0.788;SC=GGCTTGGCCAATAGCGGATAG;SOR=0.934;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=148;TCF=93;TCR=55;TR=95;WE=229635529;WS=229635511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,99:0.65:152
chr1	229636388	rs6673421	A	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.175;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=171;ReadPosRankSum=-0.132;SC=ATACCACAATATCTTGATTTC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=8;WE=229636396;WS=229636378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr1	229637645	rs754022	C	A	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=0;PP=957;ReadPosRankSum=-0.193;SC=AAGTAGTTTCCTATTGACTAT;SOR=1.478;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=62;TCR=0;TR=39;WE=229637653;WS=229637635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,45:0.65:69
chr1	229637881	rs2381108	T	G	2001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=61;PP=1564;ReadPosRankSum=-0.552;SC=GTGATTAATCTTATAGTATAA;SOR=0.966;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=9;TCR=90;TR=67;WE=229637889;WS=229637871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,72:0.69:104
chr1	229663064	rs113712941	GAGGAA	G	7743.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=69;PP=2981;SC=TCCTTGTTGAGAGGAAAGGAA;SOR=1.116;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=166;TCF=90;TCR=76;TR=140;WE=229663076;WS=229663054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr1	229683264	rs3738187	G	A	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=4.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.889;NF=14;NR=0;PP=289;ReadPosRankSum=0.959;SC=TGATGCCTACGGAAGCCTGGG;SOR=0.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=14;WE=229683272;WS=229683254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr1	229693846	rs4148757	A	C	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=78;ReadPosRankSum=0.366;SC=GGAGAAGGAGAGGCCCGGCGG;SOR=1.061;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=6;WE=229693854;WS=229693836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr1	229730452	rs2295625	G	A	1504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.663;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=26;PP=1114;ReadPosRankSum=0.459;SC=CCTGCTGAGCGCTCCACAGCC;SOR=0.519;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=219;TCF=148;TCR=71;TR=72;WE=229730460;WS=229730442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,71:0.32:219
chr1	229738170	rs3753886	T	G	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.741;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=510;ReadPosRankSum=-1.665;SC=CATCCTTGACTCGCTTAATGC;SOR=0.793;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=125;TCF=85;TCR=40;TR=37;WE=229738178;WS=229738160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,40:0.31:131
chr1	229738236	rs4925500	G	A	4146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=59;PP=2965;SC=TGGGCATGTCGGGGGGCTCCA;SOR=0.772;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=66;TCR=59;TR=125;WE=229738244;WS=229738226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr1	229746019	rs2273573	C	T	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.755;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=347;ReadPosRankSum=0.177;SC=TAACCCAGTACGTGGCAGGAT;SOR=1.208;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=74;TCF=24;TCR=50;TR=22;WE=229746027;WS=229746009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,21:0.28:76
chr1	229750036	rs7547607	C	T	2069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=34;PP=1580;ReadPosRankSum=-1.832;SC=TGGATATTGACGTGAGTTCTC;SOR=0.673;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=113;TCF=60;TCR=53;TR=73;WE=229750044;WS=229750026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,77:0.66:116
chr1	229750343	rs2273574	T	G	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=34;PP=739;ReadPosRankSum=0.183;SC=AGACCAGCCATGTGGCTAAGT;SOR=0.633;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=11;TCR=95;TR=38;WE=229750351;WS=229750333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,40:0.37:109
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chr1	229772693	rs3811473	T	G	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=1.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.09;ReadPosRankSum=-0.560;SOR=0.870;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,32:0.24:134
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chr1	229783236	.	TTATT	CTATC,CTATT	1204	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=9,46;NR=5,19;PP=161,1204;QD=15.3191339187;SC=CATTTTTCCTTTATTTTATTT;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=66;TCF=47;TCR=19;TR=14,65;WE=229783248;WS=229783226;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.21:66
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chr1	230371883	rs3811488	G	A	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.886;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=571;ReadPosRankSum=0.932;SC=TGCATTACCTGTCAGGGGTGT;SOR=0.512;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=76;TCF=44;TCR=32;TR=31;WE=230371891;WS=230371873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,30:0.37:82
chr1	230384970	rs1923950	G	A	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.063;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=331;ReadPosRankSum=-0.407;SC=ATTACATGACGCCTGAGCAGA;SOR=1.058;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=80;TCF=33;TCR=47;TR=25;WE=230384978;WS=230384960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,28:0.32:87
chr1	230386341	rs2273966	T	A	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.901;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=654;ReadPosRankSum=0.356;SC=GACAGAGAAGTGCCTCAGCTC;SOR=0.366;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=109;TCF=44;TCR=65;TR=37;WE=230386349;WS=230386331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,40:0.35:115
chr1	230415025	rs6698963	A	G	1475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=23;PP=1119;ReadPosRankSum=-0.374;SC=CCCACACTCTAAGGCACTCTC;SOR=0.770;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=184;TCF=116;TCR=68;TR=64;WE=230415033;WS=230415015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,66:0.35:189
chr1	230415148	rs2273970	G	A	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.989;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=28;PP=605;ReadPosRankSum=-0.150;SC=AAGCGTGGAGGTGTGTGGCCC;SOR=0.463;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=113;TCF=25;TCR=88;TR=37;WE=230415156;WS=230415138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,36:0.32:113
chr1	230451846	.	T	A	36	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5040;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=28;MQ=42.62;NF=2;NR=1;PP=36;QD=23.5904041824;SC=ATACATATGTTTATGTGTACA;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=3;WE=230451854;WS=230451836;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:1,3:0.75:4
chr1	230451864	.	C	G	123	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5341;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=27;MQ=49.1;NF=5;NR=1;PP=123;QD=26.2952020912;SC=ACACATATATCTATGTGTATA;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=230451872;WS=230451854;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr1	230451864	.	C	CTATGTGTATACATACATATGTATATGTGTACACATATATG	246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=246.77;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1:1.00:1
chr1	230451935	rs144363709	C	CAT	364.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=313;SC=TACACATGTGCATGTGTATAC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=230451943;WS=230451925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr1	230451978	rs11122492	G	A	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=8;PP=522;SC=ATGTGTATACGTACATATGTG;SOR=1.127;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=20;WE=230451986;WS=230451968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	230461079	rs2306813	G	A	1880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=11;PP=1465;SC=CATCGTATCTGCAGATGTAGC;SOR=2.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=47;TCR=11;TR=58;WE=230461087;WS=230461069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	230497940	rs828479	G	T	2096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=7;PP=1807;SC=GCACGAGAGGGTGGGGGAGGA;SOR=4.112;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=63;TCR=7;TR=69;WE=230497948;WS=230497930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	230498232	rs2820384	C	T	1259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=35;PP=985;SC=GGAAGCCCTCCTGGGGCTCCA;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=230498240;WS=230498222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	230503684	rs2632571	C	T	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=0;PP=734;SC=CTCAAGGTCACGCAAGCTGGC;SOR=5.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=230503692;WS=230503674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	230513128	rs828463	G	A	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=0;PP=494;SC=ACATCAACACGTGATAAATCC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=230513136;WS=230513123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	230778243	rs11361885	AC	A	326.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=321;ReadPosRankSum=-1.826;SC=GCGGAAGCGGACCCCCCTGTG;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=57;TCR=2;TR=15;WE=230778251;WS=230778233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,17:0.29:59
chr1	230778491	rs4846864	G	C	2831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=94;PP=2248;ReadPosRankSum=1.076;SC=CCTCTGTGGCGGTCTCTTCGG;SOR=3.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=99;TCF=4;TCR=95;TR=98;WE=230778499;WS=230778481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,102:0.99:103
chr1	230795177	rs1359866	T	C	3289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=9;PP=2655;SC=ATATCATTGCTATAATTTTTT;SOR=4.174;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=84;TCR=9;TR=93;WE=230795185;WS=230795167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	230796326	rs3736983	A	G	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=383;ReadPosRankSum=-0.065;SC=TTCACATTCTATCAGCAATAT;SOR=0.818;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=17;WE=230796334;WS=230796324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr1	230796375	rs3736982	A	C	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=169;ReadPosRankSum=-0.159;SC=TTACTTAACAATATATGGTTG;SOR=0.144;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=12;WE=230796383;WS=230796365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,12:0.27:44
chr1	230805215	rs34010781	G	A	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.261;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=44;PP=1339;ReadPosRankSum=1.945;SC=CTTACGCCACGATTGACAAGA;SOR=0.372;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=96;TCF=25;TCR=71;TR=63;WE=230805223;WS=230805205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,65:0.66:99
chr1	230819295	rs5781596	ATTC	A	3682.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.423;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.262;NF=41;NR=33;PP=2974;ReadPosRankSum=-0.450;SC=ATAAACATTAATTCTTCTTCT;SOR=0.432;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=71;TCR=55;TR=74;WE=230819305;WS=230819285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,93:0.66:141
chr1	230819479	rs5781597	G	GT	1292.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.41;MQRankSum=0.380;QD=24.39;ReadPosRankSum=0.443;SOR=1.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,50:0.94:53
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chr1	230822607	rs1536591	G	A	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.12;ReadPosRankSum=-0.637;SOR=0.108;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,22:0.25:89
chr1	230829139	rs1051038	A	G	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=40;PP=1223;ReadPosRankSum=1.968;SC=AGCAGCCTTAAGCATCTTGGA;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=23;TCR=65;TR=54;WE=230829147;WS=230829129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,55:0.62:88
chr1	230841559	rs3827749	G	A	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=3.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.072;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=356;ReadPosRankSum=-1.313;SC=CCGTGCCACCGCGGCCCTGCC;SOR=0.288;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=17;WE=230841567;WS=230841549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr1	230841687	rs7080	T	C	3591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=29;PP=2965;SC=ACCGGGGAGATAGTTTCTTCA;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=85;TCR=29;TR=114;WE=230841695;WS=230841677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	230845794	rs699	A	G	6700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=177;NR=63;PP=2965;SC=ACTGGCTCCCATCAGGGAGCA;SOR=2.205;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=240;TCF=177;TCR=63;TR=240;WE=230845802;WS=230845784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr1	230845977	rs4762	G	A	2282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.753;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=52;PP=1820;ReadPosRankSum=-0.621;SC=GCCCACCACCGTGGACAGCAG;SOR=0.578;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=122;TCF=41;TCR=81;TR=80;WE=230845985;WS=230845967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,82:0.66:124
chr1	230883466	rs12143120	C	T	1469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.297;HP=5;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=43;PP=1068;ReadPosRankSum=-1.347;SC=GTGAGTGGGGCGAGCAGGGGA;SOR=1.189;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=79;TCF=19;TCR=60;TR=54;WE=230883474;WS=230883456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,59:0.69:86
chr1	230883484	rs6690251	T	C	1414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.081;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=41;PP=1092;ReadPosRankSum=-0.006;SC=GGAAGGAGCATAGATGAGGCC;SOR=2.068;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=67;TCF=8;TCR=59;TR=44;WE=230883492;WS=230883474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,49:0.66:74
chr1	230883499	rs6690254	T	C	1259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.996;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=37;PP=987;ReadPosRankSum=0.760;SC=GAGGCCGAGGTTCAGCAGCCC;SOR=1.649;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=60;TCF=5;TCR=55;TR=39;WE=230883507;WS=230883489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,43:0.66:65
chr1	230910339	rs7517389	G	A	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.056;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=667;ReadPosRankSum=1.627;SC=CTGAGCAGAAGCGTCTGTGTC;SOR=1.210;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=92;TCF=53;TCR=39;TR=36;WE=230910347;WS=230910329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,41:0.40:102
chr1	230910469	.	TTTTC	T	213.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.56;MQRankSum=2.505;QD=13.36;ReadPosRankSum=0.401;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr1	230914706	rs1933630	C	A	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.315;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=250;ReadPosRankSum=0.072;SC=CGTGTCTCTCCGCTTTGCTGC;SOR=0.973;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=15;WE=230914714;WS=230914696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr1	230914729	rs1933631	A	C	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.527;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=316;ReadPosRankSum=-0.220;SC=GATGGCATTTAAGGACTTCAA;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=14;WE=230914737;WS=230914719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr1	230916260	rs28359687	C	T	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=17;PP=811;ReadPosRankSum=-0.061;SC=CTGACAAAGACGAACACCTGA;SOR=0.617;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=48;TCF=24;TCR=24;TR=35;WE=230916268;WS=230916250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,35:0.73:48
chr1	230923151	rs2297830	T	C	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=362;ReadPosRankSum=-0.618;SC=TTGTGCACACTGCCTCAGGAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=16;WE=230923159;WS=230923141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr1	230923187	rs12731671	C	G	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=3;PP=722;ReadPosRankSum=-0.081;SC=GGCACACAGGCTCCTGGCTTC;SOR=1.007;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=38;TCR=4;TR=31;WE=230923195;WS=230923177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,31:0.74:42
chr1	230923313	rs12731961	C	T	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=677;ReadPosRankSum=-0.040;SC=GGAGGAGCAGCGGTTTCGGGC;SOR=0.608;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=31;WE=230923321;WS=230923303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,29:0.63:46
chr1	230928512	rs7522057	C	G	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.333;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=5;PP=387;ReadPosRankSum=-1.369;SC=GTAGCTCCCCCGGGCTGGCTG;SOR=0.411;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=75;TCR=15;TR=30;WE=230928520;WS=230928502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,34:0.35:97
chr1	230975454	rs1202550	A	G	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=175;ReadPosRankSum=1.621;SC=AAATCTGGCAATATTGACCAG;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=230975462;WS=230975444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr1	230979657	rs41314280	G	A	1998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.204;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=44;PP=1500;ReadPosRankSum=1.211;SC=GGTGGGACATGAGAAAGGACA;SOR=0.252;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=108;TCF=31;TCR=77;TR=67;WE=230979665;WS=230979647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,72:0.63:114
chr1	230991682	rs11805491	C	T	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.623;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=373;ReadPosRankSum=-0.104;SC=ACTCCCCTCCCCAGCCAAACA;SOR=2.690;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=19;WE=230991690;WS=230991672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr1	231003851	rs11122619	G	C	172.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=94;ReadPosRankSum=0.842;SC=GCCTCACGCCGGCAGGTGCCC;SOR=0.473;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=7;WE=231003859;WS=231003842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr1	231042732	rs3811502	T	A	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.236;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=430;ReadPosRankSum=0.895;SC=ACGTTTCTGATACTGATGGAA;SOR=0.398;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=98;TCF=35;TCR=63;TR=26;WE=231042740;WS=231042722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,25:0.25:100
chr1	231047310	rs10580953	TAC	T	605.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=495;ReadPosRankSum=0.321;SC=AAAAAAAAGATACAGACTCAT;SOR=0.892;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=49;TCF=7;TCR=42;TR=15;WE=231047319;WS=231047300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
chr1	231047392	rs2153049	G	A	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=34;ReadPosRankSum=-0.182;SC=ACATCAAGAAGAGGATTGTTT;SOR=0.138;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=4;WE=231047400;WS=231047382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
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chr1	231059784	rs3748774	C	T	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=91;ReadPosRankSum=-0.211;SC=GCTAGTCCATCATATCTAAAA;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=7;WE=231059792;WS=231059774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr1	231064578	rs5781609	T	TCTC	88.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=-0.695;SC=CCCAGGCAATTCTACCTCACC;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=4;WE=231064586;WS=231064568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr1	231069340	rs12749386	C	T	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=177;ReadPosRankSum=-1.221;SC=TCATGACATCCTCTGGTACAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=8;WE=231069348;WS=231069330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr1	231069652	rs1890351	A	C	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=109;ReadPosRankSum=0.331;SC=ATAATTGTTAAAATTGAGATT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=7;WE=231069660;WS=231069642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr1	231076177	rs6671389	A	G	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.746;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=73;ReadPosRankSum=0.782;SC=CAAGACAAAAACCAGTCACCT;SOR=1.627;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=7;WE=231076185;WS=231076167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,8:0.24:34
chr1	231081304	rs6673085	T	G	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=212;ReadPosRankSum=0.705;SC=CAGCTCTACTTCTTTATGCTA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=11;WE=231081312;WS=231081294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr1	231092180	rs11122161	G	A	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.659;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=15;PP=1074;ReadPosRankSum=-0.627;SC=CCGTGTGATCGTGGGGACCTC;SOR=1.715;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=75;TCF=47;TCR=28;TR=52;WE=231092188;WS=231092170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,53:0.67:79
chr1	231092211	rs34436246	T	TG	1707.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.837;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=30;PP=1557;ReadPosRankSum=1.334;SC=CATAACTGTCTGGTCTTGCTT;SOR=0.212;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=17;TCR=48;TR=41;WE=231092219;WS=231092201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,56:0.70:80
chr1	231093785	rs59207624	CT	C	1199.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=1;PP=878;ReadPosRankSum=-1.388;SC=CCATCCAAACCTTTTTTTTTT;SOR=5.018;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=52;TCR=1;TR=48;WE=231093793;WS=231093775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr1	231093879	rs111482076	C	G	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.42;ReadPosRankSum=-1.397;SOR=0.587;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,46:0.28:167
chr1	231094050	rs60736833	GA	G	935.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=10.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;MQRankSum=1.958;QD=10.17;ReadPosRankSum=1.655;SOR=0.072;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,67:0.73:92
chr1	231096984	.	A	C	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.083;ClippingRankSum=0.000;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.716;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;PP=435;ReadPosRankSum=-0.336;SC=AGGGAAAGCAAGGAGTCACAG;SOR=0.590;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=133;TCF=79;TCR=54;TR=37;WE=231096992;WS=231096974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,39:0.28:140
chr1	231097042	rs11122162	G	A	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.082;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=609;ReadPosRankSum=0.991;SC=AGTTCAAAAAGGATGACTCTG;SOR=0.342;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=127;TCF=43;TCR=84;TR=36;WE=231097050;WS=231097032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,39:0.28:139
chr1	231114420	rs114508011	A	C	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.817;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=3;PP=136;ReadPosRankSum=-0.825;SC=TTGAGCAGGGAGAGCGGCGAG;SOR=1.255;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=9;WE=231114428;WS=231114410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr1	231114465	rs76376323	C	G	328.56	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=269;ReadPosRankSum=-0.796;SC=GGCCGCAGCCCGGCGGACAGG;SOR=1.061;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=14;WE=231114473;WS=231114455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr1	231114595	rs11122174	C	T	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.264;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=0.538;SC=AAGGCGCATGCGCGACAGCCC;SOR=2.022;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=10;WE=231114603;WS=231114585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr1	231124055	rs10779804	T	C	1070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.550;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=764;ReadPosRankSum=0.334;SC=TATTATCTTGTATTATTTCAG;SOR=1.501;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=35;WE=231124063;WS=231124045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,38:0.70:54
chr1	231161817	.	TA	T	72.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQRankSum=1.336;QD=3.16;ReadPosRankSum=-0.944;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr1	231175644	rs12025055	C	G	151.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=91;SC=GGGAAGAGCCCCAGCTCGCGG;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=231175652;WS=231175634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	231353589	rs4658907	A	G	1923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=39;PP=1443;SC=TGGAAAGTGCAGGAGGGTAAT;SOR=1.341;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=23;TCR=39;TR=62;WE=231353597;WS=231353579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	231362923	rs491182	G	A	3203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=84;PP=2524;ReadPosRankSum=1.527;SC=TAATGACAGCGTACAGGAATA;SOR=2.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=14;TCR=84;TR=98;WE=231362931;WS=231362913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,102:0.99:103
chr1	231376806	rs2274067	G	C	3053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.483;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=53;PP=2397;ReadPosRankSum=-0.026;SC=GCGTCAAGAAGTGTCGGAGAA;SOR=0.557;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=176;TCF=84;TCR=92;TR=113;WE=231376814;WS=231376796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,116:0.64:182
chr1	231377081	rs518686	C	T	3784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=23;PP=2965;SC=ACCACCACGGCTTAGCAAAGA;SOR=3.150;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=127;TCF=104;TCR=23;TR=124;WE=231377089;WS=231377071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	231400905	rs849714	A	G	931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=1;PP=827;SC=TTTGTGACCAACCTAGCCAAC;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=231400913;WS=231400898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	231401204	rs6702011	T	C	2848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=69;PP=2359;SC=TTAAGCCATATTTTCTTCACT;SOR=2.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=15;TCR=69;TR=84;WE=231401212;WS=231401194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	231401596	rs532226	T	C	5202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=130;PP=2965;SC=TACATAAAACTTGACGCTTTA;SOR=3.640;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=151;TCF=20;TCR=131;TR=149;WE=231401604;WS=231401586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr1	231401902	rs574553	G	A	3633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=40;PP=2914;SC=AACCAAAAGAGTCTACAACTG;SOR=1.302;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=69;TCR=40;TR=108;WE=231401910;WS=231401892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr1	231471268	rs35468792	AT	A	1164.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=0;PP=1356;ReadPosRankSum=0.759;SC=TAAATAATATATAAGCTCTCT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=30;WE=231471276;WS=231471258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr1	231480507	rs1009227	A	G	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=1.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.229;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
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chr1	231488524	rs2437150	C	T	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.137;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=24;PP=841;ReadPosRankSum=-1.509;SC=GCTGTAAGACCTAATTCTAAA;SOR=0.543;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=166;TCF=92;TCR=74;TR=47;WE=231488532;WS=231488514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,48:0.28:173
chr1	231502245	rs1435167	T	A	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=-0.653;QD=4.77;ReadPosRankSum=1.206;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,16:0.33:49
chr1	231502310	rs1435166	T	C	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.40;ReadPosRankSum=-0.219;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,5:0.19:27
chr1	231506557	rs2256908	G	A	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=41;ReadPosRankSum=1.737;SC=TCACAAATACGTCTCAATAAA;SOR=0.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=5;WE=231506565;WS=231506547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr1	231697030	rs1982095	G	A	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=207;ReadPosRankSum=0.533;SC=TTTCACATTTGTTATATAATT;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=10;WE=231697038;WS=231697020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr1	231830295	rs3738401	G	A	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.374;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=18;PP=975;ReadPosRankSum=-0.766;SC=TGTCTCTCTCGGCCCTTCAGT;SOR=0.866;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=139;TCF=82;TCR=57;TR=50;WE=231830303;WS=231830285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,54:0.37:147
chr1	231936016	rs2759354	A	G	3495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=85;PP=2965;SC=AGCTACCAGCACATCGTGTTT;SOR=2.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=21;TCR=85;TR=106;WE=231936024;WS=231936006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr1	231954872	rs11588937	C	T	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=185;ReadPosRankSum=1.254;SC=TCTCAGAAGACGCTGGTTCAG;SOR=1.981;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=10;WE=231954880;WS=231954862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr1	231956086	rs11122343	A	T	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=392;ReadPosRankSum=0.020;SC=TTGTGTTTTGAGGGTTAAAAA;SOR=0.770;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=17;TCR=17;TR=22;WE=231956094;WS=231956076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr1	232002332	rs3081	C	G	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=175;ReadPosRankSum=0.956;SC=TGAGGACAGCCTGCAGGACAC;SOR=0.527;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=21;TCR=23;TR=14;WE=232002340;WS=232002322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr1	232172374	rs17773715	G	A	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=6.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.234;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=2;PP=627;ReadPosRankSum=0.409;SC=CACGCTCTTCGATCCCTCGGA;SOR=1.342;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=80;TCF=71;TCR=9;TR=30;WE=232172382;WS=232172364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,30:0.37:82
chr1	232534776	rs586719	C	T	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=301;SC=GCAAAAACATCTACGATTGGT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=232534784;WS=232534771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	232535030	rs629939	C	T	3515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=71;PP=2612;SC=CTGGTCAGAGCAGAAATAAAC;SOR=1.309;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=113;TCF=41;TCR=72;TR=112;WE=232535038;WS=232535020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	232538234	rs17177525	T	G	3697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=82;PP=2932;SC=CAAATAAGGATAGAATTAGAA;SOR=1.931;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=116;TCF=33;TCR=83;TR=115;WE=232538242;WS=232538224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	232551416	rs12569188	G	A	2990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=63;PP=2278;SC=GTCACAGCACGGGCACCAGCC;SOR=2.154;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=20;TCR=63;TR=83;WE=232551424;WS=232551406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr1	232564297	rs3210731	T	A	1092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=18;PP=832;SC=ATGACATCCATCTCACTATAC;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=31;WE=232564305;WS=232564287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	232568293	rs1547741	A	G	1687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=51;PP=1464;SC=ATTCAGAGCCACAAGGCTTTA;SOR=6.518;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=53;TCF=1;TCR=52;TR=52;WE=232568301;WS=232568283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	232574921	rs2275307	T	C	3150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=39;PP=2518;SC=GCGGAGATGGTGGACGCGTAG;SOR=1.222;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=64;TCR=39;TR=103;WE=232574929;WS=232574911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr1	232579597	rs4649372	T	A	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=22;PP=623;SC=ATAAACTAAGTATCGGTGATG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=232579605;WS=232579587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr1	232581247	rs1409369	C	G	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=8;PP=689;SC=TACAAGGGCCCCCCTTGAGGA;SOR=2.165;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=232581255;WS=232581237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	232581436	rs12757779	G	A	1621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=33;PP=1257;SC=GGTGCCACGTGGTGTTCCTCC;SOR=1.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=49;WE=232581444;WS=232581426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	232581667	rs12723697	G	T	237.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=7;PP=193;SC=GATGCAGAGCGATCCACCCTT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=232581675;WS=232581657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	232597987	rs12142629	T	A	5993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=101;PP=2965;SC=TCATTAAGTATCACCCGATGA;SOR=0.899;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=83;TCR=101;TR=184;WE=232597995;WS=232597977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr1	232601241	rs12145798	T	C	1648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=34;PP=1086;SC=GACATATATATACACACACAC;SOR=4.615;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=37;WE=232601249;WS=232601231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	232601261	rs34840482	CAT	C	1296.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=24;PP=1044;SC=CACACATATACATACACACAC;SOR=5.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=24;WE=232601270;WS=232601251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	232607050	rs12116796	T	A	904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=0;PP=780;SC=AACAAAGATATTTTTGGGAAA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=232607058;WS=232607040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	232607094	rs12116822	T	C	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=0;PP=795;SC=GGGAGAATGATAGATCAGGGA;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=232607102;WS=232607084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	232626745	.	C	T	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=1120;ReadPosRankSum=-0.822;SC=AGTCCTCGTGCGGTACCATGC;SOR=0.492;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=45;TCR=41;TR=61;WE=232626753;WS=232626735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,64:0.71:90
chr1	232629170	rs11294872	TA	T	4158.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=113;NR=26;PP=2786;SC=TCATTAACATTAAAAAAAAAT;SOR=3.174;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=165;TCF=135;TCR=30;TR=139;WE=232629178;WS=232629160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr1	232629475	rs3737839	C	T	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=41;PP=1201;SC=GGATATCTCTCAGTTTGTGTA;SOR=6.138;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=42;WE=232629483;WS=232629465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	232650750	rs3795366	A	G	5590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=64;PP=2965;SC=TCTGCAGGACAGAAGTGATGC;SOR=1.417;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=116;TCR=64;TR=180;WE=232650758;WS=232650740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr1	232650867	rs4649383	C	T	9592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=154;NR=141;PP=2965;SC=TCACACCCATCTTGGGCACAG;SOR=0.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=297;TCF=155;TCR=142;TR=295;WE=232650875;WS=232650857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,302:1.00:302
chr1	232941153	rs12409898	C	T	1847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=28;PP=1461;SC=GCTTCAGCTTCTCGTTTGCGG;SOR=0.877;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=52;WE=232941161;WS=232941143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr1	233086456	rs13381	T	C	2101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=21;PP=1709;SC=CGCCCACCAGTATGGCCCGGC;SOR=1.646;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=43;TCR=21;TR=64;WE=233086464;WS=233086446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	233113827	rs1045158	G	T	1630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=6;PP=1291;SC=CCTTCCAGGCGTTTCTTTTAG;SOR=3.486;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=42;TCR=6;TR=48;WE=233113835;WS=233113817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr1	233120192	rs113070999	G	A	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.466;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=17;PP=1077;ReadPosRankSum=1.674;SC=CTGCTCGGTGGCATCAGGGGG;SOR=1.288;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=82;TCF=52;TCR=30;TR=52;WE=233120200;WS=233120182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,56:0.64:88
chr1	233121791	rs12038915	G	A	1408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=21;PP=1100;ReadPosRankSum=-0.748;SC=CCAGGAGCCCGTGCCACCATC;SOR=0.299;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=46;TCF=25;TCR=21;TR=45;WE=233121799;WS=233121781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,46:0.98:47
chr1	233122127	rs41309639	C	T	2697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=12;PP=2162;ReadPosRankSum=0.181;SC=CAAGGAGAGCCGGCTGCCCGA;SOR=1.683;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=77;TCF=65;TCR=12;TR=76;WE=233122135;WS=233122117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,81:0.99:82
chr1	233122172	rs151123406	G	A	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=702;ReadPosRankSum=-0.049;SC=TGAGGTGGACGTCTGGAGGAA;SOR=0.713;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=139;TCF=85;TCR=54;TR=42;WE=233122180;WS=233122162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,44:0.31:143
chr1	233134086	rs56231757	C	T	1750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.699;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=28;PP=1366;ReadPosRankSum=-0.112;SC=GCTGCCACCACTCGGGGCATT;SOR=0.834;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=67;TCR=49;TR=67;WE=233134094;WS=233134076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,67:0.57:118
chr1	233137225	rs140788891	CATAA	C,CATAAATAA	690.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=10,10;NR=1,1;PP=666,777;SC=AACTCCATCTCATAAATAAAT;SOR=4.407;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=11,11;WE=233137236;WS=233137215;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.44,0.56:18
chr1	233150270	rs6424263	T	C	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=217;ReadPosRankSum=0.651;SC=GTAGGCCCAATATAATTTATT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=11;WE=233150278;WS=233150260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr1	233152910	rs11271054	A	AAAAGCAAGATTTTGAGTCCTCACAGCTATTCT	1116.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=53.18;SOR=3.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	233296891	rs2296515	T	C	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.385;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=42;ReadPosRankSum=0.622;SC=TCCCTAAGCCTCTCAGCGGGC;SOR=0.116;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=6;WE=233296899;WS=233296881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr1	233296908	rs2296516	T	G	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.321;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=119;ReadPosRankSum=-0.616;SC=GGGCATTTTGTTTTCTTTCTC;SOR=0.204;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=10;WE=233296916;WS=233296898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr1	233314770	rs373797776	C	T	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.789;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=271;ReadPosRankSum=0.538;SC=GGAACTATGCCCCCAGCTCAG;SOR=0.240;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=54;TCF=47;TCR=7;TR=17;WE=233314778;WS=233314760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,17:0.30:56
chr1	233395214	rs2139998	T	A	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=271;SC=GATACTTTTTTAATTTTACTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=233395222;WS=233395204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	233397267	rs10489808	G	A	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=261;ReadPosRankSum=-0.906;SC=ACATTCAACCGAGACAACTGT;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=11;WE=233397275;WS=233397257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr1	233397752	rs6701073	T	C	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.120;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=5;PP=716;ReadPosRankSum=0.051;SC=AACATCGAAATCACATGAAGA;SOR=0.143;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=48;TCF=42;TCR=6;TR=32;WE=233397760;WS=233397742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,37:0.69:54
chr1	233398670	rs12132556	C	A	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=0;PP=879;ReadPosRankSum=-1.042;SC=AAAACATTTACATTTTGAAGT;SOR=2.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=34;WE=233398678;WS=233398660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,35:0.74:47
chr1	233398713	rs1033325	C	T	1697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.734;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=10;PP=1346;ReadPosRankSum=0.582;SC=CCTTGGATTTCTGTGATTAGT;SOR=0.145;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=79;TCF=68;TCR=11;TR=56;WE=233398721;WS=233398703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,59:0.72:82
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chr1	233398993	rs1033323	C	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.798;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=172;ReadPosRankSum=-0.235;SC=TTTAGACTATCTATTGAATAT;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=9;WE=233399001;WS=233398983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr1	233431241	rs10442595	G	A	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=242;ReadPosRankSum=-0.327;SC=TGCGCCCCGGGGCTGGTGAGC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=11;WE=233431249;WS=233431231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr1	233489499	rs7539016	A	G	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=3;PP=554;SC=TAAGTGTGTCATAAGGAAAAG;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=233489507;WS=233489489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr1	233489529	rs7549137	G	A	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=5;PP=1125;SC=AGCCCATTGAGCATATGAAAT;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=40;WE=233489537;WS=233489519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	233489707	rs7551511	G	T	2999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.213;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=65;PP=2965;ReadPosRankSum=0.147;SC=GAAAGGTATTGTGTGTGTGTG;SOR=0.332;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=125;TCF=54;TCR=71;TR=116;WE=233489715;WS=233489695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:8,104:0.93:112
chr1	233490536	rs137943316	A	AATGTCTTGGGGATAATCTG	4355.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=0;PP=2900;SC=TAGCAACTCTAAACTGCGTTG;SOR=6.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=55;TCR=1;TR=26;WE=233490551;WS=233490526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr1	233490543	rs2049182	G	A	4056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=9;PP=2207;SC=TCTAAACTGCGTTGAGAGATG;SOR=4.593;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=74;TCR=9;TR=83;WE=233490551;WS=233490526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr1	233490764	rs4649219	G	T	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=1014;ReadPosRankSum=-0.977;SC=AAAGGTGAGAGAAATTTTTAA;SOR=1.119;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=1;TCR=60;TR=25;WE=233490784;WS=233490754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr1	233490776	rs4649220	C	T	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=1014;ReadPosRankSum=1.348;SC=AATTTTTAAACAGCATAATGT;SOR=0.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=0;TCR=54;TR=19;WE=233490784;WS=233490754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,21:0.36:59
chr1	233512362	rs10489691	A	G	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=40;PP=842;ReadPosRankSum=0.041;SC=TTACGTGGTCATTAAAGTAGC;SOR=0.720;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=143;TCF=30;TCR=113;TR=50;WE=233512370;WS=233512352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,52:0.35:147
chr1	233514934	rs3795375	G	A	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.344;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=732;ReadPosRankSum=-1.205;SC=TGGGTGCACCGTCCTTCTGGC;SOR=1.313;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=117;TCF=71;TCR=46;TR=40;WE=233514942;WS=233514924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,40:0.34:118
chr1	233514975	rs3795374	G	T	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.251;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=25;PP=902;ReadPosRankSum=0.013;SC=ACCTCAGAGAGCTTCATAAAG;SOR=0.388;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=151;TCF=91;TCR=60;TR=55;WE=233514983;WS=233514965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,54:0.36:150
chr1	233515071	rs963982	C	T	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.103;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=665;ReadPosRankSum=1.762;SC=CCCGCAGAAGCGCCAGTCCTC;SOR=0.386;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=180;TCF=108;TCR=72;TR=51;WE=233515079;WS=233515061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,50:0.27:183
chr1	233515102	rs963981	T	G	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.167;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=30;PP=967;ReadPosRankSum=-0.674;SC=GCCATCCACCTGTGGGGAGGC;SOR=0.578;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=219;TCF=122;TCR=97;TR=65;WE=233515110;WS=233515092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,63:0.29:221
chr1	233749855	rs2795294	A	G	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.853;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.404;HP=1;HapScore=2;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=85;ReadPosRankSum=0.081;SC=CGGGGCCAGAAGAGGCGGCGG;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=233749863;WS=233749846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr1	233749896	rs140745317	C	CTTGGCTTTGGCT	140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.622;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=1;PP=405;ReadPosRankSum=0.361;SC=CGGCGTTGGCCTTGGCGGCGG;SOR=0.016;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=1;WE=233749904;WS=233749886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr1	233785786	rs4649241	A	C	3495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=92;PP=2598;SC=CTTCCCTGAGAGTACACCAGG;SOR=2.246;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=29;TCR=92;TR=121;WE=233785794;WS=233785776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	234367549	rs2236220	T	C	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=152;ReadPosRankSum=-0.769;SC=GCGCTGACTCTGCAGAGCTGC;SOR=0.336;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=11;WE=234367557;WS=234367539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr1	234442376	rs674385	G	A	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=3;PP=81;SC=TGGCCATGAGGCCTTAAAGGG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=234442384;WS=234442366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	234444761	.	T	TAAAAA	456.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=26.87;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr1	234509259	rs10910420	G	C	4254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=56;PP=2965;SC=CGCCGCGTGAGTTGCTTTTTG;SOR=1.082;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=134;TCF=78;TCR=56;TR=134;WE=234509267;WS=234509249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr1	234510262	rs4300255	A	G	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.032;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=356;ReadPosRankSum=1.528;SC=GCGCAGAGAAAACCTTGCCTG;SOR=0.156;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=17;WE=234510270;WS=234510252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr1	234519452	rs58896934	C	CT	552.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=382;SC=ATTTCAAATCCTTTTTTTTTC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=17;WE=234519460;WS=234519442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	234528006	rs3754317	A	G	1646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=1;PP=1261;SC=TGCTTGAGCCAATGAGGCAGA;SOR=6.736;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=55;TCF=54;TCR=1;TR=55;WE=234528014;WS=234528002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
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chr1	234529540	rs1134756	G	A	2447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.706;HP=1;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=2470;ReadPosRankSum=-0.089;SC=TCTTCTGAACGTCGGTCCACT;SOR=0.359;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=108;TCF=48;TCR=60;TR=58;WE=234529560;WS=234529530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,59:0.53:111
chr1	234529552	rs2175594	C	T	2489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.602;HP=1;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=33;PP=2470;ReadPosRankSum=0.021;SC=CGGTCCACTCCGCTTGGTTAT;SOR=0.398;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=107;TCF=44;TCR=63;TR=60;WE=234529560;WS=234529530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,60:0.55:110
chr1	234529570	rs2175593	G	A	2282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=43;PP=1292;ReadPosRankSum=-0.501;SC=TATCTGCTTCGACCAAATTAG;SOR=0.631;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=107;TCF=34;TCR=73;TR=64;WE=234529578;WS=234529560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,64:0.59:109
chr1	234541622	rs2271444	G	T	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.434;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=1;PP=662;ReadPosRankSum=1.340;SC=GAGAGTGAGGGCGATGAGGTT;SOR=2.797;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=58;TCF=52;TCR=6;TR=32;WE=234541630;WS=234541612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,34:0.53:64
chr1	234546245	rs1141264	C	T	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=695;ReadPosRankSum=-0.197;SC=CTGCTAAAAACGTACAAATGC;SOR=0.569;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=52;TCF=30;TCR=22;TR=34;WE=234546253;WS=234546235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,35:0.66:53
chr1	234546354	rs41266235	C	T	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.197;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=283;ReadPosRankSum=-1.001;SC=CCGTGCTGGACTCTATGAGGG;SOR=1.022;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=46;TCF=16;TCR=30;TR=15;WE=234546362;WS=234546344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,16:0.30:54
chr1	234561394	rs199988220	ATAATT	A	697.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=610;ReadPosRankSum=0.182;SC=AAAAACAAAGATAATTTAAAG;SOR=0.859;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=12;WE=234561406;WS=234561384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr1	234561590	rs4920240	T	A	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=297;SC=AAACAGAAAATTAACATCAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=234561598;WS=234561580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	234563556	rs10910434	T	A	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=36;PP=933;ReadPosRankSum=1.067;SC=ATTTAGTTTTTAAAAAATCAG;SOR=0.925;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=1;TCR=49;TR=37;WE=234563564;WS=234563546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,37:0.73:51
chr1	234564864	rs71701823	GAA	G	1643.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.725;NF=23;NR=12;PP=1276;ReadPosRankSum=0.399;SC=AAAGCAAAAAGAAAAGAAAGT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=35;WE=234564873;WS=234564854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,42:0.68:62
chr1	234564951	rs12135427	A	T	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=549;ReadPosRankSum=2.325;SC=TATCAAAAACAAACTGAACAA;SOR=0.667;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=93;TCF=59;TCR=34;TR=29;WE=234564959;WS=234564941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,27:0.29:92
chr1	234565078	.	G	GA	1728.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.000;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.281;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=2.349;NF=52;NR=25;PP=922;ReadPosRankSum=-0.250;SC=AAGCTGGTAGGAAAAAAAAAA;SOR=1.039;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=182;TCF=124;TCR=58;TR=77;WE=234565086;WS=234565068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,86:0.56:154
chr1	234565176	rs111283864	C	T	6241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.411;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=136;NR=92;PP=2962;ReadPosRankSum=0.229;SC=GGAACCAACACTTTCAAGCAA;SOR=0.614;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=333;TCF=203;TCR=130;TR=228;WE=234565184;WS=234565166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,235:0.69:342
chr1	234566085	rs2236587	A	G	2099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.679;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=56;PP=1554;ReadPosRankSum=-0.118;SC=TTTAATATGCACAAGTCTTAA;SOR=0.446;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=125;TCF=33;TCR=92;TR=79;WE=234566093;WS=234566075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,82:0.62:132
chr1	234569192	rs3754311	T	C	2527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.463;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=27;PP=1939;ReadPosRankSum=-1.801;SC=GCTGAATGGATGCATTTTTCA;SOR=0.524;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=154;TCF=112;TCR=42;TR=97;WE=234569200;WS=234569182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,98:0.62:157
chr1	234582457	rs270527	C	T	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.668;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=2;PP=857;ReadPosRankSum=-1.447;SC=AAAGTTTTCTCTTTGTTTTAA;SOR=0.299;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=56;TCF=54;TCR=2;TR=37;WE=234582465;WS=234582447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,40:0.66:61
chr1	234582720	rs139816698	C	T	2263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.401;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=67;PP=1787;ReadPosRankSum=2.027;SC=CTCTGCTTTCCGCTAGACATT;SOR=1.721;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=111;TCF=22;TCR=89;TR=80;WE=234582728;WS=234582710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,81:0.72:112
chr1	234584176	rs115691704	T	G	2107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-7.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.523;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=11;PP=1625;ReadPosRankSum=0.069;SC=ATCATAATTCTCATCAGGATT;SOR=0.126;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=123;TCF=111;TCR=12;TR=87;WE=234584184;WS=234584166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,89:0.71:125
chr1	234584288	rs114916639	G	A	4314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.011;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=91;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.325;SC=AAACAAGCTTGGCTTCAAACC;SOR=0.797;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=246;TCF=102;TCR=144;TR=153;WE=234584296;WS=234584278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,161:0.63:256
chr1	234603451	rs6657924	A	C	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=28;ReadPosRankSum=0.688;SC=TTTCACCATCAAGACTACATA;SOR=0.465;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=4;WE=234603459;WS=234603441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr1	234607055	rs10713847	TG	T	353.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.311;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=377;ReadPosRankSum=-2.081;SC=TCTTGAAAAATGTCAGGCAAT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=11;WE=234607063;WS=234607045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr1	234607086	rs6687548	G	A	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=99;ReadPosRankSum=-1.711;SC=TTATTTCACAGTAGCTCTTCT;SOR=0.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=7;WE=234607094;WS=234607076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,8:0.23:35
chr1	234607104	rs6697027	C	T	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=53;ReadPosRankSum=1.653;SC=TCTGTTTCTACAAAACATATG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=6;WE=234607112;WS=234607094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr1	234744413	rs4636	C	A	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=239;ReadPosRankSum=-0.302;SC=CGGCCCCGGCCGCGGTGGACA;SOR=0.495;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=12;WE=234744421;WS=234744403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
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chr1	235301496	rs367780945	CA	C	58.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=5.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=1.614;QD=1.59;ReadPosRankSum=-0.529;SOR=0.097;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,10:0.27:37
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chr1	235357314	rs35180803	AT	A	1283.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.284;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=0;PP=2603;ReadPosRankSum=0.308;SC=CAACAGAACGATTGTTATGTT;SOR=3.142;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=49;TCR=3;TR=35;WE=235357322;WS=235357293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,40:0.68:59
chr1	235357543	rs10802438	A	G	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.337;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=558;ReadPosRankSum=0.222;SC=TAAGAAAAAAAGTATGTCGTA;SOR=2.621;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=24;WE=235357551;WS=235357533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr1	235383188	rs4659654	A	G	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.815;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=30;PP=711;ReadPosRankSum=-1.105;SC=CATCTTTGTCATCCAGATTTT;SOR=0.326;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=76;TCF=16;TCR=60;TR=40;WE=235383196;WS=235383178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,43:0.54:79
chr1	235392546	rs12731746	T	C	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.115;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=6;PP=1194;ReadPosRankSum=-0.475;SC=TTTCACTTACTTCTTCTTCAC;SOR=2.387;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=81;TCF=66;TCR=15;TR=49;WE=235392554;WS=235392536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,49:0.59:83
chr1	235394541	rs7518225	A	C	282.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=226;ReadPosRankSum=0.523;SC=AAGAAAAAAAACCCAAAATAT;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=10;WE=235394549;WS=235394531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr1	235397937	rs35818300	GCA	G	127.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=104;ReadPosRankSum=-0.819;SC=GGGTAAACAGGCACACACACA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=3;WE=235397946;WS=235397927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr1	235490391	rs3840452	CA	C	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=98;ReadPosRankSum=0.921;SC=GAAAGAGCCGCAACCAGGCGC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=235490399;WS=235490381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr1	235505313	rs3841735	A	AT	1672.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.375;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.718;NF=54;NR=7;PP=1556;ReadPosRankSum=-0.854;SC=GAAATTTTCAATTTTTTTATT;SOR=0.050;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=111;TCF=102;TCR=9;TR=61;WE=235505321;WS=235505303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,64:0.67:95
chr1	235543476	.	TTGTGTGTGTGTGTG	T,TTGTGTGTG	750.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.89;QD=34.12;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,9,13:0.41,0.59:22
chr1	235564924	rs17543709	G	T	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.036;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=208;ReadPosRankSum=-0.340;SC=TTATGAATCAGCACGGTCATT;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=10;TCR=42;TR=14;WE=235564932;WS=235564914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,13:0.24:55
chr1	235594182	rs2291687	A	G	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=144;ReadPosRankSum=-0.134;SC=GGTTTAATAGAGAATTGTTAG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=235594190;WS=235594172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr1	235594250	rs2291688	A	G	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.204;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr1	235598973	rs2055127	C	T	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=289;ReadPosRankSum=-0.700;SC=AGCCCTCCATCGCACCAAATG;SOR=0.582;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=61;TCF=50;TCR=11;TR=17;WE=235598981;WS=235598963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,17:0.27:62
chr1	235601958	rs3819974	G	T	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=289;ReadPosRankSum=0.642;SC=GTGAAAACTAGATCTTGTCCC;SOR=0.573;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=46;TCF=43;TCR=3;TR=17;WE=235601966;WS=235601948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,17:0.36:47
chr1	235628908	rs1305556	G	A	2011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=17;PP=1535;SC=AAGATTAAGTGTAAGACATTC;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=45;TCR=17;TR=62;WE=235628916;WS=235628898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr1	235647631	rs291387	G	T	1328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=0;PP=1100;SC=TACAGAGCAGGGCATACCTCT;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=235647639;WS=235647621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	235652513	rs291396	T	C	6687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=147;NR=49;PP=2965;SC=AATAAGGATCTTCCCTGTCTT;SOR=2.291;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=196;TCF=147;TCR=49;TR=196;WE=235652521;WS=235652503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr1	235667398	rs149884283	AC	A	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=58;ReadPosRankSum=-0.180;SC=CGGGCCTCCCACCCCCCCGGC;SOR=0.527;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=4;WE=235667406;WS=235667388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	235667690	rs291348	A	G	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=13;PP=443;SC=CGACGTCTGGAGGGCTCCTCG;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=235667698;WS=235667680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	235715523	rs14326	A	G	1424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.320;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=44;PP=1186;ReadPosRankSum=-0.782;SC=GGAGGTCCGCAGCTGCCTGGG;SOR=0.437;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=81;TCF=11;TCR=70;TR=52;WE=235715531;WS=235715513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,52:0.64:81
chr1	235715556	rs423026	C	G	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.333;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=37;PP=965;ReadPosRankSum=0.738;SC=GCACAGAGCACAGGTGCTCAG;SOR=0.123;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=60;TCF=4;TCR=56;TR=41;WE=235715564;WS=235715546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,41:0.67:61
chr1	235715601	rs400948	A	G	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=294;ReadPosRankSum=-0.833;SC=TCCAGGGAAGAGGTGTCCACG;SOR=0.527;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=14;WE=235715609;WS=235715591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr1	235747005	rs2774335	C	T	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.637;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=536;ReadPosRankSum=2.041;SC=AGCTGAGCTTCGGGCGGAGGG;SOR=0.269;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=21;WE=235747013;WS=235746995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
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chr1	235826382	rs36014994	TA	T	172.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.40;ReadPosRankSum=-1.673;SOR=0.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
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chr1	235827641	rs12092604	C	T	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=111;ReadPosRankSum=0.387;SC=AGAACCTACACCCCAAGGTGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=8;WE=235827649;WS=235827639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr1	235856901	rs3754232	G	A	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=113;ReadPosRankSum=-1.150;SC=ATCATTTGGTGCAAGACCATC;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=7;WE=235856909;WS=235856891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr1	235860340	rs7541057	C	T	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.23;ReadPosRankSum=-0.507;SOR=0.074;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,10:0.22:46
chr1	235878431	rs3831362	A	AGTT	292.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=331;ReadPosRankSum=0.493;SC=GTCAGTCCTAAGTTGTTGTTG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=235878439;WS=235878421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr1	235887276	rs6667717	G	T	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=184;ReadPosRankSum=1.278;SC=TATAGTTACAGTGGCCCATGA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=11;WE=235887284;WS=235887266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr1	235894550	.	G	C	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.172;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=27;PP=576;ReadPosRankSum=-0.870;SC=AATCATTATAGAGATTGAGTA;SOR=0.984;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=82;TCF=10;TCR=72;TR=30;WE=235894558;WS=235894540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,33:0.35:93
chr1	235896726	rs6429275	C	T	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.433;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=350;ReadPosRankSum=1.212;SC=GTCTGAATTCCGGAATACAAA;SOR=1.051;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=17;WE=235896734;WS=235896716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr1	235910392	rs6676149	A	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=2.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.81;ReadPosRankSum=-0.210;SOR=1.199;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,6:0.19:32
chr1	235910542	rs3754234	C	T	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.862;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=792;ReadPosRankSum=0.014;SC=TTTAATGGACCGAAGGAGAAG;SOR=1.278;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=123;TCF=67;TCR=56;TR=43;WE=235910550;WS=235910532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,43:0.34:128
chr1	235918688	rs149138177	CAAAAG	C	799.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=1.951;QD=11.76;ReadPosRankSum=-0.444;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,24:0.35:68
chr1	235918870	rs61738992	T	G	3544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.523;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=98;PP=2959;ReadPosRankSum=0.015;SC=ACTGGTTGGCTAGCAAGGAAA;SOR=1.164;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=186;TCF=39;TCR=147;TR=120;WE=235918878;WS=235918860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,124:0.66:189
chr1	235922228	rs3738519	T	C	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=305;ReadPosRankSum=-1.468;SC=CTTTAAAGAATAGTAAAATAA;SOR=0.377;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=85;TCF=84;TCR=1;TR=22;WE=235922236;WS=235922218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,22:0.24:90
chr1	235940450	rs2273584	C	T	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.438;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=476;ReadPosRankSum=1.332;SC=GTTGGAGATTCTTTAGATGAT;SOR=1.259;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=90;TCF=49;TCR=41;TR=26;WE=235940458;WS=235940440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,27:0.29:92
chr1	235945294	rs6696123	T	C	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.801;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=525;ReadPosRankSum=0.438;SC=CTTGGGATGATAAACAATGGC;SOR=0.853;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=93;TCF=47;TCR=46;TR=35;WE=235945302;WS=235945284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,34:0.35:98
chr1	235972435	rs3820553	T	C	1940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=7.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.324;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=44;PP=1559;ReadPosRankSum=1.600;SC=AAGCCTGCTGTAGTAAGCGCA;SOR=0.876;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=235;TCF=110;TCR=125;TR=78;WE=235972443;WS=235972425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,81:0.33:243
chr1	235972867	rs1063128	T	C	2030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FS=1.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.45;ReadPosRankSum=0.091;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:228,87:0.28:315
chr1	236142565	rs1536132	T	C	2016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=57;PP=1706;SC=CTGGGGTGGGTCAAGCCTGCA;SOR=8.189;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=0;TCR=57;TR=57;WE=236142573;WS=236142555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	236154012	.	C	T	422	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=16;NR=0;PP=422;QD=28.5482007842;SC=GGAAAGATCACGAGCAGCTCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=236154020;WS=236154011;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	236175153	rs2031486	T	C	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.495;NF=9;NR=0;PP=188;ReadPosRankSum=-1.261;SC=GACAGGGCAATGGGCCATGTG;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=9;WE=236175161;WS=236175143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr1	236175339	rs2031487	T	C	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.065;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=968;ReadPosRankSum=-1.765;SC=GGCATTCATCTACATCTGTAA;SOR=0.185;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=60;TCF=29;TCR=31;TR=41;WE=236175347;WS=236175329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,37:0.71:52
chr1	236176990	rs10803217	T	C	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.174;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=98;ReadPosRankSum=1.494;SC=CAGCTTCACCTGCACCCCACT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=236176998;WS=236176980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr1	236193145	rs2273586	G	C	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=420;ReadPosRankSum=-0.420;SC=TGGTGCGAACGCTTCTGCAGG;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=17;WE=236193153;WS=236193135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr1	236201609	rs4659620	T	G	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=579;ReadPosRankSum=-0.613;SC=TCTAGCCCGGTGGGCTCTCTC;SOR=0.460;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=26;WE=236201617;WS=236201599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr1	236205090	rs2385052	C	T	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=54;ReadPosRankSum=0.524;SC=TCTACTTTCCCAAGCTCTTAT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=236205098;WS=236205080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr1	236205121	rs4297282	T	C	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=140;ReadPosRankSum=0.092;SC=CACCATGTAATGCTCACAACT;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=8;WE=236205129;WS=236205111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr1	236208688	rs10733131	AT	GA	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=0;PP=1692;ReadPosRankSum=-1.414;SC=ATGATCTATAATACACATTAC;SOR=1.453;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=57;TCR=0;TR=30;WE=236208697;WS=236208678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,37:0.65:57
chr1	236208773	rs10733133	C	T	4302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.088;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=40;PP=2962;ReadPosRankSum=0.103;SC=AAATTTTCAACTGATTCCCTG;SOR=0.509;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=228;TCF=174;TCR=54;TR=157;WE=236208781;WS=236208763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,164:0.69:236
chr1	236209024	rs3768088	C	G	1444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=6.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=44;PP=1168;ReadPosRankSum=0.276;SC=GGAAAAATATCGATAGATTTT;SOR=0.958;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=77;TCF=5;TCR=72;TR=47;WE=236209032;WS=236209014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,51:0.63:81
chr1	236209081	rs3768089	G	A	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=429;ReadPosRankSum=-0.228;SC=CAGTGCTATAGAGCGATGGCA;SOR=0.941;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=19;WE=236209089;WS=236209071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr1	236305885	rs7522547	G	A	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=49;ReadPosRankSum=-0.708;SC=CGCGATGCGCGGAGACCCCCG;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=5;WE=236305893;WS=236305875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr1	236368391	rs3215798	C	CT	1907.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=5;PP=2055;SC=GGCATGATGTCTGTAAGTATG;SOR=3.830;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=44;WE=236368399;WS=236368381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr1	236368708	rs1254206	T	C	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=274;SC=ATGTGAAACATTCAGGAATGA;SOR=2.494;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=236368716;WS=236368698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	236381825	rs1055851	G	C	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=11;PP=497;SC=ATTACCTACTGTGTTGTAATA;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=17;WE=236381833;WS=236381815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	236381897	rs1615601	T	A	155.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=5;PP=109;SC=AAGAAAAAGCTTATTAGTAAG;SOR=2.303;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=236381905;WS=236381887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	236381917	rs1614938	T	A	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=138;SC=GGCTAACATGTTGCATACTGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=236381925;WS=236381907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	236384022	rs34880815	A	ATTT	263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=0;PP=165;SC=ACAATATAAAATTTTTTTTTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=236384030;WS=236384012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	236384278	rs1405624	G	C	896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=26;PP=769;SC=AAAGAAAATAGCAATAAACTC;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=236384286;WS=236384268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	236385116	rs2463190	C	T	911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=0;PP=714;SC=TCTGCCTATTCCTAAATTCTA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=236385124;WS=236385106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	236385165	rs2463189	G	C	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=3;PP=1043;SC=AAAAAGCTTGGACTCAGTGGA;SOR=4.125;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=39;WE=236385173;WS=236385155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	236385360	rs2477587	C	T	1938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=51;PP=1544;SC=AAAATTGAACCGCATTTGGCT;SOR=3.575;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=7;TCR=51;TR=58;WE=236385368;WS=236385350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr1	236385379	rs2463188	A	G	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=40;PP=1224;SC=CTAAACGATAAGTAAGTTTTG;SOR=3.865;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=44;WE=236385387;WS=236385369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	236393654	rs2812471	A	G	1242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=36;PP=1054;SC=GCTCATGCCTATAATCCTAGC;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=38;WE=236393662;WS=236393644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	236395936	rs3835673	C	CT	153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=135;SC=GAAAAATGGTCTTTTTTTTTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=236395944;WS=236395926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	236406593	rs2695061	T	C	136.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=1;PP=145;SC=AATGCCATTATGAATAATAAG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=236406601;WS=236406583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	236413147	rs1726639	T	C	1201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=3;PP=885;SC=TTGATATCAATGAGAATATTT;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=34;WE=236413155;WS=236413137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	236413282	rs2056713	G	A	1872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=43;PP=1387;SC=AAAGAAGTTCGTAAGTTTAGT;SOR=2.265;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=13;TCR=43;TR=56;WE=236413290;WS=236413272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	236413362	rs2477598	C	T	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=16;PP=538;SC=CAATGATATACACTAAATATA;SOR=3.160;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=236413370;WS=236413352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	236413384	rs2477597	T	C	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=12;PP=442;SC=ATACATTCCATTATAAAAATC;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=236413392;WS=236413374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	236415347	rs1749589	T	C	3910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=77;PP=2965;SC=AGGAGGGACTTACCTTATTAG;SOR=1.445;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=45;TCR=77;TR=122;WE=236415355;WS=236415337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	236415444	rs1618510	G	A	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=34;PP=1045;ReadPosRankSum=1.659;SC=TATTTTTTTTGGAATTTCTTC;SOR=4.461;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=35;WE=236415452;WS=236415434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr1	236416921	rs2812465	C	T	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=41;PP=1174;ReadPosRankSum=-0.126;SC=ACTTCCTATCCTCGTGGCACC;SOR=4.712;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=42;WE=236416929;WS=236416911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr1	236433135	rs3834089	AT	A	2336.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=14;PP=2248;SC=GTCACATATAATACCTTTGAT;SOR=2.342;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=47;WE=236433143;WS=236433125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr1	236444879	rs11281666	G	GGCCCGGCCCT	723.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=2;PP=1580;SC=CCTCTTTTCTGGCCCGGCCCT;SOR=2.833;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=7;WE=236444887;WS=236444869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr1	236444973	rs1269025	C	T	1191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=15;PP=932;SC=CGCTATCACTCGGGCTTACCT;SOR=1.040;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=21;TCR=15;TR=36;WE=236444981;WS=236444963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr1	236557771	rs966365	G	A	3826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=38;PP=2965;SC=CTAAACAGATGGGGAGAGGCA;SOR=1.590;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=118;TCF=79;TCR=39;TR=117;WE=236557779;WS=236557761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	236557928	rs966364	G	A	1482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=44;PP=1338;SC=TTTTCGACCCGACTTTTATCT;SOR=6.184;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=45;WE=236557936;WS=236557918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	236572389	rs659901	G	A	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.81;ReadPosRankSum=-0.384;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr1	236572475	rs669710	A	G	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.139;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=5;PP=585;ReadPosRankSum=0.476;SC=TTTAAATTAAAGCAAACCCGC;SOR=1.013;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=73;TCF=58;TCR=15;TR=30;WE=236572483;WS=236572465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,30:0.40:75
chr1	236577762	rs61021118	C	CT	133.37	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.77;QD=19.05;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr1	236590497	rs1759388	C	G	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=74;ReadPosRankSum=-0.552;SC=TCTTGATAAGCAGCATTGTTT;SOR=0.116;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=6;WE=236590505;WS=236590487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr1	236590563	rs1778861	C	T	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=302;ReadPosRankSum=0.227;SC=GTAGTCCAGCCCTTCTGATTT;SOR=0.627;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=17;WE=236590571;WS=236590553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr1	236590629	rs636378	C	T	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=459;ReadPosRankSum=0.513;SC=TCTTACACCACGGAGTGTGTG;SOR=0.575;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=25;WE=236590637;WS=236590619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,27:0.42:65
chr1	236590659	rs636048	G	C	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.842;HP=6;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=513;ReadPosRankSum=-0.292;SC=ATCACACTTTGTTTCTTTCTT;SOR=0.155;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=51;TCF=20;TCR=31;TR=25;WE=236590667;WS=236590649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr1	236590816	rs635487	T	G	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=256;ReadPosRankSum=-1.034;SC=TTTTTTGAGATTTATAGAGTT;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=12;WE=236590824;WS=236590806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr1	236645670	rs604070	C	T	1983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=35;PP=1545;ReadPosRankSum=0.156;SC=ACTTACTAGACGTGATCAGGA;SOR=0.680;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=65;TCR=59;TR=73;WE=236645678;WS=236645660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,75:0.60:124
chr1	236700673	rs62670060	GAGC	G	592.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=680;ReadPosRankSum=0.368;SC=GCTGGATTCTGAGCAGATTTA;SOR=0.826;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=15;WE=236700683;WS=236700666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr1	236700807	rs1126407	T	A	3273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.688;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=37;PP=2524;ReadPosRankSum=0.365;SC=GTAATCCCGTTTGTTGGCACC;SOR=0.994;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=193;TCF=131;TCR=62;TR=125;WE=236700815;WS=236700797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,127:0.64:197
chr1	236700823	rs1041934	T	C	3580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.483;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=49;PP=2573;ReadPosRankSum=-1.636;SC=GCACCATTCCTGATCAGCTGG;SOR=0.959;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=201;TCF=125;TCR=76;TR=138;WE=236700831;WS=236700813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,141:0.68:208
chr1	236700857	rs1041935	C	T	4160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.654;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=66;PP=2962;ReadPosRankSum=1.494;SC=GATTGTGATACGTGGGCATGT;SOR=0.911;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=227;TCF=121;TCR=106;TR=153;WE=236700865;WS=236700847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,156:0.66:236
chr1	236700982	rs2737706	T	C	2714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.716;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=72;PP=2096;ReadPosRankSum=-1.097;SC=ATTTGATACTTTGAGGCCCAA;SOR=0.955;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=136;TCF=31;TCR=105;TR=91;WE=236700990;WS=236700972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,97:0.67:144
chr1	236702153	rs2244808	G	A	208.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=169;SC=AGCACTCATGGGGCCCCTGTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=236702161;WS=236702143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	236702209	rs1041936	CA	TG	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=603;ReadPosRankSum=-0.049;SC=ATGGCAGCAGCATGAAACCTC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=14;WE=236702218;WS=236702199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr1	236702447	rs12744425	T	G	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=10.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.12;ReadPosRankSum=0.062;SOR=4.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr1	236702450	rs12744427	T	C	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=10.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.12;ReadPosRankSum=0.123;SOR=4.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr1	236702475	rs11807205	A	G	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=66;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=132;ReadPosRankSum=0.547;SC=GCCCAGCCTTATATTTCCTAC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=236702483;WS=236702465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr1	236702497	rs111502141	AGTTT	A	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=64;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=148;ReadPosRankSum=-1.611;SC=CCTGAGATATAGTTTGTTTGG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=236702508;WS=236702487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr1	236702517	rs11807542	T	C	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=79;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=38;ReadPosRankSum=-1.006;SC=GCTTTGTAGTTTTTCTCCATA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=236702525;WS=236702507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr1	236703700	rs2244659	A	G	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=58;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=210;SC=AAGCACTGCTAGTGTTTTGGG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=236703708;WS=236703694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	236703734	rs2243405	T	C	241.22	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.9970;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=48;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=191;ReadPosRankSum=1.036;SC=CATTTGGTCATGTGTGTGGAG;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=9;WE=236703742;WS=236703724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr1	236703767	rs2758994	C	T	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=173;ReadPosRankSum=0.147;SC=AGGTATAAAACTGGACGCAAG;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=9;WE=236703775;WS=236703757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr1	236703832	rs34818366	CG	C	581.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.561;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=314;ReadPosRankSum=0.077;SC=TTTTTGGTGGCGGGGGGGGCT;SOR=0.137;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=51;TCF=43;TCR=8;TR=20;WE=236703840;WS=236703822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr1	236704888	.	ATAT	AACAGGTTAT,A	151.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=0;PP=91;ReadPosRankSum=-1.440;SC=TTATATGTCAATATAAAATAT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=1;WE=236704902;WS=236704878;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.30:10
chr1	236704891	.	TAAA	T	148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.44;ReadPosRankSum=-2.372;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	236704894	.	A	AGGTT	97	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;FR=0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=10;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=0;PP=97;QD=118.0;SC=GTCAATATAAAATATTTAGAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=1;WE=236704902;WS=236704878;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,1:0.14:7
chr1	236704897	.	ATT	A	148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.44;ReadPosRankSum=-1.221;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr1	236706352	rs2758174	A	C	3699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.084;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=100;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.547;SC=TTTGAAGAGCACCAAATTTTC;SOR=0.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=207;TCF=56;TCR=151;TR=134;WE=236706360;WS=236706342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,135:0.65:207
chr1	236706371	rs2758175	A	G	2858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.400;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=87;PP=2254;ReadPosRankSum=1.135;SC=TCTTAACTCTATATAAAAATT;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=178;TCF=38;TCR=140;TR=108;WE=236706379;WS=236706361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,109:0.61:179
chr1	236706425	rs2244267	G	A	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=49;PP=1176;ReadPosRankSum=-0.109;SC=CCACAATAGAGGCCCAAAGCA;SOR=1.005;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=86;TCF=0;TCR=86;TR=49;WE=236706433;WS=236706415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,49:0.57:86
chr1	236706671	rs2243530	T	A	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.957;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=170;ReadPosRankSum=0.221;SC=TGTAATCATGTGTGTTTGCTT;SOR=0.627;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=8;WE=236706679;WS=236706665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr1	236706780	rs2243527	C	T	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=566;ReadPosRankSum=-1.020;SC=TGAAACATTCCGTAGTGTTCT;SOR=0.883;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=25;WE=236706788;WS=236706770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,30:0.58:52
chr1	236706862	rs2243525	G	C	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.921;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;PP=677;ReadPosRankSum=-0.321;SC=CTTTTCAGAGGCTGCCATTCG;SOR=0.839;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=66;TCF=36;TCR=30;TR=37;WE=236706870;WS=236706852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,38:0.57:67
chr1	236707007	rs2799410	C	T	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=312;ReadPosRankSum=-1.206;SC=TACCGCCTTCCACCCGTGAAC;SOR=0.963;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=16;WE=236707015;WS=236706997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr1	236707036	rs2794786	A	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.49;ReadPosRankSum=-1.611;SOR=1.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr1	236707045	rs2799409	C	T	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.989;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.25;ReadPosRankSum=-0.849;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr1	236708022	rs5781896	GT	G	301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=174;ReadPosRankSum=-0.889;SC=GTTAATTAAGGTTTTTTTTTT;SOR=0.582;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=15;WE=236708030;WS=236708012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr1	236708224	rs2244063	A	C	1303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=31;PP=1026;ReadPosRankSum=1.696;SC=AGGTGAGGTTACAGTTTTTGA;SOR=0.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=19;TCR=42;TR=45;WE=236708232;WS=236708214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,46:0.74:62
chr1	236708316	rs2758181	A	G	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.743;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=490;ReadPosRankSum=0.098;SC=AGTATGTGGAAGTTGTGTATG;SOR=2.753;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=22;WE=236708324;WS=236708306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,23:0.70:33
chr1	236708357	rs60495052	C	CCCTT	283.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.150;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=356;ReadPosRankSum=-0.207;SC=TGTAATTTGCCCCTTTTTATA;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=8;WE=236708365;WS=236708347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr1	236711297	rs2254823	A	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=281;ReadPosRankSum=-0.100;SC=AATGGCATGTATCCTTTCCTT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=12;WE=236711305;WS=236711287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr1	236711323	rs15701	T	C	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=361;ReadPosRankSum=-0.033;SC=TGATAATTTATTGTGATGTTA;SOR=1.893;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=16;WE=236711331;WS=236711313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr1	236711586	rs1160	G	A	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.518;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=38;PP=908;ReadPosRankSum=-1.088;SC=GCACCATTAGGTCCTGCTGGG;SOR=2.259;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=40;WE=236711594;WS=236711576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,42:0.74:57
chr1	236714064	rs6989	A	C	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=497;ReadPosRankSum=-0.892;SC=GATTTTGTAAAGAAGTGATAA;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=20;WE=236714072;WS=236714057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr1	236714335	rs2254487	C	T	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=5.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=34;PP=772;ReadPosRankSum=1.139;SC=TGAGTCAGTCCGCCTGCCTCG;SOR=1.201;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=0;TCR=54;TR=34;WE=236714343;WS=236714325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,31:0.61:51
chr1	236715442	.	A	ATTT	1875.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.113;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.105;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=2395;ReadPosRankSum=1.149;SC=AATAAAAAGTAGTGTTACTGT;SOR=3.139;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=3;TCR=67;TR=19;WE=236715453;WS=236715432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,47:0.58:81
chr1	236715443	.	G	A	1912.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=11.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.61;ReadPosRankSum=0.608;SOR=3.139;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,47:0.58:81
chr1	236715443	.	GTG	ATT	2377	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=1;NR=18;PP=2377;QD=127.919361835;SC=ATAAAAAGTAGTGTTACTGTA;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=54;TCF=5;TCR=49;TR=19;WE=236715453;WS=236715432;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:35,19:0.35:54
chr1	236715445	.	G	T	1870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.826;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=14.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.98;ReadPosRankSum=0.574;SOR=3.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,46:0.59:78
chr1	236716741	rs1475132	G	A	698.22	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5463;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=597;ReadPosRankSum=2.007;SC=ACAAAAGACCGGACCTCTAGT;SOR=3.690;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=25;WE=236716749;WS=236716731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,24:0.89:27
chr1	236716959	rs2275685	C	T	1577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.236;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=43;PP=1222;ReadPosRankSum=-1.309;SC=CCATGGCCACCGAAAACTGTG;SOR=1.128;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=89;TCF=25;TCR=64;TR=57;WE=236716967;WS=236716949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,58:0.65:89
chr1	236717104	rs2275686	A	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=136;ReadPosRankSum=1.623;SC=TTGAAAAAATATCCAACATAC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=236717112;WS=236717094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr1	236717926	rs2275687	T	C	2200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.536;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=52;PP=1802;ReadPosRankSum=0.974;SC=CATCAAGGCTTCTGCTCTCTC;SOR=0.528;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=128;TCF=42;TCR=86;TR=80;WE=236717934;WS=236717916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,80:0.61:131
chr1	236718524	rs6668848	G	C	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=378;ReadPosRankSum=1.146;SC=CAAGCACTAGGTTGTGTCTTA;SOR=1.101;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=17;WE=236718532;WS=236718514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr1	236718561	rs6668926	G	A	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=1;PP=752;ReadPosRankSum=-0.275;SC=GGCACACAGGGCAAGGGTGAC;SOR=1.524;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=52;TCF=50;TCR=2;TR=33;WE=236718569;WS=236718551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,36:0.65:55
chr1	236718620	rs1126627	T	C	2333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.907;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=17;PP=1714;ReadPosRankSum=-0.503;SC=TTCACCTGGTTCAAGGTGTCA;SOR=0.578;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=83;TCR=24;TR=75;WE=236718628;WS=236718610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,84:0.71:118
chr1	236719135	rs1885532	T	C	4777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=115;NR=22;PP=2965;SC=AGTCCAGGGCTTCCAGGAAAA;SOR=3.196;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=115;TCR=22;TR=137;WE=236719143;WS=236719125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr1	236719193	rs1885533	A	G	4042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.749;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=51;PP=2962;ReadPosRankSum=0.876;SC=CTTCTTCATCACCCCAATATG;SOR=1.368;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=239;TCF=154;TCR=85;TR=162;WE=236719201;WS=236719183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,170:0.67:253
chr1	236719259	rs1885534	G	A	5095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.017;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=105;PP=2962;ReadPosRankSum=1.154;SC=ACACAGGAAAGAGATGTGCCA;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=256;TCF=102;TCR=154;TR=171;WE=236719267;WS=236719249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,179:0.67:268
chr1	236720761	rs2799404	T	C	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=282;ReadPosRankSum=1.812;SC=CGCTATCTGCTTCATAGCCTA;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=12;WE=236720769;WS=236720751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr1	236721610	rs2275688	G	A	1841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.351;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=1;PP=1494;ReadPosRankSum=-0.774;SC=GCGCTTCCCAGGACATTCTTC;SOR=2.162;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=80;TCF=78;TCR=2;TR=59;WE=236721618;WS=236721600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,61:0.73:83
chr1	236721660	rs2275689	T	C	2748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.782;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=21;PP=2185;ReadPosRankSum=0.661;SC=CACAGCAGTGTTCAGCACTGG;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=144;TCF=111;TCR=33;TR=95;WE=236721668;WS=236721650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,97:0.66:147
chr1	236721731	rs819431	T	C	7357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=133;PP=2965;SC=AGGTATACAATGCTGTCTGTC;SOR=0.807;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=250;TCF=117;TCR=133;TR=250;WE=236721739;WS=236721721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr1	236722182	rs819432	A	T	1080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=0;PP=890;SC=TATATTCAGAAAATAATATAC;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=236722190;WS=236722172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	236722489	rs2146122	C	T	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=189;ReadPosRankSum=1.418;SC=AAAAAAAAAACCAACTTCAAT;SOR=0.317;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=11;WE=236722497;WS=236722479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr1	236723177	rs10754576	GC	AA	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.212;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=1575;ReadPosRankSum=-1.864;SC=GCAGCTGAAGGCACTCAGAGA;SOR=2.164;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=30;WE=236723186;WS=236723167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,33:0.85:39
chr1	236724504	rs1077439	G	A	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.028;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=634;ReadPosRankSum=-0.675;SC=ATAAAAAGTAGAAAAAGAAAA;SOR=0.049;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=30;WE=236724512;WS=236724494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,30:0.67:45
chr1	236724605	rs1077438	G	T	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.046;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=19;PP=774;ReadPosRankSum=-0.221;SC=TAGAACGGTAGGGAAGTCAAT;SOR=0.771;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=73;TCF=36;TCR=37;TR=41;WE=236724613;WS=236724595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,42:0.55:77
chr1	236724715	rs1077437	T	G	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=641;ReadPosRankSum=-0.513;SC=CAGGTTCATATCATCTTCATT;SOR=0.848;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=28;WE=236724723;WS=236724705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr1	236724766	rs1077436	C	T	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=248;ReadPosRankSum=0.892;SC=ATTTTAATTACATTCTACTGG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=12;WE=236724774;WS=236724756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr1	236729867	rs2758172	C	T	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.770;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=2;PP=1234;ReadPosRankSum=0.820;SC=ATCATCAGCCCCATGTTTAAA;SOR=2.340;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=67;TCF=63;TCR=4;TR=50;WE=236729875;WS=236729857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,50:0.75:67
chr1	236732198	rs12135604	C	A	836.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=4.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=1.270;QD=18.59;ReadPosRankSum=-0.058;SOR=0.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr1	236732199	.	A	AC	378.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=1.109;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.940;SOR=0.259;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr1	236735939	rs2853602	T	C	2429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.649;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=42;PP=1953;ReadPosRankSum=0.204;SC=TATAGCAAATTGATGAGTATC;SOR=0.606;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=141;TCF=76;TCR=65;TR=93;WE=236735947;WS=236735929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,93:0.65:143
chr1	236739416	rs2115740	C	T	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=536;ReadPosRankSum=-0.484;SC=CTCTTCTGAGCGCACACATGC;SOR=0.476;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=25;WE=236739424;WS=236739406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,27:0.79:34
chr1	236740039	rs6658793	G	C	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.441;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=1;PP=706;ReadPosRankSum=0.107;SC=CCAGTACACAGAGGCATGAAC;SOR=3.019;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=51;TCF=46;TCR=5;TR=31;WE=236740047;WS=236740029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,30:0.60:50
chr1	236744424	rs35257076	A	AT	530.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=324;ReadPosRankSum=0.524;SC=GCCCTCTGCTATTTTTTTTTA;SOR=0.540;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=20;WE=236744432;WS=236744414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr1	236744712	rs4518892	C	A	1415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.632;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=41;PP=1137;ReadPosRankSum=1.091;SC=CTTCTAGATGCACCTAATTAA;SOR=1.304;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=63;TCF=8;TCR=55;TR=46;WE=236744728;WS=236744702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,48:0.74:65
chr1	236746275	rs2794769	G	C	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.082;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=39;PP=1486;ReadPosRankSum=-1.568;SC=CAGTTTTGCAGAGTATCACAT;SOR=0.261;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=103;TCF=35;TCR=68;TR=64;WE=236746283;WS=236746265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,68:0.64:107
chr1	236746443	rs2794768	C	T	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.095;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=34;PP=1062;ReadPosRankSum=2.537;SC=CCCACAGCTCCACTGGGATCC;SOR=0.551;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=46;WE=236746451;WS=236746433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,50:0.68:73
chr1	236748505	rs1006456	T	C	6958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=6.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.981;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=151;PP=2962;ReadPosRankSum=0.669;SC=CCACGCTTATTAAATCCTCCA;SOR=1.023;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=381;TCF=152;TCR=229;TR=241;WE=236748513;WS=236748495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,251:0.64:395
chr1	236748630	rs1006455	C	T	2031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.63;ReadPosRankSum=-0.919;SOR=1.259;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,53:0.62:86
chr1	236748636	rs1006454	G	A	1949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.68;ReadPosRankSum=-0.743;SOR=1.281;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,49:0.62:79
chr1	236749022	rs10925166	G	A	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.99;ReadPosRankSum=0.518;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr1	236749026	rs10925167	T	A	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.77;ReadPosRankSum=1.441;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr1	236749348	rs2794764	C	T	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=402;ReadPosRankSum=3.557;SC=GGTTTGCTTTCTATTTTTCCT;SOR=0.468;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=17;WE=236749356;WS=236749338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr1	236749451	rs3831993	TA	T	161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=156;ReadPosRankSum=0.674;SC=TACTGGCATATAAGCATGACC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=236749459;WS=236749443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr1	236749649	rs2794763	T	C	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.186;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=632;ReadPosRankSum=-0.390;SC=TTGATAACCATAAATGGCAGC;SOR=0.223;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=30;WE=236749657;WS=236749639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,36:0.72:50
chr1	236749817	rs2799420	C	T	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.345;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=504;ReadPosRankSum=-1.116;SC=GGCAAAAATTCATCATTACAT;SOR=2.833;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=23;WE=236749825;WS=236749807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr1	236751519	rs34200005	GA	G	800.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.320;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=952;ReadPosRankSum=-0.909;SC=AGGGCCTTTTGAGATTAATAA;SOR=3.872;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=23;WE=236751527;WS=236751509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,23:0.77:30
chr1	236755170	rs2794760	G	T	2541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-8.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.620;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=7;PP=1846;ReadPosRankSum=0.119;SC=GCAAACTGTAGAAGGTTATCT;SOR=0.267;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=120;TCF=112;TCR=8;TR=83;WE=236755178;WS=236755160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,90:0.70:128
chr1	236755427	rs2794759	A	G	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=32;PP=903;ReadPosRankSum=1.971;SC=AGCAATTAAAAAGTGAATTCA;SOR=0.544;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=3;TCR=50;TR=34;WE=236755435;WS=236755417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,36:0.64:56
chr1	236755690	rs2794758	G	A	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=109;ReadPosRankSum=-0.552;SC=TCCGATACTCGCCCCTTCTTG;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=236755698;WS=236755680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr1	236755814	rs2794757	G	A	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=346;ReadPosRankSum=-0.189;SC=ACATACACACGTAACTTACTT;SOR=1.140;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=19;WE=236755822;WS=236755804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr1	236755837	rs2564739	C	T	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=310;ReadPosRankSum=0.700;SC=TTTCTAAAAGCCTAATGAGTG;SOR=0.892;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=19;WE=236755845;WS=236755827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr1	236755937	rs67239913	TA	T	190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=127;ReadPosRankSum=0.656;SC=TAGAAGGCTGTAAAAAAAAAA;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=12;WE=236755945;WS=236755927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr1	236757200	rs2564738	A	G	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=472;ReadPosRankSum=0.287;SC=AATGATACAGACAAAACAAGA;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=20;WE=236757208;WS=236757190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr1	236757229	rs2794754	G	A	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=2;PP=635;ReadPosRankSum=-1.371;SC=AAAAAGGAATGCTGGGAAATT;SOR=0.804;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=28;WE=236757237;WS=236757219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,31:0.79:39
chr1	236757507	rs2794753	A	G	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=135;ReadPosRankSum=0.285;SC=CGTTCTCAGAATAAAACACAC;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=236757515;WS=236757497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr1	236758887	rs2794751	T	C	2580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.047;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=51;PP=1840;ReadPosRankSum=-0.543;SC=AAGCATGTAATGCAGAAGAGG;SOR=0.414;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=185;TCF=102;TCR=83;TR=106;WE=236758895;WS=236758877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,113:0.58:195
chr1	236759060	rs2794750	T	C	1904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.843;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=17;PP=1516;ReadPosRankSum=-0.759;SC=TCACTTATCTTACAAAAAAAA;SOR=0.816;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=99;TCF=71;TCR=28;TR=62;WE=236759068;WS=236759050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,65:0.64:102
chr1	236767072	rs1529540	A	G	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=340;ReadPosRankSum=-0.057;SC=CTACTCATAAACATTTCAAGC;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=14;WE=236767080;WS=236767065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr1	236767176	rs1529541	C	G	2795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-0.703;QD=25.19;ReadPosRankSum=-0.355;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,73:0.66:111
chr1	236767178	rs375752396	AG	A	944.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=2.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.000;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.855;SOR=0.444;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,56:0.54:103
chr1	236767330	rs10802551	A	G	1903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=50;PP=1514;ReadPosRankSum=-0.646;SC=CTTCATCTCTAGATAAGAGGC;SOR=0.840;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=95;TCF=24;TCR=71;TR=66;WE=236767338;WS=236767320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,67:0.68:98
chr1	236881403	rs2275399	C	T	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.500;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=433;ReadPosRankSum=0.330;SC=CCAAAGAAAACCTTTCCAAAG;SOR=2.746;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=19;WE=236881411;WS=236881393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr1	236882110	rs1341865	G	A	1543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=8;PP=1289;SC=TTAAGGAAAAGATGGATGCTT;SOR=2.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=47;WE=236882118;WS=236882100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	236882303	rs1341864	T	C	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=33;PP=939;SC=TGGTGTCCATTGGCGCTGAAG;SOR=2.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=43;WE=236882311;WS=236882293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr1	236883240	rs1768053	T	C	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=1;PP=133;SC=TTATGAATACTGTATTTATAA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=236883248;WS=236883230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr1	236883421	rs1341863	C	T	2031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=19;PP=1588;SC=TTGATGGCAACGTGAAAATGA;SOR=1.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=44;TCR=19;TR=63;WE=236883429;WS=236883411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr1	236883564	rs1341862	G	A	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=28;PP=807;SC=TGAGCAAGATGTTTTAAAGTC;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=236883572;WS=236883554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	236890781	rs1768056	A	G	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=1;PP=385;SC=CAAGGAAGTCAAAAGGAGAGG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=236890789;WS=236890774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	236894647	rs819640	G	A	1629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.594;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=50;PP=1252;ReadPosRankSum=-1.264;SC=TGAGTTACAGGAAATTTGAAG;SOR=0.628;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=219;TCF=53;TCR=166;TR=66;WE=236894655;WS=236894637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,71:0.31:230
chr1	236897633	rs707203	A	G	3406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=3;PP=2812;SC=ATGGGGGCGAAGGGGGAGGAT;SOR=5.913;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=93;TCR=3;TR=95;WE=236897641;WS=236897623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr1	236899042	rs2288600	G	A	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.697;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=679;ReadPosRankSum=0.650;SC=TTGTCCGTCCGGGCTGTTGTG;SOR=0.623;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=54;TCR=57;TR=37;WE=236899050;WS=236899032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,42:0.34:123
chr1	236899899	rs11355106	TC	T	1529.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.105;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.997;NF=5;NR=41;PP=1456;ReadPosRankSum=-0.486;SC=TGTGGAAGGATCCCCCTCCAG;SOR=0.941;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=74;TCF=7;TCR=67;TR=46;WE=236899907;WS=236899889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,55:0.68:81
chr1	236900018	rs7542508	G	A	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=146;ReadPosRankSum=-0.699;SC=ATTTCCAAAGGCTAATGTTAT;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=7;WE=236900026;WS=236900008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr1	236900598	.	CAT	C	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=5;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=151;ReadPosRankSum=-1.899;SC=TCCGTGGGGGCATATATATAT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=4;WE=236900607;WS=236900588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr1	236902532	.	AT	A	288.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.18;ReadPosRankSum=1.269;SOR=0.207;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,22:0.32:69
chr1	236902560	rs7527525	C	T	1989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.616;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=10;PP=1512;ReadPosRankSum=0.229;SC=GGGGAGGGGGCTTGCTGGTGT;SOR=0.416;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=113;TCF=100;TCR=13;TR=78;WE=236902568;WS=236902550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,79:0.70:113
chr1	236902594	rs2288601	C	G	3205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.488;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=31;PP=2509;ReadPosRankSum=-0.277;SC=TTTGTGTTTGCGGAGCAGCTT;SOR=0.548;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=162;TCF=118;TCR=44;TR=110;WE=236902602;WS=236902584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,115:0.69:167
chr1	236902865	rs2288602	A	C	1986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.682;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=43;PP=1569;ReadPosRankSum=-0.530;SC=TCCTGGCGCCACGGGAAGCCC;SOR=0.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=105;TCF=44;TCR=61;TR=72;WE=236902873;WS=236902855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,73:0.68:107
chr1	236902955	rs7544174	T	C	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.499;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=637;ReadPosRankSum=0.772;SC=GTGAATATCATTTTGGCCCTG;SOR=1.769;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=26;WE=236902963;WS=236902945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr1	236910863	rs10802557	T	C	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=183;ReadPosRankSum=0.254;SC=ACATTTCAGATGTTTTTGTTT;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=10;WE=236910871;WS=236910853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr1	236914610	rs3738545	G	C	354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=328;SC=CTTGACTTCTGTGTACCTAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=236914618;WS=236914600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr1	236924506	rs2282366	A	G	3466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=85;PP=2822;SC=CTGCTTTAGCAGGAGTCCACT;SOR=2.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=23;TCR=85;TR=108;WE=236924514;WS=236924496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	236958532	rs28372871	G	T	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=328;ReadPosRankSum=-0.538;SC=GAGGAGCTCGGGCAGACCAAT;SOR=0.765;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=73;TCF=68;TCR=5;TR=20;WE=236958540;WS=236958522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,21:0.29:73
chr1	236972186	rs12759827	A	G	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=40;PP=1016;ReadPosRankSum=0.830;SC=TACGAGTAACACTGCAGAGAC;SOR=0.768;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=59;TCF=3;TCR=56;TR=43;WE=236972194;WS=236972176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,45:0.69:65
chr1	236978992	rs5781924	T	TTCTG	1327.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQRankSum=1.611;QD=10.14;ReadPosRankSum=0.606;SOR=0.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,37:0.28:131
chr1	236988593	rs5781926	A	AT	393.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=9.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=1.719;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.301;SOR=2.917;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,22:0.26:85
chr1	237001926	rs3820568	A	G	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.935;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=265;ReadPosRankSum=-0.273;SC=GGCCTAATCCATTGTGTTTCC;SOR=0.163;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=52;TCF=2;TCR=50;TR=16;WE=237001934;WS=237001916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,16:0.30:54
chr1	237013550	rs146375090	AT	A	833.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=1.303;QD=13.90;ReadPosRankSum=-1.524;SOR=0.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,23:0.38:60
chr1	237013553	rs200399202	T	A	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=1.291;QD=13.59;ReadPosRankSum=-1.497;SOR=0.344;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,24:0.39:62
chr1	237023333	rs10925254	T	C	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.25;ReadPosRankSum=-1.069;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr1	237024414	.	G	T	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.988;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.900;HP=17;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-2.694;NF=17;NR=0;PP=253;ReadPosRankSum=0.249;SC=TTTTTTTTTTGTCTTTTTTAG;SOR=2.356;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=17;WE=237024422;WS=237024404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr1	237024416	.	C	T	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.626;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.11;MQRankSum=-3.136;QD=18.44;ReadPosRankSum=0.049;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr1	237037998	rs150727404	CT	C	154.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=3.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQRankSum=1.804;QD=4.84;ReadPosRankSum=0.742;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr1	237038008	rs10925256	T	A	180.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=2.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.30;MQRankSum=1.327;QD=5.02;ReadPosRankSum=0.543;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,8:0.22:36
chr1	237038161	rs1770449	T	C	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.130;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=38;PP=965;ReadPosRankSum=1.074;SC=GTTATACTAATGAGCTTTGTC;SOR=0.273;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=67;TCF=12;TCR=55;TR=48;WE=237038169;WS=237038151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,48:0.71:68
chr1	237049879	rs12065382	C	T	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=221;ReadPosRankSum=-0.612;SC=CTGAGATGGACTCATAGCAGC;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=11;WE=237049887;WS=237049869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr1	237054569	rs2229276	A	G	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=425;ReadPosRankSum=-0.581;SC=ACCTGTACGCAGAGGCTGCTG;SOR=0.579;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=101;TCF=22;TCR=79;TR=30;WE=237054577;WS=237054559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,31:0.29:106
chr1	237057608	rs2297965	G	A	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.45;ReadPosRankSum=-1.533;SOR=0.742;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,31:0.27:116
chr1	237058744	rs12070777	C	A	995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=2.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.72;ReadPosRankSum=-1.874;SOR=0.888;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,47:0.27:174
chr1	237058828	rs1131449	C	T	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.221;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=243;ReadPosRankSum=0.510;SC=TGTGGAGACTCGCAGACATCG;SOR=0.425;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=76;TCF=23;TCR=53;TR=20;WE=237058836;WS=237058818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,23:0.28:83
chr1	237058996	rs75739277	C	CTATT	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=101;ReadPosRankSum=1.579;SC=TCACTCGTAGCTATTCTGCAT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=3;WE=237059004;WS=237058986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr1	237060433	rs3820571	G	T	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.57;ReadPosRankSum=-1.039;SOR=1.380;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,32:0.25:126
chr1	237061056	rs2853522	A	C	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.505;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=107;ReadPosRankSum=0.124;SC=GCTGACACTTACCTGCTTCTG;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=237061064;WS=237061046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr1	237063335	rs1050996	G	C	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=3.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.91;ReadPosRankSum=-1.680;SOR=0.386;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,23:0.19:118
chr1	237063504	rs9779	A	G	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.782;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=237;ReadPosRankSum=-0.216;SC=TTAGATATATATATTCATTCT;SOR=0.343;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=15;WE=237063512;WS=237063494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,16:0.31:52
chr1	237540615	rs10925391	A	C	2263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.808;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=22;PP=1686;ReadPosRankSum=0.517;SC=ATATCCGTATATCTGCAGGGG;SOR=0.297;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=112;TCF=82;TCR=30;TR=74;WE=237540623;WS=237540605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,80:0.68:117
chr1	237551241	rs71561868	G	GTC	198.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=138;ReadPosRankSum=-0.608;SC=AGCAGGCACTGTCTATCTCTG;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=237551249;WS=237551231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr1	237551376	rs10754602	T	A	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.280;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=520;ReadPosRankSum=-1.927;SC=AATGATTTTTTATCCTTACAG;SOR=0.411;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=25;WE=237551384;WS=237551366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr1	237580606	rs6673182	G	T	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.51;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	237580612	rs6673187	G	C	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.38;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	237617757	rs3765097	C	T	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=1.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;QD=5.78;ReadPosRankSum=0.414;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,52:0.28:184
chr1	237619875	rs60132900	AT	A,ATT	1680.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.05;MQRankSum=0.116;QD=18.07;ReadPosRankSum=0.727;SOR=1.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:3,72,18:0.77,0.19:93
chr1	237620049	rs2045955	T	C	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.689;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=863;ReadPosRankSum=-0.691;SC=AGAAGCATGATTGGGTTCATA;SOR=0.807;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=151;TCF=54;TCR=97;TR=46;WE=237620057;WS=237620039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,46:0.30:153
chr1	237632285	rs35662567	A	AT	607.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=566;ReadPosRankSum=-0.297;SC=TAGATGTAACAGAGGATATTT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=52;TCR=0;TR=16;WE=237632293;WS=237632275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr1	237632556	.	G	A	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.867;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=-1.066;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.404;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr1	237632595	rs71561877	T	TGTG	363.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.500;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=310;ReadPosRankSum=-1.344;SC=TTGAGTGAGGTGTGGTGGTGT;SOR=0.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=13;WE=237632603;WS=237632585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr1	237656185	rs139196633	A	AAGGGAGGG	817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.17;QD=43.04;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	237670140	rs2618702	A	G	2326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.721;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=62;PP=1887;ReadPosRankSum=-0.850;SC=ATTTATTTTCAGATTCTGTGA;SOR=0.430;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=133;TCF=36;TCR=97;TR=88;WE=237670148;WS=237670130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,88:0.67:132
chr1	237675150	rs57830998	A	G	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQRankSum=0.000;QD=17.65;ReadPosRankSum=1.198;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr1	237693921	rs2779365	A	G	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=3.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.82;ReadPosRankSum=1.368;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr1	237711644	rs2618661	T	C	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=444;SC=GGAAGAACAGTAATGAGGTAG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=237711652;WS=237711634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	237711797	rs2253273	A	G	3003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=48;PP=2455;SC=TCACCCCATCACAAGAAGCAA;SOR=0.775;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=50;TCR=48;TR=98;WE=237711805;WS=237711787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr1	237714103	rs2306238	G	A	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.62;ReadPosRankSum=-1.030;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr1	237730124	rs2805390	A	G	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=39;PP=1108;SC=CTGGAGGCTCATCTCCTCTGC;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=39;WE=237730132;WS=237730114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	237730169	rs2779401	C	T	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=351;SC=ACCAGTGTTTCCCACAGCACA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=237730177;WS=237730159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	237732395	rs2805396	G	A	768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=0;PP=620;SC=GGGTGGGTGCGATTTTCCTGG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=23;WE=237732403;WS=237732387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	237753074	rs11331089	AT	A	651.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.191;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=287;ReadPosRankSum=0.174;SC=CTAAAACTTGATTTTTTTTTT;SOR=0.490;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=103;TCF=87;TCR=16;TR=29;WE=237753082;WS=237753064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,38:0.38:101
chr1	237754340	rs1332777	A	G	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=355;ReadPosRankSum=1.119;SC=TATGTGAGGAAGGTTACAGTC;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=18;WE=237754348;WS=237754330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr1	237755188	rs2618713	C	T	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.100;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=37;PP=732;ReadPosRankSum=-0.402;SC=TTATTTCTATCTGTCACTCAT;SOR=1.125;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=157;TCF=32;TCR=125;TR=44;WE=237755196;WS=237755178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,48:0.30:162
chr1	237755203	rs2779430	T	C	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=1.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.616;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,31:0.27:116
chr1	237757027	rs1478915	G	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.638;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=174;ReadPosRankSum=-0.662;SC=TGTGACCAAGGTATTTCTATT;SOR=0.061;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=11;WE=237757035;WS=237757017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr1	237765200	rs2805418	G	A	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=36;ReadPosRankSum=0.935;SC=CACATCAATCGATATGCAAGA;SOR=0.138;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=4;WE=237765208;WS=237765190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr1	237765470	rs791541	A	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=93;ReadPosRankSum=2.631;SC=TATAGCATTGATTTATTCTGA;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=6;WE=237765478;WS=237765460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr1	237794603	rs1759123	A	G	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=0;PP=750;SC=GTGGCTTATTAAATACTGTGA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=237794611;WS=237794593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr1	237801770	rs707189	T	C	4015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=76;PP=2965;SC=TTGACTTTCTTAGATTTGCTG;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=36;TCR=76;TR=112;WE=237801778;WS=237801760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr1	237802559	rs530109	T	C	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.02;SOR=1.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr1	237813126	rs625006	A	G	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=113;ReadPosRankSum=-0.241;SC=CCCTTTGAAGATTATCTACTG;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=237813134;WS=237813116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr1	237814783	rs684923	C	T	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.160;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=643;ReadPosRankSum=1.359;SC=TAAATGAACACGCAAAGATGC;SOR=2.170;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=27;WE=237814791;WS=237814773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,28:0.78:36
chr1	237814898	rs2184014	C	A	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=62;ReadPosRankSum=0.272;SC=TCATGCTTGACGCTGGGAAAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=237814906;WS=237814888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr1	237824332	rs471647	G	A	1491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=42;PP=1225;SC=TTTTTCTAAAGAATAATCTGA;SOR=5.376;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=44;WE=237824340;WS=237824322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	237831103	rs477245	C	A	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=330;SC=TATTCCTTTACGGTATCTAAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=237831111;WS=237831093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	237841390	rs34967813	A	G	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.077;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=89;ReadPosRankSum=0.559;SC=CCTTATGAACAAGAAATCAAG;SOR=1.609;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=7;WE=237841398;WS=237841380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr1	237862164	rs1521745	G	C	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=2;PP=950;SC=AAATATTACTGTTGTGTCATT;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=33;WE=237862172;WS=237862154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	237862436	rs1521744	T	C	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=210;SC=GGATTTGTAATAAAGTCTTTA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=237862444;WS=237862426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	237863439	rs12754190	G	A	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=511;SC=TAGAGTAATGGAGAAATAAAC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=237863447;WS=237863429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	237863718	rs2797436	T	G	2609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=47;PP=1949;SC=CAATGCTGTCTTCATTATTTG;SOR=0.832;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=89;TCF=42;TCR=47;TR=88;WE=237863726;WS=237863708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	237865203	rs939699	C	T	940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=4;PP=767;SC=CTGAATAGTACATAGCTTAAG;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=237865211;WS=237865193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	237872714	rs35261418	GT	G	1219.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.32;MQRankSum=0.297;QD=23.01;ReadPosRankSum=0.425;SOR=2.226;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,52:0.98:53
chr1	237881770	rs2797441	C	T	1680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=26;PP=1219;SC=AGAAAGATACCGAGGATGAAG;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=29;TCR=26;TR=55;WE=237881778;WS=237881760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	237890437	rs2685301	C	T	5056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=73;NR=73;PP=2965;SC=AACTACTGTCCAAGCAGAGGA;SOR=0.810;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=73;TCR=73;TR=146;WE=237890445;WS=237890427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr1	237893674	rs2797445	C	T	3966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=61;PP=2965;SC=TTTAGTGGGGCTCTAAGATGA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=63;TCR=61;TR=124;WE=237893682;WS=237893664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	237905568	.	T	TC	87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=30;MQ=61.35;NF=6;NR=0;PP=87;QD=20.3333333333;SC=TATTCCTGTCTCCTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=6;WE=237905576;WS=237905558;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,6:0.35:17
chr1	237923053	rs2253831	C	T	2337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.210;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=23;PP=1826;ReadPosRankSum=-1.211;SC=TCAGTGGCCACGTGGTTTCTA;SOR=1.318;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=135;TCF=92;TCR=43;TR=84;WE=237923061;WS=237923043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,88:0.63:140
chr1	237954883	rs147499106	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=133;ReadPosRankSum=0.134;SC=AAAGATTTCACGATGAACGTA;SOR=0.247;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=8;WE=237954891;WS=237954873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr1	237955649	rs68129840	CTGTG	C,CTG	383.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.36;QD=29.52;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,6,7:0.46,0.54:13
chr1	237993724	rs2275692	C	T	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=1;PP=626;SC=TGATCTTTGACGTGTATTGAG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=237993732;WS=237993714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr1	238048325	rs2298100	A	G	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=12;PP=506;SC=TCATGTAATTAGTAACAAGGG;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=238048333;WS=238048315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr1	240421383	rs10926181	G	A	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=486;SC=TTTGGGCTGAGGGATATGATG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=240421391;WS=240421373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr1	240421437	rs10926182	C	T	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=83;SC=CTGTGTAAACCGAGGTTAGTA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=240421445;WS=240421427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	240492543	rs6686353	G	A	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=608;ReadPosRankSum=1.057;SC=ATGCAAATGCGGTGTCTTCAG;SOR=0.658;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=33;TCR=73;TR=31;WE=240492551;WS=240492533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,32:0.30:106
chr1	240492734	rs3795677	G	A	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=845;ReadPosRankSum=1.118;SC=TGCTCAATTCGTCGCAAACTG;SOR=0.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=70;TCR=86;TR=51;WE=240492742;WS=240492724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,55:0.33:165
chr1	240497221	rs150801382	C	T	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.422;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=574;ReadPosRankSum=-0.896;SC=TATATTGTTTCGTATTATCTC;SOR=2.636;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=25;WE=240497229;WS=240497211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,27:0.84:32
chr1	240497265	rs10157874	A	C	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.238;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;ReadPosRankSum=-1.134;SC=ATTTTTACATATAGTCATATT;SOR=1.078;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=16;WE=240497273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,16:0.28:57
chr1	240497598	rs12122068	T	C	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.25;ReadPosRankSum=1.703;SOR=0.141;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr1	240601269	rs2356386	A	G	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-6.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=1;PP=877;ReadPosRankSum=0.062;SC=ATAATTGTGCATGAATAAAAT;SOR=0.673;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=73;TCF=72;TCR=1;TR=49;WE=240601277;WS=240601259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,49:0.67:73
chr1	240635491	rs2210861	G	C	209.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=171;SC=ATAAATTAGCGTCTGTAGCTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=240635499;WS=240635482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	240643167	rs11578184	A	C	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=143;ReadPosRankSum=-0.268;SC=CAAAGGGGACATTCACCCCCT;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=8;WE=240643175;WS=240643157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr1	240643184	rs9442211	C	T	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=146;ReadPosRankSum=0.780;SC=CCCTTCTCTCCCAAAAATCAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=8;WE=240643192;WS=240643174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr1	240643435	rs12748248	A	T	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=352;ReadPosRankSum=-0.258;SC=GTGAAACCATACCCTTGGGAG;SOR=0.384;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=5;TCR=56;TR=21;WE=240643443;WS=240643425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,21:0.34:62
chr1	240655330	rs9287248	G	A	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=210;ReadPosRankSum=-0.728;SC=TTCTGAGTAAGACACCTTCTG;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=10;WE=240655338;WS=240655320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr1	240656824	rs10926280	C	A	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=43;PP=1254;ReadPosRankSum=1.185;SC=CCGTAGAGTACGGGATCAATC;SOR=0.920;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=79;TCF=15;TCR=64;TR=52;WE=240656832;WS=240656814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,51:0.67:76
chr1	240977964	rs12744536	G	T	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=164;ReadPosRankSum=0.982;SC=TTAAACACATGTAATTGTCAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=9;WE=240977972;WS=240977954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr1	240979803	rs3738068	G	A	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=248;ReadPosRankSum=-2.382;SC=CATAAATTCAGTAAGGTCTCT;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=12;WE=240979811;WS=240979793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr1	241100122	rs261857	G	T	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=395;SC=CCTCTTGAAAGATTTAATTTC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=241100130;WS=241100112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	241146322	rs7520707	A	G	1001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.405;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=692;ReadPosRankSum=-0.387;SC=CTGATGAAACATATTTCTTAA;SOR=1.527;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=63;TCF=41;TCR=22;TR=40;WE=241146330;WS=241146312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,43:0.64:67
chr1	241519098	rs4659599	T	A	1971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=50;PP=1578;ReadPosRankSum=0.354;SC=CTTGGTCCACTCTCAAGATAC;SOR=1.358;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=66;TCF=13;TCR=53;TR=63;WE=241519106;WS=241519088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr1	241667233	rs4660099	C	T	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.210;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=423;ReadPosRankSum=1.346;SC=GTGCGCCTTGCGCATCCAGCT;SOR=0.085;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=57;TCF=56;TCR=1;TR=22;WE=241667252;WS=241667223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr1	241667244	rs4659607	G	T	2340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=4;PP=2148;SC=GCATCCAGCTGCGGGATAACT;SOR=5.166;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=65;TCR=4;TR=69;WE=241667252;WS=241667223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr1	241675119	rs6673988	G	C	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-5.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=389;ReadPosRankSum=1.452;SC=ATAAAACCAAGATTCCTTCAA;SOR=0.563;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=19;WE=241675127;WS=241675109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
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chr1	241712134	rs11556464	C	T	7028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=163;NR=57;PP=2965;SC=TCTAGGTTGGCTCATTACAAG;SOR=2.188;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=220;TCF=163;TCR=57;TR=220;WE=241712142;WS=241712124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr1	241767930	rs632966	G	A	1386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=38;PP=1116;SC=GGGGGAAACCGGGCATAAGAG;SOR=6.043;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=38;WE=241767938;WS=241767920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr1	241798631	rs3737604	C	T	2707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=28;PP=2078;ReadPosRankSum=-1.027;SC=TATTAAAATACGATAACTGGC;SOR=0.774;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=86;TCR=39;TR=91;WE=241798639;WS=241798621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,96:0.74:130
chr1	241838057	rs67170285	C	T	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.99;ReadPosRankSum=0.478;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr1	241838065	rs66585415	T	C	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.47;ReadPosRankSum=1.310;SOR=0.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr1	241847018	rs10802979	C	T	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.832;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=267;ReadPosRankSum=-1.397;SC=GAGTATCATACAGTTAATTTA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=13;WE=241847026;WS=241847008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr1	241875326	rs12092919	T	C	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=30;PP=532;ReadPosRankSum=-1.209;SC=TTCTGGCGTCTGGATTTGATA;SOR=1.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=30;WE=241875334;WS=241875316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr1	241886430	rs12748037	C	G	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.42;ReadPosRankSum=-0.637;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr1	241907817	rs10802990	T	C	3938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.651;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=78;PP=2765;ReadPosRankSum=-0.562;SC=GAGCGTATAATGGTCAGACTA;SOR=0.508;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=241;TCF=125;TCR=116;TR=155;WE=241907825;WS=241907807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,161:0.64:250
chr1	241907948	rs6703922	T	C	1605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.748;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=51;PP=1335;ReadPosRankSum=-1.617;SC=GCCAGTGAAATTCCTGTGCCT;SOR=3.039;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=88;TCF=2;TCR=86;TR=51;WE=241907956;WS=241907938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,54:0.59:92
chr1	241913062	rs11432682	C	CT	147.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=188;ReadPosRankSum=1.178;SC=TGCAGGTGCCCTTTTTGGGAA;SOR=0.437;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=7;WE=241913070;WS=241913052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr1	241920499	rs67278585	TGTAG	T	646.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=653;ReadPosRankSum=-1.493;SC=GATACATCATTGTAGGTTCTA;SOR=0.456;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=15;WE=241920510;WS=241920489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr1	241920562	rs6663895	C	T	1635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.473;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=10;PP=1217;ReadPosRankSum=0.502;SC=ACTTTTCATGCACTCACTGGA;SOR=1.679;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=101;TCF=79;TCR=22;TR=59;WE=241920570;WS=241920552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,62:0.60:103
chr1	241929542	rs12095445	G	A	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=21;PP=972;ReadPosRankSum=0.433;SC=GATTTATTACGAGTGAACTGC;SOR=0.616;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=66;TCF=34;TCR=32;TR=44;WE=241929550;WS=241929532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,46:0.67:69
chr1	241933876	rs11809239	A	G	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=40;ReadPosRankSum=0.111;SC=TGAGTATGGTAGCATATCTTA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=5;WE=241933884;WS=241933866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr1	241934825	rs139942709	C	CA	152.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=126;ReadPosRankSum=0.191;SC=ACATTTTTTTCAAAAAAAAAT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=241934833;WS=241934815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr1	241935152	rs114725032	C	T	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=137;ReadPosRankSum=2.116;SC=TCATTATATACGTATATATAA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=241935160;WS=241935142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr1	241936055	rs6429310	A	G	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-5.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.479;NF=33;NR=4;PP=646;ReadPosRankSum=-0.383;SC=GTGAGCCACCACGCCTGGCCT;SOR=0.846;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=64;TCF=56;TCR=8;TR=37;WE=241936063;WS=241936045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,40:0.58:69
chr1	241946766	rs953597	A	C	2461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=65;PP=1857;SC=TGAAGTATATAGTTCAAATGC;SOR=2.679;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=17;TCR=65;TR=82;WE=241946774;WS=241946756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr1	241951034	rs6429312	C	T	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=450;ReadPosRankSum=-0.195;SC=GGTCTTGAACCCAAGTAAAAA;SOR=0.487;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=19;WE=241951042;WS=241951024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr1	241951106	rs6429313	A	G	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.926;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=14;PP=948;ReadPosRankSum=-0.606;SC=AACTTTGACCAAATTTTCCAG;SOR=0.905;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=88;TCF=64;TCR=24;TR=54;WE=241951114;WS=241951096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,56:0.62:91
chr1	241951329	rs12074374	C	T	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=391;ReadPosRankSum=-0.867;SC=GATATTTGACCGGGAAAAGTA;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=18;WE=241951337;WS=241951319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr1	241954005	rs35435449	TA	T	317.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.35;MQRankSum=3.299;QD=4.48;ReadPosRankSum=-0.477;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,31:0.44:71
chr1	241964559	rs4658661	C	T	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=8.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.51;ReadPosRankSum=0.084;SOR=0.311;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,56:0.28:201
chr1	242015820	rs2526704	A	G	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=87;ReadPosRankSum=-0.431;SC=AGTGGCTTGCACCTGTTGTCC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=242015828;WS=242015810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr1	242016590	rs4149867	C	T	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=180;ReadPosRankSum=1.667;SC=TCTTGAATTACAGTTCTGTTA;SOR=0.206;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=10;WE=242016598;WS=242016580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr1	242020495	rs2995544	C	T	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=278;ReadPosRankSum=-0.972;SC=CTAAAACTTACAGTAGAAAAA;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=13;WE=242020503;WS=242020485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr1	242030151	rs735943	A	G	2398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.428;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=32;PP=1860;ReadPosRankSum=-0.502;SC=TCAAGAAGTCATAGTTGGGAT;SOR=0.575;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=148;TCF=100;TCR=48;TR=97;WE=242030159;WS=242030141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,99:0.65:152
chr1	242035438	rs4149965	G	A	4359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.469;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=56;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.220;SC=CTTTTCTGAAGTGTTTGTGCC;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=256;TCF=160;TCR=96;TR=152;WE=242035446;WS=242035428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,161:0.61:266
chr1	242042301	rs1047840	G	A	2752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.946;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=62;PP=2255;ReadPosRankSum=-0.088;SC=CTACTCTTTTGAGAGCAGCAA;SOR=0.834;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=304;TCF=139;TCR=165;TR=112;WE=242042309;WS=242042291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,114:0.36:319
chr1	242042545	rs1776148	A	G	2626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=32;PP=2110;SC=TTACGAGAAGAGGCATGTTCT;SOR=1.058;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=48;TCR=32;TR=80;WE=242042553;WS=242042535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	242042690	rs1418760	A	G	1919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=44;PP=1455;SC=TATATGTAAGAAAAAATAGAT;SOR=3.500;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=8;TCR=44;TR=52;WE=242042698;WS=242042680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr1	242045275	rs1635498	C	T	2700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=39;PP=2038;SC=CTCCAAGCTACGTTTATCTCA;SOR=0.761;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=46;TCR=39;TR=85;WE=242045283;WS=242045265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	242048514	.	G	GTAAATAAATAAA	486.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=666;SC=ATCTCAAAAAGTAAATAAATA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=4;WE=242048522;WS=242048504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr1	242048945	rs1635488	C	T	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=9;PP=265;SC=TTTCTCTCTTCCCTTTAGCTA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=242048953;WS=242048935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	242053042	rs851797	A	G	877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=23;PP=687;SC=TTTGTATATTAACTTTATAAT;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=242053050;WS=242053032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	242253024	rs7523793	T	C	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=377;ReadPosRankSum=-1.032;SC=TATTATGTGTTGTTCAGAGAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=17;WE=242253032;WS=242253014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr1	242264102	rs12124966	A	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.282;HP=10;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=372;ReadPosRankSum=1.297;SC=AAAAAAAAAAAGGGGGCAGGT;SOR=1.078;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=74;TCF=32;TCR=42;TR=24;WE=242264110;WS=242264081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,19:0.28:69
chr1	242277309	.	C	A	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.962;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=371;ReadPosRankSum=1.045;SC=GTTTTTAGGGCAAAAGAGTTT;SOR=0.851;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=65;TCF=35;TCR=30;TR=19;WE=242277317;WS=242277299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,22:0.30:73
chr1	242428834	rs2053192	T	A	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.426;NF=0;NR=18;PP=371;ReadPosRankSum=-0.792;SC=CTCATTAAAATTAATCTATTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=18;WE=242428842;WS=242428824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr1	242612420	rs2654871	G	A	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=467;ReadPosRankSum=0.655;SC=AGAGCCCAGCGAAGTCCTTAT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=21;WE=242612428;WS=242612417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr1	242687390	rs2810008	G	A	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.132;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=10;PP=895;ReadPosRankSum=-0.019;SC=TCGCCCTTACGTGCTCCAGCT;SOR=0.524;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=72;TCF=57;TCR=15;TR=44;WE=242687398;WS=242687380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,44:0.62:71
chr1	243327520	rs1815604	A	T	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQRankSum=-1.295;QD=18.31;ReadPosRankSum=-0.623;SOR=0.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr1	243329049	rs3766664	G	A	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FS=20.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.80;MQRankSum=-4.880;QD=0.48;ReadPosRankSum=0.540;SOR=1.967;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:265,33:0.11:298
chr1	243332884	rs140816120	AAG	A	161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.29;MQRankSum=0.090;QD=17.97;ReadPosRankSum=-0.180;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr1	243335940	rs74889777	GA	G	170.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=2.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQRankSum=-2.064;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.070;SOR=1.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
chr1	243362331	rs2789172	C	T	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.04;QD=32.29;SOR=6.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	243388370	rs10926973	A	T	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=0;PP=1010;ReadPosRankSum=-1.110;SC=AGCTAAAAGGAGAGAAAGTTC;SOR=2.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=62;TCR=0;TR=46;WE=243388378;WS=243388360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,46:0.73:63
chr1	243419429	rs3904682	T	A	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.553;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=18;PP=783;ReadPosRankSum=-0.142;SC=GGGAGAAAGCTGGACATTTCC;SOR=0.534;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=71;TCR=45;TR=46;WE=243419437;WS=243419419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,46:0.40:116
chr1	243433654	rs2275154	A	G	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=374;ReadPosRankSum=1.069;SC=TTCTGCTGCTATGATGTTATT;SOR=0.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=18;WE=243433662;WS=243433644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr1	243481431	rs2783972	A	G	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=169;ReadPosRankSum=0.011;SC=GACAGATTGTATAAAGAAAAT;SOR=0.833;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=14;WE=243481439;WS=243481421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,17:0.32:53
chr1	243493907	rs2275155	A	T	1498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.006;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=29;PP=1236;ReadPosRankSum=-0.685;SC=TTGAAAAAGAACTTGCATCTC;SOR=0.395;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=40;TCR=48;TR=55;WE=243493915;WS=243493897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,56:0.64:87
chr1	243509685	.	C	T	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.719;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=120;ReadPosRankSum=-0.268;SC=TCTTACAATTCAGCATCACAA;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=243509693;WS=243509675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr1	243579112	rs10927011	G	A	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=334;ReadPosRankSum=-0.260;SC=AGCAAATGGAGGCCCAGCATG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=16;WE=243579120;WS=243579102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr1	244527857	rs10927214	T	C	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=345;ReadPosRankSum=1.553;SC=ATAGCCTATATGCATAGTCCT;SOR=1.220;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=16;WE=244527865;WS=244527847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr1	244528127	rs9782996	T	C	2207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.981;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=67;PP=1873;ReadPosRankSum=0.584;SC=GGAGTTAGAATTGCACATCCT;SOR=0.133;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=101;TCF=5;TCR=96;TR=72;WE=244528135;WS=244528117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,72:0.71:101
chr1	244601152	rs3127465	C	T	1691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=33;PP=1178;SC=AATTAATGACCTCCTGCCAAA;SOR=1.302;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=53;WE=244601160;WS=244601142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	244624635	rs3006006	G	C	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=134;ReadPosRankSum=0.889;SC=CCGGGACCCAGGCGCCTGCAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=9;WE=244624643;WS=244624625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr1	244624887	rs3124058	T	C	1134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.610;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=31;PP=884;ReadPosRankSum=-1.477;SC=CCCATGCGCCTCGGGACCGCT;SOR=0.193;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=67;TCF=13;TCR=54;TR=41;WE=244624895;WS=244624877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,42:0.60:70
chr1	244715966	rs35587664	G	A	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=53;PP=1481;ReadPosRankSum=-0.035;SC=TGATCTTATCGCGGGATGGAA;SOR=0.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=260;TCF=93;TCR=167;TR=83;WE=244715974;WS=244715956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,84:0.31:268
chr1	244773784	rs6698173	T	C	1639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=40;PP=924;SC=ATTTTTAAAATGCTTCATCTT;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=40;WE=244773792;WS=244773774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr1	244773803	rs6698180	T	C	1320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=29;PP=647;SC=TTAATTTCTGTGTGATCTTTT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=244773811;WS=244773793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr1	244803205	rs60280231	CTT	C	2505.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=52;NR=19;PP=739;SC=CTTCTAATGCCTTTTTTTTTT;SOR=2.439;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=105;TCF=74;TCR=31;TR=71;WE=244803227;WS=244803195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,80:0.95:84
chr1	244999153	rs80005339	T	C	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.369;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=605;ReadPosRankSum=-1.630;SC=TGTCACTGGCTTCTCTGCCAC;SOR=1.101;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=51;TCF=23;TCR=28;TR=27;WE=244999161;WS=244999143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr1	245133489	rs7545078	T	G	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.122;HP=5;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=614;ReadPosRankSum=1.552;SC=GGGGGCCGGGTGGCAGACGGG;SOR=0.919;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=29;WE=245133497;WS=245133479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr1	245133539	rs7542813	A	G	1719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=24;PP=1717;SC=GTGGCGCGAAACGGGGACAGG;SOR=0.929;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=20;TCR=24;TR=44;WE=245133558;WS=245133529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	245133549	rs10536649	GGC	G	778.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.402;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=776;ReadPosRankSum=0.451;SC=ACGGGGACAGGGCGCGCGCTC;SOR=1.206;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=44;TCF=24;TCR=20;TR=23;WE=245133558;WS=245133529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr1	245133623	rs145835471	T	TCCTCC	1715.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=1785;ReadPosRankSum=-0.803;SC=GAGCGGCCCCTCCTCCAGGCC;SOR=0.752;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=52;TCF=26;TCR=26;TR=33;WE=245133631;WS=245133613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,42:0.76:55
chr1	245165456	rs111647414	C	T	1767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.363;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=15;PP=1358;ReadPosRankSum=-0.610;SC=GATAAGGCCTCGGACTTTACT;SOR=1.201;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=95;TCF=70;TCR=25;TR=63;WE=245165464;WS=245165446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,65:0.67:97
chr1	245179011	rs201488109	CA	C	400.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=7.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.82;MQRankSum=2.031;QD=4.71;ReadPosRankSum=0.087;SOR=1.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,37:0.44:85
chr1	245179171	rs1196365	C	T	3651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-9.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=88;PP=2305;ReadPosRankSum=0.994;SC=CCAAAGTGATCAGCAGACCGC;SOR=1.094;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=4;TCR=120;TR=91;WE=245179179;WS=245179161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,95:0.74:128
chr1	245179188	rs1196366	G	T	3209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=77;PP=2102;ReadPosRankSum=0.132;SC=CCGCATCACTGTGCTGCCTGG;SOR=0.565;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=108;TCF=2;TCR=106;TR=79;WE=245179196;WS=245179178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,82:0.73:112
chr1	245222634	rs694793	C	G	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=0;PP=718;SC=TTGGAGAAACCTGGCCTTTTC;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=245222642;WS=245222624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr1	245222839	rs579269	G	T	2348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=58;PP=1817;SC=AATCCTTACCGGAAACTAAAA;SOR=3.026;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=12;TCR=58;TR=70;WE=245222847;WS=245222829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	245245378	rs10927386	T	C	4012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=59;PP=1924;SC=ACTTATTGAATGTTTAGGTAG;SOR=1.538;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=31;TCR=59;TR=90;WE=245245386;WS=245245368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr1	245245402	rs10927387	C	T	3904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=66;PP=2321;SC=AAGAAGAACCCACTGGATACA;SOR=2.520;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=17;TCR=66;TR=83;WE=245245410;WS=245245392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	245318688	rs12409851	C	T	4128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=47;PP=2965;SC=GATGTAGCGTCGGTGGAACCT;SOR=1.323;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=79;TCR=47;TR=126;WE=245318696;WS=245318678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	245674440	rs141156117	G	A	1948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.175;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=58;PP=1449;ReadPosRankSum=-0.861;SC=TGTAAGTAACGCAGTTATATA;SOR=0.400;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=117;TCF=21;TCR=96;TR=72;WE=245674448;WS=245674430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,76:0.63:120
chr1	245703819	rs7551348	T	C	1630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=5;PP=1315;SC=ACATCATTCTTTGTAAATCGT;SOR=4.003;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=47;WE=245703827;WS=245703809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr1	245703990	rs9919234	G	T	7706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=139;NR=82;PP=2965;SC=ACGAGGGGTTGTTTAAGAGAA;SOR=1.336;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=221;TCF=139;TCR=82;TR=221;WE=245703998;WS=245703980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr1	245765800	rs7541927	T	A	1139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=7;PP=922;SC=TGCATGTATATCGCAGAGTAT;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=245765808;WS=245765790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr1	245775407	.	T	TGAGA	83	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=5;MMLQ=28;MQ=47.23;NF=0;NR=4;PP=83;QD=21.5;SC=TGTGTGTGTGTGAGAGAGAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=245775415;WS=245775397;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
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chr1	245850095	rs871840	C	T	4952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.402;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=122;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.063;SC=AGGCCCAGGACGCAGGGAGCA;SOR=0.874;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=260;TCF=83;TCR=177;TR=178;WE=245850103;WS=245850085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,183:0.68:268
chr1	245851304	rs6701084	A	G	3996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=79;PP=2965;ReadPosRankSum=1.661;SC=GCAGGGCGACAGTCAGCCACT;SOR=0.381;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=135;TCF=55;TCR=80;TR=134;WE=245851312;WS=245851294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,135:0.99:136
chr1	246021941	rs2362587	T	C	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.924;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=834;ReadPosRankSum=0.246;SC=TGCTTATGATTGCCTGGCACA;SOR=0.789;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=125;TCF=70;TCR=55;TR=53;WE=246021949;WS=246021931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,52:0.40:131
chr1	246022071	rs2185370	C	T	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=239;ReadPosRankSum=0.223;SC=AGCACAGGAGCGAGGGAAGCA;SOR=0.728;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=15;WE=246022079;WS=246022061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr1	246027024	rs12123124	A	G	1661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.33;ReadPosRankSum=-0.928;SOR=0.778;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,45:0.39:116
chr1	246027029	rs61830203	A	T	1712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.28;ReadPosRankSum=-1.295;SOR=0.731;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,48:0.37:129
chr1	246027034	rs2153404	G	C	4953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=111;NR=19;PP=2962;SC=ACCTCATTACGACAGGGCTTC;SOR=3.327;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=112;TCR=19;TR=130;WE=246027042;WS=246027014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr1	246091456	.	ATG	A	2185.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=0.000;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=3.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.54;ReadPosRankSum=-0.158;SOR=0.241;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,54:0.73:74
chr1	246091457	rs6669768	T	C	321.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-5.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=3.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.219;SOR=1.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,20:0.27:74
chr1	246091457	.	TGCCAGGGG	CAGCAGGGA,CGCCAGGGG	2924	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=6,9;NR=35,57;PP=2924,1576;QD=20;SC=GTTGACAGGATGCCAGGGGTT;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=67;TCF=9;TCR=58;TR=41,66;WE=246091473;WS=246091447;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.61:67
chr1	246091459	.	C	CAG	2179.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=3.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.46;ReadPosRankSum=-0.091;SOR=0.241;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,54:0.73:74
chr1	246091465	rs2275317	G	A	2207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=3.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.95;ReadPosRankSum=-0.739;SOR=0.290;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,57:0.72:79
chr1	246091515	rs2275318	C	T	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=58;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=284;ReadPosRankSum=-0.761;SC=ACACCTCCCACGAAGTGCAAT;SOR=0.190;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=15;WE=246091523;WS=246091505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,15:0.31:49
chr1	246091531	rs6669866	T	C	1458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=36;PP=1161;SC=GCAATTCTCCTCAAGATGCAG;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=246091539;WS=246091521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr1	246093465	rs11295264	GA	G	721.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FS=0.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.011;QD=4.03;ReadPosRankSum=-2.150;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,64:0.36:179
chr1	246110573	rs10802300	A	G	1783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=7.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.535;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=9;PP=1398;ReadPosRankSum=2.301;SC=AAGAGCAAGTAGCTAAAGGAA;SOR=0.958;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=200;TCF=169;TCR=31;TR=68;WE=246110581;WS=246110563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,72:0.35:208
chr1	246489706	rs57404221	GA	G	943.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.057;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.997;NF=9;NR=30;PP=446;ReadPosRankSum=-0.698;SC=GGCTAGTGAAGAAAAAAAAAA;SOR=0.543;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=76;TCF=19;TCR=57;TR=39;WE=246489714;WS=246489696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,47:0.68:69
chr1	246489769	rs367922653	TA	T	59.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=3.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.49;ReadPosRankSum=0.802;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,9:0.22:40
chr1	246490438	rs3737245	T	C	4560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.54;SOR=3.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr1	246490438	.	TAACAACAAAATAAG	CAACGACAAAATAAA,CAACGACAAAATAAG	1689	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=49,76;NR=6,10;PP=1689,637;QD=31.8630522702;SC=TTTTTGTAACTAACAACAAAA;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=92;TCF=82;TCR=10;TR=55,86;WE=246490460;WS=246490428;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.60:92
chr1	246490442	rs3737246	A	G	4731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.50;SOR=3.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr1	246490452	rs3737247	G	A	2198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=2.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.79;ReadPosRankSum=0.895;SOR=1.075;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,79:0.68:117
chr1	246498866	rs10159376	A	C	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=595;ReadPosRankSum=-1.658;SC=ATAAACATTAAATTTTAATAG;SOR=0.489;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=26;WE=246498874;WS=246498856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr1	246670281	rs6671418	G	C	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=2;PP=1120;SC=GCGGCTGCCGGCCGCCCGACG;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=41;WE=246670289;WS=246670271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr1	246670298	rs150603688	CCT	C	74.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=0.027;QD=1.44;ReadPosRankSum=-1.893;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,8:0.15:52
chr1	246670333	rs6426303	A	G	2989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=19;PP=2476;SC=CGACTCAGGTAGGCGAGGGCG;SOR=2.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=70;TCR=19;TR=89;WE=246670341;WS=246670323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	246670481	rs7520453	C	G	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=7.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.46;ReadPosRankSum=-0.516;SOR=1.249;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,55:0.28:200
chr1	246704563	rs764243	C	T	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=421;ReadPosRankSum=-1.710;SC=TATCAGTTCACGGTGACAGAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=18;WE=246704571;WS=246704553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr1	246707816	rs3124119	T	C	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=451;ReadPosRankSum=-0.504;SC=TTATTCTTTTTACTCACCGTA;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=18;WE=246707824;WS=246707806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr1	246707858	rs3129568	A	G	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.782;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=594;ReadPosRankSum=0.210;SC=TGCGCCTCCCAAAACAGTGCT;SOR=0.267;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=34;WE=246707866;WS=246707848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,37:0.73:51
chr1	246711789	rs3124131	T	A	1267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.321;HP=11;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=6;PP=1407;ReadPosRankSum=2.579;SC=CCTAAAAAAATAAAATAAAAA;SOR=0.514;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=79;TCF=69;TCR=10;TR=51;WE=246711797;WS=246711778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,47:0.64:74
chr1	246711816	rs5782396	GA	G	793.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.337;HP=6;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=6;PP=924;ReadPosRankSum=-0.027;SC=CACGTAGGGAGAAAAAGGAAA;SOR=1.107;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=110;TCF=88;TCR=22;TR=36;WE=246711824;WS=246711806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,39:0.35:112
chr1	246712033	rs1890160	A	G	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=32;PP=981;SC=TTGGATTTAAAAGAAACATGT;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=246712041;WS=246712023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr1	246714426	rs12140400	A	G	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.63;ReadPosRankSum=-1.545;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr1	246714587	rs10754526	G	A	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.87;ReadPosRankSum=2.641;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,9:0.16:55
chr1	246714631	rs80342781	TG	AA	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.21;ReadPosRankSum=-1.143;SOR=0.578;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,8:0.17:46
chr1	246714636	rs34850511	T	A	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.40;ReadPosRankSum=-1.595;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,8:0.18:44
chr1	246714728	rs9426201	G	A	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=14;PP=437;SC=ACTAGAATTAGATGCAAAAAG;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=246714736;WS=246714718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr1	246720174	rs3120710	A	G	147.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=3;PP=89;SC=CCTTGGCATGAAACTTGGCTT;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=246720182;WS=246720164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	246720798	rs3124071	G	A	2767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=53;PP=2203;SC=AGTCACAGTGGATCACTCGTA;SOR=1.105;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=36;TCR=53;TR=89;WE=246720806;WS=246720788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr1	246727558	rs3120713	G	T	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=1;PP=361;SC=GATATTCTATGTAAAACACTG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=246727566;WS=246727548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	246755124	rs6702823	T	C	3585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=51;PP=2726;SC=GGTGAGAACTTGCAAAACACC;SOR=0.896;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=63;TCR=52;TR=114;WE=246755132;WS=246755114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr1	246903654	rs3007322	G	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.02;ReadPosRankSum=0.527;SOR=0.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,10:0.21:47
chr1	246929483	rs12144408	A	G	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.259;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=436;ReadPosRankSum=0.193;SC=TTTTTTATCTATGTTATATTT;SOR=1.321;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=66;TCF=9;TCR=57;TR=23;WE=246929491;WS=246929473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,24:0.36:67
chr1	246939610	rs3838991	A	ATATT	1670.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=1.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.171;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,48:0.30:162
chr1	246939856	rs3795465	G	A	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=778;ReadPosRankSum=-1.988;SC=ACCAGAAGCAGTTTTCGCAAG;SOR=0.672;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=119;TCF=52;TCR=67;TR=44;WE=246939864;WS=246939846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,45:0.38:120
chr1	246939943	rs6685364	T	C	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.847;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=744;ReadPosRankSum=0.499;SC=CTGCTCTAGCTTGAGCAGCTT;SOR=0.557;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=95;TCF=30;TCR=65;TR=36;WE=246939951;WS=246939933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,37:0.38:98
chr1	246940179	rs3795464	G	A	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=1.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.59;ReadPosRankSum=1.938;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,21:0.27:79
chr1	246940182	rs3795463	C	A	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.88;ReadPosRankSum=1.502;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,22:0.28:80
chr1	246940442	rs3795462	T	C	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=271;ReadPosRankSum=1.191;SC=CCCTGCTGGATGAGAACCCAG;SOR=0.527;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=15;WE=246940450;WS=246940432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr1	246943547	rs41267531	A	C	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=2;PP=712;ReadPosRankSum=-1.597;SC=TCTGGATTTTATGTGTGTGAC;SOR=0.572;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=29;WE=246943555;WS=246943537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,30:0.75:40
chr1	247006160	rs5021094	G	T	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.640;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=142;ReadPosRankSum=0.181;SC=AGGAATACTAGAGCCAAACAC;SOR=0.280;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=11;WE=247006168;WS=247006150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr1	247021266	.	C	CTTCT	128	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=15;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=65.19;NF=0;NR=6;PP=128;QD=22.1666666667;SC=ACACTTTCTTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=247021274;WS=247021256;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr1	247021269	rs77746851	T	C	78.18	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=67.64;QD=19.55;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	247025531	rs55727006	C	T	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=217;ReadPosRankSum=-1.492;SC=GCCTGTAATCCCTGCACTTTG;SOR=0.257;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=12;WE=247025539;WS=247025521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr1	247031237	rs2800222	C	G	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=46;ReadPosRankSum=1.697;SC=CGTGGTAATACTAGCTAAAAA;SOR=0.114;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=6;WE=247031245;WS=247031227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr1	247048834	rs2642990	T	C	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=0;PP=418;SC=GATAACATCGTTACCACTGGA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=247048842;WS=247048824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr1	247054530	rs1472275	T	C	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.334;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=1.294;SC=ATCTTTGTATTTAGTTTACTT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=247054538;WS=247054520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr1	247067492	rs34554106	AG	A	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.34;MQRankSum=0.792;QD=7.82;ReadPosRankSum=-1.368;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
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chr1	247091604	.	CAA	C	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=5.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.27;MQRankSum=1.750;QD=1.87;ReadPosRankSum=0.243;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr1	247094670	rs138217683	C	T	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-1.224;NF=5;NR=5;PP=147;ReadPosRankSum=-0.083;SC=TAACGAAGCCCGGCGCCCGCG;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=10;WE=247094678;WS=247094660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr1	247109014	rs2642982	G	C	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=557;SC=TCGGGCTGACGCAGCTGGACC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=247109022;WS=247109004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr1	247109267	rs2642983	A	C	4736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.361;NF=19;NR=90;PP=2965;ReadPosRankSum=1.613;SC=TGCCATTTCAAATTCACGCAG;SOR=1.716;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=19;TCR=91;TR=109;WE=247109275;WS=247109257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,114:0.99:115
chr1	247109291	rs111328919	CG	C	4125.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=68;PP=2965;SC=TGAGCCACTGCGCCCAGCCTC;SOR=3.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=4;TCR=70;TR=72;WE=247109304;WS=247109281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr1	247109296	rs41267541	A	G	3841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.94;NF=4;NR=58;PP=1767;SC=CACTGCGCCCAGCCTCTGAGA;SOR=4.062;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=4;TCR=60;TR=62;WE=247109304;WS=247109281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr1	247129945	rs1779985	A	G	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=366;SC=CTAATCAGCTAGGTATGGGGG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=247129953;WS=247129940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr1	247130577	rs4971282	C	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.465;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=44;ReadPosRankSum=-1.550;SC=TATTAAAAAGCCACTGGATTG;SOR=0.048;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=5;WE=247130585;WS=247130571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr1	247150740	rs3749427	T	C	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.400;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=531;ReadPosRankSum=-1.713;SC=GGTTAAAGGCTTTTCCACATT;SOR=1.176;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=86;TCF=41;TCR=45;TR=27;WE=247150748;WS=247150730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,29:0.32:92
chr1	247151557	rs2642992	A	G	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.197;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=33;PP=763;ReadPosRankSum=0.090;SC=AGAAGACAAAACTGGAAAAAA;SOR=0.475;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=106;TCF=12;TCR=94;TR=38;WE=247151565;WS=247151547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,42:0.37:113
chr1	247162658	rs2642973	C	T	9077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=189;PP=2965;SC=ACCTGAGTGTCTGGCTGTCTT;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=281;TCF=92;TCR=189;TR=280;WE=247162666;WS=247162648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr1	247202032	rs10924897	G	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.029;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=134;ReadPosRankSum=-0.365;SC=GTGGTTCTTAGTTGTTTTGTC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=7;WE=247202040;WS=247202022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr1	247241850	rs41305955	G	C	2829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=32;PP=2211;ReadPosRankSum=1.872;SC=CCGCTTCCTGGCGGTTCCCTT;SOR=0.523;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=55;TCR=32;TR=86;WE=247241858;WS=247241840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,91:0.99:92
chr1	247242027	.	C	T	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=1.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.47;ReadPosRankSum=-1.525;SOR=1.172;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,31:0.65:48
chr1	247242032	rs3806269	C	T	1854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.32;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr1	247267274	rs4925692	C	A	1777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=9;PP=1400;SC=CCCGACAGGGCTCCGGCCGGC;SOR=3.180;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=45;TCR=9;TR=54;WE=247267282;WS=247267264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	247274899	rs73135916	A	G	121.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.38;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	247287098	rs11356486	GA	G	51.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=2.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.94;MQRankSum=-5.440;QD=1.12;ReadPosRankSum=-3.151;SOR=1.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,6:0.13:46
chr1	247287256	rs12058911	T	A	1970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-3.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.738;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=3.384;NF=14;NR=70;PP=2962;ReadPosRankSum=1.756;SC=TGTGATGTGCTTTTAGCTGGG;SOR=1.538;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=198;TCF=53;TCR=145;TR=84;WE=247287284;WS=247287246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,87:0.42:205
chr1	247287260	rs3901383	A	G	2964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=9.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.27;MQRankSum=-3.306;QD=14.60;ReadPosRankSum=0.134;SOR=0.289;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,115:0.57:203
chr1	247287269	rs78802037	T	C	7352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.90;QD=39.74;SOR=2.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr1	247287276	rs148833748	A	T	1517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=0.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.25;MQRankSum=-4.012;QD=8.98;ReadPosRankSum=3.783;SOR=0.573;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,64:0.38:169
chr1	247322298	rs6675536	G	T	2420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=35;PP=1825;SC=CTCTTGTGAGGGCAAATTACC;SOR=0.850;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=42;TCR=35;TR=76;WE=247322306;WS=247322288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr1	247323244	rs77506010	G	T	1306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-6.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=41;PP=945;ReadPosRankSum=-1.491;SC=CTAGAACTATGACTCTGTCTA;SOR=0.578;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=70;TCF=4;TCR=66;TR=44;WE=247323252;WS=247323234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,48:0.65:74
chr1	247323260	rs9793102	C	A	2215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=51;PP=1394;SC=GTCTACACTTCCTTTCTCCCA;SOR=5.820;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=2;TCR=51;TR=53;WE=247323268;WS=247323250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr1	247365152	rs78194184	T	C	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=453;ReadPosRankSum=0.395;SC=TTTTACAGAGTTCCTTATCAA;SOR=1.453;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=20;WE=247365160;WS=247365143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr1	247365285	rs113974396	GGA	G	4391.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.594;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.708;NF=51;NR=38;PP=2964;ReadPosRankSum=-0.522;SC=GAAGAAAAGAGGAGACACATC;SOR=0.781;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=145;TCF=79;TCR=66;TR=89;WE=247365294;WS=247365275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,113:0.64:177
chr1	247365430	rs10754539	A	G	3910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=82;PP=2965;SC=AAAGGTGTCAACACAACCCTT;SOR=1.769;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=37;TCR=82;TR=119;WE=247365438;WS=247365420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr1	247471678	rs112741017	C	T	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=1;PP=808;ReadPosRankSum=-0.809;SC=CACATGCATTCAACACAACCA;SOR=1.094;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=32;WE=247471686;WS=247471668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,31:0.76:41
chr1	247485932	rs10924984	A	G	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=2;PP=710;SC=TCCTCAGAGCACCCGAGTAAG;SOR=4.977;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=33;WE=247485940;WS=247485922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr1	247486421	rs6692645	G	C	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=65;ReadPosRankSum=1.006;SC=GAGGCAAACAGGGGATTTTCA;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=6;WE=247486429;WS=247486411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr1	247486736	rs6426239	C	T	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.429;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=97;ReadPosRankSum=1.383;SC=TACAAAATGACGCACATGAAA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=247486744;WS=247486726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr1	247582401	rs199692916	A	T	1398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.002;HP=7;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=60.01;MQRankSum=0.016;NF=17;NR=40;PP=1035;ReadPosRankSum=-0.063;SC=GAAGACTTTTAAAAAAAATTG;SOR=0.446;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=91;TCF=26;TCR=65;TR=57;WE=247582409;WS=247582391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,58:0.62:93
chr1	247582463	.	TATA	T	552.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.56;MQRankSum=0.000;QD=20.48;ReadPosRankSum=1.429;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,24:0.89:27
chr1	247586772	.	C	G	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.327;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=362;ReadPosRankSum=0.135;SC=AATGCAAAGGCCTGTCTCAGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=16;WE=247586780;WS=247586762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr1	247587531	rs4925543	A	G	6376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=66;PP=2965;SC=TCCACTGTCGAGAGGTGAGCC;SOR=1.479;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=192;TCF=126;TCR=66;TR=192;WE=247587539;WS=247587521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr1	247588152	rs141637807	C	T	1882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.708;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=43;PP=1333;ReadPosRankSum=0.754;SC=TCTGGGGGCTCTGCTCTTTGG;SOR=0.495;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=183;TCF=64;TCR=119;TR=68;WE=247588160;WS=247588142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,76:0.40:191
chr1	247597329	rs12124866	C	T	43.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=55;SC=TCAGGTGTGTCCTGATGCTTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=3;WE=247597337;WS=247597325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	247597365	rs10925022	G	A	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=0;PP=740;SC=CTCTGGTCAGGTGTGTTCTGA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=247597373;WS=247597355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	247597629	rs72771997	C	T	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.103;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.032;NF=2;NR=36;PP=766;ReadPosRankSum=-0.244;SC=GTGCTGCGCACTCTGGCTTCA;SOR=1.405;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=110;TCF=10;TCR=100;TR=38;WE=247597637;WS=247597619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,39:0.35:111
chr1	247597656	rs3835304	TG	T	1331.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.008;NF=0;NR=44;PP=1463;ReadPosRankSum=-0.092;SC=CCCGGTGGGCTGGGGTTTGAG;SOR=1.644;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=73;TCF=1;TCR=72;TR=44;WE=247597664;WS=247597646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,46:0.68:68
chr1	247611514	rs112819557	T	C	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.515;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=135;ReadPosRankSum=-0.086;SC=GCCATCTTGGTCTCGGCGGCG;SOR=0.081;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=11;WE=247611522;WS=247611504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,10:0.23:43
chr1	247611592	.	TACA	T	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=29.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=-3.463;QD=0.62;ReadPosRankSum=-5.275;SOR=4.825;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,16:0.16:100
chr1	247611659	rs201053423	CAG	C	5361.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.365;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.861;NF=54;NR=58;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.058;SC=ACGACTCTGACAGAGTTATCT;SOR=0.808;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=172;TCF=79;TCR=93;TR=112;WE=247611668;WS=247611649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,136:0.68:201
chr1	247614386	rs12070953	T	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.859;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=0.565;SC=CCCCTTCATATCTTTATTTCT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=7;WE=247614394;WS=247614376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr1	247614407	rs12065526	G	A	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.050;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=144;ReadPosRankSum=-0.757;SC=CAGGGTGTAGGTGAAGGGATT;SOR=2.570;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=10;WE=247614415;WS=247614397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,11:0.28:40
chr1	247614553	rs12086048	C	T	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.738;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=780;ReadPosRankSum=0.483;SC=GGGAGGAACACGTCCCAAAGG;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=67;TCR=40;TR=43;WE=247614561;WS=247614543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,44:0.39:113
chr1	247614693	rs6695302	C	T	4464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=73;PP=2965;SC=GTGTCATTCACAGCGGTGTCA;SOR=0.874;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=137;TCF=64;TCR=73;TR=137;WE=247614701;WS=247614683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr1	247614896	rs11583410	A	C	2188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.723;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=36;PP=1772;ReadPosRankSum=0.608;SC=GGGCTTGCAGATGGCCACGTA;SOR=0.602;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=115;TCF=57;TCR=58;TR=74;WE=247614904;WS=247614886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,76:0.66:116
chr1	247615261	rs35305980	GA	G	4331.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.172;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.282;NF=47;NR=66;PP=2964;ReadPosRankSum=-0.376;SC=AGTCCCCTAAGAAGCTATGGT;SOR=0.422;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=181;TCF=71;TCR=110;TR=113;WE=247615269;WS=247615251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,134:0.65:206
chr1	247615340	rs55889481	C	T	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=6.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=-0.538;QD=4.77;ReadPosRankSum=-1.205;SOR=1.378;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,35:0.23:149
chr1	247615358	rs10925030	C	G	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=8.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=-0.500;QD=3.88;ReadPosRankSum=0.992;SOR=1.819;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,26:0.21:122
chr1	247654498	rs61070846	G	A	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.230;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=464;ReadPosRankSum=-0.321;SC=GGCCTGGACTGGAGAAAATTC;SOR=1.401;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=102;TCF=72;TCR=30;TR=28;WE=247654506;WS=247654488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,29:0.29:101
chr1	247690417	rs12404733	T	G	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.828;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=566;ReadPosRankSum=-0.347;SC=TCATTTTCTGTTAAGCATTTA;SOR=0.876;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=96;TCF=33;TCR=63;TR=34;WE=247690425;WS=247690407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,35:0.34:102
chr1	247694949	rs6702693	G	C	2664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=2.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.76;ReadPosRankSum=1.203;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,66:0.69:96
chr1	247694958	rs6702695	G	A	2753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=1.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.27;ReadPosRankSum=1.134;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,70:0.69:101
chr1	247695612	rs6657127	G	A	5766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=91;NR=81;PP=2965;SC=TCCAGGAAGGGGAGGTTGGCA;SOR=0.847;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=91;TCR=81;TR=172;WE=247695620;WS=247695602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr1	247695756	rs6697472	T	C	3780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=86;PP=2956;SC=GAGGGTCGTGTGGAGAAGCCC;SOR=1.900;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=37;TCR=86;TR=123;WE=247695764;WS=247695746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr1	247702172	.	G	C	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.119;ClippingRankSum=0.000;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=325;ReadPosRankSum=-0.835;SC=GCCTAATACAGATGGCTAATG;SOR=0.596;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=94;TCF=39;TCR=55;TR=25;WE=247702180;WS=247702162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,28:0.29:97
chr1	247712303	rs41315846	T	C	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.55;ReadPosRankSum=-0.083;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr1	247726822	rs142922665	CTTTT	C	978.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=11;PP=633;ReadPosRankSum=0.149;SC=CAACCAAATGCTTTTTTTGAA;SOR=0.739;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=92;TCF=48;TCR=44;TR=25;WE=247726833;WS=247726812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,30:0.27:111
chr1	247729206	rs367904043	CT	C	70.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQRankSum=-1.849;QD=3.22;ReadPosRankSum=-0.854;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr1	247752161	rs10925085	T	C	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.507;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=24;PP=671;ReadPosRankSum=1.111;SC=ACCCTCACCCTGCAGCTGCCC;SOR=0.528;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=117;TCF=52;TCR=65;TR=47;WE=247752169;WS=247752151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,46:0.38:120
chr1	247752650	rs35280339	AT	A	718.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.996;NF=0;NR=33;PP=464;ReadPosRankSum=-0.820;SC=ACTGTGATGAATTTTTTTTTT;SOR=1.697;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=0;TCR=58;TR=33;WE=247752659;WS=247752640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,37:0.69:54
chr1	247835352	rs1151641	C	T	1106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=0;PP=901;SC=GTATGAAAAACCAGTAAAATC;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=247835360;WS=247835342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr1	247835674	rs28446289	G	A	2873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=48;PP=2212;ReadPosRankSum=1.394;SC=GTGCGGATACGGAGAATAGCA;SOR=0.676;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=174;TCF=93;TCR=81;TR=103;WE=247835682;WS=247835664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,108:0.60:180
chr1	247835908	rs28556931	T	A	2108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.789;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=41;PP=1660;ReadPosRankSum=1.305;SC=GCAATAGCCATGACCATGCTG;SOR=0.381;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=111;TCF=46;TCR=65;TR=74;WE=247835916;WS=247835898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,75:0.66:113
chr1	247835950	rs1151640	T	C	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.864;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=486;ReadPosRankSum=0.683;SC=TGGTTCATAATAGTACTGTAA;SOR=0.997;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=92;TCF=45;TCR=47;TR=28;WE=247835958;WS=247835940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,28:0.30:92
chr1	247836008	rs28555391	G	A	1788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.848;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=31;PP=1420;ReadPosRankSum=-1.590;SC=CCATGGTGGTGAAGAGAACCA;SOR=0.483;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=94;TCF=46;TCR=48;TR=65;WE=247836016;WS=247835998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,65:0.70:93
chr1	247836207	rs28711149	T	A	2792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.651;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=41;PP=2162;ReadPosRankSum=-1.948;SC=GTTATAGATTTTGGCAATGAT;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=147;TCF=85;TCR=62;TR=100;WE=247836215;WS=247836197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,104:0.68:152
chr1	247875415	rs2282316	A	G	3998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.619;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=80;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.003;SC=TAGGAGACAAAGGTGATGAGG;SOR=0.864;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=221;TCF=102;TCR=119;TR=138;WE=247875423;WS=247875405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,146:0.63:230
chr1	247875608	rs6587382	C	G	1874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.696;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=36;PP=1466;ReadPosRankSum=0.181;SC=CGAAACCACACACCCAGGAGC;SOR=0.783;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=50;TCR=62;TR=65;WE=247875616;WS=247875598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,67:0.58:116
chr1	247875689	rs7512807	A	G	2136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.797;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=27;PP=1685;ReadPosRankSum=0.836;SC=AGATGGCAAGACAGCGGTCAT;SOR=0.813;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=102;TCF=61;TCR=41;TR=71;WE=247875697;WS=247875679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,73:0.70:105
chr1	247921100	rs1552812	T	G	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=14;PP=470;ReadPosRankSum=-0.049;SC=CCAATAGACCTCCTACTGCAA;SOR=0.714;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=116;TCF=63;TCR=53;TR=33;WE=247921108;WS=247921090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,34:0.28:121
chr1	247921352	rs1552813	C	T	3359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=40;PP=2722;SC=ATCTATCATACGCCATCACAC;SOR=1.265;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=64;TCR=40;TR=104;WE=247921360;WS=247921342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr1	247921717	rs10888359	C	A	1774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=44;PP=1392;SC=ATATTCCCAACAAATCTAGAA;SOR=3.139;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=9;TCR=44;TR=53;WE=247921725;WS=247921707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr1	247921789	.	AGT	A	141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.25;ReadPosRankSum=0.524;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr1	247978087	rs10888248	G	A	1622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=39;NR=7;PP=1330;SC=ATTGAAAGAAGAAAAGCAACA;SOR=3.126;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=46;WE=247978095;WS=247978077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr1	247978319	rs6695283	A	G	5620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=73;PP=2965;SC=TGGAAGGCAAATAGAGTAGGC;SOR=0.897;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=92;TCR=73;TR=165;WE=247978327;WS=247978309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr1	247978339	rs6681046	G	A	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.292;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=1054;ReadPosRankSum=-1.178;SC=CTTTTGACTGGCCTTCTGTGG;SOR=0.574;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=154;TCF=81;TCR=73;TR=59;WE=247978347;WS=247978329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,59:0.38:157
chr1	247978541	rs35979231	AAGG	A	4103.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.340;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.623;NF=29;NR=53;PP=2945;ReadPosRankSum=2.565;SC=ACAGTAGGATAAGGAGAAGGT;SOR=0.862;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=134;TCF=51;TCR=83;TR=82;WE=247978551;WS=247978531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,104:0.66:157
chr1	247978924	rs56958172	G	A	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.462;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=27;PP=822;ReadPosRankSum=0.368;SC=TCCCCATCAGGGCACACAAAT;SOR=0.353;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=157;TCF=56;TCR=101;TR=47;WE=247978932;WS=247978914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,49:0.30:162
chr1	247978996	rs10888249	A	G	2900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=60;PP=2384;SC=AAAACCCCATAAGGATAAATT;SOR=2.066;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=81;TCF=21;TCR=60;TR=80;WE=247979004;WS=247978986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr1	248004296	rs6681483	A	G	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.961;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=280;ReadPosRankSum=-0.523;SC=TGACCTTTCTAACAGCTTCTT;SOR=0.330;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=14;WE=248004304;WS=248004286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr1	248004614	rs6667389	G	A	4285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=59;PP=2962;ReadPosRankSum=0.862;SC=TGGTCACCTCGGTGATATAAA;SOR=0.661;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=228;TCF=140;TCR=88;TR=153;WE=248004622;WS=248004604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,156:0.67:232
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chr1	248004775	rs10888256	C	T	3991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-7.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.562;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=96;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.930;SC=ACCAACCTGGCACAGAGCCCA;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=211;TCF=71;TCR=140;TR=143;WE=248004783;WS=248004765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,149:0.68:218
chr1	248004848	rs4607924	G	C	2498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=53;PP=1912;ReadPosRankSum=-0.237;SC=CATAGGCCATGAAGGCCAGGA;SOR=0.737;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=127;TCF=44;TCR=83;TR=82;WE=248004856;WS=248004838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,88:0.66:134
chr1	248004877	rs10888257	C	T	2278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=3.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.64;ReadPosRankSum=0.407;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,79:0.68:116
chr1	248004884	rs1339845	T	C	4925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.38;SOR=1.207;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr1	248005213	rs7522811	G	C	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.227;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=26;PP=804;ReadPosRankSum=0.125;SC=TGTGGGGGATGAAAAACATTC;SOR=1.379;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=36;WE=248005221;WS=248005203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,39:0.61:64
chr1	248020448	rs10749636	G	A	136.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=106;SC=GACACCACCCGTCGGCGCCTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=248020456;WS=248020438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr1	248020556	rs11204523	G	C	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.845;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=718;ReadPosRankSum=-0.070;SC=GTCATGGCCTGGGCGCCGCCC;SOR=0.302;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=31;WE=248020564;WS=248020546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,32:0.71:45
chr1	248023966	rs3737277	C	T	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.063;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=399;ReadPosRankSum=0.232;SC=AGTTGGAGGACGCCTTGACTC;SOR=0.379;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=89;TCF=31;TCR=58;TR=30;WE=248023974;WS=248023956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,31:0.33:95
chr1	248024073	rs3737276	A	C	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=38;ReadPosRankSum=0.000;SC=GATTCGGGTCAGTAATTCTTC;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=6;WE=248024081;WS=248024063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr1	248028219	rs946696	G	A	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=332;ReadPosRankSum=0.000;SC=GCCAGCGCCCGGCCCTGGGTC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=13;WE=248028227;WS=248028209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr1	248039294	rs1339847	G	A	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.876;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=27;PP=969;ReadPosRankSum=0.422;SC=ATGGAGGGATGTCCCCAACAA;SOR=0.562;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=188;TCF=111;TCR=77;TR=60;WE=248039302;WS=248039284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,65:0.32:201
chr1	248039713	rs3811445	A	G	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=7.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.490;SOR=1.433;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,26:0.25:105
chr1	248058755	rs1337876	A	G	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=0;PP=889;SC=GCAACTCCATATAACTGTTGG;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=248058763;WS=248058745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr1	248058797	rs1856248	T	G	2143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=0;PP=1824;SC=ATAAAAAGCATAGAAGAATGC;SOR=8.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=59;TCR=0;TR=59;WE=248058805;WS=248058787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr1	248058845	rs4500353	A	C	3458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=10;PP=2965;SC=ATCAGCTGTTATTATTATTAT;SOR=4.262;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=102;TCF=92;TCR=10;TR=101;WE=248058853;WS=248058835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	248058879	rs6587387	A	T	4608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=103;NR=36;PP=2965;SC=TCTGTTCAGCAGCAGTAGAGA;SOR=2.093;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=103;TCR=36;TR=139;WE=248058887;WS=248058869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr1	248059423	rs10888267	C	T	2262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.950;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=49;PP=1609;ReadPosRankSum=0.811;SC=CCACTTCCTGCGTGAGATGCC;SOR=1.044;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=139;TCF=59;TCR=80;TR=80;WE=248059431;WS=248059413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,86:0.58:148
chr1	248059456	rs12135078	G	A	2393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.046;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=49;PP=1919;ReadPosRankSum=1.035;SC=GATGGCCTGCGTCAGCACTGT;SOR=0.702;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=138;TCF=68;TCR=70;TR=85;WE=248059464;WS=248059446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,87:0.61:143
chr1	248059476	rs12139390	A	C	2244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-7.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.411;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.760;NF=48;NR=42;PP=1743;ReadPosRankSum=-1.328;SC=TGGCCATCGAAGGCACCGTCT;SOR=0.357;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=142;TCF=81;TCR=61;TR=90;WE=248059484;WS=248059466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,90:0.62:144
chr1	248059703	rs11204545	T	A	2976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=6.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.63;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,78:0.62:126
chr1	248059712	rs11204546	T	C	2802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=4.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.59;ReadPosRankSum=-1.064;SOR=1.278;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,71:0.62:114
chr1	248059856	rs10888268	T	C	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=241;ReadPosRankSum=0.374;SC=CTGACTTCACTTCCATCCAGG;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=10;WE=248059864;WS=248059846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr1	248084434	rs11204563	G	A	2634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.82;QD=34.22;SOR=5.394;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	248084464	rs11204564	T	C	1670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.01;MQRankSum=-1.667;QD=32.13;ReadPosRankSum=1.436;SOR=4.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr1	248084471	rs149623571	A	G	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.27;MQRankSum=-2.925;QD=11.06;ReadPosRankSum=-0.281;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,15:0.33:46
chr1	248084473	rs143274587	C	A	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.32;MQRankSum=-2.968;QD=11.31;ReadPosRankSum=-0.734;SOR=1.319;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr1	248085108	rs4625315	C	T	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.95;QD=31.99;SOR=6.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr1	248085341	rs4925773	T	A	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=28;PP=802;SC=ACACTTTTATTTCTACATCTG;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=248085349;WS=248085331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr1	248112627	rs4925787	T	C	5928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=132;PP=2965;SC=TCAATGCTTGTGCTCACACTG;SOR=1.598;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=67;TCR=132;TR=199;WE=248112635;WS=248112617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr1	248112745	rs4925788	G	T	4221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.66;QD=32.23;SOR=1.187;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr1	248112762	rs4925789	TG	CA	5932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.09;QD=46.35;SOR=1.366;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr1	248112771	rs4925791	C	T	6355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.72;QD=42.37;SOR=1.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr1	248112809	rs4925583	A	G	7404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=57;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=119;NR=117;PP=2965;SC=TCATGTTCCTATGGCCAGGTT;SOR=0.764;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=236;TCF=119;TCR=117;TR=236;WE=248112817;WS=248112799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr1	248112836	rs4925792	A	G	7773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=134;PP=2965;SC=GCTGTCTACCACATGAAATCT;SOR=0.798;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=254;TCF=119;TCR=135;TR=253;WE=248112844;WS=248112826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr1	248129240	rs4478844	G	A	3402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=58;PP=2698;SC=ACTATCATTGGTGTGTCAGGA;SOR=0.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=46;TCR=59;TR=104;WE=248129248;WS=248129230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr1	248185824	.	G	A	2776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.970;ClippingRankSum=0.000;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.578;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=50;PP=2184;ReadPosRankSum=1.355;SC=ACAGACACCTGGGTCTATGAG;SOR=0.958;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=367;TCF=204;TCR=163;TR=122;WE=248185832;WS=248185814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:261,125:0.32:386
chr1	248343543	rs9435919	C	T	2609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=33;PP=2003;SC=CTTCAACTACCTGTCTGGCAG;SOR=0.948;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=40;TCR=33;TR=72;WE=248343551;WS=248343533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr1	248344442	rs4916105	C	T	251.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=147;SC=AATAAGGACACTAAAGTATTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=248344450;WS=248344432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr1	248366702	rs4916112	G	A	8334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=168;NR=88;PP=2965;SC=TTGGCTCTGAGTGCTTTCTTT;SOR=1.371;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=256;TCF=168;TCR=88;TR=256;WE=248366710;WS=248366692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr1	248367415	rs4916082	C	T	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=43;PP=1239;SC=CATAAATCTGCAATGACATAT;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=43;WE=248367423;WS=248367405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	248402758	rs6666148	C	T	3914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=65;PP=2965;SC=AAATTCATCACTTTTTCTGTG;SOR=0.862;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=55;TCR=65;TR=120;WE=248402766;WS=248402748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr1	248457979	rs6667171	C	A	5731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=99;PP=2965;SC=CCCCAGCCACCGTTTCAGGGC;SOR=1.071;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=173;TCF=74;TCR=99;TR=172;WE=248457987;WS=248457969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr1	248458676	rs6678138	T	C	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.81;MQRankSum=-0.970;QD=29.45;ReadPosRankSum=-0.912;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr1	248458689	rs6674940	A	G	932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.26;QD=33.31;SOR=6.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr1	248458717	rs12745228	C	G	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=8;PP=1154;SC=GTACATGGGCCTGTGGAGCCG;SOR=4.271;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=49;WE=248458725;WS=248458707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr1	248486895	rs4244184	G	T	3766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=86;NR=29;PP=2965;SC=AAAAGAAGACGTTAGCAGACA;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=86;TCR=29;TR=115;WE=248486903;WS=248486885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr1	248486913	rs4244185	A	G	3824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=41;PP=2903;SC=ACAGCAAAACATGAAATTTAT;SOR=1.793;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=133;TCF=90;TCR=43;TR=131;WE=248486921;WS=248486903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr1	248487638	rs7555310	A	G	4222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=85;PP=2965;SC=CATCTTGGGTACAGTGGTGCA;SOR=1.724;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=36;TCR=85;TR=121;WE=248487646;WS=248487628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr1	248487768	rs7555424	A	G	5556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=116;NR=39;PP=2965;SC=GCCACTGAAAAGATGGCCAGG;SOR=2.188;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=116;TCR=39;TR=155;WE=248487776;WS=248487758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr1	248512064	rs28372410	T	G	4400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=95;NR=34;PP=2965;SC=GGTCCAAGCTTCATCATCCAC;SOR=2.233;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=131;TCF=95;TCR=36;TR=129;WE=248512072;WS=248512054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr1	248512094	rs28728105	C	T	6063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=78;PP=2965;SC=ATTCAACCACCGTGATGGAAT;SOR=1.119;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=105;TCR=79;TR=183;WE=248512102;WS=248512084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr1	248512637	rs2039824	C	T	3291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=62;PP=2502;SC=AGCTCTCTTGCTCTGACACCT;SOR=1.300;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=36;TCR=62;TR=98;WE=248512645;WS=248512627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr1	248512749	rs28377739	G	A	2540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=34;PP=2065;SC=GACCGTGCTCGGGTTTCCAAG;SOR=0.934;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=44;TCR=34;TR=78;WE=248512757;WS=248512739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr1	248512767	rs28545014	G	T	2420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=32;PP=1848;SC=AAGAGGAGCAGACAGAACAAA;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=41;TCR=32;TR=73;WE=248512775;WS=248512757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr1	248513023	rs28607995	G	A	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=632;SC=TAAGAAACCCGAGAGGCTCAC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=248513031;WS=248513013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr1	248513088	rs28481429	G	C	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=190;SC=ATAATTGATTGTGGTTATTAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=248513096;WS=248513078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr1	248525638	rs34079073	CA	C	9290.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=118;PP=2957;SC=CCTATTTACTCATCCTCCTCA;SOR=0.929;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=193;TCF=74;TCR=119;TR=192;WE=248525646;WS=248525628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr1	248550976	rs6587467	T	G	7434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=125;NR=95;PP=2965;SC=TCACAATAAATGCTCAGGATT;SOR=0.999;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=220;TCF=125;TCR=95;TR=220;WE=248550984;WS=248550966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr1	248569282	rs28667896	A	G	1896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=1;PP=1630;SC=AGTAAATGCTAGATATCAGTC;SOR=8.015;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=51;TCR=1;TR=52;WE=248569290;WS=248569272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
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chr1	248617133	rs78191942	C	T	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=4.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.34;MQRankSum=-0.221;QD=4.07;ReadPosRankSum=-0.750;SOR=0.247;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,20:0.17:119
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chr1	248617153	rs140089153	C	CTG	506.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=7.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQRankSum=-0.139;QD=4.52;ReadPosRankSum=3.686;SOR=0.153;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,20:0.18:112
chr1	248636641	rs201256586	C	CTG	190.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=36.19;MQRankSum=-1.383;QD=31.79;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr1	248685253	rs9727474	T	C	3519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=56;PP=2721;SC=CCCAGCTCTATGTGGCCATGG;SOR=0.779;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=60;TCR=56;TR=116;WE=248685261;WS=248685243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr1	248737259	rs189248971	C	G	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.68;QD=27.19;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr1	248738133	rs373986839	A	G	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.53;MQRankSum=-6.412;QD=2.83;ReadPosRankSum=-2.754;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,19:0.18:107
chr1	248789454	rs1892441	G	C	4796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=43;PP=2965;SC=TCCTTAGGAAGCCTTATCCTC;SOR=1.826;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=98;TCR=43;TR=141;WE=248789462;WS=248789444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr1	248789504	rs1892442	T	C	5786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=74;PP=2965;SC=TGCTACTTTCTGAGCAGATGA;SOR=1.155;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=110;TCR=74;TR=184;WE=248789512;WS=248789494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr1	248790075	rs1892443	A	G	5784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=108;PP=2965;SC=GCCACGTAGCAGTCATAGGCC;SOR=1.018;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=191;TCF=83;TCR=108;TR=191;WE=248790083;WS=248790065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr1	248801480	.	A	G	31.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=31.54;QD=15.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr1	248801514	.	AC	A	278	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000;HP=6;HapScore=3;MGOF=81;MMLQ=23;MQ=42.72;NF=5;NR=2;PP=278;QD=44.1428571429;SC=ATCAGTCACCACCCCTGATGC;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=7;WE=248801574;WS=248801495;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,7:0.78:9
chr1	248801592	.	C	T	1896	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.53;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=98;MMLQ=28;MQ=44.79;NF=56;NR=18;PP=1896;QD=26.0915028723;SC=TCCCTGCTAGCCCTTCCTGAT;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=56;TCR=18;TR=74;WE=248801619;WS=248801582;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr1	248801778	rs201643849	A	T	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.54;QD=31.34;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr1	248801944	rs143010547	TCAGCACG	T	1846.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.28;QD=41.97;SOR=2.007;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr1	248813135	rs4916153	G	A	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=1;PP=1189;SC=GGTGGCATGTGGGTCACTTGT;SOR=6.439;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=45;WE=248813143;WS=248813125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr1	248813547	rs201161767	G	C	117.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.31;QD=29.26;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr1	248813901	rs144600224	A	T	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.78;MQRankSum=-1.769;QD=14.58;ReadPosRankSum=-0.644;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr1	248813972	rs147604785	G	A	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.40;MQRankSum=0.388;QD=22.24;ReadPosRankSum=1.535;SOR=2.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,24:0.75:32
chr1	248814052	rs28533004	T	A	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=3.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.15;MQRankSum=-0.306;QD=1.29;ReadPosRankSum=-0.783;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,9:0.17:54
chr1	248814080	rs1782242	A	C	1999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.15;QD=29.41;SOR=1.644;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr1	248814126	rs28418327	G	A	1732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.836;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.227;NF=31;NR=85;PP=2338;ReadPosRankSum=-1.070;SC=GGAAACGGGCGTTGCTGAACA;SOR=0.133;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=208;TCF=46;TCR=162;TR=116;WE=248814134;WS=248814116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,69:0.57:122
chr1	248845097	rs2000390	C	T	8395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=140;PP=2965;SC=GTGGATCACACTGGATCTGCA;SOR=1.027;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=252;TCF=111;TCR=141;TR=250;WE=248845105;WS=248845087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr1	248845411	rs11485825	G	A	5396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=98;PP=2965;SC=GATCCAAAACGGAGAGGTTCT;SOR=1.214;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=62;TCR=98;TR=160;WE=248845419;WS=248845401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr1	248845458	rs4509608	C	T	4302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=72;PP=2965;SC=AGATGCTGATCGAGAGTGATG;SOR=1.027;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=52;TCR=72;TR=124;WE=248845479;WS=248845448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr1	248845471	rs4575113	T	C	3673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=59;PP=2896;SC=GAGTGATGACTGCAATGATGA;SOR=0.726;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=57;TCR=60;TR=115;WE=248845479;WS=248845448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr1	248845499	rs4462184	A	G	3030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=41;PP=2367;SC=CCCCACCAGCACTGCCAGATA;SOR=1.029;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=56;TCR=41;TR=97;WE=248845507;WS=248845489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr1	249110906	rs4926508	G	C	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=812;ReadPosRankSum=1.438;SC=TTGGGTCCCAGCCCCTCTTGT;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=33;WE=249110914;WS=249110896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr2	41366	rs55798386	C	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=176;ReadPosRankSum=1.987;SC=CCTCTGGAAGCAACACTAGTT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=9;WE=41374;WS=41358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr2	45895	rs4241318	A	G	2081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=30;PP=1786;SC=GGTCTCGGGGATTGCGGGGTC;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=35;TCR=30;TR=65;WE=45903;WS=45885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	233416	rs300756	G	A	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=89;ReadPosRankSum=1.928;SC=AAAACAGGCCGGGGGAAGAAC;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=6;WE=233424;WS=233406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr2	264895	rs4854300	G	C	2449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=6;PP=2038;SC=GGGCAAGAGGGTGGCAGTGCG;SOR=4.323;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=67;TCR=6;TR=73;WE=264903;WS=264885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	271998	rs112400131	CA	C	856.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=2.162;QD=7.45;ReadPosRankSum=0.362;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,60:0.52:115
chr2	273070	rs12714403	A	G	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.282;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=255;ReadPosRankSum=0.468;SC=GGGGCTGTGAAGTCCTTCTTG;SOR=1.004;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=69;TCF=14;TCR=55;TR=19;WE=273078;WS=273060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,19:0.26:72
chr2	283231	rs368562757	A	AT	156.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.185;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=171;ReadPosRankSum=-0.412;SC=AATAAATCGCATTTTTTTGCA;SOR=0.042;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=10;WE=283239;WS=283221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr2	676177	rs2293083	C	G	3237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=71;PP=2472;SC=CTGCAATACACTGAACTCTCC;SOR=2.086;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=25;TCR=71;TR=96;WE=676185;WS=676167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr2	676457	rs2293082	G	C	3702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=12;PP=1047;SC=GCTGCAGCCCGGCACAGCCCT;SOR=3.638;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=83;TCF=71;TCR=12;TR=78;WE=676465;WS=676422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr2	676478	rs3215297	T	TGTAA	5293.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=15;PP=2967;SC=CCAGAACTCCTGTGTCACTAC;SOR=3.452;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=101;TCF=84;TCR=17;TR=91;WE=676486;WS=676468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr2	677213	rs3749138	G	A	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=2;PP=691;SC=GCCACAGGCCGGGTGCTCTGT;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=677221;WS=677203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	1079130	rs4971429	G	A	2309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=3.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.61;ReadPosRankSum=-1.086;SOR=0.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,57:0.73:78
chr2	1079130	.	GCG	ACA	2084	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=40;NR=4;PP=2084;QD=48.5788153378;SC=TGAGCAGGAGGCGTGCGTCAC;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=73;TCF=65;TCR=8;TR=44;WE=1079151;WS=1079120;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:29,44:0.60:73
chr2	1079132	rs4971430	G	A	2309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=1.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.24;ReadPosRankSum=-1.359;SOR=0.324;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,58:0.73:79
chr2	1079143	rs4971431	A	G	2855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=12;PP=2960;SC=TGCGTCACCTATCCCCACCCC;SOR=3.391;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=68;TCR=12;TR=80;WE=1079151;WS=1079120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr2	1079320	rs4971432	C	T	2579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=71;PP=2035;ReadPosRankSum=2.019;SC=TCTGTGTGGGCGGAAGCCACC;SOR=0.667;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=133;TCF=28;TCR=105;TR=91;WE=1079328;WS=1079310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,94:0.70:134
chr2	1161410	rs146999596	T	C	2038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=46;PP=1439;ReadPosRankSum=0.151;SC=TGGACTGGGATATTAATCATT;SOR=0.732;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=87;TCF=27;TCR=60;TR=66;WE=1161418;WS=1161400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,75:0.76:99
chr2	1168756	rs4597564	G	A	1357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.360;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=24;PP=984;ReadPosRankSum=0.312;SC=AATTGGAAGGGACTTCTCTTG;SOR=0.392;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=74;TCF=34;TCR=40;TR=49;WE=1168764;WS=1168746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,51:0.69:74
chr2	1168982	rs7560649	T	A	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=130;ReadPosRankSum=1.317;SC=GATAATTGTGTTAGTTTCAGA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=1168990;WS=1168972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr2	1241592	rs146197111	C	T	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=1;PP=777;SC=GCATCAGCCTCGAAACTCACG;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=1241600;WS=1241582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	1241883	rs35402865	G	A	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=29;PP=780;ReadPosRankSum=-1.475;SC=TGATTAACCCGAAACAGAAAA;SOR=1.022;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=7;TCR=44;TR=34;WE=1241891;WS=1241873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,36:0.67:54
chr2	1241944	rs28502413	G	C	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.836;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=348;ReadPosRankSum=-1.499;SC=CATTAAAAATGAAGCCATCAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=15;WE=1241952;WS=1241934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr2	1243312	rs28760535	T	C	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.37;ReadPosRankSum=0.527;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr2	1243318	rs28436921	C	T	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.30;ReadPosRankSum=1.860;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr2	1243608	rs28570180	A	C	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.954;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=33;PP=962;ReadPosRankSum=-1.657;SC=GTATTTTCTGATTCATGATGT;SOR=1.402;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=49;TCF=6;TCR=43;TR=37;WE=1243616;WS=1243598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,38:0.75:51
chr2	1243645	rs28411047	T	G	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=536;ReadPosRankSum=0.747;SC=CAGTCTCTGGTTTTTTGAAAT;SOR=0.968;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=23;WE=1243653;WS=1243635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,23:0.74:31
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chr2	1251088	rs55953201	C	T	1424.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.308;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=1665;ReadPosRankSum=-0.567;SC=GTAATTTTCACCCCTCTGCAG;SOR=0.257;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=22;WE=1251096;WS=1251077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,36:0.73:49
chr2	1263005	rs9330340	A	G	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=460;ReadPosRankSum=1.114;SC=GTAAAGTTTAATGTTACCAAT;SOR=2.400;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=18;WE=1263013;WS=1262995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr2	1263356	rs62106570	T	C	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=301;ReadPosRankSum=0.428;SC=CTGGACCCATTCTCCTGCCCT;SOR=0.569;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=13;WE=1263364;WS=1263346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr2	1271230	rs13023962	A	G	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=513;ReadPosRankSum=0.405;SC=TTGCTTCAGCATCGTGGCCGG;SOR=0.512;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=25;TCR=26;TR=33;WE=1271238;WS=1271220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,34:0.65:52
chr2	1320143	rs4927635	C	T	2301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.169;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=53;PP=1782;ReadPosRankSum=-1.189;SC=CAGATTGAGACGAAGGTATGC;SOR=0.517;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=149;TCF=57;TCR=92;TR=89;WE=1320151;WS=1320133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,89:0.60:148
chr2	1320300	rs35466197	A	G	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.27;ReadPosRankSum=-0.376;SOR=1.893;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr2	1320304	rs74994128	CG	AC	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.27;ReadPosRankSum=-0.734;SOR=1.893;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr2	1426940	rs28909374	G	T	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=175;ReadPosRankSum=0.020;SC=AAATGCCACCGACAGGCGCAT;SOR=0.446;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=11;WE=1426948;WS=1426930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr2	1437163	rs1473936	A	C	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.841;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=0;PP=683;ReadPosRankSum=-0.175;SC=AGTACCAAAGATACCATAGAC;SOR=2.362;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=68;TCR=3;TR=30;WE=1437171;WS=1437153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
chr2	1437204	rs78253418	C	A	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.298;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=4;PP=786;ReadPosRankSum=-0.329;SC=TCTTTATGTGCCATAGAAACC;SOR=1.442;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=125;TCF=106;TCR=19;TR=43;WE=1437212;WS=1437194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,44:0.34:131
chr2	1437410	rs4927578	C	T	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=5.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=28;PP=691;ReadPosRankSum=-0.836;SC=CACTGAGGAGCGGCAACTCCC;SOR=0.555;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=29;WE=1437418;WS=1437400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,31:0.65:48
chr2	1442381	rs76046082	C	A	126.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=93;ReadPosRankSum=-0.674;SC=CCCTCCTCCACGTCAGGGGGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=1442389;WS=1442371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr2	1442417	rs4425120	C	T	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=286;ReadPosRankSum=-0.134;SC=TGTGCAACATCGTGGGCATCC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=13;WE=1442425;WS=1442407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr2	1442476	rs1969248	T	C	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.817;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=1;PP=536;ReadPosRankSum=-0.683;SC=GGGGAATCCCTGAGCAAAGCC;SOR=1.347;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=79;TCF=73;TCR=6;TR=27;WE=1442484;WS=1442466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,27:0.34:79
chr2	1442551	rs34191654	AT	A	311.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=3.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.000;QD=3.32;ReadPosRankSum=-0.306;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,37:0.39:94
chr2	1457364	rs2070881	A	G	5562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=144;NR=32;PP=2965;SC=CTCCGGAGAGACCCCACTTAT;SOR=2.901;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=176;TCF=144;TCR=32;TR=176;WE=1457372;WS=1457354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr2	1459806	rs4927610	A	G	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=2;PP=499;SC=CTGCTACCACAGGGTCCTCCT;SOR=4.091;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=22;WE=1459814;WS=1459796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	1480734	rs115298811	A	G	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=377;ReadPosRankSum=1.108;SC=ACTGACCCCTACAGAGGACTG;SOR=0.561;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=79;TCF=73;TCR=6;TR=21;WE=1480742;WS=1480724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,24:0.30:81
chr2	1481155	rs2280132	G	T	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=243;ReadPosRankSum=1.949;SC=ACGCGCGCCTGCGGCCTGTGC;SOR=0.818;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=10;WE=1481163;WS=1481145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr2	1481231	rs2175977	G	C	262.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=5;PP=204;SC=GGCCGCGCCAGCGAGGTCCCC;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=9;WE=1481239;WS=1481221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	1488668	rs6715129	T	C	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.10;ReadPosRankSum=-0.634;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,4:0.14:28
chr2	1491420	rs28911483	C	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.765;NF=3;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=1.000;SC=GAGGCAGGAGCATGGCGTGAA;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=3;WE=1491428;WS=1491414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr2	1491497	rs6727192	T	C	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.863;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.304;NF=6;NR=1;PP=50;ReadPosRankSum=-1.081;SC=ACAGAAAGAATGAGACTCCGT;SOR=0.027;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=7;WE=1491518;WS=1491487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr2	1491723	rs78406347	G	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.391;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=204;ReadPosRankSum=-1.546;SC=TGGATCTGGCGTCCATCAACC;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=10;WE=1491731;WS=1491713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr2	1497442	rs9679267	A	G	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.523;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=194;ReadPosRankSum=-0.875;SC=GCAAACTGCCAGGCAGTGTCA;SOR=0.068;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=16;WE=1497450;WS=1497432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr2	1497831	rs10189329	G	A	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.485;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=504;ReadPosRankSum=1.208;SC=TATCCAGAGCGTCTTCCTTCA;SOR=0.144;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=58;TCF=1;TCR=57;TR=26;WE=1497839;WS=1497821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,26:0.45:58
chr2	1520676	rs1126799	T	C	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.536;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=317;ReadPosRankSum=-1.319;SC=CTCCCTCGGGTGACTTGGATC;SOR=0.169;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=70;TCF=61;TCR=9;TR=19;WE=1520684;WS=1520666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,22:0.29:76
chr2	1546327	rs1042589	C	G	4112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=83;PP=2962;ReadPosRankSum=0.226;SC=CAGGCAAATCCGAAATCAGCA;SOR=0.678;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=290;TCF=145;TCR=145;TR=166;WE=1546335;WS=1546317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,172:0.58:299
chr2	1642537	rs6729142	T	C	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.29;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	1642537	.	TGCTATACC	CGTTATACG,CGTTATATG	66	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=58.17;NF=3,7;NR=0,0;PP=18,66;QD=27.1559582874;SC=GGGAATAAAATGCTATACCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=3,7;WE=1642553;WS=1642527;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.25:12
chr2	1642539	rs6742040	C	T	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.77;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	1642544	rs116214231	C	T	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.12;ReadPosRankSum=0.522;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr2	1642545	rs6742039	C	G	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.78;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	1642803	.	CGGGTCTCATTTCAAGGTTTCCTGGGTGTGCACCGCCCCTGATGCTCTGAGCT	C	203.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.53;QD=40.75;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	1647171	rs6730800	T	C	2561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.969;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=21;PP=2060;ReadPosRankSum=0.155;SC=CCCGGAGGTCTACCCTGGGGA;SOR=2.225;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=81;TCF=59;TCR=22;TR=80;WE=1647179;WS=1647161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,82:0.99:83
chr2	1652822	rs1863135	T	G	2987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=49;PP=2401;SC=TGGATGCGTCTATGTAGGAGG;SOR=0.733;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=49;TCR=49;TR=98;WE=1652830;WS=1652812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr2	1664654	rs17841813	A	G	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.70;ReadPosRankSum=-1.892;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr2	1667310	rs12475392	G	A	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.435;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=512;ReadPosRankSum=0.580;SC=TGTCAGCTGCGGAATTCTGTG;SOR=1.503;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=92;TCF=73;TCR=19;TR=28;WE=1667318;WS=1667300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,30:0.31:98
chr2	1668710	.	A	T	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.680;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.817;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=293;ReadPosRankSum=0.277;SC=GAGCAGGCAAAGGGCCGGCCT;SOR=0.153;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=15;WE=1668718;WS=1668700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr2	1669931	.	G	T	1066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=0;PP=852;ReadPosRankSum=-0.287;SC=GCGAGCTAGTGGAGGGGTGAG;SOR=1.197;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=61;TCR=0;TR=36;WE=1669939;WS=1669921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,37:0.61:61
chr2	1696510	rs138859568	AAC	A	1004.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.147;NF=1;NR=20;PP=855;ReadPosRankSum=-0.269;SC=GAGGTGCAGGAACACACAGAG;SOR=0.910;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=21;WE=1696519;WS=1696500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr2	1813057	rs12988270	G	T	1306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.142;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=33;PP=957;ReadPosRankSum=1.843;SC=GCAAAAGGCTGTCTGAAAATG;SOR=0.049;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=54;TCF=9;TCR=45;TR=42;WE=1813065;WS=1813047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,45:0.79:57
chr2	1842968	rs6728368	T	C	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.863;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=582;ReadPosRankSum=-1.302;SC=AGCCGTCGCATCCTGGCGTGG;SOR=0.308;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=105;TCF=76;TCR=29;TR=35;WE=1842976;WS=1842958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,34:0.32:107
chr2	1843285	rs10196494	A	G	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.17;ReadPosRankSum=1.533;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr2	1844458	rs4381806	T	C	93.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=62;ReadPosRankSum=-0.524;SC=TGTTGACATATACTTGCTTTG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=4;WE=1844466;WS=1844448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr2	1844652	.	C	T	35	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=35;QD=23.2570708491;SC=CACCCCACACCGTTGATTTCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=3;WE=1844660;WS=1844642;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr2	1890173	rs4853824	A	G	177.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=138;SC=ATTCAATCCCATGTCTACATC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=1890181;WS=1890169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	1913874	rs2241684	C	A	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.172;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=124;ReadPosRankSum=-0.280;SC=GTCCTGGCCCCGGCTTCCAGC;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=7;WE=1913882;WS=1913870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr2	1926437	rs1529667	G	T	7427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=113;NR=107;PP=2965;SC=GCGTCCTTCCGGGGAAGTCCT;SOR=0.766;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=220;TCF=113;TCR=107;TR=220;WE=1926445;WS=1926427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr2	1926617	rs2241686	G	A	1439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FS=4.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.00;ReadPosRankSum=-0.665;SOR=0.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:211,77:0.27:288
chr2	1946646	rs7355555	A	C	1500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.558;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=20;PP=1052;ReadPosRankSum=-1.361;SC=ATTGACCAAGAAGAACAATTT;SOR=0.613;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=230;TCF=161;TCR=69;TR=66;WE=1946654;WS=1946636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,72:0.30:243
chr2	1946914	rs3748988	A	G	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.550;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=15;PP=659;ReadPosRankSum=-1.518;SC=CCCCTGGCTCATCATTGTCCT;SOR=0.317;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=118;TCF=86;TCR=32;TR=43;WE=1946922;WS=1946904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,42:0.37:115
chr2	1982877	rs2304007	T	G	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.968;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=285;ReadPosRankSum=-1.255;SC=TCATCAGGACTGGGTCCCCAA;SOR=0.895;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=85;TCF=57;TCR=28;TR=25;WE=1982885;WS=1982867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,24:0.27:88
chr2	1983374	rs2304008	A	C	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.517;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=596;ReadPosRankSum=-0.886;SC=ATCACAAGCGACCCTCTTCCA;SOR=0.868;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=124;TCF=58;TCR=66;TR=39;WE=1983382;WS=1983364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,39:0.29:133
chr2	1983395	rs2304009	C	T	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.76;ReadPosRankSum=-0.060;SOR=0.659;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,33:0.25:131
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chr2	3217777	rs11127386	A	C	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=407;SC=CCGCTCCCCCAACCCCACGAC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=3217785;WS=3217767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr2	3217908	rs11682452	G	C	3589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=31;PP=2788;ReadPosRankSum=1.841;SC=CTGTGTTGTTGCTTTTACTTA;SOR=0.883;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=79;TCR=32;TR=109;WE=3217916;WS=3217898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,113:0.99:114
chr2	3277947	rs2694081	T	A	1533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=1;PP=1322;SC=TACCCTTAAGTGGGGTGCACA;SOR=6.229;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=44;WE=3277955;WS=3277937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	3322555	rs62121538	T	C	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=504;ReadPosRankSum=0.732;SC=GGTGACGTGCTACTCCTCGAT;SOR=1.096;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=22;WE=3322563;WS=3322545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr2	3322700	rs75927199	G	A	3686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.250;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=49;PP=2802;ReadPosRankSum=-0.047;SC=TGAGCTACAGGAAGAATGCCA;SOR=0.567;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=184;TCF=114;TCR=70;TR=125;WE=3322708;WS=3322690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,132:0.69:192
chr2	3322797	rs12618407	C	A	2184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.878;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=70;PP=1768;ReadPosRankSum=0.515;SC=GGGTCCATAACATCTAATTTT;SOR=1.549;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=124;TCF=17;TCR=107;TR=78;WE=3322805;WS=3322787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,78:0.61:127
chr2	3342009	rs3811617	T	C	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=108;ReadPosRankSum=0.094;SC=AATAGTCACATGCACATTTCG;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=8;WE=3342017;WS=3341999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr2	3356849	rs4854122	A	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=51;ReadPosRankSum=1.047;SC=TATAACTTTCATAACTAATAA;SOR=0.291;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=8;WE=3356857;WS=3356839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,8:0.21:39
chr2	3356953	rs2875394	A	T	5069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=127;NR=26;PP=2965;SC=AAAAAGCATGATATGTTTAGG;SOR=3.215;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=127;TCR=26;TR=153;WE=3356961;WS=3356943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr2	3358458	rs146001084	ATTATGAAGTTAGAT	A	3275.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=41;PP=2974;SC=TTTAATAGAGATTATGAAGTT;SOR=3.198;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=51;TCF=3;TCR=48;TR=43;WE=3358479;WS=3358448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	3391826	rs11127423	C	T	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=153;ReadPosRankSum=0.789;SC=GCAGCGAAGCCGCGCGCCCGG;SOR=0.876;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=12;WE=3391834;WS=3391816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr2	3392075	rs10865541	T	C	10472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=150;NR=167;PP=2965;SC=TCGACTCCTTTACTACCTCCG;SOR=0.731;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=319;TCF=150;TCR=169;TR=317;WE=3392083;WS=3392065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr2	3392295	rs11686212	A	G	6199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=79;PP=2965;SC=CCTGAGCATGAGCGAGATGGA;SOR=0.969;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=182;TCF=103;TCR=79;TR=182;WE=3392303;WS=3392285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr2	3392513	rs12999423	TT	CA	10129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=89;NR=112;PP=2947;SC=CAGTGCCCCTTTAGGGATGGA;SOR=0.941;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=213;TCF=92;TCR=121;TR=201;WE=3392522;WS=3392503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr2	3393565	rs71396985	C	CAA	371.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.341;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=364;ReadPosRankSum=1.195;SC=GGAGGGCGGACGAGTTTTATT;SOR=0.204;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=11;WE=3393573;WS=3393555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,11:0.23:47
chr2	3425514	rs7558487	G	C	2226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=52;PP=1871;SC=GCACACTGACGTTGTCACCAT;SOR=2.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=13;TCR=52;TR=65;WE=3425522;WS=3425504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	3425948	rs10206964	T	C	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=311;SC=CCCGTCAGGATGCCTGTGCGC;SOR=2.670;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=3425956;WS=3425938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	3428508	rs10166880	T	G	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.168;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=668;ReadPosRankSum=1.597;SC=ATACATAATTTCGTAGCCTCA;SOR=3.955;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=27;WE=3428516;WS=3428498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr2	3460870	rs7579428	T	C	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=295;SC=GCACATACACTGTGGAATACT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=3460878;WS=3460868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	3463978	rs10182502	G	A	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=2.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.01;ReadPosRankSum=-0.318;SOR=1.018;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,29:0.25:115
chr2	3464169	rs10192109	C	T	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.073;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=94;ReadPosRankSum=1.688;SC=GTGGGAGCCGCGAGGGAGCCG;SOR=0.041;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=9;WE=3464177;WS=3464159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,9:0.26:35
chr2	3466665	rs193278916	G	A	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=3;PP=709;ReadPosRankSum=-0.167;SC=CCGTGGCTCCGCACATGATGG;SOR=0.403;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=33;WE=3466673;WS=3466655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,33:0.77:43
chr2	3466829	rs114714946	A	G	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=2.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.01;ReadPosRankSum=-1.054;SOR=0.967;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,20:0.22:93
chr2	3469278	rs4971513	C	G	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=348;SC=CTCTCTACACCGCGTCTGTAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=3469286;WS=3469268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	3469463	rs4971514	G	C	1898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.01;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=40;PP=1542;SC=GGATTTCCCTGCAGGTACCTG;SOR=1.498;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=21;TCR=40;TR=61;WE=3469471;WS=3469453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	3470115	rs7593516	T	C	6090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.14;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr2	3470124	rs7574517	G	A	6129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.78;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr2	3470186	rs11691759	G	C	3442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=64;PP=2706;SC=CCTGCGCTGAGCATTTCACCT;SOR=1.418;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=38;TCR=64;TR=102;WE=3470194;WS=3470176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	3470254	rs11677515	T	G	1910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=46;PP=1604;SC=GGTTAAGTGATATCCAGCTAC;SOR=3.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=53;WE=3470262;WS=3470244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	3481637	rs4535074	T	C	1958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=45;PP=1497;SC=CTTACTGAGTTGGAAAGCTCC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=21;TCR=45;TR=66;WE=3481645;WS=3481627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	3481659	rs4321399	G	A	2046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=53;PP=1656;SC=TAGAGAAGGCGCTTCTCCCTG;SOR=2.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=14;TCR=53;TR=67;WE=3481667;WS=3481649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr2	3481716	rs4535075	T	C	1247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=34;PP=1008;SC=CCAAGGAGTATACAGGTGTTT;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=3481724;WS=3481706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	3482796	rs11890651	T	G	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=43;PP=1436;SC=GGGCCTGCGCTCTCTCTCTCC;SOR=3.306;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=10;TCR=43;TR=53;WE=3482804;WS=3482786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	3482912	rs13431788	G	A	1191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=6;PP=1061;SC=CCCCTAACACGGCCCAGCACG;SOR=3.026;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=3482920;WS=3482906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	3483205	rs6767	C	T	4319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=94;PP=2965;SC=GGGACAGCTTCAACACACAGT;SOR=2.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=32;TCR=94;TR=126;WE=3483213;WS=3483195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr2	3483390	rs7569694	T	G	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=19;PP=530;SC=GCCCAGGACTTCCCCGCAGTT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=3483398;WS=3483380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	3488502	rs9752130	A	G	6461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=82;PP=2965;SC=AGATGCTGTCAGCCTCGCATC;SOR=1.194;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=211;TCF=129;TCR=82;TR=211;WE=3488510;WS=3488492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr2	3502709	rs10208494	A	G	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=342;ReadPosRankSum=0.294;SC=TTTACGAGGCACGTGTTAGTT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=20;WE=3502717;WS=3502699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr2	3502909	rs10627319	A	ACTT	6834.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=86;PP=2957;SC=CCTTCTACTTAGTATTTATTA;SOR=2.167;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=118;TCF=15;TCR=103;TR=99;WE=3502919;WS=3502899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr2	3502910	rs58219575	G	T	6843.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=86;PP=2965;SC=CTTCTACTTAGTATTTATTAA;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=35;TCR=101;TR=116;WE=3502919;WS=3502899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr2	3502932	rs10194787	G	A	1559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.513;HP=4;HapScore=2;MGOF=62;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=50;PP=1201;ReadPosRankSum=1.312;SC=ATATCAACTTGTTAACATTAA;SOR=1.263;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=105;TCF=19;TCR=86;TR=59;WE=3502940;WS=3502922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,63:0.57:110
chr2	3504290	rs6146601	GTGTACCTGCCGCCGCA	G	1283.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=20;NR=0;PP=2969;SC=GCTCGTGGGTGTGTACCTGCC;SOR=3.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=20;WE=3504313;WS=3504280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	3504687	rs9950	A	G	8856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.067;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=157;NR=152;PP=2965;ReadPosRankSum=0.638;SC=TGTCCCTCACATCGAAGTACC;SOR=0.275;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=311;TCF=157;TCR=154;TR=309;WE=3504695;WS=3504677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,309:1.00:310
chr2	3504819	rs34240449	A	G	3108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=81;PP=2499;SC=ACGCAAGCTCACACCCACCCA;SOR=3.235;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=16;TCR=81;TR=97;WE=3504827;WS=3504809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr2	3504893	rs35008570	G	GA	1294.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=37;PP=1570;SC=CCATAAAAATGAAACTACACT;SOR=5.994;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=38;WE=3504901;WS=3504883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	3518525	.	T	C	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.000;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.353;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=25;PP=1047;ReadPosRankSum=1.293;SC=TGGCAGTGAATCTAGCACACT;SOR=0.122;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=69;TCF=25;TCR=44;TR=45;WE=3518533;WS=3518515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,53:0.69:77
chr2	3523324	rs10179340	A	G	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.545;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=222;ReadPosRankSum=-0.539;SC=GCCGCGCTTTATCTTATAGGG;SOR=1.244;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=13;WE=3523332;WS=3523314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr2	3523444	rs6751350	C	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=127;ReadPosRankSum=0.869;SC=ATTCAAGCCCCGACCCTGTCC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=7;WE=3523452;WS=3523434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr2	3595834	rs13002108	C	A	1289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.021;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=45;PP=1052;ReadPosRankSum=1.272;SC=CTTCCCTTTCCCCTAACTTGT;SOR=1.946;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=66;TCF=2;TCR=64;TR=46;WE=3595842;WS=3595824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,49:0.71:69
chr2	3605468	rs12711976	A	G	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.581;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=28;PP=551;ReadPosRankSum=0.016;SC=CACAGGGTTTATTAGGCCACC;SOR=1.091;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=138;TCF=47;TCR=91;TR=40;WE=3605476;WS=3605458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,43:0.31:140
chr2	3625393	rs113127192	G	A	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.09;ReadPosRankSum=-1.639;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,14:0.22:63
chr2	3627648	rs7576238	G	C	4193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=75;PP=2965;SC=CTCTGGAGTTGCCCAGAGGGC;SOR=0.978;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=60;TCR=75;TR=134;WE=3627656;WS=3627638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr2	3652616	rs3769507	G	C	3286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=50;PP=2580;SC=TTCTGCAGGTGAGGCATGGGT;SOR=0.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=50;TCR=50;TR=100;WE=3652624;WS=3652606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr2	3653576	rs7604806	A	G	1569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=3;PP=1347;SC=TGATAAATGTACCTGCTTTAG;SOR=4.849;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=44;TCR=3;TR=47;WE=3653584;WS=3653566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
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chr2	3685074	rs3811527	A	G	1693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=47;NR=12;PP=1266;SC=GGAGGAGGCCACGGTGTCACC;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=47;TCR=12;TR=59;WE=3685082;WS=3685064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	3690849	.	C	G	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.947;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.736;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=56;ReadPosRankSum=-1.008;SC=TCCCTCCACTCCTGTGGAGGT;SOR=0.066;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=7;WE=3690857;WS=3690839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chr2	3721729	rs12105179	A	G	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=59;ReadPosRankSum=-2.949;SC=TTGTAAATTGACATTCTGCAA;SOR=0.986;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=6;WE=3721737;WS=3721719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr2	3726163	rs2043080	T	C	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.968;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=358;ReadPosRankSum=-1.160;SC=CAACGGTTCGTTCATCGAAGT;SOR=0.557;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=66;TCF=22;TCR=44;TR=25;WE=3726171;WS=3726153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,28:0.41:68
chr2	3729254	rs13426642	C	T	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.167;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=277;ReadPosRankSum=-0.564;SC=GAAAGAGGAACCAGGACAGGA;SOR=1.027;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=75;TCF=47;TCR=28;TR=21;WE=3729262;WS=3729244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,21:0.27:79
chr2	3749084	rs11689171	T	C	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.709;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.392;NF=31;NR=15;PP=811;ReadPosRankSum=0.909;SC=AAAATCACGCTGTGTTTTGCT;SOR=1.222;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=135;TCF=82;TCR=53;TR=46;WE=3749092;WS=3749074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,47:0.35:136
chr2	3749151	rs66473381	GGAA	G	1351.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.338;NF=6;NR=22;PP=1119;ReadPosRankSum=0.765;SC=TGACAACTCAGGAAGAAGAAG;SOR=0.686;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=90;TCF=20;TCR=70;TR=28;WE=3749161;WS=3749141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,38:0.37:104
chr2	3749267	rs11681270	G	A	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=118;ReadPosRankSum=1.070;SC=CTCAGACTGTGCTATTTCCCT;SOR=1.259;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=8;WE=3749275;WS=3749257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr2	3756073	rs17505481	G	A	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=152;ReadPosRankSum=-0.466;SC=TCGTTTCTAAGGAGTCTGGAA;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=8;WE=3756081;WS=3756063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr2	3774436	rs357940	C	T	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=4;PP=988;SC=TGGTCTGCCTCTCTCTGCATC;SOR=3.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=35;WE=3774456;WS=3774426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	3774448	rs12711970	T	C	1163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=4;PP=993;SC=CTCTGCATCCTTCCTGGACCC;SOR=3.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=36;WE=3774456;WS=3774426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	3774519	rs357941	T	C	2844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=26;PP=2073;SC=AGGGCAGTGCTGTGCACACTG;SOR=1.821;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=61;TCR=26;TR=87;WE=3774527;WS=3774509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr2	3815250	rs10180257	A	G	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=225;ReadPosRankSum=0.933;SC=TCTCTGAGGAACTTGTGTCTT;SOR=0.404;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=45;TCR=7;TR=14;WE=3815258;WS=3815240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,13:0.25:51
chr2	3815477	rs17017989	T	A	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.847;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=637;ReadPosRankSum=-0.888;SC=GCAGGTGACGTGCAGTTTCAT;SOR=0.175;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=68;TCF=16;TCR=52;TR=33;WE=3815485;WS=3815467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr2	3826324	rs13005405	C	T	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.055;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=331;ReadPosRankSum=-0.586;SC=TCTAGAAGGTCGCACTATTTC;SOR=0.255;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=68;TCF=64;TCR=4;TR=20;WE=3826332;WS=3826314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,20:0.29:69
chr2	3826387	rs13021385	T	C	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.659;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=15;PP=853;ReadPosRankSum=0.403;SC=TGATAAAATGTGGTGTATTTT;SOR=0.789;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=176;TCF=124;TCR=52;TR=54;WE=3826395;WS=3826377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,56:0.31:183
chr2	3826597	rs13035992	G	A	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.03;ReadPosRankSum=0.511;SOR=0.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,26:0.25:102
chr2	4135981	rs1024026	C	T	1078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=18;PP=851;ReadPosRankSum=-0.239;SC=CCTAGCATGTCAAGGCCAGAC;SOR=0.473;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=51;TCF=27;TCR=24;TR=36;WE=4135989;WS=4135971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,40:0.74:54
chr2	4136145	rs1024027	A	G	441.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5349;FS=2.754;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=325;ReadPosRankSum=0.649;SC=CTAGAAGTTTATGGACCAATG;SOR=1.863;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=15;WE=4136153;WS=4136135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
chr2	4672571	rs145852772	G	A	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.319;NF=5;NR=1;PP=82;ReadPosRankSum=0.319;SC=AAACACCAATGGAAATTTAGT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=6;WE=4672579;WS=4672561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr2	4672827	rs200724344	CCT	C	211.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.60;MQRankSum=1.645;QD=13.23;ReadPosRankSum=1.405;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr2	5834249	rs3841075	G	GTGA	396.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.445;NF=0;NR=11;PP=508;ReadPosRankSum=1.968;SC=AGTTGTAGTGGTGATGATGAT;SOR=0.241;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=11;WE=5834257;WS=5834239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr2	6980931	rs12617815	G	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=57;ReadPosRankSum=0.319;SC=GCTAGAACTGGGCCAGGGAGG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=6980939;WS=6980921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr2	7001225	.	ACACACACACG	A	810	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MMLQ=23;MQ=59.15;NF=16;NR=1;PP=810;QD=48.8823529412;SC=ATGTACGTATACACACACACG;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=17;WE=7001243;WS=7001214;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr2	7001233	rs3085147	ACG	A	2142.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.68;QD=42.01;SOR=3.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	7001249	rs202012587	ACACACACACC	A	113.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=0.619;QD=2.99;ReadPosRankSum=1.307;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,9:0.24:38
chr2	7001251	.	ACACACACC	A	751.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-0.495;QD=19.78;ReadPosRankSum=-1.169;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,29:0.76:38
chr2	7001259	.	C	A	1472	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=47;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=53;NR=11;PP=1472;QD=23.543300196;SC=ACACACACACCCACACACTTA;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=53;TCR=11;TR=64;WE=7001267;WS=7001249;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
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chr2	7005069	rs2595172	C	T	1494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=3;PP=1251;SC=AGAACCGGCTCTACAGACCAG;SOR=4.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=40;TCR=3;TR=43;WE=7005077;WS=7005059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	7005369	rs11678810	A	G	1749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=35;PP=1399;SC=GTGCCTCCTGACAGGCGCCCA;SOR=1.238;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=56;WE=7005377;WS=7005359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	7005992	rs4669108	C	T	904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=4;PP=765;SC=GGCAGGAGCCCTGGGGCTGGG;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=7006000;WS=7005982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	7017903	rs10182815	A	G	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=3;PP=1067;SC=TGGCATACAGAGACTGCTCTG;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=37;WE=7017911;WS=7017893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	7019079	rs6704746	A	G	3364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=43;PP=2589;SC=GATGAATTTCACAAAGCAATC;SOR=1.309;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=72;TCR=43;TR=115;WE=7019087;WS=7019069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr2	7027323	rs9917321	T	A	4956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=112;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.802;SC=CTTTTGCTGATTTCCTTCAAG;SOR=1.112;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=39;TCR=113;TR=151;WE=7027331;WS=7027313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,160:0.99:161
chr2	7046272	.	TACAC	T	441.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.32;QD=31.55;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	7076975	.	A	AGT	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQRankSum=-0.489;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.272;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr2	7130521	rs1622254	A	G	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.53;ReadPosRankSum=1.765;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr2	7130599	rs34954937	CATATA	C	406.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.12;ReadPosRankSum=0.523;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr2	7137067	rs364891	A	G	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=549;ReadPosRankSum=-0.107;SC=GATGACCACAACAAGGTACCG;SOR=0.368;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=23;WE=7137075;WS=7137057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,23:0.70:33
chr2	7154632	rs309325	T	C	5840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=78;PP=2965;SC=GATTAGAAACTGCAATTAGCT;SOR=1.110;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=186;TCF=108;TCR=78;TR=186;WE=7154640;WS=7154622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr2	7154826	rs3215278	AT	A	1669.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.030;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.837;NF=17;NR=48;PP=1002;ReadPosRankSum=1.311;SC=TCCTGTTTGCATTTTTTTTTC;SOR=0.434;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=102;TCF=24;TCR=78;TR=65;WE=7154835;WS=7154816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,78:0.76:103
chr2	7164483	rs6709878	C	T	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=7;PP=821;ReadPosRankSum=0.176;SC=AGAGTCCTCACGGCGTTTCTC;SOR=0.789;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=45;TCR=9;TR=40;WE=7164491;WS=7164473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,44:0.76:58
chr2	7170388	rs377057460	CTGTGTGTGTGTGTGTG	C	1263.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=2.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQRankSum=2.288;QD=19.75;ReadPosRankSum=0.601;SOR=1.591;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,41:0.64:64
chr2	7208324	rs1869298	G	T	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.908;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=363;ReadPosRankSum=1.137;SC=ACAAGTATCAGTGAGTAAGGT;SOR=0.863;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=76;TCF=32;TCR=44;TR=23;WE=7208332;WS=7208314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,26:0.32:82
chr2	7208339	rs147240722	T	C	1363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=28;PP=1018;ReadPosRankSum=-0.735;SC=TAAGGTTTTCTTTAACAGGGT;SOR=0.642;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=25;TCR=40;TR=46;WE=7208347;WS=7208329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,50:0.70:71
chr2	7208422	rs1869297	T	C	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=188;ReadPosRankSum=-0.722;SC=GGGTTGTTTATAACACATTTT;SOR=0.527;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=12;WE=7208430;WS=7208412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,13:0.32:40
chr2	7243449	rs10617957	AGTGTGT	A	3699.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.400;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.150;NF=68;NR=14;PP=2994;ReadPosRankSum=-1.451;SC=TGCATGAGTGAGTGTGTGTGT;SOR=0.122;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=160;TCF=131;TCR=29;TR=82;WE=7243464;WS=7243439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,100:0.72:138
chr2	7403641	rs111726098	T	TAC	398.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.847;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.510;NF=13;NR=5;PP=737;ReadPosRankSum=0.541;SC=CAGGTATAGATACACACACAC;SOR=0.148;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=63;TCF=52;TCR=11;TR=18;WE=7403649;WS=7403631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,18:0.32:57
chr2	7409989	rs10548278	TTG	T	1277.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.842;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.008;NF=2;NR=40;PP=1566;ReadPosRankSum=1.047;SC=GAACCCAGGTTTGTGTGTGTG;SOR=1.341;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=139;TCF=18;TCR=121;TR=42;WE=7409998;WS=7409979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,46:0.43:106
chr2	7421557	rs4668533	C	G	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=526;SC=TTGGCTCCAACTAGATGCACG;SOR=4.174;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=16;WE=7421578;WS=7421547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	7421778	rs4668534	A	T	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=32;PP=826;ReadPosRankSum=0.650;SC=TAGCTGCTGAAGCACGAAGCA;SOR=0.859;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=53;TCF=9;TCR=44;TR=39;WE=7421786;WS=7421768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,41:0.71:58
chr2	7421860	rs57998976	A	T	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5016;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=195;ReadPosRankSum=-0.137;SC=TGGTGGCCAGATTTCCTGCCA;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=9;WE=7421868;WS=7421850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr2	7471480	rs70942698	T	TCACACACA	322.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=2;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.319;NF=4;NR=0;PP=202;ReadPosRankSum=0.703;SC=TCTTTGTCTTTCACACACACA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=4;WE=7471490;WS=7471470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr2	7471732	rs6732990	G	A	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=277;SC=TCTGGAATGAGCTGTTCACAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=7471740;WS=7471722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr2	8822912	rs3845751	A	C	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.364;HP=24;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.797;NF=37;NR=12;PP=607;ReadPosRankSum=-0.986;SC=AAAAAAAAAAAAAAAACCCTT;SOR=0.076;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=142;TCF=123;TCR=19;TR=49;WE=8822925;WS=8822882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,48:0.33:146
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chr2	8910717	rs10929557	T	C	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=169;ReadPosRankSum=-0.665;SC=TATTATTTTGTATTGTCTGCT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=9;WE=8910725;WS=8910708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr2	8910987	rs12476359	A	T	2696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=73;PP=2170;SC=AAAAGCATTTAAAAATTAATA;SOR=4.099;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=9;TCR=73;TR=82;WE=8910995;WS=8910977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
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chr2	8916847	rs4669338	A	T	341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=284;SC=AAGCTTATTAACTATCATAGA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=8916855;WS=8916837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	8943291	rs2356658	G	A	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=35;PP=995;SC=AAAACAAAACGCAAGCCCAAG;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=8943299;WS=8943281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	8998624	rs10929559	A	G	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=0;PP=710;SC=TGGCCCACGGAGACATGGCAT;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=8998632;WS=8998618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	9419411	rs10193043	G	A	4599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=31;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.221;SC=TCTCAGCACAGACACGGTTTA;SOR=0.791;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=144;TCF=111;TCR=33;TR=140;WE=9419419;WS=9419401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,144:0.99:146
chr2	9458460	rs3811599	A	G	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=1;PP=460;SC=TAGACTTTTCATTAGCCCTCT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=9458468;WS=9458450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	9460234	rs17522163	G	A	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=11;NR=1;PP=328;SC=GAGAAAGAAAGGAAATGCCAC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=9460242;WS=9460224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	9467815	rs7569295	C	T	1526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=0;PP=1253;SC=GGAATCCAGGCGATACTAAGT;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=47;WE=9467823;WS=9467805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
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chr2	9484542	rs6724103	C	T	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=1;PP=998;SC=AGGGAAATTTCTCCAATTTTT;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=33;WE=9484550;WS=9484532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	9484561	rs79044067	TAAAA	T	2011.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=1;PP=968;SC=TTGTTGTTGTTAAAAAAAAAA;SOR=6.273;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=35;WE=9484572;WS=9484551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	9491017	rs4669385	C	T	2798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=80;PP=2346;SC=GCTTTGACCTCATTTCACGTA;SOR=6.666;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=82;TCF=2;TCR=80;TR=82;WE=9491025;WS=9491007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
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chr2	9547171	rs10929579	G	A	2396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=58;PP=1920;SC=GCCTGGGTCAGTGGAACCCAT;SOR=2.895;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=14;TCR=58;TR=72;WE=9547179;WS=9547161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	9552379	rs10929581	C	T	5255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=8;PP=2965;SC=CAGAGAGTTACGGAATTTTTT;SOR=4.822;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=117;TCF=108;TCR=9;TR=110;WE=9552391;WS=9552369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr2	9552383	rs112462761	A	AT	2490.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.826;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.462;NF=74;NR=9;PP=1049;ReadPosRankSum=-1.938;SC=GAGTTACGGAATTTTTTTTTT;SOR=2.670;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=129;TCF=110;TCR=19;TR=83;WE=9552391;WS=9552369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:9,104:0.92:113
chr2	9552537	rs201017480	G	A	2595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.788;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=75;PP=2115;ReadPosRankSum=0.367;SC=GCTTTGTCCTGAAGATGAAAG;SOR=0.853;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=150;TCF=32;TCR=118;TR=94;WE=9552545;WS=9552527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,93:0.64:146
chr2	9554255	rs10208358	G	A	2054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=4;PP=1682;SC=GTAAAACCACGTGAACATCAA;SOR=4.977;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=56;TCR=4;TR=60;WE=9554263;WS=9554245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
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chr2	9554461	rs10185646	C	A	6587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=155;PP=2965;SC=AACCCATTCACATCATTTATT;SOR=2.326;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=48;TCR=155;TR=203;WE=9554469;WS=9554451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr2	9569972	rs7589401	A	T	5085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=135;NR=12;PP=2965;SC=GGGTGATGGAACTAGAATTAT;SOR=4.804;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=135;TCR=12;TR=147;WE=9569980;WS=9569962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr2	9571054	rs2002044	C	T	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=629;SC=CTCTATATGGCATGTATGGTT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=9571062;WS=9571044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	9572888	rs12478467	A	T	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=507;SC=AAGTACTATTAAAAAAAAAAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=9572896;WS=9572878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	9576553	rs6432003	T	C	1087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=34;PP=940;SC=AAGATAATAATGTGGTCTTGG;SOR=4.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=38;WE=9576561;WS=9576543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
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chr2	9583922	rs11681316	A	G	2150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=64;PP=1808;ReadPosRankSum=1.306;SC=AGCCTTTCACATGCACTCGGA;SOR=5.610;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=66;TCF=1;TCR=65;TR=65;WE=9583930;WS=9583912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr2	9597276	.	ATGTG	A	45.25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.967;NF=0;NR=3;PP=92;ReadPosRankSum=0.967;SC=TGGAAAGTATATGTGTGTGTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=3;WE=9597287;WS=9597266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr2	9613289	rs2001658	T	C	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=18;PP=402;SC=ACTGCTAAATTGCTAATTAAT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=9613297;WS=9613279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	9615556	rs6432007	T	C	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=16;PP=381;SC=AGTGAGGCGGTGTGGCCTTCA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=9615564;WS=9615546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	9616035	rs7591166	A	G	284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=2;PP=216;SC=CCGAGAAAACAGAAGTTGCCA;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=9616043;WS=9616025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	9616301	rs3831465	TAGG	T	223.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=61.78;NF=0;NR=6;PP=240;SC=AATCAGTATATAGGAGAAGGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=9616311;WS=9616291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	9630231	rs6705408	C	T	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=433;ReadPosRankSum=-2.399;SC=TCACAAAATACAAGCTGTGAT;SOR=0.116;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=7;WE=9630252;WS=9630221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr2	9630244	rs3833563	AT	A	191.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.757;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=440;ReadPosRankSum=-1.817;SC=GCTGTGATTGATTTGTAGGTC;SOR=0.105;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=8;WE=9630252;WS=9630221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr2	9631340	rs10495562	T	C	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=302;ReadPosRankSum=-0.720;SC=GTGAGTACTATTTCATCACAG;SOR=0.955;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=15;WE=9631348;WS=9631330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr2	9631444	.	T	C	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=36;ReadPosRankSum=-0.385;SC=ACCCAAGCTTTAGTTATGCCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=9631452;WS=9631434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr2	9633137	rs4622692	T	G	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.730;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=454;ReadPosRankSum=2.069;SC=TCCAAACAGTTAATGTCTTGA;SOR=0.650;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=86;TCF=35;TCR=51;TR=28;WE=9633145;WS=9633127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,30:0.33:90
chr2	9634856	rs1048610	A	G	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.385;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=492;ReadPosRankSum=0.208;SC=CACAGCGGCCAGAAAGGTCCC;SOR=1.729;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=99;TCF=42;TCR=57;TR=31;WE=9634864;WS=9634846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,34:0.32:106
chr2	9642478	rs34367192	C	T	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=111;ReadPosRankSum=-0.924;SC=GCTACAGTTACGTTACAGTGA;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=7;WE=9642486;WS=9642468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr2	9642521	rs13031491	C	T	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=25;ReadPosRankSum=0.262;SC=CTCCTGGCTCCGTCACCCACT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=9642529;WS=9642511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr2	9650350	rs35431407	C	CATAA	232.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=200;ReadPosRankSum=-1.072;SC=TAAATAGAGCCTTATAATCAG;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=6;WE=9650358;WS=9650340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr2	9661184	rs4328603	T	C	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=4.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.84;ReadPosRankSum=0.233;SOR=0.057;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,9:0.20:46
chr2	9662410	rs35744046	T	C	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.108;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=138;ReadPosRankSum=0.952;SC=GACATATACATACACTATACC;SOR=2.424;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=10;WE=9662418;WS=9662400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,10:0.26:39
chr2	9770589	rs200302461	G	GCGGGGC	1865.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=1.388;NF=6;NR=24;PP=1663;ReadPosRankSum=-0.131;SC=CATGGCGGGCGCGGGGCCGGG;SOR=0.639;Source=Platypus;TCF=10;TR=30;WE=9770597;WS=9770579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,49:0.62:79
chr2	9981672	rs112717131	T	C	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.658;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=201;ReadPosRankSum=0.531;SC=TGCTTGAACCTGGGAAGCGGA;SOR=0.061;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=13;WE=9981680;WS=9981662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr2	9983529	rs114421205	GC	AA	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.500;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=314;ReadPosRankSum=2.235;SC=CCCCGAGCGCGCGGTTTCCCT;SOR=0.740;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=9;WE=9983538;WS=9983519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr2	9983582	rs62621835	C	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=5.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.98;ReadPosRankSum=-2.711;SOR=1.574;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,10:0.20:50
chr2	9983591	rs35818430	A	AG	1899.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=26;PP=1951;SC=TCCGGCCGGAAGCTTCTCCAG;SOR=0.818;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=38;WE=9983599;WS=9983572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	9983686	rs2303914	G	T	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.651;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=308;ReadPosRankSum=1.236;SC=CCTCGAGGAGGCGGTAAGGAG;SOR=2.448;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=14;WE=9983694;WS=9983676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr2	9983716	rs385513	A	C	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=537;SC=CTGGCGGGCCACGATCGCCGG;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=9983724;WS=9983694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	9985172	.	C	T	108	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=8;NR=0;PP=108;QD=17.8464015684;SC=TAGTTTAATTCGGTTTCATAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=8;WE=9985180;WS=9985171;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr2	9985247	rs76407483	A	T	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=7.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.819;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=8;PP=929;ReadPosRankSum=0.471;SC=ATTTTTTATTAATAAAGTTGC;SOR=0.218;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=133;TCF=117;TCR=16;TR=46;WE=9985255;WS=9985237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,46:0.35:132
chr2	9989442	rs16867195	A	G	1727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=20;PP=1424;SC=AAATACCTGGAAAAATGCTTA;SOR=1.118;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=30;TCR=20;TR=50;WE=9989450;WS=9989432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	9991556	rs287991	G	A	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=244;SC=TGGGTTAATTGAAAAAAAAAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=9991564;WS=9991546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	9994288	rs4669471	C	G	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=0;PP=900;SC=ATGCTACATACAGACCCCAGA;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=9994296;WS=9994278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	10008872	rs12623017	A	G	3675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=83;PP=2965;SC=GTCTTCAAAGAAAAGTTGTAG;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=22;TCR=83;TR=105;WE=10008880;WS=10008862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr2	10044941	rs450192	G	T	1608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=2;PP=1340;SC=TTAAAAATAAGTTTTGTTGCA;SOR=5.590;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=47;TCR=2;TR=48;WE=10044949;WS=10044931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	10045014	rs400917	C	T	5003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.51;SOR=2.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr2	10045024	rs396190	G	A	5043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.86;SOR=2.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr2	10045147	rs448327	A	G	4278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=93;PP=2965;SC=TAAGTGTGTGACATATATTGT;SOR=1.954;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=37;TCR=93;TR=130;WE=10045155;WS=10045137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr2	10050947	rs1054561	T	C	2268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=45;PP=1864;SC=ATCCTATAGCTAAAATGGCAA;SOR=1.545;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=66;WE=10050968;WS=10050937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	10050960	rs1054565	A	G	2198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=46;PP=1739;SC=AATGGCAAAAACTGTTAAGTA;SOR=1.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=65;WE=10050968;WS=10050937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	10051053	rs10495576	G	C	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=345;SC=GTAAGTGTACGTCAATTTTAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=10051061;WS=10051043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	10053412	rs12467598	C	T	9875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=117;NR=172;PP=2965;SC=ATGCACCTGCCTTACTTCTGT;SOR=1.124;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=289;TCF=117;TCR=172;TR=289;WE=10053420;WS=10053402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr2	10059097	rs2303921	A	C	1559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.189;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=20;PP=1236;ReadPosRankSum=0.241;SC=GAAATCTCAGATAGTGCTTCA;SOR=0.824;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=214;TCF=144;TCR=70;TR=65;WE=10059105;WS=10059087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,68:0.30:226
chr2	10059329	rs193108127	T	G	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=345;ReadPosRankSum=0.749;SC=AATGCTTAAGTTTTTTACTTT;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=17;WE=10059337;WS=10059319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr2	10059770	rs1820965	G	T	4762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=48;PP=2965;SC=CACTGGTCGAGTCAACAGCAA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=97;TCR=48;TR=145;WE=10059778;WS=10059760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr2	10094992	rs2303918	A	G	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=3;PP=751;SC=AGCTTATGATACCTTGCAGTA;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=10095000;WS=10094982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	10126123	rs1835424	A	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=-0.439;SC=ACCCTTTTTTAAAAAATGAGA;SOR=0.770;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=6;WE=10126131;WS=10126113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr2	10126330	rs2303920	G	A	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.038;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=543;ReadPosRankSum=-0.668;SC=TAACATTCAAGTTGATACCTA;SOR=0.278;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=96;TCF=38;TCR=58;TR=35;WE=10126338;WS=10126320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,35:0.36:96
chr2	10126416	rs16867274	A	G	1372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=40;PP=1113;SC=ACAAGGTAAGATCGGCAGGGA;SOR=4.223;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=44;WE=10126424;WS=10126406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	10130973	rs12475243	T	G	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.528;NF=4;NR=23;PP=448;ReadPosRankSum=0.862;SC=GGCTGGAGTTTGCACGCAGAA;SOR=0.599;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=87;TCF=13;TCR=74;TR=27;WE=10130981;WS=10130963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,27:0.31:88
chr2	10133284	rs12618788	C	T	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.307;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=152;ReadPosRankSum=-0.562;SC=TCATTTATGGCCAAACATTTT;SOR=0.287;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=11;WE=10133292;WS=10133274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr2	10133728	rs6711126	T	C	2132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=31;PP=1671;ReadPosRankSum=1.454;SC=CAAATATTTTTGAAGATTACA;SOR=0.655;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=117;TCF=72;TCR=45;TR=79;WE=10133736;WS=10133718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,80:0.67:120
chr2	10133820	rs6750565	C	T	2119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=61;PP=1672;ReadPosRankSum=-1.969;SC=GCAGGGATGTCATAGAGGCCA;SOR=0.786;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=25;TCR=90;TR=78;WE=10133828;WS=10133810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,79:0.68:117
chr2	10133843	rs12472800	C	T	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=452;ReadPosRankSum=1.049;SC=CTGGGTTCTCCGTGTGTCCTA;SOR=0.829;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=74;TCF=11;TCR=63;TR=25;WE=10133851;WS=10133833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,27:0.35:77
chr2	10135855	rs11674576	T	C	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=569;ReadPosRankSum=0.000;SC=GATCTTCCTTTAGCCTGATTT;SOR=1.839;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=23;WE=10135863;WS=10135845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr2	10135956	rs41264205	G	A	3521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.945;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=29;PP=2800;ReadPosRankSum=1.054;SC=CCTTAATGTTGATGCAGCTGG;SOR=1.306;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=181;TCF=132;TCR=49;TR=125;WE=10135964;WS=10135946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,130:0.69:189
chr2	10138991	.	CGT	C	73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=93;MMLQ=28;MQ=55.68;NF=2;NR=0;PP=73;QD=48.0;SC=CATATATATACGTATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=10139000;WS=10138981;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	10139015	.	T	TATAC	530	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=2;HapScore=3;MGOF=17;MMLQ=28;MQ=60.92;NF=11;NR=0;PP=530;QD=49.8181818182;SC=CACATATATATACATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=10139025;WS=10139005;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr2	10139017	.	C	T	343	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=2;HapScore=3;MGOF=17;MMLQ=28;MQ=60.83;NF=10;NR=0;PP=343;QD=37.7771212547;SC=CATATATATACATATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=10;WE=10139025;WS=10139005;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,10:0.71:14
chr2	10140651	rs2163338	A	G	1908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=13;PP=1511;SC=GAGAGCTAACAGGTCAATCTA;SOR=2.602;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=65;TCF=51;TCR=14;TR=64;WE=10140659;WS=10140641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	10183748	rs372827624	TGCC	T	169.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=205;ReadPosRankSum=0.210;SC=AGCTCCGGGTTGCCGCCGCCG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=10183758;WS=10183738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr2	10188649	rs11687357	A	T	4245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=85;PP=2965;SC=GGAACTATGTATGCAGCTTCC;SOR=1.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=38;TCR=85;TR=123;WE=10188657;WS=10188639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr2	10220091	rs180700353	G	A	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.96;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr2	10225241	rs6432058	C	T	1932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=6;PP=1394;SC=CTGAGTAAGACGATGTTTGTG;SOR=3.877;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=50;TCR=6;TR=56;WE=10225249;WS=10225231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	10226306	rs34098251	G	GC	3894.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=75;PP=2957;SC=GAATAGACCAGCGAGCTCTGA;SOR=1.893;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=15;TCR=78;TR=89;WE=10226314;WS=10226296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	10262920	rs1130609	T	G	2041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.225;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=49;PP=1530;ReadPosRankSum=-1.728;SC=TCGCTGCGCCTCCACTATGCT;SOR=0.328;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=116;TCF=33;TCR=83;TR=72;WE=10262928;WS=10262910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,77:0.63:122
chr2	10264057	rs6432065	T	C	3084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=97;PP=2473;ReadPosRankSum=-1.788;SC=TCGTCTTGTATGTTTTTCCAT;SOR=0.673;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=202;TCF=48;TCR=154;TR=128;WE=10264065;WS=10264047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,129:0.63:206
chr2	10281903	rs5829249	G	GC	959.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=6;PP=941;SC=GGTGGCCATGGCCTGGGGCTG;SOR=2.147;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=22;WE=10281911;WS=10281897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	10282147	rs11896140	T	C	2553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=56;PP=2018;ReadPosRankSum=0.422;SC=GCTATGCCCCTTGCTCTTTCA;SOR=0.664;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=52;TCR=87;TR=90;WE=10282155;WS=10282137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,92:0.65:142
chr2	10332876	rs56228505	AC	A	422.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=1;NR=13;PP=305;SC=CTGCCACTCCACCCCCCCCTG;SOR=4.047;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=14;WE=10332884;WS=10332866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	10350599	rs7423163	G	C	1414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.770;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=30;PP=1044;ReadPosRankSum=-0.148;SC=TTATCTGGGTGGGAACTCACC;SOR=0.547;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=44;TCR=50;TR=57;WE=10350607;WS=10350589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,60:0.60:100
chr2	10563233	rs2270304	G	A	2498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=59;PP=2048;ReadPosRankSum=-0.237;SC=GGGTGGGGGCGGGGCTGCATG;SOR=0.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=43;TCR=84;TR=89;WE=10563241;WS=10563223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,91:0.71:128
chr2	10563297	rs2270305	G	A	1415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.033;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=51;PP=1184;ReadPosRankSum=1.674;SC=CCTCCCCTCTGCAGCTTCTTG;SOR=2.602;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=68;TCF=2;TCR=66;TR=52;WE=10563305;WS=10563287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,53:0.78:68
chr2	10564528	rs11674615	C	T	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.454;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=7;PP=1046;ReadPosRankSum=-0.167;SC=TGAGGCTGTCCGCTCCTCGTG;SOR=0.368;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=64;TCF=55;TCR=9;TR=45;WE=10564536;WS=10564518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,48:0.72:67
chr2	10595534	rs6721235	T	C	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.570;SOR=0.689;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,29:0.25:114
chr2	10717714	rs12473957	G	C	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.567;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=5;PP=506;ReadPosRankSum=-0.637;SC=CTATTGAAAGGCTATTTTTCT;SOR=0.384;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=112;TCF=97;TCR=15;TR=32;WE=10717722;WS=10717704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,32:0.28:116
chr2	10729897	rs759403	C	T	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.457;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=387;ReadPosRankSum=-0.883;SC=GGAAAAAGTACGTAAAAATTT;SOR=1.697;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=20;WE=10729905;WS=10729887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr2	10762302	rs70953325	TA	T	4696.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=81;PP=2951;SC=GGTAAACAGTTAACACAGGAA;SOR=1.501;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=23;TCR=82;TR=103;WE=10762310;WS=10762292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr2	10774531	rs77767350	C	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.788;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=81;ReadPosRankSum=-0.573;SC=AACAAGGCTTCAGCTGAAATG;SOR=1.730;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=6;WE=10774539;WS=10774521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr2	10799467	rs147521601	TGGG	T	782.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.523;NF=1;NR=20;PP=340;ReadPosRankSum=1.657;SC=TCAAATCTAATGGGGGGGGGG;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=21;WE=10799477;WS=10799457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,21:0.84:25
chr2	10808776	rs55925118	C	CAA	1357.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=15;PP=1267;SC=ATTACTAAAACTACTCACGCA;SOR=0.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=24;WE=10808784;WS=10808766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	10813782	rs6748766	T	C	1135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=31;PP=937;SC=AGAAATTATATACATACCAGT;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=10813790;WS=10813772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	10908893	rs1198849	A	G	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.846;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=568;ReadPosRankSum=-1.456;SC=GGCCGCCTACAACACTCTGAA;SOR=1.157;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=109;TCF=40;TCR=69;TR=36;WE=10908901;WS=10908883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,38:0.34:113
chr2	10911891	rs1198850	T	C	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.948;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=93;ReadPosRankSum=0.956;SC=AGTGCCCGGGTGTGGGTGTGT;SOR=0.157;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=8;WE=10911899;WS=10911881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr2	10912092	rs12999992	C	T	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=27;PP=627;ReadPosRankSum=-0.149;SC=CGAAGGAAACCGGCCCTGCCC;SOR=0.796;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=62;TCF=13;TCR=49;TR=34;WE=10912100;WS=10912082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,35:0.56:63
chr2	10912634	rs189760105	C	A	3668.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.400;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=43;PP=2834;ReadPosRankSum=-0.799;SC=GCCTTTTCTGCAAAAAATCAC;SOR=1.238;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=210;TCF=132;TCR=78;TR=130;WE=10912642;WS=10912624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,136:0.62:219
chr2	10915020	rs2969881	A	G	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.705;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=574;ReadPosRankSum=0.246;SC=AGGGTCCTCCAGGTTTGGTTC;SOR=0.828;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=134;TCF=68;TCR=66;TR=39;WE=10915028;WS=10915010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,39:0.28:138
chr2	10922516	rs1686482	A	C	1801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=47;PP=1454;SC=GTATCCAGAAACAGCAGTATT;SOR=4.615;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=4;TCR=47;TR=51;WE=10922524;WS=10922506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	10924524	rs1198873	T	C	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=29;PP=669;SC=TCTCATTTTATGGAAGAGCGA;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=10924532;WS=10924514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	10927345	rs1686510	T	C	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=2;PP=488;SC=GTTCCAAATATAAACCTACAA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=10927353;WS=10927335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	10928694	.	GA	G	269.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=2.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.40;MQRankSum=-0.240;QD=10.37;ReadPosRankSum=0.699;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr2	10928710	rs1734433	A	C	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-2.401;NF=32;NR=1;PP=1012;ReadPosRankSum=2.745;SC=AAAAAAAAACATATAGCAGAG;SOR=1.329;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=33;WE=10928718;WS=10928700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,31:0.86:36
chr2	10928777	rs2952626	A	C	3621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=23;PP=2810;SC=GAAAGCCTATAATCAGCTGTT;SOR=2.691;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=84;TCR=23;TR=107;WE=10928785;WS=10928767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr2	10928906	rs1734432	T	C	3631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=64;PP=2870;SC=CTGATTTAAATAGACAAAGTT;SOR=1.189;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=41;TCR=64;TR=105;WE=10928914;WS=10928896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr2	10928962	rs1734431	A	G	3409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=56;PP=2708;SC=ATCCATTTAGAAAGTATTCTC;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=40;TCR=56;TR=96;WE=10928970;WS=10928952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr2	10929133	rs1734430	A	G	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=15;PP=452;SC=GACAAGGGACAATCAGGAGGC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=10929141;WS=10929123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	10929867	rs11904084	T	C	4775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=69;PP=2965;SC=GCAGTTGAAGTGGTTTACCTC;SOR=0.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=84;TCR=69;TR=153;WE=10929875;WS=10929857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr2	10929938	rs138712410	G	A	2954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.154;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=56;PP=2218;ReadPosRankSum=0.089;SC=ACACGATGTCGGATCTTGTCC;SOR=0.566;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=155;TCF=78;TCR=77;TR=108;WE=10929946;WS=10929928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,111:0.70:159
chr2	10930050	rs1686514	A	T	2588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=73;PP=2103;SC=AAATCCAATTAACACTTAATG;SOR=4.539;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=7;TCR=73;TR=80;WE=10930058;WS=10930040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr2	10930106	rs200934850	ATTTT	A	718.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=18;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=261;SC=CTTATAGGTAATTTTTTTTTT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=14;WE=10930117;WS=10930096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	10930903	rs4807	T	C	7842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=188;PP=2965;SC=CAGTTTCACTTTTCCTTTCGT;SOR=2.720;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=239;TCF=51;TCR=188;TR=238;WE=10930911;WS=10930893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr2	10931001	rs1614107	A	G	1235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=31;PP=932;SC=TTTGAGACACAGTCTCTCTCT;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=10931009;WS=10930991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	10932082	rs1734421	T	C	2801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=72;PP=2295;SC=CATCAAACAATTGGGCCAAGA;SOR=7.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=73;TCF=1;TCR=72;TR=73;WE=10932090;WS=10932072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	10933249	rs4799	C	T	4209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=89;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.871;SC=ATCCTCCGCTCCGTCCCCCGA;SOR=0.738;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=134;TCF=44;TCR=90;TR=132;WE=10933257;WS=10933239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,137:0.99:138
chr2	10933346	rs143770934	T	TAGGC	1473.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=26;PP=1437;SC=AGACGGAAGGTAGGCGGTCCT;SOR=5.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=26;WE=10933354;WS=10933336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	10937037	rs1734343	T	G	1127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=0;PP=938;SC=GTGACACATATTTCATCTTCA;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=10937045;WS=10937027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	10937065	rs1734344	T	C	1326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=0;PP=1119;SC=TCGGAGGGTATAGGAATCACT;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=41;WE=10937073;WS=10937055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	10937409	rs1686444	C	T	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=26;PP=767;SC=ATCTGCTTCACATAGACTCAG;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=10937417;WS=10937399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	10938043	rs56346617	T	G	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=198;SC=GGGCACGGTGTCTCACGCCTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=10938051;WS=10938033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	10942567	rs1686434	G	A	1913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=0;PP=1609;SC=TTTATACAGCGTTTTCTCCAA;SOR=8.121;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=56;TCR=0;TR=55;WE=10942575;WS=10942557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	10942687	rs4758	C	T	8627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=178;NR=88;PP=2965;SC=GGTTGAAATTCGATGGAGTTA;SOR=1.699;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=266;TCF=178;TCR=88;TR=266;WE=10942695;WS=10942677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr2	10950284	rs1734449	G	C	2547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=4;PP=1997;SC=CATATATTAAGTCATTTAAGA;SOR=5.058;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=72;TCF=68;TCR=4;TR=72;WE=10950292;WS=10950274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	10952790	rs6726687	T	C	2126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=27;PP=1514;SC=CTCCCTCCGCTGGCCCGCACC;SOR=1.276;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=69;WE=10952798;WS=10952780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	10961184	rs1686497	A	G	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=289;SC=CAGAATTTTCAGGTCGTGTTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=10961192;WS=10961174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	10994418	rs1198852	T	C	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=2;PP=634;SC=TGAGCCACTGTGTCCGGCCTC;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=10994426;WS=10994409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	11053020	rs3732104	A	G	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.714;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=34;PP=790;ReadPosRankSum=0.352;SC=GCGTGGACGCAGCCGAGGGCC;SOR=0.463;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=132;TCF=32;TCR=100;TR=46;WE=11053028;WS=11053010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,48:0.36:133
chr2	11053740	rs3732105	C	T	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.391;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=19;PP=849;ReadPosRankSum=0.763;SC=GTGGTGTCATCGCCATCGCCC;SOR=0.954;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=158;TCF=76;TCR=82;TR=48;WE=11053748;WS=11053730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,51:0.31:163
chr2	11264830	rs7560331	G	A	3600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.140;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=39;PP=2892;ReadPosRankSum=1.163;SC=CGTGGACCTGGCAACCTGCTC;SOR=0.918;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=178;TCF=121;TCR=57;TR=125;WE=11264838;WS=11264820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,130:0.70:187
chr2	11273407	rs141443952	G	GTCTC	247.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.372;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.950;NF=19;NR=3;PP=375;ReadPosRankSum=1.093;SC=TCAGGCACAGGTCTCTCTCTC;SOR=3.014;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=68;TCF=49;TCR=19;TR=22;WE=11273418;WS=11273397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,10:0.18:56
chr2	11295226	rs148805827	C	CG	125.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=177;SC=GACTGTCGCCCGGGGCGGGGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=11295234;WS=11295216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	11295867	rs7598570	G	C	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.123;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=181;ReadPosRankSum=-1.505;SC=AGCTGCTGCCGGCTGGGAGCC;SOR=0.180;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=10;WE=11295875;WS=11295857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr2	11300732	rs2271622	C	T	6682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=108;NR=93;PP=2965;SC=CCCCCTCACTCGGAGCCTCTC;SOR=0.846;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=108;TCR=93;TR=201;WE=11300740;WS=11300722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr2	11300869	rs6432182	T	C	3360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=79;PP=2527;SC=ATGTTATTTGTGAATGGTATG;SOR=1.961;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=112;TCF=31;TCR=81;TR=110;WE=11300877;WS=11300859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr2	11300927	.	TAAAA	T	1030.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;QD=35.54;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	11304471	.	A	ATAT	110.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.21;MQRankSum=0.319;QD=5.27;ReadPosRankSum=0.619;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr2	11312181	rs12987956	G	A	1769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=45;PP=1464;SC=AGTAAGAACCGGACTCACATG;SOR=3.570;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=7;TCR=45;TR=52;WE=11312189;WS=11312171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	11312224	rs3732103	C	T	953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=30;PP=846;SC=CAAGTGTCTACGTAGTAGGGT;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=11312232;WS=11312214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	11348364	rs141148984	C	CTAACT	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=314;SC=ATGAATAAACCTATTAATTCA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=11348372;WS=11348354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	11348609	rs5829297	CAAAT	C	675.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=630;SC=CATAAATTTACAAATAAAAGA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=14;WE=11348620;WS=11348599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	11356190	rs726843	G	A	1375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=6;PP=1044;SC=TTCAAGGCACGTATTACTATG;SOR=3.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=40;WE=11356198;WS=11356180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	11357100	rs57554471	G	A	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=165;SC=CACCCACCTCGGCCTCCCAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=11357108;WS=11357090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	11359031	rs9808228	G	T	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=265;SC=AAAACATGGGGATTACTAAAA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=11359039;WS=11359021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	11359120	rs2230774	G	T	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=14;PP=563;SC=TATGGAATCAGTTTCTCTACA;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=29;WE=11359128;WS=11359110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	11359300	rs17463952	C	T	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=55;ReadPosRankSum=1.892;SC=CAATATTTTTCCCTCAAGACA;SOR=0.495;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=5;WE=11359308;WS=11359290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr2	11725179	rs55893544	G	GA	2035.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.276;NF=59;NR=11;PP=786;ReadPosRankSum=-0.028;SC=TCTGTGATTAGAAAAAAAAAA;SOR=1.072;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=106;TCF=85;TCR=21;TR=70;WE=11725187;WS=11725169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,82:0.96:85
chr2	11725241	rs12470971	G	A	5344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.220;NF=106;NR=62;PP=2965;ReadPosRankSum=1.093;SC=TTTTATTGGAGCCCTGTCCTG;SOR=1.275;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=170;TCF=107;TCR=63;TR=168;WE=11725249;WS=11725231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,170:0.99:172
chr2	11727507	rs13394619	G	A	4862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=105;PP=2965;SC=GCCCACTGCAGTATTTGTAAA;SOR=1.427;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=56;TCR=105;TR=161;WE=11727515;WS=11727497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr2	11731774	rs2358040	T	G	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=234;SC=TGGGAAGCAATCTGATGATAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=11731782;WS=11731764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	11738091	rs1435547	T	C	4963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=119;PP=2965;SC=CTCTGCTCCATGTGTGGCATT;SOR=1.840;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=170;TCF=50;TCR=120;TR=169;WE=11738099;WS=11738081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr2	11738765	rs1865575	C	T	1150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=1;PP=973;SC=AAACCCAGTGCGCATGTTTGC;SOR=5.784;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=36;WE=11738773;WS=11738755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	11741193	rs11681838	C	A	1160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=32;PP=961;SC=CATTTAGTAACAGCCTTGACC;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=11741201;WS=11741183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	11742458	rs72772088	A	G	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=290;SC=GGTCATCCGCAGGCCTGGCAC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=11742466;WS=11742448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	11752635	rs2304399	T	C	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=12;PP=530;SC=GGCAGAAAATTGAGGATGTGG;SOR=0.874;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=22;WE=11752643;WS=11752625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	11755443	rs2252958	T	G	1267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=35;PP=997;SC=CTCAGCCTACTTGTCCCTGTC;SOR=5.084;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=36;WE=11755451;WS=11755433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
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chr2	11757023	rs892868	C	T	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=385;ReadPosRankSum=1.871;SC=TGGTCAACTTCGGATCGGAGA;SOR=0.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=18;WE=11757031;WS=11756999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr2	11774324	rs2304402	G	A	5248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=81;PP=2965;SC=GGCGGCCCCCGACATCATGCA;SOR=0.803;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=73;TCR=81;TR=154;WE=11774332;WS=11774314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr2	11775296	rs111631311	AG	A	280.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=397;ReadPosRankSum=1.946;SC=CCACCTTCATAGCCCCCTACG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=8;WE=11775306;WS=11775286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr2	11775298	.	C	T	289.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.040;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=405;ReadPosRankSum=1.958;SC=ACCTTCATAGCCCCCTACGAT;SOR=0.204;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=8;WE=11775306;WS=11775286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr2	11778184	rs33962728	G	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=187;ReadPosRankSum=0.185;SC=TTGCCATTCAGCTGAGAGAAC;SOR=1.445;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=9;WE=11778192;WS=11778174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr2	11798481	.	A	T	200	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=9;NR=0;PP=200;QD=26.085690283;SC=TCAGCAGAGCAGGGGTTGATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=9;WE=11798489;WS=11798480;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr2	11810095	rs6432225	G	A	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=17;PP=762;SC=CACCACGTGCGCGGACAGCGC;SOR=1.112;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=31;WE=11810103;WS=11810085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	11817812	rs4669769	G	C	3454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=41;PP=2637;ReadPosRankSum=-0.834;SC=CCAGCTGGGAGACCTCGCAGG;SOR=0.473;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=113;TCF=72;TCR=41;TR=112;WE=11817820;WS=11817802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,113:0.99:114
chr2	11853913	rs4614906	G	A	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.032;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=253;ReadPosRankSum=-0.102;SC=GGGTGGATTCGAAATGTATGG;SOR=1.697;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=62;TCF=51;TCR=11;TR=18;WE=11853921;WS=11853903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,20:0.30:66
chr2	11853964	rs4640359	G	A	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=505;ReadPosRankSum=0.085;SC=ATAGAATGTCGTTGTTATGCT;SOR=0.760;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=72;TCF=39;TCR=33;TR=32;WE=11853972;WS=11853954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
chr2	11853988	rs12465630	A	T	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.094;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=906;ReadPosRankSum=-1.110;SC=ACATTTTAAGATTAGAGAAAA;SOR=0.371;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=77;TCF=32;TCR=45;TR=44;WE=11853996;WS=11853978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,45:0.56:80
chr2	11854099	rs4668739	T	C	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=202;ReadPosRankSum=1.228;SC=CCGCAGCACTTGCTGGATGCT;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=11;WE=11854107;WS=11854089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr2	11905636	rs3214670	GT	G	337.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=3.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.56;ReadPosRankSum=1.100;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,25:0.26:95
chr2	11905876	rs10209969	C	T	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.174;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=322;ReadPosRankSum=0.832;SC=TCTCAGGGCACGGGGACCTGG;SOR=0.242;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=60;TCF=4;TCR=56;TR=20;WE=11905884;WS=11905866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,23:0.35:66
chr2	11924950	rs3795974	T	C	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.370;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=447;ReadPosRankSum=1.736;SC=CACTGGATGGTGATGTAGGAC;SOR=0.169;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=100;TCF=64;TCR=36;TR=33;WE=11924958;WS=11924940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,32:0.32:100
chr2	11931931	rs78343196	A	AT	276.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.266;NF=10;NR=3;PP=189;ReadPosRankSum=-1.672;SC=GTTTTCTCTGATTTTTTTTTA;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=13;WE=11931939;WS=11931921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr2	11932173	rs7561070	G	T	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.900;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=528;ReadPosRankSum=0.366;SC=CTTAGCAAGTGTTGGTTTTGT;SOR=0.280;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=52;TCF=5;TCR=47;TR=23;WE=11932181;WS=11932163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr2	11936798	rs2577264	A	G	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=29;ReadPosRankSum=1.239;SC=AAGAAAGAATAGGAAGGCACC;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=4;WE=11936806;WS=11936788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr2	11936921	.	G	C	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=445;ReadPosRankSum=-1.131;SC=GCCACCCTCTGAGCAGCCAGC;SOR=0.735;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=73;TCF=46;TCR=27;TR=25;WE=11936929;WS=11936911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,25:0.34:73
chr2	12864613	rs6432324	T	A	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=203;ReadPosRankSum=-0.755;SC=AGTTCCTGAATGAGGCCCCAC;SOR=0.086;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=10;WE=12864621;WS=12864606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr2	12877501	rs5829384	G	GA	3208.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.602;NF=51;NR=26;PP=2971;ReadPosRankSum=2.203;SC=GTGAGAATGGGTAGAGGAAGC;SOR=0.719;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=127;TCF=83;TCR=44;TR=77;WE=12877509;WS=12877491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,93:0.62:151
chr2	15319070	rs5829492	TA	T	290.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=6.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.77;ReadPosRankSum=1.473;SOR=1.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,22:0.36:61
chr2	15374887	rs34561027	A	G	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=420;ReadPosRankSum=1.491;SC=AAGACATGGTAATCAGCACTT;SOR=0.479;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=20;WE=15374895;WS=15374877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,21:0.37:57
chr2	15378822	rs140225141	G	GAATT	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=362;SC=TTAAAAAAAAGAATAGTGAGA;SOR=3.611;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=9;WE=15378830;WS=15378812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	15415525	rs3755127	C	T	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=634;ReadPosRankSum=1.098;SC=AGAAAGGAAACAAAAATAAAA;SOR=2.012;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=27;WE=15415533;WS=15415515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr2	15417280	rs3214432	ATT	A	972.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=1072;ReadPosRankSum=0.704;SC=TATTAAAGTGATTTTTTTTTT;SOR=0.489;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=19;WE=15417293;WS=15417270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
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chr2	15427173	rs4668892	C	T	2612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.647;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=30;PP=2123;ReadPosRankSum=0.103;SC=TGGAAACAAACGTACATATGA;SOR=0.606;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=162;TCF=116;TCR=46;TR=101;WE=15427181;WS=15427163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,102:0.61:168
chr2	15448311	rs1318102	A	T	1830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=19;PP=1498;ReadPosRankSum=0.995;SC=ACTCTGCTCAATAATAAGCTG;SOR=0.686;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=105;TCF=75;TCR=30;TR=65;WE=15448319;WS=15448301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,66:0.63:105
chr2	15468025	rs2042145	T	C	1834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.854;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=53;PP=1465;ReadPosRankSum=1.556;SC=CACTATCTAGTAGGGTGCCTT;SOR=1.938;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=110;TCF=24;TCR=86;TR=63;WE=15468033;WS=15468015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,66:0.58:114
chr2	15471002	rs6759219	C	A	281.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=202;SC=AAGACAGACACATTTAAAAAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=15471010;WS=15470992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	15491994	.	GCACACACACACA	G,GCA	4530.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.23;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=46,46;NR=11,11;PP=252,2997;SC=TGGTCTGCATGCACACACACA;SOR=2.712;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=97;TCF=73;TCR=24;TR=57,57;WE=15492013;WS=15491984;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.21,0.79:112
chr2	15493881	rs2277915	A	G	2973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=74;PP=2186;SC=GAAGAAGAATATTCAATCTAA;SOR=3.732;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=11;TCR=74;TR=85;WE=15493889;WS=15493871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr2	15519992	rs2058866	G	T	1949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=46;PP=1437;SC=GTTATAGAGAGGGAAGATTCA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=14;TCR=46;TR=60;WE=15520000;WS=15519982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	15523266	rs6756934	A	T	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=342;SC=ATGGTCATCAATCTTGTATCC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=15523274;WS=15523256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	15523307	rs3834149	TA	T	726.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.36;QD=25.06;SOR=3.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	15523549	rs3755129	T	C	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=849;SC=CACCACTCTATATCCACATCA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=15523557;WS=15523539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	15533689	rs2380650	T	C	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=1;PP=385;SC=AACTATTCACTTACCAAATGA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=15533697;WS=15533679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	15533734	rs139494535	G	GAAATGAAAGCGTATGTCTACAC	1880.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=72.34;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	15533779	rs9710889	G	A	2010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=24;PP=1431;SC=ATGAAAAGTCGTAGCAACTTT;SOR=1.318;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=38;TCR=24;TR=62;WE=15533787;WS=15533769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	15533884	rs9710962	C	A	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=32;PP=1158;SC=AATACCATTCCGCAAACAAAA;SOR=2.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=41;WE=15533907;WS=15533874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	15533895	rs13417550	A	G	1744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.16;SOR=3.855;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	15533899	rs11689153	A	G	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.24;SOR=3.855;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	15542296	rs75566418	A	G	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=8;PP=884;ReadPosRankSum=0.527;SC=TCTTACCCATATCCTCTTTCT;SOR=0.866;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=55;TCR=15;TR=39;WE=15542304;WS=15542286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,40:0.56:71
chr2	15564718	rs10929367	T	C	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=29;PP=904;SC=ATGTATGTGGTTTGTGTATCT;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=15564726;WS=15564708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	15567649	rs3796002	T	C	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=536;SC=TCCTTTGTAGTATTTAATTTT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=15567657;WS=15567639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	15601287	rs11411624	A	AT	2996.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=5;PP=2483;SC=TTATCAATATAAAAAAGAAGG;SOR=4.698;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=68;TCR=5;TR=72;WE=15601295;WS=15601277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	15601441	rs7590340	C	T	6796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=136;PP=2965;SC=ACAGAATTTCCAGGGCTTGTA;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=210;TCF=74;TCR=136;TR=210;WE=15601449;WS=15601431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr2	15601574	rs7590458	C	T	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=39;PP=1178;SC=TATGAAACACCTTGAAATGAC;SOR=5.283;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=41;WE=15601582;WS=15601564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	15601881	.	C	G	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=383;ReadPosRankSum=-0.783;SC=AGCATCATATCTCTGTTCAGA;SOR=0.483;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=20;WE=15601889;WS=15601871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr2	15607842	rs4668909	T	C	2303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.13;SOR=0.992;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	15608013	rs4668910	C	A	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=328;SC=TGACTGATTTCATTATTGATT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=15608021;WS=15608003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	15614404	rs13014906	T	C	3675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=73;PP=2945;SC=CTTCTCCAGCTCTAGTCTCCA;SOR=1.508;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=34;TCR=73;TR=107;WE=15614412;WS=15614394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr2	15615910	rs1990754	A	G	6770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=114;PP=2965;SC=AAGTTTTCACAGATGAAACAG;SOR=0.719;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=221;TCF=106;TCR=115;TR=220;WE=15615918;WS=15615900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr2	15616013	rs1990755	C	G	3456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=88;PP=2739;ReadPosRankSum=0.993;SC=ATCTAAGAAGCGAAAAACAAA;SOR=2.488;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=101;TCF=10;TCR=91;TR=98;WE=15616021;WS=15616003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,105:0.99:106
chr2	15616030	rs1990756	C	T	2696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=75;PP=2138;SC=CAAATCAATACAAATGCATCT;SOR=5.524;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=3;TCR=76;TR=78;WE=15616038;WS=15616020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr2	15618339	rs1125534	G	A	1447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=8;PP=1061;SC=ATCACATTTCGTAGAACTCAC;SOR=2.511;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=41;WE=15618347;WS=15618329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	15623608	rs10201564	C	G	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=19;PP=538;SC=AAAATTAAGGCCGAAAATGAG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=15623616;WS=15623598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	15644107	rs3732002	C	A	2564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.50;SOR=8.015;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	15644111	rs3732003	C	T	2698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.84;SOR=8.318;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	15644401	rs2287265	C	T	3175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=87;PP=2691;SC=TAAAATGTCCCTTTATAATGA;SOR=5.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=4;TCR=87;TR=91;WE=15644409;WS=15644391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr2	15674686	rs13029846	T	C	3478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=51;PP=2903;SC=GGGTGGTAAATAGCTGTGTTG;SOR=0.907;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=62;TCR=51;TR=113;WE=15674694;WS=15674676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr2	15676686	rs10208972	G	A	3921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=95;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.347;SC=CTACAGAAGAGGGGGAAATTA;SOR=1.998;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=17;TCR=96;TR=112;WE=15676694;WS=15676676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,119:0.99:120
chr2	15678368	rs7595512	C	T	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=474;SC=CATTTGAGCACACATACAGCT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=15678376;WS=15678358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	15678482	rs2380657	T	C	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=20;PP=1039;SC=CGTTTTTAGTTTCTCCACTCA;SOR=0.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=21;TCR=20;TR=41;WE=15678490;WS=15678472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	15678501	rs66736557	GA	G	968.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=20;PP=666;SC=CATTATTTCTGAAAAAAAAAT;SOR=0.798;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=33;WE=15678509;WS=15678491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	15679609	rs2058868	A	T	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=260;SC=TCTCTAATAAAGCTTCCCTCA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=15679617;WS=15679599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	15691886	rs7572131	G	A	564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=479;SC=CATATATATGGAATATAGTGA;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=15691894;WS=15691876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	15694164	rs34789730	T	TA	3933.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=23;PP=2936;SC=CAGAAAAACATTGAATTTCAC;SOR=2.303;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=79;TCF=56;TCR=23;TR=77;WE=15694172;WS=15694154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr2	15731998	rs10221770	A	G	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.914;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=168;ReadPosRankSum=-1.117;SC=CGCCACTGCCACGCCGTGTCA;SOR=1.319;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=16;WE=15732006;WS=15731988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,18:0.32:57
chr2	15732238	rs73915402	G	C	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=53;ReadPosRankSum=1.100;SC=GATCAGGGGCGGCCGCGGCTC;SOR=0.434;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=6;WE=15732246;WS=15732228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr2	15737480	rs2302931	C	A	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=172;ReadPosRankSum=-2.530;SC=AATATAGATACCTTTTGTTTC;SOR=0.656;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=11;WE=15737488;WS=15737470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr2	15737698	rs2302932	G	A	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=54;ReadPosRankSum=0.802;SC=AATCTTGTCAGTATCTGGGGG;SOR=0.193;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=5;WE=15737706;WS=15737688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr2	15744123	rs3213793	T	G	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.315;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=113;ReadPosRankSum=1.482;SC=TGAGCAGATTTTCTGTATATT;SOR=0.223;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=7;WE=15744131;WS=15744113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr2	15747234	rs55800266	G	A	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=371;ReadPosRankSum=-0.896;SC=TTGTCCTAATGTTTTATAAGT;SOR=0.215;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=69;TCF=67;TCR=2;TR=21;WE=15747242;WS=15747224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,23:0.33:70
chr2	15747393	rs10929378	C	T	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.765;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=36;PP=667;ReadPosRankSum=1.219;SC=AAACTTTGAACAACATCAAGC;SOR=0.837;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=161;TCF=38;TCR=123;TR=46;WE=15747401;WS=15747383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,49:0.30:164
chr2	15753307	rs3217220	A	AT	74.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=1.769;QD=2.41;ReadPosRankSum=1.244;SOR=0.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr2	15753482	rs2302935	C	G	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=78;ReadPosRankSum=0.026;SC=TGTTTTGTTTCAAGAAAATTT;SOR=0.105;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=5;WE=15753490;WS=15753472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr2	15758293	rs3770466	T	C	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.223;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=421;ReadPosRankSum=1.229;SC=TTATTCTTTGTTTCTCATGCA;SOR=0.987;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=68;TCF=55;TCR=13;TR=24;WE=15758301;WS=15758283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,27:0.38:72
chr2	15763788	rs41264163	C	T	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-5.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=309;ReadPosRankSum=-0.423;SC=CAATCTAGAACACATGCACAG;SOR=0.348;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=17;WE=15763796;WS=15763778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,19:0.39:49
chr2	15768846	rs3835049	AT	A	194.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=12.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQRankSum=2.630;QD=2.63;ReadPosRankSum=0.703;SOR=1.192;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,17:0.23:74
chr2	15768981	rs62122280	C	G	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=341;ReadPosRankSum=2.339;SC=TTGTAGGGCTCTATTATATTC;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=17;WE=15768989;WS=15768971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr2	15770061	rs2302937	G	A	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.073;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=151;ReadPosRankSum=0.994;SC=ATGATAAAATGCAACTCTTTC;SOR=0.036;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=9;WE=15770069;WS=15770051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr2	15770775	rs3770471	C	T	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=-1.383;SC=CTGGAGATAACTTGCCCAGTA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=15770783;WS=15770765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr2	15840505	rs4668460	C	A	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.79;ReadPosRankSum=0.313;SOR=0.605;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,23:0.22:106
chr2	15840522	rs4668461	G	T	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.200;SOR=0.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,29:0.23:125
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chr2	15841288	rs1421609	G	A	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.823;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=308;ReadPosRankSum=-1.366;SC=CATTGATGTGGCTATCTGTGT;SOR=1.574;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=14;WE=15841296;WS=15841278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr2	15883483	rs76958094	C	G	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.229;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=515;ReadPosRankSum=1.153;SC=CATCTATTTTCTGAAAGAGAT;SOR=3.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=20;WE=15883491;WS=15883473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr2	15883812	.	C	T	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=249;ReadPosRankSum=-0.701;SC=TAATTTGTGTCTTCTCTCTCT;SOR=1.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=12;WE=15883820;WS=15883802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr2	16082031	rs186146246	C	T	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.921;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=406;ReadPosRankSum=0.815;SC=TCGGTCTGCCCCGTTTGCCCA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=17;WE=16082039;WS=16082028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr2	16734284	rs12997119	T	C	4094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=77;PP=2944;ReadPosRankSum=-0.309;SC=GGAGAGAGAATGGTAGAGGTT;SOR=0.335;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=139;TCF=60;TCR=79;TR=137;WE=16734292;WS=16734274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,145:0.99:146
chr2	16743453	rs6751062	A	C	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=33;PP=845;SC=GGTGGCCCACAGAGGTCCTTC;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=42;WE=16743461;WS=16743443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	16746897	rs62122698	C	G	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=268;SC=GTCAGTTCAGCGTGATCATTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=10;WE=16746905;WS=16746887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	17696573	rs834514	C	T	2220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=28;PP=1796;SC=CATATTAGGACCTGCTATAGT;SOR=1.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=43;TCR=28;TR=71;WE=17696581;WS=17696563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	17698678	rs665312	A	G	2162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=39;PP=1819;SC=TATTTTGGCTACTGAGTGATG;SOR=1.341;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=24;TCR=39;TR=63;WE=17698686;WS=17698668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	17773524	rs2680827	G	A	2068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=51;PP=1620;SC=TTTCAACCTTGTTTTTATTCC;SOR=2.799;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=11;TCR=51;TR=62;WE=17773532;WS=17773514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	17883218	rs11681696	T	A	179.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5436;FS=9.031;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=113;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TAAAAAAAAATTTAAACCGAA;SOR=4.163;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=6;WE=17883226;WS=17883208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr2	17884495	rs1065381	C	T	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.065;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=371;ReadPosRankSum=1.334;SC=TTTTCAAGGGCAGATAAATGT;SOR=0.880;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=22;WE=17884503;WS=17884485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr2	17888457	rs6734462	G	A	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=5;PP=678;ReadPosRankSum=-1.120;SC=CAGTGGGAATGATACAGTAAA;SOR=0.962;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=33;WE=17888465;WS=17888447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,33:0.60:55
chr2	17890091	rs10657992	G	GTATA	1013.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=1242;ReadPosRankSum=-0.985;SC=TGAAAATTGTGTATATATATA;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=67;TCF=1;TCR=66;TR=22;WE=17890099;WS=17890081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr2	17897488	rs35195207	T	C	2716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.815;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=66;PP=2145;ReadPosRankSum=-0.569;SC=TTCAGTTGCCTCTGATTGTAG;SOR=0.190;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=137;TCF=38;TCR=99;TR=97;WE=17897496;WS=17897478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,99:0.70:141
chr2	17898326	rs12469221	C	T	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=760;ReadPosRankSum=0.823;SC=AATGGGATAGCCATGAAAATT;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=36;TCR=24;TR=38;WE=17898334;WS=17898316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,38:0.63:60
chr2	17913266	rs2052746	A	C	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=749;SC=TGCAAATTAGATTTACATCAA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=17913274;WS=17913256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	17927275	rs12474069	C	T	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=290;ReadPosRankSum=-0.549;SC=ATATTAAACTCAACAAAATAA;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=12;WE=17927283;WS=17927265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr2	17941423	rs2555072	T	G	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.699;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=527;ReadPosRankSum=-0.763;SC=ACAGTCTTGGTATCTTGATTT;SOR=0.346;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=70;TCF=6;TCR=64;TR=28;WE=17941431;WS=17941413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,29:0.40:73
chr2	17942775	rs1812152	T	A	1995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.143;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=44;PP=1462;ReadPosRankSum=0.433;SC=GAGGAATCAGTCTCGGTATGG;SOR=0.553;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=268;TCF=143;TCR=125;TR=89;WE=17942783;WS=17942765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,93:0.34:277
chr2	17954027	rs300175	G	A	3501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=74;PP=2875;SC=AGGCAACTCAGTGAAGTAGAG;SOR=1.992;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=28;TCR=74;TR=102;WE=17954035;WS=17954017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr2	17954140	rs300176	A	G	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=55;ReadPosRankSum=-1.586;SC=CTTTCCCCATATCTAGATTAG;SOR=0.116;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=6;WE=17954148;WS=17954130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr2	17959405	rs143973077	G	GTA	388.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.537;NF=0;NR=24;PP=587;ReadPosRankSum=-0.350;SC=TTGTATATGTGTATATATATA;SOR=0.760;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=24;WE=17959413;WS=17959395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr2	17959420	rs10535305	TAC	T	397.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.528;NF=0;NR=25;PP=389;ReadPosRankSum=0.530;SC=TATATATATATACACACACAC;SOR=0.384;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=25;WE=17959429;WS=17959410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
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chr2	17962450	rs300168	A	G	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=1.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.33;ReadPosRankSum=-0.817;SOR=0.553;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,39:0.28:137
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chr2	17998025	rs34069439	A	T	2968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=65;PP=2489;SC=GGGGCAGCGAAGGCTGCAGTG;SOR=2.102;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=23;TCR=65;TR=88;WE=17998033;WS=17998015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	17998095	rs35858730	C	T	4317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=40;PP=2965;SC=CCAGCCCACCCACCTTCAGGG;SOR=1.719;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=90;TCR=40;TR=130;WE=17998103;WS=17998085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr2	17998331	rs13001625	T	C	10601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=213;PP=2965;SC=CAGACCTCCTTAACCGCGGCA;SOR=1.639;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=314;TCF=100;TCR=214;TR=313;WE=17998339;WS=17998321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr2	18112473	rs4240213	G	A	5581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=75;PP=2965;SC=CCGATAAGGAGTACTACTTTG;SOR=1.009;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=174;TCF=98;TCR=76;TR=173;WE=18112481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr2	18113623	rs4832524	A	G	2475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.526;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=51;PP=1934;ReadPosRankSum=0.283;SC=GCGGATGCACACCTTCATTAC;SOR=0.515;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=130;TCF=51;TCR=79;TR=87;WE=18113631;WS=18113613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,93:0.69:135
chr2	18113789	rs3747515	G	A	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.503;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=445;ReadPosRankSum=1.384;SC=ATCCTTTCCCGACATTAGGTT;SOR=0.058;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=23;WE=18113797;WS=18113779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr2	18767384	rs11096544	G	T	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=25;ReadPosRankSum=-0.180;SC=ACGGGCAGAAGGGAGTTCTCC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=3;WE=18767392;WS=18767377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr2	20101522	.	A	C	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=0.000;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=452;ReadPosRankSum=-1.302;SC=ATGTAAGCGGAGTACAGTGCC;SOR=0.746;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=113;TCF=90;TCR=23;TR=34;WE=20101530;WS=20101512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,35:0.31:113
chr2	20113221	rs6748924	A	G	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=147;ReadPosRankSum=0.168;SC=GCTGATTTTCATACAAAACTC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=10;WE=20113229;WS=20113211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr2	20131079	rs1191778	T	C	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.347;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=462;ReadPosRankSum=-0.458;SC=CTTCATCTGTTCATGGTATTG;SOR=1.184;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=87;TCF=56;TCR=31;TR=25;WE=20131087;WS=20131069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,25:0.28:90
chr2	20131184	rs1191779	C	A	1986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=44;PP=1513;SC=AAACATTTTTCAAAATTGAGG;SOR=2.621;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=12;TCR=44;TR=56;WE=20131192;WS=20131174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	20133221	rs2293669	C	T	2902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.255;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=69;PP=2175;ReadPosRankSum=-0.504;SC=TTCAAAAATGCAGTCACTGCT;SOR=0.498;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=158;TCF=51;TCR=107;TR=104;WE=20133229;WS=20133211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,107:0.67:160
chr2	20173255	rs10153717	A	C	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.587;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=683;ReadPosRankSum=-0.094;SC=TTCCTTTGTTATTTTTTCCTC;SOR=0.293;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=28;WE=20173263;WS=20173245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,30:0.73:41
chr2	20189089	rs3731663	C	T	2812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.566;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=73;PP=2180;ReadPosRankSum=0.590;SC=CACGAAGGAGCTGGGAAGTAA;SOR=0.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=34;TCR=111;TR=95;WE=20189097;WS=20189079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,100:0.66:152
chr2	20233135	rs1191824	T	C	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=803;SC=TAAATAGGGTTATACAAAACC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=20233143;WS=20233125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	20320480	rs11885236	G	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.12;MQRankSum=-1.282;QD=8.29;ReadPosRankSum=0.598;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr2	20401858	.	TAA	T	137.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.080;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr2	20403794	rs10205485	A	T	4623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=80;NR=54;PP=2965;SC=CGTTGAGGCCAGATGAGTGGT;SOR=1.092;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=80;TCR=54;TR=134;WE=20403802;WS=20403784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr2	20403949	rs2230924	C	T	2631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.180;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=51;PP=2158;ReadPosRankSum=-1.213;SC=CAGCTGTAGCCTCCAGGCCGG;SOR=0.418;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=145;TCF=62;TCR=83;TR=95;WE=20403957;WS=20403939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,97:0.66:147
chr2	20405004	rs3732166	C	T	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.441;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=205;ReadPosRankSum=-0.083;SC=GCAGGGTGCACTCAGTACATG;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=10;WE=20405012;WS=20404997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr2	20405050	rs6531225	A	C	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=4;PP=692;SC=ACCACTGCCCACAGGCATGAC;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=20405058;WS=20405040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	20423154	rs4666375	A	G	2529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=62;PP=2014;SC=AGCAGTGGAGAACCCGAGTGC;SOR=2.613;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=16;TCR=62;TR=78;WE=20423162;WS=20423144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr2	20424062	rs138986173	G	A	159.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5958;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=149;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CTCCCGCGCCGGCCGCGCTGC;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=7;WE=20424070;WS=20424052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr2	20455176	rs111928251	GT	G	479.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=0.667;QD=12.62;ReadPosRankSum=-0.078;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,29:0.76:38
chr2	20462852	rs3796066	G	C	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-4.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=470;ReadPosRankSum=0.546;SC=GCTCTTAAAAGCTTCCAACTT;SOR=0.602;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=20;WE=20462860;WS=20462850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr2	20525948	rs9306890	T	C	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=269;ReadPosRankSum=-0.533;SC=TTTCTTAGGGTTGAGAATTTT;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=12;WE=20525956;WS=20525938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr2	20699625	rs13010768	G	A	32.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.93;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr2	20699667	rs342089	C	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.95;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr2	20700786	rs961496	C	T	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=-0.712;SC=CCAGTATTCCCTAGGGATGGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=20700794;WS=20700776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr2	20700900	rs342088	A	G	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=13;PP=640;SC=CTTCTTTGCTAGCCTTGGGCA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=27;WE=20700908;WS=20700890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	20818454	rs3732152	T	A	4177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.97;SOR=1.971;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr2	20818454	.	TTCTG	ATCTA,ATCTG	1621	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=28,80;NR=14,32;PP=836,1621;QD=21.1778065443;SC=GGGGCTGGGCTTCTGGTTGGC;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=113;TCF=81;TCR=32;TR=42,112;WE=20818466;WS=20818444;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.37:113
chr2	20818458	rs3732151	G	A	1098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=2.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.55;ReadPosRankSum=0.158;SOR=0.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,45:0.39:115
chr2	20818517	rs3732150	T	C	2678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.604;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=40;PP=2129;ReadPosRankSum=0.520;SC=ATAAGACACATTGGGCTCTGG;SOR=0.772;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=158;TCF=91;TCR=67;TR=97;WE=20818525;WS=20818507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,99:0.62:160
chr2	20822218	rs4666444	T	C	915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=31;PP=785;SC=CACCACAGAGTGGGGGGCCCA;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=20822226;WS=20822208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	20823612	rs13030108	A	G	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=4;PP=362;SC=CTCTGTCCAGAACACTCTCAG;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=20823620;WS=20823602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	20823724	rs6531248	T	C	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=8;PP=457;SC=CACAGGCGGCTGGCAGCAGGA;SOR=1.493;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=10;TCR=8;TR=18;WE=20823732;WS=20823714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	20823816	rs2305460	G	T	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=46;ReadPosRankSum=0.691;SC=CAGCAGGGGGGTCAGAGGAAG;SOR=0.941;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=7;WE=20823824;WS=20823806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr2	20823850	rs6733419	T	C	820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.08;SOR=2.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	20823850	.	TGCTCTCTC	CGCTCTCTC,CGCTCTCTT	200	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.4;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=4,2;NR=13,9;PP=33,200;QD=3.98654191454;SC=ATGCCATGGCTGCTCTCTCTC;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17,11;WE=20823866;WS=20823840;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:17
chr2	20823858	rs2305459	C	T	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.15;ReadPosRankSum=1.571;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr2	20824498	rs2305458	C	T	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.675;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=483;ReadPosRankSum=0.921;SC=TTACGGTCCACGGATGACACG;SOR=1.483;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=24;WE=20824506;WS=20824488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr2	20824559	rs2305457	C	T	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.434;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=329;ReadPosRankSum=-1.154;SC=CAAAGAGCCCCTCATCAGGGT;SOR=0.506;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=70;TCF=37;TCR=33;TR=22;WE=20824567;WS=20824549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,23:0.30:77
chr2	20824658	rs10199441	G	A	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.415;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=267;ReadPosRankSum=-0.994;SC=TGGAGCTGGAGAATCACAGAC;SOR=0.243;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=20;WE=20824666;WS=20824648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,25:0.37:67
chr2	20824691	rs17663045	C	T	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.717;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=627;ReadPosRankSum=0.913;SC=GAGGATTTCCCACAAGTGTCC;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=31;WE=20824699;WS=20824681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,34:0.64:53
chr2	20824708	rs10191266	T	C	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=76;ReadPosRankSum=-0.468;SC=GTCCAGGTGGTCCGGTCAGAC;SOR=0.394;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=9;WE=20824716;WS=20824698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr2	20838318	rs3796064	G	A	2181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.841;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=45;PP=1602;ReadPosRankSum=-0.201;SC=CAAAAAAGTCGAAAGCCTCTT;SOR=0.571;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=264;TCF=125;TCR=139;TR=96;WE=20838326;WS=20838308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,98:0.36:275
chr2	20841059	rs4666449	C	T	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=469;ReadPosRankSum=0.224;SC=GGTACGCCCGCCTGCTGCCCC;SOR=1.532;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=21;WE=20841067;WS=20841049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr2	20845273	rs2304423	G	A	1984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=10;NR=47;PP=1623;SC=CGCCTGCCAGGGGAAAAGAAG;SOR=3.113;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=10;TCR=47;TR=57;WE=20845281;WS=20845263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr2	20870579	rs13013489	G	A	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=13;PP=598;SC=CACTGCGGCGGCTGGGCTTCG;SOR=1.051;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=23;WE=20870587;WS=20870569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	20871190	rs4666457	A	C	2602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=85;PP=2125;SC=AGGTAGCGCGAGGGCCGGGGA;SOR=3.912;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=11;TCR=85;TR=96;WE=20871198;WS=20871180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr2	20884546	rs10171934	A	C	2400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.715;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=29;PP=1849;ReadPosRankSum=1.114;SC=ACTTTCACAAAGACCATCCAT;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=140;TCF=96;TCR=44;TR=94;WE=20884554;WS=20884536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,94:0.67:140
chr2	20884586	rs10182643	G	C	3387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.260;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=58;PP=2672;ReadPosRankSum=0.065;SC=AGGCAGAGCTGCTTCTGGAAA;SOR=0.828;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=180;TCF=93;TCR=87;TR=123;WE=20884594;WS=20884576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,124:0.69:180
chr2	20939706	rs2046325	T	C	3847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=1.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.311;QD=25.15;ReadPosRankSum=0.759;SOR=0.506;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,96:0.63:153
chr2	20939706	.	TAC	CAT	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=59.95;NF=70;NR=7;PP=2944;QD=20;SC=AGAATAAACATACACATTTTA;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=147;TCF=131;TCR=16;TR=77;WE=20939716;WS=20939696;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:70,77:0.52:147
chr2	20939708	rs653347	C	T	3847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=2.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.305;QD=25.31;ReadPosRankSum=0.838;SOR=0.429;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,95:0.62:152
chr2	21225281	rs1042034	C	T	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=588;ReadPosRankSum=-0.761;SC=GATATAATCACTGAAGATTGT;SOR=0.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=47;TCR=59;TR=31;WE=21225289;WS=21225271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,31:0.29:107
chr2	21231524	rs676210	G	A	5408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.444;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=84;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.546;SC=CTGGAATTCTGGTATGTGAAG;SOR=0.643;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=294;TCF=165;TCR=129;TR=190;WE=21231532;WS=21231514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,195:0.65:299
chr2	21232803	rs584542	T	C	4077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=103;PP=2965;SC=TGCTCAAGAATGTCATTTATT;SOR=2.235;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=34;TCR=103;TR=137;WE=21232811;WS=21232793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr2	21233976	.	C	G	2655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.997;ClippingRankSum=0.000;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.072;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=49;PP=1982;ReadPosRankSum=0.976;SC=CCAGTATGTTCTCCCCAGAGA;SOR=0.867;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=304;TCF=154;TCR=150;TR=110;WE=21233984;WS=21233966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,115:0.37:311
chr2	21235475	rs568413	T	C	2227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=51;PP=1803;SC=AGACCCATCATATGATAGTGT;SOR=2.517;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=14;TCR=51;TR=65;WE=21235483;WS=21235465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	21236482	rs488329	A	G	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=173;SC=GACCTTCACAACAATATTGTA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=21236490;WS=21236472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	21237438	rs200261177	A	T	2243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.558;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=53;PP=1741;ReadPosRankSum=-0.618;SC=AGACTCCCAGATGCCTTCTGA;SOR=1.059;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=125;TCF=48;TCR=77;TR=83;WE=21237446;WS=21237428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,85:0.67:127
chr2	21237544	rs673548	G	A	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=492;ReadPosRankSum=-0.454;SC=CAAAAATACCGATTTGACAAG;SOR=1.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=20;WE=21237552;WS=21237534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr2	21246306	rs12714102	G	C	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-5.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=2;PP=548;ReadPosRankSum=-0.433;SC=TTGTCTTGAAGTGGAAACACA;SOR=0.569;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=94;TCF=87;TCR=7;TR=32;WE=21246314;WS=21246296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,33:0.33:100
chr2	21250914	rs679899	G	A	1732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.041;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=53;PP=1365;ReadPosRankSum=0.846;SC=TTCTTTCAGAGCTTCTTTCAC;SOR=0.181;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=107;TCF=21;TCR=86;TR=70;WE=21250922;WS=21250904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,68:0.64:106
chr2	21252365	rs67556837	GAGGA	G	431.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.98;MQRankSum=1.037;QD=25.40;ReadPosRankSum=0.214;SOR=3.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr2	21255573	rs10701091	C	CCATCT	1090.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.815;NF=0;NR=23;PP=1286;ReadPosRankSum=0.591;SC=TCAAATCTAACTTCAAAACCC;SOR=2.432;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=23;WE=21255581;WS=21255562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,28:0.78:36
chr2	21265518	rs12714264	A	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=-0.765;SC=TGACTTCTCCATTATGTTTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=21265526;WS=21265508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr2	21360583	rs312966	A	G	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.476;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=32;PP=1395;ReadPosRankSum=-0.163;SC=AGGAAGAGTCATGGAAAAGAA;SOR=0.495;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=120;TCF=75;TCR=45;TR=79;WE=21360591;WS=21360573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,78:0.64:122
chr2	23860168	rs2288697	G	A	2780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.159;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=47;PP=2228;ReadPosRankSum=-0.231;SC=CCTTCAGACAGGGCACTCGTT;SOR=0.649;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=147;TCF=72;TCR=75;TR=97;WE=23860176;WS=23860158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,100:0.66:152
chr2	23860216	rs2288698	C	A	2345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.457;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=55;PP=1616;ReadPosRankSum=-0.122;SC=AAAAACCATGCTATTGTTCCC;SOR=0.855;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=131;TCF=50;TCR=81;TR=87;WE=23860224;WS=23860206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,92:0.66:139
chr2	23860259	rs2288699	A	G	1698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.316;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=50;PP=1307;ReadPosRankSum=-0.630;SC=TAAGTCCCCAACCCCCTCTCC;SOR=1.387;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=81;TCF=13;TCR=68;TR=57;WE=23860267;WS=23860249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,60:0.70:86
chr2	23865085	rs4665623	T	C	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.293;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=0;PP=659;ReadPosRankSum=-0.614;SC=AATCGGTCAGTTCCTGGACGC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=28;WE=23865093;WS=23865075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr2	23865109	rs3806508	C	A	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=2;PP=781;ReadPosRankSum=0.215;SC=TGTCTCGTTCCCCTCTGTGAC;SOR=0.663;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=54;TCR=3;TR=34;WE=23865117;WS=23865099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,33:0.60:55
chr2	23865139	rs3806509	C	T	1782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=14;PP=1372;ReadPosRankSum=-1.064;SC=AGTGCAGGGCCGGGGATGGTC;SOR=0.748;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=78;TCR=22;TR=64;WE=23865147;WS=23865129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,64:0.64:100
chr2	23865176	rs3806510	G	A	2719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.380;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=37;PP=2228;ReadPosRankSum=-0.196;SC=AAATGTAACCGGCAGATGACG;SOR=1.109;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=144;TCF=86;TCR=58;TR=100;WE=23865184;WS=23865166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,100:0.68:146
chr2	23865260	rs642931	T	C	2031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.120;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=47;PP=1588;ReadPosRankSum=-0.247;SC=CCACCCTGATTGCACACTCCT;SOR=0.261;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=119;TCF=47;TCR=72;TR=81;WE=23865268;WS=23865250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,81:0.68:119
chr2	23866082	rs3731615	C	T	1098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=35;PP=2207;ReadPosRankSum=0.455;SC=CCACTCCTCTCAGGGCACCGC;SOR=1.143;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=4;TCR=47;TR=38;WE=23866098;WS=23866072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,40:0.75:53
chr2	23866090	rs150707812	C	CGCA	1398.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=2156;ReadPosRankSum=0.464;SC=CTCAGGGCACCGCAGAACAGT;SOR=0.960;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=1;TCR=46;TR=27;WE=23866098;WS=23866072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,35:0.73:48
chr2	23907211	rs59352915	TA	T	1184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.862;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.340;SOR=1.506;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,71:0.70:102
chr2	23919169	rs72796125	C	T	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.909;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=216;ReadPosRankSum=-1.539;SC=CTCCTCACCCCGCCCGCTCTC;SOR=0.217;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=11;WE=23919177;WS=23919159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr2	23926233	rs72796138	C	T	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.223;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=361;ReadPosRankSum=1.041;SC=GGAGCTTCATCGAGTCCCCAA;SOR=1.030;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=75;TCF=26;TCR=49;TR=22;WE=23926241;WS=23926223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,22:0.28:79
chr2	23977377	.	A	C	974	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=29;NR=4;PP=974;QD=30.5688246226;SC=TAAAATACACATAACTCTTTT;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=33;WE=23977385;WS=23977376;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	24005662	rs140638944	A	C	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.448;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=596;ReadPosRankSum=-0.035;SC=TCTAGAACACAGGCATGACTT;SOR=2.242;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=26;WE=24005670;WS=24005652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,29:0.74:39
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chr2	24042550	rs2879639	C	T	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=1;PP=697;SC=AAAAATATACCATAATTCTAA;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=24042558;WS=24042540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr2	24055058	rs10432637	G	C	8492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.919;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=144;PP=2965;ReadPosRankSum=0.580;SC=ACACCCCACTGTCTTTAGTTT;SOR=0.186;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=249;TCF=103;TCR=146;TR=247;WE=24055066;WS=24055048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,257:0.99:259
chr2	24056843	.	G	A	4539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.549;ClippingRankSum=0.000;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.914;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=66;PP=2962;ReadPosRankSum=0.254;SC=CAGGTCTCCTGAGTGCAGGAT;SOR=0.981;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=271;TCF=158;TCR=113;TR=167;WE=24056851;WS=24056833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,171:0.61:281
chr2	24057022	rs199499624	C	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.81;MQRankSum=-4.929;QD=3.06;ReadPosRankSum=-3.035;SOR=0.533;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr2	24087621	rs72788214	A	C	912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=0;PP=715;SC=AATTTACTCAAATAACATTTG;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=24087629;WS=24087611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	24087857	rs12623316	A	G	1792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.60;SOR=3.952;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	24108557	rs72790304	G	A	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.786;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=162;ReadPosRankSum=-1.140;SC=CAATTAAAATGAAAAATATTT;SOR=1.536;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=13;WE=24108565;WS=24108547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,14:0.26:54
chr2	24108652	rs7579201	T	C	3556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=40;PP=2838;SC=TCGACGATTCTGTCGGATGTT;SOR=1.412;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=72;TCR=40;TR=112;WE=24108660;WS=24108642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr2	24111311	rs72790306	T	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=88;ReadPosRankSum=0.841;SC=CATCAACATTTGCTTATATAA;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=9;WE=24111319;WS=24111301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr2	24149439	rs61739076	G	A	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.949;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=703;ReadPosRankSum=-0.845;SC=GCCTCATCCAGAGTGACGCCG;SOR=0.490;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=88;TCF=66;TCR=22;TR=36;WE=24149447;WS=24149429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,34:0.40:86
chr2	24181159	rs12616678	G	T	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=6;PP=607;SC=TACTTTCTTTGTACTTTTACA;SOR=1.708;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=24181167;WS=24181149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	24181356	rs370272783	A	G	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=169;ReadPosRankSum=-1.591;SC=GTCATCTACTATGTTGAAGTA;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=9;WE=24181364;WS=24181346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr2	24239189	rs113601626	T	TCCTGGC	858.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.684;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=3.169;NF=4;NR=16;PP=1007;ReadPosRankSum=-0.949;SC=AGGCACCTGGTCCTGGCCCTG;SOR=1.327;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=71;TCF=26;TCR=45;TR=20;WE=24239197;WS=24239179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,23:0.29:78
chr2	24244458	rs142123482	G	C	1493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=6.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.878;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=7;PP=1227;ReadPosRankSum=0.212;SC=CTGCCCCTCCGGTGTCACCAC;SOR=0.368;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=94;TCF=85;TCR=9;TR=56;WE=24244466;WS=24244448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,54:0.59:92
chr2	24245659	rs17712391	C	T	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.217;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=391;ReadPosRankSum=1.749;SC=GCTGGCAGCACGGCCCTGGCG;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=74;TCF=72;TCR=2;TR=23;WE=24245667;WS=24245649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,28:0.34:83
chr2	24246175	rs12989842	C	T	2784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=77;PP=2323;SC=GTAAACCTGCCGTCCCAGGCC;SOR=5.186;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=5;TCR=77;TR=82;WE=24246183;WS=24246165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	24246679	rs925228	A	G	2073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=53;PP=1652;SC=TACCAAGCTCAGGGCATCCAT;SOR=4.244;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=5;TCR=53;TR=58;WE=24246687;WS=24246669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	24255862	rs10179142	C	G	3142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=69;PP=2567;SC=CAGAAGTAATCGAGTTAACAT;SOR=2.354;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=18;TCR=69;TR=87;WE=24255870;WS=24255852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr2	24255991	rs17763442	C	T	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.348;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=282;ReadPosRankSum=-0.234;SC=CTAAAAAATCCGAACAAAACA;SOR=0.746;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=51;TCF=28;TCR=23;TR=15;WE=24255999;WS=24255981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,20:0.34:58
chr2	24256071	rs17763463	T	C	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=23;PP=983;ReadPosRankSum=1.477;SC=TCTCCTAGAATACAACTAATA;SOR=0.646;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=68;TCF=34;TCR=34;TR=47;WE=24256079;WS=24256061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,49:0.70:70
chr2	24272645	rs116520786	C	T	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=62;ReadPosRankSum=0.732;SC=GGAGCGACGGCGGGGCTGGGG;SOR=0.648;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=7;WE=24272653;WS=24272635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr2	24302246	rs2303287	C	T	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=31;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=302;ReadPosRankSum=0.577;SC=CTTCCTTTCTCGGGGTAATGT;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=15;WE=24302254;WS=24302236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr2	24307260	rs5829915	A	ACAGGG	170.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.242;NF=0;NR=6;PP=193;ReadPosRankSum=0.436;SC=GCAGGACAGGACAGGGCAGGG;SOR=0.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=6;WE=24307268;WS=24307250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr2	24342505	rs1056122	T	C	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.225;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=564;ReadPosRankSum=0.614;SC=TGTAAGTTGCTACCAGAAGAT;SOR=0.275;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=122;TCF=90;TCR=32;TR=38;WE=24342513;WS=24342495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,38:0.31:122
chr2	24344060	rs33913065	T	G	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.557;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=32;PP=918;ReadPosRankSum=-1.507;SC=AATATTCATCTGCCCGGACAC;SOR=0.633;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=190;TCF=90;TCR=100;TR=62;WE=24344068;WS=24344050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,65:0.33:195
chr2	24369674	rs11693860	C	T	5403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=78;NR=83;PP=2965;SC=ACAAGGATAACGAAAAAAGAA;SOR=0.789;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=78;TCR=83;TR=161;WE=24369682;WS=24369664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr2	24384424	rs4665667	T	C	2690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=20;PP=2282;SC=ATTTGAAACCTTTGGCAAGAG;SOR=2.359;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=65;TCR=20;TR=85;WE=24384432;WS=24384414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	24386925	rs35664527	C	CA	127.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=150;ReadPosRankSum=2.720;SC=TATTTTCACACAAAAAAAGTA;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=8;WE=24386933;WS=24386915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr2	24387178	rs113322110	G	GC	1863.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=41;PP=2142;SC=TTGAGCCTCAGCAGGAACGGG;SOR=3.215;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=49;TCF=4;TCR=45;TR=45;WE=24387186;WS=24387168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	24388096	rs4665668	G	A	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=601;SC=AGCTGGCACCGATGTCTCCAG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=24388104;WS=24388086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	24390517	rs2288072	G	A	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.812;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=31;PP=1194;ReadPosRankSum=-0.115;SC=CGCGTTTGGGGCTGCTGAAGC;SOR=0.858;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=89;TCF=41;TCR=48;TR=56;WE=24390525;WS=24390507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,56:0.62:91
chr2	24395269	rs918802	T	C	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=0;PP=698;SC=AGCCTTTCCTTCGTTCAAGTA;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=24395277;WS=24395259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	24395294	rs918803	T	C	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=0;PP=906;SC=TAGAAATTTCTTAAGTTTTCT;SOR=5.838;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=24395302;WS=24395284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	24395506	rs889830	T	C	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=43;PP=1108;SC=CGGACTCAAGTGATCCTCCCA;SOR=4.935;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=4;TCR=43;TR=47;WE=24395514;WS=24395496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	24398281	rs2042467	T	G	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=3;PP=1218;SC=CCCAAAGGCCTGGCTCTCAAC;SOR=5.097;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=49;TCR=3;TR=52;WE=24398289;WS=24398271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	24398446	rs2042468	A	T	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=32;PP=890;ReadPosRankSum=-0.480;SC=AATGGAGGTGAGATAACGTGG;SOR=0.836;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=68;TCF=17;TCR=51;TR=42;WE=24398454;WS=24398436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,42:0.61:69
chr2	24400769	rs55661701	A	C	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.087;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=18;PP=556;ReadPosRankSum=0.052;SC=TGCATTCTACATATGTTCTAG;SOR=0.508;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=135;TCF=55;TCR=80;TR=39;WE=24400777;WS=24400759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,43:0.29:148
chr2	24402127	rs61193015	C	CAA	2056.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=31;PP=1983;SC=TAAAATGAAACGAGAATGTTG;SOR=1.931;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=39;WE=24402135;WS=24402117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	24413298	rs2288073	A	G	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.853;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=516;ReadPosRankSum=-0.336;SC=AAGCTCATCTATGCAGACAAG;SOR=0.570;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=58;TCR=34;TR=30;WE=24413306;WS=24413288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,30:0.33:92
chr2	24429234	rs138070209	CCCGGCGGGAAGGAAGGTGGAGATGCAGGGGG	C	101.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.08;ReadPosRankSum=-1.636;SOR=1.140;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,6:0.18:33
chr2	24431184	rs2303291	C	T	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.271;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=272;ReadPosRankSum=0.083;SC=TGCACCCAGGCGGTCCTACGG;SOR=0.369;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=67;TCF=43;TCR=24;TR=19;WE=24431192;WS=24431174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,21:0.28:75
chr2	24432138	rs2303292	C	T	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.809;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=597;ReadPosRankSum=1.268;SC=GGCTAGAACACTCCACCCGCC;SOR=0.957;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=83;TCF=29;TCR=54;TR=39;WE=24432146;WS=24432128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,42:0.48:88
chr2	24432211	rs2303293	C	T	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=41;PP=1170;SC=AGGGGTCTAGCGTCTAAGGTC;SOR=3.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=47;WE=24432219;WS=24432201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	24432620	rs2303294	A	G	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=0;PP=1131;ReadPosRankSum=-1.008;SC=GTCTGCCAGGAAGGCCTTAAG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=42;WE=24432628;WS=24432610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,44:0.83:53
chr2	24432667	rs2303295	C	G	3086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=19;PP=2433;SC=TGATGCTACCCCCAGACGCGT;SOR=3.077;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=87;TCR=19;TR=106;WE=24432675;WS=24432657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr2	24432839	rs2303296	A	G	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=7.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.66;ReadPosRankSum=0.038;SOR=1.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,35:0.23:149
chr2	24432937	rs2303297	C	T	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=126;ReadPosRankSum=-2.849;SC=TTTTAAATCCCGGCACAAACC;SOR=0.573;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=10;WE=24432945;WS=24432927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr2	24440997	rs2551183	A	T	2277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=59;PP=1793;SC=AATAATGTCAACATAAACTGA;SOR=6.154;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=61;TCF=2;TCR=59;TR=61;WE=24441005;WS=24440987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	24475205	rs4450560	T	C	5083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=133;NR=23;PP=2965;SC=GATTTTAATATCAAAATACCT;SOR=3.345;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=133;TCR=23;TR=156;WE=24475213;WS=24475195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr2	24484150	rs4665680	T	C	1847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=52;PP=1656;SC=TATAAGTATATTTATTTGTTT;SOR=6.556;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=53;TCF=1;TCR=52;TR=53;WE=24484158;WS=24484140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	24498839	rs4411652	T	G	184.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.81;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	24521493	rs7559133	C	T	1925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=14;PP=1614;SC=CAGGTAGCTCCATCATCATTC;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=45;TCR=14;TR=59;WE=24521501;WS=24521483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	24521766	rs6707600	C	T	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=19;PP=488;SC=CAATAAAAGTCAGGCAGAGTT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=24521774;WS=24521756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	24524725	rs72793213	A	G	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=171;ReadPosRankSum=-0.510;SC=CTTTTCAAGTATAACTTGTTG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=9;WE=24524733;WS=24524715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr2	24524958	rs7603997	C	T	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=3.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.44;ReadPosRankSum=-0.285;SOR=0.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,35:0.24:144
chr2	24550867	rs60863260	CA	C	1759.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=3.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=0.157;QD=19.55;ReadPosRankSum=0.514;SOR=2.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,87:0.97:90
chr2	24896389	rs4665712	T	G	1628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=46;PP=1346;SC=GCCAGTTTGGTTTTTTCTTTT;SOR=5.018;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=3;TCR=46;TR=49;WE=24896397;WS=24896379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	24905927	rs11125744	G	C	6493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=95;PP=2965;SC=TAATGAATACGAGCGTCTACA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=199;TCF=104;TCR=95;TR=199;WE=24905935;WS=24905917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr2	24933689	rs7593430	A	C	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=1;PP=565;SC=TTTCTTCATTATCTCAAAGTC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=24933697;WS=24933679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	24952740	rs11439247	C	CT	1368.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=31;PP=1411;SC=CGAAGTCTCACCTGTCACCAG;SOR=4.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=33;WE=24952748;WS=24952730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	24974945	rs11125763	T	G	2074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=32;PP=1595;SC=AGAGTTCTCTTCTCCAGCAAA;SOR=1.092;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=27;TCR=32;TR=59;WE=24974953;WS=24974935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	24980955	rs150066931	A	G	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=4.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.02;ReadPosRankSum=-0.382;SOR=1.159;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,38:0.26:149
chr2	25013348	.	T	G	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.797;ClippingRankSum=0.000;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=659;ReadPosRankSum=-0.605;SC=CGGAGAGCAATACAAGTGGCG;SOR=0.645;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=35;TCR=69;TR=35;WE=25013356;WS=25013338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,38:0.36:106
chr2	25022442	rs34475213	TA	T	95.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=0;PP=87;SC=AAAGTTCTGGTAAAAAAAAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=5;WE=25022450;WS=25022432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	25037042	rs1003064	G	A	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.229;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=329;ReadPosRankSum=0.588;SC=GACCTGTACAGTCTCCACTTC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=14;WE=25037050;WS=25037040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr2	25039804	rs2099505	G	A	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=480;SC=TTTATATACTGTACATTACTC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=25039812;WS=25039794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	25040423	rs10178420	G	A	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=4;PP=452;SC=GAGATTGAATGTCAGTGATCC;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=25040431;WS=25040413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	25046090	rs1127568	T	C	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=381;ReadPosRankSum=0.795;SC=AGTCAAAATCTGAGATGATTT;SOR=0.504;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=21;WE=25046098;WS=25046080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr2	25046355	rs4665273	T	C	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=87;ReadPosRankSum=-0.328;SC=GTCAGATTATTCCAGCATTTT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=5;WE=25046363;WS=25046345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr2	25047408	rs7604576	A	G	1843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=38;PP=1368;ReadPosRankSum=-0.777;SC=TTTTCTACCTACAGACACAGA;SOR=0.420;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=97;TCF=35;TCR=62;TR=61;WE=25047416;WS=25047398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,68:0.64:106
chr2	25048847	rs2289090	A	G	2025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-8.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=2;PP=1582;ReadPosRankSum=-1.543;SC=CTTAGGTCCCAGGGCTGCTTC;SOR=1.022;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=125;TCF=122;TCR=3;TR=83;WE=25048855;WS=25048837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,87:0.67:130
chr2	25050977	rs7566416	T	C	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.184;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=643;ReadPosRankSum=-0.802;SC=TGCCCTCCGTTTCCATCCCTG;SOR=0.530;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=32;WE=25050985;WS=25050967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,32:0.63:51
chr2	25057298	rs2278486	C	G	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.52;ReadPosRankSum=1.423;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr2	25061270	.	GGGGTGGGGT	G	367	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=367;QD=190.5;SC=CCCTAATCCAGGGGTGGGGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=2;WE=25061286;WS=25061260;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,2:0.33:6
chr2	25064079	rs2241757	G	A	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=108;ReadPosRankSum=0.648;SC=TGGGTCCAGGGCCGGGGCCCT;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=7;WE=25064087;WS=25064069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr2	25064193	rs2241759	G	A	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.043;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=530;ReadPosRankSum=0.471;SC=CCCGGTAGTCGGGCAAGCCGC;SOR=1.445;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=24;WE=25064201;WS=25064183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,26:0.81:32
chr2	25194741	rs7593864	G	A	3529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=74;PP=2722;SC=GAGACCTGCCGGGCTCCTTCC;SOR=1.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=31;TCR=74;TR=105;WE=25194749;WS=25194731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr2	25314186	rs2918630	T	C	1847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.724;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=39;PP=1472;ReadPosRankSum=-0.680;SC=TTCCCATTCTTATTCCAGGTG;SOR=0.598;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=113;TCF=41;TCR=72;TR=63;WE=25314194;WS=25314176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,67:0.57:118
chr2	25359422	rs3731631	G	A	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.088;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=220;ReadPosRankSum=-1.739;SC=TCCTGAAGCTGAAAGTGGACA;SOR=0.673;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=34;TCR=31;TR=18;WE=25359430;WS=25359412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,17:0.26:65
chr2	25360186	rs112767688	C	T	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.951;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=4;PP=761;ReadPosRankSum=0.017;SC=CCGACCCTGGCCTTCTGCCCG;SOR=0.276;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=55;TCF=50;TCR=5;TR=33;WE=25360194;WS=25360176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,34:0.61:56
chr2	25376681	rs113389176	G	A	3650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.235;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=85;PP=2860;ReadPosRankSum=-1.353;SC=CCCAGTATTGGGGTTCCTCAT;SOR=1.065;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=203;TCF=77;TCR=126;TR=132;WE=25376689;WS=25376671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,135:0.65:209
chr2	25377176	rs2164808	T	C	2397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=52;PP=1903;SC=TCCCCGTCTATGAAATGAAGT;SOR=1.206;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=33;TCR=52;TR=85;WE=25377184;WS=25377166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	25383887	rs1042571	G	A	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.865;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=314;ReadPosRankSum=-0.450;SC=CAGGGCAGGGGAGAGCAAGGG;SOR=0.327;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=64;TCF=59;TCR=5;TR=18;WE=25383895;WS=25383877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,22:0.32:69
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chr2	25466888	rs2289093	G	T	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.702;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=527;ReadPosRankSum=0.024;SC=TGCAGGCCCAGCGGTGTCCCA;SOR=0.255;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=30;TCF=17;TCR=13;TR=24;WE=25466896;WS=25466878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,25:0.78:32
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chr2	25602142	rs2304426	G	A	3182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.185;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=13;PP=2543;ReadPosRankSum=0.693;SC=GGGAGGCAGAGGACTCTTTGT;SOR=2.026;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=140;TCF=119;TCR=21;TR=107;WE=25602150;WS=25602132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,109:0.76:144
chr2	25602310	rs2304427	C	T	2946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.518;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=79;PP=2329;ReadPosRankSum=0.027;SC=TTGCTTCTCCCGTTACTCGTT;SOR=0.880;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=38;TCR=121;TR=103;WE=25602318;WS=25602300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,107:0.65:164
chr2	25610287	rs66917623	G	T	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=568;ReadPosRankSum=1.702;SC=CAGGGTGGGTGAGCGTGGAGA;SOR=0.495;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=27;WE=25610295;WS=25610277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,30:0.81:37
chr2	25650631	rs34648410	A	G	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.583;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.366;NF=1;NR=46;PP=1135;ReadPosRankSum=0.078;SC=TTAGCATCCAATACCTCATAA;SOR=2.066;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=75;TCF=3;TCR=72;TR=47;WE=25650639;WS=25650621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,49:0.63:78
chr2	25650668	rs3832082	C	CT	581.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.442;NF=0;NR=19;PP=685;ReadPosRankSum=0.302;SC=GTTTTGCCTACTTCCTGGACT;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=19;WE=25650676;WS=25650658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr2	25655772	rs7583475	T	C	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=601;ReadPosRankSum=-0.057;SC=GCCGCAGCTCTGCCAGCAGCG;SOR=0.627;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=31;WE=25655780;WS=25655762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr2	25656880	rs1395949	C	G	2557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=6.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.485;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=74;PP=2168;ReadPosRankSum=-1.170;SC=GTGGGGAAGTCGGGAGAAAGT;SOR=0.111;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=115;TCF=16;TCR=99;TR=89;WE=25656897;WS=25656870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,88:0.77:115
chr2	25875401	rs78873877	TA	T	362.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=4.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.716;QD=2.77;ReadPosRankSum=1.169;SOR=1.191;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,36:0.27:131
chr2	26161226	rs11388254	C	CA	684.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=0.026;QD=12.23;ReadPosRankSum=0.008;SOR=0.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr2	26174744	rs71441005	C	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.059;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=333;ReadPosRankSum=0.944;SC=TCTTCTCCTCCGGCGGGATGA;SOR=1.002;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=60;TCF=33;TCR=27;TR=20;WE=26174752;WS=26174734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,20:0.33:60
chr2	26174882	rs41285967	T	C	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.893;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.043;NF=8;NR=14;PP=305;ReadPosRankSum=-0.508;SC=CAGAGGGGGCTGGGCACGGTG;SOR=0.274;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=22;WE=26174890;WS=26174872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr2	26177198	rs17047211	A	G	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.389;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=28;PP=735;ReadPosRankSum=1.327;SC=GCACGCGGATATACTCATCAT;SOR=0.852;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=143;TCF=60;TCR=83;TR=47;WE=26177206;WS=26177188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,50:0.34:148
chr2	26203678	rs1465878	T	C	6059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=82;PP=2965;SC=CTCGTTCACCTGGGGCTTGTT;SOR=1.122;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=196;TCF=114;TCR=82;TR=196;WE=26203686;WS=26203668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr2	26321526	rs11678157	T	C	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.161;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=7;PP=797;ReadPosRankSum=1.388;SC=TTTTCTGCATTGTAGGAATAG;SOR=1.460;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=36;WE=26321534;WS=26321516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,39:0.75:52
chr2	26350136	rs2289022	G	T	1338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.604;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=40;PP=1040;ReadPosRankSum=1.147;SC=ACTCTGCTCTGTCTTTGTAAA;SOR=1.609;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=67;TCF=7;TCR=60;TR=43;WE=26350144;WS=26350126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,47:0.65:72
chr2	26357748	rs2243834	G	T	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.796;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=6;PP=1340;ReadPosRankSum=0.128;SC=CTGTTGAATCGTGATTTTATC;SOR=1.734;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=86;TCF=75;TCR=11;TR=57;WE=26357756;WS=26357738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,59:0.66:89
chr2	26395129	.	C	A	1298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.978;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=948;ReadPosRankSum=-0.264;SC=CAGTCCACACCGCGTGCTGTG;SOR=0.964;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=46;WE=26395137;WS=26395119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,50:0.68:74
chr2	26399214	rs4665830	G	A	3394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.494;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=66;PP=2589;ReadPosRankSum=0.140;SC=CCTTCCCAGGGGAGTACGCCG;SOR=0.954;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=180;TCF=80;TCR=100;TR=114;WE=26399222;WS=26399204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,122:0.65:188
chr2	26405434	rs114308539	G	A	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=517;ReadPosRankSum=-0.552;SC=AAAGGAACTTGTCACGGCAAG;SOR=0.789;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=72;TCF=28;TCR=44;TR=30;WE=26405442;WS=26405424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,29:0.41:71
chr2	26405985	rs10779956	A	G	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=26;PP=712;ReadPosRankSum=-0.432;SC=CTCCCTCACCAGGTGTGGTGT;SOR=0.796;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=32;WE=26405993;WS=26405975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,36:0.64:56
chr2	26408064	rs4665833	T	C	196.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=186;SC=CAGGGCTCGATCTCATCTCCT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=26408072;WS=26408054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	26415088	rs34898931	TA	T	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.049;QD=5.37;ReadPosRankSum=0.670;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
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chr2	26420809	rs2289019	G	C	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=4.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=615;ReadPosRankSum=2.424;SC=CACCTAGGGGGTTTTGTGTCG;SOR=0.892;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=24;WE=26420817;WS=26420799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,24:0.73:33
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chr2	26455002	rs35746418	C	G	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=662;ReadPosRankSum=0.605;SC=GGGCATATAGCTTCACAAAGG;SOR=0.354;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=15;WE=26455010;WS=26454986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr2	26455127	rs11552518	G	A	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=560;ReadPosRankSum=0.429;SC=TTGCTATTCTGTATTGGCATG;SOR=0.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=42;TCR=41;TR=32;WE=26455135;WS=26455117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,32:0.38:85
chr2	26457267	rs3892649	T	G	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.027;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=149;ReadPosRankSum=1.260;SC=AAGATAAAACTATAATTTATT;SOR=0.048;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=11;WE=26457275;WS=26457257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr2	26462093	rs12987980	A	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.051;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=-0.313;SC=GTAATTTACAATAATAACAAC;SOR=0.042;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=5;WE=26462101;WS=26462083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr2	26467347	rs62128457	C	A	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.630;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=274;ReadPosRankSum=1.029;SC=CCACCCCAGTCCCGGCAGGAG;SOR=0.360;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=60;TCF=54;TCR=6;TR=20;WE=26467355;WS=26467337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,22:0.35:63
chr2	26477125	rs147970487	G	GACT	2122.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=4;PP=1798;SC=ATTCCAGAATGACTATCTTGA;SOR=3.564;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=32;WE=26477133;WS=26477115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	26501953	rs7604564	C	A	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=166;ReadPosRankSum=-0.268;SC=TAGGTGTTAGCATAACACCGG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=11;WE=26501961;WS=26501943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,11:0.27:41
chr2	26505858	rs17528590	A	G	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.020;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=478;ReadPosRankSum=-1.356;SC=TCACCTCTCTATTTTTTTACC;SOR=0.982;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=59;TCF=27;TCR=32;TR=23;WE=26505866;WS=26505848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,24:0.41:59
chr2	26507724	rs17528653	T	C	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.480;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=493;ReadPosRankSum=-0.273;SC=AATAACGAGGTTCTTATTCGA;SOR=1.066;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=24;WE=26507732;WS=26507714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr2	26512733	rs1056632	T	G	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.732;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=542;ReadPosRankSum=0.538;SC=GTCCCTGTACTAGGTGGATTC;SOR=0.775;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=118;TCF=50;TCR=68;TR=36;WE=26512741;WS=26512723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,38:0.32:117
chr2	26512957	rs1056471	G	C	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=777;SC=CTATTAAATAGTTTGCACTTA;SOR=5.353;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=26512965;WS=26512947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr2	26532735	rs3856397	G	A	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.292;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=1;PP=662;ReadPosRankSum=-0.017;SC=TGACTGCTCTGACCAGGCTGC;SOR=2.925;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=28;WE=26532743;WS=26532725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,28:0.72:39
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chr2	26536299	rs11886746	C	G	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.474;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=534;ReadPosRankSum=-0.164;SC=TGCTGTGGACCGGCCCCCAGA;SOR=0.551;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=147;TCF=79;TCR=68;TR=42;WE=26536307;WS=26536289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,44:0.30:148
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chr2	26537499	rs10187359	A	C	4085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.152;SC=CACCTGCAGAAACGTGTGTGC;SOR=1.138;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=129;TCF=31;TCR=98;TR=128;WE=26537507;WS=26537489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,131:0.99:132
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chr2	26590084	rs6748996	T	G	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.848;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=590;ReadPosRankSum=0.318;SC=TAGCCTACACTCTAGGTAAGG;SOR=1.075;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=87;TCF=34;TCR=53;TR=36;WE=26590092;WS=26590074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,38:0.42:91
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chr2	26607992	rs934280	T	C	2376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=60;PP=2018;SC=TTGGAACAGCTTTTGCCAACA;SOR=2.995;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=12;TCR=60;TR=72;WE=26608000;WS=26607982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	26609469	rs7585892	G	A	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=1.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.69;ReadPosRankSum=0.219;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,11:0.22:49
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chr2	26652671	rs4356622	A	G	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.790;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=616;ReadPosRankSum=0.089;SC=CTGCTCTTGGAGGGCCCCTGG;SOR=1.398;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=26;WE=26652679;WS=26652661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr2	26653457	rs4450561	G	A	3620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.633;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=35;PP=2918;ReadPosRankSum=-0.210;SC=TTGGAGTATCGTCTTCATAAT;SOR=0.818;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=194;TCF=142;TCR=52;TR=135;WE=26653465;WS=26653447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,138:0.68:202
chr2	26663187	rs138497746	T	TTGTG	1353.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=0.302;QD=29.43;ReadPosRankSum=-0.181;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,33:0.72:46
chr2	26663215	rs56218945	A	G	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.297;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.478;NF=46;NR=5;PP=1150;ReadPosRankSum=3.126;SC=GTGTGTGTGTATATATATATA;SOR=1.885;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=78;TCF=71;TCR=7;TR=51;WE=26663223;WS=26663205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr2	26667615	rs939820	T	C	2057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=15;PP=1541;SC=TGAGAAGTTTTGGGAGATTTG;SOR=2.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=50;TCR=15;TR=65;WE=26667623;WS=26667605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	26671544	rs4072407	A	G	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=649;ReadPosRankSum=0.771;SC=TCTCCTCCCCATGACCCAACT;SOR=0.549;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=27;TCR=22;TR=35;WE=26671552;WS=26671534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,38:0.72:53
chr2	26676322	rs1402962	A	G	3906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.25;SOR=0.742;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr2	26676395	rs12623642	G	T	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=425;ReadPosRankSum=1.467;SC=GGAGGCCTTCGTCATGGGTCT;SOR=0.651;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=18;TCR=67;TR=28;WE=26676403;WS=26676385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,30:0.33:90
chr2	26677810	rs2280516	A	G	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=592;ReadPosRankSum=0.753;SC=CATGTGGGGCAGTTGGCTCTT;SOR=0.392;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=51;TCF=33;TCR=18;TR=28;WE=26677818;WS=26677800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr2	26682816	rs150188422	G	GTGTA	275.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=351;ReadPosRankSum=-1.440;SC=GTGTATATGTGTGTGTGTGCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=7;WE=26682824;WS=26682806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr2	26684497	rs2280512	C	T	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.259;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=8;PP=1189;ReadPosRankSum=-0.656;SC=TCCCTGTCCCCGCCAACCCGG;SOR=1.432;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=69;TCF=57;TCR=12;TR=51;WE=26684505;WS=26684487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,52:0.75:69
chr2	26688662	rs2272071	C	T	3071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.370;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=41;PP=2418;ReadPosRankSum=-0.668;SC=CATACACAGCCACCGTCAGCA;SOR=1.233;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=166;TCF=97;TCR=69;TR=110;WE=26688670;WS=26688652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,113:0.68:167
chr2	26689912	rs3215308	TG	T	1330.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.884;NF=49;NR=1;PP=906;ReadPosRankSum=-0.676;SC=GGGGAACCTGTGGGGGGGGCA;SOR=0.990;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=77;TCF=74;TCR=3;TR=50;WE=26689920;WS=26689902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,52:0.73:71
chr2	26691182	rs56265746	G	A	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=70;ReadPosRankSum=-0.345;SC=AGGGCTGGCAGGAGGGAAAAG;SOR=0.223;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=4;WE=26691190;WS=26691172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr2	26693967	rs2272072	C	T	1626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.563;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=23;PP=1145;ReadPosRankSum=-0.985;SC=CCCCAGAGCCCCTGCATGGCC;SOR=0.606;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=211;TCF=141;TCR=70;TR=67;WE=26693975;WS=26693957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,71:0.33:215
chr2	26698400	rs150711817	A	AG	685.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.884;NF=0;NR=28;PP=571;ReadPosRankSum=-0.902;SC=CAAGTGACAGAGGGGGGGGCA;SOR=0.542;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=28;WE=26698408;WS=26698390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,29:0.74:39
chr2	26698682	rs6712188	G	T	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=262;ReadPosRankSum=1.351;SC=GTGGCTCCAGGCCCCACAGGC;SOR=0.620;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=57;TCR=1;TR=17;WE=26698690;WS=26698672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,18:0.31:59
chr2	26699126	rs4335905	C	G	1772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=31;PP=1461;SC=GCCACAGGTACAGCTCCACCT;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=23;TCR=31;TR=54;WE=26699134;WS=26699116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	26699159	rs4997760	C	T	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=673;ReadPosRankSum=1.955;SC=TCCAGCCTGCCGAGCCGAAGC;SOR=0.765;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=34;WE=26699167;WS=26699149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,32:0.73:44
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chr2	26699855	rs2272069	G	C	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.636;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=445;ReadPosRankSum=-0.630;SC=GGGCATAGGCGACACGCTTGT;SOR=0.291;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=96;TCF=39;TCR=57;TR=28;WE=26699863;WS=26699845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,32:0.33:98
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chr2	26724725	rs6547079	T	G	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=27;PP=821;SC=GACTGCTTGTTGGGGAGGAGG;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=26724733;WS=26724715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
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chr2	26733500	rs939817	C	T	1427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=5;PP=1252;SC=ATCCCGCCCTCCACAGCCTGT;SOR=3.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=42;WE=26733508;WS=26733490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	26733677	rs7582117	G	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.519;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=260;ReadPosRankSum=-1.609;SC=GTGGACCAGAGACACTGGCCT;SOR=0.153;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=14;WE=26733685;WS=26733667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,15:0.31:49
chr2	26739423	rs11687696	T	C	2166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.536;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=66;PP=1650;ReadPosRankSum=0.725;SC=AGGAGCCCACTGTGCCGTCAG;SOR=0.869;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=139;TCF=47;TCR=92;TR=97;WE=26739431;WS=26739413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,92:0.68:135
chr2	26739526	rs55682147	A	G	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=256;ReadPosRankSum=0.721;SC=TCCACCCCGTATATGTGGCTG;SOR=0.693;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=14;WE=26739534;WS=26739516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr2	26750557	rs10865425	T	C	1846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=0;PP=1517;SC=CAGCCCAAGATTTCTTCGGTC;SOR=8.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=54;TCR=0;TR=54;WE=26750565;WS=26750547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	26781247	rs4665880	G	C	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.494;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=13;PP=1076;ReadPosRankSum=-0.274;SC=CCCAGCCCCTGCTAGAACTTT;SOR=1.031;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=156;TCF=113;TCR=43;TR=53;WE=26781255;WS=26781237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,51:0.34:151
chr2	26795217	.	GTT	G	542.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.204;QD=27.14;ReadPosRankSum=1.206;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr2	26795235	rs13004284	C	T	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.566;NF=0;NR=11;PP=268;ReadPosRankSum=1.011;SC=TTTTTTTTCTCTTGAATCATC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=11;WE=26795243;WS=26795225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr2	26798893	rs13002673	A	T	8178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=462;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.524;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=126;NR=179;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.543;SC=CCTTCAGCCAAGGCGGCCATT;SOR=0.990;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=449;TCF=195;TCR=254;TR=305;WE=26798901;WS=26798883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,309:0.68:454
chr2	26799031	rs2272464	G	A	2288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=69;PP=1864;ReadPosRankSum=-0.660;SC=CAGAGCTTACGAATTTCTACC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=15;TCR=102;TR=79;WE=26799039;WS=26799021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,80:0.67:119
chr2	26800422	rs1053807	G	A	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.727;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=23;PP=697;ReadPosRankSum=0.083;SC=AAGACAAGACGGGCACAGTGC;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=125;TCF=51;TCR=74;TR=38;WE=26800430;WS=26800412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,38:0.29:130
chr2	26801553	.	G	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.626;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=102;ReadPosRankSum=0.585;SC=CCTGGGGACAGGTATCCTCTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=8;WE=26801561;WS=26801543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,8:0.22:36
chr2	26801586	rs1148956	G	A	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.132;HP=6;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=258;ReadPosRankSum=-0.389;SC=GCCAGGATCTGCCCCCCATCC;SOR=0.230;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=65;TCF=60;TCR=5;TR=17;WE=26801594;WS=26801576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,17:0.28:61
chr2	26802392	rs2272467	A	T	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.924;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=42;PP=1102;ReadPosRankSum=-0.077;SC=TTTAGCCATGACCATGCTACC;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=72;TCF=12;TCR=60;TR=50;WE=26802400;WS=26802382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,52:0.70:74
chr2	26804008	rs744538	A	G	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=-0.664;SC=AGCCCTGGAAAGGGCAGTTCT;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=4;WE=26804016;WS=26803998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr2	26804122	rs744539	T	G	1846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=6.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.139;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=7;PP=1479;ReadPosRankSum=-0.460;SC=TAGAGGTGAGTGTGGGCCCAG;SOR=1.583;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=97;TCF=83;TCR=14;TR=62;WE=26804130;WS=26804112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,65:0.64:101
chr2	26804143	rs744540	T	C	1991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=12;PP=1526;ReadPosRankSum=1.191;SC=TACAAAGTCATACTTCAAACC;SOR=0.794;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=95;TCR=20;TR=70;WE=26804151;WS=26804133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,73:0.61:119
chr2	26804218	rs935171	G	A	5223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=89;PP=2965;SC=CATGTCAGGTGTTTGCCGCTA;SOR=0.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=88;TCR=89;TR=176;WE=26804226;WS=26804208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr2	26818006	rs1148962	T	C	2034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=23;PP=1553;SC=CTCTATGGCCTTTCCACCCCT;SOR=1.234;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=58;WE=26818014;WS=26817996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	26818021	rs1148963	C	T	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=289;ReadPosRankSum=-0.382;SC=ACCCCTCACCCCTCAGTCCCC;SOR=0.772;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=57;TCF=31;TCR=26;TR=19;WE=26818029;WS=26818011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,22:0.34:64
chr2	26846282	rs1615551	T	C	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.681;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=367;ReadPosRankSum=0.771;SC=CCCCACCTACTTTTAGGATTT;SOR=2.022;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=86;TCF=70;TCR=16;TR=23;WE=26846290;WS=26846272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,25:0.28:89
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chr2	27164806	rs3820823	G	A	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=617;ReadPosRankSum=-0.725;SC=GACACTTTCTGCAACATTTCA;SOR=0.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=33;WE=27164814;WS=27164796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,33:0.72:46
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chr2	27167784	rs3739088	C	T	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=45;ReadPosRankSum=-1.730;SC=TCTTTTGTGTCCTCTCCTCCC;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=6;WE=27167792;WS=27167774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,6:0.19:32
chr2	27169637	rs3835821	TC	T	1016.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.754;NF=23;NR=3;PP=1020;ReadPosRankSum=0.988;SC=TGAGCCTCTGTCTCCTCATCT;SOR=0.850;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=26;WE=27169645;WS=27169627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,30:0.67:45
chr2	27169842	rs11126784	C	A	2182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.074;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=47;PP=1720;ReadPosRankSum=-1.635;SC=CTCCCGGAGGCAGGTCGAGTG;SOR=0.404;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=105;TCF=37;TCR=68;TR=77;WE=27169850;WS=27169832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,80:0.74:108
chr2	27246285	rs10865456	C	T	4172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=70;NR=58;PP=2965;SC=AACTAGAGCACGAATACATCC;SOR=0.838;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=70;TCR=58;TR=128;WE=27246293;WS=27246275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr2	27249156	.	C	G	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=0.000;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=1.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.185;SOR=0.572;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,65:0.28:231
chr2	27249245	rs3754733	A	G	4373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.913;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=114;PP=2962;ReadPosRankSum=0.615;SC=CTGACTGCACAGCTTCCCCGT;SOR=0.870;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=226;TCF=70;TCR=156;TR=164;WE=27249253;WS=27249235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,168:0.71:235
chr2	27258120	.	C	A	1526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-7.551;ClippingRankSum=0.000;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=1168;ReadPosRankSum=0.409;SC=ACAAGCTCCTCTAAGTGAACC;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=81;TCF=47;TCR=34;TR=53;WE=27258128;WS=27258110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,56:0.67:84
chr2	27259794	rs13021112	G	A	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=505;ReadPosRankSum=0.435;SC=AGAATGTGATGGTGAGGAAGG;SOR=1.101;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=22;WE=27259802;WS=27259784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,23:0.74:31
chr2	27260469	rs1124649	G	A	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.430;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=19;PP=692;ReadPosRankSum=0.842;SC=CCGACTGAAAGTGCTGGCATT;SOR=0.763;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=136;TCF=65;TCR=71;TR=41;WE=27260477;WS=27260459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,42:0.29:143
chr2	27261329	rs11690454	A	G	1621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=6;PP=1344;SC=CCACCTGACTAGGGGGTTGTG;SOR=3.398;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=42;TCR=6;TR=48;WE=27261337;WS=27261319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	27262763	rs146244277	GGGA	G	5532.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.86;NF=6;NR=113;PP=2971;SC=CTGGGTGTCAGGGAGGAGGCG;SOR=4.754;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=130;TCF=7;TCR=123;TR=119;WE=27262773;WS=27262753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr2	27263122	rs1866654	T	C	4007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=36;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.361;SC=AGCAGAATTCTGGGAAAGGAG;SOR=0.744;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=232;TCF=174;TCR=58;TR=145;WE=27263130;WS=27263112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,149:0.63:238
chr2	27276202	rs3806520	G	A	995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.181;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=755;ReadPosRankSum=0.354;SC=GGCTGGCTCCGGCTCTCCCAC;SOR=0.445;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=29;TCR=20;TR=33;WE=27276210;WS=27276192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,35:0.69:51
chr2	27279416	rs2384570	A	G	2290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=14;PP=1726;SC=TCACATGGTCACATACTTGCT;SOR=2.891;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=60;TCR=14;TR=74;WE=27279424;WS=27279406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr2	27280092	rs6711384	T	A	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.718;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=3;PP=680;ReadPosRankSum=0.025;SC=TTGCCTCCTTTGACCACCTAA;SOR=1.863;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=30;WE=27280100;WS=27280082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,30:0.83:36
chr2	27280127	rs6721395	G	A	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.506;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=8;PP=840;ReadPosRankSum=-0.402;SC=TTCTGTCCTGGTATCTGTTCA;SOR=1.329;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=37;WE=27280135;WS=27280117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,37:0.74:50
chr2	27290525	rs11681145	A	G	3423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.602;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=76;PP=2678;ReadPosRankSum=0.613;SC=GTCTGTACCCACTGCCACTGA;SOR=0.797;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=77;TCR=106;TR=131;WE=27290533;WS=27290515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,133:0.71:187
chr2	27292651	rs10865461	T	C	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=368;ReadPosRankSum=0.716;SC=TTCAGAATAATTTTCTGCTTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=15;WE=27292659;WS=27292641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr2	27293150	rs1053609	G	T	1663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.351;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=49;PP=1439;ReadPosRankSum=-1.814;SC=TTATGTTCAAGCCCAGGATAT;SOR=1.998;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=85;TCF=19;TCR=66;TR=60;WE=27293158;WS=27293140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,59:0.69:85
chr2	27302165	rs2289360	T	C	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.327;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=38;PP=723;ReadPosRankSum=0.665;SC=ATGCCACCTCTGCCTGGCTCT;SOR=1.066;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=76;TCF=10;TCR=66;TR=43;WE=27302173;WS=27302155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,44:0.57:77
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chr2	27307769	rs2304682	G	C	1619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.844;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=34;PP=1284;ReadPosRankSum=1.596;SC=ACGTAGCACCGAGCACAACAG;SOR=0.975;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=83;TCF=34;TCR=49;TR=56;WE=27307777;WS=27307759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,59:0.66:90
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chr2	27351279	rs1866561	G	A	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.862;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=2;PP=691;ReadPosRankSum=-1.374;SC=AAAAGTCAGGGAAGTGGGGCA;SOR=0.217;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=50;TCF=48;TCR=2;TR=31;WE=27351287;WS=27351269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,32:0.62:52
chr2	27351948	rs6715286	T	G	5019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=80;PP=2965;ReadPosRankSum=1.924;SC=GTAGCCAGGATACATACGTCT;SOR=0.280;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=70;TCR=82;TR=150;WE=27351956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,154:0.99:155
chr2	27353507	rs2304678	G	C	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=2.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.33;ReadPosRankSum=0.680;SOR=0.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,40:0.26:155
chr2	27354173	rs11126874	C	A	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=1;PP=389;SC=ATCTTGTCAGCGGCAACCTCA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=27354181;WS=27354163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	27354971	rs11695930	C	T	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=642;ReadPosRankSum=0.800;SC=CAATAAAGAGCTCATTGTCCT;SOR=0.646;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=163;TCF=97;TCR=66;TR=47;WE=27354979;WS=27354961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,47:0.28:165
chr2	27355454	rs4665948	A	C	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=1;PP=646;SC=TTCAGCCACCACCCAAAGTCT;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=27355462;WS=27355444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	27355991	rs2289358	G	T	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.958;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=390;ReadPosRankSum=-0.225;SC=ACACCTTCCAGACACGGACGT;SOR=0.478;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=91;TCF=66;TCR=25;TR=27;WE=27355999;WS=27355981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,28:0.31:90
chr2	27356278	rs2289359	T	C	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.017;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=234;ReadPosRankSum=0.795;SC=CCATGGCAGGTGCCCATACAA;SOR=1.965;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=14;WE=27356286;WS=27356268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr2	27424496	rs1006898	G	A	2175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=11;PP=1716;SC=TCAAAGGAGGGCTTTGAGAAA;SOR=3.007;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=55;TCR=11;TR=66;WE=27424504;WS=27424486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	27424636	rs1395	G	A	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.590;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=27;PP=965;ReadPosRankSum=1.502;SC=TGGCATGCTGGAGCCCATGCT;SOR=0.426;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=182;TCF=105;TCR=77;TR=56;WE=27424644;WS=27424626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,61:0.32:192
chr2	27426362	rs2580761	G	A	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.070;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=666;ReadPosRankSum=0.168;SC=ACCTCAGAGCGGGCCTGGAAG;SOR=2.049;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=28;WE=27426370;WS=27426352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr2	27426514	rs1275521	G	C	3712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=24;PP=2965;SC=CCCTTGTCATGCACACAGATG;SOR=2.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=80;TCR=24;TR=104;WE=27426522;WS=27426504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr2	27428147	rs1298361	A	G	1328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=1;PP=1082;SC=TACTATAGCCAAGACCAGCCT;SOR=6.273;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=45;WE=27428155;WS=27428137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	27428295	rs1275524	A	G	6727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=88;PP=2965;SC=CTGACCCCACAATGATAACTG;SOR=1.125;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=220;TCF=132;TCR=88;TR=220;WE=27428303;WS=27428285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr2	27428702	rs1275525	A	C	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=2;PP=563;SC=CCCTGTTGACATCATTCCCAT;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=27428710;WS=27428692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	27428815	rs1275526	C	G	3392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=25;PP=2788;SC=CTCAGCTTATCTCTTCTTTTC;SOR=2.393;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=82;TCR=25;TR=107;WE=27428823;WS=27428805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	27428877	rs1275527	C	G	3608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=65;PP=2965;SC=CCCCACACCACGGCTTACTGC;SOR=1.035;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=49;TCR=65;TR=114;WE=27428885;WS=27428867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr2	27435250	rs1275533	A	G	2837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=31;PP=2349;SC=GCGCCTCACGACCCGGGTAGT;SOR=1.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=54;TCR=31;TR=85;WE=27435258;WS=27435240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr2	27435374	rs11608	G	A	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.698;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=402;ReadPosRankSum=-1.348;SC=AAGCAGGGTCGCTGGCCAGCC;SOR=0.324;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=80;TCF=20;TCR=60;TR=27;WE=27435382;WS=27435364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,28:0.35:81
chr2	27438710	rs11126918	G	A	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.685;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=41;PP=928;ReadPosRankSum=-0.416;SC=TTGCTTAAGCGCCTTTCATTC;SOR=3.752;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=2;TCR=62;TR=41;WE=27438718;WS=27438700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,42:0.67:63
chr2	27440785	rs1275536	C	T	6239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=124;NR=65;PP=2965;SC=AGGCCCTCACCGATCCCTCCT;SOR=1.573;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=189;TCF=124;TCR=65;TR=189;WE=27440793;WS=27440775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr2	27445315	rs3214689	G	GT	2744.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.504;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.873;NF=47;ReadPosRankSum=0.394;SC=GAAGGTAGGAGTTGGTGCAGG;SOR=1.274;Source=Platypus;WE=27445323;WS=27445305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,90:0.73:123
chr2	27448171	.	CT	TT	134	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5002,0.5000;HP=24;HapScore=4;MGOF=7;MMLQ=14;MQ=54.71;NF=1,0;NR=6,15;PP=52,134;QD=7.85714285714;SC=GTGTTATTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=7,15;WE=27448179;WS=27448161;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr2	27448171	.	CT	CTT	134	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5002,0.5000;HP=24;HapScore=4;MGOF=7;MMLQ=14;MQ=54.71;NF=1,0;NR=6,15;PP=52,134;QD=7.85714285714;SC=GTGTTATTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=7,15;WE=27448179;WS=27448161;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:30,7:0.19:37
chr2	27448995	.	A	G	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.897;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=227;ReadPosRankSum=0.121;SC=ACCCCCCTTCACAGGTGTGTA;SOR=0.909;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=15;WE=27449003;WS=27448985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr2	27449293	rs7593448	C	G	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.438;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=1142;ReadPosRankSum=-1.232;SC=CCCTGGAGTACAAGCTGGAAT;SOR=0.694;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=49;WE=27449301;WS=27449283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,50:0.76:66
chr2	27460968	rs1141313	A	G	3831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.327;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=86;PP=2723;ReadPosRankSum=0.919;SC=TGGCTCACGCAGAGCAGCAAA;SOR=0.503;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=208;TCF=73;TCR=135;TR=138;WE=27460976;WS=27460958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,150:0.66:226
chr2	27462076	rs3739092	C	T	2577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.843;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=58;PP=2115;ReadPosRankSum=0.549;SC=TTCACCTGCCCCCGCAGGAGG;SOR=0.400;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=121;TCF=38;TCR=83;TR=88;WE=27462084;WS=27462066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,92:0.71:130
chr2	27462337	rs138840581	C	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.452;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=207;ReadPosRankSum=-0.492;SC=TATCGATGGGCAGGTACGCAA;SOR=0.260;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=12;WE=27462345;WS=27462327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr2	27462405	rs2014252	T	A	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.828;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=186;ReadPosRankSum=0.539;SC=TTTCTTCCCTTCCCAGCACAT;SOR=2.262;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=10;WE=27462413;WS=27462395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr2	27481460	rs58965570	C	T	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=337;ReadPosRankSum=2.102;SC=TTGTTGCTGTCCCTTATCCCT;SOR=0.836;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=13;WE=27481468;WS=27481450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr2	27486134	rs113407226	G	A	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=2.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.39;ReadPosRankSum=1.058;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,34:0.26:130
chr2	27497815	.	T	G	25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=25;QD=29.8856062736;SC=TAATGAGACGTGCAAACTCAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=2;WE=27497823;WS=27497808;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,2:0.22:9
chr2	27505782	rs62130709	C	T	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.561;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=38;PP=935;ReadPosRankSum=0.292;SC=GTGCCAGGGACGGGGCAGGGC;SOR=0.437;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=70;TCF=7;TCR=63;TR=43;WE=27505790;WS=27505772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,44:0.61:72
chr2	27522543	rs141577308	C	CCTAT,CCTATCTAT	2078.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=8.451;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2,2;NR=29,29;PP=512,744;ReadPosRankSum=-1.239;SC=CGCACTCAGCCCTATCTATCT;SOR=3.645;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=90;TCF=11;TCR=79;TR=31,31;WE=27522551;WS=27522533;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.29,0.69:42
chr2	27528593	.	C	T	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.210;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=272;ReadPosRankSum=-0.681;SC=CGGCCTCATCCGTCAGTATGG;SOR=0.951;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=45;TCF=20;TCR=25;TR=15;WE=27528601;WS=27528583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr2	27528692	rs4665963	T	C	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=497;ReadPosRankSum=-1.953;SC=CCAGGTGGGCTCTAGGGGAGG;SOR=1.264;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=22;WE=27528700;WS=27528682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,23:0.82:28
chr2	27532870	rs62130714	A	G	2225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=43;PP=1770;ReadPosRankSum=0.693;SC=GGAATAACACAATGAAGAGGA;SOR=0.642;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=64;TCR=59;TR=88;WE=27532878;WS=27532860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,89:0.72:124
chr2	27535311	rs5830041	T	TG	6364.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=82;PP=2936;SC=CTTCTTCCCCTGGCTGTCAGC;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=148;TCF=65;TCR=83;TR=140;WE=27535319;WS=27535301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr2	27549833	rs35568684	CA	C	430.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.582;HP=14;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.766;NF=6;NR=15;PP=234;ReadPosRankSum=0.640;SC=GCTGTATGAACAAAAAAAAAA;SOR=0.235;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=21;WE=27549841;WS=27549822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr2	27550967	rs1049817	A	G	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.300;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=830;ReadPosRankSum=-0.620;SC=TTCGAGCCTTAGGAGGGTTGG;SOR=1.431;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=37;WE=27550975;WS=27550957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,38:0.61:62
chr2	27556721	rs3739095	G	A	1939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.921;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=35;PP=1463;ReadPosRankSum=0.461;SC=GCTCAAATCAGTGCTTAATCC;SOR=0.405;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=110;TCF=51;TCR=59;TR=69;WE=27556729;WS=27556711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,73:0.63:116
chr2	27558252	rs11684134	A	G	1622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=18;PP=1312;ReadPosRankSum=0.814;SC=AGGGGGAGATAAAAGGAAATG;SOR=0.698;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=61;TCR=27;TR=59;WE=27558260;WS=27558242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,59:0.66:89
chr2	27566520	rs11689803	T	A	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-5.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.307;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=421;ReadPosRankSum=-0.446;SC=TTCCCCATCTTTTCTCCCTCA;SOR=0.083;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=22;WE=27566528;WS=27566510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr2	27589810	rs2280737	T	C	4606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=99;PP=2962;ReadPosRankSum=0.483;SC=TGAGCTAGAGTGAATGAAGAG;SOR=0.681;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=262;TCF=117;TCR=145;TR=177;WE=27589818;WS=27589800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,181:0.67:270
chr2	27590491	.	T	TA	304.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=1.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.48;MQRankSum=2.553;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.593;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
chr2	27591804	rs80051818	T	C	1283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.008;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=1072;ReadPosRankSum=-0.032;SC=AGAGCTGTTTTACTATTGGGC;SOR=0.226;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=65;TCF=45;TCR=20;TR=46;WE=27591812;WS=27591794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,45:0.70:64
chr2	27592423	rs7602534	C	T	1881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.723;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=38;PP=1256;ReadPosRankSum=-1.047;SC=CTGCCTGAGACACAGACATAG;SOR=0.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=108;TCF=49;TCR=59;TR=67;WE=27592431;WS=27592413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,77:0.65:118
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chr2	27599132	rs12475426	G	A	4473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.162;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=77;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.512;SC=GTCTTGAGAGGGAGGGGAAGT;SOR=0.480;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=217;TCF=111;TCR=106;TR=151;WE=27599140;WS=27599122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,161:0.71:228
chr2	27600239	rs13472	G	A	2165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.915;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=22;PP=1629;ReadPosRankSum=0.440;SC=CACTGAGCTCGTGAAGTGCCT;SOR=0.527;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=105;TCF=78;TCR=27;TR=79;WE=27600247;WS=27600229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,82:0.73:112
chr2	27606098	rs2384629	A	G	1172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=1;PP=978;ReadPosRankSum=-0.631;SC=TATTTCACAGAAATATAAGAA;SOR=4.351;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=34;WE=27606106;WS=27606088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr2	27656822	rs3214499	G	GA	2901.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.676;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=46;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.467;SC=AGTGATTTGTGACTCTGTTAT;SOR=0.601;SbPval=0.51;Source=Platypus;TCF=45;TR=75;WE=27656830;WS=27656812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,89:0.66:135
chr2	27659491	rs780102	T	C	1528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.156;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=9;PP=1097;ReadPosRankSum=0.228;SC=AAAGGGAATATGTTTGTGCCT;SOR=0.449;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=79;TCF=67;TCR=12;TR=54;WE=27659499;WS=27659481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,58:0.68:85
chr2	27659824	rs116758259	T	G	2559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.793;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.385;NF=70;NR=19;PP=1963;ReadPosRankSum=1.622;SC=ACAAAATATTTTTCTTTTCTT;SOR=0.881;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=138;TCF=107;TCR=31;TR=89;WE=27659840;WS=27659814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,92:0.65:141
chr2	27663215	rs1260341	T	A	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.215;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=497;ReadPosRankSum=-1.088;SC=CATGCCTTCTTTGACATTTAA;SOR=2.015;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=25;WE=27663223;WS=27663205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr2	27663416	rs1260342	G	T	5245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.025;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=76;PP=2962;ReadPosRankSum=0.011;SC=GATTGGTCACGACCACTCTTG;SOR=0.835;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=303;TCF=178;TCR=125;TR=195;WE=27663424;WS=27663406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,196:0.64:304
chr2	27665361	rs780112	C	G	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.887;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=10;PP=661;ReadPosRankSum=1.967;SC=ACCCTTGCCCCGTCCTACTGC;SOR=1.795;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=67;TCF=47;TCR=20;TR=41;WE=27665369;WS=27665351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,40:0.60:67
chr2	27667297	rs4803	A	G	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.525;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=355;ReadPosRankSum=0.301;SC=CAGCTCTACCAACTACTGAAA;SOR=1.075;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=18;WE=27667305;WS=27667287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr2	27667520	rs10635082	T	TTTTG	525	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=40.38;ReadPosRankSum=0.937;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,12:0.92:13
chr2	27669341	rs11333597	AT	A	1865.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.643;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.731;NF=1;NR=50;PP=1960;ReadPosRankSum=0.507;SC=ACTGCTCTGGATTCTCAAGCT;SOR=1.700;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=79;TCF=3;TCR=76;TR=51;WE=27669349;WS=27669331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,58:0.67:87
chr2	27669365	rs11430923	G	GT	728.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=31;PP=461;ReadPosRankSum=1.310;SC=CTGGGTCTTAGTTTTTTTTTT;SOR=0.638;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=32;WE=27669373;WS=27669355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,34:0.67:51
chr2	27670307	rs11126999	G	A	1650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.964;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=17;PP=1246;ReadPosRankSum=-0.508;SC=AATCCAGAACGTGAATCAATT;SOR=0.556;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=58;TCR=24;TR=57;WE=27670315;WS=27670297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,60:0.69:87
chr2	27672456	rs77876269	C	T	4174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.613;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=62;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.402;SC=AGAGCTCCATCTTCATGTTCC;SOR=0.758;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=187;TCF=102;TCR=85;TR=140;WE=27672464;WS=27672446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,142:0.75:190
chr2	27676287	rs56076827	A	T	2424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.183;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=37;PP=1807;ReadPosRankSum=-0.261;SC=CGCTGTTTCCAGAGTCTCGCA;SOR=1.012;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=138;TCF=75;TCR=63;TR=89;WE=27676295;WS=27676277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,92:0.64:143
chr2	27677691	rs780104	G	A	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.757;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=221;ReadPosRankSum=2.449;SC=AAAGGAAGACGGGCAGGCAGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=11;WE=27677699;WS=27677681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr2	27681598	rs780106	A	C	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=354;ReadPosRankSum=0.304;SC=TGAGGCCACAATGCCACTAAG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=14;WE=27681606;WS=27681588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr2	27684734	rs780107	A	G	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.464;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=629;ReadPosRankSum=1.290;SC=AGAGAGGGACACCAGAAAGAT;SOR=1.981;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=24;WE=27684742;WS=27684724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,26:0.70:37
chr2	27685388	rs780110	G	A	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=1;PP=962;ReadPosRankSum=0.577;SC=AGTAAGGACTGACACAAGAGA;SOR=1.536;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=66;TCF=64;TCR=2;TR=42;WE=27685396;WS=27685378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,42:0.66:64
chr2	27688601	rs1647276	C	T	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.487;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=688;ReadPosRankSum=-1.245;SC=TGGTTATTGGCCAGCCTCTCA;SOR=0.142;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=33;WE=27688609;WS=27688591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,35:0.67:52
chr2	27706640	rs2272417	T	C	2007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.745;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=16;PP=1606;ReadPosRankSum=-0.188;SC=TTCTCCCCAGTACGCAACTTG;SOR=0.937;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=124;TCF=95;TCR=29;TR=73;WE=27706648;WS=27706630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,74:0.59:125
chr2	27715207	rs8395	T	A	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=0;PP=966;ReadPosRankSum=1.861;SC=GGGAGTGGCATTACCCTCTGG;SOR=1.938;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=38;WE=27715215;WS=27715197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,38:0.72:53
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chr2	27721971	rs813592	T	C	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=16;PP=1032;SC=GCTTCTGCTTTCCAGCCACTG;SOR=1.096;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=39;WE=27721979;WS=27721961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	27722416	rs1260320	G	A	2951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=68;PP=2511;SC=GGTGCTAGAAGGCAGGAAGTT;SOR=2.356;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=89;TCF=20;TCR=69;TR=88;WE=27722424;WS=27722406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr2	27728777	rs2293572	C	G	1437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=37;PP=1160;SC=ATTGGCAGGTCTAGATCCAAG;SOR=2.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=49;WE=27728785;WS=27728767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	27729480	rs2293571	G	A	4551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=67;PP=2965;SC=TGAGGATGTGGCCCGGATGGA;SOR=0.827;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=139;TCF=71;TCR=68;TR=138;WE=27729488;WS=27729470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr2	27730940	rs1260326	T	C	3260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=32;PP=2475;SC=CAGACCTTGCTGGTGAGAGTC;SOR=1.702;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=69;TCR=32;TR=100;WE=27730948;WS=27730930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr2	27803279	rs145678525	C	T	2138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.519;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=39;PP=1562;ReadPosRankSum=0.059;SC=AAGTGAGAACCAAAAAGACCT;SOR=0.410;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=226;TCF=134;TCR=92;TR=80;WE=27803287;WS=27803269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,89:0.37:240
chr2	27806793	rs145957642	G	GT	221.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.706;NF=1;NR=10;PP=360;ReadPosRankSum=-1.887;SC=TTTTTCTAAGGTTCTTTTGTG;SOR=0.280;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=11;WE=27806801;WS=27806783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,11:0.27:41
chr2	27855660	.	G	A	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.158;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=276;ReadPosRankSum=0.136;SC=CATTAGGAGTGAAAAAAAAAT;SOR=2.360;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=5;TCR=44;TR=14;WE=27855668;WS=27855650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,15:0.30:50
chr2	27857992	rs4666009	T	A	4218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-7.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.979;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=62;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.988;SC=GGCTTTGATTTTTTTGTGGCT;SOR=0.325;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=218;TCF=136;TCR=82;TR=153;WE=27858000;WS=27857982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,156:0.71:219
chr2	27858112	rs76683865	G	A	2819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.576;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=75;PP=2136;ReadPosRankSum=1.076;SC=GTAATTGATTGTTGGTGGGGA;SOR=0.363;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=170;TCF=40;TCR=130;TR=102;WE=27858120;WS=27858102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,106:0.61:173
chr2	27858167	.	C	CT	239.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.73;ReadPosRankSum=-1.624;SOR=0.434;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr2	27861707	rs11692692	G	A	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.441;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=116;ReadPosRankSum=-0.725;SC=TAAATTTTGCGTTTGTTGGCT;SOR=0.036;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=8;WE=27861715;WS=27861697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr2	27864089	rs146979490	A	G	2278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.425;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=28;PP=1799;ReadPosRankSum=1.669;SC=GGAATTTAGAAAGTGTTTCTC;SOR=0.875;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=130;TCF=83;TCR=47;TR=80;WE=27864097;WS=27864079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,82:0.59:138
chr2	27865416	.	T	TA	2509.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.000;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.003;NF=1;NR=95;PP=2429;ReadPosRankSum=-1.791;SC=TGTTAGGAACTAAAAAAAGGT;SOR=0.362;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=153;TCF=1;TCR=152;TR=96;WE=27865424;WS=27865406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,100:0.67:149
chr2	27876641	rs74965659	C	T	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.187;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=36;PP=831;ReadPosRankSum=-0.068;SC=GATGGACATACACCAAGTGTA;SOR=1.786;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=56;TCF=7;TCR=49;TR=40;WE=27876649;WS=27876631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,42:0.72:58
chr2	27878490	rs148624419	A	G	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=38;PP=895;ReadPosRankSum=0.037;SC=GCAAGAGTCAATTTTCCAAGG;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=1;TCR=49;TR=39;WE=27878498;WS=27878480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,42:0.79:53
chr2	27883958	rs6756254	C	T	3014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=56;PP=2277;ReadPosRankSum=-0.650;SC=ACCCAGGGCACGAGGGAAGAG;SOR=0.589;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=153;TCF=70;TCR=83;TR=107;WE=27883966;WS=27883948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,112:0.71:158
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chr2	27886820	rs58106741	G	T	4710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.148;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=103;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.526;SC=CCCTGGCGTCGCAAGACCTCA;SOR=0.511;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=245;TCF=90;TCR=155;TR=168;WE=27886828;WS=27886810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,168:0.68:248
chr2	27887034	rs9678851	C	A	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.219;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=668;ReadPosRankSum=0.576;SC=GTCGCGCCCCCCGACAGCGGT;SOR=1.274;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=105;TCF=60;TCR=45;TR=39;WE=27887042;WS=27887024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,42:0.39:109
chr2	27891453	rs142886666	A	T	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=100;ReadPosRankSum=0.289;SC=AGTAGCTGGGACAAAAGTCAC;SOR=0.693;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=6;WE=27891461;WS=27891443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr2	27907817	rs75617903	G	A	2317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.081;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=8;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.002;SC=TAAACATTCAGTACATTTAGA;SOR=0.284;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=121;TCF=111;TCR=10;TR=76;WE=27907836;WS=27907807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,81:0.65:125
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chr2	27995781	rs3736594	A	C	65.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=39;ReadPosRankSum=-0.674;SC=GAAATACTTGAAGGAACCTTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=27995789;WS=27995771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
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chr2	28084530	.	T	TG	246.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=0.420;QD=12.34;ReadPosRankSum=-1.241;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
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chr2	28219371	rs149178160	G	A	1560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.637;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=49;PP=1313;ReadPosRankSum=0.641;SC=AAGCAGTGTGGATCTCAAATT;SOR=0.033;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=88;TCF=8;TCR=80;TR=57;WE=28219379;WS=28219361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,56:0.63:89
chr2	28239462	rs147520771	A	T	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.501;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=29;PP=729;ReadPosRankSum=0.626;SC=ACATCCCAGAATCCACTGTGT;SOR=1.027;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=63;TCF=7;TCR=56;TR=32;WE=28239470;WS=28239452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,32:0.51:63
chr2	28464435	rs6737817	T	C	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=663;SC=GATCTTGGCTTACTGCAACCT;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=28464443;WS=28464425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	28634790	rs12624279	G	A	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.60;ReadPosRankSum=2.211;SOR=0.480;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,9:0.18:50
chr2	28718897	rs4665423	A	G	2829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=28;PP=2360;SC=ACACAGAGGAACATAAAAGCA;SOR=1.802;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=63;TCR=28;TR=91;WE=28718905;WS=28718887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr2	28748857	rs4666085	T	C	2998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=44;PP=2289;SC=GCCCCTCTCCTTCCCAACACA;SOR=0.780;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=95;TCF=50;TCR=45;TR=94;WE=28748865;WS=28748847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr2	28748916	rs10181687	A	C	2447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=61;PP=1976;ReadPosRankSum=1.358;SC=CCACTTTATCACTGGAGCCCA;SOR=1.029;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=19;TCR=62;TR=80;WE=28748924;WS=28748906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,79:0.99:80
chr2	28752498	rs6728486	T	C	5017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=29;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.783;SC=GGATAAAGCTTAGAGACTGAC;SOR=1.427;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=147;TCF=118;TCR=29;TR=145;WE=28752506;WS=28752488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,153:0.99:154
chr2	28752555	rs4473343	T	C	8557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=160;NR=100;PP=2965;SC=AACAAAATAATATTTAGCCAA;SOR=1.278;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=263;TCF=161;TCR=102;TR=260;WE=28752563;WS=28752545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr2	28752727	rs6710800	C	G	3041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=67;PP=1960;SC=TGATGACCCTCGTACCATTTT;SOR=5.728;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=3;TCR=67;TR=70;WE=28752749;WS=28752717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	28752741	rs6725577	A	G	2921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=64;PP=1828;SC=CCATTTTACCATGAACTCGGC;SOR=8.380;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=0;TCR=64;TR=64;WE=28752749;WS=28752717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	28761257	rs7589169	A	G	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=23;PP=670;SC=AGGTGAGGCCACGGGCCTAGG;SOR=4.174;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=28761265;WS=28761247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	28761282	rs7589254	A	G	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=20;PP=594;SC=CCCCAAGGGCAGTGGGGCCCA;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=28761290;WS=28761272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	28761981	rs6753929	G	C	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.230;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=773;ReadPosRankSum=-0.186;SC=CAGAGCATTTGTAAACCTGGT;SOR=0.846;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=102;TCF=50;TCR=52;TR=42;WE=28761989;WS=28761971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,44:0.42:105
chr2	28763374	rs11127162	G	T	1379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.412;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=41;PP=1074;ReadPosRankSum=-0.782;SC=AGGAGAACAGGAGTGATAGGG;SOR=2.434;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=70;TCF=17;TCR=53;TR=50;WE=28763382;WS=28763364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,51:0.73:70
chr2	28771452	rs56019402	CTA	C	1602.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.320;NF=23;NR=16;PP=1830;ReadPosRankSum=-0.226;SC=GAAGTCCCTTCTATATATATA;SOR=0.500;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=46;TCF=24;TCR=22;TR=39;WE=28771461;WS=28771442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
chr2	28771579	rs72789777	C	T	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.820;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=519;ReadPosRankSum=-0.369;SC=GTCTCAGACTCAGTAGTTTGG;SOR=0.476;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=83;TCF=49;TCR=34;TR=28;WE=28771587;WS=28771569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,33:0.37:89
chr2	28771624	rs11680168	T	G	3220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=41;PP=2584;SC=TCTAATGCGTTCCCTGGTACT;SOR=1.037;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=58;TCR=41;TR=99;WE=28771632;WS=28771614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr2	28771897	rs11680304	T	C	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=381;SC=ACCTGAGATGTGAATCCTGTT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=28771905;WS=28771887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	28785754	rs7560628	G	C	318.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=261;ReadPosRankSum=0.310;SC=CATTGACAAGGATGGGTTTTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=28785762;WS=28785744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,11:0.92:12
chr2	28788428	rs34237604	AG	A	224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=268;SC=GCCTTGAGCCAGGAATCCAGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=28788436;WS=28788418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	28789643	rs10186460	T	C	12166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=204;NR=186;PP=2965;ReadPosRankSum=1.872;SC=TTCATTTTCTTTCTTGGACCC;SOR=0.247;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=394;TCF=208;TCR=186;TR=390;WE=28789651;WS=28789633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,385:1.00:386
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chr2	28795962	rs13005854	G	A	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.52;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=2;PP=204;SC=TAGGGGCTGCGGAGTGGGGAC;SOR=2.494;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=28795970;WS=28795952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr2	28804835	rs5830085	GA	G	454.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=1.809;QD=5.41;ReadPosRankSum=-0.895;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,31:0.37:84
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chr2	28808539	rs13393932	G	A	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=131;ReadPosRankSum=0.917;SC=TAAAAGAAATGTATTGAGTCT;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=6;WE=28808547;WS=28808529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr2	28812285	rs12468715	T	C	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=2;PP=869;ReadPosRankSum=-1.456;SC=CAGAGAGGACTGCCTGACATC;SOR=0.820;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=118;TCF=112;TCR=6;TR=43;WE=28812293;WS=28812275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,41:0.35:116
chr2	28812982	rs4666105	C	T	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.19;ReadPosRankSum=0.309;SOR=0.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,14:0.21:67
chr2	28816425	rs10176136	T	C	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=196;ReadPosRankSum=0.639;SC=GGCTCCTGGTTCCATGTCTGC;SOR=0.317;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=11;WE=28816433;WS=28816415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr2	28816829	rs376532276	G	T	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=79.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.44;MQRankSum=-0.541;QD=10.33;ReadPosRankSum=-5.778;SOR=7.251;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,43:0.41:104
chr2	28816830	rs368325462	A	T	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=67.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-2.928;QD=10.14;ReadPosRankSum=-6.025;SOR=6.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,38:0.36:106
chr2	28816948	rs4665429	C	T	3828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.435;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=93;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.856;SC=TGCATGTATACGTGTACACGT;SOR=1.020;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=237;TCF=87;TCR=150;TR=140;WE=28816956;WS=28816938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,146:0.59:246
chr2	28821472	rs140828676	G	C	1502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=13;PP=1113;ReadPosRankSum=1.384;SC=AAGCTATTCTGGCTTTCTGTT;SOR=0.620;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=107;TCF=84;TCR=23;TR=58;WE=28821480;WS=28821462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,58:0.55:106
chr2	28821662	rs7557359	C	T	2354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=62;PP=1916;SC=GCCTGCAGAGCAGGGAGTGGA;SOR=3.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=8;TCR=62;TR=70;WE=28821670;WS=28821652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	28824303	rs1106882	C	G	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=125;ReadPosRankSum=-1.380;SC=CTAGGATTATCCACCTACACC;SOR=0.563;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=10;WE=28824311;WS=28824293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr2	28824793	rs7601771	C	G	2414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.425;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=61;PP=1890;ReadPosRankSum=-1.039;SC=CAACTTTGTTCACCATCTCCG;SOR=1.112;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=143;TCF=53;TCR=90;TR=93;WE=28824801;WS=28824783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,91:0.65:139
chr2	28827767	.	G	A	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.516;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=509;ReadPosRankSum=-0.019;SC=CAGGCTCCCTGAACGCCTGAG;SOR=0.446;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=23;WE=28827775;WS=28827757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr2	28841021	rs1881256	G	A	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.858;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=163;ReadPosRankSum=0.641;SC=GATAGCCATGGAACCCATTCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=8;WE=28841029;WS=28841011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr2	28841049	rs1881255	G	A	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.891;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=245;ReadPosRankSum=-0.537;SC=GCCTTGGTTGGTCTGAATGAA;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=14;WE=28841057;WS=28841039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr2	28847806	rs11127181	C	G	5969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=125;NR=48;PP=2965;SC=AATGGAATGACCTTTGTACTG;SOR=1.961;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=173;TCF=125;TCR=48;TR=173;WE=28847814;WS=28847796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr2	28849435	rs10186023	T	C	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.458;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=343;ReadPosRankSum=0.000;SC=TCTGGCAACATCCTTGCCCAT;SOR=1.112;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=68;TCF=11;TCR=57;TR=20;WE=28849443;WS=28849425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,19:0.28:69
chr2	28849473	rs899149	T	C	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.784;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=51;ReadPosRankSum=0.292;SC=CCGAGCTCCTTGCTCATGGGA;SOR=0.089;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=7;WE=28849481;WS=28849463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr2	28853352	rs6713038	C	T	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=264;ReadPosRankSum=-0.400;SC=GGCTGCAGGCCCCTGGGGTAG;SOR=0.237;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=14;WE=28853360;WS=28853342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr2	28853377	rs6731155	T	C	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.557;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=290;ReadPosRankSum=1.468;SC=CTGCTCTGTGTGTCAGAGCCA;SOR=1.336;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=58;TCR=3;TR=17;WE=28853385;WS=28853367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,17:0.27:62
chr2	28855918	rs34314459	A	AG	2458.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=42;PP=2641;SC=TGAGCAGCCAAGGCCTGGTGG;SOR=1.362;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=63;TCF=20;TCR=43;TR=60;WE=28855926;WS=28855908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	28863738	rs56350389	A	G	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=545;ReadPosRankSum=1.373;SC=CCCCTCAGAGAGGAAAGTGTC;SOR=0.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=74;TCR=15;TR=29;WE=28863746;WS=28863728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,30:0.33:90
chr2	28865760	rs2272387	T	C	4510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=88;PP=2965;SC=GAACAGCCGATTGCTCCCAGA;SOR=1.643;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=41;TCR=88;TR=129;WE=28865768;WS=28865750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr2	28865968	rs57817040	T	C	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=10;PP=266;SC=CTATAGCCACTCTCTTCACCG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=28865976;WS=28865958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr2	29045323	rs4436918	C	T	1017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=23;PP=725;SC=CTATTATATACATTACACCTT;SOR=2.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=29045331;WS=29045313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	29052256	rs12998251	T	C	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=21;PP=444;SC=TGTTTTTTAATGTGCTTCTAA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=29052264;WS=29052246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	29062941	.	CT	C	360.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=418;ReadPosRankSum=0.736;SC=TTTATCTTCACTTTAGAGACA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=13;WE=29062949;WS=29062931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr2	29072698	rs113746661	A	G	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.772;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=2;PP=717;ReadPosRankSum=1.415;SC=TTATCTTAAAATGCATATTTT;SOR=0.253;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=45;TCF=43;TCR=2;TR=30;WE=29072706;WS=29072688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr2	29074256	rs113783200	C	T	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=224;ReadPosRankSum=-0.861;SC=ATTTAAATACCATAGTTAAAT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=10;WE=29074264;WS=29074246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr2	29075469	rs191845330	T	C	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.457;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=45;PP=1145;ReadPosRankSum=1.288;SC=GCAATCAAAGTATTTCATTTT;SOR=1.936;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=80;TCF=11;TCR=69;TR=50;WE=29075477;WS=29075459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,52:0.65:80
chr2	29087799	rs13030945	C	A	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=278;ReadPosRankSum=0.244;SC=GGTATTTTCCCAAATATCTTT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=15;WE=29087807;WS=29087789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,15:0.33:46
chr2	29117511	rs142375364	G	A	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.132;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=271;ReadPosRankSum=0.256;SC=TCCGCCCCGCGCCGGTGCGCC;SOR=0.124;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=13;WE=29117519;WS=29117501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr2	29124976	rs147302501	C	T	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.664;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=35;PP=961;ReadPosRankSum=-1.739;SC=AGGAGAGTTACACAGTAAATT;SOR=1.217;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=74;TCF=21;TCR=53;TR=47;WE=29124984;WS=29124966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,47:0.63:75
chr2	29129300	rs36066576	AT	A	1418.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=0.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.56;MQRankSum=2.625;QD=10.21;ReadPosRankSum=1.192;SOR=0.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,89:0.64:139
chr2	29135468	rs6715296	C	G	4865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=85;NR=50;PP=2965;SC=AATGGAAAGGCGACAATAGCA;SOR=1.324;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=85;TCR=50;TR=135;WE=29135476;WS=29135458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr2	29136489	rs4666132	G	T	2040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=21;PP=1644;ReadPosRankSum=-0.516;SC=TATATTTTTGGAGGAGGAAAA;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=79;TCR=31;TR=75;WE=29136497;WS=29136479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,74:0.68:109
chr2	29136623	rs4666133	T	C	1668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.937;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=46;PP=1250;ReadPosRankSum=-0.104;SC=ACCCAAAGTATGCCTTTTAAA;SOR=0.481;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=97;TCF=27;TCR=70;TR=66;WE=29136631;WS=29136613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,68:0.68:100
chr2	29136685	rs12472068	C	T	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.056;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=37;PP=978;ReadPosRankSum=-0.781;SC=AACAAAGGTGCGGAGTGGTAG;SOR=2.088;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=65;TCF=18;TCR=47;TR=47;WE=29136693;WS=29136675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,48:0.72:67
chr2	29136869	rs143803602	T	C	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=3;PP=693;ReadPosRankSum=0.638;SC=GTTTTGATAATATATACTATT;SOR=0.457;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=59;TCF=55;TCR=4;TR=37;WE=29136877;WS=29136859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,37:0.62:60
chr2	29140711	rs4389288	G	A	2790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.571;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=52;PP=2153;ReadPosRankSum=0.258;SC=TTTTTAGGAAGAAAATTAAAT;SOR=0.619;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=80;TCR=86;TR=102;WE=29140719;WS=29140701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,106:0.61:174
chr2	29145663	.	G	GTT	160	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=18;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=28;MQ=60.7;NF=8;NR=2;PP=160;QD=16.3;SC=TTCTTGCTGTGTTTTTTTTTT;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=10;WE=29145671;WS=29145653;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:16,10:0.38:26
chr2	29145681	rs200370183	C	T	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=18.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.76;MQRankSum=0.393;QD=13.49;ReadPosRankSum=-2.066;SOR=4.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr2	29145683	.	G	T	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=11.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=-1.555;QD=14.41;ReadPosRankSum=-2.124;SOR=3.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr2	29145684	.	G	T	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=5.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=-1.567;QD=13.45;ReadPosRankSum=-2.452;SOR=2.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr2	29145725	rs9653591	G	T	1942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.44;QD=39.65;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	29145725	.	GTAGA	TTAGA,TTAGT	600	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=60.32;NF=33,23;NR=18,8;PP=390,600;QD=8.32884730485;SC=TTTTCATAAGGTAGATTGGGG;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=33;TCR=18;TR=51,31;WE=29145737;WS=29145715;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:51
chr2	29145729	rs184560977	A	T	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=12.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=-0.252;QD=14.78;ReadPosRankSum=0.654;SOR=1.772;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr2	29149234	.	CATTT	C	292.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.010;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=248;ReadPosRankSum=-0.253;SC=CACAAGTAGTCATTTATTTTT;SOR=1.022;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=6;WE=29149245;WS=29149224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
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chr2	29152456	rs1140697	A	G	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.472;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=17;PP=1015;ReadPosRankSum=-0.077;SC=TTAGCATTGAAGAACGTCTGG;SOR=0.546;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=137;TCF=92;TCR=45;TR=48;WE=29152464;WS=29152446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,51:0.36:142
chr2	29161010	rs4233731	G	A	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=739;SC=GTTTTACCCCGGGTGCAATGA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=29161018;WS=29161000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	29169612	rs3087649	T	C	4790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=79;PP=2965;SC=GAGATTCTGATTTAGATCCTG;SOR=0.832;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=70;TCR=79;TR=149;WE=29169620;WS=29169602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr2	29226222	rs4666160	G	A	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=340;ReadPosRankSum=-0.830;SC=TAAGGAAGCAGTCAGGCTTCT;SOR=0.330;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=15;WE=29226230;WS=29226212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr2	29226498	rs12613325	G	A	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.956;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=33;PP=1728;ReadPosRankSum=-1.346;SC=TTCCCAGCCCGTTACCTCCAG;SOR=0.533;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=114;TCF=19;TCR=95;TR=40;WE=29226520;WS=29226488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,43:0.37:116
chr2	29226512	rs12623297	A	G	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.541;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=32;PP=1728;ReadPosRankSum=-0.661;SC=CCTCCAGGCCAGGGAGTCCTC;SOR=0.373;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=108;TCF=13;TCR=95;TR=37;WE=29226520;WS=29226488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,39:0.35:111
chr2	29226559	rs12619829	C	T	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.847;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=401;ReadPosRankSum=0.335;SC=GTAAGAGCTCCAAGTCAAACC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=2;TCR=51;TR=21;WE=29226567;WS=29226549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,21:0.38:55
chr2	29240005	rs13409097	T	C	1649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.497;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=43;PP=1274;ReadPosRankSum=0.155;SC=AGAGTTTGCCTTGACCTTGTG;SOR=0.717;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=243;TCF=125;TCR=118;TR=78;WE=29240013;WS=29239995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,78:0.31:254
chr2	29245933	rs13420380	G	A	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=14;PP=483;ReadPosRankSum=0.305;SC=CTGCAACAGGGCCTGGCCTTG;SOR=0.612;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=48;TCR=44;TR=29;WE=29245941;WS=29245923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,31:0.32:98
chr2	29246044	rs6721861	T	C	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.313;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=202;ReadPosRankSum=0.035;SC=GTGTGCTTGGTGGTGACTGGG;SOR=0.371;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=62;TCF=24;TCR=38;TR=18;WE=29246052;WS=29246034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,21:0.30:69
chr2	29247304	rs66715573	C	T	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=403;ReadPosRankSum=-0.427;SC=GGGGAGAGGCCCTGGGATGTG;SOR=0.551;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=52;TCF=5;TCR=47;TR=22;WE=29247312;WS=29247294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr2	29287708	rs10182566	C	T	104.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=37;ReadPosRankSum=1.383;SC=GGGGTGACTGCGTGAGTGTGG;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=5;WE=29287716;WS=29287698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr2	29287926	rs139768554	C	CGCT	905.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=3.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=1.569;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.844;SOR=0.661;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,26:0.30:88
chr2	29294629	rs34253433	C	T	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=1.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.88;ReadPosRankSum=-0.490;SOR=0.842;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,51:0.27:187
chr2	29294754	rs17744093	G	C	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=4.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.45;ReadPosRankSum=1.784;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,17:0.20:84
chr2	29295016	rs10200693	A	G	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.623;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=32;PP=852;ReadPosRankSum=0.933;SC=ATGGGATGGCATTTGGAAGCT;SOR=1.411;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=109;TCF=51;TCR=58;TR=49;WE=29295024;WS=29295006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,50:0.45:112
chr2	29295676	rs13385188	G	A	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.534;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=834;ReadPosRankSum=-1.330;SC=TGCTGTCCTCGCTGTCACTAA;SOR=0.683;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=135;TCF=72;TCR=63;TR=48;WE=29295684;WS=29295666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,48:0.36:133
chr2	29296870	rs62132765	C	T	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.131;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=897;ReadPosRankSum=-0.148;SC=CCATATCTTTCCTTTTGCCTG;SOR=1.085;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=180;TCF=86;TCR=94;TR=54;WE=29296878;WS=29296860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,57:0.30:187
chr2	29297068	rs35929540	C	T	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.210;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=573;ReadPosRankSum=-1.540;SC=TTTTCAAGAACTGAATGCCAC;SOR=1.130;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=94;TCF=45;TCR=49;TR=31;WE=29297076;WS=29297058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,31:0.34:92
chr2	29356669	rs3100232	A	G	2812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=70;PP=2289;SC=TTTTGAAAACATCGAAACCAA;SOR=2.354;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=22;TCR=70;TR=92;WE=29356677;WS=29356659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr2	29366875	rs3217572	C	CACAG	2736.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=41;PP=2967;SC=TGTTCAAGGACACAGTATGGT;SOR=3.037;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=52;TCF=6;TCR=46;TR=47;WE=29366883;WS=29366865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	29383256	rs3100246	G	T	4370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.156;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=78;PP=2965;ReadPosRankSum=0.473;SC=GGGGAACTCCGCCTCGGAGAG;SOR=1.059;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=53;TCR=79;TR=130;WE=29383264;WS=29383246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,137:0.99:138
chr2	29383374	rs2305450	G	A	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=48;PP=1377;SC=ATTCTTTAGAGTACAAAAGGT;SOR=4.615;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=4;TCR=48;TR=52;WE=29383382;WS=29383364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	29390299	rs11364047	AG	A	2960.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=22;PP=2610;SC=TTAAACCTGAAGACCAGCTAC;SOR=1.771;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=63;TCF=41;TCR=22;TR=61;WE=29390307;WS=29390289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	29416572	rs1670283	T	C	6229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=91;PP=2965;SC=CGAACAGAGATCTCTGCAGCT;SOR=0.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=191;TCF=100;TCR=91;TR=190;WE=29416580;WS=29416562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr2	29419591	rs1670284	G	T	2990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=73;NR=16;PP=2433;SC=CTTTAAGACTGTTTCATATAG;SOR=2.910;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=73;TCR=16;TR=89;WE=29419599;WS=29419581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
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chr2	29498210	rs4589708	A	G	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=5;PP=817;SC=GGAGGGGACAATGAGGCCATG;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=29498218;WS=29498200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	29519622	rs2272409	C	T	924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=2;PP=742;ReadPosRankSum=-0.582;SC=TGCGTGCACGCGCACATATCG;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=30;WE=29519630;WS=29519612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
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chr2	29525345	rs11127214	T	C	3588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.07;QD=44.31;SOR=7.403;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr2	29541104	rs2276549	C	T	1773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=12;PP=1387;SC=CTTTCTTAATCTGGGTTCCGG;SOR=2.604;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=56;WE=29541112;WS=29541094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	29543663	rs2293564	T	C	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=6;PP=893;SC=TGACCTGCCATTGAGGAGTGT;SOR=2.833;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=33;WE=29543671;WS=29543653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	29754721	rs11689790	T	C	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=7;PP=739;ReadPosRankSum=-0.221;SC=TCTGGAAATGTGTAACCAAAA;SOR=0.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=34;WE=29754729;WS=29754711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,36:0.63:57
chr2	29917940	rs2256376	C	G	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=21;PP=591;SC=CTTTTCAGCCCCCTCCACTCC;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=29917948;WS=29917930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	29940529	rs2246745	A	T	6223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=95;NR=101;PP=2965;SC=GAGAAGGAGAAGGCATGTTTG;SOR=0.733;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=196;TCF=95;TCR=101;TR=196;WE=29940537;WS=29940519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr2	30143499	rs4358080	G	C	1494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=38;PP=1195;SC=GCAGCGGCAGGAGCCACAGGA;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=45;WE=30143507;WS=30143489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	30381505	rs1137288	T	C	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=-1.976;SC=TGCAGTACAGTGAAGTTCAAG;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=7;WE=30381513;WS=30381495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr2	30480196	rs6548005	C	G	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-4.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=397;ReadPosRankSum=1.673;SC=AGTCCCTGGCCTATGGCATGC;SOR=0.527;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=22;WE=30480204;WS=30480186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,26:0.74:35
chr2	30955528	rs2276567	C	A	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.576;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=159;ReadPosRankSum=1.976;SC=AGGGCCCGGCCACCTCCCACC;SOR=0.066;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=11;WE=30955536;WS=30955518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr2	30957326	rs2276568	A	G	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=319;ReadPosRankSum=-0.232;SC=TGTATTCTCTATGGCCTTCCA;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=60;TCF=41;TCR=19;TR=20;WE=30957334;WS=30957316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,19:0.31:62
chr2	30959262	rs509380	G	T	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.213;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=235;ReadPosRankSum=-1.035;SC=AGGGGTGAGAGTTCCTCTTCT;SOR=0.169;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=59;TCF=45;TCR=14;TR=17;WE=30959270;WS=30959252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,17:0.28:60
chr2	30961022	rs55799526	C	G	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.52;ReadPosRankSum=-0.277;SOR=0.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,12:0.20:59
chr2	30968228	rs7567391	A	G	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.013;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=407;ReadPosRankSum=0.296;SC=GGATTTGGGGACTGACTACTT;SOR=0.497;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=79;TCF=26;TCR=53;TR=26;WE=30968236;WS=30968218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,24:0.30:79
chr2	30976058	rs2926304	C	T	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=498;ReadPosRankSum=-0.195;SC=AATCTTGACACGACATCCTGT;SOR=0.660;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=112;TCF=62;TCR=50;TR=36;WE=30976066;WS=30976048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,38:0.34:113
chr2	30977073	rs485100	G	A	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=4.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.29;ReadPosRankSum=0.066;SOR=1.264;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,25:0.24:104
chr2	30980940	rs508405	C	T	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.315;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=3;PP=414;ReadPosRankSum=-0.626;SC=CTCCATTCGGCCTCGCCCCAG;SOR=0.969;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=77;TCF=66;TCR=11;TR=26;WE=30980948;WS=30980930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,27:0.35:78
chr2	30986989	rs579016	G	T	2755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=30;PP=2038;SC=GGGCTCCCCAGTGACTTACCC;SOR=1.460;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=57;TCR=30;TR=87;WE=30986997;WS=30986979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr2	31000370	rs6548033	G	C	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=136;ReadPosRankSum=-0.807;SC=AGGACTCTGTGGGTAAGCACC;SOR=0.250;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=9;WE=31000378;WS=31000360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr2	31009977	rs1915125	G	C	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=583;SC=GGGTATGCTCGTGTGGGGCTC;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=31009985;WS=31009967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	31010212	rs13021213	C	T	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.520;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=27;PP=579;ReadPosRankSum=-0.624;SC=AGAAGACTTCCGAGGTCCTTT;SOR=1.230;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=87;TCF=22;TCR=65;TR=34;WE=31010220;WS=31010202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,35:0.38:93
chr2	31178615	rs41291165	G	A	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.873;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=25;PP=700;ReadPosRankSum=-0.460;SC=CCTGCAGTCAGGAACAAATGA;SOR=1.911;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=29;WE=31178623;WS=31178605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,31:0.63:49
chr2	31188957	rs889896	C	T	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=0;PP=785;SC=GTGCCTGGCACGTAGTTAGAT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=28;WE=31188965;WS=31188947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	31401290	rs4952052	A	C	1854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=13;PP=1537;SC=TAAAGGGCTGAAGGGGACAGA;SOR=2.342;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=58;WE=31401298;WS=31401280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	31410708	rs1822496	C	T	6498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=127;PP=2965;SC=CAGAAAGACACAATTATTCAC;SOR=1.233;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=211;TCF=82;TCR=129;TR=209;WE=31410716;WS=31410698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr2	31414807	rs1562022	C	G	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=12;PP=1147;SC=CTACCCTATACAGGTAGAAGC;SOR=1.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=43;WE=31414815;WS=31414797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	31415967	rs7591444	T	C	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=2;PP=753;SC=AACCTCACCCTGAGAGCCCTG;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=31415975;WS=31415957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	31416213	rs11124248	T	C	2085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=44;PP=1621;SC=AACGCCTAGTTATCAGGACCC;SOR=1.839;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=17;TCR=44;TR=61;WE=31416221;WS=31416203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	31416305	rs11124249	C	T	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.37;SOR=6.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	31416309	rs11124250	A	G	1004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.67;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	31416317	rs12619774	C	G	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.51;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	31424885	rs11692905	C	T	4471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=49;PP=2965;SC=AGAGTGGCCCCGGGTGAATGA;SOR=1.385;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=86;TCR=49;TR=135;WE=31424893;WS=31424875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr2	31457817	rs2236170	T	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=55;ReadPosRankSum=-0.617;SC=ATGGGAAGCCTTCAGTTGAGG;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=5;WE=31457825;WS=31457807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr2	31467351	rs2295473	T	A	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-5.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.025;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=29;PP=536;ReadPosRankSum=-0.380;SC=TTTCAGGTGCTCTCTTTTCTT;SOR=0.891;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=96;TCF=18;TCR=78;TR=35;WE=31467359;WS=31467341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,36:0.38:95
chr2	31483890	rs13028669	T	C	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=117;ReadPosRankSum=-0.227;SC=CAGTGCATCATGTGTGTGACA;SOR=0.208;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=11;WE=31483898;WS=31483880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr2	31484334	rs654650	G	A	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=383;ReadPosRankSum=0.721;SC=GTAGGGGAAGGAATGATGCAA;SOR=0.602;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=69;TCR=10;TR=22;WE=31484342;WS=31484324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,23:0.28:82
chr2	31488965	rs619002	C	T	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=167;ReadPosRankSum=1.192;SC=CATTCTGGTGCTCATAGGAGG;SOR=0.941;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=13;WE=31488973;WS=31488955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr2	31489627	rs67643147	TAC	T	90.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=0.079;QD=4.54;ReadPosRankSum=-1.405;SOR=0.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr2	31562323	rs45591431	G	C	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=80;ReadPosRankSum=-0.627;SC=GGGCAGATCAGAAGAGACAGC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=7;WE=31562331;WS=31562313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr2	31567714	.	C	A	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.952;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=743;ReadPosRankSum=0.621;SC=ACTCATTTTACTAGTGACTCC;SOR=0.841;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=36;WE=31567722;WS=31567704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,37:0.64:58
chr2	31567743	rs566224	T	C	1282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=29;PP=1063;SC=TACCTTACCTTACATTGTCAC;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=39;WE=31567751;WS=31567733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	31569471	rs7599175	A	G	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=533;ReadPosRankSum=0.041;SC=ACCCAGCCAGAATGAGCATTT;SOR=0.784;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=22;WE=31569479;WS=31569461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr2	31569735	rs45459599	A	G	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=490;ReadPosRankSum=-1.077;SC=CCCACACCCCAGACACATCAG;SOR=0.914;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=21;WE=31569743;WS=31569725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr2	31570376	rs1366813	T	C	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=412;ReadPosRankSum=0.510;SC=CGGGATCCCATGGGCTCCTTA;SOR=0.402;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=19;WE=31570384;WS=31570366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr2	31570626	rs4952083	C	T	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.34;ReadPosRankSum=1.076;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr2	31570631	rs4952084	A	G	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.34;ReadPosRankSum=1.400;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr2	31571241	rs13415401	G	C	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.017;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=736;ReadPosRankSum=-0.788;SC=TAGGGAAAGAGAAGGATGCCA;SOR=0.954;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=52;TCF=23;TCR=29;TR=33;WE=31571249;WS=31571231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,37:0.69:54
chr2	31571786	rs1884725	A	G	2107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.325;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=46;PP=1599;ReadPosRankSum=-0.468;SC=AAGGAACTGTAAAGCTTATTC;SOR=0.884;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=122;TCF=56;TCR=66;TR=79;WE=31571794;WS=31571776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,80:0.62:128
chr2	31572398	rs1429374	A	G	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.762;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=514;ReadPosRankSum=1.011;SC=GAAGATCATTATAAGATCTTA;SOR=0.255;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=21;WE=31572406;WS=31572388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr2	31572482	rs11408029	T	TG	1354.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.009;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=11;PP=1538;ReadPosRankSum=0.819;SC=GCTTCCTATATGGGGTCAGCA;SOR=0.880;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=80;TCF=58;TCR=22;TR=43;WE=31572490;WS=31572472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,48:0.61:79
chr2	31587235	rs1018505	G	A	1179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=27;PP=899;SC=ACATCATCCCGTGAAAAAAAG;SOR=2.362;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=31587243;WS=31587225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	31588288	rs2365842	T	A	2708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=36;PP=2083;SC=ACAAAATGGCTCATCCCGCCC;SOR=1.046;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=50;TCR=36;TR=86;WE=31588296;WS=31588278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	31589847	rs2295475	G	A	1431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.333;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=1055;ReadPosRankSum=0.885;SC=CTTGGCCACCGATGTATATCT;SOR=0.256;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=84;TCF=48;TCR=36;TR=51;WE=31589855;WS=31589837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,55:0.62:88
chr2	31590785	rs761926	C	G	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=5.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.555;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=4;PP=794;ReadPosRankSum=-0.216;SC=AATTTGCAAACCAGGGCCACC;SOR=1.765;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=54;TCF=45;TCR=9;TR=33;WE=31590793;WS=31590775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,36:0.62:58
chr2	31590917	rs17011368	T	C	1022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.176;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=21;PP=740;ReadPosRankSum=0.370;SC=TTGTTCTTTATAGCATCCTGA;SOR=0.442;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=137;TCF=63;TCR=74;TR=44;WE=31590925;WS=31590907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,48:0.32:149
chr2	31591384	rs45446491	ACAGG	A	901.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=869;ReadPosRankSum=-0.041;SC=ACTCCTCTACACAGGCAGCCC;SOR=0.539;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=57;TCF=53;TCR=4;TR=20;WE=31591395;WS=31591374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,25:0.40:62
chr2	31593265	rs17323225	T	C	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.388;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=509;ReadPosRankSum=-1.231;SC=ATTCCAGTTATGTTACTCCCA;SOR=0.489;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=127;TCF=75;TCR=52;TR=40;WE=31593273;WS=31593255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,44:0.33:132
chr2	31596731	rs17395224	G	A	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=651;ReadPosRankSum=0.083;SC=TACACTGACCGTACTCACTTG;SOR=0.608;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=98;TCF=70;TCR=28;TR=35;WE=31596739;WS=31596721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,38:0.36:107
chr2	31596955	rs4952086	G	A	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.62;ReadPosRankSum=-0.783;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr2	31596963	rs4952087	T	C	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.14;ReadPosRankSum=1.197;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr2	31600146	rs10187719	T	C	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=14;PP=431;SC=CCTTGCTCTGTAGGGGCTGCA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=31600154;WS=31600136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	31609448	rs477626	A	C	2075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=33;PP=1383;SC=TCTTACTACAATGTCTCCCTC;SOR=1.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=53;WE=31609456;WS=31609438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	31611367	rs206847	T	C	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.25;ReadPosRankSum=-0.180;SOR=0.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,5:0.19:27
chr2	31621598	rs10175754	T	C	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=259;ReadPosRankSum=0.975;SC=ACACCTGGGATGGCAGAACCC;SOR=0.665;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=20;WE=31621606;WS=31621588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr2	31805619	rs619857	T	C	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=2;PP=264;SC=GTGCGCGCTCTACGCTGCGCT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=31805627;WS=31805609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	31805880	rs142200057	A	AG	4279.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=61;PP=2936;SC=CCGTAGCCGGAGGCTTCGCGA;SOR=0.986;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=94;TCF=33;TCR=61;TR=91;WE=31805888;WS=31805870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr2	32312700	rs7561519	T	C	1110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=34;PP=887;SC=TTCACATGATTGTCCAGATTT;SOR=4.021;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=36;WE=32312708;WS=32312690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	32314473	rs469305	A	T	256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.34;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	32324072	rs7566162	T	C	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=22;PP=657;SC=ATTGTTCATGTTTTCACAGGG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=32324080;WS=32324062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	32361482	rs11392886	T	TC	239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=283;SC=AAGGGACGGTTAGTAGTACTC;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=32361490;WS=32361472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	32362079	rs10627985	G	GTATA	5345.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.272;NF=44;NR=48;PP=2974;ReadPosRankSum=0.032;SC=CAGCATTTTAGTATATTTTCC;SOR=0.884;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=110;TCF=48;TCR=62;TR=92;WE=32362087;WS=32362069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,112:0.98:114
chr2	32369901	rs2365556	T	C	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=262;SC=CACAGTGAGCTGAGATCATGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=32369909;WS=32369891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	32390834	rs6733481	A	C	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=105;ReadPosRankSum=1.691;SC=AAGGGGACGGAAGCCGGAGGC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=6;WE=32390842;WS=32390824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr2	32412085	.	G	A	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.742;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.93;MQRankSum=-3.011;QD=14.63;ReadPosRankSum=2.955;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr2	32412089	.	G	A	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.181;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.31;MQRankSum=-3.857;QD=10.28;ReadPosRankSum=3.266;SOR=1.077;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr2	32412095	.	G	A	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.618;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=7.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.22;MQRankSum=-5.410;QD=6.30;ReadPosRankSum=3.377;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,12:0.24:50
chr2	32429880	.	AT	A	123.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.17;MQRankSum=-0.170;QD=7.28;ReadPosRankSum=-1.224;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr2	32460348	rs212714	A	G	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-4.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=220;ReadPosRankSum=1.256;SC=TTCATTAGACATATTTATATT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=16;WE=32460356;WS=32460338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr2	32461493	rs55638726	T	TC	519.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=11;PP=482;SC=AATTCTGAGTTTTATCTTCTC;SOR=3.912;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=12;WE=32461501;WS=32461483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	32532072	.	GGAAA	G	759.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.968;NF=11;NR=5;PP=706;ReadPosRankSum=-0.028;SC=AATCCCAAAAGGAAAGAAAGA;SOR=1.112;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=16;WE=32532083;WS=32532062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr2	32667058	rs55734616	C	A	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.29;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	32667061	rs60955793	T	A	1875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.62;SOR=6.138;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	32667182	rs60197615	G	C	6037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=110;NR=74;PP=2965;SC=TGAGAAGCTTGTTAATACTCT;SOR=1.161;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=185;TCF=111;TCR=74;TR=184;WE=32667190;WS=32667172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr2	32690189	rs35682129	A	G	1764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.692;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=42;PP=1113;ReadPosRankSum=0.093;SC=ATTTTCTTCAACCTCCGCCTC;SOR=0.977;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=233;TCF=112;TCR=121;TR=76;WE=32690197;WS=32690179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,81:0.34:241
chr2	32690253	.	ATT	A	81.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=0.000;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=1.504;QD=2.04;ReadPosRankSum=0.824;SOR=0.297;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,9:0.22:40
chr2	32690317	.	ATT	A	110.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQRankSum=-0.000;QD=9.23;ReadPosRankSum=1.465;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr2	32706579	rs9646977	T	A	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=45;PP=1332;SC=TCATGCCTGTTATCCCAGCAC;SOR=6.316;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=46;WE=32706587;WS=32706569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	32712875	rs2366891	A	C	3303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=84;PP=2813;SC=TCAGGTATGAATTCAGGAGAA;SOR=4.571;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=8;TCR=85;TR=92;WE=32712883;WS=32712865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr2	32713706	rs2366894	A	T	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=207;ReadPosRankSum=0.047;SC=TTCTAGTTCAACTGGAAACAA;SOR=0.283;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=13;WE=32713714;WS=32713696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr2	32749880	rs2710609	C	T	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.86;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	32749890	rs2710610	C	T	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.76;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	32749893	rs2710611	A	T	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.73;SOR=6.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	32749903	rs2710612	T	C	1164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.60;SOR=6.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	32800242	rs151053864	T	C	1960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.672;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=29;PP=1410;ReadPosRankSum=-0.442;SC=TGGCAAGACATGTGCCACTCT;SOR=0.420;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=116;TCF=75;TCR=41;TR=74;WE=32800250;WS=32800232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,77:0.65:119
chr2	32822729	rs2583713	A	G	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=322;ReadPosRankSum=-0.925;SC=TCTCCAGTTGAGTGGGAGAAG;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=14;WE=32822737;WS=32822724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr2	32822957	rs2710625	G	A	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.244;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=38;PP=1091;ReadPosRankSum=-1.264;SC=AAGCTGTGACGCTTTCAACCT;SOR=1.122;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=80;TCF=24;TCR=56;TR=53;WE=32822965;WS=32822947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,57:0.66:86
chr2	32855615	rs2710623	A	G	820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=4;PP=657;SC=TACAATTGCTACTGGAAGGGA;SOR=3.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=32855623;WS=32855605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	32860415	rs11124286	C	T	1711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=1244;ReadPosRankSum=-0.543;SC=ATCCAGAACTCGTGCAGCAAA;SOR=0.301;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=24;TCR=30;TR=53;WE=32860423;WS=32860405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,57:0.98:58
chr2	32928119	rs7586406	A	G	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=399;ReadPosRankSum=0.771;SC=TGTTTAGAGAATAAGTTCTAT;SOR=0.123;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=20;WE=32928127;WS=32928109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr2	32959024	rs1551177	T	C	4005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.658;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=102;PP=2962;ReadPosRankSum=0.700;SC=GTATGGAAATTACTTGGCATT;SOR=0.620;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=47;TCR=149;TR=134;WE=32959032;WS=32959014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,143:0.70:205
chr2	32961691	rs17497801	C	T	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=577;ReadPosRankSum=-1.044;SC=AGATTAGGTACACCTGCAAGT;SOR=1.154;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=26;WE=32961699;WS=32961681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr2	32961745	rs10200333	T	A	2616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=13;PP=2171;ReadPosRankSum=-0.862;SC=TAATTATTTTTACTTGATTTT;SOR=2.352;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=85;TCF=72;TCR=13;TR=84;WE=32961753;WS=32961735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,84:0.99:85
chr2	32961858	rs2273660	A	G	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=32;PP=1096;ReadPosRankSum=-0.288;SC=GTCATTTGTTATGAAAGAGCC;SOR=0.644;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=170;TCF=77;TCR=93;TR=58;WE=32961866;WS=32961848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,59:0.35:169
chr2	32983526	rs2273665	C	T	2237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.754;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=47;PP=1718;ReadPosRankSum=-2.278;SC=ATCTTCGGAACAAGGAGTTTC;SOR=0.826;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=116;TCF=49;TCR=67;TR=80;WE=32983534;WS=32983516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,82:0.69:118
chr2	33036324	rs3731578	G	A	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=289;ReadPosRankSum=0.152;SC=CTTGCCTTTCGTTTGAACATG;SOR=0.136;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=15;WE=33036332;WS=33036314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr2	33046014	rs139045069	GAAGCAGATTCTGGAA	G	1286.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=2.262;QD=9.39;ReadPosRankSum=-1.808;SOR=0.729;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,39:0.28:137
chr2	33172358	.	C	A	44	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=44;QD=39.3856062736;SC=GGGGCCGGACCGCGCGCGACC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=2;WE=33172366;WS=33172348;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:1,2:0.67:3
chr2	33172827	rs147166401	G	A	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.182;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=402;ReadPosRankSum=-0.520;SC=GGTGCCGCAGGAGACCCAGAG;SOR=1.106;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=83;TCF=25;TCR=58;TR=22;WE=33172835;WS=33172817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,24:0.28:86
chr2	33335818	rs17012574	C	T	1501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.885;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=41;PP=1125;ReadPosRankSum=-1.072;SC=ACCTTTTCAGCGTGAGTATAG;SOR=0.499;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=170;TCF=54;TCR=116;TR=64;WE=33335826;WS=33335808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,66:0.37:177
chr2	33359457	rs12620839	C	T	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=193;ReadPosRankSum=-0.135;SC=GTTTATTCACCGCTAGGTGCA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=44;TCR=3;TR=12;WE=33359465;WS=33359447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,13:0.27:49
chr2	33392911	rs6728094	G	A	8008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=121;NR=129;PP=2965;SC=ATCAAGGAGAGCCCTTCTGCC;SOR=0.763;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=250;TCF=121;TCR=129;TR=250;WE=33392919;WS=33392901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr2	33407186	rs6759943	T	C	1881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=0;PP=1674;SC=TACTGGACTTTTATTGGTTGA;SOR=8.015;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=53;WE=33407194;WS=33407176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	33407285	rs2367619	G	A	6070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=130;NR=58;PP=2965;SC=CACGTATGCTGGTATAGTCCT;SOR=1.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=130;TCR=59;TR=188;WE=33407293;WS=33407275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr2	33412077	rs1065324	G	A	3206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=71;PP=2403;SC=CAGGCAAGGCGTTGGGGACGC;SOR=1.893;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=30;TCR=71;TR=101;WE=33412085;WS=33412067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	33413640	rs6712473	G	T	2051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=5;PP=1605;SC=CCAATCTGTTGTAGTGAAATT;SOR=4.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=52;TCR=5;TR=57;WE=33413648;WS=33413630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	33413949	rs4542826	G	A	1686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=42;PP=1296;SC=TGCTTTAGCAGTGTCTTACAG;SOR=3.830;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=47;WE=33413957;WS=33413939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	33414009	rs3922572	T	A	451.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=389;SC=AATGCTTTTTTAAAAAAAAGG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=33414017;WS=33413999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	33442549	rs2290449	G	A	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=682;ReadPosRankSum=1.704;SC=GGCTGTGAGGGACAGCAGTGC;SOR=3.912;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=26;WE=33442557;WS=33442539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr2	33447202	rs2290448	C	T	6169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=91;PP=2965;ReadPosRankSum=1.280;SC=AGCGGGTTAACAACACCTTTT;SOR=0.270;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=193;TCF=102;TCR=91;TR=191;WE=33447210;WS=33447192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,201:1.00:202
chr2	33525382	rs935996	A	C	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=1;PP=758;SC=TGGAGTGATAAATACTAAAGT;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=33525390;WS=33525375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	33540138	rs2276591	G	A	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=359;SC=AGATTTATTTGCCATCTGTTT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=33540146;WS=33540128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	33540172	rs3216704	A	AT	832.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=658;SC=AATGAAACCGATTTTTTTCAA;SOR=5.283;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=23;WE=33540180;WS=33540162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	33540248	rs1058840	G	A	2190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=16;PP=1694;SC=TCTGTGGTCCGCAAGGGGAGT;SOR=2.206;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=50;TCR=16;TR=66;WE=33540256;WS=33540238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	33568191	rs5024712	T	C	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=23;PP=594;SC=CTATGTTGGCTGGGTGCATGG;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=33568199;WS=33568181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	33572555	rs6706620	G	A	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.184;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=151;ReadPosRankSum=-0.022;SC=TGACTGGGCAGTGCCGCTCCC;SOR=0.041;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=14;WE=33572563;WS=33572545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,12:0.22:55
chr2	33585796	rs4422143	T	C	4898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.757;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=94;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.735;SC=ACATCAGGCGTGGGATGGGGA;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=164;TCF=70;TCR=94;TR=163;WE=33585804;WS=33585786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,170:0.99:171
chr2	33622448	rs2367734	T	C	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=21;PP=611;SC=GAGTTTCAGTTTGAGAAGATG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=21;WE=33622456;WS=33622438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	33622475	rs12053346	T	C	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=373;SC=GTTCTGGAGATGTACATTAAG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=33622483;WS=33622465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	33623306	rs2034693	C	T	1258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=1;PP=1024;SC=TTGTCTGTGACTGAAGCAATG;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=38;WE=33623314;WS=33623297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	33623387	rs624060	AT	GC	4566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=12;PP=2947;SC=TCCTCACAGAATAATATCCAA;SOR=3.724;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=81;TCR=13;TR=87;WE=33623396;WS=33623377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr2	33623720	rs8970	A	G	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=87;ReadPosRankSum=-0.272;SC=CTGGAAATACAGAAACAGCAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=33623742;WS=33623710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr2	33623734	rs622716	A	G	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=224;SC=ACAGCATGGAATTGCAAGTCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=33623742;WS=33623710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	33643734	.	AT	A	42.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=1.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQRankSum=-0.069;QD=1.12;ReadPosRankSum=2.170;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr2	33643740	rs6724875	T	G	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=13.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQRankSum=2.211;QD=4.57;ReadPosRankSum=1.200;SOR=0.037;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr2	33643741	.	T	G	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.015;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQRankSum=0.484;QD=0.93;ReadPosRankSum=3.056;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,11:0.22:49
chr2	33744958	rs7597095	C	T	1198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=6;PP=864;SC=ATTGAGGGCACAGCTGCAGGG;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=33744966;WS=33744948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	33745208	rs2305576	T	C	3067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=75;PP=2254;SC=CCACCAACTTTGTTAAAATTG;SOR=2.197;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=104;TCF=27;TCR=77;TR=102;WE=33745216;WS=33745198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr2	33748913	rs6735997	A	G	1508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=6.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=0;PP=1271;ReadPosRankSum=0.484;SC=AGGCTCTATTATAATTCAGAG;SOR=1.852;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=71;TCR=0;TR=50;WE=33748921;WS=33748903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,50:0.70:71
chr2	33752152	rs10189430	G	T	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.788;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=1;PP=602;ReadPosRankSum=-0.308;SC=GGGCCCGGGGGTGTGCAGGAG;SOR=1.802;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=28;WE=33752160;WS=33752142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,27:0.69:39
chr2	33759395	rs35933402	C	T	2038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.360;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=15;PP=1688;ReadPosRankSum=0.054;SC=TGTAGCTTTCCCTGGACCTCT;SOR=1.439;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=101;TCF=75;TCR=26;TR=69;WE=33759403;WS=33759385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,69:0.68:102
chr2	33759563	rs74326828	G	A	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=33;PP=830;ReadPosRankSum=-0.908;SC=GTTCTAAAACGGAAGAATTTT;SOR=0.723;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=34;WE=33759571;WS=33759553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,35:0.69:51
chr2	33764286	rs7592762	T	C	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.458;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=257;ReadPosRankSum=-1.186;SC=AGGTAAGTGGTTGAGGGAGAA;SOR=1.055;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=15;WE=33764294;WS=33764276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr2	33787976	rs10572554	CCTAA	C	1700.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=38;PP=1679;SC=GAGAATTGACCCTAACTAACT;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=38;WE=33787987;WS=33787966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	33952022	rs4670913	C	A	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=4;PP=899;SC=AGAGGAAAACCCAGGAAATGA;SOR=3.611;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=32;WE=33952030;WS=33952012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
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chr2	35696612	rs4670472	C	T	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=2;PP=25;SC=GTTTTAGTGTCTATGTGCATG;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=35696620;WS=35696602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr2	36605676	rs60204094	A	AT	151.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.8399;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=143;ReadPosRankSum=-0.812;SC=GCGGTAAGTCATTTTTTTTTT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=36605684;WS=36605666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
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chr2	36739553	rs848526	T	C	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=31;PP=584;ReadPosRankSum=0.710;SC=TGTGTACACATGGCCCTTCCC;SOR=0.871;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=31;WE=36739561;WS=36739543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,33:0.72:46
chr2	36756288	rs711247	T	C	2106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.831;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=44;PP=1543;ReadPosRankSum=0.697;SC=TCTCTTATTTTGGTCCAGGAG;SOR=0.325;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=130;TCF=52;TCR=78;TR=79;WE=36756296;WS=36756278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,84:0.62:135
chr2	36771701	rs2276671	C	A	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.01;BaseQRankSum=-3.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=33;PP=816;ReadPosRankSum=-1.436;SC=TAGGTGTTTTCTAATTTTTAA;SOR=0.565;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=51;TCF=6;TCR=45;TR=38;WE=36771709;WS=36771691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,38:0.75:51
chr2	36775315	rs2270333	C	G	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-5.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=2;PP=583;ReadPosRankSum=-1.956;SC=AGAAGTCATCCCTTTGTTTTT;SOR=0.555;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=32;WE=36775323;WS=36775305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,32:0.74:43
chr2	36775410	rs11318146	CT	C	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=1.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-1.618;QD=1.57;ReadPosRankSum=0.552;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,13:0.27:49
chr2	36782886	rs848642	G	A	3647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=97;PP=2803;ReadPosRankSum=1.285;SC=TTCATGGCACGAAGAACTGCA;SOR=0.647;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=50;TCR=144;TR=131;WE=36782894;WS=36782876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,135:0.68:200
chr2	36808732	rs848637	T	G	1921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.227;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=53;PP=1462;ReadPosRankSum=0.995;SC=TCAAAATTTTTACTGTAGGAG;SOR=1.167;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=99;TCF=23;TCR=76;TR=67;WE=36808740;WS=36808722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,70:0.70:100
chr2	36824956	rs5830430	G	GC	329.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=61.07;NF=9;NR=1;PP=388;SC=CGGCCGTAGGGCTGCCGGTCG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=36824964;WS=36824946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	36825137	rs1544655	G	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=108;ReadPosRankSum=-0.172;SC=GCTGCAGGCCGGGGCCGGGAA;SOR=2.925;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=6;WE=36825145;WS=36825127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr2	36825170	rs2287104	T	C	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=132;ReadPosRankSum=-0.820;SC=CCCACCCGCCTCGGCCCCCGC;SOR=0.941;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=7;WE=36825178;WS=36825160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr2	36825330	.	C	CG	153	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=45;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=153;QD=43.5;SC=CGGCCCAGCCCGCCCAGCCCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=36825338;WS=36825320;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr2	36943419	rs4670598	T	C	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=4;PP=415;SC=TGATGCAGTCTATCCCCACAC;SOR=1.721;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=36943427;WS=36943409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	36994439	rs11124542	A	C	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.667;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=28;PP=511;ReadPosRankSum=0.201;SC=GTCAGTAGGTAGACCATGTGT;SOR=0.178;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=30;WE=36994447;WS=36994429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,32:0.67:48
chr2	37000797	rs3770784	C	G	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=28;ReadPosRankSum=-1.065;SC=TCGCTTGAACCCGGAGGTTGC;SOR=0.116;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=6;WE=37000805;WS=37000787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr2	37001570	rs974964	C	T	2436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=57;PP=1837;SC=CAGGGTTTGACGGTTTCCACA;SOR=2.425;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=74;TCF=17;TCR=57;TR=73;WE=37001578;WS=37001560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	37010574	rs3821147	G	A	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.778;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=630;ReadPosRankSum=0.514;SC=AGAAACCCACGGTGTCTTTGA;SOR=1.139;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=125;TCF=79;TCR=46;TR=36;WE=37010582;WS=37010564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,36:0.27:131
chr2	37032669	rs72785023	G	A	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.780;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=403;ReadPosRankSum=-0.008;SC=TGGTGATGGTGGATGGCTGGC;SOR=0.313;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=58;TCF=24;TCR=34;TR=24;WE=37032677;WS=37032659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,23:0.38:60
chr2	37076498	rs62132520	A	C	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.502;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=0;PP=666;ReadPosRankSum=1.313;SC=CTTCAGCAGAACAAAAGGGCA;SOR=2.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=53;TCR=1;TR=30;WE=37076506;WS=37076488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
chr2	37076594	rs62132521	T	C	2917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.409;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=30;PP=2276;ReadPosRankSum=-0.424;SC=AGATGATGCATTGCGTCATAC;SOR=0.895;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=163;TCF=115;TCR=48;TR=106;WE=37076602;WS=37076584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,107:0.65:165
chr2	37077015	rs723674	C	A	2159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=63;PP=1761;SC=CTACCATGTCCTGCTGGTTTC;SOR=8.410;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=0;TCR=63;TR=63;WE=37077023;WS=37077005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	37078095	rs10668550	A	ATT	1429.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=0.000;QD=32.49;ReadPosRankSum=1.095;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr2	37094945	rs2540923	A	G	1939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=13;PP=1475;SC=TAAAGAAAAAACATATACTTA;SOR=2.507;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=52;WE=37094953;WS=37094935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	37095139	rs6752845	G	C	296.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=276;SC=ACGTAAGAAAGCTTACTTAAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=37095147;WS=37095129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	37096970	rs2160379	C	T	1153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=33;PP=925;SC=TGTCAATAAACGATCACTTTG;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=37096978;WS=37096960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	37111045	rs2691106	T	A	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=1;PP=670;ReadPosRankSum=0.344;SC=CCAAGTGCATTTTGTGCTCCA;SOR=0.633;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=30;WE=37111053;WS=37111035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,32:0.76:42
chr2	37129618	rs148671880	A	ATAAT	1714.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.90;QD=48.99;SOR=7.168;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	37230728	rs1007823	T	C	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.143;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=21;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.904;SC=GAGCAGCTCTTACTATCTGTT;SOR=0.382;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=108;TCF=80;TCR=28;TR=70;WE=37230742;WS=37230718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,71:0.63:113
chr2	37230734	rs17497654	C	T	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.669;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=1499;ReadPosRankSum=0.520;SC=CTCTTACTATCTGTTGTACAA;SOR=1.053;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=113;TCF=75;TCR=38;TR=38;WE=37230742;WS=37230718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,43:0.37:117
chr2	37234519	rs2013223	T	C	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=7;PP=236;SC=CCAAGTCTCGTTCTGTCGCCC;SOR=2.670;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=37234527;WS=37234509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	37241050	rs17020125	G	A	2556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.941;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=59;PP=1982;ReadPosRankSum=0.019;SC=ACAGCTGGCTGGAAGATCCTT;SOR=1.264;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=132;TCF=46;TCR=86;TR=86;WE=37241058;WS=37241040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,90:0.64:140
chr2	37248015	rs17020136	T	C	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=500;ReadPosRankSum=0.425;SC=ATGAAAACTTTTCCAAAAATA;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=20;WE=37248023;WS=37248005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr2	37255015	rs2540998	G	A	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=1;PP=962;SC=GCAGCAAAATGTCTCAAGGTG;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=35;WE=37255023;WS=37255005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	37255806	rs17020143	C	T	2495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.508;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=3;PP=2042;ReadPosRankSum=0.358;SC=ATTTTAAGAACGCACATTAAA;SOR=0.336;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=118;TCF=115;TCR=3;TR=87;WE=37255814;WS=37255796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,88:0.73:121
chr2	37265193	rs139662639	A	C	1273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=3.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.30;ReadPosRankSum=-0.423;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,45:0.68:66
chr2	37280571	rs75117295	T	A	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=1.264;SC=ATTATAATAATCTTGCTATGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=37280579;WS=37280561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr2	37302556	rs34545380	GA	G	2538.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.31;QD=25.64;SOR=6.974;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr2	37306343	rs6743906	G	A	1210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=19;PP=972;SC=GAAAAACTGTGAAAGTATCCC;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=19;TCR=19;TR=38;WE=37306351;WS=37306333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	37316733	.	G	A	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.753;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=27.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQRankSum=-3.870;QD=5.77;ReadPosRankSum=0.047;SOR=4.875;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,37:0.43:87
chr2	37316738	.	G	A	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.568;ClippingRankSum=0.000;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=23.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQRankSum=-4.636;QD=4.99;ReadPosRankSum=0.665;SOR=4.356;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,30:0.31:96
chr2	37317869	rs4670654	C	T	963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=18;PP=802;SC=AAAACAGGTACGTAATTATTT;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=28;WE=37317877;WS=37317859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	37318041	rs4670655	A	G	221.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=150;SC=TAGTGAGTATAAAATAAAATT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=37318049;WS=37318031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	37347062	rs4648217	T	TTA	335.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.75;ReadPosRankSum=0.352;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr2	37373982	rs2307475	A	AT	4160.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=36;PP=2975;SC=TTAGGAAAAAAGGCAATCACT;SOR=1.244;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=42;TCR=36;TR=77;WE=37373990;WS=37373972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	37406644	rs10182091	A	G	1962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.129;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=42;PP=1524;ReadPosRankSum=-0.679;SC=CCCAAGAGCCATAGCTTGGAA;SOR=0.526;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=143;TCF=69;TCR=74;TR=85;WE=37406652;WS=37406634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,84:0.59:143
chr2	37406680	rs10205833	C	G	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.518;HP=6;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=41;PP=1431;ReadPosRankSum=-0.014;SC=TGTGGAAATGCAAAAAAGATA;SOR=0.473;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=116;TCF=43;TCR=73;TR=68;WE=37406688;WS=37406670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,67:0.58:116
chr2	37406761	rs4459710	T	C	951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=30;PP=762;ReadPosRankSum=-0.870;SC=TTTATTTGGGTCTATGTTTTG;SOR=0.536;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=31;WE=37406769;WS=37406751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr2	37406807	rs2111630	A	G	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=295;ReadPosRankSum=-0.304;SC=CAATATCATCATGTCCACTCG;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=14;WE=37406815;WS=37406797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr2	37415496	rs11124566	G	C	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=322;ReadPosRankSum=-0.043;SC=CCTGCAATGAGGAACCGCCTT;SOR=0.337;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=19;WE=37415504;WS=37415486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr2	37428743	rs2540973	C	T	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=357;ReadPosRankSum=0.847;SC=TTTAACAATGCTTCCACATGA;SOR=1.220;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=15;WE=37428751;WS=37428733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr2	37444039	.	T	TA	474.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.781;NF=15;NR=0;PP=590;ReadPosRankSum=-0.106;SC=TTCTCTCTGTTAGAGAAAACA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=15;WE=37444047;WS=37444029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr2	37447471	.	AAT	A	58.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=7.35;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	37447627	rs35462755	C	CA	678.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.897;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=497;ReadPosRankSum=0.545;SC=CTAGGAATAACAAAAAAAATA;SOR=1.850;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=26;WE=37447635;WS=37447617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,29:0.71:41
chr2	37456032	rs2098386	C	T	2304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=15;PP=1846;SC=TCTTCTTCAACTAAGGAAGCT;SOR=2.617;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=54;TCR=15;TR=69;WE=37456040;WS=37456022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	37483772	rs2465485	T	A	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=20;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.430;NF=20;NR=0;PP=499;ReadPosRankSum=1.400;SC=ATAGCCAAAATTTTTTTTTTT;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=20;WE=37483780;WS=37483762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,25:0.83:30
chr2	37494591	rs2302650	A	G	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.030;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=449;ReadPosRankSum=-0.912;SC=TAGCCACTTCATTACGGAGTT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=24;WE=37494599;WS=37494581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
chr2	37499406	rs2160394	C	T	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=495;ReadPosRankSum=-0.545;SC=AGTTACCAACCGCAAAGTCTA;SOR=0.682;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=23;WE=37499414;WS=37499396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr2	37543371	rs6544066	A	G	1398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.030;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=9;PP=1035;ReadPosRankSum=1.540;SC=ATAATAGCACACACAGTACCT;SOR=1.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=99;TCF=82;TCR=17;TR=57;WE=37543379;WS=37543361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,62:0.58:106
chr2	37586681	rs2302651	A	G	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=196;ReadPosRankSum=-0.446;SC=AATGAAAGCCATTTCTTTAGA;SOR=0.927;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=72;TCF=66;TCR=6;TR=19;WE=37586689;WS=37586671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,21:0.28:76
chr2	37595696	rs1468816	A	C	2204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=22;PP=1689;ReadPosRankSum=0.177;SC=CTATAAAAGTACAAATGGTCA;SOR=0.674;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=79;TCR=33;TR=75;WE=37595704;WS=37595686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,80:0.68:118
chr2	37599680	rs10490448	G	A	1634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.804;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=27;PP=1337;ReadPosRankSum=0.184;SC=GGAGTACAACGGTGGGATATG;SOR=0.300;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=83;TCF=38;TCR=45;TR=54;WE=37599688;WS=37599670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,55:0.64:86
chr2	38177525	rs11687301	A	C	2631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=3;PP=2091;ReadPosRankSum=1.793;SC=GGTGAGCTACAGAACAGTTCT;SOR=4.099;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=71;TCR=3;TR=73;WE=38177533;WS=38177515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,80:0.99:81
chr2	38178406	rs4670799	A	G	3109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=40.92;ReadPosRankSum=-0.693;SOR=0.866;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,75:0.99:76
chr2	38178406	.	ATGTTCTC	GTGTTCTC,GTGTTCTG	1314	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=55,35;NR=22,15;PP=487,1314;QD=6.7762495136;SC=GCTTCCAACGATGTTCTCCAG;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=56;TCR=23;TR=77,50;WE=38178421;WS=38178396;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.97:79
chr2	38178413	.	C	G	1549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.193;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=2.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.67;ReadPosRankSum=-0.060;SOR=0.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,55:0.66:83
chr2	38179134	rs4670800	G	A	12962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=421;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=183;NR=216;PP=2965;SC=TACAGCACAGGTCATTCTCCA;SOR=0.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=399;TCF=183;TCR=216;TR=399;WE=38179142;WS=38179124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,418:1.00:418
chr2	38179414	rs72332368	CTG	C	3590.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=63;PP=2950;SC=CTTTCATAGCCTGTAGAATTC;SOR=2.805;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=75;TCF=8;TCR=67;TR=71;WE=38179423;WS=38179404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr2	38224507	.	C	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=120;ReadPosRankSum=-0.136;SC=GAGAGATAATCCATTCAAAAG;SOR=1.038;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=9;WE=38224515;WS=38224497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr2	38298593	rs34468862	G	GA	445.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=399;SC=ATATTTCTGGGAAAAAAATCT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=14;WE=38298601;WS=38298583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	38541581	rs71400348	C	CTAT	131.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=144;ReadPosRankSum=-1.016;SC=TCCTGTTCGCCTACTGATAAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=38541589;WS=38541571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr2	38542573	rs12712583	T	C	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=750;ReadPosRankSum=0.566;SC=TTATTTTGTATCTCAGCGCAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=29;WE=38542581;WS=38542563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,29:0.85:34
chr2	38604351	rs3731847	A	G	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=587;ReadPosRankSum=-1.248;SC=CGCCGGCGCCACAGCCCCTGG;SOR=0.527;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=22;TCR=17;TR=34;WE=38604359;WS=38604341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,36:0.88:41
chr2	38925610	rs12465156	A	G	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.767;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=114;ReadPosRankSum=-1.822;SC=GGATGTTAGCAGTTAATTTAG;SOR=0.033;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=10;WE=38925618;WS=38925600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr2	38956947	rs2272445	A	G	2177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=55;PP=1727;SC=CTATGCTACAAGTGACCCAAT;SOR=4.047;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=6;TCR=55;TR=61;WE=38956955;WS=38956937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	38977371	rs3112183	C	T	4143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=109;PP=2965;SC=ATGCACGTTACGCAAAATCTG;SOR=3.929;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=15;TCR=109;TR=124;WE=38977379;WS=38977361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr2	38977402	rs3134630	T	C	2865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=77;PP=2394;SC=CAATTACTTATTTGCCTTAAA;SOR=5.994;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=80;TCF=3;TCR=77;TR=80;WE=38977410;WS=38977392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr2	39006603	rs3112201	T	G	1677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=27;PP=1230;SC=AAACTCCTGATCTCCAAGGAT;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=25;TCR=27;TR=52;WE=39006611;WS=39006593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	39025043	rs34207268	G	GA	432.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.07;MQRankSum=0.096;QD=19.67;ReadPosRankSum=1.680;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,19:0.86:22
chr2	39025555	rs1530853	G	A	7288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=120;PP=2965;ReadPosRankSum=1.887;SC=GATCAAGTTCGCAACGAAGCT;SOR=0.263;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=230;TCF=109;TCR=121;TR=228;WE=39025563;WS=39025545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,235:1.00:236
chr2	39025632	rs1530852	A	G	4125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=109;PP=2965;SC=AACAGGCAGGATAGGTTATTG;SOR=3.964;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=15;TCR=109;TR=124;WE=39025640;WS=39025622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr2	39030074	rs13029406	C	T	2663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=73;PP=2144;SC=CAAAAAACCTCAGATGATGAC;SOR=4.307;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=8;TCR=73;TR=81;WE=39030082;WS=39030064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	39042639	rs3112138	G	A	4233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=97;NR=32;PP=2965;SC=AAAGAGAAATGAGAACCAACT;SOR=2.233;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=97;TCR=32;TR=129;WE=39042647;WS=39042629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr2	39045885	rs10176932	C	T	1686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=0;PP=1320;SC=CCATTTTACACGGCTGGTAAG;SOR=7.903;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=49;WE=39045893;WS=39045883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	39050019	rs3112146	G	T	910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=714;SC=AAAATTCACAGCTAACATACA;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=39050027;WS=39050009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	39050061	rs34582261	AT	A	1687.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=2;PP=1827;SC=CATGCCCTTGATTTCCCCCAT;SOR=5.549;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=43;TCR=2;TR=45;WE=39050069;WS=39050051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	39050141	rs3770681	A	C	3835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=40;PP=2943;SC=TTACAAACGGAGACTTAAAAG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=84;TCR=40;TR=124;WE=39050149;WS=39050131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr2	39065729	rs17494315	C	A	3125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=0;PP=2614;SC=CAAAATTCAACGTCAAATACA;SOR=9.044;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=85;TCF=85;TCR=0;TR=85;WE=39065737;WS=39065719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr2	39075356	rs11124651	A	C	1624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=0;PP=1201;SC=CAAACTTTAAAATAATTATAT;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=42;WE=39075364;WS=39075346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	39082344	rs7598922	T	C	4705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=102;PP=2965;SC=AGGTGGTCCATTCAGAGAATC;SOR=2.253;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=35;TCR=102;TR=137;WE=39082352;WS=39082334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr2	39088323	rs11893062	G	A	1863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.680;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=37;PP=1355;ReadPosRankSum=-0.710;SC=GGTTATCAAAGAATATACGAC;SOR=0.567;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=229;TCF=107;TCR=122;TR=72;WE=39088331;WS=39088313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,78:0.33:239
chr2	39090696	rs3099999	T	C	3677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=98;PP=2965;SC=TACACACATATCTTCAATCAG;SOR=3.892;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=13;TCR=98;TR=111;WE=39090704;WS=39090686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr2	39117117	rs7565111	G	A	2094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=36;PP=1619;SC=AACCACCGCAGGCAACATGGG;SOR=1.000;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=25;TCR=36;TR=61;WE=39117125;WS=39117107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	39158297	rs199921991	C	G	3567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.849;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=68;PP=2808;ReadPosRankSum=0.289;SC=CCTGCCCAAGCACAAGGAAGT;SOR=0.966;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=168;TCF=77;TCR=91;TR=120;WE=39158305;WS=39158287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,126:0.70:180
chr2	39185048	rs422854	C	T	1659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=46;NR=2;PP=1381;SC=TGCAAAGGCCCCTGGAGATAG;SOR=5.549;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=46;TCR=2;TR=48;WE=39185056;WS=39185038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	39187190	rs6755527	T	C	2307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=30;PP=1808;SC=GGACTTCGAGTCCTCTCCGGC;SOR=0.844;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=33;TCR=30;TR=63;WE=39187198;WS=39187180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr2	39187519	rs958412	A	G	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=16;PP=714;SC=GCGCCTACAAACTGGAGGCGG;SOR=1.220;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=26;WE=39187527;WS=39187509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	39198966	rs2305516	A	G	2120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=7;PP=1752;SC=AGCTGAGTTTATGGACTTTGA;SOR=3.947;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=57;TCR=7;TR=64;WE=39198974;WS=39198956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	39214821	rs2290445	A	C	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=303;SC=AATTGCTTATAATTAAAAGTA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=39214829;WS=39214811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	39224351	rs1454223	G	T	1593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=1;PP=1453;SC=AAGTAGTTTAGAAACTTAATC;SOR=6.399;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=49;WE=39224359;WS=39224341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	39224615	rs5830551	G	GT	1136.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=36;PP=1089;SC=GAAAATGCAAGTTTTTTTCTG;SOR=5.136;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=37;WE=39224623;WS=39224605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	39233500	rs7577088	G	A	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=514;SC=TTAATGAAATGAGTGTTTTGT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=39233508;WS=39233490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	39251375	rs10634554	T	TCAC	682.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=930;SC=TATTCAACTGTCACAATAAAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=16;WE=39251383;WS=39251365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	39262068	rs10153761	C	T	2593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=67;PP=2038;SC=AGGTACAAGACAAAAATATCT;SOR=3.153;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=12;TCR=67;TR=79;WE=39262076;WS=39262058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	39281730	rs997344	G	C	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=447;SC=CATTCAATGAGAGGCATATAT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=39281738;WS=39281720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	39283784	rs180918477	G	C	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=3;PP=573;ReadPosRankSum=0.405;SC=TAGTACGTTAGCATCTAATAA;SOR=1.675;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=26;WE=39283792;WS=39283774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,27:0.82:33
chr2	39406572	rs7566123	C	A	1934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=53;PP=1661;SC=GAAAATCTTCCAGTTTGTGTA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=53;WE=39406580;WS=39406562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	39440727	rs10196407	G	C	1222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=35;PP=907;SC=AACACCATGCGGAAGGGTCCT;SOR=3.564;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=39;WE=39440735;WS=39440717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	39452861	rs11124663	C	T	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=2;PP=537;SC=ATGGGGTAGCCAGATGCATTG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=39452869;WS=39452851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	39479122	rs3770678	G	C	221.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=182;SC=AAACATGATCGCTAAAAATGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=39479130;WS=39479112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	39494197	rs2302749	C	T	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=3;PP=738;SC=AGAGATGAAACAGCCAAGAAA;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=28;WE=39494205;WS=39494187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	39494469	rs10865149	C	G	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=490;SC=GATCAGTGCACAAAGGATGAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=39494477;WS=39494459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	39507417	rs3755176	T	A	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=13;PP=1140;SC=TACTACCTCTTGTATCTGGGT;SOR=1.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=43;WE=39507425;WS=39507407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	39514136	rs3755172	T	C	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=22;PP=735;SC=TGAAAATGATTAATCTTCATG;SOR=2.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=39514144;WS=39514126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	39514204	rs3755171	G	C	220.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=181;SC=CTCTGACATAGTGTCATTATT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=39514212;WS=39514194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	39526842	rs2111382	A	C	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=6;PP=636;SC=GCAACTTAATAATTCTTGAAT;SOR=2.215;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=24;WE=39526850;WS=39526832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	39536669	.	G	A	436	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=14;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=22;MQ=55.68;NF=0;NR=19;PP=436;QD=24.7774322393;SC=AACTAAAAAAGAAAAAAAAGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=12;TCR=46;TR=19;WE=39536686;WS=39536659;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:39,19:0.33:58
chr2	39542658	rs5830562	AT	A	280.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=187;SC=CACTTTGCAAATTTTTTTTTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=12;WE=39542666;WS=39542648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	39553271	rs3815594	A	G	5692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=124;NR=42;PP=2965;SC=AGATTCTTCAATGATGATGCA;SOR=2.221;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=167;TCF=125;TCR=42;TR=166;WE=39553279;WS=39553261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr2	39558928	rs6760382	G	A	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=139;SC=GTACATGCCTGAATTACTTTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=39558936;WS=39558918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	39564620	rs1125839	C	A	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=2;PP=790;SC=GTAAGTAAAGCCTTAGTTTAA;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=39564628;WS=39564610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	39570427	rs3732053	T	C	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=626;SC=CAATAAAACATAGCTTGCTTT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=23;WE=39570435;WS=39570417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	39583446	rs8545	A	G	2245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=34;PP=1720;SC=CTTTCATCATAATAATTTCTT;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=35;TCR=34;TR=69;WE=39583454;WS=39583436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	39944055	rs2540229	G	A	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=267;ReadPosRankSum=0.658;SC=GACTGCCTCAGTGGTTGATCT;SOR=0.813;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=14;WE=39944063;WS=39944045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr2	39982898	rs10688564	G	GAGTAT	226.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=284;ReadPosRankSum=-0.147;SC=CATCTATTTTGAGTAAATAAT;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=6;WE=39982906;WS=39982888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr2	39993167	rs4670959	T	C	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.268;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=470;ReadPosRankSum=0.914;SC=ATCTGTCTTATGGGACAAACC;SOR=0.273;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=87;TCF=60;TCR=27;TR=28;WE=39993175;WS=39993157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,30:0.32:93
chr2	40342600	rs148215685	G	T	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=468;ReadPosRankSum=-1.010;SC=AAGCTAGTGTGCCAGGGGACA;SOR=1.079;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=108;TCF=50;TCR=58;TR=30;WE=40342608;WS=40342590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,32:0.29:111
chr2	40392313	rs434725	G	C	1363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=37;PP=1166;SC=ATCACTGTGAGAGCAAGTGAT;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=37;WE=40392321;WS=40392303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	40402275	rs6734847	G	A	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=316;ReadPosRankSum=-0.250;SC=TGAGGTCAATGGCCCTAAACA;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=14;WE=40402283;WS=40402265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr2	40403104	rs106706	A	G	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.409;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=593;ReadPosRankSum=-0.363;SC=ACTTCTGTACATTATTAGATA;SOR=1.230;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=56;TCF=38;TCR=18;TR=36;WE=40403112;WS=40403094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,38:0.62:61
chr2	40404839	rs433572	C	T	2344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.385;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=15;PP=1776;ReadPosRankSum=0.262;SC=TAGGGAGACACGGAGAGAGAA;SOR=1.215;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=128;TCF=101;TCR=27;TR=85;WE=40404847;WS=40404829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,87:0.67:130
chr2	40655563	.	CCACACACACA	C,CCACACA	1400.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.08;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=27,27;NR=0,0;PP=921,823;SC=ACACACTGAACCACACACACA;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=27,27;WE=40655582;WS=40655553;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.66,0.34:38
chr2	42165754	rs10192292	C	T	1641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=1251;ReadPosRankSum=-0.223;SC=CAGGTGGAACCTGCAAGAAAG;SOR=0.691;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=79;TCF=50;TCR=29;TR=53;WE=42165762;WS=42165744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,60:0.71:85
chr2	42165961	rs7590930	T	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.559;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=330;ReadPosRankSum=0.540;SC=TGGCCTCCCCTTGTTGTGCTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=13;WE=42165969;WS=42165951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr2	42181051	.	GCA	G	44	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=15;MQ=59.9;NF=2;NR=1;PP=44;QD=15.6666666667;SC=AGGCACGCGCGCACACACACA;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=3;WE=42181060;WS=42181042;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,3:0.17:18
chr2	42396722	rs7233	A	G	3073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=15;PP=2634;SC=CCGCCCCTCTAAGCCCGGAGC;SOR=3.160;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=75;TCR=15;TR=90;WE=42396730;WS=42396712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	42491951	rs6735571	C	T	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.189;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=844;ReadPosRankSum=0.633;SC=TATTTTCATCCAGTGCACTTT;SOR=0.516;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=34;WE=42491959;WS=42491941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,35:0.69:51
chr2	42510018	rs6736913	A	G	4807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=46;PP=2965;SC=TCCGACCGGGAAAATAGTTTA;SOR=1.826;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=101;TCR=46;TR=147;WE=42510026;WS=42510008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
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chr2	42544821	rs7558501	C	T	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.056;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=224;ReadPosRankSum=-0.082;SC=AGCAGAACATCAGAGTTCCCT;SOR=0.154;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=12;WE=42544829;WS=42544811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr2	42560975	rs7572231	A	G	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=634;ReadPosRankSum=0.759;SC=AGTCTCCAGCAGCCACAGAAA;SOR=0.527;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=33;WE=42560983;WS=42560965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,33:0.73:45
chr2	42719847	rs113015907	T	TG	5419.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=9;PP=2975;SC=TGGCCGCGCCTGGGCCTCGCT;SOR=4.768;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=103;TCR=9;TR=111;WE=42719868;WS=42719837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr2	42719860	rs112592817	G	GC	6650.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=33;PP=2975;SC=GCCTCGCTGGGCGCGCACCCC;SOR=2.645;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=109;TCR=36;TR=136;WE=42719868;WS=42719837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr2	42795954	rs78106475	T	C	835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=15;PP=693;SC=TGGGAGCGGGTTCCGGGAGCG;SOR=1.220;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=26;WE=42795962;WS=42795944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	42836516	rs6720277	A	G	3445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=1;PP=2848;SC=AATATTGAATAAAATGTTGAT;SOR=7.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=93;TCF=92;TCR=1;TR=93;WE=42836524;WS=42836506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr2	42989994	rs2278585	G	T	1552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=2;PP=1291;SC=TGTCCCTCCAGGCCAGAGCGC;SOR=5.464;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=43;WE=42990002;WS=42989984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	42990010	rs12617777	C	A	2389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=4;PP=1935;SC=AGCGCGGCAGCCCTTACCCCC;SOR=5.255;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=65;TCR=4;TR=69;WE=42990018;WS=42990000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	42990101	rs2278586	G	C	6083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=114;NR=79;PP=2965;SC=TGCACTTTCAGCTTCCCTATG;SOR=1.056;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=195;TCF=116;TCR=79;TR=193;WE=42990109;WS=42990091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr2	42990336	rs1992286	T	G	3215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=59;PP=2846;SC=GGTCCAGGGATCGGCAGGCGG;SOR=1.081;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=41;TCR=59;TR=100;WE=42990344;WS=42990326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr2	42990522	rs12712859	C	T	3846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=73;PP=2965;SC=AGAGGATGAGCGCCAGTGGCA;SOR=1.170;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=50;TCR=73;TR=123;WE=42990530;WS=42990512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr2	42996709	rs35746707	ATGTGTGTGTG	A	492.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.532;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQ=59.27;MQRankSum=2.004;NF=8;NR=0;PP=1491;ReadPosRankSum=1.223;SC=AACCTCTGAAATGTGTGTGTG;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=8;WE=42996726;WS=42996699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr2	42996759	rs34567167	AAGAG	A	1004.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.266;NF=21;NR=2;PP=835;ReadPosRankSum=0.333;SC=GTGTGTGTGAAAGAGAGAGAG;SOR=1.236;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=23;WE=42996770;WS=42996749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr2	42997614	rs2241850	G	A	2185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.636;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=7;PP=1780;ReadPosRankSum=-0.322;SC=AAGAGGCAGGGGCTGGGCTGG;SOR=2.237;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=113;TCF=99;TCR=14;TR=76;WE=42997622;WS=42997604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,77:0.66:116
chr2	43011169	rs4953660	G	T	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=5.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.044;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=39;PP=971;ReadPosRankSum=0.403;SC=TGTCTCCCCGGTGCATGCCAT;SOR=2.434;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=61;TCF=3;TCR=58;TR=40;WE=43011177;WS=43011159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,43:0.67:64
chr2	43015612	rs3816181	G	T	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=12;PP=1232;ReadPosRankSum=1.078;SC=GCCCCCTCCCGCTAGGGCCAG;SOR=0.665;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=83;TCF=65;TCR=18;TR=57;WE=43015620;WS=43015602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,63:0.68:92
chr2	43015704	rs3816182	T	A	2590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.147;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=42;PP=2020;ReadPosRankSum=0.079;SC=TCCTTCCTGGTGTTGGGGCCT;SOR=0.501;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=145;TCF=82;TCR=63;TR=93;WE=43015712;WS=43015694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,95:0.63:150
chr2	43015719	rs3816183	T	C	2185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.477;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=44;PP=1594;ReadPosRankSum=-0.305;SC=GGGCCTCCGATGAACATGACT;SOR=0.477;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=142;TCF=77;TCR=65;TR=90;WE=43015727;WS=43015709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,91:0.64:143
chr2	43015757	rs3816184	G	A	2051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.578;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=48;PP=1514;ReadPosRankSum=-1.199;SC=CCTGCAATGCGCAAAGTGGGG;SOR=1.023;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=116;TCF=42;TCR=74;TR=73;WE=43015765;WS=43015747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,78:0.64:122
chr2	43015902	rs3816185	G	A	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=322;ReadPosRankSum=-1.095;SC=TCTCATCCCCGGTTCATGCCT;SOR=0.330;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=15;WE=43015910;WS=43015892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr2	43019730	rs2304656	A	G	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.677;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.795;NF=3;NR=24;PP=537;ReadPosRankSum=1.021;SC=GGAGGCCCGCAGCTCCGCCCA;SOR=1.151;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=27;WE=43019738;WS=43019720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr2	43451957	rs149290349	G	A	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.435;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=361;ReadPosRankSum=-1.342;SC=AGCGGCCGCAGCCGCGGCCGC;SOR=0.132;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=18;WE=43451965;WS=43451947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr2	43452183	rs7933	A	G	4184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.204;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=46;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.861;SC=CTGTGGTGCAACTTGGGCCGC;SOR=1.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=78;TCR=47;TR=124;WE=43452191;WS=43452173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,128:0.99:129
chr2	43455063	rs67278917	CCA	C	4038.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.016;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.474;NF=20;NR=62;PP=2962;ReadPosRankSum=0.765;SC=ATACAGGTTGCCACAAAAAGC;SOR=1.356;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=121;TCF=34;TCR=87;TR=82;WE=43455072;WS=43455053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,105:0.70:149
chr2	43514036	rs11900952	G	A	1714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=11;PP=1338;SC=CTTCCGTCTCGGCGCACTTAC;SOR=2.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=52;WE=43514044;WS=43514026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
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chr2	43711523	rs998768	G	T	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.427;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=605;ReadPosRankSum=-1.406;SC=CTTTTTTAGGGAAGAAGGGAA;SOR=0.165;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=30;WE=43711531;WS=43711513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr2	43712610	rs6747229	T	A	169.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.157;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.12;ReadPosRankSum=-0.857;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
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chr2	43735713	rs6761129	C	T	2618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=16;PP=2025;ReadPosRankSum=-0.499;SC=CTCACTCACACGTCAAACAGG;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=144;TCF=118;TCR=26;TR=91;WE=43735721;WS=43735703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,97:0.64:151
chr2	43754992	rs1491508	C	T	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=144;ReadPosRankSum=-1.427;SC=CTTTTTAAAACGTACACAAAA;SOR=0.280;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=11;WE=43755000;WS=43754982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,11:0.27:41
chr2	43768545	rs72790940	T	G	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=430;ReadPosRankSum=0.502;SC=TCCCCAAGAATAATCTGCTTG;SOR=1.609;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=18;WE=43768553;WS=43768535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr2	43778857	rs34461850	GA	G	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=61.19;MQRankSum=0.608;NF=20;NR=0;PP=274;ReadPosRankSum=-1.927;SC=AATACTTGGGGAAAAAAAAAA;SOR=4.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=20;WE=43778865;WS=43778847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,24:0.92:26
chr2	43787576	rs4337518	G	A	745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=21;PP=600;SC=AAAGAAATCAGTCTTCTGAAG;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=43787584;WS=43787566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	43793725	rs1158411	G	A	1880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=20;PP=1528;SC=AGGTAAGAATGAAACCTCAAA;SOR=1.453;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=55;WE=43793733;WS=43793715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	43793963	rs34512555	T	TAA	583.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.58;QD=38.92;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	43797619	rs17031056	C	T	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.041;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=285;ReadPosRankSum=0.435;SC=TTATAAAGTACCTGAGAACTT;SOR=0.660;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=29;TCR=35;TR=17;WE=43797627;WS=43797609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,19:0.28:67
chr2	43797710	rs11904510	G	A	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=27;PP=854;SC=ATGTCAGCCTGAGAGGCAAAT;SOR=3.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=30;WE=43797718;WS=43797700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	43798792	rs11884742	G	A	1900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=17;PP=1522;ReadPosRankSum=-0.747;SC=TTTTAAAAACGATTTCCCAAA;SOR=0.793;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=59;WE=43798800;WS=43798782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr2	43799070	rs3752355	C	T	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=542;SC=ACTTGAATTGCTTACTTACAT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=43799078;WS=43799060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	43800174	rs11898207	A	G	3798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=99;PP=2965;SC=TTATGCAATGACTACTATAAT;SOR=3.338;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=18;TCR=99;TR=117;WE=43800182;WS=43800164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr2	43801712	rs11899823	A	G	7329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=103;NR=119;PP=2965;SC=ATGGTTTCCAAGAGGTCACTT;SOR=0.877;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=222;TCF=103;TCR=119;TR=222;WE=43801720;WS=43801702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr2	43802261	rs970175	C	A	907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=742;SC=ATTAAATACACAGAATGACCA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=43802269;WS=43802251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	43804229	rs13021894	T	C	5194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.413;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=100;PP=2965;ReadPosRankSum=0.345;SC=GACCCATGCTTCCGTTCTGCC;SOR=1.229;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=58;TCR=100;TR=157;WE=43804237;WS=43804219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,162:0.99:163
chr2	43805608	rs6759861	C	G	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=288;ReadPosRankSum=-1.233;SC=TAAACATACCCTAACTCTCAA;SOR=1.382;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=17;WE=43805616;WS=43805598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr2	43805739	rs61754256	C	T	1347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.915;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=22;PP=1014;ReadPosRankSum=1.540;SC=CAGTCTGTAACAGATCATCTA;SOR=0.500;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=76;TCF=43;TCR=33;TR=49;WE=43805747;WS=43805729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,51:0.65:79
chr2	43817950	rs35899859	CT	C	256.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=1.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=1.391;QD=6.11;ReadPosRankSum=-0.959;SOR=0.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr2	43819139	rs17031095	A	G	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.546;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=750;ReadPosRankSum=1.123;SC=GTTGCACACAATGTAACAGCA;SOR=0.191;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=54;TCF=30;TCR=24;TR=35;WE=43819147;WS=43819129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,41:0.66:62
chr2	43871983	rs12105773	T	C	3731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.188;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=90;PP=2965;ReadPosRankSum=1.379;SC=CTATTTAGGGTCTGCTTCATT;SOR=3.470;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=108;TCF=18;TCR=90;TR=107;WE=43871991;WS=43871973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,111:0.99:112
chr2	43872032	rs4450661	A	G	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=190;ReadPosRankSum=0.029;SC=GTTTGATTTAATTTTTGTCAA;SOR=0.395;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=1;TCR=57;TR=14;WE=43872040;WS=43872022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,15:0.25:61
chr2	43902511	rs755862	G	C	1900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=7;PP=1591;SC=TATTCTCCAGGCCTCAGTCAT;SOR=3.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=51;TCR=7;TR=58;WE=43902519;WS=43902501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
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chr2	43903354	rs4952675	T	C	6845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=109;NR=92;PP=2965;SC=GGTCTTGAGTTTGACCTCTGT;SOR=0.902;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=201;TCF=109;TCR=92;TR=201;WE=43903362;WS=43903344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr2	43903483	rs4952995	T	C	3424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=100;PP=2687;SC=TAGGACAGTGTGCCAGGGTCA;SOR=3.556;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=17;TCR=101;TR=117;WE=43903491;WS=43903473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr2	43905898	.	G	GAGGTGGAGGTGC	941	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=61.27;NF=7;NR=0;PP=941;QD=135.857142857;SC=GGTGGAGGTGGAGGTGGAGGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=43905906;WS=43905888;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,7:0.78:9
chr2	43921489	rs12616572	A	T	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=3;PP=1048;SC=TTAAGTGGATATGCCTTGTAT;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=35;WE=43921497;WS=43921479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	43926943	rs7606783	T	A	4645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=92;PP=2965;SC=CTGGGGCTCCTGTGAGTGACT;SOR=1.644;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=42;TCR=92;TR=134;WE=43926951;WS=43926933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr2	43931176	rs4953002	T	C	6982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=122;NR=84;PP=2965;SC=AGGCCTTCAATATGGAGAGTG;SOR=1.087;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=207;TCF=122;TCR=85;TR=206;WE=43931184;WS=43931166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr2	43931321	rs4953003	G	A	2414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=70;PP=1961;SC=TAAAGGAGGTGTTTAAAGGGT;SOR=8.608;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=0;TCR=70;TR=70;WE=43931329;WS=43931311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	43937500	rs17414174	T	C	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.265;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=263;ReadPosRankSum=1.795;SC=GTTTAGAACGTAATTCCTCAA;SOR=0.441;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=58;TCF=17;TCR=41;TR=15;WE=43937508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,15:0.26:58
chr2	43939525	rs13028613	A	G	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=644;ReadPosRankSum=1.594;SC=TCACTAAGGTAGGAACCTCCT;SOR=0.527;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=104;TCF=28;TCR=76;TR=36;WE=43939533;WS=43939515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,38:0.34:112
chr2	43947944	rs17031344	A	G	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=703;SC=GTTAGGGCTTAAACTTTTCCT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=43947952;WS=43947934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	43953664	rs7574334	A	G	1828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=56;PP=1624;SC=TAATTATCAAATCAATTTAAT;SOR=8.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=0;TCR=57;TR=56;WE=43953672;WS=43953654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	43965700	rs60748869	G	GT	427.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=317;ReadPosRankSum=0.216;SC=AATTTAAAGTGTTTTTTTTTC;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=19;WE=43965708;WS=43965690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr2	43968167	rs2278358	G	A	1805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.693;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=31;PP=1380;ReadPosRankSum=-0.410;SC=CACCTAAAGAGGAATGCAGAT;SOR=0.610;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=111;TCF=60;TCR=51;TR=63;WE=43968175;WS=43968157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,67:0.57:117
chr2	43968331	rs58382159	G	A	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=296;ReadPosRankSum=0.587;SC=TCATTGATGTGGAGCTAGGAA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=12;WE=43968339;WS=43968321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr2	43971292	rs12151633	C	T	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=622;ReadPosRankSum=-0.715;SC=TTTGTTAAACCCATAGAATTC;SOR=2.235;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=24;WE=43971300;WS=43971282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,25:0.76:33
chr2	43985940	rs7570252	C	A	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=281;ReadPosRankSum=0.558;SC=CACAGTTATGCTTAGGATTGG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=13;WE=43985948;WS=43985930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr2	43991310	rs10205936	C	T	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.52;ReadPosRankSum=-0.850;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr2	43991310	.	CCA	TCC	262	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=6;NR=0;PP=262;QD=52.5779791437;SC=TAATTATTTTCCATCTCTCCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=6;WE=43991320;WS=43991300;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr2	43991312	.	A	C	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=-0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.52;ReadPosRankSum=-0.289;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr2	43991357	rs7565517	A	C	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=20;NR=1;PP=602;SC=ACTTTTTCTTATCTTTAAAGA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=43991365;WS=43991347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	43992575	rs10495905	C	A	2414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.952;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=32;PP=1845;ReadPosRankSum=-0.705;SC=CTCTTTTGATCGCCAGTTACA;SOR=0.316;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=146;TCF=100;TCR=46;TR=90;WE=43992583;WS=43992565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,93:0.61:152
chr2	44004010	rs2288709	T	C	1599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=37;PP=1279;ReadPosRankSum=-0.115;SC=GCAGAAAAATTTGTTTTCTTC;SOR=0.690;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=75;TCF=23;TCR=52;TR=54;WE=44004018;WS=44004000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,57:0.73:78
chr2	44010620	rs3815995	G	A	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=551;ReadPosRankSum=0.072;SC=TTACATATGAGTGACATTAAC;SOR=0.836;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=32;TCF=18;TCR=14;TR=26;WE=44010628;WS=44010610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,28:0.82:34
chr2	44016885	rs3815994	C	G	1699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=45;PP=1313;ReadPosRankSum=1.020;SC=TCCAGGAAAACCTGTAAGTAC;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=16;TCR=65;TR=56;WE=44016893;WS=44016875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,60:0.69:87
chr2	44019719	rs75726568	A	G	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=200;ReadPosRankSum=0.516;SC=AACATCAAGTATATTCTCATC;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=9;WE=44019727;WS=44019709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr2	44019799	rs13420319	G	A	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.874;HP=7;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=411;ReadPosRankSum=-0.476;SC=ATAACTCCTTGTTTTTCCTTC;SOR=0.132;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=22;WE=44019807;WS=44019789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr2	44019930	rs10199777	C	T	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.252;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=832;ReadPosRankSum=-1.370;SC=TTTAGCATAACGTCTTCAGGG;SOR=1.061;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=60;TCF=35;TCR=25;TR=38;WE=44019938;WS=44019920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,40:0.65:62
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chr2	44021826	rs9309107	T	A	2845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.974;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=81;PP=2267;ReadPosRankSum=1.142;SC=TTAGTCCCATTTATAGTTAAT;SOR=0.970;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=23;TCR=116;TR=97;WE=44021834;WS=44021816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,102:0.70:145
chr2	44028109	rs79621281	G	A	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.034;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=710;ReadPosRankSum=-0.805;SC=TTTAGCCAATGTTGTCTCATC;SOR=0.305;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=33;WE=44028117;WS=44028099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,35:0.73:48
chr2	44028723	rs17031591	G	A	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=264;ReadPosRankSum=0.408;SC=ACAGGAGAGCGTGGCAGCAAA;SOR=0.495;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=15;WE=44028731;WS=44028713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr2	44032189	rs10177630	C	G	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=18;PP=1120;ReadPosRankSum=-1.018;SC=TCATAGAGAGCCTTTGTGGCA;SOR=0.746;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=60;TCR=27;TR=58;WE=44032197;WS=44032179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,57:0.67:85
chr2	44032263	rs17031616	G	A	1839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=38;PP=1331;ReadPosRankSum=1.316;SC=GTTTATGGGCGTGAAGTGATT;SOR=0.781;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=95;TCF=44;TCR=51;TR=72;WE=44032271;WS=44032253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,74:0.75:99
chr2	44036800	rs4952683	A	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=285;ReadPosRankSum=-0.569;SC=TCCTTGAATTAGTAAAGTTGA;SOR=0.622;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=12;WE=44036808;WS=44036790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr2	44037047	rs17031643	T	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.40;ReadPosRankSum=0.566;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr2	44049872	rs4073237	C	T	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.065;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=5;PP=956;ReadPosRankSum=-0.513;SC=TCTCCCTGCACGAGTCCCACT;SOR=0.186;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=75;TCF=69;TCR=6;TR=45;WE=44049880;WS=44049862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,46:0.60:77
chr2	44071625	rs4148209	C	A	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.237;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=2318;ReadPosRankSum=-1.171;SC=AGGAGCCCCTCATCTCTCCTG;SOR=0.895;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=75;TCR=53;TR=53;WE=44071647;WS=44071615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,55:0.42:131
chr2	44071639	rs4148210	C	T	1325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=23;PP=2318;ReadPosRankSum=1.524;SC=TCTCCTGTCTCCCACAGGGCC;SOR=0.737;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=130;TCF=74;TCR=56;TR=52;WE=44071647;WS=44071615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,54:0.40:134
chr2	44071743	rs4148211	A	G	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.017;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=29;PP=645;ReadPosRankSum=0.204;SC=GACCTCAACTACCAGGTAGAG;SOR=1.598;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=107;TCF=30;TCR=77;TR=35;WE=44071751;WS=44071733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,36:0.32:112
chr2	44071833	rs4148212	A	C	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.67;ReadPosRankSum=-1.002;SOR=0.064;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,7:0.19:37
chr2	44079004	rs4148214	T	C	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.980;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=539;ReadPosRankSum=-1.097;SC=TCCAAGAAGCTACAGTGTCCA;SOR=2.599;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=68;TCF=10;TCR=58;TR=26;WE=44079012;WS=44078994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,24:0.36:66
chr2	44099433	rs4148217	C	A	4629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=7.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.779;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=122;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.033;SC=CAGCAGTTTACGACGCTGATC;SOR=0.307;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=232;TCF=52;TCR=180;TR=163;WE=44099441;WS=44099423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,162:0.69:234
chr2	44099582	rs4148218	G	A	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=412;ReadPosRankSum=0.000;SC=GCATCCAGCAGGGCGTTGGTG;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=17;WE=44099590;WS=44099572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr2	44101214	rs10709506	CA	C	928.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=1071;SC=GGTTTGATTTCATTGTGATTG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=44101222;WS=44101204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	44101394	rs4953027	A	G	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=157;ReadPosRankSum=0.027;SC=CATCTAAATTAGGATGGCTTT;SOR=0.055;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=9;WE=44101402;WS=44101384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr2	44101430	rs4952689	T	G	1104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=0;PP=995;ReadPosRankSum=0.961;SC=AAAAAAAAATTAGAGACTTGG;SOR=5.728;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=34;WE=44101438;WS=44101420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr2	44101538	rs28517482	C	T	4774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.590;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=68;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.744;SC=CTTTCCCTTACTTTTTAGGTT;SOR=0.663;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=160;TCF=90;TCR=70;TR=157;WE=44101546;WS=44101528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,159:0.99:160
chr2	44101649	.	G	GCCC	2683.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=51;PP=954;SC=GAGAGCAAGTGCCCCCCACCC;SOR=4.370;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=73;TCF=10;TCR=63;TR=55;WE=44101663;WS=44101639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	44102491	rs4148221	C	T	1045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.486;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=754;ReadPosRankSum=1.204;SC=TCAGCAATGCCCTCTACAACT;SOR=0.547;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=46;TCR=99;TR=44;WE=44102499;WS=44102481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,47:0.31:154
chr2	44104610	rs10609687	ACT	A	337.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=229;ReadPosRankSum=-0.842;SC=ATATGGGGAGACTCTGTGAAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=44104619;WS=44104607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr2	44104925	rs6544718	T	C	5346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=96;PP=2965;SC=ATCCTCAGTGTCATGGAGCTG;SOR=1.096;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=67;TCR=96;TR=163;WE=44104933;WS=44104915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr2	44187829	rs10190161	A	C	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=22;PP=592;SC=TATTTTGATAAGCCAAAGATC;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=29;WE=44187837;WS=44187819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	44202374	rs189675905	A	G	2309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.984;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=66;PP=1929;ReadPosRankSum=-0.625;SC=TTAATTCAAAAAACAGATTAT;SOR=0.223;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=124;TCF=21;TCR=103;TR=82;WE=44202382;WS=44202364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,83:0.66:126
chr2	44209477	rs6741066	C	T	4637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=70;PP=2965;ReadPosRankSum=0.643;SC=CCCAATCAAACTGATTGGAAA;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=142;TCF=71;TCR=71;TR=139;WE=44209485;WS=44209467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,150:0.99:152
chr2	44502788	rs3738985	A	C	5363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=86;NR=79;PP=2965;SC=CGGATCCAGGAAGCTCAACAG;SOR=0.753;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=86;TCR=79;TR=165;WE=44502796;WS=44502778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr2	44508835	rs11124986	G	A	1318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=40;PP=1111;SC=GTTTCCAGTTGTTATTTACTC;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=40;WE=44508843;WS=44508825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	44512797	rs74997007	T	C	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.153;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=777;ReadPosRankSum=0.638;SC=AATGTTTCTTTCTTCCAAATT;SOR=1.022;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=35;WE=44512805;WS=44512787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,38:0.66:58
chr2	44512971	rs3768919	G	A	1273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=23;PP=1062;SC=GTAAAAATACGTTGCAACCAT;SOR=1.151;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=39;WE=44512979;WS=44512961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	44531484	rs3738984	C	T	2009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=55;PP=1638;SC=GATGGTAAGTCCTCATGACAG;SOR=6.770;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=56;WE=44531492;WS=44531474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	44545234	rs11348872	GT	G	536.50	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=3.659;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.67;MQRankSum=1.629;QD=15.78;ReadPosRankSum=-1.205;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,30:0.88:34
chr2	44547574	rs698761	G	A	5449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=110;NR=52;PP=2965;SC=CCGCTAAAATGAGAATAAGGT;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=162;TCF=110;TCR=52;TR=162;WE=44547582;WS=44547564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr2	44547909	rs8886	T	C	592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=20;PP=443;SC=TGAATGTAACTGCTTTAAGAA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=44547917;WS=44547899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	44548613	rs2241871	T	C	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=31;PP=1070;SC=AAAAATTAAATAGAAGGCCTT;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=44548621;WS=44548603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	44556298	rs2033951	T	C	1701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=47;PP=1434;SC=TCTTTTATAATAACTGTTTTA;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=47;WE=44556306;WS=44556288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	44565447	rs2289463	A	T	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=0;PP=483;SC=AAACTGCATAAATATTTTGAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=44565455;WS=44565437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	44569474	rs2304769	G	A	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=642;SC=CAAAATAAACGTTTTAAGTCA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=44569482;WS=44569464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	44569700	rs61004197	AAAT	A	1437.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=25;PP=1392;SC=TTCTGAAAGAAAATAATGAGA;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=29;WE=44569710;WS=44569690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	44569739	.	T	TA	114	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=1.0000;HP=15;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=17;MQ=58.81;NF=1;NR=8;PP=114;QD=13.0;SC=TACACTCCATTAAAAAAAAAA;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=9;WE=44569747;WS=44569729;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:12,9:0.43:21
chr2	44570776	rs17580226	C	T	2094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=0;PP=1761;SC=CATAGGGATACATGAATCAGG;SOR=8.349;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=61;TCR=0;TR=61;WE=44570784;WS=44570766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	44570804	rs12053381	C	A	2944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=83;NR=2;PP=2478;SC=CTTCTCCCTCCCTCACATGCG;SOR=6.161;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=85;TCF=83;TCR=2;TR=85;WE=44570812;WS=44570794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr2	44573624	rs698763	G	A	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=427;SC=TAGACTTAACGTTGTACAAAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=44573632;WS=44573614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	44573658	rs698764	T	C	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=340;SC=AAATAGTAGGTATTTCACAGA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=44573679;WS=44573648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	44573671	rs698765	G	T	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=340;SC=TTCACAGATTGTAAATGTTCT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=44573679;WS=44573648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	44617324	rs1085486	T	A	1753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=14;PP=1417;SC=CTTTTTTGAATACTAAAAATG;SOR=2.262;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=56;WE=44617332;WS=44617314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	44622256	rs1067342	A	C	291.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=211;SC=TATGGTCTAAATTTTTAGTTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=44622264;WS=44622246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	44858687	rs10191477	T	C	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.862;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=871;ReadPosRankSum=-1.799;SC=AAGCAATCCTTCTGCCTCAGC;SOR=0.361;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=39;WE=44858695;WS=44858677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,41:0.72:57
chr2	44931520	rs343989	C	T	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.522;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=241;ReadPosRankSum=-0.098;SC=TAGCCCATCACGGATATTGAA;SOR=1.460;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=64;TCF=17;TCR=47;TR=17;WE=44931528;WS=44931510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,18:0.28:64
chr2	44942384	rs343957	C	G	2352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=20;PP=2079;SC=TTTTTGGTCACTTCACAATCA;SOR=2.049;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=74;TCF=54;TCR=20;TR=73;WE=44942392;WS=44942374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	44981119	rs3738980	T	G	2058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=2;PP=1635;ReadPosRankSum=1.288;SC=TAATTAGCCTTGTACTTATCT;SOR=0.950;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=101;TCF=98;TCR=3;TR=66;WE=44981127;WS=44981109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,69:0.66:105
chr2	44993542	rs343937	A	G	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.47;ReadPosRankSum=1.365;SOR=0.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,17:0.22:78
chr2	45170153	rs4953152	G	A	1545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=51;PP=1232;ReadPosRankSum=0.967;SC=CAGGGAAGCCGTGACTCCTGG;SOR=1.259;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=1;TCR=67;TR=52;WE=45170161;WS=45170143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,54:0.77:70
chr2	45170194	rs338079	A	G	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=619;ReadPosRankSum=-1.368;SC=CTTGTCCGGGACGCGCGGAAG;SOR=1.038;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=26;WE=45170202;WS=45170184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,27:0.75:36
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chr2	45774548	rs1865685	A	C	3359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=25;PP=2554;SC=TATATGGTTTATTGTCTCTCA;SOR=2.193;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=74;TCR=25;TR=98;WE=45774556;WS=45774538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr2	45806979	rs200689697	G	A	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=47.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQRankSum=-3.550;QD=4.84;ReadPosRankSum=-4.496;SOR=6.037;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,26:0.29:89
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chr2	45829286	rs12998864	A	C	1447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=46;PP=1157;SC=GGTAAAAAAGAGATGCAAGAT;SOR=3.830;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=53;WE=45829294;WS=45829276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	45879610	rs637909	A	G	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=22;PP=613;SC=CCTCCCCGTCATTCCGGGAAC;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=45879618;WS=45879600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
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chr2	46207618	rs7557421	G	A	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=360;ReadPosRankSum=-0.679;SC=CTCTGCCTGAGACCCTGTCAT;SOR=0.869;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=19;WE=46207626;WS=46207608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,20:0.36:56
chr2	46228391	rs374169133	CAT	C	457.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.236;NF=15;NR=0;PP=440;ReadPosRankSum=-0.347;SC=TGATGGAAGACATATATATAT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=15;WE=46228400;WS=46228381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,19:0.39:49
chr2	46237446	rs1987070	C	A	2327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.300;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=15;PP=1734;ReadPosRankSum=0.813;SC=TTATTCCATACATGCATAGAT;SOR=1.239;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=136;TCF=107;TCR=29;TR=81;WE=46237454;WS=46237436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,86:0.62:139
chr2	46237584	rs61730655	A	G	2275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=59;PP=1767;ReadPosRankSum=-0.422;SC=GCACAATGACAGAGAAGAGGA;SOR=0.711;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=123;TCF=33;TCR=90;TR=80;WE=46237592;WS=46237574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,84:0.65:130
chr2	46583235	rs6743991	C	A	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.77;ReadPosRankSum=-0.923;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr2	46583281	rs35508970	C	CT	139.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=164;ReadPosRankSum=2.744;SC=CACCCCCCCCCCTTTCCAGTT;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=4;WE=46583289;WS=46583271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr2	46584059	rs34136947	T	G	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.941;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=162;ReadPosRankSum=-0.424;SC=GCAGGAAAAATGGATGTCCTT;SOR=0.160;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=11;WE=46584067;WS=46584049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr2	46602722	rs7567582	T	C	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.347;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=0.967;SC=CGCCCTGTTCTGTCTGTTCCC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=46602730;WS=46602712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr2	46603671	rs7557402	C	G	1332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=957;ReadPosRankSum=0.533;SC=TCTTTCCCCCCCATTAGTGAG;SOR=0.719;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=94;TCF=61;TCR=33;TR=57;WE=46603679;WS=46603661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,59:0.61:97
chr2	46605659	rs7571218	A	G	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-3.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.472;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=303;ReadPosRankSum=-0.590;SC=GTTAATTAGCAGCCCCTCTAC;SOR=2.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=17;WE=46605667;WS=46605649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr2	46605954	rs7598371	G	C	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.605;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=49;PP=981;ReadPosRankSum=1.638;SC=GCTGTCTGGTGGACAGCAAAG;SOR=1.797;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=84;TCF=14;TCR=70;TR=56;WE=46605962;WS=46605944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,60:0.69:87
chr2	46608542	rs13006131	C	G	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=0;PP=813;ReadPosRankSum=0.124;SC=CCTTCAGCATCTTATAGCTGA;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=33;WE=46608550;WS=46608536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,32:0.74:43
chr2	46739157	rs3814045	A	G	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.288;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=390;ReadPosRankSum=-0.485;SC=CACTAGCTTCACTTCCCAGAG;SOR=0.432;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=87;TCF=72;TCR=15;TR=30;WE=46739165;WS=46739147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,30:0.34:89
chr2	46771134	rs6714484	G	C	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.958;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=401;ReadPosRankSum=-1.189;SC=AACAAACAGAGCCGGATAAGC;SOR=0.022;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=64;TCF=2;TCR=62;TR=21;WE=46771142;WS=46771124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,21:0.32:65
chr2	46799852	rs1451153	G	T	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=213;ReadPosRankSum=0.074;SC=AAAATATAATGGGTTTGTTAA;SOR=0.668;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=16;WE=46799860;WS=46799842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr2	46803354	rs41281473	C	T	2397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.220;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.905;NF=52;NR=42;PP=1905;ReadPosRankSum=0.729;SC=TTAAGGAATACGCACCAAATG;SOR=0.813;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=163;TCF=87;TCR=76;TR=94;WE=46803362;WS=46803344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,94:0.57:166
chr2	46818992	rs17818315	C	T	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.149;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=280;ReadPosRankSum=-1.090;SC=TGATACAAGACGAAAAATCTG;SOR=1.099;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=73;TCF=47;TCR=26;TR=20;WE=46819000;WS=46818982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,24:0.30:79
chr2	46819815	rs2305350	A	G	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.328;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=157;ReadPosRankSum=-0.310;SC=GTATACATATATTTCCTGCTA;SOR=0.197;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=58;TCF=11;TCR=47;TR=14;WE=46819823;WS=46819805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,18:0.28:64
chr2	46839477	rs1824050	T	C	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.239;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=122;ReadPosRankSum=0.186;SC=ATGTTTCCAATGCCAACCTAG;SOR=1.436;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=42;TCF=21;TCR=21;TR=10;WE=46839485;WS=46839467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,10:0.23:44
chr2	46842410	rs2242033	A	G	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.166;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=-0.690;SC=AATAGGTCATAAAGTCAATTT;SOR=0.042;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=6;WE=46842418;WS=46842400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr2	46845849	rs2122715	A	G	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=100;ReadPosRankSum=-1.120;SC=AACCTTAGGCACAATGTAATG;SOR=0.787;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=7;WE=46845857;WS=46845839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr2	46851180	rs11333819	AT	A	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=2.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.62;ReadPosRankSum=2.399;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr2	46851183	rs56198684	T	A	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=2.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.09;ReadPosRankSum=2.208;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr2	46986416	rs6738426	A	G	6117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=72;PP=2965;SC=TTTTTGATACATTTGATCCAT;SOR=1.438;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=135;TCR=72;TR=207;WE=46986424;WS=46986406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr2	46987300	rs3768720	T	G	2651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=55;PP=1982;SC=TCCCCAAAGGTTGTTAACTAG;SOR=1.583;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=27;TCR=55;TR=82;WE=46987308;WS=46987290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr2	47044277	rs2289930	C	T	937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=8;PP=788;SC=CCACTGCAGCCCTGAGCCCCA;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=47044285;WS=47044270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	47045267	rs2289931	G	A	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=3;PP=1472;SC=GCAGCAACCCGGGCCAGCCCA;SOR=4.977;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=48;WE=47045275;WS=47045257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	47045309	rs2289933	C	T	3599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=11;PP=2194;SC=TCTTGCCTCTCCTCCTCCAGG;SOR=3.316;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=64;TCR=11;TR=75;WE=47045329;WS=47045299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	47045321	rs17773492	A	G	4461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=25;PP=2944;SC=TCCTCCAGGGAACTCTTTGAA;SOR=2.347;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=103;TCF=78;TCR=25;TR=102;WE=47045329;WS=47045299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr2	47049409	rs2278715	C	T	1652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=52;PP=1457;SC=GCCAGTCCCCCACTTCGGTCT;SOR=4.654;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=4;TCR=52;TR=56;WE=47049417;WS=47049399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	47049453	rs1053952	A	G	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=411;SC=GTCCTCCTAGAGAAATCTAGA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=47049461;WS=47049443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	47081092	rs11687883	C	T	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=55;ReadPosRankSum=1.296;SC=AAGGATGATACGGTTTGGCTG;SOR=1.565;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=6;WE=47081100;WS=47081082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr2	47083030	rs3835756	ATG	A	314.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.537;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.668;NF=8;NR=0;PP=90;ReadPosRankSum=1.387;SC=ATCTATATATATGTATATATA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=8;WE=47083052;WS=47083018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,9:0.25:36
chr2	47083044	rs1079	A	T	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=1.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=-1.634;QD=7.10;ReadPosRankSum=0.814;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,12:0.26:46
chr2	47083252	rs11691225	G	T	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.390;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=305;ReadPosRankSum=-0.231;SC=TCCCTTTTCTGTTATTGGCAA;SOR=0.230;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=17;WE=47083260;WS=47083242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr2	47085398	rs2278711	C	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=35;ReadPosRankSum=-1.074;SC=TGCGTGAGTCCGTCTGAACGA;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=5;WE=47085406;WS=47085388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr2	47132945	rs7600882	G	T	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=389;ReadPosRankSum=3.181;SC=TAGATATATAGAGAGAGAATA;SOR=0.760;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=17;WE=47132953;WS=47132935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr2	47177617	rs61738825	C	T	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=25;PP=793;ReadPosRankSum=-1.404;SC=CGAAGATGAGCGAAGCCAAAA;SOR=0.627;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=115;TCF=54;TCR=61;TR=49;WE=47177625;WS=47177607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,50:0.43:117
chr2	47177787	rs2033533	G	T	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=157;ReadPosRankSum=0.662;SC=AGCTGCCCTTGCACTTACAGT;SOR=0.307;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=8;WE=47177795;WS=47177777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr2	47250819	rs12988535	A	G	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=377;SC=AGCAGCCACAAGTCTCGGTTC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=47250827;WS=47250809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	47251555	rs72872958	G	T	1503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FS=0.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.74;ReadPosRankSum=1.511;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:236,81:0.26:317
chr2	47251634	rs6713052	T	C	1504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=47;PP=1127;ReadPosRankSum=1.575;SC=GTCATGTAAGTCCTTTGAGCC;SOR=0.616;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=45;TCR=144;TR=62;WE=47251642;WS=47251624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,65:0.33:197
chr2	47314052	rs1474394	T	C	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=1;PP=695;SC=CAATCATGTTTTGTGGCCAGA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=47314060;WS=47314044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	47348155	rs6741295	GC	AA	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=666;ReadPosRankSum=0.769;SC=AGCTGACCTGGCAGTGTAGAG;SOR=0.582;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=14;WE=47348164;WS=47348145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr2	47357564	rs59073987	A	T	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.673;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=456;ReadPosRankSum=0.621;SC=GTGGAGCTTCAAAACATTTAA;SOR=2.133;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=19;WE=47357572;WS=47357554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr2	47380203	rs815809	T	C	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.077;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=360;ReadPosRankSum=-1.210;SC=GGTGATCCCTTGAAATTAAAT;SOR=1.519;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=22;WE=47380211;WS=47380193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr2	47382214	rs815806	C	G	2745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=11;PP=2293;SC=GGAACGAGAGCGGCACGAAGG;SOR=3.638;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=72;TCR=11;TR=83;WE=47382222;WS=47382204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr2	47672569	rs1981929	G	A	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=245;ReadPosRankSum=-0.535;SC=TTGGAGACCTGCTGTACTATT;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=11;WE=47672577;WS=47672559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr2	48010488	rs1042821	G	A	5475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=137;PP=2965;SC=GCTGCCCCCGGGGCCTCTCCT;SOR=3.008;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=30;TCR=137;TR=167;WE=48010496;WS=48010478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr2	48022900	rs3136316	A	G	407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=330;SC=GTGAGCCACCACACCTGGCAT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=48022908;WS=48022890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr2	48030458	rs2072447	G	C	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=1;PP=1032;SC=TGAAAGTTATGTCTTATAATG;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=37;WE=48030466;WS=48030448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	48032740	rs267608104	A	AT	515.52	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=253;ReadPosRankSum=0.982;SC=TTCATTTGTGATTTTTTTTTT;SOR=1.112;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=19;WE=48032748;WS=48032730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,25:0.86:29
chr2	48032874	rs2234731	ACTAT	A	1223.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=24;PP=1377;SC=TCATTTGAAGACTATCTATCT;SOR=3.258;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=26;WE=48032885;WS=48032864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	48032937	rs3136359	T	C	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=11;PP=309;SC=TGAAGTACATTTAAACAATAT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=48032945;WS=48032927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	48033551	rs3136367	C	G	6988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=125;NR=90;PP=2965;SC=GGGCACTTCTCTTGCTAGCAC;SOR=1.127;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=215;TCF=125;TCR=90;TR=215;WE=48033559;WS=48033541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr2	48033890	.	CTT	C,CT	2772.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.000;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=4.489;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.30;MQRankSum=0.394;QD=18.61;ReadPosRankSum=1.497;SOR=1.558;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:15,64,70:0.43,0.47:149
chr2	48040904	rs373765859	G	GA	3321.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=34;PP=2975;SC=TATTAACACAGAAAAAAGATG;SOR=1.524;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=102;TCF=64;TCR=38;TR=90;WE=48040912;WS=48040894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr2	48046012	rs374445177	TA	T	148.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.503;QD=1.32;ReadPosRankSum=0.634;SOR=0.626;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,26:0.23:113
chr2	48046013	rs200604756	A	T	213.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=4.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-1.805;QD=1.83;ReadPosRankSum=0.097;SOR=0.317;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,27:0.23:117
chr2	48066915	rs150563177	T	C	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=275;ReadPosRankSum=-1.165;SC=TCATCTGTTATAAACAAAAGC;SOR=0.460;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=15;WE=48066923;WS=48066905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr2	48589683	rs34242257	G	A	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.625;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=41;ReadPosRankSum=-0.699;SC=ACTCCAGCCTGGGCGGCCAGC;SOR=0.120;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=48589691;WS=48589673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr2	48689053	rs11125171	A	G	359.53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=32.68;ReadPosRankSum=1.729;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr2	48722755	rs4443044	T	C	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=183;ReadPosRankSum=-0.186;SC=TTTGTGTATGTTGGATGCAGG;SOR=0.317;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=11;WE=48722763;WS=48722745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr2	48725610	rs3811519	C	T	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=27;ReadPosRankSum=-1.147;SC=CTCTAAGATACAACACTCTGT;SOR=0.078;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=5;WE=48725618;WS=48725600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr2	48734576	rs6716341	G	A	3431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=88;PP=2722;SC=CCCTGCAGGAGTTAGGACACT;SOR=3.077;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=17;TCR=89;TR=105;WE=48734584;WS=48734566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr2	48738388	rs62135170	C	T	1451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=0;PP=2493;ReadPosRankSum=1.646;SC=TATAATTTCCCTACTCCACAT;SOR=1.999;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=62;TCR=0;TR=45;WE=48738403;WS=48738378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,47:0.72:65
chr2	48738395	rs188302472	A	C	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=807;ReadPosRankSum=-1.135;SC=TCCCTACTCCACATTTTTCTT;SOR=0.267;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=76;TCF=74;TCR=2;TR=20;WE=48738403;WS=48738378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,21:0.27:79
chr2	48738687	rs4528813	G	C	1904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=1;NR=53;PP=1630;SC=ATTTCAGGAGGAAGAGGACAT;SOR=5.820;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=54;TCF=1;TCR=53;TR=54;WE=48738695;WS=48738677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	48756555	.	A	C	121	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=7;NR=0;PP=121;QD=22.2530303639;SC=GGACTACGAGACACCCTGCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=48756563;WS=48756554;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr2	48757288	rs116061481	C	T	96.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.14;ReadPosRankSum=1.834;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr2	48808594	rs3749142	C	T	2201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.803;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=48;PP=1629;ReadPosRankSum=-0.500;SC=AGCCAAAATCCGGATGGTCTT;SOR=0.529;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=271;TCF=122;TCR=149;TR=92;WE=48808602;WS=48808584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,95:0.34:279
chr2	48809593	rs3792234	G	T	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-6.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.488;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=579;ReadPosRankSum=-1.454;SC=GGAGTTTACAGGAACTTGAAT;SOR=0.407;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=131;TCF=79;TCR=52;TR=43;WE=48809601;WS=48809583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,43:0.32:135
chr2	48822381	rs2140551	G	A	4328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=26;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.031;SC=AAATAGAAAAGAAGTGGATTA;SOR=1.525;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=129;TCF=103;TCR=26;TR=128;WE=48822389;WS=48822371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,137:0.99:138
chr2	48844968	rs2293269	C	G	3256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=32;PP=2565;SC=TCCGAGGGCACTGCGTGCCGC;SOR=1.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=70;TCR=32;TR=102;WE=48844976;WS=48844958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr2	48847918	rs10634616	G	GAATA,GAATAAATA	857.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=7,7;NR=1,1;PP=120,250;SC=TCCATCTCAAGAATAAATAAA;SOR=3.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=8,8;WE=48847926;WS=48847908;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.29,0.71:14
chr2	48848515	rs17037472	G	C	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=113;ReadPosRankSum=-1.122;SC=ACAGGGTAATGTTCTTAGGGT;SOR=0.175;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=6;WE=48848523;WS=48848505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr2	48873978	rs10432667	A	G	4289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.154;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=71;PP=2962;ReadPosRankSum=1.227;SC=AACAAATTCTAATGTGGAGTC;SOR=0.830;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=197;TCF=96;TCR=101;TR=135;WE=48873986;WS=48873968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,148:0.69:214
chr2	48898798	rs3920390	T	A	2087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=34;PP=1612;SC=CGGATAATGTTATTGTCTGTC;SOR=1.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=27;TCR=34;TR=61;WE=48898806;WS=48898788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	48906625	rs1965508	T	C	1486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=29;PP=1187;SC=ATCAGTTGGATTATATTGCAT;SOR=1.378;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=45;WE=48906633;WS=48906615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	48915871	rs11125179	A	G	6718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=148;PP=2965;SC=AGCCCATAATATCTTCACAGG;SOR=2.314;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=200;TCF=52;TCR=148;TR=199;WE=48915879;WS=48915861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr2	48921375	rs2293275	T	C	1656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=21;PP=1302;SC=TGTTTTGTTATTCACTTTCCT;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=26;TCR=21;TR=47;WE=48921383;WS=48921365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	48925746	rs6755901	C	T	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=5;PP=863;SC=CTTTTGGTTTCTACTTACTCT;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=48925754;WS=48925736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	48925986	rs70946824	AT	A	553.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.86;ReadPosRankSum=-0.725;SOR=3.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,29:0.94:31
chr2	48952701	rs6545063	C	G	1004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=0;PP=825;SC=GAGGAACATGCAAATAGTGCC;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=48952709;WS=48952691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	48956431	rs11892719	T	A	3030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=58;PP=2276;SC=TCTGCATGATTATGAGCTATG;SOR=1.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=36;TCR=58;TR=93;WE=48956439;WS=48956421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr2	48956475	rs11887058	C	T	2028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=47;PP=1628;SC=ACCACTGTGTCCCCCTGAAAA;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=14;TCR=47;TR=61;WE=48956483;WS=48956465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	48956512	rs11897846	A	G	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=32;PP=1002;SC=GTTGTCCCCAAATCATACAGT;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=34;WE=48956520;WS=48956502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	48960032	rs10495960	G	A	3688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.860;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=31;PP=2828;ReadPosRankSum=0.471;SC=ATTCCCGAAGGCATTCCCAAG;SOR=1.191;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=201;TCF=146;TCR=55;TR=129;WE=48960040;WS=48960022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,135:0.64:212
chr2	48982485	rs4073367	T	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=60;ReadPosRankSum=1.409;SC=AACCACCAAGTTTTGGGTTCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=48982493;WS=48982475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr2	48982622	rs4073366	C	G	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=307;ReadPosRankSum=0.707;SC=GCATCAAGGGCGCCGCGACGG;SOR=1.473;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=13;WE=48982630;WS=48982612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr2	49189921	rs6166	C	T	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=638;ReadPosRankSum=-1.403;SC=AGTGGAACCACTGGTGACTCT;SOR=0.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=57;TCR=36;TR=33;WE=49189929;WS=49189911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,33:0.34:97
chr2	49191041	rs6165	C	T	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.247;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=249;ReadPosRankSum=0.151;SC=TGACCCCTAGCCTGAGTCATA;SOR=1.773;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=14;WE=49191049;WS=49191031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr2	49215977	rs2072488	G	A	1123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=0;PP=961;SC=AGATGAGAGAGGAACGCAGAA;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=49215985;WS=49215967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	49216284	rs2072487	C	T	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=21;PP=594;SC=ATGCGGTCTTCAGCTGAGGTA;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=49216292;WS=49216274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	49217916	rs2072486	T	G	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=122;ReadPosRankSum=-0.396;SC=ATACGTGAATTAGGCTCATGT;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=8;WE=49217924;WS=49217906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr2	49241849	rs6708637	G	A	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=254;SC=TTTCCAATCCGCATTTTCAGA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=49241857;WS=49241839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	49244559	rs2091787	A	G	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.202;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=243;ReadPosRankSum=1.168;SC=AGTATCAAGTAGGCCTTTTAG;SOR=0.043;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=15;WE=49244567;WS=49244549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
chr2	49510173	rs7578654	A	C	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.016;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=30;PP=950;ReadPosRankSum=-0.613;SC=CTGCTATATAACTTGATCTCT;SOR=0.457;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=147;TCF=61;TCR=86;TR=54;WE=49510181;WS=49510163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,58:0.37:155
chr2	50201110	rs9636391	A	G	1675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=16;PP=1280;SC=AGCTACCTGCAAGTTTTCACA;SOR=1.569;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=54;WE=50201118;WS=50201100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	50246224	rs7571903	C	G	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=415;ReadPosRankSum=-0.228;SC=CCCTGTTTTGCAAATCCTTCC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=5;WE=50246257;WS=50246216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr2	50246232	rs146211469	TCCAAAACATTA	T	237.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=1352;ReadPosRankSum=-0.339;SC=TGCAAATCCTTCCAAAACATT;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=4;WE=50246257;WS=50246216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr2	50246249	rs7586095	T	G	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=586;ReadPosRankSum=-0.123;SC=CATTACCTCATCTGTGCTTTC;SOR=0.247;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=7;WE=50246257;WS=50246216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr2	50280283	rs1363050	T	C	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=-0.484;SC=TTAAGCTAGTTTCAAAGGAAG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=5;WE=50280291;WS=50280273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr2	50280338	rs1363049	G	A	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.634;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=138;ReadPosRankSum=0.788;SC=TAGAAAAGACGCATATGCAGA;SOR=2.437;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=10;WE=50280346;WS=50280328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,11:0.26:42
chr2	50434741	rs17040210	C	T	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=257;ReadPosRankSum=1.149;SC=TACTATGTGACGGAACTTGAC;SOR=0.724;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=12;WE=50434749;WS=50434731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr2	50434759	rs1715984	C	G	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=5;PP=646;SC=GACTTTGAATCAAATATTATA;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=50434767;WS=50434749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	50692459	rs12713101	T	A	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=331;SC=ACTGCTTCTATGGGTTATGAC;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=50692467;WS=50692449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	50692819	rs10168838	T	G	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=424;SC=AACTAGTTTTTAAAGTTCTAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=50692827;WS=50692809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	50693504	rs75315267	AAC	A	1870.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=15;PP=1438;SC=GAACCCAAATAACAGTTACTG;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=17;TCR=16;TR=31;WE=50693513;WS=50693494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	50699305	rs2075234	T	A	649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=0;PP=548;SC=AATTAAAAACTTGAATAAGGA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=50699313;WS=50699303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	50733860	rs7584062	A	G	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.27;SOR=4.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	50758657	rs2066948	T	C	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=686;SC=TTATCATTTATTTAAGACTTC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=50758665;WS=50758647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	50858107	rs961405	T	A	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.671;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=84;ReadPosRankSum=-1.334;SC=AGAAAAGGAATGTCTGCTTAT;SOR=2.110;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=6;WE=50858115;WS=50858097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr2	50966283	rs1546667	C	T	737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=5;PP=633;SC=TTGTATGTCACAAATCTGTAG;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=25;WE=50966291;WS=50966273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	52929596	rs6711444	C	G	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=44;ReadPosRankSum=0.967;SC=CTGTCTTAGTCCATTTTGTGC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=52929604;WS=52929586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr2	52929680	rs6726779	T	C	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=158;ReadPosRankSum=0.752;SC=CTCTGACAACTAGAAAGTTCA;SOR=0.520;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=13;WE=52929688;WS=52929670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr2	52929780	rs6726935	T	G	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.444;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=295;ReadPosRankSum=-0.042;SC=CTTCCACTCATGGCAGAAGGC;SOR=1.194;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=61;TCF=27;TCR=34;TR=16;WE=52929788;WS=52929770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,17:0.27:64
chr2	52929844	rs6545299	G	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.39;ReadPosRankSum=-0.805;SOR=1.226;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,8:0.20:40
chr2	54028568	.	C	T	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=500;ReadPosRankSum=-0.572;SC=CAGATGACACCATACTATCCT;SOR=0.724;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=51;TCR=15;TR=26;WE=54028576;WS=54028558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,26:0.39:67
chr2	54041983	rs2542571	G	T	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=2.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.48;ReadPosRankSum=-1.676;SOR=1.267;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,13:0.22:60
chr2	54122956	rs698856	A	G	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.67;ReadPosRankSum=0.712;SOR=0.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,6:0.16:37
chr2	54343012	rs7573491	C	A	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=3.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=382;ReadPosRankSum=-0.935;SC=ACTTCCGCTCCGCCATGACAC;SOR=0.880;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=16;WE=54343020;WS=54343002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr2	54369120	.	T	TTGTGTGTG	904.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=10;PP=711;SC=GCTGGCTAATTTGTGTGTGTG;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=10;WE=54369128;WS=54369110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	54369154	rs10611682	TTTGTTG	T	538.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=595;SC=GTGTGTATATTTTGTTGTTGT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=16;WE=54369167;WS=54369144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	54482703	rs76397255	GGGGCCC	G	7609.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.877;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=4.337;NF=49;NR=118;PP=2977;ReadPosRankSum=-0.380;SC=CCCACGTTCAGGGGCCCGGGC;SOR=0.421;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=341;TCF=96;TCR=245;TR=167;WE=54482716;WS=54482693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,199:0.64:310
chr2	54482964	rs843704	C	T	2024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.897;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=48;PP=1556;ReadPosRankSum=-1.396;SC=TTGAGGCTGCCGTCAGTTGTC;SOR=0.883;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=254;TCF=117;TCR=137;TR=84;WE=54482972;WS=54482954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,86:0.32:265
chr2	54482989	rs6740641	C	T	5304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=82;PP=2962;ReadPosRankSum=0.126;SC=AGGCAGAGGCCGCTTCTAGGC;SOR=0.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=251;TCF=134;TCR=117;TR=175;WE=54482997;WS=54482979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,186:0.70:265
chr2	54494370	rs865816	A	G	1808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=1;PP=1459;SC=GGCACAAAGAAGCTCCCAATA;SOR=6.518;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=49;WE=54494378;WS=54494360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	54494448	rs1817557	G	A	2043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.681;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=32;PP=1476;ReadPosRankSum=-0.779;SC=CATCAGCTCCGGAAGCTGGGT;SOR=0.486;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=104;TCF=57;TCR=47;TR=69;WE=54494456;WS=54494438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,76:0.69:110
chr2	54587596	rs2280718	C	T	3057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=62;PP=2521;ReadPosRankSum=-0.194;SC=CCCAGCACTCCTGAGAGCAGA;SOR=0.764;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=58;TCR=87;TR=103;WE=54587604;WS=54587586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,104:0.71:147
chr2	54587659	rs13184	G	C	1931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.214;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=63;PP=1455;ReadPosRankSum=-0.474;SC=CTTTTCACTAGGCACAAGCCT;SOR=1.162;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=114;TCF=27;TCR=87;TR=80;WE=54587667;WS=54587649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,81:0.70:115
chr2	54839276	rs3796014	A	G	4040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=53;PP=2965;SC=ATGTGTCTCTACCTCTGCTCT;SOR=0.920;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=65;TCR=53;TR=116;WE=54839284;WS=54839266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr2	54844911	rs72618664	G	A	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=43;PP=1214;SC=TTCCATATCCGTTGGCTTAAC;SOR=5.507;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=45;WE=54844919;WS=54844901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
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chr2	55071101	.	T	TTGTGTG	284.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQRankSum=-1.032;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.339;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
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chr2	55091029	rs2358155	C	T	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=759;ReadPosRankSum=1.229;SC=ATCGCCAGGTCGGTAAGCAGG;SOR=0.747;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=123;TCF=77;TCR=46;TR=44;WE=55091037;WS=55091019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,45:0.35:129
chr2	55093784	rs17417731	T	A	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.99;ReadPosRankSum=-0.844;SOR=0.068;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,8:0.20:41
chr2	55121930	rs998230	C	G	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.130;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=351;ReadPosRankSum=0.729;SC=AGTTTTCCATCTCATATATTT;SOR=0.088;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=16;WE=55121938;WS=55121920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr2	55122589	rs6545454	A	G	2806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.399;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=67;PP=2141;ReadPosRankSum=0.372;SC=CTGGGACTAGAGTGAGGCAAA;SOR=0.842;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=152;TCF=42;TCR=110;TR=90;WE=55122597;WS=55122579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,100:0.61:164
chr2	55138272	rs2304688	G	A	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=219;ReadPosRankSum=0.808;SC=ACTAATATGGGTTATATTTAC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=11;WE=55138280;WS=55138262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr2	55155672	rs10164886	A	G	3957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-7.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.978;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=65;PP=2962;ReadPosRankSum=0.183;SC=CACCTGCCACATGCCTCCTGC;SOR=1.047;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=240;TCF=142;TCR=98;TR=165;WE=55155680;WS=55155662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,164:0.69:237
chr2	55155957	rs17418194	C	T	1557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.817;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=47;PP=1210;ReadPosRankSum=-1.116;SC=AGCCAGAGTGCGTTTTCTTTG;SOR=0.137;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=84;TCF=9;TCR=75;TR=55;WE=55155965;WS=55155947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,57:0.66:86
chr2	55176112	rs13394146	C	T	4681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=69;PP=2965;SC=GTTAAACAATCACTTGTAGTC;SOR=0.763;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=71;TCR=69;TR=140;WE=55176120;WS=55176102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr2	55177822	rs77213467	T	C	1838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.200;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=20;PP=1281;ReadPosRankSum=-0.294;SC=GCTACAGAGGTTTCGACTGTC;SOR=0.383;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=58;TCR=29;TR=58;WE=55177830;WS=55177812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,66:0.71:93
chr2	55180965	rs4671998	G	A	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=568;SC=TGGAGGTTGCGGTGAGCTGAG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=55180973;WS=55180955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	55186229	rs12623902	T	C	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=13;PP=942;SC=GAAGATGTTGTTTTGTTTACA;SOR=1.559;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=39;WE=55186237;WS=55186219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	55186394	rs17346629	A	C	1083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=26;PP=854;SC=CGGAAAAGAGAGGCCGTAAGC;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=38;WE=55186402;WS=55186384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	55187297	rs58866010	A	AG	2543.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=55;NR=14;PP=2819;SC=AGAGGGCCGGAGGGGTAGTGG;SOR=3.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=62;TCR=16;TR=69;WE=55187305;WS=55187287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	55201038	rs2255026	C	T	1993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=49;PP=1609;SC=TCAAAAAGAACGGAATGATTT;SOR=2.694;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=13;TCR=49;TR=62;WE=55201046;WS=55201028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	55214618	rs2580769	A	C	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=1;PP=831;ReadPosRankSum=0.878;SC=TGTTTTCCAGACATCTCACCT;SOR=3.442;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=30;WE=55214626;WS=55214608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr2	55214912	rs2580770	C	G	994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=792;SC=AAAACAAAAACGCTACTACAT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=55214920;WS=55214902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	55258704	rs10173203	C	G	3133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=31;PP=2541;SC=TGGATTATATCGAAGGTCAGA;SOR=1.585;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=65;TCR=31;TR=95;WE=55258712;WS=55258694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr2	55402841	.	T	C	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=2.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.85;ReadPosRankSum=-0.391;SOR=1.279;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,21:0.33:63
chr2	55402841	.	TAA	CAG	992	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=20;NR=0;PP=992;QD=52.2733937431;SC=GATTTATTTATAAGTTAGTTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=58;TCR=2;TR=20;WE=55402851;WS=55402831;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:40,20:0.33:60
chr2	55402843	.	A	G	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.321;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.15;ReadPosRankSum=-0.129;SOR=1.241;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,22:0.33:67
chr2	55404794	rs14026	G	A	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=476;ReadPosRankSum=0.020;SC=TTTCATGTCTGCAGAGAACAG;SOR=1.085;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=24;WE=55404802;WS=55404784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr2	55404925	rs6545477	C	T	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=156;ReadPosRankSum=0.650;SC=CATCTGAAGGCAAAAATGAAA;SOR=0.994;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=12;WE=55404933;WS=55404915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr2	55407754	rs6716066	C	T	5159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=95;PP=2965;SC=TCACTGTAGACAATCTGAGCT;SOR=1.256;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=62;TCR=95;TR=157;WE=55407762;WS=55407744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr2	55407935	rs10183953	G	A	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=21;PP=653;SC=AGCACAGTAGGACTGGATTTT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=55407943;WS=55407925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	55436934	rs9677948	G	A	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=3.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.90;ReadPosRankSum=0.717;SOR=1.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,30:0.20:147
chr2	55439963	rs2118283	C	A	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=24;PP=724;SC=GAAAGGCTTTCTTATGTCTTT;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=55439971;WS=55439953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	55470115	rs11357	C	T	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=510;SC=TTTGCACTTACATCACCCACT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=55470123;WS=55470105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	55471407	rs2589083	T	C	1435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=46;PP=1146;SC=AATGTCATAATGTACTTTAAG;SOR=5.590;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=48;WE=55471415;WS=55471397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	55473371	rs2576724	A	G	2182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-6.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.270;HP=1;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=2;PP=1614;ReadPosRankSum=0.807;SC=AATATTGTTCATGAACTAACA;SOR=1.903;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=111;TCF=107;TCR=4;TR=82;WE=55473379;WS=55473361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,88:0.76:116
chr2	55473386	rs3833559	CAT	C	6668.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.36;NF=119;NR=11;PP=2973;SC=CTAACAATAACATGTAACAAA;SOR=4.601;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=139;TCF=128;TCR=11;TR=130;WE=55473395;WS=55473376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr2	55473681	rs2589081	A	C	2092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=60;PP=1772;SC=GTCACATAATACTTGCAAGTT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=0;TCR=60;TR=60;WE=55473689;WS=55473671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	55489629	rs2589093	T	C	2171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=64;PP=1907;ReadPosRankSum=0.805;SC=TTTAGATTTATTCTCAAATAT;SOR=5.549;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=67;TCF=1;TCR=66;TR=65;WE=55489637;WS=55489619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr2	55490819	rs1056445	G	T	4367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.021;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=35;PP=2965;ReadPosRankSum=0.478;SC=AGCAGCCCCAGTGAGCACATC;SOR=2.243;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=102;TCR=36;TR=136;WE=55490827;WS=55490809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,139:0.99:140
chr2	55518742	rs2249856	T	C	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=3;PP=551;SC=TGTGCACTTGTTTCACACTTA;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=22;WE=55518750;WS=55518732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	55522422	rs2589110	A	G	3905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=50;PP=2965;SC=TTATTCTGATAACTGGCCTAG;SOR=0.973;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=65;TCR=50;TR=115;WE=55522430;WS=55522412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr2	55527108	rs1545121	G	A	3872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=73;PP=2911;SC=TGATGATGCTGATGAGCTTTT;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=38;TCR=73;TR=111;WE=55527116;WS=55527098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr2	55528257	rs2576699	A	C	1053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=4;PP=663;SC=GCTGGCAATGACGCATTCACC;SOR=2.115;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=55528265;WS=55528247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	55528514	rs2589117	A	G	209.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=103;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=170;SC=TCAATCATGTATAATACAGAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=55528522;WS=55528504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	55559651	rs368125112	CA	C	70.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=2.111;QD=1.77;ReadPosRankSum=-0.032;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,12:0.30:40
chr2	55566531	rs12621734	A	C	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=207;ReadPosRankSum=-0.047;SC=AGTGGAAAATAAATGGGCTAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=4;WE=55566549;WS=55566521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr2	55566538	rs71821845	CTATT	C	235.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.13;ReadPosRankSum=-1.657;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr2	55576634	rs2589090	C	T	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=0.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.76;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,62:0.29:211
chr2	55582601	rs5831355	T	TTTGACACA	249.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.824;SOR=0.081;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,8:0.21:38
chr2	55582684	rs1437394	A	T	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.688;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=496;ReadPosRankSum=0.637;SC=GACCATATAAATTCAATGAAC;SOR=1.315;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=103;TCF=70;TCR=33;TR=32;WE=55582692;WS=55582674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,33:0.31:108
chr2	55589364	rs13019339	G	A	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=128;ReadPosRankSum=-0.559;SC=AAATAGTATCGTTTCTGAAAA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=7;WE=55589372;WS=55589354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr2	55589434	rs3111412	T	A	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.690;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=355;ReadPosRankSum=-0.854;SC=ACTGAAAGAATTTTACAAACC;SOR=0.333;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=64;TCF=51;TCR=13;TR=21;WE=55589442;WS=55589424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,21:0.30:70
chr2	55591017	rs114386931	T	C	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.104;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=175;ReadPosRankSum=-1.609;SC=TGAAGTATTTTAGGAGATAGA;SOR=0.086;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=14;WE=55591025;WS=55591007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr2	55599655	rs3111411	G	A	1331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.234;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=33;PP=1008;ReadPosRankSum=-1.577;SC=TTCTAAAATAGAAACAATTAT;SOR=1.879;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=47;WE=55599663;WS=55599645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,49:0.77:64
chr2	55749193	rs17369150	A	G	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.656;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=684;ReadPosRankSum=-0.906;SC=GCATTAATAAAATGATTTGGT;SOR=0.653;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=51;TCF=24;TCR=27;TR=29;WE=55749201;WS=55749183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr2	55760940	rs4671248	G	T	3340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=89;NR=8;PP=2852;SC=CTTAAGGAACGAGAACAGTGA;SOR=4.429;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=89;TCR=8;TR=97;WE=55760948;WS=55760930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr2	55762957	rs3762513	C	T	1746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=49;PP=1532;SC=ATTAAGTTTACACCTAGATCT;SOR=4.294;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=5;TCR=49;TR=54;WE=55762965;WS=55762947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	55764754	rs11280083	AATATGAATAC	A	2675.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.250;NF=3;NR=37;PP=2968;ReadPosRankSum=-0.640;SC=TTTCTCTAATAATATGAATAC;SOR=2.179;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=40;WE=55764771;WS=55764744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr2	55771050	rs3816489	C	G	2581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=1;PP=2113;SC=ATTCTAATTGCTCTTATTGTC;SOR=7.249;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=71;TCF=70;TCR=1;TR=71;WE=55771058;WS=55771040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	55771161	rs1045910	A	G	7264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=134;NR=81;PP=2965;SC=CCACAAAAAGACCTGAAGATT;SOR=1.219;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=216;TCF=135;TCR=81;TR=215;WE=55771169;WS=55771151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr2	55805440	rs2903704	T	C	1509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=30;PP=1224;SC=GGGGTACATATGAAACTCCAA;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=24;TCR=30;TR=54;WE=55805448;WS=55805430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	55808969	rs1975486	C	T	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=15;PP=436;SC=TTATTTAAACCTCTATTCCTA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=55808977;WS=55808959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	55812073	rs7594279	T	G	2468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=1;PP=2023;SC=GTCAGAAATCTATTATTTTGC;SOR=7.546;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=86;TCF=85;TCR=1;TR=86;WE=55812081;WS=55812063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr2	55844445	rs782594	T	C	2318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=64;PP=1906;SC=TCCACCGCTCTAGCCGCCGCC;SOR=6.214;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=66;TCF=2;TCR=64;TR=66;WE=55844453;WS=55844435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	55863360	rs35916020	T	TA	670.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.416;NF=24;NR=1;PP=452;ReadPosRankSum=1.301;SC=GAATTCTCTTTAAAAAAAAAA;SOR=3.841;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=25;WE=55863368;WS=55863350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr2	55873301	rs2627776	T	A	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=1;PP=430;SC=TTCCACTTTTTAAAGCAATAT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=55873309;WS=55873291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	55874657	.	AT	A	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.743;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=0.605;QD=0.96;ReadPosRankSum=1.007;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr2	55883317	rs2627765	G	T	1597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=13;PP=1279;SC=GGAAAATCTCGGGGAATAACA;SOR=2.124;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=48;WE=55883325;WS=55883307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	55889062	rs782604	G	A	1869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=10;PP=1459;SC=ATCATAAAACGTAACAAACAT;SOR=3.076;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=45;TCR=10;TR=55;WE=55889070;WS=55889052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	55894247	rs782637	T	C	2334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=37;PP=1695;SC=ATATAGGAAATAAGTACATTA;SOR=0.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=33;TCR=37;TR=70;WE=55894255;WS=55894237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr2	55898290	rs782632	C	G	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=236;SC=CATTCTAGGTCTAGGGAACAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=55898298;WS=55898280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	55898929	rs2627771	AC	GT	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=0;PP=669;SC=GCCACTGCACACCAGCCTGGG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=14;WE=55898938;WS=55898919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	55899228	rs782631	A	T	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=28;PP=855;SC=TCTGGAAACAAGAGGCAGTTT;SOR=2.899;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=55899236;WS=55899218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	55900283	rs782629	A	G	214.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=175;SC=ATTTTCAAATACCATGACATG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=55900291;WS=55900273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	55912120	rs782572	T	C	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=22;PP=786;SC=GAAGTACCAATCTCTCTTCTC;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=55912128;WS=55912110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	55914573	rs11386711	C	CA	146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=106;SC=GAGTCCACCTCAAAAAAAAAA;SOR=3.611;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=6;WE=55914581;WS=55914566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	55914621	rs809732	T	C	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=1;PP=381;SC=TGGACTCTGGTTGTCTGGAAT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=55914629;WS=55914611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	56216052	rs10865292	G	A	4247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=59;PP=2965;SC=GAAATTTGGTGTTTAATTTTG;SOR=0.996;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=74;TCR=59;TR=133;WE=56216060;WS=56216042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr2	56411817	rs35587531	C	T	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=2;PP=360;SC=AAGTTGTTCCCCAGCCCCGGC;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=56411825;WS=56411807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	56603118	rs72803075	C	G	1575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.018;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=41;PP=1180;ReadPosRankSum=0.184;SC=GTTGTGTCGTCGCTTGTTCGC;SOR=0.531;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=85;TCF=21;TCR=64;TR=56;WE=56603126;WS=56603108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,58:0.67:86
chr2	58381785	rs848294	T	C	866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=7;PP=739;SC=TGGGGTCTCTTTGACCCATTT;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=27;WE=58381793;WS=58381775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	58388696	rs848291	A	G	2114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=30;PP=1596;SC=GTCCACACTGAGAATTATCAC;SOR=0.917;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=34;TCR=30;TR=64;WE=58388704;WS=58388686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	58392789	rs848288	T	C	3771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=97;NR=12;PP=2965;SC=CCAACTGTCATTGTTAGATTT;SOR=3.874;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=98;TCR=12;TR=109;WE=58392807;WS=58392779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr2	58392797	rs148383677	TTTA	T	5537.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=81;NR=15;PP=2970;SC=CATTGTTAGATTTATTTTCAT;SOR=3.524;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=102;TCF=85;TCR=17;TR=96;WE=58392807;WS=58392779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr2	58453843	.	G	GA	1055.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.438;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=9.982;HP=13;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.452;NF=16;NR=20;PP=629;ReadPosRankSum=0.676;SC=AACAGTGTCAGAAAAAAAAAA;SOR=0.506;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=47;TCF=23;TCR=24;TR=36;WE=58453851;WS=58453833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,41:0.93:44
chr2	60679942	rs17331129	T	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.809;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=140;ReadPosRankSum=-0.014;SC=ATCTTAAGCATGATTTCAAAC;SOR=1.022;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=12;WE=60679950;WS=60679932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr2	60687959	rs7569946	A	G	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.392;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=786;ReadPosRankSum=-0.606;SC=AGAAGCGCAAACTCCCGTTCT;SOR=0.565;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=151;TCF=88;TCR=63;TR=47;WE=60687967;WS=60687949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,49:0.33:150
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chr2	60997770	rs10187671	T	A	382.41	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=385;ReadPosRankSum=-0.905;SC=TTTTTTTTTTTAATGAAGAGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=15;WE=60997778;WS=60997760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr2	61007782	rs10496089	A	G	4985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=125;NR=11;PP=2965;SC=ATAATTATAAAGTTTCATGTA;SOR=4.819;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=126;TCR=11;TR=136;WE=61007790;WS=61007772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr2	61008036	rs3845814	C	T	1660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=48;PP=1368;SC=ACTATAGTCCCCTTCCTCCTT;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=48;WE=61008044;WS=61008026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	61009813	rs67779326	T	TA	663.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=64.13;MQRankSum=2.183;QD=31.61;ReadPosRankSum=0.911;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr2	61009909	rs10197672	C	T	2460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=50;PP=1782;SC=AGTATAGGTACGTGAAATTTT;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=30;TCR=50;TR=80;WE=61009917;WS=61009899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr2	61014952	rs4672404	A	G	1259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=37;PP=1067;SC=TTTGGGAGGCAGAGGCGGGCA;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=39;WE=61014960;WS=61014942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	61018788	rs11695223	C	T	160.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=2;PP=115;SC=GGTGGGTGGCCGGTGGTGATA;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=61018796;WS=61018783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	61021349	rs11125855	A	G	1970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=57;PP=1713;ReadPosRankSum=-0.042;SC=CTTTAGTGGTAATTCAGTAGT;SOR=4.582;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=60;TCF=1;TCR=59;TR=58;WE=61021357;WS=61021339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,59:0.97:61
chr2	61108926	rs147771199	C	G	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=159;ReadPosRankSum=0.120;SC=GCGGCCGCCTCCGGCCAGGAC;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=9;WE=61108934;WS=61108916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr2	61118739	rs10185028	A	G	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=365;ReadPosRankSum=0.810;SC=CTGCTGTTATAAAAAAAACAG;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=15;WE=61118747;WS=61118729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr2	61121492	rs842644	G	A	1163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=0;PP=906;SC=TTATAATGCAGTCTATTTGGA;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=61121500;WS=61121482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	61128268	rs6707682	G	A	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=165;ReadPosRankSum=0.306;SC=GTTGATTTCTGTTTCTTTTTT;SOR=0.892;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=10;WE=61128276;WS=61128258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr2	61128284	rs2115592	T	C	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=28.88;ReadPosRankSum=-0.984;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr2	61145498	rs149570046	AT	A	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=1.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.493;QD=0.38;ReadPosRankSum=0.585;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,14:0.17:80
chr2	61175312	rs12479056	T	C	3009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.943;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=54;PP=2424;ReadPosRankSum=-0.461;SC=TCTGGTCGATTTTTAAGTCCT;SOR=0.618;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=163;TCF=83;TCR=80;TR=103;WE=61175320;WS=61175302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,107:0.64:168
chr2	61187478	.	CAA	C	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.05;ReadPosRankSum=1.337;SOR=0.138;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr2	61297743	rs76214607	G	A	1332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=45;PP=1077;ReadPosRankSum=1.132;SC=ATATTCAAATGCATGTATTAA;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=75;TCF=0;TCR=75;TR=45;WE=61297751;WS=61297733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,47:0.59:79
chr2	61298684	rs200693095	CA	C	113.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQRankSum=1.005;QD=3.79;ReadPosRankSum=1.066;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr2	61304002	rs1729657	A	G	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=466;ReadPosRankSum=0.026;SC=AGTATTCTTGACTCCTTTTCT;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=19;WE=61304010;WS=61303992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr2	61304377	rs10172306	A	T	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=389;ReadPosRankSum=0.308;SC=AAATGTGGAAAATTGTTTGGA;SOR=0.643;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=18;WE=61304385;WS=61304367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr2	61308517	rs1177295	A	G	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=209;ReadPosRankSum=-0.197;SC=CTTTTAAGGTAAGAAGGAGCC;SOR=0.495;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=13;WE=61308525;WS=61308507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr2	61349446	rs1177284	G	A	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=452;ReadPosRankSum=0.160;SC=TAAAAGAAATGCATAGTTAGG;SOR=1.528;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=17;WE=61349454;WS=61349436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr2	61361325	rs142269591	TG	T	3301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.297;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.864;NF=22;NR=63;PP=2948;ReadPosRankSum=-1.393;SC=ACAGAAAAAGTGGTTTGAGCA;SOR=1.313;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=133;TCF=38;TCR=95;TR=85;WE=61361333;WS=61361315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,104:0.64:162
chr2	61384906	rs7558954	T	C	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=84;ReadPosRankSum=0.712;SC=CTGTGTCCACTGCCCCTAGTT;SOR=0.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=61384914;WS=61384896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr2	61385100	rs1665258	G	A	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=2.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.64;ReadPosRankSum=-1.043;SOR=0.575;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr2	61385105	rs1729671	G	C	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=3.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.15;ReadPosRankSum=-0.641;SOR=0.590;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr2	61385248	rs1177309	A	G	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.160;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=142;ReadPosRankSum=-0.433;SC=CCTTGCTCCAAAGAGAACCCC;SOR=3.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=61385256;WS=61385238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
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chr2	61389799	rs1729673	G	A	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.525;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=669;ReadPosRankSum=-0.955;SC=TAGCAAATGTGTATAGAAATA;SOR=0.226;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=30;WE=61389807;WS=61389789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,32:0.57:56
chr2	61389965	rs201654797	G	T	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=39.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.57;ReadPosRankSum=-2.658;SOR=5.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,14:0.25:57
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chr2	61415492	rs14170	A	G	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.972;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=656;ReadPosRankSum=0.148;SC=ATTCTTCCTCAGCTAGGGTAG;SOR=0.068;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=29;WE=61415500;WS=61415482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,30:0.73:41
chr2	61417617	rs777591	A	G	1485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.696;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=29;PP=1116;ReadPosRankSum=0.378;SC=TTAACTAATTAGAAATGACAC;SOR=0.508;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=39;TCR=52;TR=52;WE=61417625;WS=61417607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,56:0.59:95
chr2	61441611	.	A	G	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=0.000;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=0.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.15;ReadPosRankSum=0.683;SOR=0.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:200,31:0.13:231
chr2	61448776	rs2290324	A	C	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.231;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=26;PP=656;ReadPosRankSum=-1.519;SC=TATTTAGATCAATCTGAACCC;SOR=1.022;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=66;TCF=12;TCR=54;TR=31;WE=61448784;WS=61448766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
chr2	61450454	rs2123111	A	G	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=57;ReadPosRankSum=-0.261;SC=ATTAGTGGAAATAAGTTTTTC;SOR=0.241;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=6;WE=61450462;WS=61450444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,5:0.18:28
chr2	61456611	rs145830957	C	A	1388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=9.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.68;MQRankSum=-3.033;QD=23.94;ReadPosRankSum=2.263;SOR=5.401;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,51:0.88:58
chr2	61456624	rs200365755	C	A	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.69;MQRankSum=-5.960;QD=17.50;ReadPosRankSum=-2.415;SOR=2.411;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,42:0.61:69
chr2	61484556	rs2060824	T	C	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.467;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.48;ReadPosRankSum=0.605;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr2	61522047	rs35292974	T	C	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=154;ReadPosRankSum=0.102;SC=AGATAAATTATTTTTATCAAT;SOR=0.346;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=9;WE=61522055;WS=61522037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr2	61522123	rs13014347	T	C	2153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=19;PP=1730;SC=CCACTTGATCTTCACTTGAAT;SOR=1.897;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=47;TCR=19;TR=66;WE=61522131;WS=61522113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr2	61528299	rs11428092	T	TA	475.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.333;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=516;ReadPosRankSum=-0.010;SC=ATACCATCTATAAAAAACAGG;SOR=1.922;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=75;TCF=16;TCR=59;TR=23;WE=61528307;WS=61528289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,26:0.31:85
chr2	61538602	rs141750762	G	GAAAAGAGAAAGAAAAAGAAAA	2471.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.79;QD=68.66;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	61552379	rs11448157	A	AT	135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.523;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=190;ReadPosRankSum=0.101;SC=ACAAACATACATGTGCCCACT;SOR=0.061;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=7;WE=61552387;WS=61552369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr2	61552484	rs2593624	T	A	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.006;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=274;ReadPosRankSum=-1.904;SC=AACAGATTTTTAAAAAGTACT;SOR=0.294;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=16;WE=61552492;WS=61552474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,15:0.34:44
chr2	61570886	rs72381726	AAAGT	A	744.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.431;NF=21;NR=0;PP=830;ReadPosRankSum=-0.094;SC=TCCTTTCAACAAAGTAAGATA;SOR=0.242;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=71;TCR=0;TR=21;WE=61570897;WS=61570876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,22:0.34:65
chr2	61575308	rs6722430	A	G	5402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=108;PP=2965;ReadPosRankSum=0.298;SC=TCTTTCTGACATGCCTTGGGA;SOR=0.463;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=178;TCF=69;TCR=109;TR=177;WE=61575316;WS=61575298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,178:0.99:179
chr2	61576517	rs811378	G	A	2697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=64;PP=2125;SC=TCAACAAGATGTAAGTGGAGA;SOR=2.625;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=17;TCR=65;TR=81;WE=61576525;WS=61576507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	61605614	rs10208769	T	A	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=349;ReadPosRankSum=-0.483;SC=ATTCTTGCATTTGTCAGCAAA;SOR=0.573;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=59;TCF=18;TCR=41;TR=21;WE=61605622;WS=61605604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,23:0.37:62
chr2	61622251	rs3213951	C	T	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.843;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=767;ReadPosRankSum=-0.848;SC=AATAATAAAACATATGGATGA;SOR=0.052;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=35;WE=61622259;WS=61622241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,35:0.69:51
chr2	61647901	rs778155	A	G	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.610;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=303;ReadPosRankSum=0.648;SC=AGGAATTGATATAAGTAAATA;SOR=1.127;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=17;WE=61647909;WS=61647891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,18:0.36:50
chr2	61697889	.	G	C	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.971;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=32;PP=576;ReadPosRankSum=1.083;SC=CCGACCGGCGGGGGGGAGGGG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=32;WE=61697897;WS=61697879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,32:0.76:42
chr2	61713209	rs35844473	GGAAAATC	G	652.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=1199;ReadPosRankSum=-0.440;SC=ACTGAAAACAGGAAAATCTTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=11;WE=61713228;WS=61713199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr2	61713218	rs60155512	T	A	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.47;ReadPosRankSum=0.918;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr2	61713218	.	TGT	AGG	1172	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=11;PP=1172;QD=111.406170442;SC=AGGAAAATCTTGTGTTTGTAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=11;WE=61713228;WS=61713199;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
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chr2	61761169	rs1446532	G	A	193.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=114;SC=TTTAATTACAGAAAACTGAGA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=61761177;WS=61761159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	62053546	rs72380346	CGCT	C	1653.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.225;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=1637;ReadPosRankSum=1.597;SC=GACACCCTGACGCTGCAAACA;SOR=1.027;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=59;TCF=39;TCR=20;TR=35;WE=62053556;WS=62053536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,42:0.64:66
chr2	62053878	rs11392751	G	GA	67.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.42;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	62063093	rs11299120	TA	T	335.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=0.973;QD=7.14;ReadPosRankSum=-0.775;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr2	62065759	rs6545910	C	T	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.74;ReadPosRankSum=1.864;SOR=0.689;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:168,58:0.26:226
chr2	62066417	rs36214963	ATATAT	A	1468.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.23;NF=25;NR=0;PP=1373;SC=ACAAAATATCATATATTATAT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=25;WE=62066429;WS=62066407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	62066927	rs4672457	A	G	4723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=70;PP=2965;SC=TCCTGCATCCACAAGCTGACC;SOR=0.843;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=150;TCF=80;TCR=70;TR=150;WE=62066935;WS=62066917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr2	62074097	rs12476816	G	A	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=394;ReadPosRankSum=1.060;SC=TCAGGAATCCGAGACCAATCT;SOR=0.638;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=17;WE=62074105;WS=62074087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr2	62074140	rs113296637	A	AAC	630.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=58.95;NF=0;NR=14;PP=576;SC=CTCTACTAAAAACAAAACTTA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=14;WE=62074148;WS=62074130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	62081012	rs4270331	A	C	6186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=127;NR=75;PP=2965;SC=CAGCGGGCTGAGCCACTTTCT;SOR=1.352;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=203;TCF=128;TCR=75;TR=202;WE=62081020;WS=62081002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr2	62081217	rs1881616	A	G	1343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=39;PP=1152;SC=CTGGCCCGGGACGGGAAAGCT;SOR=5.186;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=41;WE=62081225;WS=62081207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	62095994	rs4672463	A	G	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=15;PP=483;SC=AAACTTGGCCAGGCACGGTGG;SOR=2.636;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=62096002;WS=62095984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	62099156	rs3828276	T	C	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=173;SC=AACAGATGACTACAAAGCTTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=62099164;WS=62099146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	62104660	rs36062307	TA	T	518.14	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=9.853;HP=14;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.571;NF=0;NR=25;PP=285;ReadPosRankSum=-0.072;SC=CTAGAATTATTAAAAAAAAAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=25;WE=62104668;WS=62104650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,26:0.90:29
chr2	62107376	rs5831625	T	TC	1411.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=3;PP=1363;SC=TAAAGTTTGTTTTTTAAACTT;SOR=3.797;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=35;WE=62107384;WS=62107366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	62112246	rs57035931	C	CT	1531.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=9.613;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.476;NF=5;NR=55;PP=878;ReadPosRankSum=0.171;SC=CAAATTAGAACTTTTTTTTTT;SOR=3.578;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=9;TCR=105;TR=60;WE=62112254;WS=62112236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,67:0.92:73
chr2	62196080	.	CT	C	109.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.722;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.668;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr2	62228180	rs55785307	C	G	328.22	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=270;ReadPosRankSum=1.692;SC=GTTAGCTTGTCTATTCAGCTT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=62228188;WS=62228170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr2	62729674	rs4672527	T	C	3790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=75;PP=2965;SC=AGTAGTCAGGTAAGATTGAAT;SOR=1.568;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=113;TCF=37;TCR=76;TR=112;WE=62729682;WS=62729664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr2	62729747	rs11443505	G	GA	3510.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=57;PP=2975;SC=ATTTAAGATAGAAAAAATTAT;SOR=0.728;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=106;TCF=42;TCR=64;TR=97;WE=62729755;WS=62729737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr2	62733189	rs17854454	C	T	2774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.912;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=73;PP=2057;ReadPosRankSum=-0.038;SC=GACTCTGGACCGGTCCGATTG;SOR=0.470;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=322;TCF=101;TCR=221;TR=112;WE=62733197;WS=62733179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,118:0.36:330
chr2	62733253	rs11676567	C	T	5165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=130;PP=2965;SC=GCACCGGATCCGGCAGCTCCA;SOR=3.316;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=25;TCR=130;TR=155;WE=62733261;WS=62733243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr2	62738883	rs6757222	C	T	1368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.948;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=9;PP=1043;ReadPosRankSum=1.347;SC=TTTTTTGGTTCGGTGGCATTT;SOR=1.333;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=63;TCF=49;TCR=14;TR=45;WE=62738891;WS=62738873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,47:0.72:65
chr2	62738931	rs6757448	G	C	2647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=29;PP=2036;SC=CCTGCTATATGAAGCAGCTGC;SOR=1.275;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=50;TCR=29;TR=79;WE=62738939;WS=62738921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	62739135	rs4405748	A	C	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=500;SC=AAAATATTTTATATATTACAC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=62739143;WS=62739125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	63380809	rs7595595	G	A	174.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=139;SC=ATATTTTAAAGTTTCTGGGTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=63380817;WS=63380799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	63486429	rs992214	C	T	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=6;PP=1170;SC=TTAAAAATAGCGTTAATTCTT;SOR=3.516;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=43;WE=63486437;WS=63486419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	63540523	rs1517402	A	T	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=55;PP=1696;SC=TTTAACATATATCTGTGATAC;SOR=8.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=0;TCR=56;TR=55;WE=63540531;WS=63540513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	63605772	rs2292794	A	G	748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=547;SC=CAGGAAAGATAAAATTAAAAT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=63605780;WS=63605762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	63609017	rs2138796	A	T	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.06;ReadPosRankSum=-1.483;SOR=0.476;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,10:0.22:45
chr2	63720210	rs7563623	A	G	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=382;SC=GAATAAACATACTCTAGTGTA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=63720218;WS=63720200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	63798333	rs4671068	C	T	1442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=2;PP=1203;SC=GCATAAGCCACCGCGCCTGGT;SOR=5.376;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=43;TCR=2;TR=44;WE=63798341;WS=63798323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	63816672	rs10469944	C	G	185.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=7;PP=181;SC=GCGTTTGCAGCAGACGTGTTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=63816680;WS=63816662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	63822785	rs2305157	T	C	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=431;SC=ACTACCACTGTTTATTAACTA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=63822793;WS=63822775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	63826528	rs7606045	T	G	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=455;SC=TTTCTTGTTTTTGTTTAGTAG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=63826536;WS=63826518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	63849491	rs262496	T	C	2431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.384;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.318;NF=52;NR=36;PP=1976;ReadPosRankSum=-0.080;SC=AAACCCTTCATAGTCTTGGTC;SOR=0.843;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=141;TCF=82;TCR=59;TR=88;WE=63849499;WS=63849481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,90:0.63:143
chr2	64069277	rs78573846	GA	G	800.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=0.826;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=1.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,50:0.64:78
chr2	64069732	rs6546029	G	A	1503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.145;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=43;PP=1198;ReadPosRankSum=0.660;SC=GAGAAAAGCCGGGTGGGTTTT;SOR=0.154;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=69;TCF=4;TCR=65;TR=47;WE=64069740;WS=64069722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,50:0.69:72
chr2	64084007	rs62136367	A	C	1543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.934;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=47;PP=1286;ReadPosRankSum=-0.228;SC=TTTTACTTGTAAATCAATAGG;SOR=1.981;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=84;TCF=7;TCR=77;TR=49;WE=64084015;WS=64083997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,52:0.60:86
chr2	64085114	rs10183479	G	A	2891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.251;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=73;PP=2254;ReadPosRankSum=-0.072;SC=GTAATCTTGGGCACTGGTTTT;SOR=1.314;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=176;TCF=63;TCR=113;TR=106;WE=64085122;WS=64085104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,110:0.59:185
chr2	64124722	rs11558741	C	A	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.59;ReadPosRankSum=1.461;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,5:0.16:32
chr2	64139470	rs147421356	A	T	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=331;ReadPosRankSum=-0.585;SC=AATTTCTATAAATCATTACCT;SOR=2.613;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=14;WE=64139478;WS=64139460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr2	64139834	rs2302808	A	T	1780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.18;SOR=3.076;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	64139901	rs2302809	A	T	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=695;SC=CTTATAAAGAACCAGTTTATT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=64139909;WS=64139891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	64140301	rs10207847	A	T	835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=3;PP=705;SC=ACATGATGAGAACAGTGACAT;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=64140309;WS=64140291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	64146946	rs62136393	A	C	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=329;ReadPosRankSum=0.938;SC=AACTAAAGAAATATTAAGCAT;SOR=0.634;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=15;WE=64146954;WS=64146936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr2	64147834	rs1440002	G	A	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=173;ReadPosRankSum=-0.367;SC=TTAGTTTAACGATTATTATAA;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=9;WE=64147842;WS=64147824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr2	64160864	rs34015596	G	C	3028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.581;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=43;PP=2291;ReadPosRankSum=-1.316;SC=GCTGGATGAAGAATCAGTAGT;SOR=1.007;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=174;TCF=100;TCR=74;TR=108;WE=64160872;WS=64160854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,115:0.63:182
chr2	64189566	rs17028275	A	G	2407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.928;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=68;PP=1866;ReadPosRankSum=1.463;SC=CAATATCCAGATAATGGCTCA;SOR=1.107;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=134;TCF=27;TCR=107;TR=84;WE=64189574;WS=64189556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,91:0.63:144
chr2	64195997	rs34977697	C	CA	306.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.76;ReadPosRankSum=-0.829;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr2	64331815	.	CT	C	142.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=-0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.14;ReadPosRankSum=0.115;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr2	64780144	rs7576956	A	G	5750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.975;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=139;NR=48;PP=2962;ReadPosRankSum=0.031;SC=AAGAATGTCAATTGGCAAGAA;SOR=1.224;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=303;TCF=213;TCR=90;TR=187;WE=64780152;WS=64780134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,195:0.62:313
chr2	64794945	rs7598893	G	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=280;ReadPosRankSum=0.055;SC=CAGGCCAGGCGCAGTGGATCA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=15;WE=64794953;WS=64794935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr2	64796479	rs6546087	C	T	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=270;ReadPosRankSum=0.184;SC=TAAATGTTCACTTATATTGAA;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=14;WE=64796487;WS=64796469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
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chr2	64799937	rs147232569	TAA	T	173.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=0.883;QD=8.27;ReadPosRankSum=0.653;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
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chr2	65131523	rs12623286	A	T	1001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.736;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=787;ReadPosRankSum=1.504;SC=CGTGTTGGCAATTCTGGCAGA;SOR=0.587;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=115;TCF=72;TCR=43;TR=43;WE=65131531;WS=65131513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,44:0.38:116
chr2	65131732	rs735473	G	A	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.672;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=371;ReadPosRankSum=-0.591;SC=CTGTGCTGTTGTTGGCTCTCT;SOR=0.373;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=61;TCF=12;TCR=49;TR=23;WE=65131740;WS=65131722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,25:0.38:65
chr2	65132050	rs78893802	G	A	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.283;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=16;PP=920;ReadPosRankSum=-0.037;SC=ATGACAACAAGCCACAGACTT;SOR=0.507;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=166;TCF=122;TCR=44;TR=57;WE=65132058;WS=65132040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,58:0.33:176
chr2	65200618	rs4671636	C	A	1335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=12;PP=1035;SC=AAAATGAAACCATGAACAGCA;SOR=1.455;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=38;WE=65200626;WS=65200608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	65216886	rs1064512	G	C	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.144;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=-2.054;SC=GCGTTGCGCGGGCTTCCTGCG;SOR=1.483;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=7;WE=65216894;WS=65216876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr2	65231245	rs11891502	A	G	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=119;ReadPosRankSum=0.595;SC=GAAAACTTTGAGGTTTGAATG;SOR=0.204;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=7;WE=65231253;WS=65231235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr2	65245365	rs759458	G	A	1826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.601;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=39;PP=1324;ReadPosRankSum=0.097;SC=ACTCAACAACGTAGAGCTCAA;SOR=0.341;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=272;TCF=167;TCR=105;TR=85;WE=65245373;WS=65245355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,87:0.32:275
chr2	65296798	rs7572857	G	A	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.623;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=561;ReadPosRankSum=-0.003;SC=TGACCCTGGCGGCCCCTCTAG;SOR=0.465;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=118;TCF=72;TCR=46;TR=36;WE=65296806;WS=65296788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,36:0.30:120
chr2	65298839	rs17849707	A	G	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.324;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=592;ReadPosRankSum=1.236;SC=CTTCCTCCACAGGCAGCAGTC;SOR=0.299;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=147;TCF=56;TCR=91;TR=42;WE=65298847;WS=65298829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,44:0.29:153
chr2	65315880	rs1420184	G	C	1461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=44;PP=1273;ReadPosRankSum=0.868;SC=CTAATTCTTAGTGCATTTCTA;SOR=0.610;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=65;TCF=6;TCR=59;TR=49;WE=65315888;WS=65315870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,48:0.75:64
chr2	65315903	rs1420185	G	A	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=34;PP=887;ReadPosRankSum=1.037;SC=ATCCATAATGGAGCGTGAGGA;SOR=0.527;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=49;TCF=2;TCR=47;TR=36;WE=65315911;WS=65315893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,36:0.73:49
chr2	65325265	rs76210337	A	G	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=44;ReadPosRankSum=-0.119;SC=GTCTAAGTGGAAAAAAAAAAA;SOR=0.297;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=5;WE=65325273;WS=65325255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr2	65341374	rs17029863	T	C	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=88;ReadPosRankSum=1.278;SC=GAAAGCTGATTGACATTAACC;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=9;WE=65341382;WS=65341364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr2	65473930	rs58944514	AAAATTTTC	A	2872.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.272;NF=1;NR=49;PP=2966;ReadPosRankSum=-1.073;SC=TGTTAAATCAAAAATTTTCTT;SOR=0.772;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=85;TCF=1;TCR=84;TR=50;WE=65473945;WS=65473920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,73:0.66:111
chr2	65478371	rs7574628	T	A	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=428;ReadPosRankSum=-0.607;SC=TTGAAATATTTTCAGTTTTTA;SOR=2.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=19;WE=65478379;WS=65478361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr2	65481008	rs268871	A	C	1955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.009;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=43;PP=1354;ReadPosRankSum=1.617;SC=GGTAAGTGAAAGGAAAATATC;SOR=0.978;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=27;TCR=43;TR=69;WE=65481016;WS=65480998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,72:0.99:73
chr2	65488538	rs268862	G	A	3084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.97;NF=28;NR=67;PP=2491;SC=TACATTAGAAGTGGTGATTTC;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=28;TCR=67;TR=95;WE=65488546;WS=65488528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr2	65492486	rs4671647	C	T	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=254;ReadPosRankSum=0.962;SC=GCTCTGGTCACCTCTATAGAG;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=12;WE=65492494;WS=65492476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr2	65495570	rs55843720	A	C	2401.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.19;SOR=6.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	65495570	.	AT	CC	2421	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=40;NR=1;PP=2421;QD=60.3528749966;SC=GGTACCAAATATTACGTTCTA;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=54;TCR=1;TR=41;WE=65495581;WS=65495560;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:14,41:0.75:55
chr2	65495571	rs60931828	T	C	2401.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.48;SOR=6.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	65495573	rs72536103	A	AC	2426.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=1;PP=1920;SC=ACCAAATATTACGTTCTACTT;SOR=6.593;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=42;WE=65495581;WS=65495560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	65495887	rs268875	G	A	8366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-1.256;NF=107;NR=166;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.893;SC=GCTTGTTCCCGTCATACCCGT;SOR=0.460;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=274;TCF=107;TCR=167;TR=273;WE=65495895;WS=65495877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,271:1.00:272
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chr2	65604914	rs268120	A	G	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=245;ReadPosRankSum=-1.781;SC=TCAAAGCGGCAGTCCTCAGCA;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=14;WE=65604922;WS=65604904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr2	66662875	rs10594206	CTTT	C	91.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-0.566;QD=13.11;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr2	66665146	rs2280334	T	C	4264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=91;PP=2965;SC=CGCTTCCCTCTTTCTCTGTGC;SOR=2.063;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=34;TCR=91;TR=125;WE=66665154;WS=66665136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr2	66667186	rs2271856	C	T	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=22;PP=492;SC=CACACACGCGCGCGCGCGCGC;SOR=3.816;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=24;WE=66667208;WS=66667176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	66667200	.	A	AACACACACACACAC	91	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=1;HapScore=3;MGOF=7;MMLQ=19;MQ=53.76;NF=0;NR=5;PP=91;QD=19.0;SC=CGCGCGCGCGAACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=5;WE=66667208;WS=66667176;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:12,5:0.29:17
chr2	66667224	.	CGG	C	127.74	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=25.55;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr2	66667226	.	G	GACACACA	127.74	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=25.55;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr2	66794834	rs1000756	G	A	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=309;ReadPosRankSum=0.515;SC=TTTGGAGAAGGTGGAAAAAAA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=15;WE=66794842;WS=66794824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr2	66798282	rs2861108	G	T	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=312;ReadPosRankSum=1.058;SC=TTAATCACAGGGTTCTCTGGC;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=15;WE=66798290;WS=66798272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr2	67630980	rs3770657	G	A	3115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=50;PP=2504;SC=TTACTAGGTAGTGAACCTTTT;SOR=0.896;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=41;TCR=50;TR=91;WE=67630988;WS=67630970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr2	67631831	rs61740794	G	A	2491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=26;PP=2030;SC=TAATAATTCCGAACATGGAGC;SOR=1.409;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=50;TCR=26;TR=76;WE=67631839;WS=67631821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	67632125	rs3770655	C	T	2649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=47;PP=2141;SC=ATTGGTTCTTCCAGGAAGTTC;SOR=1.358;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=72;WE=67632133;WS=67632115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	67637196	rs1569	G	A	6682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=162;PP=2965;SC=AAGACTTCACGAAGACTGCTG;SOR=3.056;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=195;TCF=33;TCR=162;TR=195;WE=67637204;WS=67637186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr2	68272883	rs72821819	G	A	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=20;ReadPosRankSum=0.660;SC=TAATATGTAAGTTATAAATAA;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=3;WE=68272891;WS=68272878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr2	68358341	rs62145930	T	C	1474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.456;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.727;NF=42;NR=4;PP=1134;ReadPosRankSum=-0.753;SC=TGAGCCACCGTGCCCAGCCTC;SOR=0.331;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=61;TCF=57;TCR=4;TR=46;WE=68358349;WS=68358331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,50:0.78:64
chr2	68358653	rs17035004	T	C	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=404;ReadPosRankSum=1.498;SC=TACACTTCAATGACTCTATTT;SOR=2.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=22;WE=68358661;WS=68358643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,21:0.78:27
chr2	68385097	rs2044693	A	G	2478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.290;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=48;PP=1857;ReadPosRankSum=1.295;SC=GCAGAGCGCCAGGGCAGAGGA;SOR=0.393;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=141;TCF=74;TCR=67;TR=93;WE=68385105;WS=68385087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,98:0.67:146
chr2	68385590	rs201777481	T	C	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=44;PP=1250;ReadPosRankSum=-0.425;SC=GATGAAGATATTTACTCCTAT;SOR=0.799;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=78;TCF=11;TCR=67;TR=51;WE=68385598;WS=68385580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,52:0.64:81
chr2	68389276	rs11402583	G	GA	544.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.637;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.143;NF=22;NR=3;PP=374;ReadPosRankSum=-0.318;SC=GTCTCCAAGGGAAAAAAAAAA;SOR=0.260;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=47;TCR=6;TR=25;WE=68389284;WS=68389266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,26:0.72:36
chr2	68415767	rs687	G	A	1934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.103;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=37;PP=1413;ReadPosRankSum=0.652;SC=AACCAGAATTGTCCAAATCAA;SOR=0.209;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=117;TCF=48;TCR=69;TR=70;WE=68415775;WS=68415757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,74:0.60:123
chr2	68444171	rs374427852	C	CACGCAG	1951.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.613;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.886;NF=31;NR=13;PP=2032;ReadPosRankSum=2.557;SC=CACACACACACAGAGAGAGAT;SOR=4.491;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=76;TCF=52;TCR=24;TR=44;WE=68444179;WS=68444161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,52:0.64:81
chr2	68483396	rs7593613	A	T	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=250;SC=CCTTCCTGCTAAGCAGCAGAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=68483404;WS=68483386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	68511506	rs5831925	GA	G	497.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=14;NR=6;PP=331;SC=AAATAATTTGGAAAAAAAAAA;SOR=1.931;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=20;WE=68511514;WS=68511496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	68511584	rs735815	A	G	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=60;ReadPosRankSum=-1.291;SC=CATATGTAAGAGAGATCTCTT;SOR=0.960;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=30;TCF=13;TCR=17;TR=8;WE=68511592;WS=68511574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr2	68592584	rs880668	T	C	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.019;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=591;ReadPosRankSum=0.681;SC=AGACTTGGGTTCAGCTCCACC;SOR=1.151;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=96;TCF=39;TCR=57;TR=31;WE=68592592;WS=68592574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,33:0.32:102
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chr2	68622914	rs1063479	G	A	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.935;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=687;ReadPosRankSum=0.806;SC=GAGTGGATCAGAGCCATCCAG;SOR=1.073;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=94;TCF=32;TCR=62;TR=37;WE=68622922;WS=68622904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,38:0.40:95
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chr2	68772281	rs11337234	AT	A	1262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.849;NF=51;NR=4;PP=808;ReadPosRankSum=1.371;SC=AGAATATCCTATTTTTTTTTT;SOR=0.813;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=89;TCF=82;TCR=7;TR=55;WE=68772289;WS=68772271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,59:0.75:79
chr2	68881938	rs140852128	CA	C	404.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=3.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.42;MQRankSum=0.371;QD=13.06;ReadPosRankSum=1.516;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,25:0.81:31
chr2	68882468	rs6722313	T	C	4750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.903;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=127;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.153;SC=CCACCGTGTTTGTGAAGGAGA;SOR=1.024;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=263;TCF=91;TCR=172;TR=189;WE=68882476;WS=68882458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,194:0.71:272
chr2	69002760	rs10445945	C	T	3052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=37;PP=2458;SC=AGCACCAGGACGGGCACTGTG;SOR=1.132;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=58;TCR=37;TR=95;WE=69002768;WS=69002750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr2	69034249	rs17035954	T	C	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.48;ReadPosRankSum=-0.619;SOR=0.053;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,10:0.18:56
chr2	69034286	rs115232205	A	G	2064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.411;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=5;PP=1640;ReadPosRankSum=0.429;SC=TATCTCCCATATTTTGTCTAG;SOR=2.015;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=86;TCF=78;TCR=8;TR=67;WE=69034294;WS=69034276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,69:0.78:88
chr2	69040500	rs2280310	G	A	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.808;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=591;ReadPosRankSum=2.367;SC=CCTGGAGCCAGTACGAAGGGT;SOR=1.380;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=104;TCF=45;TCR=59;TR=33;WE=69040508;WS=69040490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,33:0.31:107
chr2	69043264	rs67399232	CT	C	2395.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.090;NF=31;NR=16;PP=1603;ReadPosRankSum=0.125;SC=AGTTATTTCCCTTTTTTTTTT;SOR=0.676;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=155;TCF=100;TCR=55;TR=47;WE=69043274;WS=69043254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,71:0.43:164
chr2	69043266	rs78107572	T	A	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.393;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.335;NF=39;NR=12;PP=1577;ReadPosRankSum=1.684;SC=TTATTTCCCTTTTTTTTTTTA;SOR=0.566;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=174;TCF=127;TCR=47;TR=51;WE=69043274;WS=69043254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,65:0.37:176
chr2	69043539	rs2271832	G	C	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=237;ReadPosRankSum=-1.914;SC=AACCCCATCAGAAAGAAGCTC;SOR=0.260;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=12;WE=69043547;WS=69043529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr2	69049939	rs4241344	G	T	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FS=1.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.43;ReadPosRankSum=-1.243;SOR=0.658;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:164,61:0.27:225
chr2	69173570	rs1128272	C	T	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.736;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=32;PP=738;ReadPosRankSum=0.030;SC=GGTGTATTTGCTGGAGAACAT;SOR=1.211;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=94;TCF=15;TCR=79;TR=37;WE=69173578;WS=69173560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,38:0.39:97
chr2	69180161	rs7561266	T	A	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=516;ReadPosRankSum=-1.360;SC=AGAATTGAGATCCAACCACAT;SOR=1.542;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=22;WE=69180169;WS=69180151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr2	69201894	rs4417751	C	T	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.451;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=30;PP=783;ReadPosRankSum=0.611;SC=TTTAGGAGGTCTGCTTCTTAT;SOR=0.097;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=53;TCF=4;TCR=49;TR=34;WE=69201902;WS=69201884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,35:0.65:54
chr2	69204629	rs35624281	T	C	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=71;ReadPosRankSum=0.682;SC=GATTTCAGATTGTCTTTGCTG;SOR=0.473;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=7;WE=69204637;WS=69204619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr2	69204671	rs9808077	A	T	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.322;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=31;ReadPosRankSum=0.117;SC=CTCCTGCCCTAGCTAACTATG;SOR=1.179;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=6;WE=69204679;WS=69204661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,6:0.19:31
chr2	69205023	rs146210841	TAC	T	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.11;ReadPosRankSum=0.539;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,3:0.19:16
chr2	69205942	rs13424275	C	T	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.802;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=7;PP=972;ReadPosRankSum=-0.352;SC=TGGAACTGACCTCTGATAAGA;SOR=0.971;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=125;TCF=99;TCR=26;TR=46;WE=69205950;WS=69205932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,49:0.37:131
chr2	69297622	rs4591376	C	T	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=426;SC=TGACCCTGAACGGATAATATA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=69297630;WS=69297615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	69298817	rs13030844	T	C	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.622;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=682;ReadPosRankSum=1.378;SC=CAGAGCCCATTATCCACTATG;SOR=1.802;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=29;WE=69298825;WS=69298807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,30:0.71:42
chr2	69300087	rs57008189	G	C	238.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=2.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.48;MQRankSum=4.959;QD=7.96;ReadPosRankSum=1.316;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr2	69300087	.	GGG	CGT	617	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=62.57;NF=7;NR=0;PP=617;QD=95.7811249803;SC=GTTGAATCCTGGGACTGAGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=7;WE=69300100;WS=69300077;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:19,7:0.27:26
chr2	69300088	rs67110959	GGAC	G	220.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.19;MQRankSum=5.302;QD=6.49;ReadPosRankSum=1.432;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,8:0.24:34
chr2	69300090	.	ACTG	A	628	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=23;MQ=62.5;NF=7;NR=0;PP=628;QD=95.8571428571;SC=GAATCCTGGGACTGAGAGGGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=7;WE=69300100;WS=69300077;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:20,7:0.26:27
chr2	69300093	.	G	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.955;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=2.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.26;MQRankSum=5.218;QD=7.05;ReadPosRankSum=1.936;SOR=1.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr2	69300243	rs10202939	G	A	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.738;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,14:0.23:62
chr2	69304719	rs7424907	T	C	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.952;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=36;PP=813;ReadPosRankSum=-1.793;SC=CTGGTGTTTTTCTGCTTAAGA;SOR=1.388;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=118;TCF=20;TCR=98;TR=41;WE=69304727;WS=69304709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,41:0.34:121
chr2	69304779	rs13419465	C	T	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=315;ReadPosRankSum=0.514;SC=CCATCTCTCCCTTCTGCCTTT;SOR=0.790;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=16;WE=69304787;WS=69304769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr2	69317925	rs4854546	G	A	6720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=125;NR=81;PP=2965;SC=GCTAAAAGCAGAACCCTGATT;SOR=1.089;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=206;TCF=125;TCR=81;TR=206;WE=69317933;WS=69317915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr2	69318129	rs4241348	T	G	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=25;PP=777;SC=TACTTCATTGTTGGTGGGGTG;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=69318137;WS=69318119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	69330284	rs4241349	G	A	275.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=226;SC=TGGGTGTCCAGCTTGGTAAGC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=69330292;WS=69330274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	69420596	.	TAC	T	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQRankSum=-0.668;QD=1.44;ReadPosRankSum=-0.553;SOR=0.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,8:0.17:47
chr2	69741609	rs2276689	C	T	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.949;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=139;ReadPosRankSum=-1.842;SC=TTACCGCTGGCTCCTGGGCAG;SOR=3.056;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=9;WE=69741617;WS=69741599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr2	69741753	rs3832159	CTGT	C	506.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.95;MQRankSum=4.549;QD=7.24;ReadPosRankSum=0.641;SOR=0.463;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,19:0.27:70
chr2	69741854	rs6715776	T	G	5991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=79;PP=2965;SC=ATTGCTGGTTTCTGGGTTGCT;SOR=1.033;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=105;TCR=79;TR=183;WE=69741862;WS=69741844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr2	69759415	rs2276687	G	A	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=610;ReadPosRankSum=1.712;SC=TGTGCACAGGGAAGTTATTCC;SOR=1.414;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=1;TCR=61;TR=28;WE=69759423;WS=69759405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
chr2	69771484	rs3771544	C	T	1208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.330;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=7;PP=953;ReadPosRankSum=-0.616;SC=GAGTGCAGTGCACATTAAGTG;SOR=0.395;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=137;TCF=121;TCR=16;TR=50;WE=69771492;WS=69771474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,50:0.36:137
chr2	69784255	rs3771543	C	T	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-5.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=299;ReadPosRankSum=0.186;SC=TGTTGTAGAACACATTCTTAG;SOR=0.418;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=16;WE=69784263;WS=69784245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr2	69784278	rs3821277	T	C	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=136;ReadPosRankSum=0.392;SC=TCTCAGAACTTGGAGATATTA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=10;WE=69784286;WS=69784268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr2	70014986	rs11677629	T	C	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=33;ReadPosRankSum=0.328;SC=AATTGTTGGCTTGTTTACTGT;SOR=0.086;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=3;WE=70014994;WS=70014976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr2	70015108	rs11683908	A	G	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.903;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=6;PP=729;ReadPosRankSum=-0.555;SC=TCAGTGCTCAACAAATGTTTG;SOR=0.056;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=53;TCF=47;TCR=6;TR=35;WE=70015116;WS=70015098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,37:0.67:55
chr2	70015181	rs10496171	C	T	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.691;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=871;ReadPosRankSum=-0.706;SC=CTCTTGTGTGCTCAGGCAACC;SOR=1.099;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=104;TCF=58;TCR=46;TR=45;WE=70015189;WS=70015171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,44:0.42:105
chr2	70031797	rs3771541	C	G	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=31;PP=947;SC=TGGCTGACTTCGCAGCAACAG;SOR=3.321;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=36;WE=70031805;WS=70031787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	70033584	rs2228203	C	T	2239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.098;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=65;PP=1706;ReadPosRankSum=0.064;SC=GGGATGATGACGCCCACGGTG;SOR=1.968;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=104;TCF=26;TCR=78;TR=82;WE=70033592;WS=70033574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,83:0.79:105
chr2	70033649	rs17037076	G	A	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=31;PP=722;ReadPosRankSum=-0.140;SC=TCTTCCTCTCGTGCTCTTGGT;SOR=3.145;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=31;WE=70033657;WS=70033639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,32:0.84:38
chr2	70033711	rs3771539	G	C	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=110;ReadPosRankSum=-0.576;SC=CACCCAATAAGAAAGACATGG;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=70033719;WS=70033701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr2	70039677	rs2305523	A	C	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=502;SC=TGAAGCTCCAATTCTTGTGGT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=19;WE=70039685;WS=70039667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	70046255	rs3732269	G	C	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.20;ReadPosRankSum=1.559;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr2	70046262	rs3732268	G	A	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.27;ReadPosRankSum=0.063;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr2	70057448	rs3732266	T	G	177.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=6;PP=144;SC=CGGGGCGGACTGGGGAGCGCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=70057456;WS=70057438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	70064927	rs1377996	C	A	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=563;ReadPosRankSum=0.223;SC=CTCATTTGATCAGTCTGTAAG;SOR=0.551;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=25;WE=70064935;WS=70064917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
chr2	70066571	rs3832156	C	CTT	531.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=5.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=0.000;QD=16.11;ReadPosRankSum=-1.641;SOR=2.655;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
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chr2	70068258	rs3836157	CT	C	551.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=646;SC=TAAAGCTTAGCTTTTTTGGAG;SOR=4.712;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=21;WE=70068266;WS=70068248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr2	70120909	rs3214822	GA	G	143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=192;ReadPosRankSum=-0.717;SC=GGGGAAAAATGAAAGCTGTGT;SOR=0.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=7;WE=70120917;WS=70120899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr2	70121197	rs2278934	T	C	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=10.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.76;ReadPosRankSum=0.094;SOR=2.506;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,17:0.25:68
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chr2	70131320	rs35836496	G	GT	107.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=1.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=1.916;QD=2.69;ReadPosRankSum=-0.194;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,9:0.22:40
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chr2	70164034	rs3771531	T	C	4654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=19;PP=2965;SC=TTCAGGGGATTGCTGCAAACA;SOR=3.324;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=139;TCF=120;TCR=19;TR=138;WE=70164042;WS=70164024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr2	70164580	rs3217643	C	CAGGG	1041.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=853;SC=AACCCCAGAGCAGGGGTTCAG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=16;WE=70164588;WS=70164570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	70188676	rs3796097	T	C	3666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=98;PP=2965;SC=CGAAGCAGAGTGGGGATGACT;SOR=2.266;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=132;TCF=33;TCR=99;TR=131;WE=70188684;WS=70188666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr2	70190288	rs34641834	C	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.68;ReadPosRankSum=-1.465;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr2	70377653	rs12989348	G	A	1698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.193;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=34;PP=1262;ReadPosRankSum=0.173;SC=GGATCCACTCGATGATGAAAG;SOR=0.946;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=92;TCF=43;TCR=49;TR=59;WE=70377661;WS=70377643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,64:0.63:101
chr2	70443518	rs373922488	C	A	3639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=49;PP=2762;ReadPosRankSum=-0.015;SC=TAATGCCACACAGGGAAGGCT;SOR=0.697;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=216;TCF=139;TCR=77;TR=131;WE=70443526;WS=70443508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,138:0.59:232
chr2	70454794	rs2592181	G	C	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=107;SC=ATTCACAACAGAATTATTTTC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=70454802;WS=70454784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	70457784	rs200532251	C	CAA	439.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQRankSum=-0.192;QD=16.91;ReadPosRankSum=0.498;SOR=3.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,22:0.85:26
chr2	70463334	rs78928004	CT	C	68.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=0.808;QD=2.64;ReadPosRankSum=-0.567;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr2	70524577	rs2618235	G	A	4392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=69;PP=2965;SC=TGGCTTTGTCGTTGCAATGCA;SOR=0.797;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=65;TCR=70;TR=134;WE=70524585;WS=70524567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr2	70528827	rs2279159	G	A	3821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=49;PP=2928;ReadPosRankSum=-0.785;SC=CTCCTGCCCCGGGCTGGAAGG;SOR=0.353;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=114;TCF=65;TCR=49;TR=112;WE=70528835;WS=70528817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,120:0.99:121
chr2	70676639	rs538118	A	G	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=1.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.63;ReadPosRankSum=1.179;SOR=0.904;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,22:0.22:102
chr2	70905099	rs2902577	T	G	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=683;ReadPosRankSum=0.970;SC=GGGCCCAACATCCTGCATGGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=28;WE=70905107;WS=70905089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,29:0.67:43
chr2	70906115	rs2074815	C	A	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.184;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=40;PP=1178;ReadPosRankSum=-0.366;SC=AAAAATAGAACCACTTATGGG;SOR=1.169;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=90;TCF=25;TCR=65;TR=54;WE=70906123;WS=70906105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,58:0.62:93
chr2	70915134	rs2074820	C	G	1022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.047;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=2;PP=909;ReadPosRankSum=-1.013;SC=CCTGGGCCCACTTTCCAGGAG;SOR=3.091;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=33;WE=70915142;WS=70915124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,34:0.69:49
chr2	70915320	rs7340254	T	A	2432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.16;ReadPosRankSum=-1.941;SOR=0.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,63:0.68:93
chr2	70915323	rs7340145	C	T	2411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.10;ReadPosRankSum=-1.100;SOR=1.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,58:0.65:89
chr2	70915347	rs7340146	C	T	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=38;PP=948;ReadPosRankSum=0.203;SC=TCAACTTCCACAACCAATCCC;SOR=1.051;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=64;TCF=5;TCR=59;TR=41;WE=70915355;WS=70915337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,42:0.65:65
chr2	70917768	rs12691192	C	T	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.441;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=453;ReadPosRankSum=0.535;SC=TTGGGGTACACAGCAAAATCT;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=19;WE=70917776;WS=70917758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr2	70917812	rs10084293	C	T	1123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=8.755;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.54;ReadPosRankSum=2.087;SOR=5.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,42:0.95:44
chr2	70933636	rs2287096	T	C	1944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.849;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=60;PP=1568;ReadPosRankSum=-1.011;SC=TACACGTTTCTCAGAGCACAG;SOR=1.826;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=88;TCF=9;TCR=79;TR=65;WE=70933644;WS=70933626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,67:0.72:93
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chr2	71012734	rs7566476	C	G	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.308;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=36;PP=998;ReadPosRankSum=-0.988;SC=TGATTCAGAACTGTTGTTACT;SOR=0.486;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=65;TCF=13;TCR=52;TR=46;WE=71012742;WS=71012724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,46:0.71:65
chr2	71047410	rs35637981	C	G	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=1;PP=343;SC=TGTGCAGAGCCGGGATTCCAA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=71047418;WS=71047400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	71058226	rs2080390	C	T	1466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=18;PP=1076;SC=TGAAAAGAAACGTTTTGTCAC;SOR=1.067;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=26;TCR=18;TR=44;WE=71058234;WS=71058216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	71061108	rs17662453	G	A	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=37;PP=1533;ReadPosRankSum=-0.779;SC=TCAGCAACTGGACATTGGTCT;SOR=0.507;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=59;WE=71061116;WS=71061098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,61:0.98:62
chr2	71062833	rs11450450	G	GC	4551.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=59;PP=2957;SC=GATGTGGCTTGCTCGGGGCCA;SOR=0.760;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=110;TCF=44;TCR=66;TR=103;WE=71062841;WS=71062823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr2	71127794	rs2234495	C	A	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.463;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=103;ReadPosRankSum=-0.191;SC=CCCCGCGCGCCGGGCGGAGTC;SOR=0.760;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=6;WE=71127802;WS=71127784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr2	71162930	rs55655347	A	G	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.299;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=44;ReadPosRankSum=0.516;SC=TTTACTGTCAACCTAGAGGAG;SOR=0.120;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=5;WE=71162938;WS=71162920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr2	71162996	rs11685700	A	G	1643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=7;PP=1375;SC=AAGGCTGAGCAGCTCTCTCCA;SOR=3.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=50;TCR=7;TR=57;WE=71163004;WS=71162986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	71163086	rs11681642	T	C	3226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=42;PP=2488;SC=GACTGCTCCATGGCCATGGAG;SOR=1.158;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=63;TCR=42;TR=105;WE=71163094;WS=71163076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr2	71163220	rs35768563	C	T	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.17;ReadPosRankSum=0.492;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,50:0.68:74
chr2	71163225	rs759219	C	T	2680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.01;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	71163277	rs34965400	G	A	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=388;ReadPosRankSum=-0.972;SC=CCCGGGCCCCGCTTCTTGCCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=19;WE=71163285;WS=71163267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,19:0.86:22
chr2	71170525	.	TGGG	T	520.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.70;ReadPosRankSum=-0.160;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr2	71170528	.	GG	CA	1217	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=12;NR=1;PP=1217;QD=97.7282980663;SC=TGTGTGGTGGGGGCGGACTCT;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=13;WE=71170538;WS=71170522;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,13:0.57:23
chr2	71170530	.	GC	G	1222	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.4;NF=13;NR=1;PP=1222;QD=90.7879214193;SC=TGTGGTGGGGGCGGACTCTGA;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=14;WE=71170538;WS=71170522;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,14:0.61:23
chr2	71170531	.	C	CAG	675.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.03;ReadPosRankSum=-2.118;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr2	71175511	rs35598289	G	GAA	2751.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.304;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=20;PP=2354;ReadPosRankSum=0.307;SC=TAGGACTACAGAAAATGATCA;SOR=1.811;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=98;TCF=57;TCR=41;TR=61;WE=71175519;WS=71175501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,75:0.66:113
chr2	71175552	rs34723947	T	TG	2746.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.580;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.913;NF=32;NR=47;PP=2729;ReadPosRankSum=-0.645;SC=CTGATTTCTTTGGGGCACACT;SOR=0.407;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=129;TCF=51;TCR=78;TR=79;WE=71175560;WS=71175542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,99:0.71:139
chr2	71185391	rs967063	A	C	2462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-7.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.615;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=56;PP=1875;ReadPosRankSum=-0.946;SC=GAGCACAGAAAGTGCCCAGAA;SOR=0.625;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=67;TCR=85;TR=100;WE=71185399;WS=71185381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,100:0.64:157
chr2	71186382	rs17006573	G	A	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=571;ReadPosRankSum=0.153;SC=CAACACTGCCGTCAGCACTCC;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=24;WE=71186390;WS=71186372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr2	71190384	rs2072462	C	T	3699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.531;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=82;PP=2953;ReadPosRankSum=-0.991;SC=GGGCGGGCCGCGTGGAGGGTC;SOR=1.003;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=233;TCF=107;TCR=126;TR=143;WE=71190392;WS=71190374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,142:0.61:231
chr2	71190545	rs2072463	G	A	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.375;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=893;ReadPosRankSum=0.280;SC=GTGCAGCAGCGCTTTTCCTCC;SOR=0.155;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=50;TCF=16;TCR=34;TR=39;WE=71190553;WS=71190535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,43:0.78:55
chr2	71191777	rs2270263	C	T	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.130;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=873;ReadPosRankSum=1.044;SC=AATTCCTTTCCGAACGGGGTC;SOR=1.646;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=55;TCF=19;TCR=36;TR=37;WE=71191785;WS=71191769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,36:0.64:56
chr2	71205976	rs1115049	A	G	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.853;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=328;ReadPosRankSum=0.198;SC=TCCCGGCTGCAGGGAGCGAGA;SOR=1.371;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=17;WE=71205984;WS=71205966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
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chr2	71305456	rs6713	C	T	6618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=128;PP=2965;SC=AGGTTTTCTTCTGGCGCTGAC;SOR=1.363;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=75;TCR=128;TR=203;WE=71305464;WS=71305446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr2	71336978	rs146624706	TCA	T	79.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.80;ReadPosRankSum=-0.521;SOR=0.297;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,4:0.19:21
chr2	71337203	rs115175255	C	T	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.653;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=314;ReadPosRankSum=1.305;SC=ACTTAGACTGCGGATCTTCTT;SOR=1.189;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=83;TCF=25;TCR=58;TR=22;WE=71337211;WS=71337193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,23:0.27:86
chr2	71351487	rs11541017	G	A	2672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.977;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=63;PP=2023;ReadPosRankSum=0.077;SC=AAGAGGGACCGCTTCACTTAC;SOR=1.020;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=154;TCF=58;TCR=96;TR=97;WE=71351495;WS=71351477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,102:0.64:159
chr2	71357195	rs11126319	C	A	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.578;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=522;ReadPosRankSum=0.160;SC=GAACGCGCCCCCGGGGGAGGA;SOR=0.354;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=90;TCF=69;TCR=21;TR=32;WE=71357203;WS=71357185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,33:0.37:89
chr2	71357417	rs2012479	C	A	2067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=55;PP=1613;ReadPosRankSum=0.601;SC=GAGGGCGGGGCGGGAGGCAGA;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=30;TCR=80;TR=75;WE=71357425;WS=71357407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,77:0.69:112
chr2	71357634	rs1813348	C	T	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=4;PP=177;ReadPosRankSum=-0.699;SC=TGCGAAAGCGCTCGCGCTGCC;SOR=0.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=9;WE=71357642;WS=71357624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr2	71360060	rs138723053	C	A	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.714;NF=27;NR=1;PP=471;ReadPosRankSum=0.043;SC=AAGTTCACTTCTTTAACAAAA;SOR=0.675;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=83;TCF=79;TCR=4;TR=28;WE=71360068;WS=71360050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,27:0.32:84
chr2	71360100	rs72905506	G	A	1280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.877;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.714;NF=45;NR=7;PP=1069;ReadPosRankSum=0.725;SC=AAATATTAGAGAATGGTAGGA;SOR=0.995;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=153;TCF=128;TCR=25;TR=52;WE=71360108;WS=71360090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,53:0.33:161
chr2	71360144	rs10199088	A	C	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.779;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.720;NF=54;NR=25;PP=1449;ReadPosRankSum=0.159;SC=CTTGTGATAGAAAATTTTGAT;SOR=1.069;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=233;TCF=147;TCR=86;TR=79;WE=71360152;WS=71360134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,83:0.34:247
chr2	71360399	rs76328738	A	G	1802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.199;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=41;PP=1364;ReadPosRankSum=-0.393;SC=AGAGCTGAAAACTCAAGCAAA;SOR=1.020;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=187;TCF=89;TCR=98;TR=71;WE=71360407;WS=71360389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,73:0.38:194
chr2	71360625	rs1813160	G	T	1066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.127;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.145;NF=19;NR=30;PP=905;ReadPosRankSum=0.394;SC=ATAATGATGAGGAGGAGGAAG;SOR=0.907;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=158;TCF=66;TCR=92;TR=49;WE=71360633;WS=71360615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,50:0.29:172
chr2	71360723	rs1813159	A	G	4411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=18;NR=87;PP=2755;SC=TTTTGAGAGAAGAGAGAGCAC;SOR=3.196;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=18;TCR=88;TR=105;WE=71360743;WS=71360713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr2	71360735	rs138856662	T	TTCC	3959.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=58;PP=2971;SC=AGAGAGCACTTTCCTCCTCAA;SOR=5.023;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=87;TCF=3;TCR=84;TR=60;WE=71360743;WS=71360713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr2	71361332	rs9941620	T	G	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=27;PP=573;ReadPosRankSum=0.266;SC=TAGCAAGTTCTATTCTCTAAT;SOR=0.495;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=65;TCF=5;TCR=60;TR=30;WE=71361340;WS=71361322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,29:0.45:65
chr2	71365509	rs357757	C	T	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=111;ReadPosRankSum=0.175;SC=AGAACAGAATCGTAGAACAGT;SOR=0.892;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=6;WE=71365517;WS=71365499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr2	71367166	rs72905526	T	C	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=309;ReadPosRankSum=0.061;SC=TTCAGTAGTATCCAGGAAAGA;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=16;WE=71367174;WS=71367156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr2	71367221	rs72905527	G	A	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=81;ReadPosRankSum=0.046;SC=ATCCTTTCTCGTGAGTCTTGC;SOR=0.770;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=6;WE=71367229;WS=71367211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr2	71375037	rs80193384	A	G	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=447;ReadPosRankSum=-1.284;SC=AGTATTTTATATATTATACTT;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=42;TCR=1;TR=20;WE=71375045;WS=71375027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr2	71376687	rs72905552	C	T	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=294;ReadPosRankSum=0.934;SC=AGCCCACCTGCGGGATAGAGA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=2;TCR=52;TR=17;WE=71376695;WS=71376677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
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chr2	71417065	rs357777	G	T	4369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=106;PP=2965;SC=GGTCTCGTGAGGGAATAAACC;SOR=2.653;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=26;TCR=106;TR=132;WE=71417073;WS=71417055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
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chr2	71620818	rs6741436	C	T	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.430;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=32;PP=900;ReadPosRankSum=-0.585;SC=GCTCTCGCTTCCCCTGCAACC;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=69;TCF=16;TCR=53;TR=41;WE=71620826;WS=71620808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,43:0.62:69
chr2	71627539	rs3771371	C	T	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.298;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=386;ReadPosRankSum=0.046;SC=TACTGTTTAACCTATTGTGGA;SOR=0.141;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=19;WE=71627547;WS=71627529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr2	71633275	rs3732233	T	C	1824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.213;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=29;PP=1417;ReadPosRankSum=1.901;SC=TAGATACAATTTATGATCGAT;SOR=0.218;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=83;TCF=49;TCR=34;TR=64;WE=71633283;WS=71633265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,65:0.77:84
chr2	71633389	rs6714975	C	T	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.773;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=26;PP=600;ReadPosRankSum=0.000;SC=GTAATAGAAACAAGGTAACAA;SOR=1.312;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=28;WE=71633397;WS=71633379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,30:0.61:49
chr2	71635931	rs12466025	G	T	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=512;ReadPosRankSum=-0.718;SC=GACCTTATATGTGGTGTCCTT;SOR=0.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=22;WE=71635939;WS=71635921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr2	71636036	rs12474072	A	G	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.687;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr2	71645828	rs4852783	G	A	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.239;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=27;PP=680;ReadPosRankSum=0.694;SC=GAATTTTATTGCTGTATTTTA;SOR=0.941;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=32;WE=71645836;WS=71645818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,36:0.62:58
chr2	71645890	rs4852784	G	C	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=298;ReadPosRankSum=-1.201;SC=TTTATTTTGTGTACATATGGG;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=13;WE=71645898;WS=71645880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr2	71645946	rs4438512	G	A	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=85;ReadPosRankSum=-1.383;SC=TAGGAGTTTCGTTTGTTGCTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=71645954;WS=71645936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr2	71651939	rs12613800	T	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=8.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.95;ReadPosRankSum=-1.477;SOR=0.111;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,12:0.20:59
chr2	71654175	rs1804020	G	A	1795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FS=2.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.39;ReadPosRankSum=0.435;SOR=0.517;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:197,84:0.30:281
chr2	71661855	rs35526551	C	CA	1416.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=2.168;QD=6.88;ReadPosRankSum=0.024;SOR=0.755;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:144,62:0.30:206
chr2	71661949	rs1398	G	A	2333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.388;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQ=60.03;MQRankSum=1.471;NF=43;NR=59;PP=1683;ReadPosRankSum=-1.437;SC=TGGGGGAAAGGAAAGAATTCA;SOR=0.592;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=333;TCF=140;TCR=193;TR=102;WE=71661957;WS=71661939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:236,110:0.32:346
chr2	71708810	rs34707417	T	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.108;NF=3;NR=0;PP=30;ReadPosRankSum=0.566;SC=AATTTCTGGATCTGTGGTCTT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=3;WE=71708818;WS=71708800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr2	71708825	rs71402983	T	TATCC	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.887;NF=4;NR=0;PP=110;ReadPosRankSum=0.135;SC=GGTCTTCATCTATCCATCCAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=71708833;WS=71708815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr2	71708852	.	C	T	68	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=29;MQ=58.91;NF=6;NR=0;PP=68;QD=17.1285354245;SC=ATCCATCCATCCATCCATGCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=6;WE=71708869;WS=71708842;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr2	71708852	.	C	CCATCCATCCATCCATCCATT	193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-1.735;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.471;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr2	71708918	rs35628632	C	T	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=304;ReadPosRankSum=0.737;SC=TGAATGCCTACTCAGTGCCCT;SOR=0.598;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=42;TCR=20;TR=21;WE=71708926;WS=71708908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,21:0.34:62
chr2	71709120	rs12470028	G	A	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=197;ReadPosRankSum=0.708;SC=CCAGAGGGGGGTGCTCCATGG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=11;WE=71709128;WS=71709110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr2	71738987	rs34603128	C	T	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=332;ReadPosRankSum=-0.111;SC=GAGCTGTGCCCCTGTTCCCGC;SOR=0.495;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=61;TCF=10;TCR=51;TR=21;WE=71738995;WS=71738977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,23:0.37:63
chr2	71742736	rs61104194	C	T	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.099;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=30;PP=894;ReadPosRankSum=0.484;SC=CTGCTCTTTCCTCCTTCTGGC;SOR=1.082;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=157;TCF=73;TCR=84;TR=50;WE=71742744;WS=71742726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,51:0.32:158
chr2	71743276	rs115184725	C	T	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.924;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=833;ReadPosRankSum=-1.744;SC=GATCAGCAGGCACTGATATGT;SOR=0.318;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=71;TCF=51;TCR=20;TR=45;WE=71743284;WS=71743266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,45:0.66:68
chr2	71744258	rs11688242	T	C	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=542;ReadPosRankSum=-0.519;SC=GCTCCAGAGATCCTGTGTTTC;SOR=0.788;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=27;WE=71744266;WS=71744248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr2	71747235	rs11675897	A	G	2707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=15;PP=2160;SC=TAATGGAATCATATAATGCAC;SOR=3.033;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=91;TCF=75;TCR=16;TR=90;WE=71747243;WS=71747225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
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chr2	71747851	rs12713755	T	C	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=13;NR=1;PP=351;SC=CCATCCTGGGTTCCCGGATGT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=71747859;WS=71747841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr2	71753487	rs35982795	C	T	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.334;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=211;ReadPosRankSum=1.316;SC=GTGCGTGGGGCGCGCCCTTGG;SOR=0.061;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=61;TCF=5;TCR=56;TR=17;WE=71753495;WS=71753477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,17:0.27:63
chr2	71755380	rs4852800	A	G	2034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=5;PP=1720;SC=TCAGGGTTTTAGAGGAGAGAC;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=54;TCR=5;TR=59;WE=71755388;WS=71755370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	71762232	rs4852801	C	T	4666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.968;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=117;PP=2962;ReadPosRankSum=1.339;SC=GAGCCTCCTGCCCCCAGCAAA;SOR=0.872;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=231;TCF=66;TCR=165;TR=162;WE=71762240;WS=71762222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,166:0.71:234
chr2	71762309	rs115823472	CA	TG	2912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=54;PP=2944;ReadPosRankSum=0.938;SC=AGCATCCTGCCAGTATCCCAG;SOR=0.731;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=96;TCF=17;TCR=79;TR=67;WE=71762318;WS=71762299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,73:0.75:97
chr2	71766487	rs7609409	G	A	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=462;ReadPosRankSum=0.760;SC=TAAGGCCTCTGTTGCCCATTT;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=21;WE=71766495;WS=71766477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr2	71776345	rs736096	C	T	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=1.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.53;ReadPosRankSum=-0.248;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr2	71776345	.	CA	TG	518	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=22;NR=4;PP=518;QD=21.9795336485;SC=GGCCTCGGGCCACATCTGTTT;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=56;TCF=51;TCR=5;TR=26;WE=71776354;WS=71776335;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr2	71776346	rs934061	A	G	2202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=5;PP=487;SC=GCCTCGGGCCACATCTGTTTC;SOR=4.103;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=58;TCF=53;TCR=5;TR=52;WE=71776354;WS=71776335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	71780215	rs2303596	T	C	4873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.956;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=93;PP=2965;ReadPosRankSum=0.470;SC=ATGTGGATGATGCCATCCAGT;SOR=0.168;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=170;TCF=75;TCR=95;TR=167;WE=71780223;WS=71780205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,176:0.99:178
chr2	71780821	rs2303597	T	C	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=259;SC=GTGTGGTCCCTTTCCCAGCTC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=71780829;WS=71780813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	71781161	rs5832058	GAC	G	220.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=175;ReadPosRankSum=0.634;SC=TGCACACACTGACACACGGCT;SOR=0.142;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=6;WE=71781170;WS=71781151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr2	71795152	rs2288355	A	T	5239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.509;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=86;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.061;SC=TTGGGCTCTCAGTGGATGAGA;SOR=0.637;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=247;TCF=134;TCR=113;TR=183;WE=71795160;WS=71795142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,191:0.73:262
chr2	71796865	rs10205023	C	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=202;ReadPosRankSum=0.083;SC=GGCTGACATACGCAGGGGTGC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=9;WE=71796873;WS=71796855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr2	71797176	rs10183967	A	C	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.727;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=31;ReadPosRankSum=0.893;SC=ACCTCCGGAGACTTCATGCTT;SOR=1.296;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=69;TCF=22;TCR=47;TR=42;WE=71797184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,42:0.61:69
chr2	71797712	rs3764971	G	A	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.836;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=496;ReadPosRankSum=0.099;SC=ATGAGTGACCGGTTCCCCCTC;SOR=0.209;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=91;TCF=79;TCR=12;TR=31;WE=71797720;WS=71797702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,32:0.34:93
chr2	71801334	.	C	CAGGCGG	1146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=0.000;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=2.432;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.431;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,29:0.26:113
chr2	71817571	rs720541	A	T	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=436;ReadPosRankSum=-1.821;SC=CGTCAGGTGCAGCAAACTCTT;SOR=0.521;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=76;TCF=3;TCR=73;TR=24;WE=71817579;WS=71817561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,27:0.35:77
chr2	71828423	rs2303604	A	T	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=1;PP=457;SC=AACCCGAATAAGTAGACTGAA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=71828431;WS=71828413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	71829821	rs1529408	G	T	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=8;PP=893;SC=CGCCTAGTGCGCCTTGATACT;SOR=2.432;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=34;WE=71829829;WS=71829811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	71838597	rs2303606	C	A	2438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-6.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.772;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=56;PP=1853;ReadPosRankSum=-0.990;SC=GTGCTTAGATCCTGGCATGGG;SOR=1.131;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=122;TCF=46;TCR=76;TR=86;WE=71838605;WS=71838587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,90:0.71:127
chr2	71847943	rs12995778	C	A	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=80;SC=AAATGGACACCCCTAGGTTAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=71847951;WS=71847933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	71871039	rs84181	A	G	1480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=17;PP=1130;SC=AACTCTGAAGAATGCTGCTTG;SOR=1.298;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=46;WE=71871047;WS=71871029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	71871236	rs84182	A	G	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=21;PP=625;SC=GTGTGTGCGTACTGGGCAGTG;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=71871244;WS=71871226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	71891361	rs2303599	C	T	1582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=8;PP=1332;SC=TTGGGTGCCCCGTGTTGGCTG;SOR=3.171;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=49;WE=71891369;WS=71891351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	71901286	rs2559081	C	T	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=0;PP=602;SC=TCTCTCTAACCTTGCTTCCTT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=71901294;WS=71901276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	71906171	rs1863812	T	C	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=5;PP=997;SC=GGCCAAAAACTACCTCTCTGT;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=38;WE=71906179;WS=71906161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
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chr2	71907930	rs7558412	G	T	197.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.62;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=95;SC=AGTGGAAGTAGGGGTGGCAGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=71907938;WS=71907924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	71909822	rs2559082	C	T	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=2.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.46;ReadPosRankSum=-1.384;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,19:0.23:83
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chr2	72707874	rs653220	A	G	1078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.236;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=34;PP=869;ReadPosRankSum=-0.013;SC=TAATAATCTGAACAAGCTAGA;SOR=3.223;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=46;TCF=3;TCR=43;TR=35;WE=72707882;WS=72707864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,36:0.75:48
chr2	72742083	rs57089571	GAC	G	423.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=1.226;QD=10.09;ReadPosRankSum=-0.148;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr2	73151231	rs1561247	C	T	1460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=3;PP=1271;SC=CTCTCGAGTGCGGGGAGGTGT;SOR=4.935;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=48;TCR=3;TR=51;WE=73151239;WS=73151221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	73195837	rs10565763	TTTCC	T	523.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=401;ReadPosRankSum=-0.742;SC=TGGTCTCCTTTTTCCTTCCTT;SOR=0.126;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=9;WE=73195848;WS=73195827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr2	73215562	rs1370383	T	C	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=182;ReadPosRankSum=-0.522;SC=TGGAGGAACATCAGAGAGTGA;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=9;WE=73215570;WS=73215552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr2	73226090	rs12233055	G	A	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.564;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=14;PP=1269;ReadPosRankSum=-0.243;SC=CAATGGAGACGGCGCTGATGA;SOR=1.292;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=96;TCF=72;TCR=24;TR=61;WE=73226098;WS=73226080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,64:0.64:100
chr2	73226259	rs732180	A	G	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=409;ReadPosRankSum=-1.764;SC=GAAAGTGGGTAGAAGGAAGAG;SOR=2.935;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=18;WE=73226267;WS=73226249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr2	73226282	rs732179	T	C	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.164;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=309;ReadPosRankSum=0.466;SC=CCCTCAGGACTCAAAGGGATC;SOR=2.948;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=15;WE=73226290;WS=73226272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr2	73268663	rs62147736	A	G	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.781;NF=12;NR=2;PP=329;ReadPosRankSum=0.424;SC=TACTAAAAATACAAACATTAG;SOR=0.420;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=14;WE=73268671;WS=73268653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr2	73268929	rs111373797	T	C	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=245;ReadPosRankSum=0.263;SC=CATCCCAGGCTCAAGTGATCC;SOR=3.014;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=10;WE=73268937;WS=73268919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr2	73315986	rs373810830	G	A	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.060;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=500;ReadPosRankSum=0.135;SC=TCCCCAGGGCGGCGGCCCTGT;SOR=0.442;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=75;TCF=27;TCR=48;TR=29;WE=73315994;WS=73315976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,29:0.38:77
chr2	73339430	rs4143146	T	G	2238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=60;NR=19;PP=1745;SC=AGCCCCGCCCTGTTAGGCCTT;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=60;TCR=19;TR=79;WE=73339438;WS=73339420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr2	73339708	rs1864488	G	A	6879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=103;PP=2965;SC=GCCACTCGGGGCAGCCGTGCG;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=216;TCF=113;TCR=103;TR=216;WE=73339716;WS=73339698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr2	73450139	rs17008885	A	T	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.903;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=1041;ReadPosRankSum=1.106;SC=TGTAATGAGCACTCATCTCTT;SOR=0.953;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=165;TCF=91;TCR=74;TR=55;WE=73450147;WS=73450129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,55:0.32:170
chr2	73471193	rs11289471	GT	G	455.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=3.605;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.316;SOR=0.567;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,38:0.38:100
chr2	73491683	rs4852916	G	A	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=239;ReadPosRankSum=0.999;SC=TGAGCGTGGAGGGTCAAGGCT;SOR=0.126;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=12;WE=73491691;WS=73491673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr2	73492614	rs526106	A	T	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.621;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=43;PP=1476;ReadPosRankSum=-1.594;SC=GGGGGCTGGGACCGCTCTGAG;SOR=0.944;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=111;TCF=40;TCR=71;TR=65;WE=73492622;WS=73492604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,65:0.59:111
chr2	73519874	rs116522000	C	T	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=26;PP=631;ReadPosRankSum=-0.979;SC=CCACTTGCGCCGCAGCTGTTC;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=27;WE=73519882;WS=73519864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,28:0.76:37
chr2	73650122	rs1881246	T	A	5489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=136;PP=2965;SC=TTTATTTGCATGTAACCTTTC;SOR=4.301;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=16;TCR=136;TR=152;WE=73650130;WS=73650112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr2	73675019	rs66492706	CT	C	789.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=623;SC=TCAAAGCTGGCTTTTTTTCCA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=73675027;WS=73675009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	73675227	rs34628045	T	TCTC	8332.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=90;NR=53;PP=2967;SC=GGCTGTAAGTTCTCTAGAAAC;SOR=1.703;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=104;TCR=62;TR=143;WE=73675235;WS=73675217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr2	73675669	rs2037814	T	G	3925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=70;NR=41;PP=2965;SC=CACTCACATGTAGAGGACCTC;SOR=1.453;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=71;TCR=41;TR=111;WE=73675677;WS=73675659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr2	73675844	rs7598901	C	T	7832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=140;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=0.534;SC=AACAAGAGTTCGCAGACAGTC;SOR=1.123;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=239;TCF=141;TCR=98;TR=237;WE=73675852;WS=73675834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,242:0.99:244
chr2	73718368	.	A	C	1374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.190;ClippingRankSum=0.000;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=4.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.08;ReadPosRankSum=0.925;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:163,63:0.28:226
chr2	73828310	rs1320374	T	C	2160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=9;PP=1789;SC=TTCTAAAAACTGTTTCCTGTA;SOR=3.393;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=58;TCR=9;TR=67;WE=73828318;WS=73828300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	73828538	rs1052161	G	A	5139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=103;PP=2965;SC=GACCTACTGAGGCCATTTGTG;SOR=1.687;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=49;TCR=103;TR=151;WE=73828546;WS=73828528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr2	73898118	rs7570683	C	T	1684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=2;PP=1424;SC=GTGACATTGACTGCAGGTAAT;SOR=5.670;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=49;TCR=2;TR=51;WE=73898126;WS=73898108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	73898359	rs4341964	G	A	1477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=44;PP=1286;SC=CTCAATCATAGTAAAGGACAT;SOR=6.229;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=46;WE=73898367;WS=73898349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	73899613	rs2421585	T	G	2600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=65;PP=2043;SC=CAAGAAGAATTCCCATGAAGG;SOR=3.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=12;TCR=65;TR=77;WE=73899621;WS=73899603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr2	73899955	rs6725284	G	T	3120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=85;NR=13;PP=2611;SC=GTTTGTTCCTGTGGAAAATGT;SOR=3.611;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=85;TCR=13;TR=98;WE=73899963;WS=73899945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr2	73900210	rs4637150	A	G	1485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=37;PP=1208;SC=TTAGCCCTACATGTAGGGAGA;SOR=2.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=47;WE=73900218;WS=73900200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	73900918	.	CTT	C	59.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=-0.000;QD=4.98;ReadPosRankSum=1.333;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr2	73927931	rs4852974	A	G	6744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.179;NF=144;NR=51;PP=2965;ReadPosRankSum=0.887;SC=CTGTAGCCCTAGTCCCGGGCA;SOR=1.007;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=145;TCR=51;TR=195;WE=73927939;WS=73927921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,198:0.99:199
chr2	73928098	rs2001490	C	G	12968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=410;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=165;NR=229;PP=2965;SC=TTCAGATTCACCCACCCAGAA;SOR=1.066;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=395;TCF=166;TCR=229;TR=394;WE=73928106;WS=73928088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,405:1.00:405
chr2	73928366	rs2012574	G	C	3676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=72;PP=2965;SC=GCCATCCCCCGGGAGAGCAAG;SOR=1.016;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=55;TCR=72;TR=126;WE=73928374;WS=73928356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr2	73956940	rs67805162	CT	C	41.15	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr2	73957124	rs7210	A	G	1593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=28;PP=1195;SC=ATAATGTCCCAATACTTTCTT;SOR=1.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=48;WE=73957132;WS=73957114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	73957227	rs13003035	T	A	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=14;PP=399;SC=TATACAAACATGTGTAAGTGA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=73957235;WS=73957217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	73993436	rs34279043	CA	C	55	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.78;QD=13.75;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	73994074	rs2567599	G	A	2848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=70;PP=2319;SC=ACAAAAAGCAGATCTTTCCAG;SOR=3.690;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=10;TCR=71;TR=80;WE=73994082;WS=73994064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	74000701	rs2116367	C	T	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=13;PP=536;SC=AAAGATGAGCCAGTTCAGTTC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=20;WE=74000709;WS=74000691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	74007136	rs2272051	T	C	3966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=67;PP=2965;SC=CAATGCCAAGTCGGCCAAAAG;SOR=1.071;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=48;TCR=67;TR=115;WE=74007144;WS=74007126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr2	74007345	rs3813228	A	G	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=23;PP=695;SC=GCCAGAGGCCAGTAGCACAGG;SOR=3.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=74007353;WS=74007335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	74071769	rs138606897	G	C	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=565;ReadPosRankSum=-1.120;SC=GGCTCTTTAGGGGGATAGAGA;SOR=1.352;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=23;WE=74071777;WS=74071759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr2	74128361	rs1653258	T	G	4260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.81;SOR=4.525;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr2	74128369	rs1632564	G	A	4729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.23;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr2	74128391	rs1721241	G	C	4418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=85;NR=46;PP=2965;SC=CTCTTCTCCCGCAAATCCCAA;SOR=1.542;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=131;TCF=85;TCR=46;TR=131;WE=74128399;WS=74128381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr2	74128433	rs1050146	C	T	5137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=80;PP=2965;SC=CTCAGCCACACACACCATGTG;SOR=0.717;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=75;TCR=80;TR=155;WE=74128441;WS=74128423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr2	74129664	rs1653256	A	G	11053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=206;NR=163;PP=2965;ReadPosRankSum=1.853;SC=ATCACCCATCATCATGACCCT;SOR=0.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=371;TCF=207;TCR=164;TR=369;WE=74129672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,382:0.99:384
chr2	74129712	rs1721243	C	G	10584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.888;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=133;NR=187;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.294;SC=AACTCTCCCTCTAAAATGCTT;SOR=0.200;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=322;TCF=133;TCR=189;TR=320;WE=74129720;WS=74129702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,331:0.99:333
chr2	74129895	rs1721244	G	A	3182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=79;PP=2576;SC=CTAAACACAGGTCAGCTCATG;SOR=3.352;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=15;TCR=79;TR=94;WE=74129903;WS=74129885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr2	74135380	rs756127	G	A	1762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.173;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=11;PP=1324;ReadPosRankSum=1.738;SC=ATTGTCAGGAGATAGACCCTG;SOR=2.359;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=54;TCF=42;TCR=12;TR=53;WE=74135388;WS=74135370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,57:0.98:58
chr2	74135797	rs702461	T	C	1713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.818;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=5;PP=1431;ReadPosRankSum=0.643;SC=TTGTCTCCACTAGATCTGGCA;SOR=4.215;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=53;TCF=47;TCR=6;TR=51;WE=74135805;WS=74135787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,53:0.96:55
chr2	74135898	rs756128	A	G	5063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.556;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=65;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.829;SC=CCAACAGGGAAAAGATGACCC;SOR=0.638;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=157;TCF=90;TCR=67;TR=155;WE=74135906;WS=74135888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,160:0.99:161
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chr2	74140789	rs891698	T	C	6506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.123;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=132;PP=2965;ReadPosRankSum=0.168;SC=CAGCCCCTTTTCTGATTCTGA;SOR=1.499;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=70;TCR=134;TR=200;WE=74140797;WS=74140779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,210:0.98:214
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chr2	74185876	rs4777	A	T	6857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=103;NR=108;PP=2965;SC=AATACCATGAAGTTCAGGCTG;SOR=0.740;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=211;TCF=103;TCR=108;TR=211;WE=74185884;WS=74185866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr2	74300569	rs202066361	T	TC	200.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=251;ReadPosRankSum=-0.825;SC=CATGTGGGTTTCCTGTTTTCT;SOR=0.245;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=9;WE=74300577;WS=74300559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr2	74362090	rs828879	A	G	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=21;PP=604;SC=AGTCTGGAATATCTGCCTGTG;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=74362098;WS=74362080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	74374884	rs1667605	G	A	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=4;PP=132;ReadPosRankSum=-1.146;SC=GACAGCCGCCGGCCCCGCGGT;SOR=0.418;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=9;WE=74374892;WS=74374874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr2	74383630	rs11540640	G	A	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.824;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=541;ReadPosRankSum=-0.041;SC=GTCTATAACAGATAGCAATGA;SOR=0.871;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=106;TCF=71;TCR=35;TR=33;WE=74383638;WS=74383620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,34:0.30:114
chr2	74383911	rs828852	G	A	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.04;SOR=4.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	74383911	.	GT	AC,AT	298	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=0,1;NR=4,17;PP=40,298;QD=23.3669687156;SC=ACATTTTAAAGTAGGCATTTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=4,18;WE=74383920;WS=74383901;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.22:18
chr2	74383912	rs56259334	T	C	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.94;ReadPosRankSum=0.670;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr2	74394034	rs56873314	G	C	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=162;ReadPosRankSum=-1.144;SC=CAATAAAACTGAATCACCTTC;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=10;WE=74394042;WS=74394024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr2	74405867	rs79791015	T	G	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.51;ReadPosRankSum=-0.248;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,12:0.19:62
chr2	74405952	rs2272240	T	C	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=196;ReadPosRankSum=-1.267;SC=GCTGCGAGCCTTTGCAAACCT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=11;WE=74405960;WS=74405942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr2	74425932	rs3821321	G	A	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.555;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=127;ReadPosRankSum=-1.018;SC=CGAGGGGCACGCCGGGCCCCC;SOR=1.148;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=10;WE=74425940;WS=74425922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,11:0.24:45
chr2	74448655	rs7587117	T	C	1826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.882;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=54;PP=1267;ReadPosRankSum=0.826;SC=AAATGTCAGATGTGGAGCAGG;SOR=1.220;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=119;TCF=38;TCR=81;TR=75;WE=74448663;WS=74448645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,79:0.62:127
chr2	74448672	rs1020485	C	A	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.539;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=548;ReadPosRankSum=1.189;SC=CAGGTTTGAGCACCATATTTC;SOR=0.142;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=99;TCF=19;TCR=80;TR=32;WE=74448680;WS=74448662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,36:0.34:106
chr2	74450125	rs6745054	T	C	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=5.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.61;ReadPosRankSum=1.045;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,20:0.38:52
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chr2	74482892	rs7602215	T	C	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.613;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=312;ReadPosRankSum=0.366;SC=CAGGTTTCAATGGCTCTCACC;SOR=0.351;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=56;TCF=49;TCR=7;TR=19;WE=74482900;WS=74482882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,18:0.31:59
chr2	74486869	rs10181732	C	A	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.068;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=29;PP=725;ReadPosRankSum=-0.179;SC=TGTTCATAACCAAAGCAAACT;SOR=0.388;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=101;TCF=29;TCR=72;TR=44;WE=74486877;WS=74486859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,45:0.43:104
chr2	74489318	rs55651232	G	A	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.868;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=326;ReadPosRankSum=-1.421;SC=GTGGAGTGGTGTAGACTCGGG;SOR=0.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=90;TCF=57;TCR=33;TR=28;WE=74489326;WS=74489308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,28:0.30:92
chr2	74531832	rs12991424	G	C	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.922;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=37;PP=889;ReadPosRankSum=1.358;SC=CAAAAGACAGGGGAGGCAGGG;SOR=1.309;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=73;TCF=20;TCR=53;TR=49;WE=74531840;WS=74531822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,49:0.68:72
chr2	74595716	rs34598987	G	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=253;ReadPosRankSum=0.457;SC=TATATTAATCGGTGACTTTGC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=12;WE=74595724;WS=74595706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr2	74669136	rs3732294	C	A	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=113;ReadPosRankSum=1.408;SC=CTTCCACCCCCGCCAAAGGCC;SOR=0.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=7;WE=74669144;WS=74669126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
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chr2	74720002	rs4853026	C	G	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=4;PP=826;SC=GGCATGGGCTCTCCTGCTTAA;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=74720010;WS=74719995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr2	75061873	rs663504	C	G	3301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=81;PP=2608;SC=CTCCCTACTCCGGGCCTGGGA;SOR=2.948;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=18;TCR=82;TR=99;WE=75061881;WS=75061863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr2	75099694	rs28363003	G	A	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=45;PP=1025;ReadPosRankSum=0.754;SC=TGTGTATGTCGATGGGGGGGC;SOR=0.509;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=67;TCF=2;TCR=65;TR=47;WE=75099702;WS=75099684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,45:0.73:62
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chr2	75113572	rs2306806	G	A	4989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.753;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=90;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.392;SC=CTTGGGTGTGGAGGGGTTGGT;SOR=0.778;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=157;TCF=67;TCR=90;TR=155;WE=75113580;WS=75113562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,158:0.99:159
chr2	75113657	rs2229626	C	T	2717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=43;PP=2320;SC=AGATGCGCAACGTGGAACTGG;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=42;TCR=43;TR=85;WE=75113665;WS=75113647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	75113789	rs2229627	C	G	5057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=69;PP=2965;SC=CACTCAACCCCGGCAAGCAGA;SOR=1.083;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=170;TCF=101;TCR=69;TR=170;WE=75113797;WS=75113779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr2	75115108	rs10194657	A	G	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=13;PP=1237;SC=AGCGTGGACTACTCTTCCGAG;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=48;WE=75115116;WS=75115098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	75116627	rs4853069	C	T	3507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=9.008;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=91;PP=2927;ReadPosRankSum=0.815;SC=ATCCCAGCCCCCCCTGCCTAC;SOR=2.596;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=118;TCF=26;TCR=92;TR=115;WE=75116635;WS=75116617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,113:0.97:116
chr2	75185856	rs12366	G	T	3032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=10;PP=2529;ReadPosRankSum=0.356;SC=GAGGAGGAGGGACCTGCTGGG;SOR=1.918;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=105;TCF=94;TCR=11;TR=102;WE=75185864;WS=75185846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,105:0.98:107
chr2	75187573	rs3771799	G	A	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=13;PP=1057;SC=ATCCCTAAATGTCAGGCTTGC;SOR=1.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=42;WE=75187581;WS=75187563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	75187793	rs3821312	A	T	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=445;SC=AATTTTAGCTACCTAGCCTCA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=75187801;WS=75187783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	75425728	rs6715729	A	G	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.976;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=19;PP=1073;ReadPosRankSum=-0.694;SC=CGGCGATGGGAAAGAAGTTGT;SOR=0.422;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=85;TCF=56;TCR=29;TR=50;WE=75425736;WS=75425718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,53:0.58:92
chr2	75744918	rs2286995	T	C	2851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.222;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=18;PP=2231;ReadPosRankSum=-0.313;SC=ACAGTAGCCCTGGGCCACTTC;SOR=1.364;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=165;TCF=128;TCR=37;TR=103;WE=75744926;WS=75744908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,105:0.61:171
chr2	75745081	rs2286994	T	C	2858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.243;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=75;PP=2291;ReadPosRankSum=-0.693;SC=GATTACGTAGTGTGTCTTTAC;SOR=0.566;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=184;TCF=65;TCR=119;TR=117;WE=75745089;WS=75745071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,116:0.62:186
chr2	75873733	rs2286238	T	C	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.260;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=204;ReadPosRankSum=-0.025;SC=CTTTCTAGGCTGGGAGAACAC;SOR=0.042;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=12;WE=75873741;WS=75873723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
chr2	75874015	.	C	A	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.964;ClippingRankSum=0.000;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=30;PP=670;ReadPosRankSum=0.530;SC=TCTGCTCCCCCCGCCGGCCTC;SOR=0.695;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=98;TCF=20;TCR=78;TR=37;WE=75874023;WS=75874005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,41:0.41:101
chr2	75874390	rs2286239	G	C	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.510;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=110;ReadPosRankSum=-0.046;SC=GGGTCGGTGCGCGCGTGAGCG;SOR=1.148;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=13;WE=75874398;WS=75874380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,12:0.23:52
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chr2	75881828	rs6759555	T	C	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.072;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=4;PP=741;ReadPosRankSum=0.965;SC=AACGTGGACTTAGATTGTAAG;SOR=0.322;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=118;TCF=109;TCR=9;TR=40;WE=75881836;WS=75881818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,40:0.34:116
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chr2	75919296	rs111967112	T	C	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=26.89;ReadPosRankSum=-0.179;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
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chr2	75928300	rs6547019	G	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=151;ReadPosRankSum=-0.721;SC=ATACACATGGGATAAAAAATG;SOR=0.446;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=10;WE=75928308;WS=75928290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr2	75929238	rs3088180	C	A	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=70;ReadPosRankSum=1.098;SC=AAAATGTGAGCCAGCATATTA;SOR=0.321;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=5;WE=75929246;WS=75929233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr2	75933830	rs6728499	T	A	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.006;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=83;ReadPosRankSum=1.416;SC=AATGGAATTATTAATTGAAAT;SOR=0.045;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=6;WE=75933838;WS=75933820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr2	77748595	rs7571330	T	C	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.863;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=343;ReadPosRankSum=2.105;SC=GTGTTGTGCATTTATAGATTA;SOR=1.103;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=57;TCF=53;TCR=4;TR=20;WE=77748612;WS=77748585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,21:0.34:61
chr2	79253028	rs3816371	G	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=-0.149;SC=GTACTGGGAGGTCTCAGGGAT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=6;WE=79253036;WS=79253018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr2	79254065	rs431912	C	T	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FS=37.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQRankSum=-11.776;QD=3.88;ReadPosRankSum=-1.288;SOR=4.131;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:181,48:0.21:229
chr2	79254101	rs396461	T	G	1962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FS=11.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQRankSum=-9.544;QD=6.48;ReadPosRankSum=1.338;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:218,85:0.28:303
chr2	79254261	rs452267	T	C	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=8.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=-2.014;QD=5.57;ReadPosRankSum=0.801;SOR=1.789;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,50:0.25:201
chr2	79255426	rs383969	G	C	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.444;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=103;ReadPosRankSum=-0.792;SC=TCAGCAGCCTGAGCTTGGCGT;SOR=0.138;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=9;WE=79255434;WS=79255416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,9:0.22:40
chr2	79312414	rs3739144	G	A	3524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=49;PP=2871;SC=TGAATCCTATGGTACAATGAG;SOR=0.846;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=59;TCR=49;TR=108;WE=79312422;WS=79312404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr2	79313815	rs2073445	G	T	1664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=10;PP=1344;SC=TGGGAAGTTTGGGACCAGTGG;SOR=2.701;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=48;WE=79313823;WS=79313805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	79314081	rs6738657	T	C	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=37;PP=1231;SC=AAGGAGATAATTAAGAAAGAA;SOR=3.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=42;WE=79314102;WS=79314071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	79314094	rs6723688	G	T	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=35;PP=1073;SC=AGAAAGAATCGCAGGGCAAGG;SOR=4.977;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=37;WE=79314102;WS=79314071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	79348129	.	GAA	G,GA	1016.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.29;MQRankSum=0.347;QD=17.53;ReadPosRankSum=0.091;SOR=0.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:5,13,40:0.22,0.69:58
chr2	79349372	rs283891	C	G	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=473;SC=GTTTACAGATCCTCTAATGTC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=79349380;WS=79349362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	79350347	rs12228	A	G	5428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=115;NR=44;PP=2965;SC=ACTAGAGGCAACTGGAAAATA;SOR=2.026;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=159;TCF=115;TCR=44;TR=159;WE=79350355;WS=79350337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr2	79385758	rs80188986	A	C	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=11.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQRankSum=-4.444;QD=3.87;ReadPosRankSum=0.358;SOR=2.153;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,23:0.21:111
chr2	79385786	rs76653007	T	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=5.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=-6.925;QD=0.89;ReadPosRankSum=-1.946;SOR=1.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,9:0.10:92
chr2	79385787	rs77686105	G	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=5.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQRankSum=-7.347;QD=0.90;ReadPosRankSum=-1.660;SOR=1.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,8:0.09:91
chr2	79422965	rs1434199	C	G	2253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=28;PP=1729;SC=ACATATCACTCAATGAAAGTT;SOR=1.002;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=67;WE=79422973;WS=79422955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	79750282	rs72921161	A	G	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=494;ReadPosRankSum=-0.379;SC=GTTTTTGTGTAACATTGCATT;SOR=0.280;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=46;TCR=4;TR=24;WE=79750290;WS=79750272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr2	79750543	rs10205858	C	T	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=432;SC=TCCACACTGGCTCAAAAACAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=79750551;WS=79750533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr2	80529956	rs6733871	T	C	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=4.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.89;ReadPosRankSum=-2.134;SOR=1.222;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,36:0.23:154
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chr2	80801524	rs2276661	T	C	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=376;ReadPosRankSum=-1.141;SC=TTATTTATTTTGTAATTACTG;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=21;WE=80801532;WS=80801514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr2	84518438	rs1968722	T	C	1938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=42;PP=1524;SC=TTTTTTCCAGTCAGCAGCCTC;SOR=1.942;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=58;WE=84518446;WS=84518428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr2	84650707	rs2832	A	G	1894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=1;PP=1558;SC=TGGTGAAAACATCTTAATTCA;SOR=7.024;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=69;TCF=68;TCR=1;TR=68;WE=84650715;WS=84650697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	84676163	rs10202632	C	A	1089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=27;PP=895;SC=TTTACACTTACACAAAATCTA;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=33;WE=84676171;WS=84676153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	84755996	rs35980296	A	ATT,ATTT	1749.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.50;MQRankSum=0.000;QD=37.23;ReadPosRankSum=-0.738;SOR=2.259;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,32,14:0.68,0.30:47
chr2	84756049	rs4832089	G	A	3272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=29;PP=2665;SC=CTATGTTGAGGTGTTCTCTCC;SOR=1.819;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=103;TCF=74;TCR=29;TR=102;WE=84756057;WS=84756039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	84756341	rs4832090	T	G	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=710;SC=AAATAAGATTTCACATATTAT;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=84756349;WS=84756331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	84771480	rs1037863	G	A	3993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=60;PP=2965;SC=AGGAATATCTGTATCACAGAG;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=125;TCF=65;TCR=60;TR=125;WE=84771488;WS=84771470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr2	84771567	rs1542477	C	T	3015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=70;PP=2270;SC=ATGTCCGCTCCAAGAAAATCA;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=21;TCR=70;TR=91;WE=84771575;WS=84771557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr2	84777274	.	T	TA	292.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.249;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=162;ReadPosRankSum=0.980;SC=TTCTGTGCACTAAAAAAAAAA;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=11;WE=84777282;WS=84777264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr2	84784808	.	ATT	A	634.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=3.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.96;MQRankSum=-6.174;QD=14.43;ReadPosRankSum=-0.789;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr2	84784811	.	T	A	643.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=3.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.20;MQRankSum=-6.259;QD=14.31;ReadPosRankSum=-3.899;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr2	84784813	.	T	A	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.034;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=2.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.43;MQRankSum=-6.343;QD=13.99;ReadPosRankSum=-5.157;SOR=1.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr2	84800605	rs11891970	C	A	2652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=19;PP=2126;SC=CCATTCAGGCCGCATTTGAAT;SOR=2.133;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=58;TCR=19;TR=77;WE=84800613;WS=84800595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr2	84806553	rs6547569	G	A	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=1;PP=426;SC=TGCTTCCAATGCCTGCTGATT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=84806561;WS=84806543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	84822715	rs6761632	C	T	1739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=2;PP=1414;SC=TATTTCAAACCTGACTTTTAC;SOR=5.630;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=46;TCR=2;TR=48;WE=84822723;WS=84822705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	84834063	rs4276039	T	C	6766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=172;NR=29;PP=2965;SC=GCACAAATACTGGGTGCTGCA;SOR=3.184;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=173;TCR=30;TR=201;WE=84834071;WS=84834053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr2	84834237	rs4441485	T	C	4217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=135;PP=2965;SC=AGAATAATTTTGATTCATACA;SOR=5.079;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=10;TCR=135;TR=145;WE=84834245;WS=84834227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr2	84897361	rs12470102	T	A	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=236;SC=TCTCTTTTTATCCTGTTTCTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=84897369;WS=84897351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	84897517	rs1881095	A	G	1926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=23;PP=1479;SC=CTGTTTATCTAAATTTTTCTG;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=56;WE=84897525;WS=84897507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	84899360	rs4832106	G	A	1380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=0;PP=1229;SC=CCTGTAGGATGTCATTGAGTC;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=43;WE=84899368;WS=84899350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	84926756	rs74514752	G	A	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.111;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=702;ReadPosRankSum=0.048;SC=GTCAGAAGCTGCACATTGTTC;SOR=0.968;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=68;TCF=36;TCR=32;TR=38;WE=84926764;WS=84926746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
chr2	85108252	rs34667238	G	GC	483.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.55;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	85360828	.	GGGC	G	759.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.60;QD=42.21;SOR=3.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	85510777	rs7574856	A	G	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=385;ReadPosRankSum=1.699;SC=TTCTGCCATCACGCTGAAGCA;SOR=0.741;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=18;WE=85510785;WS=85510767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
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chr2	85549868	rs4240199	A	G	8882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.96;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
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chr2	85622059	rs6886	T	C	3154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=57;PP=2193;SC=GGGACTCTCATGGCCCTGAGG;SOR=0.951;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=48;TCR=57;TR=105;WE=85622067;WS=85622049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr2	85625222	rs6885	T	G	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.080;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=713;ReadPosRankSum=0.956;SC=CAAGGGCAAATGGGCTGGAGT;SOR=1.347;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=34;WE=85625230;WS=85625212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,37:0.76:49
chr2	85626479	rs34063934	G	C	1749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.015;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=48;PP=1437;ReadPosRankSum=-0.577;SC=AGAGAAGGGCGCACAGCTCTC;SOR=0.290;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=81;TCF=13;TCR=68;TR=59;WE=85626487;WS=85626469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,61:0.73:84
chr2	85626524	rs35666320	C	T	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=33;PP=753;ReadPosRankSum=-0.482;SC=TGAGGCAGGACAACCAGGAAG;SOR=0.551;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=54;TCF=1;TCR=53;TR=34;WE=85626532;WS=85626514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,36:0.64:56
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chr2	85628983	rs2229668	C	T	3122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=21.135;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=65;PP=2379;ReadPosRankSum=-0.118;SC=GAGAAGAAGACGCCCTGGTTC;SOR=0.842;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=175;TCF=86;TCR=89;TR=114;WE=85628991;WS=85628973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,118:0.66:180
chr2	85629330	rs75351468	C	A	2152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.438;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=50;PP=1714;ReadPosRankSum=0.991;SC=ACAAAAAGGACCTCTCACGTG;SOR=0.846;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=133;TCF=52;TCR=81;TR=80;WE=85629338;WS=85629320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,81:0.61:133
chr2	85769246	rs1078005	G	A	1872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=12;PP=1540;SC=ATTGTTTGGTGTGATGTTCTG;SOR=2.428;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=42;TCR=12;TR=54;WE=85769254;WS=85769236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	85781318	rs1254896	T	G	3254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=53;PP=2400;SC=CAAAGAACAGTCCAATGGATC;SOR=0.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=48;TCR=53;TR=101;WE=85781326;WS=85781308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	85788402	rs55829881	AC	A	132.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=22.12;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr2	85823167	rs35880310	TG	T	258.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.849;NF=1;NR=9;PP=299;ReadPosRankSum=-1.042;SC=TGGGCCGGCCTGGGGCAAGGG;SOR=0.527;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=10;WE=85823175;WS=85823157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
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chr2	85924729	rs11127	C	T	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=692;ReadPosRankSum=0.359;SC=TCTAGAGTTACCCAGGGCCTC;SOR=0.662;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=33;WE=85924737;WS=85924719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,32:0.70:46
chr2	85924899	rs1437742	T	A	305.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=10.792;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=277;ReadPosRankSum=-0.517;SC=ATCTCCCAGCTTGGGAAAGTG;SOR=4.972;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=12;WE=85924907;WS=85924889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,11:0.92:12
chr2	85925529	rs4240200	A	G	1822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=11;PP=1539;ReadPosRankSum=0.373;SC=AGGCCCCACAACCTGCTCAGG;SOR=0.801;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=97;TCF=79;TCR=18;TR=63;WE=85925537;WS=85925519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,65:0.64:101
chr2	85925667	rs4240201	G	A	4317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=71;PP=2962;ReadPosRankSum=0.850;SC=GCCCACAGCTGGCTGTTCTCT;SOR=0.709;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=216;TCF=115;TCR=101;TR=151;WE=85925688;WS=85925657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,156:0.69:226
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chr2	85925848	rs12845	C	G	1484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.428;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=46;PP=1164;ReadPosRankSum=-0.004;SC=TCCCCTCTCACGAGAATAAAG;SOR=1.426;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=90;TCF=16;TCR=74;TR=53;WE=85925856;WS=85925838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,55:0.59:93
chr2	85925928	rs76223661	C	G	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.638;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=193;ReadPosRankSum=1.361;SC=CAGTGGCATGCTGGGGTGAGC;SOR=0.061;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=12;WE=85925936;WS=85925918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr2	85981761	rs17851881	T	C	2332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=25;PP=1940;SC=GAGCCGGGTCTGCGTCCTCGC;SOR=1.547;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=48;TCR=25;TR=73;WE=85981769;WS=85981751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	86014345	rs736991	G	A	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.617;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=37;PP=1122;ReadPosRankSum=-1.130;SC=AAATGGGGTGGTGAAACCCCA;SOR=0.368;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=190;TCF=70;TCR=120;TR=66;WE=86014353;WS=86014335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,69:0.35:199
chr2	86107840	rs11127008	G	A	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=55;ReadPosRankSum=0.108;SC=CCAGCTACTCGGGAGGCTGAG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=4;WE=86107848;WS=86107830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr2	86107951	rs34410645	GA	G	247.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=5.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.08;ReadPosRankSum=0.109;SOR=2.088;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr2	86107987	rs11127009	T	C	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.601;HP=7;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=442;ReadPosRankSum=0.265;SC=TTTTAAAAAATAGACAAGTAG;SOR=0.797;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=45;TCF=23;TCR=22;TR=27;WE=86107995;WS=86107977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr2	86292656	rs311563	C	T	5874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=143;PP=2965;SC=AATCCCTAATCGCCTGCCTGG;SOR=3.088;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=30;TCR=143;TR=173;WE=86292664;WS=86292646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr2	86302103	rs3815840	A	G	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=116;SC=CAATCACCAGAATCCGAACAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=86302111;WS=86302093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	86304932	.	GCGCACACACACACACACA	GCA,G	90	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=50.63;NF=4,4;NR=0,0;PP=90,57;QD=27.0;SC=GCACGCGCGCGCGCACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4,4;WE=86304957;WS=86304923;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:4
chr2	86305123	rs2288117	T	C	2996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=18;PP=2429;SC=AGAAAAAAGGTCATAAAAAAC;SOR=2.520;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=85;TCF=67;TCR=18;TR=84;WE=86305131;WS=86305113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	86310110	rs2288118	C	T	1209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=5;PP=1003;SC=GCTACAATCACTACAACTTAA;SOR=3.500;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=86310118;WS=86310100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	86315741	rs2288120	C	T	2742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=19;PP=2152;SC=TGGCTGGAAACGTGATAGTCA;SOR=2.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=67;TCR=19;TR=86;WE=86315749;WS=86315731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	86316948	rs114299317	T	G	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=2;PP=821;ReadPosRankSum=0.053;SC=AACTCACATGTGCGCCCTGGG;SOR=0.960;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=46;TCF=43;TCR=3;TR=34;WE=86316956;WS=86316938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,35:0.73:48
chr2	86317037	rs4832242	G	C	4070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=48;PP=2965;SC=GAGGGATCGGGATTTTCTTCC;SOR=1.214;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=81;TCR=48;TR=129;WE=86317045;WS=86317027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr2	86332809	rs4832245	G	A	6193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=151;NR=44;PP=2965;SC=CACGCTACCCGACCAACTCCT;SOR=2.514;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=195;TCF=151;TCR=44;TR=195;WE=86332817;WS=86332799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr2	86334199	rs2367201	G	A	5608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=148;NR=17;PP=2965;SC=TATAAGTGGGGTATGTAATTT;SOR=4.187;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=148;TCR=17;TR=165;WE=86334207;WS=86334189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr2	86343476	rs4832022	C	A	835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=1;PP=677;SC=TTGGGTGACACAGCAAGACAC;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=86343484;WS=86343466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	86343494	rs4832248	G	A	1075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=1;PP=855;SC=CACCCTCTCTGCAAAAAATTT;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=86343502;WS=86343484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	86344095	rs3764949	G	T	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=241;SC=TTTTTGTGAGGGGGGAGAAAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=86344103;WS=86344086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	86344367	rs2059353	T	C	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=26;PP=762;SC=TTTCAGTAGCTATTTGAATAC;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=86344375;WS=86344357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	86346308	rs6715623	G	A	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=22;PP=601;SC=TATATTTTTAGTAGTTTATTT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=86346316;WS=86346298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	86352010	rs4832250	G	T	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=423;SC=ATAATGTATAGAAAGTACTTG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=86352018;WS=86352000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	86352785	rs4618054	G	A	2904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=45;PP=2346;SC=GAGATCCAGAGAGGAGAGTAG;SOR=0.979;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=35;TCR=45;TR=80;WE=86352793;WS=86352775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	86352825	rs6740228	C	T	2841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=41;SC=TGTGATTAGTCAAGGGACACA;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=42;TCR=41;TR=83;WE=86352833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr2	86359405	rs1559515	G	T	2958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=19;PP=2387;SC=GGCTGACAGGGTATCAGAGTG;SOR=2.511;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=73;TCR=19;TR=91;WE=86359413;WS=86359395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr2	86362204	rs7606421	C	T	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=16;PP=513;SC=CATTTGGCCACATAACACGTA;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=86362212;WS=86362194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	86363074	rs3770069	A	G	2931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=36;PP=2231;SC=TTTGTCCTGCATGTGGCAGGC;SOR=1.499;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=64;TCR=36;TR=100;WE=86363082;WS=86363064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr2	86363855	rs7558040	G	C	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=20;PP=588;SC=TATCTGTGTTGACGGATCATC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=86363863;WS=86363845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	86364706	rs56274257	TG	T	1454.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=38;PP=1550;SC=GGAGCAGCAATGGGTCTCACC;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=38;WE=86364714;WS=86364696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	86385728	rs1131071	C	T	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=548;ReadPosRankSum=-0.766;SC=TTCCTTTCCACCCAGGAAGGA;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=26;WE=86385736;WS=86385718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr2	86385886	rs6739460	A	G	1449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=34;PP=1141;SC=TGAACAAAAAATACCATAAAC;SOR=2.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=45;WE=86385894;WS=86385876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	86400824	rs1050301	G	A	1405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=12;PP=1103;SC=TGTGAGGCAGGCTGTTTAGAT;SOR=2.007;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=43;WE=86400832;WS=86400814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	86434569	rs9309634	T	C	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=16;PP=529;SC=CAAGACCAGCTTGGCCAACAT;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=86434577;WS=86434559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	86437551	rs7565645	T	G	1630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=8;PP=1255;SC=TGAAGATACCTGTTGTTTCAT;SOR=3.500;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=48;TCR=8;TR=56;WE=86437559;WS=86437541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	86440718	rs11944	T	C	2415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.393;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=34;PP=1791;ReadPosRankSum=-0.948;SC=GGTTTAAGGGTGGCCCTTCAC;SOR=0.540;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=80;TCF=45;TCR=35;TR=79;WE=86440726;WS=86440708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,82:0.99:83
chr2	86479035	rs12988844	A	G	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=578;SC=AGGGCACACTAGAGGGACTGA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=86479043;WS=86479025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	86479287	rs17438687	G	T	2327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=57;PP=1934;SC=TTGGCAGCTTGCCCAATCCTT;SOR=2.899;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=13;TCR=57;TR=70;WE=86479295;WS=86479277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	86481835	rs2276625	C	T	1962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=7;PP=1545;SC=TTGAAGATAGCGTGGGATGTA;SOR=4.244;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=55;TCR=7;TR=61;WE=86481843;WS=86481825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	86491245	rs1863056	C	T	4278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=94;PP=2965;SC=CAGGCCCCGGCGGCAGATACG;SOR=2.070;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=130;TCF=35;TCR=95;TR=129;WE=86491253;WS=86491235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr2	86509267	rs1863058	G	A	2012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=12;PP=1539;SC=CAGCCAACCCGCTCGAAAATA;SOR=2.494;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=60;TCF=46;TCR=14;TR=58;WE=86509275;WS=86509257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	86509388	rs1863059	T	G	2930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=60;PP=2291;SC=GAGACAAAAATAAATACGATT;SOR=1.828;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=27;TCR=60;TR=87;WE=86509396;WS=86509378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	86683642	rs2030259	A	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=1.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.14;ReadPosRankSum=-0.067;SOR=0.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,7:0.15:47
chr2	86691250	rs12714187	G	A	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.893;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=644;ReadPosRankSum=1.825;SC=GCTGTACTGCGGCAACTCCAC;SOR=0.573;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=90;TCF=67;TCR=23;TR=34;WE=86691258;WS=86691240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,35:0.38:92
chr2	86705565	rs2292887	T	C	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=390;ReadPosRankSum=-0.196;SC=TGGGATAGTTTTGTAGTAGAA;SOR=0.465;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=59;TCF=56;TCR=3;TR=20;WE=86705573;WS=86705555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,20:0.33:60
chr2	86707504	rs4832290	T	C	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=11.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.02;ReadPosRankSum=-1.023;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,7:0.16:44
chr2	86737649	rs966477	G	A	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=456;ReadPosRankSum=-0.697;SC=GGATGGAATAGAGAGAGACAG;SOR=0.607;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=104;TCF=38;TCR=66;TR=28;WE=86737657;WS=86737639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,29:0.27:109
chr2	86756209	rs1036940	C	G	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.98;ReadPosRankSum=-0.937;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr2	86756280	rs9284788	G	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.462;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=111;ReadPosRankSum=0.416;SC=CAAGGAACCCGTGTTGATAAT;SOR=0.140;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=12;WE=86756288;WS=86756270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr2	86850022	rs396354	T	C	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.423;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=443;ReadPosRankSum=-0.098;SC=TCCCTGGAGTTTCCTCTCTTT;SOR=1.197;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=59;TCF=18;TCR=41;TR=24;WE=86850030;WS=86850012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,24:0.39:61
chr2	86947783	rs76239019	C	T	334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=2;PP=278;SC=AGCGCCGCCGCCTCCGGCATG;SOR=2.670;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=86947791;WS=86947773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	86978895	rs4832311	G	T	151.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=129;SC=CTTCCTTTGGGACGCTATAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=86978903;WS=86978885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	86979093	rs10186663	G	A	1372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=1059;ReadPosRankSum=0.970;SC=TTCTCAATGAGGTGATGGTGG;SOR=0.259;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=44;WE=86979101;WS=86979083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,46:0.98:47
chr2	86992337	rs3840984	T	TAA	2831.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=42;PP=2619;SC=AGTCAGATGTTATTAATGTTT;SOR=2.694;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=57;TCF=11;TCR=46;TR=51;WE=86992345;WS=86992327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	86998659	rs56328788	CT	C	1514.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=3.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=1.245;QD=13.17;ReadPosRankSum=1.144;SOR=0.349;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,91:0.79:115
chr2	87000658	.	A	T	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.087;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.979;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=41;PP=1167;ReadPosRankSum=-1.296;SC=TGCTCCAGAAACTTTGCCAAC;SOR=1.727;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=71;TCF=12;TCR=59;TR=47;WE=87000666;WS=87000648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,48:0.66:73
chr2	87015633	rs71378806	T	TGA	5930.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=17;PP=2957;SC=GTGAGCAGGCTGAGTTCAAAA;SOR=3.365;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=119;TCF=102;TCR=17;TR=109;WE=87015641;WS=87015623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr2	87048702	rs13001400	T	G	2453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=1;PP=2167;SC=CCGAGTTCGGTTGTTGCTGTA;SOR=7.195;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=72;TCF=71;TCR=1;TR=72;WE=87048710;WS=87048692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	87069379	rs4322832	G	A	237.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=29.72;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	87069431	rs4514875	C	T	171.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.83;QD=28.64;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	87073743	rs4971887	A	G	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.93;QD=33.15;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	87085598	rs28727404	T	C	30.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=15.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	87088964	rs62146888	A	G	161.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=49.58;NF=3;NR=3;PP=114;SC=TGCGCGGCCAAGAGGAGCCAC;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=87088972;WS=87088954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	87092865	rs10195435	C	T	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.57;QD=31.47;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	87303060	rs79162177	C	G	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.950;NF=10;NR=8;PP=359;ReadPosRankSum=-0.217;SC=TGCAGGATCTCGTGCTTGAGA;SOR=0.665;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=30;TCF=16;TCR=14;TR=18;WE=87303068;WS=87303050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr2	87355925	rs77851313	G	A	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=17.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.95;MQRankSum=-5.308;QD=2.99;ReadPosRankSum=2.280;SOR=1.397;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,38:0.21:183
chr2	88272798	rs201020598	C	T	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.15;MQRankSum=1.413;QD=13.89;ReadPosRankSum=-0.191;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr2	88328208	rs12328217	G	A	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.684;NF=0;NR=11;PP=199;ReadPosRankSum=1.394;SC=TCGCCCTGTCGCCCAGACTAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=11;WE=88328216;WS=88328198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
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chr2	88407959	rs2970918	T	C	2568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.861;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=49;PP=1769;ReadPosRankSum=-1.361;SC=CCAACTGGCATGCTGGTAACA;SOR=0.432;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=152;TCF=72;TCR=80;TR=100;WE=88407967;WS=88407949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,106:0.65:163
chr2	88409719	rs139694354	A	AGAGTGTGTGT,AGAGTGTGT	356.74	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=1;PP=349;SC=TTGATGAATGAGTGTGTGTGT;SOR=4.615;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=88409727;WS=88409709;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:9
chr2	88410102	rs2289497	C	G	1687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=50;PP=1443;SC=GTGGGTCTCTCGGGAGACCCC;SOR=7.864;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=50;WE=88410110;WS=88410092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	88411605	rs2919865	A	T	3458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.449;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=27;PP=2716;ReadPosRankSum=1.227;SC=TGTTTGAAGAATTTCCTTTCT;SOR=0.571;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=189;TCF=150;TCR=39;TR=127;WE=88411613;WS=88411595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,130:0.67:194
chr2	88411793	rs2970888	C	A	4228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=124;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.826;SC=CTGCTAAGCCCCTGGTCATTT;SOR=4.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=128;TCF=3;TCR=125;TR=127;WE=88411801;WS=88411783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,133:0.99:134
chr2	88424066	rs2241883	T	C	1368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.709;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=23;PP=1061;ReadPosRankSum=0.083;SC=TTTTTGAAAGTTGTCACCAGT;SOR=0.754;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=80;TCF=42;TCR=38;TR=52;WE=88424074;WS=88424056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,52:0.67:78
chr2	88472791	rs4129190	G	A	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=206;ReadPosRankSum=0.959;SC=TTGGACAGAGGGACCCTGTGC;SOR=0.275;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=11;WE=88472799;WS=88472781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr2	88474370	rs2139100	A	G	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=475;ReadPosRankSum=1.981;SC=TTTGGGGCACAAACGCAGAAT;SOR=0.797;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=22;WE=88474378;WS=88474360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr2	88485392	rs1878810	G	C	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=197;ReadPosRankSum=1.005;SC=TGTCCTCCGGGTGCCACCTGC;SOR=0.275;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=11;WE=88485400;WS=88485382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr2	88748390	rs4972212	A	T	1539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.199;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=44;PP=1178;ReadPosRankSum=0.301;SC=GGACCTATTCAATGCCTGTGT;SOR=0.970;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=80;TCF=12;TCR=68;TR=51;WE=88748398;WS=88748380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,55:0.65:84
chr2	88751655	.	T	C	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.569;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.789;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=237;ReadPosRankSum=1.017;SC=CGGCTGGCCATGGACAGCCAG;SOR=0.070;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=57;TCF=6;TCR=51;TR=19;WE=88751663;WS=88751645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,20:0.34:59
chr2	88751751	rs11456039	A	AG	635.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=19;PP=829;SC=GAGCAGCCGAAGTGCCGGCGG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=88751759;WS=88751741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	88825315	rs368206812	GT	G	323.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=2.034;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=0.000;QD=6.35;ReadPosRankSum=2.074;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr2	88826005	rs148800605	C	T	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.153;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=502;ReadPosRankSum=-1.419;SC=TCCAGGGTCACGCCGCAAGAG;SOR=0.396;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=99;TCF=70;TCR=29;TR=32;WE=88826013;WS=88825995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,32:0.32:99
chr2	88826071	rs58882124	G	C	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.467;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=26;PP=817;ReadPosRankSum=0.542;SC=AATCCTCTCTGTTGCTTCATT;SOR=0.882;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=148;TCF=77;TCR=71;TR=44;WE=88826079;WS=88826061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,45:0.30:151
chr2	88861757	rs1800980	T	G	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=1;PP=770;ReadPosRankSum=0.066;SC=TTGTAAATGTTAGATTATTTT;SOR=0.859;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=32;WE=88861765;WS=88861747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,35:0.71:49
chr2	88870632	rs4972221	A	T	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=32;PP=923;SC=ATTATTTAAAAGACTACAAAG;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=88870640;WS=88870622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	88874891	rs1805165	C	A	5776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=120;PP=2965;SC=TCTTTTGTAGCGAAAGGATCC;SOR=1.908;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=49;TCR=120;TR=169;WE=88874899;WS=88874881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr2	88879131	rs1805164	T	C	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.683;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=36;PP=865;ReadPosRankSum=-0.028;SC=GTCCCAGGCATTGAATTGGCT;SOR=0.809;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=165;TCF=47;TCR=118;TR=49;WE=88879139;WS=88879121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,51:0.30:170
chr2	88895123	rs13045	T	C	5704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=86;PP=2965;SC=TTCACGGTCTTGGTCCCACTG;SOR=0.850;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=98;TCR=86;TR=184;WE=88895131;WS=88895113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr2	88895351	rs7571971	T	C	2824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=53;PP=2107;SC=CATGAAGCAGTGCAGTCCATC;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=43;TCR=53;TR=96;WE=88895359;WS=88895341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
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chr2	88997878	rs908277	C	T	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=134;ReadPosRankSum=1.119;SC=GGCACAGTACCTGTCTTGTAC;SOR=0.624;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=9;WE=88997886;WS=88997868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,8:0.21:38
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chr2	89185774	rs232191	G	A	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.586;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=66;ReadPosRankSum=0.105;SC=CAACATGCATGCTTCCTCTGT;SOR=0.061;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=7;WE=89185782;WS=89185764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr2	89196757	rs3843805	G	A	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.610;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=719;ReadPosRankSum=-0.434;SC=CATAAAATCTGTGCTGTCAAA;SOR=0.907;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=108;TCF=62;TCR=46;TR=41;WE=89196765;WS=89196747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,41:0.38:109
chr2	89196906	rs4588191	A	C	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=644;ReadPosRankSum=-0.362;SC=TCCCCTGCATATCCACAAAAA;SOR=0.643;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=104;TCF=51;TCR=53;TR=34;WE=89196914;WS=89196896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,34:0.31:110
chr2	89197190	rs55661410	C	T	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.789;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=29;PP=592;ReadPosRankSum=-2.074;SC=TCCTGGAATCCCACCTCGATT;SOR=0.814;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=116;TCF=32;TCR=84;TR=39;WE=89197198;WS=89197180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,40:0.33:122
chr2	89246951	rs10865492	C	T	1749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.556;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=35;PP=1301;ReadPosRankSum=1.029;SC=CTAAACTAGACGCCTTATAGA;SOR=0.865;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=258;TCF=132;TCR=126;TR=79;WE=89246959;WS=89246941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,80:0.31:259
chr2	89292182	rs59175543	A	G	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=23.192;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.662;NF=42;NR=28;PP=1271;ReadPosRankSum=-0.908;SC=GATGCAGAGAATGAGGATGGA;SOR=0.950;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=235;TCF=110;TCR=125;TR=70;WE=89292190;WS=89292172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,72:0.30:241
chr2	89292201	rs35262290	C	T	1582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.713;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.277;NF=45;NR=28;PP=1232;ReadPosRankSum=0.007;SC=GAGACTGGGTCATCCGGATGG;SOR=1.191;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=252;TCF=127;TCR=125;TR=73;WE=89292209;WS=89292191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,74:0.29:259
chr2	89292401	rs143871003	T	C	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=7.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.790;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-5.664;NF=1;NR=29;PP=560;ReadPosRankSum=0.821;SC=CCCTCATGTCTATGCTGTGTC;SOR=0.184;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=98;TCF=2;TCR=96;TR=30;WE=89292409;WS=89292391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,31:0.31:100
chr2	89309735	rs80322626	A	G	1830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.732;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-8.769;NF=36;NR=36;PP=1312;ReadPosRankSum=-0.973;SC=TGCAGACAGGAAGGATGGAGA;SOR=0.687;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=221;TCF=101;TCR=120;TR=72;WE=89309743;WS=89309725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,78:0.33:236
chr2	89309762	rs77800356	T	G	1915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.343;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.703;NF=41;NR=40;PP=1501;ReadPosRankSum=-0.111;SC=CAACTGGATGTCACATCTGGC;SOR=0.688;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=245;TCF=113;TCR=132;TR=81;WE=89309770;WS=89309752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,84:0.32:260
chr2	89512775	rs145409842	T	G	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.94;MQRankSum=1.055;QD=19.20;ReadPosRankSum=0.048;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr2	89513004	rs141893646	A	G	1504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-4.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.644;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.312;NF=51;NR=32;PP=1150;ReadPosRankSum=-0.783;SC=ATCCACTGCCACTGAACCGAG;SOR=0.816;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=279;TCF=166;TCR=113;TR=83;WE=89513012;WS=89512994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,81:0.30:271
chr2	89521584	rs370505542	G	C	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.41;MQRankSum=-2.227;QD=10.89;ReadPosRankSum=-1.817;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
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chr2	89544163	rs56876886	G	C	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.358;NF=12;NR=0;PP=168;ReadPosRankSum=0.029;SC=CTCTTACACAGATTCTGAGAC;SOR=0.124;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=12;WE=89544171;WS=89544153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr2	89544473	rs147079411	A	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.14;MQRankSum=0.091;QD=1.89;ReadPosRankSum=-0.029;SOR=1.236;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,5:0.17:29
chr2	89924052	.	A	AC	126.25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.99;MQRankSum=-0.180;QD=18.04;ReadPosRankSum=-1.465;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr2	89986921	rs424406	C	T	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=25.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.42;MQRankSum=-6.287;QD=1.65;ReadPosRankSum=-0.518;SOR=3.378;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,17:0.15:117
chr2	90008035	rs183334211	C	A	2525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.515;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.645;NF=63;NR=40;PP=1878;ReadPosRankSum=1.064;SC=GCTTTGCAATCAGGGGGTCCC;SOR=0.989;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=297;TCF=162;TCR=135;TR=103;WE=90008043;WS=90008025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,108:0.36:301
chr2	90008103	rs11685391	G	A	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-5.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.382;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.496;NF=25;NR=50;PP=1317;ReadPosRankSum=-1.401;SC=TCAGCAGCCTGCAGCCTGAAG;SOR=0.829;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=230;TCF=85;TCR=145;TR=75;WE=90008111;WS=90008093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,59:0.34:175
chr2	90024874	rs56726814	C	A	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-4.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.072;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.642;NF=9;NR=12;PP=287;ReadPosRankSum=-0.089;SC=GACCCCACTGCCTTCCATGTG;SOR=0.446;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=21;WE=90024882;WS=90024864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,21:0.35:60
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chr2	90061120	rs72930203	G	A	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.521;NF=0;NR=11;PP=188;ReadPosRankSum=-0.236;SC=CCAATACAATGAAGTCTGGCT;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=11;WE=90061128;WS=90061110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
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chr2	90249478	rs202170599	T	C	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=1.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQRankSum=-7.486;QD=3.16;ReadPosRankSum=0.311;SOR=0.276;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,17:0.13:130
chr2	90249506	rs117668633	T	C	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=1.254;QD=4.36;ReadPosRankSum=1.480;SOR=0.471;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,25:0.27:92
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chr2	91766609	rs56138505	G	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=437;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.55;MQRankSum=-1.764;QD=0.19;ReadPosRankSum=1.253;SOR=0.683;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:390,46:0.11:436
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chr2	91767199	rs2558010	A	C	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.510;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.324;NF=15;NR=0;PP=205;ReadPosRankSum=0.211;SC=AATTTGTGTCAGCTTATATTC;SOR=1.234;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=53;TCR=3;TR=15;WE=91767207;WS=91767189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,15:0.26:58
chr2	91767507	rs2580541	T	A	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=2.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQRankSum=0.017;QD=2.30;ReadPosRankSum=0.692;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,21:0.15:136
chr2	91809227	rs2536993	A	G	2256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-13.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.301;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-11.971;NF=135;NR=10;PP=2371;ReadPosRankSum=-0.614;SC=TGGGGCCTCCATGGTGGCTTG;SOR=0.078;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=327;TCF=312;TCR=15;TR=145;WE=91809235;WS=91809217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,112:0.38:295
chr2	91809324	rs2536994	C	T	3399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=12.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=768;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.308;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-21.292;NF=148;NR=151;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.706;SC=AGTATGACAACGGATTGGAGG;SOR=0.906;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=884;TCF=462;TCR=422;TR=299;WE=91809332;WS=91809314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:592,174:0.23:766
chr2	91809385	rs55812636	C	G	5491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=711;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.201;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-20.019;NF=69;NR=206;PP=2962;ReadPosRankSum=4.074;SC=CCTGGCCATGCCTTTTTCTAT;SOR=1.016;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=799;TCF=247;TCR=552;TR=275;WE=91809393;WS=91809375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:534,176:0.25:710
chr2	91809404	rs55918232	G	C	5230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=593;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.173;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-18.588;NF=61;NR=187;PP=2962;ReadPosRankSum=3.124;SC=ATTTTCTATGGAATGCACGCA;SOR=0.881;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=676;TCF=206;TCR=470;TR=248;WE=91809412;WS=91809394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:436,157:0.26:593
chr2	91809456	rs2191971	T	G	1684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FS=25.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.70;MQRankSum=-11.419;QD=6.04;ReadPosRankSum=-2.750;SOR=0.131;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:217,62:0.22:279
chr2	91809468	.	C	CTAA	2464.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DP=260;ExcessHet=3.0103;FS=23.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQRankSum=-11.199;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.274;SOR=0.138;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:193,66:0.25:259
chr2	91809470	rs2386154	G	A	2479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=9.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQRankSum=-9.875;QD=10.00;ReadPosRankSum=-0.777;SOR=0.278;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:179,69:0.28:248
chr2	91809472	.	G	GTGACTAACAA	2821.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.876;ClippingRankSum=0.000;DP=248;ExcessHet=3.0103;FS=7.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQRankSum=-9.593;QD=11.42;ReadPosRankSum=0.001;SOR=0.325;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:179,68:0.28:247
chr2	91960776	rs372330500	AG	A	106.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=57.16;NF=3;NR=2;PP=83;SC=GCCACTCTGGAGGGGGGGGGG;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=91960784;WS=91960766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	95537245	rs4854234	C	G	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=157;ReadPosRankSum=-0.801;SC=GGAGCTGCCCCGCTGACCGCA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=10;WE=95537253;WS=95537235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr2	95537572	rs4854235	C	T	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=817;ReadPosRankSum=-3.978;SC=GCGCAGCGCACGCAGCAAGAC;SOR=0.874;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=40;WE=95537580;WS=95537562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,40:0.70:57
chr2	95537622	rs11164112	A	G	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.693;NF=37;NR=11;PP=889;ReadPosRankSum=0.266;SC=GGACACGCACAGCTGGAAGTC;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=57;TCR=17;TR=48;WE=95537630;WS=95537612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,50:0.66:76
chr2	95539833	rs111469930	C	T	2273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.214;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=64;PP=1732;ReadPosRankSum=-0.721;SC=CTCATCCGTACTCCACCACCT;SOR=0.558;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=103;TCF=13;TCR=90;TR=74;WE=95539841;WS=95539823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,80:0.73:109
chr2	95775761	rs113259652	G	A	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.407;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=609;ReadPosRankSum=0.943;SC=CTGCTAAAGCGCCTTTCCACA;SOR=0.421;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=51;TCF=31;TCR=20;TR=31;WE=95775769;WS=95775751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr2	95830652	rs6719142	T	C	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.49;MQRankSum=0.117;QD=2.05;ReadPosRankSum=1.355;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,3:0.19:16
chr2	95830737	rs11395151	C	CA	1534.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=18;PP=1698;SC=TGTGTACCCACAAAAACTTAA;SOR=1.519;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=48;TCF=29;TCR=19;TR=44;WE=95830745;WS=95830727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	95846158	rs3112230	T	C	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=15;PP=452;SC=CAATAGCTTTTATTTTTTTCC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=95846166;WS=95846148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	95847040	rs10578519	TGCG	T	6492.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=65;NR=58;PP=2973;SC=GACAAAGGCTTGCGGCGGCGA;SOR=0.963;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=166;TCF=89;TCR=77;TR=123;WE=95847057;WS=95847030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr2	95944902	rs61086044	A	AC	778.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.47;NF=5;NR=18;PP=934;SC=GGTGCTGGGCACCGCAGGGTG;SOR=2.400;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=95944910;WS=95944892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	95945568	rs7585914	G	A	1436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=16;PP=1102;SC=CTTTCTTAGTGACACCCATGT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=49;WE=95945576;WS=95945558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	95945830	rs7586229	G	T	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=417;SC=TCCCGGTGTGGCTGCCAGTGT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=95945838;WS=95945820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	95947085	rs12992066	A	G	3621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=81;PP=2832;SC=CTGGTGTGCCAGAGCTGGGAG;SOR=2.001;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=31;TCR=81;TR=112;WE=95947093;WS=95947075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr2	95952177	rs7602232	C	G	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=7;PP=684;SC=GGCTGGGTGACGGGTAGATGG;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=25;WE=95952185;WS=95952167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	95963242	rs2248415	C	G	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.9887;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=22;NR=18;PP=615;SC=GGAGGGGGGTCGGGGGGAGGA;SOR=1.547;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=40;WE=95963250;WS=95963230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	96012907	rs7602807	C	G	2537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=59;PP=1909;SC=CCGCCTCCGCCGCAGACCAGT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=20;TCR=59;TR=79;WE=96012915;WS=96012897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr2	96048862	rs58372613	C	T	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=529;ReadPosRankSum=2.135;SC=GGAGGGAGCCCACCCGCCCAT;SOR=0.914;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=22;WE=96048870;WS=96048852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,23:0.82:28
chr2	96049917	.	TACACACACAC	T	150.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=-0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.150;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.502;NF=1;NR=5;PP=730;ReadPosRankSum=2.260;SC=AACAGATTGCTACACACACAC;SOR=0.074;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=6;WE=96049934;WS=96049907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr2	96076409	rs6577014	C	T	1684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=41;PP=1490;SC=AGTTCTGACCCCACTCACCAA;SOR=2.393;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=53;WE=96076417;WS=96076399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	96504594	rs11676926	C	T	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.122;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.130;NF=22;NR=44;PP=1156;ReadPosRankSum=0.264;SC=TTCGTTTGGGCTTTCTGGATC;SOR=1.332;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=200;TCF=81;TCR=119;TR=66;WE=96504602;WS=96504584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,69:0.34:202
chr2	96514492	rs150195180	C	T	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.844;NF=9;NR=1;PP=153;ReadPosRankSum=-1.733;SC=ACTCGGGAGGCTGAGGCAGGA;SOR=0.512;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=10;WE=96514500;WS=96514482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr2	96555522	rs12471925	C	A	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.251;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-9.094;NF=32;NR=5;PP=656;ReadPosRankSum=-0.630;SC=AACGAACATCCTATTAAATGT;SOR=1.880;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=124;TCF=102;TCR=22;TR=37;WE=96555530;WS=96555512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,35:0.28:123
chr2	96601296	rs145876416	A	ATGATTAAT	322.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.73;MQRankSum=-3.462;QD=7.02;ReadPosRankSum=2.291;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,8:0.17:46
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chr2	96601364	rs148485539	C	T	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.63;MQRankSum=-2.436;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.866;SOR=0.773;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr2	96604473	rs75003856	T	A	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.78;MQRankSum=-3.194;QD=2.30;ReadPosRankSum=-1.225;SOR=0.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,14:0.16:87
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chr2	96604591	rs62154561	A	G	6609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.784;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-11.907;NF=138;NR=126;PP=2962;ReadPosRankSum=3.121;SC=ACTGGAAGTTAGTGAATCCAT;SOR=0.638;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=420;TCF=219;TCR=201;TR=264;WE=96604599;WS=96604581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,220:0.58:378
chr2	96604606	rs80350011	C	A	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.25;MQRankSum=-5.225;QD=3.30;ReadPosRankSum=-0.903;SOR=0.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:297,80:0.21:377
chr2	96604632	rs62154562	A	T	3917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=4.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-11.191;NF=54;NR=141;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.948;SC=AAATGTGATCACTGTCTTTCA;SOR=0.677;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=316;TCF=85;TCR=231;TR=195;WE=96604640;WS=96604622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,147:0.54:272
chr2	96604675	rs75415330	T	C	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=2.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.56;MQRankSum=-3.965;QD=2.92;ReadPosRankSum=-0.598;SOR=1.196;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,27:0.17:161
chr2	96604679	rs62154563	C	T	1967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=11.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.17;MQRankSum=-7.472;QD=12.95;ReadPosRankSum=-1.006;SOR=3.168;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,65:0.43:152
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chr2	96610395	rs147285461	C	CA	153.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQRankSum=-7.104;QD=1.55;ReadPosRankSum=2.495;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,11:0.11:99
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chr2	96610413	rs74491979	C	T	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=1.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQRankSum=-6.112;QD=0.36;ReadPosRankSum=0.446;SOR=0.917;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,9:0.08:109
chr2	96610420	rs78473403	G	T	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=3.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQRankSum=-5.653;QD=0.57;ReadPosRankSum=-0.881;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,8:0.08:101
chr2	96610540	rs371461424	G	C	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=6.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQRankSum=-4.816;QD=1.27;ReadPosRankSum=1.926;SOR=0.018;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,3:0.12:25
chr2	96610544	rs375876591	G	T	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=6.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.61;MQRankSum=-4.602;QD=1.38;ReadPosRankSum=1.829;SOR=0.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,3:0.13:23
chr2	96610546	rs367956544	G	T	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=6.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.61;MQRankSum=-4.602;QD=1.64;ReadPosRankSum=1.920;SOR=0.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,3:0.13:23
chr2	96610552	rs11897663	G	C	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=7.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.13;MQRankSum=-2.831;QD=2.92;ReadPosRankSum=1.416;SOR=0.011;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,3:0.19:16
chr2	96610567	.	T	TAC	91.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.43;MQRankSum=-1.562;QD=7.64;ReadPosRankSum=-0.718;SOR=0.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
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chr2	96610805	rs371613132	AAGAAAG	A	435.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=9.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.37;MQRankSum=-8.570;QD=3.49;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=2.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,36:0.29:125
chr2	96610836	rs11893977	T	C	3227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=41.119;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-13.667;NF=127;NR=6;PP=2746;ReadPosRankSum=-1.343;SC=GTAGATAATATAATAGTCAGG;SOR=3.777;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=240;TCF=214;TCR=26;TR=133;WE=96610844;WS=96610826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,102:0.48:211
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chr2	96610921	rs62154594	T	G	8455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.305;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-9.044;NF=80;NR=169;PP=2962;ReadPosRankSum=0.677;SC=TTCTGAAATATTCTAGAAGAA;SOR=0.448;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=367;TCF=115;TCR=252;TR=249;WE=96610931;WS=96610911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,217:0.64:341
chr2	96610923	rs75080810	C	G	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FS=6.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.83;MQRankSum=-2.163;QD=1.63;ReadPosRankSum=0.724;SOR=0.351;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:284,54:0.16:338
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chr2	96610958	rs79852024	G	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.60;MQRankSum=-0.384;QD=1.26;ReadPosRankSum=-0.271;SOR=0.589;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:188,28:0.13:216
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chr2	96614212	rs4907288	A	G	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.043;NF=14;NR=1;PP=264;ReadPosRankSum=0.436;SC=GCTAAGTTTTAGAAGAAAATA;SOR=0.638;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=43;TCF=40;TCR=3;TR=15;WE=96614220;WS=96614202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr2	96616310	rs139114553	C	T	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.41;MQRankSum=-2.409;QD=8.77;ReadPosRankSum=-1.547;SOR=0.084;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr2	96616313	.	A	ATT	113.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.166;HP=1;HapScore=4;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.455;NF=7;NR=2;PP=352;ReadPosRankSum=-1.373;SC=AGAGTTGCCTAATTAGTAAAA;SOR=0.069;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=9;WE=96616321;WS=96616303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr2	96616348	rs62154609	C	G	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.31;MQRankSum=-4.892;QD=11.79;ReadPosRankSum=-2.192;SOR=0.206;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
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chr2	96616355	rs62154610	T	C	130.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.751;NF=10;NR=0;PP=81;ReadPosRankSum=-1.686;SC=TTTCTAAAGTTGTGTGAAGAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=42;TCR=1;TR=10;WE=96616370;WS=96616338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,7:0.18:39
chr2	96616378	rs62154611	C	T	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.895;HP=4;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-7.148;NF=31;NR=6;PP=832;ReadPosRankSum=0.647;SC=CATGACATGACAAATGTTAAG;SOR=0.091;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=74;TCF=66;TCR=8;TR=37;WE=96616386;WS=96616368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,31:0.46:68
chr2	96616442	rs74960926	C	A	1668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=4.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.89;MQRankSum=-8.841;QD=13.04;ReadPosRankSum=1.142;SOR=0.379;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,47:0.37:128
chr2	96616448	rs76503749	G	T	1643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=4.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.27;MQRankSum=-7.720;QD=13.05;ReadPosRankSum=0.275;SOR=0.366;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,45:0.36:126
chr2	96616485	rs78218362	C	G	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.307;HP=2;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.568;NF=23;NR=42;PP=1135;ReadPosRankSum=-3.105;SC=TAAAAAATCTCTGAAATCATA;SOR=1.996;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=161;TCF=73;TCR=88;TR=65;WE=96616493;WS=96616475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,36:0.31:116
chr2	96616501	.	C	CAA	741.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=38.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.23;MQRankSum=-4.049;QD=7.65;ReadPosRankSum=1.125;SOR=5.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,24:0.25:97
chr2	96616505	rs373114066	AGC	A	780.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=35.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.31;MQRankSum=-3.932;QD=8.22;ReadPosRankSum=1.656;SOR=5.253;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,23:0.24:95
chr2	96616532	rs112676430	T	G	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=12.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.50;MQRankSum=-3.464;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.738;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,20:0.29:70
chr2	96616571	rs146478446	C	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.77;MQRankSum=-2.849;QD=3.45;ReadPosRankSum=-0.403;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,7:0.16:44
chr2	96616576	rs143490798	T	C	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.31;MQRankSum=-3.075;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.757;SOR=0.904;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,7:0.16:43
chr2	96616580	rs201649771	A	G	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.82;MQRankSum=-3.105;QD=3.12;ReadPosRankSum=-0.760;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,6:0.15:39
chr2	96616597	rs114583836	A	G	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.42;MQRankSum=-2.784;QD=2.54;ReadPosRankSum=0.104;SOR=0.586;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,4:0.11:35
chr2	96616599	rs116630524	G	A	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.70;MQRankSum=-3.173;QD=2.61;ReadPosRankSum=-0.876;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,5:0.15:34
chr2	96616607	rs141967446	G	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.89;MQRankSum=-2.683;QD=4.11;ReadPosRankSum=-1.140;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
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chr2	96619799	rs145806545	A	C	3953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.060;HP=3;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-10.730;NF=20;NR=135;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.219;SC=TTCATTTCTTAAAAGAAAACA;SOR=0.263;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=253;TCF=27;TCR=226;TR=155;WE=96619807;WS=96619789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,133:0.58:228
chr2	96619831	rs76870447	T	C	2130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.43;MQRankSum=-9.760;QD=11.64;ReadPosRankSum=-1.024;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,78:0.43:183
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chr2	96619853	rs201388512	T	C	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.51;MQRankSum=1.287;QD=4.41;ReadPosRankSum=0.205;SOR=0.053;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,24:0.18:130
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chr2	96780716	rs2229169	T	G	5978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-8.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.411;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=143;NR=93;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.047;SC=GGCAGATGGCTCCCAGGCTGT;SOR=0.733;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=359;TCF=218;TCR=141;TR=236;WE=96780724;WS=96780706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,238:0.66:362
chr2	96780986	rs29000568	C	CTCCTCCTCT	5635.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.16;MQRankSum=3.680;QD=27.76;ReadPosRankSum=0.035;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,134:0.66:203
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chr2	96795714	rs749459	G	A	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.352;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=216;ReadPosRankSum=-0.341;SC=GGCTGAAGGCGAGCCTGGAAC;SOR=0.415;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=16;WE=96795722;WS=96795704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr2	96795857	rs749458	T	C	3061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=34;PP=2416;SC=GTTGCTGCTCTGAGACTTGAT;SOR=1.345;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=62;TCR=34;TR=96;WE=96795865;WS=96795847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr2	96795944	rs749457	A	G	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=1.134;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.99;ReadPosRankSum=2.490;SOR=0.957;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,22:0.25:88
chr2	96798510	rs1168966	G	A	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=182;ReadPosRankSum=-0.712;SC=AGATCCCTCCGGACATACAGA;SOR=0.476;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=14;WE=96798518;WS=96798500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,14:0.26:54
chr2	96858914	rs997548	A	G	5166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.087;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=58;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.038;SC=GAAATGGAGGAGCAGGATTAG;SOR=0.920;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=264;TCF=174;TCR=90;TR=177;WE=96858922;WS=96858904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,180:0.67:267
chr2	96859034	rs997547	A	G	6129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.587;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=0.931;SC=CATCCCTCTCAATCACCTCCA;SOR=0.355;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=334;TCF=159;TCR=175;TR=232;WE=96859042;WS=96859024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,237:0.69:343
chr2	96861159	rs2276650	C	G	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.200;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=572;ReadPosRankSum=-0.699;SC=CATTTCCCAACGTTGCTCTTT;SOR=0.993;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=50;TCF=34;TCR=16;TR=28;WE=96861167;WS=96861149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr2	96874590	rs6725867	TT	CC	7902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.436;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=97;PP=2944;ReadPosRankSum=0.600;SC=CGCACCCTACTTTTTCTCCGC;SOR=0.659;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=292;TCF=131;TCR=161;TR=178;WE=96874599;WS=96874580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,198:0.65:306
chr2	96919642	rs3852673	C	T	2445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.857;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=42;PP=1819;ReadPosRankSum=-1.839;SC=GCAGCTCCAGCGCCTGCTCCT;SOR=0.525;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=115;TCF=63;TCR=52;TR=90;WE=96919650;WS=96919632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,93:0.79:118
chr2	96919769	.	T	C	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.802;ClippingRankSum=0.000;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=5.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.10;ReadPosRankSum=0.786;SOR=0.972;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,36:0.22:161
chr2	96934504	rs62153033	T	C	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=389;ReadPosRankSum=0.159;SC=TAAGATGTGCTACAAGAGGGC;SOR=0.458;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=17;WE=96934512;WS=96934494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr2	96943473	rs3214063	T	C	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.246;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=24;PP=1063;ReadPosRankSum=-1.184;SC=AAAAGGAGTATAAAAGTGGGC;SOR=0.283;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=68;TCF=31;TCR=37;TR=48;WE=96943481;WS=96943463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,52:0.72:72
chr2	96944553	rs772175	G	A	1778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=35;PP=1326;ReadPosRankSum=-0.378;SC=TGACCCTGCAGGTTGTAGTAA;SOR=0.729;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=209;TCF=107;TCR=102;TR=73;WE=96944561;WS=96944543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,75:0.35:212
chr2	96950487	.	C	CT	58	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5020;HP=17;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=19;MQ=60.36;NF=2;NR=2;PP=58;QD=16.0;SC=GCAGCTTTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=4;WE=96950495;WS=96950477;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr2	96952833	rs3171927	A	G	1966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=44;PP=1521;ReadPosRankSum=-1.280;SC=GACAACTCCAACTTGGGAAAC;SOR=0.704;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=101;TCF=32;TCR=69;TR=64;WE=96952841;WS=96952823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,68:0.62:109
chr2	96955480	rs3214058	T	C	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.270;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=331;ReadPosRankSum=0.484;SC=GAAAAATTTTTTCCTGGGCCA;SOR=4.479;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=13;WE=96955488;WS=96955470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr2	96956315	rs772176	T	G	2124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=44;PP=1755;SC=TTGATGCAGGTATCTACATTA;SOR=1.758;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=64;WE=96956323;WS=96956305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	96962859	rs17479466	A	G	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.925;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=35;PP=927;ReadPosRankSum=0.618;SC=TCCTTGAGCAAAACGTTATTG;SOR=2.944;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=62;TCF=8;TCR=54;TR=37;WE=96962867;WS=96962849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,41:0.60:68
chr2	96966661	rs3731930	G	C	2286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.893;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=11;PP=1838;ReadPosRankSum=-0.021;SC=TAGAGAGCTTGTTTACACTAG;SOR=0.831;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=137;TCF=116;TCR=21;TR=80;WE=96966669;WS=96966651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,82:0.59:138
chr2	96991492	rs772174	A	G	5486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=121;NR=39;PP=2965;SC=CAGGGCTCCTAGAGAGGGCGG;SOR=2.376;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=160;TCF=121;TCR=39;TR=160;WE=96991500;WS=96991482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr2	96993757	rs2279105	C	T	5498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.497;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=0.827;SC=CTGCCCCTCACGGACTGGGCC;SOR=0.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=278;TCF=125;TCR=153;TR=202;WE=96993765;WS=96993747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,210:0.74:284
chr2	96993884	rs1048675	A	G	2590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=56;PP=2100;ReadPosRankSum=-0.596;SC=TGACCATCCCAATCCCTAAGA;SOR=0.655;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=59;TCR=88;TR=94;WE=96993892;WS=96993874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,95:0.64:149
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chr2	97026576	rs62153915	C	T	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=367;ReadPosRankSum=1.660;SC=AGCGTGTTGCCAGGAAATCAA;SOR=0.283;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=17;WE=97026584;WS=97026566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
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chr2	97326286	rs4907246	T	C	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=615;ReadPosRankSum=-0.652;SC=TTTTACCTTATTTTTTAATTT;SOR=0.883;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=26;WE=97326294;WS=97326276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr2	97351840	rs7599598	A	G	3532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=69;PP=2769;ReadPosRankSum=1.465;SC=CCGCCTCAACACCGTGCTCCC;SOR=0.462;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=115;TCF=45;TCR=70;TR=114;WE=97351848;WS=97351830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,117:0.99:118
chr2	97353725	rs868168	G	A	2123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.456;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=54;PP=1707;ReadPosRankSum=0.602;SC=GCAGGCACGCGGGGGTGGGGG;SOR=4.014;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=63;TCF=8;TCR=55;TR=61;WE=97353733;WS=97353715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,65:0.97:67
chr2	97360079	rs72809820	C	T	2455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=20;PP=1990;ReadPosRankSum=0.714;SC=GGGCCTCATGCTCCCTGCCCT;SOR=0.952;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=59;TCR=21;TR=76;WE=97360087;WS=97360069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,79:0.95:83
chr2	97400324	rs6727384	A	G	3787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.709;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=75;PP=2836;ReadPosRankSum=-1.050;SC=CCTCAAGCCCACATCAGCAAT;SOR=0.285;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=122;TCF=44;TCR=78;TR=119;WE=97400332;WS=97400314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,126:0.98:128
chr2	97403110	rs58361269	G	A	1599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=45;PP=1318;SC=CTCTCAACCAGGACCGGTGGC;SOR=7.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=45;WE=97403118;WS=97403100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	97463095	rs1318597	T	C	2236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=22;PP=1832;SC=CCCTCGGCCTTTGTGCCTCGG;SOR=1.503;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=39;TCR=22;TR=61;WE=97463103;WS=97463090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	97492479	rs2276654	G	A	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.968;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=136;ReadPosRankSum=-0.797;SC=CCTGGCCTCAGGAGGAAGGAG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=97492487;WS=97492469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr2	97493877	rs1320149	T	C	3838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.222;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=98;PP=2825;ReadPosRankSum=-1.313;SC=GTCTGAAGTTTGAGAATGGGG;SOR=0.857;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=240;TCF=88;TCR=152;TR=149;WE=97493885;WS=97493867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,157:0.61:259
chr2	97507727	rs1320146	T	C	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.137;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=123;ReadPosRankSum=-0.300;SC=GTGCCCACTCTGCCCCAAGCC;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=97507735;WS=97507717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
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chr2	97529360	rs59271006	T	A	2423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=13;PP=1986;SC=AGCAGCCAGATGGAGAGAGTG;SOR=3.056;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=77;TCF=64;TCR=13;TR=76;WE=97529368;WS=97529350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	97544016	rs62152871	G	A	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.632;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=74;ReadPosRankSum=0.109;SC=GCTCTCCCACGCTGGCTTCCC;SOR=0.105;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=6;WE=97544024;WS=97544006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr2	97544089	rs6750988	G	C	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=5;PP=940;SC=GCCAACCCCCGCCGCTTGGGG;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=97544097;WS=97544079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	97559759	rs11677797	G	A	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.897;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=450;ReadPosRankSum=-0.349;SC=ATGGCCTCATGAGGCCCAGGA;SOR=0.533;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=71;TCF=31;TCR=40;TR=27;WE=97559767;WS=97559749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,30:0.40:75
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chr2	97568453	rs11888101	A	G	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=1017;ReadPosRankSum=0.531;SC=GCCTGGGGGAAAAGCGACAGC;SOR=0.667;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=31;TCR=57;TR=41;WE=97568461;WS=97568443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,42:0.47:90
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chr2	97637905	rs6715329	T	C	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=4.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.282;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=941;ReadPosRankSum=-0.171;SC=CAGGTGCCTGTATCTTGGGCT;SOR=1.721;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=64;TCF=40;TCR=24;TR=41;WE=97637913;WS=97637895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,42:0.64:66
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chr2	97747978	rs1257094	C	T	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.98;QD=33.54;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
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chr2	97814956	rs4386368	G	A	1336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=2;PP=991;SC=GTGGACATACGTGTATAGACT;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=38;WE=97814964;WS=97814946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	97817469	rs62153866	T	A	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.202;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.557;NF=6;NR=1;PP=59;ReadPosRankSum=-2.017;SC=ATCTGTAGATTAGTAAATGGC;SOR=0.012;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=7;WE=97817477;WS=97817459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,4:0.19:21
chr2	97817511	rs62153867	T	C	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.634;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.828;NF=8;NR=1;PP=119;ReadPosRankSum=1.359;SC=ATATGAGTGATTTCAACGTCC;SOR=0.010;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=9;WE=97817519;WS=97817501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,5:0.17:29
chr2	97817564	rs33971912	C	CT	1796.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.88;QD=35.93;SOR=4.935;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	97818101	rs111932285	T	G	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.99;MQRankSum=-1.150;QD=3.53;ReadPosRankSum=-1.221;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,2:0.22:9
chr2	97818114	rs146739597	G	T	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.19;MQRankSum=-1.282;QD=3.18;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,2:0.20:10
chr2	97818161	rs74715701	C	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.93;MQRankSum=-3.573;QD=5.95;ReadPosRankSum=-0.488;SOR=0.245;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
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chr2	97818188	rs141129874	T	C	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=7.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.50;MQRankSum=-3.613;QD=5.43;ReadPosRankSum=-0.597;SOR=0.052;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,7:0.21:34
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chr2	97818197	rs200340181	G	T	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=11.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.85;MQRankSum=-3.049;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.942;SOR=0.013;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,6:0.17:35
chr2	97818236	rs112647905	A	C	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=21.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.45;MQRankSum=-2.569;QD=4.06;ReadPosRankSum=-0.734;SOR=0.008;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,8:0.19:43
chr2	97818260	.	GGC	G	78.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.053;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=22.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.74;MQRankSum=-2.676;QD=1.61;ReadPosRankSum=-0.199;SOR=2.206;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,6:0.12:49
chr2	97818264	.	G	GTT	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.768;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=18.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.72;MQRankSum=-2.647;QD=1.82;ReadPosRankSum=-0.640;SOR=2.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,6:0.13:47
chr2	97818348	rs58438329	A	G	1681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=37;PP=1307;SC=TTTGTTTAGTATTCTACTCTG;SOR=2.393;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=49;WE=97818356;WS=97818338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	97820321	.	T	TG	394	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=7;HapScore=1;MGOF=17;MMLQ=28;MQ=51.85;NF=7;NR=0;PP=394;QD=58.7142857143;SC=ACCATTTTTTTTGGAGGGGAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=7;WE=97820340;WS=97820311;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:23,7:0.23:30
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chr2	98354139	rs17488834	G	T	1717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.203;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=48;PP=1386;ReadPosRankSum=1.288;SC=GTAAGCCTCTGCCCCTGTGAT;SOR=0.934;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=286;TCF=140;TCR=146;TR=83;WE=98354147;WS=98354129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,81:0.28:286
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chr2	98355990	rs11678558	G	A	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=312;ReadPosRankSum=-0.184;SC=AGCCCTCCACGCCGGCTCTTC;SOR=0.465;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=16;WE=98355998;WS=98355980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr2	98376989	rs3214760	TA	T	281.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.501;NF=14;NR=0;PP=363;ReadPosRankSum=0.978;SC=CATTTATGGATAAAAAGGTGC;SOR=0.212;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=52;TCR=0;TR=14;WE=98376997;WS=98376984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,16:0.32:50
chr2	98377512	rs2044458	A	T	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.993;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=239;ReadPosRankSum=1.520;SC=GCTCAGCCTCATGTCACATGC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=12;WE=98377520;WS=98377502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr2	98382886	rs895438	G	A	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=6.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.660;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=404;ReadPosRankSum=-1.093;SC=TTGTTAATACGGTGCACTATG;SOR=1.078;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=82;TCF=68;TCR=14;TR=23;WE=98382894;WS=98382876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,23:0.28:83
chr2	98409046	rs12995673	G	A	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.771;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=592;ReadPosRankSum=0.433;SC=TTCAGGCTGCGGCTCCTGGGG;SOR=0.564;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=129;TCF=85;TCR=44;TR=36;WE=98409054;WS=98409036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,36:0.27:132
chr2	98409565	rs13032265	T	C	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=100;ReadPosRankSum=0.888;SC=AGGGAAAAAATAGCAAGAAAT;SOR=0.260;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=6;WE=98409573;WS=98409555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr2	98449796	rs6721250	C	T	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=2;PP=225;SC=AAAGAATATACAAATTAGGGG;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=98449804;WS=98449786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr2	98611994	rs2279824	G	T	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=4;PP=114;ReadPosRankSum=0.430;SC=GGTGCAGCGCGCCTAGGAGGC;SOR=0.758;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=9;WE=98612002;WS=98611984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr2	98795873	rs11419620	T	TG	4369.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=79;PP=2965;SC=ATTGGCATTGTGGTTATTCTT;SOR=1.769;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=111;TCF=25;TCR=86;TR=100;WE=98795881;WS=98795863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr2	98797744	rs4851890	C	T	290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=6;PP=230;SC=AGGCCTCCATCGGGTCAGAAG;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=98797752;WS=98797734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	98804314	rs1466156	G	A	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=0;PP=779;SC=ACTAACAAAGGAATGATTGAC;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=98804322;WS=98804304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr2	98833446	rs67163987	C	CCA	271.92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=71;ReadPosRankSum=1.593;SC=ATTGTAAGCACCCGCCCCGCA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=4;WE=98833457;WS=98833436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr2	98833449	rs62156666	G	C	280.96	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=255;ReadPosRankSum=1.534;SC=GTAAGCACCCGCCCCGCACCC;SOR=0.693;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=8;WE=98833457;WS=98833436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr2	98844575	rs7606220	A	G	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.586;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=494;ReadPosRankSum=-1.135;SC=AACATAGTGAACCTCTTGTCT;SOR=2.303;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=21;WE=98844583;WS=98844565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr2	98844674	rs7601049	C	G	2340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.471;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=22;PP=1759;ReadPosRankSum=0.570;SC=GAATGAAGATCTGACTCTTTT;SOR=0.955;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=121;TCF=84;TCR=37;TR=78;WE=98844682;WS=98844664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,85:0.65:131
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chr2	98862097	rs4851121	A	G	3295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=80;PP=2646;SC=TTTTTCTTAAATACATTAAGT;SOR=2.948;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=17;TCR=81;TR=97;WE=98862105;WS=98862087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
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chr2	98994414	rs937725	T	C	1843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=5;PP=1484;SC=AAACTATCAGTGAGTAATTTC;SOR=4.294;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=46;TCR=5;TR=51;WE=98994422;WS=98994404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
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chr2	99168953	rs1181562	T	C	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=0;PP=394;SC=TGGGTGATTATGGGATATGAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=99168961;WS=99168943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	99234586	rs373790267	A	AT	581.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQRankSum=0.881;QD=9.54;ReadPosRankSum=-0.352;SOR=1.077;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr2	99272802	rs11679648	G	A	2568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=19;PP=1944;ReadPosRankSum=-0.668;SC=GATTTTAAACGGCACATGCTC;SOR=0.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=107;TCR=29;TR=90;WE=99272810;WS=99272792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,94:0.67:140
chr2	99294712	.	A	AATATAT	185.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=26.53;ReadPosRankSum=1.668;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr2	99725223	rs6542864	A	G	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=758;SC=CAGTCTCATAAAACTCAAAGA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=99725231;WS=99725213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	99725479	rs11396964	A	AT	1899.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=43;PP=2065;SC=GGAATTTGAAATCTTCTTTGA;SOR=3.872;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=53;TCF=3;TCR=50;TR=45;WE=99725487;WS=99725469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	99726043	rs6733624	A	G	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=446;SC=AAAAAATTAGACCATTATTTC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=99726051;WS=99726033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	99743419	rs13008171	G	A	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=370;SC=AATGAGCTCTGAATTAGTAGT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=99743427;WS=99743416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	99766927	.	CT	C	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=1.905;QD=1.02;ReadPosRankSum=-0.041;SOR=0.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,8:0.23:35
chr2	99771533	rs2516834	C	T	1410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=36;PP=1224;SC=AGCGGAAACGCTTCAAACCGG;SOR=2.687;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=46;WE=99771541;WS=99771523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	99771590	rs2632260	G	T	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=12;PP=394;SC=TCTTGGGCGCGCGCGGTGTTT;SOR=3.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=99771598;WS=99771580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	99778985	rs2632277	T	C	9565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=161;PP=2965;SC=TGGGACGTTCTTGTCTTCTTT;SOR=1.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=273;TCF=112;TCR=161;TR=273;WE=99778993;WS=99778975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr2	99779131	rs2516835	T	C	9401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=172;NR=112;PP=2965;SC=AGTATGCTGCTTATCATCAAA;SOR=1.251;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=285;TCF=173;TCR=112;TR=284;WE=99779139;WS=99779121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr2	99779655	rs2632276	C	A	136.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.67;QD=27.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	99802820	rs6757661	A	G	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=43;PP=1300;SC=TTTTGAGACGAAGTCTCTCTC;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=43;WE=99802828;WS=99802810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	99804642	rs10865030	T	C	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=979;ReadPosRankSum=1.280;SC=TATTTTAGACTGTGACAAAAG;SOR=0.922;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=38;WE=99804650;WS=99804632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr2	99811894	rs7605843	C	T	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=4;PP=982;SC=CAGACATTTACCATTTCTTCA;SOR=3.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=34;WE=99811902;WS=99811884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	99812070	rs1044575	G	A	3472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=66;PP=2793;SC=AGGACTTCCAGCAGAGGAGAA;SOR=1.149;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=46;TCR=66;TR=112;WE=99812078;WS=99812060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr2	99859954	rs36096004	C	CAGAT,CAGATAGAT	1119.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;QD=46.66;ReadPosRankSum=-1.232;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,6,17:0.25,0.71:24
chr2	99912307	rs11289179	GA	G	349.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=213;SC=GAATCATAGTGAAAAAAAAGC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=10;WE=99912315;WS=99912297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	99918180	rs10688800	C	CAA	919.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=5.593;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.43;MQRankSum=-1.686;QD=31.71;ReadPosRankSum=-0.360;SOR=2.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr2	99923088	rs13003899	T	C	219.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=242;SC=AAGTACTTATTGATGTAGACA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=99923096;WS=99923081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	99938301	rs13017871	C	T	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=0;PP=1198;SC=AGAAACTTTCCACATCTCAGC;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=99938309;WS=99938291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	99954636	rs11326784	GT	G	228.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=0;PP=166;SC=CTTCCGGCCTGTTTTTTTTTG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=9;WE=99954644;WS=99954626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	99954735	rs4850901	C	A	2210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=17;PP=1881;ReadPosRankSum=-0.673;SC=TAACCACCTGCAATGCTTTGG;SOR=1.230;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=75;TCF=57;TCR=18;TR=73;WE=99954743;WS=99954725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,72:0.99:73
chr2	99976564	rs3828162	A	G	114.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=119;SC=CTTGTGTTGTAATGAAAGAAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=99976572;WS=99976555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	99995458	rs200706463	AT	A	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=-0.242;QD=0.39;ReadPosRankSum=-2.039;SOR=0.699;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,18:0.17:104
chr2	99995725	.	T	C	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.000;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.684;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=11;PP=992;ReadPosRankSum=0.109;SC=CTTATTATTTTTGCTGCTATC;SOR=0.912;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=125;TCF=90;TCR=35;TR=46;WE=99995733;WS=99995715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,46:0.36:127
chr2	100006890	.	GT	G	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=0.027;QD=1.04;ReadPosRankSum=0.279;SOR=1.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,19:0.23:84
chr2	100288931	rs4851222	G	A	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=510;ReadPosRankSum=-0.689;SC=GTTAACACCCGGCACAGTCCA;SOR=0.673;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=109;TCF=83;TCR=26;TR=31;WE=100288939;WS=100288921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,31:0.26:117
chr2	100343557	rs4851223	C	T	5669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=94;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.772;SC=CGATGTGCCACTGTCTGGACT;SOR=0.299;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=174;TCF=79;TCR=95;TR=173;WE=100343565;WS=100343547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,179:0.99:180
chr2	100454072	rs5832886	C	CT	6997.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=113;PP=2979;SC=TTAGTCCCCCCCAACAAAAAA;SOR=1.836;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=150;TCF=30;TCR=120;TR=143;WE=100454080;WS=100454062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr2	100721050	rs13421952	A	G	55.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=2;PP=24;SC=CCCACCGCCCACCCCCAGGTC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=100721058;WS=100721040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	100915629	rs4851286	T	C	2439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=23;PP=1816;ReadPosRankSum=-0.658;SC=TACACTTTGGTATACATTTCA;SOR=0.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=89;TCR=33;TR=85;WE=100915637;WS=100915619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,88:0.69:128
chr2	100915772	rs4851287	A	G	1919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.862;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=49;PP=1473;ReadPosRankSum=1.703;SC=GCTCCTTTGAAGTGAGAGATC;SOR=0.445;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=112;TCF=24;TCR=88;TR=63;WE=100915780;WS=100915762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,70:0.58:120
chr2	100916051	rs2033749	T	C	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=120;ReadPosRankSum=1.221;SC=CTCTATAATCTTAGAGCTGAT;SOR=2.584;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=6;WE=100916059;WS=100916041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr2	100916306	rs2033748	A	G	1444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=3.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.30;ReadPosRankSum=-1.328;SOR=1.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,38:0.61:62
chr2	100916315	rs11123823	A	G	1381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=3.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.03;ReadPosRankSum=-1.006;SOR=1.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,36:0.60:60
chr2	100917109	rs13006224	C	T	3194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.323;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=50;PP=2448;ReadPosRankSum=1.832;SC=GTCATACCTCCGAGCTCCCTG;SOR=0.870;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=154;TCF=80;TCR=74;TR=111;WE=100917117;WS=100917099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,117:0.71:165
chr2	100925803	rs10195793	A	G	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=185;ReadPosRankSum=2.362;SC=TATAAATACAATACAATACAA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=9;WE=100925811;WS=100925793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr2	100986964	rs1437971	A	C	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.709;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=602;ReadPosRankSum=0.588;SC=GCACTGGGCAAACTTCTGAAC;SOR=3.467;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=23;WE=100986972;WS=100986954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr2	101009600	rs1530030	G	A	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=558;ReadPosRankSum=0.132;SC=GACCCCGGGCGTCCTCAAAGG;SOR=0.914;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=24;WE=101009608;WS=101009590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr2	101010082	rs3748930	G	C	3046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.326;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=48;PP=2303;ReadPosRankSum=-1.365;SC=GGATCCCCCGGGTCTCTGTCC;SOR=0.843;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=163;TCF=93;TCR=70;TR=113;WE=101010090;WS=101010072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,117:0.70:168
chr2	101011877	rs2241810	T	C	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.857;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=718;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTCCGATCAATCTGCCAAGTA;SOR=0.080;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=35;WE=101011885;WS=101011867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,36:0.68:53
chr2	101014247	rs4149517	C	A	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=211;ReadPosRankSum=-0.659;SC=CCTGTCTGGACGGCCACCAGT;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=10;WE=101014255;WS=101014240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr2	101014363	rs2241809	C	T	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.082;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=11;PP=936;ReadPosRankSum=0.057;SC=AGTAGACCCACACACACCATT;SOR=0.471;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=79;TCF=61;TCR=18;TR=43;WE=101014371;WS=101014353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,47:0.57:83
chr2	101022886	rs4149512	C	T	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.074;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=0;PP=806;ReadPosRankSum=-0.275;SC=ACCTCTGTAACATGAAGGAAC;SOR=4.762;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=35;WE=101022894;WS=101022876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,34:0.69:49
chr2	101031561	rs3828193	G	T	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.793;NF=23;NR=46;PP=1539;ReadPosRankSum=-0.304;SC=GAGGTTCTTGGTTCCTCTTGT;SOR=0.627;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=107;TCF=35;TCR=72;TR=69;WE=101031569;WS=101031551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,70:0.62:112
chr2	101126124	rs1829479	T	A	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.326;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.285;NF=4;NR=35;PP=694;ReadPosRankSum=-0.222;SC=TTTCTCCTTATTATGTTACTT;SOR=0.281;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=103;TCF=7;TCR=96;TR=39;WE=101126132;WS=101126114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,40:0.37:108
chr2	101437561	rs6542989	G	A	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=17;PP=758;ReadPosRankSum=1.265;SC=TGACCTTTCTGAAGAGCTGGG;SOR=0.680;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=153;TCF=94;TCR=59;TR=46;WE=101437569;WS=101437551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,47:0.29:162
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chr2	101520972	rs5832941	A	AT	240.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=578;ReadPosRankSum=-0.891;SC=GCCCAATGAAAGAGTGCCTGT;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=9;WE=101520993;WS=101520962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr2	101520985	rs10168430	A	T	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=578;ReadPosRankSum=-0.134;SC=GTGCCTGTGCATTTAAACATT;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=10;WE=101520993;WS=101520962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr2	101521173	rs3042779	AT	A	772.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.771;QD=12.46;ReadPosRankSum=0.226;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,50:0.81:62
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chr2	101564628	rs10207725	A	C,G	2173.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=40,18;NR=10,7;PP=1080,456;SC=TGAATGTTCAATTTTTGTTTT;SOR=2.395;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=75;TCF=58;TCR=17;TR=50,25;WE=101564636;WS=101564618;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.68,0.32:77
chr2	101566070	rs3739005	C	T	682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=18;PP=553;SC=TTTGAATTTTCGAGTTCCCAG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=101566078;WS=101566060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	101580575	rs41280595	G	A	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.821;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.311;NF=25;NR=10;PP=644;ReadPosRankSum=-1.682;SC=CTTGCCGGGTGCCACTAGGAA;SOR=0.482;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=101;TCF=74;TCR=27;TR=35;WE=101580583;WS=101580565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,39:0.36:108
chr2	101581246	rs7581886	C	T	1833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=9;PP=1519;SC=TTACCCACCACGCGTTCCTCT;SOR=2.872;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=58;TCF=48;TCR=10;TR=56;WE=101581254;WS=101581236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	101581294	rs11473114	C	CTT	1212.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.637;HP=13;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=545;ReadPosRankSum=0.256;SC=ACCCAAGCAACTTTTTTTTTT;SOR=1.244;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=106;TCF=63;TCR=43;TR=41;WE=101581302;WS=101581284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,50:0.55:91
chr2	101581495	rs60563199	CT	C	1407.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.663;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.113;NF=7;NR=30;PP=2354;ReadPosRankSum=0.803;SC=AGAGTCGGCCCTGGTCCATTG;SOR=0.247;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=62;TCF=8;TCR=54;TR=37;WE=101581516;WS=101581485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,41:0.63:65
chr2	101581508	rs17025086	A	G	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.668;NF=8;NR=35;PP=2569;ReadPosRankSum=-0.541;SC=GTCCATTGAAAGAGGAGGACT;SOR=0.749;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=59;TCF=10;TCR=49;TR=43;WE=101581516;WS=101581485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,45:0.71:63
chr2	101581976	rs4851392	A	G	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=332;SC=AGCCTCTCTGATTTTGACCAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=101581984;WS=101581971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	101582245	rs3841571	AGCCCAGGCATGGGG	A	1396.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.749;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=2969;ReadPosRankSum=1.734;SC=ACCACTGCCCAGCCCAGGCAT;SOR=2.356;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=24;WE=101582266;WS=101582235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,35:0.74:47
chr2	101584895	rs2289950	C	T	1386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=6.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=48;PP=1091;ReadPosRankSum=1.377;SC=GGTCAGGTACCGCGCACGGGC;SOR=1.457;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=88;TCF=5;TCR=83;TR=50;WE=101584903;WS=101584885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,50:0.57:88
chr2	101584951	rs35503589	A	G	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=272;ReadPosRankSum=-0.246;SC=GGGGTGCAGGATGGCGTGGCC;SOR=0.197;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=14;WE=101584959;WS=101584941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr2	101587642	rs75107839	A	T	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.303;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=439;ReadPosRankSum=-0.718;SC=GAAGGGTACAACCAAGCTATT;SOR=1.501;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=20;WE=101587650;WS=101587632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr2	101591304	rs2305160	A	G	5535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=80;PP=2965;SC=GCACTTTAACACACTCGACGT;SOR=0.918;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=176;TCF=96;TCR=80;TR=176;WE=101591312;WS=101591294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr2	101591443	rs2305159	A	C	1918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.979;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=52;PP=1448;ReadPosRankSum=1.686;SC=TGGGATGTCCACATCAGACCA;SOR=0.505;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=97;TCF=23;TCR=74;TR=69;WE=101591451;WS=101591433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,72:0.71:102
chr2	101594191	rs11541353	C	T	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=24;PP=785;ReadPosRankSum=0.716;SC=CCTTCCCCATCGTCCTGCGAC;SOR=0.547;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=167;TCF=80;TCR=87;TR=48;WE=101594199;WS=101594181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,50:0.29:174
chr2	101598677	rs2278727	C	T	4783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=61;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.820;SC=TTATGTTTTTCGGCTCCACCT;SOR=0.443;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=95;TCR=62;TR=154;WE=101598685;WS=101598667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,160:0.99:161
chr2	101609827	rs9223	C	T	2817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.053;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=56;PP=2324;ReadPosRankSum=1.402;SC=AGAGCCAGACCGTGTTTCAAA;SOR=0.702;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=161;TCF=80;TCR=81;TR=106;WE=101609835;WS=101609817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,107:0.65:164
chr2	101612051	rs2305158	G	A	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.171;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=308;ReadPosRankSum=-0.848;SC=ATAATGCCCCGGCACTGAAGT;SOR=1.035;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=51;TCF=24;TCR=27;TR=16;WE=101612059;WS=101612041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
chr2	101619283	rs2278724	C	G	5885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=120;NR=65;PP=2965;SC=GAGTATCCCTCTAGCCGCCCT;SOR=1.417;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=120;TCR=65;TR=185;WE=101619291;WS=101619273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr2	101619321	rs2278723	T	C	6746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=114;PP=2965;SC=GTCTGGTTGTTACCGAGAGAT;SOR=0.921;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=207;TCF=93;TCR=114;TR=207;WE=101619329;WS=101619311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr2	101620856	rs34386800	TA	T	569.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.93;ReadPosRankSum=-0.184;SOR=0.467;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,37:0.39:96
chr2	101622696	rs34763346	T	TG	708.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.287;NF=11;NR=15;PP=824;ReadPosRankSum=1.159;SC=GATCCATATCTGGGATGTAAA;SOR=0.760;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=74;TCF=32;TCR=42;TR=26;WE=101622704;WS=101622686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,29:0.39:75
chr2	101622728	rs10934	C	T	1523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=33;PP=1297;ReadPosRankSum=0.699;SC=AAATAGAATGCCCAGACCCGT;SOR=0.866;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=92;TCF=41;TCR=51;TR=57;WE=101622736;WS=101622718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,56:0.64:88
chr2	101624471	rs746924	T	C	6143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=81;PP=2965;SC=GTCCAGTCCCTTTCTGCCGCC;SOR=0.976;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=106;TCR=81;TR=187;WE=101624479;WS=101624461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr2	101627343	rs35511736	CA	C	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=5.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.28;MQRankSum=1.320;QD=2.14;ReadPosRankSum=0.597;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr2	101627852	rs1062059	C	T	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.834;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=229;ReadPosRankSum=-0.902;SC=AGGGCAACCCCGGTGCCTCCC;SOR=0.175;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=45;TCF=43;TCR=2;TR=13;WE=101627860;WS=101627842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,14:0.30:46
chr2	101635538	rs13007048	C	T	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=32;PP=779;ReadPosRankSum=0.552;SC=CCTTGGGTCTCGGCTCTTCAT;SOR=0.871;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=33;WE=101635546;WS=101635528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,33:0.72:46
chr2	101638888	rs3739014	A	G	3540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=59;PP=2618;SC=ACTGCCGGGCATCTATGCGGT;SOR=0.853;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=50;TCR=59;TR=109;WE=101638896;WS=101638878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr2	101644855	rs11683877	G	A	2283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.389;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=19;PP=1777;ReadPosRankSum=0.777;SC=TGCCAACTGGGGGCCCTGGGC;SOR=0.260;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=129;TCF=105;TCR=24;TR=85;WE=101644863;WS=101644845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,87:0.67:129
chr2	101646144	rs3739015	G	A	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.598;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=30;PP=1121;ReadPosRankSum=1.265;SC=AGAGAGAGACGGACGCCAGGG;SOR=0.756;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=192;TCF=89;TCR=103;TR=64;WE=101646152;WS=101646134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,67:0.35:194
chr2	101646359	rs12472882	G	C	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=461;ReadPosRankSum=1.368;SC=CCAGAAAAGCGTCCATGCTTA;SOR=0.538;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=19;WE=101646367;WS=101646349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr2	101652732	rs4850957	C	T	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=29;PP=669;ReadPosRankSum=-0.566;SC=CCCTGCTCTCCGAGGGGCCAA;SOR=0.954;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=55;TCF=7;TCR=48;TR=33;WE=101652740;WS=101652722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,33:0.61:54
chr2	101656623	rs112836069	C	G	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.650;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=15;PP=955;ReadPosRankSum=0.808;SC=GGGAAGCAGACAGTAGGGCCA;SOR=0.361;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=71;TCF=50;TCR=21;TR=46;WE=101656631;WS=101656613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,47:0.65:72
chr2	101656726	rs2289953	T	C	3636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=61;PP=2634;SC=ATCCGCCCCGTGGTGTGACAG;SOR=0.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=59;TCR=61;TR=120;WE=101656734;WS=101656716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr2	101675808	rs7572457	A	G	2108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.054;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=12;PP=1733;ReadPosRankSum=1.541;SC=AACTGTTAGTATGCTACAGTG;SOR=0.493;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=116;TCF=99;TCR=17;TR=75;WE=101675816;WS=101675798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,75:0.65:116
chr2	101869588	rs2272320	G	T	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=4.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.79;ReadPosRankSum=0.355;SOR=0.310;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,36:0.36:101
chr2	101874442	rs6757365	C	T	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.002;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=483;ReadPosRankSum=-0.297;SC=GTGTTTTGGGCATTTCTGTGT;SOR=1.053;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=108;TCF=30;TCR=78;TR=31;WE=101874450;WS=101874432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,33:0.29:112
chr2	101881549	rs3768995	A	T	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=3.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-1.414;QD=5.71;ReadPosRankSum=1.279;SOR=0.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,31:0.33:95
chr2	101889306	rs750783	A	G	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.67;ReadPosRankSum=1.938;SOR=0.623;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,17:0.20:86
chr2	101898412	rs13151	G	C	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.341;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=240;ReadPosRankSum=-1.400;SC=GTGGACTGCTGTCATCACTTC;SOR=1.341;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=48;TCF=26;TCR=22;TR=17;WE=101898420;WS=101898402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr2	101911385	rs3828194	A	G	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=14.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.70;ReadPosRankSum=0.500;SOR=0.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,48:0.27:179
chr2	101925026	rs11123868	T	C	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.420;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=57;PP=1122;ReadPosRankSum=1.860;SC=GCCCCGACGCTGGCTTCGCGC;SOR=1.151;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=100;TCF=9;TCR=91;TR=62;WE=101925034;WS=101925016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,64:0.63:101
chr2	101967346	rs6543032	C	T	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.73;ReadPosRankSum=-1.447;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,48:0.28:174
chr2	101971618	rs6753727	T	C	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=300;ReadPosRankSum=0.335;SC=TGGAGACCAATCACTTATTGC;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=60;TCR=0;TR=18;WE=101971626;WS=101971608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,19:0.31:62
chr2	102003633	rs11554173	G	T	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.27;ReadPosRankSum=-1.527;SOR=1.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr2	102018908	rs2175968	A	G	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.659;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=10;PP=983;ReadPosRankSum=-0.603;SC=CTTATTGCCCATGGCAGTGTC;SOR=1.565;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=79;TCF=60;TCR=19;TR=52;WE=102018916;WS=102018898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,52:0.67:78
chr2	102031176	rs4851434	A	G	820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=670;SC=TCCTCTGCCAATGGCCAGGCA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=102031184;WS=102031166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	102031289	rs202038959	C	T	1577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.789;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=28;PP=1126;ReadPosRankSum=-0.231;SC=TGCTTTGTTCCCTCCTATCTG;SOR=0.505;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=85;TCF=45;TCR=40;TR=55;WE=102031297;WS=102031279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,61:0.66:92
chr2	102031489	rs4851435	C	G	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.208;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=463;ReadPosRankSum=-0.137;SC=TAAACTGCAACTTCCCCCACC;SOR=1.536;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=22;WE=102031497;WS=102031479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr2	102035192	rs6709913	C	T	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.55;ReadPosRankSum=-1.036;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr2	102038849	rs4851436	T	A	8025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=163;PP=2965;SC=TTTCTTTGCCTGTTCTTGCTC;SOR=1.719;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=241;TCF=77;TCR=164;TR=240;WE=102038857;WS=102038839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr2	102045328	rs6543047	C	T	1116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=0;PP=873;ReadPosRankSum=-0.742;SC=CAGAAGAGTACGCACAGAAAA;SOR=2.348;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=50;TCR=0;TR=37;WE=102045336;WS=102045318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,39:0.76:51
chr2	102066878	rs4851448	A	T	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=3;PP=561;SC=AGAGATGGAGATTTGCCATGT;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=21;WE=102066886;WS=102066870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	102067083	rs7585228	T	C	1862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=35;PP=1470;SC=ACCTATCAGGTAGCAATACTG;SOR=1.355;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=56;WE=102067091;WS=102067073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr2	102068715	rs11123884	C	G	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=153;ReadPosRankSum=2.110;SC=GGAATTAATGCGAATTGTGGA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=8;WE=102068723;WS=102068705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr2	102068872	rs4851449	T	A	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.89;ReadPosRankSum=1.913;SOR=0.686;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,21:0.24:89
chr2	102083183	rs4851455	T	C	1370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=5;PP=999;SC=CTCCAATAACTTGCTTCCCTT;SOR=3.467;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=41;WE=102083191;WS=102083173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	102314437	rs13430711	T	C	2582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=72;NR=0;PP=2078;SC=CCGGGCCGGCTCGGCTGCCGC;SOR=8.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=72;TCR=0;TR=72;WE=102314445;WS=102314427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	102314633	.	G	GGGCAGCC	1512.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.829;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.451;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.894;NF=2;NR=21;PP=1343;ReadPosRankSum=-0.585;SC=CGCGGGGAGCGGGCAGCCGGC;SOR=0.357;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=75;TCF=4;TCR=71;TR=23;WE=102314641;WS=102314623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,39:0.80:49
chr2	102315057	rs1567385	A	G	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=30;PP=785;ReadPosRankSum=-0.676;SC=TTATTGGGGGACGAGGAGAGG;SOR=0.579;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=34;WE=102315065;WS=102315047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,34:0.85:40
chr2	102448164	rs149086802	CT	C	346.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=318;ReadPosRankSum=1.411;SC=CTTTATCTGCCTTTTTCTTCC;SOR=0.558;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=47;TCF=31;TCR=16;TR=13;WE=102448172;WS=102448154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,18:0.34:53
chr2	102459268	rs17801985	A	G	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=391;ReadPosRankSum=-0.812;SC=GCATCTTACTATCTCCATTCT;SOR=0.512;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=18;WE=102459276;WS=102459258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr2	102483883	rs17745869	T	G	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=40;PP=946;ReadPosRankSum=-0.551;SC=CCCTCACAGATTTGAGGAATT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=40;WE=102483891;WS=102483873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,41:0.76:54
chr2	102501891	rs57584884	A	G	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.601;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=630;ReadPosRankSum=-0.346;SC=TTTATCATAAACCATTTCTAA;SOR=4.029;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=25;WE=102501899;WS=102501881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,25:0.78:32
chr2	102504563	rs11895969	T	A	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=61;ReadPosRankSum=0.732;SC=GCCGTGGAAATAGTCATAGGT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=102504571;WS=102504553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr2	102505434	rs79538056	A	G	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=24;PP=482;ReadPosRankSum=-0.014;SC=TAGTTGCTCTATCTTTTAATA;SOR=0.629;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=15;TCR=71;TR=29;WE=102505442;WS=102505424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,29:0.33:87
chr2	102632582	rs3819369	T	A	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=668;ReadPosRankSum=-0.321;SC=AAAGAAAGACTTAAAATATCG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=27;WE=102632590;WS=102632572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,29:0.85:34
chr2	102788409	rs2041747	G	A	3465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=83;PP=2597;SC=TCACATTTTGGTGTTAAATCC;SOR=2.595;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=23;TCR=83;TR=106;WE=102788417;WS=102788399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr2	102804538	rs144678772	A	AACC	397.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.862;NF=0;NR=11;PP=485;ReadPosRankSum=1.058;SC=GGAAACAGAGAACCAGCTCCA;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=11;WE=102804546;WS=102804528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr2	102817954	rs2302623	A	T	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=1;PP=723;ReadPosRankSum=1.190;SC=TTACCTAAATACTAGGGATCA;SOR=0.981;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=30;WE=102817962;WS=102817944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,31:0.74:42
chr2	102828378	rs138145179	A	ATT	512.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.798;NF=18;NR=0;PP=359;ReadPosRankSum=-0.623;SC=CTTCTAGCTTATTTTTTTTTT;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=18;WE=102828386;WS=102828368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr2	102828768	rs1922290	G	C	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=61;ReadPosRankSum=0.541;SC=TTGGATATACGTGAGCTCATG;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=102828776;WS=102828758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr2	103040945	rs887972	G	A	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=223;ReadPosRankSum=1.013;SC=GGCTTTTCATGGAAAAGCGTG;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=12;WE=103040953;WS=103040935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr2	103059613	rs1558651	A	G	2675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=26;PP=2123;SC=AGGACAAAGTATTCTCACCAG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=52;TCR=26;TR=78;WE=103059621;WS=103059603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr2	103090575	rs79463214	A	C	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.25;ReadPosRankSum=-0.365;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr2	103095404	rs11692304	G	A	3001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.140;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=37;PP=2282;ReadPosRankSum=1.657;SC=ACCACAAATCGCCTCCGGTCA;SOR=1.440;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=181;TCF=114;TCR=67;TR=117;WE=103095412;WS=103095394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,121:0.65:185
chr2	103120232	rs2075188	G	A	2883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=66;PP=2273;SC=CATCACATGAGCCAGGCATCT;SOR=1.994;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=25;TCR=67;TR=91;WE=103120240;WS=103120222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr2	103120311	rs2075187	G	A	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=37;PP=1088;SC=AAACTTTTATGAAACCTGATT;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=38;WE=103120319;WS=103120301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
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chr2	103128866	rs4851609	T	C	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=159;ReadPosRankSum=-0.768;SC=CTACAGGAAGTGGTTGAAATT;SOR=0.941;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=13;WE=103128874;WS=103128856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,16:0.33:49
chr2	103136309	rs1403550	T	C	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.307;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=651;ReadPosRankSum=-2.733;SC=TCTCCAATAATGATTCCAGGG;SOR=0.497;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=121;TCF=65;TCR=56;TR=46;WE=103136317;WS=103136299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,49:0.37:131
chr2	103136446	rs1403551	T	G	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=379;ReadPosRankSum=1.043;SC=TGTCCCCATTTTCTGTCCTTG;SOR=0.123;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=20;WE=103136454;WS=103136436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr2	103141447	rs2015478	A	G	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.905;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=12;PP=467;ReadPosRankSum=-1.889;SC=TGTATGGAGGAGTCCTTACGT;SOR=0.526;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=78;TCF=47;TCR=31;TR=26;WE=103141455;WS=103141437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,28:0.35:80
chr2	103141651	rs1024798	G	C	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.27;ReadPosRankSum=-1.485;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,8:0.22:36
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chr2	103149162	rs2008159	A	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=154;ReadPosRankSum=-0.760;SC=ATTGTCCACAAGATTGTTTTG;SOR=0.892;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=10;WE=103149170;WS=103149152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,10:0.28:36
chr2	103149182	rs2008157	A	G	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=-0.451;SC=GGTGTTTCTCAAGAGTCTGTC;SOR=0.527;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=8;WE=103149190;WS=103149172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr2	103300506	rs6757258	A	G	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.907;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=231;ReadPosRankSum=-0.100;SC=CTTTGTCCCCATCGCAGAAGC;SOR=1.179;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=49;TCF=47;TCR=2;TR=17;WE=103300514;WS=103300496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr2	103334969	rs1052431	G	A	2598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.857;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=63;PP=1958;ReadPosRankSum=0.253;SC=CTAACACAGCGCCCAGGCTGG;SOR=0.938;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=162;TCF=66;TCR=96;TR=102;WE=103334977;WS=103334959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,108:0.64:169
chr2	103335441	rs33993717	A	G	4260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.938;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=62;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.835;SC=CACCAGAAATATGTCCCACAT;SOR=0.782;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=277;TCF=163;TCR=114;TR=157;WE=103335449;WS=103335431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,156:0.56:278
chr2	103335754	rs72828057	T	C	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.87;ReadPosRankSum=0.272;SOR=0.123;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,24:0.26:92
chr2	103343234	rs3796061	G	C	1340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=2;PP=1144;SC=AGGAGGAAGCGTGCAGTTTCA;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=41;WE=103343242;WS=103343224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	103375056	rs2732838	T	G	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=427;ReadPosRankSum=-0.622;SC=GCTTAACAAGTACCAAGCTGG;SOR=0.720;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=87;TCF=37;TCR=50;TR=27;WE=103375064;WS=103375046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,31:0.33:94
chr2	103378581	rs5833037	CT	C	168.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.03;ReadPosRankSum=1.886;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr2	103378857	rs2540298	C	G	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.659;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=46;PP=1098;ReadPosRankSum=0.085;SC=TATGAAGATACCCTTATGTAT;SOR=0.524;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=31;TCR=131;TR=57;WE=103378865;WS=103378847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,59:0.36:166
chr2	103414593	rs140870577	CACTA	C	514.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=575;ReadPosRankSum=1.055;SC=ACTTCTTGAACACTAACTAAT;SOR=0.343;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=14;WE=103414604;WS=103414583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr2	103431404	rs887987	T	C	3073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=95;PP=2446;SC=GGTTGTTGGATGGCATATTCA;SOR=4.824;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=8;TCR=96;TR=103;WE=103431412;WS=103431394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr2	104995800	rs4851692	C	T	2446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=41;PP=1871;ReadPosRankSum=-0.771;SC=GTGACCCATACCTGATGTCTC;SOR=0.668;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=75;TCR=64;TR=88;WE=104995808;WS=104995790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,93:0.63:147
chr2	105472055	rs186512421	T	C	275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=10;PP=198;SC=CGGCAGGGGCTGGCGGCGGCG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=105472063;WS=105472045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	105654716	rs3739160	C	T	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=34;PP=1194;SC=AAGCGGCTTACCTCTGCCGCG;SOR=1.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=47;WE=105654724;WS=105654706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	105654830	rs3739159	G	T	301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=9;PP=247;SC=AGGTTGGGGGGGAGGAGGTGG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=105654838;WS=105654820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	105709023	rs6543282	T	C	2957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=70;PP=2198;SC=TTAGCAAAAGTGAAGGTAATG;SOR=1.958;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=28;TCR=70;TR=98;WE=105709031;WS=105709013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr2	105886219	rs2241798	C	A	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=12;PP=359;SC=ACCCGCCCAGCGACTGGCCTC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=105886227;WS=105886209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	105897261	rs2679833	C	T	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=32;PP=1245;SC=TGGAGGGGAGCGCACGGTGGC;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=49;WE=105897269;WS=105897251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	105915128	rs12476720	G	A	1853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=49;PP=1537;SC=GCACGGGGGCGCGCTGGGATA;SOR=3.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=9;TCR=49;TR=58;WE=105915136;WS=105915118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	105924510	rs2241801	A	G	3448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=59;NR=54;PP=2818;SC=CTGAGGCCGCACGCAGCTCGT;SOR=0.782;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=113;TCF=59;TCR=54;TR=113;WE=105924518;WS=105924500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
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chr2	106013248	rs11884297	C	T	6379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=182;PP=2965;ReadPosRankSum=0.148;SC=ATAAATGTGGCTTTGATCAAA;SOR=6.869;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=186;TCF=2;TCR=184;TR=184;WE=106013256;WS=106013238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,186:0.99:188
chr2	106471393	rs6543345	T	C	2108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=5;PP=1734;SC=AGGAGAAAACTGGTTGCAGAG;SOR=4.648;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=59;TCR=5;TR=64;WE=106471401;WS=106471383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	106471825	rs3832068	C	CA	300.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.47;MQRankSum=-0.000;QD=17.69;ReadPosRankSum=-0.778;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr2	106682226	rs4271786	T	C	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=2.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=32.45;ReadPosRankSum=1.231;SOR=2.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,27:0.77:35
chr2	106682235	rs4266035	C	G	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.05;ReadPosRankSum=0.982;SOR=1.218;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,30:0.81:37
chr2	106682365	rs4477942	T	G	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.836;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=26;PP=948;ReadPosRankSum=-1.028;SC=GGCGCTTCCATGGTGCCCGGG;SOR=0.793;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=72;TCF=37;TCR=35;TR=44;WE=106682373;WS=106682355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,46:0.62:74
chr2	106710668	rs11268588	C	CGCAGGAAGGAAGTGCCACCTT	535.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.20;ReadPosRankSum=-0.491;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr2	106715342	rs3820891	G	A,T	2415.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=2,4;NR=28,44;PP=562,1149;SC=ACCTCCCTGCGCTGCTTCAGC;SOR=4.228;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=78;TCF=6;TCR=72;TR=30,48;WE=106715350;WS=106715332;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.38,0.62:81
chr2	106717274	rs3739136	A	G	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.523;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=212;ReadPosRankSum=-1.577;SC=TCTTAGACCCAGGCCCTTCAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=11;WE=106717282;WS=106717264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr2	106717656	rs10177888	G	A	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=284;ReadPosRankSum=-0.873;SC=CCTCCCAGAAGAAAAATTACC;SOR=0.495;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=14;WE=106717664;WS=106717646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr2	106742139	rs4851925	C	T	2965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=40;PP=2421;SC=GCCAGCCCTACAGAAAGCAAT;SOR=0.999;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=53;TCR=40;TR=93;WE=106742147;WS=106742129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr2	106742177	rs3739137	T	A	2094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=44;PP=1635;ReadPosRankSum=0.861;SC=TGAATTTACATGTGCAGGCAC;SOR=0.727;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=47;TCR=70;TR=74;WE=106742185;WS=106742167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,77:0.64:121
chr2	106780015	rs3910716	C	T	1091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=3;PP=944;SC=AATGCGTATACAGACATTTAT;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=35;WE=106780023;WS=106780005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	106780055	rs10631203	C	CTG	2429.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=15;PP=2187;SC=AGCAAACAAACAGAATTAATT;SOR=1.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=42;WE=106780063;WS=106780045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	106782398	rs4851115	C	G	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=3;PP=963;SC=CAAGAACCCACTTTTGTTTTA;SOR=4.047;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=106782406;WS=106782388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	106810583	rs141195431	T	A	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=590;ReadPosRankSum=0.179;SC=GCTCCCCAGCTGGCAGCGGGC;SOR=0.885;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=28;WE=106810591;WS=106810573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr2	106810727	rs7604916	A	G	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=29;PP=877;SC=CCAGGGCCCTACCGCGCGGGG;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=35;WE=106810735;WS=106810717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	106810767	rs78870678	G	T	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.87;ReadPosRankSum=-0.413;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr2	106992845	rs56959583	A	G	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.31;MQRankSum=-1.021;QD=20.99;ReadPosRankSum=-0.303;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr2	106992952	rs4641931	A	G	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.04;MQRankSum=-1.066;QD=6.40;ReadPosRankSum=-0.144;SOR=0.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,31:0.29:107
chr2	106992963	rs11464214	A	AG	5163.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=61;PP=2963;SC=TGTGGGCAAAATTCCTGTGCT;SOR=1.281;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=67;TCR=63;TR=127;WE=106992971;WS=106992942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr2	106993072	.	C	CT	509.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.754;NF=0;NR=26;PP=461;ReadPosRankSum=0.044;SC=CTTTTCTTTCCTTTTTTTTGG;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=0;TCR=64;TR=26;WE=106993080;WS=106993062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr2	107007467	rs7575679	G	A	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=9.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.22;MQRankSum=-8.089;QD=3.00;ReadPosRankSum=0.697;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,26:0.18:141
chr2	107007576	rs60043380	A	T	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.43;MQRankSum=0.147;QD=23.41;ReadPosRankSum=0.032;SOR=2.522;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,43:0.78:55
chr2	107107472	rs139702056	C	G	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=8.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=1.047;QD=5.80;ReadPosRankSum=-0.031;SOR=0.268;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,35:0.26:134
chr2	107107511	rs11124115	C	T	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.447;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.824;NF=17;NR=24;PP=675;ReadPosRankSum=-0.202;SC=TCTGGGATTCCGCAAAAGGGA;SOR=0.813;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=146;TCF=84;TCR=62;TR=41;WE=107107519;WS=107107501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,38:0.27:140
chr2	107107567	rs2228021	G	C	3256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=64;NR=86;PP=2965;SC=GCTGTGTTTCGGGATGCAAGC;SOR=1.797;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=152;TCF=65;TCR=87;TR=150;WE=107107575;WS=107107557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr2	107107694	rs6543414	A	G	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.76;QD=34.69;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	107107765	rs6543415	C	A	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=38;PP=1090;SC=GACCACCAGGCTTCAGTGTGC;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=39;WE=107107773;WS=107107755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	107118896	rs4340514	T	C	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.69;QD=31.88;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	107119136	rs4365459	G	C	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=380;SC=ATTTGCCTCAGAGAACCTGCG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=107119144;WS=107119126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	107121040	rs146000492	T	TA	2256.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=14;PP=1416;SC=AGACCCCATCTAAAAAAAAAT;SOR=2.862;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=105;TCF=79;TCR=26;TR=65;WE=107121048;WS=107121030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	107423128	rs3796114	C	T	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.369;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=318;ReadPosRankSum=1.571;SC=TCCCAAGAAACCCTTTTTAAG;SOR=2.817;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=77;TCF=62;TCR=15;TR=20;WE=107423136;WS=107423118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,21:0.26:81
chr2	107423188	rs1470591	G	A	2554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.798;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=35;PP=1973;ReadPosRankSum=-0.603;SC=CCTGGAAGCCGGGAAGAACCA;SOR=0.557;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=121;TCF=75;TCR=46;TR=90;WE=107423196;WS=107423178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,91:0.74:123
chr2	107423395	rs1470590	T	G	2195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.467;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=39;PP=1642;ReadPosRankSum=-0.933;SC=TGGACATCATTATGAGGATTC;SOR=0.731;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=117;TCF=57;TCR=60;TR=72;WE=107423403;WS=107423385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,79:0.63:126
chr2	107429801	rs6739022	C	T	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=80;SC=AGATAATTATCAAACCATTTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=107429809;WS=107429791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	107446396	rs877693	T	C	1847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=0;PP=1522;SC=AAATCAGAAATACTTCTGGTT;SOR=8.155;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=55;TCR=0;TR=55;WE=107446404;WS=107446386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	107446430	rs935565	T	C	2544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=2;PP=2152;SC=ATAAGGTATTTTCAACCTGTA;SOR=6.385;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=72;TCF=70;TCR=2;TR=72;WE=107446438;WS=107446420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	107460474	rs12473361	T	G	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.374;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=532;ReadPosRankSum=-1.398;SC=TTAATGCAGATGGGTGGCAGA;SOR=1.199;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=52;TCF=10;TCR=42;TR=25;WE=107460482;WS=107460464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr2	108618540	rs3731683	G	A	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=152;ReadPosRankSum=1.223;SC=AATTGTTCCTGAAATCAAATT;SOR=0.264;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=9;WE=108618548;WS=108618530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr2	108868907	rs201707821	C	T	1298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.614;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=22;PP=1029;ReadPosRankSum=-0.906;SC=TCTAGATAGACACGCTTTCCT;SOR=0.609;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=171;TCF=109;TCR=62;TR=58;WE=108868915;WS=108868897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,58:0.32:183
chr2	108909993	rs114944675	T	C	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=63;ReadPosRankSum=1.329;SC=AATGTGAATGTACTTAATGCC;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=5;WE=108910001;WS=108909983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr2	108915136	rs7590599	T	C	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=382;ReadPosRankSum=-1.508;SC=CTGCCCCTGGTCTTCTTTGCA;SOR=0.678;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=67;TCF=41;TCR=26;TR=21;WE=108915144;WS=108915126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,21:0.31:68
chr2	108915263	rs4149422	C	T	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.374;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=320;ReadPosRankSum=-2.442;SC=TTTTCCCTCACTTGTTTTGTA;SOR=0.017;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=15;WE=108915271;WS=108915253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr2	108999483	rs375960129	CA	C	96.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQRankSum=-0.935;QD=4.61;ReadPosRankSum=-0.107;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr2	109006665	rs13021399	T	A	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.70;ReadPosRankSum=-0.385;SOR=0.449;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,24:0.24:98
chr2	109065858	rs2460947	T	C	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=240;ReadPosRankSum=-1.637;SC=CCCGCGCTGCTGTCGCCTCCC;SOR=0.582;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=17;WE=109065866;WS=109065848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,19:0.31:62
chr2	109065919	rs3820957	T	C	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.698;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=492;ReadPosRankSum=0.117;SC=TAGAGCCCGTTTGTGTACGAA;SOR=1.570;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=64;TCF=51;TCR=13;TR=24;WE=109065927;WS=109065909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,24:0.38:64
chr2	109067337	rs12468089	C	T	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=186;ReadPosRankSum=-0.240;SC=GACTCTGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=0.317;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=10;WE=109067345;WS=109067327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr2	109067359	rs13397470	GT	AA	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=572;ReadPosRankSum=0.228;SC=GTGGAACAAAGTATGCGGTTG;SOR=0.446;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=12;WE=109067368;WS=109067349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,15:0.33:46
chr2	109069008	rs2683797	T	C	1036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.821;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=781;ReadPosRankSum=0.536;SC=GGCTTTCTGTTTCTGTTCTAC;SOR=0.683;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=181;TCF=87;TCR=94;TR=51;WE=109069016;WS=109068998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,51:0.27:186
chr2	109085373	rs10179602	A	G	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=2.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.86;ReadPosRankSum=-1.170;SOR=1.096;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,29:0.25:116
chr2	109089404	rs2243888	C	G	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=79;ReadPosRankSum=2.299;SC=ACAGATTCTTCTTAGTGTTAG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=5;WE=109089412;WS=109089394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr2	109092121	rs3213886	G	A	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.872;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=264;ReadPosRankSum=-0.687;SC=GTAAGATTCCGGAATCTCACA;SOR=0.326;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=18;WE=109092129;WS=109092111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,20:0.32:62
chr2	109098994	rs3213887	T	C	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.130;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=81;ReadPosRankSum=-1.370;SC=TTACTAAGAGTAGCATTTATG;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=109099002;WS=109098984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
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chr2	109099572	rs2718698	C	G	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=9;NR=27;PP=940;SC=ACTTCAAAAGCAAAAGAAACA;SOR=2.242;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=109099580;WS=109099562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	109103108	rs3754925	C	T	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=5.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=345;ReadPosRankSum=-0.326;SC=TGCCAAGGTGCGTTCTTCAGG;SOR=0.421;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=6;TCR=69;TR=22;WE=109103116;WS=109103098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,24:0.30:80
chr2	109106381	rs12104502	A	G	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=13;PP=739;ReadPosRankSum=-0.822;SC=CTGAACTTCAAACATTGCAGT;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=158;TCF=111;TCR=47;TR=46;WE=109106389;WS=109106371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,48:0.29:166
chr2	109277239	rs12472770	C	T	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.598;NF=7;NR=28;PP=577;ReadPosRankSum=1.675;SC=GAAATGCTGACCCCAGGCTAT;SOR=0.743;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=112;TCF=27;TCR=85;TR=35;WE=109277247;WS=109277229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,34:0.30:113
chr2	109292280	rs7584953	T	C	4745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=23;PP=2965;SC=CTAGCCCCATTGGTTGGCCAC;SOR=3.180;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=115;TCR=23;TR=138;WE=109292288;WS=109292270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr2	109389463	rs826580	G	A	3358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=69;PP=2585;SC=GAAATGGGGAGGACTTTCAAT;SOR=1.747;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=32;TCR=69;TR=101;WE=109389471;WS=109389453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	109393522	rs58272304	TG	T	1477.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=0;PP=1592;SC=CTCTAGGTCCTGGGGTAAAGC;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=41;WE=109393530;WS=109393512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	109411248	rs111234702	GAATAT	G	414.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=188;SC=TACGAAATTTGAATATAATAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=109411260;WS=109411238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	109429146	rs975597	T	A	1563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=16;PP=1278;SC=GAGTTCAAGCTCGTTTAGATA;SOR=1.656;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=51;WE=109429154;WS=109429136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	109489753	.	AATG	A	940	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=19;NR=0;PP=940;QD=51.0;SC=TAATTTTTCAAATGATGATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=19;WE=109489763;WS=109489752;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,19:0.68:28
chr2	109490104	rs6737810	A	G	1342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=37;PP=1151;SC=TGATCATTTAAACCAGGGGTT;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=37;WE=109490112;WS=109490094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	109513321	rs7607563	C	A	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=2;PP=728;SC=CCCTCGTTGGCTCCTTGGCTT;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=109513329;WS=109513311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	109513654	rs12623957	G	A	5236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=97;PP=2965;SC=TCTTCTCGAGGCAATCAAATG;SOR=1.284;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=160;TCF=63;TCR=97;TR=160;WE=109513662;WS=109513644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr2	109513786	rs3789738	A	T	1445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.43;SOR=4.317;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	109522720	rs260639	G	A	1620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=10;PP=1326;SC=CCTTCATGTCGGTGGGGTGGG;SOR=2.790;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=43;TCR=10;TR=53;WE=109522728;WS=109522710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	109526969	rs260632	G	A	2877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=39;PP=2327;SC=CATCCTTCTCGGAGAACATCA;SOR=0.809;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=45;TCR=39;TR=84;WE=109526977;WS=109526959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr2	109527087	rs260631	G	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.662;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=171;ReadPosRankSum=0.480;SC=AGAGCTGCCCGGTGTCTGTGT;SOR=0.069;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=11;WE=109527095;WS=109527077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr2	109527373	rs260630	A	G	2678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=25;PP=2189;SC=GAGTCCAGGAAGCAGGGCACC;SOR=1.730;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=55;TCR=25;TR=80;WE=109527381;WS=109527363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr2	109539653	rs260643	A	G	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.18;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	109539653	.	AT	GC,GT	102	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=7,9;NR=0,0;PP=102,47;QD=22.2096964089;SC=TGTGGCAAACATCCCTCCCTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7,9;WE=109539662;WS=109539643;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.78:9
chr2	109539654	rs2077536	T	C	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.68;ReadPosRankSum=0.264;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr2	109539774	rs3749107	G	A	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.373;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=893;ReadPosRankSum=0.871;SC=GTAGTGAAAGGGATCCGTGCT;SOR=1.051;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=38;WE=109539782;WS=109539764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,38:0.73:52
chr2	109745782	rs200435574	TGGCCGGTCCCCGCCACGCA	T	775.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=3;NR=3;PP=1801;SC=CGGGCTCGGCTGGCCGGTCCC;SOR=0.914;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=6;WE=109745808;WS=109745772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	109746039	rs34609468	G	A	763.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=636;ReadPosRankSum=-0.913;SC=CAAGGCGGCCGCCGCTGCTGC;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=25;WE=109746047;WS=109746029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,26:0.90:29
chr2	109758196	rs13023759	C	T	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=3.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=388;ReadPosRankSum=0.899;SC=TTCTAGACCCCGGGGAACAAG;SOR=0.836;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=17;WE=109758204;WS=109758186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr2	109929958	rs6748434	A	G	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=7;PP=845;ReadPosRankSum=1.032;SC=TTGCTGGGTGAGCGCTGTACC;SOR=0.634;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=46;TCR=10;TR=38;WE=109929966;WS=109929948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,38:0.67:57
chr2	109988215	rs11680644	C	G	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=113;ReadPosRankSum=-0.083;SC=ACCTGACCTTCAAGCCCCTTT;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=7;WE=109988223;WS=109988205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr2	110301827	.	G	GT	737.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=464;ReadPosRankSum=0.491;SC=CACACTTCTAGTTTTTTTTTA;SOR=0.871;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=51;TCF=25;TCR=26;TR=27;WE=110301835;WS=110301817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
chr2	110372192	rs6594048	A	G	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=3;PP=567;SC=GGGGCGCCCTAGGCGGCGAAC;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=21;WE=110372200;WS=110372182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	110855123	rs2004273	G	T	5706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=114;NR=62;PP=2965;SC=AGGGGCTGCTGCAGGGGCCGG;SOR=1.342;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=114;TCR=62;TR=176;WE=110855131;WS=110855113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr2	110873470	.	G	GA	33	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.8060;HP=14;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=22;MQ=60.34;NF=0;NR=3;PP=33;QD=12.3333333333;SC=GCCTGGGAGGGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=3;WE=110873478;WS=110873460;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,3:0.30:10
chr2	110882699	rs2048243	A	G	920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.985;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=4;PP=725;ReadPosRankSum=1.358;SC=AAAGCCAAGAAGATTTTCCAT;SOR=1.609;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=117;TCF=96;TCR=21;TR=39;WE=110882707;WS=110882689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,38:0.32:117
chr2	110886686	rs3838315	A	AGACCAGAT	1177.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=1.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.71;ReadPosRankSum=0.003;SOR=0.459;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,29:0.26:110
chr2	110889108	rs11240790	C	T	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=171;ReadPosRankSum=0.591;SC=TGAAGATGTCCCATAAGTAAT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=9;WE=110889116;WS=110889098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr2	110905664	rs1509417	G	A	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=137;ReadPosRankSum=0.706;SC=GGGGTTTGATGTGGTTTGAAT;SOR=0.055;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=9;WE=110905672;WS=110905654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr2	110919041	rs3817140	A	G	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.951;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=194;ReadPosRankSum=-0.248;SC=AGTTATAAAAATATCGCTATT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=9;WE=110919049;WS=110919031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr2	110919321	rs2271244	C	T	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.038;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=266;ReadPosRankSum=2.433;SC=AAAGAAACTCCAAATCAAAAA;SOR=0.152;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=58;TCF=2;TCR=56;TR=18;WE=110919329;WS=110919311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,17:0.29:59
chr2	110922703	rs11675767	C	T	2231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.327;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=75;PP=1718;ReadPosRankSum=1.004;SC=CTTCACTTGACTCTTGGCCTT;SOR=1.289;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=265;TCF=73;TCR=192;TR=94;WE=110922711;WS=110922693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,97:0.35:275
chr2	110959898	rs11240794	C	G	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.825;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=467;ReadPosRankSum=0.549;SC=AGTTTCTTCTCTACTCTTGCA;SOR=1.297;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=71;TCF=66;TCR=5;TR=24;WE=110959906;WS=110959888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,25:0.33:75
chr2	111397237	.	CTT	C	175.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.744;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=14.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=2.068;QD=2.58;ReadPosRankSum=0.095;SOR=0.005;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,13:0.19:68
chr2	111556523	rs17523470	T	C	2455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.225;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=27;PP=1819;ReadPosRankSum=-0.713;SC=AGAAATGTTATACTATTCCAG;SOR=0.330;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=122;TCF=87;TCR=35;TR=84;WE=111556531;WS=111556513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,91:0.69:131
chr2	111753449	rs3761707	G	C	6373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=138;NR=61;PP=2965;SC=AATAATGATGGTCACCGTGAT;SOR=1.796;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=200;TCF=139;TCR=61;TR=199;WE=111753457;WS=111753439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr2	111789092	rs3789090	G	A	2166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=0;PP=1884;SC=TCTGCACTGTGTCCATGCTTA;SOR=8.410;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=66;TCR=0;TR=66;WE=111789100;WS=111789082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	111909610	rs79493742	A	G	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=51;ReadPosRankSum=1.074;SC=ATTGACTAGGAAGAACTGGTG;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=111909618;WS=111909600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr2	112605465	rs4848800	T	C	2098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=56;PP=1850;SC=GTAAATACGATACAAATGAAT;SOR=3.682;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=8;TCR=56;TR=64;WE=112605473;WS=112605455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	112616040	.	T	C	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.819;ClippingRankSum=0.000;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.82;MQRankSum=-2.117;QD=0.58;ReadPosRankSum=-0.877;SOR=0.152;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,11:0.11:101
chr2	112641256	rs2037198	G	A	2185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=58;PP=1805;SC=AGGCCAGTCTGAAAGCTGAGG;SOR=5.010;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=4;TCR=58;TR=62;WE=112641264;WS=112641246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	112656372	rs35898499	A	T	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.032;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=458;ReadPosRankSum=-1.372;SC=TCTGGCGTAGAGGTGAGTGCG;SOR=1.544;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=77;TCF=17;TCR=60;TR=25;WE=112656380;WS=112656362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,24:0.30:80
chr2	112686988	rs13027171	G	A	4607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.524;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=64;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.019;SC=TGCTCAATCAGTGTACCTAAT;SOR=0.650;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=231;TCF=139;TCR=92;TR=162;WE=112686996;WS=112686978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,164:0.70:235
chr2	112687157	rs138909702	A	ATATTTATTTATTTATT	1299.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.48;MQRankSum=1.778;QD=29.54;ReadPosRankSum=-0.897;SOR=3.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,33:0.75:44
chr2	112702647	rs11683694	C	T	5996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.412;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=0.721;SC=GGTAAGTCCACAGACCAGAGT;SOR=0.683;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=335;TCF=168;TCR=167;TR=220;WE=112702655;WS=112702637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,227:0.65:348
chr2	112704862	rs7601798	A	G	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.586;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=257;ReadPosRankSum=-0.367;SC=CCCGCCCCCCACAAAAAAAGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=16;WE=112704870;WS=112704852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr2	112705157	rs3761701	T	C	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=35;PP=892;SC=AAGTCCGAGCTGTGGGCTTAT;SOR=4.514;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=38;WE=112705165;WS=112705147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	112705185	rs3761700	G	T	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=5.464;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=433;ReadPosRankSum=0.239;SC=TTCTCTAATAGCGGACAGGAT;SOR=3.500;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=17;WE=112705193;WS=112705175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,17:0.85:20
chr2	112725684	rs113538397	A	ATGTGTG	4358.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.12;QD=47.38;SOR=5.574;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr2	112740373	rs1996323	G	A	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=0;PP=686;SC=ATACATCTGTGTGTGCTTTGT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=112740381;WS=112740363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	112751928	rs7604639	G	A	2253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=25;PP=1737;SC=GCCGTCACCAGAGGGGGAGTT;SOR=1.257;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=44;TCR=25;TR=69;WE=112751936;WS=112751918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
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chr2	112753097	rs6726639	A	C	6403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=148;PP=2965;SC=TCCCAGTGACACTGAAACTTG;SOR=1.975;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=204;TCF=55;TCR=149;TR=203;WE=112753105;WS=112753087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr2	112753781	rs34346510	TA	T	5274.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=91;PP=2951;SC=TTACCACAGTTAAATAACACC;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=33;TCR=94;TR=123;WE=112753789;WS=112753771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr2	112753883	rs10173553	C	T	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=34;PP=1061;SC=GCTCTTCAGGCCACCAACCAT;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=36;WE=112753891;WS=112753873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	112753950	rs13003919	G	A	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=528;ReadPosRankSum=-0.765;SC=TCTTTCAAAGGCTGTTGTGAT;SOR=0.566;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=22;WE=112753958;WS=112753940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr2	112754229	rs72825639	T	C	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.873;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=29;PP=467;ReadPosRankSum=-1.460;SC=GGTGAACTTATGCACATACAT;SOR=0.989;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=117;TCF=30;TCR=87;TR=37;WE=112754237;WS=112754219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,37:0.32:117
chr2	112754471	rs75015369	C	T	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=170;ReadPosRankSum=0.045;SC=AACCTACTCTCGATCGTTTTT;SOR=0.784;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=11;WE=112754479;WS=112754461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr2	112754720	rs4848238	A	C	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=116;ReadPosRankSum=-0.549;SC=CTAGTTTCCCATCAGTTATTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=112754728;WS=112754713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr2	112754880	rs3811633	G	A	2199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.007;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=26;PP=1637;ReadPosRankSum=-0.314;SC=CCCATGACTGGTCTATTGGTA;SOR=0.158;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=114;TCF=82;TCR=32;TR=78;WE=112754888;WS=112754870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,79:0.68:116
chr2	112754943	rs3811634	C	T	2894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=45;PP=2269;ReadPosRankSum=1.013;SC=CGCCTGGCAACGCAGATCCTG;SOR=0.658;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=170;TCF=95;TCR=75;TR=104;WE=112754951;WS=112754933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,108:0.61:177
chr2	112755001	rs2230515	A	G	5593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=102;PP=2965;SC=GATTGGGTTGATTTTATACAT;SOR=1.088;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=174;TCF=72;TCR=102;TR=174;WE=112755009;WS=112754991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr2	112761369	rs56097910	G	A	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=439;ReadPosRankSum=-0.054;SC=CTGGCTGCCCGTGGGTGAGTT;SOR=0.396;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=54;TCR=1;TR=22;WE=112761377;WS=112761359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr2	112761653	rs4848933	C	G	2042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=55;PP=1663;SC=AATCTCAGTTCCCAGTGGGCC;SOR=6.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=56;WE=112761661;WS=112761643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr2	112765973	rs1131244	A	G	1853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=18;PP=1389;SC=ACAACTCTTCACAGCGGGAGA;SOR=1.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=61;WE=112765981;WS=112765963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	112766262	rs10210692	A	G	5782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=120;NR=59;PP=2965;SC=GGACGCTGATAGGCTCAGGAA;SOR=1.623;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=180;TCF=121;TCR=59;TR=179;WE=112766270;WS=112766252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr2	112770770	rs4374383	A	G	1260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=7;PP=969;SC=CAACATGAGTACTAACCGTAG;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=37;WE=112770778;WS=112770760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	112770798	rs4500955	T	C	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=15;PP=901;SC=AGGCTGCAGCTGCATCACACA;SOR=1.414;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=43;WE=112770806;WS=112770788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	112773366	rs6710591	A	G	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=11;PP=715;SC=TCTAAAGATTATGTTCTTTTA;SOR=1.051;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=25;WE=112773374;WS=112773356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	112773528	rs111619827	TCTTGTAC	T	1223.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=18;PP=1269;SC=ATTGAGTTGCTCTTGTACCTT;SOR=2.147;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=21;WE=112773542;WS=112773518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	112779286	rs10667527	A	ATC	1093.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=22;PP=1050;SC=GCTTGCTCAGATCTCTTTTAT;SOR=4.332;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=23;WE=112779294;WS=112779276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	112779732	rs72825667	G	T	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.736;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=181;ReadPosRankSum=-1.890;SC=CCAGCTTTGTGCATGATCATC;SOR=0.112;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=11;WE=112779740;WS=112779722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr2	112785775	rs4848958	T	C	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=540;SC=GTTGTATAAATATTAGGCCAC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=112785783;WS=112785765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	112813163	rs10176769	G	A	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=372;ReadPosRankSum=-0.731;SC=CAGCTTCCTGGTCAAGATGGT;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=16;WE=112813171;WS=112813153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr2	112813190	rs145486099	G	C	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=100;ReadPosRankSum=-1.485;SC=CTGCCGCTCGGTAGCCGGGCT;SOR=0.165;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=9;WE=112813198;WS=112813180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr2	112813391	rs9308665	C	G	2448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=59;PP=1983;SC=GGCCGTCGTGCGGCTTCGCTT;SOR=2.332;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=18;TCR=59;TR=77;WE=112813399;WS=112813381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	112817458	rs58182983	A	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.89;ReadPosRankSum=1.048;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,7:0.15:46
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chr2	112832684	rs6542026	G	A	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=376;SC=ATTTAAAACCGTATGTTTTCA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=112832692;WS=112832674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	112847088	rs56112761	A	C	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.819;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=7;PP=667;ReadPosRankSum=0.334;SC=GAACAGACTGATGTGATTAGA;SOR=0.321;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=99;TCF=83;TCR=16;TR=35;WE=112847096;WS=112847078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,38:0.37:102
chr2	112847164	rs11123128	C	T	3488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.658;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=46;PP=2781;ReadPosRankSum=1.885;SC=CTCACCCATGCTTTTTCTTCT;SOR=1.179;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=182;TCF=104;TCR=78;TR=125;WE=112847172;WS=112847154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,127:0.69:185
chr2	112854931	rs56931482	C	G	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.236;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=277;ReadPosRankSum=0.165;SC=GAATTTTGAACAATTTAGTTT;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=13;WE=112854939;WS=112854921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr2	112856165	rs4849007	C	A	3054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=28;PP=2382;SC=AATTGTCCTTCTTTTAGGATT;SOR=1.657;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=65;TCR=28;TR=93;WE=112856173;WS=112856155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr2	112858122	rs4848272	C	T	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5007;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=436;ReadPosRankSum=-1.179;SC=ATTTTTTATACAATGGCTTTT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=19;WE=112858130;WS=112858112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,19:0.79:24
chr2	112863827	rs60252270	A	G	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=76;ReadPosRankSum=0.549;SC=CTGGTTGTCCATAACTGAAAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=112863835;WS=112863817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr2	112865517	rs7562848	G	C	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=28;PP=1045;SC=CCTCGTACTTGCATGTACTTG;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=112865525;WS=112865507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	112917102	rs1320360	G	C	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=0;PP=919;ReadPosRankSum=0.270;SC=TGTACTTGGGGCTGTCCAGCG;SOR=2.124;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=50;TCR=0;TR=37;WE=112917110;WS=112917092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,37:0.74:50
chr2	112945188	rs4848281	T	A	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=39;PP=1063;SC=GTTCCCGCCCTCTCACCAGTG;SOR=4.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=42;WE=112945196;WS=112945178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	113033779	.	C	T	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.18;ReadPosRankSum=-0.225;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr2	113277707	rs34238996	CA	C	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.16;MQRankSum=0.302;QD=2.23;ReadPosRankSum=-0.287;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr2	113300330	rs4849071	G	A	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=569;ReadPosRankSum=-0.660;SC=TATGACCCCAGATGCATGTGC;SOR=1.432;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=24;WE=113300338;WS=113300320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr2	113305150	rs11123139	G	C	2592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.357;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=83;PP=2262;ReadPosRankSum=-0.388;SC=CAGAGGTAATGACGGGCGTCC;SOR=1.112;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=134;TCF=11;TCR=123;TR=89;WE=113305158;WS=113305140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,87:0.66:131
chr2	113308516	rs2304555	T	A	3630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.299;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=84;PP=2763;ReadPosRankSum=-1.603;SC=AAAATGGCACTGTTATGTTGA;SOR=1.443;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=199;TCF=80;TCR=119;TR=129;WE=113308524;WS=113308506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,133:0.65:204
chr2	113308622	rs3816140	C	T	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=29;PP=756;ReadPosRankSum=-0.139;SC=AAGAAATTCACTGGGGGTAGT;SOR=0.481;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=30;WE=113308630;WS=113308612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,33:0.62:53
chr2	113309473	rs1545133	C	T	4180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.512;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=70;PP=2962;ReadPosRankSum=0.064;SC=GAGGGTTGTTCGACACAAAAA;SOR=0.519;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=221;TCF=124;TCR=97;TR=155;WE=113309481;WS=113309463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,156:0.69:225
chr2	113310197	rs11351307	CT	C	687.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-0.571;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.238;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,39:0.75:52
chr2	113315735	rs57858974	CT	C	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.464;NF=0;NR=7;PP=192;ReadPosRankSum=0.579;SC=CCTGAGAGTTCTTTTTAAAAG;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=113315743;WS=113315725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr2	113321900	rs41280572	T	C	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=2;PP=638;ReadPosRankSum=0.393;SC=GAATGTTGGATGAAGCATTCT;SOR=0.473;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=29;WE=113321908;WS=113321890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr2	113326281	rs6746874	C	G	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=301;ReadPosRankSum=-0.897;SC=AAATGTGTAACCAGTTGCAGT;SOR=0.859;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=13;WE=113326289;WS=113326271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr2	113326502	rs13010814	C	T	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.097;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=41;PP=1182;ReadPosRankSum=-1.119;SC=GATGATGTTACAGTCACAATC;SOR=1.083;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=92;TCF=27;TCR=65;TR=57;WE=113326510;WS=113326492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,57:0.61:93
chr2	113344047	rs752992	T	C	2666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.051;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=58;PP=1953;ReadPosRankSum=0.823;SC=CCCCACCCCATCACCACACAG;SOR=1.001;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=152;TCF=55;TCR=97;TR=89;WE=113344055;WS=113344037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,98:0.62:158
chr2	113346413	rs3748024	C	G	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.265;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=586;ReadPosRankSum=-0.954;SC=AGAGGAGGTGCTACTAGATGT;SOR=0.221;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=54;TCF=31;TCR=23;TR=32;WE=113346421;WS=113346403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,35:0.60:58
chr2	113346512	rs1047652	A	C	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.921;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=701;ReadPosRankSum=-1.616;SC=GACTGCCCCCACGCCCCTCCC;SOR=0.968;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=69;TCF=33;TCR=36;TR=36;WE=113346520;WS=113346502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
chr2	113404708	rs4849091	G	A	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=37;PP=1127;ReadPosRankSum=-0.257;SC=CTCAAGGGCTGCTGATGGCCG;SOR=0.730;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=31;TCR=57;TR=58;WE=113404716;WS=113404698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,58:0.66:88
chr2	113416680	rs183898160	G	C	3082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.036;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=43;PP=2507;ReadPosRankSum=1.245;SC=TGGTGAGTTGGAATTCCTGGT;SOR=1.115;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=164;TCF=91;TCR=73;TR=110;WE=113416688;WS=113416670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,110:0.66:166
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chr2	113479745	rs34781106	AC	A	2587.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=56;PP=2026;SC=GTGCCCCCCGACCCCCCGTCT;SOR=1.725;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=81;TCF=17;TCR=64;TR=72;WE=113479753;WS=113479734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr2	113480209	.	G	A	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.317;ClippingRankSum=0.000;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=980;ReadPosRankSum=0.407;SC=CCTGAGTTCCGGAGCTGAGGG;SOR=0.680;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=154;TCF=77;TCR=77;TR=51;WE=113480217;WS=113480199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,51:0.31:166
chr2	113480938	.	G	GCACA,GCA	643.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=6,6;NR=9,9;PP=163,121;ReadPosRankSum=-1.593;SC=GGGTACACATGCACACACACA;SOR=0.446;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=15,15;WE=113480946;WS=113480928;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.95:20
chr2	113481439	rs13384583	T	A	4222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=92;PP=2965;SC=GGGGACACAGTGGCACTGCAA;SOR=2.360;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=124;TCF=31;TCR=93;TR=123;WE=113481447;WS=113481429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr2	113481547	rs2063919	A	G	2655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=41;PP=2296;SC=AGGCCTCAGAAGAATGAGCAA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=42;TCR=41;TR=83;WE=113481555;WS=113481537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr2	113482779	rs4849116	A	C	6319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=89;PP=2965;SC=GTGGGCACCTACACAGGGCCC;SOR=0.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=192;TCF=103;TCR=89;TR=192;WE=113482787;WS=113482769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr2	113484319	rs2138604	G	A	6134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=124;PP=2965;SC=GATCCAGGTGGGAGCTGGGTG;SOR=1.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=183;TCF=59;TCR=124;TR=183;WE=113484327;WS=113484309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr2	113484353	rs2138605	A	G	3999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=98;PP=2965;SC=CAGGCCCAGCAGGGGCGGAGC;SOR=3.187;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=19;TCR=99;TR=117;WE=113484361;WS=113484343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr2	113484441	rs2138606	T	G	1023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=31;PP=899;SC=CTCCTCAGCCTCGCCTGGGCT;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=113484449;WS=113484431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	113496737	.	G	A	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.357;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=449;ReadPosRankSum=0.067;SC=AACATAGGGTGATACAAGAGA;SOR=2.655;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=19;WE=113496745;WS=113496727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr2	113498566	rs3811040	A	G	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.040;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=737;ReadPosRankSum=-0.933;SC=TTCAGCAACTAAAGAGTCAGA;SOR=0.102;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=31;WE=113498574;WS=113498556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,33:0.61:54
chr2	113513825	rs6731822	T	C	8791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=151;NR=143;PP=2965;ReadPosRankSum=1.188;SC=CTCTGGCTTATGGCTTTTGAC;SOR=0.234;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=296;TCF=152;TCR=144;TR=294;WE=113513833;WS=113513815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,296:1.00:297
chr2	113514883	rs11311327	AT	A	90.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=162;ReadPosRankSum=-1.561;SC=GCTAAAAAAAATAATCATTTT;SOR=0.116;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=6;WE=113514891;WS=113514873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr2	113520129	rs36093393	G	A	4596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.493;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=103;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.585;SC=TACTCCTGAAGCTTTCTCTGC;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=275;TCF=114;TCR=161;TR=172;WE=113520137;WS=113520119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,177:0.63:282
chr2	113532885	rs3783550	G	T	2462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=63;PP=2085;SC=GAACAAGATGGTAGAAAAAGG;SOR=3.198;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=12;TCR=63;TR=75;WE=113532893;WS=113532875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	113535395	rs2071376	G	T	904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=763;ReadPosRankSum=-0.837;SC=TTCTCATAGAGCCTGCCTAGG;SOR=5.353;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=27;WE=113535403;WS=113535385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr2	113535438	rs2071375	C	T	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=1;PP=526;ReadPosRankSum=-0.626;SC=GTGGGGTGGGCAGGTGGGGGC;SOR=0.600;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=27;WE=113535446;WS=113535428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr2	113537223	rs17561	C	A	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.644;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=43;PP=1070;ReadPosRankSum=-0.488;SC=CTAAAAGGTGCTGACCTAGGC;SOR=1.148;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=76;TCF=6;TCR=70;TR=46;WE=113537231;WS=113537213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,46:0.59:78
chr2	113540177	rs1894399	C	T	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=0;PP=863;ReadPosRankSum=1.502;SC=GGTCTCTGGACCTCTAGTGAG;SOR=1.656;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=50;TCR=0;TR=35;WE=113540185;WS=113540167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,34:0.68:50
chr2	113540205	rs1609682	G	T	2440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=6;PP=2085;SC=CAAAAGTATTGAAGATTCAAG;SOR=4.294;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=66;TCR=6;TR=72;WE=113540213;WS=113540195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	113588302	rs1143643	C	T	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=308;ReadPosRankSum=0.073;SC=CCCAACTTTCCGTGTGATTAT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=15;WE=113588310;WS=113588292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr2	113588755	rs1143640	CAA	C	646.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.029;NF=14;NR=1;PP=498;ReadPosRankSum=-0.318;SC=GCAAAATTGTCAAATAGACCT;SOR=0.223;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=15;WE=113588764;WS=113588746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr2	113588793	rs1143639	C	T	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.891;NF=27;NR=2;PP=526;ReadPosRankSum=0.246;SC=GGGATGGGGGCGGGGAGAAGG;SOR=0.582;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=51;TCF=48;TCR=3;TR=29;WE=113588801;WS=113588783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr2	113590390	rs1143634	G	A	1639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.404;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=45;PP=1305;ReadPosRankSum=0.047;SC=CCCATGTGTCGAAGAAGATAG;SOR=1.658;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=91;TCF=31;TCR=60;TR=64;WE=113590398;WS=113590380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,65:0.68:96
chr2	113590467	rs1143633	C	T	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=276;ReadPosRankSum=1.152;SC=TGAGGCGAGGCGGCAAAATTT;SOR=0.418;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=16;WE=113590475;WS=113590457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr2	113671303	rs3811045	T	C	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FS=3.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.12;ReadPosRankSum=-1.747;SOR=0.470;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:187,64:0.25:251
chr2	113671378	rs3811046	G	T	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FS=19.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.09;ReadPosRankSum=-0.697;SOR=1.118;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:181,60:0.25:241
chr2	113671410	rs3811047	A	G	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=13.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.33;ReadPosRankSum=-5.228;SOR=0.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,46:0.24:191
chr2	113671518	rs3811048	G	A	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=485;ReadPosRankSum=-0.837;SC=TTACAGGGTGGGAGAATTGTA;SOR=1.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=23;WE=113671526;WS=113671508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr2	113763393	rs200675990	C	G	1730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=10;PP=1508;ReadPosRankSum=0.529;SC=CTCTTGGGGTCGGTCTGCACA;SOR=0.619;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=88;TCR=16;TR=67;WE=113763401;WS=113763383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,65:0.64:102
chr2	113763575	rs895497	A	G	3653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=76;PP=2846;SC=ACACCTCAGCAGGGGAGCATT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=38;TCR=76;TR=114;WE=113763583;WS=113763565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr2	113783570	rs13030063	C	T	1271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=0;PP=1083;SC=CTTAGACCTGCCATGGGTGAT;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=38;WE=113783578;WS=113783560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	113783909	rs6744874	A	T	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=522;SC=AAAGGCCTGCATACAGCATGT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=113783917;WS=113783899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	113785020	rs12711747	A	G	1257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=1;PP=958;SC=TTAGGATTAGAAAGACATGCA;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=33;WE=113785028;WS=113785010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	113785202	rs11673918	G	A	6754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=109;NR=98;PP=2965;SC=TTGGGGGGTTGACTAAACTGG;SOR=0.789;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=208;TCF=109;TCR=99;TR=207;WE=113785210;WS=113785192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr2	113785727	rs1562304	A	G	1314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.30;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	113786833	rs3948121	C	G	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=529;SC=CCCCAGTTGTCACCAGGACAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=113786841;WS=113786823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	113789316	rs2305150	C	T	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=24;PP=1041;SC=GTGAAGAGAACAAGATAGATC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=23;TCR=24;TR=47;WE=113789324;WS=113789306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	113816940	rs2278716	C	G	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=4.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.38;ReadPosRankSum=-0.185;SOR=0.151;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr2	113816940	.	CCA	GCC	484	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=6;NR=3;PP=484;QD=59.7186527625;SC=CAGACCCCAGCCAACTCAGCC;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=9;WE=113816950;WS=113816930;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr2	113816942	rs2278717	A	C	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=4.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.38;ReadPosRankSum=-0.185;SOR=0.151;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr2	113818632	rs2251872	G	A	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=421;SC=CCCAGGCATTGGGGCAGCACA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=113818640;WS=113818622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	113818702	rs2515395	G	C	147.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=114;SC=TGAAGACACAGGCTCTGGGGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=113818710;WS=113818692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	113819614	rs2252007	T	C	2769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=9;PP=2341;SC=CAGGCCGTCTTACAGCAGTCC;SOR=3.994;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=73;TCR=9;TR=82;WE=113819622;WS=113819604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr2	113830173	rs3811050	C	T	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=510;ReadPosRankSum=-1.712;SC=CAATTATAGACGAATGGCCTG;SOR=2.226;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=22;WE=113830181;WS=113830163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,22:0.76:29
chr2	113830201	rs3811051	T	G	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=0;PP=567;ReadPosRankSum=0.510;SC=CGTGCAGCCCTTGGCTGAGTG;SOR=1.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=30;WE=113830209;WS=113830191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr2	113830563	rs12469822	G	A	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.102;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=106;ReadPosRankSum=0.820;SC=CAAAAAGTCTGTAAGTGGAGT;SOR=0.082;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=7;WE=113830571;WS=113830553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr2	113830582	rs4849150	A	C	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=332;SC=GTGTTATTAAACCCATTTTAC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=113830590;WS=113830572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	113831945	rs3811058	T	C	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.844;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=175;ReadPosRankSum=1.478;SC=ACACAAGAGATGGCCAGCTGC;SOR=1.609;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=70;TCF=22;TCR=48;TR=20;WE=113831953;WS=113831935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,20:0.28:72
chr2	113832312	rs6761276	T	C	1494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=5.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.564;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=42;PP=1216;ReadPosRankSum=0.238;SC=AAGATCTGCATACTTCCTAAC;SOR=1.700;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=65;TCF=11;TCR=54;TR=49;WE=113832320;WS=113832302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,50:0.76:66
chr2	113832333	rs6743376	C	A	1632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=43;PP=1285;SC=AGAGGCTTGGCCCGCACCAAG;SOR=3.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=8;TCR=43;TR=51;WE=113832341;WS=113832323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	113875509	rs2234677	G	A	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=0.861;SC=CCCAGGTACTGCCCGGGTGCT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=7;WE=113875517;WS=113875499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr2	113875565	rs2234678	A	G	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.84;ReadPosRankSum=-0.232;SOR=1.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,14:0.26:53
chr2	113875584	rs2234679	G	C	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.561;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=240;ReadPosRankSum=0.314;SC=CCTGTCCTATGAGGCCCTCCC;SOR=0.366;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=61;TCF=40;TCR=21;TR=17;WE=113875592;WS=113875574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,17:0.28:61
chr2	113875631	rs16065	T	C	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=338;ReadPosRankSum=0.666;SC=TCTCATTTTTTCACCTGAGAA;SOR=0.619;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=78;TCF=44;TCR=34;TR=23;WE=113875639;WS=113875621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,23:0.29:78
chr2	113875753	rs4251969	C	G	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.958;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=287;ReadPosRankSum=-0.625;SC=TCTGGGGGATCTGGGCACGGG;SOR=1.296;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=51;TCF=11;TCR=40;TR=19;WE=113875761;WS=113875743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,18:0.33:54
chr2	113875773	rs4251970	A	G	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.551;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=181;ReadPosRankSum=0.586;SC=GGAGGCATCCATGGGAGACCA;SOR=1.700;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=12;WE=113875781;WS=113875763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,10:0.26:39
chr2	113877495	rs928940	G	T	900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=631;SC=GTGCATACTCGGACTGGAAAC;SOR=3.690;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=113877503;WS=113877485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	113877538	rs4251986	G	C	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.05;ReadPosRankSum=-0.063;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,11:0.20:54
chr2	113877713	rs878972	A	C	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=179;ReadPosRankSum=0.546;SC=AGGGTAAATTATTTTTAGGAT;SOR=0.645;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=13;WE=113877721;WS=113877703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,13:0.28:46
chr2	113887207	rs419598	T	C	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FS=0.504;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.93;ReadPosRankSum=0.055;SOR=0.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:194,73:0.27:267
chr2	113887262	rs423904	C	T	1410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.206;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=49;PP=2429;ReadPosRankSum=-1.255;SC=GCCAGGAAAGCCAATGTATGT;SOR=0.892;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=200;TCF=50;TCR=150;TR=63;WE=113887281;WS=113887252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,65:0.32:203
chr2	113887273	rs446433	G	A	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=43;PP=2429;ReadPosRankSum=-1.141;SC=CAATGTATGTGGGCATCACGT;SOR=0.648;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=160;TCF=31;TCR=129;TR=53;WE=113887281;WS=113887252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,54:0.33:163
chr2	113887294	rs495282	G	C	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=7.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.254;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=34;PP=746;ReadPosRankSum=1.726;SC=CACTTTGCCCGTCTGTCTGCA;SOR=0.941;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=114;TCF=12;TCR=102;TR=37;WE=113887302;WS=113887284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,38:0.32:118
chr2	113887338	rs495410	A	C	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=415;ReadPosRankSum=-0.368;SC=CCCTAGGTGCAATGTCCTAAT;SOR=1.040;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=1;TCR=52;TR=20;WE=113887346;WS=113887328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,22:0.39:56
chr2	113888557	rs451578	G	A	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=5.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.859;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=285;ReadPosRankSum=0.806;SC=AAAAATACCCGGGGTCTCTTC;SOR=1.760;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=16;WE=113888565;WS=113888547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,17:0.31:54
chr2	113888579	rs432014	T	C	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.205;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=359;ReadPosRankSum=-0.030;SC=TTATTGCTGCTTCCTCTTCTA;SOR=0.940;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=67;TCF=54;TCR=13;TR=21;WE=113888587;WS=113888569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,24:0.34:70
chr2	113888793	rs454078	A	T	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.989;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=37;PP=800;ReadPosRankSum=-0.733;SC=AAACAACCAAAATTTTTTCTT;SOR=0.996;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=179;TCF=64;TCR=115;TR=53;WE=113888801;WS=113888783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,54:0.29:188
chr2	113888900	rs380092	T	A	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=354;ReadPosRankSum=0.681;SC=GCAGAGTGCCTGGCTTGCGCT;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=0;TCR=52;TR=17;WE=113888908;WS=113888890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,20:0.36:55
chr2	113940681	rs3748914	T	C	2182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.766;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=33;PP=1663;ReadPosRankSum=-1.647;SC=AAGACAGCAGTGAGCCTGAGG;SOR=0.826;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=119;TCF=70;TCR=49;TR=84;WE=113940689;WS=113940671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,85:0.71:119
chr2	113940839	rs4849167	G	C	4009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.507;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=74;PP=2960;ReadPosRankSum=0.658;SC=TTTTCCTGGGGGGCTTCAGAC;SOR=0.630;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=231;TCF=120;TCR=111;TR=152;WE=113940847;WS=113940829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,161:0.68:238
chr2	113942903	rs1975535	A	C	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=672;ReadPosRankSum=-0.078;SC=CTCTCTGTGTATCCAGGGCTC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=29;WE=113942911;WS=113942893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr2	113943470	rs2241976	A	G	2242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.704;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=28;PP=1665;ReadPosRankSum=0.363;SC=GGGAGGGTGGACACCCCCAGG;SOR=0.815;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=117;TCF=71;TCR=46;TR=75;WE=113943478;WS=113943460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,81:0.64:126
chr2	113953401	rs923693	A	G	5633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=93;PP=2965;SC=CTGTCTTTGGACTGTCCTCCC;SOR=0.811;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=174;TCF=81;TCR=93;TR=174;WE=113953409;WS=113953391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr2	113953657	rs4849169	A	C	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.855;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=8;PP=701;ReadPosRankSum=1.217;SC=AGGCTCTGGGAGGCAATGGAT;SOR=0.864;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=133;TCF=104;TCR=29;TR=42;WE=113953665;WS=113953647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,42:0.31:135
chr2	113953952	rs4848318	T	C	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=105;ReadPosRankSum=-0.022;SC=CCTGTGCCGATGCATGCACAG;SOR=0.096;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=12;WE=113953960;WS=113953942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,12:0.23:52
chr2	113953973	rs71385890	A	AT	221.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=600;ReadPosRankSum=0.423;SC=GTGTGCAGAGAGACAGCCCGC;SOR=0.142;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=7;WE=113953984;WS=113953963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr2	113953974	rs10579377	GACA	G	221.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=600;ReadPosRankSum=0.969;SC=TGTGCAGAGAGACAGCCCGCG;SOR=0.114;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=7;WE=113953984;WS=113953963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr2	113955074	rs902695	G	A	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.636;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=361;ReadPosRankSum=0.664;SC=GCACACTTGCGTGTGTCTGAG;SOR=0.769;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=84;TCF=45;TCR=39;TR=25;WE=113955082;WS=113955064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,25:0.29:85
chr2	113956371	rs2276561	G	C	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.278;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=785;ReadPosRankSum=-0.390;SC=CTGCGGCCACGCACTCCGCGC;SOR=0.775;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=151;TCF=75;TCR=76;TR=43;WE=113956379;WS=113956361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,43:0.28:151
chr2	113956821	rs2305133	C	G	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.627;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=49;ReadPosRankSum=-1.233;SC=GCCGAGCCCACCTCCCCGCCG;SOR=1.692;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=7;WE=113956829;WS=113956811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr2	113977862	rs4849175	T	G	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=319;SC=CAGGAATGGTTGGGGAGACAG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=113977870;WS=113977852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	113994417	rs1110839	G	T	2090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=54;PP=1749;SC=GGTCCTCATCGCCCCCTTCTT;SOR=3.293;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=10;TCR=55;TR=64;WE=113994425;WS=113994407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	114000458	rs902691	C	A	1117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=31;PP=923;SC=TGGGTATCTCCAAGGCACTTG;SOR=3.321;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=36;WE=114000466;WS=114000448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	114386338	rs149500718	G	A	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=27.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	114425425	rs145764632	C	A	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.90;QD=32.35;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	114426115	rs80314553	T	C	2725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.23;QD=32.84;SOR=4.830;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr2	114476582	rs6741521	C	A	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=3;PP=438;SC=AGATCTAAACCAATTATTTTA;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=114476590;WS=114476572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	114480812	rs3835109	A	AAAC	477.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.53;NF=1;NR=10;PP=564;SC=TTAAAAAATTAAACCAAAGAA;SOR=3.611;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=11;WE=114480820;WS=114480802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	114480881	rs73955056	A	G	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.63;ReadPosRankSum=-1.834;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr2	114486880	rs3841578	GA	G	74.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=-0.431;SC=TCATACGGAAGAAAAAAAAAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=114486888;WS=114486874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr2	114486907	rs4849269	T	C	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=200;SC=CTATTCCCTCTGAAAAACAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=114486915;WS=114486897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	114492135	rs2305254	C	T	1030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=718;ReadPosRankSum=1.081;SC=TTAAGCAGAGCAAACTAGCTA;SOR=0.399;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=31;WE=114492143;WS=114492125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr2	114493524	rs10199704	C	T	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=36;PP=1255;SC=TTGTTCTCCTCCTAAATACCG;SOR=2.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=45;WE=114493532;WS=114493514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	114500473	rs3748905	T	C	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=37;PP=926;ReadPosRankSum=-0.306;SC=AGGAAGAGCATAATATGAAAT;SOR=0.690;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=143;TCF=32;TCR=111;TR=49;WE=114500481;WS=114500463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,49:0.34:145
chr2	114501242	rs3748907	T	C	1928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.210;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=38;PP=1447;ReadPosRankSum=-0.414;SC=AGTTCTGAAGTGGCTTGAATA;SOR=0.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=91;TCF=45;TCR=46;TR=74;WE=114501250;WS=114501232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,76:0.81:94
chr2	114513386	rs7578249	C	T	2578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=26;PP=1996;SC=AGTTAACTACCAGAAAATAGC;SOR=1.473;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=56;TCR=26;TR=82;WE=114513394;WS=114513376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr2	114513787	rs4538208	C	G	1925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=60;NR=7;PP=1433;SC=CGCAGGGCTCCGGCGCCCCTG;SOR=3.706;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=60;TCR=7;TR=67;WE=114513795;WS=114513777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	114514098	rs7592689	A	C	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=271;SC=GCTCCTGAAGACGCGGTGCCC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=114514106;WS=114514088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	115200246	rs151095638	G	A	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=250;ReadPosRankSum=0.123;SC=AGCAGTAGCAGCGGCAGCAGC;SOR=0.914;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=13;WE=115200254;WS=115200240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr2	115822286	rs1509742	T	G	2904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=15;PP=2368;SC=AGTAAGATTCTGTGAGGGTGA;SOR=3.567;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=84;TCR=15;TR=99;WE=115822294;WS=115822276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr2	115919677	rs7557011	CT	GC	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=58.06;NF=4;NR=2;PP=299;SC=CCGCCTCCCGCTTCCCAGGCT;SOR=1.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=6;WE=115919686;WS=115919667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	116066984	rs975453	G	A	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=34;PP=1013;SC=TGATAATTTCGCATTCAAATG;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=37;WE=116066992;WS=116066974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	116099725	rs843403	A	T	1431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=40;PP=1189;SC=CAAACTCATTAAGCACTCTCT;SOR=4.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=43;WE=116099733;WS=116099715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	116283668	rs984066	G	A	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=12;PP=527;SC=AACTACCGGAGGACAGTAATG;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=19;WE=116283676;WS=116283658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	116447277	rs35766316	G	A	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=103;ReadPosRankSum=-0.274;SC=TTCATTATTCGTATACTGCTT;SOR=0.563;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=8;WE=116447285;WS=116447267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,8:0.24:34
chr2	116447606	rs62155260	T	C	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=125;ReadPosRankSum=0.975;SC=CAAAACTTTATGTTTCCCTAA;SOR=0.512;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=8;WE=116447614;WS=116447596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr2	116497445	.	AG	A	2662.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=0.000;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.770;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=1.439;NF=10;NR=56;PP=2473;ReadPosRankSum=0.682;SC=TGTATCCCAAAGGAAAGCAGT;SOR=0.831;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=108;TCF=20;TCR=88;TR=66;WE=116497453;WS=116497435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,86:0.67:129
chr2	116497479	rs1550854	A	G	3000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=70;PP=2309;SC=GGTAAGTAACATGGAAGTACT;SOR=3.033;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=16;TCR=71;TR=86;WE=116497487;WS=116497469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr2	116497528	rs1550853	A	G	1397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=39;PP=1181;SC=GTGACTTGACAGATGGTATTC;SOR=6.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=40;WE=116497536;WS=116497518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	116503671	rs36044503	G	A	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.965;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=566;ReadPosRankSum=0.819;SC=GGCAGGTCAAGTGAACCCAAC;SOR=1.037;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=78;TCF=47;TCR=31;TR=28;WE=116503679;WS=116503661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,29:0.36:81
chr2	116510817	rs2053724	G	C	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.776;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=26;PP=957;ReadPosRankSum=-0.112;SC=GTTAAACCGAGCTCAGAACAT;SOR=0.512;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=84;TCF=37;TCR=47;TR=48;WE=116510825;WS=116510807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,49:0.58:85
chr2	116525960	rs1446495	G	A	3678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=59;PP=2642;SC=ATTTCACCACGTAGCTATGTT;SOR=0.759;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=57;TCR=59;TR=116;WE=116525968;WS=116525950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr2	116539911	rs75830748	A	G	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.497;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=340;ReadPosRankSum=-0.094;SC=ATTTATACACATATTTTTAAA;SOR=1.242;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=61;TCF=46;TCR=15;TR=21;WE=116539919;WS=116539901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,25:0.38:65
chr2	116548526	rs6735355	A	G	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=144;ReadPosRankSum=-1.404;SC=TAGTAATTCAAAAGAGAAATG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=116548534;WS=116548516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr2	116548820	rs3738879	C	T	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=541;ReadPosRankSum=0.851;SC=GTTTTACCTGCAAATGACTCT;SOR=0.648;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=59;TCF=31;TCR=28;TR=28;WE=116548828;WS=116548810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
chr2	116593675	rs10549769	ATG	A	1354.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=7.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=2.075;QD=23.36;ReadPosRankSum=-0.268;SOR=0.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,46:0.79:58
chr2	116593692	rs62157981	T	A	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=7.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=-0.933;QD=0.60;ReadPosRankSum=2.309;SOR=2.253;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,10:0.14:70
chr2	116594221	rs736335	G	C	1330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.975;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=28;PP=1037;ReadPosRankSum=-0.709;SC=TAGATCTATAGATACAGATAT;SOR=0.066;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=56;TCF=16;TCR=40;TR=43;WE=116594229;WS=116594211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,46:0.77:60
chr2	116598431	rs62157986	C	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.316;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=295;ReadPosRankSum=0.190;SC=ACGTGTTTTCCTGCTGTGTTT;SOR=0.976;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=15;WE=116598439;WS=116598421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr2	116598546	rs272011	G	A	257.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=213;SC=CTCTGTTCCTGATTACACCGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=116598554;WS=116598536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	116599659	rs272010	A	T	1086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=1;PP=865;SC=AACTTAGAGTAGAATTAGGTT;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=116599667;WS=116599649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	116599927	rs272009	T	C	2537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=76;PP=1875;SC=AATAATGGACTGTATTTATAC;SOR=4.431;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=7;TCR=76;TR=83;WE=116599935;WS=116599917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr2	118572471	rs3755492	A	C	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.175;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=347;ReadPosRankSum=-0.577;SC=GGCTCAGAAGACCCACGCGCG;SOR=1.450;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=65;TCF=20;TCR=45;TR=20;WE=118572479;WS=118572461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,20:0.30:67
chr2	118583940	rs2303348	C	T	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.581;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=2;PP=563;ReadPosRankSum=-0.145;SC=GTTTTCTTCGCTACTTGAAAC;SOR=2.445;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=108;TCF=87;TCR=21;TR=32;WE=118583948;WS=118583930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,35:0.30:118
chr2	118688754	rs971754	T	C	3354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=80;PP=2521;SC=GAAATGGTGATGAAAAGACAT;SOR=2.021;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=31;TCR=80;TR=111;WE=118688762;WS=118688744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr2	118704478	rs7580124	T	G	3158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=88;PP=2569;SC=TGACATGAACTTTTACAAAAT;SOR=3.507;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=14;TCR=88;TR=102;WE=118704486;WS=118704468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr2	118704503	rs2303329	A	G	2724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=79;PP=2297;SC=ACAAGGAGTAATTAGACGCAA;SOR=6.618;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=82;TCF=2;TCR=80;TR=81;WE=118704511;WS=118704493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr2	118705570	rs10186396	A	G	2168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.99;NF=67;NR=11;PP=1853;SC=GCGCCTGGCCAAATCTGCTTT;SOR=3.640;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=68;TCR=11;TR=78;WE=118705578;WS=118705560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr2	118706879	rs1035598	A	G	4314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=77;PP=2965;SC=AAAAATAAGCACATGCTGAAA;SOR=0.976;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=61;TCR=77;TR=138;WE=118706887;WS=118706869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr2	118731573	rs748767	G	A	3994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=81;NR=46;PP=2965;SC=AGACGGCTCTGCAAGTATATG;SOR=1.270;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=81;TCR=46;TR=127;WE=118731581;WS=118731563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr2	118732975	rs6722547	T	C	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=517;SC=AGCAGCAGCATCCTGAGAGAG;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=118732983;WS=118732965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	118735395	rs889899	G	A	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=1;PP=600;SC=TTGCTCCCCAGTCTGTAGAGG;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=118735403;WS=118735385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	118743736	.	C	G	221	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5005;HP=21;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=53.94;NF=3;NR=7;PP=221;QD=25.5771212547;SC=GGTATATTCTCTTTTTTTTTT;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=10;WE=118743744;WS=118743726;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr2	118753097	rs17584619	C	T	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.855;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.583;NF=11;NR=18;PP=444;ReadPosRankSum=1.699;SC=CAAAACAGAGCGATTAAACAA;SOR=1.020;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=106;TCF=46;TCR=60;TR=29;WE=118753105;WS=118753087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,29:0.27:108
chr2	118753148	rs10633675	A	ATC	3117.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=64;PP=2965;SC=CCACTCAGATATGTCTTATAA;SOR=4.774;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=68;TCF=1;TCR=67;TR=65;WE=118753156;WS=118753138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr2	118764242	rs34609704	C	CA	2230.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=17;PP=2112;SC=ACACAGTAGACACTCAAAAGT;SOR=1.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=47;WE=118764250;WS=118764232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr2	118766024	rs10864966	A	G	3490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=93;NR=1;PP=2909;SC=CAGACATGGAAGAAGTTAAAA;SOR=7.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=94;TCF=93;TCR=1;TR=94;WE=118766032;WS=118766014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr2	118771663	rs12477588	A	G	3004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=53;PP=2318;SC=GGGGTGGAGTACAAAGCGGAA;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=39;TCR=54;TR=92;WE=118771671;WS=118771653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
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chr2	119726678	rs13004924	G	A	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=618;ReadPosRankSum=-0.663;SC=GGAGCAGGCAGGGACTTCCTG;SOR=0.829;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=29;WE=119726686;WS=119726668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,29:0.71:41
chr2	119732042	rs11693199	T	C	3650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=63;PP=2914;SC=TTCTGACCCTTAATCATTTTC;SOR=1.129;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=45;TCR=63;TR=108;WE=119732050;WS=119732032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr2	119739127	rs111379161	CT	C	62.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=2.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=1.849;QD=1.23;ReadPosRankSum=1.795;SOR=0.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,12:0.24:51
chr2	119739269	rs56216274	C	T	2129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=52;PP=1720;SC=ATCCCAGCTACGACTGTCCCT;SOR=2.517;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=15;TCR=53;TR=67;WE=119739277;WS=119739259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	119748135	rs3835093	TC	T	1017.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=1.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=1.046;QD=6.36;ReadPosRankSum=1.021;SOR=0.823;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,57:0.36:160
chr2	119749477	rs2304708	T	G	3959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=75;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.277;SC=CTGATTCCTTTGTTCTTAGGA;SOR=0.599;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=192;TCF=86;TCR=106;TR=137;WE=119749485;WS=119749467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,142:0.71:199
chr2	119749611	rs4848530	C	T	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=30;PP=785;ReadPosRankSum=-0.384;SC=TGTGCTGGGGCTTGCCCTAGG;SOR=1.287;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=32;WE=119749619;WS=119749601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,35:0.71:49
chr2	119749858	rs3765035	A	G	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=176;ReadPosRankSum=0.903;SC=CCCGCAGGACATCCCATCCCC;SOR=0.481;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=11;WE=119749866;WS=119749850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr2	119915132	rs11308896	CG	C	1364.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=3;PP=1590;SC=CGAGGGTTTACGGGGGCCGGT;SOR=4.664;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=46;TCF=43;TCR=3;TR=40;WE=119915140;WS=119915122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	119915249	rs7556873	T	C	1560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.913;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=18;PP=1128;ReadPosRankSum=1.773;SC=AGATGCCGCGTACCTGGCAGC;SOR=1.258;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=192;TCF=124;TCR=68;TR=65;WE=119915257;WS=119915239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,69:0.35:197
chr2	119915509	rs1317848	G	T	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.450;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=673;ReadPosRankSum=0.730;SC=AGCCCGGGCCGCCCCGAGTCG;SOR=1.232;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=29;WE=119915517;WS=119915499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr2	119988565	rs838100	G	A	1078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.352;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=28;PP=760;ReadPosRankSum=0.544;SC=TGACCTGAGAGCCTCAGACCC;SOR=0.873;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=160;TCF=68;TCR=92;TR=48;WE=119988573;WS=119988555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,50:0.30:165
chr2	120003642	rs838083	C	T	1293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=34;PP=1023;SC=CCAGCATGCTCTTTTTGATAT;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=37;WE=120003650;WS=120003632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	120005840	rs67985074	TC	T	804.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=2.980;NF=6;NR=28;PP=396;ReadPosRankSum=-0.296;SC=GTCCAGCACCTCCCCCCCCCA;SOR=0.672;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=110;TCF=22;TCR=88;TR=34;WE=120005848;WS=120005829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,40:0.37:108
chr2	120012171	rs12711924	G	A	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=2;PP=587;ReadPosRankSum=-1.058;SC=AGCGCCCGCCGTCTTGTCTTT;SOR=0.892;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=27;WE=120012179;WS=120012161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr2	120014985	rs838072	A	G	1933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=0;PP=1612;SC=GGCTCTGGCAATCTATTTTTG;SOR=8.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=55;TCR=0;TR=55;WE=120014993;WS=120014983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	120059895	rs16744	G	GGAAA	538.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=588;ReadPosRankSum=-0.584;SC=AAAGAGAGAAGGAAAGACCTG;SOR=1.085;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=11;WE=120059903;WS=120059885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr2	120059921	rs8600	C	A	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=397;ReadPosRankSum=1.048;SC=AAAGAAATAACCAGATTTTAG;SOR=0.473;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=15;WE=120059929;WS=120059911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr2	120059988	rs1890	T	C	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.151;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;PP=991;ReadPosRankSum=1.084;SC=ATTTCAAAAATTCAGCAGTGG;SOR=0.314;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=45;WE=120059996;WS=120059978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,46:0.72:64
chr2	120060082	rs1052500	T	C	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=891;ReadPosRankSum=-0.126;SC=TTTGTAGTTCTTATAATCTTC;SOR=0.626;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=24;TCR=41;TR=45;WE=120060090;WS=120060072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,48:0.71:68
chr2	120078689	rs6719102	T	C	392.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=338;ReadPosRankSum=-0.408;SC=TAATGCAAAATTGTATTTATA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=14;WE=120078697;WS=120078679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr2	120078778	rs1132267	T	C	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=640;ReadPosRankSum=1.694;SC=CTTAAAGGGATATCTACAAGA;SOR=0.551;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=43;TCF=21;TCR=22;TR=31;WE=120078786;WS=120078768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,32:0.74:43
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chr2	120125029	rs2084202	A	G	5106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=34;PP=2965;SC=TCCGTGGCCGAGAGCTTGGAG;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=105;TCR=34;TR=139;WE=120125037;WS=120125019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
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chr2	120125689	rs8192503	A	T	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=74;ReadPosRankSum=-0.770;SC=CTGGGCTGTCATCAGGCCACA;SOR=1.140;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=5;WE=120125697;WS=120125679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr2	120125910	rs2276596	C	A	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=246;ReadPosRankSum=-2.034;SC=GGAAGGGCATCTGCTCATCAA;SOR=0.418;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=53;TCF=21;TCR=32;TR=16;WE=120125918;WS=120125900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,15:0.28:54
chr2	120125936	rs2244135	T	C	1489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=31;PP=1223;SC=GCTCAGCAGCTCAGACTGGAA;SOR=1.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=45;WE=120125944;WS=120125926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	120125973	rs3091407	G	C	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=480;ReadPosRankSum=-0.820;SC=CTCTCAAACTGCCTGAGGCCC;SOR=0.146;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=21;WE=120125981;WS=120125963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr2	120128482	rs956309	C	T	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=6.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=30;PP=638;ReadPosRankSum=-1.656;SC=CAATGGGGCACGTGTGGGAAA;SOR=0.719;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=84;TCF=5;TCR=79;TR=31;WE=120128490;WS=120128472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,33:0.38:88
chr2	120187344	rs11123523	A	G	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=180;SC=CCTCCTTATTATTCTTAAGTC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=120187352;WS=120187334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	120189404	rs4340531	A	G	114.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.51;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	120189433	rs4599130	G	C	133.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=1;PP=103;SC=CGGCCACAGCGGAGCAGCTGG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=120189441;WS=120189423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	120194651	rs3217464	A	AGTGTGC	4111.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=45;PP=2957;SC=CACCAACCAGACGATCTGCTT;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=22;TCR=54;TR=63;WE=120194659;WS=120194641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr2	120197670	rs1042656	G	A	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=5;PP=847;SC=GTCTCTGTCCGTGGGTGACCC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=31;WE=120197678;WS=120197660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	120199140	rs1126839	A	G	5277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=101;PP=2965;SC=TCACCTCCCCATTGAGGAAGC;SOR=1.141;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=171;TCF=70;TCR=101;TR=171;WE=120199148;WS=120199130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr2	120209689	rs2587692	A	G	2682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=65;PP=2186;SC=GGTTATGAGCAGGAGCTGTGG;SOR=2.387;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=20;TCR=65;TR=85;WE=120209697;WS=120209679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	120221585	rs2253870	G	A	735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=593;SC=TTGGTATTAAGTGCAGCCTCA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=120221593;WS=120221575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	120221984	rs2579647	A	C	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=389;SC=TGAATGAGGAACTGGGTCTCC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=120221992;WS=120221974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	120230998	rs2579641	G	A	1312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=9;PP=1073;SC=TCCTGTCCCCGGGTTCGTGGG;SOR=2.476;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=41;WE=120231006;WS=120230988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	120231165	rs2587701	T	C	2240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=54;PP=1645;SC=AGGTGAGCCATGGGCCCAGGC;SOR=2.103;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=20;TCR=54;TR=74;WE=120231173;WS=120231155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	120231303	rs2587702	T	C	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=12;PP=312;SC=AGGGGGAAAGTGATTTGAACC;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=120231311;WS=120231293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	120303820	rs2579624	A	T	2437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=57;PP=1916;SC=AAAAGAAAAGAAGTACCTAAT;SOR=2.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=12;TCR=57;TR=69;WE=120303828;WS=120303810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr2	120362407	rs1568540	C	T	5448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=98;PP=2965;SC=GAAAGGGTGACAGAGGGGCAG;SOR=1.017;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=72;TCR=98;TR=169;WE=120362415;WS=120362397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr2	120362897	rs1521914	T	A	2582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=73;PP=2175;ReadPosRankSum=-0.740;SC=GTATCAAGTGTCAGTACAGTT;SOR=4.073;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=4;TCR=74;TR=77;WE=120362905;WS=120362887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,79:0.99:80
chr2	120366057	rs11398750	G	GT	1334.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.510;NF=38;NR=11;PP=515;ReadPosRankSum=0.798;SC=TCTGGACACAGTTTTTTTTTT;SOR=0.672;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=75;TCF=59;TCR=16;TR=49;WE=120366065;WS=120366047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,57:0.95:60
chr2	120369300	rs10864986	T	C	6592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=117;PP=2965;SC=ATAAACGGGTTGTTCGCAATC;SOR=0.794;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=227;TCF=110;TCR=117;TR=226;WE=120369308;WS=120369290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr2	120383138	rs77292092	CATT	C	3540.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.345;NF=64;NR=4;PP=2957;ReadPosRankSum=0.722;SC=AATTTGAAATCATTATCCACT;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=77;TCF=72;TCR=5;TR=68;WE=120383148;WS=120383128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr2	120385094	rs200629080	GATATATAT	G,GAT	1091.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22,22;NR=0,0;PP=283,789;ReadPosRankSum=0.405;SC=AGTAAAAGTGGATATATATAT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=22,22;WE=120385109;WS=120385084;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.40,0.57:30
chr2	120387637	rs12711931	G	C	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=605;SC=TGGTAGATTAGACTGTGTGGC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=120387645;WS=120387627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	120388412	rs2272058	G	A	5876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=113;PP=2965;SC=CAAAACATCAGTCTTGAGCAT;SOR=1.355;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=65;TCR=113;TR=178;WE=120388420;WS=120388402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr2	120404629	rs11349518	AT	A	3018.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.615;HP=15;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;MQRankSum=0.566;NF=19;NR=97;PP=1466;ReadPosRankSum=0.915;SC=GTAGAACGGTATTTTTTTTTT;SOR=0.246;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=194;TCF=34;TCR=160;TR=116;WE=120404638;WS=120404618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:8,145:0.95:153
chr2	120409430	rs1521912	A	G	996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=0;PP=852;SC=ACAAAAGTAGATGGAACTAAA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=120409438;WS=120409420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	120414062	.	C	T	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.798;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.127;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=26;PP=607;ReadPosRankSum=-1.577;SC=ACCAGTAGGTCAGTCCCTTCC;SOR=0.197;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=49;TCF=6;TCR=43;TR=31;WE=120414070;WS=120414052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,32:0.62:52
chr2	120414083	rs6761357	C	T	1209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=33;PP=956;SC=ATTTGCTTTCCGTGGGCCACT;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=35;WE=120414091;WS=120414073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	120438523	rs13011768	A	G	6991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=82;PP=2965;SC=TGGAGTTCCAATCTCGTACCA;SOR=1.106;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=206;TCF=123;TCR=83;TR=205;WE=120438531;WS=120438513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr2	120438696	rs939777	A	G	9787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=137;NR=155;PP=2965;SC=TCACCTTCCAACCTGTGAGTG;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=293;TCF=138;TCR=155;TR=292;WE=120438704;WS=120438686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr2	120439230	rs1983406	C	G	6272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=119;PP=2965;SC=TGGGCAAAGACGGGGAGAAGC;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=71;TCR=119;TR=190;WE=120439238;WS=120439220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr2	120443443	rs939778	A	G	2823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=74;PP=2286;SC=GTTAGAAGTAACTTTTTCAGG;SOR=4.332;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=8;TCR=74;TR=82;WE=120443451;WS=120443433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	120635205	rs3768914	G	A	91.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=63;ReadPosRankSum=-0.253;SC=AGAAATTACTGTGGTGTAATT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=120635213;WS=120635195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr2	120643280	rs74866537	G	GT	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=59;ReadPosRankSum=-1.282;SC=AGACTGCTCAGTTTTTTCAGA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=120643288;WS=120643270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr2	120689905	rs2292361	A	G	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.674;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=292;ReadPosRankSum=0.120;SC=TTGCTCATCTAGAACATAATC;SOR=0.061;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=43;TCF=42;TCR=1;TR=15;WE=120689913;WS=120689895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,15:0.34:44
chr2	120703842	rs2289581	A	G	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=2.000;SC=CATACAAAAAATATGCTTCCT;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=3;WE=120703850;WS=120703832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr2	120704164	rs3214717	A	AT	769.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.190;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=1070;ReadPosRankSum=0.795;SC=AGTTATCTAAATGTTTCAAAT;SOR=0.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=16;WE=120704174;WS=120704154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr2	120704166	rs2289580	G	T	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.190;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=1099;ReadPosRankSum=0.375;SC=TTATCTAAATGTTTCAAATAA;SOR=0.473;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=20;WE=120704174;WS=120704154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr2	120718322	rs12618050	A	G	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.20;ReadPosRankSum=-0.157;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr2	120718672	rs6737776	T	G	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=7;PP=202;SC=AATCATCATGTTTAAGTGCAT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=120718680;WS=120718662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	120720133	rs147401949	G	T	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.562;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=192;ReadPosRankSum=-0.017;SC=TTTAAAAATTGGAGAACATGA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=9;WE=120720141;WS=120720123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr2	120725704	rs10194955	A	G	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=23;PP=699;SC=ACTACTGCCCACTAGTCAAAT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=120725712;WS=120725694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	120734737	rs3832049	C	CA	394.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.9993;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.632;NF=0;NR=15;PP=252;ReadPosRankSum=0.149;SC=TGGCATTTTACAAAAAAAAAA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=15;WE=120734745;WS=120734727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr2	120776972	rs3216703	TG	T	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=89;ReadPosRankSum=0.062;SC=GATCAGGCACTGTAACATTCA;SOR=0.138;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=4;WE=120776980;WS=120776962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr2	120799566	rs41279782	T	C	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.853;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.472;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=10;NR=0;PP=255;ReadPosRankSum=0.723;SC=ATTTACTTATTATCTTGCCAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=10;WE=120799574;WS=120799556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr2	120830815	rs3738970	A	G	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.246;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=86;ReadPosRankSum=-1.728;SC=AGACAAAATTATTTGTGGGGG;SOR=0.621;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=7;WE=120830823;WS=120830805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr2	120834904	rs372930726	G	T	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.476;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=35;PP=770;ReadPosRankSum=-0.786;SC=TAAGCATTGTGTTGTGATGCT;SOR=1.363;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=144;TCF=42;TCR=102;TR=44;WE=120834912;WS=120834894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,46:0.30:151
chr2	120885310	rs1034489	G	A	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=18;PP=921;ReadPosRankSum=1.414;SC=CTTATTGGAAGCAACGATTGG;SOR=0.660;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=151;TCF=97;TCR=54;TR=52;WE=120885318;WS=120885300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,53:0.34:155
chr2	120889173	rs3738968	G	C	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.572;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.073;NF=27;NR=8;PP=560;ReadPosRankSum=0.089;SC=GGGTTATTTTGCCTTTTTTTT;SOR=0.352;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=71;TCR=20;TR=35;WE=120889183;WS=120889163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,34:0.37:92
chr2	120900736	rs75582263	T	C	2228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.730;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=56;PP=1740;ReadPosRankSum=-0.924;SC=ATAGCCCTGGTGAAGTGAAAT;SOR=0.842;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=123;TCF=45;TCR=78;TR=84;WE=120900744;WS=120900726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,89:0.68:130
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chr2	120980428	rs11550347	G	C	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.066;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=40;PP=1432;ReadPosRankSum=-2.112;SC=GGCAAAGACGGCCCAGTAGCT;SOR=0.679;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=209;TCF=108;TCR=101;TR=77;WE=120980436;WS=120980418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,76:0.36:210
chr2	121708663	rs10864866	A	G	1474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=2;PP=1160;SC=TGTAATTCACAGATGACCAGG;SOR=5.670;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=47;TCR=2;TR=49;WE=121708671;WS=121708659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	121712729	rs10175446	C	T	1883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.58;QD=33.64;SOR=8.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
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chr2	121713030	rs12614482	G	A	2340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.90;SOR=5.630;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	121713041	rs12617878	T	C	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=2;NR=38;PP=1135;SC=AGGATGGGGCTAGCAGATCTC;SOR=5.186;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=40;WE=121713049;WS=121713012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	121726447	rs2592595	G	A	10100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=183;PP=2965;SC=GAAGCAGCTCGGCGGCCAGCG;SOR=1.186;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=305;TCF=121;TCR=184;TR=304;WE=121726455;WS=121726437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,319:1.00:319
chr2	121729323	rs2677507	A	G	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=0;PP=330;SC=TGGCATGCCCAGGTCTGGGTG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=121729331;WS=121729315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	121729360	rs2592592	T	C	1032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=1;PP=879;SC=CATGTGCCCCTGGCAGGACTG;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=121729368;WS=121729350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	121729490	rs2592591	C	T	4590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=53;PP=2965;SC=CCCTGAGTAACAGACTGTCCT;SOR=1.371;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=94;TCR=53;TR=147;WE=121729498;WS=121729480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr2	121729686	rs2592590	T	C	1065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=30;PP=886;SC=AGGACCAGGCTTGTGGGCTGC;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=121729694;WS=121729676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	121730138	rs3106962	C	G	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=2;PP=542;SC=GGGGTCACTTCAGGGCATGTG;SOR=4.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=121730146;WS=121730128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	121740190	rs1968619	C	T	1950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.34;SOR=5.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	121740194	rs1530580	T	G	2052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.68;SOR=5.464;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	121740505	rs280196	C	T	1361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=38;PP=1177;SC=GCCCCACTGACGCCCCATGGC;SOR=3.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=43;WE=121740513;WS=121740495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	121744225	rs2276553	A	G	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.953;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=528;ReadPosRankSum=-1.655;SC=GATGGGGCAGAAGAGAGTCTG;SOR=0.349;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=23;WE=121744233;WS=121744215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr2	121746956	rs3738880	G	T	2505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=47;PP=1797;ReadPosRankSum=0.620;SC=CACCGTAGACGCCCTGGCCAG;SOR=0.703;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=136;TCF=62;TCR=74;TR=86;WE=121746964;WS=121746946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,93:0.64:145
chr2	121747406	rs12711538	G	A	3756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.963;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=69;PP=2962;ReadPosRankSum=0.088;SC=TGGGGTCCCCGATTCAGCCCT;SOR=0.550;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=182;TCF=91;TCR=91;TR=132;WE=121747414;WS=121747396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,135:0.73:184
chr2	121747429	rs10167980	A	G	3226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.625;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=64;PP=2441;ReadPosRankSum=1.632;SC=CTGGAGTGCCACCACCTCACC;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=78;TCR=92;TR=120;WE=121747437;WS=121747419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,127:0.72:176
chr2	121982011	rs4384798	T	A	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.868;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=185;ReadPosRankSum=0.147;SC=AAAGGTGCAGTGCCACAGTAT;SOR=0.280;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=14;WE=121982019;WS=121982001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
chr2	121989489	rs2304667	G	A	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.191;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=765;ReadPosRankSum=1.350;SC=ACAGGTTGGCGATCTTCTCAA;SOR=0.354;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=186;TCF=118;TCR=68;TR=55;WE=121989497;WS=121989479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,55:0.30:186
chr2	121989657	rs35847463	G	A	1495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.906;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=51;PP=1270;ReadPosRankSum=0.705;SC=CACCCAGGGCGGCGGGGCAGG;SOR=3.812;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=75;TCF=2;TCR=73;TR=51;WE=121989665;WS=121989647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,50:0.68:74
chr2	121995065	rs13001348	G	A	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=5.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=0;PP=702;ReadPosRankSum=0.723;SC=GTGAGCGAGCGAACCCACACT;SOR=0.871;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=58;TCR=0;TR=32;WE=121995073;WS=121995055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr2	121996932	rs755865	G	A	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=4.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=423;ReadPosRankSum=-0.131;SC=GTTCTGGGCCGCTGTCCCACC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=19;WE=121996940;WS=121996922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr2	122004596	rs2252862	C	G	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=37;PP=915;ReadPosRankSum=-0.839;SC=AAGCAGGGTGCCCCTGGATCC;SOR=0.598;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=54;TCF=5;TCR=49;TR=41;WE=122004604;WS=122004586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,42:0.75:56
chr2	122006700	rs7562700	G	C	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.883;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=749;ReadPosRankSum=0.142;SC=AAGTGACCGCGGGGGGCCAAG;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=74;TCF=32;TCR=42;TR=43;WE=122006708;WS=122006690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,46:0.60:77
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chr2	122038940	rs35023952	G	A	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.395;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=390;ReadPosRankSum=-0.558;SC=GCAGACCACCGGGGCCCAGGG;SOR=0.083;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=53;TCF=4;TCR=49;TR=20;WE=122038948;WS=122038930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,22:0.39:56
chr2	122042750	rs13415738	A	T	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.867;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=27;PP=653;ReadPosRankSum=0.536;SC=CGCGCCGAGGACCCAGCGGCG;SOR=0.368;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=48;TCF=6;TCR=42;TR=32;WE=122042758;WS=122042740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,32:0.70:46
chr2	122122562	rs184004962	C	T	3526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.314;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=31;PP=2755;ReadPosRankSum=1.143;SC=TTGATGTAAACAGTAAGCACA;SOR=1.004;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=176;TCF=129;TCR=47;TR=126;WE=122122570;WS=122122552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,128:0.71:181
chr2	122273475	rs79295629	T	C	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=502;ReadPosRankSum=0.638;SC=CTTATATACATTTGTCTAGAG;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=20;WE=122273483;WS=122273465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,21:0.81:26
chr2	122520713	.	G	GT	39.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.74;MQRankSum=-0.319;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr2	125192068	rs1425745	T	C	2919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=39;PP=2031;SC=CAGAATCAGATGTTGCTGACT;SOR=1.000;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=50;TCR=39;TR=89;WE=125192076;WS=125192058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr2	125204285	rs11689115	G	T	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=193;ReadPosRankSum=-1.888;SC=GTGCAAAGCTGCCCTTGGACA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=9;WE=125204293;WS=125204278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr2	125232609	rs4411700	G	T	1081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=34;PP=932;SC=GAGAGAAAGAGAATGGCAGAT;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=125232617;WS=125232599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	125405302	rs924802	C	T	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.903;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=274;ReadPosRankSum=-2.026;SC=TTGCTTCTAACGTCTCTTGCT;SOR=1.528;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=19;WE=125405310;WS=125405292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,18:0.28:65
chr2	125521188	rs72980426	A	G	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=653;ReadPosRankSum=1.072;SC=GGGGTCATGGAAAAGAGTCCC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=27;WE=125521196;WS=125521178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr2	125669260	rs2602655	A	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.019;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=155;ReadPosRankSum=1.518;SC=TTTCATGAGTAGTCCTGTGTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=125669268;WS=125669250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr2	127447763	rs6709803	G	A	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.018;NF=10;NR=1;PP=211;ReadPosRankSum=-0.753;SC=GATGCAGCTTGGGCCAAGGTG;SOR=0.784;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=11;WE=127447771;WS=127447753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr2	127453664	rs1050967	A	C	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.172;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=22;PP=1079;ReadPosRankSum=-1.301;SC=CCCTGCAGGGAGACCCTGCCC;SOR=0.415;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=78;TCF=49;TCR=29;TR=54;WE=127453672;WS=127453654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,54:0.66:82
chr2	127657221	rs3795873	C	T	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=9;PP=641;SC=GCACACGGCCCAGCCCTCCAC;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=13;TCR=9;TR=22;WE=127657229;WS=127657211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	127808116	rs12466912	C	G	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.513;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=26;PP=1932;ReadPosRankSum=0.048;SC=GGATGCGGATCGCAAGTCAGA;SOR=0.393;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=126;TCF=48;TCR=78;TR=47;WE=127808135;WS=127808106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,48:0.37:131
chr2	127808127	rs12466914	C	G	1001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.414;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=1932;ReadPosRankSum=0.520;SC=GCAAGTCAGACCTTCCGTCCC;SOR=0.486;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=123;TCF=46;TCR=77;TR=46;WE=127808135;WS=127808106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,47:0.36:130
chr2	127808226	rs2071270	A	T	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.913;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=593;ReadPosRankSum=-0.387;SC=GCAGCAGGACAGTATGGGGCT;SOR=0.485;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=86;TCF=54;TCR=32;TR=30;WE=127808234;WS=127808216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,30:0.35:85
chr2	127808909	rs6745677	G	A	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.349;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=300;ReadPosRankSum=0.231;SC=GCACCCAAGCGACAGGGCCGG;SOR=0.405;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=62;TCF=20;TCR=42;TR=20;WE=127808917;WS=127808899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,22:0.33:67
chr2	127811712	rs35339559	G	GCA	257.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=310;ReadPosRankSum=-0.326;SC=CACCACGCATGCAGAGCAAGC;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=8;WE=127811720;WS=127811702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr2	127815238	rs3754615	G	A	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=87;ReadPosRankSum=0.732;SC=CGGGGTTTGGGGGAGACAGAC;SOR=1.329;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=5;WE=127815246;WS=127815228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr2	127816536	rs2276580	G	A	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=23;ReadPosRankSum=0.641;SC=CAGCAAAGCCGGAGGAGAAGG;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=5;WE=127816544;WS=127816526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,5:0.19:27
chr2	127816695	rs2228955	C	T	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.32;ReadPosRankSum=1.384;SOR=0.682;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,32:0.23:140
chr2	127816846	rs140171337	CTG	C	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=271;ReadPosRankSum=2.125;SC=AGGTGTGAAACTGTGTGTGTG;SOR=0.197;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=10;WE=127816857;WS=127816836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr2	127821085	rs2071268	C	T	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=229;ReadPosRankSum=0.984;SC=CCTCCCACGACTCTGACTCTG;SOR=0.343;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=13;WE=127821093;WS=127821075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,13:0.32:40
chr2	127821207	rs1137845	G	A	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.418;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=845;ReadPosRankSum=0.265;SC=ACGTGTTGACGTAGAAACCTA;SOR=0.480;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=122;TCF=75;TCR=47;TR=47;WE=127821215;WS=127821197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,48:0.38:126
chr2	127821499	rs72481904	T	C	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.112;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=884;ReadPosRankSum=-0.702;SC=GGCACCGTGCTGGGCCTCACC;SOR=0.902;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=157;TCF=99;TCR=58;TR=57;WE=127821507;WS=127821489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,58:0.35:165
chr2	127825968	rs934826	G	A	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=213;ReadPosRankSum=-0.237;SC=GGGCCCTTGAGGCCGAGAGAA;SOR=0.883;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=11;WE=127825976;WS=127825958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr2	127826533	rs1060743	A	G	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=19;PP=480;ReadPosRankSum=0.073;SC=TCTTTTTGGCAGTTTGAAGGG;SOR=0.649;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=40;TCR=57;TR=33;WE=127826541;WS=127826523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,34:0.34:101
chr2	127834136	rs2276575	T	C	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=495;ReadPosRankSum=-0.707;SC=ATTCAGCTCGTGCCATTTTTC;SOR=0.514;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=84;TCF=59;TCR=25;TR=27;WE=127834144;WS=127834126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,29:0.35:84
chr2	127834369	rs62157856	C	T	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=114;ReadPosRankSum=-0.527;SC=ACAGCACAGACCAGGGGCTGG;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=6;WE=127834377;WS=127834359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr2	127834384	rs13387613	T	C	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=20;ReadPosRankSum=-0.203;SC=GGCTGGGAAGTCTCTAGCCAA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=4;WE=127834392;WS=127834374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr2	127839474	rs11682128	G	A	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.246;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=501;ReadPosRankSum=-2.050;SC=GCCCTGTCTCGCCCCTTCCTC;SOR=1.429;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=94;TCF=15;TCR=79;TR=29;WE=127839482;WS=127839464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,30:0.31:97
chr2	127839513	rs61525314	G	A	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.781;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=364;ReadPosRankSum=2.402;SC=GGGGGCCACGGAGGCAGGATG;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=19;WE=127839521;WS=127839503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
chr2	128015367	rs4662718	C	T	2258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=45;PP=1720;SC=TTTTATAATACTTATAATCAC;SOR=1.371;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=25;TCR=45;TR=70;WE=128015375;WS=128015357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	128028792	rs4150499	T	C	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=3;PP=884;SC=TTTGGGATTCTCTCCCTCCAG;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=128028800;WS=128028782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	128029065	rs11345447	GA	G	1161.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=37;PP=703;SC=TATATATGAGGAAAAAAAAAA;SOR=2.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=43;WE=128029073;WS=128029055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	128050134	rs4150402	T	C	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=293;SC=CACCTATGCCTATTGTTACAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=128050142;WS=128050124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	128175875	rs1799809	G	A	1651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=5;PP=1394;SC=CATCCTTGGTGGGCAGAGGTG;SOR=3.872;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=47;TCR=5;TR=52;WE=128175883;WS=128175865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	128176195	rs2854700	G	A	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=477;SC=AGCTTGGGGTGAAAGGACACA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=128176203;WS=128176185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	128177377	rs1158867	C	T	1140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=7;PP=867;SC=GACCCTCAATCCCAGCTTCCG;SOR=2.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=34;WE=128177385;WS=128177367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	128181028	rs1878844	A	G	1963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=25;PP=1652;SC=CGCTGGGTGCAGGGTGGGCAG;SOR=1.196;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=40;TCR=25;TR=65;WE=128181036;WS=128181018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	128183914	rs2069928	G	T	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.809;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=302;ReadPosRankSum=0.061;SC=CTGCCATTGCGTTTGGGGGAT;SOR=1.552;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=16;WE=128183922;WS=128183904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr2	128249441	rs334152	C	T	291.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=252;SC=TCCACTTTACCGACTCGTTTA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=128249449;WS=128249434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	128260549	rs115638711	A	C	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=401;ReadPosRankSum=0.271;SC=AAATGTGCAGATCTTCAGTGT;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=16;WE=128260557;WS=128260539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr2	128261245	.	A	AAAAT	90.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.242;NF=0;NR=3;PP=132;ReadPosRankSum=-0.405;SC=GTATACAGCAAAAATAAATAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=3;WE=128261253;WS=128261235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr2	128281469	rs2303947	C	T	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=424;ReadPosRankSum=-0.063;SC=GCAAAAGTTACCACTGAGGAA;SOR=1.893;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=18;WE=128281477;WS=128281459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr2	128321875	rs190798933	C	T	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.372;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=543;ReadPosRankSum=-0.523;SC=GGGCCCTGCCCTGCCCTCACA;SOR=1.973;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=28;WE=128321883;WS=128321865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
chr2	128331645	rs76746601	C	A	2110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=58;PP=1686;SC=CAGGTGAGGCCTCCCCCTTCC;SOR=4.375;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=5;TCR=58;TR=63;WE=128331653;WS=128331635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	128340043	rs74711761	G	A	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.244;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=30;PP=1089;ReadPosRankSum=-0.533;SC=TCAGATCCCAGCCCCACTGCT;SOR=1.050;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=73;TCF=31;TCR=42;TR=49;WE=128340051;WS=128340033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,51:0.65:78
chr2	128342547	rs4662741	G	A	2072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=54;PP=1673;SC=CAGGGAGACCGTGGAAAGCAG;SOR=3.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=7;TCR=54;TR=61;WE=128342555;WS=128342537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	128346228	rs11673952	A	C	599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=14;PP=438;SC=CTCTGGGTCCACAGCATGCAG;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=128346236;WS=128346218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	128350551	rs11678239	G	A	5119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=129;PP=2965;SC=GGTCACCTCTGGCCATCCGCG;SOR=4.572;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=14;TCR=129;TR=143;WE=128350559;WS=128350541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr2	128350578	rs58867441	T	TG	3190.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=78;PP=2936;SC=CCCTCGGCCTTGGCACCTCCA;SOR=4.735;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=90;TCF=6;TCR=84;TR=84;WE=128350586;WS=128350568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr2	128351346	rs7558838	T	C	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=36;PP=866;SC=CAGCTCAAAGTGTGGTCCCCA;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=37;WE=128351354;WS=128351336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	128363530	rs11382004	G	GC	1297.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=34;PP=1532;SC=GGGCGGCTGGGCCGCGGGACC;SOR=4.351;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=36;WE=128363538;WS=128363520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
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chr2	128377833	rs2248519	C	G	1868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=7;PP=1653;SC=CAGAGGTGCACAAGAGCTGTG;SOR=3.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=50;TCR=7;TR=57;WE=128377841;WS=128377823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	128381808	rs13422424	C	T	2763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=44;PP=2149;ReadPosRankSum=0.414;SC=CCCCCTGGCACGACTCCCGGG;SOR=0.727;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=95;TCR=67;TR=106;WE=128381816;WS=128381798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,108:0.65:167
chr2	128382859	rs2245297	C	T	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=2;PP=291;SC=GGGCAAGAGCCCGGCCACGGG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=128382867;WS=128382849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	128385224	rs10164978	C	G	2819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.724;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=49;PP=2230;ReadPosRankSum=0.266;SC=GAACTGGTGGCCTGGAGGGTA;SOR=0.427;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=160;TCF=76;TCR=84;TR=99;WE=128385232;WS=128385214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,102:0.62:164
chr2	128385244	rs58961411	T	C	2612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.856;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=50;PP=1966;ReadPosRankSum=0.708;SC=ACAGGTTGTCTGGGAAGGCGA;SOR=0.504;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=157;TCF=75;TCR=82;TR=99;WE=128385252;WS=128385234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,103:0.64:162
chr2	128386120	rs144295028	TGGGTG	T	188.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=4;PP=196;SC=GGTGCCAGACTGGGTGGGGTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=128386132;WS=128386110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	128388437	rs138651379	A	C	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.823;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=442;ReadPosRankSum=0.684;SC=GGAGCCACCCAAGGAAAAGCT;SOR=1.658;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=89;TCF=41;TCR=48;TR=25;WE=128388445;WS=128388427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,26:0.28:92
chr2	128388674	.	T	G	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.160;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=16.620;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.61;ReadPosRankSum=-0.289;SOR=3.851;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,18:0.33:54
chr2	128389343	rs10208043	C	T	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=27;PP=662;ReadPosRankSum=1.376;SC=GCTGGGGCGGCGGCCAGCCCA;SOR=1.668;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=29;WE=128389351;WS=128389333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,29:0.76:38
chr2	128389422	rs10183797	G	C	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.278;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=141;ReadPosRankSum=-0.718;SC=CACCGCAGCTGGTGGCGGCAG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=9;WE=128389430;WS=128389412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr2	128392131	rs115658461	C	T	2035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=28;PP=1438;ReadPosRankSum=-0.212;SC=GGACAGTCCCCGGAAGCCACC;SOR=0.566;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=122;TCF=78;TCR=44;TR=74;WE=128392139;WS=128392121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,79:0.59:133
chr2	128393261	rs2255178	T	C	1687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=3;PP=1392;SC=GGGCCGCAGCTGGAGACCCAG;SOR=5.058;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=45;TCR=3;TR=48;WE=128393269;WS=128393251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	128393289	rs2255177	T	C	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.939;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=10;PP=1133;ReadPosRankSum=0.194;SC=AGTGTGTCCATCACCCAGGAG;SOR=0.859;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=88;TCF=70;TCR=18;TR=53;WE=128393297;WS=128393279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,58:0.60:97
chr2	128394244	rs199624518	CCAGGGACCTGTG	C	2614.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.007;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.164;NF=5;NR=36;PP=2970;ReadPosRankSum=-0.533;SC=GCCACCAGGTCCAGGGACCTG;SOR=0.973;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=92;TCF=12;TCR=80;TR=41;WE=128394263;WS=128394234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,67:0.60:111
chr2	128394758	rs2255039	T	C	1620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.641;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=22;PP=1192;ReadPosRankSum=0.854;SC=ACGGCCCCAATGGCAGGAGCC;SOR=0.921;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=105;TCF=68;TCR=37;TR=64;WE=128394766;WS=128394748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,65:0.60:109
chr2	128394875	rs59579995	C	CA	3141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=1.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=66.00;MQRankSum=9.958;QD=17.95;ReadPosRankSum=-0.051;SOR=0.819;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,116:0.66:175
chr2	128394876	.	C	A	2276	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=66.12;NF=59;NR=41;PP=2276;QD=23.1077121255;SC=TCTGACCCCCCCGTCCCCTGT;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=173;TCF=104;TCR=69;TR=100;WE=128394885;WS=128394865;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:73,100:0.58:173
chr2	128394877	rs56272236	C	T,CT	7063.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=82;NR=66;PP=2976;SC=CTGACCCCCCCGTCCCCTGTC;SOR=1.251;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=154;TCF=86;TCR=68;TR=148;WE=128394885;WS=128394865;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.66,0.34:176
chr2	128396807	rs891515	A	G	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.551;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=309;ReadPosRankSum=-1.564;SC=CATGGACAGCAGGAGGGGAGA;SOR=0.050;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=47;TCF=45;TCR=2;TR=20;WE=128396815;WS=128396797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr2	128400608	rs4662751	C	T	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.226;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=216;ReadPosRankSum=0.643;SC=TGCCCAGGCCCTTGGCCTTCT;SOR=0.481;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=15;WE=128400616;WS=128400598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr2	128401091	rs2244507	A	G	3171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=63;PP=2595;SC=GGGGTTTGCCAGATGAAGAAG;SOR=1.234;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=39;TCR=63;TR=102;WE=128401099;WS=128401081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr2	128407499	rs2243805	G	A	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=5;PP=1174;SC=CCCTGGTGGTGGATCTACTCT;SOR=3.365;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=43;WE=128407507;WS=128407489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	128411934	rs6707277	A	G	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=0;PP=1219;SC=CACACAGGAGAGGTGGCAGGT;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=41;WE=128411942;WS=128411924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	128411950	rs6707282	A	G	1439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=0;PP=1195;SC=CAGGTGTGCCAGGAAGGGCTG;SOR=7.903;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=51;WE=128411958;WS=128411940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	128421763	rs34006819	C	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5165;FS=3.680;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=90;ReadPosRankSum=0.180;SC=CATCCGACGCCGGGGCAGAGC;SOR=1.061;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=6;WE=128421771;WS=128421753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr2	128421829	rs79110686	G	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=52;ReadPosRankSum=-0.825;SC=CCCTGCCGCCGCAGCTTTCCG;SOR=0.368;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=4;WE=128421837;WS=128421819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr2	128421884	.	T	C	34.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
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chr2	128431397	rs7591197	A	G	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.185;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=43;PP=1174;ReadPosRankSum=-0.808;SC=CTAGAACCCTAGGGGGTGACC;SOR=0.509;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=81;TCF=14;TCR=67;TR=53;WE=128431405;WS=128431387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,52:0.66:79
chr2	128431494	rs7591310	A	G	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=240;ReadPosRankSum=0.462;SC=CAAGGCTTAGAGGTGACTCCA;SOR=0.412;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=11;WE=128431502;WS=128431484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr2	128432534	rs79485780	A	G	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.935;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=13;PP=527;ReadPosRankSum=0.166;SC=CGCCTCGGCCAGGGGTCCCGC;SOR=0.294;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=30;WE=128432542;WS=128432524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr2	128522100	rs188324868	T	C	2392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.070;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=9;PP=1919;ReadPosRankSum=-0.773;SC=ACACAGTAGATAATAAAAAGG;SOR=0.313;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=129;TCF=118;TCR=11;TR=84;WE=128522108;WS=128522090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,87:0.66:132
chr2	128526579	rs143186338	T	TTAAA	117.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=1.678;QD=6.93;ReadPosRankSum=-0.211;SOR=0.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr2	128608271	rs34858843	GA	G	632.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=1.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.43;ReadPosRankSum=0.955;SOR=1.222;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr2	128608290	rs6713679	T	C	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=316;ReadPosRankSum=-1.357;SC=AAAATCAAAATAATCAAAAAC;SOR=0.804;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=16;WE=128608298;WS=128608280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr2	128608384	rs34706819	G	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.35;ReadPosRankSum=-1.465;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr2	128610719	rs35614229	T	C	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.863;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=495;ReadPosRankSum=-1.227;SC=AAAATACTCCTTCAAAAGTTT;SOR=1.863;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=21;WE=128610727;WS=128610709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr2	128699750	rs2304519	G	C	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.954;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=44;PP=1144;ReadPosRankSum=-0.277;SC=TGAAACAGAAGACATTGCATC;SOR=0.519;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=125;TCF=20;TCR=105;TR=54;WE=128699758;WS=128699740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,53:0.43:122
chr2	128708063	rs2461463	T	C	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=36;PP=922;SC=CCAACAAAGATGATTAAGAAG;SOR=3.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=41;WE=128708071;WS=128708053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	128744580	rs2948068	A	G	3105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=62;PP=2343;SC=AGAGAGGGAAACAAAATGCCA;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=32;TCR=63;TR=94;WE=128744588;WS=128744570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr2	128747490	rs115985093	C	T	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=638;ReadPosRankSum=2.437;SC=TCATTTCACACAGTCCACATA;SOR=1.280;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=29;WE=128747498;WS=128747480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr2	128751012	rs142670061	A	G	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=62;ReadPosRankSum=0.567;SC=TGTGTCCCAAACAAACTCTTA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=6;WE=128751020;WS=128751002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr2	128753854	rs1550174	T	C	2078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=5;PP=1622;SC=TGGGACACTTTGTTTTATGCT;SOR=4.244;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=53;TCR=5;TR=58;WE=128753862;WS=128753844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	128757804	rs10928793	C	T	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=356;ReadPosRankSum=-0.811;SC=TCGGTATCACCAGGCCCTCAG;SOR=1.041;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=58;TCF=29;TCR=29;TR=19;WE=128757812;WS=128757794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,20:0.34:59
chr2	128772310	rs35312230	C	T	1501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.443;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=8;PP=1205;ReadPosRankSum=-0.945;SC=TTCTGTGTTACGTATTTTACC;SOR=0.418;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=75;TCF=65;TCR=10;TR=55;WE=128772318;WS=128772300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,56:0.73:77
chr2	128849114	rs4476299	T	C	2210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.605;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=52;PP=1731;ReadPosRankSum=-0.712;SC=TCTGGTGTCCTATCCCTTCCC;SOR=0.401;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=123;TCF=42;TCR=81;TR=83;WE=128849122;WS=128849104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,83:0.65:128
chr2	128860835	rs7355336	A	G	1132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=33;PP=902;SC=CAATTACTACATGCATTTCCT;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=128860843;WS=128860825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	128870808	rs4662775	T	C	2544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.363;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=76;PP=2059;ReadPosRankSum=0.948;SC=GCAAAATCAATTATGTATTCA;SOR=1.739;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=121;TCF=13;TCR=108;TR=83;WE=128870816;WS=128870798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,85:0.69:123
chr2	128872595	rs56397917	C	T	2333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=11;PP=1791;ReadPosRankSum=1.007;SC=GGGCATAATCCGAGGTAATGG;SOR=0.915;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=103;TCF=88;TCR=15;TR=74;WE=128872603;WS=128872585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,79:0.73:108
chr2	128874061	rs10210598	G	A	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=664;ReadPosRankSum=0.518;SC=CCTACGTGGAGAGTCAACCAC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=27;WE=128874069;WS=128874051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr2	128877837	rs4662593	G	C	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=654;ReadPosRankSum=-0.602;SC=AGGGTTGGGAGAGGAAAACCA;SOR=2.012;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=27;WE=128877845;WS=128877827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr2	128878014	rs4662594	G	A	4678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=86;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.850;SC=CACCTTTAAAGGTTTGGCAGT;SOR=0.690;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=250;TCF=123;TCR=127;TR=170;WE=128878022;WS=128878004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,172:0.68:253
chr2	128878667	rs6430990	T	C	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=478;ReadPosRankSum=0.177;SC=CATTCGAAGATATTCTTAATT;SOR=0.527;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=21;WE=128878675;WS=128878657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr2	128879022	rs6430991	G	C	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.267;NF=0;NR=13;PP=290;ReadPosRankSum=-0.160;SC=TCTTGTTGCCGAGGCTAGAGT;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=13;WE=128879030;WS=128879012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
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chr2	128880993	rs4633871	A	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=186;ReadPosRankSum=0.842;SC=CAGTATGCACATAACTGAAAG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=9;WE=128881001;WS=128880983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr2	128913757	rs3738923	G	A	2108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=3;PP=1719;ReadPosRankSum=1.149;SC=TTTCTCAGCTGTATGTAAAGT;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=64;TCR=3;TR=65;WE=128913765;WS=128913747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr2	128915057	rs13392666	T	A	564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=446;SC=GAGAATTGTATCTCTAGAGAT;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=128915065;WS=128915047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	128929028	rs17178432	A	T	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=161;ReadPosRankSum=-1.095;SC=TTCTAAGAACATAGTGTGTTT;SOR=0.082;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=8;WE=128929036;WS=128929018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr2	128934400	rs2290111	T	C	2308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=28;PP=1751;ReadPosRankSum=1.669;SC=ACGATGGCACTGATTCTCCCC;SOR=0.573;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=79;TCF=51;TCR=28;TR=78;WE=128934408;WS=128934390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,78:0.99:79
chr2	128936000	rs2290110	T	C	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=14;PP=868;SC=TGTGTCTGTATGAGTGTTTCA;SOR=1.236;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=37;WE=128936008;WS=128935990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	128936171	rs3217587	TATG	T	850.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=16;PP=881;SC=TTTCATTATATATGATGAATG;SOR=3.716;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=17;WE=128936181;WS=128936161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	128939606	rs62160075	C	T	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.12;ReadPosRankSum=-0.452;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr2	128939799	rs17178720	C	T	2787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.640;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=51;PP=2087;ReadPosRankSum=1.995;SC=GAGAAATGGACGGCTACAGGT;SOR=0.715;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=150;TCF=75;TCR=75;TR=101;WE=128939807;WS=128939789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,105:0.68:154
chr2	128939817	rs1699	G	A	5015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=89;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.172;SC=GGTTCTGGAAGTCAGGGTACT;SOR=1.088;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=66;TCR=90;TR=154;WE=128939825;WS=128939807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,159:0.99:161
chr2	128941483	.	G	GGT	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=360;ReadPosRankSum=-0.405;SC=GTTTTTTCATGGTGTGTGTGT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=8;WE=128941491;WS=128941473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr2	128941513	.	A	T	61	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=29;MQ=56.57;NF=0;NR=5;PP=61;QD=19.1542425094;SC=TGTGTGTGTGAGAGAGAGAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=5;WE=128941521;WS=128941503;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr2	128944424	rs744265	T	C	2607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=68;PP=1992;ReadPosRankSum=0.860;SC=GATGTGTGAGTGAATCACGAT;SOR=0.950;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=95;TCF=26;TCR=69;TR=94;WE=128944432;WS=128944414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,93:0.99:94
chr2	128947505	rs11542865	G	A	739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=22;PP=595;SC=TTAAAGCTCTGTTGGATTTGT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=128947513;WS=128947495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	130737578	rs4233601	G	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.13;MQRankSum=0.366;QD=13.58;ReadPosRankSum=-0.241;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr2	130738163	rs144773989	G	A	3037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=5.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.38;MQRankSum=-1.408;QD=21.39;ReadPosRankSum=-1.191;SOR=0.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,106:0.75:142
chr2	130750107	.	C	CCGGCGG	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.66;MQRankSum=-0.000;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr2	130897055	rs28751929	G	A	647.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.9848;FS=3.961;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-1.332;NF=18;NR=5;PP=419;ReadPosRankSum=-0.437;SC=TAGCGGAAGTGTCAGGAAATG;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=23;WE=130897063;WS=130897045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,25:0.93:27
chr2	130897234	rs3177472	C	T	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.787;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.140;NF=7;NR=15;PP=460;ReadPosRankSum=-1.511;SC=CAGGATGGCACGCTCCGCCAC;SOR=1.437;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=22;WE=130897242;WS=130897224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr2	130897559	.	C	A	119	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=42.02;NF=1;NR=8;PP=119;QD=17.085690283;SC=TGTGGATAGGCCCCCAGGGAT;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=9;WE=130897567;WS=130897549;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:27,9:0.25:36
chr2	130897620	.	A	G	87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=47.31;NF=4;NR=3;PP=87;QD=17.3958875067;SC=TTCCTCCGGGACTGCCTGGGG;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=7;WE=130897628;WS=130897610;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr2	130900188	rs28743163	A	G	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.055;NF=41;NR=27;PP=1511;ReadPosRankSum=-0.474;SC=TGCCCCAGCTACGATGTTCCC;SOR=0.653;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=104;TCF=65;TCR=39;TR=68;WE=130900196;WS=130900178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,55:0.61:90
chr2	130902067	rs60089935	C	T	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.317;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.078;NF=28;NR=37;PP=1365;ReadPosRankSum=-1.362;SC=GAGGAGAGGACTGGCGGAGTC;SOR=1.770;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=102;TCF=50;TCR=52;TR=65;WE=130902075;WS=130902057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,37:0.51:73
chr2	130902194	rs60152285	C	T	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=2.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.79;MQRankSum=-0.776;QD=13.39;ReadPosRankSum=-1.311;SOR=0.301;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr2	130902549	rs34080706	C	T	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=0.000;QD=17.05;ReadPosRankSum=1.316;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr2	130910847	rs4511676	G	A	4675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.474;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=57;PP=2962;ReadPosRankSum=1.238;SC=AGCTGGGGACGGGTCAGGGCC;SOR=1.191;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=225;TCF=138;TCR=87;TR=163;WE=130910855;WS=130910837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,169:0.72:234
chr2	130925088	rs10909567	C	T	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.777;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.177;NF=15;NR=9;PP=449;ReadPosRankSum=0.621;SC=CATTCACAGACGTCTGATGAG;SOR=0.179;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=24;WE=130925096;WS=130925078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr2	130930819	rs60309319	C	T	1685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.469;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.395;NF=57;NR=15;PP=1686;ReadPosRankSum=0.957;SC=CCCACTGCCCCGAGCACCACT;SOR=0.271;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=94;TCF=78;TCR=16;TR=72;WE=130930827;WS=130930809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,56:0.76:74
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chr2	130939348	rs1817097	G	A	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.079;NF=5;NR=28;PP=705;ReadPosRankSum=-0.082;SC=CGCCTGCGTTGTGGCGGCCTC;SOR=0.883;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=54;TCF=9;TCR=45;TR=33;WE=130939356;WS=130939338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,35:0.62:56
chr2	130940090	rs1968675	G	T	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.077;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.477;NF=5;NR=6;ReadPosRankSum=0.250;SC=TTCCGGGTACGCCCGGCCCGC;SOR=0.543;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=15;TCF=8;TCR=7;TR=11;WE=130940098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr2	130941034	rs34409208	T	G	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.20;MQRankSum=-0.941;QD=10.80;ReadPosRankSum=-1.000;SOR=0.919;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr2	130941065	rs6737226	T	C	1334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.54;QD=32.56;SOR=3.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	130948303	rs12612244	T	C	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=3.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.56;MQRankSum=2.266;QD=13.47;ReadPosRankSum=-0.022;SOR=2.428;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr2	130948314	.	GTTTTTT	G	84.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.75;MQRankSum=3.816;QD=3.68;ReadPosRankSum=0.375;SOR=0.141;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr2	130948327	rs10175962	G	T	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.69;MQRankSum=-1.896;QD=2.93;ReadPosRankSum=1.120;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr2	130949411	rs10208844	G	T	1765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=14;PP=1856;SC=CCCTCAGTATGCTTCGCCTTC;SOR=1.835;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=55;TCR=14;TR=69;WE=130949419;WS=130949401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	130949491	rs60154251	G	A	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=17.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.22;MQRankSum=-3.415;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.704;SOR=1.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,43:0.41:104
chr2	130949553	rs1052422	A	G	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=3.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.033;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.582;NF=16;NR=37;PP=1090;ReadPosRankSum=-0.602;SC=ACAAAGGCCCACTTGGCATAC;SOR=2.857;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=114;TCF=41;TCR=73;TR=53;WE=130949561;WS=130949543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,19:0.23:84
chr2	130951548	rs1052319	G	A	2801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=55;PP=2495;SC=TGGTGATCTCGGCCACAGACA;SOR=1.450;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=37;TCR=55;TR=91;WE=130951556;WS=130951538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	130951566	rs7340193	G	A	2754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=55;PP=2414;SC=ACAGCTGCTCGTGGTAGGCCT;SOR=1.429;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=37;TCR=55;TR=92;WE=130951574;WS=130951556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr2	130951581	rs1052312	A	G	1654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=1.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.65;MQRankSum=-5.600;QD=21.77;ReadPosRankSum=-1.702;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,42:0.55:76
chr2	130951584	rs7340507	T	C	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=1.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.42;MQRankSum=-5.381;QD=20.65;ReadPosRankSum=-1.263;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,43:0.54:80
chr2	130952540	rs56151061	C	T	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.951;NF=24;NR=1;PP=604;ReadPosRankSum=-0.170;SC=TGTGAGCCACCGCGCCCGGCC;SOR=0.487;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=25;WE=130952548;WS=130952530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr2	130952718	rs3853852	G	A	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=8.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.33;MQRankSum=-6.767;QD=8.43;ReadPosRankSum=-0.793;SOR=1.447;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,21:0.25:84
chr2	130952725	rs3863907	C	T	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=5.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.59;MQRankSum=-7.290;QD=8.60;ReadPosRankSum=-0.880;SOR=0.970;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,27:0.28:95
chr2	130960023	rs4663031	T	C	1813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.922;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.845;NF=51;NR=54;PP=1777;ReadPosRankSum=-0.306;SC=GTAGGCAGTTTGGTTCTGGGT;SOR=0.551;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=180;TCF=84;TCR=96;TR=105;WE=130960031;WS=130960013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,77:0.52:147
chr2	130961729	rs201980950	A	AT	489.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.56;MQRankSum=0.394;QD=17.49;ReadPosRankSum=-1.195;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr2	131116404	rs7568956	T	C	2519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=2.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.47;ReadPosRankSum=0.444;SOR=0.955;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,93:0.61:153
chr2	131487673	rs272128	A	C	6202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=117;PP=2965;SC=TGCCATGCTCACATACCTGTA;SOR=1.203;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=74;TCR=117;TR=191;WE=131487681;WS=131487663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr2	131520663	rs1905235	T	C	7042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=118;PP=2965;SC=CAGGGACCAATCCCGGCTGGA;SOR=0.959;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=213;TCF=95;TCR=118;TR=213;WE=131520671;WS=131520653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr2	131672950	rs12464119	A	G	1808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.030;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=35;PP=1416;ReadPosRankSum=-1.512;SC=AAGGCACCCAACTCGCACCAA;SOR=0.799;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=269;TCF=142;TCR=127;TR=78;WE=131672958;WS=131672940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,79:0.29:270
chr2	131673316	rs3739129	C	T	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.32;ReadPosRankSum=-1.422;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,45:0.27:167
chr2	131673702	rs62178867	G	A	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=778;ReadPosRankSum=1.235;SC=GAGACGCCGAGCACAGAGGAG;SOR=0.642;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=37;WE=131673710;WS=131673692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,41:0.64:64
chr2	131674285	rs3739127	A	G	1504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.933;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=34;PP=1062;ReadPosRankSum=-0.964;SC=TTATTGAGTCAATAGTTCTAG;SOR=0.449;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=230;TCF=140;TCR=90;TR=76;WE=131674293;WS=131674275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,77:0.33:235
chr2	131688587	rs6718816	G	A	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.237;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=569;ReadPosRankSum=1.291;SC=GTCAGAAGGCGTTCCACATGG;SOR=0.998;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=25;WE=131688595;WS=131688577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr2	131688783	rs61750360	G	A	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.970;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=884;ReadPosRankSum=0.923;SC=GCAGGCCCACGTCGAAAGGAG;SOR=0.513;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=67;TCF=35;TCR=32;TR=44;WE=131688791;WS=131688773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,47:0.67:70
chr2	131703968	rs67022442	G	C	553.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=10.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=460;ReadPosRankSum=-0.595;SC=TATTTTGGTTGTGTGCTCTGT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=17;WE=131703976;WS=131703958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,18:0.90:20
chr2	131769237	rs13023338	G	A	1633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=4;PP=1357;SC=AGAGCCCATCGGAGCTGATGG;SOR=4.615;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=47;TCR=4;TR=51;WE=131769245;WS=131769227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	131829560	rs34094232	A	ACACC	1551.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.875;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=29;PP=1726;ReadPosRankSum=1.532;SC=AAGTAGCGACAATCACTAGAG;SOR=0.055;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=70;TCF=4;TCR=66;TR=33;WE=131829568;WS=131829550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,40:0.57:70
chr2	132110828	rs373666409	G	T	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=19.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	132111121	rs11895354	G	A	96.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.59;QD=32.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	132111123	rs370814343	T	C	130.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=65.02;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	132111127	rs13410274	G	T	96.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=32.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	132111166	.	G	GCC	457.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.08;QD=41.61;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	132111167	.	G	GCCGCCGCCGC	457.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.08;QD=41.61;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	132120501	rs146351322	C	CT	5559.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=1.425;NF=126;NR=30;PP=2979;ReadPosRankSum=1.244;SC=AAGACGCTGACTTTTTTTGTG;SOR=1.824;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=185;TCF=146;TCR=39;TR=156;WE=132120509;WS=132120491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,187:0.99:188
chr2	132200568	rs62176150	C	T	2341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.674;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.242;NF=37;NR=48;PP=1893;ReadPosRankSum=-0.133;SC=CACTGATCTCCAGCTGGATCT;SOR=0.677;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=117;TCF=54;TCR=63;TR=85;WE=132200576;WS=132200558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,85:0.72:118
chr2	132201395	rs146766088	TG	AA	5559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.914;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.647;NF=66;NR=55;PP=2944;ReadPosRankSum=0.323;SC=ATGAAACTGATGAAGGGGAGG;SOR=0.451;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=202;TCF=113;TCR=89;TR=121;WE=132201404;WS=132201385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,136:0.63:215
chr2	132201942	rs72859867	T	C	1704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.850;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.130;NF=12;NR=46;PP=1428;ReadPosRankSum=0.851;SC=CCTGTACCACTTCATGGAACA;SOR=0.228;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=82;TCF=14;TCR=68;TR=58;WE=132201950;WS=132201932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,57:0.72:79
chr2	132248584	rs10182785	T	C	2223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=23;PP=1820;SC=CCCTGGCACTTCCCCCATGAA;SOR=1.542;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=45;TCR=23;TR=68;WE=132248592;WS=132248574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	132249372	rs6706952	C	T	114.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=1;PP=119;SC=AGGGCCACGCCGCCGCTGTGC;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=132249380;WS=132249362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	132272401	.	G	T	1638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.132;ClippingRankSum=0.000;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.293;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.901;NF=26;NR=37;PP=1272;ReadPosRankSum=-0.079;SC=AATTGGGGAGGAAAGTGAAGC;SOR=0.998;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=102;TCF=50;TCR=52;TR=63;WE=132272409;WS=132272391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,65:0.61:106
chr2	132273988	rs199565961	GC	G	575.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.659;NF=4;NR=13;PP=1051;ReadPosRankSum=1.735;SC=GTGAGTGTTGGCCCCGTCACA;SOR=0.963;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=17;WE=132274002;WS=132273978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr2	132273994	rs372388255	T	G	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.07;MQRankSum=-2.277;QD=21.96;ReadPosRankSum=1.224;SOR=0.936;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr2	132491544	rs7599401	C	G	2682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=60;PP=2031;SC=TTATTTTTCTCTCTGTGTTTT;SOR=1.954;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=24;TCR=60;TR=84;WE=132491552;WS=132491534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr2	132494171	rs4850247	G	A	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.209;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.025;NF=13;NR=10;PP=838;ReadPosRankSum=1.289;SC=AGGGTATTCTGTGGTCAACTT;SOR=0.452;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=61;TCF=36;TCR=25;TR=23;WE=132494190;WS=132494161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,22:0.36:61
chr2	132494182	rs11690978	G	C	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.528;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.445;NF=18;NR=17;PP=1780;ReadPosRankSum=-1.226;SC=TGGTCAACTTGGTGCCGTGTA;SOR=0.567;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=53;TCF=26;TCR=27;TR=35;WE=132494190;WS=132494161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,36:0.68:53
chr2	132494272	rs4850248	A	G	1017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=32;PP=921;SC=AGTAATAACTATAATTTTATA;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=132494280;WS=132494262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	132586836	.	A	AG	61	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=24;MQ=42.38;NF=2;NR=2;PP=61;QD=31.2114401178;SC=CTGGGGCAGTAGGCGTCGAAG;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=4;WE=132586844;WS=132586826;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr2	132586854	rs4558626	C	T	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.25;MQRankSum=-0.258;QD=2.05;ReadPosRankSum=1.085;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr2	132586866	rs186960073	C	A	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.256;NF=2;NR=3;PP=176;ReadPosRankSum=-0.341;SC=GGACTGGCCGCAAAGCTGCCC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=5;WE=132586874;WS=132586844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr2	132591808	rs55998054	T	G	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.401;NF=19;NR=18;PP=545;ReadPosRankSum=1.760;SC=GATGCCTCGCTCTCAAAGTCG;SOR=0.683;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=111;TCF=60;TCR=51;TR=37;WE=132591816;WS=132591798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,42:0.37:113
chr2	132592178	rs9751367	T	C	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.450;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-5.611;NF=14;NR=6;PP=396;ReadPosRankSum=0.855;SC=TGCTGGGGAGTTGGGGCAGGG;SOR=1.154;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=52;TCF=31;TCR=21;TR=20;WE=132592186;WS=132592168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr2	132593636	rs59199382	C	T	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=11.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQRankSum=-3.975;QD=3.48;ReadPosRankSum=-0.201;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,9:0.22:41
chr2	133014491	.	C	T	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=6.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.33;MQRankSum=-5.389;QD=1.01;ReadPosRankSum=-1.047;SOR=0.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,8:0.08:97
chr2	133014497	.	G	C	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.518;ClippingRankSum=0.000;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=9.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.56;MQRankSum=0.208;QD=15.18;ReadPosRankSum=-1.928;SOR=2.062;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,41:0.39:106
chr2	133014504	rs79813268	G	T	1544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=8.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.95;MQRankSum=-0.368;QD=13.43;ReadPosRankSum=-1.190;SOR=2.010;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,44:0.38:115
chr2	133014510	rs9287404	T	C	2500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=2.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.71;MQRankSum=-4.936;QD=21.19;ReadPosRankSum=-0.289;SOR=0.326;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,64:0.54:118
chr2	133014602	rs75245503	G	C	7759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FS=9.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.79;MQRankSum=-9.465;QD=24.87;ReadPosRankSum=-0.033;SOR=1.192;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,185:0.59:312
chr2	133014612	rs74853538	A	C	8075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=11.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FS=9.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQRankSum=-8.836;QD=23.61;ReadPosRankSum=-0.820;SOR=1.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,207:0.61:342
chr2	133014619	rs78327226	C	T	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FS=40.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQRankSum=-7.869;QD=2.71;ReadPosRankSum=-0.838;SOR=3.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:287,43:0.13:330
chr2	133014640	rs78867621	C	T	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FS=33.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQRankSum=-8.162;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.751;SOR=2.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:305,50:0.14:355
chr2	133014651	rs111708138	A	AC	7855.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.758;HP=3;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-8.944;NF=103;NR=88;PP=2966;ReadPosRankSum=1.046;SC=GGCCCTCGGCACCACCGAGAC;SOR=1.072;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=328;TCF=181;TCR=147;TR=191;WE=133014665;WS=133014630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,221:0.61:361
chr2	133014657	rs113237573	G	A	1258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=413;ExcessHet=3.0103;FS=9.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQRankSum=-8.577;QD=3.06;ReadPosRankSum=1.017;SOR=1.583;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:346,65:0.16:411
chr2	133014678	rs72869462	A	G	10885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=455;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-3.948;NF=136;NR=152;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.245;SC=CATGAGCCCCAGGTCCCGCCA;SOR=0.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=457;TCF=217;TCR=240;TR=288;WE=133014686;WS=133014668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,286:0.63:452
chr2	133014703	rs72869464	T	C	11575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=453;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.549;HP=3;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-2.724;NF=123;NR=168;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.637;SC=GACCCCGAGGTGACCTCAGCC;SOR=0.771;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=461;TCF=194;TCR=267;TR=291;WE=133014711;WS=133014693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,283:0.63:449
chr2	133014721	rs72869465	T	C	11115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=456;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.559;HP=2;HapScore=1;MGOF=50;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.091;NF=110;NR=193;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.725;SC=GCCACAAACCTAACGCCAGGG;SOR=0.782;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=465;TCF=171;TCR=294;TR=303;WE=133014729;WS=133014711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,286:0.64:450
chr2	133014751	rs75204936	T	C	4082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.724;HP=2;HapScore=1;MGOF=50;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.419;NF=40;NR=87;PP=2454;ReadPosRankSum=0.631;SC=TCGTTTCTCATCCATCCTCCA;SOR=0.949;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=333;TCF=113;TCR=220;TR=127;WE=133014759;WS=133014741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,128:0.41:314
chr2	133014776	rs72869466	CA	TG	3674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.410;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=62;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.533;NF=18;NR=69;PP=2944;ReadPosRankSum=-0.514;SC=GGTCAAGCTCCAGGAGACCGG;SOR=1.107;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=250;TCF=61;TCR=189;TR=87;WE=133014796;WS=133014761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,97:0.40:243
chr2	133014786	rs72869468	G	A	1415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FS=10.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQRankSum=1.461;QD=6.38;ReadPosRankSum=-0.863;SOR=0.253;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:172,50:0.23:222
chr2	133075726	rs2598810	A	G	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.012;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.483;NF=35;NR=37;PP=1584;ReadPosRankSum=0.428;SC=CACACTGGAGAGAAGCCCTAC;SOR=0.389;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=146;TCF=62;TCR=84;TR=72;WE=133075734;WS=133075716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,73:0.49:148
chr2	133075809	rs55902546	G	A	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=1.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.55;MQRankSum=-0.729;QD=1.75;ReadPosRankSum=-0.062;SOR=0.944;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,23:0.15:154
chr2	133075904	rs113311843	C	CA	3678.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.445;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-9.713;NF=50;NR=55;PP=2968;ReadPosRankSum=1.114;SC=AGAAACAATACAATGCAATGT;SOR=0.717;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=187;TCF=84;TCR=103;TR=105;WE=133075912;WS=133075894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,120:0.59:204
chr2	133402607	rs1131671	C	T	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.058;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=6;PP=871;ReadPosRankSum=-0.590;SC=TGGTTTTATTCATTTACTGTG;SOR=0.044;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=57;TCF=51;TCR=6;TR=37;WE=133402615;WS=133402597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,36:0.64:56
chr2	133425912	rs2709533	C	T	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.254;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=127;ReadPosRankSum=0.132;SC=TTTAATGGCCCCCTCACTCCC;SOR=0.078;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=8;WE=133425920;WS=133425902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr2	133426183	rs2709532	G	C	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.117;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=2;PP=44;ReadPosRankSum=1.110;SC=ACCATCCCACGCCTCAGAGCC;SOR=0.072;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=4;WE=133426191;WS=133426173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr2	133538640	.	T	C	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.602;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.112;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=7;PP=1258;ReadPosRankSum=0.515;SC=AGTCTTTTGGTACTTCCATAT;SOR=0.343;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=81;TCF=72;TCR=9;TR=53;WE=133538648;WS=133538630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,55:0.68:81
chr2	133539460	rs6717116	A	T	1342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=1;PP=1120;ReadPosRankSum=1.420;SC=CAACTCTTTTAAAGGTGGTGG;SOR=4.615;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=38;WE=133539468;WS=133539450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr2	133539566	rs6730282	G	A	5122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.696;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=51;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.760;SC=CAACAGGGCTGTGTCTATTCC;SOR=1.414;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=110;TCR=52;TR=161;WE=133539574;WS=133539556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,170:0.99:171
chr2	133539621	rs7607544	C	T	3315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.988;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=52;PP=2371;ReadPosRankSum=0.661;SC=TGGTGTTCTCCGATTATTTTT;SOR=0.686;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=159;TCF=83;TCR=76;TR=114;WE=133539629;WS=133539611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,123:0.71:173
chr2	133541444	rs12691829	T	C	4681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.75;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr2	133541454	rs12691830	A	G	4528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.13;SOR=0.876;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr2	133541575	rs12611515	C	T	2296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=32;PP=1975;SC=AGCAGGGAGACGGACCTGCCT;SOR=1.032;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=41;TCR=32;TR=73;WE=133541583;WS=133541565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	133542014	rs12616282	T	C	5018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.217;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=61;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.808;SC=TGCCCATGGGTGCCGAAGACC;SOR=1.096;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=100;TCR=62;TR=160;WE=133542022;WS=133542004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,168:0.99:169
chr2	133542545	rs10191147	G	A	5495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=73;PP=2965;SC=GGTTCTCCACGGACTTATCGG;SOR=0.845;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=161;TCF=88;TCR=73;TR=160;WE=133542553;WS=133542535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr2	133554288	rs1868076	A	G	7055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=178;PP=2965;SC=GATCCAAGAGACGTGAGTGAA;SOR=3.279;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=210;TCF=32;TCR=178;TR=210;WE=133554296;WS=133554278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr2	133636211	rs140434127	ACACACACACACACACACG	A	565.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.27;MQRankSum=4.284;QD=12.04;ReadPosRankSum=-1.093;SOR=0.326;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr2	133683658	rs2577634	G	T	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=276;ReadPosRankSum=0.611;SC=ACACACTTTAGGTCCATGTGT;SOR=0.892;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=17;WE=133683666;WS=133683648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr2	135076111	rs4954134	C	G	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.509;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=181;ReadPosRankSum=-0.191;SC=GTTCTTTAGGCCACAGCTTGA;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=8;WE=135076119;WS=135076101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr2	135096097	rs7598410	T	C	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.035;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=35;PP=918;ReadPosRankSum=0.382;SC=AATGATATTCTCTCAGGGTGA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=35;WE=135096105;WS=135096087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,35:0.69:51
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chr2	135602601	rs6430545	T	A	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=1.607;SC=GAGATAACAGTATTTTCTTCT;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=6;WE=135602609;WS=135602591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr2	135629927	rs12469941	C	T	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=-0.358;SC=AATAGGTCCTCTGTAATTACT;SOR=0.141;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=6;WE=135629935;WS=135629917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr2	135677268	rs3769024	G	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.395;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=126;ReadPosRankSum=-0.533;SC=TCCAGTTTGGGGTTTGGATTT;SOR=2.053;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=9;WE=135677276;WS=135677258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,9:0.24:37
chr2	135677471	rs3841862	A	AGTTT	387.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=1.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.48;ReadPosRankSum=-0.815;SOR=1.251;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr2	135694354	rs1823118	G	C	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=272;ReadPosRankSum=1.005;SC=AAAGAAAATAGAGGGTTTTTT;SOR=0.663;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=66;TCF=63;TCR=3;TR=19;WE=135694362;WS=135694344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,19:0.27:71
chr2	135694379	rs1374289	C	T	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=405;ReadPosRankSum=-0.363;SC=TGTATTTGTTCTTAAATGACC;SOR=0.594;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=74;TCR=6;TR=23;WE=135694387;WS=135694369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,23:0.27:85
chr2	135694398	rs150434426	A	C	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.224;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=3;PP=464;ReadPosRankSum=0.572;SC=CCAGAGTTTTATCTTTTCTGC;SOR=0.968;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=96;TCF=82;TCR=14;TR=26;WE=135694406;WS=135694388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,25:0.25:100
chr2	135700151	rs3816339	A	T	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=129;ReadPosRankSum=1.505;SC=TAGTGGTAAGAGATTGGAAAA;SOR=0.877;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=9;WE=135700165;WS=135700141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr2	135703338	rs57267734	CT	C	335.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=4.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.654;SOR=0.074;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,21:0.36:58
chr2	135705558	rs1979033	G	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=146;ReadPosRankSum=-1.013;SC=TACACTATCAGATGAACAGAA;SOR=0.260;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=8;WE=135705566;WS=135705548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr2	135710322	rs10166142	A	G	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.831;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=582;ReadPosRankSum=-0.699;SC=TCAGTCTTTTATGTAACATTT;SOR=0.806;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=82;TCF=34;TCR=48;TR=35;WE=135710330;WS=135710312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,35:0.42:84
chr2	135711516	rs3814355	C	T	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.503;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=35;PP=1243;ReadPosRankSum=-0.978;SC=ACATGGCAGACAAAAAGGAAA;SOR=0.653;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=234;TCF=130;TCR=104;TR=77;WE=135711524;WS=135711506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,79:0.33:236
chr2	135711657	rs3814354	G	A	2260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.529;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=48;PP=1740;ReadPosRankSum=-0.267;SC=GCAGTGGGAAGAGCAAACATT;SOR=0.600;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=260;TCF=128;TCR=132;TR=97;WE=135711665;WS=135711647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,98:0.38:260
chr2	135740876	rs60969462	A	G	1766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.629;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=55;PP=1343;ReadPosRankSum=-0.443;SC=TTGAAGGAAGATATTTCTTTC;SOR=0.614;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=179;TCF=45;TCR=134;TR=73;WE=135740884;WS=135740866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,75:0.40:186
chr2	135741061	rs12623713	G	A	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=20;ReadPosRankSum=-0.464;SC=CCTTTCAGTCGGATAAAGCAG;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=3;WE=135741069;WS=135741051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr2	135745392	rs11888766	G	A	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=4.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.17;ReadPosRankSum=0.639;SOR=0.363;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,27:0.27:101
chr2	135745545	rs11899779	C	T	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=680;ReadPosRankSum=-0.345;SC=CCAGGCATTGCCTGTGATGGT;SOR=0.685;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=74;TCR=59;TR=40;WE=135745553;WS=135745535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,44:0.31:141
chr2	135745722	rs10928526	A	G	1628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=38;PP=1105;ReadPosRankSum=0.091;SC=AAGATGTGAGACTTGGAATGT;SOR=0.666;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=232;TCF=108;TCR=124;TR=70;WE=135745730;WS=135745712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,75:0.32:238
chr2	135748872	rs144837592	AAAAAC	A	188.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=0.000;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.753;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr2	135756265	rs58663889	G	T	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=48;ReadPosRankSum=-1.085;SC=ATAAATATTTGTTGACCAAAA;SOR=0.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=5;WE=135756273;WS=135756255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr2	135762980	rs7606415	C	T	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.026;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=473;ReadPosRankSum=0.902;SC=TCTTTGTAAACACATCAAGGA;SOR=0.873;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=62;TCF=42;TCR=20;TR=24;WE=135762988;WS=135762970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,24:0.39:61
chr2	135893372	rs10445686	A	G	1797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FS=1.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.88;ReadPosRankSum=-0.692;SOR=0.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:224,82:0.27:306
chr2	135911422	rs17261772	T	C	1878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=49;PP=1260;ReadPosRankSum=0.162;SC=GGAGACTCTTTGATGATACAC;SOR=0.662;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=223;TCF=89;TCR=134;TR=83;WE=135911430;WS=135911412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,90:0.38:235
chr2	136071170	.	C	G	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.723;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=508;ReadPosRankSum=-1.423;SC=AGCTGGTATTCAATTCCTATG;SOR=0.175;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=90;TCF=12;TCR=78;TR=28;WE=136071178;WS=136071160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,35:0.36:98
chr2	136393658	rs961360	A	G	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.771;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=627;ReadPosRankSum=1.485;SC=TTTTCTGTAGATGAGAATACG;SOR=0.936;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=89;TCF=48;TCR=41;TR=35;WE=136393666;WS=136393648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,37:0.39:95
chr2	136396300	rs2278731	T	C	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.987;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=365;ReadPosRankSum=1.110;SC=CCTATTAAAATGCCAACAGAC;SOR=0.421;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=96;TCF=65;TCR=31;TR=29;WE=136396308;WS=136396290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,31:0.30:104
chr2	136407445	rs1446586	A	G	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.55;ReadPosRankSum=-1.229;SOR=0.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,28:0.24:116
chr2	136407479	rs1446585	A	G	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.46;ReadPosRankSum=0.220;SOR=0.626;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,39:0.27:144
chr2	136467119	rs2304366	C	T	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=37;PP=920;ReadPosRankSum=1.113;SC=ATAAAGAAATCAGTGAAAATA;SOR=0.636;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=183;TCF=54;TCR=129;TR=52;WE=136467127;WS=136467109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,52:0.28:189
chr2	136467164	rs2304367	C	A	3247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=89;PP=2589;SC=AGTTCGATTACTTTCCTTAGG;SOR=4.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=6;TCR=89;TR=95;WE=136467172;WS=136467154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr2	136480013	rs148346034	T	C	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.049;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=391;ReadPosRankSum=-0.814;SC=ATTAACGTTGTTTCTCAACTA;SOR=1.567;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=65;TCF=37;TCR=28;TR=20;WE=136480021;WS=136480003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,21:0.30:69
chr2	136527443	rs113881162	G	GTGAT	4514.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.926;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.578;NF=35;NR=40;PP=2969;ReadPosRankSum=1.129;SC=AACTGAGGTTGTGATTGATTA;SOR=1.061;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=147;TCF=61;TCR=86;TR=75;WE=136527451;WS=136527433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,112:0.67:166
chr2	136545844	rs1042712	C	G	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=470;SC=GGCCGGTAAACATAGATGAAG;SOR=3.258;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=14;WE=136545852;WS=136545834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	136546110	rs2278544	A	G	203.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=164;SC=TGGTGGGTCCAGCATCTAGGA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=136546118;WS=136546100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	136548169	rs892716	A	G	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=271;SC=CACTCCTGCAAATAGCAGATG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=136548177;WS=136548159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	136548192	rs1808756	G	A	267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=210;SC=TCCAACAGGGGAAGGTGCACG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=136548200;WS=136548182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	136555659	rs2322659	T	C	2098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=31;PP=1643;SC=CATCACCTCATTGTAATCTCC;SOR=0.910;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=36;TCR=31;TR=67;WE=136555667;WS=136555649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr2	136561557	rs2304371	G	A	2129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=23;PP=1685;SC=GGCTCATTCAGCGTGATCCAA;SOR=1.284;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=40;TCR=23;TR=63;WE=136561565;WS=136561547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	136564689	rs375300532	ACTC	A	979.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.156;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=680;ReadPosRankSum=-1.340;SC=ACCATCCTGAACTCCTCACCT;SOR=0.435;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=18;WE=136564699;WS=136564679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr2	136565028	rs10928549	C	G	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=24;PP=773;SC=CCTCCATGCACCCAACCCACT;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=136565036;WS=136565018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	136567154	rs116951780	C	T	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.37;ReadPosRankSum=1.018;SOR=0.873;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,22:0.22:102
chr2	136569848	rs12988076	C	A	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=325;ReadPosRankSum=-0.516;SC=GTACCACCCACCTTCCAATCA;SOR=0.906;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=15;WE=136569856;WS=136569838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr2	136575199	rs6719488	G	T	2761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.043;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=52;PP=2224;ReadPosRankSum=-0.906;SC=AGTAGGCAACGCCTGGGAGGC;SOR=0.520;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=160;TCF=72;TCR=88;TR=100;WE=136575207;WS=136575189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,103:0.63:163
chr2	136575534	rs4954449	T	C	3310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=57;PP=2593;SC=GCTTCCCAGATTCTCTGATAG;SOR=0.973;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=43;TCR=57;TR=100;WE=136575542;WS=136575524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr2	136581685	rs3820791	G	C	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=31;PP=659;ReadPosRankSum=-0.059;SC=CTTTGGAAATGACCTCTAAGT;SOR=0.433;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=110;TCF=15;TCR=95;TR=37;WE=136581693;WS=136581675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,38:0.35:110
chr2	136594158	rs2236783	G	A	1869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=10;PP=1522;ReadPosRankSum=-0.673;SC=CATCACTGAGGGTCTGGAGTT;SOR=0.803;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=98;TCF=83;TCR=15;TR=68;WE=136594166;WS=136594148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,68:0.67:101
chr2	136598550	rs141917101	T	C	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.834;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=27;PP=648;ReadPosRankSum=0.627;SC=TGTCCTCAGGTTTCAAGCAGT;SOR=1.346;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=78;TCF=11;TCR=67;TR=30;WE=136598558;WS=136598540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,31:0.38:82
chr2	136602293	rs138730070	C	T	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.404;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=261;ReadPosRankSum=-1.271;SC=CCTAGCAACTCGTACTGTCAG;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=16;WE=136602301;WS=136602283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr2	136602384	rs140430334	G	T	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=51;ReadPosRankSum=-1.611;SC=AAGTACATCTGGTGACGTAAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=136602392;WS=136602374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr2	136622825	rs309177	A	G	2986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=85;PP=2597;SC=ACAACATAGCATGGGAAGTCA;SOR=6.207;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=3;TCR=85;TR=88;WE=136622833;WS=136622815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr2	136626115	rs142761194	G	C	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=229;ReadPosRankSum=-1.072;SC=ATAAGCTATTGCAAGGGCCTA;SOR=0.239;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=12;WE=136626123;WS=136626105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr2	136633771	rs191079	T	C	1222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=5;PP=1045;SC=CGGCACCGCCTGGCCCAGACG;SOR=3.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=39;WE=136633779;WS=136633761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	136664975	rs76296777	A	G	1178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.565;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=34;PP=879;ReadPosRankSum=0.010;SC=ACTCGTTCCAATCCTGGGGAA;SOR=1.222;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=139;TCF=56;TCR=83;TR=50;WE=136664983;WS=136664965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,52:0.37:142
chr2	136677919	rs113342018	G	T	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=152;ReadPosRankSum=0.556;SC=TTATATATATGTTCATAGAAA;SOR=0.495;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=8;WE=136677927;WS=136677909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr2	136680534	rs309158	A	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=78;ReadPosRankSum=-0.403;SC=TCAATTGTAAACTTATCAATG;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=6;WE=136680542;WS=136680524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr2	136690414	rs34744196	TA	T	979.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=43.728;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.49;ReadPosRankSum=0.562;SOR=5.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:6,47:0.89:53
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chr2	136743138	rs6752967	A	G	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=6.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.549;SOR=1.792;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,26:0.34:76
chr2	136743143	rs2278682	G	C	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=5.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.97;ReadPosRankSum=1.116;SOR=2.019;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,23:0.30:76
chr2	136956733	rs7578292	T	C	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.106;NF=17;NR=3;PP=266;ReadPosRankSum=-0.337;SC=CGGCAAATACTGTGCATTCTG;SOR=0.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=69;TCF=58;TCR=11;TR=20;WE=136956741;WS=136956723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,22:0.29:75
chr2	137639616	rs1465612	C	T	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=0;PP=567;SC=TAATGAAAAACTTGCAATACC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=137639624;WS=137639608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	137640006	rs11298935	CT	C	447.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=374;SC=AAAATAGACTCTTTTTTTTAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=17;WE=137640014;WS=137639996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	137814477	rs17727482	C	G	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.987;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=23;PP=939;ReadPosRankSum=-0.952;SC=TCATAGCTCCCCCTCTCTTTG;SOR=0.903;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=170;TCF=93;TCR=77;TR=56;WE=137814485;WS=137814467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,60:0.34:178
chr2	137917922	rs4954474	T	A	2056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.479;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=49;PP=1503;ReadPosRankSum=-0.721;SC=ACTGTCATGATCCTCAGGGGA;SOR=0.646;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=250;TCF=110;TCR=140;TR=85;WE=137917930;WS=137917912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,89:0.34:258
chr2	138000226	rs7605259	T	C	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.693;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.631;NF=7;NR=28;PP=819;ReadPosRankSum=0.261;SC=TTGTGGAATGTGAGCACCTTT;SOR=1.292;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=118;TCF=32;TCR=86;TR=35;WE=138000242;WS=138000216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,36:0.30:120
chr2	138000233	.	CT	C	919.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.605;ClippingRankSum=0.000;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.844;NF=5;NR=44;PP=1955;ReadPosRankSum=-0.845;SC=ATGTGAGCACCTTTTTTTTTT;SOR=0.656;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=92;TCF=16;TCR=76;TR=49;WE=138000242;WS=138000216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,53:0.65:82
chr2	138033616	rs199954270	G	GT	211.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.265;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=131;ReadPosRankSum=-0.400;SC=TTTTTACATAGTTTTTTTTTA;SOR=0.441;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=50;TCF=6;TCR=44;TR=13;WE=138033624;WS=138033606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,15:0.26:58
chr2	138163391	rs1551281	T	C	973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=803;SC=TAGTGTGCATTTTACTCTTTA;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=138163399;WS=138163381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	138169158	rs1463285	T	C	1935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=5;PP=1666;SC=TTTAATATCTTAATGTCTCTT;SOR=4.370;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=51;TCR=5;TR=56;WE=138169166;WS=138169148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	138208631	rs1453302	G	T	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=36;PP=895;ReadPosRankSum=-0.402;SC=AGCTAAAAAAGCTATCCTCAT;SOR=0.721;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=54;TCF=1;TCR=53;TR=37;WE=138208639;WS=138208621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,37:0.69:54
chr2	138237038	rs1584435	C	T	1133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=13;PP=904;SC=CTTCAGGTCCCTGTCAGAATG;SOR=1.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=39;WE=138237046;WS=138237028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	138378351	rs58339575	AG	A	368.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.670;NF=4;NR=10;PP=431;ReadPosRankSum=-0.281;SC=AATATCATTCAGTATGCCATA;SOR=0.558;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=14;WE=138378359;WS=138378341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,14:0.27:51
chr2	138721979	.	T	G	105	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000;HP=9;HapScore=3;MGOF=10;MMLQ=16;MQ=59.27;NF=6;NR=0;PP=105;QD=23.2952020912;SC=CTGGTGGGGGTGGGGAAAGAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=6;WE=138721987;WS=138721963;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,6:0.27:22
chr2	138727607	rs3100702	G	A	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=68;ReadPosRankSum=-0.010;SC=ATATAATTGGGACATTTCATG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=5;WE=138727615;WS=138727597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr2	138759649	rs11558538	C	T	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.647;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=12;PP=645;ReadPosRankSum=0.193;SC=GTAGCCAAGACATCGAACCTC;SOR=1.240;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=148;TCF=94;TCR=54;TR=43;WE=138759657;WS=138759639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,44:0.28:160
chr2	138762873	rs3842548	C	CTT	147.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.782;NF=0;NR=5;PP=91;ReadPosRankSum=1.017;SC=TTGAAAGAAGCTTATATATTT;SOR=0.141;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=5;WE=138762881;WS=138762863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr2	138771219	rs12475006	G	A	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=248;ReadPosRankSum=-1.025;SC=TGTACTCCTTGAAATATGAGC;SOR=0.616;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=15;WE=138771227;WS=138771209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr2	138771760	rs1050891	A	G	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=167;ReadPosRankSum=-0.933;SC=TCACTCATTTATTTCCATATT;SOR=0.242;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=10;WE=138771768;WS=138771750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr2	139045444	rs11900034	TT	AA	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.52;MQRankSum=-0.622;QD=10.10;ReadPosRankSum=-0.897;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr2	139045855	rs35998722	C	T	2034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.467;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.407;NF=45;NR=47;PP=1473;ReadPosRankSum=1.551;SC=AAGACCTAAGCGAATAGGATG;SOR=0.640;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=257;TCF=124;TCR=133;TR=92;WE=139045863;WS=139045845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,95:0.36:265
chr2	139045972	rs6733578	T	C	6458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.798;SC=TTCTGCCAGATACCTGTGGTA;SOR=0.266;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=91;TCR=103;TR=192;WE=139045980;WS=139045962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,200:1.00:201
chr2	139045987	rs13033503	C	T	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.138;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=30;PP=1278;ReadPosRankSum=1.233;SC=GTGGTAGTACCATTTCGTTTT;SOR=0.784;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=201;TCF=105;TCR=96;TR=66;WE=139045995;WS=139045977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,68:0.33:208
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chr2	139046385	rs13382964	G	A	5286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=141;PP=2965;SC=CTCCAGCAGGGTCTGCGTGAC;SOR=3.844;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=161;TCF=20;TCR=141;TR=161;WE=139046393;WS=139046375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr2	139308191	rs115949311	C	A	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.314;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=329;ReadPosRankSum=1.123;SC=TTTTTGTTTGCTTTGAATTTT;SOR=0.375;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=84;TCF=29;TCR=55;TR=28;WE=139308199;WS=139308181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,28:0.33:84
chr2	139308397	rs148464901	T	TTCTCTC	447.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=44.77;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	139429068	rs10803570	G	A	7367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=128;PP=2965;SC=TGCTGTCTGCGTACGCCATGG;SOR=1.064;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=222;TCF=94;TCR=128;TR=221;WE=139429076;WS=139429058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr2	139429286	rs60855564	C	T	1392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.625;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=41;PP=1032;ReadPosRankSum=1.067;SC=GCCGTGACTGCGCACTCAAAC;SOR=0.097;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=68;TCF=4;TCR=64;TR=45;WE=139429294;WS=139429276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,50:0.68:73
chr2	140992337	rs13387241	C	A	5056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=99;NR=52;PP=2965;SC=CATGAAATAACGAATATTCTT;SOR=1.493;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=99;TCR=52;TR=151;WE=140992345;WS=140992327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr2	140997197	rs3748864	T	G	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=351;SC=ACTTGACCATTGATATAATAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=140997205;WS=140997187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	141004513	rs11895946	C	T	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=10;NR=0;PP=266;SC=AGTGCTTCCTCTTTCAAAAAC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=141004521;WS=141004509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	141004529	rs2129483	A	G	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=0;PP=451;SC=AAAACACCTCAATTGCAGTGG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=141004537;WS=141004519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	141027926	rs3748865	A	G	5048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=124;PP=2965;ReadPosRankSum=1.743;SC=CTGCAACAACAAAGAAAAAAA;SOR=1.572;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=154;TCF=28;TCR=126;TR=152;WE=141027934;WS=141027916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,155:0.99:156
chr2	141032088	rs1386356	C	T	5427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=73;PP=2965;SC=CTTCATAGCGCGTTGGACAGA;SOR=0.967;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=166;TCF=93;TCR=73;TR=165;WE=141032096;WS=141032078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr2	141032220	rs76176617	C	T	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.471;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=53;PP=1450;ReadPosRankSum=0.280;SC=GGACATTTTTCTTCAGTCATA;SOR=0.433;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=88;TCF=9;TCR=79;TR=60;WE=141032228;WS=141032210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,61:0.68:90
chr2	141260668	rs4444457	A	G	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=4.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.425;SOR=1.208;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,35:0.26:134
chr2	141264470	.	C	T	2759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.637;ClippingRankSum=0.000;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.487;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=85;PP=2311;ReadPosRankSum=-1.089;SC=GCATTTTCATCACATGTATTA;SOR=1.323;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=151;TCF=32;TCR=119;TR=104;WE=141264478;WS=141264460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,101:0.65:155
chr2	141267744	rs1948051	T	C	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.87;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	141274576	rs4954672	T	C	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.730;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=33;PP=879;ReadPosRankSum=-0.750;SC=TGTGTTTGTTTTGAACTGTGA;SOR=2.047;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=35;WE=141274584;WS=141274566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,38:0.64:59
chr2	141283603	rs1352047	T	G	2784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=77;PP=2358;SC=TACCTCATTTTCAAAGATTAT;SOR=4.830;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=6;TCR=77;TR=83;WE=141283611;WS=141283593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr2	141284041	rs7562323	A	G	895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=27;PP=783;SC=AACTCTGGGAAGCCAAACTTG;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=141284049;WS=141284031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	141294285	.	GA	G	83.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=4.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.579;QD=1.44;ReadPosRankSum=2.202;SOR=2.224;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,13:0.22:58
chr2	141298467	rs6729619	A	C	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=413;ReadPosRankSum=0.302;SC=TCATGAATACACTAACACAAT;SOR=0.233;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=57;TCR=0;TR=20;WE=141298475;WS=141298457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,20:0.33:60
chr2	141298674	rs13013854	T	C	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=2.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.73;ReadPosRankSum=-0.559;SOR=1.045;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,37:0.25:149
chr2	141298682	rs11694934	G	C	1178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=2.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.86;ReadPosRankSum=-0.601;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,34:0.26:133
chr2	141298749	rs11694970	G	C	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=227;ReadPosRankSum=1.329;SC=TAAACTATTAGACTGCCTCAA;SOR=0.142;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=0;TCR=52;TR=13;WE=141298757;WS=141298739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,15:0.27:55
chr2	141299317	rs9287535	A	G	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=212;ReadPosRankSum=0.484;SC=TATACAATGAAAAAACACATT;SOR=0.416;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=53;TCR=3;TR=14;WE=141299325;WS=141299307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,14:0.25:55
chr2	141359287	rs1441465	C	T	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr2	141473409	rs10716305	CA	C	223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=258;SC=TGAATATAAACATTTTTTTCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=141473417;WS=141473399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	141473505	rs4954852	A	T	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=2;PP=860;SC=GAAAACTCACATAAAACTTGG;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=31;WE=141473513;WS=141473495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	141474402	rs5834770	G	GA	3331.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.234;NF=0;NR=115;PP=2797;ReadPosRankSum=-0.690;SC=ATAAGACACAGAAAAAAAATA;SOR=6.753;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=134;TCF=1;TCR=133;TR=115;WE=141474410;WS=141474392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,117:0.99:118
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chr2	141533598	rs188572675	G	A	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=0.191;SC=TTGTTGAATTGAGGAGCTAAT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=141533606;WS=141533588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
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chr2	141598681	rs74787922	A	C	2816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-5.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.656;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=100;PP=2082;ReadPosRankSum=-0.624;SC=AGGAAAGAGAAGATTTAAAGG;SOR=0.935;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=180;TCF=33;TCR=147;TR=121;WE=141598689;WS=141598671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,121:0.67:180
chr2	141625410	rs12987572	A	C	1085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=31;PP=895;ReadPosRankSum=-0.744;SC=TGACCTACAGAAAGATAAATA;SOR=0.458;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=34;WE=141625418;WS=141625400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,36:0.86:42
chr2	141680800	.	T	G	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=289;ReadPosRankSum=0.590;SC=AGTTTTTATTTCACATTTTTT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=15;WE=141680808;WS=141680790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr2	141707694	rs1980343	C	T	146.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=118;SC=CATGTATATTCTTGCCTAATA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=141707702;WS=141707684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	141707812	rs141827692	G	C	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=3;PP=821;ReadPosRankSum=-0.974;SC=ACCTTCTTTAGTACAATTGAT;SOR=0.582;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=51;TCF=47;TCR=4;TR=33;WE=141707820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,34:0.65:52
chr2	141709419	rs1429348	T	G	2985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=44;PP=2287;SC=AGTGAGCATTTGGTACTTGCC;SOR=0.758;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=44;TCR=44;TR=87;WE=141709427;WS=141709409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr2	141762830	rs13413663	C	T	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.901;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=573;ReadPosRankSum=-0.690;SC=CATTTTAATTCCTTTAGTTTC;SOR=2.998;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=23;WE=141762838;WS=141762820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,23:0.68:34
chr2	141771058	rs3791766	T	A	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=355;ReadPosRankSum=1.104;SC=AAGATAAATCTTTTATAACTT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=17;WE=141771066;WS=141771048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr2	141816621	rs1525579	A	G	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=13;PP=418;SC=AAAGATGTCTAACCTATAAAG;SOR=2.531;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=141816629;WS=141816611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	141945949	rs1249434	C	T	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=0;PP=1076;SC=TCTTTTTAAACGCAAACTTTT;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=141945957;WS=141945939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	141987087	rs79330716	G	A	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=35;ReadPosRankSum=0.253;SC=GTTATTGAAAGCTATTTTCTA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=141987095;WS=141987077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr2	142012027	rs431809	G	T	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.341;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=1288;ReadPosRankSum=0.568;SC=AAAGATGTCTGCTTACATTTC;SOR=1.460;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=30;WE=142012044;WS=142012017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,29:0.74:39
chr2	142012036	rs9973397	T	G	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.518;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=382;ReadPosRankSum=1.454;SC=TGCTTACATTTCTGTTAACTA;SOR=0.852;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=43;TCF=25;TCR=18;TR=10;WE=142012044;WS=142012017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,10:0.24:42
chr2	142012301	rs373757	T	C	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=37;ReadPosRankSum=0.674;SC=ACTATAGTCTTGATTGTTCTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=142012309;WS=142012291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr2	142237868	rs4264514	G	A	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=115;ReadPosRankSum=-0.974;SC=TGATATGCTTGTAGTTGAAAG;SOR=0.096;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=6;WE=142237876;WS=142237858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr2	142356622	rs201776388	G	C	546.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=27;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.390;NF=20;NR=1;PP=617;ReadPosRankSum=3.486;SC=ACTCCCCCCCGCCCCCCCCCC;SOR=2.670;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=21;WE=142356630;WS=142356612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,21:0.81:26
chr2	142567738	rs28529494	G	T	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=2.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQRankSum=-0.243;QD=5.64;ReadPosRankSum=1.025;SOR=0.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr2	142888376	rs1375610	G	C	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.507;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=33;PP=525;ReadPosRankSum=-0.308;SC=GCGGCGGCAGGGGCCGCTTGG;SOR=1.093;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=96;TCF=8;TCR=88;TR=35;WE=142888384;WS=142888366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,36:0.36:99
chr2	143746494	rs10496935	C	G	1457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=1081;ReadPosRankSum=2.041;SC=GTCATCACTTCATTGTCCCTG;SOR=0.721;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=81;TCF=40;TCR=41;TR=56;WE=143746502;WS=143746484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,57:0.70:82
chr2	143787161	rs6429999	C	A	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.14;ReadPosRankSum=2.313;SOR=0.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,13:0.32:40
chr2	143787274	rs6430000	C	T	1236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=35;PP=1009;SC=TTACCTAATGCCATTTTTATT;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=38;WE=143787282;WS=143787264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	143791014	rs2304700	G	T	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-6.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=46;PP=1147;ReadPosRankSum=0.000;SC=ATGAACAAGGGACAGAAGGCA;SOR=0.368;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=69;TCF=2;TCR=67;TR=48;WE=143791022;WS=143791004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,49:0.68:72
chr2	143798189	rs9013	A	G	2526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.726;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=70;PP=2055;ReadPosRankSum=-0.503;SC=TGTTCCAAACAAAGATGTTTT;SOR=1.247;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=152;TCF=43;TCR=109;TR=93;WE=143798197;WS=143798179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,94:0.61:153
chr2	143913004	rs2580857	T	G	2396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=1;PP=2006;SC=TCATGGAAAATTGTATGTTTA;SOR=7.024;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=65;TCF=64;TCR=1;TR=65;WE=143913012;WS=143912994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	143973860	rs1451805	G	A	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=28;ReadPosRankSum=0.262;SC=GAAAACTTCCGTCACTGCAAT;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=143973868;WS=143973850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr2	144194565	rs17230746	C	T	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=874;ReadPosRankSum=0.591;SC=TAAGTCACTACGACAGTGATA;SOR=0.610;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=60;TCF=30;TCR=30;TR=39;WE=144194573;WS=144194555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,40:0.66:61
chr2	144710295	rs56385884	A	G	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=402;ReadPosRankSum=1.056;SC=AGCATGAATCATATATTAAAT;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=23;WE=144710303;WS=144710285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,24:0.73:33
chr2	144934655	rs5834992	A	AG	806.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=969;SC=ACAGCACCAAAGGGGAAATCC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=23;WE=144934663;WS=144934645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	145121339	rs10206546	G	A	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.45;ReadPosRankSum=0.866;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,4:0.17:24
chr2	145155414	rs13003631	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=81;ReadPosRankSum=-1.691;SC=TACCATGTTGGCCAGGCTGGT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=145155422;WS=145155404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr2	145155789	rs112140314	A	AT	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=70;ReadPosRankSum=2.074;SC=TTTCACTAAGATTTTTTTTTC;SOR=0.105;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=6;WE=145155797;WS=145155779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr2	145157858	rs35213774	A	G	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=6.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.57;ReadPosRankSum=-0.259;SOR=1.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,26:0.26:99
chr2	145181758	rs10928212	A	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=85;ReadPosRankSum=-0.732;SC=ACCACTCAGTATCTTCCCACT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=145181766;WS=145181748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr2	145255387	rs78783951	T	C	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.445;NF=1;NR=23;PP=402;ReadPosRankSum=-0.846;SC=AAAGACACTGTCATTCTCAAC;SOR=0.421;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=80;TCF=4;TCR=76;TR=24;WE=145255395;WS=145255377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,24:0.30:80
chr2	145255399	.	TATATATATATATGTCATTCTCAACATATATATATATATGTCATTCTCAAC	T	662.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.27;QD=44.18;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	145255430	.	A	AT	124	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=53.16;NF=0;NR=3;PP=124;QD=45.0;SC=CAACATATATATATATATGTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=3;WE=145255438;WS=145255420;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:15,3:0.17:18
chr2	145271250	rs116497883	C	T	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.476;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=521;ReadPosRankSum=0.272;SC=TCCCAGGACCCGCTGCCCGAA;SOR=0.180;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=25;WE=145271258;WS=145271240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,28:0.78:36
chr2	147596973	rs4411641	A	G	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.899;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=261;ReadPosRankSum=-0.380;SC=CTAAATTTGAATGATAAAATA;SOR=1.863;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=15;WE=147596981;WS=147596963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr2	148701099	rs66919703	GA	G	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.61;ReadPosRankSum=-0.918;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr2	148730367	rs2307397	G	C	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.621;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=31;PP=788;ReadPosRankSum=-1.496;SC=TCTCCATGGAGAGCAGTTCTT;SOR=0.509;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=123;TCF=36;TCR=87;TR=45;WE=148730375;WS=148730357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,48:0.37:129
chr2	148733548	rs2307399	T	TA	221.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.325;NF=3;NR=5;PP=204;ReadPosRankSum=-0.061;SC=TCAAATCCTTTAAAAAAATTG;SOR=0.515;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=8;WE=148733556;WS=148733538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr2	149240657	rs5835195	GT	G	1937.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=7.183;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.77;MQRankSum=-0.104;QD=19.38;ReadPosRankSum=-0.050;SOR=0.097;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:8,92:0.92:100
chr2	149243260	rs2121344	G	A	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=499;SC=GAGAGGCATCGAATCTCCGAA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=149243268;WS=149243250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	149449002	.	A	G	348	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=15;NR=0;PP=348;QD=25.5180808365;SC=GGTGATTTGTATTTTTAAAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=15;WE=149449010;WS=149449001;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr2	149449185	rs6724787	G	A	7849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=129;NR=124;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.725;SC=ATTTGTTTCTGCCAGGCATTT;SOR=0.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=254;TCF=129;TCR=125;TR=253;WE=149449193;WS=149449175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,265:1.00:266
chr2	149520214	rs10193313	C	A	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=1;PP=473;SC=GCAATGTTTTCTTATATTTTT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=149520222;WS=149520204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	149633145	.	CCCCCCACCCATCCCCGTG	C	457.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.768;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=2241;ReadPosRankSum=2.614;SC=CCGGCCCCGGCCCCCCACCCA;SOR=0.250;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=8;WE=149633170;WS=149633135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr2	149806596	rs143758774	T	A	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.539;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=297;ReadPosRankSum=1.613;SC=TGGCTATGGATGCCTGCTTGC;SOR=1.911;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=13;WE=149806604;WS=149806586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr2	149853960	rs6738277	A	G	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.921;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=602;ReadPosRankSum=0.890;SC=GTATATGGCAAGGGACAGGGG;SOR=1.267;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=28;WE=149853968;WS=149853950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
chr2	150062776	rs79466863	G	A	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.46;ReadPosRankSum=-1.960;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr2	150305703	rs11681264	G	A	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.527;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=40;PP=1097;ReadPosRankSum=-0.619;SC=TGGGCTGTCCGTGAGTGAACA;SOR=1.148;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=72;TCF=18;TCR=54;TR=51;WE=150305711;WS=150305693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,56:0.74:76
chr2	150320627	rs34341723	TA	T	1326.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=2.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQRankSum=1.040;QD=12.40;ReadPosRankSum=1.167;SOR=0.380;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,76:0.71:107
chr2	150427516	rs4500908	C	T	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=495;ReadPosRankSum=0.120;SC=AAGTCTTAATCTATTACCAAA;SOR=0.914;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=22;WE=150427524;WS=150427506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
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chr2	150432469	rs10932467	G	T	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=85;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TAAAATTACTGTGGTATTAGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=150432477;WS=150432459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr2	150432976	rs11545261	C	T	2074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=25;PP=1530;SC=CTGGACATGTCTGTATTGCAC;SOR=0.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=34;TCR=25;TR=59;WE=150432984;WS=150432966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	150433128	rs11680630	C	G	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=527;ReadPosRankSum=-1.711;SC=TGTTATAAACCTGTCTTCCTT;SOR=1.022;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=25;WE=150433136;WS=150433118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr2	150443689	rs4667420	C	G	5416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=85;PP=2965;SC=ACAAAACAGACGAGTGATCGA;SOR=0.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=78;TCR=85;TR=163;WE=150443697;WS=150443679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr2	150443813	rs4667419	C	T	1959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=54;PP=1564;SC=CCAGAACTCGCCCCCATGCCA;SOR=5.353;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=3;TCR=54;TR=57;WE=150443821;WS=150443803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr2	151328284	rs11338446	GA	G	2748.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.782;HP=15;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=97;PP=1757;ReadPosRankSum=1.521;SC=CACTATGAAAGAAAAAAAAAA;SOR=3.250;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=124;TCF=10;TCR=114;TR=104;WE=151328293;WS=151328273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,118:0.99:119
chr2	151343988	rs2334309	A	T	415.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.89;ReadPosRankSum=1.276;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,17:0.89:19
chr2	151857799	rs6709096	A	T	1970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=21;PP=1544;ReadPosRankSum=-1.214;SC=CTCTGTATCTACAGCTGTTTA;SOR=0.740;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=115;TCF=81;TCR=34;TR=73;WE=151857807;WS=151857789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,71:0.62:114
chr2	151900223	rs7589036	T	C	9834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=206;NR=106;PP=2965;SC=GGAACTAGATTGGTTACCACA;SOR=1.558;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=313;TCF=206;TCR=107;TR=312;WE=151900231;WS=151900213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr2	151900390	rs200971691	TAAAAAC	T	677.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.35;MQRankSum=2.258;QD=13.03;ReadPosRankSum=1.555;SOR=0.340;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,20:0.38:52
chr2	152108261	rs4665119	T	G	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=303;ReadPosRankSum=-0.621;SC=CCACTTTCTTTTCTCTGCAGA;SOR=1.085;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=17;WE=152108269;WS=152108251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr2	152109159	rs289885	C	T	1492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=0;PP=1190;SC=TTGCATTTTCCTTCCTAGAAG;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=152109167;WS=152109149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	152117780	rs2271811	T	C	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=10;PP=857;ReadPosRankSum=-0.629;SC=ATCGTTCTTATTAGCCCTTTT;SOR=0.852;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=62;TCF=47;TCR=15;TR=42;WE=152117788;WS=152117770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,43:0.68:63
chr2	152118271	rs55775354	G	A	3839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=5.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.87;ReadPosRankSum=0.254;SOR=1.264;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,96:0.72:133
chr2	152118275	rs56376752	A	G	3881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=3.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.33;ReadPosRankSum=0.308;SOR=1.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,97:0.71:137
chr2	152118338	rs35240993	G	GT	3293.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=69;PP=2845;SC=TTTTGGTTTCGTTTTTTGTTC;SOR=1.524;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=103;TCF=22;TCR=81;TR=85;WE=152118346;WS=152118328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr2	152132130	rs289834	A	G	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.418;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=405;ReadPosRankSum=0.526;SC=TCTTCACGCAATGTGTCAGGA;SOR=0.273;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=76;TCF=54;TCR=22;TR=24;WE=152132138;WS=152132120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,24:0.32:76
chr2	152135335	rs72856970	G	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.028;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=99;ReadPosRankSum=0.846;SC=TTTAACATTAGTCATACCTTC;SOR=0.140;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=8;WE=152135343;WS=152135325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,8:0.20:40
chr2	152135514	rs289831	A	G	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=63;ReadPosRankSum=-1.075;SC=TCTAATCCAAATGAAAATGTT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=7;WE=152135522;WS=152135504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,7:0.21:33
chr2	152138522	rs3771886	T	C	1554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=35;PP=1264;SC=CCTTCTTTAGTTGAATATTTT;SOR=2.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=46;WE=152138530;WS=152138512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	152139271	rs10169816	C	T	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=3;PP=458;SC=TAAAGCCTAACGGCCTCCCAA;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=152139279;WS=152139261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	152139416	rs1048135	G	A	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=536;ReadPosRankSum=1.167;SC=TTCATCTGGCGAATGCTCCTT;SOR=0.675;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=42;TCF=22;TCR=20;TR=28;WE=152139424;WS=152139406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr2	152139493	rs10182245	A	G	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=17;PP=518;SC=AATAAATATTATAAGCATAGC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=152139501;WS=152139483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	152222731	rs79800957	G	A	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=355;ReadPosRankSum=-1.345;SC=CAACCCACACGGTGTGTTAAA;SOR=0.582;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=13;TCR=66;TR=23;WE=152222739;WS=152222721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,24:0.28:85
chr2	152266473	rs2290368	T	C	2082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.426;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=12;PP=1482;ReadPosRankSum=-0.235;SC=CAGCCGGAGCTGGGAAAGTCG;SOR=0.211;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=95;TCF=81;TCR=14;TR=70;WE=152266481;WS=152266463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,76:0.75:101
chr2	152266731	rs2290367	T	A	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=286;ReadPosRankSum=1.460;SC=GAATGTGGCGTGGGCTCAGGT;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=14;WE=152266739;WS=152266721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr2	152267072	rs4664045	T	G	1892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.988;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=43;PP=1520;ReadPosRankSum=-1.099;SC=TAGCGGAGAGTGGGGCGCTCT;SOR=0.393;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=105;TCF=40;TCR=65;TR=71;WE=152267080;WS=152267062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,72:0.68:106
chr2	152267672	rs7585604	G	A	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=1;PP=266;SC=TTCATTTGCAGGAGTTAGAAA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=152267680;WS=152267662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr2	152267897	rs147405197	G	GT	147.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.896;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr2	152271188	rs144193655	GTTTATT	G	222.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=273;SC=TTTATTCCTTGTTTATTTTTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=152271201;WS=152271180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	152273503	rs6735771	G	A	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=82;ReadPosRankSum=-0.567;SC=ATGAGAGACAGACATTAAAAG;SOR=0.859;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=7;WE=152273511;WS=152273493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr2	152289767	rs72860233	G	A	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=492;ReadPosRankSum=0.433;SC=GTTGACTATAGCACTTTATGT;SOR=1.040;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=23;WE=152289775;WS=152289757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr2	152292169	rs34105266	GA	G	1210.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.076;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.305;NF=1;NR=51;PP=806;ReadPosRankSum=-1.693;SC=TTTGAAGTAGGAAAAAAAAAG;SOR=1.981;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=85;TCF=4;TCR=81;TR=52;WE=152292177;WS=152292159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,55:0.71:77
chr2	152298355	rs75978332	C	T	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=71;ReadPosRankSum=2.165;SC=ATAGTTAACACTCAGATTTTT;SOR=0.122;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=6;WE=152298363;WS=152298345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr2	152298562	.	T	TTTTTATTTTATTTTA	360.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.42;QD=40.08;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	152299764	rs111990681	C	T	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=202;ReadPosRankSum=1.089;SC=ACTTCATTTTCTCCTTCAGGG;SOR=0.818;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=13;WE=152299772;WS=152299754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr2	152300147	rs143852417	A	G	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=423;ReadPosRankSum=-0.779;SC=CAAAATGCAAAGCAGTTGGAA;SOR=0.551;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=22;WE=152300155;WS=152300137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr2	152303171	rs2432941	G	A	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=37;PP=878;ReadPosRankSum=1.502;SC=TTTGTGAACTGTCACCTATTA;SOR=0.402;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=64;TCF=1;TCR=63;TR=38;WE=152303179;WS=152303161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,38:0.59:64
chr2	152311570	rs2444263	G	A	3556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.823;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=60.05;MQRankSum=-1.332;NF=62;NR=64;PP=2958;ReadPosRankSum=-0.295;SC=CTCAATCACCGGCATTATTTC;SOR=0.601;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=193;TCF=96;TCR=97;TR=126;WE=152311578;WS=152311560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,128:0.64:199
chr2	152314547	rs35044903	C	CA	259.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=327;ReadPosRankSum=0.216;SC=TACTTTGATTCAAATAATCTT;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=10;WE=152314555;WS=152314537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr2	152315549	rs2444260	G	T	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=244;ReadPosRankSum=1.010;SC=CATTGTCAGTGGTGTGGCCTG;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=11;WE=152315557;WS=152315539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr2	152316655	rs75413772	C	A	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=63;ReadPosRankSum=0.779;SC=AAAGTTTAATCAAAAATTTTA;SOR=0.458;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=6;WE=152316663;WS=152316645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr2	152320118	rs2123465	G	A	2019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.841;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=34;PP=1599;ReadPosRankSum=-0.360;SC=AGCAGCAACAGTGGAAAATGC;SOR=0.223;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=106;TCF=46;TCR=60;TR=68;WE=152320126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,72:0.66:109
chr2	152322095	rs2444257	A	T	3214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.878;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=44;PP=2612;ReadPosRankSum=0.122;SC=AATGAAAAATAATGAAGAAAT;SOR=0.852;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=185;TCF=112;TCR=73;TR=117;WE=152322103;WS=152322085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,118:0.62:190
chr2	152331418	rs1065177	C	G	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.142;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=478;ReadPosRankSum=-1.207;SC=CAAAAACCTTCTGGCACAGAT;SOR=1.061;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=23;WE=152331426;WS=152331408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr2	152346522	rs78592085	G	A	1975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.546;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=37;PP=1472;ReadPosRankSum=2.154;SC=GGAAGATACCGTTGTCTGTTG;SOR=0.812;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=268;TCF=145;TCR=123;TR=87;WE=152346530;WS=152346512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,90:0.32:278
chr2	152346979	rs1061305	T	C	1687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.827;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=29;PP=1152;ReadPosRankSum=1.419;SC=CCCCCACTGATGCTTAGTGCA;SOR=0.868;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=92;TCF=48;TCR=44;TR=62;WE=152346987;WS=152346969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,67:0.70:96
chr2	152348842	rs2288193	T	A	1821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.729;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=27;PP=1493;ReadPosRankSum=-2.188;SC=GGTGTGACTATATCCCTTTTT;SOR=0.846;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=106;TCF=57;TCR=49;TR=62;WE=152348850;WS=152348832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,65:0.59:110
chr2	152349026	rs2288195	G	A	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=375;ReadPosRankSum=-0.926;SC=AGGAGAGACCGTGAATGAGTG;SOR=1.044;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=18;WE=152349034;WS=152349016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr2	152350462	rs4664455	T	C	1770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.745;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=51;PP=1408;ReadPosRankSum=-0.895;SC=GGGGGAAATGTTATGTTTAAT;SOR=1.970;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=78;TCF=11;TCR=67;TR=57;WE=152350470;WS=152350452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,59:0.75:79
chr2	152350903	rs112383145	G	GTA	546.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.764;NF=0;NR=11;PP=461;ReadPosRankSum=0.207;SC=ATGGAAAGTAGTATGTTTCCT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=11;WE=152350911;WS=152350893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr2	152352843	rs7575451	C	G	3323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.541;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.700;NF=60;NR=65;PP=2417;ReadPosRankSum=-1.916;SC=GGAGTGACAGCTAAAGGAGTT;SOR=0.774;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=194;TCF=95;TCR=99;TR=125;WE=152352851;WS=152352833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,127:0.64:199
chr2	152353395	rs10497081	T	G	2364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.066;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=13;PP=1829;ReadPosRankSum=0.823;SC=TGTATTATTTTAAATCATGAA;SOR=0.968;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=107;TCF=88;TCR=19;TR=78;WE=152353403;WS=152353385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,81:0.72:113
chr2	152359276	rs201290038	AT	A	32.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-1.965;QD=0.91;ReadPosRankSum=-2.664;SOR=0.266;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,7:0.19:36
chr2	152360136	rs3835058	AT	A	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=52;ReadPosRankSum=-1.611;SC=AATAGTAAAAATTTTTACTAC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=152360144;WS=152360126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr2	152369117	rs13023600	T	C	2643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=2;PP=2176;SC=CGTGAGCCACTGCACCTGGTG;SOR=6.492;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=75;TCF=73;TCR=2;TR=75;WE=152369125;WS=152369107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	152371228	rs76123095	C	T	2994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.861;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=19;PP=2468;ReadPosRankSum=1.335;SC=AATTTGAAACCCACAGTTAGG;SOR=0.873;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=145;TCF=117;TCR=28;TR=102;WE=152371236;WS=152371218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,103:0.70:147
chr2	152374800	rs16830136	G	A	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.865;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=623;ReadPosRankSum=0.534;SC=ATGAATGTGCGCCAGAGGAAA;SOR=1.973;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=57;TCF=37;TCR=20;TR=31;WE=152374808;WS=152374790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr2	152382454	rs6721666	C	G	863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=1;PP=709;ReadPosRankSum=0.814;SC=GCCAAGAGACCGGTGGTTGAT;SOR=2.636;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=48;TCF=46;TCR=2;TR=38;WE=152382462;WS=152382444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,36:0.78:46
chr2	152383913	rs2288198	T	C	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.664;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=462;ReadPosRankSum=-0.683;SC=ACACTCATGATAGTGGTTATT;SOR=0.350;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=26;WE=152383921;WS=152383903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr2	152387553	rs4664475	T	C	2734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.602;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=57;PP=2000;ReadPosRankSum=3.052;SC=GCAACATGGGTGTGTCGTGGA;SOR=0.695;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=165;TCF=82;TCR=83;TR=111;WE=152387561;WS=152387543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,114:0.67:169
chr2	152388228	rs60806638	G	C	2034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.784;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.759;NF=49;NR=22;PP=1715;ReadPosRankSum=1.068;SC=CCCAGACTTTGTGACAATTTA;SOR=0.584;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=111;TCF=79;TCR=32;TR=71;WE=152388236;WS=152388218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,73:0.62:117
chr2	152388415	rs56026241	AT	A	871.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.977;NF=0;NR=23;PP=866;ReadPosRankSum=-0.606;SC=TTTGATCTAAATTGTGGAAGA;SOR=0.770;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=23;WE=152388423;WS=152388405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,28:0.70:40
chr2	152394534	rs3732310	T	G	1761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.460;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=48;PP=1434;ReadPosRankSum=0.810;SC=TTACCCAAAGTTAATGTAAAT;SOR=0.363;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=92;TCF=18;TCR=74;TR=62;WE=152394542;WS=152394524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,62:0.67:92
chr2	152396726	rs66541369	T	TA	866.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=0;PP=968;ReadPosRankSum=1.221;SC=TTTTTCTCTTTAAAAAAATGT;SOR=1.528;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=69;TCR=0;TR=39;WE=152396734;WS=152396716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,37:0.66:56
chr2	152402515	.	T	TA	518.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.000;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=23.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=-1.396;QD=6.57;ReadPosRankSum=-0.542;SOR=4.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,49:0.62:79
chr2	152403014	rs4664486	C	T	2006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.764;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=50;PP=1469;ReadPosRankSum=-0.298;SC=TCAGGAAACACAAAAGATGGA;SOR=0.525;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=106;TCF=34;TCR=72;TR=75;WE=152403022;WS=152403004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,76:0.69:110
chr2	152404294	rs2288201	C	T	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=31;PP=748;ReadPosRankSum=0.351;SC=TAGTAGGGGACGACGAGGGCA;SOR=1.775;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=33;WE=152404302;WS=152404284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,31:0.84:37
chr2	152409416	rs2288203	C	T	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=44;PP=1070;ReadPosRankSum=1.152;SC=CTCAACAGACCGAGATGCATT;SOR=0.458;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=65;TCF=2;TCR=63;TR=46;WE=152409424;WS=152409406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,49:0.71:69
chr2	152409809	rs4575719	C	A	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=495;ReadPosRankSum=2.002;SC=AGCCACCCCCCAGAGCTGGCC;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=22;WE=152409817;WS=152409799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,25:0.74:34
chr2	152417311	rs3214502	T	TC	672.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=665;ReadPosRankSum=-0.738;SC=TCTCACACACTCCCTACTAAC;SOR=0.804;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=18;WE=152417319;WS=152417301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr2	152421937	rs7602715	A	G	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=5.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.408;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=1;PP=885;ReadPosRankSum=-0.205;SC=GCAATTATCTAAAGTTAAGCT;SOR=2.206;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=55;TCF=52;TCR=3;TR=36;WE=152421945;WS=152421927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,36:0.64:56
chr2	152422076	rs2288210	C	G	3559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.217;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=49;PP=2907;ReadPosRankSum=-0.036;SC=CACCACACTTCTAAAGTTAGG;SOR=0.813;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=187;TCF=111;TCR=76;TR=124;WE=152422084;WS=152422066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,127:0.67:190
chr2	152424933	rs3214503	T	TA	132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=7.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.99;ReadPosRankSum=-1.614;SOR=2.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr2	152427249	rs7568873	A	G	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=28;PP=672;ReadPosRankSum=-1.263;SC=AAGAGCATAGATGAGAATCAT;SOR=0.388;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=30;WE=152427257;WS=152427239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,32:0.70:46
chr2	152475938	rs10186656	T	G	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=456;ReadPosRankSum=1.617;SC=GCTTTTAACATGCAGAGCTAA;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=18;WE=152475946;WS=152475928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr2	152476028	rs10172023	C	G	2146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.876;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=16;PP=1761;ReadPosRankSum=0.031;SC=GCAGGCAGATCCATTCATGCA;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=126;TCF=99;TCR=27;TR=79;WE=152476036;WS=152476018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,78:0.61:128
chr2	152481977	rs10186482	A	G	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=38;ReadPosRankSum=1.465;SC=GATTAATTTCATAATTCTCAC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=152481985;WS=152481967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr2	152490219	rs6709886	A	G	1783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.672;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.947;NF=34;NR=36;PP=1348;ReadPosRankSum=0.546;SC=CGCTCTGGTCAGGCAGGCATG;SOR=0.536;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=103;TCF=52;TCR=51;TR=70;WE=152490227;WS=152490209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,72:0.69:105
chr2	152490458	rs6710212	A	G	1996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=42;PP=1574;SC=AGTTGCTTGCAGTAACCATCT;SOR=1.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=60;WE=152490466;WS=152490448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	152496526	rs6713162	A	G	1634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.030;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=37;PP=1274;ReadPosRankSum=-0.614;SC=GAGCCAATGGACACCCAGCCA;SOR=0.446;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=30;TCR=54;TR=58;WE=152496534;WS=152496516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,60:0.70:86
chr2	152499205	.	A	G	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.337;ClippingRankSum=0.000;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.985;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=480;ReadPosRankSum=-0.006;SC=TCTAAAATAGACATTAATAGT;SOR=0.938;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=77;TCF=29;TCR=48;TR=26;WE=152499213;WS=152499195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,27:0.35:78
chr2	152500449	rs13013209	C	G	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.499;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.684;NF=14;NR=26;PP=676;ReadPosRankSum=-0.280;SC=TCTGGCACTTCTTGGCCAACA;SOR=0.980;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=134;TCF=49;TCR=85;TR=40;WE=152500457;WS=152500439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,41:0.30:138
chr2	152511778	rs10930723	A	C	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.015;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=457;ReadPosRankSum=0.094;SC=TTTTATATAAATTTACCTGAC;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=20;WE=152511786;WS=152511768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,26:0.72:36
chr2	152520027	rs12620077	A	G	1974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.339;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=14;PP=1419;ReadPosRankSum=0.627;SC=CTTATTATCCAGAGTAAACGC;SOR=0.389;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=112;TCF=94;TCR=18;TR=81;WE=152520035;WS=152520017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,83:0.72:115
chr2	152521096	rs10170273	C	T	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.108;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=861;ReadPosRankSum=-0.875;SC=TCTTCTTTTCCTCTTCCCAGC;SOR=0.464;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=63;TCF=29;TCR=34;TR=39;WE=152521104;WS=152521086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,41:0.63:65
chr2	152525471	rs58903550	A	G	1298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.187;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=9;PP=1000;ReadPosRankSum=-0.795;SC=CAATTCTCAGAGCAAGAGTTG;SOR=0.934;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=39;WE=152525479;WS=152525461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,46:0.73:63
chr2	152527572	rs7426114	C	T	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.734;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=18;PP=665;ReadPosRankSum=0.146;SC=TGAGCCAACACCATGCCCATG;SOR=0.573;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=121;TCF=63;TCR=58;TR=36;WE=152527580;WS=152527562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,36:0.28:128
chr2	152527608	rs34577613	C	T	1941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.785;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=41;PP=1427;ReadPosRankSum=0.343;SC=GTGAACTTGACGGTATCTGGG;SOR=0.877;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=103;TCF=40;TCR=63;TR=66;WE=152527616;WS=152527598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,71:0.66:108
chr2	152531077	rs6711382	A	G	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.571;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=43;PP=1163;ReadPosRankSum=-0.562;SC=ATTAAGTCATACCAATCCCGT;SOR=1.441;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=201;TCF=81;TCR=120;TR=61;WE=152531085;WS=152531067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,66:0.32:209
chr2	152531781	rs12618063	C	A	5021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.902;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=69;PP=2962;ReadPosRankSum=0.737;SC=ATTTCACATCCCAGCAAAGAC;SOR=0.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=302;TCF=186;TCR=116;TR=185;WE=152531789;WS=152531771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,191:0.61:312
chr2	152536498	rs6735208	T	A	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=3.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.04;ReadPosRankSum=1.025;SOR=1.067;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,26:0.24:110
chr2	152550727	rs74532673	T	C	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=222;ReadPosRankSum=0.513;SC=ATGTGTGATTTGTCATCTTGA;SOR=1.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=10;WE=152550735;WS=152550717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr2	152552062	rs6433569	A	C	2413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=38;PP=1910;ReadPosRankSum=-0.359;SC=TTGTCAGTACATCACATGGTA;SOR=0.506;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=330;TCF=218;TCR=112;TR=103;WE=152552070;WS=152552052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:239,106:0.31:345
chr2	152566433	rs12464543	A	G	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.163;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=339;ReadPosRankSum=2.180;SC=TACCATTACAAAAATGATTAG;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=15;WE=152566441;WS=152566423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr2	152573902	rs34733773	A	AGGC	1688.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.765;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=1657;ReadPosRankSum=0.948;SC=TCTTCAAGGGAGGCAATGTCC;SOR=0.836;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=136;TCF=96;TCR=40;TR=40;WE=152573910;WS=152573892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,48:0.33:144
chr2	152573981	rs4611637	A	G	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.222;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.419;NF=24;NR=42;PP=1079;ReadPosRankSum=-0.782;SC=CTGGAGGATCAGCCAGAGGCG;SOR=1.071;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=203;TCF=86;TCR=117;TR=66;WE=152573989;WS=152573971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,70:0.33:209
chr2	152581866	rs4300824	T	C	1664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=11;PP=1253;ReadPosRankSum=-0.577;SC=CTCATAGTAATTCAACTGCTC;SOR=0.632;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=235;TCF=198;TCR=37;TR=71;WE=152581874;WS=152581856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,75:0.31:241
chr2	152584153	rs4664499	A	C	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=109;ReadPosRankSum=1.248;SC=GAGTTGAGATAAGTAATTTCT;SOR=0.093;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=8;WE=152584161;WS=152584143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr2	152684704	rs150910136	A	AC	191.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=1.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.35;MQRankSum=3.419;QD=2.52;ReadPosRankSum=-1.167;SOR=0.389;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,16:0.21:76
chr2	152729138	rs770609	T	C	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=580;SC=CTATAAAGAATTTCAAGAATC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=152729146;WS=152729128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	152827973	rs7567588	A	G	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=5;PP=701;SC=GACTGCAGCTAGCCATCTGAG;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=152827981;WS=152827963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	152828281	rs7607341	C	G	1206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=36;PP=1005;SC=GAACATCTCTCTCTTCCCCTG;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=152828289;WS=152828271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	153192324	rs2003332	C	T	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=37;PP=1062;SC=CACCCCGTGCCGGGAGCGAGC;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=39;WE=153192332;WS=153192314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	153378459	rs4664114	T	C	3237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.206;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=76;PP=2428;ReadPosRankSum=-1.349;SC=TTAAACAGAATGCTATGAACC;SOR=0.594;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=195;TCF=81;TCR=114;TR=132;WE=153378467;WS=153378449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,132:0.68:195
chr2	153378574	rs4664592	A	G	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.561;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=37;PP=898;ReadPosRankSum=0.940;SC=TTATGAAAAAAGTAATGAAAG;SOR=0.446;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=67;TCF=6;TCR=61;TR=42;WE=153378582;WS=153378564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,40:0.62:65
chr2	153378652	rs4664593	G	A	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=276;ReadPosRankSum=-0.719;SC=TTGCTTCTGCGACAGAGATAG;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=12;WE=153378660;WS=153378642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr2	153415229	.	A	AT	481.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=5.600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.12;MQRankSum=2.934;QD=6.69;ReadPosRankSum=-0.463;SOR=0.191;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr2	153415244	rs35066174	T	TC	524.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.980;HP=14;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-1.963;NF=41;NR=6;PP=698;ReadPosRankSum=1.815;SC=TTTTTTTTTTTCCCCAACAGA;SOR=0.537;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=112;TCF=87;TCR=25;TR=47;WE=153415252;WS=153415234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,29:0.28:102
chr2	153415376	rs6434098	T	G	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.836;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=33;PP=897;ReadPosRankSum=0.264;SC=GAATTTTATGTGGTCACAGCA;SOR=0.938;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=181;TCF=76;TCR=105;TR=55;WE=153415384;WS=153415366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,56:0.30:185
chr2	153417325	rs6713836	A	G	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.32;ReadPosRankSum=-0.411;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,15:0.22:67
chr2	153435434	rs16831399	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=116;ReadPosRankSum=-1.290;SC=CTCATCCACACGCTGTCAATG;SOR=1.230;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=10;WE=153435442;WS=153435424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,10:0.25:40
chr2	153463984	rs72210499	TACAC	T	313.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=7;PP=336;SC=TTTTTCTAAATACACACACAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=7;WE=153463995;WS=153463974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	153468107	rs35776654	C	T	1986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.807;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=34;PP=1507;ReadPosRankSum=1.266;SC=TAGGCCTGGACGAATACTTGG;SOR=0.396;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=112;TCF=65;TCR=47;TR=77;WE=153468115;WS=153468097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,77:0.68:113
chr2	153476066	rs5835439	G	GCCA	634.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=6;NR=9;PP=750;SC=CGCCGCCGCCGCCCCCTCCTC;SOR=0.941;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=15;WE=153476074;WS=153476056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	153478931	rs7609122	T	C	2431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=0;PP=2126;SC=TGTGCCGCCTTGTGAAATGTG;SOR=8.526;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=70;TCR=0;TR=69;WE=153478939;WS=153478921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	153481943	rs2346532	T	C	2046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=10;PP=1680;SC=TTCTCTTTGATGTCTTTAGCT;SOR=3.327;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=56;TCR=10;TR=66;WE=153481951;WS=153481933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	153483257	rs7604573	T	C	2725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=78;PP=2390;SC=TTCAGGAAAATTATATTCTAG;SOR=8.714;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=78;TCF=0;TCR=78;TR=78;WE=153483265;WS=153483247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr2	153484685	rs3811570	G	A	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=310;SC=TCTTAGACTCGTTGATTTGGT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=153484693;WS=153484675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	153492910	rs1561267	G	T	1899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=15;PP=1557;SC=TCCCCATTGAGTTTCACTGGG;SOR=2.340;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=47;TCR=15;TR=62;WE=153492918;WS=153492900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	153497168	rs1465818	C	T	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=313;SC=TTCTCTGCAACTGAGCAGAAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=153497176;WS=153497162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	153514583	rs6713779	G	C	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=30;PP=994;SC=AGATACCATTGTTATATAGGT;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=153514591;WS=153514573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	153519524	rs1036526	A	G	2950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=7;PP=2340;SC=GAATTCCATTAGAAAAAAATA;SOR=3.962;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=74;TCR=7;TR=81;WE=153519532;WS=153519514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr2	153520782	rs3762507	A	G	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=22;PP=632;SC=GAGAAAAATTATATTTGGAAA;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=153520790;WS=153520772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	153520819	rs3762506	C	A	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=430;SC=GAGAAATAAGCGTCTAACATG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=153520827;WS=153520809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	153529361	rs2304559	T	C	275.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=255;SC=TTATTAGACATAAAACAACTC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=153529369;WS=153529351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	153535670	rs10166987	C	T	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=23;PP=1175;SC=TTAAAATCTACAGAACTGAGA;SOR=0.919;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=20;TCR=23;TR=43;WE=153535678;WS=153535660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	153549814	rs10172024	G	C	5804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=145;NR=35;PP=2965;SC=TGGTCACCAAGTGTACACAAG;SOR=2.758;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=181;TCF=146;TCR=35;TR=180;WE=153549822;WS=153549804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr2	153572438	rs2346548	C	T	2449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=69;NR=0;PP=2074;SC=GACCTAGATTCTGAAATCTTG;SOR=7.140;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=69;TCR=0;TR=69;WE=153572446;WS=153572428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	153576548	.	G	GTCAGTCTTAAATGATTGGCTGCCAATGTTTCATTTCTTTATCATTCCCCTCCCCCCTTTTTTACCCTTTTTTGAATGTGCATGGAATGTAAATTA	3343.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.36;QD=66.87;SOR=2.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	153576580	.	A	ATTTC	2016	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MMLQ=28;MQ=60.45;NF=1;NR=38;PP=2016;QD=52.3846153846;SC=CCAATGTTTCATTTATCATTC;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=62;TCF=3;TCR=59;TR=39;WE=153576588;WS=153576570;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:23,39:0.63:62
chr2	153577013	rs9646744	G	A	6280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=122;PP=2965;SC=TTATAGTATTGCTTTCCTACC;SOR=1.295;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=197;TCF=74;TCR=123;TR=196;WE=153577021;WS=153577003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr2	154801196	rs72865049	A	G	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=204;ReadPosRankSum=1.162;SC=GAGATGAGAAAAGTGGTGCCT;SOR=0.776;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=11;WE=154801204;WS=154801186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr2	155099146	rs9288324	G	A	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=25;ReadPosRankSum=0.271;SC=CATCTTGGTAGTATCTCTGCT;SOR=0.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=4;WE=155099154;WS=155099142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr2	155265623	rs1405936	G	A	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=28;PP=583;ReadPosRankSum=0.035;SC=TCAGCTTCATGTTTTAGAGGG;SOR=0.566;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=90;TCF=11;TCR=79;TR=32;WE=155265631;WS=155265613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,33:0.35:94
chr2	155306885	rs697648	C	T	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=4;PP=1123;SC=AAGCTAAAGACGAAATAAGCT;SOR=3.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=43;WE=155306893;WS=155306875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	155555165	rs372814428	A	C	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.275;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr2	155555195	rs5835535	T	TC	1064.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.32;QD=32.26;SOR=3.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	155711357	rs17642086	T	C	3776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.734;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=58;PP=2742;ReadPosRankSum=0.353;SC=CCCAGTTCCATGCAACATTTG;SOR=0.369;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=203;TCF=126;TCR=77;TR=142;WE=155711365;WS=155711347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,149:0.71:210
chr2	157183211	rs35479735	TC	T	1448.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=10;PP=1479;SC=CTGGATTGTCTCCCTCCCTCC;SOR=2.303;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=37;WE=157183219;WS=157183201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	157189011	rs834836	G	C	2040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=34;PP=1581;SC=CTCCGCGTCTGTCTTCATTCA;SOR=0.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=32;TCR=34;TR=66;WE=157189019;WS=157189001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	157370018	rs56102423	GT	G	371.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=11.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.339;SOR=0.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr2	157406249	rs2116665	G	A	2789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.750;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=58;PP=2154;ReadPosRankSum=1.515;SC=GGGAAAGTGCGTGTGAGCGGC;SOR=0.991;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=159;TCF=71;TCR=88;TR=101;WE=157406257;WS=157406239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,105:0.63:166
chr2	157406296	rs2116664	A	C	2533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=6.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.048;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=62;PP=2031;ReadPosRankSum=-1.368;SC=TATGCCAGGTATCTGGGAGGG;SOR=1.255;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=133;TCF=41;TCR=92;TR=85;WE=157406304;WS=157406286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,88:0.64:138
chr2	157426111	.	A	G	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-3.963;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=458;ReadPosRankSum=-0.187;SC=TGCCAGTGACAGAACTGGCAG;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=20;WE=157426119;WS=157426101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr2	157427593	rs1469652	T	C	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=7;PP=774;SC=GCTTTATTTCTCATTTTCTAA;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=157427601;WS=157427583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	157427837	rs1469651	C	A	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.205;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=756;ReadPosRankSum=-0.800;SC=ACCACAATTCCTATTGTAAAC;SOR=0.208;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=17;WE=157427858;WS=157427827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr2	157427850	rs1469650	G	A	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=756;ReadPosRankSum=-0.239;SC=TTGTAAACGCGGAATGGCTTA;SOR=0.656;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=14;WE=157427858;WS=157427827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr2	157467040	rs11892929	A	G	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=-0.699;SC=ACCCTGTATTATTTAACAAAT;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=5;WE=157467048;WS=157467030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr2	157467106	rs11894134	T	C	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.565;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=107;ReadPosRankSum=-0.275;SC=ATTACATACTTACCAGTGACT;SOR=1.292;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=31;TCF=17;TCR=14;TR=9;WE=157467114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr2	158152850	.	T	C	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.124;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=250;ReadPosRankSum=1.656;SC=ATCGATAAAGTATATAAAGAT;SOR=0.725;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=46;TCF=42;TCR=4;TR=15;WE=158152858;WS=158152840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,16:0.33:49
chr2	158157361	rs3214040	C	T	1944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.818;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=36;PP=1529;ReadPosRankSum=0.245;SC=TCTATGGCCACGGAGACCACC;SOR=0.560;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=99;TCF=46;TCR=53;TR=69;WE=158157369;WS=158157351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,72:0.71:102
chr2	158162475	rs3214039	C	T	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=416;ReadPosRankSum=0.259;SC=AGAGAGTCCACCACTAAACAC;SOR=0.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=19;WE=158162483;WS=158162465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr2	158162521	rs3816595	T	G	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=318;ReadPosRankSum=1.885;SC=GTGTGGGTCCTGCAGTCAACT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=14;WE=158162529;WS=158162511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr2	158165004	rs6728956	C	T	190.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5731;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=148;ReadPosRankSum=0.319;SC=TTAACTGTTGCTAACAAAAAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=158165012;WS=158164994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr2	158275111	rs5835667	T	TA	98.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=11.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.82;MQRankSum=2.393;QD=2.90;ReadPosRankSum=-0.684;SOR=3.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr2	158283710	rs155614	A	G	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=-0.060;SC=TATTCCTCCAAAGGTAATTGT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=158283718;WS=158283706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr2	158284056	rs155613	C	T	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=551;SC=AAACGAAATACAAATGTTACA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=158284064;WS=158284046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	158286936	rs145695913	AC	A	168.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=254;ReadPosRankSum=-0.643;SC=TAATGTTTGTACCCCACTCTA;SOR=0.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=11;WE=158286944;WS=158286930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,10:0.22:46
chr2	158291107	.	T	TAG	65	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=65;QD=35.0;SC=TGTGTGTGCGTAGAGAGAGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=2;WE=158291115;WS=158291097;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,2:0.12:16
chr2	158291188	rs11904180	A	C	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.107;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=510;ReadPosRankSum=1.599;SC=GGGAGAGACAAAAAATAATTC;SOR=0.171;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=24;WE=158291196;WS=158291178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
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chr2	158390468	rs7594480	T	C	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.759;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=14;PP=897;ReadPosRankSum=2.547;SC=AGTTGAGATATAGTCTTCTTA;SOR=0.821;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=119;TCF=81;TCR=38;TR=44;WE=158390476;WS=158390458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,43:0.36:121
chr2	158395079	rs7576514	C	G	6323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=148;NR=34;PP=2965;SC=AAAAACATGGCCTTACTTCAC;SOR=2.985;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=182;TCF=148;TCR=34;TR=182;WE=158395087;WS=158395069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr2	158400908	rs6728987	C	T	2560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.998;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.468;NF=76;NR=5;PP=2071;ReadPosRankSum=1.112;SC=AACTAAGTACCTCTATCCTCA;SOR=1.276;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=117;TCF=109;TCR=8;TR=81;WE=158400916;WS=158400898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,86:0.69:125
chr2	158401137	rs10432556	T	C	1391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=52;PP=1102;ReadPosRankSum=0.777;SC=AACAAGAAAATGTAATTTTGT;SOR=1.501;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=74;TCF=3;TCR=71;TR=54;WE=158401145;WS=158401127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,57:0.74:77
chr2	158485075	rs114245489	G	T	1500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.750;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=34;PP=1189;ReadPosRankSum=1.044;SC=AGAGAAACCAGCACCGTACCT;SOR=0.854;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=104;TCF=48;TCR=56;TR=61;WE=158485083;WS=158485065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,60:0.58:103
chr2	158626980	rs1146031	C	T	3396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=50;PP=2592;SC=CGGCAACATTCTCCCCTTGCC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=48;TCR=50;TR=98;WE=158626988;WS=158626970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	158636910	rs2227861	G	A	4770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=108;NR=39;PP=2965;SC=AGCACTCCACGGCTTGGCCAG;SOR=2.052;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=108;TCR=40;TR=147;WE=158636918;WS=158636900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr2	158637137	rs1866885	A	G	1236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=0.786;QD=13.74;ReadPosRankSum=1.260;SOR=0.884;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,66:0.73:90
chr2	158655883	rs111834201	C	CAA	1754.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=1;PP=608;ReadPosRankSum=-0.671;SC=TATAGTAAGCCAAAAAAAAAA;SOR=6.184;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=66;TCF=60;TCR=6;TR=50;WE=158655891;WS=158655873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr2	159028800	rs2222390	A	G	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=15;PP=446;SC=AATTTAAATAACAATTCATTG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=159028808;WS=159028790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	159035344	rs3836162	A	AT	2921.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=11;PP=2258;SC=ACTTAGAAACATTTTTTTTAA;SOR=4.047;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=101;TCF=86;TCR=15;TR=87;WE=159035352;WS=159035334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr2	159077019	rs958671	A	C	2016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=13;PP=1395;SC=TATAGAAAAAAGTTCCCTCTG;SOR=2.799;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=47;TCR=13;TR=60;WE=159077027;WS=159077009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	159166069	rs7559772	T	C	2707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=70;PP=2227;SC=AAAGTCTTTCTTATTTTTATT;SOR=4.671;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=5;TCR=71;TR=75;WE=159166077;WS=159166059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr2	159312733	rs1111212	C	T	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=2;PP=696;SC=ACCTCGTTCCCTTACCAAAAT;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=159312741;WS=159312723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	159434492	rs2356188	G	A	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.48;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	159434500	rs2356189	A	G	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.67;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	159520085	rs3771679	G	C	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=459;SC=CTTAGCTTGTGTGTGAAGGGG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=159520093;WS=159520075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	159522879	rs2248854	C	G	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=621;SC=ACATATGAGACTGGAACTCTG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=159522887;WS=159522869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	159530651	rs2711034	A	T	2045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=56;PP=1714;SC=TTCTGTAGGAATCACACACCA;SOR=5.960;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=59;TCF=3;TCR=56;TR=58;WE=159530659;WS=159530641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr2	159534863	rs2356505	A	G	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=2;PP=553;SC=GGAAACACACACAGCCTGTTT;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=159534882;WS=159534855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	159534874	rs2356506	C	T	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=2;PP=902;SC=CAGCCTGTTTCTGCCATAGTT;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=31;WE=159534882;WS=159534855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	159534889	rs2711040	C	T	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=2;PP=1066;SC=ATAGTTTTGCCATTAGCCCCC;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=36;WE=159534897;WS=159534879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	159660870	rs17810398	C	T	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.25;ReadPosRankSum=-0.215;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,24:0.21:117
chr2	159661077	rs2271663	C	T	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=371;ReadPosRankSum=1.196;SC=CTGGAGGGATCCCTCTGAGAG;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=15;WE=159661085;WS=159661067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr2	159663599	rs9869	T	C	1810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=42;PP=1378;ReadPosRankSum=-2.284;SC=ATACAGACACTGGATGCCCTG;SOR=0.507;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=40;TCR=59;TR=70;WE=159663607;WS=159663589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,71:0.70:101
chr2	159672442	rs10016	G	A	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=266;ReadPosRankSum=0.450;SC=GGTAAATTAAGCAGCTTTTGT;SOR=0.171;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=0;TCR=59;TR=15;WE=159672450;WS=159672432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,18:0.30:61
chr2	159954420	rs13414916	C	T	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=313;ReadPosRankSum=0.328;SC=AACTAGTGCCCATGAGAAATC;SOR=1.708;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=15;WE=159954428;WS=159954410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr2	159992572	.	C	T	274	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=24;MQ=57.35;NF=12;NR=0;PP=274;QD=25.7309343789;SC=CGCGCGCGCGCGTTTAAGGGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=159992580;WS=159992562;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr2	160005983	.	C	T	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.734;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.125;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=237;ReadPosRankSum=-0.951;SC=AGAAGCAGAACGTAAGAAAAT;SOR=0.233;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=60;TCF=4;TCR=56;TR=16;WE=160005991;WS=160005973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,16:0.28:57
chr2	160019863	rs12466551	A	G	2382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=35;PP=1848;SC=AAAGATGGAAACCTAAGATTA;SOR=0.744;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=38;TCR=35;TR=73;WE=160019871;WS=160019853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	160026058	.	CT	C	93.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=128;ReadPosRankSum=-0.076;SC=CAGTTTGGGGCTTCTTCCTTT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=6;WE=160026066;WS=160026048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,6:0.19:31
chr2	160033174	rs759034	A	G	726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=20;PP=557;SC=CCAGAGAGCCAGACTTGGGTG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=160033182;WS=160033164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	160034919	rs4665031	A	G	1212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=2;PP=959;SC=ACCTTATCCTATTACACGTTT;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=35;WE=160034927;WS=160034915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	160035207	rs6748288	T	C	6198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=123;PP=2965;SC=TCTCCCTGAATGGCAAGGCCG;SOR=1.173;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=84;TCR=123;TR=207;WE=160035215;WS=160035197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr2	160073895	rs4665042	G	C	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=0.114;SC=GGTTCAAAGGGGGAGGACATA;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=8;WE=160073903;WS=160073885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,8:0.21:38
chr2	160075886	rs146371641	G	GC	1474.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FS=1.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.566;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:178,67:0.27:245
chr2	160076026	rs2303334	C	G	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-7.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=516;ReadPosRankSum=-0.564;SC=AGCCACATGCCTGGTATTCCT;SOR=0.656;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=101;TCF=14;TCR=87;TR=29;WE=160076034;WS=160076016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,31:0.30:104
chr2	160076077	rs2303335	T	A	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.069;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=329;ReadPosRankSum=0.324;SC=ATCCGGCCAGTGTCACCCTTC;SOR=0.463;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=18;WE=160076085;WS=160076067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,19:0.28:69
chr2	160082354	rs12692544	C	T	5873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.35;SOR=1.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr2	160082354	.	CATAATGGCTA	TATAATGGCTA,TATAATGGCTG	1720	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=50,8;NR=112,36;PP=1720,892;QD=10.8319210651;SC=TAATTGGGTACATAATGGCTA;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=50;TCR=112;TR=162,44;WE=160082372;WS=160082344;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:162
chr2	160082364	rs34344829	A	G	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=2.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.26;ReadPosRankSum=-0.549;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,47:0.35:136
chr2	160082384	rs13419975	T	A	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.398;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=28;PP=538;ReadPosRankSum=-0.298;SC=TACTGCACAGTCTCCATGTAA;SOR=0.368;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=97;TCF=10;TCR=87;TR=32;WE=160082392;WS=160082374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,33:0.33:101
chr2	160084224	rs2042494	G	A	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=2;PP=841;SC=ATGTTCTGTCGTGGGTTTGCA;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=31;WE=160084232;WS=160084214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	160084263	rs2042495	A	G	1369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=9;PP=1116;SC=ACGGTGTTCCAGGTGTGGGAG;SOR=2.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=48;WE=160084271;WS=160084253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	160084473	rs2288110	A	C	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=435;ReadPosRankSum=-0.303;SC=GAAGAAAAACAAATGTAAGCT;SOR=0.749;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=19;WE=160084481;WS=160084463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr2	160084534	rs2288111	A	G	175.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=140;SC=CTTCTCCAGCAGTGAAGGCCA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=160084542;WS=160084524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	160086653	rs4664276	CA	TG	7154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=61;PP=2944;ReadPosRankSum=0.839;SC=GAATCGCTGCCACTCCTGCTG;SOR=0.689;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=248;TCF=145;TCR=103;TR=144;WE=160086662;WS=160086643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,172:0.64:269
chr2	160086692	rs3821296	A	G	4850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=92;PP=2962;ReadPosRankSum=0.432;SC=TAGAGGGAACAGGTACTTTCA;SOR=0.696;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=276;TCF=136;TCR=140;TR=181;WE=160086700;WS=160086682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,188:0.66:285
chr2	160087535	rs3821301	T	G	5636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=27;NR=142;PP=2965;SC=CCTTAAGAAATCCCCATTTGT;SOR=3.422;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=171;TCF=27;TCR=144;TR=169;WE=160087543;WS=160087525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr2	160112881	rs7591849	G	T	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.165;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=265;ReadPosRankSum=1.664;SC=TGTTCTGTGCGCCTTGCTTAA;SOR=0.906;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=73;TCF=17;TCR=56;TR=19;WE=160112889;WS=160112871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,20:0.27:75
chr2	160114437	rs3213715	G	A	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=361;ReadPosRankSum=1.560;SC=ATTAATACAAGGTGAGGTTAA;SOR=0.948;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=19;WE=160114445;WS=160114427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr2	160116281	rs4665052	A	G	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=252;ReadPosRankSum=-0.623;SC=TCTAATAAACATAACTTTCAT;SOR=0.560;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=77;TCF=53;TCR=24;TR=21;WE=160116289;WS=160116271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,23:0.29:79
chr2	160132196	rs35620648	A	AC	2461.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=13;NR=58;PP=2168;SC=AAACACTGAAACCCCCCCAAA;SOR=2.010;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=83;TCF=14;TCR=69;TR=71;WE=160132204;WS=160132186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr2	160136337	rs174264	G	A	1883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=21;PP=1442;SC=TTCACTATGCGGACACCTCAT;SOR=1.316;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=34;TCR=21;TR=55;WE=160136345;WS=160136327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	160176943	rs174229	A	C	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=11;PP=360;SC=AAAGAAAACAAATAATTAGAG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=160176951;WS=160176933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	160181552	.	TATTA	T	160.25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=26.71;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr2	160181561	.	T	TTC	160.25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=32.05;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr2	160182074	rs440241	T	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=188;ReadPosRankSum=1.013;SC=ACATAAATTATCAGAAAGAAA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=160182082;WS=160182064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr2	160182374	rs148382881	T	C	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.240;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=407;ReadPosRankSum=-0.227;SC=CTTTGACTCATTAGTCTTTTT;SOR=0.415;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=63;TCF=25;TCR=38;TR=22;WE=160182382;WS=160182364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,22:0.34:65
chr2	160193370	rs2287634	T	A	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.087;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=611;ReadPosRankSum=-0.460;SC=CAATAGGTAATGTATAATTAA;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=25;WE=160193378;WS=160193360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr2	160203934	rs965163	A	C	2097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=0;PP=1883;SC=ATATTAGGCAAGTAATAAACA;SOR=8.349;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=61;TCR=0;TR=61;WE=160203942;WS=160203924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	160231108	rs6742788	A	G	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.722;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=117;ReadPosRankSum=1.132;SC=CCAAAAGCCTATTTTTGCTTA;SOR=0.892;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=6;WE=160231116;WS=160231098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr2	160239378	rs2302927	A	G	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=262;ReadPosRankSum=-0.262;SC=TTAAAAGAGCAAAACATGAGT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=13;WE=160239386;WS=160239368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr2	160241936	rs1469015	A	G	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.63;ReadPosRankSum=0.189;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr2	160243183	rs918351	TA	AT	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=1136;ReadPosRankSum=-0.727;SC=CATGATTTCGTATCTTCTAAA;SOR=0.320;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=1;TCR=64;TR=23;WE=160243192;WS=160243173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,27:0.38:71
chr2	160252392	rs62171538	A	G	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.558;NF=8;NR=33;PP=885;ReadPosRankSum=2.019;SC=CACAATTAACAGTTTGATTTT;SOR=0.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=11;TCR=45;TR=41;WE=160252400;WS=160252382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,42:0.74:57
chr2	160257280	rs74538917	A	G	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.584;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.139;NF=2;NR=6;PP=141;ReadPosRankSum=-0.269;SC=GGTCAGGCGCAGTGGCTCACA;SOR=0.197;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=8;WE=160257288;WS=160257270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr2	160261729	rs74694096	AC	A	633.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.36;QD=35.21;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	160285060	rs57144725	C	T	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=144;ReadPosRankSum=0.626;SC=ACTCCTCAAACAACCCAAATA;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=9;WE=160285068;WS=160285050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr2	160285575	rs12473781	C	T	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=148;ReadPosRankSum=-0.915;SC=CCCTTTGCTCCGGCTCTTCTG;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=8;WE=160285583;WS=160285565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr2	160285660	rs10754963	T	A	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=3.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.88;ReadPosRankSum=0.919;SOR=0.245;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,14:0.23:62
chr2	160289863	rs61733380	T	C	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=44;PP=1174;ReadPosRankSum=-2.439;SC=GGAATGCCTGTTTATATTGTT;SOR=0.948;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=78;TCF=7;TCR=71;TR=48;WE=160289871;WS=160289853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,47:0.61:77
chr2	160295297	rs2302923	C	A	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=198;ReadPosRankSum=0.785;SC=CGGGTACTTTCAAAGTGTTCT;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=10;WE=160295305;WS=160295287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr2	160304741	rs12470533	A	T	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.164;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=316;ReadPosRankSum=0.779;SC=TCACTTATGTAAATGTGGATA;SOR=0.252;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=44;TCF=40;TCR=4;TR=16;WE=160304749;WS=160304731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr2	160604936	rs13024801	G	A	3029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.326;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=43;PP=2361;ReadPosRankSum=0.771;SC=AGAATCTGAAGGTAGAAATAC;SOR=0.368;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=141;TCF=80;TCR=61;TR=93;WE=160604944;WS=160604926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,102:0.68:151
chr2	160605268	rs1365803	T	C	1760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=36;PP=1328;ReadPosRankSum=1.167;SC=TTGCAGTCCCTCCAGCACTTG;SOR=0.396;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=74;TCF=24;TCR=50;TR=56;WE=160605276;WS=160605258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,60:0.78:77
chr2	160605484	.	CTTTTCTTTT	C	342.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQRankSum=1.532;QD=19.04;ReadPosRankSum=1.427;SOR=1.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr2	160605513	rs71338844	G	A	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=71;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.834;NF=0;NR=7;PP=103;ReadPosRankSum=0.524;SC=TTTTTGAGACGGAGTCTCAGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=160605521;WS=160605503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr2	160609162	rs1365802	T	C	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=4.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=674;ReadPosRankSum=0.699;SC=AATTTATAGATTGTTGAATTT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=27;WE=160609170;WS=160609152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr2	160637324	rs2303551	A	G	2783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.828;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=15;PP=2328;ReadPosRankSum=-0.167;SC=GAGAATTGAAAAGCCATCAGT;SOR=0.307;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=138;TCF=119;TCR=19;TR=93;WE=160637332;WS=160637314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,97:0.66:146
chr2	160654524	rs2556106	G	T	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=4;PP=370;SC=GGGCGGGATGGCCGGCCGGGT;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=160654532;WS=160654514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	160667004	rs35590513	G	A	4043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-9.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.317;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=133;NR=11;PP=2962;ReadPosRankSum=0.295;SC=AAAAATTATTGAGTCATAAGA;SOR=0.428;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=213;TCF=199;TCR=14;TR=144;WE=160667012;WS=160666994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,144:0.66:217
chr2	160676350	rs17827158	T	C	1786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.757;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=29;PP=1322;ReadPosRankSum=-0.355;SC=AGCCAAAAACTTCTCATTTTT;SOR=0.562;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=90;TCF=47;TCR=43;TR=60;WE=160676358;WS=160676340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,67:0.68:98
chr2	160676427	rs12692566	C	A	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=35;PP=1049;SC=ACATAAGAGACTTATCTAGAG;SOR=4.615;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=38;WE=160676435;WS=160676417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	160676445	rs36120198	A	AT,ATT	1100.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=1,1;NR=27,27;PP=187,338;SC=GAGAAGAAACATTTTTTCCTA;SOR=4.743;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=28,28;WE=160676453;WS=160676435;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.42,0.58:33
chr2	160698700	rs41265133	A	C	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=277;ReadPosRankSum=1.843;SC=CTCTCTCTCTATATATATATA;SOR=0.385;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=53;TCF=50;TCR=3;TR=15;WE=160698708;WS=160698690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,16:0.31:52
chr2	160711045	rs3951216	G	C	1652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=36;PP=1250;SC=TTCCAGCACGGTCTAAAGAAG;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=44;WE=160711053;WS=160711035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	160711556	rs975490	T	G	3518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=94;PP=2879;SC=TATTGTTGAGTCTTGTCCATT;SOR=3.892;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=14;TCR=94;TR=108;WE=160711564;WS=160711546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr2	160729134	rs1397705	A	C	4566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=114;PP=2965;SC=AATTTGTTTTATGGTATTATC;SOR=5.042;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=8;TCR=114;TR=122;WE=160729142;WS=160729124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr2	160729186	rs10168271	T	C	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=39;PP=931;SC=CTGTCACATGTGTGGGCCCCT;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=39;WE=160729194;WS=160729176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	160734722	rs2292387	C	T	1216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=0;PP=1015;SC=GACTCCAATCCTGAAGATCAT;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=160734730;WS=160734712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	160735008	rs2292388	C	T	5058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=81;PP=2965;SC=CTCAAATCTACAAAAGGAGAA;SOR=0.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=74;TCR=81;TR=155;WE=160735016;WS=160734998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr2	160737495	rs2729712	A	C	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=16;NR=0;PP=452;SC=CTTACCTTTTATTTTCCAGCT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=160737503;WS=160737485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	160737560	rs2729711	G	T	1723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=8;PP=1350;SC=GGTAAAACAGGAAGAATATAA;SOR=3.383;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=52;WE=160737568;WS=160737550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	160737621	rs11675155	C	T	3367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=38;PP=2617;SC=CACAGTTGGGCGTCTTATTGT;SOR=1.428;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=70;TCR=38;TR=108;WE=160737629;WS=160737611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr2	160738677	rs16822581	G	A	4148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=89;NR=33;PP=2965;SC=ACATCTGCTAGAGAATGAATG;SOR=1.918;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=89;TCR=33;TR=122;WE=160738685;WS=160738667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr2	160742862	rs2271383	G	A	2097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=6;PP=1665;SC=CTAAGCTATTGGTGAGTGAGA;SOR=4.310;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=57;TCR=6;TR=63;WE=160742870;WS=160742852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	160761082	rs6760195	T	G	2204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=28;PP=1655;SC=ACTGCGGGGCTGGCGTGCCCG;SOR=1.439;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=50;TCR=28;TR=78;WE=160761090;WS=160761072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	160805993	rs6726923	C	G	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=0;PP=539;SC=CATCACCAACCAGACCAGAGG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=23;WE=160806001;WS=160805983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	160807742	rs952184	A	T	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=8;PP=1294;SC=ATATTTATTAATATTTTTGGG;SOR=3.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=43;TCR=8;TR=51;WE=160807750;WS=160807732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	160813249	rs3749113	G	A	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=30;PP=884;SC=AATTTTCTTGGGCAGAAAGAA;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=160813257;WS=160813239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	160833188	rs2715918	A	G	2433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=20;PP=1869;SC=TGCCAGAGTCATTCTTACCGT;SOR=2.356;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=64;TCR=20;TR=84;WE=160833196;WS=160833178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr2	160840370	rs5835784	AC	A	302.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=301;SC=TGGGATACTCACCCCTCAGAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=160840378;WS=160840360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	160843623	rs6757188	T	C	1676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=17;PP=1268;SC=CAAATTAAAATAGTGTTGGTC;SOR=1.358;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=48;WE=160843631;WS=160843613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	160872982	rs34121457	A	AG	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.07;ReadPosRankSum=1.412;SOR=4.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,22:0.92:24
chr2	160872991	rs34555459	T	G	1373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=30;NR=0;PP=908;SC=AAGGGGGGGGTGCGAGGAGAG;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=160872999;WS=160872972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	160873021	rs2715939	G	A	2872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.02;QD=31.23;SOR=4.502;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr2	160873270	rs2667040	A	G	3000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=83;PP=2452;SC=CTGTGCTGATACCGATGGGCA;SOR=6.759;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=85;TCF=2;TCR=83;TR=85;WE=160873278;WS=160873260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr2	160873294	rs3833577	T	TA	1561.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=48;PP=1208;SC=GCAATTCTTATAAAAAAAATA;SOR=6.630;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=1;TCR=58;TR=49;WE=160873302;WS=160873284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	160876827	rs1511213	A	G	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=315;SC=TGCAAAGGAGATAACACCCTG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=160876835;WS=160876817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	160889673	rs2203053	G	A	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.988;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=38;PP=816;ReadPosRankSum=0.537;SC=AAAACAACCAGGTCTTATTTT;SOR=0.799;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=151;TCF=21;TCR=130;TR=43;WE=160889681;WS=160889663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,43:0.28:151
chr2	160898783	rs3792194	A	G	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.890;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=153;ReadPosRankSum=-1.525;SC=ATATATCGAAAGCATTTTTTA;SOR=0.052;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=11;WE=160898791;WS=160898773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr2	160901517	rs4665143	A	G	5019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=62;PP=2965;SC=CCAGGCAACCACTGCCTCCTA;SOR=1.338;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=107;TCR=62;TR=169;WE=160901525;WS=160901507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr2	160919040	rs11285500	AC	A	320.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=339;SC=TCCGCGCCCCACCCCCTCCGG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=10;WE=160919048;WS=160919030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	160958349	rs34330288	GA	G	1387.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=41;PP=1090;SC=TGGTTCCCTGGAAAAAAAAAA;SOR=1.371;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=71;TCF=25;TCR=46;TR=58;WE=160958358;WS=160958339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
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chr2	160964057	.	GGA	TGG	1507	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=28;NR=0;PP=1507;QD=55.7309955308;SC=CAAAGCTGTTGGAGTCATGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=28;WE=160964067;WS=160964047;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr2	160964059	rs13008664	A	G	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.69;ReadPosRankSum=0.749;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
chr2	160968743	rs66470452	CA	C	417.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=467;ReadPosRankSum=0.632;SC=TTAGGTTAAACAAGATTCCAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=14;WE=160968751;WS=160968733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr2	161028992	rs1037694	T	C	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=95;ReadPosRankSum=0.212;SC=TTTCACCAAGTGTATGTTATT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=7;WE=161029000;WS=161028982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr2	161029218	rs2305818	G	A	1614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=34;PP=1073;ReadPosRankSum=-0.193;SC=GGTGGAGGGAGTCATTCCGCC;SOR=0.512;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=173;TCF=76;TCR=97;TR=66;WE=161029226;WS=161029208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,69:0.40:173
chr2	161132293	rs57047289	T	C	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=35;PP=626;ReadPosRankSum=1.093;SC=TACTTAGGCCTGACTGAATCC;SOR=0.675;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=163;TCF=49;TCR=114;TR=48;WE=161132301;WS=161132283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,52:0.31:169
chr2	161169828	rs10929977	C	G	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=366;ReadPosRankSum=-1.833;SC=AAAAGAACAGCTCTACTTTGT;SOR=0.468;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=17;WE=161169836;WS=161169818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr2	161174693	rs1430	C	T	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=249;ReadPosRankSum=1.046;SC=TGCATTTGTTCGTTGTCTTAT;SOR=0.352;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=12;WE=161174701;WS=161174683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr2	161797329	rs1524626	C	T	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=306;ReadPosRankSum=0.669;SC=AAACCCTGCCCAGGGACTCTC;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=15;WE=161797337;WS=161797319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr2	161797513	rs1524625	A	G	2014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.378;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=37;PP=1637;ReadPosRankSum=0.784;SC=TCATGTTTCAAAACACCAGAG;SOR=0.608;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=115;TCF=60;TCR=55;TR=73;WE=161797521;WS=161797503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,73:0.61:120
chr2	162072738	rs1267034	A	G	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=382;ReadPosRankSum=-0.115;SC=TATCTTAATAATATTATAGGG;SOR=0.551;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=69;TCF=65;TCR=4;TR=21;WE=162072746;WS=162072728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,21:0.29:72
chr2	162175290	rs1116165	T	C	2674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=14;PP=2126;SC=TGAATAAACATTTTTGTGCTT;SOR=3.180;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=68;TCR=14;TR=81;WE=162175298;WS=162175280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	162224193	rs58162668	G	GT	3928.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=41;PP=2969;SC=TATAAAAGGAGTTTTTATTTT;SOR=1.501;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=125;TCF=74;TCR=51;TR=108;WE=162224201;WS=162224183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr2	162224495	rs2303318	A	C	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=622;ReadPosRankSum=-2.313;SC=AACTCTCATCATATTACATTT;SOR=1.432;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=23;WE=162224503;WS=162224485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr2	162241846	rs62188123	T	C	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.73;ReadPosRankSum=-0.992;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr2	162247772	rs1921674	C	T	1390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=36;PP=1139;SC=GATTTAAATTCGAATTTTTGA;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=42;WE=162247780;WS=162247762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	162265270	rs16845844	A	G	1087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=2;PP=856;ReadPosRankSum=-0.771;SC=TCTGGTCATCATTATTTTTGG;SOR=0.467;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=64;TCF=61;TCR=3;TR=45;WE=162265278;WS=162265260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,45:0.71:63
chr2	162274607	rs200480786	ATGTGTG	A	164.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.59;ReadPosRankSum=1.534;SOR=0.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr2	162274847	rs116175783	G	C	2772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.701;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=58;PP=2102;ReadPosRankSum=1.252;SC=AGTGGCTCAAGCGCTCGTGTT;SOR=0.782;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=130;TCF=48;TCR=82;TR=90;WE=162274855;WS=162274837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,99:0.70:141
chr2	162280748	rs890076	G	A	1878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.78;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	162730312	rs35292746	T	C	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.515;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=206;ReadPosRankSum=0.711;SC=AGAATCCCTCTGACAATGCCT;SOR=1.802;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=10;WE=162730320;WS=162730302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr2	162757676	rs6754546	A	G	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=352;ReadPosRankSum=-0.355;SC=CTCTGAAGTTACTAATGATTG;SOR=2.948;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=15;WE=162757684;WS=162757666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
chr2	162813807	rs10221808	A	G	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=425;ReadPosRankSum=-0.353;SC=CATCATTTAAAATTTTCATTT;SOR=1.893;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=18;WE=162813815;WS=162813797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr2	162815262	rs12466127	C	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=142;ReadPosRankSum=0.419;SC=TCTTATGGTACTTTTCTTTAT;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=7;WE=162815270;WS=162815252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr2	162821515	rs4233647	G	A	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=6.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.608;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=0;PP=542;ReadPosRankSum=-0.192;SC=TACACCTCTCGTTTTAATTTT;SOR=1.888;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=82;TCF=79;TCR=3;TR=29;WE=162821523;WS=162821505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,28:0.35:79
chr2	162873188	rs2970931	T	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=166;ReadPosRankSum=0.842;SC=TTATATATAATATGAAATACA;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=8;WE=162873196;WS=162873178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr2	162876828	rs35175377	CA	C	580.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=3.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.92;MQRankSum=-2.659;QD=9.22;ReadPosRankSum=2.365;SOR=2.110;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,37:0.59:63
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chr2	162890196	rs11437441	C	CA	536.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=0.781;QD=24.40;ReadPosRankSum=0.282;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
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chr2	162894766	rs10930040	A	G	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=333;ReadPosRankSum=1.678;SC=TAACTATTTTAAAAGCTTATA;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=14;WE=162894774;WS=162894756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr2	162930286	rs3216773	CGCCAGGGTCCTAGCAGAA	C	673.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=1.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;MQRankSum=3.535;QD=7.32;ReadPosRankSum=0.688;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,23:0.25:92
chr2	163051415	rs1468916	C	T	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=350;SC=AACATCACTTCTAAGTCACAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=163051423;WS=163051405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	163124051	rs1990760	C	T	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.289;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=370;ReadPosRankSum=-0.136;SC=TTTTGCAGTGCTTTGTTTTCT;SOR=2.536;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=82;TCF=21;TCR=61;TR=22;WE=163124059;WS=163124041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,23:0.27:84
chr2	163128824	rs3747517	T	C	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.855;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=377;ReadPosRankSum=0.405;SC=AACTGTCTCATGTTCGATAAC;SOR=0.562;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=97;TCF=62;TCR=35;TR=28;WE=163128832;WS=163128814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,30:0.30:101
chr2	163241144	rs34382064	C	A	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.666;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=231;ReadPosRankSum=-0.888;SC=TAAAAAGTCACCATTTTGTGA;SOR=1.664;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=12;WE=163241152;WS=163241134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr2	163694878	rs4667768	C	G	1246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.99;SOR=2.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	163694886	rs4667769	G	A	1303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.06;SOR=1.839;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	164468328	rs2231901	G	T	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.14;ReadPosRankSum=-0.124;SOR=0.083;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr2	165349459	rs1051160	G	A	2045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.11;SOR=7.903;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	165349459	.	GTAAT	ATAAC,ATAAT	635	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=29,49;NR=0,0;PP=635,357;QD=23.740271547;SC=TTTTCACATGGTAATGTTTTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=50;TCR=0;TR=29,49;WE=165349471;WS=165349449;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.58:50
chr2	165349463	rs11765	T	C	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.92;ReadPosRankSum=0.826;SOR=1.390;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr2	165353712	rs8192673	C	T	8358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=106;NR=148;PP=2965;SC=TGACTATGAACAGACATACCC;SOR=1.041;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=255;TCF=106;TCR=149;TR=254;WE=165353720;WS=165353702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr2	165358672	rs4667463	A	G	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=0;PP=596;SC=AGAAAATAACATAAATTATTA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=165358680;WS=165358662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	165424837	rs17437781	A	G	5615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=127;NR=34;PP=2965;SC=TTTTCTGTAGAATTATTGGCG;SOR=2.740;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=162;TCF=128;TCR=34;TR=161;WE=165424845;WS=165424827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr2	165476253	rs61748245	A	T	2158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.136;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=41;PP=1700;ReadPosRankSum=1.621;SC=ACAGATGTAAATGGAGAACAG;SOR=0.563;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=280;TCF=168;TCR=112;TR=97;WE=165476261;WS=165476243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,98:0.34:285
chr2	165578581	rs6414069	A	G	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=1.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.551;SOR=0.972;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,34:0.26:129
chr2	165584407	rs12692743	C	T	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=-0.641;SC=AACACCTTCACACAAACACAA;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=5;WE=165584415;WS=165584397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr2	165630460	rs355865	T	C	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-5.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=216;ReadPosRankSum=0.335;SC=ATGTGCTTTATGCAATAAAAA;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=13;WE=165630468;WS=165630450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr2	165657066	rs62173958	T	C	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.239;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=411;ReadPosRankSum=0.442;SC=ATCTCTCTCCTAGGCAGCATA;SOR=1.132;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=79;TCF=40;TCR=39;TR=25;WE=165657074;WS=165657056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,26:0.31:83
chr2	165657096	rs62173959	G	C	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.052;HP=5;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=446;ReadPosRankSum=0.023;SC=TCAAAATTTTGTACTTGAAAT;SOR=0.993;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=74;TCF=28;TCR=46;TR=26;WE=165657104;WS=165657086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,26:0.35:74
chr2	165657142	rs7588491	A	C	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.803;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=0.694;SC=TTCATAATGAACCCAAACTGG;SOR=0.256;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=11;WE=165657150;WS=165657132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,11:0.28:40
chr2	165698715	rs71028447	A	AG	497.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=508;SC=TCCCACCGCTAGGCTGCGCTT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=13;WE=165698723;WS=165698705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	165809138	rs10544528	ATG	A	934.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.754;NF=25;NR=0;PP=1040;ReadPosRankSum=-0.952;SC=CAGTTGCAGCATGTGTGTGTG;SOR=1.559;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=25;WE=165809147;WS=165809128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,30:0.67:45
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chr2	165996107	rs1946892	T	A	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=27;PP=907;ReadPosRankSum=0.963;SC=CTTCCGTTTCTGTGGTGGTGC;SOR=0.671;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=147;TCF=63;TCR=84;TR=47;WE=165996115;WS=165996097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,47:0.32:149
chr2	166003479	rs16850131	G	A	1343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.349;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=43;PP=1060;ReadPosRankSum=-0.086;SC=CTTTCCAACAGCTCTCCTAAC;SOR=1.292;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=176;TCF=64;TCR=112;TR=60;WE=166003487;WS=166003469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,63:0.34:183
chr2	166003573	rs58539679	C	T	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.946;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=234;ReadPosRankSum=0.039;SC=CTATTTAGAACACAGAGCTTT;SOR=0.046;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=64;TCF=3;TCR=61;TR=17;WE=166003581;WS=166003563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,17:0.26:66
chr2	166012203	rs3731760	C	T	1673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=4;PP=1409;SC=GCCACCACACCCAGCCTATGC;SOR=4.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=46;TCR=4;TR=50;WE=166012211;WS=166012193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	166018703	rs6756990	T	C	311.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5033;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=223;ReadPosRankSum=0.296;SC=GGAGCAGCACTGCTCTTTATT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=10;WE=166018711;WS=166018693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr2	166018764	rs60156545	C	CT	368.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.932;HP=10;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.885;NF=14;NR=3;PP=237;ReadPosRankSum=0.021;SC=TTCCTACCTACTTTTTTTTTT;SOR=0.090;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=17;WE=166018772;WS=166018754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr2	166018901	rs11887309	C	A	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=700;ReadPosRankSum=-0.429;SC=CAAAAAAAAACCCATTTTATT;SOR=0.602;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=31;WE=166018909;WS=166018891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,31:0.69:45
chr2	166018990	rs11887343	C	A	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=541;ReadPosRankSum=0.760;SC=GGTGGCTGTACACCCACAGTC;SOR=0.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=22;WE=166018998;WS=166018980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr2	166019384	rs9333576	T	C	2568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.809;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=65;PP=1971;ReadPosRankSum=-0.923;SC=GTGCCAGAAATCATGATTTCT;SOR=0.850;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=122;TCF=28;TCR=94;TR=83;WE=166019392;WS=166019374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,92:0.69:134
chr2	166020295	rs2304710	C	T	5412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.431;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=143;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.212;SC=TACTACCTTACACCAGTTTCT;SOR=0.896;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=284;TCF=77;TCR=207;TR=194;WE=166020303;WS=166020285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,203:0.69:294
chr2	166020893	rs7579000	G	A	3718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.538;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=38;PP=2772;ReadPosRankSum=-0.680;SC=AATTTTCAAAGTTACTCACGC;SOR=1.226;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=203;TCF=136;TCR=67;TR=132;WE=166020901;WS=166020883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,139:0.64:216
chr2	166025174	rs4667795	G	A	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=365;ReadPosRankSum=2.814;SC=CATAAGTCAGGCTATACCCAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=15;WE=166025182;WS=166025164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr2	166025417	rs4667796	G	A	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.951;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=415;ReadPosRankSum=0.943;SC=AAAGTTTATCGATGCAAAAAC;SOR=0.103;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=21;WE=166025425;WS=166025407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr2	166026859	rs3754962	G	A	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=275;ReadPosRankSum=0.086;SC=AAATTTTACAGATACTTGAAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=11;WE=166026867;WS=166026849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr2	166027176	rs3754961	A	G	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.025;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=340;ReadPosRankSum=-0.941;SC=GTTTGTTTAAACCAGTTGATA;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=8;WE=166027195;WS=166027166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr2	166027187	rs3754960	T	A	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.853;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=340;ReadPosRankSum=-0.235;SC=CCAGTTGATATATCATAACTA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=166027195;WS=166027166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr2	166032775	rs72471101	CATT	C	3373.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.731;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.380;NF=39;NR=32;PP=2971;ReadPosRankSum=-0.641;SC=TTCTCATCATCATTATCTTGT;SOR=0.797;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=58;TCR=48;TR=71;WE=166032785;WS=166032765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,85:0.69:124
chr2	166153499	rs7593568	A	G	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=388;SC=TCTAAGTTTTATTTTATGTGT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=166153507;WS=166153489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	166167166	rs7560348	T	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.643;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=-0.681;SC=ATATTATATATAATGGAAATT;SOR=0.031;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=6;WE=166167174;WS=166167156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr2	166170127	rs2121371	T	C	2290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=16;PP=1688;SC=AACCTAATTATAGCCAGTGTC;SOR=2.400;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=52;TCR=16;TR=68;WE=166170135;WS=166170117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	166172317	rs1838846	A	G	3960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=108;PP=2965;SC=TTTTTTAAAAAAATATGCCAG;SOR=6.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=4;TCR=108;TR=112;WE=166172325;WS=166172307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr2	166179650	rs1867864	C	T	2388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.900;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=20;PP=1843;ReadPosRankSum=0.885;SC=TTTGTTTCTTCTCTTGTTATT;SOR=0.602;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=114;TCF=87;TCR=27;TR=82;WE=166179658;WS=166179640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,85:0.73:117
chr2	166183273	rs74598858	A	G	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=90;ReadPosRankSum=-2.255;SC=CATGGTGTATATTTAGTTAAA;SOR=0.250;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=6;WE=166183281;WS=166183263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr2	166183577	rs17184707	C	T	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.781;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=39;PP=1004;ReadPosRankSum=-1.112;SC=TAAAATACTTCCTGACTTGAT;SOR=3.516;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=1;TCR=49;TR=39;WE=166183585;WS=166183567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,39:0.74:53
chr2	166221569	rs3835933	TG	T	249.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=602;ReadPosRankSum=-0.833;SC=ATACAGAAGATGGGGGGGGGG;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=15;WE=166221590;WS=166221559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr2	166221582	rs3769951	C	T	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=0;PP=1059;ReadPosRankSum=1.581;SC=GGGGGGGGCACACCTAATTAA;SOR=1.077;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=54;TCR=0;TR=31;WE=166221590;WS=166221559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr2	166221883	rs67174953	GTATC	G	1465.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=1349;SC=CTATCTATCTGTATCTATCTA;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=26;WE=166221894;WS=166221873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	166224047	rs2304010	G	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.27;ReadPosRankSum=-0.612;SOR=0.074;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,9:0.20:44
chr2	166229922	rs6432821	T	C	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=21;PP=528;SC=CTTTGTACCATGGAAATGTCA;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=166229930;WS=166229912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	166234076	rs1864885	A	G	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=24;ReadPosRankSum=1.237;SC=TAATTTTGGGAAAAAAGAAAA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=4;WE=166234084;WS=166234066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr2	166245230	rs2060198	T	A	2054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.347;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.931;NF=43;NR=29;PP=1701;ReadPosRankSum=-0.815;SC=GAATCCTACGTCTGATCAAAG;SOR=0.984;Source=Platypus;TCR=54;TR=72;WE=166245238;WS=166245220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,73:0.59:124
chr2	166514165	rs12620509	C	G	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=480;ReadPosRankSum=1.823;SC=CCCTAGCCAACAAGGGTTGGC;SOR=1.033;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=53;TCF=51;TCR=2;TR=23;WE=166514173;WS=166514155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr2	166514594	rs10803800	A	G	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=10;PP=251;SC=TGAGTTAACCATTTTCATATT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=166514602;WS=166514584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	166535918	rs777346	C	T	2251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.680;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=36;PP=1871;ReadPosRankSum=-0.317;SC=TGCCTTACACCATGACCCCGG;SOR=0.648;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=131;TCF=61;TCR=70;TR=80;WE=166535926;WS=166535908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,80:0.60:133
chr2	166610972	rs67722214	CA	C	124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=-0.338;SC=GAGTAAAAACCAAAAAAAAAT;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=9;WE=166610980;WS=166610962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr2	166611006	rs62174818	C	T	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.757;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=434;ReadPosRankSum=-0.799;SC=AATTGCCAAACTCAGTCTGAA;SOR=2.226;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=20;WE=166611014;WS=166610996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr2	166611086	rs41268661	C	T	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=13;PP=832;ReadPosRankSum=0.044;SC=CAACATCTCACTTGTGCTTGT;SOR=0.793;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=42;WE=166611094;WS=166611076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,46:0.61:75
chr2	166618262	rs1968294	C	T	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=385;ReadPosRankSum=1.102;SC=AGAGCTGTTACCTGCTTGGGC;SOR=1.022;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=17;WE=166618270;WS=166618252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr2	166621354	rs2113840	T	C	1567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=0;PP=1238;SC=TACCACAATATGGATTTGGGA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=43;WE=166621362;WS=166621344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	166626606	rs4667836	G	A	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.411;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=423;ReadPosRankSum=1.195;SC=CCTTAGAGTAGCTAAAAAACA;SOR=0.373;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=71;TCR=9;TR=25;WE=166626614;WS=166626596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,27:0.33:82
chr2	166770120	rs10176588	A	G	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.674;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=1130;ReadPosRankSum=-0.199;SC=CAAGGAGAAGAAAAGACCGAG;SOR=0.923;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=89;TCF=52;TCR=37;TR=52;WE=166770128;WS=166770110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,55:0.57:97
chr2	166771663	rs7590559	C	T	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=205;ReadPosRankSum=0.103;SC=GGAATTAATACTAGTGGCTAA;SOR=0.874;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=11;WE=166771671;WS=166771653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr2	166773971	rs6750044	G	A	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=349;ReadPosRankSum=-0.594;SC=TTATCAAATGGTATAAAGGAT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=16;WE=166773979;WS=166773961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr2	166781242	rs58208220	T	TA	588.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.641;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=733;ReadPosRankSum=0.169;SC=AATATTTACCTAAAATAAACA;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=22;WE=166781250;WS=166781232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr2	166788336	rs7592429	T	C	2791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=54;PP=2319;SC=GCATCCAATGTATTTCCCAAG;SOR=1.531;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=28;TCR=54;TR=82;WE=166788344;WS=166788326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr2	166797646	rs1432273	C	T	1581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.524;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=30;PP=1202;ReadPosRankSum=-1.012;SC=ATCTGGTTCACAGTCTCCAGG;SOR=0.747;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=231;TCF=134;TCR=97;TR=70;WE=166797654;WS=166797636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,72:0.31:235
chr2	166799596	rs13000534	T	C	729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=1;PP=617;SC=AATGCCAGTCTACCTTACAGC;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=166799604;WS=166799586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	166799893	rs10930190	G	A	2546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=68;PP=2140;SC=TTAGAAATGAGAGAAATAAAT;SOR=5.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=71;TCF=3;TCR=68;TR=71;WE=166799901;WS=166799883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	166802306	rs5836067	ACTGT	A	820.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=872;ReadPosRankSum=-1.249;SC=CTATAGTGGTACTGTCTAATA;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=18;WE=166802317;WS=166802296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr2	166810161	.	G	GCCCGCTCA	978.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=1;PP=961;SC=CCGCCCGCCCGCCCGCTCACC;SOR=4.615;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=15;WE=166810169;WS=166810151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr2	166810433	rs5836068	GT	G	529.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=491;SC=GGACCCGGAGGTGAGGGCTGC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=166810441;WS=166810423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	166854780	rs142978131	T	TA	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=226;ReadPosRankSum=0.079;SC=AAATTATTCTTACTAATATGT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=166854788;WS=166854770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr2	166892444	rs34673057	TAAA	T	1030.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=991;SC=TATCATAAAGTAAAAAAAAAA;SOR=4.977;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=20;WE=166892456;WS=166892434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	166892448	rs114707732	A	T	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.32;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	166892788	rs2298771	C	T	1914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=24;PP=1481;SC=CCAATTTCTGCTGTATGATTG;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=33;TCR=24;TR=57;WE=166892796;WS=166892778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	166893081	rs7601520	G	A	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=16;PP=544;SC=TTACACCAATGTAGGGAAGAG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=166893089;WS=166893071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	166894165	rs67819222	C	CT	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=-0.976;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.165;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr2	166894230	rs2020318	T	C	1703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=10;PP=1457;SC=GTTACATATGTATACATGTGC;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=54;TCF=44;TCR=10;TR=53;WE=166894238;WS=166894220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	166895819	rs10168027	A	G	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.291;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=70;ReadPosRankSum=-0.803;SC=CAAATGTTACAGAAAAACTTA;SOR=0.105;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=6;WE=166895827;WS=166895809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr2	166895913	rs201455607	CTTT	C,CT	756.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.28;QD=30.27;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:2,12,11:0.48,0.44:25
chr2	166896143	rs2126152	T	G	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=25;PP=965;SC=TTCCACCAGATAATAACATAC;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=32;WE=166896151;WS=166896133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	166897864	rs6432860	A	G	1584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=20;PP=1249;SC=GGTCCATCACAACCAGGTTGA;SOR=1.036;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=30;TCR=20;TR=50;WE=166897872;WS=166897854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	166898017	rs10198801	G	T	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.462;NF=1;NR=14;PP=340;ReadPosRankSum=-0.035;SC=CCACCAAAAGGTATACTTTAT;SOR=0.527;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=15;WE=166898025;WS=166898007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr2	166900606	rs6753355	A	C	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=556;SC=TAATATGGACATTTGAATGTG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=166900614;WS=166900596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	166903188	rs538921	A	C	2547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=6;PP=2100;SC=TTCCTCATACAACCACCTGCT;SOR=4.407;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=71;TCR=6;TR=77;WE=166903196;WS=166903178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	166903228	rs6432861	C	T	1706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=17;PP=1338;ReadPosRankSum=-2.207;SC=TTCAATATTACGTAACAATCA;SOR=0.700;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=90;TCF=65;TCR=25;TR=63;WE=166903236;WS=166903218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,65:0.70:93
chr2	166903445	rs7580482	T	C	5237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=88;PP=2965;SC=AAATGACCAATACAAAAAATA;SOR=0.846;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=167;TCF=78;TCR=89;TR=165;WE=166903453;WS=166903435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr2	166904062	.	G	T	192	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=10;NR=0;PP=192;QD=22.6771212547;SC=TTATCATCCGGTTTTAATTTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=10;WE=166904070;WS=166904061;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr2	166904346	rs1461193	G	A	2684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.399;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=69;PP=2178;ReadPosRankSum=1.346;SC=ACTATGCTATGATATTGCCTA;SOR=3.590;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=79;TCF=10;TCR=69;TR=78;WE=166904354;WS=166904336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,82:0.99:83
chr2	166905375	rs1542484	A	G	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.143;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=915;ReadPosRankSum=-0.836;SC=ATACACAGATACACACAAATT;SOR=0.531;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=56;TCF=40;TCR=16;TR=37;WE=166905383;WS=166905365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,40:0.67:60
chr2	166905480	rs994399	G	A	1843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=42;PP=1440;SC=AAAGAAAGTCGTATGATGAAC;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=17;TCR=42;TR=59;WE=166905488;WS=166905470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	166905572	rs1542483	T	A	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=297;ReadPosRankSum=-1.091;SC=TTAAATATATTATTCATTCAA;SOR=0.836;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=14;WE=166905580;WS=166905562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr2	166909544	rs3812718	C	T	2467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.464;NF=16;NR=69;PP=2100;ReadPosRankSum=-0.036;SC=CTAATCACTTCTTACCTGGAA;SOR=0.647;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=23;TCR=97;TR=85;WE=166909552;WS=166909534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,88:0.68:130
chr2	166909559	rs3812719	C	A	3416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=79;PP=2693;SC=CTGGAATTACCGAAATAGTTT;SOR=3.567;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=14;TCR=79;TR=93;WE=166909567;WS=166909549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr2	166915014	rs8191987	A	G	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=210;ReadPosRankSum=0.098;SC=TTAATTTGATATTTAGCTATA;SOR=0.239;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=12;WE=166915022;WS=166915004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr2	166915335	rs10930201	C	A	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=466;SC=TCTAAAGTGCCCCATGAAAAC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=166915343;WS=166915325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	166930214	rs566839	T	A	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=32;PP=1008;SC=TTTTAAAGAGTGGACTAAGAG;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=166930222;WS=166930204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	167060449	rs10180721	A	T	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=1;PP=728;SC=AAAATCTGAAAAATAAATATT;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=167060457;WS=167060439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	167060980	rs77944059	GAAAC	G	312.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=307;SC=CCAAGGTAAAGAAACAAACAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=167060991;WS=167060970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	167085124	rs10199799	T	G	2664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.61;SOR=6.466;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr2	167085141	rs58519838	CTT	C	4219.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=83;NR=2;PP=2950;SC=TAAAGAATAACTTATATCCTT;SOR=6.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=89;TCF=87;TCR=2;TR=85;WE=167085150;WS=167085131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr2	167090042	rs722204	G	A	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=13;PP=473;SC=AGTCAATTCTGAAACTCACTA;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=167090050;WS=167090032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	167099158	rs6746030	A	G	5349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=119;PP=2965;SC=GAGAACCTCCATACACAACCT;SOR=2.207;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=159;TCF=40;TCR=119;TR=159;WE=167099166;WS=167099148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr2	167129497	rs13395140	A	T	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.765;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.864;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=135;ReadPosRankSum=2.435;SC=ACCAGCAACGAAGATTTCTGC;SOR=2.964;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=8;WE=167129505;WS=167129487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr2	167137119	rs6432893	G	A	920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.026;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=753;ReadPosRankSum=0.989;SC=GGAGAAAAAAGCAGAGAACAT;SOR=0.897;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=34;WE=167137127;WS=167137109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,35:0.59:59
chr2	167144974	rs6747673	A	T	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=1;PP=638;ReadPosRankSum=1.338;SC=CTTTTTTAAGACGGTCTAACA;SOR=0.527;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=29;WE=167144982;WS=167144964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr2	167144995	rs13402180	T	C	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.816;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=3;PP=981;ReadPosRankSum=0.021;SC=TCTGTTGAAATTCTAATTCTT;SOR=0.444;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=67;TCF=63;TCR=4;TR=45;WE=167145003;WS=167144985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,46:0.67:69
chr2	167145142	rs13414203	A	G	2035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.442;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=52;PP=1466;ReadPosRankSum=-0.946;SC=TTTTGCCAGCAGCACGCAGCG;SOR=0.953;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=118;TCF=37;TCR=81;TR=75;WE=167145150;WS=167145132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,81:0.62:131
chr2	167149693	rs7588632	G	A	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=464;ReadPosRankSum=1.272;SC=CATACACCAGGTACATATGCC;SOR=1.460;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=20;WE=167149701;WS=167149683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr2	167162277	rs4429487	G	A	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.276;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=23;PP=1037;ReadPosRankSum=-2.170;SC=TAAATTTGCCGTTTCAAAAAG;SOR=0.555;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=167;TCF=108;TCR=59;TR=62;WE=167162285;WS=167162267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,67:0.38:176
chr2	167163043	rs9646771	T	C	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.331;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=434;ReadPosRankSum=-0.987;SC=TCCAGTCCGGTGGGTTATTCA;SOR=1.723;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=71;TCF=49;TCR=22;TR=24;WE=167163051;WS=167163033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,25:0.34:73
chr2	167163199	rs9646772	A	T	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=162;ReadPosRankSum=-2.331;SC=AACTTTTCCTAAGAAAAAAAT;SOR=0.507;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=12;WE=167163207;WS=167163189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr2	167163372	rs4583483	T	C	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.63;ReadPosRankSum=-0.405;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr2	167163372	.	TC	CA	25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=25;QD=39.2339374311;SC=CCAGAGTCTTTCAAGGTGCAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=2;WE=167163381;WS=167163362;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,2:0.14:14
chr2	167163373	rs4443015	C	A	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.63;ReadPosRankSum=-0.499;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr2	167163663	rs4447616	C	T	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=150;ReadPosRankSum=-1.051;SC=GTTTACCTTTCTACATGGCAG;SOR=0.245;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=9;WE=167163671;WS=167163653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr2	167168093	rs6432901	C	T	1643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=6;PP=1344;SC=TGAAGGGCAGCTGTTTGCCAG;SOR=3.788;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=49;WE=167168101;WS=167168083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	167279922	rs6738031	C	A	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.091;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=280;ReadPosRankSum=0.135;SC=TTCTCTGATCCATATATATAT;SOR=1.901;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=15;WE=167279930;WS=167279912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr2	167284520	rs3748895	T	C	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=99;ReadPosRankSum=-0.708;SC=ACTGAAACTTTCTACTATGTG;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=6;WE=167284528;WS=167284510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr2	167313313	rs67265532	AATAT	A	294.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=8;NR=0;PP=564;SC=TCAAGACTAAAATATATATAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=167313345;WS=167313303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	167313329	rs71428927	T	G	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.26;MQRankSum=1.611;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,2:0.25:8
chr2	167313333	.	T	C	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.91;MQRankSum=1.732;QD=3.86;ReadPosRankSum=-0.282;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,2:0.22:9
chr2	167313337	rs7593207	T	G	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.91;MQRankSum=1.732;QD=3.86;ReadPosRankSum=-1.480;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,2:0.22:9
chr2	167322522	rs7593452	G	A	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=382;ReadPosRankSum=-1.106;SC=ATTTGTTTTCGAAATAATGTA;SOR=0.437;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=55;TCF=4;TCR=51;TR=20;WE=167322530;WS=167322512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,21:0.36:59
chr2	167327064	rs12992062	A	G	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.63;ReadPosRankSum=0.181;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr2	167328750	rs2293567	C	T	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.814;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=518;ReadPosRankSum=0.659;SC=AAAATCTTTGCAGACGTCAAT;SOR=1.556;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=68;TCR=2;TR=27;WE=167328758;WS=167328740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,28:0.38:74
chr2	167334085	rs7565062	G	T	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=124;ReadPosRankSum=0.022;SC=CAAATCAGGAGTTGGCTTTAA;SOR=0.646;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=27;TCR=23;TR=12;WE=167334093;WS=167334075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,13:0.24:55
chr2	168812218	rs74969437	C	T	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=29;PP=661;ReadPosRankSum=1.671;SC=AGAAGAGAGACGCCAGCCACT;SOR=0.500;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=31;WE=168812226;WS=168812208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,31:0.79:39
chr2	168931636	rs56031549	C	T	1745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=30;PP=1356;ReadPosRankSum=-0.180;SC=TGAGAAAAAGCTGCTTTCCCT;SOR=0.700;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=241;TCF=147;TCR=94;TR=74;WE=168931644;WS=168931626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,77:0.31:245
chr2	168986154	rs925846	A	G	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.888;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=46;PP=1225;ReadPosRankSum=-1.077;SC=AACATCAAATATGATACACAT;SOR=0.877;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=100;TCF=23;TCR=77;TR=58;WE=168986162;WS=168986144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,59:0.57:103
chr2	168996775	rs2278785	T	C	1729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=2;PP=1456;SC=TCAACCCCGATGTAGTATTTC;SOR=5.747;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=51;TCR=2;TR=53;WE=168996783;WS=168996765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	168997097	rs2278784	A	G	3695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=50;PP=2965;SC=AAATGTTAGCATATTAATGAT;SOR=0.986;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=66;TCR=50;TR=116;WE=168997105;WS=168997087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr2	169487610	rs11347055	GT	G	137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=111;SC=CTATATCCTGGTTTTTTTTTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=169487618;WS=169487600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	169487668	rs4667585	A	C	115.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=89;SC=CAGGCTTCCTAAGAATTATTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=169487676;WS=169487658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	169551748	rs2288188	T	G	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=224;ReadPosRankSum=1.907;SC=TTCTATTGTTTCTTCGCTCAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=11;WE=169551756;WS=169551738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr2	169674655	rs830026	T	C	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=7.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.95;ReadPosRankSum=0.334;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr2	169674663	rs830025	A	T	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=2.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.60;ReadPosRankSum=0.813;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr2	169674764	rs830024	C	G	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.271;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=318;ReadPosRankSum=-0.328;SC=CCTGTGCTCGCGAACTCCTCT;SOR=0.990;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=34;TCF=14;TCR=20;TR=18;WE=169674772;WS=169674754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr2	169674806	rs2461389	G	C	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=251;ReadPosRankSum=-0.222;SC=TAGGACTGCAGGTGTGTGCCA;SOR=0.460;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=16;WE=169674814;WS=169674796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr2	169681278	rs11374385	T	TTTTGTTTG	951.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.47;MQRankSum=1.881;QD=20.25;ReadPosRankSum=1.811;SOR=0.919;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr2	169707262	rs139707092	AAATTCTCTGG	A	1935.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.348;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.219;NF=35;NR=4;PP=2981;ReadPosRankSum=-0.210;SC=ATCTCTACTGAAATTCTCTGG;SOR=0.995;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=84;TCF=70;TCR=14;TR=39;WE=169707279;WS=169707252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,51:0.61:84
chr2	169721377	rs479661	G	A	3868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=11.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.24;ReadPosRankSum=0.677;SOR=0.218;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,95:0.67:142
chr2	169721381	rs3931	A	G	3915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=10.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.82;ReadPosRankSum=0.364;SOR=0.246;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,99:0.68:146
chr2	169727879	rs61598834	G	GA	548.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=568;ReadPosRankSum=0.649;SC=ATAAAAACAAGAAAAAAAGAG;SOR=1.075;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=52;TCR=0;TR=23;WE=169727887;WS=169727869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr2	169728069	.	GAAA	G	2417.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.996;ClippingRankSum=0.000;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.553;NF=4;NR=49;PP=724;ReadPosRankSum=-0.924;SC=TCTGACACTAGAAAAAAAAAA;SOR=0.990;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=106;TCF=13;TCR=93;TR=53;WE=169728081;WS=169728059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,68:0.74:92
chr2	169730344	rs16856071	A	G	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=51;ReadPosRankSum=0.712;SC=GTTTTAAAATATATTATAGTT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=169730352;WS=169730334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr2	169758147	rs6715133	C	T	59.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5164;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=36;ReadPosRankSum=-0.319;SC=AGATGTATATCGTTTTACTTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=169758155;WS=169758137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr2	169763148	rs560887	T	C	6810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=128;PP=2965;SC=TTGCTTTTTATGCTTGTATCT;SOR=0.997;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=228;TCF=100;TCR=128;TR=228;WE=169763156;WS=169763138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr2	169764176	rs492594	G	C	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.917;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=563;ReadPosRankSum=-0.503;SC=CCTGTTTGCAGTTGGCTTTTA;SOR=0.191;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=117;TCF=77;TCR=40;TR=34;WE=169764184;WS=169764166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,37:0.30:124
chr2	169764546	rs2232328	C	G	2045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.472;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=62;PP=1537;ReadPosRankSum=0.988;SC=ATTCCCTACTCTGTTCATATG;SOR=0.632;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=315;TCF=108;TCR=207;TR=95;WE=169764554;WS=169764536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:221,95:0.30:316
chr2	169801488	rs853789	A	G	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=168;ReadPosRankSum=-1.856;SC=AAGATAGTAAACAAGAAAGTA;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=9;WE=169801496;WS=169801478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr2	169814347	rs853773	A	G	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.80;ReadPosRankSum=2.362;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr2	169814655	rs853772	G	T	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=58;ReadPosRankSum=1.145;SC=CAGAGAGAGGGTTATATTAAT;SOR=0.963;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=7;WE=169814663;WS=169814645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,7:0.20:35
chr2	169820618	rs4148796	AT	GC	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=359;ReadPosRankSum=-0.788;SC=ACTGCTAGATATATACCTAGA;SOR=0.465;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=8;WE=169820627;WS=169820608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr2	169824739	rs4148789	T	TA	460.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.90;MQRankSum=0.671;QD=38.39;ReadPosRankSum=-0.108;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr2	169824743	rs2389613	C	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.77;MQRankSum=0.612;QD=33.55;ReadPosRankSum=-0.366;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr2	169824749	rs28405534	C	A	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.72;MQRankSum=0.588;QD=33.25;ReadPosRankSum=-0.765;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
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chr2	169830051	rs2389605	C	T	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=168;ReadPosRankSum=-0.150;SC=TGGTTATTCACTGAACACTGT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=169830059;WS=169830047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr2	169830155	rs2287623	G	A	1405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.908;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=12;PP=995;ReadPosRankSum=-0.709;SC=ACACCTTTCTGTTTGATCAAT;SOR=0.858;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=95;TCF=72;TCR=23;TR=54;WE=169830163;WS=169830145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,58:0.59:98
chr2	169830328	rs2287622	A	G	1313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.529;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=31;PP=978;ReadPosRankSum=-1.297;SC=TGGTTTAATGACCATGTTGAG;SOR=0.426;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=63;TCF=18;TCR=45;TR=46;WE=169830336;WS=169830318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,48:0.72:67
chr2	169842809	rs2287618	T	C	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=302;SC=GAAGACAAAATGCTTGAGTCA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=169842817;WS=169842799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	169997051	rs990626	G	A	1620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=40;PP=1248;SC=TAGGCAGTTCGATGGCTGCAG;SOR=2.790;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=50;WE=169997059;WS=169997041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	170003432	rs4667591	T	G	2579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.290;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=50;PP=1943;ReadPosRankSum=1.093;SC=GCAGACTCGATTTTAGGTTCC;SOR=0.517;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=132;TCF=57;TCR=75;TR=91;WE=170003440;WS=170003422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,93:0.67:138
chr2	170010985	rs2075252	T	C	1782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.509;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=21;PP=1304;ReadPosRankSum=-0.877;SC=CCTATGTCCTTGGGATCCCAA;SOR=0.461;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=123;TCF=87;TCR=36;TR=68;WE=170010993;WS=170010975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,72:0.57:127
chr2	170027136	.	G	C	3818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.000;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.796;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=92;PP=2962;ReadPosRankSum=0.141;SC=ATGCACTGCTGATTGACACAT;SOR=0.419;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=200;TCF=56;TCR=144;TR=132;WE=170027144;WS=170027126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,134:0.66:204
chr2	170032989	rs2229265	C	T	2619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=21;PP=2027;ReadPosRankSum=1.792;SC=TGCCACTCAGCTGAAGGGTGC;SOR=0.518;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=134;TCF=106;TCR=28;TR=94;WE=170032997;WS=170032979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,97:0.71:137
chr2	170050472	rs2075248	T	C	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=26;PP=573;ReadPosRankSum=-0.806;SC=GACAAGCTGGTTGTAGCATGG;SOR=0.848;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=70;TCF=11;TCR=59;TR=30;WE=170050480;WS=170050462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,29:0.41:71
chr2	170053505	rs2228171	C	T	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.083;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=218;ReadPosRankSum=-0.515;SC=CGCCCAGATGCGCATTGGAAC;SOR=0.100;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=14;WE=170053513;WS=170053495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,15:0.28:53
chr2	170053580	rs2302696	C	T	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=83;ReadPosRankSum=0.676;SC=GAGCAAAACACAAGCATGTTC;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=6;WE=170053588;WS=170053570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr2	170055255	rs16823023	T	C	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.225;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=622;ReadPosRankSum=1.389;SC=ACAACATGCATCTCTGGAACG;SOR=0.374;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=117;TCF=93;TCR=24;TR=38;WE=170055263;WS=170055245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,40:0.33:121
chr2	170058497	rs16856600	G	A	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=341;ReadPosRankSum=-0.453;SC=GGCAAAAAACGCTGCAAAATG;SOR=0.638;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=17;WE=170058505;WS=170058487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr2	170059190	rs2239599	T	C	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.549;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=5;PP=749;ReadPosRankSum=-0.468;SC=CATTCACACATAGCAGGATTC;SOR=0.326;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=144;TCF=132;TCR=12;TR=45;WE=170059198;WS=170059180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,45:0.31:145
chr2	170129528	rs830994	G	A	1972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.592;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=36;PP=1445;ReadPosRankSum=0.523;SC=TGTGGCTGAGGACACAGACCT;SOR=0.869;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=106;TCF=51;TCR=55;TR=67;WE=170129536;WS=170129518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,72:0.65:110
chr2	170129636	rs830995	A	G	1103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.368;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=33;PP=868;ReadPosRankSum=0.195;SC=TATCCAAGACATGAAGCCACT;SOR=1.054;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=10;TCR=47;TR=40;WE=170129644;WS=170129626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,41:0.68:60
chr2	170134191	rs831003	G	C	1895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=0;PP=1539;SC=ATATTTCTCTGCAGCCATTTT;SOR=8.015;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=49;WE=170134199;WS=170134181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	170139346	rs831010	C	T	3889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=95;NR=15;PP=2965;SC=AGAATCTGTTCACTGTTCAGA;SOR=3.357;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=95;TCR=15;TR=110;WE=170139354;WS=170139336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr2	170139639	rs831011	A	G	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=749;SC=ACCCTCTGGAATTAGGCACAG;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=170139647;WS=170139629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	170149034	rs34980705	G	GAT	1049.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.36;QD=41.99;SOR=5.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	170163768	rs2247506	T	C	1623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.52;ReadPosRankSum=-1.302;SOR=0.695;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:208,86:0.29:294
chr2	170163816	rs34104660	G	T	5284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.188;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=118;PP=2962;ReadPosRankSum=0.126;SC=CAGCTCCATCGGGGCAGTCTC;SOR=0.846;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=282;TCF=114;TCR=168;TR=195;WE=170163824;WS=170163806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,196:0.69:285
chr2	170163970	rs16856802	T	G	1259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=41;PP=1066;ReadPosRankSum=1.456;SC=TAATCTATTGTCATTAACAAG;SOR=1.312;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=59;TCF=3;TCR=56;TR=43;WE=170163978;WS=170163960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,43:0.72:60
chr2	170175334	rs2229263	T	C	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.801;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=454;ReadPosRankSum=-1.121;SC=CACCCAGGAGTTGGGGATGCA;SOR=1.006;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=116;TCF=73;TCR=43;TR=32;WE=170175342;WS=170175324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,33:0.28:116
chr2	170177446	rs72880427	C	T	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.397;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=27;PP=636;ReadPosRankSum=-1.056;SC=GATATTTAACCGAAGAAATAT;SOR=1.591;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=51;TCF=8;TCR=43;TR=31;WE=170177454;WS=170177436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr2	170218816	rs1559013	T	C	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=6;PP=760;SC=CGAGAGGCTCTGGCTGGGCTC;SOR=2.517;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=31;WE=170218824;WS=170218806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	170218847	rs1559014	C	G	1292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=7;PP=999;SC=CACTGGCCGGCGCTAGGCAGG;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=170218855;WS=170218837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	170336024	rs1879466	G	C	4474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=46;PP=2965;SC=AGCTAGGCCTGCACGGCTGTG;SOR=1.785;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=94;TCR=46;TR=138;WE=170336032;WS=170336014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr2	170338681	rs12614103	A	G	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=0.405;SC=TTTTATGTACATATGTCTCTT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=170338689;WS=170338671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr2	170371060	rs143361344	ATCTC	A	726.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.096;NF=13;NR=2;PP=650;ReadPosRankSum=0.677;SC=AGGCTCCACAATCTCTCATAT;SOR=0.957;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=15;WE=170371071;WS=170371050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr2	170387132	.	G	GT	733.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.624;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=646;ReadPosRankSum=-0.060;SC=TCCAAATGTCGTTTTTTCATA;SOR=1.489;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=23;WE=170387140;WS=170387122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,30:0.67:45
chr2	170387483	rs74815242	G	C	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.566;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=405;ReadPosRankSum=-1.122;SC=CACTGTGAGGGGTACAAATAT;SOR=0.084;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=73;TCF=59;TCR=14;TR=26;WE=170387491;WS=170387473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,27:0.35:77
chr2	170394469	rs2290004	T	G	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.268;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;ReadPosRankSum=-0.875;SC=ATGTACTACCTAATAATTTAC;SOR=0.311;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=34;WE=170394477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,36:0.68:53
chr2	170396718	rs75958526	G	A	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=231;ReadPosRankSum=-0.739;SC=TTTTTTAAAGGTATAGCTGCC;SOR=0.590;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=58;TCF=18;TCR=40;TR=18;WE=170396726;WS=170396708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,19:0.32:59
chr2	170402707	rs2290009	T	C	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.576;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=466;ReadPosRankSum=-0.375;SC=ATAAAATTAATGTCTACCATT;SOR=0.269;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=23;WE=170402715;WS=170402697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,24:0.83:29
chr2	170411693	rs2683455	T	C	1805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.12;SOR=2.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	170411693	.	TAATTC	CAATTC,CAATTG	751	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=12,2;NR=32,9;PP=751,121;QD=17.8584366488;SC=GCAGAAAAGTTAATTCTTGAG;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=44,11;WE=170411706;WS=170411683;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:44
chr2	170411698	rs12618227	C	G	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.67;ReadPosRankSum=-0.013;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,13:0.28:46
chr2	170411776	rs114920384	T	C	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.890;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=413;ReadPosRankSum=0.991;SC=CTAAAAAGGATAGAGCATATA;SOR=0.407;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=21;WE=170411784;WS=170411766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr2	170413692	.	G	C	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.065;ClippingRankSum=0.000;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=2.127;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.46;ReadPosRankSum=0.740;SOR=0.525;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,50:0.24:206
chr2	170413896	.	G	GC	868.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=65.47;MQRankSum=4.721;QD=24.13;ReadPosRankSum=0.907;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr2	170413897	.	GA	CA	962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000,1.0000;HP=8;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=29;MQ=65.3;NF=0,0;NR=19,27;PP=457,962;QD=25.8826953972;SC=TAACAAATAGGAAAAAAAATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=19,27;WE=170413905;WS=170413887;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr2	170413897	.	GA	GAA	962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000,1.0000;HP=8;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=29;MQ=65.3;NF=0,0;NR=19,27;PP=457,962;QD=25.8826953972;SC=TAACAAATAGGAAAAAAAATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=19,27;WE=170413905;WS=170413887;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,27:0.75:36
chr2	170413897	rs56157235	G	A,GA	1269.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=65.33;QD=35.27;SOR=7.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,24,12:0.67,0.33:36
chr2	170413920	.	G	A	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.346;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.384;NF=0;NR=22;PP=524;ReadPosRankSum=-1.555;SC=AACAAAAACTGAATCCAATAT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=22;WE=170413928;WS=170413910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,24:0.73:33
chr2	170417031	rs35933910	T	C	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.221;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=187;ReadPosRankSum=-0.136;SC=AACTATTAAATTGTAGAAATT;SOR=0.458;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=32;TCR=21;TR=14;WE=170417039;WS=170417021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,14:0.25:55
chr2	170417298	.	G	A	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.331;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.824;NF=7;NR=24;PP=637;ReadPosRankSum=0.712;SC=ACAAGGAACTGAAAAAGAAAA;SOR=1.409;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=55;TCF=15;TCR=40;TR=31;WE=170417306;WS=170417288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr2	170425508	.	CA	C	93.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=-0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.58;MQRankSum=0.534;QD=6.70;ReadPosRankSum=-0.818;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr2	170425523	rs2683446	A	C	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.31;MQRankSum=-0.182;QD=29.46;ReadPosRankSum=-0.717;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr2	170465125	rs79028989	G	A	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.400;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=5;PP=751;ReadPosRankSum=1.537;SC=AAGTGAAGATGAAATTTTTTT;SOR=1.721;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=35;WE=170465133;WS=170465115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,35:0.69:51
chr2	170488454	rs3754921	A	G	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=30;PP=693;ReadPosRankSum=-1.714;SC=GTATGTGAATATGTATATTTT;SOR=0.619;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=132;TCF=34;TCR=98;TR=41;WE=170488462;WS=170488444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,42:0.31:137
chr2	170492567	rs2290007	A	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=155;ReadPosRankSum=0.944;SC=CTATACTTCTATACATTAATT;SOR=0.264;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=9;WE=170492575;WS=170492557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr2	170492584	rs2290008	T	C	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=1;PP=1066;SC=AATTTTTCCCTATTTTAATTT;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=38;WE=170492592;WS=170492574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	170493103	rs1050354	T	A	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.873;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=681;ReadPosRankSum=0.222;SC=CAGAAAAAGATGACAAGTATA;SOR=0.326;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=129;TCF=78;TCR=51;TR=41;WE=170493111;WS=170493093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,44:0.33:133
chr2	170505684	rs3213946	G	A	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.769;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=377;ReadPosRankSum=0.879;SC=ACATTCAGGAGTAATTACCAT;SOR=1.489;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=52;TCR=2;TR=19;WE=170505692;WS=170505674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,20:0.36:55
chr2	170510651	rs61741435	C	T	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=438;ReadPosRankSum=1.227;SC=GATGAATTTTCTCATCTTTTC;SOR=0.582;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=70;TCF=23;TCR=47;TR=24;WE=170510659;WS=170510641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,23:0.33:69
chr2	170531060	.	C	CA	126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=2.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.37;ReadPosRankSum=-1.099;SOR=0.216;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr2	170531572	rs11682248	T	C	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=200;ReadPosRankSum=2.193;SC=CAAACACAATTTTTTGTTTTC;SOR=0.984;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=10;WE=170531580;WS=170531562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr2	170531614	rs11688600	A	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=59;ReadPosRankSum=0.188;SC=ACAGTTTAACATAATAATATG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=5;WE=170531622;WS=170531604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr2	170550839	rs3820952	A	G	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.311;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=469;ReadPosRankSum=0.249;SC=GGTGTCCATGATGCTCCTAGA;SOR=0.293;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=64;TCF=9;TCR=55;TR=26;WE=170550847;WS=170550829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,24:0.38:63
chr2	170550956	rs1446901	A	C	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.97;ReadPosRankSum=-1.465;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr2	170558231	rs11685651	T	C	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=165;ReadPosRankSum=-0.294;SC=GAAAAGTGTATCACTTAAGAT;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=10;WE=170558239;WS=170558221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr2	170558293	.	AAAAAG	A	91	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=29;MQ=60.83;NF=0;NR=4;PP=91;QD=24.25;SC=CTTAAAAAAAAAAAAGAGAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=170558305;WS=170558283;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr2	170592709	rs2288331	A	G	2805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.384;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=82;PP=2239;ReadPosRankSum=0.776;SC=TAAAAGAGAAATGGATTCCTA;SOR=1.163;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=134;TCF=24;TCR=110;TR=98;WE=170592717;WS=170592699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,102:0.74:138
chr2	170605981	rs4667607	C	T	2608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=17;PP=1953;SC=ATCTAGTCGGCGGACAAACTA;SOR=2.330;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=62;TCR=17;TR=79;WE=170605989;WS=170605971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr2	170606423	rs200809967	T	TTA	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.41;ReadPosRankSum=0.531;SOR=0.287;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,4:0.13:31
chr2	170606438	rs10611184	TATAC	T	1217.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.367;NF=0;NR=27;PP=1412;ReadPosRankSum=-0.041;SC=TATATATATATATACACACAC;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=27;WE=170606458;WS=170606413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,31:0.84:37
chr2	170606442	rs61101061	C	T	44.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.442;NF=0;NR=9;PP=220;ReadPosRankSum=-0.806;SC=TATATATATACACACACACAT;SOR=0.210;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=9;WE=170606458;WS=170606413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,4:0.11:36
chr2	170606450	rs79825047	C	T	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.274;NF=1;NR=24;PP=1177;ReadPosRankSum=-1.151;SC=TACACACACACATATATGTGT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=25;WE=170606458;WS=170606413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,30:0.88:34
chr2	170606476	.	CAT	C	673	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=83;MMLQ=28;MQ=58.0;NF=0;NR=20;PP=673;QD=35.0;SC=TATATGTATACATATATATGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=20;WE=170606485;WS=170606466;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,20:0.91:22
chr2	170606478	.	T	TATATGTGTATATATACGCATGTATGTATAC	748.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQRankSum=-0.542;QD=41.60;ReadPosRankSum=0.659;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr2	170606496	rs144201291	C	CGCAT	334.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=94;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.728;NF=0;NR=15;PP=642;ReadPosRankSum=-0.461;SC=TGTATATATACGTATGTATAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=15;WE=170606504;WS=170606486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr2	170606553	.	A	AC	145	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5003;HP=1;HapScore=2;MGOF=105;MMLQ=23;MQ=54.54;NF=1;NR=4;PP=145;QD=33.6;SC=GTGTATATATAGTATGTATGT;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=170606561;WS=170606544;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:0,5:1.00:5
chr2	170606570	.	G	A	138	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=134;MMLQ=28;MQ=57.93;NF=4;NR=2;PP=138;QD=28.7952020912;SC=ATGTATACATGTATGTGTATA;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=170606578;WS=170606560;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	170606588	.	A	G	94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5001;HP=2;HapScore=2;MGOF=90;MMLQ=24;MQ=58.23;NF=5;NR=0;PP=94;QD=25.7542425094;SC=ATATATACGTATGTATGTATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=170606596;WS=170606578;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr2	170606618	.	A	G	78.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	170606658	rs1469355	G	A	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.796;HP=2;HapScore=3;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=13;NR=1;PP=598;ReadPosRankSum=-2.670;SC=GTATATATGTGTATATATATA;SOR=2.115;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=14;WE=170606668;WS=170606648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr2	170606660	rs199777191	A	G	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.796;HP=2;HapScore=3;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=148;ReadPosRankSum=2.688;SC=ATATATGTGTATATATATACA;SOR=0.129;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=6;WE=170606668;WS=170606648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr2	170606724	rs10164599	A	G	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=12;PP=696;SC=AAGGTAATATAGAATATTTGA;SOR=1.214;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=18;TCR=12;TR=30;WE=170606732;WS=170606714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	170632807	rs10930375	C	T	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=606;SC=ATCTTTAGGGCGAAGCACATG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=170632815;WS=170632797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	170632896	rs10930376	T	C	2295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=10;PP=1769;SC=TTCTACACCATGTGGTGATAA;SOR=3.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=60;TCR=10;TR=70;WE=170632904;WS=170632886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	170633103	rs11325477	GA	G	3071.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=59;PP=2970;SC=GTCTAAGAATGAATCACCTTA;SOR=2.698;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=74;TCF=12;TCR=62;TR=71;WE=170633111;WS=170633093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
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chr2	170668813	rs3731674	C	T	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=130;ReadPosRankSum=0.873;SC=TTCAGTGGGGCAATCTCAGCT;SOR=0.157;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=12;WE=170668821;WS=170668803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,13:0.28:46
chr2	170676227	rs1541776	T	C	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.780;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=116;ReadPosRankSum=-0.215;SC=GATTTAGAAATATTTTCTTCC;SOR=0.105;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=8;WE=170676235;WS=170676217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr2	170677837	rs59311986	AC	A	624.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.145;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=29;PP=1102;ReadPosRankSum=1.328;SC=CCAAGTAAAAACAAAACCAAA;SOR=0.144;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=31;WE=170677845;WS=170677827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,30:0.75:40
chr2	170678576	.	T	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.688;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=5.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=-1.825;QD=3.22;ReadPosRankSum=-3.555;SOR=2.068;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr2	170684224	rs2303555	C	T	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=291;ReadPosRankSum=0.513;SC=CCGCGGCTGCCGGCGGCGAGG;SOR=0.382;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=15;WE=170684232;WS=170684214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr2	170762487	rs10171268	C	T	3758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=103;NR=7;PP=2965;SC=TGATATTTAACATGAATGTGT;SOR=4.995;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=103;TCR=7;TR=110;WE=170762495;WS=170762477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr2	170762566	rs10194785	A	T	4723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.471;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=50;PP=2962;ReadPosRankSum=1.081;SC=AGCGAGAACTAAACGAGCATG;SOR=0.916;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=248;TCF=169;TCR=79;TR=167;WE=170762574;WS=170762556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,171:0.68:253
chr2	170782037	rs1461958	C	T	708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=0;PP=602;SC=ATACTATGATCACATCATTAA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=170782045;WS=170782027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	170782338	rs13016918	C	T	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=269;ReadPosRankSum=1.095;SC=GAGGTGACTGCGTGATGACAT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=14;WE=170782346;WS=170782328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr2	170784004	rs6723655	T	C	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=596;ReadPosRankSum=0.070;SC=TTTTGATTAATTTTTTTTCAA;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=23;WE=170784012;WS=170783994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr2	170784049	rs898851	G	A	506.81	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=448;ReadPosRankSum=1.854;SC=AAGAACACCAGTTGTGTGCTC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=17;WE=170784057;WS=170784039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr2	170785484	rs10165565	G	A	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=393;ReadPosRankSum=-0.887;SC=TCAAGCTTTGGTTTTCTTTTC;SOR=0.749;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=19;WE=170785492;WS=170785474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr2	170821010	rs10197085	A	G	1451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.964;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=33;PP=1045;ReadPosRankSum=1.675;SC=TCCTCTGAGGAAACTGGAGGG;SOR=1.204;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=98;TCF=42;TCR=56;TR=52;WE=170821018;WS=170821000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,55:0.54:102
chr2	170850738	rs1461959	T	C	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=0;PP=1319;SC=TGAAATAATTTGAGTTGCTTG;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=41;WE=170850746;WS=170850728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	170865588	rs10205516	G	T	191.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5436;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=121;ReadPosRankSum=-0.319;SC=TTTAGTGCCTGCTAGGATAAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=170865596;WS=170865578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr2	170870595	rs10497357	T	C	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.333;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=507;ReadPosRankSum=-0.814;SC=AGCTGGAACGTTATCGGTGTT;SOR=0.134;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=61;TCF=6;TCR=55;TR=26;WE=170870603;WS=170870585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
chr2	170871950	rs16857446	T	G	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=102;ReadPosRankSum=0.825;SC=AAGTGACATTTTGGTATATTT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=170871958;WS=170871940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr2	170871976	rs13028230	A	G	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=164;SC=TTTGTCTGTTATATATGATCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=170871984;WS=170871966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	170911950	rs6741614	T	C	1668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.840;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=4;PP=1318;ReadPosRankSum=0.516;SC=AAAGAAATAATGATTTTTTTT;SOR=2.271;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=79;TCF=70;TCR=9;TR=58;WE=170911958;WS=170911940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,60:0.72:83
chr2	170917648	rs10203212	A	G	1650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.682;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=18;PP=1268;ReadPosRankSum=-0.912;SC=TAAGTGAACTATTTAAAGGAA;SOR=0.320;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=92;TCF=67;TCR=25;TR=60;WE=170917656;WS=170917638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,61:0.64:95
chr2	170917983	rs35032863	CT	C	3163.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.263;NF=4;NR=114;PP=1816;ReadPosRankSum=1.564;SC=TAAGAGGGAGCTTTTTTTTTT;SOR=1.820;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=183;TCF=11;TCR=172;TR=118;WE=170917992;WS=170917971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,135:0.99:137
chr2	170929880	rs10202446	G	A	1487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-7.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=2;PP=1117;ReadPosRankSum=0.650;SC=GACCTTTTATGTAATAGGAAA;SOR=0.974;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=75;TCF=72;TCR=3;TR=49;WE=170929888;WS=170929870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,53:0.66:80
chr2	171055882	.	A	T	3123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.625;ClippingRankSum=0.000;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.931;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=84;PP=2488;ReadPosRankSum=-0.143;SC=GCTGCAGTGAAAATTCTGGAT;SOR=0.341;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=161;TCF=36;TCR=125;TR=111;WE=171055890;WS=171055872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,114:0.69:165
chr2	171055942	rs35521414	T	A	3369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=93;PP=2786;SC=TTTGGTGTTTTATGCACACTG;SOR=7.764;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=93;TCF=0;TCR=93;TR=93;WE=171055950;WS=171055932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr2	171056569	rs6756347	T	A	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=0;PP=823;SC=ATAGTACATATGTTTTACTAA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=28;WE=171056577;WS=171056562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	171070850	rs13423313	G	T	3058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=38;PP=2331;ReadPosRankSum=0.695;SC=TTCACATGTGGTCTCCTGCTC;SOR=0.435;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=58;TCR=38;TR=95;WE=171070858;WS=171070840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,102:0.99:103
chr2	171070912	rs13385825	T	C	3096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.345;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=52;PP=2177;ReadPosRankSum=-0.828;SC=GCTCAGTCACTGAGCTTGTCA;SOR=0.496;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=50;TCR=53;TR=101;WE=171070920;WS=171070902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,107:0.99:108
chr2	171071369	rs4667626	C	T	4301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=100;PP=2965;SC=GTTTTCTTGACGTGTGCAGTT;SOR=3.014;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=22;TCR=100;TR=122;WE=171071377;WS=171071359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr2	171073887	rs2161916	G	A	5214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=91;PP=2965;SC=TTGGCACCCCGTTCTGGATGG;SOR=0.948;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=162;TCF=71;TCR=91;TR=161;WE=171073895;WS=171073877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr2	171092445	rs1035625	A	G	451.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5349;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=343;ReadPosRankSum=0.834;SC=GGGCCTTTTTAGGACATCTGA;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=14;WE=171092453;WS=171092435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,15:0.88:17
chr2	171192084	rs12466203	G	A	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.137;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=25;PP=652;ReadPosRankSum=-0.145;SC=GTTATGACTCGGGGTTTGTTC;SOR=0.264;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=87;TCF=19;TCR=68;TR=35;WE=171192092;WS=171192074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,39:0.43:91
chr2	171225841	rs4668246	A	G	3381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=65;PP=2581;ReadPosRankSum=0.254;SC=ACAGCTGGCCAAGGTTCTCCA;SOR=0.707;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=242;TCF=132;TCR=110;TR=142;WE=171225849;WS=171225831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,141:0.57:246
chr2	171242761	rs17497636	G	A	3862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.249;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=80;PP=2939;ReadPosRankSum=-0.370;SC=TGATTGTTCAGCATTTGACTT;SOR=1.022;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=208;TCF=94;TCR=114;TR=141;WE=171242769;WS=171242751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,145:0.68:213
chr2	171256597	rs7561268	A	C	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=654;SC=AAGAGGGAGAATGGACTTTGG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=171256605;WS=171256590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	171256930	.	T	TA	182	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=17;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=59.15;NF=1;NR=8;PP=182;QD=20.5555555556;SC=TTTTTTTTTTTATCGAGATGG;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=9;WE=171256938;WS=171256920;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,9:0.39:23
chr2	171260708	rs10930425	C	A	1924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=6;PP=1348;SC=TCCTGGTGGTCCCAAGGCTAG;SOR=3.877;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=47;TCR=6;TR=53;WE=171260716;WS=171260698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	171260787	rs6736609	G	A	4331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=49;PP=2965;SC=CATTGATGCTGTACCCGTGGA;SOR=1.203;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=78;TCR=49;TR=127;WE=171260795;WS=171260777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr2	171260820	rs6751520	T	C	4501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=52;PP=2965;SC=CCGCCCGCTCTTGGACATGTT;SOR=1.059;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=126;TCF=73;TCR=53;TR=125;WE=171260828;WS=171260810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr2	171261021	rs6751781	T	G	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=27;PP=771;SC=TATATGGTGGTTTGTAAGAAT;SOR=5.486;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=28;WE=171261029;WS=171261011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	171264091	rs138990294	T	TGCTCTGGATATGAAA	1197.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=0.862;QD=26.62;ReadPosRankSum=-0.093;SOR=2.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr2	171300648	rs4667639	T	A	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=399;ReadPosRankSum=0.606;SC=AGTTCCCTTCTAGCAGCCCTC;SOR=0.719;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=78;TCF=18;TCR=60;TR=28;WE=171300656;WS=171300638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,26:0.35:75
chr2	171319997	rs12477518	A	C	2044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=35;PP=1411;SC=GCTTCCAAAAAGGACTGTCTA;SOR=0.811;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=68;TCF=33;TCR=35;TR=67;WE=171320005;WS=171319987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	171323280	rs67549561	CTGTGTCCTAAGAT	C	336.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.591;NF=1;NR=6;PP=1883;ReadPosRankSum=-0.882;SC=CTGGCCATCCCTGTGTCCTAA;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=7;WE=171323300;WS=171323270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr2	171323328	rs4359605	T	C	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.748;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.472;HP=2;HapScore=2;MGOF=105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=211;ReadPosRankSum=1.519;SC=AAACATGTAATTGGCTAGTTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=9;WE=171323336;WS=171323318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr2	171355198	rs6761297	A	G	6435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=98;PP=2965;SC=ATCACTGGGTACTGGGAAAAA;SOR=0.744;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=93;TCR=98;TR=191;WE=171355206;WS=171355188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr2	171355329	rs6733198	G	C	2083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=51;PP=1787;SC=AGACTCCAACGTAACAATGGT;SOR=5.318;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=4;TCR=51;TR=55;WE=171355337;WS=171355319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	171356274	rs10185178	G	A	2451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=41;PP=1779;SC=AGATACAAAAGGGTCAGAGAG;SOR=0.968;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=32;TCR=41;TR=73;WE=171356282;WS=171356264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr2	171358211	rs7593940	G	A	3012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=30;PP=2401;SC=CGGGCAATAGGCTGGAGGGGA;SOR=1.708;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=100;TCF=68;TCR=32;TR=98;WE=171358219;WS=171358201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr2	171358474	rs7608168	T	A	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=484;SC=TCAGGAGCACTGGAATGAGTC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=171358482;WS=171358464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	171508262	rs6724627	G	A	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=36;PP=727;ReadPosRankSum=0.203;SC=CAAAGTGGCCGTAAAGCTGTT;SOR=0.712;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=141;TCF=30;TCR=111;TR=45;WE=171508270;WS=171508252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,47:0.32:146
chr2	171508490	rs10718459	CA	C	813.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=5;PP=627;SC=GCCCTTTGATCAAAAAAAATT;SOR=3.056;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=27;WE=171508498;WS=171508480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	171509700	rs13382220	G	A	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=422;ReadPosRankSum=0.620;SC=CTGTCATTGCGTAAGAAAGCA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=92;TCF=1;TCR=91;TR=25;WE=171509708;WS=171509690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,24:0.26:94
chr2	171570488	rs7563812	C	G	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.293;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=799;ReadPosRankSum=-2.218;SC=GCGATCCCCGCGTCCGCAGTG;SOR=0.481;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=34;WE=171570496;WS=171570478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,34:0.72:47
chr2	171572180	.	G	A	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=855;ReadPosRankSum=-1.330;SC=CCGCCGATGGGTGCAGCTGGA;SOR=0.610;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=72;TCF=23;TCR=49;TR=41;WE=171572188;WS=171572170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,42:0.58:72
chr2	171572940	rs3749036	G	A	1940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.869;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=30;PP=1488;ReadPosRankSum=0.574;SC=CCCGTGGACCGCCGACATGCC;SOR=0.346;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=117;TCF=75;TCR=42;TR=75;WE=171572948;WS=171572930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,76:0.63:121
chr2	171627676	rs1861462	T	G	3026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=43;PP=2352;SC=TCGGATGGTCTGCTGAAGAGG;SOR=1.127;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=62;TCR=43;TR=105;WE=171627684;WS=171627666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr2	171632225	rs17694506	C	T	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=95;ReadPosRankSum=0.272;SC=AGACTTTAGTCCTCTGTGAGC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=171632233;WS=171632215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr2	171632385	rs10626619	C	CTT	2101.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=20;PP=2010;SC=AAAATAAAAACAATACGAAAT;SOR=0.735;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=41;TCF=19;TCR=22;TR=38;WE=171632393;WS=171632375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	171632401	rs13028382	C	T	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.747;HP=1;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=761;ReadPosRankSum=0.768;SC=GAAATAATGACGCTTTGCTTT;SOR=1.112;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=47;TCF=27;TCR=20;TR=33;WE=171632409;WS=171632391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,33:0.69:48
chr2	171634347	rs11334749	TA	T	1957.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.604;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=45;PP=1834;ReadPosRankSum=-0.161;SC=CAATTGTTACTATAGATAGAA;SOR=0.364;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=84;TCF=2;TCR=82;TR=47;WE=171634355;WS=171634337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,57:0.59:97
chr2	171649402	rs3764916	C	T	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.646;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=21;PP=805;ReadPosRankSum=1.136;SC=CCCGAGAGTACCAGCTGGCAA;SOR=0.332;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=65;TCF=28;TCR=37;TR=42;WE=171649410;WS=171649392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,43:0.66:65
chr2	171654663	rs2287111	A	C	1450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=35;PP=1112;SC=TCATAGAACTATAAGCAGTCA;SOR=4.615;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=38;WE=171654671;WS=171654653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	171678379	rs2241165	C	T	1836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=0;PP=1563;SC=GACACCGTTCCATATTTGAAG;SOR=7.978;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=52;TCR=0;TR=52;WE=171678387;WS=171678369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	171678625	rs769404	T	C	6123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=131;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.827;SC=GCGTGGCCCATGGATGCACCA;SOR=0.596;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=202;TCF=69;TCR=133;TR=200;WE=171678633;WS=171678615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,214:1.00:215
chr2	171705157	rs35403424	AT	A	432.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=2.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.56;ReadPosRankSum=1.185;SOR=0.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,30:0.32:95
chr2	171786169	rs2676158	A	G	152.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=1;PP=92;SC=CGACTCGGCCAGGGGGCGGCC;SOR=1.329;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=171786177;WS=171786159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	171786229	rs147298093	C	T	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=6.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.29;ReadPosRankSum=-0.543;SOR=0.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr2	171786239	rs3770442	C	T	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=2.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.869;HP=6;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=229;ReadPosRankSum=0.584;SC=CTCCACCCCCCCTCATTTTTA;SOR=2.165;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=4;WE=171786247;WS=171786219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr2	171793357	rs35123411	C	A	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.146;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=44;ReadPosRankSum=0.922;SC=TATCCTCACACCACTGCACTC;SOR=0.269;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=4;WE=171793365;WS=171793347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr2	171818289	rs2557804	G	A	9694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=231;PP=2965;SC=AGATGTGGCTGATAATAACAG;SOR=2.930;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=285;TCF=54;TCR=231;TR=285;WE=171818297;WS=171818279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,295:1.00:295
chr2	171822466	rs4668356	C	T	7533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=112;NR=121;PP=2965;SC=ACGCACCCTCCGACCCTGCCA;SOR=0.762;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=234;TCF=112;TCR=122;TR=233;WE=171822474;WS=171822456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr2	171850201	rs200288621	G	A	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.11;ReadPosRankSum=1.718;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr2	171850207	rs371236744	G	A	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.88;ReadPosRankSum=-0.241;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr2	171851048	rs11397597	C	CA	245.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.82;ReadPosRankSum=0.413;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
chr2	171906469	rs3217296	GA	G	1126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=3.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.542;SOR=1.079;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,40:0.27:148
chr2	171910313	rs11553951	C	T	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=238;ReadPosRankSum=0.468;SC=TTTCCAGGTCCTGGATTTTAT;SOR=0.610;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=13;WE=171910321;WS=171910303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,14:0.30:46
chr2	171913207	.	CAA	C	34	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=14;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=34;QD=13.3333333333;SC=GGGTCCAGAACAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=171913216;WS=171913197;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr2	171916664	rs2676130	A	T	2208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=57;PP=1676;SC=AATCAGACAAATCTGTAGATG;SOR=5.074;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=59;TCF=2;TCR=57;TR=59;WE=171916672;WS=171916654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	171974424	.	TACAC	T	57	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=57;QD=40.5;SC=ACTTTATACTTACACACACAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=2;WE=171974435;WS=171974414;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,2:0.25:8
chr2	172016756	rs113416007	G	A	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=87;ReadPosRankSum=0.512;SC=TCCGCGGCGCGGGAGAGGAGG;SOR=0.105;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=6;WE=172016764;WS=172016746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr2	172180771	rs10205459	A	G	656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=7;PP=475;SC=ATCCACACTCAGTGCATTTTC;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=23;WE=172180779;WS=172180761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	172188368	rs13023973	C	T	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=30;PP=890;SC=GAAAGGACTCCGGAGAGTTCC;SOR=4.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=32;WE=172188376;WS=172188358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	172193808	rs3731987	T	C	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=1;PP=458;SC=AAAGTAGACATTGAGATTAAG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=172193816;WS=172193798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	172216969	rs3731986	T	C	1880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=38;PP=1475;SC=CTGAGTTTTCTTTTACTTTTT;SOR=1.571;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=58;WE=172216977;WS=172216959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
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chr2	172378657	rs884409	T	G	2784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=15;PP=2179;SC=ACTGCCCTACTCAACCTCCCC;SOR=3.375;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=76;TCR=15;TR=91;WE=172378665;WS=172378647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr2	172378818	rs868106	A	G	3604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=96;PP=2939;SC=CCACCAGGCAATGAGCGCCCT;SOR=3.671;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=16;TCR=97;TR=112;WE=172378826;WS=172378808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr2	172378889	rs2356782	C	G	1478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=43;PP=1256;SC=CTCCCCACCCCCAAGAGGCCC;SOR=4.758;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=45;WE=172378897;WS=172378879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	172379686	rs960750	G	A	1938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=9;PP=1567;ReadPosRankSum=-0.862;SC=GAGCCTGCGCGATCGGGGGCG;SOR=2.115;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=53;TCR=9;TR=61;WE=172379694;WS=172379676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr2	172379781	rs960749	G	A	6192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.224;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=71;PP=2965;ReadPosRankSum=0.876;SC=AAAGATTGCCGGAGCGAGAAT;SOR=1.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=121;TCR=73;TR=192;WE=172379789;WS=172379771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,200:1.00:201
chr2	172379936	rs960748	G	A	2185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=61;PP=1848;ReadPosRankSum=-0.800;SC=AGTGTGTTTCGCCGCCCTGCC;SOR=2.010;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=11;TCR=62;TR=72;WE=172379944;WS=172379926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
chr2	172398311	rs7586144	T	C	1242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=33;PP=1060;SC=CAGGTCAGTATTTCAGTGTAT;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=35;WE=172398319;WS=172398301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	172409790	rs143524630	TA	T	2158.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=1;PP=2405;SC=TATTGCTTTTTAAATAATTTA;SOR=6.994;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=65;TCF=64;TCR=1;TR=61;WE=172409798;WS=172409780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	172411273	rs10455	G	A	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=22;PP=779;SC=GAGTTAAACAGTGAAGTAGCA;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=172411281;WS=172411263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	172549248	rs6433311	A	G	287.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=238;SC=AATTTTTCATACTATATGTAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=172549256;WS=172549238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	172569134	rs5836347	AT	A	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=1.905;QD=1.65;ReadPosRankSum=0.393;SOR=0.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,8:0.23:35
chr2	172582281	rs139032813	A	ATTAC	2279.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=30;PP=2321;SC=GATTCCTTTTATTATGTATTA;SOR=0.941;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=46;WE=172582289;WS=172582271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	172582344	rs139881666	AAC	A	1918.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=28;PP=1711;SC=GAAAAATAATAACATACATTG;SOR=1.508;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=38;WE=172582353;WS=172582334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	172644229	rs2292813	T	C	4213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=63;PP=2965;SC=GTGGTAAAGATAGCCACTGAG;SOR=0.724;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=63;TCR=63;TR=126;WE=172644237;WS=172644219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr2	172709215	rs3770444	G	C	996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=15;PP=880;SC=AAATAAACTCGAAGTTAATTA;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=14;TCR=15;TR=29;WE=172709223;WS=172709205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	172712480	rs2056202	T	C	5277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=132;PP=2965;SC=ATATAAAACGTCATTGGCTGG;SOR=4.119;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=16;TCR=133;TR=148;WE=172712488;WS=172712470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr2	172725301	rs1878583	A	G	4853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=100;PP=2965;SC=CTGGGGTCATATAACGCTCTC;SOR=1.506;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=50;TCR=100;TR=150;WE=172725309;WS=172725291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr2	172822963	rs370978033	C	T	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FS=8.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.98;ReadPosRankSum=-0.568;SOR=1.192;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:256,83:0.24:339
chr2	172864845	rs6730085	C	A	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.796;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=158;ReadPosRankSum=0.420;SC=GGGCGGCGAGCGAGTGCTCGC;SOR=2.115;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=9;WE=172864853;WS=172864835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr2	172865009	rs62183782	T	A	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.200;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=22;PP=962;ReadPosRankSum=-1.275;SC=GCGCTCAGACTTCTCGGCGCA;SOR=0.568;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=67;TCF=33;TCR=34;TR=46;WE=172865017;WS=172864999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,48:0.70:69
chr2	172944018	rs71415273	T	A	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=1.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.875;SOR=0.917;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,20:0.22:92
chr2	172944748	rs58045367	G	A	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=325;ReadPosRankSum=1.516;SC=TGTGGGGGAAGCACTTGAGGG;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=15;WE=172944756;WS=172944738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr2	172966250	rs2228184	T	C	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.989;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=18;PP=1023;ReadPosRankSum=-0.443;SC=AGGCCAAGTATTGAGTCTTTT;SOR=1.367;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=85;TCF=49;TCR=36;TR=51;WE=172966258;WS=172966240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,52:0.59:88
chr2	173332115	rs2272499	G	A	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=4.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.191;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=468;ReadPosRankSum=-0.338;SC=ACTCAGAGTCGAGGCCATTTG;SOR=0.948;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=76;TCF=63;TCR=13;TR=25;WE=173332123;WS=173332105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,27:0.35:78
chr2	173334161	rs147116420	T	TATGATTTAGTACC	242.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.11;ReadPosRankSum=0.501;SOR=0.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr2	173335873	.	C	G	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.645;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=244;ReadPosRankSum=-0.649;SC=CCCACCTTCTCAGATACCTTG;SOR=1.341;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=12;WE=173335881;WS=173335863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr2	173344474	rs1920979	A	G	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=31;PP=982;ReadPosRankSum=-0.143;SC=TATGGTGAGCATCCCTCTGTC;SOR=0.843;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=68;TCF=24;TCR=44;TR=46;WE=173344482;WS=173344464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,51:0.71:72
chr2	173353060	rs1319059	G	A	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=34;PP=820;ReadPosRankSum=-0.565;SC=AATAAGCATTGTAAGTAAATC;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=34;WE=173353068;WS=173353050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,35:0.71:49
chr2	173427053	rs10176813	T	G	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.524;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=412;ReadPosRankSum=-0.274;SC=TTCTTAAACCTATTATTAGGT;SOR=1.270;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=20;WE=173427061;WS=173427043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr2	173427583	rs146518851	A	G	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=3.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.87;ReadPosRankSum=-1.271;SOR=1.532;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,10:0.20:49
chr2	173428874	rs6433368	C	T	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.636;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=36;PP=921;ReadPosRankSum=-0.033;SC=TGCTTTGTCTCCTCCTATGCA;SOR=2.716;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=66;TCF=17;TCR=49;TR=43;WE=173428882;WS=173428864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,43:0.61:70
chr2	173435374	rs13417334	A	G	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=0;PP=1049;ReadPosRankSum=0.146;SC=TAAAACTTCAAATAGTGCATA;SOR=0.768;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=55;TCR=1;TR=39;WE=173435382;WS=173435364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,43:0.69:62
chr2	173460640	rs12693005	T	C	2794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.914;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=64;PP=2071;ReadPosRankSum=-0.142;SC=ACGAGGCTGATGACTGGTGCG;SOR=1.026;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=160;TCF=73;TCR=87;TR=111;WE=173460648;WS=173460630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,115:0.68:168
chr2	173600603	rs76443145	C	A	160.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5341;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=123;ReadPosRankSum=0.792;SC=GGTCGCCAGGCGTCCGGGAGG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=173600611;WS=173600593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr2	173600783	rs34574292	C	CG	858.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=17;PP=803;SC=AAAGGTAGCTCGCCGGGGGCC;SOR=1.802;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=18;WE=173600791;WS=173600773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	173609173	rs13005651	T	A	4383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.042;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=86;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.963;SC=AATGCAAACGTTGCGTGGTCA;SOR=0.467;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=228;TCF=97;TCR=131;TR=155;WE=173609181;WS=173609163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,160:0.68:234
chr2	173659913	rs7585729	T	C	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=21;PP=459;SC=ATGCAACTCTTGTAGTATATT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=173659921;WS=173659903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	173782917	rs62174627	G	A	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=-0.412;QD=2.13;ReadPosRankSum=-0.708;SOR=0.057;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,8:0.18:44
chr2	173793096	rs3835838	GA	G	490.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=395;ReadPosRankSum=0.134;SC=GCATTTTTAGGAATGACGTGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=12;WE=173793104;WS=173793086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr2	173848200	rs59582070	C	CT	322.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=2.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.04;ReadPosRankSum=-0.605;SOR=1.032;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,29:0.27:106
chr2	173861340	rs2290374	G	A	3045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=60;PP=2322;ReadPosRankSum=-1.826;SC=TTGTTTAAAAGTCCTGAATTC;SOR=0.704;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=84;TCR=87;TR=118;WE=173861348;WS=173861330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,119:0.68:175
chr2	173861450	rs2290375	A	T	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=1.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.15;ReadPosRankSum=-0.035;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,39:0.59:66
chr2	173861456	rs5010643	G	C	2323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.25;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	173865976	rs3214814	G	GT	1069.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=1.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=1.667;QD=4.84;ReadPosRankSum=-0.339;SOR=0.521;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:162,59:0.27:221
chr2	173866203	rs2028934	C	T	2736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=74;PP=2300;SC=CCTCATCACACTGAAATGTGT;SOR=7.378;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=75;TCF=1;TCR=74;TR=75;WE=173866211;WS=173866193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr2	174052199	.	C	G	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=235;ReadPosRankSum=-1.075;SC=AGTTTCTGCTCTTGAGTTCTT;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=10;WE=174052207;WS=174052189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr2	174052453	.	A	G	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.696;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=393;ReadPosRankSum=-1.738;SC=GTAACCTACTATTGGACTCAC;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=17;WE=174052461;WS=174052443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr2	174068513	rs11899707	G	C	5445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=106;NR=51;PP=2965;SC=GTTTCCCTCTGTCTATTGTAG;SOR=1.623;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=106;TCR=51;TR=157;WE=174068521;WS=174068503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr2	174086285	rs74417392	C	T	1484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=44;PP=1235;SC=AATAAAATCACAAATGTTTGG;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=44;WE=174086293;WS=174086275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	174123399	rs820008	A	G	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.023;NF=8;NR=1;PP=136;ReadPosRankSum=-0.436;SC=CACTTTCTCAAATTCTGTAAT;SOR=0.275;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=9;WE=174123407;WS=174123389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr2	174128513	rs3769148	C	T	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.015;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=17;PP=1006;ReadPosRankSum=0.647;SC=CATGTCCATTCGATTCAGTGG;SOR=0.344;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=123;TCF=89;TCR=34;TR=51;WE=174128521;WS=174128503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,53:0.40:131
chr2	174131525	rs111588144	A	G	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.133;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.139;HP=16;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=11;PP=208;ReadPosRankSum=-0.729;SC=AAAAAAAAAAAAAAGAAATGT;SOR=3.967;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=11;WE=174131533;WS=174131501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr2	174223675	rs11675433	C	T	883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=779;SC=TCTATACAGCCGTTATGAAAA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=174223683;WS=174223665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	174228418	rs4972555	C	T	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=1;PP=847;SC=ATCAGAAACTCTGAATGTGTC;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=174228426;WS=174228408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	174228744	rs1529887	T	C	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=27;PP=780;SC=GAAGGGGACCTAGAGGAAACC;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=174228752;WS=174228734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	174230153	rs2288993	C	G	3424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=31;PP=2792;SC=TTTTGAAGTTCTGTGTTTTGT;SOR=1.915;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=75;TCR=31;TR=106;WE=174230161;WS=174230143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr2	174230983	rs35959156	G	GT	1116.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.63;SOR=7.378;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	174940280	rs72920507	A	G	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.344;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=164;ReadPosRankSum=0.277;SC=TATAGAGGAAATGGGTTATTA;SOR=1.453;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=52;TCF=29;TCR=23;TR=14;WE=174940288;WS=174940270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,15:0.26:58
chr2	174946760	rs11558990	T	C	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.729;NF=27;NR=10;PP=780;ReadPosRankSum=-0.835;SC=ACCTGGGTCATACTTGTCCAC;SOR=0.869;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=42;TCR=16;TR=37;WE=174946768;WS=174946750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,40:0.63:63
chr2	175199869	rs56000618	G	T	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.713;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=18;PP=847;ReadPosRankSum=0.942;SC=CAACGCATTTGCTTGTTTTAA;SOR=0.776;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=111;TCF=63;TCR=48;TR=44;WE=175199877;WS=175199859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,44:0.38:116
chr2	175200014	rs34372833	G	A	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.269;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=385;ReadPosRankSum=1.636;SC=TTGGAACCCAGAAAGATGCCT;SOR=0.105;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=18;WE=175200022;WS=175200004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr2	175200903	rs35548534	G	C	1678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FS=2.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.83;ReadPosRankSum=0.224;SOR=0.558;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:206,82:0.28:288
chr2	175201299	rs62174227	C	G	3675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.256;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=77;PP=2716;ReadPosRankSum=2.194;SC=ACAAGTCGGGCTTCCATTCGA;SOR=0.841;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=189;TCF=81;TCR=108;TR=134;WE=175201307;WS=175201289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,138:0.71:194
chr2	175223296	rs4972650	T	A	250.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=5;PP=152;SC=ATGACTTATATGTAATTACTT;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=175223304;WS=175223286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	175244756	rs2358666	T	C	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=1;PP=397;SC=CAGCCTGATTTCTGTCTTTTA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=175244764;WS=175244746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	175245627	rs138237113	TATC	T	241.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=283;ReadPosRankSum=-1.030;SC=TACACTATGATATCATGTTAT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=175245637;WS=175245617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr2	175263063	rs10497410	G	A	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=212;ReadPosRankSum=-0.362;SC=AGCAACAGTCGATAACAGGAT;SOR=0.752;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=16;WE=175263071;WS=175263053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,16:0.31:52
chr2	175263218	rs10930660	A	G	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=412;ReadPosRankSum=-1.036;SC=TAAAAATATCATAAAGTTATT;SOR=0.324;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=19;WE=175263226;WS=175263208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr2	175306804	rs7574442	C	G	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.624;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=338;ReadPosRankSum=0.622;SC=ATGGCTTTGTCATCACATTTA;SOR=1.385;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=15;WE=175306812;WS=175306794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr2	175311194	.	T	A	662	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=23;NR=1;PP=662;QD=29.0321338561;SC=ACACCTGCAATTATTTAGCTC;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=175311202;WS=175311193;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	175318396	rs12614979	G	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=22;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.843;NF=5;NR=1;PP=69;ReadPosRankSum=0.633;SC=TCAAAAAAAAGAAAAAAAAAA;SOR=0.050;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=6;WE=175318404;WS=175318386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,4:0.16:25
chr2	175318411	rs201863632	G	A	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQRankSum=-4.675;QD=2.21;ReadPosRankSum=-3.153;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,4:0.14:28
chr2	175318590	rs12468711	G	T	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.067;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=276;ReadPosRankSum=-0.749;SC=CAAATAGTATGTGAGAGTAGA;SOR=2.584;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=12;WE=175318598;WS=175318580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr2	175326258	rs72910819	G	T	1866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-8.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.285;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=36;PP=1363;ReadPosRankSum=-0.714;SC=AAAAAGAAAGGATGAATAGTA;SOR=0.449;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=270;TCF=163;TCR=107;TR=82;WE=175326266;WS=175326248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,88:0.31:280
chr2	175335076	rs2358637	G	T	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=6;PP=377;SC=AATTTTTTTCGACTAAACACA;SOR=1.329;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=14;WE=175335084;WS=175335066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	175431707	rs2163236	C	G	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=189;ReadPosRankSum=-0.161;SC=CTACCCCACTCCAGGCAAGAA;SOR=0.596;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=51;TCF=46;TCR=5;TR=13;WE=175431715;WS=175431697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,13:0.25:52
chr2	175431990	rs143689509	AAGAG	A	1021.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=1170;ReadPosRankSum=0.616;SC=CACAGAATGAAAGAGAGAGAG;SOR=0.776;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=23;WE=175432001;WS=175431980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,26:0.70:37
chr2	175436940	rs4972450	G	A	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.185;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=21;PP=997;ReadPosRankSum=0.199;SC=CCGGTTGTGCGGACTTGATTG;SOR=0.945;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=144;TCF=82;TCR=62;TR=52;WE=175436948;WS=175436930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,54:0.36:148
chr2	175439512	rs1367218	T	C	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.706;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=12;PP=719;ReadPosRankSum=-0.089;SC=TTCCACAAGATGTGCTCCATC;SOR=0.291;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=157;TCF=125;TCR=32;TR=46;WE=175439520;WS=175439502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,54:0.33:166
chr2	175439536	rs12624277	G	A	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.271;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=19;PP=962;ReadPosRankSum=1.233;SC=TTTGAAAAGCGGCTCACAAGT;SOR=0.374;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=185;TCF=131;TCR=54;TR=56;WE=175439544;WS=175439526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,59:0.31:191
chr2	175439681	rs3049897	T	TA	270.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=8.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=2.385;QD=2.31;ReadPosRankSum=0.019;SOR=0.156;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,27:0.23:117
chr2	175613059	rs3816448	A	C	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=8;PP=338;SC=CTTTGCATCAACTATGGGCCC;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=13;WE=175613067;WS=175613049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	175613600	rs2646159	T	C	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=611;SC=GAGGCAAGCATAAAACTCTGT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=175613608;WS=175613590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	175614908	.	CAAA	C,CA	1463.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.340;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.03;MQRankSum=-0.314;QD=30.49;ReadPosRankSum=1.749;SOR=2.024;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,14,33:0.29,0.69:48
chr2	175622178	rs11327107	TG	T	355.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=361;SC=GCCACCATCCTGGGTGATTTA;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=175622186;WS=175622168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	175622788	rs2646164	G	A	2011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=46;PP=1549;SC=TAGTGTGAACGTTTTTCTCAA;SOR=1.828;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=20;TCR=46;TR=66;WE=175622796;WS=175622778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	175622907	rs2600687	T	C	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=10;PP=234;SC=GAGGCTGAGGTGGGTGGATCA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=175622915;WS=175622897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	175666306	rs4327209	A	G	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.969;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=178;ReadPosRankSum=0.221;SC=CAATTTCACAAAAGACAATAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=175666314;WS=175666296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr2	175666656	rs2646153	G	A	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=168;ReadPosRankSum=-0.168;SC=ATGCTTTCTCGTAATTCCTTG;SOR=0.289;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=10;WE=175666664;WS=175666646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr2	175677022	rs12613075	C	T	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=628;ReadPosRankSum=-0.144;SC=GCAACCCGCACTGCAAATGGC;SOR=0.864;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=28;WE=175677030;WS=175677012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,31:0.77:40
chr2	175742880	rs143010951	T	A	2527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=68;PP=1954;ReadPosRankSum=0.639;SC=ATGGGAAAGATGTTTTTAAGA;SOR=0.740;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=23;TCR=99;TR=84;WE=175742888;WS=175742870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,89:0.71:126
chr2	175809522	rs137922226	T	A	1590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=3;PP=1272;ReadPosRankSum=-0.559;SC=GTTAAGTGGTTAATCTCACAA;SOR=1.007;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=95;TCF=89;TCR=6;TR=58;WE=175809530;WS=175809512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,59:0.62:95
chr2	175939604	rs2302663	G	A	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=26;PP=624;ReadPosRankSum=1.261;SC=TCCTAAAATCGGTAAGAATGC;SOR=0.547;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=82;TCF=7;TCR=75;TR=28;WE=175939612;WS=175939594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,31:0.36:86
chr2	175945338	rs12693057	G	A	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=5.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.647;SOR=0.164;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,22:0.22:100
chr2	175945502	rs3217146	GA	G	829.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.832;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=4.023;NF=9;NR=23;PP=891;ReadPosRankSum=-1.111;SC=CTCTGGAGAAGAAACAACTTA;SOR=0.290;SbPval=0.06;Source=Platypus;TC=114;TCF=17;TCR=97;TR=32;WE=175945510;WS=175945492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,36:0.28:129
chr2	175991852	.	A	G	160	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=7;NR=1;PP=160;QD=24.3464015684;SC=CTGTGGTCCCAGCTACTCTGG;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=175991860;WS=175991851;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	175991969	.	GA	G	42.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=-0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=0.524;QD=2.85;ReadPosRankSum=0.346;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr2	176043218	.	G	A	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=39;PP=1006;ReadPosRankSum=-0.832;SC=CTAGTGTGGGGATTTTTGTAA;SOR=0.832;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=40;WE=176043226;WS=176043208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,41:0.71:58
chr2	176044008	rs12615406	G	T	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=254;ReadPosRankSum=0.141;SC=GGTAAAGGTCGTATCAGTAAC;SOR=0.440;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=68;TCF=9;TCR=59;TR=19;WE=176044016;WS=176043998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,19:0.30:64
chr2	176804220	rs148648399	T	TAC	1111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.708;NF=26;NR=0;PP=1149;ReadPosRankSum=-0.228;SC=ATCTAGTGTGTACACACACAC;SOR=1.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=49;TCR=5;TR=26;WE=176804228;WS=176804210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,34:0.69:49
chr2	176844508	rs77165351	A	T	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=2.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.10;ReadPosRankSum=2.363;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,22:0.79:28
chr2	176844644	rs12373766	C	T	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.953;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=611;ReadPosRankSum=0.411;SC=TTAGAAAAAGCGAATTAGAAG;SOR=1.460;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=25;WE=176844652;WS=176844634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,29:0.67:43
chr2	176866967	rs935492	C	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=-1.609;SC=GCCTCCAGAGCAGGCAGCAGC;SOR=1.162;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=6;WE=176866975;WS=176866957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr2	176947268	rs72919090	G	C	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=33;ReadPosRankSum=1.356;SC=GCCCCGTCAGGAAGGAGAGTC;SOR=0.138;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=4;WE=176947276;WS=176947258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr2	176957822	rs2518053	G	A	3192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=72;PP=2805;SC=CGGCGGCGGCGGCGGCAGCCT;SOR=1.993;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=28;TCR=72;TR=100;WE=176957830;WS=176957812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr2	176964904	rs847151	G	A	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.702;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=583;ReadPosRankSum=-2.489;SC=AGTCTAGCCTGGCTCCTGCAG;SOR=0.771;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=132;TCF=58;TCR=74;TR=36;WE=176964912;WS=176964894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,38:0.27:142
chr2	176965086	rs35817516	G	A	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.648;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=587;ReadPosRankSum=0.619;SC=TCTTGCCTGCGACCTTCACTG;SOR=0.530;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=101;TCF=54;TCR=47;TR=37;WE=176965094;WS=176965076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,38:0.38:101
chr2	176965369	.	C	G	2266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.257;ClippingRankSum=0.000;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.465;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=44;PP=1729;ReadPosRankSum=-0.803;SC=CAGGCAGAAACGCAAGGAATT;SOR=0.813;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=292;TCF=154;TCR=138;TR=99;WE=176965377;WS=176965359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,102:0.34:296
chr2	176983598	rs143151088	CAAAACCAAAACA	C	936.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=66.07;QD=40.73;SOR=6.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	176987456	rs144600979	C	A	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=2.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.16;ReadPosRankSum=1.046;SOR=1.308;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,22:0.28:80
chr2	176988290	rs56007470	C	CGCA	2852.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.779;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.185;NF=17;NR=36;PP=2321;ReadPosRankSum=0.701;SC=CATTCGCAGCCGCAGCAGCAG;SOR=0.976;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=104;TCF=29;TCR=75;TR=53;WE=176988298;WS=176988280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,69:0.69:100
chr2	176996023	rs4972804	C	T	2548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.14;QD=33.98;SOR=5.339;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	177014970	rs1867863	G	T	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=500;ReadPosRankSum=0.111;SC=GTCGAACGGTGGTGGCTCAGA;SOR=1.532;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=21;WE=177014978;WS=177014960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr2	177016728	rs34727427	T	C	1593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.559;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=28;PP=1257;ReadPosRankSum=0.458;SC=GCAGCCGCCCTCCGGGACGGC;SOR=0.633;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=200;TCF=123;TCR=77;TR=69;WE=177016736;WS=177016718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,68:0.34:201
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chr2	177036754	rs1051929	T	C	8709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=144;NR=117;PP=2965;SC=CAGCGCCAACTTGCAGGGCAG;SOR=0.847;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=261;TCF=144;TCR=117;TR=261;WE=177036762;WS=177036744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr2	177054411	rs13390932	T	C	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=8.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.50;ReadPosRankSum=-0.893;SOR=1.241;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,56:0.27:211
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chr2	177465595	rs17343601	T	C	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=0.091;SC=TCATTCAGTGTTTGCAATAGC;SOR=0.082;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=6;WE=177465603;WS=177465585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
chr2	178085137	rs9068	G	A	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=18;PP=1008;SC=GAGCAAATTAGTGGGTACCTT;SOR=1.251;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=27;TCR=18;TR=45;WE=178085153;WS=178085127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	178098087	rs139080704	CA	C	1629.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.593;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=3.485;NF=10;NR=45;PP=1639;ReadPosRankSum=-0.030;SC=GGGAATGACACAAAGGAAAAC;SOR=1.124;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=195;TCF=45;TCR=150;TR=55;WE=178098095;WS=178098077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,66:0.30:223
chr2	178301428	rs3754989	C	T	285.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=236;SC=GTCATTCTCTCTAACTGAAGT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=178301436;WS=178301418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	178326838	rs1979059	C	G	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.20;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	178326847	rs1979058	G	A	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.47;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	178358072	rs1348849	C	T	910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=24;PP=776;SC=TAGACAATTACATAAATGAGT;SOR=3.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=178358080;WS=178358062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	178362572	rs12468046	G	A	410.10	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=368;ReadPosRankSum=1.830;SC=TGCACCTATTGTAAGGGTGTT;SOR=0.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=14;WE=178362580;WS=178362562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr2	178378452	rs2364854	T	A	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=449;SC=TAAGAAAATGTCAGACTTGAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=178378460;WS=178378442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	178417142	rs11694988	C	T	5635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.139;NF=18;NR=151;PP=2965;ReadPosRankSum=0.605;SC=AGCTTGCAGGCGGAGGACCCG;SOR=2.846;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=18;TCR=151;TR=169;WE=178417150;WS=178417132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,170:0.99:171
chr2	178417225	rs11695035	C	T	3673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=55;PP=2965;SC=AGGCCTTGTACAGGGCCTGGG;SOR=0.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=58;TCR=55;TR=113;WE=178417233;WS=178417222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr2	178481818	rs10497497	G	T	5806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=126;NR=119;PP=2965;SC=TACATTTTCCGATTTGGGTCA;SOR=1.440;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=246;TCF=127;TCR=119;TR=245;WE=178481826;WS=178481808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr2	178482094	rs28630685	C	T	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.58;QD=32.99;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	178494173	rs3830637	G	GGGA	1602.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.338;NF=22;NR=7;PP=1156;ReadPosRankSum=1.495;SC=ACACTGGCAGGGGAGGATGAG;SOR=1.455;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=29;WE=178494181;WS=178494163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr2	178528703	rs13025391	C	T	4832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=106;PP=2965;SC=GGAAGAACCTCGCTTTATTAC;SOR=2.120;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=40;TCR=107;TR=146;WE=178528711;WS=178528693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr2	178528789	rs13025904	G	A	2076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=53;PP=1601;SC=TGAACCCTTCGCAAATCACAA;SOR=4.014;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=6;TCR=53;TR=59;WE=178528797;WS=178528779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	178534110	rs2222711	G	T	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=0;PP=814;SC=TTTCAGGAGTGCTTCCTTAAA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=178534118;WS=178534100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	178534324	rs6433687	A	G	3429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=91;PP=2839;SC=TTAATCTGTGATTATGTGTAG;SOR=3.675;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=14;TCR=91;TR=105;WE=178534332;WS=178534314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	178540293	rs3770016	A	G	2903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=38;PP=2314;SC=CTTTTGTTGCATTCCTAAACA;SOR=1.247;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=62;TCR=38;TR=100;WE=178540301;WS=178540283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr2	178545713	rs4538242	C	T	1439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=26;PP=1063;SC=ATAAACACATCTATGGGAAAA;SOR=1.464;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=41;WE=178545721;WS=178545703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	178561947	rs2886424	G	C	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=492;ReadPosRankSum=0.556;SC=AAGTTTAGCTGGTTTACACAT;SOR=0.260;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=64;TCR=2;TR=24;WE=178561955;WS=178561937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,24:0.35:68
chr2	178565815	rs10201180	T	C	1551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=13;PP=1118;SC=TTTTGGTTTCTGTTAAGGGGA;SOR=1.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=47;WE=178565823;WS=178565805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
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chr2	178681534	rs6433698	C	T	4483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.124;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=59;PP=2962;ReadPosRankSum=0.298;SC=GCATACAAACCTGACATAAAC;SOR=1.189;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=234;TCF=140;TCR=94;TR=162;WE=178681542;WS=178681524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,167:0.69:241
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chr2	178682471	rs3821009	C	T	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.919;NF=10;NR=1;PP=213;ReadPosRankSum=-1.699;SC=TAATTTTGCCCTCCATTTAAG;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=11;WE=178682479;WS=178682461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr2	178682558	rs3841879	A	ATATAAAC	2263.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.832;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.791;NF=28;NR=4;PP=2429;ReadPosRankSum=0.636;SC=TGATGACTCCACTTGGTTTAT;SOR=1.211;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=65;TCF=53;TCR=12;TR=32;WE=178682566;WS=178682548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,48:0.63:76
chr2	178682603	rs6720891	T	C	2387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.702;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=25;PP=1939;ReadPosRankSum=-0.797;SC=GTCGTTGATCTGCATCATCAA;SOR=1.042;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=125;TCF=88;TCR=37;TR=87;WE=178682611;WS=178682593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,87:0.67:130
chr2	178682655	rs3821010	A	G	2871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=49;PP=2189;ReadPosRankSum=0.691;SC=AGCCACTCCTATGGGGAAAGA;SOR=0.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=72;TCR=72;TR=98;WE=178682663;WS=178682645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,104:0.68:154
chr2	178684799	rs7581861	T	C	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=28;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TAGGAGCCTGTGCTTATGAAA;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=3;WE=178684807;WS=178684789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr2	178684820	rs41440047	G	A	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=159;ReadPosRankSum=-0.089;SC=TTATACGAGAGTGTGAGACAT;SOR=1.609;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=8;WE=178684828;WS=178684810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr2	178684897	rs58355920	A	T	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.879;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=452;ReadPosRankSum=-1.531;SC=TTTTAAAGCAAACTTCTGTTT;SOR=2.655;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=21;WE=178684905;WS=178684887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr2	178685129	rs13386870	C	T	58.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.70;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr2	178704882	rs3770054	A	G	1230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.163;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=9;PP=1012;ReadPosRankSum=0.186;SC=GAAGGATGCAAAAGAATTGCT;SOR=0.985;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=55;TCR=13;TR=46;WE=178704890;WS=178704872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,45:0.64:70
chr2	178740398	rs111953090	C	G	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=5.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.34;ReadPosRankSum=-0.120;SOR=2.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr2	178769992	rs2695096	T	C	1860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=48;PP=1470;SC=TGCACACTTCTTCTATATGCC;SOR=6.556;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=49;WE=178770000;WS=178769982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	178936373	rs1435573	T	G	4670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.832;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=57;PP=2965;ReadPosRankSum=1.712;SC=GCAGCAGAGGTGTTCCTGCAT;SOR=0.835;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=80;TCR=58;TR=137;WE=178936381;WS=178936363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,144:0.99:145
chr2	178936614	rs6433711	C	T	7611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=127;NR=111;PP=2965;SC=AGGGGGATACCGAGGCAGATT;SOR=0.789;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=238;TCF=127;TCR=111;TR=238;WE=178936622;WS=178936604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr2	178969245	.	T	C	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.990;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.49;ReadPosRankSum=1.581;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,35:0.56:63
chr2	178986130	rs200040728	TACACAC	T	353.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQRankSum=0.483;QD=9.83;ReadPosRankSum=1.012;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr2	178986132	.	C	T	189	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=28;MQ=57.87;NF=0;NR=12;PP=189;QD=18.6476010456;SC=TGTATATATACACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=12;WE=178986140;WS=178986113;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr2	178986138	rs201783668	C	T	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQRankSum=0.722;QD=12.09;ReadPosRankSum=0.681;SOR=0.434;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr2	178990941	rs56809827	CAT	C	872.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=1.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.52;ReadPosRankSum=0.694;SOR=0.944;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,28:0.24:116
chr2	179188959	rs35032920	G	A	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=31;PP=942;ReadPosRankSum=-0.381;SC=TCTGTAAGTCGGCAATTGCTA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=11;TCR=49;TR=38;WE=179188967;WS=179188949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,38:0.62:61
chr2	179193118	rs78499676	T	C	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.564;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=44;PP=1114;ReadPosRankSum=1.360;SC=AACATTTTTATCATATTCAGG;SOR=2.494;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=76;TCF=7;TCR=69;TR=46;WE=179193126;WS=179193108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,46:0.60:77
chr2	179193203	rs1368903	T	C	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=203;ReadPosRankSum=-2.049;SC=TGGCAGTATGTGTAAAACTAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=12;WE=179193211;WS=179193193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr2	179201048	rs16866263	G	T	1755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.933;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=22;PP=1270;ReadPosRankSum=-1.588;SC=ACAGCTTTCCGTGGCAGTCCC;SOR=1.054;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=89;TCF=55;TCR=34;TR=60;WE=179201056;WS=179201038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,64:0.67:95
chr2	179203797	rs1434087	G	A	6990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=143;PP=2965;SC=GAACTCAGTCGGCACCTAACT;SOR=1.577;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=213;TCF=70;TCR=143;TR=212;WE=179203805;WS=179203787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr2	179208974	rs12464380	G	C	3092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.560;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=61;PP=2494;ReadPosRankSum=2.295;SC=TTCCTCCCCCGTCCTGTGTTT;SOR=0.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=182;TCF=85;TCR=97;TR=115;WE=179208982;WS=179208964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,115:0.62:184
chr2	179213872	rs964165	C	T	2082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.013;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=1;PP=1700;ReadPosRankSum=0.451;SC=TTTTGAAGAACGGGAGAGGTC;SOR=1.935;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=98;TCR=1;TR=72;WE=179213880;WS=179213862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,73:0.71:103
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chr2	179238841	rs10190530	A	G	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=-2.227;SC=CTTTTTGGTGATTACTTTCAT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=179238849;WS=179238831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr2	179258923	rs919177	C	T	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.18;ReadPosRankSum=0.724;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
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chr2	179260653	rs34253857	A	G	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=444;ReadPosRankSum=0.410;SC=ACAACAACATAGAAACCACAC;SOR=1.287;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=19;WE=179260661;WS=179260643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr2	179363807	rs3214536	A	AT	201.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.849;NF=9;NR=1;PP=158;ReadPosRankSum=-0.429;SC=GAAAGATTAAATTTTTTTTTG;SOR=0.527;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=10;WE=179363815;WS=179363797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr2	179441932	rs55980498	G	A	2829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.082;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=48;PP=2273;ReadPosRankSum=-0.161;SC=ACAGGACCTGGGGGACCAGGT;SOR=0.527;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=153;TCF=83;TCR=70;TR=100;WE=179441940;WS=179441922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,103:0.65:159
chr2	179443674	.	C	T	1475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.005;ClippingRankSum=0.000;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=48;PP=1019;ReadPosRankSum=-0.099;SC=ACAGCTGAGGCGCACGTCACC;SOR=0.696;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=218;TCF=55;TCR=163;TR=63;WE=179443682;WS=179443664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,69:0.30:230
chr2	179444768	rs4145333	C	G	7388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=160;PP=2965;SC=TCCAAATTAGCTACTCTGAAG;SOR=1.771;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=230;TCF=70;TCR=160;TR=230;WE=179444776;WS=179444758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr2	179446381	rs72646869	C	T	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=1.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.36;ReadPosRankSum=0.013;SOR=0.510;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,34:0.24:141
chr2	179566146	rs2251987	T	G	2222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=21;PP=1888;SC=ACATGGAAGGTTTTGTTCTGA;SOR=1.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=48;TCR=21;TR=69;WE=179566154;WS=179566136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	179582853	rs72648982	T	C	4359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=79;PP=2962;ReadPosRankSum=2.705;SC=CAAGAAATTCTAATTTCTGGA;SOR=0.683;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=203;TCF=90;TCR=113;TR=143;WE=179582861;WS=179582843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,149:0.70:213
chr2	179584914	rs201420077	C	G	4070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.344;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=79;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.377;SC=TGGAAGCCCTCCACTATGGCC;SOR=0.881;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=222;TCF=98;TCR=124;TR=137;WE=179584922;WS=179584904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,145:0.63:230
chr2	179585266	rs2562831	C	T	3460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=71;PP=2883;SC=TGTTTCTAACCTGCTTTCGAT;SOR=1.565;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=33;TCR=71;TR=104;WE=179585274;WS=179585256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr2	179591708	rs114742263	C	T	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=2;PP=708;ReadPosRankSum=-0.422;SC=GAAAAATATTCTATGATCTCA;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=28;WE=179591716;WS=179591698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,31:0.76:41
chr2	179600563	rs2742348	G	A	8433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.178;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=131;NR=122;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.788;SC=CAAACTTGTTGGAAGCCTTAC;SOR=0.358;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=253;TCF=131;TCR=122;TR=253;WE=179600571;WS=179600553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,263:1.00:264
chr2	179612383	rs72648907	C	T	1768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=49;PP=1314;ReadPosRankSum=-1.130;SC=AGGAACCTCACGCTTTCCAGC;SOR=0.547;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=206;TCF=63;TCR=143;TR=73;WE=179612391;WS=179612373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,77:0.36:215
chr2	179614952	rs10803917	A	G	3281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=68;PP=2638;SC=ACCAATGCTAACTCTTCTTCC;SOR=1.887;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=27;TCR=68;TR=95;WE=179614960;WS=179614942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr2	179615887	rs922984	T	C	2134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=23;PP=1646;SC=GATTTTCATGTCCTCTCTAGA;SOR=1.162;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=38;TCR=23;TR=61;WE=179615895;WS=179615877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	179615931	rs922985	C	G	3122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=33;PP=2482;SC=CTTCACTTCTCAAAGTTCTTG;SOR=1.396;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=56;TCR=33;TR=88;WE=179615939;WS=179615921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr2	179615994	rs922986	T	C	3793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=48;PP=2686;SC=TCTCCATTAATGTTTTTCTAG;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=69;TCR=48;TR=117;WE=179616002;WS=179615984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr2	179616770	rs58651353	GA	G	705.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=0.612;QD=13.57;ReadPosRankSum=1.230;SOR=1.140;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,41:0.79:52
chr2	179618019	rs3754953	T	A	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=287;SC=AACAGAAAACTACATTCCCCA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=179618027;WS=179618009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	179620951	rs7585334	C	T	3052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=18;PP=2446;SC=CAATTAACCACCTTCTACACT;SOR=2.906;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=76;TCR=18;TR=94;WE=179620959;WS=179620941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr2	179621477	rs6433728	C	T	3543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=84;PP=2916;SC=TGGGACTTGGCGGACTCTCTT;SOR=2.345;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=27;TCR=84;TR=111;WE=179621485;WS=179621467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr2	179623758	rs2291310	C	T	5383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=99;NR=69;PP=2965;SC=TACAGCATTACTAGCAACAAA;SOR=1.185;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=99;TCR=69;TR=168;WE=179623766;WS=179623748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr2	179623939	rs6705594	T	C	2882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=81;PP=2223;SC=ACCACAAAAATGAGTGGATTT;SOR=3.171;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=16;TCR=81;TR=97;WE=179623947;WS=179623929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr2	179629363	rs4894043	T	C	1767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=22;PP=1468;SC=AAAGCGTGTATTCTTGCCCAT;SOR=1.302;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=34;TCR=22;TR=56;WE=179629371;WS=179629353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	179629461	rs2291311	C	T	1907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=39;PP=1537;SC=CCGGATATCACGGCACAGAAG;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=23;TCR=39;TR=62;WE=179629469;WS=179629451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	179632710	rs2291313	T	C	8367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=141;NR=113;PP=2965;ReadPosRankSum=2.208;SC=AACTGGGAATTACTGGAATGT;SOR=0.916;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=256;TCF=142;TCR=114;TR=254;WE=179632718;WS=179632700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,256:0.99:258
chr2	179633298	rs4471922	G	T	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=388;SC=CCCATCGTATGGCTATCCCAC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=179633306;WS=179633288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	179634376	rs72125115	GTA	G	908.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=3;PP=961;SC=ATATATATGTGTATATATATA;SOR=3.611;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=22;WE=179634385;WS=179634366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	179635882	rs4894047	C	T	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=279;SC=TCTTTTAAAACGATAACGATC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=179635890;WS=179635872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	179639297	rs3816781	C	T	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=410;SC=TTATCTCCCCCATACTATCAG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=179639305;WS=179639287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	179642425	rs719201	G	A	4191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=35;PP=2965;SC=AACTTATCACGCTTACCATCA;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=92;TCR=35;TR=127;WE=179642433;WS=179642415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr2	179643886	rs2291302	A	G	2979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=52;PP=2504;SC=AATTTACATCAAATAGTTATA;SOR=1.006;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=40;TCR=52;TR=92;WE=179643894;WS=179643876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr2	179643934	rs2291301	A	G	3536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=45;PP=2906;SC=GCAAGGAGCTATGATAAATGT;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=58;TCR=45;TR=103;WE=179643942;WS=179643924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	179644035	rs1552280	G	A	3528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=60;PP=2813;SC=CTTGATTCTTGAATCAAATCC;SOR=0.862;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=49;TCR=60;TR=109;WE=179644043;WS=179644025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr2	179644855	rs10497520	T	C	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=21;PP=1128;SC=TCTCCAACTTTAGGTTCTTGA;SOR=0.874;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=23;TCR=21;TR=44;WE=179644863;WS=179644845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	179650408	rs35813871	G	A	2462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=13;PP=1913;SC=AGGGCTAGCTGTGCGGGGGCG;SOR=3.014;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=62;TCR=13;TR=75;WE=179650416;WS=179650398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	179698844	rs78585114	G	A	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=439;ReadPosRankSum=-1.151;SC=GAAGATAAACGGCGGCACTTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=20;WE=179698852;WS=179698834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr2	179702268	rs1032283	A	G	5302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=88;NR=70;PP=2965;SC=ATGGTGCAAGAGGGGACTCAG;SOR=0.934;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=88;TCR=70;TR=158;WE=179702276;WS=179702258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr2	179702356	.	G	A	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.000;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.897;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=25;PP=801;ReadPosRankSum=-0.367;SC=CATGTCTTCAGGCAGGAGCAG;SOR=0.622;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=177;TCF=83;TCR=94;TR=50;WE=179702364;WS=179702346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,52:0.28:186
chr2	179702577	rs3045731	A	AGG	854.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=763;SC=ACAACCTACAAGGTTAAAATT;SOR=4.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=16;WE=179702585;WS=179702567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	179702610	rs2078403	C	T	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.472;HP=2;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=67;ReadPosRankSum=0.573;SC=GCAAGAATTACGGATGAGAAA;SOR=0.061;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=5;WE=179702618;WS=179702600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr2	179710550	rs17453403	C	G	2592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.146;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=60;PP=1992;ReadPosRankSum=1.297;SC=TGGAAGAAAACATAGACCACT;SOR=0.981;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=141;TCF=50;TCR=91;TR=90;WE=179710558;WS=179710540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,94:0.63:149
chr2	179719966	rs1872203	A	T	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=320;ReadPosRankSum=-0.913;SC=AAGGAGCATGATACATGAATA;SOR=0.233;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=57;TCR=0;TR=18;WE=179719974;WS=179719956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,20:0.33:60
chr2	179721032	rs12464157	C	T	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=363;ReadPosRankSum=0.785;SC=GATATTTAAGCGCCTTCAGAT;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=19;WE=179721040;WS=179721022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr2	179732980	rs10165177	A	G	1125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=27;PP=944;SC=TATGAAGACAAATTTTTTTTT;SOR=2.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=179732988;WS=179732970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	179733011	rs76209803	A	T	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=321;ReadPosRankSum=1.677;SC=TCTATAGCACATTTTGCTAGC;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=13;WE=179733019;WS=179733001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr2	179737144	rs12693170	C	A	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=1;NR=9;PP=269;SC=CAACCAAAGCCGAAGATGGTT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=179737152;WS=179737134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	179753245	rs7573293	C	T	927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=5;PP=688;SC=TTTTAGTTTACGAAACTACCT;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=179753253;WS=179753235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	179753549	rs1873164	G	A	290.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=8;PP=210;SC=GGCATAGCAGGAAGCAAAAAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=179753557;WS=179753539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	179770175	rs34883828	C	A	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=3.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.77;ReadPosRankSum=-0.146;SOR=1.150;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,27:0.25:108
chr2	179783470	rs72961212	C	T	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=1.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.10;ReadPosRankSum=1.455;SOR=0.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,29:0.22:130
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chr2	179839833	rs10930846	A	G	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=578;ReadPosRankSum=1.089;SC=AGGACTCAGCACTCTCAAACT;SOR=0.718;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=58;TCF=27;TCR=31;TR=31;WE=179839841;WS=179839823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr2	179980070	rs2044479	G	A	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=222;ReadPosRankSum=-0.183;SC=TGTCGTTACAGTTAAGTGACA;SOR=0.590;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=12;WE=179980078;WS=179980060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,12:0.29:41
chr2	179988395	rs5836671	T	TA	510.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.36;MQRankSum=-0.147;QD=20.43;ReadPosRankSum=0.100;SOR=2.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,23:0.92:25
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chr2	180047746	rs1446673	G	C	1223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-5.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.314;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=6;PP=864;ReadPosRankSum=-0.575;SC=ACAATAGAAAGAATCATTAGT;SOR=0.051;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=58;TCF=52;TCR=6;TR=40;WE=180047754;WS=180047736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,46:0.72:64
chr2	180047908	rs6757681	T	C	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.132;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=34;PP=938;ReadPosRankSum=-0.671;SC=TCCGTCTGTCTTTTCCTCCTA;SOR=0.502;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=71;TCF=14;TCR=57;TR=43;WE=180047916;WS=180047898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,46:0.61:75
chr2	180308335	rs10171283	C	G	287.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=239;SC=GTCAAGAAATCATTATTTTCA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=180308343;WS=180308325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	180310560	rs139227051	C	T	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=339;ReadPosRankSum=0.338;SC=ATTCCCAATGCTTTTTTAAAA;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=17;WE=180310568;WS=180310550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr2	180387784	rs72954339	G	A	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.684;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=337;ReadPosRankSum=-0.560;SC=GGCAGCAAAAGTTAACACTTG;SOR=0.382;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=18;WE=180387792;WS=180387774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr2	180409496	rs80000888	C	A	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.785;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=1;PP=863;ReadPosRankSum=-2.250;SC=TGACTATTCACAAATGTAATG;SOR=1.791;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=52;TCF=50;TCR=2;TR=36;WE=180409504;WS=180409486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,38:0.69:55
chr2	180448523	rs11695089	A	G	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=2;PP=527;ReadPosRankSum=-1.343;SC=TCTTCCTACTATCCCCATGAT;SOR=0.642;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=89;TCF=82;TCR=7;TR=29;WE=180448531;WS=180448513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,29:0.32:92
chr2	180634235	rs148987445	C	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=208;ReadPosRankSum=-0.646;SC=CCTACCTGTGCTGCTGTTGCT;SOR=1.402;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=12;WE=180634243;WS=180634225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr2	180725481	rs259816	T	C	1205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=11;PP=1024;SC=CGGCTAAACATAGCGGGGCAC;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=43;WE=180725489;WS=180725471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	180810264	rs6433818	A	T	5662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.447;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=71;PP=2962;ReadPosRankSum=0.281;SC=AATTTGAACCACTTGAATTTT;SOR=0.649;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=293;TCF=186;TCR=107;TR=195;WE=180810272;WS=180810254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,208:0.66:314
chr2	180810358	rs71425650	C	T	4629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.999;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=110;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.286;SC=TTTTTGTTTCCTATCATTTGT;SOR=1.142;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=239;TCF=76;TCR=163;TR=154;WE=180810366;WS=180810348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,165:0.65:252
chr2	180835589	rs4894140	A	G	2823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=30;PP=2281;SC=TATAGCTAAAAGTTAACAGAA;SOR=1.248;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=48;TCR=30;TR=78;WE=180835597;WS=180835579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr2	180835792	rs3768837	T	A	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.328;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=40;PP=1134;ReadPosRankSum=-1.500;SC=CTAAGCATAATACTTCGTGTG;SOR=1.450;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=67;TCF=9;TCR=58;TR=46;WE=180835800;WS=180835782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,48:0.71:68
chr2	180835822	rs3768838	A	T	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.322;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=33;PP=901;ReadPosRankSum=-1.293;SC=AAATACATATACAAGGAAGAA;SOR=2.200;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=35;WE=180835830;WS=180835812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,35:0.73:48
chr2	180837722	rs6433820	T	C	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.968;NF=5;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=1.742;SC=GGCGACAGAGTGAGACTCCAT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=180837730;WS=180837712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr2	180837806	rs6433821	T	A	1751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=10;PP=1469;ReadPosRankSum=0.325;SC=CATCCAACATTTTTATCCCAA;SOR=0.572;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=98;TCF=84;TCR=14;TR=67;WE=180837814;WS=180837796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,67:0.67:100
chr2	180843126	rs2367990	C	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=145;ReadPosRankSum=1.834;SC=CTACATAGTGCTCCTTAATTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=180843134;WS=180843116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr2	180846743	rs3738943	G	T	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=521;ReadPosRankSum=-1.042;SC=TAAATTTTTTGAAGAGCAGAA;SOR=1.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=20;WE=180846751;WS=180846733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr2	181848601	.	A	G	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.531;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=85;ReadPosRankSum=0.216;SC=GTTTCTGTTAAGGGATTTGGG;SOR=0.105;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=7;WE=181848609;WS=181848591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
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chr2	181854692	rs61080739	C	T	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.167;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=399;ReadPosRankSum=-0.182;SC=TCTTCCCTATCAATATGAGAT;SOR=3.352;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=18;WE=181854700;WS=181854682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr2	181927343	rs1401135	G	T	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=141;ReadPosRankSum=0.114;SC=TTTCCTAACTGGAATATTAAA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=181927351;WS=181927333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr2	181927360	rs1401134	A	G	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=54;ReadPosRankSum=-1.000;SC=TAAAATATACATATGATCATG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=181927368;WS=181927350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr2	182344846	rs11412304	G	GT	712.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.80;QD=26.40;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	182350447	rs155102	A	G	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=771;ReadPosRankSum=-0.831;SC=CTCAATAAATATTTATTGAAT;SOR=5.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=27;WE=182350455;WS=182350442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr2	182350743	rs155103	A	G	5322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=129;PP=2965;SC=TCAAATTGGTACTTGATTTCT;SOR=3.625;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=152;TCF=22;TCR=130;TR=151;WE=182350751;WS=182350733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr2	182359613	rs165419	G	A	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=429;SC=AGTGAAGTACGTAAAACTGGT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=182359621;WS=182359603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	182374534	rs1143674	A	G	3101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=77;PP=2472;SC=TGAAAAAAACAGTAGGAATAT;SOR=3.588;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=12;TCR=77;TR=89;WE=182374542;WS=182374524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr2	182376546	rs1466109	T	G	1970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=42;PP=1533;SC=ATCGAGAGGGTGTAATGAGTG;SOR=1.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=19;TCR=42;TR=61;WE=182376554;WS=182376536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	182387133	rs7602504	A	G	1419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=41;PP=1132;SC=TTAAAAGTAAATGGTAGAATT;SOR=5.376;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=43;WE=182387141;WS=182387123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	182395345	rs1143676	G	A	7822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=126;NR=113;PP=2965;SC=GGCATAGTCCGGTTCTTGTCC;SOR=0.785;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=240;TCF=126;TCR=114;TR=239;WE=182395353;WS=182395335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr2	182399097	rs7562325	T	C	1865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=35;PP=1378;SC=ATGTTGCGCATGTAAGATTAC;SOR=0.925;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=63;WE=182399105;WS=182399087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	182399497	rs11418738	A	ATT	671.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=13;NR=4;PP=232;SC=TTTTAAACTGATTTTTTTTTT;SOR=2.737;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=17;WE=182399505;WS=182399487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	182399638	rs2124443	A	G	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=27;PP=867;SC=TTGTACTTCTATTGATCTCAT;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=32;WE=182399646;WS=182399628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	182402790	rs6747500	G	A	49.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=71;SC=CCCCATCCACGGAAAAATTGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=182402798;WS=182402780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	182403792	rs57234957	A	AT	5718.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=104;NR=19;PP=2936;SC=ACTGGTTGACAATAAGCGGTG;SOR=3.580;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=129;TCF=110;TCR=19;TR=123;WE=182403800;WS=182403782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr2	182403851	rs10180793	G	A	8067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=150;NR=100;PP=2965;SC=CTTCCATTAAGTCACCATCTA;SOR=1.215;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=250;TCF=150;TCR=100;TR=250;WE=182403859;WS=182403841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr2	182412289	.	G	GA	603.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=464;ReadPosRankSum=-0.147;SC=GGATACCCTGGAAAAAAAATG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=55;TCR=0;TR=25;WE=182412297;WS=182412279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr2	182412633	rs139036113	G	GACACACACACACAC	4060.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.426;NF=4;NR=38;PP=2193;ReadPosRankSum=0.764;SC=CAGACACACAGACACACACAA;SOR=1.392;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=8;TCR=78;TR=42;WE=182412641;WS=182412623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,92:0.99:93
chr2	182412723	rs34890422	C	CGT	1295.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=24;PP=1153;SC=TAAGTAAAAACGTACAATTTT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=24;WE=182412731;WS=182412713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	182413259	rs12997453	A	G	1396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=9;PP=1195;SC=TATTACATTGAGTTTTTACCT;SOR=2.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=42;WE=182413267;WS=182413249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	182413602	rs13003064	A	T	3296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.383;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=66;PP=2646;ReadPosRankSum=-0.727;SC=ATTACATTAAATATTAATCAG;SOR=1.218;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=40;TCR=66;TR=105;WE=182413610;WS=182413592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,106:0.99:107
chr2	182430120	rs7604902	C	A	2345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.438;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=5;PP=1858;ReadPosRankSum=0.671;SC=AATTGGTTCACCTAATTTTAA;SOR=1.544;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=130;TCF=117;TCR=13;TR=79;WE=182430128;WS=182430110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,83:0.61:135
chr2	182430299	rs184376027	T	C	1165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.094;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=41;PP=922;ReadPosRankSum=-0.288;SC=TTATTTCTTATTGTTTCTGGA;SOR=0.430;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=148;TCF=16;TCR=132;TR=47;WE=182430307;WS=182430289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,47:0.32:146
chr2	182438716	rs10427195	A	G	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=441;ReadPosRankSum=1.574;SC=ATGCATTTAAATAGTATTTGC;SOR=1.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=19;WE=182438724;WS=182438706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,19:0.79:24
chr2	182468818	rs6433923	A	T	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.630;HP=8;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=338;ReadPosRankSum=1.014;SC=TGAAAAAAAAATAAATTTTCC;SOR=0.110;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=16;WE=182468826;WS=182468808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr2	182468855	rs6433924	A	G	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.093;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=107;ReadPosRankSum=-0.998;SC=TTTCATAGAGAGGAACAACAG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=182468863;WS=182468845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
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chr2	182543455	rs1801262	T	C	3144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=75;PP=2648;SC=GCGTTCATGGTTTCGAGGTCG;SOR=2.646;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=20;TCR=75;TR=95;WE=182543463;WS=182543445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
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chr2	182792965	rs34728960	G	A	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=1037;ReadPosRankSum=0.277;SC=CAAGTAAAGCGTCTAATTCTA;SOR=0.786;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=34;TCR=47;TR=49;WE=182792973;WS=182792955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,54:0.61:89
chr2	182794534	rs1051085	G	A	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=54;ReadPosRankSum=-1.099;SC=TTGTATGTCAGTATTTTTCAT;SOR=0.138;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=4;WE=182794542;WS=182794524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr2	182928555	rs1196161	G	C	3549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=50;PP=2603;SC=GTCATGAGTGGTGAATCATGG;SOR=0.872;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=46;TCR=50;TR=96;WE=182928563;WS=182928545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr2	182981846	rs1882211	G	C	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=383;ReadPosRankSum=0.445;SC=TGAAAACTTTGCACTCTTTTC;SOR=1.519;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=16;WE=182981854;WS=182981836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr2	183066377	rs111979949	C	CA	2148.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=9.036;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.65;MQRankSum=-0.604;QD=30.70;ReadPosRankSum=-0.798;SOR=5.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,67:0.96:70
chr2	183066391	rs200353420	C	A	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=15.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQRankSum=-0.695;QD=6.44;ReadPosRankSum=-0.473;SOR=2.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,30:0.31:97
chr2	183066394	.	C	A	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.342;ClippingRankSum=0.000;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=17.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQRankSum=-0.914;QD=5.98;ReadPosRankSum=-0.455;SOR=2.738;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,29:0.28:103
chr2	183088584	rs3754929	G	A	2092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=11;PP=1649;SC=TACTTTTTCAGACTTACCTTG;SOR=2.904;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=51;TCR=11;TR=62;WE=183088592;WS=183088574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	183106758	rs2568667	T	G	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=720;SC=TCAGATACAGTGTAGGTAGAA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=183106766;WS=183106748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	183584755	rs6729801	G	A	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=2;PP=909;ReadPosRankSum=0.164;SC=TGCACATGGCGATTTTTTAAA;SOR=1.022;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=37;WE=183584763;WS=183584745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,41:0.82:50
chr2	183593451	rs3832045	AT	A	424.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.204;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.399;NF=10;NR=12;PP=294;ReadPosRankSum=-0.756;SC=ATATGTTAGAATTTTTTTTTC;SOR=0.738;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=22;TCR=27;TR=22;WE=183593459;WS=183593441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr2	183593697	rs288280	C	T	3295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.798;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=69;PP=2580;ReadPosRankSum=0.629;SC=GCTATCCCAGCCTCTTCATTT;SOR=0.304;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=164;TCF=58;TCR=106;TR=113;WE=183593705;WS=183593687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,119:0.69:173
chr2	183597063	rs288282	T	G	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=-0.721;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.888;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,29:0.63:46
chr2	183597318	rs825660	A	G	2275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=77;PP=1845;ReadPosRankSum=0.005;SC=AAAGAAACACATTTAGAAATT;SOR=0.878;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=131;TCF=9;TCR=122;TR=82;WE=183597326;WS=183597308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,83:0.62:133
chr2	183616592	rs3098359	C	T	4199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=90;PP=2965;SC=CTAGATAACTCTGAATCATTA;SOR=2.741;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=21;TCR=90;TR=111;WE=183616600;WS=183616582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr2	183616748	rs3115425	G	C	2775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.325;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=34;PP=1957;ReadPosRankSum=-1.393;SC=ATGATGGGGGGGTTTTTTGTG;SOR=0.568;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=168;TCF=116;TCR=52;TR=104;WE=183616756;WS=183616738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,111:0.63:176
chr2	183622319	rs141152570	AATAAT	A	261.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.111;NF=7;NR=0;PP=274;ReadPosRankSum=-0.125;SC=GTCACTGATAAATAATATAAT;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=7;WE=183622331;WS=183622309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr2	183622547	rs288334	T	G	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.041;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=570;ReadPosRankSum=1.017;SC=AAGCTTATCATTATCAGTAAG;SOR=1.670;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=26;WE=183622555;WS=183622537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr2	183627504	rs192618	A	G	2705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=59;PP=2093;ReadPosRankSum=0.333;SC=CAACTGTTAAATTTTATTTCT;SOR=0.643;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=150;TCF=56;TCR=94;TR=96;WE=183627512;WS=183627491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,101:0.64:159
chr2	183627619	rs190830	C	G	863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=661;ReadPosRankSum=-0.678;SC=TCTGTTTTCTCATCCTTGTCA;SOR=1.414;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=26;WE=183627627;WS=183627609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr2	183699584	rs7775	G	C	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=11.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.78;ReadPosRankSum=-0.145;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,33:0.24:135
chr2	183699768	rs73977799	G	A	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=79;ReadPosRankSum=2.179;SC=TAACAACTGGGTCAGACTGCA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=6;WE=183699776;WS=183699758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr2	183703336	rs288326	G	A	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.734;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=360;ReadPosRankSum=0.487;SC=ACTTTAGCCCGAATGACTGGG;SOR=0.241;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=17;WE=183703344;WS=183703326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr2	183793383	rs9333279	T	C	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=636;ReadPosRankSum=-0.808;SC=AACTGCAGTTTAGGAAAAGGG;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=25;WE=183793391;WS=183793373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,25:0.78:32
chr2	183793398	rs9333280	A	G	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=0;PP=706;ReadPosRankSum=0.572;SC=AAAGGGAAACAGACTACCCCA;SOR=2.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=35;WE=183793406;WS=183793388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,37:0.80:46
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chr2	183799570	rs139260477	A	G	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=545;ReadPosRankSum=-1.331;SC=CCTAGGCAGGATAACAAATAA;SOR=0.779;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=17;WE=183799578;WS=183799548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr2	183806893	rs140820523	TA	T	109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.92;ReadPosRankSum=0.108;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
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chr2	183822374	rs17265866	G	C	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=274;ReadPosRankSum=-0.483;SC=TACTCTGAAAGCATACTAACT;SOR=0.906;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=14;WE=183822382;WS=183822364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,16:0.36:44
chr2	183827018	rs2271671	G	A	1867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=46;PP=1406;ReadPosRankSum=-0.937;SC=TGTGAAGGCAGAATAATAATA;SOR=0.596;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=89;TCF=23;TCR=66;TR=63;WE=183827026;WS=183827008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,67:0.74:91
chr2	183841691	rs144939357	GA	G	148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=1.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=1.386;QD=4.51;ReadPosRankSum=-0.507;SOR=1.276;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr2	183848114	rs1400130	T	C	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.363;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=32;PP=514;ReadPosRankSum=-1.275;SC=TGAACCACTATGGGGAAAGAC;SOR=0.328;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=145;TCF=29;TCR=116;TR=43;WE=183848122;WS=183848104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,45:0.30:151
chr2	183850877	rs41270217	C	T	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.899;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=335;ReadPosRankSum=0.671;SC=AAAGCTACCACGGATAAAATA;SOR=0.313;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=69;TCF=41;TCR=28;TR=23;WE=183850885;WS=183850867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,25:0.34:73
chr2	183851058	rs10185562	C	T	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=421;SC=ATTATCAATTCAGAAACTGGC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=183851066;WS=183851048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	183860298	rs10497617	G	A	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=124;ReadPosRankSum=0.285;SC=GACTTAAGTAGTGAACATTTT;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=7;WE=183860306;WS=183860289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr2	183867004	rs141187393	G	GA	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=26;ReadPosRankSum=-0.131;SC=CAGTCTAGGAGAAAAAAAAAT;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=4;WE=183867012;WS=183866994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr2	183902656	rs111233403	C	A	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=141;ReadPosRankSum=-3.018;SC=CCCACGGCCTCCCTTGCCCTT;SOR=0.385;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=47;TCR=1;TR=12;WE=183902664;WS=183902646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,11:0.24:46
chr2	183960143	rs57818913	G	GT	661.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=2.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.25;MQRankSum=4.071;QD=8.17;ReadPosRankSum=-0.799;SOR=0.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,37:0.46:81
chr2	183960522	rs13399265	T	C	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=682;ReadPosRankSum=0.507;SC=GGAGGTCAATTTGATTGTCCT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=26;WE=183960530;WS=183960512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,26:0.70:37
chr2	183988984	rs2705719	C	G	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=425;SC=CTTCCCGGTGCAAAAACCCTT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=183988992;WS=183988974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	183995742	rs925803	A	C	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=22;PP=714;SC=CAGGGTCCTGATCAGTTGCCC;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=183995750;WS=183995719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	184022015	rs3791249	G	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=118;ReadPosRankSum=-0.307;SC=GTCACTGACAGAATTAGCCCA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=184022023;WS=184022005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr2	184024269	rs61756082	T	A	4011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.063;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=48;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.117;SC=CTTTAGCCTTTACACCACCAA;SOR=0.158;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=196;TCF=140;TCR=56;TR=143;WE=184024277;WS=184024259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,147:0.75:197
chr2	184025750	rs140119771	TA	T	275.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=2.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQRankSum=1.665;QD=5.87;ReadPosRankSum=-1.226;SOR=0.349;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,13:0.28:47
chr2	185463815	rs147358574	C	CCT	2829.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=0.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=0.746;QD=20.65;ReadPosRankSum=-1.296;SOR=0.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,88:0.64:137
chr2	185798504	rs4667000	A	C	1456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.925;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=45;PP=1175;ReadPosRankSum=-0.306;SC=AACATGACCAAAAAAGGGGTA;SOR=1.340;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=69;TCF=4;TCR=65;TR=47;WE=185798512;WS=185798494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,49:0.69:71
chr2	185800905	rs12476147	A	T	6242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=85;NR=107;PP=2965;SC=CATCTTCAACAATCTTCACCA;SOR=0.866;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=193;TCF=85;TCR=108;TR=192;WE=185800913;WS=185800895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr2	185801747	rs4667001	G	A	1611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=1.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.96;ReadPosRankSum=-0.257;SOR=0.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,57:0.56:101
chr2	185801755	rs4667002	A	G	3813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.52;SOR=2.857;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr2	185801917	rs728534	A	G	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.84;ReadPosRankSum=-0.178;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,50:0.69:72
chr2	185802211	rs5836928	C	CACA	1836.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.99;MQRankSum=1.007;NF=23;NR=18;PP=2138;ReadPosRankSum=1.854;SC=GTAAAAAGAACACAATACTTT;SOR=0.439;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=33;TCR=25;TR=41;WE=185802219;WS=185802201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,48:0.77:62
chr2	185802243	rs1366842	C	A	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.360;HP=4;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.796;NF=25;NR=16;PP=1089;ReadPosRankSum=0.159;SC=TCAAATGCAACAATGATACAT;SOR=0.127;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=41;WE=185802251;WS=185802233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,45:0.78:58
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chr2	185803364	rs3731834	C	G	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.206;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=650;ReadPosRankSum=2.152;SC=TAGCACACCTCTGCAGCCTTT;SOR=0.912;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=154;TCF=73;TCR=81;TR=43;WE=185803372;WS=185803354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,46:0.29:159
chr2	186610344	rs11884004	T	G	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.445;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=50;PP=1325;ReadPosRankSum=-0.224;SC=TGGACCCAAATAAGCTGGAAA;SOR=0.504;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=82;TCF=8;TCR=74;TR=56;WE=186610352;WS=186610334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,60:0.70:86
chr2	186610388	rs17813736	G	A	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.607;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=33;PP=821;ReadPosRankSum=-0.194;SC=TTTAAGTACTGGACACCATTC;SOR=2.780;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=33;WE=186610396;WS=186610378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,34:0.65:52
chr2	186611566	rs6758484	C	A	5825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=144;PP=2965;SC=AAAATATTAACAGAAAAATTG;SOR=4.578;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=13;TCR=144;TR=157;WE=186611574;WS=186611556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr2	186611938	rs12618129	G	A	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=278;ReadPosRankSum=0.439;SC=CCTGATTTCTGTTAGGCCCTG;SOR=0.765;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=12;WE=186611946;WS=186611928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr2	186625670	rs10547921	TA	T	185.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.80;MQRankSum=1.191;QD=9.78;ReadPosRankSum=0.085;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr2	186625770	rs7562137	A	G	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.209;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=473;ReadPosRankSum=1.495;SC=ATTTTACGAAAAAAAACTCAG;SOR=0.928;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=40;TCF=17;TCR=23;TR=25;WE=186625778;WS=186625760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr2	186627943	rs17228441	T	C	1500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.319;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=30;PP=1232;ReadPosRankSum=-0.041;SC=GGTTCAATTATTTCAGCGCAG;SOR=0.529;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=78;TCF=42;TCR=36;TR=54;WE=186627951;WS=186627933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,54:0.68:80
chr2	186629349	rs1986166	G	A	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.482;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.277;NF=5;NR=21;PP=552;ReadPosRankSum=-0.379;SC=TCTTTCAACTGACATTTACTG;SOR=1.095;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=26;WE=186629357;WS=186629339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr2	186653546	rs3752671	G	A	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.694;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=13;PP=918;ReadPosRankSum=0.696;SC=TCTGTAGCACGTGCAGTGAAG;SOR=0.801;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=159;TCF=116;TCR=43;TR=52;WE=186653554;WS=186653536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,53:0.33:160
chr2	186654592	rs992822	A	G	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=9;PP=974;ReadPosRankSum=-1.676;SC=GAAGCAATCAATGCTATACTA;SOR=0.754;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=67;TCR=18;TR=43;WE=186654600;WS=186654582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,43:0.51:84
chr2	186655726	rs10931199	G	A	2265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=35;PP=1770;SC=TCTTCATTACGATCTCAACTT;SOR=0.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=33;TCR=35;TR=68;WE=186655734;WS=186655716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	186656657	rs10173807	C	T	2604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=53;PP=2318;SC=GGTTTGCCAACGGACATTTAG;SOR=1.416;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=28;TCR=53;TR=81;WE=186656665;WS=186656647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr2	186656956	rs17229201	T	C	2337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.153;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=53;PP=1535;ReadPosRankSum=0.543;SC=TTTAATGAAATGGAATCTGAA;SOR=0.909;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=147;TCF=68;TCR=79;TR=96;WE=186656964;WS=186656946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,100:0.66:152
chr2	186657089	rs17229222	C	A	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.165;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=812;ReadPosRankSum=-0.636;SC=ATGAGAGATCCCCACAAAGAG;SOR=0.415;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=30;TCR=40;TR=41;WE=186657097;WS=186657079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,45:0.61:74
chr2	186658056	rs60029104	G	A	1268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.543;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=18;PP=1040;ReadPosRankSum=0.207;SC=CAAAGAGATCGATTTAGATCA;SOR=1.012;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=75;TCF=40;TCR=35;TR=44;WE=186658064;WS=186658046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,45:0.56:80
chr2	186658438	rs10490391	C	T	1577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.880;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=1219;ReadPosRankSum=0.699;SC=TTTTGTGATACGTTTCCAAAA;SOR=0.445;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=88;TCF=41;TCR=47;TR=58;WE=186658446;WS=186658428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,58:0.64:90
chr2	186658565	rs10490392	G	T	1483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.795;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=25;PP=1171;ReadPosRankSum=0.323;SC=CTGTAGTAGAGAAAGAAGACA;SOR=0.542;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=91;TCF=51;TCR=40;TR=54;WE=186658573;WS=186658555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,56:0.60:94
chr2	186659359	rs2161036	G	T	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.827;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=21;PP=1071;ReadPosRankSum=0.709;SC=CAAAGAGTAAGGGAAGTCACA;SOR=0.963;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=83;TCF=46;TCR=37;TR=51;WE=186659367;WS=186659349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,52:0.61:85
chr2	186661673	rs55938253	A	G	3945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.348;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=54;PP=2962;ReadPosRankSum=1.430;SC=GCAGTTTCTTACAAAAGCTGC;SOR=1.013;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=196;TCF=107;TCR=89;TR=136;WE=186661681;WS=186661663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,141:0.69:203
chr2	186661877	rs182519742	A	C	1502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.060;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=35;PP=1008;ReadPosRankSum=-0.081;SC=ATACTGTGCTATCCAGCTGTG;SOR=0.506;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=163;TCF=58;TCR=105;TR=58;WE=186661885;WS=186661867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,64:0.37:172
chr2	186664473	rs11686997	T	C	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=590;ReadPosRankSum=0.052;SC=GGAAAAAATATGAATCAAAAC;SOR=0.655;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=28;WE=186664481;WS=186664463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,31:0.67:46
chr2	186664963	rs10931200	C	A	1908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=31;PP=1492;ReadPosRankSum=-0.567;SC=TAGTGTACCCCTTTGCAACAA;SOR=0.688;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=53;TCR=46;TR=67;WE=186664971;WS=186664953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,70:0.69:101
chr2	186665432	rs36004074	G	A	1565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.759;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=1269;ReadPosRankSum=-0.115;SC=GTAGAAGATGGAAAATCTGAT;SOR=0.457;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=89;TCF=53;TCR=36;TR=55;WE=186665440;WS=186665422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,57:0.60:95
chr2	186665824	rs11695215	A	G	2582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=5.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=37;PP=2084;ReadPosRankSum=-1.008;SC=AGCACCATTTAACAAGCATTG;SOR=0.800;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=148;TCF=85;TCR=63;TR=90;WE=186665832;WS=186665814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,91:0.61:149
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chr2	186670104	rs7576532	A	C	2612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=28;PP=2092;SC=TTGTATATGAACAGTTCATAG;SOR=1.501;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=54;TCR=28;TR=82;WE=186670112;WS=186670094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	186670780	rs16827154	T	A	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=6.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.629;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=18;PP=1578;ReadPosRankSum=-0.304;SC=TGATGAGATATACACACATTT;SOR=1.123;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=119;TCF=80;TCR=39;TR=65;WE=186670788;WS=186670770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,66:0.55:120
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chr2	186671357	rs17826534	G	A	2277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.217;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=41;PP=1755;ReadPosRankSum=-1.083;SC=CAAAACCAACGAGAAAGTAAA;SOR=0.522;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=132;TCF=65;TCR=67;TR=84;WE=186671365;WS=186671347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,86:0.63:137
chr2	186671912	rs1862066	G	A	2663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=39;PP=2073;ReadPosRankSum=-0.514;SC=ATTTTCCAACGTCAGGTTAAC;SOR=0.707;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=147;TCF=87;TCR=60;TR=98;WE=186671920;WS=186671902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,100:0.66:151
chr2	186678241	rs34138386	A	AT	185.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=206;ReadPosRankSum=0.738;SC=TAGGCATTTGATTTTAATATT;SOR=0.495;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=7;WE=186678249;WS=186678231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr2	186678877	rs17230036	A	G	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.837;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=919;ReadPosRankSum=1.868;SC=AATGAATTCAATCTCAAGCCT;SOR=0.022;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=60;TCF=2;TCR=58;TR=20;WE=186678895;WS=186678867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,20:0.33:61
chr2	186678887	rs2161035	T	C	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.193;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=1587;ReadPosRankSum=-0.791;SC=ATCTCAAGCCTGGTGATATTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=28;WE=186678895;WS=186678867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr2	186680041	rs2287606	G	T	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.846;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=208;ReadPosRankSum=-1.115;SC=ATGCCATAAGGTAAGAAAATA;SOR=0.148;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=12;WE=186680049;WS=186680031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr2	186696759	rs2302913	C	T	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=3;PP=52;SC=TTACTGTTTGCATAAATACCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=186696767;WS=186696749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	186697876	rs1468999	A	G	5856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=81;NR=93;PP=2965;SC=AATGTCTTCAACTTTGTCAAA;SOR=0.809;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=174;TCF=81;TCR=93;TR=174;WE=186697884;WS=186697866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr2	187364811	rs4144786	G	A	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=1;PP=514;SC=GGTAAGGACTGTAAATATGCA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=187364819;WS=187364801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	187364878	rs4144785	A	G	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=208;ReadPosRankSum=0.375;SC=TAAACAATCAAATTTACATTT;SOR=0.853;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=13;WE=187364886;WS=187364868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,13:0.30:44
chr2	187370673	rs11690758	G	C	3291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.172;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.93;MQRankSum=-0.601;NF=59;NR=65;PP=2397;ReadPosRankSum=0.763;SC=ACAGTGCCTGGGTTCAAATCC;SOR=0.366;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=174;TCF=79;TCR=95;TR=124;WE=187370681;WS=187370663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,130:0.73:179
chr2	187455278	rs9333287	C	T	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=15;PP=489;SC=GAACTGGAGCCGGCCCCCTCC;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=187455286;WS=187455268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	187466921	rs200501166	A	AT	84.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.57;ReadPosRankSum=-1.136;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr2	187487160	rs9333288	G	A	6124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=69;NR=116;PP=2965;SC=AAATTTTGGTGAGTCTTCTGG;SOR=1.361;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=69;TCR=117;TR=185;WE=187487168;WS=187487150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr2	187490371	rs2197787	T	G	1871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=43;PP=1262;SC=CCTAGTTTGTTAAAAATATGT;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=43;WE=187490379;WS=187490361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	187490389	rs28633327	G	T	1600.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.50;QD=50.02;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	187497988	rs56088351	A	G	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.786;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=184;ReadPosRankSum=-0.305;SC=TATGTTTTTCATTGATTTCTA;SOR=2.331;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=14;WE=187497996;WS=187497978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr2	187501648	rs13430921	A	G	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=377;ReadPosRankSum=-0.631;SC=TGTCATATATATATGAATCTG;SOR=0.141;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=78;TCF=78;TCR=0;TR=21;WE=187501656;WS=187501638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,22:0.28:80
chr2	187501682	rs56136540	G	A	2577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-7.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=0;PP=2088;ReadPosRankSum=0.980;SC=ACAAAATATTGCATAAGTAAA;SOR=1.845;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=124;TCF=124;TCR=0;TR=86;WE=187501690;WS=187501672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,89:0.70:127
chr2	187521260	rs3738919	C	A	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=384;ReadPosRankSum=-0.578;SC=GGAAATTTAGCTTTGTAAAGT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=17;WE=187521268;WS=187521250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr2	187529823	rs35994921	AT	A	181.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.000;QD=5.19;ReadPosRankSum=0.425;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr2	187532373	rs2595391	T	G	1066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=5.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.786;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=5;PP=823;ReadPosRankSum=0.670;SC=ATATTCATGGTAGGTTTTCTT;SOR=1.225;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=101;TCF=85;TCR=16;TR=41;WE=187532381;WS=187532363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,42:0.42:101
chr2	187532417	rs2230616	G	A	4576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=53;PP=2965;ReadPosRankSum=0.626;SC=TCCTGATCATGTCTTTCTTCC;SOR=0.611;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=97;TCR=53;TR=149;WE=187532425;WS=187532407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,154:0.99:155
chr2	187540732	rs3213964	G	A	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=229;ReadPosRankSum=-0.065;SC=GTTTTTTAAAGAACGACAGCT;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=11;WE=187540740;WS=187540722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr2	187541810	rs2887831	T	C	1374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.639;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=12;PP=1140;ReadPosRankSum=0.434;SC=TGAGGGAAGATAAATTTTATG;SOR=1.981;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=71;TCF=45;TCR=26;TR=47;WE=187541818;WS=187541800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,48:0.66:73
chr2	187559029	.	A	ACAGCAG,ACAG	1728.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.000;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=7.437;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.232;NF=33,33;NR=32,32;PP=1245,1420;ReadPosRankSum=-0.831;SC=GCCTCATCCAACAGCAGCAGC;SOR=1.539;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=115;TCF=54;TCR=61;TR=65,65;WE=187559037;WS=187559019;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.48:83
chr2	187559047	rs144403657	G	GCAA	1651.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.708;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.256;NF=37;NR=35;PP=1551;ReadPosRankSum=4.713;SC=AGCAGCAGCAGCAACAACAAC;SOR=0.180;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=161;TCF=94;TCR=67;TR=72;WE=187559055;WS=187559037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,48:0.33:147
chr2	187559222	rs6705757	T	G	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=37;PP=903;ReadPosRankSum=-0.290;SC=CCCTTCCCTATCCATTCCTAT;SOR=1.392;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=58;TCF=2;TCR=56;TR=38;WE=187559230;WS=187559212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,40:0.63:63
chr2	187608102	rs200281950	T	TC	140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=7.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.23;ReadPosRankSum=0.132;SOR=1.915;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,12:0.19:63
chr2	187611748	rs2247924	G	A	1928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.469;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=11;PP=1662;ReadPosRankSum=0.922;SC=TTTAAAGTAAGACATCCTGAC;SOR=2.872;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=51;TCR=12;TR=61;WE=187611756;WS=187611738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,59:0.97:61
chr2	187627567	rs2595381	G	A	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.628;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=35;PP=855;ReadPosRankSum=0.280;SC=TGGGGATTGTGTGTCTGCTGT;SOR=0.526;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=135;TCF=29;TCR=106;TR=47;WE=187627575;WS=187627557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,50:0.34:146
chr2	187692908	rs17852916	T	G	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.082;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=400;ReadPosRankSum=-0.325;SC=AAAGTTGATCTCTTGTTGTCC;SOR=0.448;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=55;TCR=26;TR=27;WE=187692916;WS=187692898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,26:0.33:79
chr2	187692983	rs17856918	T	C	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=333;ReadPosRankSum=-0.568;SC=CCTTTGGTCATCCGGCTTAGA;SOR=0.744;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=71;TCF=33;TCR=38;TR=21;WE=187692991;WS=187692973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,22:0.31:71
chr2	187693003	rs10195632	A	T	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.042;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=322;ReadPosRankSum=0.362;SC=ACTAGTGTGAAATTTTCCACT;SOR=0.576;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=82;TCF=36;TCR=46;TR=21;WE=187693011;WS=187692993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,23:0.27:85
chr2	187693044	rs17852915	C	T	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.465;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=349;ReadPosRankSum=0.765;SC=CAGTGGGACACACAATATTCT;SOR=0.639;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=80;TCF=35;TCR=45;TR=23;WE=187693052;WS=187693034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,26:0.30:87
chr2	187693104	rs10172225	C	T	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.088;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=428;ReadPosRankSum=0.334;SC=TCCCAAATGACACAGTGGGTA;SOR=1.638;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=66;TCF=22;TCR=44;TR=24;WE=187693112;WS=187693094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,26:0.37:71
chr2	187693155	rs10195758	A	T	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.167;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=399;ReadPosRankSum=-1.543;SC=TAATTTTATAATCATAGGTTA;SOR=1.182;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=21;WE=187693163;WS=187693145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,21:0.32:65
chr2	187693521	rs59504667	TA	T	254.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.632;NF=1;NR=11;PP=172;ReadPosRankSum=-0.973;SC=TGTGAAACTTTAAAAAAAAGG;SOR=0.507;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=12;WE=187693529;WS=187693511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr2	187694410	rs6745572	C	T	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.628;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=281;ReadPosRankSum=0.285;SC=TTTGTGAAAACTGACCCTACA;SOR=0.124;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=18;WE=187694418;WS=187694400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
chr2	187697883	rs10164815	A	G	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.331;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=152;ReadPosRankSum=0.390;SC=CTTTTCTTCAATCTCATTTTT;SOR=0.980;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=12;WE=187697891;WS=187697873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr2	187697996	rs10188850	C	T	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.412;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=231;ReadPosRankSum=2.094;SC=TTTGCAAAGTCGTGGATATTT;SOR=0.446;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=15;WE=187698004;WS=187697986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr2	187698019	rs10189037	G	T	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.664;HP=6;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=179;ReadPosRankSum=-1.551;SC=ATTTTGTGGAGAAAAATTAGT;SOR=0.377;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=13;WE=187698027;WS=187698009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr2	187698037	rs7609183	G	A	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=20;PP=600;SC=AGTTGGTTGCGTATCAATAAT;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=187698045;WS=187698027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	187698053	rs10188869	C	T	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=50;ReadPosRankSum=0.345;SC=ATAATGTGAACAATACACAAT;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=5;WE=187698061;WS=187698043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr2	187698707	rs6434197	C	T	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.334;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=588;ReadPosRankSum=-0.876;SC=AAGATGGCAGCAGCTATCAAA;SOR=0.392;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=154;TCF=55;TCR=99;TR=43;WE=187698715;WS=187698697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,47:0.29:162
chr2	187698751	rs7559533	G	A	2227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.184;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=61;PP=1795;ReadPosRankSum=-1.338;SC=CTATGCATTCGGTACACCTAA;SOR=0.413;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=109;TCF=23;TCR=86;TR=79;WE=187698759;WS=187698741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,80:0.73:110
chr2	187702339	rs72348328	GTA	G	208.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.140;NF=0;NR=4;PP=166;ReadPosRankSum=-0.589;SC=CATATCCATTGTATATATATA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=187702348;WS=187702329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr2	187709415	rs72096458	AC	A	774.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=2.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.61;MQRankSum=2.241;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.129;SOR=0.372;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,32:0.38:84
chr2	187709553	rs11892669	A	G	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.147;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=401;ReadPosRankSum=-1.100;SC=ACATTTAAAAATATTTAGAAT;SOR=0.253;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=64;TCF=3;TCR=61;TR=23;WE=187709561;WS=187709543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,23:0.35:65
chr2	187712648	rs11885224	T	G	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=151;ReadPosRankSum=0.374;SC=GAATAGATTCTACTGGAGAAT;SOR=0.242;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=9;WE=187712656;WS=187712638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr2	187712685	rs140128829	C	CTGATTTTTCAT	313.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.577;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=1347;ReadPosRankSum=0.959;SC=AGTCTCTAGGCTTCATTATTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=5;WE=187712693;WS=187712675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr2	187713866	rs6725956	C	G	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=60;ReadPosRankSum=-0.529;SC=ATGCTGGGTGCGGGCGGAGGC;SOR=0.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=6;WE=187713874;WS=187713856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr2	187713922	rs6726153	G	A	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.40;ReadPosRankSum=1.691;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr2	188216807	rs858745	T	C	3420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=35;PP=2891;SC=AATTCCAAACTTCTCAAGCTG;SOR=1.542;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=67;TCR=35;TR=102;WE=188216815;WS=188216797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr2	188243633	rs3771084	A	G	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=369;SC=CAAGACATCTAGTAATTTTCT;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=188243641;WS=188243623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	188245640	rs1511877	G	A	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=334;SC=GACATTATATGAAAATCTATA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=188245648;WS=188245630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	188250301	rs698577	T	A	2329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=29;PP=1741;SC=ACCAGAAAATTCAGGGTACAC;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=40;TCR=30;TR=69;WE=188250309;WS=188250291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	188293545	rs113375998	G	A	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.533;NF=4;NR=0;PP=41;ReadPosRankSum=1.550;SC=GCGTGAACACGGGAGGTGGAG;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=188293553;WS=188293535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr2	188348696	rs144825443	TAAAC	T	571.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=420;ReadPosRankSum=-0.317;SC=TTAAATGTCTTAAACAATTTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=10;WE=188348707;WS=188348693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr2	189393929	.	C	CT	228.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.244;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=157;ReadPosRankSum=0.922;SC=AAAGGTAAGGCTTTTTTTTTA;SOR=0.238;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=14;WE=189393937;WS=189393919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,14:0.34:41
chr2	189448896	rs2048138	A	T	1777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=0;PP=1427;SC=TGCAACTGAAATTGTTGTTTA;SOR=8.015;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=51;WE=189448904;WS=189448886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	189454360	rs62181296	T	C	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.124;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=179;ReadPosRankSum=-1.110;SC=ATTGGGATGATTGAGTGATGG;SOR=1.371;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=11;WE=189454368;WS=189454350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr2	189855166	rs13306275	A	G	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.310;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=481;ReadPosRankSum=1.780;SC=CTGGACAATTATGTGCCAAAA;SOR=2.910;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=21;WE=189855174;WS=189855156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr2	189857993	rs12693525	T	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=-1.710;SC=CTACTCCAACTTTTGGGAGAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=189858001;WS=189857983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr2	189859434	rs371354802	CT	C	407.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.588;HP=13;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.810;NF=6;NR=17;PP=240;ReadPosRankSum=-0.713;SC=ATTTTACCATCTTTTTTTTTT;SOR=0.249;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=54;TCF=7;TCR=47;TR=23;WE=189859442;WS=189859424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr2	189860996	rs62181728	G	A	80.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.409;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=130;ReadPosRankSum=1.358;SC=GTGTGTGTGTGTATATATATA;SOR=0.446;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=8;WE=189861004;WS=189860986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr2	189861031	rs62181730	T	C	78.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=240;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TCTATATATATACACACACAC;SOR=1.179;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=6;WE=189861041;WS=189861021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr2	189861033	rs192889832	C	T	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=378;ReadPosRankSum=1.790;SC=TATATATATACACACACACAC;SOR=0.368;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=8;WE=189861041;WS=189861021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr2	189862203	rs3134654	C	T	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=8;PP=505;SC=TCTCTGACACCATGTTGTTAC;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=10;TCR=8;TR=18;WE=189862211;WS=189862193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	189863389	rs13306272	C	T	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.190;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=150;ReadPosRankSum=0.990;SC=CATATAATGCCAATCTCCCAG;SOR=0.892;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=55;TCF=32;TCR=23;TR=13;WE=189863397;WS=189863379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,13:0.23:56
chr2	189864080	rs1800255	G	A	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=3.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.455;SOR=1.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,18:0.25:73
chr2	189864582	rs1801184	T	C	2208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.680;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=48;PP=1810;ReadPosRankSum=1.490;SC=AACCAGGCGGTCCAGGTGCTG;SOR=0.507;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=111;TCF=41;TCR=70;TR=78;WE=189864590;WS=189864572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,80:0.69:116
chr2	189866199	rs2271682	T	A	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.881;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=446;ReadPosRankSum=-0.337;SC=ACTACCTGGATATAAAAAGAA;SOR=1.013;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=98;TCF=64;TCR=34;TR=27;WE=189866207;WS=189866189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,29:0.28:102
chr2	189867844	rs3736489	T	A	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=226;ReadPosRankSum=1.758;SC=ATCTATTGATTATCTGTCTAT;SOR=0.737;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=13;WE=189867852;WS=189867834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,13:0.32:40
chr2	189867882	rs3736490	C	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.139;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=173;ReadPosRankSum=-1.608;SC=CCTCTCCCCCCTCTGTAAGTC;SOR=2.115;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=8;WE=189867890;WS=189867872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr2	189868207	.	TTAAC	T	823.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.130;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.060;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=493;ReadPosRankSum=-1.278;SC=ATTGATCCTCTTAACTATTAT;SOR=0.507;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=13;WE=189868218;WS=189868197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,23:0.40:58
chr2	189874015	rs181104237	G	A	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=44;PP=1075;ReadPosRankSum=-0.624;SC=ATTAGAATGGGAACGAAAAAA;SOR=0.425;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=76;TCF=4;TCR=72;TR=47;WE=189874023;WS=189874005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,50:0.60:83
chr2	189875421	rs1516446	T	G	4102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=56;PP=2965;SC=TTGATGTGCATCTGGCATTCC;SOR=0.998;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=63;TCR=56;TR=119;WE=189875429;WS=189875411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr2	189875695	rs3768660	T	G	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.644;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=314;ReadPosRankSum=-1.220;SC=TTGAATAGAATAAATAAAATT;SOR=0.119;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=46;TCF=3;TCR=43;TR=16;WE=189875703;WS=189875685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,17:0.36:47
chr2	189899541	rs4666770	T	C	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=0;PP=836;SC=TATGCTCATATACAAGGTAAA;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=189899549;WS=189899538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	189899572	rs7420715	T	C	1791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=0;PP=1496;SC=GTTCTAGTGCTGTAATAGTAT;SOR=7.978;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=51;WE=189899580;WS=189899562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	189901295	rs12693526	G	A	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=1;PP=631;SC=TATGTAATAAGTAGTAAAAAG;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=189901303;WS=189901285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	189907937	rs6434312	A	G	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=23;PP=1159;SC=GACCTCTGTCACCTCGGTCTC;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=26;TCR=23;TR=49;WE=189907945;WS=189907927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	189918337	rs6750027	T	C	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=8;PP=273;SC=TTAAGGAAGGTCCTTAAGGAT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=189918345;WS=189918327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	189918787	rs6738371	C	T	1723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=28;PP=1361;SC=AATGATCTTGCTCAGATACCA;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=48;WE=189918795;WS=189918777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	189923104	rs7556733	A	G	2880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=12;PP=2425;SC=TGCGTTTATTAAGCAGTAATT;SOR=3.109;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=71;TCR=12;TR=83;WE=189923112;WS=189923094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr2	189923434	rs12989558	A	C	1790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=4;PP=1556;SC=TCATAGCACAAAATATTTCTC;SOR=4.654;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=49;TCR=4;TR=53;WE=189923442;WS=189923424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	189923630	rs5837121	AT	A	3244.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.186;NF=27;NR=91;PP=1920;ReadPosRankSum=0.604;SC=CTATAAACACATTTTTTTTTT;SOR=0.671;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=160;TCF=38;TCR=122;TR=118;WE=189923639;WS=189923620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,138:0.99:139
chr2	189925313	rs6414121	G	C	217.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=178;SC=TGGAGATAATGATAGTACCTA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=189925321;WS=189925303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	189925548	rs6414122	T	A	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=32;PP=1273;SC=TGAATCTGTGTAAGTTTAACA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=46;WE=189925556;WS=189925538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	189927506	rs7424947	C	G	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=0;PP=406;SC=TGAAACTTACCCATAAGTCTT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=189927514;WS=189927496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	189932831	rs2229495	T	C	2411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=29;PP=1767;SC=CAGAGGTACCTGGAGAGCCCT;SOR=0.914;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=41;TCR=29;TR=70;WE=189932839;WS=189932821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	189936687	rs6434317	T	G	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=3;PP=579;SC=ACTTTTCAATTAATTAAATGT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=189936695;WS=189936677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	189943121	rs5837122	GA	G	436.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.51;QD=21.84;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	189962065	.	G	C	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.750;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.112;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=492;ReadPosRankSum=-0.893;SC=CCCTAAAACAGAAAATGATGA;SOR=0.520;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=54;TCF=16;TCR=38;TR=26;WE=189962073;WS=189962055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr2	189974958	rs4128539	G	T	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=2;PP=694;SC=TACCAAAATTGGTATTGCCAC;SOR=3.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=189974966;WS=189974948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	189997838	rs62182417	G	A	257.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=56.17;NF=1;NR=7;PP=187;SC=GCCCAAGTACGACTTTTTTTT;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=8;WE=189997846;WS=189997828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	190313396	rs6738193	A	G	1328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=25;PP=1107;SC=TGCCTATAGCATATTCTGTGA;SOR=1.038;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=44;WE=190313404;WS=190313386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	190319966	rs5837143	C	CA	1078.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=0;PP=734;ReadPosRankSum=1.202;SC=GACTTTGCCTCAAAAAAAAAA;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=65;TCR=0;TR=37;WE=190319974;WS=190319956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr2	190319990	rs1224958	A	G	2932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=1;PP=2378;SC=TAAATTCCTTACACATGTTTG;SOR=7.500;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=79;TCF=78;TCR=1;TR=79;WE=190319998;WS=190319980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	190322196	rs10497700	T	C	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=406;SC=TCCAAAGCTATTCCTAGTTTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=190322204;WS=190322186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	190323530	rs1157910	A	G	5622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=63;PP=2965;SC=ACAATTTTACATGTGTAGCAT;SOR=1.574;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=190;TCF=127;TCR=63;TR=189;WE=190323538;WS=190323520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr2	190327076	rs2304703	C	T	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=0;PP=847;SC=TTAAAAGATACGAAGACACTT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=190327084;WS=190327066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	190327126	rs2304702	C	G	1503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=1;PP=1326;SC=AGTACGGTAGCAAAAACAAAA;SOR=6.184;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=46;WE=190327134;WS=190327116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	190430177	rs2304704	A	G	3194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.361;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=38;PP=2632;ReadPosRankSum=1.610;SC=TCCAGAGCAGAACGTACTCCA;SOR=1.205;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=62;TCR=39;TR=100;WE=190430185;WS=190430167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr2	190443304	rs1439815	C	T	2425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=65;PP=2001;SC=AGATACTATTCCCATCACATG;SOR=6.302;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=2;TCR=65;TR=67;WE=190443312;WS=190443294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	190444630	rs1439816	C	G	5373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=95;PP=2965;SC=GGCGGGGTGACAAAAAGCGAT;SOR=1.047;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=75;TCR=95;TR=170;WE=190444638;WS=190444620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr2	190445076	rs4287798	T	G	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=209;SC=CCAGAACTCGTGTAGAGTTGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=190445084;WS=190445066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	190448047	rs987028	T	C	4640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=115;NR=26;PP=2965;SC=TTTTAAGTTGTCTTTTCACTT;SOR=2.932;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=115;TCR=26;TR=141;WE=190448055;WS=190448037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr2	190448552	.	T	C	413	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5063;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=28;MQ=60.6;NF=1;NR=6;PP=413;QD=63.9673160782;SC=CACACACATATACACAGTAGT;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=7;WE=190448560;WS=190448538;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,7:0.32:22
chr2	190531426	rs1437880	G	A	4952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=69;NR=67;PP=2965;SC=TGTCATTTCCGGATGCATTAT;SOR=0.707;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=69;TCR=67;TR=136;WE=190531434;WS=190531416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr2	190541861	.	G	T	27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=18;HapScore=3;MGOF=7;MMLQ=30;MQ=58.16;NF=0;NR=4;PP=27;QD=15.4428031368;SC=TTTTTTTTTTGGAACAGAGTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=4;WE=190541869;WS=190541850;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:18,4:0.18:22
chr2	190554759	rs62185872	T	A	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=31;ReadPosRankSum=0.992;SC=AATGCAATTTTGTTTCTAGTA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=190554767;WS=190554749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr2	190558022	.	A	G	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=373;ReadPosRankSum=-0.586;SC=ATTCCACAATAATAACCACCA;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=16;WE=190558030;WS=190558012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr2	190561060	rs113995284	A	G	2625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=58;PP=2028;ReadPosRankSum=1.681;SC=GCTAACTTCAAGGTCAACCAG;SOR=0.665;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=152;TCF=57;TCR=95;TR=94;WE=190561068;WS=190561050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,96:0.61:157
chr2	190570001	rs11319823	TA	T	328.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=12;PP=330;SC=TAGGCAATAATAAAAAAAAAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=12;WE=190570009;WS=190569991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	190575668	rs115359564	G	A	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=134;ReadPosRankSum=-1.691;SC=GGTAATAGTGGTGACCTCAAC;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=7;WE=190575676;WS=190575658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr2	190593168	rs3067424	ATTTTT	A	328.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=390;ReadPosRankSum=2.354;SC=TCCTTATTTTATTTTTATTTT;SOR=0.430;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=11;WE=190593180;WS=190593158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,11:0.26:43
chr2	190593311	rs1225087	C	G	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=6;PP=755;SC=TTACAAGTGTCAGCCACCGTG;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=190593319;WS=190593301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	190595258	rs1225090	G	T	3817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=59;PP=2721;SC=GTCAACAATTGGTTGTAGATG;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=52;TCR=59;TR=111;WE=190595266;WS=190595248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr2	190602513	rs1225099	T	C	336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=4;PP=186;SC=TATCTATTTTTGAACGTTTTC;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=190602521;WS=190602503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	190609408	rs113178256	A	AT	153.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.265;NF=7;NR=0;PP=199;ReadPosRankSum=-1.040;SC=TTCTTCATATATTTTTTCTGG;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=7;WE=190609416;WS=190609398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr2	190611414	rs2254166	T	C	2614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=65;PP=2110;SC=TTATTTTTAATAATGGTAATA;SOR=3.528;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=11;TCR=65;TR=76;WE=190611422;WS=190611404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	190611459	rs2254167	A	G	1002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=26;PP=801;SC=TTTTTGAATGAAAGTTCTTGA;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=190611467;WS=190611449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	190617643	rs2243876	A	G	2961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=50;PP=2181;SC=ACTGTGTTGCATTTGTTAAAA;SOR=0.773;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=46;TCR=50;TR=96;WE=190617651;WS=190617633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr2	190617700	rs16831960	T	C	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=29;PP=588;ReadPosRankSum=0.821;SC=CACCACCAGATGCAACCTGAA;SOR=0.873;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=69;TCF=12;TCR=57;TR=34;WE=190617708;WS=190617690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,36:0.50:72
chr2	190647108	rs10168387	T	C	3001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=3;PP=2600;SC=ACCACTAAACTTAAAACTTTT;SOR=6.161;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=89;TCF=86;TCR=3;TR=89;WE=190647116;WS=190647098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr2	190670539	rs3214425	T	TA	184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.62;ReadPosRankSum=-0.399;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,12:0.30:40
chr2	190682632	rs3791773	G	C	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=-0.836;SC=TCTAGAATTGGAGGAGGAGAC;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=190682640;WS=190682622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr2	190682952	rs113116659	T	TAAAC	154.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=61;ReadPosRankSum=-0.177;SC=TATGATATAATAAACAATGTA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=2;WE=190682960;WS=190682942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr2	190722170	rs735558	G	A	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=6;PP=864;ReadPosRankSum=-0.281;SC=AATCGTACTAGCTACCATTTC;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=51;TCR=10;TR=37;WE=190722178;WS=190722160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,40:0.63:63
chr2	190722343	rs735559	T	C	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=325;ReadPosRankSum=0.397;SC=TTCTCTCGATTCCTCCTTTCC;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=14;WE=190722351;WS=190722333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
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chr2	191111045	rs17736581	A	G	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=2;PP=24;SC=TGTCACTTTCAGTCAAATTAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=191111053;WS=191111035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	191159232	rs188339	A	G	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=10;PP=567;SC=CAGTTCTAGTAGGGGGAAAGA;SOR=1.302;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=25;WE=191159240;WS=191159222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	191161622	rs1058180	T	C	5457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=113;PP=2965;SC=ATGACTCCCGTGCAACCTTTT;SOR=1.119;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=70;TCR=113;TR=183;WE=191161630;WS=191161612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr2	191175639	rs36074132	GT	G	474.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.589;NF=9;NR=8;PP=557;ReadPosRankSum=-0.809;SC=AGAACAAAAAGTTTTAAAAGG;SOR=0.556;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=17;WE=191175647;WS=191175629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,18:0.82:22
chr2	191184475	rs291466	A	G	2972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.820;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=73;PP=2129;ReadPosRankSum=-0.646;SC=GCGCTGCCCCATCGCCAAACA;SOR=0.845;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=192;TCF=75;TCR=117;TR=117;WE=191184483;WS=191184465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,124:0.62:200
chr2	191184524	rs3749022	C	T	2277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.638;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=69;PP=1731;ReadPosRankSum=-0.665;SC=TCTCCCGGACCGTTCCAGCGC;SOR=1.799;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=127;TCF=24;TCR=103;TR=81;WE=191184532;WS=191184514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,84:0.64:131
chr2	191231458	rs11544940	G	A	3081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=31;PP=2376;SC=CAACAGAGGAGGAAACAGCAG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=62;TCR=31;TR=93;WE=191231466;WS=191231448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr2	191235901	rs1882891	A	C	3338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=67;PP=2608;SC=TGCCATACTGAGGGCCATGGG;SOR=1.282;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=40;TCR=67;TR=107;WE=191235909;WS=191235891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr2	191301368	rs9646748	A	G	2311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FS=4.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.552;SOR=0.499;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:290,107:0.27:397
chr2	191334459	rs145257711	A	ATTTTTAT	842.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.54;QD=46.82;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	191354491	rs3811609	T	C	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.151;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=796;ReadPosRankSum=-0.198;SC=TTTGTTTTTATAGGGGCTGCT;SOR=0.444;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=146;TCF=88;TCR=58;TR=50;WE=191354499;WS=191354481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,52:0.35:147
chr2	191354658	rs59123011	C	CCT	3560.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=50;PP=2966;SC=ACAAATGCCCCGAGAAGCCTA;SOR=1.497;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=67;WE=191354666;WS=191354648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr2	191364708	rs72907168	G	A	2777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.661;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=52;PP=2400;ReadPosRankSum=1.618;SC=TGCTATCACTGATCATGGGGC;SOR=0.797;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=144;TCF=70;TCR=74;TR=99;WE=191364716;WS=191364698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,99:0.68:145
chr2	191373775	rs6707244	C	T	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=1;PP=741;SC=GGGTTGGTTTCCCTTTCCAGA;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=191373783;WS=191373765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	191375375	rs6712426	G	A	1579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=47;PP=1405;SC=TGGGAGGCCTGGGGAGGCGGA;SOR=6.273;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=48;WE=191375383;WS=191375365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	191379268	rs4586658	G	A	1273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=7;PP=1073;SC=ACTGAGGCACGGCCACACCAG;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=191379276;WS=191379258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	191390126	rs10931458	G	A	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=367;SC=AAAAGGGAATGCATTTTCTAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=191390134;WS=191390116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	191399433	rs12693579	T	C	1003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=20;PP=637;SC=CCGGCTCCGCTGCGAGGAGCG;SOR=0.798;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=17;TCR=20;TR=37;WE=191399441;WS=191399423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	191399537	.	T	C	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=174;ReadPosRankSum=-0.246;SC=GGAGGGAGAGTTGGGCTCGTT;SOR=0.105;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=10;WE=191399545;WS=191399527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr2	191545606	rs13382951	C	T	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=0.573;SC=TCCTATGGGCCAGGCACTGTG;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=5;WE=191545614;WS=191545596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr2	191548681	rs112414896	G	A	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=210;ReadPosRankSum=-0.354;SC=TTTTTAAAACGTCATCTGAGC;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=11;WE=191548689;WS=191548671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr2	191746233	rs78219026	T	G	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.451;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=131;ReadPosRankSum=0.656;SC=GCCTCGTTCCTTTCGGGGCCC;SOR=2.303;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=10;WE=191746241;WS=191746223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr2	191765206	rs3771313	T	C	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=48;ReadPosRankSum=0.210;SC=ATTATTTAAATAGTGTCCTAA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=191765214;WS=191765196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr2	191766899	rs3771312	T	G	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.98;ReadPosRankSum=-1.017;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr2	191777768	rs11363248	AT	A	266.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=179;SC=GCTATTTGTGATTTTTTTTTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=11;WE=191777776;WS=191777758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	191789206	rs7564529	A	G	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=129;ReadPosRankSum=1.367;SC=TTTTTCATATATTTCTCTACT;SOR=1.075;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=8;WE=191789214;WS=191789196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr2	191848312	rs12477076	T	C	1216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=0;PP=1024;SC=GATGCAGCAGTGAGAGCGTGG;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=191848320;WS=191848302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
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chr2	191859685	rs10190333	A	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.767;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.75;MQRankSum=2.968;QD=7.20;ReadPosRankSum=-1.550;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
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chr2	191874667	rs2066802	A	G	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.372;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=16;PP=811;ReadPosRankSum=0.267;SC=TGTCATCATAAAGCTGGTGAA;SOR=0.867;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=143;TCF=63;TCR=80;TR=40;WE=191874675;WS=191874657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,44:0.30:146
chr2	191875035	rs36077929	C	T	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.076;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=42;PP=1285;ReadPosRankSum=1.483;SC=TGGAAACATGCTCTCTCTTTT;SOR=0.657;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=299;TCF=140;TCR=159;TR=87;WE=191875043;WS=191875025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:215,84:0.28:299
chr2	191899148	rs375344996	CA	C	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.29;MQRankSum=0.283;QD=1.54;ReadPosRankSum=-0.142;SOR=0.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr2	191922307	rs56816363	CT	C	172.76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=18;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQ=56.44;MQRankSum=-0.518;NF=0;NR=8;PP=99;ReadPosRankSum=1.461;SC=AATTTCTTTTCTTTTTTTTTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=8;WE=191922315;WS=191922297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr2	191922841	rs3024866	G	A	3020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=52;PP=2293;SC=TCGGTTGCTGGAGAGGAAATC;SOR=1.265;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=34;TCR=52;TR=86;WE=191922849;WS=191922831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr2	191926496	.	C	T	3538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=0.000;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=66;PP=2585;ReadPosRankSum=-0.662;SC=TAAGTACCAACGGCCTCTGAG;SOR=0.667;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=194;TCF=99;TCR=95;TR=134;WE=191926504;WS=191926486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,137:0.70:196
chr2	191996518	rs1551443	T	C	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.116;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=461;ReadPosRankSum=0.294;SC=TAGTATCATCTGAATGTCCCA;SOR=0.419;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=80;TCF=59;TCR=21;TR=32;WE=191996526;WS=191996508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,36:0.40:89
chr2	192160839	rs4853574	A	T	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.61;ReadPosRankSum=0.185;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,15:0.18:82
chr2	192160875	rs4853575	C	T	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=3.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.29;ReadPosRankSum=-0.194;SOR=1.138;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,24:0.23:106
chr2	192161058	rs11397643	G	GT	1335.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.333;NF=2;NR=43;PP=1071;ReadPosRankSum=-0.238;SC=GTTTTTGTCAGTTTTTTTTAA;SOR=3.139;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=58;TCF=5;TCR=53;TR=45;WE=192161066;WS=192161048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr2	192214833	rs67146186	A	T	2132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.403;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=16;PP=1732;ReadPosRankSum=-0.742;SC=TAAGAAGTACACTGAGTTAAC;SOR=0.456;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=85;TCF=67;TCR=18;TR=71;WE=192214841;WS=192214823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,71:0.84:85
chr2	192214966	rs59642822	T	C	1753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.788;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=45;PP=1390;ReadPosRankSum=1.736;SC=GTATTTTTCTTCAGTCCTTGT;SOR=1.254;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=74;TCF=17;TCR=57;TR=57;WE=192214974;WS=192214956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,60:0.78:77
chr2	192225294	rs2138913	A	G	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.038;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=1;PP=1109;ReadPosRankSum=0.654;SC=TGAGAAGGAAAAAAAGCATGG;SOR=1.961;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=57;TCF=55;TCR=2;TR=42;WE=192225302;WS=192225284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,42:0.71:59
chr2	192225477	rs10692524	G	GTGTTGT	630.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=3.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=0.974;QD=19.11;ReadPosRankSum=0.725;SOR=0.118;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr2	192226908	rs2271769	G	C	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=447;ReadPosRankSum=1.418;SC=CCATGTTACCGATGTGAACAA;SOR=1.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=19;WE=192226916;WS=192226900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr2	192227230	rs12988758	T	C	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=42;PP=1089;ReadPosRankSum=-0.227;SC=ACAAGAATTCTATTTTTGTTA;SOR=1.211;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=1;TCR=57;TR=43;WE=192227238;WS=192227220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,43:0.77:56
chr2	192247808	rs34460997	A	G	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=279;SC=GTTTGCTTCAATCAGATTATG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=192247816;WS=192247803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	192247836	rs4641883	C	T	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=335;SC=TAGGCAGCTGCATTGAGAAAG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=192247844;WS=192247826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	192248174	.	T	A	48	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=5;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=48;QD=27.5904041824;SC=TCACTGTTTTTTATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=192248182;WS=192248164;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	192250539	.	T	C	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.797;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=1.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.28;ReadPosRankSum=1.508;SOR=1.037;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,41:0.53:78
chr2	192250543	rs13000398	A	G	3360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=12;PP=742;SC=TGATGGTGTAATTAGGAATAA;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=78;TCF=65;TCR=13;TR=77;WE=192250551;WS=192250529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr2	192250568	rs13026888	T	C	4423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=32;PP=2965;SC=TAAAACAATATAGTGAGGAAG;SOR=2.285;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=98;TCR=32;TR=130;WE=192250576;WS=192250558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr2	192250726	rs13018796	G	A	6858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=83;NR=125;PP=2965;SC=AGCATTTTGAGAGCAGGATGA;SOR=1.211;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=209;TCF=83;TCR=126;TR=208;WE=192250734;WS=192250716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr2	192279327	rs2271767	T	C	6661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=117;NR=89;PP=2965;SC=AGAGGTTCCATTGGTGGATGT;SOR=0.980;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=206;TCF=117;TCR=89;TR=206;WE=192279335;WS=192279317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr2	192701393	rs10167187	A	G	2865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=71;PP=2281;SC=CTTCCACGGCACCGGAAACGG;SOR=2.662;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=19;TCR=71;TR=90;WE=192701401;WS=192701383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
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chr2	192746182	.	G	A	612	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=57.53;NF=12;NR=13;PP=612;QD=25.8708485019;SC=TCTCTTAAAGGTATTGTGTGG;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=25;WE=192746190;WS=192746181;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr2	196582816	rs842736	T	C	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=1;PP=438;SC=CTTATTATACTCCACTATATG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=196582824;WS=196582806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	196602582	rs75708451	A	AAAT	684.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=621;ReadPosRankSum=-1.082;SC=TTAAGTAGTAAAATATGCTTT;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=15;WE=196602590;WS=196602572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr2	196602603	rs72913263	C	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.073;NF=13;NR=1;PP=255;ReadPosRankSum=1.497;SC=CTCTACTCAGCCAGCCAACAA;SOR=0.970;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=14;WE=196602611;WS=196602593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr2	196605447	rs147122074	TATAAA	T	340.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.20;ReadPosRankSum=0.470;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr2	196636482	.	G	C	1774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=0.000;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.700;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=37;PP=1416;ReadPosRankSum=1.655;SC=TTCATGCTCTGAGTATAAGTT;SOR=0.570;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=239;TCF=126;TCR=113;TR=74;WE=196636490;WS=196636472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,75:0.32:238
chr2	196636662	rs1145939	C	G	2887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=76;PP=2421;SC=AAAGGTCTAACAATAGCTGAA;SOR=4.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=6;TCR=76;TR=82;WE=196636670;WS=196636652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	196663997	rs7567285	T	C	2357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=14;PP=1738;SC=TAATATCCGATAACTTCATCT;SOR=2.774;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=72;TCF=57;TCR=15;TR=71;WE=196664005;WS=196663987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr2	196673533	rs13411834	A	G	5168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=55;PP=2965;SC=CCATGTACAAAGGTTGGCATA;SOR=1.261;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=93;TCR=55;TR=148;WE=196673541;WS=196673523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr2	196681284	rs2280452	A	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=299;ReadPosRankSum=1.154;SC=ACAACAATAGAGGTCACAAAT;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=14;WE=196681292;WS=196681274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr2	196682630	rs975417	C	A	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=578;SC=TCAAGTTCTGCCCTTAAAATA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=196682638;WS=196682620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	196709683	rs16840768	G	A	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=375;ReadPosRankSum=-0.416;SC=TAAATCTACTGTTATTTAATA;SOR=0.207;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=70;TCR=0;TR=22;WE=196709691;WS=196709673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,22:0.32:69
chr2	196720705	rs16841018	T	C	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=119;ReadPosRankSum=0.000;SC=GGAGCTACTATTTTTGCCACT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=7;WE=196720713;WS=196720695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr2	196726374	rs182745175	C	T	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=274;ReadPosRankSum=-0.889;SC=TATATTATGTCGTTTTTGCAC;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=11;WE=196726382;WS=196726364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr2	196749504	rs60214909	G	A	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=151;ReadPosRankSum=-0.131;SC=AAGCACCAACGGACCAGATCA;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=196749512;WS=196749494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr2	196749544	rs341947	C	A	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.302;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=67;ReadPosRankSum=0.251;SC=CTGCATTGGACAGATGAGAAG;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=196749552;WS=196749534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr2	196756535	rs79407338	GAA	G,GA	2668.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=7,7;NR=87,87;PP=1027,382;SC=GCCCCTTAATGAAAAAAAAAA;SOR=4.514;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=116;TCF=7;TCR=109;TR=94,94;WE=196756544;WS=196756525;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.37,0.63:103
chr2	196762491	rs5837482	TA	T	414.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=9.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=0.814;QD=8.29;ReadPosRankSum=1.424;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,13:0.26:50
chr2	196762506	.	A	C	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.219;HP=16;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.714;NF=7;NR=13;PP=452;ReadPosRankSum=2.565;SC=AAAAAAAAAAAAACTCATGAG;SOR=1.077;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=77;TCF=34;TCR=43;TR=20;WE=196762514;WS=196762481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,20:0.28:71
chr2	196771780	rs6710775	G	A	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=377;ReadPosRankSum=-0.336;SC=CTGATTCAATGTTGCAATGAA;SOR=0.880;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=20;WE=196771788;WS=196771770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,18:0.36:50
chr2	196791276	rs1489802	T	G	2388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.292;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=67;PP=1865;ReadPosRankSum=-1.669;SC=AGGCAAAAGTTGCATCTCCAG;SOR=1.131;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=115;TCF=18;TCR=97;TR=78;WE=196791284;WS=196791266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,84:0.69:121
chr2	196825402	rs6719500	T	C	1662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.046;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=34;PP=1219;ReadPosRankSum=0.509;SC=CTTACTTTTTTTGTCATTGCC;SOR=0.592;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=228;TCF=104;TCR=124;TR=75;WE=196825410;WS=196825392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,77:0.33:235
chr2	196851911	rs10931715	G	A	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=759;ReadPosRankSum=0.373;SC=ATTCCTAAACGAATAGTCTGC;SOR=0.934;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=35;WE=196851919;WS=196851901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,37:0.67:55
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chr2	196883851	rs142619352	C	T	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.208;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=221;ReadPosRankSum=2.266;SC=AAAACAACTTCCCTCTATATT;SOR=2.240;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=13;WE=196883859;WS=196883841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,13:0.28:46
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chr2	196935811	rs12693777	T	C	1467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.826;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=26;PP=1087;ReadPosRankSum=-0.094;SC=TAACCAAATGTATATAGAAAG;SOR=0.566;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=42;TCR=41;TR=52;WE=196935819;WS=196935801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,55:0.62:88
chr2	197004439	rs1054537	A	G	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.225;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=589;ReadPosRankSum=0.239;SC=TAACTTGAGAAATATTGAGGT;SOR=1.022;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=45;TCF=27;TCR=18;TR=29;WE=197004447;WS=197004429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
chr2	197010823	rs2271888	C	T	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=353;ReadPosRankSum=0.803;SC=ATTCATTCACCTAAACACTTT;SOR=0.711;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=16;WE=197010831;WS=197010813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr2	197021141	rs6712829	G	A	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=527;ReadPosRankSum=0.857;SC=ACTAAAATAGGTACTATTTAG;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=24;WE=197021149;WS=197021131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr2	197021276	rs10931726	T	C	3313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.381;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=46;PP=2495;ReadPosRankSum=1.252;SC=AAATTTCTGCTCGACAATCCT;SOR=1.005;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=163;TCF=94;TCR=69;TR=121;WE=197021284;WS=197021266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,125:0.74:170
chr2	197021372	rs12478353	T	A	1668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=52;PP=1295;ReadPosRankSum=-0.167;SC=CAGCAAATTTTCCTCTGGGGG;SOR=1.109;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=73;TCF=8;TCR=65;TR=58;WE=197021380;WS=197021362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,63:0.80:79
chr2	197065889	rs3795921	A	G	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=362;ReadPosRankSum=-2.174;SC=ACAACAGCACATAGCTTTATC;SOR=1.547;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=21;WE=197065897;WS=197065884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr2	197065964	rs3820908	C	A	2116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.103;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=6;PP=1682;ReadPosRankSum=-0.789;SC=AGCTTCTGAACCTGCCTGTCC;SOR=2.688;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=95;TCF=83;TCR=12;TR=70;WE=197065972;WS=197065954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,73:0.73:100
chr2	197066175	rs4566380	T	G	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.36;ReadPosRankSum=2.348;SOR=0.578;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr2	197087030	.	C	T	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.590;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.451;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=351;ReadPosRankSum=0.651;SC=TGGAACTCTTCATCAAGGTAT;SOR=0.368;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=71;TCF=17;TCR=54;TR=22;WE=197087038;WS=197087020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,22:0.29:76
chr2	197106759	rs2045277	T	C	2668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=29;PP=1996;SC=AACTGTGCCCTCTCCTTTCAC;SOR=1.206;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=48;TCR=29;TR=77;WE=197106767;WS=197106749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	197118729	rs4850690	C	T	4888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=113;NR=40;PP=2965;SC=GAGGCACATACGACATTATCT;SOR=1.996;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=113;TCR=40;TR=153;WE=197118737;WS=197118719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr2	197122493	rs6731238	T	G	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=6.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.957;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=6;PP=962;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CAATGTTCCATGATATCTGAT;SOR=0.819;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=131;TCF=112;TCR=19;TR=46;WE=197122501;WS=197122483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,46:0.34:137
chr2	197135806	rs4850693	T	C	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=2;PP=376;SC=CAAGATGTTTTGCAAAGGATG;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=197135814;WS=197135796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	197172856	rs41510048	A	T	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=385;SC=AGGAGCTGAGATGATTAATAG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=197172864;WS=197172846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	197184321	rs1531111	C	T	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=559;ReadPosRankSum=1.311;SC=TCGCTGTCCCCGGCCTGGAGT;SOR=0.619;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=43;TCR=49;TR=31;WE=197184329;WS=197184311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,34:0.35:96
chr2	197208531	rs6716054	T	G	1995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.962;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=48;PP=1475;ReadPosRankSum=-0.478;SC=ATTATAACCTTTCTCTCCGTA;SOR=0.400;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=115;TCF=32;TCR=83;TR=70;WE=197208539;WS=197208521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,74:0.63:117
chr2	197521750	rs34133636	G	A	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=2.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.16;ReadPosRankSum=-1.450;SOR=0.667;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,44:0.28:158
chr2	197534692	rs7590083	C	T	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.167;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=28;PP=557;ReadPosRankSum=0.629;SC=GTGCTTCTTACTCTCATCAAA;SOR=0.396;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=112;TCF=20;TCR=92;TR=35;WE=197534700;WS=197534682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,35:0.30:115
chr2	197537015	rs16856309	G	T	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.220;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=170;ReadPosRankSum=0.640;SC=TTTTTATAGGGGTGCACATAG;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=45;TCF=26;TCR=19;TR=13;WE=197537023;WS=197537005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,15:0.31:48
chr2	197541753	.	C	T	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=683;ReadPosRankSum=-0.877;SC=AGTGGGACAGCGAAGGTTAAG;SOR=0.859;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=36;WE=197541761;WS=197541743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,38:0.67:57
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chr2	197584504	rs2680970	C	T	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.390;NF=0;NR=15;PP=256;ReadPosRankSum=0.183;SC=AAAAAAATTGCAAAATGATAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=15;WE=197584512;WS=197584494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr2	197593787	rs2460436	C	T	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=181;ReadPosRankSum=-0.682;SC=CTTAATCAGACATTATTATTG;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=11;WE=197593795;WS=197593777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr2	197594203	rs2577580	G	C	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.736;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=567;ReadPosRankSum=-1.552;SC=TAGAACCCTAGCAGCCCCATG;SOR=1.185;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=101;TCF=5;TCR=96;TR=29;WE=197594211;WS=197594193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,31:0.29:108
chr2	197629531	rs113641244	TA	T	615.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=446;SC=GCTCATGTACTAAAAAAAAAT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=23;WE=197629539;WS=197629521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	197636379	rs62185599	A	G	2488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=3;PP=2151;ReadPosRankSum=-0.718;SC=TGTCACAGTGAGGCTGATAAT;SOR=4.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=71;TCR=3;TR=73;WE=197636387;WS=197636369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,74:0.99:75
chr2	197650118	rs140040626	CAGAAACACATGCAAAACTTAACAG	C	529.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.156;NF=7;NR=1;PP=1998;ReadPosRankSum=1.169;SC=TTCCAGAACACAGAAACACAT;SOR=0.859;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=8;WE=197650149;WS=197650108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr2	197662526	rs11559078	T	C	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.368;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=347;ReadPosRankSum=0.708;SC=CATACCTTCATTGACATCTTT;SOR=0.401;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=82;TCF=65;TCR=17;TR=26;WE=197662534;WS=197662516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,28:0.33:85
chr2	197708881	rs3795919	A	G	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.719;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=44;ReadPosRankSum=0.459;SC=TTACTTATCAACTAAATAAGT;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=197708889;WS=197708871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr2	197709173	rs3839046	TA	T	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=39;ReadPosRankSum=0.652;SC=ATACTAACCTTAAAAAAAAAA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=197709181;WS=197709163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr2	197710542	rs16858898	A	G	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.408;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=272;ReadPosRankSum=-0.197;SC=ATGCCTACGGAACATCCTACA;SOR=0.976;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=14;WE=197710550;WS=197710532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr2	197712865	rs7559167	T	C	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=212;ReadPosRankSum=-1.418;SC=TCAGAGAAAGTAAGGGTCTTC;SOR=0.264;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=11;WE=197712873;WS=197712855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr2	197737587	rs3795915	T	G	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=1;PP=798;SC=ATTTTACTGATGCATTTTAAT;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=197737595;WS=197737577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	197737833	rs6708412	T	C	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=21;ReadPosRankSum=0.757;SC=TAACTAATTATACAATTGTCC;SOR=0.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=4;WE=197737841;WS=197737823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr2	197744712	rs3835878	C	CTG	604.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=621;ReadPosRankSum=-0.457;SC=TTTAGATAAACTGTGCAGAAA;SOR=0.542;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=55;TCF=44;TCR=11;TR=17;WE=197744720;WS=197744702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,18:0.32:56
chr2	197744884	rs3835877	T	TA	108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=2.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.53;ReadPosRankSum=0.613;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,9:0.21:43
chr2	197750042	rs365342	G	A	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=305;ReadPosRankSum=-0.845;SC=TAAATCTCAAGTTTATTTAAT;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=12;WE=197750050;WS=197750032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr2	197758148	rs332299	C	T	78.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=57;SC=AATGATTTCGCCTGCATTTGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=197758156;WS=197758138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	197761824	rs332300	T	C	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=1;PP=753;SC=AAAGCTTTCATTTAAATAATT;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=197761832;WS=197761814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	197763250	rs17199109	C	A	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=0.758;SC=AAAAGGTGATCCAAATATATT;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=197763258;WS=197763240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr2	197777589	rs12693800	C	T	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.065;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=579;ReadPosRankSum=0.080;SC=GGTTAATGTTCATGTAACAGT;SOR=1.713;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=68;TCF=63;TCR=5;TR=26;WE=197777597;WS=197777579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,27:0.39:69
chr2	197854233	rs144034091	T	TAC	534.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.722;NF=13;NR=0;PP=595;ReadPosRankSum=0.653;SC=GCTGATGAACTACACACACAC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=13;WE=197854241;WS=197854223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr2	197863004	rs77910925	A	G	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=4.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=247;ReadPosRankSum=-0.333;SC=TTTCAGTGTTATTATTACTGT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=12;WE=197863012;WS=197862994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr2	197863026	rs75547979	C	A	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=4.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=261;ReadPosRankSum=1.502;SC=ATTATTATAACGTGAAGTAAT;SOR=0.659;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=40;TCR=3;TR=14;WE=197863034;WS=197863016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr2	197863214	rs1966703	C	T	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-4.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=36;PP=839;ReadPosRankSum=-0.275;SC=GAAGTTACTACAAACACAATA;SOR=1.054;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=51;TCF=2;TCR=49;TR=38;WE=197863222;WS=197863204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,43:0.74:58
chr2	197863698	rs17385301	G	A	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.104;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=388;ReadPosRankSum=0.872;SC=TATCTACTGCGTTCACTGGAG;SOR=0.883;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=73;TCF=36;TCR=37;TR=23;WE=197863706;WS=197863688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,23:0.31:74
chr2	197863851	rs4850742	C	T	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=485;SC=AAGAAACATGCACAAGGTGTT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=197863859;WS=197863841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	197864996	rs6434897	A	C	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=0;PP=701;SC=AGGGAAATTTATTTTAATTAT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=197865004;WS=197864986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	197865275	rs16860307	T	C	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.209;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=418;ReadPosRankSum=-0.577;SC=TTTTAAATTATATCACCTCCT;SOR=0.044;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=73;TCF=1;TCR=72;TR=22;WE=197865283;WS=197865265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,22:0.30:73
chr2	197866470	rs12478175	T	A	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=524;ReadPosRankSum=1.093;SC=TCAGCGTTTCTACTTACATTG;SOR=0.826;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=18;TCR=31;TR=25;WE=197866478;WS=197866460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr2	197872727	rs57048274	T	TTCTC	2170.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=43;PP=2354;SC=GACATTCTCTTTCTCCCATTC;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=0;TCR=55;TR=43;WE=197872735;WS=197872717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	197946392	rs35272229	C	T	5384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=130;PP=2962;ReadPosRankSum=1.796;SC=TTTCCTTCAGCTCCCTGGCTC;SOR=0.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=309;TCF=110;TCR=199;TR=200;WE=197946400;WS=197946382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,203:0.64:316
chr2	197953372	rs146161383	TAAGTC	T	4297.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=11;PP=2974;SC=ACAGACAACTTAAGTCAAGTC;SOR=3.634;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=85;TCF=70;TCR=15;TR=70;WE=197953384;WS=197953362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr2	197954780	rs4300850	A	G	2741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=67;PP=2281;SC=AAACAGAGCAACTCACGGCAA;SOR=2.861;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=14;TCR=68;TR=81;WE=197954788;WS=197954770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	197986048	rs2697270	T	C	3043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=23;PP=2337;SC=AGACTAAGAGTGTCATACCTG;SOR=2.278;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=71;TCR=23;TR=94;WE=197986056;WS=197986038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr2	197989945	rs2579395	T	C	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=548;SC=CCGACTGGAGTGCACTATGCA;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=197989953;WS=197989935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	197990741	rs35338671	A	C	2218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.108;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=31;PP=1647;ReadPosRankSum=0.784;SC=CTGAGTGCTTAATCAAAACCT;SOR=0.888;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=118;TCF=63;TCR=55;TR=76;WE=197990749;WS=197990731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,81:0.64:126
chr2	197990899	rs77359771	G	C	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.61;ReadPosRankSum=0.334;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr2	197990909	rs2918628	G	A	1277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.22;SOR=6.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	198001319	rs3731569	A	G	2128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.887;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=37;PP=1535;ReadPosRankSum=-1.610;SC=CACTCACTTCACTTCTGGAAG;SOR=0.352;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=123;TCF=70;TCR=53;TR=81;WE=198001327;WS=198001309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,86:0.68:127
chr2	198001443	rs2579387	C	T	1742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=47;PP=1376;SC=GCCCTGCCGACGTTAAATCAA;SOR=5.097;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=48;WE=198001451;WS=198001433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	198011904	rs2249470	G	A	4190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=90;PP=2965;SC=ATAGTAAGACGTGTCACTCAC;SOR=2.053;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=36;TCR=91;TR=126;WE=198011912;WS=198011894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr2	198175297	rs10931780	G	C	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.976;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=538;ReadPosRankSum=-1.115;SC=GCCGCCGCCCGCTACCTGGTC;SOR=0.976;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=107;TCF=77;TCR=30;TR=31;WE=198175305;WS=198175287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,30:0.28:108
chr2	198257652	rs11380582	T	TA	814.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.13;MQRankSum=0.411;QD=19.87;ReadPosRankSum=1.738;SOR=4.073;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,37:0.90:41
chr2	198257795	rs4685	T	C	6009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.551;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=80;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.870;SC=ATGTCTCAAATACATTGGGCC;SOR=0.632;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=103;TCR=81;TR=183;WE=198257803;WS=198257785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,187:0.99:188
chr2	198263146	rs16865262	T	C	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=5;PP=812;ReadPosRankSum=1.350;SC=AATTTGAAAATTGATACTGCT;SOR=0.784;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=61;TCF=54;TCR=7;TR=38;WE=198263154;WS=198263136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,40:0.62:64
chr2	198264903	rs140740106	AAAT	A	5075.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.678;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.815;NF=23;NR=85;PP=2971;ReadPosRankSum=-1.752;SC=ATAATAAAACAAATAATGTTA;SOR=1.290;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=168;TCF=44;TCR=124;TR=108;WE=198264913;WS=198264893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,128:0.69:186
chr2	198265173	rs788017	T	A	1474.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.83;SOR=5.630;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	198265526	rs788018	A	G	5154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=111;NR=38;PP=2965;SC=CTCCCAAATTACCCATAATTT;SOR=2.129;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=111;TCR=38;TR=149;WE=198265534;WS=198265516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr2	198266943	rs788019	C	T	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=658;SC=ATCAACTATTCAGCCAAACTG;SOR=5.058;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=198266951;WS=198266933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	198267770	rs3217350	G	GAA	1465.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=6;NR=24;PP=1289;SC=CTGAAAAAGAGAAAAGAGAAG;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=30;WE=198267778;WS=198267760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	198273347	.	T	C	28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;FR=0.5064;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=28;QD=31.3856062736;SC=TTTTAATCACTGTTAAAATAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=198273355;WS=198273337;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:1,2:0.67:3
chr2	198281743	rs699318	T	C	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=9;PP=270;SC=GCTCATTCTCTTTTCTATGTA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=198281751;WS=198281733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	198283305	rs788023	T	C	1680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=23;PP=1317;SC=GATCAGGGGTTTTCCCTCCTG;SOR=0.931;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=27;TCR=23;TR=50;WE=198283313;WS=198283295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	198285317	.	CAG	C	3565.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=0.000;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.707;NF=0;NR=68;PP=2954;ReadPosRankSum=0.383;SC=AATAACAAAACAGAATATCAT;SOR=0.877;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=114;TCF=3;TCR=111;TR=68;WE=198285326;WS=198285307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,90:0.68:133
chr2	198327314	rs3754822	G	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.562;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=283;ReadPosRankSum=-0.202;SC=AGGATTACAAGCATTTTGTTC;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=14;WE=198327322;WS=198327304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr2	198355135	rs148517124	T	TTG	1117.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.23;QD=39.92;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr2	198359027	rs7585486	G	C	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.720;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=10;PP=396;ReadPosRankSum=-1.431;SC=ACAAAACATGGAATTACAGGC;SOR=1.001;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=34;TCF=17;TCR=17;TR=22;WE=198359035;WS=198359017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
chr2	198362018	rs8539	T	C	2525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.64;NF=47;NR=22;PP=2028;SC=CTCCAATGTTTTTGTATTTAT;SOR=1.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=47;TCR=22;TR=69;WE=198362026;WS=198362008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	198363504	rs1050347	A	G	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.921;NF=43;NR=12;PP=1353;ReadPosRankSum=-0.438;SC=CATAAGCCCGAGTGAGATGAG;SOR=0.770;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=63;TCR=17;TR=55;WE=198363512;WS=198363494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,55:0.67:82
chr2	198365043	rs1116734	C	G	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=2;PP=513;SC=TAGCGGCGACCGCTGGGGCGA;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=198365051;WS=198365033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	198365788	rs2305560	C	T	1187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=8;PP=971;ReadPosRankSum=-0.297;SC=AAACATTTCTCTTCCTACAGG;SOR=0.672;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=55;TCR=12;TR=44;WE=198365796;WS=198365786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,44:0.65:68
chr2	198380635	.	C	T	37	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=3;NR=1;PP=37;QD=17.9428031368;SC=GTTCCTCGTTCGCCCTCTCCC;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=4;WE=198380643;WS=198380625;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr2	198508951	rs10497806	G	A	3891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=47;PP=2965;SC=CCTCAATCACGAGCCTTGGGC;SOR=0.986;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=67;TCR=47;TR=114;WE=198508959;WS=198508941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr2	198509058	rs16866940	C	T	2541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.644;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=61;PP=1973;ReadPosRankSum=-3.110;SC=CTAATATGCTCATGTGAAAAT;SOR=0.761;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=54;TCR=94;TR=96;WE=198509066;WS=198509048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,99:0.65:152
chr2	198511086	rs16866970	G	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=128;ReadPosRankSum=1.239;SC=GCTGGAAAATGTGCTTTAAAC;SOR=0.250;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=7;WE=198511094;WS=198511076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr2	198563642	rs6743671	T	C	44.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	198623751	rs73054817	A	G	1871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.670;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=45;PP=1354;ReadPosRankSum=1.936;SC=AAAGAGAGGCATGATGTCAGC;SOR=0.428;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=111;TCF=39;TCR=72;TR=71;WE=198623759;WS=198623741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,75:0.64:117
chr2	198643631	rs700655	G	A	1595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=28;PP=1138;ReadPosRankSum=-0.139;SC=GTAAACTGGCGTACAAAACCT;SOR=0.660;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=226;TCF=130;TCR=96;TR=70;WE=198643639;WS=198643621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,76:0.32:240
chr2	198669754	rs770659	G	C	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=9;PP=267;SC=GGAGCGCACCGGTGCCTAGCG;SOR=1.473;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=198669762;WS=198669744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	198669871	rs770658	G	C	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.81;ReadPosRankSum=1.471;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr2	198949344	rs113185553	A	G	4331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.269;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=84;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.891;SC=GAGGGACGTCAAAAAGGGTTT;SOR=0.664;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=248;TCF=126;TCR=122;TR=159;WE=198949352;WS=198949334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,167:0.65:257
chr2	198950029	rs2228135	A	G	2425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.650;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=59;PP=1920;ReadPosRankSum=-0.047;SC=AATCTGTTCAATACAGGGATT;SOR=0.449;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=128;TCF=34;TCR=94;TR=83;WE=198950037;WS=198950019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,86:0.64:134
chr2	198950240	rs1064213	G	A	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.782;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=23;PP=834;ReadPosRankSum=-3.016;SC=CTGTCAGATTGTAGCAATGAA;SOR=1.051;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=180;TCF=95;TCR=85;TR=55;WE=198950248;WS=198950230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,55:0.31:180
chr2	198950968	rs75433604	A	AT	2169.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.415;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.371;NF=1;NR=59;PP=2457;ReadPosRankSum=0.719;SC=TAGGAGAAACACTCACACTCT;SOR=1.836;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=100;TCF=3;TCR=97;TR=60;WE=198950976;WS=198950958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,63:0.62:101
chr2	200173684	rs10153730	T	G	5839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=117;PP=2965;SC=GCCAGCCCTGTAGAGAGAGGA;SOR=1.815;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=168;TCF=51;TCR=117;TR=168;WE=200173692;WS=200173674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr2	200245245	rs1348813	C	G	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=19;PP=642;SC=AATACACAAACCTCAACCAGG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=200245253;WS=200245235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	200298313	rs7596597	A	G	3849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=90;PP=2965;SC=GAAGGGAAGCAACAGTTATAA;SOR=2.488;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=28;TCR=90;TR=118;WE=200298321;WS=200298303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr2	200323452	rs114693875	A	G	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.93;ReadPosRankSum=-0.789;SOR=0.262;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,9:0.13:70
chr2	200625581	rs2346586	T	C	2201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.196;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=56;PP=1717;ReadPosRankSum=-0.336;SC=GAAGGAGAGATTAGTATTTGG;SOR=1.440;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=106;TCF=26;TCR=80;TR=70;WE=200625589;WS=200625571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,76:0.64:119
chr2	200677625	rs2030653	C	T	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=26;PP=755;SC=GGCCTGATGTCTTCCTGACAA;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=200677633;WS=200677615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	200684249	.	T	TA	322.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.59;ReadPosRankSum=-1.543;SOR=0.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr2	200710706	rs769960	T	G	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.48;ReadPosRankSum=-1.569;SOR=0.035;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr2	200776353	rs62178345	T	G	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.776;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=630;ReadPosRankSum=0.468;SC=CTGGAGCCGATCCGCAGCGCA;SOR=1.270;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=30;WE=200776361;WS=200776343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
chr2	200800493	rs6435039	A	G	216.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=169;SC=ACACACATACACACACACGCA;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=9;WE=200800501;WS=200800490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	200808455	rs16832081	A	G	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=474;ReadPosRankSum=-0.836;SC=ATAGATATTAATGCCTTCTTT;SOR=1.371;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=19;WE=200808463;WS=200808445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr2	200820505	rs281766	T	G	1881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=9;PP=1456;SC=CAGGCACCGGTGTGAAGGGTC;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=44;TCR=9;TR=53;WE=200820513;WS=200820495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	200873144	rs113489455	AATACAAAAAAAACTTG	A	1066.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=2.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=2.550;QD=7.26;ReadPosRankSum=-0.171;SOR=1.018;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,35:0.24:147
chr2	201194279	rs3739119	C	A	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=380;ReadPosRankSum=-1.710;SC=CCTGCAGCTGCCTCCTGGGAG;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=15;WE=201194287;WS=201194269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr2	201253956	rs842823	A	G	4335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=32;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.757;SC=GGCCTATTCCACTAGAAGCAA;SOR=1.511;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=154;TCF=122;TCR=32;TR=153;WE=201253964;WS=201253946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,155:0.99:156
chr2	201254049	rs3820881	G	C	6627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=123;PP=2965;SC=CTCCAAACTAGGTAATGCAGT;SOR=0.892;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=224;TCF=101;TCR=123;TR=224;WE=201254057;WS=201254039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr2	201254171	rs4674015	A	G	2757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=75;PP=2231;SC=CATAAGTAACATTTACTGAAA;SOR=4.150;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=8;TCR=76;TR=83;WE=201254179;WS=201254161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr2	201277011	.	CT	C	91.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.993;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=13.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQRankSum=2.203;QD=2.13;ReadPosRankSum=-0.854;SOR=0.034;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,11:0.26:43
chr2	201277181	rs6706953	T	C	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=631;ReadPosRankSum=1.848;SC=GATGTTAGACTTAAATATTCC;SOR=0.818;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=22;WE=201277189;WS=201277171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr2	201280996	rs5837739	CA	C	73.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.000;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.180;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr2	201334852	rs17532294	A	G	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=36;PP=960;ReadPosRankSum=1.170;SC=CGTGAGGTCTAAAGAGATTTA;SOR=1.487;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=36;WE=201334860;WS=201334842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,37:0.80:46
chr2	201354935	rs3795969	C	G	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.817;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=607;ReadPosRankSum=0.640;SC=GGAGGGCAGGCAAGGCGCGGT;SOR=0.868;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=98;TCF=58;TCR=40;TR=33;WE=201354943;WS=201354925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,33:0.34:97
chr2	201355106	rs13018579	G	A	1995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.929;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=41;PP=1591;ReadPosRankSum=0.712;SC=GCCCACCAGGGCCGTGGCTCT;SOR=0.986;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=108;TCF=51;TCR=57;TR=71;WE=201355114;WS=201355096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,72:0.67:108
chr2	201371768	rs3739116	G	T	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=2.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.09;ReadPosRankSum=-1.123;SOR=1.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,21:0.24:86
chr2	201397569	rs842940	G	A	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=179;ReadPosRankSum=-0.660;SC=CAGATTTTATGTAAAGTTTAG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=9;WE=201397577;WS=201397559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr2	201397647	rs842939	A	C	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=284;ReadPosRankSum=-1.565;SC=TATCAGTTATACTTTTTCTTT;SOR=0.859;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=14;WE=201397655;WS=201397637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr2	201437334	rs12052989	T	C	7734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=148;NR=92;PP=2965;SC=AAATCATCCCTGGAAACCTAG;SOR=1.311;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=241;TCF=149;TCR=92;TR=240;WE=201437342;WS=201437324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr2	201440939	rs66861543	CT	C	1134.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=39;PP=805;SC=ACCAAGGGGCCTTTTTTTTTT;SOR=2.737;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=50;TCF=4;TCR=46;TR=43;WE=201440947;WS=201440929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	201445152	rs4674194	C	T	343.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=213;ReadPosRankSum=-0.623;SC=ACTTCACTGACTTCTGCTTCA;SOR=0.275;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=15;WE=201445160;WS=201445142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr2	201451006	rs4470327	C	T	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=36;PP=1323;SC=GGCTTTCTCCCGTAACAGCGG;SOR=1.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=50;WE=201451014;WS=201450996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	201460104	rs7597590	A	G	2476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=58;PP=2023;SC=ACCGTGCAGCAAAGTCCAGAT;SOR=2.215;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=20;TCR=58;TR=78;WE=201460112;WS=201460094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	201464295	rs10179964	T	C	2130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=18;PP=1635;SC=TCATTAGGCCTGGGATGGGGC;SOR=1.965;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=69;WE=201464303;WS=201464285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	201466954	rs2248130	C	G	2723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=35;PP=2142;SC=TCTTGGTAGACTGTGCCTCTA;SOR=1.039;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=46;TCR=35;TR=81;WE=201466962;WS=201466944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	201468732	rs2293525	C	G	6450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=144;NR=50;PP=2965;SC=GATATGTTCTCTTTTTAGACA;SOR=2.105;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=195;TCF=145;TCR=50;TR=194;WE=201468740;WS=201468722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr2	201470233	rs35086177	ATTTT	A	1213.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=2;PP=590;SC=AGTCTTATTGATTTTTTTTTT;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=24;WE=201470244;WS=201470223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	201473674	rs2470902	G	A	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=8;PP=927;SC=AGCAGTGATCGCACTGTGTTA;SOR=2.432;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=37;WE=201473682;WS=201473664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	201474179	rs17593811	C	T	3050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=75;PP=2375;ReadPosRankSum=1.820;SC=AGCTGTTTCTCTACCCCTTTT;SOR=1.959;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=10;TCR=77;TR=85;WE=201474187;WS=201474169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,93:0.99:94
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chr2	201505953	rs11887334	C	T	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.069;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=623;ReadPosRankSum=-0.046;SC=AAGAGTGTTACATAAAATAAT;SOR=1.313;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=28;WE=201505961;WS=201505943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
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chr2	201521731	rs4674302	A	G	985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.917;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=33;PP=829;ReadPosRankSum=-1.816;SC=AAAACTATGAATGGATATTTT;SOR=0.230;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=56;TCF=7;TCR=49;TR=39;WE=201521739;WS=201521721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,37:0.67:55
chr2	201523736	rs10931910	A	G	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-5.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=353;ReadPosRankSum=0.804;SC=TTTTAGAAACAAGAAACTTTT;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=21;WE=201523744;WS=201523726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr2	201534136	rs2715907	C	T	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=352;SC=CACTACACTCCAGTGTCATGC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=201534144;WS=201534128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	201677454	rs2270281	C	T	2377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=4;PP=2007;SC=CAGGCATGACCTAGGGTAGGA;SOR=5.166;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=63;TCR=4;TR=67;WE=201677462;WS=201677444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr2	201677791	rs2270280	T	C	2499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=53;PP=2074;SC=TTTGTGCCTGTATCGGGTATA;SOR=2.062;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=74;TCF=20;TCR=54;TR=73;WE=201677799;WS=201677781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	201683695	rs2881880	T	C	2426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=55;PP=1895;SC=TGTGACTATATTTTTCTAAGA;SOR=2.463;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=17;TCR=55;TR=72;WE=201683703;WS=201683685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	201686122	rs3815501	T	C	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=30;PP=985;SC=TCTGATGCCATTTTGTACCTG;SOR=2.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=201686130;WS=201686112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	201686666	rs6705053	C	T	1349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=2;PP=1091;SC=GTGGTGGGCGCCTGTAGTTCC;SOR=5.186;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=39;WE=201686674;WS=201686656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	201719258	rs5837758	CA	C	298.37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=1.941;NF=14;NR=0;PP=140;ReadPosRankSum=-0.333;SC=GACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SOR=2.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=14;WE=201719266;WS=201719248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,17:0.89:19
chr2	201736112	rs11892119	T	C	6892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.999;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=129;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.758;SC=TCCAGGTCTATCATAGCTACT;SOR=0.943;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=213;TCF=84;TCR=129;TR=212;WE=201736120;WS=201736102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,220:1.00:221
chr2	201736166	rs7562391	A	C	5061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.388;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=108;PP=2965;ReadPosRankSum=0.420;SC=TAATGTGTACATCATTAAGAG;SOR=2.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=35;TCR=109;TR=142;WE=201736174;WS=201736156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,150:0.99:152
chr2	201768238	rs7917	C	T	5866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=110;NR=67;PP=2965;SC=CATCATGATACTTTGGATGCT;SOR=1.333;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=110;TCR=67;TR=177;WE=201768246;WS=201768228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr2	201785657	rs2307358	T	C	1567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=0;PP=1246;SC=TTTATATTAATAGAATTTGTC;SOR=7.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=45;WE=201785665;WS=201785647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	201785837	rs2307362	G	A	4157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=100;PP=2965;SC=AATTGTGGATGAGAAGGAAGA;SOR=2.676;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=27;TCR=100;TR=127;WE=201785845;WS=201785815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr2	201881677	rs13405753	A	G	3002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=2;PP=2497;ReadPosRankSum=0.126;SC=ACCTTAAAAAATACTTAAAAT;SOR=5.330;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=85;TCF=83;TCR=2;TR=84;WE=201881685;WS=201881667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,87:0.99:88
chr2	201950456	rs150160270	A	AAT	1436.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.21;MQRankSum=0.316;QD=35.04;ReadPosRankSum=0.805;SOR=3.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr2	201994540	rs10931931	C	T	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.494;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=215;ReadPosRankSum=-0.047;SC=TTGACTGGCCCGGAGCTGTAC;SOR=1.675;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=47;TCR=4;TR=14;WE=201994548;WS=201994530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,14:0.26:53
chr2	202006096	rs10190751	G	A	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=259;ReadPosRankSum=0.165;SC=CTCTTCTACAGATGATAACAC;SOR=0.610;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=58;TCF=31;TCR=27;TR=16;WE=202006104;WS=202006086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,20:0.31:64
chr2	202025131	rs2518142	G	A	4888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=114;NR=41;PP=2965;SC=GTTGTTTTCCGTGTTTGTTTT;SOR=2.185;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=157;TCF=116;TCR=41;TR=155;WE=202025139;WS=202025121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr2	202025621	rs1594	A	G	952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.162;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=38;PP=752;ReadPosRankSum=0.300;SC=ACAGCTCACCATCCCTGTACC;SOR=1.888;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=139;TCF=30;TCR=109;TR=42;WE=202025629;WS=202025611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,44:0.30:145
chr2	202027942	rs12721503	T	C	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=544;ReadPosRankSum=0.322;SC=GAAGGCTTTGTTATATAAACA;SOR=1.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=22;WE=202027950;WS=202027932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr2	202070735	rs6712872	A	T	920.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=29;PP=959;SC=TAATAAAAAAATTTTTTTTCC;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=35;WE=202070743;WS=202070725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	202074207	rs17860405	A	G	3498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.322;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=79;PP=2744;ReadPosRankSum=-0.693;SC=GTCCCAGGCTATGTATCCTTT;SOR=0.854;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=174;TCF=59;TCR=115;TR=118;WE=202074215;WS=202074197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,125:0.69:182
chr2	202082459	rs13006529	T	A	5977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=89;NR=91;PP=2965;SC=TGCACTTTCATTATAGCAGAG;SOR=0.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=89;TCR=91;TR=180;WE=202082467;WS=202082449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr2	202122995	rs3769823	A	G	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=0.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.69;ReadPosRankSum=-0.778;SOR=0.783;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,41:0.27:150
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chr2	202131426	.	G	A	1623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.000;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.636;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=35;PP=1214;ReadPosRankSum=-0.285;SC=TAATAGACTGGATTTGCTGAT;SOR=1.199;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=110;TCF=48;TCR=62;TR=55;WE=202131434;WS=202131416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,60:0.52:115
chr2	202131459	.	G	C	1567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=0.000;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.626;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=36;PP=1218;ReadPosRankSum=-0.178;SC=CACTAGAAAGGAGGAGATGGA;SOR=0.910;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=98;TCF=38;TCR=60;TR=56;WE=202131467;WS=202131449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,60:0.58:104
chr2	202139648	.	C	T	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.261;ClippingRankSum=0.000;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=24;PP=857;ReadPosRankSum=0.372;SC=ATCTCGGACTCTCCAAGAGAA;SOR=0.655;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=121;TCF=58;TCR=63;TR=48;WE=202139656;WS=202139638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,47:0.39:120
chr2	202139739	.	CT	C	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.05;ReadPosRankSum=0.341;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,10:0.28:36
chr2	202146656	.	C	T	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.453;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=20.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.82;MQRankSum=-7.127;QD=2.43;ReadPosRankSum=-0.181;SOR=4.378;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,24:0.38:64
chr2	202151163	rs3769818	A	G	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=7.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.338;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=4;PP=793;ReadPosRankSum=0.129;SC=CAGTCACAATATTATGTGATG;SOR=0.390;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=135;TCF=124;TCR=11;TR=41;WE=202151171;WS=202151153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,41:0.30:135
chr2	202153225	rs700635	C	A	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=178;ReadPosRankSum=-0.696;SC=AATTCAGATGCGAATTCAAAC;SOR=0.116;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=12;WE=202153233;WS=202153215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,12:0.25:48
chr2	202154397	rs6715284	C	G	1022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.524;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=861;ReadPosRankSum=2.894;SC=CAACCCCCATCCCCACTCCAG;SOR=0.986;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=114;TCF=54;TCR=60;TR=43;WE=202154405;WS=202154387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,42:0.37:115
chr2	202173812	rs16837131	C	A	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=474;ReadPosRankSum=0.430;SC=AAGTCAAGACCAAACTTCATG;SOR=0.507;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=54;TCR=0;TR=24;WE=202173820;WS=202173802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr2	202195311	rs2272390	G	A	1883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.315;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=33;PP=1472;ReadPosRankSum=-0.678;SC=AAATTCAAATGTGAGTTCTTC;SOR=1.021;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=266;TCF=154;TCR=112;TR=88;WE=202195319;WS=202195301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,87:0.32:271
chr2	202211443	rs1406122	C	T	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.318;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=42;PP=1040;ReadPosRankSum=-1.172;SC=ACTTGGAGTGCTGAGATTTTT;SOR=1.089;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=144;TCF=47;TCR=97;TR=58;WE=202211451;WS=202211433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,59:0.40:148
chr2	202211458	rs144460714	ATCT	A	2967.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.330;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.843;NF=14;NR=49;PP=2738;ReadPosRankSum=0.349;SC=ATTTTTCCAAATCTTCTCTTA;SOR=0.259;SbPval=0.06;Source=Platypus;TC=115;TCF=15;TCR=100;TR=63;WE=202211468;WS=202211448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,76:0.59:128
chr2	202213147	rs112503110	A	AT	403.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.292;NF=0;NR=14;PP=483;ReadPosRankSum=0.284;SC=TTCTTAGGGGATCCCTAGGAT;SOR=0.716;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=14;WE=202213155;WS=202213137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr2	202215409	rs71022364	C	CAAAACAAAACAAAACAA	380.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=2.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQRankSum=-3.207;QD=12.69;ReadPosRankSum=0.466;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr2	202215492	rs13014235	C	G	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.600;NF=13;NR=11;PP=349;ReadPosRankSum=-1.145;SC=GGAGCTGGTACAAGAGGAGTT;SOR=0.643;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=86;TCF=45;TCR=41;TR=24;WE=202215500;WS=202215482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,25:0.29:87
chr2	202245244	rs3795966	A	G	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=106;ReadPosRankSum=-0.434;SC=ACTTGTATAAAAGGTCAGTTA;SOR=0.471;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=9;WE=202245252;WS=202245234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,9:0.22:41
chr2	202245423	rs34594680	A	T	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=3.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.07;ReadPosRankSum=0.740;SOR=1.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,24:0.23:104
chr2	202245944	rs3832088	TAA	T	1112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.826;HP=17;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=934;ReadPosRankSum=1.653;SC=ACCCAGAGCTTAAAAAAAAAA;SOR=0.297;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=17;TCR=64;TR=32;WE=202245963;WS=202245934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,31:0.44:70
chr2	202245955	rs72937131	A	G	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=3.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.48;ReadPosRankSum=4.259;SOR=0.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,31:0.40:77
chr2	202248788	rs7579617	T	C	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.215;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=4;PP=561;ReadPosRankSum=0.230;SC=CATGAAAATATAGCTGAGGAA;SOR=0.480;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=120;TCF=107;TCR=13;TR=33;WE=202248796;WS=202248778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,34:0.28:121
chr2	202248979	rs7579853	T	A	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.985;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=37;PP=787;ReadPosRankSum=-1.446;SC=AGATTGAAAGTCTAGATTAAT;SOR=0.297;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=135;TCF=15;TCR=120;TR=44;WE=202248987;WS=202248969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,46:0.33:139
chr2	202249060	rs2540328	C	T	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-4.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=361;ReadPosRankSum=0.527;SC=TAAAAATCCCCAAATCTGGAA;SOR=1.044;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=18;WE=202249068;WS=202249050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr2	202252478	rs35620793	A	G	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=5;PP=863;ReadPosRankSum=1.155;SC=CTCGAAGGCAACTGGCACTGC;SOR=0.547;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=63;TCF=55;TCR=8;TR=35;WE=202252486;WS=202252468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,36:0.57:63
chr2	202252539	rs2244438	G	A	1807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.778;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=16;PP=1377;ReadPosRankSum=-0.919;SC=AAGGCTCTCTGTCGGGGTGAC;SOR=1.047;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=115;TCF=84;TCR=31;TR=64;WE=202252547;WS=202252529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,67:0.57:117
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chr2	202257930	rs3815515	C	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=171;ReadPosRankSum=-0.627;SC=AAGCAAGAAGCGTATATATAT;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=7;WE=202257938;WS=202257920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr2	202259903	rs144631526	AC	A	453.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.743;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.395;NF=18;NR=0;PP=651;ReadPosRankSum=-1.405;SC=GATGATTAAAACAGCAATCAG;SOR=2.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=18;WE=202259911;WS=202259893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr2	202260049	rs2256584	G	A	4542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=94;NR=45;PP=2965;SC=CTTTAAGTTTGTGCTGAAGGT;SOR=1.691;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=94;TCR=45;TR=139;WE=202260057;WS=202260039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr2	202264156	rs13022344	C	T	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.484;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=604;ReadPosRankSum=0.040;SC=TCAGATAAGACATGGTTCCGC;SOR=0.414;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=135;TCF=57;TCR=78;TR=37;WE=202264164;WS=202264146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,39:0.27:143
chr2	202264316	rs6732993	C	T	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=21;ReadPosRankSum=0.637;SC=AAAGCAACGTCCTAGAAAGCA;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=4;WE=202264324;WS=202264306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr2	202284236	rs113582398	C	CTTAAT	1303.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.768;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=1321;ReadPosRankSum=1.048;SC=AACAAGCAAACTTAAAGTGGC;SOR=1.411;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=103;TCF=58;TCR=45;TR=28;WE=202284244;WS=202284226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,36:0.32:113
chr2	202285100	rs4507084	A	G	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=315;ReadPosRankSum=-0.632;SC=ATTTTCTCCTATAAGCGATAG;SOR=0.790;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=16;WE=202285108;WS=202285090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,17:0.34:50
chr2	202342802	rs2243791	T	C	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.989;NF=28;NR=0;PP=706;ReadPosRankSum=0.958;SC=ATTAATTGTGTCCTACAGGAT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=28;WE=202342810;WS=202342792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr2	202344179	rs34469362	GT	G	485.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=292;SC=TAATATAAAGGTTTTTTTTTT;SOR=4.615;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=15;WE=202344187;WS=202344169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	202352649	rs2714481	A	G	1702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=45;PP=1373;SC=TAAAAGATCCAATTGGTAAAT;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=45;WE=202352657;WS=202352639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	202357949	rs2714482	A	C	2620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.677;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=20;PP=1982;ReadPosRankSum=-0.692;SC=TTGTCTTTACAAAGCCTCTGA;SOR=2.048;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=79;TCF=58;TCR=21;TR=78;WE=202357957;WS=202357939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,84:0.99:85
chr2	202358395	rs6743951	T	C	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=7.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.34;ReadPosRankSum=-2.546;SOR=1.545;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,26:0.25:106
chr2	202358589	rs73991611	G	A	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.250;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=659;ReadPosRankSum=-0.882;SC=CATCAGCTTCGAAGTGTTTTT;SOR=1.211;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=77;TCF=50;TCR=27;TR=33;WE=202358597;WS=202358579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,33:0.43:77
chr2	202402250	rs3083390	AAC	A	126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.368;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.556;NF=0;NR=5;PP=157;ReadPosRankSum=-0.613;SC=AAAAACAATAAACACATATGT;SOR=2.964;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=5;WE=202402259;WS=202402240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr2	202410147	rs10931955	C	A	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=181;ReadPosRankSum=1.691;SC=AGTGAAATGCCTATTTATTTC;SOR=0.293;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=9;WE=202410155;WS=202410137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr2	202410300	rs10804117	A	T	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=444;ReadPosRankSum=1.023;SC=CCTCTTCAGGATGATTACTTT;SOR=0.859;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=14;TCR=16;TR=22;WE=202410308;WS=202410290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,24:0.75:32
chr2	202410395	rs10931956	G	C	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.284;NF=0;NR=11;PP=164;ReadPosRankSum=-1.252;SC=AATATATATGGGAAAATATTT;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=11;WE=202410403;WS=202410385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr2	202430428	.	ATTT	A	654.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.79;ReadPosRankSum=1.894;SOR=0.267;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr2	202430432	.	T	A	663.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.02;ReadPosRankSum=2.811;SOR=0.267;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr2	202430584	rs73991652	G	A	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.732;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=526;ReadPosRankSum=-0.316;SC=TGTCTGTGGTGTAATAACTTT;SOR=1.319;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=100;TCF=30;TCR=70;TR=33;WE=202430592;WS=202430574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,35:0.33:105
chr2	202430679	rs147482125	T	TTC	313.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=349;ReadPosRankSum=-0.293;SC=TTTTGAACCCTTCTCTTTTAC;SOR=0.430;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=10;WE=202430687;WS=202430669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr2	202436645	rs58588240	C	T	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.756;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=578;ReadPosRankSum=0.106;SC=ACCATATTAACGAGACTTAAA;SOR=0.269;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=114;TCF=73;TCR=41;TR=32;WE=202436653;WS=202436635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,33:0.28:117
chr2	202436684	rs55872838	T	A	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.989;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.285;NF=13;NR=20;PP=588;ReadPosRankSum=-1.515;SC=CTGTTCTTTCTGGAGGTGGTG;SOR=0.943;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=114;TCF=59;TCR=55;TR=33;WE=202436692;WS=202436674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,34:0.28:121
chr2	202436753	rs60615067	AT	A	507.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.563;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.404;NF=2;NR=16;PP=566;ReadPosRankSum=-0.242;SC=ACTGAAAAAAATGTAAGTGTA;SOR=0.197;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=67;TCF=4;TCR=63;TR=18;WE=202436761;WS=202436743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,20:0.26:76
chr2	202436782	rs55688187	T	A	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.69;ReadPosRankSum=1.123;SOR=0.067;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,9:0.20:46
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chr2	202504757	rs55754648	T	C	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=63;ReadPosRankSum=-1.691;SC=CCAACAGTTATGTGCTGGGTG;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=5;WE=202504765;WS=202504747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr2	202505545	rs56321285	G	A	289.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=209;SC=AATGATACTAGTCAATTTTTC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=202505553;WS=202505535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	202505740	rs2540424	T	A	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=403;SC=TTTGAGATGGTGTATTGCTGT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=202505748;WS=202505730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	202507982	rs6723016	T	C	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.016;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=977;ReadPosRankSum=1.954;SC=CCTTAGTGATTCCCAGCTCGT;SOR=0.536;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=72;TCF=50;TCR=22;TR=47;WE=202507990;WS=202507972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,46:0.65:71
chr2	202509814	rs3754932	T	C	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=351;ReadPosRankSum=1.448;SC=AATTAATAAATTGCTGCACTT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=14;WE=202509822;WS=202509804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr2	202523347	rs2597900	C	T	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.636;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=35;PP=632;ReadPosRankSum=-0.360;SC=CCTTAGTAGACGGCAGCAGAG;SOR=1.155;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=134;TCF=19;TCR=115;TR=39;WE=202523355;WS=202523337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,39:0.28:137
chr2	202534303	rs145833090	TATAGGAAGAGCTTAA	T	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.80;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr2	202555132	rs2287050	T	C	3260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=89;PP=2456;ReadPosRankSum=-1.005;SC=GTGTGGTTGGTGTTTAGTAAG;SOR=1.661;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=110;TCF=20;TCR=90;TR=109;WE=202555140;WS=202555122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,116:0.99:117
chr2	202557702	rs6725443	C	T	2094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=41;PP=1662;SC=ACATCTCTGCCGTAGAACAGA;SOR=1.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=60;WE=202557710;WS=202557692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr2	202558687	rs10931969	C	T	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=778;ReadPosRankSum=1.425;SC=TCCTCCCTGCCGGAGCTTCTG;SOR=0.823;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=35;WE=202558695;WS=202558677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,38:0.68:56
chr2	202566741	rs7603563	T	C	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.25;ReadPosRankSum=0.076;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr2	202569963	rs116564093	T	C	1474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.236;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=35;PP=1114;ReadPosRankSum=-1.045;SC=GAAAACTATTTTCTGCAACAA;SOR=0.569;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=199;TCF=72;TCR=127;TR=57;WE=202569971;WS=202569953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,61:0.30:204
chr2	202569992	rs3219171	A	T	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=3.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.240;SOR=1.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,38:0.25:154
chr2	202570232	rs3219170	A	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=27;ReadPosRankSum=0.491;SC=ACTTATGGTAAACAAAATCCC;SOR=0.446;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=5;WE=202570240;WS=202570222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr2	202571562	rs3219169	C	T	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=0.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.96;ReadPosRankSum=0.834;SOR=0.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,43:0.24:182
chr2	202572806	rs2058662	C	G	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.091;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=95;ReadPosRankSum=-0.576;SC=TGAGAGCAAGCTTTATTATCA;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=202572814;WS=202572796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr2	202574825	rs1210940	C	T	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=21;PP=558;SC=AATCCATCAACAAGAAACAAC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=202574833;WS=202574815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	202575821	rs3219168	G	A	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.832;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=448;ReadPosRankSum=-1.702;SC=GAACGACTCAGTATTTCTGGA;SOR=0.697;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=98;TCF=48;TCR=50;TR=28;WE=202575829;WS=202575811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,30:0.29:102
chr2	202575942	rs10200479	C	T	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=123;ReadPosRankSum=0.684;SC=GAGCATCCAACGTAGTACTAA;SOR=0.247;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=8;WE=202575950;WS=202575932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
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chr2	202589257	rs3219163	T	C	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=30;PP=575;ReadPosRankSum=-0.382;SC=GTTTAGAAAATCCAAAACCAT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=100;TCF=1;TCR=99;TR=30;WE=202589265;WS=202589247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,29:0.29:99
chr2	202593459	rs7601642	A	G	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=264;ReadPosRankSum=-0.028;SC=ATTTAAGGGAATTTGCTGGTC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=13;WE=202593467;WS=202593449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr2	202606639	rs3731703	G	A	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=41;PP=1059;ReadPosRankSum=-0.841;SC=TTATTATGATGTGATTATGAT;SOR=1.282;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=57;TCF=3;TCR=54;TR=43;WE=202606647;WS=202606629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,47:0.71:66
chr2	202608877	rs4673207	C	A	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=628;ReadPosRankSum=-0.369;SC=CAGTGCATAGCAAGAAGTAAA;SOR=0.420;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=43;TCF=42;TCR=1;TR=26;WE=202608885;WS=202608867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr2	202622509	rs28729117	T	C	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.94;ReadPosRankSum=1.003;SOR=0.888;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,22:0.31:71
chr2	202625615	rs3219156	C	T	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.244;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=26;PP=995;ReadPosRankSum=0.156;SC=TGAGATGGCACTGGCTTTTCA;SOR=0.558;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=179;TCF=103;TCR=76;TR=58;WE=202625623;WS=202625605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,59:0.32:187
chr2	202633582	rs3219153	A	G	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.753;NF=18;NR=20;PP=629;ReadPosRankSum=-0.920;SC=GGAAGAAATGATTTTACCTTC;SOR=0.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=45;TCR=51;TR=38;WE=202633590;WS=202633572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,36:0.38:96
chr2	202633725	rs10655798	T	TA	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.43;ReadPosRankSum=-1.499;SOR=0.052;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr2	202671381	rs2192672	C	G	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.725;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=412;ReadPosRankSum=0.815;SC=CTTGAACCTACAAGATTATGG;SOR=0.307;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=17;WE=202671389;WS=202671371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr2	202672143	rs3214362	G	GA	473.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=468;ReadPosRankSum=1.157;SC=GGCAAATAAAGAAAAAATGGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=17;WE=202672151;WS=202672133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr2	202688293	rs4675229	A	G	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=1;PP=821;SC=TGTACTTCGTAATACCTTCTG;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=202688301;WS=202688283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	202698422	.	A	ATCTTCTTCT	798.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=3.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=0.017;QD=21.02;ReadPosRankSum=0.898;SOR=0.139;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr2	202712095	rs917958	A	C	2368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=23;PP=1878;SC=CTCTTATTTCATTTGCTAGGG;SOR=1.516;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=71;WE=202712103;WS=202712085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	202737075	rs201971784	TTTAAGGGA	T	1256.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=1.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.67;ReadPosRankSum=1.432;SOR=0.341;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,39:0.30:130
chr2	202737085	rs374280027	CTTT	C	1287.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=1.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.91;ReadPosRankSum=1.253;SOR=0.315;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,39:0.33:118
chr2	202737088	.	T	C	2530	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=1;NR=28;PP=2530;QD=20;SC=AAGGGATCTTTAAGCAGGATT;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=98;TCF=5;TCR=93;TR=29;WE=202737096;WS=202737056;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:69,29:0.30:98
chr2	202741064	rs2072504	G	A	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.75;ReadPosRankSum=1.542;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr2	202741256	rs4675235	A	T	2238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=25;PP=1264;SC=GGAGGAAGAGACTTCACTTGC;SOR=0.853;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=24;TCR=25;TR=49;WE=202741277;WS=202741246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	202741269	rs4675236	G	A	2276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=29;PP=1280;SC=TCACTTGCCCGCTTTGCCCTG;SOR=1.022;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=53;TCF=23;TCR=30;TR=52;WE=202741277;WS=202741246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	202939654	rs10221698	T	C	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.828;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=467;ReadPosRankSum=1.107;SC=TATGTTCCTGTCAGCAAACCT;SOR=0.537;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=52;TCR=44;TR=28;WE=202939662;WS=202939644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,29:0.28:104
chr2	202955454	rs1568535	G	C	3957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=85;NR=36;PP=2965;SC=TGGCTCAGGGGTCAGCAGCTG;SOR=1.807;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=124;TCF=88;TCR=36;TR=121;WE=202955462;WS=202955444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr2	202964380	rs2882486	G	A	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=178;ReadPosRankSum=0.123;SC=CTTCAAAGGAGAGCTACAATG;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=15;WE=202964388;WS=202964370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,16:0.32:50
chr2	202964528	rs2350722	T	C	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.394;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=265;ReadPosRankSum=0.858;SC=CGGTAAGAACTCAAATGTCTT;SOR=0.368;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=62;TCF=21;TCR=41;TR=17;WE=202964536;WS=202964518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,21:0.30:69
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chr2	203000730	rs9679591	A	T	3010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.11;SOR=1.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
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chr2	203003066	rs3043926	G	GGTGT	3349.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=0;PP=2387;SC=ATATGAACTAGGTGTGTGTGT;SOR=8.554;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=78;TCF=77;TCR=1;TR=58;WE=203003074;WS=203003056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	203003085	rs16838883	T	C	2347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.220;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=5;PP=1750;ReadPosRankSum=0.852;SC=GTGTGTATGGTATATATAAAA;SOR=1.094;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=113;TCF=102;TCR=11;TR=76;WE=203003093;WS=203003075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,81:0.68:120
chr2	203029951	rs7582695	T	A	2089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=2;PP=1872;ReadPosRankSum=-0.854;SC=AGAAGTGTTTTAAGTGTTTGC;SOR=4.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=68;TCF=66;TCR=2;TR=66;WE=203029959;WS=203029941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr2	203051886	rs6722588	C	T	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=24;PP=740;SC=GGATACCATGCACAGTTGTAT;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=203051894;WS=203051876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	203072693	rs55694983	A	G	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=81;ReadPosRankSum=-0.859;SC=CAGCCTCCCAAAGTGCTAGGA;SOR=1.445;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=6;WE=203072701;WS=203072683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr2	203079307	rs3769817	T	C	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=340;SC=TTTAGCATTCTTAACAGGTTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=203079315;WS=203079297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	203139738	rs11397579	A	AC	486.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=623;SC=AATAGCTTCTACACCTTCATT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=14;WE=203139746;WS=203139728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	203139844	rs80282360	T	C	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=233;ReadPosRankSum=0.518;SC=AGGTTCTAAATGAGAAGAAAC;SOR=0.840;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=14;WE=203139852;WS=203139834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
chr2	203152355	rs7572505	G	A	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.765;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=466;ReadPosRankSum=-0.249;SC=ATGCTATCTTGCTAATTTATT;SOR=1.805;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=88;TCF=72;TCR=16;TR=28;WE=203152363;WS=203152345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,27:0.31:88
chr2	203154953	rs1474001	G	A	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=38;ReadPosRankSum=0.926;SC=ATGAGCCACCGTGCCCAGCCT;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=4;WE=203154961;WS=203154943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr2	203155015	rs11310035	GT	G	184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=194;ReadPosRankSum=0.473;SC=ATCCCTTTAAGTTTTGTTTGT;SOR=0.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=8;WE=203155023;WS=203155005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr2	203155936	rs3731700	A	C	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.758;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=22;PP=689;ReadPosRankSum=-1.803;SC=CAGAGATATCAATGGGAACAG;SOR=0.416;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=115;TCF=40;TCR=75;TR=37;WE=203155944;WS=203155926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,37:0.33:113
chr2	203384776	rs11390605	C	CT	1033.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=10.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=-0.168;QD=18.80;ReadPosRankSum=2.462;SOR=3.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,47:0.85:55
chr2	203421199	rs1061157	G	A	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.437;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=25;PP=788;ReadPosRankSum=-1.117;SC=GAGCACAGAGGCCTAATTCTC;SOR=0.551;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=141;TCF=58;TCR=83;TR=45;WE=203421207;WS=203421189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,46:0.32:144
chr2	203651278	rs55689177	CA	C	1666.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=7;PP=1109;SC=GACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=4.080;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=81;TCF=71;TCR=10;TR=59;WE=203651286;WS=203651268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	203651475	.	ATT	A,ATTT	884.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.549;NF=2,2;NR=26,26;PP=329,164;ReadPosRankSum=-0.121;SC=TACATGCATGATTTTTTTTTT;SOR=1.075;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=55;TCF=2;TCR=53;TR=28,28;WE=203651484;WS=203651465;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.71:41
chr2	203661779	rs6704822	A	G	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=369;SC=CAAGTGTTCAATTGACCAAAT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=203661787;WS=203661769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	203679306	rs72932767	T	C	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=304;ReadPosRankSum=-1.182;SC=TTAGTGTTGATTGGAAAAATG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=13;WE=203679314;WS=203679296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr2	203682304	rs72932772	C	G	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=625;ReadPosRankSum=-0.646;SC=CAGATATATACTATAAATATA;SOR=5.058;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=23;WE=203682312;WS=203682294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,24:0.96:25
chr2	203686059	rs114889031	A	G	3491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.468;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=39;PP=2693;ReadPosRankSum=0.932;SC=CAGATTCAAGATAATGAACAA;SOR=0.547;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=176;TCF=124;TCR=52;TR=127;WE=203686067;WS=203686049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,129:0.73:177
chr2	203686234	rs143506102	GTTTCC	G	1911.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=60.14;MQRankSum=0.662;NF=2;NR=38;PP=1865;ReadPosRankSum=3.139;SC=GTAGTTAATTGTTTCCTTTCA;SOR=1.314;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=66;TCF=2;TCR=64;TR=40;WE=203686246;WS=203686224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,48:0.72:67
chr2	203690387	rs1344959	G	A	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=5;PP=1048;SC=TTTAAATGGGGATTATCAGAT;SOR=3.383;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=203690395;WS=203690377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	203693559	rs4675296	C	G	6921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=141;NR=67;PP=2965;SC=TACATAGAATCCTCAAATTTA;SOR=1.677;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=208;TCF=141;TCR=67;TR=208;WE=203693567;WS=203693549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr2	203747522	rs72934751	A	G	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=458;ReadPosRankSum=-0.111;SC=AGATGAAAATATTAACATATT;SOR=0.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=24;WE=203747530;WS=203747512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr2	203748544	rs34788166	A	AT,ATT	2617.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.76;QD=33.56;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,28,50:0.36,0.64:78
chr2	203748594	rs10196719	A	G	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=39;PP=1149;SC=GGAGTGCAGTAGTGCAATCTT;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=40;WE=203748602;WS=203748584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	203749392	rs3050865	C	CTTT	1099.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=19;PP=991;SC=CTTATTTCTTCCTTTACAATG;SOR=5.136;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=20;WE=203749400;WS=203749382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	203765756	rs35212307	T	C	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=229;ReadPosRankSum=2.466;SC=ACTGATGAGATGTTCTCCATT;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=11;WE=203765764;WS=203765746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr2	203806724	rs75869289	C	T	4956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.996;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=97;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.639;SC=AGCTGGGAACCTTTTTCCATC;SOR=0.462;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=271;TCF=117;TCR=154;TR=177;WE=203806732;WS=203806714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,184:0.65:284
chr2	203817257	.	A	AT	1343.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.000;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.453;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.601;NF=48;NR=7;PP=630;ReadPosRankSum=0.272;SC=TATGCATTTGATTTTTTTTTT;SOR=1.730;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=131;TCF=103;TCR=28;TR=55;WE=203817265;WS=203817247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,66:0.52:128
chr2	203820275	rs3731695	T	C	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=-1.383;SC=TCTGTAGTTATTGTTAAAATT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=203820283;WS=203820265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr2	203836507	rs72928608	G	C	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.093;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=530;ReadPosRankSum=0.808;SC=AGTTTTGTTTGTTGCTTTAAA;SOR=1.402;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=21;WE=203836515;WS=203836497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr2	203846817	rs72932557	A	T	3915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.974;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.692;NF=106;NR=35;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.185;SC=CAACCAAGGTACACCTCTCCT;SOR=0.979;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=207;TCF=152;TCR=55;TR=141;WE=203846825;WS=203846807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,144:0.68:211
chr2	203848402	rs72932561	G	A	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=29;PP=767;ReadPosRankSum=-0.021;SC=GTCTTAGAAAGGAAGGTGAAT;SOR=1.280;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=30;WE=203848410;WS=203848392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,29:0.78:37
chr2	203880992	rs2351524	T	C	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=175;ReadPosRankSum=0.837;SC=TTTTGCTTTCTTTACTGCTAT;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=8;WE=203881000;WS=203880982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr2	203921270	rs4673241	A	G	1163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=28;PP=931;SC=TTTACTGAGAACAACTAGGTT;SOR=2.432;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=36;WE=203921278;WS=203921260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	203933339	rs72934514	A	G	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=107;ReadPosRankSum=-1.207;SC=GGAGTAAGCTACATGATTTGT;SOR=0.169;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=203933347;WS=203933329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr2	203990789	rs72934556	T	G	2914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.112;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=42;PP=2102;ReadPosRankSum=0.297;SC=CCCATGGAGTTGCAACTCTTG;SOR=0.986;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=153;TCF=88;TCR=65;TR=105;WE=203990797;WS=203990779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,111:0.70:159
chr2	203996870	rs6748898	A	G	4436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=121;PP=2965;SC=GAATAAGGCTAATAAAGCTAA;SOR=6.917;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=124;TCF=3;TCR=121;TR=124;WE=203996878;WS=203996860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr2	204002809	rs10180815	A	C	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=642;SC=CTCTCAAGCTATTTTGTTTTG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=204002817;WS=204002799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	204036545	.	C	CT	62	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=63.51;NF=4;NR=0;PP=62;QD=16.5;SC=CCTGTTGTACCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=204036553;WS=204036535;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,4:0.57:7
chr2	204054834	rs62182253	G	A	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=489;SC=ACTCCAGCCTGGGCAACAGAG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=17;WE=204054842;WS=204054824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	204062061	rs4675323	A	G	7243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=116;PP=2965;SC=AAAGGCCACCATCCCCAAAAA;SOR=0.759;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=239;TCF=123;TCR=116;TR=239;WE=204062069;WS=204062051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr2	204090887	rs2351773	C	G	2233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=28;PP=1837;SC=TGAACCTTTACCTACTAGCAC;SOR=1.042;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=40;TCR=28;TR=68;WE=204090895;WS=204090877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	204111394	rs13015873	T	C	1758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=0;PP=947;SC=CATTTATTGATACAGTTAATT;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=34;WE=204111409;WS=204111384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	204111398	rs10586509	GTTAA	G	1783.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=0;PP=1492;SC=TATTGATACAGTTAATTCAGA;SOR=6.043;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=204111409;WS=204111384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	204111443	rs6435176	A	G	2701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=11;PP=2235;SC=TCCAAATTAAATTGATTATTT;SOR=3.556;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=68;TCR=11;TR=79;WE=204111451;WS=204111433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr2	204111705	rs6751894	T	C	1831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=56;PP=1399;SC=ATGTTTAGGCTGGGCACGGTG;SOR=4.615;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=4;TCR=56;TR=60;WE=204111713;WS=204111695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
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chr2	204154677	rs114407963	A	T	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.49;ReadPosRankSum=-0.520;SOR=1.259;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
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chr2	204206977	rs4675333	C	T	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=34;PP=1070;SC=GGACCAAGTCCAGTTCTGTTA;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=46;WE=204206985;WS=204206967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
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chr2	204261723	rs3731652	G	C	5964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=129;PP=2965;SC=GCAGGCAGATGCAGTCATCTG;SOR=1.987;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=51;TCR=129;TR=180;WE=204261731;WS=204261713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr2	204267570	.	G	C	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=534;ReadPosRankSum=-1.291;SC=ACCATTTGTTGAATGAATGGG;SOR=0.412;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=21;WE=204267578;WS=204267560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr2	204304026	rs368201180	CACAT	C	373.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=501;ReadPosRankSum=-0.089;SC=TGTACACACACACATACACAT;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=10;WE=204304037;WS=204304016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr2	204305093	rs3814365	T	C	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.663;SOR=0.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,35:0.28:126
chr2	204322298	rs2469953	T	C	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=4.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.61;ReadPosRankSum=-0.529;SOR=1.110;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,44:0.26:167
chr2	204355822	rs2469962	G	A	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.441;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=196;ReadPosRankSum=-1.316;SC=GAACTTGGTCGAGTTATGCAT;SOR=0.036;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=12;WE=204355830;WS=204355812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr2	204594512	rs3116496	T	C	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.429;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=38;PP=748;ReadPosRankSum=0.491;SC=GAAGCAGCACTGCTTTTATGT;SOR=0.846;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=150;TCF=48;TCR=102;TR=54;WE=204594520;WS=204594502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,56:0.36:156
chr2	204732714	rs231775	A	G	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.350;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=5;PP=583;ReadPosRankSum=-0.726;SC=GAACCTGGCTACCAGGACCTG;SOR=1.117;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=101;TCF=79;TCR=22;TR=33;WE=204732722;WS=204732704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,33:0.32:103
chr2	204732850	rs231776	A	G	3992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=91;PP=2965;SC=CAGCAGTCAAAGGCAGTGATT;SOR=2.689;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=25;TCR=91;TR=116;WE=204732858;WS=204732840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr2	204821494	rs4264550	C	T	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.554;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=37;PP=917;ReadPosRankSum=0.999;SC=AAAAGGTAAGCGATTTCTATC;SOR=1.938;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=62;TCF=3;TCR=59;TR=38;WE=204821502;WS=204821484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,39:0.61:64
chr2	204824178	rs146016344	AGT	A,AGTGT	1638.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=37.24;ReadPosRankSum=1.696;SOR=6.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,31,12:0.70,0.27:44
chr2	204824200	rs78281070	T	C	1641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.703;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=3;PP=1003;ReadPosRankSum=0.503;SC=TGTGTGTGTGTGCACGTGTGT;SOR=1.727;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=67;TCF=60;TCR=7;TR=44;WE=204824208;WS=204824190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,46:0.67:69
chr2	204824283	rs10172036	T	G	6299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=130;NR=61;PP=2965;SC=AGCATTTAGATAATTTATGCT;SOR=1.597;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=130;TCR=61;TR=191;WE=204824291;WS=204824273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr2	204824324	rs10183087	A	C	6961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=126;NR=88;PP=2965;ReadPosRankSum=1.118;SC=ACCCTATAATATGGAACTCTG;SOR=0.385;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=215;TCF=127;TCR=88;TR=214;WE=204824332;WS=204824314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,216:1.00:217
chr2	205829991	rs236843	C	T	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.962;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=458;ReadPosRankSum=1.034;SC=CCCAACTGGCCGCATTTAAGC;SOR=0.997;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=73;TCF=34;TCR=39;TR=26;WE=205829999;WS=205829981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,28:0.37:76
chr2	205912210	rs7563474	C	A	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=0;PP=112;SC=ACATAAAAGCCTGTTGTAAAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=205912218;WS=205912200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr2	205912403	rs1510765	T	C	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.509;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=178;ReadPosRankSum=0.619;SC=AGTCTGAAACTGGTTGTTCCA;SOR=0.346;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=14;WE=205912411;WS=205912393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr2	205969220	rs2289025	G	A	6339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=140;PP=2965;SC=ACTTCGCCAAGAACTAAGGAC;SOR=2.231;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=50;TCR=140;TR=190;WE=205969228;WS=205969210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr2	205978113	rs368750104	CA	C	767.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.41;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	205978118	rs5837952	GT	G	742.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=39.09;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	205978347	rs5837953	T	TGATTTGA	3394.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=45;PP=2957;SC=ATGAAAACCCTGATTTGAGCT;SOR=3.383;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=75;TCF=7;TCR=68;TR=48;WE=205978355;WS=205978337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
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chr2	205986767	rs1434161	C	T	985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=28;PP=826;SC=TTAATTCTCCCTTCATTTAAT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=205986775;WS=205986757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	205990353	rs2276676	C	T	2999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=26;PP=2457;SC=GAGATGTCACCGGACGAACCC;SOR=1.662;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=62;TCR=26;TR=88;WE=205990361;WS=205990343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	206036918	rs736320	C	T	2953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=20;PP=2286;SC=ATATTGTTTTCCTTTCTTCTG;SOR=2.621;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=71;TCR=20;TR=91;WE=206036926;WS=206036908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr2	206041366	rs11329569	TA	T	367.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.35;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	206364737	rs10197347	T	C	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.475;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=669;ReadPosRankSum=-0.024;SC=CAAGGCCATCTGAGTATGACC;SOR=0.138;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=37;WE=206364745;WS=206364727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,38:0.73:52
chr2	206364791	rs11683289	C	G	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.196;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=82;ReadPosRankSum=-0.596;SC=TTGAATTCATCTTTTCTAAGA;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=7;WE=206364799;WS=206364781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr2	206417900	rs12466943	T	G	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=160;ReadPosRankSum=-1.050;SC=TCAATTCCTATAGCAATGTGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=8;WE=206417908;WS=206417890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr2	206418032	rs6730102	G	A	2662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=38;PP=1898;SC=ATCTCTAATTGCTTTTCTCTC;SOR=0.999;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=91;TCF=52;TCR=39;TR=90;WE=206418040;WS=206418022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr2	206480054	rs13387277	C	T	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=131;ReadPosRankSum=-0.967;SC=ATCACTTCTGCTCCCATCCCA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=206480062;WS=206480044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr2	206562250	rs849558	C	T	1458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=10;PP=1192;SC=TTCTTTGGGTCGTTGATTTCT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=45;WE=206562258;WS=206562240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	206565500	rs3771051	C	T	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=65;PP=1599;ReadPosRankSum=-0.730;SC=TCCAAGGCCACCATCTCTGGT;SOR=0.965;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=102;TCF=3;TCR=99;TR=67;WE=206565508;WS=206565490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,66:0.66:100
chr2	206581033	rs849541	G	A	2760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=63;PP=2234;SC=CTCTACATCAGGTTCACCTCC;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=24;TCR=63;TR=87;WE=206581041;WS=206581023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr2	206590686	rs2228639	T	C	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.206;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=283;ReadPosRankSum=1.470;SC=GGATTGCTAATGAACAGATCA;SOR=1.453;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=63;TCF=51;TCR=12;TR=19;WE=206590694;WS=206590676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,20:0.32:63
chr2	206608039	rs849568	T	C	4986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=105;PP=2965;SC=CCCGCCTGGTTAGCAGCCGCT;SOR=1.771;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=45;TCR=105;TR=150;WE=206608047;WS=206608029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr2	206614646	rs10932123	T	G	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=108;ReadPosRankSum=-0.053;SC=AGGGACCTAGTGGTCCCCCAG;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=7;WE=206614654;WS=206614636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr2	206630073	rs35659576	A	AAC	921.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.321;NF=22;NR=2;PP=1046;ReadPosRankSum=0.242;SC=CAGGTGCAATAACACACACAC;SOR=0.900;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=50;TCF=44;TCR=6;TR=24;WE=206630082;WS=206630063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
chr2	206632302	.	TA	T	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=1.962;QD=1.21;ReadPosRankSum=-0.505;SOR=0.763;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,13:0.21:61
chr2	206641239	.	TCGCA	T	2089.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.000;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=0.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.22;ReadPosRankSum=-1.320;SOR=0.820;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,58:0.34:171
chr2	206641245	rs200483574	T	TA	2132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.69;ReadPosRankSum=-1.828;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,59:0.35:168
chr2	206884595	rs11366043	AT	A	859.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.411;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=28;PP=504;ReadPosRankSum=0.339;SC=CAGAGAATTAATTTTTTTTTA;SOR=1.135;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=61;TCF=11;TCR=50;TR=34;WE=206884603;WS=206884585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,41:0.64:64
chr2	206911191	rs34828561	C	CA	268.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.751;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.373;NF=13;NR=0;PP=220;ReadPosRankSum=-0.870;SC=GACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=13;WE=206911199;WS=206911181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr2	206921451	rs818009	G	A	2012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=32;PP=1654;ReadPosRankSum=-0.075;SC=CTTCCAATTCGGTTTCCAGGT;SOR=0.773;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=98;TCF=51;TCR=47;TR=68;WE=206921459;WS=206921441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,69:0.70:98
chr2	206921763	rs17220727	C	T	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=309;ReadPosRankSum=-0.303;SC=TTAAAAATTGCGTCACTATAG;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=14;WE=206921771;WS=206921753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr2	206927850	rs17286674	G	A	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.229;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=303;ReadPosRankSum=-1.147;SC=ATTTCACTGAGGGACTTCTGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=13;WE=206927858;WS=206927840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr2	206995010	rs4147725	A	G	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.453;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=314;ReadPosRankSum=1.073;SC=CAGTATTTTCAATGTAAAAAA;SOR=0.243;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=70;TCF=8;TCR=62;TR=21;WE=206995018;WS=206995000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,24:0.32:76
chr2	207003438	rs4147729	TA	T	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=71;ReadPosRankSum=1.366;SC=TACAAAATGTTAAAAGCACAG;SOR=0.180;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=4;WE=207003446;WS=207003428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr2	207006676	rs1801318	T	C	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=0.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.62;ReadPosRankSum=-1.186;SOR=0.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,57:0.27:211
chr2	207006825	rs4147718	C	A	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-7.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=413;ReadPosRankSum=0.113;SC=TGCAAATTTACTTTAAAATTA;SOR=0.140;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=90;TCF=0;TCR=90;TR=25;WE=207006833;WS=207006815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,25:0.27:91
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chr2	207008763	rs1127566	C	A	1846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=6.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.058;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.868;NF=37;NR=40;PP=1393;ReadPosRankSum=2.059;SC=CGCGAGAGAGCGCATCCTCCC;SOR=0.791;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=233;TCF=119;TCR=114;TR=77;WE=207008771;WS=207008753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,80:0.33:242
chr2	207023595	rs4147709	C	A	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=105;ReadPosRankSum=2.260;SC=GTCAATGGACCAAACAAACAA;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=6;WE=207023603;WS=207023585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr2	207023620	rs4147708	A	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=74;ReadPosRankSum=1.385;SC=AACAAACAGAAGCGTGAGCCA;SOR=0.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=6;WE=207023628;WS=207023610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr2	207024886	rs113729178	G	GC	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.63;QD=30.52;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr2	207027407	rs35430253	C	CT	254.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.878;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=241;ReadPosRankSum=0.645;SC=TTCAACCTTTCCTACAAGACT;SOR=2.229;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=10;WE=207027415;WS=207027397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,11:0.22:50
chr2	207041053	rs3732083	T	C	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.92;ReadPosRankSum=-0.306;SOR=0.576;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,34:0.25:134
chr2	207041441	rs3732082	G	A	1332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.798;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=36;PP=959;ReadPosRankSum=-0.595;SC=ACTCCACAGTGTCCCGGAAGT;SOR=0.990;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=162;TCF=68;TCR=94;TR=56;WE=207041449;WS=207041431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,59:0.36:166
chr2	207345826	rs3213811	G	A	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=65;ReadPosRankSum=-0.193;SC=GAAATGAATTGCTATATGATG;SOR=0.141;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=6;WE=207345834;WS=207345816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr2	207452151	rs3832131	GT	G	955.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=29;PP=606;SC=TCATTGGAAAGTTTTTTTTTC;SOR=2.833;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=31;WE=207452159;WS=207452141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	207457277	rs114737372	C	T	1647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.723;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=6;PP=1292;ReadPosRankSum=0.707;SC=TGGACCGAATCGTTTTGATTT;SOR=0.446;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=73;TCF=66;TCR=7;TR=53;WE=207457285;WS=207457267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,57:0.77:74
chr2	207472573	rs1991537	A	G	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=104;ReadPosRankSum=-0.637;SC=TGATAGAGTAATGTTCATTCA;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=7;WE=207472581;WS=207472563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr2	207472606	rs5838036	G	GT	922.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=3;PP=570;ReadPosRankSum=0.733;SC=TCCATGGACAGTTTTTTTTTT;SOR=2.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=32;WE=207472614;WS=207472596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,37:0.95:39
chr2	207472683	rs78458117	C	CTA	3341.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=30;PP=2804;SC=TAATCCTAGCCTGTTTTCTGA;SOR=1.022;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=61;TCF=28;TCR=33;TR=58;WE=207472691;WS=207472673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	207516721	rs35581991	A	G	1217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=32;PP=891;SC=TAAAGCTCTCACATGGAGAAG;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=38;WE=207516729;WS=207516711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	207527608	rs2359680	T	C	4366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=35;PP=2965;SC=ACGATGTCTATGGATTGTGAA;SOR=2.066;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=99;TCR=35;TR=134;WE=207527616;WS=207527598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr2	207527840	rs2115591	G	T	4474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=51;PP=2965;ReadPosRankSum=0.398;SC=ATGACTTTCTGTGGCATCTTT;SOR=0.409;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=80;TCR=51;TR=130;WE=207527848;WS=207527830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,136:0.99:137
chr2	207530855	rs13022891	G	C	1927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=51;PP=1624;SC=GGGAAAAGATGCTGGAAAACC;SOR=4.370;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=4;TCR=52;TR=55;WE=207530863;WS=207530845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	207569715	rs16838626	T	C	3835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=94;PP=2965;ReadPosRankSum=0.965;SC=TTGCAATGTATCTTTGAAGAG;SOR=2.017;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=114;TCF=18;TCR=96;TR=112;WE=207569723;WS=207569705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,114:0.99:115
chr2	207569803	rs16838630	A	C	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=49;PP=1142;SC=ATTATTGGCTAGCTATTATGA;SOR=7.864;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=49;WE=207569811;WS=207569793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	207570529	rs56067462	G	C	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=8;PP=1296;SC=TTTTGAAAGAGGGCTGTCTCC;SOR=3.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=52;WE=207570537;WS=207570519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	207570705	rs16838632	A	G	1264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=36;PP=999;SC=ATATGGTGCTATAAGTTCCAA;SOR=4.021;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=39;WE=207570713;WS=207570695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	207572341	rs16838641	T	G	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=567;SC=GTCGCTATTTTCTTTTAAGGG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=207572349;WS=207572331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	207575074	rs74345488	C	T	1582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=0;PP=1296;SC=TTTGCCTGCACGTGATGTTTT;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=46;WE=207575082;WS=207575064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	207613980	rs13427620	G	A	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=141;ReadPosRankSum=0.292;SC=CCCTGGCTCAGTGGAACTAAG;SOR=0.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=8;WE=207613988;WS=207613970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr2	207621759	rs1990849	A	G	4157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=96;PP=2965;SC=TGACATCATAATAAAGCTAAA;SOR=2.452;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=31;TCR=96;TR=127;WE=207621767;WS=207621749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr2	207820276	rs13420911	G	A	2143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.724;NF=39;NR=44;PP=1660;ReadPosRankSum=-0.413;SC=CCCACCCCATGTATTATCTGA;SOR=0.698;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=130;TCF=62;TCR=68;TR=83;WE=207820284;WS=207820266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,82:0.65:127
chr2	207824384	rs11903403	T	G	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.597;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=11;PP=1036;ReadPosRankSum=-0.924;SC=ACAACTCAAGTATACGCAAGC;SOR=1.186;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=74;TCF=55;TCR=19;TR=46;WE=207824392;WS=207824374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,48:0.62:77
chr2	207824548	rs1453168	G	A	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=31;PP=899;ReadPosRankSum=2.168;SC=TATCCATTCCGGCTCTAAAAA;SOR=0.565;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=50;TCF=6;TCR=44;TR=36;WE=207824556;WS=207824538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,38:0.75:51
chr2	207824650	rs1453169	A	G	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=104;ReadPosRankSum=-1.201;SC=GTTTAGGCCTAAGGAAGCCTA;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=207824658;WS=207824640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr2	207825656	rs13397039	A	T	3060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.499;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=80;PP=2408;ReadPosRankSum=0.043;SC=ATTTCAATGCATCTTGGTGTA;SOR=0.529;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=167;TCF=40;TCR=127;TR=107;WE=207825664;WS=207825646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,110:0.65:170
chr2	207833760	rs73053220	A	T	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=247;ReadPosRankSum=-0.630;SC=GAAGAAAGAGAAGACAGCTAT;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=12;WE=207833768;WS=207833750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr2	207833848	rs7582092	A	G	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.263;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=688;ReadPosRankSum=1.646;SC=ATAGAAATCCATTCTTCCAAA;SOR=0.277;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=41;WE=207833856;WS=207833838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,41:0.77:53
chr2	207911123	rs57504830	A	G	166.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=2.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.25;MQRankSum=-1.660;QD=3.88;ReadPosRankSum=-1.139;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr2	207946141	rs2287507	A	G	4547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=110;PP=2965;SC=AGTTTAAGGGACAAAATGTTT;SOR=3.743;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=17;TCR=111;TR=127;WE=207946149;WS=207946131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr2	207946164	rs2287506	T	C	3532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=84;PP=2776;SC=GTTTAAATCCTATCTCTTCCA;SOR=4.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=9;TCR=84;TR=93;WE=207946172;WS=207946154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr2	207974818	rs2244923	C	T	4105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=92;PP=2965;SC=TTTCTATGCACGTGAATGTAG;SOR=2.284;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=124;TCF=31;TCR=93;TR=123;WE=207974826;WS=207974808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr2	207974875	rs2244918	A	G	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=36;PP=892;ReadPosRankSum=-2.822;SC=AAATGCAGACATAAAGTATGT;SOR=0.760;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=5;TCR=49;TR=40;WE=207974883;WS=207974865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,43:0.74:58
chr2	207988613	rs2700166	C	T	1567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=25;PP=1308;SC=CTTCAGCCCCCAGCCCTCCTT;SOR=0.823;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=21;TCR=25;TR=46;WE=207988621;WS=207988603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	207998878	rs35538720	A	ATTTT	760.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=9.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQRankSum=0.630;QD=8.95;ReadPosRankSum=0.950;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,45:0.53:85
chr2	208031992	rs1269424	T	A	3894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=88;PP=2947;SC=CCTGCACAATTCACGTTAGGG;SOR=2.075;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=33;TCR=89;TR=121;WE=208032000;WS=208031982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr2	208442095	rs2709387	G	A	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=304;ReadPosRankSum=1.777;SC=TTCTTTCAACGCTTTAGCCAG;SOR=0.646;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=57;TCR=1;TR=17;WE=208442103;WS=208442085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,19:0.31:61
chr2	208447632	.	AAC	A	323.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.872;SOR=0.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,12:0.22:55
chr2	208447642	rs12478868	A	T,ATAT	1909.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=33.50;SOR=2.107;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,44,13:0.77,0.23:57
chr2	208477852	rs2551949	G	A	3789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.220;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=44;PP=2863;ReadPosRankSum=0.544;SC=CTTTCTCACAGTAAATTGCCT;SOR=0.842;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=194;TCF=127;TCR=67;TR=132;WE=208477860;WS=208477842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,138:0.68:204
chr2	208477927	.	G	C	2912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.328;ClippingRankSum=0.000;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.198;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=64;PP=2283;ReadPosRankSum=0.103;SC=AAGAATCACAGAGTGATTGCT;SOR=1.010;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=189;TCF=79;TCR=110;TR=104;WE=208477935;WS=208477917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,108:0.55:195
chr2	208477956	rs2709416	C	T	2362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.143;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=58;PP=1931;ReadPosRankSum=-0.494;SC=GTTCCAGTGTCTGAAGAAGAT;SOR=1.524;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=145;TCF=52;TCR=93;TR=81;WE=208477964;WS=208477946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,83:0.56:149
chr2	208489101	rs4234080	C	A	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.568;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=566;ReadPosRankSum=0.968;SC=GAGGGCCATTCCGCCTGCACC;SOR=0.446;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=29;WE=208489109;WS=208489091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,28:0.70:40
chr2	208611699	.	CA	C	79.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=5.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=0.657;QD=2.10;ReadPosRankSum=1.271;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,10:0.26:38
chr2	208633413	rs4675711	T	C	2339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=53;PP=2013;SC=CCAGCTGCGCTAGGAGCAGCA;SOR=2.173;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=17;TCR=53;TR=70;WE=208633421;WS=208633403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	208693261	rs720632	C	G	4101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=76;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.744;SC=AAGACTGAAGCCAGCAAGACA;SOR=0.416;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=56;TCR=77;TR=132;WE=208693269;WS=208693251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,132:0.99:133
chr2	208693307	rs720631	T	C	2442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=70;PP=1876;SC=GTGCAGCTGGTGGCACAATCT;SOR=2.967;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=16;TCR=70;TR=86;WE=208693315;WS=208693297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr2	208717440	rs10932211	A	G	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.245;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=861;ReadPosRankSum=0.969;SC=AGGCAGGGAAAGGCTGAAAAA;SOR=0.494;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=35;WE=208717448;WS=208717430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,38:0.70:54
chr2	208794622	rs138008155	T	A	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=82;ReadPosRankSum=0.805;SC=TAGGCTTACCTCCAAAAACAT;SOR=0.582;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=7;WE=208794630;WS=208794612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr2	208811097	rs10932215	C	T	2725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=24;PP=2084;SC=CTACCTTATACTTTGAAGTAT;SOR=1.927;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=57;TCR=24;TR=81;WE=208811105;WS=208811087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
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chr2	209007559	rs796287	T	G	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.917;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=425;ReadPosRankSum=1.172;SC=TGAACAGAGATACAGTCGTCT;SOR=0.329;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=75;TCF=10;TCR=65;TR=25;WE=209007567;WS=209007549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,27:0.36:75
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chr2	209010777	rs3214759	GC	G	1575.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.234;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.235;NF=19;NR=37;PP=1575;ReadPosRankSum=-0.969;SC=GGAGTGATTGGCCCCCACTGA;SOR=0.840;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=154;TCF=54;TCR=100;TR=56;WE=209010785;WS=209010767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,66:0.38:174
chr2	209028191	rs796280	C	T	3747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.365;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=76;PP=2695;ReadPosRankSum=0.090;SC=AATAAGGTGACAGTAGACAGT;SOR=0.927;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=201;TCF=93;TCR=108;TR=136;WE=209028199;WS=209028181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,144:0.69:208
chr2	209030578	rs796281	A	G	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=602;ReadPosRankSum=-0.815;SC=AAGCACATCAATTTAACATGG;SOR=1.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=25;WE=209030586;WS=209030568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr2	209032987	rs62194831	G	A	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.09;ReadPosRankSum=-1.275;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr2	209033097	rs13414543	A	G	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=291;ReadPosRankSum=0.181;SC=AGTTTAAAAGATACATTACCC;SOR=0.527;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=16;WE=209033105;WS=209033087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr2	209033173	rs7562540	A	G	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.713;NF=2;NR=9;PP=227;ReadPosRankSum=-0.060;SC=CAAGGCGGGCAGATCGCGAGG;SOR=0.169;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=11;WE=209033181;WS=209033163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr2	209035485	rs6435420	T	G	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=658;ReadPosRankSum=-0.460;SC=ATTTTGCAGATGAGGAAACTA;SOR=1.552;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=25;WE=209035493;WS=209035475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr2	209035658	rs6748431	C	T	7673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.601;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=130;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.760;SC=AATTTACAATCTCACACCTAC;SOR=0.664;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=228;TCF=130;TCR=98;TR=227;WE=209035666;WS=209035648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,235:1.00:236
chr2	209035849	rs4292037	A	C	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=37;PP=969;ReadPosRankSum=-0.833;SC=TGTCCATCCAAAGTTTCATTT;SOR=0.507;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=54;TCF=2;TCR=52;TR=39;WE=209035857;WS=209035839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,40:0.73:55
chr2	209036605	rs10932244	T	C	1165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.690;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=8;PP=879;ReadPosRankSum=0.275;SC=CAACCAGACATAGAAATCTAA;SOR=0.356;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=68;TCF=56;TCR=12;TR=39;WE=209036613;WS=209036595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,42:0.59:71
chr2	209036712	rs10804166	T	C	2121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.375;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=43;PP=1602;ReadPosRankSum=-0.668;SC=CCAGGCTTACTCTGTTTGCGG;SOR=1.096;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=122;TCF=52;TCR=70;TR=72;WE=209036720;WS=209036702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,78:0.60:129
chr2	209036778	rs6435421	A	G	2756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=62;PP=2183;SC=AAGGAGAGGCAGAGAGATGAA;SOR=1.828;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=27;TCR=62;TR=89;WE=209036786;WS=209036768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	209036888	rs62194836	A	G	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=115;ReadPosRankSum=0.829;SC=TATTTAATCAACTCAGAATCC;SOR=1.071;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=7;WE=209036896;WS=209036878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr2	209045657	rs10208685	T	C	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.006;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=197;ReadPosRankSum=0.425;SC=ATCATAAGTATTAAATACAGT;SOR=0.048;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=11;WE=209045665;WS=209045647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr2	209046162	rs6435425	G	A	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.70;ReadPosRankSum=-1.016;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr2	209046162	.	GTA	ATG	434	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=1;NR=8;PP=434;QD=54.1630972069;SC=AATAAAATTGGTATGATTGTT;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=9;WE=209046172;WS=209046152;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,9:0.45:20
chr2	209046164	rs6435426	A	G	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.76;ReadPosRankSum=-1.014;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr2	209049829	rs144966371	T	TC	1367.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.753;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=37;PP=2985;ReadPosRankSum=1.598;SC=GCTTTTTTTTTTCCCATCCCT;SOR=0.810;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=103;TCF=25;TCR=78;TR=55;WE=209049848;WS=209049810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,69:0.62:112
chr2	209049830	rs373081943	T	C	2619.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.773;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.18;ReadPosRankSum=0.821;SOR=0.825;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,71:0.63:113
chr2	209049840	rs10804167	C	T	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.833;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=2299;ReadPosRankSum=-0.142;SC=TCCCATCCCTCCCTCCCCCAC;SOR=0.551;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=29;TCR=62;TR=33;WE=209049848;WS=209049810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,36:0.37:97
chr2	209051586	rs7572263	A	G	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-4.259;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=126;ReadPosRankSum=-2.352;SC=ATTTTTACCCACTGCCAATAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=9;WE=209051594;WS=209051576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr2	209101905	rs57383668	GA	G	1892.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=39;PP=1240;SC=TAACGGGAAGGAAAAAAAAAA;SOR=0.898;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=24;TCR=41;TR=61;WE=209101914;WS=209101895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr2	209138946	rs6705163	C	T	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=22;PP=751;SC=GCTGAATAAGCTGAGCTCCTC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=209138954;WS=209138936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	209163556	rs7569723	C	T	5577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=131;PP=2965;SC=AGAGAATGTTCATGTGACTGA;SOR=2.618;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=36;TCR=131;TR=167;WE=209163564;WS=209163546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr2	209168853	rs893256	C	T	3721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=78;NR=39;PP=2838;SC=ACATTGTTGCCATTGAAGGCC;SOR=1.515;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=78;TCR=39;TR=117;WE=209168861;WS=209168843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr2	209176807	rs12624141	T	G	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=319;SC=GAGGCATTTTTACCCAAAGCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=209176815;WS=209176797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	209184844	rs934712	A	G	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=406;SC=CTAAATGAGAATATATTAATA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=209184852;WS=209184834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	209184980	rs10932258	G	A	1125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=14;PP=800;SC=TTGTAGATGAGTTCTTGTATT;SOR=1.040;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=21;TCR=14;TR=35;WE=209184988;WS=209184970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	209184999	rs10932259	C	T	1345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=24;PP=1016;SC=TTAAAAACCCCAAAATTCTTC;SOR=0.929;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=20;TCR=24;TR=44;WE=209185007;WS=209184989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	209189912	rs893255	A	G	935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=18;PP=806;SC=TTTTACAGATATTAAGAGAGT;SOR=1.071;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=12;TCR=18;TR=30;WE=209189920;WS=209189902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	209190330	rs2363468	T	C	3762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=62;PP=2761;SC=TTGCTGGAATTGAGGATTGTG;SOR=0.790;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=60;TCR=62;TR=122;WE=209190338;WS=209190320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr2	209190519	rs893254	A	T	7422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.99;SOR=0.918;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr2	209190528	rs893253	C	G	7553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.16;SOR=1.108;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr2	209191082	rs1529979	C	A	3988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=74;PP=2965;SC=TTCAAGTGGCCAATCAGGAAG;SOR=1.355;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=43;TCR=74;TR=117;WE=209191090;WS=209191072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr2	209191099	rs1529978	T	C	3511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=87;PP=2578;SC=GAAGCAAAAATGAGGGTGATG;SOR=1.934;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=36;TCR=87;TR=123;WE=209191107;WS=209191089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr2	209194589	.	G	GA	871.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.009;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.686;NF=11;NR=14;PP=939;ReadPosRankSum=-1.316;SC=GAATTTTATGGAAAGAATGAT;SOR=0.335;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=25;WE=209194597;WS=209194579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,32:0.71:45
chr2	209194696	rs1437414	G	C	1385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=25;PP=1088;SC=AAAATTTCAAGCTAAAACGTA;SOR=1.455;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=39;WE=209194704;WS=209194686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	209195099	rs1866045	G	A	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=0;PP=1058;SC=AACTATCACCGTGCTGTAGCT;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=37;WE=209195107;WS=209195089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	209195133	rs12694109	T	C	1712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=0;PP=1496;SC=AGCTGCAGGCTCAGAGCAGCA;SOR=7.903;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=51;WE=209195141;WS=209195123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	209195491	rs112938452	G	GAGA	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=432;SC=TTTTCCTGAGGAGGTTTCCTA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=209195499;WS=209195481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	209199945	rs2363469	A	G	1745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=0;PP=1423;SC=TGCCTCATAGAATATAGTTGA;SOR=7.864;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=49;WE=209199953;WS=209199935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	209201054	rs6744236	T	C	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=20;PP=477;SC=TTTTGTTTCCTGTCACTCTCC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=209201062;WS=209201044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	209201739	rs7596571	T	C	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=21;PP=471;SC=TAGTTTAATATGTACTTTAGT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=209201747;WS=209201729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	209203122	rs4675756	C	G	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=391;SC=AATTTTTTAACGGTATAAATG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=209203130;WS=209203112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	209209827	rs2304544	G	A	3672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=87;NR=31;PP=2965;SC=ACCTATTTCTGCCCTAAGTTG;SOR=2.113;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=87;TCR=31;TR=118;WE=209209835;WS=209209817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr2	209209997	rs2043718	C	T	1516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=43;PP=1204;SC=AGTTTTATTACAGCATTTATC;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=43;WE=209210005;WS=209209987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	209212707	rs2304545	G	A	2209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=22;PP=1621;SC=TTGGGCAGACGGGCAAGGAGG;SOR=1.418;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=43;TCR=22;TR=65;WE=209212715;WS=209212697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	209214770	rs2118297	A	G	4332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=54;PP=2965;SC=GAGGAGATACACAAAAGAAGC;SOR=1.375;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=95;TCR=54;TR=149;WE=209214778;WS=209214760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr2	209215448	rs994696	A	G	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=389;SC=GAGGAAAGATATTTTCTGAGT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=209215456;WS=209215438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	209215586	rs994697	A	G	1188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=19;PP=938;SC=ACAGCAGTGAAGAAGATTTCA;SOR=0.984;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=16;TCR=19;TR=35;WE=209215594;WS=209215576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	209219190	rs6435453	A	G	972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=0;PP=861;SC=AGCACTCAATAAAAGTTAACT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=209219198;WS=209219180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	209220157	rs10208191	G	T	1197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=33;PP=995;SC=CAGTTCTGTGGCTGTTTAGAC;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=209220165;WS=209220147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	209224874	rs11357589	CA	C	1809.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=8;PP=1721;SC=AGCAGTTTGTCAACCAGCATA;SOR=2.701;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=42;WE=209224882;WS=209224864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	209293168	rs962595	C	T	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=591;SC=TGCAGCAGAACAACAACACTC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=209293176;WS=209293158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr2	209346020	rs61511423	T	TGCAACCTC	1715.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.32;QD=47.66;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	209353607	rs6726003	A	G	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=399;SC=CCCTGTCTCAAGAAAAGATAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=209353615;WS=209353602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	209353656	rs11335842	GT	G	564.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.43;NF=19;NR=1;PP=368;SC=GCTCTGCTAAGTTTTTTTTTT;SOR=4.892;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=20;WE=209353664;WS=209353646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	209358027	rs3820900	C	T	2891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=61;PP=2223;SC=GTCGGTGGAACCTCTCCGTGG;SOR=1.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=26;TCR=61;TR=87;WE=209358035;WS=209358017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr2	210517785	rs2254169	C	T	1777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=0;PP=1487;SC=CGGTTTGCTACAAATTTTTCC;SOR=8.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=54;TCR=0;TR=54;WE=210517793;WS=210517775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	210558134	rs41265969	G	T	6079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.052;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=99;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.225;SC=AGAAAAGGAGGCCATAAATCA;SOR=0.374;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=318;TCF=180;TCR=138;TR=211;WE=210558142;WS=210558124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,222:0.67:330
chr2	210594540	rs4673486	A	G	6604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=129;NR=71;PP=2965;SC=CGAATGCAAGATATAGTTAAA;SOR=1.422;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=201;TCF=130;TCR=71;TR=200;WE=210594548;WS=210594530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr2	210594717	rs11389149	C	CT	2518.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=75;PP=2969;SC=CCAATCTTGTCTTTTTAAAAA;SOR=5.186;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=90;TCF=5;TCR=85;TR=80;WE=210594725;WS=210594707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	210594768	rs7594601	T	C	1452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=28;PP=1218;SC=AGGTCCCAGATTGTAGACCTG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=210594776;WS=210594758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	210636747	rs116428671	G	C	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.429;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=574;ReadPosRankSum=-0.975;SC=GCGGCGGCTAGCGAGGAGACA;SOR=0.129;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=27;WE=210636755;WS=210636737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,27:0.69:39
chr2	210654225	rs35337581	C	T	2531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=9;PP=2093;ReadPosRankSum=-1.438;SC=TAAAACCTTACAAAACGATGG;SOR=0.971;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=123;TCF=110;TCR=13;TR=90;WE=210654233;WS=210654215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,90:0.72:125
chr2	210678691	rs2159745	T	G	3088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=87;PP=2575;SC=TTACACTGTTTCTATTATCTT;SOR=7.614;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=88;TCF=1;TCR=87;TR=88;WE=210678699;WS=210678681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	210698785	rs75245711	C	T	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.599;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=646;ReadPosRankSum=-0.566;SC=ATGGGAATGTCTTCAGGAGAG;SOR=0.197;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=26;WE=210698793;WS=210698775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,28:0.88:32
chr2	210745681	rs2370838	C	A	4846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=93;NR=64;PP=2965;SC=CTTTCATTTCCTAGGTACTGT;SOR=1.157;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=158;TCF=94;TCR=64;TR=157;WE=210745689;WS=210745671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr2	210786137	rs9288415	G	A	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=3;PP=760;SC=AAACTACTACGTTTGTGTCAT;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=210786145;WS=210786127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	210846867	rs2723222	A	G	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.915;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=613;ReadPosRankSum=0.390;SC=TCAGTGTCATAGTTTTTGTAA;SOR=0.298;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=27;WE=210846875;WS=210846857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr2	210874246	rs3738934	T	C	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=353;ReadPosRankSum=0.259;SC=TTTAGTATTATTTAATACTGA;SOR=0.538;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=61;TCF=51;TCR=10;TR=21;WE=210874254;WS=210874236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,22:0.34:64
chr2	210880893	rs7570090	C	T	1498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.055;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=50;PP=1124;ReadPosRankSum=1.209;SC=GGAAGATTTGCGGGAAACAGG;SOR=0.977;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=195;TCF=50;TCR=145;TR=64;WE=210880901;WS=210880883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,68:0.34:200
chr2	210882171	rs2075116	A	T	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.881;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=1;PP=757;ReadPosRankSum=2.730;SC=TTTAGGAGTTACTTATTTCCT;SOR=3.119;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=43;TCF=40;TCR=3;TR=32;WE=210882179;WS=210882161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,31:0.74:42
chr2	210882456	rs2243769	G	T	251.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=270;SC=AAGTGGATATGCTTTTTTTTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=210882464;WS=210882446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	210882677	rs2723213	C	T	183.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=1;PP=148;SC=CTATGTTGGCCAGGCTGGTCT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=210882685;WS=210882667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	210889759	rs6435550	A	G	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=305;ReadPosRankSum=0.989;SC=GTCTCACCCAAAATTCATGCA;SOR=0.249;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=16;WE=210889767;WS=210889749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr2	211060050	rs2286963	T	G	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.912;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=511;ReadPosRankSum=1.757;SC=TCTGCTAATTTATGTTGCACT;SOR=1.934;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=59;TCF=13;TCR=46;TR=25;WE=211060058;WS=211060040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
chr2	211069438	rs263677	G	A	3008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=75;PP=2450;SC=GTAGAGAATGGTCTCATTTAA;SOR=3.166;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=16;TCR=75;TR=91;WE=211069446;WS=211069428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr2	211074909	rs3764913	T	C	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.424;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=345;ReadPosRankSum=0.335;SC=TAGAAGTCCTTTTTTACACAC;SOR=1.051;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=19;WE=211074917;WS=211074899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr2	211162998	rs7592060	G	A	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=108;ReadPosRankSum=0.619;SC=GCCCTATTATGTGAAACATTT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=211163006;WS=211162992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr2	211163063	rs150329321	TAC	T,TACACACAC	880.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=16,16;NR=2,2;PP=890,255;SC=ACACACATACTACACACACAC;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=18,18;WE=211163072;WS=211163053;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.27,0.73:26
chr2	211167132	rs2292300	A	T	4038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.265;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=77;PP=2962;ReadPosRankSum=0.611;SC=GAAGAGCTAAACTCATCCCAA;SOR=0.573;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=191;TCF=88;TCR=103;TR=142;WE=211167140;WS=211167122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,151:0.74:203
chr2	211168181	rs35179660	T	TC	140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=175;ReadPosRankSum=0.135;SC=TCAGTTCCATTTTTGCCTATC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=211168189;WS=211168171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr2	211168346	rs12469767	A	C	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.591;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=603;ReadPosRankSum=-0.017;SC=GAGTGGGGTCATCCCTGGCTG;SOR=0.299;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=56;TCF=32;TCR=24;TR=34;WE=211168354;WS=211168336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,34:0.60:57
chr2	211302627	rs41272663	C	A	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.270;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=370;ReadPosRankSum=-0.242;SC=ATTAGTTCTGCTGAAGCAAAT;SOR=0.235;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=59;TCF=9;TCR=50;TR=22;WE=211302635;WS=211302617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,21:0.36:58
chr2	211319824	rs2287432	T	C	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.058;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=722;ReadPosRankSum=-0.801;SC=TATAGAAACATGATTACCGTG;SOR=0.466;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=66;TCF=44;TCR=22;TR=38;WE=211319832;WS=211319814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,39:0.62:63
chr2	211320041	rs71395583	G	GA	150.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=12.56;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	211341156	rs2287418	C	G	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=276;ReadPosRankSum=-0.896;SC=AGGGGAAAAACAGAAACTAGG;SOR=0.593;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=14;WE=211341164;WS=211341146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr2	211341204	rs56033100	G	GC	373.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=9;PP=494;SC=GAGGGCGGCGGCGGCGCCCAG;SOR=2.494;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=11;WE=211341212;WS=211341194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr2	211342502	rs17552879	G	A	1494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.856;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=34;PP=1135;ReadPosRankSum=0.150;SC=TGAGTCTTAAGCTGGATATCT;SOR=1.348;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=76;TCF=29;TCR=47;TR=51;WE=211342510;WS=211342492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,54:0.68:80
chr2	211421452	rs3835047	A	ATCT	6203.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=89;NR=30;PP=2969;SC=GCCACAAATCATCAAAATGAC;SOR=2.534;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=125;TCF=94;TCR=31;TR=119;WE=211421460;WS=211421442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr2	211452598	rs149496892	TAC	T	1887.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=0;PP=1715;SC=ATAAAAAAGATACAGTCTGTG;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=36;WE=211452607;WS=211452592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	211456637	rs1047883	A	G	4026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.74;SOR=1.434;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	211456637	.	ACC	GCT	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=47;NR=29;PP=2947;QD=20;SC=CTTGGACAACACCCTCCCTGC;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=51;TCR=31;TR=76;WE=211456647;WS=211456627;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,76:0.93:82
chr2	211456639	rs2229589	C	T	4026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.24;SOR=1.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr2	211457662	.	GG	AT	1346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=0.000;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.702;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=1644;ReadPosRankSum=3.301;SC=AGGTCACCCCGGGGCCAATAG;SOR=1.103;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=132;TCF=46;TCR=86;TR=37;WE=211457671;WS=211457652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,39:0.28:137
chr2	211481257	rs2287599	C	G	6053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=98;NR=79;PP=2965;SC=CACTGAAAGGCCTCAACAGGT;SOR=0.842;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=179;TCF=99;TCR=80;TR=177;WE=211481265;WS=211481247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr2	211513118	rs4673540	C	T	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=1;PP=724;SC=GGCTACCACTCGAGCTAATGA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=211513126;WS=211513108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	211514995	rs34449727	G	T	1252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=3;PP=934;ReadPosRankSum=-0.336;SC=AGCCCCGACTGGAACTATAGG;SOR=1.022;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=60;TCF=54;TCR=6;TR=39;WE=211515003;WS=211514985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,44:0.67:66
chr2	211515058	rs3213784	A	T	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.817;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=528;ReadPosRankSum=0.172;SC=CATAAACCTGACCTGCTTTTT;SOR=1.022;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=121;TCF=87;TCR=34;TR=35;WE=211515066;WS=211515048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,36:0.28:127
chr2	211521227	rs58225253	CT	C	230.86	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=9.031;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.18;MQRankSum=0.567;QD=14.43;ReadPosRankSum=-0.079;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,14:0.88:16
chr2	211523457	rs6435580	C	T	2364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.062;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=58;PP=1783;ReadPosRankSum=-0.629;SC=CACTGTGTTACGTCATGTTGG;SOR=1.382;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=147;TCF=58;TCR=89;TR=89;WE=211523465;WS=211523447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,91:0.61:150
chr2	211527827	rs5838215	GT	G	2882.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=1.859;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.35;MQRankSum=0.480;QD=22.01;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.370;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:5,126:0.96:131
chr2	211533070	rs10932347	A	G	2134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=46;PP=1757;SC=GAGGGGCAGGATAGAATGTTA;SOR=2.070;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=20;TCR=46;TR=66;WE=211533078;WS=211533060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	211541721	rs41272673	A	G	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=575;ReadPosRankSum=-0.789;SC=GTTTTTGTTTATTTTTCCAGA;SOR=0.612;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=71;TCR=11;TR=29;WE=211541729;WS=211541711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,31:0.35:88
chr2	212252809	rs934607	G	A	3958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.903;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=117;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.344;SC=AAGCCACATGGGTCGTATGAA;SOR=0.537;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=188;TCF=22;TCR=166;TR=134;WE=212252817;WS=212252799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,136:0.72:190
chr2	212285103	rs2289086	T	C	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5016;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=204;ReadPosRankSum=1.726;SC=TTAGTGCTTATGAACTATTAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=10;WE=212285111;WS=212285093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr2	212286934	rs3791709	A	T	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=625;ReadPosRankSum=1.380;SC=TGTTGTTTTAATCGTAATGAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=24;WE=212286942;WS=212286924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,23:0.68:34
chr2	212295590	rs141267844	G	GT	161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=208;ReadPosRankSum=-0.068;SC=AGGCTTATTGGTTTCTTGTAT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=8;WE=212295598;WS=212295580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr2	212295875	rs6710946	C	T	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=11;PP=327;SC=CCCAGGTTTTCCCATTTTTCT;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=212295883;WS=212295865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr2	212544024	rs10169970	G	A	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=148;ReadPosRankSum=1.494;SC=TATGGCAAATGACTTTGGTGG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=8;WE=212544032;WS=212544014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr2	212569879	rs10221746	T	C	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQRankSum=-1.097;QD=3.89;ReadPosRankSum=0.349;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr2	212569924	rs10221615	G	A	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=44;ReadPosRankSum=0.477;SC=TGATCCACCCGCCTCAACCTC;SOR=0.641;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=5;WE=212569932;WS=212569914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr2	212569983	rs6723705	G	A	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.229;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=307;ReadPosRankSum=-0.700;SC=AGTCAATCTTGTGTAATTTTT;SOR=1.005;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=58;TCF=43;TCR=15;TR=18;WE=212569991;WS=212569973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,20:0.33:61
chr2	212576777	rs76603692	A	C	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=5;PP=1421;ReadPosRankSum=-0.193;SC=ATACTGACCCATGAATACCAG;SOR=0.977;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=89;TCF=82;TCR=7;TR=60;WE=212576785;WS=212576767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,60:0.66:91
chr2	212578379	rs67894136	TA	T	368.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.47;MQRankSum=2.238;QD=7.53;ReadPosRankSum=-0.889;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr2	212587321	rs13002712	G	A	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=318;ReadPosRankSum=-1.237;SC=TTAATGAAACGCTGCCAAAAC;SOR=0.784;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=68;TCF=6;TCR=62;TR=21;WE=212587329;WS=212587311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,25:0.34:73
chr2	212589986	rs35778743	T	C	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.889;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=308;ReadPosRankSum=-0.587;SC=AGCTGAGTTCTGGAGTGACAA;SOR=0.134;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=55;TCF=9;TCR=46;TR=21;WE=212589994;WS=212589976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,20:0.34:58
chr2	212615516	rs6757068	T	C	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.795;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=313;ReadPosRankSum=0.042;SC=GAAATACTCCTGCTCCTTTAT;SOR=0.046;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=58;TCF=5;TCR=53;TR=22;WE=212615524;WS=212615506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,23:0.38:60
chr2	212989410	rs6723461	G	C	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=296;ReadPosRankSum=2.780;SC=CAGCACACAGGTCTGCCTGTA;SOR=0.169;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=14;WE=212989418;WS=212989400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr2	213291226	rs34480397	C	CTCTT	693.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.589;NF=0;NR=15;PP=809;ReadPosRankSum=-0.983;SC=AAACCTCAATCTCTTTATCTC;SOR=2.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=15;WE=213291234;WS=213291216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,18:0.82:22
chr2	213403091	rs73989053	G	A	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=599;ReadPosRankSum=-0.097;SC=TCCCGGGATGGGTGAAGAGGG;SOR=0.394;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=43;TCF=42;TCR=1;TR=26;WE=213403099;WS=213403081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr2	213886454	rs2291241	A	T	2075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=45;PP=1657;SC=TCTGGTTAGAAAAATGAAAAA;SOR=1.542;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=21;TCR=45;TR=66;WE=213886462;WS=213886444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	213886647	rs141472671	A	ATTTTATCT	2211.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=0;PP=2328;SC=ACAGCATAAGATTTTATCTTC;SOR=3.958;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=30;WE=213886655;WS=213886637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	213914343	rs2165444	C	T	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=518;SC=TGGTCATTACCGACTACATAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=213914351;WS=213914333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	214012403	.	CAA	C	33.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=0.000;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=4.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.19;ReadPosRankSum=2.060;SOR=0.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,17:0.10:178
chr2	214012405	rs6738070	A	C	4470.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=4.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.12;ReadPosRankSum=-1.837;SOR=1.341;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,161:0.90:178
chr2	214142631	rs13000409	G	C	2303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=42;PP=2038;SC=CAGGGCATGTGAGAGGTCTTC;SOR=1.163;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=28;TCR=42;TR=70;WE=214142639;WS=214142621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	214228792	rs12469417	C	T	260.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=2;PP=202;SC=TTGAATTTTACTTTTTAGATT;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=214228800;WS=214228782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	214228959	rs4146048	G	A	1360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=13;PP=1182;SC=GATATTTAAAGGTGAGTAAGT;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=40;WE=214228967;WS=214228949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	214233812	rs6752347	C	A	2012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=47;PP=1609;SC=AGTGTGGAAACAATTTTAATT;SOR=2.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=11;TCR=47;TR=58;WE=214233820;WS=214233802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	214261534	rs339815	T	C	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=262;ReadPosRankSum=0.701;SC=ACCCTTTATCTGTGTTCTTTA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=15;WE=214261542;WS=214261524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr2	214727150	rs2042790	T	C	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.951;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=311;ReadPosRankSum=-0.132;SC=CATTTATTCATATTCTGAAAA;SOR=1.508;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=15;WE=214727158;WS=214727140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr2	214727221	rs2042791	A	C	1202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.466;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=14;PP=880;ReadPosRankSum=-0.670;SC=TCTCCATGCAACCCCACAAAG;SOR=0.963;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=59;TCF=34;TCR=25;TR=42;WE=214727229;WS=214727211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,46:0.72:64
chr2	214727367	rs2042792	C	G	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.841;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=526;ReadPosRankSum=-0.322;SC=GTGCACAGGACCCCTAGAAAT;SOR=1.453;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=22;WE=214727375;WS=214727357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
chr2	214973011	rs16851495	G	A	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.754;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=849;ReadPosRankSum=0.946;SC=CCAGTAAACTGTTTTTAATGC;SOR=0.223;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=40;WE=214973019;WS=214973001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,43:0.80:54
chr2	215013777	rs5838412	GTA	G	500.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.04;MQRankSum=-0.783;QD=21.77;ReadPosRankSum=-0.635;SOR=2.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr2	215013801	rs2372226	G	A,GTATATATATA	873.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=57.51;MQRankSum=-0.805;QD=29.12;ReadPosRankSum=1.742;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,16,13:0.53,0.43:30
chr2	215102929	rs1912207	T	A	2107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=21;PP=1571;SC=TGTTACCTCATATTGAAGTTG;SOR=1.437;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=39;TCR=21;TR=60;WE=215102937;WS=215102919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	215595765	rs6435849	C	G	2422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=43;PP=1941;SC=AACAGCGCTTCCTAAAATAAA;SOR=1.164;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=28;TCR=43;TR=71;WE=215595773;WS=215595755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	215595861	rs34664471	G	GA	425.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.674;NF=1;NR=12;PP=163;ReadPosRankSum=-0.703;SC=GGCTTTGCAGGAAAAAAAAAA;SOR=0.527;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=13;WE=215595880;WS=215595851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr2	215595872	rs28685662	G	A	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=26;PP=749;SC=AAAAAAAAAAGCATTCTTTTG;SOR=5.610;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=27;WE=215595880;WS=215595851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	215632125	rs5031007	T	C	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=271;ReadPosRankSum=0.486;SC=AACTTGACTATTTTAAAGTCT;SOR=0.263;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=15;WE=215632133;WS=215632115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
chr2	215632256	rs2070093	A	G	1790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.242;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=32;PP=1352;ReadPosRankSum=-1.203;SC=CTATATCCACATGCCCATTCT;SOR=0.913;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=130;TCF=71;TCR=59;TR=74;WE=215632264;WS=215632246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,75:0.58:130
chr2	215645464	rs2229571	C	G	1528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.691;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=32;PP=1255;ReadPosRankSum=0.798;SC=TACTGTTTTTCCTCCCTGATG;SOR=0.506;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=180;TCF=81;TCR=99;TR=62;WE=215645472;WS=215645454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,64:0.34:189
chr2	215645545	rs2070096	C	G	2496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.204;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=44;PP=1940;ReadPosRankSum=0.701;SC=CTGAGGGCACCGTTTGCTTAA;SOR=0.604;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=142;TCF=72;TCR=70;TR=98;WE=215645553;WS=215645535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,100:0.69:145
chr2	215657178	.	T	A	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.940;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=13.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQRankSum=-2.845;QD=4.88;ReadPosRankSum=0.626;SOR=3.467;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,25:0.34:74
chr2	215657182	rs56130510	TA	T	372.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=11.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQRankSum=-2.478;QD=6.01;ReadPosRankSum=1.729;SOR=3.150;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,25:0.40:62
chr2	215674090	rs35933323	T	G	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.44;ReadPosRankSum=1.054;SOR=0.820;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:176,64:0.27:240
chr2	215674323	rs1129804	C	G	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=20;ReadPosRankSum=0.100;SC=AGGCTCCTCGCAGAGCGGGAA;SOR=0.631;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=4;WE=215674331;WS=215674313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,4:0.19:21
chr2	215674341	rs17489363	A	G	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.49;ReadPosRankSum=-2.226;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,3:0.19:16
chr2	215809597	rs10633768	G	GTA	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=61.19;MQRankSum=0.674;NF=2;NR=1;PP=100;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TTGTATGTGTGTATATATATA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=3;WE=215809605;WS=215809587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr2	215809842	.	TACA	T	511.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.696;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=422;ReadPosRankSum=0.291;SC=AATAGAAAGTTACAACAAAAA;SOR=0.776;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=11;WE=215809852;WS=215809832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr2	215820013	rs10498027	G	A	4088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.178;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=83;PP=2962;ReadPosRankSum=0.038;SC=TGACACAGACGTAAGTGATGA;SOR=0.860;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=245;TCF=113;TCR=132;TR=152;WE=215820021;WS=215820003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,158:0.62:255
chr2	215833415	rs4673925	A	G	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.862;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=2;PP=753;ReadPosRankSum=0.306;SC=TCATTTGTATAACATTCCAGA;SOR=3.076;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=32;WE=215833423;WS=215833405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,31:0.69:45
chr2	215833622	rs6756540	G	T	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=369;ReadPosRankSum=1.310;SC=TCAACTTTTTGTTTCTGTTAG;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=15;WE=215833630;WS=215833612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr2	215840829	rs7594021	A	G	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=270;ReadPosRankSum=-0.160;SC=AACTTCAGAAACTATATATAA;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=12;WE=215840837;WS=215840819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr2	215848034	rs7608150	T	C	217.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=178;SC=ATCACCCTGGTTGCTCTTTGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=215848042;WS=215848024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	215851246	rs7559069	A	G	2006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=4;PP=1663;SC=ATGGCAATAAATGTCAAAAAG;SOR=4.840;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=57;TCF=53;TCR=4;TR=57;WE=215851254;WS=215851236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	215855780	rs4533467	G	A	1795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=56;PP=1497;ReadPosRankSum=1.352;SC=AATGTGAGGCGCTTGTTATGC;SOR=0.957;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=13;TCR=81;TR=65;WE=215855788;WS=215855770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,65:0.68:96
chr2	215862383	rs1980844	G	A	2670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=70;NR=5;PP=2104;SC=TCTATGAACAGGACTTATTCA;SOR=5.084;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=70;TCR=5;TR=75;WE=215862391;WS=215862373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr2	215862633	rs1326748	C	G	1982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=58;PP=1661;SC=TTACATTGAACTTATGATCGT;SOR=8.222;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=0;TCR=58;TR=58;WE=215862641;WS=215862623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr2	215865575	rs10498030	T	C	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.326;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=27;PP=910;ReadPosRankSum=0.053;SC=GGTTGTGTGATGGAGAATTGT;SOR=0.684;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=202;TCF=97;TCR=105;TR=60;WE=215865583;WS=215865565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,65:0.31:212
chr2	215872334	rs940279	G	A	2899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=14;PP=2382;SC=CTGGAAGAGAGGCAATTTAAT;SOR=3.467;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=75;TCR=14;TR=89;WE=215872342;WS=215872324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	215874965	rs6733264	G	T	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=1;PP=932;SC=AAGATAGAAAGAAATCAGTCA;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=34;WE=215874973;WS=215874955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	215875251	rs1409607	A	T	2126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=52;PP=1632;SC=ATCCATTTCCACATGGCAAAT;SOR=4.943;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=4;TCR=52;TR=56;WE=215875259;WS=215875241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	215876166	rs7560008	A	T	2070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=0;PP=1743;SC=TACTCACTGGAATTTATGGGA;SOR=8.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=66;TCR=0;TR=66;WE=215876174;WS=215876156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	215876589	rs11388414	G	GT	418.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=2.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.50;MQRankSum=2.669;QD=6.25;ReadPosRankSum=0.752;SOR=0.295;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,25:0.37:67
chr2	215878240	rs7594353	G	A	1789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.65;SOR=6.043;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	215878246	rs10192100	C	T	1848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.02;SOR=5.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	215880108	rs6753310	C	T	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=553;SC=TTCCAAAAGCCGAATAAATGG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=215880116;WS=215880098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	215890312	rs2177423	A	G	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=213;SC=AAATATTATGAGAAGTGTTAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=215890332;WS=215890304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	215890324	rs5838479	G	GT	404.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=153;SC=AAGTGTTAAGGTTTTTTTTTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=10;WE=215890332;WS=215890304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	215890352	rs5838480	GTT	G	428.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.36;QD=32.98;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	215928677	rs12694351	G	C	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.54;ReadPosRankSum=-0.051;SOR=0.057;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,8:0.18:44
chr2	215928972	rs1523721	G	C	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=190;ReadPosRankSum=1.558;SC=CATTACATCAGTATGGCACAT;SOR=0.124;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=11;WE=215928980;WS=215928962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,11:0.26:43
chr2	215940242	rs6711179	T	C	3651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.373;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=52;PP=2762;ReadPosRankSum=-0.022;SC=TATTGTGCAATCATAACCCTG;SOR=0.838;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=171;TCF=98;TCR=73;TR=126;WE=215940250;WS=215940232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,131:0.74:176
chr2	215976231	rs2948978	A	T	239.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=222;SC=ACAAAAAAAAATTTTTGAAAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=215976239;WS=215976221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	216176807	rs4535042	T	G	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.818;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=4;PP=103;ReadPosRankSum=-0.191;SC=CCCTCCTACCTGCGCACGTGG;SOR=0.039;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=8;WE=216176815;WS=216176797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr2	216182769	rs4672766	A	T	1924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=0;PP=1657;SC=CAGAATTTTCACGTTGAATTC;SOR=8.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=55;TCR=0;TR=55;WE=216182777;WS=216182759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	216190020	rs2372536	C	G	2684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=52;PP=2146;SC=CCAGGTGTAACTGTTGAGGAG;SOR=0.982;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=91;TCF=39;TCR=52;TR=90;WE=216190028;WS=216190010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr2	216190691	rs2177737	A	C	2031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=18;PP=1586;SC=AAAATCAATAAGTCTTTTGTT;SOR=1.946;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=48;TCR=18;TR=66;WE=216190699;WS=216190681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	216200907	rs13002576	C	G	3286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=83;PP=2598;SC=CTCTTTCTCCCTTGTTTACTC;SOR=2.628;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=22;TCR=83;TR=105;WE=216200915;WS=216200897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr2	216209472	rs13010249	A	G	6167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=145;NR=70;PP=2965;SC=AAAAGGCCCCATGCAATTTAC;SOR=1.599;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=215;TCF=145;TCR=70;TR=215;WE=216209480;WS=216209462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr2	216211712	rs10932609	A	T	4255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=99;PP=2965;SC=ATTCAGTTCAACCCTTTATGT;SOR=2.488;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=129;TCF=30;TCR=99;TR=129;WE=216211720;WS=216211702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr2	216212089	.	C	T	467	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=18;NR=0;PP=467;QD=27.8761784748;SC=GGTCTTCTCCCACCACATTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=18;WE=216212097;WS=216212088;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr2	216212279	rs4673992	G	C	5946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=107;NR=64;PP=2965;SC=AAAACAGAAGGCTGCTAATCA;SOR=1.295;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=174;TCF=109;TCR=65;TR=171;WE=216212287;WS=216212269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr2	216212339	rs4673993	T	C	6753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.527;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=112;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.750;SC=CAGTTTTTTATTCAGGAGCAG;SOR=0.613;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=206;TCF=94;TCR=112;TR=204;WE=216212347;WS=216212329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,213:1.00:214
chr2	216214124	rs4672768	G	A	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=5;PP=1360;SC=GGTGGATGGAGAACCCAAATC;SOR=4.003;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=44;WE=216214132;WS=216214114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	216229692	rs11651	A	G	4056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=42;PP=2965;SC=TCCCATCATCATAACACGTTG;SOR=1.858;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=93;TCR=42;TR=135;WE=216229700;WS=216229682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr2	216232556	rs7568287	C	T	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.829;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=455;ReadPosRankSum=-1.251;SC=GAGACAAACACGGAAGTGGAT;SOR=1.051;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=67;TCF=62;TCR=5;TR=24;WE=216232564;WS=216232546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,24:0.34:71
chr2	216235089	rs1250209	C	T	3171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=47;PP=2507;SC=TCCACTATGACGTTGTAGGTG;SOR=0.842;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=45;TCR=47;TR=92;WE=216235097;WS=216235079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr2	216236712	rs17449032	T	C	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=26;PP=718;ReadPosRankSum=-0.201;SC=GCCCATGAGATGGTTGTCTGA;SOR=0.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=168;TCF=81;TCR=87;TR=51;WE=216236720;WS=216236702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,53:0.31:173
chr2	216243832	rs1250204	T	C	4390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=36;PP=2965;SC=TTTATTCCAATGAACAACGGT;SOR=2.099;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=104;TCR=36;TR=140;WE=216243840;WS=216243822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr2	216248305	rs1250203	G	T	913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=794;SC=TCGAATGATCGCTTACATGAG;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=216248313;WS=216248295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	216249587	rs13652	C	T	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.745;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=272;ReadPosRankSum=0.671;SC=CTGTACCTGTCTCTCCGTAAG;SOR=1.460;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=15;WE=216249595;WS=216249577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr2	216249819	rs1250201	C	T	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=433;SC=GTAAATACTACGTGTAATTAG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=216249827;WS=216249809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	216253039	rs1250215	G	C	1973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.133;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=55;PP=1484;ReadPosRankSum=-1.117;SC=AGGGGCAAATGGGGCTTATTT;SOR=1.175;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=111;TCF=35;TCR=76;TR=77;WE=216253047;WS=216253029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,80:0.69:116
chr2	216256615	rs6709607	T	C	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=30;ReadPosRankSum=-0.990;SC=AAAGGTAAAATCAATATTTCA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=4;WE=216256623;WS=216256605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr2	216262621	rs6725958	A	C	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.182;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=272;ReadPosRankSum=0.856;SC=TTTCCAGAGGACTGTTACTGC;SOR=1.292;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=15;WE=216262629;WS=216262611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr2	216263926	rs2692224	C	A	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=826;ReadPosRankSum=0.100;SC=TACATGGGAACCACAAGGACA;SOR=0.205;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=13;WE=216263946;WS=216263916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr2	216263938	rs3832178	C	CT	477.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.979;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=818;ReadPosRankSum=0.548;SC=ACAAGGACAGCTCAGGGCTGT;SOR=0.232;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=13;WE=216263946;WS=216263916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr2	216269030	.	T	TTTTTTG	571.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.32;MQRankSum=1.153;QD=28.59;ReadPosRankSum=-1.789;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr2	216269046	rs56380797	G	T	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.561;NF=13;NR=2;PP=307;ReadPosRankSum=-0.997;SC=GTTTTGTTTTGTTTTAAAGCA;SOR=0.560;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=15;WE=216269054;WS=216269036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr2	216269095	rs13306359	C	T	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.263;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.026;NF=19;NR=14;PP=625;ReadPosRankSum=-0.309;SC=AGAAAAGGCACTTAATTTTCA;SOR=0.302;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=48;TCF=30;TCR=18;TR=33;WE=216269103;WS=216269085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,33:0.67:49
chr2	216269209	rs1053238	T	G	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=916;ReadPosRankSum=-0.703;SC=GATTCCTCAGTGGGTACTTGG;SOR=0.674;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=65;TCF=27;TCR=38;TR=39;WE=216269217;WS=216269199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,41:0.60:68
chr2	216269254	rs7589580	T	G	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.464;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=805;ReadPosRankSum=-0.845;SC=GCCTGGGCTGTCCTCTTCGGG;SOR=0.350;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=62;TCF=29;TCR=33;TR=38;WE=216269262;WS=216269244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,40:0.61:66
chr2	216271812	rs7592898	A	T	311.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=219;ReadPosRankSum=1.472;SC=AACAATCCTGATAAGATAACA;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=10;WE=216271820;WS=216271802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr2	216272819	rs7570208	C	G	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=230;ReadPosRankSum=0.518;SC=AAGAGGGGGACGCTTAGCTGA;SOR=0.111;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=13;WE=216272827;WS=216272809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,12:0.24:49
chr2	216272900	rs2577301	T	G	4262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=39;PP=2965;SC=TCCACAGTCGTGTCAGGAGGG;SOR=1.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=83;TCR=39;TR=122;WE=216272908;WS=216272890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr2	216273202	rs16853986	G	A	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.216;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=40;PP=1289;ReadPosRankSum=0.838;SC=TCCCTCAAATGACTCTACAGC;SOR=0.353;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=95;TCF=26;TCR=69;TR=58;WE=216273210;WS=216273192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,60:0.59:102
chr2	216274853	rs5838510	A	AAC	473.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.161;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=673;ReadPosRankSum=1.209;SC=AATTTAAATTAACACACACAC;SOR=1.508;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=15;WE=216274861;WS=216274843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr2	216288795	rs11693652	G	A	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=84;ReadPosRankSum=1.114;SC=TAAATGGCTAGAATGCTGGCA;SOR=0.175;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=6;WE=216288803;WS=216288785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr2	216295312	rs1250241	T	A	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=72;ReadPosRankSum=-1.150;SC=TTTTCTTGACTTCCAGAAGTT;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=216295320;WS=216295302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr2	216295337	rs7586990	A	G	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=2.336;SC=AAGCATGCTGATATACTGGAT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=6;WE=216295345;WS=216295327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr2	216296730	rs113868976	A	AT	585.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.30;MQRankSum=2.989;QD=4.88;ReadPosRankSum=-0.597;SOR=0.764;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,37:0.31:120
chr2	216296860	rs7567647	G	A	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=339;ReadPosRankSum=0.348;SC=AGTCAATTCAGTTAAGTGTCT;SOR=0.487;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=17;WE=216296868;WS=216296850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr2	216298084	rs2289202	G	A	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.456;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=637;ReadPosRankSum=0.574;SC=GCCCAGCCCCGATGCAGGTAC;SOR=0.843;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=132;TCF=65;TCR=67;TR=37;WE=216298092;WS=216298074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,41:0.29:143
chr2	216298230	rs10202709	C	T	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.519;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=258;ReadPosRankSum=-0.239;SC=TAGGTACAAGCTTTTCTAGTT;SOR=0.180;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=15;WE=216298238;WS=216298220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr2	216299281	rs1250246	A	C	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=245;ReadPosRankSum=-2.008;SC=AAATATAAGCAGTTTTTAAAC;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=14;WE=216299289;WS=216299279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,14:0.30:46
chr2	216299571	rs10648691	T	TTAC	1191.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=1.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=1.581;QD=9.61;ReadPosRankSum=-0.154;SOR=1.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,36:0.29:124
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chr2	216808354	rs150285041	G	A	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=13;PP=398;SC=GACGAGGTCAGGAGATCGAGA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=216808362;WS=216808344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr2	216810468	rs62183184	A	C	3869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=66;PP=2965;SC=CTAAGGTAGAAAAATGGACCA;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=52;TCR=66;TR=118;WE=216810476;WS=216810458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr2	216811707	rs1344695	G	T	1450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=0;PP=1187;SC=TGATCACAACGAGTTATTTTT;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=39;WE=216811715;WS=216811697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	216861273	rs2303845	T	C	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=23;PP=681;SC=ACAATATCAATTAAAACTTAT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=216861281;WS=216861263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	216878008	rs1864253	C	G	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.633;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=29;PP=756;ReadPosRankSum=1.271;SC=CACTCGCACCCGCAGCAGCAG;SOR=0.764;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=156;TCF=62;TCR=94;TR=49;WE=216878016;WS=216877998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,53:0.33:159
chr2	216908679	rs2303842	C	T	2237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=33;PP=1632;SC=CCACATCCACCGACTGTCCAG;SOR=0.747;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=71;TCF=37;TCR=34;TR=70;WE=216908687;WS=216908669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	216982370	rs3815855	C	G	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=1.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.24;ReadPosRankSum=-2.606;SOR=0.844;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,30:0.28:109
chr2	217012901	rs207906	A	G	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.871;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=553;ReadPosRankSum=0.169;SC=AGGTGACAACAAAAAGTCAGA;SOR=0.403;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=106;TCF=35;TCR=71;TR=35;WE=217012909;WS=217012891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,37:0.35:107
chr2	217024697	rs58550995	CT	C	243.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.13;MQRankSum=0.911;QD=14.34;ReadPosRankSum=-1.961;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr2	217055151	rs12466253	T	C	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.223;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=46;PP=936;ReadPosRankSum=-0.282;SC=GTCTGGGCCGTGGAAATTATC;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=83;TCF=12;TCR=71;TR=54;WE=217055159;WS=217055141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,57:0.66:86
chr2	217055171	rs12470053	A	G	2171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=59;PP=1756;SC=CATTCTCAATATGAATAGCAG;SOR=4.680;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=4;TCR=60;TR=63;WE=217055179;WS=217055161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr2	217057484	rs1805381	T	A	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.647;NF=0;NR=36;PP=854;ReadPosRankSum=-0.406;SC=CCTTTTTTTTTAAAAAGTATT;SOR=1.654;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=0;TCR=52;TR=36;WE=217057492;WS=217057474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,36:0.68:53
chr2	217069151	rs1438162	A	G	1043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.788;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=35;PP=818;ReadPosRankSum=-0.190;SC=CTGGTGTTCTATGATTGAAGT;SOR=0.459;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=137;TCF=29;TCR=108;TR=46;WE=217069159;WS=217069141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,48:0.32:149
chr2	217069876	rs2287561	T	G	1985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.412;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=27;PP=1467;ReadPosRankSum=0.506;SC=GAAATTGGCCTGATTCCTTTC;SOR=0.407;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=132;TCF=88;TCR=44;TR=76;WE=217069884;WS=217069866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,82:0.59:138
chr2	217123958	rs169616	T	C	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=318;SC=CTGTTGGCTCTGGGGGTGCCA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=217123966;WS=217123948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	217148417	rs876771	C	A	2454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=62;PP=2071;SC=TGCACTTGACCGAGCCATCAC;SOR=4.205;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=6;TCR=62;TR=68;WE=217148425;WS=217148407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	217280261	rs5838583	GT	G	134.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=0.781;QD=3.13;ReadPosRankSum=2.309;SOR=0.266;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr2	217297350	rs2271334	G	A	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=70;ReadPosRankSum=-0.038;SC=CAGTGAAGTGGCCTTCACCCA;SOR=0.223;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=6;WE=217297358;WS=217297340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr2	217311630	rs284550	G	T	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=5.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.797;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=273;ReadPosRankSum=0.684;SC=CTCGCGACACGCACGCGGTCT;SOR=1.165;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=62;TCF=48;TCR=14;TR=17;WE=217311638;WS=217311627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,18:0.28:64
chr2	217329184	rs2129119	T	C	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.002;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=224;ReadPosRankSum=-0.451;SC=AGGGGAATCATTGTCAGCACC;SOR=0.156;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=54;TCF=52;TCR=2;TR=15;WE=217329192;WS=217329174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,16:0.29:55
chr2	217342773	rs284524	T	G	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=331;ReadPosRankSum=0.687;SC=GGGGGCAAATTTTTCAAGATG;SOR=0.193;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=5;WE=217342790;WS=217342763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr2	217342782	.	TG	T	89.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=317;ReadPosRankSum=0.634;SC=TTTTTCAAGATGGGTGTTTGC;SOR=0.193;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=5;WE=217342790;WS=217342763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr2	217343136	rs5838586	G	GC	178.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=178;ReadPosRankSum=-0.097;SC=ACCTCCCCCAGCCTAGAGCTG;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=7;WE=217343144;WS=217343126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr2	217364452	rs284573	C	G	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.863;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=520;ReadPosRankSum=0.562;SC=GTCTGTGCATCTAATACCATT;SOR=1.863;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=21;WE=217364460;WS=217364442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr2	217364539	rs284572	C	T	1892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.803;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=19;PP=1507;ReadPosRankSum=2.134;SC=ACAGCAATCCCTGTTTTGTTT;SOR=1.721;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=93;TCF=63;TCR=30;TR=68;WE=217364547;WS=217364529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,68:0.74:92
chr2	217498290	rs5838590	C	CGCCGCTGCT	310.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=2;NR=5;PP=586;SC=CTGCCGCCGCCGCCGCTGCTG;SOR=1.179;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=217498298;WS=217498280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	217526760	rs145598325	T	G	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.782;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=288;ReadPosRankSum=1.031;SC=CAGCTCCTCCTCAGCCCTGGG;SOR=2.481;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=4;TCR=45;TR=16;WE=217526768;WS=217526750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,15:0.31:48
chr2	217541582	rs2160549	T	C	3673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=70;PP=2934;SC=AGATGCCACGTTTGCGGCCAC;SOR=1.159;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=47;TCR=70;TR=117;WE=217541590;WS=217541572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr2	217736131	rs2241191	G	A	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.669;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=2;PP=631;ReadPosRankSum=0.781;SC=TGAAAAACACGTGGGTTCTTG;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=26;WE=217736139;WS=217736121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,28:0.70:40
chr2	218577575	rs1835333	T	A	817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=0;PP=663;SC=AGTTTGCATCTGTCACCCACC;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=218577583;WS=218577565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	218604247	rs4672848	A	C	2912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=17;PP=2342;SC=GCATAAGTAGAACTGGGGCAG;SOR=2.885;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=73;TCR=17;TR=90;WE=218604255;WS=218604237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	218604356	rs4294980	G	A	5074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=109;PP=2965;SC=GCCAGGGAGAGGCAACTTGCA;SOR=1.538;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=56;TCR=109;TR=165;WE=218604364;WS=218604346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr2	218672657	rs2241451	C	T	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=196;ReadPosRankSum=0.832;SC=AAGCTTCACTCGGAAGCTGAG;SOR=1.022;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=9;WE=218672665;WS=218672647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr2	218674697	rs918949	C	T	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.899;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=33;PP=828;ReadPosRankSum=-1.330;SC=ACAGAGTTGACGAAGAGCACA;SOR=1.532;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=69;TCF=13;TCR=56;TR=39;WE=218674705;WS=218674687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,37:0.54:69
chr2	218675144	rs918950	G	A	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.524;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=654;ReadPosRankSum=1.267;SC=CAGAAGGAACGCTGCTTTTCA;SOR=0.124;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=49;TCF=6;TCR=43;TR=30;WE=218675152;WS=218675134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,33:0.60:55
chr2	218675199	rs1035672	G	A	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=360;ReadPosRankSum=-0.763;SC=CAGTCTGAACGTTTGATGATT;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=17;WE=218675207;WS=218675189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr2	218679599	rs2059408	T	C	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=538;ReadPosRankSum=0.947;SC=CTCAGCCAGCTATGGCCTCTG;SOR=1.911;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=22;WE=218679607;WS=218679589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,24:0.86:28
chr2	218683154	rs2571445	A	G	1625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=23;PP=1253;ReadPosRankSum=0.969;SC=ATGGCCCGCCAGCCGAAGCCA;SOR=0.786;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=87;TCF=53;TCR=34;TR=61;WE=218683162;WS=218683144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,64:0.70:92
chr2	218694510	rs55877504	CT	C	374.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=1.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.21;ReadPosRankSum=-1.000;SOR=0.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,12:0.23:52
chr2	218694512	rs55694913	T	G	383.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=578;ReadPosRankSum=-1.103;SC=AAGCCCTGCTTTGAAAAGCCA;SOR=0.560;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=12;WE=218694520;WS=218694500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,13:0.24:54
chr2	218694691	rs10188605	A	G	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.36;ReadPosRankSum=-1.368;SOR=0.562;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,24:0.26:93
chr2	218695102	rs3796028	G	A	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.682;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=315;ReadPosRankSum=-0.124;SC=GGCTGGATCCGTCTTCTGGTA;SOR=1.252;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=88;TCF=37;TCR=51;TR=23;WE=218695110;WS=218695092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,23:0.26:89
chr2	218696405	rs17789645	C	T	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=-0.489;SC=TGAGGCCCAGCGCTTTGGCTC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=5;WE=218696413;WS=218696395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr2	218745685	rs10199795	G	A	4302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=90;PP=2965;ReadPosRankSum=1.486;SC=TGAGGGGGTCGGAGGTGTTAT;SOR=0.761;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=44;TCR=91;TR=134;WE=218745693;WS=218745675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,136:0.99:137
chr2	218758123	rs141673800	G	GCA	409.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=2.133;NF=11;NR=4;PP=491;ReadPosRankSum=-0.182;SC=GTGCGCGCGCGCACACACACA;SOR=0.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=15;WE=218758131;WS=218758113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr2	218768422	rs3791936	T	G	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.143;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=29;PP=631;ReadPosRankSum=0.936;SC=CTGTCAGGAATTTCCTCCTGG;SOR=0.991;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=98;TCF=14;TCR=84;TR=32;WE=218768430;WS=218768412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,35:0.34:104
chr2	218770003	rs7600493	G	A	1696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.467;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=24;PP=1247;ReadPosRankSum=0.552;SC=CCACGCCCAGGGGAACTCATG;SOR=1.040;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=179;TCF=105;TCR=74;TR=67;WE=218770011;WS=218769993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,70:0.37:188
chr2	218801469	.	C	T	61.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.021;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=35;ReadPosRankSum=1.150;SC=GTTTCAGGCTCTCCCCAAAGC;SOR=2.788;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=3;WE=218801477;WS=218801459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr2	218801767	rs4674232	C	T	3337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=72;PP=2700;SC=TTTTCCTCCCCGCAAAACTCC;SOR=1.677;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=34;TCR=72;TR=106;WE=218801775;WS=218801757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	218937860	rs10211510	G	T	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.809;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=5;PP=742;ReadPosRankSum=1.504;SC=ATGACGGTGTGTAGTGGAGGC;SOR=0.435;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=49;TCF=43;TCR=6;TR=35;WE=218937868;WS=218937850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,35:0.71:49
chr2	218940259	rs7423696	C	T	1926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.762;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=46;PP=1467;ReadPosRankSum=-0.534;SC=TGCTGATGCCCAGCCCCAGAG;SOR=0.327;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=96;TCF=28;TCR=68;TR=68;WE=218940267;WS=218940249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,71:0.72:99
chr2	218941095	rs6759925	C	G	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=174;ReadPosRankSum=-1.150;SC=AGCCCCAGCACTGGGGTCTCT;SOR=3.816;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=8;WE=218941103;WS=218941085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
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chr2	219093278	rs60528331	A	G	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=0;PP=573;SC=GCAAAGAAACAAGTGCTCAGC;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=219093286;WS=219093273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	219099260	rs1018288	G	C	1687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=48;PP=1565;SC=TTTCAACTCCGTCCATAAAAA;SOR=7.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=48;WE=219099268;WS=219099250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	219099484	rs10932765	T	C	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=2;PP=733;ReadPosRankSum=-1.972;SC=TAATTCTGCATACTACATATT;SOR=0.984;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=48;TCR=3;TR=34;WE=219099492;WS=219099474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,34:0.67:51
chr2	219103580	rs10169718	A	G	1895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.622;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=61;PP=1489;ReadPosRankSum=0.644;SC=CCATGTGAGTATAGAATTTGG;SOR=1.711;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=97;TCF=8;TCR=89;TR=65;WE=219103588;WS=219103570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,69:0.67:103
chr2	219104316	rs34974153	AT	A	455.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=5.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;MQRankSum=1.332;QD=10.13;ReadPosRankSum=-1.056;SOR=0.083;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,31:0.69:45
chr2	219117482	rs35271699	G	A	182.53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.9988;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=143;ReadPosRankSum=-0.674;SC=GCTGCTGCCCGATTCCACAGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=219117490;WS=219117472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr2	219128506	rs2292549	C	T	2488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=61;PP=1976;SC=CTGTCTCTACCGGGCCCCACT;SOR=2.690;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=15;TCR=61;TR=76;WE=219128514;WS=219128496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	219138940	rs4791	C	T	2549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.453;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=51;PP=1998;ReadPosRankSum=-0.381;SC=TAGACATAAACTTTATTACAT;SOR=0.885;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=134;TCF=58;TCR=76;TR=88;WE=219138948;WS=219138930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,92:0.67:138
chr2	219139573	rs6734242	G	A	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=308;SC=TGCTCGTTCTGTTATCTGTCC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=219139581;WS=219139563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	219140288	rs2292550	G	C	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=395;ReadPosRankSum=-0.628;SC=TGTAGTCCTCGGGGCTGATGG;SOR=0.818;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=26;WE=219140296;WS=219140278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr2	219140385	rs72947598	A	G	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=235;ReadPosRankSum=-0.524;SC=CTCAGGCATCAGTGTCCAGAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=11;WE=219140393;WS=219140375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr2	219142023	rs2168703	G	A	907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=2;PP=786;SC=TCCCTAGTGTGCCGGGGTCCG;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=219142031;WS=219142013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	219142491	rs2271543	C	T	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.395;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=726;ReadPosRankSum=0.026;SC=AGCTGGGGAACGCCACCAAGT;SOR=0.369;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=61;TCF=36;TCR=25;TR=19;WE=219142500;WS=219142481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,19:0.31:62
chr2	219142492	rs2168704	G	A	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.375;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=2056;ReadPosRankSum=-0.387;SC=GCTGGGGAACGCCACCAAGTT;SOR=1.193;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=64;TCF=38;TCR=26;TR=45;WE=219142500;WS=219142481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,46:0.71:65
chr2	219142594	rs3817266	C	T	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.796;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=21;PP=896;ReadPosRankSum=-0.339;SC=GGTCCCCATCCCTTCCCTGGG;SOR=0.451;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=196;TCF=130;TCR=66;TR=57;WE=219142602;WS=219142584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,59:0.29:200
chr2	219142773	rs6707559	C	T	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=40;PP=995;ReadPosRankSum=-0.229;SC=CAGAAGGAAGCGCTTGGCTCC;SOR=0.414;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=57;TCF=3;TCR=54;TR=43;WE=219142781;WS=219142763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,45:0.76:59
chr2	219143229	rs2292551	G	A	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.964;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=28;PP=1011;ReadPosRankSum=0.367;SC=TTAAGTCTCTGGGACTCACCT;SOR=0.716;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=181;TCF=87;TCR=94;TR=60;WE=219143237;WS=219143219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,59:0.32:185
chr2	219143327	rs2292552	T	C	1036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.527;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=26;PP=710;ReadPosRankSum=-1.034;SC=CAGGCCCAAATCTGCCCCGCT;SOR=0.370;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=141;TCF=52;TCR=89;TR=45;WE=219143335;WS=219143317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,49:0.33:148
chr2	219144089	rs12987180	G	A	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.682;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=469;ReadPosRankSum=0.311;SC=GGACACAGACGGCCGGGCATG;SOR=0.249;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=91;TCF=26;TCR=65;TR=27;WE=219144097;WS=219144079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,32:0.32:100
chr2	219144149	rs12987219	G	A	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=289;ReadPosRankSum=0.116;SC=CCAGCCCCCAGTACTTTCCTC;SOR=1.092;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=17;WE=219144157;WS=219144139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,19:0.40:48
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chr2	219146607	rs7585702	T	C	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=112;ReadPosRankSum=1.767;SC=GGTGGCCTCATCTGCTCCAAG;SOR=0.787;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=8;WE=219146615;WS=219146597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,9:0.27:33
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chr2	219221982	rs144807145	G	GTCTCTCTCTC	378.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.589;QD=29.13;ReadPosRankSum=0.819;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr2	219227756	rs6723716	T	C	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=272;ReadPosRankSum=-0.912;SC=CAGGTGGGAATGGGGCTTTCA;SOR=1.044;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=17;WE=219227764;WS=219227746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr2	219231807	rs3845833	C	T	1869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=49;PP=1497;SC=CCAAGATGCCCATCTTGAGGG;SOR=2.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=11;TCR=49;TR=60;WE=219231815;WS=219231797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr2	219232354	rs7608923	C	A	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.280;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=27;PP=841;ReadPosRankSum=-0.271;SC=AAGGCTCCAGCGCCCCTTAGC;SOR=1.495;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=58;TCF=17;TCR=41;TR=36;WE=219232362;WS=219232344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,39:0.64:61
chr2	219252208	rs3731863	C	T	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.004;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=487;ReadPosRankSum=0.176;SC=TAGAAGCGCTCGTAGTATTAG;SOR=2.112;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=84;TCF=58;TCR=26;TR=29;WE=219252216;WS=219252198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,29:0.35:83
chr2	219252630	rs17221959	C	T	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.404;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=18;PP=657;ReadPosRankSum=0.543;SC=GCATTGTTGGCGCCATCATCA;SOR=0.437;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=129;TCF=80;TCR=49;TR=42;WE=219252638;WS=219252620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,45:0.32:139
chr2	219254622	rs2695342	A	G	3990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=64;PP=2965;SC=CCCGCCGAGCAGACATCAGAG;SOR=0.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=134;TCF=70;TCR=64;TR=134;WE=219254630;WS=219254612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr2	219257688	rs2045433	T	C	1523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=18;PP=1154;SC=CACCAAGGAGTTCACCCCCAC;SOR=1.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=46;WE=219257696;WS=219257678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	219259270	rs2279015	G	A	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.959;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=399;ReadPosRankSum=-2.027;SC=CCCACCCCCAGTGTGGGCGCT;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=85;TCF=80;TCR=5;TR=23;WE=219259278;WS=219259260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,23:0.26:87
chr2	219263277	rs2695344	A	G	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=24;PP=693;SC=CTTCTGGCAGACGCCGCTCCC;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=219263285;WS=219263267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	219265094	rs2579958	T	C	3931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=66;PP=2943;SC=GCGCTCCTGTTCGCTCGAGGT;SOR=0.998;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=49;TCR=66;TR=115;WE=219265102;WS=219265084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr2	219265136	rs11463820	T	TC	4655.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=80;PP=2965;SC=GAGAGGGAACTCTTCGGGGGT;SOR=1.888;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=101;TCF=16;TCR=85;TR=96;WE=219265144;WS=219265126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr2	219266204	rs2252235	T	C	2333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.590;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=10;PP=1874;ReadPosRankSum=1.209;SC=TCCTCCTGGCTCAGGGGTTCA;SOR=1.155;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=112;TCF=97;TCR=15;TR=81;WE=219266212;WS=219266194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,82:0.73:113
chr2	219266423	rs2227251	C	A	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.655;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=30;PP=683;ReadPosRankSum=-0.009;SC=AGGAGAATGGCGCCATCCCTA;SOR=0.249;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=115;TCF=17;TCR=98;TR=38;WE=219266431;WS=219266413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,40:0.34:117
chr2	219267498	.	G	A	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.021;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.457;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=343;ReadPosRankSum=-0.126;SC=GCACTAGGCTGAGGTTGAGGC;SOR=0.141;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=5;TCR=49;TR=18;WE=219267506;WS=219267488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr2	219267781	rs2227255	C	T	1927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.062;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=15;PP=1586;ReadPosRankSum=-1.086;SC=AGCGTCCTCACGTGGATGAGT;SOR=1.398;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=105;TCF=79;TCR=26;TR=72;WE=219267789;WS=219267771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,72:0.65:110
chr2	219267913	rs2227258	A	G	3600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=66;PP=2904;ReadPosRankSum=-1.609;SC=ATGCAGCCCAATGAACCTGCG;SOR=0.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=204;TCF=104;TCR=100;TR=134;WE=219267921;WS=219267903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,133:0.64:209
chr2	219288382	rs4672893	A	G	2113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=5;PP=1848;SC=TGCTCCCCCAAGCCCCTGAGC;SOR=4.174;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=57;TCR=5;TR=61;WE=219288390;WS=219288372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr2	219288899	rs3731866	C	T	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=5;PP=630;SC=TTCCTGGGCCCGGCTCTTTGT;SOR=2.400;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=219288907;WS=219288889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	219294258	rs6720403	A	C	7002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=114;PP=2965;SC=TCCCTGGGAGAAGGTGCCCTG;SOR=0.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=215;TCF=101;TCR=114;TR=215;WE=219294266;WS=219294248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr2	219296545	rs17572485	G	A	3939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=35;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.860;SC=GACCTCAGCTGGTGACAGTTG;SOR=0.921;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=92;TCR=35;TR=126;WE=219296553;WS=219296535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,126:0.99:127
chr2	219319657	rs6436058	A	G	2691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=27;PP=2054;SC=TGTTCCTCACAAGGCCTGACG;SOR=1.821;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=61;TCR=27;TR=88;WE=219319665;WS=219319647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr2	219320233	rs143712588	GAA	G	382.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-0.436;QD=9.33;ReadPosRankSum=0.218;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr2	219324423	rs199821589	AGTG	A	2123.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.061;NF=45;NR=1;PP=2173;ReadPosRankSum=-0.917;SC=ATGAACCTGCAGTGGACACTG;SOR=0.593;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=79;TCF=78;TCR=1;TR=46;WE=219324433;WS=219324413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,54:0.65:83
chr2	219327898	.	AACACACACACACACACACAC	A	144.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.51;QD=36.24;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	219447612	rs111430766	CT	C	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.01;MQRankSum=1.887;QD=1.01;ReadPosRankSum=-0.371;SOR=0.050;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,13:0.23:56
chr2	219447912	.	A	G	2962	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MMLQ=23;MQ=55.65;NF=6;NR=98;PP=2962;QD=20;SC=GAGAGAGAGAACGTTTGTGTG;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=7;TCR=119;TR=104;WE=219447927;WS=219447901;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:22,104:0.83:126
chr2	219508372	rs3770213	A	T	4291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=61;PP=2965;SC=GACTGTGGCAAGAGGCTCTTC;SOR=0.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=65;TCR=61;TR=126;WE=219508380;WS=219508362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr2	219513782	rs4674322	T	C	3117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.898;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=53;PP=2527;ReadPosRankSum=-1.773;SC=GAAGGGGTAATGGCTCTGCTG;SOR=0.428;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=172;TCF=100;TCR=72;TR=119;WE=219513790;WS=219513772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,120:0.69:174
chr2	219525582	rs6722185	A	G	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=459;SC=CCACACAGTAATGCTGACCTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=219525590;WS=219525572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	219527005	rs2303561	C	T	3290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=48;PP=2496;SC=AAATTTCTCTCAACTTGGCAA;SOR=0.849;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=55;TCR=48;TR=103;WE=219527013;WS=219526995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr2	219529348	rs2243911	C	T	3349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=85;NR=13;PP=2769;SC=GGGCTGACCACGATCAGCCTA;SOR=3.589;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=85;TCR=13;TR=98;WE=219529356;WS=219529338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr2	219532903	rs2556384	C	T	4541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.09;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr2	219532903	.	CGG	TGA	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=42;NR=50;PP=2947;QD=20;SC=ACTGCTGAAGCGGTCCACCCC;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=46;TCR=54;TR=92;WE=219532913;WS=219532893;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,92:0.92:100
chr2	219532905	rs2556385	G	A	4541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.82;SOR=0.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr2	219541056	rs2556388	T	C	1243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=31;PP=998;SC=TCTCCCTCTATCTCTGTTCCT;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=219541064;WS=219541046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr2	219545309	rs2303565	T	C	7335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=126;NR=93;PP=2965;SC=GTTCTACCCCTTGGCTTCCTC;SOR=0.996;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=219;TCF=126;TCR=93;TR=219;WE=219545317;WS=219545299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr2	219555262	rs1344642	G	A	3175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=50;PP=2508;SC=CAGACTTTGCGGAGGGACAGC;SOR=0.775;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=44;TCR=50;TR=94;WE=219555270;WS=219555252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr2	219558193	rs55996799	C	G	952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=873;ReadPosRankSum=0.959;SC=ATTTGAGACACCCCCTTGGAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=29;WE=219558201;WS=219558183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr2	219562675	rs1863704	G	A	3942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=80;PP=2965;ReadPosRankSum=1.557;SC=CTCCTTATAGGTGTCTTGGCC;SOR=0.574;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=43;TCR=81;TR=123;WE=219562683;WS=219562665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,125:0.99:126
chr2	219602499	rs3731877	G	C	3255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=20;PP=2642;SC=CACGCCACCTGAGAAACCCTC;SOR=2.608;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=74;TCR=20;TR=94;WE=219602507;WS=219602489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr2	219602819	rs3731876	G	A	6497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=104;NR=96;PP=2965;SC=GTTCGAGCCCGTCAGAAAAAA;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=201;TCF=105;TCR=96;TR=200;WE=219602827;WS=219602809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr2	219605118	rs7562426	G	A	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=4;PP=850;SC=GCAAAGCAGCGGGGTGGTGCT;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=219605126;WS=219605108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	219609684	.	C	T	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=0;PP=959;ReadPosRankSum=-0.969;SC=TTAATATGTACAAAATAATTA;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=40;WE=219609692;WS=219609674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,39:0.75:52
chr2	219609776	rs2272191	G	A	7291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=201;NR=21;PP=2965;SC=TAGTAACGACGCTTCAGGGCT;SOR=4.274;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=222;TCF=201;TCR=21;TR=222;WE=219609784;WS=219609766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr2	219609995	rs2272190	G	C	2878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=97;PP=2454;SC=AAGAGCCCCCGGGGAGAAGGT;SOR=5.974;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=101;TCF=4;TCR=97;TR=101;WE=219610003;WS=219609985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr2	219610322	rs2272189	G	A	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=397;SC=GCCCAGGGAAGAATGGGCAGC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=219610330;WS=219610312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	219610433	rs586194	A	G	2091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=12;PP=1700;SC=TTCCCTGGGAACAGAGGAAGT;SOR=2.658;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=48;TCR=12;TR=60;WE=219610441;WS=219610423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	219612282	rs2272188	A	G	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=8;PP=828;SC=GAGCCCCATCATCTGGCTGTA;SOR=2.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=39;WE=219612290;WS=219612272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	219616681	rs6708650	A	G	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=526;SC=CCCAGGCTGGAGTGCAATGGT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=219616689;WS=219616671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	219618237	rs6436073	A	C	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=543;SC=GCTGGAGGGTACCAAGACCCC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=219618245;WS=219618227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	219618497	rs6757772	T	G	580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=453;SC=ATTCTCCAGCTGGGGGTTGGT;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=219618505;WS=219618487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	219618708	rs55900247	T	C	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=1;PP=1032;SC=GTAAATAGAATTTTTTTTATG;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=34;WE=219618716;WS=219618698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	219691566	rs1467320	A	G	602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=3;PP=482;SC=GGATGGCATGAGAAACCCTGC;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=219691574;WS=219691556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	219692527	rs11385903	G	GC	1890.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=21;PP=1717;SC=ATCACCAACAGCCCTTTCCGG;SOR=0.960;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=44;TCF=23;TCR=21;TR=42;WE=219692535;WS=219692517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	219692790	rs5838710	A	AG	1767.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=38;PP=1941;SC=GCATCCCTGCAGGGAGGGGCG;SOR=1.981;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=48;TCF=8;TCR=40;TR=46;WE=219692798;WS=219692780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	219696014	rs650898	G	A	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=23;PP=1338;SC=GGGACAAGGAGGTGGGGGAAG;SOR=0.773;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=49;TCF=25;TCR=24;TR=48;WE=219696022;WS=219696004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	219736369	rs141494427	C	G	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.909;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=253;ReadPosRankSum=0.449;SC=CCCGGACCCCCTGGCCCCGCG;SOR=0.074;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=14;WE=219736377;WS=219736359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr2	219892233	rs61749573	T	A	2085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.115;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=10;PP=1643;ReadPosRankSum=-0.654;SC=CTCATAGGGGTCACTGTCCAG;SOR=1.042;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=109;TCF=93;TCR=16;TR=73;WE=219892241;WS=219892223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,75:0.68:111
chr2	219903258	rs6736922	T	G	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.027;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=980;ReadPosRankSum=0.167;SC=GTGAGCATCATGTCCTTGGGA;SOR=0.527;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=33;TCR=32;TR=43;WE=219903266;WS=219903248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,42:0.68:62
chr2	219903723	rs4674354	C	T	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=982;ReadPosRankSum=0.962;SC=ATGGATTCTCCACCTTCTGGG;SOR=0.600;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=73;TCF=27;TCR=46;TR=45;WE=219903731;WS=219903713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,47:0.64:74
chr2	219903787	rs4672910	T	C	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=561;ReadPosRankSum=0.054;SC=AATAAATCAATCAAAGCATAA;SOR=0.573;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=24;WE=219903795;WS=219903777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr2	219906066	rs11674400	C	A	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=340;ReadPosRankSum=0.548;SC=AAGACTCAGTCCCATGGGGCT;SOR=1.519;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=16;WE=219906074;WS=219906064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr2	219920037	rs394452	A	G	2698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.887;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=34;PP=2282;ReadPosRankSum=-0.935;SC=CCTCCCCCGGAGTCCAGCTGC;SOR=0.330;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=144;TCF=98;TCR=46;TR=94;WE=219920045;WS=219920027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,97:0.66:146
chr2	219920412	rs3731881	A	G	2955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.898;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=54;PP=2343;ReadPosRankSum=0.432;SC=TCAGCCTGTGAGGCTCGCGGT;SOR=0.612;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=162;TCF=79;TCR=83;TR=110;WE=219920420;WS=219920402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,111:0.67:165
chr2	219922073	rs34694069	G	GC	851.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.484;NF=23;NR=2;PP=1002;ReadPosRankSum=-0.759;SC=CCCCGGGCGGGCTCTTCACCT;SOR=0.776;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=49;TCF=43;TCR=6;TR=25;WE=219922081;WS=219922063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr2	219923410	rs71974827	G	GAGA	2134.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.705;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=1706;ReadPosRankSum=0.647;SC=AGCTGACTCTGAGAAGAAGCT;SOR=1.321;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=70;TCF=44;TCR=26;TR=35;WE=219923418;WS=219923400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,50:0.62:81
chr2	219941063	rs897477	G	A	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=718;ReadPosRankSum=0.600;SC=CTTGGAAGCTGTTCTCCAAGT;SOR=0.728;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=58;TCF=34;TCR=24;TR=36;WE=219941071;WS=219941053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,39:0.62:63
chr2	220012576	rs7585742	G	C	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.139;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=545;ReadPosRankSum=1.521;SC=TTCCAATTCAGTATTAGGTAC;SOR=1.445;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=18;WE=220012584;WS=220012566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr2	220022176	rs6436120	C	T	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=1;PP=453;SC=CCCAACCCCACATTCGAATTA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=220022184;WS=220022166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	220022435	rs2030452	G	C	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=26.732;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=412;ReadPosRankSum=-0.286;SC=TACAGAGTAAGGGTGCTAAAA;SOR=4.892;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=24;WE=220022443;WS=220022425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr2	220023196	rs2293069	A	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=5.229;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=122;ReadPosRankSum=-0.319;SC=CTCCCTGATAAAATAGAAGGC;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=220023204;WS=220023186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr2	220028900	rs6753739	A	G	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.149;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=597;ReadPosRankSum=-0.312;SC=AGAACTGATCAGGCCACACTG;SOR=0.871;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=58;TCF=31;TCR=27;TR=34;WE=220028908;WS=220028890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,36:0.59:61
chr2	220033830	rs3795986	A	G	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=32;PP=886;ReadPosRankSum=0.574;SC=GGAGGCTAGGAAAAGTTTGGG;SOR=0.804;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=63;TCF=10;TCR=53;TR=39;WE=220033838;WS=220033820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,39:0.56:70
chr2	220033956	rs6436121	T	C	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.781;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=348;ReadPosRankSum=-1.229;SC=ATCTCAATTCTGCACCCACCT;SOR=0.030;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=18;WE=220033964;WS=220033946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr2	220034497	rs142326026	C	CCA	1369.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FS=7.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.01;ReadPosRankSum=0.144;SOR=1.158;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,53:0.23:228
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chr2	220037666	rs1127102	A	G	1764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.883;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=23;PP=1377;ReadPosRankSum=-0.591;SC=GACATTAGCGAGAGACGGCAG;SOR=1.007;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=89;TCF=54;TCR=35;TR=61;WE=220037674;WS=220037656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,63:0.68:92
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chr2	220040330	rs1127101	A	G	2184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=51;PP=1640;ReadPosRankSum=0.407;SC=CATGAGCTACATATTTCTTCT;SOR=0.735;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=123;TCF=46;TCR=77;TR=80;WE=220040338;WS=220040320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,89:0.68:130
chr2	220041091	rs6436123	G	A	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.936;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=30;PP=890;ReadPosRankSum=0.564;SC=TGAAGGGCACGGAAAGGTATG;SOR=0.132;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=54;TCF=11;TCR=43;TR=40;WE=220041099;WS=220041081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,40:0.73:55
chr2	220041433	rs6436124	C	A	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.645;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=2;PP=602;ReadPosRankSum=1.013;SC=CCGCTCAGGCCGGGAGGGGCG;SOR=0.303;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=26;WE=220041441;WS=220041423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr2	220041455	rs6436125	C	T	1676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=4;PP=1300;SC=GCCGGGAGGCCGGGGAGGGGG;SOR=4.091;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=47;WE=220041463;WS=220041445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	220045035	rs7577690	G	A	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=159;ReadPosRankSum=0.220;SC=GGGGATGGGAGTGGAGTGATA;SOR=0.758;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=11;WE=220045043;WS=220045025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,11:0.24:46
chr2	220046349	rs2272017	G	C	2426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.002;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=33;PP=1909;ReadPosRankSum=-1.107;SC=GTTCATCCTGGTTCTCCTGCC;SOR=0.371;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=115;TCF=71;TCR=44;TR=79;WE=220046357;WS=220046339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,83:0.70:118
chr2	220046975	rs3731900	C	A	3641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.960;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=73;PP=2862;ReadPosRankSum=-2.014;SC=GGGTCCCCCCCAGATGGAGTG;SOR=0.483;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=214;TCF=90;TCR=124;TR=133;WE=220046983;WS=220046965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,137:0.62:220
chr2	220047393	rs3731901	C	T	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.129;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=520;ReadPosRankSum=-1.238;SC=GTAGGGCTTCCTGGCTAGGAG;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=21;WE=220047401;WS=220047383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,22:0.85:26
chr2	220071803	rs6714820	C	G	935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=25;PP=804;SC=GCCCAGCGGACAGGGACTTTG;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=220071811;WS=220071793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	220072766	rs4674366	G	T	1404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=31;PP=1184;SC=GCAGGGTAATGGCAGCCAAGT;SOR=1.954;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=41;WE=220072774;WS=220072756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr2	220072852	rs4674367	C	T	1743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.243;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=8;PP=1337;ReadPosRankSum=0.751;SC=AGCTTCAACCCTACCCTGTCG;SOR=2.976;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=49;TCF=40;TCR=9;TR=48;WE=220072860;WS=220072842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,52:0.98:53
chr2	220078496	rs2139823	T	C	2498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=8;PP=1996;SC=GACACAGGCCTCAGGCCCCCT;SOR=3.826;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=65;TCR=8;TR=72;WE=220078504;WS=220078486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	220083279	rs1109866	C	T	4703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=92;PP=2965;SC=CCAGAGTCCCCAGAGCCATCC;SOR=1.334;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=57;TCR=92;TR=149;WE=220083287;WS=220083269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr2	220083453	rs1109867	G	T	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=20;PP=621;SC=GGCCGGGACTGGTCACTCGGA;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=220083461;WS=220083443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	220085845	rs2276633	A	G	5866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=101;PP=2965;SC=CATGCAGGGCAGTGGTCTCAG;SOR=0.830;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=194;TCF=93;TCR=101;TR=194;WE=220085853;WS=220085835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr2	220088248	rs908196	A	G	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=233;SC=CGGTTTTCCCAAAGACACTGT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=220088256;WS=220088238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	220089590	rs3216709	T	TG	1781.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=40;PP=1906;SC=CGGGGTGGGGTGGGGAAGAGA;SOR=2.066;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=51;TCF=8;TCR=43;TR=47;WE=220089598;WS=220089580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	220089685	rs2276637	G	C	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=14;PP=572;SC=TTAAGAGACAGTTCCTGATTT;SOR=1.230;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=220089693;WS=220089675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	220113242	rs7601549	T	G	7335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=151;PP=2965;SC=TGGAGGCGCTTCAGCCCCCAG;SOR=1.727;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=216;TCF=65;TCR=151;TR=216;WE=220113250;WS=220113232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr2	220113384	rs8447	G	A	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=779;SC=CTTACACTTGGGGGTAGCGGG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=220113392;WS=220113374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	220118531	rs939574	G	C	2937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=47;PP=2143;SC=CCCCAAAGGAGAGGGGCAATT;SOR=0.896;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=39;TCR=47;TR=86;WE=220118539;WS=220118521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr2	220135208	rs2891733	C	T	1563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=45;PP=1305;SC=GCACTCTGATCGGGGGGCCAA;SOR=7.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=45;WE=220135216;WS=220135198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	220136155	rs7594971	T	C	7809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=208;NR=156;PP=2965;SC=CATCTGCCACTGCAACCTAGA;SOR=0.701;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=364;TCF=208;TCR=156;TR=364;WE=220136163;WS=220136145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr2	220136351	rs3731892	G	A	7209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=138;PP=2965;SC=CTGCAGAAAAGGTATACCACG;SOR=1.226;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=222;TCF=84;TCR=138;TR=222;WE=220136359;WS=220136341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr2	220136371	rs3731894	T	C	6449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=129;PP=2965;SC=GAGCAGCTGTTGGTGGCAGAG;SOR=0.874;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=225;TCF=96;TCR=129;TR=225;WE=220136379;WS=220136361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr2	220168607	rs2271593	C	T	2619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=2.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.48;ReadPosRankSum=2.253;SOR=0.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,66:0.72:92
chr2	220168616	rs2271594	C	T	2579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=3.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.04;ReadPosRankSum=1.397;SOR=0.361;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,65:0.71:92
chr2	220194247	rs3832109	A	AATT	1052.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.868;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.696;NF=4;NR=19;PP=1130;ReadPosRankSum=0.725;SC=AGGACCTCTGAATTCTCACAG;SOR=0.396;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=23;WE=220194255;WS=220194237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,27:0.71:38
chr2	220194531	rs149517641	CG	C	944.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.867;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=940;ReadPosRankSum=0.410;SC=CTGAGACACTCGGATCCACTC;SOR=1.839;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=26;WE=220194539;WS=220194521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr2	220195446	rs6707009	C	G	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=193;ReadPosRankSum=0.203;SC=TTCCCCCCTCCCCATCTCTAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=11;WE=220195454;WS=220195436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr2	220197207	rs2048737	T	C	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=68;ReadPosRankSum=-0.191;SC=CAGGATCGCTTTCTTGGCCCT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=220197215;WS=220197197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr2	220197321	rs2385405	C	T	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.968;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=10;PP=1252;ReadPosRankSum=-0.677;SC=TGGAGCCCCTCGGAGCTCCCA;SOR=2.040;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=91;TCF=68;TCR=23;TR=57;WE=220197329;WS=220197311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,61:0.64:96
chr2	220197388	rs2385404	C	A	2230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=34;PP=1679;ReadPosRankSum=-0.540;SC=CCGGCCAAGTCTCAGTGAAGG;SOR=0.740;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=74;TCR=51;TR=83;WE=220197396;WS=220197378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,87:0.66:132
chr2	220197424	rs2385403	C	T	1772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=31;PP=1193;ReadPosRankSum=-0.523;SC=AGGGGCTGAGCGGGGCTGCAG;SOR=0.700;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=59;TCR=51;TR=66;WE=220197432;WS=220197414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,70:0.59:118
chr2	220197492	rs2385402	C	G	1691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.868;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=45;PP=1273;ReadPosRankSum=1.549;SC=TTCAGCCAATCGTGAGCGGGC;SOR=1.003;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=97;TCF=30;TCR=67;TR=63;WE=220197500;WS=220197482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,65:0.64:101
chr2	220197835	rs139479208	ATAATATTATATATTAT	A	3115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=11.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.07;MQRankSum=1.950;QD=24.93;ReadPosRankSum=3.262;SOR=0.173;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,95:0.76:125
chr2	220239534	rs3731904	G	A	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=210;ReadPosRankSum=0.368;SC=GCACTAGAGGGGAAGCAGCCC;SOR=0.914;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=11;WE=220239542;WS=220239524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr2	220239561	rs3731905	C	G	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.189;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=293;ReadPosRankSum=-0.098;SC=CAGAGAGGGTCTGGGGTGGGT;SOR=0.287;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=19;WE=220239569;WS=220239551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,19:0.39:49
chr2	220246218	rs6436148	T	C	3177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=44;PP=2456;SC=GAGTCGGCGCTCGGAACAGCC;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=50;TCR=44;TR=94;WE=220246226;WS=220246208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr2	220249299	rs5838737	C	CT	1992.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.383;NF=0;NR=69;PP=1668;ReadPosRankSum=-0.067;SC=TTTGTTTTTTCTTTTTTTTGA;SOR=6.385;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=95;TCF=0;TCR=95;TR=69;WE=220249307;WS=220249289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,72:0.97:74
chr2	220249329	rs2002892	C	T	1547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=46;PP=1289;SC=TCGCTCTTGTCGCCCAGTCTG;SOR=7.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=46;WE=220249337;WS=220249319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	220250147	rs907679	A	G	2017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=9;PP=1510;SC=AGTCCTCACCACAGGCTGGGT;SOR=3.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=59;TCR=9;TR=68;WE=220250155;WS=220250137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	220250322	rs878437	C	A	4424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=91;PP=2965;SC=GGGACTCTGCCGCCCTCCCCA;SOR=1.527;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=43;TCR=91;TR=134;WE=220250330;WS=220250312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr2	220250826	rs2271456	G	A	2110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.243;NF=5;NR=60;PP=1729;ReadPosRankSum=0.603;SC=GGGCACTGCAGCCAGCCAGGC;SOR=2.774;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=5;TCR=61;TR=65;WE=220250834;WS=220250816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,68:0.99:69
chr2	220250897	rs11352428	AG	A	1093.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=23;PP=1209;SC=CAGACTAAGCAGGGTGGTCCT;SOR=2.165;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=31;WE=220250905;WS=220250887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	220251178	rs2271457	T	C	3652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=71;PP=2770;SC=CATGACGATATGTGGAGATGA;SOR=0.998;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=53;TCR=71;TR=124;WE=220251186;WS=220251168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr2	220251208	rs1040009	T	C	3343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=75;PP=2741;SC=TACTCATAAGTAACAGACAGC;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=27;TCR=75;TR=101;WE=220251216;WS=220251198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr2	220252287	rs138394024	CTCG	C	2293.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=11;PP=2361;SC=TGACTCCTCTCTCGCACCCAC;SOR=2.393;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=45;WE=220252297;WS=220252277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	220264412	rs13018645	A	G	1802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=30;PP=1485;ReadPosRankSum=-0.800;SC=GATGAGTATTATTCTGTTAAG;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=22;TCR=31;TR=52;WE=220264420;WS=220264402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr2	220264543	rs58721028	C	CAT	5364.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=27;PP=2965;SC=TGCCTAGGAACGTGTCTGCAC;SOR=2.226;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=100;TCF=71;TCR=29;TR=96;WE=220264551;WS=220264533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr2	220283259	rs1318299	A	G	2390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=26;PP=1695;SC=CGGGCTTCCCACTCGGCTCCC;SOR=1.423;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=50;TCR=27;TR=76;WE=220283267;WS=220283249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr2	220283277	rs2017800	T	C	3360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=59;NR=45;PP=2585;SC=CCCCGCTGAGTTCGCCCGTGT;SOR=0.956;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=59;TCR=45;TR=104;WE=220283285;WS=220283267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr2	220283826	rs907677	T	G	2699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=51;PP=2198;SC=AGGCCTGGGGTCTGGGGTCCC;SOR=1.375;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=30;TCR=51;TR=81;WE=220283834;WS=220283816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	220284717	.	G	C	503	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MMLQ=29;MQ=59.76;NF=15;NR=5;PP=503;QD=26.8885606274;SC=AGGCCCTCCCGCTCTGTCCTG;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=220284725;WS=220284716;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	220284779	rs12991025	C	T	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=7;PP=1293;SC=CCAGCTTTATCACCCGCAACT;SOR=3.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=46;WE=220284787;WS=220284769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	220306413	rs4674398	G	T	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=23;PP=925;SC=CATGTGCCTAGGGCTCCGGAG;SOR=1.347;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=37;WE=220306421;WS=220306403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	220308581	rs10932805	A	C	1334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=1;PP=1082;SC=GGGGGTCCCCAGTGCTGGGCA;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=37;WE=220308589;WS=220308571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	220315970	rs10932806	G	A	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.116;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=380;ReadPosRankSum=-0.868;SC=TGCTGCTCAAGTGTATCATCA;SOR=0.198;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=71;TCF=7;TCR=64;TR=24;WE=220315978;WS=220315960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,24:0.33:73
chr2	220316579	rs4674399	C	T	1297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=33;PP=1252;SC=CCGTGACTCTCCCCTGGCCCA;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=45;WE=220316587;WS=220316569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	220330646	rs1976618	C	T	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=0;PP=1070;SC=TGTGTGTGTGCGCGCGTGTGC;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=220330654;WS=220330636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	220330661	rs1976617	A	G	2232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=55;NR=0;PP=1286;SC=GTGTGCGTGCACGTGTGCGTG;SOR=8.121;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=55;TCR=0;TR=55;WE=220330669;WS=220330651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	220330724	rs1567488	C	T	4149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=44;PP=2965;SC=CGCGTGCGTGCGCGTATGCTG;SOR=1.626;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=93;TCR=45;TR=136;WE=220330732;WS=220330714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr2	220330804	rs1567487	T	C	3757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=51;NR=90;PP=2623;SC=GGGCCACCTGTGCTCCCCCCG;SOR=1.290;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=51;TCR=90;TR=141;WE=220330812;WS=220330794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr2	220332095	.	A	G	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.735;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=498;ReadPosRankSum=-0.633;SC=GCAAGCTGCTACTTACATCTG;SOR=0.314;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=77;TCF=29;TCR=48;TR=30;WE=220332103;WS=220332085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,29:0.37:78
chr2	220332247	.	G	C	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=115;ReadPosRankSum=0.593;SC=CTGGGAAACAGAGCTCCAACC;SOR=0.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=7;WE=220332255;WS=220332237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr2	220333950	rs10167209	T	C	5904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=88;PP=2965;SC=TGTCCATTCCTGACTTCCTGC;SOR=0.988;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=110;TCR=88;TR=198;WE=220333958;WS=220333940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr2	220337196	rs1039897	G	A	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=16;PP=513;SC=AGCTTTGCCCGTCTTCTCTCC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=220337204;WS=220337186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	220341935	rs201853159	A	AG	952.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.41;QD=50.14;SOR=4.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	220341937	.	G	GGCGGGGCCTGGTACAGCGGC	2954	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=59.5;NF=7;NR=0;PP=2954;QD=20;SC=AGGAGATGAGGCCCTGGCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=7;WE=220341946;WS=220341927;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,7:0.41:17
chr2	220341938	.	C	T	196	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=59.57;NF=4;NR=0;PP=196;QD=57.6928031368;SC=GGAGATGAGGCCCTGGCCCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=4;WE=220341946;WS=220341927;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:20,4:0.17:24
chr2	220341938	.	C	CGGGGCCTGGTACAGCGGCT	1560.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.50;QD=67.86;SOR=4.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	220346596	rs3731906	C	T	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=466;SC=GAAACAGGCTCTAATCAGTGA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=220346604;WS=220346586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	220353104	rs875097	A	G	3433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=48;PP=2863;SC=GGGAGGGGCTAGGCCGGAGTG;SOR=0.752;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=51;TCR=48;TR=98;WE=220353112;WS=220353094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr2	220356806	rs907146	C	T	5501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=70;PP=2965;SC=GGTCTGCATACGTCAATCAAG;SOR=1.096;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=98;TCR=70;TR=168;WE=220356814;WS=220356796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr2	220361265	rs2385541	A	G	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=462;SC=ACTCTTGAGTAGGGTTTGAGT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=220361273;WS=220361255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	220361486	rs2010592	G	A	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.351;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=357;ReadPosRankSum=-0.102;SC=GGCTGTGGCCGGGCCTGTCTT;SOR=3.312;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=16;WE=220361494;WS=220361478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr2	220361520	rs16859986	C	G	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.142;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=1;PP=711;ReadPosRankSum=-0.476;SC=CCTGACTCGGCCCGCGGGTAG;SOR=2.038;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=30;WE=220361528;WS=220361510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,31:0.72:43
chr2	220362283	rs2010528	C	G	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=381;ReadPosRankSum=-0.375;SC=GTCCCTTTAACAGCCAAGGAG;SOR=0.582;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=16;WE=220362291;WS=220362273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr2	220362557	rs12474050	C	T	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=38;PP=1016;ReadPosRankSum=0.693;SC=GGACCAAGGACGGGGAGGACA;SOR=0.664;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=27;TCR=65;TR=54;WE=220362565;WS=220362547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,55:0.58:95
chr2	220362899	rs2029251	C	G	5580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=82;NR=97;PP=2965;SC=TCGCTCGCGTCGACGTGGCCT;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=82;TCR=97;TR=179;WE=220362907;WS=220362889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr2	220366953	rs2385539	G	C	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.818;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=470;ReadPosRankSum=-2.088;SC=AAGTAGGGAGGGGGAGGGCAG;SOR=1.234;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=79;TCF=73;TCR=6;TR=26;WE=220366961;WS=220366943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,26:0.32:80
chr2	220371181	rs10932808	T	A	1575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=46;PP=1413;SC=GGGGAACCCCTCAGCTGATGG;SOR=3.486;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=55;TCF=7;TCR=48;TR=53;WE=220371189;WS=220371171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	220379560	rs3731909	C	G	1497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.515;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=31;PP=1115;ReadPosRankSum=-2.406;SC=CTGGAGCAGCCCCCCGAGACC;SOR=0.759;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=220;TCF=123;TCR=97;TR=73;WE=220379568;WS=220379550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,76:0.33:229
chr2	220380125	rs1872858	G	A	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.772;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=75;ReadPosRankSum=-1.268;SC=TCCTCAACAGGGCTTCCCTTC;SOR=0.030;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=7;WE=220380133;WS=220380115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
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chr2	220402680	rs11695248	T	C	1577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.22;ReadPosRankSum=0.449;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,40:0.74:54
chr2	220404381	rs1976616	A	G	2792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=65;PP=2352;SC=GGGCTGCCACATAGTCGGAGT;SOR=2.174;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=23;TCR=65;TR=88;WE=220404389;WS=220404371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr2	220404648	rs1043833	C	T	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=632;ReadPosRankSum=-0.182;SC=CCATGAGGCGCAGTGGTGAGG;SOR=0.617;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=102;TCF=41;TCR=61;TR=36;WE=220404656;WS=220404638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,38:0.36:105
chr2	220404726	rs1043832	G	A	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.672;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=420;ReadPosRankSum=1.694;SC=GCTCTGCCACGTGGGCCTTGA;SOR=1.270;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=62;TCF=15;TCR=47;TR=24;WE=220404734;WS=220404716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,23:0.37:63
chr2	220405230	rs6436154	G	A	1362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=32;PP=1031;ReadPosRankSum=-0.997;SC=AGGAGAAAGCGTGCTGCTCCG;SOR=0.733;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=153;TCF=73;TCR=80;TR=60;WE=220405238;WS=220405220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,59:0.39:153
chr2	220405321	rs6436155	T	C	5189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.97;NF=86;NR=85;PP=2965;SC=AGCAGCTGCCTGGTCCCCATC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=86;TCR=85;TR=171;WE=220405329;WS=220405311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr2	220406239	rs13004994	T	G	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=10;PP=1011;ReadPosRankSum=-1.444;SC=ATGTCCGAATTGGCATGGAAA;SOR=0.579;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=42;WE=220406247;WS=220406229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,44:0.70:63
chr2	220406722	rs3731912	T	C	3833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=80;PP=2962;ReadPosRankSum=1.886;SC=GCTCCTCGCCTAGCGTCACCA;SOR=0.741;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=197;TCF=73;TCR=124;TR=126;WE=220406730;WS=220406712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,133:0.66:203
chr2	220406944	rs7581251	G	A	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=14;PP=481;SC=CTTATCAAAAGGACAACGGGG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=220406952;WS=220406934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	220409701	rs10932811	C	T	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=515;ReadPosRankSum=-0.525;SC=CTCTGAATCCCTCTACCATCA;SOR=0.565;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=68;TCF=16;TCR=52;TR=28;WE=220409709;WS=220409691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,29:0.41:70
chr2	220412256	rs8179770	T	C	1361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=16;PP=979;SC=CAGTGCTCTTTCTCACTGGGT;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=42;WE=220412264;WS=220412246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	220413658	rs56198734	CA	C	836.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=605;ReadPosRankSum=0.334;SC=GGAAGCCTAGCAACCTTCCAT;SOR=1.312;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=18;WE=220413669;WS=220413648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr2	220413661	rs12996466	C	T	1793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=0;PP=1136;SC=AGCCTAGCAACCTTCCATAAA;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=35;WE=220413669;WS=220413648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	220414016	rs6436156	C	T	5699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.30;SOR=3.683;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr2	220414016	.	CCCT	TCCC,TCCT	2277	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=6,19;NR=40,135;PP=598,2277;QD=14.1623451057;SC=GGCCACCAGACCCTGCTTATC;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=158;TCF=21;TCR=137;TR=46,154;WE=220414027;WS=220414005;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.29:158
chr2	220414019	rs13023533	T	C	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=3.571;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.07;ReadPosRankSum=-1.387;SOR=0.347;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,49:0.34:146
chr2	220415595	rs146790993	GGA	G	427.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.345;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=558;ReadPosRankSum=0.081;SC=ATGGGGCTGGGGAGAGAAGGG;SOR=1.739;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=46;TCF=9;TCR=37;TR=15;WE=220415604;WS=220415585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,14:0.29:48
chr2	220415646	rs1043582	T	C	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.637;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=126;ReadPosRankSum=-0.634;SC=TGGACACCAGTACACAAAGAG;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=8;WE=220415654;WS=220415636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr2	220415717	rs3731918	G	A	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=118;ReadPosRankSum=-0.405;SC=CTTGGCGGCAGGAAGGTGGGG;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=220415725;WS=220415707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr2	220415752	rs6745782	C	T	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=3;PP=49;SC=GGGCACAGCGCGGCACCTGAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=220415760;WS=220415742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	220416164	rs6761575	T	C	255.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=180;SC=CACCCCAAGTTCTGGAAAGCC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=220416172;WS=220416162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	220416570	rs4672931	C	T	1630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=40;PP=1358;SC=GCATGGCCCCCAGGAGGAGAG;SOR=2.393;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=53;WE=220416578;WS=220416560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	220416591	rs4672932	C	T	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=32;PP=1212;SC=ATGCATCTTCCCTCCCTGAAG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=42;WE=220416599;WS=220416581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	220416803	rs4672933	A	T	4451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=48;PP=2965;SC=CAGGATGTACACTCTCTGTCG;SOR=1.414;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=90;TCR=48;TR=138;WE=220416811;WS=220416793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr2	220416942	rs34490902	G	C	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.669;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=336;ReadPosRankSum=-1.524;SC=TTCTTCCCTGGGGGTGAGGGG;SOR=0.250;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=86;TCF=24;TCR=62;TR=30;WE=220416950;WS=220416932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,31:0.35:89
chr2	220416967	rs4672934	C	T	1236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.539;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=36;PP=1011;ReadPosRankSum=1.229;SC=CTAGCGAGGCCGGAGCCACCT;SOR=1.567;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=68;TCF=14;TCR=54;TR=43;WE=220416975;WS=220416957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,43:0.63:68
chr2	220417228	rs60549465	G	T	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.432;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=361;ReadPosRankSum=-0.979;SC=GGGCAGCGAGGGGCCCGAAAG;SOR=1.251;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=96;TCF=58;TCR=38;TR=28;WE=220417236;WS=220417218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,28:0.30:94
chr2	220417266	rs59332477	C	T	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.556;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=18;PP=624;ReadPosRankSum=0.669;SC=ACCTTCCTGTCGGATGCGGAC;SOR=1.105;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=118;TCF=62;TCR=56;TR=42;WE=220417274;WS=220417256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,44:0.37:120
chr2	220419236	rs10932813	T	C	3332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=30;PP=2585;SC=GGGAATCCGCTGTGAAGGAGA;SOR=1.819;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=71;TCR=30;TR=101;WE=220419244;WS=220419226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr2	220419339	rs10932814	T	C	4152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=73;PP=2965;SC=TGGATACAGCTGTACTCCACC;SOR=0.842;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=140;TCF=67;TCR=73;TR=140;WE=220419347;WS=220419329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr2	220420785	rs3087971	G	A	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.094;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=29;PP=849;ReadPosRankSum=-0.572;SC=GGTGGCTCTCGCAGCCGTAGG;SOR=0.735;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=140;TCF=75;TCR=65;TR=54;WE=220420793;WS=220420775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,59:0.38:156
chr2	220420956	rs10932816	A	G	1709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=38;PP=1386;SC=CGAGACACACATCCTGGCCTT;SOR=1.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=16;TCR=38;TR=54;WE=220420964;WS=220420946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	220421417	rs1983210	C	G	3295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.314;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=71;PP=2465;ReadPosRankSum=-0.205;SC=GTGGTGTCAGCTCCGAGACCA;SOR=0.223;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=186;TCF=63;TCR=123;TR=119;WE=220421425;WS=220421407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,123:0.65:189
chr2	220421479	rs13010015	A	G	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.960;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=35;PP=714;ReadPosRankSum=-0.373;SC=AGCTGGGCTGAGTCTTTTCTT;SOR=1.557;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=116;TCF=18;TCR=98;TR=38;WE=220421487;WS=220421469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,40:0.33:120
chr2	220422400	rs2278200	C	G	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.47;ReadPosRankSum=1.477;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,4:0.16:25
chr2	220422774	rs2278201	A	G	1034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.341;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=22;PP=737;ReadPosRankSum=0.092;SC=CTGGCTCCCCAGGGGCCACAC;SOR=0.567;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=163;TCF=99;TCR=64;TR=54;WE=220422782;WS=220422764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,54:0.33:163
chr2	220427347	rs10804275	G	T	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.898;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.414;NF=8;NR=21;PP=516;ReadPosRankSum=-1.462;SC=CCAGGCGCACGGCTGCCACAT;SOR=0.177;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=86;TCF=17;TCR=69;TR=29;WE=220427355;WS=220427337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,30:0.34:88
chr2	220427395	rs3183099	G	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.312;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.437;NF=5;NR=10;PP=236;ReadPosRankSum=1.271;SC=ACGAGGAGACGTCTGGAGGAC;SOR=0.446;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=15;WE=220427403;WS=220427385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr2	220427428	rs55904205	GA	G	312.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.246;NF=1;NR=8;PP=290;ReadPosRankSum=-1.194;SC=TGCCGGGCATGAGGGGTGTGC;SOR=1.075;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=9;WE=220427436;WS=220427418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr2	220427996	rs11904583	T	C	2052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=63;NR=0;PP=1760;SC=AACAGTGGCCTGGGAGTGAAG;SOR=8.287;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=63;TCR=0;TR=63;WE=220428004;WS=220427991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	220428381	rs2303543	A	T	3978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.346;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=100;PP=2962;ReadPosRankSum=0.348;SC=CATTGCACAGACACCCCCGCA;SOR=1.101;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=215;TCF=68;TCR=147;TR=142;WE=220428389;WS=220428371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,145:0.66:221
chr2	220430203	rs1039898	C	T	6446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=133;PP=2965;SC=CAACGACACCCTGTCCTGGGG;SOR=1.670;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=64;TCR=133;TR=197;WE=220430211;WS=220430193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr2	220431919	rs4674412	A	G	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=25;PP=953;SC=GCGGATGGCAAGCCTGTGAGA;SOR=1.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=35;WE=220431927;WS=220431909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	220432709	rs2292360	A	T	4982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.674;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=115;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.150;SC=GCGGACAGGAATCCATCAACC;SOR=0.882;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=287;TCF=110;TCR=177;TR=182;WE=220432717;WS=220432699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,186:0.63:297
chr2	220435034	rs10180675	A	G	12407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=192;NR=182;PP=2965;SC=CCTGGCAGTAAAGCACCTTGA;SOR=0.730;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=375;TCF=193;TCR=182;TR=374;WE=220435042;WS=220435024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,381:1.00:381
chr2	220435375	rs1061399	G	A	1878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.982;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=13;PP=1560;ReadPosRankSum=-1.391;SC=AGGATGCGCAGTGCCAGGCTC;SOR=0.939;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=97;TCF=76;TCR=21;TR=65;WE=220435383;WS=220435365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,65:0.67:97
chr2	220437081	rs35118453	C	T	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=230;ReadPosRankSum=0.392;SC=TCCCCACTAGCAGGGCCAGGT;SOR=0.612;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=50;TCF=30;TCR=20;TR=16;WE=220437089;WS=220437071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,14:0.29:48
chr2	220439678	rs12720063	C	T	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.301;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=21;PP=824;ReadPosRankSum=-0.882;SC=CTCACTGGGCCGTGCTGCACC;SOR=0.852;SbPval=0.68;Source=Platypus;TCR=76;TR=53;WE=220439686;WS=220439668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,54:0.30:178
chr2	220462481	rs146242946	G	A	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=250;ReadPosRankSum=0.640;SC=CCCCCGCACCGCCCCTTTTCG;SOR=0.569;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=14;WE=220462489;WS=220462471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr2	220462640	rs681747	G	T	7161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=147;NR=84;PP=2965;SC=CAGACGGGGAGGTTCGGTATG;SOR=1.407;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=231;TCF=147;TCR=84;TR=231;WE=220462648;WS=220462630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr2	220466199	rs620698	G	T	3782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=47;PP=2965;SC=TGTGCAAGGAGCCCAAGAGAA;SOR=1.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=68;TCR=47;TR=115;WE=220466207;WS=220466189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr2	220466344	rs11405075	G	GT	1422.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.12;MQRankSum=0.359;QD=17.56;ReadPosRankSum=-0.529;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,67:0.83:81
chr2	220471116	rs633200	C	G	4041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=89;PP=2965;SC=GGACCTGGACCCTGCTTACTG;SOR=1.918;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=36;TCR=89;TR=125;WE=220471124;WS=220471106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr2	220473355	rs673951	G	A	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=695;ReadPosRankSum=0.965;SC=GCCTGAGGGCGTACGGGGCAG;SOR=0.634;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=41;TCR=49;TR=34;WE=220473363;WS=220473345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,35:0.36:96
chr2	220476443	rs627530	C	T	5012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=65;PP=2965;SC=CCTTCTCCGTCTGCCAGCCCT;SOR=0.994;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=86;TCR=66;TR=151;WE=220476451;WS=220476433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr2	220476645	rs581547	T	C	2808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=54;PP=2209;SC=GGGGCTGCCATGGGCAGGCTG;SOR=1.227;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=35;TCR=54;TR=89;WE=220476653;WS=220476635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr2	220478009	.	GGGA	G	80.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.18;ReadPosRankSum=0.319;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr2	220478018	.	G	T	62.74	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	220478019	.	G	T	62.74	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	220479055	rs2305052	C	A	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=383;ReadPosRankSum=0.303;SC=AGGTCCTGGGCAGCCACCTGT;SOR=1.244;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=16;WE=220479063;WS=220479045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr2	220479312	rs624773	T	C	3385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=57;PP=2809;SC=CTCTGTACCCTACCTTGTCAC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=58;TCR=57;TR=114;WE=220479320;WS=220479302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr2	220480639	rs640807	T	C	1412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=37;PP=1062;SC=GGGAGTGACATGGGCCTGGGG;SOR=1.747;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=53;WE=220480647;WS=220480629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	220480693	rs665845	G	C	1747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=29;PP=1470;SC=TGAGGCCTTCGCAGAGACCTC;SOR=0.994;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=21;TCR=29;TR=50;WE=220480701;WS=220480683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	220494118	rs597306	A	C	2032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=39;PP=1779;SC=GAGCCCCCCCACTCAGGGACC;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=24;TCR=39;TR=63;WE=220494126;WS=220494108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr2	220495167	rs612078	A	C	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=21;PP=675;SC=GTCCCCTGCTAAGGGCTGAGT;SOR=4.255;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=23;WE=220495175;WS=220495157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	220500423	rs589767	A	G	5114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.87;SOR=0.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr2	220500426	rs639214	A	G	5127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.59;SOR=0.782;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr2	220502137	rs621515	C	T	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=567;SC=TGTGTGTGTTCTGTGTGTTCT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=220502145;WS=220502127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	220502367	rs635311	A	C	4815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=75;PP=2965;SC=GGGTCCCTGGATGCTGGTCTG;SOR=0.734;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=68;TCR=75;TR=143;WE=220502375;WS=220502357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr2	220505265	rs684428	T	C	6446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=115;PP=2965;SC=GTCCCAGCGTTTGTTGCTCAT;SOR=1.106;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=79;TCR=115;TR=194;WE=220505273;WS=220505255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr2	220586231	rs9288551	C	G	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.208;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=141;ReadPosRankSum=-0.998;SC=AGGCTATGCGCTTTATCTGCA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=220586239;WS=220586221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr2	220586367	rs368069746	AAG	A	59.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.935;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=2.003;NF=3;NR=2;PP=161;ReadPosRankSum=0.000;SC=CATCTAGAAAAAGAGAGAGAG;SOR=0.895;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=5;WE=220586376;WS=220586357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr2	220771223	rs4674470	C	T	4359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=98;PP=2965;SC=AAGATGCCCCCAGGTGACATC;SOR=1.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=37;TCR=98;TR=135;WE=220771231;WS=220771213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr2	220771290	rs4674471	G	A	1778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=46;PP=1479;SC=TGTGCATTTTGCCAGGGAAAC;SOR=3.690;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=53;WE=220771298;WS=220771280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	220771310	rs4674472	A	G	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=41;PP=1282;SC=CCAGAGTTGCACGATTTCTAT;SOR=4.407;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=45;WE=220771318;WS=220771300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	220771378	rs4674473	A	G	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=12;PP=363;SC=GCATATGTGTATGGCATGCCT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=220771386;WS=220771368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	222290902	rs2303901	A	G	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.354;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=305;ReadPosRankSum=-1.343;SC=AAGAAGTCACAGGGACTGACA;SOR=1.578;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=48;TCF=8;TCR=40;TR=18;WE=222290910;WS=222290892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr2	222298963	.	G	A	1431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=0.000;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=32;PP=1046;ReadPosRankSum=1.584;SC=GTGAATTTACGATAGGCAATT;SOR=0.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=191;TCF=92;TCR=99;TR=62;WE=222298971;WS=222298953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,64:0.32:198
chr2	222431689	rs7589393	G	A	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.60;MQRankSum=-2.017;QD=4.13;ReadPosRankSum=-2.284;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr2	222434898	rs11687492	T	C	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.406;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=436;ReadPosRankSum=1.103;SC=GGAAACGTGATGGGAATAGAA;SOR=1.253;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=97;TCF=37;TCR=60;TR=34;WE=222434906;WS=222434888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,36:0.37:98
chr2	222435035	rs200647532	TCC	T	376.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=12;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.829;NF=0;NR=12;PP=396;ReadPosRankSum=0.216;SC=CAAGTTTTTCTCCCCCCCCCC;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=12;WE=222435056;WS=222435025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr2	222435048	rs2710504	A	G	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.751;NF=0;NR=12;PP=360;ReadPosRankSum=-1.017;SC=CCCCCCCCCAAAAAAAGAGGG;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=12;WE=222435056;WS=222435025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr2	222437136	rs11381414	A	AG	249.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=5;PP=205;SC=AGGGCGGCCGAGCCCCGCCTT;SOR=2.833;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=222437144;WS=222437126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr2	223423362	rs4674664	A	G	6863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=104;PP=2965;SC=ACATCCCACCACTCACCACCT;SOR=0.764;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=220;TCF=116;TCR=104;TR=220;WE=223423370;WS=223423352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr2	223436428	rs3211018	T	C	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=28;ReadPosRankSum=0.180;SC=GCTGGCCTAATATGCAGGGAA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=223436436;WS=223436421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr2	223436607	rs7185	C	T	2040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=32;PP=1385;SC=AAGGGTCCAACATTGATTTCT;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=30;TCR=32;TR=62;WE=223436615;WS=223436597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr2	223488979	rs16863940	G	A	377.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=251;ReadPosRankSum=0.404;SC=TTATTTAAGGGTGCAATCTTA;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=10;WE=223488987;WS=223488969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr2	223489249	rs3214770	GT	G	193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.958;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=177;ReadPosRankSum=1.314;SC=TTTTTTTAATGTTTACATTGT;SOR=1.259;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=7;WE=223489257;WS=223489239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr2	223489293	rs2290031	C	T	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=228;ReadPosRankSum=-2.382;SC=AAACAGTAACCTTTCTTTTTG;SOR=0.646;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=32;TCF=14;TCR=18;TR=12;WE=223489301;WS=223489283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr2	223493435	rs2019357	G	A	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=392;ReadPosRankSum=1.174;SC=TGCACATAGTGTAGCGCCTGG;SOR=0.686;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=65;TCF=43;TCR=22;TR=25;WE=223493443;WS=223493425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,26:0.38:69
chr2	223520905	rs2166652	G	C	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=549;ReadPosRankSum=1.025;SC=CATTCTGCTGGCAACAGTTCC;SOR=0.649;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=19;TCR=75;TR=28;WE=223520913;WS=223520895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,28:0.29:97
chr2	223520978	rs2044537	A	G	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=205;ReadPosRankSum=0.282;SC=ATGTATCTTTATGAGACTAAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=11;WE=223520986;WS=223520968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr2	223785504	rs6739824	T	C	1553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=0;PP=1362;SC=GCCACTTGACTATTGTTTCTT;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=48;WE=223785512;WS=223785494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr2	223793480	rs1550420	C	T	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=5;PP=465;SC=GCTGGGGATACCTCAGCCTTA;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=223793488;WS=223793470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	223797797	rs17781935	G	A	1245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=0;PP=1010;SC=AAATTACTTAGAGAATGGCCA;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=223797805;WS=223797790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	223799207	rs935030	C	T	1504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=0;PP=1348;SC=CAACACAGTTCACCATTTTGT;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=45;WE=223799215;WS=223799197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	223917629	rs3795886	C	T	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=15;PP=1133;ReadPosRankSum=-1.134;SC=GTGCGGCCGGCGGCGGCAGCG;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=85;TCF=64;TCR=21;TR=58;WE=223917637;WS=223917619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,58:0.67:86
chr2	223917812	rs10201907	T	C	3434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=60;PP=2574;SC=AGCCGCTGCCTGTGGTGTCGG;SOR=0.762;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=54;TCR=60;TR=114;WE=223917820;WS=223917802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr2	223917983	rs12621643	T	G	3248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.939;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=44;PP=2526;ReadPosRankSum=-0.169;SC=GGGCAGACGATGAGCTGGAGG;SOR=0.996;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=170;TCF=101;TCR=69;TR=115;WE=223917991;WS=223917973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,118:0.68:174
chr2	223918080	rs10189762	C	G	5780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=122;PP=2965;SC=GGACCCCTGCCGGTGGCTCCA;SOR=1.301;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=195;TCF=72;TCR=123;TR=194;WE=223918088;WS=223918070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr2	224463164	rs16864975	G	A	2131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.007;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=55;PP=1553;ReadPosRankSum=1.978;SC=TCATCTCATCGTTGATTTGTT;SOR=0.838;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=325;TCF=143;TCR=182;TR=95;WE=224463172;WS=224463154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:234,100:0.30:334
chr2	224629876	rs10644138	C	CCATCAT	3165.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=7;PP=2703;SC=ATTATTAACACCATCATCATC;SOR=4.014;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=76;TCF=65;TCR=11;TR=44;WE=224629884;WS=224629866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	224634763	.	G	A	601	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=59.8;NF=20;NR=2;PP=601;QD=28.8986914794;SC=GCCCGGCCGCGATCCTATTTT;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=224634771;WS=224634762;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	224702305	rs3738961	G	C	220.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=5;PP=166;SC=ACAATGCCCTGGCACTGAAAG;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=9;WE=224702313;WS=224702295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	224743373	rs571111	C	T	2900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=12;PP=2284;SC=GTGTGGACGCCGCCCAGCTCT;SOR=3.586;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=70;TCR=12;TR=82;WE=224743381;WS=224743363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr2	224743591	rs602675	C	T	2566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=70;PP=2133;SC=CATAACACCTCCTTAAGATTT;SOR=5.031;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=5;TCR=71;TR=75;WE=224743599;WS=224743581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	224743652	rs547234	A	G	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=613;SC=TGTAATCCCAACACTTTGGGA;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=224743660;WS=224743642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	224744701	rs516849	A	G	1203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=1;PP=894;SC=GAGGCAAGCAATTTGTTACTC;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=224744709;WS=224744691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	224758906	rs625150	C	T	3332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=9;PP=2749;SC=AGCCAGGTTCCTGGGGGTCTC;SOR=4.450;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=89;TCR=9;TR=98;WE=224758914;WS=224758896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr2	224760494	rs597349	G	A	951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=26;PP=759;SC=GGTGTACAACGGGTCATTCAA;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=224760502;WS=224760484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	224763816	rs530065	C	T	2289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=56;PP=1789;SC=GGATGTAGAACAGAAATCACC;SOR=2.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=14;TCR=56;TR=70;WE=224763824;WS=224763806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr2	224765894	rs604990	G	A	2398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=12;PP=1965;SC=TGGCTCTGAAGGATACTGCAG;SOR=2.995;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=57;TCR=12;TR=69;WE=224765902;WS=224765884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	224770780	rs622896	C	T	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=466;SC=ACAACAGAAACTTGACTTTCA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=224770788;WS=224770770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	224777094	rs541712	T	C	5959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.38;NF=21;NR=113;PP=2965;SC=CACTTTAAGTTGTTCTTCAAA;SOR=3.242;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=21;TCR=113;TR=134;WE=224777113;WS=224777084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr2	224777105	rs113054269	G	GTGAT	5835.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=88;PP=2957;SC=GTTCTTCAAAGTGATTAAGAA;SOR=3.528;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=125;TCF=13;TCR=112;TR=96;WE=224777113;WS=224777084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr2	224844919	rs729631	C	G	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=514;SC=CCCACACACACTGCCTGGCTG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=224844927;WS=224844909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	224866387	rs12138	G	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=129;ReadPosRankSum=-0.143;SC=TCACCATGGCGAGCTGCTTCT;SOR=0.350;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=11;WE=224866395;WS=224866377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,11:0.23:47
chr2	224866576	rs12436	C	A	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.979;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=542;ReadPosRankSum=-1.838;SC=TGGAAGGCAGCGTCACAGAGG;SOR=0.465;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=82;TCF=27;TCR=55;TR=28;WE=224866584;WS=224866566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,30:0.35:85
chr2	225244235	rs16865905	A	C	62.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5051;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=39;ReadPosRankSum=1.150;SC=TCAGTACTCCATTTCTAGAAC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=225244243;WS=225244225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr2	225244888	rs3738954	A	G	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=789;ReadPosRankSum=0.009;SC=AGCTCCCAAGATGCCATTCTT;SOR=0.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=60;TCF=28;TCR=32;TR=41;WE=225244896;WS=225244878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,42:0.69:61
chr2	225244923	rs3738953	A	G	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.661;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=674;ReadPosRankSum=-0.490;SC=GATTCAGCTGAACCTACAGGA;SOR=1.547;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=33;WE=225244931;WS=225244913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,36:0.62:58
chr2	225368321	rs3738951	A	G	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=548;ReadPosRankSum=-1.139;SC=ACACAATCATAATAAACCTCA;SOR=0.914;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=22;WE=225368329;WS=225368311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr2	225434445	rs10498163	A	G	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.671;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=376;ReadPosRankSum=0.947;SC=GAACTACATCATGAGACAAAT;SOR=0.053;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=21;WE=225434453;WS=225434435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,22:0.81:27
chr2	225665074	rs1560859	G	A	817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=25;PP=668;SC=TTCAAAGTTTGCTGGCATTTT;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=225665082;WS=225665064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	225668717	.	A	ATG	562.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=1.182;NF=23;NR=2;PP=872;ReadPosRankSum=-2.017;SC=AAATAGAAATATGTGTGTGTG;SOR=0.416;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=65;TCF=61;TCR=4;TR=25;WE=225668726;WS=225668707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr2	225719781	rs145044043	G	GAC,GACAC	1514.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.261;NF=0,0;NR=30,30;PP=708,344;ReadPosRankSum=-0.691;SC=CATGAGCAAGGACACACACAC;SOR=4.921;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=95;TCF=6;TCR=89;TR=30,30;WE=225719789;WS=225719771;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.28,0.67:36
chr2	225875158	rs590233	A	C	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=505;SC=ACCTAGAGGAAAATATAAAAT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=225875166;WS=225875148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	225907150	rs397052	C	T	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.44;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	226273490	rs2048935	T	C	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=113;ReadPosRankSum=0.297;SC=TGGCCATAATTATTGGAGTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=7;WE=226273498;WS=226273480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr2	226273689	rs2048936	T	C	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-4.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.940;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=37;PP=844;ReadPosRankSum=1.193;SC=TGAAGGCCTATGATGGCTTGG;SOR=0.879;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=165;TCF=70;TCR=95;TR=61;WE=226273697;WS=226273679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,64:0.34:186
chr2	226447735	rs3828256	C	T	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.361;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=28;PP=713;ReadPosRankSum=0.447;SC=GCCGGCGCTCCAAAGAGCCTG;SOR=1.144;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=56;TCF=11;TCR=45;TR=34;WE=226447743;WS=226447725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,34:0.62:55
chr2	226447844	rs6436570	G	A	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=424;SC=CACAGAGTACGGGGTCTTGAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=226447852;WS=226447834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr2	226593875	rs114514101	G	T	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=1;PP=511;ReadPosRankSum=-0.250;SC=TTCTTCTTCAGTGTGTTTGTA;SOR=0.216;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=80;TCF=77;TCR=3;TR=27;WE=226593883;WS=226593865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,27:0.33:82
chr2	227660544	rs1801278	C	T	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=674;ReadPosRankSum=-0.261;SC=CTAGCAGCCCCGGGAGGTGCA;SOR=0.752;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=107;TCF=48;TCR=59;TR=36;WE=227660552;WS=227660534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,36:0.32:112
chr2	227662753	rs2234931	C	T	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FS=3.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.75;ReadPosRankSum=-0.971;SOR=0.467;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:163,64:0.28:227
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chr2	227927189	.	G	GT	304.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=1.132;QD=7.81;ReadPosRankSum=-0.987;SOR=0.155;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr2	227945408	rs146260443	T	C	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=32;ReadPosRankSum=0.964;SC=ACATAAAACATGCCAAAGCCA;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=5;WE=227945416;WS=227945398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr2	227966148	rs16823202	C	T	1157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=0;PP=1012;SC=GGCAATACTTCTAAAAATAAA;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=35;WE=227966156;WS=227966138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	227966298	rs59443812	T	TA	1732.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.201;NF=12;NR=45;PP=847;ReadPosRankSum=-0.176;SC=AAACATGCCTTAAAAAAAAAA;SOR=1.112;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=89;TCF=22;TCR=67;TR=57;WE=227966306;WS=227966288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,73:0.92:79
chr2	227967601	rs11274738	ACAATATTTCAGCAATAGGGAAAG	A	4163.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=35;PP=2974;SC=GGTTCAAGCAACAATATTTCA;SOR=3.234;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=103;TCF=18;TCR=85;TR=39;WE=227967631;WS=227967591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr2	227967830	rs10707643	GA	G	1017.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQ=60.45;NF=24;NR=14;PP=655;SC=TCACACAAATGAAAAAAAAAA;SOR=1.402;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=42;TCF=27;TCR=15;TR=38;WE=227967838;WS=227967820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	227968553	rs7602059	A	C	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=2;PP=778;SC=CAACAGTAGTACCAACTTATT;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=227968561;WS=227968543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	227973095	rs7600536	A	T	1303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=0;PP=1079;SC=TTAACCCGAAAGTAGTGTTAA;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=39;WE=227973103;WS=227973085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	227973410	rs55741079	C	A	3873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=70;NR=48;PP=2965;SC=ATTAAGACTTCTGGCTACACA;SOR=1.198;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=70;TCR=48;TR=118;WE=227973418;WS=227973400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr2	227973623	rs12475686	A	G	3620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.090;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=74;PP=2935;ReadPosRankSum=-0.636;SC=CAATCATCAGACATAGAAATC;SOR=1.676;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=36;TCR=74;TR=109;WE=227973631;WS=227973613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr2	227974113	rs6436654	A	G	6376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=112;PP=2965;SC=AATCACAGCCACCAGCACATC;SOR=0.949;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=92;TCR=112;TR=204;WE=227974121;WS=227974103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr2	227974191	rs6436655	A	G	3086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=73;PP=2419;SC=CAGTCCGGGCACGGTGGTTCA;SOR=2.694;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=94;TCF=21;TCR=73;TR=93;WE=227974199;WS=227974181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr2	228102723	rs13424243	G	C	1703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=51;PP=1225;ReadPosRankSum=-1.608;SC=CTTCTGTGACGGGGCCAAAGG;SOR=0.658;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=22;TCR=69;TR=67;WE=228102731;WS=228102713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,71:0.76:94
chr2	228102752	rs1882435	C	A	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.05;ReadPosRankSum=0.277;SOR=0.475;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,15:0.20:75
chr2	228104760	rs7579991	C	T	4204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=22;PP=2965;SC=CAAAGAGTCACCATGAAGTCA;SOR=3.126;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=105;TCR=22;TR=127;WE=228104768;WS=228104750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr2	228109626	rs113428834	T	TG	3747.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=5.629;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.80;MQRankSum=0.321;QD=35.36;ReadPosRankSum=1.439;SOR=2.013;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,105:0.99:106
chr2	228109784	rs6750210	C	T	1794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=48;PP=1459;SC=TTAAAACAGTCGTGCAAGAAA;SOR=3.690;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=7;TCR=48;TR=55;WE=228109792;WS=228109774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	228111435	rs10178458	T	C	3845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=44;PP=2786;SC=CCAGGGACACTGGGCTACCCA;SOR=1.434;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=123;TCF=78;TCR=45;TR=122;WE=228111443;WS=228111425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr2	228111600	rs10168566	G	T	3152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.79;SOR=4.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	228111604	rs10168567	G	T	3063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.40;SOR=6.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr2	228111651	rs10192026	A	G	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=34;PP=985;SC=GCTTTGTTTTACTTTTGAGAC;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=228111659;WS=228111641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	228112100	.	G	C	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.917;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=0.940;SC=AGACGAAGGAGAGACAGGACA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=8;WE=228112108;WS=228112090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,8:0.23:35
chr2	228112186	rs4321358	A	G	3926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=29;PP=2962;SC=GGGAGAGGATACACAATAGCA;SOR=2.113;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=84;TCR=29;TR=113;WE=228112205;WS=228112176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr2	228112197	.	G	C	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-5.280;ClippingRankSum=0.000;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.949;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=632;ReadPosRankSum=0.705;SC=CACAATAGCAGAGAGGGCAGA;SOR=0.369;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=112;TCF=79;TCR=33;TR=36;WE=228112205;WS=228112176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,43:0.36:119
chr2	228113175	rs6436669	A	G	3726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=47;PP=2965;SC=CCTGCTAAAGAAGAAGATATA;SOR=1.028;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=67;TCR=47;TR=114;WE=228113183;WS=228113165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr2	228118403	rs12621551	T	G	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.507;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=33;PP=834;ReadPosRankSum=-2.169;SC=GTGTCTAGGATGAAGTCCTTG;SOR=0.484;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=58;TCF=7;TCR=51;TR=39;WE=228118411;WS=228118393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,40:0.67:60
chr2	228119461	rs35467545	G	A	3068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=61;PP=2337;ReadPosRankSum=1.472;SC=GTCATGTGCAGTTTTGATTAG;SOR=0.710;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=74;TCR=93;TR=109;WE=228119469;WS=228119451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,112:0.65:171
chr2	228121132	rs141425127	C	G	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.345;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=591;ReadPosRankSum=0.250;SC=TCCCTAATAGCCTATTTTAAT;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=27;WE=228121140;WS=228121122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr2	228124702	rs4332918	A	G	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.596;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=597;ReadPosRankSum=1.748;SC=GAAAGGGAACAGAGATCTCTT;SOR=0.399;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=43;TCF=19;TCR=24;TR=28;WE=228124710;WS=228124692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,32:0.68:47
chr2	228128540	rs10205042	C	T	5686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=91;NR=77;PP=2965;SC=ATGGCCAGGCCTGAAAGGAAG;SOR=0.861;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=169;TCF=91;TCR=78;TR=168;WE=228128548;WS=228128530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr2	228128568	rs34505188	G	A	3010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=59;PP=2363;ReadPosRankSum=-1.166;SC=GAACGAGGCCGCCCAGGAAAG;SOR=0.660;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=171;TCF=79;TCR=92;TR=110;WE=228128576;WS=228128558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,115:0.65:177
chr2	228131169	rs11677877	A	G	1843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.183;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=32;PP=1492;ReadPosRankSum=-0.460;SC=CCTGGAGATCACGGACTGCCA;SOR=0.797;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=103;TCF=55;TCR=48;TR=74;WE=228131177;WS=228131159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,74:0.72:103
chr2	228131752	rs34019152	G	A	2622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.868;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=44;PP=1993;ReadPosRankSum=-0.504;SC=ATATCCCAGGGCCTCCCGGTC;SOR=0.728;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=150;TCF=77;TCR=73;TR=95;WE=228131760;WS=228131742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,101:0.64:157
chr2	228131912	rs10933174	C	A	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=29;PP=629;ReadPosRankSum=-2.077;SC=TTTAGATGAACTTGGAGGGAG;SOR=0.532;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=6;TCR=63;TR=32;WE=228131920;WS=228131902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
chr2	228135631	rs28381984	C	T	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.766;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=574;ReadPosRankSum=0.560;SC=CCTGGAACTCCGGGAGTGAAA;SOR=0.776;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=108;TCF=38;TCR=70;TR=37;WE=228135639;WS=228135621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,38:0.34:112
chr2	228137543	rs35793546	A	C	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=563;ReadPosRankSum=1.166;SC=ATCAAATGCCAAATGCTTTTA;SOR=0.358;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=24;WE=228137551;WS=228137533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,23:0.77:30
chr2	228142038	rs59353048	GAA	G	488.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.65;MQRankSum=0.692;QD=22.22;ReadPosRankSum=-1.750;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,18:0.82:22
chr2	228144706	rs6729152	G	T	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.512;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=166;ReadPosRankSum=-0.028;SC=ATGTAGAAATGATCAATATAT;SOR=0.412;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=13;WE=228144714;WS=228144696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,12:0.26:46
chr2	228145543	rs6436671	C	T	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=8.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.32;ReadPosRankSum=-0.573;SOR=1.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,31:0.23:134
chr2	228146991	rs111486503	AATAT	A	314.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.51;ReadPosRankSum=-0.281;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr2	228149107	rs6436672	A	G	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=345;ReadPosRankSum=0.431;SC=GCTGATTCTCAGGCTAATAAA;SOR=1.055;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=21;WE=228149115;WS=228149097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr2	228154095	rs7593281	C	T	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=65;ReadPosRankSum=1.038;SC=CAGAAATTTGCTACTAAATTA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=5;WE=228154103;WS=228154085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr2	228158418	rs7569636	T	C	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.774;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=698;ReadPosRankSum=0.288;SC=GGCTGAGAAGTGATTAGGTGG;SOR=0.197;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=89;TCF=72;TCR=17;TR=39;WE=228158426;WS=228158408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,42:0.44:95
chr2	228158648	rs7608999	G	C	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=303;ReadPosRankSum=-0.307;SC=TTAATTACCTGTTTACCAGCC;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=13;WE=228158656;WS=228158638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr2	228159063	rs6436675	T	C	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=0;PP=569;SC=CTGGACAAAATCATGGGGTGA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=228159071;WS=228159053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	228159660	rs35803812	GT	G	262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=2.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=2.442;QD=4.04;ReadPosRankSum=-0.307;SOR=0.205;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,23:0.35:65
chr2	228194570	rs6706656	G	A	4030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=91;PP=2965;SC=GCTTACTGCCGTAGGCTAACC;SOR=2.556;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=28;TCR=91;TR=119;WE=228194578;WS=228194560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr2	228194639	rs11384091	T	TA	769.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.513;NF=1;NR=34;PP=591;ReadPosRankSum=2.566;SC=TCTACTGCATTAAAAAAAAAA;SOR=2.833;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=35;WE=228194647;WS=228194629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,32:0.91:35
chr2	228195563	.	G	GAAA	688.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.517;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=30.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQRankSum=-2.807;QD=8.72;ReadPosRankSum=-3.152;SOR=0.017;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,22:0.28:79
chr2	228195565	.	A	AATGAAGATGTTTCAT	688.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.658;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=25.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=-3.079;QD=9.31;ReadPosRankSum=-3.614;SOR=0.020;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,18:0.24:74
chr2	228197238	rs11557342	G	A	3614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.998;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=3.945;NF=86;NR=59;PP=2632;ReadPosRankSum=-2.952;SC=GTGTACTTACGCTGAGTGAAA;SOR=1.014;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=253;TCF=139;TCR=114;TR=145;WE=228197246;WS=228197228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,149:0.48:310
chr2	228197368	rs4500938	A	G	3083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=76;PP=2440;SC=AGAGAAGAGCAAAGAGGCTTT;SOR=3.056;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=16;TCR=76;TR=92;WE=228197376;WS=228197358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr2	228204929	rs4420693	C	T	3037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=28;PP=2434;SC=AGCCTTGTATCGAGGTTCTTT;SOR=1.711;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=64;TCR=29;TR=92;WE=228204937;WS=228204919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
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chr2	228207625	rs6738078	G	A	3627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=104;PP=2965;SC=GGTAATTGACGTATGCTATCC;SOR=5.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=108;TCF=4;TCR=104;TR=108;WE=228207633;WS=228207615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr2	228220528	rs12478005	T	C	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=201;ReadPosRankSum=-0.483;SC=TCATACAATATTTTAAAGTGA;SOR=0.665;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=11;WE=228220536;WS=228220518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr2	228356364	.	GTT	G	107.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=2.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.85;ReadPosRankSum=1.170;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
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chr2	228399480	rs7588620	T	C	1037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=1;PP=848;SC=TAAGTTTACCTGTGTTTCATG;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=228399488;WS=228399470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	228416498	rs7598597	C	T	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=481;SC=CTACAAGTTACGTTAAACTGT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=228416506;WS=228416495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	228416712	rs13426457	A	G	10629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=256;NR=107;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.785;SC=GCATGCCCACAGGATTCGGCA;SOR=0.909;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=365;TCF=257;TCR=108;TR=363;WE=228416720;WS=228416702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,369:1.00:370
chr2	228476140	rs2176186	C	T	1707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.066;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=31;PP=1300;ReadPosRankSum=-0.219;SC=TAGAATGGCTCCAGAGCACCG;SOR=0.394;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=91;TCF=48;TCR=43;TR=58;WE=228476148;WS=228476130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,62:0.65:95
chr2	228476253	rs2138402	C	G	2197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=39;PP=1873;SC=GCTGAAGCCTCTGCAGTTGGA;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=69;WE=228476261;WS=228476243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr2	228493411	rs185166128	A	G	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=39;ReadPosRankSum=-0.727;SC=AAAGACACCAATTCTCAACAC;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=228493419;WS=228493401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr2	228560800	rs11334205	GA	G	5069.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-7.406;NF=51;NR=118;PP=2983;ReadPosRankSum=0.611;SC=CACAGCCCCTGAAAAAAAACA;SOR=1.226;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=183;TCF=57;TCR=126;TR=169;WE=228560808;WS=228560790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,197:0.99:199
chr2	228565656	rs11694828	G	A	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=131;ReadPosRankSum=0.965;SC=TGAGGTTGCTGGAGAAAGCAG;SOR=0.527;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=10;WE=228565664;WS=228565646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,10:0.28:36
chr2	228567111	rs71039629	AT	A	554.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=-0.078;NF=2;NR=26;PP=308;ReadPosRankSum=0.242;SC=TGAAAACCTGATTTTTTTTTT;SOR=2.368;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=62;TCF=2;TCR=60;TR=28;WE=228567119;WS=228567101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,29:0.94:31
chr2	228736313	rs12478068	G	T	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=686;SC=AGGACCGCGCGGTGCAACCTG;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=228736321;WS=228736303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	228736527	rs12470042	A	G	1696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=47;PP=1458;SC=AGGAGGGCGCAGCCACTGAAA;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=6;TCR=47;TR=53;WE=228736535;WS=228736517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	228736608	rs10933219	C	T	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=500;SC=CCTTCAGATGCTGGACTCTTC;SOR=3.816;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=228736616;WS=228736598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	228740927	rs4972994	G	A	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=0;PP=768;SC=TAGTAGAGACGGGGTTTCACC;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=228740935;WS=228740920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	228741250	rs7571353	T	A	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=41;PP=1260;SC=TAGGAAAAATTATTCCACTGA;SOR=3.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=47;WE=228741258;WS=228741240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	228750239	rs4973445	G	T	2334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=54;PP=1876;SC=AATACATTATGTTTTAAAAAT;SOR=2.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=12;TCR=54;TR=66;WE=228750247;WS=228750229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	228758456	rs35758334	C	A	4483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=118;NR=19;PP=2965;SC=AACATGAAGTCTTTATTAACA;SOR=3.196;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=118;TCR=19;TR=137;WE=228758464;WS=228758446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr2	228767618	rs2949014	T	C	1912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=0;PP=1629;SC=AAGAATTAGATGGAATCTGGT;SOR=8.155;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=57;TCR=0;TR=57;WE=228767626;WS=228767608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	228776996	rs3748862	T	C	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.399;NF=27;NR=1;PP=606;ReadPosRankSum=-0.698;SC=TCGCCCAGGCTGGAGTGCAGT;SOR=0.518;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=62;TCF=60;TCR=2;TR=28;WE=228777004;WS=228776986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr2	228777085	rs181189267	C	T	2674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.620;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=22;PP=2130;ReadPosRankSum=-0.168;SC=AGTTATGTCACGTTCTTGGTA;SOR=1.429;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=154;TCF=113;TCR=41;TR=99;WE=228777093;WS=228777075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,101:0.63:161
chr2	228783479	rs1533960	C	A	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=20;PP=1460;ReadPosRankSum=-0.238;SC=ATATATATCCCCACCCCTCTC;SOR=0.680;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=297;TCF=230;TCR=67;TR=88;WE=228783487;WS=228783469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,87:0.29:299
chr2	228883029	rs3811515	A	C	2431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.115;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=44;PP=2003;ReadPosRankSum=-0.087;SC=TCTCACTGTGATGAGGGCTTT;SOR=0.264;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=111;TCF=45;TCR=66;TR=80;WE=228883037;WS=228883019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,82:0.73:112
chr2	228883721	rs3811514	T	C	2181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=21.959;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=61;PP=1746;ReadPosRankSum=-1.286;SC=AGCAATCCCTTGGCAATGGCT;SOR=2.027;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=126;TCF=45;TCR=81;TR=85;WE=228883729;WS=228883711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,88:0.68:130
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chr2	228973723	rs11374866	C	CT	108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQRankSum=0.000;QD=5.18;ReadPosRankSum=1.705;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
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chr2	229035427	rs11685283	T	C	437.98	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=338;ReadPosRankSum=2.482;SC=TGCTATAAAGTACACATAACT;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=13;WE=229035435;WS=229035417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
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chr2	230096837	rs6743582	C	T	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=17;PP=468;SC=ATGACTTAACCACCTCTTAAA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=230096845;WS=230096827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	230135527	rs1227013	C	T	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=336;SC=AACGCCTGAACCCGTGCGTTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=230135535;WS=230135517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	230135711	rs67686611	G	GC	1412.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.26;NF=6;NR=21;PP=1225;SC=CTGGCCCCCGGCTCCCGGGTG;SOR=1.730;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=27;WE=230135719;WS=230135701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	230231889	rs2302769	A	T	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.978;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=506;ReadPosRankSum=0.874;SC=TTTGAGAATGAGAAGGCCTTT;SOR=1.362;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=25;WE=230231897;WS=230231879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,27:0.69:39
chr2	230271780	rs7562609	A	G	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=68;ReadPosRankSum=-0.079;SC=AGGCTCACACAATGGGTTGTT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=7;WE=230271788;WS=230271770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr2	230282624	rs6760224	G	A	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=305;SC=GACAGGAAAGGGGGTTGTTTC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=230282632;WS=230282622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	230411518	rs369516727	TAGAC	T	397.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.778;NF=12;NR=1;PP=450;ReadPosRankSum=0.055;SC=GATAGATAGATAGACAGACAG;SOR=0.209;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=50;TCF=48;TCR=2;TR=13;WE=230411529;WS=230411508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr2	230411633	rs72985919	G	A	2489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.725;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=25;PP=2010;ReadPosRankSum=-1.288;SC=GTAAATATGTGTATTTACAAG;SOR=0.624;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=102;TCR=38;TR=92;WE=230411641;WS=230411623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,93:0.66:141
chr2	230450646	rs72987941	T	A	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.394;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=18;PP=645;ReadPosRankSum=-0.473;SC=TGAAGGGGGGTCACACTTCGT;SOR=1.025;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=120;TCF=67;TCR=53;TR=45;WE=230450654;WS=230450636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,45:0.36:125
chr2	230453040	rs72987944	C	T	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=162;ReadPosRankSum=-0.902;SC=ACCAGGTCCGCGGATGGACAC;SOR=0.527;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=10;WE=230453048;WS=230453030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr2	230453214	rs11458391	G	GA	1948.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.179;NF=11;NR=48;PP=749;ReadPosRankSum=-1.647;SC=CCTGGGAAGGGAAAAAAAAAA;SOR=0.761;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=83;TCF=16;TCR=67;TR=59;WE=230453222;WS=230453204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,78:0.95:82
chr2	230456232	rs56156768	C	T	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.317;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=311;ReadPosRankSum=-1.222;SC=ATACTAGAACCGCTGGAGTCA;SOR=0.188;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=66;TCF=62;TCR=4;TR=20;WE=230456240;WS=230456222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,21:0.32:66
chr2	230655733	rs722268	C	T	1884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=0;PP=1549;SC=TATTTCTCAACTATATTCAAA;SOR=8.121;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=55;TCR=0;TR=55;WE=230655741;WS=230655723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	230666898	rs10432554	A	G	256.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=1;PP=212;SC=TTTACTCCCTATATGATTCTT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=230666906;WS=230666888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	230668968	rs4972915	G	A	2751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=73;PP=2259;SC=AAAAATATATGTGCAATCCTG;SOR=4.125;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=9;TCR=73;TR=82;WE=230668976;WS=230668958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr2	230744570	rs479492	C	T	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=259;SC=TTTTAAGTACCTGGCTCACAA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=230744578;WS=230744560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	230861519	rs1035834	G	T	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=57.68;MQRankSum=0.065;NF=4;NR=0;PP=30;ReadPosRankSum=-0.404;SC=TCATCAATTTGTGCAAAGGTA;SOR=0.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=4;WE=230861527;WS=230861509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr2	230914766	rs6748654	T	C	1415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=36;PP=1132;SC=ATGCCAAACATTTTTAGCATG;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=37;WE=230914774;WS=230914756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	231025209	rs13400142	G	C	353.53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=265;ReadPosRankSum=-0.843;SC=CCCGCCACAGGCTCAAGCGAT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=231025217;WS=231025199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr2	231042802	rs2241525	C	T	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=17;PP=863;ReadPosRankSum=-1.648;SC=ATTACACACACGGGTATTTTC;SOR=0.464;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=160;TCF=113;TCR=47;TR=49;WE=231042810;WS=231042792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,51:0.30:169
chr2	231050569	rs2114591	G	A	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=70;ReadPosRankSum=-0.152;SC=CAACAGATCCGTGCTCTGTCT;SOR=0.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=6;WE=231050577;WS=231050559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
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chr2	231072569	rs41309106	T	C	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.769;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=5;PP=1198;ReadPosRankSum=1.302;SC=GAGCTTACATTGTGTCACTTC;SOR=0.385;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=71;TCF=65;TCR=6;TR=50;WE=231072577;WS=231072559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,53:0.73:73
chr2	231072709	rs1365776	C	T	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.930;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=30;PP=702;ReadPosRankSum=0.671;SC=ATCTTACCTCCTGGGAGGCTT;SOR=1.195;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=128;TCF=39;TCR=89;TR=40;WE=231072717;WS=231072699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,43:0.33:131
chr2	231076032	rs3769837	G	T	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=0;PP=468;SC=TCTCCTGCCTGTTCAAGCTCC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=231076040;WS=231076027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr2	231077725	rs1129411	A	G	2395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=40;PP=1692;SC=CTGCTCTGCCATTCATAGGAA;SOR=1.136;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=32;TCR=40;TR=72;WE=231077733;WS=231077715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	231077868	rs7601176	A	G	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=322;ReadPosRankSum=-0.593;SC=CCCCAGGTGCAGAGAACTGAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=14;WE=231077876;WS=231077858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr2	231077911	rs7601190	A	C	194.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=131;SC=GTGGCCCCTTAATATTTTATT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=231077919;WS=231077901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	231120255	rs55829350	CG	C	329.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=10;PP=197;SC=CAGGTAAGGACGGGGGGGGGG;SOR=2.833;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=11;WE=231120263;WS=231120245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	231149108	rs4972946	G	A	1173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=23;PP=823;SC=GAGAAGGCAGGAAAACAGCCA;SOR=1.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=34;WE=231149116;WS=231149098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	231175763	rs78116662	G	A	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-5.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.616;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.030;NF=17;NR=5;PP=376;ReadPosRankSum=-0.790;SC=AGCCACACATGTTAGAGAAAC;SOR=0.093;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=63;TCF=54;TCR=9;TR=22;WE=231175771;WS=231175753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,25:0.38:66
chr2	231176040	rs139570354	G	A	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.51;MQRankSum=-1.550;QD=3.43;ReadPosRankSum=1.248;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr2	231223975	rs11678791	C	T	456.81	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=354;ReadPosRankSum=1.585;SC=ACAAAATAGACGTGTCATGAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=13;WE=231223983;WS=231223965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr2	231226488	rs11891724	C	T	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.638;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=903;ReadPosRankSum=-1.643;SC=GGCCCAAGGTCCTGAGGGGAA;SOR=0.602;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=146;TCF=74;TCR=72;TR=52;WE=231226496;WS=231226478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,50:0.33:153
chr2	231248324	rs55793821	G	C	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=143;ReadPosRankSum=-0.200;SC=TACAGCTTTTGAGTTTATTAA;SOR=0.076;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=9;WE=231248332;WS=231248314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr2	231254919	rs17332171	C	T	1589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=46;PP=1314;ReadPosRankSum=0.392;SC=ACCCATTAGACGCTGACTCGC;SOR=3.422;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=48;WE=231254927;WS=231254909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,50:0.96:52
chr2	231256812	rs7559665	A	G	5738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=105;PP=2965;SC=GAACCTTGGCAAAGTGTATAC;SOR=0.991;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=187;TCF=81;TCR=106;TR=186;WE=231256820;WS=231256802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr2	231258218	rs7563909	A	T	1672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=32;PP=1383;SC=GTCACACAACAGATTTAACAT;SOR=1.565;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=48;WE=231258226;WS=231258208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	231258309	rs72495174	T	A	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.59;SOR=3.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	231258322	rs72996292	A	G	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=13;PP=442;SC=TTTAATATACACTTTCAGAGT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=231258330;WS=231258299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	231261620	rs6732940	G	A	4130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.106;NF=4;NR=112;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.833;SC=AGTCTCAGTTGGAGTATGTGG;SOR=4.548;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=4;TCR=113;TR=116;WE=231261628;WS=231261610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,120:0.99:121
chr2	231266252	rs371373398	G	A	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr2	231282534	rs35969967	C	CT	314.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=339;SC=GGTGTTTGTCCTTTTTTTCGT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=11;WE=231282542;WS=231282524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	231307610	.	G	T	2077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-6.782;ClippingRankSum=0.000;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.370;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=7;PP=1733;ReadPosRankSum=0.380;SC=AAACATCTCAGAATCTTGATG;SOR=1.110;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=122;TCF=108;TCR=14;TR=75;WE=231307618;WS=231307600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,76:0.61:125
chr2	231309139	rs55637456	A	T	1649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=47;PP=1353;SC=TCCTACCATGAGTGACATGTT;SOR=6.439;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=48;WE=231309147;WS=231309129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	231327220	rs75519436	G	A	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.504;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=543;ReadPosRankSum=-0.691;SC=TCTCAGCACCGAGAAGTGAGC;SOR=0.338;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=93;TCF=65;TCR=28;TR=31;WE=231327228;WS=231327210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,33:0.34:97
chr2	231331694	rs1678159	A	G	640.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5066;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=493;ReadPosRankSum=0.511;SC=CAGATCATGGAGGTTTGAGGC;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=15;WE=231331709;WS=231331684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,16:0.94:17
chr2	231331701	rs3214547	A	AG	690	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5066;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=702;ReadPosRankSum=0.307;SC=TGGAGGTTTGAGGCACGGACA;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=17;WE=231331709;WS=231331684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,16:0.94:17
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chr2	231363252	rs34979917	TA	T	776.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.188;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=28;PP=443;ReadPosRankSum=1.604;SC=AACAAAGAGGTAAAAAAAAAA;SOR=2.712;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=33;WE=231363260;WS=231363242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,36:0.95:38
chr2	231406680	rs836237	T	C	4293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=54;PP=2965;SC=AATGAGCAGATGTACACCCGA;SOR=1.186;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=87;TCR=54;TR=141;WE=231406688;WS=231406670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr2	231406846	rs10199013	G	A	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=32;PP=884;SC=TGTTACAATCGCCCTTATCAT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=32;WE=231406854;WS=231406836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	231407519	rs6717269	C	T	2351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=18;PP=1897;SC=CATTGCATAACTGCTATATTG;SOR=2.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=69;WE=231407527;WS=231407509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	231407663	rs9288668	C	T	5525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=84;PP=2965;ReadPosRankSum=0.175;SC=TTTATTTAGCCATTCTTATCT;SOR=0.774;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=90;TCR=85;TR=173;WE=231407671;WS=231407653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,179:0.99:181
chr2	231682658	rs74535657	G	A	1423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.774;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=34;PP=983;ReadPosRankSum=1.057;SC=GGAATTGTTCGTCGTCTTTCA;SOR=0.506;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=91;TCF=29;TCR=62;TR=53;WE=231682666;WS=231682648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,57:0.59:97
chr2	231738168	rs2289235	G	A	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=7;PP=819;ReadPosRankSum=0.042;SC=CAAGAGGGGGGGCTCAGTGGG;SOR=0.858;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=57;TCR=12;TR=39;WE=231738176;WS=231738158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,39:0.57:68
chr2	231738263	rs2289234	C	T	3961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=7.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.89;ReadPosRankSum=0.290;SOR=0.318;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,99:0.65:153
chr2	231738269	rs2289233	G	A	3943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=5.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.95;ReadPosRankSum=0.225;SOR=0.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,98:0.64:152
chr2	231738318	rs3816150	T	C	1494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.228;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=49;PP=1093;ReadPosRankSum=0.414;SC=GAAAGGGTCATGTCTAGAGAG;SOR=1.617;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=97;TCF=27;TCR=70;TR=63;WE=231738326;WS=231738308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,64:0.66:97
chr2	231740276	rs2289231	A	G	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=0;PP=520;SC=AGGGGGCCTTACGGAGTGCGT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=18;WE=231740284;WS=231740266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	231860848	rs6722863	A	G	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=0;PP=625;SC=CTGGAGGCCCAAGCCAGGCTC;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=231860856;WS=231860838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr2	231943505	.	C	T	560	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=25;HapScore=3;MGOF=7;MMLQ=20;MQ=53.41;NF=0;NR=32;PP=560;QD=18.5866003921;SC=AAATCTTTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=2;TCR=61;TR=32;WE=231943513;WS=231943487;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:31,32:0.51:63
chr2	231944373	rs2303353	A	T	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.295;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=647;ReadPosRankSum=-1.861;SC=AAAAGAAGTAATTTTTCTGGG;SOR=0.465;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=31;WE=231944381;WS=231944363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
chr2	231949932	rs150738021	A	G	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.758;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=29;PP=1518;ReadPosRankSum=0.220;SC=GACCACCACCAGTGGTCTTAG;SOR=3.258;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=31;WE=231949954;WS=231949922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,31:0.70:44
chr2	231949946	rs2303357	G	A	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.150;HP=3;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=1502;ReadPosRankSum=1.287;SC=GTCTTAGGTTGTGATTCTCAT;SOR=2.049;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=26;WE=231949954;WS=231949922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,26:0.72:36
chr2	232030510	rs2303351	C	A	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=517;ReadPosRankSum=-0.125;SC=GCTGCTCAGTCAACTTCAGAT;SOR=1.542;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=23;WE=232030518;WS=232030500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr2	232030555	rs2303350	G	A	1519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=9;PP=1235;ReadPosRankSum=-1.996;SC=ATGAACTTCTGTTGAACTTTT;SOR=0.758;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=69;TCR=13;TR=57;WE=232030563;WS=232030545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,57:0.69:83
chr2	232030861	rs2303349	A	G	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.122;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=441;ReadPosRankSum=-0.830;SC=AAATTATTTAACAAAAGAGAG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=19;WE=232030869;WS=232030851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr2	232035429	rs6749	G	A	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.813;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=28;PP=781;ReadPosRankSum=0.766;SC=ATGATTAAGGGCCAGAGGTGC;SOR=0.283;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=34;WE=232035437;WS=232035419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,35:0.70:50
chr2	232087474	rs1626450	AT	GA	1433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=9;PP=1497;SC=GTTGAAGTTGATAAAGTTTCT;SOR=1.473;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=27;WE=232087483;WS=232087464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	232196472	rs1729082	T	A	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.604;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=475;ReadPosRankSum=-0.502;SC=TGTCAGGGTGTCCATGGCATT;SOR=0.416;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=59;TCF=53;TCR=6;TR=25;WE=232196480;WS=232196462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
chr2	232196564	rs1669083	C	T	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.723;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=647;ReadPosRankSum=0.923;SC=AGCCCCAGCTCGGAGAACTCT;SOR=0.593;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=139;TCF=92;TCR=47;TR=40;WE=232196572;WS=232196554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,40:0.29:139
chr2	232196597	rs1669084	G	A	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.336;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=916;ReadPosRankSum=-0.257;SC=TTCTGACCACGGAGTACCTGG;SOR=0.572;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=157;TCF=90;TCR=67;TR=50;WE=232196605;WS=232196587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,51:0.31:163
chr2	232225535	rs35889244	C	CG	1987.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=27;PP=2000;SC=CCAGCCCCCACGGGACCCCCC;SOR=0.726;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=53;TCF=24;TCR=29;TR=48;WE=232225543;WS=232225525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr2	232263127	rs2290130	G	A	1990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.493;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=38;PP=1500;ReadPosRankSum=1.837;SC=CTGCCCCCACGTCCCCTTCAT;SOR=0.637;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=233;TCF=129;TCR=104;TR=82;WE=232263135;WS=232263117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,86:0.36:239
chr2	232326801	rs2595514	A	T	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.167;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=37;PP=756;ReadPosRankSum=-2.088;SC=TCCCAATGAGATGTTAGACTC;SOR=1.002;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=168;TCF=56;TCR=112;TR=52;WE=232326809;WS=232326791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,53:0.31:171
chr2	232458443	rs10933378	T	C	4937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=82;PP=2965;SC=GCCCCTGGACTCCAGCCTGTA;SOR=0.945;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=64;TCR=82;TR=146;WE=232458451;WS=232458433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr2	232572381	rs6737601	A	G	4560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=30;PP=2965;SC=CCTAACTAGAAACCTAGAATG;SOR=2.517;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=105;TCR=30;TR=135;WE=232572389;WS=232572371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr2	232573588	rs147358606	G	A	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.27;ReadPosRankSum=-0.610;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr2	232574836	rs114389792	C	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.25;ReadPosRankSum=-0.366;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr2	232574908	rs139567956	C	T	411.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5118;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=282;ReadPosRankSum=1.200;SC=TTCGGGCCTGCCGGGGTGGCG;SOR=0.627;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=17;WE=232574916;WS=232574898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,17:0.89:19
chr2	232575280	rs144713495	G	A	2682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=37;PP=1995;ReadPosRankSum=1.587;SC=CCGCAGGCCCGGACGCCGGAC;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=95;TCR=54;TR=102;WE=232575288;WS=232575270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,105:0.68:154
chr2	232577519	rs115998635	C	T	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.050;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=556;ReadPosRankSum=1.122;SC=CTTAGGATGACGATGTCGATA;SOR=2.805;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=24;WE=232577527;WS=232577509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr2	232597603	rs199614325	AAC	A	429.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=469;ReadPosRankSum=0.422;SC=GAAAAAAGTAAACAGTTTCCT;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=11;WE=232597612;WS=232597593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr2	232602682	rs74905712	C	T	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.023;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=25;PP=1124;ReadPosRankSum=1.346;SC=TTGTCCTGGTCGCCCTAAGCC;SOR=0.683;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=102;TCF=50;TCR=52;TR=55;WE=232602690;WS=232602672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,57:0.54:106
chr2	232653481	rs3830626	A	ACT	1450.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.333;NF=5;NR=27;PP=1500;ReadPosRankSum=0.891;SC=TTATTCTAAGACTCTGTAATT;SOR=1.280;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=32;WE=232653489;WS=232653471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr2	232658839	rs77908672	T	C	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=90;ReadPosRankSum=-0.022;SC=GGAATATTTGTCAAATGAATA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=232658847;WS=232658829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr2	232673112	rs11695913	C	T	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=0;PP=869;ReadPosRankSum=0.910;SC=GACTACTCAGCCTTGTTTTCG;SOR=1.651;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=57;TCR=1;TR=38;WE=232673120;WS=232673102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,39:0.67:58
chr2	232790053	rs5268	C	T	1116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=3;PP=984;SC=CTCCGAAGGCCGGCTGGGCGG;SOR=4.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=33;WE=232790061;WS=232790043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr2	232888856	rs896990	T	G	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=193;ReadPosRankSum=-0.873;SC=TTAATGAATATTTCTTATACA;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=9;WE=232888864;WS=232888846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr2	233028070	rs3116181	A	G	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=480;ReadPosRankSum=-0.356;SC=AGGGCAGGAGATTTTAAACTT;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=21;WE=233028078;WS=233028060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr2	233075081	rs17272089	C	T	1461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.491;NF=32;NR=34;PP=1193;ReadPosRankSum=0.093;SC=CCCGAGACCTCGATGATGCCC;SOR=0.709;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=211;TCF=104;TCR=107;TR=66;WE=233075089;WS=233075071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,67:0.31:214
chr2	233201328	rs3811578	A	G	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=138;ReadPosRankSum=0.432;SC=CCGAGGACTCAAGCACCAGCT;SOR=0.824;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=15;WE=233201336;WS=233201318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,15:0.27:56
chr2	233243660	rs2014448	T	C	2238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=31;PP=2017;SC=CTGACCTGATTTTTGCTCTCC;SOR=0.990;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=44;TCR=31;TR=75;WE=233243668;WS=233243650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	233244586	rs2853374	C	G	1474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=32;PP=1278;SC=TGCCTGCCTCCGCCCGCCAGG;SOR=1.225;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=51;WE=233244594;WS=233244576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	233244930	rs1048988	G	C	2417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=6.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.179;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-10.538;NF=58;NR=31;PP=1956;ReadPosRankSum=-0.696;SC=TACATGTTTCGCATGGGAACC;SOR=1.555;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=149;TCF=88;TCR=61;TR=89;WE=233244945;WS=233244920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,78:0.56:140
chr2	233244937	rs1048989	A	G	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=54.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.61;MQRankSum=-7.046;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.521;SOR=6.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,21:0.15:137
chr2	233245090	rs2260307	A	G	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.271;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.699;NF=18;NR=19;PP=620;ReadPosRankSum=-1.438;SC=TGTGGGGCTCAGGGCTGTGGG;SOR=1.935;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=116;TCF=59;TCR=57;TR=37;WE=233245098;WS=233245080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,29:0.28:104
chr2	233245210	rs13034594	C	T	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.547;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.858;NF=39;NR=27;PP=1007;ReadPosRankSum=-1.136;SC=TGGGTAATGACCCCCTTCCTG;SOR=1.506;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=209;TCF=116;TCR=93;TR=66;WE=233245218;WS=233245200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,37:0.28:131
chr2	233245958	rs200610301	C	A	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.76;MQRankSum=0.521;QD=1.21;ReadPosRankSum=1.615;SOR=0.042;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,4:0.15:27
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chr2	233272162	rs2678517	G	A	2158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.846;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.266;NF=42;NR=31;PP=1726;ReadPosRankSum=-0.150;SC=GGGAATCCTGGCTATGGAGTG;SOR=0.842;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=108;TCF=58;TCR=50;TR=73;WE=233272170;WS=233272152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,75:0.68:110
chr2	233272528	rs6728119	G	T	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.960;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=36;PP=1001;ReadPosRankSum=0.451;SC=GACCTCTATCGCATATCCTGA;SOR=1.135;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=160;TCF=70;TCR=90;TR=57;WE=233272536;WS=233272518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,57:0.35:163
chr2	233272925	rs2678518	A	G	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.296;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.119;NF=44;NR=8;PP=1124;ReadPosRankSum=0.903;SC=TGAGGAGGGGACACGGGGCCA;SOR=1.082;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=81;TCF=69;TCR=12;TR=52;WE=233272933;WS=233272915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,49:0.61:80
chr2	233273107	rs1130346	A	G	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.979;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.471;NF=0;NR=12;PP=194;ReadPosRankSum=-2.785;SC=CTGGCGAAGCACCAGGTGATG;SOR=2.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=12;WE=233273115;WS=233273097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,8:0.20:41
chr2	233273207	rs2945421	G	A	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.406;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.502;NF=2;NR=7;PP=121;ReadPosRankSum=-0.078;SC=CTCCCTCCCCGCAGGGTGCCC;SOR=3.602;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=34;TCF=16;TCR=18;TR=9;WE=233273215;WS=233273197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,5:0.16:32
chr2	233274145	rs2090543	G	C	1579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.71;QD=33.61;SOR=7.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	233274169	rs2091555	T	C	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.494;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.613;NF=33;NR=2;PP=794;ReadPosRankSum=0.704;SC=GTGAGTGCCGTGGGGTGGCCC;SOR=1.765;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=69;TCF=64;TCR=5;TR=35;WE=233274177;WS=233274159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,33:0.51:65
chr2	233323177	rs2003780	T	C	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.887;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=427;ReadPosRankSum=-0.426;SC=AAGTTTGAGCTTCAGTTTCCT;SOR=0.348;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=19;WE=233323185;WS=233323167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr2	233344991	rs2741279	T	G	4518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=84;PP=2965;SC=CACACAGTGTTGGGCCCTGCA;SOR=1.235;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=54;TCR=84;TR=138;WE=233344999;WS=233344981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr2	233345249	rs1190432	C	T	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=20;PP=661;SC=GCCCCCTTGCCCCCCACCCAG;SOR=1.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=233345257;WS=233345239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	233346027	rs746379	C	G	731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=13;PP=580;SC=CTCCCAACCCCCTTGTCCTCC;SOR=1.270;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=22;WE=233346035;WS=233346017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	233346662	rs909432	A	C	1200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=32;PP=939;SC=AGGAGGTGGCACAGGGAGGCC;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=233346670;WS=233346652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr2	233349588	rs1529874	G	A	5612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=66;PP=2965;SC=AGGTCGTCATGCTCTGACACA;SOR=1.191;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=174;TCF=107;TCR=67;TR=173;WE=233349596;WS=233349578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr2	233350000	rs2573246	C	G	1111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=27;PP=861;SC=ACAGGGGCCACAGGTCAGAGG;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=233350008;WS=233349990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	233385396	rs1550094	G	A	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=25;PP=828;SC=GCCCCCCAGCGCCCTGCAAGG;SOR=1.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=34;WE=233385404;WS=233385386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr2	233386229	rs2853444	T	C	3000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=65;PP=2363;SC=GTCTTCACTCTCCTCTTGGGG;SOR=2.636;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=19;TCR=65;TR=84;WE=233386237;WS=233386219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr2	233387635	rs733603	A	G	1969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=33;PP=1584;SC=AATAGAGTGTAGGGAGGCCGG;SOR=0.986;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=58;WE=233387643;WS=233387625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr2	233388311	rs733602	C	T	768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=16;PP=656;SC=TTTCCAATGCCCCGTCCCCAG;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=233388319;WS=233388301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	233388813	rs2741299	T	G	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=23;PP=878;SC=TGCTCGGGCCTCGTCCGGGAC;SOR=1.483;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=37;WE=233388821;WS=233388803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	233389167	rs58091792	G	C	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=16;PP=396;SC=CTCCGGAAAGGGCTTACCCCA;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=233389175;WS=233389157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	233389918	rs2853447	A	G	2379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=34;PP=1904;SC=CCACTCCTCCATCTGTAGGTC;SOR=1.112;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=46;TCR=34;TR=80;WE=233389926;WS=233389908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr2	233390199	rs61744404	C	G	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.051;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=277;ReadPosRankSum=-1.078;SC=TCAGGTACCCCCCGCCAGGCA;SOR=1.341;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=58;TCF=25;TCR=33;TR=19;WE=233390207;WS=233390189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,18:0.32:56
chr2	233390937	rs2245601	A	G	1309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=27;PP=1005;SC=TGGAGGGGCCAGTGCTGACAC;SOR=1.364;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=16;TCR=27;TR=43;WE=233390945;WS=233390927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr2	233391463	rs2278478	A	G	1389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=34;PP=1229;SC=GGAGGAAGCTAGAAGCCCCCA;SOR=3.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=41;WE=233391471;WS=233391453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr2	233391965	rs4973537	A	G	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=0;PP=442;SC=GCAGTGAGCCAAGCTCGTGCC;SOR=4.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=233391973;WS=233391955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	233392010	.	T	TG	185.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.52;MQRankSum=-1.104;QD=4.64;ReadPosRankSum=1.365;SOR=1.274;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,11:0.28:40
chr2	233392020	rs113930536	A	AAAAG,AAAG	1119.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=64.05;QD=37.32;SOR=2.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,19,11:0.63,0.37:30
chr2	233400074	rs2767	A	G	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=28;PP=697;ReadPosRankSum=-0.108;SC=GAGGAGCCACAGTCCCTAATG;SOR=0.576;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=49;TCF=4;TCR=45;TR=31;WE=233400082;WS=233400064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,32:0.65:49
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chr2	233404334	rs140146282	C	CGGGCTGGCT	403.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.60;MQRankSum=1.936;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.101;SOR=0.349;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
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chr2	233406998	.	T	G	273	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=13;NR=0;PP=273;QD=23.6747086575;SC=AGTGGGGTTTTATAGAGAACT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=13;WE=233407006;WS=233406997;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,13:0.59:22
chr2	233408190	rs34697564	A	AC	1185.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.898;HP=10;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-1.179;NF=50;NR=31;PP=1005;ReadPosRankSum=2.289;SC=CCCTCCATCCACCCCCCCCAT;SOR=0.401;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=100;TCF=59;TCR=41;TR=81;WE=233408198;WS=233408177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,52:0.59:88
chr2	233408220	rs10714586	AG	A	2884.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=30;PP=2611;SC=AGGAGGCCTGAGGGGGGGCAG;SOR=2.019;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=115;TCF=82;TCR=33;TR=100;WE=233408228;WS=233408210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr2	233408239	rs2573206	C	G	2327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.767;NF=65;NR=17;PP=1940;ReadPosRankSum=-1.747;SC=AGCCACTAAGCGTGGGGGTGG;SOR=0.380;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=127;TCF=102;TCR=25;TR=82;WE=233408247;WS=233408229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,80:0.64:125
chr2	233408283	rs13018423	C	T	4086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.710;NF=99;NR=46;PP=2962;ReadPosRankSum=0.224;SC=CCTGCCCACCCCACCCTGACA;SOR=0.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=215;TCF=146;TCR=69;TR=145;WE=233408291;WS=233408273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,147:0.67:219
chr2	233414341	rs4973540	C	T	251.89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.9992;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=58.39;MQRankSum=-0.235;NF=8;NR=2;PP=210;ReadPosRankSum=0.325;SC=CCACTAAAACCTTCTCCATAT;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=10;WE=233414349;WS=233414331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr2	233415978	rs11899983	T	C	3984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=54;PP=2965;SC=TTAGGAATTATCTTCCTGAGA;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=77;TCR=55;TR=130;WE=233415986;WS=233415968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr2	233421284	rs3830645	CT	C	7858.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=180;PP=2966;SC=GAACTTGAGACTTTTATTATC;SOR=2.546;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=226;TCF=34;TCR=192;TR=208;WE=233421292;WS=233421274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr2	233428927	rs1656397	G	C	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=175;ReadPosRankSum=-0.162;SC=AAAGACACATGTTTTTTACTC;SOR=0.650;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=10;WE=233428935;WS=233428917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr2	233429144	rs111584120	GTATTTTATTT	G,GTATTT	1420.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=0,0;NR=27,27;PP=364,1443;SC=AAGGTTAAAAGTATTTTATTT;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=74;TCF=5;TCR=69;TR=27,27;WE=233429161;WS=233429134;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.46,0.54:35
chr2	233429185	rs1656396	G	A	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=98;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=228;ReadPosRankSum=0.835;SC=TATTTGAGACGGAGTGTCGCT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=10;WE=233429204;WS=233429175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr2	233429196	rs1729255	C	G	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-4.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=98;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.037;NF=0;NR=11;PP=228;ReadPosRankSum=0.239;SC=GAGTGTCGCTCTGTCACCCAG;SOR=1.414;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=11;WE=233429204;WS=233429175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr2	233470843	rs7571133	G	A	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=656;ReadPosRankSum=-1.272;SC=GCCAAGATCTGTAACGCTGAC;SOR=0.766;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=79;TCR=40;TR=41;WE=233470851;WS=233470833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,41:0.33:124
chr2	233498669	rs2276557	G	T	1373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.613;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=17;PP=1052;ReadPosRankSum=1.574;SC=CGGAGTTCCCGGAGTTCAGCC;SOR=0.348;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=76;TCF=53;TCR=23;TR=51;WE=233498677;WS=233498659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,53:0.69:77
chr2	233498790	rs1107504	G	T	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=261;ReadPosRankSum=0.655;SC=CCGAAGTCCCGGGCCCTGTTT;SOR=0.324;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=14;WE=233498798;WS=233498780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr2	233502984	rs13029754	A	G	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-5.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=3;PP=484;ReadPosRankSum=0.622;SC=ACTTAAAGGCAGGACCCCAAT;SOR=0.770;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=75;TCF=67;TCR=8;TR=31;WE=233502992;WS=233502974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,30:0.41:73
chr2	233536926	rs11684420	T	C	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.256;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=552;ReadPosRankSum=0.298;SC=CTTTCTTAAGTGATTGGCAGA;SOR=1.005;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=46;TCF=31;TCR=15;TR=28;WE=233536934;WS=233536916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,29:0.62:47
chr2	233537125	rs11550699	A	G	1709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=34;PP=1359;ReadPosRankSum=-0.550;SC=GAGGGTGTCAAAGGTGCCAAG;SOR=0.643;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=47;TCR=55;TR=63;WE=233537133;WS=233537115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,64:0.61:105
chr2	233641010	rs41266951	A	T	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=162;ReadPosRankSum=1.510;SC=AAAAGAATATAGAAACCTTAC;SOR=0.573;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=10;WE=233641018;WS=233641000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr2	233641083	rs737027	G	C	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.168;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=501;ReadPosRankSum=-0.232;SC=TAGCTCTGTTGCTATTTGCCA;SOR=0.988;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=82;TCF=63;TCR=19;TR=27;WE=233641091;WS=233641073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,30:0.34:88
chr2	233652137	rs3217559	T	TG	359.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=421;ReadPosRankSum=-1.228;SC=GCTTAAAAAATGTGGGGGTGG;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=12;WE=233652145;WS=233652127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr2	233660704	rs2305139	T	G	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-6.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=408;ReadPosRankSum=1.437;SC=GGGCAGGCACTGTTATTATGT;SOR=0.174;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=57;TCF=56;TCR=1;TR=26;WE=233660712;WS=233660694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr2	233681512	rs1078323	T	G	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=246;ReadPosRankSum=-0.468;SC=CGAATACTACTGGTCAGTGCT;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=14;WE=233681520;WS=233681502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr2	233704676	.	G	A	1741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=0.000;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.386;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=45;PP=1418;ReadPosRankSum=0.491;SC=GCAGCTTCGAGAAGAGGTAAA;SOR=0.433;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=131;TCF=45;TCR=86;TR=72;WE=233704684;WS=233704666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,70:0.54:130
chr2	233708806	rs3816334	A	G	4032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=83;NR=34;PP=2965;SC=AGCAGCAGCAACAGCAACAGC;SOR=1.857;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=83;TCR=34;TR=117;WE=233708814;WS=233708796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr2	233710713	rs4973054	G	C	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=20;PP=597;SC=GAGGTCAACTGCTGCACCTGC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=233710721;WS=233710703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	233711987	rs12328140	G	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.952;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr2	233712049	rs2305137	G	A	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=3;PP=765;SC=CTCCCCTCCCGTTTTGCAGTT;SOR=3.690;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=27;WE=233712057;WS=233712039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	233712226	rs10555297	CACA	C	787.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=10;PP=519;SC=CAGCAGCTGCCACAGCAGCAG;SOR=0.990;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=15;WE=233712236;WS=233712216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	233712248	rs12328151	G	A	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-2.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.419;HP=4;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.868;NF=1;NR=8;PP=97;ReadPosRankSum=-1.221;SC=AGCAGCAGCCGCCACAGCAGC;SOR=2.030;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=9;WE=233712256;WS=233712238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr2	233721455	rs1947105	G	A	2675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=30;PP=2024;SC=AATTTGAGCCGCTTGGTTGCC;SOR=1.101;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=49;TCR=30;TR=78;WE=233721463;WS=233721445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	233723182	rs1284	G	A	2056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=23;PP=1733;SC=ACCATTAAAAGTTGGGGCTCC;SOR=1.410;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=44;TCR=23;TR=67;WE=233723190;WS=233723172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr2	233740055	rs35523521	AAGAG	A	1909.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=7.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.69;ReadPosRankSum=-0.213;SOR=1.227;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,57:0.29:197
chr2	233740227	rs778338	A	G	3830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=98;PP=2965;SC=CCAGGGTTGGAGTGGTGGTCA;SOR=3.611;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=16;TCR=98;TR=114;WE=233740235;WS=233740217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr2	233744130	rs67252740	GCCC	G,GC	1309.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=42.25;SOR=6.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,11,20:0.35,0.65:31
chr2	233744133	.	C	G	419.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=12;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=800;ReadPosRankSum=2.525;SC=TCCCAGAGCCCCCCCCCCCCC;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=19;WE=233744142;WS=233744120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr2	233747015	rs72997493	A	G	2466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.201;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=80;PP=1990;ReadPosRankSum=-0.395;SC=CTGCAGATCAACGGCAGCCCC;SOR=1.038;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=134;TCF=17;TCR=117;TR=90;WE=233747023;WS=233747005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,91:0.66:137
chr2	233750074	rs2292725	C	T	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.978;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=34;PP=727;ReadPosRankSum=-1.889;SC=TGCATGCCTTCACCACCTGGG;SOR=1.108;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=142;TCF=30;TCR=112;TR=41;WE=233750082;WS=233750064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,42:0.29:144
chr2	233750118	rs2292726	G	A	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.697;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=500;ReadPosRankSum=0.463;SC=CACCAAAGCCGGCTGTCCCGG;SOR=1.488;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=85;TCF=8;TCR=77;TR=26;WE=233750126;WS=233750108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,25:0.29:85
chr2	233752639	rs2250665	A	T	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=1;PP=661;SC=AAATTTGCATATTCTAAAAAG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=233752647;WS=233752634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	233752944	rs72427034	ACACG	A	1251.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.427;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.801;NF=2;NR=37;PP=1811;ReadPosRankSum=2.511;SC=ACACACACACACACGCACGCA;SOR=1.445;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=91;TCF=7;TCR=84;TR=39;WE=233752955;WS=233752934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,39:0.63:62
chr2	233757679	rs748002	G	A	2202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.336;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=38;PP=1698;ReadPosRankSum=0.601;SC=AGAAGTGGTCGGCCGCATAAC;SOR=0.597;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=125;TCF=62;TCR=63;TR=79;WE=233757687;WS=233757669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,82:0.64:128
chr2	233757697	rs895432	A	G	3627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=62;PP=2940;SC=AACGGTACACAATGTCACACA;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=57;TCR=62;TR=119;WE=233757705;WS=233757687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr2	233757860	rs6721903	T	C	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=149;ReadPosRankSum=0.086;SC=ACATTGGACATAGCAGTGTGC;SOR=0.132;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=8;WE=233757868;WS=233757850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr2	233759695	rs938569	G	C	1914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=57;PP=1512;ReadPosRankSum=-2.219;SC=CCTTGGCTGAGACAGAGGAGC;SOR=0.846;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=91;TCF=9;TCR=82;TR=64;WE=233759703;WS=233759685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,66:0.70:94
chr2	233785015	rs778354	G	A	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=7;PP=1153;SC=TAATCTCCTCGGGCTGTAGGA;SOR=3.171;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=46;WE=233785023;WS=233785005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	233791608	rs1878289	C	G	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.795;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=470;ReadPosRankSum=0.688;SC=CCATTTAGAGCCAAACATGTC;SOR=0.242;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=20;WE=233791616;WS=233791598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr2	233791648	rs2592127	G	T	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=462;ReadPosRankSum=0.120;SC=GTCAGACGCAGTCCTTCGTAT;SOR=0.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=23;WE=233791656;WS=233791638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr2	233792565	rs2921705	G	A	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=2.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.23;ReadPosRankSum=-0.810;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr2	233834975	rs4973588	A	G	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=5;PP=719;SC=GCAAGGAGGCATTCTGCTCCA;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=233834983;WS=233834965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr2	233880271	rs60652209	A	G	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-5.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.778;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=251;ReadPosRankSum=0.012;SC=CCACCCAGCCATCCACCCATT;SOR=1.040;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=75;TCF=69;TCR=6;TR=20;WE=233880279;WS=233880261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,23:0.29:78
chr2	233899126	rs2233391	C	A	5539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-7.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.940;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=103;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.309;SC=TTTGCAGCTTCACGACAGGGC;SOR=0.482;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=333;TCF=173;TCR=160;TR=202;WE=233899134;WS=233899116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,211:0.61:346
chr2	233925166	rs1141328	G	A	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=188;ReadPosRankSum=-0.241;SC=CTGCCGGCCCGGCCGAGGAGG;SOR=0.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=11;WE=233925174;WS=233925156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr2	233925406	rs34218488	T	G	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.896;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=248;ReadPosRankSum=-0.205;SC=GTTGTTCTTATGTCACAGGAC;SOR=1.688;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=12;WE=233925414;WS=233925396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr2	233925491	rs4246649	A	G	204.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=6;PP=168;SC=AGCTGGTCTCATGGCAGGTTT;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=233925499;WS=233925481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr2	233943999	rs13419542	C	T	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=2.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.723;SOR=1.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,25:0.25:99
chr2	233986988	rs188105466	C	A	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=343;ReadPosRankSum=-0.618;SC=AGGGACAGGACGGCAGGAGGT;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=16;WE=233986996;WS=233986978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr2	233998646	rs6738961	C	T	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=7;PP=1143;SC=CTGGCACATGCGGCTCAACAG;SOR=3.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=42;WE=233998654;WS=233998636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	234054515	rs147786898	G	A	1982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=9;PP=1618;SC=AAGGTAACATGCAAGGACAGT;SOR=3.407;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=52;TCR=9;TR=61;WE=234054523;WS=234054505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	234054989	rs36180605	T	G	5500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=140;PP=2965;SC=CTTGACCCTCTGTCTCTAACG;SOR=3.104;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=30;TCR=140;TR=170;WE=234054997;WS=234054979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr2	234055004	rs36189208	T	C	3863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=114;PP=2965;SC=CTAACGCTGCTGCCCACAGGT;SOR=3.484;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=21;TCR=114;TR=135;WE=234055012;WS=234054994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr2	234066969	rs36127492	C	G	4874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=85;NR=61;PP=2965;SC=TCCTGCAGCTCATTAAGTCAC;SOR=1.082;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=85;TCR=61;TR=146;WE=234066977;WS=234066959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr2	234067089	rs36165346	A	G	3126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=81;PP=2469;SC=AACTTCTAAAATGGGCTGTGA;SOR=3.258;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=15;TCR=81;TR=96;WE=234067097;WS=234067079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr2	234072626	rs141642539	T	C	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=23;PP=540;SC=GAGGCAAGGGTGGGCTCAGCC;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=234072634;WS=234072616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	234079551	.	CAAA	C	182.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQRankSum=2.277;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.370;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr2	234091158	rs4571051	T	C	4315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=84;PP=2965;SC=AAGCAAAGGATGGTGTCTGTT;SOR=1.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=149;TCF=65;TCR=84;TR=149;WE=234091166;WS=234091148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr2	234093035	rs6740918	G	A	2015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=28;PP=1462;ReadPosRankSum=-1.024;SC=AACTGAATCCGTGTTCTCCCC;SOR=0.687;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=80;TCR=45;TR=78;WE=234093043;WS=234093025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,81:0.63:129
chr2	234104029	rs6706611	G	A	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.306;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=19;PP=885;ReadPosRankSum=-0.973;SC=GCTCTTTCCCGTCCCTTTCCT;SOR=0.822;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=178;TCF=107;TCR=71;TR=52;WE=234104037;WS=234104019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,53:0.29:180
chr2	234107070	rs7569827	G	A	2231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=64;PP=1783;ReadPosRankSum=-0.842;SC=TTATGAAAGCGCCCTGGGCTT;SOR=3.202;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=5;TCR=65;TR=69;WE=234107078;WS=234107060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr2	234112649	rs7609436	T	C	270.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=192;SC=CAATGTTACATGTCTCTATCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=234112657;WS=234112639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	234113057	rs7346	G	A	3863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=66;PP=2962;ReadPosRankSum=0.310;SC=GCTCCTTCACGTGCTCATCCT;SOR=0.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=196;TCF=101;TCR=95;TR=136;WE=234113065;WS=234113047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,140:0.70:200
chr2	234113301	rs9247	C	T	1848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-6.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.579;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=51;PP=1410;ReadPosRankSum=-0.355;SC=CGAGCTCCCGCATCACGGCAA;SOR=0.375;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=97;TCF=18;TCR=79;TR=64;WE=234113309;WS=234113291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,68:0.67:102
chr2	234113421	rs70958391	C	CGTATGTGT	452.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=748;ReadPosRankSum=1.035;SC=TGCGTGAGTGCGTATGTGTGT;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=10;WE=234113429;WS=234113411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr2	234160345	rs2289477	T	G	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=2;PP=715;SC=CCTCGGGGACTGCCAGTGTGT;SOR=4.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=32;WE=234160353;WS=234160335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	234160669	rs10199278	C	G	179.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=144;SC=AACCTGAGGCCGAGTCCCTGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=234160677;WS=234160659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	234173503	rs12994997	G	A	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=401;SC=GGGCTCTGGCGAGGTACTATT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=234173511;WS=234173493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	234181593	rs2289475	G	C	6511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=80;NR=109;PP=2965;SC=ATCAAAGAATGTCTTGCCTTT;SOR=1.052;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=80;TCR=109;TR=189;WE=234181601;WS=234181583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr2	234182240	rs2289472	C	T	1728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=5;PP=1397;SC=TTGGGTTTCTCTTGGCTGGGG;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=45;TCR=5;TR=50;WE=234182248;WS=234182230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr2	234183368	rs2241880	A	G	2488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=60;PP=1998;SC=CAATGTGGATACTCATCCTGG;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=17;TCR=60;TR=77;WE=234183376;WS=234183358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr2	234183468	rs2241879	G	A	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=17;PP=504;SC=TTGATATGGTGACAGAGCCTG;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=234183476;WS=234183458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr2	234184417	rs3792109	G	A	4204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=52;PP=2965;SC=TGAATGTCACGGTCCCTTTGT;SOR=1.170;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=80;TCR=52;TR=131;WE=234184425;WS=234184407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr2	234197717	rs4663136	C	G	1034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=30;PP=854;ReadPosRankSum=0.726;SC=AGCAGCATGGCGCAACATCGA;SOR=4.174;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=31;WE=234197725;WS=234197707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chr2	234227523	rs2304777	A	G	4426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=73;PP=2965;SC=GGGCATTTACATGGAAGGAGA;SOR=0.762;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=74;TCR=73;TR=147;WE=234227531;WS=234227513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr2	234227693	rs2304776	C	T	1628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=46;PP=1389;SC=AGATGGTAGACGGAGCCCAGG;SOR=5.549;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=48;WE=234227701;WS=234227683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr2	234229295	rs72976383	C	T	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.633;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=18;PP=890;ReadPosRankSum=1.133;SC=CTCTGACCTGCGCCTTCCGCT;SOR=0.788;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=176;TCF=114;TCR=62;TR=53;WE=234229303;WS=234229285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,54:0.31:177
chr2	234235749	rs2304774	G	C	2533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=10;PP=2032;SC=CTGCCTGTCTGCTCTCTCTCC;SOR=3.471;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=66;TCR=10;TR=76;WE=234235757;WS=234235739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr2	234238254	rs745498	T	G	2382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=37;PP=1880;SC=GTAGAGGGCATAGTCTTCTAG;SOR=0.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=32;TCR=37;TR=69;WE=234238262;WS=234238244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	234247627	rs2241874	T	C	402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=371;SC=AATGTGTGCATTCTTAGCGCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=234247635;WS=234247617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr2	234255548	rs1046976	T	C	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=1.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.32;ReadPosRankSum=1.634;SOR=0.783;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,26:0.26:101
chr2	234294561	rs3075537	T	TTC	7681.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=76;PP=2965;SC=AGCACTCTTGTTATAAATAAA;SOR=0.753;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=142;TCF=57;TCR=85;TR=133;WE=234294569;WS=234294551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr2	234294791	rs838716	G	C	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.53;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	234347091	rs3214826	TA	T	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.16;ReadPosRankSum=2.117;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr2	234354245	rs2305542	G	A	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=5.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.603;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=2;PP=603;ReadPosRankSum=0.781;SC=GTTTGCCTGCGCATCGTCCCC;SOR=1.191;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=71;TCF=64;TCR=7;TR=30;WE=234354253;WS=234354235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,29:0.41:70
chr2	234355340	.	C	T	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.145;ClippingRankSum=0.000;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.212;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=5;PP=963;ReadPosRankSum=0.418;SC=GCCTGTGCAGCTGACCTTGTG;SOR=0.215;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=151;TCF=140;TCR=11;TR=51;WE=234355348;WS=234355330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,53:0.34:155
chr2	234358831	.	G	GACGT	1193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.636;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.978;NF=0;NR=23;PP=1219;ReadPosRankSum=-0.026;SC=GTTTTGGTGAGACGTAGCGGG;SOR=4.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=23;WE=234358839;WS=234358821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,30:0.70:43
chr2	234368715	.	TA	T	59.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=1.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.46;ReadPosRankSum=0.392;SOR=0.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,10:0.24:41
chr2	234399965	.	G	C	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.953;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=527;ReadPosRankSum=0.260;SC=TTGTGTTTCTGAAATACATTG;SOR=2.215;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=24;WE=234399973;WS=234399955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr2	234436169	.	G	A	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.537;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=399;ReadPosRankSum=-0.447;SC=AAATGATACTGAGGGCCCAGG;SOR=1.931;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=18;WE=234436177;WS=234436159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr2	234438246	rs56828432	C	CT	3801.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=63;PP=2974;SC=AAGGACTGTCCTAGGAGCTAG;SOR=1.499;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=89;TCF=18;TCR=71;TR=80;WE=234438254;WS=234438236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr2	234438354	rs12692193	C	T	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=25;PP=704;SC=GAAAAGTAAACATTTCTTTAA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=234438362;WS=234438344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	234442437	rs11332355	CA	C	1029.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=37;PP=622;SC=TACACAGAAACAAAAAAAAAA;SOR=6.091;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=38;WE=234442445;WS=234442427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	234449316	rs2167884	G	A	4024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=62;PP=2965;SC=ACCTTCCGCAGTGGTCCATGC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=60;TCR=62;TR=122;WE=234449324;WS=234449306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr2	234449462	rs1545525	T	C	1216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=34;PP=1024;SC=TGAGAAATAATTGCATACTTA;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=234449470;WS=234449452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr2	234450822	rs1901812	T	C	174.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=139;SC=CACCTAGCAATTAAACCGCAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=234450830;WS=234450820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	234457900	rs3965793	T	A	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=513;SC=AACAAAAATATTGATATAGTT;SOR=3.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=19;WE=234457908;WS=234457890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr2	234469664	rs6753062	T	C	2395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=12;PP=1904;SC=CCATAGGGTATAGGCCAAGTC;SOR=3.228;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=59;TCR=12;TR=71;WE=234469672;WS=234469654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr2	234545039	rs149250772	A	AT	414.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=17;NR=1;PP=292;SC=AGTGAGTGTGATTTTTTTTTT;SOR=5.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=18;WE=234545047;WS=234545029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	234580453	rs3832043	AT	A	1067.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=1;PP=729;SC=TCAGTGACTGATTTTTTTTTT;SOR=6.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=39;WE=234580461;WS=234580443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	234590527	rs7586110	T	G	2783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=28;PP=2203;SC=CTTCTTCCACTTACTATATTA;SOR=2.054;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=71;TCR=28;TR=99;WE=234590535;WS=234590517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
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chr2	234601669	rs6759892	T	G	2221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=21;PP=1793;ReadPosRankSum=-0.809;SC=CCTCCTTCGCTCATTTCAGAG;SOR=0.985;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=77;TCF=56;TCR=21;TR=76;WE=234601677;WS=234601659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,77:0.99:78
chr2	234601965	rs1105880	A	G	7100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=83;NR=134;PP=2965;SC=GATCATTCCTAACTGCTCCTC;SOR=1.284;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=219;TCF=84;TCR=135;TR=217;WE=234601973;WS=234601955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr2	234602191	rs2070959	A	G	3954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=70;NR=47;PP=2965;SC=CCTGGAGCATACATTCAGCAG;SOR=1.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=70;TCR=47;TR=117;WE=234602210;WS=234602181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr2	234602202	rs1105879	A	C	4092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=45;PP=2965;SC=CATTCAGCAGAAGCCCAGACC;SOR=1.207;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=76;TCR=45;TR=120;WE=234602210;WS=234602181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr2	234626287	rs869283	G	A	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=4;PP=669;SC=ATCCTGGGGCGACCAGGACAA;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=234626295;WS=234626277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	234627937	rs2011404	T	C	3519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=53;PP=2744;SC=TTAACCTCTGTGGGGCGGTGC;SOR=0.973;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=66;TCR=53;TR=119;WE=234627945;WS=234627927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr2	234628238	rs201293328	C	T	3111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=6.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.324;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.265;NF=11;NR=88;PP=2304;ReadPosRankSum=-0.294;SC=GTGGCTGTTCCGAGGGGACTT;SOR=0.434;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=148;TCF=14;TCR=134;TR=99;WE=234628246;WS=234628228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,109:0.69:159
chr2	234637803	rs3821242	T	C	1198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=7;PP=912;SC=TCCCCTGCCGTGGCTGGCCAC;SOR=2.891;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=38;WE=234637811;WS=234637793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	234637853	rs6706232	G	A	1749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=11;PP=1479;SC=CCTGGGCTGAGAGTGGAAAGG;SOR=2.628;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=53;WE=234637861;WS=234637843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr2	234637912	rs6431625	T	C	2651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=22;SC=ATGCGGGAGGTCTTGCGGGAG;SOR=2.162;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=62;TCR=22;TR=84;WE=234637920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr2	234638249	rs7574296	A	G	5401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=85;NR=96;PP=2965;SC=TCTGCGCGGCAGTGCTGGCTA;SOR=0.832;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=181;TCF=85;TCR=96;TR=181;WE=234638257;WS=234638239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr2	234638580	rs45449995	A	G	1488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.853;NF=3;NR=49;PP=1191;ReadPosRankSum=-0.811;SC=CAGGCCAATCATGCCCAACAT;SOR=0.965;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=4;TCR=67;TR=52;WE=234638588;WS=234638570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,53:0.73:73
chr2	234652308	rs34622615	G	T	3661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.981;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=90;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.623;SC=ACTCGAAGGGGTCCTCGAAGG;SOR=1.151;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=222;TCF=86;TCR=136;TR=138;WE=234652316;WS=234652298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,138:0.62:222
chr2	234652347	rs13009407	C	G	1809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-6.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=59.97;MQRankSum=0.810;NF=48;NR=35;PP=1390;ReadPosRankSum=-0.570;SC=CGCCCTCCGCCCCCGCCTCGC;SOR=0.686;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=210;TCF=119;TCR=91;TR=83;WE=234652355;WS=234652337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,84:0.39:215
chr2	234652642	rs76063448	C	T	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=473;ReadPosRankSum=0.415;SC=GGCCCGAGTGCTCGGAGACCT;SOR=0.289;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=22;WE=234652650;WS=234652632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr2	234663649	rs10929301	C	G	6377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.91;NF=45;NR=165;PP=2965;SC=AGCTGAAGACCTACTCGAAGG;SOR=2.682;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=210;TCF=45;TCR=165;TR=210;WE=234663657;WS=234663639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr2	234668879	rs34983651	C	CAT	337.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=382;SC=TGGTTTTTGCCATATATATAT;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=8;WE=234668887;WS=234668869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr2	234676413	rs2302538	T	C	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=4;PP=912;ReadPosRankSum=-0.919;SC=AGAGGACCCCTGTTTTCTAGT;SOR=0.538;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=60;TCF=55;TCR=5;TR=42;WE=234676421;WS=234676403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,41:0.69:59
chr2	234676458	rs12471326	T	C	1926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=13;PP=1571;ReadPosRankSum=-0.064;SC=TCATATTATGTTCTTTCTTTA;SOR=0.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=86;TCR=19;TR=71;WE=234676466;WS=234676448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,71:0.68:105
chr2	234688036	rs6431631	C	A	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=371;ReadPosRankSum=0.026;SC=GCAGCAGTAGCCTCAAGTGAG;SOR=0.717;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=32;TCR=51;TR=28;WE=234688044;WS=234688026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,33:0.36:92
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chr2	234703136	rs6431634	T	C	1517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.122;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=44;PP=1113;ReadPosRankSum=-0.180;SC=AGTCTGGAGGTGCTCTTCGTC;SOR=0.482;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=87;TCF=23;TCR=64;TR=61;WE=234703144;WS=234703126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,64:0.70:91
chr2	234704150	rs2885297	T	C	1736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.655;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=1;PP=1493;ReadPosRankSum=1.498;SC=TCAGCAGGACTGGGGTAGGGC;SOR=1.694;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=89;TCF=87;TCR=2;TR=60;WE=234704158;WS=234704140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,59:0.68:87
chr2	234704318	rs2361503	A	G	8992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=485;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.183;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=157;NR=159;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.038;SC=CAGATCCTGGAACTGTCAGTC;SOR=0.571;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=470;TCF=238;TCR=232;TR=316;WE=234704326;WS=234704308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,325:0.67:482
chr2	234704495	rs11563248	T	G	3171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.744;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=64;PP=2443;ReadPosRankSum=-0.788;SC=CGTGCTTCCTTTATCCTGATG;SOR=1.241;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=145;TCF=60;TCR=85;TR=106;WE=234704503;WS=234704485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,111:0.72:155
chr2	234704690	rs759173	T	C	2512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=57;ReadPosRankSum=0.089;SC=TCGTAGCCCTTGGTGAGGCTC;SOR=0.471;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=133;TCF=50;TCR=83;TR=93;WE=234704698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,98:0.70:140
chr2	234704746	rs759172	G	C	1698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.858;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=28;PP=1301;ReadPosRankSum=0.152;SC=CAGGAGGCCTGTAGGAGTCCC;SOR=0.582;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=80;TCF=36;TCR=44;TR=52;WE=234704754;WS=234704736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,56:0.66:85
chr2	234707341	rs1500479	T	C	2683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=12;PP=1972;SC=AGACAGAACGTGAGGCCCTGA;SOR=3.339;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=66;TCR=12;TR=78;WE=234707349;WS=234707331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	234708428	rs13013882	G	A	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=13;PP=1427;SC=CCCCTCAGGTGAGGATGGCTA;SOR=2.262;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=56;WE=234708436;WS=234708418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr2	234708570	rs11563069	G	A	2456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=57;PP=1915;SC=TACGCAGACCGCAGAGCAGCT;SOR=1.816;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=26;TCR=57;TR=83;WE=234708578;WS=234708560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr2	234708720	rs2041652	T	G	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=300;ReadPosRankSum=-0.609;SC=CCTAGATATATGCACAGCTCT;SOR=0.859;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=14;WE=234708728;WS=234708710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr2	234713812	rs2041651	G	T	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=31;PP=1068;SC=CCAGGGGTGAGGGAGTGGAGA;SOR=2.531;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=40;WE=234713820;WS=234713802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	234720734	rs988344	A	C	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=28;PP=685;SC=TCTCACTTGGAGGCTCCCCAG;SOR=4.047;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=31;WE=234720742;WS=234720724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	234725502	rs726016	T	C	1374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=23;PP=1027;SC=CTATCTCATGTGGATTTATGT;SOR=0.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=23;TCR=23;TR=46;WE=234725510;WS=234725492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	234727250	rs719419	T	G	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=5;PP=1035;SC=GGGGGGTGGCTGGGCCTTTTG;SOR=3.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=46;WE=234727258;WS=234727240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr2	234727478	rs6759919	A	G	1078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=31;PP=949;SC=GCCGTCTCTCAGGGAGGGAGG;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=234727486;WS=234727468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr2	234727986	rs6754859	C	T	3944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=55;PP=2965;SC=AGTTTAGCTGCGATGAGGTGG;SOR=0.949;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=70;TCR=55;TR=125;WE=234727994;WS=234727976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr2	234728078	rs1500480	T	C	3523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=76;PP=2831;SC=TGGATAGCCTTCTTCCTCCAG;SOR=2.058;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=30;TCR=76;TR=106;WE=234728086;WS=234728068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr2	234738175	rs502059	A	G	603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=513;SC=CTCTGCAGGGACCAAGGCATT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=234738183;WS=234738165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr2	234738472	rs582432	G	A	1881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=7;NR=50;PP=1573;SC=GCTGTTCCCCGAGGAAACAGG;SOR=3.690;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=7;TCR=50;TR=57;WE=234738480;WS=234738462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	234740758	rs213547	A	G	2301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=7;PP=1772;SC=AACACGCTTGATGAATGACAG;SOR=3.643;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=57;TCR=7;TR=64;WE=234740766;WS=234740748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr2	234740797	rs76276350	C	CAAAA	5891.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=42;NR=27;PP=2971;SC=TCCTCCAAAGCTGTGTGTATC;SOR=1.863;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=75;TCF=47;TCR=28;TR=69;WE=234740806;WS=234740787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr2	234740798	rs3064782	T	A	3967.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.100;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=26;PP=2025;ReadPosRankSum=-0.719;SC=CCTCCAAAGCTGTGTGTATCA;SOR=1.990;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=117;TCF=84;TCR=33;TR=83;WE=234740806;WS=234740787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,128:0.98:130
chr2	234740985	rs474242	G	A	4224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.92;SOR=2.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr2	234740985	.	GGC	AGG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=26;MMLQ=28;MQ=59.94;NF=17;NR=59;PP=2947;QD=20;SC=AGTCCACCCCGGCACTCGGGG;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=79;TCF=17;TCR=62;TR=76;WE=234740995;WS=234740975;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,76:0.96:79
chr2	234740987	rs658482	C	G	4224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.47;SOR=2.535;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr2	234741022	rs122856	T	C	3763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=58;PP=1937;SC=GTGGGAGGCATGTGGCAAGCT;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=22;TCR=58;TR=80;WE=234741036;WS=234741012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr2	234741028	rs5839496	A	AG	3694.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=52;PP=2936;SC=GGCATGTGGCAAGCTGAGACC;SOR=1.882;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=23;TCR=53;TR=75;WE=234741036;WS=234741012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr2	234741443	rs213548	G	A	216.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=266;SC=ATGCACCTGGGGAGGCCTTTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=234741451;WS=234741433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	234749151	rs213555	C	T	2826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=0;PP=2423;ReadPosRankSum=0.511;SC=AAGAATTCGGCTGAGATTCAC;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=87;TCF=87;TCR=0;TR=86;WE=234749159;WS=234749141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,87:0.99:88
chr2	234749780	rs3821238	G	C	3113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.273;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=58;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.269;SC=AAATATTCCAGAACTATTTCC;SOR=0.901;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=159;TCF=75;TCR=84;TR=103;WE=234749791;WS=234749770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,112:0.67:167
chr2	234749783	rs17863822	C	G	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.287;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=24;PP=2485;ReadPosRankSum=0.457;SC=TATTCCAGAACTATTTCCCTG;SOR=0.774;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=158;TCF=77;TCR=81;TR=53;WE=234749791;WS=234749770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,54:0.33:165
chr2	234753008	rs169925	G	A	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=590;ReadPosRankSum=-0.520;SC=CTCCCCTGACGATGCGGACTG;SOR=2.694;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=23;WE=234753016;WS=234752998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,25:0.81:31
chr2	234754273	rs2302156	T	C	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=0;PP=651;ReadPosRankSum=1.734;SC=ATGCTCTTTATGGGTTCTGTA;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=52;TCR=0;TR=30;WE=234754281;WS=234754263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr2	234758500	rs529963	G	A	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.885;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=611;ReadPosRankSum=-0.760;SC=GCTTCATGGAGGAGTCCTCCA;SOR=1.542;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=28;WE=234758508;WS=234758490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr2	234758539	rs685139	T	C	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;PP=851;ReadPosRankSum=1.081;SC=AACATGGTTGTTTGAGTGACA;SOR=0.640;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=73;TCF=48;TCR=25;TR=45;WE=234758547;WS=234758529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,47:0.62:76
chr2	234758614	rs693637	A	G	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=585;ReadPosRankSum=0.450;SC=GGAGACAGCAAGAGCCTGCCA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=29;WE=234758622;WS=234758604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr2	234761355	rs554699	G	A	3543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.498;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=89;PP=2821;ReadPosRankSum=0.751;SC=CAAAGTGACAGGCAAAAAAAA;SOR=0.366;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=182;TCF=45;TCR=137;TR=123;WE=234761365;WS=234761345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,126:0.67:187
chr2	234762480	rs626110	A	T	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.243;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=887;ReadPosRankSum=-2.323;SC=AAGGTGGGGAAGACCCTTACC;SOR=0.292;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=43;WE=234762488;WS=234762470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,44:0.68:65
chr2	234763225	rs622954	TC	CT	2226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.861;HP=6;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=2254;ReadPosRankSum=-0.765;SC=GACTCCGCCCTCCCTGCCTTC;SOR=0.845;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=83;TCF=31;TCR=52;TR=50;WE=234763234;WS=234763215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,59:0.66:90
chr2	234775675	rs213544	G	T	2881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.739;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=21;PP=2300;ReadPosRankSum=-1.608;SC=GGCTGAAAAGGCTGCACTGAT;SOR=0.820;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=157;TCF=123;TCR=34;TR=103;WE=234775683;WS=234775665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,107:0.66:163
chr2	234846198	rs1019103	G	A	876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=769;SC=ATAGGCCAAAGTGACCTGGGC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=234846206;WS=234846188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	234847478	rs17862925	C	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-4.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=1.990;SC=GGGGCCTTGGCACGGCGCCCG;SOR=0.081;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=8;WE=234847486;WS=234847474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,8:0.21:38
chr2	234875433	rs12185625	A	G	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.247;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=402;ReadPosRankSum=0.664;SC=CCACACGGCCAGAAATGGGGC;SOR=0.892;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=54;TCF=11;TCR=43;TR=23;WE=234875441;WS=234875423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,21:0.38:55
chr2	234878261	rs6760498	G	A	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=210;ReadPosRankSum=0.405;SC=AGTGTGGGGCGGGGAAGAAAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=11;WE=234878269;WS=234878251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr2	234888643	rs6745987	T	C	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=1;PP=718;SC=GCCAGTGTGCTACCTACTTTC;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=234888651;WS=234888633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	234888721	rs6736916	C	T	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.167;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=4;PP=509;ReadPosRankSum=1.568;SC=TAAACAAACACGTCATTGGCT;SOR=0.936;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=93;TCF=80;TCR=13;TR=32;WE=234888729;WS=234888711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,33:0.35:95
chr2	234890391	rs6708995	G	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.846;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=123;ReadPosRankSum=-0.976;SC=AATATCTCATGAATTCTGTTC;SOR=0.027;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=10;WE=234890399;WS=234890381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr2	234892127	rs4663995	T	C	257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=179;SC=CAATTAACAATGTGGCAATTG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=234892135;WS=234892117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	234916771	.	AT	A	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.62;ReadPosRankSum=0.468;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr2	234916831	rs6734618	A	G	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.576;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=234;ReadPosRankSum=-0.873;SC=AGTAGTTGTGATAATAAAAGA;SOR=0.066;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=12;WE=234916839;WS=234916821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr2	234967539	rs593668	T	A	3152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=46;PP=2453;SC=TCCGGGAGACTACATGCAGGA;SOR=0.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=100;TCF=53;TCR=47;TR=99;WE=234967547;WS=234967529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr2	235404365	.	C	T	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=90;ReadPosRankSum=-0.152;SC=CACCGCGGCCCCCCGACCTGG;SOR=0.326;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=8;WE=235404373;WS=235404355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,8:0.22:37
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chr2	235951819	rs3795962	A	G	1920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=34;PP=1436;SC=CGTCCGTCCTAGAAAAGCTGA;SOR=1.071;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=23;TCR=34;TR=57;WE=235951827;WS=235951809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr2	235961953	rs28403580	G	A	2963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=33;PP=2208;ReadPosRankSum=0.363;SC=AAATGGCACAGAGAGAAAGTG;SOR=0.716;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=167;TCF=113;TCR=54;TR=105;WE=235961961;WS=235961943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,109:0.63:172
chr2	236403607	rs3738998	C	A	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.869;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=451;ReadPosRankSum=0.854;SC=CACGCGGCTGCTCCGCCGAGG;SOR=0.214;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=22;WE=236403615;WS=236403597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr2	236433161	rs62191529	G	A	2078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.551;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=52;PP=1562;ReadPosRankSum=0.147;SC=GACAGGCCACGGGGCTGCACC;SOR=1.588;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=110;TCF=42;TCR=68;TR=77;WE=236433169;WS=236433151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,79:0.71:112
chr2	236433331	rs11689907	T	C	133.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=83;SC=GAAGGGACCCTGTGTCCAAGA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=236433339;WS=236433321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	236433390	rs10207027	G	A	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=3;PP=51;SC=TAGGGACCTCGTCCCTTTCTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=236433398;WS=236433380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr2	236578649	rs10201486	C	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=178;ReadPosRankSum=1.324;SC=GGGGCGTGGGCCACACTCCCG;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=10;WE=236578657;WS=236578639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr2	236923361	rs35361765	C	CT	140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=152;ReadPosRankSum=0.666;SC=CTACTTTGACCTTTTTTTTTC;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=9;WE=236923369;WS=236923351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr2	237146643	rs72060634	TGTG	T	363.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.705;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.281;NF=3;NR=6;PP=318;ReadPosRankSum=-1.013;SC=GGAGGTTAGTTGTGGTGGTGG;SOR=0.321;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=9;WE=237146653;WS=237146633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr2	237149941	rs6756597	C	T	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.802;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=441;ReadPosRankSum=0.318;SC=CCAAACGTGGCTGGAGATTTC;SOR=0.920;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=113;TCF=82;TCR=31;TR=35;WE=237149949;WS=237149931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,36:0.31:116
chr2	237150166	rs2015983	A	C	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.897;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=143;ReadPosRankSum=-0.072;SC=CTCTCCATTGAGATGCCGTCG;SOR=0.201;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=64;TCF=16;TCR=48;TR=17;WE=237150174;WS=237150156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,17:0.26:66
chr2	237247036	rs111440161	G	GA	3177.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.472;NF=23;NR=95;PP=2007;ReadPosRankSum=0.641;SC=CTGGGAGAGAGAAAAAAAAAT;SOR=0.651;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=209;TCF=40;TCR=169;TR=118;WE=237247044;WS=237247026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,133:0.63:211
chr2	237252454	rs72978647	C	A	2268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=51;PP=1711;ReadPosRankSum=-1.719;SC=TGAAGACTTTCTGAAATGACA;SOR=0.656;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=132;TCF=51;TCR=81;TR=85;WE=237252462;WS=237252444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,88:0.65:136
chr2	237255303	rs62192371	A	G	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.527;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=620;ReadPosRankSum=0.147;SC=GGGCAGGAGAAGGCTCCTTCC;SOR=0.947;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=48;TCF=24;TCR=24;TR=30;WE=237255311;WS=237255293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,32:0.57:56
chr2	237374309	rs35432941	C	T	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.118;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=27;PP=938;ReadPosRankSum=1.555;SC=CCTTTTCAGCCTGGATTACTG;SOR=0.475;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=43;WE=237374317;WS=237374299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,43:0.62:69
chr2	237395443	rs1986381	C	G	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.617;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=409;ReadPosRankSum=0.117;SC=TTTAAGAAAACCAGATGCTAT;SOR=1.832;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=21;WE=237395451;WS=237395433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr2	237396935	rs6751722	G	A	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=36;PP=915;ReadPosRankSum=-0.518;SC=TCCTGCTAAGGGTCCCCACGG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=36;WE=237396943;WS=237396925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,38:0.76:50
chr2	237995735	rs138951874	G	GTTGTT	368.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.978;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=389;ReadPosRankSum=-1.818;SC=AAAATTTTGTGTTGTTTTGTT;SOR=0.006;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=10;WE=237995743;WS=237995725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr2	238005370	rs11333953	GT	G	309.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.750;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=344;ReadPosRankSum=1.118;SC=ATAAATGGCCGTTAAATGCAT;SOR=0.122;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=11;WE=238005378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr2	238166147	rs4377288	G	A	1648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.574;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=30;PP=1384;ReadPosRankSum=0.631;SC=AGCTATACCCGGTCTGGCTGC;SOR=0.534;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=50;TCR=51;TR=60;WE=238166155;WS=238166137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,62:0.58:106
chr2	238233483	rs13032404	G	A	2321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.19;ReadPosRankSum=1.370;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,83:0.72:115
chr2	238243176	.	C	T	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=35;ReadPosRankSum=0.328;SC=GTGGTTATTTCAGAATAGATT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=3;WE=238243184;WS=238243166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr2	238243285	rs2270671	G	A	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.276;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=208;ReadPosRankSum=-0.577;SC=TGAAACTTCCGTGGTAGGTGG;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=6;WE=238243300;WS=238243275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr2	238243292	rs1131296	G	A	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.569;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=335;ReadPosRankSum=-0.191;SC=TCCGTGGTAGGTGGCTCTGAC;SOR=1.759;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=8;WE=238243300;WS=238243275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr2	238243464	rs2270669	C	G	2676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=44;PP=2266;SC=GGGGGCTCAGCCCTCTCCCAG;SOR=0.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=43;TCR=44;TR=87;WE=238243472;WS=238243454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr2	238244963	rs6728818	A	G	3826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=34;PP=2965;SC=AACAGTGGCCATCTTTGTGGC;SOR=1.999;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=101;TCR=35;TR=133;WE=238244971;WS=238244953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
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chr2	238257013	rs2646265	G	A	1713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.644;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=53;PP=1385;ReadPosRankSum=0.213;SC=GGTATCCAGGGAATCCTCTTT;SOR=0.787;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=181;TCF=45;TCR=136;TR=69;WE=238257021;WS=238257003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,70:0.38:184
chr2	238257127	rs3790990	C	A	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.108;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=327;ReadPosRankSum=0.959;SC=AGTCATCAAACGAAAACACTC;SOR=1.004;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=60;TCF=32;TCR=28;TR=19;WE=238257135;WS=238257117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,17:0.28:60
chr2	238257213	rs2646264	C	G	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.594;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=569;ReadPosRankSum=0.232;SC=CTTGGAGCCTCCTGGCAGCAA;SOR=0.726;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=71;TCF=34;TCR=37;TR=29;WE=238257221;WS=238257203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,29:0.40:73
chr2	238257353	rs2646263	A	G	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.676;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=330;ReadPosRankSum=-0.407;SC=TGCCTGGCACACCATAACCAC;SOR=2.219;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=16;WE=238257361;WS=238257343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr2	238258814	rs3790993	C	G	2941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=51;PP=2276;ReadPosRankSum=-1.261;SC=GGCCCCGGTTCCCGATTCCTC;SOR=0.715;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=80;TCR=80;TR=102;WE=238258822;WS=238258804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,109:0.65:168
chr2	238259675	rs3790995	G	A	1573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-5.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=12;PP=1194;ReadPosRankSum=0.985;SC=CAGTAGTACTGAAGAGGAGGG;SOR=0.606;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=81;TCF=64;TCR=17;TR=55;WE=238259683;WS=238259665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,58:0.67:86
chr2	238261112	rs4663726	GC	AA	2770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.685;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=17;PP=2645;ReadPosRankSum=0.795;SC=AGCCTGCTTGGCAATGTGCCC;SOR=0.251;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=82;TCF=60;TCR=22;TR=51;WE=238261121;WS=238261102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,69:0.73:95
chr2	238261850	rs2646257	T	C	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=35;ReadPosRankSum=1.313;SC=TTGCACAGCATTGTGGAAGTA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=5;WE=238261858;WS=238261840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr2	238266146	rs2645777	C	T	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=81;ReadPosRankSum=-0.921;SC=AGGAAGAGCCCGTCTGCAGGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=238266154;WS=238266136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr2	238266248	rs7577192	G	C	86.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=1.282;SC=AAATATCTAAGAGGCACAGAT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=238266256;WS=238266238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr2	238266633	rs4663730	G	A	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=326;ReadPosRankSum=0.398;SC=GCAAGGCTTCGAGGGACAAGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=14;WE=238266641;WS=238266623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr2	238267058	rs4663731	G	A	4832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=128;NR=13;PP=2965;SC=TTTTATCAACGTGTTTTAAAG;SOR=4.407;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=129;TCR=13;TR=141;WE=238267066;WS=238267048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr2	238267717	rs2646254	C	T	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=39;PP=1421;ReadPosRankSum=0.909;SC=AAGAACCAGGCAATCCTTTGT;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=229;TCF=117;TCR=112;TR=81;WE=238267725;WS=238267707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,82:0.36:227
chr2	238269871	rs2645769	C	G	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=311;ReadPosRankSum=-1.697;SC=CTTTGCTCTACAGTAAGAATC;SOR=0.504;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=1;TCR=58;TR=17;WE=238269879;WS=238269861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,16:0.28:58
chr2	238271786	rs11287247	GC	G	89.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=60;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ATCTACCAAGGCCCCCCCCCC;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=6;WE=238271794;WS=238271776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr2	238271882	rs11385011	T	TA	617.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=349;ReadPosRankSum=0.619;SC=TATAAAGACATAAAAAAAACT;SOR=0.725;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=72;TCF=52;TCR=20;TR=22;WE=238271890;WS=238271872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,31:0.41:75
chr2	238274828	rs2645770	C	A	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=51;ReadPosRankSum=1.248;SC=CTTTGAGAAGCAATTCTATCC;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=238274836;WS=238274818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr2	238277573	rs2645774	C	A	1643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.747;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=48;PP=1261;ReadPosRankSum=0.572;SC=TCAGTGGGGACCCCCCTCTGA;SOR=0.834;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=220;TCF=93;TCR=127;TR=77;WE=238277581;WS=238277563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,76:0.34:223
chr2	238277795	rs2646260	A	G	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=3.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.65;ReadPosRankSum=-0.478;SOR=0.986;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,43:0.25:171
chr2	238283460	.	C	T	3670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.331;ClippingRankSum=0.000;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.404;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=65;PP=2926;ReadPosRankSum=0.209;SC=ACAGCGTTGACGACGTCCTGC;SOR=0.491;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=191;TCF=100;TCR=91;TR=130;WE=238283468;WS=238283450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,135:0.68:199
chr2	238283605	rs12622093	G	A	1820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.322;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=49;PP=1409;ReadPosRankSum=0.816;SC=ACAGAGGGAAGCCGCTCCTGA;SOR=0.863;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=243;TCF=103;TCR=140;TR=80;WE=238283613;WS=238283595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,83:0.34:243
chr2	238303906	rs2645778	A	G	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.85;ReadPosRankSum=-1.589;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr2	238305211	rs1553032	C	T	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=1;PP=583;SC=TCTGAAAAGGCCTATAAATCC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=238305219;WS=238305209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	238419543	rs145305319	C	CGTGT	923.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.974;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.677;NF=18;NR=5;PP=986;ReadPosRankSum=-0.072;SC=TGCACACACTCGTGTGTGTGT;SOR=0.337;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=23;WE=238419552;WS=238419533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr2	238419611	rs2292879	A	G	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.868;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=19;PP=1308;ReadPosRankSum=0.562;SC=CAGTGCCATGAGCCTGTGCTT;SOR=0.836;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=60;TCR=29;TR=58;WE=238419619;WS=238419601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,61:0.66:92
chr2	238428418	rs3751106	G	A	2352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=1;PP=1918;ReadPosRankSum=0.127;SC=CTAGTGGAGGGGGTGGATGTG;SOR=1.591;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=127;TCF=125;TCR=2;TR=84;WE=238428426;WS=238428408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,87:0.66:131
chr2	238428454	.	TC	GA	4381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.176;ClippingRankSum=0.000;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=2.030;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.18;ReadPosRankSum=-0.267;SOR=1.057;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,107:0.61:174
chr2	238428459	rs3751105	G	A	4361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=1.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.50;ReadPosRankSum=-0.239;SOR=0.961;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,109:0.61:178
chr2	238434434	rs11883500	C	T	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=510;ReadPosRankSum=-1.152;SC=GCCCTGGGGACTGCTGCTGCA;SOR=0.924;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=25;WE=238434442;WS=238434424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr2	238443226	rs2292884	A	G	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=602;ReadPosRankSum=1.242;SC=CTGAATAAGCATATTTCAGCT;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=32;TCR=17;TR=29;WE=238443234;WS=238443216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,32:0.59:54
chr2	238443407	rs2292885	G	C	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=389;ReadPosRankSum=-0.313;SC=TGTTTGTAAGGTTAAGTTCTG;SOR=1.022;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=17;WE=238443415;WS=238443397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr2	238449007	rs3817362	T	C	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=533;ReadPosRankSum=-0.779;SC=GGTGCTGGAGTGCGCACGGAG;SOR=0.804;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=45;TCF=27;TCR=18;TR=32;WE=238449015;WS=238448997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,32:0.70:46
chr2	238449107	rs2271809	AG	GT	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=873;ReadPosRankSum=0.972;SC=AGGAGGAGGAAGCCAAGGACG;SOR=0.925;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=18;WE=238449116;WS=238449097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr2	238632159	.	G	GT	378.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.000;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=5.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=1.547;QD=4.98;ReadPosRankSum=0.164;SOR=1.453;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,23:0.30:76
chr2	238641117	rs56182016	C	T	1229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.147;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=907;ReadPosRankSum=0.704;SC=ACTTTAATTGCTGATTACATT;SOR=0.446;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=200;TCF=84;TCR=116;TR=58;WE=238641125;WS=238641107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,60:0.29:205
chr2	238643907	rs3769078	G	A	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=745;ReadPosRankSum=-0.282;SC=TCTTTTGGTCGCAGGCGTCTG;SOR=0.690;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=65;TCR=67;TR=44;WE=238643915;WS=238643897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,47:0.35:135
chr2	238648144	rs3769072	C	G	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=71;ReadPosRankSum=2.084;SC=TTAGAGGAGGCAAACTTTATA;SOR=0.163;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=5;WE=238648152;WS=238648134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr2	238656936	rs2304431	A	G	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-1.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.482;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=109;ReadPosRankSum=-0.633;SC=TTTATCATTCATAGCCCCATC;SOR=0.375;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=12;WE=238656944;WS=238656926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr2	238659708	rs3769062	C	T	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=2;PP=644;ReadPosRankSum=0.870;SC=TTTATTTTCCCTTAACGCTTA;SOR=0.818;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=70;TCF=64;TCR=6;TR=28;WE=238659716;WS=238659698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,28:0.39:71
chr2	238661832	rs733579	T	C	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.52;ReadPosRankSum=0.934;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr2	238661870	.	GT	G	26	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=3;NR=1;PP=26;QD=10.0;SC=AGGACTGAGGGTTTTTTTTTA;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=4;WE=238661878;WS=238661860;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:18,4:0.18:22
chr2	238662154	rs3769061	A	G	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.854;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=214;ReadPosRankSum=-1.342;SC=AATGTTAACAATAGGCTGCGT;SOR=0.172;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=13;WE=238662162;WS=238662144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr2	238667501	rs3215064	G	GA	279.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=17;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=197;ReadPosRankSum=-1.315;SC=TAAAAAAAAAGAAAAAAAATC;SOR=0.330;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=13;WE=238667509;WS=238667491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr2	238668802	rs3213868	A	G	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.496;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=0.700;NF=27;NR=16;PP=606;ReadPosRankSum=-0.434;SC=CCAAGATGACAAAAGAAGAGT;SOR=0.860;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=134;TCF=80;TCR=54;TR=43;WE=238668810;WS=238668792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,43:0.32:135
chr2	238671117	rs734388	A	G	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-5.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.590;NF=12;NR=0;PP=130;ReadPosRankSum=0.258;SC=CTTGTTTCTCATGACTCTTTG;SOR=1.078;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=12;WE=238671125;WS=238671107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,12:0.29:41
chr2	238671172	.	GT	G	2098.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.171;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.919;NF=34;NR=17;PP=2024;ReadPosRankSum=-0.738;SC=TTTGGAACGTGTGTTTACATT;SOR=1.099;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=74;TCF=48;TCR=26;TR=51;WE=238671180;WS=238671162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,60:0.71:84
chr2	238671328	rs868119	A	G	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.626;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.106;NF=11;NR=14;PP=434;ReadPosRankSum=0.631;SC=CTGAGAAAGAACAACACACAG;SOR=0.256;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=88;TCF=31;TCR=57;TR=25;WE=238671336;WS=238671318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,25:0.29:86
chr2	238672703	rs3739038	C	G	1223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.405;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.947;NF=18;NR=31;PP=930;ReadPosRankSum=1.063;SC=AGAGCCAGGGCACTTCAATCC;SOR=0.564;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=142;TCF=50;TCR=92;TR=49;WE=238672711;WS=238672693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,51:0.34:148
chr2	238683166	rs2279644	G	A	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=631;ReadPosRankSum=0.588;SC=TAGTGGGGACGGTACAGAGAG;SOR=0.657;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=34;TCR=67;TR=36;WE=238683174;WS=238683156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,39:0.36:109
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chr2	238730317	rs62196084	A	G	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=0.701;SC=TATACATTGTAGTTAACTATA;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=5;WE=238730325;WS=238730307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr2	238730635	rs56387887	G	A	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=102;ReadPosRankSum=0.017;SC=TATTTATGTCGAATCCTGATC;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=3;WE=238730643;WS=238730625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
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chr2	238733016	rs4663795	G	A	1343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.852;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=24;PP=952;ReadPosRankSum=1.853;SC=CAGGGACACAGGGAAATCAAG;SOR=0.758;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=164;TCF=78;TCR=86;TR=54;WE=238733024;WS=238733006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,60:0.34:174
chr2	238742547	.	T	G	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.78;ReadPosRankSum=1.501;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr2	238742837	rs55675197	T	C	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.46;ReadPosRankSum=0.228;SOR=0.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,10:0.17:58
chr2	238896494	.	C	CAT	227.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=7.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.36;MQRankSum=1.095;QD=20.70;ReadPosRankSum=1.751;SOR=3.229;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr2	238903310	rs10203101	C	T	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.754;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=12;PP=861;ReadPosRankSum=-0.083;SC=TAACTTTACACGTGTTCAAAG;SOR=1.546;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=59;TCF=37;TCR=22;TR=42;WE=238903318;WS=238903300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,46:0.70:66
chr2	238912120	rs10929262	A	C	2810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.658;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=53;PP=2155;ReadPosRankSum=0.310;SC=CCCCTGCCTTAAATGTAACTC;SOR=0.804;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=144;TCF=69;TCR=75;TR=96;WE=238912128;WS=238912110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,100:0.67:150
chr2	238939370	rs11679080	C	T	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.667;NF=6;NR=38;PP=1032;ReadPosRankSum=-1.918;SC=CACCAGTGGCCGGACACACCC;SOR=0.511;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=66;TCF=8;TCR=58;TR=44;WE=238939378;WS=238939360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,45:0.67:67
chr2	238972827	rs821480	T	C	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=500;ReadPosRankSum=0.044;SC=ATAAGTAGTGTAGATCTGTAG;SOR=1.981;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=22;WE=238972835;WS=238972822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,24:0.73:33
chr2	238990388	rs3210400	G	A	2210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.321;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=45;PP=1714;ReadPosRankSum=-1.452;SC=GAGCGGGCAGGCAGAGGTGGA;SOR=0.919;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=124;TCF=54;TCR=70;TR=76;WE=238990396;WS=238990378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,81:0.63:129
chr2	238991796	rs2278742	C	T	3420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.918;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=36;PP=2709;ReadPosRankSum=-1.614;SC=CATTGCAGAGCATTTCTCCTG;SOR=0.977;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=187;TCF=133;TCR=54;TR=130;WE=238991804;WS=238991786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,133:0.67:198
chr2	238999883	rs1128552	T	C	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=292;ReadPosRankSum=-1.111;SC=CAATGATTGCTGGCCTTGGGA;SOR=0.990;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=18;WE=238999891;WS=238999873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,18:0.41:44
chr2	239000091	rs17069	T	G	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=184;ReadPosRankSum=0.299;SC=TGGCACTTGTTTAGCATTTAA;SOR=0.430;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=13;WE=239000099;WS=239000081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr2	239002480	rs72316729	CTTG	C	2873.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.750;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.893;NF=26;NR=36;PP=2611;ReadPosRankSum=0.877;SC=TGTGCATCCACTTGTTGTGTG;SOR=0.320;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=120;TCF=40;TCR=80;TR=62;WE=239002490;WS=239002470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,74:0.56:131
chr2	239005586	rs13033964	G	A	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=130;ReadPosRankSum=-1.741;SC=GTGGGCAGGCGGCAGGATCCG;SOR=0.693;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=9;WE=239005594;WS=239005576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr2	239006879	rs12993309	C	T	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.077;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=402;ReadPosRankSum=0.201;SC=GTGTCCCCTTCGACGTGGCCA;SOR=0.544;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=50;TCF=17;TCR=33;TR=22;WE=239006887;WS=239006869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr2	239007755	rs68159827	CATT	C	2227.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=2;PP=1970;SC=CCCTTTTGATCATTATTAACT;SOR=5.630;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=48;TCR=2;TR=43;WE=239007765;WS=239007745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr2	239007806	rs1054640	A	G	2320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.253;NF=65;NR=17;PP=1786;ReadPosRankSum=1.088;SC=GTGCAGCTCCAGGTCATTCCT;SOR=1.542;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=84;TCF=66;TCR=18;TR=82;WE=239007814;WS=239007796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,85:0.99:86
chr2	239007850	rs1054641	T	A	3921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=54;PP=2915;SC=GACTCAGCTTTTACCTTAATT;SOR=1.072;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=75;TCR=55;TR=129;WE=239007858;WS=239007840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr2	239007991	rs15787	T	A	2116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=58;PP=1754;SC=AAGGAACTACTTGATGATTTT;SOR=4.310;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=5;TCR=58;TR=63;WE=239007999;WS=239007981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr2	239009336	rs61744770	G	A	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=227;ReadPosRankSum=0.000;SC=TGGTCCGCGAGGGGGGCTGCG;SOR=1.347;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=10;WE=239009344;WS=239009326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr2	239009384	rs62196013	C	T	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=121;ReadPosRankSum=-0.343;SC=CCTGGCTCCACGAAGCTGGCT;SOR=1.911;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=8;WE=239009392;WS=239009374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
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chr2	239010577	rs1562333	G	C	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=337;ReadPosRankSum=0.098;SC=CCCGGGGCTTGGTAGGACCAA;SOR=0.634;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=20;WE=239010585;WS=239010567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr2	239010690	rs34878344	C	A	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=138;ReadPosRankSum=2.594;SC=GCTAGAGACCCGGGAGGGAGC;SOR=0.426;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=9;WE=239010698;WS=239010680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr2	239010719	rs36066915	T	C	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=10;PP=327;SC=TGCACCACGCTGCCGTCAGTG;SOR=1.244;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=16;WE=239010727;WS=239010709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr2	239016425	.	T	C	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.869;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.498;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=633;ReadPosRankSum=0.317;SC=TGCCCCTCCTTCCCCAGGTCA;SOR=1.273;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=119;TCF=82;TCR=37;TR=34;WE=239016433;WS=239016415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,34:0.28:121
chr2	239016539	rs935415	C	G	5350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=84;PP=2965;SC=GACTCCTGCTCATGGGTACCC;SOR=0.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=79;TCR=84;TR=163;WE=239016547;WS=239016529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr2	239016640	rs878134	G	T	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=25;PP=527;ReadPosRankSum=-0.588;SC=GGGAGACAGGGTGAGCAGTCA;SOR=0.735;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=94;TCF=15;TCR=79;TR=29;WE=239016648;WS=239016630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,30:0.31:96
chr2	239025523	rs11903074	T	C	3033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=29;PP=2433;SC=GTGGGTCACATGTGTGCCCTC;SOR=1.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=71;TCR=29;TR=100;WE=239025531;WS=239025513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr2	239033901	rs10172440	T	C	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.122;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=537;ReadPosRankSum=0.597;SC=CCAGGCCCATTCACCCACAGG;SOR=1.147;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=88;TCF=51;TCR=37;TR=29;WE=239033909;WS=239033891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,28:0.32:87
chr2	239034043	rs10170048	A	C	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.301;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=168;ReadPosRankSum=1.023;SC=CACAGCCCCAAGTGGGCCACC;SOR=0.077;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=13;WE=239034051;WS=239034033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr2	239036416	rs12692214	T	C	4063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.64;SOR=2.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr2	239036416	.	TAGCCAGC	CAGCCAGA,CAGCCAGC	1308	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=9,22;NR=43,67;PP=1308,444;QD=26.1820745166;SC=CCGGGGCCCCTAGCCAGCCTC;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=89;TCF=22;TCR=67;TR=52,89;WE=239036431;WS=239036406;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.58:89
chr2	239036423	rs62197371	C	A	1729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=11.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.21;ReadPosRankSum=0.072;SOR=1.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,65:0.68:95
chr2	239037273	rs72989009	C	A	565.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5172;FS=6.038;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=479;ReadPosRankSum=-0.653;SC=CAACCCCCCACGTCCTCTCGG;SOR=3.816;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=20;WE=239037281;WS=239037263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,20:0.87:23
chr2	239051550	rs935411	T	C	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=82;ReadPosRankSum=-0.213;SC=TTGGGAACTTTGCCTTCTACA;SOR=0.180;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=6;WE=239051558;WS=239051540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr2	239070272	.	G	A	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.634;ClippingRankSum=0.000;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=11;PP=1432;ReadPosRankSum=-0.279;SC=GTCGACCCCCGGGACGCCTGG;SOR=0.614;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=83;TCR=17;TR=63;WE=239070280;WS=239070262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,64:0.64:100
chr2	239079542	rs2278737	A	G	3091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=39;PP=2532;SC=GAAAACTAAGACACAATTGGG;SOR=1.190;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=56;TCR=39;TR=95;WE=239079550;WS=239079532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr2	239079798	rs112719715	T	C	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.45;MQRankSum=-0.176;QD=24.82;ReadPosRankSum=-1.261;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr2	239082166	rs3832064	G	GC	4630.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=34;PP=2936;SC=CTCTTATAGGGCCTTTTACCT;SOR=1.999;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=108;TCF=72;TCR=36;TR=106;WE=239082174;WS=239082156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr2	239092618	rs3217566	C	CCACA	3741.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=7;PP=2973;SC=TAGGAAAACACCACACACAGT;SOR=4.147;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=96;TCF=84;TCR=12;TR=68;WE=239092626;WS=239092608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr2	239093788	rs6431588	T	C	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=7;PP=1279;SC=CAATAACCAATTTGAGTATCA;SOR=3.516;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=46;WE=239093796;WS=239093778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr2	239133641	rs72992741	A	G	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=273;ReadPosRankSum=-1.212;SC=TGCCTGGCCCAGGACTTCCTC;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=16;WE=239133649;WS=239133639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr2	239133980	rs7558525	C	T	1625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.641;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=1232;ReadPosRankSum=0.990;SC=CGAGAGGGCCCGGCTGTGCCC;SOR=1.004;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=96;TCF=54;TCR=42;TR=55;WE=239133988;WS=239133970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,59:0.58:101
chr2	239134056	rs7572285	A	G	3988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=6.178;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.41;ReadPosRankSum=0.609;SOR=0.982;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,102:0.65:157
chr2	239134063	rs7584376	G	T	3899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=6.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.00;ReadPosRankSum=1.037;SOR=0.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,99:0.63:156
chr2	239134138	rs7572392	A	C	2059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.625;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=50;PP=1569;ReadPosRankSum=0.966;SC=ACCATCAGGGACTCTGGAAAC;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=36;TCR=80;TR=72;WE=239134146;WS=239134128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,76:0.63:120
chr2	239136143	rs3795902	C	T	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=383;ReadPosRankSum=-1.478;SC=TGACTCTGTCCCCACCTCCCT;SOR=0.638;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=16;WE=239136151;WS=239136133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr2	239139883	rs13425452	G	C	1702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=42;PP=1361;ReadPosRankSum=1.377;SC=ACACATTCGCGAGGGGAGCGC;SOR=0.709;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=94;TCF=28;TCR=66;TR=61;WE=239139891;WS=239139873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,62:0.63:98
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chr2	239140426	.	A	AC	833.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.199;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.52;ReadPosRankSum=-1.349;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
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chr2	239140728	rs11689033	A	G	1931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.438;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=29;PP=1601;ReadPosRankSum=-0.058;SC=CTGGCTGGAGAAATCCGGTGT;SOR=0.987;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=119;TCF=68;TCR=51;TR=69;WE=239140736;WS=239140718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,72:0.61:119
chr2	239148535	rs1047589	G	C	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=100;ReadPosRankSum=-0.259;SC=CAGGCGCCGCGGGTGGCGCCA;SOR=0.536;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=9;WE=239148543;WS=239148525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr2	239148970	rs56294817	C	A	2979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=14;PP=2333;SC=GACCACTGATCTGCCGCGCGT;SOR=3.189;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=94;TCF=79;TCR=15;TR=93;WE=239148978;WS=239148960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr2	239148996	rs140615710	CCCGT	C	3000.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.129;NF=44;NR=17;PP=2765;ReadPosRankSum=1.699;SC=CAGGCGTCCACCCGTCCGTCC;SOR=0.648;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=121;TCF=92;TCR=29;TR=61;WE=239149007;WS=239148986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,76:0.71:107
chr2	239229372	rs13398676	C	A	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.346;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=26;PP=991;ReadPosRankSum=0.807;SC=CGCCGCTGACCGAGAAGCTGC;SOR=0.386;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=139;TCF=84;TCR=55;TR=60;WE=239229380;WS=239229362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,60:0.44:136
chr2	239242719	rs5839695	G	GT	322.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.30;QD=23.05;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr2	239261866	rs3213874	G	A	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.154;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=330;ReadPosRankSum=0.531;SC=TCCTGGGCACGAGTGTGCATG;SOR=1.626;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=59;TCF=11;TCR=48;TR=18;WE=239261874;WS=239261856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,21:0.34:62
chr2	239307245	rs571820	A	G	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=84;ReadPosRankSum=-0.483;SC=TTTTGGTTGTAGCAGGGGTTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=239307253;WS=239307235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr2	239976598	rs79344481	G	A	3514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.644;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=86;PP=2710;ReadPosRankSum=-0.559;SC=CGGGTGTTCCGAGACTGCAAC;SOR=0.618;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=176;TCF=50;TCR=126;TR=122;WE=239976606;WS=239976588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,127:0.68:186
chr2	239976697	rs113824469	T	TTATTA	1378.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.354;NF=1;NR=29;PP=1614;ReadPosRankSum=0.403;SC=GCCGTGGTATTTATAATTTTT;SOR=0.818;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=52;TCF=1;TCR=51;TR=30;WE=239976705;WS=239976683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,36:0.71:51
chr2	239990570	.	G	A	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.336;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=8.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.87;MQRankSum=-0.325;QD=3.61;ReadPosRankSum=0.812;SOR=2.108;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,14:0.21:67
chr2	240016824	rs2279274	A	G	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=44;PP=1114;ReadPosRankSum=0.319;SC=CCCTGGGCGCACTCCGGGGTC;SOR=0.876;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=63;TCF=1;TCR=62;TR=45;WE=240016832;WS=240016814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,45:0.71:63
chr2	240055901	rs2278778	G	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.539;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=67;ReadPosRankSum=1.754;SC=AGCGTGGGCAGCCTCAGAGCC;SOR=0.064;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=6;WE=240055909;WS=240055891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr2	240066417	rs2290087	A	G	3843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=55;PP=2937;SC=GAAGCTGCACAAAAAGGAGAT;SOR=1.005;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=68;TCR=55;TR=123;WE=240066425;WS=240066407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr2	240066526	rs2290088	T	C	1611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=50;PP=1187;SC=TCAACACTGCTGTGTTGCTGC;SOR=5.283;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=53;TCF=3;TCR=50;TR=52;WE=240066534;WS=240066516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr2	240078587	rs5839723	GAC	G	688.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.728;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.381;NF=0;NR=19;PP=700;ReadPosRankSum=-2.068;SC=CACCTCAACAGACACACCTTT;SOR=1.431;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=2;TCR=59;TR=19;WE=240078596;WS=240078577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,21:0.36:59
chr2	240083528	rs3791515	G	A	1343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.383;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=50;PP=1159;ReadPosRankSum=0.899;SC=CTCCTCCCTGGAAGCCCCCCA;SOR=1.028;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=176;TCF=40;TCR=136;TR=62;WE=240083536;WS=240083518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,61:0.34:179
chr2	240083731	rs3828216	C	T	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.849;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=229;ReadPosRankSum=0.472;SC=GACTCCTGGGCGAGGGGGCGC;SOR=0.153;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=18;WE=240083739;WS=240083721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,17:0.32:53
chr2	240085403	rs11124182	C	A	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=581;SC=TCCCTGCCTCCGGTGAAGAGC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=240085411;WS=240085393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	240085674	rs13010577	C	T	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=0.501;SC=CCTACAGCAGCAATGCAGGGC;SOR=0.593;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=9;WE=240085682;WS=240085664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr2	240111477	rs531993	A	T	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=65;ReadPosRankSum=0.703;SC=AGTCACCGGGAGTTGAGGGTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=240111485;WS=240111467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr2	240111870	rs74761897	CG	C	203.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.849;NF=0;NR=10;PP=127;ReadPosRankSum=1.845;SC=CTTCACGGGGCGGGGGGGGGG;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=10;WE=240111878;WS=240111860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr2	240273360	rs62182143	C	T	7138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=141;NR=86;PP=2965;SC=CAGACAAAGACGATTCCACCC;SOR=1.349;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=227;TCF=141;TCR=86;TR=227;WE=240273368;WS=240273350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr2	240323661	rs1709851	C	A	4207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=42;PP=2965;SC=TGTTGAGTTACAGGTCGGCCC;SOR=1.591;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=84;TCR=42;TR=126;WE=240323669;WS=240323651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
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chr2	240500173	rs10187580	T	C	3612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=20;PP=2850;ReadPosRankSum=-0.766;SC=CCCTGTCGTCTGCAAGCTGGA;SOR=1.716;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=110;TCF=90;TCR=20;TR=109;WE=240500181;WS=240500163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,114:0.99:115
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chr2	240500437	rs10180205	C	T	6593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.875;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=118;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.822;SC=TCTTGGATGCCGTCCGATTGC;SOR=0.858;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=198;TCF=79;TCR=119;TR=196;WE=240500445;WS=240500427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,204:1.00:205
chr2	240504878	rs6719279	C	T	3573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=73;PP=2741;SC=GGTAGCCATTCTAGTCATAGT;SOR=1.695;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=34;TCR=73;TR=107;WE=240504886;WS=240504868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr2	240701886	rs10189627	T	C	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=4.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.07;ReadPosRankSum=-0.145;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr2	240721384	rs2898872	C	A	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.240;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=226;ReadPosRankSum=-0.101;SC=TGAATTGACTCCTGCTTGGCC;SOR=0.438;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=65;TCF=48;TCR=17;TR=17;WE=240721392;WS=240721374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,17:0.26:66
chr2	240834539	rs13419982	C	A	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.327;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=323;ReadPosRankSum=0.758;SC=TCTTCCTTATCCCCACCATCC;SOR=0.013;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=54;TCF=50;TCR=4;TR=18;WE=240834547;WS=240834529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,18:0.35:52
chr2	240900607	rs138479490	TG	T	705.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.518;NF=13;NR=14;PP=672;ReadPosRankSum=-0.914;SC=CCGGCAGCTGTGGGGGAAAAA;SOR=0.663;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=95;TCF=48;TCR=47;TR=27;WE=240900615;WS=240900597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,33:0.31:107
chr2	240909304	rs34036698	CAG	C	1122.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.923;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.487;NF=0;NR=27;PP=993;ReadPosRankSum=0.449;SC=AACAAATGGACAGAGTCACAG;SOR=1.613;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=94;TCF=7;TCR=87;TR=27;WE=240909313;WS=240909294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,33:0.32:104
chr2	240921463	rs4149551	C	T	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=433;ReadPosRankSum=-0.197;SC=CTAATAGTCACACGTTCTGTG;SOR=0.416;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=52;TCR=0;TR=22;WE=240921471;WS=240921453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,22:0.42:53
chr2	240923050	rs1530144	C	T	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.519;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=550;ReadPosRankSum=-0.338;SC=GTCAGGGCCACGGTGCCAGGC;SOR=0.618;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=132;TCF=64;TCR=68;TR=37;WE=240923058;WS=240923040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,39:0.29:136
chr2	240923146	rs6716293	TC	CT	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=1148;ReadPosRankSum=0.783;SC=TAGAGAAACATCGGGCAACCC;SOR=0.653;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=83;TCF=13;TCR=70;TR=25;WE=240923155;WS=240923136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,27:0.32:85
chr2	240946766	rs13848	T	C	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=151;ReadPosRankSum=-0.962;SC=TTGCAGAATATTGTAAAACCT;SOR=0.534;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=11;WE=240946774;WS=240946756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr2	240954110	rs2289407	A	G	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.528;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=19;PP=1201;ReadPosRankSum=-0.552;SC=GTGCTGATCTACATTCAAAAT;SOR=1.099;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=217;TCF=143;TCR=74;TR=67;WE=240954118;WS=240954100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,65:0.30:220
chr2	240958129	rs4149540	C	T	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=166;ReadPosRankSum=-0.479;SC=TCACTGCATTCCAGAGAAAAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=10;WE=240958137;WS=240958119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr2	240961728	rs2083411	T	C	1879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.015;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=43;PP=1472;ReadPosRankSum=-0.144;SC=CATAGCGCAGTTTGCACTGCA;SOR=0.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=268;TCF=123;TCR=145;TR=78;WE=240961736;WS=240961718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,82:0.30:272
chr2	240961852	rs7596788	A	G	1098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.927;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=37;PP=767;ReadPosRankSum=0.992;SC=GAAACCTCTTAGTGATAAAAA;SOR=0.314;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=130;TCF=18;TCR=112;TR=44;WE=240961860;WS=240961842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,48:0.35:137
chr2	240969312	rs10187574	A	G	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=2.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.91;MQRankSum=-0.481;QD=7.89;ReadPosRankSum=-1.158;SOR=0.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,28:0.33:85
chr2	240969483	rs145620667	G	A	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.84;MQRankSum=-0.210;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.469;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr2	240981179	rs6731916	T	C	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=382;ReadPosRankSum=1.048;SC=TTGTCTCTGGTTCAAAAATGT;SOR=0.245;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=18;WE=240981187;WS=240981169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr2	240981375	rs6732185	T	A	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.504;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=535;ReadPosRankSum=0.343;SC=ATGAAGAGACTTGGATGAAGA;SOR=0.338;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=93;TCF=27;TCR=66;TR=28;WE=240981383;WS=240981365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,33:0.34:97
chr2	240982116	.	C	A	225	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=55.35;NF=3;NR=5;PP=225;QD=32.4714015684;SC=GACGAAGGGCCGTGGGTGAAG;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=8;WE=240982124;WS=240982106;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,8:0.44:18
chr2	240982228	rs10439373	C	T	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.508;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.695;NF=2;NR=4;PP=55;ReadPosRankSum=-0.629;SC=GATGAAGGGCCGTGGGTGAAG;SOR=1.144;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=6;WE=240982236;WS=240982218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr2	240984833	rs13389099	C	G	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.546;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.862;NF=37;NR=17;PP=1120;ReadPosRankSum=0.501;SC=GGGTGATGTGCGCATATGACA;SOR=0.537;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=129;TCF=92;TCR=37;TR=54;WE=240984841;WS=240984823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,56:0.42:134
chr2	240985099	rs150098707	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.95;MQRankSum=0.693;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.000;SOR=1.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr2	240985511	rs10933560	A	G	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.567;NF=0;NR=8;PP=141;ReadPosRankSum=-3.706;SC=TGGGAGCTGCAGGCCTACAAA;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=8;WE=240985519;WS=240985501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr2	241079884	rs508944	A	T	981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=37;PP=1106;SC=GCATGGATTTAAAAAAAAAAT;SOR=3.967;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=42;WE=241079892;WS=241079874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	241375527	rs2352823	C	T	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=9;PP=270;SC=GCGCCGGGAACCCGGGCCTGG;SOR=1.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=241375535;WS=241375517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	241390516	rs3828336	C	T	3173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.265;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=48;PP=2454;ReadPosRankSum=0.386;SC=GGTGAGCGGCCGAGTTCCTTT;SOR=0.157;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=161;TCF=102;TCR=59;TR=111;WE=241390524;WS=241390506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,113:0.68:165
chr2	241392491	rs4268920	A	G	168.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=5;NR=1;PP=105;SC=CCTCTCCCGCAGCGCCACCGT;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=241392499;WS=241392481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr2	241395353	rs12695019	A	G	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=1;PP=419;SC=GGCCGCCTCGATCCAGCCTGC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=241395361;WS=241395343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	241395503	rs2292832	T	C	1106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=24;PP=815;SC=CTGGGGCAGCTGGAACAACGC;SOR=1.292;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=38;WE=241395511;WS=241395493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	241401566	rs35971355	G	A	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=7;PP=630;SC=CTGCCACGGCGGGGGAAACAT;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=26;WE=241401574;WS=241401556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	241403955	rs3830536	GTGACGCCTGCGTGTGCGTGTCAACGCCTGTGTGCGCGCGT	G	5952.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=6;PP=2967;SC=TGCACACGTGGTGACGCCTGC;SOR=3.209;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=29;WE=241404002;WS=241403945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr2	241404213	rs41266965	T	C	3564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=78;PP=2755;ReadPosRankSum=-1.207;SC=GTCCTGGATGTGGCCCCATTG;SOR=1.292;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=47;TCR=79;TR=124;WE=241404221;WS=241404203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,124:0.98:126
chr2	241404317	rs2229458	C	T	2316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=47;PP=1853;SC=CCCAGGGCCCCGGGCCTGAGG;SOR=1.426;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=26;TCR=47;TR=73;WE=241404325;WS=241404307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr2	241405400	rs10700206	C	CGTG	1074.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=3;PP=931;SC=TCACCTGGCACGGGCCCTTAC;SOR=2.925;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=19;WE=241405408;WS=241405398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr2	241405485	rs2228330	C	T	2104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=15;PP=1640;SC=GTGACGACGGCAGCGGCTCGG;SOR=2.472;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=52;TCR=15;TR=66;WE=241405493;WS=241405475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr2	241405528	rs2228331	A	G	2497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=28;PP=2033;SC=TGACCTCTGCAGCCGGAAGGT;SOR=1.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=56;TCR=28;TR=84;WE=241405536;WS=241405518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr2	241465261	rs35186665	G	A	2921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.632;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=68;PP=2128;ReadPosRankSum=0.192;SC=CGTTGTGGCAGTGAGTCTGGA;SOR=0.808;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=161;TCF=58;TCR=103;TR=105;WE=241465269;WS=241465251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,111:0.66:167
chr2	241465361	rs68048482	T	C	963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=5.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.915;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=32;PP=824;ReadPosRankSum=-0.010;SC=GAGGCCACCCTATGGCAGGGC;SOR=0.195;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=56;TCF=2;TCR=54;TR=34;WE=241465369;WS=241465351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,33:0.60:55
chr2	241492255	rs4676428	G	T	3151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.156;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=34;PP=2499;ReadPosRankSum=-1.280;SC=CCCCAGGACCGAAATATCTTT;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=167;TCF=114;TCR=53;TR=111;WE=241492263;WS=241492245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,113:0.66:172
chr2	241492528	rs10933614	A	T	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.333;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=32;PP=838;ReadPosRankSum=-0.558;SC=ACCTGACGGGATGCCCTTGAG;SOR=0.126;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=52;TCF=4;TCR=48;TR=36;WE=241492536;WS=241492518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,36:0.68:53
chr2	241496567	rs7609147	A	G	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.899;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=2;PP=929;ReadPosRankSum=0.007;SC=CCTGGGCCCCAGGTCAGGGTC;SOR=2.241;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=76;TCF=71;TCR=5;TR=51;WE=241496575;WS=241496557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,51:0.67:76
chr2	241512470	rs2001823	G	T	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=5.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=567;ReadPosRankSum=1.279;SC=CTCCCCGGCCGGGGCTATGGG;SOR=0.730;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=56;TCF=49;TCR=7;TR=27;WE=241512478;WS=241512460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,31:0.51:61
chr2	241531737	rs2975762	A	G	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=298;ReadPosRankSum=0.635;SC=ACCTTCCCCTACTGTCCTCTT;SOR=0.495;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=14;WE=241531745;WS=241531727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr2	241533845	rs2975763	T	C	1398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=1;PP=1207;SC=GGCACGGGGTTGCTGGCAGGA;SOR=6.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=42;TCR=1;TR=43;WE=241533853;WS=241533835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr2	241534188	rs70961719	A	T	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.709;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=26;PP=612;ReadPosRankSum=0.316;SC=GAGGCTGGGCAGGTGCCTGGG;SOR=3.056;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=27;WE=241534196;WS=241534178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr2	241534381	.	A	G	638	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=25;NR=2;PP=638;QD=24.9174523166;SC=TGAGGCCACCATGGCGGGAGG;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=241534389;WS=241534380;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr2	241534583	rs143463073	C	T	1575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.650;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=35;PP=1233;ReadPosRankSum=-1.045;SC=TGTACATTGCCGTCCTGCAGA;SOR=0.674;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=193;TCF=100;TCR=93;TR=68;WE=241534591;WS=241534573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,67:0.35:189
chr2	241537421	rs3749166	G	A	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.793;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=11;PP=713;ReadPosRankSum=-0.508;SC=TCCTGCCTGCGGGCACCTACA;SOR=0.803;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=119;TCF=87;TCR=32;TR=44;WE=241537429;WS=241537411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,43:0.36:121
chr2	241537617	rs58715822	TC	T	336.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.716;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=400;ReadPosRankSum=1.438;SC=CCCCTATCTGTCCTGGCAGAC;SOR=0.690;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=48;TCF=26;TCR=22;TR=13;WE=241537625;WS=241537607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,14:0.28:50
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chr2	241538229	rs2975767	A	G	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=19;PP=612;SC=CCCTGCCAGGAGGCTGCGGCC;SOR=4.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=20;WE=241538237;WS=241538219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr2	241555991	rs1509	G	T	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=483;ReadPosRankSum=0.676;SC=CTGCCAGGGGGCTCATGATAT;SOR=0.608;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=63;TCF=11;TCR=52;TR=24;WE=241555999;WS=241555981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,23:0.36:64
chr2	241558397	rs6437353	G	A	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.113;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=421;ReadPosRankSum=-1.581;SC=ACTCCACACCGTGGCAGTGAA;SOR=1.029;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=72;TCF=49;TCR=23;TR=27;WE=241558405;WS=241558387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,29:0.39:75
chr2	241558547	rs7582275	G	A	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.351;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=162;ReadPosRankSum=-0.501;SC=GGGGGTTTGTGCCACCTTAGA;SOR=0.967;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=12;WE=241558555;WS=241558537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr2	241569329	rs2975785	A	G	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.847;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=6;PP=704;ReadPosRankSum=-0.698;SC=CCCCCTGCTCACTCTCTGCTG;SOR=1.360;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=61;TCF=50;TCR=11;TR=40;WE=241569337;WS=241569319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,41:0.64:64
chr2	241570249	rs3749172	A	C	2411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-8.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.978;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=85;PP=1776;ReadPosRankSum=0.959;SC=CGTGGCTCCCAGTGCTAAGGC;SOR=1.456;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=158;TCF=29;TCR=129;TR=100;WE=241570257;WS=241570239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,103:0.64:162
chr2	241570391	rs2975786	A	G	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=135;ReadPosRankSum=1.128;SC=AAGGAGCCCGAGATCAGCCCT;SOR=0.223;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=9;WE=241570399;WS=241570381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr2	241621869	rs74882485	G	A	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.72;QD=31.38;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr2	241621943	rs371806447	G	C	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.074;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.816;NF=18;NR=11;PP=476;ReadPosRankSum=-2.550;SC=GAGACTCCTCGGCCATGAGGA;SOR=0.333;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=42;TCF=27;TCR=15;TR=29;WE=241621951;WS=241621933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr2	241622209	rs4081908	T	C	1790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=32;PP=1568;SC=TCACAGAGGGTGAAGGTGGCA;SOR=0.758;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=69;TCF=36;TCR=33;TR=68;WE=241622217;WS=241622199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr2	241627928	rs1560619	A	G	3159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=59;PP=2614;SC=TGCACAGGACAGGTAGGCAGA;SOR=0.921;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=48;TCR=59;TR=107;WE=241627936;WS=241627918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr2	241631267	rs71428453	A	G	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=2;PP=710;SC=TGTGGGAACCAGCCAGCTCCT;SOR=4.548;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=32;WE=241631275;WS=241631257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr2	241631413	rs71428454	T	G	2534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=52;PP=1893;SC=TCCAAGGCCCTGCTCCCAGTG;SOR=1.638;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=27;TCR=52;TR=79;WE=241631421;WS=241631403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr2	241631476	rs4328629	C	G	1532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=29;PP=1222;SC=GCAGCTCGGGCCCTGCTGCCT;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=47;WE=241631484;WS=241631466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr2	241631839	rs202017172	G	A	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=26.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	241631886	rs375751722	C	G	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	241631901	rs372417168	C	T	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	241659368	rs6437368	C	A	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=386;SC=GAAGTGCTGCCCACTGCAGGC;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=241659376;WS=241659358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr2	241663019	rs2043252	C	T	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=47;ReadPosRankSum=-0.253;SC=TGATGGGTGGCTGCTCCTCCC;SOR=0.105;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=4;WE=241663027;WS=241663009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr2	241674222	rs3755533	T	C	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=35;PP=785;ReadPosRankSum=-0.535;SC=GGGAGCGGGGTGGGGGACAGG;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=8;TCR=48;TR=41;WE=241674230;WS=241674212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,42:0.70:60
chr2	241680633	rs4414678	G	T	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=1;PP=763;SC=GTCCCTCTCCGCGCACCCCCC;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=241680641;WS=241680623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	241680802	rs56024577	G	A	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.776;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=316;ReadPosRankSum=-1.030;SC=GCACTGTAGGGACAGGAGGGA;SOR=1.568;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=20;WE=241680810;WS=241680792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,20:0.32:63
chr2	241683599	rs370117548	C	T	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=310;ReadPosRankSum=-0.014;SC=GCTGGGCCCACGTCTGCCCAG;SOR=0.737;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=16;WE=241683607;WS=241683589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr2	241684660	rs1529665	T	C	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=388;ReadPosRankSum=-0.438;SC=CAGCTGTAAATCCATCAAGGG;SOR=0.622;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=15;WE=241684668;WS=241684650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr2	241696840	rs10594016	ATCC	A	1246.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.480;QD=25.44;ReadPosRankSum=1.539;SOR=0.988;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,33:0.67:49
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chr2	241708675	rs2288753	C	T	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=322;ReadPosRankSum=-0.833;SC=GCTTCCAGCACTGGCCTCAGC;SOR=1.708;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=14;WE=241708683;WS=241708665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,17:0.85:20
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chr2	241728843	rs2288745	C	T	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=29;PP=740;ReadPosRankSum=-1.445;SC=CCAGACAAGCCAGGCCCCCAA;SOR=0.883;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=56;TCF=10;TCR=46;TR=35;WE=241728851;WS=241728833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,35:0.62:56
chr2	241737017	rs10167412	C	A	1362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.102;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=10;PP=1045;ReadPosRankSum=0.468;SC=GACCATGGCCCCCAGCAACCC;SOR=0.554;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=75;TCF=60;TCR=15;TR=48;WE=241737025;WS=241737007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,50:0.62:80
chr2	241808825	rs140694338	AGGCCTCCCT	A	547.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.969;NF=0;NR=12;PP=2796;ReadPosRankSum=0.599;SC=CCATCCTTCAAGGCCTCCCTG;SOR=0.922;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=12;WE=241808841;WS=241808815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr2	241810957	rs10196315	C	T	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.758;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=532;ReadPosRankSum=0.233;SC=TCCTTCTGCCCCTGGTCCCCA;SOR=1.863;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=22;WE=241810965;WS=241810947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,22:0.79:28
chr2	241812566	rs12997245	G	A	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.777;NF=1;NR=19;PP=448;ReadPosRankSum=0.664;SC=CCGATGCTGCGGATTCGGCCC;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=20;WE=241812574;WS=241812556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr2	241815307	rs12478859	CA	TG	5712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=22;PP=2947;SC=CATCTGCCCCCAACCCTGCCC;SOR=2.340;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=123;TCF=93;TCR=30;TR=107;WE=241815316;WS=241815297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr2	241815473	rs12695032	G	A	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=42;PP=1111;ReadPosRankSum=1.324;SC=CTGGATTGTCGAGGGCGCGGC;SOR=0.610;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=70;TCF=7;TCR=63;TR=47;WE=241815481;WS=241815463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,48:0.66:73
chr2	241816545	rs6732985	C	T	1897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.720;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=6;PP=1579;ReadPosRankSum=-0.364;SC=AGCAGTGCTGCGGAGGATGCC;SOR=0.275;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=97;TCF=90;TCR=7;TR=68;WE=241816553;WS=241816535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,68:0.68:100
chr2	241818279	rs4273214	C	A	1997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=39;PP=1479;ReadPosRankSum=0.297;SC=ACACACCTGTCCCATGCCCAC;SOR=0.717;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=40;TCR=52;TR=69;WE=241818287;WS=241818269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,74:0.76:97
chr2	241827618	rs6707763	T	C	90.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=63;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GCTGCTGACCTGGGAGAGAAT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=241827626;WS=241827608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr2	241827696	rs4675869	A	G	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=331;ReadPosRankSum=0.924;SC=AGGCCCCCGCAGCCAGCACCC;SOR=0.495;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=19;WE=241827704;WS=241827686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,19:0.86:22
chr2	241828012	rs6708304	T	C	1741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.997;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=46;PP=1253;ReadPosRankSum=-0.008;SC=CGCCCTGCAGTTCTGCCCAGT;SOR=0.952;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=21;TCR=75;TR=59;WE=241828020;WS=241828002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,62:0.64:97
chr2	241828034	rs6707568	A	G	3089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=60;PP=1754;SC=CTCGGGCGCCAGGAAGAGCAC;SOR=2.484;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=19;TCR=60;TR=79;WE=241828042;WS=241828024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr2	241830944	rs10171053	G	T	2346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.933;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=15;PP=1317;ReadPosRankSum=-1.061;SC=TGACCAGGAGGGTGCGCCTAC;SOR=0.286;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=88;TCF=69;TCR=19;TR=62;WE=241830952;WS=241830934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,60:0.68:88
chr2	241830969	rs10171067	G	A	3242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.623;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=26;PP=1988;ReadPosRankSum=0.565;SC=AGAGCTGGGCGCTGGCCGGCA;SOR=0.551;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=134;TCF=98;TCR=36;TR=92;WE=241830977;WS=241830959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,94:0.68:138
chr2	241831005	rs10195453	C	T	3478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=40;PP=2729;ReadPosRankSum=1.452;SC=GGCTGAGGATCCTTCTCAAGC;SOR=0.680;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=179;TCF=122;TCR=57;TR=123;WE=241831013;WS=241830995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,125:0.68:184
chr2	241831264	rs6737320	G	A	3597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.536;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=87;PP=2898;ReadPosRankSum=1.085;SC=CTGCCAACTTGGCCCCTGCCC;SOR=1.096;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=198;TCF=69;TCR=129;TR=127;WE=241831272;WS=241831254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,131:0.65:201
chr2	241831296	rs6709469	C	G	2835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=71;PP=2275;ReadPosRankSum=1.052;SC=TCACCTGCAGCCCTCTCTGCT;SOR=0.659;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=44;TCR=110;TR=99;WE=241831304;WS=241831286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,103:0.64:160
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chr2	241834770	rs4293565	A	G	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=41;ReadPosRankSum=0.253;SC=CACACACAGAAGACAGTCGCC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=241834778;WS=241834760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
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chr2	241872597	rs4441463	A	G	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=690;ReadPosRankSum=-0.357;SC=GCCAGTCTCCAGGAGCAGCTG;SOR=0.558;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=37;WE=241872605;WS=241872587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,36:0.72:50
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chr2	241898824	rs10169006	A	G	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.162;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=704;ReadPosRankSum=1.064;SC=GAGAGCCTCCAGGACCTAGCG;SOR=1.132;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=61;TCF=27;TCR=34;TR=35;WE=241898832;WS=241898814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,36:0.58:62
chr2	241898947	rs10179839	G	T	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=7;PP=196;ReadPosRankSum=0.672;SC=GAGTGGGGGTGCCAGGAGGAA;SOR=0.293;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=10;WE=241898955;WS=241898937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
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chr2	241904781	rs12467536	C	T	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.036;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=233;ReadPosRankSum=-0.336;SC=CCTGTCCGTGCGGCCCCACGC;SOR=1.122;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=18;TCF=10;TCR=8;TR=10;WE=241904789;WS=241904771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr2	241905779	rs12466789	A	G	1272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.955;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=27;PP=1002;ReadPosRankSum=0.887;SC=CGTGCAGGACATCCTGCGGGA;SOR=0.846;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=75;TCF=36;TCR=39;TR=50;WE=241905787;WS=241905769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,51:0.65:78
chr2	241905885	rs183897720	A	G	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.291;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=299;ReadPosRankSum=-1.666;SC=CTCTGGGAAGAACACCTGCTG;SOR=0.160;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=15;WE=241905893;WS=241905875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr2	241922430	rs4577273	T	C	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.427;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=457;ReadPosRankSum=-0.339;SC=GAGGTATCGCTGGAGCCCCTG;SOR=1.993;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=29;WE=241922438;WS=241922420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr2	241973309	rs377138641	G	A	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=396;ReadPosRankSum=0.493;SC=GAGTGCAGTCGGTGCTCTGTG;SOR=0.948;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=58;TCF=3;TCR=55;TR=21;WE=241973317;WS=241973299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr2	241974289	rs2074822	G	A	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.884;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=108;ReadPosRankSum=-0.175;SC=CACCTCAGGCGTGTGAAACTA;SOR=0.160;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=241974297;WS=241974279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr2	241976615	rs34203344	CG	C	1076.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=60.08;MQRankSum=1.414;NF=25;NR=11;PP=1074;ReadPosRankSum=1.720;SC=ACTCCTCATCCGGGTTCCCGC;SOR=0.377;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=124;TCF=94;TCR=30;TR=36;WE=241976623;WS=241976605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,42:0.34:124
chr2	241979550	rs7571117	T	C	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.731;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=471;ReadPosRankSum=0.174;SC=AGGTGGAGAATGGCTCTGCGG;SOR=1.058;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=129;TCF=45;TCR=84;TR=36;WE=241979558;WS=241979540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,34:0.26:133
chr2	241991029	rs10206324	A	G	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.741;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=146;ReadPosRankSum=-0.303;SC=CCCCTGCTGCAGCCAGGCCCC;SOR=0.330;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=12;WE=241991037;WS=241991019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr2	242002828	rs7581709	C	T	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=6;PP=672;ReadPosRankSum=0.953;SC=GGAGGTGGCACGCCTCCCGAG;SOR=0.612;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=121;TCF=103;TCR=18;TR=43;WE=242002836;WS=242002818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,42:0.35:121
chr2	242003558	rs34771867	T	C	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=1.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-1.833;QD=2.69;ReadPosRankSum=-0.853;SOR=0.992;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,14:0.22:63
chr2	242004199	rs2286319	G	C	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.941;NF=25;NR=8;PP=542;ReadPosRankSum=1.519;SC=GAGCAAGGGCGGGGCTGGAGC;SOR=0.744;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=100;TCF=75;TCR=25;TR=33;WE=242004207;WS=242004189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,33:0.31:106
chr2	242004219	rs11464431	T	TG	5467.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=74;NR=42;PP=2957;SC=CAGGGACCCCTGCCACGCCCC;SOR=1.561;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=122;TCF=80;TCR=42;TR=116;WE=242004227;WS=242004209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr2	242007465	.	AC	A	140	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=6;PP=140;QD=28.8333333333;SC=TGTGGACTGTACCACCTGCCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=6;WE=242007475;WS=242007455;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,6:0.32:19
chr2	242009273	rs13000549	G	T	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.84;ReadPosRankSum=0.204;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,5:0.13:38
chr2	242011151	rs6760731	A	G	1454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=13;PP=1155;SC=TGCCCCACCCATCGGCCCCAT;SOR=1.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=48;WE=242011159;WS=242011141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr2	242011330	rs6746124	C	A	2109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=46;PP=1665;ReadPosRankSum=0.410;SC=CTTGGTGGCCCACCCTCGTCC;SOR=0.724;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=206;TCF=96;TCR=110;TR=87;WE=242011338;WS=242011320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,89:0.42:212
chr2	242021000	rs140631844	A	ATCAGG	1903.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=1.319;QD=14.10;ReadPosRankSum=0.645;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,50:0.37:135
chr2	242021216	rs2302045	G	A	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.421;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=31;PP=691;ReadPosRankSum=-0.858;SC=TCGGTAAGTCGGGGCTTGGCC;SOR=0.135;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=106;TCF=10;TCR=96;TR=36;WE=242021224;WS=242021206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,40:0.36:111
chr2	242021742	rs2108485	G	T	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.449;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=551;ReadPosRankSum=1.357;SC=CGAGACAAAGGCCTTTCCAGT;SOR=0.564;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=134;TCF=66;TCR=68;TR=39;WE=242021750;WS=242021732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,42:0.30:141
chr2	242026608	rs4035	A	G	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.558;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=208;ReadPosRankSum=0.656;SC=TTACTGTACCACAATAAATTT;SOR=0.034;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=15;WE=242026616;WS=242026598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr2	242027926	rs2067987	T	A	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=186;ReadPosRankSum=0.533;SC=TCAGCACTGCTAAAGGAAGCG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=10;WE=242027934;WS=242027916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr2	242033696	rs57117519	T	C	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=124;ReadPosRankSum=0.109;SC=GCTCACCTCCTGCACCTCCCC;SOR=0.859;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=7;WE=242033704;WS=242033686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr2	242035544	rs2240539	G	C	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.658;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=686;ReadPosRankSum=1.095;SC=TCCTCATCCAGACTTGCCCTT;SOR=0.935;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=130;TCF=68;TCR=62;TR=38;WE=242035552;WS=242035534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,40:0.31:130
chr2	242038726	rs149977848	G	A	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=399;ReadPosRankSum=1.910;SC=CTGACCTCAAGTGATCTGCCT;SOR=0.242;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=63;TCR=0;TR=21;WE=242038734;WS=242038716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,22:0.34:65
chr2	242039198	rs3796093	T	C	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.716;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=25;PP=875;ReadPosRankSum=0.170;SC=TTGGAGGCTGTAGTCAGTTTG;SOR=0.823;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=107;TCF=51;TCR=56;TR=45;WE=242039206;WS=242039188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,47:0.42:111
chr2	242047530	rs34777851	G	T	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.810;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=13;PP=826;ReadPosRankSum=0.005;SC=AAAAAAAGTGGCTGGTCTCTA;SOR=1.298;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=166;TCF=109;TCR=57;TR=47;WE=242047538;WS=242047520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,49:0.28:173
chr2	242047750	rs6708265	A	G	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.375;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=490;ReadPosRankSum=0.425;SC=ACGCCACGGCACTCAGCGCAG;SOR=1.112;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=70;TCF=10;TCR=60;TR=26;WE=242047758;WS=242047740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,27:0.40:68
chr2	242062117	rs2302048	G	A	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.386;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=7;PP=779;ReadPosRankSum=2.666;SC=AGTGGTGCCCGGCGCCACTCC;SOR=1.227;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=127;TCF=99;TCR=28;TR=42;WE=242062125;WS=242062107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,41:0.33:123
chr2	242062410	rs2302051	C	A	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=46;ReadPosRankSum=0.627;SC=AGCAGCCGCCCGAGGCAGGTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=5;WE=242062418;WS=242062400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr2	242063350	rs13385610	T	C	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.756;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=197;ReadPosRankSum=1.208;SC=CAGGCATTGATTGCAAATACC;SOR=0.330;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=12;WE=242063358;WS=242063340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr2	242063448	rs2302052	G	A	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.058;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=337;ReadPosRankSum=-1.810;SC=GGGTCCTGGCGGCTGAGTCGC;SOR=0.876;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=50;TCF=27;TCR=23;TR=19;WE=242063456;WS=242063438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
chr2	242065624	rs2240541	A	G	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.717;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=142;ReadPosRankSum=-0.725;SC=GCCGTAAGCCATCTCGATGGT;SOR=1.483;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=61;TCF=36;TCR=25;TR=16;WE=242065632;WS=242065614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,17:0.26:65
chr2	242066314	rs2240542	T	C	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=579;ReadPosRankSum=-0.244;SC=CCAGGGCTCCTGCAAGGCTCA;SOR=0.671;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=128;TCF=73;TCR=55;TR=40;WE=242066322;WS=242066304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,41:0.31:131
chr2	242066830	rs2240544	G	A	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.779;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=33;PP=816;ReadPosRankSum=0.850;SC=CCTGTTCACCGTGCACTGGCA;SOR=0.794;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=138;TCF=35;TCR=103;TR=43;WE=242066838;WS=242066820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,44:0.30:147
chr2	242072280	rs11684830	G	A	2951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=18;PP=2526;ReadPosRankSum=1.019;SC=CTCCCACCAAGGGACTTACCC;SOR=1.445;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=70;TCR=18;TR=87;WE=242072288;WS=242072270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,90:0.99:91
chr2	242077496	rs1470414	C	T	3708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=77;PP=2845;ReadPosRankSum=-0.859;SC=CATGACGTGACGGTGCCCTGG;SOR=0.534;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=44;TCR=78;TR=120;WE=242077504;WS=242077486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,124:0.99:125
chr2	242079007	rs2074828	A	G	5891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=123;PP=2965;SC=ACTGCAAAACATTAGTGAAGC;SOR=1.333;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=198;TCF=75;TCR=123;TR=198;WE=242079015;WS=242078997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr2	242082222	rs2074834	C	A	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=334;SC=TTTCCACGCGCTAAGGCCTGC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=242082230;WS=242082212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr2	242082262	rs6709462	T	C	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=2;PP=547;SC=CAGAGAGCGCTGTCCTGCTCT;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=242082270;WS=242082252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr2	242082480	rs758068	A	C	1679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=35;PP=1364;SC=CAAGCTTCCAACTCTAACAAC;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=54;WE=242082488;WS=242082470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr2	242082559	rs2066941	T	C	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=543;SC=CCAACTAATTTATAATGCTGA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=242082567;WS=242082549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr2	242088921	rs3806599	A	C	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=4;PP=751;SC=CACAGCGACTAGCACCGATTG;SOR=3.767;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=242088929;WS=242088911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr2	242099961	rs2017989	C	T	1757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=45;PP=1502;SC=AGCTAGCGGGCTGTGTGTGGA;SOR=2.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=11;TCR=45;TR=56;WE=242099969;WS=242099951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr2	242121959	rs34186191	G	A	1027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=2;PP=843;SC=ACACCTGCTCGCCATCTTCTG;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=242121967;WS=242121949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr2	242122602	rs1974555	T	G	112.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=0;PP=116;SC=GGCATTCACGTGCTGTCCGAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=242122610;WS=242122600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr2	242135017	.	A	C	525	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=59.44;NF=18;NR=1;PP=525;QD=29.4616427656;SC=GTCCAAGTGCATGGCTCCCCA;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=19;WE=242135025;WS=242135016;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr2	242139491	rs2013250	C	T	4653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=125;NR=18;PP=2965;SC=GAGCCACTGACGTTTCCTTCC;SOR=3.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=125;TCR=18;TR=143;WE=242139499;WS=242139481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr2	242141719	rs2074840	C	T	2476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=63;PP=2012;SC=CCCTGCATGACGTGAGCTCGG;SOR=3.471;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=11;TCR=63;TR=74;WE=242141727;WS=242141709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr2	242142737	rs1179530	T	C	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=2;PP=623;SC=CCACAGGCCGTTCGCCCCCAG;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=242142745;WS=242142727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr2	242142868	rs369123528	C	T	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.090;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=342;ReadPosRankSum=0.783;SC=GGACCACGTGCGCAGGTACTT;SOR=1.086;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=75;TCF=36;TCR=39;TR=25;WE=242142876;WS=242142858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,26:0.32:82
chr2	242157087	rs111770284	C	T	2287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=15;PP=1881;SC=CCGGCCGTGACCCCCTCCCCG;SOR=2.505;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=56;TCR=15;TR=71;WE=242157095;WS=242157077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr2	242157241	rs76832527	G	A	3617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=77;PP=2618;ReadPosRankSum=-0.790;SC=GGCCGAGCGCGCCCAGGACAT;SOR=0.669;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=119;TCF=41;TCR=78;TR=118;WE=242157249;WS=242157231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,119:0.99:120
chr2	242176019	rs2305073	T	C	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.292;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=3;PP=615;ReadPosRankSum=0.968;SC=GGGGGGCACATGGACACATAC;SOR=0.970;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=99;TCF=87;TCR=12;TR=35;WE=242176027;WS=242176009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,35:0.35:100
chr2	242196324	rs11693403	T	C	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=52;ReadPosRankSum=-0.932;SC=TGCTTATTCCTGCCCAGCAGC;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=6;WE=242196332;WS=242196314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr2	242203916	rs11891776	A	C	1161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=25;PP=937;SC=CAGGCTCCAGAGGGTTCCTGG;SOR=1.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=39;WE=242203924;WS=242203906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr2	242206956	rs35334418	C	T	2802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=30;PP=2167;SC=CTCCTAACAGCGACCTTGGTT;SOR=1.408;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=51;TCR=30;TR=81;WE=242206964;WS=242206946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr2	242259614	rs6745662	G	A	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.934;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=362;ReadPosRankSum=0.911;SC=CCTTTTCTCTGTAGAGGCTTG;SOR=2.027;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=73;TCF=58;TCR=15;TR=22;WE=242259622;WS=242259604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,23:0.31:75
chr2	242275579	rs41266959	G	A	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=81;ReadPosRankSum=0.697;SC=TTTATAGATAGTGTTAATGAG;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=7;WE=242275587;WS=242275569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr2	242283071	rs6750169	C	T	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=257;ReadPosRankSum=-0.343;SC=TTGTAGTCAACAGCAATGTGT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=13;WE=242283079;WS=242283061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr2	242283094	rs6707518	A	G	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=503;ReadPosRankSum=-0.145;SC=AGTCTGTGCTAATGTTCTCGT;SOR=0.563;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=46;TCF=42;TCR=4;TR=23;WE=242283102;WS=242283084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
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chr2	242396087	rs2074774	A	T	1405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.634;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=16;PP=988;ReadPosRankSum=2.002;SC=TGGTCAGGAGAGTAGTAGCGG;SOR=0.621;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=221;TCF=173;TCR=48;TR=67;WE=242396095;WS=242396077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,70:0.31:225
chr2	242402062	rs4675811	A	T	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=16.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-1.403;QD=7.67;ReadPosRankSum=1.547;SOR=2.161;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,61:0.33:183
chr2	242407467	rs55764424	C	T	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.464;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=281;ReadPosRankSum=1.277;SC=GATTTCCAGCCGGCACCTGCC;SOR=1.749;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=54;TCR=4;TR=16;WE=242407475;WS=242407457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,16:0.28:58
chr2	242432704	rs2271030	G	C	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.015;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=147;ReadPosRankSum=0.942;SC=ATGCTGTCTTGCAGGATGACT;SOR=0.016;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=11;WE=242432712;WS=242432694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,9:0.24:38
chr2	242433348	rs2018761	A	G	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.281;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=218;ReadPosRankSum=-0.418;SC=TGCTTGTCCCATATCCTGGGT;SOR=0.290;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=19;WE=242433356;WS=242433338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,19:0.38:50
chr2	242447962	rs11555263	G	A	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.624;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=278;ReadPosRankSum=-0.776;SC=CTCCCAGCCCGCGAAGCAACG;SOR=0.126;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=18;WE=242447970;WS=242447952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr2	242523923	rs144402439	C	G	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=516;ReadPosRankSum=0.609;SC=CAGAGGCTCACGGCCACACCC;SOR=1.308;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=22;WE=242523931;WS=242523913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,23:0.79:29
chr2	242542298	rs6437269	T	C	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.385;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=453;ReadPosRankSum=0.989;SC=TCAGCAGGGTTGCACATGGGC;SOR=2.215;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=20;WE=242542306;WS=242542288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr2	242556732	rs7580021	G	A	1782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-6.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=1;PP=1406;ReadPosRankSum=-0.411;SC=TTCTTTTATTGAAATCTCAAC;SOR=1.036;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=81;TCR=1;TR=60;WE=242556740;WS=242556722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,62:0.74:84
chr2	242557019	rs7580246	G	A	2202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=10.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.86;ReadPosRankSum=-1.414;SOR=0.065;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,58:0.71:82
chr2	242557028	rs36043566	G	C	2101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=2.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.02;ReadPosRankSum=-0.125;SOR=0.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,50:0.67:75
chr2	242572846	rs3208142	A	G	3548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.272;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=74;PP=2792;ReadPosRankSum=0.386;SC=GGGTGTGCTTAGAGGAGAAAC;SOR=1.022;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=193;TCF=84;TCR=109;TR=126;WE=242572854;WS=242572836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,128:0.64:200
chr2	242590338	rs35731596	A	G	1829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.088;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=13;PP=1355;ReadPosRankSum=-0.456;SC=TGTTCTCTTCAGCACAGAAAT;SOR=1.002;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=80;TCR=18;TR=70;WE=242590346;WS=242590328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,75:0.72:104
chr2	242593114	rs4567973	A	G	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.619;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=36;PP=1066;ReadPosRankSum=-1.147;SC=AGAGCAGACCACAGGTAAAAC;SOR=1.248;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=80;TCF=24;TCR=56;TR=49;WE=242593122;WS=242593104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,53:0.62:86
chr2	242606036	rs6709768	G	C	4088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=72;PP=2965;SC=TGCTTGGTTAGTGAAAGCATG;SOR=0.949;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=55;TCR=72;TR=127;WE=242606044;WS=242606026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr2	242607483	rs7565540	GC	TT	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=3;PP=1232;SC=AGGCCCTTGGGCCCCCTATGG;SOR=3.611;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=22;WE=242607492;WS=242607473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr2	242610253	rs35454903	T	C	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.260;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=34;PP=606;ReadPosRankSum=0.915;SC=AGACAGGCAGTGGGGCGTGCA;SOR=1.654;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=53;TCF=3;TCR=50;TR=36;WE=242610261;WS=242610243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,38:0.67:57
chr2	242610773	rs7601000	T	A	3789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=80;NR=35;PP=2965;SC=CTGGTGGAGCTGCAGCCTTCA;SOR=1.797;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=80;TCR=35;TR=115;WE=242610781;WS=242610763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr2	242611050	rs1130910	C	G	1335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=36;PP=1055;SC=GCTGCCTGCCCGGGCGCTGTG;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=37;WE=242611058;WS=242611040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr2	242612909	rs1130906	A	G	160.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=3;PP=135;SC=TCGGGGAGCCAGAGATCCCCG;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=242612917;WS=242612903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr2	242613089	rs7943	A	G	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=11;PP=416;SC=CTTGGGCTCCACGTCCGAGTT;SOR=1.127;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=18;WE=242613097;WS=242613079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr2	242613133	rs7740	T	G	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=9;PP=363;SC=GCTGCAGTGGTAATGTGTGGG;SOR=1.473;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=242613141;WS=242613123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr2	242615462	rs5860	T	C	537.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=420;ReadPosRankSum=-0.555;SC=GTCTGGACTCTGCTGGGGACG;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=17;WE=242615470;WS=242615452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr2	242617792	rs4076640	A	G	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=305;SC=TTGCTGACACAACTGTGCCAG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=242617800;WS=242617783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr2	242622192	rs35052478	A	AG	706.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=786;SC=TAGAAAAATTAGCCGGGCGTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=17;WE=242622200;WS=242622182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr2	242625413	rs62191287	A	T	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=383;ReadPosRankSum=0.560;SC=ACTTTACTAAATCTCTAGACA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=0;TCR=60;TR=19;WE=242625421;WS=242625403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,21:0.33:64
chr2	242648545	rs7595652	C	T	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.98;ReadPosRankSum=-0.564;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,16:0.24:68
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chr2	242658779	rs71351113	A	T	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=339;ReadPosRankSum=0.633;SC=GCCGCCCCCAACCCCCCAACA;SOR=1.382;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=19;WE=242658787;WS=242658769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr2	242662761	rs7572153	T	C	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.099;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=388;ReadPosRankSum=-0.093;SC=CAGGAGAAGGTGCTCCATGGC;SOR=2.019;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=22;WE=242662769;WS=242662751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
chr2	242674959	rs62191977	T	G	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.041;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=29;PP=730;ReadPosRankSum=0.732;SC=AGCTGCGGCGTTTCCGCGTCC;SOR=2.076;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=51;TCF=9;TCR=42;TR=33;WE=242674967;WS=242674949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,36:0.65:55
chr2	242680366	rs4073890	A	G	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.758;HP=10;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=613;ReadPosRankSum=1.430;SC=AAAAAAAAAAACTCGCTCTCT;SOR=0.916;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=99;TCF=62;TCR=37;TR=35;WE=242680374;WS=242680345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,34:0.35:98
chr2	242680430	rs4073889	A	G	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.851;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=719;ReadPosRankSum=0.699;SC=GTCTCATAGGATCTTCTTCCT;SOR=0.407;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=100;TCF=38;TCR=62;TR=42;WE=242680438;WS=242680420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,42:0.42:100
chr2	242682029	rs78147778	T	C	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.730;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=27;PP=509;ReadPosRankSum=0.979;SC=GAGTCCCTCCTGGTGCTGGTG;SOR=0.230;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=122;TCF=23;TCR=99;TR=36;WE=242682037;WS=242682019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,37:0.30:125
chr2	242684115	rs4234097	T	C	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.750;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=282;ReadPosRankSum=0.337;SC=TGCTTCTCTTTGCCCCAAGGT;SOR=0.137;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=75;TCF=65;TCR=10;TR=24;WE=242684123;WS=242684105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,26:0.34:77
chr2	242684317	.	G	C	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=0.000;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.860;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=531;ReadPosRankSum=-0.424;SC=TGTGTGCCTTGAGATGGGTGG;SOR=0.812;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=120;TCF=31;TCR=89;TR=34;WE=242684325;WS=242684307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,34:0.27:124
chr2	242684394	rs4675884	G	C	1868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=53;PP=1220;SC=GGGACCCCCCGCCAAGGACAG;SOR=5.211;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=3;TCR=55;TR=56;WE=242684402;WS=242684383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr2	242688203	rs34519321	C	T	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.235;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=784;ReadPosRankSum=0.341;SC=ACTCTCTGGGCGGCAGTGCCA;SOR=0.515;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=171;TCF=117;TCR=54;TR=50;WE=242688211;WS=242688193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,51:0.29:173
chr2	242688292	rs34767042	C	T	1299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.948;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=42;PP=802;ReadPosRankSum=-0.254;SC=ACCTGTGTGCCGCCCGCCTGT;SOR=0.850;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=184;TCF=66;TCR=118;TR=62;WE=242688300;WS=242688282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,65:0.34:193
chr2	242688366	rs35386923	C	T	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-6.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=369;ReadPosRankSum=-2.979;SC=AGGTCTCAGACAGGAGTCACT;SOR=0.575;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=84;TCF=3;TCR=81;TR=24;WE=242688374;WS=242688356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,26:0.30:87
chr2	242688434	rs34077392	T	C	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=344;ReadPosRankSum=1.144;SC=GTGAGGATGGTCCTGGTGTCC;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=5;WE=242688450;WS=242688424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr2	242688442	rs35249772	T	TC	258.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=344;ReadPosRankSum=-1.604;SC=GGTCCTGGTGTCCCTCGTGCT;SOR=1.214;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=7;WE=242688450;WS=242688424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr2	242688672	rs78280775	C	T	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.987;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=4;PP=895;ReadPosRankSum=-0.359;SC=ACATGGTGCTCGGGTCACAGG;SOR=0.327;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=144;TCF=134;TCR=10;TR=47;WE=242688680;WS=242688662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,47:0.31:151
chr2	242688870	rs113047262	T	C	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.461;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=35;PP=658;ReadPosRankSum=1.389;SC=CCTGCAGACATCTCCACTCAG;SOR=1.901;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=128;TCF=11;TCR=117;TR=36;WE=242688878;WS=242688860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,36:0.28:128
chr2	242690675	rs1106639	G	A	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.219;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=36;PP=1023;ReadPosRankSum=-1.694;SC=TCCGTTTTACGTCCTCATCGA;SOR=0.808;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=182;TCF=77;TCR=105;TR=61;WE=242690683;WS=242690665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,61:0.32:191
chr2	242695497	rs62192024	T	C	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.48;ReadPosRankSum=-0.670;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,7:0.18:39
chr2	242707101	rs6756901	A	G	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=274;ReadPosRankSum=-0.638;SC=GCCCAGCCTGACCCATGTGCC;SOR=0.576;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=79;TCF=51;TCR=28;TR=21;WE=242707109;WS=242707091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,21:0.27:77
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chr2	242743651	rs744986	G	A	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=151;ReadPosRankSum=0.397;SC=GGGGAGGCCGGGGATCCTTGC;SOR=0.169;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=10;WE=242743659;WS=242743641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
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chr2	242755465	rs34241734	C	G	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.875;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=324;ReadPosRankSum=1.650;SC=ATTTGGGGTGCAGTGGGTGCG;SOR=0.265;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=14;WE=242755473;WS=242755455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr2	242755599	rs66482163	G	A	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=602;ReadPosRankSum=0.445;SC=TCCTGAGCGCGTTCCCCAGTC;SOR=0.288;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=29;WE=242755607;WS=242755589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,30:0.67:45
chr2	242757334	rs3749152	G	A	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=253;ReadPosRankSum=-1.294;SC=CCCCGACCTCGGGGACCCAGC;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=12;WE=242757342;WS=242757324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr2	242758179	rs2293764	C	T	2648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=22;PP=2139;ReadPosRankSum=-1.706;SC=GCGGCTACTCCGACCTGGCGT;SOR=0.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=114;TCR=35;TR=94;WE=242758187;WS=242758169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,94:0.62:152
chr2	242758203	rs2293763	T	C	3288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.513;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=45;PP=2763;ReadPosRankSum=1.112;SC=TCGGGCCGGCTCCTGAGGGGG;SOR=0.993;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=193;TCF=116;TCR=77;TR=121;WE=242758211;WS=242758193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,120:0.62:192
chr2	242758326	rs2293761	G	A	2031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.975;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=57;PP=1537;ReadPosRankSum=0.401;SC=CCAGCCCCAAGCCGCCCAACC;SOR=1.154;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=115;TCF=34;TCR=81;TR=79;WE=242758334;WS=242758316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,82:0.67:122
chr2	242758475	rs2293759	A	G	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.937;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=473;ReadPosRankSum=1.079;SC=TCTTAGTGCAAGATCCTGTGG;SOR=1.655;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=20;WE=242758483;WS=242758465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr2	242812080	rs4973697	T	C	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.493;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=28;PP=988;ReadPosRankSum=-0.260;SC=CGGCCAGAGGTTGGGGACCCT;SOR=1.469;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=78;TCF=34;TCR=44;TR=44;WE=242812088;WS=242812070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,47:0.58:81
chr2	242813124	rs13016102	T	C	2728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=36;PP=2130;SC=AACTGAATCATAGCCTCTCAC;SOR=0.997;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=50;TCR=36;TR=86;WE=242813132;WS=242813114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr2	242813202	rs28512331	G	A	1610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.98;ReadPosRankSum=-1.078;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,42:0.68:62
chr2	242813205	rs28380696	A	G	1640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.04;ReadPosRankSum=-0.390;SOR=0.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,41:0.65:63
chr2	242813241	rs28392509	C	T	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=542;ReadPosRankSum=-0.163;SC=TCTCCCCAAACCTCTCCTCGC;SOR=1.493;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=26;WE=242813249;WS=242813231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr2	242814027	rs76439282	C	T	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.475;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=41;PP=1567;ReadPosRankSum=-0.176;SC=CAGGTGAGGCCCCCGGGCGAG;SOR=0.353;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=93;TCF=33;TCR=60;TR=67;WE=242814035;WS=242814017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,66:0.70:94
chr2	242814283	rs28499542	C	T	2174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.957;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=35;PP=1650;ReadPosRankSum=1.447;SC=CCACCCCTGGCGACGACCTTG;SOR=0.392;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=107;TCF=64;TCR=43;TR=79;WE=242814291;WS=242814273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,82:0.72:114
chr2	242814360	rs28378061	T	C	2170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.450;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.97;MQRankSum=-0.767;NF=40;NR=38;PP=1685;ReadPosRankSum=0.142;SC=CAGGTGCCCATCGCTGAGGGC;SOR=0.530;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=128;TCF=69;TCR=59;TR=78;WE=242814368;WS=242814350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,80:0.62:129
chr2	242814463	rs28523279	A	T	1889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.678;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=34;PP=1554;ReadPosRankSum=1.560;SC=CTGGGGATTCAGTGGCCATGC;SOR=0.539;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=105;TCF=53;TCR=52;TR=66;WE=242814471;WS=242814453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,67:0.65:103
chr2	243037022	rs147597270	A	T	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.27;MQRankSum=0.878;QD=0.55;ReadPosRankSum=-0.856;SOR=0.450;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,11:0.12:92
chr3	239555	.	CT	C	501.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;QD=18.58;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	367757	rs162734	G	C	3889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=45;PP=2965;SC=CGTGAGTATTGTTTCAAACGA;SOR=1.266;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=72;TCR=45;TR=117;WE=367765;WS=367747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr3	367898	rs9843977	A	T	1900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=55;PP=1526;SC=CAAACAAAAAAAAAATTTGGT;SOR=5.353;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=3;TCR=55;TR=58;WE=367906;WS=367888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	386247	rs3736632	C	T	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=3;PP=632;SC=TGAAAAAATTCTGACTTTTCT;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=24;WE=386255;WS=386237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	391001	rs2272524	G	A	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=1;PP=929;SC=TTTACTTTCCGCTTTTAAAAA;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=391009;WS=390991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	391100	rs13060847	A	G	4375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.40;SOR=2.629;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr3	403288	rs9824311	G	A	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.94;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	403297	rs9839027	C	A	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.45;SOR=6.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	403308	rs9824442	G	A	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=732;SC=GTATGACTAGGACATAGAAAA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=403316;WS=403278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	403345	rs9846775	A	G	1705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=4;PP=1400;SC=TTTCTTCCACAAAAGTTTAAA;SOR=4.875;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=54;TCR=4;TR=58;WE=403353;WS=403335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	404771	rs4684390	C	T	912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=0;PP=775;SC=ATGAAACCCACTGGAACATTT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=404779;WS=404761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	417994	rs930237	A	G	1222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=4;PP=953;SC=TGATTTTGACATGTGACAGAA;SOR=4.174;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=41;WE=418002;WS=417984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	439963	rs6442827	A	G	3566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=39;PP=2965;SC=GACTCACCCAATAGAGGTATT;SOR=1.445;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=70;TCR=39;TR=109;WE=439971;WS=439953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr3	440028	rs6771714	T	C	2618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=56;PP=1980;SC=GGGGCGATAATGATAGCATTT;SOR=1.143;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=94;TCF=36;TCR=58;TR=92;WE=440036;WS=440018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr3	440088	rs6771803	T	A	1825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=46;PP=1427;SC=GAGATTATATTTGGGGAAGTC;SOR=3.422;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=53;WE=440096;WS=440078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	447069	rs11705894	C	T	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=251;SC=TCAATGCTAACACAAATGTCC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=447077;WS=447059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	1320271	rs3732517	G	A	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=551;ReadPosRankSum=0.126;SC=CTTAGGCTCAGTGATCACCTT;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=24;WE=1320279;WS=1320261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,31:0.94:33
chr3	1415195	rs3765098	C	T	220.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=181;SC=TATTTTACTTCCTAAGCACAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=1415203;WS=1415185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	1424718	rs2291101	G	A	1861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.342;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=17;PP=1516;ReadPosRankSum=-0.664;SC=AGGAGAAAGTGTCATCTGTGG;SOR=1.851;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=63;TCF=45;TCR=18;TR=62;WE=1424726;WS=1424708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr3	1424745	rs4684146	C	T	2597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.041;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=22;PP=2078;ReadPosRankSum=0.548;SC=CAAGGTTTGTCTACAGAAATG;SOR=1.654;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=80;TCF=57;TCR=23;TR=79;WE=1424753;WS=1424735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,82:0.99:83
chr3	1427566	rs72997748	C	T	1820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=46;PP=1327;SC=CATTCCCACACCTCATTTCTT;SOR=3.076;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=9;TCR=46;TR=55;WE=1427574;WS=1427556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	1427625	rs9820933	C	T	682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=545;SC=AATATGGATACTTGTTGAAAC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=1427633;WS=1427615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	2777622	rs1554198	A	G	3944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=59;PP=2871;SC=AATACATAGAAGAGAGAAAGG;SOR=0.757;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=59;TCR=59;TR=118;WE=2777630;WS=2777612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr3	3030223	rs13068264	C	A	1295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=33;PP=1059;SC=TGTAATCTACCGAAGTGGCAT;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=36;WE=3030231;WS=3030213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	3076218	rs9845519	G	A	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=3;PP=1030;SC=TGAATGGGTAGATAAATGAAT;SOR=4.514;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=38;WE=3076226;WS=3076208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	3076284	rs6765545	G	C	2477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=16;PP=1838;SC=TGAATACACTGCTCCAATTCT;SOR=2.271;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=53;TCR=16;TR=69;WE=3076292;WS=3076274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	3076401	rs6790908	C	T	2716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=52;PP=2310;ReadPosRankSum=-0.387;SC=GGCCTGACAACCACAGCCCCA;SOR=0.453;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=34;TCR=54;TR=86;WE=3076409;WS=3076391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,86:0.99:87
chr3	3076443	rs6803232	A	G	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=44;PP=1452;SC=CCAGGACTCCATTCTCCGTGG;SOR=2.468;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=13;TCR=45;TR=57;WE=3076451;WS=3076433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	3080527	rs163543	C	T	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=458;SC=AGAGTACTCACTGAAAGTGAG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=3080535;WS=3080517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	3081825	rs339285	T	C	2395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=55;PP=1786;SC=CCTCAGCTGATGCCTCTAGAT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=27;TCR=55;TR=82;WE=3081833;WS=3081815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	3082025	rs4685596	G	T	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=397;SC=ATTGTAGCACGTACAATCAAT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=3082033;WS=3082015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	3084653	rs6800354	C	T	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=0;PP=1044;ReadPosRankSum=2.322;SC=TTCTGTTTATCTTCTTAGGTT;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=39;WE=3084661;WS=3084643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,42:0.93:45
chr3	3115478	rs163897	T	C	1688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=38;PP=1102;SC=AATTGTCAGCTGAATCTAAGA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=55;WE=3115486;WS=3115468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	3133791	rs7647903	G	A	1929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=7;PP=1589;SC=GAGAAAATTAGTCACAATAGA;SOR=3.575;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=52;TCR=7;TR=59;WE=3133799;WS=3133781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	3137155	rs11389765	A	AT	267.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=160;ReadPosRankSum=0.403;SC=AAGATCAGTGATTTTTTTTTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=9;WE=3137163;WS=3137145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr3	3139383	rs334802	C	A	251.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=177;SC=TCCAGCAAAACTCACTGGTGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=3139391;WS=3139374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	3143267	rs6771148	G	C	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=282;SC=GAGTACTTGAGAAGAACGGGT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=3143275;WS=3143257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	3170792	rs334773	C	T	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=18;PP=605;SC=CTGTGCCTTCCGAAGCAGTAT;SOR=1.893;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=25;WE=3170800;WS=3170782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	3170910	rs334772	A	G	252.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=203;SC=TTGGAAACCTATATAAATGGA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=3170918;WS=3170900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	3171460	rs334769	C	T	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=1;PP=744;SC=TGACCTGTTACGTGAAAAAGG;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=3171468;WS=3171450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	3171502	rs334768	C	A	1767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.938;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=14;PP=1373;ReadPosRankSum=-1.698;SC=AAGTGCTTTGCCTGTGTTTCT;SOR=2.287;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=58;WE=3171510;WS=3171492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,59:0.95:62
chr3	3171713	rs113671187	G	GCCTGACT	1082.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=283;SC=TTAGCTAAGTGCCAGTAGCTT;SOR=1.893;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=15;WE=3171721;WS=3171701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	3179262	rs334767	A	T	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=15;PP=452;SC=TATGCCCGTCATAAACCCTGC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=3179270;WS=3179252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	3189059	rs1621648	T	C	274.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=196;SC=GATACTAAAATGGTGGCAAGG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=3189067;WS=3189056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	3189279	rs1705805	A	G	1629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=23;PP=1148;SC=TGAAGATCGCAAAAGAGGAGA;SOR=0.922;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=25;TCR=23;TR=48;WE=3189287;WS=3189269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	3189398	rs1669348	A	G	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=26;PP=955;SC=GTAAGTATATACTAGGCTTGG;SOR=1.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=38;WE=3189406;WS=3189388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	3192524	rs4183	A	ATAAC	1617.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=1392;SC=AATTTGTTAGATAACTTTATC;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=25;WE=3192532;WS=3192514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	3193957	rs1705800	A	C	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=233;SC=GTGCCTCAGCATCCCGAGCAG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=3193965;WS=3193954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	3196273	rs11300080	AT	A	625.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=512;SC=TAAAATACTCATTTTTTTTCA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=23;WE=3196281;WS=3196263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	3197871	rs1705789	T	C	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=0;PP=659;SC=TGGCCTACCATATATAAAGTA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=3197879;WS=3197861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	3215954	rs1669321	A	G	3341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=84;PP=2675;SC=TACTATATAAAAACATATATA;SOR=4.219;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=10;TCR=84;TR=94;WE=3215962;WS=3215944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr3	3217128	rs11332452	AT	A	109.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=75;SC=GTCAGTAGCTATTTTTTTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=5;WE=3217136;WS=3217118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	3221430	rs1672753	C	T	1460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=33;PP=1119;SC=CGAGGGAGGGCCCGTGTCGCG;SOR=2.208;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=45;WE=3221438;WS=3221420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	3886580	rs4685689	A	G	3598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=48;PP=2757;SC=ATAACATCGCAAAGACTGTGG;SOR=1.052;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=68;TCR=48;TR=116;WE=3886588;WS=3886570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr3	3887416	.	G	A	4608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=70;NR=77;PP=2965;SC=CCCAATCTGCGTGAGATCAGT;SOR=0.790;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=70;TCR=77;TR=147;WE=3887424;WS=3887406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr3	3887876	rs2120609	T	C	3764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=55;PP=2955;ReadPosRankSum=2.342;SC=TTAAGGTTAATGGGACCCTTC;SOR=0.976;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=70;TCR=56;TR=124;WE=3887884;WS=3887866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,126:0.98:128
chr3	4047054	rs9846908	T	G	1098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=33;PP=911;ReadPosRankSum=0.629;SC=TTCACATATTTGTCAGTCATA;SOR=5.728;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=33;WE=4047062;WS=4047044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr3	4358210	rs7647539	A	G	1964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=11;PP=1566;SC=CGGTCGTTCGACATTTGAAGC;SOR=2.872;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=44;TCR=11;TR=55;WE=4358218;WS=4358200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	4403837	rs2633852	A	G	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=4;PP=513;SC=GTCAGTCCATAGTGGGCAGGC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=4403845;WS=4403827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	4461569	rs711667	G	A	402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=305;SC=TGAGCAAGGTGCAGTGTTTGG;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=4461577;WS=4461559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	4461698	rs711666	C	T	1539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=24;PP=1311;SC=GCAAAGGGTACCTATTTTGCA;SOR=0.776;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=46;TCF=22;TCR=24;TR=45;WE=4461706;WS=4461688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	4562667	rs1038639	T	G	2085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=7;PP=1734;ReadPosRankSum=1.143;SC=AGAGTTTCATTTTCATACACT;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=53;TCR=7;TR=59;WE=4562675;WS=4562657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr3	4687470	rs5846330	G	GCT	864.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=1023;ReadPosRankSum=1.003;SC=CTGTATATAGGCTCTCTCTCT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=21;WE=4687478;WS=4687460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr3	4687498	rs41289624	T	A	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=659;SC=CTACAAATATTCATACATACA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=4687506;WS=4687488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	4693656	rs6442894	C	T	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=1;PP=741;SC=GGATGCTACACGTGACACTGG;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=4693664;WS=4693646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	4693943	rs28724276	G	A	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.99;SOR=4.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	4693953	rs28592010	G	A	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.16;SOR=4.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	4693959	rs28461825	C	T	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.17;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	4693977	rs28562557	G	A	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=73;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=440;SC=GCCTGTAGCCGTCGTGTTGTA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=4693985;WS=4693967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	4694011	rs56896093	G	A	171.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=55;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=136;SC=AATACACTCAGTCACCTTGCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=4694019;WS=4694001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	4695680	rs13316843	G	A	177.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=142;SC=GGGGAAGGAGGAACCTTAGGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=4695688;WS=4695670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	4712413	rs2306875	G	A	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=4;PP=319;SC=TGTTTTCTAGGTTGGTTCTTT;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=4712421;WS=4712403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	4725619	rs3215005	CA	C	1497.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=37;PP=1561;SC=ACCAAGATCACAAGCTGTTTG;SOR=5.186;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=37;WE=4725627;WS=4725609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	4726947	rs733018	T	G	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=11;PP=352;SC=TCCCTGGGTTTCCCCAAACTC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=4726955;WS=4726937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	4732670	rs4685801	G	A	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=15;NR=0;PP=442;SC=TACTAAAAAAGAAGGTAGTAC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=4732678;WS=4732663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	4738774	rs3749382	A	G	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=0;PP=1105;SC=TGAGGCAGCTAATGAGTTCCA;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=38;WE=4738782;WS=4738764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	4738999	rs149795767	G	GGT	269.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQRankSum=-1.098;QD=14.99;ReadPosRankSum=0.053;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr3	4748193	rs34548572	G	A	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=342;SC=AGGGCCAGGAGTGGGAAGTTA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=4748201;WS=4748183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	4767262	rs7613447	T	C	3009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=69;PP=2287;SC=AGAACGCCACTGAGGTGTGTT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=34;TCR=69;TR=103;WE=4767270;WS=4767252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr3	4776784	rs11920001	A	G	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=5;PP=745;SC=GGTGCGTAGTAAGTATGCAGC;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=4776792;WS=4776774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	4817057	rs6442905	T	C	3638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=73;PP=2695;SC=ATGAAAAGAATGTAGCGCTTA;SOR=1.117;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=51;TCR=73;TR=124;WE=4817065;WS=4817047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr3	4821374	rs78956048	G	A	2357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=41;PP=1852;SC=GGAGCATTGCGACGATATTTG;SOR=0.984;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=34;TCR=41;TR=75;WE=4821382;WS=4821364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr3	4842231	rs2291862	C	T	4035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=59;PP=2965;SC=AATTCTACGACTGATATTTTC;SOR=0.806;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=64;TCR=59;TR=123;WE=4842239;WS=4842221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr3	4856180	rs711631	T	C	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=22;PP=690;SC=GCATTGTCACTGTGCTGAGTC;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=4856188;WS=4856170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	4856234	rs901854	G	A	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=13;PP=482;SC=TACTCAGGAAGCCGTCCAAAG;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=4856242;WS=4856224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	4856993	rs6442911	C	G	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=325;SC=GGCGGGGTGCCTGCCCAGTTA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=4857001;WS=4856983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	4859725	rs9844268	G	A	1782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=4;PP=1428;SC=CTTTACCAAGGCTGCTCAGCT;SOR=4.654;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=48;TCR=4;TR=52;WE=4859733;WS=4859715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	4872790	.	GTCTCTC	G,GTC	139.82	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.26;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=0;NR=5;PP=56;SC=GTCTGTCTTTGTCTCTCTCTC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=5;WE=4872803;WS=4872780;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:5
chr3	4878335	.	T	C	46	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.6;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=46;QD=26.9237375157;SC=AGTTCTGCCATAGAAGGAGAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=4878343;WS=4878334;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	4927281	rs4685841	T	C	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=557;ReadPosRankSum=1.811;SC=ACCATCACAATTTAAAAGGCC;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=22;WE=4927289;WS=4927271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr3	4927308	rs6794077	A	G	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=3;PP=719;SC=GGTTGCTCACAGAACAAAACA;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=4927316;WS=4927298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	4942300	rs3762783	T	C	6343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=89;PP=2965;ReadPosRankSum=1.688;SC=GTGAACTTTTTTTGCAAAGGA;SOR=0.299;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=104;TCR=90;TR=192;WE=4942308;WS=4942290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,203:1.00:204
chr3	4942430	rs3762784	G	A	1966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=52;PP=1538;SC=ATCAGCTGGGGCCTGGATTTC;SOR=5.926;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=54;TCF=2;TCR=52;TR=54;WE=4942438;WS=4942420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	5024415	rs11398309	A	AT	256.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=163;SC=CAGTAAATGCATTTTTTTTTT;SOR=3.442;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=7;WE=5024423;WS=5024405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	5025514	.	G	GGTGTGTGTGT,GGTGTGTGT	502.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.07;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=1,1;NR=7,7;PP=118,170;SC=GCAGATTCAGGGTGTGTGTGT;SOR=3.912;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=8,8;WE=5025522;WS=5025504;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:11
chr3	5229689	.	TC	T	1048.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=6;PP=1169;SC=TGGGGGGGTATCCGGGCCGTC;SOR=1.942;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=27;WE=5229697;WS=5229679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	5241223	rs377120	C	T	1879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=10;PP=1515;SC=TGTGATGATACAGCCTCAGTT;SOR=2.872;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=48;TCR=10;TR=57;WE=5241231;WS=5241213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	5241309	rs410509	C	A	3651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=54;PP=2961;SC=TCCAGAAAGCCGTCAAGTTAG;SOR=0.763;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=60;TCR=54;TR=114;WE=5241317;WS=5241299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr3	6828364	rs1533434	A	G	3560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.943;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=73;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.699;SC=ACAGAACCCCAGTCTATAAGG;SOR=0.916;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=47;TCR=73;TR=119;WE=6828372;WS=6828354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,118:0.99:119
chr3	6903601	rs342034	A	G	1853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=50;PP=1546;SC=CCAGGTAGGGATGCGCTCCCT;SOR=3.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=7;TCR=50;TR=57;WE=6903609;WS=6903591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	6904812	rs143886923	G	GT	3035.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.458;NF=7;NR=92;PP=1364;ReadPosRankSum=-0.573;SC=TCTCCTTGCTGTTTTTTTTTT;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=123;TCF=10;TCR=113;TR=99;WE=6904820;WS=6904802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,108:0.97:111
chr3	6998144	rs17046460	C	T	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=1;PP=916;SC=GGGCAAACGCCGGCACCATGT;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=6998152;WS=6998134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
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chr3	7603194	rs1965222	C	T	3693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=62;PP=2910;SC=GGATAGAGACCATTTGTGCCT;SOR=0.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=55;TCR=62;TR=117;WE=7603202;WS=7603184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
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chr3	7620382	rs7614915	C	T	3690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=54;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.872;SC=TCCTGTCTTCCTGGCAATGTT;SOR=0.245;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=57;TCR=55;TR=110;WE=7620390;WS=7620372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,113:0.99:114
chr3	7620789	rs1485175	T	C	3309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=68;PP=2494;SC=TCATAGACTATGATGAACACA;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=42;TCR=69;TR=109;WE=7620797;WS=7620779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr3	7620828	rs1485174	G	A	3525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=62;PP=2893;SC=AAGCCAGAGGGGTTCTCAAGT;SOR=1.189;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=42;TCR=62;TR=103;WE=7620836;WS=7620818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr3	7621093	rs1485173	T	A	402.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=311;ReadPosRankSum=-0.329;SC=TGTGTTCATTTTTGTAAGTAC;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=15;WE=7621101;WS=7621083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr3	7649591	rs2139187	C	A	674.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.383;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=525;ReadPosRankSum=1.116;SC=CCCAAGTAGGCCCCAGTGTCT;SOR=4.003;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=22;WE=7649599;WS=7649581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,23:0.92:25
chr3	7649747	rs146667493	A	AT	1557.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=30;PP=1508;SC=AAAAGACATGACTCATGCTTT;SOR=2.419;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=33;WE=7649755;WS=7649737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	7649815	rs114582026	G	T	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.83;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	7649819	rs115155482	C	T	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.83;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	7721997	rs2280739	G	A	3708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.98;NF=43;NR=74;PP=2965;SC=GTAACTCTCCGTTTCTTTCAT;SOR=1.278;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=43;TCR=74;TR=117;WE=7722005;WS=7721987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr3	7732726	rs5846531	AT	A	247.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=162;SC=AACTTTGCAGATTTTTTTTTT;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=10;WE=7732734;WS=7732716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	7781858	rs62233907	C	G	296.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=1;PP=152;SC=TTGAGAATCACTGGGAACCAC;SOR=3.056;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=7781866;WS=7781848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	8299606	.	AAAGG	A	490.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.16;QD=37.75;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	8543713	rs5846598	G	GT	3324.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=50;PP=2973;SC=ACTTTTTCTTGTTCCCCTTCC;SOR=0.914;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=24;TCR=55;TR=72;WE=8543721;WS=8543703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr3	8556671	rs60137047	T	G	2924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.802;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=54;PP=2280;ReadPosRankSum=-0.816;SC=ATTGGTGCATTTCGACCGCAT;SOR=0.824;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=40;TCR=55;TR=93;WE=8556679;WS=8556661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,95:0.99:96
chr3	8667735	.	C	A	795	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=27;NR=0;PP=795;QD=30.7322671314;SC=TGTTCTAAAGCCAGTCAGCAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=8667743;WS=8667734;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	8667896	rs355058	T	C	7654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=130;NR=117;PP=2965;SC=TGCCACAGCATTGAGACACTG;SOR=0.812;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=249;TCF=131;TCR=118;TR=247;WE=8667904;WS=8667886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr3	8669367	rs5846608	TG	T	2057.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=20;NR=33;PP=2023;SC=ACCGCGGTGCTGGGGAGATGC;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=21;TCR=34;TR=53;WE=8669375;WS=8669357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	8675318	rs2276801	C	T	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=1;PP=210;SC=CCCAGCCCCCCGGCCAAGGCC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=8675326;WS=8675308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	8675539	rs2276800	G	A	1566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=27;PP=1272;SC=GGACTCACGCGGGCCAGCCAG;SOR=0.952;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=22;TCR=27;TR=49;WE=8675547;WS=8675529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	8675778	rs11131140	T	C	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=397;SC=TAGAGAGGAATTGTACCATTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=8675786;WS=8675768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	8676204	rs3774210	A	G	2416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=42;PP=2002;SC=GCACACTTGTATCTCCAGCAT;SOR=0.887;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=35;TCR=42;TR=77;WE=8676212;WS=8676194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	8676945	rs3816911	T	C	1491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=10;PP=1232;SC=AATAGTGACATAGGAAATGCA;SOR=2.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=47;WE=8676953;WS=8676935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	8686368	rs241051	T	C	5921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=101;NR=77;PP=2965;SC=AAATGCAGGCTAAAATATCTC;SOR=0.967;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=178;TCF=101;TCR=77;TR=178;WE=8686376;WS=8686358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr3	8701374	rs80210627	T	C	2731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.030;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=32;PP=2305;ReadPosRankSum=-0.854;SC=TGGGATCCAGTATTCATCCAT;SOR=0.986;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=83;TCF=50;TCR=33;TR=82;WE=8701382;WS=8701364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,85:0.99:86
chr3	8701430	rs371133	T	C	3269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=46;PP=2701;SC=TATGTATTCATTCATTCAATG;SOR=0.880;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=56;TCR=46;TR=102;WE=8701438;WS=8701420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr3	8809703	rs2228485	G	A	1693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=42;PP=1309;SC=GCACACACGCGTTCCCGCTCA;SOR=2.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=54;WE=8809711;WS=8809693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	8931984	rs656626	A	C	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=3;PP=600;SC=CCAGAAAGCAAAAATATAATT;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=8931992;WS=8931974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	8932189	rs607531	C	T	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=20;PP=636;SC=TGTATCGTCCCATTTATATAA;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=8932197;WS=8932179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	8943988	rs464302	C	A	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=141;SC=AAGTAAATTTCTTTGGTTTAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=8943996;WS=8943978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	8955240	rs430781	T	C	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=3;PP=416;SC=AGTAAATGAATAAATTTAATA;SOR=3.056;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=8955248;WS=8955230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	8955389	rs373572	C	T	730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=15;PP=561;SC=TTCGATTTCTCGAACTATTTC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=8955397;WS=8955379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	8988809	rs689296	C	T	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=166;SC=AAATATGCAACCCTGCATTCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=8988817;WS=8988799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	9000767	.	T	TA	378.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=244;ReadPosRankSum=0.434;SC=CTCTATCCCCTAAAAAAAAAA;SOR=1.292;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=13;WE=9000775;WS=9000757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr3	9005078	rs615967	C	T	3534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=69;NR=35;PP=2941;SC=ATGGTCGCTCCCGAGGATGCT;SOR=1.544;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=69;TCR=35;TR=104;WE=9005086;WS=9005068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr3	9032159	rs2648330	T	G	52.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5339;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=35;ReadPosRankSum=-0.524;SC=CCTCTGGGGCTTTTGGCTGCC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=9032167;WS=9032149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr3	9034558	rs511815	C	T	3259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=36;PP=2464;SC=GGATTGACACCAGCAGGGAAA;SOR=1.257;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=63;TCR=36;TR=99;WE=9034566;WS=9034548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr3	9036010	rs637172	T	G	2074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=22;PP=1581;SC=CTTCACAGAATTCTCGACTCC;SOR=1.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=64;WE=9036018;WS=9036000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	9066853	rs421041	T	C	2149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=30;PP=1702;SC=CACTGCAGGCTGGCTTCTGCA;SOR=0.898;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=40;TCR=30;TR=69;WE=9066861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	9069747	rs416685	A	G	2138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=14;PP=1636;SC=AGTTTCCATCACGGTGAATGG;SOR=2.895;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=58;TCR=14;TR=72;WE=9069755;WS=9069737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	9089178	rs2292250	A	G	2662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=42;PP=1875;SC=CACAAGGCACAAGGAAGTTAT;SOR=0.911;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=35;TCR=42;TR=77;WE=9089186;WS=9089168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr3	9089254	rs2244864	C	G	1847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=41;PP=1499;SC=GGAAGCCGAACAGAGATCACG;SOR=2.564;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=11;TCR=41;TR=52;WE=9089262;WS=9089244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	9091151	rs610457	C	G	1892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=39;PP=1347;SC=CATCAGGCCCCTTCTACCCAG;SOR=1.098;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=65;WE=9091159;WS=9091141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr3	9102137	rs6775479	G	C	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=337;SC=TTGAGACAGGGTGTTGCTCTG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=9102145;WS=9102127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	9122948	rs2664089	A	G	1686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=30;PP=1283;SC=ACCATTGCCTAGATCCTGACA;SOR=1.118;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=22;TCR=30;TR=52;WE=9122956;WS=9122938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	9166281	rs735253	G	C	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=77;SC=AACCTGCAGAGCCAGGGCCCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=9166289;WS=9166276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	9406661	rs2728949	G	A	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=1;PP=1126;SC=TGAAATATGAGATGATAATAT;SOR=5.838;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=39;WE=9406669;WS=9406651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	9406836	rs1054975	T	C	4218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=65;PP=2965;SC=TGACAGAAAGTGACCTCGGAA;SOR=0.862;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=71;TCR=65;TR=136;WE=9406844;WS=9406826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr3	9407022	rs2648536	T	C	3990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=95;PP=2965;SC=TGGAGCAATATTTAAAATAGT;SOR=2.565;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=27;TCR=95;TR=122;WE=9407030;WS=9407012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr3	9408443	rs2648535	A	C	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=0;PP=112;SC=AGAGATGAGAAACTAGGGAGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=9408451;WS=9408433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	9422210	rs2596916	T	C	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=5;PP=628;SC=GGTCTGACTGTTTCCATATTG;SOR=2.124;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=9422218;WS=9422200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	9425911	rs1129170	G	A	2209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=9;PP=1637;SC=GATCCAAGAAGAGAAACTGGA;SOR=3.545;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=59;WE=9425919;WS=9425901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	9426194	rs114170432	T	G	673	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=693;ReadPosRankSum=0.982;SC=GTTATTTTTTTTGTGTGTACA;SOR=0.399;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=27;WE=9426202;WS=9426184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,24:0.92:26
chr3	9489767	rs2258735	T	C	2040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=52;PP=1554;SC=CTATAATCCCTAGAAGAAACT;SOR=4.479;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=4;TCR=52;TR=56;WE=9489775;WS=9489757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	9495385	rs2648580	A	G	2823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=3;PP=2385;ReadPosRankSum=-0.966;SC=ATAGTTTTAGATAATTATTGA;SOR=4.615;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=80;TCR=3;TR=80;WE=9495393;WS=9495375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,82:0.99:83
chr3	9516340	rs115699611	G	A	276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=206;SC=CATGCCTAGTGCTGAGTTGAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=9516348;WS=9516330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	9547950	rs2625890	G	C	1926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.82;SOR=2.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	9547959	rs2625889	C	T	1615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.88;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	9743398	rs144534173	TGGAG	T	2509.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=14;PP=2058;SC=ACAGGTGGTATGGAGGGAGGG;SOR=1.609;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=39;WE=9743409;WS=9743388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	9757086	rs697820	C	G	3417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=46;PP=2700;SC=CCCAGGCCCTCCATCCCAGTG;SOR=0.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=57;TCR=46;TR=103;WE=9757094;WS=9757076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr3	9757511	rs3914774	T	C	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=4;NR=0;PP=114;SC=CTGTCAGAAGTTGAACAGGGT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=9757519;WS=9757509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	9768336	rs3868893	C	G	3428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=82;PP=2726;SC=AGTTCACCCTCTTTCCCCTAC;SOR=2.197;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=27;TCR=82;TR=109;WE=9768344;WS=9768326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr3	9769008	rs3891072	A	T	2855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=45;PP=2131;SC=TCATTCATTGAATACATCCTT;SOR=0.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=41;TCR=45;TR=86;WE=9769016;WS=9768998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr3	9782917	rs17050540	C	T	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=2;PP=844;SC=ACCTGAGTTTCCTGGGCTCTC;SOR=3.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=9782925;WS=9782907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	9787527	rs17050543	C	T	3751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=61;PP=2915;SC=GGGGAGCTGGCTGGCTGTCAG;SOR=0.709;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=58;TCR=61;TR=119;WE=9787535;WS=9787517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr3	9803126	rs17252807	A	G	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=3;PP=360;SC=ACAGCCTACCATGGCCAAGCC;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=9803134;WS=9803116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	9822275	rs3868897	C	T	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=348;ReadPosRankSum=-0.466;SC=CAGCCCACCTCCAGAGAACAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=13;WE=9822283;WS=9822265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr3	9829171	rs2290309	G	A	763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=11;PP=677;SC=AAAGTACAACGAAGATAAAAC;SOR=0.776;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=23;WE=9829179;WS=9829161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	9829226	rs293786	A	C	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=6;PP=1282;SC=AAAAAGAACTAAGACACACAC;SOR=3.516;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=42;WE=9829234;WS=9829216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	9841989	rs6443266	A	G	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=882;ReadPosRankSum=0.664;SC=AGGTAAGTTCACCATGGAGGA;SOR=0.770;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=39;WE=9841997;WS=9841979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,39:0.98:40
chr3	9851674	.	A	G	56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.6;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=1;NR=4;PP=56;QD=18.1542425094;SC=TGGGAGGGCGAGCGCGGCGAG;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=5;WE=9851682;WS=9851664;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr3	9859460	rs3806671	C	T	1466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=32;PP=1219;SC=AGACCCCCAGCCCTATGCCTG;SOR=1.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=45;WE=9859468;WS=9859450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	9860623	rs3806668	T	G	1908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=35;PP=1431;ReadPosRankSum=0.384;SC=TGTGGTTACCTCCACTCTCCC;SOR=0.917;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=68;TCF=32;TCR=36;TR=65;WE=9860631;WS=9860613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,67:0.97:69
chr3	9867625	rs3732527	C	T	5542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=103;PP=2965;SC=CCAAGTCCCGCGGACGAGGTG;SOR=1.135;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=177;TCF=74;TCR=103;TR=176;WE=9867633;WS=9867615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr3	9868577	rs12490900	A	G	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=233;SC=AGCCTTACCCACTCAGCCCTA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=9868585;WS=9868575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	9871030	rs2290305	T	G	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.33;NF=9;NR=19;PP=801;SC=ATTGACCGGATGCTGGACCGC;SOR=1.460;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=28;WE=9871038;WS=9871020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	9874670	rs7622954	G	A	597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=2;PP=489;SC=GCTCAGAAACGCCTCTTTGAC;SOR=2.948;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=9874678;WS=9874660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	9876301	rs13088594	G	T	2697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=22;PP=2269;SC=ACACGTACCTGTTAGGGCAGC;SOR=1.882;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=59;TCR=22;TR=81;WE=9876309;WS=9876291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr3	9885022	rs3846165	T	C	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=2;PP=349;SC=TTAGGTGGCTTGTCCCAGCTC;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=9885030;WS=9885015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	9885109	rs57223920	C	T	1619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=10;PP=1254;SC=CGAGGCAGTCCCCTCCCGGTC;SOR=2.655;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=46;WE=9885117;WS=9885099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	9885615	rs2290306	G	C	2147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=46;PP=1552;SC=GCACTGGGCGGACACCCAGGC;SOR=1.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=65;WE=9885623;WS=9885605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr3	9896351	rs279563	A	G	2104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=42;PP=1743;SC=ACAGAAAACAAAAGGTGCGAG;SOR=1.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=19;TCR=42;TR=61;WE=9896359;WS=9896341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	9932337	rs279558	G	C	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=1;PP=754;SC=AATAGGGTCAGTGGGCCGCTT;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=9932345;WS=9932327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	9934605	rs279553	T	C	1900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=22;PP=1365;SC=ACAGTGTGACTCTCAAGTATG;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=57;WE=9934613;WS=9934595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	9944937	rs279588	G	T	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=6;PP=603;SC=GAGCTGGGAAGATAAGAGCCA;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=9944945;WS=9944927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	9947864	rs279583	T	C	309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=255;SC=ACTTGGGAGGTGGAGGCTGCA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=9947872;WS=9947854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	9947898	rs279582	T	A	262.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=1;PP=196;SC=GCGCCATTGCTCTCCAGCCTG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=9947906;WS=9947888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	9947997	rs279581	C	T	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=8;PP=877;SC=CATCTCCAGGCAGGGGAGGGG;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=37;WE=9948005;WS=9947987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	9952706	rs279572	A	G	2517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=33;PP=1935;SC=CGAATGCCACAGCTCGAGAGT;SOR=1.039;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=49;TCR=33;TR=82;WE=9952714;WS=9952696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	9952788	rs279571	T	C	3266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=45;PP=2773;SC=TTCTCCCTGATGAACTCTCCT;SOR=1.148;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=66;TCR=45;TR=111;WE=9952796;WS=9952778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr3	9956279	rs455863	G	A	3811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=57;PP=2965;SC=TCTTGTGTCCGGATGGTGAGT;SOR=0.761;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=56;TCR=57;TR=113;WE=9956287;WS=9956269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr3	9956894	rs693802	C	T	196.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=2;PP=147;SC=CTGAGCAGTCCCTCAGCCGCC;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=9956902;WS=9956884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	9957455	rs1056286	C	T	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=6;PP=310;SC=GCAGCCGGCTCGAACGAGAGG;SOR=1.244;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=16;WE=9957463;WS=9957445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	9958947	rs34605147	T	TG	411.86	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.889;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.514;NF=14;NR=1;PP=278;ReadPosRankSum=-0.066;SC=CTGCCCCCCTTGGGGGGGGGC;SOR=4.294;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=15;WE=9958955;WS=9958937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,17:0.89:19
chr3	9959713	rs4686383	C	T	3126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=47;PP=2412;SC=AGAAGGAGACCGACTGTGACC;SOR=0.802;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=90;TCF=43;TCR=47;TR=89;WE=9959721;WS=9959703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr3	9960070	rs708567	C	T	1019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=14;PP=665;SC=GCAGCTGACTCAGGGGTGGAG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=29;WE=9960078;WS=9960060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	9962157	rs783494	T	C	2219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=23;PP=1752;SC=CCAGCCTTCCTCACCCCTCTC;SOR=1.545;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=71;WE=9962165;WS=9962147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	9962767	rs34198416	TATTC	T	459.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=451;SC=TCACAGAACATATTCATTCAT;SOR=2.494;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=8;WE=9962778;WS=9962757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	9969932	rs57179462	TGG	T	4282.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=46;PP=2966;SC=GGGCTGGGGTTGGGGTGTTGC;SOR=0.820;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=35;TCR=49;TR=78;WE=9969941;WS=9969922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr3	9970031	rs279549	A	G	3089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=52;PP=2379;SC=GCCCGACTGCAACTGCTGACC;SOR=0.731;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=52;TCR=52;TR=104;WE=9970039;WS=9970021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr3	9972493	rs279545	G	A	1436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=2;PP=1189;ReadPosRankSum=-0.476;SC=TTGATGCTGGGAATTTGGAGA;SOR=3.958;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=42;WE=9972501;WS=9972483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr3	9975247	rs183956	C	G	1447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=36;PP=1182;SC=TGGGACCAGGCGCGGGACCTG;SOR=3.467;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=42;WE=9975255;WS=9975237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	9976159	rs279552	A	G	2760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=19;PP=2041;SC=AGTCCCAGCTATGCTCTGGGG;SOR=2.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=59;TCR=19;TR=78;WE=9976167;WS=9976149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr3	9991425	rs76098202	G	A	5035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.064;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=78;PP=2965;ReadPosRankSum=1.073;SC=CTGTCCAGCCGTGGGAGCTTG;SOR=0.282;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=156;TCF=78;TCR=78;TR=154;WE=9991433;WS=9991415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,161:0.99:162
chr3	10085035	rs803335	G	T	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=3;PP=450;SC=CCAGACAGACGACAGTGCAAG;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=10085043;WS=10085025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	10088223	rs200221245	T	G	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQRankSum=-4.324;QD=5.79;ReadPosRankSum=-1.007;SOR=1.096;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr3	10088239	rs201770712	G	A	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQRankSum=-3.870;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.249;SOR=1.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr3	10088242	rs199726231	G	A	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=2.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQRankSum=-3.612;QD=11.10;ReadPosRankSum=-0.555;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr3	10088266	rs72492997	G	T	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.799;HP=4;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.637;NF=23;NR=0;PP=471;ReadPosRankSum=-0.034;SC=GACAATAGGTGTTTGACCTGG;SOR=2.183;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=51;TCR=5;TR=23;WE=10088274;WS=10088256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,29:0.45:64
chr3	10088299	rs112887807	C	T	1408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.14;MQRankSum=-2.479;QD=18.06;ReadPosRankSum=0.375;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,38:0.49:78
chr3	10088308	rs72492998	T	C	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=4.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.59;MQRankSum=-1.293;QD=16.80;ReadPosRankSum=0.895;SOR=1.308;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,37:0.45:82
chr3	10088343	rs73126218	A	G	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.827;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.195;NF=22;NR=20;PP=774;ReadPosRankSum=-0.386;SC=GTGCTAAGAAATAAGATTCGA;SOR=1.022;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=104;TCF=57;TCR=47;TR=42;WE=10088351;WS=10088333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,38:0.42:90
chr3	10088404	.	C	T	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.688;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=5.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.61;MQRankSum=-1.073;QD=15.25;ReadPosRankSum=-0.184;SOR=1.873;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr3	10088407	.	AG	A	814.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-4.374;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=9.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.10;MQRankSum=-1.077;QD=16.29;ReadPosRankSum=-0.246;SOR=2.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chr3	10088409	rs375350046	TAAG	T	756.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=9.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.79;MQRankSum=-0.773;QD=15.77;ReadPosRankSum=-0.666;SOR=2.498;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr3	10088422	rs144167368	C	T	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=9.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.07;MQRankSum=-0.493;QD=16.33;ReadPosRankSum=-1.430;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr3	10088443	rs145517746	C	A	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.24;MQRankSum=-1.254;QD=11.42;ReadPosRankSum=-0.291;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr3	10088444	rs142624538	A	G	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.43;MQRankSum=-1.308;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.683;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr3	10088461	rs150415982	T	C	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.54;MQRankSum=-1.738;QD=3.09;ReadPosRankSum=1.804;SOR=0.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr3	10089723	rs12330369	G	A	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.06;ReadPosRankSum=0.409;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,5:0.17:29
chr3	10089738	rs62245508	A	G	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.828;NF=4;NR=3;PP=239;ReadPosRankSum=-1.066;SC=GCCAGCAGGTATGTTGAAACA;SOR=0.693;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=7;WE=10089757;WS=10089728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
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chr3	10089834	rs74351786	A	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=3.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.19;MQRankSum=-2.978;QD=13.87;ReadPosRankSum=-0.538;SOR=0.096;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
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chr3	10089852	rs75274508	A	G	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQ=54.91;MQRankSum=-3.070;NF=0;NR=5;PP=397;ReadPosRankSum=1.168;SC=CTGGGTCTCAAGAAAGCTCAA;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=5;WE=10089860;WS=10089805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr3	10089886	rs73811818	G	T	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=65;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.823;NF=0;NR=4;PP=46;ReadPosRankSum=-1.180;SC=CTTGATGAAAGGAAGAGACTT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=10089894;WS=10089876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr3	10091035	rs10222446	T	C	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.353;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.295;NF=30;NR=1;PP=630;ReadPosRankSum=-2.562;SC=TTTACACTGTTCTGTTGACTC;SOR=3.170;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=96;TCF=79;TCR=17;TR=31;WE=10091043;WS=10091025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,12:0.16:77
chr3	10091252	rs77076948	A	C	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.90;MQRankSum=-2.260;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.054;SOR=0.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr3	10091261	rs80128604	G	A	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.97;MQRankSum=-1.787;QD=7.52;ReadPosRankSum=-0.862;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr3	10105661	rs369470214	CT	C	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=14.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.74;MQRankSum=-7.883;QD=0.67;ReadPosRankSum=-3.144;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,14:0.11:124
chr3	10127418	rs143239014	T	G	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=543;SC=TGGTACAGACTGGAGGCCAGG;SOR=6.358;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=10127426;WS=10127408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	10276163	rs708035	T	A	4513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=52;PP=2965;SC=TCCTCAGTGATATTCCAAGCA;SOR=1.378;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=89;TCR=52;TR=141;WE=10276171;WS=10276153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr3	10280753	rs11465932	G	A	1068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=33;PP=858;SC=GCATTTGGATGCTCATGTGTG;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=10280761;WS=10280743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	10283716	rs796552	A	G	1404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=1;PP=1140;SC=CCTGATTCAGAAACCTGATTT;SOR=6.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=37;WE=10283724;WS=10283706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	10290839	rs2072577	G	A	1464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=3;PP=1329;SC=GGGTCGCCAGGAAGGGTGGTG;SOR=4.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=44;TCR=3;TR=47;WE=10290847;WS=10290829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	10302172	rs394558	G	A	3340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=65;PP=2780;SC=AACCCCAGAGGTCAGCATGGA;SOR=1.418;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=38;TCR=65;TR=103;WE=10302180;WS=10302162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr3	10302369	rs451952	T	C	1792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=40;PP=1496;SC=GTAAAGCTTGTACCAGGCATC;SOR=1.961;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=16;TCR=40;TR=56;WE=10302377;WS=10302359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	10302395	rs439483	G	C	1422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=33;PP=1164;SC=TTTTAGTTCTGTTGATGAAAT;SOR=2.252;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=44;WE=10302403;WS=10302385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	10302479	rs402330	G	A	285.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=262;SC=GGCCTCCAGGGAACAAACTGA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=10302487;WS=10302469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	10311939	rs2075352	C	T	3388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=37;PP=2622;SC=TCAGCCGTTCCGGAGCCTTCT;SOR=1.374;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=63;TCR=37;TR=100;WE=10311947;WS=10311929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr3	10312507	rs2075353	A	G	3870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=43;PP=2965;SC=CAGATTGCCTATGGGAGGAGC;SOR=1.258;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=67;TCR=43;TR=110;WE=10312515;WS=10312497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr3	10318230	rs3217211	A	AT	2095.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=42;PP=2134;ReadPosRankSum=1.499;SC=TGTCAAGTTGATGAGGACAGC;SOR=1.451;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=5;TCR=44;TR=47;WE=10318238;WS=10318220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr3	10328250	rs35683	A	C	1150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=1;PP=863;SC=GCCAACCACTATCCTGCAGAT;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=10328258;WS=10328240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	10342876	rs696221	C	T	3061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=18;PP=2555;SC=TCCCAGTTGTCTGGTTAGTTG;SOR=2.930;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=80;TCR=18;TR=98;WE=10342884;WS=10342866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr3	10345527	rs697232	G	A	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=224;SC=AAAGGGGGACGTGTTAATACT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=10345535;WS=10345517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	10347546	rs3835090	CAACAGT	C	503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=572;SC=TCAAGGATCCCAACAGTGTGT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=11;WE=10347559;WS=10347536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	10359628	rs1642977	T	A	731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=6;PP=562;SC=CCACCCTGGATCCATGAATGA;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=10359636;WS=10359618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	10379923	rs35678	C	T	4296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=66;PP=2965;SC=GCTCCCGCTCCGCGTGGTCGA;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=67;TCR=66;TR=133;WE=10379931;WS=10379913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr3	10382111	rs171337	T	C	3770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=69;NR=40;PP=2965;SC=GCTCTCAGGGTCCTGCCCAGG;SOR=1.295;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=110;TCF=70;TCR=40;TR=109;WE=10382119;WS=10382101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr3	10382148	rs154242	G	A	3766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=41;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.986;SC=TGCCCACCCCGGGCCTGGTTA;SOR=0.546;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=75;TCR=41;TR=115;WE=10382156;WS=10382138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,117:0.99:118
chr3	10387059	rs241509	C	A	2360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=16;PP=2001;SC=TGGTCTCCTGCGGACCCACCT;SOR=2.472;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=56;TCR=16;TR=72;WE=10387067;WS=10387049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	10400643	rs28113	G	A	1266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=28;PP=1035;SC=GGGGAGCCCAGGGAATGCTCC;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=37;WE=10400651;WS=10400633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	10401856	rs2278554	G	T	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=362;SC=CCTGTGTCGGGAGCCTCTGCC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=10401864;WS=10401846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	10419856	rs56113011	C	G	186.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=183;SC=GATGAGGTAACTGAGGCCGAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=10419864;WS=10419846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	10420087	rs751122	T	C	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=15;PP=757;SC=CCCCGTCCTGTTGTTTGGCTG;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=13;TCR=15;TR=28;WE=10420095;WS=10420077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	10420875	rs4684686	G	A	1769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=5;PP=1486;ReadPosRankSum=-0.763;SC=TGTCAGAGCCGGTGGGGAGGG;SOR=2.948;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=51;TCR=5;TR=54;WE=10420883;WS=10420865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr3	10421107	rs7616000	A	G	3251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=89;PP=2684;SC=GTGTGGGGATACGGGTTGGGG;SOR=4.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=7;TCR=89;TR=96;WE=10421115;WS=10421097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr3	10427190	rs725027	C	T	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=461;SC=ATAGAGATGCCGCAGAGGTTG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=10427198;WS=10427180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	10443827	rs13084776	G	C	7999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=152;NR=95;PP=2965;SC=CAGGGATCTGGACCACCTGGC;SOR=1.248;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=248;TCF=152;TCR=96;TR=247;WE=10443835;WS=10443817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr3	10967739	rs2272395	T	C	2978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=66;PP=2485;SC=CCATGATGCCTCTCTCCCCGC;SOR=2.128;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=23;TCR=66;TR=89;WE=10967747;WS=10967729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr3	10975046	.	A	G	1878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=43;PP=1463;SC=ATCTTGGTCTATACTGGCCTC;SOR=2.019;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=59;WE=10975054;WS=10975036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	10976876	rs2245532	A	G	1721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=46;PP=1372;SC=CGGAGGGGACACTGCCCGAGG;SOR=3.872;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=5;TCR=46;TR=51;WE=10976884;WS=10976866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	11075503	rs2246543	T	C	1086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.47;SOR=5.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	11075507	rs6799755	A	G	1086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.28;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	11383864	.	C	G	282.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.42;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	11596302	rs8154	T	C	2757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=47;PP=2047;SC=ACATGAGCGATGATGAGACCA;SOR=0.735;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=47;TCR=47;TR=94;WE=11596310;WS=11596292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr3	11596402	rs1046593	C	T	1541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=39;PP=1245;SC=GACCCCAGGCCTGGTGATTCT;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=44;WE=11596410;WS=11596392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	11643465	rs2276749	T	C	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=20;PP=673;SC=GCAGGGTCTGTATTCTGGGTT;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=11643473;WS=11643455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	11880816	rs303862	C	A	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=20;PP=705;SC=TGGCACAAAACGGAGTAAAAT;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=11880824;WS=11880806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	11912797	rs62246062	C	T	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.81;QD=24.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	11912866	rs73813067	T	C	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.81;QD=24.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	11924613	rs369394286	AG	A	638.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.59;QD=31.94;SOR=3.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	11925136	rs423051	T	G	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.80;QD=28.18;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	11925489	rs2470561	C	T	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.12;QD=31.52;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	11925610	rs421090	C	T	286.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.10;QD=31.86;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	12045891	rs79624759	T	C	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.20;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	12045899	rs77368781	C	T	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.12;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	12045923	rs73135622	A	C	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=1;PP=602;SC=GGCTAAGCCGACGCCTCAGCC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=12045931;WS=12045913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	12045986	rs67270413	G	A	1672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=15;PP=1339;SC=CCGCGCCACCGGACCCCGTAG;SOR=1.938;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=52;WE=12045994;WS=12045976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	12046013	rs72624441	A	C	2133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=31;PP=1656;SC=GCGCCCCCAGACCTTTAAGCC;SOR=0.971;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=40;TCR=31;TR=70;WE=12046021;WS=12046003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	12046076	rs2618395	T	C	2107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=37;PP=1539;SC=TCATCGCCAATCTGCCCAACG;SOR=1.098;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=67;TCF=27;TCR=40;TR=64;WE=12046084;WS=12046066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr3	12046124	rs76272937	AG	GC	2208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.31;QD=44.18;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	12046131	rs74213196	A	C	1996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=86;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=11;NR=31;PP=865;SC=GCAAGCGCCGACGCCGCCGCC;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=42;WE=12046139;WS=12046130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	12046148	rs2623874	C	T	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.01;QD=46.76;SOR=3.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	12046168	rs2623875	A	C	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=103;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=24;PP=548;SC=GCCTCGGCCTAGGCGGCGCCC;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=12046176;WS=12046158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	12046196	rs2600233	A	C	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=58;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=9;PP=262;SC=CCTCGCCGGGACCGGAGCGGA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=12046204;WS=12046186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	12046207	rs2600234	C	G	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.31;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	12046297	.	A	C	87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=80;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=5;NR=0;PP=87;QD=24.3542425094;SC=GCAGCAGCTTATTCAGCTCGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=12046305;WS=12046287;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	12046362	rs2923856	G	C	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.86;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	12046364	rs2923857	G	C	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.86;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	12046372	rs2623877	G	C	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.86;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	12046445	rs2600235	T	G	152.03	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	12046445	.	TT	GC	179	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=1;NR=3;PP=179;QD=58.1169687156;SC=GCCGGGCGCCTTCGCCCTCGG;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=12046454;WS=12046435;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	12046446	rs2623879	T	C	152.03	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	12202866	rs308950	C	G	679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=577;SC=CTAATATGCTCTGTGACCCTG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=12202874;WS=12202856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	12208652	rs795008	A	G	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=5;PP=632;SC=GCAACAGTGAACTAAAATTCT;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=12208660;WS=12208642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	12208671	rs795009	G	T	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=6;PP=812;SC=CTGGAAAGTTGCATGCCCTCC;SOR=2.649;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=12208679;WS=12208661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	12229015	rs794999	A	G	2677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=44;NR=48;PP=2289;SC=CGGCCCCACCACCCACGGAGA;SOR=0.829;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=45;TCR=49;TR=92;WE=12229023;WS=12229005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr3	12231996	rs151063425	G	A	1086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=8;PP=838;SC=CAAGCAAGTCGCAGTCCCTGA;SOR=2.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=35;WE=12232004;WS=12231986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	12232074	rs310764	A	G	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=27;PP=1196;SC=AAGCCAAAGCAGAGACCATCC;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=25;TCR=27;TR=52;WE=12232082;WS=12232064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	12232208	rs310765	T	G	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=522;SC=GCTTGGTGGTTATGTCCCATG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=12232216;WS=12232198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	12317739	rs151229409	GAAGGGAGGAAGGA	G	5314.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.48;MQRankSum=0.728;QD=42.52;ReadPosRankSum=-0.832;SOR=2.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,124:0.99:125
chr3	12557945	.	ATGTG	A	114	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=16;MQ=62.21;NF=3;NR=0;PP=114;QD=39.0;SC=AACAAAATATATGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=12557956;WS=12557935;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,3:0.38:8
chr3	12571420	.	G	GT	438.92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.855;NF=4;NR=14;PP=234;ReadPosRankSum=0.406;SC=AAATGGTTCAGTTTTTTTTTT;SOR=0.941;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=18;WE=12571428;WS=12571410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,22:0.81:27
chr3	12613866	rs2648307	T	C	2616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=49;PP=1926;SC=GGAAGGCTCATGAAAAGGTAA;SOR=0.901;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=90;TCF=40;TCR=50;TR=89;WE=12613874;WS=12613856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr3	12626516	rs3729931	G	A	2821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=43;PP=2263;SC=AATGGGGGGTGAATGAACAAC;SOR=0.778;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=50;TCR=43;TR=93;WE=12626524;WS=12626506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr3	12647547	rs3214791	T	TG	516.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=599;SC=TTCTACCTTTTCTGTACCACC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=12647555;WS=12647541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	12650482	rs2454440	T	A	2367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=61;PP=1856;SC=AAAAGACAACTTCATTTCTTG;SOR=4.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=9;TCR=61;TR=70;WE=12650490;WS=12650472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr3	12660291	rs3729926	C	T	1699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=46;PP=1326;SC=CAAAAGTATTCAACCCAAGAA;SOR=5.097;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=3;TCR=46;TR=49;WE=12660299;WS=12660281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	12779409	rs2271209	A	G	904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=710;SC=AGATGGGGGTACTGTCCTTGG;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=12779417;WS=12779399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	12810629	rs112818257	CCGGGACTGG	C	904.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=2941;SC=CCCTCACTGCCCGGGACTGGC;SOR=2.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=13;WE=12810645;WS=12810619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	12810755	rs7641959	G	C	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=6;NR=10;PP=333;SC=CATACCTCCCGGAAGGCTGAG;SOR=1.244;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=16;WE=12810763;WS=12810745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	12810783	rs61606491	C	T	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=12;PP=402;SC=GCTCCGGCCTCGGCCATCCCA;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=12810791;WS=12810773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	12838293	rs12631514	G	C	2383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=49;PP=1877;SC=TTCAGGTGCAGCCCGCCGCCG;SOR=1.358;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=28;TCR=49;TR=77;WE=12838301;WS=12838283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr3	12845158	rs9835677	G	A	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=4;NR=27;PP=871;SC=TGGAGCAGGAGAGGGGGCCCT;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=12845166;WS=12845148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	12848822	rs11718898	T	C	1878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=12;PP=1437;ReadPosRankSum=-0.836;SC=CCTCTGGTGGTCAAAGTGAAG;SOR=1.371;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=57;WE=12848830;WS=12848812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr3	12849011	rs34529773	TA	T	920.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=35;PP=1033;SC=TAGTTTATGGTAAAAAAACAA;SOR=3.675;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=39;WE=12849019;WS=12849001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	12849031	rs59302336	C	CA	550.92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.38;MQRankSum=0.000;QD=19.68;ReadPosRankSum=0.632;SOR=1.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,25:0.89:28
chr3	12856856	rs2305398	A	G	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=25;PP=917;SC=CGGCAAACACAGCCCCCGAAG;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=41;WE=12856864;WS=12856846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	12857493	rs2305397	C	T	2101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=28;PP=1558;SC=GAGCATATGCCTGTGCTGGTA;SOR=0.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=35;TCR=28;TR=63;WE=12857501;WS=12857483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr3	12857823	rs731646	C	T	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=18;PP=1121;SC=CAGGGAGGGCCGTGTTGCATC;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=46;WE=12857831;WS=12857813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	12858028	rs3732675	T	C	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=1017;ReadPosRankSum=-1.376;SC=TGTGGCTGACTCTTTCTACAA;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=20;TCR=20;TR=38;WE=12858036;WS=12858018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,37:0.95:39
chr3	12859004	rs3732678	A	C	2180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=24;PP=1724;SC=GGGCCAGGCCACCAGCGGGAG;SOR=1.146;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=38;TCR=24;TR=62;WE=12859012;WS=12858994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr3	12861586	rs4684883	T	C	4256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=49;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.887;SC=GTCCTGCAGGTCGGCCACACA;SOR=0.566;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=88;TCR=49;TR=135;WE=12861594;WS=12861576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,138:0.99:139
chr3	12861608	rs3817121	G	A	4926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=72;PP=2965;SC=CCGGAGCACCGTCATCACAGC;SOR=0.837;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=84;TCR=72;TR=156;WE=12861616;WS=12861598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr3	12875443	rs12629133	G	A	3084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=61;PP=2423;SC=GAAGGATTCCGCTTCAGCCCC;SOR=1.408;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=97;TCF=36;TCR=61;TR=97;WE=12875451;WS=12875433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr3	12942408	rs9818523	G	A	2530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=32;PP=1943;ReadPosRankSum=0.493;SC=TTTGGTGTGCGGCTGGCGACC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=84;TCF=51;TCR=33;TR=82;WE=12942416;WS=12942398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,83:0.98:85
chr3	12942850	rs56387830	GC	G	1523.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=17;PP=1560;SC=TGGGGGGGTGGCCAGGGCTGG;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=39;TCF=21;TCR=18;TR=38;WE=12942858;WS=12942840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	12944158	rs63063761	CA	C	612.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=21.314;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.25;MQRankSum=-1.532;QD=21.13;ReadPosRankSum=0.992;SOR=5.206;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,27:0.93:29
chr3	12954868	rs2600322	A	G	2001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=14;PP=1586;SC=ACAGCCAGACATGGACCCTGG;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=57;TCR=14;TR=71;WE=12954876;WS=12954858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	12956531	rs2255964	G	A	1766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=8;PP=1371;SC=CTGGGGAGCCGGCGGACTGGC;SOR=3.139;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=43;TCR=8;TR=51;WE=12956539;WS=12956521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	12976863	rs2600206	T	C	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=0;PP=568;SC=TCAAGCTCCGTGCTTGGAAGG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=12976871;WS=12976853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	12983423	rs72624443	C	T	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=83;SC=AACACGACACCGGGCCGTGGG;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=12983431;WS=12983413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	13368892	rs2271509	G	A	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=23;PP=850;SC=TGCGGACAACGCAGGTGTTGT;SOR=1.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=33;WE=13368900;WS=13368882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	13379400	rs3773302	C	T	2309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=27;PP=1816;ReadPosRankSum=-0.674;SC=GCAGCAGCACCTCCACCTGCA;SOR=0.569;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=72;TCF=45;TCR=27;TR=71;WE=13379408;WS=13379390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,75:0.99:76
chr3	13383540	rs2271504	A	G	4006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=60;PP=2965;ReadPosRankSum=0.553;SC=TCAGGTCCATAAAGGGGAAGT;SOR=0.742;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=63;TCR=61;TR=122;WE=13383548;WS=13383530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,125:0.98:127
chr3	13393166	rs11292029	CT	C	550.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=345;ReadPosRankSum=1.321;SC=TTTGATTTTTCTTTTTTTTTT;SOR=5.058;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=21;WE=13393174;WS=13393156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,24:0.96:25
chr3	13395579	rs2280084	C	A	1674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=34;PP=1285;SC=CAGGTCCAGCCGGGGGTTGCG;SOR=1.371;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=54;WE=13395587;WS=13395569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	13399786	rs6795271	G	A	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=10.544;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=2;PP=841;ReadPosRankSum=-0.829;SC=GTAGACAGGCGCGAGGGTGAG;SOR=4.736;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=32;WE=13399794;WS=13399776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,33:0.97:34
chr3	13399948	rs6807718	T	C	2933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=64;PP=2285;SC=CTCACTCCTCTCTGAGCTATG;SOR=1.821;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=25;TCR=64;TR=89;WE=13399956;WS=13399938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr3	13407556	rs3732671	T	C	1747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=47;PP=1309;SC=TTTACCCGGATGCCGCTGCAG;SOR=2.658;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=15;TCR=48;TR=62;WE=13407564;WS=13407546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	13415146	rs6810356	G	T	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=0;PP=1350;SC=TGAAGTCGAGGCTTGCTCAGA;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=50;TCR=0;TR=50;WE=13415154;WS=13415136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	13418086	rs6442377	C	A	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=17;PP=488;SC=GACGGGTGGGCTGGGCCCTGG;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=13418094;WS=13418076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	13419123	rs35998066	T	TG	767.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=869;SC=TGGAGGAGGATGGGACCACCA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=13419131;WS=13419113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	13420624	rs6442378	G	A	1552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=41;PP=1290;ReadPosRankSum=-0.802;SC=CTTAGGCCACGTAGAGCAAAG;SOR=2.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=6;TCR=42;TR=47;WE=13420632;WS=13420614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr3	13421150	rs7628051	C	T	3632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=37;PP=2862;ReadPosRankSum=-0.022;SC=ACCGGCCGGGCTGGGTCTCCT;SOR=1.629;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=80;TCR=39;TR=115;WE=13421158;WS=13421140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,122:0.98:124
chr3	13421320	rs7625586	T	C	2334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=61;PP=1876;SC=ATCTCTGCACTCTGCTCTCAG;SOR=4.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=5;TCR=61;TR=66;WE=13421328;WS=13421310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr3	13429918	.	G	A	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=18;PP=1034;SC=GATGTAAGAAGGAGGGATGTA;SOR=1.005;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=23;TCR=18;TR=41;WE=13429926;WS=13429908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	13438830	rs13066607	A	G	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=423;SC=GGGCTGCAGAAGACAAACAGG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=13438838;WS=13438820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	13522973	rs2675232	C	T	1249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=29;PP=865;ReadPosRankSum=-0.719;SC=CAACATAAGCCTCAGGCTCTC;SOR=1.061;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=39;WE=13522981;WS=13522963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr3	13523010	rs2655218	T	C	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=418;ReadPosRankSum=0.850;SC=AGCCCTCGGATGGCCTTCCAC;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=22;WE=13523018;WS=13523000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr3	13539850	rs75944917	C	G	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=2;PP=1022;SC=TGGACTGTTGCTTGGGGTAGG;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=35;WE=13539858;WS=13539840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	13574068	rs35913726	AC	A	585.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=14;PP=423;SC=CTTCCCCATAACCCCCCCATC;SOR=3.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=16;WE=13574076;WS=13574058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	13670508	rs41283996	G	A	3933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=71;PP=2965;SC=TGATCTGCGCGCGCGGCTACC;SOR=0.954;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=54;TCR=72;TR=125;WE=13670516;WS=13670498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr3	13678173	rs2290188	G	T	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=47;PP=1398;ReadPosRankSum=-0.696;SC=CCTCCCTCTCGTCCCAGCCCC;SOR=4.977;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=48;WE=13678181;WS=13678163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr3	13679829	rs7820	C	T	1410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=39;PP=1259;SC=TTTTGTTTAACTATAAAGTAG;SOR=4.125;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=43;WE=13679837;WS=13679819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	13679850	rs71773469	TTA	T	942.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=1033;SC=TACATGTACATTATATAAAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=23;WE=13679859;WS=13679840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	13860957	rs79020924	A	G	1586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=43;PP=1228;SC=AGCACAGGTCACTGCACGCCA;SOR=5.549;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=45;WE=13860965;WS=13860947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	14105854	.	TCCAGCAGCAGCAGCCCCAGCAGCAGCC	T	212.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.60;QD=35.46;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	14105882	.	C	A	366	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=55.37;NF=1;NR=14;PP=366;QD=26.7180808365;SC=AGCAGCAGCCCCAGCAGCAGC;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=14105904;WS=14105872;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	14105885	.	GCAGCAGCAGCCC	G	702	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=54.3;NF=0;NR=9;PP=702;QD=80.6666666667;SC=AGCAGCCCCAGCAGCAGCAGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=9;WE=14105904;WS=14105872;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,9:0.56:16
chr3	14105924	.	C	A	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.93;MQRankSum=2.369;QD=6.10;ReadPosRankSum=-2.369;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr3	14106310	.	T	TCCAGCACCAGCAGTC	1027.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=3;PP=768;SC=CAGCAGCAGCTCCAGCACCAG;SOR=2.833;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=17;WE=14106318;WS=14106300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	14106499	rs2607779	G	A	1042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=22;PP=717;SC=GAGAGGCCCCGTGGGTATTCT;SOR=1.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=32;WE=14106507;WS=14106489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	14154231	rs2731316	T	G	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=683;SC=TATGTCAAGATGTCAAGACCT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=14154239;WS=14154221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	14157890	rs2607747	C	G	1491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=3;PP=1118;SC=CCCCAGTGCCCTGGTGTGGGT;SOR=4.654;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=50;WE=14157898;WS=14157880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	14157913	rs2731314	A	G	1717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.510;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=4;PP=1300;ReadPosRankSum=0.715;SC=CTGGGAGGCCACATGTCACTC;SOR=4.582;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=61;TCF=56;TCR=5;TR=59;WE=14157921;WS=14157903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,63:0.97:65
chr3	14158220	rs2731313	G	A	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=1;NR=17;PP=511;SC=GGCAGGAAAAGAAGCACTGAA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=14158228;WS=14158210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	14166835	rs2733579	C	T	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=343;SC=TCTCCCTCTGCTCGCCGTGTC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=14166843;WS=14166825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	14175149	rs2733585	G	A	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=1;PP=625;SC=GAACCCCCGGGTGGGGACCCT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=14175157;WS=14175139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	14180633	rs2731320	C	T	1189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=1;PP=913;SC=CGACTGGGTACGCCACTGGCC;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=35;WE=14180641;WS=14180623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	14187449	rs2228001	G	T	965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=4;PP=784;SC=GCTCACAGCTGCTCAAATGGG;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=14187457;WS=14187439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	14187699	rs2733532	T	C	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=362;SC=AGGCGAGGGTTAGTAATCAGA;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=14187707;WS=14187689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	14188700	rs2733533	C	A	2922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=11;PP=2298;SC=TGACTTGAGGCTGGGGCAGAA;SOR=3.492;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=77;TCR=11;TR=88;WE=14188708;WS=14188690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr3	14188762	rs2733534	G	C	5794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=115;NR=57;PP=2965;SC=CCCTGAGCTTGTCTTCTCTGC;SOR=1.583;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=172;TCF=115;TCR=57;TR=172;WE=14188770;WS=14188752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr3	14189340	rs2607749	A	G	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=6;PP=666;SC=GGCCTGGGGAAGGAAGAGGCC;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=14189348;WS=14189330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	14190237	rs2279017	T	G	4084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=61;PP=2965;SC=GGCACCTGTGTCGGGTGAGCA;SOR=0.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=61;TCR=61;TR=122;WE=14190245;WS=14190227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr3	14190268	rs2470353	G	C	3167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=61;PP=2344;ReadPosRankSum=-0.953;SC=TGGCCAGCAGGGGAACAAGGC;SOR=1.089;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=45;TCR=62;TR=105;WE=14190276;WS=14190258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,111:0.98:113
chr3	14197987	rs2958057	A	T	2410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=37;PP=1902;SC=CCATGTGTTTAGCCTGAAACT;SOR=0.719;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=38;TCR=37;TR=75;WE=14197995;WS=14197977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	14199887	rs2228000	G	A	4242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=88;PP=2965;ReadPosRankSum=1.247;SC=TGAGGATGCCGCTGGCAAGCT;SOR=0.662;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=45;TCR=90;TR=133;WE=14199895;WS=14199877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,139:0.99:140
chr3	14220095	rs2607775	C	G	5850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.243;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=102;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.678;SC=AATTCCACTTCGCGAGTGACG;SOR=0.410;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=194;TCF=92;TCR=102;TR=193;WE=14220103;WS=14220085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,191:0.99:192
chr3	14485484	rs36107877	C	A	2899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=15.311;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=54;PP=2173;ReadPosRankSum=0.052;SC=CTGGCCCCCCCCCTTGACCTC;SOR=0.022;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=109;TCF=49;TCR=60;TR=102;WE=14485492;WS=14485474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,106:0.95:112
chr3	14486392	rs3773189	A	G	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=256;SC=CCCCTGCCCCAATGCTTTGCC;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=14486400;WS=14486382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	14519885	rs2241781	A	T	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=593;SC=GGGTTTTTTTAATCTTATTGA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=14519893;WS=14519875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	14520164	rs2241780	A	G	1333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=33;PP=1015;SC=ATACTAACAGAAATTCAATTT;SOR=4.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=37;WE=14520172;WS=14520154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	14520560	rs2304510	G	C	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=3;PP=303;SC=CTTGAACGCTGTGTCAGAAAA;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=14520568;WS=14520550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	14520848	rs145595809	C	T	358.53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=329;ReadPosRankSum=1.244;SC=GAAGGCTGCTCCAGGGAGTTA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=12;WE=14520856;WS=14520838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr3	14526538	rs1062540	G	A	1390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=22;PP=1076;SC=CGACGGGGCCGGCGGCTTTCC;SOR=0.829;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=20;TCR=22;TR=42;WE=14526546;WS=14526528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	14526612	rs35363110	AT	A	364.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.859;HP=13;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.474;NF=3;NR=17;PP=238;ReadPosRankSum=0.801;SC=TTGCACTAGGATTTTTTTTTT;SOR=2.531;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=20;WE=14526620;WS=14526602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,20:0.91:22
chr3	14526656	rs1126666	A	G	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=14;PP=458;SC=AATTGTGGGTATGTGTGCGTG;SOR=3.126;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=16;WE=14526676;WS=14526646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	14561627	rs5846840	A	AG	637.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=12;NR=5;PP=710;SC=CCTGCCTCTGAGGCCTCAGTG;SOR=1.981;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=17;WE=14561635;WS=14561617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	14702848	rs3832217	A	AT	440.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=424;SC=CTTTTTCAAGATTTTTTTGTG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=14702856;WS=14702845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	14702982	rs2276754	C	A	2734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=19;PP=2224;SC=GCTTCTTGTCCATTCCATGTG;SOR=2.247;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=62;TCR=19;TR=81;WE=14702990;WS=14702972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr3	14703401	rs55915506	CATAATTACA	C	1906.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.625;NF=0;NR=42;PP=2983;ReadPosRankSum=-0.361;SC=CAAATGAAGACATAATTACAA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=67;TCF=0;TCR=67;TR=42;WE=14703417;WS=14703391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr3	14706770	rs3836383	A	ATTGG	482.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=498;SC=TGATTGATTGAAGCACTTTTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=14706778;WS=14706760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	14708918	rs2280383	A	G	2159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=17;PP=1703;SC=TGGGTAATTCATACTTCTTTC;SOR=2.524;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=59;TCR=17;TR=75;WE=14708926;WS=14708908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	14725668	rs12488352	G	A	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=0;PP=539;SC=CTTCTTTCCTGGGCCATTTAC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=14725676;WS=14725658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	14756730	rs9869372	A	G	115.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.76;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	14763954	rs12486391	G	A	2141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=18;PP=1757;SC=CAAAGGATAAGGCAGAAGAGT;SOR=1.875;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=44;TCR=18;TR=62;WE=14763962;WS=14763944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	14768534	rs7636830	A	G	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=20;PP=897;SC=GGCCGCAGGTAAGGAGGCTGA;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=16;TCR=20;TR=36;WE=14768542;WS=14768524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	14814156	rs3796306	G	A	182.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=116;SC=GGTGCCACCGGGGCCCTCTGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=14814164;WS=14814146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	14905513	rs172429	T	G	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=521;SC=GAAGTAGGAATTTTGTGCCTG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=14905521;WS=14905503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	14939198	rs2117775	G	A	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=25;PP=793;SC=CTGGACCCCCGGGTTCCACTT;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=14939206;WS=14939188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	14939364	rs2117774	G	A	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=1;PP=424;SC=ACCCAGGGATGTGACTCCAGG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=14939372;WS=14939354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	14939479	rs2164356	G	T	3218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=76;NR=22;PP=2738;SC=ACGTCTTCCTGGCCCGGGAGC;SOR=2.326;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=76;TCR=22;TR=98;WE=14939487;WS=14939469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr3	14939679	rs2307090	G	A	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=39;PP=1208;SC=ATGCAAATCAGTGGGACATCT;SOR=5.330;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=42;WE=14939687;WS=14939669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	14942024	rs2307088	T	C	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=18;PP=527;SC=CGCCAAAGCCTGGACCCTGCC;SOR=2.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=14942032;WS=14942014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	14942675	rs293906	G	A	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=28;PP=824;SC=GCAGGCAACCGTCTCTCTTGT;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=14942683;WS=14942665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	14949268	rs9818644	C	T	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=23;PP=639;SC=GGCGAGGCTCCGATAAGCCCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=14949276;WS=14949258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	14960170	rs293916	T	C	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=2;PP=445;SC=TAGGTGGACATGGTCCCTCTG;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=14960178;WS=14960160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	14965466	rs4685234	C	T	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=2;PP=925;ReadPosRankSum=-0.700;SC=AAAGACAAGCCGCAGGCACGC;SOR=3.383;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=33;WE=14965474;WS=14965456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,33:0.97:34
chr3	14965507	rs4685235	A	G	1419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=10;PP=1079;SC=GGCTTCTTTCAGTTACAGAGC;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=51;WE=14965515;WS=14965497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	15100801	rs13068576	G	A	311.56	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=285;ReadPosRankSum=1.053;SC=TCATCCTGACGCTCCCATAGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=15100809;WS=15100791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr3	15115270	rs3831	G	T	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=2;PP=479;SC=GGGCCCAAAGGTGCCCTCTCC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=15115278;WS=15115260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	15127522	rs72400013	CTAG	C	683.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=611;SC=CTGAGGGAGCCTAGTCTCTAC;SOR=2.584;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=13;WE=15127532;WS=15127512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	15127643	rs9867079	G	A	69.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=48;SC=GGGTATGTACGCCTATAATCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=15127651;WS=15127633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	15133088	rs9869512	C	T	2174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=50;PP=1809;SC=CCAGGTACAACGCAAAGTGCT;SOR=1.852;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=21;TCR=50;TR=71;WE=15133096;WS=15133078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	15216429	rs7639618	C	T	4543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=69;PP=2965;SC=ACCCCTACCACATAACACAAC;SOR=0.762;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=75;TCR=69;TR=144;WE=15216437;WS=15216419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr3	15216703	rs11718863	A	T	2102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=23;PP=1677;SC=TTGTCATTATACTGGGCAAGT;SOR=1.010;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=34;TCR=23;TR=57;WE=15216711;WS=15216693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	15222262	rs2129947	G	A	181.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=148;SC=TTCACTATAAGCTTCCAGATT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=15222270;WS=15222252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	15301363	rs2291853	G	A	4302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=55;PP=2965;SC=AGTGACCACAGTCAACTCCAC;SOR=1.122;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=74;TCR=55;TR=128;WE=15301371;WS=15301353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr3	15311325	rs1287467	A	G	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=22;PP=772;SC=CCTTGGCGGCACGGAGCACCT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=33;WE=15311333;WS=15311315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	15345924	rs9828229	G	A	1454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=43;PP=1193;SC=CGGCGGAAACGTCCTGTGCTC;SOR=6.229;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=44;WE=15345932;WS=15345914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	15371819	rs3773464	C	A	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=506;SC=ACAACATGTGCAATTGGATCC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=15371827;WS=15371817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	15456441	rs73142299	A	G	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=3;PP=429;SC=AAATAAATAAATAAGTGTTAG;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=15456449;WS=15456431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	15456948	rs1869852	AA	GC	1677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=3;PP=927;SC=ACAGGCATGAAACACCACACC;SOR=4.407;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=33;WE=15456957;WS=15456938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	15471527	rs145949458	C	A	1503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=42;PP=1425;ReadPosRankSum=-0.327;SC=GAGTTTATTTCATTTTTTTTT;SOR=1.508;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=6;TCR=44;TR=48;WE=15471536;WS=15471517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,51:0.96:53
chr3	15476055	rs6797367	A	G	4176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=100;PP=2965;SC=GGTAGAGAACATTTTCTGGAT;SOR=2.409;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=32;TCR=100;TR=132;WE=15476063;WS=15476045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr3	15478047	rs144767041	G	A	2838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=47;PP=2206;SC=GGAACCAGCCGGCCACAAGGA;SOR=0.887;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=34;TCR=48;TR=81;WE=15478055;WS=15478037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr3	15480726	rs17041129	C	T	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=29;PP=1076;ReadPosRankSum=1.205;SC=GCTACTTTGGCGTGGAGTCCA;SOR=0.555;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=42;WE=15480734;WS=15480716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr3	15717693	rs2246960	G	A	1164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=35;PP=959;SC=CCTTGTCAACGTGTAGCTCGG;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=15717701;WS=15717683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	15718652	rs2470540	T	A	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=139;SC=AGTCCATATATTATGTACAAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=15718660;WS=15718642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	15736385	rs2455814	A	T	4887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.639;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=98;PP=2965;ReadPosRankSum=0.289;SC=TCTCCCACCCACCCAGTTCAA;SOR=0.319;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=53;TCR=100;TR=151;WE=15736393;WS=15736375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,157:0.99:159
chr3	15737610	rs2470547	T	C	2737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=11;PP=2107;SC=AAACTCCCATTAGGTCTTTCA;SOR=3.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=66;TCR=11;TR=77;WE=15737618;WS=15737600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	15737689	rs2470548	G	A	5071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.98;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr3	15737698	rs2470549	T	C	4822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.50;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr3	15752830	rs2455833	T	C	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=571;SC=TATTTTACACTAAAGAATTGT;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=15752838;WS=15752820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	15753641	rs2455834	A	G	2489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=25;PP=1968;SC=CAAAGGTTACACTTACCTGAA;SOR=1.775;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=58;TCR=25;TR=83;WE=15753649;WS=15753631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr3	15756039	rs200662705	G	GAA	673.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.70;MQRankSum=-0.253;QD=30.62;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr3	15756215	rs924754	A	T	1567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=39;PP=1225;SC=TAATGTGTAAACCTTAGTTTT;SOR=3.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=46;WE=15756223;WS=15756205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	15807692	rs73038264	A	G	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=4;PP=1276;SC=AACATTAAGAATAACAAAAAT;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=43;WE=15807700;WS=15807682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	15807725	rs6789076	T	A	2292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=16;PP=1787;SC=TTCTTATTACTCAGAGGTTAC;SOR=2.432;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=53;TCR=16;TR=69;WE=15807733;WS=15807715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr3	15815757	rs73038271	A	G	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=355;SC=AAATCCATGAAGTTAATGAAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=15815765;WS=15815747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	15900973	rs62243667	A	C	1916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=46;PP=1557;SC=GCCGCCGCCGACCGGCCCACT;SOR=2.419;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=13;TCR=46;TR=59;WE=15900981;WS=15900963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	15901053	rs71064238	CT	C	770.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=15;PP=851;SC=CTGAGAAGACCTGCGGGCAGG;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=19;WE=15901061;WS=15901043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	16268769	rs1394908	C	G	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=303;SC=CTGTTATTCTCTTAATGATTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=16268777;WS=16268759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	16268974	rs15767	T	A	2117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=20;PP=1713;SC=AGCAGTGGCGTTTTGACCAGA;SOR=1.716;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=47;TCR=20;TR=67;WE=16268994;WS=16268964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr3	16268986	rs14576	C	A	2371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=25;PP=1961;SC=TTGACCAGATCAATGCTGTGG;SOR=1.519;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=51;TCR=25;TR=76;WE=16268994;WS=16268964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr3	16310857	rs842258	G	A	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=624;ReadPosRankSum=-0.883;SC=GAAAAACTACGTTTAGTGGTC;SOR=5.058;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=24;WE=16310865;WS=16310847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,24:0.96:25
chr3	16358584	rs690241	T	C	2708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=37;PP=1998;SC=GCTGCTGTCCTGAAACACAGT;SOR=1.014;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=50;TCR=37;TR=87;WE=16358592;WS=16358574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr3	16364919	rs690216	A	C	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=41;PP=1372;SC=GAGGTAGACAAGGTCTCTGAA;SOR=1.211;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=27;TCR=41;TR=68;WE=16364927;WS=16364909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	16368121	rs690145	T	C	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=407;SC=GTTAAGAATGTGAAATTCTGG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=16368129;WS=16368111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	16419125	.	C	G	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=0;PP=781;SC=TCTCTACACTCTAAATTCCAT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=16419133;WS=16419115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	16450775	rs62236343	G	T	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=2;PP=515;SC=CACAGCTCTTGCATGGCCTCT;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=16450783;WS=16450765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	16450872	rs1546650	T	C	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=1199;ReadPosRankSum=1.527;SC=ACCCTGACTGTAGCGCTCACC;SOR=0.275;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=47;WE=16450880;WS=16450862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr3	16457700	rs62236345	C	T	1465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=21;PP=1142;SC=AAGGGTACTACTGGCAGAGAT;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=43;WE=16457708;WS=16457690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	16475256	rs2303851	A	G	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=210;SC=TGAGGACAGCATGCAAATTTC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=16475264;WS=16475247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	16535229	rs3815962	C	T	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=1;PP=813;SC=CCCATGTACTCACCAGCACTC;SOR=3.675;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=16535237;WS=16535219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	16636093	rs35729175	TA	T	240.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.555;NF=0;NR=13;PP=163;ReadPosRankSum=0.496;SC=GGTGGCATCTTAAAAAAAAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=13;WE=16636101;WS=16636083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr3	16639754	rs3773827	G	T	2005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=32;PP=1507;SC=ACTAAAAGAAGGTTCGATGAT;SOR=0.754;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=32;TCR=32;TR=64;WE=16639762;WS=16639744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	16646745	rs9847342	C	G	1297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=24;PP=1113;SC=CGACCGGCTCCAGGAGGAGCA;SOR=0.883;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=45;WE=16646753;WS=16646735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	16926445	rs138820460	A	AG	38.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=1;PP=73;SC=GGAGGAGAGGAGAGGGGCCGC;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=16926453;WS=16926435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr3	16926521	.	CT	C	107	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=4;MGOF=51;MMLQ=19;MQ=59.02;NF=2;NR=1;PP=107;QD=46.6666666667;SC=GCAGGCGGGTCTGCTGGGGCG;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=16926532;WS=16926511;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	16926524	.	CT	C	107	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=4;MGOF=51;MMLQ=17;MQ=59.02;NF=2;NR=1;PP=107;QD=46.6666666667;SC=GGCGGGTCTGCTGGGGCGCCC;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=16926532;WS=16926511;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	16926599	rs7626446	T	G	322.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.35;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	16926607	rs7626448	T	C	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.64;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	16926642	rs6442655	A	G	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.41;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	16926648	rs6442656	T	G	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.41;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	16926666	rs7626542	T	G	963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=5;PP=629;SC=GGTCGCCTCGTCCACGGGCGG;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=16926674;WS=16926656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	16974610	rs9880307	C	A	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=10;PP=1130;SC=ATTGGACAGCCGGAGTATTTT;SOR=2.252;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=44;WE=16974618;WS=16974600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	17051081	rs28498854	T	A	1034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=0;PP=825;SC=GATTTTTTTCTAGGAAATTAA;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=17051089;WS=17051077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	17053499	rs4602367	A	G	2682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=37;PP=2108;SC=GAGGAGGAGGAAAGCCTCATA;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=38;TCR=37;TR=75;WE=17053507;WS=17053489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	17077268	rs17272796	C	T	1227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=9;PP=1023;SC=TTCTCTAATACGAGTTGAGGT;SOR=2.419;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=38;WE=17077276;WS=17077258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	17131421	rs35185988	C	T	1706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=40;PP=1343;ReadPosRankSum=-0.879;SC=TTACAATAAACCATTATGGAG;SOR=1.646;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=9;TCR=41;TR=49;WE=17131429;WS=17131411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr3	17131501	rs11549706	C	T	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=485;SC=GAATAATATTCGGGATTTTAA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=17131509;WS=17131491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	18055231	rs61978649	A	C	1470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=40;PP=1140;SC=AGACAGTCACAGTAGTCCAGA;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=50;WE=18055239;WS=18055221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	18057982	rs9310538	A	G	119.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=61;SC=GAGGGACCTAATGGGAGGGCG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=18057990;WS=18057972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	18058059	rs9310539	A	G	231.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=2;PP=116;SC=CTGAGATCTGATTGTTTAAAC;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=18058067;WS=18058049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	18058093	rs62240226	C	G	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.71;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	18308436	rs7432753	A	G	1837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=7;PP=1519;SC=TTGACCAACAAAGGTCTAAAT;SOR=3.342;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=53;WE=18308444;WS=18308426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	18419553	rs9310557	C	T	1167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=0;PP=1038;SC=ATCCTAGACACAGAGGCCTCT;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=18419561;WS=18419543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	18419859	rs10460976	G	A	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=804;SC=TTCATTGGCTGAATTGTTTTG;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=18419867;WS=18419849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	18427924	rs2229261	G	T	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=2;PP=579;SC=TGCTGATGAGGGGGGCAGGAC;SOR=3.690;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=18427932;WS=18427914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	19436587	rs10470642	T	C	281.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=202;SC=GCTCTGTCTCTTACCACAGGT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=19436595;WS=19436577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	19556990	rs56353870	AT	A	259.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=147;SC=TGTTATGGGCATTTTTTTTTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=10;WE=19556998;WS=19556980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	19946992	rs2931394	G	A	181.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=146;SC=TTTTTTTCTAGTCATCTTGTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=19947000;WS=19946982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	19959756	rs2929366	G	A	3124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=61;PP=2414;SC=TGTCGTATTGGTTGTGTCCAT;SOR=1.270;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=38;TCR=62;TR=99;WE=19959764;WS=19959746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr3	19961330	rs2931403	C	T	1504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=5;PP=1327;SC=CTTACCAGTACTGAAATTTTA;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=41;TCR=5;TR=46;WE=19961338;WS=19961320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	19962044	rs13078867	G	A	2874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=45;PP=2229;ReadPosRankSum=1.109;SC=TAACCAACTGGAATAACTTTT;SOR=0.268;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=51;TCR=45;TR=95;WE=19962052;WS=19962034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,95:0.99:96
chr3	19962223	rs13079262	G	A	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=341;SC=ATCTTCATACGTAACAAACAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=19962231;WS=19962213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	19974700	rs2929350	T	C	1197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=863;ReadPosRankSum=-0.663;SC=TTAGTTCCTATGGAAAGTGGA;SOR=0.765;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=41;WE=19974708;WS=19974690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr3	19975215	rs17795400	C	A	6245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=123;NR=75;PP=2965;SC=AGGTTTTGTTCCCTGTGAAGC;SOR=1.207;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=199;TCF=123;TCR=76;TR=198;WE=19975223;WS=19975205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr3	19975582	rs2929349	A	G	407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=308;SC=CTGGCTACAAAGACGCCTCCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=19975590;WS=19975572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	19992432	rs6773437	G	T	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=0;PP=734;SC=GGCCAAATACGGGAAATAAAA;SOR=5.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=19992440;WS=19992422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	20017489	rs4858122	GG	CC	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=2;PP=831;SC=AAAGATGCTTGGTAACCATTT;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=20017498;WS=20017479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	20025665	rs34961993	G	GA	185.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=118;SC=AGTCACCTGTGAAAAAAAAAT;SOR=2.833;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=20025673;WS=20025655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	20027708	rs11128931	A	G	1111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=31;PP=836;SC=AGAAATTTTTATCCTAGAGAT;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=20027716;WS=20027698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	20042462	rs13093485	G	A	2183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=6;PP=1788;SC=AGCATGAGGGGTTTTGCTGCA;SOR=4.343;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=59;TCR=6;TR=65;WE=20042470;WS=20042452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	20042834	rs4103004	C	T	3352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=61;PP=2847;ReadPosRankSum=-0.882;SC=TCTATTGCTGCGTATTCTTCT;SOR=0.361;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=47;TCR=62;TR=108;WE=20042842;WS=20042824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,107:0.99:108
chr3	20053581	rs2686326	C	T	2550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.340;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=32;PP=1850;ReadPosRankSum=-0.745;SC=TTGGAATTACCTTTCTTTGCC;SOR=0.502;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=72;TCF=39;TCR=33;TR=71;WE=20053589;WS=20053571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,81:0.99:82
chr3	20113830	rs3021408	G	A	2161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=9;PP=1793;SC=TTTAGGCCGAGGAGTCTTGTA;SOR=3.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=56;TCR=9;TR=65;WE=20113838;WS=20113820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	20113989	rs3749180	C	A	1803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=45;PP=1483;SC=ATAACGAGTTCATTGTAGCGT;SOR=2.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=55;WE=20113997;WS=20113979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	20114044	rs3828349	T	C	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.49;SOR=3.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	20114048	rs3828348	G	A	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.43;SOR=3.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	20136611	rs2293140	C	T	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=77;SC=TTCAGTCCTACAGGAGTTCAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=20136619;WS=20136601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	20136645	rs2293141	A	T	402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=334;SC=TTACCAGTGAACTTAAAGGAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=20136653;WS=20136635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	20141301	rs11128939	T	G	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=1;PP=338;SC=GAGAGAGAGATAGACATACCA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=20141309;WS=20141291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	20141356	rs35424474	C	T	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=4;PP=772;SC=CTTTGCAGCTCTTGAGAAAGT;SOR=3.193;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=20141364;WS=20141346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	20142360	rs4858764	T	C	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=233;SC=TGATAGCAGGTTTTTGATTAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=20142368;WS=20142350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	20143020	rs4858155	G	C	2049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=55;PP=1776;SC=ACCTAAAATTGTACTTGACTC;SOR=3.407;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=9;TCR=55;TR=64;WE=20143028;WS=20143010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	20156302	rs2365794	T	C	599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=448;SC=AAGGTGATTGTCACAGATAAT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=20156310;WS=20156292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	20168875	rs41285061	C	G	1055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=0;PP=838;SC=ATTTATATAACTAGGATAGGT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=20168883;WS=20168865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	20188074	rs2686314	C	T	309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=232;SC=GCAAATGTTACCCTTTTATGT;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=20188082;WS=20188064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	20212189	rs1052930	A	G	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=1;PP=351;SC=AATATCCAACAAAACCTTCAT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=20212197;WS=20212179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	20218306	rs77405492	A	C	260.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=185;SC=AAACCAAAGGACACTTATGCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=20218314;WS=20218296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	20219885	rs6550402	C	T	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=16;PP=657;SC=GAAGTATTCACAAGAAAGCAT;SOR=1.214;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=12;TCR=16;TR=28;WE=20219893;WS=20219875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	21462754	rs451242	A	G	1283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=6;PP=946;SC=GAATGGGTCCAGGAGCTGGCC;SOR=3.306;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=44;WE=21462762;WS=21462744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	21462787	rs427233	G	A	2245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=16;PP=1683;SC=GAGGAAGCGCGGAAGTCTGGA;SOR=2.271;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=53;TCR=16;TR=69;WE=21462795;WS=21462777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	24006477	rs4858097	T	A	1093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=3;PP=933;SC=GGTTTGTCCATTGAGTAAGTC;SOR=4.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=32;WE=24006485;WS=24006467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	24270289	rs75964684	T	C	1036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=11;PP=847;SC=TAGGGAGGTATTCACAGGATT;SOR=1.352;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=30;WE=24270297;WS=24270279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	24562877	rs11714172	G	T	3756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=69;PP=2895;SC=GGCCCCACCCGCCCTGTTCTT;SOR=1.247;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=43;TCR=69;TR=112;WE=24562885;WS=24562867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr3	24563021	rs74928881	G	C	994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=759;SC=GGCTCAGGGAGCTTCAGAGCA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=24563029;WS=24563011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	25775253	rs1488992	T	C	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=0;PP=724;SC=AATATTCTTGTTTATAAAACA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=25775261;WS=25775248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	25775356	rs6550987	A	C	2863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=22;PP=2470;SC=AGATAGCCACACCATACCTGC;SOR=2.276;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=68;TCR=22;TR=90;WE=25775364;WS=25775346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr3	25805879	rs11129208	T	C	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=351;SC=CACACAGAAATGTATAATGAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=25805887;WS=25805869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	25836023	rs9831075	C	T	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=31;PP=907;SC=TTTTTAAATGCTATATGTGAA;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=25836031;WS=25836013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	25902401	rs4681082	G	C	186.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=151;SC=TGTAGGAATTGAAGATGAGAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=25902409;WS=25902391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	25904394	rs6550999	T	C	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=364;SC=TATAGACTACTCTAGACATTA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=14;WE=25904402;WS=25904384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	27184801	rs10865812	T	A	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=0;PP=786;SC=TTATACTATGTTTCTGATTTG;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=27184809;WS=27184791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	27203864	rs62255210	C	T	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=366;SC=AATTACCACCCAAGCATCGTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=27203872;WS=27203854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	27204052	rs17854381	G	A	1663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=16;SC=CCCTGAGCATGTGGGGTGGCA;SOR=1.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=54;WE=27204060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	27233376	rs11926580	G	T	354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=296;SC=ATACAGAAATGGATATAAATA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=27233384;WS=27233366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	27233498	rs11926556	C	A	2060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=25;PP=1573;SC=CATCATGAACCGATTGAAATA;SOR=1.284;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=41;TCR=25;TR=66;WE=27233506;WS=27233488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	27243045	rs17680166	G	C	3053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=45;PP=2463;SC=TACCTTCTGGGACTGGTTCAT;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=48;TCR=45;TR=93;WE=27243053;WS=27243035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr3	27243119	rs17680194	G	A	2170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=50;PP=1711;SC=GGCCACGGATGTCTTTGAATA;SOR=2.015;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=17;TCR=50;TR=67;WE=27243127;WS=27243109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	27243871	rs34940413	T	C	580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=4;PP=435;SC=AGAAAAAGAATTGCATTTTTA;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=27243879;WS=27243861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	27294507	rs2166214	A	T	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.30;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	27296796	rs1550769	C	G	3081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=68;PP=2461;SC=CATGAAACCACTTTCAAGAAT;SOR=1.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=29;TCR=68;TR=97;WE=27296804;WS=27296786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr3	27296822	rs1550768	A	T	2445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=55;PP=2083;SC=TGTAAAACATATCCAGTAAGA;SOR=2.432;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=72;TCF=16;TCR=56;TR=71;WE=27296830;WS=27296812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr3	27297684	rs12494667	C	A	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=361;SC=ATAAAATAAGCTTTCTTTCCT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=27297692;WS=27297674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	27297816	rs3213930	G	C	1365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=20;PP=889;SC=CAACCACAGAGGTGAGTTTAC;SOR=0.866;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=23;TCR=20;TR=43;WE=27297824;WS=27297806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	27326097	rs11129280	G	T	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=4;PP=577;SC=ACTTACTAACGGTTACTTTGT;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=27326105;WS=27326087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	27326451	rs10510594	A	G	1126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=29;PP=895;SC=ACAACCTATCATCTATATAAA;SOR=2.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=36;WE=27326459;WS=27326441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	27326553	rs34894168	AC	A	195.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=4;PP=244;SC=TCTGTGCGGGACACTAACACT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=27326561;WS=27326543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	27329417	rs10510593	A	C	255.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=182;SC=GTTGCTTATAAACTGATCTGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=27329425;WS=27329407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	27332282	rs62255594	C	T	180.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=153;SC=ACAAAAGGAACAGGGTAAAGA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=27332290;WS=27332272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	27332820	rs10510592	A	G	2996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=57;PP=2411;SC=TATATATTTCAAAGGAGCTTT;SOR=1.289;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=33;TCR=57;TR=90;WE=27332828;WS=27332810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr3	27335350	rs633157	A	T	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=83;SC=TGTAGAATGCAGGGAATATTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=27335358;WS=27335340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	27350384	rs77257134	G	T	1363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=10;PP=1036;SC=TATAGTAGCAGAACTGGAAAG;SOR=2.409;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=42;WE=27350392;WS=27350374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	27353716	rs552647	C	A	1128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=31;PP=918;SC=CCAAAAGCACCCAAGGAAGCA;SOR=4.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=33;WE=27353724;WS=27353706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	27363637	rs11393122	T	TA	1450.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=1;PP=913;ReadPosRankSum=1.705;SC=TTATAACAAGTAAAAAAAAAA;SOR=3.841;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=67;TCF=63;TCR=4;TR=49;WE=27363645;WS=27363627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr3	27387462	rs56104872	G	GGTAA	2246.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=0;PP=2067;SC=ATTAAGAATCGCTATGGTAAA;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=31;WE=27387471;WS=27387452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	27387463	rs2370957	C	A	2255.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=0;PP=1029;SC=TTAAGAATCGCTATGGTAAAT;SOR=7.903;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=32;WE=27387471;WS=27387452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	27394419	rs12494966	T	G	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=22;PP=682;SC=TCCTTTAAAATTAAACCAGAG;SOR=1.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=27394427;WS=27394409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	27424718	rs1472256	A	G	5507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=99;PP=2965;SC=TATCATCATCATCTTGAAGCA;SOR=0.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=85;TCR=99;TR=184;WE=27424726;WS=27424708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr3	27427616	rs17630711	A	G	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=395;SC=AATGCTTCATATAGTTTAAAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=27427624;WS=27427606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	27525403	rs148062123	GGGGATGGCGA	G	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=2;NR=0;PP=562;SC=GCCACACAAAGGGGATGGCGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=27525420;WS=27525393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	27759338	rs9866625	C	A	311.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=6.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQRankSum=-0.615;QD=14.85;ReadPosRankSum=-0.494;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr3	27763427	rs368178421	G	GCGGCGC	1064.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=5;PP=1124;SC=GGCGGCGGCGGCTGCAGCGGC;SOR=2.066;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=25;WE=27763435;WS=27763417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	28358057	rs11706332	C	T	273.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=196;SC=AGTTCCAGTACAGTCTTAAAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=28358065;WS=28358047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	28373462	rs139773536	C	CA	2653.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.44;MQRankSum=0.052;QD=26.54;ReadPosRankSum=-0.774;SOR=0.444;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,98:0.98:100
chr3	28381887	rs3762797	A	T	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=308;SC=AAAAGATAAAAATTACCTTTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=28381895;WS=28381877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	28520417	rs1563656	T	A	1259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=22;PP=900;SC=CTATCAAAACTACAAGGTGTA;SOR=0.954;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=39;WE=28520425;WS=28520407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	28533458	rs13099814	A	G	529.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=287;ReadPosRankSum=0.950;SC=TAAACAATGGACAGCTCAGTT;SOR=3.056;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=12;WE=28533466;WS=28533448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr3	28557206	rs10539083	CTG	C	278.76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=192;SC=AAAAGATTTCCTGTGTGTGTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=28557215;WS=28557196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	28557236	rs7617655	G	A	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=110;SC=GTGTGTGTGTGTATACACATA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=28557244;WS=28557226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	29628479	rs3773103	A	T	1214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=0;PP=998;SC=TAAGAGCCTAATGTTCAACCA;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=29628487;WS=29628469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	29628739	.	TTGTG	T	391.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.357;ClippingRankSum=0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.47;MQRankSum=3.479;QD=35.61;ReadPosRankSum=-1.460;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr3	29804300	rs7340719	C	A	175.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=140;SC=GGGTACAATTCTCAAATCAAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=29804308;WS=29804290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	29804487	rs1371839	A	T	1582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=12;PP=1337;ReadPosRankSum=-0.800;SC=CCAGGTAAGAAATTCACTAAT;SOR=1.054;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=54;TCF=42;TCR=12;TR=53;WE=29804495;WS=29804477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr3	29804509	rs1371840	T	C	1688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=22;PP=1223;ReadPosRankSum=1.221;SC=AGTGACTGAATGATGCCGAGG;SOR=0.976;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=60;TCF=37;TCR=23;TR=57;WE=29804517;WS=29804499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,62:0.97:64
chr3	29977739	rs1449287	T	C	2519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=63;PP=1987;SC=TCAGATGTGATATTCTCCATT;SOR=3.145;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=12;TCR=63;TR=75;WE=29977747;WS=29977729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr3	30029724	rs1868491	C	T	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=30;PP=955;SC=AGTAAGTCTACCCCTGTCTAA;SOR=3.026;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=36;WE=30029732;WS=30029714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	30032470	rs3773125	T	C	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=323;SC=TAGCTGAGGGTATCTCTACTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=30032478;WS=30032460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	30045552	rs55920068	CAATT	C	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=457;SC=TGTGGTCTGACAATTTATTTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=30045563;WS=30045542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	30713126	rs11466512	T	A	1175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=10;PP=930;SC=TGTTTCCCCATCAGAATATAA;SOR=2.012;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=37;WE=30713134;WS=30713116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	30769948	rs7617829	C	T	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=336;SC=AAGACCAGAACATCAAGGCAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=30769956;WS=30769938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	30842298	.	GACACACAC	G	304.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=297;SC=GACACAGATAGACACACACAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=2;WE=30842313;WS=30842288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	30885806	rs1494738	T	C	2945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=20;PP=2326;SC=AATTAACAGATAATGATACTG;SOR=2.380;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=89;TCF=68;TCR=21;TR=88;WE=30885814;WS=30885796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr3	30903008	rs6774917	T	C	1680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=0;PP=1443;SC=TCCCATTTGCTTTCTATTCAG;SOR=7.864;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=50;TCR=0;TR=50;WE=30903016;WS=30902998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	30903304	rs1393745	C	T	3441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=94;PP=2763;SC=TCTAATTACACCACATAACAA;SOR=5.323;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=6;TCR=95;TR=100;WE=30903312;WS=30903294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr3	30935904	rs11921654	G	A	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=4;PP=1287;ReadPosRankSum=-0.844;SC=TAACCTTTTAGGTACGGAAAA;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=46;WE=30935912;WS=30935894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr3	31621228	rs58289734	T	TAAA	968.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=0;PP=793;SC=AATGTAATGATGAAGAGTACA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=31621236;WS=31621218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	31642037	rs11713598	A	T	250.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=208;SC=TATTTGGTCAATATTATGCAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=31642045;WS=31642027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	31658678	rs368561756	C	CTT	207.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=22;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=0;NR=6;PP=79;SC=TGATTTTTTTCTTTTTTTTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=31658686;WS=31658668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	31663515	rs10662891	A	AGTGTG	637.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=767;SC=TTGGTTTTATAGTTTTAAGTA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=13;WE=31663523;WS=31663505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	31677395	rs11129457	T	G	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=360;SC=TCATCATAGTTCAGTAAACCA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=31677403;WS=31677385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	31725316	rs2278959	G	A	3029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=47;PP=2445;SC=TTGGGTGTTCGTGACAGCTGG;SOR=0.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=46;TCR=47;TR=93;WE=31725324;WS=31725306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr3	31725691	rs2278960	T	C	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=27;PP=923;SC=CAACCACTGTTAAGCAAATTC;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=31725699;WS=31725681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	31839135	rs7653447	A	G	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=252;SC=GCAAAAGGTCACAGCTATTTT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=31839143;WS=31839125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	31839242	rs7643025	T	C	1949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=15;PP=1357;SC=CACAATACAATGTACCAGAAA;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=48;TCR=15;TR=62;WE=31839250;WS=31839232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	32022333	.	GCA	G	105	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=22;MQ=59.24;NF=3;NR=1;PP=105;QD=27.5;SC=ACACACGCACGCACACACACA;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=4;WE=32022342;WS=32022323;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr3	32022680	rs76150980	G	C	174.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=6;PP=105;SC=ATGGTCCGTGGGCGCCCGGGA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=32022688;WS=32022670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	32022771	rs62244394	C	G	215.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=5;PP=176;SC=GCCGCGCGTGCCTGCTCCAAA;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=32022779;WS=32022761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	32031962	rs1808125	A	G	2432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-5.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.155;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-5.455;NF=41;NR=55;PP=2348;ReadPosRankSum=4.360;SC=AAGACCTTCCATCACAATTCA;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=42;TCR=56;TR=96;WE=32031970;WS=32031952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:55,89:0.62:144
chr3	32148085	rs1077601	C	T	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=0;PP=547;SC=TGGCCGCGACCATTGGCGGAG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=32148093;WS=32148075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	32188006	rs9839702	G	A	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=0;PP=732;SC=ATCCTATCATGAACATGTTAC;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=32188014;WS=32187996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	32200233	rs2305362	G	A	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=294;SC=CAAGAGCAGAGCCCGGCATTG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=32200241;WS=32200223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	32200322	rs2305361	T	C	1472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=11;PP=1247;SC=TCCATACCCGTGGTGGGTGCT;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=46;WE=32200330;WS=32200312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	32200972	rs57228367	A	G	334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.31;QD=33.48;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	32200973	rs59329824	G	A	334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.47;QD=30.43;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	32207606	rs6799559	A	G	1655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=46;PP=1319;SC=ACATGCAAACATGTGAATGGT;SOR=7.864;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=46;WE=32207614;WS=32207596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	32493682	rs342745	A	G	2016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=56;PP=1771;SC=CCCAACCTGGAGGACTGGGGC;SOR=4.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=5;TCR=56;TR=61;WE=32493690;WS=32493672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	32746522	rs7429569	A	G	213.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=174;SC=AATTTATGAAACACAAATAGT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=32746530;WS=32746512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	32758763	rs11129531	G	A	1388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=33;PP=997;SC=TTTTCAATTTGTGTCTTTCTT;SOR=2.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=40;WE=32758771;WS=32758753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	32815231	rs2396631	A	T	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=22;PP=669;SC=TACCCCTGACATTTGGCCAAA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=32815239;WS=32815221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	32915214	rs6799979	C	G	2399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=12;PP=1880;SC=GGAAGCTGGTCGTTCGGTTGT;SOR=3.167;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=72;TCF=60;TCR=12;TR=71;WE=32915222;WS=32915204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	32927509	rs6774703	G	T	2553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=57;PP=2046;SC=AAGCCGTGACGGCGAGGCATA;SOR=1.582;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=28;TCR=57;TR=85;WE=32927517;WS=32927499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr3	32933344	rs10630076	G	GTC	760.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.579;NF=1;NR=21;PP=945;ReadPosRankSum=0.975;SC=GTGTGTGCGTGTCTCTCTCTC;SOR=1.022;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=47;TCF=1;TCR=46;TR=22;WE=32933352;WS=32933334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,25:0.83:30
chr3	33055721	rs4302331	A	G	1763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=31;PP=1332;SC=AGGTGGCTGCACACTGCATCC;SOR=0.831;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=27;TCR=31;TR=58;WE=33055729;WS=33055711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	33093190	rs12632196	T	C	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=2;PP=973;SC=ACACCCCTCCTCAAATTAATC;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=36;WE=33093198;WS=33093180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	33099880	rs7637435	T	C	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=25;PP=574;SC=TAATGACTGCTGGAAAAATTT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=33099888;WS=33099870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	33138544	rs7614776	A	G	9052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.04;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr3	33138549	rs7637099	G	A	9058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.62;SOR=0.896;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr3	33165303	rs4320036	C	G	44.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=1;PP=27;SC=ATTTTTAGTACAGATGGGGTT;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=33165311;WS=33165298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr3	33165436	rs6777433	T	A	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=7;PP=646;SC=ATTGAGGTACTATTTATATAC;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=33165444;WS=33165426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	33171659	rs4392367	A	G	1614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=45;PP=1359;SC=AGAGTTCATCAAGGTCCACTG;SOR=7.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=45;WE=33171667;WS=33171649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	33175793	rs4234239	C	A	1681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=39;PP=1360;ReadPosRankSum=-0.847;SC=CTGGTGGCTACGAGAAAATAT;SOR=1.688;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=48;TCF=8;TCR=40;TR=47;WE=33175801;WS=33175783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr3	33194990	rs6810039	C	A	8024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=124;NR=131;PP=2965;SC=TCCAAGCCCCCTCTGTCACAG;SOR=0.757;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=255;TCF=124;TCR=131;TR=255;WE=33194998;WS=33194980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr3	33255592	rs9637517	A	G	1065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=18;PP=778;SC=AGCACAAAGAACTTTCCTGTG;SOR=0.941;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=14;TCR=18;TR=31;WE=33255600;WS=33255582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	33434128	rs62252101	G	A	2602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=59;PP=2126;ReadPosRankSum=0.109;SC=AAGTAAATGCGTAAGTACAAT;SOR=1.036;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=22;TCR=60;TR=81;WE=33434136;WS=33434118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr3	33444286	rs623244	T	G	1416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=18;PP=1045;SC=TCACACAAACTAGATACCTGT;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=25;TCR=18;TR=43;WE=33444294;WS=33444276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	33618551	rs11391504	G	GA	492.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.80;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	33626219	rs371484858	TA	T	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.793;QD=2.20;ReadPosRankSum=0.660;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr3	33725814	rs111738010	GA	G	33.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=1.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.899;QD=0.36;ReadPosRankSum=-1.128;SOR=0.370;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,16:0.17:95
chr3	33879770	rs3203777	G	A	1169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=25;PP=926;SC=AGCCGATTTGGTTAACAGATC;SOR=2.242;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=34;WE=33879778;WS=33879760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	35723375	.	G	A	1635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=32;PP=1341;SC=AACTGCAGGTGAGTGAGCATG;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=55;WE=35723383;WS=35723365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	35724256	rs1513475	T	C	472.85	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.55;ReadPosRankSum=1.912;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr3	35725250	rs969818	C	T	1450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.949;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=14;PP=1079;ReadPosRankSum=-0.686;SC=TGACTCGCAGCCTTGCTGTCT;SOR=1.616;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=46;WE=35725258;WS=35725240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr3	35731725	rs1513476	C	T	566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=475;SC=TAGGGATAGACAAAACATTGT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=35731733;WS=35731715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	35756778	rs2305233	A	T	966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=0;PP=858;SC=AATCCTAACCAACCTTTTTCC;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=35756786;WS=35756768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	36422064	rs59881573	G	A	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=550;SC=CCTGGCGCGCGGCGGGCAGGG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=36422072;WS=36422054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	36422126	rs113135397	C	T	2379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.27;SOR=5.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	36422135	rs112766131	G	A	2644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.36;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	36422216	rs73052248	T	C	4295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=63;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.633;SC=AACCGCCCTCTCCTGCATCCA;SOR=0.301;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=136;TCF=73;TCR=63;TR=135;WE=36422224;WS=36422206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,140:0.99:141
chr3	36422392	rs76102263	G	A	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.229;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=12;PP=339;ReadPosRankSum=2.638;SC=ACGTCCGGTAGGACCCGCTGC;SOR=0.035;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=13;WE=36422400;WS=36422382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr3	36484823	rs3749279	C	T	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=403;SC=ATCCATTGATCGTAAGAGAGA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=36484831;WS=36484813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	36534540	rs2290528	G	A	1334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=4;PP=1051;ReadPosRankSum=1.439;SC=GGGTCCTTATGTGTCATGCAA;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=42;WE=36534548;WS=36534530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr3	36570279	rs75665620	A	T	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=5;PP=652;SC=AGAGAAAATCATTTGGTAACT;SOR=2.066;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=36570287;WS=36570269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	36587526	rs10717668	CT	C	721.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=776;SC=TTTATCAAACCTTTTTCTCAC;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=22;WE=36587534;WS=36587516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	36587544	rs7645444	G	A	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=1;PP=749;SC=CACTGTGCTGGTTTCCCACCC;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=36587552;WS=36587534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	36779707	rs3796187	G	A	6767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=92;PP=2965;ReadPosRankSum=1.065;SC=GGCTCTGCTGGAGCTCCCTCT;SOR=0.297;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=109;TCR=92;TR=200;WE=36779715;WS=36779697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,209:1.00:210
chr3	36896653	rs9818599	G	C	1607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=2;PP=1350;SC=AAACCCAAGAGCTGGACTTAC;SOR=4.493;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=45;TCR=2;TR=46;WE=36896661;WS=36896643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	36900073	rs113115457	T	C	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=253;SC=CCAGGTGACATGGGCAGGCCT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=36900081;WS=36900063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	37067092	.	TATATA	T	144	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.26;QD=36.00;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	37067099	rs6771325	A	T	153.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.26;QD=38.26;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	37067120	.	T	A	280	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5076;HP=20;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=28;MQ=52.71;NF=11;NR=2;PP=280;QD=24.2131701959;SC=TTTTTTTTTTTAATACAGACT;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=13;WE=37067128;WS=37067110;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,13:0.65:20
chr3	37067120	.	TAATACAGAC	T	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.518;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.99;MQRankSum=-3.072;QD=3.21;ReadPosRankSum=-1.644;SOR=0.245;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,4:0.17:23
chr3	37070437	rs41562513	G	A	1897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=56;PP=1543;SC=CGTAAACGCTGTGGCCTGCCT;SOR=5.353;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=58;TCF=2;TCR=56;TR=58;WE=37070445;WS=37070427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	37096024	rs749072	T	C	3872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=87;PP=2965;SC=TATGAGAACATAGGCCTCTAG;SOR=2.100;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=32;TCR=88;TR=119;WE=37096032;WS=37096014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr3	37150988	rs6806252	C	G	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=822;ReadPosRankSum=0.705;SC=CCCACCAGCACTGCACACACT;SOR=2.115;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=29;WE=37150996;WS=37150978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr3	37151157	rs36068826	T	C	1689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=29;PP=1268;ReadPosRankSum=1.727;SC=GTCACTCTTATATGTTGCCAG;SOR=0.321;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=53;TCF=23;TCR=30;TR=52;WE=37151165;WS=37151147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr3	37163039	rs336595	G	A	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=21;PP=1213;SC=TGATAAAAATGAAAATAAACA;SOR=0.994;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=28;TCR=21;TR=49;WE=37163047;WS=37163029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	37512646	rs11713408	TG	CC	4025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=61;PP=2947;SC=ATTACTGCTGTGGTGGAAATG;SOR=2.435;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=81;TCF=17;TCR=64;TR=78;WE=37512655;WS=37512636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr3	37522828	rs197757	G	A	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=446;SC=CTGATGCCCAGAAAAGTGCCT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=37522836;WS=37522818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	37535865	rs472893	TG	CA	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=1;PP=586;SC=CCAGTCTGGATGGCATCCCTG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=37535874;WS=37535855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	37535984	rs2507940	C	G	1656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=18;PP=1343;SC=CTCCTTCCTTCCCCCTAGAGT;SOR=1.487;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=52;WE=37535992;WS=37535974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	37536225	rs267523	C	A	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=3;NR=9;PP=350;SC=TCTACCTGCCCGGAGGGCACC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=37536233;WS=37536215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	37560597	rs17815094	C	T	284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.78;QD=28.48;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	37574951	rs267561	G	A	2701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=55;PP=2132;SC=CACGTTCCAGGAGAGATTGGT;SOR=1.312;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=32;TCR=55;TR=87;WE=37574959;WS=37574941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr3	37575039	rs267560	G	A	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=578;SC=GTTCCCTGTCGCTGTTCCTCC;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=37575047;WS=37575029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	37583851	rs2844349	A	C	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=196;SC=GTGACAAGGAAAAGAGGTGGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=37583859;WS=37583841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	37627112	rs1155741	T	C	2197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=35;PP=1676;SC=CCATATTACATTCCAAGAAGG;SOR=1.066;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=60;WE=37627120;WS=37627102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr3	37627149	rs1155742	G	A	2302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=43;PP=1828;SC=TGTGGCTAAAGAAGTCTCAAC;SOR=1.451;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=66;WE=37627157;WS=37627139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	37627286	rs140414819	G	GCC	324.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=10;PP=242;SC=GGAAGAAGGGGGCCCCCCCAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=10;WE=37627295;WS=37627276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	37627287	rs2364183	G	C	467.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=12;PP=288;SC=GAAGAAGGGGGCCCCCCCAAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=37627295;WS=37627276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	37818805	rs2276003	G	C	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=0;PP=610;SC=TACCACTCCTGCCTCTACAAT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=21;WE=37818813;WS=37818795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	37953024	rs13099971	G	C	1738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=0;PP=1492;SC=AATAATGAAGGCTTCTTTATC;SOR=7.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=51;WE=37953032;WS=37953014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	37953083	rs13079669	T	A	2784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=6;PP=2262;SC=ACCCCCAACATGAACCTTTGG;SOR=4.590;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=74;TCR=6;TR=80;WE=37953091;WS=37953073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	38049930	rs191071095	C	T	2074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=39;PP=1656;SC=GGCACCTGTCCCTCCTAGGTC;SOR=1.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=65;WE=38049938;WS=38049920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	38050808	.	C	T	2801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=54;PP=2266;SC=GAGAAGGACGCCATCTCGTAG;SOR=1.191;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=36;TCR=54;TR=90;WE=38050816;WS=38050798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr3	38134438	rs11129778	A	G	1530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=42;PP=1265;SC=GCCACTGACCACAGTAGCATT;SOR=4.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=45;WE=38134446;WS=38134428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	38348686	rs753330	T	G	1687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=7;PP=1332;SC=CTGGGATGAGTCTCAGTCTCT;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=51;WE=38348694;WS=38348676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	38350479	rs818819	T	C	2821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=19;PP=2222;SC=ACCGGGCCCATGCCATTATCC;SOR=2.380;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=69;TCR=19;TR=88;WE=38350487;WS=38350469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr3	38350519	rs818818	G	A	3669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=48;PP=2722;SC=TGTTGGGGCCGTGTTGCTGAC;SOR=1.010;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=65;TCR=48;TR=113;WE=38350527;WS=38350509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr3	38350543	rs818817	A	G	3509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=57;PP=2682;SC=GATCGCCTACAGTCTTCCCCA;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=58;TCR=57;TR=115;WE=38350551;WS=38350533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr3	38350630	rs704929	C	A	2851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=56;PP=2420;SC=AAGCGAGTACCGGGCATGTAC;SOR=1.694;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=28;TCR=56;TR=84;WE=38350638;WS=38350620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	38354390	rs695939	A	G	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=3;PP=530;SC=GAATCACCTCATGCTGGCACA;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=38354398;WS=38354380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	38355176	.	T	TGTGTGTGTGTGTGTGCGCGCGC	957.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;QD=63.85;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	38355509	rs696253	C	T	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=5;PP=138;SC=CCGCCTGCCACGGCCGGCCAC;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=38355517;WS=38355499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	38390020	rs2615631	C	A	3711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=42;PP=2877;SC=TCTACACTTCCTTTTTTAAAA;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=73;TCR=42;TR=115;WE=38390028;WS=38390010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr3	38401677	rs818851	C	T	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=2;PP=402;SC=TTGCAGCCCTCGTGCCTGTTC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=38401685;WS=38401667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	38401839	rs818850	T	C	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=28;PP=973;SC=GGACTCAGGGTGGTGTTCATG;SOR=1.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=46;WE=38401847;WS=38401829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	38401918	rs818849	A	G	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=17;PP=481;SC=AGGGATTCCTATTCTCCTTCT;SOR=2.737;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=38401926;WS=38401908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	38402007	rs818848	T	A	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=2;PP=84;SC=GCATCTGTTGTCACCAGGTCC;SOR=1.609;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=38402015;WS=38401997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	38406648	rs704942	T	C	1015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=11;PP=767;SC=GCTGTGACACTGGTGTGTGGT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=34;WE=38406656;WS=38406638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	38406773	rs704943	G	T	1318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=26;PP=977;SC=ACCAGCAGCTGCAGGTAACTG;SOR=1.364;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=41;WE=38406781;WS=38406763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	38406793	rs2234608	T	G	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=22;PP=727;SC=GTGGCTACGTTGTGTGAGTGT;SOR=1.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=38406801;WS=38406783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	38408248	rs704946	G	A	2185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=2;PP=1780;SC=GGAGGTAATTGTTCATTCTGT;SOR=6.184;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=62;TCR=2;TR=64;WE=38408256;WS=38408238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr3	38408361	rs843890	G	A	3968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=73;PP=2965;SC=ACTCACATACGGAGGTTGGTT;SOR=1.225;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=45;TCR=73;TR=118;WE=38408369;WS=38408351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr3	38408459	rs2234617	A	G	1304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=38;PP=1115;SC=GACTGAAAACATTGATAAGCA;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=38;WE=38408467;WS=38408449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	38409600	rs704947	T	G	2168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=16;PP=1703;SC=TTTTCATGCTTTGTGTGTGTC;SOR=2.035;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=47;TCR=16;TR=62;WE=38409608;WS=38409590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	38411731	.	G	GCACACACACACA	302	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=0.9998;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.57;NF=0;NR=2;PP=302;QD=152.5;SC=GCACTGTAGCGCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=2;WE=38411739;WS=38411721;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:13,2:0.13:15
chr3	38442490	rs2070488	G	A	3511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.959;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=32;PP=2549;ReadPosRankSum=0.832;SC=AGAGACCATCGGAATTTGTTT;SOR=1.562;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=77;TCR=34;TR=107;WE=38442498;WS=38442480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,115:0.97:118
chr3	38519424	rs2070489	A	G	2835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=42;PP=2113;SC=TCTGCAACGAACGCTTCACTC;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=43;TCR=42;TR=85;WE=38519432;WS=38519414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr3	38521156	rs13097628	T	C	3406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=26;PP=2590;SC=AGTTCTGTGCTGTCTTCTCTC;SOR=2.218;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=79;TCR=26;TR=105;WE=38521164;WS=38521146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr3	38523039	rs140094697	A	C	149.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=117;SC=GGGGAGGTGCAGGGATGAGGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=38523047;WS=38523029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	38524742	rs1046048	C	T	3512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=45;PP=2614;SC=GGTCGGTCAACGGCACTACCT;SOR=1.074;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=63;TCR=45;TR=108;WE=38524750;WS=38524732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr3	38622467	rs7430407	T	C	4841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=54;PP=2965;SC=TCTCCTCATCTTCTTCTTGGT;SOR=1.257;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=87;TCR=54;TR=141;WE=38622475;WS=38622457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr3	38627629	rs7645173	A	G	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=32;PP=911;SC=TGAAAGCCCAAGGAGCCCTTG;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=38627637;WS=38627619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	38648062	rs6599222	C	T	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=210;SC=TCCAAAGCTCCCACCAGTGGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=38648070;WS=38648052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	38674712	rs6599230	T	C	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=24;PP=1015;SC=CTTGCTTCTCTGCCATGCGCT;SOR=0.874;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=45;WE=38674720;WS=38674702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	38739574	rs6599241	T	C	5848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=75;PP=2965;SC=ATGTTGACCATGATGAGGAAG;SOR=1.132;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=115;TCR=75;TR=190;WE=38739582;WS=38739564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr3	38739845	rs6599242	A	G	4472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=62;PP=2965;SC=TACCGAAGATAGAGTAGATGA;SOR=0.864;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=76;TCR=62;TR=138;WE=38739853;WS=38739835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr3	38748797	.	C	T	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=0;PP=935;SC=GCTTCTGGGGCTTCTTGGAGC;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=38748805;WS=38748787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	38749026	rs6599248	T	A	1191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=36;PP=1016;SC=TCTTGCCACATCCAGTGTCGG;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=38;WE=38749034;WS=38749016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	38812650	rs10212338	G	A	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=590;SC=TGGAGCAAACGTTCATGGTGT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=38812658;WS=38812640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	38945560	rs4073113	A	G	1464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=32;PP=1167;SC=GGTTTTCTCCACAAGGGAGAC;SOR=1.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=44;WE=38945568;WS=38945550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	38946872	rs4514993	A	T	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=16;PP=479;SC=TCAAAACTTAACAAACTACTT;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=38946880;WS=38946862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	38949363	rs6599267	A	C	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=8;PP=944;SC=TAAATGAATTATTTCAATTTG;SOR=2.554;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=38;WE=38949371;WS=38949353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	38951753	rs7429404	T	C	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=16;PP=492;SC=CCAAGCTTCTTTTTCCTTCCA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=38951761;WS=38951743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	38961537	rs6779297	T	C	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=18;PP=454;SC=AAAAAAACATTGAAAGGAAAG;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=38961545;WS=38961527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	38967103	rs4676474	C	T	883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=753;SC=GGCCTGTGACCTCCAAGGTGA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=38967111;WS=38967093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	39093638	rs147562907	G	A	1316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=39;PP=1149;SC=GAAGGTGCCCGGCGCCACGAC;SOR=5.994;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=41;WE=39093646;WS=39093628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	39149092	rs6786764	A	G	1987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=25;PP=1565;SC=GACCGACCCGACGCCAGTAGC;SOR=0.906;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=32;TCR=25;TR=57;WE=39149100;WS=39149082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	39166484	rs784508	C	T	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=4;PP=302;SC=TTATCCATGCCCCTTGACCTG;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=39166492;WS=39166474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	39166509	rs784507	A	G	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=6;PP=488;SC=GCTGCTGGCTATGCTTCAGTG;SOR=1.721;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=20;WE=39166517;WS=39166499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	39166743	rs2669852	T	C	407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=5;PP=277;SC=TGCAAGGTGGTCTGGACCTTC;SOR=0.976;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=12;WE=39166751;WS=39166733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	39167905	rs784506	G	A	1356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=33;PP=1076;SC=CCTGACAGCCGGGTGGGGCCT;SOR=2.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=41;WE=39167913;WS=39167895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	39169693	rs1298712	A	G	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=428;SC=AGCAGAACAAAACTGGCTAAA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=39169701;WS=39169683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	39169712	rs1274969	T	C	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=4;PP=549;SC=AAATACTCAATTTTGTATATT;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=39169720;WS=39169702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	39175576	rs784492	G	T	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=3;PP=914;SC=GGACGTTCACGTGGGGAATTC;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=32;WE=39175584;WS=39175566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	39178899	rs784495	C	T	3010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=54;PP=2295;ReadPosRankSum=0.454;SC=TGGGGACTGGCGGGCATGGGC;SOR=0.371;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=41;TCR=55;TR=95;WE=39178907;WS=39178889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
chr3	39179909	rs784497	G	A	1713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=29;PP=1405;SC=GCACGTGAATGGACGTGGGAG;SOR=1.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=20;TCR=29;TR=49;WE=39179917;WS=39179899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	39180099	rs784498	TG	CA	4781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=43;PP=2947;SC=TGGAGGCCATTGAAATCTGCA;SOR=0.987;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=60;TCR=45;TR=99;WE=39180108;WS=39180089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr3	39180162	rs811969	A	C	3378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=61;PP=2650;SC=TGGTGGGGAAACCTGCATGAT;SOR=1.008;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=44;TCR=61;TR=105;WE=39180170;WS=39180152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr3	39180263	rs704959	G	A	1937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=39;PP=1480;SC=AAGGCCCGAAGGTCCCTGAGG;SOR=1.688;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=17;TCR=39;TR=56;WE=39180271;WS=39180253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	39184959	rs1274958	C	T	2934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=26;PP=2349;SC=TCATCCAGGACGCCTGATGTG;SOR=2.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=61;TCR=26;TR=87;WE=39184967;WS=39184949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr3	39185077	rs1274957	G	A	5680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=84;PP=2965;SC=GGTTCCCCACGCTCCCTTCCT;SOR=0.868;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=101;TCR=84;TR=185;WE=39185085;WS=39185067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr3	39185248	rs784519	A	G	3642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=52;PP=2781;SC=AAGATGCTGTAGAAGAATCAG;SOR=0.784;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=50;TCR=52;TR=102;WE=39185256;WS=39185238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr3	39185968	rs810743	A	G	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=457;SC=AGAGGGATGTAAGAAGCACAG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=39185976;WS=39185958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	39186728	rs784517	C	T	1949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=36;PP=1545;SC=CCCGGCGAGCCCGCTTCAGGA;SOR=1.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=23;TCR=36;TR=59;WE=39186736;WS=39186718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	39229900	rs6805248	T	C	3724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=55;PP=2929;SC=AAACAGATGCTGCTGCTGCTG;SOR=0.828;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=67;TCR=55;TR=121;WE=39229908;WS=39229890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr3	39308293	rs4271863	A	T	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=54.16;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=206;ReadPosRankSum=0.253;SC=TTTTTTTTTTAAATGGAGTCT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=39308301;WS=39308283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr3	39323163	rs11715522	A	C	2513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=60;PP=2008;SC=CTGCCAACTTAAACGCCTCCA;SOR=2.425;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=17;TCR=60;TR=77;WE=39323171;WS=39323153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr3	39431081	rs2270770	G	A	1630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=25;PP=1302;SC=AAACACGCCTGCAAACCCTCC;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=50;WE=39431089;WS=39431071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	39433147	rs1995236	G	A	2342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=55;PP=1907;SC=AGGATAGTTCGGCTTAGCCAC;SOR=2.271;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=18;TCR=55;TR=73;WE=39433155;WS=39433137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	39437800	rs9877539	A	G	4405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=29;PP=2965;SC=TAAACATGGGATAACAGAGAC;SOR=2.500;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=104;TCR=29;TR=132;WE=39437808;WS=39437790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr3	39452123	rs2077797	G	A	2166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=44.22;ReadPosRankSum=-0.844;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr3	39452129	rs2077799	G	T	2188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=41.30;ReadPosRankSum=-0.990;SOR=3.219;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,52:0.98:53
chr3	39453610	rs2723	C	T	2709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=40;PP=2186;SC=CAGTTTTATTCTAACTTTAAT;SOR=0.717;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=40;TCR=40;TR=80;WE=39453618;WS=39453600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr3	40204178	rs1714414	T	C	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=3;PP=895;SC=TGAAGACCTTTGATAATCATA;SOR=3.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=40204186;WS=40204168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	40251282	rs2679798	G	A	1912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=20;PP=1443;SC=GGGTTATTGGGAACAAGAAGC;SOR=1.498;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=36;TCR=20;TR=56;WE=40251290;WS=40251272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	40251392	rs1799418	T	C	3029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=45;PP=2237;SC=AGGCTCGGGATCCCCAGACTC;SOR=0.713;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=92;TCF=47;TCR=45;TR=91;WE=40251400;WS=40251382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr3	40251628	rs1799419	G	A	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=397;SC=AGCTTCTGCAGTGGGGTGTTG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=40251636;WS=40251618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	40353259	rs1470937	T	G	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=7;PP=380;SC=GATCATTTCTTTATATACACA;SOR=0.976;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=13;WE=40353267;WS=40353249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	40498845	rs2276868	C	T	2020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=27;PP=1616;SC=CGCCTAACGCCGCCAACATGG;SOR=0.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=32;TCR=27;TR=59;WE=40498853;WS=40498835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	40498933	rs4973904	A	G	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=36;PP=1240;SC=CTGAGGCGCCAAACGGCTCCC;SOR=2.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=47;WE=40498941;WS=40498923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	40503520	.	A	ACTGCTGCTGCTGCTG	1927.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.95;QD=62.18;SOR=1.839;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	40503809	rs11539046	G	A	2252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=60;PP=1817;SC=TGTTGAGGCTGGAGTTAGGAG;SOR=8.380;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=0;TCR=60;TR=60;WE=40503817;WS=40503799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	40505886	rs11129881	C	G	1717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=2;PP=1444;SC=TGGATGATTTCGGATTACCTG;SOR=4.935;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=46;TCR=2;TR=48;WE=40505894;WS=40505876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	40519429	rs4553952	T	C	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=9;PP=857;SC=TCTTACTTTTTCAAACCTAGA;SOR=2.165;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=33;WE=40519437;WS=40519419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	40557271	rs10550548	TTG	T	533.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=1021;ReadPosRankSum=0.226;SC=AGCACAGATATTGTGTGTGTG;SOR=1.981;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=18;WE=40557280;WS=40557261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr3	41497115	rs3816945	C	G	1946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=35;PP=1591;SC=AAATGAAAGACGGTCTTGGTG;SOR=1.278;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=56;WE=41497123;WS=41497105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	41756965	rs61744388	C	T	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=6;PP=560;SC=TGAAGCACTACAGGCATCAGG;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=41756973;WS=41756955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	41756986	rs61744385	A	T	1327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=7;PP=688;SC=GGGAGACACAACTTCAGCTGT;SOR=2.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=41756994;WS=41756976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	41759191	rs17060938	T	C	3462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.107;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=43;PP=2497;ReadPosRankSum=-0.667;SC=AAAGCAGAAATGGGGCCTGAG;SOR=1.028;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=71;TCR=44;TR=114;WE=41759199;WS=41759181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,120:0.99:121
chr3	41795841	rs9867627	A	C	1372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=27;PP=1100;SC=AAACCATCAGAGAAAATCTTA;SOR=1.132;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=46;WE=41795849;WS=41795831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	41831203	rs17215589	C	T	2601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=33;PP=1985;SC=AACATGGCAGCGAATAAGGTC;SOR=0.934;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=43;TCR=33;TR=76;WE=41831211;WS=41831193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	41841716	rs4973986	A	C	1881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=28;PP=1526;SC=AAGCCCTGGGACTGAGCAGAA;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=29;TCR=28;TR=57;WE=41841724;WS=41841706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	41841811	rs149544106	T	TATTA	806.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=825;SC=ATTAAAATAATATTAGTGTGA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=15;WE=41841819;WS=41841801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	41861013	rs59543183	GA	G	2830.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=50;PP=1811;SC=AATGAAGTGGGAAAAAAAAAG;SOR=0.956;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=111;TCF=49;TCR=62;TR=91;WE=41861021;WS=41861003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr3	41877414	rs3774372	T	C	2065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=46;PP=1719;ReadPosRankSum=-0.816;SC=CTGTTTTAATTTGCTGTTCCT;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=62;TCF=15;TCR=47;TR=61;WE=41877422;WS=41877404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr3	41925423	rs1716687	T	C	2399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=31;PP=1862;SC=GTAAACCAATTACGTGAGCAA;SOR=1.079;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=45;TCR=31;TR=76;WE=41925431;WS=41925413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	41938500	rs1717005	G	C	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=14;PP=488;SC=TATCCACTGCGATGGAAAGAA;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=41938508;WS=41938490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	41939993	rs1625226	T	A	1709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=37;PP=1268;SC=ATCTGTGGTTTAAAAAAAAAG;SOR=2.024;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=51;WE=41940001;WS=41939983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	41949301	rs59146151	T	C	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=5;PP=407;SC=AGCTTCTACATCTTATGTAGG;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=41949309;WS=41949291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	41952781	rs1716991	C	T	1933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=9;PP=1571;SC=TTGTCTTGCACTGATCCCTCT;SOR=2.910;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=55;WE=41952789;WS=41952771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	41952852	rs35263917	T	C	2809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=34;PP=2089;ReadPosRankSum=-0.733;SC=TCAAGAGTACTCTTAGGCCGA;SOR=0.392;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=51;TCR=35;TR=84;WE=41952860;WS=41952842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,91:0.99:92
chr3	41977464	rs73071203	A	C	2534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=52;PP=2072;ReadPosRankSum=-0.750;SC=CACCCATTTCAACCCCCTACC;SOR=0.565;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=83;TCF=30;TCR=53;TR=82;WE=41977472;WS=41977454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr3	41978640	rs146197255	AG	A	2777.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=12;PP=2441;SC=GATGAAGGGAAGAGGTATTTG;SOR=2.737;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=56;WE=41978648;WS=41978630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr3	41978738	rs73071208	A	T	2479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=52;PP=1962;SC=CAGAGATCAGAAACAACAGCT;SOR=1.581;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=27;TCR=52;TR=79;WE=41978746;WS=41978728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	41996275	rs7651623	A	G	2547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=58;PP=2072;SC=TCTCACATACAATAGAATAAC;SOR=2.245;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=78;TCF=19;TCR=59;TR=77;WE=41996283;WS=41996265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	41996304	rs17284472	G	A	1942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=11.688;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=53;PP=1584;ReadPosRankSum=1.149;SC=TAGCTCCTAAGAAGTAAACAA;SOR=5.279;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=57;TCF=4;TCR=53;TR=56;WE=41996312;WS=41996294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr3	42133149	rs4974011	C	G	2626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=66;PP=2045;SC=TCTCTTGCTCCGTGCTGCTTG;SOR=3.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=11;TCR=66;TR=77;WE=42133157;WS=42133139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	42202061	rs4974003	G	T	2133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.02;QD=33.34;SOR=4.277;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	42218095	rs1010987	G	C	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=314;SC=CAGGGGTTACGAGTCCCCCTA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=42218103;WS=42218085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	42226151	rs4234445	T	C	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=16;PP=825;SC=CTTTTGAATCTCTGTTCTCCC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=17;TCR=16;TR=33;WE=42226159;WS=42226141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	42230395	rs3816396	C	T	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=331;SC=TTGGGAGAGCCGTCTGGTGGG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=42230403;WS=42230385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	42230743	rs2290135	G	A	170.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=105;SC=TGTACCAGGCGCTCGGCAGAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=42230751;WS=42230733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	42234740	rs2290137	G	A	3136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=61;PP=2395;SC=CAATGGCCATGCTGAGACGGG;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=97;TCF=36;TCR=61;TR=97;WE=42234748;WS=42234730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr3	42236415	rs9851455	A	G	1254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.405;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=923;ReadPosRankSum=-0.728;SC=GCTACCACTCACTGGGCCTGT;SOR=0.578;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=44;WE=42236423;WS=42236405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
chr3	42242687	rs9846541	G	A	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=333;SC=GTGGTGGCTCGCGCCTATAAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=42242695;WS=42242677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	42244321	rs9311309	G	A	3742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=65;PP=2939;SC=TGCGGAAGGCGGGGCACCTCT;SOR=0.932;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=50;TCR=66;TR=115;WE=42244329;WS=42244311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr3	42251577	rs10634555	C	CGGA	1761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.873;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.058;NF=25;NR=6;PP=1348;ReadPosRankSum=-1.565;SC=CCAGCGGCCACGGAGGAGGAG;SOR=2.584;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=88;TCF=60;TCR=28;TR=31;WE=42251585;WS=42251567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,38:0.90:42
chr3	42264393	rs3733053	A	G	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=7;PP=709;SC=TCTGGAGCTCATGGGCATTTC;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=42264401;WS=42264383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	42264422	rs3733054	T	C	1664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=10;PP=1291;SC=AACCTGTCATTTCTTCTTTCA;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=49;WE=42264430;WS=42264412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	42265270	rs3836498	TCTC	T	1977.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=38;PP=1887;SC=AGACCCACGTTCTCCTCTCTT;SOR=5.376;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=39;WE=42265280;WS=42265260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	42265634	rs1043610	C	T	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.788;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=813;ReadPosRankSum=0.371;SC=CGAGCTGTCACGCGGCACGGG;SOR=1.802;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=36;WE=42265642;WS=42265624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,37:0.95:39
chr3	42299870	rs8192472	C	T	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=198;SC=AGTAGTGGAACTGATGGACCA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=42299878;WS=42299860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	42304609	.	A	G	300	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=12;NR=0;PP=300;QD=27.8976010456;SC=CACTGTATCTAGGAACCCTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=42304617;WS=42304608;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	42304784	rs1868522	A	G	5571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=50;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.271;SC=GGACCGCCAGAAATCATGTTG;SOR=0.738;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=160;TCF=109;TCR=51;TR=158;WE=42304792;WS=42304774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,171:0.99:172
chr3	42305131	rs754635	C	G	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=409;SC=ATGGCTGTAGCGAGCAAAGGA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=42305139;WS=42305121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	42555524	rs2278215	G	A	279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=258;SC=CCCACCCCAGGTCTGGGGAGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=42555532;WS=42555514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	42660489	rs10712209	CT	C	159.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=1.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.000;QD=3.55;ReadPosRankSum=1.175;SOR=0.301;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr3	42687278	rs73085333	C	T	197.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=133;SC=CTTGAAAACACTATTGATGTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=42687286;WS=42687268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	42728144	rs6805421	A	G	1993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=25;PP=1519;SC=TCCCTCTCCAACCAGGTCCCC;SOR=0.899;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=32;TCR=25;TR=57;WE=42728152;WS=42728134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	42733468	rs123509	T	C	1753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=39;PP=1427;SC=CAATGTGCTGTGCCTGACTAA;SOR=1.292;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=24;TCR=39;TR=63;WE=42733476;WS=42733458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	42735150	rs11079	T	C	1524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=19;PP=1199;SC=AGTTTTTGCATCCAGAGCTCA;SOR=1.225;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=27;TCR=19;TR=46;WE=42735158;WS=42735140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	42735274	rs339697	A	G	877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=22;PP=643;SC=CTGGGATCACAGCGGAATGCT;SOR=4.332;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=42735282;WS=42735264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	42738297	rs2290973	G	A	1342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=7;PP=1052;SC=ACACCTGGCAGGATGGCTGTG;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=42738305;WS=42738287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	42799554	.	T	TAC	102	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=22;MQ=57.71;NF=3;NR=1;PP=102;QD=26.25;SC=GCTCCGGTGGTACACACACAC;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=42799562;WS=42799544;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,4:0.44:9
chr3	42799858	rs339678	T	A	44.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=1;NR=1;PP=58;SC=GCATCAGAAATGAAGCCTCAG;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=42799866;WS=42799848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr3	42907112	rs2228468	A	C	2110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=41;PP=1610;SC=TCTGAGAACTACCCTAACAAG;SOR=1.410;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=21;TCR=41;TR=62;WE=42907120;WS=42907102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr3	42917047	rs9865715	A	G	2798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=29;PP=2229;SC=TTGAGGATGGAGCCAAAGGAG;SOR=1.504;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=57;TCR=29;TR=86;WE=42917055;WS=42917037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr3	42947776	rs6789928	T	C	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=2;PP=175;SC=CAGAGCGCTCTTCCGCGACCC;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=42947784;WS=42947766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	42954912	rs11129987	C	T	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=18;PP=487;SC=GGACCAGATCCTTAAATCAAC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=42954920;WS=42954902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	42955839	.	AAAG	A	1508.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=2;PP=1261;SC=GAAGAGGAAGAAAGAAGATTT;SOR=4.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=27;WE=42955849;WS=42955829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	42956273	rs1427801	T	C	2181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=57;PP=1708;SC=CACATTGCATTGCACATCAGA;SOR=1.936;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=21;TCR=57;TR=78;WE=42956281;WS=42956263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	42956984	rs834579	A	G	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=427;SC=AACATTTACCATGTACTCTAG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=42956992;WS=42956974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	43073761	rs658958	G	A	2456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=27;PP=1929;SC=TCTCTCAGGCGTCTTGGCTCC;SOR=1.639;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=55;TCR=27;TR=82;WE=43073769;WS=43073751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	43074430	rs2948619	A	G	3942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.30;SOR=0.715;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr3	43074434	rs2936817	C	T	3976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.71;SOR=0.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr3	43074871	rs588335	A	G	3589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=74;PP=2891;SC=TCTGGTGGGCACCCGATGTGC;SOR=1.297;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=45;TCR=75;TR=119;WE=43074879;WS=43074861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr3	43095101	rs536119	A	G	3642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=50;PP=2888;SC=GAGAAATGCCAGAACCCAGCC;SOR=1.241;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=78;TCR=50;TR=128;WE=43095109;WS=43095091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr3	43097710	rs664628	A	G	1284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=17;PP=963;SC=CAGGGTGTCTACAGAACATGC;SOR=0.954;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=22;TCR=17;TR=39;WE=43097718;WS=43097700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	43121559	rs604033	C	T	4651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=81;PP=2965;SC=GAATGAGGGACGGGATGTCCA;SOR=0.978;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=64;TCR=81;TR=145;WE=43121567;WS=43121549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr3	43121762	rs139060322	G	A	4551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=72;PP=2965;ReadPosRankSum=1.938;SC=ACATACTGGAGGTCCATGCCA;SOR=0.286;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=59;TCR=73;TR=131;WE=43121770;WS=43121752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,140:0.99:141
chr3	43122966	rs2936818	G	A	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=8;PP=266;SC=CGGCCACTGGGAAGCACCACA;SOR=2.448;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=43122974;WS=43122956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	43414318	rs6441771	A	G	1042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=9;PP=814;SC=CGTGGAAGAGAGACCAGCTTG;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=34;WE=43414326;WS=43414308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	43591142	rs12638282	G	A	679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=0;PP=516;SC=GACAGCCCGAGACAGCACTGC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=43591150;WS=43591132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	43592906	rs9829081	T	C	3441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=3;PP=2857;SC=AATTTACATATAATAAACTGC;SOR=6.518;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=103;TCF=100;TCR=3;TR=103;WE=43592914;WS=43592896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr3	43602803	rs3772165	C	T	2736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=49;PP=1989;SC=CCTCTTCACCCGCACACCATG;SOR=1.218;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=33;TCR=49;TR=82;WE=43602811;WS=43602793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr3	43607136	rs7616708	T	C	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=7;PP=674;SC=TTCTGTTATTTTTACTTACCT;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=26;WE=43607144;WS=43607126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	43642126	rs6441785	C	A	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=32;PP=1061;SC=AGTTTCAAAACTAAAAACTTT;SOR=2.419;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=40;WE=43642134;WS=43642116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	43756577	rs10662733	C	CTG	711.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.845;NF=0;NR=28;PP=1043;ReadPosRankSum=0.927;SC=TCAATTCACTCTGTGTGTGTG;SOR=1.314;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=102;TCF=0;TCR=102;TR=28;WE=43756585;WS=43756567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,32:0.63:51
chr3	44308380	.	A	T	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.13;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	44399668	rs4682970	T	C	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=2;PP=765;SC=CTTGAGACCTTTATTATCATG;SOR=3.912;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=44399676;WS=44399658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	44402828	.	A	T	1413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=0;PP=1239;SC=TCTATTTTGTATGTAAATGCC;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=42;WE=44402836;WS=44402818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	44404095	.	C	G	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=332;SC=GTTTCTCCATCTACCTCTGAC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=44404103;WS=44404085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	44408864	rs372993721	G	GT	393.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=452;SC=GTAATAGAATGTTTAAAAGAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=44408872;WS=44408854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	44437781	rs28439262	G	A	621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=2;PP=451;SC=TTATGTGTGTGCTTCAAAAAG;SOR=3.056;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=18;WE=44437789;WS=44437771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	44437870	rs6441838	A	C	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=21;PP=636;SC=TGTTAACATGAGTGTGTGCTC;SOR=1.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=32;WE=44437878;WS=44437860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	44540791	rs36046723	TTC	T	5289.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.33;NF=51;NR=51;PP=2969;SC=CATAAGGTTTTTCTCTCCAGT;SOR=1.027;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=55;TCR=57;TR=102;WE=44540800;WS=44540781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr3	44599103	rs2293600	T	G	145.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=6;PP=143;SC=AGAGGGAAAATAGTTTTGTGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=44599111;WS=44599093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	44612050	rs9873604	C	T	4528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=51;PP=2965;ReadPosRankSum=1.118;SC=TCCCGACTCACTGACCACCAG;SOR=0.626;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=90;TCR=52;TR=140;WE=44612058;WS=44612040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,147:0.99:148
chr3	44635461	rs13319803	G	A	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=4;PP=813;SC=CCTTCCTCTGGTACAGAGAAT;SOR=3.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=44635469;WS=44635451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	44762830	rs56084453	A	G	2542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.988;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=55;PP=2144;ReadPosRankSum=-0.622;SC=ACCCAACATCAGAGAACTCAT;SOR=1.621;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=79;TCF=24;TCR=55;TR=78;WE=44762838;WS=44762820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,81:0.99:82
chr3	44763037	rs7640654	A	C	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=20;PP=969;SC=AAATGCAATGAATGTGGGAAT;SOR=1.270;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=33;WE=44763045;WS=44763027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	44775962	rs4682752	A	G	3273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=31;PP=2503;SC=GAGAGTTAACATGCAGAAGAA;SOR=1.981;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=84;TCR=31;TR=115;WE=44775970;WS=44775952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr3	44803108	rs56236286	AAAGACAG	A	6080.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=56;PP=2974;SC=AGCTCTGGGTAAAGACAGAAG;SOR=0.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=42;TCR=65;TR=93;WE=44803122;WS=44803098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr3	44816952	rs10574346	CTT	C	439.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=10;PP=168;SC=AGAAACTTAACTTTTTTTTTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=10;WE=44816961;WS=44816942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	44826315	rs56895721	G	GT	221.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=2;PP=183;SC=AAAATCCAGTGTTTTTTTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=8;WE=44826323;WS=44826305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	44827793	rs7642843	T	C	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=487;SC=ATAGGAAATTTACATCTTGTG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=44827801;WS=44827783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	44840612	rs5848711	A	AT	1640.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=0;PP=2001;SC=GTCTTTGGAGATATAGAACTG;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=47;TCR=1;TR=43;WE=44840620;WS=44840602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	44854563	rs3762636	A	G	2413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.828;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=21;PP=1926;ReadPosRankSum=1.247;SC=CTTTTTTCCCAAAGCTTTTCT;SOR=2.138;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=85;TCF=63;TCR=22;TR=84;WE=44854571;WS=44854553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,87:0.99:88
chr3	44868018	.	GT	G	192.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=159;SC=TCTTAATCTTGTTTTTTTTTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=9;WE=44868026;WS=44868008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	44869026	rs4682999	A	T	3160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=55;PP=2458;SC=AGCAGGTAAAATTCCTGTTAC;SOR=1.081;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=96;TCF=41;TCR=55;TR=95;WE=44869034;WS=44869016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr3	44882784	rs6766221	C	T	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=12;PP=314;SC=GACCAAGTCTCGCTATGTTGC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=44882792;WS=44882774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	44884647	rs3804583	C	A	3339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=40;PP=2639;ReadPosRankSum=0.997;SC=AAACCTACGCCTGGAAAGTCA;SOR=0.504;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=106;TCF=66;TCR=40;TR=105;WE=44884655;WS=44884637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,108:0.99:109
chr3	44906746	rs10429	A	G	2657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=69;PP=2029;SC=GTGGGACTGTATCCTAGGGCG;SOR=3.509;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=12;TCR=69;TR=81;WE=44906754;WS=44906736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	45127515	rs9874077	T	C	2496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=46;PP=1996;ReadPosRankSum=-0.773;SC=ATTGATGTTGTCATTGTAGAT;SOR=0.470;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=29;TCR=47;TR=75;WE=45127523;WS=45127505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,77:0.99:78
chr3	45132637	rs1879240	T	C	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=1;PP=428;SC=TGTTCATCACTGTCCCCAAAG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=45132645;WS=45132627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	45137087	rs2037358	T	G	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=24;PP=656;SC=AAAACAGGCATGAAGCATGGA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=45137095;WS=45137077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	45187671	rs1863837	C	T	2245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=12;PP=1666;SC=CACTCCACGCCATCCGCCTCC;SOR=2.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=53;TCR=12;TR=65;WE=45187679;WS=45187661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	45267058	rs33750	G	A	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=4;PP=301;SC=GGAGGCGGCCGGTGCGGCGAC;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=45267066;WS=45267048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	45267310	rs41118	C	T	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.04;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	45267321	rs395917	C	T	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=15;PP=469;SC=GCCGCCGCCGCCTCCTCCGGG;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=45267329;WS=45267300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	45461102	rs11383389	G	GT	3508.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=11;PP=2973;SC=TCAAAGTGTAGTTGTGTATGG;SOR=3.724;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=94;TCF=80;TCR=14;TR=88;WE=45461110;WS=45461092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr3	45500174	rs745551	C	A	1225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=5;PP=1093;SC=GCGACACTCCCTGTCAAAAAA;SOR=3.967;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=42;WE=45500182;WS=45500164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	45515648	rs11919039	T	C	218.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=8;NR=0;PP=242;SC=GTCCCTGCTTTTCCTACCTTA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=45515656;WS=45515638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	45517799	rs3733117	T	C	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=12;NR=0;PP=363;SC=CTTCTCAGCTTCTTCCAGGCA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=45517807;WS=45517789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	45527099	rs7640603	C	G	1767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=13;PP=1423;SC=CTAGTGCTTACTTTTCTCACT;SOR=2.437;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=52;WE=45527107;WS=45527089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	45527218	rs7610357	T	C	2954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=44;PP=2251;SC=TGAACATGCTTACCCAGCAGG;SOR=0.784;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=86;TCF=42;TCR=44;TR=85;WE=45527226;WS=45527208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr3	45530401	rs3733116	G	A	1544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=39;PP=1127;SC=TCCTTCACTCGTCCCCATACC;SOR=2.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=48;WE=45530409;WS=45530391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	45533224	rs2128361	G	A	2182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=50;PP=1747;SC=CCAACATCGCGTCTTTCACTG;SOR=1.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=24;TCR=50;TR=74;WE=45533232;WS=45533214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	45541785	rs140846169	C	T	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=165;SC=TGAGCCACCGCGCCCGGCCTT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=45541793;WS=45541777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	45542083	rs2306522	T	C	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=24;PP=764;SC=TAAGCACTTATACTGCTTTGC;SOR=3.477;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=45542091;WS=45542073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	45559519	rs2170549	T	C	1757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=36;PP=1287;SC=AGGAGAAAGCTGAGGCCAGGA;SOR=1.197;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=58;WE=45559527;WS=45559509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	45565554	rs267220	A	G	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=18;PP=1072;SC=CCCTGATGGTAATGGCTGCTC;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=18;TCR=18;TR=36;WE=45565562;WS=45565544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	45637253	rs267237	C	T	2970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=38;PP=2465;SC=AGCCCAGGACCCCTTCTGTGT;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=47;TCR=38;TR=85;WE=45637261;WS=45637243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr3	45637439	rs267236	T	C	2562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=50;PP=2009;SC=CGCCAGCTGGTCTGGACGGTT;SOR=1.966;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=21;TCR=50;TR=71;WE=45637447;WS=45637429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr3	45677635	rs11379880	C	CT	3732.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.44;SOR=0.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr3	45677637	.	GCA	TGC	2937	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=31;NR=35;PP=2937;QD=20;SC=CTCTTGTCCTGCAAGGAGCCT;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=66;WE=45677647;WS=45677627;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,66:0.92:72
chr3	45677638	rs5848762	CA	C	3732.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.44;SOR=0.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr3	45677782	rs36136468	G	A	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=12;PP=398;SC=TGGGGGATGCGTAAGGAACAT;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=45677790;WS=45677772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	45677815	rs10662872	G	GAGA	629.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=533;SC=AGGGAGGAGAGAGATCATCTT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=10;WE=45677823;WS=45677805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	45746836	rs1969626	A	G	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=22;PP=598;SC=TTAAGTATTTATCATTAATTT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=45746844;WS=45746826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	45748429	rs2742441	G	A	2277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=39.96;ReadPosRankSum=0.298;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,55:0.96:57
chr3	45748435	rs2673039	A	G	2169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=42.54;ReadPosRankSum=0.180;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr3	45754487	rs2742369	C	A	260.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=184;SC=TACAGATTTGCGGGGGAGATG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=45754495;WS=45754477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	45754749	rs2248991	G	A	963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=27;PP=756;SC=TTCAATGCATGCTATAAAGTG;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=45754757;WS=45754739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	45755730	.	T	G	42	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=4;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=42;QD=38.3856062736;SC=TGCTATTTTGTTTGTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=45755740;WS=45755720;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,2:0.50:4
chr3	45755731	.	TTG	T	121	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=4;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=62.65;NF=0;NR=4;PP=121;QD=36.0;SC=GCTATTTTGTTTGTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=45755740;WS=45755720;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	45761115	rs2064062	G	C	1842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=34;PP=1395;SC=GTCAGCATGGGTCATATCTGT;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=57;WE=45761123;WS=45761105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	45763635	rs2673062	A	G	5474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=127;PP=2965;SC=TTGGATTATAATTTTCTGTCA;SOR=2.550;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=33;TCR=127;TR=160;WE=45763643;WS=45763625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr3	45764246	rs2742448	A	G	1136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=0;PP=946;SC=TTGTCGGTAGATTGTATTAGT;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=45764254;WS=45764236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	45764544	rs2742449	T	C	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=46;PP=1101;SC=CATAAATCAATGTTCAACATC;SOR=7.864;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=46;WE=45764552;WS=45764534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	45765132	rs73058498	T	G	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=6;PP=145;SC=TACAGTTCAGTGGCATTAAGT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=45765140;WS=45765122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	45772742	rs2531755	T	C	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=2;PP=1288;SC=TCTGATACCATTCTCTCCTTT;SOR=4.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=43;TCR=2;TR=45;WE=45772750;WS=45772732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	45772772	rs2673055	G	A	2480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=12;PP=2011;SC=TGGAAACTATGGTGTTTGAAA;SOR=2.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=60;TCR=12;TR=72;WE=45772780;WS=45772762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	45773732	rs11709306	G	A	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=657;ReadPosRankSum=-0.703;SC=AGACTTACAAGTACAGTTCAC;SOR=2.376;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=27;WE=45773740;WS=45773722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr3	45776900	rs1468543	A	G	1753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=49;PP=1524;SC=ATTGAAAAACAACACAGCAAA;SOR=3.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=7;TCR=49;TR=56;WE=45776908;WS=45776890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	45779136	rs1468542	A	T	2162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=18;PP=1759;SC=GAGAAGATTTACAAAAATGGT;SOR=1.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=61;WE=45779144;WS=45779126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	45784963	rs9821974	T	C	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=0;PP=559;SC=GCTAAACAGCTGAAAACTGGG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=45784981;WS=45784953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	45784972	rs10575376	GGT	G	1028.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=991;SC=CTGAAAACTGGGTCTGATATC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=22;WE=45784981;WS=45784953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	45799871	rs2251347	C	T	980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=13;PP=656;SC=CTGGACCCACCGTCAGAGACC;SOR=0.880;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=29;WE=45799879;WS=45799861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	45814094	rs17279437	G	A	2790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=67;PP=2154;SC=CAGTGACGCCGTGAAATACAC;SOR=2.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=19;TCR=67;TR=86;WE=45814102;WS=45814084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr3	45817418	rs758386	A	G	5261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=88;PP=2965;SC=ACGCCTTCTCACACTCCTCAT;SOR=0.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=75;TCR=88;TR=162;WE=45817426;WS=45817408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr3	45977866	rs4535265	C	T	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=509;SC=TGGTCCCCAGCGCCGGCACTG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=45977874;WS=45977856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	45977899	rs1873002	T	C	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=0;PP=728;SC=CTCCTCCCAATGCCACACCTG;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=45977907;WS=45977889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	45979877	rs9875616	G	A	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=337;ReadPosRankSum=-0.446;SC=CTGTGAATCAGTTTAGGAGGT;SOR=2.584;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=13;WE=45979885;WS=45979867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr3	45989044	rs2234358	T	G	1082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=31;PP=871;ReadPosRankSum=0.971;SC=AATTTGCAAGTCATGGCTGTG;SOR=5.728;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=31;WE=45989052;WS=45989034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr3	45996761	rs1463680	G	A	1030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=11;PP=828;SC=CATTTGGGTCGAGAGAATCAG;SOR=1.542;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=33;WE=45996769;WS=45996751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	46001063	rs1532071	G	A	3673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=31;NR=81;PP=2891;SC=GGAAGAAAAGGAGAGAGAATC;SOR=1.991;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=31;TCR=81;TR=112;WE=46001071;WS=46001053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr3	46007702	rs1994490	T	C	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=414;SC=AAGGTGCATCTTCCCATGGAC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=46007710;WS=46007692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	46008790	rs3796375	G	A	1549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=36;PP=1166;SC=CAGCAAGCTCGCCTCCATCTG;SOR=2.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=13;TCR=36;TR=49;WE=46008798;WS=46008780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	46009864	rs3733100	C	G	2389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=26;PP=1920;SC=TAGCTCCAGGCCCTGCAGGCA;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=42;TCR=26;TR=68;WE=46009872;WS=46009854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	46010077	rs4683158	C	T	5380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=109;PP=2965;SC=CATGCGCTCCCGTAGCTGCTT;SOR=1.667;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=52;TCR=109;TR=161;WE=46010085;WS=46010067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr3	46016599	rs3821884	T	G	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=614;SC=GACAATGATATATGTGGAAGG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=46016607;WS=46016589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	46016851	rs751552	A	T	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=35;PP=1223;SC=GAAAAAGCAGATTACATAGAG;SOR=2.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=47;WE=46016859;WS=46016841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	46016944	rs751553	C	T	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=276;SC=CAAAAAATGTCACCCAATTTT;SOR=2.448;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=46016952;WS=46016934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	46021218	rs4682801	G	T	1449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=11;PP=1145;SC=ACTTGACAAAGCGGATCCCAT;SOR=2.400;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=47;WE=46021226;WS=46021208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	46026209	rs11338292	CA	C	1301.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=1;PP=1377;SC=CCAAATATTTCAATATGATGT;SOR=5.784;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=32;WE=46026217;WS=46026199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	46026259	rs3733097	G	A	2365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=11;PP=1876;SC=GAACAAAAATGAAAGGGTTGA;SOR=3.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=61;TCR=11;TR=72;WE=46026267;WS=46026249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	46400062	rs3092960	G	A	3022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=55;PP=2309;SC=CAACAAACACGCCTTCCACTG;SOR=1.225;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=39;TCR=56;TR=94;WE=46400070;WS=46400052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr3	46414943	.	TACAGTCAGTATCAATTCTGGAAGAATTTCCAG	T	5872.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=37;PP=2957;SC=TCATTTTCCATACAGTCAGTA;SOR=0.883;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=96;TCF=53;TCR=43;TR=85;WE=46414982;WS=46414933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr3	46449864	rs6808835	G	T	4379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.325;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=1.355;SC=CTCATGCTGGGGGCGATCCCA;SOR=0.462;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=144;TCF=29;TCR=115;TR=140;WE=46449872;WS=46449854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,143:0.97:147
chr3	46450072	rs6441977	G	A	5915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=141;NR=46;PP=2965;SC=GCCTGAATTCGTGGTTTATAA;SOR=2.241;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=141;TCR=47;TR=187;WE=46450080;WS=46450062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr3	46477826	rs56063910	C	T	1404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.32;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	46477830	rs75094754	C	T	1289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.77;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	46482980	rs17285324	A	T	3804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=1.001;SC=GGCACCTAAAATGTTCCAGAA;SOR=1.242;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=28;TCR=88;TR=115;WE=46482988;WS=46482970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,118:0.99:119
chr3	46484898	rs7615975	T	G	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=452;SC=ATGAGGTAAGTCCCCATCCTG;SOR=4.174;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=15;WE=46484906;WS=46484888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	46487775	rs4682816	C	G	1210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=0;PP=828;SC=AGAACTATTCCTCTGTGAATT;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=35;WE=46487811;WS=46487765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	46487787	rs201856214	TTTGCACCCTTAAAATTA	T	2402.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=0;PP=2967;SC=CTGTGAATTATTTGCACCCTT;SOR=5.856;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=31;WE=46487811;WS=46487765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	46501284	rs10662431	C	CCTT	547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQ=60.83;NF=3;NR=7;PP=511;SC=ACTGAACACTCCTCCTACGGC;SOR=0.836;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=46501292;WS=46501274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	46539523	rs2037391	G	A	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=0;PP=934;SC=AGGAGAGCTCGACCCACCCAG;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=46539531;WS=46539513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	46539864	rs11130092	C	T	141.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=139;SC=CATTAAAGATCGTTTTTTCAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=46539872;WS=46539854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	46560721	rs35989475	TTAAG	T	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=278;SC=TTTGTCACCATTAAGTAAGTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=46560732;WS=46560711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	46593147	rs1879325	A	G	784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=669;ReadPosRankSum=-0.943;SC=ACAAACAGAAAACAGTTTTAA;SOR=5.058;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=24;WE=46593155;WS=46593137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,24:0.96:25
chr3	46621354	rs142219504	C	T	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=11;PP=644;SC=GTAAGCAATTCAGAGGGGCGG;SOR=1.352;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=31;WE=46621362;WS=46621344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	46654132	rs2139637	G	A	2615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=27;PP=2091;SC=GGTCAAGTGCGACACATTTGG;SOR=1.416;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=51;TCR=27;TR=78;WE=46654140;WS=46654122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	46658737	rs9832679	A	G	5353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=65;PP=2965;SC=GATCTCAAGCATTTCTGGGAA;SOR=1.367;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=117;TCR=66;TR=182;WE=46658745;WS=46658727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr3	46658872	rs9870935	G	T	2930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=76;PP=2466;SC=AAAATACATCGTATAATTTAG;SOR=3.442;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=13;TCR=76;TR=89;WE=46658880;WS=46658862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr3	46717931	rs6808525	T	C	1592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=39;PP=1203;SC=GACTAAGCACTGGGGTCTGGA;SOR=2.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=48;WE=46717939;WS=46717921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	46718298	rs6806400	A	G	2901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=45;PP=2252;SC=AGCCCTCCCCAGCCCACCCTA;SOR=0.735;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=93;TCF=48;TCR=45;TR=91;WE=46718306;WS=46718288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr3	46730900	rs143925967	G	T	1554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=42;PP=1289;SC=TCCTCCAGCCGCAGCAGAGCT;SOR=4.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=45;WE=46730908;WS=46730890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	46933960	rs1001284	C	G	2410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=31;PP=1908;SC=TGCGCTGCCACTCGCGCGCGC;SOR=0.920;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=41;TCR=31;TR=72;WE=46933968;WS=46933950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr3	46943028	rs1531137	T	C	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=26;PP=827;SC=CTGCGTCCCCTGGAACCAGCC;SOR=2.115;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=34;WE=46943036;WS=46943018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	46944274	rs1138518	T	C	2961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=44;PP=2222;SC=GTTTCTGCAATGGCGAGGTAA;SOR=1.000;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=58;TCR=44;TR=102;WE=46944282;WS=46944264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr3	46963502	rs4587	T	C	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=1;PP=325;SC=AAGACCATCCTCTGCAGGACA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=46963510;WS=46963492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	46965197	rs2290546	C	G	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=33;PP=1037;SC=CTGTGGAAAACGCGCTGCCAC;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=42;WE=46965205;WS=46965187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	46967040	rs2290545	G	A	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=26;PP=1092;SC=AAGAATAGAGGGAACAAGCAG;SOR=1.552;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=39;WE=46967048;WS=46967030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	46982365	rs6804732	T	C	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=6;PP=627;SC=AGGACAGCCATGGGCAGAAAG;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=46982373;WS=46982355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	47018214	rs936181	T	C	4429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=84;PP=2965;SC=CAGCCGTAGTTGCCTCCATCT;SOR=0.828;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=154;TCF=70;TCR=84;TR=154;WE=47018222;WS=47018204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr3	47021509	rs113932344	CGCGCGCGCGG	C	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.57;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	47029661	rs12152493	G	A	1668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=31;PP=1326;SC=AATGGTACACGTGTGTCCTGG;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=22;TCR=31;TR=53;WE=47029669;WS=47029651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	47033937	rs13066214	C	T	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=10;PP=694;SC=TTGCCTCCTCCACCCTGTGCC;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=28;WE=47033945;WS=47033927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	47035625	rs936185	G	A	1787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=48;PP=1433;SC=GAGCAAAGCAGGCGAGCTGGG;SOR=6.556;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=49;WE=47035633;WS=47035615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	47038135	rs11396344	C	CA	2813.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=37;PP=2554;SC=GCTAGGGGTCCGGGGGGAGAA;SOR=1.032;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=57;WE=47038143;WS=47038125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	47043538	rs2305634	C	T	2178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=37;PP=1827;SC=ACACCTCTTCCTTGGAGTCAG;SOR=0.957;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=29;TCR=37;TR=66;WE=47043546;WS=47043528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	47044122	rs11928558	A	T	3805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=74;PP=2905;SC=CTGACCTATTACCCCCACCCC;SOR=1.515;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=40;TCR=74;TR=114;WE=47044130;WS=47044112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr3	47045739	rs1079276	C	G	7632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=161;PP=2965;SC=GCCAGACTCCCAGACCCCAGC;SOR=1.837;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=231;TCF=70;TCR=161;TR=231;WE=47045747;WS=47045729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr3	47045846	rs2305637	C	T	3600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=68;PP=2965;SC=AGCAGCCGCTCCCCCCAGGAG;SOR=1.159;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=50;TCR=68;TR=118;WE=47045854;WS=47045836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr3	47046842	rs2305638	G	C	1354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=43;PP=1051;SC=GGCAGACTAGGGGGCAGATAA;SOR=4.047;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=48;WE=47046850;WS=47046832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	47047176	rs5848810	A	AG	3011.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=49;PP=2969;SC=TGGAGTGGCCAGGGGGCAGTC;SOR=0.896;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=93;TCF=38;TCR=55;TR=79;WE=47047184;WS=47047166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr3	47050908	rs3214838	AG	A	2682.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=64;PP=2338;SC=TGGGCAGCCCAGGGGGGTGAG;SOR=2.531;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=10;TCR=66;TR=74;WE=47050916;WS=47050898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr3	47059323	rs2385867	C	T	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=311;SC=GTGAGTAAAGCCAGCCAATCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=47059331;WS=47059313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	47061183	rs2290547	G	A	1445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=4;PP=1215;SC=GACATACTTAGGACAAGAAAT;SOR=4.174;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=38;TCR=4;TR=42;WE=47061191;WS=47061173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	47079112	rs6768722	G	A	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=5;PP=830;SC=GGTCTTGGACGGACTCCCAAA;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=47079120;WS=47079102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	47103861	rs10589946	GTT	G	635.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.33;QD=28.90;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	47125385	rs4082155	G	A	4181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=56;PP=2965;SC=GCTCTCTTTGGGCTCTATTTC;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=123;TCF=67;TCR=56;TR=123;WE=47125393;WS=47125375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr3	47125916	rs5848822	CT	C	30.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=0;NR=4;PP=50;SC=GTACAGTTGACTTTTTTTTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=4;WE=47125924;WS=47125906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	47142907	rs60548476	TCC	T	2292.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=4;PP=2150;SC=ACAGCCTATTTCCCCATCAGA;SOR=4.654;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=51;TCR=4;TR=52;WE=47142916;WS=47142897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	47161214	rs11923706	T	C	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=4;PP=559;SC=CAGTCTCGGGTATGTCTTTAT;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=47161222;WS=47161204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	47161339	.	G	T	653.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.238;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.197;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=569;ReadPosRankSum=1.140;SC=TTATTTTGCTGGGGTTTTATT;SOR=2.737;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=22;WE=47161347;WS=47161329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,22:0.92:24
chr3	47162661	rs6767907	A	G	5332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=115;PP=2965;SC=CAGGCAGGCGATTATCTATTT;SOR=1.681;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=168;TCF=53;TCR=115;TR=168;WE=47162669;WS=47162651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr3	47187075	rs6442059	C	G	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=23;PP=931;SC=CCCCTCACATCAGGTCATGTG;SOR=1.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=36;WE=47187083;WS=47187065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	47198826	rs11708451	G	A	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=2;PP=393;SC=TTGAGCCCAGGAGTTCAGTTA;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=47198834;WS=47198816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	47205502	.	CGCGGCGGCG	C	500.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQ=60.86;NF=0;NR=8;PP=2055;SC=CAGGTCCGACCGCGGCGGCGG;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=47205518;WS=47205492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	47276968	rs2276854	C	T	1405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=12;PP=1122;SC=TCACTGAGGCCCCCATCCTCC;SOR=1.900;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=41;WE=47276976;WS=47276958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	47277458	rs1874264	A	G	287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=229;SC=GAGAACAGACATCAAGGGGCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=47277466;WS=47277448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	47277885	rs13094438	G	A	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=4;PP=202;SC=GCCTCTCCCTGAGTCTCCTTG;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=47277893;WS=47277875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	47282303	rs2276853	G	A	1164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=1;PP=942;SC=TGCTTCTCCCGTAGTGACTTC;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=34;WE=47282311;WS=47282293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	47286227	rs6772449	G	T	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=358;SC=ATCCTCCCATGCACCCACCGA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=47286235;WS=47286217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	47287603	rs35871850	A	AT	981.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=2;PP=1031;SC=CAAGAAGAGGAGCTCTTGGAG;SOR=3.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=22;WE=47287611;WS=47287593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	47316725	rs903538	G	A	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=0;PP=839;SC=AAATGATAGTGAGTGAGCTTT;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=47316733;WS=47316715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	47318747	rs924009	T	G	4201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=44;PP=2965;SC=GCCCAGTCAGTTGAAGGCAAA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=88;TCR=44;TR=132;WE=47318755;WS=47318737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr3	47322496	rs807936	C	T	2639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=34;PP=2027;SC=GGTTTCAGTTCCCAAAATTAA;SOR=0.821;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=41;TCR=34;TR=75;WE=47322504;WS=47322486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	47376095	rs295450	A	G	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=6;PP=969;SC=TTGGCAGTGGAGAGCCAGGCT;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=47376103;WS=47376085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	47449058	rs900688	T	C	2896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=54;PP=2491;SC=CATTGGACACTCTTCAGCCTG;SOR=1.286;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=34;TCR=54;TR=88;WE=47449066;WS=47449048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr3	47452087	rs900689	G	A	4301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=48;PP=2965;SC=AACCCATCCCGGCACAGCACC;SOR=1.478;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=142;TCF=94;TCR=48;TR=141;WE=47452095;WS=47452077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr3	47452786	rs1531875	G	A	3344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=50;PP=2754;SC=ACCCCTATGAGCATCCTGAGA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=54;TCR=50;TR=103;WE=47452794;WS=47452776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr3	47454399	rs6789730	G	A	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.07;ReadPosRankSum=-0.910;SOR=0.337;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr3	47456225	rs6442066	T	C	1211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=21;PP=1014;SC=CTGTTCTTCATCAGGACTCTT;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=40;WE=47456233;WS=47456215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	47459679	rs12487736	C	T	2204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=11;PP=1676;SC=CACACGCAGACGTGGCCTGCC;SOR=3.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=55;TCR=11;TR=66;WE=47459687;WS=47459669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	47462200	rs900690	T	C	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=8;PP=269;SC=GCGTTGGCTGTCCCACTGGCT;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=47462208;WS=47462190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	47462587	rs900691	A	G	3463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=95;PP=2965;SC=GAGGAGCAGTACCCGGACTGC;SOR=3.473;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=16;TCR=96;TR=111;WE=47462595;WS=47462577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr3	47464122	rs1038394	A	G	2089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=48;PP=1601;SC=GAGGCATGGCAAGGCCCCCCA;SOR=2.338;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=15;TCR=48;TR=63;WE=47464130;WS=47464112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr3	47539751	rs2170814	T	C	2092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=40;PP=1565;SC=GCAAGAAGCCTGTTGCCCAGG;SOR=1.002;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=30;TCR=40;TR=70;WE=47539759;WS=47539741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	47539969	rs13059519	C	T	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=20;PP=652;SC=GGAAAGGACACCCAGAGTCAG;SOR=2.546;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=47539977;WS=47539959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	47543389	rs3816779	G	A	2981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=64;PP=2330;SC=CTCTACAGATGTTTATCAAGG;SOR=2.135;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=23;TCR=64;TR=87;WE=47543397;WS=47543379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr3	47555142	rs2291298	C	A	3688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=80;PP=2965;SC=ACGACGGAGGCTGGAGAGCAA;SOR=1.552;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=42;TCR=80;TR=122;WE=47555150;WS=47555132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr3	47603926	rs11456803	A	AT	54.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=64;SC=TATTTTAAGTATTTTTTTGCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=47603934;WS=47603916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	47604299	rs4858839	C	T	285.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=8;PP=236;SC=CATACAGCAACCAAATAATAA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=47604307;WS=47604289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	47614413	rs2280567	G	A	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=367;SC=GGCAGCCACGGCCACAGTAAG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=47614421;WS=47614403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	47618953	rs3732530	C	A	2995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=57;PP=2370;SC=CAGCTCTGGCCCTTGAGGGTC;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=33;TCR=57;TR=90;WE=47618961;WS=47618943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr3	47676715	.	C	T	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=5;PP=315;SC=AGAGCAGCTGCTGCGGCTGTG;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=14;WE=47676723;WS=47676705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	47676902	rs3216712	C	CA	38.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=63;SC=TCCTTACCTCCACCACTATAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=47676910;WS=47676892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr3	47680066	rs12633923	C	T	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=732;SC=ATATTATATCCTGTGAGAACT;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=47680074;WS=47680056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	47680119	rs12636863	T	C	1697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=8;PP=1322;SC=TAGAATTATTTAGAGTCCCCT;SOR=2.790;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=46;WE=47680127;WS=47680109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	47712202	rs1141601	T	C	3652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=71;PP=2775;SC=CACTAGCACCTTTACTCTAAG;SOR=1.781;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=32;TCR=71;TR=103;WE=47712210;WS=47712192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr3	47762030	rs12495204	A	G	1386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=0;PP=1029;SC=AAAAGACTCCATAAGTGAGAA;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=44;WE=47762038;WS=47762020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	47770380	rs6442081	G	A	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=173;SC=CAGCCTGGGCGACAGACTCCA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=47770388;WS=47770370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	48019232	rs6770467	A	G	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=553;SC=CTCCAACAAGAACACTACCAC;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=48019240;WS=48019222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	48019258	rs6770477	A	G	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=3;PP=801;SC=GAAATAATTCATATGCTTCCA;SOR=4.021;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=36;WE=48019266;WS=48019248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	48209486	rs3731539	C	T	2902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=63;PP=2288;SC=ATGGAACTTCCGAAAACATTC;SOR=1.942;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=25;TCR=63;TR=88;WE=48209494;WS=48209476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr3	48219320	rs3731514	AAC	A	3394.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=29;PP=2993;SC=AACAAATAGGAACACACACAC;SOR=1.464;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=97;TCF=67;TCR=30;TR=78;WE=48219331;WS=48219310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr3	48225509	rs3731503	T	C	399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=366;SC=AACACTAGACTTCTAGGTGAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=48225517;WS=48225499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	48228059	.	CA	C	47.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.353;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=2.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.93;MQRankSum=1.840;QD=1.65;ReadPosRankSum=-0.027;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr3	48414197	rs9852211	A	T	2042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=11;PP=1563;SC=GGCAAAGCCTATAAATTCAGA;SOR=2.985;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=46;TCR=11;TR=57;WE=48414205;WS=48414187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	48414215	rs9815103	G	A	2466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=21;PP=1800;ReadPosRankSum=-0.830;SC=AGAGCAGCCCGGAGAGGAGAA;SOR=0.813;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=72;TCF=51;TCR=21;TR=71;WE=48414223;WS=48414205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,79:0.99:80
chr3	48419723	rs7630741	G	T	130.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=101;SC=TTTGGAAGAGGCTTCCAAATA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=48419731;WS=48419713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	48422235	rs6784322	T	A	1833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=8;PP=1500;SC=GAAGGCAGTGTTCCTCTGTCT;SOR=3.219;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=47;TCR=8;TR=54;WE=48422243;WS=48422225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	48422512	.	GTT	G	402.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.01;QD=28.77;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	48450706	rs3217706	TC	T	461.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=0;PP=371;SC=CCCTCACCCATCCCCCCCGTG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=14;WE=48450714;WS=48450696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	48451300	rs3214871	AG	A	2234.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=23;PP=1952;SC=CTACCTTGGCAGGCCCCACCC;SOR=1.329;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=50;TCF=26;TCR=24;TR=49;WE=48451308;WS=48451290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	48454468	rs3214041	C	T	4379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=62;PP=2965;SC=GCCCATTCTCCCAGCCACACC;SOR=0.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=60;TCR=62;TR=122;WE=48454476;WS=48454458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr3	48455626	rs6794875	A	G	452.98	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=349;ReadPosRankSum=-0.189;SC=CCAGTCACACAGTGTCCTCCA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=14;WE=48455634;WS=48455616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr3	48461313	rs2362450	C	G	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=19;PP=1187;SC=CTACCTCTGACGGTGACAGCG;SOR=1.067;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=44;TCF=25;TCR=19;TR=43;WE=48461321;WS=48461303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	48462461	rs11130171	A	G	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=13;PP=407;SC=AAGAGGACCCAGGATGAGGGA;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=48462469;WS=48462451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	48463618	rs9883759	T	A	2753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.222;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=37;PP=2157;ReadPosRankSum=0.778;SC=TCAGAAGCTGTGACAGCAAAG;SOR=0.416;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=81;TCF=43;TCR=38;TR=80;WE=48463626;WS=48463608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr3	48463711	rs9883927	T	C	2617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=44;PP=2085;SC=CTCCCAGCAGTCATGCCCTGG;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=32;TCR=44;TR=76;WE=48463719;WS=48463701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr3	48474249	rs2279077	A	G	2810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=46;PP=2294;SC=AGGCCCCTCAAGTCCACCATG;SOR=0.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=38;TCR=46;TR=84;WE=48474257;WS=48474239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr3	48476431	rs13062723	C	G	3255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=61;PP=2673;SC=CTGGGCTGCACAGAGTCCTGG;SOR=1.378;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=34;TCR=61;TR=95;WE=48476439;WS=48476421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr3	48481647	rs3774808	G	A	1422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=7;PP=1150;SC=GTCTACGACAGAGGGTGGGGC;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=44;WE=48481655;WS=48481637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	48505239	rs138163219	C	T	1994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=46;PP=1543;ReadPosRankSum=-0.775;SC=TCCCTGCTGGCGGACCACGAC;SOR=0.807;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=67;WE=48505247;WS=48505229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,69:0.99:70
chr3	48505302	rs6442124	A	G	951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=26;PP=761;SC=TGGGGCGGGCATCTAGACTGC;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=48505310;WS=48505292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	48505964	rs2242150	C	A	1866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.370;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=1484;ReadPosRankSum=0.855;SC=GATGGAACCACTCTGTTCTTG;SOR=0.333;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=63;TCF=32;TCR=31;TR=61;WE=48505972;WS=48505954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,62:0.97:64
chr3	48508585	rs11797	C	T	4009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=55;PP=2965;SC=GGAAGAGCTACAGCCTAGGCA;SOR=0.899;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=67;TCR=55;TR=122;WE=48508593;WS=48508575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr3	48541556	rs369583778	G	T	1090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=33;PP=909;SC=GCGGACGGACGCGAGCGCCGG;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=35;WE=48541564;WS=48541546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	48576483	rs7615170	C	G	599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=513;SC=GGTTACGAGGCGGAGGTGGGG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=48576491;WS=48576473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	48602523	rs138595277	G	GGGC	3881.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=44;PP=2924;SC=AGACCCCGCTGGCAGCCCCCC;SOR=1.218;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=79;TCF=26;TCR=53;TR=67;WE=48602531;WS=48602513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr3	48603222	rs3832252	A	AACAG	772.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=14;PP=862;SC=AGGAGAGGGTAACAGGAGAGA;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=16;WE=48603230;WS=48603212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	48605075	rs66737445	GA	G	4292.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.158;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.06;MQRankSum=0.169;NF=53;NR=72;PP=2979;ReadPosRankSum=1.437;SC=TCCCCCTGGAGAAAAAAAGAC;SOR=0.196;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=146;TCF=66;TCR=80;TR=125;WE=48605083;WS=48605065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,158:0.99:160
chr3	48606701	rs13060933	A	G	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=3;PP=472;SC=CCTTCCCCCTAAACCCCAGAA;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=48606709;WS=48606691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	48607242	rs6781283	A	G	4549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=79;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.896;SC=GAGGCCCCGCACCTGAATTCT;SOR=0.243;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=158;TCF=79;TCR=79;TR=157;WE=48607250;WS=48607232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,159:0.99:160
chr3	48608506	rs9878950	T	C	4916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=61;PP=2965;SC=CTGCTGCCCCTACAACTGGTG;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=86;TCR=61;TR=147;WE=48608514;WS=48608496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr3	48610925	rs9814951	T	C	1831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=1430;ReadPosRankSum=-0.744;SC=CTCCTCCTCCTATCCACACAC;SOR=0.598;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=53;WE=48610933;WS=48610915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,57:0.98:58
chr3	48611650	rs35562294	C	T	2490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=1;PP=2130;SC=CAGCACCTAGCGGAGGGTCCG;SOR=7.328;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=79;TCF=78;TCR=1;TR=79;WE=48611658;WS=48611640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr3	48613396	rs9881877	G	A	2181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=50;PP=1632;SC=CTTCTGCCCCGCACGGCCTCA;SOR=2.439;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=14;TCR=51;TR=64;WE=48613404;WS=48613386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr3	48618666	rs1003649	A	G	3906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=93;PP=2965;SC=CTTACCCGCCATGACTCCCCC;SOR=0.873;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=56;TCR=93;TR=149;WE=48618674;WS=48618656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr3	48621554	rs2854395	G	A	2619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=69;PP=2184;ReadPosRankSum=1.845;SC=AAGATACCAGGAGTGATGAGG;SOR=3.056;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=7;TCR=71;TR=76;WE=48621562;WS=48621544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,78:0.99:79
chr3	48621593	rs2854394	T	C	2135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=56;PP=1894;ReadPosRankSum=-0.716;SC=ATTTCAAGGATTTTGGGAGAA;SOR=2.617;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=7;TCR=57;TR=63;WE=48621601;WS=48621583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr3	48624040	rs2228563	C	T	3795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=68;PP=2884;SC=GTCACGGATCCTTTGCAAGAT;SOR=1.309;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=43;TCR=68;TR=111;WE=48624048;WS=48624030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr3	48624611	rs2255532	C	T	2742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=36;PP=2269;SC=CTTCCCACTACGCCCACTATA;SOR=1.116;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=53;TCR=36;TR=89;WE=48624619;WS=48624601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr3	48625266	rs1264194	T	C	2188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=47;PP=1594;SC=CTTCTCCAGCTGGCCCTAGGA;SOR=1.108;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=34;TCR=47;TR=81;WE=48625274;WS=48625256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr3	48625680	rs28581474	A	C	1962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=25;PP=1515;SC=CCTGCCCCCAATGGTCCCTAA;SOR=1.196;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=42;TCR=25;TR=66;WE=48625688;WS=48625670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	48630252	rs35623035	G	A	3569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.049;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=56;PP=2843;ReadPosRankSum=0.451;SC=CCCGTCAGAGGAGTGTACTGG;SOR=0.280;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=110;TCF=54;TCR=56;TR=109;WE=48630260;WS=48630242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr3	48641971	rs35343040	A	G	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=9;PP=360;SC=CTAGTTGCCCAGCTGCAAAGC;SOR=1.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=15;WE=48641979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	48663046	rs7631574	C	T	214.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=4;PP=147;SC=CTCCCGAGTCCTTCCTACACC;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=48663054;WS=48663036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	48666923	rs2276852	A	G	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=416;ReadPosRankSum=1.717;SC=AGAGGGGGTCATAGACCTAAA;SOR=3.352;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=20;WE=48666931;WS=48666913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr3	48667014	rs2276851	A	T	2764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=28;PP=2029;ReadPosRankSum=0.802;SC=ACGAATCCACAAAGGCTCATT;SOR=1.103;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=66;TCR=29;TR=92;WE=48667022;WS=48667004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,95:0.97:98
chr3	48668287	rs71324909	G	A	947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.452;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=803;ReadPosRankSum=1.279;SC=TGTCCCACACGTCCTGCTCTC;SOR=0.643;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=30;WE=48668295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr3	48668394	rs3821876	G	T	2062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=10;PP=1749;SC=CATACACTTGGATGCCTCCTA;SOR=3.293;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=56;TCR=10;TR=66;WE=48668402;WS=48668384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	48669447	rs13324142	C	T	2097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=46;PP=1666;SC=TAGGTGACCACGAAGCCGAAG;SOR=1.451;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=27;TCR=46;TR=73;WE=48669455;WS=48669437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	48669648	rs2276850	G	A	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=19;PP=1196;SC=AAGTGGTGGTGGGGGGCACAT;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=34;TCR=19;TR=53;WE=48669656;WS=48669638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	48670827	rs34368826	G	T	3664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=50;PP=2731;SC=GGAGCACCTAGGGACATGATA;SOR=0.973;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=62;TCR=50;TR=112;WE=48670835;WS=48670817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr3	48672693	rs66952042	CCGAGGCGTCGCAAGCGGAGAATGCCTGCTCCAG	C	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.29;QD=42.34;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	48675856	rs13096357	C	A	328.53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=7.782;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=241;ReadPosRankSum=-0.520;SC=TAGACTCAGCCAGGCTCCTTG;SOR=3.418;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=10;WE=48675864;WS=48675846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr3	48678011	rs2310997	G	C	269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=217;SC=GGAAGAAAATGGGGGGCAGGG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=48678019;WS=48678001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	48678971	rs9878063	T	G	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=17;PP=602;SC=TGGAGCCAGGTCAGGTTACAG;SOR=1.781;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=48678979;WS=48678961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	48679751	.	C	T	763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=4;PP=600;SC=GGGGAGAGATCCTCTGCCTCC;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=23;WE=48679759;WS=48679741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	48680284	.	C	G	2370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=23;PP=1973;SC=CCACTCTCCTCAAAGAGAGCC;SOR=1.483;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=47;TCR=23;TR=70;WE=48680292;WS=48680274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	48681053	rs9868809	C	T	1034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=871;ReadPosRankSum=-0.769;SC=CTGCCAGGAGCCCAAAGAGCC;SOR=0.829;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=35;WE=48681061;WS=48681043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr3	48681765	rs147930066	CAG	C	39.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.81;ReadPosRankSum=0.493;SOR=0.067;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,4:0.18:22
chr3	48682658	rs34638686	C	T	3752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=50;PP=2905;SC=GGCAGGGGGGCGTGTCAGGAC;SOR=1.205;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=76;TCR=50;TR=125;WE=48682666;WS=48682648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr3	48682756	rs34581457	C	A	4654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=71;PP=2965;ReadPosRankSum=1.190;SC=ACCCCAGCATCCTGCTGAAAA;SOR=0.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=84;TCR=73;TR=154;WE=48682764;WS=48682746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,153:0.99:155
chr3	48689192	rs2286652	G	A	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=5;PP=844;SC=TGGTCGCAGAGCATGGAAGGA;SOR=2.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=30;WE=48689200;WS=48689182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	48689787	rs12107418	A	G	1516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=6;PP=1145;ReadPosRankSum=0.230;SC=CCACTTGAATACTGCCTTTCA;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=44;WE=48689795;WS=48689777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr3	48690079	.	C	G	1874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=44;PP=1404;ReadPosRankSum=-0.733;SC=TCTAGCCCTTCTAGGCTGCCC;SOR=1.150;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=13;TCR=45;TR=57;WE=48690087;WS=48690069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,61:0.98:62
chr3	48690110	rs2302295	T	C	1373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=33;PP=1049;ReadPosRankSum=-1.001;SC=GGACCCACAGTAGACCTTAAT;SOR=1.445;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=41;WE=48690118;WS=48690100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr3	48691316	rs12107252	T	C	2994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=69;PP=2327;SC=CTTACTAAGCTGACAGTCTTT;SOR=1.774;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=32;TCR=69;TR=101;WE=48691324;WS=48691306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr3	48694147	rs2286651	G	A	2097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=9;PP=1730;ReadPosRankSum=-0.868;SC=AGCGCGGGCGGCAGACGCACG;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=59;TCR=9;TR=67;WE=48694155;WS=48694137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,68:0.99:69
chr3	48697654	rs3821875	C	G	4648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=72;PP=2965;ReadPosRankSum=1.325;SC=CCCCTGGGTGCTGATGGCAAA;SOR=0.234;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=74;TCR=73;TR=146;WE=48697662;WS=48697644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,150:0.99:151
chr3	48699519	rs3733086	C	T	3438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=55;PP=2751;SC=AGGACACCGGCTTGGGACCGT;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=45;TCR=55;TR=100;WE=48699527;WS=48699509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr3	48700730	rs13092720	G	A	999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=27;PP=857;SC=GACGATGGCTGGAGAGGGGTC;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=48700738;WS=48700720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	48719453	rs34096717	A	C	5951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=10.300;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=98;PP=2965;ReadPosRankSum=2.414;SC=CCTCCACCTGAATTCCCCTAA;SOR=0.454;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=184;TCF=86;TCR=98;TR=180;WE=48719461;WS=48719443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,192:0.98:195
chr3	48719637	rs9883469	G	A	1711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=38;PP=1266;SC=CATCTAGAGCGTCAGCGAGGC;SOR=2.107;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=52;WE=48719645;WS=48719627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	48720303	rs9812977	G	A	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	48725682	.	C	G	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=10;PP=1138;SC=GAGTCGCTCTCAAGTACTGGA;SOR=2.400;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=45;WE=48725690;WS=48725672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	48732223	rs11557629	G	A	2069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.066;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=10;PP=1703;ReadPosRankSum=0.928;SC=CGTCCCCCCAGTGGGGGACTA;SOR=3.226;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=69;TCF=58;TCR=11;TR=67;WE=48732231;WS=48732213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,69:0.97:71
chr3	48732480	rs17080319	T	C	4022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=55;PP=2965;SC=ATCTCTCACATCTCCTCGCCA;SOR=1.016;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=71;TCR=56;TR=126;WE=48732488;WS=48732470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr3	48752654	rs11708786	C	T	798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=2;PP=639;SC=ATTTGTTACCCAAGATTATCC;SOR=3.442;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=48752662;WS=48752644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	48754877	rs9834996	G	T	208.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=143;SC=CTGACGGGCGGTTGGGTGGAT;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=48754885;WS=48754867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	48897078	rs6414612	A	G	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=19;PP=653;SC=TGGCAAGAAAAAGGTGAATTA;SOR=2.124;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=48897086;WS=48897068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	48982732	rs9864243	G	A	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	49044713	rs71324929	C	T	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=337;SC=GACGAAGGGTCGTCATTGGAC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=49044721;WS=49044703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	49048842	rs74574462	C	T	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=6.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.55;ReadPosRankSum=-1.557;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr3	49053219	rs7100	A	G	3300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=55;PP=2541;SC=GTCCCACCCCATTTTGCTGTG;SOR=0.825;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=49;TCR=55;TR=104;WE=49053227;WS=49053209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr3	49054316	rs71324930	C	T	1801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=53;PP=1513;SC=GCCTAGTTGGCGCTACTCTCC;SOR=5.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=55;TCF=2;TCR=53;TR=55;WE=49054324;WS=49054306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	49054692	rs3087866	T	C	2381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=26;PP=1723;SC=AACCAACTTCTGCCAAAGCAG;SOR=1.550;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=48;TCR=26;TR=74;WE=49054700;WS=49054682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	49055788	rs3923475	G	T	2310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=31;PP=1783;SC=GCCACGGCACGGGGCCCATCT;SOR=0.776;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=37;TCR=31;TR=68;WE=49055796;WS=49055778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	49064110	rs11706052	A	G	4354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=68;PP=2965;SC=CCACCTGTGTAGCAGCTCACC;SOR=0.707;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=67;TCR=70;TR=135;WE=49064118;WS=49064100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr3	49070499	rs4974081	C	T	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=8;PP=833;SC=TCTTGGATAGCTTCCACACTC;SOR=1.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=32;WE=49070507;WS=49070489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	49135492	.	G	A	2419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.690;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=26;PP=2007;ReadPosRankSum=-1.222;SC=CTTGTCGAAGGGTTTTGCCAG;SOR=1.194;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=75;TCF=47;TCR=28;TR=73;WE=49135500;WS=49135482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,76:0.97:78
chr3	49139406	rs35673421	G	A	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=22;PP=722;SC=ACAGAACTGAGTAGACCCCTA;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=49139414;WS=49139396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	49141116	rs5030795	G	A	4198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=81;PP=2965;ReadPosRankSum=0.339;SC=GCTGGGGCCGGTGCCTGTTAA;SOR=1.082;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=54;TCR=83;TR=134;WE=49141124;WS=49141106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,137:0.99:139
chr3	49148890	rs4292260	T	C	5995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=97;PP=2965;SC=CCATCCTCCCTTATCCTCCTC;SOR=0.736;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=190;TCF=93;TCR=97;TR=190;WE=49148898;WS=49148880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr3	49156473	rs11552724	C	G	6267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=104;NR=86;PP=2965;SC=GGATCTCCATCCTTGCTCTCC;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=104;TCR=86;TR=190;WE=49156481;WS=49156463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr3	49161313	rs13082063	C	T	5230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=95;PP=2965;SC=GCAACTCCTGCGCCCGCTGCT;SOR=1.048;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=72;TCR=95;TR=167;WE=49161321;WS=49161303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr3	49166069	rs9865051	C	T	3065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=30;PP=2322;SC=GAGGTTCAGCCCCAGATTAGA;SOR=1.364;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=52;TCR=30;TR=82;WE=49166077;WS=49166059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr3	49210732	rs7617480	A	C	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=25;SC=TCCAACCTAGATTTGAGCTGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=49210740;WS=49210722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr3	49213030	rs11713297	T	C	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=7;PP=578;SC=TCTCTCTCCTTCTTGCAGGAA;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=23;WE=49213038;WS=49213020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	49215966	rs9837625	C	T	1232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=9;PP=952;SC=GTCGCTGCGCCGGCTCCTTGA;SOR=2.133;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=36;WE=49215974;WS=49215956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	49249381	rs9867285	A	G	271.31	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.402;NF=0;NR=11;PP=246;ReadPosRankSum=-0.549;SC=AGATCACAAGATCAGGAGATC;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=11;WE=49249389;WS=49249371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr3	49269758	rs2099526	G	T	2517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=69;PP=2049;SC=AATCTAGCATGATTGACTTTA;SOR=5.394;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=4;TCR=69;TR=73;WE=49269766;WS=49269748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	49294250	rs13068038	C	A	4973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.325;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=85;PP=2965;ReadPosRankSum=0.047;SC=GGGGGAAAGACAAGAAGCAGC;SOR=0.718;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=158;TCF=72;TCR=86;TR=154;WE=49294258;WS=49294240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,159:0.98:162
chr3	49298139	rs7626076	G	A	2059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=24;PP=1581;SC=CGGGACACCTGTGGCAGGGCT;SOR=1.162;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=36;TCR=24;TR=60;WE=49298147;WS=49298129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	49298205	rs4955417	T	C	2626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=37;PP=2049;ReadPosRankSum=-0.665;SC=GGGCCTCTGGTGGCCTGTAGG;SOR=0.495;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=53;TCR=37;TR=89;WE=49298213;WS=49298195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,89:0.99:90
chr3	49313978	rs13077498	C	T	3089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=50;PP=2616;SC=GGTTTTCTCTCGGGGCACAGA;SOR=0.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=44;TCR=50;TR=94;WE=49313986;WS=49313968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr3	49315851	.	G	A	1948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=16;PP=1520;SC=TCATCATCTCGACGTTGGTAA;SOR=2.129;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=61;WE=49315859;WS=49315841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	49322027	rs2304442	T	A	1907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=30;PP=1326;SC=CCTATGGGAATCAAAGCACTC;SOR=0.826;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=27;TCR=30;TR=57;WE=49322035;WS=49322017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	49335360	rs61754208	T	C	3259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=58;PP=2321;SC=TTGGAAAATTTTGTGGAATCG;SOR=1.413;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=33;TCR=58;TR=91;WE=49335368;WS=49335350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr3	49343175	rs2230929	G	A	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=7;PP=1018;SC=CCACATGGGCGTCCCTTCCAG;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=40;WE=49343183;WS=49343165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	49354975	.	GTT	G,GT	447.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.81;QD=20.35;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,9,13:0.41,0.59:22
chr3	49362369	rs56038006	C	T	3053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=58;PP=2340;SC=TGTTGTCTAGCTTGCTCAACT;SOR=1.284;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=37;TCR=58;TR=95;WE=49362377;WS=49362359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr3	49373045	rs34514189	A	G	2565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=67;PP=2077;SC=GAGAGACAGAAATTTACTGTA;SOR=4.091;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=6;TCR=68;TR=73;WE=49373053;WS=49373035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr3	49394834	rs1050450	G	A	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.04;QD=27.15;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	49395673	.	GGCC	G	132	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=19;MQ=49.42;NF=1;NR=2;PP=132;QD=48.0;SC=ACACCGACTGGGCCGCCGCCG;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=3;WE=49395683;WS=49395663;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr3	49395757	rs1800668	G	A	104.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.61;NF=2;NR=3;PP=51;SC=AACAAGCACTGTAAGGGGAGG;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=49395765;WS=49395747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	49398514	rs892974	C	A	257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.28;QD=25.78;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	49406140	.	CTT	C	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQRankSum=1.356;QD=2.61;ReadPosRankSum=1.766;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr3	49450449	rs6779524	C	T	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=1;PP=683;SC=CAGATTCCCACCCCAGCCTTC;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=49450457;WS=49450439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	49455330	rs11715915	C	T	2331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=59;PP=1990;SC=CCACACGCCTCCGCTGCACCC;SOR=3.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=11;TCR=59;TR=70;WE=49455338;WS=49455320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr3	49463287	.	G	A	715	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=26;NR=0;PP=715;QD=28.8373543287;SC=TGGGGAAAGGGCCAGCCAGCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=49463295;WS=49463286;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	49463926	rs6762593	A	G	2570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=73;PP=2421;SC=AAGCTCAAAGATCAAAGGTGC;SOR=2.140;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=96;TCF=21;TCR=75;TR=94;WE=49463946;WS=49463916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr3	49548008	rs2131107	C	G	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=28;NR=5;PP=913;SC=CTGCCCCTCTCGGGGAGGACC;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=49548016;WS=49547998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	49548294	rs2329024	T	C	1865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=45;PP=1544;SC=GAGTTCTCATTTTCCATTTTA;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=14;TCR=45;TR=59;WE=49548302;WS=49548284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	49568095	rs2311801	G	A	276.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=261;SC=TCTCTAGGGGGGAGGAATCAG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=49568103;WS=49568085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	49570200	rs1801143	C	T	3039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=45;PP=2384;SC=TCTACCTGCACACAGTCATTC;SOR=0.714;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=49;TCR=45;TR=94;WE=49570208;WS=49570190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr3	49680225	rs71324983	C	T	4653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=60;PP=2965;SC=CACCTAAGATCGTCTTCAATG;SOR=0.934;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=80;TCR=60;TR=139;WE=49680233;WS=49680215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr3	49689210	rs34762726	G	A	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=17;PP=927;SC=CCAGGGCCTGGCCCCAAGTGA;SOR=1.061;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=20;TCR=17;TR=37;WE=49689218;WS=49689200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	49690199	rs4855885	G	A	3942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=18;PP=2965;SC=TCCGCAGCACGGCCCGCAAGA;SOR=3.240;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=102;TCR=18;TR=120;WE=49690207;WS=49690189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr3	49690496	rs11709525	C	T	5047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=88;PP=2965;SC=AGACACCCTCCGGCAGCTCCA;SOR=1.186;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=147;TCF=59;TCR=88;TR=146;WE=49690504;WS=49690486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr3	49701983	rs9858542	G	A	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=17;PP=843;SC=GCAAACTGACGGAAGGTATGC;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=31;WE=49701991;WS=49701973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	49713753	rs6778597	T	C	2050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=9;PP=1605;SC=GCACTAGCTTTTAGGAAGCAG;SOR=3.296;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=45;TCR=9;TR=54;WE=49713761;WS=49713743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	49714225	rs1131095	T	C	4394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=52;PP=2965;SC=CCCTGTATTATGTGGACCTCA;SOR=1.378;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=145;TCF=91;TCR=54;TR=143;WE=49714233;WS=49714215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr3	49719729	rs9822268	G	A	1277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=1;PP=1032;ReadPosRankSum=-0.734;SC=AGAGCGTCGAGGGGGCTGGGA;SOR=4.565;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=37;WE=49719737;WS=49719719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,39:0.98:40
chr3	49721532	rs3197999	G	A	1665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.89;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=31;PP=1357;ReadPosRankSum=-0.703;SC=GCTGGCCAGCGGGACCTTGCG;SOR=0.362;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=26;TCR=32;TR=56;WE=49721540;WS=49721522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr3	49721798	rs13085791	C	A	1761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.634;NF=41;NR=16;PP=1347;ReadPosRankSum=-1.181;SC=TCTCACTCTCCCGCACACGTC;SOR=0.556;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=57;WE=49721806;WS=49721788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,59:0.97:61
chr3	49722356	rs9837520	G	A	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=1.105;NF=25;NR=24;PP=1108;ReadPosRankSum=-0.832;SC=GTGACTCTCAGTCCATTGCCC;SOR=0.829;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=38;TCR=36;TR=49;WE=49722364;WS=49722346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,45:0.92:49
chr3	49723735	.	C	G	30	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=11;HapScore=4;MGOF=5;MMLQ=23;MQ=42.47;NF=3;NR=2;PP=30;QD=12.9542425094;SC=CGCCCCCCCCCCCCACCTCAC;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=5;WE=49723743;WS=49723716;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr3	49723750	rs71324987	A	G	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=6.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.16;MQRankSum=3.183;QD=19.75;ReadPosRankSum=-2.576;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr3	49724808	rs3020779	T	C	3561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=64;SC=TGTGATCATTTGGGAACTTGT;SOR=0.924;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=53;TCR=64;TR=117;WE=49724816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr3	49736565	rs6785549	G	A	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=23;PP=683;SC=ATGGCTGTGGGCTGCTCAGAA;SOR=3.180;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=27;WE=49736573;WS=49736555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	49737954	rs35620248	G	A	4395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.618;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=48;PP=2965;ReadPosRankSum=0.813;SC=TCTCTGCTTCGGCTGTACCGA;SOR=1.367;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=89;TCR=49;TR=137;WE=49737962;WS=49737944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,138:0.99:139
chr3	49739086	rs1491986	C	T	911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=14;PP=717;SC=TGGCAAGGCCCCTGGCCTGGG;SOR=1.101;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=24;WE=49739094;WS=49739076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	49739507	rs1491985	G	C	1639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=18;PP=1257;SC=TTCCTCACCTGACCTCCAGTG;SOR=1.051;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=47;WE=49739515;WS=49739497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	49744392	rs3749241	A	G	1562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=42;PP=1243;SC=GTCTAGCAAGATTGTGCCAGG;SOR=6.358;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=43;WE=49744400;WS=49744382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	49750188	rs3749240	T	A	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=47;PP=1331;SC=AGCAACACACTTCTGTGGGGG;SOR=4.534;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=4;TCR=47;TR=51;WE=49750196;WS=49750178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	49753003	rs34614773	T	G	1810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=3;PP=1454;SC=CCTGTCCCCCTGCAGAGCCCT;SOR=5.486;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=62;TCF=59;TCR=3;TR=62;WE=49753011;WS=49752993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	49753788	rs11720705	A	G	2324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=31;PP=1922;SC=AAGCAGGAGCATGTGGGTGGC;SOR=1.292;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=53;TCR=31;TR=84;WE=49753796;WS=49753778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr3	49760039	rs1466685	T	C	3470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=43;PP=2660;SC=CTGGATGCGCTGCAGCACTGC;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=65;TCR=43;TR=108;WE=49760047;WS=49760029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr3	49785133	rs7374183	G	A	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=379;SC=AAGTGACTTCGTGCTTTGAGA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=49785141;WS=49785123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	49830425	rs34160951	C	T	3765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=27;PP=2960;ReadPosRankSum=0.604;SC=AGGTACGGGGCTGCTCTGGCC;SOR=0.501;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=99;TCR=28;TR=123;WE=49830433;WS=49830415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,129:0.98:132
chr3	49924940	rs1062633	T	C	2497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=46;PP=1959;SC=ACTAGTACTCTGAAGGTGGGT;SOR=0.979;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=38;TCR=46;TR=84;WE=49924948;WS=49924930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	49928691	rs7433231	T	C	2012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=30;PP=1492;SC=TACTCCATGCTGCGGGCTACC;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=31;TCR=30;TR=61;WE=49928699;WS=49928681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr3	49936102	rs2230590	T	C	2377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=53;PP=1814;SC=GCCAGGGCCTTGGATAGGTAC;SOR=1.525;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=28;TCR=53;TR=81;WE=49936110;WS=49936092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr3	49949071	rs868891	A	G	2288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=21;PP=1885;SC=GGGAGTACACAGGCTTCCCTG;SOR=1.996;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=58;TCR=21;TR=79;WE=49949079;WS=49949061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr3	49978069	rs6772095	C	T	1626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=36;PP=1189;SC=TAGCACGTAGCCTCGTCCTCA;SOR=1.791;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=52;WE=49978077;WS=49978059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	50098993	.	CTTTTTT	C	89.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.010;ClippingRankSum=0.000;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=4.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQRankSum=0.859;QD=1.79;ReadPosRankSum=0.068;SOR=2.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,9:0.18:50
chr3	50112589	rs376657561	CA	C	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=5.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQRankSum=1.174;QD=1.58;ReadPosRankSum=2.259;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr3	50129374	rs5848907	T	TA	1134.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=0;PP=1388;SC=ACTATTTGGATTATCTTATAA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=50129382;WS=50129364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	50130011	.	G	A	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.190;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=5.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.55;MQRankSum=-2.505;QD=3.83;ReadPosRankSum=0.571;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr3	50130016	.	G	A	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.104;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQRankSum=-3.111;QD=2.24;ReadPosRankSum=0.568;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr3	50192760	rs2526390	C	T	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=52;SC=CGGCCCCGAGCGCCCCTGAGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=50192768;WS=50192750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	50212512	rs2624833	G	T	4551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.442;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=63;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.845;SC=TCTAACCCCTGTTCCTCGTCT;SOR=0.558;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=143;TCF=79;TCR=64;TR=142;WE=50212520;WS=50212502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,147:0.99:148
chr3	50251833	rs5848902	A	AG	2595.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=20;PP=2607;SC=CTGTGCCTACAGGTCGAGGAC;SOR=1.609;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=67;TCF=41;TCR=26;TR=61;WE=50251841;WS=50251823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	50255663	rs35926495	C	T	6184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=2.771;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=43.86;ReadPosRankSum=-0.274;SOR=1.768;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,139:0.99:141
chr3	50255666	rs56048629	C	T	6209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=2.742;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=43.42;ReadPosRankSum=-0.056;SOR=1.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,141:0.99:143
chr3	50306752	rs67324803	G	GC	533.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=10;PP=598;SC=GCCGCCCCCAGCCCCCACGCC;SOR=1.493;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=16;WE=50306760;WS=50306742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	50308718	rs4688739	A	G	1155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=3;PP=875;SC=AACCTCACTCACTCCCAGAGC;SOR=3.664;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=38;WE=50308726;WS=50308708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	50329826	rs1076872	A	G	2285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=61;NR=20;PP=1735;SC=GCCACACGCCACGCGCGCCAC;SOR=2.191;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=61;TCR=20;TR=81;WE=50329834;WS=50329816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr3	50332697	rs13100173	G	A	3047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=47;PP=2312;SC=AGGCTGTGGTGGATCTGGTAG;SOR=0.754;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=96;TCF=49;TCR=47;TR=96;WE=50332705;WS=50332687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr3	50338388	.	A	C	180	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=10;HapScore=4;MGOF=13;MMLQ=17;MQ=57.8;NF=11;NR=0;PP=180;QD=19.5246556861;SC=CCCCTCCCCCACCCCCACCCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=11;WE=50338396;WS=50338367;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr3	50357869	rs709210	A	C	1316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.690;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=35;PP=1138;ReadPosRankSum=0.929;SC=ATGGCCCATGACACCGCCAGC;SOR=2.676;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=43;WE=50357877;WS=50357859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr3	50375606	rs3840490	A	AC	283.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=332;SC=AATGTTGGCCACCTGGGCGTC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=50375614;WS=50375596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	50402309	rs2239801	C	G	3663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=63;NR=63;PP=2629;SC=CCACCGCCCCCTCTCCTCACT;SOR=0.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=63;TCR=63;TR=126;WE=50402317;WS=50402299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr3	50597092	rs1034405	G	A	4229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=82;PP=2965;SC=GGCCACTCACGCATGGATGGC;SOR=1.220;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=54;TCR=82;TR=136;WE=50597100;WS=50597082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr3	50609123	rs636168	T	C	2883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=14;PP=2323;SC=CAGCCACTTATATTCTCTGTG;SOR=3.358;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=77;TCR=14;TR=91;WE=50609131;WS=50609113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr3	50609624	rs2232248	T	G	2134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=35;PP=1662;SC=TGTTTATTCCTCGGCCAGAAA;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=37;TCR=35;TR=72;WE=50609632;WS=50609614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	50616049	.	G	A	89	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=89;QD=41.2570708491;SC=CTTGAAATGAGGGGCTGCCAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=50616057;WS=50616048;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	50645635	rs621975	T	G	2696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=55;PP=2234;SC=ACCAATCCAGTGCAAGTCAAG;SOR=1.697;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=25;TCR=55;TR=80;WE=50645643;WS=50645625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr3	50645793	rs622502	C	G	3373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=42;PP=2641;SC=TGCCTCCCCCCTCAGACTCAC;SOR=1.382;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=76;TCR=42;TR=118;WE=50645801;WS=50645783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr3	50678001	rs608961	C	T	278.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=259;SC=CTCCCTGCCACGCTTCTAGGG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=50678009;WS=50677991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	50679390	.	C	G	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=365;SC=CTTGGACTCTCTATGGCTTTG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=50679398;WS=50679380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	50683809	rs876105	T	C	1063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=24;PP=876;SC=TCCCCCTCTTTCCAGCTATGG;SOR=2.049;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=33;WE=50683817;WS=50683799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	50683871	rs148878106	A	T	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=15;PP=447;SC=TACATCTGCCAAACAGGCTCA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=50683879;WS=50683861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	50684489	rs4468971	A	G	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=14;PP=1284;SC=AGGATGGAGTAGGGGGAACCA;SOR=1.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=47;WE=50684497;WS=50684479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	51246360	rs4301044	A	G	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=33;PP=984;SC=CAGCACTTAGATTGGTTGGTG;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=39;WE=51246368;WS=51246350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	51273773	rs1480361	T	C	2666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=36;PP=2197;SC=TATGTTGTTTTAGTTTCTGCA;SOR=0.987;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=43;TCR=36;TR=79;WE=51273781;WS=51273763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr3	51349887	rs2170177	C	A	2112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=11;PP=1657;SC=GTCACATTTTCTCTTTCTCTG;SOR=2.904;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=53;TCR=11;TR=64;WE=51349895;WS=51349877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	51393706	rs35251332	C	CAG	2534.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=29;PP=2668;SC=TCTAGGAAAACGGGCAGTACA;SOR=0.970;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=54;WE=51393714;WS=51393696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	51395571	rs1542574	C	T	156.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=111;SC=TCCAGACCTACGCCACAAACC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=51395579;WS=51395561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	51418348	rs2241784	G	A	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=1;PP=1174;SC=GGAGCTTGCTGCTGAAGAAAC;SOR=6.138;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=41;WE=51418356;WS=51418338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	51422766	rs13091931	G	T	295.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=24.65;ReadPosRankSum=-1.534;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr3	51469107	rs4611808	C	T	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=18;PP=861;SC=TTTGTTAATACAAAACAAGCA;SOR=1.085;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=14;TCR=18;TR=32;WE=51469115;WS=51469097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	51517625	.	T	TTGTGTG	109	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=26;MQ=60.75;NF=3;NR=0;PP=109;QD=37.3333333333;SC=TTAAACTAGTTTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=3;WE=51517633;WS=51517615;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,3:0.27:11
chr3	51697493	rs904145	A	G	1462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=26;PP=1216;SC=CACCAAGCTGAAAGGCAGTGA;SOR=1.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=42;WE=51697501;WS=51697483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	51895850	rs986539	C	T	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=10;PP=795;SC=CATTTATGTACTTCCCATTTA;SOR=1.688;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=29;WE=51895858;WS=51895840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	51907736	rs7635409	A	G	2847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=25;PP=2361;SC=GGACACAGATATAGCAGACCT;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=60;TCR=25;TR=85;WE=51907744;WS=51907726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr3	51908226	rs1505403	T	C	1482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=27;PP=1271;SC=CAGGGTATGCTAGGAAGGGGC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=41;WE=51908234;WS=51908216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	51908430	rs6794320	T	C	3738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=68;PP=2915;SC=GCTACCTCATTCCATTTTCCA;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=47;TCR=68;TR=115;WE=51908438;WS=51908420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr3	51911118	rs3036712	C	T	166.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.85;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	51929360	rs34574240	GA	G	843.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=30;PP=847;SC=GGGCTTTCAAGAAAAAAAGAG;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=30;WE=51929368;WS=51929350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	51936949	rs7635125	T	C	6091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=121;NR=68;PP=2965;SC=AGACACTAGCTACTAGCACTA;SOR=1.432;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=122;TCR=69;TR=189;WE=51936957;WS=51936939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr3	51967439	rs323886	A	G	1137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=2;PP=955;ReadPosRankSum=-0.896;SC=AGCTACAAGAAACAAGGCCCA;SOR=3.556;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=36;WE=51967447;WS=51967429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr3	51969218	rs41291742	G	A	1979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=33;PP=1597;SC=CTTACCCATCGTCCGCGCCGG;SOR=0.822;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=64;WE=51969226;WS=51969208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	51978220	rs28547534	A	G	4165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=82;PP=2965;SC=TGCTGGAACCACTGGGGCCGT;SOR=1.171;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=138;TCF=55;TCR=83;TR=137;WE=51978228;WS=51978210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr3	51989611	rs115390330	G	A	556.81	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=497;ReadPosRankSum=1.528;SC=AAATCCTGCAGCTTTAGGCTC;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=19;WE=51989619;WS=51989601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr3	51990119	rs28587738	A	C	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=3;PP=170;SC=CCTGCTCGGCACGCCGCCCGC;SOR=1.179;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=51990127;WS=51990109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	51990315	rs28651222	A	G	1455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=22;PP=1109;SC=TCCCGACTCCACTCGGACTCT;SOR=1.036;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=29;TCR=22;TR=51;WE=51990323;WS=51990305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	51994923	rs3214327	GGT	G	3798.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=20;PP=2950;SC=TTCTGTGGGAGGTACAAAACA;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=55;TCR=20;TR=74;WE=51994932;WS=51994913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr3	52018049	.	C	T	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=6;PP=1127;SC=GTTAGCCATTCACTTTGCCCC;SOR=3.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=41;WE=52018057;WS=52018039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	52020411	rs323893	C	T	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=15;PP=571;SC=CCTCATCTCACGTCCCTGCTG;SOR=1.802;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=22;WE=52020419;WS=52020401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	52021316	rs323895	A	G	2826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=39;PP=2136;SC=CCCTGCCCCCACACCACAGGC;SOR=1.090;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=53;TCR=39;TR=92;WE=52021324;WS=52021306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr3	52179833	rs146526945	T	C	994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=6;PP=837;SC=AGGGCTGCCCTTGGGCCCAGG;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=52179841;WS=52179823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	52188364	rs116293720	G	A	1587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=35;PP=1304;SC=CTCTCGGCTGGGCTTACCGCG;SOR=1.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=51;WE=52188372;WS=52188354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	52272945	rs11441245	C	CG	614.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.452;NF=10;NR=11;PP=451;ReadPosRankSum=-0.580;SC=GGCCGAGAGCCGGGGGGGGGC;SOR=0.353;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=21;WE=52272953;WS=52272935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr3	52414112	rs73072968	C	T	5550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=85;NR=86;PP=2965;SC=CACCAGGCTCCGATGTCAAGT;SOR=0.764;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=85;TCR=86;TR=171;WE=52414120;WS=52414102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr3	52415865	rs770284	A	G	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=27;PP=783;SC=GAGCGCCTCCAGGGCGTGCTG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=52415873;WS=52415855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	52430698	rs365048	A	G	3441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=53;PP=2706;SC=CTGGAGCGCCATAAGTTTGGG;SOR=0.800;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=58;TCR=53;TR=111;WE=52430706;WS=52430688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr3	52448051	rs73072983	G	A	1573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=28;PP=1033;SC=AGAGGAAACCGTCTTCAGGGC;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=47;WE=52448059;WS=52448041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	52453893	rs498778	C	T	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=11;PP=730;SC=CCAACAGAGGCTTCCATGGAT;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=31;WE=52453901;WS=52453883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	52471942	rs82825	G	A	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=4;PP=977;SC=GGCCACAGGGGTGAGTTCCAG;SOR=3.442;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=35;WE=52471950;WS=52471932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	52477080	rs2016575	T	C	1943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=43;PP=1370;SC=TTTCGGACCATGGCTCCTGGG;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=26;TCR=43;TR=69;WE=52477088;WS=52477070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr3	52488202	rs1035002	C	T	205.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=136;SC=TGAGTCCCCACGTCCTCTGCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=52488210;WS=52488192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	52492085	rs4687614	G	A	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=21;PP=534;SC=ATATAACTGCGTTCATTAATA;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=52492093;WS=52492075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	52492707	rs1541495	T	C	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=16;PP=626;SC=TTGATAAAAATCTGCTTCCGC;SOR=1.445;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=24;WE=52492715;WS=52492697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	52505758	rs3065763	G	GAT	1392.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=3;PP=1312;SC=TGACAGAAAAGGTGGAAATCC;SOR=3.981;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=29;WE=52505766;WS=52505748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	52506282	rs4312651	A	G	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=3;PP=348;SC=TGGGCATGCGACACTGTTCCC;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=52506290;WS=52506272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	52506426	rs6784615	C	T	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=13;PP=622;SC=TAAGGCCCAGCGCTGCACAGC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=13;TCR=13;TR=26;WE=52506434;WS=52506416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	52506491	rs6445486	A	G	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=15;PP=489;SC=TGGGTGTCCTAATTTAATCAT;SOR=2.531;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=19;WE=52506499;WS=52506481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	52510592	rs9856575	G	A	3581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=79;PP=2815;SC=CCACAACAGCGTCTCCGAGAT;SOR=1.823;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=34;TCR=79;TR=113;WE=52510600;WS=52510582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr3	52512318	rs2109559	A	G	2407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=37;PP=1837;SC=AGGACCTCACAGTTTTGGGAT;SOR=0.846;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=42;TCR=37;TR=79;WE=52512326;WS=52512308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr3	52513940	rs4687618	T	C	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=22;PP=546;SC=GGAGCCAGTTTGGGGGGCTTG;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=52513948;WS=52513930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	52518786	rs4687619	T	C	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=32;PP=829;SC=CTCTGCTTTGTGCCACGGTCT;SOR=3.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=36;WE=52518794;WS=52518776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	52523405	rs887515	C	T	1518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=31;PP=1251;SC=CCGGCCCCAGCGGAAGTCCCA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=47;WE=52523413;WS=52523395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	52524974	rs4687621	A	C	156.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=124;SC=CCACTTCTTAACCGGGGTGGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=52524982;WS=52524964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	52536308	rs758801	A	C	423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=10;PP=355;SC=CAGATGCAGTACCTACAACCA;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=52536316;WS=52536298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	52537969	rs4687545	T	C	2787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=53;PP=2383;SC=AAGCGTGCCCTCTGCGGGAAG;SOR=1.116;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=36;TCR=53;TR=89;WE=52537977;WS=52537959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr3	52540773	rs1010553	T	C	2745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=21;PP=2077;ReadPosRankSum=-0.866;SC=CCGCCAATGGTGTGATCCACA;SOR=1.028;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=67;TCR=21;TR=87;WE=52540781;WS=52540763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,90:0.99:91
chr3	52544470	rs9835659	A	G	2309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=47;PP=1724;SC=TGAGCTGGACATGAGAGGTGG;SOR=1.236;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=30;TCR=47;TR=77;WE=52544478;WS=52544460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	52546487	rs7644763	C	T	3117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=57;PP=2468;SC=CTGTCTTCCCCGTGCTTGGGA;SOR=1.059;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=39;TCR=57;TR=96;WE=52546495;WS=52546477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr3	52548818	rs740903	C	T	1632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=36;PP=1290;SC=CAAGTCGCTGCCTGCATAGCC;SOR=2.124;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=48;WE=52548826;WS=52548808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	52553272	rs146328407	G	GC	1041.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=6;PP=1105;SC=CCCGTGCCCCGCCCCCAGGGC;SOR=2.303;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=28;WE=52553280;WS=52553262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	52554304	rs7630214	G	C	6617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=129;PP=2965;ReadPosRankSum=0.458;SC=CCGAACGCGGGCCGTGAGTCT;SOR=0.575;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=201;TCF=71;TCR=130;TR=200;WE=52554312;WS=52554294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,208:1.00:209
chr3	52559167	rs58050076	CGG	C	618.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;QD=29.46;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,19:0.90:21
chr3	52853340	rs7620907	G	C	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=562;SC=ACCCCACCCCGCTCTATGGGG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=52853348;WS=52853330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	52867288	rs4687661	A	T	3630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=46;PP=2812;SC=AGTTCCTGGGAAAGGCTCCTG;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=66;TCR=46;TR=112;WE=52867296;WS=52867278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr3	52867595	rs60332615	C	A	1859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=6;PP=1544;SC=CACACCTGCACCCCCATCCCC;SOR=4.029;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=52;TCR=6;TR=58;WE=52867603;WS=52867585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	52867715	rs6787916	G	C	4121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=61;PP=2965;SC=TCAGGTCCTCGTCCTTCACAG;SOR=0.755;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=68;TCR=61;TR=129;WE=52867723;WS=52867705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr3	52867811	rs6776876	A	T	3947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=56;NR=77;PP=2965;SC=GCCTCGGTAGAAAGGCACACC;SOR=1.095;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=56;TCR=77;TR=133;WE=52867819;WS=52867801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr3	52868610	rs11922961	T	C	975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=0;PP=824;SC=GCCGGGCCCATAGCTACAAAT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=52868618;WS=52868600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	52868668	rs142854055	G	GCACA,GCACACA	3071.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.256;NF=29,29;NR=6,6;PP=1211,185;ReadPosRankSum=-1.478;SC=ACACACAGATGCGCACACACA;SOR=2.019;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=53;TCF=47;TCR=6;TR=35,35;WE=52868678;WS=52868658;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.17,0.81:54
chr3	52868670	rs62255421	G	A	3251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.302;NF=48;NR=5;PP=1572;ReadPosRankSum=-1.526;SC=ACACAGATGCGCACACACACA;SOR=2.476;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=80;TCF=71;TCR=9;TR=53;WE=52868678;WS=52868658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,74:0.99:75
chr3	52868716	rs77032405	GC	G	4660.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.372;NF=75;NR=60;PP=2983;ReadPosRankSum=0.404;SC=ATCTATCTAGGCCCCCCCCAC;SOR=0.758;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=87;TCR=67;TR=135;WE=52868732;WS=52868706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,159:0.98:162
chr3	52870729	rs11431693	C	CA	3315.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.24;QD=36.44;SOR=1.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr3	52874446	rs6769789	C	T	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=2;PP=461;SC=AACGATGCTGCGGGATGACCT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=52874454;WS=52874436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	52874716	.	GTT	G	39	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=0.9998;HP=19;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=19;MQ=59.8;NF=0;NR=4;PP=39;QD=10.5;SC=CAAGTCTCATGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=4;WE=52874725;WS=52874706;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,4:0.31:13
chr3	52874753	rs56019197	T	C	112.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.26;NF=0;NR=4;PP=86;SC=TCTCACCCTGTCACCCAGGCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=52874761;WS=52874743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	52874779	rs7638431	G	A	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=83;SC=GCAATGGCACGATCTCGCCTC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=52874787;WS=52874769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	52877647	rs55829187	C	CA	2023.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=7;PP=1499;SC=CTGAGGGCTACAGGTGAGCTT;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=35;WE=52877657;WS=52877637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	52877649	rs56008508	G	A	2032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=7;PP=1053;SC=GAGGGCTACAGGTGAGCTTTC;SOR=2.737;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=39;WE=52877657;WS=52877637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	52877720	rs4687668	T	C	2264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=33;PP=1637;SC=GGGATAAAAATGCAACATGGC;SOR=1.079;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=46;TCR=33;TR=79;WE=52877728;WS=52877710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	52878721	rs7650966	G	C	257.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=211;SC=CAGACCAAATGCAGGACACAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=52878729;WS=52878711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	52878746	rs10663469	C	CAG	931.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=861;SC=AGAGTTAAAACAAGTTTGGTT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=17;WE=52878754;WS=52878736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	52878825	rs7629528	C	A	2057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=16;PP=1502;SC=AGGAGCTGCTCATGCAGGGAC;SOR=2.105;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=61;WE=52878833;WS=52878815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr3	52881634	rs5848962	T	TG	1975.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=31;PP=1757;SC=AAGAGAGCTGTGGTACCTCTT;SOR=1.412;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=40;WE=52881642;WS=52881624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	52883654	rs3216716	CT	C	609.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=632;SC=GGAGGGTGTGCTCAAACCCAG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=52883662;WS=52883644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	52886914	rs4687675	A	T	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=35;PP=989;SC=GCCTTTGAAAACCCTAAAAGG;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=52886922;WS=52886904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	52960013	rs11360013	GC	G	1639.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=1;PP=1786;SC=CTGCAGCCCTGCCATAGTGGC;SOR=5.376;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=41;WE=52960021;WS=52960003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	52960256	rs34584015	AG	A	2057.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=35;PP=1375;SC=ATCATTTTAGAGGGGCGAAAA;SOR=3.033;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=36;WE=52960269;WS=52960246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	52960261	rs34585187	C	A	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=3;NR=35;PP=1210;SC=TTTAGAGGGGCGAAAAGCATT;SOR=3.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=38;WE=52960269;WS=52960246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	52968726	rs2257216	T	C	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=4;PP=527;SC=TCTCTAATAATAACGTTTATT;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=52968734;WS=52968716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	52968801	rs2710315	T	C	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=19;PP=1049;SC=GGGTTTTCCATGCTGATGTGG;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=26;TCR=19;TR=45;WE=52968809;WS=52968791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	53003021	rs2245424	G	C	1516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=1;PP=1321;SC=ACTTCAAAGAGCTTCCAGTTC;SOR=6.316;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=47;TCR=1;TR=48;WE=53003029;WS=53003011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	53125922	rs11242	T	C	1190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=2;PP=879;SC=CCTGAAGTCATGTCATTTTGT;SOR=3.912;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=34;WE=53125930;WS=53125912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	53126143	rs2581786	G	A	2003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=46;PP=1628;SC=CCTTCCTCTGGGACCAGCCAG;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=13;TCR=46;TR=59;WE=53126151;WS=53126133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	53133526	rs2581829	A	G	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=27;PP=864;SC=ACTCACTGAGACTCCAGAGCC;SOR=2.247;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=53133534;WS=53133516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	53139506	rs2564942	CA	TG	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=1112;SC=AAGAGCAAAGCAAGAAGGCCA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=20;WE=53139515;WS=53139503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	53212574	rs2306571	C	G	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=13;PP=486;SC=AGGCTGGACCCTGGAGAGGGG;SOR=1.230;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=21;WE=53212582;WS=53212564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	53213538	rs2035451	C	G	2700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=19;PP=2119;SC=TGGAGGTCTACGAGGGAGGGA;SOR=2.026;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=55;TCR=19;TR=74;WE=53213546;WS=53213528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	53213815	rs3830263	C	CGTGT	814.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=13;PP=731;SC=CGAGCCGTGCCGTGTGTGTGT;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=13;WE=53213823;WS=53213805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	53215875	rs11130350	A	C	1691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=29;PP=1312;SC=CCCAGTGTAGATACAGCAGCT;SOR=0.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=22;TCR=29;TR=51;WE=53215883;WS=53215865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	53216051	rs6445568	T	C	79.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	53220444	rs6793352	T	C	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=16;PP=727;SC=GTGTCTCCCCTTCAGGCCACT;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=24;WE=53220452;WS=53220434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	53222761	rs2306574	C	T	3365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=52;PP=2599;SC=CAATGTGCTGCTGGACCGGGA;SOR=0.786;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=57;TCR=52;TR=108;WE=53222769;WS=53222751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr3	53223291	rs7630600	T	G	1584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=42;PP=1306;SC=GCTGGGCTGGTCTGGGCTGGG;SOR=3.398;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=7;TCR=43;TR=49;WE=53223299;WS=53223281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	53223927	rs1075865	C	G	1772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=21;PP=1426;SC=TGGGAGTGACCGGAAACATCA;SOR=1.536;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=62;TCF=40;TCR=22;TR=61;WE=53223935;WS=53223917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	53224002	rs900495	T	C	1899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=34;PP=1527;SC=TGGAGCCACCTTTCAGGCCCA;SOR=1.342;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=52;WE=53224010;WS=53223992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	53267133	rs6445573	G	C	1467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=11;PP=1192;SC=GTGTCTGGGCGAGGGGTGAAG;SOR=2.400;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=46;WE=53267141;WS=53267123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	53324819	rs201612547	ATGGCAC	A	3225.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=21;PP=2978;SC=CCTTACCGGGATGGCACTGGC;SOR=1.257;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=62;TCF=37;TCR=25;TR=55;WE=53324832;WS=53324809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	53326534	rs34366563	A	G	2564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=48;PP=2090;SC=GACTGAGAACAGGGCTCAACG;SOR=1.075;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=34;TCR=48;TR=82;WE=53326542;WS=53326524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr3	53529140	rs312480	T	C	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=4;PP=498;SC=CGCCCCCGCCTCAACGCCCAG;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=53529148;WS=53529130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	53766026	rs2612033	T	C	1489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=20;PP=1079;SC=CCTCCCAAGATGTCTTTGTCA;SOR=0.994;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=26;TCR=20;TR=46;WE=53766034;WS=53766016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	53766212	rs2306866	A	T	250.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=238;SC=CAGCGTGCACATGAGCTGCTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=53766220;WS=53766202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	53769479	rs1045958	C	T	3231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.247;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=68;PP=2407;ReadPosRankSum=0.040;SC=TGCTGAGCAGCGCTGCCCTGG;SOR=1.299;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=104;TCF=35;TCR=69;TR=101;WE=53769487;WS=53769469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,107:0.97:110
chr3	53776995	rs2612026	T	C	1993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=7;PP=1596;SC=TTCTTTTCCTTTGGAGACAAA;SOR=3.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=49;TCR=7;TR=56;WE=53777003;WS=53776985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	53778620	rs28365115	C	G	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=398;SC=GCCTCTGAGTCGTGAAGAGAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=53778628;WS=53778610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	53779825	rs3821860	A	G	3692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.384;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=77;PP=2950;ReadPosRankSum=-0.897;SC=GCATTTACTTAACTGCCTGTC;SOR=1.860;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=32;TCR=77;TR=108;WE=53779833;WS=53779815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,113:0.99:114
chr3	53796744	rs3774567	T	C	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=856;SC=TGCCCTTAAATCTCCACACAC;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=53796752;WS=53796734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	53806803	rs2278517	G	C	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=4;PP=1084;SC=TCAGGCTGTGGCGGGCCGTCA;SOR=4.223;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=38;TCR=4;TR=42;WE=53806811;WS=53806793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	53814197	rs1829423	G	A	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=4;NR=24;PP=834;SC=CAGGAAAGGAGAGAGACATCA;SOR=3.056;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=53814205;WS=53814187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	53845092	.	C	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.929;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=206;ReadPosRankSum=0.216;SC=CCCTGCCCTGCAAAGCCTTAT;SOR=0.556;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=11;WE=53845100;WS=53845082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr3	53853009	rs34974961	T	C	3629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=57;PP=2893;ReadPosRankSum=-0.662;SC=GTCTTGGGGATTGGCACTTCT;SOR=0.276;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=108;TCF=49;TCR=59;TR=106;WE=53853017;WS=53852999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,115:0.99:116
chr3	53856653	rs2241808	C	T	1967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=51;PP=1601;SC=AGGCACAGGCCGCGCTCCACC;SOR=3.575;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=7;TCR=51;TR=58;WE=53856661;WS=53856643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	53857803	rs12676	A	C	853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=5;PP=670;SC=GCTCCCCGCGAGCACGTCCTT;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=53857811;WS=53857793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	53880789	rs2232332	A	G	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=18;PP=580;SC=CTGCCGGCTCAAGGGGCATGC;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=53880797;WS=53880779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	53882663	rs1025690	G	A	4170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=72;PP=2965;SC=CGGCTTCAACGTGACGCTTGG;SOR=0.902;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=60;TCR=72;TR=132;WE=53882681;WS=53882653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr3	53882673	rs5849009	G	GT	3891.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=37;NR=70;PP=2975;SC=GTGACGCTTGGTTTTTTCTCT;SOR=1.005;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=121;TCF=40;TCR=81;TR=107;WE=53882681;WS=53882653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr3	53883722	rs1025689	C	G	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=7;PP=424;SC=ATCTAATCCCCGGAGACTTGA;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=19;WE=53883730;WS=53883712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	53883910	rs4687751	C	T	423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=10;PP=317;SC=TCCCCTTCTACGCATAACCAA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=53883918;WS=53883900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	53886912	rs3733075	C	T	2762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=42;PP=2142;ReadPosRankSum=1.597;SC=CATTTTCCTACATCGGCTTCC;SOR=0.223;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=42;TCR=43;TR=84;WE=53886920;WS=53886902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,90:0.99:91
chr3	53890787	rs3821867	G	A	217.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=199;SC=GAGAACTTGGGTTTGTTTCCA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=53890795;WS=53890777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	53891097	rs2276840	C	G	177.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=113;SC=GTTGTCCAAACGTGCTGGGCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=53891105;WS=53891087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	53892553	rs13315972	C	T	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=547;ReadPosRankSum=0.719;SC=GTCTTGGGCACGTGGGTCTCG;SOR=2.753;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=23;WE=53892561;WS=53892551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,24:0.96:25
chr3	53892641	rs9840079	T	G	3102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=14;PP=2482;SC=ACTAGAGGTATGGGCGAAGCC;SOR=3.118;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=76;TCR=14;TR=90;WE=53892649;WS=53892631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr3	53905308	rs1046677	T	C	2765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=33;PP=2146;SC=CCAGGGCTTTTCCTTCAAACA;SOR=1.065;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=48;TCR=33;TR=81;WE=53905316;WS=53905298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr3	53906513	rs4687757	G	A	2262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=33;PP=1760;SC=TCTGTCCAACGATTCCAAAAG;SOR=0.807;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=37;TCR=33;TR=69;WE=53906521;WS=53906503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	53906663	rs2289203	T	C	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=442;SC=TTCCCTAAGTTAGACTGGGCA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=53906671;WS=53906653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	53906951	rs12632292	A	G	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=503;ReadPosRankSum=0.065;SC=ATCTACAATCAGTTGACATTC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=23;WE=53906959;WS=53906941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr3	53910118	rs744277	A	G	1470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=49;PP=1503;ReadPosRankSum=-0.341;SC=CTGGGGGGGGAAAAGAAAAGG;SOR=2.948;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=61;TCF=9;TCR=52;TR=56;WE=53910129;WS=53910108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr3	53910121	rs5849012	AG	A	1461.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.10;ReadPosRankSum=-0.217;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr3	53910899	rs5849013	GA	G	804.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=33;PP=579;SC=GTTTTATAAGGAAAAAAAAAA;SOR=5.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=33;WE=53910907;WS=53910889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	53910919	rs11419180	G	GT	561.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.147;NF=0;NR=28;PP=391;ReadPosRankSum=0.805;SC=ATGCTCAAGTGTTTTTTTTTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=28;WE=53910927;WS=53910909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,23:0.92:25
chr3	53911540	rs3733079	G	A	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=3;PP=200;SC=AGTAGGAGTCGGTGTGACTAT;SOR=1.179;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=53911548;WS=53911530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	53912341	rs3733081	C	A	2431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=6;PP=2059;SC=ATTATGATACCAATAGTGGTG;SOR=4.294;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=68;TCR=6;TR=74;WE=53912349;WS=53912331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr3	53915930	rs2276843	C	T	896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.84;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	53915937	rs2276844	T	A	996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.34;SOR=6.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	53916130	rs2276845	A	G	5226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=101;PP=2965;SC=CTGGGTCATTATGGCCGGAGA;SOR=1.320;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=161;TCF=59;TCR=102;TR=160;WE=53916138;WS=53916120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr3	53921022	rs1020082	T	C	2572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.88;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	53921028	rs10440151	T	G	2444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.27;SOR=1.835;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	53922620	rs3816144	A	G	3587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=93;PP=2842;SC=CTTGCCCATTATTCCAAATGG;SOR=3.086;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=19;TCR=93;TR=112;WE=53922628;WS=53922610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr3	54157710	rs2290132	A	T	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=29;PP=872;SC=GTGAGCCCCGAGCAGCATCAG;SOR=3.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=32;WE=54157718;WS=54157700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	54401650	rs1868506	C	A	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.284;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=812;ReadPosRankSum=-0.829;SC=GGGGCTTGAACGACCCCTGGC;SOR=2.455;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=33;WE=54401658;WS=54401640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,33:0.97:34
chr3	54401666	rs1868507	G	A	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.690;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=620;ReadPosRankSum=-0.703;SC=CTGGCCACAAGCTCTGCCCAT;SOR=2.704;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=27;WE=54401674;WS=54401656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr3	54419977	rs9836159	C	T	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=11;PP=477;SC=TATCCTCTAGCCTATATTTTC;SOR=1.371;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=17;WE=54419985;WS=54419967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	54596815	rs9814659	T	C	4127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.257;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=59;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.770;SC=TCTCTCTCTTTCTTTTTTACA;SOR=0.428;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=66;TCR=60;TR=125;WE=54596823;WS=54596805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,126:0.99:127
chr3	54604188	rs2251788	T	C	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=371;SC=CTTTTGGTAGTGACTGGTTAA;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=54604196;WS=54604178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	54615971	rs6782115	A	G	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=10;PP=351;SC=TGATTGTTTCACAATAAATCT;SOR=1.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=54615979;WS=54615961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	54676441	rs3832224	CA	C	491.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=517;SC=TTCTTGTTTTCAAAAAATGAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=54676449;WS=54676431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	54786864	rs34310780	G	GT	383.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.43;MQRankSum=-0.189;QD=23.98;ReadPosRankSum=1.742;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr3	54798258	rs3732748	G	A	3242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=47;PP=2346;SC=TTTTTACCCAGATCTCCACCT;SOR=0.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=48;TCR=47;TR=95;WE=54798266;WS=54798248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr3	54919272	rs1405330	A	G	2014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=6;PP=1655;ReadPosRankSum=-0.747;SC=TGGGGGAGTGATACTTATTCA;SOR=2.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=56;TCR=6;TR=61;WE=54919280;WS=54919262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr3	54919351	rs10510774	A	G	3287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=50;PP=2469;SC=TGGCAGATGAATGGTAAGAAT;SOR=0.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=47;TCR=50;TR=97;WE=54919359;WS=54919341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr3	54928487	rs58625954	G	A	1747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.24;SOR=2.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	54928489	rs58346602	A	T	1830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.94;SOR=2.133;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	54928496	rs1526595	T	C	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.10;SOR=2.110;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	54930640	rs79621910	C	G	217.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=173;SC=AGTGAGGCCCCCTCTATACTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=54930648;WS=54930630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	54930773	rs17253119	A	G	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=12;PP=917;SC=TTTCCACTTCAAGGGACTTCC;SOR=1.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=38;WE=54930781;WS=54930763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	54934054	rs17253231	A	C	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=546;SC=CATCTCCTTCAAACCAAGACT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=54934062;WS=54934044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	54961949	rs4245920	C	T	2085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=37;PP=1461;SC=GACTGAGTCTCCTTGGGCGTC;SOR=1.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=57;WE=54961957;WS=54961939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	55038898	rs4955827	A	G	3189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=63;PP=2413;SC=GAAAACAGCCACACATTTCTG;SOR=1.300;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=40;TCR=65;TR=102;WE=55038906;WS=55038888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr3	55038998	rs56926640	TA	T	91.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.33;MQRankSum=1.417;QD=4.17;ReadPosRankSum=0.291;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr3	55108055	rs358076	G	A	1086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=17;PP=896;SC=TCGTTCTTACGTTAGAGAGGG;SOR=0.880;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=31;WE=55108063;WS=55108045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	55733390	rs4955865	C	T	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=0;PP=528;SC=TGGAGGTAAGCAGCGATGAAA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=55733398;WS=55733385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	55989276	rs140781604	TTGTGTGTGTGTG	T	1046.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.01;MQRankSum=2.350;QD=37.38;SOR=3.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr3	56019805	rs6806267	T	C	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=1;PP=360;SC=ACTGACTTATTTCCATCTTTT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=56019813;WS=56019795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	56019905	rs6445762	C	A	1492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=9;PP=1239;SC=TGCAGTGGCCCGAGGAAAACC;SOR=2.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=46;WE=56019913;WS=56019895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	56020159	rs7613818	G	A	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=18;PP=512;SC=ATAACTAAACGAAGCAAACTT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=56020167;WS=56020149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	56037025	rs5849124	C	CAT	4104.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=9;PP=2974;SC=GGAAGAAACTCAAATATTTTC;SOR=4.035;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=86;TCF=76;TCR=10;TR=80;WE=56037033;WS=56037015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr3	56037241	rs35658351	CA	C	2807.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=53;PP=2087;SC=ATTAGCTCAACAAAATCCATG;SOR=6.123;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=0;TCR=57;TR=53;WE=56037257;WS=56037231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	56037249	rs34984094	A	AG	2757.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=52;PP=2401;SC=AACAAAATCCATGCATTCGCA;SOR=6.837;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=54;TCF=1;TCR=53;TR=53;WE=56037257;WS=56037231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	56052839	rs3816575	G	T	1516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.662;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=10;PP=1243;ReadPosRankSum=-0.819;SC=AGAAAAGCAGGCACATTTAAA;SOR=2.649;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=48;WE=56052847;WS=56052829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr3	56330401	rs74804174	G	T	1743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=35;PP=1385;SC=GCTGGAGGAGGTGGTTGAGGT;SOR=1.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=18;TCR=35;TR=53;WE=56330409;WS=56330391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	56591178	rs73079891	A	G	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=3;PP=588;SC=CGGCACCCCTATATCCAATTG;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=56591186;WS=56591168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	56591278	rs150150392	T	TGGGGTAAGCA	2599.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=18;PP=866;SC=GCCATGAACTTGGGGTAAGCA;SOR=1.140;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=31;WE=56591286;WS=56591268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	56593543	rs12486047	C	A	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=350;SC=TCTTGCATTACCACCTTAGTA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=56593551;WS=56593533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	56593680	rs11130525	T	C	1161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=26;PP=912;SC=GTTTTATTTATAGTGGTTAGA;SOR=1.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=38;WE=56593688;WS=56593670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	56597688	rs6781293	A	G	915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=6;PP=769;SC=AGTTATAAAGAATAAGCTTCT;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=56597696;WS=56597678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	56597954	rs6769055	C	T	3808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=78;NR=29;PP=2965;SC=CACCTGCAACCCCTAATATGC;SOR=2.012;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=78;TCR=29;TR=107;WE=56597962;WS=56597944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr3	56599159	rs73081810	T	C	1586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=29;PP=1241;SC=TTTGATATTATAGCTGGGCAT;SOR=1.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=47;WE=56599167;WS=56599149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	56599208	rs55831745	G	C	1036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=26;PP=870;SC=TGATTTCACAGCTAAATAAGA;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=32;WE=56599216;WS=56599198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	56599258	rs10687224	G	GTATT	804.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=872;SC=CAAGATATTTGTATTCCCCTT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=15;WE=56599266;WS=56599248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	56601175	rs112310084	T	C	935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=649;SC=ATACCAGCACTTTGGGAAGCC;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=56601183;WS=56601165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	56605404	rs139586078	TA	T	273.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.555;NF=0;NR=13;PP=192;ReadPosRankSum=-0.746;SC=TAAAGCTTATTAAAAAAAAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=13;WE=56605412;WS=56605394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr3	56627048	rs1388256	A	G	271.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=4;PP=245;SC=AAGAACTGCAAAGAAAATGGA;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=9;WE=56627056;WS=56627038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	56627598	rs1491170	A	G	2404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=34;PP=1893;SC=CTGTTCTCTCAGTCAACACAC;SOR=0.995;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=46;TCR=34;TR=79;WE=56627606;WS=56627588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	56628031	rs7637449	G	A	5080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=97;PP=2965;SC=CGAGACAGACGACGACAAAAA;SOR=1.319;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=57;TCR=97;TR=154;WE=56628039;WS=56628021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr3	56674190	rs1489949	A	C	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=3;NR=25;PP=812;SC=GAATAGCTTTATTTCCAATTC;SOR=3.477;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=56674198;WS=56674180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	56787451	rs3821412	C	T	1467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=20;PP=1101;SC=ACAGTTCTCACGAAGCACCAC;SOR=1.067;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=27;TCR=20;TR=47;WE=56787459;WS=56787441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	56835761	rs3732508	G	A	2372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=20;PP=1811;SC=CGCTGGCCGGGGGTAGCTCCA;SOR=1.966;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=53;TCR=20;TR=73;WE=56835769;WS=56835751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr3	56932708	rs7633179	G	A	825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=729;SC=AAGGAGGGAAGCCAATAAAGA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=56932716;WS=56932698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	57011234	rs13080107	T	C	2585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=36;PP=1935;SC=TTTTTCTGGCTGCCTAATCCA;SOR=1.030;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=50;TCR=36;TR=86;WE=57011242;WS=57011224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr3	57131529	rs6764188	A	C	4794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=86;NR=56;PP=2965;SC=ATTGCCCAATAAGTTGGCACC;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=86;TCR=56;TR=142;WE=57131537;WS=57131519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr3	57132200	rs2291462	A	G	4259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=55;PP=2965;SC=CGGGAGTGCAAGTGGGAACAG;SOR=0.908;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=67;TCR=55;TR=121;WE=57132208;WS=57132190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr3	57137090	rs2247656	A	G	2356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=14;PP=1916;SC=AGTAGTCTAGAGCCAAATTTC;SOR=2.802;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=71;TCF=57;TCR=14;TR=70;WE=57137098;WS=57137080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	57138419	rs6780995	G	A	2509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=34;PP=1783;SC=GCAGCTGGTCGTCTCTGTAGT;SOR=0.902;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=40;TCR=34;TR=74;WE=57138427;WS=57138409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr3	57139833	rs1545982	G	A	175.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=122;SC=CCAGTGGCCTGGGGGTCGCTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=57139841;WS=57139823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	57139972	rs1545981	A	G	1462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=9;PP=1219;SC=TGTGCGGTGCATGGTCGAAGG;SOR=2.925;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=40;TCR=9;TR=49;WE=57139980;WS=57139962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	57140108	rs2035654	G	A	3860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=56;PP=2965;SC=GATACTTTGAGACTTGATAGA;SOR=0.812;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=117;TCF=61;TCR=56;TR=117;WE=57140116;WS=57140098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr3	57148968	rs11916303	C	A	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=583;SC=AAAGATGTGTCCCTCAAAAGC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=57148976;WS=57148958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	57199350	rs111756850	C	A	147.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.8127;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=5;PP=145;ReadPosRankSum=0.765;SC=GTTCTCTGCGCCCCGGCCGCC;SOR=0.446;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=9;WE=57199358;WS=57199340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr3	57203398	rs4299455	C	A	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=25;PP=646;SC=GAGACTGTCACCACCTCCCCC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=57203406;WS=57203388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	57335705	.	TAC	T	218.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.02;QD=21.87;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	57414097	rs17793014	T	A	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=5;PP=865;ReadPosRankSum=-0.917;SC=GAGGCACATATTTAAAATAAT;SOR=2.038;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=33;WE=57414105;WS=57414087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr3	57414263	rs17793086	T	G	1664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.099;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=36;PP=1301;ReadPosRankSum=0.527;SC=GACAAACTGGTTTTAGTTATT;SOR=1.707;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=52;WE=57414271;WS=57414253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr3	57414330	rs11915740	C	A	1190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=893;ReadPosRankSum=0.780;SC=AACAAAGAAACTTGAATAGGT;SOR=0.293;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=34;TCF=18;TCR=16;TR=33;WE=57414338;WS=57414320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr3	57422876	rs78888096	TA	T	259.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=186;SC=ATTTACTAGTTAAAAAAAAAC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=57422884;WS=57422866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	57431721	rs372891308	AAAATAAAT	A	2191.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=1;PP=2703;SC=TCAAAAACATAAAATAAATAA;SOR=6.518;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=44;TCF=40;TCR=4;TR=26;WE=57431736;WS=57431711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	57443817	rs6768661	T	C	2382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=37;PP=1918;SC=AATTGATTATTTATCATACCG;SOR=0.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=38;TCR=37;TR=75;WE=57443825;WS=57443807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	57456371	rs9871422	T	C	925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=23;PP=707;SC=ATACTGAAAGTAAATAAGTTT;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=57456379;WS=57456361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	57457123	rs6445886	C	T	2048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=4;PP=1627;SC=TTTTTCTATACTTTTAAATTT;SOR=4.977;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=56;TCR=4;TR=60;WE=57457131;WS=57457113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	57469053	rs9826084	A	C	1159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=3;PP=931;SC=CCATGAAAATAATATTTCACA;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=34;WE=57469061;WS=57469043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	57469097	rs9863860	C	T	1848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=15;PP=1495;SC=AATTAAAATTCCTTACCTGGA;SOR=2.381;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=44;TCR=15;TR=59;WE=57469105;WS=57469087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	57469272	rs9864150	C	T	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=521;SC=AGACTTATGGCAATTAATGTT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=57469280;WS=57469262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	57475351	rs6806444	T	G	2107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=27;PP=1589;SC=CGCACCATAGTGTAATGAATC;SOR=1.131;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=39;TCR=27;TR=66;WE=57475359;WS=57475341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	57484373	rs73078594	A	T	2441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=72;PP=2094;SC=AATATCCATCAAAACGTGAAT;SOR=7.223;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=74;TCF=1;TCR=73;TR=73;WE=57484381;WS=57484363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr3	57488279	rs10662782	T	TTTC	1481.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.522;NF=2;NR=29;PP=958;ReadPosRankSum=1.734;SC=ATGTAGATCTTTTTTTTTTTC;SOR=3.500;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=31;WE=57488287;WS=57488269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr3	57494138	rs6445902	A	C	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=14;PP=1026;SC=ACAAAACTGTATCAGCAAATG;SOR=1.347;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=38;WE=57494146;WS=57494128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	57494724	rs727978	A	G	79.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=89;SC=AATACCTCTGAGGTAAAAACA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=57494732;WS=57494719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	57509103	rs6768974	T	C	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=55;SC=GAGCAAGACCTTGTTTAAAAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=57509111;WS=57509093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	57545154	rs3732546	T	C	1945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=22;PP=1407;SC=TTAAACACGCTTAAAGTTGTT;SOR=1.034;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=29;TCR=22;TR=51;WE=57545162;WS=57545144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	57545169	.	G	GC	2403.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=24;PP=2279;SC=GTTGTTTAAAGTGTTTTACAC;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=24;TCR=25;TR=47;WE=57545177;WS=57545159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	57627500	rs9873675	T	C	931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=768;SC=CAAAACAAAATAAAAAAGGTG;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=57627508;WS=57627490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	57627580	rs9816093	A	C	152.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=4;PP=122;SC=ACACAGATTGATTTTTCCTTT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=57627588;WS=57627570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	57647371	rs11709815	G	A	779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=15;PP=516;SC=AGCAAAAAGTGTGGATTTTAA;SOR=2.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=21;WE=57647379;WS=57647361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	57649224	.	T	C	68	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5180;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=28;MQ=57.57;NF=4;NR=0;PP=68;QD=25.6928031368;SC=AATATATATATACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=4;WE=57649232;WS=57649214;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,4:0.67:6
chr3	57649224	.	T	TATATATAC	115.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.30;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=2.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr3	57994719	rs1658338	T	A	1034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=34;PP=934;SC=CAGGGGTGGGTTATAGGGGGC;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=57994727;WS=57994709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	58089516	rs6445945	A	G	117.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=91;SC=TAGCTTTGAAATAATCTCCCA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=58089524;WS=58089507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	58089594	rs3215311	GT	G	372.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.6;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=203;SC=TTTATGTTTTGTTCAGTGTGG;SOR=2.494;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=58089602;WS=58089584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	58089851	rs1522385	G	A	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=12;PP=310;SC=TCTGGAGGGTGCTCGGCCCAG;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=17;WE=58089859;WS=58089841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	58089877	rs1522386	A	G	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=313;SC=ACTCATGGGTAGTTGCTTCCC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=58089885;WS=58089867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	58090803	rs73074072	G	A	5792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=0.472;SC=TCCTTTCCCTGTAGCCCCTTT;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=92;TCR=98;TR=188;WE=58090811;WS=58090793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,192:0.99:194
chr3	58092346	rs2177153	A	G	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=5;PP=953;ReadPosRankSum=-0.866;SC=GAGCTGTCGTAACATAGAATA;SOR=2.078;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=38;WE=58092354;WS=58092336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr3	58109430	rs11313721	TA	T	33	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.59;QD=8.25;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	58112440	rs2362903	A	G	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=24;PP=949;SC=TTCCTTTCGCACCGGGGGATT;SOR=1.038;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=41;WE=58112448;WS=58112430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	58121626	rs6445948	T	A	1904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=0;PP=1449;SC=AGGCACTAATTGGAAAATATG;SOR=8.155;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=53;WE=58121634;WS=58121616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	58127827	rs34336464	C	T	1373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=42;PP=1111;SC=GTAATAAGATCACCTTTGCGT;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=42;WE=58127835;WS=58127817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	58129020	rs35408341	GA	G	35.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=0;PP=43;SC=AATGGAACTGGAAAAAAAAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=58129028;WS=58129010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	58131515	rs7355798	C	T	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=586;SC=TGTGCATCTCCTTCTGTCTCT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=58131523;WS=58131505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	58133803	rs66977380	AT	A	336.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=266;SC=TTCAAGGCTCATTTTTTTTTC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=58133811;WS=58133793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	58138528	rs9884098	G	A	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=41;PP=1265;SC=TCCGTGCCCCGCATGCGGCCG;SOR=3.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=8;TCR=41;TR=49;WE=58138536;WS=58138518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	58145263	rs12634123	G	A	1470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=17;PP=1066;SC=TAACCTGTCTGATGTATTAAA;SOR=1.519;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=47;WE=58145271;WS=58145253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	58155230	rs9870243	C	G	1257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=2;PP=1033;SC=CCTGGGGTTACTGTGTAGGGT;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=37;WE=58155238;WS=58155220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	58156176	rs4681660	G	A	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=374;SC=TAATTGCCACGCTCTCCCACC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=58156184;WS=58156166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	58179318	rs9812109	C	T	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=572;SC=CCTGTGACCCCAAAGGACAGT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=58179326;WS=58179308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	58183636	rs35677470	G	A	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=16;PP=868;SC=GTCCTCAAGCGGATGTTCTTC;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=37;WE=58183644;WS=58183626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	58186911	rs4234389	A	G	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=35;PP=1078;SC=GAGGGAAACCAGCTGTCCCCT;SOR=3.417;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=40;WE=58186919;WS=58186901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	58194051	rs3732631	C	A	2323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.771;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=51;PP=1713;ReadPosRankSum=-0.805;SC=AAAGAGAATTCCCAGGGGTTT;SOR=1.481;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=76;TCF=25;TCR=51;TR=75;WE=58194059;WS=58194041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,80:0.99:81
chr3	58196639	rs2292677	C	T	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=490;SC=GACATCCTGGCGCTGCTCTGG;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=58196647;WS=58196629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	58270963	rs6774235	T	C	1227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=13;PP=899;SC=TGAATGTCTCTTTGGGCCCCT;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=32;WE=58270971;WS=58270953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	58296209	rs59232688	CT	C	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=2.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.69;ReadPosRankSum=0.868;SOR=1.113;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,12:0.17:71
chr3	58395891	rs4681851	C	G	2801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.969;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=66;PP=2221;ReadPosRankSum=-0.420;SC=ATTCAGGTAACTGGTTATAGA;SOR=1.999;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=19;TCR=68;TR=84;WE=58395899;WS=58395881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,89:0.97:92
chr3	58409173	rs4681852	A	T	1607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=5;PP=1243;SC=TATTTGTGTGATTCTTTAATT;SOR=4.091;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=41;TCR=5;TR=46;WE=58409181;WS=58409163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	58416538	rs4264746	T	C	2103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=16;PP=1788;SC=CATTGGGCCCTCTGAAGACTA;SOR=2.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=47;TCR=16;TR=62;WE=58416546;WS=58416528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	58516383	rs4387990	G	A	3571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=78;PP=2735;SC=GAACAAGGACGGGCACAAGTT;SOR=2.100;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=30;TCR=78;TR=108;WE=58516391;WS=58516373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr3	58520306	rs7611026	G	C	3041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=49;PP=2540;SC=CTGGCACCTTGAAATCTTCTC;SOR=0.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=38;TCR=49;TR=87;WE=58520314;WS=58520296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr3	58520859	rs4681862	A	G	1173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=34;PP=967;SC=TCTGGTGACTATGGAGAGACA;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=58520867;WS=58520849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	58553160	rs7637862	T	G	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=184;SC=CAGGGCTGCTTCCTGCGGTGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=58553168;WS=58553150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	58555343	rs7632668	C	T	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=10;NR=0;PP=293;SC=GCTCTGCTTTCCTCCAGGGTC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=58555351;WS=58555333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	58555386	rs7609991	G	T	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=7;PP=812;SC=CCAGGTGCTTGCGGGGCCCAG;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=58555394;WS=58555376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	58572577	rs17059434	C	G	2539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=63;PP=2109;SC=GGCGTTGCTCCCACTTACCCG;SOR=2.642;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=16;TCR=63;TR=79;WE=58572585;WS=58572567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	58572625	rs80312641	G	A	2192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=50;PP=1757;SC=CGGTGGCATCGGAGGGCCCCC;SOR=2.483;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=14;TCR=50;TR=64;WE=58572633;WS=58572615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr3	58575110	rs6445991	A	G	1600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=41;PP=1271;ReadPosRankSum=-0.863;SC=GACTGGTCAGAGTCAAAGTCC;SOR=2.187;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=48;WE=58575118;WS=58575100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr3	58612485	rs11708352	G	A	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=635;SC=GGCTGCCCCCGAGTCTGTCCT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=58612493;WS=58612482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	58612598	rs11708342	C	T	2080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=23;PP=1735;SC=TGGGCACTGCCGGCTGAAGCT;SOR=1.539;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=43;TCR=23;TR=66;WE=58612606;WS=58612588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	58621935	rs6791782	C	T	252.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=1;PP=211;SC=TTTAAGGCCCCTGGGAGGTGA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=58621943;WS=58621932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	58625975	rs3749287	C	G	1326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=30;PP=1041;SC=GCTGAAAATGCCTAATCTGTA;SOR=1.954;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=42;WE=58625983;WS=58625965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	58631184	rs111621495	G	GAAATA	1932.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=6;PP=1591;SC=ATGAATGAATGAAATAAAATA;SOR=2.948;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=30;WE=58631192;WS=58631174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	58635197	rs9811989	G	A	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=27;PP=874;SC=AACTAAAAATGCCTTGCCACT;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=38;WE=58635205;WS=58635187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	58641352	rs57504511	C	T	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=10;PP=706;SC=AAAATCCAGTCGGAAACTGGC;SOR=1.051;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=25;WE=58641360;WS=58641342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	59025434	rs6446005	G	C	1239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=35;PP=1018;ReadPosRankSum=-0.698;SC=CACAAACCACGAACAAGCTGA;SOR=2.636;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=39;WE=59025442;WS=59025424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,39:0.98:40
chr3	59996927	rs4679626	T	C	891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=730;ReadPosRankSum=-0.597;SC=GGAAACATATTGTTTGGCAGA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=26;WE=59996935;WS=59996917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr3	59996969	rs4679627	C	T	1762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=2;PP=1414;SC=GGCTCTAACACTGAGGGTCTC;SOR=5.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=52;TCF=50;TCR=2;TR=52;WE=59996977;WS=59996959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	59999690	rs13067835	T	C	1695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=26;PP=1265;ReadPosRankSum=0.981;SC=TGCCGGGATATGAAAGGGAAG;SOR=0.298;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=32;TCR=26;TR=57;WE=59999698;WS=59999680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,59:0.98:60
chr3	60898271	rs6793737	G	A	1271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=0;PP=1058;SC=ACAGGATATAGATTTATAAAG;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=60898279;WS=60898261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	61739275	.	T	TTTTTG,TTTG	519.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.15;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=506;SC=TTTTTTTTTTTGGAGATTGGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=13;WE=61739283;WS=61739265;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:14
chr3	62229553	rs1352882	C	T	3320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=58;PP=2620;SC=ATGAAAGTATCCCTATTATTC;SOR=0.967;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=41;TCR=58;TR=99;WE=62229561;WS=62229543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr3	62355666	rs3215030	G	GT	328.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=272;SC=CTCTGCTATAGTTTTTTTTTC;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=13;WE=62355674;WS=62355656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	62431415	rs6791296	T	C	1318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=4;PP=1219;SC=AAAAACCCCATGAGAAACAAT;SOR=4.317;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=47;WE=62431423;WS=62431405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	62477233	.	A	AAC	142.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.14;QD=23.80;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	62498378	rs1376917	G	A	1398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=7;PP=1124;SC=AAAACTGAATGTAACTCAACA;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=43;WE=62498386;WS=62498368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	62556622	rs833663	A	G	5121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=86;NR=71;PP=2965;SC=ACCTAAGGGAAAGGAGAAAGA;SOR=0.927;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=86;TCR=71;TR=157;WE=62556630;WS=62556612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr3	62631553	rs4588354	G	T	1267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=35;PP=1094;SC=GAGGTTATTGGCAAGGCCCCT;SOR=3.202;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=39;WE=62631561;WS=62631543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	62636826	rs4688302	C	T	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=27;PP=818;SC=GGTCTTTGTCCCATGGCCCAG;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=62636834;WS=62636816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	62739092	rs478123	A	G	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=12;PP=664;SC=CCACAGCTCTAGGCCCAGGCG;SOR=0.922;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=14;TCR=12;TR=26;WE=62739100;WS=62739082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	63437977	rs6793874	C	G	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=20;PP=558;SC=TTTAAAAATCCCTCAAAAGTG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=63437985;WS=63437967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	63466382	rs6772726	G	T	266.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=271;SC=CTGAACCAAGGGCAATGCTCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=63466390;WS=63466372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	63821914	rs2637982	C	G	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=7;PP=860;SC=GAAATGCCTACGGTAGTTTTC;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=63821922;WS=63821904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	64133350	rs27673	A	G	2519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=54;PP=1963;SC=AGTGTTGGCCATCATAGGTCA;SOR=1.754;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=26;TCR=54;TR=80;WE=64133358;WS=64133340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr3	64145913	rs26942	T	A	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=311;SC=TTAAGGTGAGTCTCTACTAAG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=64145921;WS=64145903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	64184397	rs696017	G	T	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=265;SC=CTGGAATGAGGAAGGACCAGT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=64184405;WS=64184391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	64184676	rs695937	G	A	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=22;PP=623;SC=GTGAGAAAGAGGAAAAAACCT;SOR=4.332;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=64184684;WS=64184666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	64518994	rs1017537	T	C	3503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=80;PP=2849;SC=TGTGATGTCCTCAAAAAAGCA;SOR=2.237;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=27;TCR=80;TR=106;WE=64519002;WS=64518984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr3	64525171	rs11130968	G	A	259.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=126;SC=GTGGTTCTGCGAGCTTCATTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=64525179;WS=64525161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	64525177	rs11130969	C	T	192.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.58;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	64526610	rs11130970	G	A	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=0;PP=548;SC=GACTATCCTCGCTGCACTGTA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=64526618;WS=64526603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	64526651	rs3841969	CCAATGTG	C	1088.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=0;PP=1247;SC=TCCATACTAGCCAATGTGCAA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=21;WE=64526665;WS=64526641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	64526717	rs3796384	G	C	2401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=17;PP=1970;SC=CATGCTTGCTGTCTGAATGGA;SOR=2.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=55;TCR=17;TR=72;WE=64526725;WS=64526707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	64526942	rs3796383	A	C	1617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=25;PP=1165;SC=AGGATGGGAAAGCATTTCCAG;SOR=0.970;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=27;TCR=25;TR=52;WE=64526950;WS=64526932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	64527321	rs1373163	T	C	1170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=26;PP=879;SC=TCACAAAAAATAGGGTGTGAT;SOR=3.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=64527329;WS=64527311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	64527336	rs1036919	C	T	951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=19;PP=721;SC=TGTGATGATCCGAGATGTGAA;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=64527344;WS=64527326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	64527378	rs1036918	G	A	913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=8;PP=743;SC=GACATTGTTCGCACTAAAACT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=27;WE=64527386;WS=64527368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	64527465	rs1036917	C	T	1824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=11;PP=1514;SC=TGAACAAAGACATCCTGTTCT;SOR=2.644;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=46;TCR=11;TR=57;WE=64527473;WS=64527455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	64554254	rs7635677	T	C	3159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.619;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=72;PP=2389;ReadPosRankSum=0.894;SC=GTTTTTTAATTACACGGAGTT;SOR=2.601;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=93;TCF=21;TCR=72;TR=92;WE=64554262;WS=64554244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr3	64589851	rs9985304	A	G	3435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=58;ReadPosRankSum=-0.977;SC=GCCATGTCTGAGAATGTTAGC;SOR=0.806;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=50;TCR=59;TR=107;WE=64589859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,110:0.98:112
chr3	64599279	rs6806842	T	C	320.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=266;ReadPosRankSum=2.018;SC=AGGTGTGTCCTTTTCCCACAG;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=9;WE=64599287;WS=64599269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr3	64617042	rs6768487	G	C	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=17;NR=1;PP=523;SC=TGAAAGCTCTGCCTCTGCATG;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=64617050;WS=64617032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	64617070	rs6445420	C	T	1307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=4;PP=1014;SC=AGGAAGGAAGCAGTATCTGGC;SOR=3.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=39;WE=64617078;WS=64617060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	64617371	rs13079218	T	C	2075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=15;PP=1803;SC=TAATCCACCATAACGAGACTG;SOR=2.157;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=45;TCR=15;TR=60;WE=64617379;WS=64617361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	64617423	rs9882622	G	C	2990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=18;PP=2438;SC=ATTACATGTGGTTAACAATTT;SOR=2.858;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=74;TCR=18;TR=92;WE=64617431;WS=64617413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr3	64617690	rs35122501	A	G	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.40;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	64617699	rs7640062	A	G	975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.42;SOR=6.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	64619048	rs11717158	C	T	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=288;SC=GCCCTGGCAACAGTGCACAGA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=64619056;WS=64619038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	64633504	rs12715589	A	T	309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=2;PP=282;SC=ATATTATGCAAGCTAAAACAG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=64633512;WS=64633494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	64640206	rs11326156	TA	T	4436.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=38;PP=2967;SC=AAACATGTAGTAAAACGGTTT;SOR=0.936;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=85;TCF=47;TCR=38;TR=82;WE=64640220;WS=64640196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr3	64640212	rs59517147	G	T	4495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=39;PP=2439;SC=GTAGTAAAACGGTTTTAGCCA;SOR=0.930;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=95;TCF=56;TCR=39;TR=92;WE=64640220;WS=64640196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr3	65353448	rs7634490	G	A	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=29;PP=1071;SC=TTTGGTTTACGTAGGAATCAT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=43;WE=65353456;WS=65353438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	65416648	rs4688566	C	A	973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=28;PP=912;SC=TAATTCTTCACGCTTATGCCC;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=65416656;WS=65416638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	65425560	rs142043619	T	TCTG	1125.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.630;NF=13;NR=11;PP=1260;ReadPosRankSum=1.503;SC=CAACCTTCTGTCTGCTGCTGC;SOR=0.487;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=31;TCF=17;TCR=14;TR=24;WE=65425568;WS=65425550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr3	65456198	rs57455654	G	GA	612.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.64;ReadPosRankSum=1.651;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr3	65464625	rs7636096	G	A	43.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr3	65479068	rs7641222	A	C	182.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=147;SC=AGGTGAACTGAAATCTCCTGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=65479076;WS=65479058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	65583600	.	TGG	T	938.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=25;PP=560;SC=GAGGCGGGGGTGGGGGGGGGG;SOR=5.058;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=26;WE=65583609;WS=65583590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	65607592	rs112243102	T	TCACACACACA	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=0;PP=551;SC=CCTGGACTTTTCACACACACA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=2;WE=65607600;WS=65607582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	65607637	rs3749455	A	G	264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=156;SC=GCCAAAGTCCAACTACTTACA;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=65607645;WS=65607627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	66023592	rs28696109	A	G	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=0;PP=569;SC=GGAGGGAAGCAGGAAATCGAG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=66023600;WS=66023582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	66293766	rs66918103	T	C	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=19;PP=656;SC=TATAAAATACTTCAGAAATGC;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=66293774;WS=66293756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	66293851	rs1678092	T	C	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=4;PP=51;SC=AAGTCATAAATGGCAATAAAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=66293859;WS=66293841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	66354911	rs813636	G	C	4597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=52;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.309;SC=GGGGAGGCTTGTGAGCTTCTG;SOR=0.455;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=130;TCF=78;TCR=52;TR=129;WE=66354919;WS=66354901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,139:0.99:140
chr3	66419793	rs11277069	CCAGGTGTA	C	1167.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=1;PP=2942;SC=CTTCAATCAGCCAGGTGTACA;SOR=3.690;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=22;WE=66419808;WS=66419783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	66419942	rs1129179	A	G	2670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=45;PP=2062;SC=TAGACGTGGCAAAGACAAGAA;SOR=0.836;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=39;TCR=45;TR=84;WE=66419964;WS=66419932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr3	66419956	rs13874	C	T	2611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=44;PP=2043;SC=ACAAGAATTACGCTGGCAAAG;SOR=0.995;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=77;WE=66419964;WS=66419932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	66421147	rs332378	T	C	2744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=69;PP=2205;ReadPosRankSum=-1.204;SC=TTTCTATTTATTGTGCAAAAT;SOR=1.609;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=82;TCF=10;TCR=72;TR=79;WE=66421155;WS=66421137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,82:0.98:84
chr3	66428282	rs1046844	C	T	1339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=36;PP=1026;SC=GCCTGCAGTGCAAACCCTCTT;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=43;WE=66428290;WS=66428272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	66430811	rs2279290	T	G	2887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=31;PP=2301;SC=AAGCAAGTACTGGGCTTCCGC;SOR=1.657;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=65;TCR=31;TR=95;WE=66430819;WS=66430801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr3	66432680	rs332371	A	G	1246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=9;PP=875;SC=TCTGCTTCACAGTTACTGAGG;SOR=2.461;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=40;WE=66432688;WS=66432670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	66433312	rs900172	A	G	121.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=0;PP=84;SC=AACACAGTGCAATTCTTTCAA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=66433320;WS=66433302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	66433676	rs900171	A	G	3831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=66;PP=2965;SC=TCAGGGGTCAAGTGGTGCCGC;SOR=1.074;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=48;TCR=66;TR=114;WE=66433684;WS=66433666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr3	66433937	rs9872772	T	G	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=9;PP=224;SC=GCATCTGAGATTCTGTCTCAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=66433945;WS=66433927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	66444330	rs67550176	T	C	1312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=1;PP=1027;SC=AAGAAATAAATTGCATCCAGC;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=38;WE=66444338;WS=66444320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	66444615	rs6793110	G	A	768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=675;SC=GGAAGCTGTCGCTGCTGATAT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=66444623;WS=66444605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	66451907	rs12494912	T	C	1255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=1;PP=1088;SC=ATTAGTCACATTGACCTGTTT;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=38;WE=66451915;WS=66451897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	66455797	rs3796148	T	C	918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=32;PP=734;SC=TGAAGTCCCCTGGGTGCATGC;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=34;WE=66455805;WS=66455787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	66463251	rs4856924	G	A	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.21;SOR=6.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	66463254	rs12493943	C	G	1255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.30;SOR=6.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	66550756	rs1403625	G	C	2126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.54;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	66550762	rs1403626	G	C	2047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.52;SOR=0.780;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	67048762	rs4856833	T	C	1065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=20;PP=796;SC=ATAGCTGGAGTCGGGGCCCCA;SOR=1.418;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=32;WE=67048770;WS=67048752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	67276059	rs9868022	G	T	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=312;SC=GGGAAATGGAGAGTAACCACT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=67276067;WS=67276049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	67426125	rs1065399	C	T	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=138;SC=TCCCTTTTTACGGAAAAATGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=67426133;WS=67426122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	68587884	rs3828366	A	C	2175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=12;PP=1697;SC=TTGCAAACACAGTTGTTTCCT;SOR=2.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=54;TCR=12;TR=66;WE=68587892;WS=68587874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	68606548	rs7616164	G	T	3392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=75;PP=2744;SC=TATTGTGCCTGTTGAGAACCA;SOR=2.193;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=25;TCR=75;TR=100;WE=68606556;WS=68606538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr3	68782213	rs6549143	A	G	3026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=39;PP=2383;SC=ATTTTCTGCAAAGGGGCCATG;SOR=0.953;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=50;TCR=39;TR=89;WE=68782221;WS=68782203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr3	68788363	rs1504301	G	T	3717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=84;PP=2883;SC=GGAAAACAAAGGCCAAATAAT;SOR=2.224;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=30;TCR=85;TR=114;WE=68788371;WS=68788353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr3	68788465	rs1504300	G	T	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=785;SC=TTAAATTTACGGTTGGTAAAT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=68788473;WS=68788455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	68801921	rs9835691	T	C	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=473;SC=CAACCCTAGGTTTCTTTGGGT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=68801929;WS=68801911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	69036707	rs4855542	G	A	2482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=51;PP=1989;SC=GCATATGCCTGGGTAGATGAA;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=21;TCR=51;TR=72;WE=69036715;WS=69036697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr3	69037633	rs9310136	G	C	298.31	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.9970;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=214;ReadPosRankSum=0.000;SC=AAATATGAATGCTAATGGTAG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=8;WE=69037641;WS=69037623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr3	69038217	rs4855543	A	G	1275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=32;PP=1008;SC=AGGATATAACATGACTTTTCA;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=39;WE=69038225;WS=69038207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	69053444	rs35171227	T	C	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.23;SOR=5.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	69053447	rs9860095	A	T	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.49;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	69054212	rs375408376	CAA	C,CA	410.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=54.99;MQRankSum=1.688;QD=16.43;ReadPosRankSum=0.252;SOR=3.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:3,10,12:0.40,0.48:25
chr3	69059023	rs9812253	A	C	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=430;SC=TAGAGATCAAAATGAAGACAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=69059031;WS=69059013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	69077197	rs9855731	A	G	2491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=15;PP=2152;SC=TCATGCCATGATAAGTCAATC;SOR=2.681;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=57;TCR=15;TR=72;WE=69077205;WS=69077187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	69091640	rs9985501	C	T	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=8;PP=596;SC=CCCAGAGTTACACACTTTGAA;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=26;WE=69091648;WS=69091630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	69093598	rs2271118	T	C	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=412;SC=AGTATACAGGTTTCCAGAAAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=69093606;WS=69093588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	69096614	rs2292199	G	A	4206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=69;NR=57;PP=2965;SC=TTATTGGTGTGGAAGAAACCA;SOR=0.945;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=69;TCR=57;TR=126;WE=69096622;WS=69096604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr3	69104695	rs6549179	T	A	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=17;PP=630;SC=GAAAAAATATTATTAATACAA;SOR=1.893;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=24;WE=69104703;WS=69104685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	69104752	rs6549180	C	T	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=422;SC=AAACAAACTACAGAGTATTAC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=69104760;WS=69104742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	69225588	rs11128118	T	G	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=4;PP=899;SC=ACCCCTGAACTAGATTATCTG;SOR=4.021;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=39;WE=69225596;WS=69225578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	69225875	rs9872199	T	A	264.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=187;SC=TTAAGGTCATTCAGAGGTACA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=69225883;WS=69225865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	69225911	rs9868107	A	G	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=82;SC=TCAGAGGAGAAATTTAAGAGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=69225919;WS=69225901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	69229976	rs12054011	G	C	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=302;SC=CATGATCCGTGAGGCGGTTTT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=69229984;WS=69229966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	69230026	rs9818314	T	C	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=7;PP=708;SC=ATCCAGGTGTTGCGTGTTTTT;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=69230034;WS=69230016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	69230061	rs9831516	G	A	1756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=13;PP=1450;SC=TGAAGAGTACGAGGATGCACG;SOR=2.345;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=54;WE=69230069;WS=69230051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	69230801	rs9836305	G	A	1585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=36;PP=1086;SC=CGGAGAGCAGGTGGGACTGGG;SOR=3.171;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=43;WE=69230809;WS=69230791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	69242770	rs11310698	CA	C	1506.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=7;PP=910;SC=GTAGGGGACTCAAAAAAAAAA;SOR=3.407;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=59;TCR=9;TR=53;WE=69242778;WS=69242760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	69244162	rs9853587	G	A	1368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=8;PP=985;SC=GCTCAGAGGCGTTGTTCATAC;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=40;WE=69244170;WS=69244152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	69245454	rs9310141	T	C	3100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=51;PP=2502;SC=TGACTTTTCGTCTCCAGTGTC;SOR=0.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=44;TCR=51;TR=95;WE=69245462;WS=69245444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr3	69245949	rs9860235	G	C	1342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=0;PP=1083;SC=AAATCTCAGAGAGCAAAAATA;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=37;WE=69245957;WS=69245946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	69246152	rs13059488	A	G	3935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=61;PP=2965;SC=TGCACAAACAAGCCACTTTGC;SOR=0.761;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=121;TCF=59;TCR=62;TR=120;WE=69246160;WS=69246142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr3	69246274	rs13059687	A	G	2578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=57;PP=2093;SC=ATTGTAACAAAGCATGTTCCT;SOR=2.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=18;TCR=57;TR=75;WE=69246282;WS=69246264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr3	69265291	rs7643175	T	C	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=1;PP=1018;SC=GGCGACAAAGTGAGACTCCAT;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=37;WE=69265312;WS=69265281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	69265304	rs77475566	C	CA	1182.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=0;PP=1033;SC=GACTCCATCTCAAAAAAAACC;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=50;TCR=1;TR=41;WE=69265312;WS=69265281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	69265371	rs62254460	G	C	4404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=104;NR=22;PP=2965;SC=TGATTAACATGTTTTGAACAG;SOR=2.922;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=104;TCR=22;TR=126;WE=69265379;WS=69265361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr3	69267578	rs4855301	A	T	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=9;PP=323;SC=TAGTTAGAGGACCCTTTTGGG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=69267586;WS=69267568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	69271206	rs6549189	T	C	1664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=46;PP=1448;SC=GTAGATAGAGTTTGGCTTTTG;SOR=3.486;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=53;WE=69271214;WS=69271196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	69273656	rs9848940	G	T	3566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=95;NR=8;PP=2965;SC=GATTGGCAATGTGATATTTTT;SOR=4.366;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=95;TCR=8;TR=103;WE=69273664;WS=69273646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr3	69299185	rs73099842	C	A	4962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=69;PP=2965;SC=GCAGTTTGTCCAATCTTACCT;SOR=0.955;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=84;TCR=69;TR=153;WE=69299193;WS=69299175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr3	69359728	.	CACACAGAGAGAGAGAG	C	30.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.24;MQRankSum=-2.397;QD=0.67;ReadPosRankSum=2.167;SOR=0.980;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,7:0.15:46
chr3	69359730	rs142506790	CACAGAGAGAGAGAG	C	490.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.625;NF=1;NR=49;PP=904;ReadPosRankSum=-1.234;SC=CACACACACACACAGAGAGAG;SOR=1.609;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=51;TCF=2;TCR=49;TR=50;WE=69359753;WS=69359718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr3	69362706	rs1483895	C	T	2078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=42;PP=1585;SC=GTCAGGGCCACGGCTGGCAAG;SOR=1.542;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=24;TCR=42;TR=66;WE=69362714;WS=69362696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr3	71007361	rs1053797	G	T	4365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=6.505;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.90;MQRankSum=0.000;QD=27.12;ReadPosRankSum=0.390;SOR=2.526;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,160:0.99:161
chr3	71015021	rs7638391	G	T	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=379;SC=GCAAAGACCTGTTGGGTGGAC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=71015029;WS=71015011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	71019750	rs9874207	T	C	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=0;PP=520;SC=CCAGGGAGTATGATGCTTTGT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=71019758;WS=71019740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	71247576	rs9855825	A	T	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;QD=23.05;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	71803988	.	C	T	1551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.33;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	72495593	rs11460842	T	TA	97.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.78;MQRankSum=1.426;QD=6.98;ReadPosRankSum=-1.341;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr3	72495777	rs13066407	C	G	2253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=32;PP=1932;SC=TTTGGCCTTCCGAGGAGTGGA;SOR=0.984;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=47;TCR=32;TR=79;WE=72495785;WS=72495767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr3	72495945	rs13088771	A	G	4663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=97;PP=2965;SC=ACTGGAAGAGAGAGCGAGGAA;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=46;TCR=98;TR=143;WE=72495953;WS=72495935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr3	73004157	rs1532190	T	G	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=544;SC=GTAGCATTATTTACCTATCAG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=73004165;WS=73004147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	73016974	rs3821379	A	G	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=23;PP=682;SC=CCCAAAGCATAGAGTTATACC;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=73016982;WS=73016964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	73024350	rs1052278	C	A	2797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=61;PP=2291;SC=TGTCTTGTGACCAAGGAAATA;SOR=1.954;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=25;TCR=62;TR=86;WE=73024358;WS=73024340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr3	73046508	rs9834246	G	C	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=17;PP=719;SC=GGGGACGAGTGGCGGACCCGC;SOR=0.880;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=33;TCF=16;TCR=17;TR=32;WE=73046516;WS=73046498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	73046544	rs9310254	T	C	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=10;PP=657;SC=AGATATCCTCTTTTCTCCACC;SOR=1.302;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=27;WE=73046552;WS=73046534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	73046561	rs9873229	C	T	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=9;PP=486;SC=CACCAGGCTACCCGTACGCTA;SOR=1.085;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=13;TCR=9;TR=22;WE=73046569;WS=73046551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	73096591	rs71277513	A	ATAAT	1009.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=22;PP=1234;SC=TGTCTGGTTGATGATTGATTA;SOR=4.977;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=23;WE=73096599;WS=73096581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	73110076	rs726029	G	A	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=4;PP=416;SC=GAATCAATGGGAATTTAACCC;SOR=1.493;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=73110084;WS=73110066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	73111368	rs2231924	T	C	1498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=7;PP=1244;ReadPosRankSum=-0.796;SC=GAACCAATTTTCCACAATGTC;SOR=1.781;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=45;WE=73111376;WS=73111358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
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chr3	73111973	rs2231928	A	G	4243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.436;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=59;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.196;SC=GCTCAAGACCATGGGTTGGAG;SOR=0.908;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=84;TCR=61;TR=141;WE=73111981;WS=73111963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,146:0.98:149
chr3	73111998	rs1060584	C	T	5201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.211;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=64;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.171;SC=AATGTTCACACTTCTATTTGG;SOR=1.023;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=170;TCF=103;TCR=67;TR=165;WE=73112006;WS=73111988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,169:0.98:173
chr3	73112919	rs3841614	T	TA	1158.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=15;PP=1038;SC=AGATTTTTAATACCTACAGAG;SOR=0.693;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=22;WE=73112927;WS=73112909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	73112974	rs11708712	A	T	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=19;PP=616;SC=TGTACTTTTTAAAAATTGGGC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=28;WE=73112982;WS=73112964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	73434086	rs6787588	A	G	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=28;PP=841;SC=CTTCTTCTGCATAAACACAAG;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=73434094;WS=73434076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	73437112	rs6549532	A	G	1872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=31;PP=1373;SC=GTAGGAAGCCAATTTACCTGG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=31;TCR=31;TR=62;WE=73437120;WS=73437102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	73437225	rs3830251	T	TA	464.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.990;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=61.83;MQRankSum=0.622;NF=1;NR=15;PP=297;ReadPosRankSum=1.043;SC=ATTAATCTTTTAAAAAAAAAG;SOR=2.908;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=16;WE=73437233;WS=73437215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr3	73438828	rs2306507	C	G	192.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=1;PP=133;SC=TTTAACTTGTCTGGCCTCACT;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=73438836;WS=73438818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	73440108	rs35427155	G	GA	653.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=405;SC=TGGTGAACATGAAAAAAAAAA;SOR=5.058;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=19;WE=73440116;WS=73440098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	73450198	rs3816831	G	A	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=10.028;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=37;PP=1213;ReadPosRankSum=0.381;SC=CCCTTCTTCCGTTGTCAGTAT;SOR=1.682;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=52;WE=73450206;WS=73450188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,54:0.96:56
chr3	73453201	rs2291464	C	T	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=2;PP=660;SC=TGGAGGAAAACTATAGGGTGC;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=73453209;WS=73453191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	73453325	rs2291463	C	T	2023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=31;PP=1484;SC=AGGGATCCAGCACGGGTGGGC;SOR=0.910;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=36;TCR=31;TR=67;WE=73453333;WS=73453315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	73457145	.	C	T	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=452;SC=CCCTGTCATCCCACACAAGAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=73457153;WS=73457135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	73523755	.	GT	G	1314.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=28;PP=1334;SC=TCTAAGCTTGGTTTATGTTGA;SOR=2.303;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=34;WE=73523763;WS=73523745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	73651621	rs11343439	TA	T	1307.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=37;PP=836;SC=TCCTTTGGGTTAAAAAAAAAA;SOR=2.049;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=55;TCF=9;TCR=46;TR=45;WE=73651630;WS=73651611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	73673578	rs6763344	G	C	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=2;PP=258;SC=GCGCGTCGCAGGCGTCGCGCA;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=73673586;WS=73673568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	74315580	rs615824	C	G	3253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=17;PP=2441;SC=CTCACTATGGCGGATAGTAAC;SOR=2.880;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=77;TCR=17;TR=93;WE=74315588;WS=74315570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr3	74344134	rs1352475	A	G	981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=0;PP=757;SC=ATGGAACATCAGATGAAACAA;SOR=5.728;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=33;WE=74344142;WS=74344124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	75386297	rs6769147	G	A	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=12;PP=611;SC=GGATACAAAGGCTGTGCTGAG;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=23;WE=75386305;WS=75386287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	75386380	rs4677501	T	G	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=13;PP=576;SC=ATGACTTCAGTGGGTGGATTC;SOR=0.963;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=22;WE=75386388;WS=75386370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	75679893	rs200917196	C	T	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.78;MQRankSum=-1.718;QD=5.68;ReadPosRankSum=0.108;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr3	75679937	rs141031386	G	A	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=2.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.66;MQRankSum=-3.586;QD=4.85;ReadPosRankSum=1.456;SOR=0.182;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,16:0.21:75
chr3	75679944	rs201399352	C	T	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.35;MQRankSum=0.932;QD=4.85;ReadPosRankSum=-0.797;SOR=0.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,21:0.23:90
chr3	75679958	rs200114452	C	T	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=7.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.35;MQRankSum=-3.534;QD=4.00;ReadPosRankSum=-0.228;SOR=0.155;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,22:0.20:110
chr3	75679963	rs201125883	C	T	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=4.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.41;MQRankSum=-1.190;QD=8.60;ReadPosRankSum=0.382;SOR=1.237;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,43:0.37:117
chr3	75679973	rs183720508	A	G	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=10.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.64;MQRankSum=-3.490;QD=5.38;ReadPosRankSum=-2.124;SOR=0.182;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,29:0.23:127
chr3	75679993	rs202177109	C	T	952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=3.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.33;MQRankSum=-0.674;QD=6.81;ReadPosRankSum=0.286;SOR=1.013;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,49:0.35:140
chr3	75680010	rs75174508	T	C	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=10.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.21;MQRankSum=-2.597;QD=3.17;ReadPosRankSum=2.658;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,29:0.21:139
chr3	75680122	.	C	A	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.361;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.12;MQRankSum=-0.767;QD=7.37;ReadPosRankSum=-0.285;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr3	75680133	rs200731407	G	T	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.12;MQRankSum=0.767;QD=21.67;ReadPosRankSum=-1.451;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr3	75680148	rs199578100	A	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.895;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.72;MQRankSum=0.998;QD=13.40;ReadPosRankSum=-1.519;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr3	75786662	rs202184453	A	T	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.06;QD=41.62;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	75786672	rs200017345	C	T	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.15;QD=46.29;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	75786681	rs111677009	G	A	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.79;QD=47.30;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	75786684	rs201345045	G	T	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.56;QD=46.52;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	75786737	rs78297221	A	T	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=13;PP=819;SC=GTTTTTCCACATTCATTACAT;SOR=1.214;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=20;TCR=13;TR=33;WE=75786768;WS=75786727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	75786748	rs112332186	C	T	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=16;PP=885;SC=TTCATTACATCCATACGGTTT;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=36;WE=75786768;WS=75786727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	75786760	rs145576551	TC	T	1618.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=19;PP=944;SC=ATACGGTTTTTCCCCGTGTGA;SOR=0.746;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=25;WE=75786768;WS=75786727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	75786833	rs139448820	G	A	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=14;PP=707;SC=CATTACATACGTAAGGTTTCT;SOR=1.136;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=26;WE=75786853;WS=75786823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	75786845	rs62250105	T	C	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=12;PP=714;SC=AAGGTTTCTCTCCTGTGTGAG;SOR=0.874;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=13;TCR=12;TR=25;WE=75786853;WS=75786823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	75786888	rs1615736	C	T	739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.00;QD=41.10;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	75786894	rs144168413	GT	G	671.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.49;QD=44.78;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	75790797	rs147946451	C	T	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.68;QD=42.18;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	75790810	.	G	GT	502.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.99;QD=45.70;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	75790811	rs199577560	G	T	511.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.99;QD=46.52;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	75790814	rs200578600	C	T	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.17;QD=42.65;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	75790838	rs140982339	C	T	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.77;QD=41.86;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	75790860	rs150203551	C	T	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.45;QD=47.80;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	75790879	rs116016107	CA	TG	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.76;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	75790899	.	C	G	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.00;QD=62.74;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1:1.00:1
chr3	75986663	rs12171318	C	A	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.018;NF=37;NR=0;PP=857;ReadPosRankSum=1.473;SC=AAGACATGAACGTGTCACTAG;SOR=0.997;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=61;TCR=1;TR=37;WE=75986671;WS=75986653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,34:0.57:60
chr3	75986686	rs62269817	A	G	1490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.48;MQRankSum=-8.166;QD=16.56;ReadPosRankSum=-0.799;SOR=0.731;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,51:0.57:90
chr3	75986695	rs79015247	G	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=10.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.18;MQRankSum=-4.546;QD=3.54;ReadPosRankSum=0.994;SOR=0.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,20:0.21:94
chr3	75986717	rs78834776	G	A	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=1.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.66;MQRankSum=-3.170;QD=0.73;ReadPosRankSum=1.597;SOR=0.444;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,17:0.13:132
chr3	75986719	rs62269818	G	C	2403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.881;HP=5;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.795;NF=68;NR=31;PP=2156;ReadPosRankSum=-1.197;SC=TGACTGTGGTGTTTTGGGGTC;SOR=0.125;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=153;TCF=113;TCR=40;TR=99;WE=75986727;WS=75986707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,80:0.61:132
chr3	75986794	rs80235520	G	A	2694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=52.317;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.872;NF=36;NR=99;PP=2783;ReadPosRankSum=1.858;SC=AGTTGGATGCGAATTTCACTT;SOR=3.175;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=213;TCF=71;TCR=142;TR=135;WE=75986802;WS=75986784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,92:0.53:174
chr3	75986813	rs77101234	T	A	1750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=6.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=42.816;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.016;NF=17;NR=75;PP=2012;ReadPosRankSum=-3.208;SC=TTTATGATGATATTATGTGAG;SOR=3.411;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=174;TCF=47;TCR=127;TR=92;WE=75986821;WS=75986803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,67:0.44:152
chr3	75986833	rs73123284	C	T	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=4.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.025;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.258;NF=4;NR=37;PP=804;ReadPosRankSum=-5.551;SC=GTCTTTGGTTCGACGTTTAAG;SOR=2.617;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=109;TCF=20;TCR=89;TR=41;WE=75986841;WS=75986823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,21:0.22:94
chr3	75986874	rs7610755	G	C	1721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=39;PP=1282;SC=CCAGGTTTTTGTTACACGGTA;SOR=3.486;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=45;WE=75986882;WS=75986864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	75986950	.	A	G	401	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=51;MMLQ=29;MQ=45.98;NF=0;NR=10;PP=401;QD=43.5771212547;SC=TCAAAATTGAAGCCATCTTTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=10;WE=75986969;WS=75986940;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr3	75986961	.	T	C	401	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=51;MMLQ=24;MQ=45.71;NF=0;NR=9;PP=401;QD=48.4190236164;SC=GCCATCTTTCTGAAATTGGCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=9;WE=75986969;WS=75986940;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr3	76484183	rs3849491	T	C	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=34;PP=804;SC=TGATTGAGGATGCAGAGCTGA;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=76484191;WS=76484173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	77607070	rs5850333	A	AC	1606.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=11;PP=1071;SC=ATGTTAAAATACCTGAAAAGA;SOR=2.461;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=37;WE=77607078;WS=77607060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	77645946	rs35328861	CT	C	392.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;QD=21.82;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	77646007	rs1523750	C	T	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.67;NF=0;NR=16;PP=452;SC=GTATTTACTCCCATAATTAAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=77646015;WS=77645997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	77651695	rs3732916	A	G	911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=730;SC=TTTGTGCATGAGATAGAAATT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=77651703;WS=77651685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	77651985	rs9852724	C	T	1106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=0;PP=981;SC=TCCACTCTCCCACAACATCTG;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=77651993;WS=77651975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	77681865	rs1451617	T	A	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=301;SC=TTGGACACTGTCCTCTTTTCT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=77681873;WS=77681855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	78666765	rs9839790	T	C	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=7;PP=1089;SC=CCCAGCTTGGTGAAAAGTGTT;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=40;WE=78666773;WS=78666755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	78676405	rs7625555	T	C	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=5;PP=792;SC=GGATAGCATTTGGTAACTTCC;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=78676413;WS=78676395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	78676467	rs7636043	A	G	1675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=12;PP=1319;SC=TAGTGACAACATACCTCCTGT;SOR=2.342;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=57;WE=78676475;WS=78676457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	78683531	rs200487470	T	TA	1485.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=7;PP=1108;SC=TATCTATGATTAAAAAAAACA;SOR=3.528;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=45;WE=78683539;WS=78683521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	78700779	rs3925684	C	A	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=0;PP=819;SC=TATATTAAAACAAGTTTTAGA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=78700787;WS=78700769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	78700901	rs6795556	G	T	3726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.523;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=38;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.892;SC=TACCCGCGTAGGTACTAGTAA;SOR=1.308;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=76;TCR=39;TR=113;WE=78700909;WS=78700891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,118:0.99:119
chr3	78706519	rs9818170	C	T	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=731;SC=GAGTACTAAACTGTCATGCAC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=78706527;WS=78706509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	78706553	rs3832208	AT	A	308.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=295;SC=TTCCAAAGTCATTTTTTCCCT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=10;WE=78706561;WS=78706543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	78708810	rs10662787	A	AATAT	1347.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=3;PP=767;SC=TCAGGACATTAATATATATAT;SOR=2.833;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=14;WE=78708818;WS=78708800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	78709044	rs9829907	G	A	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=21;PP=590;SC=AATAATAGATGTATTAATACT;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=78709052;WS=78709034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	78717343	rs2271151	C	T	4155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=70;PP=2965;SC=TTGGTTGCCACGATAATGTGA;SOR=0.988;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=125;TCF=55;TCR=70;TR=124;WE=78717351;WS=78717333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr3	78719577	rs9309810	C	G	1222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=35;PP=1048;SC=ATTAAAGTAGCAGACATGCAT;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=78719585;WS=78719567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	78844755	rs1487138	T	C	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=10.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.53;MQRankSum=-1.490;QD=21.51;ReadPosRankSum=0.166;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,38:0.72:53
chr3	79557155	rs62257610	C	T	170.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=107;SC=ATCACAAGGACAGGAAACCAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=79557163;WS=79557145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	81548209	rs34988523	T	TAAG	2422.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=4;PP=2129;SC=AACATTACTATAATAAAAGAG;SOR=3.830;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=44;TCF=40;TCR=4;TR=39;WE=81548217;WS=81548199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	81584268	rs60133692	CT	C	384.19	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.23;ReadPosRankSum=1.894;SOR=1.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,24:0.89:27
chr3	81643167	rs2172397	T	C	4225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=96;PP=2965;SC=AATCTTAAAATTTCCCAGCTA;SOR=2.434;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=27;TCR=96;TR=123;WE=81643175;WS=81643157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr3	81691855	rs12054089	A	C	933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=0;PP=706;SC=GTACACACACAATGAATTTAG;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=81691863;WS=81691845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	81792592	rs3772889	T	C	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=2;PP=766;SC=TGAACACACATACACCCCCAC;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=81792600;WS=81792582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	81792730	rs3772888	G	A	3519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=44;PP=2819;SC=AGATTCATGGGACAACGAAGT;SOR=1.138;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=64;TCR=44;TR=108;WE=81792738;WS=81792720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr3	81810702	rs11391701	A	AG	389.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=10;PP=376;SC=GAGGCCCGAGAGGTCGAGTGG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=10;WE=81810710;WS=81810692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	87100309	rs2575753	T	C	3512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=93;NR=55;PP=2965;SC=ACCACCTTTCTATCTTGAAAC;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=93;TCR=55;TR=148;WE=87100317;WS=87100299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr3	87100434	rs7619398	G	A	1488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=53;PP=1768;SC=CCATTTTCTTGGATCATAATA;SOR=3.417;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=6;TCR=53;TR=59;WE=87100442;WS=87100424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	87100893	rs2256481	G	A	1107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=18;PP=962;SC=TTCCCTGCATGAGCAAGAGCA;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=18;TCR=18;TR=36;WE=87100901;WS=87100883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	87275442	rs72591121	G	GA	195.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.47;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	87295049	rs11540913	T	C	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=13;PP=427;SC=CAATGTCTACTACAGCAAAAG;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=87295057;WS=87295039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	88179083	.	TA	T	153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=61.07;NF=0;NR=7;PP=126;SC=AAGCTACTTTTAAAAAAAAAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=88179091;WS=88179073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	88188420	rs9813894	G	A	1552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=0;PP=1271;SC=ACAGCTCTCAGTACTTCCAAA;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=43;WE=88188428;WS=88188410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	88189341	rs7653652	T	C	2912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=48;PP=2239;SC=AGTCACAGGATATTTCAGGCT;SOR=1.095;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=36;TCR=48;TR=84;WE=88189349;WS=88189331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr3	88190768	rs7432826	C	A	2313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=36;PP=1803;SC=ATAAAACTTGCATTAACAGAT;SOR=0.869;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=31;TCR=36;TR=67;WE=88190776;WS=88190758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	88190809	rs7432838	C	T	1845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=38;PP=1366;SC=CTGATGAAAACGGTTCAGAAA;SOR=1.942;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=16;TCR=38;TR=54;WE=88190817;WS=88190799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	88199179	rs6551277	T	C	4185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=109;NR=18;PP=2965;SC=TTGTTGCCGTTGTCTTTCCCC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=129;TCF=109;TCR=20;TR=127;WE=88199193;WS=88199169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr3	88199185	rs11374933	T	TC	3906.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=24;PP=2979;SC=CCGTTGTCTTTCCCCCCCAGT;SOR=2.925;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=125;TCF=92;TCR=33;TR=104;WE=88199193;WS=88199169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr3	88199298	rs6551278	T	C	4210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=103;PP=2965;SC=TATGCGACACTGTCACCAACC;SOR=1.790;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=47;TCR=103;TR=150;WE=88199306;WS=88199288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr3	88205660	rs143863539	C	T	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.021;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=556;ReadPosRankSum=0.155;SC=ATTACCGAAACCATCTGTTAA;SOR=2.330;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=22;WE=88205668;WS=88205650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr3	90251669	rs7426740	C	A	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=28;PP=844;SC=AGACTTTTAGCATCTTGTTTG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=90251677;WS=90251659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	90264768	rs6803112	A	G	1093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=9;PP=770;SC=TTCACTTTCCACTTTCTGAGG;SOR=1.923;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=37;WE=90264776;WS=90264758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	90276511	rs9815264	G	A	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=6;PP=509;SC=AAGTATCTAGGATCTCTCATT;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=20;WE=90276519;WS=90276501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	90276661	rs9815542	G	A	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=22;PP=770;SC=GAGCACACATGTTCTCAGAGC;SOR=1.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=90276669;WS=90276651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	94225786	rs1906643	G	T	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=1;PP=409;SC=TTCTTTATATGCTGAAATAGC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=94225794;WS=94225776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	97194422	rs7624823	T	G	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=13;PP=395;SC=AGGGATCCCATAAGAATCCAC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=97194430;WS=97194412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	97356617	rs62262805	C	T	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=375;ReadPosRankSum=0.048;SC=TGCTTATCTTCATTTGATCCA;SOR=0.906;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=17;WE=97356625;WS=97356607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr3	97541018	rs974572	C	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=130;ReadPosRankSum=-0.866;SC=CCGTTCCCTTCAGACAGCCCC;SOR=0.657;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=9;WE=97541026;WS=97541008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr3	97593380	rs2279898	G	A	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=3.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.94;ReadPosRankSum=-1.198;SOR=0.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:144,50:0.26:194
chr3	97605677	rs831902	A	G	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=148;ReadPosRankSum=0.597;SC=AATAGATGACATACATTTTTC;SOR=0.404;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=9;WE=97605685;WS=97605667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr3	97611916	rs1506441	A	C	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.506;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=150;ReadPosRankSum=-0.130;SC=GCAAAGCAAAAATGATTTGTT;SOR=0.105;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=9;WE=97611924;WS=97611906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr3	97619250	rs5851085	C	CAACTA	312.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.827;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=379;ReadPosRankSum=-0.637;SC=TTCAAAAAGACAGATTATGTG;SOR=1.781;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=8;WE=97619258;WS=97619240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,10:0.21:47
chr3	97651884	rs4857298	A	C	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=467;ReadPosRankSum=0.377;SC=AATTCCCCAGACACAAGGATA;SOR=0.598;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=54;TCR=16;TR=26;WE=97651892;WS=97651874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,24:0.34:70
chr3	97660106	rs4857302	A	C	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.249;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=405;ReadPosRankSum=0.801;SC=TAGTGGAAAGAATACTCAGAT;SOR=1.380;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=79;TCF=41;TCR=38;TR=27;WE=97660114;WS=97660096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,29:0.33:87
chr3	97660198	rs832089	A	G	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=173;ReadPosRankSum=0.093;SC=TCTGTTTTTTATTTTGAAAAC;SOR=0.289;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=10;WE=97660206;WS=97660188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr3	97664725	rs2172257	C	T	1585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.245;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=48;PP=1177;ReadPosRankSum=-0.444;SC=TTTTCTTGAGCTTCATCCTTT;SOR=1.340;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=200;TCF=74;TCR=126;TR=68;WE=97664733;WS=97664715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,70:0.34:205
chr3	97666183	rs2307808	TCTC	T	3599.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=60.08;MQRankSum=0.683;NF=49;NR=18;PP=2870;ReadPosRankSum=1.012;SC=AGACAGGAAATCTCCTCCTCT;SOR=0.826;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=111;TCF=82;TCR=29;TR=67;WE=97666193;WS=97666173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,90:0.69:130
chr3	97673268	rs832079	A	C	1830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=14;PP=1335;SC=TCACGTGAGTAGAGTGGGCCA;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=55;WE=97673276;WS=97673258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	97686575	rs699304	T	C	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=267;ReadPosRankSum=-0.543;SC=CCATTACACCTTCGTGAGAAC;SOR=0.776;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=12;WE=97686583;WS=97686565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr3	97726747	rs832032	T	A	1854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=51;PP=1479;SC=CATTGTAGGCTTCTAAAACAT;SOR=5.283;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=3;TCR=51;TR=54;WE=97726755;WS=97726737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	97727727	rs832030	G	C	2921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=82;NR=1;PP=2530;SC=TTAAGAGCATGCTTATTTACA;SOR=7.476;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=84;TCF=83;TCR=1;TR=83;WE=97727735;WS=97727717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr3	97727753	rs832029	G	A	4103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=7;PP=2965;SC=GTATGTGATGGTGTGTTCAAA;SOR=5.336;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=110;TCR=7;TR=117;WE=97727761;WS=97727743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
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chr3	97744611	rs832041	A	G	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=484;ReadPosRankSum=-1.438;SC=GCTCAACATAACATGTTCTGA;SOR=0.387;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=20;WE=97744619;WS=97744601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
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chr3	97852083	rs9826076	C	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=5.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.05;MQRankSum=1.164;QD=10.76;ReadPosRankSum=-0.989;SOR=0.120;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
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chr3	97868970	rs12639519	T	A	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=384;ReadPosRankSum=1.598;SC=ATCTCTTATCTGTATCTTTAT;SOR=0.741;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=16;WE=97868978;WS=97868960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
chr3	97887865	rs4133320	G	A	4323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.865;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.997;NF=77;NR=88;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.261;SC=TGCAATTGGCGTAACCACAGA;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=301;TCF=142;TCR=159;TR=165;WE=97887873;WS=97887855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,170:0.55:308
chr3	97887957	rs143003334	T	C	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-8.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.948;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.144;NF=1;NR=39;PP=587;ReadPosRankSum=0.854;SC=TTATGACCAATGGACTGTGCA;SOR=1.795;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=109;TCF=10;TCR=99;TR=40;WE=97887965;WS=97887947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,42:0.38:111
chr3	97887985	rs4133321	T	A	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.799;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.502;NF=10;NR=39;PP=1137;ReadPosRankSum=0.175;SC=ATTAATCTTGTCATATATAGC;SOR=0.092;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=81;TCF=12;TCR=69;TR=49;WE=97887993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,51:0.60:85
chr3	97888042	rs4133322	A	T	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.651;NF=9;NR=19;PP=638;ReadPosRankSum=0.227;SC=ATTCAGACTAACCTTCTGTAA;SOR=0.619;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=28;WE=97888050;WS=97888032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,27:0.64:42
chr3	97888197	rs7623031	C	T	1725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.963;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.712;NF=28;NR=35;PP=1128;ReadPosRankSum=0.389;SC=TTATATCTTACACATTTGTTC;SOR=0.907;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=84;TCF=41;TCR=43;TR=63;WE=97888205;WS=97888187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,68:0.77:88
chr3	97888337	rs13082608	C	T	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=957;ReadPosRankSum=0.603;SC=CCTGCATCTCCGCAAGCAGAT;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=39;WE=97888345;WS=97888327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,40:0.71:56
chr3	97888438	rs72487748	G	C	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.226;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.071;NF=10;NR=14;PP=401;ReadPosRankSum=0.387;SC=GCAAGTCATAGTTTCATTCAT;SOR=0.830;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=87;TCF=47;TCR=40;TR=24;WE=97888446;WS=97888428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,24:0.27:90
chr3	97983040	rs4241470	C	T	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=272;ReadPosRankSum=1.357;SC=TCAATTATAGCACTGATCAAA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=15;WE=97983048;WS=97983030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr3	97983117	rs4241471	A	G	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=18;PP=1305;ReadPosRankSum=1.153;SC=TCAACTCACAATTCCATTGCA;SOR=0.718;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=96;TCF=65;TCR=31;TR=57;WE=97983125;WS=97983107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,59:0.60:99
chr3	97983257	rs2132894	C	G	7284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.60;QD=38.96;SOR=0.840;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr3	97983257	.	CTTCCTGGC	GTTCCTGGA,GTTCCTGGC	2212	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=58.61;NF=56,97;NR=43,84;PP=2212,1272;QD=22.8835138875;SC=AAATACCGCTCTTCCTGGCAT;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=181;TCF=97;TCR=84;TR=99,181;WE=97983273;WS=97983247;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.55:181
chr3	97983265	rs4241472	C	A	2825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=5.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQRankSum=0.169;QD=15.88;ReadPosRankSum=-0.587;SOR=0.808;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,109:0.61:178
chr3	97983374	rs4857358	A	G	3315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=5.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.101;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-10.823;NF=73;NR=36;PP=2755;ReadPosRankSum=-0.321;SC=TTGGGAGTTTAGCCTTTGTGG;SOR=0.928;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=167;TCF=107;TCR=60;TR=109;WE=97983382;WS=97983364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,110:0.65:168
chr3	97983391	rs2173236	C	G,T	5353.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=79,33;NR=32,28;PP=2686,1175;SC=GTGGATGCTTCGTTATCATCC;SOR=1.388;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=172;TCF=112;TCR=60;TR=111,61;WE=97983399;WS=97983381;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.65,0.35:173
chr3	97983487	rs74203917	TTGTAACCAC	T	2229.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQRankSum=-4.626;QD=10.04;ReadPosRankSum=-1.472;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,66:0.30:222
chr3	97983561	rs9289564	G	C	6400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=126;PP=2965;SC=CATTTGCAAAGCTTTACTTTA;SOR=1.503;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=68;TCR=126;TR=192;WE=97983569;WS=97983551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr3	97983711	rs9853887	T	C	1481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=34;PP=1163;ReadPosRankSum=-0.611;SC=ACACTTTTACTGTGACATTAT;SOR=1.078;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=46;WE=97983719;WS=97983701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
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chr3	97983981	rs9871143	G	A	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.212;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.418;NF=11;NR=1;PP=212;ReadPosRankSum=-0.401;SC=GCAAGCAGATGACCAAGATAT;SOR=1.702;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=12;WE=97983989;WS=97983971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
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chr3	98073591	rs11288615	TA	T	1983.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=51;PP=1883;SC=TAAATGTTCTTAAAAAAATTA;SOR=1.997;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=72;TCF=19;TCR=53;TR=67;WE=98073599;WS=98073581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
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chr3	98225441	rs1132750	A	C	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=1.836;SC=GGCTGAAGTCATCTGAAGGCT;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=5;WE=98225449;WS=98225439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr3	98281349	rs9850648	G	T	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.990;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=35;PP=678;ReadPosRankSum=-0.005;SC=TCTAATAGCTGGTATCAAAAT;SOR=1.105;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=141;TCF=29;TCR=112;TR=41;WE=98281357;WS=98281339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,43:0.30:144
chr3	98304467	rs1729995	T	C	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.819;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=1242;ReadPosRankSum=1.419;SC=TGCCCCGCCGTTCTCCACGAT;SOR=0.516;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=85;TCF=38;TCR=47;TR=53;WE=98304475;WS=98304457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,53:0.63:84
chr3	98487121	rs3217579	TAGTG	T	1331.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.885;NF=27;NR=0;PP=1291;ReadPosRankSum=-0.013;SC=TCTGCACGTTTAGTGAGTATT;SOR=2.110;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=27;WE=98487132;WS=98487111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,34:0.74:46
chr3	98489686	rs1440153	A	G	3298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=29;PP=2528;ReadPosRankSum=0.656;SC=AGGGTGCCCGATTCTGGTTTC;SOR=0.692;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=161;TCF=120;TCR=41;TR=113;WE=98489694;WS=98489676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,121:0.72:169
chr3	98489915	rs1440152	C	G	1650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.202;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;PP=1413;ReadPosRankSum=0.029;SC=AAGTGGACACCCCATATTTAA;SOR=1.089;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=95;TCF=51;TCR=44;TR=64;WE=98489923;WS=98489905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,64:0.67:95
chr3	98490141	rs844160	A	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=191;ReadPosRankSum=0.187;SC=ACCCTTATTAATTTGTGGCTT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=12;WE=98490149;WS=98490131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,12:0.24:51
chr3	98491619	rs2334230	G	T	1870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-5.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.440;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=6;PP=1500;ReadPosRankSum=0.370;SC=AAATATAGTAGGTATTTGGCA;SOR=1.219;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=104;TCF=94;TCR=10;TR=65;WE=98491627;WS=98491609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,67:0.64:104
chr3	98501080	rs3772100	C	T	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.917;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=532;ReadPosRankSum=-1.395;SC=ATGAGGCTTCCGCCTGCTGGA;SOR=0.906;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=68;TCF=36;TCR=32;TR=27;WE=98501088;WS=98501070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,29:0.41:71
chr3	98501128	rs3772101	A	G	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.999;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=575;ReadPosRankSum=0.763;SC=CTGTTTTCCCAGTCACTTTCA;SOR=0.874;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=60;TCF=21;TCR=39;TR=30;WE=98501136;WS=98501118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr3	98503683	rs704585	C	T	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.780;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=563;ReadPosRankSum=0.440;SC=TTTCTACTTGCGCAACAAGTG;SOR=0.187;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=72;TCF=62;TCR=10;TR=30;WE=98503691;WS=98503673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,32:0.41:79
chr3	98503776	rs999147	A	G	2469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.608;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=41;PP=1813;ReadPosRankSum=-0.085;SC=TCACTTGTCCATCTGTCCAAC;SOR=0.766;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=150;TCF=87;TCR=63;TR=98;WE=98503784;WS=98503766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,102:0.64:160
chr3	98503941	rs62278486	G	A	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=345;ReadPosRankSum=0.852;SC=ATGGTTTCTTGCCTTAATACA;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=17;WE=98503949;WS=98503931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr3	98507134	rs73136057	C	A	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.817;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=482;ReadPosRankSum=-0.230;SC=AAACAGACAGCCACACTGTTC;SOR=1.124;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=67;TCF=35;TCR=32;TR=26;WE=98507142;WS=98507124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,28:0.41:68
chr3	98518160	rs62821060	T	TA,TAA	1985.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.61;MQRankSum=0.334;QD=25.79;ReadPosRankSum=-0.369;SOR=2.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:3,54,20:0.70,0.26:77
chr3	98519481	rs1822017	G	A	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.55;ReadPosRankSum=1.215;SOR=0.785;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,32:0.24:132
chr3	98520602	rs9860216	A	G	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.101;NF=0;NR=26;PP=644;ReadPosRankSum=-0.476;SC=TCCTGTGTCCAAGTGTTCTCA;SOR=1.552;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=26;WE=98520610;WS=98520592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr3	98531342	rs9814819	A	G	1852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.754;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=56;PP=1470;ReadPosRankSum=0.051;SC=AAAAAACAACAAAAAATTGGT;SOR=1.728;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=90;TCF=11;TCR=79;TR=62;WE=98531350;WS=98531332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,65:0.69:94
chr3	98536571	rs1440150	T	C	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.433;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=3;PP=825;ReadPosRankSum=0.774;SC=CAACCACCCATTTAAAAAATG;SOR=0.100;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=54;TCF=51;TCR=3;TR=35;WE=98536579;WS=98536561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,37:0.65:57
chr3	98540931	rs9843214	T	C	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=247;ReadPosRankSum=0.603;SC=AGCACACTAATGTGAGTGCTT;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=12;WE=98540939;WS=98540921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr3	98541012	rs866873	G	A	1994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=6;PP=1506;SC=TCTTAGCCCAGTGCTACCCAG;SOR=3.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=51;TCR=6;TR=57;WE=98541020;WS=98541002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	98542194	rs6440159	G	A	34.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr3	98542485	rs142035943	G	GAAGAA	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=232;SC=ATTCTGCTATGAAGTCATGCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=98542493;WS=98542475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	98542536	rs9845558	A	G	121.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=56;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=88;ReadPosRankSum=-0.967;SC=AAGTAACACAATAATTCAGTA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=98542544;WS=98542526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr3	98544123	rs11341324	CA	C	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.72;ReadPosRankSum=-0.125;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
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chr3	98544353	rs828622	G	A	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=28;PP=809;SC=TAAAAACTTTGCCAACTTTTG;SOR=3.855;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=32;WE=98544361;WS=98544343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	98619997	rs17852693	G	C	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-3.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.397;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=184;ReadPosRankSum=0.595;SC=CGAGCAGCAGGAGCAGGACAA;SOR=0.350;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=14;WE=98620005;WS=98619987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr3	99536937	rs1718240	C	T	2261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=60;PP=1901;SC=GGAGCCCTTCCGTGCGCCTCA;SOR=4.143;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=7;TCR=60;TR=67;WE=99536945;WS=99536927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	100016726	rs3832199	A	AT	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.18;ReadPosRankSum=-1.100;SOR=1.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,9:0.24:38
chr3	100277476	rs7645690	G	C	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=144;ReadPosRankSum=-0.638;SC=CTCTTTGCCTGTAACTTCTCT;SOR=0.478;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=10;WE=100277484;WS=100277466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,10:0.27:37
chr3	100277514	rs7645700	G	A	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=56;ReadPosRankSum=0.474;SC=GTTTGCTCCCGGAGACTTCCC;SOR=0.148;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=6;WE=100277522;WS=100277504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr3	100295733	rs7427360	A	G	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.313;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=500;ReadPosRankSum=-0.182;SC=CTATTTTAAAAACCGTCTAAC;SOR=1.807;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=112;TCF=67;TCR=45;TR=30;WE=100295741;WS=100295723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,32:0.27:117
chr3	100352043	rs610854	C	T	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=0;PP=831;SC=TAGTTATTGCCTAAAAATAAT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=100352051;WS=100352033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	100354524	rs1144122	A	G	2111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=13;PP=1652;ReadPosRankSum=1.531;SC=AAAACAGGTAAAGGATGTCAC;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=105;TCF=85;TCR=20;TR=70;WE=100354532;WS=100354514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,73:0.66:110
chr3	100354698	rs1718281	T	A	1410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.75;SOR=4.370;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	100368692	rs1144118	A	G	1510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=42;PP=1199;SC=AGAAATTGCTATCTTGATATA;SOR=4.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=46;WE=100368700;WS=100368682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	100472848	rs905604	T	C	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=407;ReadPosRankSum=0.341;SC=TTTGCTTTGTTTTGGAAATTG;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=17;WE=100472856;WS=100472838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr3	100539887	rs7615467	C	T	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.016;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=36;PP=941;ReadPosRankSum=-1.372;SC=AGGATTGCAACGTGCTATTAC;SOR=0.860;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=190;TCF=75;TCR=115;TR=57;WE=100539895;WS=100539877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,56:0.29:192
chr3	100542463	rs61061653	C	CAAAA	165.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQRankSum=-1.636;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.803;SOR=0.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr3	100543944	rs13069634	A	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.99;ReadPosRankSum=-0.641;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr3	100551066	rs9845149	G	T	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.126;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=6;PP=921;ReadPosRankSum=0.284;SC=CCCAACCGTGGTAGACTGCTT;SOR=1.012;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=123;TCF=105;TCR=18;TR=49;WE=100551074;WS=100551056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,48:0.38:125
chr3	100554525	rs79498378	A	G	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.780;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=642;ReadPosRankSum=-1.460;SC=GCAATACAATAAACAATGGAG;SOR=3.128;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=29;WE=100554533;WS=100554515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr3	100558416	rs9841585	T	C	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.870;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=549;ReadPosRankSum=0.795;SC=GAATTACCAGTTGTGGGCACC;SOR=0.496;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=108;TCF=81;TCR=27;TR=33;WE=100558424;WS=100558406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,35:0.31:112
chr3	100558508	rs113833109	C	T	3158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=64;PP=2303;ReadPosRankSum=0.236;SC=GAAGTGGCATCGTGAGGAGGG;SOR=0.728;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=165;TCF=69;TCR=96;TR=112;WE=100558516;WS=100558498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,121:0.71:171
chr3	100558547	rs113915012	C	T	2057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=50;PP=1563;ReadPosRankSum=-1.048;SC=TGGGACACTACCTAAATGATG;SOR=0.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=27;TCR=75;TR=68;WE=100558555;WS=100558537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,74:0.68:109
chr3	100559117	rs78799633	A	G	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.558;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=446;ReadPosRankSum=-0.962;SC=TTTACTGTGGACATGTTTCCA;SOR=0.162;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=22;WE=100559125;WS=100559107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,24:0.73:33
chr3	100560745	rs66923918	GA	G	106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=17;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=9;NR=0;PP=108;SC=ATCTGGAGAAGAAAAAAAAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=9;WE=100560753;WS=100560735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	100565031	rs6774830	G	C	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=399;SC=GAACATTGCTGAGAGCAATGC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=100565039;WS=100565029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	100566571	rs3806656	A	G	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.284;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=400;ReadPosRankSum=1.750;SC=ATAAAAAGACACCCTCTAAAG;SOR=0.177;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=80;TCF=6;TCR=74;TR=25;WE=100566579;WS=100566561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,24:0.32:76
chr3	100570787	rs60146880	T	TAAA	813.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.50;MQRankSum=1.392;QD=31.30;ReadPosRankSum=-1.135;SOR=0.420;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr3	100581261	rs10567225	AT	A	471.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=19.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.23;ReadPosRankSum=-1.245;SOR=1.297;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,31:0.74:42
chr3	100583651	rs10711419	GA	G	143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.82;ReadPosRankSum=-0.898;SOR=0.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,14:0.27:51
chr3	100585694	rs3732899	C	G	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=12;PP=794;ReadPosRankSum=-0.784;SC=TTTCTTTTCTCAAGGTCAACA;SOR=0.713;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=136;TCF=100;TCR=36;TR=42;WE=100585702;WS=100585684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,42:0.31:134
chr3	100594326	rs3839090	CGGCATA	C	5286.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=44;PP=2965;SC=TGCTTAATCTCGGCATAGATT;SOR=1.078;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=93;TCF=48;TCR=45;TR=86;WE=100594339;WS=100594316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr3	100605206	rs1987384	A	G	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=761;SC=AAAATCACAGAGGGATTCAGA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=100605214;WS=100605196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	100617680	rs2245370	C	T	2647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=18;PP=2130;SC=ACAGGAAGACCGAGCTCGGTG;SOR=2.133;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=59;TCR=18;TR=77;WE=100617688;WS=100617670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	100621426	rs2576365	C	A	3779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=33;PP=2962;SC=GTTCAAAGTTCATAAAAGAAA;SOR=2.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=84;TCR=33;TR=117;WE=100621434;WS=100621416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr3	100944932	rs75852013	A	G	3211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.889;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=65;PP=2205;ReadPosRankSum=1.169;SC=TTTAGATTTCAGAAGCAATCA;SOR=0.454;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=203;TCF=91;TCR=112;TR=126;WE=100944940;WS=100944922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,134:0.63:214
chr3	100946742	rs521661	T	G	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.886;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=37;PP=1211;ReadPosRankSum=-0.860;SC=AAGGGGCAGGTGTTCCACTCA;SOR=0.926;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=89;TCF=33;TCR=56;TR=57;WE=100946750;WS=100946732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,56:0.64:87
chr3	100949842	rs348867	G	A	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.828;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=671;ReadPosRankSum=0.283;SC=GGTGTGCTTGGAGAGTCCTGA;SOR=2.049;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=29;WE=100949850;WS=100949832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,31:0.67:46
chr3	100976755	rs7613046	G	C	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.602;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=34;PP=879;ReadPosRankSum=-0.653;SC=TCTCTGAAAAGCCTGGACAAC;SOR=2.066;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=56;TCF=3;TCR=53;TR=35;WE=100976763;WS=100976745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,35:0.62:56
chr3	100994377	rs2271972	T	C	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=564;ReadPosRankSum=0.435;SC=GTACTGGTTTTAGGATCCATG;SOR=3.098;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=21;WE=100994385;WS=100994367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,22:0.85:26
chr3	101066992	.	A	T	24	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=24;QD=29.3856062736;SC=TACTTTTTTTAAAAAAAAGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=2;WE=101067000;WS=101066982;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr3	101085208	rs75513564	A	G	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=0;PP=1030;ReadPosRankSum=-1.759;SC=TTGTTCAAGAAGAATAAAAAA;SOR=2.256;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=50;TCR=0;TR=38;WE=101085216;WS=101085198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,37:0.76:49
chr3	101085683	rs58636547	TAAAAA	T	148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=145;ReadPosRankSum=0.707;SC=TTTAAATTCCTAAAAAAAAGT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=101085695;WS=101085673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr3	101177848	rs6809436	T	G	2713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=6.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.504;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.039;NF=47;NR=63;PP=2088;ReadPosRankSum=-0.373;SC=ATATGTTTTTTATTTTTATGG;SOR=0.460;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=313;TCF=119;TCR=194;TR=110;WE=101177856;WS=101177838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,114:0.35:324
chr3	101177901	rs151020849	GA	G	2202.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.022;HP=10;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.235;NF=1;NR=90;PP=1311;ReadPosRankSum=-1.127;SC=TTCCCACTAGGAAAAAAAAAA;SOR=2.167;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=154;TCF=6;TCR=148;TR=91;WE=101177909;WS=101177891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,103:0.67:154
chr3	101212855	rs6791803	T	C	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=199;ReadPosRankSum=2.362;SC=TTGAACTATATACAAGAGCTA;SOR=0.823;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=11;WE=101212863;WS=101212845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr3	101232093	rs55749605	C	A	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=480;SC=AAAAAAAGCCCGCAAAGTGCG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=101232101;WS=101232083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	101283792	rs3762735	C	G	3572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=53;PP=2654;ReadPosRankSum=-0.390;SC=GAGAGTACACCCCCTTCTGAA;SOR=0.623;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=241;TCF=150;TCR=91;TR=140;WE=101283800;WS=101283782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,150:0.59:254
chr3	101308846	rs6441614	G	A	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=113;SC=TTTTTCAGCAGTTTTTTTTCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=101308854;WS=101308842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	101370551	rs78127229	T	C	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.232;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.920;NF=1;NR=32;PP=622;ReadPosRankSum=1.422;SC=AAAAAAAGCATGTGTAGTGAG;SOR=3.797;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=33;WE=101370559;WS=101370541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,32:0.76:42
chr3	101373480	rs34508490	A	G	1584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=4;PP=1299;ReadPosRankSum=-0.499;SC=TTATCTTCAAATATTTTTTTG;SOR=0.680;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=75;TCR=6;TR=51;WE=101373488;WS=101373470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,54:0.63:86
chr3	101389864	rs9837549	T	C	4189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=13;PP=2965;SC=CTACTGTTGTTAGTGGGCTTC;SOR=4.039;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=112;TCR=13;TR=124;WE=101389872;WS=101389854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr3	101401248	rs41273611	G	C	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-5.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=298;ReadPosRankSum=0.561;SC=TATTGTTCAAGAAAGTAAAGA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=17;WE=101401256;WS=101401238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,17:0.36:47
chr3	101443461	rs994573	T	C	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=3;PP=992;SC=CTCCTTCAGATTACAAGCTCC;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=39;WE=101443469;WS=101443451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	101484335	rs2625282	G	A	3833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.435;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=73;PP=2962;ReadPosRankSum=2.609;SC=CAGAAGTTCAGGGGCAGCAGC;SOR=1.049;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=188;TCF=85;TCR=103;TR=127;WE=101484343;WS=101484325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,135:0.68:199
chr3	101504624	rs2625289	A	C	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=224;ReadPosRankSum=0.436;SC=TTATCGGAAGATTATCGTAGT;SOR=0.776;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=11;WE=101504632;WS=101504614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr3	101571550	rs587555	A	G	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=4.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=414;ReadPosRankSum=-1.007;SC=GTCATTTTGTATACACTAAAT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=17;WE=101571558;WS=101571540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr3	101572822	rs2925334	C	A,G	1300.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=0,0;NR=15,28;PP=283,639;SC=GTTGGCTAACCAAGATGACTG;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=15,28;WE=101572830;WS=101572812;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.35,0.65:43
chr3	101574503	rs677011	G	A	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.002;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=619;ReadPosRankSum=0.833;SC=GCCATCCTCAGCATTTGTCAT;SOR=0.272;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=41;TCF=25;TCR=16;TR=27;WE=101574511;WS=101574493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr3	101575882	rs595788	T	C	1511.31	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.480;HP=16;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.326;NF=67;NR=18;PP=973;ReadPosRankSum=-0.681;SC=TCTGGATTTTTTTTTTTTTTT;SOR=1.132;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=95;TCF=74;TCR=21;TR=85;WE=101575891;WS=101575867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:10,76:0.88:86
chr3	101576029	rs3217713	T	TACTTTTAGAAAGCTTTAATAACC	10512.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=12;PP=2965;SC=AATGCAAAGGTACACCAGAGT;SOR=2.154;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=101;TCF=63;TCR=38;TR=30;WE=101576037;WS=101576019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr3	101576175	rs14134	T	C	3372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.599;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=88;PP=2651;ReadPosRankSum=0.401;SC=TGCTGCCAGCTTGCAGTATCG;SOR=0.325;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=148;TCF=28;TCR=120;TR=112;WE=101576183;WS=101576165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,116:0.74:156
chr3	102157283	rs11340850	GT	G	2219.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=19;PP=2075;ReadPosRankSum=0.448;SC=GAGTGAAGGAGTTAAGTGGGA;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=53;TCR=27;TR=55;WE=102157291;WS=102157273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,68:0.71:96
chr3	102157365	rs6784362	A	T	3003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.956;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=59;PP=2374;ReadPosRankSum=0.938;SC=GCTTCTAACAATTAGAGTGCT;SOR=0.466;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=143;TCF=72;TCR=71;TR=110;WE=102157373;WS=102157355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,112:0.74:151
chr3	102157417	rs6784389	A	G	2379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.728;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=56;PP=1816;ReadPosRankSum=-1.088;SC=TGTGATGCCAACCTCCACAGT;SOR=0.963;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=115;TCF=39;TCR=76;TR=84;WE=102157425;WS=102157407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,88:0.72:122
chr3	102172106	rs11708291	T	C	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=71;ReadPosRankSum=0.229;SC=ACAAATCACTTTCCTTTGCCT;SOR=0.193;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=5;WE=102172114;WS=102172096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr3	102174936	rs62272486	G	A	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=450;ReadPosRankSum=0.081;SC=AGTTGAACTAGACTCTAGAAT;SOR=0.223;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=20;WE=102174944;WS=102174933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr3	102176799	rs75957873	C	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=173;ReadPosRankSum=-0.014;SC=CCACATTAACCCTGTTATGCC;SOR=0.123;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=11;WE=102176807;WS=102176789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,12:0.26:47
chr3	102181131	rs12054046	A	G	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.643;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=661;ReadPosRankSum=-0.862;SC=TTAGGATTCAACCTACAACCA;SOR=3.461;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=26;WE=102181139;WS=102181121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,24:0.73:33
chr3	105260596	rs599278	T	C	3658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=81;PP=2912;SC=CTTCAACAGCTATCACAGTTC;SOR=2.366;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=27;TCR=81;TR=108;WE=105260604;WS=105260586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr3	105404031	rs16851440	T	C	1352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=0;PP=1062;SC=GGAAATGGTATAATAGGAAGA;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=38;WE=105404039;WS=105404021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	105412286	rs10635036	C	CTT	534.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=461;SC=CAAAACCACTCTACCATATCT;SOR=2.833;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=9;WE=105412294;WS=105412276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	105422844	rs2305037	C	T	1912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=18;PP=1507;SC=TTGGTGAACCCGTTGGGCTGC;SOR=1.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=59;WE=105422852;WS=105422834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	105438806	rs7624400	G	A	1111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=4;PP=850;SC=ACTCAAATACGCTGAGTCATA;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=105438814;WS=105438796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	105452751	rs1992520	C	T	1116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=0;PP=948;SC=TCATTTCAAACAAAGCACTTA;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=105452759;WS=105452741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	105453034	rs6768096	A	G	953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=28;PP=815;SC=TTTCCAGCACAAATTGTTAGT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=105453042;WS=105453024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	105455955	rs2289746	T	C	915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=5;PP=730;SC=GAGAGTCTTATTTATTTCAAG;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=105455963;WS=105455945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	105468330	rs1443098	C	T	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=0;PP=112;SC=TGTCCACATACTAAATAGCAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=105468338;WS=105468328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	105470436	.	C	G	3833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.474;ClippingRankSum=0.000;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.086;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=82;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.500;SC=AAGGCACTGTCTGAATACTTT;SOR=1.067;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=208;TCF=86;TCR=122;TR=133;WE=105470444;WS=105470426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,139:0.65:215
chr3	105495432	rs9809911	G	T	3992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=112;PP=2965;SC=TAAACACCTAGATGCATGCAA;SOR=4.039;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=13;TCR=112;TR=125;WE=105495440;WS=105495422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr3	105586538	rs2221379	G	A	1148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=33;PP=950;SC=TTCCTCCATCGATTAGAGCAA;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=105586546;WS=105586528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	105588069	rs11711088	G	A	1899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=10;PP=1442;SC=CTCGCAGCACGTCAGAAAGGA;SOR=2.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=47;TCR=10;TR=57;WE=105588077;WS=105588059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	107451907	rs4855764	C	T	3664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=61;PP=2790;SC=TCTGCTCATACTGTGGGTTGG;SOR=0.914;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=49;TCR=61;TR=110;WE=107451915;WS=107451897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr3	107519843	rs1532325	T	C	2381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=0;PP=1990;SC=TGGTAGAGAATGTTAGCTCTT;SOR=8.581;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=71;TCR=0;TR=71;WE=107519851;WS=107519833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	107646728	rs4855779	G	A	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=307;ReadPosRankSum=-0.120;SC=AGGACGCAGAGATCCATTACT;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=13;WE=107646736;WS=107646718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr3	107647001	rs34976355	C	CA	2543.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=1.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.01;MQRankSum=1.073;QD=14.79;ReadPosRankSum=1.766;SOR=0.851;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,110:0.64:172
chr3	107769230	rs696364	C	T	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.22;ReadPosRankSum=-0.307;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr3	107776511	rs709436	C	T	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=341;SC=GTTATTCTAACGATCAAAAAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=107776519;WS=107776501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	107809798	rs445541	C	T	227.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=2;PP=148;SC=CGCAGGTGTCCGGAGCAGCAG;SOR=1.863;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=8;WE=107809806;WS=107809788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	107882643	rs327168	G	A	209.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=196;SC=TGAATTATGTGTTAAGAAAAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=107882651;WS=107882633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	107884211	rs327167	T	C	1387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=0;PP=1161;SC=GTTAAACCATTTGTAGGTTCT;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=39;WE=107884219;WS=107884201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	107884269	rs62264150	A	G	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.097;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=1;PP=492;ReadPosRankSum=-2.943;SC=CAAGAGCATCAGTGTGTACCT;SOR=2.955;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=82;TCF=71;TCR=11;TR=32;WE=107884277;WS=107884259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,32:0.37:87
chr3	107885875	rs2305551	A	G	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=155;ReadPosRankSum=0.766;SC=ACTCACAAACATATTTTTTCA;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=8;WE=107885883;WS=107885865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr3	107910327	.	C	CT	276.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=3.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=2.833;QD=3.90;ReadPosRankSum=1.012;SOR=0.233;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,25:0.35:71
chr3	107932621	rs62267895	G	A	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=224;ReadPosRankSum=1.067;SC=TTAACCAAAGGTCTAAATGAT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=11;WE=107932629;WS=107932611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr3	107937231	rs1289761	T	C	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=206;ReadPosRankSum=1.723;SC=TCTAATTTTGTCTATACTGGC;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=10;WE=107937239;WS=107937221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr3	107937286	rs1289760	A	G	1089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=6;PP=855;SC=ATAGTCAAAAAGAATAATTCT;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=30;WE=107937294;WS=107937276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	107937360	rs56273515	C	T	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.020;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=135;ReadPosRankSum=0.209;SC=AAATTACTATCATCAGGGTGG;SOR=1.242;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=45;TCF=25;TCR=20;TR=11;WE=107937368;WS=107937350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,11:0.23:48
chr3	107937408	rs1135897	C	T	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.805;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=184;ReadPosRankSum=-0.477;SC=CAATATATTTCAATGCTTCTT;SOR=0.306;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=17;WE=107937416;WS=107937398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr3	107937571	rs1289759	G	A	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=223;ReadPosRankSum=-1.351;SC=TTTAAGCAAAGAACTGCTGAA;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=10;WE=107937579;WS=107937561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr3	107937602	rs1289758	C	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=86;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ACTTTTCTTTCAAATGATTTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=107937610;WS=107937592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr3	107938240	rs1289754	G	C	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.125;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=3;PP=1198;ReadPosRankSum=-0.079;SC=GGAAAAAGAAGGGTCGTTTAC;SOR=1.588;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=65;TCR=4;TR=52;WE=107938248;WS=107938230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,52:0.72:72
chr3	108070556	rs9846218	T	C	1288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=0;PP=1076;SC=AACAATTATTTGTATGAATGT;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=108070564;WS=108070546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	108072243	rs6766283	C	T	996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=1;PP=820;SC=GGCATTAATTCTCTTTATAAC;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=108072251;WS=108072233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	108072298	rs6779254	T	C	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=3;PP=1328;SC=GCTTTCTTCATTTATGTTCCT;SOR=4.450;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=44;TCR=3;TR=47;WE=108072306;WS=108072288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	108072704	rs6779650	T	C	1249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=43;PP=1022;SC=TTTCCTAATATGCCATGAGCT;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=43;WE=108072712;WS=108072694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	108081217	rs3792332	C	A	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.00;ReadPosRankSum=0.254;SOR=0.695;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,43:0.26:163
chr3	108081247	rs16854512	G	A	2965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.698;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=65;PP=2306;ReadPosRankSum=0.323;SC=TGCCCTCTGCGATTTTGGCAG;SOR=0.778;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=143;TCF=54;TCR=89;TR=104;WE=108081255;WS=108081237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,107:0.73:147
chr3	108096098	rs1463426	C	G	6493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=155;NR=47;PP=2965;SC=ATTTTTCTTGCTTCTAGCCTC;SOR=2.433;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=202;TCF=155;TCR=47;TR=202;WE=108096106;WS=108096088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr3	108096227	rs1463425	G	C	5613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=138;PP=2965;SC=GCCTGTCGGAGCAGACAATTC;SOR=3.231;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=27;TCR=138;TR=165;WE=108096235;WS=108096217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr3	108102586	.	T	A	972	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=20;HapScore=3;MGOF=1;MMLQ=20;MQ=58.99;NF=0;NR=31;PP=972;QD=32.4764907273;SC=CCTATAAAAATAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=31;WE=108102594;WS=108102570;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,31:0.89:35
chr3	108103508	.	A	G	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.710;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.175;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=470;ReadPosRankSum=0.000;SC=GAAATCCATGAGGCTGAAACT;SOR=1.321;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=20;WE=108103516;WS=108103498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr3	108107704	rs1463431	C	T	1898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=0;PP=1559;SC=TGAAGGAGAACAAAGATGAAG;SOR=8.155;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=56;TCR=0;TR=56;WE=108107712;WS=108107694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	108135606	rs56933265	TAA	T	651.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=-1.338;QD=11.85;ReadPosRankSum=1.787;SOR=0.246;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,19:0.35:55
chr3	108135609	rs116262927	A	T	660.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=-1.338;QD=12.01;ReadPosRankSum=1.674;SOR=0.246;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,19:0.35:55
chr3	108140148	rs4593038	A	G	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=172;SC=GAGTGGCTCCAGGGATCCGCA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=108140156;WS=108140138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	108147543	rs61745179	C	A	1821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.229;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=20;PP=1386;ReadPosRankSum=0.119;SC=TGTCTCGGTGCAGCTTCTGGA;SOR=1.210;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=97;TCF=66;TCR=31;TR=68;WE=108147551;WS=108147533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,70:0.71:99
chr3	108156633	rs113832514	A	AAAAG	997.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=19;PP=1148;SC=ACCTTCTGGAAAAAGAAAGAC;SOR=4.003;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=21;WE=108156641;WS=108156623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	108158574	rs3996040	C	T	2763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=29;PP=2096;SC=CCAGATACACCGTTACTGACC;SOR=1.531;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=55;TCR=30;TR=83;WE=108158582;WS=108158564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr3	108172817	rs6437783	C	T	4046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=69;NR=51;PP=2965;SC=CACACTATTACCCTAGCAGTT;SOR=1.057;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=121;TCF=69;TCR=52;TR=120;WE=108172825;WS=108172807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr3	108174537	rs3957557	T	C	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.872;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=465;ReadPosRankSum=-1.101;SC=TACACAGTCTTCCCCCCATTC;SOR=0.345;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=71;TCF=59;TCR=12;TR=24;WE=108174545;WS=108174527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,26:0.37:71
chr3	108179219	rs11303627	CA	C	283.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=1.266;QD=5.67;ReadPosRankSum=-0.766;SOR=0.965;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr3	108188755	rs11917965	A	C	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=1;PP=700;ReadPosRankSum=-1.126;SC=AAACACCATTAAGATAAAATG;SOR=1.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=28;WE=108188763;WS=108188745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,30:0.83:36
chr3	108188993	rs9868484	G	A	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.11;ReadPosRankSum=1.104;SOR=0.617;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,38:0.27:140
chr3	108189627	rs4299484	C	T	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.930;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=477;ReadPosRankSum=0.015;SC=CCTGTTGATCCGTGCCACTAG;SOR=0.425;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=97;TCF=41;TCR=56;TR=28;WE=108189635;WS=108189617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,29:0.29:101
chr3	108189710	rs34103044	A	G	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.145;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=989;ReadPosRankSum=-0.018;SC=AATCACATTGAAAACACTCCT;SOR=0.472;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=69;TCF=24;TCR=45;TR=47;WE=108189718;WS=108189700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,51:0.69:74
chr3	108189750	rs12495639	C	T	1529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=36;PP=1117;SC=ATTTTAATCCCGGGCATTCTC;SOR=2.494;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=45;WE=108189758;WS=108189740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	108211869	rs140450152	A	AAAGG	2881.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.80;QD=45.03;SOR=8.349;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	108214537	rs2603140	T	G	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=480;SC=TGGTGTTCTATAATTTTTTCA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=108214545;WS=108214527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	108216807	rs17539094	G	A	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=474;ReadPosRankSum=1.212;SC=GGTGCTTGTGGCCTCACTTCC;SOR=0.771;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=85;TCF=81;TCR=4;TR=25;WE=108216815;WS=108216797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,25:0.29:86
chr3	108224685	.	CA	C	179.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=0.000;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=1.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.11;ReadPosRankSum=0.729;SOR=0.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,25:0.29:85
chr3	108229171	rs2249886	T	C	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=598;SC=AGGCTGATCATACCCTAAGCA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=108229179;WS=108229161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	108229437	rs150536264	G	GA	1458.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.615;NF=10;NR=47;PP=821;ReadPosRankSum=1.020;SC=GATTCAACCTGAAAAAAAAAA;SOR=0.822;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=97;TCF=18;TCR=79;TR=57;WE=108229445;WS=108229427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,65:0.76:86
chr3	108271012	rs2305514	T	C	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.450;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=498;ReadPosRankSum=-0.073;SC=CATTCCTTTATCCATATTCAC;SOR=0.358;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=26;WE=108271020;WS=108271002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr3	108272414	rs76336584	T	TA	296.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=367;ReadPosRankSum=-1.867;SC=AAGTAGAAAATAAAAAAGCAA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=16;WE=108272422;WS=108272404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,16:0.33:49
chr3	108273272	rs13071874	T	C	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=192;ReadPosRankSum=1.556;SC=ACTGTCTCAATTTGTTTATTC;SOR=0.593;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=10;WE=108273280;WS=108273262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr3	108273441	rs2045095	T	C	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.803;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=452;ReadPosRankSum=-0.568;SC=CCAAATTGCATATGCTGGAAG;SOR=2.093;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=23;WE=108273449;WS=108273431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr3	108286947	rs11386134	G	GA	554.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5017;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=427;ReadPosRankSum=1.454;SC=TGCAATACTAGAAAAAAAAGA;SOR=1.371;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=19;WE=108286955;WS=108286937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,24:0.80:30
chr3	108295067	rs16854713	G	A	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.337;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=95;ReadPosRankSum=0.733;SC=TAAAAGTTTCGGCATTTTGCA;SOR=1.329;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=10;WE=108295075;WS=108295057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,11:0.26:42
chr3	108308273	.	G	T	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=373;ReadPosRankSum=-1.304;SC=GCGTGCGCCGGCCTTTAGCTT;SOR=1.255;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=18;WE=108308281;WS=108308263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr3	108324365	rs41267019	C	T	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=74;ReadPosRankSum=-0.779;SC=GGTGGGGGTGCGGGGAATGGT;SOR=0.250;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=6;WE=108324373;WS=108324355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr3	108327050	rs10684119	T	TAAC	560.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=5.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.51;MQRankSum=1.826;QD=13.68;ReadPosRankSum=-0.977;SOR=0.075;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr3	108344636	rs5851600	TA	T	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.908;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr3	108355423	rs10711079	AT	A	1463.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=2;PP=1319;SC=CACATCAGTGATTTTTTTCTA;SOR=5.709;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=54;TCF=50;TCR=4;TR=48;WE=108355431;WS=108355413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	108355575	rs10711080	CT	C	1607.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=11;NR=48;PP=1002;SC=TTGTTTTGTCCTTTTTTTTTT;SOR=2.551;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=75;TCF=13;TCR=62;TR=59;WE=108355584;WS=108355565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	108356501	rs143129590	T	TTTAAGGTAGTA	231.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=1857;SC=TGCATTAAATTTTAAGGTATG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=108356509;WS=108356491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	108366978	rs2399235	A	G	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=249;ReadPosRankSum=-0.910;SC=TCTCATTAATATTTGAGTTAG;SOR=0.582;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=16;WE=108366986;WS=108366968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
chr3	108393134	rs41267025	T	C	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=27;PP=563;ReadPosRankSum=0.017;SC=GACATCAGAGTTCTTAAAGAA;SOR=0.897;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=88;TCF=5;TCR=83;TR=28;WE=108393142;WS=108393124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,27:0.31:86
chr3	108394771	rs12486790	G	A	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.844;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=34;PP=712;ReadPosRankSum=-0.669;SC=TATAGGTGGTGTAAAGTTAGA;SOR=1.042;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=125;TCF=33;TCR=92;TR=43;WE=108394779;WS=108394761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,43:0.34:127
chr3	108403086	rs9856097	T	C	3772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=76;NR=37;PP=2877;SC=TAGGAAGACCTCTTGTGAAAG;SOR=1.690;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=76;TCR=37;TR=113;WE=108403094;WS=108403076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr3	108475808	rs1107337	G	A	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.033;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=716;ReadPosRankSum=1.115;SC=GTTGGGCTTGGTTGGGATCTT;SOR=0.108;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=32;WE=108475816;WS=108475798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,33:0.79:42
chr3	108475974	rs11708527	G	A	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.983;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=290;ReadPosRankSum=0.758;SC=AGTACTCCCCGGGTTGATCAG;SOR=0.324;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=17;WE=108475982;WS=108475964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,17:0.33:51
chr3	108549720	rs2290055	T	G	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=481;ReadPosRankSum=0.103;SC=TTTTATGAAATGTCATTCAAC;SOR=0.655;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=19;WE=108549728;WS=108549710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr3	108557820	rs7651205	T	C	1502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=21;PP=956;SC=ACCAGGTATGTTGTGATTCAG;SOR=0.732;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=22;TCR=21;TR=43;WE=108557828;WS=108557810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	108565815	rs2593831	T	C	1434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=13;PP=1108;SC=TAACCAAGAATAGGCAATAGT;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=46;WE=108565823;WS=108565805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	108567923	rs2715716	G	A	2072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=0;PP=1876;SC=GTTTATATTTGCAGCCAAATG;SOR=8.318;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=66;TCR=0;TR=66;WE=108567931;WS=108567913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	108634973	rs10933973	C	A	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.670;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=13;PP=771;ReadPosRankSum=-1.130;SC=AGCTCCATTACCATCATTGTT;SOR=0.440;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=137;TCF=103;TCR=34;TR=47;WE=108634981;WS=108634963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,49:0.35:140
chr3	108639119	rs2715688	A	G	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.757;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=97;ReadPosRankSum=-0.640;SC=GCTGTTGCCCATTCAGTAATC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=108639127;WS=108639109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr3	108639270	rs6791441	C	T	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.618;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=341;ReadPosRankSum=-1.500;SC=GGATACTTTACTACTTCACTT;SOR=1.911;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=17;WE=108639278;WS=108639260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr3	108639423	rs2715687	C	T	270.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=9;PP=248;SC=AAAAAGTCAACAAATCCATCC;SOR=3.056;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=108639431;WS=108639413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	108677821	rs2197737	C	A	278.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=173;SC=CTTAATTTTCCGAAGTCTTTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=108677829;WS=108677811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	108678002	rs2197738	G	A	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=13;PP=449;SC=ACCAGGGAAAGAAGCTGCAGA;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=22;WE=108678010;WS=108677992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	108682218	rs2715755	A	G	2049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=19;PP=1538;SC=TTCTCGTTCCATAGAGTCTAC;SOR=2.030;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=51;TCR=19;TR=70;WE=108682226;WS=108682208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	108690221	rs2593943	G	A	6752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=138;NR=70;PP=2965;ReadPosRankSum=1.562;SC=GGTAGCTGATGCTCAGGAAAA;SOR=0.653;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=209;TCF=139;TCR=70;TR=208;WE=108690229;WS=108690211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,217:1.00:218
chr3	108698627	rs2953338	G	A	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=31;PP=863;SC=ACAAGAACATGCGTGTAATGC;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=108698635;WS=108698617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	108703422	rs1868195	A	G	257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=227;SC=ATTCTTTCACATCTCTGTTGT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=108703430;WS=108703412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	108703518	rs2593958	G	T	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=10;PP=1307;ReadPosRankSum=-0.806;SC=TTTTCAGCAGGATAATTGCAC;SOR=1.536;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=50;WE=108703526;WS=108703508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr3	108703548	rs2593959	C	T	2222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.100;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=20;PP=1754;ReadPosRankSum=0.094;SC=ATTTGTATAACTGTAGTACAC;SOR=1.997;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=72;TCF=51;TCR=21;TR=70;WE=108703556;WS=108703538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,72:0.97:74
chr3	108703702	rs2593960	A	T	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=36;PP=1024;ReadPosRankSum=0.497;SC=AAATGTTAGCAGTTCATTAAC;SOR=2.124;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=42;WE=108703710;WS=108703692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr3	108705715	rs11433147	A	AT	667.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=6;PP=426;SC=ACATGAGCTGATTTTTTTTTA;SOR=2.124;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=20;WE=108705723;WS=108705705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	108719400	rs34841653	T	C	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.050;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=500;ReadPosRankSum=-0.281;SC=ATAGTTTATCTCACCAGGATT;SOR=0.487;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=116;TCF=96;TCR=20;TR=32;WE=108719408;WS=108719390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,32:0.27:118
chr3	108719470	rs3762698	C	G	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=5.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.45;ReadPosRankSum=-0.695;SOR=1.154;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,48:0.26:183
chr3	108724202	rs13072610	A	G	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.200;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=52;PP=1355;ReadPosRankSum=1.458;SC=TTTGGTAGATAGCCTATTTAT;SOR=3.082;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=79;TCF=4;TCR=75;TR=53;WE=108724210;WS=108724192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,57:0.68:84
chr3	108724279	rs2290058	T	A	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=23;PP=720;SC=AAAAAGTTTTTAAATCAGAAG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=108724287;WS=108724269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	108725694	rs2044586	C	T	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=603;SC=TTATATTTTACTTTCTAACTT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=108725702;WS=108725692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	108725759	rs2044587	C	T	1712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=3;PP=1316;SC=TTAAAATCTACTAGTGCTTCA;SOR=5.136;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=50;WE=108725767;WS=108725749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	108725848	rs5851630	ATTGC	A	5687.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=38;PP=2947;SC=CATGACACAAATTGCTTAATC;SOR=1.323;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=96;TCF=52;TCR=44;TR=84;WE=108725870;WS=108725838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr3	108725862	rs2044589	T	C	5766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=60.08;NF=68;NR=52;PP=2965;SC=CTTAATCCTATATTAATTACT;SOR=1.127;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=69;TCR=52;TR=120;WE=108725870;WS=108725838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr3	108725984	rs2044590	G	C	3554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=88;PP=2860;SC=GTAAAAATAAGCTTCAACTGG;SOR=2.771;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=21;TCR=88;TR=109;WE=108725992;WS=108725974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr3	108754146	rs9821261	G	A	900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=5;PP=749;SC=ATATTTAAGAGCCCTTAACAT;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=108754154;WS=108754136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	108754214	rs3762697	T	C	1036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=23;PP=665;ReadPosRankSum=-1.186;SC=GGGATACCCATGGCTTGTCTT;SOR=0.829;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=58;TCF=28;TCR=30;TR=43;WE=108754222;WS=108754204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,45:0.76:59
chr3	108754238	rs4855576	A	T	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=34;PP=1258;SC=TGATATTGAAAAGAATTTAAA;SOR=1.238;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=21;TCR=34;TR=55;WE=108754246;WS=108754228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	108754260	rs3762696	A	G	1161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.714;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.316;NF=9;NR=29;PP=918;ReadPosRankSum=0.550;SC=GTTTCTCCACATCGATGTCAT;SOR=2.103;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=38;WE=108754268;WS=108754250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr3	108754320	rs11438791	T	TA	226.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.53;MQRankSum=0.707;QD=20.55;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr3	108776343	rs1031252	C	T	2423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=68;PP=2055;SC=TCTAGAGTTACATTTAAAAAG;SOR=3.855;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=10;TCR=68;TR=78;WE=108776351;WS=108776333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr3	108781952	rs13060344	G	T	1465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.350;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=23;PP=1097;ReadPosRankSum=-0.391;SC=ATTAACATTTGCTGAATGACT;SOR=0.362;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=82;TCF=49;TCR=33;TR=53;WE=108781960;WS=108781942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,56:0.64:87
chr3	108788701	rs35996834	C	CT	573.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.885;NF=1;NR=17;PP=732;ReadPosRankSum=0.700;SC=ATTATTGTTACTACAAGAAGC;SOR=0.392;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=18;WE=108788709;WS=108788691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr3	108812154	rs9821382	A	G	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=367;ReadPosRankSum=-0.729;SC=CAACTTTACTAGTAACTAGGG;SOR=0.092;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=18;WE=108812162;WS=108812144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr3	108829765	rs6437822	C	T	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=42;ReadPosRankSum=-1.567;SC=AACGTTTCACCGTGCTATTAT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=4;WE=108829773;WS=108829755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr3	108855774	rs1356071	A	G	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=20;PP=668;SC=TATTTATCATATCTCCTACAG;SOR=2.019;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=108855782;WS=108855764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	109019435	rs9865540	G	A	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=535;SC=GTGGGAGGCTGAGGAGGGCAG;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=109019443;WS=109019425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	109027157	rs7611135	C	T	2548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.800;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=80;PP=2083;ReadPosRankSum=0.547;SC=ATGAAATTCACGATGAGTATT;SOR=1.360;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=147;TCF=29;TCR=118;TR=97;WE=109027165;WS=109027147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,96:0.64:151
chr3	109027820	rs7611871	G	A	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=525;ReadPosRankSum=0.666;SC=GTAGGGACCGGACGAATCATG;SOR=1.681;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=21;WE=109027828;WS=109027810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr3	109049384	rs13059848	T	C	1410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.590;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=1154;ReadPosRankSum=-0.676;SC=AGGCCTCTTGTGGAGATTCCA;SOR=0.707;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=46;TCF=26;TCR=20;TR=45;WE=109049392;WS=109049374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr3	109050980	rs1163438	T	C	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=23;PP=569;SC=GACAGAATCTTGCTCTGTCGC;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=109050988;WS=109050970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	109178758	rs769533	C	T	1273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=33;PP=1004;SC=GTTTTCTTCACAATTTCACCA;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=40;WE=109178766;WS=109178748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	110611137	rs1381838	G	A	4818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=93;NR=58;PP=2965;SC=AAGCTCTATCGATTTCAAGTG;SOR=1.215;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=93;TCR=58;TR=151;WE=110611145;WS=110611127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr3	110789092	rs873132	C	T	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=310;ReadPosRankSum=1.890;SC=GGCACTAGACCGAGCGCTGGG;SOR=0.566;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=14;WE=110789100;WS=110789082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr3	110789199	rs873133	G	A	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.270;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=504;ReadPosRankSum=1.063;SC=TTGTAATCCAGCGGGCGGAAG;SOR=0.468;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=43;TCF=16;TCR=27;TR=27;WE=110789207;WS=110789189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr3	110791113	rs4682228	A	G	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=12;PP=532;SC=CGTTCTCTGGAGCAGCGAGGC;SOR=1.292;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=19;WE=110791121;WS=110791103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	110792906	rs2399372	G	A	302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=246;SC=GGTAGACACTGGTTTTGTATT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=110792914;WS=110792896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	110793050	rs2399373	G	A	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.501;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=470;ReadPosRankSum=0.429;SC=GGGCACAGATGTTGTGACTTA;SOR=0.206;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=55;TCF=34;TCR=21;TR=23;WE=110793058;WS=110793040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr3	110830746	.	ATGTG	A	582.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;QD=38.85;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	110837554	.	G	C	4534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.711;ClippingRankSum=0.000;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.895;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=51;PP=2962;ReadPosRankSum=0.972;SC=ATTGATGGAGGAAATGAAACA;SOR=1.188;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=277;TCF=177;TCR=100;TR=163;WE=110837562;WS=110837544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,172:0.60:285
chr3	110866195	.	CT	C	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=0.000;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.54;ReadPosRankSum=2.315;SOR=0.417;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,22:0.18:121
chr3	110866437	rs62273799	G	A	1672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=51;PP=1456;SC=TATGCATTAAGTGTTGTTTAG;SOR=7.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=0;TCR=51;TR=51;WE=110866445;WS=110866427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	111260975	rs2276873	C	T	2820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=20;PP=2378;SC=ATAAACAGACCCAGGCGTGTG;SOR=2.503;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=62;TCR=20;TR=82;WE=111260983;WS=111260965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	111261242	rs3832264	G	GCTGCTGAAATTGATCACCA	2190.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.17;NF=1;NR=15;PP=2973;SC=CCTTGTGACTGCTGCTGAAAT;SOR=6.138;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=16;WE=111261250;WS=111261232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	111313030	rs34321066	C	T	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.514;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=50;PP=1467;ReadPosRankSum=0.084;SC=TCCTCTTCCTCGTCTTCCCGC;SOR=0.886;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=122;TCF=37;TCR=85;TR=71;WE=111313038;WS=111313020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,75:0.58:130
chr3	111356083	rs1533270	G	C	2431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=21;PP=1980;SC=GTTCATCCCCGTCAGGTGCAG;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=52;TCR=21;TR=73;WE=111356091;WS=111356073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	111451603	rs3821919	G	C	1610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=39;PP=1331;SC=AAAATGAGCAGCATATACAGC;SOR=2.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=48;WE=111451611;WS=111451593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	111604541	rs1283007	G	C	1885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=57;PP=1520;SC=AGAGGAGTTGGGAATTTTATG;SOR=4.343;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=6;TCR=57;TR=63;WE=111604549;WS=111604531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	111637816	rs16858868	A	G	1672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=2;PP=1389;SC=CTACATGGGCATGGAGACTGT;SOR=5.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=59;TCF=57;TCR=2;TR=58;WE=111637824;WS=111637806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	111637904	rs2399399	G	A	5231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=113;NR=49;PP=2965;SC=CCATTTCTGTGTTGATTAATC;SOR=1.802;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=162;TCF=113;TCR=49;TR=162;WE=111637912;WS=111637894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr3	111638132	rs951660	A	C	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=18;PP=547;SC=CTTATTCAGGAATAGGCTTTG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=111638140;WS=111638122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	111638952	rs6779756	C	T	527.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=354;ReadPosRankSum=-0.297;SC=CTCTCTAGCTCGCTTATATGG;SOR=2.948;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=14;WE=111638960;WS=111638942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr3	111639353	rs937551	G	T	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=323;SC=TGCATTACTGGGGTTTTGGAT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=111639361;WS=111639343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	111658290	rs712509	T	G	2837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=8;PP=2268;SC=GTTATCTCAGTGTGTCTTGTT;SOR=4.307;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=73;TCR=8;TR=81;WE=111658298;WS=111658280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr3	111658486	rs712510	T	G	4364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=106;PP=2965;SC=AGGTACTTTTTCCAGGTGTCA;SOR=2.868;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=27;TCR=106;TR=133;WE=111658494;WS=111658476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr3	111659377	rs698358	T	C	3601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=38;PP=2772;SC=TCTCTTTTCCTCCAGGAAAAA;SOR=1.428;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=68;TCR=38;TR=106;WE=111659385;WS=111659367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr3	111677526	rs11713044	G	A	2557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=38;PP=1963;SC=CCTTCAAACAGCTATTTCTCT;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=38;TCR=38;TR=76;WE=111677534;WS=111677516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	111685328	rs774859	T	C	1123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=755;SC=TGGATTTTGTTATGCACCTCC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=25;WE=111685336;WS=111685321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	111685347	rs67645066	CAT	C	59.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.21;ReadPosRankSum=0.749;SOR=0.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,5:0.19:27
chr3	111685348	rs774858	A	G	635.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=49;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=974;ReadPosRankSum=-0.751;SC=CCTTGACCCCATGTGTGTGTG;SOR=2.753;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=24;WE=111685356;WS=111685337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,22:0.81:27
chr3	111685374	.	GGT	G	1083.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=12.304;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.96;MQRankSum=0.456;QD=31.87;SOR=5.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,33:0.97:34
chr3	111685395	.	GTA	G	595	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=20;MQ=60.01;NF=33;NR=1;PP=595;QD=17.6470588235;SC=GTGTGTGTGTGTATGTATTAG;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=63;TCF=59;TCR=4;TR=34;WE=111685404;WS=111685385;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:29,34:0.54:63
chr3	111686738	rs799570	G	A	2009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=58;PP=1616;SC=GAAGACAGCTGTTCTGTGTCT;SOR=4.648;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=3;TCR=58;TR=61;WE=111686746;WS=111686728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	111692829	rs774852	C	T	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=483;SC=TGGCCGTTCTCTTTGAGGAAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=111692837;WS=111692819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	111705992	rs3804765	A	G	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=308;SC=ACAGAAAACAATAATTCCTTT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=111706000;WS=111705982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	111719493	rs774764	A	G	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=412;ReadPosRankSum=2.124;SC=GTGCCTTCCTAGGGCCCATGA;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=18;WE=111719501;WS=111719483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr3	111730546	rs3749310	G	A	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=0;PP=486;SC=GTGTCCAGCCGTATCCTTCCA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=111730554;WS=111730536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	111730591	rs3749311	G	T	1003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=8;PP=750;SC=TTGGCTTTAAGCTCTTTGTTG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=111730599;WS=111730581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	111753527	rs73216052	C	T	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=233;ReadPosRankSum=0.498;SC=AGCAATGAGGCGGCTTCAGTT;SOR=0.314;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=14;WE=111753535;WS=111753517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr3	111760771	rs774774	A	G	5536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=69;PP=2965;SC=TTACAGGTAAAACAGAAAGCA;SOR=1.075;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=97;TCR=69;TR=166;WE=111760779;WS=111760761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr3	111763085	rs4682350	C	T	2689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=5;PP=2303;SC=TCAGATACCTCAACTATTCTT;SOR=5.058;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=72;TCR=5;TR=77;WE=111763093;WS=111763075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr3	111763278	rs7650559	G	T	3819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=93;PP=2965;SC=CTTGGAAGTGGTTGGGGATTC;SOR=3.836;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=13;TCR=93;TR=106;WE=111763286;WS=111763268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr3	111765834	rs1561911	G	A	6838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=96;PP=2965;SC=GGCTTCGGTCGGATTACTCGT;SOR=0.829;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=212;TCF=116;TCR=96;TR=212;WE=111765842;WS=111765824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr3	111766124	rs9811691	G	T	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.499;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=228;ReadPosRankSum=-0.308;SC=CTTCTATGGAGCCTTCTTTAT;SOR=1.547;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=51;TCR=4;TR=14;WE=111766132;WS=111766114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,14:0.25:56
chr3	111766215	rs1318554	A	G	4786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=107;NR=37;PP=2965;SC=CTAAACCATGATGAAAACCAC;SOR=2.136;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=145;TCF=108;TCR=37;TR=144;WE=111766223;WS=111766205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr3	111766559	rs1688304	T	G	2004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=21;PP=1589;SC=AAAAAGAAAATAAAGGAAAAT;SOR=1.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=33;TCR=21;TR=54;WE=111766567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	111799845	rs340151	A	T	7024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=115;PP=2965;SC=GGGACATGGAAGTGGACGACC;SOR=0.842;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=215;TCF=100;TCR=115;TR=215;WE=111799853;WS=111799835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr3	111805438	rs3833596	G	GT	1131.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=30;PP=1350;ReadPosRankSum=-1.213;SC=CGGCGGGACAGTAGTAGGACC;SOR=0.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=33;WE=111805446;WS=111805428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,36:0.61:59
chr3	111828384	rs5851818	G	GT	5394.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=81;PP=2972;SC=GCTTCTGTTTGTTTAGCTCAC;SOR=0.768;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=146;TCF=60;TCR=86;TR=134;WE=111828392;WS=111828374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr3	111828423	rs340167	G	A	3970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=86;PP=2965;SC=GCCCTCTCTGGGTCGTTATTT;SOR=1.870;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=38;TCR=86;TR=124;WE=111828431;WS=111828413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr3	111828476	rs2120095	A	G	2636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=66;PP=2193;ReadPosRankSum=0.591;SC=AGTGTGGAACATTACATTTTG;SOR=1.380;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=17;TCR=67;TR=83;WE=111828484;WS=111828466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,87:0.99:88
chr3	111832120	rs340165	A	G	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=22;PP=620;SC=TCATTTATTCACTCATCCCCT;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=111832128;WS=111832110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	111866148	rs56364691	T	C	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=282;ReadPosRankSum=-1.137;SC=AGATTCATATTGATATGTAAT;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=14;WE=111866156;WS=111866138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr3	111866295	rs78511788	C	T	2093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.230;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=50;PP=1596;ReadPosRankSum=-0.326;SC=TTGTTTAGAACTCTCTTAACA;SOR=1.066;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=135;TCF=53;TCR=82;TR=78;WE=111866303;WS=111866285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,80:0.59:135
chr3	111870228	rs6781137	C	T	2566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=54;PP=1966;ReadPosRankSum=-0.006;SC=TTTGCTCATTCTCACAGCCAG;SOR=0.692;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=56;TCR=88;TR=88;WE=111870236;WS=111870218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,95:0.61:155
chr3	111873902	rs11369523	T	TA	522.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=2.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQRankSum=0.096;QD=18.03;ReadPosRankSum=0.863;SOR=1.492;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,25:0.86:29
chr3	111885896	rs4682084	A	G	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=429;SC=TAATTTAAAAATGTAACTTCA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=111885904;WS=111885886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	111904539	rs2399407	C	T	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.93;MQRankSum=-0.660;QD=22.89;ReadPosRankSum=-1.239;SOR=0.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,24:0.80:30
chr3	111918216	rs13098660	A	G	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.964;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=21;PP=1122;ReadPosRankSum=-0.613;SC=CTTTTAAGCCAAAAGCCTTAA;SOR=1.446;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=88;TCF=52;TCR=36;TR=60;WE=111918224;WS=111918206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,66:0.68:97
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chr3	111921225	rs6781844	G	T	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=250;ReadPosRankSum=-0.439;SC=TCTATTATTTGCAGCAACTTT;SOR=1.123;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=13;WE=111921233;WS=111921215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
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chr3	111926950	rs17505536	G	A	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.85;ReadPosRankSum=-0.129;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
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chr3	111936200	rs1388857	C	A	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=1066;ReadPosRankSum=-0.276;SC=AGTATAATAACAAAAAATTCA;SOR=1.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=25;WE=111936215;WS=111936190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,25:0.81:31
chr3	111936207	rs6779306	T	A	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.41;ReadPosRankSum=1.052;SOR=0.422;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,6:0.17:36
chr3	111950367	rs55735606	C	G	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.008;NF=0;NR=12;PP=202;ReadPosRankSum=-0.477;SC=ACAAAAAATACATGAATATTA;SOR=0.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=12;WE=111950375;WS=111950357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,12:0.26:47
chr3	111950382	rs144475498	ATTG	A	724.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.426;NF=0;NR=16;PP=600;ReadPosRankSum=1.500;SC=ATATTAACATATTGTTTAGCA;SOR=1.284;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=16;WE=111950392;WS=111950372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr3	111958679	rs13065023	T	C	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.456;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=422;ReadPosRankSum=0.595;SC=AAGATATTACTTGCTTACCAT;SOR=1.893;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=20;WE=111958687;WS=111958669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr3	111958862	rs13089635	C	A	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.370;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=552;ReadPosRankSum=1.323;SC=ACCTTTGATACAAACACACAT;SOR=0.495;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=29;WE=111958870;WS=111958852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,32:0.70:46
chr3	111962774	rs13089316	T	C	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.442;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=592;ReadPosRankSum=0.690;SC=CTTTCTTTATTATTAGCACTT;SOR=1.609;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=26;WE=111962782;WS=111962764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr3	111981696	rs5851826	CA	C	822.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=1050;ReadPosRankSum=-1.535;SC=TACCTCACTACAAAAAAACAT;SOR=0.984;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=16;WE=111981712;WS=111981690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr3	111981704	rs5003791	C	T	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=1036;ReadPosRankSum=-0.596;SC=TACAAAAAAACATATATTTTA;SOR=0.874;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=22;WE=111981712;WS=111981690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr3	111981849	rs9860819	C	T	4151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.625;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=56;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.628;SC=TAGGCATCCCCTTCATTTCAC;SOR=0.585;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=239;TCF=152;TCR=87;TR=148;WE=111981857;WS=111981839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,152:0.61:250
chr3	111981878	rs9809384	T	C	4574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.440;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=77;PP=2962;ReadPosRankSum=0.489;SC=ATTATGAATATCCAGCGCCAA;SOR=0.736;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=267;TCF=142;TCR=125;TR=167;WE=111981886;WS=111981868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,175:0.61:287
chr3	111981924	rs9809404	T	C	3714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.150;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=96;PP=2733;ReadPosRankSum=-0.740;SC=AAACAGGGCTTATTAAAAGAA;SOR=0.603;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=222;TCF=53;TCR=169;TR=130;WE=111981932;WS=111981914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,141:0.58:244
chr3	111983157	rs62276974	G	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=31.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.94;ReadPosRankSum=0.421;SOR=3.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,20:0.22:90
chr3	111983197	rs6788397	C	T	1554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.715;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=38;PP=1050;ReadPosRankSum=-0.213;SC=GAATCTGCATCATTCAGAAAA;SOR=1.685;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=78;TCF=26;TCR=52;TR=53;WE=111983205;WS=111983187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,60:0.71:84
chr3	111984970	rs4682098	T	C	205.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=172;SC=TTTAGTTGGGTAGTTTTCAAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=111984978;WS=111984968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	111985048	rs4682099	G	A	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=254;ReadPosRankSum=-0.728;SC=ATAGCTTCCAGTGTATGAAAT;SOR=0.941;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=13;WE=111985056;WS=111985038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
chr3	111988992	rs13069541	T	G	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=481;ReadPosRankSum=0.159;SC=TGATATTCCTTGTTAATTTTC;SOR=0.446;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=21;WE=111989000;WS=111988982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr3	111993716	rs6805112	G	A	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=23;SC=TTCTGATGTTGAGAAAAATTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=111993724;WS=111993706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr3	111993915	rs4682100	A	G	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=93;ReadPosRankSum=0.687;SC=AAGTGAGAAAAACATTAAAAA;SOR=1.022;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=5;WE=111993923;WS=111993905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr3	111997731	rs139203276	C	CTCATTTAT	423.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=463;ReadPosRankSum=-1.822;SC=ATATCATCTTCTCATTTATTC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=7;WE=111997739;WS=111997721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr3	111999736	rs147052896	A	ACTTGTTTTCT	610.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=1588;ReadPosRankSum=-1.720;SC=CAGTTTCACTACTTTTCATGA;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=5;WE=111999744;WS=111999726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,15:0.88:17
chr3	112005423	rs7621431	T	C	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=154;ReadPosRankSum=-0.121;SC=ATTGAAAATATTGAGCTAAAG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=9;WE=112005431;WS=112005413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr3	112052103	rs2276772	G	T	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=442;ReadPosRankSum=1.314;SC=GAAGGAGGGCGCAGGGCAGGC;SOR=0.627;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=22;WE=112052111;WS=112052093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,22:0.39:56
chr3	112052173	rs9883527	T	C	2302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=39;PP=1607;SC=CTTCGGCTCTTGCCACAATCT;SOR=0.914;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=33;TCR=40;TR=72;WE=112052181;WS=112052163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr3	112059768	rs1131199	C	G	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.923;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=15;PP=1273;ReadPosRankSum=-0.868;SC=ATGCCCTTCTCTCATCTGTCT;SOR=1.332;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=74;TCF=51;TCR=23;TR=54;WE=112059776;WS=112059758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,56:0.74:76
chr3	112063850	rs2272022	C	A	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.703;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=398;ReadPosRankSum=-0.388;SC=GCTGTACACACCTGCTTCCTT;SOR=0.235;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=73;TCF=47;TCR=26;TR=27;WE=112063858;WS=112063840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,29:0.39:74
chr3	112184927	rs2171513	A	G	3784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=16;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.687;SC=TGATCATTCAATGGTCCCTGT;SOR=2.093;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=108;TCF=92;TCR=16;TR=107;WE=112184935;WS=112184917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr3	112185025	rs9288952	G	A	6882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.704;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=103;PP=2965;ReadPosRankSum=1.222;SC=TCTTGAGTTCGGTCCAATGAC;SOR=0.540;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=219;TCF=113;TCR=106;TR=214;WE=112185033;WS=112185015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,222:0.98:227
chr3	112188478	rs11267594	A	AGTACATAGAATATGTATATAC	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=53.79;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	112190137	rs2931761	G	T	6300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=116;NR=66;PP=2965;SC=GGAAGTAAACGATACAGGAGC;SOR=1.321;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=117;TCR=66;TR=182;WE=112190145;WS=112190127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr3	112218046	.	C	T	1396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.249;ClippingRankSum=0.000;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.725;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=28;PP=1143;ReadPosRankSum=-0.609;SC=GTACTAAGTTCAGCAAGGGAG;SOR=0.505;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=179;TCF=109;TCR=70;TR=66;WE=112218054;WS=112218036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,66:0.35:189
chr3	112253058	rs35560667	C	CA	3087.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.397;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.352;NF=96;NR=11;PP=2076;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CTAAATTTCTCAAAAAAAAAA;SOR=1.863;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=141;TCF=122;TCR=19;TR=107;WE=112253066;WS=112253048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:13,122:0.90:135
chr3	112253193	rs11381118	C	CA	1541.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=3.713;NF=10;NR=70;PP=847;ReadPosRankSum=-0.807;SC=GCCTAGAAGCCAAAAAAAAAA;SOR=0.760;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=170;TCF=24;TCR=146;TR=80;WE=112253201;WS=112253183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,80:0.71:112
chr3	112267269	.	T	C	942	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=37;NR=0;PP=942;QD=26.3992219607;SC=TGTAAGTCTATTGGGACAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=37;WE=112267277;WS=112267268;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	112267523	rs9809247	G	A	3367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=90;PP=2724;SC=TAACTAGCACGTAATCTGCTA;SOR=4.534;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=9;TCR=90;TR=99;WE=112267531;WS=112267513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr3	112280218	rs2279532	G	A	1895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=8;PP=1616;SC=TTGCCCCGCCGGAGAAAGCGG;SOR=3.575;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=52;TCR=8;TR=60;WE=112280226;WS=112280208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	112289320	rs9869455	G	A	1104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=3;PP=941;SC=GTAATCAAGTGCAGTGTAATT;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=35;WE=112289328;WS=112289310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	112289372	rs9869579	G	A	2022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=18;PP=1610;SC=CATTTACACCGTGTTTCTTTC;SOR=2.035;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=46;TCR=18;TR=64;WE=112289380;WS=112289362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	112301458	rs5851844	C	CCTTAGTAAT	3868.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=1;PP=2900;SC=TAAGGTTTTCCCTTTAAAAAT;SOR=7.083;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=65;TCF=62;TCR=3;TR=51;WE=112301466;WS=112301448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	112338027	rs13084615	T	C	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=792;SC=GGTGAAGGCTTTGGGCCTAAT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=112338035;WS=112338017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	112415652	rs10934180	G	C	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=58.18;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=24;ReadPosRankSum=-1.383;SC=ATCAGGAGCTGAAAGAGGACA;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=3;WE=112415660;WS=112415642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr3	112538571	rs35585943	CT	C	697.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=2;PP=539;SC=TACAATGATACTTTTTTTTTT;SOR=4.407;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=26;WE=112538579;WS=112538561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	112545910	rs58161637	GT	G	389.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.701;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=319;ReadPosRankSum=-0.212;SC=CAGTAGACTTGTGGCCCTCCC;SOR=1.250;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=9;WE=112545918;WS=112545900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr3	112546473	rs1997281	G	A	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.037;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.183;NF=29;NR=8;PP=687;ReadPosRankSum=-0.259;SC=TTCTTAATGCGATAGGAGGGC;SOR=1.088;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=108;TCF=80;TCR=28;TR=37;WE=112546481;WS=112546463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,38:0.34:112
chr3	112642568	rs9865242	C	G	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=284;ReadPosRankSum=1.354;SC=TGTAATGCCTCAGATGCCTTC;SOR=0.760;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=39;TCF=19;TCR=20;TR=13;WE=112642576;WS=112642558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,13:0.32:40
chr3	112647832	rs9826308	A	C	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.883;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=173;ReadPosRankSum=0.267;SC=TCCAGGAGATATGCGCAGCTG;SOR=0.521;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=12;WE=112647840;WS=112647822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr3	112647988	rs9868053	C	T	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.629;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.667;NF=11;NR=2;PP=200;ReadPosRankSum=0.964;SC=CATTTGTTTCCGTCACAAATC;SOR=0.073;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=48;TCF=43;TCR=5;TR=13;WE=112647996;WS=112647978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr3	112648125	rs6438117	G	T	2501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.97;ReadPosRankSum=0.405;SOR=0.934;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,72:0.32:228
chr3	112648125	.	GGT	TGG	2419	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=38;NR=26;PP=2419;QD=38.6323105447;SC=TGATGGCCACGGTACGAATCT;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=218;TCF=116;TCR=102;TR=64;WE=112648135;WS=112648115;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:154,64:0.29:218
chr3	112648127	rs4596117	T	G	2501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=4.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.721;SOR=0.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,70:0.31:223
chr3	112648222	rs2171509	T	C	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.162;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.189;NF=7;NR=21;PP=543;ReadPosRankSum=-0.315;SC=TGTTTCTTTCTTGTAGGCTTT;SOR=0.258;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=93;TCF=17;TCR=76;TR=28;WE=112648230;WS=112648212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,27:0.28:95
chr3	112666859	rs2133946	C	T	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=310;ReadPosRankSum=0.280;SC=TTTTCACATTCTTCAGACTAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=16;WE=112666867;WS=112666849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,16:0.33:49
chr3	112693753	rs62263759	A	T	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=35;PP=860;ReadPosRankSum=-0.099;SC=TCCTCCACACAGGTACAGAAG;SOR=1.412;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=61;TCF=8;TCR=53;TR=39;WE=112693761;WS=112693743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,41:0.62:66
chr3	112709828	rs2272393	C	G	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=393;SC=TCTCTCTGCCCGTCTTCTGGG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=112709836;WS=112709818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	112710242	rs2248029	T	C	3787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-6.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=84;PP=2877;ReadPosRankSum=0.415;SC=ACCGCTTCCCTGGCCGTCCGG;SOR=0.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=220;TCF=94;TCR=126;TR=146;WE=112710250;WS=112710232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,150:0.66:226
chr3	112727184	rs2306857	A	T	6760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=145;PP=2965;SC=CTTTGCACAAAACTTTTGGCA;SOR=1.664;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=214;TCF=69;TCR=145;TR=214;WE=112727192;WS=112727174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr3	112732309	rs5851869	GT	G	498.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=1.099;QD=10.18;ReadPosRankSum=-0.521;SOR=2.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,36:0.73:49
chr3	112738318	rs2293560	C	T	2582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=8;PP=2241;SC=CACCCCCGCCCACATGCGCCG;SOR=4.119;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=70;TCR=8;TR=78;WE=112738326;WS=112738308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	112738625	rs7633507	C	T	1053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=30;PP=893;SC=AGGAGCCCGGCGGGAGGCTGC;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=112738633;WS=112738615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	112935114	rs146281507	TAGA	T	4223.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.692;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.791;NF=22;NR=48;PP=2968;ReadPosRankSum=-1.790;SC=AGCTCGAAAGTAGAAGAAGTG;SOR=0.445;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=141;TCF=40;TCR=101;TR=70;WE=112935124;WS=112935104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,107:0.62:172
chr3	112935138	rs4682130	C	G	4962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=106;PP=2965;SC=GAGGTTTTCTCTTCAGTCTGA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=53;TCR=106;TR=159;WE=112935146;WS=112935128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr3	112991312	rs3814398	C	T	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.711;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=10;PP=1237;ReadPosRankSum=2.284;SC=AAACCATCATCGTCACCAAAG;SOR=0.410;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=77;TCF=65;TCR=12;TR=53;WE=112991320;WS=112991302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,54:0.68:79
chr3	112991842	rs11717833	A	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=146;ReadPosRankSum=1.150;SC=GCTCCTAACTACATCCCTCCC;SOR=0.160;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=6;WE=112991850;WS=112991832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr3	112991959	rs11710894	C	T	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.234;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=694;ReadPosRankSum=-0.892;SC=TGGTCATCCCCTGGGGCCAGA;SOR=0.328;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=34;WE=112991968;WS=112991949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,35:0.71:49
chr3	112997554	rs775228	A	G	2846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.621;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=59;PP=2259;ReadPosRankSum=-0.275;SC=TGGCCAGCAAAGAGCAGCAGA;SOR=0.619;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=157;TCF=65;TCR=92;TR=102;WE=112997562;WS=112997544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,104:0.65:160
chr3	112998090	rs3856720	T	C	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.405;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=297;ReadPosRankSum=2.667;SC=ATACGGTCTTTCCCAGCCCCA;SOR=2.955;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=14;WE=112998098;WS=112998080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr3	112998265	rs2649878	A	G	1560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.972;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=45;PP=1199;ReadPosRankSum=1.842;SC=CCATCCCCCCATCGCGGCTGT;SOR=0.964;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=92;TCF=28;TCR=64;TR=63;WE=112998273;WS=112998255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,62:0.69:90
chr3	112999611	rs775229	A	G	1838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=57;PP=1512;ReadPosRankSum=-0.485;SC=ATAAACCTGCATCTGGTGTGA;SOR=0.635;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=90;TCF=12;TCR=78;TR=66;WE=112999619;WS=112999601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,66:0.73:90
chr3	113003595	rs775222	G	C	3219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.383;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=29;PP=2626;ReadPosRankSum=-0.762;SC=GGACTCCCCGGCGTGGCCGTC;SOR=0.443;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=174;TCF=135;TCR=39;TR=117;WE=113003603;WS=113003585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,118:0.66:179
chr3	113005743	rs146459508	G	GT	1645.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.281;NF=9;NR=26;PP=980;ReadPosRankSum=0.132;SC=ACTATATATTGTTTTTTTTTT;SOR=0.623;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=16;TCR=49;TR=35;WE=113005762;WS=113005733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,40:0.73:55
chr3	113005754	rs5022662	A	T	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.85;MQRankSum=1.439;QD=26.64;ReadPosRankSum=1.003;SOR=0.899;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,45:0.73:62
chr3	113010303	rs17321330	G	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=105;ReadPosRankSum=-0.046;SC=ACTTTCAGGCGAGTTCAGTTT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=8;WE=113010311;WS=113010293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr3	113010466	rs2291905	T	C	1965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=49;PP=1463;SC=AGGATAAGACTGCCTTTCCTA;SOR=2.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=18;TCR=49;TR=67;WE=113010474;WS=113010456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr3	113012797	rs810209	G	A	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=11;PP=560;SC=CTTAGCACCTGCATTTTAAAC;SOR=0.846;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=25;WE=113012805;WS=113012787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	113012974	rs775217	A	G	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=344;SC=TAGAGTTTGGAATATGCTATA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=113012982;WS=113012964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	113013848	rs11398178	A	AT	1453.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=37;PP=1695;SC=TTGATTAAAGATAAGAATATA;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=37;WE=113013856;WS=113013838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	113015436	rs808949	G	C	3873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=115;NR=5;PP=2965;SC=CAAGGCCTAAGATCCTGGGGC;SOR=5.943;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=115;TCR=5;TR=120;WE=113015444;WS=113015426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr3	113015553	rs808950	A	C	12202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=219;NR=171;PP=2965;SC=CCAAAGATCAACCCCCTTCTC;SOR=0.970;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=390;TCF=219;TCR=171;TR=390;WE=113015561;WS=113015543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,397:1.00:397
chr3	113015660	rs2270781	G	A	4731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.397;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=120;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.101;SC=AACAGAAAGCGTTTGAAGGGC;SOR=0.525;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=264;TCF=73;TCR=191;TR=170;WE=113015668;WS=113015650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,178:0.64:277
chr3	113022870	rs4682484	T	C	2954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=72;PP=2262;SC=CTGGAGCTCATGGATTCGTTC;SOR=1.774;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=29;TCR=72;TR=101;WE=113022878;WS=113022860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr3	113022996	rs2270782	G	A	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=23;PP=685;SC=AAAGAAAATAGACAAAAACAC;SOR=3.767;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=113023004;WS=113022986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	113027214	rs775231	A	C	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=463;SC=TAGTCACTAGAAAAATAACTC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=113027236;WS=113027204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	113027228	rs73235039	A	G	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.78;ReadPosRankSum=0.993;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr3	113092197	rs1463640	A	G	1100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=2;PP=913;ReadPosRankSum=-0.261;SC=ATCCATGATGAACAAAAGCAT;SOR=1.022;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=45;TCF=43;TCR=2;TR=37;WE=113092205;WS=113092187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,37:0.82:45
chr3	113119301	rs7647220	C	T	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.740;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=255;ReadPosRankSum=-0.138;SC=GGAAAATCCCCAAATGCTCTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=10;WE=113119309;WS=113119291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr3	113125966	rs73237123	A	G	1862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=60;PP=1434;ReadPosRankSum=-0.277;SC=AAACATTTACATATTTCATAG;SOR=0.796;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=7;TCR=87;TR=65;WE=113125974;WS=113125956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,68:0.69:98
chr3	113135345	rs12635786	A	C	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.137;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=642;ReadPosRankSum=0.796;SC=TTGAACATGAAATATTTAAAT;SOR=0.847;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=54;TCF=29;TCR=25;TR=30;WE=113135353;WS=113135335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
chr3	113135543	rs12630518	G	A	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=161;ReadPosRankSum=0.301;SC=GATTAATGCAGTATTTAGCAT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=8;WE=113135551;WS=113135533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr3	113145006	rs73239107	C	T	2326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=20;PP=1785;ReadPosRankSum=0.026;SC=TGTTTGAATCCAGAGTCACAA;SOR=0.687;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=100;TCR=34;TR=79;WE=113145014;WS=113144996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,85:0.61:140
chr3	113146130	rs59722850	T	C	1170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=38;PP=925;ReadPosRankSum=-1.400;SC=CCTTCCCCTTTGGTAAATGTT;SOR=0.706;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=91;TCF=24;TCR=67;TR=51;WE=113146138;WS=113146120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,51:0.54:94
chr3	113152596	rs2291413	T	A	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=30;PP=767;ReadPosRankSum=0.180;SC=CATATTTCATTAGCACCAAAC;SOR=0.515;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=32;WE=113152604;WS=113152586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,33:0.73:45
chr3	113164109	rs2054823	A	G	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.173;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=10;PP=1036;ReadPosRankSum=-0.410;SC=AGGGAAAGGGAAGTAATAAAT;SOR=1.058;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=77;TCF=58;TCR=19;TR=46;WE=113164117;WS=113164099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,52:0.63:83
chr3	113169372	.	GA	G	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=6.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.60;ReadPosRankSum=0.140;SOR=0.140;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,17:0.19:89
chr3	113207758	rs7625841	G	A	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.487;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=5;PP=1046;ReadPosRankSum=1.195;SC=GAAAAAACCTGAGAGTTGTAA;SOR=1.258;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=66;TCF=58;TCR=8;TR=44;WE=113207766;WS=113207748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,44:0.65:68
chr3	113211953	rs3732804	C	T	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=287;ReadPosRankSum=0.282;SC=ACAACTAGCACTTGTTGATAT;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=13;WE=113211961;WS=113211949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr3	113233563	rs2306069	C	T	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=25;PP=691;ReadPosRankSum=-0.950;SC=CGCTCCCGGTCCCAAAGCACC;SOR=0.848;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=7;TCR=42;TR=29;WE=113233571;WS=113233553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr3	113251962	rs61738949	C	A	3313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.632;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=22;PP=2642;ReadPosRankSum=-1.797;SC=CCCCAGGCAGCCCCCGGCACC;SOR=0.513;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=188;TCF=157;TCR=31;TR=121;WE=113251970;WS=113251952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,122:0.64:190
chr3	113285423	rs2271495	T	C	2107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.662;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=49;PP=1636;ReadPosRankSum=-0.956;SC=CTTCACTATGTTTAGTTTTCT;SOR=0.929;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=108;TCF=37;TCR=71;TR=74;WE=113285431;WS=113285413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,78:0.67:116
chr3	113286405	rs2292511	C	T	1560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.076;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=23;PP=1210;ReadPosRankSum=0.212;SC=GGAGCTACAACTATCAAGAAG;SOR=1.160;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=90;TCF=50;TCR=40;TR=57;WE=113286413;WS=113286395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,60:0.64:94
chr3	113300183	rs2271494	A	T	1632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.105;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=17;PP=1282;ReadPosRankSum=0.653;SC=GATGCTTTCCATTTTATTCCT;SOR=0.216;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=76;TCF=56;TCR=20;TR=57;WE=113300191;WS=113300173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,58:0.73:79
chr3	113313947	rs2614193	C	T	649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=528;SC=AACCTACTTTCAGAATTAAGA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=113313955;WS=113313937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	113322006	rs17325765	T	G	3867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.869;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=81;PP=2883;ReadPosRankSum=-2.692;SC=AGGTACCCACTCTGCCTCGCC;SOR=0.844;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=203;TCF=93;TCR=110;TR=144;WE=113322014;WS=113321996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,154:0.72:214
chr3	113331289	rs9842516	T	G	1930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.007;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=55;PP=1503;ReadPosRankSum=1.544;SC=CAGAGATGAGTTGTACCTCCA;SOR=1.037;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=111;TCF=20;TCR=91;TR=65;WE=113331297;WS=113331279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,70:0.60:116
chr3	113373930	rs930818	A	G	7392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=151;NR=92;PP=2965;SC=ATCAGGAAGCACTGTGGCTAT;SOR=1.345;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=244;TCF=151;TCR=93;TR=243;WE=113373938;WS=113373920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr3	113376110	rs10606566	TTGC	T	2401.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=31;PP=2630;SC=GTTGTTGCTGTTGCTGCTGCT;SOR=1.047;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=87;TCF=28;TCR=59;TR=50;WE=113376120;WS=113376100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	113499458	rs1430944	G	A	762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=5;PP=585;SC=CTTTAGGTCTGTCTCTCAAAG;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=113499466;WS=113499448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr3	113557787	rs66781755	AGCC	A	6204.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=31;PP=2948;SC=CCGTCAGGTAAGCCGCGGGCC;SOR=2.353;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=120;TCF=83;TCR=37;TR=108;WE=113557797;WS=113557777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr3	113594377	rs13079383	A	G	1355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.038;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=30;PP=978;ReadPosRankSum=-2.002;SC=AGGGACGACTATACCTTTCAG;SOR=0.646;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=132;TCF=67;TCR=65;TR=55;WE=113594385;WS=113594367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,57:0.41:139
chr3	113595156	rs2712350	C	G	2134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=54;PP=1667;SC=AAGAAAATCTCCCTCATACTC;SOR=3.327;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=8;TCR=54;TR=62;WE=113595164;WS=113595146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	113609403	rs9862440	G	A	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.890;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=159;ReadPosRankSum=0.179;SC=ACCGTGGGGTGCTCTATTCTA;SOR=0.052;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=11;WE=113609411;WS=113609393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr3	113619872	rs2632244	C	T	1488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=5;PP=1128;SC=TTTTCTGTCACTTTAGAGCCT;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=42;WE=113619880;WS=113619862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	113631884	rs2712341	A	C	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=2;PP=751;ReadPosRankSum=0.320;SC=TAACATAGAGACTGCTTTATT;SOR=0.970;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=58;TCF=54;TCR=4;TR=32;WE=113631892;WS=113631874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr3	113655207	rs3765114	C	T	1832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.547;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=39;PP=1377;ReadPosRankSum=0.055;SC=GAACCTTCAACCGAACAGCAG;SOR=0.479;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=241;TCF=133;TCR=108;TR=78;WE=113655215;WS=113655197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,83:0.34:244
chr3	113656833	rs1963015	C	G	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.200;NF=7;NR=0;PP=103;ReadPosRankSum=-0.029;SC=GCCTGGGCAACAAGAGCGAAA;SOR=0.202;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=7;WE=113656841;WS=113656823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr3	113659308	rs2029228	G	C	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=351;ReadPosRankSum=-1.367;SC=CCCCCTGCTAGAGCCAACTAC;SOR=0.190;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=16;WE=113659316;WS=113659298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,15:0.31:49
chr3	113664183	rs68028538	CAG	C	548.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.553;NF=17;NR=0;PP=619;ReadPosRankSum=0.904;SC=GCATAAAAAACAGAAATTTTC;SOR=0.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=59;TCR=1;TR=17;WE=113664192;WS=113664173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,17:0.30:56
chr3	113673125	rs11921691	A	G	6292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=82;PP=2965;ReadPosRankSum=0.637;SC=GGCTCTTCCAAGATGCCAGCT;SOR=0.343;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=106;TCR=82;TR=186;WE=113673133;WS=113673115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,194:0.99:195
chr3	113679725	rs3732785	C	T	2065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=56;PP=1725;SC=GATGAGTGATCTTGTGTGGGA;SOR=4.582;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=4;TCR=56;TR=60;WE=113679733;WS=113679715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	113720624	rs6438178	C	T	3945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=105;PP=2965;SC=GATAGTCAAGCGTCTACCAAA;SOR=4.443;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=11;TCR=105;TR=116;WE=113720632;WS=113720614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr3	113775149	.	G	C	1435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=6.227;ClippingRankSum=0.000;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.755;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=2;PP=1194;ReadPosRankSum=1.088;SC=AAGCACAGACGGGCCGCGACT;SOR=0.263;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=81;TCF=79;TCR=2;TR=52;WE=113775157;WS=113775139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,52:0.63:82
chr3	113784007	rs34428541	A	AT	778.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=10.792;HP=12;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.598;NF=34;NR=0;PP=558;ReadPosRankSum=-1.262;SC=TTTCCTGAAGATTTTTTTTTT;SOR=6.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=34;WE=113784015;WS=113783997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,33:0.92:36
chr3	113795834	rs7631864	G	A	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=26;PP=753;SC=GGGATGCAGGGAAGGAGTGCT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=113795842;WS=113795824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	113801826	rs13086657	C	T	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=12;PP=746;SC=TTGTAGACTTCGTCTTGTCAG;SOR=1.244;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=33;WE=113801834;WS=113801816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	113801965	rs13071100	T	C	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=279;SC=AAGTTTTAAATTGTAGGGTGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=113801973;WS=113801955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	113858350	rs2251177	C	T	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=607;SC=TACTTACTTGCTGGGGGAAGC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=113858358;WS=113858340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	113890815	rs6280	C	T	1669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=35;PP=1372;SC=TTCAGGTGGCCACTCAGCTGG;SOR=1.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=50;WE=113890823;WS=113890805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	113955055	rs11316836	GA	G	585.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=3.407;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=1.249;QD=8.49;ReadPosRankSum=0.215;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,37:0.54:69
chr3	113955164	rs3732782	T	G	2245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=41;PP=1766;ReadPosRankSum=-1.333;SC=GTAGCCAAAGTCCTTTCTATG;SOR=0.740;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=157;TCF=77;TCR=80;TR=81;WE=113955172;WS=113955154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,83:0.51:162
chr3	113955265	rs6438190	G	A	2065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-6.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.415;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=45;PP=1564;ReadPosRankSum=-0.878;SC=CACATTCTTTGCACTCGTAGG;SOR=0.412;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=125;TCF=51;TCR=74;TR=79;WE=113955273;WS=113955255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,82:0.63:130
chr3	113955320	rs6438191	C	T	1998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.257;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=38;PP=1622;ReadPosRankSum=1.673;SC=GAAAACAGAGCGGTAGGTGAA;SOR=0.522;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=123;TCF=65;TCR=58;TR=75;WE=113955328;WS=113955310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,78:0.60:129
chr3	113955820	rs3732780	G	C	2124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.298;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=42;PP=1467;ReadPosRankSum=-0.289;SC=TTGGTCCCTGGGAGTCACATT;SOR=0.451;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=134;TCF=72;TCR=62;TR=87;WE=113955828;WS=113955810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,89:0.65:137
chr3	113955975	rs76061345	C	T	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=29;PP=718;ReadPosRankSum=-1.300;SC=AAGTGCCCTTCTGCATTTCCA;SOR=0.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=31;WE=113955983;WS=113955965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,32:0.62:52
chr3	114026673	rs11714612	A	G	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.524;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=7;PP=1008;ReadPosRankSum=-0.689;SC=GAAGAGAGAGATGTCATATTG;SOR=0.407;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=60;TCF=51;TCR=9;TR=41;WE=114026681;WS=114026663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,40:0.68:59
chr3	114027065	rs35641088	C	CGTGT	363.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.521;NF=1;NR=11;PP=545;ReadPosRankSum=-0.054;SC=ATCAGTGCTGCGTGTGTGTGT;SOR=0.412;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=12;WE=114027073;WS=114027055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr3	115561556	rs2944401	A	G	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.166;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=337;ReadPosRankSum=-0.164;SC=CTCCATTTGTATGAATTATGT;SOR=3.202;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=15;WE=115561564;WS=115561546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr3	115571364	rs3821560	C	T	1822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=26;PP=1410;ReadPosRankSum=0.518;SC=TGACATCCGCCGAGGAGACCT;SOR=0.702;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=69;TCR=44;TR=66;WE=115571372;WS=115571354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,68:0.59:115
chr3	116163634	.	GAC	G	641	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=28;MQ=62.45;NF=39;NR=6;PP=641;QD=14.3555555556;SC=AAGGAGATCAGACACACACAC;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=58;TCF=48;TCR=10;TR=45;WE=116163674;WS=116163624;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,45:0.78:58
chr3	116163653	.	AC	A	645.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.572;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=5.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.91;MQRankSum=1.971;QD=16.56;ReadPosRankSum=1.255;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
chr3	116163655	.	ACAAACACACAC	A	566.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=8.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.91;MQRankSum=0.881;QD=12.59;ReadPosRankSum=1.367;SOR=2.851;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr3	116728295	rs11381408	G	GA	452.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=476;ReadPosRankSum=1.341;SC=CTTAATTAAAGAAAAAATACC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=18;WE=116728303;WS=116728285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr3	118381320	rs28380350	C	A	4352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.108;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=54;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.758;SC=TCACACAAGGCAGGAATGAAG;SOR=0.318;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=67;TCR=55;TR=121;WE=118381328;WS=118381310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,134:0.99:135
chr3	118621500	rs34908332	C	T	1486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.826;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=29;PP=1158;ReadPosRankSum=1.335;SC=TGAGCCATTGCTCCTGGACAT;SOR=0.851;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=200;TCF=104;TCR=96;TR=65;WE=118621508;WS=118621490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,67:0.32:207
chr3	118621664	rs36052974	C	A	6281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=133;NR=87;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.417;SC=GGCTGACTGACTCTGTGTTTC;SOR=0.800;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=332;TCF=199;TCR=133;TR=220;WE=118621672;WS=118621654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,231:0.67:347
chr3	118621833	rs73185803	T	C	2330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.867;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=83;PP=1669;ReadPosRankSum=-0.772;SC=ATAAAGTCGTTGTTAGGATTT;SOR=0.905;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=18;TCR=138;TR=94;WE=118621841;WS=118621823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,100:0.60:166
chr3	118624369	rs62275716	C	T	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=277;ReadPosRankSum=0.078;SC=TCAGCAGAACCCTTCATTTTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=14;WE=118624377;WS=118624359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr3	118624631	rs6782002	G	A	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=28;PP=841;ReadPosRankSum=1.064;SC=AGAAATCAGCGGAAGACCATA;SOR=0.748;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=59;TCF=17;TCR=42;TR=40;WE=118624639;WS=118624621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,43:0.70:61
chr3	118645118	rs9848979	A	G	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=249;ReadPosRankSum=0.062;SC=AACAGGAAGAATAAGCAATAA;SOR=1.148;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=12;WE=118645126;WS=118645108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr3	118645201	rs16829163	A	T	64.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5040;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=41;ReadPosRankSum=-0.319;SC=CCCTTAGATTACACTGTTTTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=118645209;WS=118645191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr3	118649060	rs2903250	G	T	3306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=75;PP=2629;SC=AGGACTGCTGGCTGACCCCGG;SOR=2.655;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=20;TCR=75;TR=95;WE=118649068;WS=118649050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr3	118753542	rs73185835	G	T	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=111;ReadPosRankSum=1.501;SC=CACACCCAGCGCCGGGCCGCT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=118753550;WS=118753532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr3	118824042	rs143862519	A	ATTC	4536.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.261;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.297;NF=22;NR=74;PP=2968;ReadPosRankSum=-0.145;SC=AGAGACATTTATTCTTCTTGC;SOR=1.263;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=170;TCF=40;TCR=130;TR=96;WE=118824050;WS=118824032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,113:0.65:175
chr3	118865801	rs4077931	C	T	1707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.383;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=1315;ReadPosRankSum=1.548;SC=AAAGACCTTCCGTACAGATTG;SOR=0.448;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=180;TCF=80;TCR=100;TR=70;WE=118865809;WS=118865791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,71:0.38:185
chr3	118865970	rs4077930	G	A	4376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.304;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=61;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.146;SC=CCAAGTGTACGGCCAAGCCAC;SOR=0.860;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=244;TCF=148;TCR=96;TR=156;WE=118865978;WS=118865960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,161:0.65:249
chr3	118866515	rs9864127	C	T	1901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=54;PP=1572;SC=AGGGGTACAACGGAAGGGCAC;SOR=8.121;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=0;TCR=54;TR=54;WE=118866523;WS=118866505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	118867047	rs9289122	C	G	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=273;ReadPosRankSum=-0.386;SC=CAGAAATTGACCAAGGAAAGG;SOR=1.290;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=46;TCF=23;TCR=23;TR=17;WE=118867055;WS=118867037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr3	118870025	rs11373158	A	AC	1585.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.020;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=3.539;NF=41;NR=10;PP=1824;ReadPosRankSum=-1.601;SC=TGACCACATAATTTTGCTCAG;SOR=1.253;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=145;TCF=108;TCR=37;TR=51;WE=118870033;WS=118870015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,55:0.33:166
chr3	118878789	rs13077000	C	T	951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.055;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=740;ReadPosRankSum=-0.530;SC=CTACAAAGAACGAGCCTCTCT;SOR=1.418;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=33;WE=118878797;WS=118878779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,34:0.74:46
chr3	118909159	rs9840317	A	G	1452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=20;PP=1073;SC=GCAACACAACAAGACTTTGTG;SOR=0.909;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=25;TCR=20;TR=45;WE=118909167;WS=118909149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	118909962	rs3796356	T	C	1831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=53;PP=1373;ReadPosRankSum=-0.932;SC=GTAAGACCTGTGGTCTTGGGG;SOR=2.242;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=8;TCR=54;TR=61;WE=118909970;WS=118909952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr3	118909987	rs3796357	C	T	1408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=39;PP=1165;SC=GCCATTTTTACTTACTGGTGG;SOR=5.235;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=40;WE=118909995;WS=118909977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	118912961	rs62263545	T	C	1086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=0;PP=893;SC=ATGTAAGATATGGTACACTTT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=118912969;WS=118912951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	118913337	rs7628485	A	G	925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=27;PP=789;SC=GTCTTTCAGTAAGGAATTCTA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=118913345;WS=118913327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	118922654	rs12186112	A	C	1348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=0;PP=1031;SC=AACAAACAAAAAAATCTGTTG;SOR=6.043;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=118922662;WS=118922644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	118930791	rs5868	G	C	1681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=1;PP=1325;SC=GCTATCAGCAGCTGCAACCAG;SOR=6.479;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=48;TCF=47;TCR=1;TR=46;WE=118930799;WS=118930781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	118931119	rs72655941	T	C	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=197;ReadPosRankSum=-0.881;SC=ATAGCGTTCATTTTATCCTTT;SOR=0.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=12;WE=118931127;WS=118931109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr3	118931389	rs6784208	C	T	4917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=74;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.749;SC=CACCAAAAGACCCAGGGTCAT;SOR=0.278;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=160;TCF=85;TCR=75;TR=158;WE=118931397;WS=118931379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,160:0.99:161
chr3	118935284	rs68075325	CACGCACAT	C	254.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.84;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	118935300	rs73187814	C	T	229.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.83;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	118948618	rs4422293	G	C	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=1;PP=998;ReadPosRankSum=0.441;SC=GAGATGTTTTGATACAGGCAA;SOR=0.446;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=67;TCF=66;TCR=1;TR=40;WE=118948626;WS=118948608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,42:0.61:69
chr3	119013928	rs3732412	A	T	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.559;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=323;ReadPosRankSum=0.325;SC=TCGAGTTGTGATAGAGTCGGT;SOR=0.336;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=64;TCF=15;TCR=49;TR=21;WE=119013936;WS=119013918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,23:0.33:69
chr3	119013987	rs10707359	CT	C	195.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.32;ReadPosRankSum=1.305;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr3	119084331	rs17203055	A	G	2090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.740;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=57;PP=1588;ReadPosRankSum=2.610;SC=GCCTCTGTCCATCGGTGTCCA;SOR=0.620;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=38;TCR=87;TR=82;WE=119084339;WS=119084321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,84:0.65:129
chr3	119118104	rs4688001	A	G	4510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=60;PP=2965;SC=CAGTGCCTGTAGAAGGTAAGA;SOR=0.996;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=78;TCR=60;TR=138;WE=119118112;WS=119118094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr3	119128628	rs1463139	A	G	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.23;ReadPosRankSum=-0.308;SOR=0.297;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,4:0.19:21
chr3	119128634	rs1463138	T	C	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.99;ReadPosRankSum=-0.759;SOR=0.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr3	119133183	rs3732413	G	A	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.813;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=629;ReadPosRankSum=0.088;SC=TTCAAAGGGCGGCCCGGAAAG;SOR=0.582;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=91;TCF=35;TCR=56;TR=34;WE=119133191;WS=119133173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,33:0.34:96
chr3	119133554	rs61740281	G	A	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.444;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=24;PP=988;ReadPosRankSum=1.173;SC=TGAAAGACGCGCACAAGGCCC;SOR=0.972;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=196;TCF=112;TCR=84;TR=63;WE=119133562;WS=119133544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,66:0.32:206
chr3	119171280	rs1919586	C	G	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=3.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.47;ReadPosRankSum=-1.495;SOR=1.097;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,38:0.26:145
chr3	119196334	rs3732419	G	T	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.638;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=177;ReadPosRankSum=0.221;SC=ATGGAGAGTGGTCCTCTAGGA;SOR=0.061;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=11;WE=119196342;WS=119196324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr3	119197285	rs4688005	A	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=4.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.15;ReadPosRankSum=-0.157;SOR=1.249;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,22:0.24:92
chr3	119198873	rs4688007	G	A	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.856;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=27;PP=1089;ReadPosRankSum=-1.619;SC=ACTGATTTAGGACGACCTGTC;SOR=0.761;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=170;TCF=88;TCR=82;TR=59;WE=119198881;WS=119198863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,58:0.35:167
chr3	119211384	rs11556604	T	G	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=199;ReadPosRankSum=1.880;SC=CTTGAATATCTGCTATCAAGC;SOR=0.733;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=15;WE=119211392;WS=119211374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,15:0.33:46
chr3	119305169	rs20569	G	A	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=314;ReadPosRankSum=0.355;SC=AGCTGAAGCCGGGCAAGCCCA;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=16;WE=119305177;WS=119305159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr3	119325907	rs2251566	G	A	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=27;PP=643;ReadPosRankSum=0.036;SC=GGCAACAAGGGGAGGAATGAA;SOR=1.230;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=53;TCF=3;TCR=50;TR=28;WE=119325915;WS=119325897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr3	119327604	rs5852212	GC	G	132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=2.928;QD=2.60;ReadPosRankSum=-0.243;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,10:0.20:51
chr3	119327653	rs1723969	T	C	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.942;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.087;NF=25;NR=7;PP=590;ReadPosRankSum=1.756;SC=TTGACACATTTATTAGAACCC;SOR=0.903;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=94;TCF=72;TCR=22;TR=32;WE=119327661;WS=119327643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,32:0.32:100
chr3	119328449	rs3832185	CAGGCTTT	C	628.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=3.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.31;ReadPosRankSum=0.525;SOR=0.474;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,19:0.31:61
chr3	119331874	rs2272270	C	T	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.355;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=435;ReadPosRankSum=0.672;SC=GCCTGGACCCCGCTGGACCTG;SOR=1.639;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=71;TCF=42;TCR=29;TR=25;WE=119331882;WS=119331864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,27:0.38:71
chr3	119331892	rs2272269	C	G	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.262;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=382;ReadPosRankSum=-0.275;SC=CTGAGTACACCAGGGCCAGTG;SOR=1.143;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=71;TCF=38;TCR=33;TR=28;WE=119331900;WS=119331882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,30:0.43:70
chr3	119332042	rs2272268	G	A	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=83;ReadPosRankSum=0.784;SC=TAGCTCTGTGGCCCTGGGCAG;SOR=0.204;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=8;WE=119332050;WS=119332032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr3	119334986	rs2247660	G	A	1419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=27;PP=1178;SC=TGGCAACCCCGGAGATTGAAA;SOR=1.280;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=44;WE=119334994;WS=119334976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	119336728	rs4688020	C	T	998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=0;PP=823;SC=CACTAATATTCTGAAAAAGTG;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=119336736;WS=119336718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	119338265	rs76752760	C	T	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=604;ReadPosRankSum=-0.382;SC=CCAGGACTCACCTTAGAATAC;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=28;WE=119338273;WS=119338255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,33:0.67:49
chr3	119338492	rs61733986	G	A	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.785;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=256;ReadPosRankSum=-2.208;SC=CCAGTGCTCCGTACTGCAGTG;SOR=2.271;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=14;WE=119338500;WS=119338482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr3	119338956	rs2280669	A	G	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=15;PP=847;SC=GCTCCTAACCATGGCATTTCC;SOR=1.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=43;WE=119338964;WS=119338946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	119339010	rs1877595	G	A	1567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=23;PP=1028;SC=TAAATGTGAAGTAAAAATGTG;SOR=0.859;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=20;TCR=23;TR=43;WE=119339018;WS=119339000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	119339054	rs1877594	C	T	1019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=20;PP=740;SC=CAAGCTAAACCGTCATCCTTC;SOR=1.483;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=31;WE=119339062;WS=119339044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	119348345	rs3054091	A	ATT	914.14	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=31.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.05;MQRankSum=0.000;QD=20.31;ReadPosRankSum=-1.870;SOR=1.780;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,34:0.76:45
chr3	119361250	rs8007	A	G	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=0;PP=504;SC=GAAAAGAGGCATGCCTATCAG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=119361258;WS=119361240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	119362318	rs67683909	A	G	1886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.45;SOR=2.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	119362369	rs6783324	G	A	966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=787;SC=CTTAAAATACGCTACACATTT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=119362377;WS=119362359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	119367390	rs2688643	T	C	3961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=53;PP=2965;SC=AGAGCTTCTCTGAGATGTCAT;SOR=1.005;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=76;TCR=53;TR=128;WE=119367398;WS=119367380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr3	119378872	rs1880040	G	A	6039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=100;NR=88;PP=2965;SC=CCTGCTCCTCGCAGCAGTGAA;SOR=0.846;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=188;TCF=100;TCR=88;TR=188;WE=119378880;WS=119378862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr3	119379186	rs4688023	C	T	3980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=90;PP=2965;SC=AGGTGGTAGACAGCCCCTTCC;SOR=1.628;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=41;TCR=91;TR=130;WE=119379194;WS=119379176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr3	119379352	rs4688024	C	T	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=453;SC=TCCATCCGCTCAGGGGTCTTC;SOR=5.421;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=119379360;WS=119379342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	119395799	rs2280578	A	C	2708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=72;PP=2143;SC=GTCAACAGAGACCCGACCACG;SOR=4.281;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=6;TCR=72;TR=78;WE=119395807;WS=119395789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr3	119395875	.	G	C	89.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.99;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	119395918	.	AAGAGGGCAGAGGGCAGAAGGC	A	413.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.89;QD=41.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	119421911	rs7624404	T	A	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=289;ReadPosRankSum=-1.414;SC=CCTGACCCGCTGGTCCCTTGC;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=13;WE=119421919;WS=119421901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr3	119421934	rs7634701	A	G	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=2.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=487;ReadPosRankSum=0.133;SC=GCGGGAGGAAAGAGGCGGCAC;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=20;WE=119421942;WS=119421924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr3	119421963	rs7612861	C	T	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=640;ReadPosRankSum=0.358;SC=ACGCAGTAACCATCGAGGAGC;SOR=0.582;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=28;WE=119421971;WS=119421953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,28:0.76:37
chr3	119422106	rs7612954	C	A	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.510;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=702;ReadPosRankSum=-1.166;SC=GCGTCCGTCGCCTCCTAGGCC;SOR=0.382;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=34;WE=119422114;WS=119422096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,39:0.75:52
chr3	119422204	rs7624672	T	C	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=316;SC=ACGGTTGTCCTTGGTCGGGTG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=119422212;WS=119422194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	119426307	rs9848716	T	C	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.237;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=301;ReadPosRankSum=-0.992;SC=ATCCAAGATATTCTCTATATT;SOR=0.460;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=24;TCR=16;TR=17;WE=119426315;WS=119426297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr3	119428529	rs6786722	C	A	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=448;ReadPosRankSum=1.797;SC=CCTCCCCACCCTGCAGTGATT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=20;WE=119428537;WS=119428519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr3	119434527	rs6438544	G	C	2333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=31;PP=1815;SC=TCCATACTCTGCAGAATATGT;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=39;TCR=31;TR=70;WE=119434535;WS=119434517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	119459639	rs34948068	A	T	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=415;ReadPosRankSum=2.000;SC=TAATGAAATGATGAAAAAGAA;SOR=0.458;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=18;WE=119459647;WS=119459629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr3	119459682	.	T	TTGTGTGTG	42.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.37;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,1:0.50:2
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chr3	119501780	rs2472668	G	A	1941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=42;PP=1461;SC=AGTGCCACCAGGTCCTTCTTC;SOR=2.507;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=54;WE=119501788;WS=119501770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	119501798	rs2461831	T	A	1699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=41;PP=1291;SC=TTCTCTCCACTTTACAGCCCA;SOR=3.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=8;TCR=41;TR=49;WE=119501806;WS=119501788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	119529113	rs3732356	G	T	1980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=59;PP=1641;SC=CGTGGGTGTGGGCATGCTTGT;SOR=8.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=0;TCR=59;TR=59;WE=119529121;WS=119529103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	119531709	rs61755051	C	T	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.179;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=27;PP=1099;ReadPosRankSum=1.217;SC=CCGACAGTGGCGGGAAAGAGA;SOR=0.440;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=71;TCF=32;TCR=39;TR=51;WE=119531717;WS=119531699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,54:0.73:74
chr3	119533733	rs6785049	G	A	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=155;ReadPosRankSum=-0.858;SC=TCTTCCTCTCGCCCCCAACTT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=9;WE=119533741;WS=119533723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr3	119533773	rs6797879	T	C	1441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=6;PP=1156;SC=CTGGTGCCGGTCTGTGGGCTG;SOR=3.516;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=45;WE=119533781;WS=119533763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	119533910	rs4058490	T	C	3683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=60;PP=2786;SC=CAGTGTTCAATGCGGAGACTG;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=125;TCF=65;TCR=60;TR=125;WE=119533918;WS=119533900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr3	119534153	rs2276707	C	T	1267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.883;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=944;ReadPosRankSum=-0.657;SC=GCCCCTCCATCCTGTTACCAT;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=43;WE=119534161;WS=119534143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,46:0.79:58
chr3	119595503	rs1719895	A	G	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	119721171	rs12108149	T	C	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=646;ReadPosRankSum=0.770;SC=AGGTAAACTATATTCTTTATT;SOR=2.242;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=1;TCR=46;TR=27;WE=119721179;WS=119721161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr3	119886548	rs9858566	G	C	7538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=128;NR=100;PP=2965;SC=GGCTAAAGCCGAGCTCCTTGG;SOR=1.018;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=230;TCF=129;TCR=101;TR=228;WE=119886556;WS=119886538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr3	119886776	rs902790	T	A	5020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=114;PP=2965;SC=AGCCGCCTCTTTCTGGTAGGA;SOR=2.185;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=42;TCR=114;TR=155;WE=119886784;WS=119886766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr3	119900212	rs1488765	G	C	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=165;ReadPosRankSum=-1.373;SC=GCAGACCCTGGGGGGTGAAGA;SOR=1.765;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=12;WE=119900220;WS=119900202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr3	119900260	rs1488764	T	C	200.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=180;SC=AAGAGGTCAATGAGCAGTAGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=119900268;WS=119900250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	119904125	rs902791	A	G	4370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=67;PP=2965;SC=GACAGAGACCATATCAGATGT;SOR=0.801;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=148;TCF=80;TCR=68;TR=147;WE=119904133;WS=119904115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr3	119904315	rs902792	G	C	2011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=48;PP=1567;SC=TTGTGAACATGCTGGAGCATG;SOR=3.021;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=11;TCR=48;TR=59;WE=119904323;WS=119904305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	119904366	rs5852234	A	ACTG	137.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.002;NF=0;NR=6;PP=200;ReadPosRankSum=0.505;SC=GTATGTAAAAACTGCAGCATT;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=6;WE=119904374;WS=119904356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr3	119905641	rs2319542	G	A	1863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=32;PP=1472;SC=CTGCAAAAGAGTCAAGGTCAA;SOR=0.906;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=24;TCR=32;TR=56;WE=119905649;WS=119905631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	119911667	rs2319543	G	A	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=0;PP=546;SC=ATGAGAAACAGGAACTTTGGA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=119911675;WS=119911657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	119912297	rs902793	C	A	2067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=65;PP=1620;ReadPosRankSum=1.346;SC=AAGAAAGACACTTACAGCCAT;SOR=0.655;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=113;TCF=8;TCR=105;TR=71;WE=119912305;WS=119912287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,74:0.63:117
chr3	120123953	rs1147701	T	A	1955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=58;PP=1647;SC=TCAGAGGGCCTTGGCAACAAA;SOR=6.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=59;TCF=1;TCR=58;TR=59;WE=120123961;WS=120123943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	120130899	rs1259326	T	C	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=675;SC=CACACACACATACATGCACAC;SOR=6.358;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=22;WE=120130907;WS=120130889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	120169641	rs1147708	T	C	5947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=113;PP=2965;SC=GGCCCCGCGCTGACCTGGGAA;SOR=0.928;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=90;TCR=113;TR=203;WE=120169649;WS=120169631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr3	120320939	rs12762	C	T	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.382;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=301;ReadPosRankSum=-1.296;SC=GTCAGTTGTACGGTGGGTTGT;SOR=0.269;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=16;WE=120320947;WS=120320929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr3	120369575	rs3817627	T	G	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=8.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.68;ReadPosRankSum=1.056;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:168,59:0.26:227
chr3	120371369	rs1054095	G	A	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.588;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=296;ReadPosRankSum=0.992;SC=CATTCAGGCTGCAAATGGTTG;SOR=0.317;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=55;TCF=36;TCR=19;TR=20;WE=120371377;WS=120371359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
chr3	120371414	rs2551607	G	A	1997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=33;PP=1575;SC=GAGCAGTAGGGAGGGTGTGGA;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=28;TCR=33;TR=61;WE=120371422;WS=120371404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	120389316	rs2255543	T	A	3008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=48;PP=2378;SC=TGTGAGTGACTTGGCCTTCGT;SOR=0.714;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=46;TCR=48;TR=94;WE=120389324;WS=120389306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr3	120389491	rs17140269	A	G	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=355;ReadPosRankSum=-0.531;SC=AACGACCTGTAGGCTCTAATG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=14;WE=120389499;WS=120389481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr3	120394521	rs17140396	T	C	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=219;ReadPosRankSum=0.326;SC=TTGGGAAACCTCTAGACAGTT;SOR=1.885;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=10;WE=120394529;WS=120394511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr3	120413158	rs7612975	G	A	1884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=42;PP=1490;SC=GCATATTTCTGTAGGCATAAT;SOR=2.303;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=56;TCF=13;TCR=43;TR=55;WE=120413166;WS=120413148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	120428621	rs11720353	T	C	1278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.594;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=12;PP=923;ReadPosRankSum=-0.925;SC=TTTAAAAATGTTTTACCATTT;SOR=0.113;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=71;TCF=56;TCR=15;TR=43;WE=120428629;WS=120428611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,48:0.62:77
chr3	120461522	rs114707519	T	C	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=360;ReadPosRankSum=-1.192;SC=AGCGGGGTGCTTCCCCAGCTG;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=2;TCR=57;TR=19;WE=120461530;WS=120461512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,19:0.31:62
chr3	120461576	rs7647895	T	C	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=417;ReadPosRankSum=-0.624;SC=AGGGGCGTGGTTCATTTAAGC;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=16;WE=120461584;WS=120461566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr3	120500093	rs3732401	C	T	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=3.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.56;ReadPosRankSum=2.466;SOR=0.417;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,24:0.20:120
chr3	120500446	rs2229308	T	A	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=71;ReadPosRankSum=-0.605;SC=TGTGCAAAGATTGATGGTAGA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=120500454;WS=120500436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr3	120760495	rs1688679	T	G	1681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=3;PP=1319;SC=TCTTTGCTCATTAATATTGGT;SOR=4.935;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=44;WE=120760503;WS=120760485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	121100283	rs17740066	G	A	4416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.007;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=72;PP=2962;ReadPosRankSum=1.024;SC=TTGTCTGTTCGTTGGAACCAG;SOR=0.751;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=228;TCF=118;TCR=110;TR=160;WE=121100291;WS=121100273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,164:0.69:236
chr3	121195302	rs71678533	TAC	T	58.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;QD=1.51;ReadPosRankSum=0.868;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,7:0.18:39
chr3	121202433	rs201304336	TA	T	484.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=5.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=0.525;QD=9.50;ReadPosRankSum=1.256;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,37:0.73:51
chr3	121238749	rs702018	G	A	4085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=56;PP=2965;SC=TGCCAGCACGGCCAACCATCT;SOR=0.929;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=130;TCF=73;TCR=57;TR=129;WE=121238757;WS=121238739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr3	121263720	rs702017	C	A	5281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=135;PP=2965;SC=TAGCTTGTCTCTTTCGTAGTC;SOR=2.792;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=171;TCF=36;TCR=135;TR=171;WE=121263728;WS=121263710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr3	121289829	rs9812322	G	T	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.49;ReadPosRankSum=1.302;SOR=0.096;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,19:0.23:81
chr3	121295683	.	C	T	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.473;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=200;ReadPosRankSum=0.406;SC=CGGCTTACTGCAGCCTCAACC;SOR=1.659;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=11;WE=121295691;WS=121295673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr3	121295834	rs67439929	C	T	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.398;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=409;ReadPosRankSum=-0.421;SC=AGAGCAAGACCTTGTCTCTAA;SOR=0.088;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=22;WE=121295842;WS=121295824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,23:0.79:29
chr3	121295864	rs116776770	T	G	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=1.052;SC=TAAAATAAATTAAGATAATGG;SOR=0.193;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=5;WE=121295872;WS=121295854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr3	121304933	rs9813391	G	A	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=3.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.62;ReadPosRankSum=0.199;SOR=1.156;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,31:0.24:131
chr3	121339354	rs7640859	T	C	1360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.448;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=6;PP=948;ReadPosRankSum=-1.540;SC=AACCTAACTGTTTTTCTTACT;SOR=0.098;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=57;TCF=51;TCR=6;TR=41;WE=121339362;WS=121339344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,47:0.76:62
chr3	121339520	rs35295338	A	C	1860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.893;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=48;PP=1482;ReadPosRankSum=0.922;SC=ACTTGCTCTTATGGTTTGATG;SOR=0.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=101;TCF=28;TCR=73;TR=66;WE=121339528;WS=121339510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,67:0.66:102
chr3	121340536	rs4676684	T	C	2386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.596;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=63;PP=1831;ReadPosRankSum=1.641;SC=CACCTGCAGGTGTGCCCCGCC;SOR=1.371;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=125;TCF=47;TCR=78;TR=96;WE=121340544;WS=121340526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,97:0.77:126
chr3	121350593	rs1128158	C	A	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=144;ReadPosRankSum=-1.655;SC=CTGTCCAGAACCTCATCTGGT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=8;WE=121350601;WS=121350583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr3	121350616	rs1128154	G	T	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=266;ReadPosRankSum=0.678;SC=GACATTTGCAGCAGGAATAGG;SOR=0.846;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=14;WE=121350624;WS=121350606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr3	121350966	rs9869984	C	G	2184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=43;PP=1778;SC=TAATCATATACAGCCACAGCT;SOR=1.574;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=20;TCR=43;TR=63;WE=121350974;WS=121350956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	121351480	rs9815500	T	C	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=155;ReadPosRankSum=-1.014;SC=ACTGATAAGATCCCCCGCCCT;SOR=0.264;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=9;WE=121351488;WS=121351470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr3	121353254	rs2070179	T	C	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.69;ReadPosRankSum=0.937;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,16:0.19:86
chr3	121353328	rs6770842	A	C	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.333;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=198;ReadPosRankSum=1.095;SC=AGGGCATGGCACTTGAAGGAA;SOR=0.979;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=15;WE=121353336;WS=121353318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,17:0.29:58
chr3	121354381	rs7620842	A	T	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=106;ReadPosRankSum=0.433;SC=CACTTTAGCCACCAAAGTGCT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=6;WE=121354389;WS=121354372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr3	121361646	rs12487377	G	A	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.857;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=661;ReadPosRankSum=1.107;SC=TGAACAAAAAGTAAATAAAAT;SOR=0.486;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=107;TCF=79;TCR=28;TR=39;WE=121361654;WS=121361636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,39:0.35:110
chr3	121361787	rs2070178	G	A	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.802;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=585;ReadPosRankSum=1.138;SC=TCTGAGATGTGTGCTTCTCCA;SOR=0.446;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=110;TCF=37;TCR=73;TR=33;WE=121361795;WS=121361777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,35:0.30:116
chr3	121366123	rs9818402	C	T	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.774;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.889;NF=33;NR=10;PP=836;ReadPosRankSum=0.140;SC=CCACCGCACCCGGCTTGTATT;SOR=0.116;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=96;TCF=82;TCR=14;TR=43;WE=121366131;WS=121366113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,43:0.43:100
chr3	121366377	rs7356043	A	G	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=342;ReadPosRankSum=-0.251;SC=GAAGCCTTGAAGTCTGTCCTG;SOR=0.631;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=8;TCR=47;TR=20;WE=121366385;WS=121366367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr3	121387060	rs56109033	T	C	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=270;ReadPosRankSum=0.227;SC=AGAAAGTGTATTTGAGCAAAA;SOR=0.264;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=14;WE=121387068;WS=121387050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr3	121388362	rs11363204	AT	A	258.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=186;SC=AAAAAGCATAATTTTTTTTTG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=11;WE=121388370;WS=121388352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	121396049	rs3835145	T	TA	350.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=14.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=-1.924;QD=7.16;ReadPosRankSum=-0.348;SOR=0.006;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,10:0.20:49
chr3	121396060	rs78322216	C	A	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.431;HP=14;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.633;NF=19;NR=3;PP=494;ReadPosRankSum=-2.289;SC=AAAAAAAAAACAAAACCCTGC;SOR=0.116;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=79;TCF=74;TCR=5;TR=22;WE=121396068;WS=121396039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,21:0.27:79
chr3	121412892	rs11915822	A	G	2797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.406;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=52;PP=2128;ReadPosRankSum=-1.156;SC=GTCTCTTCCAAGTGGACTTTT;SOR=0.752;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=347;TCF=173;TCR=174;TR=111;WE=121412900;WS=121412882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:234,120:0.34:354
chr3	121414217	rs35674179	C	A	1573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.660;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=14;PP=1172;ReadPosRankSum=-0.601;SC=TGTTTCCATACACTCTTTAGC;SOR=0.495;SbPval=0.35;Source=Platypus;TCR=30;TR=58;WE=121414225;WS=121414207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,61:0.41:149
chr3	121418765	rs11927625	T	C	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.822;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=25;PP=560;ReadPosRankSum=-0.070;SC=CTTTAGAAGATATATGTGGAG;SOR=0.069;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=58;TCF=2;TCR=56;TR=27;WE=121418773;WS=121418755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,29:0.46:63
chr3	121433906	rs55964762	T	C	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.07;ReadPosRankSum=-0.349;SOR=0.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr3	121433926	rs9854052	T	A	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.28;ReadPosRankSum=0.191;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr3	121435621	rs9832267	T	C	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=5.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.70;ReadPosRankSum=-0.963;SOR=0.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,34:0.28:120
chr3	121435624	rs9812411	C	T	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=8.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.78;ReadPosRankSum=-0.740;SOR=0.835;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,33:0.28:119
chr3	121437097	rs56286202	C	T	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=49;ReadPosRankSum=0.923;SC=CACTTAAGTACGAGGTATTTG;SOR=0.097;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=6;WE=121437105;WS=121437087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chr3	121447911	rs1919554	A	C	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=252;ReadPosRankSum=-0.092;SC=TAAGAAAAAAAAAAACAAAAC;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=14;WE=121447919;WS=121447901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr3	121449612	rs7643293	G	T	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.781;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=455;ReadPosRankSum=1.272;SC=CTTAATCCTCGCTTCACCTAG;SOR=0.289;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=61;TCF=55;TCR=6;TR=24;WE=121449620;WS=121449602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,24:0.38:64
chr3	121489439	rs148949254	TA	T	3175.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.044;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.022;NF=23;NR=63;PP=2971;ReadPosRankSum=0.431;SC=GGACAGAAAATAAACAGATGA;SOR=0.309;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=144;TCF=32;TCR=112;TR=86;WE=121489447;WS=121489429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,104:0.66:157
chr3	121500479	rs149985093	TACACACACACACAC	T	1125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.02;MQRankSum=1.527;NF=24;NR=0;PP=2997;ReadPosRankSum=0.921;SC=GCAATAAATGTACACACACAC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=24;WE=121500500;WS=121500469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,29:0.67:43
chr3	121500510	rs57816005	A	AAT	485.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.488;NF=24;NR=0;PP=640;ReadPosRankSum=-0.264;SC=ACACACACACAATATATGTGT;SOR=0.193;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=53;TCR=1;TR=24;WE=121500518;WS=121500499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,17:0.31:55
chr3	121500699	rs17849995	C	T	1519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.181;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=43;PP=1222;ReadPosRankSum=-1.441;SC=TTTCTTACGGCACTTCGCTAG;SOR=0.976;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=73;TCF=19;TCR=54;TR=57;WE=121500707;WS=121500689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,58:0.76:76
chr3	121507415	rs4073474	C	T	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=36;PP=1051;SC=CCCAATTCTACTATTTTACCA;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=121507423;WS=121507405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	121508830	rs6802815	A	T	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=0;PP=1732;SC=GTCCAAATTTAAAAAAAAATC;SOR=8.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=58;TCR=0;TR=58;WE=121508838;WS=121508820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	121514458	rs141330650	TA	T	698.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.590;NF=7;NR=18;PP=333;ReadPosRankSum=-0.368;SC=GGAAGGTCTTTAAAAAAAAAA;SOR=0.818;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=25;WE=121514467;WS=121514448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,35:0.95:37
chr3	121518315	rs77787916	G	A	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=83;ReadPosRankSum=1.242;SC=ACTTGATGCCGGACTGTGTCC;SOR=0.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=6;WE=121518323;WS=121518305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr3	121526099	rs4582090	A	G	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=439;ReadPosRankSum=1.032;SC=TTATATACAAATCATATGCGG;SOR=1.863;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=121526107;WS=121526089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
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chr3	121563494	rs77198814	G	T	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=82;ReadPosRankSum=-0.356;SC=ATTGGTTAAAGTAATTAGTAA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=6;WE=121563502;WS=121563484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr3	121573455	rs12629720	C	G	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.506;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=51;ReadPosRankSum=-2.120;SC=AGGAGAAACCCAGAATCAAGA;SOR=1.863;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=6;WE=121573463;WS=121573445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr3	121573729	rs9834185	T	G	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=29;ReadPosRankSum=1.054;SC=GAAATGTCAATAAAAAATTTA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=121573737;WS=121573719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr3	121591338	rs368234052	A	G	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=4.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=281;ReadPosRankSum=1.235;SC=ATATTTATTTAGCATTTTTTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=14;WE=121591346;WS=121591328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr3	121613205	rs4603998	G	C	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=413;ReadPosRankSum=0.475;SC=GAGTTAAACTGAGTTGCTGAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=17;WE=121613213;WS=121613195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr3	121631841	rs1523519	G	A	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.413;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=857;ReadPosRankSum=0.237;SC=TATCAACATGGTTGGCATTCT;SOR=0.457;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=121;TCF=73;TCR=48;TR=47;WE=121631849;WS=121631831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,47:0.37:126
chr3	121641031	.	G	A	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-6.386;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.978;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=3;PP=563;ReadPosRankSum=-2.061;SC=CCTAATAAATGAGAAGCTAAG;SOR=1.508;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=85;TCF=74;TCR=11;TR=31;WE=121641039;WS=121641021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,31:0.36:86
chr3	121641697	.	G	C	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.000;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.656;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=28;PP=895;ReadPosRankSum=1.534;SC=CTGGGCGGCTGAGAAATATCC;SOR=0.618;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=141;TCF=52;TCR=89;TR=46;WE=121641705;WS=121641687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,51:0.35:147
chr3	121643163	rs2293611	G	C	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=3.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.96;ReadPosRankSum=2.037;SOR=1.491;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,17:0.21:82
chr3	121659197	rs3817599	G	A	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=393;ReadPosRankSum=-0.519;SC=CAGTGAAGGGGGTTTGTTTAC;SOR=0.883;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=21;WE=121659205;WS=121659187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,21:0.40:52
chr3	121712051	rs2877561	A	C	4762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=58;PP=2965;SC=GAGTGATATCAAGTGAGCGGT;SOR=1.209;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=88;TCR=58;TR=146;WE=121712059;WS=121712041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr3	121712805	rs3915061	G	C	2712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=31;PP=2086;SC=GAGGCTGGACGGCAGGGACAA;SOR=1.338;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=53;TCR=31;TR=84;WE=121712813;WS=121712795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr3	121712980	rs3915060	C	T	5666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=93;NR=82;PP=2965;SC=CCCATGTTCCCGCCCTTGCCC;SOR=0.796;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=175;TCF=93;TCR=82;TR=175;WE=121712988;WS=121712970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr3	121720494	rs62269207	C	T	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.624;NF=11;NR=9;PP=441;ReadPosRankSum=0.058;SC=ATGACAAGAACTTAGGCTTGC;SOR=0.357;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=15;TCR=12;TR=20;WE=121720502;WS=121720484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,21:0.78:27
chr3	121720514	rs35657414	GT	G	297.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.740;HP=15;HapScore=3;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.558;NF=11;NR=4;PP=180;ReadPosRankSum=-0.116;SC=CTTATTTCTGGTTTTTTTTTT;SOR=2.225;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=15;WE=121720524;WS=121720504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr3	121810427	rs57304749	CT	C	5258.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=128;PP=2986;SC=CAAGTTTTACCTTTTTTTTTC;SOR=1.743;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=215;TCF=49;TCR=166;TR=163;WE=121810435;WS=121810417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr3	121825197	rs2681417	G	A	6365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=147;NR=54;PP=2965;SC=GTATGATGGTGTTATGCAGAA;SOR=2.109;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=202;TCF=148;TCR=54;TR=201;WE=121825205;WS=121825187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr3	121836966	rs10580127	TGA	T	4073.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.19;NF=27;NR=56;PP=2974;SC=GAGACATTGATGAGAGAGAGG;SOR=0.957;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=31;TCR=63;TR=83;WE=121836975;WS=121836956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr3	121976253	rs9869985	G	A	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=19;PP=516;SC=GCCTTCTCAGGCGGGGCACTG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=121976261;WS=121976243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	122000871	rs4678174	C	T	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.071;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=193;ReadPosRankSum=0.189;SC=TGCCCAAACTCCTCCCTCTTA;SOR=1.398;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=65;TCF=48;TCR=17;TR=17;WE=122000879;WS=122000861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,20:0.27:74
chr3	122001099	rs2270916	T	C	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.893;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=732;ReadPosRankSum=-0.351;SC=GGAACCCCTCTTGGGCACTGT;SOR=0.105;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=35;WE=122001107;WS=122001089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,38:0.83:46
chr3	122003045	rs2036400	G	C	7032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=107;NR=103;PP=2965;SC=CCGCGCCCCCGTCAAGCTACC;SOR=0.711;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=212;TCF=107;TCR=105;TR=210;WE=122003053;WS=122003035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr3	122003832	rs1801726	G	C	7243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=149;PP=2965;SC=GACCCGACACGAGCCATTACT;SOR=1.643;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=215;TCF=65;TCR=150;TR=214;WE=122003840;WS=122003822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr3	122004098	rs4677948	A	T	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=30;PP=996;SC=GTCCCAGGGAAGAGGAATCGC;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=122004106;WS=122004088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	122056432	rs17589	C	T	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.344;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=190;ReadPosRankSum=-1.206;SC=ATGAGACTTACGGAAAATTGG;SOR=0.455;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=15;WE=122056440;WS=122056422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,14:0.27:51
chr3	122081659	rs9857709	A	C,G	2703.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.93;QD=39.76;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,34,34:0.50,0.50:68
chr3	122081660	rs9857710	A	C	2898.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.93;QD=42.01;SOR=3.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	122128466	rs4306808	G	C	2512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=4;PP=2057;SC=TGCTCAGTGTGCAAGCAGCAG;SOR=5.283;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=66;TCR=4;TR=69;WE=122128474;WS=122128456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	122128519	rs10511410	G	C	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.852;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=11;PP=708;ReadPosRankSum=-2.166;SC=GCTGTCATCAGTGCAAGGTAA;SOR=0.427;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=154;TCF=124;TCR=30;TR=46;WE=122128527;WS=122128509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,47:0.29:160
chr3	122133321	rs6777596	C	T	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.351;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=372;ReadPosRankSum=0.131;SC=TAAAAGAAACCGTCTTTTTAA;SOR=3.312;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=16;WE=122133329;WS=122133311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr3	122133830	rs3749213	T	G	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.494;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=36;PP=1191;ReadPosRankSum=0.474;SC=TACCTGACACTATCAAGGACC;SOR=0.759;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=259;TCF=139;TCR=120;TR=79;WE=122133838;WS=122133820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,77:0.29:268
chr3	122134032	rs61736421	C	T	2988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.814;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.433;NF=50;NR=52;PP=2436;ReadPosRankSum=-1.363;SC=CAAACATTTTCCAGATCTCAC;SOR=0.332;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=141;TCF=65;TCR=76;TR=102;WE=122134040;WS=122134022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,103:0.72:143
chr3	122145810	rs4677950	T	A	1713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=2;PP=1470;SC=CTGACACAGGTACGTGAAAGC;SOR=5.590;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=47;TCR=2;TR=49;WE=122145818;WS=122145800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	122161101	rs9842736	C	T	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=386;ReadPosRankSum=0.901;SC=ATTAAGGGAACGCTTATCATG;SOR=0.749;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=18;WE=122161109;WS=122161091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr3	122168341	rs3749209	C	A	1979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=0;PP=1641;SC=ATGTACAATCCATTAATATTT;SOR=8.189;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=56;TCR=0;TR=56;WE=122168349;WS=122168331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	122180011	rs56074178	C	G	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.927;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=466;ReadPosRankSum=-2.264;SC=AATTTGTGTACAAAATAAAAA;SOR=0.193;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=18;WE=122180019;WS=122180001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr3	122186188	rs4678193	C	T	2296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=37;PP=1672;SC=CTCCATGTTACTAATCTGAGC;SOR=0.772;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=38;TCR=37;TR=75;WE=122186196;WS=122186178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	122215166	rs9289194	A	AACACACACAC,AACACACACACAC	606.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=54.83;QD=60.67;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,5,5:0.50,0.50:10
chr3	122247606	rs7628052	A	G	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.442;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=539;ReadPosRankSum=0.433;SC=AAAGGAAAAAATAAAATAAAA;SOR=0.267;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=68;TCF=12;TCR=56;TR=29;WE=122247614;WS=122247596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,30:0.41:73
chr3	122259606	rs9851180	T	C	5914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.354;SC=GTGGGCCTCATACATCTCTTC;SOR=0.457;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=103;TCR=88;TR=188;WE=122259614;WS=122259596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,195:0.98:198
chr3	122259738	rs145948621	G	GTT	388.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=2.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQRankSum=-1.213;QD=14.40;ReadPosRankSum=-0.971;SOR=0.166;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr3	122259745	rs9831600	G	T	1316.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.35;MQRankSum=-0.645;QD=26.87;ReadPosRankSum=-0.069;SOR=0.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,45:0.92:49
chr3	122259782	rs9868934	A	G	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=795;SC=CTGTCTCACAAGCTGGAGTGC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=122259790;WS=122259772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	122269380	rs1979853	A	G	92.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=72;SC=ATGTTGCTGAATGAATGAATG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=122269388;WS=122269375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	122271204	rs3216715	T	TA	94.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=60;ReadPosRankSum=0.175;SC=GAAATTTGTTTAAAAAAAAAA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=122271212;WS=122271194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr3	122274757	rs73192127	G	C	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.421;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=653;ReadPosRankSum=0.958;SC=CATCTTTCCAGACTGATAACT;SOR=0.419;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=136;TCF=58;TCR=78;TR=40;WE=122274765;WS=122274747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,41:0.29:142
chr3	122277160	rs9289198	G	T	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=3;PP=1685;ReadPosRankSum=-0.496;SC=CCCCACAAGGGTCTGCAGTCA;SOR=1.143;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=50;TCF=46;TCR=4;TR=38;WE=122277180;WS=122277150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,40:0.75:53
chr3	122277172	rs9289199	G	A	1427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.740;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=8;PP=2125;ReadPosRankSum=0.037;SC=CTGCAGTCACGCACCTGAGCA;SOR=0.382;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=61;TCF=52;TCR=9;TR=48;WE=122277180;WS=122277150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,50:0.78:64
chr3	122285005	rs12485294	G	A	1123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=31;PP=933;SC=CCCATGTGCTGGGCACGTACA;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=122285013;WS=122284995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	122287289	.	T	C	21	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=21;QD=18.5904041824;SC=ATGGTAGGCCTGCATGCTGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=3;WE=122287297;WS=122287279;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,3:0.33:9
chr3	122288210	rs2332285	G	A	6991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=114;NR=94;PP=2965;SC=TCCAAGGACAGGCAGGTAGAT;SOR=0.914;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=208;TCF=114;TCR=94;TR=208;WE=122288218;WS=122288200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr3	122290579	rs2036342	C	T	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.301;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=648;ReadPosRankSum=-2.091;SC=AGCTGAAAGCCAAAGGAATTG;SOR=0.780;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=46;TCF=22;TCR=24;TR=30;WE=122290587;WS=122290569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr3	122437321	rs7645033	T	C	8814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=154;NR=129;PP=2965;SC=GTGTGGAATATGCTATCTCCT;SOR=0.850;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=285;TCF=154;TCR=131;TR=283;WE=122437329;WS=122437311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr3	122437834	rs3821688	A	G	5291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=130;PP=2965;SC=CTTGTCATCCACTATTTCACA;SOR=3.135;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=25;TCR=130;TR=155;WE=122437842;WS=122437824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr3	122471407	rs72280610	TA	T	769.86	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=17.301;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQRankSum=1.434;QD=13.75;ReadPosRankSum=1.082;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:7,49:0.88:56
chr3	122474305	rs6794019	C	A	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=468;SC=AAAAAAGATACAAGTTAGTAC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=122474313;WS=122474295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	122477795	rs2137210	G	A	3142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=75;PP=2649;SC=GCTGACCTGGGAGTGGAATCT;SOR=3.865;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=11;TCR=75;TR=86;WE=122477803;WS=122477785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr3	122478032	rs10657578	C	CCACA	732.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=638;SC=CATGTGCGTTCCACACACACA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=13;WE=122478040;WS=122478022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	122512542	rs76805079	G	C	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=392;ReadPosRankSum=-0.829;SC=ACCGCAAGGCGGGTTCTGCCG;SOR=0.914;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=25;WE=122512550;WS=122512532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr3	122512631	rs3806643	G	A	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=9;PP=255;SC=CCACAGGAAGGAGCCCCGGCG;SOR=2.494;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=122512639;WS=122512621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	122513964	rs891406	A	C	95.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=2;PP=69;SC=CCTGCTGCTCAGGACTATTCT;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=122513972;WS=122513954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	122605544	rs9864868	G	A	4264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=90;NR=40;PP=2965;SC=AAACTGTGCAGATATTTTACA;SOR=1.699;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=90;TCR=40;TR=130;WE=122605552;WS=122605534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr3	122629589	rs7622250	A	G	86.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=60;SC=CCCGGGAGGCAGAGCTTGCAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=122629597;WS=122629579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	122630323	rs2303982	T	G	2121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=38;PP=1462;SC=ATGAGGTAGGTCCGGTTTCTT;SOR=1.938;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=53;WE=122630331;WS=122630313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	122630346	rs2303983	T	C	1785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=28;PP=1001;SC=ACCTGCACAGTCGGTGGCCTC;SOR=1.900;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=39;WE=122630354;WS=122630336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	122631896	rs2276782	A	T	1628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=41;PP=1339;SC=GCGCAGGAGGACCTCCACCAG;SOR=2.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=9;TCR=41;TR=50;WE=122631904;WS=122631886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	122640902	rs181328300	C	T	1972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=15;PP=1668;ReadPosRankSum=2.437;SC=GCACGTGCAGCTCCTCCAGGT;SOR=0.606;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=106;TCF=86;TCR=20;TR=77;WE=122640910;WS=122640892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,76:0.75:102
chr3	122642401	rs2276780	G	A	2336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=17;PP=2017;SC=GAATCAGCTTGTGGCTGGTAA;SOR=2.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=55;TCR=17;TR=72;WE=122642423;WS=122642391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr3	122642415	rs2276779	G	C	2370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=27;PP=1953;SC=CTGGTAATCTGGGGGTAAGGC;SOR=1.358;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=50;TCR=27;TR=77;WE=122642423;WS=122642391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr3	122642590	rs2276778	G	A	2716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=58;PP=2015;SC=CAGAAGCCGCGATGCTGTTTC;SOR=1.967;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=23;TCR=58;TR=81;WE=122642598;WS=122642580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	122658093	rs55699792	G	A	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.645;NF=8;NR=1;PP=202;ReadPosRankSum=2.037;SC=CTCCCTCCACGTACATTGCGG;SOR=0.412;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=9;WE=122658101;WS=122658083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr3	122694767	rs73856781	C	A	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.845;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=1;PP=550;ReadPosRankSum=-0.350;SC=CTCCTGCCCCCTCTCTGGCCA;SOR=1.900;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=90;TCF=79;TCR=11;TR=30;WE=122694775;WS=122694757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,32:0.34:94
chr3	122694820	rs895076	A	T	4922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=113;NR=40;PP=2965;SC=CAAATCTAGAAACTCTTCATG;SOR=2.043;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=113;TCR=40;TR=153;WE=122694828;WS=122694810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr3	122694930	rs9968193	C	T	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.185;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=43;PP=1099;ReadPosRankSum=-1.362;SC=CCTTCTGACCCTCACGCAGCC;SOR=0.819;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=197;TCF=71;TCR=126;TR=64;WE=122694938;WS=122694920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,69:0.34:204
chr3	122807995	rs836860	G	A	1563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=3;PP=1249;ReadPosRankSum=1.977;SC=ACTCACAGTCGTTGGCTCCTT;SOR=3.570;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=45;TCR=3;TR=47;WE=122808003;WS=122807985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr3	122811042	rs836863	A	G	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=0;PP=1034;SC=CACAGGCCCTAGCACTGTTGA;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=35;WE=122811050;WS=122811032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	122821108	rs2717233	C	T	981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=0;PP=888;SC=CACCCTCTAGCTCTCACAGCC;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=32;WE=122821116;WS=122821098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	122821385	rs2241961	T	C	4175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=99;PP=2965;SC=AAGTGCCAAATGCTTTCATTG;SOR=1.847;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=40;TCR=99;TR=139;WE=122821393;WS=122821375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr3	122821478	rs2241962	T	A	1037.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.62;ReadPosRankSum=1.227;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,44:0.92:48
chr3	122821671	rs2241963	AT	GA	5530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=54;PP=2947;SC=GTTCTCAGCAATGGTGGAGTC;SOR=0.865;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=109;TCF=51;TCR=58;TR=104;WE=122821680;WS=122821661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr3	122834887	rs836839	A	T	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=422;ReadPosRankSum=-0.503;SC=CCACTGATACAGTAAGCTCTT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=17;WE=122834895;WS=122834877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr3	122835210	rs836840	A	G	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=384;ReadPosRankSum=-0.082;SC=GAAGGGTGCCAGGGGTGGGGT;SOR=0.638;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=17;WE=122835218;WS=122835200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr3	122835232	rs2278668	T	C	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=347;ReadPosRankSum=0.107;SC=GGGACAGGTTTTGAAATGGTG;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=14;WE=122835240;WS=122835222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr3	122843110	rs861375	G	T	3697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.579;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=83;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.446;SC=GTTTCTCCACGTTTCACAGGA;SOR=0.353;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=180;TCF=63;TCR=117;TR=133;WE=122843118;WS=122843100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,132:0.74:179
chr3	122843212	rs2305051	C	T	2329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.269;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=47;PP=1813;ReadPosRankSum=-0.051;SC=GTGTGTGTGTCAGTGGGCGTG;SOR=0.836;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=113;TCF=52;TCR=61;TR=80;WE=122843220;WS=122843202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,83:0.72:115
chr3	122873923	rs2717225	G	C	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.215;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=27;PP=712;ReadPosRankSum=-0.697;SC=TGATCTGCCTGCAGCTAATTC;SOR=1.373;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=58;TCF=14;TCR=44;TR=33;WE=122873931;WS=122873913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,35:0.57:61
chr3	122942358	rs1546605	A	G	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=6.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=575;ReadPosRankSum=-1.441;SC=GCAGTGAATTACCTTGATTTA;SOR=0.909;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=75;TCF=74;TCR=1;TR=27;WE=122942366;WS=122942348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,27:0.37:73
chr3	122942402	rs1546604	G	A	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-5.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.797;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=12;PP=864;ReadPosRankSum=-0.119;SC=TTTTTACACTGTAGTTTTATT;SOR=0.566;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=134;TCF=104;TCR=30;TR=51;WE=122942410;WS=122942392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,51:0.38:135
chr3	122964900	rs12493729	C	G	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=622;ReadPosRankSum=2.221;SC=GACTGTGCCTCTTCATTCTAC;SOR=0.630;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=26;TCR=71;TR=33;WE=122964908;WS=122964890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,35:0.33:107
chr3	122978486	rs9289216	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.941;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=50;ReadPosRankSum=-0.475;SC=TGTTTACTTCGGGTATCAGTT;SOR=0.252;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=5;WE=122978494;WS=122978476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr3	122990291	rs9860349	C	T	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=4.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=221;ReadPosRankSum=1.239;SC=ACTCTCTGACCTGTTACAATT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=12;WE=122990299;WS=122990281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr3	123003687	rs56140025	G	A	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=59.98;MQRankSum=-1.313;NF=3;NR=17;PP=367;ReadPosRankSum=-0.065;SC=TGCCGCCCCTGACACAGAAGG;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=20;WE=123003695;WS=123003677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr3	123008519	rs4677881	T	G	369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=312;SC=GCGGATGCGGTATGGGGTATG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=123008527;WS=123008515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	123010241	rs56301263	C	T	1336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FS=3.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.24;ReadPosRankSum=1.236;SOR=0.971;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:186,69:0.27:255
chr3	123010276	rs9809236	G	A	3668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.518;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=103;PP=2957;ReadPosRankSum=2.329;SC=CCCAGATGTCGGCCCCTCCAC;SOR=0.242;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=181;TCF=30;TCR=151;TR=128;WE=123010284;WS=123010266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,128:0.70:184
chr3	123014877	rs9881951	C	T	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=1;PP=979;ReadPosRankSum=0.836;SC=CTGTTGTCTCCGCCACCTGCT;SOR=0.849;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=50;TCR=1;TR=36;WE=123014885;WS=123014867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,37:0.71:52
chr3	123014900	rs56322900	C	T	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=280;ReadPosRankSum=0.681;SC=CAAATGCCTCCCTCCCCAGGT;SOR=0.240;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=64;TCR=3;TR=17;WE=123014908;WS=123014890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,17:0.25:67
chr3	123015094	rs9882534	G	C	4633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=132;PP=2965;SC=GGCCTGAGACGGCCGTGGCTC;SOR=2.962;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=31;TCR=132;TR=163;WE=123015102;WS=123015084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr3	123015183	.	C	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.52;ReadPosRankSum=0.024;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr3	123018963	rs4482616	A	G	2817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=17;PP=2250;SC=GAGGTGCCCCATACATGGCGT;SOR=2.925;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=81;TCR=17;TR=98;WE=123018971;WS=123018953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr3	123021838	rs9877581	A	G	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=1;PP=407;SC=GAGCAGCTGCAGTGACAGTGG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=123021846;WS=123021828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	123021870	rs9844212	G	C	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=486;ReadPosRankSum=-0.843;SC=GGACTCTTCAGCACTCCCTTC;SOR=2.494;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=19;WE=123021878;WS=123021860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr3	123022152	rs112464175	C	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=62;ReadPosRankSum=-1.094;SC=CGCAGGCTCCCGCCTGTCCTC;SOR=0.374;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=7;WE=123022160;WS=123022142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,7:0.19:36
chr3	123022714	.	AG	A	247.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.30;MQRankSum=0.904;QD=15.48;ReadPosRankSum=1.855;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr3	123022716	.	AAGAGAAGAGAAGAGAAGAGAAGAG	A	247.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQRankSum=0.904;QD=15.48;ReadPosRankSum=2.607;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr3	123022740	.	G	GAAGAA	64.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.013;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQRankSum=-0.566;QD=4.32;ReadPosRankSum=2.059;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr3	123022770	rs56140660	C	T	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.21;MQRankSum=1.285;NF=18;NR=1;PP=376;ReadPosRankSum=0.097;SC=GCACATTGAGCCAAAGCTGAT;SOR=0.824;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=48;TCF=43;TCR=5;TR=19;WE=123022778;WS=123022760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr3	123037043	rs75867257	A	G	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.37;ReadPosRankSum=0.552;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr3	123037047	rs4327330	A	C	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=194;SC=ACACCCAGGGAAGCCACTCAT;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=123037055;WS=123037033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	123039496	rs3935566	A	G	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=122;ReadPosRankSum=-1.960;SC=CTGCAAGAGGAGTCATTTTCC;SOR=0.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=7;WE=123039504;WS=123039486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr3	123039808	rs112520557	G	A	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=379;ReadPosRankSum=0.467;SC=TTCTCCCTAAGAGACAGGTGC;SOR=0.502;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=18;WE=123039816;WS=123039798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr3	123044336	rs112811518	G	GA	1537.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.962;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.315;NF=13;NR=42;PP=1952;ReadPosRankSum=2.003;SC=GAGATGGGGGGAGATGAGGAG;SOR=1.207;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=190;TCF=48;TCR=142;TR=55;WE=123044344;WS=123044326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,60:0.27:219
chr3	123047478	rs9855635	A	G	1571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.209;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=5;PP=1253;ReadPosRankSum=-0.317;SC=AGCCACCCACAGCTGTCACTC;SOR=1.396;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=92;TCF=84;TCR=8;TR=66;WE=123047486;WS=123047468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,66:0.70:94
chr3	123047666	rs9855969	A	G	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=53;PP=1750;SC=ATGGAGCAGGAGTAAAGCTGG;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=13;TCR=53;TR=66;WE=123047674;WS=123047656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr3	123049678	rs4678009	C	T	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.150;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=182;ReadPosRankSum=-0.115;SC=GTCAGTCAGTCGCTCGGGCTG;SOR=0.083;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=11;WE=123049686;WS=123049668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr3	123049707	rs9829332	G	T	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=420;ReadPosRankSum=0.648;SC=CCCAGGGAGGGAGACGGTACC;SOR=1.681;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=22;WE=123049715;WS=123049697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr3	123049938	rs6806529	A	C	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=30;PP=974;SC=GAGAAGCAAAAAGATTCACCC;SOR=4.680;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=32;WE=123049946;WS=123049928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	123066555	rs112525497	A	AAAGG	2979.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=7;PP=2236;SC=TGCCCACTTGAAAGGAAGTGG;SOR=3.500;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=60;TCF=50;TCR=10;TR=46;WE=123066563;WS=123066545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	123167249	rs4678027	G	A	940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=28;PP=748;SC=CGCGGGCAGAGCCCCCGGGGG;SOR=4.047;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=123167257;WS=123167239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	123218524	rs148392509	TTAAAA	T	1777.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.488;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.678;NF=2;NR=36;PP=1661;ReadPosRankSum=-0.824;SC=CTTTTCTAGATTAAAATAAGA;SOR=1.520;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=70;TCF=6;TCR=64;TR=38;WE=123218536;WS=123218514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,48:0.60:80
chr3	123339166	.	C	G	1839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.254;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=51;PP=1522;ReadPosRankSum=-0.754;SC=CAATGGCTCTCACAGCATTGC;SOR=0.532;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=89;TCF=13;TCR=76;TR=61;WE=123339174;WS=123339156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,62:0.71:87
chr3	123378534	rs39639	C	G	2014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=38;PP=1541;SC=GATGAAAACTCTCAGAAAAGA;SOR=1.284;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=60;WE=123378542;WS=123378524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	123411589	rs40305	G	A	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.848;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=5;PP=674;ReadPosRankSum=0.135;SC=TACCATCCACGGTGACTTGGC;SOR=1.922;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=66;TCF=50;TCR=16;TR=34;WE=123411597;WS=123411579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,36:0.53:68
chr3	123418913	rs865358	G	A	8800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=108;NR=170;PP=2965;SC=GGGTCTTTCCGTTCAGCGTCC;SOR=1.215;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=278;TCF=108;TCR=170;TR=278;WE=123418921;WS=123418903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr3	123440967	rs820355	G	A	5750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.148;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.781;SC=GTGCCCAGAGGCTCCTACCAT;SOR=0.341;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=185;TCF=97;TCR=88;TR=184;WE=123440975;WS=123440957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,191:0.99:192
chr3	123444785	rs820329	A	T	2454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.881;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=16;PP=1935;ReadPosRankSum=-2.792;SC=GGCAGGGGGAACTCACCATTC;SOR=1.331;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=133;TCF=107;TCR=26;TR=93;WE=123444793;WS=123444775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,93:0.68:136
chr3	123451773	rs9833275	G	C	1600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=6;PP=1381;SC=CTACAGGACAGCTGGCCTTGG;SOR=3.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=44;TCR=6;TR=50;WE=123451781;WS=123451763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	123451932	rs35156360	G	A	2231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.459;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=45;PP=1661;ReadPosRankSum=0.884;SC=GCCACTTCAGGCTTTGGAATC;SOR=0.494;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=120;TCF=52;TCR=68;TR=83;WE=123451940;WS=123451922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,85:0.68:125
chr3	123452838	rs4678047	G	A	2439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.904;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=51;PP=1866;ReadPosRankSum=0.894;SC=GAAGGACCGGGGTCTGCGGGG;SOR=0.535;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=107;TCF=39;TCR=68;TR=82;WE=123452846;WS=123452828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,86:0.78:110
chr3	123456432	rs2168439	C	T	3167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=84;PP=2473;SC=CAAATCTGCTCACCTTCTGGC;SOR=2.856;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=20;TCR=84;TR=104;WE=123456440;WS=123456422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr3	123457711	rs2198766	C	A	1840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=0;PP=1568;SC=CTAATACAGGCTGGATCAGGG;SOR=8.015;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=55;TCR=0;TR=54;WE=123457719;WS=123457701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	123457893	rs9840993	G	A	5109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=80;PP=2965;SC=TCCACTGCTGGAGCTGAAAAT;SOR=0.859;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=150;TCF=68;TCR=82;TR=148;WE=123457901;WS=123457883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr3	123633612	rs11551801	G	A	990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=0;PP=876;SC=CACCTGATGAGTTTTCTTCTG;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=123633620;WS=123633602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	123634046	rs2700373	G	A	1943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=30;PP=1556;SC=CAGCAAGTCCGCTGTTGCTGA;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=60;WE=123634054;WS=123634036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	123650432	rs2271969	A	G	302.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=209;SC=ACAAACTTGGAAAATACCTGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=123650440;WS=123650422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	123650447	.	TA	T	47	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=35;MMLQ=18;MQ=58.31;NF=0;NR=5;PP=47;QD=10.0;SC=ACCTGTTTCTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=123650455;WS=123650437;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,5:0.56:9
chr3	123650451	rs77809387	A	C	230.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.17;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	123652476	rs6784695	G	A	1560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=5;PP=1273;SC=CAACATTTCCGGAGCCACAAA;SOR=4.003;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=47;WE=123652484;WS=123652466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	123665902	rs17310144	T	G	4850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=103;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.881;SC=TCCAGATGCGTTTCTTTTCCA;SOR=0.703;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=51;TCR=104;TR=154;WE=123665910;WS=123665892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,152:0.99:153
chr3	123666192	rs17375977	C	T	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=55;PP=1578;SC=AACAAGTCTTCAGAAGTATGA;SOR=4.548;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=4;TCR=55;TR=59;WE=123666200;WS=123666182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	123688760	rs34337446	C	G	2961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=78;NR=3;PP=2434;SC=TTCAGATCATCCATATTTCAT;SOR=6.067;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=82;TCF=79;TCR=3;TR=81;WE=123688768;WS=123688750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
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chr3	123988039	rs2272486	T	C	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=25;PP=785;SC=AGATGTGGCATGTGCGCAAGC;SOR=1.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=38;WE=123988047;WS=123988029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	124044859	rs16835275	C	T	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=8;PP=526;ReadPosRankSum=-2.443;SC=GCATCATGTCCGTGGCTTCCC;SOR=0.527;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=109;TCF=90;TCR=19;TR=38;WE=124044867;WS=124044849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,37:0.34:110
chr3	124044949	rs2289778	C	T	2694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.657;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=60;PP=1951;ReadPosRankSum=0.408;SC=GGAAGAGCTTCGCTGCTGCCC;SOR=0.601;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=146;TCF=53;TCR=93;TR=96;WE=124044957;WS=124044939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,103:0.67:154
chr3	124113929	rs482285	A	T	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=352;ReadPosRankSum=-0.459;SC=CCCTCACCCCAGCCCTGGCCT;SOR=0.594;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=59;TCF=53;TCR=6;TR=21;WE=124113937;WS=124113919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,21:0.34:61
chr3	124114068	rs9841322	G	A	2479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.288;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=35;PP=1820;ReadPosRankSum=-0.883;SC=AACTGATCAAGCAGTTCCAGC;SOR=0.788;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=149;TCF=74;TCR=75;TR=81;WE=124114076;WS=124114058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,91:0.57:159
chr3	124128938	rs647010	A	G	2807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=8;PP=2272;SC=GAAACACCAGATACAGAATCC;SOR=4.332;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=76;TCR=8;TR=84;WE=124128946;WS=124128928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	124165217	rs624450	G	A	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.211;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=189;ReadPosRankSum=-0.893;SC=CACAGCAGCAGATTGGGGATG;SOR=2.170;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=5;TCR=41;TR=12;WE=124165225;WS=124165207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,12:0.27:44
chr3	124195987	rs572145	T	C	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=0;PP=406;SC=TAGACACTGGTGTCTGAGGGT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=124195995;WS=124195977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	124210105	rs182859458	C	T	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.682;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=43;ReadPosRankSum=0.739;SC=CCCTTCCCACCCCAGCCCTAA;SOR=1.863;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=5;WE=124210113;WS=124210095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,4:0.17:24
chr3	124210344	rs10755077	C	A	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.230;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=455;ReadPosRankSum=-0.391;SC=AGTGACACCTCAAAGCTAAGG;SOR=1.897;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=21;WE=124210352;WS=124210334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr3	124281980	rs2256831	T	C	1283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=38;PP=973;SC=AAGGAGGCCATGAGCGCTGGC;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=44;WE=124281988;WS=124281970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	124303786	rs2250757	G	C	1474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.516;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=38;PP=1159;ReadPosRankSum=-1.052;SC=GGTGCCTTCTGTTAGCCAGAC;SOR=0.415;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=75;TCF=16;TCR=59;TR=50;WE=124303794;WS=124303776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,52:0.68:77
chr3	124351229	rs3816201	C	G	1818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=14;PP=1473;ReadPosRankSum=-0.580;SC=CCTGCCTTCACCACCTCTGAC;SOR=0.760;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=101;TCF=79;TCR=22;TR=67;WE=124351237;WS=124351219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,69:0.66:105
chr3	124351316	rs1708303	G	A	5458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=86;PP=2965;SC=CCGAGTCCGTGGCCAACCTGC;SOR=0.705;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=83;TCR=86;TR=169;WE=124351324;WS=124351306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr3	124351424	rs1660038	T	C	5706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=78;PP=2965;SC=TGCGTCGGCTTAACAGCGGGA;SOR=0.875;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=172;TCF=92;TCR=80;TR=170;WE=124351432;WS=124351414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr3	124352573	rs652046	A	G	1621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=2;PP=1213;SC=GGAAATTGCGACTGAACAGTT;SOR=5.590;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=44;WE=124352581;WS=124352563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	124369640	rs11372663	T	TA	3344.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=34;PP=2974;SC=TAAGCCTGTTTTTCTCTCTTT;SOR=0.920;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=35;TCR=35;TR=69;WE=124369658;WS=124369630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr3	124369650	rs2291988	T	C	3140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=33;PP=2065;SC=TTTCTCTCTTTTCAGAGTCTA;SOR=0.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=37;TCR=33;TR=70;WE=124369658;WS=124369630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	124374259	rs4677938	G	A	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=1;PP=483;SC=TCTGGCCTTGGTGTCCTCAGC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=124374267;WS=124374256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	124374405	rs4677939	A	C	3547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=29;PP=2741;SC=TTTTTGGCTTAACAATGAAGA;SOR=1.819;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=71;TCR=29;TR=100;WE=124374413;WS=124374395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr3	124376653	rs106520	G	A	5170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=120;PP=2965;SC=TTAAGCACGTGAGTGTCTCCC;SOR=2.504;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=156;TCF=35;TCR=121;TR=155;WE=124376661;WS=124376643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr3	124377165	rs2175740	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=131;ReadPosRankSum=-0.329;SC=GCCTTGGTGCGTCCCCAAGTG;SOR=0.399;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=7;WE=124377173;WS=124377155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr3	124377196	rs10804562	G	A	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=71;ReadPosRankSum=-0.563;SC=CTTTGTCCACGTGGAGGCCAG;SOR=0.446;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=6;WE=124377204;WS=124377186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr3	124377430	rs56342323	G	A	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.959;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=738;ReadPosRankSum=0.292;SC=GCCACTTTCAGAAATACCAGA;SOR=0.576;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=65;TCF=25;TCR=40;TR=40;WE=124377438;WS=124377420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,43:0.63:68
chr3	124378386	rs333297	C	G	1243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=32;PP=897;SC=GTAGAGCTAGCGGTTCTGTCT;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=124378394;WS=124378376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	124378412	rs10755078	A	G	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=153;ReadPosRankSum=-0.213;SC=ACACTGTCCCAAAGGACTGTG;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=124378420;WS=124378402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr3	124379641	rs333291	C	A	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=508;SC=AGCTACTCTACACCATTGCCA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=124379649;WS=124379631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	124379748	rs333290	G	C	3826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=83;NR=33;PP=2965;SC=CCACACTCTTGCCTGCTTCCC;SOR=1.951;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=83;TCR=33;TR=116;WE=124379756;WS=124379738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr3	124379817	rs333289	T	C	4557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=81;PP=2965;SC=GTTCAGATATTGAGGTGAGTT;SOR=0.870;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=69;TCR=81;TR=150;WE=124379825;WS=124379807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr3	124380793	rs665927	C	T	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.223;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=549;ReadPosRankSum=1.296;SC=TTTAAGAATGCGTCTAAGCCC;SOR=0.424;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=14;TCR=39;TR=29;WE=124380801;WS=124380783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr3	124390796	rs3772782	C	T	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=30;PP=762;ReadPosRankSum=-0.710;SC=GGCATAGCCTCAGGGGTTACT;SOR=1.508;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=33;WE=124390804;WS=124390786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,32:0.80:40
chr3	124393595	rs333355	A	G	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.617;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=161;ReadPosRankSum=-2.050;SC=CCACAGAACCAGTGTTTGAGT;SOR=0.120;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=9;WE=124393603;WS=124393585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr3	124393610	rs333354	A	G	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=409;SC=TTGAGTGCTGACACCATATGC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=124393618;WS=124393600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	124396338	rs333349	T	G	2537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=14;PP=2058;SC=CACACATTAGTTCTTGTCCCA;SOR=2.774;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=59;TCR=14;TR=73;WE=124396346;WS=124396328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr3	124397249	rs35286809	AT	A	239.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.48;MQRankSum=1.605;QD=6.85;ReadPosRankSum=0.467;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr3	124397321	rs3830412	AT	A	80.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=79;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGATCAATTTATTTTTTATCT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=6;WE=124397329;WS=124397311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr3	124398571	rs821365	A	T	2881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=67;PP=1906;SC=AGATTTTTTTAAAAAACAAAA;SOR=6.302;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=69;TCF=2;TCR=67;TR=69;WE=124398579;WS=124398561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	124398589	rs821364	A	C	2410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=49;PP=1471;SC=AAAACTTGTTATCTTGAATGC;SOR=7.903;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=49;WE=124398597;WS=124398579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	124412524	rs2289428	T	G	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.12;ReadPosRankSum=-0.217;SOR=0.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,22:0.22:100
chr3	124412634	rs333283	G	T	2558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=58;PP=2001;SC=AATTTTCTGTGTCTTTTTGTT;SOR=2.133;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=20;TCR=58;TR=78;WE=124412642;WS=124412624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	124418846	rs2289427	C	T	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.522;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=34;PP=959;ReadPosRankSum=0.647;SC=GCCTTCCCAGCGAGCCCTCGG;SOR=0.264;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=65;TCF=17;TCR=48;TR=48;WE=124418854;WS=124418836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,46:0.72:64
chr3	124437747	rs143730660	TC	T	4181.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=5.387;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.26;MQRankSum=0.213;QD=34.56;ReadPosRankSum=1.490;SOR=1.861;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,120:0.99:121
chr3	124483420	rs61761679	G	C	1655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=43;PP=1386;SC=GGGACCAGAAGCATGGTAAGC;SOR=4.047;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=4;TCR=43;TR=47;WE=124483428;WS=124483410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	124605736	rs6438861	T	C	111.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=3;PP=66;SC=CGGCTGAGTGTGCGACAAAGT;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=124605744;WS=124605726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	124629222	rs34208404	TA	T	3406.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.525;HP=13;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.323;NF=85;NR=32;PP=1925;ReadPosRankSum=-0.494;SC=CATCTCTCTATAAAAAAAAAA;SOR=2.269;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=113;TCR=42;TR=117;WE=124629231;WS=124629212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,148:0.98:151
chr3	124642579	rs60525593	C	T	4484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=122;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.982;SC=ATCTTCATGCCTCCCCCCTGG;SOR=1.762;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=148;TCF=25;TCR=123;TR=147;WE=124642587;WS=124642569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,149:0.99:150
chr3	124646594	rs4679392	A	G	6899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=116;NR=103;PP=2965;SC=AGCAGTAGGTATAGGAATTGT;SOR=0.806;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=219;TCF=116;TCR=103;TR=219;WE=124646602;WS=124646584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr3	124646705	rs10630030	A	AAAG	7016.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=99;PP=2924;SC=AGCTGTTGGGAAAGGTGTATT;SOR=1.702;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=141;TCF=34;TCR=107;TR=131;WE=124646713;WS=124646695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr3	124653710	rs10934701	A	G	1507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=39;PP=1222;SC=AATACCATAGATCTCTTCCGA;SOR=3.080;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=46;WE=124653718;WS=124653700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	124692689	rs2270778	C	T	6101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=114;PP=2965;SC=ATTCAGCATACGGGGACATTT;SOR=1.048;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=196;TCF=82;TCR=114;TR=196;WE=124692697;WS=124692679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr3	124692785	rs2270779	C	T	2216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=60;PP=1814;SC=AGCTCAATTCCGTAAAGAAGT;SOR=5.136;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=4;TCR=60;TR=64;WE=124692793;WS=124692775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr3	124731485	rs10804567	C	G	2473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=34;PP=1979;ReadPosRankSum=-1.375;SC=GAAGAGGACACTGTTGTTGGT;SOR=0.746;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=123;TCF=70;TCR=53;TR=82;WE=124731493;WS=124731475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,86:0.67:129
chr3	124731689	rs78680419	T	A	2361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.541;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=54;PP=1897;ReadPosRankSum=0.915;SC=ATCAATCCAGTGGTAGCATCC;SOR=0.557;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=129;TCF=44;TCR=85;TR=84;WE=124731697;WS=124731679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,85:0.65:131
chr3	124732419	.	A	AGAGGAGGAGGAGGAAGAG	2658.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=4.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.40;MQRankSum=2.996;QD=34.09;ReadPosRankSum=-0.106;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,45:0.58:78
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chr3	124733649	rs6438873	T	G	1867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.231;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=30;PP=1533;ReadPosRankSum=-0.767;SC=TGTTTCTTGGTGCATGGCCGC;SOR=1.033;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=110;TCF=60;TCR=50;TR=72;WE=124733657;WS=124733639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,71:0.63:112
chr3	124746347	rs4404487	T	C	3559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.405;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=87;PP=2532;ReadPosRankSum=0.849;SC=GAAGACTTTCTGAGGCTGAAA;SOR=1.275;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=184;TCF=72;TCR=112;TR=136;WE=124746355;WS=124746337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,144:0.73:196
chr3	124774432	rs62265663	T	G	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=6;PP=207;SC=CGCTCCCGCCTCTGGGGGCCC;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=124774440;WS=124774422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	124802677	rs1574340	A	G	1137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=0;PP=881;SC=GAAGGTCCTGAGCTTGGGTCC;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=30;WE=124802685;WS=124802667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	124802881	rs2981483	A	G	5211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.07;SOR=0.778;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr3	124802888	rs2981482	C	T	5156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.23;SOR=0.965;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr3	124803043	rs2981481	G	A	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=766;SC=TATATGTACAGGTATATATGA;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=124803051;WS=124803033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	124837684	rs621383	T	C	2295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=41;PP=1751;SC=AAGACGAAGATGATGTACAGA;SOR=0.770;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=38;TCR=41;TR=79;WE=124837692;WS=124837674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr3	124839470	rs863642	G	A	8130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=106;NR=135;PP=2965;SC=CAGGGAGCCCGGGGGAATGCT;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=243;TCF=107;TCR=136;TR=241;WE=124839478;WS=124839460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr3	124854425	rs702048	T	C	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=1;PP=679;SC=ATACCAAGAGTACCTGCAGGC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=124854433;WS=124854415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	124896861	rs545103	C	G	1794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=46;PP=1399;SC=GGACAGAAAGCCATGGGCCCA;SOR=5.136;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=3;TCR=46;TR=49;WE=124896869;WS=124896851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	124912207	rs13322132	C	T	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.188;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=26;PP=1162;ReadPosRankSum=-0.715;SC=GAGTGAGACCCTGTCTCAAAA;SOR=0.416;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=23;TCR=26;TR=48;WE=124912215;WS=124912197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr3	124951171	.	CTT	C,CT	907.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.089;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.21;MQRankSum=1.260;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.410;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:4,17,29:0.34,0.58:50
chr3	124951821	rs1053738	C	T	6959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=126;PP=2965;ReadPosRankSum=1.904;SC=CATTCTCTGACGGGGTGACCT;SOR=0.487;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=206;TCF=79;TCR=127;TR=205;WE=124951829;WS=124951811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,215:1.00:216
chr3	124998098	rs10665336	C	CAAA	1648.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=3;NR=17;PP=514;SC=GGATCTAGTTCAAAAAAAAAA;SOR=2.494;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=20;WE=124998106;WS=124998088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	125179732	rs112803860	C	CATAA	583.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=709;ReadPosRankSum=1.899;SC=ACACACATTGCATAGAGTTAC;SOR=1.739;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=13;WE=125179740;WS=125179722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr3	125223456	rs2076724	C	T	1808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=35;PP=1454;ReadPosRankSum=-1.132;SC=GGTGTAATTTCTGTTACCCAC;SOR=0.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=61;TCR=58;TR=72;WE=125223464;WS=125223446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,73:0.61:119
chr3	125238792	rs56381562	G	A	357.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.702;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=406;ReadPosRankSum=1.274;SC=GGCCCGGCCCGGCCCAGCCCA;SOR=2.030;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=20;WE=125238800;WS=125238782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr3	125250610	rs62270201	A	G	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=0;PP=796;ReadPosRankSum=0.677;SC=TTTAAAAATAAAGATGTATAA;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=31;WE=125250618;WS=125250600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,32:0.65:49
chr3	125270985	rs10541213	GTATA	G	2533.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=10;PP=2176;SC=ATGTGTGTGTGTATATATATA;SOR=3.037;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=66;TCF=51;TCR=15;TR=51;WE=125270998;WS=125270975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	125279122	rs12487030	A	T	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.15;ReadPosRankSum=0.160;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr3	125297715	rs2922184	A	G	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=271;SC=TTTACGGTATATGAATAGTAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=125297723;WS=125297705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	125297747	rs60145406	AT	A	178.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=246;ReadPosRankSum=-0.307;SC=AAGGCAAAAAATAAAAAATAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=5;WE=125297755;WS=125297737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr3	125301711	rs2979382	C	G	3584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=81;NR=23;PP=2855;SC=CCTATTCCTGCTCTCTTAGGA;SOR=2.480;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=81;TCR=23;TR=104;WE=125301719;WS=125301701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr3	125726048	rs2279819	G	C	2954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=57;PP=2316;SC=TCACTTCTGCGAGGTACAGCA;SOR=1.346;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=34;TCR=57;TR=91;WE=125726056;WS=125726038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr3	125734272	rs2279820	G	A	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=358;ReadPosRankSum=0.913;SC=CTGCTGTTCCGGTCCAACCCA;SOR=1.316;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=18;WE=125734280;WS=125734262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr3	125734465	rs9862310	G	A	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.607;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=731;ReadPosRankSum=0.799;SC=TACACTTACAGTGGCCCTGCA;SOR=0.392;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=129;TCF=45;TCR=84;TR=41;WE=125734473;WS=125734455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,43:0.32:136
chr3	125735483	rs142928178	C	T	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.9997;FS=5.611;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=275;ReadPosRankSum=0.889;SC=CACTCCATTCCTGTCCCCCAA;SOR=3.611;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=12;WE=125735491;WS=125735473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr3	125741592	rs3817079	C	T	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=162;ReadPosRankSum=1.912;SC=CCCCCCTCCACGGAGCCTTTG;SOR=0.914;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=54;TCF=46;TCR=8;TR=13;WE=125741600;WS=125741582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,11:0.21:53
chr3	125741901	rs2270984	A	G	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=137;ReadPosRankSum=-0.838;SC=GAGGCTGCTCATTAACTTGCC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=9;WE=125741909;WS=125741891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr3	125741925	rs2270983	T	G	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=58;ReadPosRankSum=0.510;SC=CTCCACAAAGTCCTTGACGTG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=5;WE=125741933;WS=125741915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr3	125745433	rs7646705	C	T	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=207;ReadPosRankSum=1.344;SC=GCTACTGCCTCCTTTCCCTTA;SOR=1.501;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=11;WE=125745441;WS=125745423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr3	125775228	rs7613944	T	C	1883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=12;PP=1401;SC=CCAGGCCGGCTGTCATCATGC;SOR=2.546;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=56;WE=125775236;WS=125775218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	125775428	rs6438964	G	A	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.313;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=504;ReadPosRankSum=-2.180;SC=CCAGGAGCACGAAGTCAGAGC;SOR=0.169;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=23;WE=125775436;WS=125775418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr3	125786662	rs36125006	G	GA	191.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.421;HP=11;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.445;NF=4;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=-0.696;SC=CCAATATATAGAAAAAAAAAA;SOR=0.368;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=41;TCF=23;TCR=18;TR=9;WE=125786670;WS=125786652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr3	125786695	rs4308225	G	A	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.267;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.375;NF=29;NR=7;PP=850;ReadPosRankSum=1.130;SC=AGGACTGCCCGACAACCTTTA;SOR=1.981;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=54;TCF=40;TCR=14;TR=36;WE=125786703;WS=125786685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,36:0.67:54
chr3	125786760	rs4308226	G	A	1280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.274;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=12;PP=918;ReadPosRankSum=-0.529;SC=GCAGTGCCCCGCTCCCTGTCC;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=69;TCF=48;TCR=21;TR=46;WE=125786768;WS=125786750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,50:0.68:73
chr3	125786879	rs4234270	T	C	4566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=67;PP=2965;SC=ATGGACCAGGTGGTCTCCCTG;SOR=0.887;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=86;TCR=67;TR=153;WE=125786887;WS=125786869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr3	125824334	rs4646755	T	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=87;ReadPosRankSum=-2.758;SC=GCCTCCTGGCTGGAGTGTCTC;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=8;WE=125824342;WS=125824324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr3	125824382	rs10934744	C	A	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.365;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=259;ReadPosRankSum=0.484;SC=CCAGCACGACCCCCCTCTGCA;SOR=2.036;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=48;TCR=4;TR=17;WE=125824390;WS=125824372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
chr3	125825938	rs9282690	C	T	2271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.506;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=26;PP=1799;ReadPosRankSum=-0.764;SC=CCCAGTAACACGTGGGAGAGA;SOR=1.017;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=130;TCF=89;TCR=41;TR=86;WE=125825946;WS=125825928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,88:0.66:134
chr3	125826003	rs4646750	T	C	3320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.245;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=62;PP=2466;ReadPosRankSum=-1.106;SC=AACCGAGAGATGATCATGACA;SOR=0.432;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=195;TCF=108;TCR=87;TR=131;WE=125826011;WS=125825993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,135:0.67:202
chr3	125831572	rs4646744	GGC	G	997.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=924;SC=CCTCCAGCCAGGCGCTGCTGT;SOR=4.892;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=20;WE=125831581;WS=125831562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	125834176	rs11716254	C	T	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.481;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=272;ReadPosRankSum=0.669;SC=TAGGAGGCTCCACTGGGGAGG;SOR=1.688;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=14;WE=125834184;WS=125834166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr3	125836796	rs4646742	C	T	1745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=10.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.86;ReadPosRankSum=1.356;SOR=2.285;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,44:0.68:65
chr3	125836803	rs4646741	G	A	1862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=6.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.24;ReadPosRankSum=0.639;SOR=1.823;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,47:0.66:71
chr3	125836833	rs4646740	C	G	1672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.783;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=24;PP=1333;ReadPosRankSum=-2.220;SC=CTCTGCTCCACCCCCAGCCAC;SOR=0.501;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=98;TCF=63;TCR=35;TR=65;WE=125836841;WS=125836823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,65:0.65:100
chr3	125843400	rs3217578	A	AG	1192.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=28;PP=1267;SC=GCAAGCTGGGAGAGTAGCTGC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=28;WE=125843408;WS=125843390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	125844718	rs2278756	G	A	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=67;ReadPosRankSum=1.080;SC=GGCAGCTCACGCCTGCTGTTT;SOR=0.348;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=9;WE=125844726;WS=125844708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,9:0.22:40
chr3	125848911	rs1868125	A	G	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=1;PP=356;SC=CCTTACAACAATGCCTGGCAT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=125848919;WS=125848901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	125848945	rs2365002	T	C	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=531;SC=AAGAAGCACATGGATGGCTGT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=125848953;WS=125848935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	125849031	rs873696	C	T	1107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=15;PP=925;SC=TGGAAAGCACCGCGAGGCTGC;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=21;TCR=15;TR=36;WE=125849039;WS=125849021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	125849238	rs2002287	G	A	1389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=27;PP=1152;SC=AAGTCAAAGCGACCAGCTTAG;SOR=1.105;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=18;TCR=27;TR=45;WE=125849246;WS=125849228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	125850101	rs4646733	CA	TG	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=1147;SC=AAACAGGTGTCATTCCAAGCC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=20;WE=125850110;WS=125850091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	125850169	rs3821451	T	C	1758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=5;PP=1531;SC=CTTGGAGTTCTCCTATATGGC;SOR=4.215;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=49;TCR=5;TR=54;WE=125850177;WS=125850159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	125850193	rs3816366	A	G	2170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=14;PP=1633;SC=GCCAGTCTGCATGTGCTCACA;SOR=2.804;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=61;TCR=14;TR=75;WE=125850201;WS=125850183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	125850381	rs2305228	A	G	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=38;PP=1103;SC=TGCCAACCTGACCAGGGTGAG;SOR=4.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=41;WE=125850389;WS=125850371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	125854409	rs2276724	T	C	5039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.868;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=94;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.065;SC=TCCCGCGCACTGATCTTCCCC;SOR=0.654;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=306;TCF=156;TCR=150;TR=198;WE=125854417;WS=125854399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,204:0.65:316
chr3	125855599	rs2305229	G	T	2166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=22.493;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=20;PP=1733;ReadPosRankSum=-0.895;SC=TGCTGGGCCTGCACTCACACT;SOR=0.041;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=122;TCF=99;TCR=23;TR=79;WE=125855607;WS=125855589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,79:0.65:122
chr3	125856695	rs2305230	C	A	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=710;ReadPosRankSum=1.958;SC=CGTCCCCTCGCAGCTTCCTCA;SOR=0.639;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=61;TCF=40;TCR=21;TR=36;WE=125856703;WS=125856685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,37:0.61:61
chr3	125856916	rs6799991	A	G	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=111;ReadPosRankSum=-1.200;SC=CCCAGCACCGAGAGGTAGCCA;SOR=0.293;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=6;WE=125856924;WS=125856906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr3	125865766	rs2886059	C	A	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.430;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=26;PP=716;ReadPosRankSum=-0.093;SC=CGCTGCCAAACACTCTGCAAA;SOR=1.125;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=32;WE=125865774;WS=125865756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,36:0.69:52
chr3	125876450	rs41266449	C	G	2677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-8.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=88;PP=2103;ReadPosRankSum=1.072;SC=AGGAGGCCCTCTCTTCCCAGG;SOR=1.078;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=132;TCF=3;TCR=129;TR=90;WE=125876458;WS=125876440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,95:0.68:140
chr3	125878370	rs4646702	C	G	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=29;PP=690;ReadPosRankSum=-1.810;SC=TGGACTGGCTCTCCTCTCCGG;SOR=2.577;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=55;TCF=11;TCR=44;TR=32;WE=125878378;WS=125878360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,34:0.60:57
chr3	126133239	rs6775131	C	T	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=132;ReadPosRankSum=-0.176;SC=TGTCACCACTCTTCTTGGGTC;SOR=0.177;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=10;WE=126133247;WS=126133229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr3	126138778	rs2271630	T	C	1924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=23;PP=1411;SC=TGCTGAAGCTTGGCTGCAGCT;SOR=1.234;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=37;TCR=23;TR=60;WE=126138786;WS=126138768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	126142433	rs140223152	CGGA	C	3624.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.101;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.062;NF=22;NR=54;PP=2970;ReadPosRankSum=-1.110;SC=AGCCAGGAGACGGAGAAGACC;SOR=1.046;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=129;TCF=41;TCR=88;TR=76;WE=126142443;WS=126142423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,93:0.62:149
chr3	126142496	rs13064828	T	C	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.101;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=27;PP=599;ReadPosRankSum=-0.907;SC=ATGTAGGTGCTATGCGGTGGC;SOR=2.000;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=89;TCF=25;TCR=64;TR=32;WE=126142504;WS=126142486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,35:0.37:95
chr3	126151797	rs35133442	T	C	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=28;ReadPosRankSum=0.697;SC=CCCATGATCCTTCAGCCCTCA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=126151805;WS=126151793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr3	126157464	rs11444454	T	TG	262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=353;ReadPosRankSum=1.512;SC=TGTTCTTTGATGAAAAATGAA;SOR=0.693;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=10;WE=126157472;WS=126157454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr3	126158622	rs1799404	A	C	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=2.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.09;ReadPosRankSum=-0.687;SOR=0.988;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,26:0.25:103
chr3	126160884	rs63288960	CATTA	C	520.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=343;ReadPosRankSum=1.760;SC=ACAGCCTTCCCATTAATTGTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=9;WE=126160895;WS=126160874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr3	126169091	rs777493	T	C	3616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=21;PP=2695;SC=CAACCTTGGATGCGTAAGGGT;SOR=2.664;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=113;TCF=91;TCR=22;TR=112;WE=126169099;WS=126169081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr3	126169230	rs777494	C	T	4376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=84;PP=2965;SC=TAGAGATCCACGCACCCTCCC;SOR=1.286;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=49;TCR=84;TR=133;WE=126169238;WS=126169220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr3	126169472	rs777495	T	C	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=13;PP=358;SC=CCTACCCGCATCTCCCTTCCT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=126169480;WS=126169462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	126181071	rs6775965	A	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=90;ReadPosRankSum=-1.353;SC=GATCTGAAAAAAAAAGGAATA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=7;WE=126181079;WS=126181061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr3	126184941	rs1799389	C	T	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=315;ReadPosRankSum=0.070;SC=GGCACTGGCACTGTTCCCGTT;SOR=1.852;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=16;WE=126184949;WS=126184937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr3	126185238	rs1687463	C	T	1970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.890;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=50;PP=1560;ReadPosRankSum=-0.273;SC=TGACACTTCCCCATCAGATCA;SOR=0.524;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=106;TCF=30;TCR=76;TR=72;WE=126185246;WS=126185228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,74:0.70:106
chr3	126189919	rs777499	A	G	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.762;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=47;PP=1512;ReadPosRankSum=-0.915;SC=AACTCACCATAATTCTTTAAA;SOR=0.327;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=91;TCF=25;TCR=66;TR=67;WE=126189927;WS=126189909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,70:0.71:99
chr3	126194076	rs812367	T	C	1706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.993;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=43;PP=1280;ReadPosRankSum=-0.595;SC=AGCCCTCCAGTGGGCACTTGA;SOR=0.472;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=149;TCF=58;TCR=91;TR=75;WE=126194084;WS=126194066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,74:0.50:147
chr3	126194357	rs7624748	G	C	1438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.28;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	126202147	rs79648980	G	A	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.672;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=8;PP=719;ReadPosRankSum=-0.080;SC=GACAGCAAACGTGGATGGGGA;SOR=0.232;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=134;TCF=118;TCR=16;TR=45;WE=126202155;WS=126202137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,47:0.33:142
chr3	126207222	rs777483	A	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.600;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=188;ReadPosRankSum=-2.198;SC=CTGCTAGGCCAGAAGGATGGG;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=126207230;WS=126207212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr3	126208249	rs777479	A	C	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=33;PP=823;ReadPosRankSum=0.679;SC=GCTGTCAGCCAACAGTGTCCA;SOR=1.565;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=34;WE=126208257;WS=126208239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,34:0.67:51
chr3	126211479	rs2307882	C	CCTCT	824.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.042;NF=1;NR=17;PP=875;ReadPosRankSum=1.099;SC=AGCCTGAGCGCCTAACAAGGT;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=18;WE=126211487;WS=126211468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr3	126215130	rs6797423	G	A	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.023;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=461;ReadPosRankSum=-0.558;SC=AGCAGTGCCAGTGGCCCCATG;SOR=3.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=21;WE=126215138;WS=126215120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr3	126216829	rs13098666	T	A	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.381;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=537;ReadPosRankSum=1.265;SC=TAGAAGCTTGTCTCTATGGAG;SOR=0.460;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=26;WE=126216837;WS=126216819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr3	126218159	rs6771670	T	A	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.303;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=14;PP=970;ReadPosRankSum=0.869;SC=ACACTAGATGTGGCAGCCGCC;SOR=0.190;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=66;TCF=49;TCR=17;TR=46;WE=126218167;WS=126218149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,50:0.71:70
chr3	126218769	rs35907154	T	C	912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=0;PP=563;SC=AGAGGCACAGTGAAGCCTCGG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=126218777;WS=126218764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	126218788	rs6774768	T	C	1188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=1;PP=903;SC=GGTCAGGATTTGCTGGGCCAC;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=126218796;WS=126218778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	126219030	rs13072404	T	C	2369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=66;PP=1822;SC=ACCACCGCTGTGAGGCCCTGG;SOR=2.598;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=19;TCR=66;TR=85;WE=126219038;WS=126219020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr3	126219086	rs13092625	A	G	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=32;PP=1062;SC=CATGCTCCCCACCAACTTCCA;SOR=3.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=36;WE=126219094;WS=126219076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	126219117	rs13092793	C	T	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=1;HapScore=4;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=381;ReadPosRankSum=-2.138;SC=CTGGACTGCTCCTGCTCCTCG;SOR=2.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=10;WE=126219134;WS=126219107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr3	126219126	rs149577952	C	T	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=3;HapScore=4;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=538;ReadPosRankSum=1.317;SC=TCCTGCTCCTCGGGTCGGCAC;SOR=0.132;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=9;WE=126219134;WS=126219107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr3	126219627	rs34025926	G	A	2786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=69;PP=2235;ReadPosRankSum=0.217;SC=GGTAGTAGCCGCCATTGAACG;SOR=0.720;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=58;TCR=107;TR=106;WE=126219635;WS=126219617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,108:0.65:167
chr3	126219750	rs201018413	A	C	1103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=1408;ReadPosRankSum=0.302;SC=AGTGCAAGCCACACACAGCCT;SOR=0.593;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=16;WE=126219771;WS=126219740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,28:0.76:37
chr3	126219752	rs139417364	ACACAGCCTGGGC	A	1091.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=2970;ReadPosRankSum=0.347;SC=TGCAAGCCACACACAGCCTGG;SOR=0.527;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=15;WE=126219771;WS=126219740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,26:0.74:35
chr3	126219973	rs1177565	T	C	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=1;PP=1262;SC=CTTTGTGTCCTGGCAGCTCCT;SOR=6.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=44;WE=126219981;WS=126219963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	126220539	rs9844797	A	G	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=3;PP=979;SC=ATATTTTGGGAAACAGAAGAT;SOR=3.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=35;WE=126220547;WS=126220529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	126220845	rs7643584	G	A	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=695;SC=TCCTCAGCTCGGGGGTTGCGG;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=126220853;WS=126220835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	126226518	rs9784244	C	T	4300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=103;NR=35;PP=2965;SC=AATATCACCACTTTGCTTTAT;SOR=2.203;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=139;TCF=104;TCR=35;TR=138;WE=126226526;WS=126226508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr3	126227185	rs16837531	G	A	1889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=16;PP=1483;SC=CTGTGGGTTTGTAAGCTCCTA;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=59;WE=126227193;WS=126227175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	126228410	rs729456	G	A	1835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=26;PP=1435;SC=GCTGGGCCTCGGTTTCCCTGG;SOR=0.796;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=30;TCR=26;TR=56;WE=126228418;WS=126228400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	126236348	rs1687480	T	C	1307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=13;PP=1083;SC=CAGCTCCCACTAAGAGGGCAG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=39;WE=126236356;WS=126236338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	126268953	rs869464	T	G	2237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=58;PP=1805;SC=ACGCCTGGCCTTCAGGACCCC;SOR=2.932;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=13;TCR=58;TR=71;WE=126268961;WS=126268943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	126270757	rs13071443	G	T	1275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=1;PP=1095;SC=TAACATGAACGTCTGCATGCA;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=37;WE=126270765;WS=126270747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	126328101	rs9856833	A	G	2156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=42;PP=1634;SC=CAGTAAAAGCATACAATAGAT;SOR=1.362;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=24;TCR=42;TR=66;WE=126328109;WS=126328091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	126329910	rs777241	A	G	4404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=63;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.791;SC=TTATCTTTGCATAACAAGTGT;SOR=0.579;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=89;TCR=64;TR=150;WE=126329918;WS=126329900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,154:0.98:157
chr3	126340553	rs3732534	G	A	3510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=86;NR=18;PP=2913;SC=ATCTTGATCAGGACATTATCT;SOR=2.899;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=86;TCR=18;TR=104;WE=126340561;WS=126340543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr3	126365127	rs11453652	C	CT	2738.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=62;PP=2936;SC=GTGAGTTAAACAAAGTGTTAC;SOR=5.640;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=63;TCF=1;TCR=62;TR=63;WE=126365135;WS=126365117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	126373994	rs3108755	A	G	1336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=29;NR=14;PP=1164;SC=CCGCCCCCCAACACCGCCCCG;SOR=1.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=43;WE=126374002;WS=126373984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	126633419	rs2303994	C	G	2616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=3;PP=2150;SC=CTTTGATGCCCGTCAAGAAAT;SOR=6.251;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=89;TCR=3;TR=92;WE=126633427;WS=126633409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr3	126676545	rs56031528	C	T	2156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=52;PP=1891;SC=AGGGATTCTTCGCTTTCCTCA;SOR=3.126;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=11;TCR=52;TR=63;WE=126676553;WS=126676535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	126708453	rs6773789	T	C	6028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=116;PP=2965;SC=TGCTGTTCACTGTGTTCGCCC;SOR=1.213;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=77;TCR=117;TR=193;WE=126708461;WS=126708443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr3	126724151	rs73196539	G	A	1162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=32;PP=915;SC=TCCAGTTGCCGCCTGTTTAGC;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=126724159;WS=126724141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	126733053	rs11719489	C	T	4506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.748;SC=CGGCCCTGCGCGAGAGCTGCG;SOR=0.832;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=43;TCR=103;TR=144;WE=126733061;WS=126733043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,139:0.99:140
chr3	126739291	rs6439030	T	C	1093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=37;PP=922;SC=GCAGCCTGTGTGGCCTGGGGG;SOR=3.967;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=41;WE=126739299;WS=126739281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	126746690	rs9851451	A	G	2301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=41;PP=1788;SC=TCTCCTTGCCAGGAACACCAT;SOR=1.091;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=31;TCR=41;TR=72;WE=126746698;WS=126746680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	126746731	rs9833827	T	G	2356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=39;PP=1898;SC=AGGGGCAGGTTGGGGGTAGGC;SOR=0.934;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=30;TCR=39;TR=69;WE=126746739;WS=126746721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	126748688	rs112797556	A	G	992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=0;PP=818;SC=GTGCCAGCCAACGCGGGCGCT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=126748696;WS=126748678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	126751478	rs9840115	C	T	2352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=25;PP=2038;SC=GGCAGGGGCCCGGGGGCAGCC;SOR=1.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=44;TCR=25;TR=69;WE=126751486;WS=126751468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr3	126751689	rs6439031	G	A	5294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=114;PP=2965;SC=GGTGAACACCGTGGGAGCCCA;SOR=1.596;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=171;TCF=56;TCR=115;TR=170;WE=126751697;WS=126751679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr3	126752969	rs7621885	C	A	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=11;PP=383;SC=CGGGCCGCCGCAGTGCAGCGA;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=126752977;WS=126752959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	126880488	rs7625800	T	C	3247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=92;NR=1;PP=2734;SC=CCTGCCCCTCTCTCTGCCTGG;SOR=7.722;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=93;TCF=92;TCR=1;TR=93;WE=126880496;WS=126880478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr3	127106144	rs9856643	C	A	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=476;ReadPosRankSum=0.519;SC=GTCACTCACCCGGCAGTGTCA;SOR=0.748;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=114;TCF=67;TCR=47;TR=35;WE=127106152;WS=127106134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,35:0.35:99
chr3	127106259	rs9856935	C	T	1706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.256;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=38;PP=1352;ReadPosRankSum=0.545;SC=CAGTGTCATCCCCCACCAGTG;SOR=0.463;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=196;TCF=108;TCR=88;TR=79;WE=127106267;WS=127106249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,75:0.39:191
chr3	127323830	rs893293	C	T	1972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.373;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=26;PP=1420;ReadPosRankSum=0.247;SC=AGGAGATGATCGAGAGCATCG;SOR=0.864;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=237;TCF=157;TCR=80;TR=85;WE=127323838;WS=127323820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,87:0.36:243
chr3	127329929	rs17497006	G	A	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=444;ReadPosRankSum=-0.557;SC=TTTTACATGCGAGGAAGACAG;SOR=0.337;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=19;WE=127329937;WS=127329919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr3	127336934	rs782427	A	G	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=2.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.86;ReadPosRankSum=-0.055;SOR=0.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,43:0.25:170
chr3	127379270	rs920232	C	T	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-5.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=22;PP=551;ReadPosRankSum=-1.351;SC=TTGAAGACACCAGCCAGGCTC;SOR=0.659;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=95;TCF=40;TCR=55;TR=38;WE=127379278;WS=127379260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,41:0.41:101
chr3	127391018	rs813633	A	G	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=-0.547;SC=GTGCCGCGGGAACCCCCTGGG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=6;WE=127391026;WS=127391008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr3	127396220	rs1658037	T	C	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.694;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=274;ReadPosRankSum=-1.195;SC=CCTTGTGTGGTCCTGGACCAG;SOR=0.574;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=47;TCF=24;TCR=23;TR=15;WE=127396228;WS=127396210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,15:0.31:49
chr3	127429567	rs1010174	C	G	1427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=34;PP=1150;SC=CCCGGCTCTTCCGCAGTGACA;SOR=2.461;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=43;WE=127429575;WS=127429557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	127440083	rs13088071	A	C	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=58;PP=1361;SC=TGACCAATGCAGTCCTCTTAA;SOR=8.121;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=0;TCR=58;TR=58;WE=127440091;WS=127440073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr3	127641968	rs4141499	C	A	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.865;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=4;PP=989;ReadPosRankSum=-1.577;SC=GAATAAAATTCAGAACATGAA;SOR=0.204;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=72;TCF=67;TCR=5;TR=45;WE=127641976;WS=127641958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,50:0.65:77
chr3	127703085	rs13100951	G	A	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.059;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=35;PP=726;ReadPosRankSum=-0.138;SC=TCATCCCCCCGCCTTCAGATT;SOR=2.833;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=59;TCF=4;TCR=55;TR=36;WE=127703093;WS=127703075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,38:0.64:59
chr3	127775788	rs9847934	T	A	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.36;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	127783701	.	TCTC	T	976.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=657;ReadPosRankSum=1.234;SC=TTCATATATGTCTCCTCCTCT;SOR=1.410;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=16;WE=127783711;WS=127783691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr3	127980995	rs61740550	C	T	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.925;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=23;PP=1240;ReadPosRankSum=0.011;SC=CGATTATACCCGTGGCGGCCA;SOR=1.197;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=102;TCF=57;TCR=45;TR=59;WE=127981003;WS=127980985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,61:0.58:105
chr3	127983495	rs2811544	T	C	4178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=42;PP=2965;SC=CAACGAGAGATCCCTCGGGAC;SOR=1.592;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=88;TCR=42;TR=130;WE=127983503;WS=127983485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr3	128181777	rs2659690	A	G	4435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.713;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=79;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.123;SC=CCAGGCCACCAAAAAACTCCC;SOR=0.404;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=243;TCF=135;TCR=108;TR=167;WE=128181785;WS=128181767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,175:0.70:249
chr3	128182074	rs2981026	G	A	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=492;ReadPosRankSum=-0.278;SC=CCAGCACTTCGTAGTAGTTAG;SOR=0.599;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=81;TCF=9;TCR=72;TR=27;WE=128182082;WS=128182064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,26:0.31:85
chr3	128200806	rs11708606	G	A	4290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.753;SC=GCAAGGCAGCGTCAGCAGGCT;SOR=0.736;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=45;TCR=97;TR=140;WE=128200814;WS=128200796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,143:0.99:144
chr3	128204877	rs34870876	C	G	1890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.511;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=56;PP=1627;ReadPosRankSum=2.612;SC=ACGCAGCCCCCGTGGTGCTAG;SOR=1.501;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=101;TCF=22;TCR=79;TR=69;WE=128204885;WS=128204867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,69:0.67:103
chr3	128205860	rs1573858	G	C	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=196;ReadPosRankSum=0.466;SC=GCGGCTGCTCGGGCGCCACCT;SOR=0.464;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=58;TCF=2;TCR=56;TR=18;WE=128205868;WS=128205850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,21:0.33:63
chr3	128292060	rs2734045	G	A	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=4.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=-2.401;QD=7.27;ReadPosRankSum=0.508;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,27:0.35:77
chr3	128292062	rs200346912	CT	C	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=3.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=2.111;QD=0.75;ReadPosRankSum=0.228;SOR=0.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,11:0.19:58
chr3	128292213	rs2734046	A	G	3770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=43;PP=2965;SC=GCTGGAAACCAGAGCTTGATG;SOR=1.397;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=81;TCR=43;TR=124;WE=128292221;WS=128292203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr3	128348735	rs11453536	G	GA	45.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.542;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=0.623;SC=ATAATTGAAAGAAAAAAATTC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=6;WE=128348743;WS=128348725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr3	128350684	rs4857914	C	T	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.828;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr3	128351054	rs9868579	T	C	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=250;ReadPosRankSum=1.205;SC=AATGCACCATTAGTTTAAATC;SOR=0.321;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=13;WE=128351062;WS=128351044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr3	128356852	rs1697	C	T	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.697;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=685;ReadPosRankSum=-0.350;SC=GGGTTGGATACGGATGAAGCA;SOR=0.791;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=52;TCR=65;TR=40;WE=128356860;WS=128356842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,44:0.35:125
chr3	128363332	rs2811497	C	T	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=69;ReadPosRankSum=-0.005;SC=ACTAAAAATACATACATATAC;SOR=0.330;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=6;WE=128363340;WS=128363322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr3	128516743	rs372458845	C	T	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=227;ReadPosRankSum=1.351;SC=AGTTTCAGGACCCTCCTATTT;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=14;WE=128516751;WS=128516733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr3	128580574	rs789248	T	C	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=5.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.209;SOR=0.288;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,22:0.26:85
chr3	128580585	rs789247	C	A	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.957;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=1011;ReadPosRankSum=-1.972;SC=GGCACCTCCACGGCAGAAATG;SOR=0.452;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=88;TCF=59;TCR=29;TR=27;WE=128580593;WS=128580564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,29:0.32:92
chr3	128612659	rs1680780	G	C	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-6.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=213;ReadPosRankSum=-0.926;SC=AAGTGTTCTCGGGTCCTGTGC;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=1;TCR=58;TR=18;WE=128612667;WS=128612649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,19:0.30:63
chr3	128614075	rs11379527	G	GA	121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=1.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.10;ReadPosRankSum=0.461;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,12:0.21:58
chr3	128614133	rs1683791	C	T	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.841;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=559;ReadPosRankSum=-0.551;SC=CTGTGATTGACGCTGGTCCAT;SOR=0.553;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=111;TCF=80;TCR=31;TR=37;WE=128614141;WS=128614123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,37:0.33:111
chr3	128614185	rs1680778	A	C	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=21;PP=653;ReadPosRankSum=-0.571;SC=CATGTACTCAAGACTAGGGGA;SOR=0.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=99;TCR=64;TR=53;WE=128614193;WS=128614175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,54:0.32:170
chr3	128616325	rs1683804	C	T	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.258;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=498;ReadPosRankSum=0.410;SC=AGACATCCTGCAGCTTGGAAA;SOR=2.642;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=58;TCR=4;TR=25;WE=128616333;WS=128616315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,25:0.39:64
chr3	128616359	rs789213	C	G	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.016;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=10;PP=940;ReadPosRankSum=-0.488;SC=TCTGACCCTTCATTTTAAAAG;SOR=0.431;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=110;TCF=88;TCR=22;TR=45;WE=128616367;WS=128616349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,45:0.39:114
chr3	128618366	.	G	GGTGT	113.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=-0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.000;QD=11.37;ReadPosRankSum=-1.019;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr3	128622760	rs1683776	G	T	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.026;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=235;ReadPosRankSum=0.684;SC=GCAAGTGGGGGTGCCAGCTTC;SOR=1.565;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=14;WE=128622768;WS=128622750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr3	128624880	rs1683777	T	G	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.377;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=64;ReadPosRankSum=-0.672;SC=CCCAAGCCCGTGTGCCTCCCA;SOR=0.036;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=7;WE=128624888;WS=128624870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr3	128626952	rs1683786	T	C	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=308;ReadPosRankSum=0.023;SC=AGTGGCCGGCTCTACCCAGCA;SOR=0.350;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=61;TCF=58;TCR=3;TR=18;WE=128626960;WS=128626942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,19:0.30:64
chr3	128627021	rs1683787	A	G	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.692;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=584;ReadPosRankSum=-1.940;SC=TACACTACTGACCACAGGGAA;SOR=0.592;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=98;TCR=53;TR=42;WE=128627029;WS=128627011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,42:0.26:159
chr3	128627753	rs876754	T	C	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.173;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=388;ReadPosRankSum=-0.137;SC=GAATGGGCCATGTTGCTGGAC;SOR=0.203;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=48;TCF=43;TCR=5;TR=21;WE=128627761;WS=128627743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,21:0.40:52
chr3	128627933	rs876755	C	T	2074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.514;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=46;PP=1572;ReadPosRankSum=1.519;SC=TTGTGCACCCCAGTCTTGCGG;SOR=0.746;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=204;TCF=95;TCR=109;TR=83;WE=128627941;WS=128627923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,85:0.41:209
chr3	128629039	rs150666665	CCTG	C	550.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.136;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=676;ReadPosRankSum=-0.142;SC=TGCCATCTGTCCTGCTGCACT;SOR=0.489;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=17;WE=128629049;WS=128629029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,17:0.29:59
chr3	128629505	rs3830293	C	CTGAT	1084.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.125;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=1174;ReadPosRankSum=-0.400;SC=CCCAGTTTGGCTGATAGGCTG;SOR=0.987;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=75;TCF=56;TCR=19;TR=23;WE=128629513;WS=128629495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,28:0.37:75
chr3	128653952	rs883602	A	G	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=63;ReadPosRankSum=1.497;SC=ACCACATGCGAGCTGCCACTG;SOR=0.086;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=5;WE=128653960;WS=128653942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr3	128663955	rs7619327	G	A	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.947;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=204;ReadPosRankSum=1.974;SC=AGCCTTGGTCGGCCAGGCCTT;SOR=1.329;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=13;WE=128663963;WS=128663945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,14:0.26:54
chr3	128664654	rs9289336	G	T	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.251;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=663;ReadPosRankSum=1.397;SC=CCACCACCATGGGGGGGCCCT;SOR=1.488;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=107;TCF=34;TCR=73;TR=35;WE=128664662;WS=128664644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,36:0.33:108
chr3	128720487	rs1871951	A	G	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=2;PP=659;SC=GCCGGTCAGCACGGGCGCGGA;SOR=3.841;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=128720495;WS=128720477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	128755814	rs3732429	T	C	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.565;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=633;ReadPosRankSum=-0.695;SC=CCCCTTCTCTTCCCAGGCAGA;SOR=0.512;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=114;TCF=52;TCR=62;TR=38;WE=128755822;WS=128755804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,41:0.35:118
chr3	128755953	rs3732430	G	A	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=199;ReadPosRankSum=1.699;SC=CAGAGGCTCCGGGACCTGGTA;SOR=1.022;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=12;WE=128755961;WS=128755943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr3	128755971	rs3732431	G	A	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.114;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=240;ReadPosRankSum=-0.406;SC=GTAGGCTCACGGGAGAGCTGC;SOR=2.187;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=12;WE=128755979;WS=128755961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr3	128757560	rs2306529	C	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=28;ReadPosRankSum=-0.566;SC=GGGGGAGGAGCTTTATCTGTC;SOR=0.061;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=3;WE=128757568;WS=128757550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr3	128781123	rs115005114	C	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.625;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=85;ReadPosRankSum=-0.748;SC=TTGAGCCAGGCCCCCAGAACC;SOR=1.022;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=5;WE=128781131;WS=128781113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr3	128849360	rs13081244	C	T	2142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.639;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=10;PP=1775;ReadPosRankSum=0.424;SC=GAGAAGCCCCCGGCGCCCAGG;SOR=1.225;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=108;TCF=91;TCR=17;TR=71;WE=128849368;WS=128849350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,72:0.66:109
chr3	128853622	rs7646403	C	G	2054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=1;PP=1729;SC=TTTCAAAGGACACAACAGAAA;SOR=6.770;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=59;TCF=58;TCR=1;TR=59;WE=128853630;WS=128853612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	128859202	rs10664499	C	CTTAG	9791.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=142;NR=25;PP=2974;SC=CTGTCACAAACTTACTTACGT;SOR=3.600;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=182;TCF=155;TCR=27;TR=167;WE=128859210;WS=128859192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr3	128864520	rs9842978	C	G	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=7;PP=851;SC=CTGTATCAAGCGACTACTATG;SOR=2.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=34;WE=128864528;WS=128864510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	128864540	rs9880527	A	G	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=8;PP=840;SC=GGCAAGAATGAGCTGGGAACT;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=38;WE=128864548;WS=128864530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	128877521	rs4452346	C	T	2081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=56;PP=1574;SC=CATTCATATACAAATATTGTA;SOR=8.318;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=0;TCR=56;TR=56;WE=128877529;WS=128877511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	128889911	.	T	G	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.498;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.633;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=320;ReadPosRankSum=0.253;SC=AACAACATTCTGACACCTTAC;SOR=1.536;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=20;WE=128889919;WS=128889901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr3	128890350	rs4303883	G	A	10653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=179;NR=155;PP=2965;SC=GATAACAAATGTCTGGAAGAG;SOR=0.849;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=334;TCF=179;TCR=155;TR=334;WE=128890358;WS=128890340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,343:1.00:343
chr3	129020778	rs6765930	A	G	1475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.520;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=6;PP=1115;ReadPosRankSum=0.336;SC=CCATTGTCTTAACTTCCCTGG;SOR=1.142;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=71;TCF=61;TCR=10;TR=49;WE=129020786;WS=129020768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,51:0.72:71
chr3	129100228	rs113169163	T	C	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.128;NF=22;NR=32;PP=726;ReadPosRankSum=-0.778;SC=AGACACTGATTGGCGTGCACT;SOR=0.883;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=156;TCF=70;TCR=86;TR=54;WE=129100236;WS=129100218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,57:0.35:164
chr3	129100288	rs62266952	A	G	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.997;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.252;NF=13;NR=52;PP=1340;ReadPosRankSum=-0.976;SC=GAAGGTAAGCATCTAGCCAGC;SOR=1.384;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=108;TCF=26;TCR=82;TR=65;WE=129100296;WS=129100278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,64:0.59:109
chr3	129120743	rs6764765	A	G	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.853;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=129;ReadPosRankSum=-0.244;SC=GACAGGCCAGAGCTGAGGCTT;SOR=0.313;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=11;WE=129120751;WS=129120733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,11:0.23:48
chr3	129130018	rs73202271	G	A	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=-0.378;SC=TGTCGCTGCCGCTCGCGGTAC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=7;WE=129130026;WS=129130008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr3	129137025	rs56323212	G	A	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=242;ReadPosRankSum=0.591;SC=GGGAGGGGCGGGGGTGGCAAA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=14;WE=129137033;WS=129137015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr3	129140489	rs3774788	T	C	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.20;ReadPosRankSum=1.690;SOR=0.662;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,40:0.27:149
chr3	129140738	rs60414131	A	T	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.21;ReadPosRankSum=-1.003;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,16:0.22:74
chr3	129147418	rs3796391	G	A	3026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.939;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=83;PP=2385;ReadPosRankSum=-0.942;SC=CGGGGTATCAGATAAACCGTA;SOR=1.175;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=152;TCF=34;TCR=118;TR=104;WE=129147426;WS=129147408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,107:0.69:156
chr3	129151927	rs140697	G	A	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=6.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.553;SOR=1.262;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,51:0.28:181
chr3	129152089	rs140696	G	A	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.843;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=32;PP=584;ReadPosRankSum=-0.953;SC=TTGCCATTTTGCCTGGGAAGT;SOR=0.988;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=133;TCF=30;TCR=103;TR=39;WE=129152097;WS=129152079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,44:0.31:142
chr3	129152144	rs140695	T	C	2250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=74;PP=1816;SC=GCTGATTTCATGTTCAAGTAG;SOR=5.084;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=5;TCR=74;TR=79;WE=129152152;WS=129152134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	129153036	rs140694	G	C	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.13;ReadPosRankSum=-1.192;SOR=0.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,5:0.17:29
chr3	129155670	rs10342	C	T	2242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.384;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=58;PP=1668;ReadPosRankSum=-0.429;SC=TCACTTTCAGCATCTGCTTTA;SOR=0.893;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=277;TCF=122;TCR=155;TR=97;WE=129155678;WS=129155660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,101:0.35:289
chr3	129156536	rs140692	A	G	2416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.375;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=42;PP=1876;ReadPosRankSum=-1.077;SC=ATTTGGCTGTACTATCTTTAC;SOR=0.788;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=352;TCF=204;TCR=148;TR=105;WE=129156544;WS=129156526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:250,109:0.30:359
chr3	129168854	rs370254601	CTT	C	158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=0.833;QD=4.29;ReadPosRankSum=0.738;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,9:0.24:37
chr3	129177346	rs2285349	C	T	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.15;ReadPosRankSum=-1.440;SOR=0.076;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,8:0.21:39
chr3	129179623	rs113240923	C	CTG	789.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.806;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.431;NF=17;NR=2;PP=763;ReadPosRankSum=-2.053;SC=AGGACTAAAACGGGTTGAGAC;SOR=0.101;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=60;TCF=57;TCR=3;TR=19;WE=129179631;WS=129179613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,22:0.34:65
chr3	129182588	rs55860024	T	C	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=194;ReadPosRankSum=-0.011;SC=TAGGCCCCTGTATTTCCTTTT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=13;WE=129182596;WS=129182578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,13:0.24:55
chr3	129185641	rs6770233	T	C	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.069;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr3	129185661	rs6805886	C	A	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=427;SC=GGGCTCCTTGCCAGGATTTTA;SOR=4.615;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=129185669;WS=129185651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	129185924	rs56379561	G	A	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=277;ReadPosRankSum=0.450;SC=GTGTGTCCCAGTGAGTGGGAA;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=13;WE=129185932;WS=129185914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr3	129188023	rs2285350	T	G	152.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5436;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=117;ReadPosRankSum=-0.366;SC=GTAAGACTGATTGATGGGTTG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=129188031;WS=129188013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr3	129188325	rs7612530	G	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=107;ReadPosRankSum=0.885;SC=CTGAGATTCTGTTACTATTAA;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=6;WE=129188333;WS=129188315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr3	129197108	rs58550262	TC	T	339.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.623;NF=0;NR=21;PP=275;ReadPosRankSum=-0.518;SC=CCATTTGTGCTCCCCCCCCAG;SOR=0.154;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=82;TCF=0;TCR=82;TR=21;WE=129197116;WS=129197098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,19:0.28:67
chr3	129202316	rs112066509	C	T	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.527;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=623;ReadPosRankSum=-1.109;SC=CCCCACTGTCCCTGTTCCCCA;SOR=0.481;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=117;TCF=72;TCR=45;TR=40;WE=129202324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,41:0.34:122
chr3	129207309	rs55991801	C	G	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.704;NF=0;NR=13;PP=204;ReadPosRankSum=1.132;SC=AGATGGGGACCCAGGTGGCAC;SOR=0.722;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=2;TCR=49;TR=13;WE=129207317;WS=129207299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,11:0.23:47
chr3	129210977	rs2285354	G	C	1914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=6.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.752;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=44;PP=1453;ReadPosRankSum=0.343;SC=TTATTTCTTCGCCACAGGCCT;SOR=0.535;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=300;TCF=159;TCR=141;TR=88;WE=129210985;WS=129210967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:224,89:0.28:313
chr3	129214302	rs111401191	G	A	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.620;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.410;NF=33;NR=7;PP=799;ReadPosRankSum=-0.821;SC=AGGAAGAAGCGGGGAGAGACC;SOR=0.340;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=87;TCF=75;TCR=12;TR=40;WE=129214310;WS=129214292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,38:0.44:87
chr3	129214511	rs66556397	G	A	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=231;ReadPosRankSum=-0.873;SC=TCTCACGTGCGGTGTCCAAGT;SOR=0.324;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=12;WE=129214519;WS=129214501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr3	129218944	rs6799876	G	T	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.959;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=33;PP=674;ReadPosRankSum=2.105;SC=AGAAGCATTTGGCAGCATGTC;SOR=0.923;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=117;TCF=20;TCR=97;TR=39;WE=129218952;WS=129218934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,40:0.32:124
chr3	129247551	rs7984	A	G	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=394;ReadPosRankSum=0.093;SC=GGGAGCAGCCACGGGTCAGCC;SOR=0.640;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=54;TCR=7;TR=25;WE=129247559;WS=129247541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr3	129251263	rs56340615	C	T	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=1.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.16;ReadPosRankSum=-1.402;SOR=0.823;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,44:0.26:167
chr3	129252604	rs2071093	C	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-5.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=170;ReadPosRankSum=-1.820;SC=CGTCTCCCATCCCCTACACCT;SOR=0.273;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=14;WE=129252612;WS=129252594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr3	129262290	.	T	TCACCCAGCACC	109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.10;ReadPosRankSum=-1.543;SOR=0.018;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr3	129266162	rs2713617	C	G	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.013;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=182;ReadPosRankSum=1.165;SC=TCACCCACCCCCCACGGGCCA;SOR=1.588;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=14;WE=129266170;WS=129266152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr3	129269961	rs3736170	T	C	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=150;ReadPosRankSum=-0.527;SC=TCAAGAATGGTGCTGCTTCCC;SOR=0.074;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=10;WE=129269969;WS=129269951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr3	129279597	rs2713627	C	T	3738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=43;PP=2858;SC=TAAATAAACACGGGAGAGGAG;SOR=1.355;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=73;TCR=43;TR=116;WE=129279605;WS=129279587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr3	129281980	rs2713625	C	T	1966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=21;PP=1485;SC=CCACTCCTCACTGAGTGTGTA;SOR=1.430;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=63;TCF=41;TCR=22;TR=62;WE=129281988;WS=129281970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	129282137	rs2713624	T	C	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=2.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.85;ReadPosRankSum=0.324;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,8:0.20:41
chr3	129284150	rs2285360	G	A	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.030;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=293;ReadPosRankSum=-2.063;SC=CACGTCCCCCGCCTGGGCTCT;SOR=0.094;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=17;WE=129284158;WS=129284140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr3	129284637	rs2245469	A	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=127;ReadPosRankSum=-1.342;SC=GGGGGTGTCAAGAGCCCCAGA;SOR=0.922;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=7;WE=129284645;WS=129284627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr3	129285175	rs11925462	G	A	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=216;ReadPosRankSum=1.626;SC=CCTGGCCTGCGGGGGCAGCAC;SOR=0.237;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=13;WE=129285183;WS=129285165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr3	129285577	rs2285363	A	C	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.181;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr3	129286413	rs2245285	G	C	1043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.331;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=14;PP=879;ReadPosRankSum=0.391;SC=GCTCCTTGGTGAGATCTGTCA;SOR=1.583;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=173;TCF=102;TCR=71;TR=49;WE=129286421;WS=129286403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,48:0.27:175
chr3	129286531	rs2245281	C	A	1507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FS=2.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.91;ReadPosRankSum=0.537;SOR=0.545;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:185,70:0.27:255
chr3	129289752	rs2285365	C	T	2392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.770;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=68;PP=1834;ReadPosRankSum=-0.568;SC=ACTCGTGACTCTGGAGCCCCA;SOR=1.252;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=367;TCF=169;TCR=198;TR=108;WE=129289760;WS=129289742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:264,110:0.29:374
chr3	129289831	rs2244962	A	G	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=2.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.70;ReadPosRankSum=1.248;SOR=0.541;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,58:0.28:208
chr3	129291499	rs2285368	G	A	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.895;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=541;ReadPosRankSum=-0.656;SC=CCTGGAGCTCGGAGCCTACAT;SOR=0.486;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=83;TCF=46;TCR=37;TR=31;WE=129291507;WS=129291489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,29:0.36:81
chr3	129291751	rs2244708	T	C	1098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.035;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=37;PP=741;ReadPosRankSum=-1.896;SC=CACCTGAGAGTGGTCCTGGGG;SOR=0.980;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=147;TCF=55;TCR=92;TR=56;WE=129291759;WS=129291741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,58:0.37:156
chr3	129293183	rs2625962	T	C	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=1;PP=1274;SC=GCTTACCGCGTGGATCTCGGG;SOR=6.184;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=44;WE=129293191;WS=129293173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	129293256	rs2255703	T	C	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=618;ReadPosRankSum=-0.820;SC=TCACTCCACATGCACAGGTGA;SOR=0.465;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=115;TCF=76;TCR=39;TR=45;WE=129293264;WS=129293246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,46:0.38:120
chr3	129294294	rs11919862	G	C	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.096;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=413;ReadPosRankSum=-0.476;SC=GCCATGTGGGGCGGGTGGGGG;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=20;WE=129294302;WS=129294284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr3	129302455	rs2285370	G	A	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.417;SOR=0.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,16:0.24:68
chr3	129303072	rs2285371	G	A	2204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.996;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=54;PP=1507;ReadPosRankSum=0.853;SC=CAACAGTCACGTGGTCTGGAA;SOR=0.825;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=296;TCF=134;TCR=162;TR=96;WE=129303080;WS=129303062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:204,106:0.34:310
chr3	129303197	rs2811463	T	C	2587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=52;PP=2233;SC=TCTGCCCCTCTGGGGCTGTGC;SOR=1.259;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=34;TCR=52;TR=86;WE=129303205;WS=129303187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr3	129304797	rs2285372	G	A	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.158;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=20;PP=988;ReadPosRankSum=1.287;SC=GGACTCACTGGGTACTCCTGG;SOR=1.233;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=181;TCF=104;TCR=77;TR=56;WE=129304805;WS=129304787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,55:0.30:182
chr3	129305460	rs2301572	C	T	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.622;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=450;ReadPosRankSum=0.959;SC=TAAAGGTAACCGGAGTCTGCT;SOR=1.000;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=120;TCF=66;TCR=54;TR=33;WE=129305468;WS=129305450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,34:0.28:123
chr3	129308096	rs13079843	G	A	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.96;ReadPosRankSum=0.189;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr3	129308425	rs2251016	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=59;ReadPosRankSum=-1.611;SC=CCGGCTCCCCGCCCGCACAGC;SOR=0.048;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=5;WE=129308433;WS=129308415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr3	129324193	rs7619850	A	G	333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=255;SC=GCTTGCGCTCACAGGCCGGTC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=129324201;WS=129324183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	129546729	rs784689	T	C	6589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=141;NR=66;PP=2965;SC=ATAGCAGAGCTGGTAGGTGCA;SOR=1.655;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=141;TCR=66;TR=207;WE=129546737;WS=129546719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr3	129694934	rs784705	C	A	1111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=25;PP=771;SC=GGAAACCTGCCGGCAAAGGGG;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=129694942;WS=129694924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	129695440	rs13097335	G	T	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=118;ReadPosRankSum=0.105;SC=AGTGGGAGCTGCAGGAAATGT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=129695448;WS=129695430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr3	129695538	rs784704	C	T	1920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=6;PP=1612;SC=CTTTCCTTCCCCAGCGTCCCA;SOR=3.990;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=49;TCR=6;TR=54;WE=129695546;WS=129695528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	129695954	rs5662	T	C	2912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=62;PP=2384;SC=AAGCGGGCCTTCTGCTGGGGC;SOR=1.916;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=25;TCR=62;TR=87;WE=129695962;WS=129695944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr3	129696041	rs5663	A	G	1824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=40;PP=1386;SC=CCTGGGTCAGAGAGCCCCTGG;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=57;WE=129696049;WS=129696031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	129811073	rs13066399	T	C	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=18;PP=477;SC=CAGGTCTGCATGACCACTGGG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=129811081;WS=129811063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	130114408	rs5852594	AC	A	3109.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=71;PP=2951;SC=TATATTTAGAACCATATATTT;SOR=4.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=3;TCR=75;TR=74;WE=130114416;WS=130114398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr3	130116696	rs12488457	A	C	2932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.285;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=31;PP=2448;ReadPosRankSum=0.256;SC=CAGTGGGCCAACTCATCTGAA;SOR=0.917;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=159;TCF=109;TCR=50;TR=105;WE=130116704;WS=130116686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,105:0.66:160
chr3	130122409	rs5852595	TG	T	2673.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.284;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.600;NF=20;NR=71;PP=1367;ReadPosRankSum=-0.541;SC=TTGACTTTATTGGGGGGGGGT;SOR=1.139;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=160;TCF=39;TCR=121;TR=91;WE=130122417;WS=130122399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,107:0.67:160
chr3	130122552	rs148970927	TACACAC	T	173.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.637;NF=0;NR=8;PP=256;ReadPosRankSum=-1.132;SC=ACACACACTGTACACACACAC;SOR=0.197;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=8;WE=130122565;WS=130122542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr3	130124270	rs1497313	A	G	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-5.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=1;PP=660;ReadPosRankSum=-1.232;SC=AAAAACAGACATAAATGAGTG;SOR=0.976;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=34;WE=130124278;WS=130124260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,36:0.73:49
chr3	130124491	rs10934940	G	A	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=30;PP=881;ReadPosRankSum=-0.191;SC=GTCCAGGGGCGTGGGGTCAGA;SOR=0.647;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=19;TCR=50;TR=42;WE=130124499;WS=130124481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,42:0.62:68
chr3	130124989	rs4688761	C	T	2026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.945;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=46;PP=1610;ReadPosRankSum=-0.796;SC=GTCATGGAGACGATGGGATTG;SOR=1.137;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=117;TCF=50;TCR=67;TR=75;WE=130124997;WS=130124979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,75:0.64:118
chr3	130125116	rs1497312	G	C	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.394;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=27;PP=757;ReadPosRankSum=1.622;SC=TTTTAGGGCTGTCATGGATTT;SOR=1.085;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=63;TCF=13;TCR=50;TR=33;WE=130125124;WS=130125106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,34:0.51:67
chr3	130132302	rs11717623	T	A	2661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.11;SOR=1.773;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	130132302	.	TAG	AAT	2569	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=37;NR=16;PP=2569;QD=20;SC=TACTTATGTCTAGCAGAGAAT;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=53;WE=130132312;WS=130132292;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,53:0.91:58
chr3	130132304	rs11713542	G	T	2661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.36;SOR=1.812;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	130132509	rs2219026	A	G	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=425;SC=AATCATATCAATGAGCATTTT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=130132517;WS=130132499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	130132851	rs10512767	A	G	2140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=8;PP=1608;SC=ATAGTATGAAAAGAAAATCTA;SOR=3.750;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=61;TCF=53;TCR=8;TR=60;WE=130132859;WS=130132841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	130134492	rs16827497	T	C	1418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.855;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=17;PP=1046;ReadPosRankSum=-0.658;SC=ACTAAAGGGGTCACAGGGAAA;SOR=0.593;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=54;TCR=28;TR=49;WE=130134500;WS=130134482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,54:0.61:88
chr3	130134563	rs7628563	G	A	2291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=41;PP=1681;ReadPosRankSum=-0.170;SC=TGAGTGACTCGGAGACATTAG;SOR=0.644;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=115;TCF=54;TCR=61;TR=79;WE=130134571;WS=130134553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,85:0.70:122
chr3	130135456	rs6439233	T	C	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.769;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=8;PP=839;ReadPosRankSum=-0.261;SC=TGCCATCTGCTTCTCTCCTCC;SOR=0.250;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=37;WE=130135464;WS=130135446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,40:0.77:52
chr3	130135575	rs4688798	A	T	2150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=28;PP=1587;ReadPosRankSum=-0.707;SC=CGGTGCCAACATTTTAGTCTC;SOR=0.755;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=103;TCF=60;TCR=43;TR=69;WE=130135583;WS=130135565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,77:0.69:112
chr3	130137866	rs13062453	G	A	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=191;ReadPosRankSum=0.253;SC=CCCAATTATGGGGGGCATGAA;SOR=0.941;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=10;WE=130137874;WS=130137856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr3	130141427	rs976324	G	T	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.42;ReadPosRankSum=1.730;SOR=0.095;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr3	130141452	rs976325	A	G	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=116;ReadPosRankSum=-2.343;SC=ATTGGCCTTCATTAATGTATG;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=10;WE=130141460;WS=130141442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr3	130142584	rs2896545	A	T	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=528;ReadPosRankSum=-1.023;SC=CTATCTTTTTAAAATTTTTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=10;WE=130142595;WS=130142574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr3	130142587	rs35980322	AT	A	165.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.89;ReadPosRankSum=1.326;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr3	130142843	rs976558	C	T	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=50;ReadPosRankSum=2.021;SC=GATTTAAGTCCAGATTCTGCT;SOR=0.175;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=5;WE=130142851;WS=130142833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr3	130144984	rs1874599	G	C	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=1;PP=273;SC=TTTTTGTTTTGTCTTGTTTTA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=130144992;WS=130144974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	130145175	rs9859372	G	A	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.958;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=7;PP=637;ReadPosRankSum=-0.145;SC=CACTGTACTTGCATTTCTTTT;SOR=0.920;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=111;TCF=86;TCR=25;TR=36;WE=130145183;WS=130145165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,36:0.32:111
chr3	130148510	rs9875499	C	T	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FS=2.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.215;SOR=0.516;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:191,65:0.25:256
chr3	130158343	rs2403340	C	T	3720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=24;PP=2924;SC=AGCAAACATGCGTTCACTTCT;SOR=2.574;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=92;TCR=24;TR=116;WE=130158351;WS=130158333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr3	130159113	rs138733830	TGAGTTTAAG	T	4755.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.461;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=41;PP=2954;ReadPosRankSum=0.036;SC=TAGCAAAGGATGAGTTTAAGG;SOR=0.403;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=148;TCF=78;TCR=70;TR=83;WE=130159129;WS=130159103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,119:0.64:187
chr3	130162395	rs9883988	A	G	3235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=73;PP=2449;SC=GAGAATATTCAAAATGATGGT;SOR=2.086;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=24;TCR=73;TR=97;WE=130162403;WS=130162385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr3	130174334	rs819085	G	A	3015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=28;PP=2267;SC=TTTTTGGGAGGTAATGGCTTC;SOR=1.896;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=64;TCR=28;TR=92;WE=130174342;WS=130174324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr3	130187817	rs322113	T	C	3151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=43;PP=2604;SC=ACTTTCACATTGCCCCCACTC;SOR=0.909;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=57;TCR=43;TR=100;WE=130187825;WS=130187807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr3	130189918	rs10668406	T	TTG	272.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.000;QD=20.99;ReadPosRankSum=-0.395;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr3	130190630	rs322117	G	A	3122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=27;PP=2542;SC=AATCATAGTAGTGGTTCTGAG;SOR=2.030;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=70;TCR=27;TR=96;WE=130190638;WS=130190620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr3	130190720	rs11355796	AT	A	4170.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=57;PP=2965;SC=GAAAAAGCACATTTAGAAGAA;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=45;TCR=59;TR=99;WE=130190728;WS=130190710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr3	130190777	rs322118	G	A	3844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=58;PP=2945;SC=GAAGGTAATCGTGAGTACCAT;SOR=0.874;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=53;TCR=59;TR=111;WE=130190785;WS=130190767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr3	130284284	rs9830253	G	A	8161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=150;PP=2965;SC=CATAGAGGGCGCCAGCGACAC;SOR=1.070;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=257;TCF=106;TCR=151;TR=256;WE=130284292;WS=130284274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr3	130286886	rs9836961	T	C	2091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=2;PP=1691;SC=GTTTTTCCTATGCAGCTTGCA;SOR=6.091;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=60;TCF=58;TCR=2;TR=60;WE=130286894;WS=130286876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	130289617	rs10934949	T	C	4535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=117;NR=23;PP=2965;SC=TCCCATGCTGTCCAAAGCTAA;SOR=3.131;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=117;TCR=23;TR=140;WE=130289625;WS=130289607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr3	130300650	rs6439249	T	C	4792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=76;NR=66;PP=2965;SC=ACTGAATAGCTTGAAGGATAT;SOR=0.840;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=143;TCF=76;TCR=67;TR=142;WE=130300658;WS=130300640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr3	130308702	rs4515022	A	G	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=1;PP=573;SC=GTTTGTTTACATGTGTTTTAT;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=130308710;WS=130308692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	130313017	rs1467015	T	G	184.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=149;SC=AAATAGCCTTTGTAGAAAAAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=130313025;WS=130313007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	130313219	rs77967786	G	A	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.133;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=646;ReadPosRankSum=-0.150;SC=TGGAGTTAGGGCTTGATTCCC;SOR=0.798;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=48;TCF=24;TCR=24;TR=31;WE=130313227;WS=130313209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr3	130317341	rs4336088	G	A	5467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=124;PP=2965;SC=TTGGTAGAATGTGAAATGCTT;SOR=1.935;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=174;TCF=50;TCR=124;TR=174;WE=130317349;WS=130317331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr3	130380899	.	A	G	2163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.000;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=40;PP=1763;ReadPosRankSum=-0.396;SC=GAAGAAACAAAGTCATATTTG;SOR=0.682;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=228;TCF=123;TCR=105;TR=87;WE=130380907;WS=130380889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,88:0.38:234
chr3	130427085	rs139650657	T	C	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.003;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=1;PP=695;ReadPosRankSum=-1.179;SC=AACAGTCTTATGAAATAACTA;SOR=0.100;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=93;TCF=92;TCR=1;TR=36;WE=130427093;WS=130427075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,37:0.40:93
chr3	130569557	rs1316658	T	G	1906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=9;PP=1563;SC=GGAGGGAAGTTGTCGAGCTAC;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=47;TCR=9;TR=56;WE=130569565;WS=130569547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	130659650	rs73201921	A	T	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.052;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=35;PP=956;ReadPosRankSum=-0.942;SC=AGATACTATTAATCTGACACA;SOR=1.412;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=59;TCF=12;TCR=47;TR=42;WE=130659658;WS=130659640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,44:0.71:62
chr3	130674022	rs218494	A	G	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=387;SC=ATTGAGAGCAATATTTTATTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=130674030;WS=130674012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	130734061	rs7641006	C	T	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.752;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=11;PP=646;ReadPosRankSum=-1.518;SC=ATTTTGTATGCGTCCATATAT;SOR=0.772;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=127;TCF=91;TCR=36;TR=42;WE=130734069;WS=130734051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,45:0.34:132
chr3	130734887	rs34645149	G	GT	267.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=3.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.51;MQRankSum=1.605;QD=7.65;ReadPosRankSum=-1.990;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr3	130743812	rs35558913	G	A	1569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=37;PP=1130;ReadPosRankSum=-0.813;SC=AGGGACATACGTACCCACTCC;SOR=0.666;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=214;TCF=94;TCR=120;TR=69;WE=130743820;WS=130743802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,72:0.33:218
chr3	130748733	rs9864242	A	G	1662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.412;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=49;PP=1313;ReadPosRankSum=0.242;SC=GTAAGTAAAAATGCTTCCTAT;SOR=1.189;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=83;TCF=8;TCR=75;TR=54;WE=130748741;WS=130748723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,60:0.67:89
chr3	130828790	rs9850655	G	A	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.669;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=467;ReadPosRankSum=0.713;SC=TACTGGGGGAGCATGATATAT;SOR=0.364;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=23;WE=130828798;WS=130828780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,26:0.76:34
chr3	130851101	rs4974466	A	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=111;ReadPosRankSum=-0.852;SC=GTTCTTTATAATTCCATAAAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=130851109;WS=130851091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr3	130852185	rs2674613	T	C	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.161;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=380;ReadPosRankSum=1.436;SC=GGAATAAAAGTGTGCAACTAG;SOR=0.120;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=25;WE=130852193;WS=130852175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr3	130873723	rs1400013	T	G	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.585;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=577;ReadPosRankSum=-0.304;SC=AAGCTACATGTAATTTTACAT;SOR=0.232;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=24;WE=130873731;WS=130873713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,26:0.76:34
chr3	130881409	rs1913898	T	C	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.813;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=30;PP=1145;ReadPosRankSum=-0.446;SC=TGCTCGGGACTACTTCTCAGG;SOR=0.461;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=91;TCF=40;TCR=51;TR=56;WE=130881417;WS=130881399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,56:0.63:89
chr3	130947273	rs3737999	A	G	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=105;ReadPosRankSum=-1.063;SC=AGCTTTGTCAACGCAAGCAAA;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=6;WE=130947281;WS=130947266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr3	130947435	rs3738000	A	T	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.585;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=32;PP=1324;ReadPosRankSum=1.395;SC=TCCTATTGTGAAGAGAGTGAT;SOR=0.423;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=107;TCF=58;TCR=49;TR=66;WE=130947443;WS=130947425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,69:0.62:112
chr3	130962492	rs1469386	A	G	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=249;ReadPosRankSum=1.012;SC=CTGACCCAAAAGCCAGGAAAC;SOR=1.201;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=13;WE=130962500;WS=130962482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr3	130992114	rs16836261	A	G	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.719;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=103;ReadPosRankSum=-0.514;SC=CTCCTGGAATACCTTGTGCAT;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=6;WE=130992122;WS=130992108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr3	130992264	rs117649685	C	T	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.148;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=315;ReadPosRankSum=1.994;SC=CCTTGAACATCGCCTTGAAGT;SOR=1.003;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=76;TCF=49;TCR=27;TR=21;WE=130992272;WS=130992254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,22:0.28:78
chr3	130992385	rs16836266	T	C	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.100;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=642;ReadPosRankSum=-0.771;SC=TTCAACAGTGTGATGGCCAGG;SOR=0.224;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=94;TCF=37;TCR=57;TR=43;WE=130992393;WS=130992375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,44:0.46:96
chr3	131068497	rs12637848	C	T	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.90;ReadPosRankSum=-0.402;SOR=0.926;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,23:0.24:95
chr3	131068509	rs12632399	A	G	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.912;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=1090;ReadPosRankSum=-0.782;SC=AGTGTTTGGAAAAAGTGGTGC;SOR=0.944;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=105;TCF=74;TCR=31;TR=31;WE=131068517;WS=131068487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,30:0.29:104
chr3	131186893	rs56928817	CA	C	617.50	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.683;NF=26;NR=1;PP=420;ReadPosRankSum=-1.814;SC=GAGTAAGAAACAAAAAAAAAA;SOR=2.419;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=27;WE=131186901;WS=131186883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,32:0.89:36
chr3	131188377	rs3830301	TAC	T,TACAC	307.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=16;NF=9,9;NR=0,0;PP=265,201;SC=AACTAGAGTGTACACACACAC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=9,9;WE=131188386;WS=131188367;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.55,0.45:11
chr3	131188574	rs2291381	A	G	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.174;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=127;ReadPosRankSum=-0.941;SC=TATGTTTCCCATTTTTCCAGG;SOR=1.445;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=36;TCF=16;TCR=20;TR=12;WE=131188582;WS=131188564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr3	131206364	.	T	C	149.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=108;ReadPosRankSum=-0.180;SC=TTTGGCACAATTTAAAAACCA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=131206372;WS=131206354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr3	131220792	rs80342240	C	A	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=106;ReadPosRankSum=0.431;SC=TTCATCTTCTCCTCGCAGATA;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=7;WE=131220800;WS=131220782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr3	131221799	rs16836878	C	T	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=163;ReadPosRankSum=0.196;SC=GAACGGTCGCCGGCCGATGCT;SOR=0.565;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=14;WE=131221807;WS=131221789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,14:0.27:52
chr3	131261662	rs10716194	TG	T	2682.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=54;PP=1386;SC=CCCATGATGATGGGGGGGGGT;SOR=2.033;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=87;TCF=22;TCR=65;TR=70;WE=131261670;WS=131261652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr3	131271180	rs994967	T	C	1727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.704;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=12;PP=1185;ReadPosRankSum=-1.595;SC=AGAGATTCTGTGGACAATCGT;SOR=1.253;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=177;TCF=136;TCR=41;TR=68;WE=131271188;WS=131271170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,72:0.39:185
chr3	131271439	rs2251178	T	C	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.60;ReadPosRankSum=0.964;SOR=0.100;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,10:0.23:43
chr3	131404572	rs6439314	A	C	2008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.457;NF=56;NR=2;PP=1589;ReadPosRankSum=1.602;SC=TTGCAGTGAGACGAGACTGCG;SOR=3.849;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=59;TCR=2;TR=58;WE=131404580;WS=131404562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,62:0.97:64
chr3	131404625	rs113276957	A	AAC	1853.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.816;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.311;NF=39;NR=10;PP=1855;ReadPosRankSum=-0.005;SC=ACTCCACCTCAACACACACAC;SOR=1.556;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=98;TCF=71;TCR=27;TR=49;WE=131404633;WS=131404615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,59:0.69:85
chr3	131418898	.	CTTTT	C	370.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.084;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQRankSum=0.268;QD=8.06;ReadPosRankSum=-0.115;SOR=1.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr3	131624097	rs3749262	G	A	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.119;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=495;ReadPosRankSum=0.591;SC=CATTTCATTGGACATGCCTAC;SOR=1.519;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=21;WE=131624105;WS=131624087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr3	131756241	rs2141570	T	C	3170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=87;NR=3;PP=2620;SC=AGAATTTACTTCCACCTCTTA;SOR=6.229;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=90;TCF=87;TCR=3;TR=90;WE=131756249;WS=131756231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr3	131756349	rs1569282	A	G	1698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.559;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=36;PP=1217;ReadPosRankSum=0.097;SC=CCCGCCAGCCACAGTCCCCTC;SOR=0.928;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=237;TCF=124;TCR=113;TR=84;WE=131756357;WS=131756339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,86:0.36:242
chr3	131756375	rs1569281	A	G	7012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.526;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=129;PP=2965;ReadPosRankSum=0.552;SC=TTGTAACATCAAAATCCCCTT;SOR=0.611;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=236;TCF=107;TCR=129;TR=235;WE=131756383;WS=131756365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,240:1.00:241
chr3	132153333	rs10662251	T	TAG	1991.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.845;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=20;PP=1736;ReadPosRankSum=0.535;SC=CTTGGAAAGATTAAAGATATA;SOR=1.100;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=143;TCF=73;TCR=70;TR=44;WE=132153341;WS=132153323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,57:0.32:178
chr3	132172395	rs7613098	C	T	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=2.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.39;ReadPosRankSum=1.580;SOR=0.420;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,17:0.21:81
chr3	132182443	rs11328911	TG	T	559.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.674;NF=17;NR=1;PP=600;ReadPosRankSum=-1.174;SC=ACATACTGAATGTTTTTTTCA;SOR=0.456;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=18;WE=132182451;WS=132182433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr3	132196761	rs2369797	G	A	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.421;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=41;PP=975;ReadPosRankSum=1.489;SC=ATATCCTGTCGCATTTGTTTT;SOR=1.158;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=156;TCF=50;TCR=106;TR=55;WE=132196769;WS=132196751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,55:0.34:163
chr3	132196816	rs2369796	A	T	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.880;HP=10;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=614;ReadPosRankSum=-0.444;SC=TTTTTTTTTTAAAATCTAGGT;SOR=1.374;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=94;TCF=31;TCR=63;TR=34;WE=132196824;WS=132196795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,28:0.30:93
chr3	132218196	rs2088712	C	T	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=306;ReadPosRankSum=-0.655;SC=CCAGTTTACACACATTATATG;SOR=0.947;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=70;TCF=10;TCR=60;TR=19;WE=132218204;WS=132218186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,19:0.28:69
chr3	132218623	rs3762672	G	T	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=0.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.47;ReadPosRankSum=-1.122;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,41:0.25:164
chr3	132221076	rs200192843	CTT	C,CT	733.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.15;MQRankSum=0.411;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.836;SOR=2.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:4,16,21:0.39,0.51:41
chr3	132244313	rs9843883	C	T	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=186;ReadPosRankSum=0.911;SC=TCGTTGTTCTCTTAGGATTAG;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=10;WE=132244321;WS=132244303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr3	132244406	rs754993	G	A	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.89;ReadPosRankSum=1.011;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,30:0.27:110
chr3	132297700	.	C	G	2770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.800;ClippingRankSum=0.000;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=54;PP=2268;ReadPosRankSum=-0.056;SC=TTCATGGGAACAAGAATCATG;SOR=0.757;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=133;TCF=55;TCR=78;TR=90;WE=132297708;WS=132297690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,94:0.69:136
chr3	132358262	.	T	TG	28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=28;QD=26.5;SC=CTCAGTGCTCTGGGGGGAGCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=2;WE=132358270;WS=132358253;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,2:0.29:7
chr3	132360883	rs821572	C	T	4022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=40;PP=2965;SC=ATTCAAGGAACGTAACTGAGC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=80;TCR=40;TR=119;WE=132360891;WS=132360873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr3	132363752	.	TA	T	92.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=1.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=2.033;QD=1.24;ReadPosRankSum=-2.013;SOR=0.429;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,15:0.20:75
chr3	132403418	rs34391943	C	T	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=507;ReadPosRankSum=-0.441;SC=TACAAGATGGCAAGATGCTTC;SOR=0.698;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=88;TCF=68;TCR=20;TR=29;WE=132403426;WS=132403408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,33:0.36:92
chr3	132424378	.	A	T	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=-0.088;SC=TAGTCCTCTGAGATAGATGAG;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=132424386;WS=132424368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr3	132441046	rs145643112	C	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.518;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=354;ReadPosRankSum=-0.694;SC=GCCCCTGCTGCCGCCCCCGCG;SOR=0.179;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=20;WE=132441054;WS=132441036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr3	132441143	rs192633696	C	G	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=308;ReadPosRankSum=-1.104;SC=CCGCCCCGTACGTGTCCTCGA;SOR=0.735;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=18;WE=132441151;WS=132441133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr3	133099245	rs1197314	G	A	4869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.443;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=0.276;SC=CTGTGGAACCGGAGCCCTCTA;SOR=1.335;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=250;TCF=99;TCR=151;TR=170;WE=133099253;WS=133099235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,177:0.68:259
chr3	133108978	rs1197296	A	G	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.646;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=352;ReadPosRankSum=1.644;SC=CCCAGGCACCATCCTTGCTGC;SOR=2.066;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=20;WE=133108986;WS=133108968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr3	133114513	rs1197301	A	C	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=204;ReadPosRankSum=-0.306;SC=AAATATACACATACACACACA;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=9;WE=133114521;WS=133114505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr3	133114609	.	C	T	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.702;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=10;PP=957;ReadPosRankSum=-0.673;SC=ACCAAGCCATCAGTGCTGAAA;SOR=0.321;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=63;TCF=50;TCR=13;TR=42;WE=133114617;WS=133114599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,47:0.70:67
chr3	133114893	rs1197300	C	T	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=337;SC=TATACAAATACATATATTATA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=133114901;WS=133114883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	133166403	rs7644197	A	G	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=9;PP=270;SC=CCTCCTTGTAAACATAAAGTA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=133166411;WS=133166393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	133167363	rs2276737	G	A	1342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.435;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=8;PP=1078;ReadPosRankSum=-0.884;SC=TTCGAAAGGCGGCAGAAGAGG;SOR=2.526;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=43;WE=133167371;WS=133167353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr3	133185834	rs2737717	T	C	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.203;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=773;ReadPosRankSum=1.719;SC=CCTGGTGTCCTTGTGCTAATT;SOR=0.454;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=35;WE=133185842;WS=133185824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,35:0.67:52
chr3	133191093	rs899458	A	G	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=226;ReadPosRankSum=-0.267;SC=GGAATAGTCCAGGCTACCACC;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=14;WE=133191101;WS=133191083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr3	133329943	rs1444601	G	A	4346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=71;PP=2965;SC=ATTCCAGTCAGAACATCAAGT;SOR=0.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=133;TCF=62;TCR=71;TR=133;WE=133329951;WS=133329933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr3	133331163	rs11712186	T	C	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.226;NF=15;NR=2;PP=380;ReadPosRankSum=-0.622;SC=GGATAACAGGTGTGAGCCACT;SOR=0.278;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=17;WE=133331171;WS=133331153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr3	133335787	rs3732574	C	T	965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=23;PP=828;SC=GAAAGTTTTACTTTAGAAAAA;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=28;WE=133335795;WS=133335777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	133335960	rs11715435	A	G	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.399;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=13;PP=757;ReadPosRankSum=-0.522;SC=ACAGCCTAACAGCAGTATGCA;SOR=1.426;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=72;TCF=50;TCR=22;TR=49;WE=133335968;WS=133335950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,53:0.70:76
chr3	133335977	rs11707750	G	C	1696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.749;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=20;PP=1180;ReadPosRankSum=0.285;SC=TGCAAAAGCTGTATCACCATA;SOR=1.353;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=84;TCF=52;TCR=32;TR=59;WE=133335985;WS=133335967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,63:0.71:89
chr3	133341988	rs10935070	T	C	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.212;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=116;ReadPosRankSum=-0.777;SC=CTCTTTATTATTGGTGGCCAT;SOR=1.802;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=9;WE=133341996;WS=133341978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr3	133343047	rs11719585	T	C	1424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.40;ReadPosRankSum=-1.231;SOR=0.386;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,36:0.69:52
chr3	133343050	rs11715407	C	A	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.80;ReadPosRankSum=-1.782;SOR=0.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,36:0.71:51
chr3	133347604	rs62282419	T	C	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=1.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.16;ReadPosRankSum=-0.324;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,25:0.71:35
chr3	133356790	rs17301766	G	A	1749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.596;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=26;PP=1392;ReadPosRankSum=0.210;SC=CAGGTGTAACGAGGGCTCCTT;SOR=0.484;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=98;TCF=56;TCR=42;TR=58;WE=133356798;WS=133356780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,62:0.60:103
chr3	133358713	rs11712672	A	G	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=398;ReadPosRankSum=-0.692;SC=AAAATCAATGACCCTTCCTAA;SOR=1.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=19;WE=133358721;WS=133358703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr3	133362154	rs17301889	A	G	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=612;ReadPosRankSum=0.701;SC=TCATTACTGGAACTGGTGTGA;SOR=0.787;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=25;WE=133362162;WS=133362144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr3	133368199	rs10512909	C	T	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.580;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=10;PP=972;ReadPosRankSum=-1.214;SC=TTCTTACTAACTACAAATACT;SOR=0.249;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=74;TCF=61;TCR=13;TR=47;WE=133368207;WS=133368189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,47:0.63:75
chr3	133368362	rs3192149	T	G	4225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=56;PP=2965;SC=CTTTCAGGCTTATGTGAAACT;SOR=0.741;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=121;TCF=64;TCR=57;TR=120;WE=133368370;WS=133368352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr3	133372473	.	AT	A	123.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=-0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQRankSum=-0.168;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.969;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr3	133374030	rs7639941	T	C	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=310;SC=GCCTGGGCAATAGAGCAAGAC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=133374038;WS=133374020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	133375785	rs2718801	G	A	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.879;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=27;PP=500;ReadPosRankSum=-0.075;SC=AATACATTTTGCTGTTGACAG;SOR=0.092;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=95;TCF=5;TCR=90;TR=30;WE=133375793;WS=133375775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,31:0.30:102
chr3	133380026	rs11709461	A	T	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=504;ReadPosRankSum=-1.300;SC=ACATTAGATAAAAAGTTGCAT;SOR=0.770;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=23;WE=133380034;WS=133380016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr3	133380130	rs2718805	T	C	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=299;SC=TTCTAAGAAATCCTGGAACTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=133380138;WS=133380120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	133465283	rs1130459	A	G	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.705;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=291;ReadPosRankSum=0.585;SC=CGCACCCGGAAGATGAGGCTC;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=17;WE=133465291;WS=133465273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
chr3	133474328	rs12769	G	A	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.987;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=527;ReadPosRankSum=0.482;SC=TCGGCTACTCGGGAGCCTTCA;SOR=1.044;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=93;TCF=36;TCR=57;TR=29;WE=133474336;WS=133474318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,30:0.32:93
chr3	133483696	rs1880669	T	C	3147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=28;PP=2311;SC=TTAATGCCTTTTTCATTTTCT;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=59;TCR=28;TR=87;WE=133483704;WS=133483686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr3	133485133	rs2692696	A	G	3464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=41;PP=2620;SC=GTATTTTGCTATAGCAGTGGT;SOR=1.230;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=67;TCR=41;TR=107;WE=133485141;WS=133485123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr3	133485371	rs1525891	G	C	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=407;ReadPosRankSum=-0.678;SC=GGTGCTGTGGGCTCTGGTTCT;SOR=2.935;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=17;WE=133485379;WS=133485361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr3	133486958	rs8649	G	C	1862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.849;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=44;PP=1438;ReadPosRankSum=-0.183;SC=GCCTAAACCTGTGTGAACCCA;SOR=0.161;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=87;TCF=18;TCR=69;TR=59;WE=133486966;WS=133486948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,63:0.68:92
chr3	133489583	rs1525890	G	A	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.547;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=132;ReadPosRankSum=0.987;SC=ACCTGAGTGCGCAGAATGATC;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=133489591;WS=133489573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr3	133493705	rs35736766	GT	G	2105.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.911;HP=14;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;MQRankSum=0.341;NF=56;NR=24;PP=1050;ReadPosRankSum=0.067;SC=GAATGGGTGAGTTTTTTTTTT;SOR=2.520;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=114;TCF=78;TCR=36;TR=80;WE=133493727;WS=133493694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,94:0.98:96
chr3	133493827	rs2715626	T	C	2437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=54;PP=1928;ReadPosRankSum=0.006;SC=GGGAGTCAGATTTAAAATTCT;SOR=0.664;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=119;TCF=38;TCR=81;TR=81;WE=133493835;WS=133493817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,85:0.69:124
chr3	133524591	rs60142346	A	G	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=218;ReadPosRankSum=-0.657;SC=GGGAGAGACTATGGCTTAGGA;SOR=1.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=43;TCR=2;TR=12;WE=133524599;WS=133524581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
chr3	133546606	.	G	C	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.10;ReadPosRankSum=0.921;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr3	133546609	.	T	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.54;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr3	133547692	rs2293373	G	A	1208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.755;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=37;PP=942;ReadPosRankSum=1.046;SC=GCTTGATGTCGATCACTGCAG;SOR=1.239;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=147;TCF=47;TCR=100;TR=50;WE=133547700;WS=133547682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,53:0.35:151
chr3	133553527	rs2280672	C	T	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=36;PP=1105;SC=CAACCCTGGCCCTCCCCTCTG;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=38;WE=133553535;WS=133553517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	133556964	rs139009223	ACCGTGCCGGGCC	A	2104.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=2;PP=2965;SC=ACAGGGCTACACCGTGCCGGG;SOR=4.892;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=27;WE=133556983;WS=133556954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	133560423	rs41272335	G	A	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-6.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.099;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=6;PP=1080;ReadPosRankSum=-1.820;SC=AACCCTCCCTGCCCCTCCCAG;SOR=0.070;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=77;TCF=71;TCR=6;TR=49;WE=133560431;WS=133560413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,51:0.65:79
chr3	133583647	rs3811645	G	A	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=30;PP=886;SC=TAGGGACCCCGTGGTGAGGCC;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=32;WE=133583655;WS=133583637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	133664171	.	C	T	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.689;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.706;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=39;PP=1022;ReadPosRankSum=0.070;SC=ACACTCCAGCCCAGTGTGAGT;SOR=0.409;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=70;TCF=17;TCR=53;TR=53;WE=133664179;WS=133664161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,53:0.76:70
chr3	133674106	.	C	A	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.849;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.646;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=454;ReadPosRankSum=-0.150;SC=CCTCCAAACCCGGCCTTTCTC;SOR=2.066;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=19;WE=133674114;WS=133674096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr3	133692497	rs4634113	A	G	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=641;SC=AGGGGTTGGAAGCCACTCACC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=133692505;WS=133692487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	133692743	rs4241362	C	T	2524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=59;PP=1949;SC=GACCCGATCACACTTCATCCA;SOR=2.010;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=83;TCF=23;TCR=60;TR=82;WE=133692751;WS=133692733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr3	133692837	rs13063838	A	C	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=74;ReadPosRankSum=-0.529;SC=AGAGAGCTTCACAAGGGGCAA;SOR=0.163;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=6;WE=133692845;WS=133692827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr3	133698280	rs4640563	C	G	1931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=12;PP=1540;ReadPosRankSum=0.242;SC=TTGTGGTCAGCGTGGTGCACA;SOR=0.610;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=86;TCF=70;TCR=16;TR=63;WE=133698288;WS=133698270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,68:0.75:91
chr3	133901733	rs9829505	A	C	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=360;SC=AAAAAAATTAAGCTATTCCAC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=133901741;WS=133901723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	133941504	rs9865808	G	A	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=308;SC=CATCACAAATGGCCCTAACAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=133941512;WS=133941494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	133941534	rs7611104	A	G	256.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=8;PP=212;SC=TATGAAGCAAAAAAGACACGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=133941542;WS=133941524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	133969437	.	A	AG	185.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=6;PP=239;SC=CGGGGCCCTCAGCCGCGGGCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=133969445;WS=133969427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	133969487	.	G	GC	30.71	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=1;PP=53;SC=CAGCCGCGCCGCCCACGCATG;SOR=2.303;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=133969495;WS=133969477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr3	134077470	rs1353776	C	G	2218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=30;PP=1814;SC=CTGGGGGGCCCTCAGTCTGGG;SOR=1.091;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=43;TCR=30;TR=73;WE=134077478;WS=134077460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	134080661	rs1077718	A	G	2368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=25;NR=47;PP=1994;SC=TGTAGGGAGAAAGAGGCTTGA;SOR=1.516;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=72;WE=134080669;WS=134080651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	134197429	rs61748112	G	A	1356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=26;PP=1032;ReadPosRankSum=-0.738;SC=AAGGAGCCAAGCGTCAGTTTC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=203;TCF=112;TCR=91;TR=58;WE=134197437;WS=134197419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,61:0.29:212
chr3	134214042	rs62269547	T	C	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=0;PP=828;SC=TTTTTCATTATTATGTATGCT;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=134214050;WS=134214032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	134226159	rs6766818	C	T	3716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=107;PP=2965;SC=TTCTTTTTGACATTTTTATCT;SOR=5.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=6;TCR=107;TR=113;WE=134226167;WS=134226149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr3	134256159	rs12634127	A	G	1798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=48;PP=1507;SC=GGTTTTGATCAAGTTTGAACT;SOR=4.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=4;TCR=48;TR=52;WE=134256167;WS=134256149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	134264859	rs1357762	A	C	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=361;SC=CGTAACTTATAGTCTGACTTC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=134264867;WS=134264849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	134266148	rs12632372	G	C	3299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=70;NR=35;PP=2560;SC=AGATAAAGGCGTTAACAATCA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=70;TCR=35;TR=105;WE=134266156;WS=134266138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr3	134270586	.	TATATATATATAC	T	208.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=66.83;QD=34.80;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	134280395	rs6777283	T	A	2359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=55;PP=1968;SC=AAAAAATCACTATCTTGGAAA;SOR=2.400;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=15;TCR=55;TR=70;WE=134280403;WS=134280385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	134293619	rs4586863	A	G	147.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.22;QD=29.58;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	134322742	rs2293293	A	G	5005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=0.560;SC=CACAGCATACAAGGTAATTAA;SOR=0.905;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=69;TCR=89;TR=155;WE=134322750;WS=134322732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,164:0.99:166
chr3	134323156	rs4955535	A	G	1854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=27;PP=1433;SC=TGCCCTTGGCAAAGATCTGCA;SOR=0.966;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=35;TCR=28;TR=62;WE=134323164;WS=134323146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	134331874	rs7626611	T	C	1492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=8;PP=1195;SC=CTGCCTAGAATGTCTGTGCAT;SOR=3.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=48;WE=134331882;WS=134331864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	134331980	rs9838119	C	T	1693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=34;PP=1430;SC=ACTGATTTAGCGGCGCTGTGG;SOR=1.199;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=23;TCR=34;TR=57;WE=134331988;WS=134331970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	134514579	rs9852662	T	C	4184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=112;PP=2965;SC=CCGGCCGCCTTGGGACTGCTG;SOR=2.724;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=27;TCR=112;TR=139;WE=134514587;WS=134514569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr3	134644517	rs36187	A	G	146.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=3;NR=1;PP=56;SC=TCACAGAGAGACCTGGGCTTG;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=134644525;WS=134644514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	134644636	rs635721	G	T	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=5;PP=659;SC=TTGTTTATTCGTTTTTTCTTT;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=134644644;WS=134644626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	134670524	rs7644369	C	T	4971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=60;PP=2965;ReadPosRankSum=0.855;SC=CAGATGAGAGCTTCTCCCAGG;SOR=1.136;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=152;TCF=91;TCR=61;TR=150;WE=134670532;WS=134670514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,160:0.99:162
chr3	134697009	rs373709784	A	AC	186.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=239;SC=CCACTGAGTTACAAGTCCTAT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=134697017;WS=134696999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	134898742	rs1042787	C	T	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=905;ReadPosRankSum=-1.394;SC=CCTTCACTTACGAGGATCCCA;SOR=0.827;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=41;WE=134898750;WS=134898732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,42:0.64:66
chr3	134898960	rs10512945	G	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=79;ReadPosRankSum=-0.369;SC=CAGAAGATGAGTCTGAACTAT;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=6;WE=134898968;WS=134898950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr3	134968465	rs4243397	T	C	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=16;PP=373;SC=CAGGCCTGGATGGGGAGCACC;SOR=3.160;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=134968473;WS=134968455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	135806702	rs201690066	A	AT	456.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.630;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.727;NF=13;NR=7;PP=324;ReadPosRankSum=-1.925;SC=TAGCTTTGCAATTTTTTTTTT;SOR=1.236;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=30;TCF=17;TCR=13;TR=20;WE=135806710;WS=135806692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr3	135822011	rs75262249	A	G	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=229;ReadPosRankSum=-0.332;SC=ATAAACATATACCTATACTTT;SOR=0.239;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=12;WE=135822019;WS=135822005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr3	135913665	rs1992952	A	G	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=0;PP=585;SC=AAAGTCCCTCAGCAAGTTTCA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=135913673;WS=135913659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	135980673	rs2290131	C	T	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.033;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=459;ReadPosRankSum=0.313;SC=ACCAGTGTTACTGCCTCCTGT;SOR=1.981;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=20;WE=135980681;WS=135980663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr3	136035737	rs9833162	A	G	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=4.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.148;SOR=1.965;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,12:0.20:60
chr3	136045213	rs17265675	G	A	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.303;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=399;ReadPosRankSum=0.603;SC=AGGCAGTATCGTCCCTACTTT;SOR=2.025;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=96;TCF=56;TCR=40;TR=27;WE=136045221;WS=136045203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,25:0.26:97
chr3	136057142	rs111861599	AATT	A	316.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=354;ReadPosRankSum=0.254;SC=TGAGAAACATAATTATTAATT;SOR=1.005;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=9;WE=136057152;WS=136057132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr3	136059537	rs503973	G	C	3610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=91;PP=2965;SC=TTCTAACCAAGTGAAGTATAC;SOR=3.696;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=14;TCR=92;TR=105;WE=136059545;WS=136059527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr3	136088038	rs9860801	G	A	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.62;ReadPosRankSum=0.775;SOR=0.777;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,15:0.23:64
chr3	136139878	rs9819496	G	A	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.450;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=247;ReadPosRankSum=-0.708;SC=CTCTCAAAGTGTTGGGGTTAC;SOR=0.428;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=16;WE=136139886;WS=136139868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr3	136192645	.	TA	T	33.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.22;ReadPosRankSum=-0.328;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr3	136196028	rs16843991	T	C	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.174;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=211;ReadPosRankSum=1.064;SC=AATTTCCACATGATTACAACT;SOR=0.172;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=13;WE=136196036;WS=136196018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr3	136196071	rs1394092	C	T	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=13;PP=963;SC=TTTTGATTCCCAGCATTTTAG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=42;WE=136196079;WS=136196061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	136218930	rs900048	C	T	309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=226;SC=TAGTGTGACACTGACAGCCAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=136218938;WS=136218925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	136573289	rs9865545	G	A	2288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.252;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=9;PP=1816;ReadPosRankSum=-0.048;SC=AAATAGAATTGATTATCTGAA;SOR=1.034;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=99;TCF=86;TCR=13;TR=78;WE=136573297;WS=136573279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,81:0.78:104
chr3	136573440	rs9827648	A	G	5804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.264;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=88;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.646;SC=AAGGCTATGGAAATTTTATGG;SOR=0.321;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=296;TCF=177;TCR=119;TR=200;WE=136573448;WS=136573430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,204:0.68:301
chr3	136574501	rs1052618	A	G	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=39;PP=1051;ReadPosRankSum=-0.076;SC=AATTTAAGAAAGCAGGACTAC;SOR=1.112;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=53;TCF=3;TCR=50;TR=41;WE=136574509;WS=136574491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,42:0.75:56
chr3	136574578	rs3076229	T	TTAA	649.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=650;ReadPosRankSum=1.351;SC=TGTTCAGTTATTATGTATACT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=13;WE=136574586;WS=136574568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr3	136649463	rs7648817	C	T	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=577;ReadPosRankSum=0.050;SC=ATTAAATCCACTGTTTTCTTG;SOR=1.432;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=23;WE=136649471;WS=136649453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr3	136699133	rs5852860	CT	C	490.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=19;NR=0;PP=285;SC=ACATGTGAGGCTTTTTTTTTT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=19;WE=136699141;WS=136699128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	136701295	rs361239	G	T	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=-1.036;SC=GAATAGTCCTGCAAAGCCAGA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=136701303;WS=136701285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr3	136728886	rs361235	G	T	730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=0;PP=595;SC=AGTTAAAAATGTAATAATATT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=136728894;WS=136728876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	136739387	rs63332362	CT	C	4274.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=21;PP=2967;SC=GATGCCAGGGCTCTCAAACTG;SOR=2.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=77;TCR=22;TR=96;WE=136739395;WS=136739377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr3	136739406	rs1385306	C	G	5037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=108;NR=45;PP=2965;SC=TGCAAACAAACGAGAACAGAT;SOR=1.905;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=153;TCF=108;TCR=45;TR=153;WE=136739414;WS=136739396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr3	137781923	rs329388	A	C	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=455;SC=AAATGGGGACAAATGCAGACT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=137781931;WS=137781913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	137783700	rs179282	T	C	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=16;PP=559;SC=CCAGTGTGGATAGAGGGAATG;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=137783708;WS=137783690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	137786442	rs442800	T	C	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=9;PP=791;SC=CAGTCATCCTTGGGCCGGGGC;SOR=1.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=137786450;WS=137786432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	137787047	rs374045	C	T	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=5;PP=778;SC=CAGTCCGGGGCGTGGAGCGGG;SOR=3.383;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=35;WE=137787055;WS=137787037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	137787192	rs446644	T	C	2348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=36;PP=1897;SC=GTGACCAGTGTGCTCTGCTGG;SOR=0.798;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=40;TCR=36;TR=76;WE=137787200;WS=137787182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr3	137787282	rs419075	T	C	1795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=51;PP=1277;SC=AGGGAGAAAGTGGCTCCAACA;SOR=2.904;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=12;TCR=51;TR=63;WE=137787290;WS=137787272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	137787355	rs446847	T	C	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=551;SC=TTCATGACTGTTGCCAAATCA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=137787363;WS=137787345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	137787935	rs382629	G	A	1932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=13;PP=1566;SC=CCACTTATACGTGGATTTTCT;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=46;TCR=13;TR=59;WE=137787943;WS=137787925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	137787963	rs445025	T	G	2540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=22;PP=2015;SC=CTGCCACCCGTGAGACAGCAA;SOR=1.923;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=54;TCR=22;TR=76;WE=137787971;WS=137787953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	137788123	rs425938	T	G	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=31;PP=954;SC=TTCTTTTCTCTAGCTTACTTT;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=137788131;WS=137788113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	137788141	rs407009	T	A	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=722;SC=TTTATTGTAATAATACAGCTT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=137788149;WS=137788131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	137796175	.	C	A	1916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.865;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=0;PP=1579;ReadPosRankSum=-0.265;SC=TATCACACTGCCGCTGTGAAG;SOR=1.585;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=96;TCF=96;TCR=0;TR=63;WE=137796183;WS=137796165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,64:0.67:96
chr3	137799291	rs384828	A	T	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=4;PP=610;SC=ATGTCCTTAGATCCCTCCACT;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=137799299;WS=137799281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	137799498	rs405602	T	C	256.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=9;PP=274;SC=GCACCAGTGCTCTGGACCCCA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=137799506;WS=137799488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	137800656	rs2622711	A	G	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.543;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=29;PP=953;ReadPosRankSum=-0.798;SC=GAACATTGTGAGAACTCTGCT;SOR=1.996;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=39;WE=137800664;WS=137800646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr3	137807259	rs2724693	G	A	1255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=19;PP=991;SC=TGAAGCTCCCGTGCCTGCCGA;SOR=0.793;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=40;TCF=21;TCR=19;TR=39;WE=137807267;WS=137807249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	137816817	rs7629243	A	C	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=25;PP=725;SC=AATTTAATTTACTGAGCAAGG;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=137816825;WS=137816807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	137843018	rs1564496	G	C	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=2;PP=1141;SC=TGCCCACCCCGCCAAGAGACA;SOR=5.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=40;WE=137843026;WS=137843008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	137843106	rs2170309	T	C	3271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=41;PP=2695;SC=AGTGTTAGCTTTATTTGTTAC;SOR=1.125;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=62;TCR=41;TR=103;WE=137843114;WS=137843096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr3	137843476	rs2246945	G	T	5310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=83;NR=75;PP=2965;SC=GCCCCAAATGGCTGAATTATA;SOR=0.804;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=83;TCR=75;TR=158;WE=137843484;WS=137843466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr3	137850003	rs2724691	A	G	3921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=68;PP=2939;SC=AAGAAGGCAAACAGAAGAGGC;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=46;TCR=68;TR=114;WE=137850011;WS=137849993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr3	137880695	rs9851548	A	G	3240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=4;PP=2733;ReadPosRankSum=-0.456;SC=TCTCAAAAAAACAAAACAAAC;SOR=4.429;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=92;TCF=88;TCR=4;TR=91;WE=137880703;WS=137880685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,94:0.99:95
chr3	137880743	rs2622736	G	A	6094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.646;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=163;NR=60;PP=2965;ReadPosRankSum=1.065;SC=AAGCTGCATCGTCATCATCAT;SOR=0.138;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=230;TCF=170;TCR=60;TR=223;WE=137880751;WS=137880730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,205:0.97:211
chr3	137881265	rs3732839	T	A	3846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=73;PP=2965;ReadPosRankSum=0.730;SC=AAAATTCAGTTGTCTGAGGAT;SOR=1.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=42;TCR=74;TR=113;WE=137881273;WS=137881255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,118:0.98:120
chr3	137882377	rs2622734	G	T	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=24;PP=757;SC=ATATATATTTGTAACAGTCTA;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=137882385;WS=137882367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	137882752	rs2622733	A	G	2324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=58;PP=1847;SC=AACCACAGGTAATTCTTCATA;SOR=3.675;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=9;TCR=58;TR=67;WE=137882760;WS=137882742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr3	137981439	.	TA	T	42.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.111;ClippingRankSum=0.000;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=8.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=2.641;QD=0.58;ReadPosRankSum=0.266;SOR=0.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,14:0.19:74
chr3	138020275	rs7637162	A	G	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=0;PP=506;SC=TCAAACTCCTAATCTCAGGTG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=138020283;WS=138020265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	138020677	rs6801411	C	T	848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=720;SC=AGTCCTGATACGTGTTAGGGA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=138020685;WS=138020667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	138025136	rs3856636	T	G	1249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=7;PP=932;SC=CCCCTTAGAATTCATCTTTCT;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=34;WE=138025144;WS=138025126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	138025396	rs9846480	A	G	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=40;PP=1249;SC=AAACAATGCAACCTCTACACA;SOR=3.564;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=45;WE=138025404;WS=138025386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	138033181	rs9289556	C	T	4387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=76;PP=2965;SC=CACCCATGTCCTCATCTTCAC;SOR=0.965;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=57;TCR=76;TR=133;WE=138033189;WS=138033171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr3	138091701	rs1199333	G	T	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=1;PP=235;SC=ATGTCTTGCTGCCGCAGGTCT;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=138091709;WS=138091691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	138170788	rs13095961	T	G	2983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=6;PP=2574;SC=AGGGTTGAGGTGCAGCGCGTG;SOR=4.977;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=83;TCR=6;TR=89;WE=138170796;WS=138170778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr3	138171042	rs4678418	C	T	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.05;ReadPosRankSum=-1.372;SOR=0.042;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,5:0.15:33
chr3	138173905	rs56236670	G	A	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.666;SOR=0.094;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,10:0.23:44
chr3	138176533	rs66644444	A	T	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=117;ReadPosRankSum=1.246;SC=CAGGGGACACAGTGGGAACAG;SOR=0.892;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=10;WE=138176541;WS=138176523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr3	138179308	rs67037472	G	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=74;ReadPosRankSum=-0.721;SC=CACCCTGGCAGAGGGTGCTCT;SOR=0.255;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=7;WE=138179316;WS=138179298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,7:0.20:35
chr3	138179328	rs6763380	C	T	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=118;ReadPosRankSum=-0.765;SC=TGCCTGCTTTCCTCCGAACCC;SOR=0.389;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=10;WE=138179336;WS=138179318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr3	138187568	rs1679167	C	T	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.314;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=648;ReadPosRankSum=-0.364;SC=CGGTGAGTGGCGACATGTCCA;SOR=0.447;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=156;TCF=99;TCR=57;TR=45;WE=138187576;WS=138187558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,44:0.29:154
chr3	138188485	rs13316499	C	T	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=253;ReadPosRankSum=0.168;SC=TCAGAATAACCTCACAAAATA;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=12;WE=138188493;WS=138188475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr3	138189031	rs2347469	T	C	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=32;PP=1023;SC=TAAGAGGTTTTTAAGCCAGGC;SOR=3.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=36;WE=138189039;WS=138189021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	138189658	rs3813264	A	G	1631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=7;PP=1279;SC=GGGCTCAGATACTAGTAGTGG;SOR=3.080;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=45;WE=138189666;WS=138189648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	138191232	rs10935282	G	A	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=3;PP=996;ReadPosRankSum=-0.885;SC=ACGAGAGCTGGGGAGCCCATA;SOR=0.929;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=183;TCF=165;TCR=18;TR=54;WE=138191240;WS=138191222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,56:0.29:190
chr3	138195529	rs1679169	C	T	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.163;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=138;ReadPosRankSum=-0.503;SC=TGAACCCTGGCTGGCCAACTT;SOR=0.136;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=8;WE=138195537;WS=138195519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr3	138227355	.	C	T	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.371;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=1.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.76;ReadPosRankSum=-1.527;SOR=0.423;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,16:0.23:71
chr3	138244400	rs9878436	C	T	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.542;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=26;PP=709;ReadPosRankSum=-0.626;SC=ATTCATGCTGCGTAGGCCTGT;SOR=0.467;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=48;TCF=8;TCR=40;TR=32;WE=138244408;WS=138244390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,32:0.67:48
chr3	138251302	rs7643973	G	T	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=171;ReadPosRankSum=0.256;SC=AGAAACTTCTGGTGTGAATAC;SOR=1.609;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=9;WE=138251310;WS=138251292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr3	138251447	rs10549552	CGGTAT	C	800.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=499;ReadPosRankSum=-0.497;SC=TTTCAAAATGCGGTATGGTAT;SOR=0.807;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=10;WE=138251459;WS=138251437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr3	138256252	rs542010	G	A	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=364;ReadPosRankSum=0.156;SC=TATCCTAACAGTATTGTACAC;SOR=1.143;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=17;WE=138256260;WS=138256242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr3	138289163	rs1673608	T	C	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.476;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=287;ReadPosRankSum=-0.253;SC=TCAGTACCTGTAAAGTTTTCT;SOR=1.574;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=59;TCR=4;TR=17;WE=138289171;WS=138289153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,17:0.26:66
chr3	138289221	rs1673607	C	T	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.973;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=404;ReadPosRankSum=0.039;SC=GCAAGCCCTACTTAGTGATTC;SOR=0.412;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=98;TCF=64;TCR=34;TR=29;WE=138289229;WS=138289211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,31:0.28:111
chr3	138329862	rs811322	G	A	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.781;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=651;ReadPosRankSum=-0.281;SC=TGGTATCTCCGGACTCTGCCA;SOR=0.852;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=115;TCF=38;TCR=77;TR=39;WE=138329870;WS=138329852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,39:0.33:117
chr3	138341284	rs11303336	CT	C	99.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.99;ReadPosRankSum=-1.675;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr3	138348179	.	G	A	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=149;ReadPosRankSum=3.361;SC=GCCTGGTACCGTGAGTTTGGA;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=8;WE=138348187;WS=138348169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr3	138351813	.	C	G	1734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=0.000;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.207;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=33;PP=1286;ReadPosRankSum=-0.506;SC=ACTTCAGTATCGGGAACCATG;SOR=0.708;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=190;TCF=93;TCR=97;TR=73;WE=138351821;WS=138351803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,74:0.38:197
chr3	138417989	rs361080	G	A	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=169;ReadPosRankSum=-0.757;SC=ACACCACAGCGAACTTTCAGT;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=11;WE=138417997;WS=138417979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,9:0.27:33
chr3	138433568	rs497900	C	T	920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=28;PP=746;ReadPosRankSum=-1.751;SC=GAACCTGTAACGAAGCAGACA;SOR=0.641;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=156;TCF=62;TCR=94;TR=46;WE=138433576;WS=138433558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,48:0.30:159
chr3	138668582	rs67626684	T	C	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=8.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.50;ReadPosRankSum=-0.326;SOR=1.075;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,52:0.28:187
chr3	138668692	rs61408596	T	C	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.724;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=715;ReadPosRankSum=-1.732;SC=CCTTCGGAGGTAGGCTGGTTG;SOR=1.595;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=137;TCF=61;TCR=76;TR=41;WE=138668700;WS=138668682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,44:0.32:138
chr3	138724757	rs11924188	C	G	4129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.175;NF=66;NR=81;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.284;SC=GCCCAGCAGACGAGTCGTCCT;SOR=0.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=210;TCF=94;TCR=116;TR=147;WE=138724765;WS=138724747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,152:0.68:222
chr3	138725149	.	G	A	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.093;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.48;ReadPosRankSum=-2.000;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr3	138739617	rs1720230	A	G	112.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=2;PP=86;SC=GCTGGTTGGGACGAGCGGGGC;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=138739625;WS=138739607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	138882086	rs13097893	G	A	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.572;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=131;ReadPosRankSum=1.308;SC=CAGTCTTCCCGGTGAATGGCA;SOR=0.193;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=9;WE=138882094;WS=138882076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,8:0.23:35
chr3	139065988	rs1610195	C	T	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=338;ReadPosRankSum=0.069;SC=TCCATAGGCACTAGTGAAAGG;SOR=0.204;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=0;TCR=56;TR=18;WE=139065996;WS=139065978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,19:0.32:60
chr3	139066902	rs10755092	A	T	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=356;ReadPosRankSum=0.875;SC=CTTCTTTTCTATGCAGGTTTT;SOR=0.557;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=16;WE=139066910;WS=139066892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr3	139068008	rs11706615	T	A	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=70;ReadPosRankSum=1.307;SC=TGTTTTGTGATGCTTTAATAT;SOR=0.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=5;WE=139068016;WS=139067998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr3	139068277	rs10935321	G	A	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=84;ReadPosRankSum=0.461;SC=CATTAATCAGGTGTGTATCAA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=6;WE=139068285;WS=139068267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr3	139075644	rs9878548	C	A	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=0.243;SC=AATCTGAAAGCCCTTTTTAAG;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=139075652;WS=139075634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr3	139075938	rs7833	C	T	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=51;ReadPosRankSum=-1.025;SC=AAAAAATGGCCAGATTAAAAG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=139075946;WS=139075928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr3	139077201	rs113807526	T	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=282;ReadPosRankSum=0.703;SC=TGATCAGAATTAGGAAGTGGG;SOR=1.179;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=13;WE=139077209;WS=139077191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr3	139081416	rs57549985	TTA	T	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=141;ReadPosRankSum=0.371;SC=TATGTATGTTTTATATATATA;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=4;WE=139081425;WS=139081406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr3	139090736	rs7373116	G	A	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=2.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.54;ReadPosRankSum=1.002;SOR=1.140;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,30:0.26:115
chr3	139102120	rs7373302	C	A	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=10.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.72;ReadPosRankSum=-1.405;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,54:0.26:207
chr3	139108250	rs3215032	C	CTG	570.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=476;ReadPosRankSum=-0.046;SC=TGGAATCAAACGACCAAGACC;SOR=0.468;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=12;WE=139108258;WS=139108244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr3	139173565	rs2233817	A	G	3503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=7.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.162;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=49;PP=2824;ReadPosRankSum=0.643;SC=AGAACCCAGTACTTACCAGGT;SOR=0.817;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=192;TCF=110;TCR=82;TR=120;WE=139173573;WS=139173555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,125:0.63:197
chr3	139180919	rs3046576	ATG	A	2292.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.284;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.179;NF=54;NR=1;PP=2342;ReadPosRankSum=1.251;SC=CTGGCACAGAATGTGTGAATG;SOR=3.237;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=99;TCF=91;TCR=8;TR=55;WE=139180928;WS=139180909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,61:0.60:102
chr3	139236683	rs2071388	C	T	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=237;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTCTGCAGCACCCTACAGACA;SOR=0.486;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=1;TCR=58;TR=15;WE=139236691;WS=139236673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,16:0.27:59
chr3	139246382	rs295493	A	G	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=449;SC=GACCTTCCCCATGAAGGCTGA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=139246390;WS=139246372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	139257545	rs34662123	GC	G	2026.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=1;PP=2306;SC=TCAGGCCCTTGCCCCCTCTCG;SOR=6.901;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=70;TCF=69;TCR=1;TR=62;WE=139257553;WS=139257535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	139280328	rs35898558	G	GA	677.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=815;ReadPosRankSum=1.088;SC=GCTTTTCTTGGATGTATCGAG;SOR=0.430;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=21;WE=139280336;WS=139280318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr3	139297655	rs10513083	A	G	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.509;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=545;ReadPosRankSum=0.902;SC=TTACCCTGTAAGCTCTGCAGA;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=22;WE=139297663;WS=139297645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
chr3	139654444	rs9821708	T	C	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.150;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=75;ReadPosRankSum=-0.545;SC=CGCAGCTTCTTTGGCCTCTGT;SOR=0.074;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=5;WE=139654452;WS=139654434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr3	139654466	rs9821843	T	C	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.40;ReadPosRankSum=0.998;SOR=0.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr3	139894697	rs4305391	T	C	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=342;ReadPosRankSum=-0.474;SC=TGGATGAGAGTCTATGATTGG;SOR=0.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=16;WE=139894705;WS=139894687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr3	140178321	rs200023601	C	T	2007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.603;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=17;PP=1571;ReadPosRankSum=0.332;SC=ATGAGGACACCGCATCATGAC;SOR=0.972;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=129;TCF=94;TCR=35;TR=71;WE=140178329;WS=140178311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,73:0.56:130
chr3	140185294	rs533657	G	A	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=115;ReadPosRankSum=0.180;SC=TATCATGTGCGTTATAGAACT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=140185302;WS=140185284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr3	140251487	rs349536	T	C	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=692;ReadPosRankSum=1.181;SC=AGTATAAATCTACAAACTAAA;SOR=1.788;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=28;WE=140251495;WS=140251477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,28:0.70:40
chr3	140281723	rs11714465	C	T	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=562;ReadPosRankSum=0.863;SC=GTCCGGCTTCCCTTGAGGCCC;SOR=0.634;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=63;TCF=33;TCR=30;TR=31;WE=140281731;WS=140281713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,31:0.48:64
chr3	140282084	rs4683509	C	G	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=63;ReadPosRankSum=-0.513;SC=GGACACAGGTCGTCATTGTGA;SOR=0.569;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=7;WE=140282092;WS=140282074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr3	140282861	rs10804675	C	T	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.187;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=31;PP=898;ReadPosRankSum=-0.815;SC=TTGTGTTTGTCGTGGCCATGG;SOR=1.049;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=134;TCF=60;TCR=74;TR=51;WE=140282869;WS=140282851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,51:0.37:138
chr3	140285115	rs4683510	T	C	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.291;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=63;ReadPosRankSum=-0.352;SC=GTCTGCTGCCTGGCCCACATG;SOR=0.818;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=6;WE=140285123;WS=140285105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr3	140401693	rs698673	A	G	4777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=54;PP=2965;SC=TGCCGCAACAAGCGCATCGCT;SOR=1.226;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=83;TCR=54;TR=137;WE=140401701;WS=140401683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr3	140406947	rs28594654	G	A	2632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=8.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.428;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=62;PP=2070;ReadPosRankSum=-0.497;SC=AATAAACTACGTGCCCTTGGA;SOR=0.784;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=298;TCF=126;TCR=172;TR=106;WE=140406955;WS=140406937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:200,109:0.35:309
chr3	140407260	rs9876490	C	A	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=898;ReadPosRankSum=-0.923;SC=AGTGCTGGAGCAGACAGCCAG;SOR=0.634;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=121;TCF=65;TCR=56;TR=45;WE=140407268;WS=140407250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,44:0.37:119
chr3	140419715	rs1540506	C	T	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.067;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=12;PP=537;ReadPosRankSum=-1.899;SC=CATGACTCTTCGCTTCTGATT;SOR=0.387;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=86;TCF=57;TCR=29;TR=28;WE=140419723;WS=140419705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,30:0.32:94
chr3	140675313	rs3773837	A	G	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=603;ReadPosRankSum=0.237;SC=CTGGGCATATATACTAACTTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=25;WE=140675321;WS=140675303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr3	140675583	rs16850924	G	T	1410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.302;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=38;PP=1071;ReadPosRankSum=-1.348;SC=GCGTTAGTGAGTTCCAGATGT;SOR=0.477;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=70;TCF=12;TCR=58;TR=47;WE=140675591;WS=140675573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,51:0.68:75
chr3	140685360	.	G	GT	27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5009;HP=13;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=27;QD=10.6666666667;SC=TATTCTGTTGGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=140685368;WS=140685350;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr3	140689627	rs3836424	G	GGATTTGTAAAA	412.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=2859;ReadPosRankSum=0.955;SC=TTTGTCGTATGTGAAAAGTGT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=140689635;WS=140689618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr3	140695070	rs3773835	G	A	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=314;ReadPosRankSum=0.961;SC=AAAGATATCAGTAATGTTTAA;SOR=0.252;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=15;WE=140695078;WS=140695060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr3	140979184	rs1511378	T	C	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=376;SC=TATAAATGAATGATGAGGCTG;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=140979192;WS=140979174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	140998214	rs13087169	G	A	2770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=23;PP=2158;SC=TGCTTCTCTCGCGCAGGTCAT;SOR=2.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=63;TCR=23;TR=86;WE=140998222;WS=140998204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr3	141595527	rs11539489	C	G	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.740;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=175;ReadPosRankSum=0.396;SC=TGTTCTCGGCCGTCCCACCCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=11;WE=141595535;WS=141595517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr3	141621075	rs5853057	TG	T	1372.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.909;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=43;PP=1150;ReadPosRankSum=0.381;SC=ACCTGGTAATTGGGGGGGAGG;SOR=0.256;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=84;TCF=8;TCR=76;TR=49;WE=141621083;WS=141621065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,53:0.67:79
chr3	141622695	rs11710245	G	A	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.377;NF=0;NR=14;PP=299;ReadPosRankSum=0.596;SC=ATGATCTTGGGTCACTGCAAC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=14;WE=141622703;WS=141622685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr3	141625999	rs7622417	G	C	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.243;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=417;ReadPosRankSum=0.582;SC=TCCCTTTTATGTCTTTATAGG;SOR=0.791;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=36;TCF=18;TCR=18;TR=21;WE=141626007;WS=141625989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr3	141626123	rs3792411	A	G	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=408;ReadPosRankSum=-0.820;SC=AAACGTGAGTATGTTTTCTTA;SOR=0.509;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=18;WE=141626131;WS=141626113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr3	141641015	rs3765155	C	G	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=470;ReadPosRankSum=0.885;SC=TTAATTTGTGCGTCATCTATT;SOR=0.516;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=13;TCR=74;TR=26;WE=141641023;WS=141641005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,26:0.29:90
chr3	141644274	rs1131029	G	C	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=1;PP=372;SC=CTGGGCAACAGTCTCAAAAAG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=141644282;WS=141644264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	141709083	rs6440055	A	G	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=11;PP=861;SC=CTTAGCAGTGAGCATGAGGGA;SOR=1.308;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=31;WE=141709091;WS=141709073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	141812759	rs9877817	G	A	1432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=27;PP=1196;SC=ATATAGCACAGGATTTGGCAC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=16;TCR=27;TR=43;WE=141812767;WS=141812749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr3	141892041	.	T	TA	74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=0.9994;HP=16;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=61.97;NF=7;NR=0;PP=74;QD=11.0;SC=AGACAGGGTCTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=7;WE=141892049;WS=141892031;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:13,7:0.35:20
chr3	141904474	rs6785098	C	T	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=483;SC=AACTAAATACCACTCAGAATT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=141904482;WS=141904464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	141904977	rs6440065	G	A	2552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=18;PP=1956;SC=TTTTCCCCACGAAACAAAATG;SOR=2.484;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=77;TCF=59;TCR=18;TR=76;WE=141904985;WS=141904967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	141905472	.	C	T	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.481;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.66;MQRankSum=-2.428;QD=9.88;ReadPosRankSum=-1.624;SOR=1.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr3	141923506	rs9830411	C	T	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.699;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=573;ReadPosRankSum=0.134;SC=AAAAAACCAACAATATCCAAA;SOR=0.199;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=26;WE=141923514;WS=141923496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,25:0.74:34
chr3	141932356	rs6440072	G	A	3822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.593;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=63;PP=2962;ReadPosRankSum=1.161;SC=GCTTATCACAGAATGTACTTA;SOR=0.595;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=235;TCF=132;TCR=103;TR=141;WE=141932364;WS=141932346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,143:0.60:238
chr3	142051147	rs4608715	T	C	115.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=82;ReadPosRankSum=0.566;SC=TAAAAGTACATGATTAAAAAG;SOR=0.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=142051155;WS=142051137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr3	142076059	rs3816805	A	G	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=376;ReadPosRankSum=0.231;SC=CATCATCAGCATTAGTAAATA;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=16;WE=142076067;WS=142076049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr3	142083776	rs3214978	T	TTA	652.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=830;ReadPosRankSum=0.642;SC=ATAAAAAGATTGTTTGTTCCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=17;WE=142083784;WS=142083766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr3	142094816	rs113527448	G	GCACA	195.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.51;ReadPosRankSum=2.162;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr3	142122451	rs2306699	T	A	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=307;ReadPosRankSum=-0.072;SC=CTGGTAAACATCCCAGCAGCT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=13;WE=142122459;WS=142122441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr3	142145480	rs114962950	A	G	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=194;ReadPosRankSum=-0.922;SC=AGTAAATGGAACCCTAAGGCC;SOR=0.207;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=11;WE=142145488;WS=142145470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr3	142145787	rs148280987	C	A	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=164;ReadPosRankSum=0.323;SC=TAGTAATTCACCAGTTTTAAC;SOR=0.141;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=12;WE=142145795;WS=142145777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,13:0.27:48
chr3	142168331	rs1802904	C	T	5102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=94;NR=54;PP=2965;SC=CAGTAGCTTCCTGTATAAGGT;SOR=1.290;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=94;TCR=54;TR=148;WE=142168339;WS=142168321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr3	142215178	.	A	C	266	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=10;NR=0;PP=266;QD=30.0771212547;SC=ATATATATATATGATGACATT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=142215186;WS=142215168;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	142215233	.	G	A	179	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=11;NR=4;PP=179;QD=14.2514141698;SC=CCCTTTCCACGTACAGTTCAG;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=15;WE=142215241;WS=142215223;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:29,15:0.34:44
chr3	142215365	.	AAAGGAAGT	A	710	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=710;QD=255.925537144;SC=AATCTGGTCTAAAGGAAGTAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=3;WE=142215384;WS=142215355;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,3:0.21:14
chr3	142215367	rs72371423	AGG	A	178.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.403;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr3	142215370	rs72272981	AAGTAAC	A	175.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.25;ReadPosRankSum=0.141;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr3	142215376	.	C	A	223	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=3;PP=223;QD=64.4428031368;SC=AAGGAAGTAACAACACATTGG;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=4;WE=142215384;WS=142215355;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,4:0.24:17
chr3	142217410	.	G	A	326.31	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.629;ClippingRankSum=0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9971;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=238;ReadPosRankSum=-0.518;SC=TTATAGGCCAGAAATATAAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=142217418;WS=142217400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,11:0.92:12
chr3	142222074	rs11916455	C	T	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.368;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=200;ReadPosRankSum=2.002;SC=AATGTTGGTGCTTATCTCCAA;SOR=4.003;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=9;WE=142222082;WS=142222064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr3	142222284	rs2227931	A	G	1523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.731;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=42;PP=1097;ReadPosRankSum=1.159;SC=CTACACCATGATAATGAATGA;SOR=1.906;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=79;TCF=20;TCR=59;TR=52;WE=142222292;WS=142222274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,57:0.68:84
chr3	142231081	.	G	A	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.558;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=45.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQRankSum=-2.881;QD=4.36;ReadPosRankSum=-3.319;SOR=6.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,21:0.33:63
chr3	142231085	.	C	A	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=11.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=-4.285;QD=3.11;ReadPosRankSum=-3.225;SOR=3.287;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,5:0.10:51
chr3	142243089	rs112226233	G	T	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=537;ReadPosRankSum=-1.051;SC=CTACAAACTAGTATGTTTTCC;SOR=0.210;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=86;TCF=0;TCR=86;TR=28;WE=142243097;WS=142243079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,28:0.32:87
chr3	142259691	rs112212979	T	C	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.415;NF=14;NR=0;PP=258;ReadPosRankSum=1.307;SC=TTCAAGTTAGTGCTACTGGAA;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=14;WE=142259699;WS=142259681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr3	142266778	rs76852171	A	T	436.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=489;ReadPosRankSum=0.087;SC=GTTAAAAAAAATTTTTTTCTT;SOR=1.042;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=24;WE=142266786;WS=142266768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,22:0.40:55
chr3	142268372	rs28910272	C	T	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=165;ReadPosRankSum=-1.301;SC=AAGAACAGACCAAATGAGAAA;SOR=0.540;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=10;WE=142268380;WS=142268362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,10:0.28:36
chr3	142268612	rs34678750	A	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.142;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=158;ReadPosRankSum=-1.543;SC=AATGCCACACATATTTGGAGT;SOR=0.140;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=12;WE=142268620;WS=142268602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr3	142269075	rs28910271	C	T	1757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.208;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=36;PP=1215;ReadPosRankSum=1.321;SC=TGTTTTCGCACGTCAGCATTC;SOR=0.916;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=266;TCF=138;TCR=128;TR=82;WE=142269083;WS=142269065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,86:0.31:276
chr3	142272275	rs142950892	A	AAC	543.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.254;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.371;NF=1;NR=16;PP=590;ReadPosRankSum=0.000;SC=TGAATACACAAACACACACAC;SOR=2.584;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=58;TCF=7;TCR=51;TR=17;WE=142272284;WS=142272265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr3	142272314	rs9869842	G	A	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.460;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=32;PP=1030;ReadPosRankSum=0.667;SC=ACACACATATGTATCTCCAAT;SOR=3.112;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=38;WE=142272322;WS=142272304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr3	142275353	rs28910270	C	T	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=35;PP=900;ReadPosRankSum=1.049;SC=CTGTTCTCCACTCAAGGAATA;SOR=0.674;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=170;TCF=59;TCR=111;TR=53;WE=142275361;WS=142275343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,56:0.32:177
chr3	142277365	rs199661872	AAAAT	A	2037.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.625;NF=58;NR=0;PP=1898;ReadPosRankSum=-0.964;SC=CTCCGTCTCAAAAATAAATAA;SOR=2.206;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=110;TCF=110;TCR=0;TR=58;WE=142277376;WS=142277355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,53:0.75:71
chr3	142277398	.	A	AG	115.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.000;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.80;MQRankSum=-0.856;QD=0.72;ReadPosRankSum=4.690;SOR=0.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,15:0.09:161
chr3	142277399	.	A	G	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=28;MQ=60.7;NF=70;NR=1;PP=2962;QD=20;SC=TAAATAAATAAATAGATAGAT;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=239;TCF=237;TCR=2;TR=71;WE=142277407;WS=142277385;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:168,71:0.30:239
chr3	142277399	.	A	ATAG	2541.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=0.000;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.76;MQRankSum=-0.830;QD=11.40;ReadPosRankSum=4.686;SOR=0.042;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,68:0.30:223
chr3	142277536	rs2227929	A	G	12990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-7.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=787;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.619;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=238;NR=268;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.028;SC=TTAAACAGCCATCATCAGAAT;SOR=0.719;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=754;TCF=366;TCR=388;TR=506;WE=142277544;WS=142277526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:256,521:0.67:777
chr3	142277575	rs2227930	A	T	23414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=747;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=244;NR=477;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.081;SC=GTGAGAGCATACCACATAAAT;SOR=1.320;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=723;TCF=246;TCR=477;TR=721;WE=142277583;WS=142277565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,736:1.00:738
chr3	142280108	rs28897765	T	C	1802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=28;PP=1343;ReadPosRankSum=-0.659;SC=TTGGTGCTCTTTTAGAAGGGT;SOR=0.681;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=223;TCF=140;TCR=83;TR=73;WE=142280116;WS=142280098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,77:0.34:229
chr3	142280990	rs200229507	CTTA	C	409.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=459;ReadPosRankSum=1.153;SC=ATTCTATTTTCTTATTATTAC;SOR=1.055;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=12;WE=142281000;WS=142280980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr3	142281298	rs28897764	C	T	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.48;ReadPosRankSum=0.661;SOR=0.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,32:0.24:132
chr3	142281612	rs2227928	A	G	3977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=25;PP=2965;SC=AGTAAGAACCATTAATAAAGT;SOR=2.767;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=129;TCF=104;TCR=25;TR=129;WE=142281620;WS=142281602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr3	142281994	rs112718453	C	T	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=250;ReadPosRankSum=0.704;SC=CAAGTATATCCGAAGTGCTAA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=14;WE=142282002;WS=142281984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr3	142287047	rs62276447	T	A	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.746;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=359;ReadPosRankSum=1.605;SC=CAGTTTCATTTGCAAAAAAAA;SOR=1.931;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=17;WE=142287055;WS=142287037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr3	142388513	rs3836386	AATG	A	292.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=266;ReadPosRankSum=-0.370;SC=ACTGCTTTAAAATGATGATGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6;WE=142388523;WS=142388503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr3	142408606	rs6793735	G	A	1632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=22;NR=31;PP=1151;SC=ACACATACCCGTGCCTGCACA;SOR=1.118;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=22;TCR=31;TR=53;WE=142408614;WS=142408596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	142413407	rs6789958	C	T	3068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=59;PP=2337;SC=TTTTATTGTGCTTCAGCTTTA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=29;TCR=59;TR=87;WE=142413415;WS=142413397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr3	142413600	rs13087943	C	T	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=112;ReadPosRankSum=-0.812;SC=TGATGATATACGTAAATCAGT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=142413608;WS=142413590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr3	142417056	.	G	T	87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=3;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=87;QD=60.8856062736;SC=TTACAAGTTTGCTTTAATAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=2;WE=142417078;WS=142417046;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,2:0.25:8
chr3	142417070	rs3773504	G	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=219;ReadPosRankSum=0.566;SC=TAATAAATTTGAAGATGAAGG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=142417078;WS=142417046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr3	142503605	rs7621642	G	A	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.857;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=732;ReadPosRankSum=-0.302;SC=GACAGATGTCGGGTTACCGAC;SOR=0.597;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=142;TCF=80;TCR=62;TR=43;WE=142503613;WS=142503595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,43:0.29:149
chr3	142516826	rs16852615	G	A	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=3.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.76;ReadPosRankSum=-0.665;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,9:0.20:46
chr3	142521224	rs11382953	C	CT	329.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.119;HP=13;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.022;NF=0;NR=17;PP=167;ReadPosRankSum=0.779;SC=ATATATTTGTCTTTTTTTTTT;SOR=3.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=17;WE=142521232;WS=142521214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr3	142523349	rs3821647	G	A	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.391;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=595;ReadPosRankSum=-1.566;SC=ACAAATGTACGTTACCTCCAC;SOR=0.479;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=132;TCF=74;TCR=58;TR=43;WE=142523357;WS=142523339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,43:0.33:132
chr3	142523555	rs4259003	G	A	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.448;NF=1;NR=10;PP=251;ReadPosRankSum=-0.535;SC=TAAGTATGCAGGTTCCCTAAG;SOR=0.289;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=11;WE=142523563;WS=142523545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr3	142524858	rs1132030	G	A	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.124;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=346;ReadPosRankSum=0.863;SC=AGGAATGGAGGAATTTGAAAC;SOR=0.484;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=68;TCF=51;TCR=17;TR=22;WE=142524866;WS=142524848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,22:0.30:73
chr3	142537071	rs7772	C	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=133;ReadPosRankSum=-2.427;SC=CTTTCGGAATCCTCTTTCAGA;SOR=0.202;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=8;WE=142537079;WS=142537061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr3	142542449	rs17554211	G	T	2508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.346;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=57;PP=1837;ReadPosRankSum=0.119;SC=GCCACGGTGGGTTTTAAACCT;SOR=0.960;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=132;TCF=47;TCR=85;TR=84;WE=142542457;WS=142542439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,95:0.66:145
chr3	142548560	rs35692900	A	G	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.080;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=843;ReadPosRankSum=-0.744;SC=TGTGGTGGTGACAGGCTGTTC;SOR=0.959;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=143;TCF=76;TCR=67;TR=48;WE=142548568;WS=142548550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,49:0.32:151
chr3	142567327	rs893883	G	A	4980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=110;PP=2965;SC=GCCAAGAAAAGCGCCAATTAG;SOR=2.272;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=39;TCR=110;TR=149;WE=142567335;WS=142567317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr3	142607487	rs1457684	C	G	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=2;PP=629;SC=CCCGAAGTCCCGGGCTTAGCC;SOR=3.912;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=142607495;WS=142607477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	142607822	.	C	CGCTCACACTGGCAGCAGCGCTG	485.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.16;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	142669479	rs4683440	A	G	3160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=39;PP=2542;SC=CTATGGGGTAACTCAGAGAAT;SOR=1.156;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=54;TCR=39;TR=93;WE=142669487;WS=142669469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr3	142670467	rs2270767	C	T	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=0;PP=807;SC=AGAAGAATTACAGGAGTGGAC;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=30;WE=142670475;WS=142670457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	142670616	rs2270768	A	G	6378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=114;NR=72;PP=2965;SC=CTTTGAGAAAATTGATGTCAG;SOR=1.133;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=114;TCR=72;TR=186;WE=142670624;WS=142670606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr3	142720348	rs766360	G	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=109;ReadPosRankSum=0.461;SC=CCCTAAGGTCGCTATCTCGAC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=142720356;WS=142720345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr3	142730774	rs2124541	T	G	3191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.481;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=63;PP=2571;ReadPosRankSum=1.104;SC=TGAATCAGACTTGGGGATTTT;SOR=0.549;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=203;TCF=97;TCR=106;TR=127;WE=142730782;WS=142730764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,129:0.63:206
chr3	142739630	rs4683718	A	G	3014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.947;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=78;PP=2154;ReadPosRankSum=0.222;SC=TCACCAGTGGATGTCTGAAAC;SOR=0.430;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=140;TCF=28;TCR=112;TR=99;WE=142739638;WS=142739620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,110:0.71:154
chr3	142752293	rs1449869	G	A	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=30;ReadPosRankSum=1.068;SC=AGAATAAGAAGTACAGTCAGC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=142752301;WS=142752283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr3	142753863	.	T	G	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.305;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=16.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.80;ReadPosRankSum=-1.433;SOR=3.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,11:0.20:55
chr3	142757185	rs16852915	T	G	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=37;ReadPosRankSum=-0.842;SC=TTGTGTCTAATGTATGCTTTT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=142757193;WS=142757175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr3	142757824	rs142021689	A	G	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.065;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=724;ReadPosRankSum=0.067;SC=AGTTTTGAATATACTGTTTCT;SOR=0.892;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=34;WE=142757832;WS=142757814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,37:0.63:59
chr3	142773738	rs10935479	C	T	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;ReadPosRankSum=-0.458;SC=AATGAATACCCGATCCTTTGC;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=59;TCF=46;TCR=13;TR=33;WE=142773746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr3	142985100	rs1046706	G	T	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=434;SC=TAAATAGCTGGGCATTCCCTT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=142985108;WS=142985090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	142985890	rs12493372	T	A	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=27;PP=740;SC=AACTGCCCTGTCTGGCCTTGG;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=142985898;WS=142985880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	143214114	rs838598	T	C	2064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=3;PP=1699;SC=ACAGAATAATTCGTAAAAGTA;SOR=5.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=54;TCR=3;TR=57;WE=143214122;WS=143214104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr3	143412268	rs12488981	T	C	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.633;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=24;PP=678;ReadPosRankSum=0.291;SC=ATTGCCACCATCCTGCCAAAT;SOR=0.090;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=30;WE=143412276;WS=143412258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,33:0.77:43
chr3	143513975	rs56969315	A	G	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=363;ReadPosRankSum=1.448;SC=CTTAGTGCAAAAGAAAATAAA;SOR=0.275;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=2;TCR=49;TR=19;WE=143513983;WS=143513965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,18:0.36:50
chr3	143530497	rs72993346	A	G	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=101;ReadPosRankSum=0.513;SC=AGACCAGCCCAGCCAACATGG;SOR=0.569;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=7;WE=143530505;WS=143530487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr3	143530571	rs72993350	G	A	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=202;ReadPosRankSum=0.862;SC=ACGCACAGTGGCACACGCCTG;SOR=0.593;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=30;TCF=14;TCR=16;TR=12;WE=143530579;WS=143530561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr3	143567207	rs11714060	A	G	3781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=99;PP=2965;SC=ACCTGGATAAAGGCTATTTTA;SOR=4.174;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=11;TCR=99;TR=110;WE=143567215;WS=143567197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr3	143692018	rs2279856	C	G	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.233;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=290;ReadPosRankSum=-0.877;SC=AGGGCGACCCCGCTGATGGAG;SOR=0.408;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=88;TCF=74;TCR=14;TR=26;WE=143692026;WS=143692008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,27:0.30:89
chr3	143692052	rs115935429	C	T	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=455;ReadPosRankSum=0.545;SC=TACCTAGATTCGGGCGCATTT;SOR=0.765;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=125;TCF=86;TCR=39;TR=34;WE=143692060;WS=143692042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,37:0.29:128
chr3	145790519	rs3762694	T	A	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=663;ReadPosRankSum=1.060;SC=AAAATAGTTATTTTAATATGT;SOR=0.352;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=25;WE=145790527;WS=145790509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr3	145796891	rs73010484	T	C	1660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.473;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=56;PP=1109;ReadPosRankSum=0.221;SC=AAGCCATCACTGCATATCTTA;SOR=0.651;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=290;TCF=103;TCR=187;TR=88;WE=145796899;WS=145796881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,92:0.31:297
chr3	145838895	rs4681297	C	T	1759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.620;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=23;PP=1383;ReadPosRankSum=-1.342;SC=GGTGTTTCTCCTACCATTCAG;SOR=0.420;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=243;TCF=180;TCR=63;TR=76;WE=145838903;WS=145838885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,77:0.31:246
chr3	145840968	rs3804659	C	G	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=3.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=80;ReadPosRankSum=0.898;SC=TAATATACTACATACTCAAAT;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=145840976;WS=145840958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr3	145917761	rs1061409	T	C	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.312;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=656;ReadPosRankSum=1.844;SC=TCGGTTACAATGTAAACCATC;SOR=1.071;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=58;TCF=21;TCR=37;TR=37;WE=145917769;WS=145917751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,40:0.66:61
chr3	145918947	rs62272383	T	C	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=352;ReadPosRankSum=0.147;SC=GAAATAGATATTAAAATGCAT;SOR=0.321;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=14;WE=145918955;WS=145918937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr3	145924591	rs35080966	A	AT	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=4.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.87;ReadPosRankSum=-0.884;SOR=0.045;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,3:0.18:17
chr3	145924632	rs3762688	C	T	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=224;SC=ATAGATCACACGACATCCACT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=145924640;WS=145924622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	145938528	rs3762686	C	A	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=0;PP=683;SC=TTAATTTGTTCGCTTAAAAAG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=145938536;WS=145938518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	145938619	rs3762685	T	C	2284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.068;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=27;PP=1741;ReadPosRankSum=0.137;SC=AAAATGAGAATTGTATTCAGG;SOR=1.066;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=108;TCF=72;TCR=36;TR=85;WE=145938627;WS=145938609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,87:0.79:110
chr3	145938782	rs9850144	C	T	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.144;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=633;ReadPosRankSum=0.014;SC=TATTCTTTTTCCTTTCTTATG;SOR=0.058;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=28;WE=145938790;WS=145938772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,29:0.69:42
chr3	145939691	rs3804648	C	T	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.56;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=51;SC=ACATAAATAACAAATATATAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=145939699;WS=145939681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	145939755	rs3840204	C	CA	370.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=3;PP=123;ReadPosRankSum=-0.075;SC=AAATGTTAAACAAAAAAAAAT;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=9;WE=145939763;WS=145939745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr3	145939776	rs3804647	T	G	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.694;HP=5;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.693;NF=8;NR=4;PP=248;ReadPosRankSum=0.794;SC=CGAAATAAAGTCCCCCTTTAG;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=12;WE=145939784;WS=145939766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr3	146113576	rs11340803	CT	C	1603.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=18;PP=1346;SC=AGCATCAATGCTTTAATTTTA;SOR=1.085;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=36;TCF=16;TCR=20;TR=34;WE=146113584;WS=146113566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	146159764	rs4355250	T	A	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=334;SC=CAGGTATAAGTTCTCTACCTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=13;WE=146159772;WS=146159754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	146176075	rs12494007	C	T	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=10;PP=567;SC=GACAGACATTCGTAAATAGTC;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=20;WE=146176083;WS=146176065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	146177815	rs6806535	C	T	1635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=36;PP=1370;SC=GGTGGTCAGCCTGTTTCCCAG;SOR=1.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=50;WE=146177823;WS=146177805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	146213570	rs72286809	TTAGG	T	1248.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=1367;ReadPosRankSum=1.008;SC=AAGGTCCCCATTAGGTAGTTC;SOR=5.486;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=27;WE=146213581;WS=146213560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr3	146234909	rs343320	G	A	2654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.421;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=63;PP=2007;ReadPosRankSum=-0.513;SC=CCAGTCCAGTGCTTGGAAATT;SOR=0.340;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=159;TCF=55;TCR=104;TR=102;WE=146234917;WS=146234899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,105:0.64:163
chr3	146246288	rs2738909	A	G	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=232;ReadPosRankSum=0.129;SC=CTGTTAGCAGAAAATACAGTT;SOR=0.250;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=13;WE=146246296;WS=146246278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,15:0.34:44
chr3	146303750	rs342902	G	A	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=2;PP=384;SC=ATGAAAAAGAGTTAGATAGCG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=146303758;WS=146303740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	146307371	rs343288	G	A	5304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=138;NR=19;PP=2965;SC=AAATGGGATAGGCTATATTGT;SOR=3.830;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=138;TCR=19;TR=157;WE=146307379;WS=146307361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr3	146307635	rs343289	C	A	2803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=76;PP=2289;SC=TTAAATTTGACAGTGAAAAAA;SOR=7.403;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=77;TCF=1;TCR=76;TR=77;WE=146307643;WS=146307625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	146309715	rs862912	A	T	1467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=46;PP=1233;ReadPosRankSum=-1.560;SC=AGGTTATCATATTTTAATTTT;SOR=0.634;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=62;TCF=2;TCR=60;TR=48;WE=146309723;WS=146309705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,49:0.75:65
chr3	147121751	rs6766244	C	T	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.671;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=3;PP=612;ReadPosRankSum=1.736;SC=GTAGACTCACCTTTTCCCAGA;SOR=1.508;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=74;TCF=62;TCR=12;TR=30;WE=147121759;WS=147121741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,29:0.40:73
chr3	148459395	rs5182	C	T	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=3.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.585;SOR=0.477;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,49:0.27:184
chr3	148459988	rs5186	A	C	2399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.808;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=70;PP=1950;ReadPosRankSum=-0.620;SC=CCAAATGAGCATTAGCTACTT;SOR=0.828;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=136;TCF=31;TCR=105;TR=89;WE=148459996;WS=148459978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,88:0.65:135
chr3	148575156	rs2331407	C	T	1286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=0;PP=980;SC=TACTTACATGCTTTGAATGCC;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=35;WE=148575164;WS=148575146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	148575441	rs1356259	C	T	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=29;PP=762;SC=TGCCTCACAGCAAATTTTTCT;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=34;WE=148575449;WS=148575431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr3	148597482	rs1032465	T	G	1823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=0;PP=1482;SC=ACAGGGGAAATAATTGCTTTG;SOR=7.978;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=50;WE=148597490;WS=148597472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	148597612	rs12489516	C	T	6745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=122;NR=88;PP=2965;SC=GCTATTTTTACGGATTGTGGC;SOR=0.989;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=210;TCF=122;TCR=88;TR=210;WE=148597620;WS=148597602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr3	148714841	.	TTG	T	37	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.63;NF=0;NR=2;PP=37;QD=20.0;SC=CTGGGAAATATTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=2;WE=148714850;WS=148714831;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,2:0.14:14
chr3	148756825	rs6764352	G	A	1868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=9;PP=1522;SC=AAAATTTACAGAACTACTTAC;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=48;TCR=9;TR=57;WE=148756833;WS=148756815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	148786108	rs812249	C	T	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,17:0.24:71
chr3	148858987	rs10693502	C	CTTTT	2412.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.44;MQRankSum=-0.531;QD=21.74;ReadPosRankSum=-2.448;SOR=0.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,73:0.66:111
chr3	148868292	rs150286093	GC	G	440.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.596;NF=15;NR=0;PP=520;ReadPosRankSum=-0.655;SC=TGTCACCCCTGCCCATTGCCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=15;WE=148868300;WS=148868282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr3	148868361	rs2689232	C	T	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.600;NF=17;NR=2;PP=480;ReadPosRankSum=-0.102;SC=TCACTTTGCTCAGCAGCCTGT;SOR=0.749;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=19;WE=148868369;WS=148868351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr3	148872987	rs6440589	G	A	2452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=46;PP=2048;SC=CACCAGTGCAGCTGTACAAAG;SOR=0.995;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=35;TCR=46;TR=81;WE=148872995;WS=148872977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	148879878	rs61615092	A	G	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.35;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	148879878	.	AATGGA	GATGGA,GATGGG	598	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=30,9;NR=2,1;PP=598,121;QD=19.7741003921;SC=GTATTTCTAAAATGGACAATC;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=32,10;WE=148879891;WS=148879868;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:32
chr3	148879883	rs57943258	A	G	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.21;ReadPosRankSum=1.260;SOR=0.207;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr3	148880229	rs67649453	CAG	C	133.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=140;ReadPosRankSum=-0.703;SC=ATTGAAAAAACAGACATACAT;SOR=0.169;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=5;WE=148880238;WS=148880219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr3	148881460	.	A	G	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=39;ReadPosRankSum=-0.842;SC=CAAGACTGAAATATTTTCCAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=148881468;WS=148881456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr3	148881673	rs3732557	C	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=174;ReadPosRankSum=-0.863;SC=CATGGGTTCACGTCGTAATAT;SOR=0.527;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=10;WE=148881681;WS=148881663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr3	148885066	rs57192685	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.199;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr3	148885077	rs2681092	C	T	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=207;SC=ATAATCAGATCTGATAACCTC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=148885085;WS=148885067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	148885779	rs11426099	A	AT	806.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=507;ReadPosRankSum=0.748;SC=AGGTAAAATGATTTTTTTTTT;SOR=1.609;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=26;WE=148885787;WS=148885769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,33:0.94:35
chr3	148885851	rs2681096	G	A	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=339;SC=GTATTTTCATGTGATTCTCAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=148885859;WS=148885841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	148890105	.	T	TCACACA,TCA	184.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.524;NF=0,0;NR=5,5;PP=106,102;ReadPosRankSum=-1.282;SC=ATTTTATATATCACACACACA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5,5;WE=148890113;WS=148890095;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.57:7
chr3	148896430	rs16861582	A	G	2245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.816;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=49;PP=1837;ReadPosRankSum=-2.511;SC=TGGAAACAAGAAAAATCTTCA;SOR=1.083;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=114;TCF=47;TCR=67;TR=80;WE=148896438;WS=148896420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,80:0.70:114
chr3	148897498	.	TACACAC	T,TACACACAC	169.75	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=69;ReadPosRankSum=-0.414;SC=GTTTATATTGTACACACACAC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=6;WE=148897511;WS=148897488;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.33:15
chr3	148900046	rs16861598	C	T	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=133;ReadPosRankSum=1.063;SC=TGGATTTATACTGCGTCCCAG;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=9;WE=148900054;WS=148900036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr3	148901406	rs143522213	AC	A	580.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.744;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.131;NF=7;NR=14;PP=575;ReadPosRankSum=-0.908;SC=AAAAAAAAAAACAACTAAGGT;SOR=0.340;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=21;WE=148901414;WS=148901396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,23:0.77:30
chr3	148901540	rs36103494	C	A	78.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=3;PP=57;SC=AGTAGGAATGCATAATAAGAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=148901548;WS=148901530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	148904434	rs1053709	T	G	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=40;PP=1100;ReadPosRankSum=-0.828;SC=CGGCCTCATTTCCGGCGCTGA;SOR=0.780;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=16;TCR=65;TR=50;WE=148904442;WS=148904424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,50:0.63:79
chr3	148916235	rs701753	T	A	3036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.69;QD=32.65;SOR=1.305;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr3	148924230	rs34481162	T	C	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=33;PP=638;ReadPosRankSum=-0.373;SC=ATTGAAGGAATAGACAGATAG;SOR=1.077;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=110;TCF=9;TCR=101;TR=35;WE=148924238;WS=148924220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,37:0.33:112
chr3	148935791	rs73019064	C	T	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.067;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=285;ReadPosRankSum=-2.080;SC=ATGAAAAACCCGGTAATAATG;SOR=0.452;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=78;TCF=21;TCR=57;TR=22;WE=148935799;WS=148935781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,23:0.28:82
chr3	149039324	rs2015626	G	A	1343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=33;PP=1072;SC=TTATAAACTTGGCTTGATTAG;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=38;WE=149039332;WS=149039314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	149050925	rs1526786	T	C	1837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=5;PP=1528;SC=TCATTACTTCTACTAGTTACA;SOR=4.332;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=49;TCR=5;TR=54;WE=149050933;WS=149050915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	149087404	rs8479	T	C	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=110;SC=AGTCTGTAAATTACCCCCAGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=149087412;WS=149087394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	149087714	rs6776940	T	C	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=219;SC=GGATAAATAATGATGACATTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=149087722;WS=149087704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	149093238	rs4771	A	G	2152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=19;PP=1769;SC=ACTGGCCCTCAGTGCTGGCAA;SOR=2.242;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=56;TCR=19;TR=75;WE=149093246;WS=149093228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr3	149216629	rs9799030	C	T	1389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.306;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=43;PP=1062;ReadPosRankSum=0.861;SC=TGGTTCTCTGCGCCATCCAGG;SOR=0.929;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=159;TCF=45;TCR=114;TR=58;WE=149216637;WS=149216619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,60:0.37:161
chr3	149220517	rs12636725	C	T	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=24;PP=503;ReadPosRankSum=0.080;SC=TACAGCATGACGACTACAATT;SOR=0.604;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=17;TCR=72;TR=30;WE=149220525;WS=149220507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,30:0.33:92
chr3	149243694	rs9854499	G	C	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.413;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=123;ReadPosRankSum=-0.244;SC=TAAAATAAAAGTTGAAATTAT;SOR=0.163;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=6;WE=149243702;WS=149243684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr3	149258970	.	CA	C	35	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=35;QD=22.0;SC=CTTTTCTCCCCAAAAATGTAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=3;WE=149258978;WS=149258960;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr3	149459341	rs7633238	A	G	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.146;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=7;PP=857;ReadPosRankSum=0.462;SC=TCCTACAGTGATTTGTCTTCA;SOR=1.091;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=116;TCF=93;TCR=23;TR=43;WE=149459349;WS=149459331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,46:0.37:126
chr3	149459530	.	A	T	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.778;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.321;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=464;ReadPosRankSum=-0.372;SC=AAATAAGAGCACAGTAACTAT;SOR=0.270;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=85;TCF=8;TCR=77;TR=27;WE=149459538;WS=149459520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,29:0.33:89
chr3	149485901	rs3839072	T	TG	1058.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=30;PP=1164;ReadPosRankSum=-0.592;SC=GTGAAACAAGTGGGGAGGGGG;SOR=0.325;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=7;TCR=55;TR=34;WE=149485909;WS=149485891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,39:0.58:67
chr3	149488309	rs7630033	A	G	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.10;ReadPosRankSum=-0.150;SOR=0.576;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,30:0.25:118
chr3	149488442	rs7630153	A	G	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.493;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=51;PP=1403;ReadPosRankSum=0.571;SC=CATCCCAGACATCCAAGCGAA;SOR=0.296;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=323;TCF=129;TCR=194;TR=98;WE=149488450;WS=149488432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:228,100:0.30:328
chr3	149508537	rs73009615	T	C	1453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=4;PP=1099;ReadPosRankSum=0.526;SC=GAGATAGATATCTTAGACGAA;SOR=0.702;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=180;TCF=170;TCR=10;TR=61;WE=149508545;WS=149508527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,63:0.33:190
chr3	149510262	rs4681554	A	G	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=27;PP=760;SC=AGCCAGAGGCAGCTGTCACTG;SOR=5.353;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=28;WE=149510270;WS=149510252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	149564075	rs6440641	A	G	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=11;PP=357;SC=CTTGACATTGAGGTACCTTAT;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=149564083;WS=149564065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	149570515	.	G	T	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=31;ReadPosRankSum=0.598;SC=CATTTGTAAAGGGTCAGATTA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=149570523;WS=149570505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr3	149678534	rs6768054	C	T	4402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=111;NR=24;PP=2965;SC=CAGCTTATCACTGCAAGTGTG;SOR=3.082;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=111;TCR=24;TR=135;WE=149678542;WS=149678524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr3	149679148	rs61689176	T	TA	272.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=0.000;QD=3.33;ReadPosRankSum=-0.289;SOR=0.773;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,23:0.28:82
chr3	149679161	rs35367664	A	AT	1404.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=34;PP=1288;ReadPosRankSum=1.921;SC=AAAAAAAAAAATCCTCAGTAT;SOR=0.735;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=28;TCR=50;TR=53;WE=149679169;WS=149679138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,59:0.66:90
chr3	149686366	rs35842204	AAC	A	188.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.93;ReadPosRankSum=0.570;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr3	149686367	rs61268501	AC	A	541.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.302;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,32:0.63:51
chr3	149700519	rs7630407	T	C	4318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.648;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.293;NF=77;NR=77;PP=2962;ReadPosRankSum=0.045;SC=AGCTTCTCCATTGACTCTGGT;SOR=0.662;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=238;TCF=116;TCR=122;TR=154;WE=149700527;WS=149700509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,154:0.65:238
chr3	149701113	rs34404328	CG	C	223.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.253;NF=0;NR=8;PP=243;ReadPosRankSum=0.196;SC=GCCAGAGAGCCGGCCCCGGTA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=8;WE=149701121;WS=149701103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr3	150128392	rs879634	G	A	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.611;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=211;ReadPosRankSum=-0.923;SC=CGGCCAGAATGCTTCCTCGGT;SOR=0.155;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=14;WE=150128400;WS=150128382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr3	150129171	rs3840253	A	AT	544.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=662;ReadPosRankSum=0.376;SC=ACTTTGGGAGATTGTTGTCAA;SOR=0.286;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=0;TCR=59;TR=19;WE=150129179;WS=150129161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,22:0.36:61
chr3	150264003	rs1130834	G	C	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-8.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=40;PP=581;ReadPosRankSum=0.196;SC=TGCGAGGCTCGGCTCGTGGTG;SOR=0.807;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=120;TCF=1;TCR=119;TR=40;WE=150264011;WS=150263993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,43:0.35:122
chr3	150270077	rs12330655	C	G	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=2;PP=690;SC=TTTTAAAAAACACATTTGTGT;SOR=4.255;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=150270085;WS=150270067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	150276151	rs200333608	A	AT	221.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.043;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=328;ReadPosRankSum=0.211;SC=ATTCATTTAAACCTTTTTTTT;SOR=1.634;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=8;WE=150276161;WS=150276141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr3	150276153	.	C	T	228.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.887;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.499;HP=10;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=357;ReadPosRankSum=-0.084;SC=TCATTTAAACCTTTTTTTTTT;SOR=1.855;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=9;WE=150276161;WS=150276141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr3	150276391	rs6776252	A	G	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.23;ReadPosRankSum=0.385;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr3	150280253	rs4343650	A	T	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.558;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=239;ReadPosRankSum=-0.553;SC=ATTTGAAAAGAGGTATGAATG;SOR=0.034;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=45;TCF=43;TCR=2;TR=15;WE=150280261;WS=150280243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr3	150280445	rs1132979	C	G	1236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.090;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=33;PP=958;ReadPosRankSum=-0.557;SC=CAGCCTTACACTAGTAAGTAT;SOR=0.869;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=163;TCF=64;TCR=99;TR=52;WE=150280453;WS=150280435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,54:0.32:168
chr3	150280506	rs5853483	GA	G	419.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=2.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.56;ReadPosRankSum=0.409;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,24:0.26:92
chr3	150283050	rs73001341	C	A	1282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=36;PP=981;ReadPosRankSum=0.891;SC=AGGTGATGTTCACTTCTTTTA;SOR=0.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=12;TCR=53;TR=44;WE=150283058;WS=150283040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,46:0.68:68
chr3	150285520	rs2293151	T	C	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=531;ReadPosRankSum=-0.965;SC=AAATTAATGATTTTGTATTAT;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=23;WE=150285528;WS=150285510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,25:0.81:31
chr3	150285664	rs2293150	A	G	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.809;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=17;PP=1349;ReadPosRankSum=-0.776;SC=AAAATTAAGTAATGATTTATG;SOR=0.850;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=101;TCF=70;TCR=31;TR=60;WE=150285672;WS=150285654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,61:0.59:104
chr3	150286210	rs1915945	A	T	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=129;ReadPosRankSum=-1.221;SC=TTAAGATAAAATTTTTCTTAA;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=150286218;WS=150286200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr3	150321123	rs41267887	G	A	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.682;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=247;ReadPosRankSum=-0.015;SC=CTGTCTGAGGGCGGCCGAAGT;SOR=0.156;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=18;WE=150321131;WS=150321113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,19:0.28:68
chr3	150332199	rs1568586	T	G	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.40;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	150340114	rs2177148	A	G	114.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=88;SC=TTAACTAACTACAAAATAAAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=150340122;WS=150340104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	150342397	rs17440940	C	T	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=196;ReadPosRankSum=0.009;SC=CTCTCAAATTCTGTGTACATT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=8;WE=150342405;WS=150342387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr3	150384807	rs6440691	T	G	3652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=90;PP=2965;SC=TATACCCTGGTCAGGAAGGAA;SOR=3.026;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=19;TCR=90;TR=109;WE=150384815;WS=150384797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr3	150420438	.	T	C	425	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=13;NR=3;PP=425;QD=28.7357007842;SC=TGCTGCCAAATATCCTGTAAT;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=150420446;WS=150420437;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	150420588	rs10663389	G	GTTAAA	5525.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=46;PP=2912;SC=AGCACAGGATGTTAAACACAA;SOR=1.089;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=87;TCF=38;TCR=49;TR=78;WE=150420596;WS=150420578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr3	150420608	rs71138466	G	GT	2570.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=3.948;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.55;MQRankSum=0.656;QD=22.55;ReadPosRankSum=0.897;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:6,108:0.95:114
chr3	150420781	rs111995561	C	CAG,CAGAG	825.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.36;QD=41.29;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,7,13:0.35,0.65:20
chr3	150421419	rs17281287	G	A	3390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=74;PP=2599;SC=CTGGGAAGTCGTCGTCGTAGT;SOR=1.631;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=34;TCR=74;TR=108;WE=150421427;WS=150421409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr3	150603248	rs57919280	G	GAAAAGC	3262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FS=6.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.74;MQRankSum=7.303;QD=10.42;ReadPosRankSum=-1.280;SOR=0.424;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:217,96:0.31:313
chr3	150690566	rs3796240	T	C	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=163;ReadPosRankSum=-1.590;SC=AGGGACTGCCTCTTTGACTGC;SOR=0.650;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=10;WE=150690574;WS=150690556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr3	150804908	rs7653870	T	G	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=128;ReadPosRankSum=0.944;SC=GGCGCTGCGGTGGAAGAGGTC;SOR=0.247;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=11;WE=150804916;WS=150804898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,12:0.26:47
chr3	150834015	rs4680158	G	A	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=416;ReadPosRankSum=-0.892;SC=CCTTTCAAGAGTTCTCCTCTA;SOR=1.382;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=18;WE=150834023;WS=150834005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr3	150881774	rs17290219	A	C	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.436;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=499;ReadPosRankSum=-0.787;SC=GATCTGCTGCAGGTGGCCCCG;SOR=1.460;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=29;WE=150881782;WS=150881764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,30:0.43:69
chr3	150883600	rs2567322	C	T	2713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=12;PP=2030;ReadPosRankSum=0.495;SC=TATTTTTGGCCTCATTAACCA;SOR=0.866;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=110;TCF=94;TCR=16;TR=86;WE=150883608;WS=150883590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,94:0.78:120
chr3	150910640	rs1231520	G	C	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=28;PP=654;SC=TCTGTAAATTGGAACACTCCT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=150910648;WS=150910630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	150932075	rs55936523	T	G	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.067;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=338;ReadPosRankSum=1.168;SC=AGGATTCATCTGGAGGCTGTG;SOR=0.872;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=59;TCF=19;TCR=40;TR=20;WE=150932083;WS=150932065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,21:0.32:66
chr3	151011944	rs12492699	A	C	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.194;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=157;ReadPosRankSum=0.383;SC=GATTCCAACAAACAATAAAAG;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=10;WE=151011952;WS=151011934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,10:0.28:36
chr3	151011969	rs1048408	G	A	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=214;ReadPosRankSum=0.582;SC=ACACATCAGTGTAATCATAAT;SOR=0.430;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=13;WE=151011977;WS=151011959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,12:0.30:40
chr3	151012497	rs2242353	T	C	2086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.580;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=30;PP=1603;ReadPosRankSum=0.169;SC=GACCATTTGTTAGGATGATGT;SOR=0.932;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=295;TCF=182;TCR=113;TR=86;WE=151012505;WS=151012487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:214,90:0.30:304
chr3	151045661	rs1491980	G	C	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=237;ReadPosRankSum=2.143;SC=TTCTGTACACGAGGATAATAA;SOR=0.252;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=14;WE=151045669;WS=151045657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,14:0.34:41
chr3	151046308	rs1466684	G	A	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.769;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=624;ReadPosRankSum=1.184;SC=GCTCAAGATCGTATTTGGCAG;SOR=0.605;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=98;TCF=57;TCR=41;TR=34;WE=151046316;WS=151046298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,35:0.34:104
chr3	151056598	rs6809699	A	C	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.474;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=33;PP=991;ReadPosRankSum=0.245;SC=GACTGGTGTTACCAGGCGCAG;SOR=0.445;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=125;TCF=37;TCR=88;TR=49;WE=151056606;WS=151056588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,50:0.38:131
chr3	151067730	rs1565574	C	T	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.34;ReadPosRankSum=0.829;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,4:0.17:23
chr3	151073033	rs7615865	T	C	2010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=8.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.844;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=67;PP=1586;ReadPosRankSum=-0.962;SC=CTCAGGTAGCTATTTAAAGCT;SOR=0.522;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=206;TCF=24;TCR=182;TR=77;WE=151073041;WS=151073023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,77:0.38:202
chr3	151073937	rs1994730	T	C	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=175;ReadPosRankSum=-0.253;SC=CTTGTAATCCTGGCACTTTGG;SOR=0.348;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=15;WE=151073945;WS=151073927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,16:0.33:49
chr3	151085578	rs3732764	C	A	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.462;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=615;ReadPosRankSum=2.073;SC=CATGAACATCCGTTGCTCTTT;SOR=1.130;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=144;TCF=78;TCR=66;TR=41;WE=151085586;WS=151085568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,41:0.28:148
chr3	151090424	rs3732765	G	A	4198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.531;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=59;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.965;SC=AGAGGTTTGCGATGTGATGGG;SOR=0.806;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=254;TCF=153;TCR=101;TR=154;WE=151090432;WS=151090414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,157:0.59:264
chr3	151096112	rs12497065	T	C	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=515;ReadPosRankSum=1.387;SC=CAAGGCTGTCTTATTCCTAAA;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=21;WE=151096120;WS=151096102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr3	151100677	rs3821663	T	G	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=325;ReadPosRankSum=-0.572;SC=CTTCCCTGTTTCTAAAGCCTT;SOR=0.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=16;WE=151100685;WS=151100667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr3	151101691	rs10935841	C	T	1906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.733;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=47;PP=1356;ReadPosRankSum=-1.486;SC=GTTTTTATCACTTCACATTGA;SOR=0.917;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=105;TCF=33;TCR=72;TR=66;WE=151101699;WS=151101681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,72:0.65:111
chr3	151101746	rs12485508	C	T	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.007;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=1072;ReadPosRankSum=0.902;SC=ATACTGATGGCGATTTCTGCC;SOR=0.472;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=78;TCF=24;TCR=54;TR=47;WE=151101754;WS=151101736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,48:0.59:81
chr3	151108070	rs56194873	GT	G	271.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.839;NF=0;NR=11;PP=267;ReadPosRankSum=0.912;SC=ACACAGAAATGTTTTTTGTTT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=11;WE=151108078;WS=151108060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr3	151112568	rs3732768	G	A	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=418;ReadPosRankSum=-0.692;SC=CAATCACATCGCAGCAGCAGT;SOR=0.602;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=33;TCR=73;TR=32;WE=151112576;WS=151112558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,34:0.30:112
chr3	151131183	rs2276764	G	A	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=371;ReadPosRankSum=-1.250;SC=TCAATTGCCAGATTCCAAGGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=16;WE=151131191;WS=151131173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr3	151143354	rs10653830	T	TTG	531.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.23;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	151143447	rs6440742	G	T	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=13;PP=931;SC=ATACCTGACAGTAGTAAGCTG;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=36;WE=151143455;WS=151143437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	151154435	rs142016761	A	AAAT	130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=130;ReadPosRankSum=1.250;SC=TTCTTCCAAAAAATAAATTCT;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=4;WE=151154443;WS=151154425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr3	151154666	rs2172250	T	C	2981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=49;PP=2458;SC=GCATCTCCCATGTGATTTCTG;SOR=0.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=50;TCR=49;TR=99;WE=151154674;WS=151154656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr3	151155620	rs6781302	G	A	6179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=90;PP=2965;ReadPosRankSum=1.064;SC=TAACAGTTCTGTTTGTATACA;SOR=0.277;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=100;TCR=90;TR=189;WE=151155628;WS=151155610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,194:0.99:195
chr3	151158184	rs937126	A	T	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=3;PP=1117;SC=ATTAGAGAAAATTTTTTTTTC;SOR=4.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=41;WE=151158192;WS=151158174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	151158265	rs937125	G	A	3613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=10;PP=2798;ReadPosRankSum=-0.082;SC=CTAAAGGAAGGGAAACTGCCA;SOR=2.910;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=102;TCF=92;TCR=10;TR=101;WE=151158273;WS=151158255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,110:0.99:111
chr3	151158502	rs10663807	T	TAG	1650.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=31;PP=1321;SC=ATAATAATGATGTCTGAGTCT;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=31;WE=151158510;WS=151158492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	151165678	rs9871952	T	C	2872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=36;PP=2396;SC=ATGTACGGAGTTGTGCACCTG;SOR=1.101;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=49;TCR=36;TR=85;WE=151165686;WS=151165668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr3	151166422	rs6798252	C	T	5705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=95;PP=2965;SC=AGTACTGGATCTGTAATGTAC;SOR=0.919;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=78;TCR=95;TR=173;WE=151166430;WS=151166412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr3	151171406	rs114161831	C	T	5644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.927;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=84;PP=2962;ReadPosRankSum=1.017;SC=TGATTTCCTTCCAAGTGCACC;SOR=0.780;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=301;TCF=171;TCR=130;TR=201;WE=151171414;WS=151171396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,209:0.67:311
chr3	151171439	rs7619322	A	C	8898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.680;HP=5;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=150;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.806;SC=TTGAGCCCATAAAAAACCTCT;SOR=0.718;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=261;TCF=111;TCR=150;TR=260;WE=151171447;WS=151171429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,272:1.00:273
chr3	151171542	rs7621591	A	G	3831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=105;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.797;SC=TTCGGACTTTATTATAGCTCA;SOR=2.765;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=12;TCR=106;TR=117;WE=151171550;WS=151171532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,120:0.99:121
chr3	151463243	.	G	A	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-5.407;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.351;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=215;ReadPosRankSum=-0.532;SC=TTTGGTATTTGAGAATTAGAT;SOR=0.039;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=48;TCF=47;TCR=1;TR=14;WE=151463251;WS=151463233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,14:0.29:48
chr3	151463421	rs1972977	G	T	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.975;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=17;PP=725;ReadPosRankSum=0.590;SC=AATCTGCATTGCGGGAGACAG;SOR=1.280;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=131;TCF=71;TCR=60;TR=44;WE=151463429;WS=151463411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,45:0.34:131
chr3	151531894	rs2293004	C	T	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=3.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.620;SOR=0.456;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,50:0.28:177
chr3	151542408	rs148745568	AAAAC	A	199.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.213;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr3	151542737	rs13098550	G	A	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=833;ReadPosRankSum=0.146;SC=AGGAGATATTGATTTTTTGAA;SOR=0.576;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=14;WE=151542760;WS=151542727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr3	151542749	rs151253803	CTATT	C	382.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=825;ReadPosRankSum=0.356;SC=TTTTTTGAAACTATTAAAGAG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=10;WE=151542760;WS=151542727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr3	151545318	rs2410837	A	T	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.70;ReadPosRankSum=1.466;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr3	151545321	rs11306821	GT	G	292.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.71;ReadPosRankSum=1.619;SOR=0.297;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr3	151545323	rs62272918	T	G	301.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.07;ReadPosRankSum=1.420;SOR=0.297;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr3	151545601	rs1803155	G	A	1730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.759;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=36;PP=1363;ReadPosRankSum=-1.272;SC=CTTCAAATTTGTTAATTGGAG;SOR=0.557;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=206;TCF=111;TCR=95;TR=77;WE=151545609;WS=151545591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,77:0.37:210
chr3	151546041	rs1042201	G	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=101;ReadPosRankSum=-0.483;SC=GTCTTTCTTAGAATGGTCTAG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=151546049;WS=151546031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr3	152554357	rs701265	A	G	6694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=114;PP=2965;ReadPosRankSum=1.845;SC=TTTACCTGGTAATCATTGTAC;SOR=0.892;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=213;TCF=96;TCR=117;TR=209;WE=152554365;WS=152554347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,207:0.99:209
chr3	153202224	rs3732618	T	C	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=29;ReadPosRankSum=-0.503;SC=ATATGAATGGTGTGGTTCCTA;SOR=0.082;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=5;WE=153202232;WS=153202214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
chr3	153202348	rs3732619	G	A	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.792;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=12;PP=575;ReadPosRankSum=-0.682;SC=GAGTACAGATGCATGTATGTG;SOR=1.206;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=123;TCF=76;TCR=47;TR=37;WE=153202356;WS=153202338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,45:0.34:134
chr3	153839866	rs12493885	G	C	5572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=77;PP=2965;SC=GCCCCACCAGGTTCTGGGCCG;SOR=1.018;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=103;TCR=77;TR=180;WE=153839874;WS=153839856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr3	153839959	rs59508481	CT	TC	5886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=63;PP=2947;SC=AGGGACGCTCCTCGCAGCGCA;SOR=0.856;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=57;TCR=67;TR=118;WE=153839968;WS=153839949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr3	153847582	rs1626280	T	A	2247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=65;PP=1888;SC=GATTTGGCTTTTGTTCTTTTC;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=0;TCR=65;TR=65;WE=153847590;WS=153847572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr3	153870511	rs1727956	G	A	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=532;SC=GCTATATTTAGTTCTTTAATT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=153870519;WS=153870501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	153970704	rs2307750	CTT	C	1471.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=1;PP=1150;SC=CATTCAGACTCTTTTGACAAT;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=153970713;WS=153970694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	153970796	rs355752	A	G	3924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=89;NR=25;PP=2965;SC=ATACCTCTCTAGAGAATCTCT;SOR=2.624;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=115;TCF=90;TCR=25;TR=114;WE=153970804;WS=153970786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr3	153972500	rs355749	T	C	1560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=20;PP=1095;SC=TGTCCTCTTTTGGCCTCAGCA;SOR=1.201;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=28;TCR=20;TR=48;WE=153972508;WS=153972490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	153994502	rs355787	T	C	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=5;PP=1155;SC=CTGACTTACATGTAGATTTAA;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=42;WE=153994510;WS=153994492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	153995307	rs73160598	A	G	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=288;ReadPosRankSum=-0.485;SC=AATTTTGTATATAATTGTTAA;SOR=0.846;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=13;WE=153995315;WS=153995297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr3	154007682	rs355758	G	C	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=24;PP=946;SC=TAGAACTGCAGAGAAAATACT;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=37;WE=154007690;WS=154007672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	154018887	rs9438	G	C	3107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=84;PP=2582;ReadPosRankSum=0.746;SC=CTTAAACTGGGATCTGTGTTC;SOR=4.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=87;TCF=2;TCR=85;TR=86;WE=154018895;WS=154018877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,90:0.99:91
chr3	154021063	rs355756	G	A	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=657;SC=TTTGACATGAGAAAAGTGATA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=154021071;WS=154021053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	154024165	rs355754	T	C	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=462;SC=TCTAGGACTGTTGAAAAATTG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=154024173;WS=154024155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	154146922	rs34792862	A	G	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.032;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=440;ReadPosRankSum=0.538;SC=AGAGCAGCAGACTGGCTGCCC;SOR=1.569;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=22;WE=154146930;WS=154146912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,22:0.42:53
chr3	154802742	rs28617565	T	G	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=-1.080;SC=AGTTCTTGCTTTAAGAAATTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=154802750;WS=154802732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr3	154807720	rs3773903	G	A	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.960;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=437;ReadPosRankSum=0.839;SC=CTGCACTCCAGCCTGGAAGAC;SOR=0.357;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=23;WE=154807728;WS=154807710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr3	154858158	rs28758831	C	T	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.608;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=53;PP=1316;ReadPosRankSum=0.419;SC=TTCTAAAATTCGTCAAGTTTT;SOR=2.147;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=75;TCF=7;TCR=68;TR=57;WE=154858166;WS=154858148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,58:0.76:76
chr3	155205993	rs368444721	C	CT	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.908;NF=3;NR=33;PP=590;ReadPosRankSum=0.673;SC=GACTGTAGTTCTTTTTTTTTT;SOR=0.849;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=74;TCF=8;TCR=66;TR=36;WE=155206001;WS=155205983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,39:0.85:46
chr3	155212325	rs3214639	G	GA	2556.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=74;PP=2581;SC=TTTTAATCGAGAAAAAAGGAA;SOR=5.161;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=89;TCF=6;TCR=83;TR=76;WE=155212333;WS=155212315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr3	155241593	rs9840061	A	G	3475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=0;PP=2864;SC=CACAGCCACCATAATTGTGAG;SOR=9.624;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=120;TCF=120;TCR=0;TR=120;WE=155241601;WS=155241583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr3	155241740	rs9840234	A	G	10462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=162;NR=188;PP=2965;SC=TGTCCTCATCAGAAACTTCCC;SOR=0.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=350;TCF=162;TCR=188;TR=350;WE=155241748;WS=155241730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,354:1.00:354
chr3	155271825	rs359549	G	A	2163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=2;PP=1838;SC=TGCTCCATGCGGGAGGCTACC;SOR=6.123;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=62;TCF=60;TCR=2;TR=62;WE=155271833;WS=155271815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr3	155301264	rs9289957	T	C	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.798;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=138;ReadPosRankSum=-0.898;SC=ATGATACCTTTTGCTCCACCT;SOR=2.621;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=8;WE=155301272;WS=155301254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr3	155314034	rs359569	A	G	1601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=19;PP=1231;SC=TTGCCTTCTCACTCTTCCTAG;SOR=1.412;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=51;WE=155314042;WS=155314024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	155314296	rs359570	A	G	174.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=140;SC=AATTTGGTAGAGGTAATCTGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=155314304;WS=155314286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	155481609	rs7653384	G	A	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=716;ReadPosRankSum=2.566;SC=GAACTGTCCAGTAGATTTTAG;SOR=0.616;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=54;TCF=26;TCR=28;TR=32;WE=155481617;WS=155481599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr3	155485302	rs358733	C	T	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=2;PP=655;ReadPosRankSum=-1.094;SC=GCTTACCTTACTCACCAGAAG;SOR=0.572;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=28;WE=155485310;WS=155485292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,30:0.75:40
chr3	155523375	rs10563990	GCGCA	G	202.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=261;ReadPosRankSum=-2.450;SC=CGATGGGGTAGCGCACGCAAC;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=6;WE=155523386;WS=155523365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr3	155551144	rs7617024	T	C	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.485;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=244;ReadPosRankSum=1.566;SC=ATTTCTTCAGTGTCAGATTCA;SOR=0.136;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=13;WE=155551152;WS=155551134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr3	155551206	rs7649631	C	T	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=458;ReadPosRankSum=-0.444;SC=AGCTGTCTTCCTTATTTTACA;SOR=0.850;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=65;TCF=58;TCR=7;TR=23;WE=155551214;WS=155551196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,23:0.35:65
chr3	155611557	rs6441026	T	G	145.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=115;SC=TTATTAATTTTCTTGAGCACT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=155611565;WS=155611547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	155628877	rs10936021	T	G	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.244;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=248;ReadPosRankSum=0.176;SC=GTTTTGCTCATTTTGATTTTT;SOR=2.526;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=12;WE=155628885;WS=155628867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr3	155637190	rs1356252	A	G	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=280;ReadPosRankSum=0.818;SC=AGAAAAATCAATTCAGACAAT;SOR=0.471;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=71;TCF=7;TCR=64;TR=20;WE=155637198;WS=155637180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,20:0.27:73
chr3	155639959	rs3772117	A	G	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=215;ReadPosRankSum=0.419;SC=AAATACTATTATTACTCCTAC;SOR=0.446;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=53;TCF=40;TCR=13;TR=15;WE=155639967;WS=155639949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,15:0.27:55
chr3	155654432	rs3772113	T	A	255.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=239;SC=CTTTTTTTTTTAAATTTTCAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=155654440;WS=155654422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	155836231	rs13093154	C	T	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=4.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=357;ReadPosRankSum=1.538;SC=ACTTCCACCACGTTTTACATT;SOR=0.463;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=20;WE=155836239;WS=155836221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,20:0.36:55
chr3	155991348	rs1160221	G	T	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.944;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=530;ReadPosRankSum=0.765;SC=GCACACAGATGCTCTTTCCAT;SOR=0.291;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=99;TCF=31;TCR=68;TR=33;WE=155991356;WS=155991338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,33:0.33:99
chr3	156009925	rs1551066	C	T	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.78;ReadPosRankSum=1.851;SOR=0.470;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,24:0.22:108
chr3	156175109	rs34093583	C	CTT	888.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.769;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.723;NF=24;NR=1;PP=987;ReadPosRankSum=1.193;SC=CTTTCCCTCTCCACTAAAACT;SOR=2.833;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=54;TCF=45;TCR=9;TR=25;WE=156175117;WS=156175099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chr3	156175167	rs2293194	GG	AA	1876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.522;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.085;NF=32;NR=17;PP=1945;ReadPosRankSum=0.521;SC=CCTAAAGACCGGTAGAGGACT;SOR=0.876;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=119;TCF=75;TCR=44;TR=49;WE=156175176;WS=156175157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,51:0.41:123
chr3	156232315	rs72558055	A	T	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.947;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=32;PP=697;ReadPosRankSum=0.037;SC=AAATTGCAAGATCTTTTGCAA;SOR=1.814;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=78;TCF=2;TCR=76;TR=32;WE=156232323;WS=156232305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,33:0.42:79
chr3	156233027	rs17317854	A	G	2604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.803;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=71;PP=1930;ReadPosRankSum=-1.540;SC=TCAAAATAAAAGCTACTGAGT;SOR=0.973;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=135;TCF=27;TCR=108;TR=87;WE=156233035;WS=156233017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,93:0.65:143
chr3	156249407	rs2280030	G	C	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=382;SC=GGGGAACAAAGGCAACAGAAC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=156249415;WS=156249397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	156261110	rs1983206	T	C	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.120;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=249;ReadPosRankSum=-1.271;SC=ATTGGTTTTTTGAGAAAATAA;SOR=0.970;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=56;TCF=19;TCR=37;TR=20;WE=156261118;WS=156261100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,21:0.36:58
chr3	156262232	rs6792998	C	G	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=255;ReadPosRankSum=0.323;SC=CAAGATTCTACAGACACAGAA;SOR=0.830;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=19;WE=156262240;WS=156262222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,19:0.28:68
chr3	156262396	rs35584247	G	GA	91.14	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5032;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=0.431;SC=TTCTTCCACTGAAAAAAAATA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=156262404;WS=156262386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr3	156266642	rs6809188	C	T	3046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=42;PP=2339;SC=TCAAAAAATTCTCTTCAAAGT;SOR=1.037;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=54;TCR=42;TR=95;WE=156266650;WS=156266632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr3	156266774	rs9296	C	T	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.171;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=284;ReadPosRankSum=0.427;SC=AAACAGCATCCTCCCTCTTCT;SOR=1.358;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=19;WE=156266782;WS=156266764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,20:0.30:66
chr3	156266880	rs3773716	C	T	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5562;FS=6.021;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=92;ReadPosRankSum=-1.242;SC=ACTCATATTTCGTACTGGCAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=5;WE=156266888;WS=156266870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr3	156271595	rs2292337	G	A	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.05;ReadPosRankSum=-0.409;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,7:0.18:39
chr3	156271608	rs2292338	G	A	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.69;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,7:0.19:36
chr3	156271627	rs2292339	C	T	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.920;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=80;ReadPosRankSum=-0.264;SC=TACAACCCCGCAACAAAAGCC;SOR=0.200;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=7;WE=156271635;WS=156271617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr3	156399180	rs3851992	G	A	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=36;PP=997;SC=AGTTTATATGGCTTGGTAAAT;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=156399188;WS=156399170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	156421525	rs34277251	G	T	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=0.548;SC=CAAGACGGCCGGGCGCAGTGG;SOR=0.836;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=7;WE=156421533;WS=156421515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr3	156431750	rs61733487	A	G	1455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.09;QD=31.65;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	156544584	rs344071	C	T	4309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=82;PP=2965;SC=GATGTGAACTCCCGCCTTCAC;SOR=1.089;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=51;TCR=83;TR=133;WE=156544592;WS=156544574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr3	156697097	rs6780427	G	A	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=34;PP=1258;SC=ACTTATAACAGTGCTCTGTAG;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=48;WE=156697105;WS=156697087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	156864398	rs370594663	TAAAAAA	T	410.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=5.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=1.187;QD=18.67;ReadPosRankSum=-0.892;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr3	156864419	.	TA	T	182.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=4.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.000;SOR=1.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr3	156864551	rs6783595	T	A	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=3.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=299;ReadPosRankSum=1.664;SC=CAGAAATATCTATTTATAATT;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=13;WE=156864559;WS=156864541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr3	156867776	rs377312008	G	GAA	1305.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.724;HP=8;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=777;ReadPosRankSum=-1.869;SC=GCTGTTGGAGGAAAAAAAAGT;SOR=1.317;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=71;TCF=25;TCR=46;TR=34;WE=156867784;WS=156867766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,41:0.63:65
chr3	156870059	rs73154633	C	T	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.565;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=658;ReadPosRankSum=2.882;SC=AAACTCAATTCAGTATACTGG;SOR=1.259;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=28;WE=156870067;WS=156870049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,30:0.60:50
chr3	156870816	rs41272613	A	G	3653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=7.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.347;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=40;PP=2881;ReadPosRankSum=-0.639;SC=TCTGTACTCTACAACTCACCT;SOR=0.432;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=216;TCF=151;TCR=65;TR=127;WE=156870824;WS=156870806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,131:0.60:219
chr3	156876502	rs6441114	G	A	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=673;ReadPosRankSum=0.076;SC=ATTATTTTAAGTATCAGTGTT;SOR=1.501;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=27;WE=156876510;WS=156876492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr3	156876574	rs6441115	A	G	1723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.921;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=18;PP=1363;ReadPosRankSum=0.563;SC=ATTCACTTGAAAGGAAAGATG;SOR=0.976;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=90;TCF=62;TCR=28;TR=61;WE=156876582;WS=156876564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,63:0.67:94
chr3	156876803	rs6441116	T	G	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.486;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=34;PP=916;ReadPosRankSum=2.227;SC=ATTGTTAGATTAAACTCACTT;SOR=1.211;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=61;TCF=8;TCR=53;TR=38;WE=156876811;WS=156876793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,39:0.64:61
chr3	156877276	rs59715654	CAA	C	2487.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.811;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.904;NF=15;NR=42;PP=2152;ReadPosRankSum=-1.797;SC=CACCTGCAGACAAGAGAGGAG;SOR=0.888;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=92;TCF=25;TCR=67;TR=57;WE=156877285;WS=156877266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,65:0.64:102
chr3	156877357	rs10936061	T	C	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=35;PP=1010;ReadPosRankSum=-0.661;SC=ATCGCTTCCCTTTCCCCTCCC;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=9;TCR=52;TR=41;WE=156877365;WS=156877347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,41:0.67:61
chr3	156877530	rs12635088	G	A	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.639;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=472;ReadPosRankSum=-0.541;SC=CGGCGTAGGGGACGGAGGAGA;SOR=1.123;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=21;WE=156877538;WS=156877527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr3	156978919	rs11398653	A	AT	3731.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.622;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.873;NF=60;NR=39;PP=2933;ReadPosRankSum=0.117;SC=TGACTTATAAATCCCTACAGA;SOR=0.422;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=162;TCF=103;TCR=59;TR=99;WE=156978927;WS=156978909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,117:0.59:197
chr3	156983273	rs3749214	A	G	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.856;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=4;PP=864;ReadPosRankSum=-0.366;SC=TGGAGATCAAAACCTTAAAAA;SOR=0.334;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=50;TCF=45;TCR=5;TR=34;WE=156983281;WS=156983263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,38:0.68:56
chr3	156983414	rs7652298	T	C	2278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.547;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=55;PP=1716;ReadPosRankSum=-0.881;SC=TCTCTTTAAGTTTTCCTTCTA;SOR=0.915;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=127;TCF=43;TCR=84;TR=82;WE=156983422;WS=156983404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,85:0.64:132
chr3	157004323	rs4680353	A	C	2374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.292;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=41;PP=1682;ReadPosRankSum=0.562;SC=AATGGTTCTTAGCAGCAGGTA;SOR=0.271;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=143;TCF=83;TCR=60;TR=86;WE=157004331;WS=157004313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,92:0.61:152
chr3	157155620	.	C	G	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=51;ReadPosRankSum=-0.718;SC=CGCGCCCTGGCCGCGGTGCTA;SOR=1.270;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=4;WE=157155628;WS=157155610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr3	157296325	.	C	CATATATAT	116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=125;ReadPosRankSum=2.189;SC=CCAAAAAGTACATATATATAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=4;WE=157296334;WS=157296315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr3	157817517	rs9833383	A	G	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=463;SC=GGTCCACTATATCATCTCAAA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=157817525;WS=157817507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	157820423	rs4462902	C	T	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=1;PP=817;SC=CAACCCCAGGCTCTCTCTGCT;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=157820431;WS=157820413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	157841531	rs6789448	G	A	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.938;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=122;ReadPosRankSum=-0.120;SC=ATTTATCTCTGTTTGCTTCCA;SOR=0.148;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=8;WE=157841539;WS=157841521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr3	157849957	rs1609526	C	T	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.269;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=73;ReadPosRankSum=0.068;SC=GTATTTTTGGCGGAGATGGGG;SOR=0.182;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=7;WE=157849965;WS=157849947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr3	158178684	rs73030514	G	A	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.410;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=126;ReadPosRankSum=-0.198;SC=TTGAATATAGGCATAAAATAA;SOR=0.019;SbPval=0.04;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=11;WE=158178692;WS=158178674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,11:0.23:47
chr3	158178856	rs73172119	G	A	1343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.333;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=37;PP=1014;ReadPosRankSum=0.720;SC=TGAATAGACCGTAGAATATAA;SOR=1.054;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=63;TCF=12;TCR=51;TR=46;WE=158178864;WS=158178846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,49:0.73:67
chr3	158187189	rs9815348	G	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.142;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=261;ReadPosRankSum=-1.168;SC=TGATTCCCATGATGCATATAT;SOR=0.705;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=47;TCF=24;TCR=23;TR=17;WE=158187197;WS=158187179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr3	158254806	rs73154326	A	G	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=243;ReadPosRankSum=0.928;SC=TTCTTCATAGAAAGAACATTG;SOR=0.412;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=10;WE=158254814;WS=158254796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr3	158289035	rs3817373	T	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.914;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=90;ReadPosRankSum=-0.377;SC=CCGCGGCGAGTTAACATCGTT;SOR=0.050;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=10;WE=158289043;WS=158289025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr3	158306627	rs1075551	A	G	2099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=4.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.42;ReadPosRankSum=-0.652;SOR=1.017;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,58:0.34:169
chr3	158306630	rs2115942	T	G	2123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.64;ReadPosRankSum=-1.326;SOR=1.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,60:0.36:168
chr3	158308875	rs2566339	T	C	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.780;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=136;ReadPosRankSum=-1.328;SC=CTTGGACTTATGAGCAGAAGA;SOR=0.550;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=45;TCF=25;TCR=20;TR=15;WE=158308883;WS=158308865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr3	158310153	rs6771248	A	G	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=276;ReadPosRankSum=0.213;SC=ATTATTTGTAATATTTACCTG;SOR=0.118;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=60;TCR=0;TR=16;WE=158310161;WS=158310143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,16:0.25:63
chr3	158318015	rs2639656	C	T	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=65;ReadPosRankSum=-0.693;SC=AAATAACAGCCGTACTTGATG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=6;WE=158318023;WS=158318005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr3	158320597	rs4875	T	C	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.66;ReadPosRankSum=0.031;SOR=0.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr3	158362351	rs116614958	C	T	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=54;ReadPosRankSum=0.687;SC=TGACTTTGACCGCTTCCCGGT;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=5;WE=158362359;WS=158362341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr3	158362441	rs1864507	T	C	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.533;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=322;ReadPosRankSum=-1.947;SC=TCCTGGGAGCTGCAGCCGTCG;SOR=1.223;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=54;TCF=45;TCR=9;TR=18;WE=158362449;WS=158362431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,19:0.34:56
chr3	158362526	rs1864506	A	G	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.726;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=631;ReadPosRankSum=-0.208;SC=TAGAGAGGCTAAATCGGGACC;SOR=0.814;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=63;TCR=45;TR=39;WE=158362534;WS=158362516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,44:0.38:116
chr3	158362588	rs1864505	C	G	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.848;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=432;ReadPosRankSum=-0.161;SC=GTGACACCCCCTGGGTCCTCA;SOR=0.878;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=98;TCF=30;TCR=68;TR=30;WE=158362596;WS=158362578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,34:0.33:102
chr3	158363757	rs78679143	A	G	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.625;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.84;ReadPosRankSum=0.605;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr3	158366900	rs2303909	G	A	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=241;ReadPosRankSum=-0.699;SC=TAAAGGTATTGTAGATCTTAT;SOR=0.836;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=17;WE=158366908;WS=158366890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr3	158369798	rs9810874	A	G	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=268;ReadPosRankSum=-0.740;SC=CTAAAAAAATATTTTAACCAT;SOR=0.399;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=14;WE=158369806;WS=158369788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr3	158370127	rs116385487	T	C	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=193;ReadPosRankSum=1.941;SC=ATGTATGGGCTTTATTAATGA;SOR=0.183;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=11;WE=158370135;WS=158370117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,12:0.30:40
chr3	158372477	rs62286656	C	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.16;ReadPosRankSum=-0.144;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,5:0.14:36
chr3	158372502	rs9884039	T	C	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.527;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=39;ReadPosRankSum=-1.341;SC=AGAATGACTCTGACTTTTATG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=6;WE=158372510;WS=158372492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr3	158386737	rs1492909	C	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=162;ReadPosRankSum=-0.317;SC=ACAATACTTTCGATAAATATT;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=8;WE=158386745;WS=158386727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr3	158387487	rs6441215	T	C	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=84;ReadPosRankSum=0.158;SC=AAGCATAGGCTCCTAATGGTG;SOR=0.760;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=6;WE=158387495;WS=158387477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr3	158388721	rs56093991	C	CAAAGAAA	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=0.712;SC=GACCCTGTCTCAAAGAAAAAA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=2;WE=158388729;WS=158388711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,2:0.29:7
chr3	158388780	rs8455	T	C	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.614;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=191;ReadPosRankSum=-0.572;SC=AAATTTAAGGTGATACTTATG;SOR=0.154;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=12;WE=158388788;WS=158388770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr3	158390395	rs9841	A	T	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=168;ReadPosRankSum=-2.642;SC=TCCTTCAGTCAGTCTTCTTCC;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=9;WE=158390403;WS=158390385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr3	158399757	rs11436468	A	AT	488.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.291;NF=22;NR=2;PP=298;ReadPosRankSum=0.574;SC=ATAATGCTCCATTTTTTTTTT;SOR=0.476;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=65;TCF=56;TCR=9;TR=24;WE=158399765;WS=158399747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,27:0.39:70
chr3	158408911	rs76679758	A	G	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=124;ReadPosRankSum=-1.127;SC=TAAAATATCTACTATGTTTGT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=10;WE=158408919;WS=158408901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr3	158409093	rs145803239	C	CA	495.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.89;ReadPosRankSum=1.003;SOR=0.452;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,23:0.32:72
chr3	158409262	rs1047355	C	T	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.612;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=386;ReadPosRankSum=-0.983;SC=ACTAACTTTGCTTACTGTGAG;SOR=0.127;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=59;TCF=3;TCR=56;TR=21;WE=158409270;WS=158409252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,22:0.37:60
chr3	158422506	rs4680457	G	A	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=127;ReadPosRankSum=1.604;SC=TTAGAAGTTCGCATGAATTCA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=8;WE=158422514;WS=158422496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr3	158428809	rs3830357	A	AAGGC	373.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.38;ReadPosRankSum=1.720;SOR=0.026;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,9:0.25:36
chr3	158449965	rs6441223	T	C	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=57;ReadPosRankSum=0.253;SC=CCAGCACTCGTAGCGCGCTGG;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=7;WE=158449973;WS=158449955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr3	158450080	rs7621322	T	C	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=63;ReadPosRankSum=0.188;SC=GTCGTCGGGGTCCCCGGACCC;SOR=0.432;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=7;WE=158450088;WS=158450070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr3	158450151	rs7609656	C	T	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.180;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=335;ReadPosRankSum=-0.809;SC=CGGTGGGGCGCGGGCCCCTGG;SOR=0.177;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=21;WE=158450159;WS=158450141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,20:0.34:59
chr3	158450169	rs147016103	C	G	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=9.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.62;ReadPosRankSum=1.208;SOR=0.189;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,23:0.31:75
chr3	158450178	rs6786423	A	G	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=6.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.50;ReadPosRankSum=1.219;SOR=0.246;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,23:0.28:82
chr3	158450298	rs73015649	C	G	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=4.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.94;ReadPosRankSum=0.722;SOR=0.228;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,17:0.25:67
chr3	158451654	rs73015654	G	A	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=179;ReadPosRankSum=0.262;SC=GATGGGCGTGGTGCCATCTCT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=9;WE=158451662;WS=158451644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr3	158451882	rs73015655	A	C	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=216;ReadPosRankSum=-0.482;SC=ATATTGGATGAAGTTACATGC;SOR=0.596;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=20;TCR=23;TR=13;WE=158451890;WS=158451872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr3	158451932	rs73015657	G	A	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.562;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=159;ReadPosRankSum=-0.695;SC=ATGGGGAGTTGGGAGGTGGTT;SOR=1.232;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=11;WE=158451940;WS=158451922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr3	158520483	rs2713736	A	G	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.161;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=467;ReadPosRankSum=-0.272;SC=GTTCCTAAACAACTTTTGTTT;SOR=0.863;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=82;TCF=14;TCR=68;TR=26;WE=158520491;WS=158520473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,28:0.33:84
chr3	158522960	rs1381463	C	T	66.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5032;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=43;ReadPosRankSum=0.319;SC=TGACCATTTTCCTGGGCCAGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=158522968;WS=158522953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr3	158525322	rs114662902	A	T	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.706;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=112;ReadPosRankSum=-1.837;SC=AAGATCTTTAAAAAACCTTGT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=8;WE=158525330;WS=158525312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr3	158537415	rs146160361	CTTTTT	C	678.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=3.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQRankSum=2.767;QD=14.44;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.102;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr3	158537432	rs202109044	A	T	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=10.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.01;MQRankSum=-2.647;QD=2.75;ReadPosRankSum=-0.337;SOR=3.111;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,21:0.32:65
chr3	158537443	rs3765083	A	G	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.41;MQRankSum=2.087;QD=14.21;ReadPosRankSum=0.930;SOR=0.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,33:0.42:79
chr3	158539266	rs73017579	G	A	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.80;ReadPosRankSum=0.601;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr3	158539294	rs1548092	G	A	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=188;ReadPosRankSum=-0.243;SC=GAAAGAAGCTGATTAAACTTG;SOR=0.412;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=6;WE=158539302;WS=158539284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr3	158539486	rs1548093	A	G	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.002;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=6;PP=136;ReadPosRankSum=-1.094;SC=CATGTGAAGTATGGGTCTTTA;SOR=1.402;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=9;WE=158539494;WS=158539476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr3	158539961	rs6793618	G	A	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.830;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=278;ReadPosRankSum=-0.035;SC=GGTGGGGTCAGGGCTTCAGCA;SOR=1.826;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=16;WE=158539969;WS=158539951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,17:0.33:52
chr3	158544907	rs73019641	A	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=0.947;SC=CCCTTTGGGAAGGTTCCAGTA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=158544915;WS=158544897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr3	158545195	rs6792827	G	T	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=216;ReadPosRankSum=0.492;SC=TCGTTTCAAGGTTTGGGCTTT;SOR=0.467;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=12;WE=158545217;WS=158545185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr3	158787632	.	TTGTGTGTG	T	156.52	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;ClippingRankSum=-0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=1.383;NF=0;NR=4;PP=572;SC=CCCTCCTTTCTTGTGTGTGTG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=4;WE=158787647;WS=158787622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr3	158963503	rs34415272	G	C	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.337;NF=30;NR=6;PP=782;ReadPosRankSum=-0.550;SC=CACCCGCCTCGGCCTCCCAAA;SOR=0.823;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=59;TCF=48;TCR=11;TR=36;WE=158963511;WS=158963493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,34:0.57:60
chr3	158970714	rs1020470	T	C	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=249;ReadPosRankSum=-0.331;SC=ATGTGCTGCATATTATTTCCT;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=11;WE=158970722;WS=158970704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr3	158991724	rs2621285	A	T	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.534;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=35;PP=846;ReadPosRankSum=-1.811;SC=TATTTTTACAAATGAAGAGAG;SOR=1.981;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=56;TCF=6;TCR=50;TR=38;WE=158991732;WS=158991714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,42:0.70:60
chr3	159482768	rs9832139	G	T	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=169;ReadPosRankSum=0.952;SC=CGGCGGCTGGGGGGCTCTGCC;SOR=0.840;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=53;TCF=9;TCR=44;TR=14;WE=159482776;WS=159482758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,14:0.25:55
chr3	159584137	rs148163160	T	TA	575.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=436;ReadPosRankSum=-0.285;SC=ACTATTCTAATAAAAAAAAGC;SOR=0.841;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=101;TCF=2;TCR=99;TR=28;WE=159584145;WS=159584127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,30:0.36:84
chr3	159710992	rs2243130	G	A	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=377;ReadPosRankSum=-1.350;SC=AAAAATTCACGTTTCTGGTAT;SOR=0.186;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=18;WE=159711000;WS=159710982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr3	159733600	rs589545	G	A	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.057;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=85;ReadPosRankSum=-0.712;SC=TTCTAAATCTGAAAAATTGCT;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=159733608;WS=159733596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr3	159733692	rs491966	T	C	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=264;ReadPosRankSum=-1.472;SC=CTACACTTGATCCTGAGATCT;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=13;WE=159733700;WS=159733682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr3	159736893	rs2647930	T	C	2744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.575;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=21;PP=2078;ReadPosRankSum=1.133;SC=TTAAACATCCTAAGTGGTCAA;SOR=0.475;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=144;TCF=113;TCR=31;TR=93;WE=159736901;WS=159736883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,100:0.62:160
chr3	159737076	rs2647931	G	A	1915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.603;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=55;PP=1447;ReadPosRankSum=0.538;SC=TCCTCTCGCCGCAAGCACATG;SOR=1.285;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=91;TCF=13;TCR=78;TR=63;WE=159737084;WS=159737066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,70:0.71:99
chr3	159744277	rs2936300	C	T	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=443;SC=TCCACCACAGCGAAACCAGTT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=159744285;WS=159744267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	159744352	rs2279742	C	T	1189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=12;PP=1026;SC=CGAGACCTGACGGGAAGCGGG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=38;WE=159744360;WS=159744342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	159744438	rs2914119	C	T	3823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.46;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr3	159744438	.	CTC	TTT	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=45;NR=27;PP=2947;QD=20;SC=AGGACAGGCACTCGCATGGGT;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=47;TCR=28;TR=72;WE=159744448;WS=159744428;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,72:0.96:75
chr3	159744440	rs2936301	C	T	3823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.52;SOR=1.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr3	159944142	rs185340430	C	T	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=445;ReadPosRankSum=-0.501;SC=CCGACGGCGGCGAGGGCCGCT;SOR=0.627;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=75;TCF=10;TCR=65;TR=25;WE=159944150;WS=159944132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,26:0.34:76
chr3	159976271	rs16831149	C	T	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.497;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=74;ReadPosRankSum=-1.087;SC=TTAATCAGAACGTGTTTCAAA;SOR=0.093;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=5;WE=159976279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr3	159976432	rs58665245	G	GA	318.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.351;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=310;ReadPosRankSum=0.781;SC=AGCTGCAATAGAAAAAAAAAA;SOR=1.812;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=16;WE=159976440;WS=159976422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr3	159995356	rs3737214	A	G	1604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.964;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=27;PP=1255;ReadPosRankSum=-0.716;SC=ATATGTAAACATTAATTACTT;SOR=0.450;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=89;TCF=53;TCR=36;TR=65;WE=159995364;WS=159995346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,64:0.71:90
chr3	159997061	rs6778728	T	A	3544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=60;PP=2785;SC=GGATATGGTGTTATGCTGATG;SOR=1.061;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=48;TCR=60;TR=108;WE=159997069;WS=159997051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr3	160003448	rs2275150	G	A	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=85;ReadPosRankSum=0.205;SC=GACATCTTTAGGCAAAATAGT;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=160003456;WS=160003438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr3	160021681	rs4680576	G	A	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.324;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=778;ReadPosRankSum=1.374;SC=CCCAGATCCAGTAGTTAAACA;SOR=0.525;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=36;TCF=16;TCR=20;TR=35;WE=160021689;WS=160021671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr3	160102491	rs111466948	T	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.101;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=156;ReadPosRankSum=0.383;SC=AATGTACGTATACAAACACAA;SOR=2.679;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=10;WE=160102499;WS=160102481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,10:0.24:41
chr3	160119660	rs76695024	C	T	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=88;ReadPosRankSum=1.383;SC=TAGGCTTTTCCCCCGCCGTTT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=160119668;WS=160119650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr3	160119789	.	G	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.609;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=61;ReadPosRankSum=-0.225;SC=AATGACCAATGAAGCTGGAGC;SOR=0.339;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=7;WE=160119797;WS=160119779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,9:0.27:33
chr3	160130110	rs2305407	G	A	1765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=16;PP=1408;ReadPosRankSum=-0.569;SC=TTTAATTTCTGTAGTTAAACA;SOR=0.746;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=39;TCR=16;TR=54;WE=160130118;WS=160130100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,57:0.98:58
chr3	160131236	rs374785778	CT	C	39.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=1.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=2.180;QD=0.86;ReadPosRankSum=-0.422;SOR=0.327;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,10:0.22:46
chr3	160135428	rs1451760	C	T	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=0;PP=921;ReadPosRankSum=-0.458;SC=TTTCTTAAATCGAATATAAAA;SOR=1.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=57;TCR=0;TR=37;WE=160135436;WS=160135418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,38:0.67:57
chr3	160141147	rs4679884	G	T	59.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	160142618	rs11718121	A	C	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=263;ReadPosRankSum=0.414;SC=CTTTTCTGTCAATCTGAAATG;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=11;WE=160142626;WS=160142608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr3	160142810	.	A	ATGTGTGTGTGTGTG	809.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;QD=80.97;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr3	160148756	rs7631792	C	T	1067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=8;PP=843;SC=TCCTTCATCTCTGTAATGTGA;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=160148764;WS=160148746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	160150688	rs79276814	A	G	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.88;ReadPosRankSum=-0.728;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr3	160156318	rs75343910	A	G	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.652;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=587;ReadPosRankSum=0.485;SC=TTTGTGGAGTATATTCTTGAT;SOR=1.576;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=102;TCF=43;TCR=59;TR=32;WE=160156326;WS=160156308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,33:0.31:105
chr3	160156951	rs1141023	C	T	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=487;ReadPosRankSum=-2.975;SC=GACAAGTTAACTCTTCCTCAA;SOR=1.071;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=20;WE=160156959;WS=160156941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr3	160220158	rs116475044	T	C	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.968;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=75;ReadPosRankSum=0.846;SC=AAGGTTTTTTTTTTCTTTCTT;SOR=0.269;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=5;WE=160220166;WS=160220148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr3	160223032	rs721022	C	T	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=255;SC=ATCTTAAAATCAACAACCTGA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=160223040;WS=160223022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	160227707	rs2305402	A	C	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.80;ReadPosRankSum=1.009;SOR=0.478;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,7:0.19:37
chr3	160233406	rs112603907	CT	C	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=11.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.96;ReadPosRankSum=0.513;SOR=0.011;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr3	160245948	rs1551190	A	G	161.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.55;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=86;SC=TTAAAATATAACCTCATTAAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=160245956;WS=160245938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	160245980	rs4679890	C	T	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=21;SC=GGAATAGCATCATTGGAAGAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=160245988;WS=160245970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	160283126	rs4621370	A	C	2528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=72;PP=2257;ReadPosRankSum=-0.799;SC=GCCCCAACCAACGCGCCGCAC;SOR=3.611;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=5;TCR=74;TR=77;WE=160283134;WS=160283116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,76:0.99:77
chr3	160395089	rs147660859	GA	G	212.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.75;ReadPosRankSum=-0.169;SOR=1.287;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr3	160679422	rs7616249	T	C	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=223;ReadPosRankSum=-0.997;SC=AGGGTTGGTTTCACAGTGCTT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=11;WE=160679430;WS=160679412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr3	160679744	rs7629001	A	T	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=367;SC=TGCAAAAAAAATTCATTATAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=160679752;WS=160679734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	160739920	.	AT	A	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.84;ReadPosRankSum=-0.152;SOR=0.241;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,8:0.21:38
chr3	160939746	rs376329329	CTTTTTTTTTTTT	C	322.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=8.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQRankSum=1.902;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.526;SOR=0.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,16:0.16:101
chr3	160939776	rs28711573	T	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQRankSum=1.815;QD=1.96;ReadPosRankSum=0.354;SOR=0.888;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,21:0.18:114
chr3	160942667	rs76866405	T	C	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.998;SOR=0.411;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,20:0.19:107
chr3	160955879	rs4350933	G	T	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.14;ReadPosRankSum=-0.506;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,8:0.14:57
chr3	160955882	rs11344126	CT	C	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=8.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.26;ReadPosRankSum=-0.053;SOR=0.109;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,11:0.22:49
chr3	160965262	rs372150378	AT	A	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.55;ReadPosRankSum=0.498;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr3	160970437	rs6789388	G	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=80;ReadPosRankSum=0.816;SC=AGTATTCTTAGTCATATCCCA;SOR=0.399;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=8;WE=160970445;WS=160970427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr3	161064193	rs339101	A	T	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=7.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.20;ReadPosRankSum=-0.113;SOR=0.014;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,19:0.19:99
chr3	163889075	rs12494921	C	T	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=248;ReadPosRankSum=1.018;SC=GTAAATAAAACATTTAGTTAA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=14;WE=163889083;WS=163889071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr3	163889384	rs10936412	T	C	2311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.824;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=56;PP=1605;ReadPosRankSum=-0.385;SC=TACGTTCCCGTGAAGCTTTTG;SOR=1.809;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=28;TCR=57;TR=83;WE=163889392;WS=163889374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,86:0.98:88
chr3	164059123	rs76722974	G	A	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.903;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=427;ReadPosRankSum=1.085;SC=GGAGCCTGGAGCGAGACCGGA;SOR=0.901;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=81;TCF=36;TCR=45;TR=29;WE=164059131;WS=164059113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,30:0.36:83
chr3	164697082	rs73018867	A	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=176;ReadPosRankSum=1.373;SC=AAGAGGGAAAATTGTAAGTGC;SOR=0.457;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=13;WE=164697090;WS=164697072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,12:0.30:40
chr3	164699998	rs41273561	C	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.94;ReadPosRankSum=0.548;SOR=0.623;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,9:0.17:54
chr3	164712036	rs114438312	T	C	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.839;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=596;ReadPosRankSum=0.722;SC=AAACAAACTTTGTACTTACTC;SOR=0.425;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=27;WE=164712044;WS=164712026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,28:0.72:39
chr3	164714296	rs78437999	C	T	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.519;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=156;ReadPosRankSum=-0.524;SC=TAAGAAAATACTGAAAGTAAA;SOR=0.153;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=15;WE=164714304;WS=164714286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,15:0.31:49
chr3	164714532	rs4855271	C	T	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=25;PP=699;SC=TTACATATGACATTCCAAACA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=164714540;WS=164714522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	164724567	rs7618643	A	G	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=104;ReadPosRankSum=0.936;SC=ACCAAAGAATAAAAGAGTCAG;SOR=0.260;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=7;WE=164724575;WS=164724557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr3	164730804	rs74648160	T	C	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.34;ReadPosRankSum=-0.726;SOR=0.395;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,13:0.25:52
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chr3	164783260	rs9681508	T	G	176.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.47;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr3	164793758	rs9290264	C	A	923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=20;PP=735;SC=ACAAAAAGGACAATCAGAGAG;SOR=1.942;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=164793766;WS=164793748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	165491280	rs1803274	C	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.42;ReadPosRankSum=0.485;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,9:0.18:49
chr3	165495400	rs2686409	G	A	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.411;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=3;PP=1032;ReadPosRankSum=-0.347;SC=TCTGTGTGCAGGGGCAAAGCA;SOR=1.388;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=75;TCF=68;TCR=7;TR=44;WE=165495408;WS=165495390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,45:0.57:79
chr3	165495420	rs2686410	G	C	2130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.162;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=10;PP=1385;ReadPosRankSum=-0.518;SC=AAATTTGCAAGTACAAATGTT;SOR=1.003;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=99;TCF=81;TCR=18;TR=62;WE=165495428;WS=165495410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,62:0.61:102
chr3	165496622	rs2686411	A	T	199.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=190;SC=TAAGATGTCCAGAAAACATTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=165496630;WS=165496612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	166960278	rs11923256	G	T	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.647;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=9;PP=1086;ReadPosRankSum=1.177;SC=TAAATAAACTGCAGGCTTAAC;SOR=1.196;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=73;TCF=58;TCR=15;TR=48;WE=166960286;WS=166960268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,48:0.65:74
chr3	166966436	rs60512741	C	T	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.628;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=13;PP=553;ReadPosRankSum=-1.040;SC=CAGGCTGAGGCCCTAGAAAGA;SOR=0.892;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=111;TCF=65;TCR=46;TR=34;WE=166966444;WS=166966426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,36:0.31:116
chr3	167000006	.	G	GA	778.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.830;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.656;NF=27;NR=3;PP=489;ReadPosRankSum=0.023;SC=TATCTAAAGTGAAAAAAAAAA;SOR=1.270;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=30;WE=167000014;WS=166999996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,35:0.73:48
chr3	167000256	rs12638625	G	C	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.591;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=29;PP=820;ReadPosRankSum=0.405;SC=TGGAAAATTTGCTGTTGAAGG;SOR=0.493;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=132;TCF=40;TCR=92;TR=43;WE=167000264;WS=167000246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,45:0.32:139
chr3	167006568	rs7625639	G	T	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.892;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=1;PP=558;ReadPosRankSum=-0.572;SC=AAACTAAATTGCAGGTGCCTA;SOR=1.218;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=78;TCF=73;TCR=5;TR=28;WE=167006576;WS=167006558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,29:0.37:79
chr3	167006612	rs7625651	G	T	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.680;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=14;PP=1007;ReadPosRankSum=-0.183;SC=ACTAAAGGAAGTAAGCTGCCA;SOR=0.483;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=135;TCF=106;TCR=29;TR=57;WE=167006620;WS=167006602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,57:0.41:140
chr3	167023738	rs13096767	G	C	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.757;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=176;ReadPosRankSum=-0.615;SC=TGAAGTTTCTGCTGTTAAAAA;SOR=2.093;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=9;WE=167023746;WS=167023728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr3	167034814	rs13068132	T	C	2063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.676;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=32;PP=1553;ReadPosRankSum=0.276;SC=CGACTATCTTTAGAGATGGTT;SOR=0.588;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=120;TCF=66;TCR=54;TR=69;WE=167034822;WS=167034804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,76:0.60:127
chr3	167035501	rs4580553	G	A	694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=514;SC=TGATGAAACCGTAACTGTACC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=167035509;WS=167035491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	167051518	.	T	A	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=326;ReadPosRankSum=-0.591;SC=TGTGATGAAATTATTGGTGAA;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=15;WE=167051526;WS=167051508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr3	167051726	rs10936530	A	G	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.764;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=188;ReadPosRankSum=1.029;SC=CATCCTTTATAAACTGATGGG;SOR=0.079;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=13;WE=167051734;WS=167051716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr3	167051769	rs11923054	T	C	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.587;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=410;ReadPosRankSum=0.833;SC=TATTTGAGATTTTGCCTATTA;SOR=3.500;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=16;WE=167051777;WS=167051759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr3	167068256	rs4619784	T	A	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.988;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=615;ReadPosRankSum=-0.250;SC=TCTGGTGAACTTTAGCAAAGC;SOR=2.285;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=25;WE=167068264;WS=167068246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,30:0.61:49
chr3	167068402	.	C	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.915;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=138;ReadPosRankSum=-0.431;SC=ATATTTATTTCTCTAATTAAA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=167068410;WS=167068392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr3	167077691	rs4257551	T	A	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=18;PP=1301;SC=ACTGTCCACATACTTTCCCAT;SOR=1.519;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=49;WE=167077699;WS=167077681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	167077840	rs11922241	A	C	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=135;ReadPosRankSum=-1.502;SC=AAATTAATGAAACTATGCATA;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=167077848;WS=167077830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr3	167339549	rs113950826	A	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=215;ReadPosRankSum=0.221;SC=AGGATCCTTAACAGTATTACA;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=9;WE=167339557;WS=167339539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr3	167351418	rs9845725	T	C	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.773;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=417;ReadPosRankSum=-0.413;SC=TTGCTACAAATTCTTAGTTTT;SOR=0.184;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=56;TCF=2;TCR=54;TR=18;WE=167351426;WS=167351408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,18:0.31:58
chr3	167506937	rs33917740	C	G	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=97;ReadPosRankSum=0.854;SC=TTGGACTCTTCTCTTTGCTGG;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=8;WE=167506945;WS=167506927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,8:0.21:39
chr3	167506967	rs34582040	A	G	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=152;ReadPosRankSum=-0.514;SC=GTATGGCTACAGGGGCCACTT;SOR=0.855;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=61;TCF=52;TCR=9;TR=17;WE=167506975;WS=167506957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,18:0.29:63
chr3	167510472	rs2229697	G	A	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.167;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=513;ReadPosRankSum=-0.024;SC=ACTGGAAGTCGCAGTTTAGGC;SOR=1.236;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=112;TCF=45;TCR=67;TR=31;WE=167510480;WS=167510462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,35:0.30:117
chr3	167747949	rs6798995	C	T	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.147;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=25;ReadPosRankSum=-0.524;SC=GTCAGGTGAACTGTGATTATA;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=3;WE=167747957;WS=167747939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr3	167754573	rs6786410	A	G	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.004;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=1.169;SC=CCTCTTGGCAACTTGACAGAG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=6;WE=167754581;WS=167754563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr3	167754852	.	A	ATCTATGAATGCCCATTCATAGATGGGCATTTGT	250.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=-1.979;QD=10.45;ReadPosRankSum=1.779;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr3	167764820	rs77249029	A	G	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.602;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=387;ReadPosRankSum=0.359;SC=AAACAGTGATAATTCACTACA;SOR=0.389;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=19;WE=167764828;WS=167764810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,18:0.36:50
chr3	168269756	rs6771018	A	G	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=999;ReadPosRankSum=-1.736;SC=TAGAGGGAATACCATTTATGT;SOR=0.719;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=28;TCR=40;TR=46;WE=168269764;WS=168269746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,47:0.69:68
chr3	168269864	rs11321565	TA	T	174.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.65;ReadPosRankSum=1.770;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr3	168538993	rs603638	A	G	1924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=5;PP=1468;SC=TGTCTCGAGGATGCCTACGGA;SOR=3.500;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=48;TCR=5;TR=53;WE=168539001;WS=168538983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	168542454	rs145528794	T	TCA	418.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.819;NF=16;NR=0;PP=614;ReadPosRankSum=-0.819;SC=TGCAGCTCTGTCACACACACA;SOR=2.124;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=16;WE=168542462;WS=168542444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr3	168806987	rs1981745	G	A	1179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=36;PP=928;ReadPosRankSum=-0.265;SC=ATGAACCAACGAAAAACACAG;SOR=3.209;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=36;WE=168806995;WS=168806977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,38:0.84:45
chr3	168810874	rs17466625	C	T	2612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.812;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=70;PP=2047;ReadPosRankSum=0.441;SC=CAGAATGAGGCGACGATGTTG;SOR=1.945;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=161;TCF=54;TCR=107;TR=93;WE=168810882;WS=168810864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,97:0.58:168
chr3	168810980	rs12634348	C	T	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=446;ReadPosRankSum=-0.749;SC=TTGATCAGTGCTGTTTCTTAA;SOR=0.613;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=20;WE=168810988;WS=168810970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,22:0.48:46
chr3	168818560	rs9857376	C	T	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=658;SC=TATTCAGACACGCATAAAATT;SOR=5.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=23;WE=168818568;WS=168818550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	168819788	rs9290358	A	G	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=4;NR=0;PP=83;SC=AAACAGCAAGACCTTTTGAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=168819796;WS=168819786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	168840571	rs3851380	A	T	1348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=38;PP=1135;SC=AAACGGAACAACATTTTATTG;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=39;WE=168840579;WS=168840561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	168840607	rs3851381	C	T	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=629;SC=ATTAAAGAAACAAGAAGGAAA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=168840615;WS=168840597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	169098861	rs988398	C	T	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=171;ReadPosRankSum=-0.467;SC=TTCTTAAAAACCTGTTGAAAA;SOR=0.207;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=11;WE=169098869;WS=169098851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr3	169283921	rs3863106	C	T	652.41	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=506;ReadPosRankSum=0.749;SC=CTCACTATCACAAGAACAGCA;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=23;WE=169283929;WS=169283911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,24:0.92:26
chr3	169381024	rs140833063	C	A	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.634;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=428;ReadPosRankSum=-1.273;SC=GGGGCCCCGGCGCAAGAGGCA;SOR=0.184;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=21;WE=169381032;WS=169381014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr3	169485639	rs2068178	C	T	1412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.692;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=1026;ReadPosRankSum=1.136;SC=TAAACTTTCTCTAGACAATCG;SOR=0.841;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=183;TCF=89;TCR=94;TR=59;WE=169485647;WS=169485629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,64:0.33:192
chr3	169485673	rs35270580	G	A	1412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.347;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=1095;ReadPosRankSum=-0.303;SC=TTTCCTCTTCGTAGTTCATTG;SOR=0.567;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=167;TCF=74;TCR=93;TR=59;WE=169485681;WS=169485663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,62:0.35:175
chr3	169486144	rs9822885	A	G	2605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=63;PP=2067;ReadPosRankSum=-0.617;SC=GGTAACTGTAAGGAAAGCAAT;SOR=1.270;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=17;TCR=64;TR=80;WE=169486152;WS=169486134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,82:0.99:83
chr3	169492016	rs34847803	T	TA	1190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=2;PP=1459;ReadPosRankSum=-0.800;SC=GATGAGAACTTACGGTTACTG;SOR=0.418;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=62;TCF=60;TCR=2;TR=37;WE=169492024;WS=169492006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,36:0.60:60
chr3	169492101	rs10936599	C	T	3699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.238;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.110;NF=97;NR=36;PP=2920;ReadPosRankSum=-0.625;SC=ATTCGCACCACTGTGAGCACC;SOR=0.598;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=209;TCF=155;TCR=54;TR=133;WE=169492109;WS=169492091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,137:0.62:220
chr3	169500487	rs3772190	G	A	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=699;ReadPosRankSum=-0.896;SC=AAGAAAAAGGGGACTTGGGCC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=28;WE=169500495;WS=169500477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,27:0.64:42
chr3	169514585	rs10936600	A	T	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.611;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=17;PP=1009;ReadPosRankSum=0.036;SC=GCATCACATAACTGTTGTATA;SOR=1.196;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=71;TCF=40;TCR=31;TR=44;WE=169514593;WS=169514575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,44:0.59:75
chr3	169518455	rs6793295	T	C	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=13;PP=403;SC=ACCTGTTCACTGTACAGTATA;SOR=1.230;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=21;WE=169518463;WS=169518445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	169521748	rs372935425	TAA	T	433.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.712;NF=9;NR=3;PP=348;ReadPosRankSum=0.151;SC=ATATTAGACATAAGAGGCAAA;SOR=0.538;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=12;WE=169521757;WS=169521738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,14:0.26:53
chr3	169522041	rs148670211	CTG	C	70.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=71;ReadPosRankSum=-0.366;SC=AATTAGGAGACTGTATTACTA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=3;WE=169522050;WS=169522031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr3	169526272	rs28626343	T	C	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=255;ReadPosRankSum=0.983;SC=GTGTTGCTCGTGTACTTACTT;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=12;WE=169526280;WS=169526262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr3	169540184	rs16854411	A	G	1816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.274;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=50;PP=1435;ReadPosRankSum=-0.981;SC=ATGTCTGCCCAAGGAAATAGT;SOR=0.543;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=266;TCF=100;TCR=166;TR=85;WE=169540192;WS=169540174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,86:0.32:273
chr3	169540397	rs1920119	T	C	2181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.110;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=36;PP=1762;ReadPosRankSum=0.626;SC=GCCCGCGTCCTTGTGCCAGTG;SOR=1.283;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=288;TCF=158;TCR=130;TR=90;WE=169540405;WS=169540387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,95:0.32:300
chr3	169546758	rs55905579	T	C	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.117;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=24;PP=471;ReadPosRankSum=1.203;SC=GAAGCACCTGTCACTGCCTCT;SOR=0.466;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=14;TCR=71;TR=29;WE=169546766;WS=169546748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,31:0.33:93
chr3	169550759	rs12486767	G	A	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=410;ReadPosRankSum=1.563;SC=CCACCATTACGAAAAAATCTT;SOR=0.511;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=77;TCF=71;TCR=6;TR=25;WE=169550767;WS=169550749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,26:0.32:80
chr3	169558025	rs3732451	C	T	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.93;ReadPosRankSum=-0.295;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,17:0.24:70
chr3	169566090	rs9290375	A	G	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=353;ReadPosRankSum=0.632;SC=AAGTGATAACAATACGAACAG;SOR=0.633;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=103;TCF=34;TCR=69;TR=28;WE=169566098;WS=169566080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,33:0.31:107
chr3	169638913	rs77310548	G	A	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=285;ReadPosRankSum=-1.769;SC=ATCCCATATGGCAATAACAAA;SOR=0.193;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=16;WE=169638921;WS=169638903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,17:0.31:55
chr3	169642741	rs76553134	T	G	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=0.654;SC=TGGTTTGTTTTTTTTTTTTCA;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=7;WE=169642749;WS=169642731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr3	169643757	rs1290671	G	T	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=259;ReadPosRankSum=-1.254;SC=TTCAGCTATAGTACCCAGGAG;SOR=0.560;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=13;WE=169643765;WS=169643747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr3	169643955	rs1290670	C	T	1414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.700;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=30;PP=1136;ReadPosRankSum=1.169;SC=TTGAGACTTGCAATGTCTAAT;SOR=0.560;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=183;TCF=87;TCR=96;TR=64;WE=169643963;WS=169643945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,63:0.33:189
chr3	169684687	rs2072576	G	C	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.008;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=368;ReadPosRankSum=-0.657;SC=TCGGCGCGCTGGATAGTGGAA;SOR=0.310;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=63;TCF=16;TCR=47;TR=25;WE=169684695;WS=169684677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,26:0.38:69
chr3	169703678	rs78769132	A	G	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=171;ReadPosRankSum=0.226;SC=GTTAATAGCTATAAAGTGCAA;SOR=0.678;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=12;WE=169703686;WS=169703668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,13:0.27:49
chr3	169710363	rs2160898	G	T	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=287;ReadPosRankSum=-0.933;SC=CTCAATTAGAGAAATTTTTCT;SOR=0.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=17;WE=169710371;WS=169710353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,18:0.36:50
chr3	169815232	rs76680447	C	T	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=405;ReadPosRankSum=0.303;SC=GACATTACTCCTAACAGTCAC;SOR=0.503;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=60;TCF=7;TCR=53;TR=23;WE=169815240;WS=169815222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,24:0.39:61
chr3	169980956	.	CA	C	134.92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=-0.385;NF=9;NR=0;PP=90;ReadPosRankSum=0.253;SC=AACTCTGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=9;WE=169980964;WS=169980948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr3	170078232	rs3772173	C	T	1491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FS=1.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.74;ReadPosRankSum=0.284;SOR=0.597;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:188,72:0.28:260
chr3	170078470	.	G	C	4781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=6.580;ClippingRankSum=0.000;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=89;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.439;SC=AAAGCATGTCGCCTACTGTAT;SOR=0.799;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=252;TCF=117;TCR=135;TR=163;WE=170078478;WS=170078460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,168:0.65:259
chr3	170105233	rs6786374	C	T	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=118;ReadPosRankSum=-0.302;SC=TGTGGCTTTTCATGTCTGGTC;SOR=0.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=8;WE=170105241;WS=170105223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr3	170105378	rs6786542	C	T	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.975;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=342;ReadPosRankSum=1.016;SC=CTTCGTCAGTCGGACATTTGC;SOR=0.399;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=95;TCF=31;TCR=64;TR=28;WE=170105386;WS=170105368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,32:0.31:103
chr3	170197954	rs989997	T	G	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=1;PP=637;SC=AACACAAGGGTCCATAGAACC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=170197962;WS=170197944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	170198610	rs202158470	T	C	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.857;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=35;PP=757;ReadPosRankSum=-0.514;SC=CTCCCAAGGATGGTAAGTTCT;SOR=0.945;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=177;TCF=75;TCR=102;TR=56;WE=170198618;WS=170198600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,58:0.32:182
chr3	170198967	rs1861939	G	A	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=697;ReadPosRankSum=0.549;SC=TGGAGGGGCCGGGCAAGCAGA;SOR=1.788;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=28;WE=170198975;WS=170198957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,28:0.70:40
chr3	170204206	rs74330815	T	A	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.43;ReadPosRankSum=0.646;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,22:0.26:86
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chr3	170218862	rs16855165	T	C	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.884;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=19;PP=963;ReadPosRankSum=-1.192;SC=CTTGGTAAGTTTGCATGTTGA;SOR=0.490;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=81;TCF=52;TCR=29;TR=48;WE=170218870;WS=170218852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,51:0.61:84
chr3	170425920	rs115719739	C	T	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.753;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=29;PP=518;ReadPosRankSum=-0.627;SC=GAAGATTTTTCGTATCTTCAG;SOR=1.829;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=97;TCF=8;TCR=89;TR=30;WE=170425928;WS=170425910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,31:0.31:99
chr3	170715830	rs5398	G	A	1719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=46;PP=1336;ReadPosRankSum=0.777;SC=TAAAAAATGTGAACAGGGTAA;SOR=0.702;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=256;TCF=109;TCR=147;TR=79;WE=170715838;WS=170715820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,78:0.29:267
chr3	170723276	rs5406	G	A	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=292;ReadPosRankSum=0.096;SC=CCAAGAAAATGATCAGGTTGA;SOR=0.343;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=15;WE=170723284;WS=170723266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr3	170723664	rs2292622	A	G	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.50;ReadPosRankSum=0.279;SOR=0.205;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,20:0.32:63
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chr3	170724883	rs8192675	T	C	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=2.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.22;ReadPosRankSum=-0.575;SOR=1.034;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,19:0.25:77
chr3	170727701	rs369506780	GGT	G	155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQRankSum=-0.728;QD=8.65;ReadPosRankSum=0.281;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr3	170727739	rs5402	T	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.561;NF=10;NR=2;PP=194;ReadPosRankSum=-0.921;SC=TGTGTGTGTGTGACTTACCAC;SOR=0.238;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=12;WE=170727747;WS=170727729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,7:0.19:36
chr3	170732300	rs5400	G	A	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.733;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=912;ReadPosRankSum=-0.942;SC=GAATGATGCAGTCATTCCACC;SOR=0.983;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=183;TCF=100;TCR=83;TR=53;WE=170732308;WS=170732290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,54:0.29:187
chr3	170732599	rs7356034	G	A	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=75;ReadPosRankSum=-0.372;SC=TGTTTGTTACGTGTTTAAATA;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=6;WE=170732607;WS=170732589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr3	170736135	rs112230776	C	CT	155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.173;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=209;ReadPosRankSum=-0.383;SC=TTTTTTCCCCCGTGATTGTTA;SOR=0.023;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=7;WE=170736143;WS=170736125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr3	170801912	rs371989911	TA	T	88.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=1.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.01;MQRankSum=1.487;QD=2.02;ReadPosRankSum=0.652;SOR=0.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,16:0.36:44
chr3	170824745	rs16855840	T	G	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=221;ReadPosRankSum=-1.770;SC=ACTGGAACATTGGAAAAGTGA;SOR=0.627;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=13;WE=170824753;WS=170824735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,13:0.24:55
chr3	170825905	rs6444960	C	G	1513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=25;PP=1197;SC=GTTTCACCTTCGCAGGCTCAT;SOR=0.976;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=20;TCR=25;TR=44;WE=170825913;WS=170825895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	170825920	rs2291900	G	A	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=531;ReadPosRankSum=0.806;SC=GCTCATGGGGGAGCACAGGTG;SOR=0.763;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=26;WE=170825928;WS=170825910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,28:0.61:46
chr3	170857167	rs35492114	G	GCA	69.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.884;NF=5;NR=0;PP=160;ReadPosRankSum=1.333;SC=ACGCACGCGCGCACACACACA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=5;WE=170857175;WS=170857157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr3	170857240	rs6444965	T	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=178;ReadPosRankSum=-0.766;SC=GGTCAGCTGGTTCTTGGCTTT;SOR=0.829;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=13;WE=170857248;WS=170857230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,12:0.29:42
chr3	170858406	rs2292006	T	G	2324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=56;PP=1925;SC=TTTAATGAGATATGCCTAAAT;SOR=2.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=17;TCR=56;TR=73;WE=170858414;WS=170858396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	170858467	rs67124134	C	G	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=159;ReadPosRankSum=2.519;SC=TGGCAGGGAGCGGGTGAGAGA;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=10;WE=170858475;WS=170858457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr3	170875472	rs73882623	G	A	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=204;ReadPosRankSum=-0.267;SC=AGGAGAGAGTGATCAGGATCC;SOR=0.569;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=14;WE=170875480;WS=170875462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,13:0.27:49
chr3	170885097	rs2292005	C	T	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=443;ReadPosRankSum=1.552;SC=GATAAAACGGCGATCCAAAGA;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=21;WE=170885105;WS=170885087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr3	170893070	rs12637875	G	A	1531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.200;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=37;PP=1163;ReadPosRankSum=-0.617;SC=GAGGCGCTGGGTTCCGGGGGA;SOR=1.214;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=95;TCF=35;TCR=60;TR=55;WE=170893078;WS=170893060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,57:0.57:100
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chr3	170928797	rs6444972	T	C	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=390;SC=TGGGGGCTAATGGTTAAAGAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=170928805;WS=170928787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr3	171395468	rs2124147	A	G	2818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.477;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=63;PP=2326;ReadPosRankSum=-1.224;SC=TCTGTAAACTACGGATGGACC;SOR=0.893;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=145;TCF=54;TCR=91;TR=99;WE=171395476;WS=171395458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,100:0.68:146
chr3	171404478	rs2290480	C	A	2999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=70;PP=2304;ReadPosRankSum=-1.009;SC=TACTTACCAGCATGAGGTCTA;SOR=0.745;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=146;TCF=49;TCR=97;TR=104;WE=171404486;WS=171404468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,108:0.71:152
chr3	171405384	rs2305547	A	T	352.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=429;ReadPosRankSum=-0.292;SC=GCTGAGAAAAATTTTTTTTTA;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=20;WE=171405392;WS=171405374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr3	171442774	rs9882641	G	A	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=33;PP=790;ReadPosRankSum=0.010;SC=AAATACACTGGTGAGATATAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=33;WE=171442782;WS=171442764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,35:0.67:52
chr3	171452645	rs9869368	A	G	2700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.835;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=19;PP=2126;ReadPosRankSum=1.312;SC=AGAATAGTGAAGAAACTTACT;SOR=0.854;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=108;TCR=29;TR=92;WE=171452653;WS=171452635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,94:0.68:139
chr3	171455188	rs6794454	T	C	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=618;ReadPosRankSum=-0.934;SC=GACTTGGAAATGATAGATACA;SOR=0.900;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=26;WE=171455196;WS=171455178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr3	171844787	rs4894810	A	T	3404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.981;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=59;PP=2739;ReadPosRankSum=-0.452;SC=ATGTGAATGCATTGGGAGGTG;SOR=0.401;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=203;TCF=113;TCR=90;TR=124;WE=171844795;WS=171844777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,126:0.61:207
chr3	171969077	rs7652177	C	G	1562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.267;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=23;PP=1224;ReadPosRankSum=1.317;SC=GGAATGTCAACCTACATCACC;SOR=0.825;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=171;TCF=107;TCR=64;TR=66;WE=171969085;WS=171969067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,66:0.38:174
chr3	172003831	rs67373503	CT	C	215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.68;ReadPosRankSum=1.489;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr3	172034350	rs4894416	T	C	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=445;ReadPosRankSum=-0.113;SC=AAATAAGAACTTTTTATTTTA;SOR=0.527;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=19;WE=172034358;WS=172034340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr3	172034901	rs34251104	T	G	2351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.215;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=48;PP=1830;ReadPosRankSum=0.084;SC=CCTTGTGACCTAATCACCTTT;SOR=0.793;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=135;TCF=66;TCR=69;TR=88;WE=172034909;WS=172034891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,91:0.65:141
chr3	172046861	rs2270568	T	C	2897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.441;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=64;PP=2267;ReadPosRankSum=-0.253;SC=ACGACATTGGTACCAGGTATG;SOR=0.541;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=149;TCF=54;TCR=95;TR=102;WE=172046869;WS=172046851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,107:0.69:154
chr3	172046933	rs6799133	A	G	1782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.062;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=43;PP=1385;ReadPosRankSum=1.237;SC=TCTTTTACATAGCTGGAAGGC;SOR=0.495;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=81;TCF=20;TCR=61;TR=58;WE=172046941;WS=172046923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,64:0.73:88
chr3	172055101	rs56106326	A	C	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.602;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=361;ReadPosRankSum=0.222;SC=TGCTAATAAGACATTTGGTTA;SOR=1.159;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=21;WE=172055109;WS=172055091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
chr3	172059121	rs570549	G	A	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=394;ReadPosRankSum=-0.455;SC=ATGTATCTTGGTAATGCAACC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=17;WE=172059129;WS=172059111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr3	172060700	rs606797	C	T	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.108;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=603;ReadPosRankSum=-0.796;SC=AACCCCTTTTCGGTAACATTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=25;WE=172060708;WS=172060690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
chr3	172064091	rs583550	G	A	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.491;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=11;PP=911;ReadPosRankSum=-0.409;SC=ATATACATACGTGTGTGTGCG;SOR=0.258;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=68;TCF=55;TCR=13;TR=45;WE=172064099;WS=172064081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,48:0.68:71
chr3	172162829	rs482204	G	A	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.67;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	172162837	rs477251	T	C	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.67;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	172166033	rs495225	G	A	5414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=104;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.626;SC=TGCCAGCGATGCCCACCACGA;SOR=0.327;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=195;TCF=83;TCR=112;TR=187;WE=172166041;WS=172166023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,191:0.99:192
chr3	172224303	rs1131532	A	G	1881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=20;PP=1372;SC=AAAAGGCCCCAAAAAAACTGG;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=43;TCR=20;TR=63;WE=172224311;WS=172224293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr3	172224769	rs111284464	GC	G	3404.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=66;PP=2957;ReadPosRankSum=-0.617;SC=AAAGCAAGGAGCTTTTTTGCA;SOR=2.117;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=74;TCF=1;TCR=73;TR=67;WE=172224779;WS=172224759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,80:0.98:82
chr3	172224771	rs17848019	T	A	3413.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=65;PP=2266;ReadPosRankSum=-0.226;SC=AGCAAGGAGCTTTTTTGCAGC;SOR=2.117;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=84;TCF=8;TCR=76;TR=73;WE=172224779;WS=172224759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,80:0.98:82
chr3	172227199	rs3815496	C	T	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=19;PP=557;SC=AATCAGCCATCGTAAGCATAC;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=172227207;WS=172227189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	172365619	rs9865941	G	A	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=5.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=2;PP=1060;ReadPosRankSum=0.456;SC=ACTCAGTTACGCATCTCCCCC;SOR=0.671;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=58;TCF=56;TCR=2;TR=44;WE=172365627;WS=172365609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,45:0.76:59
chr3	172428508	rs7629698	C	T	970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=1;PP=765;SC=TGGACCACCTCAAAAAGCGAC;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=172428516;WS=172428498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	172428782	rs2276805	T	C	4605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=60;PP=2965;SC=CATCTTGCCCTGGCTCGGCTC;SOR=1.017;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=86;TCR=60;TR=146;WE=172428790;WS=172428772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr3	172473484	rs1403088	A	G	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=427;SC=AGCTTAATGAATAGAAACTGT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=172473492;WS=172473474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	172480173	rs10654513	A	ATT	187.87	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=181;SC=ATTTAAGTTAAACTGGTTTTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=172480182;WS=172480169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	172480174	rs11313111	AC	A	187.87	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=182;SC=TTTAAGTTAAACTGGTTTTGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=172480182;WS=172480169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	172501443	rs7649589	A	C	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=219;SC=TTATAAAATAAGTTTGTTCTC;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=172501451;WS=172501433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	172520818	rs7644191	G	C	257.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=244;SC=ATTTTTGTAAGTTCCCTGAAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=172520826;WS=172520808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	172534428	rs10936738	C	T	1208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=1;PP=973;SC=TAAATATTCTCATCAGCTGTA;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=34;WE=172534436;WS=172534418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	172537850	rs35236458	T	G	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=724;ReadPosRankSum=-0.831;SC=TTGTAAAATGTAAAAATAATA;SOR=3.767;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=25;WE=172537858;WS=172537840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr3	172538065	rs76864072	C	T	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=7.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.94;ReadPosRankSum=0.125;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,8:0.22:37
chr3	172634021	rs201062286	AT	A	78.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=-0.593;QD=2.39;ReadPosRankSum=0.628;SOR=0.191;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr3	172634025	rs141570329	T	TTG	302.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=1.597;QD=8.18;ReadPosRankSum=0.666;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr3	172766822	rs508508	G	A	2420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.946;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=43;PP=1863;ReadPosRankSum=1.017;SC=AACTTGCCACGCTTGCTATAT;SOR=0.643;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=146;TCF=72;TCR=74;TR=91;WE=172766830;WS=172766812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,94:0.61:153
chr3	173322248	rs3844523	T	C	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=410;ReadPosRankSum=-1.231;SC=ATCTGCTGTCTGAAGATCTTT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=18;WE=173322256;WS=173322238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr3	173322277	rs11718812	G	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=326;ReadPosRankSum=0.127;SC=TTCTCGACAAGCTCCCCTGTA;SOR=0.379;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=16;WE=173322285;WS=173322267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr3	173323278	rs3853390	A	G	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.909;SOR=0.522;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,23:0.22:103
chr3	174581888	rs6445184	T	C	5985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=74;PP=2965;SC=AAGGTGAGTCTGACCTAAATG;SOR=1.173;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=117;TCR=74;TR=191;WE=174581896;WS=174581878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr3	174814738	rs9823911	G	A	3117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=38;PP=2418;SC=CCAGCTAGACGGTGCTGAGAA;SOR=1.037;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=95;TCF=57;TCR=38;TR=94;WE=174814746;WS=174814728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr3	174814920	rs9836841	A	G	5862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.350;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=99;PP=2965;ReadPosRankSum=0.721;SC=TCTTAAAAATACTTTGCACAG;SOR=0.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=78;TCR=100;TR=175;WE=174814928;WS=174814910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,182:0.98:185
chr3	174935828	rs34537026	C	T	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.619;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.886;NF=9;NR=9;PP=313;ReadPosRankSum=-0.597;SC=GAAAGTATTGCAGTGAATTTC;SOR=0.368;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=40;TCF=23;TCR=17;TR=18;WE=174935850;WS=174935818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr3	174951756	rs4371530	T	C	1837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.317;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=14;PP=1402;ReadPosRankSum=-1.010;SC=GAAGATGACATGGAAATTTCA;SOR=1.196;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=107;TCF=83;TCR=24;TR=71;WE=174951764;WS=174951746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,71:0.66:108
chr3	175165079	rs6802937	C	T	4700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=79;PP=2965;SC=CATCTCTGCACCCCTCGTTGC;SOR=0.974;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=62;TCR=80;TR=141;WE=175165087;WS=175165069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr3	175165201	rs2161041	T	G	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.706;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=27;PP=649;ReadPosRankSum=-0.158;SC=TACAGTTTTTTTAAAGACCAT;SOR=0.280;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=29;WE=175165209;WS=175165191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
chr3	175189406	rs35213579	CT	C	3088.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=6;PP=1854;SC=CAGATAGATCCTTTTTTTTTT;SOR=4.752;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=84;TCF=75;TCR=9;TR=71;WE=175189425;WS=175189396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	175189417	rs79264590	G	A	1763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.497;HP=12;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.357;NF=53;NR=5;PP=1316;ReadPosRankSum=-1.592;SC=TTTTTTTTTTGTTATTTCAGG;SOR=1.609;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=87;TCF=78;TCR=9;TR=58;WE=175189425;WS=175189396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,64:0.70:92
chr3	175189447	rs9290555	G	A	2770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.316;NF=75;NR=20;PP=2196;ReadPosRankSum=0.675;SC=AGGTTCTTCAGAAAAATGTTG;SOR=0.708;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=135;TCF=107;TCR=28;TR=95;WE=175189455;WS=175189437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,98:0.71:139
chr3	175205148	rs7646041	C	T	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=516;ReadPosRankSum=-0.394;SC=CAGGAGGACACTGAGGCATAG;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=23;WE=175205156;WS=175205138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,28:0.72:39
chr3	175293752	rs62285573	C	T	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=106;ReadPosRankSum=-1.242;SC=ATCTGTGGACCATGTTTTGAG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=175293760;WS=175293742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr3	175293768	.	C	A	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=1.180;SC=TTGAGTAGCACTGATCTAGGG;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=175293776;WS=175293758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr3	175298953	rs62284484	G	C	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=40;ReadPosRankSum=0.343;SC=GAATAGGCCGGACGCGGTGGC;SOR=0.829;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=4;WE=175298961;WS=175298943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr3	175373483	rs376781296	TAAATA	T	99.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.08;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	175473047	rs9826737	T	C	1180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=5;PP=758;SC=GCCATGGCGTTACGCCTGCGG;SOR=2.964;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=175473055;WS=175473037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	176752202	rs1905503	A	T	44.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.20;ReadPosRankSum=0.319;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr3	176756230	rs77478951	G	A	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=677;ReadPosRankSum=-1.118;SC=GTGCTGCAAAGGAACAAAGGT;SOR=0.822;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=31;WE=176756238;WS=176756220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr3	176765253	rs1201300	G	A	1859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=10;PP=1236;SC=AACAAAGTAAGAAGGAAAATG;SOR=2.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=46;WE=176765261;WS=176765243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	176765269	rs3749234	T	C	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=756;ReadPosRankSum=0.018;SC=AAATGCTTCATTTACCATCTT;SOR=0.679;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=36;WE=176765277;WS=176765259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,36:0.63:57
chr3	176767672	.	TA	GG	567	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=11;NR=0;PP=567;QD=56.406170442;SC=TTGTTGTTACTAGTTAATAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=11;WE=176767681;WS=176767671;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:19,11:0.37:30
chr3	176767673	.	A	AGG	676.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.233;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.56;ReadPosRankSum=-1.445;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr3	176769608	rs1881979	G	A	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=36;PP=839;ReadPosRankSum=-0.304;SC=GAAAATCTTCGTTCCTAAAAA;SOR=1.270;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=61;TCF=2;TCR=59;TR=37;WE=176769616;WS=176769598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,40:0.62:65
chr3	176771833	.	CGTGTGTGT	C	223.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.112;NF=1;NR=13;PP=461;ReadPosRankSum=0.909;SC=AGACGAAGGTCGTGTGTGTGT;SOR=0.368;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=14;WE=176771848;WS=176771823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr3	176771861	.	T	TGC	293.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=62.13;MQRankSum=2.327;NF=1;NR=14;PP=386;ReadPosRankSum=1.295;SC=TGTGTGTGTGTGCGCGCGCGT;SOR=0.914;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=15;WE=176771869;WS=176771851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr3	178525427	rs186111936	T	C	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=316;ReadPosRankSum=0.452;SC=CCTTGCACTTTACATGTTCGC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=13;WE=178525435;WS=178525417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr3	178542331	rs368029162	ATTT	A	201.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.57;MQRankSum=-0.967;QD=20.17;ReadPosRankSum=0.405;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr3	178542417	rs9857119	A	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=8.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQRankSum=0.000;QD=8.57;ReadPosRankSum=0.685;SOR=1.881;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr3	178542421	rs113497839	G	C	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQRankSum=0.000;QD=7.93;ReadPosRankSum=1.087;SOR=1.901;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr3	178542454	rs11924270	A	G	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.532;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=64;ReadPosRankSum=0.182;SC=GAGCCACCACACCCGGCCAAA;SOR=3.241;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=4;WE=178542462;WS=178542444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr3	178546026	rs9831934	T	C	1964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.645;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=29;PP=1496;ReadPosRankSum=0.225;SC=AAACATTTAATTGCTCCTTCA;SOR=0.786;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=102;TCF=54;TCR=48;TR=66;WE=178546034;WS=178546016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,72:0.67:108
chr3	178560581	rs6443583	A	C	2455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.862;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=51;PP=1862;ReadPosRankSum=0.107;SC=TTATCCTAACAAAACTCTACA;SOR=0.601;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=41;TCR=67;TR=83;WE=178560589;WS=178560571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,87:0.78:112
chr3	178785549	rs6772028	G	A	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.270;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=385;ReadPosRankSum=0.878;SC=ATTGGGTAGGGAAGCCTGGGG;SOR=4.768;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=16;WE=178785557;WS=178785539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr3	178921639	rs2699895	C	A	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=68;ReadPosRankSum=0.250;SC=CTTTTTCTTGCACTATACAGT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=5;WE=178921647;WS=178921629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr3	178922274	rs2699896	C	A	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=461;ReadPosRankSum=0.900;SC=TAGTATATACCTACTTTTTTC;SOR=0.610;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=26;WE=178922282;WS=178922264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr3	178922430	rs3729679	A	G	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=139;ReadPosRankSum=0.570;SC=GTTTAGCAGTATGATCCATAA;SOR=2.133;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=8;WE=178922438;WS=178922420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr3	178939006	.	AAGCCCAGTGTATAT	A	1758.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.488;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.622;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.009;NF=0;NR=29;PP=2932;ReadPosRankSum=-0.478;SC=AGTTGTTTAGAAGCCCAGTGT;SOR=0.233;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=0;TCR=52;TR=29;WE=178939027;WS=178938996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,45:0.69:65
chr3	178942431	rs2699889	C	G	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.615;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=361;ReadPosRankSum=-0.534;SC=AAATAAATTTCAGGGTAAAAT;SOR=1.289;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=57;TCR=1;TR=19;WE=178942439;WS=178942421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr3	178968660	rs1170672	T	C	1619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=33;PP=1311;ReadPosRankSum=0.884;SC=CTTGTGCACATCTAGTGGGTC;SOR=0.617;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=64;TCF=24;TCR=40;TR=54;WE=178968668;WS=178968650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,55:0.83:66
chr3	179096508	rs7637065	C	G	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=22;PP=1307;SC=ATTGTATTTCCTTTTTCCCTG;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=38;TCR=23;TR=60;WE=179096516;WS=179096498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	179399570	rs13080037	C	T	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=684;ReadPosRankSum=-0.806;SC=TGCCAGGCCTCGTCTTCAGCG;SOR=0.623;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=67;TCR=27;TR=39;WE=179399578;WS=179399560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,40:0.41:97
chr3	179424862	rs16830742	A	G	2748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.108;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=76;PP=2189;ReadPosRankSum=0.616;SC=GGATTCCTCCAAGGTGAGAGT;SOR=1.199;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=150;TCF=32;TCR=118;TR=94;WE=179424870;WS=179424852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,98:0.64:153
chr3	179448066	rs11309768	AT	A	576.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=23;PP=400;SC=CCAGATTTGTATTTTTTTTTT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=23;WE=179448074;WS=179448056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	179448383	rs3213761	C	T	3002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=28;PP=2835;ReadPosRankSum=0.168;SC=CTTTTTGTTTCTGTTTCTCTG;SOR=0.871;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=77;TCR=28;TR=104;WE=179448391;WS=179448373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,92:0.99:93
chr3	179463076	rs58527921	A	G	762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.14;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr3	179463076	.	AAGGGG	GAGGGA,GAGGGG	193	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=30;MQ=60.0;NF=1,1;NR=9,19;PP=193,165;QD=24.6467874862;SC=GGGTAAGGGAAAGGGGGTGGG;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=10,20;WE=179463089;WS=179463066;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.50:20
chr3	179463081	rs59131484	G	A	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.09;ReadPosRankSum=-0.546;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr3	179469995	rs2239639	A	G	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=166;ReadPosRankSum=-1.333;SC=TGCCTCAGACAAAGTTGATAT;SOR=0.252;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=12;WE=179470003;WS=179469985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,14:0.34:41
chr3	179472674	rs2287240	C	T	2501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=51;PP=1861;SC=ATATGCGCTACCCTCCCACCC;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=28;TCR=51;TR=79;WE=179472682;WS=179472664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr3	179481971	.	CTG	CTGTG,C	198.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.4940,0.5000;FS=3.854;HP=1;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.087;NF=0,0;NR=13,13;PP=14,304;ReadPosRankSum=-0.539;SC=GCATGAGAGACTGTGTGTGTG;SOR=2.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=13,13;WE=179481980;WS=179481961;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.59:17
chr3	179501981	rs201974472	C	CA	307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.445;NF=0;NR=18;PP=207;ReadPosRankSum=0.927;SC=TTTAATTTGCCAAAAAAAAAA;SOR=0.770;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=18;WE=179501989;WS=179501971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr3	179527459	rs111620765	G	GA	487.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=332;ReadPosRankSum=0.521;SC=CTAAGCACCTGAAAAAAAAAA;SOR=3.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=19;WE=179527467;WS=179527449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr3	179592053	rs1609981	G	A	1820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=7;PP=1497;SC=TGAAAATAAAGCATTTATGCT;SOR=3.690;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=47;TCR=7;TR=54;WE=179592061;WS=179592043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr3	179592240	rs2339914	C	T	2444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=58;PP=2001;SC=GGAAATTAAACGTACACTAGA;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=18;TCR=58;TR=76;WE=179592248;WS=179592230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr3	179593072	rs55664665	T	A	1152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=2;PP=907;SC=GACTTAACTCTTTGGCTATTT;SOR=4.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=33;WE=179593080;WS=179593062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	179593352	rs2302743	C	T	952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=27;PP=787;SC=GAGGGTGGAGCGTGTGGTGCA;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=179593360;WS=179593342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr3	179597979	rs13067789	G	A	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=103;ReadPosRankSum=0.733;SC=ATAGGTTTCAGTTGGGTACAG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=7;WE=179597987;WS=179597969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr3	180333876	.	G	C	248	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=12;NR=0;PP=248;QD=23.5642677123;SC=AAGTCAGAAGGAAATTCTTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=12;WE=180333884;WS=180333875;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,12:0.50:24
chr3	180334623	rs7612917	C	T	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.728;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=633;ReadPosRankSum=0.208;SC=CCTGTTTGGTCACTCTTTCTA;SOR=0.758;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=117;TCF=60;TCR=57;TR=38;WE=180334631;WS=180334613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,38:0.31:124
chr3	180349447	rs184028306	G	A	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=43;ReadPosRankSum=1.233;SC=ACTATCAAGTGTTCTTATTGA;SOR=0.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=5;WE=180349455;WS=180349437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr3	180365043	rs34160752	T	TA	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=7.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.36;MQRankSum=1.650;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.699;SOR=0.054;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr3	180365956	rs6769457	G	A	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=-0.266;SC=CATCTACCTGGCTGTACATAA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=7;WE=180365964;WS=180365946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr3	180679156	rs7428473	G	A	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=20;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.35;NF=13;NR=15;PP=762;SC=AAAAAAAAAAGGTGTGTGTGT;SOR=1.044;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=28;WE=180679164;WS=180679146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	180688997	rs11368900	C	CA	453.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=401;ReadPosRankSum=0.315;SC=AAAAAAATGTCTATGTCTGCT;SOR=0.776;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=10;WE=180689005;WS=180688987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr3	182546017	rs9814205	C	A	1603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=25;PP=1328;SC=ATTACTCAATCTTAAGTTTGT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=50;WE=182546025;WS=182546007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	182575631	rs661774	G	T	309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=226;SC=TAATACATGAGTTGTATGTTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=182575639;WS=182575621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr3	182590354	rs771156	C	T	1555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=41;PP=1336;SC=AAAAATATTACTTTTCTCTCA;SOR=5.421;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=44;WE=182590362;WS=182590344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	182598863	rs796406	A	G	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=28;PP=788;ReadPosRankSum=-1.108;SC=ATTAAAGTACAGTATCAAATT;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=31;WE=182598871;WS=182598853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,32:0.94:34
chr3	182681740	rs4859146	C	T	2404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=25;PP=1695;SC=TGAACTTCCACGCAATAATCA;SOR=1.497;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=75;TCF=50;TCR=25;TR=73;WE=182681748;WS=182681730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	182681853	rs4859147	T	C	1535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=34;PP=1132;SC=AAAATAACAATGCAATATTAA;SOR=1.697;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=51;WE=182681861;WS=182681843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	182735182	rs6786878	C	A	3614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=94;PP=2965;SC=TAGATATGTTCATCTGCTTCA;SOR=4.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=8;TCR=94;TR=102;WE=182735190;WS=182735172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr3	182755209	rs2270968	T	G	1838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=41;PP=1357;ReadPosRankSum=0.204;SC=AATGTTGGTGTGCAGTCCAAC;SOR=0.876;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=17;TCR=42;TR=58;WE=182755217;WS=182755199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr3	182757084	rs2270967	G	A	1773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=2;NR=45;PP=1437;SC=GAGGTTCAGAGGGCTTTGAAA;SOR=5.630;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=47;WE=182757092;WS=182757074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	182790249	rs7622479	G	A	4996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=73;PP=2965;SC=TGTTTTCTGAGAGAAAACCGC;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=71;TCR=73;TR=144;WE=182790257;WS=182790239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr3	182804385	rs6806083	G	A	2823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=4;PP=2268;ReadPosRankSum=-0.922;SC=TAAAGATCTTGGGAAAGGCTA;SOR=3.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=80;TCR=4;TR=83;WE=182804393;WS=182804375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,89:0.99:90
chr3	182810144	rs3732604	T	G	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=6;PP=1253;ReadPosRankSum=-0.836;SC=ACGAAAATACTGACACAGTAA;SOR=2.799;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=51;TCR=6;TR=56;WE=182810152;WS=182810134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr3	182812430	rs371015665	G	C	2842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=86;PP=2325;ReadPosRankSum=-1.160;SC=CAATTAAACAGAATAGGCAAC;SOR=0.770;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=16;TCR=128;TR=97;WE=182812438;WS=182812420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,99:0.67:148
chr3	182817328	rs937652	C	G	3573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=79;PP=2933;SC=TGACCCCCGCCGGCCACCGTC;SOR=1.630;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=38;TCR=79;TR=117;WE=182817336;WS=182817318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr3	182853670	rs482912	T	C	2177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=42;PP=1743;SC=CCTTGGTAAATTGTCTCTGAA;SOR=1.296;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=24;TCR=42;TR=66;WE=182853678;WS=182853660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	182858287	rs522235	C	T	8432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=169;NR=87;PP=2965;SC=ACAGAAACAGCGTCATGGCTG;SOR=1.439;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=256;TCF=169;TCR=87;TR=256;WE=182858295;WS=182858277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr3	182858461	rs831256	A	G	2286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=64;PP=1874;SC=ACTTTGTTTAAGATTCCAGCT;SOR=8.468;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=0;TCR=64;TR=64;WE=182858469;WS=182858451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr3	182870082	rs682396	G	A	1058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=9;PP=877;SC=CTGAAGTGTGGGGTTGCACCA;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=182870090;WS=182870072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	182870436	rs514636	G	A	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=82;SC=AACACCTCTCGTTTTCAAACT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=182870444;WS=182870426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	182871962	rs653316	C	T	5101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=53;PP=2965;SC=TTTTTGTAGTCGCTGGGGTAG;SOR=1.508;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=99;TCR=53;TR=151;WE=182871970;WS=182871952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr3	182880629	rs602762	A	C	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=378;ReadPosRankSum=0.362;SC=CCTACGGAGCAGGGAGGGGCG;SOR=1.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=22;WE=182880637;WS=182880619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr3	182913092	rs577136	T	G	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.623;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=31;PP=781;ReadPosRankSum=-2.622;SC=TAAGCTAATTTGAATTGATTT;SOR=0.317;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=33;WE=182913100;WS=182913082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,34:0.67:51
chr3	182925404	rs6804951	T	C	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=6;PP=972;SC=ACCTTCATGGTCTTCTTGAAG;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=39;WE=182925412;WS=182925394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	182946002	rs6803121	A	G	4114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=28;PP=2965;SC=TAGACCATTGATGTTTCCATT;SOR=2.476;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=94;TCR=28;TR=122;WE=182946010;WS=182945992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr3	183027542	rs7639705	T	G	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=1.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.53;ReadPosRankSum=0.870;SOR=0.908;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,38:0.26:144
chr3	183028331	.	A	G	29	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=29;QD=15.9428031368;SC=CATGCCTGTAATTCCAGCTAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=4;WE=183028339;WS=183028321;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr3	183028450	rs60284418	CA	C	226.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.476;NF=7;NR=9;PP=157;ReadPosRankSum=0.178;SC=GACCCTGTTTCAAAAAAAAAA;SOR=0.751;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=16;WE=183028458;WS=183028440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,17:0.30:56
chr3	183028600	rs1105132	A	T	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.232;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=494;ReadPosRankSum=0.747;SC=AGAAAGCTGGATTAGGGAAAA;SOR=0.362;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=98;TCF=71;TCR=27;TR=32;WE=183028608;WS=183028590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,32:0.33:98
chr3	183029331	rs3732595	C	T	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=362;ReadPosRankSum=0.845;SC=TCCTTGGCCCCACCAAGACCC;SOR=0.235;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=50;TCR=0;TR=17;WE=183029339;WS=183029321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,17:0.33:51
chr3	183273129	rs12163540	C	G	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.934;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=3;PP=785;ReadPosRankSum=-0.170;SC=CAATTTGACTCTGGTCCTAGG;SOR=1.883;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=56;TCF=49;TCR=7;TR=34;WE=183273137;WS=183273119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,36:0.63:57
chr3	183368216	rs3755648	A	T	7913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=148;NR=99;PP=2965;SC=CAACTAAGCGAAAAGTTTTTG;SOR=1.157;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=248;TCF=149;TCR=99;TR=247;WE=183368224;WS=183368206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr3	183368891	rs2293031	C	T	5721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.154;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=95;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.767;SC=CACTGTTACACGAGCTCCTGA;SOR=0.346;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=83;TCR=96;TR=177;WE=183368899;WS=183368881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,183:0.99:184
chr3	183432983	rs3736535	C	T	1562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FS=1.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.96;ReadPosRankSum=1.648;SOR=0.565;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:186,76:0.29:262
chr3	183439972	rs3841649	A	AG	895.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=886;ReadPosRankSum=-0.017;SC=GAAGGGAACTATATTTACTAA;SOR=0.743;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=22;WE=183439980;WS=183439962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr3	183454397	.	G	C	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.247;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=578;ReadPosRankSum=2.034;SC=AAATCTAAATGATTCTCAGAA;SOR=2.884;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=24;WE=183454405;WS=183454387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,24:0.86:28
chr3	183491720	rs262960	T	C	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=749;SC=TAGCATTTGCTCAGATGGATT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=183491728;WS=183491710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	183493991	rs2606220	G	A	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=18;PP=619;SC=TTACCTTTACGGCTCTGGGAT;SOR=2.124;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=183493999;WS=183493981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	183521939	rs34612765	C	T	1366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.757;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=43;PP=1089;ReadPosRankSum=0.157;SC=ACGGGGACTCCATCGAGGACG;SOR=1.558;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=69;TCF=7;TCR=62;TR=47;WE=183521947;WS=183521929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,49:0.70:70
chr3	183535763	rs897604	A	G	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=7.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.516;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=3;PP=724;ReadPosRankSum=0.674;SC=CACCCCTGCTACACCAGCTTC;SOR=0.387;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=103;TCR=9;TR=35;WE=183535771;WS=183535753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,35:0.32:111
chr3	183536063	rs894000	T	C	1261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=45;PP=1076;SC=GCAAGGCAAGTGCACTCCCGT;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=45;WE=183536071;WS=183536053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	183543291	rs263006	G	A	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=61;ReadPosRankSum=-0.253;SC=GCTGGTTCCAGCGCCGCGCCA;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=4;WE=183543299;WS=183543281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr3	183551733	rs2305666	A	C	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=404;ReadPosRankSum=-1.388;SC=CTAGGTGAGCACAAAGCTTCA;SOR=1.445;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=18;WE=183551741;WS=183551723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr3	183558402	rs3732581	C	G	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.961;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=549;ReadPosRankSum=1.344;SC=ACTTTACCCACGTAACTGACA;SOR=0.437;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=68;TCF=38;TCR=30;TR=28;WE=183558410;WS=183558392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,30:0.40:75
chr3	183560195	rs13091	A	G	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.173;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.564;NF=19;NR=4;PP=391;ReadPosRankSum=1.552;SC=ATAAGGAGAAATGACTGAATG;SOR=0.892;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=76;TCF=61;TCR=15;TR=23;WE=183560203;WS=183560185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,24:0.32:76
chr3	183560292	rs7652031	A	T	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=7.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=434;ReadPosRankSum=-1.009;SC=AATAAAAATTATCCATTTTAA;SOR=0.617;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=80;TCF=18;TCR=62;TR=22;WE=183560300;WS=183560282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,23:0.28:83
chr3	183562276	rs3811725	A	C	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=154;ReadPosRankSum=-0.600;SC=GAATGCTTTTAAAGTATCAGC;SOR=0.223;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=8;WE=183562284;WS=183562266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr3	183580351	rs56194940	C	T	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=336;ReadPosRankSum=0.778;SC=TAGAAAGTAACGGACCCAGAG;SOR=0.997;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=16;WE=183580359;WS=183580341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr3	183584702	rs59742348	C	CTT	181.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.643;HP=10;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.414;NF=0;NR=7;PP=108;ReadPosRankSum=0.099;SC=GTGAAAAGGGCTTTTTTTTTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=7;WE=183584710;WS=183584692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr3	183585883	rs953419	A	G	1350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.141;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=37;PP=1053;ReadPosRankSum=0.661;SC=GAAACACAGTAGCGTCTTGCA;SOR=1.329;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=63;TCF=9;TCR=54;TR=42;WE=183585891;WS=183585873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,47:0.69:68
chr3	183604723	rs1829515	A	G	2407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=45;PP=1894;SC=TAGCGGTAGCATGTCAAGGAA;SOR=0.872;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=36;TCR=45;TR=81;WE=183604731;WS=183604713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr3	183604801	rs4420923	G	T	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.267;NF=1;NR=11;PP=231;ReadPosRankSum=-0.122;SC=CTCTTGTGGAGGGCCTGACAT;SOR=0.446;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=12;WE=183604809;WS=183604791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr3	183643585	rs56348509	T	C	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.441;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.621;NF=1;NR=14;PP=240;ReadPosRankSum=-0.052;SC=TACTAAAATGTATTTCATTTA;SOR=0.037;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=54;TCF=1;TCR=53;TR=15;WE=183643593;WS=183643575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,16:0.29:56
chr3	183660081	rs149866982	C	T	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=-0.822;SC=CTCGCCCTCCCAAAGTGCTGG;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=183660089;WS=183660073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr3	183663833	rs2292998	T	C	4083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=127;PP=2965;SC=ACTGAGCACATGCAGCAGCTG;SOR=4.468;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=13;TCR=127;TR=140;WE=183663841;WS=183663823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr3	183665062	.	G	C	369	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=14;NR=0;PP=369;QD=28.8408008962;SC=TACGTCAGCAGAGGAAGGGCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=183665070;WS=183665061;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	183669396	rs4148586	C	T	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=245;ReadPosRankSum=1.116;SC=GGCCCAGGGACGGCTCTGTTC;SOR=0.846;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=14;WE=183669404;WS=183669386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr3	183677635	rs28365019	T	A	218.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=12.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=-1.187;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr3	183679532	rs6443924	A	G	2400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=68;PP=2044;SC=TCTACAGGAGACGAGTTAAGC;SOR=5.283;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=72;TCF=4;TCR=68;TR=72;WE=183679540;WS=183679522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr3	183681056	rs2292999	T	G	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=339;ReadPosRankSum=0.916;SC=GCTAAGAAAATGAAACCTTGA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=13;WE=183681064;WS=183681046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr3	183682960	rs2271937	G	A	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=7.160;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=510;ReadPosRankSum=1.231;SC=GGTCAGGGGCGGAAGGCCTGT;SOR=4.362;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=20;WE=183682968;WS=183682950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,21:0.81:26
chr3	183685534	rs939336	A	G	6506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.030;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=106;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.753;SC=CCACACTGCCACAGATTCCAA;SOR=0.252;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=216;TCF=109;TCR=107;TR=213;WE=183685542;WS=183685524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,222:1.00:223
chr3	183696402	rs1132776	A	G	3687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=28;PP=2965;SC=GGAAGTACCCAGCTTTTTCCA;SOR=2.494;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=97;TCR=28;TR=125;WE=183696410;WS=183696392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr3	183699516	rs7636910	T	C	1879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=3;PP=1502;SC=TAAACTCACTTTGAACACTCT;SOR=5.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=48;TCR=3;TR=51;WE=183699524;WS=183699506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	183699781	rs2872247	A	C	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=324;ReadPosRankSum=-0.961;SC=AGGATGGGCCAAATGTTATGT;SOR=0.286;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=17;WE=183699789;WS=183699771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,18:0.36:50
chr3	183700211	rs2293001	C	T	1139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=6;PP=873;SC=GGAGAAGCTGCCAGGATTCAG;SOR=3.026;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=36;WE=183700219;WS=183700201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	183706630	rs6443926	A	C	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=39;PP=1286;SC=GTCTCCCCAGATGATCTAATC;SOR=4.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=43;WE=183706638;WS=183706620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	183749731	rs939334	T	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=49;ReadPosRankSum=-0.611;SC=GTGACACTGATGGCTTTGTAC;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=7;WE=183749739;WS=183749721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr3	183750907	.	ATTT	A	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=6.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.54;MQRankSum=1.270;QD=2.35;ReadPosRankSum=-1.718;SOR=0.016;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr3	183754029	rs6792482	T	C	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=14;PP=612;SC=AGAATATGATTATAGGTAGAA;SOR=1.931;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=183754037;WS=183754019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	183754070	rs55788911	C	T	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.707;HP=1;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=233;ReadPosRankSum=-0.354;SC=GGCTGGAGCTCGAGAATGGGA;SOR=2.217;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=10;WE=183754078;WS=183754060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr3	183754294	rs6443930	G	C	1360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=28;PP=1122;SC=ATGGACAGAGGTGAACGCTCT;SOR=1.364;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=45;WE=183754302;WS=183754284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	183754585	rs56365132	C	T	1985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.581;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=27;PP=1468;ReadPosRankSum=1.688;SC=ATCACAGAACCTCATTCAGAA;SOR=0.471;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=110;TCF=69;TCR=41;TR=68;WE=183754593;WS=183754575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,73:0.63:115
chr3	183755822	rs1000952	G	A	1882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=13;PP=1480;SC=GCCATCAGGCGCAGGTGCAGG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=55;WE=183755830;WS=183755812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	183756391	rs75040538	C	G	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.607;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.731;NF=26;NR=15;PP=919;ReadPosRankSum=-0.772;SC=GGGCCCGGGTCTCACCCCCAC;SOR=1.292;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=41;WE=183756399;WS=183756381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,40:0.71:56
chr3	183756426	rs6799766	T	C	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.780;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.629;NF=7;NR=11;PP=276;ReadPosRankSum=-1.216;SC=AGGGAAGTCATACTTCCTCTT;SOR=1.196;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=62;TCF=35;TCR=27;TR=18;WE=183756434;WS=183756416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,17:0.28:60
chr3	183756441	rs112275937	C	T	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.710;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.885;NF=25;NR=23;PP=890;ReadPosRankSum=-0.268;SC=CCTCTTCCCCCACCTCCACTT;SOR=0.425;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=62;TCF=31;TCR=31;TR=48;WE=183756449;WS=183756431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,47:0.78:60
chr3	183756637	rs56203055	C	T	3122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.936;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.202;NF=91;NR=10;PP=2636;ReadPosRankSum=-1.444;SC=AACACGAGGCCCAGAAGCAGC;SOR=1.633;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=133;TCF=118;TCR=15;TR=101;WE=183756645;WS=183756627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,102:0.78:131
chr3	183756702	rs6789754	G	A	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FS=2.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.46;MQRankSum=0.335;QD=4.41;ReadPosRankSum=0.825;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:224,70:0.24:294
chr3	183756742	rs55674402	C	T	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FS=7.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.52;MQRankSum=0.685;QD=4.43;ReadPosRankSum=-1.740;SOR=1.089;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:288,91:0.24:379
chr3	183756780	rs6765152	A	C	10930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.495;NF=118;NR=208;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.483;SC=GCTCACCTGCAAACTTCAGTC;SOR=0.578;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=327;TCF=118;TCR=209;TR=326;WE=183756788;WS=183756770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,347:1.00:348
chr3	183756808	rs6789882	G	A	8646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=122;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=195;PP=2965;SC=CTTTTTGCCAGAGAACTCCAG;SOR=2.553;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=254;TCF=54;TCR=200;TR=249;WE=183756816;WS=183756798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr3	183756836	rs11274156	A	AT,ATGTCAGTCCAAAT	8689.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=78;PP=2970;SC=TCAGGCTCTCAGTCAGCCTTG;SOR=5.000;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=145;TCF=10;TCR=135;TR=83;WE=183756845;WS=183756826;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:182
chr3	183756837	.	G	T	2113	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=38;MMLQ=28;MQ=59.93;NF=5;NR=66;PP=2113;QD=30.2502987683;SC=CAGGCTCTCAGTCAGCCTTGT;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=110;TCF=6;TCR=104;TR=71;WE=183756845;WS=183756826;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:39,71:0.65:110
chr3	183756837	rs66883074	G	GTCAGTCCAAATT	8690.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.36;QD=48.28;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr3	183756897	rs55953689	A	G	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=403;ReadPosRankSum=0.190;SC=GTAGTTTCAGACCAGACCTGA;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=1;TCR=60;TR=21;WE=183756905;WS=183756887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,21:0.34:61
chr3	183774762	rs6766410	C	A	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.219;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=938;ReadPosRankSum=0.883;SC=GCATCTGTAACCTGGACATCT;SOR=0.906;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=135;TCF=80;TCR=55;TR=52;WE=183774770;WS=183774752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,53:0.37:142
chr3	183774872	rs11432832	G	GA	2740.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=63;PP=2798;SC=AAGATTCAGGGAAGACATTTG;SOR=3.316;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=3;TCR=65;TR=66;WE=183774880;WS=183774862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr3	183776469	rs7617316	C	T	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=31;PP=1036;SC=AAAGAAGCTCCAGGCCGGGTG;SOR=2.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=39;WE=183776477;WS=183776459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	183777919	rs6807271	G	A	3475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=38;PP=2844;SC=CCATGACTGAGCCTCTGTCCT;SOR=1.428;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=73;TCR=39;TR=110;WE=183777927;WS=183777909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr3	183778010	rs6807362	G	C	7226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.98;NF=165;NR=48;PP=2965;SC=GGGGGCTCAGGATGGACAAAG;SOR=2.546;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=213;TCF=165;TCR=48;TR=213;WE=183778018;WS=183778000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr3	183815439	rs6765267	A	G	1217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=31;PP=981;SC=TCTCTCTAGTAGAACATCTAG;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=183815447;WS=183815429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	183818221	rs5855015	AG	A	1670.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.089;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.389;NF=33;NR=14;PP=1680;ReadPosRankSum=-0.483;SC=CCTCTCATATAGGGAGCACAG;SOR=0.495;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=52;TCR=22;TR=47;WE=183818229;WS=183818211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,55:0.69:80
chr3	183818416	rs7627615	G	A	4505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=89;PP=2965;SC=CATCTCCTTCGCGATGTCTGC;SOR=1.288;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=55;TCR=89;TR=144;WE=183818424;WS=183818406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr3	183823576	rs4912524	T	C	2379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=5;PP=1965;SC=GCAGGCCCAGTCTCTATGTCA;SOR=4.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=65;TCR=5;TR=70;WE=183823584;WS=183823566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	183856549	rs6787322	A	G	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.47;ReadPosRankSum=-0.272;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr3	183861243	rs843358	A	G	2425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.495;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=41;PP=1842;ReadPosRankSum=0.359;SC=TGCCTATAACATAAGTCTAAA;SOR=0.342;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=155;TCF=99;TCR=56;TR=104;WE=183861251;WS=183861233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,104:0.66:158
chr3	183861750	rs843357	A	C	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=157;ReadPosRankSum=-1.352;SC=ACAACTCCCAAGTCCCTCTGA;SOR=1.802;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=8;WE=183861758;WS=183861740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr3	183884550	rs73185720	T	C	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.494;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=481;ReadPosRankSum=1.163;SC=AACCCCCATATCTATCCTGTT;SOR=0.988;SbPval=0.83;Source=Platypus;TCR=30;TR=24;WE=183884558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,24:0.38:64
chr3	183884895	rs1709638	C	T	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=35;PP=902;ReadPosRankSum=0.555;SC=TCCAGCAACCCCACACTGCAA;SOR=0.516;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=57;TCF=5;TCR=52;TR=39;WE=183884903;WS=183884885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,40:0.69:58
chr3	183896641	rs2231216	T	C	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=748;ReadPosRankSum=-0.654;SC=CTCTTTTCCCTCAGGAGGAAC;SOR=1.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=29;WE=183896649;WS=183896631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr3	183899832	rs8478	C	T	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=30.141;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=5;PP=601;ReadPosRankSum=0.235;SC=CTCAGAAGATCGAGGTGAGGA;SOR=3.137;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=96;TCF=61;TCR=35;TR=33;WE=183899840;WS=183899822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,33:0.33:100
chr3	183900680	rs843366	G	C	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=25;PP=1113;ReadPosRankSum=-0.680;SC=GGGGCCTAGAGTCATGCCAGG;SOR=0.621;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=82;TCF=45;TCR=37;TR=54;WE=183900688;WS=183900670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,55:0.65:85
chr3	183900729	rs843365	T	C	3297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=67;PP=2439;SC=TCCGATAAACTGCTGCACCTT;SOR=1.121;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=47;TCR=67;TR=114;WE=183900737;WS=183900719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr3	183900836	rs843364	G	A	1266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=37;PP=1055;ReadPosRankSum=-0.710;SC=TACTATTTGTGATGAGGCAAA;SOR=5.943;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=37;WE=183900844;WS=183900826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr3	183901156	.	C	A	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=-0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=134;ReadPosRankSum=-1.059;SC=CTTTCAGGACCCCAGCCATAC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=8;WE=183901164;WS=183901146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr3	183901281	rs2231224	G	A	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.367;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=436;ReadPosRankSum=1.759;SC=TGCCATTCGCGCCCTCTGGCC;SOR=0.382;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=70;TCF=47;TCR=23;TR=28;WE=183901289;WS=183901271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
chr3	183903935	rs16833781	C	CG	550.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=-0.789;QD=11.24;ReadPosRankSum=-0.397;SOR=0.389;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr3	183903937	rs60293594	G	GC	883.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=0.922;QD=14.98;ReadPosRankSum=0.818;SOR=0.960;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr3	183904226	rs56351888	C	T	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.09;ReadPosRankSum=1.005;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,16:0.31:52
chr3	183904232	rs1709624	T	A	1860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=30;PP=939;SC=CTGTCTGGGGTCTGAAACTGC;SOR=1.051;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=22;TCR=30;TR=52;WE=183904240;WS=183904216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	183904520	rs55940723	T	C	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.532;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=30;PP=775;ReadPosRankSum=-0.428;SC=GGGAGGAAGATCTGATGGCCA;SOR=1.169;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=149;TCF=57;TCR=92;TR=43;WE=183904528;WS=183904510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,44:0.29:151
chr3	183905103	rs2942056	G	C	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.388;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=266;ReadPosRankSum=1.199;SC=ATCTGTGTCTGTGCCTGGTTC;SOR=2.012;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=12;WE=183905111;WS=183905093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr3	183906515	rs843345	T	C	2280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=6;PP=1760;SC=AGACTGCCCCTGCTTAGGCCA;SOR=3.706;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=60;TCR=6;TR=66;WE=183906523;WS=183906505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	183907032	rs843344	G	C	3769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=57;PP=2965;SC=GCCATGTATTGTTTTTCATAG;SOR=0.825;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=54;TCR=57;TR=110;WE=183907040;WS=183907022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr3	183907107	rs191513871	G	A	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.920;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=587;ReadPosRankSum=-1.708;SC=GATGGGCAGGGGTGGTAGCAT;SOR=1.108;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=104;TCF=44;TCR=60;TR=33;WE=183907115;WS=183907097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,34:0.32:106
chr3	183908761	rs7614381	C	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=90;ReadPosRankSum=-1.206;SC=AGTAATAAATCTAGTCTACCT;SOR=0.498;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=9;WE=183908769;WS=183908751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,9:0.22:40
chr3	183909143	rs28673709	G	A	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=100;ReadPosRankSum=0.789;SC=GACGAGGTCTGTGGAACAGGA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=7;WE=183909151;WS=183909133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr3	183951135	rs729377	C	T	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.776;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=399;ReadPosRankSum=1.335;SC=CCCCGCTGGCCCCGCCAGGCC;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=103;TCF=62;TCR=41;TR=31;WE=183951143;WS=183951125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,32:0.31:104
chr3	183951431	rs902417	C	T	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.543;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=214;ReadPosRankSum=-1.473;SC=GCTGGCTGCCCCTCGGGACGT;SOR=0.389;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=15;WE=183951439;WS=183951421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,15:0.28:53
chr3	183952773	rs9853525	C	T	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=74;ReadPosRankSum=-0.104;SC=CTGATATAAACAGAAGACAGC;SOR=0.297;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=30;TCF=18;TCR=12;TR=7;WE=183952781;WS=183952763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,6:0.19:31
chr3	183953972	rs1709657	G	A	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.796;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=331;ReadPosRankSum=0.088;SC=AGTCCCTCCCGCCCCAGACGC;SOR=1.692;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=62;TCF=55;TCR=7;TR=20;WE=183953980;WS=183953962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,20:0.31:64
chr3	183955109	rs843334	C	T	1754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=49;PP=1343;ReadPosRankSum=1.788;SC=TGCTGACCCCCCGGGAGATCC;SOR=0.650;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=181;TCF=62;TCR=119;TR=74;WE=183955117;WS=183955099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,76:0.41:187
chr3	183957095	rs843333	A	C	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.52;ReadPosRankSum=0.886;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr3	183957467	rs843332	G	T	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=1.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.30;ReadPosRankSum=-1.880;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,40:0.24:164
chr3	183959508	rs28606531	A	C	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.548;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=102;ReadPosRankSum=0.460;SC=CTGAGGGGCCAGGCCAGGTGG;SOR=0.250;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=11;WE=183959516;WS=183959498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr3	183959959	rs79886161	C	T	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.883;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=913;ReadPosRankSum=1.115;SC=TACTCCCTCCCTAGAGCCCTC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=22;WE=183959969;WS=183959949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,23:0.74:31
chr3	183959961	rs2668195	A	G	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.990;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=294;ReadPosRankSum=0.866;SC=CTCCCTCCCTAGAGCCCTCTT;SOR=0.014;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=6;WE=183959969;WS=183959949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr3	183960252	rs706584	A	C	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.16;ReadPosRankSum=0.593;SOR=0.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,7:0.14:49
chr3	183967089	rs190837241	G	A	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.474;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=27;PP=606;ReadPosRankSum=0.130;SC=GTCTCTCCAGGAGGGCAAAGC;SOR=0.944;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=85;TCF=7;TCR=78;TR=29;WE=183967097;WS=183967079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,30:0.34:89
chr3	183975365	rs7633387	C	T	3798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=84;PP=2965;SC=GCAGGCTCGCCATGCCCATGT;SOR=1.883;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=34;TCR=84;TR=118;WE=183975373;WS=183975355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr3	183994536	rs843371	A	G	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=26;PP=958;ReadPosRankSum=1.083;SC=AACAGACTCAAGGCTCAACTC;SOR=0.635;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=30;TCR=39;TR=47;WE=183994544;WS=183994526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,49:0.69:71
chr3	183996213	rs843372	C	T	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.567;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=470;ReadPosRankSum=-0.987;SC=CCCCTACCCCCGCTCGGGAAT;SOR=0.174;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=31;TCF=18;TCR=13;TR=20;WE=183996221;WS=183996203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr3	184010048	rs3914188	G	C	1817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.058;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=51;PP=1499;ReadPosRankSum=0.666;SC=GGGAGAAATGGCCAGCTGTCA;SOR=0.980;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=18;TCR=81;TR=62;WE=184010056;WS=184010038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,64:0.63:101
chr3	184020100	rs71185698	C	CA	216.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=197;ReadPosRankSum=2.160;SC=TAAGTGAATTCATGGGGAAAA;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=184020108;WS=184020093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr3	184033408	rs73187631	A	T	1567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.522;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=1194;ReadPosRankSum=0.099;SC=GTTGGTGGGGACAGGCTGTAT;SOR=0.186;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=88;TCF=56;TCR=32;TR=55;WE=184033416;WS=184033398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,58:0.64:91
chr3	184037533	rs13319149	A	G	2842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=32;PP=2314;SC=CGTGGCCCCCACCCCAGTTTT;SOR=1.808;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=68;TCR=32;TR=100;WE=184037541;WS=184037523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr3	184039666	rs2178403	A	G	1920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.935;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=46;PP=1472;ReadPosRankSum=-2.364;SC=GACAGCATCAATGGCGCCCCC;SOR=0.580;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=26;TCR=68;TR=64;WE=184039674;WS=184039656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,69:0.70:98
chr3	184045799	rs939317	A	G	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.980;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=550;ReadPosRankSum=-0.584;SC=GGGTATGACCAGCTTCTCTGG;SOR=0.180;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=55;TCF=11;TCR=44;TR=29;WE=184045807;WS=184045789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr3	184046355	rs1879244	C	T	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.114;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=8;PP=1038;ReadPosRankSum=-0.569;SC=AGCCATGCCACGTTGCCCCAG;SOR=0.917;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=78;TCF=64;TCR=14;TR=47;WE=184046363;WS=184046345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,50:0.63:79
chr3	184046470	rs2230571	C	T	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=39;PP=1259;ReadPosRankSum=-1.230;SC=ACATCCCCCACGTGTGGCTCT;SOR=0.816;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=84;TCF=29;TCR=55;TR=59;WE=184046478;WS=184046460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,62:0.71:87
chr3	184046612	rs115910779	G	A	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=536;ReadPosRankSum=0.404;SC=AAATGGCTGGGTTGGATACCC;SOR=0.616;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=85;TCF=52;TCR=33;TR=29;WE=184046620;WS=184046602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,29:0.33:87
chr3	184062776	rs9839000	A	G	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.601;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=28;PP=850;ReadPosRankSum=-0.852;SC=CATGCCTGGCAGTGGCATGCA;SOR=0.252;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=68;TCF=20;TCR=48;TR=43;WE=184062784;WS=184062766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,44:0.64:69
chr3	184070675	rs3749223	A	G	2241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=44;PP=1723;SC=AGGAAGACACAGGGAGAGGTA;SOR=1.371;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=28;TCR=44;TR=72;WE=184070683;WS=184070665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr3	184071017	rs41266265	G	A	4850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=4.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.75;ReadPosRankSum=-0.542;SOR=1.010;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,120:0.61:196
chr3	184071017	.	GTT	ATC	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=43;NR=60;PP=2944;QD=20;SC=TTTAGGAAGCGTTTGTGGCTT;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=189;TCF=82;TCR=107;TR=103;WE=184071027;WS=184071007;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:86,103:0.54:189
chr3	184071019	rs11920716	T	C	4850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=5.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.88;ReadPosRankSum=-1.005;SOR=1.067;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,121:0.62:195
chr3	184071063	rs9820367	G	C	5142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=109;PP=2965;SC=AGCCTCAGGGGTAGGGGGACC;SOR=1.878;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=48;TCR=110;TR=157;WE=184071071;WS=184071053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr3	184072459	rs73189624	G	A	2485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.920;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=54;PP=1912;ReadPosRankSum=0.764;SC=TCAGGGAGGGGGGTGGGAAGA;SOR=0.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=41;TCR=68;TR=86;WE=184072467;WS=184072449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,91:0.81:113
chr3	184075047	rs2228291	A	G	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.030;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.95;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=1027;ReadPosRankSum=-1.247;SC=AGAGGGCTGTAATAGTCTCTA;SOR=0.785;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=161;TCF=79;TCR=82;TR=53;WE=184075055;WS=184075037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,56:0.32:174
chr3	184075958	rs41266271	C	T	1974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.488;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=40;PP=1641;ReadPosRankSum=-1.000;SC=CTCCCCTTCTCTTCTAACATA;SOR=0.963;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=112;TCF=53;TCR=59;TR=72;WE=184075966;WS=184075948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,73:0.63:115
chr3	184090242	rs78565404	C	T	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.897;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=166;ReadPosRankSum=0.243;SC=CCCAGGGGCGCCCTGCAGGGA;SOR=1.329;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=9;WE=184090250;WS=184090232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr3	184090266	rs6141	C	T	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=8;PP=681;SC=GAGCTGTACACGAGACAATGC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=184090274;WS=184090256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	184091149	rs6142	G	T	1837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=14;PP=1383;SC=GGTCTTCTAGGGGGACTGAGT;SOR=1.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=53;WE=184091157;WS=184091139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	184094183	rs956732	A	G	1239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=36;PP=1033;SC=CCAAGGGTGAAGAATCTATCC;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=184094191;WS=184094173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr3	184098193	rs1920128	A	C	309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=5;PP=216;SC=GCGCCGGCCCAGAGCCCCCCG;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=12;WE=184098201;WS=184098183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	184098647	rs885650	C	T	1743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.456;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=57;PP=1405;ReadPosRankSum=-0.129;SC=GCGCGGGCGTCGGAGTGGACT;SOR=2.833;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=81;TCF=5;TCR=76;TR=59;WE=184098655;WS=184098637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,61:0.73:83
chr3	184099206	rs3749229	C	T	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=7.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.36;ReadPosRankSum=-0.064;SOR=0.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,39:0.26:151
chr3	184099378	rs35929225	C	A	2747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.737;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=52;PP=2218;ReadPosRankSum=0.599;SC=GGGAGCCAGGCGCTGAGGAGC;SOR=1.042;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=126;TCF=59;TCR=67;TR=92;WE=184099386;WS=184099368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,96:0.72:133
chr3	184100338	rs73189656	G	A	1615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.444;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=28;PP=1244;ReadPosRankSum=-0.132;SC=AAAGAGCCCCGGGCGTGAAGT;SOR=0.903;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=233;TCF=130;TCR=103;TR=69;WE=184100346;WS=184100328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,72:0.30:238
chr3	184100961	rs3833587	G	GT	412.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=9;PP=257;SC=GGTGAGGCGGGGGGGGGGCCT;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=184100969;WS=184100951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr3	184102396	rs16858778	C	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.075;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=332;ReadPosRankSum=0.068;SC=TCTTCCTGAACGTGGGCACCA;SOR=1.655;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=19;WE=184102404;WS=184102386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,19:0.30:63
chr3	184102579	rs58542381	A	C	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=305;ReadPosRankSum=1.692;SC=CTTTGTGCCTAAGCTCCGGTT;SOR=0.412;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=16;WE=184102587;WS=184102569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr3	184103722	rs79419884	A	G	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.831;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=123;ReadPosRankSum=-1.155;SC=CTTTGCTACCATGAAGACTTT;SOR=0.015;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=10;WE=184103730;WS=184103712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr3	184103903	rs16858780	A	C	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.798;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=410;ReadPosRankSum=-0.420;SC=GGCCTCCCTGATGATCACCAC;SOR=0.684;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=91;TCF=37;TCR=54;TR=27;WE=184103911;WS=184103893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,28:0.29:96
chr3	184106025	.	GTCCATCCA	GTCCA,G	315	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=23;MQ=60.57;NF=2,2;NR=3,3;PP=315,95;QD=64.0;SC=CCATCCATCCGTCCATCCATC;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=5,5;WE=184106040;WS=184106015;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.29:17
chr3	184106217	.	A	G	202	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=10;NR=2;PP=202;QD=19.7309343789;SC=CCATCCATCCATCCGTCCCTT;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=12;WE=184106225;WS=184106207;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr3	184144291	.	ACTTAATAATGTATTGTAAAT	A	207.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.66;ReadPosRankSum=0.169;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr3	184428903	rs9872799	T	G	4012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=66;PP=2965;SC=GAATTCATATTCTGGTGGATT;SOR=0.761;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=52;TCR=66;TR=118;WE=184428911;WS=184428893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr3	184429133	rs10656187	A	ATCC	4413.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.232;NF=48;NR=31;PP=2989;ReadPosRankSum=-0.952;SC=CTCCTCCCAGATCCTCCTCCT;SOR=0.854;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=109;TCF=62;TCR=47;TR=79;WE=184429141;WS=184429123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
chr3	184429414	rs10937187	C	A	5483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.698;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=131;PP=2965;ReadPosRankSum=1.710;SC=CTTGCCAAGGCTTTGGCCGCC;SOR=2.636;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=169;TCF=38;TCR=131;TR=167;WE=184429422;WS=184429404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,172:0.99:173
chr3	184570161	.	CTAGTT	C	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=227;ReadPosRankSum=-0.000;SC=AGCACTGAATCTAGTTTAGGT;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=6;WE=184570173;WS=184570151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr3	184631103	rs9821657	G	A	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=380;SC=TCTATCTTAGGGTAGCTTATA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=184631111;WS=184631093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	184633247	rs4686879	A	C	1210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=21;PP=855;SC=GAGAATTTCTAAATGTATTGG;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=32;WE=184633255;WS=184633237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	184642587	rs11391596	A	AT	738.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.94;MQRankSum=1.259;QD=16.06;ReadPosRankSum=0.960;SOR=2.511;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,36:0.78:46
chr3	184647413	rs4643688	T	C	2333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=51;PP=1910;SC=ACCAATATGATAAAATTATTG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=16;TCR=51;TR=67;WE=184647421;WS=184647403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr3	184654166	rs6444004	A	G	2502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=61;PP=1963;SC=ATCTAGTGGAAAGACAATTAT;SOR=2.955;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=13;TCR=61;TR=74;WE=184654174;WS=184654156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	184658058	rs142586532	T	TTATA	97.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=2;PP=171;SC=TAGTCTTTCATTATATATATA;SOR=1.179;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=3;WE=184658066;WS=184658048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	184675359	rs4501092	T	C	3562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=87;PP=2830;SC=CTTAACATTCTCCATTTGACA;SOR=3.851;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=103;TCF=14;TCR=89;TR=100;WE=184675367;WS=184675349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr3	184684313	rs4470487	G	A	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=323;SC=AAACAGAAGAGTTTACTTCTG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=184684321;WS=184684303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	184700356	rs4572747	A	C	3125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=24;PP=2517;ReadPosRankSum=-0.827;SC=CATTATAGGCACTTTGGTTTC;SOR=1.107;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=75;TCR=24;TR=98;WE=184700364;WS=184700346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,98:0.99:99
chr3	184700426	rs11555405	C	T	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.920;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=37;PP=1505;ReadPosRankSum=-1.973;SC=TCCTCATCTACACTCTGAAGG;SOR=0.616;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=110;TCF=54;TCR=56;TR=77;WE=184700434;WS=184700416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,77:0.70:110
chr3	184714014	rs9860814	C	T	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=623;SC=TCAATTTTAGCTGTTGGTAGT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=184714022;WS=184714004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	184717703	rs2291737	T	C	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=27;PP=810;SC=CCAATGTCATTTGGGCCTGGT;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=184717711;WS=184717693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	184766148	rs3821748	A	G	2175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.824;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=14;PP=1565;ReadPosRankSum=-1.142;SC=AGCTGGTAGCATGGATTGTTT;SOR=0.901;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=135;TCF=111;TCR=24;TR=86;WE=184766156;WS=184766138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,94:0.64:147
chr3	184766186	rs3821749	A	C	3280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.849;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=34;PP=2450;ReadPosRankSum=0.082;SC=GCACCATGTTATGCTTCAGCA;SOR=0.977;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=173;TCF=117;TCR=56;TR=112;WE=184766194;WS=184766176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,120:0.64:187
chr3	184766249	rs6779564	TC	CT	4165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.960;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=29;PP=2944;ReadPosRankSum=-0.189;SC=GTTAATCGTATCGGTTTTTAT;SOR=0.879;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=163;TCF=100;TCR=63;TR=86;WE=184766258;WS=184766239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,106:0.61:173
chr3	184766392	rs3821751	G	A	2081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.666;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=58;PP=1630;ReadPosRankSum=-1.493;SC=CCTATTTATAGTTTACTGCTT;SOR=0.175;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=110;TCF=18;TCR=92;TR=73;WE=184766400;WS=184766382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,77:0.67:115
chr3	184769911	rs2271257	C	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=139;ReadPosRankSum=0.393;SC=CCACCTCCCACGCTTCTGAGA;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=184769919;WS=184769901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr3	184935807	rs35531967	A	C	998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=4;PP=809;SC=CCCACCTCGGACTCCCAGAGT;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=184935815;WS=184935797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	185046909	rs34308085	AT	A	1672.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=15;PP=1106;SC=CAGTAGTTTTATTTTTTTTTA;SOR=2.231;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=56;WE=185046917;WS=185046899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	185046975	rs9863304	T	C	3268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=47;PP=2411;SC=ACAGGTCCCGTGTGCACGAAA;SOR=0.907;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=59;TCR=47;TR=106;WE=185046983;WS=185046965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr3	185155430	rs113427759	C	CT	988.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.414;HP=11;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.417;NF=2;NR=34;PP=660;ReadPosRankSum=-1.531;SC=TAGGTCAAGGCTTTTTTTTTT;SOR=3.442;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=36;WE=185155438;WS=185155420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,37:0.95:39
chr3	185212593	rs6798873	T	C	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.425;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=29;PP=653;ReadPosRankSum=1.008;SC=AGAAAGGGTCTCCAGGTGTTG;SOR=1.839;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=129;TCF=42;TCR=87;TR=37;WE=185212601;WS=185212583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,40:0.30:134
chr3	185226492	rs55854644	C	T	1537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=1;PP=1242;ReadPosRankSum=1.483;SC=CTTTTTCTGCCTTGCAGAAAG;SOR=1.075;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=72;TCF=70;TCR=2;TR=49;WE=185226500;WS=185226482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,51:0.68:75
chr3	185229464	rs61730237	T	C	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.778;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=28;PP=800;ReadPosRankSum=0.202;SC=CTTGGTGATATTTCTGAAATG;SOR=0.303;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=98;TCF=23;TCR=75;TR=38;WE=185229472;WS=185229454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,37:0.36:102
chr3	185232169	rs1837882	G	A	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.102;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=344;ReadPosRankSum=-0.258;SC=GGGAAATAGCGCACTGCAAAC;SOR=0.967;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=75;TCF=51;TCR=24;TR=22;WE=185232177;WS=185232159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,24:0.30:80
chr3	185252972	rs199752623	TCAAG	T	2727.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.068;NF=3;NR=45;PP=2183;ReadPosRankSum=-1.233;SC=TAGCTGGGCATCAAGCAAGAG;SOR=0.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=80;TCF=5;TCR=75;TR=48;WE=185252983;WS=185252962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,69:0.73:94
chr3	185316868	rs78873116	C	T	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.904;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=381;ReadPosRankSum=-1.136;SC=CCATTTTTTTCCTACATTTTG;SOR=0.536;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=92;TCF=28;TCR=64;TR=26;WE=185316876;WS=185316858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,28:0.26:107
chr3	185414552	rs56392101	G	C	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.386;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=376;ReadPosRankSum=-1.588;SC=GGAAAAAAAAGATGGTTATAG;SOR=0.043;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=63;TCF=7;TCR=56;TR=22;WE=185414560;WS=185414542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,22:0.33:66
chr3	185434443	rs77587335	G	A	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.660;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=294;ReadPosRankSum=1.252;SC=CAGCTGTCTTGGGCTCCCTGA;SOR=1.360;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=53;TCF=28;TCR=25;TR=16;WE=185434451;WS=185434433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,15:0.26:58
chr3	185635685	rs16860328	A	G	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=30;PP=771;ReadPosRankSum=-2.484;SC=GAAATGAGATAGCAATCTTAA;SOR=0.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=6;TCR=43;TR=34;WE=185635693;WS=185635675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,35:0.67:52
chr3	185655454	rs1862904	A	G	1795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=1;PP=1491;SC=CTATCCACAAAGGCTTTTTTT;SOR=6.479;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=47;TCR=1;TR=48;WE=185655462;WS=185655444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	185798025	rs77805826	C	T	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=33;ReadPosRankSum=-0.598;SC=TTAAATCGCTCGTAGCCCCGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=185798033;WS=185798015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr3	185879296	rs13073156	T	C	1916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=8;PP=1568;SC=ACAGTCCCTGTGACTCTGAGA;SOR=3.538;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=51;TCR=8;TR=59;WE=185879304;WS=185879286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	185882643	rs4686741	C	G	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=8;PP=842;ReadPosRankSum=1.106;SC=AATGTGTACGCAGGCGGGGAG;SOR=0.687;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=49;TCR=12;TR=40;WE=185882651;WS=185882633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,41:0.65:63
chr3	185905876	rs13087397	G	A	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=548;ReadPosRankSum=-1.400;SC=CAGCATATCCGCAGAGCATGG;SOR=1.236;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=23;WE=185905884;WS=185905866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,25:0.78:32
chr3	185960192	rs6799929	A	G	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=3;PP=374;SC=CCAAGTCCCCAGCGGCCCTGG;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=185960200;WS=185960182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	185960414	rs12489063	G	A	3968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=86;PP=2962;ReadPosRankSum=0.972;SC=AGTGCAGTGCGGAGGGAAGGG;SOR=0.696;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=209;TCF=86;TCR=123;TR=145;WE=185960422;WS=185960404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,149:0.70:214
chr3	185970970	rs61752078	A	G	1667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FS=0.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.91;ReadPosRankSum=0.962;SOR=0.756;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:204,78:0.28:282
chr3	185975470	rs372307284	CTT	C	284.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQRankSum=1.859;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.348;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr3	185982955	rs3815620	G	A	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=3;PP=924;ReadPosRankSum=-0.917;SC=ATGCTTTTCTGTAGAACCCAA;SOR=3.003;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=36;WE=185982963;WS=185982945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr3	185982972	rs3815619	T	C	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.088;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=580;ReadPosRankSum=0.429;SC=CCAAACCCCGTCTTGCCCGCC;SOR=1.714;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=26;WE=185982980;WS=185982962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,27:0.71:38
chr3	185990096	rs2193587	C	T	4449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=78;PP=2965;SC=AGGAATGTTTCTGGACACACA;SOR=0.926;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=59;TCR=79;TR=137;WE=185990104;WS=185990086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr3	186006566	rs710443	T	C	3710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=60;PP=2965;SC=CCTTCAGGTATACCACTGGGG;SOR=0.781;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=57;TCR=60;TR=116;WE=186006574;WS=186006556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr3	186006618	rs1004588	G	C	1865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=40;PP=1478;ReadPosRankSum=0.660;SC=TTCCAGGGGGGTCGCAGCCAC;SOR=0.646;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=46;TCR=62;TR=71;WE=186006626;WS=186006608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,70:0.67:105
chr3	186015283	rs3819860	A	G	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.141;HP=7;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=283;ReadPosRankSum=0.212;SC=CTGAGGAAAAAAAAGAAGATT;SOR=0.671;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=49;TCF=24;TCR=25;TR=17;WE=186015291;WS=186015273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,17:0.33:52
chr3	186015303	rs3819859	A	G	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.391;HP=3;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=797;ReadPosRankSum=-0.323;SC=TTAAAGACCAACCCAGGCCCT;SOR=1.067;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=19;WE=186015323;WS=186015293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,19:0.35:54
chr3	186015315	rs3819858	T	C	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.032;HP=1;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=797;ReadPosRankSum=0.237;SC=CCAGGCCCTCTAGCTTCTTGG;SOR=1.264;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=49;TCF=27;TCR=22;TR=19;WE=186015323;WS=186015293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,19:0.35:54
chr3	186015438	rs3819857	C	T	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=175;ReadPosRankSum=1.472;SC=GCTGTGTCTCCCCCATTATAG;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=9;WE=186015446;WS=186015428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr3	186276393	rs9854418	C	T	2106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=39;PP=1581;SC=GATGAATAGACGTTTTAAAAC;SOR=1.574;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=59;WE=186276401;WS=186276383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	186287777	rs2889755	T	C	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=2;PP=440;SC=ATACGCCCGATGATTTACCGA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=186287785;WS=186287767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	186288565	rs3806714	A	G	1356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=0;PP=1206;SC=CTGCGGACCAAGGAGACCCCC;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=39;WE=186288573;WS=186288555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	186293820	rs2280390	T	G	2114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=59;PP=1743;SC=CAGAAACTTTTGATGAACAGT;SOR=4.343;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=6;TCR=59;TR=65;WE=186293828;WS=186293810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr3	186295417	rs11386781	A	AT	857.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.476;NF=34;NR=3;PP=607;ReadPosRankSum=-1.285;SC=TAGAGTCTTGATTTTTTTTTT;SOR=1.755;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=37;WE=186295425;WS=186295407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,37:0.93:40
chr3	186302391	rs140269415	A	ATTGTGTGTGTGT,ATTGTGTGTGTGTGT	3321.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=67.26;QD=158.18;SOR=6.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,6,15:0.29,0.71:21
chr3	186336176	rs2070635	A	G	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=513;SC=CAACTGCCCTATGTAAGCCAT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=186336184;WS=186336166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	186337713	rs4917	T	C	3704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=61;PP=2735;SC=GTGACCTGCATGGTGTTCCAA;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=121;TCF=59;TCR=62;TR=120;WE=186337721;WS=186337703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr3	186337827	rs2518136	T	C	1916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=47;PP=1370;SC=TTTGCTCTCCTGTGCTTCTGA;SOR=2.799;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=13;TCR=47;TR=60;WE=186337835;WS=186337817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr3	186338382	rs4918	G	C	2826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=8;PP=2343;SC=CAGCCCGTGAGCTCACAGCCC;SOR=4.174;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=79;TCR=8;TR=87;WE=186338390;WS=186338372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr3	186338425	rs1071592	A	C	4418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=32;PP=2965;ReadPosRankSum=1.474;SC=CAGTCCCCACACCCGTGGTGG;SOR=1.205;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=105;TCR=32;TR=136;WE=186338433;WS=186338415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,140:0.99:141
chr3	186358366	rs1047115	A	C	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.957;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=30;PP=726;ReadPosRankSum=0.696;SC=GCAATGACTCAGATGTGCTGG;SOR=0.994;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=170;TCF=79;TCR=91;TR=51;WE=186358374;WS=186358356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,52:0.30:172
chr3	186360409	rs3733159	T	G	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.80;ReadPosRankSum=-0.308;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,13:0.23:56
chr3	186370333	rs1131364	G	T	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=3.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.12;ReadPosRankSum=0.846;SOR=0.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,9:0.19:47
chr3	186370350	rs7999	A	G	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=89;ReadPosRankSum=-1.844;SC=CCTTTCCCCAAAGAAAAAGCA;SOR=0.569;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=9;WE=186370358;WS=186370340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,9:0.24:37
chr3	186383709	rs78954048	A	G	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=514;ReadPosRankSum=0.582;SC=GAACACCCTCAGTTACACAAC;SOR=2.073;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=26;WE=186383717;WS=186383699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,28:0.74:38
chr3	186384015	rs11707899	C	T	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=348;ReadPosRankSum=2.986;SC=TGAGGAATTGCCAATGGCAGA;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=17;WE=186384023;WS=186384005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr3	186386664	rs5855108	T	TA	729.50	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=0;PP=570;ReadPosRankSum=1.922;SC=CTTTAATACATAAAAAAAAAC;SOR=3.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=29;WE=186386672;WS=186386654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,31:0.89:35
chr3	186386713	rs80205675	G	T	1659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=1;PP=1371;ReadPosRankSum=1.257;SC=GTTGCTTTTGGCATTCCTCAG;SOR=0.952;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=80;TCF=79;TCR=1;TR=58;WE=186386721;WS=186386703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,58:0.73:80
chr3	186390627	rs9898	C	T	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=3.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.39;ReadPosRankSum=1.418;SOR=1.107;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,20:0.24:83
chr3	186393073	rs370566711	GGTGT	GGT,G	147.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.431;NF=1;NR=11;PP=366;ReadPosRankSum=1.282;SC=TCTATGAGTGGGTGTGTGTGT;SOR=0.368;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=12;WE=186393084;WS=186393063;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.67:9
chr3	186393091	.	TGTGTGTGA	T	332	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=29;MQ=57.65;NF=1;NR=11;PP=332;QD=28.0;SC=TGTGTGTGTGTGTGTGTGAGA;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=12;WE=186393106;WS=186393081;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,12:0.80:15
chr3	186393095	rs2378122	T	A	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.14;MQRankSum=0.842;QD=15.97;ReadPosRankSum=0.608;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr3	186393097	rs7428891	T	A	186.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.282;NF=1;NR=4;PP=48;ReadPosRankSum=-0.253;SC=TGTGTGTGTGTGAGAGAGAGA;SOR=0.368;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=5;WE=186393106;WS=186393081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr3	186395180	rs7629680	T	C	6132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=114;PP=2965;SC=AGCATCCCCATGGACACCATC;SOR=0.896;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=97;TCR=114;TR=210;WE=186395188;WS=186395170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr3	186395572	rs1042464	A	T	1303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.198;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=31;PP=969;ReadPosRankSum=0.610;SC=AAGCCAGACAATCAGCCCTTT;SOR=0.570;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=192;TCF=92;TCR=100;TR=61;WE=186395580;WS=186395562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,62:0.31:197
chr3	186435370	rs1050274	G	A	2728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.052;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=38;PP=2208;ReadPosRankSum=-1.053;SC=GCTCCAGGCTGCTACTAAGTT;SOR=1.074;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=138;TCF=76;TCR=62;TR=96;WE=186435378;WS=186435360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,101:0.70:144
chr3	186435561	rs13072823	G	A	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=408;ReadPosRankSum=-0.840;SC=AAGTCACTTGGGATTTGTACT;SOR=1.519;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=15;WE=186435569;WS=186435551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr3	186437944	rs5029980	T	C	3030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=68;PP=2364;ReadPosRankSum=-0.191;SC=AGGAGGGGGATTGTCCTGTTC;SOR=0.654;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=52;TCR=102;TR=103;WE=186437952;WS=186437934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,109:0.66:164
chr3	186440243	rs1469859	G	A	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.161;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=154;ReadPosRankSum=-0.039;SC=GAGAATGCACGGCAACCGTGG;SOR=0.704;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=56;TCF=27;TCR=29;TR=15;WE=186440251;WS=186440233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,15:0.27:56
chr3	186442833	rs1656921	G	C	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=1;PP=610;SC=TGCGAATGCTGATTGCGATCA;SOR=4.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=186442841;WS=186442823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	186443018	rs1656922	T	C	3679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=69;PP=2788;SC=TCCCTCTTCATGCTTAATGAA;SOR=0.954;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=55;TCR=69;TR=124;WE=186443026;WS=186443008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr3	186449582	rs1648698	G	C	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=587;ReadPosRankSum=1.275;SC=GTACCCCTTCGCTGCCCAGTT;SOR=0.829;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=25;WE=186449590;WS=186449572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,25:0.71:35
chr3	186459927	rs710446	T	C	1822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.113;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=43;PP=1334;ReadPosRankSum=-0.408;SC=CCAGCTCCCATACAGAGTGAT;SOR=0.984;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=220;TCF=112;TCR=108;TR=73;WE=186459935;WS=186459917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,78:0.33:233
chr3	186501502	rs266720	C	A	1356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.449;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=33;PP=1030;ReadPosRankSum=-1.573;SC=GTGGATGGCACGGAGGCAAAA;SOR=0.354;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=78;TCF=21;TCR=57;TR=49;WE=186501510;WS=186501492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,51:0.61:83
chr3	186504148	rs266718	T	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=101;ReadPosRankSum=-0.659;SC=ATGTGTTTTGTTGTCGTTCCC;SOR=0.260;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=7;WE=186504156;WS=186504138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr3	186507922	rs2066500	C	T	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.786;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=34;PP=1650;ReadPosRankSum=-0.235;SC=GTGCAAAGTACCTACTTACGG;SOR=0.546;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=105;TCF=57;TCR=48;TR=71;WE=186507930;WS=186507912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,70:0.67:105
chr3	186508247	rs2234751	T	TA	817.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=1008;ReadPosRankSum=2.246;SC=AGACTAGACATACACTCTGCC;SOR=0.967;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=76;TCF=1;TCR=75;TR=27;WE=186508255;WS=186508237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,29:0.38:76
chr3	186509517	rs187868	G	A	4647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.936;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=80;PP=2962;ReadPosRankSum=0.181;SC=CTCTTACCCCGGCAATGTCTG;SOR=0.582;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=295;TCF=160;TCR=135;TR=168;WE=186509525;WS=186509507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,175:0.58:302
chr3	186518806	rs3917109	C	A	2020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=0;PP=1748;ReadPosRankSum=-1.633;SC=GTACACAGAGCAAGATATTTA;SOR=1.542;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=103;TCF=103;TCR=0;TR=69;WE=186518814;WS=186518796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,68:0.66:103
chr3	186522633	rs710450	A	C	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=221;ReadPosRankSum=0.437;SC=CCCGAAAATAAACTTAGCCTT;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=10;WE=186522641;WS=186522623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr3	186791795	rs9821439	A	G	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=1;PP=454;SC=TGGAAGAGAAACCTGTAGTCT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=186791803;WS=186791785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr3	186791817	rs2268526	A	C	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.021;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=90;ReadPosRankSum=0.765;SC=CTGCAAGAAAAGGGCTGTGCC;SOR=0.024;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=5;WE=186791825;WS=186791807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr3	186793242	rs2239612	G	A	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.47;ReadPosRankSum=-1.029;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr3	186917751	rs6764714	C	G	2808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.566;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=41;PP=2207;ReadPosRankSum=0.578;SC=GTCGCAGGACCAGACGGGCTC;SOR=1.388;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=173;TCF=102;TCR=71;TR=114;WE=186917759;WS=186917741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,117:0.65:179
chr3	186947410	rs850318	C	T	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=370;SC=TCCAGTCTAGCCGAGAACTCT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=186947418;WS=186947400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	186953932	rs72549154	C	A	2616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-7.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.563;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=55;PP=2019;ReadPosRankSum=-1.981;SC=AGGCTCAAGCCTTGGCAGGCA;SOR=0.597;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=228;TCF=106;TCR=122;TR=106;WE=186953940;WS=186953922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,108:0.46:237
chr3	186954285	rs710452	A	G	8037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=148;PP=2965;SC=GGAAGAGGCCAGGCTCAGCAT;SOR=0.939;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=267;TCF=119;TCR=148;TR=267;WE=186954293;WS=186954275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr3	186961478	rs710460	A	G	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=511;SC=TGATGGATCTATCTCATGCAG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=186961486;WS=186961468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	186965268	rs3774275	A	G	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.187;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=528;ReadPosRankSum=1.562;SC=CAAGCAAAGCAGAAACAGTTT;SOR=2.557;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=24;WE=186965276;WS=186965258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,25:0.81:31
chr3	186967942	rs2302818	G	A	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.143;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=309;ReadPosRankSum=-0.167;SC=CCCCCTTAGAGTGCTCCTGCC;SOR=0.214;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=14;WE=186967950;WS=186967932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr3	187003495	rs698105	A	G	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=100;ReadPosRankSum=-1.732;SC=AATTCATACCATTGTGATGTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=7;WE=187003503;WS=187003485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr3	187009176	rs16861893	G	A	1674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.096;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=39;PP=1263;ReadPosRankSum=-2.063;SC=CTTCAGCAGCGTCCGGAGCAG;SOR=0.785;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=217;TCF=97;TCR=120;TR=70;WE=187009184;WS=187009166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,75:0.33:224
chr3	187009351	rs16861895	C	G	1821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.564;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=27;PP=1349;ReadPosRankSum=0.172;SC=CAAGGTCAGACCTTCCCTGCT;SOR=1.037;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=253;TCF=145;TCR=108;TR=74;WE=187009359;WS=187009341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,79:0.31:257
chr3	187009372	rs16861896	G	A	1796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.719;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=30;PP=1296;ReadPosRankSum=0.304;SC=ATTTGACACTGGTCCCCAAAA;SOR=1.022;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=236;TCF=126;TCR=110;TR=74;WE=187009380;WS=187009362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,79:0.32:244
chr3	187009412	rs72549254	G	A	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.197;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=29;PP=999;ReadPosRankSum=1.213;SC=CCCCTGGCACGTACCTCATTT;SOR=0.934;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=226;TCF=116;TCR=110;TR=67;WE=187009420;WS=187009402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,72:0.31:232
chr3	187086081	rs5855133	TCAGA	T	1842.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=0;PP=1661;SC=TTCTGTGTACTCAGACAGTCT;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=32;WE=187086092;WS=187086071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	187088656	rs1047584	C	T	1863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=35;PP=1531;ReadPosRankSum=-0.602;SC=GAGCACTGGACATCCCAGGGT;SOR=0.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=53;TCR=54;TR=70;WE=187088664;WS=187088646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,71:0.65:110
chr3	187088923	rs35224605	G	A	2564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=5.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.00;ReadPosRankSum=-0.075;SOR=0.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,94:0.70:135
chr3	187088926	rs1533594	G	A	5455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.33;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr3	187416253	rs1523468	C	T	1713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=6;PP=1444;SC=ACTCTCAAGCCCATGTGCCCT;SOR=3.830;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=46;TCR=6;TR=52;WE=187416261;WS=187416243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	187416634	rs1973791	C	A	3171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=70;PP=2696;SC=TGTTCTCCTCCAGCATGCTGG;SOR=1.921;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=29;TCR=70;TR=99;WE=187416642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr3	187416719	rs11707167	T	C	3346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=67;NR=49;PP=2626;SC=GCCCGCCCGCTGGGCGCGGTC;SOR=0.990;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=68;TCR=49;TR=116;WE=187416727;WS=187416709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr3	187419661	rs113681515	G	GCCTGCC	1184.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=972;SC=ACCAGAATAAGCCCGCGACTG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=19;WE=187419669;WS=187419651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr3	187420445	rs4389470	C	T	1553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=43;PP=1217;SC=TAGCACAAACCGCTTGACCTG;SOR=4.450;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=3;TCR=43;TR=46;WE=187420453;WS=187420435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr3	187440506	rs1005099	C	A	1906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=51;PP=1527;SC=TCTTGCCTCTCCAAGGCCAGG;SOR=4.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=4;TCR=51;TR=55;WE=187440514;WS=187440496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr3	187447032	rs1056932	G	A	6363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.687;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=132;NR=71;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.969;SC=TGGCATTCTGGTTGAGGCTGT;SOR=0.297;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=204;TCF=133;TCR=71;TR=203;WE=187447040;WS=187447022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,208:0.99:210
chr3	187447926	rs1491997	C	T	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=21;PP=691;SC=ACATAGGTGACGTGGCTCTGG;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=187447934;WS=187447916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	187451609	rs1880101	A	G	1800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=38;PP=1366;SC=GGTCCCTTGTATTTGATCTTT;SOR=2.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=50;WE=187451617;WS=187451599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	187451701	rs1880100	T	C	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.43;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	187451709	rs1880099	C	T	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.43;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	187896912	rs13096262	G	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.545;NF=10;NR=1;PP=130;ReadPosRankSum=-1.911;SC=GAGGTTTTGAGAGCATTGATA;SOR=0.201;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=42;TCR=4;TR=11;WE=187896920;WS=187896903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,11:0.23:47
chr3	187897059	rs13096615	G	A	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FS=2.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.67;ReadPosRankSum=-0.049;SOR=0.895;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:189,51:0.21:240
chr3	187898092	rs16863078	T	G	5452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.098;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=65;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.208;SC=CACCTCTGTTTCCAGGATTTG;SOR=0.822;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=267;TCF=173;TCR=94;TR=189;WE=187898100;WS=187898082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,196:0.72:271
chr3	188202550	rs2067078	A	T	4400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=102;PP=2965;SC=TCATGTTTATAAGCCATCCTA;SOR=4.504;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=8;TCR=102;TR=110;WE=188202558;WS=188202540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr3	188202582	rs1559814	G	T	3109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=69;PP=2118;SC=AATTTCATGAGTGTTTCTGTG;SOR=8.554;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=0;TCR=69;TR=69;WE=188202590;WS=188202572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr3	188242669	rs200398269	TTCCTTCCTTCCGTCCG	T	1839.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.84;QD=41.81;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	188242701	rs138209867	T	G	1805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.36;QD=44.04;SOR=5.186;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	188242705	rs144299808	T	G	1676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.23;QD=49.32;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	188327461	rs1059380	C	T	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=3.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.31;ReadPosRankSum=1.421;SOR=1.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,21:0.16:130
chr3	188464248	rs3830584	G	GT	8244.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.629;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.235;NF=184;NR=21;PP=2969;ReadPosRankSum=-1.103;SC=TGTATTTGTTGTAACTATCTC;SOR=4.097;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=215;TCF=192;TCR=23;TR=205;WE=188464256;WS=188464238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,224:0.99:226
chr3	188478197	rs3841956	G	GGT,GGTGT	1309.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.07;QD=34.47;SOR=7.054;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:2,7,29:0.18,0.76:38
chr3	188478235	rs9844854	T	C	963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=34;PP=767;SC=CGTGCGCGCATGTAAATTAGC;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=188478243;WS=188478225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	188590358	rs4687001	C	T	8253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=177;NR=72;PP=2965;SC=GTTTCCACCTCTTCCTTTTAC;SOR=1.904;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=249;TCF=177;TCR=72;TR=249;WE=188590366;WS=188590348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr3	188590446	rs1136644	A	G	6597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.081;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=145;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TTGCCCCGCGATGTTCTGTGT;SOR=0.785;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=300;TCF=116;TCR=184;TR=236;WE=188590454;WS=188590436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,246:0.78:314
chr3	189028046	rs28363884	C	T	347.96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.9997;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=229;ReadPosRankSum=0.942;SC=TTTCTTCTCACCCCCTAAAAT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=10;WE=189028054;WS=189028036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr3	189033292	rs6773831	C	G	5461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.298;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=126;NR=60;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.021;SC=TATGCAGAGACTACTGCTGGG;SOR=1.109;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=249;TCF=163;TCR=86;TR=186;WE=189033300;WS=189033282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,192:0.75:257
chr3	189349247	rs28673064	A	T	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FS=3.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.96;ReadPosRankSum=0.343;SOR=1.385;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:208,45:0.18:253
chr3	189349501	rs13064999	G	A	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.27;ReadPosRankSum=-2.363;SOR=0.135;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,26:0.15:168
chr3	189507490	rs77388546	C	T	6089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=175;NR=25;PP=2962;ReadPosRankSum=2.649;SC=CTGTTATCTTCTTAAGTAGAT;SOR=0.804;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=232;TCF=203;TCR=29;TR=200;WE=189507498;WS=189507480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,205:0.86:238
chr3	189507518	rs34201045	C	CAGAG	1023.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.49;ReadPosRankSum=0.871;SOR=0.655;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:253,40:0.14:293
chr3	189582241	rs17514215	T	G	2174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=69;PP=1839;ReadPosRankSum=0.229;SC=CTGTTCAACCTCCTTGAAGGT;SOR=1.440;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=84;TCF=2;TCR=82;TR=71;WE=189582249;WS=189582231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,71:0.86:83
chr3	189586630	rs16864880	C	G	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.146;SOR=0.074;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,14:0.21:67
chr3	189587274	rs6790167	A	G	2495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=82;PP=2081;ReadPosRankSum=-1.626;SC=TCATCATCTCATTATCTGTGA;SOR=3.634;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=96;TCF=0;TCR=96;TR=82;WE=189587282;WS=189587264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,84:0.87:97
chr3	189590824	rs9840359	G	C	2515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.620;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=84;PP=1825;ReadPosRankSum=0.501;SC=GCATGAGTGAGGGTGACTTTA;SOR=0.481;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=112;TCF=14;TCR=98;TR=97;WE=189590832;WS=189590814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,102:0.88:116
chr3	189604149	rs1554131	T	G	11085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=268;NR=109;PP=2965;ReadPosRankSum=1.306;SC=TCAGTGTCCCTTGCTCACCAT;SOR=0.924;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=378;TCF=269;TCR=109;TR=377;WE=189604168;WS=189604139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,386:1.00:387
chr3	189604160	rs1345186	T	C	13122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=265;NR=117;PP=2965;SC=TGCTCACCATTATTTCCATGT;SOR=1.814;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=382;TCF=265;TCR=117;TR=382;WE=189604168;WS=189604139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,390:1.00:390
chr3	189625025	rs201745713	CT	C	335.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=-1.560;QD=6.33;ReadPosRankSum=-0.752;SOR=0.509;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr3	189688569	rs3732920	C	A	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=3;PP=1009;SC=TGAGCTAAAACATACTAAATA;SOR=4.235;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=33;WE=189688577;WS=189688559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	189689904	rs710543	A	G	2894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=68;PP=2358;SC=GCAAATGGGCAGAGGCAGACA;SOR=2.662;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=17;TCR=68;TR=85;WE=189689912;WS=189689894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr3	189690861	rs710545	T	A	3072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=86;PP=2511;SC=TCATTGGAGGTCGTAAGAAAA;SOR=6.826;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=88;TCF=2;TCR=86;TR=88;WE=189690869;WS=189690851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr3	189691499	rs1815171	G	A	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.96;MQRankSum=0.050;QD=1.91;ReadPosRankSum=-0.049;SOR=0.053;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,6:0.17:35
chr3	189692565	rs1985690	G	A	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=5.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.36;ReadPosRankSum=1.962;SOR=0.192;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,14:0.11:123
chr3	189702200	rs710558	T	C	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.26;ReadPosRankSum=-2.043;SOR=0.046;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,4:0.15:26
chr3	189702395	rs11311050	TA	T	208.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=1.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=1.780;QD=2.86;ReadPosRankSum=0.104;SOR=0.992;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,18:0.25:73
chr3	189705542	rs3114672	A	G	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.51;ReadPosRankSum=-0.032;SOR=0.991;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,18:0.19:94
chr3	189712089	rs1719599	G	A	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=4.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.31;ReadPosRankSum=-1.113;SOR=0.155;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,14:0.15:93
chr3	189712090	rs1719598	G	A	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=4.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.35;ReadPosRankSum=-1.224;SOR=0.159;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,14:0.15:92
chr3	189712094	rs139834656	A	AAAAC	212.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.22;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=0.037;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,10:0.15:66
chr3	189713205	rs9821880	T	C	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.31;ReadPosRankSum=0.720;SOR=0.629;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:239,37:0.13:276
chr3	189838018	rs35346557	G	T	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=1.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.66;ReadPosRankSum=-0.243;SOR=0.947;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,8:0.12:66
chr3	190026383	rs12629166	C	T	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=29;PP=854;SC=TCTGAACATACACGCCAAAGA;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=190026391;WS=190026373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	190030680	rs9869263	A	G	11232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=268;NR=116;PP=2965;SC=GAAATATCGCACCCCCAATGA;SOR=1.778;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=385;TCF=269;TCR=116;TR=384;WE=190030688;WS=190030670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,397:1.00:397
chr3	190040008	rs17429833	C	G	2312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.6595;FS=2.207;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=69;PP=1926;ReadPosRankSum=0.923;SC=CTCGCTCGGGCGCCCGCGCTG;SOR=0.255;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=90;TCF=9;TCR=81;TR=78;WE=190040016;WS=190039998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,78:0.87:90
chr3	190157898	rs6767754	G	A	3557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.125;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.509;NF=113;NR=1;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.548;SC=ACTCTCCTCAGTGCAGGCCTT;SOR=2.649;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=145;TCF=143;TCR=2;TR=114;WE=190157906;WS=190157888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,116:0.78:148
chr3	190158168	rs35161724	G	C	3837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=122;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.337;SC=AAAACCAGCAGCAGGAGGATC;SOR=0.718;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=155;TCF=4;TCR=151;TR=126;WE=190158176;WS=190158158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,125:0.81:154
chr3	190167533	rs10513852	C	T	11852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=520;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.817;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=291;NR=134;PP=2962;ReadPosRankSum=0.813;SC=CCTGGAATAGCGGCAAACACA;SOR=0.571;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=504;TCF=348;TCR=156;TR=425;WE=190167541;WS=190167523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,436:0.85:514
chr3	190282197	rs6764468	G	A	8725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=221;PP=2965;SC=GTAGGGTAATGAGTCCACTCT;SOR=3.602;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=259;TCF=38;TCR=221;TR=259;WE=190282205;WS=190282187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr3	190333162	rs35429399	TG	T	68.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=3.998;QD=0.55;ReadPosRankSum=-0.657;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,14:0.11:124
chr3	190338039	rs11368884	C	CT	806.92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=0.045;QD=17.54;ReadPosRankSum=0.544;SOR=3.109;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,39:0.85:46
chr3	190341241	rs4687160	C	A	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.70;ReadPosRankSum=0.780;SOR=0.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:256,34:0.12:290
chr3	190345098	rs34908328	GT	G	1985.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.49;MQRankSum=0.287;QD=24.82;SOR=3.365;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,79:0.99:80
chr3	190347391	rs7611887	C	T	5331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=143;PP=2965;SC=GCACCTAGCCCGACGGCATCT;SOR=4.447;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=14;TCR=143;TR=157;WE=190347399;WS=190347381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
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chr3	190577535	rs9855583	A	G	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=206;ReadPosRankSum=0.838;SC=CATACTAACCAGGTCTACTTT;SOR=0.643;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=52;TCF=26;TCR=26;TR=16;WE=190577543;WS=190577525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
chr3	190577763	rs7640070	G	A	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.297;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=68;ReadPosRankSum=-0.389;SC=ATTTAAGTGTGCTTTTAATAT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=190577771;WS=190577753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr3	190594309	rs9880320	G	A	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=3.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.68;MQRankSum=-0.416;QD=5.81;ReadPosRankSum=0.447;SOR=1.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
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chr3	190594452	rs9842514	A	C	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQRankSum=-3.192;QD=3.07;ReadPosRankSum=0.419;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,4:0.16:25
chr3	190594454	rs9880346	C	T	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQRankSum=-3.192;QD=3.07;ReadPosRankSum=0.449;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,4:0.16:25
chr3	190930196	rs78834434	C	T	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=541;ReadPosRankSum=-0.541;SC=TAGAGATGCACTCAAATATAC;SOR=1.432;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=23;WE=190930204;WS=190930186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr3	190936482	rs9290979	A	C	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=633;ReadPosRankSum=0.104;SC=GCATATGTACATACTTGGAGT;SOR=0.402;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=87;TCF=67;TCR=20;TR=36;WE=190936490;WS=190936472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,38:0.41:93
chr3	190980797	rs7644510	A	G	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.901;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=152;ReadPosRankSum=1.019;SC=ATCACATTACAGCATTGTTAC;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=8;WE=190980805;WS=190980787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr3	190986110	rs10804933	C	T	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=208;ReadPosRankSum=-1.448;SC=TTTTATTCCACAGCAATAGTT;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=10;WE=190986118;WS=190986100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr3	190986388	rs6794154	C	T	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=109;SC=TTAAGTTAATCACAATTAAAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=190986396;WS=190986378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	190991384	rs9857697	G	A	4394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=92;PP=2965;SC=GTGCTGTGCTGCAAGCATTGG;SOR=1.495;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=47;TCR=92;TR=139;WE=190991392;WS=190991374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr3	190991439	rs9877400	T	C	3028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=73;PP=2479;SC=AGATTTAGATTACAACTGTTA;SOR=3.134;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=15;TCR=73;TR=88;WE=190991447;WS=190991429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr3	190995847	rs3214008	T	C	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.057;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=293;ReadPosRankSum=0.656;SC=AGCTTGACTTTATGTTTAACT;SOR=2.093;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=15;WE=190995855;WS=190995837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr3	190999760	.	A	C	233	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=13;NR=0;PP=233;QD=20.5977855806;SC=TGGCTATTAAATAATATTTAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=13;WE=190999768;WS=190999759;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr3	190999790	rs6444533	A	G	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=634;ReadPosRankSum=0.525;SC=CATTATTTCAACAATGGCAGA;SOR=0.866;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=26;WE=190999798;WS=190999780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr3	190999872	rs6444534	G	A	2604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.320;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=31;PP=1948;ReadPosRankSum=-0.602;SC=TGATATGCACGTACCTTGGGT;SOR=0.479;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=152;TCF=108;TCR=44;TR=98;WE=190999880;WS=190999862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,99:0.63:157
chr3	190999917	rs6788319	C	A	2987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.792;HP=6;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=50;PP=2399;ReadPosRankSum=-0.345;SC=TTGTAAAAAACTCAACACGGA;SOR=0.685;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=177;TCF=90;TCR=87;TR=112;WE=190999925;WS=190999907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,112:0.62:180
chr3	190999990	rs6444535	C	T	1928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=52;PP=1571;ReadPosRankSum=0.350;SC=TTAAAAAAAACCTTCTGGACT;SOR=0.638;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=26;TCR=87;TR=68;WE=190999998;WS=190999980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,69:0.60:115
chr3	191047532	rs9847278	A	G	3974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=84;PP=2965;SC=CCGGAGGGAGAGCGCGCGGGA;SOR=1.666;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=42;TCR=85;TR=126;WE=191047540;WS=191047522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr3	191074873	rs188384	C	G	2941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=45;PP=2338;SC=TCCATCTACTCTAGTATGCCG;SOR=0.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=51;TCR=45;TR=96;WE=191074881;WS=191074863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr3	191075012	rs1520203	G	T	1418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.029;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=34;PP=1100;ReadPosRankSum=-1.635;SC=GTTTCTTAGGGCTTAGGTGGG;SOR=1.445;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=86;TCF=36;TCR=50;TR=52;WE=191075020;WS=191075002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,54:0.59:92
chr3	191075656	rs13434281	G	A	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=0;PP=741;ReadPosRankSum=-1.074;SC=ATTATATATTGTTGTTGAGAC;SOR=1.562;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=32;WE=191075664;WS=191075646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,32:0.67:48
chr3	191075902	rs11542549	C	T	1587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.517;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=49;PP=1322;ReadPosRankSum=0.579;SC=TCCAGAAGCGCTACAAAGACC;SOR=0.404;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=89;TCF=9;TCR=80;TR=56;WE=191075910;WS=191075892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,56:0.64:88
chr3	191087546	rs4677632	A	G	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=4.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.53;ReadPosRankSum=0.641;SOR=2.478;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,37:0.62:60
chr3	191087551	rs697905	G	A	2349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.83;SOR=6.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	191093053	rs2028572	T	C	2230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.410;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=39;PP=1804;ReadPosRankSum=-0.371;SC=ACAATCCCCATATTAACAATG;SOR=0.704;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=128;TCF=65;TCR=63;TR=76;WE=191093061;WS=191093043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,79:0.60:131
chr3	191093175	rs2028574	T	A	3136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=24.755;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=54;PP=2430;ReadPosRankSum=-1.599;SC=GAGACTAAGATTAACCATCAG;SOR=0.535;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=172;TCF=81;TCR=91;TR=115;WE=191093183;WS=191093165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,118:0.68:173
chr3	191093310	rs4677728	A	G	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.179;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=32;PP=855;ReadPosRankSum=-2.128;SC=GAGCACAGAAAAAGGAGACAC;SOR=1.933;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=56;TCF=7;TCR=49;TR=35;WE=191093318;WS=191093300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,37:0.64:58
chr3	191093384	rs4677729	A	G	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.121;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=569;ReadPosRankSum=-0.508;SC=CGCAGGTAATAGAGGACAGTC;SOR=2.833;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=24;WE=191093392;WS=191093374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr3	191093434	rs293806	A	G	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=16;PP=517;SC=ACTACAAACCAATGAATTTAA;SOR=2.636;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=191093442;WS=191093424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr3	191093475	rs4677730	T	C	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.622;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=123;ReadPosRankSum=0.573;SC=TCTTTCTCTCTAGTTCATGCT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=191093483;WS=191093465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr3	191097908	rs293812	C	T	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.206;NF=42;NR=2;PP=1030;ReadPosRankSum=0.016;SC=AAAACATCCTCGGTTGTTTTA;SOR=1.346;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=61;TCF=58;TCR=3;TR=44;WE=191097916;WS=191097898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,44:0.72:61
chr3	191097928	rs34031057	G	GT,GTT	1250.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=3.643;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.51;MQRankSum=-0.188;QD=24.05;ReadPosRankSum=-1.324;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:6,26,20:0.50,0.38:52
chr3	191097966	rs293813	T	C	2154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.820;NF=55;NR=26;PP=1700;ReadPosRankSum=-3.197;SC=CCAAGAGTGATGAAAGAAGCT;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=72;TCR=34;TR=81;WE=191097974;WS=191097956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,85:0.77:110
chr3	191098121	rs293814	C	T	1800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=55;PP=1466;ReadPosRankSum=-0.345;SC=TTTTGTGAATCTAGTCCATCT;SOR=1.132;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=82;TCF=6;TCR=76;TR=59;WE=191098129;WS=191098111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,61:0.71:86
chr3	191098539	rs1474188	C	G	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.50;ReadPosRankSum=0.024;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,16:0.23:70
chr3	191098731	rs211043	G	A	2907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.732;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=73;PP=2220;ReadPosRankSum=0.127;SC=GGTAGAGTGTGTTTTGTTTGT;SOR=1.260;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=153;TCF=53;TCR=100;TR=107;WE=191098739;WS=191098721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,112:0.69:162
chr3	191100448	rs383529	G	T	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=656;ReadPosRankSum=0.980;SC=ATAAACATACGTTAAACTTAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=25;WE=191100456;WS=191100438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr3	191100561	rs364519	C	A	2749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.785;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=25;PP=2304;ReadPosRankSum=-0.179;SC=CAGCAAATTCCAAGTCAAAAG;SOR=0.575;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=145;TCF=111;TCR=34;TR=100;WE=191100569;WS=191100551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,99:0.69:144
chr3	191107192	rs436393	A	G	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.930;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=118;ReadPosRankSum=0.958;SC=TTCATTTCACAAGAAAATGTT;SOR=0.065;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=53;TCF=52;TCR=1;TR=14;WE=191107200;WS=191107182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,17:0.29:58
chr3	191179129	rs200714149	A	C	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=170.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.48;ReadPosRankSum=-2.517;SOR=7.111;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,34:0.26:132
chr3	191888452	rs201475598	GAA	G	488.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=4.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=1.156;QD=9.77;ReadPosRankSum=1.566;SOR=1.888;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chr3	192053274	rs4571187	G	A	1222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=32;PP=951;SC=AAAAAGAAGGGCGGAAAGGAT;SOR=3.912;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=36;WE=192053282;WS=192053264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	192635348	rs9819230	C	G	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=498;ReadPosRankSum=-1.315;SC=CGAGAAGCGGCAATGGGTTTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=21;WE=192635356;WS=192635338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr3	193007560	rs12152269	G	A	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=21;ReadPosRankSum=-0.203;SC=GTTTTGCAGCGACACAATTTG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=193007568;WS=193007550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr3	193016895	rs1878716	T	C	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=92;ReadPosRankSum=-0.649;SC=AAAAACAATATAGTTTTCTTT;SOR=0.180;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=8;WE=193016903;WS=193016885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr3	193017204	.	C	T	31	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=31;QD=32.8856062736;SC=TTCATATTAGCGACAAAAGTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=2;WE=193017212;WS=193017194;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr3	193023585	rs5855481	TA	T	271.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=227;ReadPosRankSum=1.192;SC=GGTCTCTGTTTAATGCTGTCC;SOR=0.540;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=8;WE=193023593;WS=193023575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr3	193031926	rs2280268	C	T	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.544;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=450;ReadPosRankSum=-0.363;SC=ACTTGGCTGCCTGGAGGGATC;SOR=0.262;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=72;TCF=47;TCR=25;TR=24;WE=193031934;WS=193031916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,27:0.35:77
chr3	193036794	rs6788770	G	C	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.35;ReadPosRankSum=0.108;SOR=0.502;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,11:0.21:53
chr3	193042776	rs11926955	T	C	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=326;ReadPosRankSum=-2.154;SC=CAGCCTGGCCTGAGGCAAAGC;SOR=0.507;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=55;TCF=9;TCR=46;TR=21;WE=193042784;WS=193042766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,21:0.37:57
chr3	193044923	rs1387700	T	C	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=259;ReadPosRankSum=0.174;SC=AAAACCCAAGTTTCTAAGATA;SOR=0.620;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=1;TCR=56;TR=15;WE=193044931;WS=193044913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,18:0.31:59
chr3	193051401	rs11718268	C	T	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=300;ReadPosRankSum=-0.141;SC=AGAACATTTCCGCTGTCTAAG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=13;WE=193051409;WS=193051391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr3	193062906	rs6444706	G	A	2324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=64;PP=1858;SC=GATAGTTCATGTTCTGAAAAC;SOR=5.255;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=4;TCR=64;TR=68;WE=193062914;WS=193062896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	193068800	rs1038719	G	A	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=1;PP=818;ReadPosRankSum=-1.577;SC=AATACCATGGGCTTTACTTCT;SOR=0.641;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=52;TCF=51;TCR=1;TR=35;WE=193068808;WS=193068790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,36:0.67:54
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chr3	193071888	rs11300573	CA	C	1786.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.110;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.164;NF=69;NR=13;PP=1160;ReadPosRankSum=-1.614;SC=TCTATTTTTTCAAAAAAAAAA;SOR=0.529;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=119;TCR=23;TR=82;WE=193071896;WS=193071878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,87:0.67:129
chr3	193080344	rs12636830	C	T	1366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=41;PP=963;ReadPosRankSum=-0.410;SC=GGTGACAAAACATTGTACTTA;SOR=0.517;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=198;TCF=70;TCR=128;TR=66;WE=193080352;WS=193080334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,68:0.33:204
chr3	193080414	rs6797429	C	G	1587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.046;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=48;PP=1286;ReadPosRankSum=-0.068;SC=TTCTGCACTTCCATGCACCGC;SOR=1.643;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=85;TCF=14;TCR=71;TR=56;WE=193080422;WS=193080404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,56:0.64:87
chr3	193081122	rs12637558	G	T	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.118;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=387;ReadPosRankSum=-0.513;SC=CTTCAGTGTGGATAAGTAGAG;SOR=0.976;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=91;TCF=22;TCR=69;TR=27;WE=193081130;WS=193081112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,30:0.31:96
chr3	193081206	rs2367605	G	A	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=33;PP=760;ReadPosRankSum=0.027;SC=AAATTCTCAAGTGTTATTCAG;SOR=1.931;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=33;WE=193081214;WS=193081196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,33:0.72:46
chr3	193081830	rs923496	A	G	1535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=0;PP=1258;SC=CCACAGAGTTATGCCACAGAG;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=43;WE=193081838;WS=193081820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	193081866	rs4386441	T	A	2300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=14;PP=1867;SC=CGATCATGGCTTTCAAAATAG;SOR=2.864;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=59;TCR=14;TR=73;WE=193081874;WS=193081856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr3	193082138	rs923494	T	C	1888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=6.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=54;PP=1528;ReadPosRankSum=1.299;SC=TTTCTTTCAATAAACCAAACT;SOR=0.785;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=93;TCF=11;TCR=82;TR=62;WE=193082146;WS=193082128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,64:0.67:96
chr3	193090101	rs57458521	A	AGG,AAAAAAAGG,AAAGG	1498.73	.	AC=1,1,0;AF=0.500,0.500,0.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=20;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=17;NR=8;PP=568;SC=AAAAAAAAAAAGGGGGAAGTT;SOR=1.981;SbPval=0.01;Source=Platypus;TC=72;TCF=63;TCR=9;TR=25;WE=193090109;WS=193090091;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.50,0.50:12
chr3	193090255	rs2171848	C	T	2002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.54;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr3	193090260	rs6444712	T	C	1931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.99;SOR=5.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr3	193096529	rs4687419	C	T	1535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=39;PP=1258;SC=ACTCAACCGGCGAGGATCTCT;SOR=3.306;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=46;WE=193096537;WS=193096519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr3	193120359	rs142743757	GA	G	288.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=331;ReadPosRankSum=0.765;SC=GATGTTACAAGAGTCTCATTT;SOR=0.350;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=10;WE=193120367;WS=193120349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr3	193120726	rs62285692	C	T	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=-1.180;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr3	193153562	rs1996735	T	C	2388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=71;PP=1822;SC=GATAAAGACATGAAAGTAATG;SOR=3.664;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=11;TCR=72;TR=82;WE=193153570;WS=193153552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr3	193175017	rs114840163	G	A	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=214;ReadPosRankSum=2.617;SC=CACTCCTTCCGTAATATTCAT;SOR=1.022;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=10;WE=193175025;WS=193175007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr3	193180400	rs56312820	A	C	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.23;ReadPosRankSum=-1.848;SOR=0.048;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,7:0.17:42
chr3	193182715	rs12696666	T	G	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=136;ReadPosRankSum=-1.060;SC=AGAATAAGGATGAAACACACA;SOR=0.735;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=9;WE=193182723;WS=193182705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,10:0.27:37
chr3	193183039	rs7617230	T	C	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.10;ReadPosRankSum=-2.369;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr3	193183817	rs3796181	A	G	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.824;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=420;ReadPosRankSum=0.924;SC=AGCTTACCCCACTAAGCACAT;SOR=1.002;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=91;TCF=49;TCR=42;TR=30;WE=193183825;WS=193183807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,31:0.34:90
chr3	193201582	rs9842836	C	A	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=11;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=77;ReadPosRankSum=-0.678;SC=AAAAAAAAAACTTAAGTTCCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=6;WE=193201590;WS=193201575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr3	193209178	rs6788448	T	C	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.960;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=491;ReadPosRankSum=-0.415;SC=TAGGCCCACATATTAACCTCC;SOR=0.509;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=82;TCF=25;TCR=57;TR=26;WE=193209186;WS=193209168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,26:0.31:85
chr3	193210768	rs2130407	A	G	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=38;ReadPosRankSum=0.802;SC=TGGCAGAACTAAGCCAGTCTT;SOR=0.760;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=4;WE=193210776;WS=193210758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr3	193272442	rs58073069	CGTGTGT	C,CGT	603.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.25;QD=35.51;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,8,9:0.47,0.53:17
chr3	193332420	rs145894722	C	CTGTG	765.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=805;ReadPosRankSum=0.488;SC=ACGTATGGGGCTGTGTTTCCT;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=16;WE=193332428;WS=193332418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr3	193334991	rs7624750	G	A	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=675;ReadPosRankSum=-0.776;SC=GCCCTTCCTAGTTCAGAAGAC;SOR=0.804;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=32;WE=193334999;WS=193334981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,37:0.59:63
chr3	193336639	rs3772393	T	C	1808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.782;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=19;PP=1301;ReadPosRankSum=0.923;SC=ATGTAAAGGGTTGCATATTTA;SOR=0.846;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=99;TCF=66;TCR=33;TR=61;WE=193336647;WS=193336629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,67:0.63:107
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chr3	193355102	rs10451941	T	C	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=735;ReadPosRankSum=1.620;SC=AACTTGCCAATTAGCAAAAAA;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=23;TCR=37;TR=34;WE=193355110;WS=193355092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,35:0.56:63
chr3	193361917	rs77303706	G	A	1987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.266;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=61;PP=1600;ReadPosRankSum=0.458;SC=TCTTTGTTGCGAGAATAGATT;SOR=1.482;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=120;TCF=22;TCR=98;TR=72;WE=193361925;WS=193361907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,73:0.60:121
chr3	193363267	rs77539393	T	C	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=255;ReadPosRankSum=1.841;SC=TATTTTGCTTTCTAAATTGTA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=11;WE=193363275;WS=193363257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr3	193365974	rs9831900	T	G	1605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.179;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=49;PP=1236;ReadPosRankSum=0.630;SC=TTAATGTTGTTTGCTAACTAA;SOR=0.517;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=91;TCF=12;TCR=79;TR=57;WE=193365982;WS=193365964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,59:0.63:93
chr3	193374964	rs9851685	T	C	3085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=55;PP=2139;ReadPosRankSum=0.740;SC=TTAAAGAGGCTGTTAAGGAAG;SOR=0.720;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=186;TCF=100;TCR=86;TR=122;WE=193374972;WS=193374954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,123:0.66:187
chr3	193383973	rs10804957	A	G	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=396;ReadPosRankSum=1.274;SC=GGTAAATCTGAGTACTTTTTA;SOR=2.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=16;WE=193383981;WS=193383963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,18:0.82:22
chr3	193384203	rs10937595	T	A	2207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.291;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=58;PP=1809;ReadPosRankSum=-0.310;SC=GACTGCAGTCTTATTTTGACA;SOR=1.275;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=117;TCF=35;TCR=82;TR=80;WE=193384211;WS=193384193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,81:0.67:121
chr3	193386239	rs12494482	C	T	4632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.479;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=70;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.449;SC=CATGGAGTCCCTTTTACTGAG;SOR=0.761;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=256;TCF=146;TCR=110;TR=167;WE=193386247;WS=193386229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,167:0.64:259
chr3	193854148	rs76508827	TA	T	141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=-0.822;QD=1.79;ReadPosRankSum=0.232;SOR=0.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,19:0.24:79
chr3	194061826	rs11711157	C	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.708;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=64;ReadPosRankSum=1.577;SC=TCGATAGACACGGTGAGCCGC;SOR=0.358;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=8;WE=194061834;WS=194061816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr3	194061906	rs4974538	T	C	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=19;PP=1312;SC=GGAGCCCTGCTGAGGAGAGAG;SOR=1.316;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=55;WE=194061914;WS=194061896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr3	194062519	rs3732477	C	T	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.634;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=769;ReadPosRankSum=-0.107;SC=GTGCCCTCAGCGACAGTCTCC;SOR=1.220;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=136;TCF=84;TCR=52;TR=45;WE=194062527;WS=194062509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,48:0.34:141
chr3	194062565	rs3732476	C	T	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=21;PP=907;ReadPosRankSum=0.686;SC=CAACCAGGCACGGGGTGTGGG;SOR=0.572;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=158;TCF=99;TCR=59;TR=53;WE=194062573;WS=194062555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,56:0.34:166
chr3	194063300	rs62288099	T	C	4353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=66;NR=85;PP=2965;SC=GGATGTCCAGTGGGACGGTGG;SOR=0.988;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=152;TCF=67;TCR=85;TR=151;WE=194063308;WS=194063290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr3	194118874	rs1223989	T	C	5460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=65;PP=2965;SC=TGGGCAGGCCTAGCGCGGAGA;SOR=1.311;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=100;TCR=65;TR=165;WE=194118882;WS=194118864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr3	194309210	rs3732473	G	A	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=117;ReadPosRankSum=-0.163;SC=GTTACTGAACGAACTCCTGAC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=7;WE=194309218;WS=194309200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr3	194313832	rs1773184	T	C	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=375;ReadPosRankSum=1.000;SC=ACAGAAAAAGTGTTGGACAGA;SOR=0.649;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=19;TCR=51;TR=26;WE=194313840;WS=194313822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,26:0.37:71
chr3	194324939	rs6768028	A	G	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.175;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=135;ReadPosRankSum=-1.467;SC=ACAGCTGCACAAGCCCCAAGG;SOR=0.058;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=12;WE=194324947;WS=194324929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,12:0.29:42
chr3	194324982	rs745171	C	A	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.385;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=355;ReadPosRankSum=-1.793;SC=ACGATGGCACCCACGCACCCG;SOR=1.547;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=67;TCF=52;TCR=15;TR=20;WE=194324990;WS=194324972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,22:0.30:74
chr3	194325010	rs745168	G	A	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=467;ReadPosRankSum=1.815;SC=GGCAACAGCCGTGTACCTCCA;SOR=1.148;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=92;TCF=64;TCR=28;TR=25;WE=194325018;WS=194325000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,29:0.29:101
chr3	194325325	rs708632	C	T	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.525;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=48;ReadPosRankSum=-0.389;SC=GGCCATCCAGCTCTCCCCAGG;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=194325333;WS=194325315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr3	194337708	rs10933663	T	G	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.162;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=148;ReadPosRankSum=-0.878;SC=ACCACTCCCTTACTGCTGGGA;SOR=0.223;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=8;WE=194337716;WS=194337698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr3	194337901	rs922282	T	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.041;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=173;ReadPosRankSum=2.035;SC=CTCAGGGTGCTGGTCGTGGGC;SOR=1.128;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=34;TCF=18;TCR=16;TR=14;WE=194337909;WS=194337891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr3	194338423	rs12695036	CG	TC	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=7.225;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.98;ReadPosRankSum=-0.231;SOR=2.463;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,13:0.19:69
chr3	194346489	rs57336915	G	C	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=6.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.496;NF=20;NR=0;PP=365;ReadPosRankSum=-0.224;SC=GATTCCAGGCGTGAGCCACCG;SOR=0.591;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=63;TCR=1;TR=20;WE=194346497;WS=194346479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,21:0.30:70
chr3	194346544	rs1773191	T	A	1487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=2.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.136;SOR=1.000;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,44:0.29:153
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chr3	194346803	rs1773189	A	G	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.549;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=286;ReadPosRankSum=-0.017;SC=ACCCTGTATCACATGGGTTAC;SOR=0.035;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=60;TCF=1;TCR=59;TR=17;WE=194346811;WS=194346793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,17:0.28:61
chr3	194353772	rs11273892	C	CCCGCCCGACAG	970.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=2;PP=2942;SC=CGCCCGTTTCCCCGCCCGACA;SOR=2.833;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=10;WE=194353780;WS=194353762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	194353875	rs1675955	G	T	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.549;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=32;ReadPosRankSum=-0.638;SC=CAGACGCGGTGGCGGGCGAAG;SOR=2.556;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=29;TCF=14;TCR=15;TR=6;WE=194353883;WS=194353865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr3	194369579	rs3821402	CC	AA	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=874;ReadPosRankSum=1.003;SC=TCCCTCCTCCCCATGGCATAC;SOR=0.801;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=57;TCF=9;TCR=48;TR=21;WE=194369588;WS=194369569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,21:0.38:56
chr3	194371496	rs1773206	G	A	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=105;ReadPosRankSum=0.274;SC=AACTTGTGCAGATCACTAGTA;SOR=0.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=7;WE=194371504;WS=194371489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr3	194373832	rs1675953	TG	CA	13360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=137;NR=139;PP=2947;SC=TGTCCAAACTTGGTTGTGTTG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=283;TCF=139;TCR=144;TR=276;WE=194373841;WS=194373822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr3	194379567	rs1675948	A	G	1243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=0;PP=1040;SC=CAGCACACAGAGGAAAAACTC;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=194379575;WS=194379557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr3	194379596	rs1705971	C	A	1586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=1;PP=1262;SC=ACAGATTTTCCATAAGAATAA;SOR=6.358;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=45;WE=194379604;WS=194379586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	194379646	rs11438897	T	TC	4491.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=28;PP=2936;SC=AAATCAAAATTCCCTCTTTGA;SOR=2.488;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=85;TCR=31;TR=107;WE=194379654;WS=194379636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr3	194379905	rs11357453	TA	T	692.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=649;SC=TTCAAACAAGTAAAAAAATGA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=24;WE=194379913;WS=194379895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	194381530	rs1705969	A	G	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=3;PP=875;SC=CGTATAAGAAAGTACAGCAAT;SOR=4.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=33;WE=194381538;WS=194381520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	194381680	rs1675947	G	A	1106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=27;PP=945;SC=CTCTGTGCTAGATGTTATAAA;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=194381688;WS=194381670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	194381716	rs1705968	G	C	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=20;PP=586;SC=CCGCTGGGAGGACATAAGCTA;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=194381724;WS=194381706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	194381742	rs1705967	C	T	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=446;SC=GCATGACTACCTCACGGCAGA;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=194381750;WS=194381732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr3	194386136	rs1705966	C	T	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=591;SC=ACAAAATATACGGTAGTATCA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=194386144;WS=194386126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	194386881	rs1675944	A	G	3230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=36;PP=2533;SC=CATGCCAAATATCTGAACTCA;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=62;TCR=36;TR=98;WE=194386889;WS=194386871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr3	194387300	rs1675943	C	T	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=35;PP=758;ReadPosRankSum=0.726;SC=TATTAAGTTTCTCTGTTCAAA;SOR=1.299;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=111;TCF=10;TCR=101;TR=37;WE=194387308;WS=194387290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,38:0.34:113
chr3	194390617	rs1773230	G	C	2684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=7;PP=2229;SC=CTGATATCACGCCACTGCACT;SOR=4.487;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=70;TCR=7;TR=77;WE=194390625;WS=194390607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr3	194390713	rs1675926	C	A	8341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=165;NR=96;PP=2965;SC=ACAGTCTCACCTGCACTCAGC;SOR=1.338;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=261;TCF=165;TCR=96;TR=261;WE=194390721;WS=194390703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr3	194390869	rs36028600	G	GA	3069.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=80;PP=2897;SC=GTGCAACTATGAAAAAACACA;SOR=3.890;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=100;TCF=9;TCR=91;TR=86;WE=194390877;WS=194390859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr3	194392683	rs1773231	A	C	2859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=8;PP=2306;SC=TCATCCTTCAAAACCCGGCTG;SOR=4.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=77;TCR=8;TR=85;WE=194392691;WS=194392673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr3	194392761	.	AAAGAT	A	3064.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.000;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.039;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=5.027;NF=28;NR=34;PP=2625;ReadPosRankSum=-0.595;SC=GCTAGACAGAAAAGATAAGAA;SOR=0.619;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=195;TCF=94;TCR=101;TR=62;WE=194392773;WS=194392751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,88:0.37:238
chr3	194408704	rs4677673	A	G	1582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.282;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=35;PP=1240;ReadPosRankSum=-0.417;SC=GCCTGCTGTCAGGCGACAGCA;SOR=0.362;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=85;TCF=33;TCR=52;TR=62;WE=194408712;WS=194408694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,63:0.72:88
chr3	194790434	rs3796159	C	G	1759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.319;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=6;PP=1345;ReadPosRankSum=1.292;SC=GGGCAAGGCACGGGGAGCGCC;SOR=1.038;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=81;TCF=71;TCR=10;TR=54;WE=194790442;WS=194790424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,60:0.68:88
chr3	194991022	rs62285259	G	C	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=187;ReadPosRankSum=-0.486;SC=ACTCTCCTGGGGGCTGCGCTT;SOR=0.693;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=12;WE=194991030;WS=194991012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr3	194991220	rs7640099	AA	GC	320.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=385;SC=CCGGGAGCGCAAACTGACCTC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=194991229;WS=194991210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	194999996	rs7610022	T	A	1589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=7;PP=1232;SC=AAAATTGTGATTTTTTAGCTG;SOR=3.080;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=45;WE=195000004;WS=194999986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr3	195013220	.	C	T	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.732;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=37;PP=999;ReadPosRankSum=-0.523;SC=AAAATGAGCTCTTGGCAGAAA;SOR=0.840;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=38;WE=195013228;WS=195013210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,39:0.71:55
chr3	195022534	rs2275519	G	T	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.623;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=337;ReadPosRankSum=-0.345;SC=GTCCTCAACAGCTTTTACAAA;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=16;WE=195022542;WS=195022524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,17:0.33:51
chr3	195028183	rs13059843	G	A	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=696;ReadPosRankSum=1.240;SC=TTAGAAACAGGGGTTATCAAT;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=28;WE=195028191;WS=195028173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,32:0.70:46
chr3	195029738	rs10636354	G	GAAAGT	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=542;SC=GAAAACTACTGAAAGAACAAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=195029746;WS=195029728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	195053916	rs62287109	C	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=137;ReadPosRankSum=1.459;SC=TGAAATATTACATATATATAT;SOR=0.119;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=10;WE=195053924;WS=195053906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,10:0.25:40
chr3	195076877	rs6437374	C	G	5613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=81;PP=2965;SC=CCCATGCGCTCGTAGCAACCA;SOR=0.796;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=173;TCF=91;TCR=82;TR=172;WE=195076885;WS=195076867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr3	195102787	rs2275518	T	C	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=283;ReadPosRankSum=-0.913;SC=AGGTTGAAGATAGTTTTACAA;SOR=0.165;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=14;WE=195102795;WS=195102777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr3	195133474	rs57063250	G	A	342.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=4.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.57;ReadPosRankSum=-0.141;SOR=0.119;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,10:0.25:40
chr3	195133475	rs10645683	T	TAAC	333.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.141;SOR=0.119;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,10:0.25:40
chr3	195245805	rs17847362	G	A	3577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=39;PP=2843;SC=ACATTTTCCAGACATCTAACC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=71;TCR=39;TR=110;WE=195245813;WS=195245795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr3	195295661	rs7659	C	T	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.455;NF=11;NR=0;PP=220;ReadPosRankSum=-0.443;SC=GTTACATGTTCAGGTCAACTT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=11;WE=195295669;WS=195295651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr3	195295702	.	T	TGGCG	328	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=10;HapScore=3;MGOF=9;MMLQ=25;MQ=61.56;NF=11;NR=2;PP=328;QD=26.1538461538;SC=TTTGTCTTTATGGGGGGGGGG;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=13;WE=195295716;WS=195295692;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:23,13:0.36:36
chr3	195295704	.	G	GC	172.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.504;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=11.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.00;MQRankSum=0.000;QD=7.20;ReadPosRankSum=-1.101;SOR=0.031;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr3	195295708	rs142189206	G	GGGT	223.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=4.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.99;ReadPosRankSum=-0.593;SOR=0.120;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr3	195300676	rs1568566	A	G	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=1;PP=619;SC=GTCACTCTGCATCAGCACTCC;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=195300684;WS=195300666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	195306055	rs4677691	A	G	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=5.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=0;PP=701;ReadPosRankSum=0.722;SC=TGCAGTCTTTATCTCAGCAGA;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=28;WE=195306063;WS=195306045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr3	195345953	rs145174488	C	T	5302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FS=69.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.64;MQRankSum=-4.632;QD=22.66;ReadPosRankSum=-1.808;SOR=2.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,193:0.82:234
chr3	195346623	rs78469087	A	G	9504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=200;NR=105;PP=2965;SC=TGATGCCACGATTGGGACCCC;SOR=1.509;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=305;TCF=200;TCR=105;TR=305;WE=195346631;WS=195346613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr3	195346665	rs73212302	G	A	11083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=187;NR=166;PP=2965;SC=AGAAAGAGAAGTGACAGCACC;SOR=0.841;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=353;TCF=187;TCR=166;TR=353;WE=195346685;WS=195346655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,359:1.00:359
chr3	195346677	rs73214503	G	A	10543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=167;NR=163;PP=2965;SC=GACAGCACCCGGGGCCACGAC;SOR=0.748;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=330;TCF=167;TCR=163;TR=330;WE=195346685;WS=195346655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,337:1.00:337
chr3	195346861	rs116014205	T	C	6074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=76;PP=2965;SC=TACAGCCCCTTGGAAGCCGCC;SOR=1.511;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=202;TCF=126;TCR=76;TR=202;WE=195346869;WS=195346851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr3	195395272	rs62287988	C	T	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.12;QD=26.89;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	195395328	rs62287989	T	C	252.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.91;QD=31.60;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	195395399	rs62287990	G	A	192.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.41;QD=38.58;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	195395402	rs199554501	C	A	192.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.41;QD=38.58;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr3	195395549	rs58717446	C	CAT	2051.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=1.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.07;MQRankSum=-3.939;QD=29.31;ReadPosRankSum=-1.357;SOR=0.993;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,53:0.76:70
chr3	195395564	rs78351752	C	T	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=3.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.36;MQRankSum=-3.780;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.204;SOR=1.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,37:0.70:53
chr3	195399487	rs113921519	G	A	765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.96;QD=31.91;SOR=6.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr3	195399505	rs2280577	C	T	951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=33.99;SOR=6.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	195399599	rs2461859	T	C	1335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.73;QD=29.68;SOR=0.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr3	195399620	rs9840981	C	G	1658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=43;PP=1597;SC=TCGCAGTTGTCTCTTTAGATC;SOR=1.524;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=20;TCR=43;TR=63;WE=195399628;WS=195399610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr3	195399678	rs9874761	G	T	1170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=39;PP=1196;SC=TGTATTGTTTGCTAAATTGCA;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=42;WE=195399686;WS=195399668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	195400728	rs12107841	A	G	148.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=66;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQ=40.38;NF=6;NR=0;PP=115;SC=GATTGTGCCCAGCCTGTACGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=195400736;WS=195400718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	195400795	rs7615357	C	T	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.18;QD=44.16;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	195400799	rs7635172	G	A	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.91;QD=44.16;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr3	195400814	.	C	CTT	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.68;QD=40.86;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	195400822	rs56170658	G	A	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.64;QD=47.10;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	195400841	rs7615369	C	A	142.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.27;QD=35.51;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr3	195400848	rs7635190	G	A	142.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.03;QD=47.34;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	195400918	rs55992531	C	CT	296.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=8;PP=250;SC=AGTCTTTTTTCTTTTTTTTTG;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=12;WE=195400926;WS=195400908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	195412616	rs113588870	T	A	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.01;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr3	195412621	rs113400760	C	T	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.01;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr3	195412634	rs111310752	A	T	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.80;QD=24.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr3	195447805	.	T	C	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.414;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.087;NF=9;NR=0;PP=192;ReadPosRankSum=1.159;SC=CCCTCCTCCCTGGTTTGAGGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=9;WE=195447813;WS=195447795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr3	195447886	rs7627924	G	C	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.376;NF=24;NR=15;PP=835;ReadPosRankSum=0.564;SC=AGGATGGGCTGTCTCTGGGGT;SOR=0.848;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=39;WE=195447894;WS=195447876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,39:0.68:57
chr3	195451841	rs201228126	G	A	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.41;MQRankSum=-1.566;QD=29.67;ReadPosRankSum=-0.056;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr3	195451880	rs142096782	AG	GA	3751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.13;QD=44.66;SOR=2.861;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr3	195452951	rs2688542	G	C	10366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=4.728;NF=209;NR=112;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.048;SC=AGCTGCACCTGATGCCACGGT;SOR=0.653;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=333;TCF=213;TCR=120;TR=321;WE=195452959;WS=195452941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,322:0.99:326
chr3	195453064	rs2550233	T	G	9148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=88;NR=201;PP=2965;SC=GGAATCCCCTTGAAGAAACCT;SOR=1.860;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=290;TCF=88;TCR=202;TR=289;WE=195453072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr3	195453243	rs3828408	C	T	6533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.372;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-1.544;NF=129;NR=91;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.123;SC=TCAGAGACACCGACCATGGAC;SOR=1.198;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=221;TCF=129;TCR=92;TR=220;WE=195453265;WS=195453233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,207:1.00:208
chr3	195453257	rs3828406	G	A	5938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.945;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-1.302;NF=108;NR=88;PP=2965;ReadPosRankSum=1.611;SC=CATGGACATCGCAACCAAGGG;SOR=0.908;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=197;TCF=108;TCR=89;TR=196;WE=195453265;WS=195453233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,190:0.99:191
chr3	195474159	rs62284986	G	A	4739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=93;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.651;SC=GCCGCCCAGGGCCCCAAAGAA;SOR=0.477;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=62;TCR=95;TR=155;WE=195474167;WS=195474149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,157:0.99:158
chr3	195476085	rs2688497	A	G	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=25;PP=684;SC=TCAGATCAGCATGGTGGATAA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=195476093;WS=195476075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	195477713	rs2291654	G	A	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=247;SC=CTGTTTGCCCGCCCCCCGCAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=195477721;WS=195477703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	195478012	rs2291651	G	C	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=5;PP=270;SC=GTGAGGGGGGGTGGGGGGCTG;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=10;WE=195478020;WS=195478002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	195478188	rs2291650	G	A	2128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=54;PP=1696;SC=GGCCCCATCCGGGGGGGAGAC;SOR=2.406;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=14;TCR=55;TR=68;WE=195478196;WS=195478178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr3	195479256	rs2258447	T	C	2993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=24;PP=2273;SC=AGGCGTTGACTTCTGCCATGG;SOR=2.019;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=89;TCF=64;TCR=25;TR=88;WE=195479264;WS=195479246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr3	195484244	rs2550270	G	A	1672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=40;PP=1240;SC=GAGACTCCTCGGCTCTGTGGT;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=46;WE=195484252;WS=195484234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	195487737	rs2246771	A	G	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=4;PP=561;SC=AGGCCTCCCCAGGCCTCGGGC;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=195487745;WS=195487727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	195489009	rs2246901	C	A	2690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=36;PP=2074;SC=CTGGCGGAGGCGTGGAGGATG;SOR=1.038;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=53;TCR=36;TR=88;WE=195489017;WS=195488999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr3	195489669	rs2550263	C	T	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=2;PP=1183;SC=ACGCGGCTTCCCGCCCACCTC;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=41;WE=195489677;WS=195489659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	195489930	rs76733630	C	T	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=30;PP=878;SC=GGGAGGAAGGCGCTGGAGGCC;SOR=3.193;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=33;WE=195489938;WS=195489920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr3	195490284	rs2550261	T	C	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=3;PP=420;SC=GCAGGGAGGTTCCCGGCACCC;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=195490292;WS=195490274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr3	195490839	rs28406367	T	A	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=1;PP=234;SC=CTACTCCTTATCCAGATGCCA;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=195490847;WS=195490829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	195490909	rs201624504	C	T	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.378;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=260;ReadPosRankSum=-1.015;SC=TGGGCCCTGTCGCTCACCGGG;SOR=1.721;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=13;WE=195490917;WS=195490899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr3	195491169	.	G	T	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQRankSum=0.566;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr3	195492027	rs11926236	T	C	3053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=71;PP=2331;SC=AGGCCCAGGCTGGGGCTGCCA;SOR=1.813;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=31;TCR=71;TR=102;WE=195492035;WS=195492017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr3	195496129	rs2688492	C	T	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=36;PP=1083;SC=ACGCACAGCACCTGTTCCTGG;SOR=4.514;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=39;WE=195496137;WS=195496119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr3	195496147	rs78471763	A	T	1135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=33;PP=1006;SC=TGGTCTGCCCACAGCAAAGAC;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=35;WE=195496155;WS=195496137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	195497174	rs2259102	C	G	2530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=34;PP=2107;SC=CGTTGTTTGTCATCTTTCTAA;SOR=1.031;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=46;TCR=34;TR=80;WE=195497182;WS=195497164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr3	195497743	rs2260685	T	C	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=734;ReadPosRankSum=-0.506;SC=CTTGTTAGGATAGACCCCCTA;SOR=0.769;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=114;TCF=35;TCR=79;TR=37;WE=195497751;WS=195497733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,38:0.31:121
chr3	195505664	rs2688513	G	A	1942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=16;PP=1507;ReadPosRankSum=1.377;SC=CAGCTACCTGGTGTTTCCATC;SOR=1.040;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=59;WE=195505672;WS=195505654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,61:0.98:62
chr3	195512004	rs148317288	T	G	2281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.31;QD=41.49;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr3	195512042	rs6805660	T	C	4399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=52;PP=2691;SC=CCTGTGGATGTTGAGGAAGGG;SOR=0.797;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=45;TCR=53;TR=97;WE=195512050;WS=195512032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr3	195512107	rs374495657	T	A	4580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=70;PP=2965;SC=AGCATCGGTGTCATGAAGAGC;SOR=1.170;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=39;TCR=70;TR=109;WE=195512115;WS=195512097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr3	195512186	.	T	C	1786	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MMLQ=28;MQ=49.83;NF=11;NR=39;PP=1786;QD=36.4154242509;SC=CCTGTGGATATTGAGGAAGCG;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=11;TCR=40;TR=50;WE=195512194;WS=195512176;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr3	195515568	rs62282504	C	T	3743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=42;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.527;SC=TTTTACCAGACCCTGAAGGTG;SOR=0.535;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=75;TCR=42;TR=116;WE=195515576;WS=195515558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,116:0.99:117
chr3	195515594	rs13095016	C	G	5634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=56;PP=2965;SC=GTGTGGGTCTCGGTTTGTGGA;SOR=1.011;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=80;TCR=56;TR=135;WE=195515602;WS=195515584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr3	195515617	rs2641776	G	C	5555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=70;PP=2965;SC=TGTAAGCCCAGTGGATGTGAT;SOR=0.873;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=131;TCF=61;TCR=70;TR=130;WE=195515625;WS=195515607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr3	195516305	rs3749331	C	T	4019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.512;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=47;PP=2965;ReadPosRankSum=0.393;SC=CTGCTGGGTGCTGCCTGCAGT;SOR=1.299;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=82;TCR=48;TR=129;WE=195516313;WS=195516295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,129:0.99:130
chr3	195516630	rs3103954	G	T	7314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=123;PP=2965;SC=TAATTTGTTGGGATGTGTGTC;SOR=0.849;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=229;TCF=106;TCR=123;TR=229;WE=195516638;WS=195516620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr3	195516878	rs2177336	T	C	3172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=50;PP=2628;SC=GTGCCAGCTGTCCCTGTAGAT;SOR=0.734;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=46;TCR=50;TR=96;WE=195516886;WS=195516868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr3	195517124	rs1806440	G	A	3230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=38;PP=2747;SC=TTTGGAGGTAGAGAACTGGGG;SOR=1.251;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=56;TCR=38;TR=94;WE=195517132;WS=195517114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr3	195517258	rs1106502	G	A	5460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=96;NR=74;PP=2965;SC=GTCTCTGGAGGTTGGCATTCT;SOR=1.013;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=96;TCR=75;TR=170;WE=195517266;WS=195517248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr3	195517321	rs1104760	G	A	6108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=85;PP=2965;SC=AGGGGATGAGGTGGTTGTTTC;SOR=0.887;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=190;TCF=105;TCR=85;TR=190;WE=195517329;WS=195517311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr3	195517553	rs882605	A	C	5687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=100;PP=2965;ReadPosRankSum=1.723;SC=TCTGGATCAAATGTTACTAAG;SOR=0.634;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=71;TCR=102;TR=170;WE=195517561;WS=195517543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,174:0.98:177
chr3	195518112	rs142781032	T	TGTCTCCTGCGTAACA	8223.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=42;PP=2957;SC=CTGGAGGAGCTGTCTCCATCA;SOR=1.077;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=141;TCF=59;TCR=82;TR=74;WE=195518120;WS=195518102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr3	195538501	rs143120396	TTC	T	72.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.48;ReadPosRankSum=1.488;SOR=1.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,8:0.16:49
chr3	195538529	rs62282514	G	A	2376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=32;PP=1918;SC=CTGTCTCCCCGGACCTCTTTC;SOR=1.079;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=46;TCR=32;TR=78;WE=195538537;WS=195538519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr3	195593677	rs73891160	G	C	2125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=2;PP=1740;SC=GGCCTGCGAGGTGTTGGGCTT;SOR=6.091;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=64;TCF=62;TCR=2;TR=62;WE=195593685;WS=195593667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr3	195594805	rs1056749	A	G	3596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=54;PP=2965;SC=GGGGAGGGGAAGCAGGTCCAG;SOR=0.711;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=53;TCR=54;TR=107;WE=195594813;WS=195594795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr3	195594950	rs56260729	G	A	1268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=17;PP=957;ReadPosRankSum=-0.390;SC=AGAGGGGGCCGGGGAGCCGGC;SOR=0.719;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=157;TCF=106;TCR=51;TR=54;WE=195594958;WS=195594940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,56:0.35:162
chr3	195595054	rs7516	C	T	3088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.413;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=58;PP=2461;ReadPosRankSum=-1.210;SC=CACCCTGGGGCGGGAGGAACA;SOR=0.444;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=187;TCF=102;TCR=85;TR=119;WE=195595062;WS=195595044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,121:0.64:188
chr3	195595632	rs13087251	A	G	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=392;ReadPosRankSum=-0.897;SC=AGGGTCTGGGACACGAGGGGA;SOR=0.538;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=21;WE=195595640;WS=195595622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr3	195596501	rs71637188	T	TAG	2733.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.239;NF=12;NR=39;PP=2552;ReadPosRankSum=-0.391;SC=GGGCAGAGTGTAGAGAGACGA;SOR=0.693;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=58;TCF=12;TCR=46;TR=51;WE=195596509;WS=195596491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr3	195596636	rs13084875	C	T	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=2;NR=7;PP=215;SC=TGGAGGAGGCCCCAGGCAGAG;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=195596644;WS=195596626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr3	195596907	rs2278034	T	C	2881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=25;PP=2196;SC=ACAGCAGCCTTAGGGTGGCCT;SOR=2.007;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=61;TCR=25;TR=86;WE=195596915;WS=195596897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
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chr3	195603634	rs11185487	G	A	106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=3;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=95;ReadPosRankSum=1.180;SC=AGGGCGGGGCGGGGCACACCC;SOR=1.981;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=6;WE=195603642;WS=195603624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr3	195603652	rs9815549	T	G	199.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=2;NR=7;PP=201;SC=CCCACAACCCTCCCAGGAGCA;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=195603660;WS=195603642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr3	195612034	rs3747672	T	C	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=13;PP=326;SC=TGCCAAACTGTCAGTGGGGCA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=13;WE=195612042;WS=195612024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	195619254	rs9863553	A	G	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=10;PP=686;SC=ACCAGTCCCCAGCAGTCCAGC;SOR=1.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=35;WE=195619262;WS=195619244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr3	195686899	rs201656277	C	T	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.46;MQRankSum=1.068;QD=17.97;ReadPosRankSum=1.068;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr3	195690397	rs148308206	A	G	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.53;QD=33.20;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr3	195701278	rs200131790	C	T	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=36.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.11;MQRankSum=-5.657;QD=6.40;ReadPosRankSum=1.954;SOR=5.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,18:0.20:91
chr3	195701285	rs201085786	G	T	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=40.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.48;MQRankSum=-6.163;QD=7.26;ReadPosRankSum=0.853;SOR=5.577;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,20:0.21:96
chr3	195701304	rs200047587	C	T	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=32.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.04;MQRankSum=-7.423;QD=9.25;ReadPosRankSum=-2.490;SOR=3.341;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,32:0.26:125
chr3	195701310	.	C	CAA	1310.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.352;ClippingRankSum=0.000;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=16.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.59;MQRankSum=-7.742;QD=9.57;ReadPosRankSum=-3.400;SOR=1.993;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,39:0.28:137
chr3	195701331	rs78212497	G	A	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.691;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.967;NF=29;NR=36;PP=1034;ReadPosRankSum=1.051;SC=GTCCAATAGCGAGTTTGCCCC;SOR=1.009;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=200;TCF=87;TCR=113;TR=65;WE=195701339;WS=195701321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,42:0.27:154
chr3	195701388	rs57251344	GC	AA	2542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.952;NF=9;NR=58;PP=2944;ReadPosRankSum=0.758;SC=CTCCCCACAGGCGTACAGGCC;SOR=0.986;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=118;TCF=17;TCR=101;TR=67;WE=195701397;WS=195701378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,64:0.67:96
chr3	195701472	.	A	G	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.70;MQRankSum=-1.694;QD=4.78;ReadPosRankSum=-0.262;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr3	195701483	rs377526928	TCCA	T	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.27;MQRankSum=-0.021;QD=5.37;ReadPosRankSum=-0.308;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr3	195754164	rs6782834	A	G	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=28;PP=794;SC=TGAGGCAGGCATCAGAAAACA;SOR=6.736;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=195754172;WS=195754154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr3	195780535	rs9809253	C	T	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=38;PP=922;ReadPosRankSum=0.805;SC=AAAAGGAACTCGCAGATAAGC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=0;TCR=52;TR=38;WE=195780543;WS=195780525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,39:0.72:54
chr3	195789414	rs2239641	T	C	1340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.867;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=11;PP=1000;ReadPosRankSum=-0.822;SC=CAAAAAAGTTTACCTGAATTC;SOR=1.569;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=41;WE=195789436;WS=195789404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
chr3	195789428	rs507131	C	A	1604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=14;PP=1321;SC=TGAATTCATACACAGCTAATG;SOR=1.565;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=48;WE=195789436;WS=195789404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	195789708	rs2239640	G	T	5247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=72;PP=2965;ReadPosRankSum=1.025;SC=AATATGGGAAGGGATGATAAA;SOR=0.322;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=96;TCR=72;TR=166;WE=195789716;WS=195789698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,170:0.99:171
chr3	195794788	rs9855973	C	T	2216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.986;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=17;PP=1656;ReadPosRankSum=0.114;SC=TTACTGCTAACGCCCTCCCAG;SOR=0.916;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=83;TCR=24;TR=78;WE=195794796;WS=195794778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,81:0.74:109
chr3	195798258	rs480760	T	C	11572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.99;NF=221;NR=130;PP=2965;SC=ACTGTTTTGCTTTACTTACAG;SOR=1.340;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=353;TCF=222;TCR=131;TR=351;WE=195798266;WS=195798248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,365:1.00:365
chr3	195799148	.	G	C	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.786;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=113;ReadPosRankSum=1.108;SC=AATGAACTGTGACCCAAAACT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=195799156;WS=195799138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr3	195800811	rs3817672	C	T	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=2;PP=810;ReadPosRankSum=1.199;SC=TTGATGGTGCCGGTGAAGTCT;SOR=2.774;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=30;WE=195800819;WS=195800801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,33:0.97:34
chr3	195800887	.	G	A	2326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.710;ClippingRankSum=0.000;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=13;PP=1738;ReadPosRankSum=1.307;SC=GTGCTGCAGGGAAGTCCTCTC;SOR=0.625;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=99;TCF=82;TCR=17;TR=73;WE=195800895;WS=195800877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,81:0.74:110
chr3	195801927	rs200653815	AAAAAAAAAAAT	A	674.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=35.51;ReadPosRankSum=0.465;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,17:0.89:19
chr3	195801938	.	T	A	490	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=22;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=59.52;NF=21;NR=0;PP=490;QD=24.9891053594;SC=AAAAAAAAAATAAGGTACAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=21;WE=195801946;WS=195801917;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,21:0.64:33
chr3	195925355	rs1106479	C	T	1928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.667;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=39;PP=1515;ReadPosRankSum=0.592;SC=CAGGGGCCACCGTCCTCCCTG;SOR=0.763;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=123;TCF=60;TCR=63;TR=74;WE=195925363;WS=195925345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,74:0.59:125
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chr3	195926234	rs939892	T	C	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=1;PP=571;SC=CAAGAGCCTTTGCTGTCATGT;SOR=4.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=195926242;WS=195926231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
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chr3	195937678	rs12718059	G	A	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=340;ReadPosRankSum=-0.574;SC=CCTGTGGCTTGCTCAGGTCAG;SOR=1.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=15;WE=195937686;WS=195937668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
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chr3	195953775	rs68119320	C	T	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=1;PP=572;SC=ATCCGAGGAACAAGCCCAGGC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=195953783;WS=195953765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr3	195954069	rs147316733	A	ACGTCACTTC	1714.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.893;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.698;NF=11;NR=47;PP=808;ReadPosRankSum=-1.883;SC=TAAACTCAGCACGTCACTTCG;SOR=0.567;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=105;TCF=18;TCR=87;TR=58;WE=195954086;WS=195954059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,72:0.69:105
chr3	195954078	rs57985677	C	CCGTCACTTT	715.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.881;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.648;NF=11;NR=46;PP=473;ReadPosRankSum=2.245;SC=CACGTCACTTCGGCAAAGAGT;SOR=0.796;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=102;TCF=16;TCR=86;TR=57;WE=195954086;WS=195954059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,33:0.31:107
chr3	195955178	rs72611184	C	T	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=437;ReadPosRankSum=-0.441;SC=CCCCAGGAGCCGGGGAGCCTC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=19;WE=195955186;WS=195955168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,21:0.78:27
chr3	195955762	rs939885	G	A	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=31;PP=1217;ReadPosRankSum=0.498;SC=CCTGTTTCTCGTCCCCGACGG;SOR=0.661;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=91;TCF=46;TCR=45;TR=64;WE=195955770;WS=195955752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,61:0.69:88
chr3	195956675	rs60276076	C	G	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=362;ReadPosRankSum=0.625;SC=AGTGAGCTATCATTGCACCTC;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=15;WE=195956683;WS=195956665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr3	195956726	rs144375332	AAG	A	458.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.23;MQRankSum=1.236;NF=7;NR=4;PP=393;ReadPosRankSum=0.306;SC=CATCTCTTGAAAGAGAGAGAG;SOR=0.490;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=11;WE=195956735;WS=195956716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr3	195956827	rs17852687	T	C	2094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=36;PP=1492;SC=ACACTTTCCTTGGCGTGTCCA;SOR=0.807;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=31;TCR=36;TR=67;WE=195956835;WS=195956817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr3	195956970	rs67261052	C	T	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.264;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=636;ReadPosRankSum=-0.636;SC=GTTTCATAACCGAGCTACAGA;SOR=0.904;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=31;WE=195956978;WS=195956960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,34:0.77:44
chr3	195959859	rs56867360	C	T	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=227;ReadPosRankSum=-0.555;SC=GCTCAACTCCCGTGCCCGGGC;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=10;WE=195959867;WS=195959853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr3	195959924	rs1476331	T	C	1714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=4;PP=1218;SC=TATTTCACCCTACACTGCAGT;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=45;WE=195959932;WS=195959914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr3	195960225	rs9343	A	G	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=35;PP=1023;SC=ACAATGTTAGAATAAAATTGC;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=36;WE=195960233;WS=195960215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr3	195968281	rs57987393	A	G	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=238;ReadPosRankSum=-0.144;SC=CTGGTCTCAAACTCCTGGCCT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=10;WE=195968289;WS=195968272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr3	195968643	rs1045075	G	A	2963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=60;PP=2608;SC=AGACCGTAACGGCAGAAACTG;SOR=1.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=27;TCR=60;TR=87;WE=195968651;WS=195968633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr3	195975284	rs3772107	C	G	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.674;NF=0;NR=9;PP=187;ReadPosRankSum=-1.048;SC=ACTCTGTCACCCAGGCTGGAG;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=9;WE=195975292;WS=195975274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr3	196022750	rs2293160	T	C	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=1;PP=666;ReadPosRankSum=-0.703;SC=AGTAAAATCATTTCATTCACA;SOR=0.662;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=30;WE=196022758;WS=196022740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,31:0.67:46
chr3	196042137	rs34104361	CT	C	165.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQRankSum=0.087;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.093;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr3	196044894	rs2270769	G	C	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.222;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=6;PP=710;ReadPosRankSum=-0.250;SC=CCCCGCCACAGCCCGTCCTCT;SOR=1.092;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=72;TCF=57;TCR=15;TR=41;WE=196044902;WS=196044884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,43:0.61:71
chr3	196051087	rs147354585	GTC	G	152.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=17.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=2.619;QD=1.41;ReadPosRankSum=-0.514;SOR=1.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,14:0.13:108
chr3	196054439	rs6785339	T	G	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=21;PP=665;SC=TGAGCTTGCCTGCGTGCAGGG;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=196054447;WS=196054429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	196054488	rs6782336	A	G	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=12;PP=370;SC=AGGGAGTCGCAGCAGCTCTGC;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=196054496;WS=196054478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	196088809	rs368893517	TA	T	154.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=6.355;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.01;MQRankSum=1.545;QD=2.71;ReadPosRankSum=-0.074;SOR=0.144;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,17:0.30:57
chr3	196096232	.	C	T	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.093;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=417;ReadPosRankSum=-1.069;SC=AAAGATCAATCATTTAGGTAA;SOR=1.402;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=21;WE=196096240;WS=196096222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr3	196096451	rs9860931	C	T	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=441;SC=CCTTCTTATACACCAACATCA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=196096459;WS=196096441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	196118621	rs6583305	A	T	1948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.608;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=13;PP=2216;ReadPosRankSum=-0.168;SC=GTAATTTTTTAAAAAAAGGCA;SOR=0.031;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=122;TCF=109;TCR=13;TR=91;WE=196118629;WS=196118611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,87:0.73:119
chr3	196118849	rs11335716	GA	G	101.76	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=2.167;QD=6.78;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr3	196118868	rs6779332	A	C	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=18;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=31;PP=904;SC=AAAAAAAAAAACACAAACTTC;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=196118876;WS=196118858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr3	196130005	rs6799210	A	G	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=71;ReadPosRankSum=-0.772;SC=GAAGCACAGTAATAATAAGTT;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=6;WE=196130013;WS=196129995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr3	196134294	.	TA	T	110.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=2.674;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQRankSum=-0.935;QD=2.64;ReadPosRankSum=1.541;SOR=1.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr3	196158468	rs10532490	TCC	T	1161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.231;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.978;NF=26;NR=1;PP=1039;ReadPosRankSum=-1.365;SC=CGCCATCGTCTCCGTCTTTAT;SOR=3.426;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=27;WE=196158477;WS=196158458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,30:0.70:43
chr3	196158773	rs6583309	G	A	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.967;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=432;ReadPosRankSum=-0.573;SC=GGCCGGGGAAGAAAGGAAAAA;SOR=0.862;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=73;TCF=38;TCR=35;TR=21;WE=196158781;WS=196158763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,21:0.28:76
chr3	196199204	rs3796129	G	T	6982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.385;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=94;PP=2965;ReadPosRankSum=1.830;SC=AGAAAAGCATGGATCCTTGAC;SOR=0.510;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=210;TCF=115;TCR=95;TR=209;WE=196199212;WS=196199194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,217:1.00:218
chr3	196210590	rs7643192	A	G	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=309;SC=AACAGAAAACACTGGCATACA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=196210598;WS=196210580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr3	196210808	rs7646174	T	C	875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=18;PP=612;SC=GAGAGAACTTTATGATAAAAT;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=196210816;WS=196210798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr3	196210894	rs7646273	T	C	219.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=149;SC=TCTGTACATCTCTTGAAGAAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=196210902;WS=196210884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr3	196215352	rs34023868	C	CA	149.92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.765;NF=4;NR=2;PP=88;ReadPosRankSum=-1.593;SC=GACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SOR=0.446;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=6;WE=196215360;WS=196215342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,8:0.89:9
chr3	196215451	rs62798260	CA	C	1235.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=8;PP=723;SC=AGAAATATTCCAAAAAAAAAA;SOR=3.215;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=42;WE=196215459;WS=196215441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr3	196215660	rs11185543	G	A	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=744;SC=ATTAATAACTGCAGCAATATC;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=196215668;WS=196215650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr3	196236244	rs6803596	T	C	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=3;PP=1041;SC=CAAATTAATCTTTTTTTAAAA;SOR=4.565;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=39;WE=196236252;WS=196236234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	196281208	rs9311	T	C	8814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=151;NR=135;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.855;SC=TATTTAGCTTTGGTAAAATGT;SOR=0.274;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=287;TCF=152;TCR=135;TR=286;WE=196281216;WS=196281198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,291:1.00:292
chr3	196294104	rs9842616	C	G	5502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=112;PP=2965;SC=CTACAGGCTTCGGGTTTCTGA;SOR=1.570;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=171;TCF=59;TCR=112;TR=171;WE=196294112;WS=196294094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr3	196386964	rs1798631	C	G	5227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=79;PP=2965;SC=ACATGGCAGCCCTCATGCTCC;SOR=0.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=169;TCF=89;TCR=80;TR=168;WE=196386972;WS=196386954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr3	196388099	rs62623661	G	C	1906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.272;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=33;PP=1519;ReadPosRankSum=1.178;SC=CAGCTTTATGGCGTTGGACTT;SOR=0.867;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=256;TCF=147;TCR=109;TR=84;WE=196388107;WS=196388089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,84:0.32:259
chr3	196434364	rs67479689	AGTCTG	A	1267.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=2;PP=1553;SC=TTCCAGAACCAGTCTGGTAAT;SOR=4.479;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=27;WE=196434376;WS=196434354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr3	196541580	rs11185455	G	A	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.932;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=518;ReadPosRankSum=-0.391;SC=CTCCATCTCCGTGCCATTTCA;SOR=1.775;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=68;TCF=2;TCR=66;TR=27;WE=196541588;WS=196541570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,30:0.41:73
chr3	196547538	rs2166799	G	A	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=416;ReadPosRankSum=-0.883;SC=TAAAGTAGAAGGTTGATAAAA;SOR=2.124;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=17;WE=196547546;WS=196547528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
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chr3	196627088	rs9825635	A	G	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.316;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=142;ReadPosRankSum=-0.175;SC=TTTGATTACTATTGGCAGTAA;SOR=1.179;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=8;WE=196627096;WS=196627078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
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chr3	196627361	rs6772870	G	A	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=297;ReadPosRankSum=2.309;SC=TTTTACATTTGATGTAATTAT;SOR=0.420;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=13;WE=196627369;WS=196627351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr3	196650187	rs62411765	C	T	1919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.561;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=17;PP=1530;ReadPosRankSum=-1.213;SC=CTTTTTTGCCCTTGTGCAGGT;SOR=0.208;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=92;TCF=72;TCR=20;TR=69;WE=196650195;WS=196650177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,72:0.76:95
chr3	196656579	rs145947941	A	G	2296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.661;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=48;PP=1914;ReadPosRankSum=0.802;SC=GCTTTTCGGAACTTACAATGT;SOR=0.902;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=113;TCF=47;TCR=66;TR=79;WE=196656587;WS=196656569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,78:0.70:112
chr3	196656772	rs1602	G	A	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=363;SC=AAGTGTGGGTGTCATCCATGT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=196656780;WS=196656762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr3	196656790	rs55931516	G	C	237.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=81;SC=TGTCTCACTGGAGGTTATTAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=196656798;WS=196656780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr3	196657670	rs63736860	CT	C	1612.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=11;PP=946;SC=TTTCTGGGACCTTTTTTTTTG;SOR=2.797;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=48;WE=196657678;WS=196657660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr3	196666059	rs553783	A	G	2011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=13;PP=1732;SC=AGGGACGCTTATGAGCTACCA;SOR=2.658;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=49;TCR=13;TR=62;WE=196666067;WS=196666049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr3	196669488	rs3214858	C	CA	1653.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=19;PP=1738;SC=CCGAGGGCGGCGTGTCGTCAT;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=19;TCR=19;TR=38;WE=196669496;WS=196669478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr3	196669912	rs335824	C	T	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.943;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=-0.105;SC=GGGCCGAGGCCGCTTGCTTTT;SOR=0.116;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=6;WE=196669920;WS=196669902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr3	196674307	rs17855662	C	T	3151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.945;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=65;PP=2434;ReadPosRankSum=-0.519;SC=CAGTCCCCCCCATGTCCACCA;SOR=0.447;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=166;TCF=67;TCR=99;TR=113;WE=196674315;WS=196674297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,116:0.69:169
chr3	196674749	rs4916589	C	T	4413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=54;PP=2965;SC=GACTTGCAGCCGTTGCCACGC;SOR=0.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=69;TCR=55;TR=123;WE=196674757;WS=196674739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr3	196674879	rs12636891	A	G	8094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=123;NR=115;PP=2965;SC=TTGTAGTGCAAGAAGTTGACA;SOR=0.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=239;TCF=123;TCR=116;TR=238;WE=196674887;WS=196674869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr3	196674916	rs1147240	A	C	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.809;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=40;PP=1074;ReadPosRankSum=0.846;SC=TCCTGGATGTAGCGGGGCTGG;SOR=0.441;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=239;TCF=102;TCR=137;TR=75;WE=196674924;WS=196674906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,77:0.32:244
chr3	196674972	rs574365	CT	TC	8179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=105;PP=2947;SC=GCTGTGAGGGCTGCCCCAGGG;SOR=1.402;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=172;TCF=61;TCR=111;TR=165;WE=196674981;WS=196674962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr3	196735808	rs41284045	G	A	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.195;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=371;ReadPosRankSum=-1.941;SC=TCACGGGCACGCAGCTGGCAT;SOR=1.878;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=85;TCF=23;TCR=62;TR=24;WE=196735816;WS=196735798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,26:0.29:89
chr3	196736575	rs41284047	A	G	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.241;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=820;ReadPosRankSum=-0.771;SC=AGGGCTGCCGAAACCGGCGTG;SOR=1.453;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=111;TCF=64;TCR=47;TR=43;WE=196736583;WS=196736565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,46:0.38:121
chr3	196749798	rs2288766	T	G	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=6;PP=377;SC=CTCCCTGCCCTCGGCCCCTCC;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=18;WE=196749806;WS=196749788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr3	196749821	rs58329531	C	T	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=325;ReadPosRankSum=-0.110;SC=GCCCCCACTCCGCTCACCGGA;SOR=0.722;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=15;WE=196749829;WS=196749811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr3	196750016	rs2288765	A	G	1557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=31;PP=1123;SC=GTCACTCAGCAGAACTTTCTT;SOR=1.358;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=48;WE=196750024;WS=196750006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	196750841	rs2280294	C	A	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.122;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=509;ReadPosRankSum=-0.429;SC=ACACAGTGACCTGCGCCCGGT;SOR=0.422;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=62;TCF=27;TCR=35;TR=32;WE=196750849;WS=196750831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr3	196751474	rs2280296	C	T	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=8;PP=228;SC=GCTGTACACACGGATGTGTGC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=196751482;WS=196751464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr3	196754519	rs2276789	G	A	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=97;ReadPosRankSum=0.355;SC=CCTATCGGCCGGGCCTGGCAG;SOR=1.508;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=5;WE=196754527;WS=196754509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr3	196754819	rs2276788	C	G	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=50;ReadPosRankSum=-1.715;SC=CTCCCCCGCCCTGCCCAGCCC;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=5;WE=196754827;WS=196754809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr3	196754856	rs12637442	C	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=45;ReadPosRankSum=0.239;SC=GTGGCTCCAGCAGTTCTGTGT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=196754864;WS=196754846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr3	196756393	.	A	G	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=21;ReadPosRankSum=0.639;SC=CTCGACCCCGAGCCCCTGCCT;SOR=0.551;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=3;WE=196756401;WS=196756383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr3	196795720	rs6804448	T	C	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=16;PP=1019;SC=ATAAAGCTAATGATAATTTAG;SOR=1.230;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=24;TCR=16;TR=40;WE=196795728;WS=196795710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr3	196795879	rs57032552	A	ACT	1612.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=18;PP=1681;SC=CACAAATAATATTTTTATTTT;SOR=0.798;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=17;TCR=18;TR=35;WE=196795887;WS=196795869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr3	196803647	rs12632559	T	C	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=31;PP=977;SC=AGCTGACTCCTATGACCACAG;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=33;WE=196803655;WS=196803637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr3	196869688	rs7628652	A	G	2343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=47;PP=1877;SC=TGTAAAATCCAAAATGGCAAG;SOR=1.519;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=27;TCR=47;TR=74;WE=196869696;WS=196869678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr3	197020630	rs364644	G	A	2793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=20;PP=2114;SC=ATAACTCACTGCGGCCTAAAC;SOR=2.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=67;TCR=20;TR=87;WE=197020638;WS=197020620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr3	197020718	rs434681	T	C	4261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=63;PP=2965;SC=AAGACCCCTGTTCTCCTTTAA;SOR=0.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=62;TCR=63;TR=125;WE=197020726;WS=197020708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr3	197020780	rs3836429	G	GA	1808.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=47;PP=1727;SC=CTTACTGAGAGAAAAAACCTT;SOR=3.575;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=52;WE=197020788;WS=197020770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr3	197020871	rs450891	G	A	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=20;PP=579;SC=GCTTAGGGCAGTTTACAAGCT;SOR=4.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=197020879;WS=197020861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr3	197239266	rs9325394	C	G	1319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-4.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.865;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=45;PP=1098;ReadPosRankSum=-0.703;SC=ACCTGCTAAGCCGTTACTGCC;SOR=1.276;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=69;TCF=5;TCR=64;TR=48;WE=197239274;WS=197239256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,47:0.68:69
chr3	197362030	rs2451791	C	T	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FS=3.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.55;MQRankSum=-11.195;QD=3.02;ReadPosRankSum=-0.054;SOR=1.057;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:181,45:0.20:226
chr3	197362080	rs9815968	T	A	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FS=6.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.51;MQRankSum=-4.686;QD=2.72;ReadPosRankSum=2.050;SOR=0.441;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:225,55:0.20:280
chr3	197362184	rs9867990	C	T	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.09;MQRankSum=-3.579;QD=6.71;ReadPosRankSum=-0.224;SOR=0.987;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,23:0.23:99
chr3	197362187	rs9867993	C	T	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.88;MQRankSum=-3.448;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.324;SOR=0.557;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,20:0.21:94
chr3	197362234	rs373257562	T	G	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.01;MQRankSum=-1.405;QD=7.12;ReadPosRankSum=-0.723;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr3	197482760	rs13068986	C	G	2994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=54;PP=2522;SC=GGAAAATGGACGCTTCTGCGA;SOR=1.364;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=34;TCR=54;TR=88;WE=197482768;WS=197482750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr3	197483279	rs6794391	A	G	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.357;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=5;PP=1009;ReadPosRankSum=-2.150;SC=AAAATAATTGACATTTCCTCT;SOR=0.393;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=183;TCF=167;TCR=16;TR=52;WE=197483287;WS=197483269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,54:0.29:185
chr3	197490285	.	CA	C	216.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=3.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQRankSum=-0.424;QD=2.81;ReadPosRankSum=-0.269;SOR=1.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,26:0.34:77
chr3	197495334	rs3205525	G	A	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=1.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.41;ReadPosRankSum=-0.659;SOR=0.917;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,17:0.20:84
chr3	197496984	rs1708460	A	G	1739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=1;PP=1395;SC=GATTAACATAATTTCTTGCCT;SOR=5.590;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=46;WE=197496992;WS=197496974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr3	197500394	rs3830497	T	TTTTG	1394.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=1.887;QD=13.41;ReadPosRankSum=-0.875;SOR=0.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,38:0.37:104
chr3	197544201	.	A	G	135	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=24;MQ=59.4;NF=0;NR=9;PP=135;QD=18.8634680608;SC=ATTGTCCAACATGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=9;WE=197544209;WS=197544191;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr3	197557635	rs501101	C	T	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.642;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=9;PP=670;ReadPosRankSum=0.421;SC=AGTCTCTTTTCGGCAGCCATG;SOR=0.870;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=142;TCF=105;TCR=37;TR=41;WE=197557643;WS=197557625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,42:0.28:150
chr3	197574936	rs2306439	G	C	1715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=45;PP=1366;SC=GACTGGCTAAGTGCTTATTTG;SOR=3.830;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=50;WE=197574944;WS=197574926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr3	197581147	rs9863587	A	G	2520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=10;PP=2238;SC=CTCTATGTCAACGTCTTCAAA;SOR=3.611;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=66;TCR=10;TR=76;WE=197581155;WS=197581137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr3	197610609	rs114390216	G	A	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.690;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=192;ReadPosRankSum=1.133;SC=GCTGCCAGCTGTCTGCTTAAA;SOR=0.061;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=11;WE=197610617;WS=197610599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr3	197748355	.	G	C	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=0.000;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.656;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=16;PP=1159;ReadPosRankSum=1.716;SC=CAGAAGATTTGCCTTATTATG;SOR=0.806;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=156;TCF=108;TCR=48;TR=58;WE=197748363;WS=197748345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,59:0.36:164
chr4	53233	rs7658521	C	A	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=0.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.94;ReadPosRankSum=0.229;SOR=0.482;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:480,87:0.15:567
chr4	53428	rs2859214	G	A	12677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=350;PP=2965;SC=GGGAGGCCTCGTCGGAACCGG;SOR=4.492;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=389;TCF=37;TCR=352;TR=387;WE=53436;WS=53418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,393:1.00:393
chr4	59577	rs7666726	T	A	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FS=9.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.28;ReadPosRankSum=2.428;SOR=0.035;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:277,53:0.16:330
chr4	60303	rs3864127	G	A	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FS=0.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.098;SOR=0.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:208,53:0.20:261
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chr4	86024	rs77715101	G	A	1816.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.64;QD=47.81;SOR=1.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	86031	rs367720730	CA	C	1537.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.14;QD=48.05;SOR=1.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	86034	rs57594632	TC	T	1627.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.14;QD=50.87;SOR=1.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	86040	rs17853557	G	T	1501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.36;QD=44.17;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	86042	rs17857099	A	G	1533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.09;QD=46.48;SOR=1.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	86044	rs17857100	G	A	1488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.94;QD=49.63;SOR=1.143;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	86101	rs58319295	G	GC	3406.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=25;PP=2957;SC=ATGTGGCAAAGCTTTAGACGG;SOR=0.829;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=41;TCR=25;TR=65;WE=86109;WS=86091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr4	86738	rs2353625	A	G	4378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=62;PP=2965;SC=TCCATTCTGGACAAAAACCTT;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=64;TCR=63;TR=126;WE=86746;WS=86728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr4	87277	rs2006764	G	C	6761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=120;NR=78;PP=2965;SC=TGTGGCAAAGGTTTTAATCGG;SOR=1.162;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=198;TCF=120;TCR=78;TR=198;WE=87285;WS=87267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr4	87313	rs60154095	G	GA	8037.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=95;PP=2957;SC=GTACACAAGCGATTCATACTG;SOR=0.884;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=185;TCF=85;TCR=100;TR=175;WE=87321;WS=87303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr4	135694	rs12504142	G	A	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=393;SC=GTTATTTTCAGTGCATGTTTT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=135702;WS=135684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	155655	rs144152312	C	G	1872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=30;PP=1476;SC=TGGAAAAAATCCCTACAAATG;SOR=1.009;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=23;TCR=30;TR=53;WE=155663;WS=155645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr4	331658	rs3749520	T	C	3649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.45;SOR=2.247;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr4	331666	rs3749521	G	C	3650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.85;QD=43.46;SOR=1.939;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr4	331693	rs5855672	G	GC	3978.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.85;NF=38;NR=40;PP=2957;SC=TTCGGCCACAGCTCAGCCTCC;SOR=0.981;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=82;TCF=41;TCR=41;TR=78;WE=331701;WS=331683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr4	343795	rs3037605	C	CTGCT	2818.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=15;PP=2957;SC=AGTCACAGGGCTCAGGAGCAC;SOR=1.727;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=49;WE=343803;WS=343785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr4	376888	rs6854214	C	A	2575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.94;NF=59;NR=27;PP=2061;SC=TTTCAGAATTCTTCCATCTCT;SOR=1.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=59;TCR=27;TR=86;WE=376896;WS=376878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr4	420664	rs1053401	G	T	3525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=38;PP=2080;SC=ATCTTCTTCAGGCTCTTCTGG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=39;TCR=38;TR=76;WE=420672;WS=420654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr4	420688	rs2280250	C	T	3679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=43;PP=2364;SC=GGTATGAGTTCCTCTACTTCG;SOR=0.763;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=39;TCR=44;TR=82;WE=420696;WS=420678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr4	429720	rs894534	T	C	3289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=57;PP=2376;SC=GATAATGAGATGCTGATGAGT;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=52;TCR=57;TR=109;WE=429728;WS=429710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr4	437824	.	T	A	6191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.84;QD=44.23;SOR=1.340;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr4	437831	rs72501950	C	T	6103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.84;QD=44.55;SOR=1.381;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr4	648643	rs10902758	G	A	2020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=41;PP=1575;SC=GATCGACTACGTCCTCCACGG;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=27;TCR=41;TR=68;WE=648651;WS=648633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr4	656550	rs373094080	G	A	471.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=387;ReadPosRankSum=0.424;SC=AGGCCAAGGCGAGGGGATTGC;SOR=2.948;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=17;WE=656558;WS=656540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr4	658505	.	TGAGGCACAAGAATCGGGAGGCG	T	305.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=78;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=1634;SC=CTCGGGAGGCTGAGGCACAAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=658534;WS=658495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	663908	rs28675771	A	G	1742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=25;PP=1353;SC=CACTGGTCCCATGGGGACCCT;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=35;TCR=25;TR=60;WE=663916;WS=663898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr4	738512	rs6841958	T	C	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=15;PP=428;SC=AGTGTTAGTGTTCGCCGTGGA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=738520;WS=738502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	759733	rs6816483	T	C	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=7;PP=1033;SC=TCACGGGACGTGATTCCTCAG;SOR=3.109;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=42;WE=759741;WS=759723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	780286	rs10794536	C	G	1164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=8;PP=919;SC=GTCCCGCGCGCGGCTACTTCT;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=37;WE=780294;WS=780276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	780549	rs13128363	C	T	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=8;PP=204;SC=CGCAGCCTCCCTGCGCCAGGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=780557;WS=780539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	786508	rs2306250	T	C	235.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=6;PP=182;SC=CTCCATCCACTCGACCCTCTG;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=786516;WS=786498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	845772	rs10031922	T	C	1282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=42;PP=1012;SC=CCTGTGGAGATGGAGATCGGA;SOR=4.317;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=46;WE=845780;WS=845762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	858941	rs1026738	T	C	1418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=35;PP=1113;SC=CCACTGCCGATGCTGCAGTCT;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=49;WE=858949;WS=858931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	859016	rs142955360	C	T	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=23;PP=888;SC=TCTTGCTGGGCTCTCCTGGCA;SOR=1.547;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=35;WE=859024;WS=859006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	871675	rs1564280	A	G	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=17;PP=539;SC=TTTCGAATAGAAGTTTTTCAT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=871683;WS=871665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	878048	rs899387	C	T	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=554;SC=CGGCTGTGTGCGTGCTGTGGA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=878056;WS=878038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	906647	rs2279178	A	G	3452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=79;PP=2778;SC=CACCCGATGCATCATCTCAGA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=36;TCR=79;TR=115;WE=906655;WS=906637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr4	942006	rs2290403	G	A	2950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=74;PP=2477;SC=CCCGAGGCTCGACCTGGCACA;SOR=2.662;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=18;TCR=74;TR=92;WE=942014;WS=941996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr4	946226	rs11552301	T	C	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=21;PP=519;SC=TGATCGCCATTGGGGTCGTGC;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=946234;WS=946216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	946974	rs2290405	G	A	3283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=35;PP=2385;SC=TGCTTTTCCCGCAGGCACTGA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=109;TCF=73;TCR=36;TR=108;WE=946982;WS=946964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr4	949299	.	G	A	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=35;PP=1099;SC=GGGCTGGCCTGAGAGGCCTGT;SOR=3.500;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=40;WE=949307;WS=949289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	954277	rs3733347	T	C	952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=3;PP=689;SC=GAAGATGCTGTGGTCAGGGCT;SOR=3.407;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=954285;WS=954267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	954741	rs56039006	C	G	2303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=22;PP=1802;ReadPosRankSum=-0.822;SC=CTGGCCGCAGCCGGCCATGCC;SOR=0.756;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=72;TCF=50;TCR=22;TR=71;WE=954749;WS=954731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr4	960081	rs4690324	G	A	3003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=75;PP=2403;SC=TCTGCAGCTCGAGGCCTCCCT;SOR=4.174;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=9;TCR=75;TR=84;WE=960089;WS=960071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr4	980971	rs10794537	T	G	267.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=3;PP=148;SC=ACCTGGTGCATGTGGACGCGG;SOR=1.402;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=980979;WS=980961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	985324	.	G	C	3247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=68;PP=2435;SC=GCCAGCGCGTGGCGGGGAGCA;SOR=1.356;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=41;TCR=68;TR=109;WE=985332;WS=985314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr4	994452	rs3755954	C	T	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=21;PP=835;SC=GGACGGGTACCTGGACCTTCT;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=36;WE=994460;WS=994442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	1006333	rs4647942	G	A	1556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=41;PP=1177;ReadPosRankSum=-0.847;SC=GGGCCTTCCCGCCGGCCGCCG;SOR=0.718;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=19;TCR=42;TR=60;WE=1006341;WS=1006323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,59:0.98:60
chr4	1019054	rs145808953	CCA	C	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.65;ReadPosRankSum=-0.418;SOR=0.904;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,7:0.15:46
chr4	1050437	rs7680608	C	G	284.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=7;PP=264;SC=TCATAATTTTCGAAATTCACA;SOR=1.402;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=1050445;WS=1050427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	1050653	rs3816474	G	A	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=3;PP=918;SC=AGCAGGCTGGGGATGCTGATG;SOR=3.797;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=33;WE=1050661;WS=1050643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	1050849	rs10003009	GT	AC	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=35;PP=2165;SC=TGGTGACACGGTAGTTACAGC;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=41;WE=1050858;WS=1050839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	1050909	rs9992925	A	T	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=410;SC=CATCTCTGAGAACCTCGGAGC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=1050917;WS=1050899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	1052009	.	A	G	124	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=5;NR=0;PP=124;QD=31.7542425094;SC=TTTCCTTTAAAACGCTGTGAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=1052017;WS=1052001;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	1052078	rs2290410	A	T	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=2;PP=325;SC=GTTAGAACGCAGTGAAGAAGG;SOR=2.985;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=13;WE=1052086;WS=1052068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	1052125	rs11724371	T	C	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=5;PP=714;SC=GGCTTTCCCATGCTCCTCTGA;SOR=3.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=30;WE=1052133;WS=1052115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	1052166	rs2248083	A	C	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=11;PP=832;SC=CTCGGGGCCCAGGGAGGAGAC;SOR=1.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=35;WE=1052174;WS=1052156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	1052206	rs2045069	T	C	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.06;SOR=1.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	1052212	rs2045068	G	A	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.03;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	1052355	rs2045067	C	T	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=308;SC=AGGTTGCGGGCAGCCCTGGTG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=1052363;WS=1052345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	1067267	rs2290408	G	T	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=304;SC=CCCATGCACCGGGTGGAAGGA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=1067275;WS=1067261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	1067638	rs6852155	T	G	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=41;PP=1182;SC=GTGGTAGAGGTGGTGTGGGTG;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=41;WE=1067646;WS=1067628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	1084723	rs658846	G	C	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=8;PP=241;SC=ACTCTCAGGAGAGCTCACAGT;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=1084731;WS=1084713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	1087168	rs61648964	A	AAT	1647.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=8;PP=1352;SC=TATTGTAACAAATGCCAATAT;SOR=2.368;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=28;WE=1087179;WS=1087158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	1087171	rs59985183	G	T	1656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=8;PP=900;SC=TGTAACAAATGCCAATATTTA;SOR=2.554;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=34;WE=1087179;WS=1087158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	1087265	rs1670534	T	C	2529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.510;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.210;NF=43;NR=36;PP=1505;ReadPosRankSum=1.206;SC=GCGTTTGTGATGCTCACCTCC;SOR=0.620;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=80;TCF=43;TCR=37;TR=79;WE=1087273;WS=1087255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,91:0.99:92
chr4	1087327	rs138488801	G	GCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC	4301.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=9;PP=2965;SC=CAGAGCCTGTGACCTCCACGG;SOR=1.275;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=52;TCF=13;TCR=39;TR=15;WE=1087346;WS=1087317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr4	1087329	rs118112880	C	T	4343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.63;QD=58.70;SOR=0.927;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr4	1087338	rs11725984	C	T	3250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.63;QD=44.53;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr4	1087487	rs60035268	G	A	2166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=36;PP=1514;SC=CTGTGGCTCTGATGTCTGTGA;SOR=1.131;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=61;TCF=25;TCR=36;TR=60;WE=1087495;WS=1087477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr4	1087901	rs13106356	A	G	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=13;PP=382;SC=AAGCCCATGAAGGAGAGTGCC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=1087909;WS=1087891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	1090625	rs4045481	G	A	3747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=60;PP=2965;SC=TATCTGCGTCGGTCTGAAAGA;SOR=0.922;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=47;TCR=60;TR=107;WE=1090633;WS=1090615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr4	1102050	rs4974644	C	T	1868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=17;PP=1360;SC=TTAGACACCACAAATGACTAA;SOR=1.647;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=58;WE=1102058;WS=1102040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr4	1164277	rs2279279	C	G	2120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=20;PP=1782;SC=CGCAGCCGCACCAGTGTCACC;SOR=1.647;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=60;WE=1164285;WS=1164267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr4	1164552	rs13115935	A	G	3228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=77;PP=2581;ReadPosRankSum=1.529;SC=AGGAAGGGGCAGCCTCCTCGG;SOR=1.006;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=108;TCF=29;TCR=79;TR=106;WE=1164560;WS=1164542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,107:0.99:108
chr4	1165130	rs11247975	G	T	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=3;PP=829;SC=CGAAAACACCGCGTGCACGCT;SOR=3.545;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=31;WE=1165138;WS=1165120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	1165741	rs922697	A	G	2809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=60;PP=2209;SC=GTATTTGGCCAGGGCTCTGGC;SOR=1.511;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=29;TCR=60;TR=89;WE=1165749;WS=1165731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr4	1194594	rs13115903	A	T	4204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=48;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.050;SC=GCTGTGAGCAAGTGGAGAAAG;SOR=1.222;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=81;TCR=49;TR=128;WE=1194602;WS=1194584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,133:0.99:135
chr4	1207517	rs11247979	T	C	146.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=91;SC=CCCACGGCCCTGCTCTGCTCG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=1207525;WS=1207507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	1217056	rs2004531	G	A	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=2;PP=1125;SC=GGGCAGAGGTGTGAGGAACAG;SOR=5.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=42;WE=1217064;WS=1217046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	1243573	rs1680032	T	C	952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=20;PP=735;SC=GGAGAACCCCTTCCCCGACCC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=30;WE=1243581;WS=1243563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	1243617	rs3755920	T	C	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=19;PP=582;SC=GGTTTGTAGCTAACCAACGTC;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=1243625;WS=1243607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	1244267	rs2291199	A	G	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=2;PP=458;SC=AAAAAATTCCAGAAAAATGAG;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=1244275;WS=1244257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	1244416	rs1732115	A	G	1460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=25;PP=1170;SC=CTGTCTGCTCAGCATGGACAG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=51;WE=1244424;WS=1244406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	1244879	rs1564508	A	G	5055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=102;PP=2965;SC=GCCTCCGTCTACACACAGTGT;SOR=1.509;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=54;TCR=102;TR=156;WE=1244887;WS=1244869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr4	1291640	rs2293633	T	C	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=352;SC=TGGCCTGTGCTCTCATCTGGC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=1291648;WS=1291630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	1291711	rs2293634	T	G	1543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=11;PP=1116;ReadPosRankSum=0.238;SC=TGTAGCCCCATCCCCTGCCCT;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=47;WE=1291719;WS=1291701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr4	1291791	rs2293635	A	G	2079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=35;PP=1508;ReadPosRankSum=-1.288;SC=TGCACTGGCCACAGAAGCCGC;SOR=0.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=35;TCR=36;TR=69;WE=1291799;WS=1291781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,75:0.97:77
chr4	1303682	rs13112706	G	T	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=3;PP=109;SC=CCCGGCAGGGGTTGGAAAGTC;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=1303690;WS=1303672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr4	1330759	rs1128427	T	C	5442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=101;PP=2965;SC=CCCTGCAGGCTGGCCTCTCAG;SOR=0.768;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=192;TCF=91;TCR=101;TR=192;WE=1330767;WS=1330749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr4	1332175	rs13147602	A	G	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=678;ReadPosRankSum=-0.650;SC=GGCTGCCCTGAGTGGCCCCCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=25;WE=1332183;WS=1332165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr4	1343405	rs2276903	T	C	1788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=20;PP=1399;SC=CCTTCCAGATTGTGGAGGAAC;SOR=1.421;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=37;TCR=20;TR=57;WE=1343413;WS=1343395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr4	1343720	rs11247994	G	A	822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=22;PP=666;SC=GTGAAGATGCGCCTCCTGTTG;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=1343728;WS=1343710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	1348691	rs33989352	T	TG	367.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=11;PP=308;SC=GTGCCATGCATGGGGGGGGTC;SOR=2.833;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=13;WE=1348699;WS=1348681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	1348806	rs3903127	A	C	1258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=4;PP=988;ReadPosRankSum=-0.822;SC=TGTGCCAGGGACCCCCCGGGC;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=34;WE=1348814;WS=1348796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr4	1369093	rs11941200	CT	GG	2030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=0;PP=2154;SC=CCGGTCTTGCCTGATGTGCCT;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=41;WE=1369102;WS=1369083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	1369885	rs11724369	G	A	1947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=23;PP=1497;SC=GGGCCCGGGCGCCTGTGGTGC;SOR=1.214;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=38;TCR=23;TR=61;WE=1369893;WS=1369875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr4	1373699	rs112142388	C	CTTT	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=484;SC=TGACCGTGTTCTCCCTGGGTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=1373709;WS=1373692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	1373701	rs56108910	C	G	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=246;SC=ACCGTGTTCTCCCTGGGTGCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=9;WE=1373709;WS=1373692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	1373751	rs35735964	G	T	971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=2;PP=880;SC=GTGGTGTTTGGCCTTCCCCTG;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=1373759;WS=1373741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	1374695	rs28614045	C	A	3091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=72;PP=2577;SC=GATTGTTCCACGGGACGACGA;SOR=2.597;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=20;TCR=72;TR=92;WE=1374703;WS=1374685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr4	1374774	rs28522910	C	T	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=29;PP=871;SC=CAGGAGCGCCCGGGTAGGTCT;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=1374782;WS=1374764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	1374789	rs28733902	A	G	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=18;PP=517;SC=AGGTCTGGGCAAGGCGGTCAC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=1374797;WS=1374779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	1377615	rs9996817	A	G	1955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.062;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=52;PP=1579;ReadPosRankSum=-0.784;SC=ATCTCGGCTCATCCAGGTACA;SOR=3.418;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=63;TCF=10;TCR=53;TR=61;WE=1377623;WS=1377605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr4	1388350	.	G	A	453	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=27;MQ=55.19;NF=12;NR=15;PP=453;QD=18.0656004647;SC=CTGCTCACACGTGCCCATGTG;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=76;TCF=36;TCR=40;TR=27;WE=1388358;WS=1388340;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:49,27:0.36:76
chr4	1388377	.	ATG	A	1015.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.14;MQRankSum=-0.583;QD=33.86;ReadPosRankSum=-2.291;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,26:0.87:30
chr4	1388378	.	TG	CA	861	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MMLQ=28;MQ=52.49;NF=4;NR=8;PP=861;QD=76.2056562385;SC=CGCCTGCTCATGTGCCCATGT;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=12;WE=1388387;WS=1388365;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:35,12:0.26:47
chr4	1388379	.	G	GCACA	1015.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.477;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.14;MQRankSum=-0.583;QD=33.86;ReadPosRankSum=-2.231;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,26:0.87:30
chr4	1388413	.	T	C	1025	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MMLQ=23;MQ=56.38;NF=18;NR=25;PP=1025;QD=24.6458421523;SC=CTCACACATGTCGATGCGGAG;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=43;WE=1388421;WS=1388403;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	1388429	.	G	A	941	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=5;HapScore=1;MGOF=19;MMLQ=25;MQ=55.05;NF=22;NR=19;PP=941;QD=23.799297867;SC=CGGAGTGCCCGCCTGCTCACA;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=23;TCR=20;TR=41;WE=1388437;WS=1388419;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,41:0.95:43
chr4	1388583	rs9328733	A	G	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=14;PP=694;SC=GTGGAGTGCCACCTGCTCACA;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=17;TCR=15;TR=31;WE=1388591;WS=1388573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	1388622	.	T	TCA	620.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.87;QD=36.51;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	1388631	rs200849975	C	G	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.48;QD=36.14;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	1389101	rs71614971	A	G	947.96	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.291;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.989;NF=17;NR=16;PP=634;ReadPosRankSum=-0.868;SC=GCCCATGTGGAGTGCCCGCCT;SOR=0.525;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=34;TCF=17;TCR=17;TR=33;WE=1389109;WS=1389099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,31:0.97:32
chr4	1389156	rs71614972	T	C	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=3.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.25;MQRankSum=1.389;QD=39.73;ReadPosRankSum=0.981;SOR=0.499;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,22:0.96:23
chr4	1389161	rs71614973	A	G	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=3.388;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.46;MQRankSum=1.440;QD=38.49;ReadPosRankSum=1.521;SOR=0.626;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,23:0.96:24
chr4	1397297	rs11945310	T	G	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=9;PP=379;SC=CGGTGGGCCCTGGGCAACGGG;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=1397305;WS=1397287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	1397611	rs13133264	A	C	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=30;PP=890;SC=CGTCTGCGGGAGGGAGGGACA;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=41;WE=1397619;WS=1397601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	1619865	rs11722375	T	C	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=809;ReadPosRankSum=-0.748;SC=GGCAGGTGAGTGCTGCCTCTT;SOR=1.007;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=35;WE=1619873;WS=1619855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr4	1659128	rs56214302	T	C	1987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=8;PP=1601;SC=GCTCCTAAAGTGCTCACCGTT;SOR=3.611;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=50;TCR=8;TR=58;WE=1659136;WS=1659118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr4	1718874	.	G	T	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.77;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	1718874	.	GAG	TAA	570	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=7;NR=3;PP=570;QD=62.3467874862;SC=GCTTTGGGGGGAGACACAGAG;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=10;WE=1718884;WS=1718864;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,10:0.71:14
chr4	1718876	.	G	A	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=50.62;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	1719294	rs2236786	T	C	1924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=38;PP=1396;SC=GGGAGGCAAATGTCTCCAGGA;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=33;TCR=38;TR=71;WE=1719302;WS=1719284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr4	1719499	.	G	A	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=14;PP=478;SC=GTCGCACCAGGACCAACCAGG;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=1719507;WS=1719489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	1732573	rs146419121	GGGGT	G	1281.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=6;PP=1283;SC=CCGGGGTTATGGGGTGGGGGG;SOR=2.621;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=26;WE=1732584;WS=1732563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	1795321	rs4450996	C	A	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=1;PP=53;SC=CTTCCCGCTCCGGAAAGTTTG;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=1795329;WS=1795311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	1805296	rs3135883	G	A	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=1;PP=134;SC=CAAGTTGGCGGTGGCTGAGGA;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=1805304;WS=1805287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	1806834	rs4865476	G	C	136.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=106;SC=GTTCTGTGGAGATGCTCCTGG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=1806842;WS=1806824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	1807894	rs7688609	G	A	3736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=70;PP=2965;SC=ACAAGAAGACGACCAACGTGA;SOR=0.991;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=51;TCR=70;TR=121;WE=1807902;WS=1807884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr4	1809127	rs34562534	CGT	C	548.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=32.28;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	1818594	rs9328763	C	T	3045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=65;PP=2471;SC=CTTCCACGTACTTTTCTTCAC;SOR=1.760;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=30;TCR=65;TR=95;WE=1818602;WS=1818584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr4	1954945	rs489550	A	G	2990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=28;PP=2364;SC=CTTTAGCAGCATGGCTGCCTC;SOR=2.004;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=71;TCR=28;TR=99;WE=1954953;WS=1954935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr4	1961137	rs474235	G	A	1421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=33;NR=12;PP=1061;SC=AGTGGTGGGTGTGCAAGGGTA;SOR=2.030;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=45;WE=1961145;WS=1961127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	2044128	rs570712	C	T	227.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=6;PP=204;SC=CCGCCGCCGCCGCTGCTGCTG;SOR=0.941;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=11;WE=2044136;WS=2044118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	2158102	rs34241266	CT	C	760.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=2.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.85;ReadPosRankSum=0.649;SOR=0.208;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:5,43:0.90:48
chr4	2158273	rs3216822	GGA	G	3498.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=52;PP=2652;SC=CCTGCACACTGGAGTGCATGG;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=4;TCR=54;TR=56;WE=2158282;WS=2158263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr4	2158408	rs428361	C	T	1304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=8;PP=1107;SC=AGTATGAAGTCCCCTCTTGGA;SOR=2.613;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=40;WE=2158416;WS=2158398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	2176506	rs6822665	C	T	1135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=32;PP=921;SC=ATAACATCAACGTCAATTTAA;SOR=4.863;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=2176514;WS=2176496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	2210326	.	C	T	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=11;PP=316;SC=ACACAATCTTCATATTACCTA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=2210334;WS=2210316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	2275145	rs736455	G	A	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=14;PP=458;SC=AGATCAGTCAGGGAGGGAGGA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=2275153;WS=2275135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	2275718	rs2182682	G	A	1507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=7;PP=1192;SC=TACACGCCCCGCCTGACCTCC;SOR=3.398;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=49;WE=2275726;WS=2275708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	2275835	rs2051561	G	A	3616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=59;PP=2724;SC=GGCTGCCGTGGAACCTGGACC;SOR=0.853;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=56;TCR=59;TR=115;WE=2275843;WS=2275825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr4	2276047	rs11248093	T	C	183.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=0;NR=7;PP=151;SC=TCGCAGACGCTCACCCCACAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=2276055;WS=2276037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	2306053	rs661301	A	G	2514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=31;PP=2030;SC=TCGTGAGCCGAGGGGCTCCCA;SOR=1.051;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=41;TCR=31;TR=72;WE=2306061;WS=2306043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	2332799	rs1887364	C	T	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=390;SC=CAGGGGTAGACGCTGGGATGG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=2332807;WS=2332789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	2341137	rs2071681	C	T	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=615;SC=ACAACCGTCCCCCAGCTCATA;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=2341145;WS=2341127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	2341194	rs2071680	T	C	1824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=13;PP=1432;SC=GCTCAAACTCTGCGAACAGGA;SOR=2.342;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=58;WE=2341202;WS=2341184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr4	2343181	rs2071679	C	T	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=427;SC=TCAGGACCTCCGAACCCGGGT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=2343189;WS=2343171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	2355554	.	G	A	80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=80;QD=28.6928031368;SC=CCCTGACAACGCCACCACAGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=2355562;WS=2355553;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	2444931	rs1203814	A	G	4498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=59;PP=2965;ReadPosRankSum=0.013;SC=TCTACGAGCCAGCCCACGTGA;SOR=0.713;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=156;TCF=96;TCR=60;TR=152;WE=2444939;WS=2444921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,165:0.98:168
chr4	2445043	.	G	A	2573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=67;PP=1980;SC=ACGGGCACGGGAGCTCCACGT;SOR=4.174;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=7;TCR=68;TR=74;WE=2445051;WS=2445033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr4	2451694	rs3108494	T	C	4775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=46;PP=2965;SC=CGAGGAACTGTGCTGCGCCAT;SOR=1.783;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=108;TCR=46;TR=153;WE=2451702;WS=2451684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr4	2452933	rs3888113	T	C	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=16;PP=1150;SC=AGGATGGGCATTTGCTGCTCC;SOR=1.280;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=44;WE=2452941;WS=2452923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	2461888	rs3135152	A	G	3515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=63;PP=2779;SC=CAGGGCAAGCACACCAAGAGC;SOR=0.816;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=56;TCR=63;TR=118;WE=2461896;WS=2461878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr4	2502299	rs55745322	A	ATT	383.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=458;SC=GTAAGCCTATAACATTAGCAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=2502307;WS=2502289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	2502637	rs1203863	T	C	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=422;SC=GTAACAATAATAATAACAAAG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=2502645;WS=2502627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	2513620	rs3128839	G	A	1557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.51;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	2513624	rs4974709	A	G	1557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.51;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	2698364	rs3733215	C	T	1007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=26;PP=825;SC=GGTCTGAGGGCATTTGAAGGT;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=2698372;WS=2698354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	2717690	rs2295499	C	T	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=0;PP=1085;SC=TGATTTCTTCCGTTCTGATAA;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=37;WE=2717698;WS=2717680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	2743999	rs232712	A	G	236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=190;SC=GGCAGCACTCAGCCACATGCC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=2744007;WS=2743989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	2744087	rs2269495	G	A	822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=1;PP=688;SC=GCCTCTCTGGGCCGCGCCAGG;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=2744095;WS=2744077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	2746285	rs13145281	A	C	3862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=75;PP=2965;SC=GAAGCGCCCCACCAGGCTTCT;SOR=1.075;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=52;TCR=75;TR=127;WE=2746293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr4	2746307	rs11728346	A	C	2912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=76;PP=2231;ReadPosRankSum=0.334;SC=CCACCCCCACAGTGACCACTG;SOR=0.829;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=109;TCF=32;TCR=77;TR=108;WE=2746315;WS=2746297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,106:0.99:107
chr4	2828527	rs62637096	G	C	1631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=7;PP=1307;SC=GTGTGAACATGTGTGCTTGTC;SOR=2.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=46;WE=2828535;WS=2828517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr4	2828630	rs72613119	G	T	1992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=38;PP=1502;ReadPosRankSum=-0.730;SC=CTGTGTCTTTGTGTATATATA;SOR=0.569;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=58;WE=2828638;WS=2828620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr4	2901349	rs2071695	A	G	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=498;SC=GAGGTGAAGGATTCCTGGTAT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=2901357;WS=2901339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	2906453	rs2239728	T	G	1827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.121;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=12;PP=1446;ReadPosRankSum=0.361;SC=TTTTGAGATCTGGAATATTGA;SOR=2.899;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=66;TCF=53;TCR=13;TR=65;WE=2906461;WS=2906443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr4	2906707	rs4961	G	T	2654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=39;PP=2099;SC=TTCCGAGGAAGGGCAGAATGG;SOR=0.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=47;TCR=39;TR=86;WE=2906715;WS=2906697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr4	2916762	rs4963	C	G	1768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=29;PP=1286;SC=CAGAAGGGCTCTGAAGGTGAG;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=26;TCR=29;TR=55;WE=2916770;WS=2916752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	2939904	rs147169228	G	A	2491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=40;PP=1776;ReadPosRankSum=1.192;SC=CGCAGGCAGCGGGTGGGGGGA;SOR=0.301;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=34;TCR=42;TR=74;WE=2939912;WS=2939894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,81:0.99:82
chr4	3029588	rs2857844	G	A	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=9;PP=592;SC=TTGTTGTTACGGTGTCATTAC;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=14;TCR=9;TR=23;WE=3029596;WS=3029578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	3076603	.	C	CCAGCAGCAG	364.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.79;QD=52.11;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	3137674	rs363075	G	A	2973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=43;PP=2358;SC=CTTACACAGAGGGGCTCATCA;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=45;TCR=43;TR=88;WE=3137682;WS=3137664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr4	3144441	rs363107	A	G	1001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=1;PP=856;SC=TTTGATCTTTAAAAATATATG;SOR=5.353;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=26;WE=3144449;WS=3144431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	3148570	rs35892913	G	A	3337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=35;PP=2693;SC=GAGCTGTACCGTTGGGATGGC;SOR=1.480;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=66;TCR=35;TR=101;WE=3148578;WS=3148560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr4	3180021	rs363096	T	C	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=5;PP=668;SC=GTTTTTGTTTTTAGGGAATCA;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=24;WE=3180029;WS=3180011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	3219613	rs2857790	A	C	2000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=50;PP=1610;SC=CGCCATTGCTAAGGAACATCA;SOR=2.869;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=12;TCR=50;TR=62;WE=3219621;WS=3219603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr4	3230804	rs2530598	A	C	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.04;SOR=4.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	3240526	rs2858081	A	G	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=4;PP=518;SC=ACACTCAGGCACCTGCTTGCT;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=3240534;WS=3240516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	3255258	rs2798227	A	G	2277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=63;PP=1876;SC=CTCAGCCCCCACCATTTAGAG;SOR=5.610;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=3;TCR=63;TR=66;WE=3255266;WS=3255248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr4	3318413	rs2236052	A	G	4898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.073;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=110;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.809;SC=GATCCCTTTCAGAGTCGGCCG;SOR=1.658;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=45;TCR=110;TR=154;WE=3318421;WS=3318403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,163:0.99:164
chr4	3344302	.	C	G	1159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=21;PP=895;SC=TCTTTACTCTCAGTGTACTGT;SOR=1.547;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=14;TCR=21;TR=35;WE=3344310;WS=3344292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	3344891	rs2073286	T	C	77.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=1;NR=2;PP=26;SC=CCTCCCCTCCTCCTCTGTAGT;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=3344899;WS=3344881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	3444503	rs2073505	G	A	3117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=45;PP=2377;SC=CGACCCCTGCGATCCCCACTA;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=54;TCR=45;TR=99;WE=3444511;WS=3444493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr4	3445745	rs4690097	C	T	2255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=42;PP=1641;SC=GCCCCTCACACCCCCTCCCGC;SOR=0.920;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=32;TCR=42;TR=74;WE=3445753;WS=3445735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	3446132	rs1987546	C	G	1573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=40;PP=1328;SC=GCGAGTGCTTCGGGGGCCGGA;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=46;WE=3446140;WS=3446122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	3446754	rs3752440	G	A	407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=11;PP=299;SC=CGCCGCATGCGGGGCAGGCAG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=3446762;WS=3446744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	3449886	rs28468427	G	A	1080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=19;PP=863;SC=CCCTGCGGGAGGCCCTGGTCC;SOR=0.869;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=16;TCR=19;TR=35;WE=3449894;WS=3449876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	3465097	rs191800156	C	G	77.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=1;PP=25;SC=GGAACCATGACAGAAGATGAC;SOR=1.179;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=3465105;WS=3465087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	3475252	rs4325970	T	C	181.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=3;PP=146;SC=CTACGAGGGCTTGGTCCACAC;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=3475260;WS=3475242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	3487151	rs916189	A	G	1495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=15;PP=1161;SC=GGGGCCAGGCAGGGTGTCATT;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=52;WE=3487159;WS=3487141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	3487237	rs2006791	A	G	2962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=43;PP=2180;SC=CTCGGGCCAGACTGACCTGTC;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=51;TCR=43;TR=94;WE=3487245;WS=3487227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr4	3498448	rs3135164	T	C	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=7;PP=1185;SC=CCAGCCTGTGTCACTCTTGGG;SOR=3.352;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=51;TCF=43;TCR=8;TR=50;WE=3498456;WS=3498438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	3501802	rs10805009	G	C	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=0;PP=260;SC=CTCAGGATGGGGCAGCGCTGG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=3501810;WS=3501799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	3501835	rs2858035	C	A	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=504;SC=CGGTCAGGAACATGGAGCGGG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=3501857;WS=3501825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	3501849	rs2699409	T	C	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=1;PP=563;SC=GAGCGGGAACTTCCAAGGTGC;SOR=4.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=3501857;WS=3501825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	3501873	rs2699408	T	C	1239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=4;PP=931;SC=AGAGGCGGAGTGGGGAGGAGG;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=38;WE=3501881;WS=3501863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	3501924	rs2858036	A	G	1906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=20;PP=1402;SC=ACAATCTTTGAGATCTGTGCC;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=59;WE=3501932;WS=3501914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr4	3502163	rs2858037	A	G	848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=23;PP=689;SC=GGCACTGACAATTGGGGGCTG;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=3502171;WS=3502153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	3502303	rs2071700	G	C	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=4;PP=597;SC=CATCCCCTGAGGGTGTCCCCA;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=3502311;WS=3502293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	3514695	rs6789	A	G	2289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=16;PP=1737;SC=GGGCTCCCCAATGCCTTCAGA;SOR=2.439;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=52;TCR=16;TR=68;WE=3514703;WS=3514685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr4	3514938	rs1741553	A	G	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=13;PP=382;SC=GCAGCTCAGTACTAACTAGAA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=3514946;WS=3514928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	3516689	rs2515967	T	C	2689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=68;PP=2184;SC=AGTGTTCCCTTCCCGTGCTCG;SOR=3.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=10;TCR=68;TR=78;WE=3516697;WS=3516679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr4	3516742	rs1794442	A	G	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=35;PP=1029;SC=AGGACGCCAAAGGACGGCGCC;SOR=5.186;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=37;WE=3516750;WS=3516732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	3517732	rs1794444	G	C	2853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=12;PP=2371;SC=GAAACTGCGAGAATCTTGAGA;SOR=3.467;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=76;TCR=12;TR=88;WE=3517740;WS=3517722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr4	3521939	rs1741547	T	A	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=545;ReadPosRankSum=-0.733;SC=GAGGGGAGGTTCTATTTGATA;SOR=1.358;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=21;WE=3521947;WS=3521929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr4	3589623	rs10937959	G	A	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-5.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.983;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=0;PP=613;ReadPosRankSum=-1.163;SC=TGGTGCACCTGCACTTCCACA;SOR=2.792;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=50;TCR=2;TR=28;WE=3589631;WS=3589613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,29:0.55:53
chr4	3589669	.	G	GACTTCCTGGTGCACCTGC	1869.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.000;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=454;ReadPosRankSum=-0.461;SC=CCCAGATGCAGACTTCCTGGT;SOR=0.686;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=77;TCF=58;TCR=19;TR=45;WE=3589677;WS=3589659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,38:0.46:82
chr4	3589689	rs7657417	C	A	1509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.760;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=15;PP=1222;ReadPosRankSum=0.859;SC=TGCACCTGCACTTCCTGGTGC;SOR=0.571;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=136;TCF=105;TCR=31;TR=60;WE=3589697;WS=3589679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,60:0.44:135
chr4	3589719	rs59190481	CA	C	6920.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=63;PP=2951;SC=GGTTCATCTGCAACTTCCTGG;SOR=1.231;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=141;TCF=75;TCR=66;TR=137;WE=3589727;WS=3589709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr4	3589846	rs7672828	T	C	1549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.422;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=42;PP=1203;ReadPosRankSum=-0.005;SC=CTGGTGAGAATCCCTTGAGCA;SOR=1.132;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=135;TCF=44;TCR=91;TR=59;WE=3589854;WS=3589836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,61:0.44:138
chr4	3589893	rs6843750	G	A	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.410;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=32;PP=689;ReadPosRankSum=-2.023;SC=GTGCACCTGCGCCTCCAGGCA;SOR=0.382;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=69;TCF=8;TCR=61;TR=37;WE=3589901;WS=3589883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,42:0.56:75
chr4	3590537	rs73199384	G	C	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=400;ReadPosRankSum=-0.243;SC=GGAGACCCTCGCTGGGGAGGG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=3590557;WS=3590532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr4	3590549	rs73793633	G	A	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=400;ReadPosRankSum=-0.601;SC=TGGGGAGGGCGCCAAGCAGTG;SOR=0.317;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=10;WE=3590557;WS=3590532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr4	3590577	rs73793634	G	A	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=879;ReadPosRankSum=-0.163;SC=GGGTTGGGGCGTCAGCCAAGC;SOR=0.880;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=17;WE=3590596;WS=3590567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr4	3590588	rs73199385	A	C	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=879;ReadPosRankSum=1.621;SC=TCAGCCAAGCATCAGCCCCTA;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=16;WE=3590596;WS=3590567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr4	3590683	rs62272966	T	G	1912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=799;ReadPosRankSum=0.723;SC=AAACGTTCCCTGAACATGCCA;SOR=0.633;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=78;TCR=47;TR=48;WE=3590691;WS=3590673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,54:0.40:134
chr4	3590711	rs62272967	G	T	2460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=30;PP=1106;ReadPosRankSum=-0.697;SC=AGGATGCTGGGTATCAGGCTA;SOR=0.700;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=140;TCF=69;TCR=71;TR=58;WE=3590719;WS=3590701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,63:0.43:146
chr4	3590730	rs62272968	G	A	2158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.360;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=1019;ReadPosRankSum=0.160;SC=TACCTTTGCTGGACAGCTCCA;SOR=0.540;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=137;TCF=54;TCR=83;TR=55;WE=3590738;WS=3590720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,61:0.42:144
chr4	3590817	rs62272969	T	C	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.792;NF=18;NR=12;PP=1772;ReadPosRankSum=0.206;SC=CACACACACATGCACAGACAC;SOR=0.612;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=78;TCF=49;TCR=29;TR=30;WE=3590834;WS=3590807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,34:0.40:85
chr4	3590823	rs72180705	GACAC	G,GAC	2958.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.45;QD=34.81;SOR=1.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,38,47:0.45,0.55:85
chr4	3590878	rs62272970	C	T	2202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.548;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.442;NF=52;NR=10;PP=1293;ReadPosRankSum=0.592;SC=CACAGACACACACACACAGAG;SOR=0.998;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=153;TCF=122;TCR=31;TR=62;WE=3590886;WS=3590862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,65:0.41:159
chr4	3590911	rs34447251	A	C	2668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.463;NF=62;NR=19;PP=1652;ReadPosRankSum=0.960;SC=GCTCACAAGTAGAGCTCTTCG;SOR=0.725;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=199;TCF=151;TCR=48;TR=81;WE=3590919;WS=3590901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,84:0.42:202
chr4	3591015	rs62272971	A	C	3745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.728;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=64;PP=2841;ReadPosRankSum=-0.690;SC=CTGTGTATAAATTCTTTCCTT;SOR=0.599;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=372;TCF=220;TCR=152;TR=150;WE=3591023;WS=3591005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:223,156:0.41:379
chr4	3591049	rs62272972	C	T	5085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.716;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=65;PP=2587;ReadPosRankSum=-0.279;SC=TAGATGATTTCCCCCAGCTTA;SOR=0.848;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=387;TCF=201;TCR=186;TR=144;WE=3591057;WS=3591039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:246,151:0.38:397
chr4	3591069	rs62272973	C	T	5022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=79;PP=2430;ReadPosRankSum=-0.781;SC=ACCTTGAGGACTTTCGAGCAA;SOR=0.709;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=368;TCF=154;TCR=214;TR=137;WE=3591077;WS=3591059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:232,145:0.38:377
chr4	3769789	rs11269124	G	GGGGGAGCTTTCCCAGAGACCC	1924.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.94;SOR=3.664;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	4190507	.	C	CTTG	300.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=7.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQRankSum=-8.001;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.408;SOR=2.196;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,12:0.18:66
chr4	4190508	.	C	T	309.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=7.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQRankSum=-8.001;QD=4.69;ReadPosRankSum=0.574;SOR=2.196;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,12:0.18:66
chr4	4190511	.	G	GTCACTTGTTA	294.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.401;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=7.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQRankSum=-8.188;QD=4.27;ReadPosRankSum=1.236;SOR=2.290;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,12:0.17:69
chr4	4190595	rs79218997	G	C	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=34.533;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-7.199;NF=32;NR=32;PP=907;ReadPosRankSum=-3.498;SC=ATAGAAAAAGGCATGGCCAGG;SOR=2.918;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=209;TCF=118;TCR=91;TR=64;WE=4190603;WS=4190585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,19:0.11:169
chr4	4190792	rs2920255	A	C	1042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=28;PP=826;SC=TGGGAGCTGAACCTAATGCAC;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=4190800;WS=4190782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	4199622	.	C	G	1910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=35;PP=1526;SC=GGACTGCGCCCACCATGACCC;SOR=0.933;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=28;TCR=36;TR=63;WE=4199642;WS=4199612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr4	4199634	rs2916414	A	T	1971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=38;PP=1623;SC=CCATGACCCCATCAGACTTGA;SOR=1.255;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=61;WE=4199642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr4	4204299	rs2920182	T	C	1495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=37;PP=1169;SC=AGTGGATCACTCCAAACCTGA;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=45;WE=4204307;WS=4204289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	4228029	rs36055674	A	AAAG	669.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.17;QD=47.84;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	4239516	rs62286913	C	T	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.433;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-5.427;NF=25;NR=5;PP=582;ReadPosRankSum=-1.921;SC=ATTTTTCAAACGAGTTCATTT;SOR=0.267;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=70;TCF=61;TCR=9;TR=30;WE=4239524;WS=4239506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,24:0.37:65
chr4	4239539	rs62286914	C	T	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=26.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQRankSum=-5.371;QD=1.32;ReadPosRankSum=0.994;SOR=1.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,5:0.10:52
chr4	4239587	rs62286915	G	T	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=67.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.92;MQRankSum=-6.343;QD=2.26;ReadPosRankSum=-1.262;SOR=5.417;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,14:0.15:92
chr4	4239697	rs199946463	C	A	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=9.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.12;MQRankSum=-6.182;QD=1.24;ReadPosRankSum=0.424;SOR=2.699;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,11:0.13:85
chr4	4249483	rs2916466	C	T	2436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=65;PP=1987;SC=CAGATATTTCCAGTAATTCGC;SOR=3.287;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=78;TCF=13;TCR=65;TR=77;WE=4249491;WS=4249473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr4	4275976	rs11723469	A	C	2180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.98;QD=44.51;SOR=7.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	4275986	rs11723471	A	C	2493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.98;QD=40.88;SOR=8.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr4	4276132	rs7376390	T	C	5627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=95;NR=85;PP=2965;SC=TGCGCCCACGTGTGCCTCTTC;SOR=0.826;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=95;TCR=85;TR=180;WE=4276140;WS=4276122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr4	4285221	rs2980214	A	C	831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=2;PP=669;SC=AATCAATGGAACATACCAGTT;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=4285229;WS=4285211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	4301537	.	T	A	82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=24;MQ=55.03;NF=4;NR=0;PP=82;QD=29.1928031368;SC=TGTGTGTGTGTGAGAGAGAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=4301545;WS=4301527;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,4:0.80:5
chr4	4304337	rs2916382	C	T	2807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=38;PP=2220;SC=AGCCTTGTGCCGTCAGTCATT;SOR=0.859;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=50;TCR=38;TR=87;WE=4304345;WS=4304327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr4	4393068	rs3792686	T	C	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=442;SC=TTCCAAAAAGTAGTGGCTGTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=4393076;WS=4393058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	4861745	rs36059701	C	G	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=5;PP=747;SC=GCGGCCACGGCAGCCGCCATG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=4861753;WS=4861735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	5016841	rs6847131	G	T	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=505;SC=TGACATAACTGTAGTTCTCTT;SOR=4.294;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=5016849;WS=5016831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	5017146	rs67449859	A	AT	951.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.26;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	5017149	.	T	TTCATTTC	824	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=11;PP=824;QD=77.5454545455;SC=AAATTTCATTTCCATAATTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=11;WE=5017158;WS=5017139;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,11:0.50:22
chr4	5017150	.	C	A	292	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=11;PP=292;QD=29.7064738679;SC=AATTTCATTTCCATAATTTTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=5017158;WS=5017139;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	5017150	rs34659865	C	CATTTCA	952.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.31;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	5019029	rs28652843	G	A	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=577;SC=CTGATGCTACGACATGCACAG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=5019037;WS=5019019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	5019052	rs28722021	TC	AT	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=901;SC=CTTTCTTGTGTCATACGTCAC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=5019061;WS=5019042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	5021149	rs35263598	G	A	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=11;PP=361;SC=GCAGCAGCACGGGCAGAGGCC;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=5021157;WS=5021139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	5053674	rs10222952	C	T	4065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=84;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.186;SC=ATTCCCGCTTCGCGGGGCATC;SOR=0.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=48;TCR=86;TR=131;WE=5053682;WS=5053664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,134:0.98:137
chr4	5128641	rs11726208	A	G	1087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.51;SOR=5.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	5128650	rs895679	T	C	1339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.87;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	5418383	rs2301858	G	A	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=0;PP=750;SC=ATATGCATAAGTTACCAAATG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=5418391;WS=5418373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	5418539	rs168985	C	T	3780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=60;PP=2749;SC=CTGCAGCCCACGCTAACTGGA;SOR=0.776;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=55;TCR=61;TR=115;WE=5418547;WS=5418529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr4	5469810	rs2301855	T	C	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=16;PP=514;SC=AAGTCCTTCATACTGTCCCCC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=5469818;WS=5469800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	5469916	rs41268643	G	A	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=78;SC=GGAAGGTATCGCTGAGGTGAG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=5469924;WS=5469906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	5500511	rs13116133	A	C	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=335;SC=CCATCTGGCTACAGTGCACAG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=5500519;WS=5500501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	5577884	rs6840591	T	C	996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=0;PP=805;SC=CAGGTGGGTATGGGTGGGCTG;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=30;WE=5577892;WS=5577874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	5686924	rs957727	G	A	1758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=0;PP=1497;SC=ATTACTAAGGGAGCCCAGTTC;SOR=7.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=48;WE=5686932;WS=5686914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr4	5686967	rs957726	C	T	3215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=87;NR=6;PP=2647;SC=AGGGCCTATGCCCTTATCTGC;SOR=4.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=88;TCR=6;TR=93;WE=5686975;WS=5686957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr4	5687263	rs998092	A	G	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=38;PP=1082;SC=CCCCGGCTGCACCCCACCACA;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=39;WE=5687271;WS=5687253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	5730954	rs2276875	G	A	1819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=16;PP=1382;SC=CAAATGGGATGTGGCATTTTG;SOR=2.080;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=58;WE=5730962;WS=5730944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr4	5746916	rs4689313	C	T	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.03;SOR=3.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	5747078	rs2286342	A	G	1508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=34;PP=1218;SC=TGTGCGTGCCAGACTTTCTTT;SOR=1.565;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=16;TCR=34;TR=50;WE=5747086;WS=5747068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr4	5747131	rs13145958	C	A	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=23;PP=708;SC=AAATTGGCTACATTAGAGAGA;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=5747139;WS=5747121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	5750003	rs33929747	A	G	2933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=69;PP=2378;SC=CCGAAGGGCTATTGTGCGATT;SOR=2.571;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=20;TCR=69;TR=89;WE=5750011;WS=5749993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr4	5754544	rs899691	T	C	2197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=19;PP=1676;SC=GCTATGGTCCTGTGTGTTTCT;SOR=2.115;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=51;TCR=19;TR=70;WE=5754552;WS=5754534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr4	5755542	rs2302075	C	A	1340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=25;PP=1075;SC=GACCTGGTCACGGCGTCTCTG;SOR=1.005;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=41;WE=5755550;WS=5755532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	5785442	rs1383180	G	A	2048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=40;PP=1571;SC=AATCGCTTCCGGAGGCAGCAG;SOR=1.888;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=18;TCR=40;TR=58;WE=5785450;WS=5785432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr4	5830414	rs6818391	T	C	2475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=55;PP=1813;SC=ACAGCCTCAGTGTTACTTCCC;SOR=1.556;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=28;TCR=55;TR=83;WE=5830422;WS=5830404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr4	5858126	.	T	TACCATCACCACCATCATCATCATC	439.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.27;QD=43.97;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	5891590	rs41264693	G	T	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=25;PP=731;SC=TAGAGGTGAGGTTTTAGCTTC;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=5891598;WS=5891580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	5894586	rs143304363	G	A	2924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=52;PP=2059;SC=CCTCCACCGCGGCGAACATGC;SOR=0.992;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=39;TCR=52;TR=91;WE=5894594;WS=5894576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr4	5966574	rs4996083	T	C	266.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=187;SC=AATTAGATCATAGAAGGAGAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=5966582;WS=5966570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	5966618	rs6828891	A	G	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=367;SC=TCGGGAGTCGATTGTGTTCTA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=5966626;WS=5966608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	5966665	rs7442168	G	A	835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=6;PP=602;SC=GGTGTATATCGCTTGGATAAT;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=5966673;WS=5966655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	5966801	rs6839295	T	C	1818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=28;PP=1426;SC=GGCTCGGGAATAGGCCAGGAC;SOR=0.800;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=26;TCR=28;TR=54;WE=5966809;WS=5966791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	5966905	rs6857900	C	T	1089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=24;PP=837;SC=AAGCCTCCACCCAGGAACCTA;SOR=1.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=34;WE=5966913;WS=5966895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	5966943	rs6839512	T	C	822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=18;PP=582;SC=TGTCTGAGCCTTGTCATAACC;SOR=2.066;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=25;WE=5966951;WS=5966933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	5967001	rs11415729	C	CG	255.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=253;SC=TTCCATGCCCCGGGGCAGAGG;SOR=2.093;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=7;WE=5967009;WS=5966991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	5975538	rs16837960	G	A	2307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=54;PP=1895;ReadPosRankSum=-0.837;SC=TTCCTCTCCCGGCACTTCCGG;SOR=1.375;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=71;TCF=14;TCR=57;TR=68;WE=5975546;WS=5975528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,69:0.99:70
chr4	5977566	rs4689289	C	A	2978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=35;PP=2281;SC=AACAGGAAAACTACTAAACTC;SOR=1.154;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=51;TCR=35;TR=86;WE=5977574;WS=5977556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr4	5981849	rs68010642	C	T	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=2;PP=266;SC=CAAAACGCCCCGGGGTGTGGG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=5981857;WS=5981839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	5982108	rs6821688	T	C	1564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=34;PP=1198;SC=AGGTTATCCTTCAAGCAATTT;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=48;WE=5982116;WS=5982098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	5982135	rs6838551	G	T	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=10;NR=31;PP=923;SC=GCCAACAAACGGTACCCGTTT;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=41;WE=5982143;WS=5982125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	5982158	rs58696068	GT	G	532.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=24;PP=400;SC=CCACTCCGTAGTTTTTTTTTT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=24;WE=5982166;WS=5982148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	5990599	rs751240	T	C	3309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.602;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=44;PP=2734;ReadPosRankSum=-0.791;SC=CCGAGATCAGTGTCTGGAGCT;SOR=0.679;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=109;TCF=63;TCR=46;TR=107;WE=5990607;WS=5990589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,109:0.99:110
chr4	6031632	rs10461053	T	G	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=352;SC=GGCAGCCTGATGAGCTCTGAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=6031640;WS=6031622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	6087371	rs73196084	G	A	2001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=43;PP=1664;SC=AAAGGAGAAAGAATAAGCAGT;SOR=1.850;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=59;WE=6087379;WS=6087361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr4	6107765	rs10000296	T	G	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=14;PP=425;SC=GGGTCACAGCTGGGGGAGCTG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=6107773;WS=6107755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	6279047	rs10937714	C	T	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=1;PP=404;SC=TACTGAGTGTCAGCGAGATCC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=6279055;WS=6279037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	6291003	rs4689394	C	G	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=138;SC=TGGTGGCCTTCTCATTTTAGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=6291011;WS=6290993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	6292751	.	G	GTGGCAGGGGCA	435	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=1.0000;HP=1;HapScore=3;MGOF=33;MMLQ=23;MQ=62.65;NF=9;NR=0;PP=435;QD=53.1111111111;SC=GAGAGTGGGCGTGGCGCGATG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=9;WE=6292766;WS=6292745;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,9:0.82:11
chr4	6292755	rs55640037	C	CAGGGGCATG	682.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=52.52;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	6292758	.	G	A	406	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=1.0000;HP=1;HapScore=3;MGOF=33;MMLQ=24;MQ=62.0;NF=15;NR=0;PP=406;QD=29.3847475031;SC=GGCGTGGCGCGATGTCCTCTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=6292766;WS=6292745;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	6292758	rs56102017	G	GCA	670.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.13;QD=44.72;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	6292799	rs5018647	A	C	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=92;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=1;PP=729;SC=CTTCCCTGGTAACCAAGTCCT;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=6292807;WS=6292789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	6292818	rs5018648	C	G	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=4;PP=963;SC=CTGACACCTTCTATGAGTCTC;SOR=3.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=36;WE=6292826;WS=6292808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	6292909	rs9998519	C	T	5147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.76;SOR=1.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr4	6292915	rs10010131	A	G	5083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.21;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr4	6293446	rs13101355	T	C	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=204;SC=CGCTACGTGGTGCTGAGTCCA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=6293454;WS=6293436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	6293474	rs13147655	A	G	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=4;PP=362;SC=TACTGGAGGTACAGAGGTGTG;SOR=1.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=6293482;WS=6293464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	6293696	rs1801213	C	G	1150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=25;PP=890;SC=AGCAGAGGCGCATGCTGGAGC;SOR=1.802;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=36;WE=6293704;WS=6293686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	6302519	rs1801212	G	A	8775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=154;NR=123;PP=2965;SC=CTTCTTCATCGTCAGCAACCT;SOR=0.943;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=277;TCF=154;TCR=123;TR=277;WE=6302527;WS=6302509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr4	6302707	rs1801206	C	T	9015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=139;NR=138;PP=2965;SC=AGGCCGAGGTCAACTTCGGCT;SOR=0.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=277;TCF=139;TCR=138;TR=277;WE=6302715;WS=6302697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr4	6303022	rs1801214	C	T	6771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=118;NR=86;PP=2965;SC=TCGTCCTCAACGTCAGCGTCC;SOR=1.050;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=118;TCR=86;TR=204;WE=6303030;WS=6303012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr4	6303354	rs734312	G	A	4536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=54;PP=2965;SC=CTGCTGTTGCGCTGGTGGACC;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=128;TCF=73;TCR=55;TR=127;WE=6303362;WS=6303344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr4	6303955	rs1046314	G	A	4437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=78;PP=2965;SC=GCGAGTTCAAGAGCGTGCTGC;SOR=1.129;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=57;TCR=78;TR=135;WE=6303963;WS=6303945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr4	6304087	rs1046316	A	G	4118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=73;PP=2965;SC=CCCAGCTCTCACCCACCAGGC;SOR=0.874;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=65;TCR=73;TR=137;WE=6304095;WS=6304077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr4	6304242	rs1046317	T	C	1081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=30;PP=912;SC=CCATGAGGCCTTTCCCCAGTG;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=6304250;WS=6304232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	6325018	rs3796402	A	T	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=6;PP=754;SC=GGGGCCGGGAACTGCACATAC;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=6325026;WS=6325008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	6325086	rs3796403	G	A	3110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=25;PP=2352;SC=TGGTGGCGGCGATGGCAATGA;SOR=1.832;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=68;TCR=25;TR=93;WE=6325094;WS=6325076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr4	6335186	rs4689405	C	T	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=0;PP=839;SC=ACCTACATACCGGGCATATGA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=6335194;WS=6335176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	6335203	rs10937722	C	T	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=3;PP=883;SC=ATGAAAGCCACGCCTGGCTAG;SOR=4.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=34;WE=6335211;WS=6335193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	6374189	rs6837903	A	G	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.79;SOR=7.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	6374468	rs12511721	T	C	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=27;PP=643;SC=GAAGGCCAGGTGGTGGCATCA;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=6374476;WS=6374458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	6377530	rs4688997	C	G	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.72;SOR=1.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	6377534	rs4688998	A	G	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.72;SOR=1.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	6377713	rs4234738	G	C	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=21;PP=744;SC=CCGGATGGAAGAGAAGATCCA;SOR=2.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=6377721;WS=6377703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	6382919	rs62285930	C	T	2553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.174;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=41;PP=2085;ReadPosRankSum=1.237;SC=CCCCGCTCCCCGAGGCCCCAC;SOR=0.382;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=39;TCR=41;TR=79;WE=6382927;WS=6382909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,80:0.99:81
chr4	6415803	.	ATGTGTGTG	A	180	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=20;MQ=59.63;NF=0;NR=3;PP=180;QD=61.0;SC=TTGCCTGTGTATGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=3;WE=6415818;WS=6415793;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,3:0.25:12
chr4	6578487	rs4689485	A	G	2122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=51;PP=1661;SC=TTGGCCCAGTATCCTGGCAAA;SOR=2.235;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=16;TCR=51;TR=67;WE=6578495;WS=6578477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr4	6580283	rs3764809	A	G	1136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=33;PP=1020;SC=GGGCTGGGACATGGTATCAGA;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=34;WE=6580291;WS=6580273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	6591015	rs3733605	C	T	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=25;PP=717;SC=TTGCCCAGGCCGGAGTGCAGT;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=6591023;WS=6591005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	6594827	rs10937747	A	G	3117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.99;NF=94;NR=13;PP=2354;SC=CTGGGAGAACATGGCACTTGG;SOR=3.777;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=94;TCR=13;TR=107;WE=6594835;WS=6594817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr4	6594947	rs2301796	A	C	6029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=113;PP=2965;SC=AAGCCTCCCCAAGATGGGGTG;SOR=1.597;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=56;TCR=113;TR=169;WE=6594955;WS=6594937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr4	6596476	rs2301794	G	A	137.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=136;SC=GCTTCCAGGGGCTGGGGTGGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=6596484;WS=6596466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	6600012	rs2301790	A	G	1571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=33;PP=1187;SC=GATGCTGGGCATGCGCAAGCT;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=52;WE=6600020;WS=6600002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	6602255	rs2301789	A	G	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=567;SC=CATCTCACCTACCTCAGTTTC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=6602263;WS=6602245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	6602516	rs12639813	A	G	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=324;SC=GAGGGGCCTTAGCTGCTTGCT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=6602524;WS=6602506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	6606864	rs2301788	A	G	4865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=79;PP=2965;SC=CGGCACTACAACATCAGACCC;SOR=0.866;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=65;TCR=79;TR=144;WE=6606872;WS=6606854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr4	6619052	rs4689488	A	G	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=322;SC=TAGACCAGGGACATTGGGGTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=6619060;WS=6619043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	6619165	rs4689489	A	G	2131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=13;PP=1680;SC=TCTACCACCTATATGAAGTGG;SOR=2.517;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=52;TCR=13;TR=65;WE=6619173;WS=6619155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr4	6619204	rs4689490	G	A	3073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=31;PP=2450;SC=CTCAGCCAGTGACAGTGAATC;SOR=1.656;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=70;TCR=31;TR=101;WE=6619212;WS=6619194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr4	6623032	rs4234768	G	T	4091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=66;PP=2965;SC=AGATGCCCCGGCCCCAGGGCT;SOR=0.954;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=121;TCF=55;TCR=66;TR=121;WE=6623040;WS=6623022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr4	6698500	rs113431497	C	CTGAGCCTGAA	681.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=0;PP=1734;SC=GGCCCTGGCCCTGACAGCAAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=6698508;WS=6698491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	6698667	rs11734898	T	C	2570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=34;PP=1923;SC=AGGACCTGGATGCCAATGGAG;SOR=1.153;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=50;TCR=34;TR=84;WE=6698675;WS=6698657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr4	6698706	rs11733989	A	C	2455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=42;PP=1762;SC=GTGAGTTCATAGTGTTCGTGG;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=35;TCR=42;TR=77;WE=6698714;WS=6698696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr4	6718775	rs3172604	G	T	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=11;PP=329;SC=TGTCTTCCAAGTTTAAAAAAA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=6718783;WS=6718765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	6955922	rs4484301	C	G	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=368;ReadPosRankSum=-0.591;SC=CCGAGTGCACCCATGGAGTTT;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=20;WE=6955930;WS=6955912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr4	6956134	rs11732898	T	C	2920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=71;PP=2178;SC=GAGTCTTTCCTGCGTGTAGCT;SOR=1.902;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=31;TCR=71;TR=102;WE=6956142;WS=6956124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr4	6968942	rs9291126	C	T	1701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=0;PP=1471;SC=CAGAGGAAAGCTGACTTGTTT;SOR=7.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=54;TCR=0;TR=53;WE=6968950;WS=6968932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr4	6998262	.	TA	T	68.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.72;ReadPosRankSum=-0.565;SOR=0.831;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,10:0.25:40
chr4	7002803	rs2301817	C	T	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=2;PP=507;SC=TGGTTCGGGGCTAGGCACGCA;SOR=3.716;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=21;WE=7002811;WS=7002793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	7027041	rs6834102	C	T	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=23;PP=645;SC=GCAAGTGGCGCGACTCAGGAA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=7027049;WS=7027031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	7044357	rs871133	A	G	1224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=20;PP=750;SC=CCTCAGCCCCAACCTCGGCCG;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=30;WE=7044365;WS=7044347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	7044380	rs871134	C	T	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=548;ReadPosRankSum=0.531;SC=TCTTCGGGCTCGGGCTGGGGC;SOR=0.365;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=20;WE=7044388;WS=7044370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr4	7044600	rs2359010	G	A	1473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=28;PP=1128;SC=ACGGCCGCGCGGCCAGGCTTT;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=46;WE=7044608;WS=7044590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	7064003	rs11422620	A	AC	1514.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=1;PP=1602;SC=CAACAGCTGGACCCCCCACCC;SOR=6.439;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=58;TCR=1;TR=47;WE=7064011;WS=7063993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	7064214	rs9291128	T	G	4355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.31;QD=43.56;SOR=4.935;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr4	7064218	rs60881938	TA	T	4312.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.43;QD=45.40;SOR=4.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr4	7064220	rs376145748	TATATA	T	4115.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.59;QD=46.24;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr4	7064243	rs6812318	C	T	2755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.50;QD=45.18;SOR=5.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr4	7064277	rs4689585	C	T	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=49;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=27;PP=768;SC=CTCTGTATGTCGCTCAGGCTG;SOR=6.666;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=7064285;WS=7064267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	7066052	rs2359011	TA	GC	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=25;PP=1494;SC=AACTATTTACTATTACTTGGG;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=25;WE=7066061;WS=7066042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	7066103	rs201108802	CGTG	CTG,C	637.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=371;SC=GCACACTGTACGTGACATATA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=7066116;WS=7066093;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:15
chr4	7066105	rs202181611	TG	T	637.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.52;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	7066107	.	AC	TA	429	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=3;MGOF=40;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=8;PP=429;QD=60.3084843578;SC=ACTGTACGTGACATATAGAAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=7066116;WS=7066093;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,8:0.89:9
chr4	7066107	rs201458230	AC	A	637.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.52;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	7069606	rs2276969	G	A	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=2;PP=502;SC=CGGGGCCGAGGCCGGGAAGGA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=7069614;WS=7069596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	7069804	rs3822270	C	A	3860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=49;PP=2878;SC=ACCAAGCGTGCGTGCAGGCAG;SOR=1.010;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=66;TCR=49;TR=115;WE=7069812;WS=7069794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr4	7069901	rs3822269	T	C	2434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=53;PP=1829;SC=TCACCAATAATTGTGGGTCAC;SOR=2.073;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=20;TCR=53;TR=73;WE=7069909;WS=7069891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr4	7435009	rs59409649	G	A	2236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=25;PP=1622;ReadPosRankSum=-0.745;SC=CATGGGCCTCGCTAGCAGGCT;SOR=0.533;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=43;TCR=25;TR=67;WE=7435017;WS=7434999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr4	7435058	rs60816800	C	T	3171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.802;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=40;PP=2244;ReadPosRankSum=-0.842;SC=TGTTCCCCAGCGTGGAGGTGC;SOR=0.821;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=58;TCR=41;TR=98;WE=7435066;WS=7435048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,107:0.99:108
chr4	7435379	rs4689746	A	G	2889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=60;PP=2334;SC=TTGCTCTCCAAGTTGTGGGAG;SOR=1.916;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=26;TCR=60;TR=86;WE=7435387;WS=7435369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr4	7435721	rs6850206	C	T	6009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=71;PP=2965;ReadPosRankSum=0.879;SC=TTCATGCACACCTCACAGGTC;SOR=0.440;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=111;TCR=73;TR=180;WE=7435729;WS=7435711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,192:0.99:193
chr4	7436073	rs61740031	C	T	3442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=56;PP=2740;ReadPosRankSum=-0.730;SC=CTCCTTCAGGCGCCTGGCGGG;SOR=0.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=50;TCR=57;TR=106;WE=7436081;WS=7436063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,111:0.99:112
chr4	7436239	rs56402179	C	T	4131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=52;PP=2965;SC=CGGGGCCCCACGGAGCATGCT;SOR=1.162;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=77;TCR=52;TR=129;WE=7436247;WS=7436229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr4	7461769	rs12512664	A	G	2198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=18;PP=1721;SC=CATTTAGGGTAACTGAGCTGC;SOR=1.946;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=61;WE=7461777;WS=7461759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr4	7461826	rs10655902	C	CCCA	4304.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=34;PP=2939;SC=CCCAGCAGTCCCTCCCCCTGC;SOR=1.190;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=79;TCF=44;TCR=35;TR=74;WE=7461834;WS=7461816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr4	7461915	rs12498272	T	A	2080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=46;PP=1594;SC=GCGTGCCAGCTAGTAGAATCC;SOR=1.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=18;TCR=46;TR=64;WE=7461923;WS=7461905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr4	7462058	rs34961985	A	T	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=372;SC=GGCACTAACCAGCCAACCCCA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=7462066;WS=7462048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	7655855	rs2285789	C	T	2936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=45;PP=2182;SC=TTTTTCTGCCCTAAAGCTCTA;SOR=0.829;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=43;TCR=45;TR=88;WE=7655863;WS=7655845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr4	7663101	.	G	A	1060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=0;PP=901;SC=GATGCCCTCCGGACCCACAGA;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=7663109;WS=7663091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	7663167	rs2285788	A	T	2582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=15;PP=2015;SC=TGTGGGGAGCAGCTGGGGGAC;SOR=2.891;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=60;TCR=15;TR=75;WE=7663175;WS=7663157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr4	7684641	rs4689820	C	A	925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=26;PP=790;SC=TCACATCACACACCATCCTTG;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=7684649;WS=7684631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	7684661	rs4689821	CT	AC	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=769;SC=GGCGTGGATGCTAGATATAAC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=7684670;WS=7684651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	7714490	rs4689833	T	C	3911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=60;PP=2965;SC=TCCGCTCCGATTGGGAGCTGG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=60;TCR=61;TR=120;WE=7714498;WS=7714480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr4	7716932	rs6816604	T	C	9028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=145;NR=130;PP=2965;SC=TGAGCGCTCCTCCTCCTCAGA;SOR=0.829;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=275;TCF=145;TCR=130;TR=275;WE=7716940;WS=7716922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr4	7717012	rs2285781	G	A	6195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=120;PP=2965;SC=ACTGTGCCCTGGGCCAGACCT;SOR=1.345;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=189;TCF=68;TCR=121;TR=188;WE=7717020;WS=7717002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr4	7731310	rs1544402	G	A	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=540;SC=AACTCTCCCCGCAGGAGACCA;SOR=4.514;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=7731318;WS=7731300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	7731560	rs1076226	T	A	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=18;PP=534;SC=TCGCTGCATCTCAGTCTGACT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=7731568;WS=7731550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	7736455	rs6843811	G	A	1360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=28;PP=978;SC=TAAGCAGTGTGCCCAAGGTAA;SOR=1.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=7736463;WS=7736445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	7738730	rs6840685	A	C	1152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=1;PP=893;SC=GGCCAGCGGAAGGCTCCAGGG;SOR=4.977;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=34;WE=7738738;WS=7738720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	7741851	rs12501485	A	G	1235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=3;PP=977;SC=GCCTGAGGCCACGACCGTGTC;SOR=4.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=44;WE=7741859;WS=7741841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	7765566	rs730420	C	G	1601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=19;NR=37;PP=1238;SC=GAGGATCAGGCTGGGACAAGC;SOR=1.487;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=19;TCR=37;TR=56;WE=7765574;WS=7765556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr4	7770723	rs2285761	G	T	2206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=37;PP=1610;SC=GTCCGGTGCCGGAACACTGGA;SOR=1.002;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=29;TCR=37;TR=66;WE=7770731;WS=7770713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr4	7780712	rs2269877	C	G	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=375;SC=ATTGTAGAAACTGGCATAGAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=7780720;WS=7780702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	7783163	rs28542374	G	A	2409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.493;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=31;PP=1998;ReadPosRankSum=0.506;SC=CAGACTGAGCGGAGGCAGGGT;SOR=0.615;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=73;WE=7783171;WS=7783153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,75:0.99:76
chr4	7820727	rs4447865	T	A	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=268;SC=TTCTCAGAGATTGTTATCAAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=7820735;WS=7820717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	7857230	rs61742221	C	T	2238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=9;PP=1780;SC=CGGGGCTCAGCGGCACAGCTT;SOR=3.706;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=59;TCR=9;TR=68;WE=7857238;WS=7857220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr4	7984918	rs17179948	C	T	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=2;PP=899;SC=ACGACCTTGACACCACGGAGG;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=34;WE=7984926;WS=7984908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	7985392	rs4696933	C	G	2259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=57;PP=1855;SC=CCTGCAGTCACCTGGGCCATG;SOR=4.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=7;TCR=57;TR=64;WE=7985400;WS=7985382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr4	7995559	rs13130459	G	A	1909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=0;PP=1639;SC=GCTGTCAGGAGGGGGCAGCCT;SOR=8.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=53;WE=7995567;WS=7995549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr4	7995809	.	T	TAAAAGACCTGTCCTGGGTCCCTAAACTGTCTGTC	589.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.12;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	8000486	rs13108278	T	C	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=317;SC=CACCTCCTGCTGCTGGGTGGG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=8000494;WS=8000476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	8006988	rs77249161	T	C	172.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=2;PP=137;SC=GGGCTGCTCTTGTCTTCTCTG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=8006996;WS=8006978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr4	8021592	rs13131680	A	C	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=21;PP=648;SC=TGCCACCCTCATCTGCAGGAG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=8021600;WS=8021582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	8031471	rs2385904	A	G	2556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=41;PP=1958;SC=TGGAGGTCCGACACTGCTTGT;SOR=0.742;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=37;TCR=41;TR=78;WE=8031479;WS=8031461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr4	8031590	rs11942146	T	G	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=713;SC=CATTTGGTGTTTGCCCTCCTG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=8031598;WS=8031580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	8062638	rs6853485	A	C	1195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=13;PP=954;SC=GTGTGTGGACATCGAAGAGGG;SOR=1.552;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=39;WE=8062646;WS=8062628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	8062689	rs6811028	TG	CA	2092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=21;PP=2197;SC=CATTTTAATTTGTACCTTGAA;SOR=0.735;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=22;TCR=23;TR=41;WE=8062698;WS=8062679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	8062871	rs6853901	A	C	150.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=147;SC=GCATGCCCTGAGCACAGGTAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=8062879;WS=8062861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	8129382	rs13143332	A	G	876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=25;PP=722;SC=AGGATCGGGCAGGAGTGGACC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=8129390;WS=8129372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	8211624	rs1712316	C	T	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=339;SC=TCCAAGAGTCCAACCCAGGGC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=8211632;WS=8211614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	8214636	rs1712287	T	C	30.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=15.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	8216099	rs2291069	G	A	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=1;PP=738;SC=GTCCCCCGCCGGGGCCACATC;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=8216107;WS=8216089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	8216391	rs1618403	C	T	1464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=40;PP=1260;SC=AGATTACAAACTGGTGCTTTG;SOR=4.664;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=42;WE=8216399;WS=8216381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	8217829	rs1712290	C	A	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=3;PP=349;SC=CTGGGCCTGGCCTCCACAGGC;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=8217837;WS=8217819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	8219843	.	A	G	310	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=13;NR=1;PP=310;QD=24.6265151819;SC=CTGGGCAGGCATGTGTGTGTG;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=14;WE=8219851;WS=8219842;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr4	8224414	rs113477900	T	TGTC	119	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=65.19;QD=29.75;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	8228627	rs1678299	G	C	996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.31;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	8228632	rs1678300	A	C	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.85;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	8228731	rs1281145	T	C	2443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=23;PP=1766;SC=TGCCTGAGCCTGGAGCCACAG;SOR=1.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=54;TCR=24;TR=76;WE=8228739;WS=8228721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr4	8228894	rs1292647	T	C	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=34;PP=1081;SC=AAGCCGAGGATGACTGGGAGG;SOR=1.835;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=50;WE=8228902;WS=8228884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	8229218	rs1281146	A	G	2527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=32;PP=2084;SC=ACCTGTTCCTAGTGGTGGCTG;SOR=1.165;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=82;TCF=49;TCR=33;TR=81;WE=8229226;WS=8229208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr4	8229326	rs1281147	T	C	2544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=51;PP=1918;SC=TGGGGACGCCTGACCACATCT;SOR=1.055;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=36;TCR=51;TR=87;WE=8229334;WS=8229316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr4	8229713	rs1281148	A	G	4913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=59;PP=2965;SC=TCCCTGCCCAAACTTCCCACT;SOR=1.134;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=88;TCR=59;TR=147;WE=8229721;WS=8229703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr4	8229774	rs1281149	C	T	4681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=76;PP=2965;SC=CCAGGCGCTGCGCGGCCCCCT;SOR=0.706;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=75;TCR=76;TR=151;WE=8229782;WS=8229764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr4	8230070	rs1281150	T	C	1857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=29;PP=1330;SC=GGCAGGCAGCTGAGAGCTACT;SOR=0.756;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=29;TCR=29;TR=58;WE=8230078;WS=8230060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr4	8230235	rs1281151	T	C	992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=19;PP=754;SC=GGCTGCCCCTTGGGGAGTGTG;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=14;TCR=19;TR=33;WE=8230243;WS=8230225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	8237096	rs1678260	G	C	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=2;PP=619;SC=GGGGGAGTCCGACCTGGGTGG;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=8237104;WS=8237086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	8242466	rs1281103	A	G	2785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=70;NR=29;PP=2179;SC=TGGCGCTGGCAGCCGCCGTGG;SOR=1.887;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=70;TCR=29;TR=99;WE=8242474;WS=8242456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr4	8304038	rs4696797	T	C	1077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=3;PP=896;SC=GCAGCTTTGCTGGACCGCAGG;SOR=4.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=33;WE=8304046;WS=8304030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	8390859	rs13136987	G	A	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=3;PP=1012;SC=GGAATGACAGGAAATCAGGAG;SOR=3.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=36;WE=8390867;WS=8390849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	8391049	rs2242483	A	G	3429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=67;PP=2674;SC=GGTGGAAGACAGGAACCCAAA;SOR=1.101;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=44;TCR=67;TR=111;WE=8391057;WS=8391039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr4	8394376	rs11934603	C	T	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=285;SC=CACTGTGGTACGCTCATACCA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=8394384;WS=8394366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	8451656	.	A	ATTTTCTTTTC	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.75;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	8454639	rs1880024	A	G	3138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=61;PP=2432;SC=GGCTGAGAGGAGACTAACTGC;SOR=1.225;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=35;TCR=61;TR=96;WE=8454647;WS=8454629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr4	8456701	rs2002860	C	G	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=706;SC=GAAAAAGAGACATGAAACTAG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=8456709;WS=8456691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	8467375	rs10009833	C	T	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=564;SC=ATGAACCATGCTGTAACGTTC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=8467383;WS=8467365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	8473050	rs2631768	G	A	831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=25;PP=696;SC=AGCAAGTTCCGCGGTGCCCCA;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=8473058;WS=8473040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	8477385	rs10938715	G	C	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=1;PP=879;SC=TGTTCCGGTTGTATCCCTGAC;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=8477393;WS=8477375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	8594574	rs2302583	T	C	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=6;PP=806;SC=CCGCCCCCGCTGCCGCTGCTG;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=8594582;WS=8594564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	8594815	rs4411969	T	G	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=341;SC=GGACTGGTAGTGTGACCTCTC;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=8594823;WS=8594805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	8601470	rs151215420	CCT	C	706.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=601;SC=CCTCTCCATCCCTCTCCAGTC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=13;WE=8601479;WS=8601460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	8602793	rs4299567	T	C	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=331;SC=AAATGTCTGATGCGTGACGGT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=8602801;WS=8602783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	8602816	rs4594711	A	G	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=0;PP=559;SC=GGGCCACTGCAGGAGGGACTG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=8602824;WS=8602806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	8602884	rs4301095	T	C	2302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=10;PP=1903;SC=GGACCTGCAGTGATGCCGCCT;SOR=3.489;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=62;TCR=10;TR=72;WE=8602892;WS=8602874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr4	8602935	rs4431213	A	G	3407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=34;PP=2587;SC=AGCACCGGTCATGGGAGGTGG;SOR=1.876;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=84;TCR=34;TR=118;WE=8602943;WS=8602925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr4	8603117	rs35993494	A	T	5094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.636;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=70;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.862;SC=GAGGTCTGCCAGCCCGCCTTC;SOR=0.695;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=164;TCF=92;TCR=72;TR=162;WE=8603125;WS=8603107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,163:0.99:164
chr4	8613917	rs12511563	C	G	107.28	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	8613918	rs12508541	G	T	107.28	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	8616054	rs2302572	C	T	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=2;PP=640;SC=GCGGCTGACACCCCTGACGTC;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=8616062;WS=8616044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	8616070	rs2302571	T	C	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=3;PP=770;SC=ACGTCCCCGCTGTCTCTGTGC;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=8616078;WS=8616060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	8616096	rs1131140	T	C	1514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=7;PP=970;SC=GCATGTCCGATTTCAACTACC;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=8616104;WS=8616086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	8616179	rs7378066	T	C	2888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=37;PP=2280;SC=GCCCTGTACATACTCTGGCAG;SOR=1.119;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=55;TCR=37;TR=92;WE=8616187;WS=8616169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr4	8620045	rs4444816	A	G	1204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=5;PP=1083;SC=TCTGTGGGGTAGTTCCCCCTA;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=39;WE=8620053;WS=8620035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	8620325	rs4696872	A	G	1563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=42;PP=1294;SC=GGCAGCCGGCACCCTCAGGCA;SOR=4.849;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=45;WE=8620333;WS=8620315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	8620873	rs13132404	G	A	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=336;SC=AGAGGCAAGTGCACATTTGGC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=8620881;WS=8620863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	8621194	rs28514374	A	G	2103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=47;PP=1682;SC=CCCACGACCCACTGGGAGGTG;SOR=2.338;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=17;TCR=48;TR=64;WE=8621202;WS=8621184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr4	8621386	rs1050464	A	G	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=15;PP=416;SC=ACCGAGGCCCATCTCCGCATC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=8621394;WS=8621376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	8869587	rs13303225	T	C	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=3;PP=329;SC=CAGCGGCGGCTGCGGCCGGGG;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=8869595;WS=8869577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	9370690	rs10032245	G	C	1014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=32.73;SOR=6.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	9370897	rs6857841	C	T	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=471;SC=AATATCAGTGCCTAGTGCCTA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=9370905;WS=9370887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	9783915	rs148402761	C	T	1601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=11;PP=1770;SC=CGTGTCAGACCTTTTCGTGGC;SOR=2.400;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=46;WE=9783925;WS=9783895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	9836366	rs3775950	T	C	210.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=1;PP=171;SC=GCCCAAAGCATAGTTTCTTCC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=9836374;WS=9836356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	9889487	rs56399359	G	A	218.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=180;SC=TGAAGCCTGTGATGAGTTTGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=9889495;WS=9889477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	9892102	rs10939602	T	C	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=3;PP=677;SC=AGATGAGATGTCCCCGGGGAG;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=9892110;WS=9892092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	9909850	rs2280204	T	G	1078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=7;PP=983;SC=TAACCCTCAGTTGACTTACAG;SOR=2.517;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=9909858;WS=9909840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	9943700	rs4292327	G	A	4011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=95;PP=2965;SC=GCTGAGTGCAGTGGCCTTTGG;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=34;TCR=95;TR=129;WE=9943708;WS=9943690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr4	9982330	rs13125646	A	G	3448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=37;PP=2566;SC=AGATCTCACTAAGGTACATGG;SOR=1.200;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=63;TCR=37;TR=100;WE=9982338;WS=9982320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr4	9998440	rs10939650	C	T	2886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=28;PP=2145;SC=TCACAATTAACGTCCCCACAA;SOR=1.561;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=58;TCR=28;TR=86;WE=9998448;WS=9998430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr4	9998493	rs13113918	A	G	3191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=38;PP=2459;SC=GACCAGAGCAAAGTCAGAGTG;SOR=0.969;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=53;TCR=38;TR=91;WE=9998501;WS=9998483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr4	9998605	rs28592748	T	C	1607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=40;PP=1342;SC=CCTTCTGTTCTCTCCTGCTGC;SOR=2.655;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=49;WE=9998613;WS=9998595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	10027509	rs61256984	GA	G	2433.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.40;MQRankSum=0.256;QD=24.58;ReadPosRankSum=1.523;SOR=0.317;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,98:0.99:99
chr4	10027542	rs6820230	C	T	3270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.090;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.192;NF=55;NR=48;PP=2496;ReadPosRankSum=0.772;SC=TTCTTTTTCGCTGAATCACTT;SOR=0.311;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=55;TCR=49;TR=103;WE=10027550;WS=10027532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,109:0.99:110
chr4	10027643	rs6449237	A	G	1865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=2.668;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.59;ReadPosRankSum=0.789;SOR=0.299;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,59:0.97:61
chr4	10027744	rs6449238	G	A	1014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.093;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=29;PP=822;ReadPosRankSum=0.511;SC=GCTCTGGCTGGGATGCCAGGA;SOR=3.258;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=34;WE=10027752;WS=10027734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,34:0.94:36
chr4	10090178	rs4235349	T	C	3957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=27;PP=2965;SC=GGGAGGGCGATGTCTAAGTTC;SOR=2.556;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=97;TCR=27;TR=124;WE=10090186;WS=10090168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr4	10094671	rs3822247	G	A	3073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=36;PP=2364;SC=TCTCACCACCGAGGAAACCGA;SOR=1.261;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=60;TCR=36;TR=96;WE=10094679;WS=10094661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr4	10094783	rs3822245	T	C	2415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=55;PP=1728;SC=AGCACACACATGCTCACTACC;SOR=1.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=26;TCR=55;TR=81;WE=10094791;WS=10094773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr4	10099340	rs13441	T	C	1128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=12;PP=830;SC=CTTACGCCAATTGTGAACTTG;SOR=1.552;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=38;WE=10099348;WS=10099330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	10100801	rs2241484	T	C	99.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.98;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	10100812	rs2241485	A	G	44.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	10105797	rs3756223	T	C	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=9;PP=268;SC=CTCTGGGTGATAGAATTTCAT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=10105805;WS=10105787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	10118377	rs11557743	C	G	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=14;PP=471;SC=AGGCCGAGCCCGGGGACTGGA;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=10118385;WS=10118367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	10446385	rs9291410	C	T	6023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=66;PP=2965;SC=CTGCTGTGAGCTACTGTGTAA;SOR=1.185;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=110;TCR=66;TR=176;WE=10446393;WS=10446375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr4	10446906	rs10016022	A	G	4960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=114;PP=2965;SC=CAACCTTCACATCTATCAACT;SOR=2.245;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=42;TCR=115;TR=156;WE=10446914;WS=10446896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr4	10447640	rs10016702	A	G	2883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=41;PP=2415;SC=GTCGCACTGGAATTATTGCTC;SOR=0.791;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=39;TCR=41;TR=80;WE=10447648;WS=10447630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr4	10502937	rs2903960	T	G	3012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=14;PP=2363;SC=CCAGGAAGCGTATTTTTACAT;SOR=3.044;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=86;TCF=71;TCR=15;TR=85;WE=10502945;WS=10502927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr4	10509699	rs2868941	T	C	2117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=64;PP=1632;SC=TTAGGGTCAATGGGAAGTATG;SOR=3.826;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=8;TCR=65;TR=72;WE=10509707;WS=10509689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr4	10525711	.	A	AGAGGAG	186.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.37;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	10527342	rs2108878	C	T	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=574;SC=TCTTGAGCCTCATTATTGGGC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=10527350;WS=10527332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	10542058	rs1962796	C	G	2367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.00;SOR=2.062;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr4	10586384	rs12640119	G	T	1077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=0;PP=893;SC=GACAGTCACAGATCAGGCTGT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=10586392;WS=10586374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	10669522	rs13136927	A	C	2888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.364;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=41;PP=2366;ReadPosRankSum=-1.093;SC=GGTAAGAGGGATCTTCAATTC;SOR=0.770;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=98;TCF=55;TCR=43;TR=95;WE=10669530;WS=10669512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,95:0.97:98
chr4	13475414	rs34962392	TATC	T	707.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=10;PP=590;SC=AATACAGCATTATCATAGTAA;SOR=1.739;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=13475424;WS=13475404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	13548796	rs2080023	T	G	3275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=52;PP=2507;SC=GAGGTGGTTGTATGCCCAGAG;SOR=0.884;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=42;TCR=52;TR=94;WE=13548804;WS=13548786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr4	13548911	rs73231543	C	A	1162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=33;PP=961;SC=CGCGACCGCGCGGGCGTGCCT;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=13548919;WS=13548901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	13571867	rs17806666	C	A	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=29;PP=776;SC=AAGAGAAAAACCCAGTAACAT;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=13571875;WS=13571857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	13577465	.	T	C	1898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=44;PP=1447;SC=CAGCAAATAATGCTTGTTTAA;SOR=1.508;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=22;TCR=44;TR=66;WE=13577473;WS=13577455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
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chr4	13584108	rs17745075	A	G	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=536;SC=GCACACTTTGAGTATAGCAGG;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=13584116;WS=13584098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	13593336	rs758975	A	G	219.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=180;SC=AAAGTTCTTTATCAGTGGGTA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=13593344;WS=13593326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	13604182	rs17745676	T	C	2967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=48;PP=2434;ReadPosRankSum=-0.811;SC=TATTTTTCTGTATTCAGGCCT;SOR=0.314;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=40;TCR=49;TR=88;WE=13604190;WS=13604172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,91:0.99:92
chr4	13604418	rs17745712	G	C	3459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=49;PP=2702;SC=AGCCTGGTGAGCTTCTGGAAT;SOR=0.927;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=61;TCR=49;TR=110;WE=13604426;WS=13604408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr4	13606576	rs1971278	A	T	3128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=50;PP=2556;SC=TCTCTTTCTAATTTGGATTCA;SOR=0.845;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=90;TCF=39;TCR=51;TR=89;WE=13606584;WS=13606566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr4	13612486	rs1491251	C	T	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=424;SC=CACATCAGTACCTTGCAGATA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=13612494;WS=13612476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	13615174	rs2035820	G	A	4236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=49;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.903;SC=GCTATCAGACGTTACAACTTC;SOR=1.246;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=78;TCR=50;TR=126;WE=13615182;WS=13615164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,137:0.99:139
chr4	13615293	rs2109917	C	A	2598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=65;PP=2143;SC=AATCTTCAAGCGGAAAATAAA;SOR=2.862;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=80;TCF=14;TCR=66;TR=79;WE=13615301;WS=13615283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr4	13629721	rs12499127	G	A	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=39;PP=1101;SC=ATAGACATTTGTAATGCGAAC;SOR=5.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=41;WE=13629729;WS=13629711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	15004655	rs7435318	G	A	4822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=70;NR=82;PP=2965;SC=GAAACTCCCCGACCACCACCC;SOR=0.920;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=70;TCR=83;TR=152;WE=15004663;WS=15004645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr4	15005604	rs112476821	G	A	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=16;PP=1160;SC=GGCTCGCTCAGCGCCATGCCG;SOR=1.364;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=45;WE=15005612;WS=15005594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	15009232	rs1874207	C	T	1685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=45;PP=1325;SC=ATGTAAATGACCTTATCTCTA;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=45;WE=15009240;WS=15009222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	15059987	rs987399	AA	GG	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=996;SC=ATAGTACTGAAATTTGGAGTA;SOR=4.294;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=16;WE=15059996;WS=15059977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	15480225	rs9993580	A	C	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=0;PP=542;SC=ACTGTCCCCCAACTCACACTC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=15480233;WS=15480215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	15482477	rs10000250	A	G	1351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=24;PP=1015;SC=CCATTCAGCTACTGCTTGTTA;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=37;WE=15482485;WS=15482467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	15503994	rs144502190	T	TTTTTC	539.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=604;SC=GTAATTTTCCTTTTTCTTTTC;SOR=3.767;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=12;WE=15504002;WS=15503984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	15521403	rs73235032	G	A	1348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=20;PP=1023;SC=TAAGAACGGCGCAGGAAAGAC;SOR=0.919;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=26;TCR=20;TR=46;WE=15521411;WS=15521393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	15534713	rs4698397	G	A	182.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=147;SC=TTCAAAATACGGTAGCTATCA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=15534721;WS=15534706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	15538744	rs1558572	T	G	1480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=36;PP=1228;SC=GGCCAGGAAGTGTCTGGGAGG;SOR=2.935;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=44;WE=15538752;WS=15538734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	15539453	rs73237160	A	G	1680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=2;PP=1383;SC=CCATCTGGCTATGAAGACTGT;SOR=5.507;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=46;WE=15539461;WS=15539443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	15539498	rs1861044	A	G	3140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=30;PP=2499;SC=CCTGTTTGATATCATGTTGCC;SOR=1.634;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=65;TCR=30;TR=95;WE=15539506;WS=15539488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr4	15568992	rs13121363	T	C	963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=6;PP=745;SC=ATACATTTTCTCTCCTAGCAA;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=15569000;WS=15568982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	15569146	rs13116304	A	C	1743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=26;PP=1321;SC=TTGCCCCTTAAGTTTTTAAGA;SOR=1.071;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=34;TCR=26;TR=60;WE=15569154;WS=15569136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr4	15575718	rs4280723	C	G	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=302;SC=ACTTGCCTCTCAACTTCTGTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=15575726;WS=15575708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	15587897	rs6832789	A	T	3019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=76;PP=2499;SC=ACAGATTTAGAAACTTGAGCT;SOR=3.118;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=16;TCR=76;TR=92;WE=15587905;WS=15587887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr4	15602773	rs80080596	C	CTTA	580.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=3;PP=744;SC=ATCCAGAACACTTATCTTAAT;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=15602781;WS=15602763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	15603069	rs1134634	G	C	264.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=220;SC=TGTACTTTCTGTATCATGTAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=15603077;WS=15603059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	15632228	rs3775956	A	G	1449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=0;PP=1339;SC=TAATAATTATAAGTACTTAAT;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=42;WE=15632236;WS=15632218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	15689632	rs11729955	G	A	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=21;PP=1037;SC=ATCTCATGGAGGTATTGAAAA;SOR=0.843;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=18;TCR=21;TR=39;WE=15689640;WS=15689622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	15690233	rs6449160	C	A	2490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=22;PP=1979;SC=TGCTTTTCGACACCCTGAATC;SOR=1.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=51;TCR=22;TR=73;WE=15690241;WS=15690223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	15706466	rs3756247	T	C	1968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=52;NR=3;PP=1550;SC=CTGATTTTTGTTCCTTCTGTG;SOR=4.840;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=52;TCR=3;TR=55;WE=15706474;WS=15706456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr4	15706502	rs35181008	G	GTC	3000.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=12;PP=2837;SC=TGTTTGTGATGTCTTTCTTGT;SOR=2.899;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=64;TCF=50;TCR=14;TR=61;WE=15706510;WS=15706492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr4	15937731	rs2072313	T	C	3207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=43;PP=2639;SC=TCTCTTTGCCTTTGATGTGCT;SOR=0.778;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=49;TCR=43;TR=91;WE=15937739;WS=15937721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr4	15964485	rs758329	G	A	1848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=20;PP=1358;SC=TTCCAGTAAGGTTTGGGGTCA;SOR=1.355;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=55;WE=15964493;WS=15964475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr4	15964573	rs758328	A	G	2586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=31;PP=2046;SC=GGCAGTCGACACGAAGCCAGA;SOR=1.364;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=57;TCR=31;TR=88;WE=15964581;WS=15964563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr4	15972905	rs11735976	T	C	1261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=34;PP=1058;SC=AAAAACAGCATAGAAGATAAA;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=15972913;WS=15972895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	15977572	rs11734657	T	C	598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=1;PP=477;SC=ACCCTTGGAGTTCTACTATAG;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=15977580;WS=15977562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	15981332	.	C	T	121	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=4;NR=1;PP=121;QD=31.1542425094;SC=CTTGAGCACCCTCTATGTGCC;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=15981340;WS=15981331;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	15981885	rs3841512	G	GA	2423.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.227;NF=81;NR=0;PP=1771;ReadPosRankSum=-0.214;SC=TCAGTACCAAGAAAAAAAAAT;SOR=7.591;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=89;TCF=89;TCR=0;TR=81;WE=15981893;WS=15981875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
chr4	15981926	rs58036643	TA	T	70.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-2.060;QD=1.07;ReadPosRankSum=1.125;SOR=0.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,21:0.32:66
chr4	15981944	.	G	A	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.417;ClippingRankSum=0.000;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=57.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=1.657;QD=1.61;ReadPosRankSum=-6.987;SOR=6.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,38:0.27:143
chr4	15982166	rs6449209	A	G	2202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=62;PP=1911;SC=AAATTCTAGGAAAAAAAAATC;SOR=6.932;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=63;TCF=1;TCR=62;TR=63;WE=15982174;WS=15982156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr4	15982229	rs368346472	ATTTTTTT	A	587.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.89;QD=32.65;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	15986042	rs7675574	G	A	2175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=49;PP=1746;SC=GGAATGAGACGTGCCATTTAC;SOR=1.965;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=20;TCR=49;TR=69;WE=15986050;WS=15986032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr4	15986113	rs7659341	T	C	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=21;PP=583;SC=CCCCAACTCCTGGGTCACAGA;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=15986121;WS=15986103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	15986168	rs56331443	T	A	739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=479;SC=GGAACTGGGCTCCACAGCAGG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=15986176;WS=15986158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	15987509	.	T	TTTAAG	1035.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.32;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	15987512	.	T	TGCTTATTTAATCTGTATTAAATATTTAATACAGATAA	2030.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=84.61;SOR=4.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	15989191	rs2191004	C	T	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=3;PP=606;SC=CTTTTTTTTTCAACTTAAAGT;SOR=4.294;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=35;WE=15989199;WS=15989180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	15989500	.	C	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.896;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.89;MQRankSum=-4.988;QD=1.51;ReadPosRankSum=-3.070;SOR=0.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr4	15991275	rs2240685	G	A	2759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.415;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=17;PP=2231;ReadPosRankSum=-0.296;SC=AGCATGTGTCGTGAGGCTAAA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=87;TCF=69;TCR=18;TR=85;WE=15991283;WS=15991265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,88:0.98:90
chr4	16002050	rs6449212	T	C	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=0;PP=717;SC=CTTAAAGTAATGCACAATATA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=16002058;WS=16002040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	16005061	rs6825026	T	C	4935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=89;PP=2965;SC=CTGCTTTCCATAACCTCAGAA;SOR=1.349;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=52;TCR=89;TR=141;WE=16005069;WS=16005051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr4	16014736	rs16892775	C	A	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=0;PP=1152;SC=TTGTTTTTAACTGTCCGAATG;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=38;WE=16014744;WS=16014726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	16024885	rs2013854	A	G	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=9;PP=1355;SC=AAGAGTGAGCAAGCCTGCCAA;SOR=2.998;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=47;TCR=9;TR=56;WE=16024893;WS=16024875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	16025837	rs17478336	C	T	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=4;PP=884;SC=CTTTCACGTACGTCATTTCTT;SOR=3.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=34;WE=16025845;WS=16025827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	16168512	rs11724423	C	A	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=598;SC=GGTGGGGGGGCATGGGACGGT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=16168520;WS=16168502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	16172181	rs1662654	C	T	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=265;SC=CTGGCATAGACTGGGAGTAGT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=16172189;WS=16172171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	16189991	rs75841626	A	T	2530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.45;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr4	16190073	rs28645901	T	G	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=370;SC=AGATCTGTGTTTTAAATCCTA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=16190081;WS=16190063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	16192413	rs7666361	C	T	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=23;PP=1367;SC=GATTTTCATACGCTGAATGCT;SOR=0.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=27;TCR=23;TR=50;WE=16192421;WS=16192403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr4	16198378	rs10939652	A	G	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=22;PP=986;SC=AAGAGAGAAGATTGTAATGTT;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=20;TCR=22;TR=42;WE=16198386;WS=16198368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	16198439	rs10939653	T	C	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=24;PP=765;SC=TAAAACCTGGTGTTACGAAGA;SOR=1.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=34;WE=16198447;WS=16198429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	16215537	rs12651110	T	G	2187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=37;PP=1749;SC=GAAAAGAAAATGACAGAAAAC;SOR=0.844;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=33;TCR=37;TR=70;WE=16215545;WS=16215527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr4	16504184	rs872478	G	C	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=25;NR=8;PP=802;SC=TATCTCTTCTGTTTCCTCTCC;SOR=2.235;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=16504192;WS=16504174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	16510131	rs9993371	C	T	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=2;PP=617;SC=GTTAGGATTTCGGGCCTAAGA;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=16510139;WS=16510121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	16597280	rs1506462	T	A	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=260;SC=TCTTTAATGCTCTCAGAGTAG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=16597288;WS=16597270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	16753863	rs283027	A	C	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=110;SC=TCAGTGAACAAGATACAGAGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=16753871;WS=16753853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	17492145	rs731437	T	C	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=165;SC=TGATGTGCAATGCATCCTCAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=17492153;WS=17492135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	17494054	rs2597772	A	G	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=24;PP=762;SC=TCTATTCCCTAAAAACTTTAT;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=17494062;WS=17494044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	17503561	rs3733573	T	C	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=19;PP=604;SC=AGCCCCACACTCAGGGAGGCC;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=17503569;WS=17503551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	17511127	rs3733574	T	C	256.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=187;SC=TGTGGGAGGATCTCTTGAGGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=17511135;WS=17511117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	17513498	rs3217604	GC	G	1263.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=7;PP=1063;SC=CCTCTAGACTGCCCCCCGCCG;SOR=3.003;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=34;WE=17513506;WS=17513488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	17517099	rs1551091	A	G	1050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=22;PP=790;SC=GAGGGTGTAAAGTGCGGCAGT;SOR=1.547;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=34;WE=17517107;WS=17517089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	17590686	.	A	AT	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=-2.621;QD=1.79;ReadPosRankSum=-1.415;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,11:0.22:49
chr4	17634213	rs6825562	A	G	2322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=42;PP=1854;SC=TTTCTGCTGGACTTCTTTGGC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=29;TCR=42;TR=71;WE=17634221;WS=17634203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr4	17689974	rs4698646	T	C	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=3;PP=413;SC=CAGCATGTGTTACTGGGGACA;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=17689982;WS=17689964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	17694880	rs6449324	G	C	1394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=2;PP=1093;SC=AAGCTCCCAGGGACCAGAAAC;SOR=5.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=39;WE=17694888;WS=17694870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	17694916	rs3822235	A	G	2083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=16;PP=1521;SC=GCATTTGGTCAGGGCTCACCT;SOR=2.211;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=53;TCR=16;TR=69;WE=17694924;WS=17694906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr4	17694943	rs3733579	A	G	3566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=33;PP=2676;SC=GAGAATTCTGAAGCTTCACAT;SOR=1.526;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=68;TCR=33;TR=101;WE=17694951;WS=17694933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr4	17707361	rs57570581	G	A	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=1;PP=689;SC=CCCCAGGGCTGGGTCAGACAC;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=17707369;WS=17707351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	17707627	rs62295656	C	A	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=285;SC=TCCAACATCCCCTGTGTAATT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=17707635;WS=17707617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	17711076	rs3733583	T	C	2180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=43;PP=1803;SC=TCAGCCTCTTTTGCAGCTCCA;SOR=1.574;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=22;TCR=43;TR=65;WE=17711084;WS=17711066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr4	17812615	rs2074974	A	C	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=4;PP=510;SC=ATAGAAGACTACTCGGAGAGC;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=17812623;WS=17812605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	17818885	rs2302212	T	C	2997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=33;PP=2237;ReadPosRankSum=-0.761;SC=ACTCAATAGATGCTGTGAAAC;SOR=0.679;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=67;TCR=33;TR=99;WE=17818893;WS=17818875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,102:0.99:103
chr4	17841948	rs2286534	T	A	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=642;SC=ATGAATGAAATTTTTTTTCTA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=17841956;WS=17841938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	17875735	rs78581007	TCTC	T	7405.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.223;NF=62;NR=70;PP=2965;ReadPosRankSum=0.683;SC=ATCTTAAGTTTCTCCTTTTAG;SOR=0.242;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=145;TCF=65;TCR=80;TR=132;WE=17875745;WS=17875725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,169:0.99:170
chr4	20256722	rs1323066	G	A	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=37;PP=1030;SC=TCGCGGTTGCGTGTGGGCCGG;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=39;WE=20256730;WS=20256712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	20259621	rs139749288	A	AT	748.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=509;SC=AAAATACTTAAATTTCAAGCA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=13;WE=20259630;WS=20259611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	20259622	rs61790829	A	T	757.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=393;SC=AAATACTTAAATTTCAAGCAT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=20259630;WS=20259611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	20487911	.	T	A	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.120;ClippingRankSum=-0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=184;ReadPosRankSum=-1.173;SC=AGTCACAATATATGTAAAAGT;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=8;WE=20487919;WS=20487901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr4	20487975	rs76469534	C	G	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=8;PP=670;SC=AAGCAAAGGACAGGACCACTG;SOR=1.358;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=24;WE=20487983;WS=20487965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	20490710	rs543593	T	G	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=295;SC=TCACTAATGTTCAATTGTGCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=20490718;WS=20490700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	20520993	rs519813	T	C	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=2;PP=304;SC=TCATTTAAAATATTTTTTTCA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=20521001;WS=20520983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	20526985	rs146437952	C	CAT	287.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=293;SC=TGATGTTAAACATATATTATT;SOR=2.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=7;WE=20526993;WS=20526975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	20533700	rs3215198	A	AT	595.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=438;ReadPosRankSum=1.158;SC=CTTGTTAGCTATTTTTTTTAT;SOR=1.609;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=19;WE=20533708;WS=20533690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr4	20535460	rs74466092	T	TTC	387.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=408;SC=CTCTTTCACATTCTCTGTTAC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=9;WE=20535468;WS=20535450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	20555358	rs3830489	T	TTG	440.19	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5743;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=583;ReadPosRankSum=-1.493;SC=ACTTCCATACTTGTGTGTGTG;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=13;WE=20555366;WS=20555348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,15:0.88:17
chr4	20569099	rs2290750	A	G	2337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=42;PP=1681;SC=TGTATGTGCCAAGAACTACTT;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=22;TCR=42;TR=64;WE=20569107;WS=20569089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr4	20597170	rs79994812	C	T	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=1;PP=755;ReadPosRankSum=-0.837;SC=CAGAACAGTTCGATTTTCTAG;SOR=3.912;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=27;WE=20597178;WS=20597160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr4	20599783	rs67622693	CAT	C	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=485;SC=ATCAGGAAAACATAAACCATA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=20599804;WS=20599773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	20599796	rs12507257	A	G	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=492;SC=AAACCATAGTAAAACCTGTTC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=20599804;WS=20599773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	20620683	rs1379659	G	A	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=565;ReadPosRankSum=-0.913;SC=CTTCTTGACCGTGTGGGACTA;SOR=3.690;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=20620691;WS=20620673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr4	20621846	rs9070	G	C	79.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=58;SC=TTGCCCTTTTGTGGGGGTGAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=20621854;WS=20621836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	20760683	rs17623902	A	G	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=18;PP=479;SC=TGTTTGTTCCAGTTCTCACAA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=20760691;WS=20760673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	20884482	rs57696441	G	GA	76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=74;SC=CCCCCGAAAGGAAAAAAAAAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=20884490;WS=20884472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	21699127	.	T	A	1064.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=42;PP=1263;ReadPosRankSum=0.687;SC=ATAATAATAATAAAAAGAGAG;SOR=1.426;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=47;WE=21699135;WS=21699117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,36:0.95:38
chr4	21764761	rs717531	C	T	3589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=67;PP=2778;SC=AATTCCTTCACTGTGGTTGAA;SOR=1.428;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=38;TCR=67;TR=105;WE=21764769;WS=21764751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr4	21950259	rs6448102	A	G	2336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=33;PP=1620;SC=ATTCATGTCTAGGGACGCAGG;SOR=0.855;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=42;TCR=33;TR=75;WE=21950267;WS=21950249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr4	22390167	rs9002	C	T	3625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=30;PP=2832;ReadPosRankSum=-0.728;SC=TGGTGGACCACGAAGAACGCA;SOR=0.898;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=79;TCR=30;TR=108;WE=22390175;WS=22390157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,114:0.99:115
chr4	22404443	rs3733312	C	T	2795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=47;PP=2172;SC=AAAGAAAGATCCATTCTAGCA;SOR=0.997;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=36;TCR=48;TR=83;WE=22404463;WS=22404433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr4	22404455	rs3733311	T	C	2352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=38;PP=1746;SC=ATTCTAGCAGTACTTCTCTCC;SOR=0.920;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=32;TCR=39;TR=70;WE=22404463;WS=22404433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	22416076	rs9992521	C	T	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=199;SC=TTTTAAATAACAAATTATTCA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=22416084;WS=22416066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	22425877	rs61744997	A	G	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=5;PP=356;SC=GACACTGCACAATCCTACTGC;SOR=1.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=15;WE=22425885;WS=22425867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	22444251	rs374500461	CA	C	170.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=1.358;QD=2.67;ReadPosRankSum=0.514;SOR=0.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,19:0.30:64
chr4	22444692	rs10018144	C	T	1087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=13;PP=843;SC=AATTTCATAACCAGTTCTGAC;SOR=1.148;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=34;WE=22444700;WS=22444682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	22456381	rs10003859	T	A	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=412;SC=ATGGCTTCTATAACCCCTACA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=22456389;WS=22456371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	22456431	rs10003883	T	A	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=9;PP=592;SC=TCATACATATTTAGGTACTGG;SOR=1.220;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=25;WE=22456439;WS=22456421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	22749783	.	GTA	G	114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=160;ReadPosRankSum=0.508;SC=ACAGGCATATGTATATATATA;SOR=0.223;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=4;WE=22749792;WS=22749773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr4	22820504	rs358231	A	T	1890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=40;PP=1526;SC=CCAAGGAATAAGCCAAGATCA;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=22;TCR=40;TR=62;WE=22820512;WS=22820494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
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chr4	24538573	rs4697063	A	G	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=349;SC=GGTTTCTAATATAAGTTGTCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=24538581;WS=24538563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr4	24801949	rs2695232	C	T	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=1;PP=55;SC=AACAGACACCCTCCACTCTGA;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=24801957;WS=24801939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	24809884	rs1019229	T	C	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=400;SC=ACAGGATCAGTGCGTTTTCTC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=24809892;WS=24809874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	24896473	rs59796303	G	A	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=0;PP=776;SC=TCTCAAAGTCGCTGACACCCC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=27;WE=24896481;WS=24896463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	24896580	rs59614850	C	T	2761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=34;PP=2174;ReadPosRankSum=0.409;SC=AAAACATAGGCTTAAAGTCCC;SOR=0.384;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=50;TCR=34;TR=83;WE=24896588;WS=24896570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
chr4	24896658	rs12511068	C	T	2218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=58;PP=2143;ReadPosRankSum=-0.433;SC=ATGATGATGACGACGACGATG;SOR=1.164;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=91;TCF=32;TCR=59;TR=88;WE=24896666;WS=24896645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,75:0.97:77
chr4	25001439	rs7689760	T	C	2475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=34;PP=1916;ReadPosRankSum=-0.033;SC=CCAGTGTGCTTCCTGAAGGCT;SOR=0.475;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=54;TCR=35;TR=85;WE=25001447;WS=25001429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,85:0.96:89
chr4	25001576	rs7665497	C	T	2482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.34;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr4	25001576	.	CTC	TTT	2848	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=19;NR=34;PP=2848;QD=20;SC=CCTCAACATCCTCCCCATAGC;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=53;WE=25001586;WS=25001566;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr4	25001578	rs7665498	C	T	2482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.34;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr4	25001632	rs7690185	T	A	1232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=33;PP=961;ReadPosRankSum=0.212;SC=TCCTCCTTAGTACAACAGAAA;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=39;WE=25001640;WS=25001622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr4	25001685	rs7670138	A	C	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=616;ReadPosRankSum=0.861;SC=TGGGGCCTTGAATGTAAAAAG;SOR=3.528;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=21;WE=25001693;WS=25001675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr4	25005193	rs2232028	G	A	2721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=49;PP=2088;SC=GCGCCTGCACGTAAATCTCCT;SOR=1.080;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=36;TCR=49;TR=85;WE=25005201;WS=25005183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr4	25028378	.	C	T	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.419;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.328;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=5;PP=823;ReadPosRankSum=0.938;SC=GGGTGTTCTCCAGTTTCTCCA;SOR=1.683;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=97;TCF=75;TCR=22;TR=39;WE=25028386;WS=25028368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,40:0.40:99
chr4	25030312	rs10021870	G	C	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=11;PP=367;SC=ACTCTCAGGAGTGAGGCATAG;SOR=2.303;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=14;WE=25030320;WS=25030302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	25253995	rs313567	C	T	5181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=86;NR=66;PP=2965;SC=CAGAATTTGCCGATATTATGC;SOR=1.031;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=86;TCR=66;TR=152;WE=25254003;WS=25253985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr4	25316815	rs12508686	T	C	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=1;PP=386;SC=TTTTGTTTTCTCCTGAAATGA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=25316823;WS=25316805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	25363901	rs315675	T	A	4341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=83;PP=2965;SC=CACTGTGAGCTCTGTAATTCT;SOR=1.357;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=50;TCR=83;TR=133;WE=25363909;WS=25363891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr4	25370962	rs315689	A	T	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=576;SC=CTCTGGAGACATGGGGAGTTG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=25370970;WS=25370952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	25382216	rs315676	C	G	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=344;SC=ATAAATATCACTTTGGGAACT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=25382224;WS=25382206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	25391584	rs186408	G	A	241.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=166;SC=AAAAAGGAATGAGCCTGATGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=25391592;WS=25391574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	25393889	rs2292407	C	T	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=8;PP=905;SC=TAGTTTGACCCACACTCTAAA;SOR=1.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=34;WE=25393897;WS=25393879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	25394078	rs2292408	A	G	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=21;PP=602;SC=GTGAATATTTATTATCGGCTT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=25394086;WS=25394068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	25395674	rs17605267	C	A	745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=21;PP=637;SC=TCAGATTTGCCAAAAGGGCTC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=25395682;WS=25395664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	25404553	rs10023139	C	T	1293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=27;PP=996;SC=ATCCCCCACACACTAATCTTA;SOR=1.154;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=18;TCR=27;TR=45;WE=25404561;WS=25404543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	25408516	rs3214034	T	A	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=14;PP=530;SC=AGGTAAGAAGTTGATATTTCT;SOR=1.508;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=22;WE=25408524;WS=25408506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	25408724	rs28616687	A	G	172.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=84;SC=ACTGCCACTCACAGCTCTCTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=25408732;WS=25408714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	25408838	rs34811474	G	A	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=3;PP=613;SC=CTTTATAATCGAAAAGGAAAA;SOR=2.925;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=25408846;WS=25408828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	25417244	rs3816587	C	T	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=261;SC=GACTCAGTTACGGTGGTAATA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=25417252;WS=25417234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	25419283	rs9174	T	C	2893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=43;PP=2282;SC=CCATGCATTTTGAGAAGCACT;SOR=0.947;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=98;TCF=54;TCR=44;TR=97;WE=25419291;WS=25419273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr4	25674905	.	TCACA	T	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.34;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	25674911	.	G	GAGGGA	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.34;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	25674913	rs62409436	A	G	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.40;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	25678199	rs6448389	A	G	1868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=30;PP=1582;SC=TTGCTGTGTGACTGCCCCAAG;SOR=0.728;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=28;TCR=30;TR=58;WE=25678207;WS=25678189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	25758580	rs4401441	G	A	1634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=45;PP=1342;SC=CAGTTTCTTAGGCTTTTTAAA;SOR=7.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=45;WE=25758588;WS=25758570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	25769135	rs2290577	T	C	3654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=19;PP=2965;SC=TGCACCGTTTTTCTATACATA;SOR=3.176;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=87;TCR=19;TR=106;WE=25769143;WS=25769125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr4	25780599	rs13121073	C	T	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=543;SC=CATGCATGTACAACTGGTAAA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=25780607;WS=25780589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	25780891	rs4697619	A	G	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=21;PP=566;SC=AGACAAGGTGATGAGATGCTT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=21;WE=25780899;WS=25780881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	25803830	.	A	G	245	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=9;NR=0;PP=245;QD=31.085690283;SC=TACAAAAGCAACCACAGGGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=25803838;WS=25803829;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	25915648	rs2305669	G	A	3255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=59;PP=2527;SC=TCCAACGCCAGCGCCCGGCCC;SOR=0.981;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=106;TCF=46;TCR=60;TR=105;WE=25915656;WS=25915638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr4	26274274	rs7680528	T	A	2470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=18;PP=1849;SC=GCATTTTGTCTTCATTTTTTC;SOR=2.513;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=59;TCR=18;TR=77;WE=26274282;WS=26274264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr4	26322759	rs113697915	C	A	1150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=32;PP=920;SC=GGGGCCGCGGCGCGCTTGGCG;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=26322767;WS=26322749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	26364300	rs13116873	C	G	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=19;PP=730;SC=ATAGAATGAACACTCATGATT;SOR=1.214;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=30;WE=26364308;WS=26364290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	26387959	rs56122711	AT	A	298.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=3.590;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.19;MQRankSum=0.567;QD=18.67;ReadPosRankSum=0.981;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr4	26407681	rs3109839	A	G	114.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=88;SC=TGTTTTTAAGATTTGCTTATT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=26407689;WS=26407671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	26417136	rs2270226	T	C	1551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=12;PP=1329;SC=TTATGGGCAGTGGATGGAAGA;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=51;WE=26417144;WS=26417126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	26615982	rs260954	C	T	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=6;PP=540;SC=TGTATGTTTACTTAAAAACTA;SOR=1.828;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=26615990;WS=26615972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	26673761	rs9997999	T	A	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.77;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	26673787	rs7691219	A	G	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=7;PP=455;SC=TTGAAAATGAACATGTACGTA;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=18;WE=26673795;WS=26673777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	26737063	rs33992685	C	CT	229.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=4;PP=144;SC=AAAGAAATACCTTTTTTTTTT;SOR=1.085;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=8;WE=26737071;WS=26737053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	26862754	rs114264770	C	T	341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=10;PP=220;SC=GCTGCGCTTTCACCCGGCTTC;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=26862762;WS=26862744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	26862782	rs75058604	C	G	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=8;PP=271;SC=CGCCTTCATCCCGCCTCGACT;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=26862790;WS=26862772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	27004011	rs10028164	G	A	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=10;PP=254;SC=TGGACTTACAGGAGAGGTAAG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=27004019;WS=27004001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	27004490	rs5856961	T	TA	718.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=0;PP=564;SC=CATTATTTTGTAAAAAAAAAT;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=27;WE=27004498;WS=27004480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	27022800	rs10031905	A	G	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=173;SC=CCTACCGTAAACTTGCCACTC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=27022808;WS=27022790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	27162341	rs17649944	C	G	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=1;PP=610;SC=GCTTTCTGGCCTCTACCTACA;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=27162349;WS=27162331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	30132766	rs34540632	ATG	A	96.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=3.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.02;MQRankSum=4.604;QD=1.73;ReadPosRankSum=-0.052;SOR=1.341;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,11:0.20:56
chr4	30222333	.	CAT	C	103.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=-0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=173;ReadPosRankSum=1.113;SC=TGTGTGTAGACATATATATAT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=6;WE=30222342;WS=30222323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr4	31031755	rs139430988	T	TTGTGTGTGTGCA	1431.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=59.66;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	31107644	rs36105849	A	AT	229.84	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=32.83;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr4	31107645	rs34357233	A	AT	229.84	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=32.83;ReadPosRankSum=0.180;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr4	31107765	rs4580617	G	C	988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=13;PP=778;SC=AAAATTCAAAGTATGTTTAAG;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=18;TCR=13;TR=31;WE=31107773;WS=31107755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	31116254	rs34203962	AAC	A	102.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.53;QD=20.57;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	31116375	rs10006845	A	G	1230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=24;NR=20;PP=1015;SC=AGAGAGGTGAACATATACAGC;SOR=0.788;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=24;TCR=20;TR=44;WE=31116383;WS=31116365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	36069805	rs7657166	G	A	1533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=27;PP=1140;SC=CCAGGCAGTGGGCCACCATGG;SOR=0.994;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=20;TCR=27;TR=47;WE=36069813;WS=36069795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr4	36081878	rs4833069	C	T	4354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=71;PP=2965;SC=CGTCTGAGTTCGTGAACTATC;SOR=0.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=66;TCR=71;TR=137;WE=36081886;WS=36081868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr4	36109409	rs7688562	C	G	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=301;SC=CATTTGAAAACATCTGTAGGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=36109417;WS=36109399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	36123024	rs1397423	A	G	1762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=48;PP=1445;SC=CAGTTTATCAATTTTTAAACA;SOR=5.097;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=3;TCR=48;TR=51;WE=36123032;WS=36123014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr4	36130099	rs6148397	T	TACACAC,TACAC	1154.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;NF=15,15;NR=0,0;PP=726,42;SC=GTCTATATTATACACACACAC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=15,15;WE=36130107;WS=36130089;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:23
chr4	36130375	rs5857473	TA	T	834.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=32;PP=553;SC=AACCTTTGTTTAAAAAAAAAA;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=32;WE=36130383;WS=36130365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	36149025	rs1567483	G	A	1342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=28;PP=1003;SC=TTAAAACACTGTAATAAACAC;SOR=1.954;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=39;WE=36149033;WS=36149015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	36149113	rs1567484	C	T	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=12;SC=AAGGCTATCACTATTGTATGC;SOR=2.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=43;WE=36149121;WS=36149103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	36160340	rs1546495	G	T	1760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=6;PP=1203;SC=CTAAAAAGAAGAGAAAAAATA;SOR=3.461;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=41;TCR=6;TR=47;WE=36160348;WS=36160330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	36160478	.	G	C	1841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=43;PP=1431;SC=ATATCATGTTGAGGGAAATCT;SOR=2.794;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=11;TCR=43;TR=54;WE=36160486;WS=36160468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	36160603	rs17457286	G	A	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=302;SC=ATTTACCAAAGAATAATTACA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=36160611;WS=36160593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	36162273	rs11431961	C	CA	187.19	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.126;NF=2;NR=5;PP=118;ReadPosRankSum=-0.385;SC=GCTGAATTGTCAAAAAAAAAA;SOR=0.569;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=7;WE=36162281;WS=36162263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr4	36162923	rs2271330	G	A	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=656;SC=TTCTCAAAGAGTTACTACTAT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=36162931;WS=36162917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	36211914	rs4394022	C	A	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=0;PP=347;SC=GTGTGTGTGGCGGTGGAGTGG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=36211922;WS=36211904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	36258197	rs7686575	T	C	1292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=12;PP=933;SC=CTCACTTCCTTGCTTGTTCGC;SOR=1.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=41;WE=36258205;WS=36258187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	36292018	rs1995319	T	A	1909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=24;PP=1506;SC=CTGAGTGATGTTACTGGCCCC;SOR=1.034;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=34;TCR=24;TR=58;WE=36292026;WS=36292008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr4	37247021	rs892825	C	T	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=145;SC=CCCTCGCTGGCCGGTTTTGCC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=37247029;WS=37247011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	37432416	rs2973217	A	C	1697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=35;PP=1326;SC=CCTTTCCCTCAAGCCTATGGA;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=18;TCR=35;TR=53;WE=37432424;WS=37432406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	37445885	rs11724784	T	C	2939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=38;PP=2320;SC=GCACACCATCTTAGCAGATTA;SOR=0.761;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=45;TCR=38;TR=83;WE=37445893;WS=37445875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr4	37592408	rs142404333	A	G	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;PP=994;ReadPosRankSum=-0.604;SC=TCATTGAATGAGGATGTGGAA;SOR=0.336;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=37;WE=37592416;WS=37592398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr4	37592674	rs937941	T	C	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.17;SOR=2.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	37592679	rs937942	T	G	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.93;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	37636750	rs2276943	T	G	2194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=58;PP=1762;SC=ACGGGGCTAATGTGGGGAGGA;SOR=5.518;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=3;TCR=58;TR=61;WE=37636758;WS=37636740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr4	37651155	rs2292298	A	G	172.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=137;SC=TGCATTAGATATCTGTCCAGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=37651163;WS=37651145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	37666995	rs1221653	T	C	2864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=66;PP=2115;SC=CAGAAGTTTCTAGTTTGCAAA;SOR=3.391;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=12;TCR=66;TR=78;WE=37667003;WS=37666985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr4	37828175	rs2059484	T	C	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=194;SC=TCCCACCCCCTGCAGCGCACC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=9;WE=37828194;WS=37828171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	37828186	rs2059483	C	T	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=276;SC=GCAGCGCACCCGCAAACGGCA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=37828194;WS=37828171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	37831850	rs2911907	C	T	145.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=115;SC=ACATGTCTTACCAGCTTGGCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=37831858;WS=37831840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	37850312	rs35704131	TG	T	1559.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.504;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.459;NF=4;NR=41;PP=1964;ReadPosRankSum=0.817;SC=AATAATATTTTGAAATGTTCT;SOR=3.486;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=45;WE=37850320;WS=37850302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,51:0.96:53
chr4	37857106	rs6531590	G	A	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=351;SC=ATTTCCTCCAGAATGTTTTTC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=37857114;WS=37857096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	37857166	rs6842360	A	G	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=711;ReadPosRankSum=1.404;SC=CTTATGCAAGAGAAGATATTG;SOR=3.690;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=25;WE=37857174;WS=37857156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr4	38022087	rs10015663	A	G	1755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=8;PP=1397;SC=CAACAAGAGTAAAATTCCATC;SOR=3.342;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=43;TCR=8;TR=51;WE=38022095;WS=38022077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	38053815	.	T	TGTGTGTGC	1222.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;QD=39.44;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr4	38053825	rs73810093	T	C	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.12;QD=46.67;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	38054582	.	A	G	132	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=7;NR=0;PP=132;QD=23.8244589353;SC=ATTAAATCTCATTCGTGAACT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=38054590;WS=38054581;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	38054737	rs58983546	C	T	1995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=13;PP=1457;SC=CATCTCCTACCGTAATGCCCT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=46;TCR=13;TR=59;WE=38054745;WS=38054727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr4	38062387	rs75564054	T	C	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=292;SC=ACAAACTTGATGTGCTTGGAG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=38062395;WS=38062377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	38698666	.	GA	G	593.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=463;SC=TACCTTTACAGAAAAAAAAAA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=25;WE=38698674;WS=38698656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	38830456	rs189784331	C	G	1902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=28;PP=1465;SC=CTGATATGTTCACTTGGATAG;SOR=0.800;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=23;TCR=28;TR=51;WE=38830464;WS=38830446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	38942697	.	CT	C	77.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=0.044;QD=2.10;ReadPosRankSum=-0.744;SOR=0.509;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,10:0.27:37
chr4	38944976	rs34903665	A	AT	1383.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=8;PP=1487;SC=ATAATCCAATATGGGGGGTGG;SOR=2.613;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=33;WE=38944984;WS=38944966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	38988082	rs60584759	C	T	3374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=91;PP=2853;SC=GATAAACAAGCGCATTGTTAA;SOR=4.977;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=7;TCR=91;TR=98;WE=38988090;WS=38988072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr4	38995374	rs10212770	T	C	2880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=18;PP=2494;SC=TATCCATCTCTAGGTGCAAAG;SOR=2.636;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=90;TCF=72;TCR=18;TR=89;WE=38995382;WS=38995364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr4	39046586	rs111344840	CA	C	158.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=1;PP=137;SC=GCTGCCCGGACAGGGTCTAGG;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=39046594;WS=39046576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	39046651	rs76308346	C	G	169.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=1;PP=106;SC=CCCCCGCCTCCCCCGCTCCTC;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=39046659;WS=39046641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	39064126	rs2711942	G	C	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=2;PP=488;SC=AGTAATTGTAGATATATATAT;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=39064134;WS=39064116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	39064162	rs2711941	A	C	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=4;PP=950;SC=TCCTTTACATATTTTTGTTGT;SOR=3.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=35;WE=39064170;WS=39064152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	39065091	rs2711940	G	A	136.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=136;SC=GAAAGGTTTTGCAAAGAGATG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=39065099;WS=39065081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	39094738	rs2566149	G	A	2805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=42;PP=2190;SC=CCATCAACTGGTGAATGGATA;SOR=0.883;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=46;TCR=42;TR=88;WE=39094746;WS=39094728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr4	39104837	rs35745478	CTG	C	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=149;SC=ATTTTTGTATCTGTAATTTCA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=2;WE=39104846;WS=39104827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	39109399	rs12508577	A	G	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=17;PP=489;SC=CACCAAATTTATTAAGCTATA;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=39109407;WS=39109389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	39114929	rs3796510	G	A	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=335;SC=TTTGGAGAACGTGTTGGAGAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=39114937;WS=39114919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	39114945	rs3839126	A	AG	332.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=409;SC=GAGAATTGGAAGGGAAAGTCG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=11;WE=39114953;WS=39114935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	39116775	rs10026775	A	T	1899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=14;SC=AAATTTTCTTACAGATATGAT;SOR=2.342;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=55;WE=39116783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr4	39116911	rs3733276	T	C	3139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=54;PP=2218;SC=ACCTTAATACTGTGGAGGCTT;SOR=0.806;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=106;TCF=52;TCR=54;TR=105;WE=39116919;WS=39116901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr4	39117103	rs3733277	G	A	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=442;SC=AAGAGGCAATGTTTAATTTTA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=39117111;WS=39117093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	39122577	rs3733274	A	G	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=11;PP=432;SC=CTGGCATAGTAGTGTTGACAT;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=9;TCR=11;TR=20;WE=39122585;WS=39122567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	39122697	rs3733275	C	T	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=8;PP=385;SC=TTTAGTGCCCCGTTTTCTACA;SOR=1.112;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=14;WE=39122705;WS=39122687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	39128101	rs7694760	A	T	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=1;PP=662;SC=CCGTATTGACAGATGTGGGTA;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=39128109;WS=39128094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	39187522	rs6839511	G	T	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.70;QD=32.74;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	39205365	rs1451817	C	T	6152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=133;PP=2965;SC=ATCAAATCCACGTGCAAATCA;SOR=1.993;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=186;TCF=52;TCR=134;TR=185;WE=39205373;WS=39205355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr4	39217352	rs3733287	A	G	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=641;SC=CTAGTAAGGAAAATATTTGAA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=39217360;WS=39217342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	39242111	rs9998591	C	A	273.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=9;PP=224;SC=TAGTTAAATCCTTTTAAAACA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=39242119;WS=39242101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	39279671	.	CA	C	115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.31;ReadPosRankSum=0.958;SOR=0.315;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr4	39279907	rs2276888	A	G	4528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=105;PP=2965;SC=CTTCCGAAGCATTCTTCTATT;SOR=2.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=31;TCR=105;TR=136;WE=39279915;WS=39279897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr4	39302029	rs2066786	T	C	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=25;PP=605;SC=CAACATCAAATGGGCCCTGAA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=39302037;WS=39302019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	39308187	rs2066789	G	A	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=1;PP=673;SC=TTATCTGTCCGACCACACTGT;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=39308195;WS=39308177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	39343940	rs2306596	C	A	3622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=15;PP=2849;SC=CACACGGCATCTCATATACCA;SOR=3.298;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=91;TCR=15;TR=106;WE=39343948;WS=39343930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr4	39353122	rs4975007	C	T	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=10;PP=375;SC=AGGAGATTCACGAATAAACAT;SOR=1.371;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=39353130;WS=39353112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	39448542	rs7685429	C	G	3219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=53;PP=2597;SC=AGTTCAGGCCCTCACAGCGCG;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=57;TCR=53;TR=110;WE=39448550;WS=39448532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr4	39450229	rs4975017	C	A	2297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=20;NR=47;PP=1774;SC=TTTTCAAAGGCAGAAGAGAAG;SOR=1.675;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=68;TCF=20;TCR=48;TR=67;WE=39450237;WS=39450219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr4	39456392	rs1463478	G	A	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=12;PP=529;SC=AATTTAAAAAGCTAATCAAAT;SOR=1.085;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=20;WE=39456400;WS=39456382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	39457870	rs3216720	T	TG	811.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=1;PP=816;SC=CACCAACAGTTTAAGTGTAAT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=39457878;WS=39457860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	39458051	rs2125313	A	G	1906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=18;PP=1563;SC=CCCTGCGGATATATTTTTCAC;SOR=1.733;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=39;TCR=18;TR=57;WE=39458059;WS=39458041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	39459724	rs2687958	T	C	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=18;PP=1350;SC=CACTGAACCTTAATTCGAAAA;SOR=1.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=30;TCR=18;TR=48;WE=39459732;WS=39459714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr4	39460490	rs2276890	C	G	2198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=30;PP=1741;SC=AGTACCCCCACGAGCACAGAA;SOR=1.011;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=40;TCR=30;TR=70;WE=39460498;WS=39460480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr4	39472842	rs2125314	T	A	2393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=21;PP=1821;SC=TAATTTGTGCTTTTCTTCCTA;SOR=2.012;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=54;TCR=21;TR=75;WE=39472850;WS=39472832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	39478946	rs11934814	C	T	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=9;PP=263;SC=GTCAGGAGTTCGAGACCAGCC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=39478954;WS=39478936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	39501649	.	AAAAAAAAAC	A	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.7339;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=1;PP=1202;SC=CTCTGTCTCAAAAAAAAAACA;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=7;WE=39501665;WS=39501639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	39510122	rs11735116	G	T	2279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=4;PP=1997;SC=CTAAAGTGCTGCGATTACAGG;SOR=6.184;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=66;TCR=4;TR=70;WE=39510130;WS=39510112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr4	39528752	rs4975020	G	A	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=23;PP=694;SC=AAGCCCCAAAGAGACGAAGGT;SOR=4.255;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=39528760;WS=39528742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	39700173	rs1055582	C	T	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=408;SC=CGCCGCCTTCCCCTCCCCTCC;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=39700181;WS=39700163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	39747536	rs302931	A	G	274.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=271;SC=AGCTTTATGAATTGCTTACTG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=39747544;WS=39747526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	39757480	rs11389468	A	AT	834.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=806;SC=CAGTAACTTTAAAAGTCTCTT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=39757488;WS=39757470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	39827804	rs374518376	GTT	G	1217.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.39;QD=28.99;SOR=2.226;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,40:0.95:42
chr4	39864448	rs4547806	G	A	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=303;SC=TGGATACATTGACAAAATATA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=39864456;WS=39864438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	39871117	rs34039605	G	GA	770.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=28;PP=571;SC=CTATTAGCATGAAAAAAAAAA;SOR=4.548;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=29;WE=39871125;WS=39871107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	39910172	rs35396203	GA	G	1529.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=47;PP=1179;SC=TGTAATAAGAGAAAAAAAACT;SOR=3.729;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=56;TCF=5;TCR=51;TR=52;WE=39910180;WS=39910162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	39915454	rs11725674	G	C	1146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=31;PP=959;SC=GCTTATAACTGTGAGAAGTTT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=39915462;WS=39915444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	39918636	rs10001599	A	T	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=3.665;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.38;MQRankSum=-0.147;QD=20.63;ReadPosRankSum=0.100;SOR=2.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,23:0.92:25
chr4	39921942	rs28449663	A	G	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=5;PP=456;SC=TACATACATTAGCAATGCATG;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=39921950;WS=39921932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	40044833	rs28550618	C	A	1223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=0;PP=1070;SC=AAGCCCTTCTCGTCCTGGGTC;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=39;WE=40044841;WS=40044823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	40045340	rs17439810	G	C	2557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=37;PP=2013;SC=TCCTGCTCCTGCCGGAAATAC;SOR=0.881;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=36;TCR=37;TR=73;WE=40045348;WS=40045330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr4	40045727	rs1704151	T	G	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=24;PP=1090;SC=CTGGATGGCGTTCGGCGTCTT;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=19;TCR=24;TR=43;WE=40045735;WS=40045717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	40108750	rs1704154	C	T	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=172;SC=GACAGGGTCTCGCTGTGTTGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=40108758;WS=40108740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	40115239	rs4974962	A	T	2328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=61;PP=1819;SC=TTGTAACTTAATTTCTATTGC;SOR=4.834;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=4;TCR=61;TR=65;WE=40115247;WS=40115229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr4	40121562	rs794001	G	A	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=223;SC=CCCAAGAGACGATGAAGATAT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=40121570;WS=40121552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	40350763	rs10029872	T	C	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=2;PP=428;SC=ATTCCAGACTTCCGAGCCACA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=40350771;WS=40350753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	40356422	rs10009228	A	G	3064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=44;PP=2366;SC=AAGGCCACCAATTCCAAGGGG;SOR=0.780;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=48;TCR=44;TR=92;WE=40356430;WS=40356412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr4	40428010	rs278981	T	C	1643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=29;PP=1253;SC=CCTCCATACATGGCGGCCGCG;SOR=0.800;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=25;TCR=29;TR=54;WE=40428018;WS=40428000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	40435004	rs4861002	G	A	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=129;SC=TTGAGACAGGGTCTCACTCTG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=40435012;WS=40434994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	40438576	rs2307046	A	G	2931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=68;PP=2403;SC=ATATACCACGACCAGCAGAAT;SOR=2.383;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=21;TCR=68;TR=89;WE=40438584;WS=40438566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr4	40438931	rs12503550	T	C	1075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=29;PP=1024;SC=AAAACATTCATAGACTACCCA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=40;WE=40438952;WS=40438921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	40440215	rs2291580	T	C	6844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=121;PP=2965;SC=CGATCTCAGGTTCGGCCCAGT;SOR=1.131;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=83;TCR=121;TR=203;WE=40440223;WS=40440205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr4	40440854	rs1052153	G	C	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=34;PP=770;SC=GCACCTTGGCGGAGGACCCGG;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=37;WE=40440862;WS=40440844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	40778146	rs2465570	C	T	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=21;PP=1031;SC=TCAATACAGGCTCATGGTACA;SOR=0.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=40;WE=40778154;WS=40778136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	40778162	rs2437323	T	G	1307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=21;PP=935;SC=GTACACAGTTTCCCACATGTC;SOR=1.075;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=36;WE=40778170;WS=40778152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	40788544	rs2953325	A	G	1092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=0;PP=944;SC=CAAGATTTGAAGAACTCATTG;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=40788552;WS=40788534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	40809207	rs113167696	GA	G	1032.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=26;PP=696;SC=GGGAGGTAAGGAAAAAAAATC;SOR=2.133;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=31;WE=40809215;WS=40809197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	40810747	rs2261167	A	G	5808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=88;PP=2965;ReadPosRankSum=0.228;SC=GAAACCCATCAAGATTGTTCT;SOR=0.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=191;TCF=101;TCR=90;TR=188;WE=40810755;WS=40810737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,194:0.99:196
chr4	40825819	rs3841555	TA	T	844.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=791;SC=TAAAGCCACTTACCACACTCA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=19;WE=40825827;WS=40825809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	40844199	rs1865605	T	C	2040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=4;PP=1799;SC=GGAACGCAGATGCAATTCCAG;SOR=4.977;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=61;TCR=4;TR=65;WE=40844207;WS=40844189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr4	40937219	rs5857759	GA	G	469.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.49;MQRankSum=0.264;QD=21.35;ReadPosRankSum=1.735;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr4	41035354	rs116293599	C	T	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=11;PP=327;SC=GAAATTAAAACTCCAAATAAC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=41035362;WS=41035344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	41607754	rs11943304	T	C	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=349;SC=TTAAAGTGATTTTACATTTAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=41607762;WS=41607746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	41611575	rs1105886	A	G	3333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=45;PP=2430;SC=AATGTTGAGCAGTAAAAGAGA;SOR=0.903;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=57;TCR=45;TR=102;WE=41611583;WS=41611565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr4	41615249	rs66955637	A	AT	285.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=7;PP=336;SC=TTATTTGGGGATTTTTTTAAA;SOR=1.085;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=11;WE=41615257;WS=41615239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	41615690	rs13146318	T	A	1601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=49;PP=1389;SC=TAGGTTGGAGTCTTAATAAAC;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=49;WE=41615698;WS=41615680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	41629036	rs5857808	G	GGTGT	404.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=-0.605;QD=31.13;ReadPosRankSum=0.271;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr4	41648767	rs148133956	G	A	3079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=73;PP=2529;ReadPosRankSum=0.558;SC=AACCACCATTGCTCGTGCCAG;SOR=0.619;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=100;TCF=25;TCR=75;TR=98;WE=41648775;WS=41648757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,100:0.98:102
chr4	42020142	rs2581423	A	G	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=7;PP=485;SC=AGGTATAGGCACAGAACTCAA;SOR=1.508;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=22;WE=42020150;WS=42020132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	42020481	rs184488872	C	A	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=29;NR=16;PP=1197;SC=AATTAAAGAACAAGAGGCCCA;SOR=1.559;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=45;WE=42020489;WS=42020471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	42025207	rs3213767	A	G	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=531;SC=ATGTTTCTCCAAAAGCACCTT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=42025215;WS=42025197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	42025284	rs4861153	A	G	2677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=24;PP=2010;SC=AGTCATTAAAATTGTTCATTG;SOR=1.664;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=57;TCR=24;TR=81;WE=42025292;WS=42025274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr4	42400112	rs11733156	G	T	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=6;PP=845;SC=TCCTTGGCTGGCTGCGCTGGG;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=42400120;WS=42400102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	42448789	rs35005173	T	TA	360.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5582;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.769;NF=0;NR=15;PP=217;ReadPosRankSum=-1.026;SC=GAAATGAGATTAAAAAAAAAA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=15;WE=42448797;WS=42448779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,18:0.82:22
chr4	42557859	rs145505019	C	CTAAA	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=153;SC=AACTAACTAACTAAATAAATA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=42557867;WS=42557849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	42571074	rs6845603	A	T	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.59;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	42577517	rs2290868	A	G	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=397;SC=ACTAACAAATATATTATTCAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=42577525;WS=42577507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	42582047	rs6447171	A	C	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=396;SC=ATGATTTAGCAATCTATACTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=42582055;WS=42582037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	42592935	rs3833615	C	CA	739.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.13;MQRankSum=0.218;QD=23.86;ReadPosRankSum=1.124;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr4	42596461	rs77305935	TAC	T	530.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=573;SC=AAGCATAGAATACACAGTAAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=13;WE=42596470;WS=42596451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	42602606	rs6819419	A	C	555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=15;PP=514;SC=ATGAAATAATAATTTTAAACG;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=42602614;WS=42602596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	42618234	rs9991435	T	C	117.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=59;SC=TGTTAAAGTATACATTGATGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=42618242;WS=42618224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	42626659	rs11306052	GA	G	488.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=257;ReadPosRankSum=-1.406;SC=TTGCTGTTTGGAAAAAAAAAA;SOR=0.569;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=23;WE=42626667;WS=42626649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,24:0.96:25
chr4	42627805	rs1460358	A	C	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=552;SC=TCTGTTACTAACATATAAAAA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=42627813;WS=42627795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	42627836	rs2306004	C	T	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=339;SC=GAACATTTGCCGGCTGTTTCA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=42627844;WS=42627826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	42629038	rs16854624	C	T	1232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=28;PP=923;SC=AGAATTTTGTCAGCTGGGGCT;SOR=2.613;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=36;WE=42629046;WS=42629028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	42659028	rs12503784	T	C	198.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=154;SC=AGGGCAGAGCTGCCGCCGGGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=42659036;WS=42659018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	42965159	rs10213360	A	C	4726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=115;PP=2965;SC=GGGGTAAGTAAGCTGCCCAGG;SOR=2.046;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=161;TCF=46;TCR=115;TR=161;WE=42965167;WS=42965149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr4	43032612	rs4861050	G	A	896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=22;PP=694;SC=CAATACTTTGGTTTATATATA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=43032620;WS=43032602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	44176960	rs13143747	T	C	2920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=47;PP=2286;SC=TGGACAGATTTGTTTCCCGGG;SOR=0.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=97;TCF=49;TCR=48;TR=96;WE=44176968;WS=44176950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr4	44295839	rs13117500	G	A	1686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=28;PP=1225;SC=CAAAGACATCGTCAGAGAACC;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=23;TCR=28;TR=51;WE=44295847;WS=44295829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr4	44295943	rs13145563	A	G	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=504;SC=CATTTGTTTAACAATTTTCTT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=44295951;WS=44295933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	44652187	rs1113098	C	G	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=303;SC=TATTTACAAACATCAAATGAC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=44652195;WS=44652177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	44682465	rs6447368	T	C	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=6;PP=748;SC=TAGGAAAAACTTGACATGTCT;SOR=2.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=44682473;WS=44682455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	44684455	rs13117025	C	T	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=15;PP=443;SC=AACAGTGTTGCTATTTCACTT;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=44684463;WS=44684445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	44684507	rs9291245	C	T	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=320;SC=TTGTACTATTCATTATATGAG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=44684515;WS=44684497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	44685224	rs112232487	T	TA	907.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=0;PP=788;SC=TTTATTATACTTCACATAATG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=44685233;WS=44685214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	44685225	rs58659516	T	A	916.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=0;PP=512;SC=TTATTATACTTCACATAATGG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=18;WE=44685233;WS=44685214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	44690320	rs1491304	A	T	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=25;PP=712;SC=GTTTATAATTACATATGTGTG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=44690328;WS=44690310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	44691795	rs11373408	T	TA	980.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5049;FS=9.562;HP=14;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.053;NF=41;NR=3;PP=488;ReadPosRankSum=-0.733;SC=ATATGTTCATTAAAAAAAAAA;SOR=2.546;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=101;TCF=85;TCR=16;TR=44;WE=44691803;WS=44691785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,52:0.74:70
chr4	44696538	rs12641137	C	G	848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=22;PP=632;SC=CAAGTAAGTTCAATAGAAACT;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=44696546;WS=44696528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	44699484	rs6851576	T	G	933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=22;PP=783;SC=TTGTATTTATTCTACTTTATA;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=29;WE=44699492;WS=44699474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	44699506	rs6821295	C	T	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=21;PP=747;SC=CTTTTATGGGCTTTAAATCAA;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=44699514;WS=44699496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	44700453	rs1547526	G	C	220.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=181;SC=TCTGCCTTATGGATAATAATT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=44700461;WS=44700443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	44709695	rs1491302	C	T	185.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=0;PP=119;SC=GAGATTTAACCCCACAGTCAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=44709703;WS=44709687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	44712908	rs3749582	T	C	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=532;SC=GCATCATAACTCCTCCAAAAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=44712916;WS=44712898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	44713235	rs1124828	A	G	44.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=2;PP=27;SC=GAACAAAAAAAAAATCACCTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=44713243;WS=44713225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	44719018	.	G	T	141.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=87;SC=CGCGTATTACGGACAGCCACA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=44719026;WS=44719009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	44719048	rs1873522	A	T	252.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=208;SC=TACATTACACAATGGGAAGAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=44719056;WS=44719038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	44720248	rs3792705	T	A	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=381;SC=CAAATATACTTGTATTCTAAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=44720256;WS=44720238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	46042945	rs6447493	C	T	1004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=1;PP=822;SC=GTTACTGAAGCACAAAAGATT;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=46042953;WS=46042935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	46086060	rs976156	T	C	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=12;PP=284;SC=TTTCAATTACTGTGGGCCTCA;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=46086068;WS=46086050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	46263862	rs35496835	A	AG	1651.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=0;PP=1439;SC=CTTTAATGTCAGTTTTTAGAA;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=31;WE=46263872;WS=46263852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	46263864	rs10938435	T	A	1660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=0;PP=910;SC=TTAATGTCAGTTTTTAGAAAC;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=31;WE=46263872;WS=46263852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	46390865	rs11503014	C	G	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=320;SC=TTCCTGGACTCTGTGTAGGAC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=46390873;WS=46390855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	46967279	rs2055943	C	A	3621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=91;PP=2895;ReadPosRankSum=0.959;SC=GACAAAACACCTTACCATCAT;SOR=1.811;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=20;TCR=92;TR=111;WE=46967287;WS=46967269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,114:0.99:115
chr4	46994972	rs34464680	G	GA	1314.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=12.141;HP=12;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.138;NF=18;NR=33;PP=728;ReadPosRankSum=-0.968;SC=AACTGCAAGCGAAAAAAAAAA;SOR=0.085;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=89;TCF=27;TCR=62;TR=51;WE=46994980;WS=46994962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,60:0.82:73
chr4	46995366	rs2229940	G	T	1997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=13;PP=1606;SC=CAAACCGCCAGGCACAGGAAG;SOR=2.621;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=48;TCR=13;TR=61;WE=46995374;WS=46995356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr4	47033770	rs72416056	TCG	T	3973.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=62;PP=2965;SC=TTGTTGAATCTCGCTCTCTCT;SOR=1.681;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=92;TCF=28;TCR=64;TR=87;WE=47033779;WS=47033760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr4	47034075	rs45460902	G	A	1811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.24;ReadPosRankSum=0.264;SOR=1.009;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,56:0.97:58
chr4	47034104	rs6847977	G	A	1561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.08;QD=36.32;SOR=2.356;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	47034626	rs41309288	C	G	3368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=50;PP=2634;ReadPosRankSum=-1.252;SC=CACTCCGCACCCGCTCCCCGC;SOR=0.877;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=62;TCR=51;TR=111;WE=47034634;WS=47034616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,116:0.98:118
chr4	47322190	rs4482737	T	C	2303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=24;PP=1790;SC=AAGATATCCATTGGATGAGCA;SOR=1.340;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=45;TCR=24;TR=68;WE=47322198;WS=47322180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr4	47322219	rs6284	C	A	2630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=29;PP=2076;SC=CCCTGGAGATCGAAAGTTGTG;SOR=1.347;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=50;TCR=29;TR=79;WE=47322227;WS=47322209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr4	47514685	rs33995001	C	T	2461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=26;PP=1876;SC=TCCTCTCAGACCCCTAAACTG;SOR=1.522;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=50;TCR=27;TR=76;WE=47514693;WS=47514675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr4	47524961	rs12509973	T	A	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.84;SOR=6.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	47525009	rs5858076	T	A	2069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.00;SOR=2.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr4	47538044	rs35012290	G	A	4296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=89;PP=2965;SC=CTTAACTGGCGCAGTAGGTAG;SOR=1.904;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=35;TCR=89;TR=124;WE=47538052;WS=47538034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr4	47560163	rs11729411	C	A	3085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=33;PP=2314;ReadPosRankSum=-0.747;SC=TCCTACACATCCTGCCCTTTG;SOR=0.527;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=64;TCR=33;TR=96;WE=47560171;WS=47560153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,102:0.99:103
chr4	47562802	rs34470690	G	GC	818.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=1;PP=974;SC=AGTTTGGGAAGCTAGTGTCCA;SOR=4.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=22;WE=47562810;WS=47562792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	47682174	rs10517195	A	G	4397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=64;PP=2965;SC=TGACCTCGTCAGACTTATCCA;SOR=0.992;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=148;TCF=84;TCR=64;TR=147;WE=47682182;WS=47682164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr4	47839929	rs2289433	C	T	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=17;PP=956;SC=GGCTCTGCGGCAGCGCTCTTC;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=20;TCR=17;TR=37;WE=47839937;WS=47839919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	47853843	rs6822668	T	C	3266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=15;PP=2572;ReadPosRankSum=-0.780;SC=AGGCCACTAGTCTTTAAAATG;SOR=1.883;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=96;TCF=81;TCR=15;TR=95;WE=47853851;WS=47853833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
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chr4	47887991	rs6818556	G	A	2115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=45;PP=1712;ReadPosRankSum=-0.822;SC=TCACATCTACGGTTTCTGGGC;SOR=0.739;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=66;TCF=20;TCR=46;TR=65;WE=47887999;WS=47887981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr4	47888137	rs11940441	T	A	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=260;SC=ATGAAGAAACTACAACAACAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=47888145;WS=47888127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	47898491	rs6447592	C	T	1042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=5;PP=882;SC=TCATTTGATACATTATGATAG;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=47898499;WS=47898481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	47905158	rs2119204	A	G	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=8;PP=1056;SC=TGACAAGAGCAAAACTCCATC;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=45;WE=47905166;WS=47905148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	47916346	rs6826122	C	G	153.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=6;PP=121;SC=TGCAGGGCGGCGACCGGGTTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=47916354;WS=47916336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	47938879	rs17573673	G	A	6223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=75;PP=2965;SC=TGATCTCACCGAAGTAGCTGC;SOR=1.099;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=111;TCR=75;TR=186;WE=47938887;WS=47938869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr4	47944029	rs10709670	CA	C	158.37	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.34;ReadPosRankSum=1.013;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
chr4	47945455	rs6819506	C	G	291.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=180;SC=ATATATCTGTCACATAATCAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=47945463;WS=47945445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	47951945	rs1972883	G	A	3766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=68;PP=2927;SC=TGAAATCACAGTAGTCACCAT;SOR=0.968;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=49;TCR=68;TR=117;WE=47951953;WS=47951935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr4	47953515	rs3845160	A	T	1343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=23;PP=940;SC=CAGAGAGAGAAGAGTTAATGT;SOR=1.038;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=17;TCR=23;TR=40;WE=47953523;WS=47953505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	47973110	rs7693648	G	A	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=10;PP=463;SC=CGAAGAGCGAGACTCCATCTA;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=20;WE=47973118;WS=47973100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	47973234	rs7677851	T	G	50.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=66;SC=AAAGGAGTGGTGAGAATCTCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=47973242;WS=47973224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	48018761	rs77335151	A	G	183.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=0;PP=148;SC=AGGGCGCCCCATTCCCAGACC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=48018769;WS=48018751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	48069696	rs2230594	G	C	2551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=70;PP=1912;SC=GCAGCAGCTCGGCAAATGTAG;SOR=2.662;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=17;TCR=70;TR=87;WE=48069704;WS=48069686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr4	48069725	rs9996535	G	A	1723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=48;PP=1463;SC=TCAGGTTTCTGGAAAAGGGAA;SOR=4.575;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=4;TCR=48;TR=52;WE=48069733;WS=48069715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr4	48073501	rs906486	G	T	2124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=15;PP=1618;SC=TGCTGGGACTGCCAACCTTCA;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=49;TCR=15;TR=64;WE=48073509;WS=48073491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr4	48081896	rs11358014	CA	C	1462.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.301;NF=50;NR=2;PP=853;ReadPosRankSum=-0.895;SC=AGGTATGATACAAAAAAAAAA;SOR=4.615;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=69;TCF=65;TCR=4;TR=52;WE=48081905;WS=48081886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr4	48082208	rs2352590	T	C	1369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=38;PP=1140;ReadPosRankSum=-1.025;SC=TGTTTGAACATAACTGGTAGT;SOR=3.816;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=40;WE=48082216;WS=48082198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr4	48088446	rs6858664	A	G	1740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=5;PP=1396;SC=ACACCAGGGCATGGTATGATA;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=54;TCR=5;TR=59;WE=48088454;WS=48088436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr4	48097057	.	G	A	2616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=24;PP=1955;SC=TAACTTCCAGGTCAACAATCT;SOR=1.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=53;TCR=24;TR=77;WE=48097065;WS=48097047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr4	48107096	rs6825925	T	A	149.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=119;SC=AGTGTTTTTTTAAATTCAGAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=48107104;WS=48107086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	48372085	rs1466631	T	G	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=23;PP=606;SC=ATATTGAGCATTGTGTTTTTA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=48372093;WS=48372075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	48384499	rs6816010	T	C	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=15;PP=704;SC=CTTTGAATTTTTCAGTGATAA;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=26;WE=48384507;WS=48384489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	48384991	rs1565221	G	A	1675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=44;PP=1255;SC=CTGCTAGCCTGTGTAACATAG;SOR=5.058;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=46;WE=48384999;WS=48384981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr4	48396496	rs4694894	C	A	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=285;SC=TTCTTTGATACATTTTTAAGT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=48396504;WS=48396486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	48424058	rs17609614	C	T	5681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=59;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.466;SC=CCTATGGTAGCATGAAAGATG;SOR=0.796;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=181;TCF=121;TCR=60;TR=177;WE=48424066;WS=48424048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,191:0.97:197
chr4	48492434	rs10008444	G	C	1293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=26;PP=1110;SC=GCTGGCAGCAGCGCGGCAGGG;SOR=1.347;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=41;WE=48492442;WS=48492424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	48492722	rs117545505	C	T	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=3;PP=288;SC=AGTCCCCGGCCGGCCCCGGGG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=48492730;WS=48492712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr4	48516970	rs7434721	C	T	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=3;PP=810;SC=TAAACTGAAACAGAGGGGCAC;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=48516978;WS=48516960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	48529683	rs11356838	TA	T	375.50	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=224;ReadPosRankSum=0.000;SC=GATGCCCGATTAAAAAAAAAA;SOR=1.714;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=21;WE=48529692;WS=48529673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,22:0.88:25
chr4	48529733	rs4695385	G	A	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=19;PP=545;SC=TGCGTATGAGGTATCAGTACC;SOR=4.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=48529741;WS=48529723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	48537603	.	TAC	T	429.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=624;SC=TATATACACATACACACACAC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=13;WE=48537612;WS=48537593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	48545814	rs10517225	A	T	1573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.926;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=11;PP=1274;ReadPosRankSum=1.303;SC=GAAAGAATATAAGGAAATACC;SOR=2.540;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=51;WE=48545822;WS=48545804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,51:0.96:53
chr4	48558882	rs4694898	C	T	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=1;PP=547;SC=GTCTTCATCCCGGCCCTTGCC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=48558890;WS=48558873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	48559517	rs200163698	G	T	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=79.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.75;ReadPosRankSum=-1.224;SOR=5.548;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,32:0.22:145
chr4	48577121	rs28558226	C	T	4533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=74;PP=2965;SC=AAAAAATGTACGAACATAGTT;SOR=0.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=66;TCR=74;TR=140;WE=48577129;WS=48577111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr4	48582836	rs4695390	A	T	1110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=4;PP=918;SC=TGTGTCTGTCATAAGTCTCAA;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=48582844;WS=48582826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	48591650	rs17656255	T	C	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=1;PP=427;SC=CTGCAGCAGATAGAAACATGG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=48591658;WS=48591640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	48607938	rs2940319	T	C	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=11;PP=360;SC=GAACACTCTGTCATTTTACCA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=48607946;WS=48607928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	48611153	rs776603	A	T	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=504;SC=CCTAATACATATGAAAATTCC;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=48611161;WS=48611143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	48611639	rs5858122	G	GA	173.92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.126;NF=9;NR=0;PP=147;ReadPosRankSum=-0.674;SC=CTTGCCTCAAGAAAAAAAAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=9;WE=48611647;WS=48611629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr4	48625213	rs776579	C	A	528.41	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=316;ReadPosRankSum=-1.042;SC=TTAAAAAAAACAAACATTAAA;SOR=0.527;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=28;WE=48625221;WS=48625202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,24:0.89:27
chr4	48655635	rs776580	T	A	1628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=16;PP=1242;SC=AACAGCTTTTTATCTATTTGG;SOR=1.835;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=52;WE=48655643;WS=48655625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	48834573	rs2304387	T	C	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=350;SC=ATCATACGTCTTGATTTACTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=48834581;WS=48834563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	48851950	rs45463191	A	G	2968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=79;NR=1;PP=2370;SC=TTTTTGTTTGATTTTACAAAT;SOR=7.523;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=80;TCF=79;TCR=1;TR=80;WE=48851958;WS=48851940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr4	48993610	rs41265729	G	A	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=22;PP=688;SC=AATGTTTCATGTACTTATAGA;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=48993618;WS=48993600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	49034669	rs147750792	CA	C	3966.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=48;PP=2965;SC=CCAGCCATCACATTGACCGTT;SOR=0.733;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=86;TCF=34;TCR=52;TR=81;WE=49034677;WS=49034659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr4	52714354	rs10673605	A	ATTTC	2541.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=10;PP=2397;SC=CTAATTTAATATTTTTCAAAC;SOR=3.180;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=46;WE=52714362;WS=52714344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr4	52714511	rs6851073	C	G	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=22;PP=645;SC=CCTACCTGCACAAGGTTAAGG;SOR=2.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=52714519;WS=52714501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	52744145	.	T	TAGAC	100	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=100;QD=62.0;SC=GTGTCCCTGTTAGAGGGAGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=52744153;WS=52744135;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	52752812	rs2271046	A	T	1216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=20;PP=942;SC=AACGTGAGTCAAACTTACTGA;SOR=0.902;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=17;TCR=20;TR=37;WE=52752820;WS=52752802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	52753118	rs7665231	G	A	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=2;PP=199;SC=CACATTGTACGCTGTGTACCT;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=52753126;WS=52753108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	52765720	rs2271045	T	G	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=519;SC=TTGATTCTGGTCAAACATTCT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=52765728;WS=52765710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	52779651	rs200685693	G	GTTA	3421.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.16;QD=43.87;SOR=2.185;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr4	52927113	rs999634	C	A	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=26;PP=1034;SC=TGAGATAAAACGAATCAGAAA;SOR=1.445;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=39;WE=52927121;WS=52927103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	52927229	rs784944	A	G	217.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=155;SC=TTGAACAGGTAGAGATCAGAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=52927237;WS=52927219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	52938243	rs3860707	T	C	2394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=28;PP=1832;SC=AGAAGCCATGTCCGATTATAA;SOR=1.051;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=44;TCR=28;TR=72;WE=52938251;WS=52938233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	52942779	rs55839120	G	T	174.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=139;SC=CAGAAGTCTGGTACCAGATGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=52942787;WS=52942771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	52945207	rs12641673	G	A	69.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=48;SC=TTACTTGGTAGCACCTGCCAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=52945215;WS=52945197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	52945799	rs7689145	C	T	798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=648;SC=CTTTAACTTGCTTTGGCTCAC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=52945807;WS=52945789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	52946161	rs7657148	A	G	1209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=33;PP=977;SC=AAACAATTTAAGGAAAAGAAC;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=52946169;WS=52946151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	52951213	rs10556262	CT	C	570.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.426;NF=0;NR=27;PP=373;ReadPosRankSum=-0.075;SC=CTATGGTTGGCTTTTTTTTTT;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=27;WE=52951222;WS=52951202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr4	52960908	rs3214049	T	A	2224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=12;PP=1713;SC=GCAGGTCCCATGGGTCATGTA;SOR=2.602;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=49;TCR=12;TR=61;WE=52960916;WS=52960898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr4	54011424	rs4864727	C	T	1238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=1;PP=1004;SC=CCTCCTCTTCCCAAAACAGTA;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=34;WE=54011432;WS=54011414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	54243905	.	T	C	594	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=22;NR=1;PP=594;QD=27.3378788064;SC=CGTTCGTTCGTCGGCGGGTTC;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=54243913;WS=54243904;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	54245169	.	A	AT	1106.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.309;NF=38;NR=1;PP=847;ReadPosRankSum=-1.452;SC=GTAAAGTCTGATTTTTTTTTC;SOR=4.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=39;WE=54245177;WS=54245159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr4	54245476	rs1471596	A	T	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=309;SC=GGTTGTGTGAAACAATGGTTC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=54245484;WS=54245466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	54250189	rs10012853	T	G	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=17;PP=482;SC=TCATCATGAATATACTTCTTT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=54250197;WS=54250179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	54280705	rs10719406	GA	G	656.06	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5175;FS=9.031;HP=15;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.596;NF=32;NR=0;PP=343;ReadPosRankSum=-0.942;SC=AGCATGTCAAGAAAAAAAAAA;SOR=5.339;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=49;TCR=2;TR=32;WE=54280713;WS=54280695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,35:0.88:40
chr4	54310188	rs11722866	A	G	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=7;PP=447;SC=TGTACCAGACATAAAAATATA;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=23;WE=54310196;WS=54310178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	54310281	rs11723755	T	G	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=17;PP=575;SC=GTAAGTAGTATTATTTAGATG;SOR=1.112;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=29;WE=54310289;WS=54310271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	54310340	rs59279367	TA	T	299.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=339;SC=TTTAAAGCAATAAAAACGTGT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=10;WE=54310348;WS=54310330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	54327235	rs3811785	T	C	1502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=45;PP=1154;SC=AAACAAGATATGATTAGTATT;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=50;WE=54327243;WS=54327225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr4	54327584	rs3765158	A	G	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=1;PP=855;SC=AGTATTTTTGATTAGTCATTA;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=54327592;WS=54327574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	54362150	rs6836800	G	A	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=197;SC=GCTCATGTCCGGGGTTTCTGA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=54362158;WS=54362140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	54876131	rs68107873	AC	A	45.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=4.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQRankSum=-0.629;QD=0.68;ReadPosRankSum=-1.963;SOR=0.143;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,13:0.19:67
chr4	54876132	rs4437313	C	A	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=7.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQRankSum=0.101;QD=15.40;ReadPosRankSum=1.191;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,50:0.75:67
chr4	54915527	rs75090248	T	C	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=305;SC=GCCAAAAATGTAGACCATTTA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=54915535;WS=54915517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	54930269	rs139920029	CAG	C	761.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=3;PP=627;SC=CAGACGGACACAGGGGAAACG;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=14;WE=54930278;WS=54930259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	54966667	rs3194383	C	T	4298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=80;PP=2965;SC=GCTGCCCGTCCCGCAAGAGCG;SOR=1.249;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=49;TCR=80;TR=129;WE=54966675;WS=54966657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr4	54966830	rs13144341	G	A	2126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=34;PP=1733;SC=TCTGCTTAAGGGCCAGTTCTC;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=32;TCR=34;TR=66;WE=54966838;WS=54966820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr4	54966919	rs1132998	T	C	1893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=29;PP=1556;SC=AGCACCACCATCACCATCATC;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=31;TCR=29;TR=60;WE=54966927;WS=54966909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr4	54967214	rs6554148	C	T	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=24;PP=728;SC=TTAGTGTAACCGTAGAGTCAG;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=54967222;WS=54967204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	54967709	rs2278142	C	A	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.229;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=654;ReadPosRankSum=0.664;SC=AGCACCTTGCCCGAGCCTTAC;SOR=1.829;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=30;WE=54967717;WS=54967699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr4	55131001	rs71823029	TA	T	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.66;ReadPosRankSum=2.500;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr4	55141055	rs1873778	A	G	3969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=58;PP=2965;ReadPosRankSum=1.365;SC=CAATCAGCCCAGATGGACATG;SOR=0.360;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=77;TCR=58;TR=134;WE=55141063;WS=55141045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,137:0.99:138
chr4	55146406	rs6148442	T	TTGTAGGTCCCCCAG	1250.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=2900;SC=ACCTGGCACATAATCATCATC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=13;WE=55146414;WS=55146404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	55151711	rs2412559	C	A	3140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=75;PP=2591;SC=GGAGTGTGGACGGAGATGCTA;SOR=2.608;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=21;TCR=75;TR=96;WE=55151719;WS=55151701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr4	55151958	rs3830355	T	TA	1121.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=3;PP=1154;SC=GGTGATGCTATTCAGCTACAG;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=55151966;WS=55151948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	55152284	rs4864872	T	G	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=11;PP=314;SC=TTGCCCAGGTTTGAGTGCCAG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=55152292;WS=55152274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	55153837	rs7695657	A	G	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=21;PP=665;SC=TGCTGCAGCCACCTCAAACCA;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=55153845;WS=55153827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	55156380	rs4864506	G	A	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=1;PP=542;SC=GTAGTTTGGAGATATGTACAG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=55156388;WS=55156370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	55156400	rs2276948	A	G	1014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=1;PP=795;SC=GTTAAATAATAGTAAGTTCTG;SOR=5.421;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=28;WE=55156408;WS=55156390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	55161254	rs3733540	C	T	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=521;SC=TAGTTCTGTGCAGGAGTTGTA;SOR=3.816;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=21;WE=55161262;WS=55161244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	55161391	rs7685117	T	C	1335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=26;PP=979;SC=ACATGATGGATGACATCGGCA;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=21;TCR=26;TR=47;WE=55161399;WS=55161381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	55524304	rs999020	T	C	1962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=54;PP=1543;SC=AGCCTGTGCCTGGGAGGGTGG;SOR=2.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=15;TCR=54;TR=69;WE=55524312;WS=55524294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr4	55599436	rs1008658	T	C	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=29;PP=897;SC=TTTCCTGTGATTTTCATAATG;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=33;WE=55599444;WS=55599426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	55946081	rs4421048	A	G	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=189;SC=TGTGATGTCCAGGAGTTGGGG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=55946089;WS=55946071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	55948108	rs2412617	A	G	876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=7;PP=571;SC=TCTTTTTAATATGGCTGAGTC;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=55948116;WS=55948098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	55955232	rs1531289	T	C	1785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=47;PP=1356;SC=TGTAAAGAGCTGACGAGGTGA;SOR=2.376;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=15;TCR=47;TR=62;WE=55955240;WS=55955222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr4	55955737	rs3217703	A	AT	736.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=24;PP=534;SC=CTATGTATCTATTTTTTTTTT;SOR=4.407;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=26;WE=55955745;WS=55955727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	55968053	rs7655964	A	C	2418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=27;PP=1826;ReadPosRankSum=-0.776;SC=ATTTTTTTTTATCCCACTGAC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=52;TCR=28;TR=78;WE=55968061;WS=55968043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,79:0.99:80
chr4	55970680	rs13109660	G	A	708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=3;PP=560;SC=AAGGACTTTCGGTGAAGAAGT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=55970688;WS=55970670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	55971846	rs2305945	G	T	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=598;SC=CTGAGAAGTTGTAATTTATGA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=55971854;WS=55971836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	55976451	rs3828550	G	A	1203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=0;PP=1035;SC=ACTTTTGTACGCAGGCCCAGC;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=38;WE=55976459;WS=55976441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	55979558	rs2305948	C	T	3591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=77;PP=2956;ReadPosRankSum=-0.695;SC=CTCCGGGTTACACCATCTATA;SOR=0.706;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=39;TCR=78;TR=116;WE=55979566;WS=55979548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,116:0.99:117
chr4	55980239	rs7692791	C	T	1615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=5;PP=1317;SC=GCAAACTTCACTGGGGCTTAT;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=46;TCR=5;TR=51;WE=55980247;WS=55980229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr4	55980456	rs2305949	C	T	1430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=38;PP=1147;SC=ATTGAAAAAACAGAACATGAG;SOR=4.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=40;WE=55980464;WS=55980446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	56314768	rs72274656	CGTGT	C	339.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=6;NR=0;PP=295;SC=CGCACGCGCGCGTGTGTGTGT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=56314779;WS=56314758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	56447146	rs34437483	GA	G	131.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=147;SC=TCAATGTCTAGAAAAAAACCG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=56447154;WS=56447136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	56447215	rs6817663	A	G	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=2;PP=55;SC=GAATCCCAGTACTTTGATAGG;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=56447223;WS=56447205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	56465418	rs1387198	T	C	1046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=16;PP=750;SC=AGAAACAGATTGATGATTTAG;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=17;TCR=16;TR=33;WE=56465426;WS=56465408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	56471551	rs3805382	A	G	3746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=57;PP=2879;SC=GAATAAGTGCATGGCTTCTCA;SOR=0.895;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=125;TCF=68;TCR=57;TR=125;WE=56471559;WS=56471541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr4	56502178	rs3792703	G	A	265.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=4;PP=238;SC=AGAGGGTGGAGGAGAGCGGTG;SOR=1.402;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=56502186;WS=56502168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	56736794	rs150749988	T	TTTTG	792.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=819;ReadPosRankSum=-0.360;SC=CAAGTATGTTTTTTGTTTGTT;SOR=3.816;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=17;WE=56736802;WS=56736784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,19:0.90:21
chr4	56758993	rs2290015	A	G	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=450;SC=TCACAGTACCAGCATGTGTGT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=56759001;WS=56758983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	56763170	rs10014018	A	G	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=251;SC=ATATCTTATAATCTTTTTTAG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=56763178;WS=56763160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr4	57167507	rs58767323	C	G	3200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=51;PP=2539;ReadPosRankSum=-0.971;SC=GCTTAGTAAGCAGCCTAAGAG;SOR=0.773;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=99;TCF=46;TCR=53;TR=96;WE=57167515;WS=57167497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,102:0.98:104
chr4	57176710	rs13123803	G	A	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=252;SC=CTGGCTCTCTGAGGCCAGCTG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=57176718;WS=57176700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	57176965	rs5858374	T	C	2402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.56;ReadPosRankSum=2.762;SOR=0.553;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:6,88:0.94:94
chr4	57180563	rs59615456	G	C	207.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=7;PP=163;SC=GGAAGCGCCAGGTTGGGAGGA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=57180571;WS=57180553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	57181629	rs61750793	C	T	5730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.12;SOR=1.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr4	57181632	rs7672073	G	C	5925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.22;SOR=1.424;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr4	57181995	rs3796547	C	T	3452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=54;PP=2827;SC=CCGGAGAAGTCGGAGATGCAC;SOR=0.830;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=51;TCR=54;TR=105;WE=57182003;WS=57181985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr4	57182758	rs28559894	C	T	2203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.61;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr4	57425443	rs7677956	G	A	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=365;SC=CTCCACTCCAGCCTGGGCAAC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=14;WE=57425451;WS=57425433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	57425520	rs76480778	A	AT	1174.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=5;PP=857;ReadPosRankSum=-1.398;SC=CTAGCAATCAATTTTTTTTTA;SOR=1.532;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=45;WE=57425528;WS=57425510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,45:0.96:47
chr4	57425770	rs148307398	G	A	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=693;SC=GTCTCACACTGTCACCTAGGC;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=57425778;WS=57425760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	57516896	rs4371677	G	A	2673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=35;PP=2230;SC=AGCCAAGCACGGCAGACTATC;SOR=0.928;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=44;TCR=35;TR=79;WE=57516904;WS=57516886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr4	57521972	rs144818228	GGCTCAGCC	G	1695.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=3;PP=2942;SC=GCCGCGAGAAGGCTCAGCCCA;SOR=3.967;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=31;WE=57521987;WS=57521962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	57522220	rs4626270	A	G	518.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=376;ReadPosRankSum=-0.826;SC=CGAGGCGTGGAGCGGGCGGGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=15;WE=57522228;WS=57522210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr4	57523869	rs7693834	T	C	1622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=15;PP=1236;SC=GAAACACTTCTTCTTCTGTGT;SOR=1.654;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=49;WE=57523877;WS=57523859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr4	57524124	rs6857396	T	C	221.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=5;PP=183;SC=CATTGCCATTTTGAATGGGCA;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=57524132;WS=57524114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	57686821	rs3733303	T	A	170.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=115;SC=TTTTTTTTTTTAAATGAAGTC;SOR=1.329;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=57686829;WS=57686811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	57843320	rs4865167	A	G	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=16;PP=1047;SC=GCTCTGCCCCACAGCCCGAGC;SOR=1.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=44;WE=57843328;WS=57843310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	57861117	rs1713951	G	A	287.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=206;SC=AAAAAAGAAAGAAAGATTTTC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=57861125;WS=57861107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	57861358	rs2293175	C	T	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=365;SC=ATTTTACTCTCTTTTCTCTTC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=57861366;WS=57861350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	57871400	rs41553919	AT	A	678.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=3;PP=732;SC=TTTTATTTAAATTGTCTGATA;SOR=3.160;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=19;WE=57871408;WS=57871390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	57871750	.	T	TTC	1237.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.09;QD=32.57;SOR=3.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	57876955	rs1718878	G	A	223.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=3;PP=110;SC=CCTTGATGGCGTATATTTCAG;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=57876963;WS=57876945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	57881715	rs1713982	G	A	4548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=51;PP=2965;SC=GGATCTATACGGATGCAGGCC;SOR=1.219;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=134;TCF=82;TCR=52;TR=133;WE=57881723;WS=57881705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr4	57883175	rs1718866	G	C	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=3;PP=661;SC=TAAAATACTTGAGGAAGTAGA;SOR=3.442;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=24;WE=57883183;WS=57883165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	57886946	rs1718831	T	G	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=1;PP=673;SC=GCAGTTACCATGATAACAAAC;SOR=4.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=22;WE=57886954;WS=57886936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	57888510	rs1718830	T	C	1794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=49;PP=1437;SC=TGCCTGCCCCTGTCCTCCTCT;SOR=2.797;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=62;TCF=12;TCR=50;TR=61;WE=57888518;WS=57888500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr4	57889332	rs1718862	G	A	266.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=188;SC=TTCTGTGTGGGCTGTAGTATT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=57889340;WS=57889330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	57891239	rs6843644	G	A	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=421;SC=CTGAAACAATGTAACCTTTTA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=57891247;WS=57891229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	57897570	rs12621	G	T	891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=20;PP=656;SC=TGAATTGGCAGGTAGTTGAGT;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=57897578;WS=57897560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	57976487	rs11573021	G	A	273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=5;PP=230;SC=GCGGCGCCGAGGAGCAGGGCG;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=9;WE=57976495;WS=57976477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	62445190	rs73215849	G	C	962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=3;PP=812;SC=ATTAAATGTTGAAATGCTATA;SOR=3.841;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=62445198;WS=62445180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	62449316	rs3075153	GTA	G	1484.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=3;PP=1385;SC=TTCACTAGCTGTATGTTTGAT;SOR=4.174;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=29;WE=62449325;WS=62449306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	62542879	rs1391319	G	C	174.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=2;PP=139;SC=ATATGAATACGTGTTCTAACA;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=62542887;WS=62542869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	62598689	rs10434219	C	T	3879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=58;PP=2965;SC=AGCTCCCTCACAGGGTGGATG;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=62;TCR=58;TR=120;WE=62598697;WS=62598679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr4	62599289	rs9312082	G	A	2522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=71;PP=2009;SC=TCAACCTTTTGTGGTACTCTT;SOR=8.688;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=0;TCR=71;TR=71;WE=62599297;WS=62599279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	62861941	rs17226398	G	C	3927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=47;PP=2743;SC=CTCTGTCACAGGTTCACTCTT;SOR=1.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=75;TCR=47;TR=122;WE=62861949;WS=62861931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr4	62861964	rs56038622	A	T	4627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=66;PP=2965;SC=TGTATGTCCCATACCCAGTCC;SOR=0.821;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=72;TCR=66;TR=138;WE=62861972;WS=62861954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr4	65142710	rs1483713	C	T	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=516;ReadPosRankSum=-0.583;SC=TTAATATTGACAACAAGATGG;SOR=0.859;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=27;WE=65142718;WS=65142700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr4	65142835	rs1483712	G	T	237.89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.6512;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=151;ReadPosRankSum=-0.549;SC=CTTTAACTAAGGTATGTCTGC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=9;WE=65142843;WS=65142825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr4	65145955	rs1483711	T	G	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=21;PP=615;SC=TTCTTTCTTATTTCTATGAAA;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=65145974;WS=65145945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	65145966	rs5858871	T	TAA	1078.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=998;SC=TTCTATGAAATGTTATATTAG;SOR=3.528;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=20;WE=65145974;WS=65145945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	65146700	rs10012755	A	G	151.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=0;PP=122;SC=TTTTCTCAGAAACCATTTATC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=65146719;WS=65146690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	65146711	rs1483709	T	C	91.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=1;PP=88;SC=ACCATTTATCTTAAAGATGCA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=65146719;WS=65146690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	65147404	rs10001161	T	C	151.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=121;SC=GTATTTATAGTAACCTATTTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=65147412;WS=65147394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	65165661	rs11935568	G	A	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=3;PP=610;SC=AAATTAGAGCGTGAATAGCAA;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=65165669;WS=65165651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	65165849	rs13139627	G	A	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=312;SC=CAATAGAACTGTCTAGTATGT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=65165857;WS=65165839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	65180308	rs35642943	GGTGTGTGTGTGT	G	307.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.72;QD=38.47;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	65240805	rs6551827	A	T	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.51;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	66218980	rs5858955	G	GAAAT	390.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.98;NF=0;NR=7;PP=268;SC=TTTATTAAATGAAAGATATTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=66218988;WS=66218970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	66233029	rs2198104	A	G	1203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=2;PP=1001;SC=ATAACAATAAAGTGTCCCCTA;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=36;WE=66233037;WS=66233019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	66286088	rs6551921	G	A	252.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=244;SC=TCTTCTGCAAGTTGGATAATT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=66286108;WS=66286078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	66286100	rs6551922	T	C	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=293;SC=TGGATAATTGTAGTTGCTAAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=66286108;WS=66286078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	66286414	rs6551923	T	C	192.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=93;SC=ATTTTAGTTTTTCTATATAAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=66286422;WS=66286404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	66509085	rs33932471	T	G	2961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=37;PP=2293;ReadPosRankSum=1.546;SC=ACTTACCCCATTTTTTGGAAA;SOR=0.411;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=54;TCR=37;TR=90;WE=66509093;WS=66509075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,95:0.99:96
chr4	67142620	rs73239138	G	A	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=335;SC=GGACTGAGCCGTGCTACTGGC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=67142628;WS=67142610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	68214260	.	C	G	178	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=27;MQ=50.25;NF=6;NR=1;PP=178;QD=30.3958875067;SC=AAGAAAAACACAGAGAGAGAG;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=7;WE=68214268;WS=68214251;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,7:0.88:8
chr4	68357814	rs1497430	A	G	45.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=28;SC=GAGAAAGGGAAAGTAGACAGG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=68357822;WS=68357804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	68358331	rs2254659	G	A	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	68360694	rs2632453	T	C	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=51;SC=AATAGACTAATTCAAGTGGCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=68360702;WS=68360684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	68360955	rs2646282	A	G	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=24;PP=801;SC=AGATAATATCATAAGAAATGA;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=38;WE=68360963;WS=68360945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	68374597	rs1056789	C	T	1491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=29;PP=1155;SC=GCTCACTCAGCGAACATCTGG;SOR=1.514;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=45;WE=68374605;WS=68374587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	68376708	rs190255	T	C	1348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=12;PP=1064;SC=TGTTTATGTATTCATCTGCCA;SOR=2.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=44;WE=68376716;WS=68376698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	68380215	rs11250	G	A	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=4;PP=264;SC=CTACCTTGAAGGAGTGCAGTG;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=68380223;WS=68380205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	68384861	rs355507	G	T	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=50;SC=AATATAACAAGATTGAATTAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=68384869;WS=68384851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	68396525	rs355477	G	C	1632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=1;PP=1598;SC=CATGGAGATGGCACCAACCTG;SOR=6.399;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=51;TCR=1;TR=52;WE=68396533;WS=68396515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	68416393	rs11436062	T	TA	188.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=5;NR=1;PP=131;SC=TAGTTCTTTGTAAAAAAAAAA;SOR=3.442;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=6;WE=68416401;WS=68416383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	68424355	.	AGT	A	54	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=2;NR=1;PP=54;QD=20.3333333333;SC=TGGAAAAAAAAGTGTGTGTGT;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=3;WE=68424364;WS=68424345;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,3:0.17:18
chr4	68436883	rs13111555	T	C	1206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=19;PP=876;SC=AGTAAGTAAATATGTTGAGCT;SOR=1.121;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=32;WE=68436891;WS=68436873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	68458937	rs3816821	G	C	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=272;SC=CTATACTTATGCAGGTGATGC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=68458945;WS=68458927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	68496080	rs354866	G	A	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=1;PP=630;SC=ATCAAAAAGAGTGATTCTTAT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=68496088;WS=68496070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	68562236	.	T	TAC	393.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5743;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=618;ReadPosRankSum=0.000;SC=CATATATACATACACACACAC;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=13;WE=68562244;WS=68562226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr4	68700984	rs1545935	G	C	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=164;SC=CAGATTCCTAGGCTTCCTTTC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=68700992;WS=68700974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	68812283	rs11930532	C	T	3802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=70;PP=2903;SC=TGCCAAATCCCACTGTCCTGA;SOR=1.225;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=45;TCR=70;TR=115;WE=68812291;WS=68812273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr4	68812444	rs34591422	T	TAA	449.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.54;QD=34.59;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	68829207	rs6552134	G	A	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=41;PP=1237;ReadPosRankSum=2.066;SC=AGAAGTCTACGGCTCAAAGAA;SOR=4.091;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=42;WE=68829215;WS=68829197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr4	68904637	rs6552141	A	C	1832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.66;QD=33.94;SOR=0.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	68904834	rs9999589	T	G	1404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=30;PP=1170;SC=TTGACAACCTTTTTATTGACA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=43;WE=68904842;WS=68904824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	68919617	rs10018943	G	A	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=10;PP=1028;SC=TAACTCATGGGCAATCCACAC;SOR=1.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=40;WE=68919625;WS=68919607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	68928740	rs1837215	G	A	2795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=69;PP=2141;SC=TTTCTGACACGCTCATTTGGG;SOR=2.993;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=14;TCR=69;TR=83;WE=68928748;WS=68928730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr4	68934306	rs10004522	G	A	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=470;SC=ACTGTGAAAAGAAGGCTCACA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=68934314;WS=68934296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	68956498	rs13115830	C	T	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=524;SC=GAAGACACTTCTCAAATACTC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=68956506;WS=68956488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	68995529	rs10030708	C	T	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=524;ReadPosRankSum=-0.283;SC=AATACTTACGCGTACATCATG;SOR=0.922;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=25;WE=68995537;WS=68995519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,27:0.93:29
chr4	69094575	rs2319796	T	G	972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=3;NR=26;PP=812;SC=CTTCAAAAAGTCTTCTTGAAG;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=69094583;WS=69094565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	69097150	rs5859125	TA	T	383.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=10;PP=341;SC=TTACGCATTATAAAAAAATAT;SOR=1.911;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=13;WE=69097158;WS=69097140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	69098006	rs6552175	C	T	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=2;PP=314;SC=GGGATTTCCACATGACATATT;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=69098014;WS=69097996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	69100137	rs35624784	G	GA	737.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=2;PP=825;SC=AAATAATCCAGAAAAAACCTA;SOR=4.255;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=24;WE=69100145;WS=69100127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	69100396	rs13151732	G	A	1155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=34;PP=967;ReadPosRankSum=-0.569;SC=TAGAGGTTTTGTGAACACATT;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=37;WE=69100404;WS=69100386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr4	69416353	rs62316988	T	A	2228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=6;PP=1792;SC=GTTGACAAAATAATTTGTAAG;SOR=4.343;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=57;TCR=6;TR=63;WE=69416361;WS=69416343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr4	69417570	rs28374627	A	G	280.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=262;SC=GTAACCACTTATACAGTCGAG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=69417578;WS=69417560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	69434217	rs28672900	G	A	2760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=67;PP=2419;SC=GTCTTATGCAGTGCTTCTTTT;SOR=2.196;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=23;TCR=67;TR=90;WE=69434225;WS=69434207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr4	69886151	rs11730623	A	T	1327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=40;PP=1124;SC=TATACAGAGAAAAATCAATCA;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=41;WE=69886159;WS=69886141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	69962966	rs138733571	A	AT	2545.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.124;NF=16;NR=61;PP=2266;ReadPosRankSum=-0.682;SC=CTAGGTAAGTATTTTTTTCAA;SOR=0.922;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=90;TCF=20;TCR=70;TR=77;WE=69962974;WS=69962956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
chr4	69972779	rs4257713	G	A	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=385;SC=TAGTCTTTGAGTAGTTCTTAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=69972787;WS=69972769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	70079838	rs4694697	T	C	2527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=21;PP=2249;SC=TTTGATCACTTAATTTTGACA;SOR=2.147;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=57;TCR=21;TR=78;WE=70079846;WS=70079828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr4	70146704	rs7689398	G	A	3236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=50;PP=2472;SC=TGCTGGCTGCGCTACTTAACA;SOR=0.751;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=47;TCR=50;TR=97;WE=70146712;WS=70146694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr4	70283908	rs2642841	T	A	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=12;PP=342;SC=AGCTTATTGATTATTTGTTAT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=70283916;WS=70283898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	70346711	rs28679647	G	C	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=28;PP=956;SC=AATCCCAGCAGTTTCCGAGGT;SOR=3.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=32;WE=70346719;WS=70346701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	70352164	rs41297427	A	AATTATC	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=375;SC=AAATGCCAACAATTTATTCTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=70352172;WS=70352154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	70355211	rs1845555	T	C	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=6;PP=359;SC=TTTCTTCTGATGTGTTACTGA;SOR=1.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=15;WE=70355219;WS=70355201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	70355380	rs28542932	T	A	694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=19;PP=550;SC=AAAATCAAGTTTTATCAGGAA;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=70355388;WS=70355370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	70359694	rs7441743	G	A	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=295;SC=ACATATATTCGTATATAGGCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=70359702;WS=70359684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	70501545	.	C	A	23	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=54.78;NF=1;NR=1;PP=23;QD=28.8856062736;SC=GTCCACCTCACCAAAAAAAAA;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=70501553;WS=70501535;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	70513139	rs1347046	C	T	3755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=53;PP=2965;SC=AAAGGGCACCCTATATATTTC;SOR=0.766;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=54;TCR=53;TR=107;WE=70513147;WS=70513129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr4	70707945	rs1220724	A	G	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=355;SC=CTCAATTTTAAGAATCAAATG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=70707953;WS=70707935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	70715019	rs183980082	G	A	737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=719;SC=AAACCTCCAGGCGCCTTTAGA;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=70715027;WS=70715009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	70803380	rs1220860	T	A	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=82;SC=AAGTAGGCAGTTTTTTTAGTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=70803388;WS=70803370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	70804849	rs2279526	C	A	911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=749;ReadPosRankSum=0.811;SC=CCTTCAAATTCTAAAAATCCC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=30;WE=70804857;WS=70804839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr4	70805831	rs1220858	A	T	209.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=172;SC=ACTTACTTTCACACACACACA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=70805839;WS=70805821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	70811806	rs1237375	T	C	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=12;PP=706;SC=CATTGTGAGCTTGTCTAATAC;SOR=0.826;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=28;WE=70811814;WS=70811796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	70898953	rs1136515	C	T	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=626;ReadPosRankSum=1.004;SC=TCAGTAATCACGGGGCATGAT;SOR=0.743;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=27;WE=70898961;WS=70898943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr4	70899037	rs776852	T	A	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=19;PP=657;SC=AAGGAAAAATTAAAAAAAAGC;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WE=70899045;WS=70899027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	70921164	rs2271643	T	C	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=402;SC=AACACTTGTATTGTCATTCTC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=70921172;WS=70921154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	70921337	rs2271644	G	A	1411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.114;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=1001;ReadPosRankSum=-0.696;SC=GACTCTAGTTGCTTGTCTTTC;SOR=1.069;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=45;WE=70921345;WS=70921327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr4	70934964	rs4694266	A	G	69.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=101;SC=CTTTTAGTCTATGATCAATGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=70934972;WS=70934954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	70944452	rs1399812	G	A	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=16;PP=689;SC=AAGATGTCTTGTCTTTTCTTT;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=27;WE=70944460;WS=70944442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	70947318	rs2063819	C	T	2206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=51;PP=1865;SC=GTTTGCCCTTCTAAAAATATA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=16;TCR=51;TR=67;WE=70947326;WS=70947308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr4	70947376	rs2063820	T	A	951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=29;PP=848;SC=AAATGAAATTTAAAAAAGAAT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=70947384;WS=70947366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	70948533	rs7675265	T	C	389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=9;PP=262;SC=TTAAATACTTTAGATAAATTC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=70948541;WS=70948523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	71008313	rs777398	G	T	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=25;PP=780;SC=ATAGTTATCTGTTGTGCTAAA;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=71008321;WS=71008303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	71008375	rs777399	T	C	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=438;SC=CAAGTAGAAGTTGAAACAAAT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=71008383;WS=71008365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	71009033	rs777400	A	G	172.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=138;SC=TCATATTTTCATTTATAAAGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=71009041;WS=71009023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	71020205	rs1709273	C	G	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=12;PP=368;SC=TGTTTATAGGCATTTGTGCTT;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=71020213;WS=71020195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	71021888	rs1709274	C	T	182.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=147;SC=TACAGTGAAACTTAATGACTG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=71021896;WS=71021878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	71024010	rs111347259	T	TACAA	1247.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=4;PP=1183;SC=ACAGGACAAATACAATCAACT;SOR=3.334;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=21;WE=71024018;WS=71024000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	71027213	rs62305548	G	T	1392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=12;PP=1063;SC=TCTCAGAGAAGAAAGGTTATT;SOR=2.059;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=42;WE=71027221;WS=71027203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	71062256	rs3756132	C	T	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=164;SC=ATATATCATACGAAAATGAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=71062264;WS=71062246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	71062342	rs3756131	C	T	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=7;PP=497;SC=ACTAGTCCCACTGTGTTAAAC;SOR=1.508;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=21;WE=71062350;WS=71062332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	71062426	rs17704351	C	T	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=14;PP=484;SC=CACAGCGTCTCATGTCTGCCA;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=71062434;WS=71062416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	71063964	rs2306445	G	A	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=18;PP=610;SC=AAATAGGCAGGGGTTTTTGAA;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=71063972;WS=71063954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	71065943	rs34093806	GA	G	404.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=3;NR=15;PP=267;SC=GATGTCCTTTGAAAAAAAAAA;SOR=2.833;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=18;WE=71065951;WS=71065933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	71067010	rs62307377	T	C	287.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=206;SC=AAGATTCTTGTTAATTTAACA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=71067018;WS=71067006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	71067317	rs4694273	C	A	1116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=22;PP=850;SC=TGACCAGGAGCGCACCTCTAA;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=37;WE=71067325;WS=71067307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	71068489	rs3196714	T	C	2537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.293;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=9;PP=1902;ReadPosRankSum=1.568;SC=GGAGAAGAGATACCATATTTA;SOR=3.534;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=73;TCF=63;TCR=10;TR=72;WE=71068497;WS=71068479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,80:0.99:81
chr4	71098694	.	C	T	163.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=1;PP=118;SC=TAATTAATTTCACTATTTGAT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=71098702;WS=71098684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	71110488	rs41292331	C	T	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	71110505	rs140888032	AT	A	234.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.07;QD=23.47;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	71110639	rs13103289	G	A	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=11;PP=337;SC=AGAAAATTTTGTTTAAGGGCT;SOR=1.371;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=17;WE=71110647;WS=71110629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	71110680	rs41292333	G	A	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=306;SC=ATACAATTATGCTTCATAGAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=71110688;WS=71110670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	71110747	rs41292335	T	C	256.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.69;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	71110753	rs41292337	G	A	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	71113633	rs10518071	T	C	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=20;PP=597;SC=AAAGGTCAATTGTATTATAGA;SOR=1.536;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=29;WE=71113641;WS=71113623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	71114676	rs3836687	TATA	T	535.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=584;SC=CATTTGGGTCTATAATAATAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=16;WE=71114686;WS=71114674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	71114702	rs57550378	A	AT	709.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=633;SC=TGTATAATTTATTTTTTTTGC;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=25;WE=71114710;WS=71114692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	71115060	rs3775739	G	A	3898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.027;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=66;PP=2871;ReadPosRankSum=-0.084;SC=ACCTACACCAGCTCCTGCCAC;SOR=0.125;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=127;TCF=56;TCR=71;TR=122;WE=71115068;WS=71115050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,130:0.98:132
chr4	71115152	rs3775738	T	C	2635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.767;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=56;PP=1987;ReadPosRankSum=0.543;SC=CAACCACAGTTGCAGTTACTC;SOR=1.770;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=29;TCR=57;TR=84;WE=71115160;WS=71115142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,91:0.98:93
chr4	71201388	rs1351419	C	T	4423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=55;PP=2965;SC=ACTGATTCCACTATTCCTGAG;SOR=1.163;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=83;TCR=55;TR=138;WE=71201396;WS=71201378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr4	71227802	rs1842478	A	G	1532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.36;QD=34.84;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	71227998	rs1842477	A	T	437.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.51;MQRankSum=2.460;QD=36.48;ReadPosRankSum=1.942;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr4	71228001	rs1842476	G	A	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.73;QD=42.43;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	71232388	rs10031844	G	A	4088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=102;NR=15;PP=2965;SC=AGGCCCCAGGGGACCATATCC;SOR=3.704;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=102;TCR=15;TR=117;WE=71232396;WS=71232378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr4	71232430	rs10024123	T	C	5703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=72;PP=2965;SC=TCCTCCACCATGTTTTCCTTT;SOR=1.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=122;TCR=72;TR=194;WE=71232438;WS=71232420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr4	71232742	rs3775732	C	G	3842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=72;PP=2965;SC=TGCCACCACCCACAAAAGACA;SOR=1.143;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=50;TCR=72;TR=122;WE=71232750;WS=71232732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr4	71250308	rs2233586	T	A	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.42;QD=31.16;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	71250399	rs7676909	A	G	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=304;SC=ATTAATCATCAATGAAACACT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=71250407;WS=71250389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	71255657	rs2989	A	G	4176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=68;PP=2965;SC=TTCCCTGTAAATTCTCCAACT;SOR=0.876;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=56;TCR=68;TR=124;WE=71255665;WS=71255647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr4	71265172	rs1844635	A	C	80.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=89;SC=GGCTGTTGATAATTATGGACT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=71265180;WS=71265162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	71275012	rs1352689	T	C	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=364;SC=AGTAGATATATTAATACATAG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=71275020;WS=71275002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	71384488	rs28674149	C	T	2028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=5;PP=1573;SC=AGGTAGCAATCTGAAACATGA;SOR=4.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=53;TCR=5;TR=58;WE=71384496;WS=71384478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr4	71384537	rs35286445	C	T	2634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=27;PP=2005;SC=AGGATCAACTCGGTCATTACC;SOR=1.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=54;TCR=27;TR=81;WE=71384545;WS=71384527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr4	71497645	rs184414708	A	C	913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=26;PP=652;SC=GAAGTTATCCAGAGTCCTATC;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=71497653;WS=71497635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	71656836	rs201456019	AT	A	183.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=0;PP=361;SC=ATAATGACTTATCTCTTTGAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=2;WE=71656844;WS=71656834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	71690828	.	A	G	320	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=15;NR=0;PP=320;QD=23.6514141698;SC=AGAGATTTGCAGGATAATTAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=71690836;WS=71690827;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	71691743	rs6814981	C	T	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=0;PP=1026;SC=AACGCAGAAACACTATATTTT;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=37;WE=71691751;WS=71691733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	71698183	rs4694081	C	A	4423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=110;PP=2965;SC=AAGAAAAAACCCAACAGGGAT;SOR=3.226;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=24;TCR=110;TR=134;WE=71698191;WS=71698173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr4	71704965	rs3775728	C	T	4520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=66;PP=2965;SC=CGACCAGAGACTCGAGGCGAG;SOR=0.883;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=81;TCR=66;TR=147;WE=71704973;WS=71704955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr4	71705262	rs6813092	A	G	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=10;PP=490;SC=CGGAGGGCAGAGTAGGACGCG;SOR=0.914;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=18;WE=71705270;WS=71705252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	71768079	rs1871048	C	G	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=11.357;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=2;PP=731;ReadPosRankSum=0.746;SC=CGCCCCCTCCCCCTGCCATTG;SOR=5.131;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=41;WE=71768087;WS=71768069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr4	71844928	.	C	T	2382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=36;PP=1761;SC=CATTTATCATCAGCATTTTGA;SOR=0.801;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=34;TCR=36;TR=70;WE=71844936;WS=71844918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	71864013	rs6446988	A	G	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=2;PP=23;SC=CTTTAGGTATATATCTTCATC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=71864021;WS=71864003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	71892513	rs1486271	A	T	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=25;PP=945;SC=TGTTTTTTCTAAAAAAGTGTA;SOR=1.445;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=37;WE=71892521;WS=71892503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	71894321	rs35880082	C	CTTTT	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=5;NR=0;PP=162;SC=AACAATATTTCTTTTTTTTCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=71894329;WS=71894311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	71894476	.	A	AT	33	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.9382;HP=15;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=33;QD=12.0;SC=TGCCTAGCTAATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=3;WE=71894484;WS=71894466;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr4	71894554	rs140751249	A	C	112.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=86;SC=AGCTCACCACAACCTCTGCCT;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=71894562;WS=71894544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	71895260	rs4643786	C	T	225.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=186;SC=AACTTTTTGACCAGTTTCTTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=71895268;WS=71895250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	72316822	rs10022349	C	T	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=302;SC=ACTCCATCTCCCCATTAGCCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=72316830;WS=72316812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	72397710	rs3775162	C	T	1090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=12.430;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=0;PP=914;ReadPosRankSum=0.803;SC=GTTCTTCATTCAGTTCAAACA;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=31;WE=72397718;WS=72397700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,33:0.94:35
chr4	72397964	rs10446504	T	C	2162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=65;PP=1630;ReadPosRankSum=-0.848;SC=TAATTTATTGTGTTTCTCTTT;SOR=2.409;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=10;TCR=66;TR=75;WE=72397972;WS=72397954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,79:0.99:80
chr4	72411967	rs4694097	A	G	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=269;SC=CAAGCAAAGCAAGTCAGTTTC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=13;WE=72411975;WS=72411957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	72423624	rs1453474	C	T	2205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=51;PP=1832;SC=TTTAATTGAACGTACCTGTGA;SOR=2.139;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=18;TCR=51;TR=69;WE=72423632;WS=72423614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr4	72425863	rs1453458	C	T	2333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=44;PP=1843;SC=TCTCCCAGCACGACCTCAGCT;SOR=1.079;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=32;TCR=44;TR=76;WE=72425871;WS=72425853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr4	72429452	rs2290397	G	A	1635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=0;PP=1310;SC=GATGCTAGGAGATAGGAAGGG;SOR=7.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=45;WE=72429460;WS=72429442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	72432991	rs965606	A	C	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=704;SC=CCTAGTTACTATTACAAATAA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=72432999;WS=72432981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	72433759	rs1453453	C	T	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	72618296	rs9016	T	C	1342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=16;PP=979;SC=AAAGTCTGAGTGCTTGTTAAC;SOR=1.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=42;WE=72618304;WS=72618286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	72618334	rs7041	A	C	1473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=28;PP=1178;SC=TGGGTGTGGCATCAGGCAATT;SOR=1.067;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=48;WE=72618342;WS=72618324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	72620865	rs71673486	C	CTATTTATT	1175.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=19;PP=1130;SC=TATATATTTCCTATTTATTTA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=4;TCR=61;TR=19;WE=72620873;WS=72620855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	72622403	rs222033	A	C	2057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=12;PP=1634;SC=AAAATGGGAAAACGTTTTCAC;SOR=2.939;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=51;TCR=12;TR=63;WE=72622411;WS=72622393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr4	72634975	rs222016	G	A	1845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=12;PP=1458;SC=TCCATGCTGAGTCAAAGTTAC;SOR=2.507;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=56;WE=72634983;WS=72634965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr4	72934539	rs9884712	A	C	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=223;SC=TAGAATATGAATGCCTGAGGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=72934547;WS=72934529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	72934578	rs11444220	C	CT	300.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=9;NR=0;PP=281;SC=TTTATCTTATCTTTTTTCCTG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=72934586;WS=72934568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	72934632	rs9884478	C	T	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=4;PP=592;SC=ATTTCCAGGTCTCCTCAGTTG;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=72934640;WS=72934622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	73175093	rs10024487	C	T	2078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=9;PP=1643;SC=AATACTAAATCCATGAGAGAC;SOR=3.407;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=51;TCR=9;TR=60;WE=73175101;WS=73175083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr4	73414286	rs788908	C	T	3371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=57;PP=2846;SC=AGGCTCTGTTCTCCGGATTCT;SOR=0.973;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=46;TCR=57;TR=103;WE=73414294;WS=73414276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr4	73433122	rs33925079	GA	G	1742.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=21;PP=1718;SC=TACCAGCCTGGAAAGGAGGGG;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=42;WE=73433130;WS=73433112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	73433315	rs6830556	G	C	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=29;PP=898;SC=TTGGGGAAGGGAGTTGTTTGC;SOR=5.486;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=73433323;WS=73433305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	73434379	rs5859330	GT	G	1392.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=18;PP=866;SC=TTGGGTTTGAGTTTTTTTTTA;SOR=1.445;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=55;TCF=32;TCR=23;TR=44;WE=73434387;WS=73434369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	73434535	rs34234669	CA	C	157.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.95;MQRankSum=-0.000;QD=15.77;ReadPosRankSum=-1.221;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr4	73615956	rs1350836	C	T	1877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=34;PP=1480;SC=GGGATATTAACCAAGACCCAG;SOR=1.071;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=59;WE=73615964;WS=73615946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr4	73930552	rs3762883	G	A	1733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=28;PP=1365;SC=AAGTGGAGTCGGGTGCAGTGA;SOR=0.729;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=26;TCR=28;TR=54;WE=73930560;WS=73930542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr4	73930893	.	T	G	448	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=23;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=29;MQ=55.4;NF=44;NR=0;PP=448;QD=10.9720730124;SC=AGTATGCTTTTTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=50;TCR=1;TR=44;WE=73930901;WS=73930879;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,44:0.86:51
chr4	73933671	rs68113340	ATGTGTG	A	1045.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.707;NF=28;NR=0;PP=1585;ReadPosRankSum=0.854;SC=CAATTTATGTATGTGTGTGTG;SOR=4.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=50;TCR=2;TR=28;WE=73933684;WS=73933661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,36:0.92:39
chr4	73956736	rs6855349	G	A	4650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=88;PP=2965;ReadPosRankSum=1.067;SC=GATTGACACTGAGGACTGCAA;SOR=0.573;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=140;TCF=50;TCR=90;TR=138;WE=73956744;WS=73956726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,147:0.99:148
chr4	73991006	rs6822576	T	C	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=52;PP=1296;SC=CAAGTGTTAGTGCCGTGTCAT;SOR=3.841;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=6;TCR=52;TR=58;WE=73991014;WS=73990996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr4	74007870	rs12500051	A	G	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=559;SC=TTAGAACAAAAAAAAACCCTA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=74007878;WS=74007860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	74012462	rs13149759	A	T	2411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=21;PP=2038;SC=ATTAAGATTTAAAAAGTAACA;SOR=1.949;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=51;TCR=21;TR=72;WE=74012470;WS=74012452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr4	74281012	rs6832260	T	A	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=495;SC=TGGTTTCAATTCTGGAATCTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=74281020;WS=74281002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	74282092	rs35807836	A	AT	192.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=158;SC=TTATTGACTGATTTTTTTTAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=7;WE=74282100;WS=74282082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	74285239	rs962004	C	T	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=7;PP=1002;SC=TTGTTGAGCTCGTGAAACACA;SOR=2.613;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=37;WE=74285247;WS=74285229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	74302071	rs3796678	T	A	854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=19;PP=726;SC=ATAGGTGAGATATTTTGTGTT;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=74302079;WS=74302061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	74302151	rs3796677	A	T	252.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=208;SC=TTGATTTATTATTCATATTTA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=74302159;WS=74302141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	74304118	rs6446932	T	A	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=422;SC=AATGCATTTATATATTTGAAG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=74304126;WS=74304108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	74310844	rs2298839	A	G	2727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=58;PP=2070;ReadPosRankSum=0.189;SC=GATGGGGTGAAGAGTCTTGCT;SOR=1.346;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=33;TCR=60;TR=90;WE=74310852;WS=74310834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,92:0.98:94
chr4	74313169	rs7667494	T	C	282.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=264;SC=CTTTATTTTCTCTGTTGCAGG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=74313177;WS=74313159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	74318330	rs4235117	A	G	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=20;PP=653;SC=CGCTGCAAACAATGAAGCAAG;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=74318338;WS=74318320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	74349867	rs11939341	A	G	779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=2;PP=663;SC=TATAGCCATTACAATAGATAA;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=74349875;WS=74349865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	74357851	rs11733262	A	G	880.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5469;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=30;PP=727;ReadPosRankSum=0.000;SC=AAAGAAACTTATAAGATTTGA;SOR=3.675;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=30;WE=74357859;WS=74357841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,30:0.88:34
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chr4	74464443	rs11368217	TA	T	719.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=25;PP=526;SC=TCCCTAAAAATAAAAAAAAAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=25;WE=74464451;WS=74464433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	74486052	rs1247591	C	G	1697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=7;PP=1189;SC=CATCGTTGTTCGGCTGAACTT;SOR=2.970;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=44;WE=74486060;WS=74486042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr4	74486264	rs1247590	G	A	2327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=34;PP=1800;SC=CAGCGATCCTGGAGCCCCAGG;SOR=0.749;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=32;TCR=34;TR=66;WE=74486272;WS=74486254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr4	74607868	rs369603475	TA	T	145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=121;SC=CCTTTTTGGTTAAAAAAAAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=74607876;WS=74607858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr4	74713950	rs7658970	T	C	1624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=4;PP=1274;ReadPosRankSum=1.496;SC=AGAGGTACAATTACTGTCAAT;SOR=3.180;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=46;WE=74713958;WS=74713940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr4	74714098	rs2367288	G	A	5168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=1.678;SC=ATTCATCCCAGCAACATCATC;SOR=0.395;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=66;TCR=88;TR=153;WE=74714106;WS=74714088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,163:0.99:164
chr4	74718941	rs941758	C	A	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=10;PP=1016;SC=CGCTGTCCACCCCAGGCTTCC;SOR=2.133;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=41;WE=74718949;WS=74718931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	74719925	rs11723868	G	A	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=33;PP=1018;SC=TTATATTAACGAAATAAATCA;SOR=3.967;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=37;WE=74719933;WS=74719915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	74736144	rs4074	A	G	3251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=40;PP=2694;SC=TGCATTCGGAAAACTCTAGAG;SOR=0.930;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=55;TCR=40;TR=95;WE=74736152;WS=74736134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr4	74847292	rs352007	G	C	913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.88;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	74863997	rs425535	T	C	3532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=70;PP=2918;SC=GATGAACTCCTTGCGTGGTCT;SOR=1.546;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=37;TCR=70;TR=107;WE=74864005;WS=74863987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr4	75023609	rs6840665	T	C	3363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=37;PP=2767;SC=CACTGCACGCTTCCACATCCT;SOR=1.257;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=63;TCR=37;TR=100;WE=75023617;WS=75023599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr4	75023709	rs2289443	C	T	5643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=104;PP=2965;SC=CCGCTCTTTACCCCACTCTGC;SOR=1.018;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=182;TCF=78;TCR=104;TR=182;WE=75023717;WS=75023699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr4	75040944	rs13116686	T	G	3409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=37;PP=2810;SC=ACACTATTGATGAAAAACCAT;SOR=1.477;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=104;TCF=66;TCR=38;TR=103;WE=75040952;WS=75040934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr4	75046310	rs4694183	A	C	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=1;PP=676;SC=GTTTCCATGCATCTCATTTGA;SOR=5.211;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=25;WE=75046318;WS=75046300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	75046372	rs561583	A	G	2746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=11;PP=2172;SC=TGGTACTGGGACTGTCACAAG;SOR=3.339;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=68;TCR=11;TR=79;WE=75046380;WS=75046362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr4	75046465	rs561844	C	G	4315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=62;PP=2965;SC=CAGGCTTGCTCTTTGTCCAGT;SOR=0.783;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=132;TCF=69;TCR=63;TR=131;WE=75046473;WS=75046455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr4	75107255	rs4694184	T	C	1708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=25;PP=1209;SC=CACACCACCATGCGTAGCTAA;SOR=0.865;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=33;TCR=25;TR=58;WE=75107263;WS=75107245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr4	75231244	.	C	G	106	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=1;NR=4;PP=106;QD=28.1542425094;SC=TCTGTCTTCCCCTATGGTGGG;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=75231252;WS=75231234;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	75245343	rs7660209	T	A	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=21;PP=630;SC=GATAATTTTTTAAAAAAGGGT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=75245351;WS=75245333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	75246617	rs4694187	A	T	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=482;SC=TCTCCTTGACAGATTGGCATC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=75246625;WS=75246609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	75248434	rs2367707	A	G	2002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=44;PP=1465;SC=TAAGCAAAGAATATGTGGCTT;SOR=2.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=15;TCR=44;TR=59;WE=75248442;WS=75248424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr4	75248544	rs2367708	C	T	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=434;SC=TCTGCTTTTACAAATTACTTT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=75248552;WS=75248534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	75673363	rs4585380	G	A	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.129;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=17;PP=841;ReadPosRankSum=-0.857;SC=AAGAGGGCTTGGAAAATACGT;SOR=0.395;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=38;TCF=19;TCR=19;TR=36;WE=75673371;WS=75673353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr4	75673455	rs7699847	T	A	599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.57;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	75673533	rs62316277	T	C	119.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=114;SC=CCGAGGCAGGTGGATCACAAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=75673541;WS=75673523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	75675706	rs35926103	A	G	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=0;PP=886;SC=GAGAATGTAAAGAGGAAGAAA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=75675714;WS=75675696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	75675841	rs11938093	A	T	5671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=119;NR=56;PP=2965;SC=ACTGCTATCAAACAAATCACC;SOR=1.649;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=119;TCR=56;TR=175;WE=75675849;WS=75675831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr4	75719761	rs2278862	T	C	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=339;SC=GCCTCCTATTTATCCCCCCTC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=75719769;WS=75719751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	76670497	.	C	G	2659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=39;PP=1966;ReadPosRankSum=2.368;SC=ACTGCCCTGGCTGGGCAGTTT;SOR=0.878;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=51;TCR=40;TR=89;WE=76670505;WS=76670487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,92:0.98:94
chr4	76711200	rs67037358	TA	T	707.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.88;QD=23.59;SOR=6.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	76711224	rs142155815	AT	A	1401.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=50;NR=0;PP=1064;SC=AAAAAAAAAGATTTTTTTTCT;SOR=7.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=52;TCR=0;TR=50;WE=76711232;WS=76711214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr4	76721671	.	CT	C	205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=2.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.805;SOR=1.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,23:0.33:69
chr4	76722041	rs324727	G	A	1257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=38;PP=1127;SC=AGGTTATATGGTAACTCTAAA;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=38;WE=76722049;WS=76722031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	76722353	rs324726	G	A	1348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=17;PP=1053;SC=TTCGAGAGCAGGTAAGTACTA;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=22;TCR=17;TR=39;WE=76722361;WS=76722343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	76725245	rs381067	G	T	1701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=1;PP=1409;SC=TAATGCTAACGAGTATGACTT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=46;WE=76725253;WS=76725235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	76730004	rs324687	G	C	210.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=200;SC=GATTTTAAAAGTAGGAGGTTG;SOR=2.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=7;WE=76730012;WS=76729994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	76730061	rs324688	T	A	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=1;PP=596;SC=CCTTGATGAATTTAATACCAT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=76730069;WS=76730051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	76730195	rs324689	A	G	1823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=38;PP=1367;SC=TACAGAAAACAGAAGCGTTTG;SOR=1.214;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=24;TCR=39;TR=62;WE=76730203;WS=76730185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr4	76730258	rs324690	T	C	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=27;PP=824;SC=GTTGATGTATTATTTCTTAGC;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=76730266;WS=76730248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	76730309	rs145662788	CTTTAGATTACTTACTAGCCGG	C	267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=1514;SC=AGCACCTTCTCTTTAGATTAC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=76730337;WS=76730299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	76785716	rs1394913	C	T	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.70;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	76785723	rs1394914	A	G	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.49;SOR=3.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	76785736	rs1394915	T	C	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=478;SC=TGTTCCAATATATAATTAACA;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=76785744;WS=76785706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	76787673	rs7654738	T	C	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=24;PP=775;SC=GAAGCTAGGCTTGCCAGATAA;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=76787681;WS=76787663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	76788692	rs2135234	C	T	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=18;PP=524;SC=GCTCAGTTTTCGAGGGAGAGC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=76788700;WS=76788682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	76793228	rs1394916	A	G	1637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=31;PP=1380;SC=GATACTGCACAATATGTGGGG;SOR=0.931;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=24;TCR=31;TR=55;WE=76793236;WS=76793218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	76794345	rs6858658	T	G	4196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=51;PP=2965;SC=AGGAATTGCATGTTGTATTTT;SOR=1.102;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=74;TCR=51;TR=125;WE=76794353;WS=76794335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr4	76800729	rs13130621	A	G	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=5;PP=693;SC=TTTTTTTGTCAGATTCTTCTG;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=76800737;WS=76800719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	76800991	rs68095351	A	AT	190.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.78;QD=21.19;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	76804067	rs4859564	A	G	3291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=16;PP=2520;SC=GTATTATTTCATTAACCACTA;SOR=3.611;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=100;TCR=16;TR=116;WE=76804075;WS=76804057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr4	76805745	rs17220803	A	G	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=239;SC=TTTGACTTGTACCGTAAGTTC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=76805753;WS=76805735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	76805902	rs1976518	C	T	1779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=21;PP=1127;SC=GTTCTGGCGACGGGAGGCCAT;SOR=1.238;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=30;TCR=21;TR=51;WE=76805910;WS=76805892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	76805962	rs1976517	G	A	1522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=26;PP=1094;SC=GAAGGAAATAGGAAATCAGGT;SOR=1.251;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=41;WE=76805970;WS=76805952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	76805978	rs1566975	C	T	1413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=28;PP=986;SC=CAGGTTAAAACCAATAGGCAT;SOR=1.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=76805986;WS=76805968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	76809319	rs7691712	A	G	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=346;SC=CAGGTAGAGCATTCTTCTTTG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=76809327;WS=76809309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	76809386	rs7691755	A	G	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=6;PP=709;SC=TGATCTCCTCACTGTAACAGG;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=31;WE=76809394;WS=76809376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	76812673	rs13116688	C	G	114.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=1;PP=88;SC=GCCATTTACTCCTCAGCCCCT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=76812681;WS=76812663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	76838929	rs34444403	TA	T	184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=0.799;QD=3.03;ReadPosRankSum=0.297;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,20:0.33:61
chr4	76839729	rs2869456	A	C	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=336;SC=CACCCCACCCATATTAGTCCC;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=76839737;WS=76839725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	76861137	rs6847716	G	C	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=2;PP=692;SC=TACTCCGCGCGGGCTTGGGGC;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=76861145;WS=76861127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	76861859	rs2292533	C	T	1216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=8;PP=955;SC=CCCGCAGGGCCGGTGTCCCCG;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=37;WE=76861867;WS=76861849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	76878716	rs2242471	G	C	2365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=48;PP=1953;SC=CCTCTTCTGGGATTTCCCGGG;SOR=1.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=19;TCR=48;TR=67;WE=76878724;WS=76878706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr4	76878956	rs2242473	G	A	1679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=33;PP=1289;SC=AATAAATTACGTCTTAATAAA;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=17;TCR=33;TR=50;WE=76878964;WS=76878946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	76878982	rs2242474	T	C	1394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=36;PP=1055;SC=GGTTATAAGATGAAATTTTCA;SOR=2.124;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=48;WE=76878990;WS=76878972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	76997157	.	GT	G	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.889;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=4.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=-1.428;QD=1.17;ReadPosRankSum=-0.601;SOR=2.173;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,14:0.22:63
chr4	77025080	.	C	T	6342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=147;NR=34;PP=2965;SC=ATATTTATTTCTGCCTTTAGG;SOR=2.920;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=182;TCF=147;TCR=35;TR=181;WE=77025088;WS=77025070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr4	77065476	rs33962347	TA	T	182.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=1.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.12;ReadPosRankSum=0.321;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,21:0.24:86
chr4	77201332	rs1036787	G	A	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=548;SC=TACTTTATAAGGAACTAAATG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=77201340;WS=77201322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	77201487	rs1036788	C	T	1310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=21;PP=1046;SC=GGCTACAGGACGCCACGTGTG;SOR=0.892;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=41;TCF=19;TCR=22;TR=40;WE=77201495;WS=77201477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	77204398	rs74988469	CAT	C	717.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=611;SC=AGATTATTAACATGTGATTTT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=77204407;WS=77204388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	77278411	.	T	C	120	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=5;NR=0;PP=120;QD=30.9542425094;SC=GTATATTTCTTACATCATTTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=77278419;WS=77278410;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	77303898	rs6844174	C	T	1385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=36;PP=1072;SC=TGGTGATTGTCATTTGATACA;SOR=3.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=41;WE=77303906;WS=77303888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	77305346	rs17001890	A	G	4025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=52;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.694;SC=ACATGCTGTCATGTTCACATA;SOR=0.509;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=88;TCR=52;TR=139;WE=77305354;WS=77305336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,140:0.99:141
chr4	77494534	.	CAAT	C	169	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=28;MQ=60.62;NF=4;NR=0;PP=169;QD=43.25;SC=TGCTGGTTGGCAATAATAATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=77494544;WS=77494524;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,4:0.50:8
chr4	77637502	rs344122	A	C	5742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=51;PP=2965;SC=TTATTCCACGACTGAATATGA;SOR=1.935;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=176;TCF=125;TCR=51;TR=175;WE=77637510;WS=77637492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr4	77652219	rs344135	T	C	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=29;PP=650;ReadPosRankSum=0.685;SC=CTCTATCCACTGCTTTTCTCA;SOR=4.804;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=30;WE=77652227;WS=77652209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,32:0.94:34
chr4	77660162	rs344140	G	C	5039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=91;PP=2965;SC=GGCATCTCTGGCCGGGAGCGT;SOR=1.108;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=67;TCR=91;TR=158;WE=77660170;WS=77660152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr4	77660731	rs344141	C	G	2789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.054;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=46;PP=2150;ReadPosRankSum=-1.377;SC=CAGCATCTACCCGGTACCTTC;SOR=0.142;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=95;TCF=49;TCR=46;TR=93;WE=77660739;WS=77660721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,97:0.98:99
chr4	77662248	rs344142	G	A	1363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=29;PP=1141;SC=CCGAGGCGTCGGCCTCCGCCT;SOR=2.247;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=38;WE=77662256;WS=77662238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	77663262	rs344144	T	C	3930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=1.164;SC=GGTTTCCTTATAAAGATATAG;SOR=2.070;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=17;TCR=98;TR=114;WE=77663270;WS=77663252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,117:0.99:118
chr4	77669991	rs11097499	A	T	173.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=20;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=173;SC=TTTTTTTTTTAAATCTTCGGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=77669999;WS=77669981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	77817362	rs2703131	T	C	3492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=58;PP=2654;SC=GTTTTAGTGATAAACCTGCAT;SOR=1.168;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=41;TCR=58;TR=99;WE=77817370;WS=77817352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr4	77817874	rs2703130	G	T	5349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.032;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=84;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.242;SC=GTCAATGAAGGGTTCCCCGCC;SOR=0.112;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=176;TCF=91;TCR=85;TR=172;WE=77817882;WS=77817864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,175:0.99:177
chr4	77818202	rs2645674	T	C	1865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.844;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=24;PP=1404;ReadPosRankSum=-0.886;SC=AAGCCCTGCTTGTCGCAGCCT;SOR=0.870;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=37;TCR=25;TR=60;WE=77818210;WS=77818192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
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chr4	77949997	rs111698952	TGGTCCAA	T	3651.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.366;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.610;NF=9;NR=58;PP=2964;ReadPosRankSum=1.446;SC=GACTTCATGATGGTCCAAGTA;SOR=0.352;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=77;TCF=9;TCR=68;TR=67;WE=77950011;WS=77949987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,91:0.95:96
chr4	77987351	rs4241602	A	G	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=2;PP=1035;SC=GTATGGCAGTAGTATGTTTAT;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=33;WE=77987359;WS=77987341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	78669454	rs6855336	A	G	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=10;PP=614;SC=AAGGAAGAATAAGAAAAACTA;SOR=1.051;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=24;WE=78669462;WS=78669444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	78697552	rs34417165	T	TA	326.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=4;PP=201;SC=TTAGTCTGTTTAAAAAAAAAA;SOR=1.765;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=11;WE=78697560;WS=78697542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	78740132	rs6828302	G	C	137.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.58;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	78740203	.	G	GACACACACACACACACACAC	199.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.95;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	78873605	rs35979107	A	G	2205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=24;PP=1650;SC=TGGTATTGCGATATAAAAATC;SOR=1.179;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=41;TCR=24;TR=64;WE=78873613;WS=78873595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr4	78873629	rs17002849	G	A	2585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=36;PP=1819;SC=GTTGATTCTCGTTTTTGTTTC;SOR=0.740;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=43;TCR=36;TR=79;WE=78873637;WS=78873619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr4	78882331	rs57716781	C	CA	278.50	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=2.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.53;MQRankSum=0.877;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.899;SOR=0.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr4	79158843	rs10011303	G	T	798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=23;PP=657;SC=GATCATTTCAGACATCTGTTT;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=79158851;WS=79158833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	79173515	rs34015316	C	CT	969.76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.204;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.414;NF=34;NR=7;PP=690;ReadPosRankSum=-1.520;SC=TGGCACTAACCTTTTTTTTTT;SOR=2.517;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=59;TCF=45;TCR=14;TR=41;WE=79173523;WS=79173505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,42:0.89:47
chr4	79176325	rs1017647	C	T	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=420;SC=ACTGGCTGCACGCCCATGCAG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=79176333;WS=79176315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	79176361	rs1017646	T	C	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=8;PP=658;SC=ACAAATGCCATCCCCCTAGTA;SOR=1.688;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=79176369;WS=79176351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	79186171	rs2867014	G	A	3283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=73;PP=2569;SC=CCTGTTCTGCGTGTTAAGGAT;SOR=2.004;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=28;TCR=73;TR=101;WE=79186179;WS=79186161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr4	79187832	rs2008587	G	A	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=1;PP=571;SC=TTTTCATAGAGGCTATTCCTA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=79187840;WS=79187822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	79187900	rs7694740	T	G	1589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=10;PP=1244;SC=ACAAATGTAATGAAAATTGGG;SOR=2.400;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=45;WE=79187908;WS=79187890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	79188160	rs2008786	C	T	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=27;PP=1022;SC=CTTCTTATTCCGGTGTGTCCT;SOR=1.552;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=40;WE=79188168;WS=79188150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	79204209	rs1378236	C	T	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=9;PP=254;SC=TGCTTCTTTTCATTTTTATTT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=79204217;WS=79204199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	79285001	rs17003160	G	A	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=7;PP=710;SC=CACACTTGGGGTGCTGCTTTG;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=79285009;WS=79284991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	79285354	rs57911981	G	A	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=33;PP=980;SC=TACAAAGGCAGTAAGGTTGCC;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=36;WE=79285362;WS=79285344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	79291275	rs11098158	G	A	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=108;SC=ACAATTGTGTGTGTATGTATA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=79291283;WS=79291265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	79295156	rs7687731	A	G	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=207;SC=TCCTTTGCCCAGTACACTAGG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=79295164;WS=79295146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	79295418	rs34889042	C	CTG	1266.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=16;PP=1059;SC=AACTTGGAGACTGCTGATTAT;SOR=1.942;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=21;WE=79295426;WS=79295408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	79350200	.	C	CTGTGTG,CTGTGTGTG	943.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.1;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=12,12;NR=0,0;PP=89,315;SC=GTGCGTGTCTCTGTGTGTGTG;SOR=3.716;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=12,12;WE=79350208;WS=79350190;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.25,0.75:20
chr4	79372856	rs10026662	A	C	3764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=25;PP=2965;SC=AATTGAATTCACACCTCTTGC;SOR=2.757;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=91;TCR=25;TR=116;WE=79372864;WS=79372846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr4	79372930	rs753752	C	T	4862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=77;PP=2965;SC=TTATAGGCCACGTAGAATATA;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=71;TCR=77;TR=148;WE=79372938;WS=79372920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr4	79373254	rs753751	T	C	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=3;PP=236;SC=ACCTTACTTCTTGGCACCAGG;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=79373262;WS=79373244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	79385803	rs11933507	G	A	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=308;SC=CAGCTATCACGTTGCAGCTGT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=79385811;WS=79385793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	79387442	rs7660664	C	T	6472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=116;NR=87;PP=2965;SC=AGCATTTCCACCTCACCTCCA;SOR=1.050;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=116;TCR=87;TR=203;WE=79387450;WS=79387432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr4	79387464	rs7684722	A	G	6918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=108;PP=2965;SC=CTTCACCATGAAAGATATCTA;SOR=0.730;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=211;TCF=103;TCR=108;TR=211;WE=79387472;WS=79387454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr4	79391020	rs7681619	C	T	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=458;SC=TTGCCCATCCCTCATCTCTGA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=79391028;WS=79391010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	79391036	rs1496602	T	C	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=608;SC=TCTGAAGTGTTAGCAGACTTC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=79391044;WS=79391026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	79391256	rs7664505	T	C	1548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=34;PP=1238;SC=GTAAGGCCTGTCCCTCTGTCA;SOR=2.560;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=45;WE=79391264;WS=79391246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	79391427	rs11728668	T	G	135.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=105;SC=GTAGGATCGGTTACGATTGTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=79391435;WS=79391417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	79400404	rs72659024	C	T	389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=325;SC=GGTTTTATGTCAGAGTTTGAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=79400412;WS=79400394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	79409997	rs1496603	T	C	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=167;SC=CTTCCACTAATGGTGCGTCTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=79410005;WS=79409987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	79420864	rs7677541	T	C	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.05;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	79420869	rs76630865	CC	TG	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.38;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	79434484	rs72659041	T	C	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=481;ReadPosRankSum=-0.603;SC=GAGAAAGAAGTATGTCCTATT;SOR=1.255;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=20;WE=79434492;WS=79434474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr4	79437155	rs3749487	C	T	4640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=93;PP=2965;SC=GCTCTGTAACCGCTGACTTCC;SOR=1.304;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=150;TCF=57;TCR=93;TR=149;WE=79437163;WS=79437145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr4	79440425	rs2903471	T	C	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=281;SC=GATGTGGTGATAGTATGTCTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=79440433;WS=79440415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	79442873	rs17470769	C	T	282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=9;PP=238;SC=CAGTAAAAAACAGTCAACAAT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=79442881;WS=79442863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	79443774	rs931604	T	A	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=1;PP=809;SC=CACAAGTACATTAAATGCATG;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=79443782;WS=79443764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	79447763	rs34670941	T	C	1650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=16;PP=1314;SC=CAGCCATGGGTTGACCCAGGA;SOR=1.436;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=48;WE=79447771;WS=79447753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr4	79455714	rs4975070	C	G	2172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=10.165;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=46;PP=1616;ReadPosRankSum=-0.034;SC=TAATGGATCCCAATACATCTG;SOR=1.702;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=68;TCF=20;TCR=48;TR=64;WE=79455722;WS=79455704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,71:0.97:73
chr4	79455733	rs4975139	C	T	2035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.883;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=42;PP=1563;ReadPosRankSum=-0.920;SC=TGATATGTCACTAGCAGAAAT;SOR=2.184;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=57;TCF=15;TCR=42;TR=56;WE=79455741;WS=79455723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,61:0.98:62
chr4	79455858	rs4975140	T	A	495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=358;SC=TCTGCTCATATGCTCTCAGTC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=79455866;WS=79455848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	79462311	rs72659058	T	A	1466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=39;PP=1057;SC=TTTTCTAAAATCATTTTTATA;SOR=3.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=45;WE=79462319;WS=79462301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	79845007	rs13108247	C	A	1719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=19;PP=1403;ReadPosRankSum=-0.738;SC=AAAGAGATACCTACCTGGAAA;SOR=0.551;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=57;TCF=38;TCR=19;TR=55;WE=79845015;WS=79844997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr4	79854436	rs10857059	T	C	1551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=52;PP=1232;SC=TGAATGTAAATGGATCAAATC;SOR=5.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=54;TCF=2;TCR=52;TR=54;WE=79854444;WS=79854426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr4	80828668	rs10027070	A	T	1438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=44;PP=1238;ReadPosRankSum=0.541;SC=GCCATTATTTAAAAAAGCATG;SOR=4.047;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=46;WE=80828676;WS=80828658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,46:0.98:47
chr4	80828740	rs6819294	T	A	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=307;SC=CCATGTTAACTTGAGACATGA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=80828748;WS=80828730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	80905833	rs28534734	T	C	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=0;PP=538;SC=GGATGAAAAATAACCACTGAT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=80905841;WS=80905823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	80905851	rs28688624	A	C	942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=0;PP=798;SC=GATTTGTATAAATTAAAAAGT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=80905859;WS=80905841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	80905990	rs12647691	C	G	2774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=48;PP=2402;SC=GGTGCAGGGGCGGGTGGTGGT;SOR=0.979;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=37;TCR=49;TR=85;WE=80905998;WS=80905980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr4	80906131	rs4444771	C	T	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=23;PP=661;SC=AAGTCCCTCACTGAAGCTTGC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=80906139;WS=80906121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	80939979	rs4336166	C	T	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=2;PP=341;SC=TATGCAACAACACCAAAGATC;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=80939987;WS=80939969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	80975372	rs10745242	A	T	2679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=15;PP=2161;ReadPosRankSum=-0.861;SC=CTTCTTATAGATTAAAAAAAT;SOR=1.633;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=66;TCR=15;TR=80;WE=80975380;WS=80975362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,84:0.99:85
chr4	80976420	rs11730210	G	T	4274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=3.650;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.28;ReadPosRankSum=1.502;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,145:0.99:146
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chr4	81884610	rs11452353	A	AT	881.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.48;QD=30.40;SOR=6.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	81884722	rs1052325	G	A	2258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=41;PP=1709;SC=AGAACTCTACGTACAAGCTGT;SOR=0.992;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=29;TCR=41;TR=70;WE=81884730;WS=81884712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr4	81967188	rs6831040	C	T	3238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=43;PP=2541;SC=TATCACTCAACTCTTGAGGAA;SOR=0.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=47;TCR=43;TR=90;WE=81967196;WS=81967178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr4	81973224	rs12647814	A	T	1651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=26;PP=1283;SC=ATATACCCTTAAAGTTTTAAC;SOR=0.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=23;TCR=26;TR=49;WE=81973232;WS=81973214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	81973260	rs1390318	C	T	1733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=31;PP=1277;SC=ATGCTGGGAGCTTTAGGAGTT;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=19;TCR=31;TR=50;WE=81973268;WS=81973250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr4	83347309	rs34583014	TAAGA	T	1412.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=10;PP=1198;SC=GAATTCTCATTAAGATAGTTT;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=25;WE=83347320;WS=83347299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	83352177	rs10646358	C	CTT	2604.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=49;PP=2587;SC=GGCGGTGTGGCTGCCTCTTGT;SOR=5.856;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=62;TCF=2;TCR=60;TR=51;WE=83352185;WS=83352167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	83369287	rs4285076	A	G	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=35;PP=1316;SC=GATAGGGGATAGAAGTTGCAG;SOR=2.400;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=46;WE=83369295;WS=83369277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	83375719	rs6853622	T	C	141.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=111;SC=TTGGGCAGTATGTTTATTAGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=83375727;WS=83375717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	83376098	rs201969443	CT	C	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.77;ReadPosRankSum=0.527;SOR=0.141;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr4	83406549	rs113689314	A	ATGTGTG	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.57;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	83483562	rs35866205	C	T	1037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=28;PP=808;SC=TTCTCCTCCACTCAGCGCTGT;SOR=4.680;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=30;WE=83483570;WS=83483552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	83552809	rs3857138	A	C	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=25;PP=718;SC=TTGGTTACTGACTCCAAAGGC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=83552817;WS=83552799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	83582211	rs3733227	C	G	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=17;PP=492;SC=GCTCTTCCTTCTTTCTGGATG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=83582219;WS=83582201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	83626674	rs6853042	G	A	1719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=42;PP=1375;SC=GTGTCAGGGGGGAAAGCTGCA;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=10;TCR=42;TR=52;WE=83626682;WS=83626664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr4	83742336	rs4634209	C	T	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=15;PP=543;SC=TCTCATTGCACTAAACCTTAT;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=22;WE=83742344;WS=83742326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	83778378	rs4235054	A	T	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=45;PP=1303;SC=ATATATATACATGAATGGAGA;SOR=7.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=45;WE=83778386;WS=83778368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	83784337	rs7666917	G	A	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=262;SC=AAGAAAAAGGGAAAAAACGCT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=83784345;WS=83784327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	83787845	rs7356522	G	A	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=0;PP=721;SC=ATACCCACAAGTACATCTCAA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=83787853;WS=83787835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	83788139	rs2290739	C	A	1004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=25;PP=855;SC=ATAACATAAGCATCCGACCAT;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=83788147;WS=83788129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	83788344	rs2045478	A	T	3432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=76;NR=28;PP=2607;SC=CATCTGTGCTACCTCCCATGA;SOR=1.928;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=76;TCR=28;TR=104;WE=83788352;WS=83788334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr4	83788562	rs2045479	T	C	1420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=41;PP=1182;SC=ACAAGTATAGTTAAATTGAAT;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=41;WE=83788570;WS=83788552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	83791373	rs10015419	C	T	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=1;PP=833;SC=TCCACATACTCTTCACATAGT;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=83791381;WS=83791363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	83791649	rs3762902	G	T	1289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=38;PP=1091;SC=TTCTGCCTAGGTTTTGTAGAT;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=38;WE=83791657;WS=83791639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	83792498	rs7685043	G	T	78.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=1;PP=57;SC=CACAAGTAACGTAGGTACAGT;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=83792506;WS=83792488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	83792555	rs7686508	C	A	205.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=166;SC=TGCAGTAAGTCGTTACTTAAT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=83792563;WS=83792545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	83793243	rs4693525	A	C	2715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=50;PP=2154;SC=AATGCATCTGAAGATAGTTAA;SOR=1.127;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=32;TCR=50;TR=82;WE=83793251;WS=83793233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr4	83793354	rs143845447	A	ATTTTG	996.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=950;SC=GCTGTGGCTTATTTTATTTAT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=16;WE=83793376;WS=83793344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	83793368	rs11942312	C	T	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=414;SC=TATTTATGATCTATTTATTGT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=83793376;WS=83793344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	83795806	rs10025654	T	C	2872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=38;PP=2166;ReadPosRankSum=-0.342;SC=GCTCATTTTTTCTAAGATCCC;SOR=1.006;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=51;TCR=39;TR=88;WE=83795814;WS=83795796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,93:0.98:95
chr4	83838217	rs1031639	G	A	4767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=107;NR=43;PP=2965;SC=TAAAAAGTATGCCTCTCAAGC;SOR=1.989;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=109;TCR=44;TR=150;WE=83838225;WS=83838207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr4	83838262	rs897945	G	T	5810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=93;NR=79;PP=2965;SC=GTCACAGTTTGCAGGGGTTTA;SOR=0.887;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=93;TCR=79;TR=172;WE=83838270;WS=83838252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr4	83839799	rs6535411	A	G	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=31;PP=1151;SC=TGGGCATATTAATCTTTTTGT;SOR=2.419;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=39;WE=83839807;WS=83839789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	83852065	rs985899	G	A	1553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=1;PP=1254;SC=TATTTGGGAAGTACTATAAAA;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=44;WE=83852073;WS=83852055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	83857402	rs6535415	T	C	765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=19;PP=605;SC=TGGATATTTCTGTCAGTTAAA;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=83857410;WS=83857392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	83900043	rs6535422	A	G	4595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=95;NR=33;PP=2965;SC=AACCTGCAATAACTGGTGGTG;SOR=2.285;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=129;TCF=95;TCR=34;TR=128;WE=83900051;WS=83900033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr4	83900260	rs7674484	A	G	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=27;PP=773;SC=ATGTAAAACCAGCTCACTTAA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=83900268;WS=83900250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	83905258	rs9994716	C	G	1397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=0;PP=1171;SC=AACTATGAATCAGTTAAATTT;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=39;WE=83905266;WS=83905248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	83977975	rs6535432	C	T	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=575;SC=GATTCCCTTACGGTACCAGAA;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=83977983;WS=83977968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	83989516	rs2868747	T	C	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=11;NR=1;PP=326;SC=AACCAGAAGCTTTCTGTTCTC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=83989524;WS=83989506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	84015865	.	C	T	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=327;SC=GGCTCTCCTTCTGTTGATATC;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=84015873;WS=84015855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	84188850	rs1129617	G	A	848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=16;PP=660;SC=CACTGAAGCCGCTGAGCCACG;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=27;WE=84188858;WS=84188840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	84205618	rs13113787	A	C	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=11;PP=785;SC=GCCGACTCGGAGGCTGCTACT;SOR=1.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=36;WE=84205626;WS=84205608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	84223461	rs4285078	G	C	1828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=44;PP=1435;SC=AAAAATAGATGTTTACTTATG;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=6;TCR=44;TR=50;WE=84223469;WS=84223451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	84230619	rs11099592	T	C	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=16;PP=1110;SC=AAAATCTTCCTTGGTAGCAGT;SOR=1.378;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=46;WE=84230627;WS=84230609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	84232104	rs6535455	T	C	602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=14;PP=454;SC=AGCAAACATATAGCAGTATTT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=84232112;WS=84232094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	84234190	rs6818355	A	G	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.19;MQRankSum=2.121;QD=20.51;ReadPosRankSum=-0.789;SOR=2.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,25:0.93:27
chr4	84234229	rs6840520	G	A	2195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=3;PP=1887;SC=GCTAGTGGGGGATCTCCTTAT;SOR=4.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=64;TCF=61;TCR=3;TR=64;WE=84234237;WS=84234219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr4	84240654	rs12501123	G	A	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=22;PP=597;SC=TAGAAGGTCTGTTTTCACAGT;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=84240662;WS=84240644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	84240680	rs12501124	G	T	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=14;PP=391;SC=GACTGAAATCGCATATATTTA;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=84240688;WS=84240670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	84255641	rs6832713	G	C	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=2;PP=253;SC=GAAGGAGAGCGGCTGGCGGGG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=84255649;WS=84255631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	84347363	rs4693624	A	G	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=22;PP=658;SC=CAAGATAAATATATTTGTAAA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=84347371;WS=84347353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	84352750	rs12645412	T	C	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=279;SC=TATAAAGTTATTGCATAACTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=84352758;WS=84352740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	84353154	rs2047210	T	C	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=338;SC=TTCTTAATCATATAGGAAAGA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=84353162;WS=84353144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	84362443	rs4693088	T	G	910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=9;PP=580;SC=GGAATTTAAATGTTATCAATG;SOR=1.143;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=26;WE=84362451;WS=84362433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	84364751	rs7665103	A	G	726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=18;PP=562;SC=CACTCATACCAATAATTTGAG;SOR=2.494;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=84364759;WS=84364741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	84364808	rs6535473	T	C	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=15;PP=541;SC=TTAAGGAAAATATGTTATTTA;SOR=2.948;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=84364816;WS=84364798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	84367050	rs11099599	G	A	113.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=57;SC=TAAAACAAAGGCAAAAAGCTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=84367058;WS=84367040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	84367286	rs11099600	G	A	1365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=33;PP=1023;SC=TCTTCATATAGTGCTCATATA;SOR=3.365;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=37;WE=84367294;WS=84367276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	84368225	rs11272773	GCATTGTGGCCAATGCCTGTAATCC	G	551.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=2092;SC=AATTGGCCAGGCATTGTGGCC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=84368256;WS=84368215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	84369822	.	C	CA	166	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=15;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=23;MQ=57.02;NF=14;NR=1;PP=166;QD=11.2666666667;SC=GACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=15;WE=84369830;WS=84369821;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:22,15:0.41:37
chr4	84370091	rs13141136	A	G	2450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=68;PP=1990;SC=ACAGAATTCAATGTTAAACAA;SOR=4.977;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=72;TCF=4;TCR=68;TR=72;WE=84370099;WS=84370081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	84370124	rs10718573	TA	T	1184.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=47;PP=792;SC=TCTGTGGAATTAAAAAAAAAA;SOR=7.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=0;TCR=55;TR=47;WE=84370132;WS=84370114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	84374480	rs1494961	C	T	1744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=22;PP=1344;SC=GATGACTCAACTGTTTTCTTA;SOR=1.047;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=31;TCR=22;TR=52;WE=84374488;WS=84374470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	84376743	rs6831595	A	T	3488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=68;PP=2445;SC=ATCTCCGGGCACGAGCTCGGC;SOR=2.002;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=30;TCR=68;TR=98;WE=84376751;WS=84376733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr4	84377497	rs2279658	A	G	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=396;SC=AGTGTCGTCTAATCCACTCCT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=84377505;WS=84377487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	84380955	rs12505955	G	T	1007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.69;NF=6;NR=25;PP=833;SC=TTACAGGTATGTTCTTTTTTA;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=84380963;WS=84380945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	84381035	rs34365268	CA	C	269.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=294;SC=CTCAAATTTTCAAATTGTGCT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=84381043;WS=84381025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	84382058	rs34734728	CA	C	160.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=128;SC=GACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=84382066;WS=84382048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	84383810	rs12642536	C	T	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=19;PP=713;SC=AAGTCTAAGGCTTTATGCTTA;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=84383818;WS=84383800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	84393475	rs6535478	C	T	272.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=7;PP=223;SC=ATTTCAAATACGCTAAAAATA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=84393483;WS=84393465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	84397590	rs17352803	A	C	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=53;SC=GAAGATCAGCATTAAGTAATA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=84397598;WS=84397580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	84397620	rs17352824	G	A	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=79;SC=AGAAAGAACTGCTAGGGTTGA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=84397628;WS=84397610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	84397864	.	ATTAAT	A	817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=8;PP=648;SC=TTATGATTACATTAATTCAAT;SOR=1.022;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=12;WE=84397876;WS=84397854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	84401623	rs6838354	T	C	219.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=180;SC=ATCCATGAAATAGTAGTTGCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=84401631;WS=84401613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	84403491	rs35608460	A	AG	245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=303;SC=TATGTATACAATATGTGCTAC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=84403499;WS=84403481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	84509465	rs11394944	T	TG	3393.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=38;PP=2936;SC=GAGTATCTGCTCCAATGTGCC;SOR=0.867;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=75;TCF=37;TCR=38;TR=73;WE=84509473;WS=84509455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr4	85465390	.	ATT	A	640.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.57;QD=33.72;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	85530796	rs17009168	A	C	1275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=34;PP=1036;SC=GTCACAGAATATTTAGTTCCT;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=85530804;WS=85530786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	85555196	rs13102661	G	A	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=550;SC=TGTACTGTTTGTTGTTCTTAT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=85555204;WS=85555186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	85560000	rs34754898	T	TTA	107.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=172;ReadPosRankSum=-0.414;SC=AGGAAATAGTTTATATATATA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=4;WE=85560008;WS=85559990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr4	85612737	rs3747680	A	G	2826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=19;PP=2202;ReadPosRankSum=0.206;SC=GGATAGCCAGACCACAAAAGA;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=69;TCR=19;TR=87;WE=85612745;WS=85612727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,90:0.99:91
chr4	85625701	rs1838039	A	G	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=444;SC=TGATAACTGTAACACTAAATG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=85625709;WS=85625691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	85634488	rs13108722	T	C	953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=27;PP=900;SC=ATTTTCATAGTTGCGTCTACC;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=85634496;WS=85634478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	85647941	rs71670880	T	TA	154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=0;PP=93;SC=ACCATGCACTTAAAAAAAAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=85647949;WS=85647931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	85656350	rs6838727	T	C	263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=208;SC=TTGAAATTAATGCTAAATAAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=85656358;WS=85656340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	85699579	rs12502409	A	G	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=724;SC=CATTTTAGAGATAAAATAGTT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=85699587;WS=85699569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	85710824	rs13137042	C	A	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=-0.000;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr4	85730914	rs6531775	T	C	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=0;PP=579;SC=AGTGATACACTTCAAACAAAT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=85730922;WS=85730904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	85762385	rs2046402	T	C	3300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=44;PP=2424;SC=GATTAATCTCTAGGAACTGAA;SOR=0.791;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=52;TCR=44;TR=96;WE=85762393;WS=85762375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr4	86863206	rs11367691	CT	C	255.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=3;PP=166;SC=TACTGTGATCCTTTTTTTTTA;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=86863214;WS=86863196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	87024228	.	C	CTGTG,CTG	367.74	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.04;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=7,7;NR=1,1;PP=72,152;SC=GATTTCAACTCTGTGTGTGTG;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=8,8;WE=87024236;WS=87024218;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:8
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chr4	87638342	.	AT	A	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.87;ReadPosRankSum=0.164;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr4	87684031	rs710832	A	G	1946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=20;PP=1495;SC=CCTTTGGGCCATCTGGGGGCC;SOR=1.681;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=43;TCR=20;TR=63;WE=87684039;WS=87684021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr4	87724970	rs61750816	G	A	3556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=67;PP=2818;SC=CGAGTCCTGCGGGGTTTGCTA;SOR=1.159;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=42;TCR=67;TR=109;WE=87724978;WS=87724960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr4	87770252	rs17694522	G	A	3309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=80;PP=2553;ReadPosRankSum=-0.829;SC=TGAGCTGCTGGAACAATTGGC;SOR=2.543;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=12;TCR=81;TR=92;WE=87770260;WS=87770242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr4	87808810	rs3035472	G	GCA	1976.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.24;MQRankSum=0.298;NF=31;NR=5;PP=1733;ReadPosRankSum=-0.603;SC=CCACCAGTGGGCATTCAAATA;SOR=2.540;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=36;WE=87808818;WS=87808800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
chr4	87809387	rs1550931	G	T	4585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=91;PP=2965;SC=TAGGTTTGTGGACCAGGTCTT;SOR=1.355;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=56;TCR=91;TR=147;WE=87809395;WS=87809377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr4	87812586	rs55723875	TA	T	2246.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=42;NR=35;PP=1209;SC=TACCCTGATTTAAAAAAAAAA;SOR=1.329;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=97;TCF=50;TCR=47;TR=77;WE=87812594;WS=87812576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr4	87957989	rs340629	T	C	2669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.04;SOR=1.005;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr4	88048315	rs112686186	GC	G	3417.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=62;PP=2971;SC=GTTTTGTTTTGCTTCCCCCCC;SOR=4.778;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=74;TCF=6;TCR=68;TR=64;WE=88048336;WS=88048304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr4	88048327	rs146011121	CA	C	943.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.949;NF=1;NR=46;PP=707;ReadPosRankSum=1.735;SC=TTCCCCCCCCCACCAAGATAG;SOR=1.981;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=53;TCF=3;TCR=50;TR=47;WE=88048336;WS=88048304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,40:0.85:47
chr4	88048863	rs62306540	T	C	3508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=65;PP=2946;SC=ATGGTTAGTATTGGCCCTTTA;SOR=1.265;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=105;TCF=40;TCR=65;TR=104;WE=88048871;WS=88048853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr4	88052219	rs342467	T	C	3141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=49;PP=2175;SC=ACAATGACCATGTTCTTCTCC;SOR=0.808;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=52;TCR=49;TR=101;WE=88052227;WS=88052209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr4	88053085	rs342466	C	T	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=425;SC=CAAAAAGATTCTGAAATTTGT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=88053093;WS=88053075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	88056719	rs56703224	GT	G	698.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.37;QD=25.88;SOR=2.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	88056925	rs342464	A	G	1908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=48;PP=1452;SC=CAGTCCAGACATTTGTTTCAT;SOR=2.412;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=16;TCR=48;TR=64;WE=88056933;WS=88056915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr4	88226231	rs11735092	T	C	150.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=120;SC=TTAATCTTGTTCGTTTGACTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=88226239;WS=88226221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	88226480	rs6850131	A	C	359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=304;SC=AAAGAAAAAAAAATTGAAAAA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=88226488;WS=88226470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	88234874	rs7698974	C	T	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=328;SC=ATTTTTCCTTCTTCATTTTCT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=88234882;WS=88234864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	88238448	rs6531975	A	G	1367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=38;PP=1121;ReadPosRankSum=-0.743;SC=ATATAATCCAAAGATGAGAGT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=38;WE=88238456;WS=88238438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr4	88258483	rs9991501	T	C	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=287;SC=ACTGATTTTTTGTTTTAAAAC;SOR=4.047;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=15;WE=88258491;WS=88258473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	88293745	rs6849846	A	G	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=655;SC=CTCAATAATAAACTGGAAAAC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=88293753;WS=88293735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	88293887	rs6531985	G	A	3479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=47;PP=2623;SC=AGGGGACCGAGACATGTCCAG;SOR=0.965;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=63;TCR=48;TR=110;WE=88293895;WS=88293877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr4	88293992	rs11375790	G	GA	1548.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=43;PP=1539;SC=TATTAAAAGAGAAAAAATACT;SOR=3.830;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=3;TCR=48;TR=46;WE=88294000;WS=88293982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr4	88295786	rs62319101	A	G	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=2;PP=628;SC=TATGTCTGCTAAAAGCCCCAC;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=88295794;WS=88295776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	88296051	.	A	AT	101.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=0;NR=5;PP=73;SC=CACAATGGCTATTTTTTTTTT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=88296059;WS=88296041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	88312293	rs28654511	A	T	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=17;PP=487;SC=TTTAGAGGGTAGCTCGATCTA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=88312301;WS=88312283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	88356111	rs28736552	T	C	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=2;PP=888;SC=TTATGTAAAATGTTTTTCTTT;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=31;WE=88356119;WS=88356101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	88362904	rs13104303	C	T	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=5;PP=476;SC=CTTATGTTCTCTTCTTTTGGG;SOR=2.093;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=88362912;WS=88362894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	88363217	rs35607673	C	T	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=145;SC=TCATGCATTGCTTAACAATGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=88363225;WS=88363207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	88401616	rs9933	A	G	2849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=45;PP=2348;SC=TTAAGAGAAGATCAATGGGAT;SOR=0.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=46;TCR=45;TR=91;WE=88401624;WS=88401606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
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chr4	88532182	rs376870996	AGTGT	A,AGT	512.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=30.16;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,5,12:0.29,0.71:17
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chr4	88732453	rs4693183	C	T	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=185;ReadPosRankSum=-1.134;SC=CATGAAATGACGGCCTTAAAT;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=9;WE=88732461;WS=88732443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr4	88732531	rs4693878	T	C	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.595;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=624;ReadPosRankSum=-0.176;SC=ATATAACAAATAAAGCTACAA;SOR=1.142;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=28;WE=88732539;WS=88732521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,28:0.72:39
chr4	88732692	rs1054627	G	A	2208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.269;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=35;PP=1817;ReadPosRankSum=-0.232;SC=AGCAGCGGAGGAGACAATGGA;SOR=0.243;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=120;TCF=73;TCR=47;TR=80;WE=88732700;WS=88732682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,82:0.67:123
chr4	88732746	rs13144371	A	G	3036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.603;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=48;PP=2458;ReadPosRankSum=0.039;SC=AATGCAGAAGACACCACAGAG;SOR=0.631;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=167;TCF=97;TCR=70;TR=110;WE=88732754;WS=88732736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,109:0.65:167
chr4	88732918	rs1054629	A	T	3670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.853;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=68;PP=2962;ReadPosRankSum=0.648;SC=GCGCCAATGAATACGACAATG;SOR=0.407;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=216;TCF=117;TCR=99;TR=138;WE=88732926;WS=88732908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,137:0.63:218
chr4	88755828	rs7698623	T	C	4086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=33;PP=2965;SC=CAATGCTTTGTGGTAAGATAT;SOR=2.081;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=131;TCF=98;TCR=33;TR=130;WE=88755836;WS=88755818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr4	88759690	rs6835632	T	C	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=-0.690;SC=ATAATACAACTCAGTGAGAGA;SOR=0.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=7;WE=88759698;WS=88759680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr4	88812956	rs72490258	A	ACATTGCTC	222.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.33;MQRankSum=1.697;QD=7.68;ReadPosRankSum=0.684;SOR=0.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
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chr4	88813126	rs3811817	C	A	1440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-7.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.709;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.928;NF=50;NR=18;PP=1037;ReadPosRankSum=-1.241;SC=AGGAGTTGATCTCTAATGCTT;SOR=0.941;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=213;TCF=145;TCR=68;TR=68;WE=88813134;WS=88813116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,70:0.32:221
chr4	88813269	rs71594826	G	GC	7871.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FS=5.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.86;MQRankSum=-1.831;QD=26.96;ReadPosRankSum=-0.803;SOR=0.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,196:0.67:292
chr4	88813270	.	C	CCAAT	2970	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=56.5;NF=68;NR=68;PP=2970;QD=20;SC=CAGGCATTGGCATGACCAAAG;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=257;TCF=112;TCR=145;TR=136;WE=88813279;WS=88813260;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:121,136:0.53:257
chr4	88813271	.	A	T	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=56.68;NF=80;NR=68;PP=2962;QD=20;SC=AGGCATTGGCATGACCAAAGC;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=280;TCF=144;TCR=136;TR=148;WE=88813279;WS=88813260;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:132,148:0.53:280
chr4	88813271	rs35753589	A	AATT	8058.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FS=9.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.81;MQRankSum=-2.192;QD=27.50;ReadPosRankSum=0.313;SOR=0.661;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,192:0.66:293
chr4	88813503	rs6532031	T	C	6089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=103;PP=2965;SC=TGCATGCTGATCATGGTGAGC;SOR=1.014;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=186;TCF=83;TCR=103;TR=186;WE=88813511;WS=88813493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr4	88813583	rs3828551	G	A	1602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.580;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.271;NF=34;NR=28;PP=1250;ReadPosRankSum=2.926;SC=GAAGAGAGGCGGGTCAAAGAA;SOR=0.637;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=165;TCF=93;TCR=72;TR=62;WE=88813591;WS=88813573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,64:0.37:171
chr4	88813659	rs3828552	C	G	1508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.536;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=1172;ReadPosRankSum=-1.805;SC=AGGAACAAGACAAGGAAATTA;SOR=0.648;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=207;TCF=110;TCR=97;TR=64;WE=88813667;WS=88813649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,67:0.31:215
chr4	88813872	rs3828553	T	A	2294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.688;NF=57;NR=45;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.410;SC=CCAGAAACCATGATGACATCA;SOR=0.692;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=320;TCF=181;TCR=139;TR=102;WE=88813883;WS=88813862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:224,104:0.32:328
chr4	88813875	rs3828554	T	C	5506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.593;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.91;MQRankSum=-0.675;NF=118;NR=98;PP=2962;ReadPosRankSum=0.307;SC=GAAACCATGATGACATCACCC;SOR=0.541;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=319;TCF=177;TCR=142;TR=216;WE=88813883;WS=88813862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,224:0.68:328
chr4	88814048	rs3811818	A	C	1737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.537;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.743;NF=25;NR=50;PP=1417;ReadPosRankSum=0.941;SC=AAAAAGAACAACATCAAACTG;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=241;TCF=83;TCR=158;TR=75;WE=88814056;WS=88814038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,75:0.31:240
chr4	88814125	rs3811819	C	G	1022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.293;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.298;NF=19;NR=28;PP=780;ReadPosRankSum=1.061;SC=CAATTTTATCCATGGTGTGGT;SOR=0.446;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=149;TCF=51;TCR=98;TR=47;WE=88814133;WS=88814115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,48:0.31:154
chr4	88814207	rs62315861	G	A	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.635;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.121;NF=1;NR=22;PP=474;ReadPosRankSum=-0.010;SC=AAAGTCATTCGCAAAAACATT;SOR=2.085;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=53;TCF=6;TCR=47;TR=23;WE=88814215;WS=88814197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr4	88814362	rs3811821	G	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=88;ReadPosRankSum=0.783;SC=CTGCTGCGCTGTCACACCTCC;SOR=0.976;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=8;WE=88814370;WS=88814352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr4	88814665	rs17008718	A	C	1116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=0.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQRankSum=-8.975;QD=5.05;ReadPosRankSum=0.271;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,55:0.25:221
chr4	88814683	rs55724168	G	T	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FS=4.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQRankSum=-8.585;QD=5.09;ReadPosRankSum=-0.028;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:178,61:0.26:239
chr4	88814989	rs2904176	C	T	2373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.951;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.709;NF=54;NR=42;PP=1653;ReadPosRankSum=0.892;SC=CTGCTATCTTCGGGCTTTTCC;SOR=0.607;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=283;TCF=163;TCR=120;TR=96;WE=88814997;WS=88814979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,102:0.35:288
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chr4	88898941	rs11728697	C	T	6787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=147;PP=2965;SC=AGAATAAAGGCCAAAATAGAG;SOR=1.769;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=215;TCF=68;TCR=147;TR=215;WE=88898949;WS=88898931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr4	88902692	rs4754	T	C	1942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-7.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.103;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=54;PP=1435;ReadPosRankSum=0.655;SC=AAGATGATGATGACCATGTGG;SOR=0.992;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=263;TCF=120;TCR=143;TR=94;WE=88902700;WS=88902682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,95:0.35:271
chr4	88903853	rs1126616	C	T	1863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.868;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=51;PP=1454;ReadPosRankSum=0.048;SC=AGCGGAAAGCCAATGATGAGA;SOR=0.802;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=291;TCF=150;TCR=141;TR=93;WE=88903861;WS=88903843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,90:0.30:298
chr4	88959381	rs2725221	G	A	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.491;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=5;PP=1024;ReadPosRankSum=-0.842;SC=AACTTTTTCAGAGATGTTTCC;SOR=1.664;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=82;TCF=71;TCR=11;TR=47;WE=88959389;WS=88959371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,49:0.58:84
chr4	89015857	rs2231164	C	T	1685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=47;PP=1367;SC=TTTTAAATTTCAAGAAGTTTC;SOR=4.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=4;TCR=47;TR=51;WE=89015865;WS=89015847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr4	89016782	rs2231162	A	G	2778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=73;PP=2286;SC=CAAATACTAAAAGTCAGGCCT;SOR=4.021;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=9;TCR=73;TR=82;WE=89016790;WS=89016772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr4	89018565	rs2231157	A	G	3787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=93;NR=15;PP=2965;SC=ATGAAGGAAAAAAACAATTCC;SOR=3.533;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=94;TCR=15;TR=108;WE=89018573;WS=89018555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr4	89022362	rs2231153	C	T	2180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=11;PP=1734;SC=GCCCCGTTCCCAGAACAAAGA;SOR=3.126;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=52;TCR=11;TR=63;WE=89022370;WS=89022352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr4	89036353	rs2725261	C	T	1648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=48;PP=1388;SC=CTTCTTCCCACGTAATTTTAC;SOR=6.439;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=49;WE=89036361;WS=89036343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	89080351	rs2231134	C	G	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.649;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=948;ReadPosRankSum=-0.486;SC=TTGGGCTGATCAGTACCTCGT;SOR=0.625;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=134;TCF=66;TCR=68;TR=53;WE=89080359;WS=89080341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,52:0.39:135
chr4	89300241	rs61978650	C	A	1761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.124;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=42;PP=1362;ReadPosRankSum=-2.107;SC=GTCAGCTGGGCCGCAGGGGCG;SOR=1.355;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=97;TCF=40;TCR=57;TR=66;WE=89300249;WS=89300231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,67:0.69:97
chr4	89311962	rs12510688	T	C	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.624;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.879;NF=17;NR=20;PP=528;ReadPosRankSum=0.110;SC=CCTGTCTCTCTGTGGGACTTC;SOR=0.534;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=116;TCF=49;TCR=67;TR=37;WE=89311970;WS=89311952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,35:0.30:117
chr4	89319296	rs17014118	T	C	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.004;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=895;ReadPosRankSum=-0.386;SC=TCTTTTAGACTTCGTGGATGT;SOR=1.559;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=40;WE=89319304;WS=89319286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,41:0.68:60
chr4	89389640	rs4585264	C	A	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.874;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=632;ReadPosRankSum=0.074;SC=TCTAGTATCCCAGTTTGGTGA;SOR=0.412;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=28;WE=89389648;WS=89389630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,28:0.67:42
chr4	89397091	rs7699006	A	G	3809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.048;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=90;PP=2962;ReadPosRankSum=0.797;SC=AGAATGTCCTATGATGCATAT;SOR=0.531;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=197;TCF=59;TCR=138;TR=132;WE=89397099;WS=89397081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,135:0.68:200
chr4	89415396	rs6857425	T	C	5748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=107;NR=70;PP=2965;SC=TTGCCAACCTTCCTTTCCCAC;SOR=1.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=177;TCF=107;TCR=70;TR=177;WE=89415404;WS=89415386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr4	89444528	rs67364668	G	A	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=118;ReadPosRankSum=1.066;SC=AGTCCAGAATGTGGCAGCGGA;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=8;WE=89444536;WS=89444526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr4	89589871	rs114370299	G	A	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=436;ReadPosRankSum=1.307;SC=ATTTTGTTAGGTGTCATTGCA;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=17;WE=89589879;WS=89589861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
chr4	89599421	rs2604227	A	C	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=447;SC=TTAATCACCTACTTTTGTCAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=89599429;WS=89599411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	89689354	rs3756049	A	G	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=35;PP=1072;SC=TGTTTAAACTAGTAAAATTAT;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=89689362;WS=89689344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	89702564	rs2290784	C	G	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=31;PP=861;SC=GAATGATACTCTAACTACATC;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=89702572;WS=89702554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	89711849	rs2290782	T	C	6572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=34.06;ReadPosRankSum=-0.778;SOR=1.278;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,192:0.99:193
chr4	89711849	.	TGGATC	CGGATC,CGGATT	1979	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=41,12;NR=143,49;PP=1979,1207;QD=10.9444087638;SC=ACATGTGAAGTGGATCGCAGG;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=185;TCF=41;TCR=144;TR=184,61;WE=89711862;WS=89711839;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.99:185
chr4	89711854	rs2290781	C	T	1588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=1.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.83;ReadPosRankSum=0.971;SOR=0.886;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,68:0.38:180
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chr4	90169925	rs7653897	A	G	2004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.516;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=42;PP=1577;ReadPosRankSum=0.090;SC=CTCTTCCCTCACTGGAGTCAT;SOR=0.955;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=120;TCF=56;TCR=64;TR=74;WE=90169933;WS=90169915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,77:0.63:123
chr4	90749132	rs1442149	A	T	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=664;SC=ATATTTACCTATTTAAAAATA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=90749140;WS=90749126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	90749463	rs149886412	G	GAAAAA	881.14	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.171;NF=0;NR=17;PP=776;ReadPosRankSum=1.372;SC=TTCAGGGAAAGAAAAAAATAT;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=17;WE=90749471;WS=90749453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr4	90816799	rs80126664	T	A	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.500;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=424;ReadPosRankSum=0.398;SC=GTCTAGAAGATTGCAAGTGAA;SOR=2.746;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=19;WE=90816807;WS=90816789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr4	90874639	.	C	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.073;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=242;ReadPosRankSum=1.100;SC=TTTGCTTGCACATCTGCTCTG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=12;WE=90874647;WS=90874629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr4	91230579	rs12647859	G	A	2944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.619;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=73;PP=2305;ReadPosRankSum=-0.709;SC=GTTACAAAATGGTGAAACAAT;SOR=0.905;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=141;TCF=42;TCR=99;TR=100;WE=91230587;WS=91230569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,106:0.72:148
chr4	91234250	rs1466391	A	G	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=25;PP=719;SC=TCTATATCCGACATGTTCATG;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=91234258;WS=91234240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	91246656	rs1870795	C	T	1819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=13;PP=1435;SC=CTTAATTTTCCGTGAGAGGAC;SOR=2.564;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=55;WE=91246664;WS=91246646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr4	91246905	rs9284586	C	G	978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=26;PP=757;SC=TTATTTTATACTTATTTTATG;SOR=5.421;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=27;WE=91246924;WS=91246895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	91246916	rs9284587	G	A	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=418;SC=TTATTTTATGGTGTTGAAATT;SOR=4.407;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=16;WE=91246924;WS=91246895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	91549156	rs11303496	CT	C	377.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.99;ReadPosRankSum=-0.836;SOR=0.411;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr4	91584811	rs6842658	A	T	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=53;SC=ATACTTTATTATTCTTCACAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=91584819;WS=91584801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	91584992	rs6842926	A	G	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=15;PP=735;SC=ATTGTTACTTATAGGTTCACT;SOR=0.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=15;TCR=15;TR=30;WE=91585000;WS=91584982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	91585060	rs6843110	A	T	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=12;PP=576;SC=TTCTAGTTGTATGAAAGTGAA;SOR=1.051;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=22;WE=91585068;WS=91585050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	91701720	rs2271592	C	T	1894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=50;PP=1620;SC=AAGACTCTTTCCATCCAGTTC;SOR=5.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=52;TCF=2;TCR=50;TR=52;WE=91701728;WS=91701710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr4	91737018	rs3796673	C	T	4535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=87;PP=2965;SC=CAATGCTTGGCCCACGAGTGT;SOR=1.032;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=61;TCR=88;TR=148;WE=91737026;WS=91737008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr4	91832609	rs6855137	G	C	1330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=29;PP=998;SC=GATTCTCTCTGTGTCTCTCTT;SOR=3.202;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=33;WE=91832617;WS=91832599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	92240031	rs9999729	C	G	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=399;SC=TGTGCATATTCCCTCATTAGT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=92240039;WS=92240021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	92240080	rs9999885	G	A	992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=8;PP=778;SC=ATTTCATGGAGAGGAAAAAAA;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=92240088;WS=92240070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	92240278	rs7653977	A	T	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=475;SC=CTTCTGGATAATTTTTTCTAA;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=92240286;WS=92240268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	92240317	rs7683541	T	C	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=303;SC=AGATGATGCATAAGTTTACAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=92240325;WS=92240307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	92240802	rs6532289	C	T	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=2;PP=774;SC=CTACCTAATACAAAACCCAGT;SOR=4.112;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=92240810;WS=92240792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	92240892	rs6816636	C	A	1957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=20;PP=1538;SC=GAGGCAGAAGCACCATTTGTT;SOR=1.316;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=36;TCR=20;TR=56;WE=92240900;WS=92240882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr4	92240925	rs6532290	T	G	1895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=27;PP=1419;SC=GCTGCTTCTCTTATGCTCTAA;SOR=0.822;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=32;TCR=27;TR=59;WE=92240933;WS=92240915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr4	92241031	rs6817404	G	T	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=31;PP=886;SC=CTTACTTGTGGTCACCCACAA;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=92241039;WS=92241021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	92241071	rs6816883	A	G	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=348;SC=AATTCCAGAAACAAACCAATC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=92241079;WS=92241061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	92246344	rs3762827	G	A	1660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=20;PP=1323;SC=AGCATAGTAGGTGGCTCTTGC;SOR=1.262;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=56;TCF=36;TCR=20;TR=55;WE=92246352;WS=92246334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr4	92246541	rs1528572	T	A	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=639;SC=CATCTATAGATGAAAGGGAGC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=92246549;WS=92246531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	93511481	rs2870639	G	A	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.351;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=167;ReadPosRankSum=-1.246;SC=TTCAATTCAAGTGGCAATGAA;SOR=0.120;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=10;WE=93511489;WS=93511471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,10:0.26:38
chr4	94032125	rs2271385	G	C	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.397;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=38;PP=653;ReadPosRankSum=0.470;SC=ATTGTCTTGGGGTGAGAGTTG;SOR=1.237;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=132;TCF=30;TCR=102;TR=46;WE=94032133;WS=94032115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,48:0.35:136
chr4	94159770	rs13142615	A	G	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=567;SC=GCAGGGGGTGAGGGGAAATTA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=94159778;WS=94159760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	94180159	rs7687990	A	G	2498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=49;PP=2024;SC=AAGTCAGGAAAATGAGTCTTC;SOR=1.519;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=26;TCR=49;TR=75;WE=94180167;WS=94180149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	94316763	rs1385405	T	G	2834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.072;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=51;PP=2140;ReadPosRankSum=2.637;SC=TTCAGCTTGGTTGCTGGAATC;SOR=0.509;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=154;TCF=82;TCR=72;TR=105;WE=94316771;WS=94316753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,108:0.66:164
chr4	94376675	rs6819866	A	T	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=4.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=522;ReadPosRankSum=0.086;SC=TAAGAAGTCTATGCAGTGTTT;SOR=0.902;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=23;WE=94376683;WS=94376665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr4	94547357	rs11726506	C	G	2143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=1;PP=1780;ReadPosRankSum=1.109;SC=TTCATCCTGTCTATGTAAATT;SOR=5.486;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=61;TCF=60;TCR=1;TR=60;WE=94547365;WS=94547347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr4	95134165	rs10433970	C	G	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=2.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.44;ReadPosRankSum=-0.803;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,12:0.21:58
chr4	95161996	rs2306803	C	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.628;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=170;ReadPosRankSum=-0.420;SC=CTTTGTTTTACATTAAATTGA;SOR=0.064;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=10;WE=95162004;WS=95161986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr4	95169682	rs10034781	G	T	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=28;PP=834;ReadPosRankSum=-1.145;SC=TTTTGAAATGGTTTCTCCAGA;SOR=0.686;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=187;TCF=91;TCR=96;TR=57;WE=95169690;WS=95169672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,60:0.30:197
chr4	95169772	rs7435106	T	A	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=29;PP=555;ReadPosRankSum=1.227;SC=TAGGCTTTATTCCATGTTAGC;SOR=0.602;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=99;TCF=10;TCR=89;TR=32;WE=95169780;WS=95169762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,32:0.31:104
chr4	95170839	rs11722476	G	A	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.97;ReadPosRankSum=0.149;SOR=0.782;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,7:0.18:39
chr4	95173779	rs7439869	T	C	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=167;ReadPosRankSum=0.417;SC=ATGCAATATGTATCACAAAGT;SOR=0.963;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=12;WE=95173787;WS=95173769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,13:0.32:40
chr4	95186055	rs2306802	A	G	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=101;ReadPosRankSum=-1.229;SC=TTCTAAACCAAAGGTAATCTT;SOR=0.437;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=8;WE=95186063;WS=95186045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr4	95197520	rs6823404	C	T	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.604;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=12;PP=757;ReadPosRankSum=-0.841;SC=GTTCTGATGACCGTAGTCTGT;SOR=1.436;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=146;TCF=95;TCR=51;TR=47;WE=95197528;WS=95197510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,48:0.33:147
chr4	95199479	rs35670996	C	G	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=32;ReadPosRankSum=1.475;SC=AACTCAGACTCTAATGAGGGA;SOR=0.120;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=4;WE=95199487;WS=95199469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr4	95202492	rs35361491	G	A	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.029;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=48;ReadPosRankSum=0.329;SC=TAAAGAAGCAGTTTATCACAG;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=95202500;WS=95202482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr4	95206252	rs67631469	TTATC	T	916.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.233;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.746;NF=4;NR=15;PP=857;ReadPosRankSum=0.985;SC=ACTTCAATATTTATCTATATG;SOR=1.092;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=19;WE=95206263;WS=95206242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,26:0.41:64
chr4	95255637	rs2289186	T	G	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.195;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=0;PP=759;ReadPosRankSum=-1.193;SC=TTTATTATTTTTGCTACTTAC;SOR=3.167;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=42;TCR=1;TR=30;WE=95255645;WS=95255627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,30:0.70:43
chr4	95496882	rs2452600	C	T	2406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.475;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=47;PP=1885;ReadPosRankSum=-0.066;SC=GGTTCTGTGTCTTCACCAAAA;SOR=0.629;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=238;TCF=121;TCR=117;TR=91;WE=95496890;WS=95496872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,98:0.40:246
chr4	95498617	rs35078286	GAT	G	138.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr4	95503670	rs3857212	G	T	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=730;SC=TTCATTTTTTGGTCTGTGTTT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=95503678;WS=95503663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	95503738	rs75641776	T	C	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=368;ReadPosRankSum=2.325;SC=ATCATTGTTTTGAATTTTATT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=58;TCR=3;TR=19;WE=95503746;WS=95503728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,20:0.31:64
chr4	95503902	rs5013417	T	C	1781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.259;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=43;PP=1437;ReadPosRankSum=0.226;SC=TAACCAATGATTCACTTTGTA;SOR=1.201;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=92;TCF=28;TCR=64;TR=60;WE=95503910;WS=95503892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,64:0.67:95
chr4	95505975	rs12639887	C	T	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=60;ReadPosRankSum=0.703;SC=ATCTGTGTTTCGTATGGCATA;SOR=0.330;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=95505983;WS=95505966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr4	95506214	rs2172448	G	A	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=28;ReadPosRankSum=1.140;SC=TATAAGTGCAGTTTTTTACTT;SOR=0.478;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=5;WE=95506222;WS=95506204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,5:0.17:29
chr4	95508128	rs200385092	G	T	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=13.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=-1.924;QD=2.87;ReadPosRankSum=0.349;SOR=3.513;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,10:0.20:49
chr4	95508130	.	A	T	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.673;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=10.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-2.357;QD=2.31;ReadPosRankSum=0.020;SOR=3.096;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,9:0.15:61
chr4	95529430	rs10033359	C	T	820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=24;PP=697;SC=GATTACAGAACGGACATCATT;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=95529452;WS=95529420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	95529444	rs9307146	C	A	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=571;SC=CATCATTAACCTATAGACAAG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=95529452;WS=95529420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	95531417	rs10017461	A	G	1630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=32;PP=1141;SC=TGAGCAGCGCAGCTGCTACTG;SOR=1.371;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=48;WE=95531425;WS=95531407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr4	95531562	rs10007050	T	C	326.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.31;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	95531562	.	TG	CA,CG	62	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=8;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=1,1;NR=4,7;PP=62,24;QD=23.0935749724;SC=ATAGCTCTATTGTGAGCTCTT;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=5,8;WE=95531571;WS=95531552;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.62:8
chr4	95531563	rs74457440	G	A	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.20;ReadPosRankSum=-0.210;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr4	95539267	rs966845	G	A	2224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=36;PP=1694;SC=CAGCCTCACAGCTGCAGCTGC;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=33;TCR=36;TR=69;WE=95539275;WS=95539257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr4	95561459	rs7690296	A	G	2151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=17;PP=1681;ReadPosRankSum=-1.222;SC=AAACAGCGCTACTTACTCAGG;SOR=0.800;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=111;TCF=85;TCR=26;TR=75;WE=95561467;WS=95561449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,78:0.68:115
chr4	95561651	rs10716970	GT	G	450.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=1.345;QD=7.27;ReadPosRankSum=-0.725;SOR=0.866;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr4	95575601	rs2280003	C	T	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.599;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=12;PP=924;ReadPosRankSum=1.533;SC=GCCTCTTTTTCTTCTGTCAGA;SOR=0.976;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=122;TCF=86;TCR=36;TR=49;WE=95575609;WS=95575591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,48:0.40:121
chr4	95578588	rs13107595	G	A	5597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=40;PP=2965;SC=GAAGTCATCAGTGCGTTGAAA;SOR=2.221;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=162;TCF=122;TCR=40;TR=162;WE=95578596;WS=95578578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr4	95583827	rs10031423	C	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=179;ReadPosRankSum=0.704;SC=TTGTAAATTTCGAAAGTTGTT;SOR=0.350;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=10;WE=95583835;WS=95583817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr4	95585038	rs56921499	G	A	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=-1.104;SC=CCATTGGGGGGAAAAATCACT;SOR=0.317;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=10;WE=95585046;WS=95585028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,10:0.22:46
chr4	96163729	.	G	A	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.681;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=202;ReadPosRankSum=1.139;SC=GCTCCATGGCGTCCACCTGCC;SOR=0.129;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=11;WE=96163737;WS=96163719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr4	96169733	rs13118653	G	T	3900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=52;PP=2826;SC=GACAGGACTAGCAGAGTGATC;SOR=0.937;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=118;TCF=65;TCR=53;TR=117;WE=96169741;WS=96169723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr4	96256616	rs4699423	A	G	1650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.595;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=28;PP=1233;ReadPosRankSum=0.263;SC=GAACCCATTCACTATTACACT;SOR=0.909;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=108;TCF=61;TCR=47;TR=68;WE=96256624;WS=96256606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,70:0.63:111
chr4	96256673	rs1843018	G	A	3475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=66;PP=2579;SC=ACAGGTTCACGGGCTTATTCT;SOR=1.428;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=103;TCF=36;TCR=67;TR=102;WE=96256681;WS=96256663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr4	98761900	rs11735193	C	T	1751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.877;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=17;PP=1286;ReadPosRankSum=-0.881;SC=TTCCTCATAGCTTTATAAGGA;SOR=0.577;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=92;TCF=67;TCR=25;TR=58;WE=98761908;WS=98761890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,64:0.64:100
chr4	98864859	rs28417716	C	T	95.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=97;SC=TCTCATATAGCAATTCTGGAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=98864867;WS=98864849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	98893334	rs13147195	G	T	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=218;ReadPosRankSum=-1.267;SC=ATAACTATTTGACATCCTTTT;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=10;WE=98893342;WS=98893324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr4	98893437	rs783960	A	G	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=6.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.560;SOR=1.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,26:0.24:110
chr4	98893476	rs783959	C	T	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.266;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=426;ReadPosRankSum=1.072;SC=CTTTCTGAACCGAGAAGAAAG;SOR=0.808;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=104;TCF=50;TCR=54;TR=32;WE=98893484;WS=98893466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,32:0.29:111
chr4	98902278	rs35146453	A	G	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=108;ReadPosRankSum=0.351;SC=TTATAAAGCCAAAGAGTAGAC;SOR=2.517;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=8;WE=98902286;WS=98902268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr4	99027137	rs2865979	T	C	1509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.127;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=35;PP=1155;ReadPosRankSum=0.094;SC=TTATTTCATATAGTCGTGGGA;SOR=0.930;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=52;WE=99027145;WS=99027127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,54:0.77:70
chr4	99027184	rs2903150	T	C	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=427;ReadPosRankSum=0.175;SC=TCTCTCTTGATGTTAACATTT;SOR=0.540;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=23;WE=99027192;WS=99027174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
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chr4	99055480	rs13328005	T	C	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=484;ReadPosRankSum=-0.595;SC=AAGTCAATTATAGTAACTATA;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=24;WE=99055488;WS=99055470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr4	99055730	rs35399947	C	CTAA	376.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=326;ReadPosRankSum=-1.614;SC=ATTTTCAGAACTGTCTAGTCA;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=99055738;WS=99055720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr4	99064379	rs4699605	A	G	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=295;ReadPosRankSum=-0.450;SC=AAGTGTGGAGAAAAAGGAAGC;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=12;WE=99064387;WS=99064369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr4	99218108	rs34325900	G	GA	2110.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.11;MQRankSum=0.779;NF=21;NR=33;PP=2131;ReadPosRankSum=-1.923;SC=ACCATAAAGTGTGCCATACAG;SOR=0.675;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=82;TCF=33;TCR=49;TR=54;WE=99218116;WS=99218097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,61:0.64:96
chr4	99218169	.	CT	C	58.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=1.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.17;ReadPosRankSum=-0.351;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,10:0.20:50
chr4	99337881	rs10516430	C	T	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.924;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=5;PP=787;ReadPosRankSum=-0.291;SC=TTATTTTGTTCACGTTGTTCT;SOR=0.253;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=50;TCF=44;TCR=6;TR=33;WE=99337889;WS=99337871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,33:0.65:51
chr4	99399748	rs4303985	G	T	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-5.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=1;PP=618;ReadPosRankSum=-0.335;SC=TAAGAAGAGGGTTCAACCAAA;SOR=0.729;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=28;WE=99399756;WS=99399738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,29:0.69:42
chr4	99408106	rs6838913	T	C	1390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=42;PP=1085;SC=TAAAGATTATTGCATTTGTCC;SOR=4.935;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=45;WE=99408114;WS=99408096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	99428608	rs17027628	G	T	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=87;ReadPosRankSum=1.200;SC=TGTTGAGCACGTGTATTGTTA;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=99428616;WS=99428598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr4	99802345	rs181201776	A	T	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.807;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=1050;ReadPosRankSum=-0.765;SC=ACTTTTACTCACAAGAAATAC;SOR=1.266;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=44;WE=99802353;WS=99802335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,46:0.78:59
chr4	99918661	rs10035037	A	C	1259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=26;PP=873;SC=GGGACCTGAAATTAAGAAACA;SOR=1.501;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=35;WE=99918669;WS=99918651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	99926965	rs2123782	T	C	2361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=57;PP=1829;ReadPosRankSum=-0.732;SC=GAAGTAACTCTGGAATGGAAA;SOR=0.961;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=23;TCR=58;TR=80;WE=99926973;WS=99926955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr4	99952607	rs1037476	C	T	3275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=83;NR=11;PP=2682;SC=TAATACTTTTCCTTCCACTCC;SOR=3.846;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=83;TCR=11;TR=94;WE=99952615;WS=99952597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr4	99952710	rs1037475	A	G	5686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=89;PP=2965;SC=CTTTGTGACCATGGGTTATTC;SOR=0.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=183;TCF=92;TCR=91;TR=181;WE=99952718;WS=99952700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr4	99966568	rs11721765	G	C	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=13;PP=374;SC=GGTTGCCCCTGTTCTACCTGA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=99966576;WS=99966558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	100001247	rs1154412	T	C	731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=20;PP=598;SC=ATATTTACAGTAAGAGACACT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=100001255;WS=100001237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	100003288	rs28730597	C	T	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=23;PP=645;ReadPosRankSum=1.066;SC=ATTAAAACAACGAATGTGTAA;SOR=0.678;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=84;TCR=78;TR=47;WE=100003296;WS=100003278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,48:0.28:172
chr4	100006645	rs1154410	A	G	3437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=38;PP=2696;SC=GCATATGCAAAAGCAGGTTAA;SOR=1.322;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=67;TCR=38;TR=105;WE=100006653;WS=100006635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr4	100009738	rs1154401	G	C	7198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=169;NR=56;PP=2965;SC=GCCAGATCCCGTCTTGGGCGC;SOR=2.547;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=225;TCF=169;TCR=56;TR=225;WE=100009746;WS=100009728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr4	100009952	.	TG	GG	263	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000,1.0000;HP=9;HapScore=4;MGOF=7;MMLQ=15;MQ=60.36;NF=0,0;NR=6,12;PP=35,263;QD=11.6285354245;SC=GGGCGGGGCGTGGGGGGGGCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=6,12;WE=100009960;WS=100009942;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr4	100009952	rs11434442	TG	TGGG	175.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=0,0;NR=6,12;PP=35,263;SC=GGGCGGGGCGTGGGGGGGGCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=6,12;WE=100009960;WS=100009942;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:5
chr4	100021124	rs2851279	T	C	57.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=1;PP=27;SC=ACTGGAGCTGTTCCTATTCAG;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=100021132;WS=100021114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	100045500	rs1042365	T	G	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=2;PP=364;SC=TTGTTTAAACTCATGGCTTTC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=100045508;WS=100045490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	100045574	rs1042364	T	C	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=865;ReadPosRankSum=1.312;SC=GATAGTATTCTGAATTGCTCC;SOR=0.507;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=38;WE=100045582;WS=100045564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr4	100045616	rs1126673	C	T	975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=15;PP=689;SC=ATTGTTCGGACGCTGTTAATA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=15;TCR=15;TR=30;WE=100045624;WS=100045606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	100045647	rs2602894	A	G	875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=19;PP=642;SC=ATTAATAAGTATAATTTTCAT;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=100045655;WS=100045637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	100047929	rs10009145	G	A	1754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=38;PP=1455;SC=CACTTGACACGAAGTAGTTTA;SOR=1.835;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=16;TCR=38;TR=54;WE=100047937;WS=100047919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	100048327	rs9307234	G	A	3640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=95;NR=7;PP=2965;SC=ACTAGGAAAAGAATTTAAAGC;SOR=4.844;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=95;TCR=7;TR=102;WE=100048335;WS=100048317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr4	100048414	rs1126671	T	C	6873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=120;NR=99;PP=2965;SC=TCTGGAAAAATAGTCAATCCT;SOR=0.888;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=219;TCF=120;TCR=99;TR=219;WE=100048422;WS=100048404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr4	100048506	rs6836440	G	A	4414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=109;PP=2965;SC=CTGTGATGGAGCATAAAAGAA;SOR=2.584;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=31;TCR=109;TR=140;WE=100048514;WS=100048496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr4	100052733	rs1126670	C	A	1416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=10;PP=1043;SC=CTTCCTGGATCGGTTTATGTA;SOR=2.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=41;WE=100052741;WS=100052723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	100062819	rs2032349	A	G	4402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=87;PP=2965;SC=TATGGCACAGAGAGGTAGCAA;SOR=1.575;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=44;TCR=87;TR=131;WE=100062827;WS=100062809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr4	100064166	rs5860566	G	GA	459.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=360;SC=TTTATTTCTTGAAAAAAAAAC;SOR=4.407;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=16;WE=100064174;WS=100064156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	100064305	rs4699715	C	G	2945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=26;PP=2280;SC=TTTGAAATCACCTCTGAATTA;SOR=1.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=58;TCR=26;TR=84;WE=100064313;WS=100064295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr4	100064368	rs13125262	G	C	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.545;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=38;PP=1506;ReadPosRankSum=2.008;SC=TCTGCAACTCGAAGTGTGGTC;SOR=0.928;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=110;TCF=49;TCR=61;TR=67;WE=100064376;WS=100064358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,69:0.61:114
chr4	100065509	rs1800759	T	G	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=681;SC=TCCAATCACTTCCTTTTCTCC;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=100065517;WS=100065499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	100134713	rs5860571	A	AT	2109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=14;PP=1913;ReadPosRankSum=-1.025;SC=CATTTTCTCGAGTTGGTTCCA;SOR=0.657;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=75;TCF=55;TCR=20;TR=46;WE=100134721;WS=100134703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,60:0.65:92
chr4	100140306	rs4699735	A	T	4364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=64;PP=2965;SC=CCTGTAGTACACATGCTGATT;SOR=0.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=131;TCF=67;TCR=64;TR=131;WE=100140314;WS=100140296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr4	100205819	rs28364312	C	A	2298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=11.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.73;ReadPosRankSum=0.361;SOR=0.272;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,58:0.73:80
chr4	100205829	rs28364311	T	G	2271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=8.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.37;ReadPosRankSum=1.303;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,59:0.71:83
chr4	100212173	rs13134764	A	T	2327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.349;NF=42;NR=71;PP=1459;ReadPosRankSum=2.635;SC=GTATTTATTTATTTTTTTTGC;SOR=0.572;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=44;TCR=76;TR=113;WE=100212181;WS=100212159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:7,100:0.93:107
chr4	100212197	rs4147531	G	A	4527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.861;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.98;MQRankSum=-0.069;NF=23;NR=80;PP=2771;ReadPosRankSum=-1.231;SC=AATAACACCCGATTCCAGTTC;SOR=2.487;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=105;TCF=24;TCR=81;TR=103;WE=100212205;WS=100212187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,106:0.98:108
chr4	100231602	rs28914783	C	T	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=17;PP=576;SC=ATAATTATGGCTGTTTAAATA;SOR=1.382;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=26;WE=100231610;WS=100231592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	100235053	rs1789882	A	G	11071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FS=2.621;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.29;MQRankSum=0.288;QD=34.07;ReadPosRankSum=0.331;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,323:0.99:325
chr4	100239319	rs1229984	T	C	6190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=91;PP=2965;SC=GTCATCTGTGTGACAGATTCC;SOR=0.868;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=111;TCR=92;TR=201;WE=100239327;WS=100239309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr4	100258007	rs1612735	T	C	12311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=216;NR=165;PP=2965;SC=GTCCAAGGAGTATTTGAGGTG;SOR=1.007;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=383;TCF=218;TCR=165;TR=381;WE=100258015;WS=100257997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,392:1.00:392
chr4	100258054	rs1693453	C	A	10132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=228;PP=2965;SC=CAGCCACTCCCTTCCCATCCC;SOR=1.992;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=317;TCF=89;TCR=228;TR=317;WE=100258062;WS=100258044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,325:1.00:325
chr4	100260667	rs66502432	ACGCC	A	547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=644;SC=CTGCTAGACAACGCCCCCCCC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=100260685;WS=100260657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	100260677	rs2298754	C	G	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.13;QD=39.99;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	100260789	rs698	T	C	3777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=23;PP=2916;SC=AAAGGTAAAATATTTGTTATT;SOR=2.872;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=92;TCR=23;TR=115;WE=100260797;WS=100260779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr4	100261577	rs55753621	AT	A	237.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.77;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	100261578	.	T	A	232	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=7;NR=0;PP=232;QD=38.110173221;SC=CTCCAAAAAATAAAAAAGAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=100261586;WS=100261568;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,7:0.88:8
chr4	100263834	rs1693481	C	T	2464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=73;NR=2;PP=2116;SC=AAAAAGATGACGGGAAATTTC;SOR=6.413;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=75;TCF=73;TCR=2;TR=75;WE=100263842;WS=100263824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr4	100263942	rs1789912	C	T	10505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=211;NR=115;PP=2965;SC=GGGCATGTCACGGATCATACC;SOR=1.416;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=326;TCF=211;TCR=115;TR=326;WE=100263950;WS=100263932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,341:1.00:341
chr4	100263965	rs1693482	C	T	11483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=197;NR=157;PP=2965;SC=GGTGTCAAGCCGACCGATGAC;SOR=0.852;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=354;TCF=197;TCR=157;TR=354;WE=100263973;WS=100263955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,363:1.00:363
chr4	100266112	rs1693425	C	T	5780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=1.144;NF=47;NR=125;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.780;SC=CAATTTTGGCCACTGCATTCT;SOR=0.999;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=47;TCR=126;TR=172;WE=100266120;WS=100266102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,179:0.99:180
chr4	100266330	rs1693426	A	G	2848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=46;PP=2244;SC=AGCATCAGAAACTTACTCATT;SOR=0.855;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=39;TCR=46;TR=85;WE=100266338;WS=100266320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr4	100266371	rs1789915	A	G	1742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.694;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=32;PP=1288;ReadPosRankSum=-0.686;SC=CTGGGTTTTTACAAATTCTGC;SOR=1.447;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=49;WE=100266379;WS=100266361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr4	100266583	rs1662053	A	C	286.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=9;PP=239;SC=CTGCCAAGGCATTGTTTTTTA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=100266591;WS=100266573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	100268190	rs283413	A	C	2495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=5;PP=2048;SC=ACCCCTTCTCAAACACTTTCC;SOR=5.311;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=67;TCR=5;TR=71;WE=100268198;WS=100268180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr4	100269202	rs1789921	G	A	1875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=53;PP=1612;SC=AAGATAAACAGAGTTAAGTAC;SOR=8.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=53;WE=100269210;WS=100269192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr4	100341643	rs1154460	G	A	1373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=3;PP=1197;SC=CCTTGTGCATGTCTAATAACT;SOR=4.664;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=43;WE=100341651;WS=100341633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	100356179	rs1154469	C	T	4013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=32;PP=2965;SC=CTATTTCCAACTTACCCCTGC;SOR=2.194;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=95;TCR=32;TR=127;WE=100356187;WS=100356169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr4	100356337	rs1154470	G	A	4047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=70;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.831;SC=ACATCATTAGGTCATGATGAG;SOR=0.357;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=52;TCR=71;TR=122;WE=100356345;WS=100356327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,125:0.99:126
chr4	100522967	rs140052760	TTACTC	T	1370.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.868;NF=1;NR=31;PP=1557;ReadPosRankSum=1.360;SC=CTAATTCTCTTTACTCTATTC;SOR=0.708;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=52;TCF=1;TCR=51;TR=32;WE=100522979;WS=100522957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,36:0.61:59
chr4	100570681	rs4699384	T	A	2113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=47;PP=1661;ReadPosRankSum=1.187;SC=TCTGCCACCATTGGGGAGAGC;SOR=0.752;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=134;TCF=59;TCR=75;TR=83;WE=100570689;WS=100570671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,82:0.61:135
chr4	100571001	rs1491242	T	C	1364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.465;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=36;PP=1017;ReadPosRankSum=-0.481;SC=AGGCTGTGCCTGCTGGAAGGG;SOR=1.257;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=78;TCF=29;TCR=49;TR=54;WE=100571009;WS=100570991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,55:0.70:79
chr4	100574195	rs4699385	A	G	1560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.216;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=36;PP=1204;ReadPosRankSum=-0.063;SC=TTTGCTTTGCACGCACGTTGC;SOR=1.083;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=94;TCF=40;TCR=54;TR=57;WE=100574203;WS=100574185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,62:0.62:100
chr4	100574821	rs79703522	C	G	2029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-5.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.316;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=45;PP=1676;ReadPosRankSum=1.273;SC=CCTCCTCCCCCTCCTCCTGAT;SOR=1.009;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=94;TCF=42;TCR=52;TR=76;WE=100574829;WS=100574811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,76:0.81:94
chr4	100575711	rs17029277	C	T	2464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.737;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=49;PP=1951;ReadPosRankSum=0.516;SC=TGCCTGGCACCGTCGGCAGCA;SOR=0.832;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=125;TCF=59;TCR=66;TR=90;WE=100575719;WS=100575701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,90:0.71:126
chr4	100784875	rs71913814	GT	G	341.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=9.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=0.572;QD=9.24;ReadPosRankSum=-1.156;SOR=0.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr4	101109385	rs3749603	A	C	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.068;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=394;ReadPosRankSum=-0.462;SC=TAGAAAAAAAACACCAAGATA;SOR=0.061;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=18;WE=101109393;WS=101109375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr4	101953322	rs2851060	C	T	1810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=9;PP=1522;SC=GAAGAAGAACCGAAGACCAAG;SOR=3.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=55;WE=101953330;WS=101953312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	102171591	rs2583404	T	G	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=765;SC=ATTTAATAGATTATTGTTATG;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=102171599;WS=102171581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	102171606	rs2850958	A	G	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=15;PP=367;SC=GTTATGTTACATAGAAAGGAT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=102171614;WS=102171596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	102267821	rs2850327	AA	CG	3161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=1;PP=2944;ReadPosRankSum=0.358;SC=GGAGGGGAGGAAAGGCGAGGC;SOR=1.091;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=116;TCF=110;TCR=6;TR=69;WE=102267830;WS=102267811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,77:0.65:118
chr4	102642453	rs10856962	T	C	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.28;ReadPosRankSum=-0.543;SOR=0.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,10:0.19:52
chr4	102642526	rs12506517	T	C	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.401;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=435;ReadPosRankSum=0.289;SC=TACAGTAGTCTCTGCTTATCC;SOR=1.209;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=96;TCF=65;TCR=31;TR=27;WE=102642534;WS=102642516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,30:0.30:100
chr4	102750922	rs17266594	T	C	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=193;ReadPosRankSum=-0.759;SC=TTTAACCTGCTGATAGCATTG;SOR=0.162;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=12;WE=102750930;WS=102750912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,12:0.29:42
chr4	102751076	rs10516487	G	A	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=35;PP=1013;ReadPosRankSum=0.450;SC=CTGTTATATCGCTTGGAGAAT;SOR=0.741;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=187;TCF=85;TCR=102;TR=63;WE=102751084;WS=102751066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,67:0.35:193
chr4	102751276	rs10516486	C	T	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=14;PP=519;ReadPosRankSum=-1.647;SC=CTATGAATTACTAAATATCTC;SOR=0.675;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=100;TCF=56;TCR=44;TR=29;WE=102751284;WS=102751266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,34:0.32:107
chr4	102751401	rs58497383	GTTT	G	712.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.16;ReadPosRankSum=0.649;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr4	102791905	rs10516483	C	G	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=298;ReadPosRankSum=-0.626;SC=GATTGAATAACAGTGAATTAC;SOR=0.295;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=15;WE=102791913;WS=102791895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,16:0.36:44
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chr4	102839362	rs3733198	A	T	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.86;MQRankSum=0.000;QD=26.12;ReadPosRankSum=-0.138;SOR=4.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr4	102942761	rs2631261	C	T	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=112;ReadPosRankSum=2.744;SC=TAAGTTTTTCCATGTTATATA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=102942769;WS=102942751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr4	102965043	rs3113676	T	C	1216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=23;PP=804;SC=TGACAAGTTCTGTGGTCTTCC;SOR=1.055;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=39;WE=102965051;WS=102965033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	102992517	rs34184671	T	C	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.780;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=170;ReadPosRankSum=-1.200;SC=ACAGAGTAAATCAATTTCAAT;SOR=0.230;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=12;WE=102992525;WS=102992507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,11:0.23:47
chr4	103189036	rs17823966	G	A	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.703;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=5;PP=1006;ReadPosRankSum=-0.929;SC=TACCTAACTCGTGGGGAAACT;SOR=1.893;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=41;WE=103189044;WS=103189026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,42:0.68:62
chr4	103458888	rs3830689	TCA	T	584.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=579;ReadPosRankSum=-0.137;SC=GAGCCCTCTTTCACAGTTTCA;SOR=1.708;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=12;WE=103458897;WS=103458879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr4	103498015	.	T	C	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=1.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.41;ReadPosRankSum=0.510;SOR=0.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,23:0.25:93
chr4	103505784	rs10711129	CA	C	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.38;ReadPosRankSum=1.197;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr4	103514658	rs1609993	T	C	1727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=20;PP=1226;SC=GTAGTGGTGCTGGAGCTGGAG;SOR=1.217;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=55;WE=103514666;WS=103514648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr4	103553447	rs5860729	GA	G	319.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=4.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.24;ReadPosRankSum=0.456;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,21:0.34:61
chr4	103555992	rs2272697	A	G	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=309;ReadPosRankSum=-0.867;SC=GGTGAGGACAAGAAGTGGTAG;SOR=0.784;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=15;WE=103556000;WS=103555982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr4	103556316	rs909349	T	C	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.299;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=34;ReadPosRankSum=0.232;SC=TAAGAGACTATGAAACCTGAG;SOR=0.120;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=5;WE=103556324;WS=103556306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr4	103556367	rs11436517	G	GT	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=62;ReadPosRankSum=0.191;SC=ATGTGACTAAGTAACTTCTCA;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=3;WE=103556375;WS=103556357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr4	103557077	rs2866413	G	A	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FS=0.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.50;ReadPosRankSum=-0.023;SOR=0.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:173,65:0.27:238
chr4	103557192	rs4547797	C	T	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.039;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=38;PP=971;ReadPosRankSum=1.487;SC=TGTCAGGAGACGGCAAGGTCA;SOR=0.472;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=174;TCF=54;TCR=120;TR=59;WE=103557200;WS=103557182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,61:0.34:178
chr4	103557219	rs2866414	C	T	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.440;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=32;PP=798;ReadPosRankSum=-1.791;SC=CAGAGAGGCACTGTCCAATGG;SOR=0.331;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=132;TCF=28;TCR=104;TR=44;WE=103557227;WS=103557209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,49:0.35:141
chr4	103557251	rs10027437	G	A	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=527;ReadPosRankSum=-0.402;SC=GTGGCTCATCGGGGTTCTAAG;SOR=0.657;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=89;TCF=13;TCR=76;TR=28;WE=103557259;WS=103557241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,30:0.32:94
chr4	103557311	rs4496586	G	C	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=365;ReadPosRankSum=1.083;SC=CCATGTTTGTGAAGCGCTCTG;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=16;WE=103557319;WS=103557301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr4	103594918	rs227276	T	C	1036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=0;PP=858;SC=ATATATAATTTTTAAAATCCT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=103594926;WS=103594911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	103594938	rs227277	G	A	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=0;PP=1047;SC=TGTCCATTCTGAAGTTTCCAT;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=37;WE=103594946;WS=103594928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	103610872	rs227365	A	G	1610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=44;PP=1311;SC=TCACTCTAATATGTCATATTT;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=8;TCR=44;TR=52;WE=103610880;WS=103610862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr4	103611845	rs227368	C	T	4034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=79;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.798;SC=GGGATGGCTACGATCACTTGA;SOR=0.705;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=239;TCF=119;TCR=120;TR=159;WE=103611853;WS=103611835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,163:0.68:241
chr4	103612018	rs227369	G	T	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=487;SC=TTGAAGGTAAGACTAAAGCAG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=103612026;WS=103612008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	103647848	rs113584126	T	C	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=342;ReadPosRankSum=-0.330;SC=ATCCTGTTGATACAAGGTAAA;SOR=0.693;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=72;TCF=6;TCR=66;TR=18;WE=103647856;WS=103647838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,17:0.24:72
chr4	103675175	rs200701172	G	A	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=23.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.13;MQRankSum=-5.059;QD=0.71;ReadPosRankSum=-1.084;SOR=4.471;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,22:0.26:86
chr4	103719893	rs223437	G	A	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=427;ReadPosRankSum=-0.488;SC=TTGCCATGCAGTACTTTCAAG;SOR=0.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=8;WE=103719914;WS=103719883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr4	103719906	rs223436	A	G	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=427;ReadPosRankSum=-1.378;SC=CTTTCAAGCAATAACGGCTAC;SOR=0.191;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=10;WE=103719914;WS=103719883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr4	103722873	rs57915035	CCT	C	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=6.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.51;ReadPosRankSum=-0.200;SOR=0.016;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
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chr4	103747427	rs199965635	CT	C	96.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.54;ReadPosRankSum=-1.332;SOR=0.102;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,8:0.13:63
chr4	103747541	rs2023532	G	A	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=4.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.342;SOR=0.779;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:163,61:0.27:224
chr4	103789782	rs2198199	G	A	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=203;ReadPosRankSum=-1.677;SC=ATACTCATGGGCGAGTATGCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=10;WE=103789790;WS=103789772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr4	103789810	rs223333	C	A	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.664;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=251;ReadPosRankSum=0.085;SC=GGCCACAGCACCCAAACTGTA;SOR=0.250;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=14;WE=103789818;WS=103789800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr4	103790186	rs223332	G	T	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.409;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=95;ReadPosRankSum=0.441;SC=GCGCAGGCGCGGCAGCTTGGC;SOR=1.863;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=8;WE=103790194;WS=103790176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr4	103806308	rs35282200	CTA	C	1490.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.414;NF=22;NR=9;PP=1272;ReadPosRankSum=-0.988;SC=AAGGATGAAACTAGACATGCT;SOR=0.686;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=109;TCF=83;TCR=26;TR=31;WE=103806317;WS=103806298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,43:0.34:127
chr4	103866480	rs3974494	G	A	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.730;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=34;PP=964;ReadPosRankSum=0.851;SC=CTCAAAGCCTGAAACACAAAA;SOR=0.580;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=225;TCF=107;TCR=118;TR=69;WE=103866488;WS=103866470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,70:0.30:234
chr4	103911069	rs2715591	C	A	1792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=26;PP=1400;SC=TAGTTTCTTCCTGTGCAGTAT;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=30;TCR=26;TR=56;WE=103911077;WS=103911059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	103911159	rs7672319	A	C	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=1.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.67;ReadPosRankSum=1.049;SOR=1.077;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,8:0.22:37
chr4	103911168	rs151243467	C	G	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.336;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr4	103911222	rs6533051	C	G	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=28;ReadPosRankSum=0.047;SC=ATCACAGATACAAAAGAAGAT;SOR=0.197;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=4;WE=103911230;WS=103911212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr4	103941410	rs10676315	G	GTTT	286.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.033;SOR=0.138;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr4	104070066	.	C	G	1223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.764;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=996;ReadPosRankSum=-0.506;SC=GCTGTCTTCTCAGATACGCTT;SOR=1.118;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=66;TCF=36;TCR=30;TR=43;WE=104070074;WS=104070056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,44:0.64:69
chr4	104510766	rs2765	G	A	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=0;PP=799;ReadPosRankSum=-2.130;SC=GACAGGACTGGTAAATAGGAG;SOR=2.038;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=30;WE=104510774;WS=104510756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,30:0.73:41
chr4	105393361	rs4413407	A	G	253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=1;PP=241;SC=AGCCCTATACATAAAATGAAA;SOR=4.804;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=105393369;WS=105393351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	106157698	rs144386291	T	C	1187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.816;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=24;PP=893;ReadPosRankSum=2.274;SC=TCACATGCAATATTTTCCAAA;SOR=0.923;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=99;TCR=79;TR=54;WE=106157706;WS=106157688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,56:0.31:183
chr4	106164980	rs17319679	G	A	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=30;PP=787;ReadPosRankSum=0.412;SC=GCCACTGATAGGAAAGCCCAA;SOR=0.922;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=7;TCR=44;TR=35;WE=106164988;WS=106164970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,36:0.72:50
chr4	106190732	rs59519484	C	A	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.16;ReadPosRankSum=-0.592;SOR=0.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,34:0.25:137
chr4	106196834	rs146348065	C	T	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=30;PP=1254;ReadPosRankSum=-0.654;SC=GAAATTGCCTCCTTATCCCAC;SOR=0.854;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=193;TCF=96;TCR=97;TR=63;WE=106196842;WS=106196824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,65:0.32:201
chr4	106197000	rs62621450	A	G	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=4.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.224;SOR=1.247;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,28:0.25:110
chr4	106197750	rs60786079	G	A	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=205;ReadPosRankSum=2.134;SC=TTCTCATGACGTGGGCAGTGG;SOR=0.927;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=13;WE=106197758;WS=106197740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,13:0.27:48
chr4	106290757	rs148302883	G	A	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=6;PP=1048;ReadPosRankSum=0.585;SC=ATATTGCATAGCTCAAAAAGT;SOR=0.776;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=130;TCF=116;TCR=14;TR=52;WE=106290765;WS=106290747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,56:0.40:139
chr4	106292121	rs2726526	G	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.282;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=0.682;SC=AATTATAGAAGAAAGTTTACA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=5;WE=106292129;WS=106292111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr4	106320118	rs17257179	A	C	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=83;ReadPosRankSum=0.398;SC=ATATTCACATAAGAAACTTCC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=106320126;WS=106320108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr4	106359158	rs139651138	C	T	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.133;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=451;ReadPosRankSum=1.260;SC=CAAAGCAGTTCGTGCTCTTAT;SOR=0.454;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=64;TCF=14;TCR=50;TR=24;WE=106359166;WS=106359148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,26:0.39:67
chr4	106369130	rs146932766	T	C	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=55;ReadPosRankSum=0.138;SC=CTCAAACTCCTGGCCTCAAGT;SOR=0.050;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=5;WE=106369138;WS=106369120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr4	106377231	rs28712035	G	C	2705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.578;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=42;PP=1722;ReadPosRankSum=-0.733;SC=CAGTTCTCCTGGCATCTTTCA;SOR=0.775;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=382;TCF=238;TCR=144;TR=117;WE=106377239;WS=106377221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:274,128:0.32:402
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chr4	106566231	.	T	C	135	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=11;NR=0;PP=135;QD=15.4337465952;SC=ATTTTAGATATACAAATGAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=11;WE=106566239;WS=106566230;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:36,11:0.23:47
chr4	106569628	rs56849622	G	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=51;ReadPosRankSum=0.130;SC=ATAAATACTCGTCTTGAAAAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=5;WE=106569636;WS=106569620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr4	106580340	rs13147012	A	G	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.170;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=354;ReadPosRankSum=-1.343;SC=GCAGCGATCAACGGGAGAGGA;SOR=1.432;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=68;TCF=28;TCR=40;TR=19;WE=106580348;WS=106580330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,22:0.30:73
chr4	106588509	rs10019217	C	T	1537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.276;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=33;PP=1150;ReadPosRankSum=-0.105;SC=AGAACTACCACTCTTCTTTAA;SOR=0.475;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=204;TCF=89;TCR=115;TR=65;WE=106588517;WS=106588499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,67:0.33:206
chr4	106640184	rs3796926	C	A	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-7.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=464;ReadPosRankSum=0.947;SC=ATTAAAAAATCTTTTCATTTC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=78;TCF=76;TCR=2;TR=26;WE=106640192;WS=106640174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,27:0.32:84
chr4	106761411	rs190156910	G	A	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.194;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=517;ReadPosRankSum=-1.436;SC=CAAACACCATGAGGACAAAGT;SOR=1.609;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=24;WE=106761419;WS=106761401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,26:0.72:36
chr4	106848314	rs4546247	C	T	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=418;SC=ACATACATAACACATGTGTGT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=106848322;WS=106848312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	106848703	rs10856978	C	T	1611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=47;PP=1312;SC=TGTGAGCTGCCATTTTGCTGA;SOR=6.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=47;WE=106848711;WS=106848693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	106859549	rs35132891	G	C	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=395;ReadPosRankSum=1.108;SC=CTGGCCTGCAGCTGGCTCCTG;SOR=0.588;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=16;TCR=54;TR=21;WE=106859557;WS=106859539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,21:0.30:69
chr4	106861557	rs4627867	A	T	1515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=35;PP=1227;SC=ATCTGCCAATATTATGTAGAT;SOR=3.209;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=42;WE=106861565;WS=106861552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	106861730	rs4340795	A	G	4266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=47;PP=2965;SC=ATGTTATAACATACGTGGGTC;SOR=1.593;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=93;TCR=47;TR=140;WE=106861738;WS=106861720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr4	106888263	rs4597836	A	C	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.91;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	106892210	rs4449421	T	G	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=0;PP=613;SC=TTTCTTCATGTTAAAGGTATA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=106892218;WS=106892200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	107154273	rs13138528	T	C	1679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=44;PP=1396;SC=TAATCAGCAATAAACCCTTAA;SOR=4.450;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=48;WE=107154281;WS=107154263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	107156365	rs7668276	C	G	2977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=12;PP=2291;SC=GGAAAGCACTCTCCTTCTCCA;SOR=3.442;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=72;TCR=12;TR=84;WE=107156373;WS=107156355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr4	107158109	rs116744057	T	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.722;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=0.822;SC=AATCAGTTCTTACCATAAACA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=107158117;WS=107158099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr4	107165685	rs58634260	TA	T	438.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=0;PP=299;SC=ACAACCAATTTAAAAAAAAAA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=19;WE=107165693;WS=107165675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	107168431	rs3775091	G	C	4992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=107;PP=2965;SC=TTCATTAATTGATCTGGGGTT;SOR=2.303;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=36;TCR=107;TR=143;WE=107168439;WS=107168421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr4	107172377	rs13113845	C	G	1516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=41;PP=1229;SC=ATTAACTGTACATATACCACA;SOR=5.330;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=42;WE=107172385;WS=107172367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	107237689	rs115186370	G	C	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.902;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=459;ReadPosRankSum=-1.901;SC=TATAGTACGCGGGTGGCTGGA;SOR=0.374;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=111;TCF=46;TCR=65;TR=38;WE=107237697;WS=107237679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,38:0.34:113
chr4	107846927	rs17037109	G	T	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.281;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=4;PP=791;ReadPosRankSum=-0.173;SC=AAAGAAAGAGGCCCATTAACA;SOR=2.419;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=36;WE=107846935;WS=107846917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,35:0.69:51
chr4	108048977	rs2158182	A	C	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.946;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=7;PP=823;ReadPosRankSum=-1.142;SC=GCAAGATGTAAGGCTGAAGGC;SOR=1.417;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=38;WE=108048985;WS=108048967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,38:0.81:47
chr4	108581002	rs11291153	GC	G	523.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=6;PP=315;SC=CAACATCTTTGCCCCCCCAGC;SOR=1.493;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=11;WE=108581010;WS=108580992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	108581042	.	A	G	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.853;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=56;ReadPosRankSum=0.108;SC=AAATACTGCTATAAGTCACAA;SOR=0.773;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=26;TCF=14;TCR=12;TR=9;WE=108581050;WS=108581032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr4	108608100	rs45502094	CTCTAACACT	C	1675.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.358;NF=28;NR=0;PP=2962;ReadPosRankSum=1.043;SC=CTCCAAGTCACTCTAACACTT;SOR=3.080;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=28;WE=108608116;WS=108608090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,42:0.95:44
chr4	108615226	rs371693146	CT	C	1048.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=40;PP=846;SC=TGTAGTAATACTTTTTTTTTC;SOR=6.091;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=41;WE=108615234;WS=108615216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	108622241	rs17510783	C	T	4608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=119;NR=16;PP=2965;SC=GAACAGAGCTCAAAATTTAAA;SOR=3.865;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=136;TCF=120;TCR=16;TR=135;WE=108622249;WS=108622231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr4	108622475	rs13110240	C	T	2201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=61;PP=1805;SC=TTCTAGTTTACATGAGTCCTT;SOR=5.105;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=64;TCF=3;TCR=61;TR=64;WE=108622483;WS=108622465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr4	108641119	.	C	A	541	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=21;NR=1;PP=541;QD=26.1714187521;SC=TCGCAACCACCCACGGCCCCA;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=22;WE=108641127;WS=108641118;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr4	108641169	rs2074372	C	G	1692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=1;PP=1430;SC=CCTCCGCGCTCCTGGAAGGAT;SOR=6.439;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=51;TCF=50;TCR=1;TR=50;WE=108641177;WS=108641159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	108641300	rs973126	T	C	3540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=55;PP=2842;SC=TATTGCTCAGTTTGACTTTCT;SOR=0.849;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=48;TCR=55;TR=103;WE=108641308;WS=108641290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr4	108641317	rs1127006	G	A	2908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=53;PP=2334;SC=TTCTTGCACAGGCTCCCGGGG;SOR=1.295;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=86;TCF=33;TCR=53;TR=85;WE=108641325;WS=108641307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr4	108641437	rs2074374	C	G	1067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=30;PP=864;SC=GGGGCCTCCTCGCGTCGGAGC;SOR=4.743;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=108641445;WS=108641427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	108641464	rs1319253	AA	GC	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=18;PP=902;SC=GCGCTGACTTAAGCACGCGCC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=18;WE=108641473;WS=108641454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	108853384	rs6849089	C	G	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=172;ReadPosRankSum=-0.809;SC=TCCGGCCGCCCGCGCCCCCAG;SOR=0.752;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=11;WE=108853392;WS=108853374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr4	108866058	rs10002671	G	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=132;ReadPosRankSum=0.146;SC=AATGCACTCCGTGGTAGGTCT;SOR=0.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=8;WE=108866066;WS=108866048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr4	108868515	rs6856745	T	C	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=299;ReadPosRankSum=-0.205;SC=CTGGTTTATTTTTCCCTTTTT;SOR=0.760;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=18;WE=108868523;WS=108868505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,19:0.36:53
chr4	108926170	rs3775973	T	G	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=699;SC=ATGTTTATTTTATACTGTAAC;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=108926178;WS=108926160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	108931039	rs4956145	T	C	6230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=111;PP=2965;SC=GCAGAAAACCTTAAGGTAATT;SOR=1.387;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=63;TCR=111;TR=174;WE=108931047;WS=108931029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr4	108935770	rs7677408	T	C	1879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=3.289;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.64;ReadPosRankSum=1.459;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:11,102:0.90:113
chr4	108935871	rs4956147	G	A	1374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=40;PP=1168;SC=ATATTGTGTAGTGGTGAAGTC;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=40;WE=108935879;WS=108935861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	108944579	rs4956032	C	T	2340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=13;PP=1865;SC=ACCATTCTACCGAAGTTGCTT;SOR=2.932;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=55;TCR=13;TR=68;WE=108944587;WS=108944569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr4	108944821	rs4956033	C	T	1368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=37;PP=1046;SC=AAAGAAGGAGCATTGTATACT;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=37;WE=108944829;WS=108944811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	108944846	rs4956034	A	G	981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=27;PP=747;SC=GCTTGTCCACATGCTGTAAAG;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=108944854;WS=108944836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	108955534	.	G	C	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.000;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.037;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,23:0.23:100
chr4	108969590	rs4245927	A	G	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=0;PP=820;SC=CGCAGATATGAGGGGAGAAAA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=108969598;WS=108969580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	108985388	rs4613638	A	G	4516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=26;PP=2965;SC=AAAGCATCATAAGTTACAGTC;SOR=2.799;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=133;TCF=107;TCR=26;TR=132;WE=108985396;WS=108985378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr4	108991979	rs2276335	C	T	1229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=37;PP=1004;SC=ATAGCAATAGCATATTTTATG;SOR=4.514;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=39;WE=108991987;WS=108991969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	108999300	rs4956156	G	T	4051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=117;NR=5;PP=2965;SC=ACCTGATATGGGATTAAATTG;SOR=5.703;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=117;TCR=5;TR=122;WE=108999308;WS=108999290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr4	108999366	rs4956157	G	A	7107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=146;NR=70;PP=2965;SC=CACATGACTCGGCTACTTACC;SOR=1.642;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=217;TCF=146;TCR=71;TR=216;WE=108999374;WS=108999356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr4	109000536	rs6819640	T	C	729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=0;PP=584;SC=CAGAGGTGCATTGAGTTTCAC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=109000544;WS=109000526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	109002986	rs7681524	T	C	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=393;SC=TCCCCTTCCTTACCCTCCACC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=109002994;WS=109002976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	109010207	rs16996935	A	G	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=3;PP=680;SC=GGCATCTGGAAGGTCACTCAG;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=109010215;WS=109010197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	109461985	rs17583662	A	G	2699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=32;PP=2068;SC=AAGGCAGAGAAATAAAATGTC;SOR=0.897;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=44;TCR=32;TR=76;WE=109461993;WS=109461975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr4	109478108	rs11731416	C	G	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.090;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=554;ReadPosRankSum=1.915;SC=TATTCATTTTCATTGATGGCT;SOR=0.374;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=102;TCF=36;TCR=66;TR=30;WE=109478116;WS=109478098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,34:0.31:109
chr4	109576843	rs2851380	G	T	1919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=30;PP=1382;SC=ATGATTTGGTGGTGGGAAAGA;SOR=0.790;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=27;TCR=30;TR=57;WE=109576851;WS=109576833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr4	109664819	rs6533381	T	C	1017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=0;PP=834;SC=CAACAATAAGTGAACCTAATA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=109664827;WS=109664809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	109735133	rs2305436	T	C	1986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=36;PP=1076;SC=TTAGTAGTCTTGAATTAAAAT;SOR=2.208;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=48;WE=109735154;WS=109735123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	109735146	rs2305435	T	G	1754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.99;SOR=1.923;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	109735209	rs11733727	T	C	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=15;PP=336;SC=GCCAACTGACTGGCTATCAAT;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=109735217;WS=109735199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	109759469	rs4956063	C	T	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=663;SC=TTGTCTTGCACGAAACATTAA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=109759477;WS=109759459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	109762918	rs11942576	C	A	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=36;PP=1021;SC=GAATTGATTCCCTGTTTCCCA;SOR=5.186;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=38;WE=109762926;WS=109762908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	109766177	rs10015534	G	C	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=323;SC=TATACTTTGTGTATCACTGTG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=109766185;WS=109766172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	109766290	rs11098004	T	G	2957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=13;PP=2473;SC=GTAAGTAACATGTCAGTGTGT;SOR=3.417;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=75;TCR=13;TR=88;WE=109766298;WS=109766280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr4	109767453	rs5860952	C	CA	7552.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=138;PP=2936;SC=AACAGAATTCCGATCAATTTC;SOR=2.597;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=20;TCR=145;TR=157;WE=109767461;WS=109767443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr4	109769899	rs13135591	C	T	3504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=28;PP=2690;SC=TAATAGTATACATCTTTGAAA;SOR=2.100;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=77;TCR=28;TR=105;WE=109769907;WS=109769889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr4	109769942	rs112032233	T	C	2231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.367;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=37;PP=1583;ReadPosRankSum=0.863;SC=CTGGGATTCCTGGAGATCCCT;SOR=0.558;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=138;TCF=83;TCR=55;TR=89;WE=109769950;WS=109769932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,93:0.63:148
chr4	109773896	.	C	A	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.726;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=0;PP=781;ReadPosRankSum=0.563;SC=ACTAAGCAGACAAAGTGATTC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=31;WE=109773904;WS=109773886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,34:0.72:47
chr4	109782249	rs13133634	C	T	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=366;SC=TGAAAAACAACAGCAACCACC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=109782257;WS=109782239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	109790373	rs142515007	TAAATA	T	5725.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.89;QD=43.38;SOR=8.380;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr4	109810573	.	ATTTTT	A	359.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.93;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr4	109811003	rs12641411	T	C	2153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=60;PP=1596;SC=ATGACTAATGTGCCTAACTAC;SOR=2.955;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=13;TCR=60;TR=73;WE=109811011;WS=109810993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr4	109817962	rs10856995	C	T	1201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=34;PP=977;SC=ATGAACACTACATATTAAAAT;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=36;WE=109817970;WS=109817952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	109820141	rs144167011	A	ATATATCTC	528.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=591;SC=ATCTATATCTATATATCTATA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=11;WE=109820149;WS=109820131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	109820167	rs6853028	A	C	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=53;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=2;PP=669;SC=ATATATCTATATACCTACCTA;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=109820175;WS=109820157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	109820195	rs6853368	C	A	2026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.22;QD=46.06;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	109820202	rs6853372	C	T	2026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.17;QD=44.06;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	109820446	rs6830868	T	C	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=246;SC=ATGCATGACATTTTCTATTTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=109820454;WS=109820436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	109859043	rs111796687	T	TA	531.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.710;HP=9;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.53;MQRankSum=1.147;NF=3;NR=21;PP=397;ReadPosRankSum=-0.545;SC=TGTAAGTATTTAAAAAAAAAC;SOR=2.350;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=24;WE=109859051;WS=109859033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr4	109859062	rs114504357	C	A	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.763;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.710;NF=5;NR=19;PP=551;ReadPosRankSum=-0.700;SC=ACCCTTCAATCATTTTTTCTT;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=24;WE=109859070;WS=109859052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr4	109931455	rs376144125	AC	A	607.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=967;ReadPosRankSum=-0.765;SC=TTGCAGAAAGACCTCCACACT;SOR=0.999;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=14;WE=109931465;WS=109931445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr4	109931457	rs4995475	C	T	616.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=981;ReadPosRankSum=-0.653;SC=GCAGAAAGACCTCCACACTGG;SOR=0.999;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=15;WE=109931465;WS=109931445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr4	109969337	rs3108954	G	T	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.365;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=23;PP=954;ReadPosRankSum=-1.019;SC=AGGACCTATGGGGGGAGCAGG;SOR=0.440;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=67;TCF=32;TCR=35;TR=47;WE=109969345;WS=109969327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,48:0.72:67
chr4	109969456	rs3096482	T	A	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=288;ReadPosRankSum=0.357;SC=GAAGTTTTTTTAAATTCACTG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=13;WE=109969464;WS=109969446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr4	109971414	rs1863292	T	A	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=28;PP=725;ReadPosRankSum=1.095;SC=ATAATTTATATATATTTTCTC;SOR=0.551;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=6;TCR=46;TR=32;WE=109971422;WS=109971404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,33:0.60:55
chr4	110370867	rs13123618	C	T	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=240;ReadPosRankSum=-0.103;SC=TCATGGTGGTCCTGCCTTCAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=11;WE=110370875;WS=110370857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr4	110384047	rs70949082	G	GCTTTT	3936.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=16;PP=2957;SC=GTAAATACTTGCTTTTTCAGG;SOR=2.168;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=42;TCR=18;TR=53;WE=110384055;WS=110384037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr4	110384790	rs33911248	A	G	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.05;ReadPosRankSum=-0.031;SOR=0.633;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,53:0.26:204
chr4	110384938	rs10002595	T	C	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=128;ReadPosRankSum=0.305;SC=TGGCTTTTTGTAGCACCTCTT;SOR=0.247;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=8;WE=110384946;WS=110384928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr4	110402710	.	T	C	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.093;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=0;PP=695;ReadPosRankSum=1.686;SC=CTAATATTAATATGCATGTTG;SOR=3.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=29;WE=110402718;WS=110402700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,29:0.69:42
chr4	110437649	rs201010114	T	C	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=366;ReadPosRankSum=-0.639;SC=AAATTGTACCTACCAAATAAC;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=18;WE=110437657;WS=110437639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr4	110442148	rs35364322	C	CA	95.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=-0.700;SC=AACTCCATCTCAAAAAAATAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=6;WE=110442156;WS=110442138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr4	110445835	rs34224638	G	A	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=3.076;NF=14;NR=0;PP=297;ReadPosRankSum=-1.962;SC=TTATCATAGGGAATCTGCACC;SOR=0.950;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=14;WE=110445843;WS=110445829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr4	110446454	rs6812906	A	G	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=359;SC=TGGACAAGTAAAATATTATTA;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=110446462;WS=110446444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	110448374	.	CAA	C	141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=-1.200;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.391;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr4	110448702	rs6827006	A	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=174;ReadPosRankSum=2.228;SC=GCTGAGGCGGACGGACCACGA;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=11;WE=110448710;WS=110448692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,11:0.28:40
chr4	110451678	rs9994676	C	T	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=345;ReadPosRankSum=-0.923;SC=CAGATATGTACATGAAGAAAG;SOR=0.774;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=19;WE=110451686;WS=110451668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,19:0.34:56
chr4	110453908	rs34727629	C	G	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=5.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.30;ReadPosRankSum=2.195;SOR=1.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,20:0.22:93
chr4	110454039	rs35940980	T	C	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=59;ReadPosRankSum=-0.564;SC=TAACTAGCACTGGAGGTCAAT;SOR=0.163;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=7;WE=110454047;WS=110454029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr4	110454861	rs34133579	C	G	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.66;ReadPosRankSum=-0.696;SOR=0.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,10:0.19:53
chr4	110460884	rs15821	C	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=55;ReadPosRankSum=0.464;SC=AAAGCATAATCTGTCAGAGAA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=110460892;WS=110460874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr4	110580084	rs1543812	G	T	237.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=164;SC=GTATTAAAAAGAATCTTATGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=110580092;WS=110580074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	110581324	rs34754720	A	AT	980.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.611;HP=9;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=0;PP=533;ReadPosRankSum=-0.762;SC=AAATTTACTCATTTTTTTTTC;SOR=4.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=73;TCF=61;TCR=12;TR=33;WE=110581332;WS=110581314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,44:0.60:73
chr4	110581363	rs4698744	T	A	2581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.782;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.715;NF=73;NR=20;PP=1999;ReadPosRankSum=-0.047;SC=ATAACAGTTATTTATAGACAT;SOR=0.957;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=138;TCF=107;TCR=31;TR=93;WE=110581371;WS=110581353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,94:0.67:140
chr4	110585645	rs767598	G	A	184.96	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.9776;FS=6.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=144;ReadPosRankSum=-0.157;SC=CAGTGACGTCGTCATAGCTCA;SOR=2.526;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=7;WE=110585653;WS=110585635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr4	110602430	rs4698780	T	G	1303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.793;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=10;PP=1016;ReadPosRankSum=-0.406;SC=AAGGAAAAGGTCCTTGAGTCT;SOR=0.477;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=178;TCF=150;TCR=28;TR=54;WE=110602438;WS=110602420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,55:0.31:180
chr4	110603784	rs3733611	T	C	1704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.500;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=20;PP=1354;ReadPosRankSum=-1.082;SC=ACATGAAATCTTTGGTTCACA;SOR=1.394;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=199;TCF=122;TCR=77;TR=67;WE=110603792;WS=110603774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,70:0.34:204
chr4	110606394	rs3214165	C	CT	151.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.02;MQRankSum=1.679;QD=7.59;ReadPosRankSum=-1.522;SOR=0.243;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr4	110608536	rs13151303	C	T	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=436;ReadPosRankSum=1.299;SC=ATATATATTTCAGCCATTTGC;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=64;TCR=0;TR=22;WE=110608544;WS=110608526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,23:0.35:66
chr4	110615913	rs3181345	C	T	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.628;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=297;ReadPosRankSum=-0.441;SC=GTTATCTACACATAAAAATTC;SOR=0.142;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=68;TCF=11;TCR=57;TR=21;WE=110615921;WS=110615903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,23:0.31:74
chr4	110619006	rs5030552	T	C	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=4.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=130;ReadPosRankSum=0.786;SC=AACATGTAGATAGAGATCTGA;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=8;WE=110619014;WS=110618996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,8:0.21:38
chr4	110619534	rs2301717	T	G	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=5.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=399;ReadPosRankSum=-1.075;SC=AATTATTTTTTACTTATGGCA;SOR=0.465;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=19;WE=110619542;WS=110619524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr4	110661937	rs551	G	A	1682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=12;PP=1432;SC=AAAATATCCAGTGAGATTTGC;SOR=2.348;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=51;WE=110661945;WS=110661927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr4	110670807	rs7441380	G	C	656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=557;SC=ACCCATTAGCGTTTTTAACAC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=110670815;WS=110670797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	110678925	rs11098044	T	C	2229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=43;PP=1695;SC=TTACCTTGAGTCACAGATGCA;SOR=1.362;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=22;TCR=43;TR=65;WE=110678933;WS=110678915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr4	110678979	rs146158558	T	TTTTAA	2543.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=26;PP=1755;SC=AAAGGATAATTTTTGGAAAAA;SOR=1.445;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=41;WE=110678987;WS=110678969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	110679002	rs7437142	G	T	2235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=25;PP=1430;SC=GCACACTATAGCAATATACTA;SOR=0.846;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=50;WE=110679010;WS=110678992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	110681618	rs4382037	C	T	5002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=68;PP=2965;SC=AGTAAAGTTGCTTTTCCTCTT;SOR=0.734;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=74;TCR=68;TR=142;WE=110681626;WS=110681608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr4	110737389	rs2276326	T	C	907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=9;PP=811;SC=TCAACCGAGGTGGCAGCAGCA;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=30;WE=110737397;WS=110737379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	110737549	rs6828254	G	A	1715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=31;PP=1203;SC=GCAGTCTTCAGTATTTAGCTT;SOR=1.047;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=54;TCF=23;TCR=31;TR=53;WE=110737557;WS=110737539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	110745425	rs3188897	G	A	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=4;PP=457;SC=GAAAAATAAAGGTGTAATATG;SOR=1.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=110745433;WS=110745415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	110756652	rs111670300	A	G	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.898;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=36;PP=821;ReadPosRankSum=-0.808;SC=TTCTTAATGAATCCATTTCTT;SOR=1.074;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=116;TCF=25;TCR=91;TR=44;WE=110756660;WS=110756642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,47:0.38:125
chr4	110765361	rs7681770	T	G	4854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=115;PP=2965;SC=TGAAATAAGATAAAAGGACAC;SOR=2.665;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=28;TCR=115;TR=143;WE=110765380;WS=110765351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr4	110765372	rs7657133	A	G	4266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=111;PP=2965;SC=AAAAGGACACACTATCAAAAC;SOR=3.310;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=18;TCR=111;TR=129;WE=110765380;WS=110765351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr4	110773067	rs4698797	G	A	5293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=77;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.138;SC=TTCCTGGAGAGCTGGACTCAT;SOR=0.792;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=88;TCR=79;TR=164;WE=110773075;WS=110773057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,168:0.99:170
chr4	110786290	rs7679048	C	T	4222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=25;PP=2965;SC=TAGAACGTTACGGCTGTAAAA;SOR=2.798;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=99;TCR=25;TR=124;WE=110786298;WS=110786280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr4	110786517	rs7679303	A	G	1568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=43;PP=1280;SC=ACTAATACGTACAATAATGAC;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=43;WE=110786525;WS=110786507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	110790911	rs764205	A	T	6408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=142;NR=54;PP=2965;ReadPosRankSum=0.607;SC=TCTGGCTGGGATGTCAGAAGC;SOR=0.966;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=143;TCR=54;TR=196;WE=110790919;WS=110790901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,204:1.00:205
chr4	110914427	rs4698803	A	T	854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=8;PP=696;SC=CAACTGGGGGAGCACAGCTGT;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=110914435;WS=110914417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	110914559	rs11569078	G	C	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=199;ReadPosRankSum=0.785;SC=TGAAGGGGAGGGACTTGGCTC;SOR=0.560;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=12;WE=110914567;WS=110914549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr4	111014416	.	A	G	60.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5051;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=36;ReadPosRankSum=-0.319;SC=AGGCACCAAAATATTAACAGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=111014424;WS=111014406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr4	111398208	rs10004516	A	G	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=30;PP=761;ReadPosRankSum=2.260;SC=GAGAACGGACAAGTCAAGTAA;SOR=1.559;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=30;WE=111398216;WS=111398198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,30:0.67:45
chr4	111409705	rs1126483	T	C	4345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.818;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=58;PP=2962;ReadPosRankSum=0.731;SC=AGGAGCATAGTGGCCACCGAT;SOR=1.190;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=248;TCF=153;TCR=95;TR=168;WE=111409713;WS=111409695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,171:0.68:252
chr4	111437103	rs2348432	C	T	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=490;ReadPosRankSum=-0.516;SC=ACTGGTTCCACCATAAGAGTC;SOR=0.627;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=22;WE=111437111;WS=111437093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr4	111437127	rs2348433	A	C	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=290;ReadPosRankSum=-1.912;SC=GCCTCACGATATCATCTAAAT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=13;WE=111437135;WS=111437117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr4	111454153	rs671841	A	G	1801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=1;PP=1610;SC=CTGGTAAAAGACATAATAAGA;SOR=6.518;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=50;WE=111454161;WS=111454143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr4	111469321	.	G	T	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=78.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQRankSum=-2.348;QD=11.52;ReadPosRankSum=-1.681;SOR=7.978;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,53:0.72:74
chr4	111469323	rs201430742	C	T	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=69.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQRankSum=-2.553;QD=10.93;ReadPosRankSum=-4.447;SOR=7.830;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,53:0.68:78
chr4	111474659	rs12501626	C	A	3314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-7.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=104;PP=2667;ReadPosRankSum=0.568;SC=TTCATACTATCTACTGGTTCC;SOR=0.663;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=166;TCF=19;TCR=147;TR=118;WE=111474667;WS=111474649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,121:0.71:171
chr4	111781650	rs10213399	C	T	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=5;PP=602;SC=TGTGGTCTGTCGTTGACTGGA;SOR=2.124;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=23;WE=111781658;WS=111781640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	113066831	rs10002700	G	A	185.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=4;PP=150;SC=GCAGGGACCGGGTGGGATCCC;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=113066839;WS=113066821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	113178894	rs147158310	ATTTGT	A	232.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=228;ReadPosRankSum=-1.331;SC=TAGCTAATGAATTTGTTTTAA;SOR=2.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=6;WE=113178906;WS=113178884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr4	113179077	rs4834247	C	T	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.53;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
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chr4	113199075	rs701759	A	G	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.968;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=367;ReadPosRankSum=-1.016;SC=AGCAGAGCGAATAAGTGCCAT;SOR=0.307;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=67;TCF=57;TCR=10;TR=21;WE=113199083;WS=113199065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,22:0.32:68
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chr4	113344925	rs1989926	C	T	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.547;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=482;ReadPosRankSum=0.025;SC=AAAACTTCATCTTTCTTTTCA;SOR=0.255;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=92;TCF=24;TCR=68;TR=30;WE=113344933;WS=113344915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,32:0.33:96
chr4	113346714	rs916868	T	C	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=172;ReadPosRankSum=-0.726;SC=ACGAGATTGTTTCTCAAAATG;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=9;WE=113346722;WS=113346704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr4	113346996	rs10017209	G	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.44;ReadPosRankSum=-0.480;SOR=0.988;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,18:0.24:75
chr4	113347496	rs9994944	A	G	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=4.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=177;ReadPosRankSum=-1.743;SC=ATCTAAGCCTAAGTTTTCCTA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=9;WE=113347504;WS=113347486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,9:0.27:33
chr4	113349020	rs4834277	C	G	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=300;ReadPosRankSum=-1.133;SC=AGCACTGTAACAGACACTCAG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=6;WE=113349033;WS=113349010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr4	113349025	rs74727833	A	G	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=607;ReadPosRankSum=0.489;SC=TGTAACAGACACTCAGAGAGT;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=11;WE=113349033;WS=113349010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr4	113350154	rs35133578	C	A	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=331;ReadPosRankSum=-0.139;SC=GGTCTTTAGACCCACTTACTC;SOR=0.314;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=17;WE=113350162;WS=113350144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr4	113350192	rs11944440	C	T	1397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=1;PP=1164;ReadPosRankSum=0.159;SC=GAACGGGTTGCGGTGAGGAGT;SOR=1.233;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=87;TCF=85;TCR=2;TR=53;WE=113350200;WS=113350182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,53:0.61:87
chr4	113350415	rs11944513	C	T	3103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=89;PP=2605;SC=CTGTGGTAAACGAATGCAGCC;SOR=5.158;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=5;TCR=89;TR=94;WE=113350423;WS=113350405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr4	113350498	rs17444613	C	G	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=219;ReadPosRankSum=1.133;SC=AAGGTTTAACCTTCAAACAGG;SOR=0.434;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=12;WE=113350506;WS=113350488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr4	113351521	rs1029447	G	T	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=125;ReadPosRankSum=2.256;SC=TCAAATGACTGTCCTCCAGAA;SOR=0.202;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=7;WE=113351529;WS=113351511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr4	113352075	rs73841022	A	G	2701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.562;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=69;PP=2079;ReadPosRankSum=0.122;SC=AATCCTTGACACCTATTCACA;SOR=0.973;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=140;TCF=36;TCR=104;TR=91;WE=113352083;WS=113352065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,100:0.67:149
chr4	113352397	rs2074388	G	A	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.268;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=903;ReadPosRankSum=1.108;SC=TACAGCAATGGTGAGGGAGCT;SOR=0.529;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=138;TCF=63;TCR=75;TR=49;WE=113352405;WS=113352387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,50:0.33:150
chr4	113352628	rs13148353	A	G	2887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=35;PP=2044;SC=CATTCATTGCATTCACAGCTT;SOR=1.059;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=54;TCR=35;TR=89;WE=113352636;WS=113352618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr4	113352832	rs35633116	C	T	2597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.359;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=47;PP=2049;ReadPosRankSum=2.346;SC=AGAAATACTTCTGCTCACTCC;SOR=0.814;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=126;TCF=60;TCR=66;TR=85;WE=113352840;WS=113352822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,90:0.67:134
chr4	113352899	rs2074379	G	A	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.954;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=13;PP=845;ReadPosRankSum=1.686;SC=CCAAGAATATGGGCACACATC;SOR=1.340;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=144;TCF=82;TCR=62;TR=44;WE=113352907;WS=113352889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,48:0.32:151
chr4	113353285	rs11726117	T	C	4007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=46;PP=2965;SC=CTCGACAGCATGGATGTTCCC;SOR=1.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=77;TCR=46;TR=123;WE=113353293;WS=113353275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr4	113353842	rs6841595	A	C	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=615;SC=AAGGTATAGAACCCTGGTATG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=113353850;WS=113353832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	113356259	rs3815071	C	T	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.689;NF=20;NR=0;PP=365;ReadPosRankSum=1.134;SC=TGAATTGTAACGTCCTTTTGA;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=20;WE=113356267;WS=113356249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,20:0.34:58
chr4	113359703	rs231247	A	G	6005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=79;PP=2965;SC=ATGTGGAGCGACAGATGACCG;SOR=0.944;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=99;TCR=79;TR=178;WE=113359711;WS=113359693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr4	113359883	rs231248	A	T	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=213;ReadPosRankSum=0.262;SC=GGTTCCACATAATCAGGCTAG;SOR=0.152;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=0;TCR=51;TR=14;WE=113359891;WS=113359873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,14:0.28:50
chr4	113362301	rs61574683	T	G	3933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.676;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=77;PP=2915;ReadPosRankSum=1.899;SC=GTGACAGACCTTAGTGATGCT;SOR=0.644;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=226;TCF=114;TCR=112;TR=149;WE=113362309;WS=113362291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,158:0.66:240
chr4	113362316	rs1486868	A	G	6249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.692;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=87;PP=2962;ReadPosRankSum=0.336;SC=GATGCTCTCAAATATCTGGTG;SOR=1.018;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=227;TCF=103;TCR=124;TR=151;WE=113362324;WS=113362306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,160:0.67:239
chr4	113436044	rs901474	T	G	1845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=24;PP=1640;SC=CGGCGCTGGCTCCTCCCGGGC;SOR=1.366;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=40;TCR=24;TR=64;WE=113436052;WS=113436034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr4	113460927	rs2306775	C	A	1298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.148;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=21;PP=1023;ReadPosRankSum=-0.419;SC=CTTCCCCCAGCAGAGCTGTTC;SOR=0.422;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=70;TCF=40;TCR=30;TR=45;WE=113460935;WS=113460917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,46:0.67:69
chr4	113533796	rs9993534	T	C	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=54;ReadPosRankSum=-0.903;SC=AGCAGTACTCTAAAATTTAAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=4;WE=113533804;WS=113533786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr4	113550118	rs144197483	T	G	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.128;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=106;ReadPosRankSum=0.210;SC=GACCTGAATATTCATCTATTT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=113550126;WS=113550108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr4	113565740	rs79121594	A	G	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=256;ReadPosRankSum=0.829;SC=ATTCTCTCAGACAGTTAAAGG;SOR=1.329;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=11;WE=113565748;WS=113565730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr4	113568328	rs75987826	G	T	2478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.709;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=26;PP=2061;ReadPosRankSum=-0.017;SC=GAAGTAAGATGAACTAATAAT;SOR=0.596;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=132;TCF=94;TCR=38;TR=84;WE=113568336;WS=113568318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,86:0.62:138
chr4	113570639	rs4513633	C	A	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=36;ReadPosRankSum=-0.842;SC=AGATATTTCCCTATTTACTTT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=113570647;WS=113570629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr4	113578326	.	T	TTG	66	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=66;QD=23.0;SC=AGTCATAGTTTTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=3;WE=113578334;WS=113578316;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,3:0.27:11
chr4	113578609	rs1129065	C	T	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-2.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=232;ReadPosRankSum=-0.493;SC=CTTTGTTCCTCAACTTGTAAA;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=10;WE=113578617;WS=113578599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr4	114067139	rs3112980	G	A	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.66;ReadPosRankSum=-0.884;SOR=0.695;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,25:0.25:99
chr4	114072148	rs10647173	G	GAA	778.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=9.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=1.652;QD=9.73;ReadPosRankSum=0.544;SOR=0.067;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,22:0.28:80
chr4	114072149	rs61478665	T	A	787.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=4.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=1.594;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.538;SOR=0.139;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,24:0.29:83
chr4	114081490	rs436855	A	G	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.681;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=774;ReadPosRankSum=1.344;SC=TCAAAGTGCTAGGATTACAGG;SOR=0.115;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=37;WE=114081498;WS=114081480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,39:0.76:51
chr4	114171154	rs362495	A	G	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=576;SC=GAATAGGAATATGTATCAAAC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=21;WE=114171162;WS=114171144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	114185878	rs11452087	C	CA	117.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQRankSum=-0.524;QD=7.85;ReadPosRankSum=0.863;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr4	114254454	rs369809224	ATG	A	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.51;MQRankSum=1.550;QD=7.79;ReadPosRankSum=-1.335;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr4	114267023	rs9968405	G	A	6104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=136;NR=54;PP=2965;SC=CAAATCAAATGTGGGTGAAGC;SOR=2.030;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=136;TCR=54;TR=190;WE=114267031;WS=114267013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr4	114275014	rs200628845	C	G	3525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=72;PP=2718;ReadPosRankSum=-2.162;SC=GCCCCTGAACCCCTTCCCACT;SOR=0.744;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=210;TCF=101;TCR=109;TR=137;WE=114275022;WS=114275004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,139:0.65:214
chr4	114286357	rs34201791	ATG	A	1867.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;QD=30.62;SOR=6.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr4	114309839	rs6533681	C	T	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=246;ReadPosRankSum=-1.810;SC=ACTTTTCTTCCGGAAAAAATT;SOR=0.481;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=11;WE=114309847;WS=114309829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr4	114375408	rs202106323	TG	T	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=94;SC=TGGAATATTGTGGATTTTTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=114375420;WS=114375405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	114375412	.	T	A	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=51;SC=ATATTGTGGATTTTTTTTTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=114375420;WS=114375405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	114823191	.	A	G	504	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=19;NR=1;PP=504;QD=26.9385606274;SC=CTAAAGGAGCAAGAGAAATAA;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=114823199;WS=114823190;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	114827812	rs77445993	C	G	4041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.664;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=87;PP=2962;ReadPosRankSum=0.679;SC=GTTTTGGAATCAAACAGACCT;SOR=0.819;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=229;TCF=96;TCR=133;TR=146;WE=114827820;WS=114827802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,150:0.64:235
chr4	115544714	rs6851610	A	G	6286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.053;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=95;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.791;SC=ACCTGCTGCCAGAGAAGTCCA;SOR=0.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=98;TCR=96;TR=192;WE=115544722;WS=115544704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,205:1.00:206
chr4	115586696	rs4833463	A	G	218.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=179;SC=ATTTGCTGTTACCAAAGCATG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=115586704;WS=115586686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	115589159	rs6831964	C	T	1002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=1;PP=818;SC=TACTGTAGTGCCGATTTTTAA;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=115589167;WS=115589149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	115589302	rs11098261	A	G	3845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=44;PP=2965;SC=TTGAAACTATATATCATGGTG;SOR=1.227;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=69;TCR=44;TR=113;WE=115589310;WS=115589292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
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chr4	119035948	rs5861378	T	TC	3048.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=41;PP=2349;SC=GGATAATATTTCCCCCCCTAA;SOR=1.081;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=88;TCF=43;TCR=45;TR=75;WE=119035956;WS=119035938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
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chr4	119147975	rs2271577	A	G	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.437;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=471;ReadPosRankSum=0.193;SC=CACAAGTTGGAAAAGCTGGCA;SOR=0.246;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=80;TCF=72;TCR=8;TR=26;WE=119147983;WS=119147965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,25:0.32:79
chr4	119161619	rs641962	A	G	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=530;SC=ACAAAGATTGATTTTTAATTA;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=119161627;WS=119161609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	119161795	rs617430	G	A	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.576;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=345;ReadPosRankSum=-0.984;SC=GTTTGGTCCCGGGGTGGTATG;SOR=0.430;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=28;TCF=13;TCR=15;TR=18;WE=119161803;WS=119161785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr4	119174563	rs609512	T	A	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=144;ReadPosRankSum=0.084;SC=TATGTATTGGTCACTATATCA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=7;WE=119174571;WS=119174553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr4	119174640	rs5861382	CT	C	686.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=411;ReadPosRankSum=1.137;SC=TGTGTGTATTCTTTTTTTTTT;SOR=1.609;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=25;WE=119174649;WS=119174630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr4	119176703	rs7684275	A	G	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=665;ReadPosRankSum=-0.759;SC=TATGAAATGTAATAAACAAAA;SOR=0.489;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=65;TCF=58;TCR=7;TR=30;WE=119176711;WS=119176693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr4	119200274	rs658642	C	T	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=206;ReadPosRankSum=-0.289;SC=CCCCGAGAACCGTCAGTTTGA;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=9;WE=119200282;WS=119200264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr4	119200594	rs2272160	T	C	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=108;ReadPosRankSum=0.468;SC=AAGGTACATTTCTTTTTTGAT;SOR=0.634;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=7;WE=119200602;WS=119200584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr4	119217114	rs788665	C	G	2224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=60;PP=1796;SC=ATGTCAAAATCCCTTTTCTCT;SOR=4.438;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=6;TCR=60;TR=66;WE=119217122;WS=119217104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr4	119219909	rs28661939	C	A	1642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.903;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=24;PP=1250;ReadPosRankSum=1.225;SC=TTACCTGAGGCCTTCTTGCCA;SOR=0.891;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=192;TCF=121;TCR=71;TR=68;WE=119219917;WS=119219899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,70:0.35:199
chr4	119237348	rs2292597	T	C	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.700;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=15;PP=792;ReadPosRankSum=-0.474;SC=TAAATCCCAATTGTCGACAAA;SOR=0.831;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=137;TCF=91;TCR=46;TR=46;WE=119237356;WS=119237338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,45:0.31:143
chr4	119256617	rs3215324	C	CT	1024.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=1.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=1.482;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.750;SOR=0.893;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,56:0.32:177
chr4	119273712	rs13119545	C	G	1650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=17;PP=1286;ReadPosRankSum=-0.011;SC=CGGACGCGTCCTCGGGGGCCG;SOR=0.634;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=85;TCR=25;TR=74;WE=119273720;WS=119273702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,73:0.68:108
chr4	119401424	rs7659489	T	A	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-4.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-5.086;NF=18;NR=1;PP=303;ReadPosRankSum=-2.454;SC=TTTCTGTTTCTTCTGCTTTAG;SOR=0.936;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=63;TCF=60;TCR=3;TR=19;WE=119401432;WS=119401414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,13:0.22:60
chr4	119401616	rs115540404	T	C	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-5.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.065;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.801;NF=0;NR=30;PP=499;ReadPosRankSum=-0.388;SC=TCAGTCACTGTGACATTAAAT;SOR=2.252;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=3;TCR=67;TR=30;WE=119401624;WS=119401606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr4	119414256	rs113100030	AAGG	A	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQRankSum=-2.813;QD=3.52;ReadPosRankSum=-0.766;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr4	119435862	rs202102941	A	G	130.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.73;QD=26.18;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	119444456	rs28720014	G	A	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=2.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQRankSum=0.623;QD=4.35;ReadPosRankSum=-1.253;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,41:0.24:174
chr4	119461284	rs60711916	G	T	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.635;NF=14;NR=0;PP=220;ReadPosRankSum=-0.971;SC=AATAACTTCTGTCTAATTATA;SOR=0.197;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=14;WE=119461292;WS=119461274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr4	119609039	rs9968326	G	A	3857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=25;PP=2900;SC=AGGCTATCCAGTGCATTGCAA;SOR=2.664;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=86;TCR=25;TR=111;WE=119609047;WS=119609029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr4	119613045	rs6821350	T	G	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=1;PP=706;ReadPosRankSum=-0.126;SC=TTGATTGCATTTTATATCACC;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=27;WE=119613053;WS=119613035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr4	119615543	rs13111664	T	C	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=777;ReadPosRankSum=1.041;SC=ATTACTGATATTAACTTCAGT;SOR=0.906;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=16;WE=119615552;WS=119615533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr4	119615544	rs57581623	T	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=157;ReadPosRankSum=-1.538;SC=TTACTGATATTAACTTCAGTT;SOR=0.634;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=6;WE=119615552;WS=119615533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr4	119625000	rs3733517	A	G	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.895;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=133;ReadPosRankSum=-0.886;SC=TGAAACCTCTAGAAAGTTTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=119625008;WS=119624993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr4	119625273	rs298995	G	A	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=284;ReadPosRankSum=1.647;SC=CCAAATAACTGTATACTGTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=14;WE=119625281;WS=119625263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
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chr4	119674051	rs71595318	G	GA	2135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.792;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.201;NF=11;NR=80;PP=1396;ReadPosRankSum=1.279;SC=TCCCTGTAAGGAAAAAAAAAA;SOR=0.581;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=191;TCF=27;TCR=164;TR=91;WE=119674059;WS=119674041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,98:0.57:173
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chr4	119944611	rs1459058	G	T	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=10;PP=762;ReadPosRankSum=1.335;SC=AAGCCTCTGGGTCTGGGCTCT;SOR=0.775;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=115;TCF=85;TCR=30;TR=41;WE=119944619;WS=119944601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,44:0.37:118
chr4	119947961	rs70944826	AAAG	A	5565.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.400;NF=37;NR=76;PP=2964;ReadPosRankSum=-1.252;SC=GCTGAGAACCAAAGAAGTGGT;SOR=0.680;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=199;TCF=64;TCR=135;TR=113;WE=119947975;WS=119947951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,143:0.61:235
chr4	119947985	rs12645298	G	C	3726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.778;NF=49;NR=82;PP=2891;ReadPosRankSum=-0.180;SC=GACTGTGCAGGCAGCTTGAAA;SOR=0.711;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=212;TCF=80;TCR=132;TR=131;WE=119947993;WS=119947975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,137:0.63:218
chr4	119950975	rs111780874	A	AT	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=-0.298;QD=13.15;ReadPosRankSum=-0.595;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr4	119951647	rs7698598	A	G	10678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=230;NR=91;PP=2965;ReadPosRankSum=0.879;SC=CTTCAGTGGGACATCTGAGAC;SOR=0.952;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=324;TCF=233;TCR=91;TR=321;WE=119951655;WS=119951637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,322:1.00:323
chr4	120071926	rs6853794	T	C	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=0;PP=848;SC=TACTTATGATTATGCAATTAG;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=120071934;WS=120071916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	120072233	rs6828875	G	C	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.99;SOR=6.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	120072238	rs6828349	A	G	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.79;SOR=6.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	120079159	rs11721566	A	G	3075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=10;PP=2525;SC=AGCAGAGTTTACTTTTGATTA;SOR=4.059;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=77;TCR=10;TR=87;WE=120079167;WS=120079149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr4	120079387	rs11729978	G	A	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.127;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=27;PP=500;ReadPosRankSum=0.424;SC=AGCCTTTATTGAATAGTATTT;SOR=0.094;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=112;TCF=11;TCR=101;TR=33;WE=120079395;WS=120079377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,34:0.29:117
chr4	120107098	rs112369914	G	GT	328.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.390;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.432;NF=19;NR=0;PP=202;ReadPosRankSum=1.218;SC=ATTGAGATCTGTTTTTTTTTT;SOR=2.252;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=54;TCR=5;TR=19;WE=120107106;WS=120107088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,20:0.34:59
chr4	120133712	rs6851130	G	A	551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=15;PP=409;SC=AGCCCGCTCCGAGGGGCGGGC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=120133720;WS=120133702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	120161156	rs79063845	T	C	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=346;ReadPosRankSum=0.034;SC=AAAGTTACTATAGACTAGAAT;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=14;WE=120161164;WS=120161146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr4	120177522	rs7668372	G	T	1116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.106;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=863;ReadPosRankSum=-1.383;SC=CAGGTGAGATGGCTTGATTAT;SOR=0.133;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=68;TCF=19;TCR=49;TR=42;WE=120177530;WS=120177512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,43:0.61:70
chr4	120177708	rs7668423	C	T	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=25;PP=632;ReadPosRankSum=1.545;SC=TAATTATCAACGATATTAATA;SOR=0.560;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=31;WE=120177716;WS=120177698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,30:0.75:40
chr4	120192436	rs199580098	A	AT	1188.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.486;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.859;NF=42;NR=7;PP=709;ReadPosRankSum=-0.366;SC=TGTATCTTTAATTTTTTTTTT;SOR=1.124;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=87;TCF=72;TCR=15;TR=49;WE=120192444;WS=120192426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,55:0.74:74
chr4	120194718	rs35610634	G	GT	2127.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.283;NF=26;NR=38;PP=1419;ReadPosRankSum=0.579;SC=AACAAATGTTGTTTTTTTTTA;SOR=0.824;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=81;TCF=34;TCR=47;TR=64;WE=120194726;WS=120194708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,79:0.98:81
chr4	120194799	rs61730006	G	A	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=578;ReadPosRankSum=2.615;SC=ACCAGATTACGACAAGCAACC;SOR=0.521;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=26;WE=120194807;WS=120194789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr4	120214291	rs17517054	T	C	2815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.096;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=63;PP=2356;ReadPosRankSum=0.314;SC=CGGATACATATAGATTGAAAT;SOR=0.313;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=145;TCF=52;TCR=93;TR=103;WE=120214299;WS=120214281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,100:0.70:142
chr4	120220085	rs111948904	A	AAAAC	400.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.307;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=322;ReadPosRankSum=-0.706;SC=TCAGGTCATAAAAACACACAC;SOR=0.197;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=120220093;WS=120220075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr4	120241902	rs1799883	T	C	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.248;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=410;ReadPosRankSum=-1.045;SC=TTTCGAAAAGTGCTTGATTCT;SOR=0.052;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=24;WE=120241910;WS=120241892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,26:0.72:36
chr4	120243352	rs1397614	C	T	3275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=101;PP=2770;ReadPosRankSum=-0.202;SC=CAACTTCATACTGTGATGTGG;SOR=0.729;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=147;TCF=11;TCR=136;TR=110;WE=120243360;WS=120243342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,109:0.73:150
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chr4	120419979	rs141662936	C	CA	135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=160;ReadPosRankSum=-1.086;SC=GGCCACATCCCACACTCATTT;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=5;WE=120419987;WS=120419969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr4	120446652	rs141680876	T	TAC	908.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.130;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=989;ReadPosRankSum=0.230;SC=CTCTCTTACATACACACACAC;SOR=2.472;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=54;TCF=53;TCR=1;TR=22;WE=120446660;WS=120446642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr4	120446868	rs3832310	GA	G	1135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=8.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=0.594;QD=16.00;ReadPosRankSum=-0.816;SOR=2.566;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,54:0.76:71
chr4	120463856	rs2622497	A	C	2100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=55;PP=1698;SC=GACTTTAACAAACACACCCAA;SOR=4.582;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=4;TCR=55;TR=59;WE=120463864;WS=120463846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr4	120473953	rs111838506	T	A	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=139;SC=ATAATGAAGTTCACATAAATG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=120473961;WS=120473943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	120474677	rs137887715	A	G	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=794;ReadPosRankSum=-0.768;SC=GGGAAAGCACAGATCATTCCT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=13;WE=120474695;WS=120474667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr4	120474687	rs200145605	T	TA	411.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=765;ReadPosRankSum=-0.776;SC=AGATCATTCCTAAACAGTCAA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=14;WE=120474695;WS=120474667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr4	120488167	rs41278071	A	G	2734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=6.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.789;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=17;PP=2175;ReadPosRankSum=-0.862;SC=CTAGAGGTGTATATACTATAA;SOR=0.970;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=143;TCF=115;TCR=28;TR=94;WE=120488175;WS=120488157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,96:0.66:145
chr4	120528064	rs17051276	A	C	5267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.014;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=88;PP=2962;ReadPosRankSum=0.499;SC=CGGTCAGCAGATATCAGTCCA;SOR=0.785;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=289;TCF=149;TCR=140;TR=187;WE=120528072;WS=120528054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,192:0.65:297
chr4	120528327	rs3733526	G	A	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.661;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=635;ReadPosRankSum=-0.240;SC=TGTTCCAGGGGCACTGTTATC;SOR=0.524;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=110;TCF=42;TCR=68;TR=32;WE=120528335;WS=120528317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,35:0.31:113
chr4	120528524	rs10536068	ATCT	A	538.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.110;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=585;ReadPosRankSum=1.429;SC=GCTCCTAAACATCTTCTCATG;SOR=2.194;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=15;WE=120528534;WS=120528514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr4	120550059	rs11342908	GC	G	1361.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=17;PP=949;SC=CAGCTGCTGCGCCCCCCCCAC;SOR=1.085;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=49;TCF=30;TCR=19;TR=41;WE=120550067;WS=120550049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	120550125	rs10639733	A	AGGC	356.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.353;HP=4;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.397;NF=6;NR=6;PP=175;ReadPosRankSum=-0.542;SC=GGTTCCCAGGAGGCGGCGGCG;SOR=0.439;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=12;WE=120550133;WS=120550115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,11:0.24:45
chr4	120550144	rs2953291	A	G	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.414;NF=7;NR=7;PP=156;ReadPosRankSum=-2.239;SC=CGGCGGCGGCAGCGGCAGCGC;SOR=0.495;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=51;TCF=21;TCR=30;TR=14;WE=120550152;WS=120550134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,12:0.24:50
chr4	120982045	rs61752609	T	C	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=10.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.05;ReadPosRankSum=0.194;SOR=0.015;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr4	120982135	rs61752610	G	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=3.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=0.580;QD=3.56;ReadPosRankSum=-0.393;SOR=0.239;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,10:0.22:46
chr4	120983259	rs2908989	T	C	8539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=147;NR=116;PP=2965;SC=ATCTGCAACATATAAAAAGGA;SOR=0.921;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=264;TCF=148;TCR=116;TR=263;WE=120983267;WS=120983249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr4	121698199	rs3804163	G	A	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=211;ReadPosRankSum=0.100;SC=AAAAAACTGGGTTGTACAATG;SOR=0.484;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=12;WE=121698207;WS=121698189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr4	121702270	rs3761721	T	C	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=102;ReadPosRankSum=1.037;SC=ACGTAATCTGTTCAAACTAAC;SOR=0.250;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=7;WE=121702278;WS=121702260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr4	121702634	rs56402218	T	C	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=44;ReadPosRankSum=-0.906;SC=ACTGTGTGACTAGGCAGAAGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=4;WE=121702642;WS=121702624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr4	121706201	rs12499000	A	G	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=665;ReadPosRankSum=-0.086;SC=GTCCGGAACAAAGCTTTACAT;SOR=0.719;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=69;TCR=53;TR=39;WE=121706209;WS=121706191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,41:0.33:126
chr4	121719584	rs66792327	T	TA	72.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.349;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=93;ReadPosRankSum=1.647;SC=GTTTTTCTATTAAAAAAATGA;SOR=0.117;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=6;WE=121719592;WS=121719574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr4	121720941	rs4833676	C	G	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.796;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=174;ReadPosRankSum=0.766;SC=ACTGTCAAAGCCTAGTAAATT;SOR=0.223;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=10;WE=121720949;WS=121720931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr4	121720960	rs4833677	C	G	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.867;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=120;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTACACAGCTCTCAAGCAAAA;SOR=0.544;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=7;WE=121720968;WS=121720950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr4	121732640	.	G	C	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=119;ReadPosRankSum=-0.147;SC=TGATTTAAATGAGACTATTAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=7;WE=121732648;WS=121732630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr4	121738049	rs343192	T	C	2281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=7.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=59;PP=1856;ReadPosRankSum=1.906;SC=AAGACTCCTTTAGACTGCTTT;SOR=0.667;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=290;TCF=111;TCR=179;TR=95;WE=121738057;WS=121738039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,95:0.32:298
chr4	121738182	rs237212	C	T	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=382;ReadPosRankSum=-0.233;SC=GTTCGTGATCCCTTTTTTCAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=0;TCR=62;TR=20;WE=121738190;WS=121738172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,20:0.33:61
chr4	121828519	rs1901135	C	T	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.181;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=410;ReadPosRankSum=-1.356;SC=TAAAACATTTCAATACTTAAA;SOR=0.086;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=59;TCF=58;TCR=1;TR=21;WE=121828527;WS=121828509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,21:0.38:55
chr4	121957559	rs34766411	G	A	4831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.243;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=93;PP=2962;ReadPosRankSum=0.442;SC=GCTTTCTGCAGGTTTTGACTG;SOR=0.860;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=244;TCF=114;TCR=130;TR=162;WE=121957567;WS=121957549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,171:0.66:260
chr4	121957734	rs1397645	T	C	6017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=92;PP=2965;SC=CCACGGTGGCTGAGGAACAGG;SOR=0.809;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=198;TCF=105;TCR=93;TR=197;WE=121957742;WS=121957724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr4	121958091	rs3733558	T	G	1737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.505;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=32;PP=1338;ReadPosRankSum=-0.465;SC=TCCCATCTTTTAGCTCGACTG;SOR=0.627;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=242;TCF=138;TCR=104;TR=72;WE=121958099;WS=121958081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,77:0.31:251
chr4	121958187	rs3822230	A	G	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.103;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=36;PP=934;ReadPosRankSum=0.658;SC=CCACAAATACATCAAAGTAGT;SOR=0.612;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=236;TCF=109;TCR=127;TR=68;WE=121958195;WS=121958177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,69:0.29:236
chr4	121958691	rs3733559	T	C	3114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.689;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=62;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.121;SC=CCAACTGATATAAACCGGATG;SOR=0.927;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=166;TCF=75;TCR=91;TR=107;WE=121958705;WS=121958681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,111:0.65:172
chr4	121958697	rs3733560	G	A	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.755;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=2263;ReadPosRankSum=0.747;SC=GATATAAACCGGATGGGGAAC;SOR=0.674;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=169;TCF=81;TCR=88;TR=61;WE=121958705;WS=121958681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,63:0.36:177
chr4	121960955	rs17353430	G	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=4.393;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=68;ReadPosRankSum=-0.084;SC=CCTTATCTCCGTCTCATACCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=121960963;WS=121960945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr4	121961031	rs3775914	A	G	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.615;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=494;ReadPosRankSum=1.523;SC=ATGTTTCACAAGCATTAAAAC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=23;WE=121961039;WS=121961021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,23:0.74:31
chr4	121961279	rs3775915	A	T	227.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=122;ReadPosRankSum=-0.126;SC=CTTACCAGAAAAATCATTTGG;SOR=1.802;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=7;WE=121961287;WS=121961269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr4	121966807	rs2276959	C	T	2716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=14;PP=2051;SC=GAGAATACCTCTTAGGTGTAT;SOR=2.652;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=65;TCR=14;TR=79;WE=121966815;WS=121966797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr4	122063735	rs3817171	G	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=59;ReadPosRankSum=0.882;SC=CCTAAGCACTGTCTATCCGTT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=5;WE=122063743;WS=122063725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr4	122078516	rs6835790	G	C	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=148;ReadPosRankSum=-0.459;SC=GTCCCCTAAGGAGAGGTTCTA;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=9;WE=122078524;WS=122078506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr4	122082481	rs11399717	A	AT	290.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.666;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.709;NF=1;NR=10;PP=259;ReadPosRankSum=-0.295;SC=GTTGCGATTTAAAAAATACCT;SOR=2.380;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=11;WE=122082489;WS=122082471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,12:0.27:45
chr4	122137662	rs7663440	T	G	1855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=21;PP=1625;SC=GAATCTAAAATAAAAAAATAT;SOR=1.430;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=61;TCF=39;TCR=22;TR=60;WE=122137670;WS=122137652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr4	122251500	rs56169343	C	T	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=2.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.957;SOR=1.623;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,22:0.27:82
chr4	122255895	rs56351803	A	G	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.71;ReadPosRankSum=1.616;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr4	122257942	rs4558890	A	C	3361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.15;SOR=2.277;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr4	122257942	.	ACATCTCAA	CCATCTCAA,CCATCTCAG	1550	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=69,21;NR=19,4;PP=1550,454;QD=18.0087637789;SC=ATATGATTATACATCTCAACT;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=69;TCR=19;TR=88,25;WE=122257958;WS=122257932;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:88
chr4	122257950	rs2302309	A	G	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=1.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.78;ReadPosRankSum=0.383;SOR=0.919;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,35:0.31:113
chr4	122258063	rs4490481	A	G	1708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.914;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=44;PP=1388;ReadPosRankSum=-1.992;SC=GACTCAGTTGAGTAAAACACA;SOR=0.570;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=28;TCR=62;TR=64;WE=122258071;WS=122258053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,64:0.69:93
chr4	122261495	rs2276956	C	A	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.559;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=84;ReadPosRankSum=-0.417;SC=AAATTATATTCCAATGCCTAC;SOR=0.061;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=7;WE=122261503;WS=122261485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr4	122261785	rs2276955	C	T	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.499;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=576;ReadPosRankSum=-1.455;SC=GGAAATAGGACAAATCATACA;SOR=1.527;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=117;TCF=36;TCR=81;TR=35;WE=122261793;WS=122261775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,36:0.29:123
chr4	122261874	rs13104309	G	A	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=29;PP=694;ReadPosRankSum=1.917;SC=CTGCCAAAAAGTTTGATAATT;SOR=0.664;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=30;WE=122261882;WS=122261864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,33:0.67:49
chr4	122301351	rs111833066	A	G	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.37;MQRankSum=4.732;QD=21.99;ReadPosRankSum=4.097;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,31:0.77:40
chr4	122301622	rs17438900	A	C	3220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-8.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.294;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=94;PP=2352;ReadPosRankSum=-1.919;SC=GCATTGCCAAAGAGCGCCAGG;SOR=0.566;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=199;TCF=61;TCR=138;TR=137;WE=122301630;WS=122301612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,137:0.68:201
chr4	122590913	rs41278075	G	A	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=1.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=-2.315;QD=4.26;ReadPosRankSum=-0.983;SOR=0.974;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,33:0.27:122
chr4	122599249	rs3756281	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=75;ReadPosRankSum=-0.346;SC=ACTATTTCACGTTATCATCAC;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=6;WE=122599257;WS=122599239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr4	122599755	rs3733649	T	C	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=265;ReadPosRankSum=-0.105;SC=ATAATTATATTTGGTTAACAT;SOR=0.249;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=14;WE=122599763;WS=122599745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr4	122681373	rs4342205	T	C	2315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=2;PP=1972;SC=AGATCCACCATCATCTTCTTC;SOR=6.302;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=69;TCF=67;TCR=2;TR=69;WE=122681381;WS=122681363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr4	122683007	rs4370153	G	A	3042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=68;PP=2507;SC=TAGTGCAACAGCCAAGATTGT;SOR=2.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=24;TCR=68;TR=92;WE=122683015;WS=122682997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr4	122723106	rs67772833	G	A	2289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=57;PP=1839;SC=ATACACATTCGGAAGGGAGAA;SOR=3.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=11;TCR=57;TR=68;WE=122723114;WS=122723096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr4	122732899	rs4295291	A	G	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=295;SC=TTTTAGTATAAGCAAGCTTTA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=122732907;WS=122732889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	122735225	rs141260260	C	CTTA	1360.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=29;PP=1494;SC=TTATGGCACACTTACTATATA;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=29;WE=122735233;WS=122735215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	122737278	rs3217780	T	C	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=314;SC=GCCTGGCTAATTTTTCTATTA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=122737286;WS=122737268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	122737487	rs71985276	C	CT	347.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=5.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=0.070;QD=14.49;ReadPosRankSum=0.133;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr4	122739121	rs3217773	A	G	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=0;PP=606;SC=TGGCAGATTCATGAATAAGGT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=27;WE=122739129;WS=122739111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	122740162	rs2071486	C	T	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=21;PP=557;SC=CCTTTGATAACGGCTCTGTAG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=122740170;WS=122740152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	122740454	rs1396080	T	G	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=532;SC=CTAGGTTCCTTTACAAAGGAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=122740462;WS=122740444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	122742217	rs769242	T	C	5087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=110;PP=2965;ReadPosRankSum=1.805;SC=TCTTCTAATATAATTGACATG;SOR=0.869;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=157;TCF=46;TCR=111;TR=156;WE=122742225;WS=122742207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,159:0.99:160
chr4	122749436	rs2706793	G	T	2641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=32;PP=2161;SC=TATTTAAAATGAAAAACAGAA;SOR=1.124;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=44;TCR=32;TR=76;WE=122749444;WS=122749426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr4	122749541	rs1507994	C	T	5430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=60;PP=2965;SC=CAGTCCACGACGACACATGTA;SOR=1.439;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=172;TCF=112;TCR=60;TR=171;WE=122749549;WS=122749531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr4	122782879	rs56159666	G	A	2429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=66;PP=2021;SC=TTACTTTATTGTGAGCATTTT;SOR=3.471;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=10;TCR=67;TR=76;WE=122782887;WS=122782869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr4	122854116	rs13121031	G	C	1484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-6.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.621;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=32;PP=1074;ReadPosRankSum=-1.239;SC=TGAACATGAAGGCCGGGCCCC;SOR=0.507;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=190;TCF=86;TCR=104;TR=68;WE=122854124;WS=122854106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,71:0.36:196
chr4	123108762	rs7670081	G	A	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=16;PP=443;SC=AAATTAAATAGTTTTGTGGAG;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=123108770;WS=123108752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	123113352	rs72687029	A	G	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.517;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=1;PP=1126;ReadPosRankSum=-0.450;SC=ATTTTAAATAACTGCCTTTAT;SOR=1.859;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=75;TCF=72;TCR=3;TR=45;WE=123113360;WS=123113342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,45:0.60:75
chr4	123130886	rs7656479	A	G	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=5.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.063;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,28:0.31:89
chr4	123140739	rs6534345	G	C	4292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=93;PP=2965;SC=GTTTACACATGAAAGTAGTCT;SOR=2.111;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=34;TCR=93;TR=127;WE=123140747;WS=123140729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr4	123145751	rs7658836	T	A	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.461;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=21;PP=955;ReadPosRankSum=0.407;SC=AAGGTCTTCCTTTGGGAAGCG;SOR=0.928;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=110;TCF=57;TCR=53;TR=48;WE=123145759;WS=123145741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,50:0.45:111
chr4	123176566	rs45500303	C	T	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=141;ReadPosRankSum=1.793;SC=AATCCCAGCACTTTGGGAGGC;SOR=0.818;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=9;WE=123176574;WS=123176556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr4	123184827	rs45515895	G	A	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=585;ReadPosRankSum=-2.365;SC=TTTTTCAGGGGATGGGTTAAA;SOR=1.501;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=23;WE=123184835;WS=123184817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr4	123185682	rs7664976	C	A	745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=21;PP=572;SC=TCTAGTGAGGCTATACCTTAC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=123185690;WS=123185672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	123187869	rs7683061	C	T	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=466;ReadPosRankSum=-0.478;SC=GCTGCATTTTCCTACATGTAA;SOR=0.240;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=68;TCF=68;TCR=0;TR=23;WE=123187877;WS=123187859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,24:0.34:71
chr4	123192383	rs45574236	T	C	1078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.549;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=783;ReadPosRankSum=-0.417;SC=AGCATGTAGATATGGCTTTGG;SOR=0.449;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=111;TCF=39;TCR=72;TR=41;WE=123192391;WS=123192373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,44:0.37:120
chr4	123222417	rs10718670	TA	T	255.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=3.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQRankSum=1.334;QD=5.33;ReadPosRankSum=-1.840;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,18:0.38:48
chr4	123229132	rs7688384	C	T	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.188;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=6;PP=672;ReadPosRankSum=0.309;SC=ATTATAAGGCCGCCTATGACA;SOR=1.469;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=106;TCF=81;TCR=25;TR=36;WE=123229140;WS=123229122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,37:0.33:112
chr4	123237811	rs75396983	G	A	1622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.013;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=13;PP=1270;ReadPosRankSum=-0.266;SC=TTGATTTAAGGTGTTAATTTT;SOR=0.324;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=85;TCF=68;TCR=17;TR=55;WE=123237819;WS=123237801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,56:0.64:87
chr4	123280860	rs1127348	T	C	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.625;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=575;ReadPosRankSum=0.455;SC=ATACATGGCATCTAGAACCTA;SOR=1.503;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=28;WE=123280868;WS=123280850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr4	123283163	rs33976078	AAT	A	964.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.908;NF=24;NR=0;PP=945;ReadPosRankSum=0.083;SC=ACTCCTTAATAATAACTGTAA;SOR=1.501;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=24;WE=123283172;WS=123283153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr4	123333671	rs2086346	A	G	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=133;ReadPosRankSum=-0.830;SC=GCTGTTAGGTACAGGTAGATT;SOR=0.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=8;WE=123333679;WS=123333661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr4	123342616	rs1383043	G	A	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=-0.995;SC=TTTTAAAATGGTTATCCTTAG;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=6;WE=123342624;WS=123342606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr4	123377482	rs2069763	C	A	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.112;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=676;ReadPosRankSum=0.113;SC=GTAAATCCAGCAGTAAATGCT;SOR=0.272;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=29;WE=123377490;WS=123377472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr4	123536963	rs4833837	G	A	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=-0.792;SC=CCTTCTGAAAGCAGGAAAAAG;SOR=0.818;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=7;WE=123536971;WS=123536953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr4	123664204	rs309370	G	A	2142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=32;PP=1592;ReadPosRankSum=-0.850;SC=GATAGCATGCGGCTTCAAGAA;SOR=0.689;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=248;TCF=157;TCR=91;TR=88;WE=123664212;WS=123664194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,92:0.36:257
chr4	123664445	rs2292493	C	T	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.367;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=21;PP=713;ReadPosRankSum=0.095;SC=ATTGTGTGGGCGACGGGGTCT;SOR=0.840;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=84;TCR=74;TR=44;WE=123664453;WS=123664435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,46:0.28:167
chr4	123838758	rs12648093	A	G	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=747;ReadPosRankSum=1.096;SC=TGGTGAAAGCAGAAGCCCAGG;SOR=0.582;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=34;TCR=24;TR=39;WE=123838766;WS=123838748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,42:0.69:61
chr4	123843716	rs13134412	T	C	1938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=60;PP=1411;SC=CCCAGCTCAGTGGCTGCCGCA;SOR=6.091;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=62;TCF=2;TCR=60;TR=62;WE=123843724;WS=123843706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr4	123843741	rs77088263	A	G	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=147;ReadPosRankSum=0.767;SC=CACGCCGCTTAATTCGTCCGT;SOR=0.144;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=11;WE=123843749;WS=123843731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,12:0.27:44
chr4	123854495	rs1563706	T	C	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=399;SC=ATTCTTTTGATTAAGTCTATA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=123854503;WS=123854485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	123859489	.	G	A	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=289;ReadPosRankSum=-0.500;SC=ATGTGTCAGAGTCTTTGGATA;SOR=0.297;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=19;WE=123859497;WS=123859479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr4	123868279	rs11098682	G	T	280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=230;SC=GGACTTAGTAGCCTGGACAGT;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=123868287;WS=123868271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	123949267	rs7665828	T	C	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=1.556;SC=CTGTTAATGATATGTTTTTTA;SOR=0.250;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=7;WE=123949275;WS=123949257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr4	123949556	rs1472949	G	A	1983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=54;PP=1626;SC=TAAAGGTAGGGTGTTAAATTT;SOR=3.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=7;TCR=54;TR=61;WE=123949564;WS=123949546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr4	124323738	rs300574	T	C	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=36;PP=1087;SC=TCCTGAACTTTTAGCTTTCAA;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=37;WE=124323746;WS=124323728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	125631199	rs6820002	T	C	1986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=25;PP=1556;ReadPosRankSum=-1.828;SC=CCCCAGGCTGTAAGAGGCTTT;SOR=0.730;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=103;TCF=64;TCR=39;TR=69;WE=125631207;WS=125631189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,71:0.67:106
chr4	126237971	rs72928772	C	T	3529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.370;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=55;PP=2900;ReadPosRankSum=-0.230;SC=CCCCCGTTTTCCCGGACCCCT;SOR=0.856;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=194;TCF=102;TCR=92;TR=123;WE=126237979;WS=126237961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,126:0.64:198
chr4	126238924	rs6847454	A	T	10093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=186;PP=2965;SC=GCAGCAGTCCAGGCGCGCTCT;SOR=1.212;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=303;TCF=116;TCR=187;TR=302;WE=126238932;WS=126238914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,315:1.00:315
chr4	126239986	rs1039808	C	T	6212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=99;PP=2965;SC=GAGAACGTGGCGCTGGGATAT;SOR=0.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=89;TCR=99;TR=188;WE=126239994;WS=126239976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr4	126240510	rs2940779	T	C	6475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=113;PP=2965;SC=TAGTGTCATCTTAACAGTTTA;SOR=1.191;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=74;TCR=113;TR=187;WE=126240518;WS=126240500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr4	126241871	rs2710555	C	T	7898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=143;PP=2965;SC=ACATTCCCATCGGTACATCTG;SOR=1.358;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=226;TCF=83;TCR=143;TR=226;WE=126241879;WS=126241861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr4	126315034	rs925243	T	C	1361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=8;PP=1102;SC=ACCAGAGTTTTACTGCTCAGG;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=41;WE=126315042;WS=126315024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	126315282	rs925242	A	G	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=196;SC=TGCAGAAAACATGGAAGTGCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=126315290;WS=126315272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	126329789	rs958415	T	C	2586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=53;PP=2055;SC=GAGCAGAAGATGGTGGGGGAC;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=31;TCR=53;TR=84;WE=126329797;WS=126329779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr4	126335978	rs4605670	G	C	1458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=1;PP=1136;SC=AAAAGTTTTGGTATAGCTTGT;SOR=5.330;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=40;WE=126335986;WS=126335968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	126336990	rs10010000	G	T	2820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=79;PP=2343;SC=AGCAAGTATTGTCTTAATTAT;SOR=8.838;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=79;TCF=0;TCR=79;TR=79;WE=126336998;WS=126336980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr4	126337555	rs7675556	A	G	2956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=0;PP=2428;SC=TTATTTCATGAGATGCATTGT;SOR=8.909;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=80;TCF=80;TCR=0;TR=80;WE=126337563;WS=126337545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr4	126355609	rs7656135	T	G	3230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=84;PP=2605;SC=GTAAAGTTTGTCTGTTTTCTC;SOR=5.443;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=5;TCR=85;TR=89;WE=126355617;WS=126355599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr4	126369554	rs115240175	C	T	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=493;ReadPosRankSum=-0.521;SC=ATGCACTTATCTGCTACCAAA;SOR=2.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=20;WE=126369562;WS=126369544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,21:0.78:27
chr4	126369872	rs988863	G	C	10066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=177;NR=121;PP=2965;SC=TCCCTAAAGTGAGAGCCAAAG;SOR=1.142;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=298;TCF=177;TCR=121;TR=298;WE=126369880;WS=126369862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
chr4	126373789	rs12650153	G	A	4502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=62;PP=2965;SC=CCTTGCCACAGTGGTGGAACC;SOR=0.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=73;TCR=62;TR=135;WE=126373797;WS=126373779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr4	126384905	rs10010645	A	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=109;ReadPosRankSum=-0.754;SC=ATGAGTATGAAAGACCAAAAA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=126384913;WS=126384895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr4	126389627	rs6814158	A	G	2444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=17;PP=1915;SC=TAAAATTTTCATGAAATTTTA;SOR=2.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=72;TCR=17;TR=89;WE=126389635;WS=126389617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr4	126400825	rs1506361	G	T	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.601;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=588;ReadPosRankSum=2.300;SC=TAATAAAAGTGTATATTGAGT;SOR=2.002;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=26;WE=126400833;WS=126400815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr4	126402618	.	C	T	120	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=29;MQ=59.21;NF=9;NR=0;PP=120;QD=17.1968013941;SC=CTATAGAAAACACTCCAAGAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=9;WE=126402626;WS=126402617;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr4	126402921	rs11098815	T	G	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=23.678;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=54;PP=1276;ReadPosRankSum=1.244;SC=GGTGACTTCATTTGATTAGAC;SOR=4.368;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=82;TCF=7;TCR=75;TR=55;WE=126402929;WS=126402911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,58:0.67:86
chr4	126408586	rs17009825	C	T	3297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.170;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=59;PP=2524;ReadPosRankSum=2.041;SC=ATGTTGCAGACGGCCACTGGC;SOR=0.813;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=192;TCF=100;TCR=92;TR=124;WE=126408594;WS=126408576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,127:0.65:195
chr4	126411576	rs75469760	G	A	2897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.711;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=45;PP=2317;ReadPosRankSum=-1.265;SC=GGGGGAAGAAGGCCAAAAATC;SOR=0.578;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=74;TCR=62;TR=97;WE=126411584;WS=126411566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,100:0.72:138
chr4	126411594	rs62312781	G	A	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.354;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=851;ReadPosRankSum=-1.439;SC=ATCCCAAAGAGGAGAAGAAAC;SOR=0.569;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=150;TCF=80;TCR=70;TR=51;WE=126411602;WS=126411584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,50:0.33:153
chr4	126412154	rs72675395	G	A	2505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.254;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=54;PP=2029;ReadPosRankSum=0.225;SC=CTTCCTATAAGGGATGGTAAT;SOR=0.515;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=137;TCF=46;TCR=91;TR=85;WE=126412162;WS=126412144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,88:0.61:145
chr4	126412575	rs1014866	A	G	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.914;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=1353;ReadPosRankSum=-1.070;SC=ATACTTCCAGAATGCCCAAAT;SOR=1.426;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=89;TCF=54;TCR=35;TR=57;WE=126412583;WS=126412565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,58:0.64:90
chr4	128544514	rs12650360	C	G	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=5;PP=596;SC=GGGCTGGGACCTGGGTGACCT;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=128544522;WS=128544504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	128544696	rs4834207	A	G	2854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=58;PP=2196;SC=CTTGCCCCGGAAATGTTGGCG;SOR=1.440;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=32;TCR=58;TR=90;WE=128544704;WS=128544686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr4	128554404	rs2255457	G	A	1795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=43;PP=1469;SC=TGGGCTGGGGGAACTGCAAGG;SOR=2.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=11;TCR=43;TR=54;WE=128554412;WS=128554394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr4	128565000	rs3749507	A	G	8583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=157;NR=103;PP=2965;SC=TCCAACAGCGATACAAAGATG;SOR=1.174;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=262;TCF=159;TCR=103;TR=260;WE=128565008;WS=128564990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr4	128584580	rs4833380	G	A	1374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=11;PP=1100;SC=AAAGGGAGACGTCCCATCCAA;SOR=2.252;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=45;WE=128584588;WS=128584570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	128621272	rs12331481	A	C	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=32;PP=1048;SC=ATTTTGTATAACAGTCATTAT;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=41;WE=128621280;WS=128621262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	128627050	rs7683627	C	T	1327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=37;PP=1100;SC=AGGGATGCAGCGGTAGGTAGG;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=37;WE=128627058;WS=128627040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	128635022	rs34240473	C	T	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=0;PP=661;SC=ATTCAGATTACTCTGTGAAAA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=128635030;WS=128635012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	128665981	rs769293	T	C	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=19;PP=568;SC=TTTACTTTTTTCTTCCAATAT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=128665989;WS=128665971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	128689936	rs2305958	A	G	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=14;PP=883;SC=AGAAAACTCCATTTCTTGTCT;SOR=1.402;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=42;TCF=27;TCR=15;TR=41;WE=128689944;WS=128689926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	128723042	rs1380154	T	C	1625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=37;PP=1288;SC=TATCAGGTCTTGGTTTGTGCT;SOR=1.278;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=59;WE=128723050;WS=128723032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	128803159	rs3811741	G	A	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=684;SC=GAAACTCCTTGTCTACTAGCC;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=128803167;WS=128803149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	128807219	rs3811740	T	A	6202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=82;PP=2965;SC=TGAAATGCCATCTTTTTTGTC;SOR=0.947;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=188;TCF=106;TCR=82;TR=188;WE=128807227;WS=128807209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr4	128812230	.	GT	G	59.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=1.887;QD=1.53;ReadPosRankSum=-0.150;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,9:0.23:39
chr4	128814964	rs17012739	G	T	6124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=114;NR=81;PP=2965;SC=CAACGAGAGAGAGAGCATCTT;SOR=1.106;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=195;TCF=114;TCR=81;TR=195;WE=128814972;WS=128814954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr4	128923001	rs35200534	GT	G	392.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.10;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	128930847	rs74956857	G	C	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=74;ReadPosRankSum=0.524;SC=AGGCTGCTTTGAAATGGGCAC;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=128930855;WS=128930837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr4	128995989	rs6534661	A	G	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=445;SC=CTGAATATAAATGATTATTTA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=128995997;WS=128995979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	128996230	rs78710408	A	G	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=26;PP=691;ReadPosRankSum=0.640;SC=TTTACTTAAAATGTAAAGAAT;SOR=1.321;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=30;WE=128996238;WS=128996220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,32:0.82:39
chr4	128996298	rs12642346	C	T	270.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=190;SC=TGCTCTGTCTCCAGGCTGGAG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=128996306;WS=128996288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	129012181	rs2306054	G	A	2075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=25;PP=1640;SC=GAGAAAAAAGGGATGATCAAG;SOR=1.214;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=37;TCR=25;TR=62;WE=129012189;WS=129012171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr4	129012638	rs1064205	A	G	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=18;PP=753;SC=TGGAAGAAGCATTGCTTAAAG;SOR=0.880;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=14;TCR=18;TR=32;WE=129012646;WS=129012628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	129028679	rs11098950	T	C	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=350;SC=AGCTGTCTTATGTTTCTTGTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=129028687;WS=129028669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	129029009	rs34678812	G	GA	2838.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.258;NF=68;NR=15;PP=2776;ReadPosRankSum=-1.185;SC=TCCCTCTTGGGAAAAAATGTG;SOR=1.919;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=92;TCF=77;TCR=15;TR=83;WE=129029017;WS=129028999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,97:0.99:98
chr4	129043204	rs12508837	C	G	1332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=10;PP=1088;SC=AAAAAACATCCTGGAGGAGAT;SOR=2.560;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=47;WE=129043212;WS=129043194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	129043286	rs3733320	C	T	2884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=40;PP=2290;SC=ATGGCTTATACTATTATGAAC;SOR=0.982;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=49;TCR=40;TR=89;WE=129043294;WS=129043276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr4	129043601	rs3832282	T	TG	4338.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.97;QD=49.30;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr4	129043614	rs3733321	G	T	4908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.08;QD=45.03;SOR=3.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr4	129043617	rs3733322	T	G	4977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.06;QD=44.84;SOR=3.777;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr4	129043809	rs12509092	G	A	2356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=67;PP=1947;SC=AGTCTATGGTGCATGATCTAA;SOR=7.168;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=68;TCF=1;TCR=67;TR=68;WE=129043817;WS=129043799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr4	129099645	rs116056522	A	G	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.73;ReadPosRankSum=0.564;SOR=0.647;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,45:0.27:168
chr4	129100643	rs12645577	G	A	5958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=118;PP=2965;SC=TCCAGAGACCGTGGGCCAGGA;SOR=1.525;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=60;TCR=118;TR=178;WE=129100651;WS=129100633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr4	129776983	rs76983300	C	CT	356.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=292;ReadPosRankSum=1.222;SC=GTTGTTTTTACTTTTTTTTAA;SOR=1.931;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=14;WE=129776991;WS=129776973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr4	129805716	rs167618	G	A	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.133;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=36;ReadPosRankSum=0.360;SC=ATAAACAATCGGTAAGTAGTT;SOR=0.245;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=5;WE=129805724;WS=129805706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
chr4	129867280	rs10028124	T	A	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=1.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.35;ReadPosRankSum=-0.690;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,49:0.28:173
chr4	129869515	.	G	A	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.223;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.82;MQRankSum=-3.526;QD=8.38;ReadPosRankSum=2.600;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr4	129869520	rs201740923	G	A	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=2.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.80;MQRankSum=-3.986;QD=6.44;ReadPosRankSum=1.163;SOR=2.110;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr4	129869525	rs369194198	G	A	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=2.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.99;MQRankSum=-4.092;QD=6.16;ReadPosRankSum=-3.148;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr4	129873433	rs10857134	A	G	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=8.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=2;PP=860;ReadPosRankSum=-0.143;SC=TTATTCTCCTATAAGCAAGGT;SOR=0.423;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=142;TCR=6;TR=43;WE=129873441;WS=129873423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,45:0.30:149
chr4	129913243	rs35350849	G	T	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=70;ReadPosRankSum=-1.042;SC=AAACACCCATGGGGAAAATTA;SOR=0.446;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=26;TCF=15;TCR=11;TR=7;WE=129913251;WS=129913233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr4	129913345	rs13151322	G	A	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.162;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=60;ReadPosRankSum=1.215;SC=GGAGTTGTTCGATTATCACAC;SOR=0.799;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=5;WE=129913353;WS=129913335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr4	129920969	rs13118479	A	T	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.320;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=366;ReadPosRankSum=-1.792;SC=AAGTTTGATAACTCATTAAAT;SOR=0.456;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=66;TCF=11;TCR=55;TR=21;WE=129920977;WS=129920959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,22:0.32:68
chr4	129924977	rs3113487	C	A	2416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.960;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=40;PP=1803;ReadPosRankSum=1.125;SC=CCTCTGTGCCCAGGGGAAAGG;SOR=0.780;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=140;TCF=72;TCR=68;TR=89;WE=129924985;WS=129924967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,93:0.61:152
chr4	129961179	rs3113489	A	G	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=2;PP=740;SC=GTGCTTCCTAAGCTAAAGGAG;SOR=4.332;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=26;WE=129961187;WS=129961169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	129965026	rs1450727	T	C	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=35;ReadPosRankSum=-0.792;SC=TCTTGTCAATTCAAGAACAAA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=129965034;WS=129965016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr4	130003252	rs11737495	G	T	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=0.431;SC=TCCCATTTTAGAACTCAGACA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=130003260;WS=130003248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr4	130023759	rs1757935	A	T	2930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=15;PP=2384;SC=TCTTTTAGAGACTTCAGATGG;SOR=3.093;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=77;TCR=15;TR=91;WE=130023767;WS=130023749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr4	130030644	rs2271570	C	T	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.14;ReadPosRankSum=0.446;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,31:0.28:110
chr4	130030652	rs337277	A	G	3905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=67;PP=1346;SC=ATCGTTCAGAATGTCCAGAGG;SOR=1.350;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=38;TCR=67;TR=104;WE=130030660;WS=130030634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr4	130032843	rs17351999	A	G	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-4.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=453;ReadPosRankSum=-1.990;SC=GCTTTTAGCCATTGCCTAGAA;SOR=0.634;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=127;TCF=81;TCR=46;TR=40;WE=130032851;WS=130032833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,43:0.31:140
chr4	133357204	rs17494286	A	C	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=19;PP=457;SC=CTGCAACTTAAGTGATCCTCA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=133357212;WS=133357194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	133367588	rs1827132	T	C	1422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=22;PP=958;SC=AGTCCTGAATTGCAGGTGCCA;SOR=0.818;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=23;TCR=22;TR=45;WE=133367596;WS=133367578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	133368361	rs70948202	T	TC	840.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=1;NR=20;PP=837;SC=TGGGTAAGGCTTGAGACTTGC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=133368369;WS=133368351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	134074058	rs3749589	A	G	1203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=34;PP=1086;SC=TTGTGGGAGCAGAGATGGGCG;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=134074066;WS=134074048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	134076285	rs2271172	C	G	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=713;ReadPosRankSum=-1.923;SC=AGGTCTAATGCTGGTAACTCT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=28;WE=134076293;WS=134076275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,27:0.79:34
chr4	134085208	rs4461537	C	T	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.611;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=800;ReadPosRankSum=-1.561;SC=ATTGTAGTGACAACAATAGGT;SOR=0.312;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=64;TCF=25;TCR=39;TR=38;WE=134085216;WS=134085198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,40:0.62:65
chr4	138449510	rs58884168	T	A	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=132;ReadPosRankSum=-2.450;SC=CTATAAAACATATTATAAATA;SOR=0.351;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=10;WE=138449518;WS=138449508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,11:0.23:48
chr4	138449683	rs10018837	A	G	2100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.018;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=42;PP=1607;ReadPosRankSum=-0.312;SC=CCTTCACCCAACAGCCTATCT;SOR=0.839;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=309;TCF=168;TCR=141;TR=96;WE=138449691;WS=138449673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:228,98:0.30:326
chr4	138449812	rs10006580	C	G	1796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.390;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=39;PP=1382;ReadPosRankSum=1.874;SC=AGATAAATCACAAAAAAAAAT;SOR=0.364;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=209;TCF=81;TCR=128;TR=71;WE=138449820;WS=138449802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,73:0.34:212
chr4	138453453	rs28566714	G	A	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.417;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=37;PP=735;ReadPosRankSum=0.500;SC=TCCAGTCCTTGCGTTTGTTTG;SOR=2.414;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=99;TCF=9;TCR=90;TR=38;WE=138453461;WS=138453443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,37:0.36:103
chr4	139093228	rs4504306	T	C	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=489;SC=GCATTAAAAATAGCAAAATAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=139093236;WS=139093218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	139100372	rs4479754	C	T	794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=1;PP=615;SC=AATTCTTACCCGACATTATTC;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=139100380;WS=139100362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	139103366	rs10016559	A	G	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=649;SC=AGAAAGTAAAATACTATCTAA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=22;WE=139103374;WS=139103356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	139103609	rs111943478	C	CA	1228.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.107;NF=3;NR=31;PP=1119;ReadPosRankSum=0.183;SC=AGGGAAAATCCAAAAATCCCA;SOR=0.693;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=68;TCF=12;TCR=56;TR=34;WE=139103617;WS=139103599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,48:0.63:76
chr4	139140388	rs10025342	G	A	6808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=137;NR=69;PP=2965;SC=AATGAACTACGCAAACCACCA;SOR=1.432;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=138;TCR=69;TR=206;WE=139140396;WS=139140378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr4	139140494	rs6838248	G	C	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-7.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.425;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=39;PP=622;ReadPosRankSum=-0.068;SC=TTCCTGAAAAGGCGTCTTTAA;SOR=0.420;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=176;TCF=42;TCR=134;TR=53;WE=139140502;WS=139140484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,58:0.32:182
chr4	139153317	rs6823642	T	A	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=119;ReadPosRankSum=-0.024;SC=AAAAAGAACATGATGTGAGAG;SOR=0.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=8;WE=139153325;WS=139153311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr4	139937071	rs3749515	C	T	92.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=1;PP=55;SC=GACTCGGTGCCCTCGGCCCCA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=139937079;WS=139937061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	139965724	rs3805213	C	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=0.561;SC=TGAGTGATGCCAAACCTCCTG;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=5;WE=139965732;WS=139965714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr4	140005294	rs4863628	A	G	8622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.99;NF=142;NR=125;PP=2965;SC=TACCGGCCCGAATGAGCAGAT;SOR=0.832;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=268;TCF=142;TCR=126;TR=267;WE=140005302;WS=140005284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr4	140039107	rs60424237	C	CA	1067.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.450;NF=27;NR=8;PP=642;ReadPosRankSum=-1.703;SC=GATTCCACCTCAAAAAAAAAA;SOR=1.057;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=71;TCF=46;TCR=25;TR=35;WE=140039115;WS=140039096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,44:0.88:50
chr4	140039162	rs34114214	CAACT	C	774.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.729;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.871;NF=21;NR=11;PP=798;ReadPosRankSum=0.997;SC=TGATGGATACCAACTGTGATT;SOR=1.349;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=104;TCF=51;TCR=53;TR=32;WE=140039173;WS=140039152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,26:0.22:119
chr4	140216412	rs6816703	C	T	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=21;ReadPosRankSum=-1.180;SC=TCCCCCATCTCCCACTTAAAC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=3;WE=140216420;WS=140216402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr4	140217010	rs71606834	G	C	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.676;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=653;ReadPosRankSum=-1.296;SC=CCACCTGGCGGCCGGAAGTGC;SOR=0.778;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=139;TCF=60;TCR=79;TR=43;WE=140217018;WS=140217000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,43:0.30:145
chr4	140263849	rs11944434	G	A	283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=3;PP=235;SC=TGATCCACCCGCCTTAGCCTC;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=140263857;WS=140263839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr4	140270875	rs2044810	G	A	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.91;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	140270875	.	GTGCCTGTA	ATGCCTGTA,ATGCCTGTC	111	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=6;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=2,0;NR=11,2;PP=111,11;QD=11.2131701959;SC=GCAGTGGCTCGTGCCTGTAAT;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13,2;WE=140270891;WS=140270865;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:13
chr4	140308984	rs998310	C	A	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=323;ReadPosRankSum=-0.096;SC=TAATAAATTCCCAGTAAGAAC;SOR=0.142;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=17;WE=140308992;WS=140308974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr4	140375296	rs13128486	C	G	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=109;ReadPosRankSum=0.022;SC=GGCGTAATCTCTCAGCCTTTC;SOR=0.563;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=8;WE=140375304;WS=140375286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,8:0.24:34
chr4	140417471	rs4863655	G	T	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=4;PP=1236;SC=GCCATTATCAGTAGGCAGAGT;SOR=4.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=47;WE=140417479;WS=140417461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	140417671	rs4863656	G	C	2728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=56;PP=2152;SC=TGATTCTTCTGGCCACTGAAA;SOR=1.389;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=32;TCR=56;TR=88;WE=140417679;WS=140417661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr4	140625323	rs925424	A	G	3675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=69;PP=2750;SC=TCCCTTTAATACTTGCAGAAG;SOR=1.278;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=44;TCR=69;TR=113;WE=140625331;WS=140625313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr4	140640703	rs61747885	G	T	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=33;PP=860;ReadPosRankSum=1.194;SC=CTGTGCTGGGGGCTGGCTGAA;SOR=0.635;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=166;TCF=57;TCR=109;TR=52;WE=140640711;WS=140640693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,51:0.31:165
chr4	140651584	rs5862430	TCTG	T	4810.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=35;PP=2993;SC=TCCGCCAAAATCTGCTGCTGC;SOR=1.253;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=106;TCF=62;TCR=44;TR=80;WE=140651594;WS=140651574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr4	140809656	rs6839194	C	A	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=6.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.06;ReadPosRankSum=-0.928;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,16:0.20:80
chr4	140809710	rs3775241	C	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.77;ReadPosRankSum=-0.350;SOR=1.026;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,17:0.19:91
chr4	140810334	rs3733381	T	C	6360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=129;NR=60;PP=2965;SC=CCTTTTCCATTTCTTAGGAGA;SOR=1.748;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=190;TCF=130;TCR=60;TR=189;WE=140810342;WS=140810324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr4	140810637	rs11100342	C	T	1827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.680;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=37;PP=1557;ReadPosRankSum=-0.839;SC=GTGGAGGTGGCGGCTGCTGCT;SOR=0.755;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=63;TCF=26;TCR=37;TR=62;WE=140810645;WS=140810627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr4	140810700	rs11729794	C	T	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.400;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=334;ReadPosRankSum=-0.050;SC=GCTGGATATACGGCATCAAGG;SOR=0.352;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=22;WE=140810708;WS=140810690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,22:0.36:61
chr4	140811083	rs373804063	GC	G	3581.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.91;QD=40.24;SOR=2.276;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr4	140811085	rs58287721	TGCTGCTGCTGC	T	3653.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.85;QD=40.15;SOR=2.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr4	140811096	.	C	T	1775	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=60.97;NF=16;NR=31;PP=1775;QD=38.5057704797;SC=GCTGCTGCTGCTGCTGCTGCT;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=67;TCF=20;TCR=47;TR=47;WE=140811104;WS=140811053;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:20,47:0.70:67
chr4	140811135	rs3733382	T	C	2409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=33;PP=1290;SC=GCTGTTGCTGTTTCTGCTGCA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=52;WE=140811143;WS=140811125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	141290574	rs2668577	C	T	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=22;PP=886;SC=GGAACATGTTCTGCAAATTAA;SOR=1.501;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=35;WE=141290582;WS=141290564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	141311960	rs358329	T	C	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=29;PP=723;SC=ATACAATAAATGGGATTTATT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=141311968;WS=141311950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	141321425	rs2252427	A	G	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=332;SC=TGGGGTACACATTTGTTTTCT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=141321433;WS=141321415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	141372485	rs6536966	T	C	113.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=87;SC=GTGTCTTATGTCACCACTTCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=141372493;WS=141372475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	141383034	rs10644682	T	TAC,TACAC	693.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=21;NF=10,10;NR=0,0;PP=136,307;SC=AATTGGTGTATACACACACAC;SOR=3.500;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=10,10;WE=141383042;WS=141383024;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.39,0.61:18
chr4	141458485	rs882930	T	G	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=0;PP=742;SC=GCTTTCTAAATAGACATATGA;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=141458493;WS=141458475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	141543997	rs1560440	G	A	3440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=65;PP=2953;SC=CTGCCGTGGCGTGGTACAGCT;SOR=1.253;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=42;TCR=65;TR=107;WE=141544005;WS=141543987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr4	141549393	rs2291711	C	A	7151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=156;NR=66;PP=2965;SC=ACACCTAAAACAGAGACTTCA;SOR=1.917;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=222;TCF=156;TCR=66;TR=222;WE=141549401;WS=141549383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr4	141554949	rs10002459	G	A	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=256;SC=TAGAGGCAACGATTTATCCAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=141554957;WS=141554939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	141555062	rs6851737	G	T	3376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=79;NR=24;PP=2514;SC=CACAACTCCAGCATCCCATCC;SOR=2.390;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=79;TCR=24;TR=103;WE=141555070;WS=141555052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr4	141580561	rs3886094	C	T	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=320;ReadPosRankSum=0.303;SC=TTAAACTCCACGGGGCTCCTT;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=14;WE=141580569;WS=141580557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr4	141583176	rs28465061	C	T	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.764;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=366;ReadPosRankSum=1.620;SC=TCTCAATCTCCTCCGTGGCGA;SOR=0.712;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=54;TCF=28;TCR=26;TR=20;WE=141583184;WS=141583166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr4	141590043	rs111636015	G	A	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=562;ReadPosRankSum=1.579;SC=AGACTTTGACGCCAGCATTCC;SOR=0.651;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=23;WE=141590051;WS=141590033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,23:0.68:34
chr4	141592206	rs4956473	A	G	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=76;ReadPosRankSum=-0.349;SC=ATTTTATTGAAGCAAAACTGA;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=5;WE=141592214;WS=141592196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr4	141600320	rs4956329	A	G	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=158;ReadPosRankSum=1.051;SC=CATTCTTCTCAAGCTGAGTGA;SOR=0.602;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=46;TCF=5;TCR=41;TR=11;WE=141600328;WS=141600310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,12:0.25:48
chr4	141677006	rs70943501	A	AG	923.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=1;PP=1080;SC=CCTGCAGCCCAGGCCGCGGGC;SOR=5.211;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=24;WE=141677014;WS=141676996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	141847077	rs13138724	G	A	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.912;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=465;ReadPosRankSum=1.614;SC=TCCCTGCTTTGAGGGCAACGC;SOR=0.944;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=99;TCF=67;TCR=32;TR=29;WE=141847085;WS=141847067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,30:0.29:104
chr4	141847110	rs13120735	T	C	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.855;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=10;PP=672;ReadPosRankSum=-0.783;SC=ATTATAATGCTGTAGGCTGTG;SOR=1.873;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=141;TCF=89;TCR=52;TR=43;WE=141847118;WS=141847100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,44:0.30:148
chr4	141847279	rs12503723	G	A	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.711;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=347;ReadPosRankSum=-0.866;SC=GAGAATACCTGGTCCACCATG;SOR=0.193;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=53;TCF=2;TCR=51;TR=18;WE=141847287;WS=141847269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,18:0.32:57
chr4	141868736	rs2321687	G	T	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.6748;FS=5.563;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=316;ReadPosRankSum=0.646;SC=CCAGCAGGTCGGGGCCAGGGA;SOR=3.477;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=13;WE=141868744;WS=141868726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr4	141869062	rs6857782	C	T	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=34;PP=866;ReadPosRankSum=-0.749;SC=CTTCCAACCTCTACTTCTTGT;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=0;TCR=55;TR=34;WE=141869070;WS=141869052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,38:0.66:58
chr4	141870648	rs4956494	G	A	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=596;ReadPosRankSum=-1.450;SC=ATGAATGCTAGCAATGACGAC;SOR=2.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=25;WE=141870656;WS=141870638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,27:0.77:35
chr4	141924720	.	T	TACACACACAC	468.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=0;PP=802;SC=CCCTAGCACGTACACACACAC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=4;WE=141924728;WS=141924710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	141924817	rs73860215	A	G	1688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=25;PP=1360;SC=AGGGGAGGAAAGTCATAGATG;SOR=1.009;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=32;TCR=25;TR=57;WE=141924825;WS=141924807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr4	141927425	.	TACATACATATATACGTATATATATAC	T	515.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=11;PP=2889;SC=CGTATATATATACATACATAT;SOR=5.421;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=38;WE=141927458;WS=141927415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	141940050	rs79415587	A	G	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.565;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=5;PP=683;ReadPosRankSum=0.783;SC=AGGAGGGAAGATCAGTAAATT;SOR=1.119;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=31;WE=141940058;WS=141940040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,32:0.68:47
chr4	141940074	rs4245936	T	C	1949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=16;PP=1224;SC=TGAAATATTATACAGGTTTTT;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=49;WE=141940082;WS=141940064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	141940187	.	AATATATATATATATATATAT	A,AAT	352.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.09;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=1065;SC=ACTGCAAAGAAATATATATAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=4;WE=141940212;WS=141940177;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:9
chr4	141940234	rs4245937	A	G	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9992;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=103;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=164;SC=ATATATATATATGGAACTTTA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=141940242;WS=141940224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	141983449	rs62327665	T	C	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=0;PP=23;SC=GTCTGTATTATACATGATATA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=141983457;WS=141983439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	142000004	rs34299443	T	C	171.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=196;SC=CACACACACATACATACATAC;SOR=1.981;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=142000012;WS=141999994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	142150860	rs7684664	T	G	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.652;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=750;ReadPosRankSum=1.500;SC=TGGTGAGTCATTAGACACAAG;SOR=0.358;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=159;TCF=45;TCR=114;TR=48;WE=142150868;WS=142150850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,51:0.30:172
chr4	142150894	rs62327566	T	G	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.306;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=473;ReadPosRankSum=-0.712;SC=TATAGGTGAATGTTGACTTTG;SOR=0.206;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=125;TCF=26;TCR=99;TR=35;WE=142150902;WS=142150884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,37:0.28:132
chr4	142151262	rs3756106	T	C	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=43;ReadPosRankSum=2.193;SC=ATTATAGATATGAGTTTTTTT;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=142151270;WS=142151252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr4	142640462	rs1493013	CC	TT	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=1061;ReadPosRankSum=0.679;SC=TTAATTCCCTCCCTTTCTTTT;SOR=0.597;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=54;TCF=48;TCR=6;TR=21;WE=142640471;WS=142640452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,22:0.40:55
chr4	142640538	rs2254514	T	C	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.662;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=541;ReadPosRankSum=-0.652;SC=TAGGAGGCATTGTGGATGGAT;SOR=0.363;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=126;TCF=77;TCR=49;TR=41;WE=142640546;WS=142640528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,43:0.33:131
chr4	142640637	rs2857261	A	G	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.292;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=491;ReadPosRankSum=-1.186;SC=TCGGTAAGAAAAAAAATAGAT;SOR=0.052;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=65;TCF=6;TCR=59;TR=25;WE=142640645;WS=142640627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,26:0.39:66
chr4	142641650	.	A	C	1713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.946;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=17;PP=1162;ReadPosRankSum=0.811;SC=ATTTCCATCCAGTGCTACTTG;SOR=0.546;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=67;TCR=24;TR=63;WE=142641658;WS=142641640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,67:0.70:96
chr4	142651159	rs12510030	T	C	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=30;PP=1259;ReadPosRankSum=0.795;SC=AACAGTTGCTTAGAGTTGCAT;SOR=0.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=212;TCF=118;TCR=94;TR=68;WE=142651167;WS=142651149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,67:0.32:209
chr4	142651265	rs17007610	T	C	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.458;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=26;PP=418;ReadPosRankSum=-0.820;SC=AGTGGAGTGGTGTGCAAAAGT;SOR=0.337;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=89;TCF=9;TCR=80;TR=30;WE=142651273;WS=142651255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,32:0.35:91
chr4	143003155	rs11446749	G	GA	1741.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=12;PP=1685;SC=GACCTTAAAAGAAAAAAACTT;SOR=2.722;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=63;TCF=51;TCR=12;TR=56;WE=143003163;WS=143003145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr4	143007169	rs2292392	C	A	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=221;ReadPosRankSum=1.152;SC=AATGCCTAATCCATGGACTAA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=47;TCR=1;TR=14;WE=143007177;WS=143007159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,14:0.29:49
chr4	143007197	rs336325	C	T	2627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=10;PP=2159;SC=TGACACCTGGCAACCCAAAGT;SOR=3.808;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=71;TCR=10;TR=80;WE=143007205;WS=143007187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr4	143007419	rs336324	A	G	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=582;ReadPosRankSum=-2.082;SC=TCTGAAGGGGAAAAAACAAAG;SOR=1.364;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=25;WE=143007427;WS=143007409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr4	143007460	rs336323	T	G	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=439;ReadPosRankSum=-0.412;SC=GTGTTCACATTAAGCTGCCCA;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=19;WE=143007468;WS=143007450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr4	143033641	rs3822140	T	C	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=73;ReadPosRankSum=-0.483;SC=TCTCATCATATGCTTAAAAGG;SOR=0.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=7;WE=143033649;WS=143033631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr4	143043340	rs2270658	A	G	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.785;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=450;ReadPosRankSum=-1.087;SC=TTTTAAATGCAACTTTCTTTA;SOR=1.011;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=117;TCF=77;TCR=40;TR=32;WE=143043348;WS=143043330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,34:0.29:119
chr4	143044427	rs2270657	T	C	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=516;ReadPosRankSum=-2.077;SC=TTTTAACTTGTACTAAAGCAA;SOR=0.646;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=90;TCF=69;TCR=21;TR=33;WE=143044435;WS=143044417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,36:0.37:97
chr4	143044666	rs2645786	A	C	366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=365;SC=AGATTCGATTATCAGGTATGT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=143044674;WS=143044656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	143130034	rs1907123	A	T	2307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=24;PP=1830;ReadPosRankSum=-0.704;SC=GTAAGTAGAGAAATTGCTTCC;SOR=0.872;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=84;TCF=60;TCR=24;TR=83;WE=143130042;WS=143130024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,82:0.99:83
chr4	143130219	rs1994217	T	A	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=460;SC=TATTTTTATCTTAAATCCATA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=143130227;WS=143130209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	143181747	rs66750380	AT	A	194.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.64;ReadPosRankSum=0.998;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr4	143181748	rs1907111	T	A	381.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.68;ReadPosRankSum=-0.108;SOR=1.034;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr4	143192086	rs150117601	T	TTG	269.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=4.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.72;MQRankSum=1.444;QD=15.87;ReadPosRankSum=1.534;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr4	143226768	rs2627808	G	T	3049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=78;PP=2595;SC=CAAACAAAATGAGTCTTTAGA;SOR=3.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=12;TCR=78;TR=90;WE=143226776;WS=143226758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr4	143226784	rs2636640	G	A	2599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=59;PP=2214;SC=TTAGAAGAATGAAATATTAAA;SOR=2.774;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=15;TCR=59;TR=74;WE=143226792;WS=143226774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	143268528	rs882004	T	A	2082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=9;PP=1758;SC=TCCAATTACCTGATTATTATT;SOR=3.223;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=51;TCR=9;TR=60;WE=143268536;WS=143268518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr4	143324036	rs1982965	T	C	1188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=1;PP=959;SC=AAAAATCCAATCGTGTGGAAA;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=35;WE=143324044;WS=143324026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	143324094	rs1982966	G	A	2130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=13;PP=1736;SC=TACTTACGGTGTCATGAGACT;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=54;TCR=13;TR=67;WE=143324102;WS=143324084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr4	143326312	rs138973882	AAGAG	A	1237.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=5;PP=1159;SC=GCGAGCCAGCAAGAGAGAGAG;SOR=2.910;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=22;WE=143326323;WS=143326302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	143344785	rs3775712	T	G	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=2;PP=861;SC=ATTGTACCAGTACATATTGTT;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=143344793;WS=143344775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	143348523	rs3775717	A	G	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=367;SC=GTTTCTTAGTATATTTTAAAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=143348531;WS=143348513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	143348680	rs3775718	C	T	1548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=30;PP=1324;SC=ACTTGGCTTTCTAAACAAACA;SOR=1.426;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=47;WE=143348688;WS=143348670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	144317039	rs2048408	C	T	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=163;ReadPosRankSum=-0.179;SC=ATTGATGGACCGCCCCCCGCC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=10;WE=144317047;WS=144317029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr4	144354959	.	C	T	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.902;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.191;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,19:0.24:79
chr4	144361280	.	G	C	2302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.417;ClippingRankSum=0.000;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.077;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=25;PP=1781;ReadPosRankSum=-0.147;SC=TGAAGAACTGGATGAAAATTA;SOR=0.787;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=308;TCF=232;TCR=76;TR=101;WE=144361288;WS=144361270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,102:0.33:310
chr4	144380399	rs13114896	G	A	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=134;ReadPosRankSum=-0.594;SC=AACATTCATGGACCTCATTTC;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=7;WE=144380407;WS=144380389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr4	144381401	rs3795246	A	G	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=323;ReadPosRankSum=-0.690;SC=ATGAATGATTATAAACATAAG;SOR=0.263;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=15;WE=144381409;WS=144381394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
chr4	144438595	rs35601522	C	T	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.118;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=619;ReadPosRankSum=0.147;SC=ATGTTCTAGGCTTGTGAATAG;SOR=0.941;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=29;WE=144438603;WS=144438585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr4	144442735	rs11541117	C	T	2876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.548;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=89;PP=2355;ReadPosRankSum=-1.092;SC=GCAGAACTTACTATCCGTTGG;SOR=0.922;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=172;TCF=33;TCR=139;TR=108;WE=144442743;WS=144442725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,108:0.62:174
chr4	144442827	.	TA	T	515.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.600;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.853;NF=0;NR=19;PP=605;ReadPosRankSum=-0.383;SC=ATCACTATGATAAATAACTTA;SOR=1.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=19;WE=144442835;WS=144442817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr4	144445789	rs6857360	C	T	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=278;ReadPosRankSum=-0.274;SC=GAGCATATTACAGGATAGTAG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=14;WE=144445797;WS=144445779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr4	144447630	rs7694156	T	C	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.087;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=158;ReadPosRankSum=0.858;SC=TTCTAGTATTTCATTACATTT;SOR=0.059;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=11;WE=144447638;WS=144447620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr4	144456124	rs6818251	A	G	2800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=62;PP=2237;SC=AATGGTATGTATTCTCAGATG;SOR=1.635;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=31;TCR=62;TR=93;WE=144456132;WS=144456114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr4	144466050	rs7692376	A	G	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.215;HP=7;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.420;NF=8;NR=39;PP=787;ReadPosRankSum=0.499;SC=TGAAAATGTAATTTTTTTCAT;SOR=0.050;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=115;TCF=10;TCR=105;TR=47;WE=144466058;WS=144466040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,46:0.41:113
chr4	144467104	rs13139128	T	C	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=16;PP=1162;SC=AGCTGCCTAATGCAGCACAGG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=45;WE=144467112;WS=144467094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	144469383	rs2088415	A	G	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.11;ReadPosRankSum=1.216;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,9:0.20:45
chr4	144471402	.	T	G	277	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=29;MQ=55.94;NF=0;NR=13;PP=277;QD=23.9824009652;SC=TTTTTTTCCTTAAGGGAGAAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=13;WE=144471410;WS=144471392;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,13:0.43:30
chr4	144471460	rs6810805	T	C	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=219;ReadPosRankSum=0.423;SC=TAGGTAGTGGTATAATTTTTA;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=10;WE=144471468;WS=144471450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr4	144618610	rs1034494	G	C	2550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=22;PP=2005;SC=ACTCCCCGACGAAGACCTTGG;SOR=1.936;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=75;TCF=53;TCR=22;TR=74;WE=144618618;WS=144618600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr4	144801662	rs1132785	C	G,T	6933.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=54.91;QD=30.95;SOR=1.588;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,41,183:0.18,0.82:224
chr4	144801662	.	CCTGTATAAA	GCTGTATAAC,TCTGTATAAA	2962	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=29;MQ=54.33;NF=7,58;NR=19,110;PP=1348,2962;QD=53.9026105716;SC=GCTCACAATTCCTGTATAAAA;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=203;TCF=69;TCR=134;TR=26,168;WE=144801679;WS=144801652;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.13:203
chr4	144801671	rs146400730	A	C	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=0.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.92;MQRankSum=-3.867;QD=4.35;ReadPosRankSum=-0.400;SOR=0.848;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:165,30:0.15:195
chr4	144801728	rs201075956	CA	TG	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.27;MQRankSum=-5.319;QD=1.85;ReadPosRankSum=-0.410;SOR=0.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,12:0.12:103
chr4	144809800	rs143390057	C	A	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.11;QD=31.24;SOR=3.187;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr4	144811428	rs4095436	A	G	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=715;SC=GCATATTCCAATCTGGTCACT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=144811436;WS=144811418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	144811470	rs4095435	A	G	214.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.85;QD=30.69;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	144824235	rs79701609	C	T	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FS=1.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.00;MQRankSum=-9.442;QD=0.45;ReadPosRankSum=1.387;SOR=0.510;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:237,36:0.13:273
chr4	144824269	rs1899967	C	T	7716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.36;QD=41.94;SOR=3.113;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr4	144824269	.	CTCCC	TTCCC,TTCCT	2944	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.48;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=29;MQ=43.61;NF=29,19;NR=153,120;PP=101,2944;QD=0.745995673336;SC=CAGAAAATAACTCCCTGCTAC;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=186;TCF=29;TCR=157;TR=182,139;WE=144824281;WS=144824259;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.98:186
chr4	144824273	rs6818201	C	T	4168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=1.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.75;MQRankSum=3.048;QD=25.42;ReadPosRankSum=-0.729;SOR=0.533;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,143:0.87:164
chr4	144917514	rs1980037	A	C	1848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=43;PP=1465;SC=ATGAGCTAAGACTCCACTTCA;SOR=2.387;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=13;TCR=43;TR=56;WE=144917522;WS=144917504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr4	144918867	rs1473055	A	G	2982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.97;NF=23;NR=68;PP=2260;SC=TAACATCAGCATAACATCACC;SOR=2.376;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=23;TCR=68;TR=91;WE=144918875;WS=144918857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr4	144918893	rs4835126	A	G	3091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.81;QD=44.17;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr4	144918900	rs1849110	G	A	3056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.80;QD=44.95;SOR=3.849;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr4	144921607	rs1849119	C	T	1289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=32;PP=1012;SC=ATGAGCTGGACATGTGTCCCG;SOR=1.954;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=44;WE=144921615;WS=144921597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	144922436	rs201662569	T	G	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=1.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.21;MQRankSum=-4.478;QD=0.75;ReadPosRankSum=0.174;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:174,26:0.13:200
chr4	144922549	rs6537239	G	A	1650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=49;PP=1381;SC=TGAGCTAAGCGCTTTAGTATA;SOR=7.903;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=49;WE=144922557;WS=144922539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr4	144938033	rs5862681	A	AT	730.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.23;QD=34.80;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	144938047	rs12503691	C	T	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.94;QD=30.80;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	144938081	rs28373876	C	T	354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.51;QD=32.25;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	144938120	rs4561879	TG	CC	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.48;QD=42.65;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	145035788	rs6857303	G	A	2368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=17;PP=1871;ReadPosRankSum=0.142;SC=GTAACTCACTGGTTTGATTTT;SOR=0.722;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=111;TCF=87;TCR=24;TR=82;WE=145035796;WS=145035778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,84:0.74:113
chr4	145038318	rs62334650	C	T	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.142;NF=0;NR=8;PP=116;ReadPosRankSum=2.389;SC=TGTCCAAGGTCGCAAAATAGT;SOR=0.169;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=8;WE=145038326;WS=145038308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr4	145040784	rs62334651	T	C	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.394;NF=11;NR=3;PP=208;ReadPosRankSum=0.458;SC=CTCGTGTAAATAGAGTTCAAT;SOR=0.668;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=14;WE=145040792;WS=145040774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr4	145040962	rs6857144	CA	GT	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=16;PP=968;SC=TGAGAAAGGGCACAAGAATGA;SOR=4.712;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=17;WE=145040971;WS=145040952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	145040999	.	T	C	87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=41;MMLQ=24;MQ=52.85;NF=0;NR=2;PP=87;QD=60.8856062736;SC=TAGAGCGTATTATGAAAGACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=2;WE=145041019;WS=145040989;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,2:0.25:8
chr4	145041011	.	AC	A	89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=41;MMLQ=28;MQ=53.49;NF=0;NR=5;PP=89;QD=24.4;SC=TGAAAGACAAACTCTCCCACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=145041019;WS=145040989;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,5:0.56:9
chr4	145041686	rs4867	A	G	3510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.80;QD=35.11;SOR=0.909;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr4	145041741	rs4449373	T	G	2726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.39;QD=34.08;SOR=0.968;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr4	145041741	.	TCTGTATAAA	GCTGTATAAA,GCTGTATAAC	1625	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MMLQ=29;MQ=41.62;NF=33,0;NR=48,8;PP=1625,10;QD=20.491002624;SC=GCTCACAATTTCTGTATAAAA;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=33;TCR=48;TR=81,8;WE=145041758;WS=145041731;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:81
chr4	145061822	rs71590434	CA	C	1944.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.426;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.728;NF=29;NR=49;PP=1837;ReadPosRankSum=-0.344;SC=GAAGTTAGTGCAAAAAAACTA;SOR=0.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=52;TCR=88;TR=78;WE=145061830;WS=145061812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,85:0.67:127
chr4	145573954	rs3215015	GA	G	386.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.954;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=247;ReadPosRankSum=1.660;SC=TTCCAGGTAAGAAAAAAAAAT;SOR=1.473;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=55;TCF=4;TCR=51;TR=21;WE=145573962;WS=145573944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,22:0.40:55
chr4	145579907	rs6537301	G	A	1298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.456;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=1;PP=1073;ReadPosRankSum=0.101;SC=TATGACATTAGGTGCTTCTAA;SOR=1.732;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=77;TCF=74;TCR=3;TR=45;WE=145579915;WS=145579897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,46:0.58:79
chr4	145656036	.	G	A	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=325;ReadPosRankSum=0.541;SC=GACTTCTGCAGAACTGGTTAG;SOR=0.527;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=34;TCF=19;TCR=15;TR=17;WE=145656044;WS=145656026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr4	146046138	rs4835203	T	C	205.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=57.83;NF=7;NR=0;PP=166;SC=TTTTTTTCTCTTAGTCCTCAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=146046146;WS=146046128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	146048554	rs4148234	T	C	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.049;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=739;ReadPosRankSum=-1.314;SC=ACAGATGGTATGTGCAGAACA;SOR=0.237;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=40;WE=146048562;WS=146048544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,41:0.72:57
chr4	146048583	rs1378314	T	G	2332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=29;PP=1682;SC=AGGCACTGTTTTAAGCACAGC;SOR=1.379;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=46;TCR=29;TR=75;WE=146048591;WS=146048573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr4	146065006	rs9991890	C	T	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=1;PP=941;SC=TATAAAATTTCGAAATTATTT;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=146065014;WS=146064996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	146086269	rs17726651	C	T	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.895;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=401;ReadPosRankSum=-0.823;SC=CCACTGGTTTCATTTTCTTTT;SOR=1.469;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=17;WE=146086277;WS=146086259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr4	146436286	.	CTGTGTGTGTGTGTGTGTG	C	671.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.081;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.700;NF=0;NR=15;PP=1122;ReadPosRankSum=-0.176;SC=TTTGGGGAAACTGTGTGTGTG;SOR=1.071;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=1;TCR=57;TR=15;WE=146436318;WS=146436276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr4	146572140	rs11721510	G	A	2281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.955;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=5;PP=1941;ReadPosRankSum=-1.298;SC=AAGTAGAATGGAAATGGTCAA;SOR=0.120;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=109;TCF=104;TCR=5;TR=76;WE=146572148;WS=146572130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,77:0.70:110
chr4	146576418	rs2270655	G	C	2704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.246;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=38;PP=2109;ReadPosRankSum=0.120;SC=GGAAGCAACAGAAAGTTTGGA;SOR=0.435;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=148;TCF=94;TCR=54;TR=100;WE=146576426;WS=146576408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,102:0.68:151
chr4	146601349	rs17020528	C	T	1914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=14;PP=1395;ReadPosRankSum=-0.612;SC=AGAGGCCGTTCGTAGTTATGT;SOR=0.554;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=103;TCF=83;TCR=20;TR=68;WE=146601357;WS=146601339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,71:0.68:105
chr4	146653620	rs10008599	G	A	1045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.483;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=28;PP=771;ReadPosRankSum=1.719;SC=TGGACGGTGCGATTCTGAAAG;SOR=0.392;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=63;TCF=16;TCR=47;TR=40;WE=146653628;WS=146653610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,41:0.63:65
chr4	146697205	rs4835257	A	C	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.068;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=369;ReadPosRankSum=-1.911;SC=TCAAGGAAAGAATGGTTCAAG;SOR=0.469;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=79;TCF=20;TCR=59;TR=25;WE=146697213;WS=146697195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,25:0.31:80
chr4	146700781	rs9308196	A	T	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.546;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=655;ReadPosRankSum=-0.973;SC=AGTAATTGCAAATGAGTCTCC;SOR=3.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=29;WE=146700789;WS=146700771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
chr4	146767313	rs34221205	C	A	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=485;ReadPosRankSum=-1.033;SC=AGATCCTCCCCATCTTACTGG;SOR=2.019;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=20;WE=146767321;WS=146767303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr4	146770389	rs71973224	GT	G	398.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.847;NF=18;NR=1;PP=218;ReadPosRankSum=-0.408;SC=TATAATTCAGGTTTTTTTTTT;SOR=0.446;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=19;WE=146770397;WS=146770379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr4	146770828	rs72723888	G	A	195.03	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=159;ReadPosRankSum=0.489;SC=AGAGAAAAATGAGCGTGCACG;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=8;WE=146770836;WS=146770818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr4	147104263	rs919483	A	G	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.623;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=518;ReadPosRankSum=-0.603;SC=CAATAGGCCAAAAAAGTACTG;SOR=2.239;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=22;WE=147104271;WS=147104253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr4	147110652	rs17757715	C	T	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=87;ReadPosRankSum=-0.876;SC=TTGAATGATACGAGAATTCCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=147110660;WS=147110642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr4	147110891	rs7745	A	G	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=354;ReadPosRankSum=0.090;SC=TTGTGATACAATTTGTCCTCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=16;WE=147110899;WS=147110881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,19:0.83:23
chr4	147364052	rs1344140	C	T	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=338;ReadPosRankSum=-0.708;SC=TCATTCTCCCCTCCCCCACTA;SOR=1.091;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=17;WE=147364060;WS=147364042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr4	147425114	rs7439061	A	T	1910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=6.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.693;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=62;PP=1552;ReadPosRankSum=-0.892;SC=AAATAATTTTATAATCATAGA;SOR=1.650;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=104;TCF=6;TCR=98;TR=64;WE=147425122;WS=147425104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,66:0.61:108
chr4	147431302	rs6816737	G	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=209;ReadPosRankSum=0.593;SC=CTTAATTTTGGGTTTTTTCAT;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=10;WE=147431310;WS=147431292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr4	147560457	.	T	TGGC	2384.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.432;NF=27;NR=25;PP=2371;ReadPosRankSum=-0.557;SC=ACGCTGGTGGTGGCGGCGGCG;SOR=0.238;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=158;TCF=64;TCR=94;TR=52;WE=147560465;WS=147560447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr4	147560692	rs1504360	T	A	2159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=61;PP=1755;SC=TCCAACCAATTTTCCCCTCTC;SOR=6.154;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=64;TCF=2;TCR=62;TR=63;WE=147560700;WS=147560682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr4	147788709	rs10013280	C	T	1258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.849;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=870;ReadPosRankSum=1.458;SC=TAGTAAGAGGCTTCCGCTTCC;SOR=0.668;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=82;TCF=42;TCR=40;TR=50;WE=147788717;WS=147788699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,52:0.62:84
chr4	147824864	rs17610219	G	A	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=32;PP=816;ReadPosRankSum=-0.264;SC=AAGTTATTATGTACATCTTCG;SOR=1.096;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=3;TCR=48;TR=34;WE=147824872;WS=147824854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,37:0.69:54
chr4	147830297	rs35123039	A	G	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=19;PP=746;ReadPosRankSum=-1.247;SC=AGCCTCCCTCAGGGCATCCCA;SOR=0.703;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=40;TCR=34;TR=41;WE=147830305;WS=147830287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,45:0.58:77
chr4	147830499	rs3810844	C	T	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=200;ReadPosRankSum=-0.354;SC=ATCATGTTGCCTTTTATCCCT;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=147830507;WS=147830489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr4	148441139	rs4835412	G	A	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.549;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=615;ReadPosRankSum=1.284;SC=AGGTAATGTGGTTCTTTCCCT;SOR=0.529;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=131;TCF=58;TCR=73;TR=39;WE=148441147;WS=148441129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,37:0.28:134
chr4	148457005	rs113823592	CT	C	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=9.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.51;MQRankSum=-0.760;QD=0.64;ReadPosRankSum=-0.697;SOR=0.064;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,11:0.20:56
chr4	148457009	rs71594223	T	TTC	753.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=3.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.51;MQRankSum=2.395;QD=12.16;ReadPosRankSum=1.297;SOR=1.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,22:0.35:62
chr4	148461037	rs5333	T	C	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=592;ReadPosRankSum=-0.616;SC=TCCCTCTTCATTTAAGCCGTA;SOR=0.656;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=114;TCF=49;TCR=65;TR=36;WE=148461045;WS=148461027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,40:0.34:117
chr4	148461073	rs5334	G	A	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.733;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=417;ReadPosRankSum=0.661;SC=TGTATAACGAGATGGACAAGA;SOR=1.214;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=75;TCF=21;TCR=54;TR=21;WE=148461081;WS=148461063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,24:0.30:79
chr4	148461378	rs2292765	G	A	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.636;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.37;ReadPosRankSum=0.432;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr4	148463840	rs5335	G	C	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.315;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=39;PP=996;ReadPosRankSum=-1.342;SC=GCAACTGTGAGTCCGGGAATC;SOR=1.318;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=153;TCF=40;TCR=113;TR=48;WE=148463848;WS=148463830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,52:0.32:161
chr4	148560357	rs2654935	C	T	972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=30;PP=824;SC=TAGTACTTGACAGAATGCTTT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=148560365;WS=148560347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr4	148589677	rs2718454	C	T	2580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=21;PP=2060;SC=TGAAAATGGACTAATACACTT;SOR=2.191;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=59;TCR=21;TR=80;WE=148589685;WS=148589667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
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chr4	148601729	rs7666065	C	T	1117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=31;PP=864;SC=CACTATTGAACAATCACCTTA;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=148601737;WS=148601719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	148768346	.	C	T	2633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.179;ClippingRankSum=0.000;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.846;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=27;PP=1992;ReadPosRankSum=1.903;SC=TGGAAAAATTCAGAAAAGAGC;SOR=0.512;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=116;TCF=81;TCR=35;TR=88;WE=148768354;WS=148768336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,94:0.76:123
chr4	148778685	rs11410393	G	GT	542.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=7;PP=355;SC=TTTAATCATAGTTTTTTTTTT;SOR=1.721;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=18;WE=148778693;WS=148778675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	148787669	rs4240341	G	A	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=348;SC=AGGGAAAAAAGCATCATTTTC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=148787677;WS=148787664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	148796464	rs7663294	C	G	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=393;SC=TTAGGAGAAACACATTCCAGC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=148796472;WS=148796454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	148800299	rs13147854	A	G	2502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=8;PP=1943;SC=CGTTTTAGACATTTCCTCTTT;SOR=4.455;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=80;TCR=8;TR=88;WE=148800307;WS=148800289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr4	148827697	rs35780665	T	TA	1605.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.445;NF=39;NR=10;PP=960;ReadPosRankSum=0.430;SC=CAGATAAAAGTAAAAAAAAAA;SOR=0.498;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=74;TCF=56;TCR=18;TR=49;WE=148827705;WS=148827687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,62:0.93:67
chr4	148827747	rs12509618	A	C	3290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.226;NF=58;NR=42;PP=2565;ReadPosRankSum=1.004;SC=CTTGCCTTTTAGTGGCCAAGG;SOR=0.399;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=59;TCR=42;TR=100;WE=148827755;WS=148827737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,106:0.99:107
chr4	148827973	rs11099672	A	G	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=21;PP=571;SC=GTTCCCTTCTATAACAGGTAT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=148827981;WS=148827963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	148831070	rs4627844	A	G	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=35;PP=1083;SC=ATAATCCTCTATTGCATGTGT;SOR=3.716;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=38;WE=148831078;WS=148831060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	148968201	rs74523651	A	G	1672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=42;PP=1194;ReadPosRankSum=0.174;SC=GGCATCCACTATGTAAGTAAC;SOR=0.713;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=81;TCF=22;TCR=59;TR=57;WE=148968209;WS=148968191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,63:0.72:88
chr4	148984305	rs144731909	C	T	2665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.304;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=48;PP=1986;ReadPosRankSum=0.639;SC=TTAGCCCAGGCCAGACCCGAT;SOR=0.927;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=354;TCF=198;TCR=156;TR=119;WE=148984313;WS=148984295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:242,122:0.34:364
chr4	148985720	rs3775327	T	C	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=40;PP=813;ReadPosRankSum=0.715;SC=GTCTGCAGCATGGAGTGAGCA;SOR=0.612;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=73;TCF=16;TCR=57;TR=52;WE=148985728;WS=148985710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,54:0.72:75
chr4	149002016	rs10708334	AT	A	1120.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.640;NF=3;NR=41;PP=1021;ReadPosRankSum=0.828;SC=ATCTGTATATATTTTTTTATT;SOR=0.527;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=73;TCF=4;TCR=69;TR=44;WE=149002024;WS=149002006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,49:0.73:67
chr4	149073555	rs2272089	C	T	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=92;ReadPosRankSum=2.600;SC=TTAGAAATTACTGAAAGAAAT;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=6;WE=149073563;WS=149073545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr4	149073872	.	C	T	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.811;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=598;ReadPosRankSum=0.877;SC=TCACTTTTCTCTTTTCTGACA;SOR=1.897;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=25;WE=149073880;WS=149073862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,26:0.79:33
chr4	149116035	rs4835500	A	G	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.701;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=66;ReadPosRankSum=-0.883;SC=AATAAAAAATAACTGTTAAAA;SOR=0.090;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=4;WE=149116043;WS=149116025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr4	149356516	rs5525	A	G	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-5.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.228;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=22;PP=674;ReadPosRankSum=-0.595;SC=AATAGCTCCCATCATCTGGTT;SOR=0.674;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=141;TCF=66;TCR=75;TR=47;WE=149356524;WS=149356506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,47:0.34:140
chr4	149357475	rs5522	C	T	1510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.585;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=26;PP=1172;ReadPosRankSum=1.046;SC=CTTTTAACAACGGCGCGCATG;SOR=0.461;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=197;TCF=122;TCR=75;TR=62;WE=149357483;WS=149357465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,65:0.32:204
chr4	149358014	rs2070951	G	C	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=153;ReadPosRankSum=0.505;SC=GGTCTCCATCGCTAACAAATA;SOR=0.483;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=46;TCF=5;TCR=41;TR=11;WE=149358022;WS=149358004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,13:0.27:48
chr4	151119076	rs13435901	A	C	1807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=2;PP=1517;SC=AGTTCTGGTCAGTAAACAATT;SOR=5.747;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=51;TCR=2;TR=53;WE=151119084;WS=151119066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr4	151161470	rs11931842	A	G	3836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=29;PP=2846;SC=TTTTCCTAACAAATAAAGGCA;SOR=2.426;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=100;TCR=29;TR=129;WE=151161478;WS=151161460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr4	151161490	rs6838238	T	C	5082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=107;NR=47;PP=2965;SC=AATACTCCAGTACCATGGAAG;SOR=1.762;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=107;TCR=47;TR=154;WE=151161510;WS=151161480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr4	151161502	rs6813035	G	T	5012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=56;PP=2965;SC=CCATGGAAGGGTCTTGGGAGC;SOR=1.430;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=101;TCR=56;TR=157;WE=151161510;WS=151161480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr4	151174249	rs145393005	GTCCTCCTCA	G	100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=2.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.24;MQRankSum=2.948;QD=5.93;ReadPosRankSum=-0.514;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr4	151177340	rs13152819	CC	TG	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=610;SC=CACCCCCCACCCTCCTCCCGC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=151177349;WS=151177330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	151177432	rs13101258	A	C	99.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=2;PP=73;SC=CGCCTGCTGCAGCCCAGGAAG;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=151177440;WS=151177422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	151199080	rs2290846	G	A	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=616;ReadPosRankSum=0.591;SC=CTTGAGGTCCGACACCTGCCG;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=82;TCF=42;TCR=40;TR=33;WE=151199088;WS=151199070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,35:0.42:83
chr4	151207127	rs3749574	C	T	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=30;PP=702;ReadPosRankSum=-0.158;SC=GCACACACCGCAGCACATGTG;SOR=0.712;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=119;TCF=34;TCR=85;TR=41;WE=151207135;WS=151207117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,43:0.35:123
chr4	151231371	rs1813134	T	C	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.652;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=3;PP=627;ReadPosRankSum=1.372;SC=ATAAAGAAAATGAAAATTACC;SOR=0.239;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=29;WE=151231379;WS=151231361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,29:0.71:41
chr4	151242312	rs11737450	C	T	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.648;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=11;PP=682;ReadPosRankSum=0.024;SC=TCAGCAGTTACCATGCCTTAT;SOR=0.899;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=107;TCF=75;TCR=32;TR=41;WE=151242320;WS=151242302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,48:0.41:118
chr4	151357816	rs2292122	G	C	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=301;ReadPosRankSum=1.457;SC=TCTAATTTTTGCATATCCTTC;SOR=0.638;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=14;WE=151357824;WS=151357806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr4	151408800	rs7674989	T	C	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=0;PP=633;SC=TACAGATTAATGTTAATAAGA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=151408808;WS=151408790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	151409010	.	T	C	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=0.000;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.512;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=565;ReadPosRankSum=0.011;SC=TTTTTAAAAATTAGAACACAG;SOR=0.352;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=77;TCF=20;TCR=57;TR=29;WE=151409018;WS=151409000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,31:0.38:82
chr4	151412346	rs55998463	T	C	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.77;ReadPosRankSum=1.083;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr4	151505322	rs13105060	T	A	2560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=61;PP=2050;SC=CACACAACTCTGCTATAAACA;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=15;TCR=61;TR=76;WE=151505330;WS=151505312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr4	151511715	rs4401437	T	G	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=0;PP=814;SC=AAGGAGAAACTGTAGAAGGGG;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=34;WE=151511723;WS=151511712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	151656589	rs1993109	C	T	2213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=65;PP=1897;SC=TCACTGCTTACGGTGGAGAGG;SOR=6.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=66;TCF=1;TCR=65;TR=66;WE=151656597;WS=151656579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr4	151719263	rs1129998	A	G	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=397;ReadPosRankSum=-2.605;SC=CCAATTCCACAACTGAACTAC;SOR=0.631;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=72;TCF=29;TCR=43;TR=23;WE=151719271;WS=151719253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,24:0.32:76
chr4	151765243	rs186080	G	A	5359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=130;NR=36;PP=2965;SC=AAGACATATTGTAACTTACTA;SOR=2.517;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=130;TCR=36;TR=166;WE=151765251;WS=151765233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr4	151829659	rs1201207	T	C	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=22;PP=926;SC=TCAATGATTTTTTTTCCAAAA;SOR=1.473;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=33;WE=151829667;WS=151829649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	152024326	rs4696658	T	G	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=42;PP=1251;SC=AAAGGTCTGTTGAAATCCTGT;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=42;WE=152024334;WS=152024316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	152048936	rs11099782	A	T	1917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=60;PP=1670;SC=AACATTTTTTAAAAAAAAACG;SOR=5.387;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=63;TCF=2;TCR=61;TR=62;WE=152048944;WS=152048926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr4	152053408	rs7664483	G	A	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=3;PP=1240;SC=ATATTCTCTTGAAAATTATGA;SOR=5.018;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=44;TCR=3;TR=47;WE=152053416;WS=152053398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr4	152069406	.	TAC	T	145.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=-0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=3.802;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=272;ReadPosRankSum=1.732;SC=TGTCCTGTCTTACACACACAC;SOR=2.584;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=8;WE=152069415;WS=152069396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr4	152070633	rs3792611	T	A	3806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=79;NR=33;PP=2965;SC=TTTCTCTAACTTTTCCCACAT;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=79;TCR=33;TR=112;WE=152070641;WS=152070623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr4	152201018	rs148861921	G	GCAGGT	646.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=731;ReadPosRankSum=-0.076;SC=GCTGGCCTTGGCAGGTCAGCC;SOR=0.673;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=15;WE=152201026;WS=152201008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr4	152201053	rs36097019	G	A	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.556;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.877;NF=2;NR=14;PP=295;ReadPosRankSum=-0.340;SC=AACTTTATCTGTGGAGGTTCC;SOR=3.117;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=16;WE=152201061;WS=152201043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr4	152201204	rs1875308	A	G	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=231;SC=AAAGTGGTAAAATAGGCAGGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=152201212;WS=152201194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	152203664	rs6849871	C	G	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.478;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=357;ReadPosRankSum=-0.649;SC=AAATATTTTTCAACAAAACCA;SOR=2.613;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=16;WE=152203672;WS=152203654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr4	152212486	rs13126069	C	T	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.601;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=522;ReadPosRankSum=-0.400;SC=GGCTCTCCTGCGTCCCTCCTG;SOR=0.910;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=116;TCF=51;TCR=65;TR=36;WE=152212494;WS=152212476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,37:0.31:120
chr4	152212603	rs2407221	T	G	2549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=54;PP=2051;SC=CAGGGGCAGATAACTCACAGG;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=23;TCR=54;TR=77;WE=152212611;WS=152212593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr4	152212704	rs13102005	T	A	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=69;ReadPosRankSum=1.660;SC=GGGGTTGGAATGTGAAGAGTT;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=152212712;WS=152212694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr4	152583907	.	C	CT	220	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=61.82;NF=7;NR=14;PP=220;QD=10.619047619;SC=CTGCTGTTAGCTTTTTTTTTT;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=79;TCF=18;TCR=61;TR=21;WE=152583915;WS=152583897;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:58,21:0.27:79
chr4	153247486	.	CTT	C	80.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.84;ReadPosRankSum=0.395;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
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chr4	153267968	rs2714803	A	G	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=0;PP=1160;SC=TGATTTCAAAATTCATCCACA;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=38;WE=153267976;WS=153267958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	153410390	rs10021011	C	A	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.423;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=109;ReadPosRankSum=0.757;SC=GTGTTGCCCTCGAATTTGAAC;SOR=0.751;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=8;WE=153410398;WS=153410380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr4	153549745	rs138358407	C	A	1304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.30;QD=31.07;SOR=4.125;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
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chr4	153690842	rs4696354	T	C	4638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=55;PP=2965;SC=TTGGTGCATATGGAATCACCA;SOR=1.223;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=92;TCR=55;TR=146;WE=153690850;WS=153690832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr4	153750918	rs10010297	G	A	2802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=73;PP=2326;SC=AAGAATCATGGTAAGTCTTTA;SOR=3.258;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=14;TCR=73;TR=87;WE=153750926;WS=153750908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr4	153793489	rs35670437	CT	C	463.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=2;PP=453;SC=TTGTGGGAACCTTTTTTTCTT;SOR=3.500;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=17;WE=153793497;WS=153793479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	153793528	rs28473137	A	G	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.391;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.995;NF=18;NR=4;PP=511;ReadPosRankSum=-0.392;SC=TTTCAATTTGAACAATATCAG;SOR=0.124;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=22;WE=153793536;WS=153793518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,23:0.70:33
chr4	153802060	rs80127385	A	G	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=48;ReadPosRankSum=-0.270;SC=ATGCTCTAGCATTTATATTTT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=6;WE=153802068;WS=153802050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr4	153870242	.	GTAATAATAA	G	656	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MMLQ=27;MQ=55.32;NF=23;NR=1;PP=656;QD=27.5416666667;SC=CCTTGTCTCAGTAATAATAAT;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=24;WE=153870258;WS=153870232;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:20,24:0.55:44
chr4	153870267	.	TAATAATAATAAGAAGAAGAAG	T	52.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=0.000;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.24;MQRankSum=0.353;QD=0.63;ReadPosRankSum=3.367;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,10:0.12:84
chr4	153870276	.	TAAGAAGAAGAAG	T	651	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=35;MMLQ=28;MQ=57.2;NF=40;NR=9;PP=651;QD=13.3673469388;SC=ATAATAATAATAAGAAGAAGA;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=83;TCF=58;TCR=25;TR=49;WE=153870295;WS=153870266;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:34,49:0.59:83
chr4	153870279	rs11099860	G	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=5.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQRankSum=-2.942;QD=3.14;ReadPosRankSum=2.666;SOR=2.331;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,7:0.21:34
chr4	153870322	rs12642251	A	C	3399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=0.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQRankSum=-0.776;QD=21.52;ReadPosRankSum=-0.556;SOR=0.806;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,110:0.70:158
chr4	153870355	rs12651510	T	C	5786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=65;PP=2965;SC=GGACCAGGCATGGTGGCTGAA;SOR=0.952;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=85;TCR=65;TR=150;WE=153870363;WS=153870345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr4	153881835	rs3811834	C	T	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.299;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=39;PP=1038;ReadPosRankSum=-0.573;SC=TTATTCTTCACGCAGTAAGAT;SOR=0.314;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=161;TCF=36;TCR=125;TR=56;WE=153881843;WS=153881825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,57:0.34:169
chr4	153884092	.	G	GGT	598.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.000;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=0.572;QD=14.60;ReadPosRankSum=-1.901;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr4	153896358	rs3811833	C	T	4759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=100;PP=2965;SC=CAGAGCTCGGCGCCAGGGCGT;SOR=1.673;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=48;TCR=100;TR=148;WE=153896366;WS=153896348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr4	153897770	rs3811832	G	A	1618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=28;PP=1322;SC=GTGCCAACACGGAGGCCCCTC;SOR=1.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=48;WE=153897778;WS=153897760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	154091111	rs34284701	C	T	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=209;SC=TAACTTCATCCGCATCTAAAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=154091119;WS=154091101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	154178697	rs12643843	A	G	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.815;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=38;PP=924;ReadPosRankSum=0.931;SC=CTGTGCATGAACTGGCACATC;SOR=1.520;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=158;TCF=65;TCR=93;TR=56;WE=154178705;WS=154178687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,61:0.36:168
chr4	154191710	rs1470104	G	A	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=258;ReadPosRankSum=1.164;SC=AGTTTCGCAGGCTGACCTCCT;SOR=0.354;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=14;WE=154191718;WS=154191700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr4	154216710	rs893805	G	A	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.370;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=36;PP=1289;ReadPosRankSum=0.312;SC=ACCTCGGGACGATCTTAACCA;SOR=0.811;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=199;TCF=101;TCR=98;TR=64;WE=154216718;WS=154216700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,65:0.32:202
chr4	154271324	rs1440079	A	G	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.309;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=175;ReadPosRankSum=0.057;SC=TGTAATTTTCATCTTAAGTAT;SOR=0.206;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=11;WE=154271332;WS=154271314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr4	154276856	rs10471075	A	G	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.252;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=480;ReadPosRankSum=-0.879;SC=CCAAAGAGAAAGGCATTAGTA;SOR=1.886;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=85;TCF=47;TCR=38;TR=28;WE=154276864;WS=154276846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,32:0.34:95
chr4	154318554	rs79592336	C	T	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=373;ReadPosRankSum=-0.539;SC=TTCTAGTTGCCTGCTAACTAT;SOR=0.141;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=0;TCR=71;TR=21;WE=154318562;WS=154318544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,20:0.27:73
chr4	154330064	.	GTA	G	129	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=27;MQ=59.55;NF=9;NR=0;PP=129;QD=14.8888888889;SC=CATTTTGTGTGTATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=9;WE=154330075;WS=154330054;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:21,9:0.30:30
chr4	154330085	rs10030031	T	A	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.74;ReadPosRankSum=-1.255;SOR=0.343;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr4	154336105	rs140443507	CTG	C	288.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.828;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.706;NF=2;NR=8;PP=378;ReadPosRankSum=-0.088;SC=TTGCCTGTAACTGTGTTTATC;SOR=0.022;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=10;WE=154336114;WS=154336095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,11:0.27:41
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chr4	154478000	rs10639508	T	TAAATC	379.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=211;ReadPosRankSum=0.317;SC=ATAATACTGATAAGGGTGCAC;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=154478008;WS=154477990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr4	154478222	rs10001845	C	T	1547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=27;PP=1208;SC=CGTATGGAGTCCTTTCCTATC;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=21;TCR=27;TR=48;WE=154478230;WS=154478212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	154479430	rs6848033	T	C	3336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=37;PP=2709;SC=TTGGCACTCGTAGAATCTCTA;SOR=1.396;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=66;TCR=37;TR=103;WE=154479438;WS=154479420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr4	154510247	.	AC	A	123.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.411;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=105;ReadPosRankSum=-0.610;SC=ACATTCTAAGACCCCCCTCTC;SOR=0.114;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=6;WE=154510255;WS=154510237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr4	154512437	rs17279148	A	G	1332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=32;PP=1005;SC=TTTAGCTACCATTTCAAAGCC;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=39;WE=154512445;WS=154512427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	154513531	rs1371158	A	G	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=0;PP=613;SC=GTTACATGATATTTCCTCATG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=154513539;WS=154513521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	154513627	rs7669418	A	G	3234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=17;PP=2794;SC=TCACACCTAGATCAAGTACTT;SOR=3.103;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=83;TCR=17;TR=100;WE=154513635;WS=154513617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr4	154513722	rs7669741	C	T	4815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=86;PP=2965;SC=CCCTAGTGCACCTGCTCCACA;SOR=1.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=58;TCR=86;TR=144;WE=154513730;WS=154513712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr4	154513856	rs893628	G	C	1277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=34;PP=1066;SC=AGTATTAACCGATTAGCTCAT;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=154513864;WS=154513846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	154514847	rs13109887	T	C	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=2;PP=993;ReadPosRankSum=-0.709;SC=TGTGTGCAAATGTACTCACCT;SOR=3.816;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=39;WE=154514855;WS=154514837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr4	154514918	rs17279217	T	C	4704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=19;PP=2965;SC=CAGATGTGAGTGCTGTTTTAA;SOR=3.489;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=119;TCR=19;TR=138;WE=154514926;WS=154514908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr4	154514965	rs17370297	T	C	6655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=145;NR=61;PP=2965;SC=GGCACTGATATGCAGATGATT;SOR=1.791;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=206;TCF=145;TCR=61;TR=206;WE=154514973;WS=154514955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr4	154517294	rs7690932	G	T	1190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=0;PP=991;SC=TTGATTAGGAGGATCAAATCT;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=36;WE=154517302;WS=154517284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	154519658	rs13118469	A	G	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.49;SOR=6.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr4	154519666	rs13118949	G	C	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.16;SOR=7.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	154519679	rs13145743	T	C	1747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=0;PP=1087;ReadPosRankSum=1.851;SC=TATTTAAATTTAAGTACATTG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=38;WE=154519687;WS=154519648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr4	154542161	rs3761657	C	A	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=464;SC=AAATGTTTATCTCTTAAGATT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=154542169;WS=154542151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	154542814	rs7663417	G	T	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.58;ReadPosRankSum=0.583;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,31:0.65:48
chr4	154544267	rs2289319	G	A	1283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=30;PP=1024;SC=AGGCACTCTCGGTGGCCCTTC;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=36;WE=154544275;WS=154544257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	154548909	rs17030263	G	T	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.823;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=374;ReadPosRankSum=-1.487;SC=TGGCTGATGAGTTTGAGAAGA;SOR=0.192;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=64;TCF=6;TCR=58;TR=23;WE=154548917;WS=154548899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,26:0.38:68
chr4	154557383	rs142471814	ATG	A	2287.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=4;PP=2079;SC=GTATTCGCTGATGTGTATTCA;SOR=3.872;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=45;TCR=4;TR=47;WE=154557392;WS=154557373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr4	154557405	rs3214684	CT	C	1565.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=13;PP=938;SC=CTTTCTAAGGCTTTTTTTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=61;TCF=44;TCR=17;TR=54;WE=154557413;WS=154557395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr4	154624656	rs3804099	T	C	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=600;ReadPosRankSum=-0.350;SC=CAATTCAGAATGTAAGTCATC;SOR=0.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=149;TCF=48;TCR=101;TR=44;WE=154624664;WS=154624646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,45:0.29:155
chr4	154631543	rs2405432	A	T	4736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=58;PP=2965;SC=TAGTGAATAGATAATGCCTTG;SOR=1.208;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=85;TCR=58;TR=143;WE=154631551;WS=154631533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr4	154631563	rs1339	T	C	2834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.603;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=45;PP=2181;ReadPosRankSum=-0.847;SC=GAACTATTCCTATCACCACAG;SOR=0.599;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=90;TCR=67;TR=103;WE=154631571;WS=154631553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,108:0.64:168
chr4	154633734	rs2289318	G	C	1616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.743;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=53;PP=1162;ReadPosRankSum=0.160;SC=GAAAGCTGAAGCATCTTGTTA;SOR=1.701;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=240;TCF=96;TCR=144;TR=74;WE=154633742;WS=154633724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,75:0.30:247
chr4	154641489	rs1439166	T	C	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.020;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=36;PP=727;ReadPosRankSum=0.263;SC=GAAATAAGAATGTGGCATATT;SOR=1.609;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=62;TCF=4;TCR=58;TR=38;WE=154641497;WS=154641479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,40:0.59:68
chr4	154644454	rs1456384	T	C	2529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=6;PP=2139;SC=CAGGTGAGTGTGCCAAGCAAG;SOR=4.643;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=68;TCR=6;TR=74;WE=154644462;WS=154644444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
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chr4	154709856	rs6535952	A	C	3502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=82;PP=2659;SC=GCAGGTTGGCAGGGATGGGCT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=40;TCR=82;TR=122;WE=154709864;WS=154709846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr4	155156207	rs7655799	G	A	7214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=110;NR=107;PP=2965;SC=CTTTTCTAACGTCAGCCAGGA;SOR=0.719;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=218;TCF=111;TCR=107;TR=217;WE=155156215;WS=155156197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr4	155160424	.	A	AC	2360.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.000;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=2929;ReadPosRankSum=0.151;SC=AGCACTGAATACCCCACAGGT;SOR=0.733;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=89;TCF=48;TCR=41;TR=46;WE=155160437;WS=155160414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,59:0.61:96
chr4	155160429	rs150004475	A	G	2410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.624;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.801;NF=30;NR=26;PP=2928;ReadPosRankSum=-0.279;SC=TGAATACCCCACAGGTATTGA;SOR=0.544;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=95;TCF=53;TCR=42;TR=56;WE=155160437;WS=155160414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,64:0.62:103
chr4	155161666	rs6535989	C	T	4302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=33;PP=2965;SC=GCTTTGGTTTCGGCATCTCTT;SOR=2.117;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=97;TCR=33;TR=130;WE=155161674;WS=155161656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr4	155180652	rs147630053	CCA	C	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQRankSum=-1.418;QD=4.39;ReadPosRankSum=0.176;SOR=0.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr4	155190927	rs11412936	T	TA	380.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=451;SC=TAGGCTAGCTTAAAAAATTCT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=13;WE=155190935;WS=155190917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	155225784	rs70947158	AAAACAAAC	A	687.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=3;PP=1396;SC=CTGTCTTAAAAAAACAAACAA;SOR=2.712;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=10;WE=155225799;WS=155225778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	155243573	rs13109747	C	T	5350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=117;PP=2965;SC=TATAATCATACGAAAGTATTG;SOR=1.831;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=48;TCR=117;TR=165;WE=155243581;WS=155243563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr4	155243604	rs1352714	T	C	3998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=94;PP=2965;SC=TATTTCACCATTGTTGGCGTC;SOR=3.017;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=115;TCF=20;TCR=95;TR=114;WE=155243612;WS=155243594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr4	155244401	rs140019361	TTTTG	T	683.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=8;PP=592;SC=CAGGTCAGGATTTTGTTTGTT;SOR=1.244;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=12;WE=155244412;WS=155244391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	155244475	rs12500437	G	T	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=9;PP=289;SC=CAGAGGCATAGGTCTAGCTGC;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=155244494;WS=155244465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	155249289	rs111557030	G	A	1418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.470;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=14;PP=1145;ReadPosRankSum=0.640;SC=TCCTTCATCAGGATCCTTTGC;SOR=0.495;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=49;WE=155249297;WS=155249279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,49:0.83:59
chr4	155250915	rs993975	G	C	84.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=4;PP=64;SC=AGGCGCACCAGGGCCAGAACC;SOR=3.258;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=155250923;WS=155250905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr4	155252934	rs4696548	C	T	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=25;PP=812;SC=CTCGAGCTATCTGAGTTTCAG;SOR=1.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=34;WE=155252942;WS=155252924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	155256205	rs6858712	G	A	3337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=65;PP=2639;SC=GACCATCAACGAAAGTGTGGT;SOR=1.656;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=96;TCF=30;TCR=66;TR=95;WE=155256213;WS=155256195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr4	155287317	rs10005849	G	C	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=1;PP=303;SC=TAGTTAAGCAGAAACTTTATA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=155287325;WS=155287307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr4	155287535	rs10017772	T	C	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=22;PP=876;SC=AAACACAGGATGATTATCATT;SOR=0.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=22;TCR=22;TR=44;WE=155287543;WS=155287525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	155295076	rs11721758	A	G	6829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=137;PP=2965;SC=CCTTACCTTCACCAGGGCTAA;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=216;TCF=79;TCR=137;TR=216;WE=155295084;WS=155295066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr4	155407407	rs4346631	A	T	1569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=0;PP=1380;SC=AGGTCTCGTCAGGGCATGAGA;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=46;WE=155407415;WS=155407397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	155407569	rs12501998	T	C	3593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=91;PP=2794;SC=TTTTATCAGATGACATGGTAT;SOR=2.038;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=33;TCR=91;TR=124;WE=155407577;WS=155407559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr4	155407680	rs13151559	A	G	1441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=31;PP=1200;SC=AAGCTGTAAAAGAGGAAAACT;SOR=1.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=44;WE=155407688;WS=155407670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr4	155410407	rs9999285	C	G	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.480;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=10;PP=917;ReadPosRankSum=-1.355;SC=ACAACCCTCTCCATCCCTTCC;SOR=0.468;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=41;WE=155410415;WS=155410397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,43:0.77:56
chr4	155410822	rs4696593	G	A	6626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=121;NR=87;PP=2965;SC=CATCGGAGGCGCTGACCCACA;SOR=1.047;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=208;TCF=121;TCR=87;TR=208;WE=155410830;WS=155410812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr4	155411065	rs7656522	T	C	10356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=181;NR=123;PP=2965;SC=GGCCGCCGGGTAGCAACGCGA;SOR=1.118;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=305;TCF=181;TCR=124;TR=304;WE=155411073;WS=155411055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,317:1.00:317
chr4	155411104	rs6536016	A	C	9650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=152;NR=166;PP=2965;SC=CCAAGGACAGAGAGATGCTCC;SOR=0.762;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=320;TCF=154;TCR=166;TR=318;WE=155411112;WS=155411094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,329:1.00:329
chr4	155457601	rs60732160	T	C	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=52;SC=TAAACCTGCATTTACTTGATA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=155457609;WS=155457591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	155457850	.	C	G	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=354;ReadPosRankSum=0.222;SC=AAATCTCTTTCTCTTGATAAT;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=18;WE=155457858;WS=155457840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
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chr4	155459194	rs7668818	A	T	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=301;ReadPosRankSum=0.180;SC=AAAGATTTTGAATGAAACTTC;SOR=0.929;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=15;WE=155459202;WS=155459184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr4	155461113	rs7671792	T	C	1897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.633;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=17;PP=1572;ReadPosRankSum=-0.542;SC=CTGTAATAATTTGTGGTTCTG;SOR=1.207;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=88;TCF=63;TCR=25;TR=65;WE=155461121;WS=155461103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,65:0.74:88
chr4	155461687	rs62330410	A	C	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=0;PP=706;ReadPosRankSum=-0.420;SC=TGAAACCGAAAGTGCACCCTA;SOR=2.247;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=29;WE=155461695;WS=155461677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,31:0.76:41
chr4	155462148	rs7700005	A	T	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=36;PP=901;ReadPosRankSum=-0.563;SC=AATTTTAGAAACCTGATTATT;SOR=0.836;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=56;TCF=2;TCR=54;TR=38;WE=155462156;WS=155462138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,37:0.64:58
chr4	155465535	rs62330413	A	G	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=571;ReadPosRankSum=1.925;SC=TCTATTCTTCAGTGCTTGTCA;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=33;WE=155465543;WS=155465525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,34:0.64:53
chr4	155466869	rs62330417	C	T	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=2;PP=766;ReadPosRankSum=-1.068;SC=AGTTTTAGGGCTATGAAATAT;SOR=0.877;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=53;TCF=50;TCR=3;TR=35;WE=155466877;WS=155466859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,33:0.65:51
chr4	155466935	rs11935584	T	C	1966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.110;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=19;PP=1471;ReadPosRankSum=-0.136;SC=GAGGGAAATATGGCAACATGT;SOR=1.581;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=102;TCF=71;TCR=31;TR=68;WE=155466943;WS=155466925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,73:0.68:107
chr4	155467187	rs11940724	A	G	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.118;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=795;ReadPosRankSum=-0.146;SC=GGAAAATGTCATATAATAGTT;SOR=0.857;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=63;TCF=33;TCR=30;TR=38;WE=155467195;WS=155467177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,38:0.60:63
chr4	155469959	rs11451354	G	GA	859.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.082;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=470;ReadPosRankSum=0.449;SC=TTTAGCAATTGAAAAAAAAAA;SOR=0.455;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=86;TCF=58;TCR=28;TR=33;WE=155469967;WS=155469949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,42:0.61:69
chr4	155505241	rs148317511	A	AGAAGACAGAGTGCTCCCATTCCCACTTC	227.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.98;ReadPosRankSum=-0.441;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr4	155507590	rs6050	T	C	2435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FS=2.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.15;ReadPosRankSum=0.264;SOR=0.853;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:285,111:0.28:396
chr4	155508627	rs2070018	G	A	7631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=161;NR=77;PP=2965;SC=CCTCTACTCAGAAACAAGGAC;SOR=1.710;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=238;TCF=161;TCR=77;TR=238;WE=155508635;WS=155508617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr4	155510224	rs7656433	A	T	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=174;SC=TTCCTACCCTATCTCTTCCAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=155510232;WS=155510214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr4	155511897	rs2070011	T	C	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.525;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=34;PP=708;ReadPosRankSum=2.521;SC=AAAGGATTGCTGCCACTCCTA;SOR=1.964;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=57;TCF=14;TCR=43;TR=42;WE=155511905;WS=155511887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,42:0.72:58
chr4	155525276	rs2066865	G	A	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=117;ReadPosRankSum=0.729;SC=GTCAATAAAGGTACCATGTAT;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=7;WE=155525284;WS=155525266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr4	155525970	rs1049636	G	A	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=3;PP=465;SC=GTCAATAGAAGTTAGCAGTTA;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=155525978;WS=155525960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	155718171	rs57686041	A	AT	139.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.82;ReadPosRankSum=0.796;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr4	155719919	rs33918255	AT	A	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.13;ReadPosRankSum=-0.217;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr4	155720274	rs156502	T	C	2839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.398;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=41;PP=2137;ReadPosRankSum=-0.322;SC=AGCATCTTAATGGTCAGATTA;SOR=0.855;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=154;TCF=94;TCR=60;TR=107;WE=155720282;WS=155720264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,110:0.70:158
chr4	155747891	rs34828322	CTTT	C,CTT	1094.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.34;QD=25.46;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:4,30,9:0.70,0.21:43
chr4	156135676	rs1047214	C	T	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.622;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=26;PP=999;ReadPosRankSum=-0.185;SC=TTGAGATCATCCCGGACTTTG;SOR=0.627;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=147;TCF=71;TCR=76;TR=52;WE=156135684;WS=156135666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,55:0.37:150
chr4	156135812	.	C	G	1584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.187;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.720;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=36;PP=1196;ReadPosRankSum=-0.800;SC=TTCCTACACTCGCATTTGGAG;SOR=0.569;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=43;TCR=65;TR=60;WE=156135820;WS=156135802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,61:0.54:112
chr4	156136027	rs2880415	C	T	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=4.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.03;ReadPosRankSum=1.271;SOR=1.181;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,34:0.26:130
chr4	156276100	rs3775250	A	G	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.622;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=163;ReadPosRankSum=-0.077;SC=AAAACCGGAAATCATTTCTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=7;WE=156276108;WS=156276090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr4	156276289	rs2341894	C	T	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.702;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=275;ReadPosRankSum=1.381;SC=CATGTAAATACACATTTTTCT;SOR=1.493;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=15;WE=156276297;WS=156276279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr4	156276317	rs2880181	A	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=92;ReadPosRankSum=0.800;SC=CCACTCCTATAAGAACAAGAA;SOR=0.648;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=7;WE=156276325;WS=156276307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr4	156281311	rs17032890	T	G	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=3.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.61;ReadPosRankSum=-0.177;SOR=0.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,14:0.23:62
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chr4	156294624	rs34053877	G	GA	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=128;ReadPosRankSum=0.349;SC=AAATGGAAAAGAAAAATGTTT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=156294632;WS=156294614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr4	156296821	rs1037028	T	C	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=536;ReadPosRankSum=-0.149;SC=TCAAAAGTAATATAAGATTTA;SOR=1.488;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=25;WE=156296829;WS=156296811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,26:0.74:35
chr4	156632391	rs11944673	A	G	5466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=119;PP=2965;SC=ACTCTGTGAAAAAATCTTCAA;SOR=2.010;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=166;TCF=46;TCR=120;TR=165;WE=156632399;WS=156632381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr4	156643068	rs3816763	G	A	1451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.385;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=2;PP=1165;ReadPosRankSum=-0.253;SC=TGAAGGTTTTGAGGAAAGGGG;SOR=1.931;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=72;TCF=68;TCR=4;TR=51;WE=156643076;WS=156643058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,52:0.70:74
chr4	156643176	rs2306555	T	A	4149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.395;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=78;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.663;SC=CATCATGTTATTTTTTGCTTT;SOR=0.389;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=219;TCF=116;TCR=103;TR=154;WE=156643191;WS=156643166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,158:0.70:227
chr4	156643183	rs2306554	C	A	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.122;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=25;PP=2643;ReadPosRankSum=0.790;SC=TTATTTTTTGCTTTCAGATGC;SOR=1.148;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=215;TCF=111;TCR=104;TR=65;WE=156643191;WS=156643166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,69:0.31:224
chr4	156680340	rs1459845	G	T	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=27;PP=1033;SC=ACCCCTCCTCGGCCGGCCTGG;SOR=2.133;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=37;WE=156680348;WS=156680330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	156706482	rs1459853	G	A	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=18;PP=919;SC=GTGCTGCAATGTAAGAGTTTA;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=17;TCR=18;TR=35;WE=156706490;WS=156706472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr4	156721198	rs2229202	C	T	4612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=84;PP=2965;SC=GTTAAGAGCCCTGGAAGATGA;SOR=1.171;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=55;TCR=85;TR=139;WE=156721206;WS=156721188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr4	156757789	rs113590442	G	GA	255.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.962;NF=12;NR=0;PP=183;ReadPosRankSum=-0.036;SC=TTTCAATAAAGAAAAAAAAAT;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=12;WE=156757797;WS=156757779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr4	156757818	rs1399046	A	C	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-4.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.795;NF=28;NR=0;PP=589;ReadPosRankSum=-1.576;SC=ATTATCAATAATTTAAAAGGC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=28;WE=156757826;WS=156757808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,27:0.64:42
chr4	156758138	rs141290852	TACTCTGAAACAA	T	203.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=2216;ReadPosRankSum=-2.067;SC=AAATGGTGTTTACTCTGAAAC;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=6;WE=156758157;WS=156758128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr4	156773267	rs59881089	T	C	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=4;PP=612;ReadPosRankSum=-0.125;SC=CTATCTGATATGGCCCAATAG;SOR=0.775;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=103;TCF=90;TCR=13;TR=36;WE=156773275;WS=156773257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,36:0.34:105
chr4	156784584	rs77591504	A	T	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=1.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.84;ReadPosRankSum=-0.629;SOR=1.006;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,18:0.29:63
chr4	156784970	rs932081	C	T	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=44;PP=1325;SC=TAATGCTATCCGTAAAAAAAC;SOR=7.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=44;WE=156784978;WS=156784960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	156787214	rs1399044	A	G	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=518;SC=TATATTACTTATATTGTGTTC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=156787222;WS=156787207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	156787340	rs6848883	G	A	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=751;ReadPosRankSum=-1.318;SC=TTTACTCACCGTTCTCAGCAT;SOR=0.418;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=71;TCF=49;TCR=22;TR=37;WE=156787348;WS=156787330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,40:0.55:73
chr4	156826166	rs2137778	C	G	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=613;SC=TACTAAAGTTCATAAAAACCA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=156826174;WS=156826156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	156826413	rs80246692	C	A	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.780;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=178;ReadPosRankSum=1.043;SC=ATCATGGAATCACCTCTGTTA;SOR=0.207;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=13;WE=156826421;WS=156826403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr4	156826468	rs77272487	C	T	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=0.533;SC=TCTCATAGGACTGATATAAGG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=156826476;WS=156826458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr4	156832841	rs12502494	C	T	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=470;SC=TTCTCTTAACCTTTTCTCTTT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=156832849;WS=156832831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	156835631	rs6828277	T	C	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=614;ReadPosRankSum=0.938;SC=AATGTGTGAATATGAGATCAA;SOR=1.609;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=25;WE=156835639;WS=156835621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr4	156839462	rs2292537	C	T	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=25;PP=752;SC=TATACATTTGCTATCTAAAAA;SOR=4.332;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=156839470;WS=156839452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	156847230	rs1543108	A	G	2071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=51;PP=1778;SC=TACCTAAGGGAAAAAAAAGGA;SOR=2.494;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=16;TCR=52;TR=67;WE=156847245;WS=156847220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr4	156847237	rs10714400	AG	A	2061.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=50;PP=2355;SC=GGGAAAAAAAAGGAATTATTA;SOR=2.494;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=7;TCR=52;TR=57;WE=156847245;WS=156847220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr4	157555832	rs1055400	G	A	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.119;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=0;PP=1017;ReadPosRankSum=0.811;SC=TGTCTGAGCTGCACTTCTTTG;SOR=3.098;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=65;TCR=1;TR=44;WE=157555840;WS=157555822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,45:0.69:65
chr4	157557726	rs11943855	A	G	3720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=14;PP=2965;SC=TTACTTTCAAATGGTAACATC;SOR=3.651;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=95;TCR=14;TR=109;WE=157557734;WS=157557716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
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chr4	157999161	rs57784760	A	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=212;ReadPosRankSum=-1.572;SC=GATCTTCTGAAATTCAAGTTT;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=10;WE=157999169;WS=157999151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr4	158041585	rs11429434	G	GA	1035.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=1333;ReadPosRankSum=0.333;SC=AAAAAAAGAAGAAAAAGCCAT;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=20;WE=158041599;WS=158041575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr4	158041591	rs11932115	G	A	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=1329;ReadPosRankSum=0.443;SC=AGAAGAAAAAGCCATACTATA;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=24;WE=158041599;WS=158041575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr4	158041866	rs7671371	A	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=308;ReadPosRankSum=0.588;SC=AATTAATTTTATATGTTTAGA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=11;WE=158041874;WS=158041856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr4	158043559	rs41280501	C	T	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.419;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=146;ReadPosRankSum=-0.078;SC=GGTAAGATTGCAATTAATTTA;SOR=0.162;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=9;WE=158043567;WS=158043549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr4	158065038	rs12507409	T	C	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=13;PP=871;SC=ACGCCCCAACTCTGCTCATTG;SOR=1.002;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=20;TCR=13;TR=33;WE=158065046;WS=158065028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	158142740	rs28585580	T	G	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=602;ReadPosRankSum=1.863;SC=CTCTTGGATTTTTGGGCGCTA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=23;WE=158142748;WS=158142730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
chr4	158238830	rs4302506	T	C	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.763;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=180;ReadPosRankSum=-0.887;SC=TTGGAAAACATGTTAAAGGGT;SOR=0.830;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=14;WE=158238838;WS=158238820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,14:0.29:48
chr4	158255018	rs148690423	A	G	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=444;ReadPosRankSum=1.576;SC=TTAGATTCACATATATAAAAG;SOR=1.675;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=24;WE=158255026;WS=158255013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr4	159076679	rs6830475	C	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=140;ReadPosRankSum=-0.901;SC=ATAAAAACTCCAGGTGCTGAA;SOR=0.646;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=9;WE=159076687;WS=159076669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr4	159076826	rs6830702	C	T	3934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=49;PP=2965;SC=CAGTACAACCCGATTCAGGCT;SOR=0.986;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=66;TCR=49;TR=115;WE=159076834;WS=159076816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr4	159158677	rs12504074	G	A	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.559;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=411;ReadPosRankSum=0.801;SC=GTTTTGTAAGGGGCTGCAGTC;SOR=0.267;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=82;TCF=63;TCR=19;TR=24;WE=159158685;WS=159158667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,25:0.30:83
chr4	159514696	.	A	C	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.929;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.04;ReadPosRankSum=-2.024;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr4	159538140	rs11321888	CA	C	80.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=1.088;QD=2.60;ReadPosRankSum=-0.444;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr4	159568383	rs13111939	A	G	990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=765;SC=ATGTTCACAAATTTTTATTTC;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=159568391;WS=159568373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	159601676	rs11559290	C	T	2276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=31;PP=1810;SC=CTATGTGCTACAAGATGGTCT;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=72;TCF=40;TCR=32;TR=71;WE=159601684;WS=159601666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr4	159640565	rs7666472	G	C	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=472;SC=CCTGTTTGTCGCTCCCCACCC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=159640573;WS=159640555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	159690622	rs55960593	C	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=6;PP=127;ReadPosRankSum=0.239;SC=AGCGTGGACGCGCCTGATCCG;SOR=0.358;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=9;WE=159690630;WS=159690612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr4	159690640	rs59971723	C	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.780;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=145;ReadPosRankSum=-0.210;SC=CCGAGTGTGGCTCCGGACCCT;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=8;WE=159690648;WS=159690630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr4	159772709	rs55922414	C	G	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=0.911;SC=AAAACCAAAACTTTTTTATTA;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=8;WE=159772717;WS=159772699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr4	159858736	rs11737459	T	A	3058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=68;PP=2483;SC=CATCCAACTGTTTAATCAAGA;SOR=1.921;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=28;TCR=68;TR=96;WE=159858744;WS=159858726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr4	159894199	rs1820511	T	A	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=5.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.675;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=0;PP=1028;ReadPosRankSum=-0.110;SC=GAAAACAGTATACTATGAAAA;SOR=3.398;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=64;TCR=2;TR=41;WE=159894207;WS=159894189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,42:0.63:67
chr4	159894250	rs619128	C	T	4073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=93;NR=30;PP=2965;SC=AAAGCCACTCCCCAGTCTTGA;SOR=2.303;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=93;TCR=30;TR=123;WE=159894258;WS=159894240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr4	159894305	rs662473	T	C	4863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=83;PP=2965;SC=CCAATTTCACTGACGTACTCA;SOR=0.755;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=76;TCR=83;TR=159;WE=159894313;WS=159894295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr4	159894391	rs17037864	G	A	1794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.530;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=50;PP=1317;ReadPosRankSum=-1.669;SC=TTTTTCTAACGCCAGATGCTG;SOR=1.319;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=107;TCF=28;TCR=79;TR=64;WE=159894399;WS=159894381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,69:0.64:107
chr4	160050096	.	G	A	38	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=1;PP=38;QD=24.2570708491;SC=GTGTGTGTGTGTATATATATA;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=160050104;WS=160050086;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	160107918	rs10014197	T	C	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.848;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=467;ReadPosRankSum=-0.139;SC=TTGAAGCATGTAACAATTTAA;SOR=1.402;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=21;WE=160107926;WS=160107908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr4	160114277	rs6834634	G	C	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.210;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=397;ReadPosRankSum=1.357;SC=GACTGTATGTGTCATTTAAGG;SOR=2.560;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=16;WE=160114285;WS=160114267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr4	160162315	rs11944449	T	C	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=4.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=345;ReadPosRankSum=1.660;SC=GGAAATGTTGTGTTTGGAGAA;SOR=1.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=17;WE=160162323;WS=160162305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr4	160225430	rs13103075	T	A	2205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=8;PP=1733;ReadPosRankSum=1.687;SC=ATTTTAATTTTAAAATGTCTT;SOR=0.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=99;TCR=12;TR=74;WE=160225438;WS=160225420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,79:0.68:116
chr4	160251417	rs10692663	A	ATG	605.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5009;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=217;SC=GTATATGTATATGTGTGTGTG;SOR=1.981;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=6;WE=160251425;WS=160251407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,5:0.83:6
chr4	160251447	.	GTATA	G	876	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=28;MQ=58.85;NF=18;NR=4;PP=876;QD=39.9545454545;SC=GTGTGTGTGTGTATATATATG;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=54;TCF=46;TCR=8;TR=22;WE=160251458;WS=160251437;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr4	160260209	rs13127789	G	T	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.367;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=8;PP=1265;ReadPosRankSum=-0.029;SC=TTGCTTAATTGCATTGCCATA;SOR=0.105;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=85;TCF=76;TCR=9;TR=53;WE=160260217;WS=160260199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,55:0.63:87
chr4	160271268	rs11320537	GT	G	838.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.593;NF=34;NR=2;PP=456;ReadPosRankSum=-0.880;SC=CATATTTAAGGTTTTTTTTTT;SOR=0.693;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=56;TCF=51;TCR=5;TR=36;WE=160271276;WS=160271258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,40:0.77:52
chr4	160274180	rs10034898	G	C	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=453;ReadPosRankSum=-0.804;SC=GAATTTTTCTGCCATCCCAGT;SOR=0.446;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=18;WE=160274188;WS=160274170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr4	160277276	rs1135004	C	T	1391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=1011;ReadPosRankSum=-0.090;SC=GCCTCGCCCCCTATCAGTCCC;SOR=0.641;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=83;TCF=38;TCR=45;TR=49;WE=160277284;WS=160277266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,53:0.60:88
chr4	162380213	.	C	CT	280	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=9;NR=0;PP=280;QD=34.0;SC=TGAATGCCAACTTTTTTGCCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=162380221;WS=162380212;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	162421109	rs57337277	G	A	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=209;ReadPosRankSum=-0.031;SC=TTTCCAAAACGTAATTCTACT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=12;WE=162421117;WS=162421099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr4	162431434	rs62324275	A	G	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=0.328;SC=AATACCATCAATTAAAATATT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=162431442;WS=162431424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr4	162459299	rs4691769	T	C	3112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=18;PP=2508;SC=TGTGTGCTGTTGGGTGGTTCT;SOR=2.786;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=76;TCR=18;TR=94;WE=162459307;WS=162459289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr4	162463660	rs60655417	G	GA	470.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.598;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.373;SOR=0.601;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,29:0.28:103
chr4	162577430	rs17638339	A	G	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=-0.638;SC=AGTCTGGAGTATATCACATGA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=6;WE=162577438;WS=162577420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr4	162841814	rs5863499	T	TA	2783.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=83;PP=1944;SC=CCTGAAGAATTAAAAAAAAAT;SOR=4.219;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=6;TCR=98;TR=88;WE=162841822;WS=162841804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr4	162954926	rs60202022	A	G	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.511;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=511;ReadPosRankSum=-0.683;SC=TCCCAGGAACATGATTCTCGC;SOR=1.638;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=24;WE=162954934;WS=162954916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr4	164048199	rs4691895	G	C	4745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=52;PP=2965;SC=AAACCAAAAAGTTTGTGTGAC;SOR=1.300;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=146;TCF=94;TCR=52;TR=145;WE=164048207;WS=164048189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr4	164049916	rs1061075	A	C	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=0;PP=24;SC=AATATATATCAACTTACAACA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=164049924;WS=164049906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	164067105	.	T	A	38	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5064;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=38;QD=24.2570708491;SC=CAACATAATTTAAAAAAAAAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=164067113;WS=164067095;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:1,3:0.75:4
chr4	164069397	rs11722876	C	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=110;ReadPosRankSum=2.254;SC=GTGTTAATTACGTATGTCAAA;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=6;WE=164069405;WS=164069387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr4	164085425	rs4691896	T	C	1550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=11;PP=1284;SC=TCCTTCTCAATTTGTAAATCA;SOR=2.448;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=40;TCR=11;TR=50;WE=164085433;WS=164085415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	164087954	rs936562	A	T	2484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=65;PP=1908;SC=CCAGAAATAGAAAAACAACTT;SOR=4.671;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=6;TCR=65;TR=71;WE=164087962;WS=164087944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr4	164393117	rs11735477	T	A	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.646;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=26;PP=833;ReadPosRankSum=-0.721;SC=ACACTGCCAGTTGATGAACAA;SOR=0.801;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=161;TCF=75;TCR=86;TR=47;WE=164393125;WS=164393107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,46:0.28:165
chr4	164415734	rs2276979	A	G	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.055;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=413;ReadPosRankSum=0.529;SC=GTTGGGCTAGAGCTTAAAAGC;SOR=0.497;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=20;TCR=46;TR=22;WE=164415742;WS=164415724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,23:0.35:66
chr4	164415792	rs2276978	G	A	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=233;ReadPosRankSum=-0.797;SC=GGACGCTTTAGAGAAACGCAC;SOR=0.552;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=52;TCF=23;TCR=29;TR=16;WE=164415800;WS=164415782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,17:0.31:54
chr4	164415930	rs2276977	C	T	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.117;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=495;ReadPosRankSum=1.309;SC=TGCGGAGCTGCTCCGTGGCCA;SOR=0.924;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=80;TCF=40;TCR=40;TR=28;WE=164415938;WS=164415920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,28:0.34:83
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chr4	165118652	rs2288675	C	T	2325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.894;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=49;PP=1699;ReadPosRankSum=0.094;SC=CCCTGAGACTCTTAGTTCAAG;SOR=0.767;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=228;TCF=113;TCR=115;TR=90;WE=165118660;WS=165118642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,96:0.39:245
chr4	165118796	rs2288674	G	A	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.523;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.628;NF=13;NR=30;PP=709;ReadPosRankSum=-0.157;SC=GTTGTCCAGGGCAAGTTCTTT;SOR=0.968;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=129;TCF=45;TCR=84;TR=43;WE=165118804;WS=165118786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,42:0.32:131
chr4	165119006	rs35492692	A	AAT	574.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.83;MQRankSum=1.086;NF=0;NR=16;PP=622;ReadPosRankSum=-1.594;SC=CAAATATTATAATAAAGGGAC;SOR=1.519;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=16;WE=165119014;WS=165118996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr4	165981142	rs6819917	A	G	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.41;ReadPosRankSum=2.272;SOR=0.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,31:0.25:125
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chr4	166150086	rs72699582	A	G	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.906;NF=0;NR=8;PP=94;ReadPosRankSum=-0.621;SC=TTTTAGTTATAGGCATTTTAA;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=8;WE=166150094;WS=166150076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,5:0.15:34
chr4	166199390	rs10016586	C	T	2137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.589;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.426;NF=40;NR=45;PP=1601;ReadPosRankSum=1.367;SC=CTCCATACGTCGACTCCTTCT;SOR=0.779;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=159;TCF=77;TCR=82;TR=85;WE=166199398;WS=166199380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,86:0.54:158
chr4	166231868	rs28678193	A	G	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=328;ReadPosRankSum=0.646;SC=TAAATGGATTATTATACGCTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=15;WE=166231876;WS=166231858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr4	166239187	rs76952385	C	T	2473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=72;PP=1892;ReadPosRankSum=-0.780;SC=GTTATATTAACGAAGTTTTTC;SOR=0.938;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=125;TCF=18;TCR=107;TR=83;WE=166239195;WS=166239177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,88:0.67:132
chr4	166243037	rs57823891	A	C	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=459;ReadPosRankSum=1.029;SC=TCAAATGATAATACTACTAAA;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=20;WE=166243045;WS=166243027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr4	166243082	rs60759634	A	G	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-4.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=4;PP=603;ReadPosRankSum=-0.200;SC=TGATTTGTACAGTTCCTCCTG;SOR=0.678;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=34;WE=166243090;WS=166243072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,35:0.73:48
chr4	166259161	rs12501541	C	T	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=138;ReadPosRankSum=0.393;SC=AATGTTTACCCGTTTTCTTAA;SOR=0.141;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=6;WE=166259169;WS=166259151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr4	166307262	rs11100610	T	C	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=0;PP=23;SC=CTTCTCTCTATCTCCCAAATT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=166307270;WS=166307252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr4	166307575	rs17624836	T	C	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr4	166403574	rs2289230	A	G	2039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=52;PP=1661;SC=AGGTTTTATAAGATGATTTCT;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=10;TCR=52;TR=62;WE=166403582;WS=166403564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr4	166408782	rs3822062	T	G	1922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=51;PP=1590;SC=TTCAAACCTGTCCTACAATGG;SOR=3.334;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=8;TCR=51;TR=59;WE=166408790;WS=166408772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr4	166928911	rs12649793	C	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=183;ReadPosRankSum=1.210;SC=TTCAATATTGCTTTTCAATAT;SOR=0.317;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=10;WE=166928919;WS=166928901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr4	166929276	rs3775321	A	G	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.684;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=247;ReadPosRankSum=0.733;SC=TATGCCTGACATTAGAACTAG;SOR=1.385;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=14;WE=166929284;WS=166929266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,14:0.34:41
chr4	166995982	rs78368586	C	T	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=3;PP=804;ReadPosRankSum=-0.525;SC=TTGATATCCTCTGTTTTTAAA;SOR=0.754;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=75;TCF=68;TCR=7;TR=38;WE=166995990;WS=166995972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,37:0.51:72
chr4	166996276	rs76012333	G	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=95;ReadPosRankSum=2.569;SC=CTATCCAAATGTCAAAAAACA;SOR=0.202;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=7;WE=166996284;WS=166996266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr4	166999164	rs17047232	T	C	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.733;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=553;ReadPosRankSum=0.030;SC=GCGCCACTCCTGGCCACCGAA;SOR=0.966;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=107;TCF=65;TCR=42;TR=35;WE=166999172;WS=166999154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,34:0.32:106
chr4	166999276	rs78236642	A	G	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.596;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=25;PP=613;ReadPosRankSum=0.141;SC=TATCTAATTGAATCGAATCGT;SOR=1.154;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=67;TCF=6;TCR=61;TR=27;WE=166999284;WS=166999266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,29:0.41:71
chr4	167012241	rs377180243	GTTT	G,GTT	828.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=0;PP=747;ReadPosRankSum=1.835;SC=TGAGTGATTTGTTTTTTTTTA;SOR=2.208;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=56;TCR=0;TR=32;WE=167012258;WS=167012231;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.75:48
chr4	167012249	rs60017576	T	A	193.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-3.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.04;ReadPosRankSum=-1.584;SOR=0.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,12:0.25:48
chr4	167012250	rs33986267	T	TAA,A	2433.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=50.70;SOR=7.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,36,12:0.75,0.25:48
chr4	167012381	rs2654492	G	A	4498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.694;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=89;PP=2962;ReadPosRankSum=0.471;SC=TTGGACGACTGTGTGGCAACA;SOR=0.508;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=241;TCF=121;TCR=120;TR=168;WE=167012389;WS=167012371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,172:0.69:249
chr4	167012480	rs2646914	T	C	3974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=98;PP=2965;SC=GCTTTCAAGCTACACATTCTA;SOR=3.767;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=14;TCR=99;TR=112;WE=167012488;WS=167012470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr4	167012506	rs2254420	A	G	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=49;PP=1300;ReadPosRankSum=-0.429;SC=CAGCAAATTCAAGTCATGCTT;SOR=0.674;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=8;TCR=81;TR=54;WE=167012514;WS=167012496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,54:0.60:90
chr4	167012543	rs2654493	T	C	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=32;PP=807;ReadPosRankSum=0.696;SC=ATCCAGGTTTTTCTTCTGGTG;SOR=1.159;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=32;WE=167012551;WS=167012533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,33:0.60:55
chr4	167020324	.	C	T	1228	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=45;NR=1;PP=1228;QD=27.4515480989;SC=GAAGTAGAAACAGAAGTTAGA;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=46;WE=167020332;WS=167020323;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	167656278	rs12499704	A	C	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.565;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=237;ReadPosRankSum=0.359;SC=CCTTTATTTGACTGAATACTG;SOR=1.034;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=14;WE=167656286;WS=167656268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr4	167675635	rs2305593	G	A	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.721;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=7;PP=835;ReadPosRankSum=0.616;SC=AACTATTTGCGTCTGTAAGGG;SOR=1.380;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=130;TCF=103;TCR=27;TR=44;WE=167675643;WS=167675625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,45:0.34:131
chr4	167932327	rs2558141	T	C	1880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.329;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=7;PP=1427;ReadPosRankSum=-0.508;SC=TAAAATATAATACAAATTGAG;SOR=1.070;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=98;TCF=86;TCR=12;TR=65;WE=167932335;WS=167932317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,68:0.69:99
chr4	169049106	rs10002305	T	C	1553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=2;PP=1325;ReadPosRankSum=1.481;SC=AACTCCTGACTTCAGGTGATC;SOR=4.091;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=47;TCR=2;TR=48;WE=169049114;WS=169049096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr4	169083694	rs6836994	A	C	1334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=18;PP=1124;SC=GATTGGGGATATGAGGGAGCA;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=23;TCR=18;TR=41;WE=169083702;WS=169083684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	169086441	rs4405979	A	G	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=15;PP=653;SC=CAGAGACCTCAGGACACTTCA;SOR=0.749;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=17;TCR=15;TR=32;WE=169086449;WS=169086431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr4	169098914	rs477897	A	G	1923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.446;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=36;PP=1492;ReadPosRankSum=0.003;SC=AAGGATATACAGACCCTGCGA;SOR=0.526;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=118;TCF=58;TCR=60;TR=76;WE=169098922;WS=169098904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,77:0.64:120
chr4	169098984	rs10024092	G	T	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=4.204;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.92;ReadPosRankSum=-1.163;SOR=0.360;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,29:0.25:118
chr4	169105563	rs576690	A	G	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=1;PP=1043;SC=CAGGATCTGAACCACAGCCTG;SOR=5.031;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=36;WE=169105571;WS=169105553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr4	169143035	rs17611179	G	A	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=628;ReadPosRankSum=-1.049;SC=AGAGTAACCTGAAAAAATACG;SOR=0.665;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=134;TCF=33;TCR=101;TR=40;WE=169143043;WS=169143025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,45:0.31:143
chr4	169145268	rs17526539	T	G	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=150;ReadPosRankSum=0.610;SC=ATATATCTGTTGATACACCCA;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=8;WE=169145276;WS=169145258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr4	169158369	rs7663589	T	G	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=123;ReadPosRankSum=-0.832;SC=TGAAGTGTTGTTTTTCTACAA;SOR=0.350;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=10;WE=169158377;WS=169158359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,10:0.23:44
chr4	169158471	rs6552559	T	G	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.972;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=440;ReadPosRankSum=-0.314;SC=CATGGAAGAGTCCATTTACAA;SOR=1.358;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=93;TCF=55;TCR=38;TR=25;WE=169158479;WS=169158461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,26:0.27:98
chr4	169158489	rs3828560	G	C	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.805;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=391;ReadPosRankSum=-1.176;SC=CAAGAAAACTGACAAAAACAA;SOR=0.812;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=105;TCF=60;TCR=45;TR=28;WE=169158497;WS=169158479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,30:0.27:111
chr4	169158531	rs3805396	T	C	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.793;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=438;ReadPosRankSum=1.725;SC=GCAAATGTGATACAAGTCCAG;SOR=0.801;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=107;TCF=43;TCR=64;TR=30;WE=169158539;WS=169158521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,31:0.27:115
chr4	169158869	.	C	T	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.000;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.940;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=21;PP=1292;ReadPosRankSum=-0.197;SC=GCAAAGAAAACAGGAAGTAAA;SOR=1.060;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=95;TCF=63;TCR=32;TR=67;WE=169158877;WS=169158859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,71:0.71:100
chr4	169172006	rs142107414	GA	G	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=40;ReadPosRankSum=2.469;SC=AATTACATGAGAAAAAAAGAA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=4;WE=169172014;WS=169171996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr4	169172098	rs17053841	C	T	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.97;ReadPosRankSum=0.646;SOR=0.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,6:0.13:45
chr4	169183789	rs6552581	A	G	1077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=1;PP=924;SC=GTTTGTCAATATTATCATCCT;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=169183797;WS=169183779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
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chr4	169188927	rs575601	C	T	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=2.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.11;ReadPosRankSum=-1.670;SOR=0.440;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,27:0.26:102
chr4	169189151	rs72693142	A	G	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.140;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=31;PP=706;ReadPosRankSum=-1.139;SC=AAATAAATGTACATATTATTT;SOR=0.988;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=106;TCF=15;TCR=91;TR=36;WE=169189159;WS=169189141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,36:0.34:107
chr4	169190129	rs33910888	CA	C	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=1.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=0.718;QD=3.48;ReadPosRankSum=1.241;SOR=0.316;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,17:0.31:54
chr4	169194984	rs147891941	T	TA	434.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=498;ReadPosRankSum=1.733;SC=AAATGCAGGTTAAAAAATAAA;SOR=0.109;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=59;TCF=58;TCR=1;TR=20;WE=169194992;WS=169194974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,21:0.41:51
chr4	169197297	rs550625	C	T	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=433;ReadPosRankSum=-1.198;SC=CTTTTCATCACCTGAACAGCT;SOR=0.796;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=60;TCF=9;TCR=51;TR=24;WE=169197305;WS=169197287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,28:0.44:63
chr4	169213139	rs11723321	A	G	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.367;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=293;ReadPosRankSum=1.935;SC=ACAAAAGCTGACAGCTACCTT;SOR=0.074;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=15;WE=169213147;WS=169213129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr4	169227913	rs77642839	C	T	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.530;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=327;ReadPosRankSum=0.423;SC=TCAAAATTATCATTTAATCAT;SOR=1.136;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=57;TCF=9;TCR=48;TR=18;WE=169227921;WS=169227903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,19:0.33:58
chr4	169279170	rs497151	A	G	215.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=0;PP=176;SC=AGCAGAGCTGATATCTGAGTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=169279178;WS=169279160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	169282112	rs2684346	C	T	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=111;SC=AAAAAAACAGCGTGACAGTGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=169282120;WS=169282102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr4	169282187	rs3749494	G	A	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.918;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=113;ReadPosRankSum=-0.631;SC=AGGCTCAATAGTATCTTCAGA;SOR=0.293;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=9;WE=169282195;WS=169282177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr4	169282232	rs2684347	G	A	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=13;PP=980;SC=CTTACACAAAGGAAGAGCTAT;SOR=1.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=41;WE=169282240;WS=169282222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	169282355	rs2684348	T	C	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.018;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=784;ReadPosRankSum=-0.397;SC=AGCTGTCCCATACGCATCCTA;SOR=0.342;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=37;WE=169282363;WS=169282345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,37:0.77:48
chr4	169292759	rs6829368	T	C	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=4;PP=660;SC=ACCCATAAACTTACCCATTTT;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=169292767;WS=169292749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	169296472	rs34524049	TAACC	T	610.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.85;ReadPosRankSum=-0.315;SOR=0.930;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,19:0.28:69
chr4	169299528	rs13110927	T	C	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.252;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=561;ReadPosRankSum=1.028;SC=AAACTTAAATTAGCATTTTGG;SOR=0.124;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=25;WE=169299536;WS=169299518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,28:0.74:38
chr4	169299676	rs10517990	T	G	1810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=44;PP=1360;SC=TTGATTCCATTTATTTTCTGC;SOR=2.998;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=54;TCF=9;TCR=45;TR=53;WE=169299684;WS=169299666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr4	169300451	rs11734310	G	C	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=420;ReadPosRankSum=0.109;SC=ACATATCTGCGGTTTTGGCTA;SOR=0.624;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=90;TCF=71;TCR=19;TR=31;WE=169300459;WS=169300441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,31:0.34:90
chr4	169301044	rs3749497	A	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=165;ReadPosRankSum=0.226;SC=ACTGATATGTAATAAATAGTA;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=8;WE=169301052;WS=169301034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr4	169301059	rs1489232	T	C	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=491;SC=ATAGTACACATACATACTATA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=16;WE=169301067;WS=169301049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	169301077	rs3749498	G	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=80;ReadPosRankSum=0.743;SC=ATATAGATAAGGTTACCAGAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=6;WE=169301085;WS=169301067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr4	169312801	rs6840397	A	G	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=9.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.690;QD=14.61;ReadPosRankSum=2.574;SOR=0.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,68:0.80:85
chr4	169315533	rs3828493	T	C	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=73;ReadPosRankSum=1.244;SC=GAAAACCAACTGGTATAATTT;SOR=0.141;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=6;WE=169315541;WS=169315523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr4	169315571	rs11337868	TA	T	1493.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=0;PP=1605;SC=TTCAGCATCATAATATGCACA;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=39;WE=169315579;WS=169315561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	169315760	rs3749499	C	A	3777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.093;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=83;PP=2886;ReadPosRankSum=-0.785;SC=GTAATACCCTCTCCAAAGTCT;SOR=1.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=120;TCF=37;TCR=83;TR=119;WE=169315768;WS=169315750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,125:0.99:126
chr4	169317081	rs1826028	C	A	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=317;ReadPosRankSum=1.381;SC=ACAACTGTAACGTATTATATT;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=13;WE=169317089;WS=169317071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr4	169317279	rs3857035	C	T	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=189;ReadPosRankSum=-0.431;SC=TTTAGTGCTACTATTTAAAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=169317292;WS=169317269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr4	169322163	rs78252588	CTA	C	878.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.622;NF=2;NR=22;PP=826;ReadPosRankSum=0.248;SC=TTTGAAAAGACTATGTTTCTA;SOR=0.718;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=85;TCF=8;TCR=77;TR=24;WE=169322172;WS=169322153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,27:0.28:96
chr4	169325124	rs62334117	G	A	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.782;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=138;ReadPosRankSum=1.687;SC=TTAAGTTTCAGTTACTTACAA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=8;WE=169325132;WS=169325114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr4	169325282	rs201061430	TA	T	86.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=2.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQRankSum=1.583;QD=2.55;ReadPosRankSum=0.222;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr4	169327191	rs3762856	C	T	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.589;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=105;ReadPosRankSum=-1.611;SC=TAATGACTATCTTATTCTTAA;SOR=0.399;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=9;WE=169327199;WS=169327181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,9:0.26:35
chr4	169327905	rs62334119	G	T	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.336;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=246;ReadPosRankSum=-0.963;SC=AAATTACAATGTTTATATTTC;SOR=0.193;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=13;WE=169327913;WS=169327895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,13:0.32:40
chr4	169336662	rs4692661	T	C	1822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=20;PP=1384;SC=TCTCTCTCCATAGAGCACTAG;SOR=1.278;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=54;WE=169336670;WS=169336652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	169340431	rs2018241	A	C	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=27;ReadPosRankSum=-1.444;SC=AACATCAACCAGAGAACTAAC;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=4;WE=169340439;WS=169340421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr4	169340639	rs1021318	C	A	546.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.527;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=485;ReadPosRankSum=-0.450;SC=TATGCTGCTGCTGATAGCAGT;SOR=1.802;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=22;WE=169340647;WS=169340629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr4	169341435	rs2130145	A	G	3086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=25;PP=2456;SC=ACATTGTGACAATAATCTCTT;SOR=2.259;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=77;TCR=25;TR=102;WE=169341443;WS=169341425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr4	169341608	rs141226900	TACACATACACACACACACAC	T	1011.27	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=-0.400;NF=0;NR=9;PP=2301;ReadPosRankSum=1.488;SC=ACCGAATCCATACACATACAC;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=9;WE=169341635;WS=169341598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,27:0.90:30
chr4	169343044	rs61740705	A	G	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.318;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=420;ReadPosRankSum=0.883;SC=CTTATCTACCACATCCAGGAG;SOR=1.148;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=105;TCF=30;TCR=75;TR=28;WE=169343052;WS=169343034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,28:0.26:107
chr4	169369820	rs2712113	T	A	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=3;PP=642;SC=AGTAGAAGGCTATATTCTTTA;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=169369828;WS=169369810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	169369853	rs2712114	A	T	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=10;PP=1030;SC=CATACAAGTCAGAAACATGAT;SOR=1.923;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=37;WE=169369861;WS=169369843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	169374487	rs2634953	A	G	2210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=53;PP=1773;SC=GTGAAATGGCATTGAAATAGG;SOR=2.400;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=17;TCR=53;TR=70;WE=169374495;WS=169374477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr4	169392091	rs7680471	G	A	4881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=99;PP=2965;SC=AGGATGGACTGGGCAGGGGCA;SOR=1.215;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=58;TCR=99;TR=157;WE=169392099;WS=169392081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr4	169393179	rs12505232	T	G	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=503;SC=AGCTACTGTTTGTTGAGTACC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=169393187;WS=169393169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	169393595	rs13149639	A	G	1694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=30;PP=1280;SC=TTTTTACTTCACAGTACTTAC;SOR=1.009;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=24;TCR=30;TR=54;WE=169393603;WS=169393585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr4	169393972	rs113626526	G	GA	3209.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=75;PP=2930;SC=TGTAATAAAAGAAAAAATAGA;SOR=2.415;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=103;TCF=14;TCR=89;TR=85;WE=169393980;WS=169393962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr4	169432673	rs61051061	C	T	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.217;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=682;ReadPosRankSum=-0.489;SC=GGACCTCCTCCCATGAGTCCT;SOR=0.218;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=34;WE=169432681;WS=169432663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,36:0.67:54
chr4	169432841	rs1806729	G	A	2062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=26;PP=1536;ReadPosRankSum=0.086;SC=ACTCGGAAAAGGAGATCTCGC;SOR=0.619;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=100;TCF=63;TCR=37;TR=69;WE=169432849;WS=169432831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,74:0.70:105
chr4	169433326	rs7655494	TG	CA	3850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.12;ReadPosRankSum=-0.316;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,95:0.67:142
chr4	169433333	rs7673220	C	T	3604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.31;ReadPosRankSum=0.116;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,90:0.66:137
chr4	169589214	rs2723705	T	C	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=202;ReadPosRankSum=0.534;SC=AACACTGACATTGTTTTTTTT;SOR=0.237;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=13;WE=169589222;WS=169589204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr4	169612528	rs4260495	C	T	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=535;ReadPosRankSum=1.681;SC=TTTCTTTCTACCTTAAAGCCG;SOR=0.737;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=107;TCF=52;TCR=55;TR=36;WE=169612536;WS=169612518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,37:0.35:107
chr4	169799448	rs62333013	A	G	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=15;PP=569;SC=CTTCGGCCACAGCCAGACGCC;SOR=1.270;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=24;WE=169799456;WS=169799438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	169812313	rs6827082	T	C	2128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=53;PP=1751;SC=ACATCATCATTATTATTATTA;SOR=3.091;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=10;TCR=53;TR=63;WE=169812321;WS=169812303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr4	169835048	rs1532651	C	G	3736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=95;NR=12;PP=2965;SC=TTTTAAATAGCAAATCATTTA;SOR=4.057;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=95;TCR=12;TR=107;WE=169835056;WS=169835038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr4	169846255	rs3733656	T	C	2414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=44;PP=2040;SC=TCTCATTTCATTGCGTTTACT;SOR=1.308;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=28;TCR=44;TR=72;WE=169846263;WS=169846245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr4	169846359	rs66895777	GCT	G	2950.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=26;PP=2985;SC=AATTCATATTGCTCTCTCTCT;SOR=1.150;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=75;TCF=44;TCR=31;TR=64;WE=169846368;WS=169846349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr4	169847646	rs35375934	TA	T	441.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.25;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr4	170037323	rs10017472	G	A	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.232;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=0;PP=754;ReadPosRankSum=0.986;SC=TTGTTGAACAGTGAGTCCTCT;SOR=3.797;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=31;WE=170037331;WS=170037313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,32:0.76:42
chr4	170051395	rs34377181	T	TA	373.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.730;NF=0;NR=17;PP=240;ReadPosRankSum=0.638;SC=CAAGTCACATTAAAAAAAAAA;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=17;WE=170051403;WS=170051385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr4	170077432	rs9312445	A	G	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.130;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=141;ReadPosRankSum=0.015;SC=TTTCAGAAGCATAGTGAGTAG;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=170077440;WS=170077423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr4	170077459	rs35455310	AT	A	117.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=10;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=86;ReadPosRankSum=0.774;SC=CAAAACTTGTATTTTTTTTTG;SOR=0.090;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=8;WE=170077467;WS=170077449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr4	170077540	rs10024401	A	G	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.480;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=8;PP=850;ReadPosRankSum=0.757;SC=GAAAACAAGCACATTCTACCT;SOR=1.439;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=68;TCF=53;TCR=15;TR=47;WE=170077548;WS=170077530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,49:0.70:70
chr4	170077789	rs10518039	A	G	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.965;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=538;ReadPosRankSum=1.107;SC=CTTTTCCTTCATAGTTGTATA;SOR=0.053;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=32;WE=170077797;WS=170077779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,36:0.60:60
chr4	170315496	rs4692721	C	T	947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=1;PP=735;SC=AGAATCTTCACTGAAAAATGG;SOR=4.479;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=170315504;WS=170315486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	170354836	rs7680152	C	T	1462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=32;PP=1084;SC=ATAAACGTAACGAGAGACATC;SOR=2.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=41;WE=170354844;WS=170354826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	170354873	rs13139925	T	C	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=29;PP=1011;SC=CAAGAGAATATTGAATAAACT;SOR=3.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=33;WE=170354881;WS=170354863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr4	170581570	rs4692739	G	A	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.730;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=14;PP=498;ReadPosRankSum=-0.859;SC=GGAGGAGACAGTATTCCCCTG;SOR=0.947;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=107;TCF=61;TCR=46;TR=33;WE=170581578;WS=170581560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,32:0.29:110
chr4	170616918	rs2062609	G	A	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=219;ReadPosRankSum=-0.489;SC=TTTCAGTTTTGTAGGTGATGT;SOR=0.434;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=12;WE=170616926;WS=170616908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr4	170623928	rs60812626	CAAAAAAAAAAAA	C	256.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=21;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.434;NF=6;NR=0;PP=786;ReadPosRankSum=-1.379;SC=CCCATCTCTACAAAAAAAAAA;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=6;WE=170623947;WS=170623918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr4	170628474	rs1566522	A	G	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=176;ReadPosRankSum=-0.404;SC=GAAGAAAGGAAAGCAATAAGC;SOR=0.527;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=9;WE=170628482;WS=170628464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr4	170650606	.	CAGA	C	438	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=29;MQ=60.17;NF=12;NR=0;PP=438;QD=39.0833333333;SC=GAAAACCAGGCAGAAGAACCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=50;TCR=2;TR=12;WE=170650616;WS=170650605;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:40,12:0.23:52
chr4	170663321	rs6849004	C	G	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=111;ReadPosRankSum=-0.097;SC=AAAGACCTTTCAAAGTTGAGC;SOR=0.132;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=170663329;WS=170663311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr4	170678993	rs11540095	T	C	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.673;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=22;PP=1357;ReadPosRankSum=-0.036;SC=GCGGCCCCTCTCCGCCGGGCC;SOR=1.302;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=91;TCF=53;TCR=38;TR=58;WE=170679001;WS=170678983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,60:0.64:94
chr4	172735897	rs3796654	C	G	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=38;PP=1155;SC=AAAGATCACACAAGGATTGGT;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=38;WE=172735905;WS=172735887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr4	172973421	rs1505494	G	A	964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=0;PP=574;SC=AGAGCCTCAAGGCAGAGAGGA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=20;WE=172973432;WS=172973411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr4	172973423	rs10572855	CAG	C	955.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=767;SC=AGCCTCAAGGCAGAGAGGATA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=17;WE=172973432;WS=172973411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	172973580	rs1505495	C	A	1893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=23;PP=1483;SC=TTTACCCCAACCCATTCACCA;SOR=0.950;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=32;TCR=23;TR=55;WE=172973588;WS=172973570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr4	173232679	rs2136033	A	G	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=0;PP=1423;SC=AATAGGCGATAATACACATTC;SOR=7.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=47;WE=173232687;WS=173232669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	173232805	rs9312524	G	A	1841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.150;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=25;PP=1321;ReadPosRankSum=0.073;SC=TTACTGAAGAGGACCATGATG;SOR=0.792;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=210;TCF=138;TCR=72;TR=76;WE=173232813;WS=173232795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,80:0.37:215
chr4	173232944	rs168011	G	T	2477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.000;QD=18.22;ReadPosRankSum=0.522;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,88:0.65:136
chr4	173269638	rs333399	T	C	1727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=9;PP=1380;ReadPosRankSum=-0.761;SC=AAGAGTTTTGTATTTGACACA;SOR=0.753;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=89;TCF=76;TCR=13;TR=59;WE=173269646;WS=173269628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,61:0.64:95
chr4	173269915	rs333398	C	T	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=-0.583;SC=TTAAAAAAGACAATGGGAGCT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=8;WE=173269923;WS=173269905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr4	173803914	rs6810619	T	C	2769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=25;PP=2278;ReadPosRankSum=-0.204;SC=TCATAGTCCTTTAAAGATTAT;SOR=0.770;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=100;TCR=35;TR=98;WE=173803922;WS=173803904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,99:0.73:136
chr4	173873170	rs11322401	TG	T	2602.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.99;NF=50;NR=17;PP=2878;SC=ATGACATTTTTGTTTTCCTGC;SOR=2.365;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=50;TCR=17;TR=67;WE=173873178;WS=173873160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	173930479	rs4696042	A	G	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=685;SC=GGCAGTGGGAACCAGTCGGGG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=173930487;WS=173930469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	174090004	rs3733477	G	A	1761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.706;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=27;PP=1468;ReadPosRankSum=0.344;SC=TGAAGATTGGGTTCATCTTAC;SOR=0.779;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=119;TCF=71;TCR=48;TR=71;WE=174090012;WS=174089994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,68:0.59:116
chr4	174216691	.	G	A	1437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.055;ClippingRankSum=0.000;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.414;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=41;PP=1094;ReadPosRankSum=0.667;SC=GGAAGCATTTGATATCTACAA;SOR=1.116;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=148;TCF=42;TCR=106;TR=55;WE=174216699;WS=174216681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,58:0.37:155
chr4	174235079	rs138768800	GAT	G	107.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=5.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.977;SOR=0.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,8:0.15:52
chr4	174310777	rs4695833	A	T	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=2;PP=446;SC=AGGTCTGGGGAGGAGTCCAAG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=174310785;WS=174310767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	174458022	rs3775588	T	A	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.612;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=790;ReadPosRankSum=-1.019;SC=TTCATGGGGATGTATAACCGA;SOR=0.609;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=163;TCF=75;TCR=88;TR=48;WE=174458030;WS=174458012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,52:0.30:174
chr4	174458142	rs3775587	C	G	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.068;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=393;ReadPosRankSum=0.746;SC=GATCAGATCCCTCTGGGAAAA;SOR=0.833;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=78;TCF=18;TCR=60;TR=24;WE=174458150;WS=174458132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,26:0.31:83
chr4	174537063	rs4413383	G	A	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.050;NF=25;NR=0;PP=608;ReadPosRankSum=0.000;SC=TGGAGATCCAGACATAAGTGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=25;WE=174537071;WS=174537053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,23:0.77:30
chr4	175220223	rs201923363	G	A	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=538;ReadPosRankSum=-1.160;SC=CTATTTTCAGGTGAAAAATTA;SOR=0.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=62;TCR=2;TR=25;WE=175220231;WS=175220213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,26:0.40:65
chr4	175224971	rs75428449	A	C	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.673;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=107;ReadPosRankSum=-0.298;SC=TGTGATGAAAAAGCACAAGGA;SOR=1.574;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=7;WE=175224979;WS=175224961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,9:0.27:33
chr4	175225452	rs4695918	G	A	5379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=110;NR=56;PP=2965;SC=ACCTCCTTTGGGCAATGAGAA;SOR=1.528;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=110;TCR=56;TR=166;WE=175225460;WS=175225442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr4	175237408	rs1553669	T	C	2429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=56;PP=1681;SC=GAGCCTCTACTGTTAATTACT;SOR=1.967;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=20;TCR=56;TR=76;WE=175237416;WS=175237398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr4	175237536	rs72993320	C	T	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.09;ReadPosRankSum=0.134;SOR=0.156;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr4	175429370	rs5864277	GT	G	981.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.941;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=26;PP=1117;ReadPosRankSum=0.899;SC=TGATGTACGAGTTAAGGAATG;SOR=1.398;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=84;TCF=19;TCR=65;TR=31;WE=175429378;WS=175429360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,35:0.36:97
chr4	175429808	rs3775977	G	A	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.790;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=463;ReadPosRankSum=0.493;SC=CAAATTACCAGTAAGAAAATG;SOR=1.593;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=21;WE=175429816;WS=175429798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr4	175580119	rs6553802	T	C	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=2.021;SC=TCCCAATTGCTTCTCTTTTCA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=175580127;WS=175580109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr4	175598334	rs6812439	T	C	1397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=34;PP=1005;SC=TGATCCAGAATGAAACCCAGG;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=43;WE=175598342;WS=175598324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	175649861	rs1872548	T	G	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.45;QD=38.38;SOR=3.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	175649873	rs3834804	GA	G	732.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.49;QD=34.89;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	175688138	rs7696263	A	G	9250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.35;SOR=0.979;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr4	175688141	rs12651268	G	A	9215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.31;SOR=0.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr4	175688274	rs143704640	TAC	T	526.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=0;NR=10;PP=498;SC=TATTCCATTTTACACACACAC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=10;WE=175688283;WS=175688264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	175899001	.	T	TCAGAGTCAACCTCCTGTGATGCCTTCCCAGAGTCATCCTCAGTTGACGCCTTCC	2052.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.000;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=9.600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;QD=70.78;ReadPosRankSum=-0.147;SOR=0.072;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr4	176562088	rs150679897	T	C	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=493;ReadPosRankSum=1.637;SC=CATTTTATCTTATGTTATGTT;SOR=1.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=20;WE=176562096;WS=176562078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr4	176733450	rs62338073	G	T	735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=274;SC=GAAAAACTGGGGGTTTTTTTT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=12;WE=176733460;WS=176733440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	176733451	.	GGT	G	227	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;FR=1.0000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=59.78;NF=0;NR=9;PP=227;QD=28.6666666667;SC=AAAAACTGGGGGTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=9;WE=176733460;WS=176733440;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,9:0.75:12
chr4	176733452	rs113129787	G	T	735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.98;QD=45.99;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	176892056	rs11366469	CT	C	781.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.053;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.832;NF=5;NR=25;PP=559;ReadPosRankSum=-0.524;SC=CCGACAGACCCTTTTTTTTCC;SOR=0.141;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=30;WE=176892064;WS=176892046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,35:0.83:42
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chr4	177049731	rs13107453	G	A	92.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5059;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=62;ReadPosRankSum=1.282;SC=ATAGTATTTCGGTTGTTAGGT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=177049739;WS=177049721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr4	177049854	rs28698547	C	T	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=243;ReadPosRankSum=0.759;SC=TCATACAAAACTTGTTAAAAT;SOR=0.990;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=13;WE=177049862;WS=177049844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr4	177049880	rs28607147	T	C	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.352;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=354;ReadPosRankSum=-1.194;SC=TTTTCCCTGATCTGACTAGAT;SOR=1.022;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=16;WE=177049888;WS=177049870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr4	177050057	rs78649239	G	A	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=417;ReadPosRankSum=-0.366;SC=AAAATATTGTGTTTTCTATCA;SOR=0.527;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=5;WE=177050081;WS=177050047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr4	177050062	rs71830098	CTATCAAATAAAA	C	121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=542;ReadPosRankSum=-0.328;SC=ATTGTGTTTTCTATCAAATAA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=2;WE=177050081;WS=177050047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr4	177052925	rs7699831	G	C	1910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=60;PP=1606;ReadPosRankSum=1.199;SC=ATACATAATAGTTTTTTGTGT;SOR=1.900;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=85;TCF=0;TCR=85;TR=60;WE=177052933;WS=177052915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,61:0.71:86
chr4	177056340	rs59567138	A	G	3124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.957;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=41;PP=2598;ReadPosRankSum=-1.862;SC=TGATGGCACTATAAAAGTCTG;SOR=1.231;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=174;TCF=101;TCR=73;TR=111;WE=177056348;WS=177056330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,112:0.63:178
chr4	177058524	.	A	T	35	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5032;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=35;QD=34.8856062736;SC=TTTATCTATAATTTTATACAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=2;WE=177058532;WS=177058514;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr4	177058580	rs9884643	A	T	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=226;ReadPosRankSum=0.588;SC=TCTGCAAATCACAGTTCTTAC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=9;WE=177058588;WS=177058570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr4	177063096	rs9995480	G	A	95.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=67;ReadPosRankSum=1.282;SC=TGTATTTAGAGTATTGTTTTT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=177063104;WS=177063086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr4	177073026	rs4690661	G	A	5789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=76;PP=2965;SC=TGGTGTACCTGCTAAAGAGGA;SOR=1.010;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=176;TCF=99;TCR=77;TR=175;WE=177073034;WS=177073016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr4	177083166	rs2877924	A	G	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=335;SC=AAAAAGTATTAGTTTGCTTTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=177083174;WS=177083156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	177083333	rs12646277	A	G	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.347;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=225;ReadPosRankSum=-0.322;SC=GAGGTACGACATTTAAAACTG;SOR=0.051;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=12;WE=177083341;WS=177083323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr4	177083373	rs73003486	T	A	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.830;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=187;ReadPosRankSum=0.753;SC=TTTTTAGATATGTCATGGTGT;SOR=3.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=9;WE=177083381;WS=177083363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr4	177083412	rs73003487	A	G	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=79;ReadPosRankSum=-0.272;SC=GTGACTTTCTATGTGAGATCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=177083420;WS=177083402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr4	177087322	rs4388031	C	T	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.58;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=338;SC=TTTAAGAACACATTCCTTTAA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=177087330;WS=177087312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	177089844	rs74461750	TC	GA	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=1234;ReadPosRankSum=1.863;SC=CTGATCTTCTTCTGATGATTC;SOR=0.739;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=26;WE=177089853;WS=177089827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr4	177105882	rs73005172	G	A	1880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-6.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.117;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=11;PP=1504;ReadPosRankSum=-0.237;SC=TCTTTATTATGGCTAGAGATG;SOR=1.055;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=102;TCF=85;TCR=17;TR=70;WE=177105890;WS=177105872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,71:0.70:102
chr4	177113764	rs6857056	A	C	2040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=12;PP=1540;SC=CAGCTGTTTCAAAGGAAAACT;SOR=2.869;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=62;TCF=49;TCR=13;TR=61;WE=177113772;WS=177113754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr4	177113779	rs12502935	T	C	2310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=19;PP=1689;SC=AAAACTTACCTGGATTCAATT;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=74;TCF=54;TCR=20;TR=73;WE=177113787;WS=177113769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	177113956	rs2291244	A	G	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.865;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=451;ReadPosRankSum=0.039;SC=TCTGGTAGCTATAGTCCGTGA;SOR=0.798;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=88;TCF=35;TCR=53;TR=26;WE=177113964;WS=177113946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,27:0.29:92
chr4	177116779	rs4565028	T	C	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=387;ReadPosRankSum=-0.534;SC=GGCGGCGCGGTCTCGTGGGGC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=17;WE=177116787;WS=177116769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr4	177137988	rs6827525	C	T	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=129;ReadPosRankSum=0.598;SC=GAAGCAATATCCTTTCCACCA;SOR=0.752;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=8;WE=177137996;WS=177137978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr4	177142776	rs10032098	C	A	3028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=39.33;ReadPosRankSum=1.845;SOR=0.888;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,76:0.99:77
chr4	177142776	.	CA	AA,AC	1101	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=18,11;NR=49,34;PP=339,1101;QD=5.57867481414;SC=AATATCCAAACATAAGATTCA;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=18;TCR=50;TR=67,45;WE=177142785;WS=177142766;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.99:68
chr4	177142777	rs13120838	A	C	1530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.41;ReadPosRankSum=-0.688;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,54:0.72:75
chr4	177142869	rs28415362	T	G	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=352;ReadPosRankSum=-1.338;SC=AATGTGCACATTAAATATGAC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=16;WE=177142877;WS=177142859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
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chr4	177143664	rs6553937	C	G	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=485;SC=ATATTTTAGACATCAAAGAAT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=177143672;WS=177143654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr4	177146627	rs10013975	T	C	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=240;ReadPosRankSum=0.635;SC=CAGATACTTATACTGTACATT;SOR=0.622;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=12;WE=177146635;WS=177146617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr4	177241136	rs2305506	C	T	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=418;ReadPosRankSum=-0.583;SC=ACGCGCGCACCGCAGACGGCG;SOR=0.385;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=55;TCR=0;TR=22;WE=177241144;WS=177241126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,23:0.40:57
chr4	177605081	rs5864401	CTCA	C	8138.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=41;PP=2969;SC=ACAATCTTAGCTCATCATTTG;SOR=2.102;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=151;TCF=105;TCR=46;TR=141;WE=177605091;WS=177605071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr4	177608707	rs7664413	C	T	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=115;ReadPosRankSum=-1.017;SC=TTTACTATACCTTACTTGGTT;SOR=0.922;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=7;WE=177608715;WS=177608697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr4	177608875	rs4529000	A	C	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=0;PP=847;SC=TCACTTATTTAGAAGAATGAT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=177608883;WS=177608865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr4	177650614	rs3836595	T	TA	643.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=753;SC=ACACTGAAATTAAAGAACCAG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=19;WE=177650622;WS=177650606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr4	178167282	rs1347894	G	A	2741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=47;PP=2111;SC=GACCTAAACAGTCACTGAAAC;SOR=0.972;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=37;TCR=47;TR=84;WE=178167290;WS=178167272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr4	178169500	rs3828517	G	A	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.763;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=22;PP=800;ReadPosRankSum=0.049;SC=GGGGAGGTTTGTGATAGCAAT;SOR=0.852;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=172;TCF=87;TCR=85;TR=51;WE=178169508;WS=178169490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,54:0.30:183
chr4	178231152	rs10013040	C	A	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.6787;FS=1.992;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=474;ReadPosRankSum=1.330;SC=AGAAGATTCGCGCGCGGGTGC;SOR=0.885;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=28;TCF=15;TCR=13;TR=23;WE=178231160;WS=178231142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,24:0.83:29
chr4	178256759	rs3215157	CA	C	96.52	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5561;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=47;ReadPosRankSum=0.180;SC=GCTTATAATCCAAAAAAAAAA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=178256767;WS=178256749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr4	178256913	rs7689099	C	G	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.384;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=145;ReadPosRankSum=-0.151;SC=GGAGCTTCTCCTGTTTTGGAA;SOR=0.889;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=12;WE=178256921;WS=178256903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr4	178257516	rs2271102	G	A	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.854;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=48;PP=1370;ReadPosRankSum=-0.393;SC=TTGATTTTTCGGTACTGTGAA;SOR=0.183;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=83;TCF=8;TCR=75;TR=55;WE=178257524;WS=178257506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,58:0.67:87
chr4	178261034	rs36204377	GTGTAAAA	G	1610.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.357;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.766;NF=10;NR=25;PP=1790;ReadPosRankSum=1.076;SC=TTTTTCAACTGTGTAAAATGT;SOR=1.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=17;TCR=43;TR=35;WE=178261048;WS=178261024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,41:0.65:63
chr4	178262613	rs35370036	GT	G	198.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=0.881;QD=5.37;ReadPosRankSum=0.918;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr4	178262683	rs17676249	T	C	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=367;ReadPosRankSum=-0.628;SC=ACAAGCGTCCTAATTGTGGTC;SOR=0.816;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=31;TCR=28;TR=21;WE=178262691;WS=178262673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr4	178262811	rs28618113	T	C	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.58;ReadPosRankSum=-0.497;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,5:0.19:27
chr4	178272748	rs1054753	G	A	3202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=81;PP=2572;SC=TTCTAAGAGGGTTAATTATAC;SOR=3.523;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=14;TCR=81;TR=95;WE=178272756;WS=178272738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr4	178274565	rs2048074	A	G	2635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=24;PP=2154;SC=AGATCAACAGAAAAACTGCAT;SOR=1.640;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=51;TCR=24;TR=75;WE=178274573;WS=178274555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr4	178274694	rs10007075	T	G	4246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=67;PP=2965;SC=CTGCTAGTGTTTGTTTGAATG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=62;TCR=68;TR=129;WE=178274702;WS=178274684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr4	178274750	rs13112358	C	T	3651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.734;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=77;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.835;SC=ATAACTCAACCATCCAGCAAA;SOR=1.447;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=35;TCR=77;TR=111;WE=178274758;WS=178274740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,115:0.99:116
chr4	178274835	rs13112390	A	C	2088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=44;PP=1721;ReadPosRankSum=0.315;SC=AAACAGCCCAATACTCATCAC;SOR=0.610;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=24;TCR=45;TR=68;WE=178274843;WS=178274825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr4	178281754	rs1876268	G	A	5295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=99;PP=2965;SC=CCGAGTTGTGGGGAAGGATGG;SOR=1.296;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=61;TCR=99;TR=160;WE=178281762;WS=178281744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr4	178355668	rs4690521	C	G	6391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=137;PP=2965;SC=TAACAATTTACGGCAGGAAAT;SOR=1.957;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=54;TCR=137;TR=191;WE=178355676;WS=178355658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr4	178357566	rs71599314	A	ATAATTG	396.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=344;ReadPosRankSum=-1.256;SC=ATATAACCAAATAATTGAGCA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=7;WE=178357574;WS=178357556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr4	178359719	rs2271101	A	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=171;ReadPosRankSum=-0.332;SC=ATATGCACCCAATGCAGCTAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=11;WE=178359727;WS=178359709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr4	178359960	rs2228119	G	C	3121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=48;PP=2425;SC=TTGAGAAGCAGTGGTAGATAA;SOR=0.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=43;TCR=48;TR=91;WE=178359968;WS=178359950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr4	178361414	rs34241758	A	C	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=498;ReadPosRankSum=0.316;SC=TAGGACCTGAACGGTGTTCTT;SOR=0.443;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=96;TCF=62;TCR=34;TR=30;WE=178361422;WS=178361404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,30:0.30:99
chr4	178361621	rs3792607	T	A	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.78;ReadPosRankSum=2.208;SOR=0.050;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr4	178363378	rs11131799	G	A	1815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=8;PP=1513;SC=CGGCGCAGCCGCCCGCCCAGG;SOR=3.575;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=52;TCR=8;TR=60;WE=178363386;WS=178363368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr4	178363506	rs34413111	A	G	2564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.603;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=51;PP=2045;ReadPosRankSum=0.560;SC=CGAGAAGCACAGGCAAGTTCG;SOR=0.528;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=169;TCF=80;TCR=89;TR=102;WE=178363514;WS=178363496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,106:0.61:175
chr4	178882120	rs9994032	A	T	1159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=26;PP=884;SC=CCTGAAATGAAATATTTGAAT;SOR=3.026;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=32;WE=178882128;WS=178882110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr4	178887811	rs35244240	C	CTTTT	2133.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=64.69;QD=45.40;SOR=1.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr4	178887815	rs28409849	C	T	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=27;NR=21;PP=1155;SC=TTCTTTCTTTCTTTTTTAATA;SOR=0.909;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=50;TCF=27;TCR=23;TR=48;WE=178887823;WS=178887801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr4	183267728	rs33933747	TA	T	497.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=3;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=23;NR=1;PP=366;SC=AAGACATTCTTAAAAAAAAAA;SOR=4.977;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=24;WE=183267737;WS=183267718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	183268148	rs11373586	C	CG,CGG	472.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=3;MGOF=22;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=17;NF=1,1;NR=14,14;PP=49,133;SC=GTTGACTCCGCGGGGGGGGAT;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=15,15;WE=183268156;WS=183268138;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.54,0.46:13
chr4	183268174	rs6552554	C	T	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.93;QD=32.24;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	183271186	rs10644033	G	GAA	360.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.79;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	183370056	rs11721730	C	T	904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=4;PP=708;SC=AGGGGTTAAGCGGCGCACCGC;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=183370064;WS=183370046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	183370244	rs35591339	AGCG	A	1430.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=25;PP=1314;SC=AAGGTGGGTGAGCGGCGGCGG;SOR=3.611;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=28;WE=183370254;WS=183370234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	183522021	rs141344153	C	CAT	1070.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.584;NF=26;NR=0;PP=1129;ReadPosRankSum=-0.983;SC=TGTGTATATACATATATATAT;SOR=4.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=26;WE=183522029;WS=183522011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,31:0.94:33
chr4	183594117	rs3749508	A	T	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.11;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	183601590	rs34738241	A	AG	502.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.24;MQRankSum=2.367;QD=26.42;ReadPosRankSum=0.000;SOR=2.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,17:0.89:19
chr4	183601819	rs147269509	G	C	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=5.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.23;ReadPosRankSum=1.452;SOR=1.228;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,39:0.25:158
chr4	183650026	rs5864796	GA	G	954.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.042;HP=13;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.356;NF=42;NR=1;PP=542;ReadPosRankSum=-1.748;SC=CACTTGATGTGAAAAAAAAAA;SOR=3.816;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=66;TCF=61;TCR=5;TR=43;WE=183650035;WS=183650016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,49:0.94:52
chr4	183652175	rs10866256	T	C	3840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=61;PP=2965;SC=AAGAGAATGATATTCCCAGCT;SOR=0.874;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=53;TCR=61;TR=114;WE=183652183;WS=183652165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr4	183657915	rs71620944	G	T	1671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=5;PP=1258;ReadPosRankSum=1.971;SC=TTATCTAATCGTCATACGTGA;SOR=0.675;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=81;TCF=74;TCR=7;TR=53;WE=183657923;WS=183657905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,57:0.67:85
chr4	183659722	rs74988363	G	C	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.919;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=595;ReadPosRankSum=1.020;SC=ATAGATAACTGATGTTGTAAT;SOR=2.355;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=77;TCF=17;TCR=60;TR=28;WE=183659730;WS=183659712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,30:0.39:77
chr4	183664593	rs7676674	G	A	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.921;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=46;PP=1043;ReadPosRankSum=0.138;SC=CCTAAATTTGGGCTTTTAACC;SOR=1.402;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=155;TCF=27;TCR=128;TR=53;WE=183664601;WS=183664583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,55:0.34:161
chr4	183665437	rs6835335	C	G	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.108;SOR=0.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr4	183673247	.	T	A	44	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=29;MQ=61.19;NF=0;NR=4;PP=44;QD=19.6928031368;SC=AAAAAGGGGTTGAAAATCCAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=4;WE=183673255;WS=183673237;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,4:0.27:15
chr4	183674597	rs71620945	A	C	2216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.947;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=2;PP=1877;ReadPosRankSum=1.344;SC=CTTCTCTCAAATACAGGAATG;SOR=2.196;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=130;TCF=124;TCR=6;TR=80;WE=183674605;WS=183674587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,79:0.62:128
chr4	183674697	rs17263582	C	T	2716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.888;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=40;PP=1923;ReadPosRankSum=0.559;SC=CTCTTCTGGGCTCTAACGATT;SOR=0.620;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=325;TCF=208;TCR=117;TR=113;WE=183674705;WS=183674687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:223,121:0.35:344
chr4	183694501	rs6848256	G	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=159;ReadPosRankSum=0.132;SC=ACTCTGCATCGCTCATCCACG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=8;WE=183694509;WS=183694491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr4	183814169	rs2070805	A	G	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.212;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=412;ReadPosRankSum=0.990;SC=CCCCGCCCGCATTCTCCCCAC;SOR=2.093;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=23;WE=183814177;WS=183814159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,24:0.73:33
chr4	183815688	rs4742	A	G	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=35;PP=1102;ReadPosRankSum=0.962;SC=GGAACAAGGCAACATACATAC;SOR=0.691;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=249;TCF=123;TCR=126;TR=72;WE=183815696;WS=183815678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,74:0.29:255
chr4	183837910	rs72553959	C	T	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=144;ReadPosRankSum=0.055;SC=CCATGGGGGGCGAGGGAAGAG;SOR=0.616;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=14;WE=183837918;WS=183837900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,18:0.31:58
chr4	184019033	rs114170858	T	G	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=77;ReadPosRankSum=-0.679;SC=CAGCGCGGAGTCCTGCACACG;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=7;WE=184019041;WS=184019023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr4	184170025	rs907357	G	A	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=28;PP=917;SC=TAAGTTATCTGTGCTGAAGAG;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=184170033;WS=184170015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	184190355	rs11407064	A	AC	5987.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=129;PP=2957;SC=AATAGCACTTAGATTGGGTGG;SOR=3.927;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=10;TCR=131;TR=139;WE=184190363;WS=184190345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr4	184190535	rs6858486	G	A	4011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=99;NR=25;PP=2965;SC=GTGATTTTCTGTAAAAGTTGC;SOR=2.797;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=99;TCR=25;TR=124;WE=184190543;WS=184190525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr4	184192183	rs28647357	T	C	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=1;PP=516;SC=TTTAAACATTTTATTTTCTCT;SOR=4.407;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=18;WE=184192191;WS=184192173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	184192278	rs11734376	G	T	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.325;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=637;ReadPosRankSum=-0.947;SC=TTCCAGTGAGGTTTTCACTCT;SOR=1.681;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=49;TCF=32;TCR=17;TR=31;WE=184192286;WS=184192268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr4	184201909	rs11132173	G	A	2335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=0;PP=1942;SC=GTTAATTGCCGTATGCTTTAC;SOR=7.083;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=64;TCR=0;TR=64;WE=184201917;WS=184201899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr4	184202148	rs11132174	G	T	4782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=119;PP=2965;SC=ATTCCAGAATGATGGAATGCA;SOR=3.080;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=24;TCR=119;TR=143;WE=184202156;WS=184202138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr4	184203706	rs2871353	A	T	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=477;SC=GGATTTTTTTAAATGAGACAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=184203714;WS=184203696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	184203886	rs3814422	G	C	4582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=93;NR=38;PP=2965;SC=AGAGGCCTCTGATGAAATTGT;SOR=2.053;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=93;TCR=38;TR=131;WE=184203894;WS=184203876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr4	184204099	rs3814421	C	T	2289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=66;PP=1807;SC=TGATACCTTACAGGCACCATG;SOR=5.756;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=68;TCF=2;TCR=66;TR=68;WE=184204107;WS=184204089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr4	184240981	rs144080557	C	T	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.655;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.953;NF=39;NR=31;PP=1543;ReadPosRankSum=-0.297;SC=AGGGCTGTGACTCCCGAGGCC;SOR=0.608;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=123;TCF=71;TCR=52;TR=70;WE=184240989;WS=184240971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,37:0.44:84
chr4	184243528	rs7688467	G	A	3075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=54;PP=2337;SC=CATCCCAGGAGAGATAGTAAA;SOR=1.067;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=39;TCR=54;TR=93;WE=184243536;WS=184243518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr4	184366629	rs11282266	T	TGCACA	1571.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=0;PP=1727;SC=GCCTGTTTTTTGCACAAGTAG;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=28;WE=184366637;WS=184366619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	184366895	rs200057043	AT	A	403.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.627;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=406;ReadPosRankSum=0.036;SC=ATTGTTACTAATTTTTTTAAC;SOR=1.745;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=81;TCF=3;TCR=78;TR=22;WE=184366903;WS=184366885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,24:0.33:72
chr4	184367558	rs147291711	TCTG	T	5879.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=56;PP=2948;SC=TAAACACGGTTCTGCATCATT;SOR=0.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=50;TCR=60;TR=104;WE=184367568;WS=184367548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr4	184426387	rs8872	C	T	2867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=45;PP=2279;SC=ACTCGTCGGCCGCGCTCCTGA;SOR=0.780;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=48;TCR=45;TR=93;WE=184426395;WS=184426377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr4	184426526	rs6552675	A	G	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=23;PP=641;SC=TCAAGGTAGGAGCCGCGGGGC;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=184426534;WS=184426516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	184427580	rs62358469	A	G	2154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.848;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=66;PP=1826;ReadPosRankSum=-0.828;SC=TTAAGTGTGGAGGCGAAACCA;SOR=1.408;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=124;TCF=26;TCR=98;TR=79;WE=184427588;WS=184427570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,77:0.63:123
chr4	184570715	rs10015804	T	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.658;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.063;NF=7;NR=8;PP=569;ReadPosRankSum=-1.066;SC=ATATTGCTTATCGATGTCTAA;SOR=0.941;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=44;TCF=24;TCR=20;TR=15;WE=184570731;WS=184570705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,15:0.34:44
chr4	184570723	rs58975219	TA	T	553.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.301;HP=11;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=1058;ReadPosRankSum=0.548;SC=TATCGATGTCTAAAAAAAAAA;SOR=0.652;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=24;TCR=25;TR=28;WE=184570731;WS=184570705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,29:0.62:47
chr4	184570891	rs6552694	T	C	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.093;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5026;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=10;PP=222;ReadPosRankSum=-0.230;SC=TTATTGGTTTTACTCTTTTAA;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=10;WE=184570899;WS=184570881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr4	184572341	rs56817841	GA	G	280.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.865;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=358;ReadPosRankSum=0.663;SC=AGAGTGAAATGAAAAGCAGTA;SOR=0.223;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=13;WE=184572349;WS=184572331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr4	184585267	rs148884652	CTA	C	90.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.501;NF=0;NR=3;PP=81;ReadPosRankSum=-0.204;SC=TTCTCTCTCTCTATGTGTGTG;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=184585276;WS=184585257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr4	184587658	rs5864850	G	GTACC	4568.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=64;PP=2957;SC=AGGCAATGGAGTACCGTTCAG;SOR=2.788;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=98;TCF=14;TCR=84;TR=73;WE=184587666;WS=184587648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr4	184587701	rs9996255	G	A	1405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=41;PP=1136;SC=TTGACCTCCAGTGAATCTTGT;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=41;WE=184587709;WS=184587691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	184588121	rs4282227	C	T	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.051;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=65;ReadPosRankSum=-0.413;SC=AATTTATCTTCGGTTGAATGA;SOR=0.042;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=5;WE=184588129;WS=184588111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
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chr4	184588408	rs62357986	T	C	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.97;ReadPosRankSum=-0.120;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
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chr4	184600731	rs4862233	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=153;ReadPosRankSum=1.034;SC=ACTGAACCAGGTTTTTTGTCA;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=7;WE=184600739;WS=184600721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr4	184601195	rs10022122	T	G	1491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=0;PP=1378;SC=TGAGGTTAAGTTTCCCAGGAT;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=43;WE=184601203;WS=184601185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	184605066	rs62358027	G	A	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.579;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=5;PP=659;ReadPosRankSum=-0.397;SC=CACATACAACGTTCATATGAA;SOR=0.086;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=88;TCF=81;TCR=7;TR=35;WE=184605074;WS=184605056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,37:0.40:93
chr4	184606653	rs11132206	G	A	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=49;PP=1401;SC=TCAAGAAAGAGTTTTCAAAGT;SOR=7.864;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=49;WE=184606661;WS=184606643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	184607970	rs9312316	T	C	1933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=64;PP=1564;SC=CTAGATAAAATGAGCTTAGTG;SOR=6.184;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=65;TCF=1;TCR=64;TR=65;WE=184607978;WS=184607960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr4	184612553	rs67383011	G	C	2151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.718;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=59;PP=1686;ReadPosRankSum=-0.383;SC=GATGTGCCTAGTTCCTGGCAA;SOR=0.834;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=137;TCF=37;TCR=100;TR=79;WE=184612561;WS=184612543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,80:0.58:139
chr4	184614007	rs59341928	A	G	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=1.309;SC=GGGGGTCTCTAGATGAACTCC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=184614015;WS=184613997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr4	184614874	rs4862234	C	T	1468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=44;PP=1009;ReadPosRankSum=0.747;SC=TGAAGCTCACCGCTGGCTTAA;SOR=0.659;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=56;TCR=138;TR=62;WE=184614882;WS=184614864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,65:0.33:197
chr4	184615117	rs62358032	A	C	1346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.003;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=28;PP=1084;ReadPosRankSum=0.235;SC=TCTTCATGGAACAGAACTGTG;SOR=0.322;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=213;TCF=131;TCR=82;TR=62;WE=184615125;WS=184615107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,64:0.30:215
chr4	184615948	rs36221086	TATAAAATAAGC	T	945.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.510;NF=0;NR=16;PP=2980;ReadPosRankSum=0.921;SC=TTAGTTTACCTATAAAATAAG;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=16;WE=184615966;WS=184615938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,24:0.86:28
chr4	184619017	rs12651215	C	G	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.98;QD=34.71;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr4	184619029	rs147708886	TGC	T	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.19;MQRankSum=0.887;QD=9.22;ReadPosRankSum=1.292;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr4	184619034	rs62358033	G	A	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.53;MQRankSum=0.792;QD=11.82;ReadPosRankSum=1.006;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr4	184629794	rs9312318	G	A	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=238;ReadPosRankSum=0.450;SC=TCTTTTTCATGTAAACTTCAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=11;WE=184629802;WS=184629784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr4	184922669	rs3749534	G	A	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=436;ReadPosRankSum=-0.934;SC=AGGTGGCGGTGTGCTGTGGTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=20;WE=184922677;WS=184922659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr4	184931818	rs4861597	G	A	2469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.696;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=49;PP=1913;ReadPosRankSum=0.066;SC=CTAGTGAGACGGTGCTCACGG;SOR=0.624;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=55;TCR=73;TR=87;WE=184931826;WS=184931808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,92:0.69:133
chr4	184932609	rs4862282	G	A	4555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=79;PP=2965;SC=ACACACATGCGCCTAGCGGGG;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=60;TCR=79;TR=139;WE=184932617;WS=184932599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr4	185012402	rs142602934	G	A	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=240;ReadPosRankSum=1.100;SC=CAGTGCTGGCGCGGCCCTTCA;SOR=0.582;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=15;WE=185012410;WS=185012392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr4	185038274	rs4642291	G	A	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=21;PP=604;SC=AATGATAGGAGAAAGGCTATC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=185038282;WS=185038264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	185074686	rs13147555	A	C	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.008;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=433;ReadPosRankSum=-0.482;SC=TGAGATTTGGAATGGATGTTC;SOR=1.230;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=51;TCF=47;TCR=4;TR=21;WE=185074694;WS=185074676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chr4	185075033	rs35344477	A	AT	638.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.629;NF=0;NR=28;PP=449;ReadPosRankSum=-0.501;SC=AAAAAATCAGATTTTTTTTTC;SOR=0.290;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=0;TCR=72;TR=28;WE=185075041;WS=185075023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,29:0.55:53
chr4	185328349	rs72701797	C	T	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.189;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=303;ReadPosRankSum=-2.511;SC=AAGAGGCCAGCGGAGGCCTGT;SOR=1.369;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=64;TCF=54;TCR=10;TR=20;WE=185328357;WS=185328339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,20:0.31:65
chr4	185329227	rs74943424	G	A	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.121;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=3;PP=655;ReadPosRankSum=0.530;SC=CACTGACTATGTTATTTGAAG;SOR=0.158;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=43;TCF=40;TCR=3;TR=30;WE=185329235;WS=185329217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,32:0.71:45
chr4	185550764	rs4647693	T	C	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.742;NF=0;NR=23;PP=569;ReadPosRankSum=0.701;SC=ACATAAGTCTTATTAGTCATA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=23;WE=185550772;WS=185550754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,23:0.74:31
chr4	185550779	rs10660141	T	TA	333.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=15;PP=277;SC=GTCATACAAATAAAAAAAAAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=15;WE=185550787;WS=185550769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	185553098	rs2705897	T	G	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.386;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=44;ReadPosRankSum=-0.576;SC=TTAGAAACTGTAAAGACATTT;SOR=2.110;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=6;WE=185553106;WS=185553088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr4	185559487	rs2705901	G	C	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.585;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=738;ReadPosRankSum=0.157;SC=TTGCCCCACTGCTCGAGGTTT;SOR=1.123;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=128;TCF=69;TCR=59;TR=39;WE=185559495;WS=185559477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,40:0.30:133
chr4	185578229	rs13108061	G	T	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=310;ReadPosRankSum=0.431;SC=TTTGTTGTTTGTTTTAGTAGT;SOR=0.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=16;WE=185578237;WS=185578219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr4	185583092	rs60624489	C	CTATT	4657.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=70;PP=2918;SC=TTATTTCTATCCATCTCTTCA;SOR=2.170;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=87;TCF=8;TCR=79;TR=78;WE=185583100;WS=185583071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr4	185587165	rs2463447	A	G	2210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=41;PP=1749;SC=AAATTCAGCCAGCATTTAATA;SOR=0.832;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=34;TCR=41;TR=75;WE=185587173;WS=185587155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr4	185612953	rs2696035	A	G	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=188;ReadPosRankSum=-1.139;SC=TCCAAATAGCATTGAAACCCA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=9;WE=185612961;WS=185612943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr4	185615567	rs139656616	G	GTATC	1418.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.708;NF=26;NR=0;PP=1474;ReadPosRankSum=-1.136;SC=ATTCACTTTAGTATCTGTCAC;SOR=1.755;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=50;TCR=0;TR=26;WE=185615575;WS=185615562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,34:0.69:49
chr4	185616438	rs13478	C	T	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.844;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=5;PP=704;ReadPosRankSum=-0.614;SC=GTAGACTGCTCTTCTCATCCC;SOR=0.388;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=48;TCF=42;TCR=6;TR=34;WE=185616446;WS=185616428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,35:0.70:50
chr4	185622046	rs11728389	C	T	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=214;ReadPosRankSum=1.087;SC=CTAAGTAACACAATCATTTGT;SOR=0.713;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=14;WE=185622054;WS=185622036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,14:0.26:54
chr4	185634171	rs34353251	CA	C	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.61;ReadPosRankSum=-1.499;SOR=0.576;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr4	185637418	rs2077205	C	T	361.53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=271;ReadPosRankSum=1.676;SC=AAACAAACATCTTTATTACAT;SOR=1.473;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=11;WE=185637426;WS=185637408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr4	185652147	rs3806796	G	A	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.911;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=184;ReadPosRankSum=2.383;SC=AAAAACACAAGAGTTAGGAAA;SOR=0.490;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=12;WE=185652155;WS=185652137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,13:0.30:44
chr4	185652201	rs7675046	G	A	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=17;PP=442;SC=GACCCTTTCCGCGCATTTTTA;SOR=2.670;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=21;WE=185652209;WS=185652191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	185652224	rs11362720	AC	A	272.76	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=4.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=0.112;QD=16.04;ReadPosRankSum=-0.252;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr4	185655171	rs902174	C	T	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=789;ReadPosRankSum=1.495;SC=AGTACTTACCCCTCAGACCTG;SOR=0.770;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=81;TCF=41;TCR=40;TR=41;WE=185655179;WS=185655161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,40:0.49:82
chr4	185655190	rs876840	C	G	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.008;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=728;ReadPosRankSum=-0.017;SC=TGTGAGGCCGCGGCCGCCGCC;SOR=1.571;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=73;TCF=31;TCR=42;TR=38;WE=185655198;WS=185655180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,37:0.51:73
chr4	185655287	rs148806841	G	A	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.637;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=377;ReadPosRankSum=0.481;SC=CAGCCAATCCGGGCCGAGCAC;SOR=0.089;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=19;WE=185655295;WS=185655277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr4	185681475	rs6825554	G	C	3382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=6;PP=2716;SC=ATGGCAATGTGTATGCAGCAA;SOR=4.637;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=86;TCR=6;TR=92;WE=185681483;WS=185681465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr4	185683840	rs939040	A	G	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=22;PP=607;SC=GGTCTGCGAGAGATCTCCAGT;SOR=4.977;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=23;WE=185683848;WS=185683830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	185686032	rs2292898	C	T	2391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=38;PP=1930;ReadPosRankSum=-1.072;SC=CAGGCATGGTCAGGCAGCACC;SOR=0.687;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=90;TCR=63;TR=91;WE=185686040;WS=185686022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,91:0.58:156
chr4	185686856	rs3792314	C	G	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=629;ReadPosRankSum=0.695;SC=TAATTAGCTTCATTTAGCCAT;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=25;WE=185686864;WS=185686846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr4	185687233	rs3749233	C	T	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=261;ReadPosRankSum=-0.074;SC=ACCCCGTTCCCTAACCCATAG;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=12;WE=185687241;WS=185687223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr4	185687687	rs12374289	A	C	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=126;ReadPosRankSum=-0.998;SC=CCTTACCTTCATCTCTCCCTC;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=7;WE=185687695;WS=185687677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr4	185687863	rs11727009	A	G	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=711;ReadPosRankSum=-0.251;SC=TCTTGGAGGCAAAGTCCAAGA;SOR=0.746;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=25;TCR=28;TR=37;WE=185687871;WS=185687853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,37:0.67:55
chr4	185694697	rs7691972	G	A	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=102;ReadPosRankSum=-0.062;SC=CACTTGAACCGCTTCCTTCTC;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=8;WE=185694705;WS=185694687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr4	185697966	rs41278587	G	A	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=614;ReadPosRankSum=-0.439;SC=CAAATCAAATGTAAGCAAATG;SOR=0.767;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=121;TCF=85;TCR=36;TR=35;WE=185697974;WS=185697956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,36:0.29:126
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chr4	185701620	rs7680850	T	C	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.084;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=240;ReadPosRankSum=0.379;SC=AGAAGCAGCATTGGGCCCCAA;SOR=1.292;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=14;WE=185701628;WS=185701610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr4	185705006	rs2102862	G	A	1609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.865;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=13;PP=1288;ReadPosRankSum=-0.277;SC=GAAACCTTCCGGCTCCAAGAA;SOR=1.809;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=83;TCF=61;TCR=22;TR=59;WE=185705014;WS=185704996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,58:0.71:82
chr4	185735054	rs7676928	G	A	256.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=8;PP=197;SC=GAAACTGCACGCAGAGAAGGT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=185735062;WS=185735044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	185736113	rs2280297	G	C	2328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=29;PP=1914;SC=ACTCTCCTTAGTTCCTGACAA;SOR=1.209;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=44;TCR=29;TR=73;WE=185736121;WS=185736103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr4	185772135	rs144295771	T	C	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=4;PP=586;ReadPosRankSum=-0.062;SC=TATTATAACCTCAATTGATAT;SOR=0.578;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=97;TCF=85;TCR=12;TR=32;WE=185772143;WS=185772125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,32:0.33:98
chr4	185772384	rs1032299	A	G	1082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=31;PP=900;SC=GAGACTAGTCACCAAGAGTCC;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=185772392;WS=185772374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	185859505	rs6821859	T	G	3435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=24;PP=2786;SC=TTCAGCTTTATGCATTCATCT;SOR=2.279;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=75;TCR=24;TR=99;WE=185859513;WS=185859495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr4	185940461	rs4862491	C	T	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.886;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=649;ReadPosRankSum=1.163;SC=GGAGAGGCGGCTTGCACCCAG;SOR=0.078;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=32;WE=185940469;WS=185940451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,31:0.72:43
chr4	185941964	rs6841359	G	A	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=38;PP=981;ReadPosRankSum=0.208;SC=CGCTTTGGGCGCTTTTAGGAG;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=10;TCR=54;TR=45;WE=185941972;WS=185941954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,46:0.70:66
chr4	185999348	rs10023344	T	C	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=477;ReadPosRankSum=-0.797;SC=AAAACATGGGTGGGTTTCATG;SOR=0.678;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=67;TCR=5;TR=25;WE=185999356;WS=185999338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,27:0.36:74
chr4	185999404	rs10033666	A	T	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.545;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=14;PP=662;ReadPosRankSum=0.361;SC=CAGGAGGCATATGGGATGAAG;SOR=0.256;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=133;TCF=100;TCR=33;TR=42;WE=185999412;WS=185999394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,43:0.32:135
chr4	185999543	rs6841061	G	A	1418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.727;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=43;PP=1126;ReadPosRankSum=-0.980;SC=CTCGAGGAATGAAATGGTCAA;SOR=1.025;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=189;TCF=64;TCR=125;TR=63;WE=185999551;WS=185999533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,64:0.32:198
chr4	185999587	rs6818170	T	A	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.036;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=31;PP=530;ReadPosRankSum=-0.161;SC=TAAGCCTTGATCTACCCTATA;SOR=0.499;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=126;TCF=17;TCR=109;TR=37;WE=185999595;WS=185999577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,38:0.29:132
chr4	186065844	rs34795113	C	CT	217.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=2;PP=162;SC=AAGTGCAAACCTTTTTTTTTC;SOR=2.093;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=8;WE=186065852;WS=186065834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr4	186111639	rs1133657	T	C	4481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=56;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.805;SC=CATTTTGGTGTAGTACTTGAA;SOR=0.402;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=80;TCR=56;TR=135;WE=186111647;WS=186111629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,140:0.99:141
chr4	186112111	rs3108237	G	A	4812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=98;PP=2965;SC=CATTCTCTACGGGGTGTTCTG;SOR=1.842;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=143;TCF=44;TCR=99;TR=142;WE=186112119;WS=186112101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr4	186112369	rs34825796	G	GA	783.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=558;SC=AAATATATCTGAAAAAAAAAT;SOR=3.690;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=26;WE=186112377;WS=186112359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr4	186168387	rs3108252	T	G	219.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.57;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=101;SC=CTTTGATTTTTTTTTTTTATG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=186168395;WS=186168377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr4	186170358	rs3108229	G	A	1434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=37;PP=1151;SC=TTTTAACTTTGTAATAAATTA;SOR=3.816;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=42;WE=186170366;WS=186170348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr4	186188373	rs57930723	TA	T	231.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.723;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr4	186320666	rs11287696	TA	T	877.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.333;NF=36;NR=0;PP=681;ReadPosRankSum=1.643;SC=TTGTAAGATATAAAAAAAAAG;SOR=5.838;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=54;TCR=0;TR=36;WE=186320674;WS=186320656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr4	186321067	rs1053218	C	T	1393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=8;PP=1153;SC=ACTGGTTATACTTACCAGAGT;SOR=2.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=40;WE=186321075;WS=186321057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr4	186321447	rs3733646	C	G	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=4;PP=698;SC=TAATTTAAATCGTCAAACTAG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=186321455;WS=186321440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr4	186323209	rs3733645	A	G	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=1;PP=391;SC=CACTGTTTCTACAAGGCAGGG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=186323217;WS=186323199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	186323593	rs6552880	C	T	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=308;SC=CAAAAGACTTCAGTAAACTGA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=186323601;WS=186323583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr4	186324841	rs13126680	T	A	3391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=95;PP=2824;SC=TCAATTTAAATAGACAGATTA;SOR=6.974;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=97;TCF=2;TCR=95;TR=97;WE=186324849;WS=186324831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr4	186336583	rs10032989	G	A	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=9;PP=351;SC=TATATCCTTAGTATAGTAAAA;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=186336591;WS=186336573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr4	186339584	rs10003160	A	G	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=7;PP=792;SC=GAAGACAGATAGTTTGCTTAC;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=186339592;WS=186339574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr4	186347055	rs2289720	G	A	5486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=122;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.817;SC=GGGCGCTGACGCCTGCCCAAA;SOR=0.785;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=60;TCR=123;TR=182;WE=186347063;WS=186347045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,189:0.99:190
chr4	186347073	rs11132303	G	C	4193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=115;PP=2965;SC=AAAAGTTCCGGGGGCCGGCCC;SOR=2.686;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=33;TCR=115;TR=148;WE=186347081;WS=186347063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr4	186347092	rs10866275	T	C	3233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=100;PP=2583;SC=CCTGAAGTGGTGTCACCGCAC;SOR=4.370;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=11;TCR=100;TR=111;WE=186347100;WS=186347082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr4	186357523	rs7697970	C	G	1354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=37;PP=1115;SC=GGTAAAAAATCTGTTTTGAAT;SOR=3.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=41;WE=186357531;WS=186357513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr4	186361876	rs4476640	A	G	1700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=44;PP=1316;SC=GTAAAAAGGTAAGTTTACAAT;SOR=5.590;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=45;WE=186361884;WS=186361866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr4	186366315	rs2120414	T	C	2599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=73;PP=2304;SC=GCTTACAAACTAAGAAAAAAT;SOR=7.249;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=74;TCF=1;TCR=73;TR=74;WE=186366323;WS=186366305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr4	186366809	rs6833872	C	T	154.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=7;PP=189;SC=CCAGGTTTTGCATACTCTCAA;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=186366817;WS=186366799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr4	186370676	rs35349112	T	TA	729.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=21;NR=3;PP=420;SC=GACCCGGTCTTAAAAAAAAAA;SOR=3.767;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=24;WE=186370684;WS=186370666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr4	186378541	rs11722096	C	G	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.770;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=401;ReadPosRankSum=-0.042;SC=TCTAAGCTCACTCTCTCCTGT;SOR=0.252;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=58;TCF=18;TCR=40;TR=23;WE=186378549;WS=186378531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,23:0.39:59
chr4	186378790	rs4279261	T	C	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=2;PP=412;SC=AAATATATACTTAATTCCAAT;SOR=3.126;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=15;WE=186378798;WS=186378780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr4	186379104	rs7664578	T	C	1083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.84;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	186379371	rs7687202	G	A	2461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=44;PP=2115;SC=TTCTTGAAATGTAAGTTGTTT;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=29;TCR=44;TR=73;WE=186379379;WS=186379361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr4	186379899	rs35596415	G	C	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=185;ReadPosRankSum=0.804;SC=CTTTTAGCTGGATTATCTCTA;SOR=0.551;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=12;WE=186379907;WS=186379889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,12:0.29:41
chr4	186380243	rs59319722	A	C	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.920;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=145;ReadPosRankSum=1.044;SC=TCTTTGCTGTATTCTTCTGTT;SOR=1.539;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=8;WE=186380251;WS=186380233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,8:0.20:40
chr4	186380295	rs36007437	A	G	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=5.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.055;SOR=1.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,11:0.23:48
chr4	186380515	rs11132306	G	A	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=288;ReadPosRankSum=-1.326;SC=CTCATTTTCAGATATTATTGA;SOR=0.636;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=16;WE=186380523;WS=186380505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr4	186380846	rs7698680	A	T	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.859;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.94;MQRankSum=-1.425;NF=20;NR=13;PP=533;ReadPosRankSum=0.733;SC=TTACCGTCCAAGTTTTCTTCC;SOR=0.456;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=102;TCF=68;TCR=34;TR=33;WE=186380854;WS=186380836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,33:0.32:102
chr4	186381115	rs7699687	G	T	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.07;ReadPosRankSum=-0.079;SOR=0.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,21:0.27:77
chr4	186381165	rs7699724	G	A	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.875;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=480;ReadPosRankSum=1.324;SC=TCTTCAAGATGTCAGAATTTT;SOR=0.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=64;TCR=29;TR=28;WE=186381173;WS=186381155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,31:0.32:98
chr4	186382206	rs11132309	A	G	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=12.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.71;ReadPosRankSum=0.711;SOR=2.263;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,19:0.22:88
chr4	186391759	rs28715304	G	A	284.56	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9992;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=177;ReadPosRankSum=0.465;SC=GCAACGGAGCGTAGCGTGGTG;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=10;WE=186391767;WS=186391749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr4	186391868	rs28581909	T	C	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.244;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=432;ReadPosRankSum=-0.990;SC=CCCGTTTCCTTATCTGCAAAA;SOR=1.453;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=19;WE=186391876;WS=186391858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr4	186391898	rs66481949	C	T	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.949;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=423;ReadPosRankSum=-0.959;SC=TGGTAGCACCCACCTCGTAAA;SOR=1.317;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=48;TCF=28;TCR=20;TR=22;WE=186391906;WS=186391888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr4	186423637	rs4635850	G	A	2148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=33;PP=1637;SC=CCACAGCACCGCTGTTGGGGA;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=34;TCR=33;TR=67;WE=186423645;WS=186423627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr4	186423677	rs10866276	G	A	1977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=40;PP=1582;SC=AAAAACCACAGAGCAAAAATA;SOR=1.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=18;TCR=40;TR=58;WE=186423685;WS=186423667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr4	186427841	rs2306705	T	C	1328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=46;PP=1081;ReadPosRankSum=1.633;SC=CATCGTCAGGTGCTGGGAGGC;SOR=6.399;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=47;WE=186427849;WS=186427831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr4	186444698	rs4862543	A	C	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.13;QD=41.36;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	186444704	rs4861669	C	T	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.34;QD=46.99;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr4	186456617	rs4862545	A	G	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=44;PP=1379;SC=ACCGGGCTCTAAGTGTCCCCG;SOR=4.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=47;WE=186456625;WS=186456607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr4	186528433	rs13144963	T	C	3013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=57;PP=2119;SC=GCCAGTTCCCTGGAGAGCTCC;SOR=1.043;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=42;TCR=58;TR=99;WE=186528441;WS=186528423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr4	186541301	rs61753946	A	G	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.124;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=35;PP=1048;ReadPosRankSum=0.337;SC=TAGGGGACTCACGGTCTATTG;SOR=0.927;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=68;TCF=17;TCR=51;TR=46;WE=186541309;WS=186541291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,46:0.68:68
chr4	186544435	rs28528960	C	T	1174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.646;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=24;PP=812;ReadPosRankSum=1.001;SC=TCTTAGGAGCCGAATTTTTTT;SOR=0.602;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=138;TCF=62;TCR=76;TR=47;WE=186544443;WS=186544425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,51:0.35:145
chr4	186544879	rs61910743	G	C	4460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FS=2.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.10;ReadPosRankSum=1.679;SOR=0.853;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,176:0.64:277
chr4	186545719	rs13119106	G	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=297;ReadPosRankSum=0.965;SC=AGAGAGGAGAGCATGTCAGTA;SOR=0.770;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=6;WE=186545736;WS=186545709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr4	186545728	rs3841443	TA	T	86.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=283;ReadPosRankSum=1.437;SC=AGCATGTCAGTAAAGCATCAG;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=5;WE=186545736;WS=186545709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr4	186572791	rs4862557	C	T	3529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=94;NR=14;PP=2815;SC=TTGTTATGCACGCTCTGAGAA;SOR=3.816;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=94;TCR=14;TR=108;WE=186572799;WS=186572781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr4	186577592	rs35071718	G	C	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=4.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.27;ReadPosRankSum=0.149;SOR=0.044;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,7:0.17:40
chr4	186606175	rs55654028	C	T	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.36;ReadPosRankSum=-0.362;SOR=0.984;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,21:0.38:55
chr4	186611551	rs6823677	G	A	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=87;ReadPosRankSum=0.563;SC=GGCTATAAGAGTGGGGCACAA;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=6;WE=186611559;WS=186611541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr4	186611663	rs6823546	C	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=1.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.15;ReadPosRankSum=1.079;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,11:0.18:60
chr4	186611819	rs79427853	A	G	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=31;PP=810;ReadPosRankSum=2.423;SC=AGAAAATATCATGAAAGTGTG;SOR=0.533;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=39;WE=186611827;WS=186611809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,41:0.82:50
chr4	186997643	rs1568358	C	G	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=497;SC=TGGCATAAAACTATGAGTAAT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=186997651;WS=186997633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr4	187004074	rs3775291	C	T	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.660;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=685;ReadPosRankSum=-0.514;SC=CTTACACATACTCAACCTAAC;SOR=1.188;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=134;TCF=82;TCR=52;TR=40;WE=187004082;WS=187004064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,41:0.29:141
chr4	187004217	rs3775290	C	T	4351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.127;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=60;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.473;SC=AAAATATTTTCGAAATCTATC;SOR=0.801;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=211;TCF=122;TCR=89;TR=145;WE=187004225;WS=187004207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,153:0.69:223
chr4	187005376	rs6830345	T	C	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=25;PP=623;SC=TTCAATTAAATTTCTTTTTTT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=187005387;WS=187005366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr4	187005379	rs141759307	C	CT	147.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQRankSum=0.157;QD=9.23;ReadPosRankSum=-0.516;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr4	187072887	rs2276916	A	G	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=305;ReadPosRankSum=-0.559;SC=CATTTCTCAGAAAGGTAACAG;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=13;WE=187072895;WS=187072877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr4	187072932	rs2276914	A	G	1132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=4;PP=851;SC=CAAAGCCACCATCTTTTTACC;SOR=4.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=39;WE=187072940;WS=187072922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr4	187073000	rs2276913	A	G	2304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=20;PP=1700;SC=GCGTTGATCCAGAAGCCCGCA;SOR=2.219;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=60;TCR=20;TR=80;WE=187073008;WS=187072990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr4	187073030	rs2276912	T	C	3181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=42;PP=2253;SC=CTTGCAGTGTTGTAACCAAGT;SOR=1.118;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=64;TCR=42;TR=105;WE=187073038;WS=187073020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr4	187074833	rs4862650	A	G	1470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=31;PP=1150;SC=GCCCACTGACAAAGGCGTCCA;SOR=2.110;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=43;WE=187074841;WS=187074823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	187075474	rs6552958	G	A	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.58;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=35;ReadPosRankSum=0.792;SC=TTTTAAGGACGTGAGTTTTGT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=3;WE=187075482;WS=187075470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr4	187077027	rs55822915	C	T	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=233;ReadPosRankSum=-0.797;SC=TAAAAAAGAACGATGCTGTTT;SOR=0.622;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=12;WE=187077035;WS=187077017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr4	187077206	rs4862653	A	G	5527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=77;PP=2965;SC=GAAATGGCGCAAACTCGGACT;SOR=0.853;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=174;TCF=97;TCR=77;TR=174;WE=187077214;WS=187077196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr4	187077393	rs7670550	T	C	1794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=47;PP=1441;ReadPosRankSum=-0.032;SC=GTCCCTGTTCTTCGGCCCTGG;SOR=2.621;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=6;TCR=48;TR=53;WE=187077401;WS=187077383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr4	187077437	rs13114283	G	A	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=671;SC=GACCTAGAACGTGACCAGTGA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=187077445;WS=187077427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr4	187078785	rs2276924	A	G	4226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=93;PP=2965;SC=CTCGTTCCACACGCTCACGCC;SOR=1.422;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=49;TCR=93;TR=142;WE=187078793;WS=187078775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr4	187078819	rs2276923	C	G	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.529;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=33;PP=758;ReadPosRankSum=0.730;SC=GCCCCCCGTCCGGACACGCCG;SOR=0.355;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=110;TCF=19;TCR=91;TR=42;WE=187078827;WS=187078809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,43:0.39:111
chr4	187078866	rs2276922	C	T	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=40;PP=1008;ReadPosRankSum=-0.199;SC=CGTCTGAACCCGCCCCAGGTC;SOR=0.604;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=55;TCF=2;TCR=53;TR=42;WE=187078874;WS=187078856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,42:0.75:56
chr4	187078938	rs2276920	G	A	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.036;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=225;ReadPosRankSum=-0.081;SC=TCAGTTTGTCGTTCTGTTAAA;SOR=1.122;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=11;WE=187078946;WS=187078928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr4	187079017	rs1877321	G	A	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.410;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=268;ReadPosRankSum=-0.240;SC=GGCTTTCCATGGTAACTTAAA;SOR=0.078;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=16;WE=187079025;WS=187079007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,16:0.31:51
chr4	187079047	rs2276919	A	G	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-7.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.665;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=5;PP=1193;ReadPosRankSum=-1.065;SC=TCACAGTGTCACAATGCCTGG;SOR=1.402;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=92;TCF=84;TCR=8;TR=65;WE=187079055;WS=187079037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,67:0.72:93
chr4	187086150	rs73027974	C	T	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=83;ReadPosRankSum=0.134;SC=GGGGCCAGTGCCCACCCCCTT;SOR=0.627;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=7;WE=187086158;WS=187086140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr4	187088248	rs9991339	C	T	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=5.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.96;ReadPosRankSum=1.803;SOR=0.398;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,47:0.27:172
chr4	187092960	rs7694300	A	G	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=40;ReadPosRankSum=0.780;SC=GTGTATTAAAATAAAATATAT;SOR=0.193;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=4;WE=187092968;WS=187092953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr4	187093018	rs4241814	G	T	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=167;ReadPosRankSum=1.367;SC=TTCTGAGTGGGTGCCTTTGTA;SOR=0.235;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=45;TCR=3;TR=12;WE=187093026;WS=187093008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,12:0.25:48
chr4	187113041	rs1055138	C	G	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.307;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=316;ReadPosRankSum=-0.852;SC=GGCGAGTGCCCTTTCCCTGGC;SOR=1.018;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=65;TCF=45;TCR=20;TR=24;WE=187113049;WS=187113031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,23:0.35:65
chr4	187115632	rs10013653	C	A	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.367;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=2;PP=531;ReadPosRankSum=0.265;SC=GATTGAATTTCAAATTTGATG;SOR=1.675;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=65;TCF=56;TCR=9;TR=26;WE=187115640;WS=187115622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,26:0.41:64
chr4	187115777	rs62350517	G	C	1880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=37;PP=1595;ReadPosRankSum=-1.024;SC=GTGGGTACATGTGAATATGAT;SOR=0.690;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=53;TCR=62;TR=68;WE=187115785;WS=187115767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,68:0.58:117
chr4	187115841	rs7682918	C	T	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=375;ReadPosRankSum=-0.129;SC=ATCAATATAACGTGTCCTTAT;SOR=0.508;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=73;TCF=13;TCR=60;TR=24;WE=187115849;WS=187115831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,25:0.33:76
chr4	187118358	rs62350518	C	T	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.873;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=244;ReadPosRankSum=-1.262;SC=CACACTCCACCGGGAAGGCAA;SOR=2.093;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=13;WE=187118366;WS=187118348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr4	187118662	rs4862662	G	T	2143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.453;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=45;PP=1600;ReadPosRankSum=-0.022;SC=GAATTGAATGGTTGCTTCTCA;SOR=0.732;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=284;TCF=154;TCR=130;TR=100;WE=187118670;WS=187118652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,99:0.35:282
chr4	187120211	rs13146272	C	A	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.193;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=33;PP=883;ReadPosRankSum=-0.691;SC=AAAGAGCCTTCAGATCCTACA;SOR=0.271;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=172;TCF=58;TCR=114;TR=57;WE=187120219;WS=187120201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,60:0.33:181
chr4	187122304	rs3817184	C	T	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=319;ReadPosRankSum=-0.999;SC=TCATTCAAATCATACAGGTCA;SOR=0.655;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=75;TCF=51;TCR=24;TR=20;WE=187122312;WS=187122294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,21:0.27:78
chr4	187122319	rs3736455	T	G	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.912;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=361;ReadPosRankSum=-0.280;SC=AGGTCATCGCTGAACGGGCCA;SOR=0.909;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=92;TCF=63;TCR=29;TR=26;WE=187122327;WS=187122309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,28:0.29:96
chr4	187126356	.	GCAC	G	4942.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.279;ClippingRankSum=0.000;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=41.006;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.805;NF=83;NR=11;PP=2963;ReadPosRankSum=0.953;SC=ATTTGTAGGGGCACGATACAA;SOR=2.714;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=169;TCF=130;TCR=39;TR=94;WE=187126366;WS=187126346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,125:0.61:204
chr4	187126550	rs3216724	TC	T	2116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.409;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=66;PP=2119;ReadPosRankSum=0.860;SC=GCAGGAAGGCTCCCCCACGGG;SOR=3.349;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=114;TCF=4;TCR=110;TR=66;WE=187126558;WS=187126540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,76:0.71:107
chr4	187129995	rs2276917	A	G	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.433;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=14;PP=819;ReadPosRankSum=0.202;SC=CTTTCAGGTCATCTTATCTAC;SOR=0.184;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=68;TCF=51;TCR=17;TR=46;WE=187130003;WS=187129985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,45:0.68:66
chr4	187130198	rs2276918	A	G	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=8.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.116;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=25;PP=1086;ReadPosRankSum=1.814;SC=GAAACTTTCTAATGTCTACCT;SOR=0.242;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=186;TCF=118;TCR=68;TR=54;WE=187130206;WS=187130188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,55:0.29:190
chr4	187149540	rs1912826	G	A	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=149;ReadPosRankSum=0.672;SC=TTCAGGACACGTGTCTATTTA;SOR=0.533;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=45;TCF=4;TCR=41;TR=12;WE=187149548;WS=187149530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,13:0.28:46
chr4	187158034	rs3733402	G	A	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FS=3.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.36;ReadPosRankSum=-1.318;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:171,64:0.27:235
chr4	187159282	rs4253256	G	C	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=295;ReadPosRankSum=0.405;SC=TAATAATGCAGACCCCTAACC;SOR=1.264;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=46;TCR=2;TR=16;WE=187159290;WS=187159272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,16:0.33:49
chr4	187171355	rs4253299	A	G	4562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=42;PP=2965;SC=ATTTAGCCTCATGTCATTTCC;SOR=1.974;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=112;TCR=42;TR=154;WE=187171363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr4	187172353	.	C	CT	26	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=26;QD=10.75;SC=TTCTCTCTTGCTTTTTTTTAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=4;WE=187172361;WS=187172343;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:18,4:0.18:22
chr4	187175722	rs2292423	T	A	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=5.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.360;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=463;ReadPosRankSum=-1.652;SC=TTCAAACAGGTATTTATTTTT;SOR=0.933;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=56;TCF=46;TCR=10;TR=20;WE=187175730;WS=187175712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,20:0.36:55
chr4	187178599	rs4253326	C	T	1238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=36;PP=1023;SC=TAGCATAATTCAATCATAGTT;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=38;WE=187178621;WS=187178589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	187178613	rs4253327	A	T	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=26;PP=747;SC=CATAGTTTTTAAAAAAATTCA;SOR=6.518;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=187178621;WS=187178589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr4	187179210	rs925453	T	C	2874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=51;PP=2158;SC=GCAAACACAATGGAATGTGGC;SOR=0.888;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=44;TCR=51;TR=94;WE=187179218;WS=187179200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr4	187511861	rs1973352	G	A	3817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=97;PP=2965;SC=TGAAAACACAGAATTTCCTTA;SOR=2.872;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=22;TCR=97;TR=119;WE=187511869;WS=187511851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr4	187513623	rs3836618	TA	T	1141.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=0;PP=1058;SC=AGATCTCATGTAAATCACTAT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=187513631;WS=187513613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	187518980	rs1280096	T	C	5428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=144;PP=2965;SC=ATAAACCTCATGATCCTATTG;SOR=2.654;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=182;TCF=38;TCR=144;TR=182;WE=187518988;WS=187518970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr4	187519206	rs1280097	C	G	4313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=62;PP=2965;SC=AGAGGCATGGCTTGGAGGAAC;SOR=0.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=63;TCR=62;TR=125;WE=187519214;WS=187519196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr4	187521444	.	A	G	1543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.566;ClippingRankSum=0.000;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.516;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=29;PP=1277;ReadPosRankSum=1.568;SC=ATTGACCTGAATGCTCTGAAC;SOR=0.888;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=212;TCF=113;TCR=99;TR=68;WE=187521452;WS=187521434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,69:0.32:217
chr4	187527472	rs2584344	A	G	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=337;ReadPosRankSum=-0.478;SC=CCAGTGAGCTACCACTATCTG;SOR=0.963;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=14;WE=187527480;WS=187527462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr4	187530313	rs4862722	C	T	1469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=9;PP=1223;SC=TTGTAAACAACGTAAATCAAC;SOR=2.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=45;WE=187530321;WS=187530303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	187532656	.	C	A	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.511;ClippingRankSum=0.000;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.957;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;ReadPosRankSum=-0.526;SC=AACTTCAGTTCCAACAAGAAT;SOR=1.052;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=176;TCF=95;TCR=81;TR=50;WE=187532664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,49:0.27:180
chr4	187534363	rs2249916	G	A	4648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.829;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=44;PP=2962;ReadPosRankSum=0.826;SC=ATTCGGGGGCGTTATCGTTCA;SOR=0.389;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=185;TCF=123;TCR=62;TR=118;WE=187534383;WS=187534353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,119:0.64:186
chr4	187534375	rs2249917	A	G	4668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.692;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=51;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.705;SC=TATCGTTCACATCTTCTAGCG;SOR=0.462;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=183;TCF=111;TCR=72;TR=119;WE=187534383;WS=187534353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,121:0.66:183
chr4	187534542	rs2249926	T	C	2245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.885;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=61;PP=1762;ReadPosRankSum=0.141;SC=AAGACGTGACTTGCAGTTGTA;SOR=0.932;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=123;TCF=23;TCR=100;TR=74;WE=187534550;WS=187534532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,79:0.62:127
chr4	187535588	rs56242383	T	C	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.883;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=570;ReadPosRankSum=0.524;SC=TCATTCATCTTTGACCACAGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=22;WE=187535596;WS=187535578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,23:0.74:31
chr4	187538133	rs1280100	A	G	3148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=32;PP=2351;ReadPosRankSum=-1.865;SC=TTCATAACACACAAATGTAAG;SOR=0.791;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=218;TCF=164;TCR=54;TR=128;WE=187538141;WS=187538123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,135:0.59:227
chr4	187538330	rs1280099	G	A	1489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=5.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.019;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=42;PP=1096;ReadPosRankSum=-0.743;SC=TAGTTTCAACGGCAAACTGTC;SOR=1.349;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=73;TCF=3;TCR=70;TR=43;WE=187538338;WS=187538320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,50:0.62:80
chr4	187538942	rs1280098	T	G	3593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.118;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=38;PP=2785;ReadPosRankSum=-1.314;SC=CACCCCACCTTGGGGGTCATC;SOR=0.890;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=179;TCF=121;TCR=58;TR=120;WE=187538950;WS=187538932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,126:0.68:185
chr4	187557652	.	T	C	1485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=1;PP=1231;ReadPosRankSum=-0.516;SC=GTTTACAAAATAGAAATAAAG;SOR=0.674;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=64;TCR=1;TR=48;WE=187557660;WS=187557642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,51:0.76:67
chr4	187557893	rs328418	T	C	5562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.151;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=118;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.132;SC=GGCTATGACGTGATAGAGCGG;SOR=0.482;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=307;TCF=129;TCR=178;TR=213;WE=187557901;WS=187557883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,221:0.70:316
chr4	187561080	rs10001377	A	G	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=39;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TGGATTACTTAAGGTCAGGAG;SOR=2.303;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=3;WE=187561088;WS=187561070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr4	187584771	rs172903	C	G	3126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=65;PP=2546;SC=ATGACACCTACAGAGAAAAAA;SOR=1.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=29;TCR=65;TR=94;WE=187584779;WS=187584761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr4	187627659	rs200130748	TA	T	603.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=1.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=0.018;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.054;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,46:0.57:80
chr4	187627792	rs11939575	T	C	1880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.771;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=47;PP=1304;ReadPosRankSum=0.212;SC=CCATCTCTTCTGGCGTCCTCA;SOR=0.485;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=239;TCF=102;TCR=137;TR=87;WE=187627800;WS=187627782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,89:0.37:243
chr4	187628398	rs1877731	C	G	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=875;ReadPosRankSum=0.217;SC=GTGTCTGTAACAATTGAGTAC;SOR=0.731;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=128;TCF=86;TCR=42;TR=45;WE=187628406;WS=187628388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,48:0.36:135
chr4	187629140	rs367863	G	C	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.329;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=1072;ReadPosRankSum=-1.677;SC=TTAAACTAAAGAAATCCAGTT;SOR=0.379;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=180;TCF=77;TCR=103;TR=59;WE=187629148;WS=187629130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,61:0.33:186
chr4	187629497	rs458021	G	A	1475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=1141;ReadPosRankSum=-0.970;SC=TCACGTACCCGTTCTCACCCT;SOR=0.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=99;TCR=88;TR=61;WE=187629505;WS=187629487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,64:0.33:195
chr4	187629538	rs3733413	C	T	1365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.208;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=22;PP=1036;ReadPosRankSum=-1.282;SC=AGGCTCATGACAGTAGTACCA;SOR=0.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=201;TCF=124;TCR=77;TR=61;WE=187629546;WS=187629528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,63:0.30:208
chr4	187629770	rs3733414	A	C	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.275;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;PP=723;ReadPosRankSum=1.156;SC=TTCCAGGTGTACTTTTAAAAA;SOR=1.175;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=132;TCF=65;TCR=67;TR=40;WE=187629778;WS=187629760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,37:0.29:128
chr4	189012680	rs17881718	G	A	5389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=45;PP=2965;ReadPosRankSum=1.810;SC=GGGACATCTCGGTCACATTGT;SOR=0.910;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=159;TCF=114;TCR=45;TR=158;WE=189012688;WS=189012670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,163:0.99:164
chr4	189012728	rs2279550	G	C	6863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=154;NR=54;PP=2965;SC=CAAGGAAAACGCCAACTGTGT;SOR=2.101;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=209;TCF=155;TCR=54;TR=208;WE=189012736;WS=189012718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr4	189060610	rs11934889	G	C	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=1;PP=499;SC=AACAACATAGGAACAGGTCAC;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=189060618;WS=189060600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr4	189061036	rs76826594	C	T	2211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=34;PP=1655;SC=TCTCCGATGACGAGCAGGGTG;SOR=0.749;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=32;TCR=34;TR=66;WE=189061044;WS=189061026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr4	189061169	rs56361162	C	T	1055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=30;PP=910;SC=CAGCTAACTCCGTTAGCTTTC;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=34;WE=189061177;WS=189061159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr4	189061604	rs56412251	C	T	1882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=5;PP=1570;SC=CCTAGGACTGCGCAGTTACTG;SOR=4.407;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=53;TCR=5;TR=57;WE=189061612;WS=189061594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr4	189061675	rs113738610	A	AT	3311.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=29;PP=2936;SC=GTTTGTTTCTATTGCAGGAGA;SOR=1.735;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=92;TCF=59;TCR=33;TR=87;WE=189061683;WS=189061665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr4	189061855	rs138341929	G	GA	1267.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=41;PP=936;SC=GAAATATCAGGAAAAAAAAAA;SOR=4.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=63;TCF=3;TCR=60;TR=43;WE=189061863;WS=189061845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr4	189063361	rs61461219	C	CGT	338.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5007;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.230;NF=9;NR=0;PP=251;ReadPosRankSum=-1.231;SC=AACTTTATCTCGTGTGTGTGT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=9;WE=189063369;WS=189063351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr4	189064828	rs9784562	T	C	2133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=3;PP=1676;SC=AGCACATCCCTGGAAGAAACT;SOR=5.486;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=60;TCF=57;TCR=3;TR=60;WE=189064836;WS=189064818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr4	189065104	rs9784566	T	G	1316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=24;PP=1128;SC=TCTGCGCTGTTGCTGGGGGAG;SOR=1.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=39;WE=189065112;WS=189065094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr4	189065441	rs11940227	G	T	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=847;ReadPosRankSum=-0.620;SC=GCCACAGACCGTCTCTGAGCG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=28;WE=189065449;WS=189065431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr4	190329166	rs10622647	G	GCGCACACACACA	741.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=774;SC=ACATGCACGTGCACACACACA;SOR=2.948;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=14;WE=190329174;WS=190329156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr4	190394938	rs138612273	CAAGAAG	C,CAAG	1172.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=21,21;NR=2,2;PP=857,348;SC=AGGATGGTGACAAGAAGAAGA;SOR=4.479;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=23,23;WE=190394951;WS=190394928;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.38,0.62:29
chr4	190395259	rs13143685	C	G	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.619;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.013;NF=26;NR=27;PP=935;ReadPosRankSum=0.366;SC=CTGTGAGGAGCTAATCCCTGA;SOR=0.621;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=157;TCF=74;TCR=83;TR=53;WE=190395267;WS=190395249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,53:0.33:159
chr4	190395838	rs70944383	C	CA	541.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=1.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.30;MQRankSum=3.308;QD=4.23;ReadPosRankSum=-0.246;SOR=0.496;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,35:0.27:128
chr4	190862083	rs1138726	T	C	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=176;ReadPosRankSum=0.995;SC=CGCTTCTGTTTCTCCGCGCCC;SOR=0.478;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=13;WE=190862091;WS=190862073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr4	190862155	rs4145515	T	G	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=412;ReadPosRankSum=-0.850;SC=CGCAGAAGTTTCCCGGAGCCA;SOR=0.746;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=88;TCF=55;TCR=33;TR=25;WE=190862163;WS=190862145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,25:0.27:91
chr4	190862182	rs2411530	C	T	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.857;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=366;ReadPosRankSum=1.279;SC=AGTACTCCTACGTGAAGTCTA;SOR=0.831;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=101;TCF=61;TCR=40;TR=27;WE=190862190;WS=190862172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,27:0.26:103
chr4	190862287	rs4145517	C	T	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-4.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.532;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.625;NF=0;NR=12;PP=178;ReadPosRankSum=-1.076;SC=TCCACCCCCGCAACTCCGGTG;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=12;WE=190862295;WS=190862277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,11:0.26:42
chr4	190863127	rs6837422	C	G	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-6.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.162;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.619;NF=0;NR=26;PP=472;ReadPosRankSum=-0.058;SC=CTCGAGGAGTCTGGCCTCATG;SOR=0.089;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=0;TCR=70;TR=26;WE=190863135;WS=190863117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,28:0.38:73
chr4	190876195	rs7684300	C	T	1986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.505;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.780;NF=67;NR=21;PP=1103;ReadPosRankSum=-1.030;SC=TGTACAGAATCGCCCTGAAGT;SOR=0.991;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=262;TCF=199;TCR=63;TR=88;WE=190876226;WS=190876185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,83:0.37:225
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chr4	190876242	rs1061653	G	A	1494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=-3.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=31.811;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-14.037;NF=79;NR=43;PP=2962;ReadPosRankSum=2.924;SC=AATTCAGATGGACTTGTTGTT;SOR=1.708;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=288;TCF=151;TCR=137;TR=122;WE=190876327;WS=190876232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,56:0.25:223
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chr5	163266	rs3810867	C	G	8321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.23;SOR=0.855;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
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chr5	171569	rs4956981	T	C	2756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=56;PP=2097;SC=CGTAAGTGCCTCAGACGCTGG;SOR=1.557;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=31;TCR=56;TR=87;WE=171577;WS=171559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
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chr5	173258	rs6893369	A	G	1160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=28;PP=982;SC=TGTCTCACCTAAGGCCAGCAG;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=173266;WS=173248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	174240	rs6875054	GC	AA	2402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=49;PP=2945;SC=CGCAGGGCCTGCCAGGCTCAG;SOR=5.174;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=53;TCF=1;TCR=52;TR=50;WE=174249;WS=174230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	174267	rs6862729	A	G	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=32;PP=931;SC=AGCTAGGGGCAGGGGTCGGGG;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=174275;WS=174257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	181660	rs7717970	T	G	4408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=56;PP=2965;SC=CATCCATGGGTATAGGCAACC;SOR=0.864;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=72;TCR=57;TR=128;WE=181668;WS=181650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr5	181730	rs12519352	C	G	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=3.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.58;ReadPosRankSum=0.708;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,15:0.12:121
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chr5	182077	rs4956924	T	A	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.00;ReadPosRankSum=-0.888;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:209,32:0.13:241
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chr5	354051	rs2013782	T	C	2245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=67;PP=1750;SC=TGCTCCCACCTGTTCACTTGA;SOR=3.556;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=11;TCR=69;TR=78;WE=354059;WS=354041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
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chr5	421647	rs10068732	A	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.23;ReadPosRankSum=0.331;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,5:0.15:34
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chr5	424239	rs112915421	T	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.583;NF=0;NR=8;PP=116;ReadPosRankSum=-0.143;SC=GAGCTCTGTGTACCCTGTGAT;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=8;WE=424247;WS=424229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr5	427842	rs41282623	G	A	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=2.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.94;ReadPosRankSum=-0.128;SOR=0.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,19:0.18:104
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chr5	434981	rs2672725	G	C	933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=24;PP=760;SC=TCAGATCTGTGTGTCTACGCT;SOR=2.910;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=434989;WS=434971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr5	442586	rs10035612	G	C	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=339;ReadPosRankSum=0.657;SC=ACTCAGGACCGGCCCTCTGCA;SOR=0.825;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=78;TCF=67;TCR=11;TR=22;WE=442594;WS=442576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,23:0.28:83
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chr5	456915	rs2721010	A	G	4732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.493;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=129;NR=31;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.121;SC=GTGGACATTCATGTGTCAAGT;SOR=2.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=130;TCR=32;TR=160;WE=456923;WS=456905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,171:0.99:173
chr5	457176	rs59568259	T	A	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=8.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.64;ReadPosRankSum=0.374;SOR=0.006;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,7:0.13:53
chr5	457955	rs2251843	A	G	3206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=23;PP=2530;SC=GGTAATTGGCATGACCCTCAG;SOR=2.636;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=87;TCR=23;TR=110;WE=457963;WS=457945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr5	459681	rs59635824	G	T	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=188;ReadPosRankSum=1.033;SC=AAATTAAGCCGGTAGATTCCC;SOR=0.927;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=12;WE=459689;WS=459671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,12:0.24:51
chr5	462465	rs890972	C	A	6208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=148;PP=2965;SC=GGGCCGAAGCCCAGTGCTTCC;SOR=2.602;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=187;TCF=37;TCR=150;TR=185;WE=462473;WS=462455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr5	462556	rs2081942	G	A	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=57;PP=1398;ReadPosRankSum=-1.049;SC=TTGCATTCCGGTCAGATCGCT;SOR=1.284;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=72;TCF=2;TCR=70;TR=59;WE=462564;WS=462546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,64:0.84:76
chr5	465510	rs1035908	T	C	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=11;PP=225;SC=GGGGGGAGCCTGGGTCCAGGT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=465518;WS=465500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	466075	rs10474780	G	C	1633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=54;PP=1413;SC=CCTGCAGCACGGCAAGGGTTC;SOR=5.247;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=3;TCR=54;TR=57;WE=466083;WS=466065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr5	466811	rs2434697	T	C	4719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=134;NR=5;PP=2965;SC=GGCTGCTAAGTGGGCATGGGC;SOR=6.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=134;TCR=5;TR=139;WE=466819;WS=466801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr5	472951	rs890974	T	C	3728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.337;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=69;PP=2957;ReadPosRankSum=0.776;SC=CGGGGCTCGGTTGGGGGGGCC;SOR=0.944;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=73;TCR=88;TR=124;WE=472959;WS=472941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,130:0.77:169
chr5	473051	.	G	A	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.000;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=1.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.95;ReadPosRankSum=-0.787;SOR=0.844;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,21:0.19:109
chr5	473368	rs34674918	G	A	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=461;ReadPosRankSum=-0.789;SC=GGGCGAGGCGGGGCTCGGGGC;SOR=0.941;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=21;WE=473376;WS=473358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,22:0.88:25
chr5	474909	.	AG	A	114	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.52;FR=1.0000;HP=7;HapScore=2;MGOF=34;MMLQ=29;MQ=45.23;NF=5;NR=0;PP=114;QD=28.4;SC=TTAGGCGGGGAGGGAGAGAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=474917;WS=474899;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	474945	.	AG	A	1092	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=5;HapScore=1;MGOF=20;MMLQ=28;MQ=58.15;NF=28;NR=2;PP=1092;QD=37.4;SC=GGAGACCTGGAGGGAGAGGAG;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=30;WE=474953;WS=474935;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,30:0.71:42
chr5	474974	rs2721018	C	T	1778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.168;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.590;NF=54;NR=15;PP=1390;ReadPosRankSum=0.300;SC=AGGGGTTAGGCGGCGGGAGGC;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=64;TCR=18;TR=69;WE=474982;WS=474964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,70:0.84:83
chr5	475104	rs2247114	A	G	5919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=87;PP=2965;SC=ATCAGGCGGCAGAAGGTGCCG;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=107;TCR=87;TR=194;WE=475112;WS=475094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr5	475337	rs200907923	TGGAAAGTTAGGGTCACCG	T	501.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.83;MQRankSum=5.308;QD=5.90;ReadPosRankSum=-0.585;SOR=0.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,18:0.21:85
chr5	475346	rs2247107	A	T	1805.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.135;NF=1;NR=59;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.568;SC=TTGGAAAGTTAGGGTCACCGG;SOR=0.781;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=1;TCR=76;TR=60;WE=475362;WS=475327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,63:0.78:81
chr5	475895	rs45521339	C	T	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.93;ReadPosRankSum=1.196;SOR=0.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,15:0.25:60
chr5	476530	rs2244240	C	G	2265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=46;PP=1850;SC=GCTGTGCCCACCGCCGGACAT;SOR=1.678;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=21;TCR=46;TR=67;WE=476538;WS=476520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	476848	rs890976	C	T	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=5.068;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=856;ReadPosRankSum=0.294;SC=CTTGCGCGCCCCTCGCCTTCC;SOR=0.120;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=37;WE=476856;WS=476838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,40:0.87:46
chr5	476910	rs890977	T	C	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=22;PP=487;SC=CGCCTTCCCATGGTGGGCACC;SOR=4.255;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=476918;WS=476900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	477303	rs890980	A	G	1206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=2;PP=888;ReadPosRankSum=-1.430;SC=GGGCTTGTGGAAGGAGACACC;SOR=1.571;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=52;TCF=49;TCR=3;TR=38;WE=477311;WS=477293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,42:0.75:56
chr5	477639	rs890981	G	A	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=29;PP=690;ReadPosRankSum=0.140;SC=GGGGGGAAGCGCCCAGAGCTC;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=30;WE=477647;WS=477629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,33:0.80:41
chr5	478571	rs33925304	TG	T	618.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=2;PP=701;SC=TGCCGTGGGGTGGGGGGGCGC;SOR=3.816;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=20;WE=478589;WS=478562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	478655	rs3734141	G	A	1983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=10;PP=1623;ReadPosRankSum=0.615;SC=CCAGGTGTGGGGACCCCCGCT;SOR=1.885;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=51;TCR=10;TR=60;WE=478663;WS=478645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,61:0.98:62
chr5	478755	rs10053300	G	C	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.53;ReadPosRankSum=0.274;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,15:0.11:135
chr5	479050	rs3836908	CCA	C	328.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=9.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=2.268;QD=3.91;ReadPosRankSum=-0.060;SOR=0.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,14:0.17:84
chr5	479879	rs376525752	G	GC	1592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=3;PP=1811;SC=TCTCCTCACTGCCCCATGGCA;SOR=4.977;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=57;TCF=54;TCR=3;TR=45;WE=479887;WS=479869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	479905	rs890986	A	C	2200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=3;PP=1864;SC=AGCCAGTGCCAGAGCCTGCTG;SOR=5.549;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=63;TCR=3;TR=66;WE=479913;WS=479895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	481610	rs6872510	T	C	4569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=107;NR=37;PP=2965;SC=TGGCTTCTGGTTCTTCCGAGT;SOR=2.099;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=107;TCR=38;TR=144;WE=481618;WS=481600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr5	482151	.	GC	G	112	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=10;HapScore=4;MGOF=14;MMLQ=19;MQ=41.32;NF=4;NR=0;PP=112;QD=31.0;SC=AACACGCAGTGCCCCCCCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=4;WE=482170;WS=482141;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr5	482186	rs9885312	C	G	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=1;PP=757;SC=CACTTACGCGCCCGTGCAGCT;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=482194;WS=482176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	482653	rs3777230	T	C	3987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=114;NR=10;PP=2965;SC=CTGGCTGGGCTGGGCCTCACC;SOR=4.496;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=114;TCR=10;TR=124;WE=482661;WS=482643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr5	482786	rs143144929	G	A	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FS=2.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.76;ReadPosRankSum=-1.390;SOR=0.861;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:272,68:0.20:340
chr5	483675	rs56082422	G	A	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.586;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=185;ReadPosRankSum=0.962;SC=AGCCCCCCACGGCCTGGCGCC;SOR=0.105;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=13;WE=483683;WS=483665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
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chr5	711982	.	T	C	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MMLQ=28;MQ=46.86;NF=42;NR=117;PP=2962;QD=20;SC=CATTTCCCAGTACTATGCTCC;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=197;TCF=43;TCR=154;TR=159;WE=712007;WS=711964;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:38,159:0.81:197
chr5	712030	rs62622378	T	C	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=9.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.39;MQRankSum=-1.996;QD=35.05;ReadPosRankSum=0.870;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,15:0.88:17
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chr5	712045	.	C	CTCT	586.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.511;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=9.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.53;MQRankSum=-2.457;QD=36.67;ReadPosRankSum=-0.351;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr5	712054	rs112428723	A	G	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.70;MQRankSum=0.516;QD=37.42;ReadPosRankSum=-1.416;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,15:0.94:16
chr5	741736	rs61128505	G	T	265.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.90;QD=29.53;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	745306	rs172870	A	C	1874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.93;QD=32.89;SOR=8.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr5	748477	rs3817066	A	C	3261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.63;QD=44.68;SOR=1.810;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr5	748482	rs3817065	G	C	3199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.96;QD=44.44;SOR=1.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr5	756307	rs367198	T	C	67.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.31;QD=22.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	766910	rs1809933	C	T	8495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=168;PP=2965;SC=AGTCACCACCCGGAAGTAGTG;SOR=1.320;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=272;TCF=104;TCR=168;TR=272;WE=766918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr5	767033	rs1809932	A	C	5524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=87;PP=2965;SC=GCGGGTGTCCATCTGCAGGAC;SOR=0.705;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=82;TCR=87;TR=169;WE=767041;WS=767023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr5	796047	rs33929417	CTG	C	23106.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=567;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.18;MQRankSum=-0.318;QD=44.18;ReadPosRankSum=-0.957;SOR=0.229;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,522:1.00:523
chr5	796053	.	GCT	G	2966	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=28;MQ=58.48;NF=232;NR=317;PP=2966;QD=20;SC=AGTACTGTGTGCTCCCATTTC;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=566;TCF=241;TCR=325;TR=549;WE=796072;WS=796031;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:17,549:0.97:566
chr5	796064	.	T	C	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=28;MQ=58.72;NF=205;NR=194;PP=2962;QD=20;SC=CTCCCATTTCTCAGTACTGTA;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=726;TCF=368;TCR=358;TR=399;WE=796072;WS=796031;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:327,399:0.55:726
chr5	796064	rs144616948	T	TCAGTACTGTATGCCCATTTCC	30356.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=565;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.17;MQRankSum=-0.311;QD=54.50;ReadPosRankSum=-1.314;SOR=0.241;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,556:1.00:557
chr5	796221	rs111848851	G	A	11405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=833;ExcessHet=3.0103;FS=19.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQRankSum=-17.805;QD=13.78;ReadPosRankSum=3.929;SOR=0.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:520,308:0.37:828
chr5	796223	rs373490497	GCCC	G	11475.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=842;ExcessHet=3.0103;FS=17.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQRankSum=-17.941;QD=13.71;ReadPosRankSum=3.320;SOR=0.884;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:524,313:0.37:837
chr5	796229	rs200391461	A	G	11471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=836;ExcessHet=3.0103;FS=17.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQRankSum=-17.927;QD=13.77;ReadPosRankSum=4.113;SOR=0.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:518,315:0.38:833
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chr5	796277	rs386219	T	C	8614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=659;ExcessHet=3.0103;FS=1.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.22;MQRankSum=-18.475;QD=13.13;ReadPosRankSum=-1.177;SOR=0.884;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:427,229:0.35:656
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chr5	796343	rs143398223	C	CTCT	3355.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=56.749;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-6.550;NF=2;NR=94;PP=2962;ReadPosRankSum=0.732;SC=GGCCCATCAGCTCTTAAGCAG;SOR=5.862;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=319;TCF=23;TCR=296;TR=96;WE=796360;WS=796318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,86:0.29:293
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chr5	834075	rs1260864	G	A	208.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.71;QD=29.83;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	843702	rs3863147	G	A	1439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.517;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-3.258;NF=48;NR=16;PP=1293;ReadPosRankSum=-0.298;SC=CCTTGAGAGCGGCGGCCACGT;SOR=0.383;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=110;TCF=87;TCR=23;TR=64;WE=843710;WS=843692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,54:0.70:77
chr5	843723	rs3863148	C	A	1658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.723;NF=55;NR=32;PP=1604;ReadPosRankSum=0.928;SC=ACCTTCATACCTGGGGTCCGT;SOR=0.625;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=148;TCF=100;TCR=48;TR=87;WE=843731;WS=843713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,69:0.71:97
chr5	870740	rs13153992	C	T	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=2.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.76;ReadPosRankSum=-0.232;SOR=1.144;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,17:0.18:94
chr5	878460	rs112921031	C	T	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=-13.524;QD=0.12;ReadPosRankSum=-0.785;SOR=0.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:258,35:0.12:293
chr5	893356	rs13181961	C	G	3331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=76;PP=2659;SC=CACAGGCCGCCGGGCCCCGAC;SOR=1.765;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=33;TCR=76;TR=109;WE=893364;WS=893346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr5	904374	rs12518024	T	G	11767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.121;NF=72;NR=296;PP=2965;ReadPosRankSum=0.409;SC=GCCATGGGAATGGGATTTATA;SOR=0.641;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=373;TCF=72;TCR=301;TR=368;WE=904382;WS=904364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,367:0.99:370
chr5	1009425	rs10060716	A	G	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=1;PP=401;SC=TGGAGCCAGCAGTGGGGGGAC;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=1009433;WS=1009415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	1035413	.	A	ATGAG	2477.92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=1.963;NF=45;NR=19;PP=1981;ReadPosRankSum=1.503;SC=GAATGAATGAATGAGTGAGTG;SOR=0.965;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=91;TCF=63;TCR=28;TR=64;WE=1035421;WS=1035389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:10,80:0.89:90
chr5	1035482	rs12657514	A	G	4831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=71;PP=2965;SC=GGGAGTGAGTAATGGCAGGAC;SOR=0.746;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=71;TCR=71;TR=142;WE=1035490;WS=1035472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr5	1035602	rs73026754	T	C	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=44;PP=990;ReadPosRankSum=-0.780;SC=AGGGCTGGGGTGCCAGGGTGG;SOR=0.533;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=57;TCF=6;TCR=51;TR=50;WE=1035610;WS=1035592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,52:0.88:59
chr5	1036324	rs73026756	G	A	1554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=0;PP=1350;ReadPosRankSum=-0.202;SC=TCAGGGGTGCGCCACCCAGTC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=62;TCR=0;TR=52;WE=1036332;WS=1036314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,53:0.83:64
chr5	1036435	rs73026757	G	A	5276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=75;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.959;SC=ACGAGAACACGGAGCGCAGAA;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=216;TCF=125;TCR=91;TR=179;WE=1036443;WS=1036425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,188:0.83:226
chr5	1036521	rs60180971	G	A	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=0.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.49;ReadPosRankSum=1.189;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:170,37:0.18:207
chr5	1036612	rs199991387	CCCCCAACCCCCCCCACCCCA	C	913.37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5016;FS=7.782;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.452;NF=2;NR=8;PP=2406;SC=GCCCCGCCCCCCCCCAACCCC;SOR=3.325;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=10;WE=1036639;WS=1036602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr5	1036962	rs34413936	C	A	1916.10	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.742;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.283;NF=11;NR=49;PP=1573;ReadPosRankSum=-1.690;SC=CAGACAGTGTCGACAGCAGGC;SOR=0.195;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=67;TCF=11;TCR=56;TR=60;WE=1036970;WS=1036952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:7,64:0.90:71
chr5	1038526	rs3889678	A	G	2803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=22;PP=2165;SC=AGCACACCACAGCCCGCGACC;SOR=2.478;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=70;TCR=22;TR=92;WE=1038534;WS=1038516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr5	1052360	rs3810854	C	T	1794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.151;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=17;PP=1377;ReadPosRankSum=0.729;SC=GCAGCTTGGGCGGCATCACTG;SOR=0.954;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=61;TCR=21;TR=66;WE=1052368;WS=1052350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,69:0.80:86
chr5	1053341	rs2241602	A	G	2501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=9;PP=2123;ReadPosRankSum=0.416;SC=TAGCTCCCAGAGCCTGGGGCT;SOR=2.356;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=69;TCR=9;TR=76;WE=1053349;WS=1053331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,77:0.99:78
chr5	1053440	rs79151625	C	T	5917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.660;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=143;NR=69;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.083;SC=GCACGCTCAGCAGGCACACTG;SOR=0.622;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=257;TCF=176;TCR=81;TR=212;WE=1053448;WS=1053430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,218:0.84:261
chr5	1057615	rs2241606	A	G	6119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=146;NR=66;PP=2965;SC=CTTTGAAACCAGATAGGCTGG;SOR=1.794;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=212;TCF=146;TCR=66;TR=212;WE=1057623;WS=1057605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr5	1057782	rs12108965	T	C	1800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=62;PP=1564;SC=GCCCGGGACTTGGTGAGACCA;SOR=4.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=5;TCR=63;TR=67;WE=1057790;WS=1057772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr5	1060400	rs4975568	G	A	952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=2;PP=751;SC=GAAAAGACTCGGCGAAGTCGG;SOR=4.548;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=29;WE=1060408;WS=1060390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr5	1060654	rs4246749	G	A	2274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=55;PP=1775;ReadPosRankSum=-1.451;SC=AGACCGAGCCGCCCTGAGCGG;SOR=1.090;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=19;TCR=56;TR=74;WE=1060662;WS=1060644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,78:0.99:79
chr5	1062900	rs13170649	C	G	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=13.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.58;ReadPosRankSum=0.683;SOR=0.100;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,20:0.25:79
chr5	1063187	rs6863419	T	C	292.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=269;SC=GCCCACCAGATCCCCAGGATC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=1063195;WS=1063177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	1063874	.	C	G	38	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5032;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=1;NR=2;PP=38;QD=24.2570708491;SC=ACCCCCACCTCACGAGGCCCA;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=3;WE=1063882;WS=1063864;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr5	1065290	rs4362981	A	G	7954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.56;QD=47.07;SOR=2.917;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr5	1065290	.	AGGACAGCGAGGGGACACT	GGGACAGCGAGGGGACACT,GGGACAGTGAGAGGACAGC	2962	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=60.21;NF=101,18;NR=22,7;PP=2962,2914;QD=20;SC=GGACAGTGAGAGGACAGCGAG;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=125;TCF=103;TCR=22;TR=123,25;WE=1065327;WS=1065280;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.98:125
chr5	1065297	rs62331176	C	T	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-3.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.50;MQRankSum=-0.885;QD=7.30;ReadPosRankSum=0.602;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,39:0.23:167
chr5	1065298	rs55643147	GAGGGGACACTGAGGAGACACAC	G	4694.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-7.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.965;NF=63;NR=17;PP=2971;ReadPosRankSum=-0.432;SC=AGAGGACAGCGAGGGGACACT;SOR=0.635;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=104;TCF=78;TCR=26;TR=80;WE=1065327;WS=1065280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,126:0.75:167
chr5	1065301	rs79273934	G	A	1259.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.19;MQRankSum=-0.964;QD=7.59;ReadPosRankSum=-0.397;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,41:0.25:166
chr5	1065306	.	ACT	A	1250.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=0.000;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.20;MQRankSum=-0.938;QD=7.58;ReadPosRankSum=-0.544;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,40:0.24:165
chr5	1065310	.	A	C	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.000;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.15;MQRankSum=-1.610;QD=7.43;ReadPosRankSum=-0.450;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,39:0.24:164
chr5	1065311	.	GGAGACACAC	G	1207.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-3.963;ClippingRankSum=0.000;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=0.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.16;MQRankSum=-1.589;QD=7.41;ReadPosRankSum=-0.216;SOR=0.848;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,38:0.23:163
chr5	1065399	rs737154	C	T	6837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.646;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.996;NF=137;NR=114;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.144;SC=CATGCCTACCCACAAAGTTCT;SOR=0.874;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=342;TCF=182;TCR=160;TR=251;WE=1065407;WS=1065389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,254:0.73:347
chr5	1065683	rs56078134	A	C	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.06;ReadPosRankSum=0.545;SOR=0.968;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,24:0.83:29
chr5	1065689	rs13186367	C	T	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.13;SOR=4.548;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	1073689	rs10780095	C	T	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.96;ReadPosRankSum=1.387;SOR=0.350;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,10:0.16:62
chr5	1073886	rs145211606	G	A	5615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.121;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=102;PP=2962;ReadPosRankSum=0.332;SC=CCTGCTCCGCGTCCAGGTTCA;SOR=0.413;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=237;TCF=121;TCR=116;TR=201;WE=1073894;WS=1073876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,208:0.85:245
chr5	1076245	rs11951420	G	A	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=1.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.66;ReadPosRankSum=-0.390;SOR=0.964;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,24:0.15:155
chr5	1076361	rs41280371	C	T	7287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.513;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=150;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.362;SC=CCTGCAGGGACGGCCGGCCAC;SOR=0.747;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=325;TCF=140;TCR=185;TR=263;WE=1076369;WS=1076351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,275:0.81:338
chr5	1076459	rs11952124	G	T	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=8.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.37;ReadPosRankSum=-2.435;SOR=0.150;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,26:0.21:125
chr5	1078898	rs4975564	A	G	4654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=138;PP=2965;ReadPosRankSum=1.253;SC=AAGGAAAGGCAGGTCCGTGGG;SOR=4.294;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=6;TCR=140;TR=144;WE=1078906;WS=1078888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,142:0.99:143
chr5	1081668	rs13176210	G	A	7307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=169;NR=51;PP=2965;SC=AAAGAGAAGGGGAAGCCTGGA;SOR=2.367;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=220;TCF=169;TCR=51;TR=220;WE=1081676;WS=1081658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr5	1081702	rs6865765	A	G	10267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=218;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=0.733;SC=CGGTCACGGAAGGGAAGTAGA;SOR=0.726;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=322;TCF=220;TCR=102;TR=319;WE=1081710;WS=1081692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,326:1.00:327
chr5	1088657	rs80293971	G	A	985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5035;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=34;PP=815;ReadPosRankSum=-0.840;SC=CCAGGCATGCGTGTCCTGGTT;SOR=3.556;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=34;WE=1088665;WS=1088647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,34:0.87:39
chr5	1093609	rs56276350	G	GGGGCGGGGACT	1663.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=2;PP=2977;SC=CGGGACACACGGGGCGGGGAC;SOR=3.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=19;WE=1093617;WS=1093599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	1094389	rs4975552	T	A	9598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=171;PP=2965;ReadPosRankSum=0.181;SC=CAATTCAGAGTCAGCTTAGAA;SOR=1.088;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=297;TCF=125;TCR=172;TR=295;WE=1094397;WS=1094379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,308:0.99:310
chr5	1116066	rs6554618	C	T	1877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=47;PP=1472;SC=TTTTTTTAAGCGTGGTGAGCC;SOR=2.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=16;TCR=47;TR=63;WE=1116074;WS=1116056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	1208964	rs60992377	T	C	1733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=55;PP=1397;SC=GCAGCCTGGGTGTGTGGAGCT;SOR=4.977;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=5;TCR=55;TR=60;WE=1208972;WS=1208954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr5	1212178	rs4975632	G	A	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.192;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=379;ReadPosRankSum=1.390;SC=GTGCATGTGTGGGGTGTGCAG;SOR=0.264;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=20;WE=1212186;WS=1212168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,19:0.83:23
chr5	1214005	rs138649942	CCCT	C	358.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=357;ReadPosRankSum=1.117;SC=TGGGAGCACACCCTCCCAGGT;SOR=0.807;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=48;TCR=2;TR=12;WE=1214015;WS=1213995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,12:0.25:48
chr5	1214264	rs6554663	A	G	4883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=124;PP=2965;SC=GGTGGAAAGCACTCTGTGGCT;SOR=3.348;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=22;TCR=124;TR=146;WE=1214272;WS=1214254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr5	1216775	rs4975629	A	G	9169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=178;PP=2965;SC=TCCGCGCCACACAGCGCTACG;SOR=1.145;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=295;TCF=117;TCR=178;TR=295;WE=1216783;WS=1216765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,301:1.00:301
chr5	1219859	rs11746371	C	T	1740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.686;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=57;PP=1462;ReadPosRankSum=2.030;SC=AGGACCCGGGCTGTGTTCAGG;SOR=2.649;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=76;TCF=4;TCR=72;TR=59;WE=1219867;WS=1219849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,59:0.78:76
chr5	1219874	rs6869718	G	A	2336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=66;PP=2004;SC=TTCAGGGTACGGAGGGAGAGT;SOR=6.214;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=68;TCF=2;TCR=66;TR=68;WE=1219882;WS=1219864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr5	1221199	rs12513763	T	C	3585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=15;PP=2751;SC=TAGCAGAACGTACAGAAAGCT;SOR=3.196;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=87;TCR=15;TR=102;WE=1221207;WS=1221189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr5	1221342	.	C	A	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.888;ClippingRankSum=0.000;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=3.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.84;ReadPosRankSum=-0.178;SOR=1.176;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,26:0.16:162
chr5	1225564	rs7728646	T	C	1093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=1;PP=938;SC=GCACCACCCTTGCCCTGAAGC;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=1225572;WS=1225554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	1225613	rs7704058	G	A	1806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=6;PP=1470;SC=CCCCAGAACCGGACCCGGCCG;SOR=3.990;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=51;TCR=6;TR=56;WE=1225634;WS=1225603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	1225626	rs7728667	T	A	2447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=9;PP=2006;SC=CCCGGCCGCCTGCGACCTCGG;SOR=3.855;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=67;TCR=9;TR=76;WE=1225634;WS=1225603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr5	1225687	rs7705355	CT	TC	6850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=49;PP=2947;SC=CTGAGCTGCACTGGGTTTGCC;SOR=1.364;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=147;TCF=94;TCR=53;TR=141;WE=1225696;WS=1225677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr5	1225703	rs7724858	A	G	5246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=65;PP=2965;SC=TTGCCGTGGGACTGGGGAACA;SOR=1.192;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=100;TCR=65;TR=165;WE=1225711;WS=1225693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr5	1225801	rs7704363	G	A	2012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=62;PP=1602;ReadPosRankSum=1.717;SC=AGGGGAGGCCGTCTCCACCCT;SOR=0.240;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=91;TCF=12;TCR=79;TR=73;WE=1225809;WS=1225791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,74:0.81:91
chr5	1232240	rs7379178	C	T	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.869;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=186;ReadPosRankSum=-0.663;SC=GTCCCGTCTGCCCCTTGAAGA;SOR=0.184;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=10;WE=1232248;WS=1232230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr5	1232491	rs4975623	G	C	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=23;PP=626;SC=CACCGTCCTCGCTTGCCCTGA;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=1232499;WS=1232481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	1232775	rs6858999	T	A	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5050;FS=2.337;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=7;PP=1182;ReadPosRankSum=-1.712;SC=TGTGTTATTTTATGTTGTTAT;SOR=0.431;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=58;TCF=51;TCR=7;TR=52;WE=1232783;WS=1232765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,53:0.88:60
chr5	1240757	rs7447815	C	G	9226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.646;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=228;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.261;SC=CTAATGACTACGAGCACTGCC;SOR=0.533;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=400;TCF=121;TCR=279;TR=331;WE=1240765;WS=1240747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,332:0.83:402
chr5	1240848	rs6554684	A	C	2489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-6.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=99;PP=2037;ReadPosRankSum=-2.033;SC=GAGAATCCCAAGGCATGAGGA;SOR=2.165;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=117;TCF=1;TCR=116;TR=100;WE=1240856;WS=1240838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,100:0.85:117
chr5	1243009	rs7721679	A	G	4130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.009;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=136;PP=2962;ReadPosRankSum=0.250;SC=GTAGCCAGGCAGGGCCGTCCA;SOR=2.650;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=162;TCF=3;TCR=159;TR=138;WE=1243017;WS=1242999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,137:0.85:162
chr5	1244286	rs7448994	T	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=159;ReadPosRankSum=-0.307;SC=ACACCTCCACTCCCCATCCCC;SOR=0.627;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=8;WE=1244294;WS=1244276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr5	1244425	rs4073918	C	T	4063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.815;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=36;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.554;SC=GCCGCTTCCCCGAACCTGCTC;SOR=0.830;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=175;TCF=130;TCR=45;TR=142;WE=1244433;WS=1244415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,144:0.81:177
chr5	1246258	rs140436341	G	GCCCCGC	1187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.960;NF=1;NR=23;PP=1321;ReadPosRankSum=-0.760;SC=GGTGGGCGGGGCCCCGCCCAC;SOR=0.416;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=24;WE=1246266;WS=1246248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,29:0.71:41
chr5	1255520	rs33954691	G	A	3455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.626;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=64;PP=2647;ReadPosRankSum=-0.091;SC=GCACACATGCGTGAAACCTGA;SOR=0.619;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=172;TCF=86;TCR=86;TR=127;WE=1255528;WS=1255510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,131:0.74:178
chr5	1280128	rs7734992	T	C	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=572;ReadPosRankSum=0.379;SC=GCCACCTCACTGTGCGCACAA;SOR=0.495;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=23;WE=1280136;WS=1280118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,27:0.84:32
chr5	1280252	rs34471035	G	A	3822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.585;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=41;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.114;SC=TAAAAAGGAAGTTAAACCAAA;SOR=0.246;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=156;TCF=112;TCR=44;TR=130;WE=1280260;WS=1280242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,135:0.83:163
chr5	1280477	rs13167280	G	A	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5140;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=796;ReadPosRankSum=1.476;SC=CCCCTCAGGAGGCTTGCTCAG;SOR=0.693;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=28;WE=1280485;WS=1280467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,28:0.88:32
chr5	1282746	rs34846301	C	T	2699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=6.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.588;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=91;PP=2274;ReadPosRankSum=1.030;SC=ACCCCTTAAACGAGAAGGACA;SOR=3.925;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=118;TCF=6;TCR=112;TR=93;WE=1282754;WS=1282736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,94:0.79:119
chr5	1294086	rs2736098	C	T	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=5.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.80;ReadPosRankSum=-1.272;SOR=1.232;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:167,37:0.18:204
chr5	1322880	.	G	C	3392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.479;ClippingRankSum=0.000;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=3;PP=2801;ReadPosRankSum=1.204;SC=GGTGGGGAGGGATTAGCCTCA;SOR=0.783;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=133;TCF=130;TCR=3;TR=108;WE=1322888;WS=1322870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,111:0.82:135
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chr5	1324818	rs62329693	C	A	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=2.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.70;ReadPosRankSum=-0.533;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,23:0.21:107
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chr5	1325803	rs465498	A	G	1920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.663;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=9;PP=1515;ReadPosRankSum=0.013;SC=TACTCTTTGCACAGGGGGCAA;SOR=0.408;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=98;TCF=89;TCR=9;TR=79;WE=1325811;WS=1325793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,79:0.80:99
chr5	1330253	rs452932	T	C	1991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=8;PP=1591;ReadPosRankSum=1.699;SC=CCTGCCATCCTACAGCTTCCA;SOR=0.663;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=92;TCF=82;TCR=10;TR=70;WE=1330261;WS=1330243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,71:0.76:94
chr5	1331890	rs111874283	C	A	2419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.419;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=3;PP=1980;ReadPosRankSum=0.872;SC=AGTATCTGAGCAGGGCCACGC;SOR=0.412;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=108;TCF=105;TCR=3;TR=80;WE=1331898;WS=1331880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,82:0.75:109
chr5	1334507	rs5865369	GA	G	493.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=3.347;QD=2.28;ReadPosRankSum=-1.321;SOR=0.700;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:173,44:0.20:217
chr5	1337947	rs60702155	A	G	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=480;ReadPosRankSum=-0.732;SC=ATTAGGGTGCAGGGGCTGCGG;SOR=0.527;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=25;WE=1337955;WS=1337937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,28:0.85:33
chr5	1344444	rs60785550	G	A	8001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.109;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=191;NR=90;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.378;SC=CCTTTCACTGGCATTTTGTCC;SOR=0.469;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=380;TCF=264;TCR=116;TR=281;WE=1344452;WS=1344434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,287:0.75:383
chr5	1345027	.	CCCGCCGCTCCGGGCT	C	1276.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=2966;ReadPosRankSum=1.794;SC=CGGCGCCCAGCCCGCCGCTCC;SOR=1.157;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=22;WE=1345049;WS=1345017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,32:0.84:38
chr5	1363829	rs115188008	G	A	4309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=23;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.225;SC=CTCACATGGCGGTGGGCGCTC;SOR=0.649;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=188;TCF=161;TCR=27;TR=151;WE=1363837;WS=1363819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,152:0.80:190
chr5	1393753	.	A	G	347	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=50.31;NF=6;NR=11;PP=347;QD=22.4571301498;SC=CCCTGCATGCATCCTGGGGTA;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=17;WE=1393761;WS=1393743;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr5	1394815	rs1042098	A	G	5588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.210;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=130;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.169;SC=CTCCCATTGCAGGATGACTTC;SOR=1.187;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=268;TCF=105;TCR=163;TR=207;WE=1394823;WS=1394805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,210:0.76:275
chr5	1400831	.	C	G	1817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=4.306;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=1;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.416;SC=AGGGCCCCTGCGTCATGTGCC;SOR=0.941;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=83;TCF=82;TCR=1;TR=60;WE=1400853;WS=1400821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,60:0.72:83
chr5	1400845	rs28363150	C	T	1850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=4.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.824;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=1;PP=2962;ReadPosRankSum=0.687;SC=ATGTGCCCCCCGTCCCGGGCA;SOR=1.809;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=89;TCF=87;TCR=2;TR=61;WE=1400853;WS=1400821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,61:0.69:88
chr5	1409081	.	G	A	1165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=0;PP=947;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTTTCAGAAGGGGAGTGGCAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=38;WE=1409089;WS=1409071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,39:0.85:46
chr5	1409127	rs429699	T	C	2687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=15;PP=2163;SC=TTGGCTGCCTTCCCCCGGACT;SOR=3.153;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=68;TCR=15;TR=83;WE=1409135;WS=1409117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr5	1409445	.	G	A	363.22	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=303;ReadPosRankSum=1.145;SC=CCCTTCCTAGGGCTTCATGTG;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=12;WE=1409453;WS=1409435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr5	1409693	rs28363107	G	A	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=1;PP=787;ReadPosRankSum=-0.203;SC=GCACTGCTACGAGTCATTTTC;SOR=1.708;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=33;WE=1409701;WS=1409687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,34:0.83:41
chr5	1410020	rs8179031	T	C	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.984;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=45;PP=902;ReadPosRankSum=-0.786;SC=GACCGCAGCCTGGGCCAAGAC;SOR=2.422;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=62;TCF=5;TCR=57;TR=48;WE=1410028;WS=1410010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,49:0.80:61
chr5	1411025	rs28363097	G	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.562;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=115;ReadPosRankSum=-1.139;SC=ATGGTGGTGTGAATGTGTGTG;SOR=4.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=7;WE=1411033;WS=1411015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr5	1411256	rs2550936	A	C	2048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=6;PP=1602;ReadPosRankSum=-0.235;SC=TGGGGGCCGTACGTGAGCCCA;SOR=1.247;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=68;TCR=7;TR=65;WE=1411264;WS=1411246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,69:0.87:79
chr5	1411412	rs6347	T	C	3883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.306;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=77;PP=2702;ReadPosRankSum=-1.725;SC=CGGCCCAGGCTGAGGACAGAG;SOR=0.237;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=181;TCF=81;TCR=100;TR=147;WE=1411420;WS=1411402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,155:0.81:191
chr5	1416142	rs40358	C	A	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FS=1.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.88;ReadPosRankSum=0.710;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:242,57:0.19:299
chr5	1432825	rs460000	G	T	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.81;ReadPosRankSum=-1.210;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,35:0.19:181
chr5	1432876	rs465130	G	A	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.15;ReadPosRankSum=0.445;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,17:0.19:90
chr5	1432881	rs465989	C	T	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.32;ReadPosRankSum=-0.537;SOR=0.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,17:0.20:86
chr5	1442974	rs2254408	C	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.71;ReadPosRankSum=-1.568;SOR=0.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,22:0.16:140
chr5	1464028	rs6876662	C	T	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.28;ReadPosRankSum=-0.816;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,23:0.20:116
chr5	1466813	rs2277007	T	C	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.00;ReadPosRankSum=-1.529;SOR=0.533;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,34:0.19:183
chr5	1470900	rs2277005	G	A	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FS=3.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.093;SOR=0.909;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:279,70:0.20:349
chr5	1471109	rs27054	T	C	3676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=125;PP=2965;SC=GGGTTTCCCATGGGTGCTGGT;SOR=8.334;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=126;TCF=1;TCR=125;TR=126;WE=1471117;WS=1471099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr5	1479678	rs27059	G	C	4381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=8;PP=2965;SC=CCTGGTGTAAGCTCGTGTCTG;SOR=5.283;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=122;TCR=8;TR=130;WE=1479686;WS=1479668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr5	1481148	rs2447846	A	C	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.24;ReadPosRankSum=-1.260;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,26:0.28:93
chr5	1489706	.	A	G	336	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=19;NR=0;PP=336;QD=19.5142743446;SC=AACCAAATGCACCTGACAGCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=19;WE=1489714;WS=1489705;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr5	1490019	rs72717531	C	G	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=49;PP=1304;ReadPosRankSum=-0.370;SC=GCACGGCTCCCGCCAGGCAGG;SOR=0.584;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=75;TCF=16;TCR=59;TR=63;WE=1490027;WS=1490009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,62:0.84:74
chr5	1501535	.	A	ACC	261.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=-0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.45;ReadPosRankSum=-2.597;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr5	1501790	rs1979396	T	C	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=42;PP=1320;ReadPosRankSum=0.698;SC=CGGCAGAGGCTAGCCCAGGGG;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=66;TCF=13;TCR=53;TR=53;WE=1501798;WS=1501780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,54:0.82:66
chr5	1523996	.	C	T	61	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=1;NR=4;PP=61;QD=19.1542425094;SC=GCCGAGCTGCCTGGGGCGCCG;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=5;WE=1524004;WS=1523986;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr5	1594664	rs4246747	C	G	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=5;PP=165;SC=GGAACCGCGGCGGGTGGGATG;SOR=1.863;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=1594672;WS=1594654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	1708872	rs62338366	C	T	4355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.177;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=72;PP=2962;ReadPosRankSum=1.520;SC=ACTTGGAGCCCGCCCAGGGGC;SOR=0.516;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=188;TCF=97;TCR=91;TR=145;WE=1708880;WS=1708862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,150:0.78:193
chr5	1708983	rs12523324	G	A	3995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=97;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.842;SC=CCTCGACCCAGAGCCAGACAA;SOR=0.818;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=47;TCR=114;TR=137;WE=1708991;WS=1708973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,141:0.85:166
chr5	1801426	rs13176353	G	C	2469.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.462;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.620;NF=45;NR=9;PP=2962;ReadPosRankSum=0.782;SC=CGCGCTCCCCGCCCCCAGGGC;SOR=1.464;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=78;TCF=62;TCR=16;TR=54;WE=1801440;WS=1801416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,60:0.74:81
chr5	1801427	rs34372448	C	CG	2460.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.625;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.606;NF=44;NR=11;PP=2971;ReadPosRankSum=0.434;SC=GCGCTCCCCGCCCCCAGGGCG;SOR=1.565;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=74;TCF=57;TCR=17;TR=55;WE=1801440;WS=1801416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,60:0.75:80
chr5	1801432	rs11745573	A	G	2639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.335;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.989;NF=51;NR=12;PP=2962;ReadPosRankSum=0.082;SC=CCCCGCCCCCAGGGCGAAATA;SOR=1.880;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=84;TCF=64;TCR=20;TR=63;WE=1801440;WS=1801416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,68:0.76:89
chr5	1801689	rs2242412	A	C	3477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=14.730;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=83;PP=2716;ReadPosRankSum=-0.310;SC=TACAGGATGCACCTTCCTCCA;SOR=2.088;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=124;TCF=36;TCR=88;TR=113;WE=1801697;WS=1801679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:10,118:0.92:128
chr5	1814395	rs36074605	TTGTA	T	4501.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.454;NF=67;NR=10;PP=2967;ReadPosRankSum=0.461;SC=GTGGGTTAAATTGTATGTAGT;SOR=0.746;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=111;TCF=95;TCR=16;TR=77;WE=1814406;WS=1814385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,112:0.84:133
chr5	1814783	rs4147773	T	C	3061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=102;PP=2305;ReadPosRankSum=0.439;SC=CTTTCAACTGTGAAGTGGTGG;SOR=0.749;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=28;TCR=130;TR=124;WE=1814791;WS=1814773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,127:0.79:161
chr5	1880891	rs2232376	C	T	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.94;ReadPosRankSum=-0.536;SOR=0.672;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:218,54:0.20:272
chr5	2748427	rs111879512	C	G	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=25.68;ReadPosRankSum=0.136;SOR=0.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr5	2748432	rs111347141	G	A	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=25.68;ReadPosRankSum=-0.052;SOR=0.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr5	2748439	rs112775132	G	C	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=25.68;ReadPosRankSum=-1.054;SOR=0.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr5	2755031	rs62333234	A	G	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.88;ReadPosRankSum=0.426;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,8:0.15:52
chr5	2755191	rs76652220	G	C	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.89;ReadPosRankSum=0.024;SOR=0.755;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:194,31:0.14:225
chr5	3600334	rs844154	T	C	7100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=191;PP=2965;SC=GGGCACTCAATGGAGACAAGG;SOR=2.469;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=246;TCF=55;TCR=191;TR=246;WE=3600342;WS=3600324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr5	3610452	rs13183610	A	T	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=21.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.52;ReadPosRankSum=0.968;SOR=3.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,15:0.17:86
chr5	3610527	rs35761906	T	C	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=1.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.95;ReadPosRankSum=0.956;SOR=1.130;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,9:0.15:61
chr5	3610658	rs1373997	T	C	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=334;SC=AGGAGTGGAGTGGGCCCAGGA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=3610666;WS=3610648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	3610690	.	C	A	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=329;SC=AAATCAGGATCATTCTGAAGC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=3610698;WS=3610680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	4087485	rs6869319	G	T	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.97;QD=31.59;SOR=4.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	4095679	.	T	TTTTCTTTTCTTTTCTTTCTTTCTTTC	104.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.04;QD=26.23;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:0,4:1.00:4
chr5	4420188	rs140931368	G	GTGTA	6597.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.957;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.751;NF=14;NR=194;PP=2974;ReadPosRankSum=1.142;SC=TGCCTGGCATGTGTATGTGTG;SOR=3.234;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=252;TCF=19;TCR=233;TR=208;WE=4420202;WS=4420178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,172:0.98:176
chr5	4702311	.	CTG	C	192	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=20;MQ=57.88;NF=4;NR=0;PP=192;QD=48.75;SC=ATGAGCATGCCTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=4;WE=4702320;WS=4702301;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,4:0.29:14
chr5	4702349	rs61031970	GT	G	487.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.48;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	4702351	rs57238946	GT	G	487.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.48;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	4702352	.	T	G	302	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=27;MQ=58.88;NF=8;NR=5;PP=302;QD=25.9054778882;SC=TGTGTGTGTGTGCTCAGGCCC;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=13;WE=4702360;WS=4702342;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr5	4702461	rs4315900	C	T	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=359;SC=TTTTGTTAATCTTTGGTCTAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=4702469;WS=4702451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	4886332	rs1968828	C	T	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=7.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.93;ReadPosRankSum=0.578;SOR=1.876;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,10:0.14:74
chr5	4930051	rs27416	G	T	3953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=1;PP=2553;SC=GTGATATATAGATGTATCCCT;SOR=7.614;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=94;TCF=93;TCR=1;TR=91;WE=4930059;WS=4930041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr5	4930067	.	A	ATG	1464	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=53;MMLQ=27;MQ=59.59;NF=81;NR=14;PP=1464;QD=15.4736842105;SC=TCCCTCACATATGTGTGTGTG;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=112;TCF=98;TCR=14;TR=95;WE=4930075;WS=4930057;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:17,95:0.85:112
chr5	4930087	rs147939241	G	GTGAA	5973.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=24;PP=2995;SC=GTGTGTGTGTGAGAGAGAGAG;SOR=3.126;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=130;TCF=106;TCR=24;TR=119;WE=4930095;WS=4930076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr5	4930144	rs35167763	AAG	A	10797.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=104;PP=2974;SC=CAGAGAAAGAAAGAGAGGAAT;SOR=0.996;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=238;TCF=119;TCR=119;TR=214;WE=4930153;WS=4930134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr5	4930181	rs560366	C	T	12311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=133;NR=161;PP=2965;SC=CTCATGCAATCGTGGGAGCTG;SOR=0.909;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=295;TCF=134;TCR=161;TR=294;WE=4930189;WS=4930171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,304:1.00:304
chr5	5140958	rs270207	T	A	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=-0.321;QD=1.82;ReadPosRankSum=1.070;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,7:0.12:57
chr5	5140970	rs270206	C	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=-0.336;QD=2.62;ReadPosRankSum=1.193;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,6:0.14:43
chr5	5141009	rs59628659	CT	C	273.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=0;NR=12;PP=192;SC=CTGTTGTGAACTTTTTTTTTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=12;WE=5141017;WS=5140999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	5146200	rs1863969	A	T	3258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.782;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=28;PP=2624;ReadPosRankSum=-1.063;SC=TTCTTCTCGGAATTCCGAAAT;SOR=0.808;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=122;TCR=38;TR=118;WE=5146208;WS=5146190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,124:0.75:166
chr5	5146223	rs1871468	G	C	6878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=136;NR=65;PP=2965;SC=CTCAGCCTCTGCTCACTCTTT;SOR=1.738;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=136;TCR=66;TR=201;WE=5146231;WS=5146213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr5	5146335	rs2086310	C	G	8295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=151;PP=2965;SC=AAGAGCAGTGCCCGTGTCCGA;SOR=1.152;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=251;TCF=100;TCR=151;TR=251;WE=5146343;WS=5146325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr5	5146377	rs1019747	T	C	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=3.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.56;ReadPosRankSum=-1.057;SOR=1.015;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,37:0.20:186
chr5	5146395	rs1863968	A	G	3754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.761;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=82;PP=2879;ReadPosRankSum=-1.394;SC=CGACTTCCACATGGATCTGAG;SOR=0.795;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=166;TCF=65;TCR=101;TR=134;WE=5146403;WS=5146385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,139:0.82:169
chr5	5186412	rs143046364	A	AGG	124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=65.56;MQRankSum=-0.583;QD=4.80;ReadPosRankSum=1.029;SOR=0.202;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr5	5186415	.	GT	G	42.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.96;MQRankSum=-0.209;QD=1.38;ReadPosRankSum=-0.806;SOR=0.048;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,5:0.16:31
chr5	5186416	rs62339905	T	G	304.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=65.03;MQRankSum=0.048;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.042;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr5	5187776	rs1863972	G	A	6590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=141;NR=68;PP=2965;SC=TTCTAGGCCCGCTAGTAAGTA;SOR=1.713;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=209;TCF=141;TCR=68;TR=209;WE=5187784;WS=5187766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr5	5189950	rs6859975	G	A	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=0;PP=526;SC=AAATACACGCGTTAGCTTATA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=5189958;WS=5189940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	5200220	rs58639468	A	ATC	4865.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=45;PP=2995;ReadPosRankSum=0.480;SC=TGAAAGAACCATCTCTCTCTC;SOR=1.559;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=140;TCF=85;TCR=55;TR=105;WE=5200228;WS=5200210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,142:0.99:144
chr5	5200281	rs6555335	C	T	5687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=98;PP=2965;SC=GGAACATGTGCAAAAAGTCCG;SOR=0.944;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=175;TCF=77;TCR=98;TR=175;WE=5200289;WS=5200271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr5	5200490	rs17762877	T	C	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=282;ReadPosRankSum=0.726;SC=CCTGATGTGGTTCCCTTTGAA;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=12;WE=5200498;WS=5200480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr5	5223073	rs12652968	A	G	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=9.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.90;ReadPosRankSum=1.663;SOR=2.533;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,25:0.21:118
chr5	5232346	rs2913623	G	A	2042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=0;PP=1650;SC=ATTAGGTGCTGCTTGAGTGTA;SOR=8.318;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=61;TCR=0;TR=60;WE=5232365;WS=5232336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr5	5232356	rs150710468	AGG	A	3290.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=0;PP=2720;SC=GCTTGAGTGTAGGGGGAGGCT;SOR=8.688;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=73;TCF=72;TCR=1;TR=71;WE=5232365;WS=5232336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr5	5232398	rs2913624	G	A	3872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=98;NR=18;PP=2965;SC=ATTCCCCACTGCTCAGCCTTA;SOR=2.991;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=98;TCR=18;TR=116;WE=5232406;WS=5232388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr5	5232703	rs2195290	T	C	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=325;ReadPosRankSum=0.447;SC=AGTATGCCTGTGTCTCAGCTC;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=18;WE=5232711;WS=5232693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr5	5235028	rs2913630	T	C	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=501;SC=TAATTACCCATTCTAACACTC;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=5235036;WS=5235018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	5235096	rs2913631	A	G	2567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=20;PP=2072;SC=ACTAAAATATAAAAATTCTAA;SOR=2.274;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=59;TCR=20;TR=79;WE=5235104;WS=5235086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr5	5303349	rs11959893	T	C	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=3;PP=479;SC=GATGGAGCCATCCCTCACCGA;SOR=3.383;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=5303357;WS=5303339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	5303614	rs11134110	C	T	5122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=60;PP=2965;SC=TGGGTGGCAGCAGGGCCCCTG;SOR=1.287;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=156;TCF=96;TCR=60;TR=155;WE=5303622;WS=5303604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr5	5436609	rs2578552	G	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=9.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.27;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=1.026;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,23:0.13:172
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chr5	5443179	rs2578554	G	A	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=27;ReadPosRankSum=-0.385;SC=TCTGCCTAATGTCTGTTTATT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=5;WE=5443187;WS=5443169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,5:0.18:28
chr5	5460569	rs2578565	C	T	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.025;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=3;PP=1103;ReadPosRankSum=0.474;SC=TTGGAGAATACACAGATTCCA;SOR=2.085;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=61;TCF=56;TCR=5;TR=47;WE=5460577;WS=5460559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,48:0.77:62
chr5	5460619	rs2619844	G	C	3854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.306;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=15;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.830;SC=TCTGCTGAGTGTGTTTCAGAA;SOR=1.040;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=129;TCR=18;TR=124;WE=5460627;WS=5460609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,130:0.86:152
chr5	5462148	rs2578500	G	A	12114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=556;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.656;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=208;NR=225;PP=2962;ReadPosRankSum=1.781;SC=TATGTCAACTGTAGCAAAATG;SOR=0.605;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=548;TCF=262;TCR=286;TR=433;WE=5462156;WS=5462138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,440:0.80:553
chr5	5476250	rs11416699	T	TG	737.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.646;NF=1;NR=24;PP=683;ReadPosRankSum=-0.032;SC=GGTGGAAGGCTGGGGGGTTAA;SOR=0.385;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=25;WE=5476258;WS=5476240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,29:0.74:39
chr5	6020374	rs464221	A	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.21;ReadPosRankSum=-0.174;SOR=0.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,20:0.15:133
chr5	6020418	rs457263	T	G	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=1.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.32;ReadPosRankSum=-1.862;SOR=0.970;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,15:0.15:103
chr5	6020488	rs412953	C	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.31;ReadPosRankSum=1.363;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,12:0.21:57
chr5	6312877	.	CAC	GAG	189	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MMLQ=29;MQ=58.8;NF=1;NR=2;PP=189;QD=80.8226249541;SC=CACACACACACACAGAGAGAG;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=3;WE=6312887;WS=6312867;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr5	6312879	.	C	CAGAG	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.43;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=1.492;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,1:0.25:4
chr5	6337065	rs70965988	T	TACACACACACACACACACACACACAC	245.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.71;MQRankSum=-1.834;QD=40.96;ReadPosRankSum=0.524;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr5	6337241	rs4702336	T	A	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=1.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.42;ReadPosRankSum=-0.190;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,40:0.24:167
chr5	6372585	rs9451	A	G	1283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=7;PP=1001;SC=TCGCAGTCCCAGGGGATCTTC;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=45;WE=6372593;WS=6372575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	6378614	rs7723985	G	C	12150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=115;NR=262;PP=2965;SC=GCCCGTCCCCGACCCACACAG;SOR=1.810;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=377;TCF=115;TCR=262;TR=377;WE=6378622;WS=6378604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,386:1.00:386
chr5	6600150	rs3822434	G	A	2793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.858;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=35;PP=2106;ReadPosRankSum=0.057;SC=CCTCAGTCACGTCATTGTCTG;SOR=0.508;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=125;TCF=83;TCR=42;TR=100;WE=6600158;WS=6600140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,104:0.80:130
chr5	6602544	rs2303711	T	C	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=1.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.04;ReadPosRankSum=-0.613;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,20:0.19:108
chr5	6623432	rs35232789	G	GA	294.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=13;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=176;ReadPosRankSum=0.379;SC=CAACAATTAGGAAAAAAAAAA;SOR=1.270;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=18;WE=6623440;WS=6623422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr5	6632909	rs571550	G	A	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.018;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=47;PP=1105;ReadPosRankSum=1.257;SC=GGCCCAAGGAGCCGCCCCCTC;SOR=1.730;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=68;TCF=10;TCR=58;TR=54;WE=6632917;WS=6632899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,54:0.78:69
chr5	6632942	rs193743	G	T	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=32;PP=844;ReadPosRankSum=-1.633;SC=CAGGCCTCGGGGTCCGGGAAG;SOR=0.787;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=35;WE=6632950;WS=6632932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,37:0.84:44
chr5	6633779	rs248793	C	G	3969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.784;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.384;NF=89;NR=47;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.468;SC=TCTTCGCGCGCAATCGTCAGA;SOR=0.312;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=158;TCF=106;TCR=52;TR=136;WE=6633787;WS=6633769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,136:0.86:158
chr5	6645016	rs248805	A	G	6353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=145;NR=68;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.512;SC=TGATTCCAAGACGCAGAGAGA;SOR=0.710;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=269;TCF=185;TCR=84;TR=213;WE=6645024;WS=6645006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,219:0.80:274
chr5	6668087	rs824809	G	A	137.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5098;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=72;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CAGATAGAAAGGTGAATTCTA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=6668095;WS=6668084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr5	6737571	rs2279657	A	G	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.81;ReadPosRankSum=1.165;SOR=0.036;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,13:0.15:85
chr5	6737576	rs2279656	G	A	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.56;ReadPosRankSum=1.131;SOR=0.037;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,14:0.16:90
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chr5	6748518	rs274682	A	G	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.904;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=102;ReadPosRankSum=-0.388;SC=GAGAAGATCCAAAACATGTGG;SOR=0.083;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=11;WE=6748526;WS=6748508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,10:0.23:44
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chr5	7712810	rs6555488	C	T	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=365;SC=TTGATTCACACTTAGGATTAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=7712818;WS=7712806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	7717396	rs6878196	T	C	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=6.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.17;ReadPosRankSum=1.206;SOR=0.959;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,8:0.13:62
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chr5	7757647	rs52827085	C	G	3061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-7.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.141;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=93;PP=2528;ReadPosRankSum=-0.204;SC=CCACGGATCTCTCTCACGATC;SOR=1.070;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=21;TCR=113;TR=110;WE=7757655;WS=7757637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,109:0.81:134
chr5	7850898	rs11276029	TGCCCAGCC	T	145.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.49;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	7859523	rs1046012	A	G	1745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=13;PP=1399;SC=AAGTTCTTCCATTGTTTGAGT;SOR=2.658;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=62;TCF=49;TCR=13;TR=61;WE=7859531;WS=7859513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr5	7862002	.	G	A	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=41;PP=983;ReadPosRankSum=-0.602;SC=CACAGAATGGGTTCTGAAGTT;SOR=2.790;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=0;TCR=51;TR=41;WE=7862010;WS=7861992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,42:0.81:52
chr5	7862926	rs3733784	T	C	2045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=1;PP=1686;SC=AAACTCCTTATACTACTTACC;SOR=6.027;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=58;TCF=57;TCR=1;TR=58;WE=7862934;WS=7862916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	7865891	rs16879258	C	A	4081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=117;NR=1;PP=2965;SC=CTGGTGGCAACTGACTCCAAG;SOR=8.189;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=118;TCF=117;TCR=1;TR=118;WE=7865899;WS=7865881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr5	7865930	.	T	C	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.000;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=4.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.99;ReadPosRankSum=-0.477;SOR=0.310;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,35:0.19:181
chr5	7866967	rs162030	G	C	9671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=165;NR=149;PP=2965;SC=GTTCCATTAAGGCAGAAATCT;SOR=0.815;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=314;TCF=165;TCR=149;TR=314;WE=7866975;WS=7866957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr5	7868030	rs2966952	T	C	12585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=159;NR=196;PP=2965;SC=ATGATGGAATTTGACCCCGAA;SOR=0.893;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=357;TCF=160;TCR=197;TR=355;WE=7868038;WS=7868020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,381:1.00:381
chr5	7869455	rs34828626	TC	T	1059.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=28;PP=1228;SC=CCCTTCGGCCTCCGGGGGTCG;SOR=3.912;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=31;WE=7869463;WS=7869445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	7872309	.	C	T	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.736;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.617;NF=5;NR=2;PP=85;ReadPosRankSum=1.644;SC=TTAAATACTTCGGTAAAAAGT;SOR=0.066;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=7;WE=7872317;WS=7872299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chr5	7878179	rs1532268	C	T	6820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=139;NR=70;PP=2965;SC=CCTGCATCCTCGAGGACAGAC;SOR=1.598;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=211;TCF=141;TCR=70;TR=209;WE=7878187;WS=7878169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr5	7885782	rs34487083	A	AT	1992.06	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.015;NF=62;NR=10;PP=992;ReadPosRankSum=-1.224;SC=CGTATAATGTATTTTTTTTTT;SOR=1.179;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=128;TCF=106;TCR=22;TR=72;WE=7885790;WS=7885772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,95:0.86:110
chr5	7893121	rs162049	G	A	2409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=69;PP=1958;SC=ATTCATTACTGTCATAAGAAA;SOR=5.811;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=3;TCR=69;TR=72;WE=7893129;WS=7893111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr5	7897319	rs1802059	G	A	4072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=97;PP=2965;SC=AGCAGGTGGCGAGAATCCTCC;SOR=2.538;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=27;TCR=97;TR=124;WE=7897327;WS=7897309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr5	8461166	rs341899	T	C	2479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=66;PP=2110;SC=GTTTCTAAGTTTATTATTAAA;SOR=7.083;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=67;TCF=1;TCR=66;TR=67;WE=8461174;WS=8461156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	9043142	rs3834271	T	TA	1098.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.316;NF=0;NR=34;PP=715;ReadPosRankSum=-1.312;SC=GAAAATATATTAAAAAAAAAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=1;TCR=51;TR=34;WE=9043150;WS=9043132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr5	9050410	rs257098	C	T	2559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=1;PP=2279;SC=TGACTTTCTCCGGTTTTTCAT;SOR=7.195;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=74;TCF=72;TCR=2;TR=73;WE=9050418;WS=9050400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr5	9053945	rs257095	C	T	2419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=59;PP=1920;SC=AGAACTCGTGCTTGAAGCCTT;SOR=2.895;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=13;TCR=59;TR=72;WE=9053953;WS=9053935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr5	9063097	.	C	T	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.780;ClippingRankSum=0.000;DP=262;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.397;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,64:0.25:259
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chr5	9136487	rs6883525	A	C	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.082;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=356;ReadPosRankSum=1.756;SC=GAGAGAGCACAGACTGGGTTT;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=16;WE=9136495;WS=9136479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr5	9154659	rs1806151	G	C	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=147;ReadPosRankSum=0.309;SC=GCTCCCGCAGGCCCACGAACA;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=9;WE=9154667;WS=9154649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr5	9197434	rs3216958	A	AGAG	1499.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.69;MQRankSum=0.894;QD=31.91;ReadPosRankSum=0.609;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,38:0.81:47
chr5	9202419	rs1805974	T	C	887.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=757;ReadPosRankSum=0.220;SC=TCTTGCCTGCTCAGTATTTCA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=27;WE=9202427;WS=9202409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,29:0.94:31
chr5	9280957	rs6555597	C	A	8273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=211;PP=2965;ReadPosRankSum=1.434;SC=TAAAATGTAACGTTTTAGCAA;SOR=2.303;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=247;TCF=35;TCR=212;TR=246;WE=9280965;WS=9280947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,250:1.00:251
chr5	10227548	rs2136197	C	A	2834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=26;PP=2217;SC=CACTCCCAGTCAAGTTTATGC;SOR=2.044;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=64;TCR=26;TR=90;WE=10227556;WS=10227538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr5	10227823	rs3080459	C	CCT	1298.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=25;PP=1155;SC=CCCAAAATTTCCTGTTTTTAA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=25;WE=10227831;WS=10227813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	10236856	rs11133605	A	G	2718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=43;PP=2379;SC=CTAAGACATCATTTTAAAATG;SOR=0.832;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=48;TCR=43;TR=91;WE=10236864;WS=10236846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr5	10236927	rs2292263	C	T	4841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=114;NR=32;PP=2965;SC=AACTTAGTTTCCTTGATTGGT;SOR=2.608;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=114;TCR=32;TR=146;WE=10236935;WS=10236917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr5	10237155	rs6876650	G	A	3679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=91;PP=2876;SC=AAAATAACCTGTCAATGAAAA;SOR=2.978;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=17;TCR=91;TR=108;WE=10237163;WS=10237145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr5	10239278	rs2252505	C	T	9012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=115;NR=166;PP=2965;SC=CAGGTACAAACGGCAAACAGA;SOR=1.143;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=281;TCF=115;TCR=166;TR=281;WE=10239286;WS=10239268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr5	10250047	rs2607301	C	A	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=20;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=15;PP=1113;SC=AAAAAAAAAACCGGAAATGGG;SOR=2.342;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=41;WE=10250055;WS=10250037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	10250430	rs2548546	G	A	5648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=123;PP=2965;SC=CGGTTGGGGGGAAGTAATTCC;SOR=1.877;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=51;TCR=123;TR=174;WE=10250451;WS=10250420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr5	10250443	rs2578618	T	C	5318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=121;PP=2965;SC=GTAATTCCGGTTGTTGCACCA;SOR=2.408;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=36;TCR=121;TR=157;WE=10250451;WS=10250420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr5	10254504	rs140671145	CT	C	65.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=17;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=4;PP=46;SC=TAGGTCGGACCTTTTTTTTTT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=4;WE=10254512;WS=10254494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	10254817	rs2578617	A	G	7099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=114;NR=97;PP=2965;SC=ATAAGGATGGAGATGTGACTG;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=211;TCF=114;TCR=97;TR=211;WE=10254825;WS=10254807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr5	10255021	rs2607294	T	C	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=53;PP=1343;SC=ACATGCCTGCTGAGATTGTTG;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=6;TCR=53;TR=59;WE=10255029;WS=10255011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	10255083	rs2578616	A	C	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=23;PP=707;SC=AAAACATGCTACAAAACAAAT;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=10255091;WS=10255073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	10256161	rs1042392	T	C	4279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=94;PP=2965;SC=AGGCTGCTCGTGTTGCTATTG;SOR=1.375;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=54;TCR=94;TR=148;WE=10256169;WS=10256151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr5	10258125	rs2457156	G	A	2717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=12;PP=2310;SC=TCAAAACATCGTTTGATTTAT;SOR=3.482;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=71;TCR=12;TR=83;WE=10258133;WS=10258115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr5	10261542	rs2607327	C	T	5386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=150;NR=1;PP=2965;SC=GGAGATGTCTCGGTCAAAGTG;SOR=8.701;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=152;TCF=151;TCR=1;TR=151;WE=10261550;WS=10261532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr5	10261966	rs2244717	G	A	2169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=53;PP=1734;SC=AAAAATAATCGTGGTTCTCAA;SOR=3.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=9;TCR=53;TR=62;WE=10261974;WS=10261956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr5	10262740	rs2578642	C	A	9404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=178;NR=121;PP=2965;SC=GGTAAGGGATCTGTGCAGACT;SOR=1.153;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=300;TCF=178;TCR=122;TR=299;WE=10262748;WS=10262730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr5	10263451	.	TGGAG	T	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.68;NF=5;NR=106;PP=2947;QD=20;SC=CGCCTCTGCGTGGAGGGGGGG;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=119;TCF=5;TCR=114;TR=111;WE=10263472;WS=10263441;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,111:0.93:119
chr5	10263453	rs147103051	GA	G	7419.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.70;QD=44.43;SOR=4.268;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr5	10263457	rs58620077	G	A	7506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.33;QD=46.34;SOR=4.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr5	10263461	rs370306096	GGGA	G	7057.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.21;QD=46.74;SOR=4.308;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr5	10264962	rs544	A	G	1965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=51;PP=1557;SC=CTCGTGATGCATCTACAGTTA;SOR=4.174;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=6;TCR=51;TR=57;WE=10264970;WS=10264952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	10280598	.	C	T	7837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.643;ClippingRankSum=0.000;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.217;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=140;NR=126;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.133;SC=CAATTAAATTCCTTCTGGCCT;SOR=0.594;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=316;TCF=168;TCR=148;TR=266;WE=10280606;WS=10280588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,277:0.85:325
chr5	10282396	rs10067744	A	G	2703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=54;PP=2090;SC=AATCCTTGACAATGCCTGAAA;SOR=1.481;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=31;TCR=54;TR=85;WE=10282404;WS=10282386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr5	10282479	rs10052785	C	T	1818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=51;PP=1525;SC=CCGCATGATCCCCACACTCAT;SOR=5.211;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=3;TCR=51;TR=54;WE=10282487;WS=10282469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	10390340	rs11449510	G	GT	379.92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.672;NF=18;NR=0;PP=262;ReadPosRankSum=-2.023;SC=TCTTCTGGCTGTTTTTTTTTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=18;WE=10390348;WS=10390330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,19:0.86:22
chr5	10394911	rs201911419	AT	A	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.224;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
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chr5	10442496	rs2567577	T	C	2023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=57;PP=1750;SC=ACCAGGGGCCTTACGCGGCAC;SOR=5.960;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=59;TCF=2;TCR=57;TR=59;WE=10442504;WS=10442486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr5	10448247	rs1976360	G	A	1127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=1;PP=958;SC=ACATAAGCCCGGGATGTTGGT;SOR=5.670;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=33;WE=10448255;WS=10448237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	10505467	rs62362463	A	G	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.63;ReadPosRankSum=1.201;SOR=0.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,6:0.12:52
chr5	10505585	rs17816571	A	G	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FS=0.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.09;ReadPosRankSum=1.613;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:210,48:0.19:258
chr5	10505851	rs373652829	TAAA	T	391.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=2.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.87;ReadPosRankSum=0.989;SOR=1.145;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,14:0.25:57
chr5	10509069	rs1392005	C	T	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=161;ReadPosRankSum=1.349;SC=GAACCAGTGGCGGCCAGTGTT;SOR=0.177;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=11;WE=10509077;WS=10509059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr5	10564846	rs814576	C	T	762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=11;PP=592;SC=CGGCGACCCTCCTGCGCGCCG;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=23;WE=10564854;WS=10564836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	10565027	rs1103749	C	G	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=7;PP=253;SC=CGCCTCCCAGCTCCTGGCTCC;SOR=1.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=10565035;WS=10565017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	10618681	rs13169304	C	A	1373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=42;PP=1124;ReadPosRankSum=1.656;SC=GATCAGAGACCATGTCCTGCT;SOR=1.647;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=54;TCF=5;TCR=49;TR=47;WE=10618689;WS=10618671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,47:0.87:54
chr5	10624887	rs1531839	T	C	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=1.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.95;ReadPosRankSum=-1.601;SOR=0.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,45:0.24:184
chr5	10638180	rs11745612	T	C	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=2.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.68;ReadPosRankSum=-0.673;SOR=0.443;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,19:0.20:95
chr5	10638364	rs6889196	A	G	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=1.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.60;ReadPosRankSum=-0.028;SOR=0.276;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,7:0.13:55
chr5	10649412	rs13174184	G	C	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=3;PP=792;ReadPosRankSum=-0.176;SC=CCCGCCGTGGGATGTCGCCGC;SOR=0.726;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=33;WE=10649420;WS=10649402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,34:0.87:39
chr5	10649625	rs185973776	C	T	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.287;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=35;PP=1299;ReadPosRankSum=-0.982;SC=CGCCGCGCTCCGTGCGGGGCC;SOR=0.382;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=82;TCF=35;TCR=47;TR=63;WE=10649633;WS=10649615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,66:0.79:84
chr5	10649784	rs113222960	G	A	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5026;FS=7.533;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=310;ReadPosRankSum=-1.254;SC=TCCTGGCGGCGCGGGCTGCAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=14;WE=10649792;WS=10649774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr5	10650150	rs56969869	A	G	2488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=51;PP=1916;ReadPosRankSum=-1.454;SC=AGAGGAAGGCAGAGGAGGCCG;SOR=0.595;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=55;TCR=62;TR=98;WE=10650158;WS=10650140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,100:0.83:120
chr5	10650251	rs140897444	CGGGGCT	C	1155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.862;NF=5;NR=23;PP=1324;ReadPosRankSum=1.848;SC=GCGCTGGGGCCGGGGCTGGGG;SOR=0.476;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=28;WE=10650264;WS=10650241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,31:0.79:39
chr5	10650324	rs13354827	TT	GG	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=752;ReadPosRankSum=0.426;SC=ATCGCACCACTTCCGCTCCAT;SOR=0.976;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=15;WE=10650333;WS=10650314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr5	10748231	rs267944	C	T	9266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=210;NR=80;PP=2965;SC=AATGTTAATGCTTAACCGAAT;SOR=2.059;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=290;TCF=210;TCR=80;TR=290;WE=10748239;WS=10748221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr5	10748462	rs267943	C	T	3122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=78;PP=2499;SC=TGGAAAGGTTCTGGTTGCTCA;SOR=3.889;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=11;TCR=78;TR=89;WE=10748470;WS=10748452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr5	10761009	rs11740244	C	G	181.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=146;SC=GGCATCAAGGCCCGGAACCCG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=10761017;WS=10760999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	10761182	rs267927	A	G	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=12;PP=652;SC=CGAAGACATGACGCGGCGGGG;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=15;TCR=12;TR=27;WE=10761190;WS=10761172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	11082762	rs2277053	T	C	10277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=222;NR=92;PP=2965;SC=CTAGAGAAAATATTTTCACTT;SOR=1.834;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=314;TCF=222;TCR=92;TR=314;WE=11082770;WS=11082752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr5	11084189	rs1024621	T	C	4216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=108;PP=2965;SC=CTACTTTGTATCTCAAGCTCT;SOR=3.793;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=16;TCR=108;TR=124;WE=11084197;WS=11084179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr5	11098987	rs2301851	C	T	1905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=63;PP=1572;ReadPosRankSum=-0.988;SC=ATAGACTGCACGGAGGCTATT;SOR=2.542;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=78;TCF=0;TCR=78;TR=63;WE=11098995;WS=11098977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,64:0.78:82
chr5	11159657	rs1990003	T	C	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=7.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.22;ReadPosRankSum=-1.056;SOR=0.014;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,14:0.19:72
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chr5	11564995	rs7719578	A	G	6656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=161;NR=68;PP=2965;SC=GAAGAGAAACATCACGATTTA;SOR=1.810;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=230;TCF=162;TCR=68;TR=229;WE=11565003;WS=11564985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr5	11732144	rs4348210	G	A	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=0;PP=817;ReadPosRankSum=0.685;SC=TCTGCTACATGAGTATGAGTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=30;WE=11732152;WS=11732134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,32:0.94:34
chr5	11732468	rs4466167	C	A	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=33;PP=865;ReadPosRankSum=0.340;SC=AAGATACACACAGAAAAAAAA;SOR=0.986;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=35;WE=11732476;WS=11732458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,36:0.82:44
chr5	13692279	rs2166337	A	T	1704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=47;PP=1405;ReadPosRankSum=1.598;SC=ACTTGGTGAAATTTCCACTTT;SOR=0.596;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=82;TCF=17;TCR=65;TR=60;WE=13692287;WS=13692269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,60:0.73:82
chr5	13701327	rs3734112	A	G	3305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.346;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=18;PP=2638;ReadPosRankSum=0.560;SC=CTTTAAAACTATAATGATGGA;SOR=1.140;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=137;TCF=113;TCR=24;TR=107;WE=13701335;WS=13701317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,112:0.79:141
chr5	13701525	rs3734111	T	C	8418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.590;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=161;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.683;SC=AGAAACCCAGTGTACTAGAAA;SOR=0.652;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=276;TCF=71;TCR=205;TR=217;WE=13701544;WS=13701515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,220:0.77:284
chr5	13701536	rs3734110	T	C	7898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.665;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=145;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.694;SC=GTACTAGAAATCCAAGAAGCC;SOR=0.780;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=239;TCF=55;TCR=184;TR=187;WE=13701544;WS=13701515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,194:0.78:248
chr5	13701617	rs61338089	GA	G	1039.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=53;PP=620;ReadPosRankSum=-1.645;SC=TATGTTCACTGAAAAAAAAAA;SOR=2.760;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=81;TCF=0;TCR=81;TR=53;WE=13701626;WS=13701607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,52:0.81:64
chr5	13701654	rs13162313	T	C	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5294;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=38;PP=1048;ReadPosRankSum=0.431;SC=TTCACTTTTATAATGAAAAAA;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=38;WE=13701662;WS=13701644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,38:0.88:43
chr5	13721378	rs17203442	A	G	3969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.637;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=94;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.158;SC=TATACAAGTCAGTAAAAGTCA;SOR=0.601;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=191;TCF=64;TCR=127;TR=142;WE=13721386;WS=13721368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,150:0.75:201
chr5	13729714	rs3777093	A	G	1782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=52;PP=1463;SC=TTCCTTCACTATAAAACAATC;SOR=8.015;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=0;TCR=52;TR=52;WE=13729722;WS=13729704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	13735892	rs3734109	T	C	3514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=76;NR=30;PP=2823;SC=TGCACAGATATAGAATTCAGC;SOR=1.856;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=76;TCR=30;TR=106;WE=13735900;WS=13735882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr5	13737700	rs2401811	A	G	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.59;ReadPosRankSum=-0.364;SOR=0.522;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,7:0.19:37
chr5	13754394	rs2401809	C	T	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FS=9.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.000;QD=2.01;ReadPosRankSum=-0.918;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:286,55:0.16:341
chr5	13769257	rs12655133	T	A	5241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=107;PP=2965;SC=TAATTCAATATAAAGCAAGCA;SOR=1.759;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=49;TCR=107;TR=156;WE=13769265;WS=13769247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr5	13770757	rs138234449	C	CA	1793.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=0;PP=2304;SC=CTATGATACACAAAATGTCTC;SOR=8.155;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=64;TCR=0;TR=57;WE=13770765;WS=13770747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr5	13776487	rs34413787	C	T	6770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=162;NR=40;PP=2965;SC=TCAAGCATCCCTGAAAGAACT;SOR=2.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=203;TCF=162;TCR=41;TR=202;WE=13776495;WS=13776477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr5	13788886	rs10513155	C	A	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=2.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.25;ReadPosRankSum=-0.547;SOR=0.940;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:359,89:0.20:448
chr5	13810149	rs35732567	G	A	435.85	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=340;ReadPosRankSum=1.516;SC=GTTCCGTCTGGACGGGCAGGT;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=13;WE=13810157;WS=13810139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr5	13810441	rs35058767	G	A	1475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.002;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=43;PP=1173;ReadPosRankSum=0.291;SC=GTTTCAATGGGAACAGTAAAC;SOR=1.516;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=60;TCF=8;TCR=52;TR=49;WE=13810449;WS=13810431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,49:0.82:60
chr5	13810529	rs31238	C	G	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=20;PP=658;SC=AAGAACTGATCTCTGAGAATA;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=13810537;WS=13810519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	13811775	rs10078391	T	C	5971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.924;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=89;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.043;SC=AATCAGGCCTTGAAGCATGTT;SOR=1.133;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=258;TCF=147;TCR=111;TR=214;WE=13811783;WS=13811765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,221:0.83:267
chr5	13814682	rs56046501	T	C	3996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.326;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=4;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.091;SC=TGTTTTCCTTTTTAATTATAC;SOR=1.998;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=157;TCF=150;TCR=7;TR=123;WE=13814690;WS=13814672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,129:0.79:164
chr5	13815049	rs6890413	AG	CT	1574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=31;PP=1418;ReadPosRankSum=0.061;SC=CTATTATATTAGATGTAATTT;SOR=3.033;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=31;WE=13815058;WS=13815039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,39:0.83:47
chr5	13817881	rs6889720	G	A	3055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=88;PP=2447;ReadPosRankSum=0.686;SC=ACTAATTTGTGGTGTACTGTC;SOR=1.098;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=7;TCR=107;TR=94;WE=13817889;WS=13817871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,99:0.84:118
chr5	13820656	rs6554817	G	A	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=620;ReadPosRankSum=-0.138;SC=AATGATGGCCGGACACGGTGG;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=23;WE=13820664;WS=13820646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,24:0.75:32
chr5	13823262	rs10035657	T	C	1420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.731;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=6;PP=1203;ReadPosRankSum=0.296;SC=TCACTGTTGTTATTTTTGCTG;SOR=0.481;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=62;TCF=56;TCR=6;TR=49;WE=13823270;WS=13823252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,49:0.75:65
chr5	13829608	rs1348691	G	A	1355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=0;PP=1049;ReadPosRankSum=-1.198;SC=AAGACCTCCAGGATGACACAC;SOR=2.753;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=54;TCR=0;TR=42;WE=13829616;WS=13829598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,45:0.80:56
chr5	13829799	rs1348689	G	A	6748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=122;PP=2962;ReadPosRankSum=0.280;SC=CCTGCCGTCCGGCATAGCCAG;SOR=0.664;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=266;TCF=126;TCR=140;TR=233;WE=13829807;WS=13829789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,235:0.87:271
chr5	13829933	rs16902790	G	A	1729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.208;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.453;NF=2;NR=53;PP=1375;ReadPosRankSum=0.479;SC=ACTCATTTACGTATCTCAATC;SOR=2.770;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=64;TCF=3;TCR=61;TR=55;WE=13829941;WS=13829923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,59:0.86:69
chr5	13830048	rs10474996	G	A	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=7;PP=184;ReadPosRankSum=-3.719;SC=TTTCCATTCAGGAAAACAGAT;SOR=1.230;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=13;WE=13830056;WS=13830046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr5	13839695	rs9312849	C	T	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5021;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=375;ReadPosRankSum=1.248;SC=TAAATATACACGTTATTAGCA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=16;WE=13839703;WS=13839685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,17:0.85:20
chr5	13842052	rs1910089	A	T	1916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-5.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.611;NF=0;NR=86;PP=2223;ReadPosRankSum=2.492;SC=AAAAAGCTATAGTCATATAAA;SOR=2.862;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=104;TCF=0;TCR=104;TR=86;WE=13842060;WS=13842042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,64:0.81:79
chr5	13844874	rs16902837	G	A	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=595;ReadPosRankSum=-0.675;SC=ACCCGTTTTCGAAGAGCTACT;SOR=1.347;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=25;WE=13844882;WS=13844864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,27:0.79:34
chr5	13845045	rs10041113	G	A	4980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=66;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.086;SC=TCTCTAGAAGGGCAGGATCTG;SOR=0.746;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=204;TCF=122;TCR=82;TR=167;WE=13845053;WS=13845035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,175:0.82:213
chr5	13845107	rs4429853	A	G	3551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.756;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=69;PP=2643;ReadPosRankSum=0.405;SC=AAGTACCTACAAGGAGAGGAA;SOR=0.849;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=158;TCF=76;TCR=82;TR=131;WE=13845115;WS=13845097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,136:0.82:166
chr5	13845151	rs10041099	C	G	2711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=74;PP=2113;ReadPosRankSum=0.892;SC=CAAAGCTGGTCGTTCAAGGAA;SOR=0.899;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=19;TCR=93;TR=89;WE=13845159;WS=13845141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,93:0.81:115
chr5	13850651	rs795528	T	C	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=350;ReadPosRankSum=-0.853;SC=CAGCTTTATATATAAATTCAG;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=16;WE=13850659;WS=13850641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr5	13850739	rs4701988	T	A	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.724;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=506;ReadPosRankSum=0.689;SC=ACCGAGAGCTTTCAAAGAGCC;SOR=0.216;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=15;WE=13850758;WS=13850729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
chr5	13850750	rs6554820	A	G	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.672;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=1331;ReadPosRankSum=-0.787;SC=TCAAAGAGCCAGTGAACTTAC;SOR=1.550;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=33;WE=13850758;WS=13850729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,36:0.71:51
chr5	13851016	rs795526	C	T	502.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5134;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=361;ReadPosRankSum=-0.216;SC=GAGGCTAGAGCTTTAACCAGT;SOR=2.200;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=15;WE=13851024;WS=13851006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,17:0.89:19
chr5	13859743	rs1502043	G	T	4259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.34;ReadPosRankSum=-0.608;SOR=0.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,140:0.80:175
chr5	13859807	rs1867677	G	T	2244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=61;PP=1807;SC=ATTTTTAACCGCTTTCTTTAC;SOR=8.380;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=0;TCR=61;TR=61;WE=13859815;WS=13859797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr5	13862600	rs7724453	T	G	2353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=5;PP=1877;ReadPosRankSum=-0.218;SC=TCATTAATTTTAAATGTTTGC;SOR=1.038;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=92;TCF=85;TCR=7;TR=72;WE=13862608;WS=13862590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,78:0.79:99
chr5	13862616	rs7704417	C	T	2678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=14;PP=2058;ReadPosRankSum=-0.006;SC=TTTGCTATTACGGTTCTCAAA;SOR=0.744;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=103;TCR=19;TR=92;WE=13862624;WS=13862606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,98:0.77:128
chr5	13864728	rs6554827	C	A	3628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=63;PP=2792;ReadPosRankSum=-2.052;SC=CCTTCAAGGCCCGGGGAAGCT;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=169;TCF=91;TCR=78;TR=137;WE=13864736;WS=13864718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,138:0.80:172
chr5	13864885	rs6554828	G	A	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=488;ReadPosRankSum=-0.178;SC=CTTGCAGGCTGTCTGTTCATA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=20;WE=13864893;WS=13864875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr5	13865717	rs7720415	A	G	1076.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.603;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=3;PP=828;ReadPosRankSum=0.671;SC=TTGGCTGCCTATCAAAGAGGA;SOR=2.419;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=32;WE=13865725;WS=13865707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,35:0.90:39
chr5	13865980	rs7703349	T	C	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=694;ReadPosRankSum=-0.386;SC=CTCCAGTATATGTGATGTATT;SOR=0.538;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=38;WE=13865988;WS=13865970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,41:0.80:51
chr5	13866450	rs11748811	A	G	2578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.078;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=76;PP=2029;ReadPosRankSum=0.847;SC=AATTTCATGAACTCAATCCAT;SOR=1.669;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=102;TCF=7;TCR=95;TR=81;WE=13866458;WS=13866440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,87:0.81:108
chr5	13867819	rs1445810	C	T	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=590;ReadPosRankSum=-0.985;SC=TTTTAGACAACTACATTTTGC;SOR=3.477;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=25;WE=13867827;WS=13867809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,27:0.87:31
chr5	13867851	rs13156044	G	A	1034.31	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=1;PP=867;ReadPosRankSum=0.871;SC=ACTCATCCCCGAAAACGCACA;SOR=1.814;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=32;WE=13867859;WS=13867841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,35:0.90:39
chr5	13868103	rs35398031	TA	T	797.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=32;PP=497;ReadPosRankSum=-0.133;SC=ATAAGATTCCTAAAAAAAAAT;SOR=0.468;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=0;TCR=51;TR=32;WE=13868111;WS=13868093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,36:0.78:46
chr5	13870836	rs35621834	G	A	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.850;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=1;PP=1049;ReadPosRankSum=-0.377;SC=CATCCAACATGTAGAAATATT;SOR=5.283;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=41;WE=13870844;WS=13870826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,42:0.93:45
chr5	13871925	rs10513159	A	G	1761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=53;PP=1429;ReadPosRankSum=-1.088;SC=TGAAAGGCACAATGATATAAG;SOR=3.716;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=0;TCR=61;TR=53;WE=13871933;WS=13871915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,56:0.88:64
chr5	13876664	rs1445804	T	C	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=1;PP=1060;SC=GCTGAGCACATACAAGATGCT;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=37;WE=13876672;WS=13876654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	13876990	.	G	A	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.075;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5016;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=254;ReadPosRankSum=0.147;SC=TTCAGGAGATGAGGATATTTC;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=11;WE=13876998;WS=13876980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr5	13882958	rs13170062	C	T	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FS=1.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.07;ReadPosRankSum=0.559;SOR=0.525;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:292,64:0.18:356
chr5	13883262	rs10462710	C	G	2570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=70;PP=2168;SC=AGATTTGCTTCCTTTGTAACC;SOR=4.202;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=8;TCR=70;TR=78;WE=13883270;WS=13883252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr5	13885023	rs147685082	GCA	G	1115.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=0;PP=1603;SC=GTGCACACGTGCACACACACA;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=34;WE=13885032;WS=13885013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	13900345	rs1445823	A	G	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FS=10.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.40;ReadPosRankSum=-0.654;SOR=1.462;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:205,43:0.17:248
chr5	13902220	rs1530498	T	C	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=1.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.63;ReadPosRankSum=0.387;SOR=0.903;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,11:0.16:69
chr5	13911405	rs3765045	G	T	2948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.902;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=9;PP=2270;ReadPosRankSum=0.105;SC=AGATACCTCTGCCTTCTGATT;SOR=2.104;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=123;TCF=108;TCR=15;TR=94;WE=13911413;WS=13911395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,100:0.78:129
chr5	13911700	rs34152978	GAA	G	284.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=345;ReadPosRankSum=-1.196;SC=ATAATTGCCAGAAAAAAAATA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=9;WE=13911712;WS=13911690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr5	13911704	rs67065537	A	T	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=834;ReadPosRankSum=0.020;SC=TTGCCAGAAAAAAAATAAGTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=22;WE=13911712;WS=13911690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,23:0.68:34
chr5	13913885	rs3213936	A	G	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.66;ReadPosRankSum=-0.441;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,38:0.20:189
chr5	13914556	rs13179761	A	G	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=-0.506;SC=AATAATTACAAAATGATTTAA;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=6;WE=13914564;WS=13914546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr5	13914775	rs13180591	G	T	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.744;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=281;ReadPosRankSum=-0.442;SC=ATAAAATGATGTTAAGCACAT;SOR=1.194;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=17;WE=13914783;WS=13914765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,16:0.31:52
chr5	13914796	rs13162553	T	C	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=70;ReadPosRankSum=1.506;SC=AAAACAGCCATGGATTGTAAA;SOR=0.458;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=9;WE=13914804;WS=13914786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr5	13914819	rs13180613	G	A	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=100;ReadPosRankSum=-0.485;SC=GGACTAGAAGGTCCTTAACTC;SOR=0.358;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=7;WE=13914827;WS=13914809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr5	13919255	rs35925547	T	G	2292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.299;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=24;PP=1691;ReadPosRankSum=0.089;SC=TTATTCCCATTTCACAAGGCA;SOR=1.172;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=99;TCF=65;TCR=34;TR=76;WE=13919263;WS=13919245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,83:0.78:107
chr5	13928085	rs12659700	T	C	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=9.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.12;ReadPosRankSum=0.716;SOR=0.177;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,25:0.20:122
chr5	13931205	rs1530497	G	C	8214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=182;NR=67;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.870;SC=AGTGAGAAGTGAAACGCATCC;SOR=0.968;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=250;TCF=183;TCR=67;TR=249;WE=13931213;WS=13931195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,254:1.00:255
chr5	13931340	rs1530496	C	T	5789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=138;PP=2965;SC=TTCCTTCTCTCCCTTCAGTCT;SOR=2.692;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=35;TCR=138;TR=173;WE=13931348;WS=13931330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr5	13944512	rs339445	A	C	4894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=48;PP=2965;SC=GAGTGACGCTATGCTTCCAGA;SOR=1.451;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=91;TCR=48;TR=139;WE=13944520;WS=13944502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr5	13944756	rs78610465	T	C	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5027;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=539;ReadPosRankSum=0.602;SC=TCCTAGAGTGTCTGCCCTGGG;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=21;WE=13944764;WS=13944746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,21:0.88:24
chr5	14183979	rs71597901	CAG	C	282.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=5.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.87;ReadPosRankSum=0.729;SOR=1.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,12:0.16:73
chr5	14184022	rs354301	G	A	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=2.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.78;ReadPosRankSum=-0.455;SOR=1.011;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,21:0.20:107
chr5	14184079	rs354300	G	A	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.51;ReadPosRankSum=1.357;SOR=0.578;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,21:0.15:140
chr5	14184116	rs16903264	C	T	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=2.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.56;ReadPosRankSum=-0.739;SOR=0.470;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,18:0.14:126
chr5	14184211	rs354299	T	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.62;ReadPosRankSum=0.778;SOR=0.264;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,10:0.14:71
chr5	14271085	.	A	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.867;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=11.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.52;ReadPosRankSum=2.796;SOR=3.539;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr5	14297143	.	C	G	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.81;ReadPosRankSum=-0.437;SOR=0.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,19:0.20:94
chr5	14330940	rs2277045	T	C	11026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=507;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=249;NR=161;PP=2962;ReadPosRankSum=0.619;SC=AACATACAGGTGTGGGGAAAT;SOR=0.677;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=492;TCF=299;TCR=193;TR=410;WE=14330948;WS=14330930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,419:0.84:500
chr5	14366840	rs30784	T	C	1473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=0;PP=1219;ReadPosRankSum=0.612;SC=TTTAGGATGATGAAGGCATCA;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=69;TCR=0;TR=50;WE=14366848;WS=14366830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,51:0.73:70
chr5	14377962	rs30769	A	C	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=280;ReadPosRankSum=1.726;SC=GAGGTCTGGTAGACATGCTCA;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=12;WE=14377970;WS=14377953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr5	14378068	rs30770	T	G	2542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.124;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=12;PP=1987;ReadPosRankSum=-0.423;SC=AATTTCGCGGTTGTTTTAATT;SOR=1.657;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=115;TCF=96;TCR=19;TR=84;WE=14378076;WS=14378058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,88:0.75:117
chr5	14388797	.	GT	G	238.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.000;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=0.000;QD=2.59;ReadPosRankSum=0.465;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,31:0.34:92
chr5	14390346	.	C	T	2159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=0.000;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.430;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=21;PP=1648;ReadPosRankSum=-1.218;SC=GCAGCATATTCCTAAAGGAGC;SOR=0.343;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=114;TCF=86;TCR=28;TR=75;WE=14390354;WS=14390336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,78:0.67:117
chr5	14471666	rs27091	T	A	643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=19;PP=525;SC=CAGCTCTGAATTACCGAGATG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=14471674;WS=14471656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	14472626	rs26186	T	C	3231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=95;NR=0;PP=2953;SC=GGAGTCCATCTTGACCAGGAG;SOR=9.129;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=95;TCF=95;TCR=0;TR=95;WE=14472634;WS=14472616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr5	14479938	rs26173	G	A	2830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=18;PP=2267;SC=TTTACTGCCAGTGTTGTAGTC;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=68;TCR=18;TR=86;WE=14479946;WS=14479928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	14481270	rs111593684	TA	T	1757.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5012;FS=1.475;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.011;NF=64;NR=10;PP=1010;ReadPosRankSum=-1.066;SC=CCCTGTCTCTTAAAAAAAAAA;SOR=1.195;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=112;TCF=98;TCR=14;TR=74;WE=14481278;WS=14481260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,85:0.83:102
chr5	14509487	rs150510776	T	TTG	957.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.203;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.755;NF=16;NR=10;PP=1125;ReadPosRankSum=-0.360;SC=CTTTATGGTTTTGTGTGTGTG;SOR=1.889;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=26;WE=14509495;WS=14509477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,29:0.81:36
chr5	14610184	rs25960	C	G	1965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=15;PP=1509;SC=ACACTTCCCCCCACCGTGGCG;SOR=2.406;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=51;TCR=15;TR=66;WE=14610192;WS=14610174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	14610309	rs16903574	C	G	1974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=47;PP=1548;ReadPosRankSum=0.256;SC=TCAGACTGTTCAAGTTTAACT;SOR=0.631;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=25;TCR=60;TR=66;WE=14610317;WS=14610299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,68:0.77:88
chr5	14664821	rs250435	G	A	708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=2;PP=567;SC=CGCTCTGCGGGCCCTCGGAAA;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=14664829;WS=14664811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	14678996	rs31930	G	A	2016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=61;PP=1751;SC=TATAGACGTTGTTATTGGTGT;SOR=8.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=0;TCR=61;TR=61;WE=14679004;WS=14678986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	14681599	.	C	T	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.303;ClippingRankSum=0.000;DP=243;ExcessHet=3.0103;FS=1.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.32;ReadPosRankSum=0.182;SOR=0.844;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:190,51:0.21:241
chr5	14715140	rs10491477	A	G	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.53;ReadPosRankSum=1.247;SOR=0.523;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,22:0.19:117
chr5	14751399	rs697570	C	T	1063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=30;PP=901;SC=CGGGAACCGACTGACAGAAGC;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=32;WE=14751407;WS=14751389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	14769103	rs17251667	G	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.739;SOR=0.543;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,25:0.17:151
chr5	14871620	rs139106733	AGGGGCGAC	A	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.52;MQRankSum=3.697;QD=4.47;ReadPosRankSum=-1.088;SOR=1.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,8:0.19:42
chr5	15927896	.	AGAAGAAG	A	159.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.378;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQRankSum=-0.407;QD=2.54;ReadPosRankSum=2.157;SOR=0.404;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,11:0.17:63
chr5	15927907	.	G	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.020;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQRankSum=0.700;QD=2.05;ReadPosRankSum=0.193;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,9:0.13:70
chr5	16091242	rs11389357	G	GA	830.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=31;PP=655;ReadPosRankSum=1.630;SC=AATTAAAAAAGAAAAAAAAAC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=31;WE=16091250;WS=16091232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr5	16177807	rs2582666	A	G	2436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-7.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.791;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=2;PP=1929;ReadPosRankSum=-0.008;SC=AAATTATTTCAGGAAAAATAA;SOR=1.929;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=116;TCF=113;TCR=3;TR=97;WE=16177815;WS=16177797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,99:0.83:119
chr5	16179125	rs342550	C	T	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=568;ReadPosRankSum=-0.922;SC=CACCGGCTGCCTCGGGGTCTC;SOR=0.651;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=26;WE=16179133;WS=16179115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,27:0.77:35
chr5	16474778	rs11428210	C	CT	728.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQRankSum=-0.953;QD=9.98;ReadPosRankSum=0.323;SOR=0.462;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,49:0.67:73
chr5	16477751	rs162850	C	A	1472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=2;PP=1271;SC=AAATAAATGTCTCCAGAAATA;SOR=5.421;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=45;TCR=2;TR=46;WE=16477759;WS=16477741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	16478120	rs162849	A	G	3157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=31;PP=2552;SC=ACAGGAACAAATTGAAAACTA;SOR=1.634;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=63;TCR=31;TR=94;WE=16478128;WS=16478110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr5	16478200	rs162848	G	A	3347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=65;PP=2565;ReadPosRankSum=-1.049;SC=TTTTTTCTTTGTCTGCTTCTG;SOR=1.168;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=41;TCR=66;TR=105;WE=16478208;WS=16478190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,110:0.98:112
chr5	16479151	rs6883888	A	G	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=21;PP=707;SC=AAGGCTACGTACATTTCAGTA;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=16479159;WS=16479141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	16479220	rs33692	A	G	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=195;SC=GGGAAATGCCATTGTGAAATA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=16479228;WS=16479210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	16508674	rs332811	A	G	4654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=19;PP=2965;SC=ACGTACGTATATATCACAATT;SOR=3.611;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=139;TCF=120;TCR=19;TR=138;WE=16508682;WS=16508664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr5	16508898	rs33684	T	C	3305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=103;PP=2610;SC=CTCAGAAAGTTGGTGTTTACA;SOR=4.212;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=13;TCR=103;TR=116;WE=16508906;WS=16508888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr5	16572322	rs11338270	CT	C	376.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.91;MQRankSum=1.673;QD=15.07;ReadPosRankSum=-0.217;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,23:0.92:25
chr5	16617099	rs35003	A	G	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=9;PP=353;SC=GTGCTTCCAGACAGGGACGGG;SOR=1.473;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=16617107;WS=16617089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	16667003	rs26743	C	T	3341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=86;PP=2740;SC=CTCCCGTAGCCTTCCATGCTA;SOR=3.442;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=101;TCF=14;TCR=87;TR=100;WE=16667011;WS=16666993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr5	16668256	rs35579	A	G	2356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=0;PP=1878;SC=GGACCACCACACTGTATTTTC;SOR=8.885;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=79;TCF=79;TCR=0;TR=79;WE=16668264;WS=16668246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr5	16673975	rs25901	C	G	7488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=161;PP=2965;SC=TTCCATCTCGCTTCCTGGAAA;SOR=1.873;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=229;TCF=66;TCR=163;TR=227;WE=16673983;WS=16673965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr5	16679966	rs35580	C	T	2714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=14;PP=2238;SC=AGAAAAAAAACTGAGCTTCAC;SOR=3.030;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=68;TCR=14;TR=82;WE=16679974;WS=16679956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr5	16684143	rs26315	A	T	8175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=181;PP=2965;SC=CAGACAGAAAAGGCTCTTTTC;SOR=1.981;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=246;TCF=65;TCR=181;TR=246;WE=16684151;WS=16684133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr5	16711365	rs3214558	CA	C	3471.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.171;NF=18;NR=90;PP=2037;ReadPosRankSum=1.231;SC=CTAAACCATGCAAAAAAAAAA;SOR=0.847;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=136;TCF=25;TCR=111;TR=108;WE=16711373;WS=16711355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,137:0.99:138
chr5	16711451	rs27552	G	T	1877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=46;PP=1529;SC=GGTTTACCCCGCTTCAAAACA;SOR=3.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=53;WE=16711459;WS=16711441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	16762646	rs31511	T	C	1935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.119;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=18;PP=1415;ReadPosRankSum=-1.321;SC=TTGCAGGTTTTGACATACCGC;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=87;TCF=63;TCR=24;TR=70;WE=16762654;WS=16762636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,71:0.80:89
chr5	16763549	rs140203547	G	A	5485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.825;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=141;NR=45;PP=2962;ReadPosRankSum=0.045;SC=AGTCCAGCTGGACCCCCTTGG;SOR=0.414;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=226;TCF=174;TCR=52;TR=186;WE=16763557;WS=16763539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,192:0.83:232
chr5	16764255	rs375881422	CA	C	1493.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.107;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.151;NF=72;NR=3;PP=1032;ReadPosRankSum=0.405;SC=GACTCCTTCTCAAAAAAAAAA;SOR=2.709;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=156;TCF=148;TCR=8;TR=75;WE=16764275;WS=16764245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,74:0.85:87
chr5	16766093	rs2561232	C	T	4486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.004;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=135;NR=21;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.419;SC=ATTACAGTTACAACTGTTATT;SOR=1.011;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=164;TCR=26;TR=156;WE=16766101;WS=16766083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,158:0.82:193
chr5	16769273	rs11750538	G	A	2130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.498;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=37;PP=1606;ReadPosRankSum=-0.138;SC=GACACTTCCCGAACTTCCTCC;SOR=0.384;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=93;TCF=43;TCR=50;TR=73;WE=16769281;WS=16769263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,77:0.81:95
chr5	16783711	rs4702172	T	C	2006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=62;PP=1659;ReadPosRankSum=-1.449;SC=AAAATGCCTGTTTCCAAAGAG;SOR=1.828;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=76;TCF=1;TCR=75;TR=63;WE=16783719;WS=16783701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,64:0.83:77
chr5	16818363	rs12188582	A	G	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.451;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=28;PP=708;ReadPosRankSum=-1.555;SC=ATACAATCTCAGTATAATTTC;SOR=0.362;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=32;WE=16818371;WS=16818353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,36:0.80:45
chr5	16877701	rs7710976	C	G	2542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.597;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=9;PP=2071;ReadPosRankSum=-0.610;SC=TGGGAAGCTGCAGGGACTTGT;SOR=0.199;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=94;TCF=85;TCR=9;TR=80;WE=16877709;WS=16877691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,83:0.85:98
chr5	16916045	rs141673286	G	A	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5021;FS=5.541;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=559;ReadPosRankSum=0.342;SC=CAGCCTGGGCGACAGAGCGAG;SOR=3.528;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=23;WE=16916053;WS=16916035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,23:0.85:27
chr5	16916071	rs145081788	GAA	G	1133.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=21;HapScore=4;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQ=61.12;MQRankSum=0.953;NF=38;NR=1;PP=404;ReadPosRankSum=-2.250;SC=ACGTCAAAAAGAAAAAAAAAA;SOR=1.981;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=59;TCF=57;TCR=2;TR=39;WE=16916081;WS=16916061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,39:0.93:42
chr5	16916118	rs71609335	T	C	2306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.636;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.022;NF=69;NR=11;PP=1901;ReadPosRankSum=-1.403;SC=ATCCTGAATCTGAATTAACAG;SOR=0.523;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=92;TCF=81;TCR=11;TR=80;WE=16916126;WS=16916108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,81:0.86:94
chr5	17275936	rs148597377	C	G	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.36;ReadPosRankSum=0.943;SOR=0.623;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,23:0.15:156
chr5	17276053	rs59080603	CCT	C	766.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.490;NF=0;NR=26;PP=1153;ReadPosRankSum=-0.214;SC=AAAACAATCTCCTCTCTCTCT;SOR=3.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=0;TCR=57;TR=26;WE=17276062;WS=17276043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,26:0.87:30
chr5	19721490	rs12187552	T	C	8878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=127;NR=138;PP=2965;SC=AGGGTTGTCCTTGGAGAATGC;SOR=0.824;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=267;TCF=128;TCR=139;TR=265;WE=19721498;WS=19721480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr5	21121275	rs248205	G	C	4200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.830;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=90;PP=2962;ReadPosRankSum=1.402;SC=AGATTCATTAGAGTGTGTTGG;SOR=0.983;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=175;TCF=72;TCR=103;TR=151;WE=21121283;WS=21121265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,151:0.86:175
chr5	21462082	rs12657455	G	A	2448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.428;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.358;NF=1;NR=80;PP=1917;ReadPosRankSum=-1.061;SC=CGTGGCTCACGCCTGTAATCC;SOR=3.852;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=103;TCF=3;TCR=100;TR=81;WE=21462090;WS=21462072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,86:0.81:106
chr5	21751715	rs10657805	C	CAGAA	1822.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=3;PP=1245;SC=AATCTTGTCCCAGAGTGTGTG;SOR=4.565;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=47;TCF=44;TCR=3;TR=41;WE=21751749;WS=21751705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	21751741	rs370990145	T	TTGTGTGTGTG	2148.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.80;QD=43.85;SOR=4.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr5	21752050	rs6451992	A	G	13263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.51;SOR=1.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr5	21752056	rs6451993	A	G	13659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.21;SOR=1.095;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr5	21760602	rs2303748	C	A	2234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=0;PP=1822;SC=AGTATTGATTCCTCCCTTTGT;SOR=8.468;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=65;TCR=0;TR=64;WE=21760610;WS=21760592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr5	21802662	rs6897177	C	T	423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=365;SC=TTCTTAATAACTAGTGGGTAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=21802670;WS=21802652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	22078584	rs4371716	C	T	5901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.953;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=93;PP=2962;ReadPosRankSum=0.256;SC=TCGGAGCCCACGTATTCTTCC;SOR=0.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=269;TCF=147;TCR=122;TR=211;WE=22078592;WS=22078574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,217:0.77:280
chr5	23510158	.	A	AT	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=9.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=-1.162;QD=2.61;ReadPosRankSum=-0.328;SOR=0.023;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr5	23510203	rs2973615	A	G	2683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=81;PP=2416;SC=TGCTCTTTTCACCCAGGCTGG;SOR=8.764;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=81;TCF=0;TCR=81;TR=81;WE=23510211;WS=23510193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr5	23523348	rs1874165	C	T	8677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=135;NR=120;PP=2965;SC=TAAAATAATTCTTCTGATTTT;SOR=0.834;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=255;TCF=135;TCR=120;TR=255;WE=23523356;WS=23523338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr5	23527919	rs2099081	A	G	3543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=92;PP=2935;SC=ATAGCCACAAAAAGACAAATG;SOR=4.325;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=10;TCR=92;TR=102;WE=23527927;WS=23527909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr5	23975952	rs10037197	G	C	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=140;ReadPosRankSum=1.056;SC=TGCTGTTGTTGTAACAATACA;SOR=0.247;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=8;WE=23975960;WS=23975942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr5	23976115	rs1501940	G	A	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=7.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.768;SOR=0.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,33:0.19:178
chr5	24511654	rs7443837	C	G	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.83;MQRankSum=-3.312;QD=1.19;ReadPosRankSum=-0.589;SOR=0.070;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,6:0.19:31
chr5	26886200	rs41271091	C	A	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=2.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.57;ReadPosRankSum=0.074;SOR=0.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,21:0.15:144
chr5	26905920	rs5866810	GT	G	1002.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=0;PP=739;ReadPosRankSum=0.736;SC=GGGAAATTGTGTTTTTTTTTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=50;TCR=0;TR=42;WE=26905928;WS=26905910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,43:0.93:46
chr5	26988328	rs2288466	G	A	1740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=28;PP=1364;SC=TGTCAGACCCGCTATCTTTTT;SOR=0.841;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=25;TCR=28;TR=53;WE=26988336;WS=26988318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	26988424	rs2288467	T	C	2025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=31;PP=1623;SC=TAATGGTATATAATGGTAAGT;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=33;TCR=31;TR=64;WE=26988432;WS=26988414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr5	31302288	rs2287582	C	T	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=0.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.57;ReadPosRankSum=0.206;SOR=0.591;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:168,38:0.18:206
chr5	31317494	rs2302904	C	T	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FS=15.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.06;ReadPosRankSum=-0.228;SOR=1.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:327,61:0.16:388
chr5	31317529	rs2302903	A	G	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FS=30.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.47;ReadPosRankSum=-0.348;SOR=1.539;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:319,70:0.18:389
chr5	31317952	rs2229575	T	C	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.07;ReadPosRankSum=-0.156;SOR=0.711;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:253,55:0.18:308
chr5	31322851	rs2962790	A	G	2789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=10;PP=2305;SC=ATTTGAGCACAGTGTTTCTTC;SOR=4.025;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=87;TCR=10;TR=97;WE=31322859;WS=31322841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr5	31407139	rs507816	G	C	2071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=52;PP=1649;SC=CATGTACTTAGTGCCTAGACA;SOR=5.353;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=3;TCR=52;TR=55;WE=31407147;WS=31407129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr5	31409115	rs644236	T	C	2460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=3;PP=1931;SC=AAAGTCAATTTTAGGCATGCT;SOR=5.255;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=65;TCR=3;TR=67;WE=31409123;WS=31409105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr5	31409252	rs2241337	A	G	6507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=105;PP=2965;ReadPosRankSum=1.113;SC=TCCAATCCTGATTCAAAATGA;SOR=0.772;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=208;TCF=102;TCR=106;TR=206;WE=31409260;WS=31409242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,210:0.99:212
chr5	31410679	rs2287583	C	G	1551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=1;PP=1271;SC=ATTCACATGTCTTAGTTTCAA;SOR=6.229;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=42;TCR=1;TR=43;WE=31410687;WS=31410669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	31423007	rs2287584	T	C	5147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=148;PP=2965;SC=TTTGTAGAACTGGAGAAGTTT;SOR=3.019;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=31;TCR=148;TR=179;WE=31423015;WS=31422997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr5	31449241	rs371567874	CA	C	47.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.99;MQRankSum=2.024;QD=1.26;ReadPosRankSum=-1.779;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,9:0.24:38
chr5	31472087	rs6885959	T	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=1.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.99;ReadPosRankSum=-0.992;SOR=0.451;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,29:0.15:190
chr5	31472117	rs3763075	G	C	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FS=1.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.59;ReadPosRankSum=-2.663;SOR=0.558;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:203,46:0.18:249
chr5	31483596	rs10052174	G	A	7690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=178;NR=64;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.828;SC=AGACTGAAAGGAAAATGGCAA;SOR=1.065;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=243;TCF=179;TCR=64;TR=242;WE=31483604;WS=31483586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,246:1.00:247
chr5	31483753	rs11341915	GA	G	995.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=1.380;QD=12.60;ReadPosRankSum=0.372;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,67:0.85:79
chr5	31485230	rs7712436	T	C	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=353;SC=TAGTTTCAGATGGAAATGAAA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=31485238;WS=31485220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	31486540	rs7735863	A	G	12000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=228;NR=127;PP=2965;SC=TTAAAATAGTAGTATGGAACA;SOR=1.410;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=355;TCF=228;TCR=127;TR=355;WE=31486548;WS=31486530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,376:1.00:376
chr5	31508933	rs56327412	G	GT,GTT	2082.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=3.161;HP=11;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.308;NF=9,9;NR=57,57;PP=1148,253;ReadPosRankSum=0.988;SC=TAACAAACTGGTTTTTTTTTT;SOR=2.122;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=105;TCF=13;TCR=92;TR=66,66;WE=31508953;WS=31508923;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.69,0.27:77
chr5	31508945	rs4374769	C	T	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=3.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQRankSum=-1.765;QD=2.27;ReadPosRankSum=0.206;SOR=0.298;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,17:0.20:84
chr5	31511106	rs13183642	G	T	2574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=21;PP=2032;ReadPosRankSum=-0.365;SC=AGCTATAATCGCAAGGGTCTC;SOR=0.802;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=89;TCR=28;TR=87;WE=31511114;WS=31511096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,89:0.74:120
chr5	31515373	rs7730136	C	T	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.69;ReadPosRankSum=0.047;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,13:0.15:88
chr5	31515657	rs55656741	G	A	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=5.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.54;ReadPosRankSum=-0.052;SOR=0.171;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,15:0.21:72
chr5	31526272	rs35969247	G	A	3725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=6.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.196;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=21;PP=2721;ReadPosRankSum=1.674;SC=TTCTCCTGTCGGGACTGCGGC;SOR=0.413;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=163;TCF=139;TCR=24;TR=129;WE=31526280;WS=31526262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,127:0.77:164
chr5	31529299	rs6859527	A	G	1728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.22;SOR=7.428;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	31529306	rs6450850	T	C	1730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.78;SOR=7.276;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	31532429	rs2291109	A	T	2214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=10;PP=1849;SC=GCTGGCCGGGATGAGGCGCCG;SOR=3.521;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=61;TCR=10;TR=71;WE=31532437;WS=31532419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr5	31538692	rs17410000	A	C	1386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FS=7.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.72;ReadPosRankSum=-0.259;SOR=0.410;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:291,82:0.22:373
chr5	31541142	rs17410035	G	T	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=1.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.67;ReadPosRankSum=-1.541;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,17:0.19:91
chr5	32000483	rs10054504	T	C	2926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=77;PP=2395;SC=TGTGCACTTGTACGTTTGCCT;SOR=6.043;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=80;TCF=3;TCR=77;TR=80;WE=32000491;WS=32000473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr5	32037569	rs923834	A	T	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=528;ReadPosRankSum=0.773;SC=AATCATTTTTACCTTGGATGG;SOR=2.468;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=22;WE=32037577;WS=32037559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,22:0.79:28
chr5	32054092	rs149414	C	G	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=23;PP=812;SC=TAGTAGACCTCGGCGGAATCT;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=32054100;WS=32054082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	32057651	rs161545	G	A	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=695;SC=GTTATTTTATGTGGTAGTAAA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=32057659;WS=32057641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	32058115	rs151861	A	G	5969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=110;PP=2965;SC=GGGGAGCCTCAGCGGGAGGTT;SOR=1.104;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=77;TCR=110;TR=187;WE=32058123;WS=32058105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr5	32060985	rs35665699	T	TATC	3347.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=0;PP=2965;SC=CGGGAAAAGATATGAGCTTCT;SOR=8.554;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=73;TCF=73;TCR=0;TR=65;WE=32060993;WS=32060975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr5	32069910	rs6862076	T	C	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=30;PP=900;SC=CTCTTGGCTGTTAGTTTTGAT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=32069918;WS=32069900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	32071267	rs17512228	C	T	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.79;ReadPosRankSum=-1.135;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,9:0.16:57
chr5	32071325	rs56223765	G	A	2499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=8;PP=2039;ReadPosRankSum=-0.127;SC=GATCAGGTACGCAGGTAGACT;SOR=0.605;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=111;TCF=102;TCR=9;TR=85;WE=32071333;WS=32071315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,87:0.76:114
chr5	32071381	rs72761544	G	C	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=2.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.281;SOR=0.889;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:180,46:0.20:226
chr5	32072213	rs3797064	A	C	1256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FS=3.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.42;ReadPosRankSum=0.451;SOR=0.459;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:293,74:0.20:367
chr5	32074392	rs2291114	G	A	8911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=6.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.694;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=211;NR=86;PP=2962;ReadPosRankSum=0.024;SC=CCAACCTCACGGACTCTGCAG;SOR=0.662;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=392;TCF=281;TCR=111;TR=297;WE=32074400;WS=32074382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,311:0.77:404
chr5	32101168	rs2279232	A	T	5216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=90;PP=2965;SC=TGGCATGATGAACAACCCTGT;SOR=0.897;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=166;TCF=75;TCR=91;TR=164;WE=32101176;WS=32101158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr5	32135599	rs161539	G	A	2582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-5.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=1;PP=2126;ReadPosRankSum=-0.922;SC=GCTATTTTGTGTAGGTTCCTT;SOR=1.870;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=105;TCR=1;TR=87;WE=32135607;WS=32135589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,89:0.83:107
chr5	32209751	.	T	TTA	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=5.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQRankSum=-3.215;QD=1.21;ReadPosRankSum=0.912;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,5:0.14:37
chr5	32242381	rs7729256	G	T	2322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=67;PP=2023;SC=GAAAAGAAACGAACTTCCATT;SOR=5.255;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=4;TCR=67;TR=71;WE=32242389;WS=32242371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr5	32268614	.	TA	T	62.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=3.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=0.000;QD=1.39;ReadPosRankSum=-0.475;SOR=0.100;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,11:0.24:45
chr5	32379210	rs1862636	G	A	8271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=174;NR=87;PP=2965;SC=ATACAGTTACGTACTACTTAC;SOR=1.574;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=261;TCF=174;TCR=87;TR=261;WE=32379218;WS=32379200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr5	32388471	rs889318	T	C	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.40;ReadPosRankSum=-0.328;SOR=0.037;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,7:0.15:47
chr5	32388485	rs3811972	G	C	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=1;PP=1564;ReadPosRankSum=2.516;SC=ACTCACACCAGAGTTACCAGT;SOR=2.147;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=42;WE=32388493;WS=32388461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,44:0.86:51
chr5	32400266	rs1051489	A	G	3633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.853;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=106;PP=2865;ReadPosRankSum=0.662;SC=GGTTCCTTTTATGTCTTCTGC;SOR=0.317;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=167;TCF=27;TCR=140;TR=130;WE=32400274;WS=32400256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,133:0.77:172
chr5	32403346	rs4867440	C	T	11872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=178;NR=179;PP=2965;SC=GACGTTGCAACTGATGACGTA;SOR=0.699;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=357;TCF=178;TCR=179;TR=357;WE=32403354;WS=32403336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,371:1.00:371
chr5	32415360	rs5867145	TA	T	1969.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=56;PP=2189;SC=CCAGTATCCTTAAAAAGCTGG;SOR=3.327;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=66;TCF=4;TCR=62;TR=60;WE=32415368;WS=32415350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	32417664	.	G	C	1552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.706;ClippingRankSum=0.000;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=4;PP=1273;ReadPosRankSum=-0.820;SC=TATGAGTTTAGATGGACTCAA;SOR=0.577;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=108;TCF=100;TCR=8;TR=57;WE=32417672;WS=32417654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,57:0.52:110
chr5	32417694	rs178935	G	A	4789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=121;NR=20;PP=2965;SC=TTCATTAAACGCAGTAAGTCA;SOR=3.403;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=121;TCR=20;TR=141;WE=32417702;WS=32417684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr5	32444199	rs2922295	C	G	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.128;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=60;ReadPosRankSum=0.046;SC=GAGAGGCCGCCGGGCTGGGCC;SOR=0.024;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=9;WE=32444207;WS=32444196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,10:0.24:41
chr5	32444286	rs183443	A	G	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=7.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.27;ReadPosRankSum=-0.918;SOR=0.207;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,25:0.18:142
chr5	32523343	rs2457151	C	T	7139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=103;NR=112;PP=2965;SC=TAAGAATGCTCGGACTGTCAC;SOR=0.759;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=216;TCF=103;TCR=113;TR=215;WE=32523351;WS=32523333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr5	32710896	rs116399912	G	A	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FS=2.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.16;ReadPosRankSum=-1.499;SOR=0.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:298,60:0.17:358
chr5	32710965	rs56022335	GT	G	1738.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=28.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-0.526;QD=13.91;ReadPosRankSum=2.561;SOR=4.667;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,100:0.80:125
chr5	32711000	.	AT	GT	2994	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MMLQ=27;MQ=58.33;NF=0,0;NR=30,104;PP=1264,2994;QD=43.2923737516;SC=GTGTGTGTATATGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=155;TCF=0;TCR=155;TR=30,104;WE=32711008;WS=32710986;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:125,30:0.19:155
chr5	32711000	.	AT	ATGTGTGTGT	2994	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MMLQ=27;MQ=58.33;NF=0,0;NR=30,104;PP=1264,2994;QD=43.2923737516;SC=GTGTGTGTATATGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=155;TCF=0;TCR=155;TR=30,104;WE=32711008;WS=32710986;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:47,104:0.69:151
chr5	32711000	rs372542760	A	G,ATGTGTGTG	2683.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.93;MQRankSum=-0.562;QD=33.97;ReadPosRankSum=1.034;SOR=4.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:3,16,60:0.20,0.76:79
chr5	32711024	.	A	G	566	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MMLQ=28;MQ=57.59;NF=0;NR=28;PP=566;QD=21.4561147338;SC=GTGTGTGTGTATGTGTGCGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=102;TCF=0;TCR=102;TR=28;WE=32711032;WS=32711014;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:74,28:0.27:102
chr5	32716474	rs34628434	C	CT	1325.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.099;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=60.11;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=10;PP=659;ReadPosRankSum=1.223;SC=TAACATGCTACTTTTTTTTTT;SOR=0.937;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=103;TCF=75;TCR=28;TR=53;WE=32716482;WS=32716464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,63:0.70:90
chr5	32716589	rs10057069	T	C	2645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.380;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=70;PP=2138;ReadPosRankSum=0.471;SC=TCCAGTCATCTTTCCAATATG;SOR=1.483;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=107;TCF=24;TCR=83;TR=88;WE=32716597;WS=32716579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,91:0.83:109
chr5	32725072	rs1147224	T	C	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=32;PP=881;ReadPosRankSum=-1.960;SC=GAATCATGTCTTTTGCAGCAA;SOR=1.101;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=33;WE=32725080;WS=32725062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,34:0.76:45
chr5	32775047	rs1173743	G	T	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=5.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.64;ReadPosRankSum=-0.239;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,21:0.20:103
chr5	32784776	rs2246427	A	G	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.09;ReadPosRankSum=0.127;SOR=0.264;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,21:0.15:142
chr5	32786389	rs2270915	A	G	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.32;ReadPosRankSum=-0.892;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:281,45:0.14:326
chr5	32789852	rs1173756	T	C	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=388;ExcessHet=3.0103;FS=0.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.00;ReadPosRankSum=0.754;SOR=0.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:318,67:0.17:385
chr5	33441124	rs2304621	C	G	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.66;ReadPosRankSum=-0.598;SOR=0.572;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,8:0.14:56
chr5	33441403	rs55759090	A	C	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=495;ReadPosRankSum=-0.070;SC=GAAAGTCGGAACCCCCTTTGG;SOR=2.753;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=21;WE=33441411;WS=33441393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,22:0.81:27
chr5	33446539	.	G	A	616	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=22;NR=0;PP=616;QD=29.5805096612;SC=ACAAACATACGTGCTGTTCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=22;WE=33446547;WS=33446538;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr5	33448962	rs5867190	A	AT	2333.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=64;PP=2638;SC=AATCTGTTTAATTTGCCTACT;SOR=8.554;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=73;TCF=0;TCR=73;TR=64;WE=33448970;WS=33448952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr5	33452643	rs73074385	A	G	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=7.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.83;ReadPosRankSum=-0.940;SOR=0.100;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,13:0.19:68
chr5	33455616	rs6880623	A	G	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=153;ReadPosRankSum=-0.684;SC=TCCAAATACTATTTCCAAATG;SOR=0.527;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=9;WE=33455624;WS=33455606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr5	33455943	rs55749081	AT	A	2055.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=0.506;QD=19.39;ReadPosRankSum=0.432;SOR=0.923;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,86:0.81:106
chr5	33456210	rs3765144	A	G	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.38;ReadPosRankSum=0.979;SOR=0.659;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,17:0.22:78
chr5	33457535	rs2270903	T	A	6097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=147;PP=2965;SC=TGATGTGTCTTGACTGAGTTT;SOR=2.883;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=182;TCF=35;TCR=147;TR=182;WE=33457543;WS=33457525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr5	33457618	rs1003000	G	A	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=54;PP=1655;SC=GAGATGTTGTGGCTTTTTAGT;SOR=6.666;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=55;WE=33457626;WS=33457608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	33458636	rs3765145	G	A	5321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=33;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.885;SC=TATACGTGACGTACATAAACA;SOR=1.442;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=161;TCF=128;TCR=33;TR=160;WE=33458644;WS=33458626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,168:0.99:169
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chr5	33458881	rs3765147	G	A	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=414;ReadPosRankSum=0.646;SC=TATATAAGACGATAAGTAAAA;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=17;WE=33458889;WS=33458871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
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chr5	33461226	rs2270904	A	G	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=7.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.46;ReadPosRankSum=-0.470;SOR=1.523;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,27:0.18:150
chr5	33535060	rs25754	G	A	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=34;PP=1078;SC=ACATTGGACAGTCCTCTTCTG;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=36;WE=33535068;WS=33535050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
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chr5	33546432	rs29967	A	G	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.348;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=197;ReadPosRankSum=0.084;SC=TATCTGTATTAGAATTTATAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=9;WE=33546440;WS=33546422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr5	33549350	rs112196098	C	G	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.90;ReadPosRankSum=-0.433;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,32:0.19:171
chr5	33549374	rs77581578	G	T	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=2.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.27;ReadPosRankSum=-0.691;SOR=0.927;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:185,40:0.18:225
chr5	33549559	rs462629	C	A	3002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.904;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=81;PP=2369;ReadPosRankSum=0.955;SC=TCCCCTCAGCCGTGGAGGCGC;SOR=0.890;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=136;TCF=24;TCR=112;TR=97;WE=33549567;WS=33549549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,103:0.72:144
chr5	33561028	rs35553442	GA	G	2587.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=32.781;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.91;MQRankSum=-0.263;QD=18.35;ReadPosRankSum=2.374;SOR=4.205;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:10,131:0.93:141
chr5	33588684	rs56237226	C	T	2667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.381;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=28;PP=2070;ReadPosRankSum=0.716;SC=GCCAGTTTCCCCGCCGAGCCC;SOR=1.501;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=131;TCF=85;TCR=46;TR=92;WE=33588692;WS=33588674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,96:0.71:135
chr5	33615904	rs10057235	G	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.01;ReadPosRankSum=-0.218;SOR=0.424;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,22:0.19:118
chr5	33616311	rs4078398	T	C	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=7.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.38;ReadPosRankSum=-1.811;SOR=0.009;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,9:0.16:55
chr5	33630839	rs4260678	A	G	3124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.371;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=11;PP=2481;ReadPosRankSum=2.332;SC=AATTAGTAAAAGTCATGATTT;SOR=0.334;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=117;TCF=105;TCR=12;TR=95;WE=33630847;WS=33630829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,101:0.82:123
chr5	33637596	rs4076945	G	A	2652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=3;PP=2109;SC=TAAGCTTTGTGTGGATCACAG;SOR=5.994;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=78;TCF=75;TCR=3;TR=78;WE=33637604;WS=33637586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr5	33637891	rs4076946	C	A	2513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.79;QD=43.34;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr5	33637899	rs4076947	G	A	2404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.77;QD=45.37;SOR=5.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	33643395	rs10066043	A	T	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=231;ReadPosRankSum=-1.427;SC=TCCCTTAGAGAGAGTTGCCCT;SOR=0.430;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=13;WE=33643403;WS=33643385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr5	33643617	rs4866409	C	T	2802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=52;PP=2161;ReadPosRankSum=1.077;SC=TCAAAACCTGCCACAAAGCAT;SOR=0.704;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=58;TCR=69;TR=97;WE=33643625;WS=33643607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,101:0.77:131
chr5	33648842	rs34079160	GTT	G	538.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=523;ReadPosRankSum=-1.094;SC=TGGATGTTCAGTTATTTCCAA;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=14;WE=33648851;WS=33648838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr5	33648906	rs6870538	G	C	1427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=2;PP=1106;ReadPosRankSum=-0.874;SC=CCTGCATATAGCCACCAAGAG;SOR=0.995;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=55;TCF=52;TCR=3;TR=46;WE=33648914;WS=33648896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,49:0.86:57
chr5	33649220	rs4866353	A	G	1161.56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.6880;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=34;PP=837;ReadPosRankSum=2.520;SC=TAGGCCCATCATGGGAGTTAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=34;WE=33649228;WS=33649210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,39:0.91:43
chr5	33649637	rs4242082	G	A	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=3;PP=650;ReadPosRankSum=-0.130;SC=AGGTGAGGGCGTCATGAGACA;SOR=0.473;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=29;WE=33649645;WS=33649627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,30:0.79:38
chr5	33649807	rs4504387	C	A	2495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.072;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=50;PP=1958;ReadPosRankSum=0.103;SC=CCGAAGCTGGCAGGGAAGAAC;SOR=0.931;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=99;TCF=42;TCR=57;TR=86;WE=33649815;WS=33649797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,89:0.86:104
chr5	33649905	rs4621563	G	A	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.409;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.590;NF=10;NR=40;PP=1069;ReadPosRankSum=-0.720;SC=AGACAGCCACGTTTGTACAGA;SOR=1.193;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=66;TCF=14;TCR=52;TR=50;WE=33649913;WS=33649895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,49:0.77:64
chr5	33751389	rs5867210	T	TA	2243.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.507;NF=83;NR=0;PP=1746;ReadPosRankSum=-0.141;SC=ATGAAGATATTAAAAAAAAAA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=108;TCF=108;TCR=0;TR=83;WE=33751397;WS=33751379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,83:0.97:86
chr5	33751454	rs1530507	A	T	7305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=163;NR=60;PP=2965;SC=TTAATAAAACAACCAAAAGAA;SOR=2.083;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=225;TCF=164;TCR=61;TR=223;WE=33751462;WS=33751444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr5	33951693	rs16891982	C	G	5060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=102;NR=52;PP=2965;SC=AGTTGATGCACAAGCCCCAAC;SOR=1.493;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=102;TCR=52;TR=154;WE=33951701;WS=33951683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr5	33954511	rs2287949	T	C	4126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=104;PP=2965;SC=ACAGGAAGGCTGTCCATCCAA;SOR=2.160;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=141;TCF=36;TCR=105;TR=140;WE=33954519;WS=33954501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr5	33963731	rs141348470	AAAC	A	1374.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=0;PP=1373;SC=ACAATTAAAAAAACAACAACA;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=31;WE=33963741;WS=33963721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	33964210	rs183671	T	G	1879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=48;PP=1495;SC=GTGGGAAAACTCCCTGAAGAC;SOR=3.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=6;TCR=48;TR=54;WE=33964218;WS=33964200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
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chr5	33969172	rs187692103	G	C	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQRankSum=1.017;QD=18.24;ReadPosRankSum=-3.341;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr5	33969174	.	G	C	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.768;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQRankSum=0.950;QD=18.83;ReadPosRankSum=-3.625;SOR=0.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr5	33988535	rs15612	C	T	1842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=56;PP=1507;ReadPosRankSum=0.034;SC=AAACAGGCCCCGAGTTACTGG;SOR=0.941;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=70;TCF=3;TCR=67;TR=59;WE=33988543;WS=33988525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,62:0.85:73
chr5	33989518	rs2278008	C	T	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=433;ExcessHet=3.0103;FS=2.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.25;ReadPosRankSum=1.050;SOR=0.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:349,82:0.19:431
chr5	34033670	rs299594	T	C	3730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=99;PP=2965;SC=CCATTCAGAATAATCCCAAAT;SOR=4.255;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=10;TCR=99;TR=109;WE=34033678;WS=34033660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr5	34035609	rs17583316	T	C	708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=0;PP=597;SC=TCCCAGCCTATGAACCTGGTA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=34035617;WS=34035599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	34687911	rs2279604	G	A	4890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=133;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.852;SC=TTGCTTTGCCGTGAATTATAT;SOR=3.258;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=10;TCR=134;TR=143;WE=34687919;WS=34687901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,152:0.99:153
chr5	34688210	rs142375133	CGACAAA	C	12524.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=101;PP=2957;SC=AAAGAGACTTCGACAAAGACA;SOR=1.061;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=236;TCF=122;TCR=114;TR=198;WE=34688223;WS=34688200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr5	34757505	rs6865288	A	G	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=0.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.17;ReadPosRankSum=0.416;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:177,37:0.17:214
chr5	34803675	rs66603667	AC	A	447.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.51;MQRankSum=1.117;QD=24.87;ReadPosRankSum=-0.916;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,16:0.89:18
chr5	34807928	rs6895634	C	T	7200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.492;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=163;NR=93;PP=2962;ReadPosRankSum=0.271;SC=CCGAAAGTGTCGACAGCTCTG;SOR=0.756;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=330;TCF=210;TCR=120;TR=256;WE=34807936;WS=34807918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,260:0.77:336
chr5	34808652	rs111951383	G	A	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.82;ReadPosRankSum=0.137;SOR=0.639;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:176,33:0.16:209
chr5	34808797	rs113312119	T	C	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=1.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.21;ReadPosRankSum=-0.019;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,20:0.17:120
chr5	34810971	rs111531050	G	A	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.90;ReadPosRankSum=-1.202;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,13:0.21:62
chr5	34811131	rs35607113	G	A	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=8.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.20;ReadPosRankSum=-1.628;SOR=1.482;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:148,33:0.18:181
chr5	34811137	rs2271522	T	G	3902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.096;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=90;PP=2962;ReadPosRankSum=1.941;SC=TACCGCTGCTTCTTGCTGTAC;SOR=0.272;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=171;TCF=53;TCR=118;TR=136;WE=34811145;WS=34811121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,140:0.80:174
chr5	34811794	rs114935797	T	C	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=31;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=199;ReadPosRankSum=-0.025;SC=CTTTTCTCTTTTTTTAAGACA;SOR=0.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=13;WE=34811802;WS=34811784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,12:0.23:53
chr5	34812165	rs144273070	G	GA	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.792;NF=4;NR=1;PP=54;ReadPosRankSum=0.437;SC=ACATATTCTTGAAAAAAAAAG;SOR=0.976;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=5;WE=34812173;WS=34812155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr5	34812408	rs112990724	A	G	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=1.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.32;ReadPosRankSum=0.344;SOR=1.151;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,11:0.19:58
chr5	34814900	rs17522675	A	G	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.97;ReadPosRankSum=0.383;SOR=0.190;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,7:0.17:42
chr5	34818976	rs3884194	GT	G,GTT	2258.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=3.358;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.307;NF=33,33;NR=59,59;PP=1174,95;ReadPosRankSum=1.533;SC=GGAAGCATCTGTTTTTTTTTT;SOR=0.507;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=102;TCF=35;TCR=67;TR=92,92;WE=34818986;WS=34818966;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.84,0.15:109
chr5	34821825	rs10461947	C	T	4952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.666;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=58;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.106;SC=AAATGGCTTTCTCTTTCCCAA;SOR=0.268;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=200;TCF=133;TCR=67;TR=162;WE=34821833;WS=34821815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,170:0.81:210
chr5	34822926	rs7730728	T	C	1533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=0;PP=1217;SC=GTAGCTGGGATCACAGGCGCC;SOR=7.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=44;WE=34822934;WS=34822916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	34824555	rs1048944	G	T	5860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=141;PP=2965;SC=GAAAAGATACGCTGAGAGCTC;SOR=2.807;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=33;TCR=141;TR=174;WE=34824563;WS=34824545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr5	34830788	rs17523026	C	T	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FS=3.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.000;QD=4.60;ReadPosRankSum=-0.091;SOR=0.933;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:218,67:0.24:285
chr5	34840841	rs6451173	A	G	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FS=4.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.66;ReadPosRankSum=-0.440;SOR=0.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:269,63:0.19:332
chr5	34845473	rs336486	C	A	953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=0;PP=813;SC=TTATTCCTTCCGGTTTATGTT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=34845481;WS=34845463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	34863220	rs3846632	G	T	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.366;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=137;ReadPosRankSum=0.846;SC=ATGCCAGATGGGTCATCTCAT;SOR=0.188;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=11;WE=34863228;WS=34863210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr5	34880750	rs34549849	C	CT	387.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=3.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=0.738;QD=7.91;ReadPosRankSum=-1.873;SOR=1.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr5	34912090	rs2069474	G	C	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=32;PP=835;ReadPosRankSum=0.445;SC=TGTGTGTAGAGAATTCCAAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=32;WE=34912098;WS=34912080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,34:0.85:40
chr5	34918415	rs37434	A	G	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.516;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=3;PP=799;ReadPosRankSum=0.858;SC=GTCACAAAACAAGATCAGTTC;SOR=1.739;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=50;TCF=46;TCR=4;TR=41;WE=34918423;WS=34918405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,41:0.82:50
chr5	34923435	rs37431	A	C	467.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=364;ReadPosRankSum=1.360;SC=CCCAGGCTGGACTGCAGTGGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=13;WE=34923443;WS=34923425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr5	34925312	.	CT	C	158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.814;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=8.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.12;ReadPosRankSum=0.566;SOR=2.964;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr5	34945812	rs6868348	A	G	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=72;ReadPosRankSum=-0.912;SC=TTTTTTTTCCACTTACTCTTC;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=10;WE=34945820;WS=34945802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr5	34945944	rs37442	A	T	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.999;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=32;PP=1020;ReadPosRankSum=-1.676;SC=TTAAATGCCAACGATAAAGTT;SOR=0.901;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=26;TCR=42;TR=52;WE=34945952;WS=34945934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,52:0.71:73
chr5	34954588	rs37437	T	C	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=0;PP=1893;SC=TTAATCTTGATATTAAAACCT;SOR=8.410;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=66;TCR=0;TR=66;WE=34954596;WS=34954578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	34998778	rs16899972	C	A	3191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.329;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=40;PP=2469;ReadPosRankSum=0.026;SC=CTTGAACATACGTGGCAAATT;SOR=0.457;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=146;TCF=93;TCR=53;TR=106;WE=34998786;WS=34998768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,114:0.73:157
chr5	34998877	rs16899974	C	A	3695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.435;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=72;PP=2891;ReadPosRankSum=-0.590;SC=AATACTTCTACTGCAAAATCA;SOR=0.845;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=166;TCF=75;TCR=91;TR=130;WE=34998885;WS=34998867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,135:0.78:174
chr5	35010138	rs466067	A	G	8463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=158;NR=111;PP=2965;SC=CTATCATGAGACCTTTGCCTC;SOR=1.087;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=270;TCF=159;TCR=111;TR=269;WE=35010146;WS=35010128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr5	35013010	rs200794102	AAG	A	209.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=10.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.61;ReadPosRankSum=2.152;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,15:0.12:130
chr5	35025770	rs344515	G	A	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=0;PP=820;ReadPosRankSum=1.225;SC=TCACAGAGCAGAGGCTTTCTG;SOR=2.247;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=31;WE=35025778;WS=35025760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,31:0.76:41
chr5	35026683	rs344513	A	G	3350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=94;PP=2684;ReadPosRankSum=-0.920;SC=ATATTTAGAAACATGGGGAAA;SOR=2.093;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=16;TCR=95;TR=110;WE=35026691;WS=35026673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr5	35032769	rs237252	G	A	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.701;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=269;ReadPosRankSum=-1.900;SC=CTCAGGGATGGGTCTGCCTTT;SOR=2.448;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=12;WE=35032777;WS=35032759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr5	35033047	rs2291698	C	T	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=3.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.49;ReadPosRankSum=1.397;SOR=1.433;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,23:0.16:140
chr5	35033526	rs2291701	C	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.41;ReadPosRankSum=1.368;SOR=0.710;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,26:0.16:167
chr5	35033605	rs180749	G	A	3643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=81;PP=2843;SC=CATCTTGTAGGTCCCTACGTT;SOR=2.107;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=28;TCR=81;TR=109;WE=35033613;WS=35033595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr5	35033706	rs2291702	T	C	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=437;ReadPosRankSum=1.013;SC=CCTGGTCCACTGAGTAGGACA;SOR=2.753;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=23;WE=35033714;WS=35033696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,22:0.81:27
chr5	35035579	rs344156	A	G	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=638;ReadPosRankSum=-0.058;SC=TAACCACAGTATGAATTCCAT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=27;WE=35035587;WS=35035569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,26:0.84:31
chr5	35036997	rs37368	C	T	1916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=20;PP=2531;ReadPosRankSum=1.069;SC=GAGCATCATACCTTTTTTTTT;SOR=0.972;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=83;TCF=57;TCR=26;TR=66;WE=35037014;WS=35036987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,69:0.79:87
chr5	35037006	rs171081	T	C	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=3.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.92;ReadPosRankSum=-1.044;SOR=0.339;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,18:0.20:92
chr5	35037230	rs72734512	C	A	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.647;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=539;ReadPosRankSum=1.424;SC=CTGCACACACCCTGGTCATTG;SOR=2.376;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=24;WE=35037238;WS=35037220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,25:0.76:33
chr5	35039437	rs2279651	A	G	3381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=35;PP=2690;SC=ACGGGTGGCAATGGCCAACAC;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=61;TCR=35;TR=96;WE=35039445;WS=35039427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr5	35039486	rs37370	C	T	3976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=56;PP=2965;SC=CAGGTATCTGCTTCCTTCAGC;SOR=0.843;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=120;TCF=64;TCR=56;TR=120;WE=35039494;WS=35039476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr5	35641582	rs6897513	A	C	4220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=69;PP=2965;SC=GCCAACACTTAACCTTCTGGG;SOR=0.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=56;TCR=69;TR=125;WE=35641590;WS=35641572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr5	35643615	rs10941252	G	A	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=5.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.83;ReadPosRankSum=-0.267;SOR=0.355;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:169,40:0.19:209
chr5	35644621	rs7706444	T	C	1763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=53;PP=1354;SC=GTTTTGATATTGAAAAGGTTC;SOR=4.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=5;TCR=53;TR=58;WE=35644629;WS=35644611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	35654711	rs2270558	C	T	11415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=258;NR=99;PP=2965;SC=ACTCAGATGACGAGTACATTA;SOR=1.984;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=358;TCF=259;TCR=99;TR=357;WE=35654719;WS=35654701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,366:1.00:366
chr5	35659355	rs9292598	T	C	4409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=108;PP=2965;SC=TACTTTTGTTTCTTTCTACCA;SOR=3.082;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=23;TCR=109;TR=131;WE=35659363;WS=35659345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
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chr5	35709095	rs13170082	C	T	5322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.649;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=67;PP=2962;ReadPosRankSum=0.601;SC=AAAGCAGCAGCTTCCCTGGCT;SOR=0.812;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=231;TCF=146;TCR=85;TR=187;WE=35709103;WS=35709085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,189:0.82:231
chr5	35709184	rs13170390	G	C	5240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=124;PP=2962;ReadPosRankSum=0.948;SC=AAGCCATGTGGCTTCAAAAAC;SOR=0.759;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=226;TCF=71;TCR=155;TR=181;WE=35709192;WS=35709174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,185:0.80:230
chr5	35712780	rs10078803	A	G	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=3;PP=1407;ReadPosRankSum=0.271;SC=TCAAAGTAAAAACCTGAGCCA;SOR=0.995;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=59;TCF=56;TCR=3;TR=51;WE=35712788;WS=35712770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,49:0.86:57
chr5	35712834	rs10064115	G	C	3202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-5.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.857;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=6;PP=2709;ReadPosRankSum=2.165;SC=ATGGGAAATAGCATTAGCTTG;SOR=1.415;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=135;TCF=127;TCR=8;TR=109;WE=35712842;WS=35712824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,108:0.81:134
chr5	35712901	rs115898419	G	A	5946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.623;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=135;NR=64;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.692;SC=TTTGTGTGTCGAATTTTGTTT;SOR=0.768;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=245;TCF=166;TCR=79;TR=199;WE=35712909;WS=35712891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,209:0.81:258
chr5	35713007	rs10073537	T	G	5119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=137;PP=2962;ReadPosRankSum=0.416;SC=GATAAAAATATATATAATTAC;SOR=0.691;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=208;TCF=36;TCR=172;TR=166;WE=35713015;WS=35712997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,175:0.81:216
chr5	35739960	rs10043875	A	G	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=0;PP=666;SC=TTCTTTTGACACTATTATTCA;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=35739968;WS=35739950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	35763895	rs6876874	T	C	2602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.96;NF=1;NR=66;PP=1584;SC=ATTGACACAATGCTCTCAAGC;SOR=7.024;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=67;TCF=1;TCR=66;TR=67;WE=35763903;WS=35763885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr5	35763916	rs6895801	A	G	1964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=41;PP=1233;SC=ACTGTAGAAAATTGTACCTTC;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=41;WE=35763935;WS=35763906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	35763927	rs114776524	G	C	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=604;ReadPosRankSum=0.087;SC=TTGTACCTTCGAAACATTTTT;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=22;WE=35763935;WS=35763906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,25:0.74:34
chr5	35764587	rs4869466	G	A	4138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=108;NR=11;PP=2965;SC=CACACCATGGGGAAGATACAC;SOR=4.056;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=109;TCR=11;TR=119;WE=35764595;WS=35764577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr5	35764603	rs4869467	A	G	5550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=132;NR=27;PP=2965;SC=TACACACAGAATTTAACTCAG;SOR=3.036;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=160;TCF=133;TCR=27;TR=159;WE=35764611;WS=35764593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr5	35764696	rs4242258	C	T	9598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=167;NR=120;PP=2965;SC=AAGCCTTCTTCGAGTTTCCAT;SOR=1.034;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=288;TCF=167;TCR=121;TR=287;WE=35764704;WS=35764686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr5	35789164	rs1494576	G	A	10084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=183;NR=122;PP=2965;SC=GTATTATTTTGCTTTTTCAGA;SOR=1.204;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=307;TCF=185;TCR=122;TR=305;WE=35789172;WS=35789154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,314:1.00:314
chr5	35792356	rs7730148	A	C	1412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=0;PP=1191;SC=AGAGAGTTTTAAAATACTCAT;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=35792364;WS=35792346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	35799994	rs3822735	A	G	2413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=0;PP=2024;ReadPosRankSum=0.921;SC=GCTCCTGGGGAGATTCTTCAT;SOR=3.467;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=86;TCF=86;TCR=0;TR=74;WE=35800002;WS=35799984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,77:0.86:90
chr5	35807070	rs36093359	T	C	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=4.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.52;ReadPosRankSum=-0.498;SOR=0.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,28:0.19:148
chr5	35807455	rs7736291	T	G	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=1.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.88;ReadPosRankSum=0.979;SOR=0.946;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,42:0.24:173
chr5	35857177	rs1353252	G	C	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FS=0.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.07;ReadPosRankSum=1.571;SOR=0.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:204,56:0.22:260
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chr5	35857235	rs1494561	C	G	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=10.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=1.835;QD=3.97;ReadPosRankSum=0.483;SOR=0.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,38:0.23:164
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chr5	35921266	rs3734107	G	A	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=107;ReadPosRankSum=1.058;SC=AGGCCTCGCCGCTGCCTCTGG;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=9;WE=35921274;WS=35921256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,9:0.24:37
chr5	35954588	rs700164	C	T	2787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.739;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=63;PP=2109;ReadPosRankSum=1.866;SC=TACCTGTTGGCGGAGACAGAG;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=137;TCF=50;TCR=87;TR=99;WE=35954596;WS=35954578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,104:0.74:141
chr5	35962873	rs76212882	C	T	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=1.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.82;ReadPosRankSum=-0.375;SOR=0.509;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,43:0.24:180
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chr5	35965970	rs3756669	A	C	3153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.940;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=85;PP=2598;ReadPosRankSum=-1.165;SC=AAATAACTACATTGAGTCCCA;SOR=1.609;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=124;TCF=21;TCR=103;TR=100;WE=35965978;WS=35965960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,106:0.80:132
chr5	35967917	.	G	C	312	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=12;NR=0;PP=312;QD=28.8976010456;SC=CAACCACCCAGCTGTCCTCTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=35967925;WS=35967916;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr5	36037778	rs2247611	G	A	1374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=0;PP=1225;SC=CCCATGTCCTGGAAAATACAG;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=43;WE=36037786;WS=36037768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	36049675	rs2441080	G	A	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5016;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=202;SC=AATACCCTCTGCCATAATTAT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=10;WE=36049683;WS=36049665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	36051834	rs72303780	ATCCG	A	210.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=3.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=1.872;QD=6.20;ReadPosRankSum=-0.063;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,8:0.24:34
chr5	36110240	.	G	C	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=271;ReadPosRankSum=0.328;SC=GAAGGAATTTGAGAGGTTACC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=12;WE=36110248;WS=36110230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr5	36111167	rs43189	A	T	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=95;ReadPosRankSum=1.093;SC=AGATTAAAAAATATTCACAAA;SOR=0.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=6;WE=36111175;WS=36111157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr5	36124514	rs13177876	A	G	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=36;ReadPosRankSum=0.729;SC=GTTCTTAAGAACACAAGTAAA;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=5;WE=36124522;WS=36124504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr5	36136675	rs267758	C	T	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=2.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.92;ReadPosRankSum=-0.736;SOR=0.183;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:174,47:0.21:221
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chr5	36141386	rs13156321	T	A	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=4.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.690;SOR=0.075;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,17:0.22:78
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chr5	36142648	rs12658867	A	G	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FS=7.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.46;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=1.241;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:226,45:0.17:271
chr5	36142818	rs68098184	CT	C	80.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=0.795;QD=3.11;ReadPosRankSum=2.371;SOR=0.247;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr5	36143392	rs267766	C	T	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FS=2.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.30;ReadPosRankSum=0.347;SOR=0.490;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:246,52:0.17:298
chr5	36166827	rs34784319	C	CT	1331.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=4.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=0.758;QD=14.48;ReadPosRankSum=0.561;SOR=1.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,73:0.79:92
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chr5	36168638	rs145823052	A	G	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.707;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=288;ReadPosRankSum=-0.790;SC=CCTTCTAGCCATATCCAGGTG;SOR=0.941;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=77;TCF=7;TCR=70;TR=20;WE=36168646;WS=36168628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,20:0.25:81
chr5	36176874	rs40030	G	A	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=0;PP=992;SC=TTTCTTTTTCGGATGATTCTC;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=35;WE=36176882;WS=36176864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	36195448	rs11952882	A	G	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FS=3.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.23;ReadPosRankSum=-2.748;SOR=0.313;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:224,54:0.19:278
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chr5	36217764	rs111441491	G	GTTAATCA	4047.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=1;PP=2957;SC=CTAAAAACAAGTAAATTATTA;SOR=5.943;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=58;TCF=56;TCR=2;TR=52;WE=36217772;WS=36217754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
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chr5	36241988	rs34888491	G	C	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	36251437	.	G	A	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.000;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=3.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=0.615;QD=5.46;ReadPosRankSum=-1.026;SOR=0.266;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,32:0.26:122
chr5	36253937	rs4869473	G	A	7551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=155;PP=2965;SC=CAGTTGACACGGAGGAATTTA;SOR=1.705;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=228;TCF=72;TCR=156;TR=227;WE=36253945;WS=36253927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr5	36260976	rs6881086	T	A	2984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=59;PP=2291;SC=TCTAAGAAAATGAAATAAGCA;SOR=1.688;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=27;TCR=59;TR=86;WE=36260984;WS=36260966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	36262256	rs2362977	G	C	390.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5052;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=289;ReadPosRankSum=-0.269;SC=CTATGTTTAAGTACTGCCTTA;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=11;WE=36262264;WS=36262246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr5	36268218	rs6869599	A	G	2976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=8;PP=2493;SC=TGATCGCTAAAAAAGAAAAGT;SOR=4.174;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=77;TCR=8;TR=85;WE=36268226;WS=36268208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	36269551	rs1035480	G	C	10163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=132;NR=166;PP=2965;SC=TACACGCTTTGTTGGAAAACC;SOR=0.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=299;TCF=133;TCR=166;TR=298;WE=36269559;WS=36269541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,314:1.00:314
chr5	36271491	rs5867310	CT	C	780.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=30;PP=615;SC=TATTTGAAGACTTTTTTTTTT;SOR=5.549;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=31;WE=36271499;WS=36271481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	36301362	rs10941287	T	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.147;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr5	36301369	rs884692	T	G	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.094;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr5	36301420	rs884694	G	T	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=175;ReadPosRankSum=1.300;SC=TGAGCTGGACGGACTCACCTT;SOR=0.473;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=13;WE=36301428;WS=36301410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,13:0.24:54
chr5	36613053	rs7728680	A	G	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.60;ReadPosRankSum=-0.605;SOR=0.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,7:0.15:46
chr5	36683801	rs56038114	T	C	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=254;SC=CAGAGTGAGATACTGTTTCAA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=36683817;WS=36683791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	36683809	rs11284736	CA	C	520.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=11;NR=1;PP=167;SC=GATACTGTTTCAAAAAAAAAA;SOR=3.912;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=12;WE=36683817;WS=36683791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	36683903	rs56039629	C	T	2727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=8;PP=2274;SC=TATTTTGCAGCGTATATGCTC;SOR=4.332;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=79;TCR=8;TR=85;WE=36683911;WS=36683893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr5	36958085	rs141750225	CAA	C	336.14	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQRankSum=2.379;QD=18.67;ReadPosRankSum=-0.426;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr5	37007629	rs159753	T	C	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=367;ReadPosRankSum=0.779;SC=TGATTAAGTCTAGTATAACCT;SOR=2.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=15;WE=37007637;WS=37007619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr5	37019354	rs300060	G	A	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.500;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=3;PP=1075;ReadPosRankSum=0.426;SC=TTACAATTAGGTGATTTATTA;SOR=1.743;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=39;WE=37019362;WS=37019344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,41:0.85:48
chr5	37026253	rs72736713	G	A	937.89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.9995;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=701;ReadPosRankSum=0.133;SC=GCTTTGTGTTGGGCCTAATGA;SOR=4.235;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=27;WE=37026261;WS=37026243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,32:0.91:35
chr5	37036420	.	AT	A	26	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=9;HapScore=2;MGOF=48;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=26;QD=20.0;SC=TTATACCGGGATTTTTTTTTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=37036428;WS=37036410;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr5	37036449	rs10554564	GTA	G	70.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.42;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	37061261	rs188541	A	G	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=307;ReadPosRankSum=0.107;SC=TCTCTATCTTATTTTAATGAG;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=14;WE=37061269;WS=37061251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr5	37115000	rs11286555	CA	C	311.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.485;NF=16;NR=0;PP=176;ReadPosRankSum=-1.158;SC=GACTCTGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=16;WE=37115008;WS=37114990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr5	37122655	.	A	G	2544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.000;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=77;PP=2071;ReadPosRankSum=0.495;SC=ATTACACATAATTCTGTTATT;SOR=0.572;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=108;TCF=7;TCR=101;TR=83;WE=37122663;WS=37122645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,88:0.77:115
chr5	37157424	rs183703355	G	A	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.84;ReadPosRankSum=-1.774;SOR=0.555;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,15:0.13:114
chr5	37179341	.	G	A	110	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=5;NR=0;PP=110;QD=28.9542425094;SC=TACAACCCATGGTGCATTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=37179349;WS=37179340;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr5	37310913	.	T	A	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.994;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.48;ReadPosRankSum=-0.341;SOR=0.111;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,11:0.24:45
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chr5	37364443	rs217852	C	T	10341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=106;NR=225;PP=2965;SC=CAGGTCCTTGCAAAGGATAAT;SOR=1.718;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=332;TCF=106;TCR=226;TR=331;WE=37364451;WS=37364433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,337:1.00:337
chr5	37479853	rs76523401	T	G	1847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=1;PP=1590;ReadPosRankSum=0.646;SC=GTGTAACATTTTTTTTTCTGG;SOR=1.051;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=78;TCR=1;TR=59;WE=37479861;WS=37479843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,60:0.74:81
chr5	37516814	rs1967541	C	T	272.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.31;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	37605048	rs1400853	A	G	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.405;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr5	37724990	rs7444391	G	A	1614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=15;PP=1207;SC=TTTTGGATGGGAAGGTTATTG;SOR=1.524;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=48;WE=37724998;WS=37724980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
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chr5	37752460	rs1549251	T	C	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=0;PP=917;SC=AGTTTAATGATTTATATTTAA;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=37752468;WS=37752450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	37752497	rs2973079	A	G	1855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=6;PP=1356;SC=TATTCCCCACATTTGCTCCCA;SOR=4.014;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=53;TCR=6;TR=59;WE=37752505;WS=37752487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr5	38258707	rs2561096	A	G	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=524;ReadPosRankSum=-0.241;SC=TCTTGGAACTACCCGTGTTTC;SOR=1.402;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=22;WE=38258715;WS=38258697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,23:0.79:29
chr5	38305547	rs2451018	G	A	5248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.465;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=69;PP=2962;ReadPosRankSum=1.371;SC=GGTGTTGGAGGATGACTGTCA;SOR=0.888;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=211;TCF=128;TCR=83;TR=179;WE=38305555;WS=38305537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,184:0.83:221
chr5	38370537	rs1465567	T	C	1788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-6.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.485;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=59;PP=1389;ReadPosRankSum=1.156;SC=CCCCCGCAGCTGGCCCAGTGA;SOR=0.240;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=91;TCF=11;TCR=80;TR=69;WE=38370545;WS=38370527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,72:0.77:94
chr5	38408093	rs60540056	C	G	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.845;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=49;PP=1401;ReadPosRankSum=-0.895;SC=GGAGAGGAAGCGGGGCAGCAG;SOR=0.253;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=88;TCF=20;TCR=68;TR=66;WE=38408101;WS=38408083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,68:0.76:90
chr5	38425008	rs3812046	G	A	2252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=6;PP=1877;SC=TGGGGTCAGCGCCACTGTGTT;SOR=4.174;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=68;TCF=61;TCR=7;TR=67;WE=38425016;WS=38424998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr5	38435130	rs2956598	T	G	2307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=2;PP=1957;SC=GATGGGTCTCTAGGCTCTGTC;SOR=6.593;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=81;TCF=79;TCR=2;TR=81;WE=38435138;WS=38435120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr5	38527228	rs2289779	T	G	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=22;PP=1556;SC=TGACTTACTTTAAAATTGAGT;SOR=1.392;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=37;TCR=22;TR=59;WE=38527236;WS=38527218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	38528951	rs34759137	GAC	G	598.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.9972;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=659;SC=CCCTGGAGGAGACACACACAC;SOR=2.200;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=16;WE=38528960;WS=38528941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	38530485	rs11293177	CA	C	675.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=512;SC=AAAAAGATGACAAAAAAAATG;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=23;WE=38530493;WS=38530475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	38820752	rs143325273	TAAAGA	T	5319.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.037;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.659;NF=8;NR=86;PP=2943;ReadPosRankSum=-0.483;SC=GACAAATGGTTAAAGAAAAGT;SOR=1.724;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=129;TCF=17;TCR=112;TR=94;WE=38820764;WS=38820742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,130:0.83:157
chr5	38820807	rs62354662	T	C	2220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=6.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.755;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=68;PP=1779;ReadPosRankSum=0.841;SC=TATACATATGTATATATGAAT;SOR=4.068;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=88;TCF=1;TCR=87;TR=68;WE=38820815;WS=38820797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,71:0.79:90
chr5	38822029	rs111307794	G	A	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=6;PP=183;SC=CTGGGGCTGCGCGTGGCATTC;SOR=1.270;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=9;WE=38822048;WS=38822019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	38822040	rs413278	A	G	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=6;PP=222;SC=CGTGGCATTCACAGGCCGGTG;SOR=1.270;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=38822048;WS=38822019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	38823254	rs369886	C	T	643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=3;PP=600;SC=TAAGTGTGTACATGTATACAT;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=38823262;WS=38823244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	38823306	.	A	G	401	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=38;MMLQ=24;MQ=59.13;NF=16;NR=5;PP=401;QD=20.7510101213;SC=TACATGGTACATGTGTATACG;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=21;WE=38823314;WS=38823296;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr5	38823344	.	AC	GT	1316	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=14;MMLQ=24;MQ=51.43;NF=11;NR=7;PP=1316;QD=76.0815486035;SC=GTGTGTATACACGTGCATACA;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=18;WE=38823366;WS=38823334;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr5	38823358	.	C	A	113	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=1;MMLQ=28;MQ=47.72;NF=7;NR=3;SC=GCATACATACCTGGGTACGTG;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=10;WE=38823366;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:19,10:0.34:29
chr5	38876573	rs357271	T	C	1801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=48;PP=1426;SC=GTTTTGGAAATATATTAGCAG;SOR=7.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=48;WE=38876581;WS=38876563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr5	38881636	rs74924445	A	C	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=24.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.97;ReadPosRankSum=0.702;SOR=0.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,12:0.16:74
chr5	38904363	rs1239334	C	T	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.164;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=57;ReadPosRankSum=-0.798;SC=ATTTGCTGTGCTCTGGTTTGC;SOR=0.095;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=6;WE=38904371;WS=38904353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
chr5	38917574	rs357260	G	A	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.165;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=269;ReadPosRankSum=0.704;SC=GTCCTTGACCGTCCTAGAAAA;SOR=0.020;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=70;TCF=68;TCR=2;TR=20;WE=38917582;WS=38917564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,23:0.32:73
chr5	38923171	rs357293	T	C	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.663;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=148;ReadPosRankSum=-1.040;SC=AGCCAACGTGTCATGCCTTTT;SOR=1.539;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=10;WE=38923179;WS=38923161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr5	38931919	rs357277	G	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.94;ReadPosRankSum=0.048;SOR=0.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,18:0.16:113
chr5	38932466	rs357278	A	C	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=12.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.18;ReadPosRankSum=0.710;SOR=0.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,21:0.17:124
chr5	38933645	rs1051977	G	A	2359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.310;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=68;PP=1917;ReadPosRankSum=-1.240;SC=ATCCCAGTACGATTTGCAGGT;SOR=0.392;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=84;TCF=5;TCR=79;TR=73;WE=38933653;WS=38933635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,78:0.87:90
chr5	38942554	rs200385182	A	AT	182.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=2.682;QD=2.61;ReadPosRankSum=-0.631;SOR=0.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,18:0.26:70
chr5	38950776	rs2115949	G	A	6088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=112;PP=2965;SC=GGAAAAATGTGCTAGTAGAGC;SOR=1.122;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=190;TCF=78;TCR=112;TR=190;WE=38950784;WS=38950766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr5	38953427	rs2115948	T	C	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=6;PP=1327;SC=ACACTTATATTGGCAGGAACA;SOR=2.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=44;WE=38953435;WS=38953417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	38953447	rs2115947	T	A	1718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=2;PP=1530;SC=AATCCAGTCTTAAATATTAAT;SOR=4.731;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=57;TCF=55;TCR=2;TR=57;WE=38953455;WS=38953437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	38953665	rs33912683	G	GA	1662.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.276;NF=1;NR=51;PP=1125;ReadPosRankSum=1.393;SC=TCTGGAGAAAGAAAAAAAAAT;SOR=3.981;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=66;TCF=3;TCR=63;TR=52;WE=38953673;WS=38953655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr5	38954994	rs9292726	T	C	2196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=56;PP=1818;SC=ACTATATCTCTTGGCTAATTT;SOR=3.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=8;TCR=56;TR=64;WE=38955002;WS=38954984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr5	38955796	rs2043112	G	A	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FS=3.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.000;QD=2.55;ReadPosRankSum=0.035;SOR=1.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:240,51:0.18:291
chr5	38958750	rs6868087	A	G	2180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=21;PP=1761;ReadPosRankSum=0.625;SC=GTATTAAATTATAAAAAATGA;SOR=0.615;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=82;TCF=58;TCR=24;TR=70;WE=38958758;WS=38958740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,74:0.86:86
chr5	38958968	rs6868591	A	C	877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=721;SC=AAAAAAAAAAAAACTTCAGCA;SOR=4.332;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=38958976;WS=38958958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	38959794	rs2115946	T	C	906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=0;PP=709;SC=ACCAAACACATGTACACAGAA;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=26;WE=38959802;WS=38959784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	38962543	rs7729745	A	G	2160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.01;SOR=1.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr5	38966903	rs11435048	A	AT	220.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=0.073;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.587;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr5	38971912	rs7732615	T	A	1293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.80;SOR=3.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	39021369	rs13177690	G	A	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.64;ReadPosRankSum=1.574;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,4:0.17:23
chr5	39074296	rs2303808	G	C	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FS=5.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.11;ReadPosRankSum=2.643;SOR=1.140;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:210,51:0.20:261
chr5	39107353	rs404122	T	A	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=0;PP=662;SC=GTCTTCTGAGTTAACAATTAA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=39107361;WS=39107343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	39108309	rs377022	A	G	1778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=26;PP=1345;SC=ACTGTTCTCTAGGGTGGTACT;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=27;TCR=26;TR=53;WE=39108330;WS=39108299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
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chr5	39119723	rs379707	C	A	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.682;SOR=0.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,13:0.20:66
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chr5	39124593	rs2303806	A	T	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=437;ReadPosRankSum=-1.590;SC=TGAACCCCAAATGTTTGCCAA;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=18;WE=39124601;WS=39124583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
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chr5	39134169	rs68032871	T	C	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=0;PP=742;ReadPosRankSum=-1.251;SC=TTCACCCATGTTGGGGTTATT;SOR=2.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=31;WE=39134177;WS=39134163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,32:0.78:41
chr5	39134295	rs4957318	C	T	4270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.102;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=58;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.992;SC=TTCTACAATACGTACTTGCAC;SOR=0.544;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=204;TCF=133;TCR=71;TR=159;WE=39134303;WS=39134285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,163:0.77:213
chr5	39139176	rs10059957	A	G	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=235;ReadPosRankSum=1.033;SC=AGTGTGTAACATCTTAAGCAT;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=14;WE=39139184;WS=39139166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr5	39141240	rs3188386	G	A	7674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.804;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=158;NR=115;PP=2962;ReadPosRankSum=0.558;SC=CATTGACAGGGCTTCTGAAAA;SOR=0.407;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=338;TCF=202;TCR=136;TR=273;WE=39141248;WS=39141230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,283:0.81:348
chr5	39285139	rs261738	T	A	467.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.99;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	39342308	rs476569	C	T	2172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=52;PP=1771;SC=ACTAAGATAACAGAACATCCC;SOR=2.206;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=69;WE=39342316;WS=39342298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr5	39364339	rs700231	T	C	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=0;PP=1134;ReadPosRankSum=0.662;SC=GCACCCTATGTATTTTCTTAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=61;TCR=0;TR=47;WE=39364347;WS=39364329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,44:0.76:58
chr5	39364358	rs700232	G	A	1705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=1;PP=1419;ReadPosRankSum=-1.672;SC=ATCTCTTTTCGAAGTTTAGAT;SOR=1.389;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=77;TCR=1;TR=61;WE=39364366;WS=39364348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,59:0.79:75
chr5	39364554	rs700233	G	A	3335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=87;PP=2673;ReadPosRankSum=0.757;SC=GCAAAGCTCCGGCAGGCTGAC;SOR=0.693;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=133;TCF=25;TCR=108;TR=108;WE=39364562;WS=39364544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,114:0.81:141
chr5	39375082	rs2686162	C	T	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=1.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.29;ReadPosRankSum=-0.041;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,13:0.14:96
chr5	39376988	rs3733801	C	T	2859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.088;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=72;PP=2523;ReadPosRankSum=0.974;SC=GAAGGCATCACTGGAGATGTC;SOR=0.582;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=117;TCF=30;TCR=87;TR=99;WE=39376996;WS=39376978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,97:0.84:115
chr5	39377418	rs2738238	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.96;ReadPosRankSum=1.636;SOR=0.960;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,12:0.16:73
chr5	39390061	rs2855512	C	A	1764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=44;PP=1427;SC=CACTGTTATCCGTATTTTAAT;SOR=2.564;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=12;TCR=44;TR=56;WE=39390069;WS=39390051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	39394493	.	G	C	28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=28;QD=15.6928031368;SC=CGATGGAGAAGTCTCAAATAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=4;WE=39394501;WS=39394483;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,4:0.20:20
chr5	40716153	rs10737963	C	A	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=259;ReadPosRankSum=0.344;SC=TACAACCAGGCGTTCTCCTAT;SOR=0.190;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=15;WE=40716161;WS=40716143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,15:0.31:49
chr5	40728397	rs370365006	AGTC	A	1582.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=19.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQRankSum=-5.714;QD=14.01;ReadPosRankSum=4.237;SOR=4.166;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,46:0.41:113
chr5	40728405	.	T	A	1528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.987;ClippingRankSum=0.000;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=22.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQRankSum=-7.092;QD=9.93;ReadPosRankSum=-1.580;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,46:0.30:154
chr5	40728407	.	T	A	1489.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.097;ClippingRankSum=0.000;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=24.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQRankSum=-7.210;QD=9.43;ReadPosRankSum=-5.777;SOR=4.232;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,46:0.29:158
chr5	40728408	.	ACTT	A	1474.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.726;ClippingRankSum=0.000;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=26.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQRankSum=-7.766;QD=8.73;ReadPosRankSum=-5.861;SOR=4.372;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,42:0.25:169
chr5	40728411	.	T	TAAAAAA	1091.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.841;ClippingRankSum=0.000;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=23.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQRankSum=-8.141;QD=6.70;ReadPosRankSum=-7.021;SOR=4.075;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,36:0.22:163
chr5	40772071	rs837103	C	G	1902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=52;PP=1573;SC=AAAATCTTCCCAATGAACTTC;SOR=6.630;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=53;TCF=1;TCR=52;TR=53;WE=40772079;WS=40772061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	40834864	rs3816959	T	C	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.79;ReadPosRankSum=0.972;SOR=0.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,17:0.18:97
chr5	40852451	rs188934	C	G	10209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=218;NR=119;PP=2965;SC=GAGATGTGACCGCTAGGGATT;SOR=1.409;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=338;TCF=219;TCR=119;TR=337;WE=40852459;WS=40852441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,340:1.00:340
chr5	40854682	rs1697938	T	C	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.021;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=76;ReadPosRankSum=1.563;SC=TATACATGACTGAATTGGATA;SOR=0.026;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=9;WE=40854690;WS=40854672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,9:0.25:36
chr5	40928574	rs2443040	A	C	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.89;ReadPosRankSum=2.193;SOR=0.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,6:0.13:47
chr5	40928792	rs2459467	T	A	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=1.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.42;ReadPosRankSum=-0.439;SOR=0.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,25:0.26:98
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chr5	40936669	rs16870528	C	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.63;ReadPosRankSum=0.909;SOR=0.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,13:0.21:63
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chr5	40980166	rs1055021	C	A	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=350;ReadPosRankSum=1.003;SC=CTCTCCTATACCCCTCACTGG;SOR=3.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=15;WE=40980174;WS=40980156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,18:0.86:21
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chr5	40998814	rs2876850	T	A	2871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.542;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=92;PP=2413;ReadPosRankSum=0.495;SC=ACTGATTTCATTATAGAGGAA;SOR=0.211;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=119;TCF=8;TCR=111;TR=100;WE=40998822;WS=40998804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,100:0.85:118
chr5	40999900	rs1376175	T	A	1847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.436;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=52;PP=1450;ReadPosRankSum=-1.002;SC=GATGTGAATTTCAAAGAGGGC;SOR=1.880;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=79;TCF=18;TCR=61;TR=65;WE=40999908;WS=40999890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,67:0.83:81
chr5	41000243	rs1376177	G	A	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.351;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=340;ReadPosRankSum=0.104;SC=GAAATTCCTTGCTACATTGTT;SOR=3.312;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=16;WE=41000251;WS=41000233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
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chr5	41001023	rs2167229	G	A	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=530;ReadPosRankSum=-0.610;SC=CACCCTTCCCGCTTCAGCAAA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=24;WE=41001031;WS=41001013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,24:0.73:33
chr5	41004396	rs7712140	G	T	3236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=1.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=32.69;ReadPosRankSum=0.281;SOR=1.154;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,78:0.79:99
chr5	41004406	rs7711722	A	T	3381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=1.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.61;ReadPosRankSum=-0.161;SOR=1.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,86:0.80:107
chr5	41004807	rs2305314	C	T	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5272;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=259;ReadPosRankSum=-0.789;SC=AACAACTAGGCGTGGGTTATT;SOR=1.473;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=11;WE=41004815;WS=41004797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr5	41005515	.	A	AG	86	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=12;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=63.17;NF=4;NR=0;PP=86;QD=23.0;SC=CCTCTATGAAACCCCCCCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=41005523;WS=41005505;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr5	41005791	rs10941529	T	C	2654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=82;PP=1995;ReadPosRankSum=-1.359;SC=TACTAAACAATGGAGGAAATC;SOR=0.636;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=131;TCF=32;TCR=99;TR=110;WE=41005799;WS=41005781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,109:0.83:131
chr5	41008780	rs2271704	A	G	3951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=43;PP=2965;SC=GGGACAAGTGAGCATCTTCTG;SOR=1.554;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=127;TCF=83;TCR=44;TR=126;WE=41008788;WS=41008770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr5	41009899	rs1878290	A	G	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.371;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=91;ReadPosRankSum=1.888;SC=CAATTGTTAAATTGTTATTCA;SOR=0.061;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=6;WE=41009907;WS=41009889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr5	41012615	rs6876879	AA	GC	1990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.226;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=4;PP=2036;ReadPosRankSum=-1.715;SC=ACAAACAGAGAAAGTGGCTGA;SOR=1.842;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=53;TCF=44;TCR=9;TR=38;WE=41012624;WS=41012605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,49:0.86:57
chr5	41018217	rs66881546	C	T	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.96;ReadPosRankSum=0.113;SOR=0.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,8:0.16:51
chr5	41018452	rs10054110	A	T	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FS=1.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.33;ReadPosRankSum=-0.918;SOR=0.891;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:181,37:0.17:218
chr5	41019229	rs896118	A	T	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.400;NF=0;NR=18;PP=482;ReadPosRankSum=1.463;SC=CTAACGTGTCACATTTTCTGA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=18;WE=41019237;WS=41019219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr5	41032998	rs325831	A	G	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=18.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.42;ReadPosRankSum=1.530;SOR=0.444;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:174,39:0.18:213
chr5	41033112	rs4957367	G	A	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FS=3.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.09;ReadPosRankSum=1.186;SOR=0.477;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:228,64:0.22:292
chr5	41033883	.	T	TTATCTATC,TTATC	1246.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29,29;NR=0,0;PP=1109,79;ReadPosRankSum=0.555;SC=CAGGGGGGCATTATCTATCTA;SOR=3.003;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=59;TCR=0;TR=29,29;WE=41033891;WS=41033873;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.83:41
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chr5	41045768	rs325860	G	A	3547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=17;PP=2891;SC=CTTTGATTGTGATACAGACAA;SOR=3.298;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=114;TCF=97;TCR=17;TR=113;WE=41045776;WS=41045758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
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chr5	41049389	rs325863	T	C	6541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=3.507;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=44.20;ReadPosRankSum=1.552;SOR=0.605;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,147:0.99:148
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chr5	41049410	rs116584060	C	T	3409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.837;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=65;PP=2556;ReadPosRankSum=-0.471;SC=CAAGTGCTGTCGACTCCTTGG;SOR=0.282;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=145;TCF=58;TCR=87;TR=114;WE=41049418;WS=41049379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,123:0.79:155
chr5	41050999	rs325866	C	T	2597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=6;PP=2219;SC=GGAGAACAAACTCATGTCTTT;SOR=4.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=75;TCR=6;TR=81;WE=41051007;WS=41050989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr5	41057562	rs618334	T	C	1799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=54;PP=1578;SC=AAAACAAGCTTCTCATCTTCC;SOR=7.978;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=0;TCR=54;TR=54;WE=41057570;WS=41057552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	41061715	rs1023840	C	T	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.10;ReadPosRankSum=-1.931;SOR=0.689;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:193,55:0.22:248
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chr5	41061871	rs587412	T	C	4868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.251;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=156;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.172;SC=AATATAAGGATGGGGCAGACG;SOR=1.317;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=246;TCF=49;TCR=197;TR=191;WE=41061879;WS=41061861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,197:0.78:252
chr5	41070840	rs1423391	C	T	5680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.081;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=68;PP=2962;ReadPosRankSum=1.441;SC=AATGACGCGCCACTCCCAGCC;SOR=0.980;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=236;TCF=152;TCR=84;TR=193;WE=41070848;WS=41070830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,202:0.82:246
chr5	41149235	rs1014587	A	G	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.96;ReadPosRankSum=-0.439;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,11:0.22:51
chr5	41149284	rs1014588	G	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.05;ReadPosRankSum=0.621;SOR=0.327;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,17:0.17:103
chr5	41154150	rs4957374	A	C	1267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=31;PP=989;SC=GAATAAACAAAAAATTTAGGC;SOR=2.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=39;WE=41154158;WS=41154140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	41158671	rs10075985	T	C	3460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=0;PP=2869;SC=TTAAAGTCAATAGGAGATTAT;SOR=9.308;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=101;TCF=101;TCR=0;TR=101;WE=41158679;WS=41158661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr5	41158863	rs6866352	G	A	8806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=208;PP=2965;SC=TCATTTCTTCGTCATCATTGA;SOR=2.236;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=280;TCF=72;TCR=208;TR=280;WE=41158871;WS=41158853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr5	41186220	rs61733159	T	G	3787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.376;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=90;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.602;SC=ATGGATTACTTGTCCTACTGC;SOR=1.240;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=157;TCF=49;TCR=108;TR=127;WE=41186228;WS=41186210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,131:0.81:162
chr5	41199959	rs1801033	G	T	2472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.777;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=31;PP=1880;ReadPosRankSum=-1.486;SC=TACCAGAGGCGCAGTGCATGG;SOR=0.915;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=109;TCF=68;TCR=41;TR=84;WE=41199967;WS=41199949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,89:0.76:117
chr5	41381901	rs35812696	T	TC	407.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=456;SC=ATTTGAGGTTTCCCCCTGACA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=12;WE=41381909;WS=41381891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	41382681	rs319013	G	T	7443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.03;SOR=2.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr5	41382691	rs545358	C	A	7006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.20;SOR=2.789;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr5	41475766	rs318039	C	T	2355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=42;PP=1691;ReadPosRankSum=0.823;SC=CAGGCGCCACCTGTGGCTGTC;SOR=0.692;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=107;TCF=51;TCR=56;TR=80;WE=41475774;WS=41475756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,87:0.76:114
chr5	41475851	rs112273513	T	C	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=9.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.89;ReadPosRankSum=1.704;SOR=2.757;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,12:0.18:67
chr5	41805525	.	TA	T	55.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.86;ReadPosRankSum=-1.058;SOR=0.142;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
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chr5	42646552	rs201498664	C	CT	102.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=2.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.30;MQRankSum=2.824;QD=1.94;ReadPosRankSum=-2.371;SOR=0.168;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,11:0.21:53
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chr5	42718928	rs6182	G	T	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FS=3.947;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.53;ReadPosRankSum=0.955;SOR=0.480;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:302,66:0.18:368
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chr5	42769647	rs12055266	T	C	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=4;PP=1255;ReadPosRankSum=1.434;SC=GAGAGAATAATTCCAAAATGA;SOR=0.713;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=71;TCF=66;TCR=5;TR=52;WE=42769655;WS=42769637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,54:0.73:74
chr5	42769844	rs1109882	G	T	2868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=74;PP=2375;SC=GTTTTTACATGGTTGATAATA;SOR=3.442;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=12;TCR=74;TR=86;WE=42769852;WS=42769834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr5	42779686	rs11427149	G	GA	1101.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=30;PP=706;ReadPosRankSum=-0.321;SC=TTCAAATTAGGAAAAAAAAAG;SOR=0.693;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=39;WE=42779694;WS=42779676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,46:0.82:56
chr5	42796874	rs3866437	CTT	C	331.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=357;ReadPosRankSum=1.206;SC=GAAATACAAACTTATAATAAT;SOR=0.317;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=10;WE=42796883;WS=42796864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr5	42799719	rs4041462	T	TTTA	2345.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=12;PP=2000;SC=TGTACTAAATTTTATTTCTGA;SOR=1.848;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=47;WE=42799727;WS=42799709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	42799925	rs16872762	A	G	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.34;ReadPosRankSum=1.163;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,12:0.21:58
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chr5	42804983	rs4143864	C	A	2387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=84;PP=2051;ReadPosRankSum=-0.860;SC=TAACTAAGACCCTTTCACGCC;SOR=1.384;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=2;TCR=99;TR=86;WE=42804991;WS=42804973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,84:0.85:99
chr5	42807753	rs28919894	G	A	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FS=1.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.78;ReadPosRankSum=-0.259;SOR=0.867;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:250,47:0.16:297
chr5	43039793	rs1054428	T	C	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FS=5.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.33;ReadPosRankSum=-0.340;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:267,71:0.21:338
chr5	43066774	rs316408	T	C	4516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.576;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=51;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.886;SC=ATGGCGGTGCTGGGACCCTAA;SOR=1.338;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=100;TCR=52;TR=151;WE=43066782;WS=43066764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,151:0.99:152
chr5	43122371	rs11287008	T	A	55.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=20;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=192;ReadPosRankSum=-0.674;SC=TTTTTTTTTTTAACCCATCCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=43122379;WS=43122361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr5	43161317	rs55714804	T	C	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=2.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.70;ReadPosRankSum=2.444;SOR=1.379;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,19:0.24:80
chr5	43173567	rs3752831	A	G	7694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.580;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=149;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.474;SC=GCAGATACATACATTCAGTTC;SOR=0.457;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=311;TCF=129;TCR=182;TR=261;WE=43173575;WS=43173557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,272:0.84:323
chr5	43175103	rs35397154	C	T	3949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.377;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.539;NF=50;NR=87;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.279;SC=GAGAGTCTAGCCAAGCAGATG;SOR=1.136;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=178;TCF=69;TCR=109;TR=137;WE=43175111;WS=43175093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,138:0.77:180
chr5	43292483	rs113830463	C	CTTACTATGAA	487.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.772;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=1976;ReadPosRankSum=0.620;SC=TCCCAGAGCCCTTACTCTTCT;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=43292491;WS=43292473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr5	43292908	rs55794239	C	A	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=533;ReadPosRankSum=0.000;SC=ATGATATCAGCCCTCCAAATG;SOR=0.117;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=24;WE=43292916;WS=43292898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,23:0.74:31
chr5	43294357	rs138459217	TAAGTAA	T	1485.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.497;NF=0;NR=29;PP=1401;ReadPosRankSum=0.071;SC=ATTTAGGCTATAAGTAAAAGT;SOR=3.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=29;WE=43294370;WS=43294347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,37:0.84:44
chr5	43296165	rs12520012	G	A	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=181;ReadPosRankSum=-0.239;SC=ATACCTTAAAGTATACATTTA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=43296173;WS=43296155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr5	43297032	rs3733768	C	T	2351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=6;PP=1923;ReadPosRankSum=0.811;SC=AAGTAGTTGCCTACCAAAGAT;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=90;TCR=8;TR=75;WE=43297040;WS=43297022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,78:0.78:100
chr5	43297144	rs3733769	A	G	5818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.243;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=96;PP=2962;ReadPosRankSum=0.349;SC=AGTAGACAGAATAGCAGCGGT;SOR=0.571;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=244;TCF=128;TCR=116;TR=198;WE=43297152;WS=43297134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,209:0.81:258
chr5	43298557	rs35239179	C	T	1496.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.9997;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=1;PP=1268;ReadPosRankSum=1.049;SC=AAAGTGTCATCTGGGTCTATT;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=50;TCR=1;TR=46;WE=43298565;WS=43298547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,48:0.91:53
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chr5	43492265	rs6876588	T	C	1175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=2;PP=968;SC=GCTTATTCTCTGTTAGTTAAA;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=33;WE=43492273;WS=43492255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	43492978	rs10039298	G	A	8751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=90;NR=184;PP=2965;SC=TATTGCTATCGTTTATCCCAG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=274;TCF=90;TCR=184;TR=274;WE=43492986;WS=43492968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr5	43493592	rs7732089	T	C	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=1;PP=458;SC=AGTATGGATATAAACAATAAA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=43493600;WS=43493582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	43505993	rs7710628	A	G	4454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.651;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=44;PP=2962;ReadPosRankSum=0.989;SC=TGCTGATTTTATTATGAAAAT;SOR=1.723;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=174;TCF=112;TCR=62;TR=141;WE=43506001;WS=43505983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,148:0.81:182
chr5	43509348	rs6872851	T	A	4554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=77;PP=2965;SC=AAAAATTCAGTGCCACAGGGA;SOR=0.904;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=64;TCR=77;TR=141;WE=43509356;WS=43509338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr5	43509462	rs11415989	T	TC	2018.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=46;PP=2174;SC=GGATAAGATATCTTCTAAGTC;SOR=4.294;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=54;TCF=1;TCR=53;TR=47;WE=43509470;WS=43509452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	43527673	rs4318791	C	G	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=24;PP=719;SC=CCTAGACTGACTTATAATAGA;SOR=2.621;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=43527681;WS=43527663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	43530035	rs6866325	G	C	3366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.870;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=62;PP=2587;ReadPosRankSum=0.719;SC=CACATGAAATGACCAATCACC;SOR=0.826;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=63;TCR=74;TR=114;WE=43530043;WS=43530025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,121:0.84:144
chr5	43533992	rs11741521	A	G	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=40;PP=1298;SC=GTCTGCACCTAATAATGCAAG;SOR=3.816;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=44;WE=43534000;WS=43533982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	43535754	rs6869933	G	C	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.216;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=701;ReadPosRankSum=-0.433;SC=TAAAAAAGCAGGTGTCAGTAA;SOR=0.502;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=30;TCR=22;TR=39;WE=43535762;WS=43535744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,40:0.75:53
chr5	43543411	.	AC	A	40	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5001;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=29;MQ=62.07;NF=0;NR=6;PP=40;QD=13.8333333333;SC=CACAATAAGTACAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=43543419;WS=43543401;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,6:0.43:14
chr5	43609272	rs12187908	T	C	5439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.671;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=134;NR=58;PP=2962;ReadPosRankSum=0.973;SC=AACTGGGGAGTCAGAAAATTG;SOR=1.319;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=240;TCF=161;TCR=79;TR=192;WE=43609280;WS=43609262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,197:0.79:248
chr5	43609343	rs10057103	C	T	6349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.409;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=116;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.918;SC=CTCGTGTCCTCTACTTAGCAA;SOR=0.486;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=273;TCF=126;TCR=147;TR=219;WE=43609351;WS=43609333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,227:0.80:283
chr5	43612984	rs139409541	T	TA	1391.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.969;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=15;PP=1450;ReadPosRankSum=0.138;SC=CAAATATATATTTTTTTTGCC;SOR=2.206;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=94;TCF=71;TCR=23;TR=72;WE=43612992;WS=43612974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,62:0.70:89
chr5	49963235	rs62366937	C	T	284.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=2;PP=204;SC=AGGCAGCCACCAGCTTTGAGG;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=49963243;WS=49963231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	50040778	rs282561	T	C	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=494;SC=TTAAGCTTTGTTCTTTCCACG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=50040786;WS=50040768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	50045967	rs2442107	G	T	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.111;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=816;ReadPosRankSum=0.271;SC=AGCCTTTTTTGTTTGTTTGTT;SOR=0.255;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=61;TCF=27;TCR=34;TR=57;WE=50045975;WS=50045950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,52:0.93:56
chr5	50046139	rs282553	A	G	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=85;SC=TGGTAGAGGAAGCCTTAAAGC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=50046147;WS=50046129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	50052800	rs282551	T	C	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=0;PP=735;SC=GCATAACGTCTTCCATGTTCA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=50052808;WS=50052794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	50052888	rs282550	C	A	2967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=12;PP=2428;SC=TGTGTACCTCCGTTTCTTTAT;SOR=3.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=77;TCR=12;TR=89;WE=50052896;WS=50052878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr5	50053015	rs282549	G	A	5522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=102;PP=2965;SC=TCCTGGTTCCGTTTCCTGTGG;SOR=1.198;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=67;TCR=102;TR=169;WE=50053023;WS=50053005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr5	50055456	.	C	CT	400	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=17;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=62.71;NF=20;NR=10;PP=400;QD=13.4333333333;SC=CTTTCATTATCTTTTTTTTTT;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=78;TCF=54;TCR=24;TR=30;WE=50055464;WS=50055446;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:48,30:0.38:78
chr5	50057729	rs282547	G	A	4108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=38;PP=2965;SC=ATTACGGAGGGCAGGTAAGGA;SOR=1.628;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=86;TCR=38;TR=124;WE=50057737;WS=50057719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr5	52084365	rs10067659	G	C	2861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=61;PP=2142;SC=ATCCACTTTCGGGCATTCCAG;SOR=1.408;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=32;TCR=61;TR=93;WE=52084373;WS=52084355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr5	52084441	rs2897351	C	A	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=35;PP=1103;SC=AATTAGTTTTCGTGTCTCTCC;SOR=4.514;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=38;WE=52084449;WS=52084431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	52096889	rs1499280	C	A	3560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=51;PP=2749;SC=CTGCGACTACCTGTTTCAACA;SOR=0.748;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=53;TCR=51;TR=104;WE=52096897;WS=52096879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr5	52097764	rs11886	T	G	1552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=42;PP=1207;SC=GCTGCAAGAATGGCACTTTTT;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=42;WE=52097772;WS=52097754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	52157374	rs2447867	T	C	2102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=51;PP=1669;SC=CATTACCTTGTGTAAAGTTGG;SOR=1.426;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=78;TCF=27;TCR=51;TR=77;WE=52157382;WS=52157364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
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chr5	52193414	rs377107895	C	CA	4234.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=75;PP=2972;SC=CTTCCCTTCCCAAACCAACAT;SOR=1.306;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=116;TCF=33;TCR=83;TR=107;WE=52193422;WS=52193404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr5	52204943	rs1478441	C	T	1260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=32;PP=910;SC=TAATAAATTCCAATTTTTCAC;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=37;WE=52204951;WS=52204933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	52223350	rs923837	A	G	6749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=81;PP=2965;ReadPosRankSum=0.832;SC=GAAAATTCTGAAAGAACACGT;SOR=1.109;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=118;TCR=82;TR=197;WE=52223358;WS=52223340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,209:0.99:211
chr5	52235802	rs1904165	T	G	2248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=55;PP=1803;SC=TCTATGCACTTATTGAATAAT;SOR=3.393;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=7;TCR=55;TR=62;WE=52235810;WS=52235792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr5	52235853	rs9637769	C	T	1246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=35;PP=1062;SC=ATGCAAGGCACTGTGCTGCTT;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=52235861;WS=52235843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	52243059	rs3764924	A	G	694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=0;PP=591;SC=ATGTTTTCTCATTATATAGTA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=52243067;WS=52243049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	52337908	rs3212441	C	T	3828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=14;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.857;SC=CTATACTTAACACTTTGTGTC;SOR=2.483;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=101;TCR=14;TR=114;WE=52337916;WS=52337898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,120:0.99:121
chr5	52338083	rs1363192	T	G	3714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=98;PP=2965;SC=AGGCATGTGATTTGTCTTAGA;SOR=3.338;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=17;TCR=98;TR=115;WE=52338091;WS=52338073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr5	52341064	rs1421937	A	G	1211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=39;PP=1055;ReadPosRankSum=0.678;SC=TGGCTATCCAATGTTGAATAT;SOR=5.943;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=39;WE=52341072;WS=52341054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr5	52344610	rs1421933	A	G	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=48;PP=1452;SC=GGTATGGCTAACAGAAATGCA;SOR=4.450;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=4;TCR=48;TR=52;WE=52344618;WS=52344600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr5	52347369	rs1126643	C	T	6550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.918;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=119;PP=2965;ReadPosRankSum=0.739;SC=CAAACACATTCGGAGCAATTC;SOR=0.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=203;TCF=84;TCR=119;TR=202;WE=52347377;WS=52347359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,211:1.00:212
chr5	52351413	rs1062535	G	A	6709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=147;NR=57;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.107;SC=GAAGTGCTACGAAAGTAATGG;SOR=0.530;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=206;TCF=149;TCR=57;TR=204;WE=52351421;WS=52351403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,212:0.99:214
chr5	52351746	rs3212522	G	A	284.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=3;PP=265;SC=TTCAAAATAGGCTAGAATGTA;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=52351754;WS=52351736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	52354103	rs996765	A	T	2371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=66;PP=1945;SC=AATTTGAAGGATAATAATGTC;SOR=8.497;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=0;TCR=66;TR=66;WE=52354111;WS=52354093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	52355854	rs2303127	T	C	2208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.353;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=52;PP=1781;ReadPosRankSum=1.294;SC=TAAGGCATGGTAATAATTGGC;SOR=2.799;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=14;TCR=53;TR=65;WE=52355862;WS=52355844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,67:0.97:69
chr5	52366138	rs2112290	G	A	4584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=107;PP=2965;ReadPosRankSum=1.741;SC=TCCTAAAGACGAGAGAGTGGT;SOR=1.325;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=139;TCF=30;TCR=109;TR=137;WE=52366146;WS=52366128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,145:0.99:146
chr5	52366162	rs2303126	G	A	3617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=92;PP=2893;SC=AGTCAAAAATGGAAGCTTATG;SOR=4.037;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=12;TCR=93;TR=104;WE=52366170;WS=52366152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr5	52367666	rs2287872	A	T	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=2;PP=1702;SC=ACTGTGCTCTAAATTGTAAAC;SOR=5.994;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=59;TCF=57;TCR=2;TR=59;WE=52367674;WS=52367656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	52367706	rs2287871	T	C	2704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=22;PP=2038;ReadPosRankSum=-1.130;SC=TGTTTTAATGTTGCTATGCTC;SOR=0.547;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=62;TCR=23;TR=82;WE=52367714;WS=52367696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,87:0.98:89
chr5	52368922	rs984966	T	A	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=2;PP=718;SC=TAATGGCTTTTCCCCCCTCCT;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=52368930;WS=52368912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	52370174	rs3212591	G	A	3835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=34;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.826;SC=CACAAATGTTGTATGCCAATT;SOR=0.876;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=126;TCF=92;TCR=34;TR=125;WE=52370182;WS=52370164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,126:0.99:127
chr5	52379277	rs2303122	C	T	3253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=48;PP=2560;SC=ACGGGACTTTCGCATCAGTAA;SOR=0.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=46;TCR=48;TR=94;WE=52379285;WS=52379267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr5	52781376	rs33951575	GTT	G	1148.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.39;MQRankSum=0.375;QD=28.72;ReadPosRankSum=-0.051;SOR=4.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,39:0.98:40
chr5	52781902	.	CAAAAA	C	221.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=0.967;QD=18.48;ReadPosRankSum=0.765;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr5	52856504	rs2279516	G	C	2700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=43;PP=2142;SC=TGGCGGCGGTGTCAATGTCAG;SOR=0.902;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=34;TCR=43;TR=77;WE=52856512;WS=52856494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr5	52856716	rs1532163	A	G	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=317;SC=TCTCGGGAGAAGTCGGGCGGA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=52856724;WS=52856706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	52899166	rs11414085	C	CT	276.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.99;MQRankSum=0.904;QD=17.30;ReadPosRankSum=1.560;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr5	52942083	rs31304	A	C	3912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=4;PP=2965;SC=CTTTAACTGGAGTTCCAGAAG;SOR=6.238;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=111;TCR=4;TR=115;WE=52942091;WS=52942073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr5	52942197	rs31303	A	G	9056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=162;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.817;SC=TTGATACCAGAGAGCGATGGG;SOR=0.408;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=278;TCF=115;TCR=163;TR=277;WE=52942205;WS=52942187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,286:1.00:287
chr5	52978776	rs3085740	GGATT	G	829.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=774;SC=TTCTCACAGAGGATTGATTAT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=17;WE=52978787;WS=52978769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	52979097	rs567	G	A	2361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=62;PP=1841;SC=AAAGTCAGCTGTGCAGTATTT;SOR=5.255;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=4;TCR=62;TR=66;WE=52979105;WS=52979087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr5	53371315	rs70986658	C	CT	632.86	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.746;HP=11;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.464;NF=10;NR=14;PP=416;ReadPosRankSum=-0.331;SC=ATATATATTCCTTTTTTTTTT;SOR=0.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=24;WE=53371323;WS=53371305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,29:0.88:33
chr5	53371333	rs156384	A	G	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=16;NR=18;PP=761;SC=TTTTGAGATAAGGTCTCACTT;SOR=0.811;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=16;TCR=18;TR=34;WE=53371341;WS=53371323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	53450542	rs157072	T	C	1917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=52;PP=1433;SC=ATGCTCAAATTGTCTCTTTTT;SOR=2.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=13;TCR=52;TR=65;WE=53450550;WS=53450532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr5	53606295	rs35941	T	C	3415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=69;PP=2712;SC=CCTCAGTTATTCGGAGATCAG;SOR=1.677;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=35;TCR=69;TR=103;WE=53606303;WS=53606285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr5	53751901	rs7699	G	A	9706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=153;NR=144;PP=2965;SC=AAGGCTGGCTGCTGATAAAAG;SOR=0.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=298;TCF=154;TCR=144;TR=297;WE=53751909;WS=53751891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr5	53751988	rs7823	T	C	7199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=149;PP=2965;SC=TACCAGATGGTGTGGAAATCA;SOR=1.192;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=245;TCF=95;TCR=150;TR=244;WE=53751996;WS=53751978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr5	53813830	rs76854460	A	C	4327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=43;PP=2965;ReadPosRankSum=1.860;SC=CGGAGAACCCAGGAGAGATCT;SOR=1.545;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=94;TCR=44;TR=136;WE=53813838;WS=53813820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,144:0.99:146
chr5	53814052	rs2548615	T	C	1629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=35;PP=1195;SC=AGCCCCTGCCTGTCGCGCCCC;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=56;WE=53814060;WS=53814042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr5	53814394	rs2548614	T	C	3269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=56;PP=2722;SC=TGTCCCTGGGTTCCCGCGGCG;SOR=1.202;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=95;TCF=38;TCR=57;TR=94;WE=53814402;WS=53814384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr5	53815066	rs2548613	C	A	4425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=61;PP=2965;SC=AGAGCAAGATCGACGGCTTCA;SOR=0.844;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=72;TCR=62;TR=133;WE=53815074;WS=53815056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr5	53815495	rs2548612	A	C	5644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=123;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.399;SC=GGGTTTCAGAATCATATTCTA;SOR=0.960;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=172;TCF=46;TCR=126;TR=168;WE=53815503;WS=53815485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,175:0.98:179
chr5	53815722	rs2565014	G	A	278.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=199;SC=TGAGACGAGGGTAGAATTAGA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=53815730;WS=53815712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	54153803	rs10040872	C	T	3763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=59;PP=2965;SC=GTACATACTGCGGGAAAGCCT;SOR=0.798;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=53;TCR=60;TR=112;WE=54153811;WS=54153793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr5	54154209	rs3916738	G	A	3436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=66;PP=2590;SC=GAAACCTTTCGTATGTAAAGA;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=36;TCR=66;TR=102;WE=54154217;WS=54154199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr5	54154328	rs4242050	C	T	1063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=30;PP=908;SC=TTTAGCCCATCGGTTGCCATC;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=54154336;WS=54154318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	54253615	rs11954366	C	T	3097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=46;PP=2370;ReadPosRankSum=-0.389;SC=GCTTTTCTTTCTTTGTGATCA;SOR=0.231;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=92;TCF=45;TCR=47;TR=91;WE=54253623;WS=54253605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,97:0.99:98
chr5	54253635	rs3815924	T	C	2590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=43;PP=1937;ReadPosRankSum=1.038;SC=ATTTGCAGGATTCCACACCAC;SOR=0.381;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=32;TCR=44;TR=75;WE=54253643;WS=54253625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr5	54253754	rs6883914	T	C	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=24;PP=735;SC=GGAGATGCATTAGGCTTTATC;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=54253762;WS=54253744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	54329735	rs201115051	T	C	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=36;PP=1205;SC=AGCAACCTTGTCCCGCCTCAT;SOR=2.007;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=48;WE=54329743;WS=54329725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	54403957	rs3104233	T	C	2011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=14;PP=1618;SC=CAACAGCTGATGGAAAAAGCA;SOR=2.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=50;TCR=14;TR=64;WE=54403965;WS=54403947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr5	54404015	rs1875506	C	T	3813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=39;PP=2965;SC=AAAAGGGGGACGATGTGAAAC;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=84;TCR=39;TR=123;WE=54404023;WS=54404005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr5	54410120	rs3104230	A	C	2765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=63;PP=2161;SC=GGACTCAAAGACAGGTGCAGC;SOR=2.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=24;TCR=63;TR=87;WE=54410128;WS=54410110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	54433393	rs336081	G	A	4124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=79;NR=47;PP=2965;SC=GTATTCAGAGGGCCTCTCAAT;SOR=1.341;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=79;TCR=47;TR=126;WE=54433401;WS=54433383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr5	54439466	rs1021580	G	A	2334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=48;PP=1738;SC=TGTTCTTTGCGGGATCCTACA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=71;WE=54439474;WS=54439456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr5	54459961	rs381852	A	G	3347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=39;PP=2657;SC=AAGTTCTGGAAGCCAGAGGAG;SOR=1.201;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=61;TCR=39;TR=100;WE=54459969;WS=54459951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr5	54468921	rs336115	C	T	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=371;SC=GACGCCTAATCGTCAAACCCC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=54468929;WS=54468911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	54516521	rs6879219	G	A	5008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=104;PP=2965;SC=CCACTTCCGCGCAATCCTGCC;SOR=1.509;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=54;TCR=104;TR=158;WE=54516529;WS=54516511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr5	54516752	rs3111181	C	G	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=6;PP=863;SC=TCTCCTCTCCCGGGCCCCCAC;SOR=3.086;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=36;WE=54516760;WS=54516742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	54517102	rs34101652	C	CT	183.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=7;PP=140;SC=AATCAATTTACTTTTTTTTTA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=54517110;WS=54517092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	54518660	rs7730048	G	A	1260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=0;PP=1135;SC=ATGAGTTGCTGGAGAGTCGTT;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=54518668;WS=54518650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr5	54557438	rs400437	T	C	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=33;PP=1000;SC=CATTTTAAGCTCAGAGTATTT;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=54557446;WS=54557428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	54563775	rs143912964	TTTA	T	527.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=600;SC=TTTTCAATATTTTATTATGTT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=54563785;WS=54563765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	54579211	.	A	C	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.072;ClippingRankSum=0.000;DP=340;ExcessHet=3.0103;FS=544.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.41;ReadPosRankSum=-2.147;SOR=8.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:261,77:0.23:338
chr5	54693374	rs230802	G	A	2172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=60;PP=1753;SC=AATTTCATAAGTTAAGTATAA;SOR=4.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=5;TCR=60;TR=65;WE=54693382;WS=54693364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr5	54693402	rs230801	G	A	1691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=46;PP=1358;SC=GTAAATACAGGTAGTGTTTAT;SOR=5.058;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=3;TCR=46;TR=49;WE=54693410;WS=54693392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr5	54706325	rs139320115	T	TTTTAAA	5744.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=34;PP=2966;SC=TATTCTGACATTTTATTCTTT;SOR=1.536;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=99;TCF=58;TCR=41;TR=83;WE=54706333;WS=54706315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr5	54709943	rs230766	G	A	1658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=5;PP=1353;SC=TTGTTAAAACGGGTAGTGTGA;SOR=4.133;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=44;TCR=5;TR=49;WE=54709951;WS=54709933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	54710072	rs201611017	GT	G	83.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=6.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.89;ReadPosRankSum=0.777;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr5	54718618	rs230753	G	C	250.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=206;SC=ATTAATTATCGTGTGTTCTCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=54718626;WS=54718608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	54721619	rs3217330	A	AT	1276.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=0;PP=860;ReadPosRankSum=1.698;SC=GATTTTTTGGATTTTTTTTTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=50;TCR=3;TR=42;WE=54721627;WS=54721609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr5	54721642	rs230750	A	C	2086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=57;NR=9;PP=1862;SC=ATTTACTTATATAAATGTTTA;SOR=3.327;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=57;TCR=9;TR=66;WE=54721650;WS=54721632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	54737538	rs2278258	T	C	1889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=7;PP=1547;SC=TACTTCTCAGTATGAAACTTA;SOR=3.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=51;TCR=7;TR=58;WE=54737546;WS=54737528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	54737791	rs2278257	G	C	2563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=64;PP=2129;SC=CAAAAGTATTGTTGATTTCAT;SOR=4.323;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=7;TCR=65;TR=71;WE=54737799;WS=54737781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr5	54771380	rs6870449	A	G	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=278;SC=TGCATTTGCCATGAAAATAAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=54771388;WS=54771370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	54804621	rs7707766	C	T	2453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=16;PP=1836;SC=GAAGTGAAGACCCAGGTGTAC;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=56;TCR=16;TR=72;WE=54804629;WS=54804611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr5	54830295	rs2292280	T	G	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=4;PP=437;SC=GCCCCACAGCTGCGCACGCGT;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=54830303;WS=54830285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	54830380	rs11745331	A	G	1640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=21;PP=1206;SC=CGCCCCTCGGACCCGGCGGCG;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=48;WE=54830388;WS=54830370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	54941810	rs6450329	TG	CA	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=20;PP=1367;SC=AAAAATCAGTTGTCACTGTTT;SOR=2.985;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=24;WE=54941819;WS=54941800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	54944945	rs35843566	TA	T	253.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=180;SC=ATGCTCAGCATAAAAAAAAAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=11;WE=54944953;WS=54944935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	54944976	rs11738633	G	C	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=598;SC=TTTTAGAATAGCATATGACAA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=54944984;WS=54944966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	54948586	rs138550751	C	CA	668.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=13;PP=382;SC=AAGAAGATGACAAAAAACAAA;SOR=2.584;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=15;WE=54948606;WS=54948576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	54948598	rs11424790	C	CA	926.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.29;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	54952688	rs11397177	C	CTT	350.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.64;QD=31.88;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	54960609	rs4865614	A	G	5365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=78;NR=77;PP=2965;SC=CCAAGGAGAAAAGGAGACTCG;SOR=0.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=78;TCR=77;TR=155;WE=54960617;WS=54960599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr5	54960673	rs4865615	C	G	4524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=81;PP=2652;SC=ATATTCCCAGCTAGTGGTATC;SOR=2.459;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=24;TCR=81;TR=105;WE=54960695;WS=54960663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr5	54960687	rs4865616	C	T	3925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=71;PP=2169;SC=TGGTATCCAACGAAACTAGAT;SOR=3.258;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=13;TCR=71;TR=84;WE=54960695;WS=54960663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	54964974	rs7737254	A	G	3027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=15;PP=2469;SC=ACACACATGTAGCATATACAC;SOR=3.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=75;TCR=15;TR=90;WE=54964982;WS=54964964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr5	54965513	rs11749883	C	T	2258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=21;PP=1866;SC=TTAATTGAGACAAAAATTTAA;SOR=1.819;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=49;TCR=21;TR=70;WE=54965521;WS=54965503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr5	54965854	rs2408031	G	A	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=26;PP=730;SC=GTGCAGTGACGCGATCTCGGC;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=54965862;WS=54965844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	54986963	rs3846505	A	G	5028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=77;PP=2965;SC=AGAGCACCTGAAATGTTCTCA;SOR=0.771;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=71;TCR=77;TR=148;WE=54986971;WS=54986953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr5	54990005	rs7728664	C	T	794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=575;SC=CATCACACTCCAGTGTGGGCT;SOR=4.091;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=21;WE=54990013;WS=54989995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	54990035	rs10654694	C	CA	202.27	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.01;MQRankSum=-0.221;QD=9.63;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,17:0.81:21
chr5	54993829	rs3761766	A	G	2872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=67;PP=2334;SC=TCCTACACAAAGAAGATAAAT;SOR=2.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=18;TCR=67;TR=85;WE=54993837;WS=54993819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	54993929	rs3761767	A	T	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=474;SC=TTTGCTGAAGATATCTTAATG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=54993937;WS=54993919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	55149407	rs10940487	T	C	4561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.775;SC=TGAGTGCTAATTCATTTAGAA;SOR=1.103;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=33;TCR=102;TR=134;WE=55149415;WS=55149397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,140:0.99:141
chr5	55155402	rs1009639	C	T	3274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=32;PP=2527;SC=GGATGCTCCCCTCACTCTGCA;SOR=1.633;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=95;TCF=62;TCR=33;TR=94;WE=55155410;WS=55155392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr5	55212446	rs16884641	T	G	1769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=3;PP=1453;SC=AAATGACCACTTGGGATGTCC;SOR=5.421;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=60;TCR=3;TR=62;WE=55212454;WS=55212436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	55213023	rs161699	C	T	988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=28;PP=839;SC=AGACTCGGCACGCAGCGCTTG;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=55213031;WS=55213013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	55246001	rs4865999	A	G	2563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=27;PP=2137;SC=CGAGGGAGGGAAAATGTATTT;SOR=1.252;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=76;TCF=48;TCR=28;TR=75;WE=55246009;WS=55245991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr5	55252984	.	CA	C	58.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=4.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.47;MQRankSum=1.368;QD=3.26;ReadPosRankSum=0.816;SOR=0.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr5	55398269	rs318818	G	C	3990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=22;PP=2965;SC=TTAGTTGTGTGTAGATATGTT;SOR=2.991;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=101;TCR=22;TR=122;WE=55398277;WS=55398259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr5	55412347	rs318805	A	G	1811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=2;PP=1530;SC=TAATAATATTATTATTGGTTT;SOR=5.747;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=52;TCF=50;TCR=2;TR=52;WE=55412355;WS=55412337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	55466689	rs3846521	C	A	6411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=43.62;ReadPosRankSum=-0.713;SOR=1.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,146:0.99:147
chr5	55466693	rs3857293	C	T	6369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=44.23;ReadPosRankSum=-0.843;SOR=1.477;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,143:0.99:144
chr5	55479223	rs6885745	G	C	835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=710;SC=CTGCACATAGGCACAGTATCA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=55479231;WS=55479213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	55479293	rs66547356	A	G	2334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=10;PP=2056;SC=CATCTCTAAAAAAATAGAGCA;SOR=3.426;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=60;TCR=10;TR=70;WE=55479301;WS=55479283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	55528572	rs142447793	A	AACAC,AAC	872.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=13,13;NR=0,0;PP=495,52;SC=CACGCACATGAACACACACAC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=13,13;WE=55528580;WS=55528562;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:19
chr5	55528815	rs149489	T	C	3908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=102;PP=2965;ReadPosRankSum=0.271;SC=ACTGTCAACATGACAGTCAGA;SOR=1.055;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=141;TCF=38;TCR=103;TR=140;WE=55528823;WS=55528805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,140:0.99:141
chr5	55753652	rs16877004	C	T	794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=646;ReadPosRankSum=-0.888;SC=GGGAGCTCTGCGCAGTTTTGT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=28;WE=55753660;WS=55753642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr5	55753822	rs148833159	C	CA	2854.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=41;PP=2606;SC=TTCATGTCAACAGGTTCACTG;SOR=0.976;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=61;TCF=19;TCR=42;TR=57;WE=55753830;WS=55753812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr5	55759715	rs157851	T	C	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.04;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	55759720	rs4081705	G	A	963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.90;SOR=6.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	55807370	rs464605	C	T	1288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=3;PP=1092;SC=GATGTAGCTGCCATTGTGTCT;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=39;WE=55807378;WS=55807360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr5	55851872	rs78650987	G	A	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=408;ReadPosRankSum=-0.611;SC=ACATCCAAACGTTGCATGTCC;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=18;WE=55851880;WS=55851862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr5	56111751	rs28710284	G	C	214.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=7;PP=201;SC=ACGGAGCCGCGAGCCGCGGCG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=56111759;WS=56111741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	56152416	rs832567	C	A	1162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=851;ReadPosRankSum=-0.747;SC=TTGTTTCTGCCTGCATTTTAG;SOR=1.007;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=33;WE=56152424;WS=56152406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr5	56161787	rs832575	G	A	6415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=156;PP=2965;SC=GTACTTCTACGTCTAGTTCAG;SOR=2.776;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=195;TCF=39;TCR=156;TR=195;WE=56161795;WS=56161777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr5	56177443	rs702689	G	A	7147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=159;NR=67;PP=2965;ReadPosRankSum=0.160;SC=GCAGTCCATTGATAATTCCCA;SOR=1.218;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=229;TCF=161;TCR=68;TR=226;WE=56177451;WS=56177433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,230:0.99:233
chr5	56177743	rs832582	G	A	8755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=172;NR=91;PP=2965;SC=TGAGTGCACAGTCCATTTAGA;SOR=1.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=265;TCF=173;TCR=92;TR=263;WE=56177751;WS=56177733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr5	56177843	rs45556841	C	G	16356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=522;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.251;NF=291;NR=175;PP=2965;ReadPosRankSum=1.413;SC=GTAGGACCTTCTAGTTCAACA;SOR=0.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=482;TCF=300;TCR=182;TR=466;WE=56177861;WS=56177833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,513:0.99:518
chr5	56177848	rs5868032	TCAA	T	17896.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=548;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.255;NF=128;NR=152;PP=2992;ReadPosRankSum=1.551;SC=ACCTTCTAGTTCAACAACAAC;SOR=0.422;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=398;TCF=201;TCR=197;TR=280;WE=56177861;WS=56177833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,408:0.99:411
chr5	56178217	rs832583	A	C	6355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=142;PP=2965;SC=AAAGCCATCTAGACCTACCCC;SOR=1.598;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=209;TCF=67;TCR=142;TR=209;WE=56178225;WS=56178207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr5	56205643	rs252924	A	G	4357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=99;PP=2962;SC=GGCGGGACGCAAAGCGGAGAG;SOR=6.033;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=4;TCR=99;TR=103;WE=56205651;WS=56205633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr5	56205662	rs252923	T	G	3403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=70;PP=1956;SC=AGCCTGAGGCTGACTGCCGGC;SOR=8.608;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=0;TCR=70;TR=70;WE=56205670;WS=56205652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr5	56206073	rs33321	G	T	1608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=10;PP=1363;SC=GAAAAGCCAAGCCAGGGTTTA;SOR=2.790;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=43;TCR=10;TR=53;WE=56206081;WS=56206063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr5	56207123	rs2257505	T	A	4427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.605;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=41;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.712;SC=AGAAATCTTGTCTATGCTTCC;SOR=0.335;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=86;TCR=41;TR=125;WE=56207131;WS=56207113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,131:0.98:133
chr5	56209735	rs40497	A	G	5285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=56;PP=2965;ReadPosRankSum=1.454;SC=CGGCCCTTTAAAAATGAGTGA;SOR=0.544;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=154;TCF=98;TCR=56;TR=153;WE=56209743;WS=56209725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,160:0.99:161
chr5	56210923	rs331499	G	A	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=340;SC=AGATTTTTATGTTCACACCTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=56210931;WS=56210913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	56212595	rs832536	C	T	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=691;ReadPosRankSum=0.081;SC=AAAATATGAGCTTATATTTGT;SOR=1.445;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=28;WE=56212603;WS=56212585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,30:0.94:32
chr5	56221328	rs702679	A	G	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=15;PP=396;SC=ACACAAGACCATTTACATTAG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=56221336;WS=56221318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	56224485	rs10684065	T	TTGGC	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=585;SC=TGAAATGCTATAAGGGAACAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=56224493;WS=56224475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	56224714	rs252893	T	C	1380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=34;PP=1192;SC=AAATAAAATTTATGGGCCCCC;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=41;WE=56224722;WS=56224704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	56224782	rs150959650	ACT	A	270.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.01;QD=38.69;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	56224794	.	TCT	ACA	237	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=2;HapScore=4;MGOF=26;MMLQ=28;MQ=58.12;NF=0;NR=8;PP=237;QD=36.3084843578;SC=TCTCTCTCTCTCTCACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=8;WE=56224816;WS=56224772;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,8:0.53:15
chr5	56224796	rs11747763	T	A	279.85	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.01;QD=39.98;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	56224808	.	A	T	305	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=2;HapScore=4;MGOF=26;MMLQ=27;MQ=58.22;NF=0;NR=8;PP=305;QD=42.4714015684;SC=ACACACACACACTCTCTCTCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=8;WE=56224816;WS=56224772;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,8:0.53:15
chr5	56224818	.	T	TCTCACACACA	274.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.01;QD=39.26;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	56224834	rs252891	T	A	217.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=63;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=3;PP=103;SC=ACACACACACTCTCTCTCTCT;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=56224842;WS=56224824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	56226410	rs252890	T	C	6834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=159;NR=52;PP=2965;ReadPosRankSum=1.363;SC=GATTGCTCTGTCCCTTAGGAT;SOR=1.170;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=212;TCF=160;TCR=52;TR=211;WE=56226418;WS=56226400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,217:1.00:218
chr5	56229288	rs832529	C	T	2212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=67;PP=1851;ReadPosRankSum=-0.804;SC=TGTACACAAACAATTCTTTGT;SOR=7.083;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=68;TCF=0;TCR=68;TR=67;WE=56229296;WS=56229278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,68:0.99:69
chr5	56526565	rs1544737	G	T	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=1;PP=920;SC=GCAATATGTTGTTCTTAATCA;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=56526573;WS=56526555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	56526783	rs1130203	G	A	7504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=129;PP=2965;SC=CTGCTATTGGGCGTCCTAATG;SOR=0.985;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=228;TCF=98;TCR=130;TR=227;WE=56526791;WS=56526773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr5	56527224	rs1862172	T	C	1472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=38;PP=1213;SC=CCTCAGCCTCTCCAGTATCTG;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=38;WE=56527232;WS=56527214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	56527247	rs1862173	T	C	906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=21;PP=678;SC=ATTACAGGCATCCACCACCAG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=56527255;WS=56527237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	56531761	rs13170141	A	G	1562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=6;PP=1184;SC=TTATTTTTAAAATGTGAAATG;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=40;WE=56531769;WS=56531751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	56546749	rs34533194	C	CT	468.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=-0.373;QD=16.74;ReadPosRankSum=-1.954;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,23:0.82:28
chr5	56547059	rs6893468	G	A	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=34;PP=987;SC=AGGTTTATTGGAATACAACTT;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=56547067;WS=56547049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	57750350	rs15009	C	G	1208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=0;PP=969;SC=ATTCTTTTGGCTTCCCTGTAG;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=57750358;WS=57750340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	57753456	rs702723	C	T	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=566;SC=TATTCCACTACTTAAACTTGG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=57753464;WS=57753446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	57754005	rs1848510	G	A	8722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=138;NR=127;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.247;SC=TTCCCTAGACGATAAACAAAA;SOR=0.768;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=269;TCF=140;TCR=129;TR=265;WE=57754013;WS=57753995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,276:0.99:280
chr5	57754132	rs697134	G	C	6385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=127;PP=2965;SC=TTGCAGACACGAGATCCCAAT;SOR=1.685;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=181;TCF=54;TCR=127;TR=181;WE=57754140;WS=57754122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr5	57754808	rs697133	G	A	6930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=107;PP=2965;SC=AGAGTCATACGCACCTTTTCC;SOR=0.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=219;TCF=111;TCR=108;TR=218;WE=57754816;WS=57754798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr5	57755703	rs3211270	C	T	1544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=35;PP=1257;SC=TCTTCGAGTCCGCTCCGCAAC;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=13;TCR=35;TR=48;WE=57755711;WS=57755693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr5	57825920	rs10461441	A	G	1626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=6;PP=1297;SC=GACAAAAACCACAATTACTTT;SOR=4.103;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=51;TCR=6;TR=57;WE=57825928;WS=57825910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	58120753	rs11384049	G	GT	631.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=0;PP=410;SC=TGGACATCGTGTTTTTTTTTT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=20;WE=58120761;WS=58120743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	58270457	rs10718401	TA	T	2824.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.200;NF=80;NR=24;PP=1774;ReadPosRankSum=0.422;SC=TTTTTCTACTTAAAAAAAAAA;SOR=1.461;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=128;TCF=94;TCR=34;TR=104;WE=58270467;WS=58270447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,125:0.99:126
chr5	58271696	rs10051847	C	T	2880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=49;PP=1608;SC=TCTCTATTCACTCCTGTTCCT;SOR=2.115;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=19;TCR=49;TR=68;WE=58271704;WS=58271686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr5	58271713	rs10061206	T	A	2637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=39;PP=1133;SC=TCCTTTTTTTTAAAAAAAAAA;SOR=2.670;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=54;TCF=11;TCR=43;TR=50;WE=58271733;WS=58271703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	58271725	rs372313800	C	CAA	2169.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.43;QD=43.39;SOR=3.171;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	58272116	rs3763084	G	A	5543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=129;NR=36;PP=2965;SC=AGCTGAACACGCAGACATGTG;SOR=2.544;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=129;TCR=36;TR=165;WE=58272124;WS=58272106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr5	58272361	rs3763083	C	T	1127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=34;PP=960;SC=GAAAATATTACGCAGAATATA;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=58272369;WS=58272351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	58284208	rs3805557	C	T	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=242;SC=CACATATATACACATCTCAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=58284216;WS=58284198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	58284283	rs3805556	G	A	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=4;PP=846;SC=AAATGTACAAGGGAAAAATGT;SOR=2.694;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=58284291;WS=58284273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	58286625	rs1553114	C	T	5996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=135;NR=52;PP=2965;SC=AACTCAACCACCTTACCTGAA;SOR=1.969;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=188;TCF=136;TCR=52;TR=187;WE=58286633;WS=58286615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr5	58286737	.	GA	G	136.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.000;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=5.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=2.082;QD=1.22;ReadPosRankSum=-1.130;SOR=0.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,24:0.21:112
chr5	58286836	rs1973451	A	G	1314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=37;PP=1062;SC=GGCCGGGCATAGAGGCTCAAG;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=37;WE=58286844;WS=58286826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr5	58287554	rs148212719	AAC	A	1458.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.91;QD=37.40;SOR=7.378;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr5	58289046	rs7737685	G	T	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=0;PP=642;SC=CTCAGAGGCGGATAGTGTCGA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=58289054;WS=58289036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	58289334	rs7724713	A	G	918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=27;PP=781;SC=GAAGAGGAAAATTTAAGTGAA;SOR=6.736;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=58289342;WS=58289324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	58297881	rs2968014	A	G	4635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=115;PP=2965;SC=CTTTCAGTTTATTCCTTACCA;SOR=2.649;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=31;TCR=115;TR=146;WE=58297889;WS=58297871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr5	58386812	rs10075104	G	A	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=330;SC=AGGGTGCTCAGAAATGCTGTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=58386820;WS=58386802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	58475985	rs9292194	G	C	115.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	58476117	rs9292195	T	C	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=10;PP=954;ReadPosRankSum=-0.743;SC=GAATGGGAAGTGACTTGAAAG;SOR=0.981;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=40;WE=58476125;WS=58476107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr5	58489218	rs1445950	G	A	2063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=0;PP=1644;SC=ATTTGTATTTGTACTTGTGCT;SOR=8.318;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=59;TCR=0;TR=58;WE=58489226;WS=58489208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr5	58489384	rs27175	G	A	5846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=126;PP=2965;SC=ACCAAATCCCGCATTAGAAAT;SOR=2.026;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=51;TCR=126;TR=177;WE=58489392;WS=58489374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr5	58511506	rs72765914	T	G	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=0;PP=708;SC=TGGAGGAGAGTGATACAGTTG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=58511514;WS=58511496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	59443691	rs115935732	C	T	962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=17;PP=742;SC=CAGCTAGCTGCCTCCAGAGTG;SOR=1.044;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=13;TCR=17;TR=30;WE=59443699;WS=59443681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	60063576	rs1460958	G	A	1648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=0;PP=1438;SC=CTAAGTTTACGTTCAGTGTTA;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=48;WE=60063584;WS=60063566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr5	60199363	rs4647102	C	T	592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=9;PP=462;SC=TCTCAACAACCAGCACAAAGT;SOR=0.990;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=21;WE=60199371;WS=60199353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	60241142	rs158921	G	A	1745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=7;PP=1384;SC=GGGAAGTGAAGGAGCACGTGG;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=51;WE=60241150;WS=60241132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	60241268	rs158920	G	A	4316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=77;PP=2965;SC=CAGTAAAGGAGGGAAAAGTGA;SOR=1.105;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=55;TCR=77;TR=132;WE=60241276;WS=60241258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr5	60369083	rs10471502	A	G	2789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=53;PP=2085;SC=GAGGTAAGTTATATAACAGTA;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=35;TCR=53;TR=88;WE=60369091;WS=60369073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr5	60369154	rs34070675	TG	T	1564.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.335;NF=0;NR=36;PP=1511;ReadPosRankSum=0.248;SC=AAAGTTTTAGTGTCTGAATGT;SOR=4.664;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=36;WE=60369162;WS=60369144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr5	60448903	rs33927273	T	TAA	1050.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=22;PP=1028;SC=CTATTAATCTTGAGTTCATTT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=22;WE=60448911;WS=60448893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	60628153	.	G	GGGC	858.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.26;QD=40.89;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	60628826	.	T	G	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=24.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.32;ReadPosRankSum=1.039;SOR=4.797;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr5	60786880	rs7732234	C	T	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=501;SC=AGGGTCTTAGCTGACCAATAG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=60786888;WS=60786870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	60789973	.	GGA	G	198	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=198;QD=69.0;SC=ACACACACACGGAGAGAGAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=3;WE=60789982;WS=60789963;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,3:0.38:8
chr5	60790037	rs77230862	T	C	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.49;ReadPosRankSum=0.000;SOR=2.226;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr5	60939074	rs76448215	G	A	367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=2;PP=262;SC=AGTGTGTGACGTCTCCCTCTT;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=60939082;WS=60939064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	60982107	rs36025054	CT	C	779.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=10.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.13;ReadPosRankSum=-0.856;SOR=6.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,40:0.93:43
chr5	61604204	rs4700006	C	A	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=203;SC=TCTGGGTGCACAGCAACACCT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=61604212;WS=61604200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	61604456	rs4441833	T	C	580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=462;SC=TACCACAACATAGATGGACCT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=61604464;WS=61604446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	61733348	rs153857	G	A	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=480;SC=AATAGATTCAGATGTTTGGCT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=61733356;WS=61733338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	61745737	rs11329383	CT	C	2774.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.15;MQRankSum=0.236;NF=76;NR=25;PP=1554;ReadPosRankSum=0.118;SC=ATAATCAATACTTTTTTTTTT;SOR=0.834;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=141;TCF=98;TCR=43;TR=101;WE=61745746;WS=61745727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,118:0.98:120
chr5	61762880	rs35119	A	G	1056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=1;PP=882;ReadPosRankSum=1.681;SC=TAAAACTAAAATATATTACTT;SOR=4.112;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=30;WE=61762888;WS=61762870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr5	61772535	rs26635	G	T	2174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=30;PP=1704;ReadPosRankSum=-0.666;SC=CAGATAATGTGTGTAGAGATA;SOR=0.330;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=39;TCR=30;TR=68;WE=61772543;WS=61772525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr5	61781127	rs26640	C	A	145.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=0;PP=115;SC=GTTCCCAAGGCTTTGCTCTTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=61781135;WS=61781117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	61785936	rs26644	T	C	854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=682;ReadPosRankSum=-0.570;SC=TAAATTTTCTTCTCAGTGTAT;SOR=0.392;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=30;TCF=18;TCR=12;TR=29;WE=61785944;WS=61785926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr5	61826663	rs32179	G	T	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=11;PP=474;SC=AACCATAATTGGGAGGCATTG;SOR=1.127;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=18;WE=61826671;WS=61826653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	61857118	.	C	CGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGT	1284.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.44;SOR=6.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	61857121	.	G	T	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=107.28;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1:1.00:1
chr5	61874619	.	TA	T	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.233;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=12.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-1.509;QD=2.02;ReadPosRankSum=2.029;SOR=3.043;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr5	62073118	rs1845526	G	C	4083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=71;PP=2965;SC=CCCGGTGCCTGGGGCCGGAGG;SOR=0.910;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=134;TCF=62;TCR=72;TR=133;WE=62073126;WS=62073108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr5	63665293	rs56066106	TA	T	137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.68;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	63665335	rs28615727	G	A	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=609;SC=ACATAACTCCGCTCAGTGAAA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=63665343;WS=63665325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	63890387	rs4700641	C	T	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=81;SC=CATGTATATACCTAATTATTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=63890395;WS=63890377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	63890807	rs11750387	G	T	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=172;SC=GTATGCCAGAGGAGCATAGTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=63890815;WS=63890797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	63905068	rs889248	A	G	4646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=48;PP=2965;SC=GTGTTGTCTCATCTCAAGCTA;SOR=1.795;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=106;TCR=48;TR=154;WE=63905076;WS=63905058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr5	64103714	rs1870437	C	T	1365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=34;PP=1049;SC=ATTTTATTTCCTGTCCCTACC;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=64103722;WS=64103704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	64273018	rs1309581	G	A	7023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=149;NR=73;PP=2965;SC=TTGCTGAAACGCCTGAAAATG;SOR=1.599;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=222;TCF=149;TCR=73;TR=222;WE=64273026;WS=64273008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr5	64313879	rs2910769	G	A	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=717;SC=AACCCATCTTGGTGTTCTGTA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=64313887;WS=64313869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	64556640	rs10940023	T	C	407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=375;SC=ATGCTGGTGATTGTTAGCAAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=64556648;WS=64556630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	64558745	.	C	G	2037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.749;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=15;PP=1548;ReadPosRankSum=1.382;SC=CATCTATGCTCTGGGGCCAAG;SOR=1.236;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=48;TCR=15;TR=62;WE=64558753;WS=64558735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr5	64569405	rs1423424	T	A	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=19;PP=538;SC=AGCATCGCAGTTGAGGATTTT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=64569413;WS=64569395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	64569420	rs1423425	G	T	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=399;SC=GATTTTGGAGGAGGTTTTTAT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=64569428;WS=64569410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	64747918	rs3830368	T	TG	3621.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=4;PP=2936;SC=CTCTATAGCCTTCTGTTAACA;SOR=4.953;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=80;TCR=4;TR=82;WE=64747926;WS=64747908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	64857424	rs10560318	AACAC	A	2404.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=48;PP=2559;SC=GTTTAATTAAAACACACACAC;SOR=6.630;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=1;TCR=64;TR=48;WE=64857435;WS=64857414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	64859592	rs261252	T	A	6135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=143;NR=39;PP=2965;SC=CATTTTCCTATTCTTATGTGT;SOR=2.553;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=182;TCF=143;TCR=39;TR=182;WE=64859600;WS=64859582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr5	64859884	rs35326591	CTG	C	809.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=829;SC=AACCCGAAGTCTGTGGTTTTG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=17;WE=64859893;WS=64859874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	64863484	rs35529383	T	TA	294.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5339;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.668;NF=0;NR=13;PP=149;ReadPosRankSum=0.587;SC=TGAGTTTATTTAAAAAAAAAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=13;WE=64863492;WS=64863474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr5	64864657	rs152063	A	C	259.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=182;SC=GTCTCAAGTTATCAGTGTGGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=64864665;WS=64864647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	64865346	rs149512	A	T	224.41	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=321;ReadPosRankSum=0.436;SC=GGTTTTTTTTAAAAAAAAACC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=13;WE=64865354;WS=64865336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr5	64865405	rs149208	A	G	1635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=3;PP=1306;SC=TGGGAATACTAAGTGATTCAT;SOR=4.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=42;TCR=3;TR=45;WE=64865413;WS=64865395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	64880705	rs10682457	G	GAA	384.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=9;NR=0;PP=208;SC=TAGAGATTATGAAAAAAAAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=9;WE=64880713;WS=64880695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	64881936	rs27141	A	G	3138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=66;PP=2471;SC=ATGACAGGCCATACACACTCA;SOR=1.336;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=38;TCR=66;TR=104;WE=64881944;WS=64881926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr5	64886374	rs3836739	TA	T	148.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=109;SC=ATCAGAACATTAAAAAAAAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=64886382;WS=64886364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	64887472	rs10644434	T	TTATA,TTA	619.92	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=17,17;NR=0,0;PP=475,200;ReadPosRankSum=-0.850;SC=CAAGATTCCTTTATATATATA;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=17,17;WE=64887480;WS=64887462;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.80:20
chr5	64890479	rs36135	A	C	2523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=76;PP=2786;SC=ACAGCTACCCAAAAAAAAATA;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=28;TCR=77;TR=104;WE=64890487;WS=64890469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr5	64906617	rs37330	T	A	2241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=0;PP=1875;SC=TGCCCATTAATTACTTAGTAG;SOR=8.410;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=64;TCR=0;TR=64;WE=64906625;WS=64906607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	64919991	rs154854	G	A	5830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=140;NR=36;PP=2965;SC=GAGGCCGATGGTGGAGAATAG;SOR=2.683;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=143;TCR=37;TR=176;WE=64919999;WS=64919981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr5	64920803	rs37254	C	T	1678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=0;PP=1372;SC=TTTGGTTTTGCCAAACGCGAG;SOR=7.903;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=47;WE=64920811;WS=64920793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	64925256	rs43207	C	T	285.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=266;SC=GGCAGGGTATCCCTACCATAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=64925264;WS=64925252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	64933457	.	CA	C	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=5.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQRankSum=-1.115;QD=1.99;ReadPosRankSum=0.972;SOR=2.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr5	64942799	rs154955	A	G	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=2;PP=471;SC=TTATTCCCCTATTCTTTCCAC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=64942807;WS=64942789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	64946836	rs154853	G	T	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=12;PP=331;SC=ATTTTTGAATGTGTCATATGA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=64946844;WS=64946826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	64954159	rs28084	A	G	2465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=9;PP=1846;SC=TTTAAATGCCACCACACCTTG;SOR=3.937;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=72;TCR=9;TR=81;WE=64954167;WS=64954149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr5	64956428	rs37349	C	T	598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=19;NR=0;PP=531;SC=TTGGAGGGTACATCATCCAGT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=64956436;WS=64956424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	64957686	rs37347	A	G	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=0;PP=747;SC=CAGGTCTGCCAGGCTATTCCA;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=64957694;WS=64957676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	64957718	rs37346	T	C	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=1;PP=1255;SC=TGCAAAAGAATTTAAAATGAG;SOR=6.273;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=44;WE=64957726;WS=64957708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	64960311	rs36031543	A	ATCTC	2239.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=22;PP=1956;SC=ACTTAGACTCATCTCTCTCTC;SOR=1.345;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=59;TCF=15;TCR=44;TR=31;WE=64960319;WS=64960301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr5	64968170	rs5868414	AT	A	951.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=34;PP=691;SC=CTTAGCAAAGATTTTTTTTTT;SOR=4.461;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=47;TCF=4;TCR=43;TR=37;WE=64968178;WS=64968160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr5	65008946	rs3833969	GT	G	2066.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=74;PP=1432;SC=AAAGAAACAAGTTTTTTTTTT;SOR=7.452;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=97;TCF=2;TCR=95;TR=75;WE=65008954;WS=65008936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr5	65018126	rs2548786	C	G	285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=233;ReadPosRankSum=-0.688;SC=CCCGGGCGCCCAGGCGCTGCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=65018134;WS=65018116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr5	65018321	rs2548785	C	G	1611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=38;PP=1418;SC=CCCGGACCCACCCCTTCCCGA;SOR=1.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=53;WE=65018329;WS=65018311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	65073224	rs34979	C	A	5792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=133;NR=40;PP=2965;SC=CTGTTTCAACCGAAATGGTTT;SOR=2.412;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=133;TCR=40;TR=173;WE=65073232;WS=65073214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr5	65075858	rs252648	A	G	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=210;SC=TCACCATGTTAGCCAGGCTGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=65075866;WS=65075848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	65088175	rs6896574	G	A	1308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=8;PP=1036;SC=AATGTTTAAAGGCATCTCTGG;SOR=2.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=37;WE=65088183;WS=65088165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	65105622	rs2561196	G	A	1449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=40;PP=1209;SC=TTCATTTTAAGTGGTATCCCA;SOR=4.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=43;WE=65105630;WS=65105612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	65108215	rs2254485	A	G	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=25;PP=786;SC=TAATGAATCCAGAGGTATAGT;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=65108223;WS=65108205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	65156435	rs74914131	G	T	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=1;PP=725;SC=TATGTTGTGGGCACTGAGGCC;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=65156443;WS=65156425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	65167288	rs76180983	G	T	3459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=23;PP=2604;SC=GGTGGATCTTGTTCCTTTTTG;SOR=1.893;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=73;TCR=23;TR=95;WE=65167296;WS=65167278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr5	65350374	rs36303	A	G	4628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=82;PP=2965;SC=CAATCCAGCGACAAAGTAGTG;SOR=1.139;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=54;TCR=82;TR=136;WE=65350382;WS=65350364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr5	65372793	rs34201831	C	CT	1041.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.19;MQRankSum=0.309;QD=24.23;ReadPosRankSum=-0.363;SOR=1.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr5	65455250	rs74658271	ATCT	A	1516.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.29;QD=38.89;SOR=5.084;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr5	66085489	rs1982329	A	G	2927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=31;PP=2196;SC=GGCCCATCACATCCATCTGCC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=69;TCR=31;TR=100;WE=66085497;WS=66085479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr5	66195701	rs458115	C	T	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=3;PP=580;SC=ATGATACATTCTACGTTATCC;SOR=2.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=22;WE=66195709;WS=66195691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	66212985	rs37567	C	G	2200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=56;PP=1815;SC=ATCTTATTACCCCTGGTCATT;SOR=2.932;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=13;TCR=56;TR=69;WE=66212993;WS=66212975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr5	66255326	rs2280174	A	G	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=466;SC=TCAGAGGAAAAGCATTGCTGC;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=66255334;WS=66255316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	66282428	.	T	TTATATA	381.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=38.17;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	66429329	rs2371882	G	T	4249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=37;PP=2965;SC=TTACATGTCCGTCTGCCTCAT;SOR=2.017;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=92;TCR=37;TR=129;WE=66429337;WS=66429319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr5	66459878	rs1705399	G	C	4244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=83;PP=2965;SC=TCGGATGGCCGGGTGCCTGCG;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=55;TCR=83;TR=138;WE=66459886;WS=66459868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr5	66461363	rs55882716	C	T	7352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=111;PP=2965;SC=GCCAAGGAACCTGAAAGGAAG;SOR=0.702;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=223;TCF=112;TCR=111;TR=223;WE=66461371;WS=66461353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr5	66462666	rs56206043	G	C	4147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=47;PP=2965;SC=CTCTCTCGGTGACTGCCACCG;SOR=1.161;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=76;TCR=47;TR=123;WE=66462674;WS=66462656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr5	66480004	rs1697144	T	C	10201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=163;NR=148;PP=2965;SC=CTTTGGAAGATCGTTGAATCA;SOR=0.744;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=311;TCF=163;TCR=148;TR=311;WE=66480012;WS=66479994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr5	66492412	rs5744463	C	G	4594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=96;PP=2965;SC=GAGGTGATGACTTTACAGCCG;SOR=1.470;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=49;TCR=96;TR=145;WE=66492420;WS=66492402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr5	67569391	rs2302974	A	C	3851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=98;PP=2965;SC=TTGTGCATTCATTAAGTAAAT;SOR=3.990;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=13;TCR=98;TR=111;WE=67569399;WS=67569381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr5	67569479	rs2302975	A	G	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=41;PP=1131;ReadPosRankSum=0.375;SC=AAAATGTCTCAGTCTATAATT;SOR=4.849;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=42;WE=67569487;WS=67569469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
chr5	67575344	rs16897620	A	G	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.29;SOR=6.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	67575642	rs3815701	A	G	1848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=53;PP=1577;SC=CATATATAGAAATAGTGGTTA;SOR=7.978;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=53;WE=67575650;WS=67575632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	67576330	.	CT	C	115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=-0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.63;MQRankSum=0.566;QD=8.27;ReadPosRankSum=-0.251;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr5	67584758	rs1862162	A	G	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=32;PP=944;SC=TGGGAAAGATAGGGTTTAGGT;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=67584766;WS=67584748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	67587994	rs3730087	C	T	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=0;PP=768;SC=GTTACTCTAACTTTTTATTTT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=67588002;WS=67587984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	68390284	rs337259	C	T	1053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=27;PP=836;SC=GCCCTCTCCCCCTGCCTGCCT;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=68390292;WS=68390274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	68396580	rs12522805	G	A	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=109;SC=CCAGATTGATGAGCTGCTTGT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=68396588;WS=68396570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	68400583	rs78986159	C	A	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=16;PP=453;SC=GTTTGTATTTCTTCATTTTGA;SOR=4.514;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=68400604;WS=68400573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	68400594	rs149336330	ATAT	A	550.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=586;SC=TTCATTTTGAATATTATTTTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=13;WE=68400604;WS=68400573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	68409094	rs164393	A	C	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=23;PP=624;SC=TCAAGTCTTGAGGAAAACTAG;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=38;WE=68409102;WS=68409084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	68411010	rs240809	C	T	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=0;PP=990;SC=TATTTAACGACTGACTGTTGA;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=39;WE=68411018;WS=68411000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	68412048	rs34215592	A	AT	1668.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=42;PP=1843;SC=TTGTGTAAGCATTCCCCCCTT;SOR=3.788;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=44;WE=68412056;WS=68412038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	68413042	rs3840519	CT	C	2711.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=13;PP=1626;SC=ATACTCCTCCCTTTTTTTTTG;SOR=3.589;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=100;TCF=79;TCR=21;TR=82;WE=68413050;WS=68413032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr5	68415932	rs164391	G	A	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=14;PP=663;SC=CTGTCCACCAGTGAAAAAAGT;SOR=0.826;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=27;WE=68415940;WS=68415922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	68417643	rs164578	C	T	2751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=65;PP=2204;SC=GCCATTCACACCATATGCATG;SOR=2.726;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=16;TCR=65;TR=81;WE=68417651;WS=68417633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr5	68417755	rs164577	A	G	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=15;PP=416;SC=CCTACTTTTCAACTGTGTTCT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=68417763;WS=68417745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	68419054	rs164572	A	T	3371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=73;NR=29;PP=2723;SC=TGGCAGATACACTTGGCAGCA;SOR=2.004;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=73;TCR=29;TR=102;WE=68419062;WS=68419044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr5	68470559	rs426392	T	C	1476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=54;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=0;PP=1254;SC=AGAAATAAACTGACTTTTTCA;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=43;WE=68470567;WS=68470549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	68470599	rs3087334	C	CATTA	3674.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=0;PP=2957;SC=GATATGGTGTCATTAAGATTT;SOR=8.714;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=79;TCF=79;TCR=0;TR=70;WE=68470607;WS=68470589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr5	68471247	rs1128761	G	A	5791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.704;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=64;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.704;SC=AACATACTTTGGCCAAATACC;SOR=0.289;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=178;TCF=114;TCR=64;TR=176;WE=68471255;WS=68471237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,184:0.99:186
chr5	68473305	rs3087333	A	AT	2913.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.226;NF=67;NR=21;PP=2198;ReadPosRankSum=-1.397;SC=GCATCTTGTGATTTTTTTTCT;SOR=0.429;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=106;TCF=78;TCR=28;TR=88;WE=68473313;WS=68473295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,104:0.97:107
chr5	68490596	.	G	C	397.56	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=333;ReadPosRankSum=-0.689;SC=TTTGTTGTTAGATGGAGTCTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=68490604;WS=68490586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr5	68491410	.	G	A	25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=25;QD=29.8856062736;SC=ATACACATTGGTATATTGAGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=68491418;WS=68491400;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr5	68522298	rs12189395	A	G	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=19;PP=544;SC=GTATTTTATTATAGGCAATAT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=68522306;WS=68522288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	68531099	rs72767837	G	A	838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.173;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=709;ReadPosRankSum=0.984;SC=GACCCGCCACGTTTCCAGCCG;SOR=2.402;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=26;WE=68531107;WS=68531089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr5	68531253	rs2972388	C	T	1593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=26;PP=1276;SC=GAGATAAGAACACCAACCAAA;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=26;TCR=26;TR=52;WE=68531261;WS=68531243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	68551507	rs2291519	T	G	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=38;PP=1568;SC=AAAGGATCTCTAGTTATTTTC;SOR=1.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=59;WE=68551515;WS=68551497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr5	68564985	rs59967147	TA	T	1219.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.18;QD=23.01;SOR=7.978;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	68572668	rs4077460	C	T	768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=653;ReadPosRankSum=1.681;SC=GAGACTGTGCCGTTTTAGGTA;SOR=0.382;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=24;WE=68572676;WS=68572658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,24:0.96:25
chr5	68596068	rs28704183	C	G	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=22;PP=633;SC=CTACCCACAACATCGGGCTCC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=68596076;WS=68596058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	68599932	.	ATT	A	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.35;ReadPosRankSum=0.524;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr5	68602746	rs6881767	G	C	1126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=19;PP=830;SC=AAAGAAAATAGTACCTTCATG;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=14;TCR=19;TR=33;WE=68602754;WS=68602736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	68609885	rs11749723	G	T	1518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=37;PP=1171;ReadPosRankSum=-0.599;SC=TTGGGAGGGAGGAGAAAAGAA;SOR=1.460;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=47;TCF=8;TCR=39;TR=45;WE=68609893;WS=68609875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr5	68610009	rs28462372	A	C	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=263;SC=TTATAATAGAACACCAGGTGC;SOR=3.258;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=68610017;WS=68609999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	68667263	rs138054935	TCCC	T	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.57;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=15;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=0;PP=54;SC=GAGGGCTTCTTCCCCCCCCCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=68667282;WS=68667253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	68667274	.	C	A	142.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.57;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=14;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=0;PP=22;SC=CCCCCCCCCCCCCCCAGGTGA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=68667282;WS=68667253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	68688608	rs299080	T	C	2028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=43;PP=1572;SC=TGAATGGAATTCGTATTCTTT;SOR=2.419;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=11;TCR=43;TR=54;WE=68688616;WS=68688598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	68692375	rs34097088	T	TA	314.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=5.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=-1.104;QD=10.15;ReadPosRankSum=-0.285;SOR=0.135;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr5	68696035	rs142095225	G	GTTTATTTA	251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=4;PP=407;SC=AAGAAGTAGGGTTTATTTATT;SOR=1.609;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=6;WE=68696043;WS=68696025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	68706252	rs10940223	G	T	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=279;SC=CATCTTTTCAGGTGCTTATTG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=68706260;WS=68706242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	68706438	rs6871685	G	A	1709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=40;PP=1272;SC=AATATGTTCAGTATGAATCAA;SOR=2.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=11;TCR=40;TR=51;WE=68706446;WS=68706428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	68715310	rs1185246	C	T	11710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=203;NR=163;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.966;SC=ACCCACCCAACTCTTCATGAC;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=369;TCF=204;TCR=165;TR=366;WE=68715318;WS=68715300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,382:0.99:384
chr5	70307464	rs4976210	T	C	5454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=130;NR=32;PP=2965;SC=GCTCTTTGAGTTCTCAGGGTC;SOR=2.556;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=162;TCF=130;TCR=32;TR=162;WE=70307472;WS=70307454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr5	70308251	rs28409706	C	T	8907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=132;NR=135;PP=2965;SC=TCCTGAAGGACGCAAGTCTAG;SOR=0.707;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=267;TCF=132;TCR=135;TR=267;WE=70308270;WS=70308241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr5	70308262	rs61757629	C	T	3245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.628;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=65;PP=2486;ReadPosRankSum=-0.371;SC=GCAAGTCTAGCCTCCTCTTCT;SOR=0.542;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=266;TCF=120;TCR=146;TR=124;WE=70308270;WS=70308241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,128:0.46:277
chr5	70357191	.	A	G	3259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.000;DP=320;ExcessHet=3.0103;FS=4.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.01;MQRankSum=-0.924;QD=10.19;ReadPosRankSum=0.828;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:181,139:0.43:320
chr5	70751818	rs3748043	T	G	3581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=53;PP=2840;SC=GGCCGCCGGATCCTGCCACGG;SOR=0.711;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=109;TCF=55;TCR=54;TR=108;WE=70751826;WS=70751808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr5	70759757	rs76232631	C	T	251.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=207;SC=ATTGTACTGTCATTAACGAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=70759765;WS=70759747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	70763088	rs7442961	A	G	369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=306;SC=TATGATTGCCATGCTAAACCT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=70763096;WS=70763078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	70786726	rs35267960	G	GAC	1069.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=1123;SC=TGTAGGAAAAGAGTGTTATAG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=70786734;WS=70786716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	70800538	rs3761967	G	A	3267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=48;PP=2535;SC=TTTTCAAAATGTGCAGCCAGA;SOR=0.751;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=53;TCR=48;TR=100;WE=70800546;WS=70800528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr5	70805277	rs66954493	C	T	994.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=0;PP=1358;ReadPosRankSum=-1.313;SC=TGTGTGCCCCCTTTTTTTTTT;SOR=5.838;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=45;WE=70805285;WS=70805267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr5	70806457	rs715748	G	A	14216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=437;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=188;NR=232;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.797;SC=TGGAAGAGAGGGTTCCTCAAG;SOR=0.593;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=422;TCF=190;TCR=232;TR=420;WE=70806465;WS=70806447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,432:1.00:433
chr5	70806649	rs1961760	T	A	7309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=81;NR=136;PP=2965;SC=GCTAGCAGAGTTCAGTGCTAT;SOR=1.364;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=218;TCF=81;TCR=137;TR=217;WE=70806657;WS=70806639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr5	70806711	rs715747	C	G	6207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=85;NR=94;PP=2965;SC=ACATTCCCATCATGGAGAAAG;SOR=0.867;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=85;TCR=94;TR=179;WE=70806719;WS=70806701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr5	70806958	rs6886336	G	A	6673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=151;PP=2965;SC=CTTCAGTGCTGTGCCTTCACT;SOR=2.071;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=56;TCR=151;TR=207;WE=70806966;WS=70806948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr5	70807991	rs418738	G	A	219.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=210;SC=TTAGAATTTAGTAGACTTTTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=70807999;WS=70807981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	70809169	rs1698063	A	G	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=331;SC=ATCAGAAACCAAGAAAATGGA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=70809177;WS=70809159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	70818329	rs34331239	C	CA	604.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=3.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=-0.997;QD=6.79;ReadPosRankSum=0.275;SOR=0.221;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,45:0.51:89
chr5	70820212	rs114503830	T	C	2454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=69;PP=2118;SC=CTTGTTTCTTTTAGGGGATCA;SOR=7.140;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=70;TCF=1;TCR=69;TR=70;WE=70820220;WS=70820202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr5	70834703	rs276591	A	C	219.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=180;SC=TAAATTGTTTATGTTCTTGCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=70834711;WS=70834693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	70834833	rs276590	G	A	1327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=11;PP=1047;SC=GTTTGGGGAAGTATTTTAAGA;SOR=1.845;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=39;WE=70834841;WS=70834823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	70837295	rs6453014	A	C	399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=410;SC=AGTATGTATAATTCCTCATGT;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=70837303;WS=70837285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	70840233	rs182190	C	T	2715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=18;PP=2143;ReadPosRankSum=-0.726;SC=ATAAAAACCTCGGACCAGTTA;SOR=1.413;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=79;TCF=61;TCR=18;TR=78;WE=70840241;WS=70840223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,84:0.99:85
chr5	70840433	rs279290	A	G	1526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=42;PP=1227;SC=CTGGCCGGGCACGGTGGCTCA;SOR=4.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=46;WE=70840441;WS=70840423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	70845400	rs59354595	A	G	8473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=137;NR=117;PP=2965;ReadPosRankSum=0.235;SC=ATATTGGTCAAATCAGTGAAT;SOR=0.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=257;TCF=139;TCR=118;TR=254;WE=70845408;WS=70845390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,263:1.00:264
chr5	70849021	rs469039	G	T	992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=13;PP=706;SC=CTAAAAAGCCGCCTGATAATT;SOR=0.880;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=15;TCR=13;TR=28;WE=70849029;WS=70849011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	70852611	rs467620	G	A	289.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=240;SC=AGCTTTTTGGGAGATAACATA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=70852619;WS=70852601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	70860493	rs277944	T	C	114.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.51;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	70862059	rs185733	C	T	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=176;SC=CTCCTTTATACACCCACAGAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=70862067;WS=70862049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	70922616	rs12516456	G	A	1777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=39;PP=1380;SC=TGGAAATTAAGTATGCAGAAC;SOR=1.532;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=59;WE=70922624;WS=70922606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	70922712	rs77085070	C	T	419.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=351;ReadPosRankSum=1.958;SC=CTGTTGTAACCGTTTTTCAGT;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=14;WE=70922720;WS=70922702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr5	70931178	rs114421004	A	G	1287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=39;PP=1108;SC=ATGCCTAGAAATAGATGTGGA;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=40;WE=70931186;WS=70931168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	70932170	rs7444232	G	T	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=11;PP=312;SC=ATTTTTAAATGAGGTTTTTAG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=70932178;WS=70932160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	70945075	rs10064079	A	G	4254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=72;PP=2965;SC=GTGGCAGAGCATATAGGTAGG;SOR=0.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=72;TCR=72;TR=144;WE=70945083;WS=70945065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr5	70948385	rs6888301	T	G	1339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=5;PP=1041;SC=ATGCACATGTTAGATGTAACA;SOR=3.664;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=39;WE=70948393;WS=70948375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	70948654	rs2242372	G	A	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=15;PP=438;SC=ACAGAGCTCTGTGTAGTTGAG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=70948662;WS=70948644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	71403306	rs3112402	T	A	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=0;PP=677;SC=CCTGCCGCAGTGGAGAGGAGC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=71403314;WS=71403296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	71411718	rs1531312	T	C	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=22;PP=669;SC=AAAGACTCTCTTATTGCTAAA;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=71411726;WS=71411708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	71412373	rs1466343	A	G	3558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=90;PP=2961;SC=CTGGCGCTGGAGATGTATTCA;SOR=2.896;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=21;TCR=91;TR=111;WE=71412381;WS=71412363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr5	71465361	rs3112399	T	A	1433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=13;PP=1116;SC=TGATGTTAAATCCCATTCAGA;SOR=1.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=47;WE=71465369;WS=71465351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	71489082	rs34485863	G	GT	3738.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.191;NF=28;NR=76;PP=2974;ReadPosRankSum=1.137;SC=ACCCACCAAGGTTTTTTCTTT;SOR=0.507;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=124;TCF=33;TCR=91;TR=104;WE=71489090;WS=71489072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,124:0.99:125
chr5	71489169	rs67199223	CT	C	170.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=21.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=-0.502;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.501;SOR=4.396;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr5	71490962	rs1866374	A	G	5670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=112;PP=2965;SC=AGACAAGCCAATAAAAACAGA;SOR=1.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=217;TCF=105;TCR=112;TR=217;WE=71490970;WS=71490952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr5	71492734	rs7716079	C	T	10680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=204;NR=116;PP=2965;ReadPosRankSum=1.831;SC=CACCGCTCAACGGATTTTCTG;SOR=0.536;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=322;TCF=206;TCR=116;TR=320;WE=71492742;WS=71492724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,339:1.00:340
chr5	71494906	rs61734262	G	A	3177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.713;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=29;PP=2507;ReadPosRankSum=-1.031;SC=ACTATGAGAAGATAGAGAGAA;SOR=1.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=64;TCR=30;TR=92;WE=71494914;WS=71494896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,99:0.98:101
chr5	71522125	rs9293821	A	T	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=442;SC=ACCTGGCAGCACTAGAAATAG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=71522133;WS=71522115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	71618276	rs3749694	C	A	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=196;SC=GCTACAACGTCTACAGCTCTC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=71618284;WS=71618266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	72112421	rs34648	T	C	1897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.13;SOR=3.417;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	72112430	rs34647	C	G	2063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.12;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr5	72147269	rs34655	A	G	2442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=60;PP=2028;SC=GATGTGGGATAAACAGTCTTA;SOR=2.774;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=13;TCR=60;TR=73;WE=72147277;WS=72147259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr5	72151858	rs34660	T	A	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=22;PP=599;SC=TTAAATTGTGTTGGGGAAACT;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=72151866;WS=72151848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	72174432	rs266435	C	G	2388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=54;PP=1754;SC=TGTATTTGGACGGTAAGGTTA;SOR=1.996;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=21;TCR=55;TR=75;WE=72174440;WS=72174422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr5	72174553	rs266436	G	A	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=273;SC=ACTTTGTAATGCCACTTTAAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=72174561;WS=72174543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	72182743	rs4235663	A	G	79.89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQRankSum=0.967;QD=13.32;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr5	72182857	rs4704045	A	G	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=4;SC=ATAAGTAATAAGAGGTTAATG;SOR=2.419;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=19;WE=72182865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	72184098	rs17606	C	T	3604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=51;PP=2841;SC=GCATCCTGGACAGCAACAAGA;SOR=0.914;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=62;TCR=51;TR=113;WE=72184106;WS=72184088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr5	72364673	rs470926	A	G	1753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.89;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	72419267	rs638333	T	C	2597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=19;PP=2016;SC=CAAACTCATCTTCTGCTTCTT;SOR=2.140;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=61;TCR=19;TR=80;WE=72419275;WS=72419257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr5	72419410	rs7731777	A	G	3977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=54;PP=2965;SC=CCGTGGTTGGACTTGGGGCTG;SOR=0.831;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=67;TCR=54;TR=121;WE=72419418;WS=72419400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr5	72742882	rs2972191	T	C	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.097;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=31;PP=796;ReadPosRankSum=1.799;SC=ACGAGGAGACTGAGGAGGCGG;SOR=2.908;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=38;WE=72742890;WS=72742872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr5	72743299	.	G	GGC	357.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.65;QD=39.75;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	72798502	rs200370518	GTT	G	3028.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQ=60.24;NF=8;NR=67;PP=1197;SC=TAAATGGGTTGTTTTTTTTTT;SOR=2.494;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=107;TCF=12;TCR=95;TR=75;WE=72798512;WS=72798490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr5	72800408	rs703882	G	C	1916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=64;PP=1550;SC=GACTTGACTTGGCTTGTTTCT;SOR=8.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=0;TCR=64;TR=64;WE=72800416;WS=72800398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr5	72800863	rs59856963	C	CT	313.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.98;MQRankSum=1.322;QD=11.62;ReadPosRankSum=-1.985;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr5	73069581	rs4704097	A	G	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=280;SC=CAACTCTGACATTCTTATTAT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=73069589;WS=73069571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	73076511	rs6453022	C	A	1562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=30;PP=1218;SC=GCCTTTGAGCCAGAAGCCAGG;SOR=1.390;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=48;WE=73076519;WS=73076501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	73144845	rs2973568	A	G	3066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=42;PP=2248;SC=ATTCTTGCTCATCACCCAAAA;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=96;TCF=53;TCR=43;TR=95;WE=73144853;WS=73144835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr5	73145019	rs7724638	A	G	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=24;PP=635;SC=AGAATTTTCCATTCTGTTTTC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=24;WE=73145027;WS=73145009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	73153405	.	CACACACAT	C	46.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.71;MQRankSum=0.355;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.624;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr5	73153407	.	CACACAT	C	328.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-3.151;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.71;MQRankSum=-0.213;QD=19.34;ReadPosRankSum=-0.510;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr5	73160730	rs1014550	G	A	4491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=100;PP=2965;SC=ATATATATGTGGCATGGTTGC;SOR=2.110;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=139;TCF=38;TCR=101;TR=138;WE=73160738;WS=73160720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr5	73163861	rs2931422	C	T	2431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=42;PP=2040;SC=GCTGAGTGTGCTTTTACATAT;SOR=1.134;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=31;TCR=42;TR=73;WE=73163869;WS=73163851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr5	73178550	rs2973528	T	G	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=459;SC=GGAGGTGGAATGTTTGTGACA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=73178558;WS=73178540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	73189145	rs2973529	G	A	1999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=39;PP=1386;SC=CTCCCTGGTCGTGGTGTTCTC;SOR=1.574;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=17;TCR=39;TR=56;WE=73189153;WS=73189135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	73190119	rs2973530	T	A	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=488;SC=CTTGGAGGTCTTACTGCTTGC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=73190127;WS=73190109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	73197200	rs384927	G	A	3065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=71;PP=2479;SC=AGTCAGTGGGGCAAAGGTGCT;SOR=1.945;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=26;TCR=71;TR=97;WE=73197208;WS=73197190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr5	73197299	rs72772600	A	C	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=742;SC=TGCCTGTGTCATGTAGGTGTA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=73197307;WS=73197289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	73207372	rs1478453	T	A	3007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=60;PP=2240;SC=TTCCTTTCCATGAAAGCAGCA;SOR=1.686;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=26;TCR=60;TR=86;WE=73207380;WS=73207362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr5	73339114	rs285599	C	T	6150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=132;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.191;SC=AAGTGATCTACATCCTTGGTC;SOR=0.679;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=198;TCF=65;TCR=133;TR=197;WE=73339122;WS=73339104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,203:1.00:204
chr5	73930442	rs300240	C	T	609.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=517;ReadPosRankSum=0.090;SC=CAGATCTCACCCCATGTACTG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=19;WE=73930450;WS=73930432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr5	73930751	rs300239	C	T	5304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=67;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.699;SC=CATCTCCCACCTTGGTCCACT;SOR=0.333;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=93;TCR=68;TR=159;WE=73930759;WS=73930741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,165:0.99:166
chr5	73931246	rs442425	T	C	6550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.981;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=119;PP=2965;ReadPosRankSum=0.166;SC=AGACATCTTTTGAGACCCCAT;SOR=0.152;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=220;TCF=99;TCR=121;TR=217;WE=73931254;WS=73931236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,224:0.99:226
chr5	73932315	rs9176	T	C	1654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=36;PP=1254;SC=TGACATTTTGTTTCCACTCCT;SOR=2.540;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=45;WE=73932323;WS=73932305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	73981270	rs820878	T	C	9469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=181;NR=137;PP=2965;SC=CTGCCGCTCTTGGTGAAGATG;SOR=1.033;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=320;TCF=182;TCR=138;TR=318;WE=73981278;WS=73981260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,317:1.00:317
chr5	73992406	rs1696979	T	G	198.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=0;PP=130;SC=GGTATAACACTATATTCAATT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=73992414;WS=73992396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	73992609	rs1665894	G	A	1805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=29;PP=1509;SC=TAGACAAATTGCTAATAGAAA;SOR=0.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=30;TCR=30;TR=58;WE=73992617;WS=73992599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr5	74028752	rs67360841	GACAC	G,GAC	313.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.98;QD=26.14;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,6,6:0.50,0.50:12
chr5	74414091	.	T	C	1616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.625;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=26;PP=1225;ReadPosRankSum=-0.878;SC=TTGATTAGGGTTTGCTCCATT;SOR=0.726;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=48;TCF=22;TCR=26;TR=47;WE=74414099;WS=74414081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,52:0.98:53
chr5	75427518	rs1423099	C	T	1648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=1;PP=1357;ReadPosRankSum=-0.876;SC=AGAGCTGAACCACTGAAAGGA;SOR=5.058;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=48;WE=75427526;WS=75427508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr5	75427935	rs10070440	G	A	6277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=95;PP=2965;ReadPosRankSum=0.022;SC=ACAAGGACCGGCGGGAGCTGG;SOR=0.399;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=201;TCF=105;TCR=96;TR=198;WE=75427943;WS=75427925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,201:0.99:204
chr5	75470086	rs10805899	T	C	1564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=-0.681;NF=0;NR=58;PP=1296;ReadPosRankSum=-0.799;SC=CGTCGCCCCGTGCTCCCCGCG;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=0;TCR=59;TR=58;WE=75470094;WS=75470076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,59:0.98:60
chr5	75591710	rs2270927	C	G	2160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=59;PP=1728;SC=GCAAATTTCACTATTAACTTT;SOR=4.143;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=6;TCR=59;TR=65;WE=75591718;WS=75591700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	75594743	rs31244	G	A	1455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=37;PP=1146;SC=CACTGTTTTTGACAACACAGG;SOR=2.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=45;WE=75594751;WS=75594733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	75597494	rs246816	A	G	147.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=117;SC=AGTACTTTGGAAGGCCAAGGT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=75597502;WS=75597484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	75648938	rs142457579	TA	T	809.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.206;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.417;NF=7;NR=28;PP=674;ReadPosRankSum=0.948;SC=GCTAATTTTTTAATTTTTTTT;SOR=1.547;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=35;WE=75648948;WS=75648928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,36:0.90:40
chr5	75884734	rs1131232	G	A	2512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=32;PP=1840;SC=CTTTCAGTTTGTATCTGTTCA;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=51;TCR=32;TR=83;WE=75884742;WS=75884724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr5	75886168	rs2270907	A	G	1117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=0;PP=935;SC=CACAGGGTCAATGCAACTGTC;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=75886176;WS=75886158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	75888788	rs3736394	G	A	1293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=27;PP=1065;SC=TGATATTTCCGTAAGATACAG;SOR=1.055;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=18;TCR=27;TR=45;WE=75888796;WS=75888778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	75904811	rs3822529	C	G	1076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=0;PP=891;SC=AGCAATCTTTCTTCAAATAGG;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=75904819;WS=75904801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	75923294	rs2431352	T	G	4666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=64;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.848;SC=CCGTCGATGATGCCAACGTGG;SOR=0.258;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=141;TCF=77;TCR=64;TR=139;WE=75923315;WS=75923284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,144:0.99:145
chr5	75923307	rs2909888	A	G	4618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=71;PP=2965;SC=CAACGTGGACAAGGACAGAGC;SOR=0.762;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=75;TCR=71;TR=145;WE=75923315;WS=75923284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr5	75924469	rs3822541	G	T	6429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=141;NR=55;PP=2965;SC=GTTGTATCAGGTCAGAGAAGG;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=198;TCF=142;TCR=56;TR=196;WE=75924477;WS=75924459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr5	75927606	rs3797409	C	T	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=0;PP=999;SC=ATTCCTAAAACGTTGAATTAT;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=35;WE=75927614;WS=75927596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	75927954	rs3797412	A	G	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=31;PP=838;SC=TCAAATTAACATTTCTGTAAT;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=75927962;WS=75927944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	75936944	rs457821	G	A	2529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=68;PP=2062;SC=TGGATCACCTGCCACTGTTTA;SOR=2.833;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=85;TCF=16;TCR=69;TR=84;WE=75936952;WS=75936934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr5	75949844	rs457127	C	A	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=54;SC=CTTAAGAAACCTCAGTGAAAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=75949852;WS=75949834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	75950193	rs462307	A	G	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=241;SC=TTGAATGGTGAACATGAACAC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=75950201;WS=75950183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	75950222	rs3815774	T	G	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=4;PP=86;SC=TAATGGATCTTAGAACTTCAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=75950230;WS=75950212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	75950707	rs465731	G	A	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=6;PP=1362;SC=ATTCAAAAATGATGGAGTAGG;SOR=3.651;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=44;TCR=6;TR=50;WE=75950715;WS=75950697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	75950997	rs459846	G	A	1959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=55;PP=1607;SC=ACACAGAGGAGCACATGGTGA;SOR=5.926;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=57;TCF=2;TCR=55;TR=57;WE=75951005;WS=75950987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	75960818	rs11449450	T	TA	1087.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=976;SC=GTATGAGAATTAAAAAGGAGT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=25;WE=75960833;WS=75960808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	75960825	rs253092	G	C	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=0;PP=777;SC=AATTAAAAAGGAGTAATCTCA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=75960833;WS=75960808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	75960865	rs253093	T	C	1871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=3;PP=1594;SC=TAATTTCACATAGTAAAAAGC;SOR=5.247;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=54;TCR=3;TR=57;WE=75960873;WS=75960855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr5	75967514	rs34357630	GA	G	43.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.30;QD=8.78;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	75996837	rs10942789	C	T	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=0;PP=936;ReadPosRankSum=2.209;SC=GTATGGTAATCGCACTACCAG;SOR=5.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=33;WE=75996845;WS=75996827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chr5	75997063	rs2307124	A	G	6736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=43.75;ReadPosRankSum=-0.734;SOR=0.969;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,153:0.99:154
chr5	75997069	rs2307123	C	T	6592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=44.25;ReadPosRankSum=-0.735;SOR=1.107;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,148:0.99:149
chr5	75998488	rs3816909	T	G	4028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=98;PP=2965;ReadPosRankSum=1.585;SC=CCTGGCTCTCTCTCTTCAGGA;SOR=1.296;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=126;TCF=26;TCR=100;TR=124;WE=75998496;WS=75998478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,130:0.99:131
chr5	76003254	rs463188	A	T	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=423;SC=TGATTTTTTTAAAACGACCAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=76003262;WS=76003244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	76128521	rs616235	G	A	4329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=36;PP=2965;SC=ACAGGAACCAGTAGATCCTCT;SOR=2.070;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=95;TCR=36;TR=131;WE=76128529;WS=76128511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr5	76129053	rs631465	T	C	3962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=57;PP=2965;SC=TGGTCACCATTCCTTTGTATG;SOR=0.761;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=56;TCR=57;TR=113;WE=76129061;WS=76129043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr5	76171252	rs1320308	A	C	2845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=33;PP=2231;ReadPosRankSum=2.017;SC=TCTGGCAAGGAAAGGAAGAGA;SOR=1.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=56;TCR=34;TR=88;WE=76171260;WS=76171242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,91:0.98:93
chr5	76249536	rs1715771	C	G	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=37;PP=1189;SC=CGAGGCTGCCCGGCTCGCGGG;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=42;WE=76249544;WS=76249526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	76326885	rs2278241	G	A	1017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=29;PP=863;SC=GGGGTCCCTGGCAGGGGCTCA;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=76326893;WS=76326875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	76335623	rs35359101	A	C	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=612;SC=TGAAACTGACAATCATTCAAT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=76335631;WS=76335613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	76359024	rs34400049	C	A	3374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=82;PP=2549;ReadPosRankSum=1.319;SC=AGAAACTAAGCCTCAAAAAGA;SOR=1.211;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=108;TCF=25;TCR=83;TR=107;WE=76359032;WS=76359014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr5	76373240	rs2303713	A	G	196.90	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.38;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	76373240	.	AG	GC	210	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=2;NR=2;PP=210;QD=65.8669687156;SC=CTCCACGGCCAGCTCGCGCCG;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=76373249;WS=76373230;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	76373241	rs2303714	G	C	196.90	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.38;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	76607627	rs11413850	C	CT	1390.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=1;PP=998;SC=TAAATGGATACTTTTTTTTTA;SOR=6.439;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=46;WE=76607635;WS=76607617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	76621612	rs4133658	A	T	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=322;SC=TAAAACGAATATCATTTATAG;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=76621620;WS=76621602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	76627436	rs9687030	A	G	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=324;SC=TCTCATGGGAAAGTAACGAGC;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=76627444;WS=76627426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	76627468	rs73767372	C	T	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=319;SC=GAGCTCTTTGCGTTTTTGCTC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=76627476;WS=76627458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	76633297	rs7717046	G	A	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=532;SC=CAGTATCTAAGCCAGAAGGCC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=76633305;WS=76633287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	76645529	rs2306343	G	A	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=35;PP=964;SC=AAATGAGTTCGTTTTTAAGTT;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=76645537;WS=76645519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	76703374	rs3101866	A	G	1915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=42;PP=1510;SC=CATGGAGCTCAGTCTAGTGGA;SOR=2.080;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=15;TCR=42;TR=57;WE=76703382;WS=76703364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr5	76704849	rs186753	T	C	3230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=65;PP=2548;SC=ATGAAGATCCTCACACCAGTG;SOR=1.633;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=34;TCR=65;TR=99;WE=76704857;WS=76704839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr5	76708987	rs335614	A	G	1952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=20;PP=1592;SC=GAGTATGTGAATTTTTAAACT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=41;TCR=20;TR=61;WE=76708995;WS=76708977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	76709249	rs335615	A	T	235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=7;PP=229;SC=CAGCTTTTTTAAAAAAAAATT;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=76709257;WS=76709239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	76709268	rs335616	AA	GG	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=5;PP=362;SC=TTTTGTTACCAAATTGACTAG;SOR=1.863;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=76709277;WS=76709258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	76785406	.	GA	G	120.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.142;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=0.000;QD=1.61;ReadPosRankSum=-0.373;SOR=0.429;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,17:0.23:75
chr5	76916335	rs5868876	G	GC	4406.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=71;PP=2957;SC=TGAACAATTAGCTTCATGCAT;SOR=1.266;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=28;TCR=75;TR=97;WE=76916343;WS=76916325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr5	76926578	rs13357072	T	C	4069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=66;PP=2965;SC=TGGTCGTCTTTTTGCGCTTCT;SOR=0.787;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=61;TCR=66;TR=127;WE=76926586;WS=76926568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr5	76926651	rs62362480	A	C	2154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=58;PP=1643;SC=ACAGACAGGGAGCTATTAGCC;SOR=2.455;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=18;TCR=59;TR=75;WE=76926659;WS=76926641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr5	76926748	rs77572607	G	A	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=431;SC=AAGTGCCGTAGGCCCGACAAG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=76926756;WS=76926738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	77071835	.	G	A	22	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=22;QD=28.3856062736;SC=GGGAAGCGGCGTGCGAGGCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=77071843;WS=77071825;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr5	77425028	rs6453373	A	T	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=22;PP=1598;SC=TCCACTCTTTACATTCGGAAC;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=40;TCR=22;TR=62;WE=77425036;WS=77425018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr5	77656402	rs4072853	G	C	2003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=2;PP=1635;SC=GGATCTGCTCGGCGGCGGCGA;SOR=5.960;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=58;TCF=56;TCR=2;TR=58;WE=77656410;WS=77656392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr5	77684726	rs3922654	G	A	1223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=857;ReadPosRankSum=-0.598;SC=ATCCATTCTCGGATTCTAGAA;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=33;WE=77684734;WS=77684716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr5	77745853	rs66744502	C	CA	1003.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=19;PP=954;SC=ATAACTGGGGCATTGGTAAGT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=22;WE=77745861;WS=77745843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr5	78340062	rs248384	T	C	3024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=8;PP=2629;SC=ACAGCCATCCTCCAGCCATGG;SOR=4.525;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=85;TCR=8;TR=93;WE=78340070;WS=78340052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr5	78340257	rs248385	C	G	6526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.130;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=132;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.803;SC=GGAGCACAGGCAGTTCTCGTT;SOR=1.690;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=193;TCF=60;TCR=133;TR=191;WE=78340265;WS=78340247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,201:1.00:202
chr5	78340286	rs532964	A	G	5047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.754;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=106;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.768;SC=TTCACTTCAGATATAGTCGAT;SOR=2.081;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=41;TCR=106;TR=146;WE=78340294;WS=78340276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,157:0.99:158
chr5	78340411	rs531982	T	C	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=33;PP=980;SC=TGTCAGCCCATATATAAACAC;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=78340419;WS=78340401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	78351636	rs2253262	A	C	2935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=53;PP=2183;SC=CCTTTACCTGACCAGTTTCTT;SOR=1.321;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=30;TCR=53;TR=83;WE=78351644;WS=78351626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	78373431	rs682985	C	T	1498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.597;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=33;PP=1216;ReadPosRankSum=-0.607;SC=AACACCCAGACGCAGGTTGGT;SOR=1.391;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=48;WE=78373439;WS=78373421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr5	78416973	rs112263466	CA	C	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=2.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=-0.430;QD=1.59;ReadPosRankSum=-0.751;SOR=0.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,12:0.23:52
chr5	78573790	rs13182512	A	T	4468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=96;NR=43;PP=2965;SC=CTTGTATCAGATGGAGGATGA;SOR=1.765;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=140;TCF=97;TCR=43;TR=139;WE=78573798;WS=78573780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr5	78573970	rs16876598	T	C	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=50;PP=1058;SC=TGAAAGGCCATGCGTTATCCA;SOR=6.439;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=51;WE=78573978;WS=78573960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	78573993	rs375255338	TA	T	356.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.11;MQRankSum=1.393;QD=15.51;ReadPosRankSum=0.950;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,20:0.87:23
chr5	78586914	rs10043008	G	T	2660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=3;PP=2269;SC=GTATTAAGTTGTTATTTGTCT;SOR=5.421;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=75;TCF=72;TCR=3;TR=75;WE=78586922;WS=78586904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr5	78596044	rs10514159	T	C	5647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=107;PP=2965;SC=ATTATTATGATCTGCAACTTC;SOR=1.373;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=62;TCR=108;TR=168;WE=78596052;WS=78596034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr5	79281658	rs7734858	T	C	1191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=33;PP=993;SC=TCGAATGCTCTAAAACTAAAC;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=34;WE=79281666;WS=79281648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	79282544	rs2291524	C	T	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=12;PP=423;SC=GAAGAAGAAACGTAAAAATCC;SOR=0.990;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=21;WE=79282552;WS=79282534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	79286625	.	T	C	10645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=100;NR=220;PP=2965;SC=TGATCTCAAGTAGGGACGCGG;SOR=1.719;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=320;TCF=100;TCR=220;TR=320;WE=79286633;WS=79286615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,334:1.00:334
chr5	79286831	rs34727832	C	G	3981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=80;PP=2965;SC=CAGGTTGGGACTCGTCGGTGG;SOR=1.647;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=41;TCR=80;TR=121;WE=79286839;WS=79286821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr5	79351544	rs412379	G	A	1342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=0;PP=1140;SC=CACACCATTTGTTGACCCTCC;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=79351552;WS=79351534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	79351735	rs423906	C	T	5592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=83;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.882;SC=GGGCCGGCTCCCTAGAGCTCT;SOR=0.241;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=84;TCR=83;TR=166;WE=79351743;WS=79351725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,175:0.99:176
chr5	79351852	rs438042	A	T	5145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=42.88;ReadPosRankSum=0.841;SOR=0.920;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,119:0.99:120
chr5	79351859	rs405482	GG	AA	4998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=45.03;ReadPosRankSum=1.401;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,110:0.99:111
chr5	79354147	rs368936	C	T	1259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=33;PP=989;SC=GGTGTGGGCTCTTGGGCAGTT;SOR=5.838;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=79354155;WS=79354137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	79354647	rs432267	C	G	1789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=42;PP=1444;SC=GAAAAGCCCTCGTCTTCTTAG;SOR=2.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=54;WE=79354655;WS=79354637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	79354702	rs411943	C	T	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=28;PP=815;SC=TGCCCAGGCACGGGGGCAGCC;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=79354710;WS=79354692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	79354728	rs434409	C	T	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=531;SC=GCCAGATCTCCGGGGGCCCAC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=79354736;WS=79354718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	79355192	rs2434302	T	A	2372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=4;PP=2233;SC=TAGCTCCACATGGATTCTTTC;SOR=5.255;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=74;TCR=4;TR=78;WE=79355200;WS=79355182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr5	79355471	rs401302	C	T	3101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=29;PP=2582;SC=TTTGTTTTGCCTTCTGTATAT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=59;TCR=29;TR=88;WE=79355479;WS=79355461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	79361402	rs10600128	CATAAT	C	1699.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=31;PP=1649;SC=AACATGTGGGCATAATATATT;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=31;WE=79361414;WS=79361392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr5	79367029	.	T	A	2125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=52;PP=1806;SC=TTTTGTCTTTTATTTGGAATT;SOR=2.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=13;TCR=52;TR=65;WE=79367037;WS=79367019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr5	79368016	rs256437	T	C	1746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=4;PP=1487;SC=CAGGCAGAAGTGACTCACCAT;SOR=4.615;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=46;TCR=4;TR=50;WE=79368024;WS=79368006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
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chr5	79369213	rs3749685	G	T	96.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQRankSum=-0.319;QD=12.10;ReadPosRankSum=0.792;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
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chr5	79375724	rs2288395	G	C	3037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=30;PP=2434;SC=GTGTCATCATGCAGGCTGTGA;SOR=1.420;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=61;TCR=30;TR=91;WE=79375732;WS=79375714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr5	79378447	rs59301311	T	TC	599.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=19;PP=549;SC=ATACCGCACTTCCCCCCCAAA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=19;WE=79378455;WS=79378437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	79412237	rs441009	T	C	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=30;PP=1063;SC=TCCAGATCACTATGAACCTTA;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=79412245;WS=79412227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	79454740	.	A	G	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.008;ClippingRankSum=0.000;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.231;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=626;ReadPosRankSum=0.406;SC=GTCTTGACCAAAGTCAGGCAC;SOR=1.270;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=113;TCF=52;TCR=61;TR=36;WE=79454748;WS=79454730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,37:0.32:117
chr5	79473059	rs11429938	C	CT	2296.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=0;PP=2303;SC=ATCAGAGGTACTTGGACTGCG;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=57;TCR=0;TR=55;WE=79473067;WS=79473049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	79473950	rs190628403	G	A	2738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=82;PP=2314;SC=GTCACGGAGTGTTCATGCAGC;SOR=8.862;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=82;TCF=0;TCR=82;TR=82;WE=79473958;WS=79473940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr5	79551867	rs1966470	A	G	233.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=7;PP=165;SC=AGCCTCGGCGAAGCGCCTAGG;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=79551875;WS=79551857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	79596274	rs35486429	C	T	1123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=26;PP=824;SC=GTCATCTTCTCGCAGTTGTCC;SOR=3.737;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=79596282;WS=79596264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	79616083	rs1862136	G	C	3011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=41;PP=2389;SC=CTCCAAAACCGTTAACCCTAC;SOR=0.826;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=47;TCR=41;TR=88;WE=79616091;WS=79616073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr5	79731608	rs2544599	G	A	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=7;PP=431;SC=TGCTCAGGCTGGTCTTGAACT;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=17;WE=79731616;WS=79731598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	79733079	rs2544600	T	C	3700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=66;PP=2965;SC=CAGAATGATATCAGTTCTGAA;SOR=1.140;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=45;TCR=66;TR=111;WE=79733087;WS=79733069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr5	79734297	rs259028	T	C	3798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=35;PP=2965;SC=ATTTGTGAAATAGTTGATAAA;SOR=1.757;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=80;TCR=36;TR=114;WE=79734305;WS=79734287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr5	79734409	rs259029	G	A	6980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=124;NR=81;PP=2965;SC=ATCAATTATCGGTCTCTGATA;SOR=1.184;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=205;TCF=124;TCR=81;TR=205;WE=79734417;WS=79734399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr5	79735858	rs168939	A	G	1553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=34;PP=1162;SC=AAAGGTGAGTATTAACTTGAT;SOR=1.702;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=48;WE=79735866;WS=79735848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	79739685	rs259033	G	A	3379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=79;PP=2603;SC=CAGACTTCCAGCCTGGCATCC;SOR=2.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=25;TCR=80;TR=104;WE=79739693;WS=79739675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr5	79741018	rs259034	T	A	1582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=0;PP=1275;SC=TTCACAATCTTTTTGGCATTA;SOR=5.507;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=46;WE=79741026;WS=79741008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	79743821	rs2251759	T	A	748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=1;PP=523;SC=TGATTTGTTATTTTTTTTATT;SOR=4.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=79743829;WS=79743811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	79745469	rs249038	A	G	1032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=20;PP=812;SC=TGAAGGTGAAAGCTTTCATCC;SOR=0.927;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=16;TCR=20;TR=36;WE=79745477;WS=79745459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	79747291	rs249039	A	G	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=7;PP=1037;SC=TTTACTAATGATTTTATTTGC;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=37;WE=79747299;WS=79747281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	79751332	rs249040	A	G	176.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=137;SC=CAGCCTGGGCAACAGAGTGAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=79751340;WS=79751324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	79773028	rs166062	T	G	2129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=10;PP=1710;SC=AGAATTTTTTTTTTTTCTAGG;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=52;TCR=10;TR=62;WE=79773036;WS=79773018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr5	79815658	rs369998	T	C	4981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=76;PP=2965;SC=GACACCGTGATATCCTTCTTT;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=75;TCR=76;TR=151;WE=79815666;WS=79815648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr5	79855372	rs32857	A	G	3309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=54;PP=2507;SC=CCCACAGGGCAACTTTGCTGT;SOR=0.888;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=48;TCR=54;TR=102;WE=79855380;WS=79855362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr5	79855876	rs187262	T	C	1258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.667;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=30;PP=1004;ReadPosRankSum=-0.924;SC=TTATCAAAGATGGCAAAGACC;SOR=1.714;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=45;WE=79855884;WS=79855866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,45:0.96:47
chr5	79950781	rs1650697	A	G	1850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=54;PP=1562;SC=GCCGCCGCACATAGTAGGTTC;SOR=5.856;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=2;TCR=54;TR=56;WE=79950789;WS=79950771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr5	79974646	rs836807	T	C	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=446;SC=TACATACTCCTGAGTGTATCA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=79974654;WS=79974636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	80021168	rs32951	A	C	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=3;PP=721;SC=AAGAATAAGGAATAAATCTTT;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=80021176;WS=80021158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	80021193	rs245016	C	T	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=4;PP=695;SC=TTTTTTTTTCCTCTTCTGGCC;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=80021201;WS=80021183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	80021445	rs32952	A	C	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=21;PP=533;SC=TAAAGGTATTAGTATGATTCT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=80021453;WS=80021435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	80149981	rs184967	A	G	4655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=134;NR=20;PP=2965;SC=TATAAAGGACAGAGTACATTT;SOR=3.753;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=155;TCF=135;TCR=20;TR=154;WE=80149989;WS=80149971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr5	80160596	rs3991216	AAATG	A	2789.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.32;MQRankSum=0.265;QD=42.27;ReadPosRankSum=-0.079;SOR=2.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr5	80168937	rs26279	G	A	6431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=109;NR=101;PP=2965;SC=TTTCACAGGCGCAGCAGAACA;SOR=0.772;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=210;TCF=109;TCR=101;TR=210;WE=80168945;WS=80168927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr5	80382806	rs7733625	G	T	1469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=31;PP=1184;SC=GCGACCTGATGCGCTGTGCGG;SOR=1.828;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=42;WE=80382814;WS=80382796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	80388554	rs2592094	C	T	1525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=6.857;NF=44;NR=0;PP=1351;ReadPosRankSum=-0.830;SC=TGTTTATTGCCGTGGACATGG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=44;WE=80388562;WS=80388544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
chr5	80390225	rs505748	C	T	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=12;PP=345;SC=GAATTAGAGGCGGGAGAGAGA;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=80390233;WS=80390215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	80390290	rs498119	C	T	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=55;SC=AACCATTTAGCCCATGAGCCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=80390298;WS=80390280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	80409229	rs26422	C	G	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=0;PP=804;SC=TTTAGATTAACGGAAGTCCAG;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=80409237;WS=80409223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	80409729	rs10942942	T	C	2568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=66;PP=2183;SC=TAAAACGAAGTATTCAAAAAG;SOR=3.287;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=12;TCR=66;TR=78;WE=80409737;WS=80409719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr5	80521332	rs76568140	CTTT	C	84.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.71;ReadPosRankSum=1.568;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr5	80655709	rs13163821	T	C	1806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=9;PP=1438;SC=TTCTTATAAGTGGATTTACTG;SOR=3.219;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=47;TCR=9;TR=56;WE=80655717;WS=80655699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr5	80736444	rs9596	A	G	5475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.415;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=98;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.804;SC=CTGACCCAGGACCCATTGGAA;SOR=0.535;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=81;TCR=101;TR=178;WE=80736452;WS=80736434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,179:0.99:180
chr5	80744758	rs3764986	T	C	187.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=152;SC=TCACAAAGTATAGTAAAGGAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=80744766;WS=80744748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	80756855	rs6893826	A	T	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.70;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	80785011	rs66563423	G	A	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=6;PP=731;SC=ATAAATATATGTGACATTTTC;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=31;WE=80785019;WS=80785001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	81474225	rs9293290	A	T	1735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=0;PP=1460;ReadPosRankSum=-0.640;SC=AAGTCATGATATTCTTCCAGG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=48;WE=81474233;WS=81474215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr5	81474550	rs202186875	T	TA	1076.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=35;PP=740;ReadPosRankSum=-0.680;SC=ACAGTTTCCTTAAAAAAAAAC;SOR=3.816;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=36;WE=81474558;WS=81474540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,40:0.95:42
chr5	81572464	rs226199	G	C	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=552;SC=CTGAGCTGAAGTCCTGTGATG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=81572472;WS=81572454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	81573992	rs226198	C	T	1733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=7;PP=1424;SC=CGCCGGACCACGTGCCTCCTG;SOR=3.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=48;TCR=7;TR=55;WE=81574000;WS=81573982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	82135819	rs139917914	T	TA	814.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.68;QD=42.88;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	82135829	.	T	TC	1109.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.85;QD=38.27;SOR=5.353;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	82136064	rs113309601	T	TTCTTC	1990.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=1;NR=27;PP=1705;SC=TTTTTGCTTCTTCTTTGCCTT;SOR=3.912;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=28;WE=82136072;WS=82136054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	82353083	rs7724935	C	T	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.36;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	82353087	rs7707143	T	C	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.77;SOR=1.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	82360783	rs2306336	T	C	293.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=4;PP=213;SC=CATTGAACATTTGTAAGAACT;SOR=0.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=82360791;WS=82360773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	82407098	rs1478482	G	A	820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.04;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	82407105	rs1478481	A	G	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.17;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	82499307	rs2662238	G	A	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=327;SC=TGATTATTAGGCTGAATTATG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=82499315;WS=82499297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	82834009	rs35648048	G	A	3488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=59;PP=2710;SC=AGGAGGAGGAGGGAACTACAG;SOR=1.232;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=41;TCR=59;TR=100;WE=82834017;WS=82833999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr5	82875800	rs308365	C	T	4018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=32;PP=2965;SC=TTCCTTTAGTCGCTTGCGGCC;SOR=2.284;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=95;TCR=32;TR=127;WE=82875808;WS=82875790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr5	82876284	rs17206014	A	G	970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=26;PP=749;SC=TGTTTTCATCATTTCAGCCAA;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=82876292;WS=82876274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
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chr5	82940510	rs1457081	T	C	739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=26;PP=610;SC=AGCAAGGAGTTGTTAGAAGCC;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=82940518;WS=82940500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	83433002	.	TACAC	T,TAC	2467.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.107;ClippingRankSum=0.000;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.71;MQRankSum=-0.282;QD=29.03;ReadPosRankSum=1.693;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,16,68:0.19,0.80:85
chr5	83476194	rs163715	G	A	1478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=5;PP=1193;SC=AAAGTACAATGACTATGAATA;SOR=3.958;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=44;WE=83476202;WS=83476184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	85582712	rs2964837	T	C	3265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.04;QD=30.81;SOR=2.487;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr5	86564995	rs3734000	T	A	2780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=26;PP=2426;ReadPosRankSum=-0.896;SC=ACCTGGCGTCTTCCTACATTT;SOR=0.786;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=61;TCR=26;TR=85;WE=86565003;WS=86564985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,84:0.99:85
chr5	86633973	rs3752862	G	A	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=36;PP=1062;SC=GATCTTGTCCGTAATCAGAGA;SOR=3.816;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=40;WE=86633981;WS=86633963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	86637164	rs35694079	G	GA	235.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.83;QD=23.57;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	86667856	rs35014912	G	GA	1901.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.344;NF=62;NR=3;PP=1336;ReadPosRankSum=-0.524;SC=TGTTGAATTTGAAAAAAAAAA;SOR=3.528;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=84;TCF=78;TCR=6;TR=65;WE=86667864;WS=86667846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,71:0.97:73
chr5	87497977	rs358289	C	T	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=9;PP=408;SC=AGTTAAATAACCTGCCTCAAA;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=17;WE=87497985;WS=87497967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	87498027	rs3099436	G	A	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=13;PP=375;SC=GTTTGAACCAGTTCTGTCTGA;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=87498035;WS=87498017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	87498069	rs3098676	C	T	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=240;SC=TTCTACAAGGCTAACAGATCA;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=87498077;WS=87498059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	87498128	rs3099435	T	A	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=2;PP=52;SC=CCTCACCATCTTCTTCTGCTA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=87498136;WS=87498118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr5	87498849	rs3097146	G	A	831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=13;PP=608;SC=ACCCAGAGCAGAACCATAAAT;SOR=1.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=22;WE=87498857;WS=87498839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	87502325	rs357515	G	A	344.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.010;HP=13;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=300;ReadPosRankSum=-0.239;SC=CCCTGTGGGGGAAAAAAAAAA;SOR=0.169;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=16;WE=87502333;WS=87502314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr5	87503087	rs34534189	GACT	G	1301.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=23;PP=1262;SC=AATAAAATTTGACTACAACAT;SOR=3.407;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=26;WE=87503097;WS=87503077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	87963272	rs5869431	G	GA	1123.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=10;PP=935;SC=TAGGCACCATGGCTTTTTACC;SOR=1.460;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=21;WE=87963280;WS=87963262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	87968864	rs6882046	A	G	3584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=29;PP=2965;SC=ACAAGATCCAAAGTCACAGCA;SOR=2.170;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=77;TCR=29;TR=106;WE=87968872;WS=87968854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr5	87968953	rs3814424	C	T	3461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=68;PP=2965;SC=ATTCCTCTCCCCTGCTCAACA;SOR=1.458;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=36;TCR=68;TR=104;WE=87968961;WS=87968943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr5	87969138	.	G	C	3225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=60;PP=2492;SC=CCTCGGAGTGGAGAGTGAAGT;SOR=0.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=47;TCR=60;TR=107;WE=87969146;WS=87969128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr5	88416255	.	AAC	A	75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=75;QD=28.0;SC=TACATACACAAACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=3;WE=88416264;WS=88416245;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:16,3:0.16:19
chr5	89703641	rs4873	C	G	1799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=27;PP=1328;SC=TTGTCCACTACAAGCTCACTT;SOR=1.009;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=24;TCR=27;TR=51;WE=89703649;WS=89703631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	89705752	rs11315430	GC	G	644.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=6;PP=538;SC=ACCTCCTAACGCCCCCCCGCC;SOR=1.931;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=20;WE=89705760;WS=89705744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	89769728	rs2162986	T	C	3415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=55;NR=61;PP=2746;SC=GGGCTGGGCGTCCGCACCACC;SOR=0.747;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=55;TCR=62;TR=116;WE=89769736;WS=89769718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr5	89781594	rs2115500	C	T	1436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=35;PP=1034;SC=ATGATTATAGCATCCTCAAGT;SOR=2.608;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=44;WE=89781602;WS=89781584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	89807711	rs6897910	G	A	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=1;PP=627;SC=TGACAAGAGTGGAAGGTGGTG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=89807719;WS=89807701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	89814604	rs1305059	G	GTGACC	2458.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=3;PP=1906;SC=AGATGCACATGTGACCACTAA;SOR=5.590;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=31;WE=89814612;WS=89814594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	89815312	rs34548009	G	GA	1310.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=29;PP=838;SC=CTGTGGGGGGGAAAAAAAAGC;SOR=1.514;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=36;WE=89815320;WS=89815302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	89816299	rs171790	C	A	7747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.377;NF=84;NR=154;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.151;SC=TAAAAAGAGGCTAAATGCAGA;SOR=0.669;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=243;TCF=86;TCR=157;TR=238;WE=89816317;WS=89816289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,246:0.98:250
chr5	89816309	rs35118083	A	AT	7077.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.346;NF=38;NR=142;PP=2966;ReadPosRankSum=-1.463;SC=CTAAATGCAGATTTTAGATAT;SOR=1.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=208;TCF=45;TCR=163;TR=180;WE=89816317;WS=89816289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,225:0.99:228
chr5	89816383	rs13182165	G	A	3776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.214;NF=8;NR=108;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.602;SC=GTAGATATATGTCTGAAACTC;SOR=3.442;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=8;TCR=110;TR=116;WE=89816391;WS=89816373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,118:0.99:119
chr5	89820984	rs10069050	T	C	4185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=27;PP=2965;SC=TGGATCGAAGTTCATACACTT;SOR=2.494;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=97;TCR=27;TR=124;WE=89820992;WS=89820974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr5	89825210	rs603870	G	A	4331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=24;PP=2965;ReadPosRankSum=1.837;SC=CGCAGCTGGGGCTCAACCCCG;SOR=1.908;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=135;TCF=111;TCR=24;TR=134;WE=89825218;WS=89825200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,137:0.99:138
chr5	89909972	rs11286344	GA	G	158.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=14.43;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	89918620	.	CGATCTCAG	C	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=71;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=2030;SC=TGCAGTGGTGCGATCTCAGCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=89918635;WS=89918610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	90107108	rs2438374	A	G	4100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=88;PP=2965;SC=ATTGTGGAGGAGAAGGATGAT;SOR=1.963;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=33;TCR=88;TR=121;WE=90107116;WS=90107098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr5	90119324	rs2438378	G	A	1889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=32;PP=1607;SC=GGTAAACCTGGTGGAGGAACT;SOR=0.997;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=25;TCR=32;TR=57;WE=90119332;WS=90119314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr5	90445829	rs35858094	T	TTC	287.86	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.64;MQRankSum=-0.126;QD=28.79;ReadPosRankSum=1.645;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr5	90449031	rs7726023	T	C	2426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=39;PP=1951;ReadPosRankSum=-0.872;SC=CATCCCAATCTAAAAAGGTGC;SOR=0.768;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=43;TCR=40;TR=80;WE=90449039;WS=90449021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,81:0.98:83
chr5	90669400	rs6452952	A	T	275.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=197;SC=TGTTCTGTTAACATGATAATC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=90669408;WS=90669391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	90672711	rs62376564	T	G	270.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.09;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	93388777	rs148770534	T	TATAG	873.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=817;ReadPosRankSum=-0.227;SC=TTGCATATACTATAGATAGAT;SOR=3.442;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=12;WE=93388785;WS=93388767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr5	93410244	rs7732578	C	T	1123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=0;PP=902;SC=ACTTTAGGTACTTATATTCTT;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=93410252;WS=93410234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	93731985	rs308207	A	G	7663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=131;NR=101;PP=2965;SC=ATCTGTCAAGAGAGGCACCTG;SOR=0.955;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=232;TCF=131;TCR=101;TR=232;WE=93731993;WS=93731975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr5	93812719	rs17083735	A	C	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=393;SC=TTTTGTAGCAAAGGGTAAAAC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=93812727;WS=93812709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	93820775	rs115543611	T	A	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=10;PP=359;SC=CATTAAGAAATACATATAAAA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=93820783;WS=93820765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	94046387	rs306573	A	G	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=0;PP=557;SC=ATTTTTAACCAACCTGTCTCT;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=94046395;WS=94046377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	94050447	rs2638	C	T	5811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=133;NR=37;PP=2965;SC=CCTTATCCCACAGAAGAATGG;SOR=2.435;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=170;TCF=133;TCR=37;TR=170;WE=94050455;WS=94050437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr5	94050487	rs2636	T	A	7229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=126;NR=96;PP=2965;SC=CTCACTTCTTTATCCTTTCGC;SOR=0.925;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=126;TCR=96;TR=222;WE=94050495;WS=94050477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr5	94114586	rs77587867	G	T	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.83;QD=42.83;SOR=5.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	94114594	rs255372	T	C	1379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.86;QD=41.81;SOR=5.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	94203211	rs159034	G	A	784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=22;PP=634;SC=TAATAAAGTCGTATTCTGCTA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=94203219;WS=94203201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	94204080	.	G	A	5249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.000;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.354;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=75;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.801;SC=CCCAATCAAAGCAACTATTAA;SOR=0.492;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=88;TCR=76;TR=163;WE=94204088;WS=94204070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,170:0.99:171
chr5	94206202	rs159032	C	T	1405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=18;PP=1131;SC=TTCACCTATACATCAACATAT;SOR=1.038;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=25;TCR=18;TR=43;WE=94206210;WS=94206192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	94206390	rs293058	C	T	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=3;PP=387;SC=AGAACACAACCGCAGCAGCAT;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=94206398;WS=94206380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	94206957	rs201600301	CT	C	81.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=1.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.260;QD=1.05;ReadPosRankSum=-0.825;SOR=0.363;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,15:0.19:78
chr5	94278129	rs293035	T	C	4092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=93;PP=2965;SC=CATAGTCAAATACCTGAGATG;SOR=2.210;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=31;TCR=93;TR=124;WE=94278137;WS=94278119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr5	94278154	rs159351	C	T	3236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=84;PP=2797;SC=AGAGAAAAAGCCTTGTTATAA;SOR=3.634;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=12;TCR=84;TR=96;WE=94278162;WS=94278144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr5	94353240	rs139116758	T	TTCTCTAAAGGGGGACCA	1088.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=8;PP=2197;SC=CTGTTCTATTTTCTCTAAAGG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=8;WE=94353248;WS=94353230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	94619545	rs5869672	G	GC	779.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=9;PP=715;SC=CTCCGGCCGCGCCACCGGCAC;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=17;WE=94619553;WS=94619535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	94772540	rs6878669	C	T	6596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=94;NR=111;PP=2965;SC=AACTGCCAGTCCTGAGCAAAC;SOR=0.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=205;TCF=94;TCR=111;TR=205;WE=94772548;WS=94772530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr5	95119408	rs888808	T	C	2396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=7;PP=2149;ReadPosRankSum=-0.931;SC=CAGCATGTTTTTTTAATTGTT;SOR=2.891;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=65;TCR=7;TR=71;WE=95119416;WS=95119398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,72:0.99:73
chr5	95124328	rs3822753	T	G	1189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=1;PP=1039;SC=TGTCACAGTATACTGAAAGCT;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=35;WE=95124336;WS=95124318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	95159822	rs3756705	G	T	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=19;PP=523;SC=CGTGGTCAGGGCTCCGGACTT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=19;WE=95159830;WS=95159812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	95192736	.	CTTTTTT	C	981.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.851;ClippingRankSum=0.000;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=1.944;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=2.264;QD=18.88;ReadPosRankSum=1.499;SOR=1.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,30:0.58:52
chr5	95192776	rs2080947	C	G	1902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=59;PP=1844;SC=AACTGATAACCATAAAATTTG;SOR=6.630;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=60;TCF=1;TCR=59;TR=60;WE=95192784;WS=95192766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	95233795	.	GAA	G	59.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.691;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQRankSum=-0.967;QD=4.98;ReadPosRankSum=-0.984;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr5	95761432	.	TAA	T	1165.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=23;NR=4;PP=310;SC=TTCTCCATCATAAAAAAAAAA;SOR=3.797;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=27;WE=95761441;WS=95761422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,36:0.90:40
chr5	95767703	rs3792746	C	T	1562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=5;PP=1316;SC=GACGCCCACCCACCTCCAACC;SOR=3.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=46;WE=95767711;WS=95767693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	95865500	rs13186522	T	C	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=3;PP=315;SC=TTGCTGGGCATTCATTCTGTC;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=95865508;WS=95865495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	95865526	rs13161802	G	A	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=4;PP=326;SC=CCACCCTGTGGAGAGGTGCCT;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=95865534;WS=95865516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	96107202	rs27689	G	T	2983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=3;PP=2594;SC=TCACAATATTGTGGCCAGATG;SOR=6.115;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=87;TCF=84;TCR=3;TR=87;WE=96107210;WS=96107192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr5	96129417	rs190040077	A	G	784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=4;PP=639;SC=AAAAAGACAAAGTAAAAATTA;SOR=2.400;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=22;WE=96129425;WS=96129407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	96150103	rs26519	C	T	4258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=100;PP=2965;ReadPosRankSum=0.223;SC=ACTAATGTTACTGCACATTGA;SOR=1.071;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=126;TCF=24;TCR=102;TR=124;WE=96150111;WS=96150093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,132:0.99:134
chr5	96219738	.	TTATCTATCTATC	T	1534	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.53;NF=0;NR=8;PP=1534;QD=192.25;SC=TAATTTGTTTTTATCTATCTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=8;WE=96219757;WS=96219728;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:27,8:0.23:35
chr5	96222627	rs13189819	G	A	765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=616;SC=AAAAAACTAAGTTAAAAATTA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=96222635;WS=96222617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	96228072	rs75263594	C	T	2662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.059;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=41;PP=1949;ReadPosRankSum=0.751;SC=TATAGGGAGACGTCACTGCTT;SOR=0.295;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=86;TCF=44;TCR=42;TR=85;WE=96228080;WS=96228062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
chr5	96230858	rs3832368	T	TA	1053.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=1;PP=817;SC=TCCTAACTAATAAAAAAAAAG;SOR=5.943;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=39;WE=96230866;WS=96230853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr5	96230883	rs371137761	A	ATT	2160.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=1;PP=1796;ReadPosRankSum=-1.198;SC=TAACTATTGTATTTTTTGCTA;SOR=6.630;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=52;TCF=50;TCR=2;TR=50;WE=96230891;WS=96230873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr5	96231000	rs2549782	G	T	4451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=69;PP=2965;ReadPosRankSum=0.870;SC=TTTGGCTTAAGGAGGGTTTTG;SOR=0.735;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=70;TCR=71;TR=137;WE=96231008;WS=96230990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,143:0.97:147
chr5	96232142	rs2548538	T	A	2546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=32;PP=1887;SC=CATCCCGCCCTATCTCCAAAC;SOR=1.124;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=44;TCR=32;TR=76;WE=96232150;WS=96232132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr5	96232222	rs2548537	G	C	1913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=46;PP=1378;SC=GTAAATATCAGGTGCAGGTGG;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=65;WE=96232230;WS=96232212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr5	96232250	rs34701361	G	GAAA	2494.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=35;PP=1715;SC=GCTTTCAGAAGTGTAATAATG;SOR=2.179;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=46;TCF=5;TCR=41;TR=39;WE=96232258;WS=96232240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	96232286	rs2549785	C	T	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=54;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=30;PP=874;SC=GTTTAAGTCACTGGTGCCAGT;SOR=4.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=32;WE=96232294;WS=96232276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	96232345	rs56321917	CAT	C	521.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=10;PP=474;SC=AGACATCACACATGTTCCGTA;SOR=3.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=12;WE=96232354;WS=96232335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	96232402	rs2548536	T	A	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=4;PP=438;SC=ATTTTCTTTATCTCTTTTTTC;SOR=1.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=96232410;WS=96232392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	96232669	.	T	TAAG	79.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.385;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr5	96232670	.	T	TCATATGTTGGGTAACGA	79.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.29;ReadPosRankSum=0.189;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr5	96235896	rs2248374	A	G	3374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=53;PP=2568;SC=GTAACATGGTAAGGATAAAGA;SOR=0.946;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=45;TCR=53;TR=98;WE=96235904;WS=96235886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr5	96237114	rs187265	C	G	1332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=4;PP=1112;SC=GTTCCCCAAGCCTTGTTTCTG;SOR=4.021;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=40;WE=96237122;WS=96237104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	96237326	rs2287988	G	A	2542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=59;PP=2040;SC=GACTGCAACAGGAGCGCTTCC;SOR=2.332;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=18;TCR=59;TR=77;WE=96237334;WS=96237316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr5	96237413	rs171647	C	T	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=627;SC=TTAGGTCTAGCTTACCTCATC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=96237421;WS=96237403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr5	96244549	rs2549794	C	T	1537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=0;PP=1279;SC=AACTGAATGGCCCAGCTATAA;SOR=7.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=46;WE=96244557;WS=96244539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	96244585	rs2548527	A	C	2345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=67;NR=0;PP=1993;SC=ATTGTTCTCTATTTCATATTT;SOR=8.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=67;TCF=67;TCR=0;TR=67;WE=96244593;WS=96244575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr5	96244638	rs2549795	A	G	6227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=157;NR=21;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.976;SC=ATATGCACAAACCACTGACAT;SOR=2.776;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=179;TCF=158;TCR=21;TR=178;WE=96244646;WS=96244628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,182:0.99:183
chr5	96245343	rs2549796	C	T	3683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=61;PP=2965;SC=GTGACAAGGGCTCAGTCTGGG;SOR=0.903;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=51;TCR=61;TR=112;WE=96245351;WS=96245333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr5	96245439	rs1056893	C	T	2565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=50;PP=2216;SC=AACTCTTCTCCCAGTGGATGG;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=26;TCR=50;TR=76;WE=96245447;WS=96245429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr5	96245518	rs2549797	A	G	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=23;PP=661;SC=TTTGATGTAAAAGTCTTTGAT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=96245526;WS=96245508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	96249115	rs2255546	C	T	5465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=98;PP=2965;ReadPosRankSum=0.437;SC=GGGGCAGCAACTAGCATGGGA;SOR=0.370;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=172;TCF=73;TCR=99;TR=171;WE=96249123;WS=96249105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,178:0.99:179
chr5	96271804	rs185601392	C	T	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=1;PP=50;SC=GCCGCCTCAGCTCTCGGAGTA;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=96271812;WS=96271794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	96329857	rs27304	G	T	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=417;SC=GATGTTTGACGTTACAGGTTA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=96329865;WS=96329847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	96332085	rs3836862	TC	T	7498.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=90;PP=2975;SC=TTGTTTTCTCTCCCCCCAGTG;SOR=1.059;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=204;TCF=107;TCR=97;TR=185;WE=96332093;WS=96332075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr5	96339102	rs3214461	AC	A	374.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.47;QD=34.07;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	96339273	rs27613	T	G	354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=10;PP=248;SC=GGTAATTTATTTAGCTCTTAC;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=96339281;WS=96339263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	96341750	rs3839297	T	TTA	239.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.036;NF=5;NR=2;PP=346;ReadPosRankSum=-1.304;SC=GGAAAAAGTTTTATATATATA;SOR=0.976;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=7;WE=96341758;WS=96341740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr5	96342077	rs3835054	TA	T	400.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.222;HP=15;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=204;ReadPosRankSum=0.420;SC=CCTACCAAATTAAAAAAAAAA;SOR=0.278;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=30;TCF=16;TCR=14;TR=19;WE=96342085;WS=96342067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,22:0.92:24
chr5	96363407	rs27300	C	T	2810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=31;PP=2345;SC=GCTGCCTAATCTTTTTGCTCT;SOR=1.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=54;TCR=31;TR=85;WE=96363415;WS=96363397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr5	96364063	rs27712	C	T	3761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=27;PP=2965;SC=TGAGGTTTATCGTCCTTTTCT;SOR=2.344;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=85;TCR=27;TR=112;WE=96364071;WS=96364053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr5	96519094	rs3806945	A	G	2463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=22;PP=2050;SC=GTCTTATGAAACACATAGTAT;SOR=1.643;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=48;TCR=22;TR=69;WE=96519102;WS=96519084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr5	98109828	rs2547973	G	A	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.06;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	98109838	rs2662263	A	C	1243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.46;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	98192164	rs138635992	AAGG	A	5222.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.195;NF=44;NR=51;PP=2948;ReadPosRankSum=0.534;SC=CTGGAGCCATAAGGAGATCTC;SOR=0.250;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=102;TCF=45;TCR=57;TR=95;WE=98192174;WS=98192154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,119:0.99:120
chr5	98192465	rs692832	T	C	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=29;PP=659;SC=AGACAAATCATGCAAATTAAA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=98192473;WS=98192455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	98194589	rs2545735	T	C	381.41	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=279;ReadPosRankSum=1.742;SC=GAACCTTTTTTATCATTTGGT;SOR=2.448;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=11;WE=98194597;WS=98194579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr5	98194618	rs2545734	T	A	523.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.81;ReadPosRankSum=-0.789;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr5	98194781	rs330421	C	G	1154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=29;PP=922;SC=CAAAAAAGCACAGATAATTCT;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=34;WE=98194789;WS=98194771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	98194888	rs330422	C	T	270.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=250;SC=ATTTTTAAAGCATGAACTACT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=98194896;WS=98194878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	98195818	rs325203	A	G	3236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=36;PP=2602;ReadPosRankSum=0.811;SC=CTGGTGGAAAATATTTAGTTT;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=66;TCR=37;TR=100;WE=98195826;WS=98195808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,102:0.98:104
chr5	98199204	rs161941	C	T	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=8;PP=382;SC=GTCTAGTATGCTCTAGTTGTT;SOR=0.914;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=11;TCR=8;TR=19;WE=98199212;WS=98199194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	98205326	rs144514283	GCACACACACA	G	447.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=60.98;NF=9;NR=0;PP=1920;SC=ACGTGCGCGCGCACACACACA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=98205343;WS=98205316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	98210868	rs162140	T	A	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=25;PP=675;SC=TTCACTAAAATTATACGTATT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=98210876;WS=98210858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	98221383	.	A	AT	1196.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=23;PP=955;SC=AATACTGCATAAACAGAATCA;SOR=2.376;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=24;WE=98221391;WS=98221373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	98232809	rs326468	T	C	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=675;SC=AGAGTCTTATTCTTTATGTAA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=98232817;WS=98232799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	98261891	rs161744	T	C	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=467;ReadPosRankSum=1.668;SC=TATATCAGAATTTTTTTAGTA;SOR=3.160;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=18;WE=98261899;WS=98261881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr5	101574885	rs41403944	A	G	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=1;PP=603;SC=ACCCTAAGTAACCAACAATGA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=101574905;WS=101574875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	101574897	rs199652834	A	AT	532.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=264;ReadPosRankSum=-1.437;SC=CAACAATGAGATTTTTTTTTT;SOR=2.093;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=18;WE=101574905;WS=101574875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,25:0.93:27
chr5	101585209	rs10067502	G	A	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=0;PP=1083;SC=TTCAGCTGGAGACATCATGGG;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=37;WE=101585217;WS=101585199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	101592809	rs261101	T	A	1722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=0;PP=1555;SC=AAGCACTGAATTGTATTTACC;SOR=7.903;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=50;TCR=0;TR=50;WE=101592817;WS=101592799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	101595885	rs148885155	T	TGA	2620.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=36;PP=2579;SC=TGTATGAGACTGAGAGAGAGA;SOR=0.949;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=60;TCF=20;TCR=40;TR=50;WE=101595893;WS=101595875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr5	101596032	rs202209380	AAAAT	A	370.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=403;SC=ACCTAAAAAAAAAATATATAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=101596043;WS=101596022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	101606518	rs33922930	G	GA	1520.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.157;NF=2;NR=52;PP=1155;ReadPosRankSum=1.156;SC=TGTCTTTGTGGAAAAAAAAAT;SOR=4.443;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=63;TCF=3;TCR=60;TR=54;WE=101606526;WS=101606508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr5	101631761	rs76381196	T	C	5657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=93;PP=2965;ReadPosRankSum=0.195;SC=TTCGGAGACATTGGGAGGGGC;SOR=0.809;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=178;TCF=84;TCR=94;TR=175;WE=101631769;WS=101631751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,180:0.99:182
chr5	101726648	rs6874612	C	A	1013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=2;PP=795;ReadPosRankSum=-0.869;SC=TATCAAAAAACATTTTGATGT;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=29;WE=101726656;WS=101726638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr5	101726770	rs10073892	T	C	1197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=873;ReadPosRankSum=-0.807;SC=ATAGCAATGATATAATCAGCA;SOR=0.560;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=34;WE=101726778;WS=101726760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,39:0.98:40
chr5	101726851	rs1452065	A	G	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=20;PP=546;SC=TGGTGCATCAATTGTACTAAG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=101726859;WS=101726841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	101795490	rs11746217	A	G	3420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=80;PP=2683;ReadPosRankSum=-0.574;SC=TGCTTTAATAAAGAAAAGTGA;SOR=1.146;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=25;TCR=81;TR=105;WE=101795498;WS=101795480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,108:0.99:109
chr5	101795556	rs11749193	G	A	1235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=35;PP=1084;SC=CAAACAGAGTGGAGAAAGTGA;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=35;WE=101795564;WS=101795546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	101811346	rs4703232	T	C	449.96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5133;FS=6.662;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=273;ReadPosRankSum=0.618;SC=CTATGGTAGCTATTTAGTAAG;SOR=4.174;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=13;WE=101811354;WS=101811336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,16:0.89:18
chr5	101816228	rs10041652	G	A	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=28;PP=775;SC=ATTACATGATGTAAGTTTATT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=101816236;WS=101816218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	102363858	rs26433	C	T	2108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=4;PP=1635;ReadPosRankSum=-1.035;SC=GACTGGGACTCATTTTGAAAT;SOR=3.290;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=59;TCR=4;TR=62;WE=102363866;WS=102363848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr5	102364542	rs2067133	A	AAT	2857.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=11;PP=2349;SC=AAGGTAACAGACATTGCTGCA;SOR=3.021;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=46;WE=102364550;WS=102364532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr5	102512570	rs11408825	C	CA	1553.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=12;PP=1503;SC=GTTTAAAGACCATGATTCTCA;SOR=1.721;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=34;WE=102512578;WS=102512560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	102524678	rs191512780	G	T	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=326;SC=TTAATATTGTGTTGTCTTATC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=102524686;WS=102524674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	102537200	rs154290	T	G	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=2;PP=604;SC=ATAGTTTTTTTTTTTTGTTTT;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=102537208;WS=102537190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	102886512	rs58006145	T	C	1577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=0;PP=1201;SC=ACTTGAGGAATGAGTGTTATT;SOR=6.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=44;WE=102886520;WS=102886502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr5	102890560	rs11373550	G	GA	887.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=643;ReadPosRankSum=-0.919;SC=TGGATCTGTTGAAAAAAAAAA;SOR=1.347;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=30;WE=102890568;WS=102890550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,33:0.97:34
chr5	102891695	rs10045774	A	G	5083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=107;NR=43;PP=2965;SC=TTTAAACATAATCTCTTATAG;SOR=1.944;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=107;TCR=43;TR=150;WE=102891703;WS=102891685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr5	102894447	rs3734087	A	G	258.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=214;SC=AACTTTAAGAAGTTTCTGATG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=102894455;WS=102894437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	103978775	.	AGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAG	A	881.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.46;QD=41.99;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	103978969	rs33818	T	C	2121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=23;PP=1810;SC=AGTGGGGATGTCTTAATCAGA;SOR=1.143;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=37;TCR=23;TR=60;WE=103978977;WS=103978959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	106723107	rs11377163	C	CT	969.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=26;PP=907;SC=TCCTTTTTTTCTTTTTTTATG;SOR=2.303;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=30;WE=106723115;WS=106723097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	107006446	rs35553	T	G	1098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=31;PP=908;SC=AAAATGAAAGTGGGCGAGAAA;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=107006454;WS=107006436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	108168451	rs376837075	CT	C	130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=2.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=2.208;QD=2.51;ReadPosRankSum=0.638;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr5	108516629	rs6594349	A	G	2417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=55;PP=1919;SC=TTTTTTTTTTAATGGTAAAAA;SOR=3.489;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=9;TCR=55;TR=64;WE=108516637;WS=108516619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr5	108672946	rs246105	C	T	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=6;PP=913;SC=GGTGCTTCTGCAATACTGTCA;SOR=2.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=35;WE=108672954;WS=108672936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	108691730	rs199524515	GA	G	1316.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.524;NF=2;NR=51;PP=660;ReadPosRankSum=-0.431;SC=CAAATAGGCTGAAAAAAAAAA;SOR=1.445;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=88;TCF=5;TCR=83;TR=53;WE=108691752;WS=108691719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,64:0.93:69
chr5	108714437	.	G	C	5153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.000;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.847;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=63;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.348;SC=TGGCTATTCTGATGGACAAAC;SOR=0.097;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=147;TCF=84;TCR=63;TR=144;WE=108714445;WS=108714427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,153:0.98:156
chr5	109110537	rs6894260	T	A	4026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=59;PP=2965;SC=AGCTTTTTCGTACCAAAGTTC;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=64;TCR=59;TR=122;WE=109110545;WS=109110527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr5	109125072	rs2112212	C	G	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=209;SC=ATCTGTTCCTCCTAAACTTGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=109125080;WS=109125062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	109125416	rs1019446	T	C	291.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=273;SC=GTGCTTAGTATATTGACTGCT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=109125424;WS=109125406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	109152873	rs112578884	ATATATGTATATG	A	630.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=1779;SC=TCTCAAAAATATATATGTATA;SOR=4.047;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=10;WE=109152892;WS=109152863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	109156184	rs17489649	A	G	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=303;SC=ATTATCTATCACCTTATTGAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=109156192;WS=109156174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	109181682	rs3186988	A	T	5973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=105;PP=2965;SC=CTGCTCAGTCATTAGGGGTTT;SOR=1.121;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=177;TCF=71;TCR=106;TR=176;WE=109181690;WS=109181672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr5	109668544	rs2416239	T	C	2107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=14;PP=1560;SC=CCATTTATTATGCTCCTAAGA;SOR=2.517;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=50;TCR=14;TR=64;WE=109668552;WS=109668534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr5	109760504	rs11454377	T	TA	1100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.701;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.109;NF=33;NR=7;PP=689;ReadPosRankSum=-1.159;SC=TGCTGCTAGTTAAAAAAAAAT;SOR=0.281;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=73;TCF=62;TCR=11;TR=40;WE=109760512;WS=109760494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,47:0.72:65
chr5	109940707	rs6897672	G	T	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5021;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=239;ReadPosRankSum=-0.669;SC=TTTAAAATTAGTTGCTATTTC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=11;WE=109940715;WS=109940697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr5	109953869	rs6882222	T	C	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=12;PP=456;SC=AACTTTTTGTTAATAAAAAAC;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=109953877;WS=109953859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	109963430	rs6886702	A	C	366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=10;NR=0;PP=277;SC=GTCTGAGCTTATCAAAATATA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=109963438;WS=109963420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	109976588	rs10043185	G	A	5572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.700;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=54;PP=2965;ReadPosRankSum=0.138;SC=TTTAAAGTACGTACCATCTTG;SOR=1.718;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=124;TCR=55;TR=177;WE=109976596;WS=109976578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,180:0.99:182
chr5	110092531	rs3214016	A	G	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=17;PP=520;SC=TATTGTAGATATCTAACATTT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=110092539;WS=110092521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	110096939	rs7724788	G	A	4611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=42;PP=2965;SC=GCATTTTGGAGTGTGTTAAAG;SOR=1.973;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=105;TCR=42;TR=147;WE=110096947;WS=110096929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr5	110097554	rs3844597	C	A	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=365;SC=ATGAGGGATACAAGTGAAATA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=110097562;WS=110097544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	110285607	rs111524862	C	T	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=64.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.23;MQRankSum=-6.049;QD=2.96;ReadPosRankSum=-0.679;SOR=4.970;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,11:0.19:58
chr5	110408743	rs11466742	C	G	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=29;PP=842;SC=TCCGGGACGCCGCCGCCGGGG;SOR=4.047;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=32;WE=110408751;WS=110408733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	110409067	rs2289277	C	G	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=2;PP=626;SC=CTACTCAACCCTGACCTCTTC;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=110409075;WS=110409057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	110436450	rs10038177	C	T	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=23;PP=757;SC=AATAATATAGCTGTCACCTTA;SOR=3.611;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=110436458;WS=110436440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	110443228	rs10043631	C	T	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=321;SC=ATAATATTGACTGAAAAAACG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=110443236;WS=110443218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	110446455	rs34323614	A	AT	737.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=4;PP=366;SC=GCCAATTCTGATTTTTTTTTT;SOR=3.098;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=18;WE=110446463;WS=110446445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	110446741	rs13161853	C	A	2818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=5;PP=2240;ReadPosRankSum=1.504;SC=AAATCAGACTCTTTAATAAAG;SOR=3.865;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=78;TCR=5;TR=81;WE=110446749;WS=110446731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,86:0.99:87
chr5	110448751	.	A	AT	276.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.060;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQRankSum=-1.561;QD=13.84;ReadPosRankSum=-0.220;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr5	110456263	rs17624563	C	G	4158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.453;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=70;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.543;SC=CTTCAATAGTCATGCTTCCTG;SOR=0.938;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=122;TCF=50;TCR=72;TR=118;WE=110456271;WS=110456253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,128:0.98:131
chr5	110459947	rs2290680	G	C	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=16;PP=485;SC=TGTATATGAGGAGAAATTGAA;SOR=3.160;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=110459955;WS=110459937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	110461231	rs72784248	G	A	2017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=0;PP=1669;ReadPosRankSum=-0.694;SC=CCTATTTGGGGTATAAAAGGA;SOR=5.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=60;TCR=0;TR=59;WE=110461239;WS=110461221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr5	110679657	rs446176	C	G	1390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=3;PP=1108;SC=CACTTATTTTCAAGCTTTCCC;SOR=4.565;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=39;WE=110679665;WS=110679647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	110710360	rs306067	G	C	1744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=0;PP=1520;SC=CTGGCTGTATGTTACGTCAGA;SOR=7.864;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=48;WE=110710368;WS=110710350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	110710699	rs5870446	A	AG	2641.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=61;PP=2936;SC=GATAATGAGAAGGGATTCTCC;SOR=3.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=76;TCF=9;TCR=67;TR=69;WE=110710707;WS=110710689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr5	110712491	rs306129	A	G	1597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=0;PP=1435;SC=TAGCCATAGTATTAGCTATTT;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=47;WE=110712499;WS=110712481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	110730557	rs523389	C	T	1927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=55;PP=1687;SC=AAGAAATGCGCATCTGTGATA;SOR=4.840;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=4;TCR=55;TR=59;WE=110730565;WS=110730547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	110784822	rs2116824	A	G	4586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=52;PP=2965;SC=TTCTTGTGTTATTAGCTGATT;SOR=1.273;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=84;TCR=54;TR=136;WE=110784830;WS=110784812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr5	110819753	rs25925	G	C	1359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=2;PP=1042;SC=TGGCCTCTTCGCGCCTGGGAA;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=33;WE=110819761;WS=110819743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	111013695	rs10478063	G	T	2955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=28;PP=2324;SC=CTCCATGAAAGGGGACAGAGA;SOR=1.847;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=64;TCR=28;TR=91;WE=111013703;WS=111013685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr5	111013858	rs26042	G	A	2012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=57;PP=1701;SC=ACATACACATGCTACAAAATC;SOR=3.126;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=11;TCR=57;TR=68;WE=111013866;WS=111013848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	111479750	rs62372418	T	C	1336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=37;PP=1101;SC=ATAAACTGCCTTCAGAAACAG;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=37;WE=111479758;WS=111479740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr5	111497358	rs3816657	T	G	3538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=71;PP=2757;SC=CTGCTAGCCTTAAGTGTATGG;SOR=1.675;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=33;TCR=71;TR=104;WE=111497366;WS=111497348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr5	111500816	.	C	CTAAAA	1634	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=2;NR=25;PP=1634;QD=62.1111111111;SC=CATTTCTTCTCTAAAATATAT;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=27;WE=111500832;WS=111500806;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:12,27:0.69:39
chr5	111500822	.	T	TAAA	1929.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.86;SOR=3.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	111500824	.	T	C	890	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=4;NR=27;PP=890;QD=29.831329437;SC=CTCTAAAATATATTTGAAAAA;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=31;WE=111500832;WS=111500806;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,31:0.94:33
chr5	111500824	rs33929905	T	TAC	1929.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.88;SOR=3.109;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	111504479	rs7703522	C	T	6520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=126;PP=2965;SC=ATCCGAAGAACGGGTCACCGG;SOR=1.234;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=203;TCF=77;TCR=126;TR=203;WE=111504487;WS=111504469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr5	111505885	rs1560052	T	G	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=295;SC=CCTAGTTTTGTTTAAAATGTA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=111505893;WS=111505875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	111506069	rs10040749	G	A	1863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=30;PP=1510;SC=GTTCTTTTCTGTAAAGGAATA;SOR=0.725;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=29;TCR=30;TR=59;WE=111506077;WS=111506059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	111519740	rs1560058	T	C	8177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=125;PP=2965;SC=GGATCGCCTGTTGTTGGGGTC;SOR=0.701;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=252;TCF=127;TCR=125;TR=251;WE=111519748;WS=111519730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr5	111530284	rs7719346	A	G	3345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=95;PP=2945;SC=TTTTTCCGGTATTCTCTATTA;SOR=4.514;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=8;TCR=95;TR=103;WE=111530292;WS=111530274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr5	111540950	rs12658467	C	T	1148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=2;PP=1033;SC=ATTTCCACTTCAGAAATCCCA;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=34;WE=111540958;WS=111540940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	111540968	rs373807306	T	TC	1522.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=2;PP=1973;SC=CCAGCCCCTCTCCCCTGGGTC;SOR=5.507;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=55;TCF=51;TCR=4;TR=47;WE=111540976;WS=111540958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	111545670	rs890757	C	G	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=10;PP=628;SC=CCTACTGATGCTGTTTGATTC;SOR=1.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=27;WE=111545678;WS=111545660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	112217737	rs35726351	G	A	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=331;SC=TGGAAGTGCTGTGATTACAGG;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=112217745;WS=112217727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	112222694	rs712662	C	G	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=12;PP=717;SC=GTGGGGCCATCTTGTTCCTGA;SOR=0.997;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=28;WE=112222702;WS=112222684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	112227799	rs712665	A	G	10916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=174;NR=172;PP=2965;SC=TTTAGAAAATAGTACCACATG;SOR=0.705;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=346;TCF=174;TCR=172;TR=346;WE=112227807;WS=112227789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,348:1.00:348
chr5	112227939	rs712666	T	C	5716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.276;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.735;NF=68;NR=107;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.882;SC=TCCCAACATCTAGTCCTACCC;SOR=1.136;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=69;TCR=107;TR=175;WE=112227947;WS=112227929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,173:0.99:174
chr5	112228667	rs430665	G	A	1989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=51;PP=1562;SC=CGGAGCCAGAGCCGCAGGAGC;SOR=2.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=12;TCR=51;TR=63;WE=112228675;WS=112228657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr5	112228765	rs459102	C	A	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=336;SC=TCAGAGTCCCCAATCCAAATA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=112228773;WS=112228755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	112238039	rs153546	A	C	2952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=17;PP=2543;SC=CTATACAGGTACTGAGATGGA;SOR=2.967;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=73;TCR=17;TR=90;WE=112238047;WS=112238029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	112256814	rs149190	A	G	2067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=53;NR=4;PP=1681;SC=CCCTGCGGGGAGGAATGGAGG;SOR=4.514;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=57;TCF=53;TCR=4;TR=57;WE=112256822;WS=112256804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	112257366	rs153557	A	G	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=0;PP=79;SC=CCCACCCGAGAGGCGCCCTCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=112257374;WS=112257356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	112257591	rs151980	C	G	189.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=1;PP=166;SC=GGGCAGCCCCCGCGGGGTCCT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=112257599;WS=112257581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	112257908	rs153556	T	C	3381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=93;PP=2927;SC=GTCTCGCCGCTCGGGGCTGTT;SOR=4.997;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=7;TCR=94;TR=100;WE=112257916;WS=112257898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr5	112312676	rs33555	T	C	6489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=124;PP=2965;SC=CCTGGACGATTTCTGCAGGTA;SOR=1.259;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=79;TCR=124;TR=203;WE=112312684;WS=112312666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr5	112328377	rs3733969	A	G	3525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.617;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=49;PP=2675;ReadPosRankSum=1.674;SC=AGGTACTACTAGTTCAGGGGT;SOR=0.689;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=112;TCF=62;TCR=50;TR=111;WE=112328385;WS=112328367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,114:0.99:115
chr5	112343544	rs2052484	G	A	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=394;SC=TAAAAACTTGGTTCAACCAGC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=112343552;WS=112343534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	112343878	rs115903638	T	C	3352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=92;PP=2862;ReadPosRankSum=0.451;SC=TGTAGCTGACTTGTGCACTAT;SOR=4.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=97;TCF=4;TCR=93;TR=96;WE=112343886;WS=112343868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,97:0.99:98
chr5	112346431	rs58980024	TG	T	357.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQRankSum=1.518;QD=11.54;ReadPosRankSum=1.417;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr5	112349070	rs9326869	T	C	3687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=56;PP=2716;ReadPosRankSum=-1.230;SC=TAGAACATGCTGAGGGACAGC;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=74;TCR=58;TR=126;WE=112349078;WS=112349060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,130:0.96:135
chr5	112364945	rs1363333	A	G	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=21;PP=616;SC=GCAGATTTAAACCCATTTCTT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=112364953;WS=112364935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	112379083	rs4627978	A	G	911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=3;PP=675;SC=TGGCACCAACAGGCCTTCTCC;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=31;WE=112379103;WS=112379073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	112379095	rs4277906	T	C	1188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=6;PP=933;SC=GCCTTCTCCATTTCTGGCTTC;SOR=2.774;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=35;WE=112379103;WS=112379073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	112379289	rs2227948	G	A	3304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=50;PP=2607;SC=TCCTGAGTTCGGCTAGGGACA;SOR=0.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=59;TCR=50;TR=109;WE=112379297;WS=112379279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr5	112379434	rs4705755	T	A	1164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=32;PP=996;SC=GGCAGCAGTGTGGGCACCGGG;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=112379442;WS=112379424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	112384802	rs6594664	G	A	3243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=41;PP=2489;SC=TGCCAGGTTTGTCTTTGCTGC;SOR=1.287;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=65;TCR=41;TR=106;WE=112384810;WS=112384792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr5	112385004	rs7726296	CA	GC	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=31;PP=1080;SC=CTCCTACAGACAAAGGAGCAC;SOR=1.828;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=43;WE=112385013;WS=112384994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	112385035	rs7708603	T	G	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=25;PP=804;SC=AGGCATGCCCTATCTGAGAGC;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=112385043;WS=112385025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	112389747	rs4705536	C	G	1492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=43;PP=1191;SC=TCCACATTCCCTCTCCCCAGT;SOR=3.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=6;TCR=43;TR=49;WE=112389755;WS=112389737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr5	112399791	rs2227947	G	A	1871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=21;PP=1388;SC=CCTTGGCAGCGTTCTCAGCTG;SOR=1.430;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=58;WE=112399799;WS=112399781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	112406718	rs4705771	A	G	592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=16;NR=2;PP=490;SC=CCTATTTCCTACTTTTATTCT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=112406726;WS=112406708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	112439856	.	C	G	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=6;PP=586;SC=TTCAGAACCTCAAAGGGCCTC;SOR=2.066;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=112439864;WS=112439846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	112439933	.	C	G	2015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.82;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	112439941	rs6594681	T	C	1941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.13;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	112479004	rs2227949	T	C	3553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=61;PP=2617;SC=CATAGCGAAGTGTCGTTCGCT;SOR=0.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=57;TCR=61;TR=118;WE=112479012;WS=112478994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr5	112487137	rs1947026	A	C	2723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=88;PP=2188;SC=GACAGAAAGGAGGAGATTAGA;SOR=4.849;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=7;TCR=88;TR=95;WE=112487145;WS=112487127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr5	112720648	rs17327526	C	A	3535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=14;PP=2793;ReadPosRankSum=1.018;SC=ATAAAACTGCCACCTGGTTAT;SOR=1.981;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=108;TCF=94;TCR=14;TR=106;WE=112720656;WS=112720638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr5	112823998	rs348943	C	T	4874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=95;PP=2965;SC=GCCGCATCCTCTCCTCCTCGC;SOR=1.421;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=54;TCR=95;TR=149;WE=112824006;WS=112823988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr5	112824039	rs348942	T	C	2155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=56;PP=1717;SC=CTGCTGCTGCTGCTGCCGCTG;SOR=2.494;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=74;TCF=16;TCR=58;TR=72;WE=112824056;WS=112824029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr5	112824048	.	T	TGCC	1878.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.938;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=-0.095;NF=6;NR=41;PP=2006;ReadPosRankSum=-1.241;SC=CTGCTGCCGCTGCCGCCGCCG;SOR=3.160;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=82;TCF=11;TCR=71;TR=47;WE=112824056;WS=112824029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,44:0.96:46
chr5	112851089	rs190644239	A	T	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.73;SOR=3.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	112876889	rs373624814	AT	A	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=1.193;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.464;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr5	113698544	rs40179	G	C	5109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=101;PP=2965;SC=GCCGGAACCTGCACGAGATGG;SOR=1.579;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=51;TCR=101;TR=152;WE=113698552;WS=113698534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr5	113698631	rs111266015	T	TGCC	3318.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=23;PP=2982;SC=CTGCAGCCGCTGCCGCCGCCG;SOR=1.516;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=122;TCF=58;TCR=64;TR=62;WE=113698639;WS=113698621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr5	113822197	rs72801872	G	A	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.60;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	113822205	rs12719181	C	T	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.05;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	113829121	rs1841251	A	G	3890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=69;PP=2965;SC=TAAAAATGGAACAGAGGAAAC;SOR=1.016;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=51;TCR=69;TR=119;WE=113829129;WS=113829111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr5	114462355	rs2974617	C	T	3554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=50;PP=2904;SC=TCATAGAAATCTACTTTGCCT;SOR=0.888;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=109;TCF=58;TCR=51;TR=108;WE=114462363;WS=114462345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr5	114462589	rs2921623	A	C	2158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=52;PP=1754;SC=TATCTTCAACAATAGATCTAA;SOR=3.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=8;TCR=52;TR=60;WE=114462597;WS=114462579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr5	114462630	rs2974528	T	C	1367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=39;PP=1151;SC=CAGGATAATATACATTGATGT;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=39;WE=114462638;WS=114462620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	114515588	rs2278695	A	G	1501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=1;PP=1260;SC=AGGCGCTGGAATGGACACGGA;SOR=6.138;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=41;WE=114515596;WS=114515578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	114573873	rs7706217	A	T	90.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.51;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	114605323	rs76812913	A	T	1232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=3;PP=942;SC=ATATAAAGGAAATAGATTTGA;SOR=4.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=35;WE=114605331;WS=114605313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	114611356	rs267295	A	C	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=286;SC=ATTAACCCTTAATTTTCCATC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=114611364;WS=114611346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	115177668	rs144226661	G	GAGGC	393.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.06;ReadPosRankSum=0.603;SOR=0.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,13:0.20:65
chr5	115298232	rs9326980	G	C	2019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=40;PP=1623;SC=GGCAGGGGTCGCAGCACTGAA;SOR=1.647;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=20;TCR=41;TR=60;WE=115298240;WS=115298222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	115298378	rs10062297	C	T	1153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=19;PP=964;SC=GCTGGCTGGGCTGGTAGCCGC;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=17;TCR=19;TR=36;WE=115298386;WS=115298368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	115298475	rs12520255	T	C	3233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=12;PP=2747;ReadPosRankSum=0.526;SC=CTCAGGGACTTGGAAGCCGAG;SOR=2.522;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=87;TCR=12;TR=97;WE=115298483;WS=115298465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,99:0.99:100
chr5	115298518	rs12522632	A	G	3897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=44;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.828;SC=AGCCGACGCCAACCCCGAAAC;SOR=0.815;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=143;TCF=99;TCR=44;TR=142;WE=115298526;WS=115298508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,144:0.99:145
chr5	115298977	rs1445708	C	T	2742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=63;PP=2139;ReadPosRankSum=-0.839;SC=AGGGACTCTTCCTCAACGTCT;SOR=1.118;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=23;TCR=64;TR=86;WE=115298985;WS=115298967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,87:0.99:88
chr5	115323691	rs35321827	G	A	1150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=36;PP=977;ReadPosRankSum=-0.738;SC=TGGGCCCTTGGTTGAGGCCTC;SOR=5.838;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=36;WE=115323699;WS=115323681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr5	115335669	.	G	C	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=550;SC=GATTCTAAGGGTCCTATATCA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=115335677;WS=115335659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	115338704	rs1346479	T	C	294.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=6;PP=245;SC=AGCCATTTCATTTCAAACTAA;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=115338712;WS=115338694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	115338732	rs1560080	G	A	241.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=5;PP=197;SC=TTCTTGTAGAGCATAGAGTTT;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=115338740;WS=115338722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	115339086	rs6594929	A	G	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=30;PP=909;SC=AGGTAAGGTTACTTTTGATAC;SOR=5.549;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=31;WE=115339094;WS=115339076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	115341611	rs10078748	G	T	4780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=87;PP=2965;SC=TTCTGCAGGCGATTCCTGTTA;SOR=0.990;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=64;TCR=87;TR=151;WE=115341619;WS=115341601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr5	115341638	rs10078759	G	C	4076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=88;PP=2965;SC=GACTGCAGTTGATTGATGATG;SOR=1.845;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=126;TCF=37;TCR=89;TR=125;WE=115341646;WS=115341628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr5	115351150	rs10214076	T	G	1236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=25;PP=968;SC=AAAGTTTCTGTTATAGGAATT;SOR=1.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=35;WE=115351158;WS=115351140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	115351498	rs17485148	C	T	3601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=67;PP=2842;SC=TTCATTTAGGCCACTGGTTTG;SOR=1.392;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=40;TCR=67;TR=107;WE=115351506;WS=115351488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr5	115394357	rs6860908	T	C	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=81;SC=TGATTGTACATTAATTTATTC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=115394365;WS=115394351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	115420598	rs3087831	G	A	99.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=83;SC=CCAGGACTGCGGGACAAGTCT;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=115420606;WS=115420594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	115420628	rs3087832	G	A	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.28;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	115420634	rs3776796	C	G	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.71;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	115420897	rs74583480	G	A	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.18;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	115420905	rs73780832	G	A	368.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.98;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	115428381	rs1129495	T	G	6266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=133;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.051;SC=CGGCAGAGAATTCTGGCTCCC;SOR=0.391;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=197;TCF=62;TCR=135;TR=195;WE=115428389;WS=115428371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,201:0.99:203
chr5	115628117	rs6866938	C	T	1426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.121;NF=35;NR=2;PP=953;ReadPosRankSum=-1.301;SC=CCTTCACTAACGTCTTTTTTT;SOR=3.500;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=37;WE=115628125;WS=115628107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr5	115628133	rs375420756	TG	T	1792.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.47;MQRankSum=-0.105;QD=38.14;ReadPosRankSum=-1.662;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,46:0.98:47
chr5	115782549	.	C	T	4451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=68;PP=2965;SC=TGCCAAAGCTCTGGTTTCTGG;SOR=0.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=61;TCR=68;TR=129;WE=115782557;WS=115782539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr5	115783244	.	C	G	5098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=68;PP=2965;SC=AGGATGGCCTCCGGCTTTGGG;SOR=0.800;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=78;TCR=68;TR=145;WE=115783252;WS=115783234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr5	115784843	rs1968362	G	A	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=440;SC=ACACATCACAGTTGTCAGATC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=115784851;WS=115784833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	115803578	rs10551961	AGTG	A	360.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=484;SC=GACACGGCTTAGTGGTGGTGG;SOR=2.093;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=10;WE=115803588;WS=115803568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	115808551	rs200871722	TA	T	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.08;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr5	115811220	rs423834	T	C	6905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=144;NR=81;PP=2965;SC=AAGATAAAAATGGATAAAAGA;SOR=1.394;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=225;TCF=144;TCR=81;TR=225;WE=115811228;WS=115811210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr5	115813726	rs34966	A	G	8044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=167;NR=76;PP=2965;SC=CACTTCCCATATCGTTCACAC;SOR=1.788;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=245;TCF=169;TCR=76;TR=243;WE=115813734;WS=115813716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr5	115827356	rs154599	C	T	3718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=40;PP=2800;SC=TGTGACTCCACGAATCCTCTA;SOR=1.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=74;TCR=40;TR=114;WE=115827364;WS=115827346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr5	115827407	rs154600	G	A	4486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=73;NR=68;PP=2965;SC=GCAAAAGCAAGTGCAACGAGG;SOR=0.749;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=73;TCR=68;TR=141;WE=115827415;WS=115827397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr5	115837772	rs154466	G	A	1604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=2;PP=1351;SC=TGCTTGATAAGTTAAAGGAGG;SOR=5.464;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=46;WE=115837780;WS=115837762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	115838117	rs54100	C	G	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=175;SC=ACAAAAGAAACCCGTGTTTAA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=115838125;WS=115838107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	117329051	.	T	TAG	4237.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.114;ClippingRankSum=0.000;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.251;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=1.270;NF=24;NR=93;PP=2992;ReadPosRankSum=0.885;SC=ATATTATATATACACACACAC;SOR=1.812;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=26;TCR=99;TR=117;WE=117329059;WS=117329041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,122:0.95:128
chr5	117329138	rs4404718	G	A	2353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=68;PP=1959;SC=ACATATATACGCATATATATA;SOR=8.581;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=68;TCF=0;TCR=68;TR=68;WE=117329146;WS=117329128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr5	117896563	rs5870817	T	TATAG	476.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=425;SC=TAGATACATATATAATCTATA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=8;WE=117896571;WS=117896553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	117896617	rs5870818	ATG	A	781.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=943;ReadPosRankSum=0.151;SC=AGATATGTATATGTGTGTGTA;SOR=3.442;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=26;WE=117896648;WS=117896607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr5	117896640	rs1429735	T	C	1147.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=2;PP=963;ReadPosRankSum=-1.136;SC=TATATATATATACACACACAC;SOR=3.690;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=33;WE=117896648;WS=117896607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr5	117896669	rs5870821	AT	A	1459.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=13;PP=881;SC=TAAAGCAGGAATTTTTTTTTT;SOR=2.468;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=49;WE=117896677;WS=117896659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr5	117938634	rs147234228	CACAT	C	198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=472;SC=CACACACACACACATATATAT;SOR=4.174;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=11;WE=117938645;WS=117938624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	117938684	rs62370420	C	A	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=4;PP=441;SC=CTTGCACATACCTTAGGTCTA;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=117938692;WS=117938674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	118480316	rs4895362	G	A	2152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.756;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=42;PP=1637;ReadPosRankSum=-0.285;SC=GGCAAAGACAGCATTTTATCT;SOR=0.262;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=27;TCR=44;TR=68;WE=118480324;WS=118480306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,72:0.97:74
chr5	118529397	.	AAT	A	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=351;SC=ATGGTAAGATAATAGTTACTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=118529406;WS=118529387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	118531994	rs72784096	A	G	2827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=5;PP=2301;SC=GAATTTGTTGAGTCAAAGGGT;SOR=5.549;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=76;TCR=5;TR=81;WE=118532002;WS=118531984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr5	118556350	rs2271059	C	T	1823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=51;PP=1555;SC=ATTTACTGAACTAAAACTTTC;SOR=6.556;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=1;TCR=51;TR=52;WE=118556358;WS=118556340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	118669224	rs11959659	G	A	3250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=27;PP=2511;SC=TAGTGTACACGTCAACAGGGT;SOR=2.027;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=76;TCR=28;TR=103;WE=118669232;WS=118669214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr5	118690998	rs3813309	A	G	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=3;PP=680;SC=AACTGCAGCAATGAGTGCCCG;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=118691006;WS=118690988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	118691784	rs3797341	T	C	2321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=31;PP=1954;SC=TATCCTGACATTATGCACTCC;SOR=0.927;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=72;TCF=40;TCR=32;TR=71;WE=118691792;WS=118691774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr5	118691888	rs3797343	A	C	1398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=45;PP=1050;SC=GTGGTAGAAGAGGATGGGAGT;SOR=4.133;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=4;TCR=45;TR=49;WE=118691896;WS=118691878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	118691929	rs6595185	A	T	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=27;PP=774;SC=CTTTGTCCGCATGCCCTGCGC;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=118691937;WS=118691919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	118727161	rs72788136	G	A	4609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=2.203;SC=CTTAGGAGAAGCGAGAGAAAT;SOR=1.011;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=142;TCF=29;TCR=113;TR=140;WE=118727169;WS=118727151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,147:0.99:149
chr5	118727224	rs3733855	A	G	1916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=58;PP=1692;SC=GGAGGCTGAGATGGGCAGATC;SOR=6.736;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=59;TCF=1;TCR=58;TR=59;WE=118727232;WS=118727214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr5	118728495	.	C	CT	642.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.43;MQRankSum=0.188;QD=20.73;ReadPosRankSum=0.565;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,29:0.94:31
chr5	118728953	rs3203922	G	C	10266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=94;NR=210;PP=2965;SC=TTAATAATGTGTTTGATCATT;SOR=1.747;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=304;TCF=94;TCR=210;TR=304;WE=118728961;WS=118728943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr5	118827601	.	C	T	140	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=6;NR=0;PP=140;QD=29.1285354245;SC=TACTGTTTTACGTTTGTGCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=118827609;WS=118827600;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	118837658	rs257969	T	C	2313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=24;PP=1805;SC=AAAATGTCACTTGCGAGTAAC;SOR=1.516;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=48;TCR=24;TR=71;WE=118837666;WS=118837648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr5	118837833	rs460945	CA	TG	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=26;PP=1496;SC=CTTTTATTTCCAGATTAACCT;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=118837842;WS=118837823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	118845089	rs32663	G	A	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=6;PP=257;SC=ACCAAGACCAGTCCCTCTTCT;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=13;WE=118845097;WS=118845079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	118845139	rs32664	G	A	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=6;PP=230;SC=CCCAATGTGAGGATGATGAGG;SOR=1.270;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=118845147;WS=118845129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	118860938	rs11539471	T	C	2133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=32;PP=1536;SC=CAGTGGAGACTGGAATCCCTT;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=35;TCR=32;TR=67;WE=118860946;WS=118860928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr5	118861713	rs11205	A	G	2336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=54;PP=1918;SC=ATTCAAGGCAATTAAGGTAAA;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=19;TCR=54;TR=73;WE=118861721;WS=118861703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr5	118862971	rs2636961	C	T	272.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=254;SC=TTCCATCTTACCATTTTTTTT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=118862979;WS=118862961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	118867173	rs17145464	G	C	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=47;PP=1444;ReadPosRankSum=-0.607;SC=AACAATTAAAGACCTTTGAAG;SOR=4.977;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=48;WE=118867181;WS=118867163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr5	118877410	rs147689714	C	CT	250.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=183;SC=AATGATTTTTCTTTTTTTTAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=118877418;WS=118877400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	118965609	rs2431372	C	A	2136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=56;PP=1795;SC=TTTTTTGAGACGGAGTCTCGC;SOR=4.943;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=4;TCR=56;TR=60;WE=118965631;WS=118965599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	118965623	rs2434599	A	G	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=43;PP=1374;SC=GTCTCGCTCTATCGCCCAGGC;SOR=4.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=4;TCR=43;TR=47;WE=118965631;WS=118965599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	118968423	rs328698	T	G	2687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=22;PP=2080;ReadPosRankSum=-0.715;SC=ATATCTCTGTTCCCTTCATAC;SOR=0.827;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=78;TCF=56;TCR=22;TR=76;WE=118968431;WS=118968413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr5	118969960	rs328694	C	T	5785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=91;NR=85;PP=2965;SC=AGGTACTCCCCCCTCTGATGT;SOR=0.750;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=91;TCR=85;TR=176;WE=118969968;WS=118969950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr5	118970770	rs2434600	C	T	5856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=108;PP=2965;SC=GTGTGGCCTTCTCTTGCAAGA;SOR=1.275;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=172;TCF=64;TCR=108;TR=172;WE=118970778;WS=118970760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr5	120021819	rs1158194	G	A	4492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=64;PP=2965;SC=CAGCACACCCGTCTGCTATCC;SOR=0.854;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=76;TCR=64;TR=140;WE=120021827;WS=120021809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr5	121187792	rs142007771	C	A	1974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=4;PP=1633;SC=CAGATCGCCCCCCGCCGCCCC;SOR=4.943;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=56;TCR=4;TR=60;WE=121187800;WS=121187782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	121330223	rs6595336	C	T	1129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=2;PP=806;SC=TCTTAAGATACGGAAAGGAAC;SOR=4.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=121330231;WS=121330213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	121406076	rs3835066	G	GT	295.92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.6731;FS=3.802;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=371;ReadPosRankSum=-0.901;SC=TTTATAAATAGTTTGAGGATG;SOR=1.033;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=11;WE=121406084;WS=121406069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr5	121488506	rs35262183	C	G	8169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=152;NR=95;PP=2965;SC=AATGCACAGTCCAGCCAAGCG;SOR=1.268;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=247;TCF=152;TCR=95;TR=247;WE=121488514;WS=121488496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr5	121779262	rs2737094	C	T	1474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=10;PP=1171;SC=TCCTTCCCACCCAGACTAGAC;SOR=2.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=45;WE=121779270;WS=121779252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	121779438	rs2737095	C	T	1214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=33;PP=1042;SC=ATGCAACCTCCCTGAAAGTTG;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=35;WE=121779446;WS=121779428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	121785398	rs2737092	T	C	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=1;PP=799;SC=TTTCTGAACCTGTAAGGATGA;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=121785406;WS=121785388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	122012270	rs17132683	C	T	2921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=60;PP=2197;SC=ATCTCTCACCCACAAGGTACC;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=33;TCR=60;TR=93;WE=122012278;WS=122012260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr5	122012354	rs2407398	A	G	1471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=28;PP=1231;SC=CACAAACCTGACCCAGTATGA;SOR=1.203;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=46;WE=122012362;WS=122012344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	122272641	rs30042	A	G	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=28;PP=845;SC=CTTTTATCATAAAGTAAATTT;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=122272649;WS=122272631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	122335807	rs45551539	G	A	3305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=17;NR=90;PP=2681;SC=TGCCGGCCACGCCCACTCTTT;SOR=3.362;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=108;TCF=17;TCR=91;TR=107;WE=122335815;WS=122335797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr5	122343366	.	C	T	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.469;ClippingRankSum=0.000;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=23.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.92;ReadPosRankSum=1.166;SOR=4.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,23:0.28:81
chr5	122359502	rs70988555	A	AACACACACACACAC	493.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.57;QD=41.14;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	122359640	rs451195	T	C	1642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=18;PP=1278;SC=GATCGAGCAGTTGGTGAGTGG;SOR=1.298;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=27;TCR=18;TR=45;WE=122359648;WS=122359630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	122359839	rs144851383	G	GAC	1082.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=795;SC=TGACTACTAAGCGTTTTTTAT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=16;WE=122359854;WS=122359829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	122359840	rs374638812	CGTTTTTT	C	1082.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=971;SC=GACTACTAAGCGTTTTTTATG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=122359854;WS=122359829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	122364538	rs34341374	T	C	4916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.872;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.814;SC=ACGATGAAACTTGCTTCCTTT;SOR=2.738;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=140;TCF=29;TCR=111;TR=139;WE=122364546;WS=122364528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,145:0.99:146
chr5	122372402	rs28373879	G	C	1195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=35;PP=1010;SC=TGACGGGACTGCCGGCCGGCT;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=122372410;WS=122372392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	122685801	rs485847	G	A	3241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=73;PP=2664;SC=GAAACAAAGAGACAAGTCATA;SOR=2.101;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=26;TCR=73;TR=99;WE=122685809;WS=122685791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr5	122717920	rs142093713	G	T	3518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=75;PP=2965;SC=AAATAAAGTCGCCAAAAAACC;SOR=1.885;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=32;TCR=75;TR=107;WE=122717928;WS=122717910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr5	122758268	rs6882791	G	C	3129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=61;PP=2465;SC=ATCGCAGGAAGCCTGTATTCA;SOR=1.321;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=35;TCR=61;TR=96;WE=122758276;WS=122758258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr5	122924301	rs72791799	A	G	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=9;PP=274;SC=CTATGCTTAAAAAAAAAAGAG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=122924309;WS=122924291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	123966143	rs375097374	AGTGTGTGT	A	509.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=902;SC=TGAAGAGCAGAGTGTGTGTGT;SOR=1.981;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=9;WE=123966158;WS=123966133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	123973735	rs12655148	C	G	1767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=3.880;NF=1;NR=52;PP=1478;ReadPosRankSum=2.090;SC=CCTCTGCCTCCTGGGTTCAAG;SOR=4.407;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=54;TCF=1;TCR=53;TR=53;WE=123973743;WS=123973725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr5	123974608	rs4371750	T	C	2125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=44;PP=1659;SC=TCTAAAAAACTAATCAGTTAA;SOR=1.999;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=62;WE=123974616;WS=123974598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr5	123974673	rs62370761	T	C	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=34;PP=908;SC=AAGTTGCATGTGAAGCAACTT;SOR=4.351;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=38;WE=123974681;WS=123974663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	123983915	rs6862252	G	T	2684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=26;PP=2279;SC=TTTGCAGTTGGTAGCTTTTTT;SOR=1.697;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=56;TCR=26;TR=82;WE=123983923;WS=123983905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr5	123984763	rs7708070	C	T	5809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=119;PP=2965;SC=CAGCAGACCTCGCTCTCTTCC;SOR=1.557;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=57;TCR=119;TR=176;WE=123984771;WS=123984753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr5	123985484	rs11422549	C	CA	562.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=508;SC=TTTTTGCCAGCAAGTTCTATT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=13;WE=123985492;WS=123985474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	124036555	.	C	T	273	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=11;NR=1;PP=273;QD=25.6476010456;SC=ACAAACACGGCTCTTACTTCC;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=124036563;WS=124036554;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	125696140	rs11241887	G	A	3080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=84;PP=2583;SC=CAGTGGGTCCGGACCTGGAAC;SOR=5.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=4;TCR=84;TR=88;WE=125696148;WS=125696130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr5	125802027	rs62394179	G	A	7715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=145;PP=2965;SC=TCAGGACCAAGAGTAAGTCTT;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=240;TCF=95;TCR=145;TR=240;WE=125802035;WS=125802017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr5	125809145	rs11746520	G	A	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=167;SC=AGCTATATTTGTAGATATTTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=125809153;WS=125809135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	125821280	.	G	A	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=153;ReadPosRankSum=1.266;SC=CTTTTACCTGGGAACAATTAC;SOR=0.461;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=9;WE=125821288;WS=125821270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr5	125828803	rs4358517	A	G	985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=29;PP=868;SC=CAGGAAAGTGAGGAGGGAAAT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=29;WE=125828811;WS=125828793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	125891500	rs62391521	C	T	2709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=70;NR=16;PP=2235;SC=AGCCTAATAACCTGCTTCATG;SOR=2.941;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=71;TCR=16;TR=86;WE=125891508;WS=125891490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr5	125895126	.	G	GT	176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.685;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=8.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=-0.203;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.782;SOR=0.070;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr5	125944219	rs112502491	G	GTGTTTT	1923.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=32;PP=1849;SC=TGTTTATCCTGTGTTTTTGTT;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=2;TCR=53;TR=32;WE=125944227;WS=125944209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	126113129	.	C	G	147.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=86;SC=GTCCCCGCTTCGCCCCCTGCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=4;WE=126113137;WS=126113119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	126250459	.	A	AACACAC	472.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=1;PP=303;SC=CTCTTTCTCAAACACACACAC;SOR=4.977;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=7;WE=126250467;WS=126250449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	126387452	rs182181206	G	A	458.96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.662;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=364;ReadPosRankSum=-0.923;SC=GGAAAATCATGAGGGCATCAG;SOR=4.174;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=15;WE=126387460;WS=126387442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,16:0.89:18
chr5	126746277	rs31483	C	T	983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=23;PP=799;SC=TCCCTGCCACCTGGAAAACAC;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=126746285;WS=126746267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	126792974	rs3812052	T	A	4167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=94;PP=2965;SC=AGGACAGTGGTGGTAGCAGCA;SOR=2.284;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=32;TCR=94;TR=126;WE=126792982;WS=126792964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr5	126993249	rs45074	G	C	4440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=31;PP=2965;SC=CATCCCTAGTGCCCCTTGGGA;SOR=2.551;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=105;TCR=31;TR=136;WE=126993271;WS=126993239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr5	126993263	rs248709	A	T	4435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=42;PP=2965;SC=CTTGGGAACGAATCAGCAGAT;SOR=1.901;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=98;TCR=42;TR=140;WE=126993271;WS=126993239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr5	127485599	rs2617618	C	T	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=9;PP=628;SC=TGGGGTGTTACGTTGTTATCT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=127485607;WS=127485589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	127609633	rs2291628	G	A	5039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=89;PP=2965;SC=TCCACAAAGCGAAGGTTGAGA;SOR=1.201;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=63;TCR=89;TR=152;WE=127609641;WS=127609623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr5	127613791	rs426987	C	G	1328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=36;PP=1059;SC=ATGGAGATGACATAACTAACT;SOR=4.514;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=39;WE=127613799;WS=127613781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	127614472	rs190450	A	G	2767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=54;PP=2157;ReadPosRankSum=0.263;SC=GATTGCGACTACTGGATGCCA;SOR=1.191;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=37;TCR=55;TR=90;WE=127614480;WS=127614462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,91:0.98:93
chr5	127616014	rs28763927	A	G	3555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=83;PP=2965;SC=TTTCATCTTTAGAAAAACAAA;SOR=2.531;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=24;TCR=83;TR=107;WE=127616022;WS=127616004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr5	127636485	rs28763934	C	T	1304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=10;PP=1129;SC=TACTAGTGGGCCTCAGAATAA;SOR=2.247;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=41;WE=127636493;WS=127636475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	127637362	rs2307110	A	G	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=368;SC=CATAAGGATCATATAATTAAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=127637370;WS=127637352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	127638759	rs11955288	A	G	4947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=114;PP=2965;ReadPosRankSum=0.608;SC=TTCCACATGGATGCCGCTCGC;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=39;TCR=115;TR=152;WE=127638767;WS=127638749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,158:0.99:159
chr5	127640783	rs27713	G	A	3415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=87;PP=2818;SC=ATCTAAAACAGAAAAAAATAA;SOR=3.111;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=17;TCR=88;TR=104;WE=127640791;WS=127640773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr5	127646859	rs3215046	GA	G	202.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=139;SC=ACATTGATATGAAAAAAAAAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=127646867;WS=127646849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	127685135	rs154001	C	T	1275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=18;PP=1100;SC=TTTGGACAAACGCCAGGGAAC;SOR=0.902;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=22;TCR=18;TR=40;WE=127685143;WS=127685125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	127685624	rs255690	C	A	2621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.873;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=26;PP=1985;ReadPosRankSum=-0.820;SC=TGTATAGTATCTTCCAAGGAA;SOR=1.545;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=80;TCF=53;TCR=27;TR=79;WE=127685632;WS=127685614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,85:0.99:86
chr5	127744469	rs28763954	G	A	4276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=11.259;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=80;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.354;SC=CATATCCCAGGAATGATGCTG;SOR=0.723;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=138;TCF=58;TCR=80;TR=135;WE=127744477;WS=127744459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,138:0.98:141
chr5	128359247	rs31271	T	C	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=350;SC=AAATTGCTTGTACAAGTAACT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=128359255;WS=128359237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	128863471	rs6595908	A	G	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=6;PP=509;SC=CAAGAGTCTGAGTGTGCAGGT;SOR=1.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=20;WE=128863479;WS=128863461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	129015452	rs30645	T	C	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=5;PP=649;SC=TGAACCTCTTTATAGCTCTCC;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=129015460;WS=129015442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	129015668	rs246443	T	C	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=20;PP=545;SC=TGGCAAGGAATATTCCCAGTG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=129015676;WS=129015658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	129072943	rs1465686	G	T	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=18;PP=490;SC=CACAGCTCTTGGCAATTACAT;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=129072951;WS=129072933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	129100819	rs35674869	AC	A	726.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=459;SC=AACATTTGAAACCCCCCCCAC;SOR=5.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=22;WE=129100827;WS=129100809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr5	129240972	rs33917	G	C	1585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=34;NR=21;PP=1292;SC=ACGGCCGGCCGGGGAGTAGCC;SOR=1.262;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=34;TCR=21;TR=55;WE=129240980;WS=129240962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	129244122	rs32234	C	T	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=32;PP=953;ReadPosRankSum=-0.672;SC=TCTAGGGCAGCGATTCTATTC;SOR=2.891;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=35;WE=129244141;WS=129244112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr5	129244133	rs2431206	A	G	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=29;PP=852;SC=GATTCTATTCATTCTCTCTGT;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=129244141;WS=129244112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	129519874	rs10066410	G	A	1046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=0;PP=840;SC=TTTCTTTTTAGATAAATCTTT;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=129519882;WS=129519864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	129521126	rs2015018	A	G	6228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=100;PP=2965;SC=CCCACTGATGATTACTTCATA;SOR=0.845;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=89;TCR=100;TR=189;WE=129521134;WS=129521116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr5	130766662	rs1291602	T	C	3707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=67;PP=2965;SC=CAATACTCTCTGTTTAACTGT;SOR=0.958;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=55;TCR=67;TR=122;WE=130766670;WS=130766652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr5	130808198	rs31241	T	C	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=8;PP=692;SC=CAAGTAACTCTAGCACTTGCT;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=130808206;WS=130808188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	130831365	rs40400	T	C	3034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=61;PP=2396;SC=TGTGGAAACATAAAAGAGGCA;SOR=1.337;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=35;TCR=62;TR=96;WE=130831373;WS=130831355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr5	130867733	rs1029472	G	A	1774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=0;PP=1393;SC=CTCATTTACAGTTCAAAATAA;SOR=7.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=49;WE=130867741;WS=130867723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr5	130982706	.	AG	A	2672.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.868;NF=86;NR=4;PP=2971;ReadPosRankSum=1.541;SC=AAAAGGAAAAAGGGCAATTCT;SOR=0.637;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=136;TCF=131;TCR=5;TR=90;WE=130982714;WS=130982696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,95:0.71:134
chr5	130982768	rs26006	A	G	8902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=184;NR=92;PP=2965;SC=GCCAAAAAAGAAACCATTAAC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=276;TCF=184;TCR=92;TR=276;WE=130982776;WS=130982758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr5	131006082	rs27450	A	G	1777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=1;PP=1554;SC=GACCAAAAATATAAGGCAATT;SOR=6.479;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=51;TCR=1;TR=52;WE=131006090;WS=131006072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	131006356	rs26007	T	A	4025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=38;NR=92;PP=2965;SC=AAGACATTTATTTAGTAATAA;SOR=1.816;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=38;TCR=93;TR=130;WE=131006364;WS=131006346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr5	131006381	.	TA	T	46.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=2.021;QD=0.67;ReadPosRankSum=1.094;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,12:0.17:70
chr5	131008194	rs26008	T	C	6740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=134;PP=2965;SC=AGAAATCATCTGGCACTCATC;SOR=1.309;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=218;TCF=84;TCR=134;TR=218;WE=131008202;WS=131008184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr5	131066577	rs7729787	A	C	2647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=5;PP=2295;SC=TGAATAAATAAATGACATCAA;SOR=5.136;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=84;TCF=78;TCR=6;TR=83;WE=131066585;WS=131066567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr5	131066725	rs7730228	C	A	4817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=97;PP=2965;SC=GCATCACTGCCGAGTTTCTGA;SOR=1.533;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=49;TCR=97;TR=146;WE=131066733;WS=131066715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr5	131312238	rs11743803	A	G	1530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.374;HP=12;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.458;NF=74;NR=3;PP=2430;ReadPosRankSum=0.203;SC=TTATATCAAGAAAAAAAAAAA;SOR=2.891;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=88;TCF=84;TCR=4;TR=77;WE=131312246;WS=131312227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:8,68:0.89:76
chr5	131312327	rs370652	G	T	8718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=157;NR=112;PP=2965;SC=CAACAGTAATGCTACTTTATT;SOR=1.098;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=269;TCF=157;TCR=112;TR=269;WE=131312335;WS=131312317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr5	131321159	rs11740791	G	C	1235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=34;PP=947;SC=GGGCTGCAGGGGTGAGAAGAG;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=39;WE=131321167;WS=131321149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	131322494	rs77938	C	T	2906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=40;PP=2345;SC=TCAATAAAGACCTGCAGGTGA;SOR=1.029;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=94;TCF=53;TCR=41;TR=93;WE=131322502;WS=131322484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr5	131322666	rs67212057	CCACACACTCACA	C	369.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=1983;SC=ACACACATACCCACACACTCA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=10;WE=131322685;WS=131322656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	131324119	rs71970	T	G	2803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=2;PP=2391;SC=CAGAAGGCCATGGAACCTCCT;SOR=6.568;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=79;TCF=77;TCR=2;TR=79;WE=131324127;WS=131324109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr5	131324250	rs3043838	C	CTG	7170.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.17;NF=47;NR=93;PP=2969;SC=GGGCTGTACCCTGTGTGGAGG;SOR=0.960;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=167;TCF=59;TCR=108;TR=140;WE=131324258;WS=131324240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr5	131325888	rs422130	A	G	1948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=24;PP=1405;SC=CTTGTGTCAGAGAGGGGTCAG;SOR=0.899;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=33;TCR=24;TR=57;WE=131325896;WS=131325878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	131326522	rs5871439	AC	A	2344.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=56;NR=16;PP=1527;SC=GCCCCTCCACACCCCCCCCCA;SOR=2.613;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=82;TCF=62;TCR=20;TR=72;WE=131326530;WS=131326511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr5	131330054	rs253944	C	G	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=8;PP=233;SC=GGCAGGCCCTCGGGGAGTTGG;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=131330062;WS=131330044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	131347520	rs4705908	G	A	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=2;PP=235;SC=TGACCGCGGTGTCGGAACCGC;SOR=1.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=131347528;WS=131347510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	131534499	rs3749756	C	T	1314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=7;PP=1051;SC=GGCTGAAATGCTCCTAGAAGC;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=41;WE=131534507;WS=131534489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	131546280	rs154483	A	G	3035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=82;PP=2498;SC=AGAGATTCCCACTTCAAGGAA;SOR=5.046;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=6;TCR=82;TR=88;WE=131546288;WS=131546270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr5	131553340	rs2301579	C	A	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=503;SC=CCCCACATCACCCTCTCAAAG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=131553348;WS=131553330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	131553428	rs3214098	T	TA	2787.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=9;PP=2752;SC=CTAAGGATGGTTGGGGACTTA;SOR=3.458;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=54;TCR=9;TR=62;WE=131553436;WS=131553418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr5	131553665	rs154485	A	G	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=20;PP=620;SC=CAGCTCTCTGAGGATTATGGG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=131553673;WS=131553655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	131593336	rs70974026	C	CG	97	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.25;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	131593363	.	GGCT	G	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.87;QD=41.61;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	131593373	.	GCGGCGGCTC	G	572.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.11;QD=40.91;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	131602166	rs1007602	T	C	4668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=50;NR=91;PP=2965;SC=GGCCTGAGGGTAGGAGCTGGC;SOR=1.467;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=50;TCR=91;TR=141;WE=131602174;WS=131602156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr5	131607300	rs55722650	C	T	5053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=79;PP=2965;SC=TTGCTACAACCTTGCTACGCC;SOR=0.772;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=74;TCR=79;TR=153;WE=131607308;WS=131607290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr5	131607402	rs10479000	T	C	7844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=171;NR=65;PP=2965;SC=CGATGGCCCGTCTGGCGCCCA;SOR=2.035;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=237;TCF=172;TCR=65;TR=236;WE=131607410;WS=131607392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr5	131630852	rs35260072	A	C	3362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=33;PP=2655;ReadPosRankSum=0.035;SC=TGTGCACCCCAAGAAAGAATA;SOR=0.679;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=69;TCR=33;TR=101;WE=131630860;WS=131630842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,105:0.99:106
chr5	131649186	rs270607	A	G	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=425;SC=GATGTGACAGAGAAAAAAGTC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=131649194;WS=131649176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	131658085	rs270600	T	C	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=14;PP=436;SC=CCCTCTGCTGTGGGTCAGCAC;SOR=1.230;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=131658093;WS=131658075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	131660119	rs273915	G	C	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=442;SC=CCTGCTCACTGTGCCCTAAGG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=131660127;WS=131660109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	131660431	rs273914	A	T	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=386;SC=TCAGTATGAGACAAGCTCTCC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=131660439;WS=131660421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	131663062	rs272893	T	C	4192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=75;PP=2965;SC=ATGAACAACATAGCTGTACCA;SOR=1.011;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=52;TCR=75;TR=127;WE=131663070;WS=131663052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr5	131670546	rs272879	C	G	1535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=38;PP=1239;SC=TATTGCGAACCCTGCCCAGGC;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=49;WE=131670554;WS=131670536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	131671769	rs272878	T	C	555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=384;SC=ATTGTGAAAATGTCAAATAGC;SOR=4.615;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=131671777;WS=131671759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	131676320	rs1050152	C	T	4604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=65;PP=2965;SC=GATTGGAATCCTCACCCTTTT;SOR=0.807;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=141;TCF=75;TCR=66;TR=140;WE=131676328;WS=131676310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr5	131701279	rs367805	T	C	1881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=35;PP=1353;SC=ACTGGACAGATGCTCTGAATC;SOR=0.784;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=31;TCR=36;TR=66;WE=131701287;WS=131701269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr5	131719999	rs4551059	A	G	1790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=39;PP=1407;SC=CCTGGGTATGACCATCAGGTT;SOR=2.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=49;WE=131720007;WS=131719989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	131730052	rs60522531	CA	C	3557.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.219;NF=7;NR=91;PP=2966;ReadPosRankSum=0.897;SC=CCTTCAGTGACAAAAGGCCTT;SOR=2.111;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=103;TCF=8;TCR=95;TR=98;WE=131730060;WS=131730042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,113:0.99:114
chr5	131755477	rs4451042	G	T	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=408;SC=CGGATGATTGGGGCCGTTGCT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=131755485;WS=131755467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	131792639	rs3214157	A	AT	1438.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.501;NF=38;NR=14;PP=997;ReadPosRankSum=-0.644;SC=ACCTGTAGGGATTTTTTTTTA;SOR=0.765;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=63;TCF=47;TCR=16;TR=52;WE=131792647;WS=131792629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,57:0.90:63
chr5	131796498	rs2522048	T	C	5572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=85;PP=2965;SC=AACAAAACCATCAGCCCTGCT;SOR=0.837;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=76;TCR=85;TR=161;WE=131796506;WS=131796488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr5	131796573	rs2522049	T	C	2984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=77;PP=2129;SC=CCTGTAATGGTGGTTGTGAGG;SOR=2.415;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=104;TCF=25;TCR=79;TR=102;WE=131796581;WS=131796563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr5	131821520	rs142244361	G	GAC	116.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=171;ReadPosRankSum=0.210;SC=CTGTCTCTCTGACACACACAC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=131821528;WS=131821510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr5	131892357	rs2706335	C	T	6000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=108;PP=2965;SC=AGTTTTGACACGAACTGACCC;SOR=1.083;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=77;TCR=108;TR=185;WE=131892365;WS=131892347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr5	131892979	rs4526098	G	A	2972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.224;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=12;PP=2458;ReadPosRankSum=-0.789;SC=GCCTTTGTGGGCTCCAGGTCC;SOR=3.494;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=94;TCF=80;TCR=14;TR=92;WE=131892987;WS=131892969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,92:0.99:93
chr5	131951857	rs104895048	C	T	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=13;PP=357;SC=TTTAAATAAACGTCTTTATTA;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=131951865;WS=131951847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	131995843	rs1295686	T	C	1643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=8;PP=1341;SC=GTTCTACTCATGTGCTGACCT;SOR=3.300;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=52;WE=131995851;WS=131995833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	131995964	rs20541	A	G	5851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=87;PP=2965;SC=CGCGAGGGACAGTTCAACTGA;SOR=0.930;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=110;TCR=88;TR=196;WE=131995972;WS=131995954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr5	132036252	rs1468216	T	C	5168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=75;PP=2965;SC=TACTGGACCATGTTCCTCCCC;SOR=1.009;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=175;TCF=100;TCR=75;TR=175;WE=132036260;WS=132036242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr5	132036489	rs1468215	A	T	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=195;SC=TGAGTAATAAAAGTCTCAAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=132036497;WS=132036479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	132038199	rs3213639	C	T	4842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=128;NR=14;PP=2965;SC=AAAGAACTCCCTTTTAAAAAA;SOR=4.332;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=128;TCR=14;TR=142;WE=132038207;WS=132038189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr5	132039132	rs2285700	C	A	1722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=4;PP=1346;SC=ATCATGAATTCATCTCAATTC;SOR=4.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=48;TCR=4;TR=52;WE=132039140;WS=132039122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	132046789	rs11740584	G	C	5415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=138;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.792;SC=TATCCTGTACGAAGTCATTAG;SOR=3.495;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=11;TCR=140;TR=149;WE=132046797;WS=132046779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,158:0.99:159
chr5	132056147	rs2074529	C	A	2426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=1;PP=2022;SC=TTTCATTCATCTATGCTCTCT;SOR=7.249;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=73;TCF=72;TCR=1;TR=73;WE=132056155;WS=132056137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr5	132070242	rs7732520	C	T	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=360;SC=AATTTATAAACTTTAAAAGGC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=132070250;WS=132070232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	132084909	.	C	G	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=4;PP=972;SC=GATCATGCCACTGCACTCCAG;SOR=3.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=36;WE=132084917;WS=132084899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	132098242	rs30510	A	G	5042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=76;PP=2965;SC=TCTGGACCCCATTGCTGACCA;SOR=0.890;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=169;TCF=92;TCR=77;TR=168;WE=132098250;WS=132098232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr5	132149684	rs40274	G	C	2235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=32;PP=1761;SC=CCCTTGGTCCGGGTGCCGCGG;SOR=0.955;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=74;WE=132149692;WS=132149674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr5	132150948	rs40470	T	G	6488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=78;NR=120;PP=2965;SC=TGCCCAGTTTTCCTCCAACAA;SOR=1.234;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=199;TCF=78;TCR=121;TR=198;WE=132150956;WS=132150938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr5	132198199	rs254286	G	A	3038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=73;PP=2480;ReadPosRankSum=-0.946;SC=AGTGTTCAACGGTAGTAATGC;SOR=1.697;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=17;TCR=74;TR=90;WE=132198207;WS=132198189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,92:0.99:93
chr5	132198287	rs254285	C	G	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=32;PP=949;SC=GCTTGAAAATCAGTCAACACA;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=132198295;WS=132198277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	132220748	rs45441396	C	T	1282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.54;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	132220941	rs142786008	CGTGT	C	188.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=2;PP=162;SC=CACCAAAATACGTGTGTGTGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=2;WE=132220952;WS=132220931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	132227677	rs6596093	A	G	1528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=2;PP=1150;SC=CTGACTTACCACCTTCACAGT;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=47;TCR=2;TR=49;WE=132227685;WS=132227667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	132228133	rs11739417	A	G	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=404;SC=TTCTCCACACAGTAATACAGG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=132228141;WS=132228123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	132234152	rs34099243	C	CG	598.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=15;PP=662;SC=ACATCCAAATCGACAACCAAC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=15;WE=132234160;WS=132234142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	132270663	rs10039125	T	A	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=29;PP=902;SC=AATAAAATTATAAAATGAGCA;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=132270671;WS=132270653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	132273031	rs2288387	T	C	117.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=88;SC=AGCTGGGTTTTGGTAATGGTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=132273039;WS=132273021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	132388068	rs76836760	T	G	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=22;PP=934;SC=GGGCCGGGCCTGCCGCGTGCA;SOR=0.902;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=18;TCR=22;TR=40;WE=132388076;WS=132388058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	132403057	rs11448270	T	TA	1171.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=9.035;HP=13;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.316;NF=40;NR=2;PP=834;ReadPosRankSum=2.083;SC=GCTGTTGAAATAAAAAAAAAA;SOR=5.376;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=53;TCF=47;TCR=6;TR=42;WE=132403065;WS=132403047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,45:0.96:47
chr5	132403341	rs6596098	C	T	1419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=37;PP=1064;SC=TGTCAGATTGCAATGAAAATG;SOR=6.138;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=38;WE=132403349;WS=132403331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	132403359	rs6596099	T	A	1283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=34;PP=975;SC=ATGCTTACAGTTGCTTAGGGA;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=132403367;WS=132403349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr5	132405931	rs113739155	C	CT	485.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.638;NF=25;NR=0;PP=370;ReadPosRankSum=-0.276;SC=CGAAAACTAGCTTTTTTTTTT;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=25;WE=132405939;WS=132405926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,21:0.88:24
chr5	132409074	rs56121115	A	G	3970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.920;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=94;PP=2965;ReadPosRankSum=1.679;SC=GAAGATTGTGAAATTTTAAAA;SOR=2.768;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=119;TCF=24;TCR=95;TR=117;WE=132409082;WS=132409064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,122:0.99:123
chr5	132409650	rs62375234	C	T	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=1;PP=481;SC=TTTACTTAGACGTTATTTTTA;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=132409658;WS=132409640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	132409867	rs62375235	T	G	457.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=354;ReadPosRankSum=-0.528;SC=ATGGTAATTATGAAATTTTGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=14;WE=132409875;WS=132409857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr5	132412299	rs11747001	A	G	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=1;PP=813;SC=CATCTGTTTCAAAATCGATTG;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=34;WE=132412307;WS=132412289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	132425415	rs200901091	G	A	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=34.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQRankSum=-2.341;QD=4.52;ReadPosRankSum=2.610;SOR=5.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr5	132428503	rs12055249	T	C	680.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=2.607;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.42;MQRankSum=0.000;QD=24.32;ReadPosRankSum=-2.079;SOR=0.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,24:0.86:28
chr5	132435488	rs4301229	C	T	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=32;PP=885;SC=GACTTAGGCTCATTATCATTC;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=132435496;WS=132435478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	132437531	rs1131809	C	T	1359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=32;PP=1082;SC=GGAAACAGATCCAACAGTATA;SOR=2.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=41;WE=132437539;WS=132437521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	132561277	rs2241583	G	A	1961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=5;PP=1604;SC=TATACCTCTCGTTTCCATTCC;SOR=4.479;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=53;TCR=5;TR=58;WE=132561285;WS=132561267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr5	132569260	rs35758896	GCCT	G	3251.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=43;PP=2854;SC=GATGAGACTGGCCTCTTTATT;SOR=1.457;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=62;TCF=19;TCR=43;TR=61;WE=132569270;WS=132569250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr5	133316707	.	C	CT	83.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.000;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.86;ReadPosRankSum=1.047;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,12:0.27:45
chr5	133537438	rs2302598	T	A	2819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=7;PP=2313;SC=TTAAAAAATATCCCCAAAGGG;SOR=4.307;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=82;TCF=74;TCR=8;TR=81;WE=133537446;WS=133537428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr5	133537479	rs2302599	T	G	3879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=39;PP=2925;SC=CATAAGCACCTGAACACTAAA;SOR=1.869;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=127;TCF=88;TCR=39;TR=126;WE=133537487;WS=133537469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr5	133541548	rs2239543	A	G	367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=543;SC=TAACTGGGGGAAAAAAAACTT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=133541556;WS=133541538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	133561589	rs3863186	G	C	3322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=77;PP=2724;SC=GCTCCGCGCTGCTCCCGCGCC;SOR=1.970;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=31;TCR=77;TR=108;WE=133561597;WS=133561579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr5	133657610	rs139337657	G	GA	5725.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.476;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.321;NF=28;NR=151;PP=2854;ReadPosRankSum=0.976;SC=ACAGATCAGGGAAAAAAAAAT;SOR=1.674;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=221;TCF=37;TCR=184;TR=179;WE=133657618;WS=133657600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,205:0.99:208
chr5	133707192	rs34553375	C	T	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=9.638;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=4;PP=956;ReadPosRankSum=1.628;SC=GCGGCGGCGGCGGCGATCCAC;SOR=4.260;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=45;TCR=4;TR=47;WE=133707200;WS=133707182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
chr5	133873572	rs329126	A	C	2604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.91;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr5	133873577	rs2304082	C	T	2722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.92;SOR=3.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	133896744	rs2589404	A	G	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=30;PP=910;SC=TGTGGACAGAAGCCCTTAAGA;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=32;WE=133896752;WS=133896734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	133898136	rs10056247	C	T	580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=472;SC=GGTAGCAGAGCACTGGGAAAA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=133898144;WS=133898126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	133900111	rs329311	A	C	2743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=26;PP=2126;SC=CAGCAGACAAACCCCCATTTT;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=56;TCR=26;TR=82;WE=133900119;WS=133900101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	133902288	rs2044318	C	T	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=29;PP=875;SC=CCCATGCCGCCTGCCCACCCC;SOR=5.421;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=133902296;WS=133902278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	133944043	rs201249311	AT	A	291.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=7.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-1.235;QD=4.23;ReadPosRankSum=-0.919;SOR=0.102;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,25:0.36:69
chr5	133956668	rs11558540	G	A	1874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=38;PP=1523;SC=TCATCTTTTAGCATGTGTAGC;SOR=1.781;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=16;TCR=38;TR=54;WE=133956676;WS=133956658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	133984645	rs61421945	CT	C	3788.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=14;PP=2983;ReadPosRankSum=0.794;SC=GCGCCCCCCCCTCTTCTCCCA;SOR=1.402;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=103;TCF=80;TCR=23;TR=75;WE=133984653;WS=133984635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,106:0.99:107
chr5	134015523	rs10042142	C	G	1308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=40;PP=1104;SC=TTATTTACCTCTAGTCAATCC;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=40;WE=134015531;WS=134015513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	134033777	rs246341	G	A	2693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=72;PP=2257;SC=GCGTAGGACTGAATAATATTT;SOR=3.994;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=8;TCR=73;TR=80;WE=134033785;WS=134033767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr5	134109602	rs2059803	A	G	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=33;PP=935;SC=AGAATATTATATGAATAATAT;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=134109610;WS=134109592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	134113558	rs254713	G	A	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=472;SC=TACTTTTTCTGAGTACCAGAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=134113566;WS=134113548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	134164284	rs34675300	GT	G	207.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.93;ReadPosRankSum=-1.470;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr5	134346304	rs877812	G	A	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=12;PP=344;SC=AGTGAAGGGGGTGATGACTGA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=134346312;WS=134346294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	134364406	rs71660434	TCCGCGC	T	716.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=1;PP=740;SC=GCGTGCGTCCTCCGCGCCCGC;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=14;WE=134364419;WS=134364396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	134364996	rs1131611	G	T	2536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=58;PP=1985;SC=TTGGCTCGCCGGTTCTTGAAC;SOR=2.391;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=19;TCR=58;TR=77;WE=134365004;WS=134364986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr5	134365070	rs10056994	C	T	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=25;PP=736;SC=GACCCCACCCCCTTCCCCACC;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=134365078;WS=134365060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	134365091	rs474853	T	C	735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=22;PP=657;SC=GCCTGGAGCCTTCCGTCGGCC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=134365099;WS=134365081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	134368400	rs7700313	T	C	1030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=0;PP=817;SC=CTCTCTAGGTTTTAAAAATAA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=27;WE=134368408;WS=134368390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	134368721	rs10716861	CA	C	1128.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=38;PP=1099;SC=CCAGCTCGGACAAAAAAAGGC;SOR=6.043;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=39;WE=134368729;WS=134368711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	134369258	rs72800397	G	A	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=261;SC=CCGTCAGGTCGAGAACGGGAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=134369266;WS=134369248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	134670855	.	C	G	3028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=77;PP=2377;SC=GATAAGCACTCAGCAACTGGG;SOR=3.684;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=10;TCR=78;TR=87;WE=134670863;WS=134670845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr5	134782414	rs12518053	G	T	6063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.260;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=122;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.826;SC=AGATGTTTCCGGGCTCCCTCC;SOR=1.123;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=69;TCR=122;TR=190;WE=134782422;WS=134782404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,191:0.99:192
chr5	134782450	rs12520799	T	A	5396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=97;PP=2965;SC=GTCTTCCTTCTGCTGCTATGC;SOR=1.273;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=60;TCR=97;TR=157;WE=134782458;WS=134782440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr5	134782510	rs12520809	T	C	4983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=83;PP=2965;SC=CTCGAAAGATTGGAGTTGCAG;SOR=0.807;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=161;TCF=76;TCR=85;TR=159;WE=134782518;WS=134782500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr5	134782576	rs1031844	T	G	4388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=60;PP=2965;SC=GCTGGCAAGGTTTTGTTCCTC;SOR=0.799;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=71;TCR=60;TR=131;WE=134782584;WS=134782566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr5	134871440	rs8192558	A	C	1542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=44;PP=1309;SC=TGCAGCCCGGACTGAGGGCAG;SOR=4.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=48;WE=134871448;WS=134871430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	135138782	rs11738183	T	C	112.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=3;PP=66;SC=TAATATCCTATGGAGGTATTA;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=135138790;WS=135138772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	135178124	rs2304075	T	C	1335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=16;PP=929;SC=GTGTCATCGTTGGCCACCCTC;SOR=1.414;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=44;WE=135178132;WS=135178114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	135185983	rs113304805	G	A	2024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=11;PP=1581;SC=CACCAGCCTGGCCAGGACTGA;SOR=3.021;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=49;TCR=11;TR=60;WE=135185991;WS=135185973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr5	135186075	rs2304077	A	G	3821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=67;PP=2931;SC=GGCTATGAATAACCTCTGCGC;SOR=0.882;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=53;TCR=68;TR=120;WE=135186083;WS=135186065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr5	135188214	rs2304078	G	C	5546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=139;NR=29;PP=2965;SC=ACGGCAGCCCGGGGTCCTCAC;SOR=3.056;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=168;TCF=139;TCR=29;TR=168;WE=135188222;WS=135188204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr5	135276201	rs1160982	AGTT	A	2947.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=10;PP=2892;SC=CAGCACTTACAGTTGTTTTTA;SOR=3.360;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=68;TCF=54;TCR=14;TR=59;WE=135276211;WS=135276191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr5	135276314	rs40986	C	T	3522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=71;PP=2859;SC=CTAAGACTCCCAAAGATGAGT;SOR=1.449;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=37;TCR=71;TR=108;WE=135276322;WS=135276304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr5	135276701	rs31548	T	C	3755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=90;NR=26;PP=2965;SC=TGAGAATTTTTCCCAACTTCC;SOR=2.384;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=117;TCF=91;TCR=26;TR=116;WE=135276709;WS=135276691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr5	135276814	rs2066913	G	A	4326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.239;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=82;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.715;SC=TCTCAAGCGAGACTCATGTTA;SOR=1.115;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=129;TCF=47;TCR=82;TR=128;WE=135276822;WS=135276804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,137:0.99:138
chr5	135276847	rs31547	T	C	3500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=71;PP=2566;SC=TTCGAATTGATGTTGTGAGTG;SOR=1.207;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=45;TCR=71;TR=116;WE=135276855;WS=135276837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr5	135277394	rs11376205	G	GT	993.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=28;PP=882;SC=TGTTGTTGTTGTTTTTTTAAT;SOR=3.193;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=30;WE=135277402;WS=135277384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	135283222	rs977691	T	A	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=30;PP=853;SC=TATCTGGGCTTCAGTAATCTT;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=135283230;WS=135283212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	135287029	rs31517	T	C	4691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=121;PP=2965;SC=GAGCACAAGATGTCCACACCC;SOR=2.360;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=160;TCF=39;TCR=121;TR=160;WE=135287037;WS=135287019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr5	135365006	rs4976361	A	G	205.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=5;PP=166;SC=ACCTTGCAGCATGGAGCGCTC;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=135365014;WS=135364996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	135379612	rs4976464	A	G	1283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=2;PP=1016;SC=CTTAGCAAATAACTCCTAAGA;SOR=5.031;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=36;WE=135379620;WS=135379602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	135382989	rs1442	G	C	2708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=31;PP=2211;SC=GTGCCCGGCTGCTGAAAGCCG;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=47;TCR=31;TR=78;WE=135382997;WS=135382979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr5	135513085	rs55765823	T	TC	2143.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=35;PP=2192;SC=GGATTGAGATTATCTTCATGG;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=13;TCR=35;TR=48;WE=135513093;WS=135513075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	135700760	rs11307237	GA	G	346.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=254;SC=TTCTATAAAAGAAAAAAAAAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=14;WE=135700768;WS=135700750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	135700900	rs11404834	G	GA	3401.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.911;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.388;NF=53;NR=47;PP=1595;ReadPosRankSum=0.477;SC=ACCTCTACTGGAAAAAAAAAT;SOR=0.401;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=64;TCR=54;TR=100;WE=135700908;WS=135700890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,127:0.97:131
chr5	136315200	rs3217011	AT	A	3282.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=56;PP=2967;SC=AGACATGCAGATGATACTCGG;SOR=1.816;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=70;TCF=12;TCR=58;TR=68;WE=136315208;WS=136315190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr5	136315221	rs13158661	C	T	1985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=46;PP=1578;SC=GGTTAATGCCCGTCAACACAG;SOR=2.621;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=13;TCR=46;TR=59;WE=136315229;WS=136315211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	136328015	rs13181865	T	G	198.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=178;SC=ATGCCTATACTAAACATTTTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=136328023;WS=136328012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	136328367	rs3777224	C	T	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=448;SC=GGCAAAGCCACGTTCAAAGCA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=136328375;WS=136328357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	136833955	rs372446202	CCA	C	106.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.15;QD=21.37;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	136997803	.	A	AAG	672.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=65.33;QD=35.41;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	137027953	rs2301710	A	T	291.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=243;SC=GAGGAGGTGCAGCAGTCCGGC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=137027961;WS=137027943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	137028029	rs2905608	T	C	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=18;PP=901;SC=CATCTGCAAATGCACGGATGC;SOR=0.902;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=24;TCR=18;TR=41;WE=137028037;WS=137028019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	137056006	rs11741787	A	C	906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.27;QD=39.42;SOR=6.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	137056027	rs6887727	T	C	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=3;PP=806;SC=GGAACTCAAGTGACTAAGAAT;SOR=4.174;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=35;WE=137056035;WS=137056017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	137206560	rs6890689	A	C	6065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=79;NR=104;PP=2965;SC=TGCTTCTCCCAAGCAGCATGC;SOR=0.972;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=79;TCR=104;TR=183;WE=137206568;WS=137206550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr5	137216416	rs71578936	G	A	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=3;PP=850;SC=GCCAAAATAGGAATGTTCCTT;SOR=4.047;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=32;WE=137216424;WS=137216406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	137257288	rs4304074	A	G	1408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=1;PP=1230;SC=GTATGTACATAAAGGTATATA;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=42;WE=137257296;WS=137257278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	137259179	rs12187140	T	C	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=20;PP=1124;SC=GGCAGAAGGCTAGATTTTGAA;SOR=0.739;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=41;TCF=21;TCR=20;TR=40;WE=137259187;WS=137259169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	137259251	rs13188503	C	T	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=24;PP=831;SC=CTAAGACAAACCTCATATAGT;SOR=2.235;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=137259259;WS=137259241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	137271968	rs7701617	T	G	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=630;SC=ACATGAAAGTTTATTACTGAC;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=137271976;WS=137271958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	137282012	.	C	A	97	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=15;MQ=57.24;NF=0;NR=13;PP=97;QD=10.136247119;SC=TGGAATTAAACAAAAAAAATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=13;WE=137282020;WS=137282002;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:21,13:0.38:34
chr5	137347498	rs10064910	G	A	3264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=48;PP=2455;SC=AAGAATTTGCGGACCAAATTT;SOR=0.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=54;TCR=49;TR=102;WE=137347506;WS=137347488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr5	137354851	rs57706343	C	CA	243.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=24.31;ReadPosRankSum=-1.036;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr5	137372207	rs6596419	A	T	6887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=98;NR=102;PP=2965;SC=CTCTGAGCAGATCCATTGAAG;SOR=0.770;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=202;TCF=100;TCR=102;TR=200;WE=137372215;WS=137372197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr5	137420376	rs4835762	T	C	1195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=29;PP=870;SC=GTGAATGGAGTGGGGCTTGCA;SOR=2.531;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=38;WE=137420384;WS=137420366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	137454358	rs6878575	C	G	257.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=56.36;NF=7;NR=1;PP=213;SC=ATTTTTAGTACAGACGGGGTT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=137454366;WS=137454348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	137476416	rs412051	T	C	4346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=67;PP=2965;SC=CAGGACTTCTTGCCGCATCTC;SOR=0.764;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=139;TCF=71;TCR=68;TR=138;WE=137476424;WS=137476406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr5	137485292	rs217270	C	T	921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=1;PP=679;SC=AACAGAAGTACGAATCTTAAC;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=137485300;WS=137485282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	137503574	.	T	C	4016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.000;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=49;PP=2896;ReadPosRankSum=0.286;SC=GGTCAGTCAATGTCAAGTTCA;SOR=1.398;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=84;TCR=50;TR=131;WE=137503582;WS=137503564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,138:0.99:140
chr5	137506011	.	G	C	3325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.329;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=39;PP=2565;ReadPosRankSum=-0.786;SC=AATTGCTAAAGAGGCATACTA;SOR=0.559;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=108;TCF=69;TCR=39;TR=106;WE=137506019;WS=137506001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,110:0.99:111
chr5	137507104	rs200476181	TAA	T	912.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.16;MQRankSum=0.375;QD=26.85;ReadPosRankSum=-1.473;SOR=0.317;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,32:0.94:34
chr5	137513369	rs10671440	G	GAA	2243.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=0.183;QD=32.52;ReadPosRankSum=0.933;SOR=1.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,66:0.96:69
chr5	137522945	rs3172747	C	T	6618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=92;PP=2965;SC=AATCAGCAACCAAACCAACAA;SOR=0.898;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=202;TCF=110;TCR=92;TR=202;WE=137522953;WS=137522935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr5	137527917	rs2231478	C	G	2855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=13;PP=2376;SC=AAGTTATTAGCCCTTCCCATA;SOR=3.365;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=86;TCF=73;TCR=13;TR=85;WE=137527925;WS=137527907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr5	137661434	rs3734165	T	C	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=330;SC=CTATGTCTCATTATGATACCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=137661442;WS=137661424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	137708434	rs4835678	C	T	3406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=57;PP=2515;SC=AGGAAGTTATCGTGCTTCTGC;SOR=0.995;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=102;TCF=44;TCR=58;TR=101;WE=137708442;WS=137708424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr5	137717213	rs10073922	G	A	1075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=13;PP=780;SC=AGAGTGGTGAGATCAAGTCGG;SOR=1.085;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=18;TCR=13;TR=31;WE=137717221;WS=137717203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	137717265	rs6865472	G	A	1462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=28;PP=994;SC=GGATAATTCAGCGCCTCAAAG;SOR=1.157;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=47;WE=137717273;WS=137717255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	137735754	rs4835680	A	T	924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=27;PP=772;SC=GGTATGTCCAAGATGTTGTGG;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=137735762;WS=137735744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	137754695	rs7726234	T	C	2622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=36;PP=1839;SC=CCTTCTCTGGTGGAGGAGGAC;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=44;TCR=36;TR=80;WE=137754703;WS=137754685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	137763615	rs2240334	A	C	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=2;PP=848;SC=ATTCTTCCAAATATTGGCCCT;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=33;WE=137763623;WS=137763605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	137775581	rs982085	C	G	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=34;PP=1130;SC=GAGGACGCTCCGTGGCCTTCA;SOR=1.845;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=46;WE=137775589;WS=137775571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	137776931	rs2269947	C	T	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=14;PP=673;SC=TCCCACACAGCGCCTCCAACA;SOR=0.846;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=11;TCR=14;TR=25;WE=137776939;WS=137776921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	137777269	rs12516269	A	G	2991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=76;PP=2484;SC=TGACAATTTCATGGGGTCCTT;SOR=3.118;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=16;TCR=77;TR=92;WE=137777277;WS=137777259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr5	137780336	rs4835794	T	C	2283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=16;PP=1989;SC=CCAAAGTGACTTGGCAGGGCT;SOR=2.483;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=52;TCR=16;TR=68;WE=137780344;WS=137780326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr5	137780368	rs2240331	C	A	2966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=12;PP=2506;SC=CCGGAGCAGGCAGGGGCCTCT;SOR=3.586;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=74;TCR=12;TR=86;WE=137780376;WS=137780358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	137844274	rs2242599	A	G	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=28;PP=850;SC=TAAGCACCTCACCGGAAGCAG;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=137844282;WS=137844264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	137846155	rs4835685	A	G	5933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=128;NR=47;PP=2965;SC=CAATTAGTATAAGGTTTGGTT;SOR=2.020;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=128;TCR=47;TR=175;WE=137846163;WS=137846145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr5	137847078	.	TACACACACAC	T	652.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=5;NR=10;PP=696;SC=ATCACGTACATACACACACAC;SOR=1.244;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=15;WE=137847099;WS=137847068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	137849526	rs10077407	C	T	1436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=42;PP=1226;SC=AAACCTTCTACGGAATAATTT;SOR=6.138;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=43;WE=137849534;WS=137849516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	137892170	rs10117	G	A	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=6;PP=860;SC=AACAGCTTCAGTGATGCCTGC;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=137892178;WS=137892160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr5	137896597	rs10652442	A	AT	389.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=12.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=1.018;QD=12.18;ReadPosRankSum=-0.631;SOR=1.447;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr5	137897589	rs256007	A	C	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=25;PP=697;SC=TGCAAAACCAAAGGGAGGGTG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=137897597;WS=137897579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	137902868	rs71574426	GA	G	802.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=19;PP=501;SC=AATGATTTGTGAAAAAAAAAA;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=26;WE=137902876;WS=137902858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	137909674	rs41294566	GAGA	G	2281.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=28;PP=2116;SC=AATAATTACAGAGAAGAATAA;SOR=1.179;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=21;TCR=30;TR=46;WE=137909684;WS=137909664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	138117938	rs700626	A	G	3222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=41;PP=2533;SC=TAACGGGTCCATGGTATGTAG;SOR=1.241;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=67;TCR=41;TR=108;WE=138117946;WS=138117928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr5	138268323	.	C	G	3701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=67;PP=2891;SC=GCATCGCCCTCTACTGCCACC;SOR=1.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=44;TCR=67;TR=111;WE=138268331;WS=138268313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr5	138473077	rs11431215	C	CA	3147.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=61;PP=2966;SC=AGTTTGGCCCCAAAGCCATGC;SOR=1.305;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=85;TCF=18;TCR=67;TR=78;WE=138473085;WS=138473067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr5	138611708	.	TTTC	T	3896.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=18;PP=2975;SC=TCTGCTATTGTTTCTGTGGCT;SOR=2.584;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=66;WE=138611718;WS=138611698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	138713959	rs6596474	A	C	1239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=24;PP=846;SC=GGGAGCGAGGAGAAGAGGGCC;SOR=1.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=38;WE=138713967;WS=138713949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	138718476	rs11242461	T	C	170.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=131;SC=TCTCCCACTTTGCATTGCTTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=138718484;WS=138718466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	138720108	rs11242462	C	T	3685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=1;PP=2716;SC=GCACCGCTCTCCAGCTGGGCA;SOR=7.960;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=101;TCF=100;TCR=1;TR=101;WE=138720116;WS=138720098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr5	138720336	rs6596476	T	C	1528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=44;PP=1312;SC=CCCCTGCAGATACGGCTCCAT;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=44;WE=138720344;WS=138720326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	138723112	rs138480317	C	CTCCA	1630.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=0;PP=1715;SC=GAACACTGCACTCCAGCCTGG;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=31;WE=138723120;WS=138723102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	138723168	.	G	GT	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=1.064;QD=0.88;ReadPosRankSum=-0.799;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,9:0.21:43
chr5	138724126	rs33937093	TG	T	940.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=1;PP=992;SC=AGGAGGGAGGTGGGGGGCAGG;SOR=5.486;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=31;WE=138724134;WS=138724116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	138724457	rs9327846	A	G	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=331;SC=TGGGATGGGGATGGGGGATGG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=138724465;WS=138724447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	138728483	rs10078623	A	G	2609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=29;PP=2023;SC=CTGGGCCTCTACATCCCTGTT;SOR=1.339;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=48;TCR=29;TR=76;WE=138728491;WS=138728473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr5	138728533	rs10063870	C	T	3691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=51;PP=2923;SC=GCGAGGTTACCTCGGGCCGGC;SOR=0.918;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=59;TCR=51;TR=110;WE=138728541;WS=138728523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr5	138730037	rs11748963	T	C	2121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=66;PP=1871;SC=CGCGGCGGCCTGCAGGGGGCC;SOR=3.228;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=11;TCR=66;TR=77;WE=138730045;WS=138730027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr5	138730407	rs73255289	C	T	5560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=85;PP=2965;SC=CCGGAGCAGCCGAACAGGGGT;SOR=0.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=83;TCR=85;TR=168;WE=138730415;WS=138730397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr5	139213452	rs4912884	A	G	1003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=28;PP=793;SC=TGTGCCTCGTAAAATCCTGGC;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=139213460;WS=139213442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	139216541	rs138380367	G	A	3882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.062;SC=CTACAAGCACGGCGTCCTGAC;SOR=2.183;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=16;TCR=98;TR=113;WE=139216549;WS=139216531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,117:0.99:118
chr5	139216901	rs11440487	A	AG	2405.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=54;PP=2674;SC=GGCACCCCGAAGCCCCAGGCA;SOR=2.973;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=4;TCR=55;TR=58;WE=139216909;WS=139216891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr5	139231255	rs75431091	C	T	3514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=34;PP=2760;ReadPosRankSum=-0.733;SC=GGTGGCCCTGCGCCGCTCCTC;SOR=0.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=73;TCR=34;TR=106;WE=139231263;WS=139231245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,113:0.99:114
chr5	139232797	rs78656209	G	A	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=369;SC=CCTGAGCGTCGTGGCAGTGAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=139232805;WS=139232787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	139422232	rs144634106	G	A	2879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=36;PP=2318;ReadPosRankSum=1.192;SC=TGGAGCCGCCGGCTGGGACCA;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=60;TCR=36;TR=95;WE=139422240;WS=139422222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,94:0.99:95
chr5	139907713	.	C	CT	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-1.544;QD=1.11;ReadPosRankSum=-0.691;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,7:0.21:33
chr5	139908715	.	C	G	5085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=89;NR=60;PP=2965;SC=CCCGGGAGCTCCAGAAACTCA;SOR=1.106;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=89;TCR=61;TR=149;WE=139908723;WS=139908705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr5	139936680	rs143712554	ACCC	A	327.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=4.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.69;ReadPosRankSum=4.541;SOR=0.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr5	139941228	rs250430	A	G	2906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=53;PP=2265;SC=ACATCACAGCAAAACACATGG;SOR=1.216;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=34;TCR=53;TR=87;WE=139941236;WS=139941218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr5	140011468	rs4914	C	G	5306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=109;NR=54;PP=2965;SC=CCCCTTGGAGCAGCACCAGGG;SOR=1.553;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=109;TCR=54;TR=163;WE=140011476;WS=140011458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr5	140027592	rs70988770	G	GGT	314.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.791;NF=7;NR=8;PP=591;ReadPosRankSum=0.950;SC=GCTTAAGCCGGGTGTGTGTGT;SOR=0.467;SbPval=0.03;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=15;WE=140027600;WS=140027582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr5	140048267	rs2530245	T	C	3089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=59;PP=2377;SC=AGGTGGTATCTGTCTCTGGGA;SOR=1.257;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=36;TCR=59;TR=95;WE=140048275;WS=140048257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr5	140077699	rs2530234	A	G	1900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=60;PP=1714;SC=GGGACGAAGTATTTCTGCCTT;SOR=5.994;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=62;TCF=2;TCR=60;TR=62;WE=140077707;WS=140077689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	140167463	rs3733710	C	T	1626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=8;PP=1285;SC=GGAGCTGGAGCTGCTGCAGTT;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=42;TCR=8;TR=50;WE=140167471;WS=140167453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr5	140168070	rs2240696	A	G	3766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=48;PP=2965;SC=GAGGGTGCGTATGTGCCGGGC;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=64;TCR=48;TR=112;WE=140168078;WS=140168060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr5	140168151	rs2240695	G	T	3770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=49;PP=2965;SC=CAGAGGGTGTGCTCTAGCGAG;SOR=1.059;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=117;TCF=67;TCR=50;TR=116;WE=140168159;WS=140168141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr5	140174622	rs9686540	G	A	3230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=83;PP=2754;SC=CGCAGCCTGGGAGGTGGGGAG;SOR=3.000;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=102;TCF=19;TCR=83;TR=101;WE=140174630;WS=140174612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr5	140174865	rs11167600	G	C	4238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=28;PP=2965;SC=TAGCATCCACGTGGAGGTGAT;SOR=2.512;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=95;TCR=28;TR=123;WE=140174873;WS=140174855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr5	140180737	rs3806845	C	T	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=9;PP=757;SC=TATTTTTAAACTTTGGATCAA;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=140180745;WS=140180727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	140181734	rs3733708	A	G	14371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=452;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=246;NR=181;PP=2965;SC=GTCATATGAAATCCAGGTAGA;SOR=1.043;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=427;TCF=246;TCR=181;TR=427;WE=140181742;WS=140181724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,448:1.00:448
chr5	140181892	rs3733707	T	C	6856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=157;PP=2965;SC=CAGTCATCGCTCTGATCAGCG;SOR=2.856;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=39;TCR=157;TR=196;WE=140181900;WS=140181882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr5	140182101	rs7701755	G	T	2675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=34;PP=2081;SC=GCCACGGCCAGCGTGTCCGTG;SOR=1.192;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=82;TCF=47;TCR=35;TR=81;WE=140182109;WS=140182091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr5	140183058	rs2240694	G	A	5123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.150;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=60;PP=2965;ReadPosRankSum=0.476;SC=CAGAGGGTGTGCTCTGGAGAG;SOR=1.051;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=103;TCR=61;TR=163;WE=140183066;WS=140183048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,168:0.99:169
chr5	140186657	rs4151680	A	G	3872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=67;PP=2965;SC=GGAACCATATACACTCTTTGG;SOR=1.121;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=45;TCR=67;TR=112;WE=140186665;WS=140186647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr5	140186988	.	AGG	A	309.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=34.42;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	140187048	rs3822349	G	C	1082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.74;QD=32.81;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	140187102	rs3822347	A	G	2530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=12;PP=2116;SC=AGGTGATCGTAGACAGGCCGC;SOR=2.955;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=64;TCR=12;TR=76;WE=140187110;WS=140187092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr5	140187322	rs3822346	C	T	6088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=90;PP=2965;SC=GGAAAAACCACCTGATGACGA;SOR=0.802;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=189;TCF=99;TCR=90;TR=189;WE=140187330;WS=140187312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr5	140188353	.	GC	AG	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.73;QD=46.25;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	140188356	rs144593807	A	G	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.77;QD=44.60;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	140188383	rs2337987	T	G	1264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=15;PP=978;SC=AGGTGACCGCTCGCGATGCCG;SOR=1.455;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=41;WE=140188391;WS=140188373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	140188401	rs2879086	A	G	1522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=15;PP=1186;SC=CCGGCGTGCCACCTCTGGGCA;SOR=1.893;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=49;WE=140188409;WS=140188391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr5	140188575	rs2879087	G	C	3053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=47;PP=2477;SC=ATGCTGACTCGGGCTACAACG;SOR=0.733;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=52;TCR=47;TR=99;WE=140188583;WS=140188565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr5	140201264	rs4151682	C	T	2782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=1;PP=2332;SC=CTCAGAAAGGCGATAATATAA;SOR=7.614;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=89;TCF=88;TCR=1;TR=89;WE=140201272;WS=140201254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr5	140201420	rs11958868	T	C	6250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=146;PP=2965;SC=GGCTTCTCCTTGCCTACTGGA;SOR=1.620;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=218;TCF=71;TCR=147;TR=217;WE=140201428;WS=140201410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr5	140203432	rs4141841	C	T	2841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.99;NF=32;NR=52;PP=2292;SC=CCCGAGGCTGCCCTGGTGGAT;SOR=1.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=32;TCR=52;TR=84;WE=140203440;WS=140203422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	140209338	.	C	T	3587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=84;NR=25;PP=2961;SC=TGCAGGTGTTCGTGCTGGACG;SOR=2.390;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=84;TCR=25;TR=109;WE=140209346;WS=140209328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr5	140209467	rs7710794	T	G	4179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=76;PP=2965;SC=TGCGCGCAGTTGACGCCGACT;SOR=1.110;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=53;TCR=76;TR=129;WE=140209475;WS=140209457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr5	140214381	rs10067182	G	A	3449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.97;QD=33.82;SOR=3.589;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr5	140216042	rs61730623	G	A	3724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=63;PP=2791;SC=CCCAGAGACCGAGCTGGTGGA;SOR=1.040;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=46;TCR=63;TR=109;WE=140216050;WS=140216032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr5	140222641	rs6580012	A	G	3151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=59.96;NF=53;NR=50;PP=2443;SC=CGCAGCGAGCAAGCTGGTGCC;SOR=0.731;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=53;TCR=50;TR=103;WE=140222649;WS=140222631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr5	140229086	rs251354	C	G	1684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=7;PP=1419;SC=TCATTGTACACTTCTTGTGGA;SOR=3.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=50;WE=140229094;WS=140229076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr5	140230370	rs369636	AA	CC	6140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=49;PP=2947;SC=TGGCGAGGGTAAGCAGAAGAC;SOR=1.105;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=125;TCF=75;TCR=50;TR=120;WE=140230379;WS=140230360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr5	140237387	rs251364	T	G	2996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=44;PP=2401;SC=CGGTCGGTGGTTGCGGGTCAC;SOR=0.714;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=48;TCR=45;TR=92;WE=140237395;WS=140237377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr5	140237548	rs630162	A	G	6016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=76;PP=2965;SC=TCTGGATGAGACTGACTCGCC;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=182;TCF=106;TCR=76;TR=182;WE=140237556;WS=140237538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr5	140242451	rs11321479	GC	G	2116.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=14;PP=1794;SC=ATGTGACGCTGCCAGGTATTA;SOR=2.001;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=45;WE=140242459;WS=140242441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr5	140242479	rs251369	T	A	2262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=25;PP=1768;SC=AACGACAACTTTGTCTGCGCT;SOR=1.371;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=46;TCR=25;TR=71;WE=140242487;WS=140242469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr5	140249995	rs77838799	C	A	1256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.638;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=19;PP=910;ReadPosRankSum=-1.286;SC=TCTCTGTGGGCCACGGCCAGG;SOR=0.622;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=158;TCF=106;TCR=52;TR=56;WE=140250003;WS=140249985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,58:0.36:161
chr5	140256920	rs115718636	G	C	4079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=27;PP=2965;SC=CGCACATCCCGTTCCACGTGG;SOR=2.381;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=96;TCR=27;TR=123;WE=140256928;WS=140256910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr5	140262492	rs11744560	A	T	6399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=90;NR=105;PP=2965;SC=TATTACTGACAGCCAGTGATG;SOR=0.868;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=196;TCF=91;TCR=105;TR=195;WE=140262500;WS=140262482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr5	140263290	rs251380	T	G	1617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=36;PP=1272;ReadPosRankSum=-0.695;SC=CGGTGTCTGCTCAGGACGCGG;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=52;WE=140263298;WS=140263280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr5	140307284	rs155361	G	A	4615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=84;PP=2965;SC=GGGAAGTCCAGTACTCCCTAA;SOR=1.210;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=57;TCR=84;TR=141;WE=140307292;WS=140307274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr5	140307969	rs246074	C	G	3054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=39;PP=2406;SC=CTCTAGCTTGCTGGCAGTGGA;SOR=0.953;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=48;TCR=39;TR=87;WE=140307977;WS=140307959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr5	140309016	rs155360	C	T	2398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=65;PP=2004;SC=ATCAATTGAACTAAACACTCC;SOR=7.112;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=66;TCF=1;TCR=65;TR=66;WE=140309024;WS=140309006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr5	140346468	rs155364	T	A	2181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=37;PP=1677;SC=TACCTGGCCCTGCGGCCTCCC;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=29;TCR=37;TR=66;WE=140346476;WS=140346458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr5	140347398	rs12153295	C	T	7421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.325;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=130;NR=102;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.219;SC=CAGGTCACTGCAAGGTGCTGG;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=237;TCF=132;TCR=105;TR=232;WE=140347406;WS=140347388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,241:0.99:244
chr5	140347506	.	C	T	8537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=0.000;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.363;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=148;NR=115;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.063;SC=CCATTGTGGCCGTTCTCAGTG;SOR=0.785;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=266;TCF=149;TCR=117;TR=263;WE=140347514;WS=140347496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,265:0.99:268
chr5	140482483	rs31848	G	A	1957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.89;QD=33.75;SOR=4.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr5	140517174	rs400562	T	C	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=3;PP=609;SC=CAGGGCGGCCTCGGTCGGTCG;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=22;WE=140517182;WS=140517164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	140561983	rs2204704	A	G	1512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=0;PP=1252;SC=CCTGGAAGCAAAAGAATAGCT;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=38;WE=140561991;WS=140561979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	140567608	rs11167743	C	T	3644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=47;PP=2867;SC=AATGACAATGCCCCACAGTTT;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=56;TCR=47;TR=103;WE=140567616;WS=140567598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr5	140568034	rs33974901	C	CA	9024.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=90;NR=124;PP=2957;SC=AATGGAAAGACATTTGCTATG;SOR=0.744;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=223;TCF=93;TCR=130;TR=214;WE=140568042;WS=140568024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr5	140683265	rs11952797	G	A	10892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.617;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=145;NR=190;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.881;SC=GACCCACTTGGGCGTATGTCT;SOR=0.672;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=337;TCF=147;TCR=190;TR=335;WE=140683273;WS=140683255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,344:1.00:345
chr5	140710705	rs2472647	G	A	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=25;PP=1508;SC=AGGTACCAGAGTCTCATTGCC;SOR=0.950;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=55;TCF=29;TCR=26;TR=54;WE=140710713;WS=140710695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	140750044	rs6860609	T	C	2847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=35;PP=2403;SC=TTAGACCAGGTTCTCTCCGAA;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=53;TCR=35;TR=88;WE=140750052;WS=140750034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	140773812	rs144796076	G	A	9022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.134;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=142;NR=133;PP=2965;ReadPosRankSum=1.381;SC=GACTGCACACGACCCCGACAG;SOR=0.325;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=276;TCF=142;TCR=134;TR=275;WE=140773820;WS=140773802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,285:1.00:286
chr5	140774288	rs4912749	T	C	4183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=113;NR=13;PP=2965;SC=TGGACAGAGATGCGCTCAAGC;SOR=4.260;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=113;TCR=13;TR=126;WE=140774296;WS=140774286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr5	141016276	rs32954	T	C	10735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=160;NR=180;PP=2965;SC=GTGTCCCAACTCCTCATGCAT;SOR=0.822;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=342;TCF=161;TCR=181;TR=340;WE=141016284;WS=141016266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,343:1.00:343
chr5	141034792	.	TAC	T	73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=28;MQ=54.75;NF=4;NR=0;PP=73;QD=19.0;SC=CCTGATGGCCTACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=4;WE=141034801;WS=141034782;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr5	141045973	rs143722578	C	G	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=6;PP=536;SC=CCCTGTCCCCCCAAACCTCCC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=22;WE=141045981;WS=141045963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	141235896	rs11745262	G	A	1703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.946;HP=2;HapScore=1;MGOF=66;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-2.221;NF=6;NR=49;PP=1123;ReadPosRankSum=1.278;SC=GGGGTGGAGGGCACTCTGAGA;SOR=3.202;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=59;TCF=7;TCR=52;TR=55;WE=141235904;WS=141235886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,56:0.95:59
chr5	141235916	rs145694332	TGGGAGGTTAGACAAGGGCCC	T	1479.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=2927;SC=ACCTAGGGCCTGGGAGGTTAG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=22;WE=141235943;WS=141235906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	141242633	rs14359	C	G	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=3;PP=322;SC=TCCGTGTGCCCGGTGAGGCAC;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=141242641;WS=141242623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	141304314	rs6580206	T	A	1096.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=6.073;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.55;MQRankSum=2.765;QD=17.98;ReadPosRankSum=0.321;SOR=3.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:8,53:0.87:61
chr5	141324955	rs5871792	C	CCTGCTGCTG	4173.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=30;PP=2987;SC=TTCACAGGCACCTGCTGCTGC;SOR=1.206;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=107;TCF=33;TCR=74;TR=48;WE=141324963;WS=141324945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr5	141325249	rs105633	T	C	3591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=75;PP=2481;SC=GGAAGGTCCTTGGCTCCTCCG;SOR=1.553;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=36;TCR=75;TR=111;WE=141325257;WS=141325239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr5	141335241	rs164073	A	G	7723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=124;NR=102;PP=2965;SC=AAGATGCCCAACAGTACAGCC;SOR=0.894;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=226;TCF=124;TCR=102;TR=226;WE=141335249;WS=141335231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr5	141335284	rs164074	G	A	7521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=108;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.837;SC=ACATGCTCAAGGCCCCAGGCT;SOR=0.244;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=226;TCF=118;TCR=108;TR=225;WE=141335292;WS=141335274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,240:1.00:241
chr5	141335594	rs61737137	A	G	6836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=130;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.811;SC=GTGAGTGGCCAGTGGAGGTGT;SOR=0.414;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=225;TCF=94;TCR=131;TR=223;WE=141335602;WS=141335584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,229:1.00:230
chr5	141336264	rs164075	G	T	2978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=27;PP=2431;SC=AAACCATTGTGTCCTGAATCC;SOR=1.688;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=60;TCR=27;TR=87;WE=141336272;WS=141336254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	141337126	rs164076	C	T	9975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=151;NR=168;PP=2965;SC=ACTGTCGGCACAGCTGCTCTC;SOR=0.812;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=319;TCF=151;TCR=168;TR=319;WE=141337134;WS=141337116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr5	141337225	rs164077	A	G	7587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=150;PP=2965;SC=CCTGGAAGGCAGCCCCAGCTT;SOR=1.240;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=245;TCF=95;TCR=150;TR=245;WE=141337233;WS=141337215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr5	141353159	rs138158057	G	A	3202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=36;PP=2476;SC=TCCTTATGTCGTCAGAAGATC;SOR=1.306;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=98;TCF=61;TCR=37;TR=97;WE=141353167;WS=141353149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr5	141354220	rs187542	G	C	179.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=144;SC=TGGTGGCTACGAAGTTAAAAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=141354228;WS=141354210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	141357719	rs66768569	TTGTA	T	1177.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=1217;SC=TTGTACTGTTTTGTATGTAGC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=23;WE=141357730;WS=141357709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	141364511	rs252099	A	G	8851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=152;NR=132;PP=2965;SC=ATGTATACACAGAATTCCTCA;SOR=0.806;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=285;TCF=153;TCR=132;TR=284;WE=141364519;WS=141364501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr5	141364637	rs252100	C	T	3367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=96;PP=2862;SC=AAGGAATTTTCATATTATTTT;SOR=7.844;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=97;TCF=1;TCR=96;TR=97;WE=141364645;WS=141364627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr5	141367202	rs374840	GA	TT	3990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=30;PP=2947;SC=GATGTACAAAGATGTTATAAG;SOR=1.204;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=86;TCF=52;TCR=34;TR=81;WE=141367211;WS=141367192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr5	141382584	rs252114	T	C	1210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=0;PP=1033;SC=GGATGAAAGCTGGATCTACTC;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=141382592;WS=141382574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	141391532	rs164080	G	A	3923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=88;PP=2965;SC=ACTGGATGATGCGGTTCCTGA;SOR=1.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=41;TCR=88;TR=129;WE=141391540;WS=141391522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr5	141488807	rs55865281	G	A	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=2;PP=24;SC=CCCCAGGTGGGACTCCGGCGG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=141488815;WS=141488797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr5	141533062	rs449454	A	G	4785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=117;PP=2965;SC=TGACATTTCAATGATCCCTCT;SOR=2.382;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=32;TCR=118;TR=149;WE=141533070;WS=141533052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr5	141975067	rs34003	A	C	3081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=63;PP=2556;SC=GATAAAACCAAAAGAGAGTAG;SOR=1.585;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=33;TCR=63;TR=96;WE=141975075;WS=141975057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr5	142393562	rs3822397	G	A	3577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=46;PP=2797;SC=ACTAGGGAAAGTGAGGAAGAT;SOR=1.129;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=65;TCR=46;TR=111;WE=142393570;WS=142393552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr5	142416741	rs192194	T	C	3167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=78;NR=18;PP=2502;SC=AACTTGACTGTCCTTCTCTTG;SOR=3.000;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=78;TCR=18;TR=96;WE=142416749;WS=142416731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr5	142421415	rs2270068	T	G	6029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=124;PP=2965;SC=GAATTGTGGGTGTCAACTCCA;SOR=1.700;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=60;TCR=124;TR=183;WE=142421423;WS=142421405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr5	142434038	.	C	G	2085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=18;PP=1645;ReadPosRankSum=-0.832;SC=AAACAGATATCTGTGCTGAAT;SOR=0.867;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=64;TCF=46;TCR=18;TR=63;WE=142434046;WS=142434028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr5	142593652	rs258819	C	T	1238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=31;PP=990;SC=TCTTCGATAACGGTGAGTTTC;SOR=3.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=35;WE=142593660;WS=142593642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	142601811	rs72399054	TACACACACACACAC	TAC,T	763.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;NF=9,9;NR=0,0;PP=441,45;SC=GCTTCCTTCATACACACACAC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=9,9;WE=142601832;WS=142601801;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:20
chr5	143059433	rs2042253	T	C	6870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=115;NR=90;PP=2965;SC=TGTATGGGATTCCACAGACAA;SOR=0.959;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=206;TCF=116;TCR=90;TR=205;WE=143059441;WS=143059423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr5	145144419	rs338887	G	T	3361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=36;SC=CAGGGAGGCTGCTGTAGAATA;SOR=1.148;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=60;TCR=36;TR=95;WE=145144427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr5	145176221	rs338898	C	T	2127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=56;PP=1715;SC=AAAATAATATCCTTAATAATT;SOR=6.027;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=58;TCF=2;TCR=56;TR=58;WE=145176229;WS=145176211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	145197411	rs6870210	C	T	6235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=131;NR=60;PP=2965;SC=ACTCATGTGTCCATCCCTGCA;SOR=1.760;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=131;TCR=60;TR=191;WE=145197419;WS=145197401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr5	145198805	rs624380	T	C	1666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=9;PP=1426;SC=GAATCTCTCTTGGGTTGAAAC;SOR=2.925;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=42;TCR=9;TR=50;WE=145198813;WS=145198795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	145199430	rs11293460	AG	A	1778.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=1;PP=1982;SC=CCTTTACATCAGAAAATGCTG;SOR=6.273;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=48;TCF=47;TCR=1;TR=45;WE=145199438;WS=145199420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	145199681	rs139755910	TTTTTG	T	270.86	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=64.24;MQRankSum=0.770;QD=22.57;ReadPosRankSum=-1.723;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr5	145202461	rs6898776	C	T	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=429;SC=ACCTGCCACACCTTTCTAAGT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=145202469;WS=145202453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	145239283	rs72816449	C	G	3432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.573;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=23;PP=2800;ReadPosRankSum=-0.871;SC=AGTGGACATGCAAAAGCCACG;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=105;TCF=81;TCR=24;TR=103;WE=145239291;WS=145239273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,106:0.98:108
chr5	145246085	rs2569006	T	G	3200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=11;PP=2677;SC=GGTTTTGGGGTAATGTGCTTT;SOR=3.755;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=84;TCR=11;TR=94;WE=145246093;WS=145246075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr5	145252574	rs10037373	C	T	1976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=58;PP=1660;SC=TCCGTGCAGCCGGTGAAACTT;SOR=6.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=59;TCF=1;TCR=58;TR=59;WE=145252582;WS=145252564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr5	145427527	rs1859895	T	A	1849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=56;PP=1571;ReadPosRankSum=-1.107;SC=AAACATCCCATCCAGAGACAA;SOR=1.639;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=8;TCR=58;TR=64;WE=145427535;WS=145427517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,62:0.97:64
chr5	145439647	rs2962525	T	C	5576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=89;PP=2965;SC=CAGTGAGGCCTGGATCCACTC;SOR=0.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=101;TCR=89;TR=189;WE=145439655;WS=145439637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr5	145477855	rs6877277	T	C	1723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=36;PP=1482;SC=GTACATGGCCTCTGGAGAGTC;SOR=1.791;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=52;WE=145477863;WS=145477845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	145478009	rs6892928	C	T	141.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	145483679	rs12188066	T	C	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=12;NR=1;PP=360;SC=TTTTCCCTGGTTCCTTATAAG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=145483687;WS=145483669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	145483713	rs12187128	C	T	1170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=4;PP=941;SC=GATAGTCCAACTAAAGAGCAA;SOR=3.442;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=33;WE=145483721;WS=145483703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	145483844	rs12187913	A	T	4243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=86;NR=44;PP=2965;SC=TCCTCAGGACACCTGAAGAAG;SOR=1.488;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=86;TCR=44;TR=130;WE=145483852;WS=145483834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr5	145499996	rs10988	C	T	5456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=117;NR=42;PP=2965;SC=ATCTCCTTGCCTGATTTCAAT;SOR=2.069;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=160;TCF=118;TCR=42;TR=159;WE=145500004;WS=145499986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr5	145500157	rs11167931	A	G	3274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=84;PP=2722;SC=AATGAAAGACAGATCTAATTC;SOR=3.702;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=12;TCR=85;TR=96;WE=145500165;WS=145500147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr5	145508340	rs2895647	A	G	3996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=99;PP=2965;SC=GTTGTTTGTCAGTCTTCTAGA;SOR=2.416;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=30;TCR=100;TR=129;WE=145508348;WS=145508330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr5	145508457	rs2895648	T	C	1638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=17;PP=1138;SC=TGAAAATCTTTTTAACTTTCA;SOR=0.914;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=20;TCR=17;TR=37;WE=145508479;WS=145508447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	145508471	rs2895649	T	C	1562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=12;PP=1038;SC=ACTTTCATTATTGTTAAATGT;SOR=1.547;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=35;WE=145508479;WS=145508447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	145508636	rs61732383	TA	CC	3822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQ=60.63;NF=25;NR=46;PP=2947;SC=AAAACTTCATTAACAGGACCT;SOR=1.302;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=26;TCR=49;TR=71;WE=145508645;WS=145508626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr5	145508688	rs142298525	AAAAAAG	A	2191.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=47;PP=2516;SC=CAGGCTTTTAAAAAAAGAAAA;SOR=4.534;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=2;TCR=47;TR=49;WE=145508701;WS=145508678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	145509573	rs11953517	G	A	5016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=32;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.738;SC=TTAAATGCATGAAGGTACCTT;SOR=1.432;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=123;TCR=32;TR=154;WE=145509581;WS=145509563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,158:0.99:159
chr5	145512378	rs202210415	AAG	A	826.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.67;QD=45.93;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	145512390	rs35869904	G	C	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.64;MQRankSum=0.449;QD=36.64;ReadPosRankSum=1.585;SOR=4.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr5	145515346	rs12153109	C	T	927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=769;SC=ATTCAAAATACGGAAAGGAAA;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=145515354;WS=145515336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	145519603	rs67598659	C	T	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=4;PP=744;SC=CTCCTGGCCTCAAGTGATCCT;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=145519611;WS=145519596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	145519821	rs17493851	G	A	3944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=1.670;SC=TAGGCCATTTGTCACTTCACA;SOR=0.948;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=34;TCR=88;TR=121;WE=145519829;WS=145519811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,128:0.99:129
chr5	145519948	rs11951553	C	T	825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=24;PP=677;SC=CAAGGATATACACTATAGTCC;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=145519956;WS=145519938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	145522674	rs146274608	T	TTATATA	743.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=611;SC=ACAAACTATTTTATATATATA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=9;WE=145522682;WS=145522664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	145522912	rs2962504	A	G	3338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=16;PP=2541;SC=ATTTAAATACATAAATCAAAT;SOR=3.414;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=99;TCR=16;TR=115;WE=145522920;WS=145522902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr5	145523105	rs11540217	G	A	3865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=92;PP=2965;SC=TCCCAAGGCAGGTGAGTGCCT;SOR=2.574;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=25;TCR=93;TR=117;WE=145523113;WS=145523095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr5	145532859	rs17500483	T	C	2108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=37;PP=1374;SC=AGAGAAGCAATCTCCAAAGTT;SOR=2.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=47;WE=145532867;WS=145532849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	145532876	rs17500504	A	G	2009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=38;PP=1363;SC=AGTTTCTTAAAAGTTTCTTTA;SOR=3.306;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=45;WE=145532884;WS=145532866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	145532927	rs17428465	T	C	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=645;SC=AGCAATTTTCTAACTTTGCCA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=145532935;WS=145532917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	145533128	rs34090359	T	C	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=2;PP=205;SC=TCTGTGAACATATTTAAAATT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=9;WE=145533136;WS=145533124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	145533418	rs34342344	T	A	1477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=36;PP=1159;SC=CCAAAATGTGTTTATCAAAAT;SOR=2.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=45;WE=145533426;WS=145533408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	145538924	rs13178516	T	A	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=4;PP=753;SC=CTCTATAGTCTTATTAAGGAT;SOR=3.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=145538932;WS=145538914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr5	145539996	rs11540214	T	G	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=16;PP=463;SC=ATCTGACAAATGAATCATAGT;SOR=3.160;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=145540004;WS=145539986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	145543972	rs3763373	G	A	4999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=70;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.062;SC=CATCAGACAGGCCAAGGGATT;SOR=0.855;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=79;TCR=71;TR=148;WE=145543980;WS=145543962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,158:0.99:160
chr5	145557388	rs11949351	C	G	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=38;PP=1092;SC=ATCAGCCAGGCGCGGTGGCTC;SOR=6.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=39;WE=145557396;WS=145557378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	145559173	rs13157279	T	C	990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=21;PP=755;SC=TGTGTGTCTGTGTGAGAGAGA;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=36;WE=145559181;WS=145559163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	145559214	rs13171596	C	T	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=17;PP=598;SC=CAGGCTGGAGCATAATGGTGC;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=145559222;WS=145559204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	145562143	rs11540215	G	A	3703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=95;PP=2942;SC=TCCCTCTCGGGGATGCCAGGC;SOR=3.572;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=16;TCR=95;TR=111;WE=145562151;WS=145562133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr5	145643048	rs7729098	G	A	1942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=9;PP=1494;SC=CATTTTGTATGTGCAGATGAT;SOR=3.370;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=58;WE=145643056;WS=145643038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	145838440	rs11743333	G	A	5568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=131;NR=41;PP=2965;SC=TTTTGCTTCCGCTGCAGGTTT;SOR=2.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=173;TCF=131;TCR=42;TR=172;WE=145838448;WS=145838430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr5	145850459	rs11463725	G	GT	415.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=345;SC=TCTTAATTCAGTTTTTTCTTT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=11;WE=145850467;WS=145850449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	145858010	rs4705359	A	G	2811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=7;PP=2313;SC=TAGCTGTAAAATATGTTCTGT;SOR=4.228;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=70;TCR=7;TR=77;WE=145858018;WS=145858000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr5	145890028	rs4705103	A	G	1699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=9;PP=1265;SC=TCCAAGAATCAGATCAGCACC;SOR=2.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=44;TCR=9;TR=53;WE=145890036;WS=145890018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	146030055	rs6866598	C	T	3150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=27;PP=2491;SC=AGCCCACTCGCACCTGAATAC;SOR=2.124;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=101;TCF=74;TCR=27;TR=100;WE=146030063;WS=146030045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr5	146434047	rs5872003	TA	T	1522.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=1;PP=1021;SC=TGTCCAACTGTAAAAAAAAAG;SOR=6.804;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=66;TCF=62;TCR=4;TR=53;WE=146434068;WS=146434037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr5	146434060	rs2400241	C	T	2581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=5;PP=2177;SC=AAAAAAAGTCCATGAGATATC;SOR=5.031;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=68;TCR=5;TR=73;WE=146434068;WS=146434037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr5	146435163	rs11958187	G	A	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=1;PP=320;SC=AGCAGAACCCGTGGGAAGTCA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=146435171;WS=146435153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	146619206	rs4705132	G	C	3513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=52;PP=2681;SC=CCATGGGAGCGAACACTTCAA;SOR=0.711;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=55;TCR=53;TR=106;WE=146619214;WS=146619196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr5	146659014	rs78417445	T	G	2555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=60;PP=2006;SC=ATCGGTGGGCTAGGGGAGGTC;SOR=2.219;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=21;TCR=60;TR=81;WE=146659022;WS=146659004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr5	146728149	rs10072514	C	G	1784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=2;PP=1496;SC=CATGAGCATACATAATCTTGT;SOR=5.630;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=47;TCR=2;TR=49;WE=146728157;WS=146728139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	146728396	rs72831396	C	T	2779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=67;PP=2247;SC=TTGCCAAATGCTGTGCTAAGT;SOR=3.834;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=10;TCR=67;TR=77;WE=146728404;WS=146728386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr5	146753004	rs4235731	T	C	1060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=36;PP=852;SC=AATTGAGACATGCACAGGGTA;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=146753012;WS=146752994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	146754839	rs10515585	C	G	2055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=57;PP=1705;SC=GCTGCAATATCTTCGAGAGCT;SOR=4.615;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=4;TCR=57;TR=61;WE=146754847;WS=146754829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr5	146773714	rs3838662	GA	G	1417.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.098;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.429;NF=5;NR=45;PP=913;ReadPosRankSum=1.815;SC=TTCCCAGGGGGAAAAAAAAAA;SOR=2.644;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=61;TCF=8;TCR=53;TR=50;WE=146773722;WS=146773704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,58:0.97:60
chr5	146775311	rs2288808	A	T	2307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=54;PP=1815;SC=GCATGTCACCATTCATTCATT;SOR=2.505;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=15;TCR=54;TR=69;WE=146775319;WS=146775301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr5	146775377	rs2288807	G	C	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=23;PP=557;SC=TACAGTGTGTGGTGGGAGCTA;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=146775385;WS=146775367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	146777188	rs2304045	A	G	1481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=11;PP=1136;SC=TGAGTGGAACACAAAGCTCCT;SOR=2.480;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=53;WE=146777196;WS=146777178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	146777447	rs74828553	A	ATAGAAAGAG	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=5;PP=1096;SC=CAGTAAGGGTAGAGAAAGAGG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=146777455;WS=146777437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	146780521	rs13168262	C	T	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=16;PP=467;SC=GCCTCCTCTACCTCTTACTAG;SOR=3.056;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=146780529;WS=146780511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	146781440	rs3816013	A	C	181.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=119;SC=AAATGTGACCAAGTTTGTATT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=146781448;WS=146781430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	146971253	rs7449194	C	T	3192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=77;PP=2473;SC=GGTTACTCTGCAAAACAGAGG;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=19;TCR=77;TR=96;WE=146971261;WS=146971243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr5	146971279	rs77301397	A	G	2121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.47;ReadPosRankSum=1.309;SOR=2.359;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,70:0.97:72
chr5	146981164	rs111740872	TCAAAACAAAACAAAA	T	233.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=611;SC=AGACTCTGTCTCAAAACAAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=146981186;WS=146981161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	147003436	rs56384964	G	A	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=514;SC=ATCTCGCTCCGTTGCCCAGGC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=147003444;WS=147003426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	147012186	rs3763093	C	T	2553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=0;PP=2188;SC=CCTCAATGTGCTCTGTGCATG;SOR=8.714;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=77;TCF=77;TCR=0;TR=76;WE=147012194;WS=147012176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr5	147012291	rs3763094	G	A	6674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.030;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=105;PP=2965;ReadPosRankSum=0.178;SC=GGTCTCTGGCGTCCTGTAGTT;SOR=0.122;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=109;TCR=105;TR=212;WE=147012299;WS=147012281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,221:0.99:223
chr5	147016368	rs2116768	C	T	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=295;SC=AGAAAAACACCAGAGACAGAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=147016376;WS=147016365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	147019114	rs10515588	T	C	3450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=20;PP=2831;SC=AGCTGTCTTATTGATATTTTT;SOR=2.942;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=86;TCR=20;TR=106;WE=147019122;WS=147019104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr5	147019335	rs79801275	GA	G	1817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=50;PP=1513;SC=TTGAGGTTAAGAAAAAAAGCC;SOR=2.765;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=63;TCF=8;TCR=55;TR=56;WE=147019343;WS=147019325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	147020419	rs1529686	T	C	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=420;SC=TTTACTGACATAGCTAACAGT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=147020427;WS=147020409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	147020443	rs1529685	C	T	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=334;SC=GAAAGTTGAACGTTAAAATAC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=147020451;WS=147020433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	147021086	rs3765006	T	G	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=0;PP=1091;SC=ATTTACAACATAATCATTTTT;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=147021094;WS=147021076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr5	147024476	rs2116766	C	A	4928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=100;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.076;SC=AGGACACCATCAGTTCATCGT;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=55;TCR=101;TR=154;WE=147024484;WS=147024466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,158:0.99:160
chr5	147024509	rs2116765	C	T	4655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.636;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=0.379;SC=GGCACTTGTTCCTTTCCAGGA;SOR=1.675;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=45;TCR=97;TR=140;WE=147024517;WS=147024499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,146:0.99:148
chr5	147024608	rs2116764	G	A	1796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=45;PP=1552;SC=GGGGACGTGGGGGCAGGGGAG;SOR=3.570;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=8;TCR=45;TR=53;WE=147024616;WS=147024598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	147027930	rs7735403	A	G	2394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=20;PP=1817;SC=AATTTTTAGTATATCTCACCA;SOR=1.842;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=49;TCR=20;TR=69;WE=147027938;WS=147027920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr5	147040101	rs139209631	A	AAAAC	1902.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=16;PP=1224;SC=ACCCTCTATAAAAACAAACAA;SOR=1.005;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=21;WE=147040120;WS=147040091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	147040112	rs114468800	T	C	1916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=22;PP=804;SC=AAACAAACAATAAAACTCTAC;SOR=1.105;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=33;WE=147040120;WS=147040091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	147261812	rs3843496	T	C	1316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=36;PP=1067;SC=GTATCCAGATTAGTTTTCCCT;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=147261820;WS=147261802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	147286054	rs2250145	G	A	4448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=75;PP=2965;SC=GCGAAGTACTGAGACAGCCAT;SOR=0.937;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=59;TCR=75;TR=134;WE=147286062;WS=147286044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr5	147444785	rs2287772	A	G	209.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=139;SC=GTGTTCAAAAACCATTTGCGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=147444793;WS=147444778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	147444989	rs9325061	G	A	2093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=35;PP=1295;SC=CCAAAGAAAAGTGGTTTGTGG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=18;TCR=35;TR=53;WE=147444997;WS=147444979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	147445023	rs1609851	C	G	1493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=28;PP=892;SC=GTTAATAATACAAACATATTA;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=147445031;WS=147445013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	147445108	rs3036741	TCACACA	T	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=301;SC=AGCCTCTCTCTCACACACACA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=147445132;WS=147445098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	147445124	rs1007979	A	G	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.31;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	147449855	rs1423001	A	G	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=3;PP=977;SC=ATGTACTTTTAGCTAACACAA;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=35;WE=147449863;WS=147449845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	147450085	rs3752676	C	A	988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=29;PP=883;SC=TAAATGTATTCTTTTTCTTTC;SOR=3.545;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=33;WE=147450093;WS=147450075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	147468234	rs7711953	C	G	2505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=62;PP=1933;SC=AGTAGGTGCTCTCCTCTTCCT;SOR=2.920;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=15;TCR=62;TR=77;WE=147468242;WS=147468224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr5	147468614	rs10038561	A	G	4247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.93;SOR=2.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr5	147468971	rs4529181	G	C	2557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=6;PP=2040;SC=CAATGTCAGAGGGACTGAGTT;SOR=4.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=66;TCR=6;TR=71;WE=147468979;WS=147468961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr5	147475386	rs6892205	A	G	1135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=17;PP=872;SC=TCCAGCAAGCAGCGTTTTTCA;SOR=0.843;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=37;TCF=20;TCR=17;TR=36;WE=147475394;WS=147475376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	147475488	rs11958432	A	G	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=22;PP=859;SC=AGTTTGATCAATCTAGTTACA;SOR=0.902;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=39;WE=147475496;WS=147475478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	147475513	rs76839946	G	GT	1189.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.49;QD=36.05;SOR=1.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	147475590	rs11948406	G	A	315.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=190;SC=CACACTACTAGTAGGTTTGCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=147475598;WS=147475580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	147475609	rs62388363	A	G	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=185;SC=CTGGAAACTAATTTCTAGTTA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=147475617;WS=147475599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	147475627	rs62388364	G	A	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=52;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=105;SC=TTATTATTTTGTGAAACTTAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=147475635;WS=147475617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	147477351	rs140268040	T	TTTTAA	1471.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=0;PP=1777;SC=AATTTCTCTTTTTTCTTTGTA;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=30;WE=147477359;WS=147477341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	147477551	rs34482796	C	T	5768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=111;PP=2965;SC=ATGTGTCAAGCCTACTTGTGA;SOR=1.308;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=68;TCR=111;TR=179;WE=147477559;WS=147477541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr5	147478785	rs1422991	C	T	4526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=61;NR=68;PP=2965;SC=CTTCTTTTTCCCTCTTATTCA;SOR=0.829;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=61;TCR=68;TR=129;WE=147478793;WS=147478775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr5	147478981	rs11168021	C	A	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=31;PP=843;SC=CCCAGAATATCTTAACTCTTC;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=147478989;WS=147478971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	147479991	rs2303061	C	T	3331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=34;PP=2467;SC=AAATATATGGCCAACTTACTT;SOR=1.336;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=62;TCR=34;TR=95;WE=147479999;WS=147479981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr5	147480007	rs2303062	A	G	3509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=61;NR=39;PP=2620;SC=TACTTCTTCTATCTCGGCAGG;SOR=1.069;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=61;TCR=39;TR=100;WE=147480015;WS=147479997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr5	147480027	rs2303063	G	A	3437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=45;PP=2610;SC=GAGCTTTGCAGTGAATATCGA;SOR=0.808;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=55;TCR=45;TR=100;WE=147480035;WS=147480017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr5	147480112	rs2303065	T	C	2695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=72;PP=1957;SC=GGAAAGTGCATGGCAACACCT;SOR=2.117;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=98;TCF=26;TCR=72;TR=97;WE=147480120;WS=147480102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr5	147480868	rs2303066	G	A	1125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=1;PP=964;SC=CACTTCTAATGTGGCGATTCT;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=34;WE=147480876;WS=147480858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	147480955	rs2303067	A	G	2244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=17;PP=1823;SC=GAAGGAAGGTAAATCAAGAAA;SOR=2.269;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=50;TCR=17;TR=66;WE=147480963;WS=147480945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	147481018	rs2303068	G	A	3356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=54;PP=2526;SC=ATATCCTCCAGCAACTCAGAG;SOR=0.849;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=48;TCR=54;TR=102;WE=147481026;WS=147481008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr5	147481430	rs6896303	A	G	4482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=83;PP=2965;SC=GCCCAGATGGAAAAATGCATG;SOR=1.069;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=58;TCR=83;TR=141;WE=147481438;WS=147481420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr5	147484465	rs34473560	GA	G	821.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=17;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=1;PP=519;SC=TCTCAAAAAAGAAAAAAAAAA;SOR=4.863;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=30;WE=147484473;WS=147484455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	147486677	rs880687	C	A	4346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=50;PP=2965;SC=CTGTCCGTGGCCCAGATGGCA;SOR=1.230;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=78;TCR=50;TR=128;WE=147486685;WS=147486667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr5	147486818	rs3036740	CGT	C	3588.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=53;PP=2935;SC=GAGTATAGACCGTGAGTTATA;SOR=3.258;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=64;TCF=7;TCR=57;TR=60;WE=147486827;WS=147486808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr5	147488367	rs2303071	C	T	3856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=81;NR=43;PP=2965;SC=AAGGGAAAGTCGAGGCTGAAA;SOR=1.517;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=81;TCR=43;TR=124;WE=147488375;WS=147488357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr5	147491532	rs2287768	T	C	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=32;PP=954;SC=AGGGGTGACATTGGAAGTTTT;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=147491540;WS=147491522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	147493871	rs3815735	G	A	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=577;SC=TAGGAACCCAGTAAACTAATT;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=147493879;WS=147493861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	147497871	rs6891892	T	C	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=506;SC=TGAGCCACCGTACCCGGCAAT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=147497879;WS=147497861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	147497932	rs3777135	T	C	1810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=2;PP=1439;SC=CTCAGACTGTTAAAACAATTT;SOR=5.097;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=47;TCR=2;TR=49;WE=147497940;WS=147497922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	147498019	rs3777134	G	A	3398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=30;PP=2588;SC=GCTGAGTATCGGGAACAAATG;SOR=1.699;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=71;TCR=30;TR=101;WE=147498027;WS=147498009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr5	147498523	rs3764926	T	C	3798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=17;PP=2965;SC=GTTAACAAGATGAATATTCAC;SOR=3.451;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=102;TCR=17;TR=119;WE=147498531;WS=147498513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr5	147498652	rs9325073	C	G	8251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=109;NR=136;PP=2965;SC=TGGCAAGAATCGTCTTTCTGT;SOR=0.960;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=248;TCF=109;TCR=139;TR=245;WE=147498660;WS=147498642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr5	147498669	rs9325074	G	A	10036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.01;SOR=1.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr5	147498672	rs12518996	G	A	10060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.32;SOR=1.386;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr5	147498763	rs9325075	C	A	2825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=85;PP=2418;SC=ATCAGTGACTCTCACTGATAA;SOR=5.646;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=4;TCR=85;TR=89;WE=147498771;WS=147498753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr5	147499616	rs17704908	C	T	2860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=26;PP=2274;SC=ATGGAAAACTCATCTGCACTC;SOR=1.775;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=58;TCR=26;TR=84;WE=147499624;WS=147499606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	147499670	rs33920397	C	T	3613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=52;PP=2864;SC=AGACACATGGCAATAAGTGTA;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=62;TCR=52;TR=114;WE=147499678;WS=147499660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr5	147504305	rs3036731	C	CT	852.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=3;PP=342;SC=ATTACCCTATCTTTTTTTTTA;SOR=2.948;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=18;WE=147504323;WS=147504295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	147504315	rs2052537	A	T	925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=5;PP=552;SC=CTTTTTTTTTAATTATTCTGC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=20;WE=147504323;WS=147504295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	147504557	rs2052536	T	G	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=473;SC=ACAAGATTTTTGGGGGTTTGG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=147504565;WS=147504547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	147505116	rs3764930	G	A	3947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=79;NR=39;PP=2965;SC=AGAATGAAGCGGAGGATGCAA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=79;TCR=39;TR=118;WE=147505124;WS=147505106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr5	147505227	rs2112767	G	A	5240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=100;NR=53;PP=2965;SC=CAAGTTTGAAGAAATCACTAA;SOR=1.521;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=154;TCF=101;TCR=53;TR=153;WE=147505235;WS=147505217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr5	147510776	rs6895434	T	C	2720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=11;PP=2143;SC=CCACCCCTCTTCTTGAATGCC;SOR=3.428;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=67;TCR=11;TR=78;WE=147510784;WS=147510766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr5	147510866	rs2400478	T	C	7148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=133;NR=76;PP=2965;SC=CCAGGATAGGTTATCTTTGTC;SOR=1.451;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=210;TCF=134;TCR=76;TR=209;WE=147510874;WS=147510856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr5	147585797	.	C	CTCATT	1554.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=802;SC=TTTAAAAGAACCTAACCACAC;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=13;WE=147585814;WS=147585787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	147585799	.	TAAC	T	2472.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.16;SOR=7.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	147585805	.	C	T	1564.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.47;SOR=7.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	147585806	.	AC	A	1555.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.26;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=459;SC=ACCTAACCACACATTCTCATA;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=147585814;WS=147585787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	147593497	rs12186491	C	A	4126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=90;PP=2965;SC=GTTCCAGGACCCCAAGGTCTA;SOR=1.828;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=40;TCR=90;TR=130;WE=147593505;WS=147593487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr5	147902972	rs2277050	G	A	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=9;PP=300;SC=GGAGAGAAAAGAGAATATATG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=147902980;WS=147902962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	147928130	rs13171326	T	C	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=507;SC=CTCTCTGAGATTCATTTCTTC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=147928138;WS=147928120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	148206375	rs1801704	C	T	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=286;SC=CCAGTGCGCTCACCTGCCAGA;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=148206383;WS=148206365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	148206440	rs1042713	G	A	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=4;PP=1034;SC=GGCACCCAATGGAAGCCATGC;SOR=3.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=36;WE=148206448;WS=148206430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	148206473	rs1042714	G	C	1715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=9;PP=1322;SC=CGTCACGCAGGAAAGGGACGA;SOR=2.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=48;WE=148206481;WS=148206463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	148384555	rs71274358	T	TTTTG	333.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=30.34;ReadPosRankSum=2.362;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr5	148407708	rs1432794	A	C	3092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=37;PP=2662;SC=GGAAGCAGAGACGGGCATGGG;SOR=1.038;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=54;TCR=37;TR=91;WE=148407716;WS=148407698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr5	148521799	rs11744532	T	C	794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=22;PP=650;SC=CCCCAGGCTCTTTTTTGGTGC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=148521807;WS=148521789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	148578566	rs2068262	C	T	1787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=2;PP=1507;SC=TTTTTATTATCCTTTTCATTA;SOR=5.709;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=51;TCR=2;TR=53;WE=148578574;WS=148578556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	148578636	rs13362048	T	C	3879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=37;PP=2965;SC=AGCTCATCCCTGCCTCCTGCT;SOR=1.870;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=86;TCR=37;TR=123;WE=148578644;WS=148578626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr5	148580025	rs6580602	G	A	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=43;PP=1306;SC=CCCTGTCCATGGGTGTGATCT;SOR=5.376;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=45;WE=148580033;WS=148580015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	148586451	rs5872113	A	AG	1029.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=3;PP=1080;SC=TTCCAGTGTCAGGTGGGAGCA;SOR=3.407;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=148586459;WS=148586441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	148596693	rs3839234	TG	T	3025.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=54;PP=2784;SC=AGTGTTATCTTGGCTTCAGGT;SOR=1.788;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=70;TCF=12;TCR=58;TR=66;WE=148596701;WS=148596683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr5	148610276	rs2918265	C	A	4893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=69;PP=2965;SC=TAAAGGTAAGCAAGCTAGTAG;SOR=0.870;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=81;TCR=69;TR=150;WE=148610284;WS=148610266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr5	148618708	rs58203769	A	G	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=1;PP=816;SC=ACTGCTGCAAACCCTCTCTGC;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=148618716;WS=148618698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	148618749	rs59032271	C	T	2045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.53;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	148618752	rs59757169	G	A	2140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.60;SOR=3.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	148618964	rs34180939	G	A	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=26;PP=716;SC=AAGCAGGGAAGTGCTGGAGAG;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=148618972;WS=148618954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	148619189	rs11326264	AG	A	1196.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=0;PP=1087;SC=CTCAGGGAGGAGGGGGGTCTC;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=34;WE=148619197;WS=148619179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr5	148620224	rs3797315	T	G	4572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=37;PP=2965;SC=GGCGACCACTTCCTGCGTGCT;SOR=2.076;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=140;TCF=103;TCR=37;TR=138;WE=148620232;WS=148620214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr5	148625972	rs34340554	TA	T	1126.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.63;QD=23.97;SOR=1.378;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	148627054	rs10035236	G	A	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=273;SC=GTGGCTATCTGCCCATTGTTG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=148627062;WS=148627047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	148627252	rs9325136	G	A	3325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=17;PP=2717;SC=AGGCTGCTATGGAGGATGTGA;SOR=3.215;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=84;TCR=17;TR=101;WE=148627260;WS=148627242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr5	148627503	rs2304609	C	T	1707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=48;PP=1398;SC=GTAAGCATGGCTCTGGAAGCC;SOR=7.864;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=48;WE=148627511;WS=148627493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	148630191	rs1808828	C	A	1254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=28;PP=1038;SC=GGTTAACTGACACAACTGTAT;SOR=1.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=148630199;WS=148630181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	148639062	rs1438688	C	T	1896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.239;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=8;PP=1500;ReadPosRankSum=1.697;SC=CATACCATACCCCCGCCAGTC;SOR=3.515;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=58;WE=148639070;WS=148639052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,59:0.98:60
chr5	148651711	rs12054749	T	C	1021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=29;PP=879;SC=AAAGGTGCCTTCGGCTGCCGG;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=34;WE=148651719;WS=148651701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	148679301	rs171286	C	G	3088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=75;PP=2434;SC=CGCCCCACCCCCACCCCCAGG;SOR=2.189;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=25;TCR=75;TR=100;WE=148679309;WS=148679291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr5	148682188	rs352341	G	C	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=18;PP=623;SC=CTGCAAGCCTGTCACCCTCCC;SOR=2.737;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=148682196;WS=148682178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	148889672	rs2077482	A	T	423.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=384;SC=TCTAAAAAAAATTTTTCCCAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=148889680;WS=148889662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	148977613	rs7709875	C	T	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=16;PP=447;SC=GCAAGCTTGACAGAAAGGAAG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=148977621;WS=148977603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	148997686	rs6579750	A	G	7110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=170;NR=71;PP=2965;SC=CGTGACATCCACTTTCCTGAG;SOR=1.896;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=241;TCF=170;TCR=71;TR=241;WE=148997694;WS=148997676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr5	148999881	rs11409449	G	GC	1582.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=3;PP=1534;SC=GCCATGACAGGCATGATTGGA;SOR=3.767;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=34;WE=148999889;WS=148999871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	149000039	rs7733761	C	T	4285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=63;PP=2965;SC=TGAGTGGAACCTTTCCTTTCT;SOR=0.768;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=130;TCF=66;TCR=64;TR=129;WE=149000047;WS=149000029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr5	149001283	rs78820823	T	C	1687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=9.622;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=5;PP=1340;ReadPosRankSum=0.379;SC=CCCACGCTCATGTCTCCCCAC;SOR=4.244;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=54;TCF=48;TCR=6;TR=52;WE=149001291;WS=149001273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr5	149006837	rs7732873	A	G	2296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=58;PP=1801;SC=CACCGGGGGTACGTGAGCCTT;SOR=4.205;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=5;TCR=58;TR=63;WE=149006845;WS=149006827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr5	149006879	rs7733002	A	G	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=31;PP=988;SC=GGGGAAAACCACCCCACAGAA;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=33;WE=149006887;WS=149006869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	149008403	rs1056993	A	G	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=13;PP=631;SC=CTGGGAAACTACAGCTGTACC;SOR=0.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=25;WE=149008411;WS=149008393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	149008467	rs3733662	C	A	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=12;PP=388;SC=GAACAAAGACCCCCGATGTCT;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=149008475;WS=149008457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	149008521	rs1135093	A	G	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=210;SC=TATTCCCACCATGAACCAGGT;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=9;WE=149008529;WS=149008511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	149197230	rs251460	T	C	5684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=49;PP=2965;ReadPosRankSum=0.299;SC=GCCTGGCTCATAGTAGCATTG;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=126;TCR=50;TR=173;WE=149197238;WS=149197220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,180:0.98:183
chr5	149212243	rs7732671	G	C	4805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=89;NR=64;PP=2965;SC=AGACAAGAAGGCTCCCATGAT;SOR=1.036;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=89;TCR=64;TR=153;WE=149212251;WS=149212233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr5	149212471	rs17572019	G	A	5158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=76;PP=2965;SC=CGGTGCCCCGGTTTCCCAGGA;SOR=0.836;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=89;TCR=76;TR=165;WE=149212479;WS=149212461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr5	149240689	rs138029321	TCACGGAAA	T	1576.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=22;PP=2957;SC=GTGAGGAGAATCACGGAAACA;SOR=3.797;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=23;WE=149240704;WS=149240679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	149263977	rs141636549	A	G	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=0;PP=1143;ReadPosRankSum=0.465;SC=ATATGTGTGTATATATATATA;SOR=5.235;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=37;WE=149263985;WS=149263967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,40:0.95:42
chr5	149276567	rs30818	T	G	1675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=44;PP=1283;SC=ATGCTTCTGATCTTCAGTTTC;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=44;WE=149276575;WS=149276557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr5	149278258	rs30819	A	T	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=31;PP=887;SC=CACACTGTACATAAAGCACTA;SOR=5.486;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=149278266;WS=149278248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	149283406	rs251346	C	G	3159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=80;PP=2557;SC=AGACAGTTTTCAATTATTCAC;SOR=4.502;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=8;TCR=80;TR=88;WE=149283414;WS=149283396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr5	149360877	rs30832	T	C	5162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=73;NR=82;PP=2965;SC=AACCTTCAGATTAAGCCAGGC;SOR=0.758;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=73;TCR=82;TR=155;WE=149360885;WS=149360867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr5	149361221	rs3776070	A	T	6794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=133;PP=2965;ReadPosRankSum=0.923;SC=GTGCAATCCCACTGTGAGGGA;SOR=0.583;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=205;TCF=71;TCR=134;TR=204;WE=149361229;WS=149361211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,212:1.00:213
chr5	149374932	rs10875553	T	C	3409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=75;PP=2607;SC=AAGGTGGCTCTGGTACAGTAC;SOR=1.549;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=34;TCR=75;TR=108;WE=149374940;WS=149374922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr5	149379897	rs6579765	A	G	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=17;PP=624;SC=AGAGGGAAAGACTGAGACAGG;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=25;WE=149379905;WS=149379895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	149380159	rs3812009	G	C	4730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=65;PP=2965;SC=TACTAGACCCGCTCCAAGCCT;SOR=0.967;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=146;TCF=81;TCR=65;TR=146;WE=149380167;WS=149380149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr5	149380493	rs4705403	G	A	2399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=40;PP=1786;SC=CGACTCCGAGGAGGGGAAGCG;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=31;TCR=40;TR=71;WE=149380501;WS=149380483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr5	149386314	rs6872735	G	C	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=276;SC=TTTGGGAAAAGTTTCATCGTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=149386322;WS=149386304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	149389573	rs11167491	A	G	2136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=9;PP=1696;ReadPosRankSum=-0.888;SC=TTTGCAGGAAAAAAAAAGAAC;SOR=2.242;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=59;TCR=9;TR=67;WE=149389581;WS=149389563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr5	149390148	rs2241698	G	A	1577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=39;PP=1290;SC=TGGGGAGAGTGTATCAGTGGT;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=51;WE=149390156;WS=149390138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	149406271	rs6579767	C	T	5762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=84;PP=2965;SC=CTTTTCAGAGCTGACCTGCTT;SOR=0.736;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=180;TCF=96;TCR=84;TR=180;WE=149406279;WS=149406261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr5	149406733	rs2304069	G	T	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=581;SC=CTGCTTCCATGTAATGTATCA;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=149406741;WS=149406723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	149410519	rs2278394	A	C	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=22;PP=536;SC=GAACAGGGTCAGGTATAGATT;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=149410527;WS=149410509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	149417138	rs6887999	G	T	2122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=54;PP=1735;ReadPosRankSum=0.352;SC=AGCAGGCTTGGGAACTGCCTC;SOR=1.730;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=12;TCR=55;TR=66;WE=149417146;WS=149417128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,67:0.99:68
chr5	149421502	rs2276982	A	G	3422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=45;PP=2509;SC=AGAGGAGTGAAGAGAATGTGC;SOR=0.750;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=50;TCR=45;TR=95;WE=149421510;WS=149421492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr5	149424966	rs2276983	G	A	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=3;PP=1178;SC=GACGGGGTAGGCTGTTGTGTT;SOR=4.664;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=42;WE=149424974;WS=149424956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	149427387	rs2043284	T	G	2490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=61;PP=2034;SC=ACTTTTTAGGTCAGGGATATG;SOR=2.774;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=14;TCR=61;TR=75;WE=149427395;WS=149427377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr5	149428395	rs216125	C	G	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=438;SC=GTGCTACCCCCTGGGCTAGGG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=149428403;WS=149428385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	149428424	rs216126	G	C	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=305;SC=TGGGTCTTCTGTCAGTATTTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=149428432;WS=149428414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	149431223	rs216131	G	A	2191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=2;PP=1823;SC=GAGTGTTCTCGTCACCAGATG;SOR=6.154;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=62;TCR=2;TR=64;WE=149431231;WS=149431213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	149431259	rs216132	A	G	2901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=12;PP=2299;SC=ATTCCTTCTTATCAAAATGCA;SOR=3.535;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=71;TCR=12;TR=83;WE=149431267;WS=149431249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr5	149433596	rs2066934	TG	GA	2725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=12;PP=2898;SC=TTGAAGTTTGTGGGAGGGGAG;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=56;WE=149433605;WS=149433586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	149433857	rs41533349	C	G	3219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=62;NR=55;PP=2583;SC=CTTTACCGGCCACCCACCCCA;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=62;TCR=55;TR=117;WE=149433865;WS=149433847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr5	149437190	rs216138	C	G	2029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=52;PP=1680;SC=GCAGAGGTCACTCATCATCAC;SOR=3.021;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=11;TCR=52;TR=63;WE=149437198;WS=149437180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr5	149452793	rs10044553	C	T	201.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=134;SC=ATGAGCCAAGCGTCCTGATGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=149452801;WS=149452783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	149456811	rs3829987	G	A	11067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=177;NR=166;PP=2965;ReadPosRankSum=1.459;SC=GATCCCTACCGACTGTCCACC;SOR=0.257;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=345;TCF=179;TCR=166;TR=343;WE=149456819;WS=149456801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,350:1.00:351
chr5	149459540	rs3842021	G	GT	971.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=4;PP=961;SC=CCAGTCCCCAGTCACCACCCA;SOR=3.180;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=20;WE=149459548;WS=149459530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	149460343	rs17652007	G	A	2232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=16;PP=1794;SC=TGACATAGAGGTGGATGGCGG;SOR=2.406;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=54;TCR=16;TR=69;WE=149460351;WS=149460333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	149495537	rs75732095	G	A	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=43;PP=1382;SC=TGAGTGAGGGGCTAGGAAGGA;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=52;WE=149495545;WS=149495527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr5	149495606	rs12655077	G	A	838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=708;SC=CCCCTGCACCGTAGGCTTCAC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=149495614;WS=149495596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	149497105	.	G	GCA	33.71	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5040;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=111;SC=GCGCGCGCGCGCGCACACACA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=4;WE=149497115;WS=149497095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr5	149497107	rs28368814	G	A	345.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=235;SC=GCGCGCGCGCGCACACACACA;SOR=2.303;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=9;WE=149497115;WS=149497095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	149504158	rs1075846	T	C	868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=5;PP=723;SC=TCGGGAGCAGTGCCTGCTGCA;SOR=2.694;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=30;WE=149504166;WS=149504148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	149513072	rs2240780	A	G	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=2;PP=460;SC=TCTCACCATCACTCTGCACCC;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=149513080;WS=149513062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	149515202	.	C	G	3782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=41;PP=2931;SC=TCTCCCGTGTCTAGCCCAGTG;SOR=1.316;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=73;TCR=41;TR=114;WE=149515210;WS=149515192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr5	149546426	rs2302274	A	G	2244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=27;PP=1806;SC=TGCGCGGGGGACCCCGCGGCC;SOR=1.349;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=50;TCR=27;TR=76;WE=149546434;WS=149546416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr5	149546828	rs2302275	C	G	99.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=3;PP=73;SC=GCGCAGAGGCCGACGCCCTAC;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=149546836;WS=149546818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	149576233	rs2270145	G	A	3353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=96;NR=6;PP=2832;SC=TGGGCTTTTGGGGGAGCTGCC;SOR=5.263;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=96;TCR=6;TR=102;WE=149576241;WS=149576223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr5	149576273	rs2270146	C	T	4817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=52;PP=2965;SC=ACCCCGCTCCCGGCAGGCGCC;SOR=1.504;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=96;TCR=53;TR=148;WE=149576281;WS=149576263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr5	149576869	.	G	C	2393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=56;PP=1880;SC=CGCGGCATCTGAGGGGACCCT;SOR=3.105;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=11;TCR=56;TR=67;WE=149576877;WS=149576859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr5	149578999	rs731376	T	A	992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=28;PP=860;SC=AAGGCAGGGCTTGGACTGAGC;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=31;WE=149579007;WS=149578989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	149580819	rs3733680	G	A	3005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=77;PP=2514;SC=CAGAGGGAGGGGCCAGGCCTG;SOR=3.516;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=14;TCR=77;TR=91;WE=149580827;WS=149580809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr5	149582103	rs2240788	C	T	4118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=61;PP=2965;SC=GAAAGGAAGGCCCACTCACCC;SOR=0.846;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=136;TCF=75;TCR=61;TR=134;WE=149582111;WS=149582093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr5	149583300	rs2240793	T	C	6027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=86;PP=2965;SC=TCTGGTCCTTTCTCTTCTTCT;SOR=0.984;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=66;TCR=86;TR=152;WE=149583308;WS=149583290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr5	149583336	rs2240794	T	C	4712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=72;PP=2787;SC=TCGGCCTAGATAGCCAGGTGA;SOR=1.423;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=37;TCR=72;TR=109;WE=149583344;WS=149583326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr5	149583383	rs35380195	G	GGT	186.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQRankSum=1.455;QD=9.83;ReadPosRankSum=1.472;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr5	149584341	rs6878880	T	C	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=20;PP=1347;SC=GCTGCTGGCGTTTGTGGGGCC;SOR=1.051;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=29;TCR=20;TR=49;WE=149584349;WS=149584331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	149584863	rs2342283	A	G	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.61;QD=51.18;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	149584870	rs4423986	C	A	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.76;QD=46.05;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	149584881	rs5024534	G	T	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.72;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	149584881	.	GTT	TTC	646	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=40;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=17;NR=0;PP=646;QD=41.1451691095;SC=CCACTTCAGGGTTCGGTACAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=17;WE=149584891;WS=149584853;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,17:0.89:19
chr5	149584883	rs5024533	T	C	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.72;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	149584969	rs11428067	A	AG	4019.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=21;PP=2936;SC=TCGGGCCTTAAGCAGTTTAGA;SOR=2.033;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=55;TCR=21;TR=75;WE=149584989;WS=149584959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	149584981	rs4705425	A	G	4297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=25;PP=2233;SC=CAGTTTAGACAAAAGCCCGCA;SOR=1.832;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=70;TCR=25;TR=95;WE=149584989;WS=149584959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr5	149585025	rs4705426	A	C	4567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=56;PP=2965;SC=GCAGGCCCTCATGGTGTATAG;SOR=1.094;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=83;TCR=56;TR=139;WE=149585033;WS=149585015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr5	149602608	rs2241694	A	G	7801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=157;NR=109;PP=2965;SC=GCCATTTGCCATCCCGGCGGT;SOR=1.133;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=266;TCF=157;TCR=109;TR=266;WE=149602616;WS=149602598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr5	149602824	rs2241695	C	T	2242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=62;PP=1890;SC=CAACCGGGGGCCTCCTGTCTC;SOR=5.074;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=4;TCR=62;TR=66;WE=149602832;WS=149602814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	149610967	rs139753530	AAAT	A	1826.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=41;PP=1920;SC=GGGGACACAGAAATAATAATA;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=95;TCF=0;TCR=95;TR=41;WE=149610977;WS=149610957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	149644597	rs891938	T	G	5125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=78;PP=2965;SC=CAGAGGCTCATGTGAGTCCCC;SOR=0.889;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=64;TCR=78;TR=142;WE=149644605;WS=149644587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr5	149677851	rs6579784	A	G	3162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.573;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=56;PP=2644;ReadPosRankSum=0.281;SC=CGCGCTGGGCATAAAGCATAG;SOR=0.660;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=105;TCF=49;TCR=56;TR=104;WE=149677859;WS=149677841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,106:0.99:107
chr5	149737221	rs4565199	T	G	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=2;PP=359;SC=GCCGGAAGTGTGGCGCGCGAG;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=149737229;WS=149737211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	149771286	rs11742769	C	T	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=23;PP=687;SC=GGCCCTGCATCGCGGCACCAG;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=149771294;WS=149771276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	149781627	rs1056400	T	C	3527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=77;PP=2935;SC=TGCTGCATTGTTATCTGCTGT;SOR=2.237;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=28;TCR=77;TR=105;WE=149781635;WS=149781617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr5	149784414	rs11749903	C	T	1389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=26;PP=1083;SC=GGGACAGAAACATGCAGGGCC;SOR=1.154;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=44;WE=149784422;WS=149784404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	149792113	rs11739355	G	A	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=0;PP=1010;SC=ACTCCTGGCCGGTGCTTCTTC;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=149792121;WS=149792106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	149792135	rs11739357	G	A	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=0;PP=1126;SC=CAGCACATGCGCACGGCTCTG;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=149792143;WS=149792125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	149823785	rs2070844	G	A	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=2;PP=574;SC=AGGAGAGAAGGCTGGAGTTGA;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=149823793;WS=149823782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	149824067	rs2073472	T	C	2573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=61;PP=2102;SC=GAACATGAAGTGGCCCCATCT;SOR=1.900;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=86;TCF=25;TCR=61;TR=85;WE=149824075;WS=149824057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr5	149824223	rs2070842	T	C	4455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.259;NF=72;NR=68;PP=2965;ReadPosRankSum=0.158;SC=AAAAACCCTTTTAGACAGGGT;SOR=0.246;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=73;TCR=68;TR=140;WE=149824231;WS=149824213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,142:0.99:143
chr5	149824308	rs36146597	G	GC	1963.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=51;PP=2276;SC=AAGGCTGGGCGCGGTGGCTCA;SOR=5.174;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=54;TCF=1;TCR=53;TR=52;WE=149824316;WS=149824298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	149824355	rs13171800	G	A	927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=26;PP=748;SC=TTGGGAGACTGAGGCTGGTGG;SOR=5.283;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=27;WE=149824363;WS=149824345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	149826526	rs4841	C	T	4910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=95;PP=2965;SC=AGATGGTTTCCCTGGGGACAA;SOR=1.517;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=49;TCR=95;TR=144;WE=149826534;WS=149826516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr5	149826572	rs13183077	G	A	3074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=69;PP=2483;SC=CCAACAAGGAGTGCTTACGAT;SOR=2.254;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=23;TCR=69;TR=92;WE=149826580;WS=149826562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr5	149931222	rs6579792	T	G	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=1;PP=378;SC=GATTCCCTGGTCTCTGCCATT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=149931230;WS=149931215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	150051958	rs194134	T	C	8291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=159;NR=93;PP=2965;SC=CACCGCCATCTCCAAGGGCTA;SOR=1.347;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=254;TCF=160;TCR=94;TR=252;WE=150051966;WS=150051948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr5	150072693	rs33410	A	G	1334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=8;PP=1089;SC=GTAGAGCGGCAACATGAACCA;SOR=2.985;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=45;WE=150072701;WS=150072683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	150111503	rs142831418	G	A	2267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=55;PP=1819;SC=GGTTGCAACAGAGACAAAAAA;SOR=2.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=14;TCR=55;TR=69;WE=150111511;WS=150111493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr5	150138378	rs201128894	G	GC	4290.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.164;NF=81;NR=42;PP=2983;ReadPosRankSum=1.340;SC=TGAACGCCGCGCCCCCCCCAC;SOR=0.987;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=152;TCF=105;TCR=47;TR=123;WE=150138386;WS=150138368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,149:0.99:150
chr5	150278280	.	G	C	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=580;SC=GAGAAAAAAAGAGGTAAACCA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=150278288;WS=150278270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	150282674	.	AT	A	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=3.100;QD=0.45;ReadPosRankSum=-2.084;SOR=0.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,11:0.16:69
chr5	150311622	rs12656542	A	G	1965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=0;PP=1568;SC=TATTTTTCCAAATATATTATA;SOR=8.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=51;WE=150311630;WS=150311612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr5	150311678	rs11167525	A	G	3523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=17;PP=2642;SC=TGATGACTACAACTTGCCTGA;SOR=3.221;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=94;TCR=17;TR=111;WE=150311686;WS=150311668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr5	150311773	rs7727919	T	C	5786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=114;PP=2965;SC=GAATGACCCCTTGTAATACTT;SOR=1.662;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=56;TCR=114;TR=170;WE=150311781;WS=150311763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr5	150311857	rs10719367	CT	C	2012.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=45;PP=2147;SC=CTCTCTCTGTCTGAAAAAAAA;SOR=5.018;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=46;WE=150311865;WS=150311847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	150323530	rs112582282	GTGGGAGAAGGTCGTGA	G	597.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=0;NR=9;PP=2965;SC=AGGCCATCCTGTGGGAGAAGG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=9;WE=150323553;WS=150323520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	150483095	rs4958892	A	G	2737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=36;PP=2222;SC=TCTGACACTCACCCGCTTCCT;SOR=1.354;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=60;TCR=36;TR=96;WE=150483103;WS=150483085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr5	150489390	rs1133202	A	G	2184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=39;PP=1587;SC=TGTCTCCACTAGGTGTGTCTG;SOR=1.002;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=29;TCR=39;TR=68;WE=150489398;WS=150489380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr5	150496853	rs11747529	C	T	6357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=143;PP=2965;SC=TCCTCATCAGCTACACAGGGA;SOR=1.946;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=200;TCF=56;TCR=144;TR=199;WE=150496861;WS=150496843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr5	150499080	rs2303023	T	C	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=10;PP=275;SC=GACATGGCCCTCAGGCCCAAG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=150499088;WS=150499070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	150499102	rs2303024	A	G	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=132;SC=CCTTGGCACAACCAAGGCTGA;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=5;WE=150499110;WS=150499092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	150506104	rs111270752	AACACACACAC	A	853.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.69;QD=42.69;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	150509258	rs144537590	T	TTTTGTTTG	220.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=2;PP=221;SC=CCTCTTACTGTTTTGTTTGTT;SOR=2.303;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=3;WE=150509266;WS=150509248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	150512589	rs146823252	G	GAAAAT	5911.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.83;QD=42.84;SOR=0.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr5	150516887	rs2303034	G	C	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=19;PP=463;SC=AATGCCCTGGGGGTAGAAAAA;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=150516895;WS=150516877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	150564975	rs248428	T	C	2392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=21;PP=1939;SC=CCACTCCCAGTCACAGACCAC;SOR=2.043;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=77;TCF=56;TCR=21;TR=76;WE=150564983;WS=150564965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr5	150565008	rs248427	C	T	2974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=37;PP=2328;SC=GATCAGCCGCCTGTCCAGCTC;SOR=1.071;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=51;TCR=37;TR=87;WE=150565016;WS=150564998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	150565724	rs248426	C	T	2515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=57;PP=1957;SC=CAAAGCCTGCCTCATAAATGC;SOR=2.630;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=14;TCR=57;TR=71;WE=150565732;WS=150565714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr5	150565770	rs193728	G	A	1796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=40;PP=1344;SC=GAGGGAGAACGGTTTTGGGTT;SOR=2.876;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=49;WE=150565778;WS=150565760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	150567049	rs35221501	CA	C	2496.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=38;PP=2550;ReadPosRankSum=-1.423;SC=TCCATAAGCTCAAGACACTTC;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=23;TCR=39;TR=61;WE=150567057;WS=150567039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,70:0.97:72
chr5	150567074	rs36036156	T	TG	1918.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.773;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=38;PP=2208;ReadPosRankSum=0.768;SC=CAAAGCCTTCTGCAGGCCCCT;SOR=1.781;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=52;TCF=11;TCR=41;TR=49;WE=150567082;WS=150567064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,56:0.97:58
chr5	150567145	rs454130	G	A	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=29;PP=886;SC=GTCTAGGAACGGTCTTATTCA;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=150567153;WS=150567135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	150639409	rs153477	A	G	3724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.963;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=47;PP=2755;ReadPosRankSum=0.636;SC=TGACCCCATCATCGTTCCTGG;SOR=0.928;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=122;TCF=74;TCR=48;TR=121;WE=150639417;WS=150639399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,131:0.99:132
chr5	150639439	rs153478	A	G	4315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=69;PP=2965;SC=CCTCAGTGTCATGGGCAGCAC;SOR=0.706;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=70;TCR=69;TR=139;WE=150639447;WS=150639429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr5	150647239	rs989	A	G	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=19;PP=523;SC=AGCCCAGGGCATCTGCTGGGC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=150647247;WS=150647229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	150660769	rs1368393	A	G	2690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=48;PP=1670;SC=ATTGGATGTGAAAGGTGATGT;SOR=2.799;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=13;TCR=48;TR=61;WE=150660777;WS=150660759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr5	150660794	rs1368394	G	A	2010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=34;PP=1095;SC=CCCCGGAAGGGCCATTGAGGA;SOR=2.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=43;WE=150660802;WS=150660784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	150663565	rs1347147	A	C	493.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=387;ReadPosRankSum=1.139;SC=GAACAGTTCCAGTGTCTCTCC;SOR=2.948;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=14;WE=150663573;WS=150663555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr5	150667016	rs978012	T	C	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=30;PP=891;ReadPosRankSum=1.370;SC=ACGTGGGCTTTTTCCACCATC;SOR=4.174;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=31;WE=150667024;WS=150667006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chr5	150667771	rs246499	G	A	967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=1;PP=793;SC=ACTTTAGCTCGTCTATCCTTT;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=150667779;WS=150667765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	150668649	rs10071719	T	C	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=28;PP=887;SC=AAGTCAATTGTAGGTATCCTA;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=32;WE=150668657;WS=150668639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	150668692	rs17716431	A	G	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=19;PP=532;SC=AGACTGCAATAGCCAGAAAAT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=150668700;WS=150668682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	150677976	rs2431072	T	C	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=511;SC=TGTGCCCCCTTCAGGGATGCT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=150677984;WS=150677966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	150682975	rs6887412	T	C	1927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=57;PP=1470;ReadPosRankSum=1.785;SC=GAGCCTCTGATGGGTCTTTCT;SOR=2.191;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=10;TCR=59;TR=67;WE=150682983;WS=150682965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
chr5	150683005	rs28481793	T	C	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=37;PP=966;SC=CCATGGCTGCTGACCTGAGAT;SOR=4.125;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=41;WE=150683013;WS=150682995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	150683055	rs6866481	G	A	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=451;SC=GCTGGCTGAAGCCTGAAGTGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=150683063;WS=150683045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	150704758	rs246496	A	G	172.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=133;SC=TCTAGACCTCAGTTTCCCAGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=150704766;WS=150704748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	150715204	rs7721673	G	A	367.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5133;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=296;ReadPosRankSum=1.651;SC=TTCCCTCACAGTGAATGGGAG;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=13;WE=150715212;WS=150715194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr5	150718424	rs9324690	T	C	2723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=5;PP=2275;ReadPosRankSum=0.107;SC=AGATACCGGATAAAGGGTATT;SOR=2.742;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=79;TCR=5;TR=82;WE=150718432;WS=150718414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,85:0.98:87
chr5	150718462	rs9324691	T	G	5107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.895;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=126;NR=21;PP=2965;ReadPosRankSum=0.906;SC=ACAGAGATCTTCAGATATGTG;SOR=2.580;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=150;TCF=128;TCR=22;TR=147;WE=150718470;WS=150718452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,154:0.98:157
chr5	150722735	rs10062214	C	T	410.88	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=342;ReadPosRankSum=-0.653;SC=TTAAATGAGGCGGAGACTACA;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=14;WE=150722743;WS=150722725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr5	150838284	rs35256722	C	G	1876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.92;SOR=7.428;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	150838293	rs35074529	T	C	1925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.79;SOR=7.658;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	150838603	rs56026426	A	C	2222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=69;PP=1709;SC=TTACAGATGAAGGTCAGCAGT;SOR=4.174;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=7;TCR=69;TR=76;WE=150838611;WS=150838593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
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chr5	150846663	rs78066852	A	G	580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=521;SC=GTACTCCCTAAATCTATTAAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=17;WE=150846671;WS=150846653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
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chr5	150846882	rs61191955	C	A	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=9.777;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.13;MQRankSum=-0.171;QD=27.09;ReadPosRankSum=-0.606;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,17:0.89:19
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chr5	150847509	rs394736	A	G	4778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.27;SOR=2.810;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr5	150847554	rs357621	T	C	1720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=54;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=52;PP=1371;SC=TGGTAGCTCATGCCTGTAATC;SOR=3.611;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=8;TCR=52;TR=60;WE=150847562;WS=150847544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	150847574	rs13357451	T	C	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=60;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=39;PP=952;SC=CCCAGCACTTTGGGAGGTGGG;SOR=4.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=42;WE=150847582;WS=150847564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	150847604	rs189615	A	G	910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=743;SC=ATCACCTGAGATCAGGAGTTT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=150847612;WS=150847594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	150848653	rs10709981	TA	T	2546.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.304;NF=88;NR=8;PP=1573;ReadPosRankSum=0.098;SC=AAGCATAACTTAAAAAAAAAA;SOR=3.422;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=125;TCF=108;TCR=17;TR=96;WE=150848662;WS=150848643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,107:0.99:108
chr5	150848701	rs357624	A	G	5638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.204;NF=144;NR=51;PP=2965;ReadPosRankSum=0.317;SC=TCATCAGTACATATTCATTAA;SOR=0.971;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=145;TCR=51;TR=195;WE=150848709;WS=150848691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,201:1.00:202
chr5	150848874	rs357625	A	G	2009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=59;PP=1734;SC=TTTTGTTTTCATTTTTGAAAC;SOR=5.421;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=3;TCR=61;TR=62;WE=150848882;WS=150848864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	150853193	rs11279332	CTTTTGCTTTG	C	2115.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=10;PP=2987;SC=TCTGTATAGCCTTTTGCTTTG;SOR=2.208;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=31;WE=150853210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	150856107	rs165352	T	G	6431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=138;NR=57;PP=2965;ReadPosRankSum=1.018;SC=CATTAACTTTTCTTTTTTCTG;SOR=0.862;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=197;TCF=140;TCR=57;TR=195;WE=150856115;WS=150856097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,205:1.00:206
chr5	150856468	rs59943681	C	T	1941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=43;PP=1497;SC=TCACTGGCTGCCCTGGACTGC;SOR=2.419;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=15;TCR=43;TR=58;WE=150856476;WS=150856458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	150867719	rs78441677	C	T	3049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=33;PP=2332;SC=TCCTGGGCTTCGTGGGCTTTG;SOR=1.426;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=61;TCR=33;TR=94;WE=150867727;WS=150867709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr5	150886725	rs7723266	G	A	4301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=91;NR=43;PP=2965;SC=CCATCTCCTCGCTGGACCAGG;SOR=1.697;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=91;TCR=43;TR=134;WE=150886733;WS=150886715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr5	150887184	rs75548276	G	GAGA	1715.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=32;PP=1736;SC=TGCGGAGACAGAGTAGTCAGG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=32;WE=150887192;WS=150887174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	150891663	rs6862750	T	C	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=646;SC=CCTGACATGCTTTTCCCACCT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=22;WE=150891671;WS=150891655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	150891733	rs2304028	A	G	1665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=10;PP=1226;SC=CACCTGCCCCATGGGTCCATG;SOR=3.076;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=45;TCR=10;TR=55;WE=150891741;WS=150891723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	150891772	rs2304029	C	G	2690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=18;PP=2151;SC=GGCATGTGTTCTGGCTGCAGT;SOR=2.448;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=61;TCR=18;TR=79;WE=150891780;WS=150891762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr5	150900787	rs75833719	G	A	1189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=7;PP=988;SC=AGAGTCAGGCGGGCTGAGCCC;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=39;WE=150900795;WS=150900777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	150901111	rs3822699	A	G	9817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=164;NR=164;PP=2965;SC=CCAGGAGCACATCCACACCAG;SOR=0.705;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=329;TCF=164;TCR=165;TR=328;WE=150901119;WS=150901101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,334:1.00:334
chr5	150901261	rs6650971	C	T	7462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=109;NR=117;PP=2965;SC=AGCCCATCCACATGGCCTGCT;SOR=0.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=226;TCF=109;TCR=117;TR=226;WE=150901269;WS=150901251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr5	150901300	rs3734046	G	A	7463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=120;NR=106;PP=2965;SC=CATGCCACACGTACACATGGA;SOR=0.887;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=226;TCF=120;TCR=106;TR=226;WE=150901308;WS=150901290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr5	150901613	rs2053028	A	G	1417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=39;PP=1185;SC=GACAGACGTCAAAGACGAGAG;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=40;WE=150901621;WS=150901603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	150901699	rs3734050	C	T	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=410;SC=AGTGCTCTTGCGCCCGACTGA;SOR=3.912;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=15;WE=150901707;WS=150901689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	150905398	rs3734051	C	T	4989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.013;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=66;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.035;SC=GCCATCCATCCGGGGTCACTC;SOR=0.134;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=150;TCF=84;TCR=66;TR=148;WE=150905406;WS=150905388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,156:0.99:158
chr5	150906963	rs10071924	T	G	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=29;PP=985;SC=CCAGTGGAGGTTAGCAATGAG;SOR=2.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=40;WE=150906971;WS=150906953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	150907741	rs2304026	C	T	1110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=31;PP=990;SC=GGAATCTTGACCCCTGGGAGT;SOR=4.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=150907749;WS=150907731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	150907819	rs11743288	T	C	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=369;SC=GGATCACAGTTGTCCCTGCCA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=150907827;WS=150907809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	150914184	rs1432643	A	T	3255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=57;PP=2395;SC=GGTCTAGGGCAGTGAGTGTGG;SOR=1.036;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=42;TCR=57;TR=99;WE=150914192;WS=150914174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr5	150923405	rs6892335	A	G	3197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=58;PP=2647;SC=GCTGTTAATGAAGAAGTGCCT;SOR=1.156;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=37;TCR=58;TR=95;WE=150923413;WS=150923395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr5	150942919	rs6872614	A	G	2150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=14;PP=1708;ReadPosRankSum=-0.729;SC=AATCCCATGTAGTTCCCACTG;SOR=1.320;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=52;TCR=14;TR=65;WE=150942927;WS=150942909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,67:0.99:68
chr5	150946966	rs1465690	G	A	5304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=70;PP=2965;SC=TCCCCAGGTAGGGGTCAATAG;SOR=0.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=87;TCR=71;TR=157;WE=150946974;WS=150946956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr5	150948537	rs1469680	T	C	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=20;PP=472;SC=AAAGACAGGGTGCAAGTTAGG;SOR=3.442;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=150948545;WS=150948527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	151180451	rs200261823	AT	A	132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=4.468;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.14;ReadPosRankSum=0.413;SOR=0.247;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,18:0.29:62
chr5	151771817	rs1363422	C	T	1556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=21;PP=1232;SC=GAGAGGGCTGCTGGGAGGTGA;SOR=1.007;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=25;TCR=21;TR=46;WE=151771825;WS=151771807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr5	153174310	.	GA	G	3194.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.000;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.301;NF=39;NR=57;PP=1599;ReadPosRankSum=0.118;SC=GCCCCAGTAAGAAAAAAAAAA;SOR=0.349;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=47;TCR=68;TR=96;WE=153174318;WS=153174300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,131:0.99:132
chr5	153372525	rs1057772	G	A	3410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=24;PP=2701;SC=AGGTCAAAACGTCTCCATTCT;SOR=2.281;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=108;TCF=83;TCR=25;TR=107;WE=153372533;WS=153372515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr5	153372743	rs6866471	G	A	1092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=32;PP=952;SC=TAAGGCAACAGGGGAACAGAT;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=153372751;WS=153372733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	153382072	rs35082504	GTCT	G	1424.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=31;PP=1525;SC=AATAAAGAGTGTCTTCTTCTT;SOR=5.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=31;WE=153382082;WS=153382062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	153406644	rs9324765	C	T	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=686;SC=AAAACATACACTTCATCTTCC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=153406652;WS=153406641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	153406987	rs6889563	G	C	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=24;PP=677;SC=AGACAGGTTAGAGTACAGAGG;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=153406995;WS=153406977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	153413390	rs2578377	C	T	2047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=40;PP=1603;SC=TCACTGGGACCAGGGATTCCA;SOR=1.112;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=27;TCR=40;TR=67;WE=153413398;WS=153413380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	153414545	rs34907432	C	CA	1784.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=52;PP=1377;SC=AATGAAAGCCCAAAAAAAATT;SOR=3.442;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=64;TCF=5;TCR=59;TR=56;WE=153414553;WS=153414535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr5	153429459	rs690592	T	C	7357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=135;PP=2965;SC=CGGATGATGATGTCATCATAG;SOR=0.987;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=242;TCF=107;TCR=135;TR=241;WE=153429467;WS=153429449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr5	153432450	rs11451300	A	AT	3521.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=19;PP=2274;SC=TTTTGCTATAATTTTTTTTTC;SOR=3.524;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=124;TCF=96;TCR=28;TR=104;WE=153432458;WS=153432440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr5	153432733	rs2578386	T	C	5370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=91;NR=69;PP=2965;SC=CTGAGAAGGCTATCAATGAGT;SOR=0.978;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=91;TCR=69;TR=160;WE=153432741;WS=153432723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr5	153432970	rs2255493	C	T	4797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=92;PP=2965;SC=TGCGAGTGGACGACCCTGATG;SOR=1.209;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=59;TCR=92;TR=151;WE=153432978;WS=153432960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr5	153570349	rs201222592	C	CCGGGCGGA	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.85;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr5	153674536	.	TTG	T	123.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=1.468;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.296;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr5	153677361	.	TGA	T,TTCCCCGA	940.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.17;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=1019;SC=CTCTTTGTACTGAGCAAAAAC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=16;WE=153677371;WS=153677351;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:22
chr5	153677362	.	GA	CT	838	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=15;NR=0;PP=838;QD=59.4311916575;SC=TCTTTGTACTGAGCAAAAACT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=15;WE=153677371;WS=153677351;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,15:0.79:19
chr5	153677363	.	A	ATCCCCCT	940.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.49;QD=42.76;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	153709043	rs1004976	G	A	3637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=4;PP=2965;SC=AGGAAGTGGGGTTTGCAGTTA;SOR=6.053;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=101;TCR=4;TR=104;WE=153709051;WS=153709033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr5	153833069	rs146967672	A	C	2727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=45;PP=2107;ReadPosRankSum=-0.498;SC=AAGTAGGTAGACAAAATTGCC;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=90;TCF=43;TCR=47;TR=86;WE=153833077;WS=153833059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,88:0.96:92
chr5	153857101	rs34402828	A	C	5157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=44;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.929;SC=CGGGATCGCCAGACTGTGCAT;SOR=0.994;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=161;TCF=117;TCR=44;TR=160;WE=153857109;WS=153857091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,164:0.99:165
chr5	154065382	rs33982250	TA	T	1222.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=0.797;QD=16.09;ReadPosRankSum=-0.021;SOR=0.782;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,63:0.83:76
chr5	154065495	rs11958012	GG	AC	8837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=123;PP=2947;ReadPosRankSum=1.012;SC=CTCGTGATTCGGTTAATCCTC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=59;TCR=129;TR=179;WE=154065504;WS=154065485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,199:1.00:200
chr5	154134818	rs11416035	C	CG	34.71	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.35;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr5	154193735	rs863649	A	G	2314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=5;NR=61;PP=1870;SC=AGTCCCAGGAAAGGGGACAAT;SOR=4.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=5;TCR=61;TR=66;WE=154193743;WS=154193725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	154247297	rs35471086	TAA	T	1618.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=60.26;MQRankSum=0.340;NF=11;NR=20;PP=1239;ReadPosRankSum=1.970;SC=TTGCTTGAGCTAAAAGACATA;SOR=0.743;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=31;WE=154247306;WS=154247287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,39:0.95:41
chr5	154268902	rs816739	C	T	2482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=41;PP=1949;SC=CAGGAAATTTCGCCATTCTCT;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=33;TCR=41;TR=74;WE=154268910;WS=154268892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr5	154271391	rs702743	A	C	2179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=51;PP=1777;SC=TTTCTTATCAACCAAGAAGCA;SOR=2.269;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=16;TCR=51;TR=67;WE=154271399;WS=154271381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr5	154271948	rs816736	G	A	5137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=106;NR=46;PP=2965;SC=GTCACTTACCGTCAGGGAGAA;SOR=1.791;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=106;TCR=47;TR=152;WE=154271956;WS=154271938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr5	154278888	rs816740	C	T	2750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=46;PP=2083;SC=CAAGAACAGACCCTTTAGCCA;SOR=0.941;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=83;TCF=36;TCR=47;TR=82;WE=154278896;WS=154278878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	154282551	rs10515726	T	C	4425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=25;PP=2965;SC=CATTATAATATCACAGGATGA;SOR=3.040;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=112;TCR=25;TR=137;WE=154282559;WS=154282541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr5	154287016	rs76813157	T	TGAAAAAAAA	1696.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=2900;SC=GAATAAAGCTTAACAAAAAAA;SOR=5.486;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=17;WE=154287024;WS=154287006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	154287115	rs6580119	T	C	3929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=48;PP=2887;SC=GACACGACCATGAAATCCTAG;SOR=1.256;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=80;TCR=48;TR=128;WE=154287123;WS=154287105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr5	154291219	rs6580121	A	G	1032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=6;PP=806;SC=TTCCTTGCTCAATCCTGATCA;SOR=2.964;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=154291227;WS=154291209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	154291409	rs1974777	C	T	3729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=73;PP=2931;SC=CAGTCGACCTCGATGTCCTCG;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=39;TCR=73;TR=112;WE=154291417;WS=154291399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr5	154291496	rs1974776	G	A	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=40;PP=1166;SC=GACATTTTCTGGTTATTCTAT;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=41;WE=154291504;WS=154291486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	154296795	rs348735	A	C	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=643;SC=TACAAGTTACAATGCAAATAG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=154296803;WS=154296785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	154300940	rs348739	A	C	2991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=68;PP=2383;SC=CCCAGGCTAAAGTATATACAG;SOR=1.458;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=40;TCR=68;TR=108;WE=154300948;WS=154300930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr5	154306972	rs2258437	T	C	1996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=3;PP=1622;SC=TAGAAAGTAATAGCTGTTTGT;SOR=5.421;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=62;TCF=59;TCR=3;TR=62;WE=154306980;WS=154306962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	154308282	rs2644743	C	T	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=34;PP=965;SC=ATGAAGTCACCGGTGGTTCAT;SOR=4.125;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=37;WE=154308290;WS=154308272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	154308307	rs1035368	G	A	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=27;PP=752;SC=CACAGTCTGCGCTGTAAAAGC;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=154308315;WS=154308297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	154311235	rs2644744	T	C	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=22;PP=694;SC=AGCTATCTCTTTCATAGGTCT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=154311243;WS=154311225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	154311576	rs2544866	T	C	566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.49;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	155935836	rs115859006	A	G	1877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=51;PP=1533;SC=ATTAAGATGAATTTGCTTTCT;SOR=3.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=7;TCR=51;TR=58;WE=155935844;WS=155935826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	156074654	rs141437738	TAAATTGA	T	992.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=18;PP=1064;SC=CGTGAATACATAAATTGAAAG;SOR=4.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=19;WE=156074668;WS=156074644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	156376703	rs6873053	A	G	1201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=23;PP=935;SC=AGTAGACTCAACACTACTCCA;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=36;WE=156376711;WS=156376693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	156381370	rs7724832	G	A	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=1;PP=916;SC=TGATCCCATTGTCCATTAACC;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=34;WE=156381378;WS=156381360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	156390297	rs6882076	T	C	4414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=108;PP=2965;SC=GGTGGGACTCTTTAGTTTCAT;SOR=3.173;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=129;TCF=20;TCR=109;TR=128;WE=156390305;WS=156390287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr5	156464212	rs4704837	T	G	2234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=2;PP=1789;SC=CAGGCAATTTTGCTGTACATC;SOR=6.091;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=59;TCF=57;TCR=2;TR=59;WE=156464220;WS=156464202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr5	156479323	rs1553318	G	C	1273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=0;PP=1157;SC=TGGATGGTCCGCAGCTCCTCA;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=41;WE=156479331;WS=156479313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	156479424	rs1553317	A	C	6178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=151;NR=34;PP=2965;SC=AGGTAGAGACAGTTGTTGTCA;SOR=2.906;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=151;TCR=34;TR=185;WE=156479432;WS=156479414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr5	156479509	rs1553316	A	G	8284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=142;NR=136;PP=2965;SC=CATTGTCGTCAGAACAGTCGT;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=280;TCF=142;TCR=138;TR=278;WE=156479517;WS=156479499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr5	156479557	rs141023871	GTTGGAACAGTCGTCA	G	10034.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=135;PP=2933;SC=AACAGTTGTCGTTGGAACAGT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=220;TCF=53;TCR=167;TR=176;WE=156479579;WS=156479547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr5	156482099	rs2270925	T	C	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.04;SOR=3.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	156482099	.	TTA	CTT	934	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=17;NR=0;PP=934;QD=58.0863455801;SC=GAACAAGAGTTTATTTAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=17;WE=156482109;WS=156482089;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,17:0.85:20
chr5	156482101	rs2270924	A	T	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.04;SOR=3.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	156482459	rs1809941	G	T	2859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=57;PP=2231;SC=TCCAGCACATGGATGTGACAG;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=36;TCR=57;TR=93;WE=156482467;WS=156482449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr5	156531561	rs2902306	C	T	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=456;SC=TTCAGGTGCACGGAGATATCC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=156531569;WS=156531551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	156531736	rs1036199	C	A	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=17;PP=814;SC=GTCTCTCTGCCGAGTCGGTGC;SOR=1.302;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=27;WE=156531744;WS=156531726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	156531865	rs1036200	A	G	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=295;SC=CAATTAAGAAAGAGAAATACA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=156531873;WS=156531855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	156644775	rs5872504	T	TC	2891.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=36;PP=2802;SC=TCTGTTGTTTTCCTGGGCCCT;SOR=0.902;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=30;TCR=39;TR=64;WE=156644783;WS=156644765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr5	156721863	rs5872508	T	TC	2741.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.13;NF=40;NR=27;PP=2758;SC=CCCGGGCCATTCCCAGGTGAG;SOR=1.220;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=67;WE=156721871;WS=156721853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr5	156721986	rs7724099	C	A	1671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=42;PP=1338;ReadPosRankSum=-0.856;SC=TAAAGCAGGTCCTCTTATCCA;SOR=0.898;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=59;TCF=15;TCR=44;TR=57;WE=156721994;WS=156721976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr5	156723913	rs1600014	T	C	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=282;SC=GCCCTACACATCCCTGGGTGA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=156723921;WS=156723903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	156734632	rs529619	G	A	246.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=157;SC=AATATAATGTGTGTCTCTACA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=156734652;WS=156734622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	156734644	rs144622623	G	GGTGTGTGTGT	448.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=778;SC=GTCTCTACAGGGTGTGTGTGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=156734652;WS=156734622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	156738830	rs393178	G	C	2128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=62;PP=1578;SC=CGTGGGCCCAGGGCCAGAAGG;SOR=3.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=10;TCR=62;TR=72;WE=156738838;WS=156738820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr5	156811670	rs4305634	G	A	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=10;PP=316;SC=TCATGGGGCCGGGCGCGGTGG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=156811678;WS=156811660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	156816522	rs889035	G	A	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=37;PP=1051;SC=AGCCAGAAACGTGGGCAGGGG;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=38;WE=156816530;WS=156816512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	156887133	rs1105282	A	G	1397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=12;PP=998;SC=TGCCCCCGGAATTGCCCAAGA;SOR=1.714;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=42;WE=156887141;WS=156887123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	156898690	rs6860507	A	G	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=2;PP=696;SC=ATATTTCCTGAGGGAGAGTCT;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=22;WE=156898698;WS=156898680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	156898899	rs4704869	G	A	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=33;PP=977;SC=AAAAGGTCAGGTTGGGTTCTG;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=35;WE=156898907;WS=156898889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	156898967	rs6879450	G	A	399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=336;SC=AATGTTAATGGGCTGGTACTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=156898975;WS=156898957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	156899290	rs9313607	T	C	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=1;PP=533;SC=GCCCTAGACATTGCCTGCACC;SOR=6.184;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=156899298;WS=156899280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	156899869	rs4704870	T	C	7020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=105;PP=2965;SC=AACCCACTGTTATTAGACTGG;SOR=0.800;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=206;TCF=101;TCR=105;TR=205;WE=156899877;WS=156899859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr5	156904633	rs10404	C	T	1713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=13;PP=1532;SC=TTCCAGTTGGCGTTCCCATGG;SOR=2.428;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=46;TCR=13;TR=59;WE=156904641;WS=156904623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr5	156916037	rs10674185	C	CAAAAAGAA	2503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=10;PP=2124;SC=GACTCCATCTCAAAAAGAAAA;SOR=1.562;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=45;TCF=28;TCR=17;TR=29;WE=156916045;WS=156916027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	156918987	rs11466790	G	A	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=27;PP=762;SC=TAGGAGGCAAGATTTTGCACT;SOR=3.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=30;WE=156918995;WS=156918977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	156936549	rs1422794	G	T	1307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=35;PP=1055;SC=TTTCATTCTGGTGGAGCTTGA;SOR=4.021;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=39;WE=156936557;WS=156936539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	157002552	rs6556092	A	G	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=10;PP=801;SC=CGGACCCGCAAGGCTACTCCC;SOR=1.536;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=31;WE=157002560;WS=157002542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	157094771	rs36105993	TAC	T	1313.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=2.512;QD=30.55;ReadPosRankSum=1.311;SOR=2.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr5	157165832	.	CT	C	22	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;FR=0.9999;HP=18;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=17;MQ=56.98;NF=0;NR=2;PP=22;QD=12.5;SC=ATAGTATAACCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=2;WE=157165840;WS=157165822;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,2:0.20:10
chr5	157178592	rs56398160	TA	T	1602.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=30;PP=1437;SC=ATATCTTCTATAATATTTAAA;SOR=2.200;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=35;WE=157178600;WS=157178582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	157236505	rs60217753	TA	T	96.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.49;MQRankSum=0.566;QD=5.69;ReadPosRankSum=0.312;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr5	158140222	rs3734105	G	A	1658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=43;PP=1332;ReadPosRankSum=-1.019;SC=CCATTTTTTCGGTGCCAGGTA;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=8;TCR=44;TR=51;WE=158140230;WS=158140212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,52:0.98:53
chr5	158204425	rs1368298	A	G	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=4;PP=513;SC=TCTTACCTGTATAAATGAATC;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=158204433;WS=158204415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	158523522	rs7442701	C	T	1850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=45;PP=1462;SC=CCCCCGCTGGCGAGCCAGGCA;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=12;TCR=45;TR=57;WE=158523530;WS=158523512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	158523584	rs6556385	T	C	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=22;PP=550;SC=CTCCGCCCCCTGTTCCTGACT;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=158523592;WS=158523574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	158588633	rs139682876	GAAAAA	G	2108.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=20;PP=908;SC=CCCAGAACCTGAAAAAAAAAA;SOR=0.735;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=38;WE=158588646;WS=158588623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	158697481	rs3734104	C	G	1688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=21;PP=1329;SC=TAGAAGTAATCAGTTGTCATG;SOR=0.866;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=23;TCR=21;TR=44;WE=158697489;WS=158697471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr5	158705370	rs12520035	A	G	2793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.416;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=45;PP=2083;ReadPosRankSum=1.180;SC=AAGGTAAGACATACTTTTACT;SOR=0.549;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=99;TCF=53;TCR=46;TR=98;WE=158705378;WS=158705360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr5	158710419	rs1433046	C	T	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=414;SC=CATCAGTGACCCCAGTATATA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=158710427;WS=158710409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	158743846	rs11574790	G	A	2494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=48;PP=1887;ReadPosRankSum=-0.192;SC=AAGGAAAGCTGTGAAGACCCC;SOR=0.286;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=84;TCF=35;TCR=49;TR=83;WE=158743854;WS=158743836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,84:0.99:85
chr5	158747564	rs919766	A	C	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=406;SC=TGTGTTACACATTGGGGAGAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=158747572;WS=158747554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	159344461	rs3729604	G	A	4708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=94;PP=2965;SC=CTCTCCTTGGGTGGAAGGAGC;SOR=1.279;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=58;TCR=94;TR=152;WE=159344469;WS=159344451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr5	159437466	rs961265	C	T	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=6;PP=535;SC=TTTAAAAATACAAGCACCATT;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=159437474;WS=159437456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	159516781	.	G	A	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=21;PP=620;SC=TTTGGTCTAAGCCAGTTTACT;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=159516789;WS=159516771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	159665499	rs2277955	G	T	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=84;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=547;SC=GAAGTGGTGCGCCTGACTCTT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=159665507;WS=159665495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	159665523	rs10071756	C	T	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.82;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	159665527	rs10056227	G	A	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.22;SOR=4.921;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	159665534	rs10079413	A	G	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.91;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	159665726	rs10071871	C	T	4767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=93;PP=2965;SC=TAAGGACAGACGCTGCTCGCT;SOR=1.417;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=146;TCF=52;TCR=94;TR=145;WE=159665734;WS=159665716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr5	159686752	rs139134014	C	T	6142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=112;PP=2965;ReadPosRankSum=0.705;SC=AACTTGGGGACGTGGTCTTCC;SOR=0.440;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=72;TCR=113;TR=184;WE=159686760;WS=159686742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,197:0.99:198
chr5	159707993	rs59603436	T	C	940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=27;PP=700;SC=TTCCTTCCCATGGGAAAGGTT;SOR=2.899;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=33;WE=159708001;WS=159707983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	159738773	.	G	A	3995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.518;ClippingRankSum=0.000;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=28;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.763;SC=CGGGAGTTCTGAGTTCCCACG;SOR=1.285;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=126;TCF=98;TCR=28;TR=125;WE=159738781;WS=159738763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,125:0.99:126
chr5	159766379	rs13360090	C	A	995.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.51;QD=34.34;SOR=6.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	159766380	rs61666605	A	AC	930.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;QD=33.24;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	159776637	rs10053189	C	T	7656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=133;PP=2965;SC=CTGGCTCCCCCTTCTTGCCCT;SOR=1.107;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=225;TCF=92;TCR=133;TR=225;WE=159776645;WS=159776627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr5	159831664	rs2961939	C	T	1087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=4;PP=888;SC=ACCCAGGAGGCGGAAGTTGCA;SOR=3.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=36;WE=159831672;WS=159831654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	159831803	rs2961940	A	G	4490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=69;PP=2965;ReadPosRankSum=0.008;SC=AGGACAAATGATTATCAACTT;SOR=0.428;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=81;TCR=70;TR=148;WE=159831811;WS=159831793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,151:0.98:154
chr5	159832250	rs2910182	A	G	1723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=51;PP=1485;ReadPosRankSum=0.165;SC=GTAATTTGGGAGAAAAATTAT;SOR=4.370;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=54;TCF=1;TCR=53;TR=52;WE=159832258;WS=159832240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,53:0.96:55
chr5	159833355	rs36082303	A	AT	655.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=15;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.301;NF=35;NR=0;PP=351;ReadPosRankSum=-0.057;SC=AACAGTTAAAATTTTTTTTTT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=67;TCF=67;TCR=0;TR=35;WE=159833363;WS=159833345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,37:0.73:51
chr5	159835658	rs2961944	A	G	1768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=25;PP=1279;SC=ATGTATTACCATCTGAGAATT;SOR=1.057;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=33;TCR=25;TR=58;WE=159835666;WS=159835648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	159840688	rs2961949	T	C	1262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=35;PP=1108;SC=GAAAACTTCATACAACTTTTA;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=38;WE=159840696;WS=159840678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	159842465	rs2910190	A	G	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=298;SC=CCCCCTCCTCAAGGTCTCTAC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=159842473;WS=159842455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	159849991	rs2910200	C	T	1879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=51;PP=1615;ReadPosRankSum=1.762;SC=AGCTTTCTTCCCTCTGAGTAG;SOR=4.407;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=54;TCF=2;TCR=52;TR=53;WE=159849999;WS=159849981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr5	159851211	rs2910203	G	C	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=1;PP=398;SC=GACTTCCACTGTCACTAACCC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=159851219;WS=159851201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	159901408	rs2961918	C	A	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=84;SC=GCTGCTGAATCTTCAGAAAGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=159901416;WS=159901398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	159901491	.	TCTTCAGAAAGGCCTTTCTGAAC	T	798	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=18;MQ=56.8;NF=4;NR=2;PP=798;QD=140.166666667;SC=GGCTGCTGAATCTTCAGAAAG;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=6;WE=159901520;WS=159901481;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr5	159912418	rs2910164	C	G	566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=9;PP=440;SC=TGTCAGACCTCTGAAATTCAG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=18;WE=159912426;WS=159912408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	159992655	rs3812005	T	C	2557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=31;PP=2034;ReadPosRankSum=0.977;SC=GTTCGTGGAGTACTGACTCTT;SOR=1.124;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=48;TCR=32;TR=78;WE=159992663;WS=159992645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,81:0.98:83
chr5	159992697	rs4921302	C	T	2365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.658;HP=4;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=24;PP=1806;ReadPosRankSum=-1.323;SC=GGTTAGAGCTCTTTGGGGTGC;SOR=1.410;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=73;TCF=48;TCR=25;TR=72;WE=159992705;WS=159992687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,75:0.99:76
chr5	159992751	rs4921150	A	G	3388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=42.90;ReadPosRankSum=-0.216;SOR=0.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,77:0.97:79
chr5	159992754	rs3812006	T	G	3452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=42.11;ReadPosRankSum=-0.341;SOR=0.379;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,80:0.98:82
chr5	159996390	rs7709677	T	G	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=1;PP=839;SC=TTCTGAAACATTAGCCTCAAG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=159996398;WS=159996380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	160043071	rs4921308	C	A	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.433;NF=4;NR=21;PP=625;ReadPosRankSum=-0.801;SC=CCTGTTTGAACTTCCCTACAT;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=25;WE=160043079;WS=160043061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr5	160043108	rs113179038	A	AT	647.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=12;PP=221;SC=CTTCTCAAAGACTTTTTTTTA;SOR=4.174;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=13;WE=160043117;WS=160043098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	160043109	rs17052845	C	T	656.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=3;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=14;PP=424;SC=TTCTCAAAGACTTTTTTTTAA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=160043117;WS=160043098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	160044855	rs1363199	G	A	6547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=128;NR=61;PP=2965;SC=AGCACGCTTGGAGGAATTGTT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=128;TCR=61;TR=189;WE=160044863;WS=160044845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr5	160047265	rs6862674	C	G	763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=652;SC=CCAGGTGACACTACAACTTGA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=160047273;WS=160047260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	160049355	rs2032804	C	T	737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=4;PP=604;SC=GCCTTCTACTCCTCTACCTCC;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=160049363;WS=160049345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	160097429	rs3828604	T	C	2175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=19;PP=1759;SC=CTTGCATCCTTTCTATGACTT;SOR=1.863;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=69;TCF=50;TCR=19;TR=67;WE=160097437;WS=160097419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr5	160097453	rs1990888	A	C	2555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=23;PP=2066;SC=CATTGAAGATATTAGAAAGAG;SOR=1.795;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=56;TCR=23;TR=79;WE=160097461;WS=160097443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr5	160097496	rs958912	A	G	2577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=38;PP=2052;SC=TTCACGACACATCTTTGCTTG;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=49;TCR=38;TR=87;WE=160097504;WS=160097486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	160097632	rs958911	G	A	1328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=34;PP=1072;SC=AGTCTCCCACGCGCACATCCT;SOR=3.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=41;WE=160097640;WS=160097622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	160763821	.	CA	C	332.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.282;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=14.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=0.754;QD=4.56;ReadPosRankSum=2.382;SOR=0.065;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,29:0.40:73
chr5	161116903	rs4921402	C	A	1243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=36;PP=1039;SC=TGCTGTTTTGCAGTGATGAGT;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=161116911;WS=161116893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	161119071	rs12522663	G	T	3723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=46;PP=2965;SC=TCTTCTCTGCGCTTATCGAGT;SOR=1.035;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=62;TCR=46;TR=108;WE=161119079;WS=161119061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr5	161119125	rs13184586	C	G	4584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=73;PP=2965;ReadPosRankSum=1.406;SC=CACAGAAGGCCAAAAGGAAGG;SOR=0.244;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=150;TCF=76;TCR=74;TR=149;WE=161119133;WS=161119115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,153:0.99:154
chr5	161128761	rs4277944	C	G	4390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=91;PP=2965;SC=CAATGGAAGTCAGTAGCAGTG;SOR=1.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=40;TCR=91;TR=131;WE=161128769;WS=161128751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr5	161322889	rs2279020	G	A	1705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=38;PP=1399;SC=ATGCTTTAATGGTCACTGTAG;SOR=2.540;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=49;WE=161322897;WS=161322879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	161529571	rs211035	A	G	66.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=1;PP=74;SC=GTCTCGTTCTATTGCCCAGGC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=161529579;WS=161529561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	161576418	rs211014	C	A	1547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=22;PP=1262;ReadPosRankSum=1.268;SC=GCAGTTTGGGCTCCAAGATGA;SOR=0.257;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=47;TCF=24;TCR=23;TR=46;WE=161576426;WS=161576408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr5	161579441	rs211013	A	G	1567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=15;PP=1318;ReadPosRankSum=2.053;SC=GTCTAGCAGGAAATTTGACAA;SOR=0.787;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=50;WE=161579449;WS=161579431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr5	162890953	rs380101	G	A	198.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=3;PP=150;SC=GATTTAAACAGCAAAAAGGTA;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=162890961;WS=162890943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	162891894	rs3756648	G	A	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=312;SC=AATGGGTTAAGTGTATGAATC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=162891902;WS=162891884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	162909716	rs299295	C	T	5334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=70;PP=2965;SC=CAGGAAAAAGCGGCCAAGGCT;SOR=1.088;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=169;TCF=99;TCR=70;TR=167;WE=162909724;WS=162909706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr5	162909954	rs201321515	AAG	A	31.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.21;MQRankSum=0.963;QD=1.18;ReadPosRankSum=-0.467;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr5	162909955	rs5872824	AG	A	420.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.9883;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.835;NF=13;NR=17;PP=300;ReadPosRankSum=0.496;SC=TGAGGTTTAAAGAAAAAAAAA;SOR=0.990;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=30;WE=162909963;WS=162909944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,21:0.78:27
chr5	162910199	rs184181	G	C	5900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=111;PP=2965;SC=ATTAGAACCTGAGTGCCTTGT;SOR=1.355;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=174;TCF=62;TCR=112;TR=173;WE=162910207;WS=162910189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr5	162910438	rs299308	G	A	306.31	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9996;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=228;ReadPosRankSum=-0.646;SC=CCCTATTATAGTGAGGACAGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=11;WE=162910446;WS=162910428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr5	162917978	rs299320	T	A	218.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=149;SC=TTGGTTGAAATGATAAATCTA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=162917986;WS=162917968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	162932822	rs299299	T	G	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=24;PP=668;SC=CCACCGGGGCTCGGGCGGCTT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=162932830;WS=162932812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	162940739	rs964945	G	A	2404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=55;PP=2057;SC=TAGAAATTAAGGTTTTGTAGA;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=12;TCR=55;TR=67;WE=162940747;WS=162940729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr5	162940999	rs11546512	A	G	5361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=99;PP=2965;ReadPosRankSum=0.577;SC=AGAACAATCTAGGTAAGACCT;SOR=0.634;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=174;TCF=73;TCR=101;TR=171;WE=162941007;WS=162940989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,174:0.98:177
chr5	167182055	rs1862875	G	A	1649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=6;PP=1276;SC=CCCAGCTTACGCCGATGGTGA;SOR=3.830;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=43;TCR=6;TR=49;WE=167182063;WS=167182045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr5	167303317	rs1862198	G	A	1308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=37;PP=1099;SC=GGGAGCATCAGGGTGAAATGC;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=37;WE=167303325;WS=167303307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	167420255	rs17069526	T	A	963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=29;PP=885;SC=CATGGACTTGTGAATCTAGAG;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=29;WE=167420263;WS=167420245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	167566600	rs1432822	T	A	2025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=47;PP=1634;SC=CTCCATTTGGTTAATGAGGGC;SOR=1.681;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=68;WE=167566608;WS=167566590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	167576239	rs10040595	A	T	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=364;SC=CCGCGTCTCCACTCTCAGCCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=167576247;WS=167576229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	167576513	rs35438448	T	TG	2375.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=60.18;NF=8;NR=44;PP=2210;SC=CCGAGGCATGTTAGGAAAACA;SOR=2.546;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=9;TCR=48;TR=52;WE=167576521;WS=167576503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr5	167589932	rs1560649	G	C	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=353;SC=TGCCAGGGGGGATCTCTGGGA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=13;WE=167589940;WS=167589922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	167622107	rs1472355	G	T	1568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=16;PP=1115;SC=TGAGGATGAGGGAGCAGAGGC;SOR=1.436;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=45;WE=167622115;WS=167622097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	167674370	rs3733988	C	T	3208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=59;PP=2565;SC=TCAACCAGATCATCACCACTG;SOR=1.212;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=40;TCR=59;TR=98;WE=167674378;WS=167674360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr5	167675162	.	G	C	2774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=38;PP=2181;SC=CCGACTTCCAGATGGTCATTG;SOR=0.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=40;TCR=38;TR=78;WE=167675170;WS=167675152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr5	167675392	rs12189266	C	T	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=24;PP=754;SC=GATTCTGCCACCAAAGGTGGG;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=167675400;WS=167675382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	167689296	rs17632540	C	T	3814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=56;PP=2769;SC=TGCTGAACAACGCCTACTACC;SOR=0.709;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=61;TCR=56;TR=116;WE=167689304;WS=167689286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr5	167798585	rs2287703	C	T	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=264;SC=TTCATCCCTCCACCTCCAAGC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=167798593;WS=167798575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	167824840	rs10064053	T	C	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=18;PP=645;SC=GTGCTAGTGATTGGGGCCACT;SOR=1.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=26;WE=167824848;WS=167824830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	167835539	rs17551608	C	T	5229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=107;NR=50;PP=2965;SC=GGACGGCTTCCGCACTGACAG;SOR=1.684;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=107;TCR=50;TR=157;WE=167835547;WS=167835529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr5	167835766	rs6887919	T	C	1555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=44;PP=1296;ReadPosRankSum=-0.809;SC=TGGCCAGGGGTTCTCTGCAGG;SOR=4.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=45;WE=167835774;WS=167835756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,46:0.98:47
chr5	167858462	rs377710964	TCTGG	T	1647.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=29;PP=1411;SC=AAGGGCCGTGTCTGGCTGGCT;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=95;TCF=8;TCR=87;TR=29;WE=167858473;WS=167858452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	167891668	rs62384143	G	A	3515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=47;PP=2670;ReadPosRankSum=-0.871;SC=AGGGTCAGAGGAAGAGGCTGG;SOR=0.332;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=62;TCR=47;TR=108;WE=167891676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,113:0.99:114
chr5	167891830	rs3203960	T	C	3768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=54;PP=2765;ReadPosRankSum=-0.843;SC=GCACAGCCAATTGACCCAGGA;SOR=0.237;SbPval=0.52;Source=Platypus;TCF=54;TR=108;WE=167891838;WS=167891820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,118:0.99:119
chr5	167986274	rs158894	G	C	255.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=214;SC=ACACAACTACGCTTTATTAGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=167986282;WS=167986264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr5	168187760	rs2288797	G	C	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=4;PP=507;SC=CTGGGAGGGAGTGGAGCAGAG;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=168187768;WS=168187750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	168188048	rs7725649	A	T	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=328;SC=TCGGTGAAGGACCACAGAGCC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=168188056;WS=168188038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	168189501	rs2288796	C	T	2293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=20;PP=1759;SC=GGGTGACTGGCGTGTGGGGAG;SOR=1.923;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=55;TCR=20;TR=75;WE=168189509;WS=168189491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr5	168195356	rs11134527	G	A	1594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=43;PP=1299;SC=CCCACTGAGCGTGATTAGTAT;SOR=3.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=6;TCR=43;TR=49;WE=168195364;WS=168195346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	168212951	rs891921	A	G	3592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=85;PP=2912;SC=CAGTCCCTTGACAATCTCGGT;SOR=2.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=24;TCR=85;TR=109;WE=168212959;WS=168212941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr5	168213007	rs2292143	G	A	1878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.748;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=53;PP=1514;ReadPosRankSum=-1.152;SC=GGAGAAGACAGCAATCACTGT;SOR=4.174;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=6;TCR=54;TR=59;WE=168213015;WS=168212997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,61:0.97:63
chr5	168233413	rs3797716	G	A	5954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=141;NR=50;PP=2965;ReadPosRankSum=0.214;SC=TGAATTCTCCGGCGACAGTTG;SOR=1.524;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=143;TCR=51;TR=191;WE=168233421;WS=168233403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,194:0.98:197
chr5	168233474	rs3797715	G	A	8377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=132;NR=140;PP=2965;ReadPosRankSum=0.112;SC=CCTCCGGCAAGTTGGCAGGAA;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=278;TCF=134;TCR=144;TR=272;WE=168233482;WS=168233464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,276:0.99:280
chr5	168244506	rs35712765	G	GA	1172.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=27;PP=1212;SC=CATGGTCACAGGTGAAGTGTG;SOR=5.421;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=28;WE=168244514;WS=168244496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	168671698	rs10063591	A	T	2885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=28;PP=2272;SC=AGGAGGCTGTACTGTACTTAC;SOR=1.880;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=62;TCR=28;TR=90;WE=168671706;WS=168671688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr5	168690612	rs62376934	A	G	1870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=14;PP=1398;SC=ACATTGTTACAGCAGCCCTAG;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=61;WE=168690620;WS=168690602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	169021610	rs4493692	C	T	4855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=65;PP=2965;ReadPosRankSum=0.851;SC=AACGTCAGCTCATCAGTATGA;SOR=0.984;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=86;TCR=66;TR=150;WE=169021618;WS=169021600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,154:0.99:156
chr5	169028481	rs3797713	T	C	9354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=166;NR=118;PP=2965;SC=AGTTTCTATATACACACCAGT;SOR=1.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=285;TCF=166;TCR=119;TR=284;WE=169028489;WS=169028471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr5	169031150	rs3777084	T	C	1524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=23;PP=1208;SC=TGTAAGAAATTACACCCTATT;SOR=0.773;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=26;TCR=23;TR=49;WE=169031158;WS=169031140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	169031218	rs2042248	G	T	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=30;PP=1049;SC=GTAAAGACTTGTCTTTAATAA;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=169031226;WS=169031208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	169129422	rs2306559	A	G	2109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=49;PP=1760;SC=AGGATGGCAAAACGCTGCCTG;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=16;TCR=49;TR=65;WE=169129430;WS=169129412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	169267589	rs113470914	C	CGAT	415.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=532;SC=GGAGATATGGCGATGATGATG;SOR=3.442;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=11;WE=169267597;WS=169267584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	169267784	rs261623	G	A	3691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=38;PP=2798;SC=ACCATATCCAGGAGATCATGG;SOR=1.336;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=65;TCR=38;TR=103;WE=169267792;WS=169267774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr5	169291267	rs73801668	C	A	1504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=43;NR=6;PP=1283;SC=GGGGGATGGTCCCAACCAGCT;SOR=3.745;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=44;TCR=6;TR=49;WE=169291275;WS=169291257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	169302189	rs11390591	T	TA	3060.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.426;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.224;NF=38;NR=39;PP=2310;ReadPosRankSum=1.418;SC=ATTTTTTACCTAAAAAAATCC;SOR=0.877;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=52;TCR=53;TR=77;WE=169302197;WS=169302179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,106:0.97:109
chr5	169310213	rs17646221	A	C	1833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=24;PP=1353;ReadPosRankSum=1.146;SC=GTATGGAGTTACTTACTTCAG;SOR=0.314;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=32;TCR=25;TR=54;WE=169310221;WS=169310203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr5	169361595	rs259897	A	G	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.809;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=5;PP=818;ReadPosRankSum=1.116;SC=CTTTGCTTCCAGGCTGTCTGA;SOR=3.664;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=41;WE=169361603;WS=169361585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,41:0.95:43
chr5	169361660	rs259898	C	G	2476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.697;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=33;PP=2060;ReadPosRankSum=0.528;SC=TTCTAGGATGCAGCTGATGAT;SOR=0.757;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=79;TCF=45;TCR=34;TR=78;WE=169361668;WS=169361650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,81:0.99:82
chr5	169361685	rs259899	T	G	2993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=48;PP=2285;SC=CTGAACCGATTGGGTGCTACG;SOR=0.713;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=45;TCR=48;TR=93;WE=169361693;WS=169361675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr5	169361830	rs259900	G	A	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=694;SC=TGATTGTAGTGTCATCTGCAA;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=169361838;WS=169361820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	169361860	rs259901	T	C	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=454;SC=TAAAGCATTATACATTGCCAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=169361868;WS=169361850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	169454831	rs13175232	G	A	3788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=42.10;ReadPosRankSum=0.144;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,88:0.98:90
chr5	169454831	.	GAT	AAC	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=65;NR=16;PP=2947;QD=20;SC=TCAGCCTTCTGATGTTATTGT;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=87;TCF=68;TCR=19;TR=81;WE=169454841;WS=169454821;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,81:0.93:87
chr5	169454833	rs13157227	T	C	3788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=42.10;ReadPosRankSum=0.343;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,88:0.98:90
chr5	169454941	rs9791113	C	G	2291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=51;PP=1854;ReadPosRankSum=-1.059;SC=ACATGCAGCTCCTGGAGTCAA;SOR=0.420;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=76;TCF=23;TCR=53;TR=74;WE=169454949;WS=169454931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,74:0.97:76
chr5	169461399	rs3763047	G	A	4681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=61;PP=2965;SC=GGTCTCTGCCGCAGCCTGATG;SOR=1.149;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=148;TCF=86;TCR=62;TR=147;WE=169461407;WS=169461389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr5	169461547	rs3763048	C	T	2913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=79;PP=2322;SC=TGAGCTGCACCGTGAACCTGC;SOR=4.977;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=6;TCR=79;TR=85;WE=169461555;WS=169461537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr5	169468243	rs2270895	A	G	1832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.97;NF=5;NR=53;PP=1474;SC=AAGAAAAAGAATCCAAATATT;SOR=4.407;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=5;TCR=53;TR=58;WE=169468251;WS=169468233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr5	169468929	rs2270897	A	G	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=0;PP=394;SC=GTGTGTTGGCAGGGTGGTTCC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=18;WE=169468937;WS=169468921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	169472765	rs6884561	C	G	1201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=1;PP=1152;SC=CCTCAGCAAGCGCTCTGCAAA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=38;WE=169472773;WS=169472755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	169474325	rs905155	A	C	737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=581;SC=AGAGTGATTAACACAGTCCCT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=169474333;WS=169474315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	169496051	rs6868503	T	C	2032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=8;PP=1809;SC=CCTTGCCCCTTTCAAATTGAA;SOR=3.575;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=55;TCR=8;TR=62;WE=169496059;WS=169496041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr5	169504743	rs1045168	T	C	5444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=79;PP=2965;SC=GAGTGGGCCGTCCCAGGTCTA;SOR=0.841;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=88;TCR=79;TR=167;WE=169504751;WS=169504733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr5	169534942	.	C	A	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.145;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=154;ReadPosRankSum=-0.245;SC=GCCTGTCGGTCTCTGTCTTCC;SOR=0.193;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=11;WE=169534950;WS=169534940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr5	169535522	rs10063424	T	C	6935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=116;PP=2965;SC=TGCTCAGCTATGGAGGATCTG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=231;TCF=115;TCR=116;TR=230;WE=169535530;WS=169535512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr5	169661994	rs957998	G	C	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=6;PP=959;SC=GGTAAGAAGCGTGTTACTGAT;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=39;WE=169662002;WS=169661984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	169675693	rs80044664	AT	A	4037.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.248;NF=69;NR=22;PP=2974;ReadPosRankSum=1.602;SC=TTGCTCGGCTATAACTTGCTA;SOR=1.384;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=96;TCF=71;TCR=25;TR=91;WE=169675701;WS=169675683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,105:0.99:106
chr5	169679354	rs1546451	C	T	2783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=13;PP=2255;SC=AATTCCTAGCCTGTAATTGGT;SOR=3.230;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=65;TCR=13;TR=78;WE=169679362;WS=169679344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr5	169679947	rs6880961	C	T	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=0;PP=712;SC=TCTGAAAGAACGCCAAGGGAA;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=169679955;WS=169679937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	169689604	rs395407	G	C	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=543;SC=GCCGGCCACTGTGAGTGACAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=19;WE=169689612;WS=169689594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	169695446	rs2292254	C	T	656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=24;NR=10;PP=655;SC=TCTGGGGGGGCACAGGAGGCT;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=34;WE=169695454;WS=169695436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	169695611	rs366122	C	A	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=22;PP=526;SC=CCCACATGAGCCCCAGCCACG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=169695619;WS=169695601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	169697707	rs315745	G	A	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=462;SC=CAGAAAATCCGGAAACGGGCC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=169697715;WS=169697697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	169698028	rs315744	A	G	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=21;PP=645;SC=ATAACCCGGGACCAGGCAGCC;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=169698036;WS=169698018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	169702403	rs77323661	G	A	1606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=36;PP=1235;SC=GATTTAAGGGGATCTCCCTCT;SOR=2.880;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=9;TCR=37;TR=45;WE=169702411;WS=169702393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr5	169810966	rs703507	A	C	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=27;PP=797;SC=CAGGACTGGGATCCTCATCTT;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=169810974;WS=169810956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	169910084	rs4867968	G	T	1680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=25;PP=1272;SC=AAGTGGAACTGGGGCCCGCAG;SOR=0.877;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=31;TCR=25;TR=56;WE=169910092;WS=169910074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr5	170145584	rs6555913	G	A	280.96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=201;ReadPosRankSum=-0.983;SC=GGTGTTTGACGCAGAGGCTGA;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=170145592;WS=170145577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr5	170148699	.	C	A	4046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.838;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.062;NF=98;NR=27;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.174;SC=GTCAATGGGCCCCACTCCATA;SOR=2.470;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=127;TCF=100;TCR=27;TR=125;WE=170148707;WS=170148689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,131:0.98:133
chr5	170149573	rs2277952	C	T	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=513;SC=GAGCTCTTCACAGAGCATAGC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=170149581;WS=170149563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	170149674	rs12514966	A	T	2197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=19;PP=1693;SC=ACACTGTCTGATGGCTTGATG;SOR=1.965;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=47;TCR=19;TR=66;WE=170149682;WS=170149664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr5	170159997	rs17650650	C	T	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=323;SC=TGTGTCCAACCCTGTACTAAG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=170160005;WS=170159987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	170160749	rs4868018	G	A	2659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=23;PP=2163;SC=GCTCCAGCTCGTTACTCTGAG;SOR=2.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=64;TCR=23;TR=86;WE=170160757;WS=170160739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr5	170162666	rs1363712	T	C	1314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.646;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=8;PP=1030;ReadPosRankSum=0.091;SC=GTTTTCTCCATATAGGAAACC;SOR=2.985;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=45;WE=170162674;WS=170162656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,46:0.96:48
chr5	170395885	rs2446049	T	C	186.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=120;SC=TTAGCATCAGTAAGTTAAGAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=170395893;WS=170395875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	170610273	rs6555936	G	A	3471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=24;PP=2831;SC=AACATTTTACGAATAGTTGAG;SOR=2.071;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=77;TCR=24;TR=101;WE=170610281;WS=170610263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr5	170640827	rs4867648	C	A	2343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=66;PP=2006;SC=TGGTTTGTGTCTTTCCAAGGT;SOR=4.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=5;TCR=66;TR=71;WE=170640835;WS=170640817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr5	170720755	rs2914330	T	A	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=2;PP=844;SC=CAGAGTCTAGTCCGTTTGTCC;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=170720763;WS=170720745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	170813951	rs28411383	C	CT	602.76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.459;NF=1;NR=16;PP=671;ReadPosRankSum=1.129;SC=GCTGGGGTGCCTCGGAGTTTG;SOR=3.160;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=17;WE=170813959;WS=170813941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr5	170815125	rs2071276	G	T	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=16;PP=455;SC=CCAGACCGACGGGAGGCCTGA;SOR=3.500;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=170815133;WS=170815115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	170818897	rs3830032	A	G	708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.38;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	170818906	rs3830033	T	A	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.44;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	170818964	rs138910433	G	GGT	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=195;SC=TTTGGGGCGGGGGGGAGAGGA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=170818977;WS=170818954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	170818969	rs3830034	A	G	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=152;SC=GGCGGGGGGGAGAGGAAATCT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=170818977;WS=170818954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	170819887	rs3830035	G	A	5099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=117;PP=2965;SC=AACAGCTCTTGTTCATGAGTA;SOR=2.046;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=42;TCR=117;TR=159;WE=170819895;WS=170819877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr5	170827115	rs6555952	C	A	5790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.20;SOR=2.111;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr5	170827118	rs6555953	A	G	5758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.34;SOR=2.106;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr5	170847555	rs6555955	T	C	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=17;PP=352;SC=TCCTGGGCGCTGAGCCCAGTG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=170847563;WS=170847545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	171200659	rs27947	T	G	1214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=0;PP=1086;SC=TCAAGCCAGATGCCCTCAAGA;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=171200667;WS=171200649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	171200997	rs26400	C	A	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=625;SC=TTGTGCATTTCTTGTGTGTGC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=171201005;WS=171200987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	171201499	rs12153230	G	C	4238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=77;PP=2965;SC=ACCTCGGATGGCCGAGGGGAT;SOR=1.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=42;TCR=78;TR=119;WE=171201507;WS=171201489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr5	171217371	rs11950253	G	A	5345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=79;PP=2965;SC=ATGTTAAGGGGACCTCCATAA;SOR=0.728;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=82;TCR=79;TR=161;WE=171217379;WS=171217361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr5	171480055	rs4569891	G	A	2328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=43;PP=1741;SC=TTCTGGAACAGATTCCAGGCA;SOR=1.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=28;TCR=43;TR=71;WE=171480063;WS=171480045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr5	171523436	rs4868141	G	A	1804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=5;PP=1491;ReadPosRankSum=-0.819;SC=TTACGGAGGCGGCATCCACGG;SOR=3.021;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=53;TCR=5;TR=56;WE=171523444;WS=171523426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,57:0.98:58
chr5	171533629	rs2306963	A	G	621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=3;PP=486;SC=CTCACCACTTAGAGGGCGTGA;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=171533637;WS=171533619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	171533656	rs2306962	C	T	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=5;PP=870;SC=TGGGAGGGTCCGACTTGGCGA;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=31;WE=171533664;WS=171533646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	171554473	rs2279514	G	A	3457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=96;PP=2886;SC=CTGCCCAGCCGTCGAGACGGG;SOR=4.077;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=12;TCR=96;TR=108;WE=171554481;WS=171554463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr5	171627773	rs2306959	G	C	1700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=49;PP=1488;SC=AATGTGGCATGTGTGTGGCAG;SOR=5.630;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=2;TCR=49;TR=51;WE=171627781;WS=171627763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	171630197	rs201583078	T	TTTTC	1567.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=4;PP=1342;SC=AATTTTTCTTTCCCCCCCACC;SOR=3.026;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=29;WE=171630217;WS=171630187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	171630204	rs372914830	CACCCT	C	1919.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=4;PP=505;SC=CTTTCCCCCCCACCCTAACCA;SOR=3.026;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=30;WE=171630217;WS=171630187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	171881412	rs62385470	G	C	1696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=41;PP=878;SC=GCGGGGTGCAGGGAGCGCTGG;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=41;WE=171881431;WS=171881402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	171881423	rs139600850	G	A	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=34;PP=901;SC=GGAGCGCTGGGGGCGCGCCGC;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=171881431;WS=171881402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	172096768	rs10476046	C	A	278.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=229;SC=CCTAACCGTGCTGCCTGTGTC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=172096776;WS=172096758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	172097353	rs6556037	C	T	1999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=50;PP=1572;SC=GGGCGCGGCGCCCCCTGGGGA;SOR=2.694;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=10;TCR=50;TR=60;WE=172097361;WS=172097343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr5	172110833	rs142447086	C	T	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=1;PP=266;SC=GTGGGCCGTCCGGGGCTGGCG;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=172110841;WS=172110823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	172196711	rs2431663	G	T	2086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=42;PP=1464;SC=TCAAGGCAGTGATGCCCAAGG;SOR=1.751;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=17;TCR=42;TR=59;WE=172196719;WS=172196701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr5	172197326	rs112535575	A	AT	1213.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=30;PP=933;SC=ATACAAAGACATTTTTTTTCC;SOR=2.409;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=36;WE=172197334;WS=172197316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	172197581	rs34507926	G	C	101.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=0;PP=75;SC=GCTTCCCCGAGGGCGTACCTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=172197589;WS=172197571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	172261583	.	G	GC	77.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.854;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr5	172261593	rs63376061	T	C	302.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=8;PP=154;SC=GCCCCCCCCCTGCCGCACACG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=172261601;WS=172261573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	172294194	rs793027	G	T	6498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=84;PP=2965;SC=GACCTTTATCGTGCTACCTGG;SOR=0.903;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=99;TCR=84;TR=183;WE=172294202;WS=172294184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr5	172336616	rs2302957	C	T	6093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.323;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=138;NR=56;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.205;SC=TCCCCCGCAGCTGAGATCTTT;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=199;TCF=141;TCR=58;TR=194;WE=172336624;WS=172336606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,198:0.98:202
chr5	172347440	rs13187960	G	A	5430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=106;PP=2965;SC=GAGACCCCACGGTGACCTCGT;SOR=1.447;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=58;TCR=107;TR=164;WE=172347448;WS=172347430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr5	172395664	rs11749686	T	C	2941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=64;PP=2237;SC=TTCAAAGTTATTGGTGTTTTG;SOR=2.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=20;TCR=64;TR=84;WE=172395672;WS=172395654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	172395711	rs190050689	G	A	2087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=56;PP=1670;ReadPosRankSum=0.782;SC=AGGCCAGGTGGACTTGATTGA;SOR=4.080;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=3;TCR=56;TR=59;WE=172395719;WS=172395701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr5	172396394	rs505788	C	T	4093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=56;PP=2965;SC=GAAATAAAGACCTGTTTTCTC;SOR=0.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=68;TCR=56;TR=124;WE=172396402;WS=172396384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr5	172494981	rs582067	C	T	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=55.92;NF=9;NR=2;PP=270;SC=CCAGCCTGGGCGACAGAGCGA;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=172494989;WS=172494971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	172512686	rs671387	C	T	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=3;PP=262;SC=TCCCAAAGTGCTGGGATTACA;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=172512694;WS=172512676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	172561268	.	A	AAT	127.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=25.55;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr5	172561294	rs2544581	C	T	107.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=16;NR=0;PP=423;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TATATATATACACACACACAC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=16;WE=172561302;WS=172561284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr5	172573767	rs29798	T	C	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=2;PP=846;SC=ATAGTTAGTATGTTAATATTA;SOR=4.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=34;WE=172573775;WS=172573757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	172578549	rs374928255	AT	A	78.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.71;ReadPosRankSum=0.417;SOR=0.264;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr5	172585927	rs5745160	TC	T	8892.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.267;NF=33;NR=161;PP=2966;ReadPosRankSum=-0.761;SC=CCTCTTGTTTTCAGCTTGGTG;SOR=0.639;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=197;TCF=33;TCR=164;TR=194;WE=172585935;WS=172585917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,232:0.99:234
chr5	172588027	rs255303	G	T	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=397;SC=TGGACAAAAGGAGAAAGCATG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=172588035;WS=172588017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	172660508	.	CA	C	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.099;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.58;ReadPosRankSum=0.668;SOR=0.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,10:0.26:39
chr5	172745269	.	A	AAGAGAG	821.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;QD=43.25;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	173035214	rs112654016	T	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.17;ReadPosRankSum=0.548;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr5	173035239	rs76658414	T	C	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=-2.139;QD=1.63;ReadPosRankSum=0.894;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,7:0.17:41
chr5	173380347	rs12153678	G	A	1210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=35;PP=1037;SC=ATATTAGAACGGGAGCATTTT;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=173380355;WS=173380337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	173416191	rs72814721	C	T	1638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=8;PP=1278;SC=CCGCATCCCTCGCCTGCACAG;SOR=2.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=48;WE=173416199;WS=173416181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	173416365	rs61730190	C	A	4688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=66;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.132;SC=TGCAACTGGGCGGCCGTGGAG;SOR=0.988;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=88;TCR=67;TR=152;WE=173416373;WS=173416355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,152:0.99:154
chr5	174178697	rs960743	C	G	3868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=74;PP=2965;SC=GCCGCGCGCCCCGCCATCAGC;SOR=1.196;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=50;TCR=74;TR=124;WE=174178705;WS=174178687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr5	174178774	rs7709117	G	A	2946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=61;PP=2391;SC=GCTCTTGGGCGGCCGCGTTTC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=31;TCR=61;TR=92;WE=174178782;WS=174178764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr5	174868700	rs686	G	A	970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=6;PP=802;SC=TTAATAGCAAGCCCCAGAGCA;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=174868708;WS=174868690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	174868840	rs155417	T	C	2113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=37;PP=1712;SC=CCAATATGACTGATAGGGCTG;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=72;TCF=35;TCR=37;TR=71;WE=174868848;WS=174868830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr5	174870150	rs4532	C	T	2511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=71;PP=2030;SC=CTCAAGTTCCCAAGCAGGGAA;SOR=3.994;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=9;TCR=72;TR=80;WE=174870158;WS=174870140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr5	175511992	rs62389230	C	T	4917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=137;NR=37;PP=2965;SC=GTTGTTGCCTCGAAGGTATGT;SOR=2.959;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=174;TCF=137;TCR=37;TR=174;WE=175512000;WS=175511982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr5	175528527	rs116633144	A	T	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.67;QD=29.81;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	175721990	.	G	A	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.165;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=43.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.73;MQRankSum=-7.101;QD=7.52;ReadPosRankSum=0.818;SOR=6.011;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,38:0.47:80
chr5	175721995	.	G	A	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.628;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=41.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.16;MQRankSum=-6.782;QD=6.02;ReadPosRankSum=-2.493;SOR=5.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,38:0.40:96
chr5	175792605	rs2303667	G	C	1434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=10;PP=1161;SC=TGCTGGCGCTGGGCGGCGCCG;SOR=2.461;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=42;WE=175792613;WS=175792595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	175793717	rs3815898	C	T	1834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=53;PP=1527;SC=CACCGCTCTCCGGGGCACAGG;SOR=5.820;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=54;TCF=1;TCR=53;TR=54;WE=175793725;WS=175793707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr5	175811094	rs56989856	C	CGT	7305.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.189;NF=45;NR=111;PP=2974;ReadPosRankSum=-0.542;SC=GGAGTGTGCACGTGTGTGTAA;SOR=0.669;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=196;TCF=53;TCR=143;TR=156;WE=175811102;WS=175811084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,178:0.99:179
chr5	175843461	rs33956988	CG	C	1364.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=40;PP=1492;SC=ACCCGAGCCGCGGGGGAGCCG;SOR=6.138;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=41;WE=175843469;WS=175843451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	175915835	rs2963667	C	T	1761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=7;PP=1278;SC=AGGAACTGTACTTTAGAGGAA;SOR=3.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=53;WE=175915843;WS=175915825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr5	175923431	rs2963670	G	A	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=324;SC=AAAGTCTAAGGGTTGATCTTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=175923439;WS=175923425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	175933691	rs113700453	TGTGTGTGC	T	638.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=1779;SC=ACTTCAGAGTTGTGTGTGCGT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=13;WE=175933706;WS=175933681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	175956271	rs890835	A	C	2498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=42;PP=1886;SC=ACCCAGGAGCAGACCTGGGCA;SOR=0.818;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=35;TCR=42;TR=77;WE=175956279;WS=175956261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr5	175956516	rs2241585	G	A	6228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=96;PP=2965;SC=GTGGGGCAGGGTACTCACAGC;SOR=0.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=91;TCR=96;TR=187;WE=175956524;WS=175956506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr5	175992258	rs6556275	A	G	2192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.515;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=13;PP=1776;ReadPosRankSum=-0.675;SC=GGGTGGGCTCAGGTCAGACCC;SOR=3.112;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=79;TCF=65;TCR=14;TR=78;WE=175992266;WS=175992248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,78:0.99:79
chr5	175992519	rs4523018	T	A	1585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.441;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=14;PP=1357;ReadPosRankSum=1.451;SC=GGGCCAGCCCTGTGCTTGGCT;SOR=1.926;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=47;WE=175992527;WS=175992509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr5	175994173	rs11392917	C	CT	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.066;QD=17.75;ReadPosRankSum=-0.203;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,24:0.83:29
chr5	175995935	rs10056130	C	T	3453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=48;PP=2804;ReadPosRankSum=-0.025;SC=GGCTCACCACCGGCCCCTTCT;SOR=0.849;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=58;TCR=49;TR=105;WE=175995943;WS=175995925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,108:0.98:110
chr5	176001975	rs1078450	T	C	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=324;SC=CTGGTGCCAGTGGCGTGACTG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=176001983;WS=176001965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	176002144	rs4242200	A	C	4451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=66;PP=2965;SC=ATGGCTCCATAGTCCTCAATG;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=78;TCR=66;TR=144;WE=176002152;WS=176002134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr5	176002873	rs3762969	C	T	3812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=36;PP=2965;SC=CTGTCAGAACCCTGCTCTCTA;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=77;TCR=36;TR=113;WE=176002881;WS=176002863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr5	176002926	rs3762968	C	A	4861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=50;PP=2965;SC=TGGCTCTCTGCCCTCTGCCCT;SOR=1.548;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=97;TCR=50;TR=147;WE=176002934;WS=176002916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr5	176004312	rs11749537	A	G	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=1;PP=423;SC=CGGGCGGGGCATCCAGAGATA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=176004320;WS=176004302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	176004476	rs11134982	T	C	3162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=50;PP=2348;SC=GAGCGGGCAGTGGGCTCAGCC;SOR=0.869;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=57;TCR=50;TR=106;WE=176004484;WS=176004466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr5	176004846	rs1565149	C	T	3399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=88;PP=2729;SC=AGCAAGCGGGCGTGCATGTGT;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=16;TCR=88;TR=104;WE=176004854;WS=176004836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr5	176004866	rs35146200	A	AGT	2271.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.352;NF=7;NR=47;PP=2729;ReadPosRankSum=0.000;SC=TGAGTGTGAGAGTGTGTGTGT;SOR=1.068;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=78;TCF=9;TCR=69;TR=54;WE=176004874;WS=176004856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr5	176004903	rs11747451	T	C	1724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=39;PP=1249;SC=GGGGTGGCCATGAGTGAATCT;SOR=1.727;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=55;WE=176004911;WS=176004893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr5	176005175	rs1565150	A	C	3222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.39;SOR=1.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr5	176005184	rs1565151	G	A	3279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=43;PP=1898;SC=AATAGCTGGGGAAGACCGAAG;SOR=0.984;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=33;TCR=43;TR=76;WE=176005192;WS=176005181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr5	176005477	rs2358747	C	T	4713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=66;PP=2965;SC=AGGCCACAGACGGCGGGAACC;SOR=0.959;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=152;TCF=86;TCR=66;TR=151;WE=176005485;WS=176005467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr5	176008238	rs4867840	G	T	1307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=0;PP=1116;SC=CAGGCCTGATGACTGCCTGCG;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=39;WE=176008246;WS=176008228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr5	176011264	rs752139	T	C	1930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=34;PP=1526;SC=GATCCAGGTATGTGCTCCCTG;SOR=0.854;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=30;TCR=34;TR=64;WE=176011272;WS=176011254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr5	176011889	rs4868660	G	A	4335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=84;PP=2965;SC=TCTCAGTGGCGGCCAACGGCT;SOR=1.220;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=53;TCR=84;TR=137;WE=176011897;WS=176011879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr5	176017549	rs4868662	C	T	1601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=29;PP=1194;SC=TTCCCTCACACTCATCTTTCT;SOR=1.314;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=176017557;WS=176017539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	176018545	rs11134984	G	A	1974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=58;PP=1606;SC=AGTGACGGTGGTGGTGGTGAT;SOR=5.421;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=3;TCR=58;TR=61;WE=176018553;WS=176018535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	176024880	rs4868663	C	T	4744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=94;NR=42;PP=2965;SC=CCCCTGCTTCCCCTGGTGCTG;SOR=1.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=94;TCR=42;TR=136;WE=176024888;WS=176024870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr5	176025938	rs6556276	T	C	3424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=60;PP=2462;SC=TCCAAGGGCATGGGATCTGCC;SOR=0.781;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=52;TCR=60;TR=112;WE=176025946;WS=176025928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr5	176053336	rs72322414	GGTGT	G	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.68;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	176053645	rs2291441	C	G	3140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=52;PP=2396;SC=GAGTCTCCCCCGCCCCCGCCC;SOR=0.766;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=108;TCF=56;TCR=52;TR=108;WE=176053653;WS=176053635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr5	176056529	rs4868669	A	G	3011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=43;PP=2411;ReadPosRankSum=-0.701;SC=CCCGCCCCTTACCCACCGACG;SOR=0.315;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=57;TCR=43;TR=99;WE=176056537;WS=176056519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr5	176069831	rs901740	G	A	1298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=39;PP=1157;SC=TCTACCCCCAGTGCACCATGG;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=40;WE=176069839;WS=176069821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	176069862	.	C	CT	43	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5721;HP=13;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=23;MQ=56.57;NF=1;NR=2;PP=43;QD=15.6666666667;SC=TCCCCCCCCCCCCCCGCCCCA;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=176069870;WS=176069852;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:0,3:1.00:3
chr5	176081856	rs13183320	A	G	5307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=55;PP=2965;SC=GGCTCCTGGGATGGGCCTGGC;SOR=1.511;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=102;TCR=55;TR=157;WE=176081864;WS=176081846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr5	176083175	rs6878977	T	G	2398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=49;PP=2006;SC=GGGTACTGGGTTGGGTATGAG;SOR=1.673;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=75;TCF=26;TCR=49;TR=74;WE=176083183;WS=176083165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr5	176083997	rs4868677	G	A	3344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=96;PP=2701;SC=CCTGGCCTACGCAGGCCTCTG;SOR=4.077;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=9;TCR=97;TR=105;WE=176084005;WS=176083987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr5	176304399	rs2304517	A	G	2460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=39;PP=2140;SC=GGAAAGAGCTATGCCTAAGCC;SOR=0.864;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=35;TCR=39;TR=74;WE=176304407;WS=176304389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr5	176305466	rs2304516	T	A	8742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=109;NR=159;PP=2965;SC=CCTCTCTGCATCCCCATCAGG;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=268;TCF=109;TCR=159;TR=268;WE=176305474;WS=176305456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr5	176305678	rs478253	C	T	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=33;PP=917;SC=GTGACGTGCTCCCACTACCAA;SOR=2.899;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=39;WE=176305686;WS=176305668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	176306676	rs2292257	G	A	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=8;PP=667;SC=AGGAGGTGTCGGCTGGGGCCA;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=176306684;WS=176306666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	176338113	.	G	GAAGAA	1260.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.08;MQRankSum=-0.252;QD=45.03;ReadPosRankSum=0.434;SOR=3.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr5	176477828	rs41275291	C	T	5668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=108;PP=2965;SC=ACGACCCTGTCATGGCTCAAC;SOR=1.166;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=71;TCR=108;TR=179;WE=176477836;WS=176477818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr5	176516953	rs434434	A	G	1844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=42;PP=1426;SC=TGAGCTCCTTACCTGGGTGTG;SOR=2.468;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=53;WE=176516961;WS=176516943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr5	176517136	rs59390048	C	CGT,CGTGT	873.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=15,15;NR=2,2;PP=139,499;SC=TGTGTGTATGCGTGTGTGTGT;SOR=3.816;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=17,17;WE=176517144;WS=176517126;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.24,0.76:21
chr5	176517170	rs387598	G	A	1563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.283;NF=37;NR=14;PP=1382;ReadPosRankSum=1.020;SC=GGCCACTGTCGTGTGCACTAA;SOR=0.925;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=51;WE=176517178;WS=176517160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr5	176517292	rs442856	A	G	4053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=64;PP=2965;SC=CATGCGTTGCAAAGTGCTTGT;SOR=0.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=69;TCR=64;TR=133;WE=176517300;WS=176517282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr5	176517326	rs422421	T	C	4035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=68;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.764;SC=GGTGTGTTCTTTGTACACAGG;SOR=0.392;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=52;TCR=69;TR=120;WE=176517334;WS=176517316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,122:0.99:123
chr5	176517461	rs446382	T	G	2377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=37;PP=1986;SC=AGCCTGTGCGTCTGTGCTGTG;SOR=0.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=37;TCR=37;TR=74;WE=176517469;WS=176517451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr5	176517797	rs376618	C	T	12183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=388;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=181;NR=199;PP=2965;SC=CATAGGGACCCCTCGAATAGG;SOR=0.757;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=380;TCF=181;TCR=199;TR=380;WE=176517805;WS=176517787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,384:1.00:384
chr5	176518784	rs452885	C	T	2552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=47;PP=2026;SC=GCAGCATCCGCTATAACTACC;SOR=0.897;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=39;TCR=47;TR=86;WE=176518792;WS=176518774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr5	176519287	rs393923	G	A	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=520;SC=TATGGGTGCCGGTGGTCAGGG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=176519295;WS=176519277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	176520243	rs351855	G	A	2849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=47;PP=2419;SC=GCTGCTGGCCGGGCTGTATCG;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=39;TCR=47;TR=86;WE=176520251;WS=176520233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr5	176522728	rs42409	C	T	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=165;SC=CCGGAAGGTACAGGCGCTAGG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=7;WE=176522736;WS=176522718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	176523562	rs31777	C	A	2986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=32;PP=2354;SC=CCCCGGTCGTCGGGAGGGCGC;SOR=1.514;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=62;TCR=32;TR=94;WE=176523570;WS=176523552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr5	176523597	rs31776	A	G	3421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=54;PP=2654;SC=CCCTGGCCCTACCTCCAGGTG;SOR=0.769;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=51;TCR=55;TR=105;WE=176523605;WS=176523587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr5	176700885	rs12660023	G	A	1513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=44;PP=1316;SC=AGCATAGTTCGTTTTAGGTAG;SOR=5.421;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=46;WE=176700893;WS=176700875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	176721198	rs28580074	T	C	5047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.206;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=69;PP=2965;ReadPosRankSum=1.500;SC=TCAGAGGCCATTGCTACCTGA;SOR=0.386;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=74;TCR=70;TR=143;WE=176721206;WS=176721188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,158:0.99:159
chr5	176721272	rs11740250	G	C	6808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=130;NR=68;PP=2965;SC=ACCTCGCTGGGTCAGGGACCA;SOR=1.498;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=130;TCR=68;TR=198;WE=176721280;WS=176721262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr5	176729736	.	ACC	A,AC	3393.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=2.952;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.283;NF=36,36;NR=75,75;PP=1701,56;ReadPosRankSum=2.301;SC=GACAGCCCAAACCCCCCCCCC;SOR=0.172;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=173;TCF=72;TCR=101;TR=111,111;WE=176729745;WS=176729725;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.26,0.72:133
chr5	176731452	rs28362590	G	T	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=569;SC=TGGCGGGAGTGGGAATTTGCC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=176731460;WS=176731442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr5	176733116	rs4631	A	G	2912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=49;PP=2397;SC=GTCTTGCCCGATTCAAAAGCA;SOR=0.990;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=38;TCR=50;TR=87;WE=176733124;WS=176733106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr5	176733341	rs4073745	A	G	3206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=49;PP=2460;SC=CCTGGCCCAGAGGAGATTGGT;SOR=0.853;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=53;TCR=49;TR=102;WE=176733349;WS=176733331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr5	176733616	rs9834	T	C	4185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.352;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.610;NF=53;NR=68;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.629;SC=AGGCTTAGCCTCTCTGCCCTC;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=55;TCR=69;TR=121;WE=176733624;WS=176733606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,129:0.98:132
chr5	176737720	rs13190036	A	G	2759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=60;PP=2256;SC=AGAGAGGATGAGGTGAAGGGG;SOR=1.664;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=28;TCR=61;TR=88;WE=176737728;WS=176737710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr5	176738538	rs62397242	C	A	2186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=35;PP=1782;SC=CTGGTCCCAGCGGCAGCCCCA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=36;TCR=35;TR=71;WE=176738546;WS=176738528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr5	176761535	rs11738681	A	G	784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=22;PP=634;SC=AGCACTGCCCAGCCGGCTAGG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=176761543;WS=176761525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	176765395	rs11748912	G	A	643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=512;SC=TGGTCCCCACGAGCCACAGGC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=176765403;WS=176765385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	176798040	rs56235845	T	G	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=10;PP=309;SC=CGGGTGAGCTTCCGGGCCGCG;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=176798048;WS=176798030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	176798306	rs11746443	G	A	4855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=64;PP=2965;SC=GAGGAAGGGGGTCCAGGTGGG;SOR=1.026;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=155;TCF=91;TCR=64;TR=153;WE=176798314;WS=176798296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr5	176813232	rs199844043	GGTCCCCAAGCTGCGCCAGGCT	G	9735.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.602;NF=70;NR=73;PP=2926;ReadPosRankSum=-1.031;SC=AGTCCAGGCTGGTCCCCAAGC;SOR=0.824;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=153;TCF=78;TCR=75;TR=143;WE=176813260;WS=176813222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,226:0.99:228
chr5	176825069	rs34225933	C	T	4932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=67;PP=2965;ReadPosRankSum=1.520;SC=GAGTCCCGGGCACCTGCCCAA;SOR=0.983;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=157;TCF=89;TCR=68;TR=156;WE=176825077;WS=176825059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,170:0.99:172
chr5	176831826	rs17876030	C	G	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=7;PP=539;SC=TCGCAGAAGGCTCCGGTGTAG;SOR=1.230;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=20;WE=176831834;WS=176831816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr5	176831980	rs17876029	T	C	2108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=27;PP=1567;SC=CTCTCCTTCCTGGCACACCAC;SOR=1.244;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=39;TCR=27;TR=66;WE=176831988;WS=176831970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr5	176836532	rs1801020	A	G	4489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=102;PP=2965;SC=CCCTCATGGCATCCGTCCGTT;SOR=1.564;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=51;TCR=103;TR=153;WE=176836540;WS=176836522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr5	176858049	rs867755	C	T	1448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=38;PP=1182;SC=GACCTTGCCCCGGAGCAGAGG;SOR=3.516;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=44;WE=176858057;WS=176858039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	176859848	rs2731664	C	A	2207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=15;NR=47;PP=1790;SC=TTATGCCCAGCGGAGGGGGCT;SOR=2.035;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=15;TCR=48;TR=62;WE=176859856;WS=176859838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	176862963	rs4976695	T	A	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=1;PP=583;SC=AGGTCCCCCCTGGCCAGCGGG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=176862971;WS=176862953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	176863519	rs1130857	G	C	903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=16;PP=723;SC=TGGAGCCGCCGTTCAAGCCTG;SOR=0.906;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=29;WE=176863527;WS=176863509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	176867943	rs335435	A	G	3117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.199;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.368;NF=48;NR=44;PP=2617;ReadPosRankSum=-0.938;SC=AGTGCTTCCAAGAGCTGAATG;SOR=0.395;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=48;TCR=45;TR=92;WE=176867951;WS=176867933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,93:0.99:94
chr5	176885178	rs28538572	A	G	4511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=48;PP=2965;SC=GCAGCCAGGGACTCCCCTTCC;SOR=1.435;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=90;TCR=48;TR=138;WE=176885186;WS=176885168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr5	176885499	rs2544809	T	C	7104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=138;PP=2965;SC=GCATCGTGGATCTCCGTGGCG;SOR=1.322;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=222;TCF=83;TCR=139;TR=221;WE=176885507;WS=176885489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr5	176886539	rs385981	C	T	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=2;PP=436;SC=GGAGTGAGGGCGGGGGGCTGC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=176886547;WS=176886529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	176894756	rs2545794	C	T	2775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=47;PP=2365;SC=GGAAGAACTCCGCCACCTTAG;SOR=0.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=43;TCR=48;TR=89;WE=176894764;WS=176894746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr5	176895030	.	C	T	224	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=46.7;NF=3;NR=6;PP=224;QD=28.7523569497;SC=CCTCAGCCCCCTTCCCCAGCC;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=176895038;WS=176895020;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	176895817	rs446104	GC	AA	6252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=40;PP=2947;SC=GGTGGAGAAGGCGGCGAGGGA;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=133;TCF=88;TCR=45;TR=122;WE=176895826;WS=176895807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr5	176916516	rs335462	C	T	3733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=59;PP=2965;SC=TGGGCGTGGCCGGCTGGCTGT;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=113;TCF=54;TCR=59;TR=113;WE=176916524;WS=176916506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr5	176917078	rs734825	T	C	2417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.768;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=55;PP=1962;ReadPosRankSum=0.844;SC=GCTCCTGGGGTTCCCCTCATG;SOR=2.432;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=73;TCF=17;TCR=56;TR=71;WE=176917086;WS=176917068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,74:0.97:76
chr5	176930135	rs28376231	G	A	2816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=29;PP=2136;SC=GCTTGCGTGCGTGGCTGGCTC;SOR=1.434;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=55;TCR=29;TR=83;WE=176930143;WS=176930125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr5	176930171	rs138153794	AGAG	A	5023.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=41;PP=2978;SC=GAGCAGGAGCAGAGGAGGGAA;SOR=1.199;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=107;TCF=57;TCR=50;TR=90;WE=176930181;WS=176930161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr5	176935215	rs55761704	GC	G	719.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=0;PP=735;SC=CAGCCCAATCGCCCCCCTGCT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=23;WE=176935223;WS=176935205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr5	176936650	rs28565502	T	C	2929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=61;PP=2378;SC=TCCCTCCGTCTAGAGACAGCT;SOR=1.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=26;TCR=61;TR=87;WE=176936658;WS=176936640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr5	176938681	rs28695578	C	T	2512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=3;PP=2166;SC=CCTGGCCCATCCCAGGCCAGC;SOR=5.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=74;TCF=71;TCR=3;TR=74;WE=176938689;WS=176938671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr5	176939688	rs28544348	C	T	4232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=47;PP=2965;SC=CACCATGGGACAGGGGAGTGG;SOR=1.473;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=88;TCR=47;TR=135;WE=176939696;WS=176939678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr5	176939735	rs335436	A	G	4404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=102;NR=53;PP=2965;SC=TAGGTAAAGCACTGCTACTGC;SOR=1.463;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=103;TCR=53;TR=155;WE=176939743;WS=176939725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr5	176940871	rs335439	G	C	3876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=85;PP=2965;SC=GAGAGACCCTGAGGTTGGGGC;SOR=2.488;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=25;TCR=85;TR=110;WE=176940879;WS=176940861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr5	176943694	rs139078584	G	A	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=3;PP=786;SC=CGCGGTCACGGCCCCATCCCT;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=176943702;WS=176943684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	176950794	rs28723606	A	G	1007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=2;PP=822;SC=GTGGGTTTTCAGCAGGCAGGC;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=36;WE=176950802;WS=176950784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	176950879	rs28688891	T	C	4887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=120;NR=21;PP=2965;SC=TTTCTGAGGCTTGAGGCACAA;SOR=3.536;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=120;TCR=21;TR=141;WE=176950887;WS=176950869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr5	176951276	rs337382	A	G	4586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=60;PP=2965;SC=GCTGGGCCTGAGGGCTGCACA;SOR=0.960;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=72;TCR=60;TR=132;WE=176951284;WS=176951266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr5	176959296	rs2246566	T	G	2056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=40;PP=1664;SC=GCTGTGAGGATCAAGCGAGCA;SOR=1.888;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=18;TCR=40;TR=58;WE=176959304;WS=176959286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	176963349	rs335460	G	A	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=30;PP=1512;SC=CCTTCATGCAGCACACTTACC;SOR=0.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=30;TCR=30;TR=60;WE=176963357;WS=176963339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	177019688	rs4607363	G	C	3915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=35;PP=2480;SC=TGAGCCAACCGCCCCCCTCCT;SOR=2.053;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=86;TCR=36;TR=119;WE=177019696;WS=177019677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr5	177027076	rs145156383	G	GCGGCGGACC	166.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=2;NR=1;PP=770;SC=CGCGGCCGGAGCGGCGGACCC;SOR=1.609;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=3;WE=177027084;WS=177027074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	177027110	rs28707336	C	T	76.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=158;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=1;PP=53;SC=GCGGGGCGGACAGGCCTGGGC;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=177027118;WS=177027100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	177031348	rs11537644	T	C	2494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=39;PP=2014;SC=GCCCTCCCCGTGCCTGCCCCC;SOR=0.741;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=82;TCF=43;TCR=39;TR=81;WE=177031356;WS=177031338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr5	177031602	rs28499092	C	G	1924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=48;PP=1538;SC=GCTTCTCAGGCCCTGTGAGAG;SOR=3.113;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=9;TCR=48;TR=57;WE=177031610;WS=177031592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr5	177031954	rs28742937	A	G	5100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=21;PP=2965;SC=GTCTGGCGTTATCCTAAAATC;SOR=3.017;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=96;TCR=21;TR=117;WE=177031975;WS=177031944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr5	177031967	rs28698736	T	C	5347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=24;PP=2965;SC=CTAAAATCCCTGCCCTTACCA;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=97;TCR=24;TR=121;WE=177031975;WS=177031944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr5	177032050	rs28473516	C	G	8006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=163;NR=79;PP=2965;SC=CTCTAGGTAACTCCCACTGGA;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=243;TCF=164;TCR=79;TR=242;WE=177032058;WS=177032040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr5	177035925	.	G	A	5590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.000;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=61;PP=2965;ReadPosRankSum=0.758;SC=TCCGCCCCTCGGGAATCACAA;SOR=0.581;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=117;TCR=61;TR=177;WE=177035933;WS=177035915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,184:0.99:185
chr5	177035964	rs729459	T	C	5328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=87;PP=2965;SC=GCCACCTGCATGACCCAGCCT;SOR=0.704;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=182;TCF=95;TCR=87;TR=181;WE=177035972;WS=177035954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr5	177036043	rs6600953	A	G	3316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=74;PP=2675;SC=CATTGGGGACAGATAGGTGGT;SOR=2.258;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=25;TCR=75;TR=99;WE=177036051;WS=177036033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr5	177053334	rs5013573	T	C	866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=1;PP=1026;SC=CCTCGGCCTCTGAAAATGCTG;SOR=6.593;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=34;WE=177053342;WS=177053324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr5	177054649	rs72309277	ATT	A	1111.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=6.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQRankSum=0.034;QD=23.16;ReadPosRankSum=-0.067;SOR=4.062;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,45:0.94:48
chr5	177054672	rs7728458	T	C	2452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=64;PP=1503;SC=TTTTTTGAGATGGAGTCTCGC;SOR=5.960;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=65;TCF=1;TCR=64;TR=65;WE=177054680;WS=177054662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr5	177058655	rs6876792	A	G	6278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=114;PP=2965;SC=GGCATGTCACAGTTCTGTACA;SOR=0.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=227;TCF=113;TCR=114;TR=227;WE=177058663;WS=177058645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr5	177058766	rs2334991	G	A	4268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.68;QD=32.84;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr5	177161891	rs140979906	A	G	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=31.90;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr5	177180236	rs76556918	G	A	2393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=86;PP=2441;SC=ACTAAGCTGCGTTTACTGCCA;SOR=8.608;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=86;TCF=0;TCR=86;TR=86;WE=177180244;WS=177180226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr5	177305797	rs201185054	G	A	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.16;QD=33.77;SOR=6.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	177310717	rs139876295	A	G	274.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.88;QD=30.53;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	177347910	rs200509090	G	C	147.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=35.96;QD=29.58;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr5	177348037	.	C	CTTTG	658.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.35;QD=41.17;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	177348098	rs4958970	G	A	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.43;QD=42.02;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	177348106	rs4958971	A	C	1320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.52;QD=44.03;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	177348150	rs4958972	C	T	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.69;QD=43.88;SOR=6.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	177348155	rs4958973	A	G	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.69;QD=43.88;SOR=6.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	177422823	rs4072924	C	T	2175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=6;PP=1723;SC=GACGGTCACTCACCCACCGTG;SOR=4.343;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=57;TCR=6;TR=63;WE=177422831;WS=177422813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr5	177422876	rs7445271	T	C	4086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=93;NR=27;PP=2965;SC=AGGCAACAGGTTGCTGCCGAC;SOR=2.397;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=93;TCR=27;TR=120;WE=177422884;WS=177422866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr5	177482472	rs3088218	T	C	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=199;SC=GGACCAGCACTGGCACCGGCC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=177482480;WS=177482463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr5	177482694	rs11953084	T	C	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=27;PP=1691;SC=GTGAGACCAATGAAATCGCCA;SOR=1.226;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=73;TCF=46;TCR=27;TR=71;WE=177482702;WS=177482684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr5	177483118	rs11953798	T	C	1193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=29;PP=993;SC=AGCAGGCAAGTGCCCTGAAGA;SOR=1.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=43;WE=177483126;WS=177483108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	177483154	rs9687038	T	A	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=24;PP=841;SC=GAAGGAGGAGTTCATCAAGAC;SOR=2.546;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=177483162;WS=177483144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr5	177483184	rs11953029	A	G	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=5;NR=25;PP=748;SC=GGAGGAAGAGACCAAGAAATA;SOR=3.180;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=30;WE=177483192;WS=177483174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr5	177483267	.	T	TA	157	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=25;MQ=58.31;NF=0;NR=9;PP=157;QD=18.1111111111;SC=AAACAAGCCTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=9;WE=177483275;WS=177483257;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr5	177547247	rs7719667	T	C	3030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=46;PP=2375;SC=CCATGCAAAGTCTGGCGTCCC;SOR=0.757;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=45;TCR=46;TR=91;WE=177547255;WS=177547237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr5	177548085	rs7712666	C	A	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=1;PP=425;SC=GGATGCATCTCTTCCCCTTGA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=177548093;WS=177548075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	177562183	rs72536798	C	CTG	269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=2;PP=194;SC=GGGTCTCACTCTTGCTCAGGC;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=5;WE=177562191;WS=177562173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	177562251	rs10060446	G	A	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=5;PP=383;SC=GGCTCAAGCAGTCCTCCGTCC;SOR=2.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=177562259;WS=177562241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	177565520	rs10657977	T	TTGTG	82.37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=2;PP=177;SC=CATTTTATAATTGTGTGTGTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=2;WE=177565528;WS=177565510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	177570759	rs6601218	T	C	3133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=80;PP=2676;SC=GCCAGCAGCATTCTGCTTCGA;SOR=3.841;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=10;TCR=81;TR=90;WE=177570767;WS=177570749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr5	177574901	rs7380934	C	G	8613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=116;NR=148;PP=2965;SC=TCCCCGTGCTCTACTCCACCT;SOR=0.984;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=264;TCF=116;TCR=148;TR=264;WE=177574909;WS=177574891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr5	177612634	rs7715618	A	C	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=198;SC=TTGTTAGTCAACTTAGATGTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=177612642;WS=177612627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	177612734	rs7720480	T	C	1713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.84;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr5	177612744	rs7715796	A	G	1826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.48;SOR=3.417;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr5	177612983	rs13169133	G	A	9630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.92;MQRankSum=-0.066;NF=188;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=1.540;SC=GACCCGCTGCGTGGCTGATTC;SOR=0.637;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=292;TCF=190;TCR=102;TR=289;WE=177612991;WS=177612973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,304:1.00:305
chr5	177613123	rs10479619	T	C	10868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.99;NF=114;NR=213;PP=2965;SC=CCTCATGCTATTTCCCTCTAG;SOR=1.493;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=327;TCF=114;TCR=213;TR=327;WE=177613131;WS=177613113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,338:1.00:338
chr5	177613168	rs13184406	C	T	6422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=157;PP=2965;SC=CCCTACCTCACGGTCTTGTTC;SOR=3.390;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=186;TCF=29;TCR=157;TR=186;WE=177613176;WS=177613158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr5	177614387	rs6886332	A	G	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=13;PP=349;SC=TTCCCCGAGCACAGGTGCCTA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=177614395;WS=177614377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	177633116	rs3812089	A	G	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=545;SC=CATGTGATTTAAGTGCTTTGG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=177633124;WS=177633106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	177634401	rs7705458	T	C	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=419;SC=GAAAGACTTCTCAGGCTGGGA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=177634409;WS=177634391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	177636571	rs2913752	C	T	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=28;PP=845;SC=AGGTTGGGGACGAACAGGAAT;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=177636579;WS=177636561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	177636990	rs111881090	CT	C	1659.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=0;PP=1845;SC=GCCCAGGGCCCTTATACACCA;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=45;WE=177636998;WS=177636980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr5	177637447	rs2913751	G	A	1746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=18;PP=1440;SC=GAGGAAGGCAGTCTCTGCTGT;SOR=1.567;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=55;WE=177637455;WS=177637437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	177637634	rs146209319	A	G	992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=28;PP=790;SC=AGGCGGCAGCAGGAGCGACCA;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=31;WE=177637642;WS=177637624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr5	177642177	rs2913748	C	T	2967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=17;PP=2399;SC=CTCTTGAGAGCGGACATAACC;SOR=3.103;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=97;TCF=80;TCR=17;TR=96;WE=177642185;WS=177642167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr5	177658883	rs2973729	C	A	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=17;PP=455;SC=ATGGGATGGGCCAGGGCACCA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=177658891;WS=177658873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	177659624	rs140358085	C	A	250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=5;NR=5;PP=184;SC=TCCAAGGCCCCGCTCCGGGCC;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=10;WE=177659632;WS=177659614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr5	177665486	rs1544925	T	C	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	177665554	rs58562702	T	C	92.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=89;SC=GCCGGTGGCTTTGGGGCTGGG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=177665562;WS=177665544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	177665731	rs10061163	C	A	209.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=3;PP=113;SC=CTGAAGGTGACGAGGAGCCCG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=177665739;WS=177665721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr5	177668882	rs2241581	T	C	1083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=1;PP=941;ReadPosRankSum=-0.769;SC=ACCGCGATGATGGCAGTAGCA;SOR=4.294;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=33;WE=177668890;WS=177668872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr5	177668965	rs2241580	C	T	3567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=28;PP=2890;ReadPosRankSum=0.161;SC=AGCTGAGTTCCGAGGACAGGG;SOR=0.941;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=78;TCR=28;TR=105;WE=177668973;WS=177668955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,110:0.99:111
chr5	177669413	rs2241579	T	G	4699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=44;PP=2965;SC=AAGGATTAGATGCTAAACCCG;SOR=1.691;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=100;TCR=44;TR=143;WE=177669421;WS=177669403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr5	177673153	rs35716676	AGTGCAGGGACCCAGTGAG	A	753.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=2;PP=2930;SC=GGCCCTGCGAAGTGCAGGGAC;SOR=1.863;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=14;WE=177673178;WS=177673148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr5	177674995	rs11746830	C	T	1553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=36;PP=1195;SC=TATAGTGAGCCGAGGTTGTGC;SOR=3.306;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=42;WE=177675003;WS=177674985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr5	177676986	rs5873601	GCA	G	748.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=1;PP=575;SC=ACATGCACACGCACACACACA;SOR=4.892;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=16;WE=177676995;WS=177676976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr5	177681946	rs35519588	C	CT	4441.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=43;PP=2965;ReadPosRankSum=0.881;SC=ACCAGGAACACTACCTTGAGG;SOR=0.503;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=97;TCF=54;TCR=43;TR=90;WE=177681954;WS=177681936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,121:0.99:122
chr5	177715291	rs890801	G	A	2053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.60;SOR=1.539;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr5	177715302	rs5873603	CA	C	1733.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=22;PP=1519;SC=GTGAAGAGAGCAAAAAAATAA;SOR=1.402;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=60;TCF=34;TCR=26;TR=54;WE=177715310;WS=177715281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr5	177715477	rs2913833	G	T	988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=18;PP=729;SC=TTCCTCTGCAGCGGGAGGACT;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=28;WE=177715485;WS=177715467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	177715581	rs2913832	T	C	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=14;PP=462;SC=TCATCGGGGCTCCGGGCACAG;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=177715589;WS=177715571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	178040919	rs560842	G	A	2198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=61;PP=1735;SC=CTAAAGCATAGTCTTAATTAC;SOR=8.468;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=0;TCR=61;TR=61;WE=178040927;WS=178040909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
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chr5	178369673	rs10060764	T	C	1229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=6;PP=1013;SC=TTGACCCAGTTCTCTCCTAAT;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=35;WE=178369681;WS=178369663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr5	178391902	rs12719860	A	C	3468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.112;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=50;PP=2747;ReadPosRankSum=-0.110;SC=CTTCACAGTGATCAAAGTCAG;SOR=0.444;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=105;TCF=53;TCR=52;TR=102;WE=178391910;WS=178391892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,109:0.97:112
chr5	178395850	rs11741688	G	C	2575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.189;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=58;PP=2066;ReadPosRankSum=-0.016;SC=GGACCAAGGCGTGCAGCCACT;SOR=2.055;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=23;TCR=60;TR=80;WE=178395858;WS=178395840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,81:0.98:83
chr5	178396742	rs4700759	G	C	1796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=46;PP=1476;SC=ACCTCGGAGCGTTCCGAGACC;SOR=5.058;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=3;TCR=46;TR=49;WE=178396750;WS=178396732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr5	178401552	rs4700991	C	T	2242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=0;PP=1872;SC=ATCTCCTGACCTCGTGATCCA;SOR=8.380;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=62;TCR=0;TR=62;WE=178401560;WS=178401542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr5	178407292	rs2856351	C	T	6280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=132;NR=63;PP=2965;SC=GGACATAAAACTCCATAACTT;SOR=1.645;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=195;TCF=132;TCR=63;TR=195;WE=178407300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr5	178410738	rs903988	C	T	3327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=31;PP=2798;ReadPosRankSum=-0.749;SC=CCGAGGAGTACTGGAGTCTGT;SOR=0.895;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=75;TCR=31;TR=105;WE=178410746;WS=178410728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,107:0.99:108
chr5	178411290	rs11279361	AGCACGCCTC	A	3377.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.188;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=2977;ReadPosRankSum=1.641;SC=GGAGCGAGCGAGCACGCCTCA;SOR=0.395;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=46;WE=178411306;WS=178411280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,74:0.99:75
chr5	178411315	rs2645341	C	T	3467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=163;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=40;PP=1672;SC=GAACGGACTCCTGCAAAATAA;SOR=0.768;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=42;TCR=40;TR=82;WE=178411323;WS=178411305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr5	178412273	rs35715923	T	C	4454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=78;PP=2965;SC=TTCACTGTTGTACAGAAAGAT;SOR=0.886;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=64;TCR=78;TR=141;WE=178412281;WS=178412263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr5	178412592	rs6880010	T	C	1174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=0;PP=1039;SC=TAGTCCCAGCTACTCGGGAGG;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=34;WE=178412600;WS=178412585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	178413816	rs2256966	T	C	5412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=73;PP=2965;SC=CATGCCCACCTGGGGCTCGGT;SOR=1.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=178;TCF=105;TCR=73;TR=178;WE=178413824;WS=178413806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr5	178413947	rs11746675	T	C	5494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=102;PP=2965;SC=CGGGCGCATCTCCGTTCTCGT;SOR=1.152;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=66;TCR=102;TR=168;WE=178413955;WS=178413937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr5	178414565	rs2645340	C	T	1409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=39;PP=1222;SC=GTCACACATGCGCAAATACCG;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=46;WE=178414573;WS=178414555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	178415937	rs2067011	A	G	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=0;PP=660;SC=CCCACTCACCATTGAAGCGGA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=178415945;WS=178415927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	178415982	rs4701014	A	G	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=2;PP=1285;SC=TCCGCCCATCAGTGGGTTCCA;SOR=5.926;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=54;TCR=2;TR=56;WE=178415990;WS=178415972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr5	178416063	rs2645339	G	A	4371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=59;PP=2965;SC=GGGCAATGGCGTACACCGCAT;SOR=1.016;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=76;TCR=59;TR=135;WE=178416071;WS=178416053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr5	178416203	rs143495088	CCCCTCCCCA	C	2012.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=7;NR=38;PP=2974;SC=TCCCGCCTTCCCCCTCCCCAC;SOR=2.348;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=50;TCF=8;TCR=42;TR=45;WE=178416219;WS=178416193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	178416288	rs2071246	G	A	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=14;PP=1009;SC=GGGTGGAATCGTCTGACTGGG;SOR=1.414;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=41;WE=178416296;WS=178416278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	178419279	rs11283410	G	GGGCAAGGTCT	6756.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=33;PP=2967;SC=TGGAAGCTGTGGTGTTTTGCG;SOR=0.902;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=104;TCF=48;TCR=56;TR=69;WE=178419296;WS=178419269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr5	178419288	rs2645335	C	T	5847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=57;PP=2965;SC=TGGTGTTTTGCGAGTGGGCCT;SOR=0.802;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=63;TCR=57;TR=120;WE=178419296;WS=178419269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr5	178419396	rs11449973	A	AC	3692.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=68;PP=2969;SC=CTGAACAAGGACCCCCAGCAG;SOR=1.140;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=115;TCF=32;TCR=83;TR=98;WE=178419404;WS=178419386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr5	178421351	rs2645330	T	C	93.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=2;NR=2;PP=58;SC=GGAGACTCTTTCAGAAGAAGT;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=178421359;WS=178421341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	178421770	rs2645329	T	G	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.40;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	178422083	rs1078978	C	T	91.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=54;SC=CCTTCCACTTCGGCTCTGGGG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=178422091;WS=178422073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr5	178503472	rs116407910	C	T	2555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=48;PP=1874;SC=GGGATGTGGCCGTGTTCTTCA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=26;TCR=48;TR=74;WE=178503480;WS=178503462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
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chr5	178557142	rs2251105	A	G	2657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=64;PP=2081;SC=GTCACCCAAGAGCAGGACCCA;SOR=2.698;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=16;TCR=64;TR=80;WE=178557150;WS=178557132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr5	178562834	rs3822595	C	T	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=551;SC=GCCAATACCCCGAAAAGGGGG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=178562842;WS=178562825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	178562967	rs1972715	G	A	3579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=37;PP=2902;SC=AGCGCGTCCCGTCATGCACCA;SOR=1.568;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=75;TCR=37;TR=112;WE=178562975;WS=178562957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr5	178563125	rs1549603	A	T	2517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=62;PP=2022;ReadPosRankSum=-0.958;SC=AAGCAGGAGAAATTTCCACAA;SOR=1.345;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=82;TCF=18;TCR=64;TR=80;WE=178563133;WS=178563115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,81:0.99:82
chr5	178565001	rs2303639	C	T	2663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=46;PP=1975;SC=AGGCAGCACCCGGGTGCCCTT;SOR=1.005;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=35;TCR=46;TR=81;WE=178565009;WS=178564991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr5	178608341	rs11749583	C	T	1529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=42;PP=1285;ReadPosRankSum=1.513;SC=CTCCAGGCTGCCACCACCACC;SOR=3.014;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=4;TCR=43;TR=46;WE=178608349;WS=178608331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr5	178634619	rs423552	C	T	5269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.311;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=105;PP=2965;ReadPosRankSum=1.285;SC=AGTCATCGTCCGCAGCATGCC;SOR=1.160;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=60;TCR=105;TR=164;WE=178634627;WS=178634609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,169:0.99:170
chr5	178949580	rs71596435	C	T	8744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=171;NR=114;PP=2965;SC=GTGCCCCAGCCCCATTCCCCA;SOR=1.179;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=285;TCF=171;TCR=114;TR=285;WE=178949588;WS=178949570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr5	178949612	rs28550616	CA	TG	11658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=117;NR=135;PP=2947;SC=TCGTCCTCTTCATTGTGTTCA;SOR=0.889;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=256;TCF=120;TCR=136;TR=252;WE=178949621;WS=178949602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr5	178949781	rs28420183	A	G	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=30.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.17;MQRankSum=-5.946;QD=12.37;ReadPosRankSum=-1.764;SOR=5.405;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr5	178949876	rs377476632	C	T	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=25.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr5	178951598	rs4701188	G	A	6939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=173;NR=103;PP=2965;SC=GGCCACCTGCGAGCACCCTAT;SOR=1.992;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=276;TCF=173;TCR=103;TR=276;WE=178951606;WS=178951588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr5	178986978	rs7704349	C	G	1392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=11;PP=1057;SC=AGTCTGACCTCCCCACGCTCA;SOR=2.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=43;WE=178986986;WS=178986968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr5	179023783	rs112105028	G	T	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=271;SC=CGGGAGGAGGGGGGGCGGGGG;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=179023791;WS=179023773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr5	179028818	.	CAAAAAAAAAAAA	C,CA	457.27	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=20;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.327;NF=4;NR=0;PP=628;ReadPosRankSum=0.936;SC=GACCCTGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=4;WE=179028836;WS=179028808;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.87:15
chr5	179032755	rs6877888	C	T	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=0;PP=712;SC=TAACAACTCACGTTCTGGGTC;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=179032763;WS=179032745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	179041785	.	GAAAA	G	104.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.52;ReadPosRankSum=2.823;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr5	179043075	rs4515257	T	C	5471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=136;NR=41;PP=2965;SC=AGTACAGTAATGAACAGGCTT;SOR=2.468;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=136;TCR=41;TR=177;WE=179043083;WS=179043065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr5	179049138	rs4301193	C	A	177.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=148;SC=ACTGCAAAAACACTTCCCTGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=179049146;WS=179049128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	179069309	rs6887611	G	C	3529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=114;NR=19;PP=2965;SC=TGTGGGGTGCGCAGATGAGGG;SOR=3.716;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=114;TCR=19;TR=133;WE=179069317;WS=179069299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr5	179071724	rs2411400	C	T	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=194.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.74;MQRankSum=-8.288;QD=8.19;ReadPosRankSum=-1.886;SOR=7.427;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,40:0.35:113
chr5	179071836	rs4990391	C	T	6703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.881;NF=159;NR=67;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.097;SC=GCACTGAGGACGGCTCCCTGG;SOR=0.582;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=230;TCF=162;TCR=68;TR=226;WE=179071844;WS=179071826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,218:0.99:220
chr5	179071947	rs4645306	A	G	7557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.830;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.245;NF=69;NR=165;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.161;SC=GCTCTGTACCAATAACACTGT;SOR=1.805;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=236;TCF=70;TCR=166;TR=234;WE=179071955;WS=179071937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,242:0.99:244
chr5	179078391	rs57380196	C	T	1611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=44;PP=1332;SC=GTCCTCCTTCCTACCAGGACC;SOR=4.091;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=48;WE=179078399;WS=179078381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr5	179078940	rs6882398	T	C	7346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=131;NR=117;PP=2965;SC=TCAGCTCCTCTCAGCCACCAG;SOR=0.984;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=250;TCF=132;TCR=118;TR=248;WE=179078948;WS=179078930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr5	179126090	rs1134924	C	T	1638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=24;PP=1179;SC=CCCGCGGTCCCCGGGAGGCTA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=24;TCR=24;TR=48;WE=179126098;WS=179126080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	179136138	rs6601068	A	G	2301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=65;PP=1892;SC=GGCCGGGTGCAGTGGCTCACG;SOR=4.499;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=6;TCR=65;TR=71;WE=179136146;WS=179136128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr5	179142825	.	GT	G	38.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.17;ReadPosRankSum=0.570;SOR=0.084;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,7:0.21:33
chr5	179147641	rs59666900	C	T	2994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=85;PP=2407;SC=GTAAGGCTGCCAGGTTGGTCA;SOR=5.092;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=6;TCR=85;TR=91;WE=179147649;WS=179147631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr5	179267949	rs248248	T	C	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=24;PP=658;SC=ACGGTGCTCCTGCTCCACTTC;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=31;WE=179267957;WS=179267939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	179287207	rs148609553	CGT	C	32.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.99;ReadPosRankSum=1.040;SOR=0.042;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,5:0.15:33
chr5	179291279	rs172056	A	G	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=32;PP=1005;SC=CCCATCTCACAGATCAGGACA;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=179291287;WS=179291269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	179334857	rs185073	A	G	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.77;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	179407229	rs28011	C	T	2942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=81;PP=2414;SC=AAAACAGATACTAAGTGTAAG;SOR=5.283;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=5;TCR=81;TR=86;WE=179407237;WS=179407219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr5	179498595	rs3749821	C	T	4258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=81;PP=2965;SC=TGATGAGCGCCGTGTAGTACT;SOR=1.273;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=50;TCR=81;TR=131;WE=179498603;WS=179498585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr5	179498658	rs3828698	G	T	2223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=65;PP=1745;SC=TCAGCAGGGCGAGCGCGGCGA;SOR=3.500;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=10;TCR=65;TR=75;WE=179498666;WS=179498648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr5	179528351	rs67139455	TG	T	1333.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=2;PP=810;SC=ATGGCCACTGTGGGGGGGGGG;SOR=4.548;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=28;WE=179528367;WS=179528347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr5	179528359	rs113499659	G	C	1377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.06;SOR=4.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	179529124	rs7725201	G	A	2868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=50;PP=2092;SC=TCTCACTTTCGTAAGAAGCCA;SOR=0.924;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=40;TCR=50;TR=90;WE=179529132;WS=179529114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr5	179542290	.	TA	T	727.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.000;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=2.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.68;MQRankSum=3.934;QD=6.44;ReadPosRankSum=-1.569;SOR=1.054;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,52:0.46:113
chr5	179545562	rs62405054	C	G	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=419;SC=AGCCAGCACCCAGGTTCCCTG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=179545570;WS=179545552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr5	179548294	rs55667285	C	T	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=49;PP=1331;ReadPosRankSum=-0.800;SC=TTGGTATGTACGCTTTCAGTC;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=54;WE=179548302;WS=179548284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr5	179554602	rs57288534	C	T	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=14;PP=762;SC=CCGTAAGAGCCTCCTACCTTT;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=33;WE=179554610;WS=179554592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr5	179555407	rs13354066	T	C	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=4;PP=703;SC=TGGGCCGGCTTACCAGTTCCA;SOR=3.126;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=179555415;WS=179555397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr5	179555654	rs6895192	C	T	1606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=31;PP=1256;SC=ACACTCATCTCTGCATCTCTA;SOR=1.436;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=48;WE=179555662;WS=179555644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr5	179563359	rs55638756	C	T	2150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=8;PP=1726;SC=GGTGACGCGACCCCCGCCCAG;SOR=3.816;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=56;TCR=8;TR=64;WE=179563367;WS=179563349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr5	179563435	rs11546322	T	C	4023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=58;PP=2965;SC=TAGTCGACTCTTCCTGGAAGT;SOR=0.895;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=68;TCR=58;TR=126;WE=179563443;WS=179563425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr5	179565071	rs4700878	G	C	1897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=34;PP=1436;SC=GCAATGGCAAGGAGCAGTGAG;SOR=0.854;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=29;TCR=34;TR=63;WE=179565079;WS=179565061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr5	179565136	rs4700715	C	A	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=29;PP=908;SC=GCTGCTGGTCCCGGGGCTCCT;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=179565144;WS=179565126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr5	179665201	rs56333381	C	T	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.257;NF=20;NR=0;PP=479;ReadPosRankSum=-0.945;SC=ACCCAGGAGGCGGAGGTTGCA;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=20;WE=179665209;WS=179665191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr5	179729519	rs1035411	A	G	3100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=35;PP=2507;SC=GGGGCAGCTCAATTGTCTTAT;SOR=1.566;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=73;TCR=35;TR=107;WE=179729527;WS=179729509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr5	179744009	rs2112594	T	G	8814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=156;PP=2965;SC=TATTGAAAACTGATTCTGGCT;SOR=0.873;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=293;TCF=136;TCR=157;TR=291;WE=179744017;WS=179743999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr5	179763398	rs6891083	T	G	1892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=2;PP=1492;SC=AGAATCTCCATTCTCCGGCGC;SOR=5.747;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=50;TCF=48;TCR=2;TR=50;WE=179763406;WS=179763388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr5	179765467	rs55946431	C	T	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=2;PP=331;SC=GGTCCCCAGCCACGAGGCGGG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=179765475;WS=179765457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	179780292	rs199818683	CCTCCGTGGG	C	730.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.98;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr5	179780316	.	T	C	239	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=95;MMLQ=24;MQ=58.65;NF=1;NR=4;PP=239;QD=54.7542425094;SC=GTGGGCTCCGTGGGCTCCGCG;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=5;WE=179780324;WS=179780306;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,5:0.25:20
chr5	179780340	rs5873687	GT	G	766.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=100;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=17;PP=979;SC=TCCAGCTCCCGTCCGCTCGGC;SOR=3.716;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=179780348;WS=179780330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr5	179780382	rs11452117	A	AG	296.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=8;PP=298;SC=GCCCTCCGAGAGGGCGGGGAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=179780390;WS=179780372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr5	179996111	rs6877400	C	T	2683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=23;PP=2076;SC=CTAATGTAGCCGGAAAGCCAC;SOR=1.967;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=59;TCR=23;TR=82;WE=179996119;WS=179996101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr5	180017399	rs450383	T	C	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=14;PP=442;SC=CGCGGGGCCATCTCCGCCTTC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=180017407;WS=180017389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	180038248	rs35683852	T	TC	6058.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=68;PP=2966;SC=GATTTGCTTTTCCCCGATGAC;SOR=1.473;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=165;TCF=93;TCR=72;TR=152;WE=180038256;WS=180038238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr5	180041001	rs421662	G	C	6154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.28;SOR=5.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr5	180041008	rs366388	T	C	6268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.64;SOR=4.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr5	180041208	rs659268	T	C	3418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=103;PP=2584;SC=GCTTGTCCCGTGGTGGATGGG;SOR=3.704;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=122;TCF=17;TCR=105;TR=119;WE=180041216;WS=180041198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr5	180041273	.	C	CCGCGG	1667.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.41;QD=39.71;SOR=4.125;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr5	180045700	rs3214903	G	GGGTTACCCTA	3095.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=5;PP=2966;SC=ACCCCAGGCTGGGGTGCCTGA;SOR=4.370;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=33;WE=180045708;WS=180045690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr5	180046209	rs446003	C	T	1898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.31;SOR=2.604;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr5	180046426	rs70973949	C	CTGGCCGCTTAGCTAAGGCACAG	3838.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=3;PP=2900;SC=TTCCCCGCCACCCGGCGCTTT;SOR=0.756;SbPval=0.03;Source=Platypus;TC=39;TCF=19;TCR=20;TR=15;WE=180046434;WS=180046416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr5	180046492	rs201407038	CAG	C	4024.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=31;PP=2965;SC=CCCACTGAGGCAGAGGGGGTT;SOR=1.280;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=39;TCR=32;TR=68;WE=180046501;WS=180046482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr5	180047412	rs382266	T	C	2111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=49;PP=1870;SC=TCCTGCGGGGTTCTCAGTCAA;SOR=2.797;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=12;TCR=49;TR=61;WE=180047420;WS=180047402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr5	180047863	rs423086	C	G	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=12;PP=925;SC=AGGGGTGCAGCCTGAGGCCAG;SOR=1.352;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=33;WE=180047871;WS=180047853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr5	180048986	rs10635355	G	GCCTC	1093.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=20;PP=1217;SC=GTCTCCTCCTGCCTCCCTCCC;SOR=3.014;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=23;WE=180048994;WS=180048976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	180053307	rs402647	A	G	1439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=34;PP=1121;SC=AGATCCCACCACAGCCCCAAC;SOR=2.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=41;WE=180053315;WS=180053297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr5	180053387	rs4700964	C	T	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=10;PP=255;SC=CAGGGTAGGACGGGGAACACT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=180053395;WS=180053377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	180055862	rs383985	T	G	1523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.54;SOR=3.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	180055862	.	TGG	GGA	517	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=22;NR=5;PP=517;QD=21.1284398097;SC=GCGGGGTCGGTGGGGAGCCAG;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=27;WE=180055872;WS=180055852;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:14,27:0.66:41
chr5	180055864	rs438464	G	A	1523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.54;SOR=3.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	180056192	rs399108	T	C	1192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=16;PP=928;SC=TCCTGAGTGCTCAAGGGCACC;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=16;TCR=16;TR=32;WE=180056200;WS=180056182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr5	180056620	rs414348	G	A	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=1;PP=689;SC=CATCCTCCACGCGGAGGCCCA;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=180056628;WS=180056610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr5	180057263	rs147634448	G	C	5414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.087;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=85;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.726;SC=ATGGACACCAGACAGGGCACC;SOR=0.298;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=84;TCR=86;TR=169;WE=180057271;WS=180057253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,170:0.99:171
chr5	180165983	rs2054696	G	C	336.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.183;NF=18;NR=0;PP=300;ReadPosRankSum=-0.225;SC=TGTTCCCCCCGCCACCAAAAA;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=18;WE=180165991;WS=180165972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,15:0.88:17
chr5	180166461	rs10464105	C	G	4062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=59;PP=2965;SC=ACTCGGGCCACAAACATCTTG;SOR=0.778;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=124;TCF=65;TCR=59;TR=123;WE=180166469;WS=180166451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr5	180486224	rs7379015	T	G	1162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=7;PP=933;SC=ACTAACGCTGTGGCTCTGCGC;SOR=2.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=36;WE=180486232;WS=180486214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr5	180486247	rs6601166	G	T	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=9;PP=1047;SC=TGGATGTGACGCTGGACCCGG;SOR=2.476;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=41;WE=180486255;WS=180486237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr5	180486785	rs10068763	G	C	5999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=99;NR=104;PP=2965;SC=TAGAGGGACGGGCGTCCCCGA;SOR=0.742;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=99;TCR=104;TR=203;WE=180486793;WS=180486775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr5	180486891	rs33927456	C	CG	2329.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.356;NF=0;NR=71;PP=2408;ReadPosRankSum=-1.405;SC=GGACTGGCCCCGGGGGGCCCC;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=87;TCF=0;TCR=87;TR=71;WE=180486899;WS=180486881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,78:0.99:79
chr5	180582604	rs2546423	A	G	4236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=9.667;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=94;PP=2965;ReadPosRankSum=0.230;SC=TCCTATGCTCACATTCTAGGG;SOR=1.497;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=142;TCF=47;TCR=95;TR=138;WE=180582612;WS=180582594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,140:0.99:142
chr5	180582980	rs7380309	G	A	3935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.699;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=90;PP=2965;ReadPosRankSum=0.933;SC=TGGTTTCCTCGTGAATTATGA;SOR=2.051;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=34;TCR=91;TR=123;WE=180582988;WS=180582970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,129:0.99:130
chr5	180583039	.	G	GTTCTTTCTTTCTTTCTTTCT,GTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCT	1457.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.06;QD=112.13;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,9,4:0.69,0.31:13
chr5	180626030	rs79848802	G	A	2296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=14;PP=1909;SC=AGGGAATAAAGACAAGGCTCA;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=55;TCR=14;TR=69;WE=180626038;WS=180626020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr5	180626927	rs416574	A	G	5442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=101;NR=58;PP=2965;SC=GGTGATCTCAACCCCGAGCTG;SOR=1.405;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=101;TCR=58;TR=159;WE=180626935;WS=180626917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr5	180631778	.	A	T	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=4;PP=467;SC=CTCCCGGGGCAGCCGCGGGCA;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=180631786;WS=180631768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr5	180631817	rs2545112	T	C	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=3;PP=409;SC=GCGTGGCCACTGCCGCCAGCT;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=180631825;WS=180631807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr5	180652241	rs2259749	T	C	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=7;PP=297;SC=ACCCAAATGCTCTGCACTTGC;SOR=1.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=180652249;WS=180652231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	180660259	rs35032551	G	T	3639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=68;PP=2853;SC=TGGTTGAAATGGATGTGTGTT;SOR=1.588;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=34;TCR=68;TR=102;WE=180660267;WS=180660249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr5	180664759	rs34681418	CA	C	998.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=1019;SC=ACTTACCAATCAAGAGAGTCT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=180664767;WS=180664749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr5	180665798	.	C	CA	128.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=1;PP=112;SC=GACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=10;WE=180665806;WS=180665795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr5	180665829	rs144843273	AAAC	A	579.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.58;QD=41.41;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr5	180668964	rs2241370	T	G	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=309;SC=ACTCAGAACTTTTGCACCTGG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=180668972;WS=180668954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr5	180669370	rs2287715	A	G	4154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=50;PP=2965;SC=ACAGAAGAAAAATCAGTGAGG;SOR=1.117;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=123;TCF=73;TCR=50;TR=122;WE=180669378;WS=180669360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr5	180670251	rs1279738	C	G	6627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=151;NR=46;PP=2965;SC=AGTAGGCCGACACTTGAGCCA;SOR=2.373;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=197;TCF=151;TCR=46;TR=197;WE=180670259;WS=180670241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr5	180684328	rs17658015	G	A	3647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=12.156;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=6;PP=2965;ReadPosRankSum=1.301;SC=CAATAAAACTGTCCTGGTTAT;SOR=5.492;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=115;TCF=108;TCR=7;TR=113;WE=180684336;WS=180684318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,114:0.99:115
chr5	180687212	rs918388	C	T	3891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=82;NR=33;PP=2965;SC=CCATGTTGGCCAGCTGCAAGT;SOR=1.837;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=82;TCR=33;TR=115;WE=180687220;WS=180687202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr5	180687428	rs200454506	CTCT	C	8177.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=78;PP=2982;SC=CCTGATCTTCCTCTTCTTCTT;SOR=0.861;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=195;TCF=96;TCR=99;TR=160;WE=180687438;WS=180687418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr6	292694	rs3832447	GC	G	3623.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.234;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.268;NF=1;NR=96;PP=2964;ReadPosRankSum=0.268;SC=GGGAGGGGCGGCGCGCCTGGG;SOR=2.815;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=139;TCF=3;TCR=136;TR=97;WE=292702;WS=292684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,103:0.72:143
chr6	311797	.	G	GT	151.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=0.000;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=1.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.98;ReadPosRankSum=-0.480;SOR=0.964;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,27:0.17:155
chr6	312023	rs1342789	C	T	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=6.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.44;MQRankSum=-1.550;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.570;SOR=1.523;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,42:0.25:168
chr6	312029	rs150517961	TAATG	T	3447.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.970;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.285;NF=11;NR=64;PP=2944;ReadPosRankSum=0.198;SC=CCTACGACGTTAATGAAGGCA;SOR=0.461;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=134;TCF=18;TCR=116;TR=75;WE=312040;WS=312013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,89:0.62:144
chr6	335175	rs2671431	A	T	6172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=140;NR=43;PP=2965;SC=TAAGTTTCTTATTTCTGTATT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=140;TCR=44;TR=183;WE=335183;WS=335165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr6	335251	rs3757305	T	C	5154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FS=5.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.02;ReadPosRankSum=-0.282;SOR=0.839;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,133:0.49:271
chr6	335251	.	TGT	CGC	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=51;NR=64;PP=2944;QD=20;SC=ACTGTGAAGTTGTCAGAGCTC;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=261;TCF=126;TCR=135;TR=115;WE=335261;WS=335241;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:146,115:0.44:261
chr6	335253	rs3757306	T	C	5154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FS=6.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.74;ReadPosRankSum=0.016;SOR=0.847;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,134:0.49:275
chr6	335268	rs4959733	C	T	3001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.170;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=76;PP=2331;ReadPosRankSum=1.362;SC=GCTCACGGGACCCTTGCTGAC;SOR=0.995;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=249;TCF=96;TCR=153;TR=117;WE=335276;WS=335258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,121:0.48:252
chr6	346429	rs10642379	G	GACACACAC	1263.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=-2.019;QD=8.72;ReadPosRankSum=-2.052;SOR=0.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,48:0.33:145
chr6	348051	rs1877172	A	G	2046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.688;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=0;PP=1682;ReadPosRankSum=0.361;SC=TTGGGCGATGAACCCGGAGAT;SOR=2.806;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=103;TCF=102;TCR=1;TR=66;WE=348059;WS=348041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,68:0.66:103
chr6	348080	rs2797333	A	G	4247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=144;NR=1;PP=2965;SC=GCCCTCACACATGTGCTTCTC;SOR=8.608;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=145;TCF=144;TCR=1;TR=145;WE=348088;WS=348070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr6	348124	rs56362282	C	T	2682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=21;PP=2128;ReadPosRankSum=-1.786;SC=TCTCCAGGAGCGTGACACTGG;SOR=0.632;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=275;TCF=225;TCR=50;TR=110;WE=348132;WS=348114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,111:0.39:282
chr6	348906	rs11242812	G	A	2896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.701;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.99;MQRankSum=-0.796;NF=15;NR=81;PP=2274;ReadPosRankSum=1.199;SC=GCAGTTTTCCGGCACTGGCTC;SOR=1.001;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=161;TCF=27;TCR=134;TR=96;WE=348914;WS=348896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,101:0.60:167
chr6	350724	rs12154183	G	A	1259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-6.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.611;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=8;PP=977;ReadPosRankSum=-0.773;SC=TAGCTTGAATGCTTAAATATG;SOR=0.342;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=153;TCF=134;TCR=19;TR=53;WE=350732;WS=350714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,54:0.35:153
chr6	350829	rs1129085	G	A	2796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.429;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=49;PP=2146;ReadPosRankSum=1.132;SC=CAGCCGCTCCGGGAATTCTGA;SOR=0.727;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=301;TCF=169;TCR=132;TR=113;WE=350837;WS=350819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,116:0.38:307
chr6	350940	rs11408655	T	TA	4151.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.990;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.189;NF=17;NR=93;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.091;SC=AAAAGCAACATAGAGTTTAAG;SOR=0.902;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=197;TCF=33;TCR=164;TR=110;WE=350948;WS=350930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,128:0.59:217
chr6	367243	rs7776416	T	C	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=7.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.58;ReadPosRankSum=-0.840;SOR=0.192;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,23:0.24:94
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chr6	367481	rs7738368	T	G	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=2.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.34;ReadPosRankSum=0.012;SOR=0.998;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,39:0.26:148
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chr6	549390	rs2476847	C	T	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.574;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=659;ReadPosRankSum=1.922;SC=TGCTCTTTAACGTCAATATCC;SOR=2.770;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=28;WE=549398;WS=549380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
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chr6	597871	rs4960092	G	A	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=240;ReadPosRankSum=-0.657;SC=GATGTCCTACGCCAGATAACC;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=11;WE=597879;WS=597861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
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chr6	601244	.	A	G	253	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=52.56;NF=1;NR=12;PP=253;QD=22.136247119;SC=CACCCCGTGTACGAATCCACA;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=13;WE=601252;WS=601234;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
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chr6	707044	rs72837934	C	T	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.921;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=390;ReadPosRankSum=1.040;SC=ACACACCACCCCCCACGTACA;SOR=0.052;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=58;TCF=57;TCR=1;TR=19;WE=707052;WS=707034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,19:0.32:59
chr6	707241	rs12529441	C	T	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.641;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=26;PP=552;ReadPosRankSum=1.927;SC=CGCACAGATGCATGCACATAC;SOR=0.311;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=121;TCF=24;TCR=97;TR=36;WE=707249;WS=707231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,38:0.28:138
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chr6	1053816	rs12194400	C	T	2263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.413;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=60;PP=1667;ReadPosRankSum=1.401;SC=AACACAACCACGGACACAGAC;SOR=0.793;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=327;TCF=141;TCR=186;TR=101;WE=1053824;WS=1053806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:230,105:0.31:335
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chr6	1313117	rs9502889	A	C	1021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.87;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	1313121	rs9502890	A	C	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.44;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	1391085	rs147426137	G	GGGC	961.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.92;QD=41.81;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	1395043	rs2293783	T	C	2901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.673;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=68;PP=2284;ReadPosRankSum=-0.332;SC=GGTCGTATTATCACCATCACC;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=48;TCR=100;TR=100;WE=1395051;WS=1395033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,106:0.68:155
chr6	1611802	.	G	GGGC	429.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.627;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.9970;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=432;ReadPosRankSum=2.282;SC=CGGGCAGCTCGGGCGGCGGCG;SOR=1.022;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=9;WE=1611810;WS=1611792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
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chr6	1624512	rs11759759	T	C	4599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=108;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.918;SC=TGCCACTCTCTCCTGGTGACA;SOR=1.436;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=30;TCR=109;TR=138;WE=1624520;WS=1624502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,140:0.99:141
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chr6	2685904	rs10498657	T	C	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.699;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=64;ReadPosRankSum=0.708;SC=CTGCTGAGTCTGGATGAGCAG;SOR=0.030;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=7;WE=2685912;WS=2685894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr6	2689217	rs6930915	A	C	2103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.619;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=39;PP=1609;ReadPosRankSum=0.991;SC=ACAGAAGGGCAATCTGTCAAG;SOR=1.032;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=101;TCF=45;TCR=56;TR=66;WE=2689225;WS=2689207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,73:0.66:111
chr6	2749661	rs2296355	A	G	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=114;ReadPosRankSum=0.852;SC=AGGAAACACAAAAAGTTCTCA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=7;WE=2749669;WS=2749651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr6	2766144	rs17851692	T	C	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.623;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=173;ReadPosRankSum=-0.338;SC=AGGGCGAGGGTGAGGAGGGCG;SOR=1.247;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=11;WE=2766152;WS=2766134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr6	2766465	rs8333	T	C	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=10;PP=615;SC=TCGGGGCCAGTGGCGGGGGCC;SOR=1.302;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=27;WE=2766473;WS=2766455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	2766727	rs3757094	A	G	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=33;PP=1032;ReadPosRankSum=-0.092;SC=TCGGCGGTGGATGCAGCTGAT;SOR=0.826;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=72;TCF=21;TCR=51;TR=46;WE=2766735;WS=2766717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,46:0.65:71
chr6	2766779	rs3757093	G	A	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.707;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=499;ReadPosRankSum=-0.504;SC=GAAGCCGCCTGCCTCTCCTGG;SOR=1.751;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=24;WE=2766787;WS=2766769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr6	2784571	rs160703	G	A	1229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=3;PP=877;ReadPosRankSum=1.407;SC=TGGCAGACCCGTCTGCGTTAA;SOR=0.569;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=52;TCF=49;TCR=3;TR=40;WE=2784579;WS=2784561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,44:0.80:55
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chr6	2834265	rs386915	C	T	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.918;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=34;PP=605;ReadPosRankSum=-0.723;SC=AAAAATGAGGCGAAAGAGGAA;SOR=2.156;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=127;TCF=23;TCR=104;TR=37;WE=2834273;WS=2834255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,37:0.27:135
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chr6	2838102	rs316340	G	A	1205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=21;PP=925;ReadPosRankSum=0.147;SC=ATTCCATTCTGCCCAGGCTCT;SOR=0.685;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=133;TCF=80;TCR=53;TR=54;WE=2838110;WS=2838092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,54:0.39:139
chr6	2838248	rs316341	G	A	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=204;ReadPosRankSum=0.516;SC=TAAAAAAAAGGAAAAGGAAAT;SOR=0.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=11;WE=2838256;WS=2838238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr6	2854367	rs412303	G	A	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.369;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=263;ReadPosRankSum=1.436;SC=CCACAGTTTCGTTTCCTCAAT;SOR=0.930;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=52;TCF=27;TCR=25;TR=19;WE=2854375;WS=2854357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,19:0.32:60
chr6	2948965	rs318426	C	T	3898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=101;PP=2965;SC=CTTTAAGACCCAGGGTGCTGC;SOR=3.221;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=20;TCR=101;TR=121;WE=2948973;WS=2948955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
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chr6	3010459	rs2475208	C	T	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=497;ReadPosRankSum=-0.159;SC=TTATAAAAACCATCTTTATGT;SOR=0.305;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=69;TCF=11;TCR=58;TR=25;WE=3010467;WS=3010449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,25:0.35:71
chr6	3012725	rs11351160	TG	T	3705.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=82;NR=7;PP=2976;SC=ATGGTTGGGATGGGCTGTGGA;SOR=4.784;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=96;TCF=85;TCR=11;TR=89;WE=3012733;WS=3012715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr6	3015790	rs1049115	A	G	3975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=29;PP=2965;SC=TCAGCGTGCCAGCCATCCTGA;SOR=2.544;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=109;TCR=29;TR=138;WE=3015798;WS=3015780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr6	3019654	rs4149370	T	C	4151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=14;PP=2965;SC=ATCATTTAACTGAATGGTATG;SOR=3.699;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=111;TCR=14;TR=124;WE=3019662;WS=3019644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr6	3019927	rs6955	G	C	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-4.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=466;ReadPosRankSum=1.071;SC=CAGCACACTAGGAGGCCCAGG;SOR=2.235;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=25;WE=3019935;WS=3019917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,25:0.76:33
chr6	3076931	rs7755818	A	T	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=73;SC=GAAAAAAAAAAACATATATAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=3076939;WS=3076921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	3076933	.	C	CATACAT	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=68.27;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	3077141	rs2272990	T	C	1160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=26;PP=893;SC=GCGGAGGCTTTGGGAAGGTGT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=39;WE=3077149;WS=3077131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	3118947	rs2231355	A	G	2790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=39;PP=2165;SC=GCGCATGCGCACTCCCGGCAG;SOR=1.202;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=59;TCR=39;TR=98;WE=3118955;WS=3118937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr6	3138194	rs1534998	T	C	1762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=27;PP=1168;SC=GAAAATATTCTGTTTTTTCCA;SOR=0.793;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=57;TCF=29;TCR=28;TR=56;WE=3138202;WS=3138184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr6	3157798	rs909964	G	A	113.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=92;SC=CCCCCAGCTCGGTCTTTTATA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=3157817;WS=3157788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	3157809	rs909965	C	T	77.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=56;SC=GTCTTTTATACCCGGGGACCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=3157817;WS=3157788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	3255163	rs11242830	C	T	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=1;PP=663;SC=TTCAGCCATTCTCTCACTGGG;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=3255171;WS=3255153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	3255327	rs9503497	G	A	3868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=61;PP=2933;SC=TAAGAAGTTGGCTGCATAGGA;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=62;TCR=62;TR=123;WE=3255348;WS=3255317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr6	3255340	rs9503498	A	C	3495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=61;PP=2702;SC=GCATAGGAGCACAACATCACC;SOR=0.922;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=51;TCR=62;TR=112;WE=3255348;WS=3255317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr6	3259463	rs9501962	G	T	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.56;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	3263830	rs12193912	C	T	883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=1;PP=740;SC=CTGCCATCGTCGTGAAGAATC;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=3263838;WS=3263820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	3264101	rs4959785	A	G	2389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=47;PP=1805;SC=GCTAAGAACCATCACCTCATT;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=34;TCR=47;TR=81;WE=3264109;WS=3264091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr6	3264487	rs4959786	T	C	3988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=64;PP=2964;SC=TGGCGTAGAGTGGGGATTAAG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=65;TCR=64;TR=129;WE=3264495;WS=3264477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr6	3264502	rs4959787	G	C	3843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=63;PP=2802;SC=ATTAAGCAAAGGTCATGAGGC;SOR=0.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=62;TCR=63;TR=125;WE=3264510;WS=3264492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr6	3264526	rs4959788	CT	TC	4834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=57;PP=2947;SC=ATGCTCCACTCTTCCCACACC;SOR=1.002;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=105;TCF=46;TCR=59;TR=100;WE=3264535;WS=3264516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr6	3264582	rs11757564	G	A	2128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=55;PP=1751;SC=TGTGCTCTGCGACCCCCAGCC;SOR=3.160;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=70;TCF=12;TCR=58;TR=67;WE=3264590;WS=3264572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr6	3264671	rs13193012	T	C	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.715;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=139;ReadPosRankSum=-1.150;SC=CAGCTGCTTCTGCTCTGGAGT;SOR=0.042;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=10;WE=3264679;WS=3264661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr6	3285286	rs10793841	A	G	4392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=87;PP=2965;SC=GAGACGAGGAAGCACAGCCCA;SOR=1.493;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=50;TCR=87;TR=137;WE=3285294;WS=3285276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr6	3287118	rs6910086	T	C	2818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=69;NR=21;PP=2115;SC=GCTGCAGGAGTGAGGCCAGGG;SOR=2.520;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=69;TCR=21;TR=90;WE=3287126;WS=3287108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
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chr6	3410247	rs2277076	T	C	1161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=0;PP=958;SC=GAGTGAAATGTTTCACGGCAT;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=34;WE=3410255;WS=3410237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	3438738	rs12197689	G	A	2505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=32;PP=2027;SC=GGCCTCCAGCGCTTGGTGTCT;SOR=1.031;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=45;TCR=32;TR=77;WE=3438746;WS=3438728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr6	3439510	rs9503595	T	C	1415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=16;PP=1134;SC=TGCCGAATGTTCTCTGGGAGC;SOR=1.464;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=45;WE=3439518;WS=3439500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr6	3439595	rs35613438	G	GA	1394.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=26;PP=1441;SC=AGGCATTTCTGAAAGTTCCCC;SOR=1.364;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=34;WE=3439603;WS=3439585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	3439637	rs9502003	G	A	1002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=27;PP=875;SC=GAGCCACTGCGGCCCTGGACG;SOR=3.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=30;WE=3439645;WS=3439627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	3727811	rs226959	C	G	4416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=29;PP=2965;SC=CCACGCCCAGCTGCTGGTCTC;SOR=2.647;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=102;TCR=29;TR=131;WE=3727819;WS=3727801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr6	3728024	rs7767269	A	T	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=27;PP=661;ReadPosRankSum=-0.962;SC=CCACACCGTAAGAGAATGCCG;SOR=0.941;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=28;WE=3728032;WS=3728014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,30:0.73:41
chr6	3738897	rs11390464	A	AG	747.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=3;PP=756;SC=GAAAAAAGTCAGATCTCTGCC;SOR=3.160;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=17;WE=3738905;WS=3738887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	4020540	rs36124455	A	AT	508.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=1.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQRankSum=0.390;QD=6.13;ReadPosRankSum=0.094;SOR=0.388;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,36:0.43:83
chr6	4020586	rs113818223	T	C	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-6.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.372;NF=0;NR=46;PP=894;ReadPosRankSum=0.191;SC=TCGCCCAGGCTGGAGTGCAGT;SOR=2.874;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=67;TCF=1;TCR=66;TR=46;WE=4020594;WS=4020576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,46:0.67:69
chr6	4021554	rs11752006	A	G	1489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=21;PP=1124;SC=TCTTCCCTACACGGTCGGCAC;SOR=0.900;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=28;TCR=21;TR=49;WE=4021562;WS=4021544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	4021742	.	G	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.879;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=128;ReadPosRankSum=0.848;SC=GGAGCCCGGGGACTGCCGAGT;SOR=2.247;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=8;WE=4021750;WS=4021732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr6	4033065	rs6924389	A	G	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=35;PP=984;SC=CTTGTGGACCATTAAAAATGA;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=4033073;WS=4033055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	4040924	rs75972245	A	G	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.64;ReadPosRankSum=0.751;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr6	4044214	rs35085092	A	G	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=32;PP=798;ReadPosRankSum=-0.944;SC=TTGAGGCCTCAGTGAAAGCCA;SOR=1.445;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=52;TCF=2;TCR=50;TR=33;WE=4044222;WS=4044204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,36:0.64:56
chr6	4049422	rs145063296	TG	T	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.132;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=2;PP=36;ReadPosRankSum=-1.101;SC=CACAGATTATTGGAGAACTCT;SOR=0.018;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=3;WE=4049430;WS=4049412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr6	4052171	rs72841286	A	G	298.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.881;NF=16;NR=0;PP=407;ReadPosRankSum=-1.239;SC=ATTTTACCCCAATTTTTTTTT;SOR=0.161;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=56;TCR=0;TR=16;WE=4052180;WS=4052161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,17:0.29:59
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chr6	4059061	.	A	C	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.235;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=269;ReadPosRankSum=2.233;SC=AAGTGTTTTAAATGCAGCATG;SOR=0.403;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=16;WE=4059069;WS=4059051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,16:0.29:56
chr6	4069133	rs10485172	T	C	4868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.479;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=75;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.795;SC=GAAACTGGCATTGGAGACCTC;SOR=0.463;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=255;TCF=146;TCR=109;TR=170;WE=4069141;WS=4069123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,174:0.66:263
chr6	4069166	rs595413	C	T	1974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.470;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=40;PP=1529;ReadPosRankSum=-0.787;SC=CTTGTGGAGACCATTTTAACC;SOR=0.739;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=264;TCF=134;TCR=130;TR=83;WE=4069174;WS=4069156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,88:0.32:274
chr6	4069440	rs148572232	C	T	1446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=18;PP=1036;ReadPosRankSum=2.026;SC=TCTGAAGACTCAAAGAGTCGC;SOR=0.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=177;TCF=117;TCR=60;TR=56;WE=4069448;WS=4069430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,61:0.33:184
chr6	4069685	rs639905	C	T	3161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=57;PP=2412;ReadPosRankSum=0.519;SC=AAGTCTAGAGCACTGAAAGGA;SOR=0.651;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=81;TCR=79;TR=114;WE=4069693;WS=4069675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,118:0.72:163
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chr6	4079858	rs589494	C	G	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.260;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=613;ReadPosRankSum=-1.556;SC=GCCCGGCCCACCCGCCTCCAC;SOR=0.144;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=32;WE=4079866;WS=4079848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,34:0.79:43
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chr6	4135225	rs35071107	C	A	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=478;ReadPosRankSum=2.279;SC=GTTCCCGGGACCCCAGGGAGG;SOR=0.527;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=20;WE=4135233;WS=4135215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
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chr6	4715882	rs3812183	A	G	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=1;PP=985;SC=CTCAGATTCAATGTAGAACTG;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=34;WE=4715902;WS=4715872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
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chr6	4715923	rs34254931	G	GT	1168.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.104;NF=32;NR=8;PP=1143;ReadPosRankSum=0.071;SC=TGAGCCTTGGGTTTTTTCCCA;SOR=0.607;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=40;WE=4715931;WS=4715913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,45:0.73:62
chr6	4715980	rs3812180	C	A	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.097;NF=24;NR=7;PP=397;ReadPosRankSum=-1.193;SC=TGCAGGTGGTCATCAGAGAAC;SOR=1.051;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=110;TCF=80;TCR=30;TR=31;WE=4715988;WS=4715970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,31:0.29:108
chr6	4716016	rs3812179	A	G	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.914;NF=26;NR=14;PP=614;ReadPosRankSum=1.984;SC=GAATTTTATGACATTTCAGGC;SOR=0.726;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=133;TCF=84;TCR=49;TR=40;WE=4716024;WS=4716006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,40:0.30:134
chr6	4716037	rs3812178	T	C	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=775;ReadPosRankSum=-0.569;SC=AAGCCACAGGTCAGCCTGGGG;SOR=0.741;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=148;TCF=88;TCR=60;TR=52;WE=4716045;WS=4716027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,52:0.35:150
chr6	4716150	rs9502225	C	T	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-6.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.820;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=29;PP=548;ReadPosRankSum=-0.437;SC=AGTTCTGATGCAGTAGGCAGA;SOR=0.929;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=124;TCF=30;TCR=94;TR=37;WE=4716158;WS=4716140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,37:0.28:131
chr6	4716185	rs9502226	T	C	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=5.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.794;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=410;ReadPosRankSum=1.333;SC=CCCTTTTATTTAAAAATGATT;SOR=2.318;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=87;TCF=12;TCR=75;TR=23;WE=4716193;WS=4716175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,23:0.25:93
chr6	4716258	rs9502227	G	A	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.553;NF=0;NR=11;PP=193;ReadPosRankSum=1.513;SC=CGAGGCGGGCGGATCATGAGG;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=11;WE=4716266;WS=4716248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr6	4734868	rs62384814	T	C	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.281;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=667;ReadPosRankSum=1.536;SC=TATGTTCAGTTAGACTCCTAA;SOR=2.391;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=8;WE=4734890;WS=4734858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr6	4734882	rs71311001	A	AGTGAGGG	376.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.857;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=697;ReadPosRankSum=-0.532;SC=CTCCTAATTCAGGAAGGGGAG;SOR=1.467;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=9;WE=4734890;WS=4734858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,12:0.30:40
chr6	4734898	rs62384815	A	T	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.852;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=164;ReadPosRankSum=-0.499;SC=GGGAGGGCACAGGGATGGGAA;SOR=1.623;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=50;TCF=42;TCR=8;TR=13;WE=4734906;WS=4734888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,13:0.27:49
chr6	4735035	rs13196069	T	C	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.955;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=271;ReadPosRankSum=-0.984;SC=AGCATCTCCGTGAGCAGTGAG;SOR=1.027;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=88;TCF=31;TCR=57;TR=26;WE=4735043;WS=4735025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,26:0.28:92
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chr6	4735146	rs35047361	C	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.85;ReadPosRankSum=0.217;SOR=0.067;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,4:0.18:22
chr6	4936074	rs1539004	T	G	1748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=47;PP=1383;SC=CCTGCCTGGCTGAACTGGCTC;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=48;WE=4936082;WS=4936064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	4937662	rs9502253	A	C	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=2;PP=682;SC=CCCAGGAGTTAGAGAGCACAG;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=4937670;WS=4937652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	4937728	rs36001374	C	CA	682.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=12.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=-0.578;QD=18.45;ReadPosRankSum=1.114;SOR=4.472;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,31:0.84:37
chr6	4937742	rs61406305	C	CT	3027.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=18;PP=2403;SC=AAAAAAAATGCTTTAAGATTT;SOR=1.999;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=64;TCF=43;TCR=21;TR=57;WE=4937755;WS=4937718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr6	4937747	rs56133250	A	G	3183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=21;PP=1790;SC=AAATGCTTTAAGATTTTAAAC;SOR=1.810;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=73;TCF=51;TCR=22;TR=68;WE=4937755;WS=4937718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr6	4952413	rs2793263	T	C	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=1;PP=660;SC=TTGTGAATGTTTCCCTTCGGT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=4952421;WS=4952403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	4999193	rs396839	A	G	423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=11;PP=346;SC=TAGTAAAATTATTTTATTCTT;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=4999201;WS=4999183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	5000721	.	T	C	476	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=1;HapScore=4;MGOF=19;MMLQ=24;MQ=56.89;NF=16;NR=2;PP=476;QD=28.3761784748;SC=CGTGCCCAGCTGACTTTTTTT;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=18;WE=5000732;WS=5000711;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,18:0.72:25
chr6	5001577	rs912711	G	C	895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=25;PP=827;SC=CCTTGAAATAGATGAAAGGAA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=5001585;WS=5001567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	5003952	rs4960056	T	C	2055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=0;PP=1768;SC=GCCACTGGCTTAGAGCAGTTA;SOR=8.189;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=59;TCR=0;TR=58;WE=5003960;WS=5003942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr6	5086070	rs667752	A	G	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=11;PP=758;SC=CGGAGGACGCACAGCTCGGCC;SOR=1.284;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=32;WE=5086078;WS=5086060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	5086211	rs584962	G	C	2568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=31;PP=2169;SC=TCTCGCGCCTGCGAAGCTTCC;SOR=1.165;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=48;TCR=31;TR=79;WE=5086219;WS=5086201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr6	5086558	rs436556	C	A	3730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=68;PP=2965;SC=CCAGAGGCACCGTCTGGGGCC;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=44;TCR=68;TR=112;WE=5086566;WS=5086548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr6	5109592	rs9606	T	G	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.191;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=96;ReadPosRankSum=-1.490;SC=GGAGCCCCCATCTCAAACAGA;SOR=0.078;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=7;WE=5109600;WS=5109582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr6	5138809	rs11301112	GT	G	59.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.72;ReadPosRankSum=2.103;SOR=0.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr6	5139012	rs463054	C	A	1978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=35;PP=1510;ReadPosRankSum=0.388;SC=GTTAAGAGTACCAGTTAACAG;SOR=0.373;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=26;TCR=36;TR=61;WE=5139020;WS=5139002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr6	5139080	rs73361394	G	A	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=622;ReadPosRankSum=0.428;SC=GTTTAAGACAGGTTAAAAGCT;SOR=0.919;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=27;WE=5139088;WS=5139070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr6	5148679	.	T	TTCTGAATCGTAATCCTGAGCTGGGCTGGGGGCGCAGAGTCAGAACTCTGAATCGTAATCCTGAGCTGGGCTGGTGGGGCAGAGTCAGAAC	180.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=0.504;QD=7.53;ReadPosRankSum=-0.964;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,3:0.12:24
chr6	5148707	rs9504352	A	G	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=8.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQRankSum=-0.213;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.198;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr6	5148711	rs9504353	G	C	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=8.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQRankSum=-0.213;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.593;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr6	5148719	rs200871	T	C	145.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=10.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQRankSum=0.000;QD=12.15;ReadPosRankSum=-0.145;SOR=4.972;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,11:0.92:12
chr6	5148729	rs200872	T	A	141.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=9.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.75;ReadPosRankSum=0.140;SOR=4.398;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr6	5217010	rs41302851	C	T	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=7.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.162;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=32;PP=665;ReadPosRankSum=0.548;SC=AAGGTGTCAGCGTGTCTGAGG;SOR=0.242;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=5;TCR=92;TR=34;WE=5217018;WS=5217000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,34:0.35:98
chr6	5260812	rs7752203	C	G	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=123;ReadPosRankSum=-1.282;SC=GGATATTCCGCGTCAGCCCGC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=3;WE=5260824;WS=5260802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr6	5260816	rs4141761	A	G	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=103;ReadPosRankSum=1.960;SC=ATTCCGCGTCAGCCCGCACCC;SOR=0.132;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=3;WE=5260824;WS=5260802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr6	5260936	rs2224391	A	C	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=668;ReadPosRankSum=1.134;SC=CGGTACAGAGATAACACTTGT;SOR=0.859;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=35;WE=5260944;WS=5260926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,38:0.75:51
chr6	5545654	rs7749599	C	T	1943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=50;PP=1531;SC=TTGAAAGCCACTGAATTTTAT;SOR=6.736;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=51;WE=5545662;WS=5545644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
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chr6	6003513	rs3792947	A	C	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-7.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.898;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=39;PP=701;ReadPosRankSum=1.360;SC=TGGTCTGGAGAGGAGAAGGCC;SOR=0.144;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=111;TCF=7;TCR=104;TR=43;WE=6003521;WS=6003503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,43:0.39:111
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chr6	6152137	rs5988	C	G	2412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.76;ReadPosRankSum=-0.075;SOR=0.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,62:0.58:106
chr6	6152140	rs5987	C	T	2412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.42;ReadPosRankSum=0.403;SOR=0.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,60:0.58:103
chr6	6152211	rs2274394	C	G	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.420;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=29;PP=701;ReadPosRankSum=-1.862;SC=GTCATTAGCACCAAATAAAAC;SOR=1.445;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=64;TCF=12;TCR=52;TR=33;WE=6152219;WS=6152201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr6	6167621	rs435048	G	A	1422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=18;PP=1170;SC=ATACAAGCACGCATATGCACA;SOR=1.154;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=27;TCR=18;TR=45;WE=6167629;WS=6167611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	6169656	rs7769202	T	C	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.049;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=338;ReadPosRankSum=0.440;SC=ACAATGCCTATTGAAGTGTGA;SOR=0.871;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=64;TCF=37;TCR=27;TR=18;WE=6169664;WS=6169646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,18:0.27:66
chr6	6174786	rs380058	G	C	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=1;PP=890;SC=GCGAGTCTCAGAAAGAACCAC;SOR=5.610;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=32;WE=6174794;WS=6174776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	6174856	rs5986	T	C	1205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=8;PP=2068;ReadPosRankSum=0.274;SC=CCTTCTTGAATTCTGCCTTCG;SOR=0.848;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=65;TCR=14;TR=44;WE=6174874;WS=6174846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,46:0.56:82
chr6	6174866	rs5982	G	A	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.916;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=8;PP=1574;ReadPosRankSum=-0.305;SC=TTCTGCCTTCGGGACCCCGGT;SOR=0.922;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=89;TCF=66;TCR=23;TR=37;WE=6174874;WS=6174846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,38:0.42:91
chr6	6175174	rs3024444	C	T	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=27;PP=648;ReadPosRankSum=-0.736;SC=ATGGATGCACCGTGTACTGCA;SOR=0.963;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=29;WE=6175182;WS=6175164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,30:0.73:41
chr6	6195926	rs2274391	C	T	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=3;PP=719;ReadPosRankSum=0.525;SC=ACGAAGCATACGCTATGTACC;SOR=0.527;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=50;TCF=46;TCR=4;TR=32;WE=6195934;WS=6195916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr6	6196141	rs5978	GG	AA	1479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=27;PP=1625;ReadPosRankSum=-0.589;SC=GAGGAAGGGCGGTGTGAGTTT;SOR=0.871;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=30;WE=6196150;WS=6196131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,37:0.71:52
chr6	6250967	rs3024370	G	A	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.708;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=455;ReadPosRankSum=-0.665;SC=TCGATATATGGGATCCTGTAG;SOR=0.061;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=65;TCF=64;TCR=1;TR=21;WE=6250975;WS=6250957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,23:0.34:68
chr6	6318795	rs5985	C	A	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.570;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=347;ReadPosRankSum=-2.009;SC=CGGGGCACCACGCCCTGAAGC;SOR=1.536;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=18;WE=6318803;WS=6318785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr6	6318921	rs11414870	G	GA	230.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.92;ReadPosRankSum=2.143;SOR=0.755;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,11:0.28:39
chr6	6320808	rs2815822	T	G	6356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=161;NR=13;PP=2965;SC=GGGTGCAGGGTCGGTGGCTTA;SOR=4.638;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=162;TCR=13;TR=174;WE=6320816;WS=6320798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr6	6321128	rs1024231	T	C	2108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=23;NR=43;PP=1697;SC=CCCATCCCCATCCCTAGATCT;SOR=1.410;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=66;WE=6321136;WS=6321118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr6	6588881	rs977785	A	C	1021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=3;PP=803;SC=CTGAACATCCAACTGCCTTGG;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=6588889;WS=6588871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	6589192	rs112924538	G	GGA	885.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=17;PP=894;SC=AGTTGGGGTGGGAGGGGAGAG;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=20;WE=6589200;WS=6589182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	6625418	rs2233124	T	C	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=192;ReadPosRankSum=1.162;SC=TGGGTTATATTCAGGTAGGGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=11;WE=6625426;WS=6625408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr6	7231521	rs148116530	C	T	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.300;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=23;PP=886;ReadPosRankSum=1.028;SC=AAGAGCTGCCCCCGCTGGCCT;SOR=0.503;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=132;TCF=77;TCR=55;TR=52;WE=7231529;WS=7231511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,53:0.41:128
chr6	7231770	rs34561875	A	G	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.095;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=417;ReadPosRankSum=-0.284;SC=AGCAGGGCCCAGCGGGCACGT;SOR=0.489;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=61;TCF=16;TCR=45;TR=25;WE=7231778;WS=7231760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
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chr6	7240876	rs41302867	G	A	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.608;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=41;PP=1044;ReadPosRankSum=-0.894;SC=AAGAGGGAGAGAGAGGAGTTC;SOR=0.254;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=61;TCF=2;TCR=59;TR=43;WE=7240884;WS=7240866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,45:0.70:64
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chr6	7387236	rs9406026	G	A	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.363;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=9;PP=865;ReadPosRankSum=-0.962;SC=AAGTGGTGCCGGTGGTTTCCA;SOR=1.713;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=161;TCF=112;TCR=49;TR=48;WE=7387244;WS=7387226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,52:0.31:169
chr6	7387433	rs35613760	T	TA	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=1.582;QD=3.94;ReadPosRankSum=1.211;SOR=0.183;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,12:0.30:40
chr6	7387462	rs9406027	T	C	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.316;NF=0;NR=11;PP=214;ReadPosRankSum=0.448;SC=TTAGTAGGTATAAACAAAAAG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=11;WE=7387470;WS=7387452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
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chr6	7414739	rs2296258	C	T	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=21;ReadPosRankSum=-0.361;SC=TGATAAGTACCTCTAATTACA;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=3;WE=7414747;WS=7414729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
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chr6	7578819	rs2806229	T	G	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=9.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.56;ReadPosRankSum=2.061;SOR=0.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,13:0.23:57
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chr6	7579363	rs2806227	A	T	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=59;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=-0.319;SC=TTTCTTGAATATTTGCCTAGT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=2;WE=7579371;WS=7579353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
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chr6	7590653	rs2744384	A	G	1542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.935;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=35;PP=1237;ReadPosRankSum=-1.586;SC=GGAGGTGAGGAGCGCGGCCGC;SOR=0.976;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=81;TCF=33;TCR=48;TR=57;WE=7590661;WS=7590643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,57:0.67:85
chr6	7590802	rs2744385	G	C	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=157;ReadPosRankSum=-1.082;SC=AGGGGCGCCGGGGGCCCTGGA;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=10;WE=7590810;WS=7590792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr6	7595126	rs12664272	G	A	198.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=2;PP=213;SC=TCATAGACAGGGATGTGGATG;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=7595134;WS=7595116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	7601720	rs3734586	C	T	3251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=72;PP=2539;SC=AAAATGACAGCGATCTCTTTG;SOR=2.004;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=28;TCR=72;TR=100;WE=7601728;WS=7601710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr6	7605505	rs9505238	T	A	848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=0;PP=754;SC=ACTGCACAAGTCCCACAGTCA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=7605513;WS=7605495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr6	7608863	rs1535433	T	A	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr6	7879407	rs267172	T	C	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=253;ReadPosRankSum=1.109;SC=ACACGGGGGATAAAGGTCCTT;SOR=0.567;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=21;TCR=46;TR=18;WE=7879415;WS=7879397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,18:0.27:66
chr6	7883386	rs9502656	G	A	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=322;ReadPosRankSum=0.176;SC=CCTAAAGTTCGTCTTTCGCTT;SOR=0.473;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=68;TCF=59;TCR=9;TR=20;WE=7883394;WS=7883376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,22:0.31:72
chr6	7888899	rs143994913	G	A	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.70;ReadPosRankSum=0.216;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,9:0.24:37
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chr6	7892143	rs1225950	C	G	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=20;ReadPosRankSum=-0.613;SC=CTGTTCATGACTTCATAACAA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=4;WE=7892151;WS=7892133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr6	7895348	rs58711083	C	T	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=5.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.61;ReadPosRankSum=0.029;SOR=1.219;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,44:0.26:171
chr6	7899765	.	AGAGGGAGG	A	200.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.106;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.90;MQRankSum=2.192;QD=9.12;ReadPosRankSum=-0.952;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr6	7986654	rs197128	A	G	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=393;SC=AGGCGGCGGGAAGGTGGCCCG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=7986662;WS=7986646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	7986847	rs197129	G	A	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.564;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=31;PP=726;ReadPosRankSum=-0.903;SC=CCTGTACCGCGTCCTCAGCAT;SOR=1.498;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=163;TCF=75;TCR=88;TR=46;WE=7986855;WS=7986837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,50:0.30:169
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chr6	7988189	rs4959464	T	C	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=385;ReadPosRankSum=0.514;SC=TTACCAGCCATTGGTCTCTGA;SOR=0.641;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=30;TCR=75;TR=28;WE=7988197;WS=7988179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,30:0.27:113
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chr6	8073858	rs67471655	CAG	C	386.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.902;NF=0;NR=12;PP=406;ReadPosRankSum=-0.351;SC=AAAGTTTTAACAGATATTTTA;SOR=0.324;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=12;WE=8073867;WS=8073848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr6	8411882	rs62395730	C	T	4267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.935;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=71;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.207;SC=CAAATGAAAACCAGTCCGAAT;SOR=0.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=264;TCF=142;TCR=122;TR=156;WE=8411890;WS=8411872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,165:0.60:275
chr6	8413890	rs3757099	A	G	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.631;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=3.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=100;ReadPosRankSum=0.812;SC=TGTAAACATTAAGAAATATAC;SOR=0.160;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=7;WE=8413898;WS=8413880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr6	8417376	rs72191300	GA	G	190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=3.736;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=141;ReadPosRankSum=-0.435;SC=TTGATTTAATGAAAAAAAAAT;SOR=2.494;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=9;WE=8417384;WS=8417366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr6	8417521	rs6905235	G	A	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=1;PP=401;SC=GGCATGTTATGTTAAAGGAGG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=8417529;WS=8417511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	8419242	rs1360854	G	T	779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=21;PP=620;SC=CCACACAAGAGTGTGATATGA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=8419250;WS=8419232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	8428071	rs3831263	CAT	C	310.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=343;ReadPosRankSum=1.257;SC=GTGCCTATCACATGTTTTGTT;SOR=0.177;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=23;WE=8428080;WS=8428061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr6	8428137	rs3215958	A	AAGT	4526.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=5;PP=2183;ReadPosRankSum=-1.138;SC=CAACTAATATAGAAATATCAA;SOR=4.514;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=93;TCF=87;TCR=6;TR=83;WE=8428145;WS=8428127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,98:0.99:99
chr6	8429942	rs150276009	G	GTTTTCTGTT	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=0;PP=434;SC=ATTTTGATCTGTTAAGAAGCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=8429950;WS=8429932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	8430049	rs6918877	G	A	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=3;PP=668;SC=CATACTGACCGCAATTATTAT;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=8430057;WS=8430039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	8435454	rs6597317	T	C	1286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=11;PP=1034;SC=GTTTCTTCCATCCCGACCTCA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=42;WE=8435462;WS=8435444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	9616231	rs143324041	A	AGAAGAAGAAGAG	937.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=7.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.32;MQRankSum=2.968;QD=8.93;ReadPosRankSum=1.802;SOR=2.335;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,30:0.29:105
chr6	9750430	rs10949284	T	C	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.898;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=491;ReadPosRankSum=-0.882;SC=CTACAGAGGGTAAAAAGGACA;SOR=0.843;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=99;TCF=71;TCR=28;TR=30;WE=9750438;WS=9750420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,31:0.30:102
chr6	9750730	rs375191856	GTAATAATAA	G,GTAATAATAATAATAATAA	485.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=0,0;NR=10,10;PP=1982,1664;SC=CCTCCTCTATGTAATAATAAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=10,10;WE=9750746;WS=9750720;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.54,0.46:13
chr6	9776194	rs9370818	A	G	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=0.409;SC=GTAAGCTTACACTGCTGAAAT;SOR=0.426;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=8;WE=9776202;WS=9776184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr6	9795507	rs141334431	AGAG	A	449.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.59;QD=37.48;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	9795586	.	G	GGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAA	1139.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.83;QD=142.47;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	9845732	rs11968445	C	T	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=3.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.968;SOR=1.639;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,10:0.22:46
chr6	9860514	rs150538680	C	CA	282.06	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.730;NF=13;NR=1;PP=184;ReadPosRankSum=-1.608;SC=TACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SOR=2.833;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=14;WE=9860522;WS=9860504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr6	9900599	rs59046538	T	TGAG	2956.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=13;PP=2577;ReadPosRankSum=1.449;SC=TATAGTTTTCTGAGATCTTTG;SOR=0.664;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=82;TCF=60;TCR=22;TR=50;WE=9900607;WS=9900589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,67:0.69:97
chr6	9921965	rs35153317	CATT	C	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.75;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	9922006	rs1925775	A	G	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=177;SC=ATGTTATTGTAGTGGTCTAGA;SOR=1.802;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=9922014;WS=9921996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	9933492	rs9477310	G	A	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.877;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=34;PP=1309;ReadPosRankSum=-0.794;SC=AAATTCAGCCGACTTGGATTT;SOR=0.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=39;TCR=48;TR=62;WE=9933500;WS=9933482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,62:0.71:87
chr6	10430171	rs303061	T	C	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.425;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=286;ReadPosRankSum=1.249;SC=TGGTAGAAAGTACCAGAGACA;SOR=1.456;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=17;WE=10430179;WS=10430161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr6	10587038	rs539351	C	G	5067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.97;NF=56;NR=95;PP=2965;SC=TTACCAGAGACTTTGTCGACT;SOR=1.348;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=56;TCR=95;TR=151;WE=10587046;WS=10587028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
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chr6	10785011	rs113945134	C	CCAGA	7292.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=41;PP=2918;ReadPosRankSum=-1.183;SC=ATTTCTGATACCAGTATGTGA;SOR=1.595;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=133;TCF=83;TCR=50;TR=113;WE=10785019;WS=10785001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,159:0.99:161
chr6	10785227	rs70991044	AAAG	A	1160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=1097;ReadPosRankSum=-1.241;SC=TGAAATGGGGAAAGAAGTGCT;SOR=0.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=68;TCF=3;TCR=65;TR=27;WE=10785237;WS=10785217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,32:0.43:75
chr6	10785263	rs6936890	C	G	1675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=50;PP=1405;SC=TACAATTTCCCGTCACCCTAG;SOR=7.903;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=51;WE=10785271;WS=10785253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	10792197	rs521802	T	C	1190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=39;PP=946;SC=GTTCCATACATGTAAGGGCAT;SOR=6.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=40;WE=10792205;WS=10792187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	10802045	rs569418	C	G	1288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=1;PP=1064;SC=TGAGAATAGACCTGCCTTTGT;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=36;WE=10802053;WS=10802035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	10802101	rs4712966	G	A	2495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=20;PP=1970;SC=ATTTTTAAAGGTCTAACAGGA;SOR=2.215;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=59;TCR=20;TR=78;WE=10802109;WS=10802091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr6	10814091	rs6909367	A	G	4639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.823;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=129;PP=2965;ReadPosRankSum=0.267;SC=ATAGATTTATACTCTTAAAGC;SOR=4.205;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=145;TCF=15;TCR=130;TR=143;WE=10814099;WS=10814081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,144:0.99:146
chr6	10875238	rs2076257	T	A	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=5.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=640;ReadPosRankSum=-1.544;SC=AACAATAGCCTAGAAGTAAGT;SOR=1.151;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=24;WE=10875246;WS=10875228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr6	10876036	rs2076258	C	T	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=2;PP=550;ReadPosRankSum=0.144;SC=TTGTAATTAACGTATGACCTT;SOR=1.248;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=26;WE=10876044;WS=10876026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,27:0.71:38
chr6	10882100	rs2153156	G	A	2013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=48;PP=1604;SC=CGCCAGGTGGGTTTTTTTTCT;SOR=2.869;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=11;TCR=48;TR=59;WE=10882108;WS=10882090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr6	10887253	rs9358956	G	C	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=458;ReadPosRankSum=1.239;SC=GGGCTCTTTCGGCAGCGCCCC;SOR=0.771;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=55;TCF=52;TCR=3;TR=23;WE=10887261;WS=10887243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr6	10887276	rs9348724	C	G	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=5;PP=636;ReadPosRankSum=0.655;SC=GCGGGCGGGGCTCTTGGGCGG;SOR=0.754;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=81;TCF=68;TCR=13;TR=33;WE=10887284;WS=10887266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,33:0.41:81
chr6	10891781	rs1538441	C	T	1516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=30;PP=1209;SC=TTAAGGAAGACAGGACTGGGA;SOR=1.201;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=20;TCR=30;TR=50;WE=10891789;WS=10891771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	10891842	.	CTCTCTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	C,CTGTGTGTGTG	1036.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.23;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=1552;SC=TTTATAATCTCTCTCTGTGTG;SOR=3.611;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=10891869;WS=10891832;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.67,0.33:12
chr6	10891892	rs12523744	G	A	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.74;MQRankSum=2.213;QD=18.75;ReadPosRankSum=-1.765;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr6	10894255	rs9368453	G	A	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.690;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=1263;ReadPosRankSum=-0.819;SC=GGTTTGCTTTGTGACCAAAAT;SOR=0.934;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=111;TCF=68;TCR=43;TR=32;WE=10894276;WS=10894245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,35:0.30:115
chr6	10894268	rs6456745	A	G	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.716;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=1263;ReadPosRankSum=1.152;SC=ACCAAAATACAAATGTATAAT;SOR=0.978;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=125;TCF=85;TCR=40;TR=34;WE=10894276;WS=10894245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,36:0.28:127
chr6	10906256	rs4713039	A	G	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=831;ReadPosRankSum=0.150;SC=GTTTCAGGAAAGACCTTGCAA;SOR=0.829;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=57;TCF=33;TCR=24;TR=39;WE=10906264;WS=10906246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,43:0.69:62
chr6	10911282	rs4713044	G	A	454.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.6306;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=368;ReadPosRankSum=-1.157;SC=ACCAGAATGCGTTACCAGTAA;SOR=3.500;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=16;WE=10911290;WS=10911272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,16:0.89:18
chr6	10924992	rs1225764	A	G	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=23;PP=659;SC=CTGGTCTTTCAAATGCCATGT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=10925000;WS=10924982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	10931587	rs1225729	T	C	1426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=1;PP=1158;SC=TTGCTTTTAGTGTTAGCATAT;SOR=6.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=39;WE=10931595;WS=10931577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	10955408	rs1225746	C	T	4992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=52;PP=2965;SC=AGAGGTTGCTCCGGGATCCCC;SOR=1.534;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=101;TCR=52;TR=153;WE=10955416;WS=10955398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr6	10955594	rs1225747	T	C	1811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=61;PP=1439;SC=TTTGTGCTTTTGGAGACAAAT;SOR=8.349;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=0;TCR=61;TR=61;WE=10955602;WS=10955584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
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chr6	10983971	rs4532436	C	G	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-5.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=2;PP=821;ReadPosRankSum=1.321;SC=TAAAACAAGCCAATCTGTTAG;SOR=0.852;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=65;TCF=62;TCR=3;TR=43;WE=10983979;WS=10983961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,41:0.64:64
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chr6	11010800	rs9295752	T	G	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=91;ReadPosRankSum=-0.366;SC=GGTTAAGCAGTAGGAGAAATG;SOR=1.022;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=5;WE=11010808;WS=11010790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
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chr6	11094681	rs2273884	G	T	104.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=135;ReadPosRankSum=-1.391;SC=ATCTGCTGGGGTTTTTTTTGT;SOR=0.947;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=9;WE=11094689;WS=11094671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr6	11185257	rs10601	A	T	2193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=1;PP=1918;SC=CTGAAAGTTGACTGACCCATA;SOR=7.024;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=69;TCF=68;TCR=1;TR=69;WE=11185265;WS=11185247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr6	11185533	rs1050775	G	A	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.214;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=371;ReadPosRankSum=2.923;SC=CCATGACTATGGTCTTGAGCT;SOR=1.096;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=84;TCF=38;TCR=46;TR=23;WE=11185541;WS=11185523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,24:0.28:86
chr6	11185967	rs6456968	T	C	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=609;SC=GGAAATTCACTAGGCCTTGGA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=11185975;WS=11185957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	11190626	rs941982	A	G	2858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=56;PP=2293;SC=GGGAGTCTTCAACTCGTTGCA;SOR=1.396;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=33;TCR=56;TR=89;WE=11190634;WS=11190616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr6	11192522	rs5874310	C	CT	2667.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=17;PP=2426;SC=CTGCACCCCCCGACACACAGA;SOR=2.200;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=55;WE=11192530;WS=11192512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr6	11192575	rs1465131	C	T	3426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=33;PP=2631;SC=GTCACTCACTCACCCCTTTTG;SOR=1.856;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=75;TCR=34;TR=108;WE=11192583;WS=11192565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr6	11192829	rs112090949	C	CTT,CTTT	898.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=47.30;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,11,8:0.58,0.42:19
chr6	11200421	rs2078599	C	T	1274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=6;PP=1023;SC=CTCACCAAGGCAGGGACCCCA;SOR=3.417;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=41;WE=11200429;WS=11200411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	11200574	rs726230	A	C	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.744;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.52;ReadPosRankSum=-0.086;SOR=0.827;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,34:0.25:137
chr6	11201135	rs3798733	C	G	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.430;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=388;ReadPosRankSum=-0.040;SC=AGATATTTATCCAAGAGAAAG;SOR=1.732;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=73;TCF=71;TCR=2;TR=21;WE=11201143;WS=11201125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,21:0.28:75
chr6	11201157	rs3798734	C	T	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.419;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=1;PP=600;ReadPosRankSum=0.176;SC=CGGCAAGCCTCCAAACTCAGG;SOR=2.918;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=109;TCF=95;TCR=14;TR=34;WE=11201165;WS=11201147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,34:0.30:113
chr6	11201437	rs9368610	C	T	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=37;PP=1113;SC=GGCAGAGCAGCGGCAGCAGAG;SOR=5.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=39;WE=11201445;WS=11201427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	11213468	rs12215094	A	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.166;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=359;ReadPosRankSum=1.718;SC=GTGTAATGGGAAAAAAAAATA;SOR=2.121;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=48;TCR=5;TR=17;WE=11213476;WS=11213458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,13:0.27:48
chr6	11213832	rs3734404	T	C	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.220;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=720;ReadPosRankSum=-0.710;SC=GACCGTGTAATGAGCACAGCC;SOR=0.293;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=156;TCF=97;TCR=59;TR=48;WE=11213840;WS=11213822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,51:0.32:160
chr6	11214705	rs1009667	G	A	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=756;ReadPosRankSum=0.087;SC=CTCCCCTTTCGTCACCTACTT;SOR=0.632;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=133;TCF=64;TCR=69;TR=44;WE=11214713;WS=11214695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,42:0.31:135
chr6	11714639	rs35108078	G	GA	300.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.71;MQRankSum=0.668;QD=16.71;ReadPosRankSum=-1.166;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr6	11714806	rs3734273	G	A	1614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.087;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=41;PP=1259;ReadPosRankSum=0.145;SC=GGGTATTTTTGTTGTGGGTAG;SOR=1.597;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=82;TCF=27;TCR=55;TR=57;WE=11714814;WS=11714796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,61:0.72:85
chr6	11717573	rs3765253	G	C	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.544;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=15;PP=1006;ReadPosRankSum=-1.151;SC=TGCTTGGCTGGTGACTTCCAA;SOR=0.549;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=132;TCF=98;TCR=34;TR=53;WE=11717581;WS=11717563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,56:0.41:138
chr6	11723538	rs210905	A	G	2002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=12;PP=1852;SC=GGAGAGGCAGACACGGAAGAA;SOR=2.797;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=49;TCR=12;TR=61;WE=11723546;WS=11723528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr6	11723832	rs2076184	G	A	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=405;ReadPosRankSum=0.422;SC=GGCAGGGGAAGAGAACCCATC;SOR=0.749;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=20;WE=11723840;WS=11723822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr6	11770334	rs148298172	TA	T	268.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=2.899;QD=3.84;ReadPosRankSum=-0.714;SOR=0.630;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,19:0.27:70
chr6	11770425	rs45538938	C	G	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=157;ReadPosRankSum=0.234;SC=GGAGAATGAACGACCACTTCA;SOR=0.247;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=8;WE=11770433;WS=11770415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
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chr6	12124587	rs2228212	C	G	4601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=60;PP=2965;SC=CAAATCCATGCACCGCCTAGC;SOR=1.032;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=82;TCR=60;TR=141;WE=12124595;WS=12124577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr6	12165363	rs219950	C	T	10772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.464;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=211;PP=2965;ReadPosRankSum=1.022;SC=AGACTTTACTCGCCTTTCTAC;SOR=1.253;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=329;TCF=117;TCR=212;TR=327;WE=12165371;WS=12165353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,340:1.00:341
chr6	12290728	rs1800997	TA	T	523.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=629;ReadPosRankSum=0.988;SC=TTCTCCCCGTTAAAAGGGCAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=19;WE=12290736;WS=12290718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr6	12292528	rs1800542	G	A	2491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.575;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=27;PP=1884;ReadPosRankSum=0.454;SC=ATGTCTCTCGGCGTTTGAGGA;SOR=0.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=126;TCF=85;TCR=41;TR=86;WE=12292536;WS=12292518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,90:0.69:131
chr6	12294137	rs1800543	T	C	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=256;ReadPosRankSum=-1.730;SC=GACTATTAATTACACTAATAT;SOR=0.892;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=13;WE=12294145;WS=12294127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,12:0.30:40
chr6	12294258	rs5369	A	G	5369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=52;PP=2965;SC=CAGACCGTGAAAATAGATGCC;SOR=1.667;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=103;TCR=52;TR=155;WE=12294266;WS=12294248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr6	12296150	rs6413477	A	AT	1097.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.675;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.927;NF=36;NR=2;PP=920;ReadPosRankSum=-2.268;SC=CCAAAGGGTGATTTTTTTAAA;SOR=2.107;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=63;TCF=56;TCR=7;TR=38;WE=12296158;WS=12296140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,45:0.71:63
chr6	12296255	rs5370	G	T	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.876;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=24;PP=972;ReadPosRankSum=-1.667;SC=TGAAAGGCAAGCCCTCCAGAG;SOR=0.845;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=190;TCF=107;TCR=83;TR=59;WE=12296263;WS=12296245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,64:0.32:197
chr6	13206385	rs114091869	G	A	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=331;ReadPosRankSum=1.439;SC=GTGGGCACCAGGAGGGAGGAC;SOR=0.679;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=22;WE=13206393;WS=13206375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,24:0.42:57
chr6	13278648	rs3817735	A	G	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=242;ReadPosRankSum=1.470;SC=CAGTGGCCTCACCGCTGCCTG;SOR=0.622;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=11;WE=13278656;WS=13278638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr6	13286517	rs617580	A	G	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=335;ReadPosRankSum=0.014;SC=ATCTCCAAATAAAGCTCTCCC;SOR=0.356;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=16;WE=13286525;WS=13286507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr6	13288535	rs202040	C	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.955;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=276;ReadPosRankSum=-0.863;SC=GGGAGCGTGACTGTGGGTGTG;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=15;WE=13288543;WS=13288525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr6	13288648	rs202038	A	G	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=6.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.73;ReadPosRankSum=-0.671;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,31:0.27:114
chr6	13288850	rs3734878	C	T	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=46;ReadPosRankSum=0.047;SC=GATGCACACCCGTCAACGAGG;SOR=0.117;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=5;WE=13288858;WS=13288840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr6	13294866	rs6910418	G	A	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=108;ReadPosRankSum=-0.045;SC=CTGACGTGTCGTGGCTTTCCC;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=7;WE=13294874;WS=13294856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr6	13295502	rs4602719	T	C	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.032;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=787;ReadPosRankSum=0.647;SC=TTAAGATGCATCTACCCTGAG;SOR=0.630;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=76;TCF=35;TCR=41;TR=21;WE=13295523;WS=13295492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,23:0.29:78
chr6	13295515	rs1550526	A	C	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-4.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.940;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=787;ReadPosRankSum=-1.520;SC=ACCCTGAGCCAGAATTCCAGA;SOR=0.462;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=23;WE=13295523;WS=13295492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,25:0.38:66
chr6	13295536	rs454563	C	T	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=347;ReadPosRankSum=0.147;SC=ACTGGTTCCCCTCCTCATCCA;SOR=0.603;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=61;TCF=19;TCR=42;TR=23;WE=13295544;WS=13295526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,24:0.39:62
chr6	13308083	rs2439538	T	C	1238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=34;PP=1040;SC=CAAGGAAGTATTAGAAAACAA;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=13308091;WS=13308073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	13316658	rs860266	T	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=182;ReadPosRankSum=1.835;SC=TTAGATTATATGGACTTTTAC;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=10;WE=13316666;WS=13316653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
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chr6	13325279	rs2439553	C	T	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.462;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=3;PP=760;ReadPosRankSum=-0.748;SC=ATGATCCCTTCATTCAATATT;SOR=1.911;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=83;TCF=69;TCR=14;TR=34;WE=13325287;WS=13325269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,34:0.40:84
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chr6	13801615	rs3180196	T	C	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.017;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=519;ReadPosRankSum=1.174;SC=TGCTGAAAAGTGATTTCCTAG;SOR=1.238;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=28;WE=13801623;WS=13801605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
chr6	13814340	rs1204145	T	C	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.623;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=349;ReadPosRankSum=-1.566;SC=CTCCACGCGCTGCTGCGCCCG;SOR=0.124;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=21;WE=13814348;WS=13814330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr6	13814461	rs371767736	T	C	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.794;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=170;ReadPosRankSum=0.404;SC=GGAGCAGCGGTGAGGCACGTG;SOR=0.269;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=14;WE=13814469;WS=13814451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr6	14118034	rs111804875	G	A	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.351;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=0;PP=766;ReadPosRankSum=-0.292;SC=GCGGCGCAGCGCTCCAGCCAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=32;WE=14118042;WS=14118024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,34:0.71:48
chr6	14131969	rs45500695	G	A	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.324;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=35;PP=838;ReadPosRankSum=-1.291;SC=AGGTGATCTTGAGAGTGACAG;SOR=0.925;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=155;TCF=48;TCR=107;TR=48;WE=14131977;WS=14131959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,51:0.31:162
chr6	15373652	rs11757092	T	A	2916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.502;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=18;PP=2318;ReadPosRankSum=0.079;SC=CTTGTATTCGTTCTGGAGCAA;SOR=0.333;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=156;TCF=134;TCR=22;TR=102;WE=15373660;WS=15373642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,104:0.65:160
chr6	15374508	rs9383050	A	G	2158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=55;PP=1768;SC=GGAATATCTCATTGGAATGTA;SOR=2.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=13;TCR=55;TR=68;WE=15374516;WS=15374498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
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chr6	15374544	rs2072820	C	T	1339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=37;PP=1267;SC=TGGACTTGTTCCTGAATTGGA;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=39;WE=15374552;WS=15374523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	15468722	rs147212247	AGGGTGAG	A	193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=285;ReadPosRankSum=1.506;SC=CCTTCTGGAAAGGGTGAGGGT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=6;WE=15468736;WS=15468712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
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chr6	15496662	rs742099	C	T	3500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.806;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=92;PP=2799;ReadPosRankSum=-0.772;SC=CCACTGGGCCCGCCGTCAATG;SOR=1.317;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=187;TCF=61;TCR=126;TR=130;WE=15496670;WS=15496652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,131:0.70:188
chr6	15497422	rs9349979	A	G	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=454;ReadPosRankSum=-0.247;SC=GCGGGGGGTCAGGGGGTGGTG;SOR=0.599;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=74;TCF=2;TCR=72;TR=23;WE=15497430;WS=15497412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,23:0.30:76
chr6	15500999	rs13192234	G	A	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=418;ReadPosRankSum=-0.847;SC=CCGGGAGTCTGCTGTTCACCA;SOR=1.697;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=18;WE=15501007;WS=15500989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr6	15504589	rs760659	T	C	1657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=1;PP=1445;SC=CTTCCTTCTCTGCCTGTCATT;SOR=6.399;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=49;WE=15504597;WS=15504579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	15511409	rs35360051	C	T	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=46;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=249;ReadPosRankSum=0.420;SC=CCATCCCTGCCGGCGTGGAGC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=12;WE=15511417;WS=15511399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr6	15511429	rs55742636	C	CCCAT	1211.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=3;PP=1548;SC=CAGAGCCTCTCGTGTGCTCGG;SOR=4.255;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=15511437;WS=15511419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr6	15513744	rs9396589	G	T	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=157;ReadPosRankSum=0.800;SC=GGCGCTCTCTGCCCAGGAGAC;SOR=0.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=12;WE=15513752;WS=15513734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,13:0.27:49
chr6	15520920	rs112303618	G	GCA	812.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.412;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=2.047;NF=20;NR=6;PP=1067;ReadPosRankSum=-0.277;SC=AGACACACGCGCACACACACA;SOR=1.194;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=26;WE=15520928;WS=15520910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr6	15533951	rs4236167	C	T	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.304;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=783;ReadPosRankSum=0.403;SC=CTTCTCAGGTCGTCCTTCTAC;SOR=0.990;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=135;TCF=53;TCR=82;TR=48;WE=15533959;WS=15533941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,47:0.34:138
chr6	15586009	rs6926401	G	T	3893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=86;PP=2898;SC=GAGACCTGAAGGAGTGAACAG;SOR=1.907;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=35;TCR=86;TR=121;WE=15586017;WS=15585999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr6	15586132	rs12524251	A	G	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=238;ReadPosRankSum=0.615;SC=AGGTTTTTCCAAAGAAATTGT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=11;WE=15586140;WS=15586122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr6	15593240	rs7758659	T	C	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=5;PP=971;SC=GAACATCTGATACCAATGAAC;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=15593248;WS=15593230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	15595267	rs73371556	G	A	2500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=8.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.900;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=1;PP=2025;ReadPosRankSum=0.931;SC=CCCTGCAACCGTCTGTCTGCT;SOR=1.857;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=121;TCF=119;TCR=2;TR=84;WE=15595275;WS=15595257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,86:0.70:123
chr6	15615637	rs3829893	G	A	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.928;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=38;PP=973;ReadPosRankSum=-0.800;SC=TGAGCTGAAAGTATATAAAAA;SOR=0.288;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=90;TCF=22;TCR=68;TR=53;WE=15615645;WS=15615627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,51:0.57:89
chr6	15627553	rs16876738	C	G	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.406;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=742;ReadPosRankSum=-0.578;SC=AAGTAATGTACAATGAAAACA;SOR=0.229;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=34;WE=15627561;WS=15627543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,33:0.75:44
chr6	15627771	rs12525702	C	T	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.084;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=486;ReadPosRankSum=1.705;SC=GTACAGTTAACGTAATGAGAT;SOR=0.203;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=23;WE=15627779;WS=15627761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,25:0.71:35
chr6	15660871	rs909706	T	C	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=123;ReadPosRankSum=-0.210;SC=GGGTTCTAACTAGATCCCTTT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=15660879;WS=15660861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr6	16145325	rs9370867	A	G	4959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=81;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.815;SC=GTTTCAAGAAACAACCAGAGC;SOR=0.352;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=144;TCF=63;TCR=81;TR=143;WE=16145333;WS=16145315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,152:0.99:153
chr6	16147098	rs35112615	T	TA	94.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=76;SC=CATGCGATGTTAAAAAAAAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=16147106;WS=16147088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	16326587	rs78115249	G	A	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-6.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.498;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=470;ReadPosRankSum=0.225;SC=GCATCACGGTGTGGTGTCCCA;SOR=0.070;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=90;TCF=84;TCR=6;TR=30;WE=16326595;WS=16326577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,30:0.33:91
chr6	16327615	rs179990	A	G	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.825;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=22;PP=726;ReadPosRankSum=0.031;SC=GGCTGCTCTCAGCTTTCTTGG;SOR=1.077;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=174;TCF=91;TCR=83;TR=52;WE=16327623;WS=16327605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,53:0.29:181
chr6	16327864	.	G	GTGC	246.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.735;ClippingRankSum=0.000;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=4.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQRankSum=0.000;QD=6.85;ReadPosRankSum=-1.938;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,10:0.28:36
chr6	16753373	.	CAACA	C	403.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.75;ReadPosRankSum=0.057;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr6	16753374	.	AAC	A	790	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=8;NR=1;PP=790;QD=90.7777777778;SC=TTCAACAGCCAACAAAGTAAG;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=9;WE=16753386;WS=16753364;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr6	16753377	.	AA	GG	763	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=8;NR=1;PP=763;QD=90.7186527625;SC=AACAGCCAACAAAGTAAGGGA;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=9;WE=16753386;WS=16753364;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr6	16753378	.	A	AGG	403.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.066;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.43;ReadPosRankSum=0.725;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr6	17282415	rs1108512	G	C	2166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=6;PP=1792;SC=TGGGGCTGTTGCCCTTGTGTC;SOR=4.014;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=56;TCR=6;TR=62;WE=17282423;WS=17282405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr6	17284760	rs3763175	A	G	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.128;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=173;ReadPosRankSum=0.769;SC=ATACATACATATAGTTTCTTT;SOR=0.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=7;WE=17284768;WS=17284750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr6	17290459	rs11403725	G	GT	285.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=393;ReadPosRankSum=-0.028;SC=GCTGTTTTCTGTTTTGAGTTC;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=13;WE=17290467;WS=17290449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr6	17493561	rs202007605	A	AAGATATGATAGAGATG	1386.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.827;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=2897;ReadPosRankSum=0.706;SC=TCAATTTGTTAAGATATGATA;SOR=3.207;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=48;TCR=4;TR=13;WE=17493569;WS=17493551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr6	17493690	rs751502	C	G	5696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=96;PP=2965;SC=ACAGACTGTACCCATAATGGA;SOR=0.847;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=176;TCF=80;TCR=96;TR=176;WE=17493698;WS=17493680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr6	17513954	rs4716146	T	C	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=326;SC=GGTGCCTGGGTTGCAAGGACG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=17513962;WS=17513951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	17541484	rs4716155	G	T	2237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.94;QD=43.03;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	17541490	rs4716156	G	A	2159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.94;QD=45.95;SOR=3.306;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr6	17543036	rs2296249	A	G	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=366;SC=ATATATGCTGATGTTTAATAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=17543044;WS=17543026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	17543302	rs9256	A	G	3092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=56;PP=2493;SC=ACAACTGTAAAAAACTCGGCC;SOR=1.099;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=40;TCR=56;TR=96;WE=17543310;WS=17543292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr6	17606413	rs1969830	C	T	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=17;PP=392;SC=TTTTACAGTACACATTTTCAA;SOR=2.985;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=17606421;WS=17606403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr6	17628841	rs11422297	T	TA	171.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=-1.472;SC=CGACAACTTGTAAAAAAAAAA;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=7;WE=17628849;WS=17628831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr6	17629616	rs942467	G	A	4400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=64;PP=2965;SC=ACCCAGAATCGGATGACACAC;SOR=0.783;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=132;TCF=67;TCR=65;TR=131;WE=17629624;WS=17629606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr6	17633061	rs2274136	C	T	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.44;ReadPosRankSum=-0.641;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr6	17669262	rs201122253	GA	G	264.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.63;ReadPosRankSum=2.044;SOR=0.667;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr6	17669474	rs113930368	T	A	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.098;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.917;NF=19;NR=1;PP=447;ReadPosRankSum=-0.775;SC=CACACCCGGCTAATTTTTGTA;SOR=3.611;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=20;WE=17669482;WS=17669464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr6	17764279	rs1044654	A	C	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.783;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=181;ReadPosRankSum=-0.345;SC=CAACTGGATGAATCTTTCCTA;SOR=1.524;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=10;WE=17764287;WS=17764269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr6	17764530	rs9371018	C	T	1725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=30;PP=1332;ReadPosRankSum=0.852;SC=AATCTTTTCCCTCTGACACTC;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=60;TCR=56;TR=62;WE=17764538;WS=17764520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,64:0.54:118
chr6	17764755	rs2296197	T	C	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=2.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.31;ReadPosRankSum=-0.778;SOR=0.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,39:0.26:152
chr6	17777614	rs11396690	C	CT	464.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=14.514;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=1.184;QD=6.11;ReadPosRankSum=-0.873;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,29:0.38:76
chr6	17779474	.	ATATATATATATATATTTTTTTTTTTTTTTT	A	236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.37;QD=39.46;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	17779731	rs9477524	G	A	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.711;NF=11;NR=0;PP=222;ReadPosRankSum=0.694;SC=TCGAACTCCCGACCTCAGGTG;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=11;WE=17779739;WS=17779721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr6	17779973	rs9477525	A	T	88.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.16;MQRankSum=-0.524;QD=17.78;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr6	17781450	rs942376	G	A	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.837;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=206;ReadPosRankSum=0.311;SC=AGAAAAACTGGCTGCCATGCT;SOR=1.336;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=15;WE=17781458;WS=17781440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,15:0.24:63
chr6	17785948	rs4716186	A	G	924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=31;PP=865;SC=AATAGATTTCAGCCTGGGCAA;SOR=4.479;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=17785956;WS=17785938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	17794494	rs3734234	G	A	1387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.157;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=23;PP=954;ReadPosRankSum=-1.823;SC=TAACTGTCCAGCCCTCTTTGG;SOR=0.557;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=69;TCF=37;TCR=32;TR=48;WE=17794502;WS=17794484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,54:0.72:75
chr6	17794774	rs200502612	T	TA	546.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=1.732;QD=3.85;ReadPosRankSum=-1.330;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,36:0.25:142
chr6	17799766	rs6459573	T	C	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=22;PP=572;SC=TGAAACAAATTGGTCATCCAT;SOR=4.255;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=17799774;WS=17799756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	17805639	.	T	TGTGTG	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.127;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=-1.807;QD=2.62;ReadPosRankSum=-0.552;SOR=0.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr6	17809199	rs6913612	G	A	1752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=31;PP=1360;SC=AAAATCTAAAGGAAAACTGCA;SOR=1.047;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=23;TCR=31;TR=54;WE=17809207;WS=17809189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	17815716	rs6920106	C	T	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=328;ReadPosRankSum=-0.146;SC=AGGTAATGGGCGCCTTCTCAG;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=16;WE=17815724;WS=17815706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr6	17817235	rs9383327	C	G	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=2;PP=537;SC=TGGGCTGCCCCCGCTGCAGTT;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=17817243;WS=17817225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	17817519	rs41267720	C	T	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.062;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=416;ReadPosRankSum=0.422;SC=AACAAGCATTCATGCCAGGCA;SOR=0.299;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=24;WE=17817527;WS=17817509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr6	17821964	rs13211637	CA	TG	1562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.719;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=1458;ReadPosRankSum=-0.904;SC=CAATCAGCAGCACTGCTAAAA;SOR=1.231;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=124;TCF=72;TCR=52;TR=36;WE=17821973;WS=17821954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,44:0.32:139
chr6	17825888	rs7771879	T	C	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=159;ReadPosRankSum=0.202;SC=AGCAGTTTTATGTGTTTAAAA;SOR=0.188;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=10;WE=17825896;WS=17825878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr6	17834198	rs4716189	T	G	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=3.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.63;ReadPosRankSum=0.256;SOR=1.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,33:0.26:127
chr6	17834213	rs4716190	T	C	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.96;ReadPosRankSum=-1.188;SOR=0.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,35:0.27:132
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chr6	17834346	rs4716193	A	G	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=7.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.00;ReadPosRankSum=-0.061;SOR=1.511;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,30:0.26:115
chr6	17855864	rs624105	G	C	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.102;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=32;PP=947;ReadPosRankSum=0.149;SC=GAACAGCAAGGAAAAAGAAGA;SOR=1.086;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=43;WE=17855872;WS=17855854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,41:0.52:79
chr6	17882140	rs7757737	A	T	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=0.015;SC=GGCATGAGAAATGCTTGAACC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=17882148;WS=17882130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr6	18122506	rs10949483	G	A	2195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.021;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=49;PP=1827;ReadPosRankSum=-0.771;SC=GAGGGCTCCGGGGGCGCTGGG;SOR=2.262;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=65;TCF=16;TCR=49;TR=64;WE=18122514;WS=18122496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,67:0.99:68
chr6	18134008	rs113956700	G	GA	781.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=1.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.05;MQRankSum=1.541;QD=15.33;ReadPosRankSum=-0.135;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,42:0.82:51
chr6	18134021	rs2842949	C	A	2251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.33;QD=38.82;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr6	18139214	rs2842934	G	A	1587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=25;PP=1263;SC=CACCTGGATTGATGGCAACTA;SOR=0.733;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=22;TCR=25;TR=47;WE=18139222;WS=18139204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	18139964	rs375276814	GA	G	751.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.36;QD=31.32;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	18139973	rs56245893	A	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=3.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.13;MQRankSum=-1.152;QD=6.68;ReadPosRankSum=0.225;SOR=0.591;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr6	18148019	rs4449636	G	A	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=424;SC=CATCATTAAGGCAAGATAATT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=18148027;WS=18148009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	18148247	rs12529220	T	A	965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=24;PP=723;SC=TAATAAGCAGTTACTATTAAT;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=18148255;WS=18148237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	18149526	rs3930696	C	T	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=19;PP=625;SC=TTTTTTATTTCTGGTTTTATT;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=18149534;WS=18149516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	18166802	rs912528	T	G	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=253;SC=TAGGCTGGGTTTGGTGGCTCA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=18166810;WS=18166792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	18171477	rs1011620	G	A	2448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=8;PP=1913;SC=ATGCAAGGAGGAGAAAAAATA;SOR=4.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=62;TCR=8;TR=70;WE=18171485;WS=18171467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr6	18187916	rs372534	C	T	1295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=0;PP=1099;SC=AAAAGCATAGCGGGTTAAGGA;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=18187924;WS=18187906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	18201961	rs214612	T	C	1239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=43;PP=1033;SC=GCAGTGGCATTGTTCATTTGC;SOR=6.184;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=44;WE=18201969;WS=18201951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	18215303	rs214585	T	C	3531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=95;PP=2705;SC=GGACCCTGGATGACAAACAGG;SOR=2.603;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=25;TCR=95;TR=120;WE=18215311;WS=18215293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr6	18222100	rs3734242	C	T	1779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.273;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=16;PP=1358;ReadPosRankSum=-1.646;SC=ATCAACTCAACTCTATGCATG;SOR=0.261;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=181;TCF=151;TCR=30;TR=74;WE=18222108;WS=18222090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,75:0.41:185
chr6	18226386	.	G	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.282;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=88;ReadPosRankSum=0.494;SC=AGTCAAACTTGAAAGACTGAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=5;WE=18226394;WS=18226376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr6	18237661	rs1013062	C	T	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.819;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=1;PP=499;ReadPosRankSum=-1.539;SC=TATCTGCTTTCTTAACATTGG;SOR=2.083;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=93;TCF=82;TCR=11;TR=27;WE=18237669;WS=18237651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,27:0.29:92
chr6	18256224	rs58144742	CT	C	95.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=-1.006;QD=5.32;ReadPosRankSum=0.758;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr6	18258085	rs7743778	A	G	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=5;PP=737;ReadPosRankSum=0.140;SC=GCTCAGTCATAAAGTGTGGAA;SOR=0.593;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=31;WE=18258093;WS=18258075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,31:0.76:41
chr6	18264210	rs11544757	G	A	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=599;ReadPosRankSum=-0.580;SC=CAGGGGCCGAGGCGGACATGC;SOR=0.725;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=85;TCF=35;TCR=50;TR=30;WE=18264218;WS=18264200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,32:0.36:89
chr6	18264658	rs9383352	G	A	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=146;ReadPosRankSum=0.229;SC=GAGGGCACGAGGAGGTTCTGG;SOR=0.836;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=8;WE=18264666;WS=18264648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr6	18368880	rs11757266	G	A	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.092;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=403;ReadPosRankSum=0.094;SC=GCCATGCTGCGGGAGACCCCG;SOR=1.697;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=19;WE=18368888;WS=18368870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr6	18387692	rs9396858	A	G	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=261;ReadPosRankSum=0.443;SC=CTGGGAGCGCAAGTCCTGTTG;SOR=0.638;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=16;WE=18387700;WS=18387682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr6	18387953	rs9371052	A	C	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.543;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=389;ReadPosRankSum=-1.724;SC=ACTCACTGTGACACCACAATT;SOR=1.536;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=64;TCF=15;TCR=49;TR=19;WE=18387961;WS=18387943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,20:0.31:65
chr6	18399750	rs2296198	T	C	2849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=25;PP=2160;SC=GACTGAAGAATGCTGAAGACA;SOR=2.110;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=68;TCR=26;TR=93;WE=18399758;WS=18399740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
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chr6	20599628	rs9366357	C	T	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.824;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=547;ReadPosRankSum=-1.924;SC=ACGTTTGCTTCGTCTTCAAAG;SOR=0.566;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=90;TCF=62;TCR=28;TR=30;WE=20599636;WS=20599618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,37:0.37:99
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chr6	20758808	rs34291318	GT	G	235.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=4.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=1.415;QD=4.29;ReadPosRankSum=-0.501;SOR=0.290;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,19:0.35:55
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chr6	21198083	rs3793090	G	A	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=602;ReadPosRankSum=2.102;SC=ATTTGAATCCGTGATTTGAAC;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=27;WE=21198091;WS=21198073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,27:0.75:36
chr6	21201493	rs9465994	G	A	2692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=58;PP=2254;SC=GAGAAGTCTCGGGTTTGACAA;SOR=1.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=24;TCR=58;TR=82;WE=21201501;WS=21201483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr6	21231034	rs12200511	C	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=56;ReadPosRankSum=0.681;SC=ACAGGGCTTTCTCTGCATCTA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=5;WE=21231042;WS=21231024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr6	22136879	rs6921113	G	T	3569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=79;PP=2736;ReadPosRankSum=-2.247;SC=CTTCATCTCTGTGGGTTTCAG;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=80;TCR=124;TR=131;WE=22136887;WS=22136869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,138:0.66:209
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chr6	22292976	rs1205955	A	T	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=43;PP=1221;SC=GTGTAATTTTAAAAAATTAGA;SOR=4.450;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=3;TCR=43;TR=46;WE=22292984;WS=22292966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	22570189	rs6922960	T	C	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=26;PP=715;ReadPosRankSum=2.393;SC=CGGCGACGAATTGGGGAAGCC;SOR=0.443;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=30;WE=22570197;WS=22570179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,31:0.67:46
chr6	22570245	rs6900627	G	A	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.851;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=298;ReadPosRankSum=0.274;SC=CGCTGAAGAGGAGCGCGGGGG;SOR=1.609;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=15;WE=22570253;WS=22570235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr6	24146672	rs3829810	G	A	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=350;ReadPosRankSum=0.318;SC=TTTTTAGACTGTATCTTGACA;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=16;WE=24146680;WS=24146662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
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chr6	24291203	rs2274305	T	C	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=0.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.78;ReadPosRankSum=-0.941;SOR=0.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,48:0.26:185
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chr6	24448554	rs140486588	TCCCAGTGCTTTGGGAGGCCCAAGTGGGAACATTGCTTGAGG	T	158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.35;ReadPosRankSum=0.480;SOR=0.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
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chr6	24467060	rs35276216	GA	G	515.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=4.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=1.694;QD=5.93;ReadPosRankSum=0.332;SOR=1.110;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,23:0.26:87
chr6	24467633	rs2793445	C	T	1308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=30;PP=921;SC=TTACATGCACCAGTTATTTAA;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=36;WE=24467641;WS=24467623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
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chr6	24476553	rs760904	G	A	3172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=73;PP=2363;SC=AAAAGTTGGAGAGTCTCAATC;SOR=2.101;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=25;TCR=73;TR=98;WE=24476561;WS=24476543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr6	24480025	rs5874986	CAT	C	306.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.281;NF=9;NR=0;PP=316;ReadPosRankSum=1.014;SC=ATTGTACACACATATATATAT;SOR=0.404;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=9;WE=24480034;WS=24480015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr6	24489652	rs1126617	C	T	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.147;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=27;PP=799;ReadPosRankSum=0.944;SC=CCTATTTCTACGTGTGTTGAA;SOR=0.509;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=141;TCF=75;TCR=66;TR=51;WE=24489660;WS=24489642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,54:0.36:150
chr6	24489741	rs2076316	A	C	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.787;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=393;ReadPosRankSum=2.544;SC=AGCAGACATGATCTCATTGCC;SOR=0.350;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=69;TCF=12;TCR=57;TR=22;WE=24489749;WS=24489731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,23:0.31:74
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chr6	24505030	rs2744583	A	G	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.006;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=114;ReadPosRankSum=-1.242;SC=ACTTCCCAACATGCCTTCCTT;SOR=0.048;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=11;WE=24505038;WS=24505020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
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chr6	24651320	rs3181245	C	G	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=242;ReadPosRankSum=-0.417;SC=AGAATACTCTCTAAGATACAC;SOR=0.324;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=14;WE=24651328;WS=24651310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
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chr6	24806739	rs5875006	C	CTT	2926.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=52;PP=2810;ReadPosRankSum=0.714;SC=CCAATTCAAACAACGTTTTTA;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=57;TCF=1;TCR=56;TR=53;WE=24806760;WS=24806729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,67:0.99:68
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chr6	24806777	rs9379689	T	A	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=34;PP=937;ReadPosRankSum=-1.210;SC=CATAGTGCCATTTGTTTAGGG;SOR=4.712;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=35;WE=24806785;WS=24806767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr6	24809771	rs9379692	A	G	1275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=0;PP=1167;SC=GGGGTGAGATAGACACTGATC;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=39;WE=24809779;WS=24809761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
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chr6	24809881	rs9358801	T	A	6330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=142;NR=46;PP=2965;SC=AACATCTAAATGGGAACATCC;SOR=2.352;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=189;TCF=143;TCR=46;TR=188;WE=24809889;WS=24809871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr6	24809936	rs9379693	A	T	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FS=1.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.51;ReadPosRankSum=0.032;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:173,67:0.28:240
chr6	24825511	rs9358804	A	G	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=2;PP=810;SC=TCACAGCCTCACTAACTTCGT;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=35;WE=24825519;WS=24825501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	24828318	rs35374726	C	T	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=354;ReadPosRankSum=-1.374;SC=GCAGAGATAACGCCAAATTGA;SOR=1.519;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=16;WE=24828326;WS=24828308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr6	24828490	rs9461073	C	T	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.338;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.512;NF=34;NR=20;PP=905;ReadPosRankSum=1.051;SC=AGGCTCAGCCCGGTCCAGAAT;SOR=1.299;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=142;TCF=75;TCR=67;TR=54;WE=24828498;WS=24828480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,52:0.36:144
chr6	24828560	rs45437991	A	G	2664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.175;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.723;NF=22;NR=49;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.469;SC=AGCTTTAGATAGATGACCATT;SOR=0.111;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=110;TCF=26;TCR=84;TR=71;WE=24828577;WS=24828550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,74:0.64:116
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chr6	24848086	rs3813680	A	G	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=106;ReadPosRankSum=0.377;SC=ACATGTTACCATCACAGCAAT;SOR=0.416;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=8;WE=24848094;WS=24848076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr6	24850715	rs7761191	A	G	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=424;ReadPosRankSum=0.208;SC=CTTGTGCAGAAAAGTCTGTGG;SOR=1.532;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=19;WE=24850723;WS=24850705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr6	25084691	rs303007	C	T	3079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=78;NR=14;PP=2404;SC=CTCCCAAACCCACAGGATATT;SOR=3.407;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=78;TCR=14;TR=92;WE=25084699;WS=25084681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr6	25084718	rs303006	A	G	3221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=31;PP=2548;SC=TTGCAAAATCACAGGCCCATT;SOR=2.121;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=80;TCR=31;TR=111;WE=25084726;WS=25084708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr6	25086968	rs895673	G	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=80;ReadPosRankSum=-0.233;SC=TATCCACAGCGTCCTCAGCAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=6;WE=25086976;WS=25086958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr6	25092031	rs9654585	T	A	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=2;PP=842;ReadPosRankSum=1.648;SC=TCTAAAATTATAAGTTTATTT;SOR=1.092;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=54;TCF=51;TCR=3;TR=36;WE=25092039;WS=25092021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,39:0.68:57
chr6	25097450	rs392852	T	C	1676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=44;PP=1321;SC=AAAGCATTCCTATGTAAGAAA;SOR=7.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=44;WE=25097458;WS=25097440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	25106745	rs2295737	A	G	2113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=61;PP=1730;ReadPosRankSum=0.715;SC=GATTTAGATTAGAGTCTCCTC;SOR=0.620;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=14;TCR=93;TR=70;WE=25106753;WS=25106735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,73:0.66:111
chr6	25106783	rs1923195	G	A	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=45;PP=1082;ReadPosRankSum=-0.879;SC=AAAAACACATGTTCTAGCAGA;SOR=0.761;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=4;TCR=65;TR=48;WE=25106791;WS=25106773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,49:0.69:71
chr6	25108989	rs3215685	AC	A	2630.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.504;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=52;PP=2962;ReadPosRankSum=1.862;SC=AATCTTGAACACCCATAGTTT;SOR=0.343;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=80;TCF=0;TCR=80;TR=52;WE=25108999;WS=25108979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,66:0.73:90
chr6	25108991	rs79916468	C	T	2638.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.493;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=53;PP=2962;ReadPosRankSum=1.964;SC=TCTTGAACACCCATAGTTTGA;SOR=0.352;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=79;TCF=2;TCR=77;TR=54;WE=25108999;WS=25108979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,67:0.74:91
chr6	25110097	rs302990	T	C	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=133;ReadPosRankSum=-0.115;SC=TGACCCATTTTTTCCTTAATC;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=8;WE=25110105;WS=25110087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr6	25115176	rs57247838	CGTTTTT	C	487.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.820;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=412;ReadPosRankSum=-1.046;SC=ATCTTGGTCACGTTTTTGTTT;SOR=0.229;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=11;WE=25115189;WS=25115166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,15:0.30:50
chr6	25115296	rs2273671	G	T	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.309;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=30;PP=844;ReadPosRankSum=0.638;SC=AGTTCTAAAAGCAAAAGTCCG;SOR=1.106;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=54;TCF=11;TCR=43;TR=38;WE=25115304;WS=25115286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,39:0.67:58
chr6	25115397	rs302982	G	A	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=38;ReadPosRankSum=0.798;SC=ACTGAAATAGGAATGCATGGT;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=25115405;WS=25115387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr6	25279208	.	A	T	76	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=76;QD=55.3856062736;SC=GGACAAGGAAATGGAAAGCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=2;WE=25279227;WS=25279198;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,2:0.22:9
chr6	25279219	rs73732922	G	A	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=-0.812;SC=TGGAAAGCCCGGCTCACCCGG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=3;WE=25279227;WS=25279198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr6	25280119	rs6914799	C	A	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.63;ReadPosRankSum=0.619;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,12:0.29:41
chr6	25420344	rs913455	C	G	3725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=30;PP=2886;SC=TCTTACAGGTCCTTACATCAT;SOR=2.066;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=78;TCR=30;TR=108;WE=25420352;WS=25420334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr6	25426640	.	ATT	A	2048.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=0.524;QD=25.29;ReadPosRankSum=0.520;SOR=2.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:9,72:0.89:81
chr6	25435654	rs34314506	AT	A	3917.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.106;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.059;NF=74;NR=26;PP=2971;ReadPosRankSum=0.372;SC=ATTTAAAATAATTAAAAACGG;SOR=0.340;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=167;TCF=127;TCR=40;TR=100;WE=25435662;WS=25435644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,124:0.66:187
chr6	25450026	rs9295661	C	A	174.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=0;PP=109;SC=TTGAAGTGACCCTCATCTTTG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=25450034;WS=25450016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	25450952	rs146339541	CTTCCTTCT	C	325.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.900;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.968;NF=0;NR=11;PP=767;ReadPosRankSum=-0.914;SC=AAGCTGCTTCCTTCCTTCTTT;SOR=0.100;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=11;WE=25450967;WS=25450942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr6	25452214	.	G	GCCC	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.92;MQRankSum=-0.431;QD=14.58;ReadPosRankSum=0.967;SOR=2.225;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr6	25452223	rs55733029	T	C	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.5340;FS=4.771;HP=17;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.431;NF=5;NR=0;PP=97;ReadPosRankSum=-0.431;SC=TGCCCCCCCCTCCCCCCCCCA;SOR=2.225;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=5;WE=25452231;WS=25452213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
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chr6	25492296	rs1034051	C	T	2973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=70;PP=2352;SC=GAAGTGTCTTCTTCTGAGAAA;SOR=2.808;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=18;TCR=70;TR=88;WE=25492304;WS=25492286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
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chr6	25510051	rs3915740	A	G	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.63;ReadPosRankSum=-0.994;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
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chr6	25510648	.	TA	CA,CG	235	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=15,5;NR=0,0;PP=235,41;QD=17.9847475031;SC=CATCCAACTATATGTCACCTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=15,5;WE=25510657;WS=25510638;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.88:17
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chr6	25511008	rs34965228	C	CAT	715.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.346;NF=0;NR=20;PP=846;ReadPosRankSum=1.904;SC=TTATGTTAAACTTTTTACTAA;SOR=0.479;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=20;WE=25511016;WS=25510998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,21:0.37:57
chr6	25516126	rs301379	C	T	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=73;ReadPosRankSum=1.003;SC=GAGCAGATTCCGAACAGCAAG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=6;WE=25516134;WS=25516116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr6	25516158	rs301378	G	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=40;ReadPosRankSum=1.559;SC=TGCTGGGCCCGAGGGGACCTG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=25516166;WS=25516148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr6	25527963	rs214053	T	C	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=333;ReadPosRankSum=0.358;SC=GAAAGGTACATTTTGTTCTGC;SOR=2.613;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=14;WE=25527971;WS=25527953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr6	25554180	rs214049	C	G	3243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=15;PP=2570;SC=AAGGGTGGATCATTTTCCCCT;SOR=3.306;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=77;TCR=15;TR=92;WE=25554188;WS=25554170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr6	25557149	rs57318254	T	TAA	1788.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=1.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.33;MQRankSum=0.896;QD=27.10;ReadPosRankSum=1.123;SOR=0.323;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,48:0.73:66
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chr6	25605091	rs1012899	G	A	2513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=52;PP=2061;SC=AGCTTTGAGCGGCGTAGAACG;SOR=1.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=24;TCR=52;TR=76;WE=25605099;WS=25605081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr6	25606181	rs2294345	G	A	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=483;SC=TAAAACATCCGTGATGAGAAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=25606189;WS=25606171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	25610203	rs11962024	A	T	2432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.565;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=14;PP=1895;ReadPosRankSum=-0.222;SC=ATTTTTATATATAGATTTACC;SOR=1.688;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=126;TCF=99;TCR=27;TR=83;WE=25610211;WS=25610193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,86:0.67:128
chr6	25652568	rs3215471	AG	A	2030.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.411;NF=50;NR=6;PP=2061;ReadPosRankSum=-0.904;SC=AATACGGTGAAGGAGTCCTTC;SOR=0.868;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=100;TCF=87;TCR=13;TR=56;WE=25652576;WS=25652558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,64:0.61:105
chr6	25653566	rs34327841	T	TA	494.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=494;ReadPosRankSum=0.831;SC=TGTCATGTGTTTTTTATATGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=16;WE=25653574;WS=25653556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr6	25653842	rs1406927	T	G	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=124;ReadPosRankSum=1.025;SC=ATTTAGGCAGTTTTTATAAAA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=25653850;WS=25653832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr6	25661887	rs2072847	A	T	2967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=87;PP=2503;ReadPosRankSum=-0.788;SC=CTTTACTGACAGTATTTTTCA;SOR=0.644;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=27;TCR=123;TR=106;WE=25661895;WS=25661877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,106:0.71:150
chr6	25665041	rs12213891	C	T	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=1;PP=857;SC=AACTGCAAACCGAGCTGTTCA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=25665049;WS=25665031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	25669636	rs2064127	A	T	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=0;PP=736;ReadPosRankSum=0.864;SC=TGGAATTTCCATTCAGTTAAG;SOR=2.191;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=29;WE=25669644;WS=25669626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,30:0.75:40
chr6	25669783	rs149172182	T	C	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.156;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=689;ReadPosRankSum=0.238;SC=TTATATCAGCTGCTGAGCTCC;SOR=1.041;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=142;TCF=76;TCR=66;TR=47;WE=25669791;WS=25669773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,48:0.33:145
chr6	25669833	rs2272825	T	C	2508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.686;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=52;PP=1889;ReadPosRankSum=0.070;SC=TTGTTTATCATTGGGAATTTG;SOR=0.830;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=132;TCF=52;TCR=80;TR=85;WE=25669841;WS=25669823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,90:0.65:138
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chr6	25689378	rs11327870	AT	A	2108.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.790;HP=13;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=60.03;MQRankSum=0.227;NF=26;NR=48;PP=1163;ReadPosRankSum=0.568;SC=CCTTACGTGGATTTTTTTTTT;SOR=0.477;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=106;TCF=38;TCR=68;TR=74;WE=25689399;WS=25689368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,94:0.98:96
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chr6	25769510	rs2328892	A	G	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=175;ReadPosRankSum=-0.259;SC=ACCACTAAGTATTTACTGAAC;SOR=0.162;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=12;WE=25769518;WS=25769500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,12:0.29:42
chr6	25770239	rs2328893	A	G	1805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.237;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=10;PP=1385;ReadPosRankSum=-0.790;SC=AGTCCTCACAATGAAAACTGT;SOR=1.128;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=67;TCR=14;TR=59;WE=25770247;WS=25770229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,62:0.72:86
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chr6	25778055	rs12201071	C	T	2608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=9;PP=2096;SC=GATATTAACCCTTTGTTTGCA;SOR=3.698;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=66;TCR=9;TR=75;WE=25778063;WS=25778045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr6	25778260	rs142909296	C	CTGATGAATATTCA	1147.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=2.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=1.499;QD=19.13;ReadPosRankSum=-0.866;SOR=1.236;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr6	25798932	rs1165215	G	A	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.648;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=177;ReadPosRankSum=-1.015;SC=ATTCCTTCTCGTCTGAGGAGT;SOR=0.323;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=53;TCF=44;TCR=9;TR=14;WE=25798940;WS=25798922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,14:0.26:53
chr6	25801057	rs1165210	T	C	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=4;PP=503;SC=TTTTCATATGTGTAATCTTTC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=25801065;WS=25801047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr6	25813150	rs1165196	G	A	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.908;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=23;PP=1232;ReadPosRankSum=0.016;SC=AAAACTACCAGTGGAAATAGC;SOR=0.841;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=192;TCF=121;TCR=71;TR=66;WE=25813158;WS=25813140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,66:0.33:199
chr6	25819532	rs45493498	C	T	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.467;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=235;ReadPosRankSum=0.442;SC=AAAATATTTTCTTTTCTCTCT;SOR=0.114;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=64;TCF=4;TCR=60;TR=16;WE=25819540;WS=25819522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,18:0.26:68
chr6	25849620	rs942379	A	G	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.842;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=13;PP=730;ReadPosRankSum=-1.391;SC=GAAGAAATCCACTGACAGTGG;SOR=0.421;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=125;TCF=97;TCR=28;TR=46;WE=25849628;WS=25849610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,48:0.38:128
chr6	25849779	rs1165189	A	C	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.211;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=36;PP=921;ReadPosRankSum=-1.495;SC=TCTATAACTCAATTATATTTC;SOR=0.416;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=112;TCF=16;TCR=96;TR=43;WE=25849787;WS=25849769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,44:0.38:116
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chr6	25914801	rs2071299	G	A	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.210;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=659;ReadPosRankSum=1.669;SC=CAATAAACTGGCCCAACCTGA;SOR=1.111;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=153;TCF=63;TCR=90;TR=45;WE=25914809;WS=25914791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,46:0.28:167
chr6	25914901	rs2071298	G	A	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=7.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.31;ReadPosRankSum=-0.263;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,11:0.17:64
chr6	25916979	rs1865760	C	T	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=20;PP=647;ReadPosRankSum=1.254;SC=TGATGGTGCACAACCAGAAAT;SOR=0.473;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=138;TCF=76;TCR=62;TR=42;WE=25916987;WS=25916969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,42:0.29:146
chr6	25918688	rs3752421	G	A	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=1;PP=525;ReadPosRankSum=-0.861;SC=AAATGGAGGCGTTAGGATTTA;SOR=1.001;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=93;TCF=88;TCR=5;TR=31;WE=25918696;WS=25918678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,32:0.33:96
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chr6	25925823	rs7770139	A	G	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=219;ReadPosRankSum=-0.535;SC=TTAATTTCTCACAGATGATTT;SOR=1.101;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=15;WE=25925831;WS=25925813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
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chr6	26094367	rs1572982	G	A	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.619;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=147;ReadPosRankSum=0.244;SC=AGGCAAGATGGTGCCTAGGTT;SOR=2.179;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=8;WE=26094375;WS=26094357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
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chr6	26104096	rs198853	T	C	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.435;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=1;PP=880;ReadPosRankSum=0.575;SC=CCGCGCCAACTCATGTTGTTT;SOR=3.912;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=48;TCF=46;TCR=2;TR=37;WE=26104104;WS=26104086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,34:0.77:44
chr6	26104187	.	C	T	2011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.672;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=32;PP=1414;ReadPosRankSum=-0.066;SC=TGTCTGGTCGCGGCAAAGGCG;SOR=0.389;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=117;TCF=71;TCR=46;TR=74;WE=26104195;WS=26104177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,79:0.65:122
chr6	26104448	rs198852	A	G	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=584;ReadPosRankSum=0.193;SC=TATATGCCCTAAAACGTCAGG;SOR=0.754;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=26;WE=26104456;WS=26104438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr6	26107790	rs198845	G	T	2381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.881;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=43;PP=1939;ReadPosRankSum=-0.330;SC=CTCTTCTGCTGTTGCTTACCC;SOR=0.469;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=107;TCF=49;TCR=58;TR=83;WE=26107798;WS=26107780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,83:0.77:108
chr6	26108282	rs198844	C	G	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.574;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=24;PP=610;ReadPosRankSum=1.884;SC=ATAGCGGCTACACCAGCACTG;SOR=1.329;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=29;WE=26108290;WS=26108272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr6	26123629	rs198821	T	C	1341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=1;PP=1005;ReadPosRankSum=0.334;SC=CCAGTTCCTATATTCTAATAC;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=54;TCR=1;TR=42;WE=26123637;WS=26123619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,46:0.78:59
chr6	26124243	rs198820	G	A	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.695;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=566;ReadPosRankSum=-0.633;SC=AAGACAAACTGCACAGTTGTC;SOR=0.283;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=24;WE=26124251;WS=26124233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr6	26124430	rs198819	C	T	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.155;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=8;PP=984;ReadPosRankSum=0.052;SC=GAGCTTAGGCCGCTGGTTTTG;SOR=0.994;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=71;TCF=57;TCR=14;TR=46;WE=26124438;WS=26124420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,49:0.64:76
chr6	26124634	rs4645	C	T	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=933;ReadPosRankSum=0.693;SC=TGTTAGAGTACCTGACCGCCG;SOR=0.780;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=85;TCF=42;TCR=43;TR=46;WE=26124642;WS=26124624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,46:0.55:84
chr6	26124989	.	T	G	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=525;ReadPosRankSum=-0.045;SC=TAAGTTAATTTTATGCCAACC;SOR=1.751;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=23;WE=26124997;WS=26124979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,23:0.70:33
chr6	26157403	rs112830226	A	C	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=165;ReadPosRankSum=0.156;SC=AAACGCTGCTAAGCAGGGGCG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=26157411;WS=26157393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
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chr6	26189312	rs79868973	C	G	1001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.641;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=30;PP=779;ReadPosRankSum=0.149;SC=CATCTTGAAACCACAGCTGTT;SOR=0.883;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=108;TCF=33;TCR=75;TR=42;WE=26189320;WS=26189302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,44:0.38:115
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chr6	26217728	rs1997768	A	G	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.27;ReadPosRankSum=-1.471;SOR=0.045;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,5:0.16:32
chr6	26225881	rs56119218	C	A	920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=33;PP=718;ReadPosRankSum=2.316;SC=CTTTGAGACGCATTAGACCAC;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=82;TCF=0;TCR=82;TR=33;WE=26225889;WS=26225871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,34:0.41:83
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chr6	26234883	rs2050950	A	G	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.883;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=387;ReadPosRankSum=-0.133;SC=TCTGCACCAGAGTACCTTTGC;SOR=0.863;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=90;TCF=50;TCR=40;TR=25;WE=26234891;WS=26234873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,25:0.26:97
chr6	26234952	rs2050948	A	G	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=4.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.62;ReadPosRankSum=-0.289;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,21:0.23:92
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chr6	26247198	rs41266821	A	G	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.788;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=207;ReadPosRankSum=-2.123;SC=CTTGCCCCGAACAGACATGAT;SOR=0.180;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=13;WE=26247206;WS=26247188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr6	26250254	rs11759720	C	G	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=181;ReadPosRankSum=-0.421;SC=ATGGCCAAGACACAAAAGCCT;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=9;WE=26250262;WS=26250244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr6	26271713	rs9393690	A	T	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=412;ReadPosRankSum=0.061;SC=TTTTCAAAAGACCCGCGCAAC;SOR=1.410;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=19;WE=26271721;WS=26271703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr6	26285503	rs41266829	C	T	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.457;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=24;PP=903;ReadPosRankSum=0.856;SC=GTTTGGCGTGCTCTGTGTAAG;SOR=0.956;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=204;TCF=110;TCR=94;TR=58;WE=26285511;WS=26285493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,62:0.30:210
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chr6	26285683	rs2393593	T	C	1473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FS=2.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.10;ReadPosRankSum=-1.097;SOR=0.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:214,75:0.26:289
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chr6	26365702	.	C	CTGTG	342.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=68.55;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	26373490	rs371734919	TGG	T	2347.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=89.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.60;MQRankSum=-4.954;QD=20.42;ReadPosRankSum=-0.731;SOR=7.926;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,70:0.61:115
chr6	26373495	rs377114514	A	T	2335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=81.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.82;MQRankSum=-5.457;QD=19.15;ReadPosRankSum=-4.372;SOR=7.447;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,68:0.56:122
chr6	26374549	rs11758089	T	C	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=220;ReadPosRankSum=-0.312;SC=CTTTCTTTCATTGTAGGTGGA;SOR=0.859;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=16;WE=26374557;WS=26374539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,18:0.35:52
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chr6	26393021	rs1614887	G	A	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.047;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.295;NF=31;NR=23;PP=984;ReadPosRankSum=0.360;SC=GGGACAGATCGCACATCTACA;SOR=0.987;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=153;TCF=80;TCR=73;TR=54;WE=26393029;WS=26393011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,52:0.34:154
chr6	26428842	rs1741740	A	G	2414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=16;PP=1996;SC=TTCTTCTGTTAAAGACATGAT;SOR=2.432;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=58;TCR=16;TR=74;WE=26428850;WS=26428832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr6	26463321	rs3734540	A	C	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=12;NR=2;PP=394;SC=TTTCTTCCTTACCCTCATCCT;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=26463329;WS=26463316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	26466225	rs1977198	A	C	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=26;PP=1211;SC=TTCCTTAACTACATGTACAAT;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=45;WE=26466233;WS=26466215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr6	26501471	rs3215660	AG	A	1397.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=8;PP=1239;SC=GAAGCTCCTGAGGGGACTCAC;SOR=2.531;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=33;WE=26501479;WS=26501461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
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chr6	26505362	rs3736781	G	A	4454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.225;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=64;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.700;SC=AGACACTTCTGCGAAAAATGT;SOR=0.402;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=133;TCF=68;TCR=65;TR=132;WE=26505370;WS=26505352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,144:0.99:145
chr6	26505403	rs3736782	C	A	4843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=89;PP=2965;SC=TCCTTCTTGGCCAGGAGAAGA;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=53;TCR=89;TR=142;WE=26505411;WS=26505393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr6	26509330	rs9393728	C	G	1671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=29;PP=1233;SC=TGGGGGAGGACTCTGCCCCTA;SOR=1.136;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=48;WE=26509338;WS=26509320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	26545308	rs1884946	C	G	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=553;SC=CGTTTACATTCGTCAGTCTTT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=26545316;WS=26545298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	26545632	rs4871	G	A	4442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=66;PP=2965;SC=GAAAGGATGGGAACAACCCTG;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=61;TCR=66;TR=127;WE=26545640;WS=26545622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr6	26597333	rs3800302	A	G	2478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.99;NF=50;NR=24;PP=2080;SC=GCAGCAAGAAACGGGTAGTGC;SOR=1.673;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=50;TCR=24;TR=74;WE=26597341;WS=26597323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr6	26598188	rs3800303	A	G	3412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.232;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=38;PP=2791;ReadPosRankSum=0.375;SC=CTGCCGGAGGAAAAAAGCGGT;SOR=1.117;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=104;TCF=65;TCR=39;TR=103;WE=26598196;WS=26598178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,105:0.99:106
chr6	26598526	.	G	A	2417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=0.000;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.148;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=25;PP=1869;ReadPosRankSum=0.328;SC=CCACCTCAGCGAGCACCTCGC;SOR=1.437;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=120;TCF=80;TCR=40;TR=84;WE=26598534;WS=26598516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,87:0.70:125
chr6	27216848	rs1234145	T	C	1188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=18;NR=20;PP=1081;SC=GCATCTCACCTCCCCACCCCC;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=38;WE=27216856;WS=27216838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	27220519	rs5030967	C	T	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.429;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=-0.360;SC=GGGACATAGGCCTCTGCACCC;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=27220527;WS=27220509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr6	27277051	rs41269255	C	T	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.410;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=439;ReadPosRankSum=-1.334;SC=GCAATGGGGGCCATAGTCTTT;SOR=0.989;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=82;TCF=42;TCR=40;TR=25;WE=27277059;WS=27277041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,25:0.31:81
chr6	27277402	rs6456773	C	T	2860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=36;PP=2150;SC=GCTGGAATGCCGCCAATGCCT;SOR=0.887;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=46;TCR=36;TR=82;WE=27277410;WS=27277392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr6	27279774	rs17688097	C	T	1544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.790;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=33;PP=1179;ReadPosRankSum=0.251;SC=CAGGTTTGGCCGCCTCCTCAC;SOR=0.621;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=207;TCF=107;TCR=100;TR=66;WE=27279782;WS=27279764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,69:0.32:213
chr6	27279852	rs2235233	T	C	4006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=92;PP=2861;ReadPosRankSum=-1.398;SC=GTGAAGGGGCTGAGGTGGCCG;SOR=0.720;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=229;TCF=95;TCR=134;TR=156;WE=27279860;WS=27279842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,164:0.69:238
chr6	27293049	rs17739298	C	G	1720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.768;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=39;PP=1411;ReadPosRankSum=0.282;SC=TCCTAAACAACAGGCTAATCA;SOR=0.544;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=219;TCF=91;TCR=128;TR=70;WE=27293057;WS=27293039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,72:0.31:230
chr6	27356527	rs13220817	T	C	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=2;PP=287;SC=GCTGATACGTTGCTCAGTCTC;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=27356535;WS=27356518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	27356867	rs4713091	A	G	9400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=168;NR=121;PP=2965;SC=GGGTGCTCTTAGAGGTTCTGG;SOR=1.073;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=289;TCF=168;TCR=121;TR=289;WE=27356875;WS=27356857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr6	27356902	rs10807020	A	G	10236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=152;NR=153;PP=2965;SC=GGTTCTTCGAAGGAAACGGGC;SOR=0.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=306;TCF=152;TCR=154;TR=305;WE=27356910;WS=27356892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr6	27356925	rs10807021	T	G	9062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.851;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=158;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.778;SC=AAGGGTCGCGTGTGGTTTGGC;SOR=0.838;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=271;TCF=113;TCR=158;TR=270;WE=27356933;WS=27356915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,283:1.00:284
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chr6	28268497	rs2281043	C	T	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.242;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=227;ReadPosRankSum=0.540;SC=TTTTTCTTTCCCAGAGAGTGT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=14;WE=28268505;WS=28268487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr6	28269663	rs1997660	A	G	2125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.797;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=41;PP=1626;ReadPosRankSum=0.114;SC=TGATTTCCGAATAGAAGAAAA;SOR=0.527;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=280;TCF=162;TCR=118;TR=91;WE=28269671;WS=28269653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,93:0.32:292
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chr6	32489980	rs112326475	G	C	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=32.53;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
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chr6	32546670	rs34981130	C	T	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=53.63;NF=18;NR=0;PP=487;SC=TGAGGCGCTGCCATCAATGCT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=32546678;WS=32546660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr6	32548188	rs113128041	A	G	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=122;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=10;PP=179;SC=AAGGAGCAGAAACAGACCATG;SOR=3.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=13;WE=32548196;WS=32548178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr6	32549443	.	G	A	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.12;QD=19.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	32549501	rs78466762	A	C	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=18.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
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chr6	32549611	rs1071752	T	C	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.00;QD=45.60;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	32549613	rs17882084	GG	CA	1310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.60;QD=45.20;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr6	32549631	rs72500538	C	T	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.87;QD=45.03;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr6	32549711	rs9269814	G	A	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=424;SC=CCAGGCTCTGGCCTTGACCAG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=32549719;WS=32549701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr6	32552172	rs9269961	C	G	601.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.70;QD=42.98;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	32552183	rs28986202	A	AC	403.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.17;QD=40.37;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	32552188	rs112353158	G	A	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.32;QD=51.60;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	32552237	rs9269966	A	G	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.00;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	32552240	rs28724111	G	A	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.00;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	32552251	rs9269968	G	A	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.00;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	32552253	rs149553038	T	TG	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.00;QD=26.85;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	32557435	rs9270299	A	C	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=14;PP=629;SC=GTGTCCCCAGACAAAGCCAGT;SOR=0.922;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=26;WE=32557443;WS=32557425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
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chr6	32606793	rs28437906	T	C	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=19;PP=798;SC=TGGAAGGTACTTTAAACTTTC;SOR=1.547;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=30;WE=32606801;WS=32606783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	32606878	rs9272544	G	A	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=276;SC=TCTCCAGAGCGCTTGGCGTCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=32606886;WS=32606868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	32609061	rs28654242	T	A	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=0;PP=652;SC=TTCTCCGCCTTCCTGCTTGTC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=32609069;WS=32609051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	32609173	rs10093	C	G	2958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=22;PP=2488;SC=TGGAGATGAGCAGTTCTACGT;SOR=2.383;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=66;TCR=22;TR=88;WE=32609181;WS=32609163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr6	32609371	rs4467816	T	C	3770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=83;PP=2965;SC=TTTACTTAAGTTATCCCTCCA;SOR=2.522;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=24;TCR=83;TR=107;WE=32609379;WS=32609361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr6	32610152	rs202014999	C	CTT	625.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.40;QD=36.81;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	32610436	rs1048372	T	C	1611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.32;MQRankSum=-2.642;QD=32.24;ReadPosRankSum=-0.773;SOR=3.570;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr6	32610461	rs9260	A	G	1772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=8;PP=1332;SC=TGTGGGCCTCATGGGCATTGT;SOR=3.647;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=50;TCR=8;TR=58;WE=32610469;WS=32610451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr6	32610689	rs9272843	C	G	4250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=69;PP=2965;SC=GACACAGGAGCCCCCTCGGAC;SOR=1.044;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=55;TCR=70;TR=124;WE=32610697;WS=32610679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr6	32610704	rs9272851	T	C	3671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=60;PP=2791;SC=TCGGACCCATTGATCTCATGT;SOR=0.850;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=55;TCR=60;TR=115;WE=32610712;WS=32610694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr6	32610757	rs8227	A	G	4051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=44;PP=2965;SC=GAGCAGAAGAATGGACTTGCT;SOR=1.217;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=72;TCR=44;TR=116;WE=32610777;WS=32610747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr6	32610769	rs7600	A	C	4334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=85;NR=41;PP=2965;SC=GGACTTGCTAAATGACCTAGC;SOR=1.503;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=85;TCR=41;TR=126;WE=32610777;WS=32610747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr6	32610887	rs7143	C	T	5698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=95;PP=2965;SC=CTCACAAATGCCTTTACATTC;SOR=0.938;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=172;TCF=77;TCR=95;TR=171;WE=32610895;WS=32610877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr6	32611054	rs28376734	T	C	1334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=37;PP=1104;SC=GTCAAATTTTTCCATCTTTCA;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=38;WE=32611062;WS=32611044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	32627882	rs1071639	C	T	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=3;PP=568;SC=GACCTGGTGGCTGCGTGACAG;SOR=3.716;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=32627890;WS=32627872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	32627956	rs1063347	C	G	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.18;QD=45.46;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	32627956	.	CAT	GAC	1979	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=46;MMLQ=29;MQ=57.48;NF=23;NR=15;PP=1979;QD=53.4859967069;SC=TCTGGGCAGGCATAAGCAGGC;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=43;TCF=25;TCR=18;TR=38;WE=32627966;WS=32627946;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,38:0.88:43
chr6	32627958	rs7656	T	C	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.25;QD=44.43;SOR=1.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	32627988	rs1049178	A	G	2267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.96;QD=43.61;SOR=1.036;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	32627991	rs1049177	C	T	2267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.96;QD=46.28;SOR=1.007;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	32628001	rs1049175	T	C	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.96;QD=43.97;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr6	32628045	rs9273472	C	G	1289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=62;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=27;PP=973;SC=GAGAGAAGAGCATTGATCAGC;SOR=1.666;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=39;WE=32628053;WS=32628035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	32628543	rs34736308	T	C	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=7;PP=737;SC=AAATAGGCCATGAACATGGAC;SOR=2.066;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=28;WE=32628551;WS=32628533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	32628828	rs68081734	T	C	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=371;SC=AAATTGTCACTAGAAAGAAAG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=32628849;WS=32628818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	32628841	rs9273546	A	G	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.09;NF=0;NR=11;PP=327;SC=AAAGAAAGGAAGCTGAGGCTC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=32628849;WS=32628818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	32629129	rs1130432	T	C	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=403;SC=CTCACCTTTCTGACTCCTTTG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=32629137;WS=32629119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	32629155	rs1130431	C	A	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=433;SC=TGATAAGGCCCAGCCCAAGGA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=32629163;WS=32629145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	32629240	rs9273671	G	A	2211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.83;QD=45.14;SOR=1.345;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	32629247	rs9279979	A	AC	2282.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=20;PP=2159;SC=AAAGAGCAGAACTGAGTGTCT;SOR=1.390;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=49;WE=32629265;WS=32629230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr6	32629257	rs9273677	T	A	2408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=22;PP=1510;SC=ACTGAGTGTCTGTGTTTGTCC;SOR=1.238;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=59;TCF=37;TCR=22;TR=58;WE=32629265;WS=32629230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	32629320	rs9273713	A	G	1467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=57;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=27;PP=1201;SC=TGAGGTGCAGAAGGTGAAGGC;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=46;WE=32629328;WS=32629310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr6	32629346	rs9273723	T	C	1209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=62;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=29;PP=941;SC=AGGAACCTAGTTCTCCATTCA;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=32629354;WS=32629336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	32629380	rs9273742	A	G	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.95;QD=43.29;SOR=6.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	32629385	rs71542428	C	A	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.44;QD=43.72;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	32629408	rs72844321	AA	GG	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=98;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=939;SC=GGATACAGTGAATAGGTGAGA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=32629417;WS=32629398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	32629708	rs33980016	T	TG	1274.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=1;PP=954;SC=CTTTGTCTTGTGGGCCCATAG;SOR=5.058;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=23;WE=32629726;WS=32629698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	32629718	rs36233043	G	A	1615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=4;PP=1250;SC=TGGGCCCATAGTAACAGAAAC;SOR=4.514;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=42;TCR=4;TR=46;WE=32629726;WS=32629698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	32629737	rs9273912	C	T	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=14;PP=1690;SC=ACTCAATATCCCCTTACGCCA;SOR=2.428;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=53;TCR=14;TR=67;WE=32629745;WS=32629727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
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chr6	32629963	rs1049100	C	T	906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.93;QD=32.38;SOR=1.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr6	32630087	rs71542430	T	C	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.68;QD=42.43;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	32630101	rs28724259	A	G	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.06;QD=52.72;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	32630112	rs9282139	G	GA	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=71.50;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	32632426	rs70996721	GC	G	86.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=81;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=84;SC=CGATGCACCTGCCCCCACCAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=32632444;WS=32632417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	32632436	.	C	CT	131	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.89;QD=65.50;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
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chr6	32632470	rs9274359	G	A	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.42;QD=46.20;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr6	32632483	rs9274361	A	G	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.39;QD=43.59;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	32632492	rs9274363	A	G	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.87;QD=43.99;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	32632493	.	CCT	C	1312.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.87;QD=46.88;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	32632498	.	C	CAA	1447.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.76;QD=45.24;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	32632515	rs41263824	G	A	2176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.90;QD=48.37;SOR=5.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	32632523	rs9274369	A	G	2446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.77;QD=45.31;SOR=4.654;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr6	32632527	rs9274370	C	A	2536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.92;QD=45.30;SOR=4.731;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	32632529	rs71542465	G	A	2581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.00;QD=45.29;SOR=4.768;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	32632534	rs28746795	T	C	2832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.67;QD=49.70;SOR=4.029;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	32632542	rs74199853	G	C	2725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.72;QD=40.68;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr6	32632587	rs1130397	A	G	4352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=88;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.68;NF=90;NR=41;PP=2965;SC=CTCCTCTGCAAGATCCCGCGG;SOR=1.716;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=91;TCR=41;TR=131;WE=32632606;WS=32632577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr6	32632598	rs17412833	A	T	4431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=88;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=93;NR=46;PP=2965;SC=GATCCCGCGGAACGCCACCTC;SOR=1.593;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=141;TCF=95;TCR=46;TR=139;WE=32632606;WS=32632577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr6	32632628	rs1130392	G	C	7628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.43;QD=44.35;SOR=1.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr6	32632635	rs9274384	A	C	7807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.06;QD=47.03;SOR=1.186;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr6	32632637	rs1130387	TC	GA	7756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.82;QD=46.17;SOR=1.320;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr6	32632647	rs1130390	T	C	7293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.00;QD=44.20;SOR=1.315;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr6	32632688	rs1071637	T	A	5224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=94;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=87;PP=2965;SC=GTACTCGGCATCAGGCCGCCC;SOR=0.889;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=163;TCF=76;TCR=87;TR=163;WE=32632696;WS=32632678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr6	32632711	rs1049074	C	T	6691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.66;QD=44.61;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr6	32632714	rs3210148	G	C	6550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.39;QD=45.18;SOR=1.378;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr6	32632745	rs1063318	G	A	3456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=98;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=1.036;NF=27;NR=97;PP=2938;ReadPosRankSum=0.414;SC=GTCGAAGCGCGCGTACTCCTC;SOR=1.352;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=27;TCR=98;TR=124;WE=32632753;WS=32632735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr6	32632770	rs1049069	A	G	1985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.02;QD=32.03;SOR=4.943;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
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chr6	32632818	rs1130368	T	G	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.78;QD=32.64;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr6	32632859	rs74186130	C	G	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=42.43;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	32632864	rs9274409	G	A	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=42.43;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	32632878	.	C	CAGCCTGGCCCT	52.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=26.35;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	32632886	.	C	CTG	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=26.85;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	32632892	rs200624488	CCG	C	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=1;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=53.70;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1:1.00:1
chr6	32634188	rs67955939	T	C	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.62;QD=43.81;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	32634192	rs9274512	A	G	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.67;QD=43.81;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	32634226	rs68033958	G	A	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=76;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=0;PP=492;SC=AGCCCAAGGAGAGCCTGTTCC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=32634234;WS=32634216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	32634263	rs66957194	GC	TT	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=17;NR=4;PP=545;SC=GAGAGCAGCTGCCCTGCACTT;SOR=2.400;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=21;WE=32634272;WS=32634253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	32634302	rs1049062	AG	GA	2051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.37;QD=45.59;SOR=1.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	32634313	rs1049059	C	G	2133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.84;QD=42.68;SOR=1.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr6	32634369	rs1049056	C	A	1674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=61;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=21;PP=1316;SC=ATCCGCAAAGCCTTCTTCCAA;SOR=1.244;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=53;TCF=31;TCR=22;TR=52;WE=32634377;WS=32634359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	32634387	rs1049055	C	T	1663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=65;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=28;PP=1364;SC=CAAGACATAACTGAGACGAAG;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=52;WE=32634395;WS=32634377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	32634405	rs1049053	C	T	1536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.01;QD=31.36;SOR=1.007;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	32634426	rs67147537	G	A	1260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.86;QD=33.18;SOR=1.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	32634485	rs9274526	A	C	877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.54;QD=27.43;SOR=2.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	32634505	rs71542466	C	G	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.37;QD=42.39;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	32634508	rs9274528	C	T	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.32;QD=46.21;SOR=4.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	32634564	rs202167390	A	AT	106.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=108;SC=CTGGGCAGACATTTTTTTTGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=32634572;WS=32634554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	33553580	rs394199	C	T	485.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=430;ReadPosRankSum=-0.776;SC=GGGTGCAATACCAGCAGGTAC;SOR=4.294;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=18;WE=33553588;WS=33553570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr6	33560896	rs210162	A	G	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.628;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=452;ReadPosRankSum=-0.485;SC=CATCATCCGCAGGGTGGAGCG;SOR=0.363;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=26;WE=33560904;WS=33560886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr6	33561164	rs210163	C	T	3817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=83;PP=2835;SC=GCCTCGCCCTCAGGGGTCGAC;SOR=1.845;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=36;TCR=83;TR=119;WE=33561172;WS=33561154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr6	33589361	.	G	GC	894.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.000;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.859;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.295;NF=23;NR=13;PP=1149;ReadPosRankSum=1.382;SC=CACGCCCTGGGCCCCGGAGGG;SOR=0.993;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=65;TCR=37;TR=36;WE=33589369;WS=33589351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,37:0.38:97
chr6	33608216	rs41271247	G	T	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.783;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=36;PP=1418;ReadPosRankSum=1.204;SC=TACTGTGGGAGATAGGTCTCT;SOR=0.400;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=235;TCF=150;TCR=85;TR=87;WE=33608224;WS=33608206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,89:0.37:238
chr6	33608379	rs4713647	T	C	3234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=80;PP=2655;SC=GCTGCAGGGTTCTGGACCTGC;SOR=3.212;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=16;TCR=80;TR=96;WE=33608387;WS=33608369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr6	33625600	rs3831079	GT	G	278.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=336;ReadPosRankSum=-0.177;SC=GACTGTGTGTGTGTGTGTGTG;SOR=0.394;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=10;WE=33625608;WS=33625590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr6	33625696	rs2274200	T	C	1948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.880;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.98;MQRankSum=-0.625;NF=48;NR=31;PP=1539;ReadPosRankSum=-1.271;SC=CACTTCTGTGTGTGTCTGTGC;SOR=0.401;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=112;TCF=71;TCR=41;TR=79;WE=33625704;WS=33625686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,77:0.71:109
chr6	33626560	.	G	T	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=0.000;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.060;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=475;ReadPosRankSum=0.676;SC=AGGGTTCCTGGCTCTTCATCC;SOR=1.240;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=106;TCF=16;TCR=90;TR=29;WE=33626568;WS=33626550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,30:0.27:110
chr6	33626717	rs2296343	T	C	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.815;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=362;ReadPosRankSum=-1.706;SC=AAGGGCAGACTGAGACCAAAG;SOR=0.323;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=75;TCF=50;TCR=25;TR=26;WE=33626725;WS=33626707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,27:0.33:81
chr6	33630472	rs2296340	G	A	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.854;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=130;ReadPosRankSum=0.798;SC=CCCTGCTTCTGGCACCCCGGA;SOR=0.104;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=11;WE=33630480;WS=33630462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,11:0.23:48
chr6	33630624	rs2296339	C	T	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.927;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=398;ReadPosRankSum=1.788;SC=CCAGGCCTCCCTGGGGTCTGA;SOR=0.346;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=21;WE=33630632;WS=33630614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,24:0.77:31
chr6	33630816	rs2296338	G	A	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=716;ReadPosRankSum=-1.225;SC=GCTGGGGCTCGTGTGTGCATG;SOR=0.494;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=33;WE=33630824;WS=33630806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,38:0.70:54
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chr6	33631155	rs5875457	TGGGAGG	T	898.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=1054;ReadPosRankSum=-0.755;SC=TGGGCACCCCTGGGAGGGTGC;SOR=1.148;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=14;WE=33631171;WS=33631145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,23:0.70:33
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chr6	33647594	rs4713653	C	A	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=808;ReadPosRankSum=1.834;SC=TGGTAAGCAACGGAGAGGAGA;SOR=1.038;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=30;WE=33647602;WS=33647584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,31:0.74:42
chr6	33647651	rs4713654	A	G	1714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.673;HP=6;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=24;PP=1360;ReadPosRankSum=-1.273;SC=GCCCCCTCCCACCCGCAGCTG;SOR=0.321;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=104;TCF=72;TCR=32;TR=70;WE=33647659;WS=33647641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,72:0.68:106
chr6	33648198	rs148020704	G	A	3252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.625;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=47;PP=2442;ReadPosRankSum=0.058;SC=ACATCTGGACGCTCTTTGAGA;SOR=0.776;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=165;TCF=96;TCR=69;TR=115;WE=33648206;WS=33648188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,121:0.71:171
chr6	33648228	rs2229638	C	T	3703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.939;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=62;PP=2893;ReadPosRankSum=-1.543;SC=TGGACATGGCCCGGGTCTGTC;SOR=0.377;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=174;TCF=95;TCR=79;TR=127;WE=33648236;WS=33648218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,131:0.71:184
chr6	33651129	rs942636	C	T	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.589;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=27;PP=1159;ReadPosRankSum=-1.205;SC=GCGTCACCCCCACCGCCAACC;SOR=0.158;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=74;TCF=32;TCR=42;TR=54;WE=33651137;WS=33651119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,55:0.74:74
chr6	33653111	rs942637	T	C	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=619;ReadPosRankSum=0.299;SC=GCTGAGGTTGTTCCCTGGCCA;SOR=0.714;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=29;WE=33653119;WS=33653101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
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chr6	33654897	rs942642	T	C	1893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.784;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=24;PP=1513;ReadPosRankSum=0.198;SC=GCTGGGCAGGTGGGCAGGCGG;SOR=0.988;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=110;TCF=73;TCR=37;TR=73;WE=33654905;WS=33654887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,74:0.69:108
chr6	33655173	rs2281916	T	C	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=349;ReadPosRankSum=-1.408;SC=GCTGCCATCATCCCCCAGTCG;SOR=1.292;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=16;WE=33655181;WS=33655163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr6	33656250	rs2296736	T	C	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=12;PP=456;SC=TCTGGAGCTGTTCACTGATGC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=33656258;WS=33656240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr6	33656969	rs2296739	G	A	1736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=7.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.806;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=2;PP=1355;ReadPosRankSum=-0.224;SC=CTCTGGGGCCGTGGTGGGCTT;SOR=0.240;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=98;TCF=96;TCR=2;TR=60;WE=33656977;WS=33656959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,62:0.62:100
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chr6	33659557	rs2296741	C	T	5696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.189;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.242;NF=96;NR=36;PP=2962;ReadPosRankSum=1.768;SC=GCCCGGGCCTCAGCACACTCT;SOR=2.049;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=134;TCF=98;TCR=36;TR=132;WE=33659565;WS=33659526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,142:0.99:144
chr6	33659793	rs2296742	G	A	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=41;PP=1167;ReadPosRankSum=0.577;SC=TTGGCCTCGCGTCAGATATTC;SOR=6.043;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=41;WE=33659801;WS=33659783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr6	33660411	rs653536	T	C	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=532;SC=GGCTGGGTCCTCAATATCACA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=33660419;WS=33660403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	33660597	rs2229643	C	T	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.734;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=596;ReadPosRankSum=-1.102;SC=GGGTAATCATCGACACCTTCG;SOR=0.913;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=102;TCF=40;TCR=62;TR=34;WE=33660605;WS=33660587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,34:0.33:103
chr6	33660695	rs3818524	G	C	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=30;PP=800;ReadPosRankSum=-0.476;SC=CTGCTCTGTGGAGGCCGCAGC;SOR=1.054;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=33;WE=33660703;WS=33660685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,33:0.65:51
chr6	33661222	rs3818530	C	G	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=2;PP=731;ReadPosRankSum=0.399;SC=ATCCCGAGAACAAATGCCTCC;SOR=0.900;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=30;WE=33661230;WS=33661212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,30:0.81:37
chr6	33663451	rs1324966	C	T	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.818;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=549;ReadPosRankSum=0.504;SC=AGGTGCCAGGCGGCCTGACCA;SOR=0.588;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=103;TCF=75;TCR=28;TR=38;WE=33663459;WS=33663441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,41:0.38:107
chr6	33668038	rs74330951	G	A	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=411;ReadPosRankSum=-0.137;SC=TTTAAATAACGCCTTTGACCT;SOR=0.252;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=61;TCR=0;TR=22;WE=33668046;WS=33668028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,22:0.34:64
chr6	33668370	rs942643	A	G	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=585;ReadPosRankSum=2.123;SC=CATTTCACCTAGGCCCTGGGC;SOR=1.067;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=26;WE=33668378;WS=33668360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr6	33679239	rs7759182	C	A	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=190;ReadPosRankSum=1.086;SC=CGCGCGCATGCGCAGATCCCC;SOR=0.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=12;WE=33679247;WS=33679229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,12:0.27:45
chr6	33679596	rs2274458	A	C	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=406;ReadPosRankSum=-0.098;SC=TTGTAGGCGCACCGCTACTCT;SOR=1.382;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=18;WE=33679604;WS=33679586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr6	33690796	rs4713668	CA	TG	3817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.897;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=51;PP=2944;ReadPosRankSum=0.398;SC=CTCCTAATGACAGAGAGGAGG;SOR=1.575;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=118;TCF=44;TCR=74;TR=71;WE=33690805;WS=33690786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,95:0.68:139
chr6	33703230	rs545787	G	A	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=301;ReadPosRankSum=0.978;SC=TGTCCCCGGCGTCTGCGCTGT;SOR=0.487;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=81;TCF=10;TCR=71;TR=21;WE=33703238;WS=33703220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,23:0.28:82
chr6	33740325	rs11755593	G	C	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.882;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=6;PP=1143;ReadPosRankSum=0.780;SC=ATTCAGCACCGCAGGCCTGGT;SOR=1.643;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=59;TCR=8;TR=50;WE=33740333;WS=33740315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,53:0.75:71
chr6	33748831	rs2182658	T	G	2239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=5.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.985;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=21;PP=1760;ReadPosRankSum=0.724;SC=CCCAGGAATGTATAAGCACTG;SOR=1.238;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=125;TCF=86;TCR=39;TR=79;WE=33748839;WS=33748821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,81:0.64:127
chr6	33748937	rs3833665	G	GA	3296.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.918;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.388;NF=57;NR=49;PP=2220;ReadPosRankSum=-0.565;SC=TTACCTAGGAGAAAAAAAACC;SOR=0.874;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=203;TCF=106;TCR=97;TR=106;WE=33748945;WS=33748927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,136:0.68:200
chr6	33762451	rs74969061	G	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=91;ReadPosRankSum=1.642;SC=AGTCATTTCTGTATATTTCAT;SOR=0.307;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=7;WE=33762459;WS=33762441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr6	33762625	rs11758463	A	G	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.215;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=750;ReadPosRankSum=-0.117;SC=GGAGAAAAGCAGAGGTTTGCG;SOR=0.943;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=71;TCF=38;TCR=33;TR=40;WE=33762633;WS=33762615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,40:0.56:72
chr6	33768897	rs2281820	A	G	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=6.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.126;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=40;PP=1190;ReadPosRankSum=-0.355;SC=CATGGCAGCTACATGCACCAC;SOR=1.012;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=217;TCF=103;TCR=114;TR=70;WE=33768905;WS=33768887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,68:0.32:213
chr6	34026938	rs2451359	C	T	3315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=59;PP=2594;SC=AGCCCAGCCGCGTCTGTCCAC;SOR=0.936;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=50;TCR=59;TR=108;WE=34026946;WS=34026928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr6	34078463	rs744102	G	A	7101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=154;PP=2965;SC=CTCCAGGAGCGTGTGTCTGCC;SOR=1.853;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=221;TCF=67;TCR=154;TR=221;WE=34078471;WS=34078453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr6	34211341	rs35381162	GT	G	3616.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.565;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.214;NF=39;NR=42;PP=2974;ReadPosRankSum=-1.699;SC=GCTCTTTTGAGTTGAGGGTGT;SOR=0.657;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=86;TCF=40;TCR=46;TR=81;WE=34211349;WS=34211331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,99:0.99:100
chr6	34212743	rs2780219	A	G	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=5;PP=351;SC=CACCGCCCCCACCCCTTCCCC;SOR=2.049;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=34212751;WS=34212733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	34213296	rs1150783	T	C	2932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=60;PP=2487;SC=CCCCCTTCGGTTACAGGAAGG;SOR=1.389;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=33;TCR=60;TR=93;WE=34213304;WS=34213286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr6	34214322	rs1150781	C	G	3469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=60;PP=2753;SC=ACCAGCCGCCCCCATCCCAGA;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=49;TCR=60;TR=109;WE=34214330;WS=34214312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr6	34214994	rs3997805	G	GTC	1515.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=23;PP=1582;SC=TGGCTGCCTCGTCTCCTCCCT;SOR=1.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=33;WE=34215002;WS=34214984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	34511657	.	G	C	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.785;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=380;ReadPosRankSum=0.206;SC=ACTGTGTGTAGAAGTGCCAGC;SOR=0.504;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=18;WE=34511665;WS=34511647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr6	34664207	rs3800456	T	G	1987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=5;PP=1684;SC=GCGCTGGCACTGCGGGGCCGG;SOR=4.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=67;TCR=5;TR=72;WE=34664215;WS=34664197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr6	34949451	rs3817473	C	T	2327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=15;PP=1922;SC=ATGTGATCTGCTTGTTAACCC;SOR=2.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=59;TCR=15;TR=74;WE=34949459;WS=34949441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr6	34949607	rs2293242	C	T	6961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=95;PP=2965;SC=CAGCACTGTACGGGCGACTGG;SOR=0.929;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=215;TCF=120;TCR=95;TR=215;WE=34949615;WS=34949597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr6	34962019	rs11755713	G	C	1086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=1;PP=970;SC=ATTTGTTCCAGACTGCCTGTC;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=35;WE=34962027;WS=34962009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	34962060	rs3823438	G	A	2303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=9;PP=1907;SC=AAGATACACTGGATGTTTCTC;SOR=3.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=61;TCR=9;TR=70;WE=34962068;WS=34962050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr6	34977663	rs9380481	C	A	1838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=2;PP=1430;SC=CTGGGTGACACGAGCAAGACT;SOR=5.747;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=53;TCR=2;TR=49;WE=34977671;WS=34977653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr6	34977813	rs12661991	A	G	3299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=79;PP=2778;SC=AAATTTTTAAAAATTAGCTGG;SOR=2.701;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=101;TCF=20;TCR=81;TR=99;WE=34977821;WS=34977803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr6	35027927	rs820085	T	C	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=15;PP=853;SC=TCATCAGGTTTACGGACGCTG;SOR=0.811;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=17;TCR=15;TR=32;WE=35027935;WS=35027917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	35046154	rs820100	T	C	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=17;NR=1;PP=501;SC=CAGCTCTGCCTAGCTCCCCTG;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=35046162;WS=35046144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	35047579	rs2762338	G	C	1420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=39;PP=1232;SC=CTGTCACCTCGCTGCTCCTCA;SOR=3.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=43;WE=35047587;WS=35047569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	35047732	rs2689094	T	C	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=13;PP=700;SC=CAGAAAGGAATGTATGTTTGT;SOR=1.044;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=17;TCR=13;TR=30;WE=35047740;WS=35047722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	35050506	rs2177382	G	A	3524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=89;NR=21;PP=2897;SC=TGCGGCCCCCGAGCCTGGCAG;SOR=2.691;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=89;TCR=21;TR=110;WE=35050514;WS=35050496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr6	35053383	rs66645129	CTAGGAAGAG	C	1627.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=0;PP=2941;SC=CAACAGAGACCTAGGAAGAGT;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=24;WE=35053399;WS=35053381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	35054983	rs71650764	GGCAGCGTAGACGCT	G	4196.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=61;PP=2973;SC=TTGGGCGGGCGGCAGCGTAGA;SOR=5.849;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=2;TCR=63;TR=63;WE=35055004;WS=35054973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr6	35056443	rs2005	A	G	6764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=182;PP=2965;SC=ATAGGCTCCCACTGCCACCAC;SOR=3.741;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=210;TCF=27;TCR=183;TR=209;WE=35056451;WS=35056433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr6	35058117	rs707968	A	G	975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=28;PP=848;SC=GCCACTGCGCACATGCTGGTG;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=35058125;WS=35058107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	35088956	rs2494096	A	G	1445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=41;PP=1239;SC=TTCAGAAGATAACATGTGGCC;SOR=6.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=42;WE=35088964;WS=35088946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	35104018	rs12661389	C	A	3969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=95;PP=2965;ReadPosRankSum=1.424;SC=AACAATGAGCCCATGCAAGTC;SOR=1.432;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=27;TCR=95;TR=122;WE=35104026;WS=35104008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,126:0.99:127
chr6	35107682	rs3777748	T	A	1371.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=1;PP=1403;SC=CAAATTTTTTTAAAAAGGAAT;SOR=7.658;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=47;TCR=1;TR=48;WE=35107690;WS=35107672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr6	35109032	rs142118879	CGCGGCCTG	C	898.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=9;PP=2643;SC=CGGTGGGCCTCGCGGCCTGGC;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=13;TCR=10;TR=20;WE=35109047;WS=35109022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	35203203	rs13214290	T	G	1495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=17;PP=1035;SC=CCTAAACAGCTTTTTTACAAT;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=51;WE=35203211;WS=35203193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr6	35205541	rs1929849	T	C	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=1;PP=786;SC=GAGCCTCCCTTGGCTTAATGC;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=35205549;WS=35205531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	35205881	rs734538	G	A	2417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=64;PP=1917;SC=ATTAGGGGATGACACCTCCTC;SOR=4.587;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=5;TCR=64;TR=69;WE=35205889;WS=35205871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr6	35216296	rs2071920	C	T	1678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=4;PP=1286;SC=CCACCCCCGACGGTGAGGCTG;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=44;TCR=4;TR=47;WE=35216304;WS=35216286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	35258539	rs763157	C	A	1540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=40;PP=1312;SC=GGAGGGTTCTCGTTCTGTTTG;SOR=5.376;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=42;WE=35258547;WS=35258529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	35259261	rs1894650	C	G	5316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=52;PP=2965;SC=GACCTGGAGCCCAGTGCCATC;SOR=1.825;SbPval=0.53;Source=Platypus;TR=174;WE=35259269;WS=35259251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr6	35259646	rs9366883	G	C	3917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=130;PP=2965;SC=GCTGGTCTGGGGGTAGGGTAT;SOR=5.640;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=6;TCR=130;TR=136;WE=35259654;WS=35259636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr6	35260503	rs1557567	C	T	5468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=72;PP=2965;SC=GCAGTGCCCACGGCGAGCTGG;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=93;TCR=72;TR=165;WE=35260511;WS=35260493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr6	35260530	rs1557568	C	T	5993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=108;NR=76;PP=2965;SC=CGGAGGAGAGCGAGCAGGCCC;SOR=1.115;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=110;TCR=76;TR=184;WE=35260538;WS=35260520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr6	35285720	rs2395617	A	C	8383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=140;PP=2965;SC=AAGACAGCCAACCGCACGTAT;SOR=0.870;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=260;TCF=120;TCR=140;TR=260;WE=35285728;WS=35285710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr6	35378778	rs2016520	C	T	1290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=15;PP=1037;SC=ATGGGAACCACCCTGTAGAGG;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=27;TCR=15;TR=42;WE=35378786;WS=35378768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	35391787	rs2076167	C	T	4567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=123;NR=11;PP=2965;SC=TGACTGCAAACGAGGGGAGCC;SOR=4.630;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=123;TCR=11;TR=134;WE=35391795;WS=35391777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr6	35423489	rs7757405	A	G	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=491;ReadPosRankSum=-0.255;SC=CCTTCAGCCAAACACTTAACT;SOR=0.643;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=20;WE=35423497;WS=35423479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr6	35423662	rs4713867	A	C	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.225;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=34;PP=1264;ReadPosRankSum=0.053;SC=CCCCTGACCCAGATGCCTGGC;SOR=0.406;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=99;TCF=52;TCR=47;TR=67;WE=35423670;WS=35423652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,71:0.68:104
chr6	35424188	rs3800377	A	G	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.451;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=32;PP=743;ReadPosRankSum=0.000;SC=GGCTTTATCCATGGGGAAGGC;SOR=1.850;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=54;TCF=5;TCR=49;TR=34;WE=35424196;WS=35424178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,34:0.62:55
chr6	35424268	rs4713868	A	G	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=199;ReadPosRankSum=0.169;SC=GGTAGGGTTGAGGGAATGTAG;SOR=2.133;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=10;WE=35424276;WS=35424258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr6	35425416	rs13214239	A	G	1615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.049;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=28;PP=1255;ReadPosRankSum=-0.844;SC=CCTTTCTTCCATCTTCTACCC;SOR=0.333;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=114;TCF=73;TCR=41;TR=67;WE=35425424;WS=35425406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,68:0.58:118
chr6	35443573	rs2076170	T	G	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=388;ReadPosRankSum=-0.047;SC=AGGATCCATCTCTGGCACTCT;SOR=0.683;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=21;WE=35443581;WS=35443563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr6	35444349	rs34250016	TACA	T	146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.674;NF=0;NR=5;PP=175;ReadPosRankSum=-1.122;SC=TGTGTCCTTGTACAGTGTACA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=35444359;WS=35444339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr6	35448189	rs760782	T	C	4378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.560;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=92;PP=2962;ReadPosRankSum=0.648;SC=GAGGAAAACATAGACAGTGAG;SOR=0.617;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=209;TCF=76;TCR=133;TR=143;WE=35448197;WS=35448179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,160:0.71:225
chr6	35473252	rs2395628	C	T	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=311;ReadPosRankSum=-0.763;SC=TGCCCTGCTCCAAGTGAGGCC;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=16;WE=35473260;WS=35473242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr6	35474073	rs12215920	C	G	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.032;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=221;ReadPosRankSum=0.173;SC=GCGGAGAGAACAGAGAGGCTG;SOR=1.938;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=11;WE=35474081;WS=35474063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr6	35477025	rs2064318	C	G	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=2.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.77;ReadPosRankSum=-0.691;SOR=1.141;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,22:0.29:75
chr6	35477032	rs2064317	A	G	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.938;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,26:0.30:86
chr6	35477152	rs7752728	C	T	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=2.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.82;ReadPosRankSum=-1.416;SOR=0.694;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,42:0.25:167
chr6	35477303	rs9296155	T	C	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=196;ReadPosRankSum=0.631;SC=ACTCTAGACCTGGCAAACTCC;SOR=0.963;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=51;TCF=22;TCR=29;TR=15;WE=35477311;WS=35477293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,16:0.31:52
chr6	35478612	rs2273001	G	A	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.285;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=5;PP=587;ReadPosRankSum=0.711;SC=TTCCCTGTGAGCTCTCTCAGC;SOR=1.034;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=95;TCF=77;TCR=18;TR=35;WE=35478620;WS=35478602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,34:0.35:98
chr6	35479574	rs7764472	G	C	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=5.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=425;ReadPosRankSum=-0.307;SC=CGGCCTCCCCGTCCGCCCAGC;SOR=1.044;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=19;WE=35479582;WS=35479564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,19:0.39:49
chr6	35610681	rs2143404	T	C	1090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=31;PP=907;SC=ATCTTGAATGTCCCTGGGAAC;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=35610689;WS=35610671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	35704831	rs56354119	C	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-4.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=116;ReadPosRankSum=0.093;SC=CCGGAAGGCCCCCCACAGGTG;SOR=0.242;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=10;WE=35704839;WS=35704821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
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chr6	35705853	rs151133317	G	A	1632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=1154;ReadPosRankSum=1.963;SC=GTGAGCTCCGGAGGCTCCTCA;SOR=0.811;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=81;TCF=46;TCR=35;TR=59;WE=35705861;WS=35705843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,63:0.74:85
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chr6	35706064	.	G	C	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=5;PP=368;SC=TGATAGCGGTGGGGGGGGGGT;SOR=1.765;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=15;WE=35706072;WS=35706053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr6	35745413	rs150177330	TA	T	216.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=180;ReadPosRankSum=-0.155;SC=GCAGGGAGGTTAAAAAAAAAA;SOR=1.739;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=13;WE=35745421;WS=35745403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr6	35745655	rs2478467	C	T	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=358;ReadPosRankSum=-0.686;SC=GGGCAGGGATCGCATCATATT;SOR=0.264;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=20;TCF=9;TCR=11;TR=19;WE=35745663;WS=35745645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr6	35749059	rs2766579	G	A	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=133;ReadPosRankSum=0.683;SC=GGAGGTGAGCGGGCATGGGGG;SOR=0.283;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=8;WE=35749067;WS=35749049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr6	35755658	rs12211728	A	G	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FS=0.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.77;ReadPosRankSum=2.152;SOR=0.605;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:210,47:0.18:257
chr6	35763786	rs56279340	C	T	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-8.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=62;PP=1092;ReadPosRankSum=-0.154;SC=CTGTGCCCCCCACCCACGTGA;SOR=0.704;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=208;TCF=14;TCR=194;TR=66;WE=35763794;WS=35763776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,65:0.31:209
chr6	35764839	rs116063149	G	A	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=1.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.74;ReadPosRankSum=0.909;SOR=1.266;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,15:0.21:70
chr6	35764943	rs3748051	T	C	1553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.519;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=34;PP=993;ReadPosRankSum=1.936;SC=AGTCTTCATCTGGGGACTCAG;SOR=0.646;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=207;TCF=111;TCR=96;TR=72;WE=35764951;WS=35764933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,77:0.35:217
chr6	35765068	rs3748050	T	C	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=3.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.343;SOR=1.341;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,22:0.21:103
chr6	35765151	rs3748049	T	C	1106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=28;PP=853;SC=CCTCACGAGATCCACCTGCAT;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=35765159;WS=35765141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	35765177	rs3748048	G	A	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=166;ReadPosRankSum=0.726;SC=AGGGCTGGCCGTGGGCAGAGG;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=9;WE=35765185;WS=35765167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr6	35803103	rs35124200	C	T	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=371;ReadPosRankSum=0.656;SC=CCAAGGGTGCCGGAGACACTC;SOR=0.446;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=62;TCF=54;TCR=8;TR=21;WE=35803111;WS=35803093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,21:0.33:63
chr6	35855897	.	C	G	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.917;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=325;ReadPosRankSum=-0.250;SC=CCCTAAGAAACAAACACAGGC;SOR=0.639;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=82;TCF=43;TCR=39;TR=21;WE=35855905;WS=35855887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,25:0.28:88
chr6	35911856	rs61741366	G	A	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.138;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=30;PP=919;ReadPosRankSum=1.380;SC=TTGGGGTTGGGCTCCATCTCA;SOR=0.655;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=160;TCF=87;TCR=73;TR=55;WE=35911864;WS=35911846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,54:0.34:160
chr6	35923246	rs2295852	T	C	2858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=72;PP=2113;ReadPosRankSum=-0.142;SC=ATCAGGTTAATGGAGGATGCT;SOR=0.538;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=26;TCR=74;TR=98;WE=35923254;WS=35923236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,104:0.98:106
chr6	35950075	rs9470186	G	C	3035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.617;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=76;PP=2540;ReadPosRankSum=-1.034;SC=CCTCTGGCAGGACAGAAAATG;SOR=3.540;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=91;TCF=14;TCR=77;TR=89;WE=35950083;WS=35950065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,93:0.98:95
chr6	36041431	rs851010	A	G	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=5;PP=1192;SC=TGACAATAGAAGGTTGGAGGT;SOR=3.664;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=40;WE=36041439;WS=36041421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	36064036	rs851007	G	A	739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=623;SC=GCATGCACAAGTGTGTTTTAT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=36064044;WS=36064026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	36075219	rs9470219	A	C	3244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=30;PP=2590;SC=CTTCCTGTCTATGGTACTGAT;SOR=1.855;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=71;TCR=30;TR=101;WE=36075227;WS=36075209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr6	36098333	rs12191295	T	C	1642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=5;PP=1241;SC=GCCGCCACGCTGGGGCCGCCG;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=46;TCR=5;TR=51;WE=36098341;WS=36098323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	36098410	rs1059227	A	C	2669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.130;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=67;PP=1773;ReadPosRankSum=-0.673;SC=TCAACAAGACAGCCTGGGAGC;SOR=1.704;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=95;TCF=28;TCR=67;TR=94;WE=36098418;WS=36098400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr6	36103921	rs2252430	G	A	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=26;PP=933;SC=TTGGAGGGAGGGGACACTGCC;SOR=2.242;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=36103929;WS=36103911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	36189887	rs2301422	C	G	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=6;PP=291;SC=GAAGGGGAGTCGGCGTTTTAG;SOR=0.859;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=11;WE=36189895;WS=36189877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	36190156	.	C	G	24	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.9998;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=24;QD=29.3856062736;SC=TGAGCTCCCCCAAACTCTTGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=36190164;WS=36190146;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	36261885	rs4713949	A	G	1400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=2;PP=1184;SC=CTGGTGCCATATCCCATGGGC;SOR=5.186;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=41;WE=36261893;WS=36261875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	36262991	rs4713951	C	T	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=2;PP=333;SC=TCTTAGCAGACAGTGAGGGAT;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=36262999;WS=36262987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr6	36287312	rs743852	G	C	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.837;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=511;ReadPosRankSum=-0.318;SC=TGGCTGCGCAGGGTGGCTACC;SOR=0.586;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=79;TCF=38;TCR=41;TR=31;WE=36287320;WS=36287302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,32:0.39:83
chr6	36288879	rs112374394	G	GGTCTCAGCT	241.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.981;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=1694;ReadPosRankSum=-0.824;SC=ATGGAACCCAGGTGGGTAGAT;SOR=0.014;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=5;WE=36288887;WS=36288869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr6	36289145	rs763018	A	C	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.166;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=311;ReadPosRankSum=-0.497;SC=TGATGGACCCAGACAATTCTT;SOR=0.143;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=67;TCF=13;TCR=54;TR=24;WE=36289153;WS=36289135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,23:0.35:66
chr6	36290030	rs12190546	C	G	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.952;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=295;ReadPosRankSum=0.779;SC=CCTGTGAACTCCATGTGGAAG;SOR=1.730;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=14;WE=36290038;WS=36290020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
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chr6	36353169	rs6901513	G	A	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=266;ReadPosRankSum=1.722;SC=CTTGAACCCAGGAGCTGGAAG;SOR=0.384;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=12;WE=36353177;WS=36353159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr6	36355372	rs2234071	T	C	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.970;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=451;ReadPosRankSum=1.355;SC=CTCCCCTGGCTGTGGCTGCTG;SOR=0.307;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=25;WE=36355380;WS=36355362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr6	36359695	rs147244815	TTTA	T	38.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.70;MQRankSum=-1.601;QD=1.29;ReadPosRankSum=0.074;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr6	36359696	rs199820722	TTA	T	286.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-4.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.72;MQRankSum=1.652;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.626;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr6	36368169	rs6917489	G	A	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.503;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=424;ReadPosRankSum=0.541;SC=CTTGGCAGCCGTAGTTTTGTT;SOR=0.180;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=56;TCF=53;TCR=3;TR=23;WE=36368177;WS=36368159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr6	36393582	.	A	AC	763.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQRankSum=-1.891;QD=23.14;ReadPosRankSum=0.941;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr6	36393583	.	ATATAT	A	760.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.786;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQRankSum=-1.961;QD=22.37;ReadPosRankSum=1.106;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr6	36393590	rs113872867	T	A	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQRankSum=-1.961;QD=23.88;ReadPosRankSum=0.053;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr6	36393592	.	T	A	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.925;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQRankSum=-1.910;QD=23.19;ReadPosRankSum=-0.084;SOR=1.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr6	36393594	rs201851804	T	A	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQRankSum=-1.910;QD=23.19;ReadPosRankSum=-0.034;SOR=1.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr6	36393816	rs664370	A	G	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.469;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=31;PP=603;ReadPosRankSum=-0.761;SC=TGGATTGAGAACTTCTTTAGT;SOR=1.657;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=107;TCF=18;TCR=89;TR=34;WE=36393824;WS=36393806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,34:0.30:115
chr6	36446975	rs2239808	G	C	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.642;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=22;PP=784;ReadPosRankSum=-0.272;SC=GAAGGCATCAGTGCAACTGTA;SOR=0.559;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=143;TCF=62;TCR=81;TR=49;WE=36446983;WS=36446965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,52:0.34:153
chr6	36447287	rs2239807	A	G	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.22;ReadPosRankSum=1.080;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr6	36452603	rs201092661	TA	T	297.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=0.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=0.000;QD=2.36;ReadPosRankSum=0.877;SOR=0.926;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,36:0.29:126
chr6	36467791	rs659726	C	G	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=616;ReadPosRankSum=-0.196;SC=CACACATCAGCGAGGCCCAGC;SOR=0.952;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=74;TCF=1;TCR=73;TR=29;WE=36467799;WS=36467781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,28:0.38:74
chr6	36475200	rs16888690	T	C	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=227;ReadPosRankSum=0.622;SC=TCCTATCTGTTCTAATTTGGT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=10;WE=36475208;WS=36475190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr6	36483295	rs150740806	CCACA	C	55.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQRankSum=1.169;QD=4.64;ReadPosRankSum=-0.601;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr6	36492269	rs3752479	C	G	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.378;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=28;PP=670;ReadPosRankSum=0.034;SC=AGGGAGGAGACGGGAAGGAAC;SOR=0.125;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=87;TCF=8;TCR=79;TR=33;WE=36492277;WS=36492259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,33:0.38:88
chr6	36492375	rs3752478	T	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=80;ReadPosRankSum=0.915;SC=ACATATGAAATCACCCCAGAA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=6;WE=36492383;WS=36492365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr6	36493265	rs605684	T	C	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=367;ReadPosRankSum=-0.181;SC=TCCTCTGTTATTGAGCCAAAA;SOR=0.557;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=67;TCF=56;TCR=11;TR=22;WE=36493273;WS=36493255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,22:0.30:74
chr6	36493330	rs6927896	C	T	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=661;ReadPosRankSum=-0.215;SC=CAACCTGCCACGCTGGGTTTT;SOR=0.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=131;TCF=66;TCR=65;TR=45;WE=36493338;WS=36493320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,45:0.33:137
chr6	36508036	rs6913714	G	T	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.833;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=30;PP=754;ReadPosRankSum=-0.118;SC=AATCCACCCAGTGTGCACTCT;SOR=0.829;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=100;TCF=28;TCR=72;TR=41;WE=36508044;WS=36508026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,40:0.39:102
chr6	36568764	.	C	CTTTTCTTTT	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.35;MQRankSum=-2.189;QD=10.82;ReadPosRankSum=-1.902;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr6	36686272	rs236487	C	T	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=3;PP=309;SC=CTCCACAGAGCGACTCTCGGG;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=36686280;WS=36686262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr6	36695519	rs236472	T	C	1213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.543;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=33;PP=890;ReadPosRankSum=-1.123;SC=TCAAGAGGGATCTTATATCCT;SOR=1.215;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=63;TCF=16;TCR=47;TR=42;WE=36695527;WS=36695509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,45:0.66:68
chr6	36695661	rs236471	A	C	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.803;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=132;ReadPosRankSum=-0.270;SC=CATAGTACAGACTTCAAACCA;SOR=0.045;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=8;WE=36695669;WS=36695651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr6	36696330	rs236470	G	A	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=361;ReadPosRankSum=0.116;SC=GAAGGATGGGGGAAAGGGTCC;SOR=0.752;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=17;WE=36696338;WS=36696320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr6	36698285	rs190201	G	C	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=2.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.32;ReadPosRankSum=-0.063;SOR=0.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,21:0.78:27
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chr6	36700202	rs374852059	G	GGGT	286.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.431;NF=0;NR=7;PP=283;ReadPosRankSum=0.992;SC=AATGTGGGGGGGGGGTGTTAC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=36700210;WS=36700192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr6	36711406	rs3213534	G	A	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=616;ReadPosRankSum=0.918;SC=GGGGTGTGAGGTCCGCCTGGC;SOR=1.556;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=26;WE=36711414;WS=36711396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr6	36712962	rs743870	C	T	2870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=76;PP=2323;SC=GGTCTGTCTGCGGGACCTCTG;SOR=4.407;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=8;TCR=76;TR=84;WE=36712970;WS=36712952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr6	36713263	rs763046	A	G	2395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=31;PP=1964;SC=CGTCGATGCCACAGCATGAGG;SOR=1.395;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=53;TCR=31;TR=84;WE=36713271;WS=36713253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr6	36714139	rs3213535	A	G	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=289;ReadPosRankSum=0.395;SC=CCCCAGCCTGATCAGTCCTCT;SOR=0.105;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=14;WE=36714147;WS=36714129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr6	36714491	rs929051	G	A	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.041;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=6;PP=155;ReadPosRankSum=1.531;SC=CATACCCCATGTTAAATCCTT;SOR=0.116;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=9;WE=36714499;WS=36714481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr6	36715833	rs1010790	A	T	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=4;PP=950;SC=TGGGGATACTACTGCCATCTT;SOR=4.021;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=34;WE=36715841;WS=36715823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	36715921	rs3213537	C	T	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.604;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=493;ReadPosRankSum=-1.120;SC=GGGTCATGGTCCCAGCCAGGG;SOR=0.773;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=86;TCF=45;TCR=41;TR=30;WE=36715929;WS=36715911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,32:0.34:93
chr6	36723884	rs236443	C	G	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=46;ReadPosRankSum=1.501;SC=CACCCCTCCCCACCCCATCTC;SOR=1.609;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=4;WE=36723892;WS=36723874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr6	36723916	rs12203137	G	A	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=97;ReadPosRankSum=2.125;SC=TGATTCCCACGCTCAGCCCCT;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=6;WE=36723924;WS=36723906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr6	36733132	rs763048	G	A	7214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=133;NR=100;PP=2965;SC=GATCCCAGTCGTACACCTCCA;SOR=1.050;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=233;TCF=133;TCR=100;TR=233;WE=36733140;WS=36733122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr6	36759741	rs9366916	G	A	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=203;ReadPosRankSum=0.900;SC=CAGGGGCTCAGGGAGGCCAGC;SOR=0.260;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=10;WE=36759749;WS=36759731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr6	36759768	rs9349011	C	A	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=188;ReadPosRankSum=1.314;SC=TCCATCACCCCCACCCCAACC;SOR=0.540;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=12;WE=36759776;WS=36759758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr6	36766292	rs6940728	C	T	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.02;ReadPosRankSum=0.644;SOR=0.597;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,36:0.26:139
chr6	36766364	rs184098380	C	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.36;ReadPosRankSum=0.023;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,7:0.18:38
chr6	36767920	rs11419511	T	TG	639.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=684;SC=GGGAGAGCACTGGCTCAGAGC;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=17;WE=36767928;WS=36767910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	36789940	rs3842097	C	CG	583.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=1.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.309;SOR=0.904;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,30:0.29:105
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chr6	36823815	rs185738522	G	A	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.827;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=623;ReadPosRankSum=-1.286;SC=AGCCCCTGGTGGGAAAAAGGA;SOR=0.979;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=97;TCF=32;TCR=65;TR=34;WE=36823823;WS=36823805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,35:0.35:101
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chr6	36853786	rs11461877	A	AG	1220.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=10;PP=1337;SC=GAGGAGCCCGAGGGGCGCGAG;SOR=1.730;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=33;WE=36853794;WS=36853776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	36853857	rs5875560	T	TCGC	2325.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=22;PP=2050;SC=TGTGACAGCCTCGCCGCGCCC;SOR=1.067;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=58;TCF=32;TCR=26;TR=44;WE=36853865;WS=36853847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	36884490	rs2293394	C	T	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=249;ReadPosRankSum=-0.617;SC=GTCTAGTTCTCCCCTCCTGCT;SOR=1.251;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=13;WE=36884498;WS=36884480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr6	36922385	rs1405070	G	A	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.617;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.965;NF=8;NR=0;PP=156;ReadPosRankSum=0.344;SC=GACCCAAAGCGCCCAGCCCTC;SOR=0.120;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=8;WE=36922393;WS=36922375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr6	36922684	rs1405069	A	C	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=161;ReadPosRankSum=1.336;SC=GGTATCCCCGACGGCCTCAGA;SOR=0.247;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=9;WE=36922692;WS=36922674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr6	36931162	rs2296934	A	G	1532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.396;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=36;PP=1194;ReadPosRankSum=-0.359;SC=GGGCAAGGGAACTCCTACCCC;SOR=0.841;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=206;TCF=102;TCR=104;TR=66;WE=36931170;WS=36931152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,66:0.32:206
chr6	36931491	rs34165286	G	A	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=14.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.23;ReadPosRankSum=-0.493;SOR=0.067;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,14:0.23:60
chr6	36937647	rs2140937	T	C	1123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.073;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=3;PP=867;ReadPosRankSum=-0.433;SC=TTTCTGAAATTATGTAAGATG;SOR=2.115;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=36;WE=36937655;WS=36937637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,38:0.78:49
chr6	36944495	rs708007	A	G	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.164;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=124;ReadPosRankSum=1.482;SC=CCTGGCACCTACCCAGGGCTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=36944503;WS=36944485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr6	36949527	rs2293390	C	T	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.094;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=555;ReadPosRankSum=1.082;SC=ACACCTCTTGCCCCCTTTGCT;SOR=0.286;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=27;WE=36949535;WS=36949517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr6	36976901	rs6927538	C	A	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=379;ReadPosRankSum=0.593;SC=CCCTGACCTCCCCTCCACACA;SOR=0.148;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=18;WE=36976909;WS=36976891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr6	36978879	rs1724087	T	C	1393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.637;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=40;PP=1146;ReadPosRankSum=0.499;SC=TCTCCTCACCTCACCCCTTCT;SOR=2.387;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=58;TCF=6;TCR=52;TR=43;WE=36978887;WS=36978869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,46:0.74:62
chr6	36982947	rs831494	C	T	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=144;ReadPosRankSum=-0.079;SC=CTGTCTTTTTCTGCTTTGGCA;SOR=0.142;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=8;WE=36982955;WS=36982937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr6	36988364	rs831504	C	T	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=4;PP=969;ReadPosRankSum=-0.686;SC=TCCTGGTGTCCGGGAAGCAGC;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=35;WE=36988372;WS=36988354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr6	36988664	.	A	ATGTGTGTG	134	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=25;MQ=61.78;NF=1;NR=2;PP=134;QD=46.0;SC=GTATGTATGCATGTGTGTGTG;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=3;WE=36988672;WS=36988654;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,3:0.50:6
chr6	36989391	rs831502	G	C	2405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=32;PP=1913;SC=GTAAATGAAGGCTTTTTCATC;SOR=0.920;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=74;WE=36989399;WS=36989381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr6	36990736	rs831499	T	C	6299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=136;NR=54;PP=2965;SC=TTGCTGAAGGTACCCCTGAAG;SOR=1.975;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=191;TCF=137;TCR=54;TR=190;WE=36990744;WS=36990726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr6	37138023	rs59116171	GGCA	G	697.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=7;NR=8;PP=759;SC=CGGCGGGACCGGCAGCAGCAG;SOR=1.061;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=15;WE=37138033;WS=37138013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	37138220	rs262936	C	G	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=15;PP=929;ReadPosRankSum=1.867;SC=CAGCCGCAGCCACAGCCGCAA;SOR=0.787;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=49;WE=37138228;WS=37138210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,49:0.72:68
chr6	37139322	rs262938	T	C	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=44;PP=1144;ReadPosRankSum=0.436;SC=CCCGGCCCAGTCCGGAGGCCT;SOR=0.914;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=83;TCF=9;TCR=74;TR=49;WE=37139330;WS=37139312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,48:0.59:81
chr6	37180237	rs1224329	G	A	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=1;PP=1005;SC=AGGTAGTCATGAGTTCACTGC;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=34;WE=37180245;WS=37180227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	37180355	rs1150789	G	A	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=18;PP=1049;ReadPosRankSum=-1.171;SC=AAGTGCAGGAGCATGTGTGAG;SOR=0.754;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=96;TCR=45;TR=55;WE=37180363;WS=37180345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,56:0.39:145
chr6	37180523	rs1150790	A	G	5583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=79;NR=86;PP=2965;SC=ATACAATAAAAGAGGAAGCAG;SOR=0.792;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=79;TCR=86;TR=165;WE=37180531;WS=37180513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
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chr6	37237550	rs17572320	A	G	2930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.036;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=91;PP=2962;ReadPosRankSum=0.808;SC=ATTTTGGACCAGGAGATGAGC;SOR=1.426;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=163;TCF=33;TCR=130;TR=111;WE=37237558;WS=37237534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,110:0.67:163
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chr6	37252210	rs3818136	C	T	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.649;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=886;ReadPosRankSum=-0.369;SC=ACTCTCGAAACGAGGAACATC;SOR=0.599;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=159;TCF=56;TCR=103;TR=50;WE=37252218;WS=37252200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,50:0.30:167
chr6	37280844	rs149708	A	G	1078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=28;PP=921;SC=CTAGGTCCAGAGGCTCCCAGC;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=37280852;WS=37280834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	37342216	.	A	G	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=364;ReadPosRankSum=-0.167;SC=CTCTCCCCTGAAAAAAGCAGC;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=59;TCR=0;TR=19;WE=37342224;WS=37342206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,19:0.31:62
chr6	37418263	rs2270687	A	G	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=376;ReadPosRankSum=-0.794;SC=CTGTGTCAAGAGGGAGTGTCA;SOR=0.389;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=19;WE=37418271;WS=37418253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr6	37445511	.	C	G	104	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=20;MQ=60.0;NF=0;NR=12;PP=104;QD=11.5642677123;SC=GGGTCGGGGGCGGGGGGTGGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=12;WE=37445519;WS=37445501;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr6	37446061	rs3830396	TCA	T	1023.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.058;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=787;ReadPosRankSum=-1.705;SC=GCTGTGTGCCTCAGTTTCATC;SOR=1.996;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=71;TCF=63;TCR=8;TR=22;WE=37446070;WS=37446051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,29:0.36:81
chr6	37447075	rs2797790	G	A	2080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=55;PP=1572;SC=GCAGCCTCAAGTACTCCTGCA;SOR=3.816;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=8;TCR=55;TR=63;WE=37447083;WS=37447065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr6	37447994	rs1874736	C	G	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-4.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=183;ReadPosRankSum=1.951;SC=GCCCACAGTGCTGGCTTCTTC;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=11;WE=37448002;WS=37447984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr6	37450914	rs10692	T	C	3415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=85;NR=16;PP=2635;SC=TTGATCCTGATCAAGGGGCCA;SOR=3.279;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=102;TCF=85;TCR=17;TR=101;WE=37450922;WS=37450904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr6	37475494	.	GGGGGTGGGGGTAGATGGTGATGGGGATGGGGGTAGGTGGTGGT	G	600.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.55;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	37501967	rs2797786	A	G	1850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=23;PP=1465;SC=TTGAGTTACCAAGAGGTGTCC;SOR=1.467;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=40;TCR=23;TR=63;WE=37501975;WS=37501957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr6	37502554	.	TGGGAGGGGGAAGA	T	106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=3.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQRankSum=-0.812;QD=8.89;ReadPosRankSum=-2.655;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr6	37502571	.	A	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQRankSum=-1.221;QD=12.86;ReadPosRankSum=-2.200;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,2:0.22:9
chr6	37502585	rs1317487	C	A	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=22;ReadPosRankSum=0.120;SC=TTAAATTATGCAAGTAATACA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=3;WE=37502593;WS=37502575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr6	37503233	rs868870	C	T	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.798;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=178;ReadPosRankSum=2.063;SC=TGCAATGTGACGGGCCTGCAG;SOR=0.021;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=12;WE=37503241;WS=37503223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr6	37522966	rs6942122	T	C	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=4;PP=409;SC=AAGCTCTTCATTGGGCCATAA;SOR=2.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=37522974;WS=37522963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	37606190	rs41273094	T	G	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.453;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=261;ReadPosRankSum=-1.387;SC=TACCTGGAAGTTCCCCCTAAC;SOR=0.399;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=15;WE=37606198;WS=37606180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr6	37606305	rs3818020	G	A	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.040;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=11;PP=1057;ReadPosRankSum=0.700;SC=TGGGCCCTACGGACTCACCTG;SOR=0.569;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=79;TCF=62;TCR=17;TR=49;WE=37606313;WS=37606295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,49:0.61:80
chr6	37611796	rs45511994	G	A	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=157;ReadPosRankSum=1.062;SC=TCTCTGCCTAGGCCTCTGCGG;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=9;WE=37611804;WS=37611786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr6	37617519	rs708022	A	C	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.06;ReadPosRankSum=1.463;SOR=0.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr6	37617529	rs708021	T	C	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.81;ReadPosRankSum=0.232;SOR=0.241;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr6	37617569	rs708020	C	T	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.586;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=281;ReadPosRankSum=0.167;SC=TTTCATCATCCTGTTATCAGA;SOR=0.142;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=59;TCF=54;TCR=5;TR=17;WE=37617577;WS=37617559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,18:0.30:61
chr6	37620129	rs2273109	G	A	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.900;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=36;PP=1019;ReadPosRankSum=-0.293;SC=GTGAGTGGATGGGGAGGGAAG;SOR=0.195;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=66;TCF=7;TCR=59;TR=42;WE=37620137;WS=37620119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,44:0.65:68
chr6	37623566	rs3846874	C	T	2602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.401;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=60;PP=1945;ReadPosRankSum=0.477;SC=AGCGGGCAGGCGGGTTGGAGT;SOR=0.504;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=139;TCF=53;TCR=86;TR=99;WE=37623574;WS=37623556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,106:0.72:147
chr6	37623626	rs13204070	C	T	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.996;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=24;PP=553;ReadPosRankSum=0.613;SC=AGTTGCCTCGCACATCGCTCA;SOR=0.858;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=90;TCF=18;TCR=72;TR=30;WE=37623634;WS=37623616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,31:0.32:96
chr6	37626142	rs2273110	C	T	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=1.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.795;SOR=0.855;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,53:0.27:193
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chr6	37971756	rs190041895	C	A	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=42;ReadPosRankSum=1.166;SC=AGGGGCAATTCTTCTTTTTCT;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=5;WE=37971764;WS=37971746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
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chr6	38256036	rs149086313	G	GA	543.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=614;ReadPosRankSum=-0.691;SC=GAATGAGGAGGAATCTTCTTA;SOR=0.606;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=64;TCR=7;TR=18;WE=38256044;WS=38256026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,22:0.31:72
chr6	38455368	rs113789617	CGA	C	177.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQRankSum=-0.077;QD=8.46;ReadPosRankSum=1.177;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
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chr6	38472176	rs73426901	A	G	1346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.041;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=4;PP=1060;ReadPosRankSum=-1.250;SC=CACTACCCAAACTACAAAATT;SOR=0.105;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=65;TCF=61;TCR=4;TR=45;WE=38472184;WS=38472166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,48:0.70:69
chr6	38702468	.	CT	C	27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=27;QD=26.0;SC=CACACTTATGCTTTACTTTGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=2;WE=38702476;WS=38702458;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,2:0.22:9
chr6	38750705	rs3800357	A	G	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=156;ReadPosRankSum=-0.582;SC=CATTTTACATATAAGTACTTT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=8;WE=38750713;WS=38750695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr6	38757378	rs7756191	C	T	542.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=455;ReadPosRankSum=-0.712;SC=GAAATTGCTACTGACTTGTTT;SOR=3.056;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=18;WE=38757386;WS=38757368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr6	38757615	rs45529837	G	A	2779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.836;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=50;PP=2112;ReadPosRankSum=0.432;SC=ATGTCAGGAAGTGCCTTCTGT;SOR=0.315;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=142;TCF=75;TCR=67;TR=98;WE=38757623;WS=38757605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,106:0.71:150
chr6	38771096	rs12192604	T	C	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.904;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=371;ReadPosRankSum=-1.011;SC=AGGTAACTTTTCTCGTTACTG;SOR=0.659;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=83;TCF=44;TCR=39;TR=24;WE=38771104;WS=38771086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,25:0.29:85
chr6	38783177	rs56093987	G	A	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.214;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=117;ReadPosRankSum=0.550;SC=GGGAATGGAGGTGGTGAAAAT;SOR=0.105;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=9;WE=38783185;WS=38783167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr6	38793815	rs12197467	G	A	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=167;ReadPosRankSum=0.117;SC=CACATTTCAAGTGTTCAAAAG;SOR=0.173;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=9;WE=38793823;WS=38793805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr6	38794183	rs34231573	A	AT	537.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=298;ReadPosRankSum=-0.356;SC=AAATGATTGCATTTTTTTTTC;SOR=0.582;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=18;WE=38794191;WS=38794173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
chr6	38851305	rs62398567	C	T	921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=753;ReadPosRankSum=1.665;SC=AAAATGTGTACGCATATAAAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=27;WE=38851313;WS=38851295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr6	38851585	rs72852780	T	A	2803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=1;PP=2290;ReadPosRankSum=0.530;SC=CTGACAAGAATGCTCATTATT;SOR=6.067;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=81;TCF=80;TCR=1;TR=79;WE=38851593;WS=38851575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr6	38873960	rs7750330	G	A	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=4;PP=322;SC=TGGGATTACAGGTGTGAGCCA;SOR=1.445;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=38873968;WS=38873950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	38877605	rs4714198	C	A	2319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=65;PP=1952;SC=CAGCAGAAGACTCTTTCTATT;SOR=4.235;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=6;TCR=65;TR=71;WE=38877613;WS=38877595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr6	38885010	rs11291395	TA	T	1135.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=2;PP=1182;SC=TAATCCCAAATATAGACTATC;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=38885018;WS=38885000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	38899485	rs9296268	G	C	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=1;PP=83;SC=CCAATTTATTGAAGCGTCACA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=38899493;WS=38899480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	38906072	rs2073037	A	G	3385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=91;PP=2725;SC=TCTTTTAGAAATTGCTTTTTC;SOR=4.555;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=9;TCR=91;TR=100;WE=38906080;WS=38906062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr6	38913177	rs522327	A	G	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.797;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=551;ReadPosRankSum=0.162;SC=TTATTATTTGAAAAGTACATT;SOR=0.809;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=104;TCF=64;TCR=40;TR=30;WE=38913185;WS=38913167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,33:0.30:109
chr6	38941611	rs4711567	C	G	1916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.963;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=53;PP=1531;ReadPosRankSum=1.498;SC=AACGTCTTTTCATCGAGAGTC;SOR=0.155;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=93;TCF=7;TCR=86;TR=59;WE=38941619;WS=38941601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,65:0.64:101
chr6	38950342	rs150776419	TG	T	556.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=687;ReadPosRankSum=-0.910;SC=CTGAGCCCCATGGAGCCCCCT;SOR=0.593;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=18;WE=38950350;WS=38950332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr6	38952246	rs34819199	GCACA	G	152.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=193;ReadPosRankSum=2.329;SC=GCACACACATGCACACACACA;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=6;WE=38952257;WS=38952236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr6	38952287	rs35676616	G	T	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=10;PP=271;SC=CCAGCAATTGGGCCAGGCATG;SOR=4.977;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=38952295;WS=38952277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	38957771	rs3737095	T	C	2147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=64;NR=0;PP=1870;SC=ATTTCTTTTGTTTTCTCTCAC;SOR=8.318;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=64;TCR=0;TR=64;WE=38957779;WS=38957761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr6	38957853	rs3737094	A	G	6122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=119;NR=67;PP=2965;SC=AAATCCCCTTATGCAAAACCT;SOR=1.374;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=119;TCR=67;TR=186;WE=38957861;WS=38957843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr6	38979946	rs9296273	T	A	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=542;SC=AAGAGAAATGTCAGATGAGAA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=38979954;WS=38979936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	39016636	rs10305420	C	T	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=12;PP=564;SC=GCCCCCGGCCCGCTGCGCCTT;SOR=0.976;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=28;WE=39016644;WS=39016626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	39033420	rs910163	A	G	1448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.29;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	39033427	rs910162	A	T	1544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.75;SOR=5.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	39033602	rs6918287	A	G	5274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=95;NR=64;PP=2965;SC=AGCGAGGGGAAAGAGTGAGTT;SOR=1.036;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=95;TCR=64;TR=159;WE=39033610;WS=39033592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr6	39033778	rs3765466	T	A	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=40;PP=1129;SC=TGTATTCACCTCTCTGGCCTT;SOR=4.362;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=43;WE=39033786;WS=39033768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr6	39033898	rs9296276	G	T	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=7;PP=828;SC=CTCTGTCTCTGTGCCATGGGA;SOR=2.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=29;WE=39033906;WS=39033888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	39034072	rs6923761	G	A	3006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=45;PP=2296;SC=GATCCTCCTCGGCTTCAGGTA;SOR=0.757;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=44;TCR=45;TR=89;WE=39034080;WS=39034062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr6	39034210	rs4711572	A	G	1382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=37;PP=1150;SC=CTCTCTACAGAGCCCTGACCG;SOR=3.417;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=43;WE=39034218;WS=39034200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	39034248	rs9296277	G	A	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=559;SC=AACACAGGATGTGATACTGTG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=39034256;WS=39034238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	39040654	rs2235868	A	C	4286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=42;PP=2965;SC=GCACTGCACCAGGAACTACAT;SOR=1.768;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=95;TCR=42;TR=137;WE=39040662;WS=39040644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr6	39041502	rs1042044	A	C	4588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=42;PP=2965;SC=TCTCGGTCTTATCTGAGCAAT;SOR=1.678;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=88;TCR=43;TR=129;WE=39041510;WS=39041492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr6	39041671	.	C	T	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.328;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=42;PP=1065;ReadPosRankSum=0.401;SC=AACCCTCTTCCTGGGCACAGG;SOR=0.615;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=60;TCF=2;TCR=58;TR=44;WE=39041679;WS=39041661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,48:0.75:64
chr6	39046794	rs10305492	G	A	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=927;ReadPosRankSum=0.574;SC=CATTCTCTTTGCCATTGGGGT;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=73;TCF=38;TCR=35;TR=49;WE=39046802;WS=39046784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,49:0.69:71
chr6	39048491	rs1126476	A	C	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=9;PP=629;SC=TGGTGGCCATATTATACTGCT;SOR=1.136;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=24;WE=39048499;WS=39048481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	39162206	rs2815098	A	G	1716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=23;PP=1483;SC=CTAGAGGAGAAGCTAGCTGGG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=23;TCR=24;TR=46;WE=39162214;WS=39162196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr6	39278848	rs200555541	GCACACA	G	424.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=599;SC=ACCCCAAGATGCACACACACA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=11;WE=39278861;WS=39278838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr6	39282036	rs10947804	T	C	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=44;PP=947;ReadPosRankSum=-0.023;SC=AGCACGGTGCTGGGCACCGCG;SOR=1.031;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=8;TCR=58;TR=50;WE=39282044;WS=39282026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,52:0.76:68
chr6	39282119	rs62397171	C	G	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=14.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.09;ReadPosRankSum=-1.220;SOR=0.585;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr6	39282748	rs11756070	G	A	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=569;ReadPosRankSum=-1.321;SC=TGGAGGAAGCGTCTAGGCTGT;SOR=0.963;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=27;WE=39282756;WS=39282738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr6	39282806	rs11756091	G	T	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.268;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=17;PP=888;ReadPosRankSum=2.480;SC=CTTGGATATGGGGAAGTCCTG;SOR=0.409;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=64;TCF=40;TCR=24;TR=41;WE=39282814;WS=39282796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,44:0.67:66
chr6	39283083	rs11753141	G	A	3883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=76;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.597;SC=GAGGCCAGACGTTCATGGAGC;SOR=0.691;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=232;TCF=113;TCR=119;TR=148;WE=39283091;WS=39283073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,147:0.63:232
chr6	39284050	rs1535500	G	T	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.333;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=694;ReadPosRankSum=0.391;SC=GTCAGAGGCTGCCCCATCCTT;SOR=1.140;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=43;TCF=26;TCR=17;TR=30;WE=39284058;WS=39284040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,30:0.70:43
chr6	39284184	rs3734618	A	G	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=870;ReadPosRankSum=1.044;SC=CCAGGCTCCGATACACTGAGA;SOR=0.536;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=51;TCF=20;TCR=31;TR=41;WE=39284192;WS=39284174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,45:0.83:54
chr6	39290200	rs3734619	C	T	2437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.790;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=64;PP=1931;ReadPosRankSum=1.509;SC=ACTGAGCCTCCGCCTGCCTCT;SOR=1.845;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=111;TCF=35;TCR=76;TR=88;WE=39290208;WS=39290190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,89:0.79:112
chr6	39325078	rs20455	A	G	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.713;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=358;ReadPosRankSum=-1.434;SC=AGTTGGGACCATTCATGCTGG;SOR=1.310;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=65;TCF=45;TCR=20;TR=24;WE=39325086;WS=39325068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,26:0.36:72
chr6	39328450	rs56731267	C	T	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=28;ReadPosRankSum=1.695;SC=ATAGGAGCTTCGGAGGCCAGG;SOR=0.124;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=4;WE=39328458;WS=39328440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr6	39330135	rs56003110	C	T	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=22;ReadPosRankSum=2.128;SC=TAGCTGCAGCCCTGGGAAGCT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=3;WE=39330143;WS=39330125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr6	39545689	rs12697946	T	G	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-4.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=375;ReadPosRankSum=-1.554;SC=AAGCCGCCACTCTTAACTGGC;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=20;WE=39545697;WS=39545679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
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chr6	39564040	.	TA	T	597.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.734;NF=3;NR=21;PP=464;ReadPosRankSum=1.001;SC=TAGGAGTCTATAAAAAAATTG;SOR=0.608;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=69;TCF=10;TCR=59;TR=24;WE=39564048;WS=39564030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,31:0.41:76
chr6	39585399	rs2466406	A	G	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5033;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=263;ReadPosRankSum=-0.844;SC=ATCACGACAAATGTCTGTCAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=11;WE=39585407;WS=39585389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr6	39682367	rs303701	G	A	3851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=97;NR=15;PP=2965;SC=TGCAGCCTAAGTATATAATTG;SOR=3.481;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=114;TCF=98;TCR=16;TR=112;WE=39682375;WS=39682357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr6	39688367	rs10947834	T	C	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=257;ReadPosRankSum=-0.632;SC=AAGAGCTGCGTTGCATTTTCC;SOR=1.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=12;WE=39688375;WS=39688357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr6	39693271	rs10947835	C	G	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.986;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=28;PP=669;ReadPosRankSum=0.766;SC=GAGGCCACTACGGGGCGGGGC;SOR=2.812;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=29;WE=39693279;WS=39693261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,29:0.71:41
chr6	39828593	rs2504099	A	T	2027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=2;PP=1560;ReadPosRankSum=-0.741;SC=GGAGGAAGATAGTAGTAGCCT;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=55;TCF=53;TCR=2;TR=54;WE=39828601;WS=39828583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr6	39828862	rs2504098	A	C	4318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=72;PP=2965;SC=CTGCCTTGGCATGCTCATGCA;SOR=0.945;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=127;TCF=54;TCR=73;TR=126;WE=39828870;WS=39828852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr6	39832111	rs2504787	A	G	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=4;PP=641;SC=GGCAGAGCTGAGAAATGAATC;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=39832119;WS=39832101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	39832363	rs2504094	C	G	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.51;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	39832964	rs2504093	T	C	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=27;PP=680;SC=TGGCCAACTCTGCCTCACCTG;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=39832972;WS=39832954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	39839164	rs2504088	T	C	412.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=363;ReadPosRankSum=1.961;SC=TTGCCTTCATTTTGCTTGAAT;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=15;WE=39839172;WS=39839154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr6	39846137	rs2504086	A	G	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=24;PP=1191;SC=CATTACTCACATTCTCTCCTT;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=27;TCR=24;TR=51;WE=39846145;WS=39846127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	39847279	rs2504797	G	A	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.111;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=538;ReadPosRankSum=-0.074;SC=GGGGCTGGAGGGCCCATTCTT;SOR=0.392;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=90;TCF=35;TCR=55;TR=30;WE=39847287;WS=39847269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,30:0.34:88
chr6	39851818	rs3003929	G	A	2967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=52;PP=2312;ReadPosRankSum=0.948;SC=ATTTTGAAAAGATGTTTTCAG;SOR=0.360;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=35;TCR=53;TR=87;WE=39851826;WS=39851808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,93:0.99:94
chr6	39855112	rs3003945	T	G	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=289;SC=TTAGCTATTATCCACCCTCCT;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=39855120;WS=39855110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	39855427	rs3008810	C	T	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=24;PP=722;SC=GGTGGAGGAACGGAGTGGTGG;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=39855435;WS=39855417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	39855490	rs5875688	C	CTGGA	447.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=401;SC=AGGCATTGATCTGGAACTGTC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=8;WE=39855498;WS=39855480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	39864730	rs3008815	C	T	2944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=52;PP=2414;SC=TCAACAAGATCGCTGACACCA;SOR=1.095;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=36;TCR=52;TR=88;WE=39864738;WS=39864720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr6	39865047	rs3004067	T	C	2911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=69;PP=2241;SC=TTCCAGAAGCTGCCAAAGTCA;SOR=1.542;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=35;TCR=69;TR=104;WE=39865055;WS=39865037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr6	39866805	rs3830992	A	AACAATGGGC	4208.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=45;PP=2975;SC=AGGGGCAAAAAACAATGGGTA;SOR=2.303;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=84;TCF=11;TCR=73;TR=54;WE=39866813;WS=39866795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr6	39869066	rs882559	G	C	1720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=21;PP=1320;SC=ATCCTGTTCTGTCCCTTGACA;SOR=1.199;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=32;TCR=21;TR=53;WE=39869074;WS=39869056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	39873307	rs56355907	T	G	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=26;PP=668;ReadPosRankSum=2.099;SC=TCTGCAAAGTTGGCATCGTAG;SOR=0.682;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=33;TCR=66;TR=39;WE=39873315;WS=39873297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,42:0.40:105
chr6	39895410	rs3008822	T	C	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=28;PP=632;SC=GTATTCAGCTTGGGGGTCGGG;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=39895418;WS=39895400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	40360465	rs3734557	A	G	7018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=125;NR=84;PP=2965;SC=TGCCGCCCAGAATCTGGCTGT;SOR=1.168;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=209;TCF=125;TCR=84;TR=209;WE=40360473;WS=40360455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr6	40360755	rs3734555	G	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.22;ReadPosRankSum=-0.087;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr6	40360781	rs3734554	C	T	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=-0.981;SC=AAGACAGACACGGGGACACAG;SOR=1.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=4;WE=40360789;WS=40360771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
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chr6	41021108	rs41273358	G	A	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=558;ReadPosRankSum=0.902;SC=GGAAGAGGCTGCTGTGGCCAC;SOR=0.843;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=24;WE=41021116;WS=41021098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,26:0.76:34
chr6	41052002	rs6908595	A	G	992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=29;PP=817;SC=ATTACAACCTATTTGATAATT;SOR=4.047;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=41052010;WS=41051992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	41162060	rs13216201	G	T	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.60;ReadPosRankSum=0.579;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
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chr6	41162715	rs4711657	G	A	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=53;ReadPosRankSum=1.616;SC=CTAGGATTCTGGCTGCTGAGT;SOR=0.283;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=41162723;WS=41162705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr6	41169021	rs5875743	C	CA	1134.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=29;PP=1346;SC=GGCCCCAAGCCGGGAGGACTC;SOR=5.353;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=41169029;WS=41169011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	41196034	rs6458202	T	C	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.63;QD=42.61;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	41196040	rs6458203	TC	CT	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.60;QD=43.34;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	41196095	rs6458205	C	T	1684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=12;PP=931;SC=TCAGACCCAGCGTCTGACTCC;SOR=1.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=38;WE=41196112;WS=41196085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	41196104	rs10700462	C	CCTT	1810.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=11;PP=1545;SC=GCGTCTGACTCCTCCTGAGAG;SOR=1.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=22;TCR=13;TR=29;WE=41196112;WS=41196085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	41196156	rs2803496	C	T	1463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=22;PP=1165;SC=AGAAACAGATCTGGGCTGGAA;SOR=0.823;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=26;TCR=22;TR=48;WE=41196164;WS=41196146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr6	41196605	rs9369265	T	C	4427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=39;PP=2965;SC=CTCCAAGCCCTGGACAGCAGT;SOR=2.076;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=102;TCR=39;TR=141;WE=41196613;WS=41196595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr6	41196727	rs2101269	C	T	6680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=142;PP=2965;SC=GAATCTACAACGCTTCCGAAA;SOR=1.953;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=201;TCF=58;TCR=143;TR=200;WE=41196735;WS=41196717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr6	41197785	rs9296357	T	C	2811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=52;PP=2236;SC=ACTGTCTTCTTTGTGTCCTCT;SOR=1.312;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=32;TCR=52;TR=84;WE=41197793;WS=41197775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr6	41197857	rs7769759	C	T	1090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=23;PP=755;SC=GGCTCTGAGACCAGGTAGGTC;SOR=1.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=32;WE=41197865;WS=41197847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	41198909	rs4337930	T	C	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=16;PP=332;SC=TATTACAACATGATAATAATA;SOR=4.514;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=17;WE=41198917;WS=41198899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	41199973	rs1825409	C	T	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.572;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.023;NF=26;NR=10;PP=616;ReadPosRankSum=0.531;SC=AACATCCCCACTGAAAACACT;SOR=0.303;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=117;TCF=91;TCR=26;TR=36;WE=41199981;WS=41199963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,39:0.32:123
chr6	41200245	rs7746632	A	G	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.111;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=608;ReadPosRankSum=0.030;SC=ACTTGGAGGTAGGGGATGGTT;SOR=0.129;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=90;TCF=14;TCR=76;TR=35;WE=41200253;WS=41200235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,36:0.39:92
chr6	41200293	rs12526284	T	C	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.030;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=736;ReadPosRankSum=-0.637;SC=ACTGTGCATTTTATTTATTTA;SOR=2.406;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=25;WE=41200301;WS=41200283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr6	41204049	rs9394776	C	T	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=28;ReadPosRankSum=1.299;SC=TGACTAGGTCCCCTCTCAGTC;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=3;WE=41204057;WS=41204039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr6	41204092	rs9349185	C	T	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=4.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.21;ReadPosRankSum=-0.361;SOR=1.785;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr6	41204092	.	CTC	TTG	248	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=4;NR=1;PP=248;QD=60.2935749724;SC=CCCCACACCCCTCTGTCATCG;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=5;WE=41204102;WS=41204082;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr6	41204094	rs9394777	C	G	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=4.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.63;ReadPosRankSum=-0.614;SOR=1.946;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr6	41204329	rs9349186	A	T	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.668;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=351;ReadPosRankSum=0.474;SC=GAGTCCTGTTAGTGCTCCTGA;SOR=0.258;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=63;TCF=12;TCR=51;TR=24;WE=41204337;WS=41204319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,24:0.38:64
chr6	41243740	rs2234246	C	T	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=31;ReadPosRankSum=0.799;SC=TAGAAATAGCCGGTGATTACA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=4;WE=41243748;WS=41243730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr6	41243991	rs2234243	C	T	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.931;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=452;ReadPosRankSum=-0.907;SC=AGAGGCTGAACGCTACTGCTG;SOR=1.609;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=22;WE=41243999;WS=41243981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr6	41250179	rs2234239	C	T	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.671;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=183;ReadPosRankSum=-0.544;SC=TGTGAGGCTCCTTGGGAGGCT;SOR=0.338;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=12;WE=41250187;WS=41250169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr6	41303592	rs9394782	T	C	5745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=119;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.699;SC=TCCCCTCCCATGAGCGCACAG;SOR=0.408;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=202;TCF=82;TCR=120;TR=201;WE=41303600;WS=41303582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,206:1.00:207
chr6	41309552	rs2236369	T	C	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=3;PP=557;SC=CACACAGACCTCCTGGACTCC;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=41309560;WS=41309542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	41309698	rs2236370	G	C	2265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=26;PP=1775;SC=AGCCACACAGGCCTGGGCGGG;SOR=1.226;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=45;TCR=26;TR=71;WE=41309706;WS=41309688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr6	41318438	rs2273962	A	G	2081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=60;NR=15;PP=1794;SC=GTGGAAAACCATGATGGAGCT;SOR=2.463;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=60;TCR=15;TR=75;WE=41318446;WS=41318428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr6	41486990	rs2496647	G	A	1394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=3;PP=1099;SC=ATGCAAAATTGGGATAATTAT;SOR=4.125;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=39;WE=41486998;WS=41486980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	41533579	rs2104506	C	A	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.251;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=896;ReadPosRankSum=2.413;SC=CTGGGCAAGCCGATGGCAGCA;SOR=0.480;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=118;TCF=52;TCR=66;TR=46;WE=41533587;WS=41533569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,46:0.39:117
chr6	41537817	.	GAC	G	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=154;ReadPosRankSum=0.623;SC=ACCACCCCCTGACACACACAC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=3;WE=41537826;WS=41537810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr6	41552429	rs4714489	G	A	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=359;ReadPosRankSum=0.309;SC=ACTCTGCCACGCTGAGAGTGG;SOR=0.432;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=75;TCF=68;TCR=7;TR=23;WE=41552437;WS=41552419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,26:0.33:79
chr6	41553057	rs72858995	C	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=71;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GAAAGCCAGACCATGTTTTAG;SOR=0.093;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=41553065;WS=41553047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr6	41554993	rs11758591	G	C	2617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.295;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=46;PP=2142;ReadPosRankSum=-1.220;SC=GTAGAAAGCCGAGTGTTCGTG;SOR=0.570;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=82;TCR=72;TR=97;WE=41555001;WS=41554983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,95:0.61:155
chr6	41557448	.	G	A	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.901;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=163;ReadPosRankSum=0.058;SC=TGGAGGGGTGGGACAACACTG;SOR=0.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=10;WE=41557456;WS=41557438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr6	41558198	rs55892416	G	A	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=221;ReadPosRankSum=1.813;SC=GAGCTGTCCCGCTCCCTCTCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=14;WE=41558206;WS=41558188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,15:0.32:47
chr6	41562514	rs41273788	C	T	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=3.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.94;ReadPosRankSum=0.385;SOR=1.322;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,13:0.19:69
chr6	41562530	rs9367109	A	G	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.10;ReadPosRankSum=-0.769;SOR=0.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,19:0.22:88
chr6	41613772	rs7763699	A	G	1495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.265;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=8;PP=1163;ReadPosRankSum=-0.439;SC=ATGAGGGTTCAGTGGGCATGC;SOR=0.986;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=89;TCF=77;TCR=12;TR=62;WE=41613780;WS=41613762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,63:0.70:90
chr6	41617626	rs2073159	G	C	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.748;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=32;PP=463;ReadPosRankSum=-0.296;SC=CTCCAAAGCCGGGTTCCTCGA;SOR=1.730;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=100;TCF=7;TCR=93;TR=33;WE=41617634;WS=41617616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,35:0.33:106
chr6	41617658	rs2281326	G	A	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=379;ReadPosRankSum=1.268;SC=TGGGCCCACTGGAGCACCTTC;SOR=0.481;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=63;TCF=2;TCR=61;TR=21;WE=41617666;WS=41617648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,22:0.34:65
chr6	41620975	rs2842657	A	G	1712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=5;PP=1400;SC=CCGCTGCCGCAGGCCCCCACA;SOR=4.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=56;TCR=5;TR=61;WE=41620983;WS=41620965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr6	41621271	rs2230088	G	A	2024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.783;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=52;PP=1590;ReadPosRankSum=-0.021;SC=CGGACTGCCTGGAGATCTGCA;SOR=1.200;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=123;TCF=44;TCR=79;TR=75;WE=41621279;WS=41621261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,78:0.61:128
chr6	41652514	rs2073158	C	T	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.656;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=558;ReadPosRankSum=0.497;SC=CATGCCCCGGCGCCAGGGGTT;SOR=0.766;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=152;TCF=68;TCR=84;TR=43;WE=41652522;WS=41652504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,44:0.28:157
chr6	41652604	rs1062966	T	C	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.995;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=318;ReadPosRankSum=0.714;SC=GGAATGGGGATGGTGGCTGGG;SOR=0.941;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=74;TCF=23;TCR=51;TR=24;WE=41652612;WS=41652594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,26:0.33:78
chr6	41655005	rs2073157	G	A	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=91;ReadPosRankSum=-0.482;SC=CTTCAGGGCAGCCTGCAGCTT;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=41655013;WS=41654995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr6	41748263	rs28360509	C	T	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=197;ReadPosRankSum=-0.827;SC=GCCCTTGCACCTGCATGGCAG;SOR=0.315;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=11;WE=41748271;WS=41748253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr6	41748279	rs10947986	A	G	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=25;PP=697;SC=GGCAGAGGCCATGGAGCCCGC;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=41748287;WS=41748269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr6	41754576	rs9381093	C	T	2514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=63;PP=2006;ReadPosRankSum=1.229;SC=GAACACTCCTCGCTGCTGCCG;SOR=0.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=350;TCF=162;TCR=188;TR=114;WE=41754584;WS=41754566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:245,113:0.32:358
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chr6	42094699	rs6940849	G	T	1477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=28;PP=1068;SC=GACTCATTTGGTTTTTTTCTT;SOR=1.157;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=48;WE=42094707;WS=42094689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr6	42110263	rs6911399	T	C	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=20;PP=601;SC=TCAGCACGGTTTCCCCAGGGG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=42110271;WS=42110253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	42123317	rs1132156	A	C	4751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=86;PP=2965;SC=CCAGCCTCACATGTGCGGCTG;SOR=1.156;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=63;TCR=86;TR=149;WE=42123325;WS=42123307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
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chr6	42153609	rs9471799	C	T	4182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=94;PP=2965;SC=CCCACATCCCCCAGCACCACT;SOR=2.099;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=33;TCR=94;TR=127;WE=42153617;WS=42153599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr6	42162388	rs3749921	A	G	3341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=54;PP=2489;SC=TGCCCTCTACATACTGGGAGG;SOR=0.838;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=113;TCF=59;TCR=54;TR=113;WE=42162396;WS=42162378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr6	42162575	rs1474867	A	G	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=24;PP=675;SC=CCTGAGGAGCATCAGGGAGCA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=42162583;WS=42162565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	42176120	rs2295278	G	T	1133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=16;PP=910;SC=TCTAAAAAAAGAAAGAAACAA;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=38;WE=42176128;WS=42176110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	42176451	rs6936290	G	A	1242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=3;PP=909;SC=GCCCCCAACCGCTGTGGCAAC;SOR=3.967;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=35;WE=42176459;WS=42176441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	42176743	rs57369579	TG	T	1196.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=26;PP=1238;SC=CACGGTTTTTTGTTTTTTTTT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=42176757;WS=42176733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	42176749	rs55788550	T	C	1210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=25;PP=726;SC=TTTTTGTTTTTTTTTTTGAGA;SOR=5.211;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=26;WE=42176757;WS=42176733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	42181960	rs1884318	A	C	1846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=22;PP=1342;SC=GAGAAACCTAAGTAAAATAGC;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=38;TCR=22;TR=60;WE=42181968;WS=42181950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr6	42182183	rs1884317	C	T	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=112;SC=TTATTTCAGACGAAGATACTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=42182191;WS=42182173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr6	42532102	rs3749897	C	T	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.018;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=468;ReadPosRankSum=-0.037;SC=TCGACCGGAGCTTGCTGGAAT;SOR=1.395;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=77;TCF=30;TCR=47;TR=24;WE=42532110;WS=42532092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,24:0.31:77
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chr6	42608123	.	T	G	56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=57.19;NF=0;NR=4;PP=56;QD=22.6928031368;SC=ACCAGTAAGGTGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=4;WE=42608131;WS=42608113;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,4:0.27:15
chr6	42611936	rs11378753	T	TA	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=3.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.47;MQRankSum=3.805;QD=0.61;ReadPosRankSum=-0.442;SOR=1.396;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,9:0.18:50
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chr6	42633438	rs62414653	A	G	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=30;ReadPosRankSum=-0.210;SC=ACACAAGCTCATGTGAAGTTT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=42633446;WS=42633428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
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chr6	42641704	rs761537	G	A	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=68;ReadPosRankSum=-1.721;SC=GCTTCTCTCAGTAATGAATTA;SOR=0.086;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=5;WE=42641712;WS=42641694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr6	42644623	rs2038261	A	G	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=5.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.07;ReadPosRankSum=1.227;SOR=1.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,19:0.22:85
chr6	42650772	rs6906859	C	T	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=3.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.81;ReadPosRankSum=1.051;SOR=0.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,4:0.18:22
chr6	42658949	rs10058	T	A	1259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.341;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=39;PP=879;ReadPosRankSum=-0.146;SC=TGGATTTTTTTAACCCAGTTG;SOR=0.259;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=149;TCF=30;TCR=119;TR=53;WE=42658957;WS=42658939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,56:0.37:153
chr6	42666145	rs425876	C	T	1918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.352;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=33;PP=1546;ReadPosRankSum=0.952;SC=CGGCACGCTCCTCTCCAGCAG;SOR=1.009;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=263;TCF=150;TCR=113;TR=87;WE=42666153;WS=42666135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,86:0.32:265
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chr6	42834586	.	G	A	3621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.303;ClippingRankSum=0.000;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.430;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=53;PP=2855;ReadPosRankSum=0.913;SC=TATTCTTAATGTCATTGTAAC;SOR=1.179;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=199;TCF=114;TCR=85;TR=134;WE=42834594;WS=42834576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,138:0.67:206
chr6	42853842	rs2179719	A	G	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=13;PP=795;SC=CAGCTTAGGGATCAGCTGGGG;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=13;TCR=13;TR=26;WE=42853863;WS=42853832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	42853855	.	G	A	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.128;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=261;ReadPosRankSum=-0.680;SC=AGCTGGGGCAGAAAGCCAGGG;SOR=0.644;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=30;TCF=13;TCR=17;TR=17;WE=42853863;WS=42853832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr6	42937703	.	C	T	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.087;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.870;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=480;ReadPosRankSum=0.632;SC=GTTTTCTTCACTTTAAAAAAC;SOR=0.534;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=86;TCF=55;TCR=31;TR=30;WE=42937711;WS=42937693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,30:0.33:91
chr6	42989057	rs9296409	T	C	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=313;ReadPosRankSum=-1.810;SC=TTGTGGAATATGGTGGAGAAG;SOR=2.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=17;WE=42989065;WS=42989047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,18:0.82:22
chr6	43014298	rs9394939	TT	CC	7078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=44;PP=2947;SC=TGTTGATGGGTTGGTGGGTTC;SOR=1.521;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=96;TCR=47;TR=134;WE=43014307;WS=43014288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr6	43021976	rs34298469	CG	C	357.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.55;ReadPosRankSum=0.151;SOR=2.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr6	43098182	rs77231564	G	A	2313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.506;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=30;PP=1792;ReadPosRankSum=-0.171;SC=GGGGGCGGAAGGGATGAGGTG;SOR=1.090;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=124;TCF=75;TCR=49;TR=82;WE=43098190;WS=43098172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,84:0.66:127
chr6	43100537	rs78422682	T	G	2520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.837;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=56;PP=1882;ReadPosRankSum=-0.051;SC=TTCTGGGCCCTGCAGGCTTGG;SOR=0.446;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=161;TCF=66;TCR=95;TR=99;WE=43100545;WS=43100527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,104:0.63:165
chr6	43106417	rs76733341	A	T	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=20;ReadPosRankSum=1.248;SC=AAAAAATTTTAAAAAAGGTGC;SOR=0.223;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=3;WE=43106425;WS=43106407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr6	43110055	rs6933124	T	G	4390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.475;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=69;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.213;SC=CTGGGGAGGGTTATGCTGCAC;SOR=0.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=255;TCF=146;TCR=109;TR=163;WE=43110063;WS=43110045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,165:0.64:258
chr6	43112267	rs34764696	C	T	4049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.534;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=56;PP=2962;ReadPosRankSum=0.408;SC=TCCGGCCCCGCGGCCACCAAC;SOR=0.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=219;TCF=136;TCR=83;TR=149;WE=43112275;WS=43112257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,156:0.68:229
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chr6	43128434	rs61021888	A	G	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.537;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=676;ReadPosRankSum=-0.122;SC=TTTGGCCAACACTGCACCTGC;SOR=0.153;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=63;TCF=44;TCR=19;TR=39;WE=43128442;WS=43128424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,44:0.64:69
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chr6	43184275	rs111577855	C	A	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=27;PP=667;ReadPosRankSum=1.112;SC=CTGCCCCTGGCTTTCTGCCCT;SOR=0.623;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=63;TCF=12;TCR=51;TR=34;WE=43184283;WS=43184265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,37:0.56:66
chr6	43188173	rs75187159	A	G	5592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.224;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=145;NR=85;PP=2962;ReadPosRankSum=0.269;SC=GTCTGTGAGCAGCCCCTCCTT;SOR=0.528;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=341;TCF=218;TCR=123;TR=230;WE=43188181;WS=43188163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,235:0.68:347
chr6	43188716	rs2756178	A	T	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.756;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=632;ReadPosRankSum=-1.143;SC=TAATATCCCCACCCCGCCACA;SOR=0.491;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=58;TCF=27;TCR=31;TR=39;WE=43188724;WS=43188706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,44:0.77:57
chr6	43188940	rs6917902	C	T	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.255;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=819;ReadPosRankSum=-0.492;SC=AGTGGGTCGACGACGGTGGCT;SOR=0.446;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=60;TCF=33;TCR=27;TR=40;WE=43188948;WS=43188930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,44:0.70:63
chr6	43189375	rs6918623	A	G	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=7;PP=608;ReadPosRankSum=-0.065;SC=TTCCTGGCACACCCCTGCCCA;SOR=0.769;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=34;WE=43189383;WS=43189365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,37:0.66:56
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chr6	43190230	rs112422722	G	A	3754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.500;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=50;PP=2872;ReadPosRankSum=1.705;SC=GTGGTGCTGCGCCACCTGTGC;SOR=0.464;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=210;TCF=138;TCR=72;TR=138;WE=43190238;WS=43190220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,143:0.67:213
chr6	43193877	rs7832	G	A	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.237;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=18;PP=743;ReadPosRankSum=-1.744;SC=CTTCTGCCACGACCACTGGGA;SOR=0.219;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=36;WE=43193885;WS=43193867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,37:0.62:60
chr6	43193947	rs2233823	G	A	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.661;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=803;ReadPosRankSum=0.376;SC=GAAGACGACGGTGTGGCTGTG;SOR=1.049;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=48;TCF=26;TCR=22;TR=33;WE=43193955;WS=43193937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,33:0.70:47
chr6	43227141	rs111342015	G	A	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.063;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=476;ReadPosRankSum=-0.081;SC=TCTGTTTCCCGGTCCCTCCCC;SOR=1.445;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=22;WE=43227149;WS=43227131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr6	43230970	rs3800294	G	C	995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.036;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=643;ReadPosRankSum=-0.244;SC=CTGAGCCAGGGCGATGGCCGT;SOR=0.465;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=59;TCF=31;TCR=28;TR=35;WE=43230978;WS=43230960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,40:0.66:61
chr6	43231163	rs10948069	T	C	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=158;ReadPosRankSum=-0.517;SC=GGGTGCTCCATGTGTGCTGGC;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=10;WE=43231171;WS=43231153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr6	43250387	rs6936397	G	C	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.042;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=8;PP=1087;ReadPosRankSum=0.093;SC=AGTCTCCTAGGTTGTGGGTGC;SOR=1.426;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=65;TCF=52;TCR=13;TR=46;WE=43250395;WS=43250377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,47:0.71:66
chr6	43251912	rs3800297	A	G	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=699;ReadPosRankSum=-0.976;SC=TTGCCCAGGAAGAGCGGGAGG;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=29;WE=43251920;WS=43251902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,29:0.76:38
chr6	43252029	rs3800298	T	C	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.765;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=396;ReadPosRankSum=-0.479;SC=GCCCCAGCATTGGACACAGCC;SOR=1.003;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=46;TCF=21;TCR=25;TR=29;WE=43252037;WS=43252019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr6	43252107	rs11269387	G	GGAGGGGCTTCTCCAGAACCAAGGT	479.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.606;NF=1;NR=9;PP=158;ReadPosRankSum=0.342;SC=GCCTCCACCAGGAGGGGCTTC;SOR=0.330;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=10;WE=43252115;WS=43252097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr6	43252141	rs7763131	T	C	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-3.680;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.070;NF=0;NR=5;PP=41;ReadPosRankSum=0.102;SC=TCAGGGGCTATGGAAGATCAG;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=43252149;WS=43252131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr6	43269029	rs1574430	A	C	1206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=23;PP=1029;SC=GCATGCATATATGTGTGTGGT;SOR=0.968;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=17;TCR=23;TR=40;WE=43269037;WS=43269019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	43269179	rs2841648	CC	AA	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=7;PP=1319;SC=CATTCGAGACCCACTCGTCTC;SOR=1.528;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=23;WE=43269188;WS=43269169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	43270097	rs2651184	T	C	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.59;NF=5;NR=24;PP=621;SC=TCACGCAAGCTGGGACACTGC;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=43270105;WS=43270087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	43270326	rs2841646	A	G	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=306;SC=GAGACTCCGCACCCTATCCAG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=43270334;WS=43270316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	43273604	rs2242416	A	G	3311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=31;PP=2606;SC=CACATCGCCAATGTTCACACC;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=64;TCR=31;TR=95;WE=43273612;WS=43273594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr6	43276390	rs2254303	G	A	4629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=31;PP=2965;SC=GGTGAAAAGGGTGTCTGGGAC;SOR=2.544;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=111;TCR=31;TR=142;WE=43276398;WS=43276380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr6	43306346	rs1459675	A	G	9052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=137;NR=138;PP=2965;SC=GCTGGTACTTACTCCCTCATC;SOR=0.700;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=275;TCF=137;TCR=138;TR=275;WE=43306354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr6	43336771	rs9381238	C	T	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=26;PP=821;SC=GGGACTCCCCCCGGCTGCTGC;SOR=3.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=43336779;WS=43336761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	43399837	rs700008	A	G	3330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=16;PP=2906;SC=CTGGCTCCTGAGTCAGCCACG;SOR=3.420;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=86;TCR=16;TR=102;WE=43399845;WS=43399827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr6	43401105	rs9394952	G	A	1392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.250;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=36;PP=1080;ReadPosRankSum=0.543;SC=TAAGGTGAGCGGGTACTTGGG;SOR=1.170;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=73;TCF=22;TCR=51;TR=50;WE=43401113;WS=43401095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,51:0.67:76
chr6	43412865	rs2125739	T	C	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.693;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=4;PP=554;ReadPosRankSum=0.774;SC=CCACCCAGCATCCCAGTGTTC;SOR=1.717;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=102;TCF=81;TCR=21;TR=33;WE=43412873;WS=43412855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,32:0.30:108
chr6	43413081	rs9381242	G	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=305;ReadPosRankSum=-2.425;SC=GGGGGTAGGGGAGTGCAGTCC;SOR=0.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=16;WE=43413089;WS=43413071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr6	43414216	rs1214746	T	C	287.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=237;SC=CCCTACCTCATCCACAAGTTA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=43414224;WS=43414206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	43414234	rs1214747	G	C	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=236;SC=TTAGTCCACCGCTCTCCCAGA;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=43414242;WS=43414224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	43418691	rs1214748	G	A	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.975;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=30;PP=932;ReadPosRankSum=-1.642;SC=CAAGCTCACAGGTCTTGCCAC;SOR=0.968;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=157;TCF=77;TCR=80;TR=51;WE=43418699;WS=43418681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,51:0.31:163
chr6	43418733	rs1214749	G	A	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=3.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.47;ReadPosRankSum=0.215;SOR=0.478;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,44:0.27:165
chr6	43421994	.	G	C	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.193;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=2.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.80;ReadPosRankSum=-1.036;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,6:0.17:36
chr6	43469814	.	ACTCT	A	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.20;MQRankSum=-0.524;QD=7.55;ReadPosRankSum=-1.645;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr6	43480395	rs2231768	C	T	129.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=122;ReadPosRankSum=1.383;SC=TCTTTGGGCTCTTCCCTCCCA;SOR=0.707;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=4;WE=43480403;WS=43480389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr6	43492578	rs2257082	G	A	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=423;ReadPosRankSum=-1.939;SC=CCAGTGCCTCGTATATCTGGA;SOR=0.643;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=20;WE=43492586;WS=43492568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr6	43494319	rs1150800	A	G	1995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=16;PP=1600;SC=ACTACATGTAAGGTGTCTTCT;SOR=2.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=59;WE=43494327;WS=43494309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr6	43496662	rs1106841	A	C	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=89;ReadPosRankSum=-0.407;SC=TTACAAAGACACGTGCTGCAA;SOR=0.392;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=6;WE=43496670;WS=43496652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr6	43501580	rs11404474	C	CA	652.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=723;SC=TAAAAAACAACAAAAAAGGGG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=22;WE=43501588;WS=43501570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	43514351	.	C	G	2799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.391;ClippingRankSum=0.000;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.861;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=34;PP=2187;ReadPosRankSum=-0.657;SC=AGAATCTGCTCTGTGCAGGGG;SOR=0.364;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=131;TCF=88;TCR=43;TR=95;WE=43514359;WS=43514341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,99:0.71:139
chr6	43533305	rs11362688	TA	T	125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.000;QD=2.99;ReadPosRankSum=2.142;SOR=0.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr6	43538208	rs35642078	T	C	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=1;PP=785;ReadPosRankSum=0.129;SC=TATTGGAAAATAGAAATGTTA;SOR=0.849;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=52;TCF=51;TCR=1;TR=35;WE=43538216;WS=43538198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,37:0.71:52
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chr6	43646401	rs2295948	A	G	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.892;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=37;PP=1150;ReadPosRankSum=0.627;SC=GAGAGACAGGACCTGCGTGGA;SOR=0.922;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=80;TCF=25;TCR=55;TR=53;WE=43646409;WS=43646391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,52:0.60:86
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chr6	43747450	rs3025009	G	A	1165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.319;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=965;ReadPosRankSum=0.465;SC=CCAGAGCGAGGGGATGCGGAA;SOR=0.353;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=168;TCF=99;TCR=69;TR=50;WE=43747458;WS=43747440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,51:0.29:176
chr6	43747577	rs3025010	T	C	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.394;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=425;ReadPosRankSum=-0.224;SC=TCTCTTGGGCTTGGCAGGCAT;SOR=0.165;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=98;TCF=21;TCR=77;TR=27;WE=43747585;WS=43747567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,30:0.29:105
chr6	43748643	rs3025052	T	C	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=16;PP=533;SC=CCCCTGGTCCTTCCCTGGCTC;SOR=3.500;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=43748651;WS=43748633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	43752536	rs3025039	C	T	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=559;ReadPosRankSum=0.467;SC=TGACCCAGCACGGTCCCTCTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=23;WE=43752544;WS=43752526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr6	44081718	rs6883	G	A	3179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.938;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=53;PP=2425;ReadPosRankSum=-1.592;SC=TGTTGGAGTCGAATCTGGGGG;SOR=0.553;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=171;TCF=93;TCR=78;TR=112;WE=44081726;WS=44081708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,118:0.66:180
chr6	44081987	rs4711767	T	C	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=283;ReadPosRankSum=0.651;SC=CTGTATCTCTTATGGTCAGGG;SOR=0.317;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=13;WE=44081995;WS=44081977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr6	44102572	rs3841315	C	CT	2027.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.895;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.911;NF=15;NR=41;PP=2261;ReadPosRankSum=-0.512;SC=CCACCTGCCCCGGTTTCCCAG;SOR=0.909;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=88;TCF=25;TCR=63;TR=56;WE=44102580;WS=44102562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,58:0.64:91
chr6	44107200	rs11967633	G	A	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.112;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=484;ReadPosRankSum=-1.764;SC=CCGTATGGCTGCAGGGATGAT;SOR=2.037;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=113;TCF=69;TCR=44;TR=34;WE=44107208;WS=44107190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,35:0.29:119
chr6	44107365	rs41282654	G	A	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=25.844;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=605;ReadPosRankSum=-0.163;SC=GGGCCAGGACGGCTAGGGTGG;SOR=1.819;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=101;TCF=51;TCR=50;TR=32;WE=44107373;WS=44107355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,32:0.31:102
chr6	44108150	rs7738970	T	C	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.849;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=638;ReadPosRankSum=0.165;SC=TTCCCTTCCCTTCCCTGCAGG;SOR=0.824;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=83;TCF=36;TCR=47;TR=32;WE=44108158;WS=44108140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,31:0.37:84
chr6	44108937	rs4628095	G	A	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.861;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=31;PP=703;ReadPosRankSum=1.473;SC=GAGCTCTGCCGTGGGTGGGAT;SOR=2.147;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=53;TCF=6;TCR=47;TR=34;WE=44108945;WS=44108927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,34:0.65:52
chr6	44115169	rs4714759	G	A	3465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.533;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=67;PP=2707;ReadPosRankSum=1.068;SC=CAAGGAGAACGTGCCTACCAT;SOR=0.771;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=205;TCF=101;TCR=104;TR=130;WE=44115177;WS=44115159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,131:0.64:205
chr6	44116785	rs35937558	T	TC	600.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.848;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.13;MQRankSum=1.429;NF=3;NR=19;PP=683;ReadPosRankSum=1.533;SC=TTCTGCTTGTTCCAACCCCGT;SOR=0.121;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=74;TCF=6;TCR=68;TR=22;WE=44116793;WS=44116775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,24:0.34:71
chr6	44117607	rs4714761	C	T	2106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=19;PP=1572;ReadPosRankSum=-1.060;SC=ACCCCATCATCACCCAGTTCT;SOR=0.799;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=80;TCR=27;TR=76;WE=44117615;WS=44117597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,77:0.71:108
chr6	44117664	rs4714762	C	T	3110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.006;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=51;PP=2408;ReadPosRankSum=-1.655;SC=TTCCCACCATCGTCTACTACT;SOR=0.931;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=166;TCF=89;TCR=77;TR=114;WE=44117672;WS=44117654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,116:0.69:167
chr6	44117727	rs4711768	A	G	2602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=64;PP=1988;ReadPosRankSum=0.572;SC=CTCACACCACACCTCGCTGTG;SOR=0.638;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=49;TCR=98;TR=97;WE=44117735;WS=44117717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,101:0.67:151
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chr6	44119676	rs3734697	A	G	2830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.290;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=74;PP=2225;ReadPosRankSum=-0.494;SC=TGCGCATCCCAGGCCTGCTCA;SOR=1.061;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=159;TCF=50;TCR=109;TR=105;WE=44119684;WS=44119666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,107:0.67:160
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chr6	44136911	rs112447145	T	C	962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=5;PP=636;SC=GCTGAAGAGATCCTCCCACCT;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=44136919;WS=44136889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	44140275	rs1418487	A	G	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=34;PP=964;SC=TGGGTTTTGGACTAATTATCA;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=40;WE=44140283;WS=44140265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	44140320	rs1418488	C	G	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=25;PP=788;SC=ATCATGTAAGCTAATTTTTTA;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=44140328;WS=44140310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	44140818	rs3813500	C	G	1375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=31;PP=1199;SC=CAAGTGAGTGCTGGGAGCTGA;SOR=1.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=45;WE=44140826;WS=44140808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	44144861	rs62401127	T	C	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.197;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=33;ReadPosRankSum=1.027;SC=GTTAGTCAGATTTCACAGCCC;SOR=0.678;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=5;WE=44144869;WS=44144851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
chr6	44145181	rs4711775	C	T	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=421;ReadPosRankSum=3.105;SC=TGGTCTCGCCCGCCACTCACT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=19;WE=44145189;WS=44145171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr6	44147337	rs56277421	C	T	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.419;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=549;ReadPosRankSum=1.317;SC=TCTGACTCTCCTCTTTCTTCC;SOR=0.354;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=87;TCF=54;TCR=33;TR=28;WE=44147345;WS=44147327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,29:0.32:90
chr6	44147821	rs34710081	A	G	1625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.097;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=52;PP=1276;ReadPosRankSum=-0.357;SC=GGAATATATCATTATTCCCTC;SOR=1.761;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=101;TCF=25;TCR=76;TR=64;WE=44147829;WS=44147811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,64:0.63:102
chr6	44149113	rs67257607	A	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=5.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.88;ReadPosRankSum=-1.529;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr6	44149153	rs149157640	CCACA	C	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.57;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr6	44216544	rs112518852	GT	G	4798.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.889;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.183;NF=50;NR=114;PP=2929;ReadPosRankSum=0.390;SC=ATTTGGCATGGTTTTTTTTTT;SOR=0.870;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=187;TCF=56;TCR=131;TR=164;WE=44216553;WS=44216534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,197:0.99:198
chr6	44218120	rs13296	A	G	6150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=100;NR=74;PP=2965;SC=ATGAAGAAAAACCCAAGATCG;SOR=1.005;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=175;TCF=100;TCR=75;TR=174;WE=44218128;WS=44218110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr6	44220076	rs504697	T	C	4626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=128;PP=2965;ReadPosRankSum=0.247;SC=CATGTTTCTATACAATTAGTG;SOR=3.200;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=8;TCR=130;TR=136;WE=44220084;WS=44220066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,138:0.99:140
chr6	44221142	rs34776515	C	T	3311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-6.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.07;MQRankSum=2.041;NF=31;NR=45;PP=2962;ReadPosRankSum=0.698;SC=CTTGGTGTGGCAAGGAGTTTG;SOR=0.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=262;TCF=109;TCR=153;TR=76;WE=44221160;WS=44221132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,93:0.33:285
chr6	44221145	rs148703092	GGAGTTTGT	G	3252.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FS=0.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=2.078;QD=11.26;ReadPosRankSum=1.065;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:197,92:0.32:289
chr6	44222161	rs35131506	C	CTG	547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=594;SC=GGAAGAGTAACTGGAACCTAC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=13;WE=44222169;WS=44222151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	44223010	rs1875324	G	T	4908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-6.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.558;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=97;PP=2962;ReadPosRankSum=0.827;SC=TGGAGATGAGGGTGGCTGTCA;SOR=0.579;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=269;TCF=119;TCR=150;TR=177;WE=44223018;WS=44223000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,178:0.66:270
chr6	44224924	rs575034	C	A	77.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=2;PP=56;SC=CTCCCCTCCACGATCCGGGAC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=44224932;WS=44224914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	44227751	rs12211448	C	A	2361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.714;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=32;PP=1875;ReadPosRankSum=-2.110;SC=GTGTGCAAGGCCCTGGAGAGC;SOR=1.302;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=139;TCF=79;TCR=60;TR=89;WE=44227759;WS=44227741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,89:0.64:140
chr6	44228162	rs2233437	G	A	1248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.301;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=13;PP=1050;ReadPosRankSum=1.343;SC=GCCCTGGGCCGGGCAGTGCTT;SOR=0.380;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=76;TCF=58;TCR=18;TR=46;WE=44228170;WS=44228152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,46:0.61:76
chr6	44240193	rs571770	C	G	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=376;ReadPosRankSum=-1.153;SC=ATCCAAAGGACGTGTTAGGCT;SOR=2.948;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=14;WE=44240201;WS=44240183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
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chr6	44243559	rs3734710	A	G	1978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.730;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=48;PP=1634;ReadPosRankSum=0.417;SC=TGGAGAAGCTATTTGGCCTGG;SOR=1.341;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=101;TCF=35;TCR=66;TR=70;WE=44243567;WS=44243549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,71:0.66:108
chr6	44245930	rs325018	C	T	1374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=15;PP=937;SC=GCGGGGAGTGCGAGGGGCCCA;SOR=1.038;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=37;WE=44245938;WS=44245920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	44246049	rs325017	A	G	1082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=28;PP=894;SC=AGGCTTGGGCAGGGGAAACAG;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=44246057;WS=44246039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	44247951	rs484757	T	G	8892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=157;NR=128;PP=2965;SC=CATTGGCAGTTATGGTTGACA;SOR=0.865;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=285;TCF=157;TCR=128;TR=285;WE=44247959;WS=44247941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr6	44250165	rs516582	A	G	5747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=100;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.877;SC=GCTTGGCAGCACCTCGTGCAC;SOR=0.223;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=96;TCR=102;TR=195;WE=44250173;WS=44250155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,198:0.99:199
chr6	44253617	rs324142	C	T	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=1;PP=821;SC=AGGAAGAAGGCAATAATAGAG;SOR=4.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=32;WE=44253625;WS=44253607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	44253749	rs324143	A	G	2778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=38;PP=2130;SC=AGAGGCAGTCACGGTAGGTGA;SOR=1.099;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=54;TCR=38;TR=92;WE=44253757;WS=44253739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr6	44255459	rs324146	G	A	5885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=78;NR=102;PP=2965;SC=TGAGAGCTGTGGGCTTGTGCT;SOR=1.038;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=78;TCR=102;TR=180;WE=44255467;WS=44255449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr6	44268135	rs325009	C	T	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=0;PP=654;SC=CCTTGTGTCACGTAGGCCCTG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=44268143;WS=44268127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	44268371	rs325008	T	C	3314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=81;PP=2578;SC=CCACCACTCGTGAGCCCCACG;SOR=1.777;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=36;TCR=81;TR=117;WE=44268379;WS=44268361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr6	44269023	rs325007	T	C	6818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=104;PP=2965;SC=GAAAGACAGATGGTGAGCCCA;SOR=0.838;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=122;TCR=104;TR=226;WE=44269031;WS=44269013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr6	44269193	rs498512	C	T	2238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=57;PP=1873;SC=CCTGAGTTTTCTTTGCAGCCT;SOR=3.578;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=9;TCR=57;TR=66;WE=44269201;WS=44269183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr6	44269640	rs325006	G	A	1177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=1;PP=979;SC=TGGGGGAATGGCCTGGGTGAT;SOR=5.728;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=34;WE=44269648;WS=44269630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	44269680	rs325005	C	G	2256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=5;PP=2007;SC=AAGGAAGCTGCCACCACCCCG;SOR=4.680;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=62;TCR=5;TR=66;WE=44269688;WS=44269670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr6	44270365	rs325004	C	G	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=22;PP=776;SC=AATCAAGGCACCAGCACCAAA;SOR=1.681;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=44270373;WS=44270355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	44270768	rs325002	G	T	1825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=36;PP=1516;SC=AGGATCCGGGGCCCCTGGGCC;SOR=1.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=54;WE=44270776;WS=44270758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	44270936	rs325001	C	T	4291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=46;PP=2965;SC=GGGACAGGCCCGTTAACTGCC;SOR=1.420;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=82;TCR=46;TR=128;WE=44270944;WS=44270926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr6	44273546	rs324137	A	C	2147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=43;PP=1726;SC=AAGACAAAGAATGTTGAGGAG;SOR=1.410;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=22;TCR=43;TR=65;WE=44273554;WS=44273536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr6	44274797	rs7740535	T	C	5401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=101;PP=2965;SC=CAGACATGAATCCCCAGCGGC;SOR=1.246;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=68;TCR=101;TR=168;WE=44274805;WS=44274787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr6	44275011	rs324136	T	C	5742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=89;PP=2965;ReadPosRankSum=1.394;SC=CCAGGGAAGATGCCATCAGAG;SOR=0.302;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=197;TCF=108;TCR=89;TR=196;WE=44275019;WS=44275001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,197:0.99:198
chr6	44280812	rs167772	C	T	3719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=48;PP=2662;SC=ATGGTTCGGCCCTCACCTGGT;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=62;TCR=48;TR=110;WE=44280820;WS=44280802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr6	44320548	rs4714783	T	A	2974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.914;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=60;PP=2362;ReadPosRankSum=1.870;SC=CCTCATCTTCTGTGGAAACAG;SOR=1.569;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=29;TCR=61;TR=88;WE=44320556;WS=44320538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,92:0.99:93
chr6	44329587	.	G	C	1759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.315;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.869;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=15;PP=1423;ReadPosRankSum=-0.232;SC=ATCGTCCTGAGTGGACATTTT;SOR=0.896;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=107;TCF=81;TCR=26;TR=67;WE=44329595;WS=44329577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,67:0.61:110
chr6	44355423	rs2297333	C	T	1686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=4;PP=1347;SC=CGCCCCCTCCCACCTTGCGCT;SOR=4.091;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=47;WE=44355431;WS=44355413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr6	44355682	rs34753552	G	A	1330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=36;PP=1100;SC=GAGGTCGGGGGGGCGACGAGG;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=37;WE=44355690;WS=44355672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	44355699	rs2297331	T	C	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=29;PP=687;SC=GAGGAGACCCTGTGGGGTCTG;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=44355707;WS=44355689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
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chr6	44360680	rs6942323	A	G	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=334;SC=AGTAAACCCAAAGCTAAAGCC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=44360688;WS=44360670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr6	46107752	rs7451713	C	G	2687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.717;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=64;PP=2088;ReadPosRankSum=-0.499;SC=TACCCATTCACGATACCATCT;SOR=0.534;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=286;TCF=112;TCR=174;TR=109;WE=46107760;WS=46107742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,110:0.38:288
chr6	46129345	rs2235881	G	A	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=409;ReadPosRankSum=0.489;SC=GTGGCATGGCGGTGATATTGA;SOR=0.623;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=79;TCF=47;TCR=32;TR=25;WE=46129353;WS=46129335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,25:0.30:82
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chr6	46293328	rs2277121	G	A	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=457;SC=CCTTGCTCTGGGGACGGCTGG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=46293336;WS=46293318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	46521602	rs699939	C	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.132;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=1.176;SC=CTGGAAGAAACGAATAAAATT;SOR=3.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=8;WE=46521610;WS=46521592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr6	46563817	rs7761731	A	T	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=36;PP=852;ReadPosRankSum=-0.678;SC=TTAGAAGGAGATTCTCCAGGT;SOR=0.639;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=50;TCR=116;TR=52;WE=46563825;WS=46563807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,63:0.35:180
chr6	46620252	rs12192544	C	G	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.389;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=749;ReadPosRankSum=-0.207;SC=CAAATTCTTCCGCTGAAGGAG;SOR=0.570;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=136;TCF=65;TCR=71;TR=46;WE=46620260;WS=46620242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,49:0.35:141
chr6	46621097	rs8427	T	A	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=41;PP=1023;ReadPosRankSum=0.554;SC=TGGGGGAGGGTGCGCGGGCGG;SOR=0.548;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=58;TCF=2;TCR=56;TR=43;WE=46621105;WS=46621087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,42:0.74:57
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chr6	46626353	rs953062	A	G	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=233;ReadPosRankSum=1.085;SC=GATAAGCAAGAAGAGTTAATT;SOR=1.387;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=14;WE=46626361;WS=46626343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
chr6	46630068	rs9381469	G	A	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=0;PP=961;ReadPosRankSum=0.839;SC=TATAAAATTCGTGAAATTAAT;SOR=2.348;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=50;TCR=0;TR=39;WE=46630076;WS=46630058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,39:0.76:51
chr6	46649231	rs7740677	C	T	4854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=51;PP=2965;SC=GAATACATTACTTTCTTCTCT;SOR=1.639;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=103;TCR=51;TR=154;WE=46649239;WS=46649221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr6	46657057	rs3799277	A	G	3424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=52;PP=2935;SC=TGACCTGAAGACACTGATACT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=50;TCR=52;TR=102;WE=46657065;WS=46657047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr6	46657976	rs144670071	GAGA	G	4461.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.261;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.272;NF=40;NR=52;PP=2970;ReadPosRankSum=0.218;SC=GCCAAGACTGGAGAAGGAGAG;SOR=0.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=62;TCR=82;TR=92;WE=46657986;WS=46657966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,112:0.65:171
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chr6	46659663	rs12199679	C	T	1544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.765;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=14;PP=1352;ReadPosRankSum=-1.047;SC=CTGAGACACCCTTGAAAACAG;SOR=1.600;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=79;TCF=54;TCR=25;TR=53;WE=46659671;WS=46659653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,52:0.65:80
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chr6	46672943	rs1051931	A	G	1887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=11;PP=1517;SC=ATCAATAGCTACATTTGAATC;SOR=2.644;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=44;TCR=11;TR=55;WE=46672951;WS=46672933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr6	46676019	rs2216465	C	G	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=-0.239;SC=TGGGTTATCTCATTGGAATAA;SOR=0.067;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=4;WE=46676027;WS=46676009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,4:0.18:22
chr6	46677235	rs41273664	C	G	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.474;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=490;ReadPosRankSum=1.279;SC=TATAATTGTTCATTTCATGGG;SOR=2.303;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=22;WE=46677243;WS=46677225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr6	46682079	rs1362931	A	C	1421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=0;PP=1178;SC=TATTGAGGAAACCCAACTCCT;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=41;WE=46682087;WS=46682069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	46683978	rs41361844	T	TA	208.27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.126;NF=8;NR=0;PP=255;ReadPosRankSum=-0.126;SC=GCCTGGGCTTTAAAGAAATAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=8;WE=46683986;WS=46683968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr6	46684222	rs1805017	C	T	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.438;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=561;ReadPosRankSum=-0.603;SC=GGTGTCAAGGCGATCATTATC;SOR=0.459;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=126;TCF=56;TCR=70;TR=36;WE=46684230;WS=46684212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,40:0.30:135
chr6	46714466	rs9367255	C	T	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.03;ReadPosRankSum=-2.384;SOR=0.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr6	46714598	rs9349374	C	T	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.43;ReadPosRankSum=-0.481;SOR=0.740;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,43:0.26:165
chr6	46726441	rs9395212	G	C	285.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=9;NR=0;PP=236;SC=AGTTCAGAAGGCTCTCTCTTC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=46726449;WS=46726431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	46766467	rs872018	GG	CC	2573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=36;PP=2704;SC=GCCAGCCCTGGGATGGGCACT;SOR=1.692;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=47;WE=46766476;WS=46766457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	46803018	rs2297020	A	T	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=297;SC=TGAAGTTCCCACTAAAGGCAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=46803026;WS=46803008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	46803102	rs2297019	A	G	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=15;PP=802;SC=GGGAAAGGCCATGTTAGAGGA;SOR=1.151;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=37;WE=46803110;WS=46803092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	46806766	rs115391170	G	A	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.497;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=427;ReadPosRankSum=0.260;SC=CTGTCAGGCCGTGCAGGTGCA;SOR=1.226;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=68;TCF=27;TCR=41;TR=29;WE=46806774;WS=46806756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,29:0.43:67
chr6	46826508	rs613870	G	A	9009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=126;PP=2965;SC=AAGAAGTCCGGTTCTTGGTCA;SOR=0.850;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=276;TCF=150;TCR=126;TR=276;WE=46826516;WS=46826498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr6	46826715	rs572248	T	A	11087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.755;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-1.009;NF=198;NR=146;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.919;SC=CACCTTCTTCTACATAGCACC;SOR=0.769;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=345;TCF=198;TCR=147;TR=344;WE=46826723;WS=46826705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,348:1.00:349
chr6	46826844	rs571247	T	C	9174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=131;NR=165;PP=2965;SC=ATGGCATAGTTGTATTGTGGC;SOR=0.921;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=297;TCF=132;TCR=165;TR=296;WE=46826852;WS=46826834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr6	46826910	rs611779	G	A	8823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=134;NR=131;PP=2965;SC=GGATATCCTGGGCAAGGATGG;SOR=0.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=265;TCF=134;TCR=131;TR=265;WE=46826918;WS=46826900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr6	46826979	rs9381487	A	G	2027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.592;NF=37;NR=53;PP=1509;ReadPosRankSum=0.279;SC=AGTTTTCTAGATAGCTCTTGT;SOR=0.716;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=251;TCF=107;TCR=144;TR=90;WE=46826987;WS=46826969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,92:0.36:257
chr6	46827073	rs547499	A	G	3324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.517;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.335;NF=55;NR=68;PP=2506;ReadPosRankSum=1.386;SC=CTTGATTACCATGCTGCTCAT;SOR=0.766;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=200;TCF=92;TCR=108;TR=123;WE=46827081;WS=46827063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,131:0.62:213
chr6	46827126	rs610856	C	T	7150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=94;NR=118;PP=2965;SC=GGCTATCTCCCGACTGTAATG;SOR=0.936;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=212;TCF=94;TCR=118;TR=212;WE=46827134;WS=46827116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr6	46827239	rs9395218	C	T	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.797;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.459;NF=9;NR=30;PP=693;ReadPosRankSum=1.168;SC=CCAAGGATGACATTAACCGTA;SOR=0.243;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=85;TCF=15;TCR=70;TR=39;WE=46827247;WS=46827229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,41:0.46:90
chr6	46828670	rs540727	A	G	1259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=39;PP=1098;SC=AAATTTACCAATCAATTCAGC;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=39;WE=46828678;WS=46828660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	46831060	rs476374	C	T	8729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=85;NR=185;PP=2965;SC=CTTTTCCTAACAGAATTTTAT;SOR=1.742;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=271;TCF=86;TCR=185;TR=270;WE=46831068;WS=46831050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr6	46832741	rs529201	T	C	3684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=8;PP=2924;SC=GTCCCTGCCCTGACTATAACA;SOR=4.902;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=98;TCR=8;TR=106;WE=46832749;WS=46832731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr6	46832813	rs614826	G	A	4158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.171;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=56;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.777;SC=ATGGGCTCCAGACTGAATTAT;SOR=1.305;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=209;TCF=121;TCR=88;TR=148;WE=46832821;WS=46832803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,154:0.71:217
chr6	46834685	rs586024	G	A	5922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=150;NR=23;PP=2965;SC=TGAGGAACCCGTATGGAAAGT;SOR=3.467;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=150;TCR=23;TR=173;WE=46834693;WS=46834675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr6	46834906	rs5875987	TG	T	1567.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=41;PP=1680;SC=TGAGATGGAATGGAAATAATC;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=41;WE=46834914;WS=46834896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
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chr6	46988238	.	CA	C	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=3.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=1.884;QD=1.29;ReadPosRankSum=1.005;SOR=0.217;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,11:0.23:48
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chr6	47254449	.	G	A	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.242;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=168;ReadPosRankSum=0.273;SC=TTAAAGATCCGACCAGGACTG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=47254457;WS=47254439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr6	47445927	rs9349406	T	A	2467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=11;PP=1975;SC=GAGCCACCACTGGAGGAGGAG;SOR=3.174;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=65;TCR=11;TR=76;WE=47445935;WS=47445917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr6	47512590	rs6916578	C	T	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.68;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr6	47522357	rs9473132	G	A	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.825;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=509;ReadPosRankSum=0.711;SC=AGTTGTTTTTGCTTTTGAATT;SOR=0.551;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=100;TCF=62;TCR=38;TR=32;WE=47522365;WS=47522347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,32:0.31:102
chr6	47547070	rs34735056	T	TAA	898.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.83;QD=30.99;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	47549883	rs2275446	T	C	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=49;ReadPosRankSum=0.930;SC=CACACTGAGTTATTTACACTG;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=5;WE=47549891;WS=47549873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,4:0.18:22
chr6	47563692	rs2039503	C	T	10454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=139;NR=180;PP=2965;SC=CAGTAATTTACTGAGATCTTC;SOR=0.993;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=319;TCF=139;TCR=180;TR=319;WE=47563700;WS=47563682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,339:1.00:339
chr6	47577064	rs9395287	G	A	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.477;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=92;ReadPosRankSum=-0.086;SC=CTTTTCTCCTGTGAGTACTAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=7;WE=47577072;WS=47577054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr6	47624239	rs1485784	A	G	1995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=8;PP=1544;SC=CTGACTGCCTATGGGAACCGC;SOR=3.538;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=49;TCR=8;TR=57;WE=47624247;WS=47624229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr6	47624299	rs9369730	A	G	3657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=45;PP=2702;SC=ACTCTCATCCATACAAGAGCC;SOR=1.366;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=78;TCR=45;TR=123;WE=47624307;WS=47624289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr6	47626685	rs6935668	C	T	2014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=12;PP=1437;SC=TCCCGATGTACGATTGAAGCT;SOR=2.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=48;TCR=12;TR=60;WE=47626693;WS=47626675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr6	47641307	rs1411049	G	C	2004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=48;PP=1553;SC=AACCAGCTTTGGGTTACCAGA;SOR=1.931;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=20;TCR=48;TR=68;WE=47641315;WS=47641297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr6	47645772	rs9369734	G	T	354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=298;SC=TACCTTTGTGGTTTTTTTCTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=47645780;WS=47645762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	47646842	rs6907125	A	G	1933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=49;PP=1524;ReadPosRankSum=-0.635;SC=GACACCTGCCAGACTCTTAAT;SOR=1.151;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=16;TCR=50;TR=65;WE=47646850;WS=47646832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr6	47649222	rs8180544	T	G	5757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=77;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.871;SC=TCACTTTTTCTATGAGAATTA;SOR=0.405;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=186;TCF=109;TCR=77;TR=185;WE=47649230;WS=47649212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,191:0.99:192
chr6	47649573	rs10807371	CA	TG	7271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=86;PP=2947;SC=GTAGGCCAAGCAAATTGTTTA;SOR=1.063;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=66;TCR=90;TR=148;WE=47649582;WS=47649563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr6	47649694	rs9381594	A	G	2713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=49;PP=2184;SC=TTGCTTGTCCATTGAGGTCCT;SOR=0.855;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=41;TCR=49;TR=90;WE=47649702;WS=47649684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr6	47653536	rs9381596	A	G	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=574;SC=AGCTTTTGAGAGTTGGACTGG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=47653544;WS=47653526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	47653629	rs10948375	C	T	1592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.707;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;PP=1276;ReadPosRankSum=0.830;SC=AGGTCCTCCACCTCTCATCTG;SOR=0.782;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=50;WE=47653637;WS=47653619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,53:0.98:54
chr6	47653812	rs60074575	TA	T	579.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=15;PP=625;SC=TATTCCTAAATAAAAGGTCAT;SOR=3.611;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=17;WE=47653820;WS=47653802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	47653851	rs9296570	T	C	290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=232;SC=AGATGCACCATGGACGGAGTA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=47653859;WS=47653841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	47654591	rs10948376	G	T	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=586;SC=GGTGTTGTGAGCTAAGGATGA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=47654599;WS=47654581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	47654662	rs10485315	A	G	2194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=10;PP=1742;SC=GGTAATAACTAAGAGTATGTT;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=51;TCR=10;TR=61;WE=47654670;WS=47654652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr6	47654742	rs9296573	A	T	3204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=53;PP=2433;SC=TCTTCATCCTAGTGTTTGGAA;SOR=0.752;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=48;TCR=53;TR=101;WE=47654750;WS=47654732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr6	47654817	rs1556133	C	A	2339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=44;PP=1351;SC=TTATCAGTACCTGGCCATGTA;SOR=3.690;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=7;TCR=44;TR=51;WE=47654839;WS=47654807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	47654831	rs1556132	A	G	2088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=37;PP=1167;SC=CCATGTAAAGACTTGTAAAGG;SOR=3.657;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=43;WE=47654839;WS=47654807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	47654864	rs1556131	T	G	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=30;PP=860;SC=AAGCTTTCACTTCAGTCATTT;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=47654872;WS=47654854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr6	47661387	rs9395311	A	G	5165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=133;NR=12;PP=2965;SC=AATAAATGCAATTTTACTTTG;SOR=4.572;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=133;TCR=12;TR=145;WE=47661395;WS=47661377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr6	47676150	rs9369737	C	T	1374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=38;PP=1180;SC=TCTGTGCTTACCAGTATTGAT;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=38;WE=47676158;WS=47676140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	47678455	rs11356177	CT	C	5137.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.44;QD=27.77;SOR=1.333;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr6	47678678	rs944056	C	G	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=48;PP=1396;SC=AGAAAGTAGACACATTTTTAA;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=48;WE=47678686;WS=47678668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	47681494	rs6916562	T	C	2081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=0;PP=1788;SC=TACAACAATGTGTAAATCCTT;SOR=8.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=60;TCR=0;TR=60;WE=47681502;WS=47681484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr6	47682604	rs9369738	A	C	4404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=86;PP=2965;SC=AGCCAGAGAAAGGCTACATGA;SOR=1.103;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=61;TCR=86;TR=147;WE=47682612;WS=47682594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr6	47684591	rs1360157	G	A	1659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=16;PP=1287;SC=AAGGTAATTTGAATTTGCTTC;SOR=1.791;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=52;WE=47684599;WS=47684581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	47686101	rs6914013	T	C	2713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=12;PP=2182;SC=TCATTACCACTACTGTTATTT;SOR=3.180;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=71;TCR=12;TR=83;WE=47686109;WS=47686091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr6	47749728	rs7741473	T	G	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=12;PP=1110;SC=TATGAAATGGTTCAAGCTGGC;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=44;WE=47749736;WS=47749718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr6	47754498	rs1329543	A	G	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=27;PP=696;ReadPosRankSum=0.717;SC=CGCTTCACAAATCAACTTTCA;SOR=0.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=7;TCR=50;TR=31;WE=47754506;WS=47754488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,34:0.57:60
chr6	47754538	rs6900985	T	C	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=436;ReadPosRankSum=0.177;SC=TGGGGTGCTGTCCGGCTGACA;SOR=1.002;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=18;WE=47754546;WS=47754528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr6	47847179	rs3799276	A	G	5220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.482;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=120;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.042;SC=AGAGGATGACAACAAATGGCT;SOR=1.125;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=268;TCF=103;TCR=165;TR=188;WE=47847187;WS=47847169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,193:0.70:275
chr6	47847401	rs2068006	A	G	2500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.246;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=46;PP=1972;ReadPosRankSum=-0.548;SC=CTAGTTGGCCAGCAAAGACCA;SOR=0.566;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=160;TCF=88;TCR=72;TR=100;WE=47847409;WS=47847391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,103:0.61:168
chr6	47847683	rs9367307	A	T	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=535;ReadPosRankSum=0.420;SC=CTAATGTTTTAAAAAAAGAAA;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=26;WE=47847691;WS=47847673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr6	49403282	rs8589	T	C	1685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=39;PP=1203;SC=AGGGTGCTTATGCCCACAGCA;SOR=2.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=54;WE=49403290;WS=49403272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr6	49409530	.	G	C	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.000;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.66;ReadPosRankSum=2.652;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,48:0.27:179
chr6	49412275	rs9381786	T	G	2397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=9;PP=1932;SC=GGATCAACCTTTTATTTAAGT;SOR=3.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=61;TCR=9;TR=70;WE=49412283;WS=49412265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr6	49425521	rs2229384	C	T	2633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=14;PP=2140;SC=TACCAGTAAGCTTCTCTTTAG;SOR=2.805;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=80;TCF=66;TCR=14;TR=79;WE=49425529;WS=49425511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr6	49437853	rs200740164	A	AT	327.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=2.050;HP=13;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.053;NF=12;NR=5;PP=196;ReadPosRankSum=-1.081;SC=ATCTTTACAGATTTTTTTTTT;SOR=0.257;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=17;WE=49437861;WS=49437843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr6	49440599	rs7759308	T	A	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=303;SC=TTAAAATGATTAAAACATAAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=49440607;WS=49440589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	49459791	rs12175251	A	G	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=1;PP=210;SC=TGTTCTCTCTAACATACATTT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=49459799;WS=49459781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	49479750	rs13193063	T	C	817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=20;PP=533;SC=CTGGAGAAAATGTTGAAGAGT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=49479758;WS=49479740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr6	49489397	rs9369905	C	A	3107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=37;PP=2506;ReadPosRankSum=0.967;SC=AAAGCGGTTGCCAATTCAAAG;SOR=0.483;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=64;TCR=37;TR=100;WE=49489405;WS=49489387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
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chr6	49701523	rs495335	A	G	3728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=54;PP=2784;SC=CATGAGCTGGAGGCACTTGAC;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=62;TCR=54;TR=116;WE=49701531;WS=49701513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr6	49705182	rs2275597	G	A	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.814;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=26;PP=786;ReadPosRankSum=-0.457;SC=AGTAACATGGGGGTGGGAGAA;SOR=0.451;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=87;TCF=27;TCR=60;TR=40;WE=49705190;WS=49705172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,41:0.44:94
chr6	49815873	rs373553362	AT	A	141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=2.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.877;QD=1.94;ReadPosRankSum=-0.219;SOR=0.331;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,17:0.23:73
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chr6	50791584	rs71687472	CACAA	C	1460.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=24;PP=2277;ReadPosRankSum=-0.193;SC=TCCAGGTAACCACAAACAAAC;SOR=0.743;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=68;TCF=16;TCR=52;TR=29;WE=50791600;WS=50791574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,38:0.58:65
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chr6	50791640	rs2076308	G	C	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=140;ReadPosRankSum=0.300;SC=GCTTCTGGAGGGGGGGAGGTC;SOR=0.465;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=13;WE=50791648;WS=50791630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr6	50805942	rs2817404	T	G	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.098;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=125;ReadPosRankSum=0.861;SC=TCAAGCGGCTTCTTGAGAGAG;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=7;WE=50805950;WS=50805932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr6	51274751	.	CTT	C	327.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=7.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQRankSum=-1.176;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.908;SOR=2.683;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr6	51483961	rs9381994	T	C	1530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.765;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=21;PP=1170;ReadPosRankSum=0.423;SC=TTTCTTCTCTTGGGAAAGCCC;SOR=0.415;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=105;TCF=69;TCR=36;TR=58;WE=51483969;WS=51483951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,61:0.56:108
chr6	51491884	rs4715227	T	C	1960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=49;PP=1450;ReadPosRankSum=-0.116;SC=ATTATTAGTCTGGGATTCAGG;SOR=0.557;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=129;TCF=49;TCR=80;TR=82;WE=51491892;WS=51491874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,83:0.62:133
chr6	51503616	.	C	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=6.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=-1.795;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.329;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr6	51503618	.	C	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=6.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=-2.073;QD=8.30;ReadPosRankSum=-2.578;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr6	51586771	rs9349593	G	A	6884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.50;SOR=1.423;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr6	51586771	.	GC	AC,AT	2136	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=57,38;NR=95,63;PP=876,2136;QD=5.99191587202;SC=TCAGCTTCCTGCAGGCTCCTC;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=155;TCF=57;TCR=98;TR=152,101;WE=51586780;WS=51586761;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.98:155
chr6	51586772	rs45451196	C	T	3153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=1.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.55;ReadPosRankSum=-0.563;SOR=0.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,118:0.69:170
chr6	51611470	rs2397060	T	C	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=505;ReadPosRankSum=-0.919;SC=TTTGAAGAATTGCCAAGTACT;SOR=0.648;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=21;WE=51611478;WS=51611460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
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chr6	51618170	rs1326605	T	G	3465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=77;PP=2742;SC=ATAGGAGTTGTGGGAAAAAAA;SOR=1.959;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=110;TCF=31;TCR=79;TR=108;WE=51618178;WS=51618160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
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chr6	51712492	rs9370067	A	T	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=28;ReadPosRankSum=0.438;SC=AGCACTTCACAGCACAAATGT;SOR=0.117;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=4;WE=51712500;WS=51712482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr6	51720838	rs9349603	T	C	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.195;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=539;ReadPosRankSum=0.974;SC=CAGTCATGGTTAAATCATAAG;SOR=0.298;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=88;TCF=8;TCR=80;TR=29;WE=51720846;WS=51720828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,31:0.34:92
chr6	51720872	rs7452724	A	G	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=198;ReadPosRankSum=0.876;SC=ATTCGCTCTAAGGTGATTTTA;SOR=0.163;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=13;WE=51720880;WS=51720862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr6	51732598	rs9382043	G	A	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.03;ReadPosRankSum=0.027;SOR=0.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,24:0.26:92
chr6	51732628	rs9382044	G	A	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.814;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=8;PP=670;ReadPosRankSum=0.051;SC=CATGCCCATCGGCAAGCTAAA;SOR=0.578;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=134;TCF=105;TCR=29;TR=39;WE=51732636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,42:0.30:141
chr6	51732807	rs12210295	C	T	4200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.012;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=92;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.612;SC=CAGACAGAGACCCATCCAAGT;SOR=0.772;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=243;TCF=96;TCR=147;TR=151;WE=51732815;WS=51732797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,153:0.61:249
chr6	51735261	rs982874	G	T	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.859;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=365;ReadPosRankSum=0.737;SC=ACTTGAATATGGGCCTTATTT;SOR=1.760;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=18;WE=51735269;WS=51735251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,17:0.31:54
chr6	51750563	rs4711985	A	T	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=340;ReadPosRankSum=0.221;SC=GGGCAAGTCAATCCCATTTAA;SOR=0.169;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=64;TCR=0;TR=19;WE=51750571;WS=51750553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,20:0.29:68
chr6	51875250	rs2435322	A	C	1504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=36;PP=1208;SC=TCTCTTTCCAATTTAGGGCTG;SOR=2.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=45;WE=51875258;WS=51875240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr6	51890823	rs9296669	G	A	2416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=31;PP=1954;SC=AACAGTGGGAGCGCCCGCATC;SOR=1.103;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=40;TCR=31;TR=71;WE=51890831;WS=51890813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr6	51891011	rs2499480	T	C	2231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=51;PP=1650;SC=CAAAATATTATAGCTGATATT;SOR=3.360;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=7;TCR=51;TR=58;WE=51891019;WS=51891001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr6	51913240	rs10948667	G	A	3502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=27;PP=2662;SC=TTGGGAATGTGAGTGAGAATA;SOR=2.262;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=84;TCR=27;TR=111;WE=51913248;WS=51913230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr6	51914898	rs9395759	T	C	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=662;SC=CCTGTGTCCCTCAAGGCCAAC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=22;WE=51914906;WS=51914888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	51914956	rs9370096	G	A	1607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=5;PP=1406;SC=ACTCCTTACCGTGCAGTGATG;SOR=4.047;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=44;TCR=5;TR=49;WE=51914964;WS=51914946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	51924774	rs1896976	A	G	5592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=80;NR=89;PP=2965;SC=AAGCTTGGCTATCTGCCTGAA;SOR=0.809;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=80;TCR=89;TR=169;WE=51924782;WS=51924764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr6	51930886	rs5876252	T	TA	561.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=5.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.57;MQRankSum=0.808;QD=16.52;ReadPosRankSum=1.081;SOR=2.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,25:0.74:34
chr6	51935747	rs17576809	C	T	2188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=7;PP=1743;SC=TGCTTTTGTCCGGATACAGAG;SOR=3.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=53;TCR=7;TR=60;WE=51935755;WS=51935737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr6	51936846	rs3936986	T	C	3787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=30;PP=2965;SC=AGAGAGAATGTGTGTGTGTTG;SOR=2.244;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=90;TCR=30;TR=120;WE=51936854;WS=51936836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr6	51944847	rs1892274	T	C	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=16;PP=463;SC=TCAAAAACCATGAATTCCCAA;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=51944855;WS=51944837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	51949862	rs9370097	A	G	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=30;PP=850;SC=TTTTGTTTACATACGATTATT;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=51949870;WS=51949852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	52101758	rs11465553	C	T	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=22.939;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=284;ReadPosRankSum=-1.567;SC=ACAGGGGTGACGCAGGTGCAG;SOR=0.681;SbPval=0.04;Source=Platypus;TC=79;TCF=51;TCR=28;TR=22;WE=52101766;WS=52101748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,24:0.30:81
chr6	52131254	rs10807441	C	T	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.129;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=230;ReadPosRankSum=1.587;SC=CCAAAGTTTCCCCTGAAGCTC;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=10;WE=52131262;WS=52131244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr6	52137313	rs12207056	C	T	1990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.776;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=55;PP=1657;ReadPosRankSum=-1.248;SC=GGATTAGTGGCTTTGCCTCTC;SOR=0.263;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=100;TCF=18;TCR=82;TR=70;WE=52137321;WS=52137303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,71:0.72:99
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chr6	52142582	rs13191372	G	A	1366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.219;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=41;PP=1065;ReadPosRankSum=0.612;SC=AATACTTGAAGAGGGCCAGGC;SOR=0.491;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=81;TCF=12;TCR=69;TR=49;WE=52142590;WS=52142572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,50:0.60:83
chr6	52144081	rs2073036	T	C	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=271;ReadPosRankSum=0.148;SC=CTCTGGAATATGGCAAACTGG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=12;WE=52144089;WS=52144071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr6	52147692	rs2307322	T	A	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=384;ReadPosRankSum=-0.564;SC=AAAATTAGACTGGGCAGAACT;SOR=0.836;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=17;WE=52147700;WS=52147682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr6	52267967	rs76408349	A	C	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=453;ReadPosRankSum=1.348;SC=CAGGTTGCATACCCTGTCCTG;SOR=1.255;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=21;WE=52267975;WS=52267957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,21:0.78:27
chr6	52268008	rs3748066	T	G	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.760;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=4;PP=661;ReadPosRankSum=1.770;SC=TGCGGGCCGCTGCCATGACGA;SOR=1.445;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=45;TCR=6;TR=37;WE=52268016;WS=52267998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,39:0.68:57
chr6	52269199	rs3799272	T	C	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=621;ReadPosRankSum=0.727;SC=GGATATGTTATAGCTGCAGTG;SOR=1.730;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=24;WE=52269207;WS=52269189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,27:0.69:39
chr6	52355206	rs2273120	T	C	1561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=44;PP=1316;ReadPosRankSum=1.623;SC=ATCATTCTTTTCTAAAGGCAA;SOR=4.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=47;TCF=1;TCR=46;TR=45;WE=52355214;WS=52355196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,46:0.98:47
chr6	52356864	rs200224647	CT	C	655.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=719;ReadPosRankSum=0.762;SC=CTCCATCCAGCTTTGGTTTCA;SOR=0.793;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=21;WE=52356872;WS=52356854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr6	52370939	rs9688915	G	A	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=43;PP=1318;ReadPosRankSum=-1.058;SC=CTCAGGCTGGGGGTGGGGAAG;SOR=0.626;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=92;TCF=23;TCR=69;TR=58;WE=52370947;WS=52370929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,63:0.64:99
chr6	52374319	rs57120044	T	TAC	963.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.520;NF=18;NR=4;PP=860;ReadPosRankSum=0.434;SC=GTCAACAGAATACTCACGGGA;SOR=0.696;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=84;TCF=67;TCR=17;TR=22;WE=52374327;WS=52374309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,29:0.31:94
chr6	52400484	rs3215574	GA	G	389.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.88;MQRankSum=3.119;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.575;SOR=1.897;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr6	52400529	rs2073179	G	A	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.249;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.778;NF=27;NR=7;PP=652;ReadPosRankSum=1.947;SC=AAGCTTTCCAGGTCCTTCAGG;SOR=0.276;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=94;TCF=80;TCR=14;TR=34;WE=52400537;WS=52400519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,37:0.38:98
chr6	52441754	rs113436339	G	T	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=27;PP=693;ReadPosRankSum=-0.653;SC=CGCACCCTGCGCTCACGAACC;SOR=0.600;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=30;WE=52441762;WS=52441744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,31:0.82:38
chr6	52541811	rs13211066	G	A	3150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=2;PP=2603;SC=CCATATAAGCGTATCATTTTT;SOR=6.890;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=91;TCF=89;TCR=2;TR=91;WE=52541819;WS=52541801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr6	52546789	rs2281484	C	T	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=31;PP=833;ReadPosRankSum=-0.206;SC=GCTAGATATACTAGAACATAT;SOR=1.009;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=35;WE=52546797;WS=52546779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,36:0.78:46
chr6	52617731	rs2180314	C	G	8348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.96;NF=91;NR=161;PP=2965;SC=CTCAGGTTGACTAAAGGGCAG;SOR=1.459;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=252;TCF=91;TCR=161;TR=252;WE=52617739;WS=52617721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr6	52620905	.	G	A	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.273;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.297;NF=20;NR=1;PP=500;ReadPosRankSum=-0.249;SC=CTTGCTCAAGGAGCCACATCC;SOR=1.460;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=21;WE=52620913;WS=52620895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr6	52621207	.	G	C	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.168;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.395;NF=2;NR=28;PP=690;ReadPosRankSum=-0.575;SC=GAGAATATAAGATTTCTGAGT;SOR=1.514;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=46;TCF=3;TCR=43;TR=30;WE=52621215;WS=52621197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,33:0.65:51
chr6	52622814	rs2254050	C	T	1165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=35;PP=992;SC=ATAATTGAAACGATAGAATCA;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=52622822;WS=52622804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	52657552	rs4715326	C	T	1746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=12;PP=1502;SC=CACTGAAGGCCTGGAGAAGAC;SOR=2.393;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=42;TCR=12;TR=54;WE=52657560;WS=52657542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	52659097	rs72552261	C	T	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-10.187;NF=1;NR=32;PP=586;ReadPosRankSum=1.688;SC=TGGTCAAATACCTTTTGCCTT;SOR=0.425;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=122;TCF=4;TCR=118;TR=33;WE=52659105;WS=52659087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,32:0.26:122
chr6	52661267	rs143488570	ATATATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTG	A	1253.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.46;QD=43.23;SOR=6.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	52662263	rs2397106	C	T	1960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=2;PP=1839;SC=TAACCACTTTCTCCCTCTGCA;SOR=5.856;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=61;TCR=2;TR=63;WE=52662271;WS=52662253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	52697576	rs4715344	C	T	1522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=3;PP=1362;SC=GGGGTCAAAACATGGTCAGTC;SOR=4.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=50;WE=52697584;WS=52697566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	52697825	rs4715345	A	C	5674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.79;QD=42.67;SOR=1.893;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
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chr6	52843477	rs375887	A	G	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=244;ReadPosRankSum=1.029;SC=GCCCACCAAAATTTGTTCAAT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=14;WE=52843485;WS=52843467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr6	52847551	rs316133	G	C	1620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FS=2.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.56;ReadPosRankSum=0.264;SOR=0.875;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:176,71:0.29:247
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chr6	52878637	rs2297211	T	C	1450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=42;PP=1245;ReadPosRankSum=0.623;SC=GCTTGGCTGGTGGCTGGGCAG;SOR=0.697;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=105;TCF=37;TCR=68;TR=64;WE=52878645;WS=52878627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,61:0.62:99
chr6	52938468	rs5876299	AT	A	566.27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.772;HP=13;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.464;NF=3;NR=26;PP=393;ReadPosRankSum=1.942;SC=AACAAATTACATTTTTTTTTT;SOR=2.517;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=60;TCF=5;TCR=55;TR=29;WE=52938476;WS=52938458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,29:0.88:33
chr6	52943841	rs35757290	TA	T	264.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.40;ReadPosRankSum=1.059;SOR=0.111;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,12:0.24:49
chr6	52958479	rs2816350	A	G	1206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=33;PP=969;SC=GCAATCATTCAGGGTCTTAGG;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=34;WE=52958487;WS=52958469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	52963071	rs2876	A	G	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=599;ReadPosRankSum=-2.606;SC=GCATGGCATAATGTTTTTGCA;SOR=0.733;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=126;TCF=53;TCR=73;TR=36;WE=52963079;WS=52963061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,35:0.28:127
chr6	52998788	rs2816346	G	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=0.067;SC=GCCCTTGGGCGGTGCTGGGAC;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=6;WE=52998796;WS=52998778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr6	52998834	rs2816345	C	T	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=194;ReadPosRankSum=-0.054;SC=CTGAGGGATGCCAGCTTTTTT;SOR=0.307;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=46;TCR=3;TR=14;WE=52998842;WS=52998824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,14:0.28:50
chr6	52998856	rs2518573	T	G	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.036;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=224;ReadPosRankSum=-1.243;SC=CTGGTGCCACTAAGCTCTACT;SOR=0.297;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=18;WE=52998864;WS=52998846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,19:0.32:59
chr6	53134104	rs3830806	C	CACAG	4077.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.11;NF=21;NR=53;PP=2965;SC=ACCAAATGACCACAGTTTTCT;SOR=1.414;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=82;TCF=22;TCR=60;TR=74;WE=53134112;WS=53134094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr6	53134164	rs70980834	C	CCTTTT	1944.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=37;PP=1818;SC=GGCCTAGTTTCAAGATCAAAT;SOR=3.816;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=39;WE=53134172;WS=53134154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	53138203	rs35189966	TA	T	929.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=39;PP=651;SC=GAACAGGTGGTAAAAAAAAAA;SOR=5.892;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=67;TCF=1;TCR=66;TR=40;WE=53138212;WS=53138193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	53138260	rs9463895	G	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.600;NF=0;NR=8;PP=136;ReadPosRankSum=0.642;SC=GACTTCCAACGGAGCTGACAA;SOR=0.752;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=8;WE=53138268;WS=53138250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr6	53140161	rs2294862	G	A	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=94;ReadPosRankSum=1.068;SC=ATGTCAACTCGGAGAAGCCCG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=53140169;WS=53140151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr6	53140928	rs2294864	T	A	1165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=0;PP=993;ReadPosRankSum=-0.647;SC=AATTTATTTTTAAAAACTCAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=36;WE=53140936;WS=53140918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr6	53152642	rs6458913	G	A	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.546;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=269;ReadPosRankSum=-1.497;SC=AAAGCCATGTGCACTGCACAA;SOR=0.245;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=16;WE=53152650;WS=53152632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr6	53152758	rs6907982	A	G	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=416;ReadPosRankSum=0.759;SC=AAACACAATTAGATCCTCTCT;SOR=0.763;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=67;TCF=37;TCR=30;TR=23;WE=53152766;WS=53152748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,24:0.35:68
chr6	53152845	rs3817960	T	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=143;ReadPosRankSum=-0.533;SC=GGACAGAGCATCTGCCTAAGA;SOR=0.846;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=10;WE=53152853;WS=53152835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr6	53156464	rs2294870	A	C	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=479;ReadPosRankSum=-0.346;SC=TTGCTTGCCCAGTTGTCTCTA;SOR=1.040;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=21;WE=53156472;WS=53156454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
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chr6	53160383	rs3736732	G	T	2855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=20;PP=2186;SC=TATTTACAAGGGACTATAGGC;SOR=2.277;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=66;TCR=20;TR=86;WE=53160391;WS=53160373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
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chr6	53762092	rs9349688	A	G	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=395;ReadPosRankSum=-0.677;SC=GCCAGAATCAATTGGAGCCCT;SOR=1.101;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=16;WE=53762100;WS=53762082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr6	53784268	rs59246960	C	CT	385.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=11.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.31;MQRankSum=1.167;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.660;SOR=4.332;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,25:0.71:35
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chr6	53785276	rs2294789	C	A	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=247;ReadPosRankSum=0.407;SC=TGTTTTAAAGCCAAACTTGCA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=11;WE=53785284;WS=53785266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
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chr6	53847672	rs9370251	A	G	3711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.731;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=81;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.835;SC=ATACAGGCATAGATGGCTCCT;SOR=2.073;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=31;TCR=81;TR=111;WE=53847680;WS=53847662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,115:0.99:116
chr6	53883843	rs17625497	G	A	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=193;ReadPosRankSum=1.248;SC=CTTGAAAAGCGTGAAAAAAGA;SOR=0.234;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=13;WE=53883851;WS=53883833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,13:0.25:52
chr6	53989526	rs4712056	G	A	2896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=71;PP=2118;ReadPosRankSum=0.217;SC=CACCGCAGCTGTCCGGCCCAA;SOR=0.724;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=148;TCF=40;TCR=108;TR=98;WE=53989534;WS=53989516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,106:0.68:155
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chr6	54013765	rs2145755	A	G	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=441;ReadPosRankSum=-0.554;SC=TTGATAACGTATCATTTAACT;SOR=0.336;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=56;TCR=2;TR=21;WE=54013773;WS=54013755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,24:0.39:62
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chr6	54054837	rs9296739	A	G	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.674;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr6	54067088	rs67016420	AT	A	1121.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.38;QD=36.18;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	54079968	rs11757700	G	A	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=242;ReadPosRankSum=0.916;SC=CTACTGCAACGGAAGTGACAC;SOR=0.610;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=13;WE=54079976;WS=54079958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
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chr6	54121968	rs9367556	G	A	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=353;ReadPosRankSum=2.392;SC=TTGAATCTTAGTGTTTATACT;SOR=0.544;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=17;WE=54121976;WS=54121958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
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chr6	54191661	rs115438249	C	T	1706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.747;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=33;PP=1373;ReadPosRankSum=-0.926;SC=TTTTAAATTTCGCCTTGGCAC;SOR=0.937;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=259;TCF=138;TCR=121;TR=78;WE=54191669;WS=54191651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,78:0.29:270
chr6	54191970	rs1848440	T	A	1630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.842;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=53;PP=1331;ReadPosRankSum=0.208;SC=AGATGGCCGATCAAGAACAGC;SOR=1.385;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=114;TCF=24;TCR=90;TR=64;WE=54191978;WS=54191960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,65:0.57:114
chr6	54208293	rs45620541	C	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=182;ReadPosRankSum=-0.329;SC=AAGAAAGTAACCTGAAGATTA;SOR=0.481;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=10;WE=54208301;WS=54208283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr6	54214779	rs3736350	A	T	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=99;ReadPosRankSum=0.125;SC=TTAAAAACTAATTAAAACTAT;SOR=0.084;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=8;WE=54214787;WS=54214769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,7:0.21:33
chr6	54219290	rs45545344	T	C	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.672;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=420;ReadPosRankSum=1.378;SC=GTGCCATTTGTTCTGTTGGAT;SOR=1.249;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=52;TCF=27;TCR=25;TR=22;WE=54219298;WS=54219280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,22:0.40:55
chr6	54219326	rs3195579	G	A	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=339;ReadPosRankSum=1.749;SC=ATGCAAGTCCGTGAAGATTTC;SOR=0.673;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=20;WE=54219334;WS=54219316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr6	54734941	rs7765721	C	A	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.721;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=275;ReadPosRankSum=2.097;SC=CATTCTGTTACCGAATTTTAA;SOR=0.031;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=55;TCF=54;TCR=1;TR=15;WE=54734949;WS=54734931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,15:0.27:56
chr6	54735122	rs1472679	A	G	1942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=36;PP=1658;ReadPosRankSum=0.995;SC=ACTACAAGGAATGGTATCGAG;SOR=0.891;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=267;TCF=150;TCR=117;TR=90;WE=54735130;WS=54735112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,87:0.32:274
chr6	54792236	rs2746440	A	G	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=460;SC=CTATCATGATATGGATTTTGG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=54792244;WS=54792226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	54805688	rs239798	A	C	4552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=90;PP=2965;SC=TATATATATAAAACCTTGGGT;SOR=1.645;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=43;TCR=90;TR=133;WE=54805696;WS=54805678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr6	54806379	rs17678648	A	G	8774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=133;NR=143;PP=2965;SC=CACCTTCTCCAGGTCCAGTTG;SOR=0.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=276;TCF=133;TCR=143;TR=276;WE=54806387;WS=54806369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr6	54806489	rs9475077	C	A	9221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=128;NR=147;PP=2965;SC=GCAGTTGTTACCCCTGAAAGA;SOR=0.841;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=275;TCF=128;TCR=147;TR=275;WE=54806497;WS=54806479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr6	55105341	rs16869572	A	G	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=283;ReadPosRankSum=-2.530;SC=CAACTTTGCCAAGGTGTGTAG;SOR=0.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=19;WE=55105349;WS=55105331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr6	55105617	rs114944877	G	A	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=268;ReadPosRankSum=-0.237;SC=TTTGAAAATAGGAGTTAAATA;SOR=0.536;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=55;TCF=4;TCR=51;TR=16;WE=55105625;WS=55105607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,16:0.29:56
chr6	55113411	rs3122169	C	A	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.165;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=450;ReadPosRankSum=0.229;SC=TTGTTGAGTGCCTATTCCTTT;SOR=0.461;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=74;TCF=62;TCR=12;TR=27;WE=55113419;WS=55113401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,30:0.38:79
chr6	55120301	rs9475220	A	T	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=158;ReadPosRankSum=1.630;SC=ACAGTTTTGCAAGAGCATGAA;SOR=0.242;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=10;WE=55120309;WS=55120291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr6	55142337	rs2653349	A	G	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=383;ReadPosRankSum=-1.455;SC=GATGTTGATGATTGTGCTTTT;SOR=0.613;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=84;TCF=30;TCR=54;TR=24;WE=55142345;WS=55142327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,24:0.28:85
chr6	55196575	rs116111965	G	C	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.082;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=489;ReadPosRankSum=0.330;SC=ATATTTAAGAGAGCAATGCTT;SOR=0.976;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=48;TCF=29;TCR=19;TR=24;WE=55196583;WS=55196565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr6	55198696	rs116685319	T	C	1500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.417;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=38;PP=1173;ReadPosRankSum=-0.225;SC=ATGACTTCTATTGTACTGTGA;SOR=0.105;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=79;TCF=16;TCR=63;TR=52;WE=55198704;WS=55198686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,55:0.66:83
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chr6	55215079	rs1032767	G	A	325.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=9;PP=233;SC=ATAAAATGCAGCAAAATCATT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=55215087;WS=55215057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	55216344	rs146300118	A	G	2136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.792;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=60;PP=1661;ReadPosRankSum=0.259;SC=TACTTGCCTCAGTGTAATTCG;SOR=0.558;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=130;TCF=31;TCR=99;TR=80;WE=55216352;WS=55216334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,81:0.61:132
chr6	55216461	rs139761685	A	T	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=285;ReadPosRankSum=0.453;SC=TTGATCTCATAACATTAGCTA;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=15;WE=55216469;WS=55216451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr6	55223962	.	G	GTCTATCTATCTA	115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=61.46;MQRankSum=1.803;NF=0;NR=4;PP=443;ReadPosRankSum=0.894;SC=AAAATTATCTGTCTATCTATC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=4;WE=55223970;WS=55223952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr6	55264362	rs6936510	T	C	483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=377;SC=TTAAGACATATTAAATCAAGT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=55264370;WS=55264352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	55266625	rs9370418	T	C	2736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=34;PP=1845;SC=AGATCCTTCATCGATCCAAAT;SOR=1.046;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=47;TCR=34;TR=81;WE=55266633;WS=55266615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr6	55266722	rs12529201	C	T	1781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.82;SOR=2.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	55266796	rs10948913	C	T	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=141;ReadPosRankSum=0.390;SC=TTTTTTGTGGCGGAGTTTTGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=5;WE=55266804;WS=55266786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr6	55381262	rs6459082	G	A	2142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=8;PP=1782;SC=TCTTTAAAACGATAAGAGGCC;SOR=3.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=55;TCR=8;TR=63;WE=55381270;WS=55381252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr6	55406399	rs9367638	C	T	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=303;SC=ATATCACAGTCCACAGGTTAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=55406407;WS=55406389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	55428658	rs4398737	A	C	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=5;PP=432;SC=TATGATGGGGATCAGGGCTTC;SOR=1.765;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=16;WE=55428666;WS=55428648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	55739053	rs3798818	A	G	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=54;ReadPosRankSum=0.473;SC=CAGAAGCTAAACAGGAGAGTT;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=55739061;WS=55739047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr6	55739711	rs200061411	T	TA	317.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.54;ReadPosRankSum=0.808;SOR=0.591;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,21:0.30:70
chr6	55922584	rs144408375	A	G	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.093;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=209;ReadPosRankSum=1.068;SC=CATCTTTGCCAGGGAGACCTG;SOR=1.124;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=30;TCF=15;TCR=15;TR=13;WE=55922592;WS=55922574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr6	55929347	rs2235735	T	C	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.975;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=661;ReadPosRankSum=-0.221;SC=TGTTATTTCATTTTTTATCAG;SOR=1.132;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=95;TCF=64;TCR=31;TR=37;WE=55929355;WS=55929337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,38:0.39:98
chr6	55966418	rs4379279	A	G	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.086;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=331;ReadPosRankSum=1.175;SC=AAGAACATTAAATACAAACAG;SOR=1.888;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=2;TCR=51;TR=17;WE=55966426;WS=55966408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,17:0.29:58
chr6	56006843	rs2076473	T	C	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.31;ReadPosRankSum=-0.564;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr6	56044386	rs373003478	T	C	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.881;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=653;ReadPosRankSum=-2.201;SC=CTTCACAAAGTTTCTGCTTCA;SOR=2.973;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=27;WE=56044394;WS=56044376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr6	56044578	rs2038149	T	C	2072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.513;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=39;PP=1696;ReadPosRankSum=-0.367;SC=CATCTTGGGATTTGCCATCCG;SOR=0.764;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=203;TCF=108;TCR=95;TR=84;WE=56044586;WS=56044568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,85:0.40:212
chr6	56045043	rs2038150	C	A	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=45;ReadPosRankSum=-0.243;SC=TTTAAATTGTCTGTGAAATAT;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=56045051;WS=56045033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr6	56327849	rs11758339	C	T	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.765;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=650;ReadPosRankSum=0.133;SC=AATACCTCTGCAGATGGCACG;SOR=0.358;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=150;TCF=103;TCR=47;TR=42;WE=56327857;WS=56327839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,47:0.31:154
chr6	56334594	rs9349823	A	T	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=389;ReadPosRankSum=-2.337;SC=AATAAATAAGACTCCTGGAAA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=20;WE=56334602;WS=56334584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr6	56337132	rs34164953	CG	C	80.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=2.238;QD=2.88;ReadPosRankSum=0.240;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,5:0.18:28
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chr6	56341981	rs2273973	G	T	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=104;ReadPosRankSum=-0.740;SC=AAAGTGAATTGCAGAGATTGT;SOR=0.247;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=7;WE=56341989;WS=56341972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
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chr6	56374754	rs9296849	C	A	1175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=31;PP=993;SC=ACATTTTTTACAATTTAATGT;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=56374762;WS=56374744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
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chr6	56394173	rs9357922	T	C	2074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=0;PP=1797;SC=CATAAAATTGTACAGAAATAA;SOR=8.318;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=63;TCR=0;TR=63;WE=56394181;WS=56394163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr6	56395051	rs6939305	C	A	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=40;PP=1126;SC=TCTAAGGTTACAATTTAAATC;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=40;WE=56395059;WS=56395041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	56417282	rs4715630	C	T	7112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=79;NR=131;PP=2965;SC=CATTGCTTGCCATGAGGGCTT;SOR=1.291;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=210;TCF=79;TCR=131;TR=210;WE=56417290;WS=56417272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr6	56417545	rs4715631	T	C	9931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.258;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=138;NR=155;PP=2965;ReadPosRankSum=1.253;SC=ACATCAGAGGTTCCCTTTGAG;SOR=0.415;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=295;TCF=140;TCR=155;TR=293;WE=56417553;WS=56417535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,306:1.00:307
chr6	56469319	rs45582036	G	T	2103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=23;PP=1590;ReadPosRankSum=0.271;SC=CCTCTTGAGGGTTCATATGAC;SOR=0.637;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=70;TCR=32;TR=74;WE=56469327;WS=56469309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,78:0.72:108
chr6	56476456	rs201218698	T	TA	213.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5570;FS=3.736;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=172;ReadPosRankSum=-1.449;SC=GTATTTTTTTTAAAAAAAAGA;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=56476464;WS=56476446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr6	56507135	rs1024195	T	C	1395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.437;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=4;PP=1126;ReadPosRankSum=0.289;SC=AAACATTATGTAAAAGTTTTA;SOR=1.436;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=90;TCF=79;TCR=11;TR=48;WE=56507143;WS=56507125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,51:0.55:92
chr6	56818706	rs986245	T	C	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=32;PP=781;SC=AGACCAGGGTTGGGAAAGCAC;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=56818714;WS=56818696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	56873069	rs6925819	T	C	5725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=114;PP=2965;SC=CGGGTCCTGGTGCTAGGAATC;SOR=1.085;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=195;TCF=81;TCR=114;TR=195;WE=56873077;WS=56873059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr6	57185499	rs57731727	TA	T	102.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=113;ReadPosRankSum=-1.282;SC=TTCAGTGTATTAGGGGTGATT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=57185507;WS=57185489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr6	57191021	rs11381745	A	AG	245.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=288;SC=CTAGAAGAAAAGGACTCCTTA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=57191029;WS=57191011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	57244672	rs5011404	G	A	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.299;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=2;PP=499;ReadPosRankSum=-0.252;SC=TCAAATTTTTGTAACAGCTTA;SOR=1.786;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=65;TCF=56;TCR=9;TR=26;WE=57244680;WS=57244662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,27:0.39:69
chr6	57244780	rs5011403	G	A	1572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.472;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=38;PP=1111;ReadPosRankSum=-0.620;SC=GTTGGGGTTCGAGTCCATTTA;SOR=1.112;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=111;TCF=46;TCR=65;TR=59;WE=57244788;WS=57244770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,64:0.53:120
chr6	57244830	rs5011402	T	A	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.220;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=31;PP=764;ReadPosRankSum=1.307;SC=TAGGTTTTGTTAAATATGTCG;SOR=1.630;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=76;TCF=17;TCR=59;TR=36;WE=57244838;WS=57244820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
chr6	57244893	rs5011401	T	C	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=242;ReadPosRankSum=0.761;SC=CCTCTCATCATCACAGCTACT;SOR=0.559;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=13;WE=57244901;WS=57244883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr6	57246708	rs6913779	G	T	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=552;ReadPosRankSum=-0.784;SC=TAATCATTTTGATATTCTTTT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=65;TCR=0;TR=26;WE=57246716;WS=57246698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,27:0.40:68
chr6	57246773	rs113849959	T	TAGG	3666.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.763;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=4;PP=2921;ReadPosRankSum=0.067;SC=TATGAAGACTTAGGATTTCTT;SOR=1.308;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=203;TCF=185;TCR=18;TR=77;WE=57246793;WS=57246763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,90:0.46:195
chr6	57246785	rs62415470	A	C	3820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-7.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.757;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.078;NF=88;NR=14;PP=2962;ReadPosRankSum=0.468;SC=GGATTTCTTAATGACAGGTGC;SOR=0.553;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=221;TCF=193;TCR=28;TR=102;WE=57246793;WS=57246763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,105:0.47:225
chr6	57246815	rs6936571	T	C	4154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=59.98;MQRankSum=1.006;NF=117;NR=40;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.002;SC=TTGCCTGTTTTACTCTTAATT;SOR=0.727;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=314;TCF=233;TCR=81;TR=157;WE=57246823;WS=57246805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,158:0.50:316
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chr6	57246969	rs4256440	G	A	3304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.696;HP=1;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=98;PP=2962;ReadPosRankSum=0.063;SC=CTTTGGCAGTGAGTATTTTAC;SOR=0.578;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=235;TCF=31;TCR=204;TR=113;WE=57246990;WS=57246959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,120:0.49:246
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chr6	57254955	rs2894842	G	A	3045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.229;HP=7;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=67;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.666;SC=AAGTAATGTGGTTTTTTTCTT;SOR=1.554;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=215;TCF=36;TCR=179;TR=74;WE=57254963;WS=57254940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,86:0.37:232
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chr6	57255001	rs2894843	C	A	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.970;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.524;NF=0;NR=29;PP=1454;ReadPosRankSum=0.773;SC=TACTTTTGCGCCAACCTAATA;SOR=2.143;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=99;TCF=4;TCR=95;TR=29;WE=57255024;WS=57254991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,31:0.30:105
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chr6	57255032	rs7769711	C	G	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=351;ReadPosRankSum=1.201;SC=AATCATTTTTCGGGGGAAAAT;SOR=0.233;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=0;TCR=57;TR=19;WE=57255040;WS=57255022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,20:0.33:60
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chr6	57372126	rs9396314	C	G	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.84;ReadPosRankSum=-2.343;SOR=0.928;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,33:0.38:88
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chr6	57372361	rs9382770	C	A	5508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FS=3.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.95;ReadPosRankSum=0.807;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,163:0.65:251
chr6	57372365	rs9396315	A	G	2114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FS=4.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.194;SOR=1.068;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:162,86:0.35:248
chr6	57372374	rs68090917	CT	C	2002.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.120;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=58;PP=963;ReadPosRankSum=0.049;SC=AAGGCACAGCCTTGTTATGCT;SOR=0.506;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=229;TCF=30;TCR=199;TR=67;WE=57372382;WS=57372351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,74:0.31:241
chr6	57372436	rs9382771	G	C	2781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.61;ReadPosRankSum=-1.073;SOR=0.930;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,82:0.61:135
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chr6	57372456	rs35141035	AT	A	269.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.25;ReadPosRankSum=-2.168;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,21:0.25:83
chr6	57372480	rs79601039	A	G	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=223;ReadPosRankSum=-1.706;SC=CTTTCATTCCATTATTCAAAT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=1;TCR=58;TR=15;WE=57372488;WS=57372470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,17:0.27:62
chr6	57372502	rs9349872	G	A	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.62;ReadPosRankSum=0.974;SOR=0.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr6	57372510	rs77697887	T	G	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.43;ReadPosRankSum=0.345;SOR=1.159;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr6	57372514	rs77868044	T	C	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.63;ReadPosRankSum=0.374;SOR=1.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr6	57392963	rs927193	T	C	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr6	57392981	.	A	C	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.10;ReadPosRankSum=-0.135;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr6	57393029	rs77090024	T	A	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.09;ReadPosRankSum=1.130;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
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chr6	57393092	rs73752377	T	A	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=130;ReadPosRankSum=-0.040;SC=GTTTTAATATTTTTTTTTCTT;SOR=0.610;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=13;WE=57393100;WS=57393082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr6	57393125	rs927192	A	G	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.106;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=13;PP=956;ReadPosRankSum=-2.281;SC=TTCCTACACTAGCCAAGATTA;SOR=1.115;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=72;TCF=50;TCR=22;TR=48;WE=57393133;WS=57393115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,47:0.62:76
chr6	57393144	rs3763183	A	T	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=2.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.70;ReadPosRankSum=0.449;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,22:0.27:83
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chr6	57393199	rs2397502	C	A	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.902;HP=6;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=388;ReadPosRankSum=0.175;SC=GTAGAACATTCTTTTAAACTT;SOR=0.533;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=80;TCF=31;TCR=49;TR=29;WE=57393207;WS=57393189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,29:0.36:80
chr6	57393216	rs2397503	G	T	1649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=1.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.38;ReadPosRankSum=-0.521;SOR=1.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,43:0.66:65
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chr6	57393278	rs75909609	T	C	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=162;ReadPosRankSum=1.277;SC=AGATAGAATATTATTTCACTG;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=9;WE=57393286;WS=57393268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
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chr6	57398047	rs76081480	A	C	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.291;SOR=0.186;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr6	57398058	rs7771283	C	G	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=47;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=275;ReadPosRankSum=0.861;SC=ATTGAATTAGCAACCATAACA;SOR=0.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=56;TCR=0;TR=20;WE=57398066;WS=57398037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,21:0.37:57
chr6	57398081	rs7753294	T	G	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=6.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.536;HP=3;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=0;PP=1097;ReadPosRankSum=1.017;SC=TATTACAGGGTACCTGATAAG;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=77;TCF=76;TCR=1;TR=46;WE=57398089;WS=57398071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,44:0.56:79
chr6	57398117	rs139574925	T	TA	1397.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=4;PP=1886;ReadPosRankSum=-1.746;SC=AAAACTCTACTGTTTTTTCTT;SOR=0.611;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=118;TCF=111;TCR=7;TR=45;WE=57398126;WS=57398107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,45:0.34:132
chr6	57398118	rs147643173	G	T	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-7.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=2;PP=1894;ReadPosRankSum=-1.113;SC=AAACTCTACTGTTTTTTCTTG;SOR=0.705;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=130;TCF=121;TCR=9;TR=36;WE=57398126;WS=57398107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,45:0.33:136
chr6	57398154	rs80081867	T	C	4925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=2.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.66;ReadPosRankSum=0.628;SOR=0.513;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,117:0.61:192
chr6	57398157	rs9476080	A	G	5063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=3.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.57;ReadPosRankSum=0.376;SOR=0.469;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,122:0.62:198
chr6	57398163	rs9476081	A	G	5444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=4.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.75;ReadPosRankSum=-0.102;SOR=0.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,139:0.63:220
chr6	57398201	rs62398997	T	C	5635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.882;HP=2;HapScore=1;MGOF=46;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.886;NF=96;NR=74;PP=2962;ReadPosRankSum=3.216;SC=TCACCATCTTTGTCATGGAGG;SOR=0.476;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=279;TCF=162;TCR=117;TR=170;WE=57398209;WS=57398191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,154:0.56:273
chr6	57398226	rs77436138	T	G	4625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.474;HP=2;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.061;NF=61;NR=47;PP=2242;ReadPosRankSum=-0.325;SC=ATGCAGTATGTCCTATTTCTG;SOR=0.739;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=299;TCF=158;TCR=141;TR=108;WE=57398234;WS=57398216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,158:0.56:282
chr6	57398264	rs62398998	A	G	4012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.460;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.958;NF=57;NR=91;PP=2345;ReadPosRankSum=-0.322;SC=TTTGGAACAGACATTGCAGTT;SOR=0.805;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=276;TCF=108;TCR=168;TR=148;WE=57398278;WS=57398254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,147:0.52:280
chr6	57398335	rs4715745	A	T	2222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-7.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.926;HP=9;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.265;NF=8;NR=72;PP=1644;ReadPosRankSum=1.163;SC=TGAAAAAAAAAATCAGAGTGG;SOR=0.870;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=148;TCF=17;TCR=131;TR=80;WE=57398343;WS=57398325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,88:0.56:157
chr6	57398385	rs11455120	A	AT	527.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=0.000;QD=8.80;ReadPosRankSum=-1.093;SOR=0.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,19:0.32:60
chr6	57398395	rs78658694	A	T	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=460;ReadPosRankSum=-0.765;SC=ATTTTTTTTTAAAATATGCTC;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=13;WE=57398403;WS=57398375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,17:0.28:61
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chr6	57415121	rs7741368	G	A	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=5.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=1600;ReadPosRankSum=0.488;SC=TGCTGTTGTCGTAAAGACAGA;SOR=0.941;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=60;TCF=55;TCR=5;TR=19;WE=57415149;WS=57415111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,20:0.32:63
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chr6	57415420	rs9349880	T	C	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.396;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
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chr6	57433544	rs562762	G	A	3323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.266;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.774;NF=46;NR=52;PP=1454;ReadPosRankSum=-1.337;SC=TGTAGATAGTGGTTGAGAAGA;SOR=0.834;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=319;TCF=159;TCR=160;TR=98;WE=57433552;WS=57433534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:226,100:0.31:326
chr6	57433616	rs518037	T	C	3200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.177;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=96;PP=2572;ReadPosRankSum=0.289;SC=GATGGCTTGATTTAAAATTTT;SOR=0.441;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=167;TCF=17;TCR=150;TR=108;WE=57433624;WS=57433606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,111:0.65:172
chr6	57433669	rs4464799	A	G	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=560;ReadPosRankSum=-0.096;SC=CACTTTTACTACAGTGTTCAA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=0;TCR=71;TR=27;WE=57433677;WS=57433659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,29:0.40:73
chr6	57457668	rs62399096	G	A	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.431;NF=5;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=-1.621;SC=CTCCTGGCAGGTTCACTTATA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=57457676;WS=57457666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
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chr6	57457704	rs5008381	A	T	418.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=83;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=440;ReadPosRankSum=0.755;SC=CTGAGCTTGAATTCTGTTAGT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=10;WE=57457712;WS=57457693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr6	57457737	rs9476161	A	G	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.741;HP=2;HapScore=3;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=0.213;SC=TAATCTTCATAGGACCTACTT;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=10;WE=57457752;WS=57457727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr6	57457744	rs4110758	A	G	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.509;HP=1;HapScore=3;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=110;ReadPosRankSum=-0.709;SC=CATAGGACCTACTTCTAATGA;SOR=0.165;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=14;WE=57457752;WS=57457727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr6	57457779	rs4110759	G	C	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.483;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=12;PP=839;ReadPosRankSum=0.224;SC=ATTCTGGGCAGTGGTGAGTAA;SOR=0.392;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=39;WE=57457787;WS=57457769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,41:0.63:65
chr6	57457843	rs4110760	T	G	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.137;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=397;ReadPosRankSum=0.325;SC=TTTTAATATGTAAATTAGAGT;SOR=0.371;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=80;TCF=46;TCR=34;TR=28;WE=57457851;WS=57457833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,29:0.35:84
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chr6	57467317	rs4637646	G	T	2584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FS=1.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.75;ReadPosRankSum=-1.213;SOR=0.915;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:186,79:0.30:265
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chr6	57472255	rs9296900	C	T	2803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=8.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=1;PP=2304;ReadPosRankSum=0.999;SC=ATTAATAAGCCGTTAGACAAT;SOR=0.613;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=137;TCF=136;TCR=1;TR=88;WE=57472263;WS=57472245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,92:0.65:141
chr6	57472299	rs9396358	A	G	1883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=8.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.817;HP=3;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=8;PP=1402;ReadPosRankSum=-0.786;SC=CGAGTGTGGTATTGTACTAAG;SOR=1.198;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=239;TCF=202;TCR=37;TR=74;WE=57472307;WS=57472289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,79:0.32:247
chr6	57472315	rs9296901	A	G	6224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.64;ReadPosRankSum=-0.564;SOR=0.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,181:0.66:275
chr6	57472316	rs9382818	G	A	1964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.07;ReadPosRankSum=-1.139;SOR=0.703;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:192,86:0.31:278
chr6	57472344	rs111230027	A	AT	2916.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.326;HP=8;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=38;PP=2632;ReadPosRankSum=-1.488;SC=GTGCTGGCTTATTTTTTGTTG;SOR=1.036;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=299;TCF=174;TCR=125;TR=101;WE=57472352;WS=57472334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,128:0.41:315
chr6	57472476	rs9382819	T	C	1788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-8.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.993;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=63;PP=2187;ReadPosRankSum=0.420;SC=TCTGCAGTAATGAGGCCTTAG;SOR=0.365;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=239;TCF=49;TCR=190;TR=85;WE=57472503;WS=57472466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,90:0.37:246
chr6	57472488	rs9382820	C	T	1735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-8.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.528;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=58;PP=2187;ReadPosRankSum=0.260;SC=AGGCCTTAGACAGATCTCTCG;SOR=0.521;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=206;TCF=34;TCR=172;TR=71;WE=57472503;WS=57472466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,75:0.36:211
chr6	57472495	rs62400219	C	G	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=14.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.52;ReadPosRankSum=-1.268;SOR=1.966;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,60:0.30:201
chr6	57472533	rs9367767	T	C	2397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=6.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.60;ReadPosRankSum=1.145;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,72:0.65:111
chr6	57472534	rs74369127	T	C	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.23;ReadPosRankSum=0.784;SOR=0.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,31:0.28:110
chr6	57498894	rs3846934	G	A	1314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=6;PP=1107;ReadPosRankSum=0.274;SC=AAGGCCAACAGCTGTGAGCTA;SOR=0.676;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=65;TCR=9;TR=48;WE=57498902;WS=57498884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,48:0.64:75
chr6	57498944	rs3846935	G	C	2151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.392;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=23;PP=1725;ReadPosRankSum=-0.380;SC=ATTTTTATTTGTCTTTTTCCT;SOR=0.266;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=103;TCF=73;TCR=30;TR=70;WE=57498952;WS=57498934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,73:0.68:108
chr6	57499042	rs5876654	A	AT	473.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.669;QD=4.56;ReadPosRankSum=0.044;SOR=0.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,28:0.27:104
chr6	57499171	rs3846936	T	C	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=79;ReadPosRankSum=-0.554;SC=ATTAAGTAACTTACAGCATTT;SOR=0.067;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=5;WE=57499179;WS=57499161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,4:0.18:22
chr6	57499188	.	C	T	88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=8;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=88;QD=61.3856062736;SC=ATTTATTGAACGACCAGACAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=2;WE=57499204;WS=57499178;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,2:0.13:15
chr6	57499196	.	C	CA	59	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=8;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=59;QD=61.4228802356;SC=AACGACCAGACAACTAAGCTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=2;WE=57499204;WS=57499178;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,2:0.15:13
chr6	57512340	rs4364484	C	T	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=582;ReadPosRankSum=1.010;SC=GCTGATTAAGCGTTAGAATGC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=23;WE=57512360;WS=57512330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
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chr6	57512529	rs5001076	C	A	4055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=10.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=562;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=135;NR=38;PP=2962;ReadPosRankSum=0.863;SC=TGAGAGCCAACGTATTCTAAA;SOR=0.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=550;TCF=427;TCR=123;TR=173;WE=57512537;WS=57512519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:382,174:0.31:556
chr6	57512565	rs4294008	T	C	13307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=781;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.197;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=310;NR=167;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.412;SC=AAAGAAGGAATCTATCCAACC;SOR=0.779;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=762;TCF=490;TCR=272;TR=477;WE=57512573;WS=57512555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:283,491:0.63:774
chr6	57512678	rs4398719	G	A	10494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=7.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=579;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=301;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.944;SC=AAGGACTAGAGGATTACTTTA;SOR=0.741;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=564;TCF=92;TCR=472;TR=357;WE=57512686;WS=57512668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,368:0.64:576
chr6	57512711	rs5001484	G	A,C	4200.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FS=14.042;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.61;ReadPosRankSum=2.370;SOR=2.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:137,139,120:0.35,0.30:396
chr6	57512711	.	GTAACCCT	ATAACCCT,CTAACCCA	2861	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000,0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=27;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=7,1;NR=131,105;PP=440,2861;QD=3.44037110541;SC=AGGCAGTTTTGTAACCCTTTT;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=392;TCF=24;TCR=368;TR=138,106;WE=57512726;WS=57512701;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.35:392
chr6	57512718	rs5001483	T	A	3917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FS=13.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.68;ReadPosRankSum=2.745;SOR=2.617;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:253,114:0.31:367
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chr6	57512783	.	T	TGTCACCAAGG	691.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.557;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=2.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQRankSum=-0.109;QD=6.72;ReadPosRankSum=1.234;SOR=0.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,24:0.23:103
chr6	57512785	.	TG	T	694.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQRankSum=-0.292;QD=7.24;ReadPosRankSum=-1.012;SOR=0.067;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,20:0.21:96
chr6	57512787	.	T	TCACCAAGGC	1276.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=2.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQRankSum=-2.362;QD=14.03;ReadPosRankSum=0.046;SOR=1.436;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,33:0.36:91
chr6	57512788	.	T	TTA	1453.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.681;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQRankSum=-2.850;QD=20.48;ReadPosRankSum=-2.492;SOR=1.298;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
chr6	57512792	rs372064495	T	C	1992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQRankSum=-2.485;QD=23.72;ReadPosRankSum=-3.496;SOR=0.381;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,49:0.58:84
chr6	62390916	rs1204114	T	C	1980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=38;PP=1592;SC=TGGCTGACCTTTGCGGTGGTG;SOR=1.355;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=59;WE=62390924;WS=62390906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr6	62523887	rs35068148	T	TA	7185.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.128;NF=58;NR=130;PP=2979;ReadPosRankSum=0.192;SC=TCCATGCCAGTAAAAAAAGCT;SOR=0.471;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=209;TCF=64;TCR=145;TR=188;WE=62523895;WS=62523877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,243:1.00:244
chr6	62526407	rs139617837	C	A	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=301;ReadPosRankSum=-0.066;SC=CAGGGAGAGGCAAGGAAAGAT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=13;WE=62526415;WS=62526397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr6	62526443	rs1005815	C	T	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=4;PP=564;SC=AAAAGGAGCACGACCCTGCTG;SOR=3.160;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=62526451;WS=62526433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	62757987	rs9346001	C	T	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=313;ReadPosRankSum=-2.876;SC=TATAGGTTTTCCAAACTTTAC;SOR=0.334;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=16;WE=62757995;WS=62757977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr6	62887031	rs9346218	C	T	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.905;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=193;ReadPosRankSum=-0.226;SC=AATTAAAATACCGTCTTCTTT;SOR=1.702;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=11;WE=62887039;WS=62887021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr6	62887099	rs6921170	C	T	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.045;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=278;ReadPosRankSum=0.150;SC=CCTTTGGATACTGCTTGACAG;SOR=1.609;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=20;WE=62887107;WS=62887089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,22:0.40:55
chr6	62995920	rs16883133	T	G	1965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.589;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=58;PP=1442;ReadPosRankSum=0.810;SC=AGGCAGGGTCTTGGGGCAGCG;SOR=0.269;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=92;TCF=8;TCR=84;TR=65;WE=62995928;WS=62995910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,72:0.73:98
chr6	63921361	rs4710420	A	G	114.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=0;PP=84;SC=ATGGGCAGGCAACGCGCTGAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=63921369;WS=63921356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	63990094	rs3846795	C	T	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.74;ReadPosRankSum=-0.740;SOR=0.715;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,36:0.24:153
chr6	64289938	rs56188808	AT	A	59.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=1.771;QD=0.69;ReadPosRankSum=-0.209;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,19:0.22:87
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chr6	64694354	rs4710457	C	T	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.745;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=718;ReadPosRankSum=0.197;SC=CTTTCCATGTCGTGCTTCATC;SOR=1.571;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=118;TCF=67;TCR=51;TR=40;WE=64694362;WS=64694344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,40:0.33:121
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chr6	65098768	rs587278	A	G	1642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=45;PP=1260;ReadPosRankSum=0.968;SC=GTTTTAGTATAAGTCATATAA;SOR=0.548;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=79;TCF=10;TCR=69;TR=52;WE=65098776;WS=65098758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,57:0.67:85
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chr6	65301504	rs624851	A	G	4376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=54;PP=2965;SC=GGTAGCAGATAAAGCAACAGT;SOR=1.038;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=74;TCR=54;TR=128;WE=65301512;WS=65301494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr6	65302915	rs11331907	GA	G	556.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=370;SC=ATGTATCTCAGAAAAAAAAAA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=18;WE=65302923;WS=65302906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	65525121	rs1390272	C	T	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.152;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=329;ReadPosRankSum=-0.393;SC=TTGCTGAAAACGTGAACTTGT;SOR=0.918;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=66;TCF=29;TCR=37;TR=20;WE=65525129;WS=65525111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,20:0.27:74
chr6	65596759	rs7743515	G	A	1486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=42;PP=1266;SC=GAGAAATGAGGAATAGCCATG;SOR=5.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=44;WE=65596767;WS=65596749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	65611952	rs59518422	T	TATTA	1021.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=7;PP=872;SC=GTGCTCACTTTCTTGTTGAAT;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=19;WE=65611960;WS=65611942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	65622463	rs9294631	A	G	6753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=94;PP=2965;ReadPosRankSum=0.336;SC=TAGGTCACAAAGGTTATAGCG;SOR=0.846;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=108;TCR=95;TR=200;WE=65622471;WS=65622453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,209:0.99:211
chr6	65622662	rs9445437	G	C	2310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=58;PP=1945;SC=AAAATTTTTAGAAGTGTGAAC;SOR=4.407;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=6;TCR=58;TR=64;WE=65622670;WS=65622652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr6	65655883	rs9453115	C	T	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=356;ReadPosRankSum=-0.281;SC=TACTCCTGGCCATTTTGATAT;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=16;WE=65655891;WS=65655873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr6	65767393	rs10455568	G	A	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.559;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=117;ReadPosRankSum=-0.930;SC=CTGACTTTAAGAAAATGAAGG;SOR=0.061;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=7;WE=65767401;WS=65767383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr6	66005740	rs374955689	GA	G,GAA	2938.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.180;NF=84,84;NR=17,17;PP=1505,389;ReadPosRankSum=0.652;SC=AATTTATCAGGAAAAAAAAAA;SOR=1.981;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=133;TCF=107;TCR=26;TR=101,101;WE=66005748;WS=66005730;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.35,0.65:130
chr6	66005888	rs9342464	C	T	2760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=6.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.610;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=63;PP=2121;ReadPosRankSum=-0.345;SC=CTTTGCAGACCGCTACAGTTA;SOR=0.780;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=54;TCR=107;TR=94;WE=66005896;WS=66005878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,100:0.59:169
chr6	66005970	rs9345601	G	A	1949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.704;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=43;PP=1466;ReadPosRankSum=3.140;SC=AGTCAACATTGACAACACACA;SOR=0.996;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=100;TCF=35;TCR=65;TR=64;WE=66005978;WS=66005960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,71:0.65:110
chr6	66042231	rs12207746	T	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=4.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.74;ReadPosRankSum=-0.541;SOR=0.817;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,12:0.18:66
chr6	66044812	rs76148513	T	C	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=139;ReadPosRankSum=-0.741;SC=GTTCGATGACTATCAATTTAA;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=8;WE=66044820;WS=66044802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr6	66045077	rs1502965	C	T	1275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=38;PP=1087;SC=TATGAATTCCCATCACTTACT;SOR=4.514;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=41;WE=66045085;WS=66045067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	66045118	rs1502964	T	C	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=18;PP=380;SC=TGAGAGATCATGATAGATGCC;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=66045126;WS=66045108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	66053835	rs1502963	T	G	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	66063248	rs9453265	G	A	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=276;ReadPosRankSum=-1.729;SC=TTTATATTACGTTTTGAGATA;SOR=0.776;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=12;WE=66063256;WS=66063243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr6	66063513	rs1936439	G	A	2239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.716;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=58;PP=1733;ReadPosRankSum=-0.861;SC=CATACATACTGCAAAAAGGAA;SOR=0.519;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=123;TCF=32;TCR=91;TR=80;WE=66063521;WS=66063503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,85:0.66:129
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chr6	66115281	rs34154043	G	GAA,GAAA	2039.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.69;QD=38.49;SOR=2.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,33,20:0.62,0.38:53
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chr6	69666520	rs7757138	T	C	1181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=5;PP=858;SC=ACATTGACCATGAAACATTTC;SOR=3.086;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=35;WE=69666528;WS=69666510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	69666684	rs1932618	A	G	3565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=56;PP=2823;SC=AGAAGATGCAATGAGCAGCGA;SOR=0.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=53;TCR=56;TR=109;WE=69666692;WS=69666674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr6	69666747	rs3215965	GA	G	1869.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=51;PP=1109;SC=TTCATAACGTGAAAAAAAAAA;SOR=2.368;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=64;TCF=10;TCR=54;TR=59;WE=69666755;WS=69666737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr6	69728452	rs10485430	C	T	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=27;PP=794;SC=CAAGTATCTACACCATACGTT;SOR=3.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=69728460;WS=69728442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	69728522	rs2785573	C	T	272.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=195;SC=ATATTTCTAACACTTGGTATC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=69728530;WS=69728512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	69759148	rs618372	A	T	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=3;PP=313;SC=ATACTTCAAAATTTATTCTTT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=69759156;WS=69759138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	69772817	rs2793459	C	G	4490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=106;NR=18;PP=2965;SC=TATAATTACTCTGTTGCAGAA;SOR=3.400;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=107;TCR=18;TR=124;WE=69772825;WS=69772807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr6	69786046	rs35445308	G	GA	975.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=28;PP=602;SC=TGCATTCAGAGAAAAAAAAAT;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=28;WE=69786054;WS=69786036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
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chr6	70034982	rs2296975	C	T	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-6.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=43;PP=979;ReadPosRankSum=-0.524;SC=AGAAAGCAGTCATGAGTGATT;SOR=1.478;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=69;TCF=2;TCR=67;TR=44;WE=70034990;WS=70034972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,46:0.65:71
chr6	70048739	rs11751775	A	C	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=3;PP=899;ReadPosRankSum=0.506;SC=AGCTAACTTGAAGCAGCAATT;SOR=0.675;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=62;TCF=57;TCR=5;TR=39;WE=70048747;WS=70048729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,39:0.63:62
chr6	70064187	rs2296974	G	A	5369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.956;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=127;PP=2962;ReadPosRankSum=0.842;SC=CAGATTCTTCGAGTTCGTTTC;SOR=0.915;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=271;TCF=96;TCR=175;TR=192;WE=70064195;WS=70064177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,196:0.69:285
chr6	70071173	rs913543	G	A	2636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.926;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=44;PP=1948;ReadPosRankSum=-2.532;SC=AAACCTTGCCGCATGAAAGGC;SOR=0.574;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=342;TCF=209;TCR=133;TR=111;WE=70071181;WS=70071163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:227,116:0.34:343
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chr6	70407465	rs12648	A	T	2289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=31;PP=1715;ReadPosRankSum=-0.686;SC=CTTCAGGAGCATCTGCATCAC;SOR=0.416;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=45;TCR=31;TR=75;WE=70407473;WS=70407455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,76:0.99:77
chr6	70411157	rs2445969	G	A	222.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=151;SC=CAACATGTCAGTGTGTAAATT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=70411165;WS=70411147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	70423739	rs2305837	A	G	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=439;SC=ATCTTAATAAAGTACCCAGCA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=70423747;WS=70423729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	70447993	rs45559535	G	T	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=24;PP=720;SC=AAGCTGAGCTGCTTACACATT;SOR=2.621;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=70448001;WS=70447983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	70448033	rs12661224	C	T	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=315;SC=TATGTATTACCGTATTCTTGA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=70448041;WS=70448023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	70490511	rs9346353	A	G	284.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=9;PP=235;SC=TTAAAAGTCAAGTTTTAATAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=70490519;WS=70490501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	70490528	rs9346354	A	G	216.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=175;SC=ATACGACTGAATATCACTTCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=70490536;WS=70490518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	70500451	rs2305838	C	A	2863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=86;PP=2468;SC=TAGCAGGAAACCTTATGTGAA;SOR=7.569;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=87;TCF=1;TCR=86;TR=87;WE=70500471;WS=70500441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr6	70500463	rs2305839	T	G	2512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=72;PP=2195;SC=TTATGTGAAGTAAAGGTTATT;SOR=8.581;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=0;TCR=72;TR=72;WE=70500471;WS=70500441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr6	70506879	.	AG	A	1048.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.639;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.892;NF=1;NR=35;PP=1209;ReadPosRankSum=-0.261;SC=TAAAGGTTAAAGGGGCGGAGG;SOR=2.160;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=53;TCF=1;TCR=52;TR=36;WE=70506887;WS=70506869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,36:0.73:49
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chr6	70639637	rs11421187	T	TA	375.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=1.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.96;ReadPosRankSum=1.286;SOR=0.333;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,25:0.26:95
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chr6	70812123	rs7772672	A	G	4762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=83;PP=2965;SC=CTGTGAGTAAACAATACAATG;SOR=1.047;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=61;TCR=83;TR=144;WE=70812131;WS=70812113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr6	70812273	rs11759810	A	G	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=180;ReadPosRankSum=0.138;SC=CATACTCTCTATATTCCTAAC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=70812281;WS=70812263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr6	70852493	rs9342783	A	G	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.31;ReadPosRankSum=-0.248;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
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chr6	70854183	rs9364074	A	G	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.074;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=360;ReadPosRankSum=0.177;SC=CTCATTTTATATGTTAAGTAG;SOR=0.405;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=84;TCF=57;TCR=27;TR=27;WE=70854191;WS=70854173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,27:0.31:88
chr6	70854208	rs58591338	CAG	C	922.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.31;ReadPosRankSum=0.390;SOR=0.423;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,29:0.26:111
chr6	70854861	.	G	A	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.108;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=337;ReadPosRankSum=-0.513;SC=TCCAAAAGGTGAGGCTGGTCC;SOR=0.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=9;TCR=41;TR=21;WE=70854869;WS=70854851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,21:0.40:52
chr6	70854924	rs3841703	A	AT	105.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=170;ReadPosRankSum=0.032;SC=TTTTGTTAATATTTTTCTTGC;SOR=0.634;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=7;WE=70854932;WS=70854914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr6	70856536	rs7762409	C	T	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.191;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=101;ReadPosRankSum=-1.057;SC=TGTATTCATACTTTTTTTCTT;SOR=0.078;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=8;WE=70856544;WS=70856526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr6	70859487	rs2346211	A	T	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=121;ReadPosRankSum=0.079;SC=ACGGTGGCAAACCCTGTTGTT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=9;WE=70859495;WS=70859477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr6	70866421	rs3736843	T	C	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=85;ReadPosRankSum=0.423;SC=GATGTAAAAGTCACTTGCAAA;SOR=0.495;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=7;WE=70866429;WS=70866411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr6	70866609	rs2229799	C	T	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=2.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.37;ReadPosRankSum=0.226;SOR=0.391;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,23:0.24:96
chr6	70873331	rs2296010	G	A	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.639;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=23;PP=676;ReadPosRankSum=2.261;SC=CTGGGGCTTGGAGTGGGAGCA;SOR=0.525;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=106;TCF=38;TCR=68;TR=38;WE=70873339;WS=70873321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,40:0.36:110
chr6	70875976	rs802174	T	G	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=346;ReadPosRankSum=2.085;SC=AAAGATAAAATTCTTCTGAAT;SOR=0.412;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=19;WE=70875984;WS=70875966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr6	70876046	rs802175	T	C	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.25;ReadPosRankSum=0.470;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr6	70877980	rs1464159	G	A	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.20;ReadPosRankSum=0.244;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr6	70894909	rs2296005	A	T	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=195;ReadPosRankSum=1.809;SC=CAAATCACCAAATCTATAAAG;SOR=0.656;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=12;WE=70894917;WS=70894899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr6	70897698	rs3749913	A	G	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=167;ReadPosRankSum=-0.474;SC=AATAAGTGCCAGTATGAATCC;SOR=0.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=12;WE=70897706;WS=70897688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr6	70909252	rs5877242	AT	A	91.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.963;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.736;NF=5;NR=0;PP=87;ReadPosRankSum=0.001;SC=GTATTTTGAAATTTTTTGACA;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=70909260;WS=70909242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr6	70916830	rs3215860	AT	A	303.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.326;HP=10;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=194;ReadPosRankSum=0.151;SC=CTGCATTGTAATTTTTTTTTT;SOR=0.777;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=64;TCF=26;TCR=38;TR=19;WE=70916838;WS=70916820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr6	70916888	rs1200576	A	C	1690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=21;PP=1335;SC=CCCCAGGCCCACAGGGCCCCC;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=48;WE=70916896;WS=70916878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr6	70916998	rs1736	G	A	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=334;ReadPosRankSum=-0.689;SC=AAGAAGACTTGGTTCCTGGTA;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=69;TCF=26;TCR=43;TR=23;WE=70917006;WS=70916988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,23:0.32:71
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chr6	70944123	rs12197487	G	C	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=0;PP=806;ReadPosRankSum=-0.570;SC=TACCCTAAATGTCCTATCTTT;SOR=1.220;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=32;WE=70944131;WS=70944113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,33:0.61:54
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chr6	70965125	rs633762	A	C	999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=27;PP=823;SC=TTAATACAAGAAAAAGTTACT;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=70965133;WS=70965115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	70966421	rs34557832	C	CA	1036.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.653;HP=13;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.958;NF=35;NR=15;PP=499;ReadPosRankSum=0.581;SC=GCATACATAGCAAAAAAAAAA;SOR=0.103;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=124;TCF=93;TCR=31;TR=50;WE=70966429;WS=70966411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,55:0.54:101
chr6	70970251	.	CA	C	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.451;ClippingRankSum=-0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.80;MQRankSum=-1.065;QD=4.36;ReadPosRankSum=2.559;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
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chr6	70970501	rs12210870	A	G	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.771;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=365;ReadPosRankSum=1.667;SC=TAGACAATGGATATTATCATA;SOR=1.268;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=72;TCF=7;TCR=65;TR=22;WE=70970509;WS=70970491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,21:0.29:72
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chr6	70979125	rs551470	A	G	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=341;SC=AAAGATCATAAAAGAACAAAG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=70979133;WS=70979115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	70979193	rs550675	C	T	1041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=6;PP=839;SC=AGTCCACTAGCGTTACAGACT;SOR=2.964;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=70979201;WS=70979183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	70979324	rs6935778	A	G	920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=703;ReadPosRankSum=-1.174;SC=TGTTCAAAGGAAAGCATCTTA;SOR=0.512;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=51;TCF=24;TCR=27;TR=31;WE=70979332;WS=70979314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,34:0.65:52
chr6	70980247	rs2296930	A	G	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=280;ReadPosRankSum=-0.224;SC=ACAAAATGAGAGTAATAAAGG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=13;WE=70980255;WS=70980237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
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chr6	70984436	rs592121	A	G	1508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=27;PP=1149;ReadPosRankSum=-0.108;SC=TGTCCCTTTGACCCAATGGAG;SOR=0.742;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=90;TCF=46;TCR=44;TR=56;WE=70984444;WS=70984426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,57:0.62:92
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chr6	71012575	rs2242588	T	C	1484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.819;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=35;PP=1294;ReadPosRankSum=0.164;SC=GACCCCCAGCTCCATCTCCCC;SOR=0.998;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=90;TCF=37;TCR=53;TR=56;WE=71012583;WS=71012565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,56:0.62:90
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chr6	71137992	rs41265349	C	T	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.309;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=449;ReadPosRankSum=-1.181;SC=GATTTTTTCCCTTTCCTTAAC;SOR=0.382;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=24;WE=71138000;WS=71137982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr6	71190577	rs2273210	A	G	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=4;PP=759;ReadPosRankSum=-0.898;SC=TCGTATGACAATAATAATGTA;SOR=0.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=47;TCR=6;TR=34;WE=71190585;WS=71190567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,35:0.65:54
chr6	71232014	rs146416812	GTTTATA	G	1416.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.796;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.826;NF=27;NR=1;PP=1367;ReadPosRankSum=-0.013;SC=AATCATAATAGTTTATATTTA;SOR=2.461;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=28;WE=71232027;WS=71232004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,36:0.77:47
chr6	71236216	rs7740873	C	T	4449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.030;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=58;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.503;SC=ATGGTATAAACATGCCTACTG;SOR=0.422;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=229;TCF=147;TCR=82;TR=155;WE=71236224;WS=71236206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,166:0.69:241
chr6	71236451	rs373718582	TATACACACACACACACATAC	T	431.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQRankSum=-1.179;QD=16.61;ReadPosRankSum=-1.326;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr6	71236453	.	T	C	324	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=27;MQ=56.31;NF=0;NR=17;PP=324;QD=21.1041889734;SC=CATATATATATACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=17;WE=71236461;WS=71236443;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,17:0.59:29
chr6	71243085	rs146023593	GTA	G	326.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=360;ReadPosRankSum=-0.441;SC=TAATATAAATGTATATCCAAA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=71243094;WS=71243075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr6	71243352	rs9283835	A	G	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=203;ReadPosRankSum=-0.660;SC=TAAAACATTGAACTTAACCAT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=9;WE=71243360;WS=71243342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr6	71246206	rs34238069	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=131;ReadPosRankSum=0.481;SC=GAACCAGTTTGTCACATACTG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=71246214;WS=71246196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr6	71247863	rs78525529	T	C	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=195;ReadPosRankSum=-0.625;SC=AATATATTTTTGATTAGCCAA;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=9;WE=71247871;WS=71247855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr6	71269459	rs16869371	C	T	2602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=33;PP=2047;ReadPosRankSum=-0.786;SC=TGCTTCGACCCGTTCTGCAAA;SOR=0.873;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=141;TCF=89;TCR=52;TR=93;WE=71269467;WS=71269449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,95:0.66:143
chr6	71269632	rs16869373	G	A	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=34;PP=769;ReadPosRankSum=1.020;SC=TAGTATAAAAGCATTGTTAGC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=0;TCR=52;TR=34;WE=71269640;WS=71269622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,35:0.67:52
chr6	71276803	rs2293297	T	C	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=37;ReadPosRankSum=-1.345;SC=GCGTGTGTCCTGGCCGTTCGG;SOR=0.330;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=5;WE=71276811;WS=71276793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr6	71289189	rs1048886	A	G	1797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.748;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=32;PP=1351;ReadPosRankSum=-1.429;SC=CTTGTCAAACAGTCCCTTAAG;SOR=0.310;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=96;TCF=56;TCR=40;TR=72;WE=71289197;WS=71289179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,73:0.72:101
chr6	71298533	rs13654	A	G	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=508;SC=TGTAGTTTGTATAATGTGTTT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=71298541;WS=71298523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	71378188	rs781984	A	G	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.191;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=190;ReadPosRankSum=-0.776;SC=GGGTCTGGGCAGAGCTTAGGG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=13;WE=71378196;WS=71378185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr6	71469487	.	A	G	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.431;ClippingRankSum=0.000;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.378;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=5;PP=704;ReadPosRankSum=0.352;SC=TTTATAGTGAATTGATTGGTG;SOR=1.140;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=136;TCF=112;TCR=24;TR=39;WE=71469495;WS=71469477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,39:0.28:137
chr6	71482975	rs1413353	G	A	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=458;ReadPosRankSum=0.324;SC=TAGAGTCCCAGCTTTGTGGAG;SOR=0.846;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=23;WE=71482983;WS=71482965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr6	71508415	rs140648221	C	T	1928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.647;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=38;PP=1433;ReadPosRankSum=-0.141;SC=CCAGAAAAGCCGGCAAAACCA;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=62;TCR=68;TR=74;WE=71508423;WS=71508405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,76:0.57:133
chr6	71569090	rs576516	T	C	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.645;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=269;ReadPosRankSum=0.145;SC=TACTGGCCAATGACAAGGTGG;SOR=1.812;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=74;TCF=24;TCR=50;TR=21;WE=71569098;WS=71569080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,21:0.28:76
chr6	71666146	rs1320315	T	C	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.973;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=199;ReadPosRankSum=0.837;SC=GCACGCTCCCTGGCCTCTCGG;SOR=0.137;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=63;TCF=10;TCR=53;TR=19;WE=71666154;WS=71666136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,21:0.34:61
chr6	72091267	rs5877279	T	TTA,TTATA	554.74	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1,1;NR=14,14;PP=214,419;ReadPosRankSum=1.075;SC=TCTGATGAATTTATATATATA;SOR=1.358;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=15,15;WE=72091275;WS=72091257;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.95:21
chr6	72836421	rs2463696	A	C	2303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.720;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=28;PP=1549;ReadPosRankSum=-0.533;SC=AAATTAAAACAACAATGATAT;SOR=0.777;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=71;TCF=42;TCR=29;TR=70;WE=72836429;WS=72836411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,72:0.99:73
chr6	72858416	rs151080929	GTT	G	2687.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=15;NR=63;PP=843;SC=GGAGACTTGGGTTTTTTTTTT;SOR=1.581;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=108;TCF=25;TCR=83;TR=78;WE=72858439;WS=72858406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,88:0.96:92
chr6	72889472	rs2249021	A	G	6171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=85;NR=99;PP=2965;SC=AGACACCCCTAAGCACAGCAG;SOR=0.828;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=185;TCF=86;TCR=99;TR=184;WE=72889480;WS=72889462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr6	72892257	rs2463730	A	G	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=26;PP=884;SC=ACCCGAACCTAGCTCGGTACC;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=32;WE=72892265;WS=72892247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	72945492	rs2807519	C	T	5131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=110;PP=2965;SC=CTGCATTCATCGGAGTTTCTG;SOR=2.049;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=43;TCR=110;TR=153;WE=72945500;WS=72945482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr6	72945603	rs138366781	A	ATTTTC	1410.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=944;SC=AAACTAATGTATTCTGACTAT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=26;WE=72945611;WS=72945593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	72947774	rs2807525	C	T	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=580;SC=TTTTAATGCACGAATAAAGAC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=72947782;WS=72947764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	72961019	.	T	G	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.954;ClippingRankSum=0.000;DP=226;ExcessHet=3.0103;FS=0.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.20;ReadPosRankSum=1.386;SOR=0.823;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:200,23:0.10:223
chr6	72961028	.	A	C	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.877;ClippingRankSum=0.000;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.12;ReadPosRankSum=0.701;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:196,23:0.11:219
chr6	72961034	.	A	G	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.000;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=3.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.24;ReadPosRankSum=0.895;SOR=1.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:191,20:0.09:211
chr6	72961040	.	T	C	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=0.000;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=2.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.94;ReadPosRankSum=0.130;SOR=1.029;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:186,19:0.09:205
chr6	72961043	rs34821160	T	C	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=2.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.94;ReadPosRankSum=-0.298;SOR=1.004;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:188,19:0.09:207
chr6	72962352	rs9351902	A	G	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=0;PP=561;SC=ATTAGTCTTCATAAGTTTTCA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=72962360;WS=72962342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	72968609	rs6923891	C	T	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=1;PP=1088;SC=ATATTACTCTCAGTTCCTTCA;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=37;WE=72968617;WS=72968599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	72984123	rs41265501	C	T	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=329;ReadPosRankSum=0.688;SC=CATGCGTCTCCGGAGAATGAC;SOR=0.861;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=25;TCR=21;TR=18;WE=72984131;WS=72984113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr6	72984277	rs4504440	G	A	260.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=7;PP=223;SC=AGCCAACTCTGGTAAAGCACC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=72984285;WS=72984267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	73332040	rs3734212	C	G	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.258;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=259;ReadPosRankSum=-1.330;SC=ATGTGGAGTCCGGCCGGGGCA;SOR=0.469;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=15;WE=73332048;WS=73332030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr6	73332121	rs34821312	C	T	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.22;ReadPosRankSum=-0.707;SOR=0.532;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,15:0.25:59
chr6	73516397	rs9446758	A	G	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=363;SC=TTGGCCCAATATTCCTATTAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=73516405;WS=73516387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	73752879	rs148987180	G	A	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=428;ReadPosRankSum=0.909;SC=GGAAGAAAGTGTATCACCATC;SOR=0.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=32;TCR=59;TR=25;WE=73752887;WS=73752869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,29:0.30:96
chr6	73752910	rs143753417	A	G	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.469;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=44;PP=1215;ReadPosRankSum=0.016;SC=GTTAAGAAGAATCCTTTATTC;SOR=1.245;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=76;TCF=18;TCR=58;TR=56;WE=73752918;WS=73752900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,57:0.70:81
chr6	73821239	rs2000205	T	C	3174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=76;PP=2671;SC=TGTTCCTTTTTATAAAATGAA;SOR=3.430;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=14;TCR=76;TR=90;WE=73821247;WS=73821229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr6	73830423	rs1891404	A	G	1877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=43;PP=1446;SC=GTTGCTCCTAAAGAGATTCAA;SOR=3.422;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=8;TCR=43;TR=51;WE=73830431;WS=73830413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	74072681	rs9446890	G	C	2540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=68;PP=2163;SC=CATACCCACAGCCCACATATT;SOR=4.062;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=8;TCR=68;TR=76;WE=74072689;WS=74072671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr6	74079041	rs497243	A	C	3286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=51;PP=2687;SC=TCCCTGAGTCAACTATGTCCA;SOR=0.772;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=54;TCR=51;TR=105;WE=74079049;WS=74079031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr6	74104495	rs3832419	C	CG	210.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=219;ReadPosRankSum=-0.083;SC=AGAGCGTGGGCGGGGGGGCTA;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=10;WE=74104503;WS=74104487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr6	74104978	.	C	T	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.586;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.409;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=274;ReadPosRankSum=-2.475;SC=AATCAGCTGCCACCTAGTGAG;SOR=2.368;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=13;WE=74104986;WS=74104968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr6	74110212	rs3757106	T	G	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=136;ReadPosRankSum=1.383;SC=GTCTTAATGATTTTTTACTAT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=74110220;WS=74110202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr6	74114365	rs5877364	AT	A	2360.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.733;NF=55;NR=6;PP=2411;ReadPosRankSum=-0.697;SC=CTAAGTATTCATGATGCTGTA;SOR=0.921;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=91;TCF=80;TCR=11;TR=61;WE=74114373;WS=74114355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,67:0.66:101
chr6	74115935	rs57549301	C	CGG	155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.655;NF=4;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=0.160;SC=TTAGTAGAGACGGTTTCTCTA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=74115943;WS=74115933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr6	74119084	rs4708053	T	C	2358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=37;PP=1830;SC=ACGTATATGCTTAATTACTGT;SOR=0.955;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=32;TCR=37;TR=69;WE=74119092;WS=74119074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr6	74123363	rs9442907	G	A	3448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.248;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=29;PP=2714;ReadPosRankSum=0.170;SC=GATGAACTATGTTCTTTGAAT;SOR=0.487;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=194;TCF=151;TCR=43;TR=124;WE=74123371;WS=74123353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,128:0.64:199
chr6	74135016	rs311678	C	T	1779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=10;PP=1469;SC=TCAGAAATTCCTTACTTCTTT;SOR=2.790;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=49;WE=74135024;WS=74135006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	74155346	rs610913	G	T	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.414;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=216;ReadPosRankSum=-0.070;SC=CTGACTCAGAGGATTTTCTTT;SOR=3.166;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=12;WE=74155354;WS=74155336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr6	74155491	rs2985419	T	C	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=20;PP=665;SC=GTAAAAATAGTACTGAAATAT;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=74155499;WS=74155481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	74161503	rs9446904	A	G	1989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=46;PP=1591;SC=GCCCGGGCGGAGGTCTTGGCT;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=15;TCR=46;TR=61;WE=74161511;WS=74161493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr6	74161801	rs9352000	G	T	1879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=33;PP=1445;SC=CGGAGACTCGGTGGGATCCAT;SOR=0.826;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=27;TCR=33;TR=60;WE=74161809;WS=74161791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr6	74171467	rs1713862	C	G	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=0;PP=725;SC=GACGTCCTACCCCGTGATATT;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=74171475;WS=74171457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	74189574	rs7766570	G	A	2381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=27;PP=1794;SC=CTCGGTAAGGGCAAAATGTCA;SOR=1.319;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=44;TCR=27;TR=71;WE=74189582;WS=74189564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr6	74201813	.	C	T	311	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=56.08;NF=13;NR=0;PP=311;QD=26.5977855806;SC=GGCGACAGAGCGAGACTCCAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=74201821;WS=74201812;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	74228006	rs1874229	A	G	2013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=32;PP=1508;SC=AAAGATTTGCATTCAGTGCAA;SOR=0.844;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=68;TCF=35;TCR=33;TR=67;WE=74228014;WS=74227996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr6	74228049	rs1874230	A	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=1.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.00;ReadPosRankSum=1.009;SOR=0.459;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,14:0.22:63
chr6	74229258	rs2073466	G	T	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.113;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=21;PP=849;ReadPosRankSum=-1.074;SC=ATTAAGAGTCGTTACTTGGTT;SOR=0.890;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=171;TCF=89;TCR=82;TR=48;WE=74229266;WS=74229248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,48:0.27:178
chr6	74229405	rs4708060	C	A	1282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=35;PP=1068;SC=TTTTATAAGTCGGATCTTAAC;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=36;WE=74229413;WS=74229395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	74432923	rs56093139	C	T	1802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=22;PP=1335;ReadPosRankSum=-0.933;SC=TGTATTCTATCATCATATTCA;SOR=0.392;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=33;TCR=22;TR=54;WE=74432931;WS=74432913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr6	74516840	.	G	A	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.457;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=212;ReadPosRankSum=-1.952;SC=GAAATTCAAGGAAGGTAGGTC;SOR=0.165;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=13;WE=74516848;WS=74516830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr6	74521947	rs2917862	C	T	5074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.715;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=92;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.653;SC=GTACAGCCAACGGCAGTTAAT;SOR=0.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=70;TCR=92;TR=161;WE=74521955;WS=74521937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,166:0.99:167
chr6	74528293	rs3005506	A	G	903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=740;SC=TGTTGACAAAACCACTGTGTT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=74528301;WS=74528283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	74530421	rs3005537	A	G	1782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=39;PP=1436;SC=GGAGGCGGGGAGGCAGGAAGT;SOR=2.387;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=52;WE=74530429;WS=74530411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	74533192	rs2917887	T	G	1484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=30;PP=1126;SC=GGAGACAGGCTGTGAGAAGTT;SOR=1.036;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=21;TCR=31;TR=51;WE=74533200;WS=74533182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	75795122	rs112607771	G	GCACA	265.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.80;ReadPosRankSum=0.189;SOR=0.672;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,12:0.17:70
chr6	75796364	.	GTA	G,GTATA	338.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0,0;NR=13,13;PP=203,242;ReadPosRankSum=0.000;SC=AATGGTTAAAGTATATATATA;SOR=2.531;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=13,13;WE=75796375;WS=75796354;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.48,0.35:23
chr6	75797302	rs970547	C	T	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.662;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=279;ReadPosRankSum=-0.751;SC=CCTGGATAGCCTTGCCCGTTG;SOR=1.127;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=16;WE=75797310;WS=75797292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,18:0.32:56
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chr6	75811880	rs556674	G	A	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.322;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=281;ReadPosRankSum=-0.129;SC=CAGTGTAAGCGTTCAGAATGA;SOR=0.027;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=64;TCF=4;TCR=60;TR=18;WE=75811888;WS=75811870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,18:0.27:66
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chr6	75848376	rs240737	C	T	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.653;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=220;ReadPosRankSum=-0.065;SC=GCAGTTTATTCACATTATTTA;SOR=0.213;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=51;TCF=9;TCR=42;TR=16;WE=75848384;WS=75848366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,16:0.31:52
chr6	75890933	rs34433354	T	TA	527.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.557;NF=1;NR=24;PP=387;ReadPosRankSum=1.524;SC=GTAAGCTATTTAAAAAAAAAA;SOR=3.528;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=25;WE=75890941;WS=75890923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr6	75893457	rs36085827	TA	T	1256.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=8;PP=902;SC=CGTGCTTCTTTAAAAAAAAAA;SOR=2.790;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=65;TCF=52;TCR=13;TR=49;WE=75893465;WS=75893447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	75901292	rs743003	C	T	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=398;SC=GTGCTCCTTCCAGATAAAGCT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=75901300;WS=75901282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	75904455	rs240433	A	T	2764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=18;PP=2153;SC=TTCCTAAAGCACAGCTTCTTC;SOR=2.598;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=83;TCF=65;TCR=18;TR=82;WE=75904463;WS=75904445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr6	75951719	rs240419	A	C	932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=23;PP=738;SC=GAGTTCGAGAACAGCCTGAAC;SOR=2.621;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=29;WE=75951727;WS=75951709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	75953705	rs9360898	T	G	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=38;ReadPosRankSum=0.277;SC=TTCAGTAGGCTGGTCCCTGGA;SOR=0.095;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=5;WE=75953713;WS=75953695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr6	75966269	rs418485	A	G	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=1;PP=449;SC=GTAGTTTCTCAGGTGCTTTTG;SOR=3.611;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=17;WE=75966277;WS=75966259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	75968720	rs147523	G	A	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=701;SC=GGAGTGGGGAGGGGATAAGGA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=75968728;WS=75968710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	75977591	rs240395	T	A	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=39;PP=1068;SC=ACAAAAACTGTTTTTAAGGTC;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=39;WE=75977599;WS=75977581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	75994151	rs240374	A	G	3921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.318;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=63;PP=2962;ReadPosRankSum=0.468;SC=AGGTGACAAAAATGCCAATGC;SOR=0.362;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=210;TCF=122;TCR=88;TR=138;WE=75994159;WS=75994141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,140:0.66:212
chr6	76022082	rs9352202	A	G	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.69;ReadPosRankSum=-0.535;SOR=0.628;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,39:0.30:129
chr6	76022090	rs9343281	G	C	4945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=106;NR=23;PP=1848;SC=GCAGGCCTGCGCTTTGGAGCC;SOR=3.024;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=130;TCF=107;TCR=23;TR=129;WE=76022098;WS=76022072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr6	76024704	rs62415695	G	A	3996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.951;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=93;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.400;SC=ATGGCTTTGAGCTTCTCTTCT;SOR=0.970;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=195;TCF=65;TCR=130;TR=136;WE=76024712;WS=76024694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,143:0.71:200
chr6	76063133	rs6913979	A	G	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=331;SC=TCAAAAATTGACATTAGACCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=76063141;WS=76063124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	76124792	rs2808201	G	A	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-4.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=72;ReadPosRankSum=0.070;SC=TTACCACATCGCCAATAAGGA;SOR=0.163;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=7;WE=76124800;WS=76124782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr6	76138146	rs5877455	C	CAG	501.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=578;ReadPosRankSum=0.436;SC=TCACCACCTCCAGTTTCTGAA;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=59;TCR=2;TR=15;WE=76138154;WS=76138136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,15:0.25:59
chr6	76333486	rs655471	G	A	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=409;SC=TGCAAAGACTGTGGTTTGGCC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=76333494;WS=76333476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	76369054	rs507662	A	G	5007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=90;PP=2965;SC=AACAGAAACGACACTGTAGTA;SOR=1.074;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=66;TCR=90;TR=156;WE=76369062;WS=76369044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
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chr6	76538403	rs1280052	G	A	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.406;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=392;ReadPosRankSum=0.127;SC=ATTTTGTCACGCTTGAAATTG;SOR=0.585;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=32;TCF=17;TCR=15;TR=16;WE=76538411;WS=76538393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
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chr6	76554593	rs7760587	G	A	1458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=8;PP=1260;SC=TGTTAATTATGTTTAATTTGT;SOR=3.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=47;WE=76554601;WS=76554583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr6	76558358	rs9350601	A	G	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=517;ReadPosRankSum=-1.898;SC=ACTTTAAGAAATATCTAAAAT;SOR=1.121;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=22;WE=76558366;WS=76558348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr6	76566734	rs3798439	T	G	1697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=4;PP=1523;SC=CTTCTCTGTGTGTATGTTTAG;SOR=4.977;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=49;TCR=4;TR=53;WE=76566742;WS=76566724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr6	76576527	rs6453845	G	T	915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=9;PP=780;SC=TAGTGGTGACGGCGTTGGACA;SOR=1.302;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=26;WE=76576535;WS=76576517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	76583113	rs9443195	T	A	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.61;ReadPosRankSum=1.740;SOR=0.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,13:0.24:54
chr6	76595634	rs13211391	C	A	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.75;ReadPosRankSum=1.036;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr6	76595653	.	GT	G	140.92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=123;ReadPosRankSum=-0.887;SC=GTGAAAATGAGTTTTTTTAAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=76595661;WS=76595643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr6	76604573	rs3798429	T	G	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=69;ReadPosRankSum=-0.389;SC=AATTGTTTTCTATGTATGTCA;SOR=1.329;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=6;WE=76604581;WS=76604563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr6	76604797	rs3798427	A	G	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.78;ReadPosRankSum=1.524;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr6	76617511	.	A	ATGTG	301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.67;MQRankSum=2.122;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.535;SOR=0.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr6	76644527	rs9360960	C	T	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=218;ReadPosRankSum=-1.351;SC=CCGTCCCGCCCCTCAACCTTG;SOR=0.098;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=10;WE=76644535;WS=76644517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr6	76656978	rs3215818	AT	A	530.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.592;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.231;NF=19;NR=4;PP=627;ReadPosRankSum=-1.632;SC=ACAGAACGAAATTAAAAAAAT;SOR=0.197;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=79;TCF=70;TCR=9;TR=23;WE=76656986;WS=76656968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,24:0.29:82
chr6	76660271	rs41312278	C	T	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=574;ReadPosRankSum=0.821;SC=TGAGCAGTGCCCACTCACCAG;SOR=1.329;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=24;WE=76660279;WS=76660261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,26:0.72:36
chr6	76713754	rs1590560	C	T	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=4.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.885;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=624;ReadPosRankSum=0.992;SC=TTGAAATATGCGGAATAACCA;SOR=0.095;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=27;WE=76713762;WS=76713744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr6	76715299	rs17802616	G	A	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=56;ReadPosRankSum=1.333;SC=ATTGTTACATGCCTTGCAAAG;SOR=0.321;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=6;WE=76715307;WS=76715289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr6	76717157	rs3736925	C	T	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=142;ReadPosRankSum=-0.599;SC=TTGGGGGAGACGGGAATGTAC;SOR=0.684;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=56;TCF=19;TCR=37;TR=15;WE=76717165;WS=76717147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,18:0.29:62
chr6	76720990	rs2274349	A	T	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.240;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=367;ReadPosRankSum=-0.484;SC=CTGCTGGGTCAGTTCTTGCCT;SOR=1.402;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=18;WE=76720998;WS=76720980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr6	76734836	rs78017079	T	A	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.952;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=342;ReadPosRankSum=1.600;SC=TAATTAGGAATTGTTTTATAA;SOR=2.124;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=18;WE=76734844;WS=76734826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr6	76735065	rs1341568	A	G	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=221;ReadPosRankSum=-0.663;SC=ATACTGAGTAAACCTAAAAGT;SOR=0.793;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=10;WE=76735073;WS=76735055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr6	76744298	rs2274348	C	T	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=311;ReadPosRankSum=0.980;SC=GGGAACTGTTCGTGCAGTGTT;SOR=0.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=14;WE=76744306;WS=76744288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr6	76782049	rs1320537	C	A	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=2;PP=604;SC=CCCGTGAGATCAATTGGTAGC;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=76782057;WS=76782039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	78171941	rs6297	C	T	3196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=40;PP=2485;SC=CCACTGCAAACGGCAAGTCAA;SOR=1.211;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=65;TCR=40;TR=105;WE=78171949;WS=78171931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr6	78172260	rs6296	C	G	6635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=97;PP=2965;SC=TGACTTGGTTCACATACACAG;SOR=0.850;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=203;TCF=106;TCR=97;TR=203;WE=78172268;WS=78172250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
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chr6	79424433	rs9352613	A	G	1286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=16;PP=859;SC=CAGGAGATTCATGAAAACTTA;SOR=0.929;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=37;WE=79424441;WS=79424423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
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chr6	79707923	rs11752126	C	T	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=300;ReadPosRankSum=-1.149;SC=GAGATTTAGGCTGTTTCAAAT;SOR=0.779;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=17;WE=79707931;WS=79707913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,18:0.34:53
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chr6	79752792	rs9343863	T	C	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.886;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=493;ReadPosRankSum=0.157;SC=TTTTAAGAATTCACATACTCC;SOR=0.054;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=77;TCF=1;TCR=76;TR=25;WE=79752800;WS=79752782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,25:0.32:77
chr6	79912189	rs2236543	A	G	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=276;ReadPosRankSum=-2.107;SC=CTGTCCAAACACAAGGTGAAG;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=13;WE=79912197;WS=79912179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
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chr6	79918087	rs75574837	C	G	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=254;ReadPosRankSum=-1.097;SC=CACATTTGATCAAGTGAATTG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=12;WE=79918095;WS=79918077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
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chr6	79944355	rs9361504	T	G	6944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=144;PP=2965;SC=TGCCTCTGCCTCTGCAGCTGC;SOR=1.394;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=223;TCF=79;TCR=144;TR=223;WE=79944363;WS=79944345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr6	80196848	rs1875845	C	T	2672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.101;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=38;PP=2232;ReadPosRankSum=-0.484;SC=GAGGAAAAAGCCTTCATCTTC;SOR=0.410;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=158;TCF=102;TCR=56;TR=98;WE=80196856;WS=80196838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,96:0.61:157
chr6	80203253	rs9443675	G	A	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=240;ReadPosRankSum=0.051;SC=AATATGAATAGTAACATTTAG;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=11;WE=80203261;WS=80203243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
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chr6	80631539	rs700483	T	A	1413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=36;PP=1217;SC=GCGTGTTATATACACCAAAAT;SOR=2.687;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=46;WE=80631547;WS=80631529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	80657086	rs62407622	C	G	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=154;ReadPosRankSum=1.154;SC=ACGGGGCGAGCGGCGGCCGGG;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=9;WE=80657094;WS=80657076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr6	80715838	rs240226	T	G	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=656;ReadPosRankSum=0.206;SC=GGCTACATGATGGCAGGGTTT;SOR=0.687;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=134;TCF=71;TCR=63;TR=40;WE=80715846;WS=80715828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,40:0.29:137
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chr6	80720742	rs239556	A	T	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.18;ReadPosRankSum=1.180;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
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chr6	80724156	rs2295840	T	C	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.513;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=110;ReadPosRankSum=-1.094;SC=TATGGGACTTTATTTGATTTT;SOR=0.049;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=8;WE=80724164;WS=80724146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr6	80724312	rs239566	A	G	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.577;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=211;ReadPosRankSum=2.663;SC=AGGTAAGAGTAACAAAATCAG;SOR=0.622;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=47;TCF=22;TCR=25;TR=15;WE=80724320;WS=80724302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr6	80724462	rs239567	C	T	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=0.444;SC=ATGAAAAGTACTGAATCCGCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=80724470;WS=80724452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr6	80741328	rs239584	G	A	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=133;ReadPosRankSum=-0.332;SC=TAAACTTTCTGTTTTTTTGTC;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=8;WE=80741336;WS=80741318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr6	80750093	rs2295841	C	G	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=45;ReadPosRankSum=0.353;SC=AATTGGCTACCCTTTGTCAGC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=80750101;WS=80750083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr6	80750290	rs608962	C	T	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.691;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=181;ReadPosRankSum=-2.029;SC=ATTTTTCTTACTGGTACTAGT;SOR=1.274;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=11;WE=80750298;WS=80750280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr6	80751780	rs652752	G	A	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.25;ReadPosRankSum=-0.955;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr6	80774236	rs7771228	C	T	4984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=83;PP=2965;SC=TGGCTATTTCCCGTGTGCTTG;SOR=0.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=80;TCR=83;TR=163;WE=80774244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr6	80775330	rs3812152	G	A	3723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.680;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.337;NF=73;NR=58;PP=2937;ReadPosRankSum=1.185;SC=ACAGCTGAGAGTTGGTGACTT;SOR=0.921;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=190;TCF=102;TCR=88;TR=131;WE=80775338;WS=80775320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,134:0.68:196
chr6	80777467	rs3828761	C	T	2332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.527;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.699;NF=49;NR=36;PP=1825;ReadPosRankSum=1.263;SC=ATAAATGGGACGGAAGCCAAA;SOR=0.419;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=124;TCF=76;TCR=48;TR=85;WE=80777475;WS=80777457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,89:0.68:131
chr6	80777608	rs3967160	G	A	1839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.071;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.737;NF=22;NR=40;PP=1423;ReadPosRankSum=0.705;SC=CTGCCAAGATGTAAGACTGAT;SOR=0.226;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=91;TCF=28;TCR=63;TR=62;WE=80777616;WS=80777598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,67:0.71:95
chr6	80778853	rs6923330	G	C	2436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.456;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.103;NF=31;NR=54;PP=2037;ReadPosRankSum=-0.159;SC=ATTCCAGAAGGTTCCAATGAT;SOR=0.975;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=127;TCF=49;TCR=78;TR=85;WE=80778861;WS=80778843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,84:0.66:127
chr6	80878508	.	A	AAGGGAGGGAGGGAGGG	2022.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=-1.398;QD=34.28;ReadPosRankSum=-0.494;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,35:0.59:59
chr6	80910571	rs9688535	G	A	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=0.464;SC=CTTTGCTACAGTGAGCTTCTT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=80910579;WS=80910561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
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chr6	82898759	rs9361897	G	A	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=5.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=-0.569;QD=20.44;ReadPosRankSum=0.388;SOR=0.135;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
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chr6	82921339	rs9341913	G	A	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=526;ReadPosRankSum=0.771;SC=TACATATTTAGTGAAAAAGAT;SOR=1.075;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=22;WE=82921347;WS=82921329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,25:0.76:33
chr6	82922388	rs9353057	C	T	1405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.450;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=23;PP=1073;ReadPosRankSum=-1.049;SC=TGCCAAAATCCAGACATGAAA;SOR=0.387;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=48;WE=82922396;WS=82922378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,50:0.76:66
chr6	82922571	rs6900750	A	G	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=134;ReadPosRankSum=-2.626;SC=ACATACAACAAAAAATCCAAC;SOR=0.818;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=8;WE=82922579;WS=82922561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr6	82924645	rs6912968	A	G	185.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5731;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=143;ReadPosRankSum=-0.489;SC=TTTTTTAACAATATTTAGAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=82924653;WS=82924635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr6	82930437	rs34032511	G	GA	1789.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.217;HP=13;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.788;NF=6;NR=82;PP=981;ReadPosRankSum=0.381;SC=CTGTCTAGATGAAAAAAAAAA;SOR=1.115;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=196;TCF=14;TCR=182;TR=88;WE=82930445;WS=82930427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,90:0.63:143
chr6	82933309	rs9361904	C	T	1895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=23.310;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=45;PP=1495;ReadPosRankSum=-1.662;SC=CAGTTACACACTTTTCTCCAT;SOR=1.821;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=88;TCF=33;TCR=55;TR=63;WE=82933317;WS=82933299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,66:0.72:92
chr6	82936824	rs372581069	G	GA	440.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.203;NF=19;NR=0;PP=311;ReadPosRankSum=-0.129;SC=CCTTACAGTTGAAAAAAAAAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=19;WE=82936832;WS=82936814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr6	82941656	rs9449451	C	G	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=236;ReadPosRankSum=0.131;SC=ACGCTCTTCTCTGAATGAATA;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=12;WE=82941664;WS=82941646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr6	83075914	rs700494	G	A	3492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=51;PP=2808;SC=CCAGATTAACGAACCTCAGTT;SOR=0.711;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=55;TCR=51;TR=106;WE=83075922;WS=83075904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
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chr6	83666943	rs293532	G	T	3261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.36;SOR=5.004;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr6	83733785	rs4235816	C	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=7.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.48;ReadPosRankSum=0.409;SOR=1.891;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,12:0.18:66
chr6	83752057	rs4612135	C	G	2290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=11;NR=60;PP=1945;SC=AATAACAAAGCCTCCAATAAA;SOR=3.290;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=11;TCR=60;TR=71;WE=83752065;WS=83752047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr6	83754094	rs4455637	T	C	1762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=0;PP=1557;SC=ATTGAAGAAGTCAGTATCTAA;SOR=7.978;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=53;WE=83754102;WS=83754084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	83754481	rs2027282	T	C	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.093;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=52;ReadPosRankSum=-0.592;SC=AACCACAAGGTTTGCAATGCT;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=83754489;WS=83754471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr6	83775201	rs6915334	C	G	2553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=75;NR=3;PP=2119;SC=AGTGGCGGAGCCGACTACAGG;SOR=5.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=78;TCF=75;TCR=3;TR=78;WE=83775209;WS=83775191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr6	83822985	rs1925782	G	A	3510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=100;NR=8;PP=2965;SC=TCACATTTTCGTGGCAAAAAT;SOR=4.824;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=100;TCR=8;TR=108;WE=83822993;WS=83822975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
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chr6	83949261	rs1180230	T	C	5372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=47;PP=2965;SC=CAAATACCTCTCCAGCTCCTT;SOR=1.868;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=111;TCR=48;TR=158;WE=83949269;WS=83949251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr6	84055783	rs12215595	A	G	1688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=1;PP=1395;SC=GAGAAAGAGAACCAGACAAAA;SOR=6.358;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=46;WE=84055791;WS=84055778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	84108065	rs4706990	A	T	2972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=16;PP=2427;SC=CAAGTTGCATATAAAATAAAA;SOR=2.935;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=74;TCR=16;TR=90;WE=84108073;WS=84108055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr6	84140772	rs28372716	TGGC	T	178.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.792;NF=0;NR=4;PP=131;ReadPosRankSum=-0.629;SC=ACTGCAGCTGTGGCGGCGGCG;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=4;WE=84140782;WS=84140762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr6	84233831	rs504593	G	A	4699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=78;PP=2965;SC=GAGCATCTGCGGGAGAGAGCG;SOR=0.869;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=143;TCF=65;TCR=78;TR=143;WE=84233839;WS=84233821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr6	84266041	rs4706182	A	G	103.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.57;QD=20.78;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	84284664	rs6941004	G	C	1078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=0;PP=890;SC=CAAAATGCACGCTACTTTACA;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=84284672;WS=84284654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	84284880	rs2022269	T	A	4069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=93;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.727;SC=AAACAAAAAATCACAAATCAG;SOR=1.193;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=29;TCR=94;TR=122;WE=84284888;WS=84284870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,131:0.99:132
chr6	84290137	rs147751300	TAAAG	T	1756.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=12;PP=1523;SC=ATGCTTCAGTTAAAGAAAAAA;SOR=1.708;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=39;WE=84290148;WS=84290127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	84292139	rs1033653	T	A	1426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=39;PP=1194;SC=CCATAAAAACTGAATTTAAAA;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=40;WE=84292147;WS=84292129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	84300997	rs2273363	A	G	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=3.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.127;SOR=0.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,33:0.27:124
chr6	84303342	rs1033655	T	C	4258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=52;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.714;SC=TTGCGGGAACTGGAGGGGCTG;SOR=0.534;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=143;TCF=91;TCR=52;TR=142;WE=84303350;WS=84303332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,140:0.99:141
chr6	84317533	rs7752421	A	T	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.243;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=499;ReadPosRankSum=0.741;SC=GAAGACTGAAAGTGAAGATGC;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=24;WE=84317541;WS=84317523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr6	84350654	rs217325	C	G	323.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.98;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	84350654	.	CACGACTTCCA	GACGACTTCCA,GACGACTTCCT	111	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=9,3;NR=0,0;PP=111,38;QD=16.1968013941;SC=AGTTGGATGACACGACTTCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9,3;WE=84350672;WS=84350650;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:9
chr6	84350664	rs13192201	A	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.86;ReadPosRankSum=-0.637;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr6	84366385	rs3037027	C	CAAG	3683.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=17;PP=2967;SC=TATTGCCCACCAAGTGAGACA;SOR=2.720;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=66;TCF=47;TCR=19;TR=61;WE=84366393;WS=84366375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr6	84368819	rs11368249	TA	T	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.714;QD=1.31;ReadPosRankSum=0.022;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,19:0.22:86
chr6	84372214	rs34529044	AT	A	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.62;ReadPosRankSum=-0.694;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr6	84375033	.	G	A	231	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=12;NR=0;PP=231;QD=22.1476010456;SC=TAGATGATCCGGAACTGTGTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=12;WE=84375041;WS=84375032;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,12:0.46:26
chr6	84375103	rs13192685	C	A	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.520;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=0;PP=678;ReadPosRankSum=-0.978;SC=CATCACCATGCTCTTCCTAAA;SOR=2.110;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=86;TCF=83;TCR=3;TR=32;WE=84375111;WS=84375093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,34:0.39:88
chr6	84375377	rs217302	G	A	1342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=37;PP=1053;SC=GAACATATAAGCCTGTTTACT;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=37;WE=84375385;WS=84375367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	85473758	rs172562	C	T	1827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.379;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=38;PP=1267;ReadPosRankSum=0.377;SC=TCCACGGCCCCCGCCGCCTCT;SOR=0.552;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=62;TCR=69;TR=73;WE=85473766;WS=85473748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,75:0.56:134
chr6	86180926	rs10944129	A	G	995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=721;ReadPosRankSum=-0.671;SC=TTGTTAATAAATATCCATTTT;SOR=1.436;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=27;WE=86180934;WS=86180916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,33:0.65:51
chr6	86196990	rs3812139	C	G	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=193;ReadPosRankSum=-0.431;SC=TGTTTCATTCCTTTTCCAGAA;SOR=0.235;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=16;WE=86196998;WS=86196980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr6	86199233	rs2229523	A	G	6986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.80;SOR=0.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr6	86199233	.	ACGGATGAAAT	GCGGATGAAAC,GCGGATGAAAT	2962	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=20,93;NR=32,114;PP=570,2962;QD=11.9897668243;SC=CCTGAGACACACGGATGAAAT;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=207;TCF=93;TCR=114;TR=52,207;WE=86199251;WS=86199223;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.25:207
chr6	86199243	rs2229524	T	C	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=1.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.12;ReadPosRankSum=0.848;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,54:0.26:206
chr6	86199329	rs9450284	G	C	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-5.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.712;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=52;PP=1010;ReadPosRankSum=0.006;SC=TATGCTCCCAGGCCCAGCTCC;SOR=1.734;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=76;TCF=2;TCR=74;TR=53;WE=86199337;WS=86199319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,54:0.68:79
chr6	86224053	rs6454472	T	G	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.904;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=573;ReadPosRankSum=1.497;SC=CAATATTTTATTTGTAAACAC;SOR=1.402;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=25;WE=86224061;WS=86224043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
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chr6	86246709	rs12193777	C	A	2136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.703;NF=0;NR=71;PP=1744;ReadPosRankSum=0.450;SC=TTATTGAAAACCATTATTAAA;SOR=2.040;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=98;TCF=0;TCR=98;TR=71;WE=86246724;WS=86246699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,74:0.73:102
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chr6	87879217	rs9351117	C	G	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=0;PP=22;ReadPosRankSum=-0.578;SC=TCAGCTATTTCATATAAATAA;SOR=0.124;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=3;WE=87879225;WS=87879207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
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chr6	87879378	rs9359738	C	T	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.10;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
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chr6	87925826	.	G	GAC	58.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQRankSum=-2.140;QD=1.89;ReadPosRankSum=-1.183;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chr6	87965528	rs6908834	T	C	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=7.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=-1.157;SOR=0.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,39:0.25:154
chr6	87968565	rs9362415	A	G	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.616;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;PP=667;ReadPosRankSum=-1.785;SC=CACAACTTCAATAAATTCTGA;SOR=0.446;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=108;TCF=36;TCR=72;TR=40;WE=87968573;WS=87968555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,43:0.37:116
chr6	87969737	rs3734187	C	T	1806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.409;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=49;PP=1506;ReadPosRankSum=-0.376;SC=TACAGCAAAACTTGATTCTCC;SOR=0.880;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=251;TCF=92;TCR=159;TR=74;WE=87969745;WS=87969727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,78:0.30:259
chr6	87970301	rs3812132	C	G	1773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.61;ReadPosRankSum=-0.691;SOR=0.706;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:228,88:0.28:316
chr6	87971382	.	G	T	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.334;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=513;ReadPosRankSum=0.672;SC=AGATTGCACTGAGCTTGTCTT;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=51;TCF=29;TCR=22;TR=26;WE=87971390;WS=87971372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr6	87994015	rs6934603	A	G	1277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.568;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=29;PP=1048;ReadPosRankSum=0.481;SC=CACTTAATAAAGCACTTGAGA;SOR=0.590;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=152;TCF=85;TCR=67;TR=55;WE=87994023;WS=87994005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,57:0.34:166
chr6	87994572	rs4707358	G	A	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=5.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.406;SOR=1.272;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,34:0.25:136
chr6	88058675	rs9450659	A	G	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.269;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=264;ReadPosRankSum=0.289;SC=GTTCTTTCACATTTTGGATTT;SOR=1.421;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=13;WE=88058683;WS=88058665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr6	88108048	rs67076383	AGAT	A	9612.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=60.05;NF=40;NR=121;PP=2957;SC=GACAGAGAGAAGATGAGTGTT;SOR=1.255;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=41;TCR=125;TR=161;WE=88108058;WS=88108038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr6	88109304	rs1051550	G	A	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=18;PP=644;SC=GCTTGGGGGTGGGTTGGGGAT;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=24;WE=88109312;WS=88109294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	88170710	rs73492299	A	T	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=351;ReadPosRankSum=0.322;SC=ATTTTTTACAAGCACTAACTA;SOR=0.607;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=52;TCF=46;TCR=6;TR=18;WE=88170718;WS=88170700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,18:0.35:52
chr6	88210467	rs71554725	AT	A	123.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.551;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr6	88218421	rs139990538	GTAAA	G	787.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=456;ReadPosRankSum=0.443;SC=CTTTGATACTGTAAATACCAG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=10;WE=88218432;WS=88218411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr6	88221103	rs56136150	T	C	2142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=5;PP=1815;ReadPosRankSum=1.406;SC=AGCTATTTTTTTTTTTCTTTT;SOR=0.569;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=115;TCF=107;TCR=8;TR=74;WE=88221111;WS=88221093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,74:0.64:115
chr6	88224164	rs8802	T	C	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.602;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=20;PP=973;ReadPosRankSum=0.016;SC=TTCCAAGAAGTTTCATTCCAT;SOR=1.058;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=76;TCF=41;TCR=35;TR=48;WE=88224172;WS=88224154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,52:0.65:80
chr6	88226641	rs9450723	A	G	3368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=90;PP=2562;ReadPosRankSum=1.845;SC=GACTGTACACATTACACTAAG;SOR=0.690;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=183;TCF=53;TCR=130;TR=127;WE=88226649;WS=88226631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,131:0.69:189
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chr6	88317675	rs4706294	G	C	130.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=98;ReadPosRankSum=0.431;SC=TTAAAAGTAGGTATTTATTTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=88317683;WS=88317665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr6	88321997	rs7752473	G	A	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=265;ReadPosRankSum=0.528;SC=CAGTGAAATAGGATGAAAAGA;SOR=0.495;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=12;WE=88322005;WS=88321987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr6	88331299	rs7772561	A	G	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.766;NF=4;NR=20;PP=545;ReadPosRankSum=-0.101;SC=GTAGGGAAAGAAATAGTAACC;SOR=0.838;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=24;WE=88331307;WS=88331289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr6	88331334	rs34542681	TC	T	400.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.877;NF=0;NR=14;PP=445;ReadPosRankSum=-0.159;SC=TTGTGGGATTTCCCTTGTTGG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=14;WE=88331342;WS=88331324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr6	88366708	rs2307373	C	T	1920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=29;PP=1333;ReadPosRankSum=-0.686;SC=AAGGTCAGGTCACTCTCTTCC;SOR=0.277;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=28;TCR=30;TR=57;WE=88366716;WS=88366698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr6	88366771	rs2307379	A	G	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.673;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=24;PP=635;ReadPosRankSum=-0.973;SC=CTCTAGATTAACTCTGCCTGG;SOR=1.819;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=29;WE=88366779;WS=88366761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr6	88773961	rs17262755	A	G	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=2.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.945;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,54:0.28:196
chr6	88853635	rs1049353	C	T	2242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.823;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=30;PP=1798;ReadPosRankSum=0.398;SC=CAATCTTGACCGTGCTCTTGA;SOR=1.218;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=124;TCF=76;TCR=48;TR=83;WE=88853643;WS=88853625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,84:0.67:125
chr6	89790559	rs66688820	CTTCA	C	3522.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.474;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.420;NF=49;NR=22;PP=2971;ReadPosRankSum=-0.931;SC=TCTTCACTGGCTTCATTCACC;SOR=0.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=91;TCR=41;TR=71;WE=89790570;WS=89790549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,90:0.60:149
chr6	89814711	rs9362618	T	G	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.75;ReadPosRankSum=-0.508;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr6	89814772	rs35869140	CA	C	557.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.864;NF=22;NR=1;PP=530;ReadPosRankSum=0.068;SC=GAGACCCTATCAAAAAAATAT;SOR=1.075;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=23;WE=89814780;WS=89814762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,25:0.76:33
chr6	89814830	rs7753709	A	G	2297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.636;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.909;NF=69;NR=13;PP=1859;ReadPosRankSum=0.768;SC=CAGTCCTCTTATACTCACTCT;SOR=0.239;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=112;TCF=97;TCR=15;TR=82;WE=89814838;WS=89814820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,83:0.72:116
chr6	89816819	rs72915636	G	A	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=28;PP=1310;ReadPosRankSum=1.848;SC=ATACATATATGTATAAGCACG;SOR=0.707;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=100;TCF=53;TCR=47;TR=60;WE=89816827;WS=89816809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,62:0.58:106
chr6	89858851	rs6926895	G	A	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=216;ReadPosRankSum=-1.336;SC=TTGCGTAAGCGTCATAGAACA;SOR=0.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=13;WE=89858859;WS=89858841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr6	89864679	rs4053639	A	G	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.110;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=379;ReadPosRankSum=-0.623;SC=GTGGGCTAGCACTGTTAGATT;SOR=1.817;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=74;TCF=18;TCR=56;TR=22;WE=89864687;WS=89864669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,23:0.31:74
chr6	89867980	rs9344910	T	C	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.38;ReadPosRankSum=-1.054;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr6	89868190	rs3831213	G	GT	148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.10;ReadPosRankSum=-1.118;SOR=0.740;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,11:0.23:48
chr6	89868287	rs2297308	G	A	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.502;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=285;ReadPosRankSum=0.754;SC=TACTACTGACGTTTTTAATAT;SOR=0.053;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=17;WE=89868295;WS=89868277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr6	89871759	rs2297309	G	A	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=-2.420;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,31:0.26:121
chr6	89888443	rs3734201	T	C	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.949;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=103;ReadPosRankSum=1.436;SC=CAGTTATTTCTGTAGTGCATG;SOR=0.048;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=8;WE=89888451;WS=89888433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr6	89888744	rs1796743	C	T	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.212;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=609;ReadPosRankSum=0.188;SC=CGTCCAGCATCGCAGTGCGGG;SOR=0.209;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=81;TCF=16;TCR=65;TR=34;WE=89888752;WS=89888734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,37:0.43:86
chr6	89894968	rs407206	G	A	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=720;ReadPosRankSum=1.575;SC=TATAATAGAGGGTGAACCTTG;SOR=2.649;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=27;WE=89894976;WS=89894958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,28:0.80:35
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chr6	90340276	rs3210511	G	A	4379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.509;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=68;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.188;SC=AGGAGCTGTCGTCTTCTGACT;SOR=0.648;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=236;TCF=134;TCR=102;TR=159;WE=90340284;WS=90340266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,166:0.69:242
chr6	90340734	rs9344950	G	A	3068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.135;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=87;PP=2441;ReadPosRankSum=1.557;SC=CACCAATAAAGAGGAAATATG;SOR=1.205;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=158;TCF=29;TCR=129;TR=104;WE=90340742;WS=90340724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,107:0.66:161
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chr6	90402482	rs9294445	G	A	2094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=40;PP=1633;ReadPosRankSum=-0.947;SC=ATACTGCTGTGGAGTGAGGTG;SOR=0.668;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=143;TCF=72;TCR=71;TR=77;WE=90402490;WS=90402472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,79:0.54:145
chr6	90402840	rs9351212	C	A,G	3493.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=26;NF=23,48;NR=12,46;PP=493,1972;SC=TTAAATTATCCAGCCGATCCA;SOR=0.954;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=130;TCF=71;TCR=59;TR=35,94;WE=90402848;WS=90402830;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.28,0.72:127
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chr6	90422627	rs2013736	G	C	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=447;SC=ACTCTTCAATGAAAAACACAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=90422635;WS=90422617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
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chr6	90428968	rs6454774	G	A	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=45;PP=1397;SC=ATAATGCAATGAAAACACAAA;SOR=4.215;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=50;WE=90428976;WS=90428958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	90432584	rs2016744	A	T	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5061;FS=0.000;HP=20;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=289;ReadPosRankSum=-1.109;SC=AAAAAAAAAAAAAGGCTTGCA;SOR=2.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=16;WE=90432592;WS=90432574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr6	90432621	rs764108	A	G	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=3;PP=690;ReadPosRankSum=-0.207;SC=TCTCACCCACAGGAAATCAAC;SOR=0.849;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=62;TCF=57;TCR=5;TR=38;WE=90432629;WS=90432611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,39:0.61:64
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chr6	90468465	rs6937244	C	A	3016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=76;NR=5;PP=2351;SC=ACAACAACAACAAAAAATCTC;SOR=5.307;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=76;TCR=5;TR=81;WE=90468473;WS=90468455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
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chr6	90497814	rs4707570	G	A	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=510;SC=ACTGGGGTCAGTATGCAGGTG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=90497822;WS=90497804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr6	90565242	rs369328	A	G	1643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=33;PP=1238;ReadPosRankSum=1.044;SC=TGATGAAAAAATTTAAAGAAA;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=55;WE=90565250;WS=90565232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,56:0.95:59
chr6	90577602	rs60966143	C	T	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=6.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.187;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=1171;ReadPosRankSum=1.204;SC=CTATGCATGCCGTCATAATGG;SOR=0.385;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=199;TCF=85;TCR=114;TR=59;WE=90577610;WS=90577592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,57:0.29:197
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chr6	90661576	rs2236181	T	C	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=1.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.90;ReadPosRankSum=-1.584;SOR=0.936;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,29:0.26:110
chr6	91228423	rs1145727	A	G	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=109;ReadPosRankSum=-1.981;SC=ACCATGCCCTAGAAAATCTCA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=91228431;WS=91228413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
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chr6	96999725	rs1127175	C	T	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.867;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=713;ReadPosRankSum=1.046;SC=GCATAGAAGACTTTATTTCTT;SOR=1.556;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=33;WE=96999733;WS=96999715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,34:0.63:54
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chr6	97063555	rs9398148	A	G	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.366;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=473;ReadPosRankSum=0.881;SC=ACTGCGGGAAATGCTCTGTCT;SOR=0.869;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=17;TCR=15;TR=21;WE=97063563;WS=97063545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
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chr6	97339275	rs34213186	C	CA	2030.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.456;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.487;NF=14;NR=45;PP=1193;ReadPosRankSum=0.655;SC=TACCTAGTATCAAAAAAAAAA;SOR=0.921;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=73;TCF=18;TCR=55;TR=59;WE=97339283;WS=97339265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,76:0.96:79
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chr6	97679540	rs34952523	GA	G	2239.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.46;QD=26.98;SOR=2.698;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
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chr6	99771540	rs221527	T	C	4461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=96;PP=2965;SC=AATAAGCTAATGTCCTGGAAT;SOR=1.344;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=56;TCR=97;TR=152;WE=99771548;WS=99771530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
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chr6	99796886	.	TTG	GTC,GTG	722	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=30,41;NR=0,0;PP=722,199;QD=25.8489291621;SC=TCTGGGCAGCTTGACCGAGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=30,41;WE=99796896;WS=99796876;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.68:44
chr6	99796888	rs75411978	G	C	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.60;ReadPosRankSum=-0.765;SOR=0.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,34:0.74:46
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chr6	99825348	rs11548336	T	C	2842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.955;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=83;PP=2268;ReadPosRankSum=0.854;SC=GGAATTGTTTTCAGAAGATTG;SOR=1.392;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=157;TCF=25;TCR=132;TR=94;WE=99825356;WS=99825338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,98:0.60:164
chr6	99841907	rs9389317	T	G	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.359;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=2;PP=636;ReadPosRankSum=-0.530;SC=ACGCCAGCGCTCGCAATTGAC;SOR=1.814;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=53;TCF=49;TCR=4;TR=35;WE=99841915;WS=99841897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,35:0.69:51
chr6	99842056	rs9376137	C	A	2568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.171;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=54;PP=1979;ReadPosRankSum=1.505;SC=CACTCCACATCGCGACAAACG;SOR=0.528;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=146;TCF=59;TCR=87;TR=94;WE=99842064;WS=99842046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,96:0.64:150
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chr6	99849027	.	C	G	4467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.000;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.339;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=93;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.679;SC=CTTTCTCTTTCAATGCTATTT;SOR=0.534;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=241;TCF=90;TCR=151;TR=151;WE=99849035;WS=99849017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,156:0.64:245
chr6	99853849	rs11309252	CA	C	147.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=92;ReadPosRankSum=0.126;SC=ATATTGTCTCCAAAAAAAATT;SOR=0.317;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=8;WE=99853857;WS=99853839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr6	99853866	rs7744072	G	A	1172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=0;PP=908;SC=AATTGCAAACGAAATAAATCC;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=33;WE=99853874;WS=99853856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	99860731	rs4339472	A	G	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.973;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=248;ReadPosRankSum=0.532;SC=TCAGACAGAGAGGGTATGAGG;SOR=0.050;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=14;WE=99860739;WS=99860721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr6	99860747	rs9321539	T	C	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.500;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=457;ReadPosRankSum=0.072;SC=TGAGGGAAATTAGAAAAATTT;SOR=2.746;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=19;WE=99860755;WS=99860737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr6	99883694	rs9402791	T	C	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=5.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.29;ReadPosRankSum=-1.276;SOR=1.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
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chr6	99883842	rs7745005	C	T	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=291;SC=ACCTGAGAAGCCTGTTTTTTC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=99883850;WS=99883832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr6	99893938	rs4504482	T	C	3166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.629;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=45;PP=2227;ReadPosRankSum=-0.664;SC=AATCTTGATCTCCAGTTACAG;SOR=0.347;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=147;TCF=87;TCR=60;TR=104;WE=99893946;WS=99893928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,117:0.74:159
chr6	99894086	rs41288947	C	G	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.651;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=871;ReadPosRankSum=-0.323;SC=ACTACTGGATCTGAACAGCCC;SOR=1.208;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=132;TCF=76;TCR=56;TR=45;WE=99894094;WS=99894076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,46:0.34:136
chr6	99894360	rs66817403	CAAAGA	C	1555.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=30;PP=1462;ReadPosRankSum=-2.911;SC=ACAGTGTTTTCAAAGAAAAGA;SOR=0.910;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=31;WE=99894372;WS=99894350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,39:0.72:54
chr6	99916182	rs10457650	G	A	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=46;ReadPosRankSum=-0.210;SC=TAAAGGTATCGGTGTCAATCT;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=5;WE=99916190;WS=99916172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr6	99935975	rs2181687	G	A	2740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=18;PP=2119;SC=AAGCCCCCTGGCTACTATCTT;SOR=2.557;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=65;TCR=18;TR=83;WE=99935983;WS=99935965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr6	99951750	rs6934692	G	A	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=22;PP=633;SC=ACCTGAAAAAGTATAAAATTT;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=99951758;WS=99951740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	99955243	rs11410603	G	GA	448.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=278;SC=AAAGCTTAAAGAAAAAAAAAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=16;WE=99955251;WS=99955233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	99956560	rs7744845	T	C	2193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=38;PP=1727;ReadPosRankSum=0.958;SC=CTTCTTTCTTTTAAACATTCT;SOR=0.695;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=58;TCR=66;TR=72;WE=99956568;WS=99956550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,77:0.60:129
chr6	99993188	rs330806	C	A	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=174;ReadPosRankSum=-0.056;SC=ACTACACAACCCTCAGAAAAC;SOR=0.412;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=9;WE=99993196;WS=99993178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr6	99999019	rs2296155	A	G	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr6	100006244	rs486881	T	G	218.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=0;PP=179;SC=AGATATAAAGTTATCCTCAGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=100006252;WS=100006234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	100016240	rs330872	A	G	1932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=2;PP=1653;SC=CTTGATTCTGACCGCTGCGGT;SOR=5.820;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=57;TCF=55;TCR=2;TR=57;WE=100016248;WS=100016230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr6	100016340	rs41288985	G	C	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=17;PP=1106;ReadPosRankSum=0.896;SC=CCCAAAAACCGGCCCCAGGTG;SOR=0.639;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=231;TCF=178;TCR=53;TR=71;WE=100016348;WS=100016330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,74:0.31:235
chr6	100060761	rs330843	C	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=-0.219;SC=TCGGGGTCCTCGATACAGTAG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=100060769;WS=100060751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr6	100368759	rs4839764	G	A	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=0;PP=858;SC=TGCCCTTTCTGATAATACCAG;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=100368767;WS=100368749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	100403812	.	GA	G	137.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=0.000;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=2.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=3.083;QD=1.45;ReadPosRankSum=-1.722;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,24:0.25:95
chr6	100868721	rs3734355	G	A	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.546;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=817;ReadPosRankSum=2.233;SC=CCGGGATTTGGCCCCCTTTCT;SOR=1.508;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=71;TCF=43;TCR=28;TR=43;WE=100868729;WS=100868711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,44:0.61:72
chr6	100868779	rs3734354	G	T	1103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.351;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=26;PP=813;ReadPosRankSum=-1.175;SC=GAGAAGGCTGGTTTGGAGGCT;SOR=0.377;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=65;TCF=20;TCR=45;TR=40;WE=100868787;WS=100868769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,42:0.63:67
chr6	100895344	rs397662	C	T	2530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=60;PP=2048;SC=CTGGGACTGGCCCCAAATGCA;SOR=1.845;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=23;TCR=60;TR=83;WE=100895352;WS=100895334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
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chr6	101166095	rs41288423	G	A	6724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=133;PP=2965;SC=CAGACAGTCCGAGAATCCTTA;SOR=1.520;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=205;TCF=72;TCR=133;TR=204;WE=101166103;WS=101166085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
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chr6	102503317	rs2227283	G	A	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.273;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=895;ReadPosRankSum=0.978;SC=CAGAAGAGGAGAGCAAAGAGG;SOR=0.592;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=128;TCF=69;TCR=59;TR=45;WE=102503325;WS=102503307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,48:0.36:134
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chr6	105219748	rs142619769	G	GA	1356.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.437;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=4;PP=941;ReadPosRankSum=1.319;SC=TCCTCAAACTGAAAAAAAAAC;SOR=1.080;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=123;TCF=110;TCR=13;TR=56;WE=105219756;WS=105219738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,60:0.59:101
chr6	105228483	rs2124434	C	G	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=171;ReadPosRankSum=0.328;SC=GTGAGAGCAACTTGCCAATAT;SOR=0.129;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=12;WE=105228491;WS=105228473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,12:0.26:46
chr6	105232204	rs2290515	C	T	1878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=12;PP=1560;SC=TTGAATAGTACGAGAAATAGT;SOR=2.604;Source=Platypus;TCF=44;TR=56;WE=105232212;WS=105232194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	105232233	rs9322817	A	C	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.394;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=13;PP=1078;ReadPosRankSum=0.143;SC=TGTTTAGATGAAACTGTAAGT;SOR=0.283;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=72;TCF=55;TCR=17;TR=50;WE=105232241;WS=105232223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,52:0.70:74
chr6	105232460	rs71763197	C	CA	749.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=33;PP=549;ReadPosRankSum=0.922;SC=GCTTCTAAACCAAAAAAAAAA;SOR=0.946;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=58;TCF=2;TCR=56;TR=34;WE=105232468;WS=105232450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,33:0.66:50
chr6	105239352	rs17065321	C	T	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.450;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=549;ReadPosRankSum=-0.185;SC=CGTCTATCTTCCTAACAATGC;SOR=0.274;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=93;TCF=81;TCR=12;TR=32;WE=105239360;WS=105239342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,32:0.34:93
chr6	105244526	rs6918700	A	T	2172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.599;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=30;PP=1734;ReadPosRankSum=1.370;SC=CACAAATACAATACCATGTTT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=39;TCR=31;TR=69;WE=105244534;WS=105244516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr6	105259122	.	C	CATAT	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.85;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	105259152	rs2168394	C	T	1679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=3;PP=1444;SC=TATATATGAGCATATATAGCA;SOR=5.136;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=51;TCR=3;TR=54;WE=105259160;WS=105259142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr6	105300074	.	C	CTG	116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.655;NF=16;NR=2;PP=457;ReadPosRankSum=0.254;SC=TCCAAACTGTCTGTGTGTGTG;SOR=0.293;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=18;WE=105300082;WS=105300064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr6	105300103	.	T	TGC	464.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.318;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=1.144;NF=20;NR=4;PP=714;ReadPosRankSum=1.699;SC=TGTGTGTGTGTGCGCGCGTGC;SOR=1.781;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=24;WE=105300111;WS=105300093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr6	105300250	rs9499992	A	G	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.595;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=29;PP=720;ReadPosRankSum=0.114;SC=TCATTATCTGAGTAAAAAAAA;SOR=0.422;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=51;TCF=5;TCR=46;TR=34;WE=105300258;WS=105300240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,33:0.61:54
chr6	105307378	rs9499993	G	A	5169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.893;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=115;PP=2962;ReadPosRankSum=0.618;SC=TGACGCGGCCGGAGCTCCTGC;SOR=0.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=283;TCF=116;TCR=167;TR=194;WE=105307386;WS=105307368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,190:0.68:278
chr6	105405220	rs61701350	T	TC	755.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=24;PP=729;SC=TCTTAGACCGTCCCCCCCTTC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=24;WE=105405228;WS=105405210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	105548850	rs221657	C	T	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=0;PP=752;SC=CCTCCGACTCCACCAGTCTGG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=105548858;WS=105548846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	105577172	rs9404603	A	G	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=0;PP=868;ReadPosRankSum=-0.856;SC=TATGCTAGATACTTACTCTTA;SOR=5.838;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=31;WE=105577180;WS=105577162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr6	105577224	rs9404604	A	C	2603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=5;PP=2021;SC=CTTTAAAATCACTTCCTTATT;SOR=5.031;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=67;TCR=5;TR=72;WE=105577232;WS=105577214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr6	105577401	rs4946656	C	T	4315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=96;PP=2965;SC=AAAGTTAACACGTTAGATAAT;SOR=2.517;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=26;TCR=96;TR=122;WE=105577409;WS=105577391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr6	105595261	rs1190274	G	A	3131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=80;PP=2579;SC=TAAAGGTACTGTTTTATTTAG;SOR=3.779;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=11;TCR=81;TR=91;WE=105595269;WS=105595251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr6	105602108	rs1190280	T	G	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=0;PP=605;SC=TATTTATGGCTTTTGTCAAAC;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=105602116;WS=105602098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	105614712	rs1190292	T	G	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=43;PP=1192;SC=GGGTTACATATTCAAGCATTT;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=43;WE=105614720;WS=105614702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr6	105614743	rs67687316	TTG	T	522.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=29.04;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	106546395	.	G	A	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.987;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.541;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=1;PP=570;ReadPosRankSum=1.050;SC=CTCTGTGTGTGGTGTTTTAGC;SOR=1.863;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=46;TCF=43;TCR=3;TR=27;WE=106546403;WS=106546385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr6	106555025	rs1010273	G	A	7144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=388;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.790;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=123;PP=2962;ReadPosRankSum=0.241;SC=CTGCGGCCCCGGCGCCTGGGC;SOR=0.658;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=367;TCF=181;TCR=186;TR=250;WE=106555033;WS=106555015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,263:0.68:386
chr6	106899411	.	G	A	217	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=9;NR=0;PP=217;QD=27.9745791719;SC=CTATGAGAGCGCCAAATTATC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=9;WE=106899419;WS=106899410;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,9:0.69:13
chr6	106899726	rs12197698	T	C	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.213;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=34;PP=711;ReadPosRankSum=-0.543;SC=TCATTTCTAATGTTTGACTCC;SOR=1.122;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=65;TCF=12;TCR=53;TR=41;WE=106899734;WS=106899716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,44:0.64:69
chr6	106899793	rs7763469	C	T	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=622;SC=CTAAGAAACACATACTTAAAA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=106899801;WS=106899783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	106959936	rs783420	G	C	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=582;ReadPosRankSum=1.391;SC=GCCCCTAACGGAGCCCCCAGT;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=37;TCR=53;TR=29;WE=106959944;WS=106959926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,31:0.33:93
chr6	106959961	rs4946759	A	G	1735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.899;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=35;PP=1408;ReadPosRankSum=0.032;SC=GTGCCGAAGAAGGCTCCCTGG;SOR=1.083;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=90;TCF=40;TCR=50;TR=59;WE=106959969;WS=106959951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,60:0.65:93
chr6	106959999	rs1340623	C	G	3079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=51;PP=2544;SC=AGCCAGCCCCCCAAGGGCGCG;SOR=0.732;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=53;TCR=51;TR=104;WE=106960007;WS=106959989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr6	106967778	rs3747787	T	C	3923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.296;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=78;PP=2962;ReadPosRankSum=0.541;SC=CAGTTTCCCATGCACTGATCT;SOR=0.560;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=236;TCF=119;TCR=117;TR=152;WE=106967786;WS=106967768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,155:0.65:240
chr6	106973313	rs710096	T	C	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.866;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=616;ReadPosRankSum=-1.756;SC=TTTTACATACTTAATTAACTT;SOR=1.646;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=73;TCF=2;TCR=71;TR=28;WE=106973321;WS=106973303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,29:0.39:74
chr6	106987161	rs783397	A	G	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=0;PP=1376;SC=ACCATTCATTATGTAGGTCCG;SOR=7.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=45;WE=106987169;WS=106987151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr6	106987370	rs783396	A	C	6280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=109;PP=2965;SC=GATACAGAAGAAGCGTACATT;SOR=0.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=197;TCF=88;TCR=109;TR=197;WE=106987378;WS=106987360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr6	106989212	rs783392	G	A	3830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=71;PP=2838;SC=AAAAAAACTTGCTAGGTCAAA;SOR=1.117;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=48;TCR=71;TR=119;WE=106989220;WS=106989202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr6	106992464	rs1799693	A	G	2760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=19;PP=2127;SC=CATATGAGAAACCTGGATTTA;SOR=2.531;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=85;TCF=65;TCR=20;TR=84;WE=106992472;WS=106992454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr6	106992592	rs2247335	A	T	3531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=69;PP=2798;SC=GGACAAGCTAATGGCTAATAC;SOR=1.230;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=41;TCR=69;TR=110;WE=106992600;WS=106992582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr6	106992844	rs2066201	C	G	1003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=29;PP=831;SC=TTTAAACATGCGTTTTACCTT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=106992852;WS=106992834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	106999658	rs1676010	A	T	1513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=3;PP=1343;SC=TGATACATAGATATCCAAATA;SOR=4.849;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=45;TCR=3;TR=48;WE=106999666;WS=106999648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr6	107001456	rs1770731	A	T	4351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=76;PP=2965;SC=AGTGAAACAAAGGCCTGGCAG;SOR=0.929;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=58;TCR=77;TR=134;WE=107001464;WS=107001446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
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chr6	107003810	rs2066202	T	C	2378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=75;PP=1822;ReadPosRankSum=0.842;SC=CAGAAATGTATGCCTCATATA;SOR=3.033;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=9;TCR=76;TR=84;WE=107003818;WS=107003800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,87:0.99:88
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chr6	107361476	rs311207	A	G	1926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=57;PP=1628;SC=GCTCGTAGTCATGTTATTTTA;SOR=5.353;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=60;TCF=3;TCR=57;TR=60;WE=107361484;WS=107361466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr6	107365376	rs7767291	C	T	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=261;ReadPosRankSum=-0.283;SC=AGTTTTGTTACGTGGATATAC;SOR=0.446;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=14;WE=107365384;WS=107365366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
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chr6	107956095	rs9486659	A	G	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=22;PP=669;SC=GCGCGAGCCGAGCGCCGCGGA;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=107956103;WS=107956085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	108026317	rs1546962	G	T	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=6;PP=922;ReadPosRankSum=-0.785;SC=GGAGAGTCTAGTTTGTGATGT;SOR=1.880;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=36;WE=108026325;WS=108026307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr6	108026402	rs1546961	A	C	1338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.878;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=22;PP=806;ReadPosRankSum=1.609;SC=TTTTTAAAAAAGTCAGAACTT;SOR=1.047;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=90;TCF=52;TCR=38;TR=56;WE=108026410;WS=108026392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,59:0.64:92
chr6	108026455	rs1546960	A	G	2434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.834;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=55;PP=1863;ReadPosRankSum=0.275;SC=GTTTCAGTGCAGGTCCCAGCT;SOR=1.816;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=26;TCR=56;TR=80;WE=108026463;WS=108026445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,83:0.98:85
chr6	108028993	rs3734750	G	A	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.661;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=618;ReadPosRankSum=-0.446;SC=GCAGCATCCCGCAGCTCCCTG;SOR=0.476;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=126;TCF=89;TCR=37;TR=39;WE=108029001;WS=108028983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,43:0.33:130
chr6	108029020	rs3734752	T	C	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.309;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=643;ReadPosRankSum=0.339;SC=ACTCTCCTTCTGTGCCTGCTC;SOR=0.558;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=172;TCF=108;TCR=64;TR=49;WE=108029028;WS=108029010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,56:0.31:181
chr6	108029091	rs3734753	G	A	2324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FS=2.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.64;ReadPosRankSum=-1.404;SOR=0.834;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:193,76:0.28:269
chr6	108029109	rs3734754	T	C	1987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FS=1.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.087;SOR=0.594;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:189,61:0.24:250
chr6	108041801	rs11751218	G	T	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=390;ReadPosRankSum=-1.100;SC=TCTCCCAGCAGTCCCACGTTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=17;WE=108041809;WS=108041791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr6	108042213	rs846977	G	A	3171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=60;PP=2475;ReadPosRankSum=-0.805;SC=CAATAAGGCAGTACAGAGAAG;SOR=0.354;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=106;TCF=44;TCR=62;TR=104;WE=108042221;WS=108042203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,104:0.99:105
chr6	108042332	rs11961282	C	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.42;ReadPosRankSum=-0.887;SOR=0.289;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
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chr6	108042334	rs846978	T	C	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=25;PP=513;SC=GAAATGAACCTCACAACATAA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=25;WE=108042342;WS=108042322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr6	108194241	rs579120	T	C	931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=25;PP=769;SC=AAAGTCCTAATAAATGTTACT;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=108194249;WS=108194231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr6	108243115	rs142388422	T	TGGG	1868.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.313;HP=4;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=-0.535;NF=8;NR=43;PP=1264;ReadPosRankSum=-0.242;SC=TGTGGCTCCCTGGGGAAAAAC;SOR=2.531;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=82;TCF=11;TCR=71;TR=51;WE=108243132;WS=108243105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,58:0.91:64
chr6	108243119	.	GAAA	G	539	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=5;HapScore=4;MGOF=2;MMLQ=22;MQ=60.02;NF=7;NR=45;PP=539;QD=10.8653846154;SC=GCTCCCTGGGGAAAAACAAAA;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=52;WE=108243132;WS=108243105;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,52:0.98:53
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chr6	108243121	rs201981258	AAAAC	A	299.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=1.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=-1.528;QD=4.00;ReadPosRankSum=-1.041;SOR=0.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,23:0.31:75
chr6	108277287	rs9486756	C	A	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=32;PP=1379;SC=TCAAGACCAGCCTGGGTAAAT;SOR=1.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=22;TCR=32;TR=54;WE=108277295;WS=108277277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	108279290	rs2272884	G	A	1150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=32;PP=978;SC=CCAACGCCCCGGCCCGAGTGG;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=108279298;WS=108279280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
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chr6	108489462	rs383319	G	A	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.341;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=283;ReadPosRankSum=0.576;SC=CTGAGCCTCCGTTGCAAAAAC;SOR=1.508;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=15;WE=108489470;WS=108489452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr6	108495950	rs2233492	G	A	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=255;ReadPosRankSum=-0.903;SC=GCAAGGTCGCGCCTCCACACC;SOR=1.387;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=13;WE=108495958;WS=108495940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr6	108498014	rs10563315	CTG	C	522.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=500;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTCTTCTGAGCTGTGTGATTG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=12;WE=108498023;WS=108498004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr6	108502133	.	C	G	1346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.794;ClippingRankSum=0.000;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.073;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=47;PP=1095;ReadPosRankSum=0.346;SC=ATTTGCCTGTCTAAAATGCAT;SOR=0.984;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=202;TCF=55;TCR=147;TR=62;WE=108502141;WS=108502123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,62:0.30:208
chr6	108508345	rs77110427	C	T	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.367;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=220;ReadPosRankSum=0.346;SC=ACCTGCAAAACGGGGACAACA;SOR=0.120;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=56;TCF=54;TCR=2;TR=15;WE=108508353;WS=108508335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,15:0.26:57
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chr6	109258284	rs2768558	T	C	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=610;ReadPosRankSum=-1.397;SC=GTCTTTATGTTTTGAGTATAT;SOR=1.675;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=24;WE=109258292;WS=109258274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr6	109294752	rs3734649	C	T	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.466;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=38;PP=814;ReadPosRankSum=-0.068;SC=CGAGAACTCACGTCTCCCTCA;SOR=1.703;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=136;TCF=36;TCR=100;TR=46;WE=109294760;WS=109294742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,47:0.33:141
chr6	109322477	rs10457185	G	C	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=91;ReadPosRankSum=1.339;SC=ATTTTTCACTGAATGTTTACA;SOR=0.954;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=7;WE=109322485;WS=109322467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
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chr6	109322701	rs71758052	T	TGA	1843.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.910;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.770;NF=4;NR=42;PP=1509;ReadPosRankSum=-0.423;SC=TCTGTATAAATGAGAAAAACC;SOR=1.228;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=131;TCF=29;TCR=102;TR=46;WE=109322709;WS=109322691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,54:0.39:137
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chr6	109480562	rs61743581	T	C	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.655;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.018;NF=29;NR=29;PP=928;ReadPosRankSum=0.017;SC=AACAACTTCCTGGTGTAAAGC;SOR=0.594;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=177;TCF=96;TCR=81;TR=58;WE=109480570;WS=109480552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,60:0.33:180
chr6	109481678	rs57212784	A	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.165;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=137;ReadPosRankSum=0.566;SC=TTTAACTCTGACTAAAATTTA;SOR=0.024;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=8;WE=109481686;WS=109481668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr6	109560739	rs35237549	TA	T	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.93;ReadPosRankSum=0.022;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,7:0.21:33
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chr6	109583186	rs1040285	A	G	2444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=37;PP=1984;SC=CAGAAACAAGACCAAGACTCT;SOR=0.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=37;TCR=37;TR=74;WE=109583194;WS=109583176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr6	109586062	rs949882	C	T	1415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.796;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=1045;ReadPosRankSum=1.540;SC=GTATCTGAGGCCTGTTCACTT;SOR=0.721;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=88;TCF=42;TCR=46;TR=51;WE=109586070;WS=109586052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,54:0.59:91
chr6	109586240	rs949881	A	G	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=416;ReadPosRankSum=1.598;SC=GTCACCATTCAACATGCAAGA;SOR=1.697;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=19;WE=109586248;WS=109586230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr6	109591208	rs9386784	C	A	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.548;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=665;ReadPosRankSum=0.293;SC=TTATGCAAGACATTCCTAATA;SOR=0.188;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=28;WE=109591216;WS=109591198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,28:0.74:38
chr6	109591433	rs9400262	T	C	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=881;ReadPosRankSum=-0.051;SC=CACCAGCTAATGTCAGGCTGC;SOR=0.680;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=79;TCF=32;TCR=47;TR=50;WE=109591441;WS=109591423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,51:0.61:83
chr6	109591586	rs9374072	A	G	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=217;ReadPosRankSum=-0.228;SC=TCAATGTATGACCAAATCCTT;SOR=1.981;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=10;WE=109591594;WS=109591576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr6	109615603	rs9487048	G	T	3454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.977;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=47;PP=2446;ReadPosRankSum=-1.923;SC=TTCCTCAATTGATGGTTCATA;SOR=0.535;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=186;TCF=117;TCR=69;TR=122;WE=109615611;WS=109615593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,128:0.67:190
chr6	109616762	rs9400272	A	G	2127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.160;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=39;PP=1633;ReadPosRankSum=1.419;SC=GAACTCTACAACTGATAGCTC;SOR=0.628;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=100;TCF=49;TCR=51;TR=72;WE=109616770;WS=109616752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,77:0.73:105
chr6	109621494	rs6927569	T	C	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.622;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=624;ReadPosRankSum=-1.652;SC=CAAGACCCTATCCGGGTGGCC;SOR=0.867;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=42;TCF=19;TCR=23;TR=25;WE=109621502;WS=109621484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,28:0.61:46
chr6	109629420	rs11153168	A	T	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=40;PP=947;ReadPosRankSum=1.692;SC=TTTGATTTTGAGGCTGTAAAC;SOR=0.479;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=58;TCF=2;TCR=56;TR=42;WE=109629428;WS=109629410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,41:0.72:57
chr6	109659589	rs371173090	TCACACACACACACACA	T,TCACACACACACA	1733.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=26;NF=17,17;NR=1,1;PP=1799,2997;SC=ATTGTTTTTCTCACACACACA;SOR=4.758;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=54;TCF=51;TCR=3;TR=18,18;WE=109659620;WS=109659579;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.58,0.42:45
chr6	109659612	rs80090825	C	G	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.823;QD=11.43;ReadPosRankSum=-1.179;SOR=0.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,21:0.38:55
chr6	109663492	rs58605725	G	A	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=344;ReadPosRankSum=0.134;SC=CCCTTCTACCGGAAGTTTGAA;SOR=1.931;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=15;WE=109663500;WS=109663482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr6	109665129	rs10457190	C	G	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=38;ReadPosRankSum=1.176;SC=CCTCTTCCCCCCTTCTGCTGG;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=5;WE=109665137;WS=109665119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr6	109669587	rs76290206	G	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=69;ReadPosRankSum=-1.085;SC=CTGAGGAAATGAAAGTGAGCA;SOR=0.275;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=9;WE=109669595;WS=109669577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr6	109673933	rs1040284	T	C	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=348;ReadPosRankSum=-1.944;SC=AAAATCAAAATAATCTAGGTT;SOR=0.502;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=67;TCR=3;TR=21;WE=109673941;WS=109673923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,21:0.28:75
chr6	109674055	rs11153174	C	T	1272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.806;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=30;PP=995;ReadPosRankSum=-0.533;SC=CTCCCAGCAACGCTTTTTAAA;SOR=0.386;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=168;TCF=73;TCR=95;TR=58;WE=109674063;WS=109674045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,60:0.34:178
chr6	109689431	rs974034	A	G	1787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=40;PP=1351;SC=ATGACATAAGATGCTTTACAA;SOR=2.147;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=55;TCF=14;TCR=41;TR=54;WE=109689439;WS=109689421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
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chr6	109702646	rs3799840	A	T	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.10;ReadPosRankSum=1.862;SOR=0.879;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,20:0.24:84
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chr6	109764535	rs1476387	G	T	6231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=103;NR=98;PP=2965;SC=ACCCTCACAGGGGCACCCCCC;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=202;TCF=104;TCR=98;TR=201;WE=109764543;WS=109764525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr6	109765870	rs61303854	A	G	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-5.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=1;PP=560;ReadPosRankSum=1.437;SC=ATCTGAGATCATGAGGCTTGC;SOR=1.556;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=31;WE=109765878;WS=109765860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr6	109766009	rs199700552	G	A	2246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.786;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=36;PP=1714;ReadPosRankSum=-0.167;SC=ACCCTGTGGAGGTCAGGGATT;SOR=0.564;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=106;TCF=58;TCR=48;TR=77;WE=109766017;WS=109765999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,80:0.71:112
chr6	109767631	rs6149743	T	TGTGGTCTGGTCAGTGACCTGCCCAGG	5687.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.29;QD=56.31;SOR=1.855;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
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chr6	109767930	.	GC	TC,TT	885	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=13,1;NR=37,10;PP=885,142;QD=18.3954242509;SC=GCTGCCTTCCGCTTTGTGGTC;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=50,11;WE=109767939;WS=109767920;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:50
chr6	109767931	rs59056467	C	T	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=8.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.94;ReadPosRankSum=-1.255;SOR=2.428;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,12:0.23:53
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chr6	109768861	rs73762724	G	A	2128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.841;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=18;PP=1546;ReadPosRankSum=-0.567;SC=GTAGGAGACCGACCCGCCCCT;SOR=0.887;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=132;TCF=101;TCR=31;TR=81;WE=109768869;WS=109768851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,81:0.62:130
chr6	109769224	rs72092669	AACAG	A	295.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.548;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=285;ReadPosRankSum=-0.956;SC=GTACTCTCAGAACAGACAGTC;SOR=1.949;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=5;WE=109769235;WS=109769214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr6	109769300	.	G	GACACACACACACACACACAC	365.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.63;QD=73.15;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	109769336	rs111385895	TCACACACA	T	327.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=5;NR=3;PP=759;SC=TCTCCCTCTGTCACACACACA;SOR=2.584;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=8;WE=109769351;WS=109769326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	109770999	rs752262	G	C	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.034;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=22;PP=802;ReadPosRankSum=-0.095;SC=GAGGGGGTGAGGGTAAGGGGC;SOR=0.894;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=171;TCF=96;TCR=75;TR=54;WE=109771007;WS=109770989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,56:0.32:176
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chr6	109786980	rs3734652	T	C	3187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.609;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=54;PP=2546;ReadPosRankSum=-0.758;SC=GAGAGCCTGATTTCAAGCGTT;SOR=0.687;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=98;TCF=44;TCR=54;TR=97;WE=109786988;WS=109786970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr6	109787447	rs2232449	G	A	1494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.961;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=1046;ReadPosRankSum=1.775;SC=GGCTAGGACCGGGCATGAAAT;SOR=0.290;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=77;TCF=45;TCR=32;TR=48;WE=109787455;WS=109787437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,52:0.63:83
chr6	109787596	rs2232448	C	T	2633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.284;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=52;PP=1838;ReadPosRankSum=0.461;SC=GCATCTGAAGCATGCTTCTCC;SOR=0.500;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=136;TCF=58;TCR=78;TR=95;WE=109787604;WS=109787586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,103:0.70:148
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chr6	109815351	rs7755941	T	C	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.379;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=540;ReadPosRankSum=-1.574;SC=TGGTTTCTTTTCTTAGTGCCA;SOR=1.096;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=69;TCF=11;TCR=58;TR=26;WE=109815359;WS=109815341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,26:0.39:66
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chr6	109818587	rs71809712	TCA	T	361.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.920;NF=13;NR=5;PP=583;ReadPosRankSum=0.610;SC=TCTCTCTCTCTCACACACTCC;SOR=0.395;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=72;TCF=49;TCR=23;TR=18;WE=109818597;WS=109818577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,19:0.28:67
chr6	109827716	rs2277114	C	T	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=470;ReadPosRankSum=-0.243;SC=TTGACAGCTACAATTTGTGCA;SOR=0.806;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=24;TCR=41;TR=27;WE=109827724;WS=109827706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,27:0.40:67
chr6	109830298	rs6912368	C	T	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.402;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=1;PP=779;ReadPosRankSum=-1.790;SC=CTTTAAGCCCCATGTAAGTGT;SOR=1.342;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=80;TCF=76;TCR=4;TR=36;WE=109830306;WS=109830288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,38:0.44:86
chr6	109837859	rs10872035	T	C	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=500;ReadPosRankSum=0.589;SC=AGGAAGAAAATATTCCCTTTT;SOR=0.216;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=80;TCF=0;TCR=80;TR=26;WE=109837867;WS=109837849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,26:0.32:80
chr6	109837879	rs7773915	A	G	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=393;ReadPosRankSum=1.055;SC=TACTATACATATAAAATATGT;SOR=0.323;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=20;WE=109837887;WS=109837869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr6	109850199	rs72331392	AAC	A	264.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.46;ReadPosRankSum=-0.074;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,12:0.29:41
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chr6	109871163	rs9400294	G	A	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.268;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.439;NF=9;NR=1;PP=140;ReadPosRankSum=-2.934;SC=CACCGCGCCCGGCCTAGATAT;SOR=0.041;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=10;WE=109871171;WS=109871153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
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chr6	109940498	rs10499053	A	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.386;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=136;ReadPosRankSum=-0.392;SC=TATTAAACACATTGTTCATCT;SOR=0.177;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=11;WE=109940506;WS=109940488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr6	109954252	rs1406957	C	T	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=624;ReadPosRankSum=-0.297;SC=GTGGGTTCAACAAAAATGGTT;SOR=0.916;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=113;TCF=38;TCR=75;TR=36;WE=109954260;WS=109954242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,39:0.33:117
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chr6	109982160	rs2016207	C	T	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.62;ReadPosRankSum=-0.410;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,15:0.22:69
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chr6	110048489	rs11459279	C	CT	666.50	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.9996;FS=2.510;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=1.186;NF=1;NR=21;PP=321;ReadPosRankSum=-0.330;SC=TGGTAACTACCTTTTTTTTTT;SOR=0.303;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=22;WE=110048497;WS=110048479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,30:0.86:35
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chr6	110062873	rs1322124	T	G	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=144;ReadPosRankSum=1.471;SC=GAGAATACAGTTGCCTTTTAG;SOR=0.177;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=10;WE=110062881;WS=110062863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr6	110064255	rs72045093	TATTTC	T	2067.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=2;PP=2137;ReadPosRankSum=-0.244;SC=CATTGAAAGTTATTTCATTAA;SOR=0.858;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=87;TCF=82;TCR=5;TR=47;WE=110064267;WS=110064245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,54:0.59:91
chr6	110065049	rs149608939	TAAC	T	1254.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.840;NF=1;NR=25;PP=1049;ReadPosRankSum=-0.251;SC=CAGAGGGGGTTAACAAGCCAT;SOR=0.853;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=26;WE=110065059;WS=110065039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,32:0.76:42
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chr6	110106234	rs10499054	A	G	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=436;ReadPosRankSum=-1.427;SC=TGATGAAGGTAGGTAACTGTT;SOR=0.560;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=24;WE=110106242;WS=110106224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,24:0.41:59
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chr6	110110943	rs9384723	G	T	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=132;ReadPosRankSum=1.903;SC=CTTGCAATATGATTTCCACCA;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=8;WE=110110951;WS=110110933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr6	110113766	rs72944974	T	C	2523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=28;PP=1741;ReadPosRankSum=0.176;SC=GGTTCTTCTTTTTTTTTTTTA;SOR=0.669;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=126;TCF=87;TCR=39;TR=89;WE=110113774;WS=110113756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,92:0.72:127
chr6	110146303	rs1127771	G	A	5789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=84;PP=2965;SC=CACCCATCTCGGCTTTCTCGC;SOR=0.704;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=84;TCR=84;TR=168;WE=110146311;WS=110146293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr6	110423498	rs79154159	T	C	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=158;ReadPosRankSum=0.609;SC=AAACTATAAATGACTATCAGT;SOR=0.434;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=12;WE=110423506;WS=110423488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr6	110423523	rs77891600	G	C	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=116;ReadPosRankSum=-0.647;SC=ATATCAAAATGGATCCAATAA;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=9;WE=110423531;WS=110423513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr6	110428453	rs78868707	T	G	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=129;ReadPosRankSum=0.392;SC=GCAATCAGAATAGAAATAATT;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=8;WE=110428461;WS=110428443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr6	110514293	rs77753735	A	T	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=142;ReadPosRankSum=0.996;SC=CATAAAATAGATGTTAAAGAT;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=9;WE=110514301;WS=110514283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr6	110530254	rs200116966	G	GT	203.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=135;ReadPosRankSum=-0.493;SC=TAATCTCTCAGTTTTTTTTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=12;WE=110530262;WS=110530244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr6	110643956	rs6908306	T	C	1722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=18;PP=1366;SC=TTCTCTAACTTCTTTGAGCCT;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=52;WE=110643964;WS=110643946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr6	110644112	rs112341783	A	AG	1046.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=5;NR=21;PP=1275;SC=TGTGTAAGGAAGAGGAACTGG;SOR=1.942;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=26;WE=110644120;WS=110644102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	110679062	rs4945854	T	G	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=415;SC=GGAGGTCCCATCGAGGCGGCC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=110679070;WS=110679052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	110679413	rs62435951	A	G	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=53;ReadPosRankSum=0.847;SC=ACAACAGCACAGCCCCGAGTA;SOR=0.551;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=6;WE=110679421;WS=110679403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr6	110736610	rs9384742	T	C	925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=4;PP=681;SC=TCAGACACACTCCCAAACTCC;SOR=2.985;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=110736618;WS=110736600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	110745977	rs3778650	A	T	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=0;PP=881;ReadPosRankSum=1.253;SC=TATTAAAAAGACATACAAACA;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=62;TCR=0;TR=39;WE=110745985;WS=110745967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,43:0.65:66
chr6	110746526	rs7756222	T	C	2747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=47;PP=2093;SC=CACCATGGAGTGCCTCCTTAA;SOR=0.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=48;TCR=47;TR=95;WE=110746534;WS=110746516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr6	110746545	rs9487402	T	G	1718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.815;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=38;PP=1368;ReadPosRankSum=-0.634;SC=AATTGCCAGCTACTGCCTGCA;SOR=0.814;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=97;TCF=42;TCR=55;TR=66;WE=110746553;WS=110746535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,66:0.68:97
chr6	110752289	rs1033572	G	A	2340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=13;PP=1844;SC=CTGGCTTTCAGTAAATAACAA;SOR=2.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=56;TCR=13;TR=69;WE=110752297;WS=110752279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr6	110756960	rs221717	A	G	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=207;ReadPosRankSum=1.154;SC=TAACTTCTATAAAAAAGAAGC;SOR=0.186;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=12;WE=110756968;WS=110756950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr6	110757194	rs373745338	A	G	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.432;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=36;PP=840;ReadPosRankSum=-0.372;SC=ATAGATCATCACAAGTGGTAT;SOR=0.358;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=130;TCF=20;TCR=110;TR=45;WE=110757202;WS=110757184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,49:0.37:134
chr6	110777962	rs6907567	A	G	1103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.314;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=815;ReadPosRankSum=-1.280;SC=TCTCCCTCTTATTCCTGCTAC;SOR=0.449;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=146;TCF=50;TCR=96;TR=50;WE=110777970;WS=110777952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,50:0.34:148
chr6	110778128	rs714368	T	C	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.756;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=539;ReadPosRankSum=-0.536;SC=GCAGACATGATGAGGGGTGAC;SOR=0.836;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=110;TCF=64;TCR=46;TR=37;WE=110778136;WS=110778118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,37:0.32:114
chr6	110778323	rs717567	G	A	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=753;SC=ACATATACACGAATGGATAAA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=110778331;WS=110778313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	110797214	rs2428188	C	G	1873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=52;PP=1628;SC=GTACCTGGCACGTATTAGGTT;SOR=4.370;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=6;TCR=52;TR=58;WE=110797222;WS=110797204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	110797563	rs2494551	A	C	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=0;PP=720;SC=AAGCCCAGCTAGGGGCCGGCG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=110797571;WS=110797553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	110797605	rs2494552	G	A	2261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.92;QD=46.16;SOR=3.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	110797612	rs6920997	A	G	2306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.93;QD=43.52;SOR=3.872;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	110797703	rs150666553	CCGCGGG	C	6465.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.21;SOR=0.857;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr6	110797713	.	C	CCACCCCT	7048.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=32;NR=39;PP=2966;SC=CCGCGGGGCCCCTCCCCCATA;SOR=0.793;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=72;TCF=32;TCR=40;TR=71;WE=110797721;WS=110797693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr6	110797821	rs11153236	A	G	1666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=47;PP=1348;SC=AGCTCCGGGGACTGCGGGTAG;SOR=5.709;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=2;TCR=47;TR=49;WE=110797829;WS=110797811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	110797905	rs6922017	G	C	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=23;PP=501;SC=ACCAGCGCGAGGCTGTATTCT;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=110797913;WS=110797895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	110943914	rs9487465	T	C	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=200;ReadPosRankSum=-1.692;SC=GGTGGTATCATTGAAAAAGTT;SOR=0.434;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=12;WE=110943922;WS=110943904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr6	110988795	rs9386933	AC	TA	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=3.818;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.92;ReadPosRankSum=0.907;SOR=0.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,43:0.68:63
chr6	110991916	rs2691185	T	C	2225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=51;PP=1706;ReadPosRankSum=-0.872;SC=GCTCTGTCAATATCTTGGTGC;SOR=0.745;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=107;TCF=36;TCR=71;TR=75;WE=110991924;WS=110991906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,80:0.71:112
chr6	111213927	rs34637914	T	TC	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=-0.511;SC=TCGGTCTTTTTCCCCCCCCAG;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=3;WE=111213935;WS=111213917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr6	111281581	rs6910747	T	G	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.674;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=59.98;MQRankSum=-0.671;NF=25;NR=0;PP=1092;ReadPosRankSum=-0.012;SC=TTTTTCTAATTATGTTTTTTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=42;TCR=1;TR=25;WE=111281592;WS=111281571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr6	111281584	rs11354415	GT	G	581.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.586;HP=11;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.644;NF=26;NR=0;PP=1115;ReadPosRankSum=-0.254;SC=TTCTAATTATGTTTTTTTTTT;SOR=2.774;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=50;TCR=1;TR=26;WE=111281592;WS=111281571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
chr6	111281880	rs71553315	A	ATAAATAT	2407.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.130;NF=0;NR=42;PP=2695;ReadPosRankSum=0.515;SC=CTTAAGCATAATAAATATCTC;SOR=0.481;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=98;TCF=1;TCR=97;TR=42;WE=111281888;WS=111281870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,57:0.62:92
chr6	111283592	rs9374227	C	T	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=1;PP=927;ReadPosRankSum=-1.445;SC=ATTTCTGTTCCAGCTGATACA;SOR=0.557;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=58;TCF=57;TCR=1;TR=38;WE=111283600;WS=111283582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,38:0.64:59
chr6	111283718	rs9374228	A	C	5116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.948;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=84;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.910;SC=GGTTAGTTCCATTATTCTCTG;SOR=0.614;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=289;TCF=162;TCR=127;TR=187;WE=111283726;WS=111283708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,188:0.65:289
chr6	111310382	rs67767509	TAC	T	72.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=31;ReadPosRankSum=-0.524;SC=TAAAATTCCTTACAGTTATTA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=2;WE=111310391;WS=111310372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr6	111320794	rs3763195	G	A	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.852;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=5;PP=794;ReadPosRankSum=-0.486;SC=ATATGTTTGCGGGGGTATAGG;SOR=0.368;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=51;TCF=45;TCR=6;TR=36;WE=111320802;WS=111320784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,36:0.69:52
chr6	111321037	rs3763196	A	G	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=329;ReadPosRankSum=-0.831;SC=GCTTCTCTTGACCAGTAGTGA;SOR=0.412;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=15;WE=111321045;WS=111321027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr6	111346806	rs1044387	C	T	2261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.50;SOR=3.830;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	111346806	.	CTG	TTA	2838	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=4;NR=43;PP=2838;QD=20;SC=CCAGCCACTACTGTTTCATTG;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=51;TCF=6;TCR=45;TR=47;WE=111346816;WS=111346796;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,47:0.92:51
chr6	111346808	rs1044388	G	A	2261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.16;SOR=4.450;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	111346843	rs1044389	G	A	1156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=34;PP=1017;SC=ATTATCAAGCGTCAATCCATT;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=111346851;WS=111346833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	111499394	rs12213248	G	C	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=623;ReadPosRankSum=0.677;SC=TCAACCGAAGGGTGTAGGTAA;SOR=1.371;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=24;WE=111499402;WS=111499384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,24:0.80:30
chr6	111527988	rs402940	G	A	4106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=110;PP=2965;SC=CTCATCACCCGATGTCTCATT;SOR=7.345;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=111;TCF=1;TCR=110;TR=111;WE=111527996;WS=111527978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr6	111528041	rs12191266	T	C	1364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=39;PP=1034;ReadPosRankSum=-0.721;SC=TCTTTCCTTTTTCTTTTTGAG;SOR=1.219;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=58;TCF=2;TCR=56;TR=40;WE=111528049;WS=111528031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,45:0.70:64
chr6	111539925	rs77627779	C	G	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.441;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=210;ReadPosRankSum=2.431;SC=AAAGGGGGAACCAGTAATGAC;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=10;WE=111539933;WS=111539916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr6	111540372	rs405948	G	A	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=137;ReadPosRankSum=0.780;SC=GCTTTTATGTGTGCCTTACTG;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=10;WE=111540380;WS=111540362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,9:0.24:38
chr6	111543067	rs193282	G	A	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=248;ReadPosRankSum=0.558;SC=CTATCAAAAAGGGTTTATATT;SOR=0.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=13;WE=111543075;WS=111543057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr6	111587266	rs11153279	T	C	7104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=131;PP=2965;SC=AATCATCTGATGCTGACTCAG;SOR=0.813;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=244;TCF=113;TCR=131;TR=244;WE=111587274;WS=111587256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr6	111628597	rs3204954	C	G	2458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=5;PP=1930;SC=GTTCCAACTCCCGGATTTCTT;SOR=4.640;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=75;TCR=5;TR=80;WE=111628605;WS=111628587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
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chr6	111695887	rs462779	G	A	3012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=69;PP=2458;SC=CTTAAGTGTTGTATGCTTTCT;SOR=2.327;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=22;TCR=69;TR=91;WE=111695895;WS=111695877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr6	111696129	rs3218591	T	A	5054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=95;NR=57;PP=2965;SC=CCTCTTTTTCTGCAGCAGCCA;SOR=1.387;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=95;TCR=57;TR=152;WE=111696137;WS=111696119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr6	111696257	rs461646	G	A	4658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=76;PP=2965;SC=CTATAATTCAGGTCACAATCT;SOR=0.965;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=62;TCR=76;TR=138;WE=111696265;WS=111696247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr6	111711232	rs11376056	C	CG	352.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=441;SC=CCACCACACCCGCCGGTCATT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=111711240;WS=111711222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	111793561	rs7772141	T	C	223.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=184;SC=GTTATACTTCTTTGTAATCGT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=111793569;WS=111793551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr6	111918865	.	GAAAA	AAAAA,AAAAG	1283	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000,0.5000;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=66,45;NR=0,0;PP=356,1283;QD=5.92077594768;SC=AAAATACAAAGAAAACCATTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=66;TCR=0;TR=66,45;WE=111918877;WS=111918855;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:66
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chr6	111919108	rs6941014	T	C	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=56;PP=1140;ReadPosRankSum=0.128;SC=CAGAGGGCGGTGCCTGGATTG;SOR=0.753;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=5;TCR=74;TR=60;WE=111919116;WS=111919098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,56:0.74:76
chr6	112041359	rs706895	T	C	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.466;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=284;ReadPosRankSum=-1.799;SC=CAAGGCTCACTGTTGGCTATT;SOR=1.179;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=70;TCF=11;TCR=59;TR=22;WE=112041367;WS=112041349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,22:0.31:71
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chr6	112382313	rs1230345	G	T	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=1055;ReadPosRankSum=-1.002;SC=AATGCCCTCAGCAGAAGCCCC;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=40;TCR=30;TR=47;WE=112382321;WS=112382303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,50:0.68:73
chr6	112386310	rs191974194	G	A	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=196;ReadPosRankSum=0.760;SC=TGGTCAGAGTGAGATATAGTT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=112386318;WS=112386300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr6	112407590	rs9766630	G	C	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=413;ReadPosRankSum=0.428;SC=TCTTCTTCGGGAAAATGATAT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=20;WE=112407598;WS=112407580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr6	112408610	rs6568714	T	C	2276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.439;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=59;PP=1878;ReadPosRankSum=-0.712;SC=CGGCGTAGCTTACCCTGTACG;SOR=0.498;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=137;TCF=42;TCR=95;TR=88;WE=112408618;WS=112408600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,86:0.63:137
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chr6	112420703	rs12154150	T	C	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.916;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=434;ReadPosRankSum=0.081;SC=AAGAAAAAACTCTCAGCAATT;SOR=1.528;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=19;WE=112420711;WS=112420693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
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chr6	112435444	rs111835795	G	GAAT	1603.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=34;PP=1556;ReadPosRankSum=-0.756;SC=CTGGAGTGATGAATTTTTAAC;SOR=0.465;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=1;TCR=61;TR=34;WE=112435452;WS=112435434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,40:0.62:65
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chr6	112435807	rs11969913	G	T	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.231;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=7;PP=1583;ReadPosRankSum=-0.370;SC=CCTAAGTTCTGCCAGATCATA;SOR=0.446;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=68;TCF=56;TCR=12;TR=34;WE=112435815;WS=112435786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,35:0.51:68
chr6	112435912	rs1050353	A	T	1483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.436;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=35;PP=1136;ReadPosRankSum=-0.268;SC=GCTTGGGTGTAACTGAGGTGG;SOR=0.840;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=117;TCF=49;TCR=68;TR=59;WE=112435920;WS=112435902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,60:0.49:122
chr6	112438912	rs3216857	GA	G	794.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.162;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=1003;ReadPosRankSum=0.136;SC=AGCATTTCATGACTCATATTT;SOR=0.264;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=63;TCF=53;TCR=10;TR=25;WE=112438920;WS=112438902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,26:0.37:70
chr6	112443134	rs4945897	G	A	1466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=0;PP=1160;SC=AAGGAAAGATGGGAAAAAACG;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=42;WE=112443142;WS=112443124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	112450351	rs2157550	G	C	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=29;PP=887;SC=TTATGGAAGTGAAAGAGCTTT;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=112450359;WS=112450341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	112450374	rs66482680	GTGTGTGTGTGTGTGCA	G	403.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.733;NF=1;NR=3;PP=890;ReadPosRankSum=-0.847;SC=CAATTAAAATGTGTGTGTGTG;SOR=0.446;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=4;WE=112450397;WS=112450364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr6	112457383	rs1050349	G	C	1947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.76;ReadPosRankSum=-1.132;SOR=0.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,81:0.61:132
chr6	112457390	rs2032567	C	T	5242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.42;SOR=1.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr6	112457471	rs2032568	G	A	3044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=71;PP=2359;SC=GGAGAGAAAGGAATTGTAAGA;SOR=2.621;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=20;TCR=71;TR=91;WE=112457479;WS=112457461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr6	112460541	rs2072019	G	A	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.625;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=475;ReadPosRankSum=-0.340;SC=TTTCTGTTATGCTTTTCAAGT;SOR=0.307;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=26;WE=112460549;WS=112460531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr6	112460648	rs2072020	G	A	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=77;ReadPosRankSum=1.465;SC=AGAGGTATTTGTAGGTATGTT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=112460656;WS=112460638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr6	112471621	rs3832396	GACAA	G	2848.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.858;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.190;NF=45;NR=13;PP=2596;ReadPosRankSum=0.616;SC=TAAAATCATTGACAAACAAAG;SOR=0.882;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=116;TCF=87;TCR=29;TR=58;WE=112471632;WS=112471611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,74:0.59:125
chr6	112471688	rs3734286	G	C	3596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.574;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.985;NF=73;NR=62;PP=2743;ReadPosRankSum=-0.869;SC=CAACAGATGAGACTTCAATTC;SOR=0.755;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=202;TCF=104;TCR=98;TR=135;WE=112471696;WS=112471678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,141:0.68:208
chr6	112476210	rs2277084	T	C	1338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.912;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=41;PP=1112;ReadPosRankSum=-0.424;SC=CTATTCATAGTTGAAGGATTT;SOR=1.321;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=65;TCF=5;TCR=60;TR=44;WE=112476218;WS=112476200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,44:0.69:64
chr6	112480041	rs3752577	A	G	1571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.811;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=48;PP=1180;ReadPosRankSum=-0.084;SC=CTTGTAGTTCACTTTTGGCTC;SOR=0.494;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=265;TCF=93;TCR=172;TR=78;WE=112480049;WS=112480031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,82:0.30:276
chr6	112493872	rs1050348	A	G	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=8;PP=675;SC=TCCCTGACATAGTTAAGGGCC;SOR=1.697;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=27;WE=112493880;WS=112493862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	112506375	rs9374309	G	A	2611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=31;PP=2172;SC=TGACCAGCCAGCCTCACATCA;SOR=1.445;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=53;TCR=31;TR=84;WE=112506383;WS=112506365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr6	112506583	rs6908219	G	T	1285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=34;PP=1031;ReadPosRankSum=-0.864;SC=ATAGTCAATGGGCACACCAGG;SOR=2.687;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=38;WE=112506591;WS=112506573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr6	112508035	rs9400521	C	T	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=3;PP=402;SC=ATATGGAGGGCCAACTGTATT;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=112508043;WS=112508025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr6	112508769	rs9387061	TG	GT	3910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=51;PP=2947;SC=CTAACCGCAGTGCATCAGTCA;SOR=1.744;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=83;TCF=26;TCR=57;TR=76;WE=112508778;WS=112508759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
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chr6	112671611	rs11153361	G	A	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.146;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=448;ReadPosRankSum=-0.862;SC=ACACATGATGGTTTCTTCTCT;SOR=0.136;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=85;TCF=27;TCR=58;TR=28;WE=112671619;WS=112671601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,28:0.33:86
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chr6	116323910	rs1338667	T	A	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.137;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=30;PP=587;ReadPosRankSum=1.355;SC=TACCACATTGTCTCAGTGTCA;SOR=1.025;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=100;TCF=20;TCR=80;TR=36;WE=116323918;WS=116323900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,36:0.35:103
chr6	116324898	rs3798227	A	G	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=7.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=523;ReadPosRankSum=0.381;SC=TATTACTCTTAAGTAGTTTAG;SOR=0.675;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=80;TCF=79;TCR=1;TR=26;WE=116324906;WS=116324888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,26:0.32:81
chr6	116325108	rs34064900	G	A	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.778;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=35;PP=824;ReadPosRankSum=-0.452;SC=CTTGTTTTCTGAATATAATAG;SOR=0.784;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=137;TCF=33;TCR=104;TR=44;WE=116325116;WS=116325098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,45:0.31:147
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chr6	116429623	rs517352	T	A	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=445;ReadPosRankSum=0.659;SC=TTGTGAAGTCTAAACTTTACC;SOR=0.722;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=19;WE=116429631;WS=116429613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr6	116439220	rs515745	A	G	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.236;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=275;ReadPosRankSum=0.000;SC=GATTTAATTTAAGCTTAAATA;SOR=0.069;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=15;WE=116439228;WS=116439210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
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chr6	116446576	rs1064583	A	G	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.681;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=651;ReadPosRankSum=1.574;SC=GCCTGTGGGCATTTGGTATCG;SOR=1.181;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=122;TCF=69;TCR=53;TR=45;WE=116446584;WS=116446566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,44:0.36:121
chr6	116574455	rs2232472	G	A	2306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-7.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.861;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=16;PP=1849;ReadPosRankSum=-1.611;SC=TGCGCTGCATGTGGAGCCTTC;SOR=0.886;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=96;TCR=24;TR=81;WE=116574463;WS=116574445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,83:0.67:124
chr6	116575083	rs2232470	C	A	2883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.834;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=69;PP=2342;ReadPosRankSum=-0.474;SC=GCACTGGTCTCGGTCCGGATC;SOR=0.509;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=173;TCF=64;TCR=109;TR=112;WE=116575091;WS=116575073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,109:0.63:173
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chr6	116579501	rs11153601	C	T	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.694;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=255;ReadPosRankSum=-0.229;SC=TTATAACGTGCTTTATAACTC;SOR=2.147;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=12;WE=116579509;WS=116579491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr6	116599665	rs9400897	T	C	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=524;ReadPosRankSum=0.522;SC=GCAGGAGTATTCCCAAGGGCA;SOR=1.609;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=21;WE=116599673;WS=116599655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr6	116600465	rs78371471	T	TCAC	5473.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.145;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.097;NF=33;NR=69;PP=2969;ReadPosRankSum=-0.878;SC=AGGCCTTCCTTCACCACCTCA;SOR=0.289;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=202;TCF=62;TCR=140;TR=102;WE=116600473;WS=116600455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,132:0.63:210
chr6	116600774	rs3749895	C	G	3165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.207;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=60;PP=2590;ReadPosRankSum=-0.860;SC=CGGCCCGCGGCATCCTGGGGT;SOR=0.769;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=161;TCF=79;TCR=82;TR=114;WE=116600782;WS=116600764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,116:0.72:162
chr6	116600810	rs3828743	G	A	2813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.349;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=46;PP=2286;ReadPosRankSum=0.819;SC=GAAGGCGGTGGAGGCGGGAGC;SOR=0.767;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=140;TCF=72;TCR=68;TR=98;WE=116600818;WS=116600800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,99:0.70:141
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chr6	116757557	rs560644	T	C	4021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=54;PP=2965;SC=ATCCCTACAATGGGACAAACT;SOR=1.136;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=75;TCR=55;TR=129;WE=116757565;WS=116757547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
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chr6	116875427	rs7762318	G	A	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.075;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=32;PP=1163;ReadPosRankSum=1.046;SC=AAGAGATCCTGGCTGGGTTTC;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=64;TCF=22;TCR=42;TR=48;WE=116875435;WS=116875417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,51:0.75:68
chr6	116878947	rs6906668	C	T	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=550;ReadPosRankSum=2.891;SC=ATATTTGATGCATTGATACTT;SOR=0.495;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=27;WE=116878955;WS=116878937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr6	116901603	rs62424374	T	C	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=340;ReadPosRankSum=0.369;SC=ATGCTGGATATTGTCATGTGG;SOR=1.828;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=15;WE=116901611;WS=116901593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr6	116901640	rs1321534	G	A	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=89;ReadPosRankSum=1.834;SC=TTACGAATCTGCTATGAATGT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=116901648;WS=116901630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr6	116914112	.	AT	A	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.281;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.32;ReadPosRankSum=1.139;SOR=0.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr6	116938232	rs13213314	C	G	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.526;SOR=0.691;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,46:0.25:184
chr6	116950833	rs784133	T	C	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.860;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=313;ReadPosRankSum=1.378;SC=GAAGTGGGGCTTCCTCTTTTG;SOR=1.999;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=70;TCF=17;TCR=53;TR=19;WE=116950841;WS=116950823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,19:0.27:71
chr6	117037616	rs2243367	A	G	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=0.022;SC=TTGCACATATACAGTATTCAA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=117037624;WS=117037606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr6	117045674	rs1150108	A	G	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=15;PP=426;SC=CTGTGTCTTGAAGGATGGTGA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=117045682;WS=117045664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	117073874	rs10556522	AATAT	A	1053.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.124;NF=0;NR=34;PP=1394;ReadPosRankSum=-0.057;SC=GGGGGGAAGAAATATATATAT;SOR=2.242;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=0;TCR=55;TR=34;WE=117073885;WS=117073864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,31:0.76:41
chr6	117073894	rs10649123	T	TAG	119.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.325;NF=0;NR=35;PP=409;ReadPosRankSum=0.399;SC=TATATATATATATAGATACAC;SOR=0.039;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=35;WE=117073914;WS=117073884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,7:0.17:41
chr6	117073918	rs141678188	T	TATATATAC	63.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQRankSum=-2.630;QD=3.54;ReadPosRankSum=-0.838;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr6	117086265	rs641338	C	A	4415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=117;NR=18;PP=2965;SC=CGCACCCTTGCGGCCGGGGAC;SOR=3.645;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=117;TCR=18;TR=135;WE=117086273;WS=117086255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr6	117086378	rs654128	C	A	8258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=157;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.024;SC=TCTTGTCGAACTGCGAAGGCC;SOR=0.462;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=261;TCF=101;TCR=160;TR=257;WE=117086386;WS=117086368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,269:0.99:273
chr6	117114290	rs35937022	A	G	3904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=96;PP=2965;SC=TAGGGAGAGAATCAGGAGTAG;SOR=2.872;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=23;TCR=96;TR=119;WE=117114298;WS=117114280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr6	117114403	rs6901971	G	A	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=25;PP=770;SC=ATAAAAGGCAGTGAGGCATAT;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=117114411;WS=117114393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	117121894	rs6917467	G	A	2297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=54;PP=1822;SC=TTAAATCCCCGTGAGCATCAA;SOR=2.649;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=15;TCR=54;TR=69;WE=117121902;WS=117121884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr6	117130544	rs28360548	A	C	4560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=61;PP=2965;ReadPosRankSum=1.305;SC=CCCAGAACCTATGACAGCCTT;SOR=0.337;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=80;TCR=61;TR=140;WE=117130552;WS=117130534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,143:0.99:144
chr6	117130704	rs2274911	G	A	4384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=74;PP=2965;SC=TTGACTCCAGGTAAGAGTGTT;SOR=0.929;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=63;TCR=74;TR=137;WE=117130712;WS=117130694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr6	117243181	.	CT	C	45.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=0.650;QD=1.43;ReadPosRankSum=0.828;SOR=1.154;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr6	117243195	rs182606018	T	C	1408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=10;PP=1101;SC=TTTTTTTTTTTCCTGGGTAGA;SOR=2.476;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=41;WE=117243203;WS=117243171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	117587054	rs433425	T	C	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=34;PP=989;ReadPosRankSum=-0.565;SC=GCGCCCCCCGTTTGCGGCGGC;SOR=1.123;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=5;TCR=44;TR=38;WE=117587062;WS=117587044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,39:0.71:55
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chr6	117609529	rs2778	A	G	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=0.417;SC=ATTAGAAATCAGGAACGTTGC;SOR=0.241;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=10;WE=117609537;WS=117609519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
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chr6	117865928	rs9320608	C	T	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=677;SC=TTAATGGCCACTTTACTTTTG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=117865936;WS=117865918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	117869491	rs210621	G	A	10586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=195;NR=137;PP=2965;ReadPosRankSum=0.639;SC=CCGAAAGCGGGCACCCTGACT;SOR=0.397;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=335;TCF=196;TCR=139;TR=332;WE=117869499;WS=117869481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,343:1.00:344
chr6	118475798	rs205966	G	A	1526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=42;PP=1249;ReadPosRankSum=0.414;SC=GCTCACAAAAGCACCAGGAAT;SOR=1.296;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=8;TCR=44;TR=50;WE=118475806;WS=118475788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,51:0.96:53
chr6	118800890	rs2187945	T	C	241.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=168;SC=AAGATTAATATTAAAGAATTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=118800898;WS=118800880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	118801174	rs9481811	T	C	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=245;ReadPosRankSum=0.578;SC=CAGAAATTTATAAATTTATTT;SOR=1.055;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=12;WE=118801182;WS=118801164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr6	118832320	rs9489424	T	C	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.807;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=-1.294;SC=AGTTGGACACTCTTTGCCACA;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=5;WE=118832328;WS=118832312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr6	118886961	rs3734382	G	T	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=747;ReadPosRankSum=0.747;SC=ATGTCTACAGGCTGTCTCCTA;SOR=0.671;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=114;TCF=71;TCR=43;TR=40;WE=118886969;WS=118886951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,42:0.34:124
chr6	118973953	rs9489486	A	G	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.960;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=363;ReadPosRankSum=-1.349;SC=ATGTAATGTTAGCCAAGGGTC;SOR=0.915;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=58;TCF=25;TCR=33;TR=25;WE=118973961;WS=118973943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr6	118973998	rs1936059	G	T	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.015;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=488;ReadPosRankSum=-0.687;SC=ACAGAAACATGAAAGACGAAT;SOR=0.223;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=25;WE=118974006;WS=118973988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,28:0.61:46
chr6	118974042	rs9489487	C	T	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=57;ReadPosRankSum=0.708;SC=TTAATGTGCACTAGCTCGTTT;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=5;WE=118974050;WS=118974032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr6	119136759	rs65685	A	C	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.709;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=501;ReadPosRankSum=0.083;SC=TGAGTCCAGCATTCTGTCTGG;SOR=0.314;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=103;TCF=34;TCR=69;TR=30;WE=119136767;WS=119136749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,30:0.28:109
chr6	119149149	rs284921	C	G	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.308;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=924;ReadPosRankSum=-0.203;SC=AGCGTTCCGGCAATCACTCTG;SOR=0.269;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=64;TCF=36;TCR=28;TR=43;WE=119149157;WS=119149139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,47:0.69:68
chr6	119177480	rs36160966	T	G	1236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=4;PP=1003;SC=CATTTTCCCCTAAGCATATAT;SOR=4.223;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=43;WE=119177488;WS=119177470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	119245170	.	G	A	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.476;ClippingRankSum=0.000;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.188;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=31;PP=1201;ReadPosRankSum=-0.477;SC=ATGTAATCCCGCTCAAACTCC;SOR=0.458;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=206;TCF=124;TCR=82;TR=72;WE=119245178;WS=119245160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,75:0.35:214
chr6	119296378	rs200247036	T	TA	134.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-1.447;QD=3.74;ReadPosRankSum=-0.379;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr6	119300477	rs4946382	A	G	1921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=0;PP=1569;ReadPosRankSum=-0.152;SC=GAATTTAAAAAATGTTAAAAA;SOR=1.536;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=91;TCF=91;TCR=0;TR=60;WE=119300485;WS=119300467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,62:0.66:94
chr6	119323987	rs3756940	A	T	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.637;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=439;ReadPosRankSum=0.259;SC=CAGTGAATTAACAGAGTTTTA;SOR=0.269;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=22;WE=119323995;WS=119323977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr6	119327112	rs794262	G	A	923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=0;PP=756;SC=AATTGTTATCGGTTGAACTGG;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=119327120;WS=119327109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	119327632	rs17827619	C	T	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.099;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=493;ReadPosRankSum=-1.815;SC=AATAGAGCATCCTTGGTCTCC;SOR=0.439;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=102;TCF=86;TCR=16;TR=29;WE=119327640;WS=119327622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,31:0.29:107
chr6	119344020	rs9481880	C	T	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.737;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.783;NF=20;NR=0;PP=341;ReadPosRankSum=-0.409;SC=CCCGTCTGGGCGACAGAGCAA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=52;TCR=2;TR=20;WE=119344028;WS=119344010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,20:0.36:56
chr6	119346010	rs1775613	T	C	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.276;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=70;ReadPosRankSum=-0.748;SC=GGGAGAAGGATTGTGAATCCA;SOR=0.039;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=6;WE=119346018;WS=119346000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr6	119346912	rs6929403	G	A	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=37;PP=930;ReadPosRankSum=0.554;SC=CCCCGGAAGCGAAAAGAAGTA;SOR=0.437;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=0;TCR=62;TR=37;WE=119346920;WS=119346902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,40:0.61:66
chr6	119509785	rs2142887	C	G	1507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.784;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=1182;ReadPosRankSum=-0.436;SC=TTTTCCTGGACAGTGCTTACA;SOR=0.389;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=79;TCF=37;TCR=42;TR=53;WE=119509793;WS=119509775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,57:0.67:85
chr6	119509870	rs2142888	G	A	1133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=33;PP=971;SC=AGGACCCTCCGAGGATAACAA;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=119509878;WS=119509860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	119510739	rs2072888	C	T	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=469;SC=ATAGGCAGAGCGGATAGTCTT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=18;WE=119510747;WS=119510734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	119510777	rs2072889	T	G	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=0;PP=739;SC=AAAACTGCATTAAATCAAAGC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=119510785;WS=119510767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	119510941	rs2072890	C	A	2892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=42;PP=2358;SC=ACATGCCCCCCGCGAAGCAGG;SOR=0.809;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=46;TCR=42;TR=88;WE=119510949;WS=119510931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr6	119522252	rs3822996	G	T	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=571;SC=ACAATCCAGTGTCCTAATAAC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=119522260;WS=119522242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	119522306	rs9387641	T	C	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=168;ReadPosRankSum=0.660;SC=AGCCATGCCCTTTTCTCCTTT;SOR=0.495;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=44;TCF=40;TCR=4;TR=12;WE=119522314;WS=119522296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,12:0.27:44
chr6	119522353	rs9481890	T	C	1577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.992;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=14;PP=1255;ReadPosRankSum=0.402;SC=GCTGCTTTTGTGCTTCCTCTC;SOR=1.308;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=80;TCF=59;TCR=21;TR=59;WE=119522361;WS=119522343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,58:0.73:80
chr6	119522553	rs9481891	A	G	535.22	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=474;ReadPosRankSum=-1.067;SC=AATCTAAAAAACAATTTTCAT;SOR=3.716;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=18;WE=119522561;WS=119522543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,18:0.90:20
chr6	119531907	rs2267676	T	G	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=172;ReadPosRankSum=0.718;SC=CAGACAAAAATGTCTACAAAG;SOR=0.573;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=10;WE=119531915;WS=119531897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr6	119611708	rs9489670	C	T	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.185;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=0.260;SC=TTGTAAGAAACTCAGTGTAAG;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=119611716;WS=119611698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr6	119611989	rs9489671	A	T	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=357;ReadPosRankSum=-1.016;SC=CATTATTGTGATAAATTATAC;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=15;WE=119611997;WS=119611979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr6	119623079	rs6917129	A	G	91.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.282;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr6	119623079	.	AT	GC	57	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=30;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=57;QD=55.2339374311;SC=TAATACAATAATAGGGCCCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=2;WE=119623088;WS=119623069;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr6	119623080	rs72966433	T	C	91.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.645;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr6	119623358	rs11153807	G	A	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.193;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=150;ReadPosRankSum=0.586;SC=AGAGGGTAATGCTGGATTTAT;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=8;WE=119623366;WS=119623348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr6	119623415	rs6918089	G	A	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=20;SC=TTCAATGAAAGTATAAAACAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=119623423;WS=119623405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	119627976	rs6915559	G	A	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-7.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=4;PP=1129;ReadPosRankSum=-0.104;SC=GGAGGGCCATGTTACACAGAC;SOR=0.516;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=72;TCR=6;TR=50;WE=119627984;WS=119627966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,50:0.63:79
chr6	119628029	rs195092	C	T	2462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.653;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=31;PP=1931;ReadPosRankSum=1.641;SC=GAGAAGTTATCGTCACTAAGA;SOR=0.620;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=91;TCR=50;TR=88;WE=119628037;WS=119628019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,93:0.63:148
chr6	119628198	rs6915947	G	A	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=669;ReadPosRankSum=-0.893;SC=TTTGAATGGAGATGTTTTTGC;SOR=1.280;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=26;WE=119628206;WS=119628188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,29:0.78:37
chr6	119653186	rs7754482	G	A	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.324;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=25;PP=595;ReadPosRankSum=-0.389;SC=ATAAAATGAGGAGAATAATGT;SOR=1.995;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=57;TCF=10;TCR=47;TR=27;WE=119653194;WS=119653176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr6	121427283	rs56356586	T	C	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.019;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=30;PP=725;ReadPosRankSum=0.284;SC=GGATGCCAGATTCTACAGTGT;SOR=0.504;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=108;TCF=18;TCR=90;TR=37;WE=121427291;WS=121427273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,40:0.35:113
chr6	121436422	rs7772508	G	T	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=34;PP=1007;SC=ATAAAGTGCAGAAAAGTTTGC;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=39;WE=121436430;WS=121436412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr6	121491472	rs1273749	G	A	1768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=2;PP=1442;SC=CATTAAACAAGCTATATCAAA;SOR=5.670;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=50;TCF=48;TCR=2;TR=50;WE=121491480;WS=121491462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	121526447	rs9320795	G	C	1055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=19;PP=590;SC=TAAATAATAAGAAGAAGAAGA;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=121526473;WS=121526437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	121526459	rs35328788	G	T	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.86;SOR=4.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	121526465	rs35549991	G	T	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.72;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	121560155	rs12191616	C	T	1126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=2;PP=971;SC=AAAGTATGAACGAATTCATTT;SOR=4.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=34;WE=121560163;WS=121560145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	121577370	rs7745023	T	C	2059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=40;PP=1730;SC=CCAGAAAATATAGAAATATCT;SOR=1.112;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=27;TCR=40;TR=67;WE=121577378;WS=121577360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr6	121620608	rs9387944	G	T	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=3;PP=556;SC=CTTATATTTCGTTTCAAGAAG;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=121620616;WS=121620598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	121632008	rs9372653	T	A	1914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=55;PP=1630;SC=AACACAATTGTCAGGACATTC;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=0;TCR=55;TR=55;WE=121632016;WS=121631998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr6	122720806	rs6926219	G	A	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.092;NF=29;NR=7;PP=2677;ReadPosRankSum=-0.788;SC=CGTTCTCGGGGAGCTGCTGCC;SOR=0.662;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=36;WE=122720821;WS=122720796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,37:0.82:45
chr6	122720813	.	T	TGCCGTAGCTGCC	113.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=2.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=2.416;QD=2.92;ReadPosRankSum=1.774;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,6:0.15:39
chr6	122734972	rs549302	G	A	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=115;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TGTGGCCACTGACTTTACTCT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=122734980;WS=122734962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr6	122737326	rs150012876	AT	A	461.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.514;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=254;ReadPosRankSum=0.959;SC=TTTTTGATTGATTTTTTTTTT;SOR=0.947;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=77;TCF=67;TCR=10;TR=25;WE=122737334;WS=122737316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,28:0.37:75
chr6	122740474	rs3734595	G	T	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=30;ReadPosRankSum=-0.703;SC=TGTGCTTGTTGTCCAAAAAGA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=122740482;WS=122740464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr6	122743502	rs487487	T	C	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=15;PP=457;SC=TATTACAGAGTAAAATTCAAA;SOR=3.716;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=122743510;WS=122743492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	122743693	rs2243362	A	G	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=36;ReadPosRankSum=-0.385;SC=TTCAATCTTTATGGTCTTCTA;SOR=0.132;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=3;WE=122743701;WS=122743686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr6	122749156	rs45503393	G	GTC	258.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=7.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.88;ReadPosRankSum=0.398;SOR=1.535;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,10:0.19:53
chr6	122752550	rs149578348	T	TTA	349.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.102;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=182;ReadPosRankSum=0.136;SC=AAACAAGTACTTATATATATA;SOR=2.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=7;WE=122752558;WS=122752540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr6	122768231	rs2277107	T	C	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.324;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=11;PP=1176;ReadPosRankSum=0.661;SC=GCTAGACTTCTTGTTTAAAGA;SOR=0.911;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=171;TCF=132;TCR=39;TR=56;WE=122768239;WS=122768221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,60:0.33:180
chr6	122772692	rs510283	T	C	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=273;SC=ATCAAAACTTTGTACTTTATT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=122772700;WS=122772682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	122772921	.	A	AATAT	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.56;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	122775195	rs499825	A	C	1247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.43;SOR=1.347;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	122792765	rs3752573	G	C	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=2.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.09;ReadPosRankSum=-0.257;SOR=1.594;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,20:0.26:76
chr6	122792768	rs3752574	C	T	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=7.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.45;ReadPosRankSum=0.152;SOR=2.453;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,21:0.26:81
chr6	122793033	rs1267941	A	G	1957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=55;PP=1575;ReadPosRankSum=1.666;SC=AGGCCTGGGTAGGATAAAACA;SOR=4.582;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=57;TCF=1;TCR=56;TR=56;WE=122793041;WS=122793023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr6	122793073	rs3752576	C	A	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=199;ReadPosRankSum=1.290;SC=ACTGCGCATGCGCGTCACTAG;SOR=0.250;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=12;WE=122793081;WS=122793063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,15:0.34:44
chr6	123022496	rs4382328	A	G	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=351;ReadPosRankSum=1.008;SC=CAGGCTAGACATGGTGATCAG;SOR=0.454;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=55;TCR=0;TR=23;WE=123022504;WS=123022486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr6	123038887	rs6920792	CT	GC	1163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=1;PP=1290;SC=TGAACATTTACTTCTGAATAG;SOR=3.690;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=20;WE=123038896;WS=123038877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	123039201	rs34684181	T	G	992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=1;NR=27;PP=752;SC=TAGTTAAAAGTGCTCAGTTTC;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=123039209;WS=123039191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	123101348	rs2171068	G	C	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=5;PP=753;SC=ACTTTAGAACGTGGATTCCAG;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=123101356;WS=123101341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	123101647	rs2243372	A	G	2136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=42;PP=1761;SC=GGATGGGGAGAGGGGAATAAA;SOR=1.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=19;TCR=42;TR=61;WE=123101655;WS=123101637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr6	123369910	rs6900862	T	C	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.949;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=35;PP=765;ReadPosRankSum=-0.663;SC=ATCCTTTCTCTTCCGCCATCC;SOR=0.484;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=131;TCF=21;TCR=110;TR=43;WE=123369918;WS=123369900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,43:0.33:132
chr6	123539609	rs361509	C	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.441;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=85;ReadPosRankSum=-0.488;SC=CCACCCTTTCCGTCCACACCA;SOR=0.035;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=7;WE=123539617;WS=123539599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr6	123539684	rs361508	CT	TC	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.512;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=403;ReadPosRankSum=0.375;SC=GCCTGAACTACTGTGGACAAA;SOR=0.412;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=10;WE=123539693;WS=123539674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,12:0.26:46
chr6	123539904	rs7754205	C	T	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.672;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=458;ReadPosRankSum=-0.267;SC=CAGAGCATGACAGTTTGTTAA;SOR=1.311;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=97;TCF=32;TCR=65;TR=35;WE=123539912;WS=123539894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,35:0.35:99
chr6	123580660	rs12661887	C	T	77.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=3;NR=0;PP=54;SC=AAATCAGTGTCTTCATTTTCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=123580668;WS=123580650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr6	123592184	rs113318627	C	CTGTG	211.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=286;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CAGTGAAGGGCTGTGTGTGTG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=123592192;WS=123592174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr6	123600100	rs143535631	CA	C	262.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=245;SC=GCAAAATATTCAACATGAAAT;SOR=1.863;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=7;WE=123600108;WS=123600090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	123658680	rs12216080	A	G	141.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=4;NR=1;PP=117;SC=ATATTTGCAAAGGGGATGCAG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=123658688;WS=123658670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	123687288	rs2873479	A	C	2167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=34;PP=1802;SC=ACCTTTTTTAATTGAAACCGC;SOR=0.779;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=38;TCR=34;TR=72;WE=123687296;WS=123687278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr6	123687432	rs7769808	T	C	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=326;SC=ATGTTGCACATGAGAGCAAAG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=123687440;WS=123687422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	123699042	rs6901953	T	C	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.43;ReadPosRankSum=0.551;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr6	123758492	rs9320936	C	T	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=80;ReadPosRankSum=-0.274;SC=AAACTTGTCACTGTAAATTCT;SOR=1.179;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=6;WE=123758500;WS=123758482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr6	123819847	rs9320940	T	C	1508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=37;PP=938;SC=TTTCTAGACATGAGATTGTTT;SOR=2.259;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=11;TCR=37;TR=48;WE=123819855;WS=123819837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	123833457	rs6902416	G	C	1455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=19;PP=1155;SC=CCTTTCGCCAGTGTCTTTGTT;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=30;TCR=19;TR=49;WE=123833465;WS=123833447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr6	123851538	rs12196787	G	C	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=54;ReadPosRankSum=1.754;SC=AGTAAATTTAGTTATTTAATA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=123851546;WS=123851528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr6	123851590	rs12198164	G	A	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.299;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=274;ReadPosRankSum=-0.093;SC=ATTTTTTCTCGCATATGAATA;SOR=2.179;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=14;WE=123851598;WS=123851580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr6	123851610	rs12198167	G	A	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=310;ReadPosRankSum=0.159;SC=ACACAAAAATGTATATCTAAA;SOR=0.760;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=16;WE=123851618;WS=123851600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr6	123851865	rs4897276	A	T	35.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr6	123868665	rs7450199	G	A	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=542;SC=CCAAATTCCAGTTTTTAAGTA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=123868673;WS=123868655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	123869607	rs9490809	G	C	2301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=7;PP=1952;SC=ACCTTTATCAGTATCTTCGTC;SOR=4.205;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=65;TCR=7;TR=71;WE=123869615;WS=123869597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr6	123869769	rs66509682	TAA	T	1847.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.12;QD=32.42;SOR=3.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	123892044	rs12193784	A	G	2592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=5;PP=2162;SC=TTTTAATTTTAAAGCCAAATT;SOR=4.379;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=68;TCR=5;TR=73;WE=123892052;WS=123892034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr6	123892337	rs2295732	G	A	1393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=41;PP=1211;SC=TATTGATGATGAGAAACACTG;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=42;WE=123892345;WS=123892327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	124603378	rs1916790	A	G	2114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.474;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=64;PP=2962;ReadPosRankSum=1.090;SC=ATAGTTGTGAACACAGATGAA;SOR=2.506;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=98;TCF=11;TCR=87;TR=69;WE=124603398;WS=124603368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,73:0.72:102
chr6	124603390	rs802497	A	G	1661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.050;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=52;PP=2962;ReadPosRankSum=1.376;SC=ACAGATGAAAATAGTATAATT;SOR=1.494;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=79;TCF=5;TCR=74;TR=55;WE=124603398;WS=124603368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,59:0.71:83
chr6	124603503	rs713214	G	A	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=148;ReadPosRankSum=-0.543;SC=TTACCTGGTAGCCAGGTATGA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=124603511;WS=124603493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr6	124604038	rs41284438	T	C	1147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=0;PP=951;ReadPosRankSum=-1.308;SC=ATGCCAGATATGGTAACACAG;SOR=1.919;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=55;TCR=0;TR=40;WE=124604046;WS=124604028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,40:0.71:56
chr6	124604055	rs41284440	G	T	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=4;PP=1062;ReadPosRankSum=0.038;SC=ACAGTTATAAGTGCTAATTAT;SOR=0.662;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=67;TCF=62;TCR=5;TR=49;WE=124604063;WS=124604045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,49:0.72:68
chr6	124759017	.	G	GGTTTTTT	776.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=5.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=-0.473;QD=25.89;ReadPosRankSum=0.959;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,23:0.77:30
chr6	124759018	.	A	T	782.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=4.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=-0.473;QD=26.09;ReadPosRankSum=-0.270;SOR=2.004;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,23:0.77:30
chr6	124759018	.	AT	GT	472	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.9998,0.5000;HP=19;HapScore=4;MGOF=10;MMLQ=13;MQ=58.74;NF=5,17;NR=1,3;PP=187,472;QD=31.6666666667;SC=TGATCTATTGATTTTTTTTTT;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=6,20;WE=124759026;WS=124759008;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr6	124759018	.	AT	ATT	472	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.9998,0.5000;HP=19;HapScore=4;MGOF=10;MMLQ=13;MQ=58.74;NF=5,17;NR=1,3;PP=187,472;QD=31.6666666667;SC=TGATCTATTGATTTTTTTTTT;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=6,20;WE=124759026;WS=124759008;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:28,6:0.18:34
chr6	124759038	.	C	T	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=3.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=-1.260;QD=8.90;ReadPosRankSum=0.771;SOR=1.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr6	124759053	rs332614	C	T	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=416;ReadPosRankSum=-0.797;SC=CCCCAGGTAACGGTCTGATGG;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=21;WE=124759061;WS=124759043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr6	124759145	rs519362	GA	AC	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.560;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=955;ReadPosRankSum=-1.632;SC=GAGGCATGTGGATATAGCAAG;SOR=2.124;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=18;WE=124759154;WS=124759135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
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chr6	125112614	rs877058	C	A	2759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.645;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=56;PP=2102;ReadPosRankSum=-0.936;SC=CCTACTTAGCCTTCCTATTCC;SOR=0.592;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=145;TCF=61;TCR=84;TR=99;WE=125112622;WS=125112604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,105:0.68:155
chr6	125139473	rs1923726	TG	GC	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.141;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=4;PP=1347;ReadPosRankSum=0.951;SC=TCTGTGTGGGTGCTTGATCAT;SOR=2.002;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=102;TCF=77;TCR=25;TR=32;WE=125139482;WS=125139463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,35:0.33:106
chr6	125144352	rs2025251	T	G	1437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.886;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=41;PP=950;ReadPosRankSum=-0.088;SC=AAAAACATCTTTTCTCTCTCT;SOR=0.546;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=190;TCF=72;TCR=118;TR=68;WE=125144360;WS=125144342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,71:0.36:195
chr6	125229538	rs781733	T	C	3667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=28;PP=2965;SC=AAAGAAATCATGTATCTATTA;SOR=2.448;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=88;TCR=28;TR=116;WE=125229546;WS=125229528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr6	125229856	rs781734	C	T	935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=17;PP=768;SC=ATTTTGCCTGCTATGAATAAT;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=27;WE=125229864;WS=125229846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	125230075	rs781735	A	C	1015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=27;PP=794;SC=TTTGCCAACCATTGTTATTAT;SOR=4.548;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=125230083;WS=125230065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	125230575	rs1577203	G	T	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=23;PP=1266;SC=ATTTTAAGTTGATTTTTTTAT;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=26;TCR=23;TR=49;WE=125230583;WS=125230565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr6	125230965	rs1761559	A	G	1994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=29;PP=1522;SC=TTTGATAGGGATAGTAATGAA;SOR=0.790;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=31;TCR=29;TR=60;WE=125230973;WS=125230955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr6	125231037	rs1761560	G	A	1541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=31;PP=1130;SC=GTCCATGAACGTGATATATCT;SOR=1.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=46;WE=125231045;WS=125231027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr6	125231246	rs1750578	T	A	765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=5;PP=551;SC=CGTATATTGATTTTTGTATTT;SOR=2.215;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=125231254;WS=125231236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	125232072	rs699387	T	C	2009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=24;PP=1659;SC=CACAATTTTATAGTTTTGGGG;SOR=1.234;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=34;TCR=24;TR=58;WE=125232080;WS=125232062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr6	125232368	rs781740	G	T	2513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=44;PP=2033;SC=ACCAGGGAAGGGAGATCTGAG;SOR=0.876;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=34;TCR=44;TR=78;WE=125232376;WS=125232358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr6	125232594	rs781741	C	A	301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=5;PP=247;SC=CATGGTGAAACCCCATCTCTA;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=10;WE=125232602;WS=125232584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	125232766	rs11385725	C	CA	508.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.440;NF=12;NR=15;PP=332;ReadPosRankSum=-0.235;SC=GAATCCATCTCAAAAAAAAAA;SOR=0.537;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=47;TCF=25;TCR=22;TR=27;WE=125232774;WS=125232756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,27:0.77:35
chr6	125232853	rs6569400	A	G	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=33;PP=1178;SC=TTCCATGGACAGGGTGGTGGG;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=47;WE=125232861;WS=125232843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr6	125233518	rs781742	A	G	3519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=58;PP=2781;SC=AAACATAACCACCTTGAAGCT;SOR=0.922;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=50;TCR=58;TR=108;WE=125233526;WS=125233508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr6	125252731	rs4896596	C	T	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=167;ReadPosRankSum=-0.122;SC=CAATGTAATACTTTAGTGCTC;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=9;WE=125252739;WS=125252721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr6	125252994	rs9401786	C	T	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.080;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=167;ReadPosRankSum=0.170;SC=GTGCAAATGACGATAATAATA;SOR=1.581;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=11;WE=125253002;WS=125252984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr6	125284457	rs9401790	T	C	5653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.385;SC=GATCCCTATGTGCCCCTCATG;SOR=0.724;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=194;TCF=97;TCR=97;TR=191;WE=125284465;WS=125284447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,195:0.99:197
chr6	125402711	rs492800	C	T	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=5.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.232;SOR=1.592;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,28:0.24:116
chr6	125475139	rs2277111	G	A	3795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.375;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=49;PP=2899;ReadPosRankSum=1.019;SC=CGATCGCCCCGAGAGTCAGGT;SOR=0.346;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=183;TCF=120;TCR=63;TR=131;WE=125475147;WS=125475129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,137:0.72:189
chr6	125569405	rs2273562	A	G	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.153;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=5;PP=538;ReadPosRankSum=-1.220;SC=TATAAAAACCATGTTGTTCTG;SOR=0.429;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=96;TCF=83;TCR=13;TR=34;WE=125569413;WS=125569395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,38:0.37:103
chr6	125573194	rs3799734	A	G	2123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.865;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=47;PP=1718;ReadPosRankSum=1.007;SC=TAAGCGCCACAGGGCTGCGTG;SOR=0.935;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=135;TCF=64;TCR=71;TR=81;WE=125573202;WS=125573184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,83:0.61:136
chr6	125573312	rs3799733	C	A	1631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.537;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=43;PP=1294;ReadPosRankSum=0.766;SC=AGACAGTTCCCGTGACCAGGA;SOR=0.169;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=99;TCF=22;TCR=77;TR=60;WE=125573320;WS=125573302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,61:0.61:100
chr6	126072853	rs2875881	C	G	256.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=212;SC=TTGAACTGTGCAATCACTCTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=126072861;WS=126072845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr6	126242004	rs4563736	CG	GC	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=0;PP=1352;SC=TTTTCAAGCACGGGTGTCCCT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=22;WE=126242013;WS=126241994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr6	126278230	rs2295005	G	C	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=27;PP=897;ReadPosRankSum=-0.772;SC=GAAGCCGCTGGCAAGTCACCA;SOR=0.682;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=160;TCF=77;TCR=83;TR=51;WE=126278238;WS=126278220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,51:0.31:162
chr6	126288023	rs3757212	T	C	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=4;PP=868;ReadPosRankSum=-0.406;SC=ACAAATGTTTTTTCCTTTAGA;SOR=0.585;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=117;TCF=105;TCR=12;TR=43;WE=126288031;WS=126288013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,45:0.37:121
chr6	126307962	rs6569448	A	G	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=0.054;SC=TCCGAGACCAAACCCCTCGGC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=126307970;WS=126307952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr6	126319881	rs6569449	T	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.072;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=114;ReadPosRankSum=-0.963;SC=TGAAAGCTACTTATTAGGCCT;SOR=0.631;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=7;WE=126319889;WS=126319871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr6	126332554	rs116913944	A	G	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=423;ReadPosRankSum=1.079;SC=TGATGCAATCATTACTGATCG;SOR=0.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=25;WE=126332562;WS=126332544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr6	126334041	rs2206941	G	A	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=25.266;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=32;PP=874;ReadPosRankSum=0.610;SC=CTTGAGAAGAGGCATGTGGCT;SOR=1.619;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=146;TCF=72;TCR=74;TR=47;WE=126334049;WS=126334031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,48:0.31:155
chr6	126669479	rs9401876	C	A	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=316;ReadPosRankSum=-0.685;SC=AAGGTGATTTCCAATTTGGAA;SOR=1.863;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=16;WE=126669487;WS=126669469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
chr6	127471533	rs9491699	C	T	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=536;ReadPosRankSum=-1.207;SC=GTTAAGAGAACATAATGCAAG;SOR=0.420;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=24;WE=127471541;WS=127471523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr6	127471791	rs3734626	C	T	1379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.317;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=40;PP=1061;ReadPosRankSum=-0.151;SC=AAGTCCTTTGCCAAAAGAACT;SOR=1.919;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=56;TCF=5;TCR=51;TR=43;WE=127471799;WS=127471781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,47:0.76:62
chr6	127476516	rs1892172	G	A	3973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=70;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.136;SC=AGGGTAACCTGTGTCCCCCAA;SOR=0.685;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=234;TCF=126;TCR=108;TR=153;WE=127476524;WS=127476506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,157:0.66:237
chr6	127637254	rs77607850	T	C	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=191;ReadPosRankSum=0.590;SC=GTAAACTTTATGTGTCATGTC;SOR=0.909;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=14;WE=127637262;WS=127637244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr6	127637617	.	T	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.769;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=149;ReadPosRankSum=0.485;SC=GTTAAGGTGTTTTGCATGAAC;SOR=0.223;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=48;TCF=29;TCR=19;TR=13;WE=127637625;WS=127637607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,14:0.27:51
chr6	127640190	rs9285460	A	G	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=7;PP=480;SC=TTTAGATTACATAAAATTCCA;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=23;WE=127640198;WS=127640180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	127651213	rs7761452	T	C	34.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.60;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr6	127663703	rs13207650	C	T	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=173;ReadPosRankSum=-1.509;SC=CTTGTCTGTTCCAAGAGAATG;SOR=0.155;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=9;WE=127663711;WS=127663693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr6	127768472	rs2236026	G	A	3285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.224;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=78;PP=2591;ReadPosRankSum=0.116;SC=ACCATCTTTCGAAGTTTTCCC;SOR=0.444;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=172;TCF=49;TCR=123;TR=112;WE=127768480;WS=127768462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,115:0.65:177
chr6	127768762	rs6902288	G	A	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.178;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=736;ReadPosRankSum=-0.177;SC=GATTCTTCCTGTTTTTCTGTT;SOR=1.082;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=151;TCF=61;TCR=90;TR=47;WE=127768770;WS=127768752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,49:0.31:158
chr6	127768950	rs2236027	A	C	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=105;ReadPosRankSum=0.420;SC=TCAAAAGCAAACATAGCTAAA;SOR=0.538;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=9;WE=127768958;WS=127768940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr6	127770923	rs3818135	A	C	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.413;SOR=0.377;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,22:0.40:55
chr6	127771452	rs3734447	T	G	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=150;ReadPosRankSum=0.513;SC=ATCTTAGCACTTTCATTGATA;SOR=0.392;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=9;WE=127771460;WS=127771442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,10:0.25:40
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chr6	127794289	rs41285272	T	G	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=67;ReadPosRankSum=-0.135;SC=TTGTATCTTTTTAAAGAAATA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=127794297;WS=127794279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
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chr6	128030957	rs490008	G	T	1821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=2;PP=1571;SC=TATATCATAGGTTTCTGTAAG;SOR=5.856;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=51;TCR=2;TR=53;WE=128030965;WS=128030947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	128040839	rs675531	T	C	4823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=90;NR=59;PP=2965;SC=GTACCTGCTATTGCTGTGGCC;SOR=1.186;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=90;TCR=60;TR=149;WE=128040847;WS=128040829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr6	128176383	rs270032	A	G	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=25;PP=718;SC=AAACAGTGAAAAACAAAGTAG;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=128176391;WS=128176373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	128297986	rs4321844	G	T	3593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=48;PP=2698;SC=CTAGTTAGGAGAGTATAAAGC;SOR=0.973;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=61;TCR=48;TR=109;WE=128297994;WS=128297976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr6	128307118	rs4341027	T	G	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.226;NF=0;NR=21;PP=479;ReadPosRankSum=-0.815;SC=CTGACAATGATAACAATAAAA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=21;WE=128307126;WS=128307108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr6	128307155	rs34209700	T	TA	164.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.522;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.629;NF=0;NR=7;PP=93;ReadPosRankSum=-1.185;SC=TGCCTTTTCTTAAAAAAAAAA;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=7;WE=128307163;WS=128307145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr6	128312114	rs5879871	T	TAG	94.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=90;ReadPosRankSum=0.243;SC=AATAACTCCTTGTCACAATTA;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=4;WE=128312122;WS=128312104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr6	128321318	rs36043888	C	CT	144.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=117;ReadPosRankSum=0.415;SC=CTTAGGGGAACTTTTTTTTTA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=7;WE=128321326;WS=128321308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr6	128324241	rs717851	T	C	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=658;ReadPosRankSum=-0.059;SC=ATTTTCAAAATCAAGCTGCCT;SOR=0.674;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=27;WE=128324249;WS=128324231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr6	128330249	rs9321104	T	C	2417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.452;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=10;PP=1873;ReadPosRankSum=-0.324;SC=GGTAAGTGAGTGGGACAGGAC;SOR=1.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=123;TCF=107;TCR=16;TR=82;WE=128330257;WS=128330239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,85:0.69:123
chr6	128385998	rs4897241	A	G	2037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=55;PP=1598;SC=TTCCTGTTTCATAAACTATAA;SOR=3.947;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=5;TCR=55;TR=60;WE=128386006;WS=128385988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr6	128388799	rs35030557	G	T	3659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.057;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=80;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.686;SC=TTCCCGGGGGGAGTTCTGCAG;SOR=0.569;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=219;TCF=112;TCR=107;TR=154;WE=128388807;WS=128388789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,158:0.69:229
chr6	128388990	rs4897242	A	G	3584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=92;PP=2965;SC=ATATTTAGAGATTTAAGATAC;SOR=3.238;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=18;TCR=92;TR=110;WE=128388998;WS=128388980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr6	128389074	rs4897243	T	C	973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=803;SC=TAACCTGGTATACTCTTTTCA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=128389082;WS=128389064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	128403745	rs17828130	A	G	1927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=46;PP=1578;SC=CAGCCACTGGAACTGCAGGAT;SOR=2.381;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=15;TCR=46;TR=61;WE=128403753;WS=128403735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr6	128556815	rs77369097	G	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=125;ReadPosRankSum=0.695;SC=TCTGAGTAGCGTGATGAAATC;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=8;WE=128556823;WS=128556805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr6	128812869	rs76361302	CTT	C	3300.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.389;NF=59;NR=17;PP=2962;ReadPosRankSum=1.969;SC=TTTTTTTTCTCTTGTTACCTT;SOR=0.609;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=115;TCF=91;TCR=24;TR=76;WE=128812878;WS=128812859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,84:0.68:123
chr6	128813085	rs17460940	C	T	2464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.536;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=77;PP=2057;ReadPosRankSum=-2.461;SC=AATTGATTCACTACTGTTCAC;SOR=1.765;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=130;TCF=19;TCR=111;TR=87;WE=128813093;WS=128813075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,85:0.66:128
chr6	129381026	rs4404787	C	A	3336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=78;PP=2432;SC=TGACAATTACCCTGGATTTAC;SOR=2.100;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=29;TCR=78;TR=107;WE=129381034;WS=129381016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr6	129465304	.	T	C	1851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.679;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=55;PP=1485;ReadPosRankSum=-0.656;SC=TTTAAAAATGTTTTCAGTGAT;SOR=2.133;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=75;TCF=0;TCR=75;TR=55;WE=129465312;WS=129465294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,59:0.74:80
chr6	129612624	rs1015846	C	T	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=1;PP=545;SC=CCTAACAGGGCACTTAACAAA;SOR=4.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=23;WE=129612632;WS=129612614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	129622055	rs902373	A	G	2763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=66;PP=2210;SC=AATTTTTTGGAGAGATTTTTG;SOR=3.126;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=12;TCR=67;TR=78;WE=129622063;WS=129622045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
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chr6	129722425	rs3749878	G	A	2547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.722;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=46;PP=1840;ReadPosRankSum=-0.685;SC=CTTTAAAAGAGGGCAATGACA;SOR=0.916;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=338;TCF=176;TCR=162;TR=106;WE=129722433;WS=129722415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:241,113:0.32:354
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chr6	129724942	rs3828735	T	A	3472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FS=1.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.67;ReadPosRankSum=-0.438;SOR=0.586;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:159,95:0.37:254
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chr6	129785391	rs1414736	T	C	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=216;ReadPosRankSum=0.878;SC=AATGACAGACTGAATAGATAT;SOR=0.804;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=13;WE=129785399;WS=129785381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr6	129796620	rs7741996	C	T	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=448;ReadPosRankSum=-0.169;SC=ATAAAGCAGCCGTGCAGAAGC;SOR=0.701;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=100;TCF=49;TCR=51;TR=31;WE=129796628;WS=129796610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,31:0.30:105
chr6	129799682	rs2784895	C	T	2606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=2;PP=2167;SC=AACCAGTAGACAATGGAAACC;SOR=6.543;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=78;TCF=76;TCR=2;TR=78;WE=129799690;WS=129799672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr6	129802302	rs2275214	G	C	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=427;SC=AACCTATGATGTATTTCATAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=129802310;WS=129802294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	129807483	rs6569604	C	G	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=0;PP=562;SC=TTTTCAAAACCGTTTGAGAAA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=129807491;WS=129807473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	129807629	rs2229848	C	T	3490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=50;PP=2965;SC=GCCTATTATGCAATACTCCTC;SOR=0.927;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=65;TCR=50;TR=115;WE=129807637;WS=129807619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr6	129807699	rs2229849	G	C	4532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=78;PP=2965;SC=GGAAAATTGTGATCAGACCAG;SOR=1.054;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=59;TCR=78;TR=137;WE=129807707;WS=129807689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr6	129807869	rs6938825	C	A	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=657;SC=GTGTGTGGACCTACTATGCAT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=129807877;WS=129807859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	129823645	rs7754167	A	G	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=0;PP=590;SC=CTGAGCACTCAATAATAAGTA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=129823653;WS=129823641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	129835370	rs13196682	T	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=277;ReadPosRankSum=0.043;SC=TGTCAAGTTTTAAAATTTTTT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=13;WE=129835378;WS=129835365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr6	129929209	.	GAA	G	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.697;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr6	129950394	rs4295498	A	C	143.98	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=182;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CTCTCTCTCTATATATATATA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=129950402;WS=129950386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,5:0.83:6
chr6	130031215	rs3752536	T	C	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=27;PP=1011;SC=TTCCCGACGGTCTGGTCCTTG;SOR=1.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=42;WE=130031223;WS=130031205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	130152479	rs7758540	T	C	1800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=24;PP=1306;SC=CAAGCAATTTTGATATACCTA;SOR=1.107;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=36;TCR=24;TR=60;WE=130152487;WS=130152469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr6	130152520	rs7776426	A	C	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=2.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.805;SOR=0.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,17:0.25:68
chr6	130154667	rs9492393	T	C	2612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.290;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=43;PP=1998;ReadPosRankSum=-0.611;SC=AACCCATTCTTCCACAACTGG;SOR=0.706;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=131;TCF=67;TCR=64;TR=92;WE=130154675;WS=130154657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,99:0.69:143
chr6	130154686	rs4629709	A	G	4193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=71;PP=2965;SC=GGAACAAAAAACAATCCACAA;SOR=0.994;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=55;TCR=72;TR=126;WE=130154694;WS=130154676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr6	130164764	rs9321190	G	A	2441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=43;PP=1893;SC=GATGTTATAAGTGAAAACAGT;SOR=0.908;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=34;TCR=43;TR=77;WE=130164772;WS=130164754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr6	130164821	rs17396508	G	A	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=672;ReadPosRankSum=1.759;SC=AGTGACACACGTTACTATTTT;SOR=0.656;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=33;WE=130164829;WS=130164811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,33:0.70:47
chr6	130164856	rs9402185	C	T	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=27;PP=821;SC=CTATGCGATTCACCCACATTG;SOR=3.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=130164864;WS=130164846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr6	130167131	rs12189832	A	G	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=421;ReadPosRankSum=0.058;SC=GACCCATGGAATGGGAATGAC;SOR=0.770;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=64;TCF=8;TCR=56;TR=22;WE=130167139;WS=130167121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,23:0.34:68
chr6	130387431	rs148263906	G	GTA	213.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=154;ReadPosRankSum=-0.317;SC=TTATTTTTGTGTATATATATA;SOR=1.112;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=6;WE=130387440;WS=130387421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr6	130389707	.	TA	T	64	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=64;QD=29.0;SC=AATTAAAGTTTAAAATTAGCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=130389715;WS=130389697;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr6	130405020	rs7774174	A	G	221.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=151;SC=TTGTTACTGGAATTTTTGTTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=130405028;WS=130405010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	130466413	rs4897369	G	A	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.24;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	130466676	rs4897370	A	G	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=217;ReadPosRankSum=0.665;SC=ACAGAAAACAAACTAGCCTTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=10;WE=130466684;WS=130466666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr6	130467238	rs41285306	G	A	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.154;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=323;ReadPosRankSum=-0.541;SC=TGAAAAAGAAGTCAGTATATT;SOR=2.517;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=16;WE=130467246;WS=130467228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr6	130483222	rs9321214	G	A	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=287;SC=AGGAATCAGCGTAAATTAACC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=130483230;WS=130483212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	130504481	rs370056383	CA	C	69.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=2.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.13;MQRankSum=-0.479;QD=2.49;ReadPosRankSum=0.350;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr6	130505374	rs41285310	A	C	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.745;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=716;ReadPosRankSum=0.737;SC=CTTCAAGCAAACCACATTCCT;SOR=0.583;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=41;TCR=59;TR=39;WE=130505382;WS=130505364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,44:0.42:106
chr6	130530815	rs1932100	C	T	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=39;PP=1288;SC=GATCTCACAGCAGCTCTGAAG;SOR=2.348;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=52;WE=130530823;WS=130530805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	130535420	rs4897377	G	A	1402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=1;PP=1181;SC=CAAACGTCACGCTCTAGCCAT;SOR=6.138;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=42;TCR=1;TR=43;WE=130535428;WS=130535410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr6	130536494	rs34071457	AT	A	3451.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=121;PP=2458;SC=TTGTGCCTTAATTTTTTTTTT;SOR=4.391;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=143;TCF=11;TCR=132;TR=128;WE=130536502;WS=130536484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr6	130537005	rs2326951	G	A	1379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.038;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=1032;ReadPosRankSum=-0.124;SC=TTTTCCGTTAGCAAGAAGAGG;SOR=0.456;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=49;WE=130537013;WS=130536995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,53:0.68:78
chr6	130761804	rs12200105	C	T	3269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.257;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.716;NF=42;NR=74;PP=2695;ReadPosRankSum=-0.556;SC=TTGCTATGGCCGTTCTTGGAT;SOR=0.818;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=178;TCF=68;TCR=110;TR=116;WE=130761812;WS=130761794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,117:0.65:179
chr6	131148382	rs9402288	A	T	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=220;ReadPosRankSum=-0.828;SC=CAGCTTCCCAAGGTCATTCCC;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=11;WE=131148390;WS=131148372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr6	131148486	rs9402289	C	T	1814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.490;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=5;PP=1417;ReadPosRankSum=0.477;SC=AGTAACCTGCCAGCAATCCTA;SOR=1.593;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=84;TCF=75;TCR=9;TR=57;WE=131148494;WS=131148476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,61:0.69:88
chr6	131148541	rs4895897	A	G	5654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=118;NR=53;PP=2965;SC=TCCACAAAAAATTCCACTGAG;SOR=1.733;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=171;TCF=118;TCR=53;TR=171;WE=131148549;WS=131148531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr6	131148737	rs1044303	G	A	3265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=80;PP=2640;ReadPosRankSum=-0.078;SC=CTTCCTCCCCGTGACTTTGCT;SOR=0.717;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=178;TCF=64;TCR=114;TR=124;WE=131148745;WS=131148727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,122:0.69:177
chr6	131148863	rs9388856	A	T	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.488;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.676;NF=0;NR=30;PP=730;ReadPosRankSum=-0.428;SC=ATACCGATGCACTGTCAGTGT;SOR=3.345;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=30;WE=131148871;WS=131148853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,33:0.72:46
chr6	131148891	rs113795427	C	CAT	289.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.791;NF=0;NR=9;PP=342;ReadPosRankSum=2.100;SC=CCAGGAGAAACATATATATAT;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=9;WE=131148899;WS=131148881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr6	131156226	rs942	C	T	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-6.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=431;ReadPosRankSum=-1.028;SC=CTAAGATACTCATTCTGAACC;SOR=0.972;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=1;TCR=61;TR=24;WE=131156234;WS=131156216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,24:0.38:63
chr6	131179086	.	A	T	806	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5001;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=30;NR=0;PP=806;QD=28.0257070849;SC=TTGACACCACATGACCATCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=30;WE=131179094;WS=131179085;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,30:0.86:35
chr6	131184770	rs915172	T	G	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.474;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=11;PP=817;ReadPosRankSum=0.666;SC=AGAACTTAACTTATTTACCTG;SOR=1.182;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=61;TCR=18;TR=49;WE=131184778;WS=131184760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,51:0.60:85
chr6	131184975	rs867707	C	G	2011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=56;PP=1687;ReadPosRankSum=-0.112;SC=AGGCCACACACAACAAGCAGC;SOR=0.691;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=100;TCF=20;TCR=80;TR=71;WE=131184983;WS=131184965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,71:0.70:101
chr6	131197990	rs7741462	T	C	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=420;ReadPosRankSum=0.440;SC=AAACACAAAATACTGACCCAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=16;WE=131197998;WS=131197980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr6	131247975	rs2275509	C	A	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=166;ReadPosRankSum=-0.269;SC=TTCTCATTTTCTAACAATATA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=131247983;WS=131247965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr6	131276466	rs34763200	GA	G	1339.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=30;PP=1445;ReadPosRankSum=-1.452;SC=GGCTGTTGAGGAAAAAAAAAT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=30;WE=131276481;WS=131276456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,34:0.72:47
chr6	131276473	rs45550834	A	G	1411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=31;PP=1424;ReadPosRankSum=-2.130;SC=GAGGAAAAAAAAATAAATTCA;SOR=2.078;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=31;WE=131276481;WS=131276456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,36:0.73:49
chr6	131481130	rs147227838	G	GT	81.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=1.408;SC=TATATTGCTTGTTTTTTTTTC;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=5;WE=131481138;WS=131481120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr6	131481394	rs67922791	CA	C	1035.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=1007;SC=ATTTAAAGTACAACTAAATGC;SOR=5.353;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=131481402;WS=131481384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr6	131520507	rs1190789	A	G	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=245;ReadPosRankSum=1.687;SC=CTGTAAAATAATTAGTGATTG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=11;WE=131520515;WS=131520497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
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chr6	131911655	rs2608955	A	T	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=379;ReadPosRankSum=-1.391;SC=CATACAGTATATACAAAGTAT;SOR=0.826;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=17;WE=131911663;WS=131911645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,18:0.82:22
chr6	131917379	rs2608985	A	G	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=465;ReadPosRankSum=-1.863;SC=ATGTGAAAACATTGTTTAGAT;SOR=0.788;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=22;WE=131917387;WS=131917369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr6	131926334	rs2608953	C	T	1770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.284;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=2;PP=1462;ReadPosRankSum=1.214;SC=ATACTATACTCGTATCAATTC;SOR=1.725;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=82;TCF=78;TCR=4;TR=57;WE=131926342;WS=131926324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,59:0.68:87
chr6	131929309	rs71753454	A	AC	790.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=933;ReadPosRankSum=-0.376;SC=TTAAGGAGAAACCTGGTTCTT;SOR=1.259;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=25;WE=131929317;WS=131929299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr6	131931092	rs2245133	T	C	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=1;PP=963;ReadPosRankSum=1.393;SC=TCAGAACTTCTGTCAGTTCTA;SOR=0.957;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=37;WE=131931100;WS=131931082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,38:0.73:52
chr6	131936324	rs139719926	GTTT	G	991.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=651;ReadPosRankSum=0.411;SC=AGAAGAAATCGTTTTTTAGTG;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=20;WE=131936334;WS=131936314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,25:0.78:32
chr6	131940890	rs2297638	A	C	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=234;ReadPosRankSum=0.142;SC=TATTAAGAGAACATCCCTCAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=12;WE=131940898;WS=131940880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr6	131948469	rs10601285	GAAA	G	143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=2.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.75;ReadPosRankSum=-0.209;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,13:0.16:82
chr6	131948816	rs369598986	T	TAA	2007.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=4.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-1.236;QD=13.85;ReadPosRankSum=-1.076;SOR=1.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,85:0.59:145
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chr6	131973932	rs3765562	C	G	2683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.201;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=40;PP=1961;ReadPosRankSum=-0.844;SC=TCTGTCTGTGCTGCAGCAAGT;SOR=1.006;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=140;TCF=77;TCR=63;TR=95;WE=131973940;WS=131973922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,100:0.68:147
chr6	131979293	.	CAAA	C	39.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.93;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr6	131979652	rs9483311	C	T	130.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=86;ReadPosRankSum=0.210;SC=ACTTTTAACGCTGGTGGTTTG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=131979660;WS=131979642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr6	131992549	rs10080319	G	A	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=37;PP=913;ReadPosRankSum=0.527;SC=GGAACTGACCGAGTTCTGTGA;SOR=0.643;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=83;TCF=15;TCR=68;TR=45;WE=131992557;WS=131992539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,46:0.55:84
chr6	131995313	rs9493048	A	G	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-4.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=396;ReadPosRankSum=0.829;SC=GCTTGTATCCAGAGTCACATG;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=21;WE=131995321;WS=131995303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr6	131997798	rs2286453	A	C	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=497;ReadPosRankSum=-0.364;SC=AAGATATTAAACTTTCTGAAT;SOR=1.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=22;WE=131997806;WS=131997788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
chr6	132004047	rs73552660	A	C	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=163;ReadPosRankSum=-0.191;SC=ATATGGTAGCATGGGTGCTAG;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=132004055;WS=132004039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr6	132006735	rs56776570	A	G	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.890;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=576;ReadPosRankSum=0.977;SC=CAGACCCTCTACTGACTTCTT;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=24;WE=132006743;WS=132006725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr6	132007162	.	C	T	33	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=33;QD=33.8856062736;SC=GAATTTATTTCTAAACCTTCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=2;WE=132007170;WS=132007152;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr6	132014885	rs3213694	G	T	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.679;NF=0;NR=24;PP=557;ReadPosRankSum=1.907;SC=GACATTTTCTGGCCTTTTTGT;SOR=1.432;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=24;WE=132014893;WS=132014875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr6	132022419	rs201739285	G	A	1500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.87;MQRankSum=1.744;QD=22.40;ReadPosRankSum=-0.911;SOR=2.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,51:0.76:67
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chr6	132061420	rs17601580	G	A	2545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.079;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=34;PP=1878;ReadPosRankSum=-0.875;SC=GTGCTGACCAGTTGTAAAAAC;SOR=1.209;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=150;TCF=89;TCR=61;TR=94;WE=132061428;WS=132061410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,99:0.63:158
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chr6	132203432	rs7768480	A	G	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.080;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.507;NF=39;NR=5;PP=1065;ReadPosRankSum=-0.724;SC=TAATAAAGCAATTTTCTTCTC;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=44;WE=132203440;WS=132203422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,47:0.82:57
chr6	132203470	rs1799774	AT	A	2177.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=20;PP=2219;SC=AGTTCTTCTCATTTTCGTTCT;SOR=1.478;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=61;TCF=39;TCR=22;TR=57;WE=132203478;WS=132203460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr6	132207964	rs10692757	C	CTCT	1841.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=35;PP=2039;SC=GAAAGCACAACTGAGTACACA;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=35;WE=132207972;WS=132207954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	132270728	rs59140114	GA	G	818.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.28;MQRankSum=0.343;QD=23.39;ReadPosRankSum=1.734;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
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chr6	132271959	rs12206231	T	G	1681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.97;QD=44.26;SOR=1.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	132271980	rs6934749	T	G	1003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=24;PP=811;SC=GCGGGTCGCATGGGTCGCGCT;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=132271988;WS=132271970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	132641675	rs599660	T	C	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CTTTTCTTTCTAAATGGAAAT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=132641683;WS=132641665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr6	132644035	rs604196	G	A	2281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.993;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=60;PP=1840;ReadPosRankSum=-1.031;SC=AGGAAGACCCGATTAGCCCAC;SOR=2.099;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=111;TCF=37;TCR=74;TR=81;WE=132644043;WS=132644025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,83:0.72:116
chr6	132713607	rs56336490	A	G	706.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=595;ReadPosRankSum=-0.883;SC=CTTGCCTCAAATGGGCACTCA;SOR=4.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=23;WE=132713615;WS=132713597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,24:0.92:26
chr6	132722527	rs77906164	G	A	821.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5069;FS=8.502;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=661;ReadPosRankSum=0.562;SC=CCGTCCCGGGGAGCAGCCCCC;SOR=0.062;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=32;WE=132722535;WS=132722517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,32:0.89:36
chr6	132722637	rs111499244	A	G	296.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=269;ReadPosRankSum=0.000;SC=GAGGAGCGGCAGCGGCGGCGA;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=12;WE=132722645;WS=132722627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
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chr6	132785224	rs3757299	A	C	3153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.655;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=86;PP=2561;ReadPosRankSum=-0.943;SC=TCTGTAAAATAAAACACACAC;SOR=0.596;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=180;TCF=46;TCR=134;TR=116;WE=132785232;WS=132785214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,115:0.64:180
chr6	132796922	.	A	ACTTTGTTTTCCAG	124.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.79;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr6	132796923	.	TA	T	124.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=24.95;ReadPosRankSum=0.253;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr6	132859437	rs9402420	C	T	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=8;PP=731;ReadPosRankSum=0.822;SC=CAATGGTGAACAATTTCTCCC;SOR=0.631;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=90;TCR=21;TR=42;WE=132859445;WS=132859427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,44:0.39:112
chr6	132859609	rs2842899	T	A	5664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=95;PP=2965;SC=CCTTCACTTCTAACAACTGCA;SOR=0.935;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=169;TCF=74;TCR=95;TR=169;WE=132859617;WS=132859599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr6	132860522	rs2842898	C	G	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=661;SC=TTAAGGTCAACTGCAAAAATA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=132860530;WS=132860512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	132860575	rs6930707	T	G	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=42;ReadPosRankSum=1.074;SC=TATGCCAAGTTGTAGGACAAT;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=132860583;WS=132860565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
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chr6	132910612	rs3813355	G	A	5800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=102;NR=74;PP=2965;SC=GAGAGCAGCAGGAAGTTGGTG;SOR=1.038;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=102;TCR=74;TR=176;WE=132910620;WS=132910602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
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chr6	132945531	rs114717943	G	A	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.519;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=307;ReadPosRankSum=-1.002;SC=CTCTGCCTACGGCCACTGCTT;SOR=1.253;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=3;TCR=56;TR=15;WE=132945539;WS=132945521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,16:0.26:61
chr6	132966348	rs8192619	G	A	1497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FS=8.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.55;ReadPosRankSum=2.395;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:199,71:0.26:270
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chr6	133045812	rs2294758	G	A	1278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.054;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=23;PP=971;ReadPosRankSum=1.413;SC=GATCTCGTCTGTTCGCTTCTC;SOR=0.880;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=163;TCF=97;TCR=66;TR=60;WE=133045820;WS=133045802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,60:0.37:163
chr6	133045902	rs2294759	A	G	1663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.161;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=29;PP=1369;ReadPosRankSum=1.100;SC=AAGCTTGGTGAAGGTAAACTC;SOR=1.012;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=201;TCF=104;TCR=97;TR=67;WE=133045910;WS=133045892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,68:0.33:207
chr6	133048213	rs9493417	G	A	875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=23;PP=652;SC=GATGTGATCAGTTAAGTCTTT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=133048221;WS=133048203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	133052616	rs4895943	C	T	4766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=68;PP=2965;SC=TTCTGAATGACAGTGATAGCA;SOR=0.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=84;TCR=68;TR=152;WE=133052624;WS=133052606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr6	133055529	rs41286182	G	A	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.299;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=939;ReadPosRankSum=-0.374;SC=CACCCTGCTCGAAACAAGTGG;SOR=0.837;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=185;TCF=109;TCR=76;TR=52;WE=133055537;WS=133055519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,52:0.27:190
chr6	133055610	rs764262	G	T	6700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.83;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr6	133055610	.	GGG	TGC,TGG	2682	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=25,73;NR=27,99;PP=965,2682;QD=19.5859206704;SC=AAGTATAAAAGGGTAATACCT;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=173;TCF=73;TCR=100;TR=52,172;WE=133055620;WS=133055600;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.30:173
chr6	133055612	rs764263	G	C	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=3.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.26;ReadPosRankSum=1.347;SOR=0.455;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,58:0.31:186
chr6	133055876	rs45548039	G	A	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=316;ReadPosRankSum=-1.157;SC=AGATTCTTACGTTTTGTTTCA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=15;WE=133055884;WS=133055866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr6	133070995	rs4895944	G	T	5973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=138;PP=2965;SC=CACTTCAGCAGTGTGCAGACC;SOR=2.253;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=185;TCF=47;TCR=138;TR=185;WE=133071003;WS=133070985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr6	133073933	.	G	A	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.976;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=424;ReadPosRankSum=1.095;SC=CTTATTTGTTGAAGAAATGAC;SOR=1.284;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=20;WE=133073941;WS=133073923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr6	133074663	rs9493426	T	C	1699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.097;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=46;PP=1337;ReadPosRankSum=0.216;SC=GTATTTAATTTCCCGATTCCT;SOR=0.954;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=83;TCF=19;TCR=64;TR=59;WE=133074671;WS=133074653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,60:0.71:84
chr6	133076896	rs9483499	A	G	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=0.144;SC=ATATTGTATCATATAGGGAAT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=133076904;WS=133076894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr6	133079136	rs3901670	A	T	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=292;ReadPosRankSum=-1.726;SC=CTTTATCATCATTTTTCTTCT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=13;WE=133079144;WS=133079126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr6	133135807	rs9493450	C	T	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.831;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=16;PP=1025;ReadPosRankSum=0.133;SC=TGGCTCGTTGCGTTCTTGCTG;SOR=1.303;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=81;TCF=53;TCR=28;TR=51;WE=133135815;WS=133135797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,50:0.66:76
chr6	133135864	rs12202302	T	G	2982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.268;HP=5;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=53;PP=2300;ReadPosRankSum=-1.242;SC=ATGCTTTTGTTTTTTAGTGCG;SOR=0.616;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=88;TCR=82;TR=110;WE=133135872;WS=133135854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,113:0.66:170
chr6	133135886	rs9483504	A	G	3018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.607;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=64;PP=2279;ReadPosRankSum=1.129;SC=TCAAGATTCAACTTCACCCGT;SOR=0.772;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=165;TCF=68;TCR=97;TR=107;WE=133135894;WS=133135876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,111:0.66:169
chr6	133136041	rs9493451	C	G	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.519;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=632;ReadPosRankSum=0.227;SC=GTACACTTAGCTTTTGCTGAG;SOR=0.262;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=27;WE=133136049;WS=133136031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr6	133137111	rs3778174	C	T	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=228;ReadPosRankSum=-1.138;SC=GATGGAATTACAGGCACACGC;SOR=0.551;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=18;TCF=10;TCR=8;TR=13;WE=133137119;WS=133137101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr6	133138010	rs9389034	T	C	2842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.526;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=70;PP=2192;ReadPosRankSum=-1.430;SC=ACCCTTCTGATTACAGCCACC;SOR=0.957;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=141;TCF=36;TCR=105;TR=92;WE=133138018;WS=133138000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,103:0.68:152
chr6	133138067	rs34924584	ATT	A	846.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.709;NF=1;NR=24;PP=306;ReadPosRankSum=-0.891;SC=TATTAATGTGATTTTTTTTTT;SOR=0.765;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=64;TCF=3;TCR=61;TR=25;WE=133138076;WS=133138057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,30:0.70:43
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chr6	133849789	rs3822939	A	G	1380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.376;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=9;PP=1114;ReadPosRankSum=-0.066;SC=TCATTGAGACAATGGTTGTGA;SOR=1.733;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=92;TCF=75;TCR=17;TR=61;WE=133849797;WS=133849779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,59:0.63:94
chr6	133849966	rs3734279	C	T	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=45;PP=1184;ReadPosRankSum=0.457;SC=GCCGGAGATCCATTTTTTATA;SOR=0.968;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=77;TCF=9;TCR=68;TR=52;WE=133849974;WS=133849956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,52:0.63:83
chr6	134304023	rs2076583	C	T	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=25;PP=762;ReadPosRankSum=0.010;SC=TTTCAGGTAACGTTTTCAAAT;SOR=0.426;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=35;WE=134304031;WS=134304013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,38:0.67:57
chr6	134308187	rs11553666	T	G	247.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5565;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=141;ReadPosRankSum=-0.524;SC=AATTCACCACTTAATTGGTTA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=134308195;WS=134308177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr6	134327815	rs2811676	C	T	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=95;ReadPosRankSum=0.212;SC=GTCATGGGTACTTCAGGGTCA;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=7;WE=134327823;WS=134327805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr6	134327852	.	G	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=115;ReadPosRankSum=-0.576;SC=AAGTGTGTTTGAAAATTTCCA;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=8;WE=134327860;WS=134327842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr6	134493466	rs55811643	TGAATA	T	302.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=2.347;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=1.810;QD=6.73;ReadPosRankSum=-2.009;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,11:0.24:45
chr6	134493947	rs1743966	A	G	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=1009;ReadPosRankSum=0.408;SC=TCTGGGTTGCAAATGAATTTA;SOR=0.756;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=85;TCF=37;TCR=48;TR=50;WE=134493955;WS=134493937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,52:0.60:87
chr6	134494548	rs1743965	C	T	4027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=67;PP=2965;SC=AGGGAGAATACAAAAGAGGAC;SOR=1.133;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=51;TCR=68;TR=118;WE=134494556;WS=134494538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr6	134494708	rs113667538	GA	G	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=8.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.99;ReadPosRankSum=1.770;SOR=0.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr6	134495291	rs3215438	T	TC	201.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=158;ReadPosRankSum=0.968;SC=AAAGTGAGTTTCTGGCTCTAC;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=6;WE=134495299;WS=134495281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr6	134536272	.	C	T	252.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=0.000;QD=22.98;ReadPosRankSum=-1.433;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr6	134536290	.	G	C	230	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MMLQ=29;MQ=54.46;NF=0;NR=10;PP=230;QD=26.4771212547;SC=TTTTTTGAGAGAGCTTTGTTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=10;WE=134536298;WS=134536280;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,10:0.77:13
chr6	134536309	.	G	A	23	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=29;MQ=56.98;NF=0;NR=3;PP=23;QD=19.2570708491;SC=TGCCCAGGCTGGAGTACAGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=3;WE=134536317;WS=134536299;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,3:0.27:11
chr6	135260303	rs7754722	T	C	1849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=3;PP=1530;SC=ACAAAGCCCATGATGTCACTG;SOR=5.283;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=55;TCR=3;TR=58;WE=135260311;WS=135260293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr6	135286438	rs35078158	CA	C	62.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=2.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.41;ReadPosRankSum=0.580;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr6	135511108	rs210796	A	T	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=27;PP=821;ReadPosRankSum=-0.734;SC=AGCAGGTAAAATGGGCAAACA;SOR=0.729;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=33;WE=135511116;WS=135511098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,34:0.81:42
chr6	135511504	rs41287046	A	T	1595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.814;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=48;PP=1297;ReadPosRankSum=-1.281;SC=ATGTCAAAAAATATATTGATC;SOR=0.245;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=78;TCF=14;TCR=64;TR=60;WE=135511512;WS=135511494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,59:0.73:81
chr6	135514829	rs34931156	TA	T	1335.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=1;PP=1583;ReadPosRankSum=1.615;SC=AATTTCACATTAAAAGGTTTT;SOR=1.065;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=92;TCF=88;TCR=4;TR=47;WE=135514837;WS=135514819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,51:0.58:88
chr6	135522682	rs7757388	A	G	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=366;ReadPosRankSum=-0.476;SC=TAGTTTTATAAAAGTATTTGA;SOR=0.321;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=16;WE=135522690;WS=135522672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr6	135522939	rs743589	T	C	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=422;ReadPosRankSum=0.554;SC=TGGTGCCTCATGAAATCCTGT;SOR=1.911;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=22;WE=135522947;WS=135522929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,24:0.86:28
chr6	135523774	rs7762830	A	G	249.89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=207;ReadPosRankSum=-0.235;SC=CCAAAGTGCTAGGATTACAGG;SOR=0.223;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=11;WE=135523782;WS=135523764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr6	135524516	rs9385719	A	G	1631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.016;NF=5;NR=53;PP=2894;ReadPosRankSum=-0.864;SC=AAAAACTGTCATCTTTGGTGG;SOR=0.919;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=91;TCF=10;TCR=81;TR=58;WE=135524528;WS=135524506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,61:0.66:92
chr6	135524520	rs113909655	T	TTGG	1503.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.624;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.029;NF=1;NR=30;PP=2920;ReadPosRankSum=-1.129;SC=ACTGTCATCTTTGGTGGTGGT;SOR=0.247;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=80;TCF=4;TCR=76;TR=31;WE=135524528;WS=135524506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,38:0.70:54
chr6	135524553	rs9402696	C	T	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.653;NF=4;NR=36;PP=948;ReadPosRankSum=0.435;SC=GATGGTAGTGCTGGTGGTCTG;SOR=0.680;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=40;WE=135524561;WS=135524543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,40:0.73:55
chr6	135623833	rs2207000	C	T	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=3;PP=977;SC=ATTTGACTTCCAAACACCTTT;SOR=4.294;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=34;WE=135623841;WS=135623823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	135639644	rs6914831	C	T	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.491;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=4;PP=1089;ReadPosRankSum=1.556;SC=TACGTATGCTCAAAAACATTT;SOR=0.233;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=58;TCF=54;TCR=4;TR=43;WE=135639652;WS=135639634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,44:0.75:59
chr6	135748200	rs2757639	A	G	114.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=88;SC=GGGCACAATTATTATGTGTAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=135748208;WS=135748190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	135752608	rs2614270	T	C	220.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=6;PP=211;SC=AATCAAAATGTAACTCACAAA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=135752616;WS=135752598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	135754471	rs737561	C	T	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=282;SC=AGAACCAACACAGCCAATGAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=135754479;WS=135754461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	135763585	rs2614274	T	C	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=16;NR=0;PP=425;SC=ACTTTCTTTGTTTGAAGAAAT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=135763593;WS=135763575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	135763866	rs2757645	G	A	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=487;SC=AAAAACATACGTTTAAAAAAT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=135763874;WS=135763856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	135763934	rs200653130	CTTTT	C	286.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=275;ReadPosRankSum=-0.163;SC=TACTGTAGTTCTTTTAAGTCC;SOR=0.495;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=7;WE=135763945;WS=135763924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr6	135813251	rs9402709	G	T	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=84;SC=AGTATATTTGGTCAATGACAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=135813259;WS=135813241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	136359280	rs34030857	C	CG	2335.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.251;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.508;NF=11;NR=64;PP=2520;ReadPosRankSum=-1.248;SC=GAGGATCTTACGGGGGTTCGC;SOR=0.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=125;TCF=19;TCR=106;TR=75;WE=136359288;WS=136359270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,85:0.70:122
chr6	136359446	rs9376173	A	C	2415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.321;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=29;PP=1835;ReadPosRankSum=-1.577;SC=TGCTAGAGCGATATTTCCACC;SOR=0.957;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=132;TCF=82;TCR=50;TR=83;WE=136359454;WS=136359436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,88:0.64:138
chr6	136472185	rs35539959	G	GA	621.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.430;NF=31;NR=0;PP=749;ReadPosRankSum=-1.058;SC=TTCTAAAGGGGAAAAAATATT;SOR=0.250;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=97;TCF=96;TCR=1;TR=31;WE=136472193;WS=136472175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,31:0.34:90
chr6	136472439	rs4896201	G	A	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=458;ReadPosRankSum=0.739;SC=CTTGAATAATGGCAATGCATA;SOR=0.538;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=89;TCF=4;TCR=85;TR=25;WE=136472447;WS=136472429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,27:0.29:93
chr6	136472496	rs4896202	T	G	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.48;ReadPosRankSum=-0.104;SOR=0.076;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,8:0.21:39
chr6	136582092	rs62431280	C	A	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.81;MQRankSum=-0.108;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.328;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr6	136582113	rs62431281	A	C	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.241;NF=3;NR=1;PP=156;ReadPosRankSum=-0.700;SC=TGAAGACTTAAAACAAAATTT;SOR=0.105;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=136582121;WS=136582103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr6	136582194	rs141067744	T	TAAA	571.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.181;HP=8;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.202;NF=15;NR=4;PP=1477;ReadPosRankSum=3.936;SC=AAAAATCAGGTAAAAAAAATG;SOR=0.116;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=19;WE=136582211;WS=136582184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr6	136582203	rs74299323	T	C	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.534;HP=8;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.611;NF=15;NR=4;PP=1459;ReadPosRankSum=3.189;SC=GTAAAAAAAATGGTGGGTGCA;SOR=0.162;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=19;WE=136582211;WS=136582184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr6	136582417	rs62431283	G	A	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=38.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQRankSum=-5.066;QD=3.35;ReadPosRankSum=-3.866;SOR=5.357;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,21:0.20:107
chr6	136582497	rs62431284	G	T	3940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-7.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.660;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-7.209;NF=92;NR=32;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.515;SC=TTTGTCATGAGTCCATTTAGG;SOR=0.985;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=271;TCF=202;TCR=69;TR=124;WE=136582505;WS=136582487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,157:0.51:305
chr6	136590613	rs62431285	T	C	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=5.221;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQRankSum=-6.345;QD=5.75;ReadPosRankSum=-0.403;SOR=1.287;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,40:0.27:149
chr6	136590640	rs62431286	A	C	1385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=0.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.10;MQRankSum=-7.312;QD=7.00;ReadPosRankSum=2.585;SOR=0.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,63:0.32:198
chr6	136590698	rs62431287	C	T	1649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FS=8.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.00;MQRankSum=-9.957;QD=5.83;ReadPosRankSum=2.664;SOR=1.145;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,88:0.31:283
chr6	136590712	rs62431288	C	T	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FS=24.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.97;MQRankSum=-10.725;QD=5.36;ReadPosRankSum=3.615;SOR=1.868;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,72:0.27:267
chr6	136594292	rs7381749	T	C	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=1.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQRankSum=-7.895;QD=2.25;ReadPosRankSum=2.121;SOR=0.920;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,23:0.17:133
chr6	136597004	rs7762367	A	G	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=21.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQRankSum=-4.928;QD=4.15;ReadPosRankSum=-1.830;SOR=1.930;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,43:0.25:173
chr6	136597262	rs1967444	T	C	4639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.665;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.855;NF=104;NR=64;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.691;SC=GCCTTTCCACTACATATCCAG;SOR=0.906;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=320;TCF=189;TCR=131;TR=168;WE=136597270;WS=136597252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,173:0.53:325
chr6	136597281	rs1967445	A	T	6309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FS=0.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQRankSum=-3.582;QD=20.09;ReadPosRankSum=-1.340;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,163:0.52:314
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chr6	136598895	rs58951987	T	TA	360.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=437;SC=AAGTCAAGAGTAAAAACCGCT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=136598903;WS=136598885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr6	136599822	rs9942517	C	G	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.794;HP=2;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.065;NF=15;NR=21;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.262;SC=TCGTCTCATTCCTCTATTATT;SOR=0.439;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=81;TCF=43;TCR=38;TR=36;WE=136599850;WS=136599812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,45:0.49:91
chr6	136599836	rs9942518	G	A	1715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=4.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQRankSum=-4.059;QD=19.72;ReadPosRankSum=-0.749;SOR=0.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,45:0.52:87
chr6	136599842	rs9942519	G	A	1675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=4.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQRankSum=-4.338;QD=18.83;ReadPosRankSum=0.773;SOR=0.385;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,43:0.48:89
chr6	136665274	rs188121281	G	A	374.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=300;ReadPosRankSum=0.796;SC=TAGAAAACGGGTGGAGGGGAT;SOR=2.448;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=13;WE=136665282;WS=136665264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr6	136682172	rs2076190	G	A	1692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=5;PP=1384;SC=GCCTCCTCCCGCTCGCGCAGC;SOR=4.133;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=43;TCR=5;TR=48;WE=136682180;WS=136682162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	136698697	rs2076192	C	A	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=550;SC=GCCTGCCTGGCGTCTGGTGTC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=136698705;WS=136698688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	136710669	rs58458173	TA	T	137.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=1.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-0.838;QD=2.99;ReadPosRankSum=-0.814;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,13:0.28:46
chr6	136882715	rs41288957	C	T	4815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.980;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=94;PP=2962;ReadPosRankSum=0.425;SC=CTCAGCCAGTCGGTAAGTTCA;SOR=0.935;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=278;TCF=130;TCR=148;TR=169;WE=136882723;WS=136882705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,182:0.62:294
chr6	136926509	.	A	AAAC	1736.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.037;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.798;NF=4;NR=29;PP=1451;ReadPosRankSum=-1.369;SC=GGGTACCTGGAAACAATTCAA;SOR=0.074;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=67;TCF=7;TCR=60;TR=33;WE=136926517;WS=136926499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,44:0.63:70
chr6	136977568	rs2076260	T	C	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.748;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=36;PP=1033;ReadPosRankSum=2.180;SC=GCTTATATATTAAAATTGTCT;SOR=1.255;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=69;TCF=13;TCR=56;TR=43;WE=136977576;WS=136977558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,44:0.63:70
chr6	136990283	rs3765259	T	C	244.53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=223;ReadPosRankSum=1.036;SC=AACAAGGAGATATAATAAGTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=136990291;WS=136990273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr6	137026266	rs9321567	T	G	1569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=16;PP=1076;SC=TCTGGCAAATTATTTCCTGAA;SOR=1.314;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=31;TCR=16;TR=47;WE=137026274;WS=137026256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr6	137041833	rs1321477	C	T	2900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=7.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.500;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=95;PP=2392;ReadPosRankSum=-0.805;SC=AATAAGGAAACGATAGGGATT;SOR=1.517;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=151;TCF=12;TCR=139;TR=102;WE=137041841;WS=137041823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,103:0.67:153
chr6	137113137	rs55666429	G	A	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.369;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=291;ReadPosRankSum=0.840;SC=CGTTCCAGAAGCTGCCCGGCG;SOR=2.160;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=48;TCF=8;TCR=40;TR=18;WE=137113145;WS=137113127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,18:0.36:50
chr6	137143611	rs1321470	A	T	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.86;ReadPosRankSum=0.637;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr6	137143709	rs1321471	T	C	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=233;ReadPosRankSum=-0.252;SC=CACACTTCCGTCCGGTCTGCC;SOR=0.678;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=11;WE=137143717;WS=137143699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr6	137166682	rs927181	G	A	2118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=3;PP=1716;SC=TCATTGTTATGTAACAAGAGA;SOR=5.042;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=58;TCR=3;TR=61;WE=137166690;WS=137166672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr6	137167445	rs9321575	T	C	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=216;ReadPosRankSum=-0.811;SC=TTCTTTTGTGTTCTTAAGACT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=1;TCR=51;TR=13;WE=137167453;WS=137167435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,14:0.26:54
chr6	137187641	rs1884940	G	A	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=195;ReadPosRankSum=-0.177;SC=AAATAAGTCTGAAGGTGGCAA;SOR=0.404;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=11;WE=137187649;WS=137187631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr6	137193496	rs72985582	A	C	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=256;ReadPosRankSum=-1.439;SC=CATGAAAATAATCTGAGATGG;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=11;WE=137193504;WS=137193486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr6	137325847	rs1555498	C	T	2984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=65;PP=2361;SC=GTAATAGATACGGGCAAAACA;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=33;TCR=65;TR=98;WE=137325855;WS=137325837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr6	137325901	.	TAA	T,TA	1107.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.57;ReadPosRankSum=1.591;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:3,34,10:0.72,0.21:47
chr6	137338276	rs433243	A	G	5276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=100;PP=2965;SC=AGGTCTTAGTAGCAGAAAAGG;SOR=1.284;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=62;TCR=100;TR=162;WE=137338284;WS=137338266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
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chr6	137338357	rs442663	A	G	2654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=5.926;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
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chr6	137539423	rs150776768	AAAAAG	A	1201.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.541;NF=31;NR=1;PP=1339;ReadPosRankSum=0.716;SC=TCATAATAAAAAAAAGAAAAC;SOR=1.118;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=63;TCF=61;TCR=2;TR=32;WE=137539435;WS=137539413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr6	137539505	rs9376269	C	G	2521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-6.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.515;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.012;NF=78;NR=29;PP=1859;ReadPosRankSum=0.555;SC=AAAAGCCACCCTCAACATTTG;SOR=0.459;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=161;TCF=121;TCR=40;TR=107;WE=137539513;WS=137539495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,110:0.67:163
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chr6	137540370	rs7749390	A	G	1717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=13;PP=1319;SC=CCTGCCGCGAACGACGGTACC;SOR=2.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=51;WE=137540378;WS=137540360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr6	137540520	rs2234711	A	G	2021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=39;PP=1342;SC=CCAGCCCAGCACTGCCCTCCA;SOR=1.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=59;TCF=19;TCR=40;TR=58;WE=137540528;WS=137540510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr6	137540536	rs17181457	G	A	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=557;ReadPosRankSum=0.129;SC=CTCCAGCCCCGGCCTTACGTC;SOR=0.610;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=24;WE=137540544;WS=137540526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr6	138195961	rs71670547	TCTC	T	1177.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.62;SOR=5.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
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chr6	138615148	rs203145	G	A	2872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=45;PP=2318;ReadPosRankSum=0.845;SC=AAGATGCTACGGATAAGTTGA;SOR=0.683;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=96;TCR=71;TR=106;WE=138615156;WS=138615138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,107:0.64:168
chr6	138745177	rs55850386	C	T	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=56;ReadPosRankSum=0.168;SC=CTGCATTGCTCGTCTCCCCCC;SOR=0.169;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=5;WE=138745185;WS=138745172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
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chr6	138794628	rs7765573	A	G	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.142;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=235;ReadPosRankSum=0.257;SC=ACTCCTCTTTACTTACTTTAC;SOR=1.329;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=33;TCF=13;TCR=20;TR=13;WE=138794636;WS=138794618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr6	138794743	rs7765940	C	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.18;ReadPosRankSum=-2.128;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
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chr6	138820293	rs71754767	CACAG	C	205.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=1.097;QD=7.09;ReadPosRankSum=2.568;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr6	138820324	rs10457670	A	G	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=731;ReadPosRankSum=0.315;SC=ACACATATGGAAACATATGCA;SOR=0.536;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=31;WE=138820332;WS=138820314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr6	139013015	rs9321669	G	A	1994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.529;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=21;ReadPosRankSum=-1.068;SC=ACAAAGAGCTGGTGGGTCAGT;SOR=1.500;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=107;TCF=70;TCR=37;TR=73;WE=139013023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,74:0.67:110
chr6	139013227	rs59509731	TC	T	4391.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.256;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=80;PP=2963;ReadPosRankSum=0.719;SC=ATTTATATTCTCCCCTGGCTT;SOR=0.861;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=206;TCF=72;TCR=134;TR=117;WE=139013235;WS=139013217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,150:0.62:243
chr6	139013263	rs10223712	A	C	4653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-6.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.289;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=69;PP=2092;ReadPosRankSum=-1.687;SC=TGCCTGTGACAGTTTTCCCAC;SOR=1.145;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=188;TCF=85;TCR=103;TR=116;WE=139013271;WS=139013253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,127:0.63:202
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chr6	139013686	rs117648354	G	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=42;ReadPosRankSum=1.158;SC=GCAGCGCGGCGGTGCGGTGGC;SOR=0.495;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=4;WE=139013694;WS=139013676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
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chr6	139135499	rs17067925	G	A	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=384;ReadPosRankSum=1.703;SC=ATGTGAAAGCGCTCTGTGAAC;SOR=0.593;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=54;TCF=51;TCR=3;TR=19;WE=139135507;WS=139135489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,21:0.37:57
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chr6	139197609	rs1529151	G	A	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=17;PP=553;ReadPosRankSum=-0.936;SC=CAATCTTCAGGAAAGAAATGT;SOR=0.757;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=121;TCF=62;TCR=59;TR=35;WE=139197617;WS=139197599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,36:0.29:126
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chr6	139229743	rs1188868	C	T	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.918;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.033;NF=18;NR=5;PP=385;ReadPosRankSum=-1.748;SC=AGTTTGATTACTTTTAATTGT;SOR=0.315;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=72;TCF=60;TCR=12;TR=23;WE=139229751;WS=139229733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,25:0.32:77
chr6	139456761	rs185694700	T	C	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=59;ReadPosRankSum=0.842;SC=CCGCGAACGCTGCGGCCGCCG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=139456769;WS=139456751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr6	139487394	rs7768941	T	C	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=302;ReadPosRankSum=-1.010;SC=AAATCTGAAATCTGTTCTCTC;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=14;WE=139487402;WS=139487384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr6	139487836	rs3173082	T	C	2898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.339;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=38;PP=2086;ReadPosRankSum=-0.400;SC=GGCCCCCAAATAAGCCCCAGA;SOR=0.484;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=108;TCR=56;TR=111;WE=139487844;WS=139487826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,109:0.68:160
chr6	139563655	rs41289817	G	A	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=65;ReadPosRankSum=1.415;SC=CTGAAGGCACGGTGAGGCTTA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=139563663;WS=139563645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr6	139563914	rs9495391	C	G	1634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.879;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=18;PP=1144;ReadPosRankSum=0.644;SC=TTCCAGGACGCCTGATCAGCC;SOR=0.996;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=82;TCF=52;TCR=30;TR=52;WE=139563922;WS=139563904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,59:0.66:90
chr6	139564101	rs12529180	C	T	2447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.731;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=28;PP=1988;ReadPosRankSum=-0.290;SC=GCTCTGGCTCCTTGAGAGCGG;SOR=1.260;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=142;TCF=87;TCR=55;TR=85;WE=139564109;WS=139564091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,86:0.61:141
chr6	139569043	rs72988902	T	C	920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.898;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=38;PP=744;ReadPosRankSum=-2.826;SC=GAGTAGAGAGTGAGCTGTAAA;SOR=1.253;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=151;TCF=45;TCR=106;TR=49;WE=139569051;WS=139569033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,49:0.31:157
chr6	139576544	rs41289819	G	A	1574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.045;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=12;PP=1146;ReadPosRankSum=-0.642;SC=ATTTTTACTTGAAAATATGAA;SOR=1.095;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=95;TCF=71;TCR=24;TR=59;WE=139576552;WS=139576534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,63:0.64:98
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chr6	139598061	rs66961117	TA	T	484.70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.546;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=343;ReadPosRankSum=0.080;SC=TTCTTTGCCTTAAAAAAAAAA;SOR=4.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=21;WE=139598069;WS=139598051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,23:0.88:26
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chr6	142715195	rs17071756	T	C	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=511;ReadPosRankSum=1.473;SC=AAGAAAAACTTAATCACATAG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=21;WE=142715203;WS=142715185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr6	142718801	rs989946	G	A	8058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=89;NR=146;PP=2965;SC=ATACTAATTTGGAAGGAAAAA;SOR=1.285;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=235;TCF=89;TCR=146;TR=235;WE=142718809;WS=142718791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr6	142724918	rs9496369	C	T	2050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=4;PP=1620;ReadPosRankSum=0.565;SC=TTAATAGTGGCATTTTTTGTC;SOR=1.134;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=112;TCF=105;TCR=7;TR=77;WE=142724926;WS=142724908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,78:0.71:110
chr6	142738314	rs67174921	CTTCTT	C	677.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.905;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.853;NF=12;NR=2;PP=598;ReadPosRankSum=0.577;SC=TTGCATTTCTCTTCTTTTCAT;SOR=0.201;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=14;WE=142738326;WS=142738304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr6	142758631	rs1262686	A	G	4872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=74;PP=2965;SC=CAGTGGCGGCAGCATCTCTGC;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=90;TCR=74;TR=164;WE=142758639;WS=142758621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr6	143074700	rs169098	T	C	1123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.873;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=817;ReadPosRankSum=-1.403;SC=GAGTGCTAGGTGGACCAGATG;SOR=0.835;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=76;TCF=29;TCR=47;TR=47;WE=143074708;WS=143074690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,48:0.60:80
chr6	143081847	rs197462	A	G	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=484;ReadPosRankSum=0.903;SC=AGATCCAAATATCAAGGTTAG;SOR=2.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=21;WE=143081855;WS=143081837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,21:0.78:27
chr6	143090633	rs75657229	T	C	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=4;PP=1352;ReadPosRankSum=0.521;SC=CACTATGTAGTCTGCTCAGCA;SOR=1.009;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=83;TCF=77;TCR=6;TR=57;WE=143090641;WS=143090623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,58:0.69:84
chr6	143090734	rs34530989	T	C	3809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=44;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.752;SC=GCTTGCCGGTTCCAGGCCTAT;SOR=0.754;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=185;TCF=121;TCR=64;TR=127;WE=143090742;WS=143090724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,130:0.70:186
chr6	143091263	rs109836	A	G	4054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=39;PP=2965;SC=CTTGCTGGGCAGGAATGGCTC;SOR=1.904;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=95;TCR=39;TR=134;WE=143091271;WS=143091253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr6	143091769	rs34947356	G	A	1789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.485;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=26;PP=1298;ReadPosRankSum=-2.212;SC=TATTCTCATCGACTTTGCATA;SOR=0.949;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=106;TCF=57;TCR=49;TR=62;WE=143091777;WS=143091759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,69:0.61:114
chr6	143091952	.	C	T	2099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.465;ClippingRankSum=0.000;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.728;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=32;PP=1718;ReadPosRankSum=0.277;SC=GCTCAGAGGGCGTTTCAGTTG;SOR=0.827;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=122;TCF=74;TCR=48;TR=82;WE=143091960;WS=143091942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,83:0.67:124
chr6	143381712	rs3811093	T	C	1174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.011;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=13;PP=947;ReadPosRankSum=-1.257;SC=AGAGGTCGCATCCACACCTGG;SOR=0.968;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=71;TCF=49;TCR=22;TR=46;WE=143381720;WS=143381702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,46:0.63:73
chr6	143382110	rs7774011	T	C	1213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.175;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=11;PP=926;ReadPosRankSum=-0.644;SC=TCCTGCTGTCTTACTGCTCTA;SOR=1.011;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=43;WE=143382118;WS=143382100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,44:0.69:64
chr6	143382254	.	CGTGTGTGT	C	1263.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.807;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.136;NF=24;NR=11;PP=2045;ReadPosRankSum=1.198;SC=CCTGTGTGTGCGTGTGTGTGT;SOR=2.187;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=81;TCF=49;TCR=32;TR=35;WE=143382271;WS=143382244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,40:0.73:55
chr6	143382443	rs72986693	G	A	1889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.900;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=45;PP=1384;ReadPosRankSum=-1.118;SC=CTGGCAACTGGGGGACAAATG;SOR=0.518;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=97;TCF=27;TCR=70;TR=63;WE=143382451;WS=143382433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,69:0.68:102
chr6	143382534	rs112521955	C	CAACT	565.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=777;ReadPosRankSum=0.628;SC=GAAGAATCTTCAACAAAAGCA;SOR=2.613;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=14;WE=143382542;WS=143382524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
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chr6	143765993	rs200456994	CT	C	173.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=205;ReadPosRankSum=-1.029;SC=TTATTATTTTCTCCAAAGACA;SOR=0.634;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=7;WE=143766001;WS=143765983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr6	143766276	rs9373391	A	G	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=271;ReadPosRankSum=1.184;SC=AACTTTGGGGATTTAAAAAGT;SOR=0.536;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=15;WE=143766284;WS=143766266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr6	143772311	rs2272924	C	T	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=2.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.02;ReadPosRankSum=0.567;SOR=1.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,6:0.17:36
chr6	143784031	rs3830767	AT	A	643.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.376;NF=22;NR=10;PP=437;ReadPosRankSum=1.125;SC=GACCTTTTTTATTTTTTTTGT;SOR=0.593;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=94;TCF=63;TCR=31;TR=32;WE=143784039;WS=143784021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,37:0.35:105
chr6	143789181	rs161068	A	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=77;ReadPosRankSum=1.114;SC=AAAAAGTAAAAATAGATCTAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=6;WE=143789189;WS=143789171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr6	143792078	rs3762000	C	G	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.795;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=141;ReadPosRankSum=1.073;SC=GTACCAAATGCTTTTCTTTTC;SOR=0.283;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=10;WE=143792086;WS=143792068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr6	143806276	rs161058	A	G	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=545;ReadPosRankSum=-2.433;SC=TCATTACTGTAATGATTTTTC;SOR=0.610;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=61;TCR=20;TR=28;WE=143806284;WS=143806266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,28:0.36:78
chr6	143816859	rs8161	C	T	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.457;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=241;ReadPosRankSum=0.985;SC=TCACATTAGTCAGGGCTAGAG;SOR=3.486;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=14;WE=143816867;WS=143816849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,15:0.31:48
chr6	143823112	rs3762001	G	A	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.607;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=637;ReadPosRankSum=-0.943;SC=CGCCAGGTATGGGTTTCATAA;SOR=0.392;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=130;TCF=87;TCR=43;TR=41;WE=143823120;WS=143823102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,46:0.34:136
chr6	143823157	rs3762002	T	C	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.446;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=663;ReadPosRankSum=-1.925;SC=CAGGACCCCATTTGCCTCAGT;SOR=0.580;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=127;TCF=67;TCR=60;TR=36;WE=143823165;WS=143823147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,39:0.30:132
chr6	143823758	rs3789788	AG	CA	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=1180;ReadPosRankSum=0.190;SC=TTATACAAAAAGAAATGTCAC;SOR=0.432;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=2;TCR=52;TR=23;WE=143823767;WS=143823748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
chr6	143824972	rs9390096	A	G	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=125;ReadPosRankSum=-0.631;SC=GAAATATTTCAAGAGGTGAAG;SOR=0.430;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=12;WE=143824980;WS=143824962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,12:0.26:46
chr6	143828325	rs1569589	T	C	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.045;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=256;ReadPosRankSum=0.808;SC=AGAACAACTTTTCATTTCTTA;SOR=1.641;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=62;TCF=48;TCR=14;TR=17;WE=143828333;WS=143828315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,17:0.27:62
chr6	144032317	rs2488101	A	G	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=263;ReadPosRankSum=-1.123;SC=CCTCCAAGAAAAAACTACTGT;SOR=0.892;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=15;WE=144032325;WS=144032307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr6	144032822	rs2488102	A	T	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=4;PP=632;ReadPosRankSum=-0.170;SC=TACTTAGAATACTCTATTCCT;SOR=0.617;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=83;TCF=73;TCR=10;TR=33;WE=144032830;WS=144032812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,34:0.40:86
chr6	144076546	rs146622134	G	A	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=50;PP=1364;ReadPosRankSum=-1.667;SC=TGCCTGGTCCGTGCAGGGTAT;SOR=0.670;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=89;TCF=11;TCR=78;TR=58;WE=144076554;WS=144076536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,58:0.64:90
chr6	144081768	rs2073215	C	A	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=603;ReadPosRankSum=-0.321;SC=AAACACGACCCGAGAGGCTGG;SOR=0.591;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=29;TCR=59;TR=30;WE=144081776;WS=144081758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,30:0.34:88
chr6	144093352	rs1018463	C	T	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.685;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=150;ReadPosRankSum=-0.469;SC=CCAAGGGTTGCTCTGAGCTTC;SOR=1.071;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=10;WE=144093360;WS=144093342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr6	144104142	rs144077213	A	ATGTG	107	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=1;NR=1;PP=154;SC=CAAAAAAAGCATGTGTGTGTG;SOR=1.609;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=2;WE=144104150;WS=144104132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	144165809	rs35521359	CT	C	1140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=10.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQRankSum=-1.070;QD=11.76;ReadPosRankSum=1.151;SOR=2.676;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,65:0.67:97
chr6	144167477	rs2277078	G	A	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=212;ReadPosRankSum=1.330;SC=GATAGACCACGCCTCCACTTA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=11;WE=144167485;WS=144167467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
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chr6	144258619	rs1884087	G	A	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.40;ReadPosRankSum=-1.006;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
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chr6	144843072	.	GAT	G	106	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=28;MQ=59.8;NF=7;NR=1;PP=106;QD=14.0;SC=TATTTTAAGAGATATATATAT;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=8;WE=144843081;WS=144843062;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr6	144843092	rs11378187	T	TA	50.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=0.000;QD=2.42;ReadPosRankSum=2.463;SOR=0.035;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr6	144872272	.	G	GACACAC	116	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=116;QD=29.75;SC=TGCAAATGGTGACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=144872280;WS=144872262;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr6	145051594	rs4305737	G	A	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.833;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=839;ReadPosRankSum=1.859;SC=CCCCTGAAGAGCCAAGAAGAA;SOR=0.223;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=52;TCF=33;TCR=19;TR=38;WE=145051602;WS=145051584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,38:0.73:52
chr6	145069287	rs7756909	C	T	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=434;SC=ACTTTTTCTCCGTATTTCTCA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=145069295;WS=145069281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	145075724	rs4896740	C	T	341.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=253;ReadPosRankSum=-0.380;SC=AGAAGGGGTCCAAGGGGTCTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=9;WE=145075732;WS=145075714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr6	145075963	rs17074126	A	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=1.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.88;ReadPosRankSum=-0.714;SOR=0.410;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,14:0.16:85
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chr6	145076046	.	CCT	GCA	775	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=14;PP=775;QD=59.1762767759;SC=TTAGATAGATCCTTGTAAGGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=14;WE=145076056;WS=145076036;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr6	145076048	rs4243473	T	A	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.18;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	145079033	rs17074128	A	G	1896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.061;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=39;PP=1461;ReadPosRankSum=0.136;SC=TTGGTTTCCAACGTTTCCAAT;SOR=0.588;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=223;TCF=122;TCR=101;TR=82;WE=145079041;WS=145079023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,83:0.35:234
chr6	145079197	rs9283116	T	C	1818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=46;PP=1569;SC=GAGGCTTCTCTCCCCATAACT;SOR=6.556;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=47;TCF=1;TCR=46;TR=47;WE=145079205;WS=145079187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	145093052	rs80110270	A	G	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=200;ReadPosRankSum=-1.198;SC=GCCATCAAACACAGACCACCT;SOR=0.746;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=64;TCF=32;TCR=32;TR=20;WE=145093060;WS=145093042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,21:0.32:66
chr6	145095545	rs200287385	GT	G	143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=1.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.34;ReadPosRankSum=-0.252;SOR=0.231;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr6	145103215	rs10499236	C	T	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.466;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=32;PP=812;ReadPosRankSum=2.073;SC=ACGTTCCACTCTGTGTTGATA;SOR=0.457;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=137;TCF=41;TCR=96;TR=47;WE=145103223;WS=145103205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,50:0.35:142
chr6	145114935	rs4243475	A	G	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=555;ReadPosRankSum=0.514;SC=AACATGGTAGACAGATGAAAG;SOR=0.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=105;TCF=66;TCR=39;TR=36;WE=145114943;WS=145114925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,38:0.36:107
chr6	145120662	rs78815199	T	C	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=317;ReadPosRankSum=-0.338;SC=ACATTTGGAGTATCTGGTAGA;SOR=0.862;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=71;TCF=14;TCR=57;TR=20;WE=145120670;WS=145120652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,21:0.29:72
chr6	145124151	rs9399503	A	G	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.941;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=365;ReadPosRankSum=-0.814;SC=AAGCCAATAAATTTTCTTTTG;SOR=0.256;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=17;WE=145124159;WS=145124141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr6	145124295	rs59277223	C	A	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.874;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=195;ReadPosRankSum=0.310;SC=TGAGTACTAACCCACTGTTTT;SOR=1.739;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=13;WE=145124303;WS=145124285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,13:0.28:47
chr6	145141944	rs17074279	G	A	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=6.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=328;ReadPosRankSum=0.764;SC=AATTTACATCGGCTCTGATTT;SOR=0.169;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=65;TCR=0;TR=19;WE=145141952;WS=145141934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,20:0.29:68
chr6	145148690	rs2066054	A	C	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=4.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.50;ReadPosRankSum=0.174;SOR=0.272;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,29:0.26:113
chr6	145162001	rs4895657	A	G	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.226;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=221;ReadPosRankSum=-1.536;SC=CCACAGCTGCACGTGTTCCTT;SOR=1.800;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=52;TCF=13;TCR=39;TR=15;WE=145162009;WS=145161991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,15:0.28:53
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chr6	145167775	.	G	GAA	716.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=359;ReadPosRankSum=0.831;SC=ATTAAGCCAGGAAAAAAAAAA;SOR=0.359;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=68;TCF=67;TCR=1;TR=25;WE=145167783;WS=145167765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
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chr6	146007166	rs702322	G	A	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=475;SC=CCCAAGTGAGGCACTGCAGTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=146007174;WS=146007156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	146007332	rs35230590	C	T	1899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.817;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=29;PP=1352;ReadPosRankSum=0.655;SC=CATTGGTGTGCCCAGTGGCCT;SOR=0.560;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=99;TCF=58;TCR=41;TR=66;WE=146007340;WS=146007322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,70:0.69:102
chr6	146012061	rs2142978	T	C	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=5;PP=601;SC=CAAGATAGAATCATGGAAATT;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=146012069;WS=146012051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr6	146056476	rs2235482	G	C	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=49;PP=1134;SC=GCTCCTGCAGGGCCAGGGCCC;SOR=6.399;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=2;TCR=49;TR=51;WE=146056484;WS=146056466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	146112348	rs6931553	T	C	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=58.95;NF=4;NR=12;PP=365;SC=GGCCTCCAGGTCTGTGACAGG;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=146112356;WS=146112338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	146234644	rs9497426	G	A	1180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=21;PP=907;SC=CACAGATTGGGCAAGGTTCTG;SOR=0.843;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=39;TCF=18;TCR=21;TR=38;WE=146234652;WS=146234634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	146242676	rs11326222	GT	G	591.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=389;SC=AATTTGGCCAGTTTTTTTTTT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=24;WE=146242684;WS=146242666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr6	146243581	rs6917482	C	T	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=13;PP=419;SC=TTTTTCTTTCCACTAGATATG;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=146243589;WS=146243571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	146244743	rs6923545	A	G	1966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=7;PP=1601;ReadPosRankSum=-0.588;SC=TGCTTTTAAAATTATGAGTAG;SOR=2.448;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=56;TCF=49;TCR=7;TR=54;WE=146244751;WS=146244733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr6	146254100	rs55757353	T	TC	218.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=162;SC=GGGGGAAAAATCCCCCCCCCA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=146254108;WS=146254097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr6	146262697	rs9285508	G	T	5226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=123;NR=43;PP=2965;SC=ACTACTCAAGGTCCCCTAATT;SOR=2.233;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=123;TCR=43;TR=166;WE=146262705;WS=146262687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr6	146268623	rs9386141	T	A	2481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=12;PP=2050;ReadPosRankSum=0.577;SC=TACTATACCCTCCTACCTCGG;SOR=2.007;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=64;TCR=12;TR=74;WE=146268631;WS=146268613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,77:0.99:78
chr6	146273769	rs9386142	C	T	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=79;SC=ATTTCCCCCACGTGTTTCATT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=146273777;WS=146273759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	146480740	rs72225459	TTC	T	163.76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=6;PP=269;SC=GAAGGTAAGTTTCTCTCTCTC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=6;WE=146480749;WS=146480730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	146678929	rs362893	T	C	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=3.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.053;NF=1;NR=14;PP=361;ReadPosRankSum=0.029;SC=CATAACTGTCTAGAAAGGGTG;SOR=0.638;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=15;WE=146678937;WS=146678919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr6	146678952	rs362894	A	G	321.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.52;BaseQRankSum=-2.771;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.949;NF=1;NR=7;PP=423;ReadPosRankSum=-0.457;SC=CCAGGCTTACAGTTTTGGCTC;SOR=0.346;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=8;WE=146678961;WS=146678942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr6	146678953	rs35301667	G	GT	312.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.52;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.949;NF=1;NR=6;PP=424;ReadPosRankSum=-0.457;SC=CAGGCTTACAGTTTTGGCTCT;SOR=0.346;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=146678961;WS=146678942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr6	146720887	.	T	TTC	68.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQRankSum=-0.765;QD=7.64;ReadPosRankSum=1.309;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr6	146755132	rs2941	G	A	3512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=2.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.52;ReadPosRankSum=-0.389;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,128:0.71:180
chr6	146755140	rs2942	G	A	7098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.33;SOR=1.218;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr6	146755324	rs6923492	T	C	3320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.365;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=57;PP=2860;ReadPosRankSum=-0.781;SC=GCCTCTGCCGTCCCACCTGAC;SOR=0.513;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=103;TCF=46;TCR=57;TR=102;WE=146755332;WS=146755314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
chr6	146755515	rs6923864	T	G	3780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=59;NR=45;PP=2965;SC=CAGGCCCCGGTGGTCCCGGGA;SOR=0.927;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=59;TCR=45;TR=104;WE=146755523;WS=146755505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr6	146755560	rs1047006	T	G	2682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=33;PP=2026;ReadPosRankSum=-0.005;SC=CCCCGCCACCTCCGCAGCACC;SOR=0.797;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=155;TCF=103;TCR=52;TR=102;WE=146755568;WS=146755550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,107:0.66:163
chr6	146755842	rs9373491	C	A	5158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=93;PP=2965;SC=CCAGCTCCCCCGTGTCCGAGT;SOR=1.463;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=53;TCR=93;TR=146;WE=146755850;WS=146755832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr6	146920271	rs74468352	C	T	3386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.142;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=75;PP=2561;ReadPosRankSum=0.234;SC=TCTGCCTGTCCGTCCCTCCCC;SOR=1.051;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=193;TCF=76;TCR=117;TR=119;WE=146920279;WS=146920261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,126:0.62:204
chr6	146921421	rs75395649	C	A	1551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.078;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=12;PP=1054;ReadPosRankSum=0.467;SC=CTTCTGTGTACCAAAGTCAGG;SOR=0.999;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=79;TCF=58;TCR=21;TR=52;WE=146921429;WS=146921411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,58:0.67:87
chr6	146975456	rs71778473	TTA	T	3320.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.224;NF=2;NR=71;PP=2993;ReadPosRankSum=1.658;SC=AGTTTTGGTATTATATATATA;SOR=2.517;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=116;TCF=5;TCR=111;TR=73;WE=146975467;WS=146975446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,94:0.99:95
chr6	146987930	rs9403802	C	T	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=347;ReadPosRankSum=-2.123;SC=CTACCTGTAACATTATGCATG;SOR=0.628;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=79;TCR=15;TR=25;WE=146987938;WS=146987920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,22:0.23:96
chr6	147042695	rs11273150	A	AGGGAACATGCAATAATAAGATTTTTAGAGGC	2834.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.17;QD=57.85;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	147047341	rs3747754	T	C	2436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=51;PP=1899;SC=CCAGTAAGTATTTTTGCAACA;SOR=1.905;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=20;TCR=51;TR=71;WE=147047349;WS=147047331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr6	147049641	rs11155480	T	A	1314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=1;PP=1085;SC=TTTTAACAGATATTAATTTGT;SOR=5.084;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=36;WE=147049649;WS=147049631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	147049899	rs1327669	T	C	1871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=55;PP=1440;SC=TGGGATACAATGTTCAGAAGA;SOR=3.007;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=9;TCR=55;TR=64;WE=147049907;WS=147049889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr6	147054241	rs146394886	A	ATTAATGTAC	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=2983;SC=TATAAAAAAAATTTATGTGTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=147054249;WS=147054231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	147054410	rs67991595	T	TA	1041.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=27;PP=1313;SC=GAATTGTATATATTTAATCAA;SOR=4.479;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=28;WE=147054418;WS=147054400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	147054450	rs3761782	A	C	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=17;PP=519;SC=AAGGTAAATAATTTAAGAAAT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=147054458;WS=147054440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	147054498	rs3761783	G	C	220.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=181;SC=TGTGTGGACTGTCATGGAGTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=147054506;WS=147054488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	147062220	rs1327666	C	T	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=168;SC=TAAGAATTCACATCAAGGGAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=147062228;WS=147062210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	147066954	rs9647636	G	A	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=1;PP=625;SC=CTTGGGACCTGTAGGTATATC;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=147066962;WS=147066944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	147067093	rs9647637	C	T	3788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=57;PP=2893;SC=CATTTACAGGCGACACATATG;SOR=0.828;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=117;TCF=60;TCR=57;TR=116;WE=147067101;WS=147067083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr6	147073639	rs140827988	TATA	T	2379.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=6;PP=1994;SC=CATACTTGCTTATAATGTTAA;SOR=3.651;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=40;TCR=7;TR=42;WE=147073649;WS=147073629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr6	147084985	rs7752601	T	C	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=458;SC=TAGTCAGTAATAACTATGTAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=147084993;WS=147084975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	147103416	rs259405	C	T	2075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=61;PP=1746;SC=AGGACAAAACCGTGAAACATT;SOR=8.287;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=0;TCR=61;TR=61;WE=147103424;WS=147103406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr6	147631201	rs6928919	A	G	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=420;ReadPosRankSum=0.286;SC=AATAATCTTAATATGTATTTT;SOR=0.429;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=59;TCF=56;TCR=3;TR=20;WE=147631209;WS=147631191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,20:0.32:62
chr6	147635318	rs5880705	T	TAC	164.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=18.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.49;ReadPosRankSum=0.590;SOR=0.380;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr6	147635385	rs1039083	C	G	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=4.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.00;ReadPosRankSum=-1.012;SOR=0.276;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,18:0.25:73
chr6	147635413	rs1039084	A	G	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=1.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.731;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,17:0.21:81
chr6	147635547	rs1039085	C	T	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=93;ReadPosRankSum=1.933;SC=TGTTAACTTACTGGACAGGTA;SOR=1.085;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=6;WE=147635555;WS=147635537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr6	147680359	rs9390459	A	G	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.197;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=776;ReadPosRankSum=0.558;SC=CCCCTTGTCTATGGGTTGGAA;SOR=0.507;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=150;TCF=67;TCR=83;TR=47;WE=147680367;WS=147680349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,48:0.30:158
chr6	147830073	rs66812182	C	T	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.736;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=526;ReadPosRankSum=0.525;SC=CCATGTGCACCAACATAGTTT;SOR=0.221;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=84;TCF=68;TCR=16;TR=31;WE=147830081;WS=147830063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,34:0.39:88
chr6	148051229	.	G	A	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.800;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=63.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQRankSum=-6.762;QD=5.02;ReadPosRankSum=0.874;SOR=6.517;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,25:0.26:98
chr6	148051234	.	G	A	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.207;ClippingRankSum=0.000;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=62.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQRankSum=-7.114;QD=4.24;ReadPosRankSum=-2.765;SOR=6.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,24:0.22:109
chr6	148051242	.	G	A	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.551;ClippingRankSum=0.000;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=29.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQRankSum=-8.093;QD=2.78;ReadPosRankSum=-4.289;SOR=5.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,12:0.10:115
chr6	148664404	rs55914407	G	A	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=5.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.12;ReadPosRankSum=-1.256;SOR=0.298;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,34:0.26:132
chr6	148701197	rs4897000	A	G	951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=28;PP=839;SC=ACCAAGAAACAGTTGCTTCAA;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=148701205;WS=148701187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	148789478	rs17714869	T	C	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=296;ReadPosRankSum=-0.820;SC=CGAGTGAGTCTTTAATAAATG;SOR=0.576;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=14;WE=148789486;WS=148789468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
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chr6	148869370	rs17643290	G	A	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=379;ReadPosRankSum=0.173;SC=TTAGACATACGCGAAGTAGTC;SOR=0.833;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=72;TCF=64;TCR=8;TR=22;WE=148869378;WS=148869360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,23:0.32:73
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chr6	149340390	rs2275423	G	C	5459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=129;PP=2965;ReadPosRankSum=1.400;SC=CTAAAGCAGGGTCATGGCATG;SOR=1.540;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=164;TCF=34;TCR=130;TR=163;WE=149340398;WS=149340380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,167:0.99:168
chr6	149700805	rs2031450	G	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=128;ReadPosRankSum=-0.596;SC=AGTATTATATGTATATACATT;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=10;WE=149700813;WS=149700795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
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chr6	149721690	rs237025	G	A	4915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=71;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.218;SC=GGGATTGTCAGTGAAGCAGAT;SOR=0.710;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=254;TCF=154;TCR=100;TR=180;WE=149721698;WS=149721680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,180:0.70:257
chr6	149772645	rs415434	A	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.851;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.91;ReadPosRankSum=-1.337;SOR=0.031;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
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chr6	149780737	rs140859	G	GACTA	2213.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.547;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=5;PP=2242;ReadPosRankSum=-0.384;SC=AAATCGGGATGACTAACAGGT;SOR=1.689;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=80;TCF=68;TCR=12;TR=42;WE=149780745;WS=149780727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,55:0.73:75
chr6	149782798	rs411091	G	A	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=88;ReadPosRankSum=0.355;SC=TAGGTGCTAGGGCTATGGCAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=149782806;WS=149782788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr6	149782847	rs411308	G	A	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.058;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=320;ReadPosRankSum=-0.189;SC=AGCTTATAGCGCAGTGAGGAA;SOR=2.461;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=15;WE=149782855;WS=149782837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr6	149782908	rs376757	A	G	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.908;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=8;PP=858;ReadPosRankSum=-0.018;SC=TATCGATGTTAGAAGTGCACC;SOR=1.295;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=40;WE=149782916;WS=149782898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,46:0.72:64
chr6	149795261	rs382720	T	C	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=233;ReadPosRankSum=-1.343;SC=ATTCAAAGCCTGATCCGTTGG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=11;WE=149795269;WS=149795251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr6	149862457	rs73781224	A	G	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=4.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.78;ReadPosRankSum=0.019;SOR=2.133;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr6	149893214	rs140440002	A	AAAAT	127.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=1;PP=92;ReadPosRankSum=-0.000;SC=AGACTCTCAAAAAATAAATAA;SOR=0.693;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=2;WE=149893222;WS=149893206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr6	149918522	rs118032623	G	T	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.336;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=446;ReadPosRankSum=1.167;SC=AACTAGTACTGTAAAGGAAGA;SOR=1.697;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=19;WE=149918530;WS=149918512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr6	149953835	rs9322202	A	G	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=2;PP=603;SC=CCTCCTCCTAAATATAATCAA;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=149953843;WS=149953825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr6	150064968	rs58509133	C	CT	1215.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=26;PP=1205;SC=AGCAAAGAGCCATGAGTGCTA;SOR=4.615;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=27;WE=150064976;WS=150064958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
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chr6	150322381	rs9384023	T	A	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.185;NF=7;NR=17;PP=475;ReadPosRankSum=0.351;SC=CTCCTCAACCTCTTGGGTGAC;SOR=0.678;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=24;WE=150322389;WS=150322371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr6	150322408	rs11752135	T	A	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.286;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.270;NF=5;NR=14;PP=354;ReadPosRankSum=1.011;SC=TTCTGATTTATTTTTTACAGG;SOR=1.634;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=19;WE=150322416;WS=150322398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr6	150341990	rs9397120	A	G	8283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.80;QD=44.78;SOR=1.955;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
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chr6	150343148	rs78563624	A	C	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.42;QD=27.11;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	150343211	rs202055124	A	G	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.02;QD=28.14;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr6	150346740	rs1544123	A	G	1449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=38;PP=1202;SC=AGTCACCTCGATTCTGAAAAG;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=43;WE=150346748;WS=150346730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr6	150385730	rs912558	T	G	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=3;PP=551;ReadPosRankSum=-0.195;SC=CCTGTCACTCTAAATGACTCT;SOR=0.523;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=74;TCF=66;TCR=8;TR=31;WE=150385738;WS=150385720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,32:0.41:78
chr6	150385886	rs9478409	C	T	2767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=6.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.237;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=67;PP=2165;ReadPosRankSum=-0.369;SC=CTCTTGTCCACGCTCCAAATC;SOR=0.347;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=172;TCF=50;TCR=122;TR=99;WE=150385894;WS=150385876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,106:0.58:182
chr6	150385977	rs912557	C	T	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.458;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=500;ReadPosRankSum=-0.881;SC=GTGGGGCAGCCGCTGTGACAG;SOR=0.146;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=24;WE=150385985;WS=150385967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr6	150387302	rs669009	A	T	4804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.90;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr6	150387312	rs6935471	A	G	4732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.03;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr6	150390313	rs622317	G	C	1076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=34;PP=875;SC=GGCCCCGTCCGGTCCCGTCCC;SOR=3.967;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=38;WE=150390321;WS=150390303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	150464356	rs2297672	A	G	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.193;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=181;ReadPosRankSum=1.378;SC=CAGCAGCGAGACGGCCGGCGG;SOR=0.061;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=10;WE=150464364;WS=150464346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr6	150535866	rs117656601	C	T	2901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=16;PP=2257;ReadPosRankSum=-0.339;SC=TCATATCCTCCCACTGCCCCC;SOR=0.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=116;TCR=23;TR=98;WE=150535874;WS=150535856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,100:0.71:140
chr6	150713769	rs672766	C	T	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=454;SC=GGAGGAATTACGGAAGTTAAG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=150713777;WS=150713759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	150716696	rs612421	T	C	2950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=90;PP=2381;SC=CTCACAAGGCTGCCCAGGTGC;SOR=3.788;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=13;TCR=90;TR=103;WE=150716704;WS=150716686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr6	150921346	rs139317884	A	G	34.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr6	151116876	rs67415110	CAT	C	94.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=144;ReadPosRankSum=0.564;SC=AAACAAAAAACATATATATAT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=4;WE=151116885;WS=151116866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr6	151121760	rs2073062	T	C	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.72;ReadPosRankSum=-0.752;SOR=0.253;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,10:0.20:51
chr6	151121915	rs2073061	G	A	1360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.971;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=34;PP=894;ReadPosRankSum=-0.610;SC=TCTTCAGGGAGCGTCAGGAAA;SOR=0.377;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=170;TCF=61;TCR=109;TR=59;WE=151121923;WS=151121905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,62:0.35:178
chr6	151125723	rs35118684	AC	A	560.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=3.066;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.56;ReadPosRankSum=0.194;SOR=1.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,37:0.30:123
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chr6	151152257	rs926624	A	G	4476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=78;PP=2965;SC=AGGACTTAAAACTAATGGTTG;SOR=1.069;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=54;TCR=78;TR=132;WE=151152265;WS=151152247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr6	151152656	rs803411	T	C	4625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=70;PP=2965;SC=ATCAGGCCACTCCCGATCATG;SOR=0.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=71;TCR=70;TR=140;WE=151152664;WS=151152646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr6	151197152	rs2073067	C	G	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=11;PP=534;ReadPosRankSum=0.137;SC=GGAACTTTCACAGAAAATGTG;SOR=0.783;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=25;TCR=20;TR=25;WE=151197160;WS=151197142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr6	151198895	rs2073064	T	C	1412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=18;PP=949;ReadPosRankSum=0.231;SC=AATAACCTTGTGTTCCTTTTT;SOR=0.680;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=45;TCR=25;TR=50;WE=151198903;WS=151198885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,55:0.72:76
chr6	151199071	rs2073063	A	G	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=321;ReadPosRankSum=-1.511;SC=TTTGCTTGTGACTGAATGTTA;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=14;WE=151199079;WS=151199061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr6	151220245	rs803419	A	G	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=96;ReadPosRankSum=-0.893;SC=AATATCTTTGATATTTTCTTC;SOR=0.129;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=8;WE=151220253;WS=151220235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,9:0.26:35
chr6	151233641	rs6913453	G	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=195;ReadPosRankSum=-0.815;SC=GCAGAGCCGAGATGGCATGAA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=9;WE=151233649;WS=151233631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr6	151243234	rs2295084	C	T	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.402;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=4;PP=691;ReadPosRankSum=1.450;SC=TTGTGCGACTCGATAATCTTG;SOR=1.085;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=111;TCF=94;TCR=17;TR=35;WE=151243242;WS=151243224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,35:0.32:111
chr6	151243467	rs9478857	G	A	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=6.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.405;SOR=1.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,20:0.23:88
chr6	151247439	rs803455	A	G	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.088;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=447;ReadPosRankSum=-0.278;SC=TGGGTAAGACACCATCTAACA;SOR=0.892;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=63;TCF=17;TCR=46;TR=25;WE=151247447;WS=151247429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,26:0.39:66
chr6	151266504	rs803445	C	T	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=0;PP=935;SC=CTAAATAGTTCGGTTATAAAT;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=31;WE=151266512;WS=151266494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	151266564	rs2073191	T	C	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=463;ReadPosRankSum=0.174;SC=CATGGACAACTAACTTTTGTG;SOR=1.005;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=20;WE=151266572;WS=151266554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr6	151281567	rs1771798	T	C	3168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=63;PP=2551;SC=TGTTTCCAACTCGGAAGCTTC;SOR=1.538;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=32;TCR=64;TR=95;WE=151281575;WS=151281557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr6	151281668	rs7739248	T	C	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.531;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=632;ReadPosRankSum=1.652;SC=AGAAAAAGTTTCCACACACAC;SOR=1.835;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=26;WE=151281676;WS=151281658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr6	151281707	rs1771796	A	G	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=546;SC=ATGTTTGCCTAACTGCTTCCT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=151281715;WS=151281697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	151286224	rs1627462	A	C	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=30;PP=818;ReadPosRankSum=-0.770;SC=GGATTGCCACACAATGTGAAC;SOR=0.726;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=150;TCF=62;TCR=88;TR=50;WE=151286232;WS=151286214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,51:0.33:153
chr6	151293277	rs9478878	C	A	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=309;ReadPosRankSum=0.328;SC=TGATATCCATCCTGACATGAA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=16;WE=151293285;WS=151293267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr6	151336313	rs6910091	T	G	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5021;FS=8.846;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=456;ReadPosRankSum=-0.303;SC=GAAGTGAAATTTATATATAGT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=20;WE=151336321;WS=151336303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,20:0.87:23
chr6	151336739	rs509474	C	G	3205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.620;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=74;PP=2414;ReadPosRankSum=-0.895;SC=ATCACTGGTCCGTTGGTGGAA;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=171;TCF=64;TCR=107;TR=117;WE=151336747;WS=151336729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,123:0.69:177
chr6	151362895	rs140096864	CTTG	C	3027.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=40;PP=2719;SC=GAAAGCCCCTCTTGTTGTGTC;SOR=1.385;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=63;TCF=18;TCR=45;TR=58;WE=151362905;WS=151362885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr6	151362942	rs1983750	T	C	1668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=40;PP=1403;SC=CTGGCTCTAGTTGGAGAATCC;SOR=3.398;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=8;TCR=40;TR=48;WE=151362950;WS=151362932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	151626774	rs9397388	T	G	1389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=38;NR=1;PP=1135;SC=AACTTCCTTTTCTCTGTATTT;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=39;WE=151626782;WS=151626764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	151627034	rs2294792	A	G	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=40;PP=1267;SC=TCATTGTCACAGAGGGTAAGC;SOR=3.080;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=46;WE=151627042;WS=151627024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	151627096	rs2294793	C	T	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=16;PP=404;SC=ACTTTGGACTCAGCAGAAAAT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=151627104;WS=151627086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	151665302	rs6941075	T	A	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=251;SC=TGGGTTTTTCTTGAAATCTTC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=151665310;WS=151665292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	151669459	rs376944975	CAAAA	C	1306.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=8.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQRankSum=-0.848;QD=32.67;ReadPosRankSum=-0.058;SOR=3.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,36:0.90:40
chr6	151669875	rs10872670	A	G	2006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=13;PP=1634;SC=AGATGTGAGCAAAAGAGACTC;SOR=2.964;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=58;TCR=13;TR=71;WE=151669883;WS=151669865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
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chr6	151674116	rs3842128	T	TGAG	14375.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=60.06;NF=120;NR=109;PP=2924;SC=GTGTAGCAATTGAGGATTTAG;SOR=1.121;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=275;TCF=142;TCR=133;TR=229;WE=151674124;WS=151674106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr6	151674326	rs3823310	A	C	4845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=101;PP=2965;SC=AAGGAGAGGAACCTCAGGCCT;SOR=2.039;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=38;TCR=101;TR=139;WE=151674334;WS=151674316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr6	151686905	rs11155787	C	T	8453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=158;PP=2965;SC=GACTCCCTTCCTCAAATGTGC;SOR=1.375;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=250;TCF=92;TCR=158;TR=250;WE=151686913;WS=151686895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr6	151742541	rs4870017	T	C	1288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=31;PP=1010;SC=AAATCTGAAGTGGCATAATTT;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=42;WE=151742549;WS=151742531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	151748510	.	CA	C	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.66;MQRankSum=0.386;QD=2.04;ReadPosRankSum=-0.047;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr6	151857370	rs1532401	T	C	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.961;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=6;PP=901;ReadPosRankSum=-0.074;SC=TGCTTCTGCCTTTAATCTGGC;SOR=0.173;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=65;TCF=58;TCR=7;TR=42;WE=151857378;WS=151857360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,46:0.67:69
chr6	151857594	rs6931664	A	G	1686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.008;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=48;PP=1311;ReadPosRankSum=-0.194;SC=AAGATAATGCATTTCCAGCAC;SOR=0.969;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=96;TCF=26;TCR=70;TR=65;WE=151857602;WS=151857584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,65:0.68:96
chr6	151859146	rs71677524	GT	G	585.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=13.482;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-1.053;QD=6.44;ReadPosRankSum=0.666;SOR=0.044;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,40:0.44:91
chr6	151859314	rs4870034	A	G	3742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.722;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=68;PP=2962;ReadPosRankSum=0.777;SC=GAGTTCAGGAACTAGAAGAAG;SOR=0.580;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=205;TCF=95;TCR=110;TR=129;WE=151859322;WS=151859304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,131:0.62:211
chr6	151869645	rs3734803	G	A	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.693;NF=6;NR=17;PP=374;ReadPosRankSum=0.948;SC=TGAAGTATACGTGTGCATCTG;SOR=0.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=71;TCF=19;TCR=52;TR=23;WE=151869653;WS=151869635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,26:0.34:76
chr6	151869725	rs3842129	A	AT	429.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.656;NF=0;NR=16;PP=314;ReadPosRankSum=0.382;SC=ACTGATTACGATTTTTTTTAT;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=16;WE=151869733;WS=151869715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr6	151894278	rs4242277	G	T	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=351;SC=ACTTCTAATGGTATTGTCTTC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=151894286;WS=151894268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	151894340	rs12205837	C	T	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=131;ReadPosRankSum=-0.161;SC=GCAAAAGAAGCTCTTGAAAGG;SOR=0.473;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=10;WE=151894348;WS=151894330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr6	151894505	rs953767	T	C	3452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=51;PP=2697;SC=AGCCAGTACTTCTCATTTAGG;SOR=0.808;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=54;TCR=51;TR=104;WE=151894513;WS=151894495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr6	151894716	rs1807906	G	A	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=84;ReadPosRankSum=0.247;SC=CTATTCTCACGCTGCTATAAG;SOR=0.741;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=7;WE=151894724;WS=151894706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr6	151914113	rs3757318	G	A	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=390;SC=GTCAGAGTCCGTGCTCCGTTC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=151914121;WS=151914104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	151914421	rs9383930	A	G	3376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=67;PP=2650;ReadPosRankSum=0.970;SC=GAAAGGTAGGAGATATTGAAA;SOR=0.680;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=38;TCR=68;TR=105;WE=151914429;WS=151914411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,108:0.99:109
chr6	151917660	rs34430497	G	A	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.617;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=30;PP=677;ReadPosRankSum=-0.830;SC=AACACGTGTCGAGACTTGCAC;SOR=1.172;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=134;TCF=48;TCR=86;TR=42;WE=151917668;WS=151917650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,45:0.32:141
chr6	151936677	rs6929137	G	A	4900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=71;PP=2965;ReadPosRankSum=1.806;SC=GCTCATGTCTGTCAAGTCAGA;SOR=0.334;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=162;TCF=90;TCR=72;TR=159;WE=151936685;WS=151936667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,163:0.99:164
chr6	151939181	rs3734804	G	A	2336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=39;PP=1720;SC=TGAAAGATTGGTCCATTCACA;SOR=0.955;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=72;TCF=32;TCR=40;TR=71;WE=151939189;WS=151939171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr6	152129077	rs2077647	T	C	7540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=145;NR=94;PP=2965;SC=CCAAAGCATCTGGGATGGCCC;SOR=1.193;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=239;TCF=145;TCR=94;TR=239;WE=152129085;WS=152129067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr6	152201875	rs4986934	T	C	2100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=48;PP=1701;SC=GCCGGCTCCGTAAATGCTACG;SOR=2.494;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=16;TCR=48;TR=64;WE=152201883;WS=152201865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr6	152265282	rs55740371	A	AT	766.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=4.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=2.080;QD=5.99;ReadPosRankSum=-1.489;SOR=1.335;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,41:0.32:128
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chr6	152420095	rs2228480	G	A	1378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=34;PP=1086;ReadPosRankSum=-0.443;SC=TCCCTGCCACGGTCTGAGAGC;SOR=0.655;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=86;TCF=29;TCR=57;TR=52;WE=152420103;WS=152420085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,55:0.60:91
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chr6	152461061	rs3818110	G	A	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.67;MQRankSum=0.641;NF=12;NR=1;PP=569;ReadPosRankSum=0.404;SC=TTTGTCCGCCGTGGGAAAGGC;SOR=1.292;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=13;WE=152461069;WS=152461039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr6	152462172	rs140264845	AAAAC	A	608.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.425;NF=13;NR=0;PP=491;ReadPosRankSum=0.748;SC=TCCGCCTCAAAAAACAAACAA;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=13;WE=152462183;WS=152462162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr6	152464839	rs2256135	A	G	1433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.927;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=26;PP=1053;ReadPosRankSum=0.426;SC=GTATCTGAAAACGGCTATCAT;SOR=0.536;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=77;TCF=41;TCR=36;TR=54;WE=152464847;WS=152464829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,56:0.70:80
chr6	152466582	rs2813487	A	G	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.196;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=400;ReadPosRankSum=-1.072;SC=ATTGCTATACAGGGGAGGGAG;SOR=0.141;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=24;WE=152466590;WS=152466572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,25:0.76:33
chr6	152466674	rs2747662	T	C	1649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.943;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=1203;ReadPosRankSum=1.111;SC=CCTCAGGGCTTTCGGGGATCA;SOR=0.446;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=80;TCF=41;TCR=39;TR=56;WE=152466682;WS=152466664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,60:0.70:86
chr6	152469188	rs2252755	C	G	1977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.743;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=31;PP=1629;ReadPosRankSum=0.928;SC=ACCTGATAAGCCAACAGCTCC;SOR=0.862;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=115;TCF=61;TCR=54;TR=74;WE=152469196;WS=152469178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,73:0.65:113
chr6	152469331	rs2252748	C	T	1836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.795;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=39;PP=1393;ReadPosRankSum=-1.981;SC=CCACACTAGCCGGGGTGTCTC;SOR=1.043;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=107;TCF=47;TCR=60;TR=64;WE=152469339;WS=152469321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,68:0.61:112
chr6	152489037	rs997389	TT	GC	11973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=83;PP=2947;SC=ATTAACCTTTTTGTCCAGCTC;SOR=1.183;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=248;TCF=155;TCR=93;TR=233;WE=152489046;WS=152489027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr6	152489294	rs998147	T	C	4354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=136;PP=2965;SC=TCCACACAGCTGTCCTCTGCC;SOR=3.884;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=17;TCR=136;TR=153;WE=152489302;WS=152489284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr6	152522812	rs2673776	T	G	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=317;ReadPosRankSum=0.748;SC=GCCATACAAGTTTCACCTGAG;SOR=0.154;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=69;TCR=0;TR=19;WE=152522820;WS=152522802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,21:0.28:74
chr6	152523143	rs2635441	G	A	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=35;ReadPosRankSum=1.645;SC=ACTGGGGGGGGAAAAGAAAAG;SOR=0.465;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=4;WE=152523151;WS=152523133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr6	152534946	rs684807	T	A	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=34;PP=920;SC=TTATTCTTACTTCTCTAGCAT;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=152534954;WS=152534936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	152539350	rs9371243	C	G	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=8;PP=1305;ReadPosRankSum=-0.798;SC=TTTTTGAAGACAGATGGTAAA;SOR=0.996;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=75;TCF=64;TCR=11;TR=57;WE=152539358;WS=152539340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,57:0.75:76
chr6	152539572	rs35809482	TA	T,TAA	1440.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.060;NF=2,2;NR=64,64;PP=99,707;ReadPosRankSum=0.508;SC=GTATTTCAGTTAAAAAAAAAA;SOR=2.698;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=81;TCF=3;TCR=78;TR=66,66;WE=152539580;WS=152539562;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.79,0.18:73
chr6	152540278	rs2147377	A	C	1355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=27;PP=1052;SC=TCATGGAGAAAAAAGAGGGAA;SOR=1.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=38;WE=152540286;WS=152540268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	152542234	rs9397492	G	T	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.981;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=562;ReadPosRankSum=-0.735;SC=CACCAAATGTGGATATGTGCT;SOR=0.368;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=25;WE=152542242;WS=152542224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr6	152542548	rs9383976	A	G	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.075;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=5;PP=1224;ReadPosRankSum=-1.469;SC=TGTAAAGTTAACATACTCCAT;SOR=1.467;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=78;TCF=68;TCR=10;TR=51;WE=152542556;WS=152542538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,54:0.67:81
chr6	152545865	rs17082358	T	C	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=216;ReadPosRankSum=0.574;SC=ATATATTCAATTGATGGGAAA;SOR=0.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=12;WE=152545873;WS=152545855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,12:0.27:45
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chr6	152552375	rs2274142	G	A	985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=0;PP=846;SC=CAGGTTAAAGGAAGTTTAGGG;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=152552383;WS=152552365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr6	152631256	rs11292345	CA	C	299.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5042;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.625;NF=0;NR=14;PP=149;ReadPosRankSum=1.121;SC=AAACATTTTGCAAAAAAAAAA;SOR=2.531;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=14;WE=152631264;WS=152631246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr6	152638209	rs1890100	A	G	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.287;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=169;ReadPosRankSum=0.967;SC=TGGACACAACAGTCTTAGGGG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=8;WE=152638217;WS=152638199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr6	152647681	rs2306916	A	T	3598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=64;PP=2816;SC=AGCTGTAACAATTCTTGGGCA;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=49;TCR=64;TR=113;WE=152647689;WS=152647671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr6	152652034	rs6911096	A	T	4866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=88;PP=2965;SC=TGAAGCTCAGAACTCTCATTC;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=61;TCR=88;TR=149;WE=152652042;WS=152652024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr6	152653037	rs9478314	T	C	1670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.171;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=52;PP=1216;ReadPosRankSum=0.185;SC=TGAAAATACATGGAAAGGTAT;SOR=0.315;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=89;TCF=15;TCR=74;TR=65;WE=152653045;WS=152653027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,70:0.72:97
chr6	152658142	rs9479297	T	C	2047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=44;PP=1680;SC=CTGGACAAGCTTTTGTTCAAT;SOR=2.019;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=60;WE=152658150;WS=152658132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr6	152658191	rs9479298	T	C	1345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=27;PP=749;SC=CAACCATACATGGAAACATTT;SOR=2.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=33;WE=152658199;WS=152658181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	152658216	rs9479299	A	G	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=14;PP=474;SC=TTAATGAATCAGAGATGGAAC;SOR=1.931;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=152658224;WS=152658206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	152660310	rs4870095	A	G	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=245;ReadPosRankSum=1.580;SC=TCAATCTCACATGAAACATTC;SOR=0.569;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=14;WE=152660318;WS=152660300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr6	152665261	rs4645434	C	A	1957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=27;PP=1569;SC=GAGGACTTGGCTCTAAATCCG;SOR=1.000;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=37;TCR=27;TR=63;WE=152665269;WS=152665251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr6	152665464	rs35003170	TC	T	503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=519;SC=AAATGGATTTTCCCCCCAAGA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=17;WE=152665472;WS=152665454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	152671475	rs9478320	A	C	2973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.191;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=51;PP=2404;ReadPosRankSum=2.022;SC=ATGCTCCTGCAAAACCAGGTG;SOR=0.388;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=98;TCF=47;TCR=51;TR=97;WE=152671483;WS=152671465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,97:0.99:98
chr6	152671553	rs9478321	A	G	1557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.455;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=34;PP=1327;ReadPosRankSum=0.354;SC=AACCCAGTGCAACTCACAGGG;SOR=1.293;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=52;WE=152671561;WS=152671543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,52:0.98:53
chr6	152671919	rs5880967	G	GA	2839.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.021;HP=12;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.379;NF=7;NR=80;PP=1933;ReadPosRankSum=-0.680;SC=GAATTACAAAGAAAAAAAAAT;SOR=3.767;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=108;TCF=13;TCR=95;TR=87;WE=152671927;WS=152671909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,103:0.98:105
chr6	152671975	rs1387549	A	G	1893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=57;PP=1612;SC=ACATATTCCCATGGTATGCAA;SOR=8.121;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=0;TCR=57;TR=57;WE=152671983;WS=152671965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	152673147	rs6908392	G	A	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=582;SC=ATCTGTCAATGAGTAAACACA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=152673155;WS=152673137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	152673519	rs6932325	A	C	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=39;PP=828;SC=GAGCAAAGGTAGTCTTGTTTC;SOR=6.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=40;WE=152673527;WS=152673509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr6	152673543	rs11370219	C	CT	252.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.67;QD=22.98;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	152675854	rs9397102	A	G	8420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=148;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=0.445;SC=TGGTCCTGGGACTAACTTTCT;SOR=1.050;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=263;TCF=150;TCR=113;TR=259;WE=152675862;WS=152675844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,265:0.99:269
chr6	152680710	rs78531855	G	A	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=587;ReadPosRankSum=1.256;SC=TTATTTATTCGTCCACTCCTC;SOR=1.556;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=26;WE=152680718;WS=152680700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,28:0.67:42
chr6	152683183	rs7771657	G	T	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=1;PP=625;SC=TATACTAAAAGCCCCAAACGT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=152683191;WS=152683173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	152683199	rs7771662	G	A	1046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=1;PP=888;SC=AACGTAATTTGCTTATGTGCA;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=152683207;WS=152683189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	152683413	rs4407724	G	T	2335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=45;PP=1819;SC=ACTGTCGAACGCCATCCTGAT;SOR=1.394;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=26;TCR=45;TR=71;WE=152683421;WS=152683403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr6	152685864	.	G	GAA	221.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=66.19;MQRankSum=-0.385;QD=22.18;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr6	152685865	.	G	GGAAGGGAGGA	2333.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=-0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=66.19;MQRankSum=-0.385;QD=44.88;ReadPosRankSum=0.253;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr6	152688567	rs7775637	C	T	1821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=54;PP=1523;SC=CAGAGACAAACTGCAAAGCTA;SOR=8.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=0;TCR=54;TR=54;WE=152688575;WS=152688557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr6	152690559	rs1873176	G	A	1286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=0;PP=1148;SC=GACAGAGGACGGACAAAGACT;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=152690567;WS=152690549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	152694184	rs6913579	T	C	2744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=73;NR=12;PP=2276;SC=CTAGAGCAGATTCTTTTTGGT;SOR=3.535;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=73;TCR=12;TR=85;WE=152694192;WS=152694174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr6	153043035	rs17710008	G	A	3015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.240;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=51;PP=2440;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTACACCCACGGCCTCAACAG;SOR=0.575;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=167;TCF=90;TCR=77;TR=107;WE=153043043;WS=153043025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,109:0.63:172
chr6	153296541	rs2073260	G	C	2781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.650;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=47;PP=2253;ReadPosRankSum=1.313;SC=GTTTCAAGTTGTACAATCCTA;SOR=0.596;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=78;TCR=69;TR=98;WE=153296549;WS=153296531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,101:0.68:149
chr6	153296772	rs9479472	A	G	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=434;ReadPosRankSum=0.159;SC=AAAAGAACATAACATTTACAT;SOR=1.528;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=17;WE=153296780;WS=153296762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr6	153311001	rs3860814	A	C	222.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.85;QD=31.83;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	153315921	rs3799133	G	A	1277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.858;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=33;PP=1070;ReadPosRankSum=1.324;SC=AAAAGGAGATGAACATGGAGA;SOR=1.788;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=68;TCF=24;TCR=44;TR=48;WE=153315929;WS=153315911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,47:0.69:68
chr6	153323594	rs3818123	C	T	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.403;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.494;NF=13;NR=52;PP=1461;ReadPosRankSum=1.783;SC=CCGCAGCTCCCGCTCCTTCTC;SOR=1.218;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=88;TCF=18;TCR=70;TR=65;WE=153323602;WS=153323584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,66:0.72:92
chr6	153323709	rs3818125	T	C	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.761;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-4.270;NF=4;NR=11;PP=279;ReadPosRankSum=0.834;SC=CCGCCCCGGGTGAACAGCTCC;SOR=2.049;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=15;WE=153323717;WS=153323699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr6	153323896	rs3818127	T	C	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=174;ReadPosRankSum=1.030;SC=ACACCCAGAATTTGGAGATAA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=153323904;WS=153323886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr6	153332926	rs34837755	AATAAT	A	866.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.53;MQRankSum=1.196;QD=22.81;ReadPosRankSum=-1.733;SOR=0.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr6	153345309	rs545323	C	T	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=67;ReadPosRankSum=-0.842;SC=CCTCTCCACACCCCATGCCCT;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=4;WE=153345317;WS=153345301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr6	153345647	rs2073259	G	A	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.855;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=1311;ReadPosRankSum=-0.579;SC=GAGACAGAACGGGGCCGTGAT;SOR=0.943;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=49;TCR=37;TR=59;WE=153345655;WS=153345637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,61:0.68:90
chr6	153365100	rs2295230	A	C	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.588;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.701;NF=25;NR=3;PP=427;ReadPosRankSum=-0.006;SC=GGTTTCCAGGAGCTTGAGACA;SOR=0.377;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=78;TCF=71;TCR=7;TR=28;WE=153365108;WS=153365090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,28:0.35:79
chr6	153365348	rs2295231	G	A	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=224;ReadPosRankSum=0.425;SC=TTTTTAGAAGGATATACTAAA;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=13;WE=153365356;WS=153365338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr6	153603373	rs9371678	T	C	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=0.612;QD=4.17;ReadPosRankSum=2.785;SOR=0.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,11:0.24:46
chr6	154360797	rs1799971	A	G	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.249;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=17;PP=669;ReadPosRankSum=-0.242;SC=CTTAGATGGCAACCTGTCCGA;SOR=1.102;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=139;TCF=78;TCR=61;TR=44;WE=154360805;WS=154360787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,46:0.30:152
chr6	154412004	rs2075572	G	C	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=647;SC=GGCTAAAAATGAATGAGCAAA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=154412012;WS=154411996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	154414375	rs9282821	A	C	3080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=19;SC=AATAATGGCCATTATAAAGTA;SOR=2.597;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=72;TCR=20;TR=91;WE=154414383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr6	154414446	rs540825	A	T	3559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=65;PP=2821;SC=CTCTAGAGCAAGGCTGCTTGG;SOR=1.081;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=44;TCR=65;TR=109;WE=154414454;WS=154414436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr6	154414563	rs675026	A	G	3130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.48;SOR=1.577;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr6	154414573	rs562859	C	T	3055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.94;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr6	154415434	rs660756	G	T	3593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=65;PP=2622;SC=AAGTGGAGTGGCGATTTGGCA;SOR=1.247;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=42;TCR=65;TR=107;WE=154415442;WS=154415424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr6	154428702	rs650245	A	G	2352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=48;SC=AGTCTAGAGCATTAATTTTGA;SOR=1.358;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=29;TCR=48;TR=77;WE=154428710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
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chr6	154431393	rs497332	C	G	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=434;SC=AATCTATGTACCTTTGGGGTA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=154431401;WS=154431383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr6	154762394	rs9384219	A	G	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-0.567;QD=14.56;ReadPosRankSum=1.956;SOR=0.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
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chr6	154771277	rs9322467	A	G	1410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=11;PP=1079;ReadPosRankSum=0.672;SC=CCTGGTGTCCAATCCGTGTGA;SOR=0.792;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=87;TCF=70;TCR=17;TR=58;WE=154771285;WS=154771267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,59:0.66:90
chr6	154771449	rs4870285	T	C	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.579;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=49;PP=1053;ReadPosRankSum=-1.562;SC=ACCCACCCCCTGCAAACTGCC;SOR=1.008;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=117;TCF=34;TCR=83;TR=65;WE=154771457;WS=154771439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,68:0.56:121
chr6	155094988	rs7762129	G	A	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=5.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.496;SOR=0.036;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr6	155116285	rs79232250	TTC	T	321.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.597;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=335;ReadPosRankSum=-0.325;SC=TGAGCGGTTTTTCTGTTATAT;SOR=0.368;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=10;WE=155116294;WS=155116275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr6	155124583	rs3757291	T	G	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=144;ReadPosRankSum=0.441;SC=AAATGATAGATATAACGGAAT;SOR=0.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=8;WE=155124591;WS=155124573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr6	155129784	rs66499928	CCTTT	C	1323.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.695;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=3;PP=1172;ReadPosRankSum=0.229;SC=TCTCAACCAGCCTTTCTGTTT;SOR=1.298;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=108;TCF=89;TCR=19;TR=29;WE=155129795;WS=155129774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,39:0.30:129
chr6	155152311	rs911191	C	G	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=513;ReadPosRankSum=-0.324;SC=AAAGAGGTTGCCTCTCTGTAT;SOR=1.151;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=23;WE=155152319;WS=155152301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr6	155485535	rs1032140	G	A	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.710;HP=6;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=11;PP=1240;ReadPosRankSum=0.960;SC=AATCACCTCTGTTTTTGCTTT;SOR=1.207;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=75;TCF=59;TCR=16;TR=57;WE=155485543;WS=155485525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,62:0.77:80
chr6	155485554	rs1032141	G	A	2081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=22;PP=1526;ReadPosRankSum=0.089;SC=TTAAGATCCAGCAATGGGAGC;SOR=0.621;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=63;TCR=28;TR=71;WE=155485562;WS=155485544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,76:0.78:97
chr6	155486519	rs41284214	G	A	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=1.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.98;ReadPosRankSum=-1.153;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:148,50:0.25:198
chr6	155486643	rs73795328	A	G	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.48;ReadPosRankSum=1.010;SOR=0.232;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,15:0.25:60
chr6	155489849	rs73795336	G	A	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-6.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=440;ReadPosRankSum=0.256;SC=TTAGAATAATGATACAAATTG;SOR=0.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=72;TCR=0;TR=24;WE=155489857;WS=155489839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,24:0.32:74
chr6	155561564	rs11751085	C	T	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=481;ReadPosRankSum=-1.368;SC=CCTCTGAGATCCCTGCTGAGC;SOR=2.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=20;WE=155561572;WS=155561554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr6	155561760	rs4259257	T	C	3623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=45;PP=2964;SC=TCCTCCGAGGTCTCTGGCCCG;SOR=0.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=59;TCR=45;TR=104;WE=155561768;WS=155561750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr6	155561796	rs11751128	C	T	2177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=38;PP=1761;ReadPosRankSum=-0.680;SC=AGACCGCCTCCGCAAAGTCAT;SOR=0.747;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=124;TCF=64;TCR=60;TR=80;WE=155561804;WS=155561786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,82:0.65:127
chr6	155565089	rs6902025	TC	CT	3321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.784;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=17;PP=2944;ReadPosRankSum=-0.815;SC=TACCCAAATCTCATGGGTATT;SOR=0.518;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=94;TCR=28;TR=75;WE=155565098;WS=155565079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,83:0.65:128
chr6	155565744	rs6907595	T	C	3042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.330;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=50;PP=2257;ReadPosRankSum=-0.204;SC=CGTGGTGTCCTGAACTTCATG;SOR=0.561;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=96;TCR=72;TR=115;WE=155565752;WS=155565734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,118:0.70:169
chr6	155566889	rs11435976	G	GT	328.14	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.041;QD=9.94;ReadPosRankSum=0.070;SOR=1.552;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,27:0.82:33
chr6	155571113	rs3011902	A	G	3441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=84;PP=2866;SC=GGTCCGTGAGACATCTGCACC;SOR=2.970;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=19;TCR=84;TR=103;WE=155571121;WS=155571103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
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chr6	155572986	rs3011899	G	A	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=271;SC=CATACGTTTGGAGAGTGTTAC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=155572994;WS=155572976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr6	155581619	rs912721	G	A	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.406;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=343;ReadPosRankSum=0.047;SC=TAAAACAGGAGGATGGGCTGT;SOR=2.267;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=18;WE=155581627;WS=155581609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,19:0.34:56
chr6	155596901	rs927718	T	C	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=495;ReadPosRankSum=-0.093;SC=TGGCCTTATCTGGGGTCTCTG;SOR=0.620;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=120;TCF=55;TCR=65;TR=37;WE=155596909;WS=155596891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,40:0.33:121
chr6	155606460	rs3734320	T	A	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=310;ReadPosRankSum=-0.914;SC=TCCAGCCTGATTAGATGAAAA;SOR=0.110;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=15;WE=155606468;WS=155606450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr6	155635585	rs162981	A	C	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.033;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=110;ReadPosRankSum=1.323;SC=GCACCATCCAACCCTACCTCA;SOR=0.024;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=11;WE=155635593;WS=155635575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,10:0.26:38
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chr6	155635637	rs1334687	A	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=248;ReadPosRankSum=-1.013;SC=CGCGCAGGGGAGGAACCTGCG;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=6;WE=155635645;WS=155635614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
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chr6	155750219	rs231955	G	A	3512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=89;PP=2884;SC=CTTTGTCCTCGAAATAATAAA;SOR=3.654;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=13;TCR=89;TR=102;WE=155750227;WS=155750209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
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chr6	156275691	rs4870405	G	T	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.820;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=446;ReadPosRankSum=0.071;SC=TCCAGAACTAGTCATTCAATT;SOR=0.352;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=62;TCF=53;TCR=9;TR=20;WE=156275699;WS=156275681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,23:0.34:68
chr6	157101072	rs1261893	A	C	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=391;SC=GAACTTTCTCACACCTTTAGC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=157101080;WS=157101062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr6	157150230	rs12206233	A	G	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=-1.083;SC=ATGTTTTGTCAGGTCATTGTT;SOR=0.317;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=9;WE=157150238;WS=157150220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr6	157454046	rs6913416	T	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=29;ReadPosRankSum=-0.328;SC=TTTAGGAGAATCTTATGGTAC;SOR=0.193;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=4;WE=157454054;WS=157454036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr6	157495951	rs372586664	AT	A	66.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=8.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=1.838;QD=1.91;ReadPosRankSum=-0.545;SOR=0.034;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
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chr6	157744588	rs4708868	C	G	1165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.020;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=36;PP=967;ReadPosRankSum=-0.498;SC=AAGCGAGAACCAGGCGGAGGA;SOR=0.174;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=56;TCF=4;TCR=52;TR=40;WE=157744596;WS=157744578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,40:0.71:56
chr6	157950088	rs17541624	G	C	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.201;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=331;ReadPosRankSum=0.327;SC=CCTTGTAGTTGCTAGTGTCTA;SOR=0.455;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=42;TCR=17;TR=20;WE=157950096;WS=157950078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
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chr6	157963550	rs17165416	T	C	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.387;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=391;ReadPosRankSum=1.095;SC=GACTGCTTACTGTTGATTCCT;SOR=0.106;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=85;TCF=64;TCR=21;TR=28;WE=157963558;WS=157963540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,30:0.34:87
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chr6	158068481	rs616538	T	C	1225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=44;PP=1013;SC=CCGCCCGCCCTGGTGGAATGG;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=44;WE=158068489;WS=158068471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	158074504	rs636169	A	G	2455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=31;PP=1843;SC=GTGCTGCTGCATCTCTGGCTT;SOR=1.233;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=49;TCR=31;TR=80;WE=158074512;WS=158074494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr6	158353308	.	C	T	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.114;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.169;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=24;PP=629;ReadPosRankSum=0.199;SC=TATCAAGGTGCGTCTTTCTTC;SOR=1.892;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=30;WE=158353316;WS=158353298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,32:0.63:51
chr6	158361899	rs912879	C	T	1413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=10;PP=1213;SC=GATTGATGTTCTGATTTGGGT;SOR=2.409;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=46;WE=158361907;WS=158361889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	158438933	rs1109511	G	A	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=517;ReadPosRankSum=0.593;SC=TGCCGGCGAGGGCCTAAGTGT;SOR=0.987;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=1;TCR=58;TR=23;WE=158438941;WS=158438923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,23:0.38:60
chr6	158450074	rs143503873	C	CCCTGCAGAGGGTGGGCCCTGGGTCT	114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.65;ReadPosRankSum=0.284;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr6	158475941	rs2296510	T	C	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=612;ReadPosRankSum=-0.655;SC=GGAAAAACCATGGCCTCCTTG;SOR=0.896;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=32;WE=158475949;WS=158475931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,33:0.69:48
chr6	158487406	rs1009012	A	T	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=533;ReadPosRankSum=-1.370;SC=AGGCAGCCTCATCTGTCTTTT;SOR=0.481;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=22;WE=158487414;WS=158487396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr6	158487734	rs3215807	C	CT	593.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=696;ReadPosRankSum=-2.320;SC=ACGCTTGACCCTTTAGTGGCC;SOR=0.504;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=20;WE=158487742;WS=158487724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr6	158490779	rs751873	C	T	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.170;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=201;ReadPosRankSum=-0.413;SC=TTTGACTTCCCCCTCCTCCCC;SOR=0.252;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=13;WE=158490787;WS=158490769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr6	158497717	rs2296508	T	C	3740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=89;PP=2910;SC=AGTATGACGTTGGCTCAGCCG;SOR=1.665;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=42;TCR=89;TR=131;WE=158497725;WS=158497707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr6	158499097	rs3831094	G	GT	872.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.385;NF=24;NR=1;PP=1012;ReadPosRankSum=-0.991;SC=ACGTGGGGTGGTTCGTGGCGC;SOR=3.841;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=25;WE=158499105;WS=158499087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr6	158499302	rs2296507	G	T	2411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=56;PP=1935;SC=AGCTACAAGCGTCTGATCACA;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=15;TCR=56;TR=71;WE=158499310;WS=158499292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr6	158502137	rs2256014	G	T	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=1;PP=636;SC=TGTTCCTAACGCAGACCTGTG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=158502145;WS=158502127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	158502590	rs173263	C	A	2281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=54;PP=1876;SC=ATCAATCCCTCTTTTTATGTG;SOR=3.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=11;TCR=54;TR=65;WE=158502598;WS=158502580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr6	158502668	.	CT	C	633	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=21;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=49.23;NF=0;NR=15;PP=633;QD=44.5333333333;SC=TTTTTTTTTTCTCTGAGACAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=158502676;WS=158502658;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	158504981	rs2236401	C	T	3366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=21;PP=2688;SC=GAAGACTGAGCCTTTCCCCCT;SOR=2.325;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=80;TCR=21;TR=101;WE=158504989;WS=158504971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr6	158505088	rs1744173	A	G	5244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=90;PP=2965;SC=ATCAGCCTGGAGTCTCGGACA;SOR=1.040;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=61;TCR=90;TR=151;WE=158505096;WS=158505078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr6	158507981	rs2296506	G	A	8690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.913;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=172;NR=116;PP=2965;ReadPosRankSum=1.689;SC=TCCCCAACCGGCCTCGGCCAC;SOR=0.881;SbPval=0.53;Source=Platypus;TCR=119;TR=288;WE=158507989;WS=158507971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,292:1.00:293
chr6	158509750	rs350289	A	G	2331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=33;PP=1921;SC=GCACCCATGGACAGTATTCAA;SOR=0.992;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=41;TCR=33;TR=74;WE=158509758;WS=158509740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr6	158517308	rs2502601	A	G	3080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=70;PP=2494;SC=CCAGATCATGAACACAAAACC;SOR=2.885;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=16;TCR=71;TR=86;WE=158517316;WS=158517298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr6	158517451	rs2502600	A	G	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=17;PP=595;SC=CTCCCTCTAGACATCCCTCCA;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=158517459;WS=158517441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	158535720	rs150169784	T	TTATAAAATGAGATAATACATTCAAGGAA	1514.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=89.11;ReadPosRankSum=1.232;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr6	158536116	rs2502604	A	T	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=653;SC=CTTTCTTTTTAAAAAAAATGG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=158536124;WS=158536106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	158735087	rs9364951	C	T	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=1.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.37;ReadPosRankSum=-1.049;SOR=0.865;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,25:0.32:78
chr6	158735090	rs7756620	T	C	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.41;ReadPosRankSum=-0.683;SOR=0.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,28:0.32:87
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chr6	158902468	rs10499309	C	G	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.809;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=576;ReadPosRankSum=-0.428;SC=TACGACATTTCCAGAATCCCA;SOR=0.553;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=37;TCR=75;TR=35;WE=158902476;WS=158902458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,35:0.30:118
chr6	158910543	rs2274883	T	C	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=-1.416;SC=GTCTGTCTTTTAGTTTATAGT;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=5;WE=158910551;WS=158910533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr6	158923434	rs9364968	G	C	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.718;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=13;PP=763;ReadPosRankSum=-0.418;SC=CCCAGAACACGTACACCCTCC;SOR=0.808;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=133;TCF=90;TCR=43;TR=42;WE=158923442;WS=158923424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,44:0.32:139
chr6	158924088	rs914690	T	C	4417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=71;PP=2965;SC=TGGGTGAGGATGTTTGGGTTC;SOR=0.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=73;TCR=71;TR=143;WE=158924096;WS=158924078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr6	158927651	rs3828712	A	G	1506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.609;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=26;PP=1164;ReadPosRankSum=-1.251;SC=CGTACATTCTAGACTTCCAGT;SOR=0.629;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=92;TCR=68;TR=61;WE=158927659;WS=158927641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,61:0.39:156
chr6	158993341	rs34964890	CATA	C	2077.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=4;PP=1997;SC=CCAGGCTGAGCATACTATGTC;SOR=4.362;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=40;WE=158993351;WS=158993331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr6	158994577	rs4709217	T	G	4389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=91;PP=2965;SC=TTTTTACTCATTGAATCTTTT;SOR=1.592;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=46;TCR=91;TR=137;WE=158994585;WS=158994567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr6	159028476	rs3734475	G	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.545;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=9;PP=165;ReadPosRankSum=0.272;SC=TTGAGAGGCTGGGGCAGGAGG;SOR=0.275;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=10;WE=159028496;WS=159028466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr6	159028488	rs3734474	C	T	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=446;SC=GGCAGGAGGACTGCTTGAAGC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=159028496;WS=159028466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	159029237	.	CAGGTGCTGACCCCGCAGAGGTATGGGGTGCTCTCTGCT	C	954.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.80;MQRankSum=2.330;QD=20.76;ReadPosRankSum=0.840;SOR=0.324;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr6	159029342	rs6925091	G	C	3647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=24;PP=2899;SC=TTTCCACATGGATTTCTGCCC;SOR=2.604;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=86;TCR=24;TR=110;WE=159029350;WS=159029332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr6	159029868	rs9457412	G	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.938;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=97;ReadPosRankSum=0.792;SC=AGTGGCTCACGCCTGTAATCC;SOR=0.081;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=9;WE=159029876;WS=159029858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,9:0.22:40
chr6	159046076	rs6905898	T	G	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=8;PP=1067;SC=GTGGTGGTGCTGGGAGGAGAA;SOR=2.786;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=46;WE=159046084;WS=159046066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr6	159047536	rs16900886	C	T	2779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.059;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=50;PP=2277;ReadPosRankSum=0.111;SC=GGGAGGTCAACCCTTGTCCAA;SOR=0.528;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=160;TCF=85;TCR=75;TR=101;WE=159047544;WS=159047526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,101:0.64:159
chr6	159049367	rs4708800	T	C	4831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.445;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=81;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.202;SC=ATGGGGTGAATAGAGAATTCT;SOR=0.662;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=270;TCF=140;TCR=130;TR=170;WE=159049375;WS=159049357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,180:0.63:284
chr6	159050889	rs2278612	C	T	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=35;PP=854;ReadPosRankSum=0.700;SC=GGCCAGTTAGCGGGCACAGAG;SOR=1.061;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=40;WE=159050897;WS=159050879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,37:0.74:50
chr6	159052471	rs9457420	G	A	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.431;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=34;PP=742;ReadPosRankSum=0.412;SC=ATCCCGGCACGGCCTTGCATG;SOR=1.502;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=125;TCF=24;TCR=101;TR=39;WE=159052479;WS=159052461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,41:0.33:125
chr6	159065758	rs2306751	C	G	3984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=87;PP=2917;ReadPosRankSum=-0.865;SC=CCGGCGCGTCCCCTCCGGCTC;SOR=0.726;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=133;TCF=43;TCR=90;TR=130;WE=159065766;WS=159065748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,136:0.99:137
chr6	159146694	.	T	C	1350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.026;ClippingRankSum=0.000;DP=237;ExcessHet=3.0103;FS=0.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.70;ReadPosRankSum=1.489;SOR=0.583;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:174,63:0.27:237
chr6	159178345	rs901363	C	T	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=398;ReadPosRankSum=1.406;SC=AGTGATCATTCCTCTGGCCAC;SOR=0.745;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=59;TCR=35;TR=26;WE=159178353;WS=159178335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,27:0.29:94
chr6	159181885	rs3127155	G	A	731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=616;SC=TCCTTTCTACGTCCCCGTGCC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=159181893;WS=159181875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	159183351	rs9347251	T	C	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=36;PP=1068;SC=TAACAACACATATTAAAGACC;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=159183359;WS=159183341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	159184462	rs2291387	A	G	3677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=42;PP=2952;SC=TGAGGCAGTCAAGCTTGGAGT;SOR=1.591;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=80;TCR=42;TR=122;WE=159184470;WS=159184452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr6	159185427	rs7775997	G	A	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=1;PP=81;SC=ATGTGGACTTGAGGTGAAAAA;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=159185435;WS=159185417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	159185563	rs3123101	T	A	1211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=8;PP=965;SC=GCATGCTCACTATCGAAGCTC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=36;WE=159185571;WS=159185553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	159188128	rs2242318	A	G	2120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=41;PP=1637;SC=ATTAAGCAGCATTGGTCTAGT;SOR=1.418;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=23;TCR=42;TR=64;WE=159188136;WS=159188118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr6	159191788	rs3212308	C	T	2488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=18;PP=1935;ReadPosRankSum=-0.266;SC=AGCCCCAGGGCGCCTGACCTC;SOR=0.793;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=81;TCF=63;TCR=18;TR=79;WE=159191796;WS=159191778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,84:0.98:86
chr6	159192045	rs1038537	A	G	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=21;PP=629;SC=GGGCCACCCTAGCCTGCTGCC;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=159192053;WS=159192035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr6	159192214	.	T	TGG	906	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=18;NR=1;PP=906;QD=49.0;SC=TGACAGGCACTGGCTGCCAGT;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=19;WE=159192222;WS=159192213;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,19:0.86:22
chr6	159192575	rs3127181	A	G	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=652;SC=TCTCGGCACTAGGAATGTGCA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=159192583;WS=159192565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr6	159197371	rs9346767	T	C	3699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=27;PP=2965;SC=ACAGTATAACTTGTCCGTTAC;SOR=2.494;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=86;TCR=27;TR=113;WE=159197379;WS=159197361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr6	159204426	rs7769862	T	A	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=597;SC=CTTTAAAAAGTTTCCTACTTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=159204434;WS=159204416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	159204786	rs3123111	C	T	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=33;PP=1013;SC=TAAATTAAGGCGCCTTGTGTA;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=36;WE=159204794;WS=159204776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr6	159205475	rs3127217	T	C	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=114;SC=TGAGCTAAACTGCTTCTTTCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=159205483;WS=159205465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	159205632	rs9364995	C	T	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=19;PP=1007;ReadPosRankSum=-1.122;SC=CATGCTGGAGCGCACGGAGAT;SOR=1.314;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=31;TCR=20;TR=48;WE=159205640;WS=159205622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,51:0.96:53
chr6	159205668	rs3103003	G	A	1994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=24;PP=1500;SC=GCAGGGCACAGCACTCACTTG;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=37;TCR=24;TR=61;WE=159205676;WS=159205658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr6	159210662	rs140055516	TTTTC	T	1368.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=22;PP=1204;SC=AGTTTTTCTCTTTTCTTTGAG;SOR=3.126;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=24;WE=159210673;WS=159210652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	159291490	rs6455609	G	C	564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=508;SC=AACACATCAGGAAACCTCAAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=159291498;WS=159291480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr6	159316430	rs9457507	C	T	820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=18;PP=583;SC=TGATGGAATACGTGGCATCCT;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=159316438;WS=159316420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr6	159330886	rs60429477	C	T	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=118;ReadPosRankSum=-0.365;SC=CCACCGCGCCCGGCCTATCAT;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=7;WE=159330894;WS=159330876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr6	159618303	rs371373	C	T	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=-0.281;SC=TTTGTTGTCACACTGTAATGC;SOR=0.169;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=5;WE=159618311;WS=159618297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr6	159618397	rs371023	C	T	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=8.098;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.03;ReadPosRankSum=0.266;SOR=0.137;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,23:0.24:95
chr6	159620925	rs294923	G	A	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.409;SOR=0.676;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,21:0.24:89
chr6	159621087	rs62432291	C	T	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=546;ReadPosRankSum=0.525;SC=AGTGAGCCGTCCTGTTTACAG;SOR=0.774;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=105;TCF=41;TCR=64;TR=35;WE=159621095;WS=159621077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,36:0.33:109
chr6	159635943	rs400477	T	G	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=23;ReadPosRankSum=1.173;SC=AGTGGTCTACTGTCTAACCAC;SOR=0.023;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=4;WE=159635951;WS=159635936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr6	159642860	rs419281	G	A	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=320;ReadPosRankSum=1.045;SC=GGCAAATGTGGTCACATTTTG;SOR=0.173;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=0;TCR=70;TR=20;WE=159642868;WS=159642850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,22:0.30:74
chr6	159646853	rs389041	G	A	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=315;ReadPosRankSum=1.446;SC=AAAGGCCAGCGTGGGCATTTT;SOR=0.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=0;TCR=55;TR=17;WE=159646861;WS=159646843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,17:0.30:56
chr6	159650978	rs509648	A	G	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.235;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=487;ReadPosRankSum=-0.969;SC=AATCCGGGCCACAAACAGGAG;SOR=0.217;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=74;TCF=8;TCR=66;TR=27;WE=159650986;WS=159650968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,30:0.39:77
chr6	159652931	rs420137	G	C	2795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.711;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=35;PP=2103;ReadPosRankSum=-0.651;SC=GGCGGATGTTGAGCAGAACAC;SOR=0.811;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=129;TCF=77;TCR=52;TR=91;WE=159652939;WS=159652921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,100:0.72:139
chr6	159653635	rs381639	C	G	3114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.910;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=42;PP=2390;ReadPosRankSum=1.901;SC=CCTCGCCGGCCCGGAGGACCC;SOR=0.411;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=183;TCF=123;TCR=60;TR=121;WE=159653643;WS=159653625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,126:0.67:187
chr6	159654487	rs404435	G	T	3061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.026;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=60;PP=2341;ReadPosRankSum=0.232;SC=CTGCTCGTCCGCCCGCAGCAC;SOR=0.538;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=170;TCF=76;TCR=94;TR=111;WE=159654495;WS=159654477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,114:0.67:171
chr6	159654551	rs370434	C	G	2594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.594;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=48;PP=2152;ReadPosRankSum=-0.989;SC=CCGGGCCCCACAACAGCAGCC;SOR=0.410;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=128;TCF=54;TCR=74;TR=88;WE=159654559;WS=159654541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,92:0.71:130
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chr6	159655383	rs2501176	A	G	3033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.547;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=24;PP=1341;ReadPosRankSum=-0.872;SC=CCCTGGCCGCAGTACACCACG;SOR=1.542;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=93;TCF=57;TCR=36;TR=72;WE=159655391;WS=159655373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,74:0.77:96
chr6	159655402	rs2932988	A	G	3409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.973;HP=6;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=29;PP=1702;ReadPosRankSum=0.572;SC=CGCGCGCCCCACCTGGCCACT;SOR=0.976;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=111;TCF=74;TCR=37;TR=90;WE=159655410;WS=159655392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,94:0.82:115
chr6	159655593	rs2501177	C	T	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=37;PP=905;ReadPosRankSum=-0.285;SC=TATTCTATTGCATTTAGCACC;SOR=2.935;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=37;WE=159655601;WS=159655583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,37:0.82:45
chr6	159657195	rs420339	G	T	1431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=0;PP=1206;ReadPosRankSum=0.675;SC=CCAACTTCCCGGGCATGTTGA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=66;TCR=0;TR=47;WE=159657203;WS=159657185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,47:0.71:66
chr6	159659481	rs419836	C	T	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=438;ReadPosRankSum=-0.713;SC=ACTCACATTACGGTTTCCTTC;SOR=2.683;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=19;WE=159659489;WS=159659471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr6	159659523	rs450538	A	G	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=3;PP=818;ReadPosRankSum=0.944;SC=TACATATATAATTGGACTAAT;SOR=0.634;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=48;TCF=44;TCR=4;TR=32;WE=159659531;WS=159659513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,34:0.67:51
chr6	159660779	rs141435210	GCCACCACCCGCCGCACGA	G	571.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.107;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.645;NF=6;NR=5;PP=2497;ReadPosRankSum=-1.068;SC=GCCCACCACTGCCACCACCCG;SOR=0.049;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=30;TCF=15;TCR=15;TR=11;WE=159660804;WS=159660769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr6	159660879	rs386360	C	A	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=0.723;QD=18.95;ReadPosRankSum=1.351;SOR=0.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,46:0.68:68
chr6	159667961	rs294911	T	G	1656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=24;PP=1231;ReadPosRankSum=-0.859;SC=AGACTGACACTGCAGTACCTA;SOR=0.788;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=90;TCF=55;TCR=35;TR=67;WE=159667969;WS=159667951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,68:0.72:94
chr6	159669953	rs28487880	G	C	566.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=527;ReadPosRankSum=0.145;SC=GTGTGTGTGTGTGTCTGTCTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=22;WE=159669961;WS=159669928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr6	159670276	rs294907	A	G	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=33;PP=862;ReadPosRankSum=-0.089;SC=TTGAAGAAAAACATTACTAAT;SOR=0.642;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=36;WE=159670284;WS=159670266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,38:0.76:50
chr6	159670303	rs294906	G	A	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=571;ReadPosRankSum=-1.858;SC=GCCTCGCCAAGGCAGTGCATT;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=22;WE=159670311;WS=159670293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,25:0.74:34
chr6	159672455	rs294899	C	T	3276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.560;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=66;PP=2662;ReadPosRankSum=-0.552;SC=AGAAGAGTGACCTGCCTCCCC;SOR=0.787;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=189;TCF=90;TCR=99;TR=124;WE=159672463;WS=159672445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,123:0.65:190
chr6	159677498	rs294890	C	T	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=2;PP=828;ReadPosRankSum=-0.429;SC=TGGGTTACATCTTGTGTGTGA;SOR=0.723;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=57;TCF=54;TCR=3;TR=37;WE=159677506;WS=159677488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,35:0.61:57
chr6	159682206	rs294883	C	T	1939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.024;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=9;PP=1487;ReadPosRankSum=-0.198;SC=CAAAATATATCTTCTTCCAAC;SOR=0.315;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=90;TCF=79;TCR=11;TR=62;WE=159682214;WS=159682196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,67:0.71:94
chr6	159689004	rs560889	C	G	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=315;ReadPosRankSum=0.681;SC=AGGTGGGAGACAAGGATTAAT;SOR=0.617;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=59;TCF=8;TCR=51;TR=18;WE=159689012;WS=159688994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,21:0.34:62
chr6	159692321	rs409691	G	A	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.507;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=24;PP=1206;ReadPosRankSum=0.544;SC=TGGTTCAGGGGCCTCTGACGC;SOR=0.197;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=80;TCF=51;TCR=29;TR=57;WE=159692329;WS=159692311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,58:0.69:84
chr6	159692559	rs455162	G	A	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.441;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=444;ReadPosRankSum=0.671;SC=GACAGCCAGCGTGCTCAGCCC;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=20;WE=159692567;WS=159692549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr6	160114168	rs5746094	T	C	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=5;PP=538;SC=GGGTCCCCTTTCTTCTCACCC;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=160114176;WS=160114158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	160114311	rs5746092	G	C	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=19;PP=460;SC=AAGAAAGCGCGGGGAGCAGGG;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=160114319;WS=160114301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr6	160114366	rs5746091	C	T	49.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	160133957	rs752779	G	A	5686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=139;PP=2965;ReadPosRankSum=0.133;SC=ATTTAAAAAGGTCTCCCTGTA;SOR=1.423;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=179;TCF=38;TCR=141;TR=177;WE=160133965;WS=160133947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,180:0.99:181
chr6	160159907	rs6930976	A	G	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=3;PP=527;SC=TCAAAAAATCATAATATGTAC;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=160159915;WS=160159897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr6	160169258	rs7766006	G	T	3810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=80;PP=2965;SC=TCCAGCAGCCGAGCGTTGCCC;SOR=1.817;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=42;TCR=80;TR=122;WE=160169266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr6	160182617	rs2273818	C	T	7847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=133;NR=110;PP=2965;SC=TGAGACCCGCCGCGGGCCGGG;SOR=0.885;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=243;TCF=133;TCR=110;TR=243;WE=160182625;WS=160182607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr6	160182749	rs2277073	G	A	3652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=88;PP=2965;SC=AAAAGCCCAAGACGTCAAGTC;SOR=2.494;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=26;TCR=88;TR=114;WE=160182757;WS=160182739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr6	160182796	rs193058938	G	C	2000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=69;PP=1645;SC=GAAACACTGGGGTTTCAGGCG;SOR=7.140;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=70;TCF=1;TCR=69;TR=70;WE=160182804;WS=160182786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr6	160182845	rs2277072	A	G	1508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=39;PP=1233;SC=TCTGCCCGCAAGCCCAGACCC;SOR=4.271;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=43;WE=160182853;WS=160182835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	160183325	rs2273819	G	C	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=20;PP=578;SC=GAACCCTGCGGCTCCCGCGTT;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=160183333;WS=160183315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	160198359	rs3464	C	T	2341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=23;PP=1810;ReadPosRankSum=-0.817;SC=CTGCAGCTGTCGTTCTTATGA;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=74;TCF=51;TCR=23;TR=73;WE=160198367;WS=160198349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,76:0.99:77
chr6	160199424	rs34047044	TA	T	1295.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=28;PP=1324;SC=AAATACTAGTTACTAGGACTG;SOR=4.743;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=30;WE=160199432;WS=160199414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr6	160199453	rs67585961	GTT	G	575.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=14;PP=446;SC=ACTTCCCAAGGTTTAAAAAAA;SOR=2.985;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=16;WE=160199462;WS=160199443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr6	160199687	rs15982	T	C	2544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=19;PP=2160;SC=TTCTCCCCCGTTAGGTCAATA;SOR=2.362;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=61;TCR=19;TR=80;WE=160199695;WS=160199677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr6	160200026	rs4832	A	C	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=11;PP=968;SC=ACTCAACTCAAGGTACAAGAC;SOR=1.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=37;WE=160200034;WS=160200016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr6	160201295	rs2295901	C	A	1533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=10;PP=1135;SC=TGTCTAGTCCCTGCAGAAGAG;SOR=2.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=40;WE=160201303;WS=160201285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr6	160201677	rs3818300	G	A	1585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=38;PP=1256;SC=AGCATTTGTGGTAAAAGTGCT;SOR=2.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=47;WE=160201685;WS=160201667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr6	160202282	rs2295898	C	G	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=244;SC=TAAATTAGTCCAATTCATGGA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=160202290;WS=160202272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	160205991	rs1547093	C	A	4909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=121;PP=2965;SC=TCTATTAAAGCAGCAAGCATT;SOR=3.611;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=19;TCR=121;TR=140;WE=160205999;WS=160205981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr6	160206716	rs3818298	T	C	3283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=65;PP=2520;SC=CCCATAAGCATAGCCACTAAA;SOR=1.633;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=31;TCR=66;TR=96;WE=160206724;WS=160206706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr6	160211485	rs2273823	T	C	1439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=0;PP=1228;SC=TCCGGGTCGGTGGCGTCTGGC;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=43;WE=160211493;WS=160211475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	160211554	rs1128661	T	G	3705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=23;PP=2795;SC=ATATGGCTGCTCCTGGCGAGC;SOR=2.747;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=99;TCR=23;TR=122;WE=160211562;WS=160211544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr6	160211636	rs1128670	G	A	6979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=100;PP=2965;SC=CTTCGGTCGCGGTTTTGGGGG;SOR=0.757;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=214;TCF=114;TCR=100;TR=214;WE=160211655;WS=160211626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr6	160211645	rs58504486	GGTT	G	9290.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=101;PP=2969;SC=CGGTTTTGGGGGTTGTTCTCG;SOR=0.834;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=176;TCF=64;TCR=112;TR=165;WE=160211655;WS=160211626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr6	160211697	rs9346795	C	T	6539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.18;QD=44.19;SOR=2.271;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr6	160211700	rs9355278	C	G	6539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.19;QD=45.73;SOR=2.189;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr6	160212268	rs4709371	G	A	1164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=28;PP=823;SC=GGTAGAGGCAGGGTTCGCGGA;SOR=4.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=160212276;WS=160212258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	160221279	rs71927633	GCGTGGGCAGCA	G	222.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=0;PP=1058;SC=CGACGGAAGCGCGTGGGCAGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=160221297;WS=160221269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr6	160221475	rs733319	A	G	278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=7;PP=235;SC=GGCGAGCTTGAGGAGGGGGTG;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=160221483;WS=160221465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	160221560	rs12211823	G	A	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=3;PP=227;SC=CTCCAGCCCCGGGGCGGTGGG;SOR=1.270;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=160221568;WS=160221550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr6	160224346	rs2146163	T	C	5737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=140;PP=2965;SC=CAAACAAGTATGTATCAAGAG;SOR=2.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=193;TCF=53;TCR=140;TR=192;WE=160224354;WS=160224336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr6	160225559	rs9364536	G	C	5262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=62;PP=2965;SC=TGTTCTGTTTGTTGTTCTGTT;SOR=1.102;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=153;TCF=90;TCR=63;TR=152;WE=160225567;WS=160225549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr6	160226923	rs6910976	A	G	2030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=13;PP=1587;SC=CATGAAAACCAGAGGGTTCAG;SOR=2.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=55;TCR=13;TR=68;WE=160226931;WS=160226913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
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chr6	160241440	rs7775650	G	C	2172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=14;PP=1747;ReadPosRankSum=-0.788;SC=GGTGCCTCTCGGCCTGCTGGG;SOR=1.528;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=71;TCF=57;TCR=14;TR=69;WE=160241448;WS=160241430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr6	160469510	rs8191808	C	G	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.25;ReadPosRankSum=-0.648;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,54:0.29:186
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chr6	160505199	rs614754	C	G	2077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=56;PP=1765;SC=CCTGGTCCCTCGTCCACAACG;SOR=4.943;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=4;TCR=56;TR=60;WE=160505207;WS=160505189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr6	160543148	rs12208357	C	T	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=30;PP=1005;ReadPosRankSum=-0.550;SC=GCTGAGCCAGCGCTGTGGCTG;SOR=0.652;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=76;TCR=90;TR=56;WE=160543156;WS=160543138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,54:0.32:171
chr6	160575985	rs2297374	C	T	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=87;ReadPosRankSum=0.985;SC=TTTTGCAGCTCGGCAGTGGGC;SOR=0.512;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=7;WE=160575993;WS=160575975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr6	160645832	rs316003	C	T	1882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=54;PP=1394;ReadPosRankSum=0.843;SC=CCAAGCCAAGCACGCCTGAAA;SOR=0.707;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=266;TCF=104;TCR=162;TR=89;WE=160645840;WS=160645822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,89:0.33:270
chr6	160645921	rs3219197	C	CT	805.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.869;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.770;NF=3;NR=31;PP=572;ReadPosRankSum=-0.528;SC=TTGTTTAAAACTTTTTTTTAG;SOR=0.153;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=115;TCF=6;TCR=109;TR=34;WE=160645929;WS=160645911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,40:0.40:101
chr6	160663230	rs17588242	T	C	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.229;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=181;ReadPosRankSum=0.000;SC=ACACTGTGTTTTGAAGGTAAG;SOR=0.042;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=12;WE=160663238;WS=160663220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,12:0.30:40
chr6	160666660	rs11422119	A	AC	292.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.570;NF=1;NR=10;PP=336;ReadPosRankSum=0.132;SC=ATAATTTCTTACCGTCCTGAG;SOR=0.813;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=11;WE=160666668;WS=160666650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr6	160668186	rs3219195	CCT	C	526.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.456;NF=15;NR=0;PP=551;ReadPosRankSum=-1.346;SC=TTCTCCATCCCCTGATTTGAT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=15;WE=160668195;WS=160668176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr6	160668389	rs2279463	A	G	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.275;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=35;PP=944;ReadPosRankSum=0.926;SC=CCCATCCCCCATTTTTTTATA;SOR=1.061;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=73;TCF=17;TCR=56;TR=44;WE=160668397;WS=160668379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,41:0.56:73
chr6	160670282	rs316019	A	C	4910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=105;NR=44;PP=2965;SC=TTGGGCAGAGAAACTGTGAAC;SOR=1.737;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=150;TCF=106;TCR=44;TR=149;WE=160670290;WS=160670272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr6	160670494	rs316018	A	G	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=337;ReadPosRankSum=-0.430;SC=AAACTAGAACACCAACCTCAA;SOR=0.502;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=78;TCF=4;TCR=74;TR=22;WE=160670502;WS=160670484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,23:0.28:82
chr6	160670533	rs316017	C	T	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=372;ReadPosRankSum=1.739;SC=GAATATTCTACGCAACTCTCT;SOR=0.317;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=0;TCR=55;TR=20;WE=160670541;WS=160670523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,21:0.38:56
chr6	160671500	rs316016	T	C	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=285;ReadPosRankSum=-2.890;SC=GTCCCTTTTCTTGCATGCCGC;SOR=0.212;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=50;TCR=0;TR=16;WE=160671508;WS=160671490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,16:0.32:50
chr6	160677614	rs2774230	G	C	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=7.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.56;ReadPosRankSum=-2.266;SOR=0.370;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,19:0.24:78
chr6	160679400	rs624249	C	A	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.715;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=41;PP=1480;ReadPosRankSum=1.103;SC=ACGAGCCAGGCGTCTCGTACA;SOR=0.846;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=228;TCF=104;TCR=124;TR=74;WE=160679408;WS=160679390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,76:0.33:231
chr6	160769811	rs668871	C	T	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.903;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=98;ReadPosRankSum=-0.243;SC=TCCCCAACCGCTCGGCTCCCC;SOR=2.252;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=8;WE=160769819;WS=160769801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr6	160858188	rs2292334	G	A	2058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.457;NF=38;NR=34;PP=1618;ReadPosRankSum=1.765;SC=TCCCCTTTGCGGCAAGCAATA;SOR=0.655;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=88;TCF=45;TCR=43;TR=72;WE=160858196;WS=160858178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,72:0.81:89
chr6	160868668	rs3918286	A	G	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=277;ReadPosRankSum=1.429;SC=GAGCAACATGATGGCTTCAGA;SOR=1.061;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=11;WE=160868676;WS=160868658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr6	160868687	rs3918287	GC	G	353.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=377;ReadPosRankSum=-0.176;SC=GAGTGAGCAGGCCCCATGGGA;SOR=0.622;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=11;WE=160868695;WS=160868677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr6	160872151	rs1810126	C	T	3009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.780;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=94;PP=2447;ReadPosRankSum=-0.834;SC=CAAAGCTGTGCCTTGCAGAGA;SOR=1.352;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=168;TCF=22;TCR=146;TR=105;WE=160872159;WS=160872141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,106:0.63:167
chr6	160952838	rs3124784	G	A	2846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.711;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.989;NF=53;NR=42;PP=2282;ReadPosRankSum=-0.532;SC=TTATTGGGGCGTGCACAGCCA;SOR=0.575;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=134;TCF=76;TCR=58;TR=95;WE=160952846;WS=160952828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,99:0.72:138
chr6	160953035	rs3127596	A	G	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.671;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.006;NF=7;NR=46;PP=1246;ReadPosRankSum=-0.475;SC=CAAATCAGAAAGGAACTTATG;SOR=1.259;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=81;TCF=13;TCR=68;TR=53;WE=160953043;WS=160953025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,56:0.66:85
chr6	160969629	rs1801693	A	G	1945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=14;PP=1557;SC=GCTGGGGTCCATGGTAAAACA;SOR=2.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=53;TCR=14;TR=67;WE=160969637;WS=160969619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
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chr6	161006172	rs41272110	T	G	1347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.730;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=16;PP=1134;ReadPosRankSum=-0.246;SC=GTGGAGAGTGTGCCTCGATAA;SOR=0.374;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=147;TCF=110;TCR=37;TR=56;WE=161006180;WS=161006162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,55:0.37:150
chr6	161007496	rs7765781	G	C	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=3.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.91;ReadPosRankSum=0.614;SOR=0.394;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,24:0.27:89
chr6	161007538	rs7765803	G	C	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.811;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=470;ReadPosRankSum=-1.142;SC=GTTGTGAGGAGAGTTGATTCC;SOR=1.419;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=82;TCF=35;TCR=47;TR=29;WE=161007546;WS=161007528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,32:0.37:87
chr6	161010766	rs7453899	A	T	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=5.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.66;ReadPosRankSum=-1.021;SOR=0.385;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,47:0.27:171
chr6	161097590	rs12525588	A	T	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.132;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.695;NF=8;NR=20;PP=452;ReadPosRankSum=0.676;SC=CTGCTCTGCTAGCAGCTGCAG;SOR=0.206;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=80;TCF=16;TCR=64;TR=28;WE=161097598;WS=161097580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,29:0.35:82
chr6	161132146	rs4757	C	T	5102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=134;NR=26;PP=2965;SC=ATGGAAAGAACTACAGAGGGA;SOR=3.302;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=138;TCR=27;TR=160;WE=161132154;WS=161132136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr6	161135667	rs147901890	CTTATTGCCAATT	C	324.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=1278;SC=ATCCTGAGTCCTTATTGCCAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=5;WE=161135686;WS=161135664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	161137663	rs4252109	T	G	3481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=27;PP=2817;ReadPosRankSum=1.183;SC=CTAAAATCTTTCTTGTCCATT;SOR=1.049;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=78;TCR=27;TR=104;WE=161137671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,106:0.99:107
chr6	161139857	rs13231	A	G	1920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=41;PP=1518;SC=CCACGGAACAATTGGCTCCCA;SOR=1.536;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=20;TCR=41;TR=61;WE=161139865;WS=161139847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr6	161143376	rs4252117	A	G	2473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=9;PP=2092;SC=TTTTGTCATAAATTGCTTCAT;SOR=3.855;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=65;TCR=9;TR=74;WE=161143384;WS=161143366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr6	161143608	rs4252120	T	C	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=38;PP=1130;ReadPosRankSum=0.460;SC=GCGTATGTCTTTGATTTTTAC;SOR=6.043;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=38;WE=161143616;WS=161143598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr6	161152240	rs4252125	G	A	2319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=38;PP=1818;SC=CCTGCTTCCAGATGTAGAGAC;SOR=0.898;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=33;TCR=38;TR=71;WE=161152248;WS=161152230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr6	161152294	rs4252126	A	G	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=39;PP=1221;SC=ACATCTACACACTTGGACGCT;SOR=2.701;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=49;WE=161152302;WS=161152284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr6	161153080	rs4252130	A	C	1307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=45;PP=1042;SC=CAGGGGGCTAAGCTAGAATAT;SOR=7.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=45;WE=161153088;WS=161153070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr6	161160083	rs2859879	G	A	1985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=2;PP=1541;SC=TCCTCTTGACGTCCTCATCTT;SOR=5.387;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=54;TCR=2;TR=56;WE=161160091;WS=161160073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr6	161469455	rs9346846	T	A	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=514;SC=AAATGGATAATTTTTTTTAAA;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=161469463;WS=161469445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr6	161469774	rs4559074	G	A	6939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=147;NR=72;PP=2965;SC=GAGCGTGATCGTAAAAAAAAT;SOR=1.654;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=219;TCF=147;TCR=72;TR=219;WE=161469782;WS=161469764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr6	161502094	rs9347479	C	T	1557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=40;PP=1203;SC=TGCTTCTGAACGCGACGCTCC;SOR=3.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=46;WE=161502102;WS=161502084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	161509003	rs9355332	T	A	1340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=31;PP=1187;SC=CTCATCTCCATCTTTGCAGCA;SOR=2.038;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=42;WE=161509011;WS=161508993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	161517964	rs2177587	T	C	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=0;PP=929;SC=TATTTGTATATGTAATATTAT;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=161517972;WS=161517954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr6	161519350	rs5881391	CCTG	C	5095.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=91;NR=5;PP=2995;SC=CCATGGCAGCCCTGCTGCTGC;SOR=6.290;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=140;TCF=129;TCR=11;TR=96;WE=161519363;WS=161519340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr6	161531006	rs4709493	G	C	171.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=132;SC=GCCCGTGGGAGGTGCTCTGAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=161531014;WS=161530996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	161532855	rs35961625	CT	C	7727.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=126;PP=2974;SC=ACAACTACTTCTTTTCTTTTT;SOR=0.881;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=211;TCF=76;TCR=135;TR=200;WE=161532863;WS=161532845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr6	161557662	rs3734462	G	A	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.681;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=611;ReadPosRankSum=-0.436;SC=GAACTCCCACGGAGGCTGCAG;SOR=0.927;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=126;TCF=47;TCR=79;TR=36;WE=161557670;WS=161557652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,35:0.28:127
chr6	161557703	rs6455706	A	G	3460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=72;PP=2779;ReadPosRankSum=-1.622;SC=GGAGTAGCCCAAACAGACTAC;SOR=0.859;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=104;TCF=31;TCR=73;TR=103;WE=161557711;WS=161557693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,108:0.99:109
chr6	161557775	rs3734463	C	G	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.122;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=158;ReadPosRankSum=-0.519;SC=AGCGCCAGCTCAGAGCTGGCT;SOR=0.030;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=11;WE=161557783;WS=161557765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,11:0.22:49
chr6	161565305	rs59871575	G	A	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.552;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=34;PP=964;ReadPosRankSum=0.084;SC=AGCCCTGCACGGAGAGAGAAA;SOR=0.372;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=63;TCF=7;TCR=56;TR=40;WE=161565313;WS=161565295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,41:0.63:65
chr6	161807855	rs1801582	C	G	1822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.249;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=22;PP=1473;ReadPosRankSum=-0.549;SC=GCTTCAAATACGGCACTGCAC;SOR=0.577;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=207;TCF=152;TCR=55;TR=75;WE=161807863;WS=161807845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,77:0.36:214
chr6	161970150	rs71694927	ATGTG	A	713.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.283;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.730;NF=0;NR=17;PP=676;ReadPosRankSum=1.037;SC=AAAATAATGCATGTGTGTGTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=1;TCR=58;TR=17;WE=161970163;WS=161970140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr6	161990483	rs3765474	C	T	1701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.952;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=52;PP=1398;ReadPosRankSum=0.078;SC=AAAAACGTCACTTTCACTCTG;SOR=0.896;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=107;TCF=20;TCR=87;TR=63;WE=161990491;WS=161990473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,62:0.58:106
chr6	161990516	rs3765475	G	C	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.349;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=27;PP=725;ReadPosRankSum=-1.154;SC=TTCTTACACAGAGTTATGACT;SOR=0.368;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=65;TCF=10;TCR=55;TR=33;WE=161990524;WS=161990506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
chr6	162137099	rs112078090	CATCTT	C	1800.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.12;MQRankSum=0.957;NF=22;NR=15;PP=1813;ReadPosRankSum=1.741;SC=GTGCTGGGCCCATCTTACCGA;SOR=0.726;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=72;TCF=41;TCR=31;TR=37;WE=162137111;WS=162137089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,47:0.53:88
chr6	162622304	rs4709583	A	G	1876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=36;PP=1508;SC=AAAAAGCAGAAGAAGTGGCTA;SOR=1.692;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=19;TCR=36;TR=55;WE=162622312;WS=162622294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr6	162992294	rs4709639	T	A	219.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=149;SC=GAGGCAGAGGTTGCAGTGAGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=162992302;WS=162992284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	163149497	rs2276201	T	C	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=333;ReadPosRankSum=-1.180;SC=TTGGCCAGCCTTAGGATGGAC;SOR=0.576;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=59;TCF=6;TCR=53;TR=20;WE=163149505;WS=163149487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,19:0.34:56
chr6	163587146	rs1124951	C	G	4526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=37;PP=2965;SC=GGCTGCAGGGCTTGGCGCGGG;SOR=1.798;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=101;TCR=37;TR=138;WE=163587154;WS=163587136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr6	163587312	rs3064931	CAAA	C	3411.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.168;NF=5;NR=68;PP=2098;ReadPosRankSum=0.915;SC=ACAACAACAACAAAAAAATGT;SOR=1.069;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=142;TCF=19;TCR=123;TR=73;WE=163587322;WS=163587302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,89:0.61:146
chr6	163600225	rs742956	C	A	1949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.784;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=50;PP=1535;ReadPosRankSum=-0.387;SC=CGCTGCTCCTCACATGTGCGT;SOR=0.468;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=112;TCF=30;TCR=82;TR=70;WE=163600233;WS=163600215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,71:0.63:113
chr6	163611793	rs6907521	C	T	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.333;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=4;PP=1211;ReadPosRankSum=-0.044;SC=TCTCTTATACCAAAAAGCCCA;SOR=1.165;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=94;TCF=85;TCR=9;TR=55;WE=163611801;WS=163611783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,56:0.59:95
chr6	163612783	rs6937392	C	A	4506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=6.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=115;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.438;SC=AGAGCCATGACGTCCCTCTGC;SOR=0.699;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=261;TCF=81;TCR=180;TR=166;WE=163612791;WS=163612773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,170:0.62:272
chr6	163836376	rs2757578	C	T	4017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=105;PP=2965;SC=AGGTGAGCGTCTCCAGGGCCC;SOR=3.524;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=18;TCR=105;TR=123;WE=163836384;WS=163836366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr6	163837086	.	TGGGGG	T	388.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.839;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=17.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.40;ReadPosRankSum=4.265;SOR=0.011;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr6	164891959	rs73024871	C	T	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.50;MQRankSum=-0.130;QD=4.61;ReadPosRankSum=-0.499;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,24:0.26:94
chr6	164891969	rs75907516	T	TTTC	3701.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=54;PP=2984;SC=CAGCTGAGTCTTTCTTTCTTT;SOR=1.882;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=71;TCF=11;TCR=60;TR=65;WE=164891977;WS=164891949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr6	164962859	rs144747014	TCTTC	T	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.253;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr6	165108555	rs79222572	T	G	4362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-6.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.145;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=55;PP=2962;ReadPosRankSum=0.296;SC=AATATTCCCCTGATATATGTT;SOR=0.416;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=259;TCF=184;TCR=75;TR=178;WE=165108563;WS=165108545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,181:0.69:263
chr6	165108670	rs13191120	C	T	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=57;PP=1218;ReadPosRankSum=0.176;SC=CTCATTTTCTCGTTTCCTCCA;SOR=0.670;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=211;TCF=39;TCR=172;TR=67;WE=165108678;WS=165108660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,73:0.32:229
chr6	165108725	rs13220455	G	A	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=475;ReadPosRankSum=0.193;SC=GTTTTCTTCCGTTTTTTCATT;SOR=0.677;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=83;TCF=1;TCR=82;TR=25;WE=165108733;WS=165108715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,29:0.32:90
chr6	165694945	rs1333501	C	G	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=278;ReadPosRankSum=-0.296;SC=TGCTCTAGTTCTTTTATCATG;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=11;WE=165694953;WS=165694935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr6	165695049	rs2275216	G	T	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=442;ReadPosRankSum=-0.043;SC=CGATCAGTTGGTCATGCTTAT;SOR=0.596;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=19;WE=165695057;WS=165695039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr6	165712927	rs56325343	G	A	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.024;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=13;PP=352;ReadPosRankSum=-0.232;SC=GTGATCGATCGTCACCTCGTA;SOR=0.721;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=73;TCF=38;TCR=35;TR=25;WE=165712935;WS=165712917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,26:0.35:74
chr6	165713961	rs510579	A	C	1471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=31;PP=1185;SC=TGCACGTGCAAATTTTCTGGA;SOR=2.059;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=43;WE=165713969;WS=165713951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr6	165713998	rs573814	C	T	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=26;PP=870;SC=CAGAGTCAGCCCATTTCAGGG;SOR=3.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=165714006;WS=165713988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
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chr6	165832227	rs220740	C	T	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=1.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.12;ReadPosRankSum=1.173;SOR=0.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,37:0.24:152
chr6	165845027	rs148704004	AATATACTATATATC	A	614.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.236;NF=0;NR=14;PP=2589;ReadPosRankSum=-0.197;SC=TACTATATATAATATACTATA;SOR=0.357;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=14;WE=165845048;WS=165845017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr6	165862295	rs2274577	A	G	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=136;ReadPosRankSum=-0.435;SC=ATAGAAACAAAACACAAAATG;SOR=0.180;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=8;WE=165862303;WS=165862286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr6	165863695	rs57550533	C	CA	5105.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=80;NR=34;PP=2936;SC=AATCTTTGCCCATTTTTTCTA;SOR=2.156;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=83;TCR=35;TR=114;WE=165863703;WS=165863685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr6	165989776	rs1410479	C	T	4872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=122;NR=16;PP=2965;SC=AAACAAAGTTCTCATCAATTG;SOR=3.852;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=122;TCR=16;TR=138;WE=165989784;WS=165989766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr6	165989849	rs73022128	T	C	5404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.279;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=84;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.022;SC=TTCCTGTCTATCTGAATGTCC;SOR=0.534;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=299;TCF=174;TCR=125;TR=195;WE=165989857;WS=165989839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,204:0.66:311
chr6	166075362	rs6456003	G	T	992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=4;PP=779;SC=CACCCAGCAGGCCAAGCCCCC;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=166075370;WS=166075352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr6	166307718	rs6456029	T	C	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=2.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.99;ReadPosRankSum=1.890;SOR=1.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,25:0.23:110
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chr6	166401512	rs697475	T	A	940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=25;PP=834;SC=TTGGGGGTGCTTGTGCTCTCA;SOR=2.910;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=166401520;WS=166401502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr6	166571935	rs35819705	C	T	3490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=71;PP=2507;ReadPosRankSum=-0.484;SC=AGGAAGAGGGCGCCGAGACCG;SOR=0.729;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=165;TCF=72;TCR=93;TR=125;WE=166571943;WS=166571925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,138:0.76:181
chr6	166574246	rs3127334	G	A	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.143;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=7;PP=643;ReadPosRankSum=0.188;SC=AGGACTAAGGGCCTATGGGAA;SOR=2.046;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=54;TCF=40;TCR=14;TR=35;WE=166574254;WS=166574236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,36:0.64:56
chr6	166576161	rs2278678	T	A	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.758;NF=7;NR=14;PP=337;ReadPosRankSum=0.699;SC=TCCCTCCATCTCTCCAGAGAG;SOR=0.546;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=21;WE=166576169;WS=166576151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr6	166579270	rs2305089	C	T	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=755;ReadPosRankSum=0.093;SC=GCGCTGTGGACCCCCAACTCT;SOR=0.580;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=43;TCR=15;TR=35;WE=166579278;WS=166579260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,35:0.64:55
chr6	166581147	rs3099266	T	C	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.014;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=261;ReadPosRankSum=0.336;SC=CCACCTTCCCTGCTCTTGGCC;SOR=2.867;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=15;WE=166581155;WS=166581137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
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chr6	166721211	rs13204594	G	T	2770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.106;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=44;PP=2093;ReadPosRankSum=-1.125;SC=CGGCCTCGGGGGTGAGATTCA;SOR=0.068;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=95;TCF=51;TCR=44;TR=92;WE=166721232;WS=166721201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,95:0.97:98
chr6	166721224	rs7757150	C	G	3002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=43;PP=2267;SC=GAGATTCAGGCAGAAGCGCGC;SOR=0.845;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=52;TCR=43;TR=94;WE=166721232;WS=166721201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr6	166721424	rs13205770	C	T	227.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.922;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5065;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=150;ReadPosRankSum=0.253;SC=GAGGGGCCGGCGGCTGCGTCC;SOR=0.582;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=8;WE=166721432;WS=166721414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
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chr6	166796433	rs1546854	C	A	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=414;ReadPosRankSum=1.270;SC=AATGACACCCCGGCCAACCCC;SOR=0.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=2;TCR=50;TR=21;WE=166796441;WS=166796423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr6	166826255	rs909631	G	A	2248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=10;PP=1770;SC=ACCCGCTACAGCCGCGTGGAC;SOR=3.290;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=58;TCR=10;TR=68;WE=166826263;WS=166826245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
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chr6	166827436	rs2235295	T	C	2121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=52;PP=1554;SC=GGGAAGGTCATGAGAGTCGGG;SOR=2.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=69;WE=166827444;WS=166827426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr6	166831694	rs10946164	C	T	2732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=27;PP=2213;SC=TTAAAAGCAACGCTGGGACAT;SOR=1.691;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=60;TCR=27;TR=86;WE=166831702;WS=166831684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
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chr6	166862420	.	C	T	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.569;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=187;ReadPosRankSum=-0.542;SC=GAATGTGGGGCGAAGAGAGGC;SOR=0.737;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=11;WE=166862428;WS=166862410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr6	166952264	rs1003857	G	A	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=41;PP=1206;SC=CCTTCACGACGCCTTCTTCCT;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=10;TCR=41;TR=51;WE=166952272;WS=166952254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	167271711	rs943687	T	C	7193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.86;SOR=1.806;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr6	167271716	rs9347162	T	C	6857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.12;SOR=2.272;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr6	167360389	rs2236313	T	C	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=41;ReadPosRankSum=-0.873;SC=AGAAAGAAGATGCAGGTAAGA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=5;WE=167360397;WS=167360379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr6	167411287	.	A	G	2297	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=53;MMLQ=28;MQ=58.74;NF=26;NR=6;PP=2297;QD=72.8678503921;SC=TCACAGACAGAAACACAGAGA;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=32;WE=167411309;WS=167411277;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,32:0.78:41
chr6	167411388	rs73024234	C	G	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=20.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.943;SOR=1.763;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,18:0.16:110
chr6	167411401	rs73024236	C	T	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=20.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.40;ReadPosRankSum=0.293;SOR=2.257;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,18:0.15:117
chr6	167413132	.	GC	G	32	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=32;QD=31.5;SC=CTGGGGGCGCGCCCCGGCATG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=167413140;WS=167413122;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr6	167413539	rs12212247	T	C	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.146;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=30;PP=952;ReadPosRankSum=2.572;SC=TTCTTAACTTTTTTTTAAGGC;SOR=0.458;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=67;TCF=16;TCR=51;TR=41;WE=167413547;WS=167413529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,42:0.63:67
chr6	167424293	rs1322077	T	C	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=3;PP=1008;ReadPosRankSum=0.686;SC=TAAACTAAAATATTTTAGGGT;SOR=1.179;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=64;TCF=59;TCR=5;TR=42;WE=167424301;WS=167424283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,44:0.67:66
chr6	167435747	rs10624685	A	AACAC	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=95;ReadPosRankSum=-1.282;SC=GAGCTGCCCCAACACACACAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=7;WE=167435755;WS=167435744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr6	167435798	rs141889698	C	CACAA	696.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.682;NF=22;NR=0;PP=857;ReadPosRankSum=-1.304;SC=GTTGCACACACACAGGTTTGA;SOR=1.708;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=22;WE=167435806;WS=167435788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
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chr6	167440128	rs2282861	C	T	1642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=19;PP=1257;ReadPosRankSum=-0.072;SC=AGTTTTTGTGCTGATCGTTTT;SOR=0.734;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=92;TCF=62;TCR=30;TR=60;WE=167440136;WS=167440118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,62:0.66:94
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chr6	167592464	rs60509455	A	G	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.55;QD=33.99;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr6	167592656	rs4710193	G	C	1419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=37;PP=917;SC=CTGTAAAGTGGGGGGCTTTCT;SOR=2.259;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=49;WE=167592664;WS=167592646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr6	167595371	rs202096111	T	C	62.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.24;QD=20.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr6	167622070	rs671511	C	T	201.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.24;QD=28.83;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	167622105	rs28661326	A	G	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.070;NF=9;NR=3;PP=204;ReadPosRankSum=-2.231;SC=CATCCTCCTCAGACCTCACTG;SOR=1.112;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=12;WE=167622113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr6	167622205	rs28588506	G	A	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=3.388;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.49;MQRankSum=-1.476;QD=28.24;ReadPosRankSum=-0.726;SOR=0.626;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr6	167704944	rs2076005	T	G	1793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=5.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.542;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=10;PP=1505;ReadPosRankSum=0.420;SC=CAAATTTACGTGTTCACTGGT;SOR=1.783;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=83;TCF=66;TCR=17;TR=60;WE=167704952;WS=167704934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,61:0.73:84
chr6	167711243	rs1555032	C	T	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=477;ReadPosRankSum=0.421;SC=TGTCTTAAATCGAGTCTAGGG;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=19;WE=167711251;WS=167711236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr6	167711418	rs1555033	A	G	2723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.303;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=54;PP=2011;ReadPosRankSum=0.913;SC=TCTCCTGTCCACTCTGACTTC;SOR=0.576;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=77;TCR=83;TR=105;WE=167711426;WS=167711408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,109:0.67:163
chr6	167719436	rs2072767	G	A	1669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=31;PP=1204;ReadPosRankSum=0.154;SC=CATCCAGTTCGTCGGCTACGT;SOR=0.717;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=115;TCF=58;TCR=57;TR=64;WE=167719444;WS=167719426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,66:0.55:121
chr6	167728774	rs663606	TG	CA	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.646;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.243;NF=12;NR=13;PP=1245;ReadPosRankSum=-0.271;SC=GGGTACAGCATGTTTTTGTGC;SOR=0.779;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=56;TCF=24;TCR=32;TR=25;WE=167728783;WS=167728764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,21:0.40:53
chr6	167752312	.	G	GTTCCTTCC	488.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=8;PP=440;SC=AAGCCAGGTAGTTCCTTCCTT;SOR=3.258;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=9;WE=167752320;WS=167752302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	167754661	rs909545	A	G	3224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=69;PP=2547;ReadPosRankSum=-1.202;SC=AAATGAGGGGAGAGAAGCCAG;SOR=0.692;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=157;TCF=59;TCR=98;TR=109;WE=167754669;WS=167754651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,116:0.70:165
chr6	167771426	rs4616972	G	A	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.78;QD=27.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	167772755	rs61091709	C	T	5153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.96;NF=127;NR=23;PP=2965;SC=GGGGATGTTTCGAATTCGCAT;SOR=3.334;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=127;TCR=23;TR=150;WE=167772763;WS=167772745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr6	167786551	rs146852129	T	G	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.04;MQRankSum=-0.810;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.660;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr6	167786554	.	T	C	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.04;MQRankSum=-0.810;QD=6.71;ReadPosRankSum=0.660;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr6	167786961	rs151165498	G	T	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.21;MQRankSum=0.349;QD=15.15;ReadPosRankSum=-1.502;SOR=0.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
chr6	167786961	.	GGC	TGT	2057	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=24;MQ=43.65;NF=0;NR=41;PP=2057;QD=51.4748262162;SC=TAAGTCAGTGGGCGCGGCTGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=93;TCF=0;TCR=93;TR=41;WE=167786971;WS=167786951;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:52,41:0.44:93
chr6	167786963	rs201342351	C	T	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.65;MQRankSum=0.539;QD=15.58;ReadPosRankSum=-1.549;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,29:0.41:70
chr6	167789404	rs28409124	C	G	1421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=13;PP=1130;SC=AGAAAGCCCCCCACTTTACAG;SOR=2.170;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=51;WE=167789412;WS=167789394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
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chr6	167796319	rs17855833	T	C	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.10;MQRankSum=1.240;QD=16.63;ReadPosRankSum=-0.626;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr6	167796415	rs9457321	A	C	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.302;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.429;NF=10;NR=6;PP=335;ReadPosRankSum=1.745;SC=TCCTTGGGCTACCCGGCCTCG;SOR=0.877;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=42;TCF=22;TCR=20;TR=16;WE=167796423;WS=167796405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr6	167907609	.	T	TAC	458.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=744;SC=CAAATACACCTACACACATGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=167907632;WS=167907599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	167907623	.	TAC	T	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.23;ReadPosRankSum=-0.072;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,3:0.19:16
chr6	167907677	.	T	TACAC,TACACACAC	1869.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.13;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=38,38;NR=3,3;PP=350,1193;SC=CACTGATACATACACACACAC;SOR=4.565;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=41,41;WE=167907685;WS=167907667;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.76,0.24:41
chr6	168060261	rs201934756	CACACACAT	C	652.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.992;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.256;NF=0;NR=18;PP=1516;ReadPosRankSum=-0.735;SC=TGTAGATACACACACACATAC;SOR=1.197;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=3;TCR=56;TR=18;WE=168060276;WS=168060251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr6	168070425	rs4708607	C	T	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.453;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=33;PP=805;ReadPosRankSum=2.620;SC=TGAACACTGCCTTCTCATGTG;SOR=1.883;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=70;TCF=14;TCR=56;TR=38;WE=168070433;WS=168070415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,38:0.54:70
chr6	168070483	rs9355041	A	G	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=27;PP=790;SC=ACCAAAGGAAAAAGAGGCTGA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=168070491;WS=168070473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr6	168265102	rs2301530	A	G	4091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=87;PP=2965;SC=ATCTCTCTACATTAGTCTCAG;SOR=1.539;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=44;TCR=87;TR=131;WE=168265110;WS=168265092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr6	168297757	rs11459878	C	CT	1651.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=40;PP=1788;SC=TAATTACCGACTTGTATTTAA;SOR=3.080;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=43;WE=168297765;WS=168297747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr6	168298875	rs9346511	C	T	2366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=22;PP=1832;SC=TGGTTTCCTTCGGTTTCCAGT;SOR=1.874;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=74;TCF=52;TCR=22;TR=73;WE=168298883;WS=168298865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr6	168316118	rs3213591	T	G	1217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=27;PP=1009;SC=GTGCAGGTGATTGCTGGTGCC;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=37;WE=168316126;WS=168316108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	168317994	rs9364207	C	T	2643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=72;PP=2152;SC=AAAGGAAATCCTATTTAATAC;SOR=7.302;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=73;TCF=1;TCR=72;TR=73;WE=168318002;WS=168317984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr6	168323664	rs2301533	A	G	7382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=124;PP=2965;SC=GGTACCATGAAGTGAAATGGA;SOR=0.993;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=221;TCF=97;TCR=124;TR=221;WE=168323672;WS=168323654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr6	168323754	rs639777	G	A	2647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=76;PP=2175;SC=TTTTAAAATCGCTGTTAAATA;SOR=3.586;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=92;TCF=11;TCR=81;TR=87;WE=168323762;WS=168323744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr6	168343838	rs1132306	T	C	4394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=61;PP=2965;SC=TAGGAATCTATGTGAAGTCGG;SOR=0.978;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=76;TCR=61;TR=137;WE=168343846;WS=168343828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr6	168344880	rs9346632	T	C	216.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=5;PP=147;SC=CGCTTCAGCATAGTGCCTGGG;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=168344888;WS=168344870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr6	168348504	rs35550837	CT	C	4153.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=36;PP=2576;SC=TAATATTACACTTTTTTTTTT;SOR=2.455;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=162;TCF=110;TCR=52;TR=131;WE=168348513;WS=168348494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr6	168376847	rs77867907	C	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQRankSum=-1.242;QD=11.22;ReadPosRankSum=1.579;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr6	168376880	.	T	TG	1279	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=35;MMLQ=28;MQ=52.76;NF=1;NR=6;PP=1279;QD=187.714285714;SC=CCCTGCAGTGTTGGGGGAGGA;SbPval=0.03;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=7;WE=168376900;WS=168376856;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:21,7:0.25:28
chr6	168376882	.	G	GT	1178	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=4;HapScore=3;MGOF=35;MMLQ=28;MQ=51.29;NF=1;NR=6;PP=1178;QD=172.714285714;SC=CTGCAGTGTTGGGGGAGGAGA;SbPval=0.03;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=7;WE=168376900;WS=168376856;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:18,7:0.28:25
chr6	168376892	.	A	G	785	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=35;MMLQ=29;MQ=48.85;NF=4;NR=6;PP=785;QD=81.9771212547;SC=GGGGGAGGAGAAGGCAGTGGG;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=10;WE=168376900;WS=168376856;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:24,10:0.29:34
chr6	168376908	.	T	C	191	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=78;MMLQ=28;MQ=47.64;NF=6;NR=7;PP=191;QD=17.3670163498;SC=GTGGGGGTCATTCCCCCTGCA;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=13;WE=168376916;WS=168376898;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:23,13:0.36:36
chr6	168376925	.	G	GT	478	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=58;MMLQ=27;MQ=46.57;NF=4;NR=5;PP=478;QD=56.3333333333;SC=TGCAGTGTGTGGGGAAGGAGG;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=9;WE=168376937;WS=168376915;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr6	168376929	.	A	G	472	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=58;MMLQ=27;MQ=45.67;NF=6;NR=4;PP=472;QD=50.6771212547;SC=GTGTGTGGGGAAGGAGGAGGC;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=10;WE=168376937;WS=168376915;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr6	168376953	rs2516607	A	C	249.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.96;QD=31.22;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr6	168430555	rs60520213	TA	T	79.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=86;ReadPosRankSum=-0.361;SC=GAACACCTCATAAGGGTCCCC;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=168430563;WS=168430545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr6	168457801	rs3734898	A	G	2454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=24;PP=1981;SC=CCTGTGGTGGAGCCTCTCCGA;SOR=1.488;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=49;TCR=24;TR=73;WE=168457809;WS=168457791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr6	168459845	rs1548349	G	C	1209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=15;PP=892;SC=GTCCTGACCTGGGTGCAGGGC;SOR=1.206;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=38;WE=168459853;WS=168459835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr6	168462626	rs12197610	G	A	597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=8;PP=445;SC=TCTGTGCTGCGGGCAGCCCAT;SOR=0.990;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=20;WE=168462634;WS=168462616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr6	168467737	rs3816861	G	A	4457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=79;PP=2965;SC=GGCGGGCTTCGGGCGGGCACA;SOR=0.996;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=139;TCF=60;TCR=79;TR=137;WE=168467745;WS=168467727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr6	168468186	rs6906979	G	T	2489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=38;PP=1874;SC=GTGTCACCGTGTGTTCAAAAC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=37;TCR=38;TR=75;WE=168468194;WS=168468176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr6	168475764	rs9364396	G	T	2337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=3;PP=1873;SC=GTACATGTGAGTGGTGTGTAA;SOR=5.255;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=67;TCR=3;TR=70;WE=168475772;WS=168475754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr6	168475822	rs3816859	A	G	4117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=38;PP=2965;SC=AGAGTGGTGTATAACTGTGTA;SOR=1.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=81;TCR=38;TR=119;WE=168475830;WS=168475812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr6	168476198	rs2306943	A	G	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=7;PP=555;SC=CCATCAGAGCACCTGTGAGTG;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=23;WE=168476206;WS=168476188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr6	168476532	.	CGTGTCCACATTTCCGGTGCCCGGTGTCCACATTTCCGGCGTCCCGTGTCCACATTTCCGGTGCCCG	C	903	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=23;MQ=63.37;NF=0;NR=12;PP=903;QD=78.1666666667;SC=TCCGGCGTCCCGTGTCCACAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=12;WE=168476605;WS=168476522;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:27,12:0.31:39
chr6	168479604	rs34054991	G	A	3791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=15;PP=2965;SC=GCAGCAGCACGAGGACATCCC;SOR=3.767;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=103;TCR=15;TR=118;WE=168479612;WS=168479594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr6	168479790	rs11750985	C	T	4730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=117;PP=2965;SC=CGTTACTCGGCCCTCCCCCGC;SOR=2.864;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=30;TCR=117;TR=147;WE=168479798;WS=168479780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr6	168482110	rs4708429	C	T	1418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=29;PP=1054;SC=GGGCAGTGGACGGGCAGAGGC;SOR=1.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=168482118;WS=168482100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr6	168482329	rs4708430	C	T	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=112;SC=AATGCTGTTCCGTGGTGAGAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=168482337;WS=168482319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr6	168694594	rs7764061	C	T	2364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=29;PP=1816;SC=CTTGAAATTCCTGATGATTTT;SOR=1.223;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=46;TCR=29;TR=75;WE=168694602;WS=168694584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr6	168694788	rs56060091	C	G	3384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=24;PP=2891;ReadPosRankSum=0.497;SC=CCGAAGCACACAGACAGTGAG;SOR=1.161;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=76;TCR=24;TR=99;WE=168694796;WS=168694778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
chr6	168695255	.	GTGTATATA	G,GTA	446.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.15;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=21,21;NR=2,2;PP=217,513;SC=GTGTGTGTGTGTGTATATATA;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=23,23;WE=168695270;WS=168695245;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.56,0.44:16
chr6	168695309	rs4708710	C	T	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=6;PP=1614;SC=ACATCCTTCCCTACCTGTCAG;SOR=3.467;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=44;WE=168695317;WS=168695299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr6	168695345	rs4708711	G	A	2207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=20;PP=1721;SC=GCCTGCAGGCGGAGCATGCAT;SOR=1.819;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=47;TCR=20;TR=67;WE=168695353;WS=168695335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr6	168708045	rs12530360	T	C	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.574;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=289;ReadPosRankSum=-0.999;SC=AACCCAGACATGCACAGGACA;SOR=0.065;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=16;WE=168708053;WS=168708035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr6	168708751	rs10945499	A	G	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.845;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=11;PP=727;ReadPosRankSum=0.934;SC=GGGTGGACTCAGAACAGGAGC;SOR=1.150;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=127;TCF=91;TCR=36;TR=44;WE=168708759;WS=168708741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,43:0.33:131
chr6	168708793	rs10945500	C	G	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.035;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=11;PP=1010;ReadPosRankSum=1.430;SC=GGGCTGGCCTCCGCTGGAGCC;SOR=1.516;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=133;TCF=94;TCR=39;TR=50;WE=168708801;WS=168708783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,51:0.37:139
chr6	168708816	rs10945501	T	G	1336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=6.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.485;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=16;PP=1037;ReadPosRankSum=-0.951;SC=CCCCTCCCTGTGGGCCAGTGG;SOR=0.876;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=131;TCF=88;TCR=43;TR=50;WE=168708824;WS=168708806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,52:0.38:138
chr6	168709147	rs41266321	G	A	1125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.037;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=33;ReadPosRankSum=-0.216;SC=TGAGGACACAGCTGTTTGAGG;SOR=1.489;Source=Platypus;TCR=84;TR=52;WE=168709155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,53:0.32:168
chr6	168709385	rs6925614	T	C	1539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FS=3.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.40;ReadPosRankSum=-2.053;SOR=0.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:208,77:0.27:285
chr6	168711170	rs1551988	A	G	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=4.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.01;ReadPosRankSum=-0.187;SOR=1.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,16:0.24:67
chr6	168711797	rs899519	G	C	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=201;ReadPosRankSum=2.063;SC=CTGCGTGCCTGCCCCTGTGTC;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=9;WE=168711805;WS=168711787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr6	168841991	.	CG	C	263.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=293;ReadPosRankSum=-0.253;SC=TGGGCTCTCCCGGCTGCAGTG;SOR=2.303;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=9;WE=168841999;WS=168841981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr6	168927213	rs12111003	G	A	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=44;ReadPosRankSum=1.465;SC=GAAGGCAGGTGGGGGGAGCCG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=168927221;WS=168927203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr6	168928225	rs2224209	G	A	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=1;PP=227;SC=AGCCACTGCCGCAGAAAGCAG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=168928233;WS=168928215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr6	168928251	rs2609287	C	T	389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=3;PP=300;SC=GCCTCGCAGCCGTGAGGCGCT;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=168928259;WS=168928241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr6	168928519	rs2609286	C	T	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=30;PP=872;SC=CCAGTTTGGCCGGCATTGTGA;SOR=3.797;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=33;WE=168928527;WS=168928509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	169008945	rs3734421	C	T	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.759;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=29;PP=525;ReadPosRankSum=0.657;SC=GAGTGTGGCCCGAATCCACAG;SOR=1.502;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=96;TCF=21;TCR=75;TR=34;WE=169008953;WS=169008935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,35:0.36:97
chr6	169056208	rs183368835	G	A	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=10;PP=205;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CTGCACATGCGTGCTAGATAC;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=10;WE=169056216;WS=169056198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr6	169064933	rs2275919	T	C	4935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=79;PP=2965;SC=GCAAGCTTACTGACTACACCC;SOR=0.789;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=162;TCF=83;TCR=79;TR=162;WE=169064941;WS=169064923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr6	169065064	.	CTTTTTTTTTTTTTTTT	C	639.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=3.039;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=35.55;ReadPosRankSum=1.622;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,16:0.89:18
chr6	169617840	rs12435	A	G	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.99;ReadPosRankSum=1.751;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,6:0.19:31
chr6	169617896	rs182421013	C	T	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=11;PP=473;ReadPosRankSum=-0.384;SC=AGGGCATTGCCGGAAATGCAG;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=25;WE=169617904;WS=169617886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,25:0.71:35
chr6	169617934	rs58423957	GA	G	92.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=3.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.71;ReadPosRankSum=2.069;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr6	169619687	rs9800623	G	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=103;ReadPosRankSum=-0.919;SC=GGATCCACCCGCCTTGGCCTC;SOR=0.197;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=7;WE=169619695;WS=169619677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr6	169619933	rs113367461	T	TTTCCTTCC	335.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.78;MQRankSum=3.743;QD=6.58;ReadPosRankSum=-1.289;SOR=0.853;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,12:0.24:51
chr6	169620247	rs9393165	T	C	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=64;ReadPosRankSum=-0.707;SC=TTTCCCTTTCTGGGTGCCACA;SOR=0.336;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=6;WE=169620255;WS=169620237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr6	169620450	rs140725844	AAAG	A	467.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=1.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=2.740;QD=5.92;ReadPosRankSum=-0.231;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,17:0.22:79
chr6	169620541	rs36045897	G	A	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=136;ReadPosRankSum=-0.826;SC=TGGATACTCCGCCCAGGGCTT;SOR=0.204;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=8;WE=169620549;WS=169620531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr6	169621536	rs1132742	A	G	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.462;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=28;PP=735;ReadPosRankSum=0.778;SC=TGATGTAGCCAGTCTTGGGCC;SOR=0.462;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=146;TCF=45;TCR=101;TR=43;WE=169621544;WS=169621526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,45:0.30:152
chr6	169622490	rs9505895	G	A	1631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.381;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=39;PP=1097;ReadPosRankSum=-1.327;SC=AGACGAAGCCGGCATAGTCGT;SOR=0.892;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=236;TCF=114;TCR=122;TR=71;WE=169622498;WS=169622480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,75:0.31:241
chr6	169622638	rs59244158	C	A	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.224;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.746;NF=2;NR=22;PP=418;ReadPosRankSum=-1.295;SC=GCCTGTAATCCCAGCACTTTG;SOR=0.223;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=69;TCF=3;TCR=66;TR=24;WE=169622646;WS=169622628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,23:0.34:68
chr6	169628169	rs33928942	CAA	C	209.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQRankSum=2.116;QD=7.23;ReadPosRankSum=-0.092;SOR=0.264;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr6	169629783	rs6422747	G	A	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.721;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=34;PP=898;ReadPosRankSum=-0.188;SC=TCCTGCAATTGGAGAAGGAAG;SOR=1.317;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=176;TCF=72;TCR=104;TR=50;WE=169629791;WS=169629773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,50:0.27:185
chr6	169629910	rs6422748	G	C	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.614;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=232;ReadPosRankSum=-0.034;SC=AGCGGGAGCTGAGAGAGGAGC;SOR=0.033;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=50;TCF=1;TCR=49;TR=15;WE=169629918;WS=169629900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,14:0.27:51
chr6	169632378	rs74417889	C	T	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=296;ReadPosRankSum=0.023;SC=CACCGCAGGCCCCAGCAGGTC;SOR=0.235;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=52;TCF=2;TCR=50;TR=17;WE=169632386;WS=169632368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,17:0.34:50
chr6	169634809	rs9393156	C	T	7584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=117;NR=117;PP=2965;SC=TCAGTGCCCCCGCTTCTACCC;SOR=0.743;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=234;TCF=117;TCR=117;TR=234;WE=169634817;WS=169634799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr6	169635010	rs9406328	G	A	1224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=32;PP=982;SC=CGACTGCGGGGAAAGCCAACC;SOR=3.500;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=36;WE=169635028;WS=169635000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr6	169635020	rs55916292	CA	C	1360.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=32;PP=1430;SC=GAAAGCCAACCAGGGGGAGCT;SOR=4.294;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=34;WE=169635028;WS=169635000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr6	169637456	rs9283850	G	A	1909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.903;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=47;PP=1432;ReadPosRankSum=1.079;SC=CACAAGAAGCGGAGAGAGATC;SOR=1.060;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=100;TCF=29;TCR=71;TR=64;WE=169637464;WS=169637446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,69:0.64:107
chr6	169637519	rs9283851	C	T	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.729;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=596;ReadPosRankSum=-0.998;SC=CCTTATTAACCGAGGAGCATC;SOR=1.201;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=27;WE=169637527;WS=169637509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,29:0.55:53
chr6	169637701	rs12661185	T	A	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.326;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=260;ReadPosRankSum=0.475;SC=CACGCGGGTGTCACCTGCCCG;SOR=1.051;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=62;TCF=48;TCR=14;TR=17;WE=169637709;WS=169637691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,17:0.28:60
chr6	169637911	rs9766678	G	A	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.102;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=35;PP=1125;ReadPosRankSum=-0.227;SC=AAGCAAACACGGTGGCATCAG;SOR=0.551;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=68;TCF=20;TCR=48;TR=51;WE=169637919;WS=169637901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,52:0.74:70
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chr6	169639901	rs9379336	C	T	1147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=6.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=37;PP=972;ReadPosRankSum=-1.185;SC=TTCCATCCTACGGACCATACA;SOR=0.680;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=6;TCR=60;TR=41;WE=169639909;WS=169639891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,41:0.60:68
chr6	170036309	rs7775504	A	C	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=102;ReadPosRankSum=-0.613;SC=GTTTAAAATGAGTAGGATCTG;SOR=0.641;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=8;WE=170036317;WS=170036303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr6	170043646	rs9295020	A	G	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=486;ReadPosRankSum=0.025;SC=AGATCTCAGTAAATCTAGTTT;SOR=0.312;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=58;TCR=0;TR=22;WE=170043654;WS=170043636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr6	170049421	rs4145868	T	G	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=371;ReadPosRankSum=-0.570;SC=GAGGTCTAAGTTTCTTAAGAG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=18;WE=170049429;WS=170049411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,19:0.40:48
chr6	170060970	rs4716373	TG	CA	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQRankSum=0.500;QD=1.67;ReadPosRankSum=-2.235;SOR=0.884;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,7:0.12:59
chr6	170118085	rs7760142	C	T	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=11;PP=295;SC=AAAACCTTGACTTTTTAAAGT;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=170118093;WS=170118075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr6	170156683	rs9478102	T	C	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.675;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=310;ReadPosRankSum=-1.013;SC=TTTTGAATGATTATGAAATCA;SOR=0.105;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=14;WE=170156691;WS=170156673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr6	170159023	rs6459660	G	A	2747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.032;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=11;PP=2235;ReadPosRankSum=0.478;SC=GGTTTATTCAGTAATTCAGTA;SOR=0.505;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=145;TCF=129;TCR=16;TR=94;WE=170159031;WS=170159013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,97:0.65:150
chr6	170160243	rs140228395	GCCT	G	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=136;ReadPosRankSum=-0.405;SC=CCAAAGCCCTGCCTCCTCCCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=170160253;WS=170160233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr6	170162515	rs9478006	A	C	3668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.927;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=34;PP=2957;ReadPosRankSum=-1.872;SC=TTTTCCCTTCAATTTCATAGG;SOR=0.856;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=205;TCF=150;TCR=55;TR=130;WE=170162523;WS=170162505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,135:0.63:214
chr6	170173277	rs9478007	G	A	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=0;PP=1020;ReadPosRankSum=0.806;SC=TTTTAATGAAGCACTTGCTTT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=69;TCR=0;TR=42;WE=170173285;WS=170173267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,44:0.63:70
chr6	170190200	rs3807067	G	A	2044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=18;PP=1600;ReadPosRankSum=-1.451;SC=GGCAGCAGAAGTGCAGCTGAC;SOR=0.789;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=78;TCR=26;TR=72;WE=170190208;WS=170190190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,73:0.69:106
chr6	170591923	rs1033583	T	G	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=369;ReadPosRankSum=0.133;SC=ATTTTACTTATTTTAAGAGAA;SOR=0.892;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=18;WE=170591931;WS=170591913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr6	170592020	rs1546951	C	G	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.372;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=382;ReadPosRankSum=-1.286;SC=TTCCCGTGCTCCAGCTTCAGG;SOR=0.263;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=64;TCF=49;TCR=15;TR=23;WE=170592028;WS=170592010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,25:0.35:71
chr6	170594819	rs2255020	T	C	3891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=82;PP=2965;SC=CAGATGGACGTTGACTGTTGC;SOR=1.951;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=33;TCR=82;TR=115;WE=170594827;WS=170594809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr6	170595430	rs2747757	G	C	2135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=7.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.906;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=66;PP=1699;ReadPosRankSum=-0.655;SC=CGCCAAGTACGTCCCAACAGG;SOR=1.863;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=96;TCF=2;TCR=94;TR=67;WE=170595438;WS=170595420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,70:0.70:100
chr6	170598204	rs2295204	G	A	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=447;ReadPosRankSum=0.827;SC=ATTTTTCTTGGGGGATGGGCA;SOR=0.763;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=26;WE=170598212;WS=170598194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr6	170598227	rs2747756	T	G	2348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=20;PP=1575;SC=CTCCGGGTGGTAGCGGTCGCG;SOR=1.467;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=39;TCR=20;TR=59;WE=170598235;WS=170598217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr6	170626943	rs3800266	T	C	3625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.157;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=63;PP=2785;ReadPosRankSum=1.412;SC=CTTTGTGTTCTTTGCAGGAAG;SOR=0.593;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=188;TCF=86;TCR=102;TR=120;WE=170626951;WS=170626933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,125:0.64:196
chr6	170627586	rs6917485	G	T	11758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-8.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=492;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.163;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.936;NF=157;NR=151;PP=2962;ReadPosRankSum=0.629;SC=CGTGTATACAGATTCTGAACC;SOR=0.588;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=472;TCF=244;TCR=228;TR=308;WE=170627594;WS=170627576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,317:0.65:485
chr6	170627614	rs6905356	T	C	11978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=507;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.892;NF=167;NR=152;PP=2962;ReadPosRankSum=0.871;SC=GAAGTTCCCATGTGTTCAGAC;SOR=0.718;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=482;TCF=250;TCR=232;TR=319;WE=170627622;WS=170627604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,332:0.66:500
chr6	170627695	.	A	ACCCTGAACCCAGGCAAGAAGTTCCCATGTGTACAGG	6299.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=0.000;DP=428;ExcessHet=3.0103;FS=4.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQRankSum=-6.051;QD=29.03;ReadPosRankSum=2.514;SOR=0.984;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,115:0.53:217
chr6	170627761	rs6900199	A	G	8477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.039;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.316;NF=160;NR=154;PP=2962;ReadPosRankSum=0.531;SC=GTTCCCATGTATACAGACTCT;SOR=0.553;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=483;TCF=235;TCR=248;TR=314;WE=170627769;WS=170627751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,243:0.61:396
chr6	170627797	rs9366138	A	G	8145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.437;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.877;NF=129;NR=121;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.451;SC=GTTCCCATGTATACAGACTCT;SOR=0.796;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=388;TCF=195;TCR=193;TR=250;WE=170627805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,244:0.68:361
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chr6	170628231	rs7774272	C	A	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.156;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=35;PP=734;ReadPosRankSum=-0.056;SC=ATCTGCCCAGCCAATATGCCA;SOR=1.270;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=103;TCF=10;TCR=93;TR=37;WE=170628239;WS=170628221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,37:0.36:103
chr6	170632383	rs3800267	A	G	1442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.088;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=38;PP=1157;ReadPosRankSum=-0.329;SC=TAAAGGTTCTATTTGGAGTTG;SOR=1.000;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=74;TCF=23;TCR=51;TR=54;WE=170632391;WS=170632373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,54:0.73:74
chr6	170667530	rs3734773	C	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.553;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=37;ReadPosRankSum=-1.264;SC=AGGATCTTTTCGTGATGCAGT;SOR=0.008;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=6;WE=170667538;WS=170667520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr6	170713503	rs4710719	C	G	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=47;ReadPosRankSum=-1.285;SC=GTGGCCACAACTGTAAAGAGG;SOR=0.095;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=5;WE=170713511;WS=170713493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr6	170845354	rs9348278	A	G	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.733;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=294;ReadPosRankSum=0.336;SC=TGTATAAACTATATGTAGATA;SOR=0.124;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=14;WE=170845362;WS=170845344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr6	170858045	rs2076319	C	T	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=656;ReadPosRankSum=-0.296;SC=CTCACAACATCAAATCATTAC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=26;WE=170858053;WS=170858035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,27:0.64:42
chr6	170862051	rs4710839	G	C	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=151;ReadPosRankSum=-0.791;SC=GGAAACACAGGGCATGAGAGG;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=170862059;WS=170862041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr6	170862300	rs12717	G	C	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=648;ReadPosRankSum=1.173;SC=TCTCTGCCAGGAGCCGAATAC;SOR=0.709;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=30;WE=170862308;WS=170862290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,32:0.63:51
chr6	170871013	.	A	ACAG	1450	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=60.5;NF=22;NR=27;PP=1450;QD=29.7755102041;SC=AGCAACAACAACAGCAGCAGC;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=69;TCF=29;TCR=40;TR=49;WE=170871021;WS=170870994;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:20,49:0.71:69
chr6	170871037	rs71815788	GCAA	G	93.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.47;QD=23.46;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr6	170871040	.	A	G	366	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=29;MQ=59.03;NF=20;NR=8;PP=366;QD=14.313257591;SC=AGCAGCAGCAACAGCAACAGC;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=90;TCF=56;TCR=34;TR=28;WE=170871062;WS=170871030;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:62,28:0.31:90
chr6	170871052	rs112083427	G	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=27;NR=9;PP=366;ReadPosRankSum=1.834;SC=AGCAACAGCAGCAGCAGCAGC;SOR=1.609;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=91;TCF=62;TCR=29;TR=36;WE=170871062;WS=170871030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr6	170878793	rs1042327	T	C	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.034;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=34;PP=1198;ReadPosRankSum=1.084;SC=AGATTCAGAATATGGTGGGGA;SOR=1.263;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=86;TCF=37;TCR=49;TR=53;WE=170878801;WS=170878783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,57:0.63:90
chr6	170878886	rs2235506	A	G	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=260;ReadPosRankSum=0.309;SC=GAAATGTATTATGATTGTTAT;SOR=0.816;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=14;WE=170878894;WS=170878876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,14:0.30:46
chr6	170886531	rs8770	T	C	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=87;ReadPosRankSum=-0.619;SC=GTAAGCAATCTGTCAACATCT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=170886539;WS=170886521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr6	170887693	rs3173219	G	C	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-4.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.400;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=2;PP=847;ReadPosRankSum=-0.395;SC=GTGGAGAGCAGTGTAGATATC;SOR=1.379;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=68;TCF=62;TCR=6;TR=38;WE=170887701;WS=170887683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,42:0.57:74
chr6	170888208	rs960744	A	G	135.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5082;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=0.792;SC=ACCTGGCTGTACCAGTGTGCC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=170888216;WS=170888198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr6	170892100	rs9295417	T	C	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=236;ReadPosRankSum=1.703;SC=TTCTTCCAAGTATTATGTTTA;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=11;WE=170892108;WS=170892090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr6	170892444	rs370825740	CT	C	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=-0.481;QD=0.91;ReadPosRankSum=1.794;SOR=0.333;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,10:0.22:45
chr6	170892483	rs17860837	A	AT	1449.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.720;NF=46;NR=8;PP=1685;ReadPosRankSum=0.771;SC=GGCATGAAAAATTTTAAAGTA;SOR=0.897;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=86;TCF=72;TCR=14;TR=54;WE=170892491;WS=170892473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,54:0.64:84
chr6	170892848	rs4140615	A	G	1617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.204;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.483;NF=9;NR=45;PP=1249;ReadPosRankSum=1.162;SC=AAAAAAGAATACAGAGAAAAG;SOR=1.012;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=15;TCR=76;TR=54;WE=170892856;WS=170892838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,58:0.59:99
chr6	170892919	rs113114915	T	TACTC	675.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.386;NF=0;NR=14;PP=755;ReadPosRankSum=-0.024;SC=AAACTGAAAATAACAACAACA;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=14;WE=170892927;WS=170892909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr6	170893364	rs4140616	C	T	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=247;ReadPosRankSum=0.889;SC=ATGGCCCCGTCCCGACCCCGT;SOR=1.022;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=13;WE=170893372;WS=170893354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr7	286468	.	G	GGACAGGTGAGCCCTTCCTTCCTCCCTCCATCCGC	391.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.920;ClippingRankSum=0.000;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.154;SOR=0.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,11:0.20:54
chr7	286534	rs146778412	A	G	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.35;ReadPosRankSum=-1.134;SOR=0.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,6:0.16:37
chr7	296557	rs36164325	T	C	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=4.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.95;ReadPosRankSum=0.939;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,10:0.16:62
chr7	298565	.	G	A	4563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.000;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.608;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=56;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.313;SC=CAGCCTGTTAGGAACCTTGTA;SOR=0.799;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=209;TCF=133;TCR=76;TR=158;WE=298573;WS=298555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,165:0.76:217
chr7	299558	.	T	TTCTC	70.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.95;ReadPosRankSum=1.090;SOR=0.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,4:0.17:24
chr7	299850	rs36170987	G	T	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=1.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.42;ReadPosRankSum=-2.064;SOR=0.474;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,24:0.24:99
chr7	299881	rs36139924	A	G	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=1.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.43;ReadPosRankSum=0.803;SOR=0.986;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,26:0.24:110
chr7	299987	rs36138803	C	G	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.499;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=130;ReadPosRankSum=1.081;SC=GAGACAGAGGCGCCGGACCTC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=10;WE=299995;WS=299977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,10:0.22:46
chr7	330822	rs36180337	A	C	9241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=282;PP=2965;SC=CGGGTGTCCCAGCGTGGCGAC;SOR=3.516;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=327;TCF=45;TCR=282;TR=327;WE=330830;WS=330812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr7	330882	rs4077171	T	G	7465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.97;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr7	330882	.	TCA	GCG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=23;MQ=59.95;NF=44;NR=101;PP=2947;QD=20;SC=CGCGGCGGCTTCAGGGAGGTC;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=156;TCF=47;TCR=109;TR=145;WE=330892;WS=330872;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,145:0.93:156
chr7	330884	rs4077172	A	G	7465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.25;SOR=1.820;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr7	331086	rs36129019	G	A	7439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.484;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=171;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.069;SC=GTTCGCGGGCGGCTGCGAGTC;SOR=0.738;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=345;TCF=127;TCR=218;TR=269;WE=331094;WS=331076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,274:0.78:351
chr7	331427	rs141537626	C	A	6158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=7.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.181;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=153;PP=2962;ReadPosRankSum=1.237;SC=GGCTGGAGAACGTGGGACTCC;SOR=0.429;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=258;TCF=66;TCR=192;TR=209;WE=331435;WS=331417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,208:0.80:259
chr7	538277	rs34223855	G	C	1306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=1.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.08;ReadPosRankSum=1.159;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:171,44:0.20:215
chr7	538284	rs35782510	T	C	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=2.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.83;ReadPosRankSum=1.704;SOR=0.535;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,45:0.20:220
chr7	538348	rs12720025	A	T	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=1.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.62;ReadPosRankSum=0.509;SOR=0.440;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,26:0.15:178
chr7	540518	rs2070958	T	C	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=-0.844;SC=GAGACCTGAATCTCCTCTCCT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=9;WE=540526;WS=540508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,9:0.21:43
chr7	540741	rs1800814	G	A	12922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=591;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.242;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=271;NR=185;PP=2962;ReadPosRankSum=0.068;SC=GCCGACGAAGGCAGCCACTCA;SOR=0.508;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=586;TCF=355;TCR=231;TR=456;WE=540749;WS=540731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,461:0.78:589
chr7	550737	rs62433334	G	C	2429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=65;PP=2035;SC=ACCAGGGTAAGCCACAGGCCA;SOR=4.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=5;TCR=66;TR=70;WE=550745;WS=550727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr7	551946	rs9692018	T	C	2144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=4;PP=1692;SC=GGACTCACCCTGACCCGGCCC;SOR=5.042;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=58;TCR=4;TR=62;WE=551954;WS=551936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr7	591125	rs71518309	C	G	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=918;ReadPosRankSum=-0.570;SC=TGGAGGTGGACAGACGTGAGT;SOR=1.347;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=33;WE=591133;WS=591115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,33:0.97:34
chr7	624221	rs9330368	T	G	9432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=154;NR=134;PP=2965;SC=CGGGAGAAAGTAAAAAACAGA;SOR=0.783;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=290;TCF=154;TCR=136;TR=288;WE=624229;WS=624211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr7	624344	rs9330367	C	T	5416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=123;PP=2965;SC=AAGCCCTCGACGACTCGGAGT;SOR=4.900;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=9;TCR=123;TR=132;WE=624352;WS=624334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr7	624366	rs13221342	G	A	4360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=92;PP=2513;SC=TGCGTGAGCTGCCACGGTGTC;SOR=7.743;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=94;TCF=1;TCR=93;TR=93;WE=624374;WS=624356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr7	624401	rs9330366	C	T	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=47;PP=1376;SC=TCCCTCCTCCCGGGGGGCTTC;SOR=6.358;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=48;WE=624409;WS=624391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr7	772025	rs4072597	G	A	1364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=0;PP=1113;SC=CCTCAGGTGGGTGACTCATGG;SOR=6.043;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=39;WE=772033;WS=772015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	772174	rs4724987	G	A	6282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=87;PP=2965;SC=CCTTCCGGGAGCAACAGATGT;SOR=0.854;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=187;TCF=100;TCR=87;TR=187;WE=772182;WS=772164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr7	780687	rs62432212	T	C	3812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=111;PP=2815;SC=GGTGTCCCTTTGTCCCTGTGC;SOR=3.193;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=22;TCR=111;TR=133;WE=780695;WS=780677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr7	780859	rs6943174	T	G	50.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr7	780980	rs6943337	T	G	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=7;PP=579;SC=CTGTTGTGCCTCAGGCAGCTG;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=780988;WS=780970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	794471	rs34761279	A	G	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=45;PP=1335;SC=AAGTGGCCGTATTCCAGTCGT;SOR=3.830;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=50;WE=794479;WS=794461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr7	794576	rs62432239	C	T	151.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=4;PP=129;SC=CCCTCACCCCCGGGCCGCAGG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=794584;WS=794566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	801634	rs142752861	T	TTGAGCCCCAGGCCTCAAACATGTC	400.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=3;PP=1112;SC=CCCTCTGTGCTTGACCAGCAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=3;WE=801642;WS=801624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr7	803342	rs4495324	G	A	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=67;NR=1;PP=1791;SC=GGCCCGGCCTGTGTGGTTCTT;SOR=7.024;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=68;TCF=67;TCR=1;TR=68;WE=803350;WS=803332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr7	808588	rs6973614	C	T	1148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=2;PP=981;SC=GACTCGTGCTCTGGCGGGAGG;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=34;WE=808596;WS=808578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr7	808810	rs6946758	C	G	11058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=154;NR=193;PP=2965;SC=AGGGAGAAGGCTCACATCGCG;SOR=0.923;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=347;TCF=154;TCR=193;TR=347;WE=808818;WS=808800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,355:1.00:355
chr7	810219	rs4720951	T	C	3643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=77;PP=2502;SC=CTGTCCACCGTGCTGCTCAGA;SOR=1.288;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=44;TCR=77;TR=121;WE=810227;WS=810209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr7	813618	rs4719279	T	C	11586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=258;NR=96;PP=2965;SC=CATTCATCCCTAGTCTGAAAC;SOR=2.093;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=354;TCF=258;TCR=96;TR=354;WE=813626;WS=813608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,361:1.00:361
chr7	813650	rs62432869	G	A	13981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=443;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=251;NR=174;PP=2965;SC=GCACCTGTCCGGTCTCCTCAT;SOR=1.120;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=425;TCF=251;TCR=174;TR=425;WE=813658;WS=813640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,439:1.00:439
chr7	813867	rs6973746	C	G	2408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=72;PP=2106;SC=CGGTGGACACCGGCCGGGGAC;SOR=8.581;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=0;TCR=72;TR=72;WE=813875;WS=813857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr7	814612	rs34943122	G	A	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=2;PP=739;SC=GGACAGATGTGAGTCACGTCG;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=814620;WS=814602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	814788	rs3922641	G	A	4753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=82;PP=2965;SC=AAACTCATCAGGATTTATCCT;SOR=0.937;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=65;TCR=82;TR=147;WE=814796;WS=814778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr7	821798	.	C	T	2965	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=23;MQ=57.29;NF=227;NR=111;PP=2965;QD=20;SC=CGGATCTTCGCGGCGTGGCCG;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=340;TCF=229;TCR=111;TR=338;WE=821806;WS=821788;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,338:0.99:340
chr7	822523	rs4719314	A	G	18738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=574;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=338;NR=233;PP=2965;SC=CCCTCACACAACGTCAGAAAC;SOR=1.125;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=573;TCF=340;TCR=233;TR=571;WE=822531;WS=822513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,572:1.00:572
chr7	825114	rs67721251	T	C	7276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=133;NR=86;PP=2965;SC=TGGTTTCATGTTTGTTTCTGG;SOR=1.169;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=219;TCF=133;TCR=86;TR=219;WE=825122;WS=825104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr7	881668	rs6461378	C	T	14202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=472;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=186;NR=268;PP=2965;ReadPosRankSum=0.007;SC=TGGCGTCAGCCACGGCGGCAC;SOR=0.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=457;TCF=187;TCR=270;TR=454;WE=881676;WS=881658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,464:0.99:467
chr7	882895	rs6970511	C	G	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=2;PP=1144;ReadPosRankSum=2.022;SC=CTTTTATCTTCATATACTTTT;SOR=3.816;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=41;WE=882903;WS=882885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr7	890978	rs7792674	T	C	2091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=6;PP=1736;SC=CAGAGGCTGGTCCCTGGCGTC;SOR=4.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=57;TCR=6;TR=63;WE=890986;WS=890968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr7	891184	rs10628483	C	CGAT	7293.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=100;PP=2957;SC=CACCTGCACTCGATTTACCTA;SOR=1.873;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=154;TCF=33;TCR=121;TR=128;WE=891192;WS=891174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr7	899710	rs12700166	A	C	5396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=144;NR=14;PP=2965;SC=GGACCCGAACAGTGGAAGTGA;SOR=4.487;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=144;TCR=14;TR=158;WE=899718;WS=899700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr7	905786	rs4721952	A	G	1693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=49;PP=1408;SC=CCACAGCTCCATGGAACTTCG;SOR=5.097;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=52;WE=905794;WS=905776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr7	912755	rs4722034	C	T	2703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=14;PP=2121;SC=ATTTCCAACTCAGCTGCTTCC;SOR=2.805;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=62;TCR=14;TR=76;WE=912763;WS=912745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr7	925949	rs10226357	A	G	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=34;PP=1009;SC=CACTCTCAAGACTGGGGCTCT;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=36;WE=925957;WS=925939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	926077	rs10267796	G	A	763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=4;PP=602;SC=GCCAAGGGACGTGGTGCTCAG;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=926085;WS=926067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	926827	rs4722203	T	C	5890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=119;NR=55;PP=2965;SC=CTCTGGGGCATATGGCGCTGG;SOR=1.703;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=119;TCR=55;TR=174;WE=926835;WS=926817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr7	933234	.	T	A	451	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=51.19;NF=17;NR=1;PP=451;QD=26.987289586;SC=GTGTTGGGCATGGGCGCGGTG;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=18;WE=933248;WS=933224;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,18:0.86:21
chr7	933240	.	C	CGGT	677	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=23;MQ=53.54;NF=18;NR=1;PP=677;QD=39.6302240214;SC=GGCATGGGCGCGGTGTGTGCA;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=19;WE=933248;WS=933224;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,19:0.90:21
chr7	938432	rs4407767	C	T	3081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=0;PP=2474;SC=CCTACCTGGCCGCGCCGGGCT;SOR=9.000;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=83;TCF=83;TCR=0;TR=83;WE=938440;WS=938422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr7	939007	rs79698027	C	G	6664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=151;NR=68;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.858;SC=ATCTGGCAACCCCAGCCAGTG;SOR=0.782;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=222;TCF=153;TCR=69;TR=219;WE=939015;WS=938997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,230:1.00:231
chr7	940181	rs10256887	C	T	2455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=24;PP=1858;SC=TCTGCGTCGCCGGCCCCTGGG;SOR=1.734;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=55;TCR=24;TR=79;WE=940189;WS=940171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr7	940258	rs113839920	G	GGGCAAAGGCA	4119.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=29;PP=2974;SC=AATCTCCTAGGGGCAAAGGTG;SOR=1.055;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=69;TCF=23;TCR=46;TR=40;WE=940275;WS=940248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr7	940267	rs3824079	T	C	3850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=40;PP=1186;SC=GGGGCAAAGGTGGGCACAGGC;SOR=1.347;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=20;TCR=41;TR=60;WE=940275;WS=940248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr7	940298	rs13224354	C	G	1805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=149;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=46;PP=1510;SC=GAGGCTGCAGCGCTGGGGTCC;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=10;TCR=46;TR=56;WE=940306;WS=940288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr7	940501	rs72074799	AGAAGGGCC	A	1303.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=4;PP=2408;SC=CGAAGTCCTGAGAAGGGCCGA;SOR=3.407;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=25;WE=940516;WS=940491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	940724	rs11765973	G	A	1859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=43;PP=1438;SC=TTGGAGCTGTGGCCCCTACCG;SOR=2.644;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=13;TCR=43;TR=56;WE=940732;WS=940714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr7	943711	rs10282526	T	C	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=4;PP=626;SC=CACCCGGGCCTGAGGGCCCAC;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=943719;WS=943701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr7	944874	rs10243781	G	A	1859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=41;PP=1545;SC=AAGGAGTGACGATGGACAGGA;SOR=2.262;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=53;WE=944882;WS=944864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr7	944902	.	G	C	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.732;HP=3;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=718;ReadPosRankSum=-2.745;SC=GACATGGGGAGAAGACACGGG;SOR=1.839;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=30;WE=944910;WS=944892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,31:0.76:41
chr7	944993	.	CAGGGAAAGGGAA	C	630.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=1229;SC=GGAAGATGGGCAGGGAAAGGG;SOR=3.126;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=13;WE=945012;WS=944983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr7	966595	rs143976088	C	A	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=1;PP=720;ReadPosRankSum=0.583;SC=TCCACCCACACCGGGTGTCCC;SOR=3.126;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=28;WE=966603;WS=966585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,27:0.84:32
chr7	967023	rs142089847	G	T	1985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-5.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.823;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=21;PP=1596;ReadPosRankSum=-1.217;SC=CAGCAGGAGGGGCCGCCACAC;SOR=0.299;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=94;TCF=70;TCR=24;TR=71;WE=967031;WS=967013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,72:0.76:95
chr7	1012948	rs56242247	A	T	2105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.987;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=37;PP=1605;ReadPosRankSum=-0.117;SC=GAAAGAAAACAGCATGTTCTT;SOR=0.404;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=100;TCF=53;TCR=47;TR=73;WE=1012956;WS=1012938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,76:0.74:103
chr7	1015271	rs112587865	C	A	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=27;PP=646;ReadPosRankSum=1.128;SC=TTGCCCAGGCCCGGCCCCACC;SOR=1.387;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=29;WE=1015279;WS=1015261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr7	1023013	rs2272375	C	T	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=13;PP=452;SC=GGACCGGTCCCTGATGGAGGT;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=1023021;WS=1023003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	1023995	rs34743661	A	AG	5122.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=30;PP=2974;SC=AGGGGACCTAAGGGGGGTCTT;SOR=2.240;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=110;TCF=79;TCR=31;TR=99;WE=1024010;WS=1023985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr7	1024002	rs3735689	T	C	5360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=90;NR=31;PP=2965;SC=CTAAGGGGGGTCTTGTGGGTG;SOR=2.246;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=90;TCR=31;TR=121;WE=1024010;WS=1023985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr7	1024581	rs3824081	T	C	1608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=5;PP=1338;SC=TGTATCTGCCTACAGGCATCT;SOR=3.657;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=41;TCR=5;TR=46;WE=1024589;WS=1024571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr7	1024855	rs3735684	G	A	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=1.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.653;SOR=0.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:182,50:0.22:232
chr7	1037518	.	G	GC	1383.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.824;NF=2;NR=39;PP=1504;ReadPosRankSum=0.998;SC=AGACGCTGCAGCCAAGGACAC;SOR=0.669;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=58;TCF=4;TCR=54;TR=41;WE=1037526;WS=1037508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,45:0.76:59
chr7	1062527	rs3735686	G	A	3827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.703;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=71;PP=2850;ReadPosRankSum=0.050;SC=GCTACAAAGCGCGGCGACGTC;SOR=0.473;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=164;TCF=76;TCR=88;TR=135;WE=1062535;WS=1062517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,143:0.84:170
chr7	1097023	rs78351779	G	C	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.289;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=1;PP=803;ReadPosRankSum=-1.425;SC=TCTGTGGTCTGCAGCGATTAC;SOR=2.774;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=30;WE=1097031;WS=1097013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,31:0.79:39
chr7	1097183	rs11761941	G	A	2334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=45;PP=1764;ReadPosRankSum=0.922;SC=AACGGCACAGGGCTGGTGGAG;SOR=0.660;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=45;TCR=60;TR=80;WE=1097191;WS=1097173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,85:0.77:111
chr7	1097394	rs11767527	T	C	2845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.882;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=30;PP=2264;ReadPosRankSum=-0.020;SC=CCCTGGCCCCTGTGCACCTGC;SOR=0.415;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=131;TCF=93;TCR=38;TR=98;WE=1097402;WS=1097384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,102:0.75:136
chr7	1097895	rs61910751	A	G	4627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=136;NR=40;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.822;SC=TCTGGACGCCACACTATCTGA;SOR=0.684;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=225;TCF=174;TCR=51;TR=176;WE=1097903;WS=1097885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,183:0.79:233
chr7	1131356	rs3802141	T	C	6615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.838;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=160;NR=78;PP=2962;ReadPosRankSum=0.596;SC=AGCTGCACGGTGCAGAGACAT;SOR=0.560;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=302;TCF=206;TCR=96;TR=238;WE=1131364;WS=1131346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,244:0.79:309
chr7	1131411	rs11544331	C	T	8690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=400;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.091;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=190;NR=109;PP=2962;ReadPosRankSum=0.610;SC=GAGATGTACCCAGGCACCGCG;SOR=0.840;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=385;TCF=243;TCR=142;TR=299;WE=1131419;WS=1131401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,310:0.78:397
chr7	1132456	rs10246354	C	T	8428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.767;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=137;NR=135;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.161;SC=CAGACAGCACCGAGCAGTCGG;SOR=0.593;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=330;TCF=164;TCR=166;TR=272;WE=1132464;WS=1132446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,283:0.83:341
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chr7	1133305	rs1133043	C	G	4703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-8.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.779;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=117;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.608;SC=ACTCCAGCACCTGTGGCTGAC;SOR=1.087;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=227;TCF=75;TCR=152;TR=170;WE=1133313;WS=1133295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,177:0.75:235
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chr7	1477322	rs116525940	C	T	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.746;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=50;ReadPosRankSum=-1.349;SC=GCAACGAGGTCCTGGACCTGC;SOR=0.684;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=7;WE=1477330;WS=1477312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,7:0.21:33
chr7	1478407	rs4307248	G	A	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=8.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.74;ReadPosRankSum=-0.946;SOR=0.196;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,26:0.18:145
chr7	1478495	rs4492283	A	G	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FS=2.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.41;ReadPosRankSum=0.380;SOR=0.815;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:185,50:0.21:235
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chr7	1479444	rs28718334	G	A	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=1.511;SC=CTGGCTGACCGGAGCGCCTCT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=6;WE=1479452;WS=1479442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr7	1479764	rs59814665	AG	A	327.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=1.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQRankSum=2.719;QD=4.20;ReadPosRankSum=-0.983;SOR=0.928;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,17:0.22:78
chr7	1481919	rs4236408	C	A	8153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=182;NR=72;PP=2965;SC=CTGAGGATTCCGCCAAGTTCC;SOR=1.976;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=254;TCF=182;TCR=72;TR=254;WE=1481927;WS=1481909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr7	1482101	rs12540098	C	G	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=427;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.94;ReadPosRankSum=-1.149;SOR=0.715;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:342,80:0.19:422
chr7	1482134	rs4457225	C	G	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FS=4.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.68;ReadPosRankSum=0.370;SOR=0.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:222,60:0.21:282
chr7	1484572	rs10435184	A	G	2840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=57;NR=34;PP=2051;SC=GGGCTCCCCCACCCTGGGGTG;SOR=1.346;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=57;TCR=34;TR=91;WE=1484580;WS=1484562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr7	1484587	rs80020804	C	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=2.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.51;ReadPosRankSum=-0.490;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,16:0.18:91
chr7	1486451	rs75056037	G	A	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=4.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.20;ReadPosRankSum=-0.187;SOR=0.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,14:0.15:92
chr7	1486570	rs139483599	GC	G	198.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=2.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.32;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,10:0.22:46
chr7	1490091	rs4720782	G	A	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.18;ReadPosRankSum=0.836;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,4:0.15:26
chr7	1514276	.	T	C	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5105;FS=2.350;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=254;ReadPosRankSum=1.367;SC=TTGCCCAGGCTGGAGAGCCGC;SOR=0.595;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=16;WE=1514284;WS=1514266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr7	1516129	.	G	GCCTCTCCCGGATGGGCCACCC	1059.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=2.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-1.212;QD=44.16;ReadPosRankSum=-0.929;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,19:0.79:24
chr7	1517700	rs10265526	A	G	1976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=46;PP=1326;SC=GTCCAGCCGGAGCCAGAGAGG;SOR=4.935;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=48;WE=1517708;WS=1517690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr7	1517971	rs4725131	G	A	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.69;ReadPosRankSum=-0.074;SOR=0.864;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,21:0.19:110
chr7	1518336	rs11977356	G	A	1213.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=5;PP=1043;ReadPosRankSum=-0.071;SC=CCCCCCAGCCGTCTGCCAGCC;SOR=1.654;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=41;WE=1518344;WS=1518326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,41:0.87:47
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chr7	1519361	rs9692164	A	G	1795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=4.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.45;ReadPosRankSum=1.320;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,67:0.84:80
chr7	1519892	rs4546558	C	G	289.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5020;FS=4.973;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=204;ReadPosRankSum=-1.261;SC=GAGGCGGCAGCGAAGGCTGCA;SOR=3.258;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=9;WE=1519900;WS=1519882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr7	1519946	rs7783971	A	T	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=409;ReadPosRankSum=0.385;SC=TGCAGCAGCAACGCTACCTGG;SOR=1.044;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=18;WE=1519954;WS=1519936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr7	1522157	rs10227674	T	C	3337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.803;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=12;PP=2686;ReadPosRankSum=0.700;SC=CAGCAGCCCCTGCCCAAGCCC;SOR=1.580;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=147;TCF=130;TCR=17;TR=116;WE=1522165;WS=1522147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,116:0.79:147
chr7	1522175	rs10224038	A	G	7973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=164;NR=36;PP=2965;ReadPosRankSum=0.167;SC=CCCAGCCTGGACCGTACCGGC;SOR=1.883;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=202;TCF=166;TCR=36;TR=200;WE=1522183;WS=1522165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,204:1.00:205
chr7	1523559	rs10235180	T	C	1975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.565;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=53;ReadPosRankSum=-0.507;SC=GGTACCCAGCTGGCACCGAGC;SOR=0.340;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=97;TCF=27;TCR=70;TR=76;WE=1523567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,76:0.76:100
chr7	1523956	rs11972722	A	G	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=460;ReadPosRankSum=0.165;SC=GCCGCCAGGGAAGACGACCAG;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=19;WE=1523964;WS=1523946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr7	1526181	rs6969991	G	A	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5011;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=708;ReadPosRankSum=0.455;SC=GATGACAGGCGTGAGCCACCG;SOR=1.445;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=30;WE=1526189;WS=1526171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,30:0.83:36
chr7	1526456	rs62435333	C	T	2263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.978;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=54;PP=1843;ReadPosRankSum=0.600;SC=ACAGGCCAGGCGGGTAGGACG;SOR=1.824;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=101;TCF=36;TCR=65;TR=79;WE=1526464;WS=1526446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,80:0.78:102
chr7	1527687	rs10279407	C	T	2615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=7.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.419;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=86;PP=2135;ReadPosRankSum=0.486;SC=AAAACCCCTACGGCTGCTGCT;SOR=3.868;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=112;TCF=1;TCR=111;TR=86;WE=1527695;WS=1527677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,88:0.77:114
chr7	1527735	rs10267772	G	A	1134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.190;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=37;PP=985;ReadPosRankSum=0.833;SC=CAGGGCGCCCGGTAGCATCCA;SOR=2.141;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=39;WE=1527743;WS=1527725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,38:0.81:47
chr7	1528947	.	T	TCCCGGGCCCGCCGAGGGGACGTGCGCACTCACTTCAGGCCCTGCTCCCAGC	7966.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.35;QD=85.66;SOR=1.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr7	1529201	rs4425657	G	A	2361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.094;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=33;PP=1778;ReadPosRankSum=-0.881;SC=CCACGTGTGCGCATGGGGCGG;SOR=0.458;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=97;TCF=57;TCR=40;TR=76;WE=1529209;WS=1529191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,82:0.80:102
chr7	1529427	rs4380839	C	A	437.85	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=372;ReadPosRankSum=-0.825;SC=GCTCCCAGCTCCTCCCGGGAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=17;WE=1529435;WS=1529417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr7	1532561	.	G	A	1006	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=0.9997;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MMLQ=23;MQ=51.21;NF=43;NR=4;PP=1006;QD=22.1440683521;SC=GGAGTGGGGAGCGGGGCGCGG;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=52;TCF=47;TCR=5;TR=47;WE=1532569;WS=1532551;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,47:0.90:52
chr7	1532631	rs10229645	G	A	4543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.141;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=130;NR=29;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.006;SC=AGTGGGGAGCGGGGCGTGGGC;SOR=0.268;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=193;TCF=161;TCR=32;TR=159;WE=1532639;WS=1532621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,163:0.84:195
chr7	1533513	rs2251226	A	G	3915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.465;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=75;PP=2962;ReadPosRankSum=1.174;SC=GTGTCCTCCAAAATGGGCACC;SOR=0.557;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=75;TCR=94;TR=135;WE=1533521;WS=1533503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,138:0.78:176
chr7	1533556	rs2251231	T	C	4067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=4.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.36;ReadPosRankSum=-1.106;SOR=1.296;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,105:0.78:134
chr7	1533566	rs2251232	A	G	3684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=7.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.77;ReadPosRankSum=0.705;SOR=1.715;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,89:0.77:116
chr7	1534425	rs752791	A	G	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=6;PP=968;ReadPosRankSum=0.703;SC=CCCGGCACACAGGAGCCCCAG;SOR=0.593;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=71;TCF=63;TCR=8;TR=55;WE=1534433;WS=1534415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,60:0.80:75
chr7	1534593	rs752792	C	A	2180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=62;PP=1786;ReadPosRankSum=-0.367;SC=CCCGTTAGTTCCAGGGAAGGG;SOR=0.859;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=94;TCF=19;TCR=75;TR=77;WE=1534601;WS=1534583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,79:0.81:97
chr7	1534987	rs111391955	T	G	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.91;ReadPosRankSum=0.647;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr7	1535051	rs892530	A	G	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=4;PP=918;ReadPosRankSum=1.704;SC=CAGGGGCTGTACAGGGCCCCA;SOR=0.925;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=47;TCR=5;TR=40;WE=1535059;WS=1535041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,40:0.77:52
chr7	1536717	rs3735660	T	C	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=3;PP=923;ReadPosRankSum=-0.554;SC=ACGAGGGGGATGGCGGCGCGT;SOR=0.602;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=40;WE=1536725;WS=1536707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,42:0.81:52
chr7	1538539	rs57092311	A	G	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=35;PP=875;ReadPosRankSum=-0.042;SC=CGGCAGGAAGACCACGCTGTG;SOR=3.365;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=35;WE=1538547;WS=1538529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,36:0.86:42
chr7	1538595	rs2289034	C	A	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.72;ReadPosRankSum=2.100;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr7	1538614	rs2289035	G	A	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5033;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=258;ReadPosRankSum=-1.591;SC=CCCGCACCTTGGGGTTCTGCA;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=12;WE=1538622;WS=1538604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
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chr7	1542814	rs3752715	T	C	1659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.048;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=50;PP=1303;ReadPosRankSum=0.862;SC=TGAAGTCTCCTGGGGGAGGGT;SOR=0.571;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=90;TCF=23;TCR=67;TR=68;WE=1542822;WS=1542804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,67:0.75:89
chr7	1543476	rs145605530	T	TCCCCAAAGAC	2671.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.802;QD=29.69;ReadPosRankSum=1.370;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,56:0.62:90
chr7	1543981	rs1369011	C	A	2945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.930;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=38;PP=2175;ReadPosRankSum=-0.995;SC=GCGACCGGAGCGCCGCCGCCG;SOR=0.852;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=121;TCF=77;TCR=44;TR=104;WE=1543989;WS=1543971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,113:0.85:133
chr7	1544128	rs2278460	G	T	1655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=57;PP=1440;ReadPosRankSum=0.464;SC=CCGGCCTGATGCCTGCAGCGC;SOR=2.472;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=73;TCF=0;TCR=73;TR=57;WE=1544136;WS=1544118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,55:0.77:71
chr7	1574403	rs4720833	A	G	13045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=452;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=230;NR=218;PP=2965;SC=AGCGAGCGGCAGCCCCGATGC;SOR=0.715;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=448;TCF=230;TCR=218;TR=448;WE=1574411;WS=1574393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,451:1.00:451
chr7	1574562	rs4720834	T	C	2376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=65;PP=2010;SC=TCCTAAAAGATAAGGTCTTGC;SOR=7.024;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=66;TCF=1;TCR=65;TR=66;WE=1574570;WS=1574552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr7	1586653	rs112463195	A	AGCC	1810.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=9;PP=1248;SC=CTCCCGCCGGAGCCGCCGCTG;SOR=1.923;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=39;TCF=22;TCR=17;TR=27;WE=1586670;WS=1586643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr7	1586662	rs3779607	T	C	1917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=11;PP=855;SC=GAGCCGCCGCTGGGGTGGGTG;SOR=1.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=40;WE=1586670;WS=1586643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr7	1586866	rs3824072	T	C	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=21;PP=568;SC=GCACTCCAGCTCCCCGGACAA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=1586874;WS=1586856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	1588391	rs3814481	A	G	4401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=100;PP=2965;SC=CCCTAGAGCCACCGCCGCTGC;SOR=2.015;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=39;TCR=101;TR=139;WE=1588399;WS=1588381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr7	1588549	rs3814482	G	A	3161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.548;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=63;PP=2476;ReadPosRankSum=2.376;SC=CAGGGACGTGGCCGTTCTCCC;SOR=0.721;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=143;TCF=67;TCR=76;TR=115;WE=1588557;WS=1588539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,117:0.79:149
chr7	1588768	rs1124871	G	A	2223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=47;PP=1723;SC=GGTGGGGTGCGCTGTGTGTGT;SOR=2.082;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=19;TCR=47;TR=66;WE=1588776;WS=1588758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr7	1588912	rs3890492	C	A	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=13;PP=391;SC=ACATGTGTCCCCGTGTGTGAG;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=1588920;WS=1588902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	1589056	rs4294092	G	A	1433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=2;PP=1091;SC=GGTGGACCTTGGTCCCCTTGG;SOR=5.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=40;WE=1589064;WS=1589046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr7	1589083	rs1865348	G	A	2060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=7;PP=1556;SC=TGCCCTTAATGCCAAGAGTGC;SOR=3.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=53;TCR=7;TR=60;WE=1589091;WS=1589073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr7	1589417	rs10237660	T	G	2726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=22;PP=2319;SC=TCCGCCTCGTTGGGCCCCACT;SOR=2.162;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=60;TCR=22;TR=82;WE=1589425;WS=1589407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr7	1590368	rs6463921	A	G	1400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.19;SOR=5.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	1590376	rs2304360	T	C	1484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.42;SOR=4.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr7	1590443	rs2304361	T	C	3158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=73;NR=26;PP=2450;SC=TGACGCAGCCTGGCGCCCACC;SOR=2.124;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=73;TCR=26;TR=99;WE=1590451;WS=1590433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr7	1608812	rs34407549	C	G	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=0.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.21;ReadPosRankSum=-0.527;SOR=0.812;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:158,40:0.20:198
chr7	1626835	rs73289427	G	A	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.388;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=11;PP=760;ReadPosRankSum=-0.662;SC=CTCAGGCAGCGGCAGATGATG;SOR=1.002;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=158;TCF=116;TCR=42;TR=45;WE=1626843;WS=1626825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,51:0.31:166
chr7	1627632	rs7800178	T	C	3655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.690;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=92;PP=2705;ReadPosRankSum=-0.026;SC=CACAGCCACCTGATGGGGAAG;SOR=0.795;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=61;TCR=116;TR=140;WE=1627640;WS=1627622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,145:0.79:184
chr7	1657844	rs10225166	A	C	8953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.956;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=166;NR=132;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.171;SC=GGGGAGAGGCACAGGCTGGGA;SOR=0.165;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=300;TCF=168;TCR=132;TR=298;WE=1657852;WS=1657834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,300:0.99:302
chr7	1657923	rs12702990	T	G	7396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.839;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=169;PP=2965;ReadPosRankSum=0.755;SC=TATGTAGGGGTGTGTGTGTGC;SOR=2.127;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=231;TCF=62;TCR=169;TR=230;WE=1657931;WS=1657913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,233:1.00:234
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chr7	1733182	rs79496824	C	T	7421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FS=1.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.58;ReadPosRankSum=-1.439;SOR=0.565;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,183:0.78:235
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chr7	2257612	rs6951493	G	A	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.727;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=280;ReadPosRankSum=0.476;SC=TCTGCTGCTCGTGGTCTGCTC;SOR=0.346;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=85;TCF=69;TCR=16;TR=22;WE=2257620;WS=2257602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,22:0.25:88
chr7	2258899	rs1639916	G	A	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=2;PP=419;SC=CCAGCCACCAGGAGAGAGGTG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=2258907;WS=2258889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	2260482	rs73291554	T	C	1952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.129;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=12;PP=1553;ReadPosRankSum=-0.587;SC=AATAAACACATCCTCCCAGAG;SOR=1.609;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=84;TCF=66;TCR=18;TR=66;WE=2260490;WS=2260472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,68:0.76:90
chr7	2260499	rs1637731	C	T	2210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.564;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=14;PP=1764;ReadPosRankSum=0.394;SC=AGAGGTCTTCCGAACTCAATT;SOR=1.769;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=93;TCF=71;TCR=22;TR=72;WE=2260507;WS=2260489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,74:0.75:99
chr7	2260715	rs1639917	G	T	3451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=93;PP=2815;SC=CCTGAGGAGCGGCCACCTCGG;SOR=4.555;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=103;TCF=10;TCR=93;TR=102;WE=2260723;WS=2260705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr7	2269552	rs1637728	G	T	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=4;PP=255;SC=ACAGAAGACTGGAAGAGGTCC;SOR=1.270;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=2269560;WS=2269542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	2275328	rs17132341	T	C	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=5.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.260;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=32;PP=807;ReadPosRankSum=0.275;SC=AATGTGCAAATAGGTAAACAC;SOR=3.202;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=32;WE=2275336;WS=2275318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,33:0.70:47
chr7	2278663	rs4721496	T	A	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.04;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	2279482	rs11984133	A	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.863;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=116;ReadPosRankSum=0.560;SC=TGATAAGGCTACACAGATGGA;SOR=0.027;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=6;WE=2279490;WS=2279472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr7	2279851	rs6962067	T	C	1958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.85;NF=54;NR=2;PP=1670;SC=AGCGAGACTCTGTCTCAAACA;SOR=5.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=54;TCR=2;TR=56;WE=2279859;WS=2279841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr7	2290314	rs12699806	C	T	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.23;QD=39.38;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	2290317	rs60298419	T	G	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.07;QD=55.30;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	2290319	rs373496719	TC	T	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.91;QD=45.97;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	2290328	rs10230814	C	T	482.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.82;QD=37.08;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr7	2290372	rs10230822	C	T	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=3;PP=1418;SC=GGATTACAGGCGTGAGCCACC;SOR=4.731;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=48;TCR=3;TR=51;WE=2290380;WS=2290362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
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chr7	2296696	rs2302071	C	A	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.338;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=27;PP=755;ReadPosRankSum=0.731;SC=CCCGGCCCAGCCGGCGACGGG;SOR=0.435;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=38;WE=2296704;WS=2296686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,43:0.75:57
chr7	2297006	rs6888	A	G	1672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=19;PP=1143;SC=CCACCTCCACAATGCGGGACT;SOR=1.571;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=36;TCR=19;TR=55;WE=2297014;WS=2296996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
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chr7	2304191	rs2286205	A	C	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=16;PP=513;SC=CACGGGAGACACAGCAGGTCC;SOR=3.056;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=2304199;WS=2304181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	2309159	rs188087387	A	T	2354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=5.476;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.90;MQRankSum=1.780;QD=12.20;ReadPosRankSum=0.745;SOR=0.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,140:0.73:193
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chr7	2314652	rs878534	G	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=4.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.76;ReadPosRankSum=0.291;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,14:0.22:63
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chr7	2394746	rs9690787	T	C	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=16;PP=803;SC=CGGGCCGGAGTCCGAGGTGAG;SOR=0.756;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=33;TCF=17;TCR=16;TR=32;WE=2394754;WS=2394736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	2400306	rs953770	T	C	4141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.043;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=20;PP=2965;ReadPosRankSum=0.450;SC=AATGTTTTTCTTGGTAAAAAT;SOR=2.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=111;TCR=21;TR=129;WE=2400314;WS=2400296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,128:0.98:131
chr7	2402298	rs140288121	C	T	3098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.226;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=29;PP=2292;ReadPosRankSum=-0.598;SC=TCCTGGAGTACGCGTCCCCTG;SOR=0.210;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=127;TCF=96;TCR=31;TR=108;WE=2402306;WS=2402288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,114:0.86:132
chr7	2403894	.	C	G	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.657;ClippingRankSum=0.000;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=-0.584;QD=1.04;ReadPosRankSum=-0.374;SOR=0.391;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,13:0.18:74
chr7	2405885	rs2286204	C	A	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=56;ReadPosRankSum=0.843;SC=CGTGTTCTGGCCGCACAGACA;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=5;WE=2405893;WS=2405880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr7	2409035	rs2301944	C	T	1065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=3;PP=850;SC=ATGAGTTGTTCTATTCTCTTC;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=2409043;WS=2409025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	2412493	rs1548595	C	T	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.527;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=42;PP=1195;ReadPosRankSum=0.977;SC=CCAGTCGCTGCCCAACAGTGA;SOR=0.080;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=64;TCF=6;TCR=58;TR=48;WE=2412501;WS=2412483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,50:0.74:68
chr7	2414142	rs886632	A	G	3609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=26;PP=2852;ReadPosRankSum=-0.855;SC=AGCTCGTGACAGGCGCGCTCT;SOR=1.379;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=124;TCF=98;TCR=26;TR=123;WE=2414150;WS=2414132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,127:0.99:128
chr7	2414365	rs884565	A	G	3604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=83;PP=2965;SC=GGGTTGCCCCAGTGTCAGTGG;SOR=1.961;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=32;TCR=83;TR=115;WE=2414373;WS=2414355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr7	2416822	rs2240347	A	G	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=3.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.77;ReadPosRankSum=-0.239;SOR=1.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:158,35:0.18:193
chr7	2418116	rs6461350	T	A	2062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-1.527;NF=44;NR=1;PP=1224;ReadPosRankSum=4.443;SC=CTGGGTGTCATGGAGGAAGGA;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=45;WE=2418124;WS=2418108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:10,44:0.81:54
chr7	2418133	.	G	A	3137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.706;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-1.083;NF=82;NR=1;PP=2196;ReadPosRankSum=4.468;SC=AGGAGCAGGCGCGAGTGCTGC;SOR=2.701;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=91;TCF=90;TCR=1;TR=83;WE=2418141;WS=2418123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:10,82:0.89:92
chr7	2418645	rs6461351	A	G	1462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=8;PP=1182;SC=TGAATGGACTAGCCATTCCTG;SOR=2.356;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=41;WE=2418653;WS=2418635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr7	2434522	rs1978169	G	A	3357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.205;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=89;PP=2558;ReadPosRankSum=0.804;SC=AAACACACCCGCCCAGCAAGA;SOR=2.061;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=130;TCF=35;TCR=95;TR=123;WE=2434530;WS=2434512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,121:0.98:123
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chr7	2472662	rs11537796	G	C	9290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.689;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=226;NR=119;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.964;SC=CGTGCTGCGGGGCTTCTGCGC;SOR=0.808;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=436;TCF=284;TCR=152;TR=345;WE=2472670;WS=2472652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,354:0.80:445
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chr7	2577781	rs1043291	T	C	3792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=54;PP=2789;ReadPosRankSum=2.008;SC=GGGGACTCTTTTCCACGTGGT;SOR=0.766;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=90;TCR=71;TR=124;WE=2577789;WS=2577771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,136:0.80:171
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chr7	2578455	rs4721764	G	A	3993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=110;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.380;SC=CGAGGCTCCCGCAACAGGACT;SOR=0.762;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=34;TCR=142;TR=136;WE=2578463;WS=2578445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,142:0.78:181
chr7	2580914	rs62442586	C	T	4924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.579;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=76;PP=2962;ReadPosRankSum=0.653;SC=ACGCCAAAGCCGTACAGAACA;SOR=0.930;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=243;TCF=138;TCR=105;TR=183;WE=2580922;WS=2580904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,187:0.75:248
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chr7	2582153	rs138295649	C	CCCCCAGCCTCCCGGGTGT	6838.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=24;PP=2969;SC=GGATGGGGTGCCCCCAGGTGT;SOR=1.033;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=127;TCF=67;TCR=60;TR=62;WE=2582161;WS=2582143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr7	2582233	rs3735106	A	G	7255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.493;NF=179;NR=69;PP=2962;ReadPosRankSum=1.017;SC=TGTCCCCACAATGCATTCCTG;SOR=0.760;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=299;TCF=215;TCR=84;TR=248;WE=2582241;WS=2582223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,253:0.83:303
chr7	2582381	rs61673178	T	A	10313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=490;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=153;NR=210;PP=2962;ReadPosRankSum=0.247;SC=TCCACCCCTATTGTGAGCCCA;SOR=0.652;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=468;TCF=195;TCR=273;TR=363;WE=2582389;WS=2582371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,381:0.78:488
chr7	2582584	rs34108550	G	A	7650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-8.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.239;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=59.97;MQRankSum=-0.480;NF=176;NR=92;PP=2962;ReadPosRankSum=0.817;SC=ACCCTGCTCTGAGCAGAGCAG;SOR=0.937;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=333;TCF=215;TCR=118;TR=268;WE=2582592;WS=2582574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,274:0.81:339
chr7	2583165	rs13240450	G	A	4556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.088;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=57;PP=2962;ReadPosRankSum=0.192;SC=ATCCCTGGGCGTTATCCGAGG;SOR=0.933;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=209;TCF=130;TCR=79;TR=157;WE=2583173;WS=2583155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,165:0.77:215
chr7	2583328	rs61753095	C	T	6158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.443;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.552;NF=109;NR=105;PP=2962;ReadPosRankSum=1.693;SC=ACAGGGCTTCCGTCCAGGGGC;SOR=0.562;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=279;TCF=143;TCR=136;TR=214;WE=2583336;WS=2583318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,213:0.77:276
chr7	2584523	rs34720091	T	C	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.561;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=576;ReadPosRankSum=-0.640;SC=AGGAATGGGGTGGGGTGTGGG;SOR=0.239;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=27;WE=2584531;WS=2584513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,29:0.76:38
chr7	2587122	rs2164688	T	C	1862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.567;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=70;PP=1443;ReadPosRankSum=-1.789;SC=TCTGTGGGGATGGCCCAGCCC;SOR=2.780;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=87;TCF=9;TCR=78;TR=76;WE=2587130;WS=2587112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,76:0.87:87
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chr7	2598908	rs34580685	T	C	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=1;NR=16;PP=473;SC=TCGGCTCGTCTCCGTCGCCCG;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=2598916;WS=2598898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr7	2604890	rs139694552	CGT	C	533.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=1.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.20;ReadPosRankSum=0.535;SOR=0.905;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,27:0.21:127
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chr7	2611878	rs2917751	T	C	11379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=149;NR=230;PP=2965;SC=ATGCGTGGACTGGCGTCCCCG;SOR=1.226;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=381;TCF=150;TCR=231;TR=379;WE=2611886;WS=2611868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,391:1.00:391
chr7	2612335	rs6945441	T	C	7309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=140;NR=107;PP=2965;ReadPosRankSum=0.058;SC=TCTGTGTTTATGTTCCTGCCT;SOR=0.918;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=251;TCF=143;TCR=108;TR=247;WE=2612343;WS=2612325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,254:0.99:256
chr7	2613008	rs62442625	A	G	1411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=37;NR=1;PP=1139;SC=AATTCTTTCTACTTTGTAGAT;SOR=5.186;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=38;WE=2613016;WS=2612998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	2613042	rs2304540	G	C	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=7;PP=1509;SC=ATTTGTTTATGTTTCTCTAGG;SOR=3.334;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=50;TCR=7;TR=57;WE=2613050;WS=2613032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr7	2613062	rs61739566	T	C	2336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=16;PP=1754;SC=GTCATGTCCCTGGGACTCCTG;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=54;TCR=16;TR=70;WE=2613070;WS=2613052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr7	2613133	rs62442626	G	A	4474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=50;PP=2965;SC=GTAGTATTTCGGTTTGTTCTC;SOR=1.187;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=78;TCR=50;TR=128;WE=2613141;WS=2613123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr7	2619334	rs68086038	GGT	G	288.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=-0.889;QD=1.60;ReadPosRankSum=0.776;SOR=0.745;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,26:0.14:181
chr7	2619363	rs2917739	G	C,GTGTC	6697.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.54;MQRankSum=-0.057;QD=42.39;ReadPosRankSum=1.364;SOR=4.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,130,27:0.82,0.17:158
chr7	2619416	rs117437253	T	C	2056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=70;PP=1664;SC=CTCACTCTGTTGCCCAGGCTG;SOR=5.784;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=3;TCR=71;TR=73;WE=2619424;WS=2619406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr7	2622133	rs62439479	G	A	3635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=5;PP=2965;ReadPosRankSum=1.320;SC=GAGGTGTGCCGGTGCTCTGGC;SOR=4.749;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=112;TCF=106;TCR=6;TR=109;WE=2622141;WS=2622123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,110:0.99:111
chr7	2626038	rs3217437	CCAGGGAATGG	C	1003.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=2985;SC=AGGAGGGAGGCCAGGGAATGG;SOR=2.494;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=18;WE=2626055;WS=2626028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	2627294	rs56412903	C	T	1510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=3;PP=1224;SC=ACTGGGCCAGCGCTGGCAAAA;SOR=4.849;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=42;TCR=3;TR=45;WE=2627302;WS=2627284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr7	2627310	rs2917733	T	A	1884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=1;PP=1553;SC=CAAAATTCTCTGGTAGCCAGG;SOR=6.666;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=54;TCF=53;TCR=1;TR=54;WE=2627318;WS=2627300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr7	2632477	rs2917730	A	G	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=478;SC=GGGCAGGCAGAGCCCTGAGGT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=2632485;WS=2632467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	2638347	rs12700147	C	G	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=35;PP=1002;SC=CCAGGAATGACTGGGCCTGGA;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=36;WE=2638355;WS=2638337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	2640897	rs2969057	T	C	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=300;SC=CCTCTCACTTTCGTCCTCCTT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=2640905;WS=2640888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	2640985	rs4506100	G	C	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=7;PP=515;SC=TTGGCTTGATGGACACCTGTT;SOR=1.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=22;WE=2640993;WS=2640975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	2641059	.	C	CT	633.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.62;MQRankSum=0.610;QD=17.61;ReadPosRankSum=-1.397;SOR=0.526;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,31:0.86:36
chr7	2645374	rs76694868	C	T	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=334;SC=CAGCAATTCCCGGGAGGCAGG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=2645382;WS=2645372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	2649673	rs3735108	T	C	6010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=155;NR=33;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.810;SC=GGTTCATTTCTGCAGACCCCT;SOR=1.786;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=191;TCF=158;TCR=33;TR=188;WE=2649681;WS=2649663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,189:0.99:190
chr7	2649704	rs3735109	T	G	8820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.168;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=227;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=1.367;SC=GCCACAGGCCTTGGCACCTCT;SOR=1.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=319;TCF=230;TCR=89;TR=314;WE=2649712;WS=2649694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,317:0.99:320
chr7	2649777	rs1061566	C	T	13120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=443;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.121;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=220;NR=209;PP=2965;ReadPosRankSum=0.053;SC=TCTCTGCCCACGAAGAACTTT;SOR=0.182;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=433;TCF=220;TCR=213;TR=429;WE=2649785;WS=2649767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,434:0.99:437
chr7	2649819	rs3735110	C	T	10344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=205;PP=2965;SC=GTCTCCACGCCGTGATGGCAG;SOR=1.522;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=316;TCF=109;TCR=207;TR=314;WE=2649827;WS=2649809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,319:1.00:319
chr7	2671862	rs200607825	T	G	3173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.594;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=40;PP=2411;ReadPosRankSum=-0.821;SC=CGACCTGAGCTGGGAGGCCAC;SOR=0.882;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=157;TCF=104;TCR=53;TR=124;WE=2671870;WS=2671852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,128:0.79:163
chr7	2686761	rs3801079	G	C	2931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=31;PP=2308;ReadPosRankSum=-0.183;SC=CATCTCACGGGCCCGCCCTCT;SOR=0.796;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=89;TCR=37;TR=107;WE=2686769;WS=2686751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,109:0.84:129
chr7	2689472	rs3801077	A	C	5021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.782;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=83;PP=2962;ReadPosRankSum=0.049;SC=ACTCCAGGGGACGGGTTCTAC;SOR=0.702;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=239;TCF=124;TCR=115;TR=176;WE=2689480;WS=2689462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,186:0.75:248
chr7	2699687	rs56409742	C	CG	6911.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=47;NR=110;PP=2936;SC=ACTGACCCACCGGTCCCCCAT;SOR=1.214;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=175;TCF=53;TCR=122;TR=157;WE=2699695;WS=2699677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr7	2749565	rs13224990	G	A	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.682;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=48;ReadPosRankSum=-0.269;SC=GTCAACTGCCGGGTTCCAGGC;SOR=0.178;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=5;WE=2749573;WS=2749555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr7	2752487	rs7776970	G	A	4768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.738;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=101;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.037;SC=TCGGCCCCCCGTCCCTGGGAT;SOR=0.991;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=221;TCF=94;TCR=127;TR=172;WE=2752495;WS=2752477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,176:0.78:226
chr7	2773035	rs34004158	C	CAT	1337.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=1.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=3.273;QD=6.43;ReadPosRankSum=1.450;SOR=0.820;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:162,46:0.22:208
chr7	2802173	rs17132665	T	C	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=3.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.18;ReadPosRankSum=-0.813;SOR=1.480;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,25:0.19:132
chr7	2834869	rs2533886	C	T	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=6.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=334;ReadPosRankSum=-0.201;SC=ATTGTCATAACGCAGAAAACT;SOR=0.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=85;TCF=0;TCR=85;TR=22;WE=2834877;WS=2834859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,23:0.27:85
chr7	2854010	rs2644275	G	A	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.84;ReadPosRankSum=-0.427;SOR=0.662;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,10:0.14:71
chr7	2952886	rs1626708	C	T	5188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=143;NR=29;PP=2965;SC=ATGGCTCCCGCGGGGCTCCCC;SOR=3.090;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=173;TCF=144;TCR=29;TR=172;WE=2952894;WS=2952876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr7	2954801	rs1182157	T	C	3105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=2;PP=2624;SC=CCGATGTTCCTCCAGGTGAGG;SOR=6.229;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=90;TCF=88;TCR=2;TR=90;WE=2954809;WS=2954791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr7	2962753	rs2527509	G	A	1549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=5;PP=1164;SC=CTCCCTTGCCGCCATCCCCTC;SOR=3.352;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=42;WE=2962761;WS=2962743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr7	2962834	.	C	G	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.965;ClippingRankSum=0.000;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=1.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.32;ReadPosRankSum=-0.224;SOR=0.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,24:0.17:145
chr7	2963120	rs17257217	C	T	1831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=53;PP=1584;SC=TCCGAGAAGGCCCTTAATGGC;SOR=6.556;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=54;WE=2963128;WS=2963110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr7	2966445	rs1182136	T	G	10530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-10.440;NF=101;NR=228;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.793;SC=ACAAGGGAGGTGGGGGAAAGC;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=334;TCF=103;TCR=231;TR=329;WE=2966453;WS=2966434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,329:1.00:330
chr7	2968486	rs1183431	G	C	2200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=62;PP=1822;SC=GGCTTGTGCTGAGCCCGGAGC;SOR=6.963;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=63;TCF=1;TCR=62;TR=63;WE=2968494;WS=2968476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr7	2969680	rs1621509	G	A	6160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=75;PP=2965;SC=TAGGGCTGGCGTCCGTGCCTT;SOR=1.219;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=193;TCF=118;TCR=75;TR=193;WE=2969688;WS=2969670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr7	2971977	rs5881948	T	TG	666.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=786;SC=TTTCAGCAGTTGGGCTCCTGC;SOR=4.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=20;WE=2971985;WS=2971973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	2972072	rs1636167	A	G	1444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.515;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=18;PP=1114;ReadPosRankSum=-0.142;SC=CACGTTTACCACGCAGGATTG;SOR=1.123;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=76;TCF=52;TCR=24;TR=60;WE=2972080;WS=2972062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,60:0.79:76
chr7	2976767	rs6945582	G	A	8060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.136;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=160;NR=125;PP=2962;ReadPosRankSum=1.215;SC=TCCTCATCTCGTCGTTCTTCT;SOR=0.906;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=359;TCF=195;TCR=164;TR=285;WE=2976775;WS=2976757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,298:0.80:373
chr7	2985361	rs3839716	GAC	G	271.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.099;NF=15;NR=1;PP=334;ReadPosRankSum=1.191;SC=CACTACTGAGGACACACACAC;SOR=1.244;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=16;WE=2985372;WS=2985351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr7	2985389	.	GAC	G	59.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=0.464;QD=1.36;ReadPosRankSum=2.038;SOR=0.565;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,6:0.14:44
chr7	3179968	rs7779230	T	G	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.10;ReadPosRankSum=-0.911;SOR=0.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:157,36:0.19:193
chr7	3179973	rs7791857	G	C	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=0.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.15;ReadPosRankSum=-0.987;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,35:0.19:188
chr7	3179991	rs7779245	T	C	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=2.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.43;ReadPosRankSum=-0.555;SOR=0.438;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,26:0.17:151
chr7	3180657	rs6964682	C	T	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=7.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.35;ReadPosRankSum=-0.796;SOR=0.286;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,31:0.18:176
chr7	3188576	rs10257447	T	C	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.54;ReadPosRankSum=1.385;SOR=0.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,5:0.16:31
chr7	3188712	rs10254519	A	C	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=2.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.92;ReadPosRankSum=0.611;SOR=1.221;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,14:0.19:75
chr7	3188738	rs34925290	G	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=1.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.00;ReadPosRankSum=-1.039;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,14:0.22:63
chr7	3205581	rs7782623	C	T	1522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=15;PP=1159;SC=AGCAACATAGCGAGACCTCAT;SOR=1.848;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=50;WE=3205589;WS=3205571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	3205635	rs7801306	A	G	2057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=28;PP=1550;SC=ACGGTGGCACACATGGCACGC;SOR=1.042;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=67;WE=3205643;WS=3205625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr7	3205705	rs10951088	T	G	2101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=31;PP=1738;SC=CCCAGGAGTTTGGGCTGTAGT;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=32;TCR=31;TR=63;WE=3205713;WS=3205695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr7	3205763	rs10951089	A	C	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=44;PP=1565;SC=CAGAGCGAGAACCTGTCTCAA;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=18;TCR=44;TR=62;WE=3205771;WS=3205753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
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chr7	4171922	rs76692704	C	G	16654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=758;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=328;NR=266;PP=2962;ReadPosRankSum=0.539;SC=GGAACACTGTCTTGAGATCTG;SOR=0.761;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=744;TCF=409;TCR=335;TR=594;WE=4171930;WS=4171912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,597:0.80:747
chr7	4189075	rs659182	G	C	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=5.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.50;ReadPosRankSum=0.191;SOR=1.380;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,25:0.17:149
chr7	4259695	rs375747258	T	G	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FS=14.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.25;ReadPosRankSum=-0.449;SOR=1.496;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:278,67:0.19:345
chr7	4259953	rs13224192	G	T	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=-0.756;SC=TTAGCCTCCCGCCTCCTGCTT;SOR=0.293;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=7;WE=4259961;WS=4259943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr7	4260780	rs141025819	C	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=71;ReadPosRankSum=-1.565;SC=CAGCCTCGACCGGTCTGACCC;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=6;WE=4260788;WS=4260770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr7	4266952	rs74496648	G	A	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=2.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.58;ReadPosRankSum=0.584;SOR=0.154;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,8:0.15:53
chr7	4266963	rs80155066	C	T	1412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.702;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=6;PP=1656;ReadPosRankSum=-0.065;SC=GCTTCCCACCCCTTCCTGGGA;SOR=2.165;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=55;TCF=45;TCR=10;TR=44;WE=4266971;WS=4266942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,47:0.81:58
chr7	4267072	rs597636	T	A	3364.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=59;PP=2733;ReadPosRankSum=0.604;SC=GTCTTTTTTTTAAATCAGATG;SOR=0.808;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=52;TCR=60;TR=110;WE=4267080;WS=4267062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,113:0.98:115
chr7	4277369	.	C	G	4923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.354;ClippingRankSum=0.000;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.651;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=117;PP=2962;ReadPosRankSum=1.619;SC=GTGGTGTTCGCCCTCGTCCTG;SOR=0.595;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=217;TCF=65;TCR=152;TR=169;WE=4277377;WS=4277359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,172:0.78:221
chr7	4304727	rs10270413	A	G	1427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=7;PP=1166;SC=CCTGCCCTGCACTCACACCTT;SOR=3.486;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=51;WE=4304735;WS=4304717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	4308205	rs10227734	T	A	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=2.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.17;ReadPosRankSum=0.252;SOR=0.343;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,30:0.28:107
chr7	4308215	rs10268227	C	A	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=2.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.142;SOR=0.332;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,31:0.26:119
chr7	4308220	rs10227750	T	C	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=5.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.48;ReadPosRankSum=1.045;SOR=0.301;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,34:0.26:129
chr7	4490854	rs314605	C	T	7617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=138;NR=94;PP=2965;SC=AGTTATGTTCCTGGATGTTTG;SOR=1.059;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=232;TCF=138;TCR=94;TR=232;WE=4490862;WS=4490844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr7	4490934	rs442775	A	G	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.30;ReadPosRankSum=0.096;SOR=0.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,27:0.17:160
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chr7	4795042	rs77087728	G	A	8787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=424;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.731;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=232;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.063;SC=GGGCCGGATCGCCTCTGAAGG;SOR=1.169;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=413;TCF=120;TCR=293;TR=320;WE=4795050;WS=4795032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,328:0.78:420
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chr7	4802035	rs1053753	A	G	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=3.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.38;ReadPosRankSum=1.549;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,4:0.15:26
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chr7	4823186	rs11764275	G	T	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.88;ReadPosRankSum=-2.787;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,20:0.20:98
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chr7	4825307	rs11772411	T	A	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=3.352;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.80;ReadPosRankSum=1.838;SOR=1.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,29:0.22:132
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chr7	5112554	rs1130329	A	C	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.07;ReadPosRankSum=1.592;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,10:0.20:51
chr7	5161512	rs117992329	G	T	1504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=2;PP=1379;SC=TTAAAGCACTGCCACACTGGT;SOR=5.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=46;TCR=2;TR=48;WE=5161520;WS=5161502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
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chr7	5161640	rs62441986	G	C	2638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=3.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.54;MQRankSum=0.112;QD=23.77;ReadPosRankSum=1.066;SOR=0.381;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,93:0.84:111
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chr7	5167408	rs888584	G	A	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.561;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.367;NF=9;NR=41;PP=1088;ReadPosRankSum=-1.853;SC=ATGTGGAGTGGTTGGCACTGG;SOR=1.765;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=63;TCF=14;TCR=49;TR=50;WE=5167416;WS=5167398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,30:0.75:40
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chr7	5172102	rs77898154	A	G	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=1.183;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQRankSum=-8.830;QD=2.54;ReadPosRankSum=-1.307;SOR=0.423;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,13:0.14:96
chr7	5172115	rs73057805	A	G	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQRankSum=-8.734;QD=0.82;ReadPosRankSum=1.566;SOR=0.633;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,14:0.14:102
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chr7	5172208	rs74491186	C	T	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=4.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=-3.585;QD=4.93;ReadPosRankSum=0.407;SOR=0.276;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,14:0.19:73
chr7	5172213	rs72125963	TCTCCCA	T	390.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=1.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=-3.585;QD=5.35;ReadPosRankSum=-0.593;SOR=0.423;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,14:0.19:73
chr7	5172223	rs77639783	G	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=2.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-3.626;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.192;SOR=0.351;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,13:0.19:69
chr7	5172282	rs73057807	A	G	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=2.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=-2.508;QD=1.83;ReadPosRankSum=1.894;SOR=0.245;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,7:0.13:53
chr7	5172295	rs73057808	A	G	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=-2.209;QD=2.91;ReadPosRankSum=-0.447;SOR=0.323;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,8:0.16:49
chr7	5172316	rs66755282	T	G	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.990;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=116;ReadPosRankSum=-2.285;SC=TGTGAGGCCTTACTTGGATTT;SOR=0.014;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=7;WE=5172324;WS=5172306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr7	5239319	rs200973486	TA	T	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.26;ReadPosRankSum=0.563;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
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chr7	5254447	rs28607283	C	T	1907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=62;PP=1578;ReadPosRankSum=-0.362;SC=CCTGGCCCCACGTTGCCGGGC;SOR=2.247;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=74;TCF=1;TCR=73;TR=63;WE=5254455;WS=5254437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,64:0.86:74
chr7	5257490	rs7791896	T	C	1606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=4;PP=1279;SC=GGACCAAGTGTCAGCCCTGGG;SOR=4.450;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=46;WE=5257498;WS=5257480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr7	5257573	rs1134489	G	A	2198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.161;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=20;PP=1814;ReadPosRankSum=0.491;SC=ACATGATTCCGGCTCACGACA;SOR=1.501;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=111;TCF=76;TCR=35;TR=76;WE=5257581;WS=5257563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,78:0.70:112
chr7	5262151	rs62441068	C	T	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=70;ReadPosRankSum=-1.347;SC=AGCCGTGTGGCGCATTTGCAG;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=8;WE=5262159;WS=5262141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr7	5267639	rs73048056	G	C	2282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=15;PP=1735;ReadPosRankSum=-3.060;SC=ATCTTGCTGGGGTCTCTTTCC;SOR=0.658;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=81;TCR=20;TR=78;WE=5267647;WS=5267629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,82:0.79:104
chr7	5269424	rs7785898	A	C	2277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=65;PP=1957;SC=CCCGAGTGCTACTGCCTTCTG;SOR=5.640;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=68;TCF=3;TCR=65;TR=68;WE=5269432;WS=5269414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr7	5331307	rs12667188	A	G	147.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=29.58;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	5334469	rs4724524	G	T	5297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.182;NF=78;NR=33;PP=2838;ReadPosRankSum=0.483;SC=CCTCTGGGTTGTTCCTCTCTC;SOR=0.948;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=84;TCR=36;TR=111;WE=5334480;WS=5334459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,121:0.99:122
chr7	5334472	rs10623123	C	CCT	4010.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.235;NF=41;NR=33;PP=2989;ReadPosRankSum=0.878;SC=CTGGGTTGTTCCTCTCTCTCT;SOR=0.790;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=95;TCF=52;TCR=43;TR=74;WE=5334480;WS=5334459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,113:0.97:117
chr7	5334582	rs59119551	C	T	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=2.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.60;ReadPosRankSum=-0.487;SOR=0.449;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,22:0.20:110
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chr7	5336855	rs137903684	TCCCTTCTCTGTC	T	393.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=1.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=0.000;QD=5.88;ReadPosRankSum=-0.446;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,14:0.21:67
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chr7	5427720	rs4724663	A	G	6976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=125;PP=2965;SC=GCCTCTCCAGACCCGTGGGCC;SOR=1.285;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=204;TCF=79;TCR=125;TR=203;WE=5427728;WS=5427710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr7	5427950	rs112785272	G	A	6904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FS=10.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.06;ReadPosRankSum=0.506;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,252:0.81:313
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chr7	5459984	rs75583325	T	C	7799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.249;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=146;NR=136;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.004;SC=ACCGCGATGGTCCGGTTTCGG;SOR=0.490;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=351;TCF=176;TCR=175;TR=282;WE=5459992;WS=5459974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,286:0.80:357
chr7	5460452	rs113626522	G	C	4175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.822;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=143;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.839;SC=CTACCACACCGGCTTTCGGCT;SOR=1.156;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=233;TCF=38;TCR=195;TR=167;WE=5460460;WS=5460442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,172:0.72:238
chr7	5460518	rs139552678	C	CGCCGGGGCCGCCGGACTG	5342.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=2897;ReadPosRankSum=0.431;SC=CACTCTCCACCGCCTTGGCTC;SOR=0.763;SbPval=0.02;Source=Platypus;TC=125;TCF=31;TCR=94;TR=41;WE=5460526;WS=5460508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,107:0.79:136
chr7	5467858	rs73333875	A	G	5347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.580;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=140;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.945;SC=CGCTCAGTGCACAGGGGGCCG;SOR=1.004;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=225;TCF=60;TCR=165;TR=190;WE=5467866;WS=5467848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,194:0.84:231
chr7	5487458	rs4236392	T	C	3478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=85;PP=2572;SC=CCAGCTCTGCTGGGGGCTCCT;SOR=2.172;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=30;TCR=85;TR=115;WE=5487466;WS=5487448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr7	5528883	rs4724701	G	A	3958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.172;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=35;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.321;SC=TTAAAAATCAGATTACAAAAC;SOR=0.472;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=154;TCF=116;TCR=38;TR=138;WE=5528891;WS=5528873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,143:0.90:159
chr7	5529758	rs28566736	G	A	7855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.178;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=186;PP=2962;ReadPosRankSum=0.255;SC=GGTTGTCGGCGCCCAGTGGCT;SOR=1.044;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=375;TCF=146;TCR=229;TR=298;WE=5529766;WS=5529748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,301:0.80:378
chr7	5529922	rs4077245	A	C	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=37;PP=976;ReadPosRankSum=0.014;SC=AGGAGCCCTGATCACTCCAGC;SOR=2.880;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=37;WE=5529930;WS=5529912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,40:0.82:49
chr7	5530827	rs3801057	G	A	6476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.554;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=166;NR=65;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.171;SC=TGATTTCTGCGGCCCCTGAAG;SOR=0.632;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=302;TCF=216;TCR=86;TR=231;WE=5530835;WS=5530817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,232:0.77:302
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chr7	5541657	rs4724704	G	A	1696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.834;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=39;PP=1353;ReadPosRankSum=-0.532;SC=CTTTGTCCTCGCTCGCCTGCG;SOR=0.996;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=91;TCF=38;TCR=53;TR=63;WE=5541665;WS=5541647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,65:0.68:95
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chr7	5568366	rs852423	A	G	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=2.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.76;ReadPosRankSum=-0.801;SOR=0.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:193,35:0.15:228
chr7	5569327	rs2908425	G	A	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=8.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.35;ReadPosRankSum=1.644;SOR=0.123;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,20:0.24:85
chr7	5760860	rs2302907	G	A	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FS=6.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.05;ReadPosRankSum=0.457;SOR=1.218;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:250,42:0.14:292
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chr7	5983070	rs144996986	T	C	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=1.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.12;MQRankSum=-0.249;QD=1.65;ReadPosRankSum=0.025;SOR=0.895;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,11:0.15:75
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chr7	6026988	rs1805321	G	A	7077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=165;NR=58;PP=2965;SC=TCTTTCTGAGGTCTCAGGACG;SOR=2.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=223;TCF=165;TCR=58;TR=223;WE=6026996;WS=6026978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr7	6031804	rs373566669	GT	G	111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=-0.985;QD=1.35;ReadPosRankSum=0.926;SOR=0.543;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,23:0.28:83
chr7	6036980	rs1805319	G	C	7332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.148;NF=146;NR=89;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.417;SC=GCAGAGCATCGGAACAGCTCA;SOR=0.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=238;TCF=148;TCR=90;TR=235;WE=6036988;WS=6036970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,243:0.99:246
chr7	6037057	.	GAA	G,GA	2010.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.35;MQRankSum=0.900;QD=16.35;ReadPosRankSum=1.671;SOR=0.778;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:14,37,72:0.30,0.59:123
chr7	6038722	rs62456182	T	C	2082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=0;PP=1843;ReadPosRankSum=-0.862;SC=GGCGTTGAAGTAACCGGCCAT;SOR=6.901;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=64;TCR=0;TR=63;WE=6038730;WS=6038712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr7	6057777	.	CTTT	C,CT	2106.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=55.45;QD=21.95;SOR=8.410;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:12,31,53:0.32,0.55:96
chr7	6063283	rs4560	C	T	6117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=72;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.763;SC=CTTGTGAAAACCTGGCTCCTT;SOR=0.474;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=188;TCF=116;TCR=72;TR=187;WE=6063291;WS=6063273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,200:1.00:201
chr7	6063674	rs12657	G	A	3837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=87;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.674;SC=AAAGAGATCTGAGCTGCCTGG;SOR=0.635;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=157;TCF=49;TCR=108;TR=129;WE=6063682;WS=6063664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,131:0.81:162
chr7	6064470	rs372712239	CT	C	278.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQRankSum=-0.827;QD=4.98;ReadPosRankSum=0.836;SOR=0.319;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr7	6065914	rs10253000	T	C	3934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=24;PP=2965;SC=CCGGCAGACATACAGACAGCC;SOR=2.814;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=98;TCR=24;TR=121;WE=6065922;WS=6065904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
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chr7	6078376	rs2302331	A	C	3589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=81;PP=2903;SC=AACAAATATTAATCTGCCTAT;SOR=2.282;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=28;TCR=81;TR=109;WE=6078384;WS=6078366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr7	6080853	rs34743814	GA	G	1896.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.243;NF=3;NR=77;PP=1203;ReadPosRankSum=0.667;SC=ATTGCTCTCTGAAAAAAAAAA;SOR=3.638;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=119;TCF=6;TCR=113;TR=80;WE=6080862;WS=6080842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,84:0.99:85
chr7	6084310	rs511969	G	T	5672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=96;PP=2965;SC=AGAAATGGAAGTAGATCTGCC;SOR=0.938;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=78;TCR=96;TR=174;WE=6084318;WS=6084300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr7	6088339	rs523254	T	C	731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.05;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	6088349	rs523276	A	G	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.04;SOR=3.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	6088533	rs525090	C	T	1090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=18;PP=829;SC=GAATAAAGAACCTATCAAAAT;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=17;TCR=18;TR=35;WE=6088541;WS=6088523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	6097667	rs558030	T	A	2144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=2;PP=1877;SC=TTCACCTAGTTAGAGTCAATG;SOR=6.154;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=61;TCR=2;TR=63;WE=6097675;WS=6097657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr7	6097868	rs559842	A	C	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=3;NR=37;PP=1092;SC=CAGCAAGACCACATCTCTGCA;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=40;WE=6097885;WS=6097858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr7	6151161	rs635515	C	A	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.400;SOR=0.357;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,17:0.24:72
chr7	6151536	rs633827	G	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.523;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.380;NF=7;NR=4;PP=131;ReadPosRankSum=0.518;SC=GAACCACCACGCCAGGCCCTT;SOR=1.030;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=32;TCF=17;TCR=15;TR=11;WE=6151544;WS=6151526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr7	6155166	rs62454267	G	T	3163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=81;PP=2537;ReadPosRankSum=-0.607;SC=TAAGTGTTCCGTGTTGTGTTT;SOR=0.725;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=129;TCF=30;TCR=99;TR=106;WE=6155174;WS=6155156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,109:0.82:133
chr7	6189561	.	A	C	6494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.736;ClippingRankSum=0.000;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=144;PP=2962;ReadPosRankSum=1.663;SC=CTAGTAAAGTAACAAAACCGA;SOR=0.754;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=286;TCF=96;TCR=190;TR=215;WE=6189569;WS=6189551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,223:0.75:296
chr7	6204999	rs2301910	A	C	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.37;ReadPosRankSum=-0.542;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:179,47:0.21:226
chr7	6230059	.	GTT	G	165.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQRankSum=0.883;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.694;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr7	6426941	rs702483	C	T	2760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.710;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=50;PP=2085;ReadPosRankSum=0.485;SC=GGGAATTAACCTGTTTGTGTT;SOR=0.597;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=127;TCF=57;TCR=70;TR=93;WE=6426949;WS=6426931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,99:0.72:137
chr7	6427017	.	G	C	1601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.433;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=39;PP=1196;ReadPosRankSum=0.434;SC=CATATGAACAGATACTAATTT;SOR=0.519;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=65;TCF=9;TCR=56;TR=47;WE=6427025;WS=6427007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,54:0.73:74
chr7	6431690	rs836478	C	T	13960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=678;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.140;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=255;NR=247;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.720;SC=TTGCAGCTGACTTTTAATGTG;SOR=0.556;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=647;TCF=322;TCR=325;TR=502;WE=6431698;WS=6431680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,517:0.78:664
chr7	6441799	rs836551	G	C	1581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.692;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;PP=1263;ReadPosRankSum=-0.302;SC=GCAAGGCCCTGTGGGTCTTAA;SOR=0.616;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=58;TCF=31;TCR=27;TR=50;WE=6441807;WS=6441789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,53:0.87:61
chr7	6456669	rs836508	C	T	1418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=42;PP=1087;ReadPosRankSum=0.414;SC=GGATCTGAGACTGCAGAATCA;SOR=0.564;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=58;TCF=2;TCR=56;TR=44;WE=6456677;WS=6456659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,48:0.74:65
chr7	6461348	rs836514	G	A	4500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.966;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=51;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.601;SC=ACACGAGTCCGCGCTCATACC;SOR=0.323;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=197;TCF=136;TCR=61;TR=153;WE=6461356;WS=6461338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,161:0.79:205
chr7	6472278	rs149304682	G	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.6699;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.619;NF=8;NR=0;PP=118;ReadPosRankSum=-1.242;SC=GCGACAGAGCGAGACTCCGTC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=8;WE=6472286;WS=6472268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr7	6472354	rs836532	G	A	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.96;ReadPosRankSum=0.258;SOR=1.299;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,39:0.68:57
chr7	6485556	rs73342964	G	T	3907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.853;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=29;PP=2962;ReadPosRankSum=0.496;SC=AAAAAAATAGGTATCAAATAG;SOR=0.232;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=171;TCF=138;TCR=33;TR=134;WE=6485564;WS=6485546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,138:0.79:174
chr7	6487293	rs3750037	G	C	3305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=101;NR=0;PP=2817;SC=TGCTTGGGAAGCCACTTCTGT;SOR=9.250;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=102;TCF=102;TCR=0;TR=101;WE=6487301;WS=6487283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr7	6505901	rs2230263	T	C	2830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=4.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.343;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=82;PP=2271;ReadPosRankSum=-1.248;SC=TGATCATAAATAGCTGCGGAA;SOR=0.551;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=118;TCF=16;TCR=102;TR=96;WE=6505909;WS=6505891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,96:0.81:118
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chr7	6537821	rs6463568	G	C	3799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=110;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.610;SC=GCAGCCCGTCGAGCGCCCGAA;SOR=0.657;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=164;TCF=21;TCR=143;TR=127;WE=6537829;WS=6537811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,127:0.78:162
chr7	6537913	rs79970150	A	G	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=46;PP=1134;ReadPosRankSum=-2.288;SC=CCAGGGTCTCAGGTGGTGGCC;SOR=2.794;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=0;TCR=57;TR=46;WE=6537921;WS=6537903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,46:0.81:57
chr7	6541347	rs7791451	C	T	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.034;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=0;PP=1095;ReadPosRankSum=-1.936;SC=ACTGGAGCCACAGCCAGCTCT;SOR=4.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=57;TCR=2;TR=45;WE=6541355;WS=6541337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,47:0.77:61
chr7	6544630	rs78696194	G	A	2758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.823;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=84;PP=2178;ReadPosRankSum=1.714;SC=TCAGCTACACGTCCATAGTCC;SOR=0.403;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=120;TCF=14;TCR=106;TR=97;WE=6544638;WS=6544620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,101:0.80:127
chr7	6545619	rs11980487	T	C	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=5.082;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=413;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTCTGAGGGCTGCCATAGGGG;SOR=3.258;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=22;WE=6545627;WS=6545609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,25:0.83:30
chr7	6549867	rs74487555	G	A	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=2;PP=709;ReadPosRankSum=0.318;SC=TGAGCCTGGGGTGGAGGGAAA;SOR=0.976;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=28;WE=6549875;WS=6549857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,28:0.82:34
chr7	6550403	rs34411495	A	G	4872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=78;PP=2962;ReadPosRankSum=0.174;SC=CAGAACCAACATGCCCCGCAG;SOR=0.714;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=241;TCF=143;TCR=98;TR=191;WE=6550411;WS=6550393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,191:0.79:241
chr7	6550494	rs12702520	G	A	6679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.503;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=137;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.840;SC=TTGCAGGTGGGAAAACTGAGC;SOR=0.302;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=278;TCF=105;TCR=173;TR=229;WE=6550502;WS=6550484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,236:0.82:287
chr7	6550540	rs61732373	G	A	5714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=152;PP=2962;ReadPosRankSum=0.041;SC=CAGCCTTACCGCAGCTGAGGC;SOR=0.652;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=252;TCF=73;TCR=179;TR=215;WE=6550548;WS=6550530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,216:0.86:252
chr7	6566322	rs2881723	T	G	1543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.320;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=14;PP=1330;ReadPosRankSum=-0.426;SC=GGGCCCGGCGTGCGCGGCACA;SOR=1.647;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=75;TCF=54;TCR=21;TR=57;WE=6566330;WS=6566312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,55:0.75:73
chr7	6570618	rs11772639	G	C	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=13;PP=1126;ReadPosRankSum=1.023;SC=AGCCCCACCCGCTTTCAGACC;SOR=0.574;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=59;TCF=44;TCR=15;TR=49;WE=6570626;WS=6570608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,49:0.83:59
chr7	6576324	.	G	T	1529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.546;ClippingRankSum=0.000;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.859;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=18;PP=1414;ReadPosRankSum=-1.233;SC=CGGGACGGGGGGCTGCCTGTC;SOR=1.390;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=100;TCF=77;TCR=23;TR=83;WE=6576332;WS=6576314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,83:0.84:99
chr7	6590693	rs6463571	G	A	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=1;PP=172;SC=CCGCGTCCGGGCGCTTGCGGC;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=9;WE=6590701;WS=6590683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	6590924	rs150447156	C	T	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=3.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.16;ReadPosRankSum=-0.758;SOR=1.171;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,21:0.21:98
chr7	6591041	rs4724818	C	G	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=6.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.76;ReadPosRankSum=-0.459;SOR=1.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,22:0.21:107
chr7	6591115	rs73674133	A	G	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=1.020;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.99;ReadPosRankSum=0.831;SOR=0.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,20:0.24:83
chr7	6621277	rs11559146	G	A	3727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.922;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=113;PP=2962;ReadPosRankSum=1.071;SC=TCAGAGAGCCGTGCATGGATT;SOR=1.645;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=159;TCF=20;TCR=139;TR=126;WE=6621285;WS=6621267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,128:0.78:164
chr7	6621342	rs77613953	C	T	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=4.249;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.40;ReadPosRankSum=1.148;SOR=0.173;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,13:0.24:55
chr7	6628242	rs3088114	T	C	4661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=102;NR=38;PP=2965;SC=TTTTCTCTGCTCCTAGTACCT;SOR=2.014;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=141;TCF=103;TCR=38;TR=140;WE=6628250;WS=6628232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr7	6639953	rs34300529	G	A	3293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.012;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=86;PP=2633;ReadPosRankSum=-1.808;SC=CTCTGCAGGTGGCCATGGCCT;SOR=1.658;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=129;TCF=27;TCR=102;TR=106;WE=6639961;WS=6639943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,111:0.83:134
chr7	6641549	.	A	G	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.19;ReadPosRankSum=-0.971;SOR=0.140;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,5:0.14:36
chr7	6647738	rs4416743	T	C	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=9;PP=746;SC=TGCCCACGCATCCCGGCCACA;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=30;WE=6647746;WS=6647728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	6655932	rs34060186	C	G	3272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=87;PP=2631;ReadPosRankSum=-0.340;SC=TCTGCACGGGCCAGGGTGGAC;SOR=0.705;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=146;TCF=37;TCR=109;TR=118;WE=6655940;WS=6655922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,119:0.81:147
chr7	6656830	rs2243563	G	A	3947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=44;PP=2965;SC=GCCGACTCCCGGGAATCGGGG;SOR=1.323;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=69;TCR=44;TR=113;WE=6656838;WS=6656820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr7	6656897	rs1806552	A	G	3507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.766;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=66;PP=2625;ReadPosRankSum=-0.771;SC=CTGGAACTTCAATGTCTTGAG;SOR=0.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=47;TCR=66;TR=112;WE=6656905;WS=6656887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,118:0.99:119
chr7	6713936	rs7798061	C	T	1703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FS=7.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=4.176;QD=5.26;ReadPosRankSum=0.175;SOR=1.181;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:263,61:0.19:324
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chr7	7495735	rs55745506	T	C	5284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=113;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.244;SC=CCACAGGTCCTATATCCCCCT;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=216;TCF=76;TCR=140;TR=174;WE=7495743;WS=7495725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,183:0.81:225
chr7	7514235	rs6952195	C	G	6078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=87;PP=2962;ReadPosRankSum=1.197;SC=ACAGTACCTTCTCCCCTTTGA;SOR=1.042;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=252;TCF=146;TCR=106;TR=211;WE=7514243;WS=7514225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,213:0.83:256
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chr7	7516904	rs60977515	T	A	1688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=43;PP=1393;ReadPosRankSum=0.866;SC=AGAGAATGGTTATATTTCAGT;SOR=0.584;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=21;TCR=55;TR=60;WE=7516912;WS=7516894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,61:0.79:77
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chr7	7551561	rs7798119	C	A	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=699;ReadPosRankSum=0.914;SC=TCTGACATTACCTGTCTGAGA;SOR=3.321;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=28;WE=7551569;WS=7551551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,30:0.86:35
chr7	7557241	.	T	G	1368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-6.004;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=1;PP=1026;ReadPosRankSum=-1.338;SC=CTCTGTTAGCTGAGTATTTTC;SOR=1.473;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=60;TCR=1;TR=50;WE=7557249;WS=7557231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,55:0.80:69
chr7	7557297	rs1016028	T	C	5220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=119;NR=22;PP=2965;SC=GATTGCCTTCTTGAGCCATCA;SOR=3.229;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=119;TCR=22;TR=141;WE=7557305;WS=7557287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr7	7559541	rs17151557	A	C	1527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=0;PP=1143;SC=AATAAGATAGATAATATAGGA;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=41;WE=7559549;WS=7559535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr7	7559561	.	C	T	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.607;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=212;ReadPosRankSum=-0.109;SC=AAGTGGAAATCCTGTATTCTT;SOR=0.130;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=56;TCR=0;TR=14;WE=7559569;WS=7559551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,15:0.26:57
chr7	7570959	rs17168516	T	G	6461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=159;NR=22;PP=2965;SC=AACTGTATAATCAACCCATTA;SOR=3.960;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=181;TCF=159;TCR=22;TR=181;WE=7570967;WS=7570949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr7	7571094	rs7804532	G	C	9361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=88;NR=186;PP=2965;SC=CGTAGAAAGTGCAATGGTGAT;SOR=1.687;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=275;TCF=89;TCR=186;TR=274;WE=7571102;WS=7571084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr7	7613039	rs61744397	C	T	11067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=506;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=198;NR=179;PP=2962;ReadPosRankSum=0.798;SC=AAACTGAACCCACAATAATTG;SOR=0.786;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=485;TCF=253;TCR=232;TR=377;WE=7613047;WS=7613015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,391:0.78:500
chr7	7622696	rs4720741	C	T	2060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=1;PP=1643;SC=AACTGACTTACTTTCCAAATA;SOR=6.869;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=57;TCF=56;TCR=1;TR=57;WE=7622704;WS=7622686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr7	7627975	rs17523883	C	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.74;ReadPosRankSum=-1.042;SOR=0.083;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr7	7627994	rs6463702	T	C	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=0;PP=759;SC=TTAATGGCTCTGCAAGATAAA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=26;WE=7628002;WS=7627984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	7628275	rs7801367	C	T	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=38;PP=1091;SC=TTTATAATTACATATGTATGA;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=38;WE=7628283;WS=7628265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr7	7645535	rs10276434	A	G	5166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=143;NR=2;PP=2965;SC=ATAAAATATTATGATATAGTT;SOR=7.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=145;TCF=143;TCR=2;TR=145;WE=7645543;WS=7645525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr7	7646651	rs7806046	G	T	5827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=121;NR=65;PP=2965;SC=GCCCTGTGTCGGCATGCACGT;SOR=1.546;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=186;TCF=121;TCR=65;TR=186;WE=7646659;WS=7646641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr7	7712941	rs10543428	TAGCAGC	T	3782.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.30;QD=41.12;SOR=3.962;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr7	7841338	rs11555073	C	G	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FS=5.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.14;ReadPosRankSum=-1.584;SOR=0.433;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:290,71:0.20:361
chr7	7841561	rs2348558	C	T	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=27;PP=810;SC=TGCTAAACTCCTTTAGTGCTA;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=7841569;WS=7841551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	8008970	rs7786263	C	G	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.460;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=541;ReadPosRankSum=0.138;SC=GTCCAGGGCCCGCAGAGCCAC;SOR=0.255;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=29;WE=8008978;WS=8008960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,32:0.76:42
chr7	8181555	rs80350640	C	CCA	2440.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=622;ExcessHet=3.0103;FS=2.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.01;MQRankSum=2.969;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.249;SOR=0.865;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:452,103:0.19:555
chr7	8196529	rs10282493	A	T	13041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=418;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=143;NR=258;PP=2965;SC=GGATTGCAGTAGATTCTCATT;SOR=1.410;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=401;TCF=143;TCR=258;TR=401;WE=8196537;WS=8196519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,412:1.00:412
chr7	8196567	rs200840693	AAAAAAAAAAAAAAAAAAG	A	3765.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FS=4.132;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.98;MQRankSum=0.098;QD=19.41;ReadPosRankSum=2.979;SOR=1.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:19,175:0.90:194
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chr7	9765662	rs10240050	C	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.431;NF=3;NR=1;PP=60;ReadPosRankSum=0.084;SC=TATTATTGGACGAGGCGGGTC;SOR=1.609;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=4;WE=9765670;WS=9765652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
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chr7	11022564	rs218965	G	A	11087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=181;NR=161;PP=2965;SC=GGAGATCTGCGTCTCAGAAAG;SOR=0.846;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=343;TCF=182;TCR=161;TR=342;WE=11022572;WS=11022554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,349:1.00:349
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chr7	11078498	rs117308428	A	G	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=521;ExcessHet=3.0103;FS=8.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.26;ReadPosRankSum=0.367;SOR=1.393;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:413,101:0.20:514
chr7	11078528	rs76391370	T	C	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FS=4.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=-0.806;QD=2.79;ReadPosRankSum=0.515;SOR=1.016;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:317,69:0.18:386
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chr7	11082439	rs61753125	T	C	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=1.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.99;ReadPosRankSum=-0.688;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,28:0.25:113
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chr7	11151137	rs117182717	G	A	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=3.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.43;ReadPosRankSum=-0.691;SOR=1.034;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:178,40:0.18:218
chr7	11208989	rs28394821	C	A	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=641;ReadPosRankSum=0.260;SC=TCAAGTATAGCTGATAAATGC;SOR=0.732;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=32;WE=11208997;WS=11208979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,33:0.69:48
chr7	11209141	rs79953724	A	G	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.307;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=209;ReadPosRankSum=0.549;SC=GTGTTTTTGAAAAGTTTGCAG;SOR=0.283;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=12;WE=11209149;WS=11209131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,13:0.28:47
chr7	11485527	rs10262052	T	C	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=0;PP=696;SC=TGCCATTGAATGTCCTGTTAC;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=11485535;WS=11485522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	11487100	rs2074434	C	G	1374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=36;PP=1165;SC=CGTCTAATTACTCTATAATTT;SOR=3.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=41;WE=11487108;WS=11487090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr7	11509438	rs56163655	A	G	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.492;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=99;ReadPosRankSum=0.817;SC=TTGCTAGGCCAGAAGACCTCA;SOR=0.157;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=8;WE=11509446;WS=11509428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr7	11509561	rs2285744	G	C	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.957;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=462;ReadPosRankSum=1.490;SC=TCACAATACAGTCCTTCTTAC;SOR=0.950;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=70;TCF=38;TCR=32;TR=24;WE=11509569;WS=11509551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,24:0.33:72
chr7	11581003	rs2072139	G	A	2603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.816;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=18;PP=1988;ReadPosRankSum=-0.976;SC=CATATATGCAGGGTTGGACAT;SOR=1.234;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=155;TCF=118;TCR=37;TR=93;WE=11581011;WS=11580993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,96:0.60:161
chr7	11581121	rs47	T	C	6579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=105;PP=2962;SC=GGCTCGCAGTTTCCCAGTCTC;SOR=1.450;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=56;TCR=105;TR=161;WE=11581142;WS=11581111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr7	11581134	rs2074603	T	C	2112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.403;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=57;PP=1568;ReadPosRankSum=-2.916;SC=CCAGTCTCACTGCTTTCCAGT;SOR=0.376;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=146;TCF=44;TCR=102;TR=88;WE=11581142;WS=11581111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,91:0.59:154
chr7	11676377	rs2074598	G	A	1763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.307;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=43;PP=1382;ReadPosRankSum=1.151;SC=TTGAAATCACGGGCTGACACT;SOR=0.872;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=255;TCF=121;TCR=134;TR=76;WE=11676385;WS=11676367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,77:0.29:263
chr7	12257938	rs6415232	A	G	79.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=58;SC=CTTCTGCTGGATACTTTCTGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=12257946;WS=12257928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr7	12270819	rs73677559	A	C	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=257;ReadPosRankSum=-0.165;SC=AATATACACAACATCTTTATA;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=14;WE=12270827;WS=12270809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr7	12271452	rs3800842	A	G	1919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.958;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=19;PP=1383;ReadPosRankSum=-0.645;SC=CCTCACTTACATTATTTTTAG;SOR=0.445;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=118;TCF=92;TCR=26;TR=77;WE=12271460;WS=12271442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,81:0.66:123
chr7	12370794	rs1059002	T	C	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.311;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=635;ReadPosRankSum=-0.765;SC=TTGTAATTCATATACTTGATG;SOR=0.431;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=29;WE=12370802;WS=12370784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
chr7	12370952	rs6954265	C	T	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.203;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=577;ReadPosRankSum=-1.239;SC=TGCCACTAGACTCAATACTGT;SOR=1.655;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=27;WE=12370960;WS=12370942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,27:0.77:35
chr7	12371001	rs6954555	G	A	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.183;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=340;ReadPosRankSum=0.000;SC=CATACTTAAGGTCCAAGCTGT;SOR=2.093;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=16;WE=12371009;WS=12370991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
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chr7	12372999	rs6460928	T	G	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=490;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTGGAAATAATAAAAAAACAT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=20;WE=12373007;WS=12372989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr7	12373082	rs6460929	C	T	1659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.054;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=11;PP=1317;ReadPosRankSum=1.331;SC=TCTTTAAACTCTGAAATACCT;SOR=0.981;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=92;TCF=72;TCR=20;TR=57;WE=12373090;WS=12373072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,59:0.63:93
chr7	12373353	rs6460930	TG	CA	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=949;ReadPosRankSum=0.163;SC=TATGTACTCTTGTCTTTCAGA;SOR=1.432;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=19;WE=12373362;WS=12373343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr7	12375667	rs35608044	G	GT	503.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.500;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=464;ReadPosRankSum=-1.159;SC=GCATGCTGGAGTTTTTTCCCC;SOR=2.746;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=17;WE=12375675;WS=12375657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr7	12376811	rs2192828	A	C	5133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.470;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=103;PP=2962;ReadPosRankSum=0.931;SC=ACTTTTTTGGAATCTCCTACC;SOR=0.750;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=269;TCF=121;TCR=148;TR=188;WE=12376819;WS=12376801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,190:0.68:279
chr7	12382637	rs1440030	C	T	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=3;PP=892;ReadPosRankSum=-0.520;SC=GTTCATTTCACGTAGCATTAA;SOR=0.760;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=71;TCF=65;TCR=6;TR=39;WE=12382645;WS=12382627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,43:0.57:75
chr7	12383967	rs1440032	T	A	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.605;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=33;PP=1158;ReadPosRankSum=1.432;SC=CAAATACAATTTATCATGCAA;SOR=0.899;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=99;TCF=42;TCR=57;TR=54;WE=12383975;WS=12383957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,55:0.53:104
chr7	12393966	rs6944618	A	G	9020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.66;SOR=3.398;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr7	12393974	rs6944626	A	C	8964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.38;SOR=3.191;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr7	12394053	rs6945167	G	T	9315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.98;NF=134;NR=155;PP=2965;SC=ATTCAGGCATGCTACTCCCTC;SOR=0.891;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=290;TCF=135;TCR=155;TR=289;WE=12394061;WS=12394043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr7	12395813	rs2119141	T	C	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.245;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=300;ReadPosRankSum=1.130;SC=AAGGGTTGGATTGGCACCCAC;SOR=0.468;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=61;TCF=49;TCR=12;TR=20;WE=12395821;WS=12395803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,21:0.34:61
chr7	12396040	rs4719307	A	G	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=24;PP=720;SC=ACAGTCATGTATGTTTATGTA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=12396048;WS=12396030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	12396897	rs1866650	C	T	4030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.242;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=23;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.502;SC=TTACCTCAATCGTGACTCTAG;SOR=1.503;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=183;TCF=146;TCR=37;TR=132;WE=12396905;WS=12396887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,143:0.73:196
chr7	12400710	rs2053381	C	A	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=163;ReadPosRankSum=0.349;SC=TTAATGTGCCCACAGCATAGG;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=12400718;WS=12400700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr7	12400837	rs2053380	G	A	2042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=16;PP=1597;ReadPosRankSum=-0.679;SC=ATATATGACCGTTATTTTGGG;SOR=1.048;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=47;TCR=16;TR=62;WE=12400845;WS=12400827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr7	12406989	rs6460939	C	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.080;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=204;ReadPosRankSum=-1.487;SC=ATACCTGTAGCTTAGTAACTT;SOR=0.301;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=13;WE=12406997;WS=12406979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,12:0.24:49
chr7	12410112	rs963323	G	A	3283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=61;PP=2738;SC=CAGTGTGTCAGACATGCTTTT;SOR=1.225;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=97;TCF=36;TCR=61;TR=97;WE=12410131;WS=12410102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr7	12414620	rs6945357	G	T	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.283;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=447;ReadPosRankSum=-1.362;SC=CAGTATTAGTGTTGTAATTTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=19;WE=12414628;WS=12414610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr7	12417407	rs7793993	C	T	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=3;PP=828;SC=ATTACCTTGACCAATAGTTTT;SOR=3.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=12417415;WS=12417397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	12417690	rs17191008	T	G	33.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr7	12418938	rs10499421	G	C	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=359;ReadPosRankSum=0.178;SC=AAACTTTGTTGCGCATTAGAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=15;WE=12418946;WS=12418928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr7	12418964	rs10270931	T	C	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.723;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=454;ReadPosRankSum=0.097;SC=GGGGCTTTTCTTCAAATATGG;SOR=2.409;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=20;WE=12418972;WS=12418954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr7	12419039	rs10570724	TCA	T	4247.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=44;PP=2965;SC=CATGGACAGATCACAGTTTGG;SOR=0.870;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=82;TCF=36;TCR=46;TR=78;WE=12419048;WS=12419029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr7	12419108	rs6967241	A	T	2541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.035;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.279;NF=23;NR=57;PP=2128;ReadPosRankSum=-0.817;SC=CGTACCTTAAAGCCTGCAAAA;SOR=1.952;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=84;TCF=25;TCR=59;TR=80;WE=12419116;WS=12419098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,81:0.98:83
chr7	12420092	rs1025787	G	C	2208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=1;PP=1877;SC=AAAATAAAATGCAACTGTTTT;SOR=6.932;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=62;TCF=61;TCR=1;TR=62;WE=12420100;WS=12420082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr7	12420447	rs6959370	T	G	1958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=48;PP=1510;SC=TATAACTCTGTGGTTTATCTT;SOR=3.575;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=6;TCR=48;TR=54;WE=12420455;WS=12420437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr7	12420517	rs6460941	T	A	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=464;SC=AAAGTAATACTTTCATATTCT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=12420525;WS=12420507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr7	12428803	rs848016	G	A	2142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.382;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=37;PP=1799;ReadPosRankSum=-0.160;SC=TAAGTATACAGAAAAGTTCCC;SOR=0.538;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=131;TCF=69;TCR=62;TR=76;WE=12428811;WS=12428793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,78:0.58:135
chr7	12429112	rs848015	T	C	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=95;ReadPosRankSum=0.712;SC=TTATGGCTTGTACCTGTTCTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=12429120;WS=12429102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr7	12617624	.	T	A	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.599;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.633;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=386;ReadPosRankSum=-0.376;SC=TTCTTTCATATCAGAAATTCT;SOR=0.365;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=19;WE=12617632;WS=12617614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,19:0.35:54
chr7	12636026	rs758111	T	C	3422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=86;PP=2480;SC=GCCTCCCTGATGTCTGCATTC;SOR=2.133;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=29;TCR=86;TR=115;WE=12636034;WS=12636016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr7	12644334	rs849778	G	T	4130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=92;PP=2965;SC=ACTCCAACTCGTATGTGTCTG;SOR=2.038;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=126;TCF=33;TCR=93;TR=125;WE=12644356;WS=12644324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr7	12644348	rs78612532	G	GGT	2450.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=32.25;ReadPosRankSum=-0.396;SOR=1.455;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,72:0.95:76
chr7	12675546	rs2708655	A	G	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=239;ReadPosRankSum=-0.657;SC=AACAGCTTGTATCATGTTAAA;SOR=0.324;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=12;WE=12675554;WS=12675536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr7	12675649	rs75173905	G	A	2081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.721;HP=3;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=26;PP=1520;ReadPosRankSum=-1.424;SC=AAGCTAATTCGTTTCACTTTC;SOR=0.601;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=122;TCF=82;TCR=40;TR=76;WE=12675657;WS=12675639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,80:0.62:128
chr7	12675690	rs35385652	G	A	2485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.973;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=42;PP=1823;ReadPosRankSum=1.270;SC=AATGCCACACGAGATGAGCTG;SOR=0.480;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=145;TCF=82;TCR=63;TR=91;WE=12675698;WS=12675680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,96:0.62:154
chr7	12675713	rs17166250	T	C	2633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.108;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=54;PP=2123;ReadPosRankSum=-0.223;SC=AACATCTGCGTTCCTGACTGT;SOR=0.894;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=144;TCF=67;TCR=77;TR=96;WE=12675721;WS=12675703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,99:0.64:154
chr7	12684340	rs2691810	C	T	2746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=65;PP=2329;SC=TGTAAGTGTCCTTAAAAATAG;SOR=2.805;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=17;TCR=65;TR=82;WE=12684348;WS=12684330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr7	12727826	rs2280633	G	C	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.934;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.914;NF=27;NR=9;PP=668;ReadPosRankSum=-0.252;SC=AAGAGAAGTTGTAAACCAAGA;SOR=0.299;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=103;TCF=82;TCR=21;TR=36;WE=12727834;WS=12727816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,38:0.36:107
chr7	13940570	.	C	CAAGGATATAAGTAAA	407.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=2897;ReadPosRankSum=0.568;SC=ATGTCCAACTCAAGGATATAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=5;WE=13940578;WS=13940560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr7	13947289	rs10950497	G	A	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=3;PP=213;SC=CTGCAAGTATGTCATTGTTAG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=13947297;WS=13947279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	13950838	rs77694863	C	T	1861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.419;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=19;PP=1381;ReadPosRankSum=0.445;SC=GGTATTTACACGGAATTTCAG;SOR=1.696;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=116;TCF=74;TCR=42;TR=68;WE=13950846;WS=13950828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,72:0.59:123
chr7	14016939	rs2074670	T	C	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=4;PP=565;SC=GTTAAAAAGGTGCTGGTACAA;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=14016947;WS=14016929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	14017007	rs2066977	CC	TG	1540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=1467;ReadPosRankSum=-0.539;SC=AAGAAGGAAACCAGAAAGACA;SOR=0.462;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=32;WE=14017016;WS=14016997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr7	14017126	rs5882424	T	TA	482.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.41;ReadPosRankSum=0.000;SOR=2.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr7	14025640	rs3801110	G	A	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=0;PP=755;SC=GTCAATTTCAGCAAACATAAC;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=14025648;WS=14025630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	14025727	rs3823704	C	T	3539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=10;PP=2893;SC=ATTTCCTAAGCATTAGATACA;SOR=4.274;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=99;TCR=10;TR=108;WE=14025735;WS=14025717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr7	14025766	rs10215655	T	A	5482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=129;NR=42;PP=2965;SC=GTGAACAAGGTGGAAAGAAGA;SOR=2.171;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=172;TCF=129;TCR=43;TR=171;WE=14025774;WS=14025756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr7	14026357	rs3213661	A	G	942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=27;PP=742;SC=CAAATCTTTAATCTTCATTAA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=14026365;WS=14026347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	14027867	rs59844225	G	GCA	1768.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.913;NF=0;NR=51;PP=2287;ReadPosRankSum=-0.652;SC=ACACGCGCGCGCACACACACA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=88;TCF=0;TCR=88;TR=51;WE=14027875;WS=14027857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,54:0.87:62
chr7	14028189	rs11364123	CA	C	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.88;MQRankSum=0.000;QD=20.44;ReadPosRankSum=-0.668;SOR=3.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr7	14028220	rs34468165	G	GA	764.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQRankSum=-0.811;QD=17.78;ReadPosRankSum=0.165;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:5,38:0.88:43
chr7	14028245	rs11460974	G	GA	2517.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.19;MQRankSum=-0.548;QD=24.44;ReadPosRankSum=0.061;SOR=1.572;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:5,98:0.95:103
chr7	14028707	rs140879246	TA	T	2991.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=53;PP=2974;SC=CTCAGCTCAGTATTTTATATT;SOR=1.582;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=72;TCF=18;TCR=54;TR=71;WE=14028715;WS=14028697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr7	14028794	rs10622991	T	TAA	1198.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=2;NR=33;PP=468;SC=CTTTTAGGCTTAAAAAAAAAT;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=35;WE=14028802;WS=14028784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
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chr7	14384832	rs2271267	T	C	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=-0.549;SC=ATTGCTAATATATATTTCATT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=14384840;WS=14384822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr7	14517650	rs3839747	T	TAC	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=104;ReadPosRankSum=-1.710;SC=TCTTAATATTTACACACACAC;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=3;WE=14517658;WS=14517640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr7	14517977	rs3823843	G	A	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.08;ReadPosRankSum=-1.960;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr7	14622510	rs17595234	G	A	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=545;ReadPosRankSum=-0.310;SC=TTTGCCAGTTGAATTTTTGAA;SOR=2.621;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=23;WE=14622518;WS=14622500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,24:0.80:30
chr7	14622870	rs3795245	A	T	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=32;PP=747;ReadPosRankSum=-1.197;SC=TATTTTATAAAAACTGTAAAA;SOR=1.708;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=32;WE=14622878;WS=14622860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,33:0.69:48
chr7	14646986	rs17168299	C	G	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=250;ReadPosRankSum=0.269;SC=ATTATTTCTACATATGTCAGG;SOR=1.085;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=13;WE=14646994;WS=14646976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr7	14653054	rs1525088	T	C	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.246;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=486;ReadPosRankSum=1.452;SC=AGAAAAGTTATATACATGGAA;SOR=0.201;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=21;WE=14653062;WS=14653044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr7	14737622	rs145306944	AAAAG	A	179.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.35;MQRankSum=1.815;QD=6.42;ReadPosRankSum=-0.083;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr7	14758273	rs1997040	C	T	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.991;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=474;ReadPosRankSum=-0.261;SC=GAGAAGTAGTCCGGGGAGGGG;SOR=1.039;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=85;TCF=34;TCR=51;TR=28;WE=14758281;WS=14758263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,31:0.34:91
chr7	14775821	rs139628753	TG	T	876.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.64;MQRankSum=4.907;QD=20.39;ReadPosRankSum=0.076;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr7	14775823	.	GA	CA	945	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000,0.5000;HP=10;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=63.48;NF=1,0;NR=24,21;PP=922,945;QD=38.2708485019;SC=CTATTGTCTGGAAAAAAAAAA;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=25,21;WE=14775831;WS=14775813;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr7	14775823	.	GA	G	945	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000,0.5000;HP=10;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=63.48;NF=1,0;NR=24,21;PP=922,945;QD=38.2708485019;SC=CTATTGTCTGGAAAAAAAAAA;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=25,21;WE=14775831;WS=14775813;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr7	14775824	rs80024169	A	C	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.19;MQRankSum=4.858;QD=19.68;ReadPosRankSum=0.217;SOR=0.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr7	14789643	rs12673261	C	G	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=4.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=70;ReadPosRankSum=1.219;SC=TTATGTAACACTATCCAAATG;SOR=0.343;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=6;WE=14789651;WS=14789633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr7	14789844	rs1723239	A	C	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=3.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.992;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=258;ReadPosRankSum=0.631;SC=TTAAAGCATAATTTTCTAAAC;SOR=1.545;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=14;WE=14789852;WS=14789834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr7	14793399	rs1723225	T	C	65.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5032;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=42;ReadPosRankSum=1.150;SC=ACATCCAGCTTAGTTATAACC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=14793407;WS=14793395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr7	14793478	rs1723224	T	C	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=162;ReadPosRankSum=1.238;SC=TTCAGTGATATGGATGAGAAA;SOR=0.446;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=9;WE=14793486;WS=14793468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr7	14793696	rs17168389	A	G	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=56;ReadPosRankSum=1.164;SC=AACACACCCTAGATCCATAGG;SOR=1.609;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=6;WE=14793704;WS=14793686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr7	14793724	rs4632953	G	C	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.216;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=74;ReadPosRankSum=1.034;SC=AGGTGGTTCCGAAACAGTGGC;SOR=1.432;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=5;WE=14793732;WS=14793714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr7	14797180	rs147706722	T	TAC	204.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=359;ReadPosRankSum=-1.465;SC=TACATATACATACACACACAC;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=11;WE=14797188;WS=14797170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr7	14881079	rs68031412	CAAA	C	168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.34;QD=21.10;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	15346196	rs5882493	T	TA	707.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=301;ReadPosRankSum=-1.034;SC=TATGACTGTGTAAAAAAAAAA;SOR=2.115;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=29;WE=15346204;WS=15346186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,30:0.88:34
chr7	15426866	.	A	T	309	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=12;NR=0;PP=309;QD=28.6476010456;SC=AATTGGCACAAAGTTGGTGGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=15426874;WS=15426865;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	15426956	rs4541808	G	A	1714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=8;PP=1454;SC=TGAAAACAGCGTATGTACAGG;SOR=3.300;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=52;WE=15426964;WS=15426946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
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chr7	15430599	rs35830831	GT	G	336.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=391;SC=CTTCCATCTTGTTTTTTAGAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=13;WE=15430607;WS=15430589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	15458033	rs4469360	C	G	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=400;SC=TATATATTCACTAAAAACGAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=15458041;WS=15458023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	15666230	rs3779406	C	T	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=1;PP=710;ReadPosRankSum=-1.304;SC=ATTTTGCTGGCAAAATTTTAT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=31;WE=15666238;WS=15666220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,32:0.82:39
chr7	15725797	rs113582077	ATGG	A	2135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.361;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.800;NF=34;NR=17;PP=2174;ReadPosRankSum=-0.798;SC=GATGGTGGTGATGGTGGTGGT;SOR=1.474;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=103;TCF=62;TCR=41;TR=51;WE=15725810;WS=15725787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,54:0.77:70
chr7	15726066	rs1050290	G	A	8278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.436;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.22;MQRankSum=1.494;NF=117;NR=189;PP=2962;ReadPosRankSum=0.620;SC=AGACTTCACGGCGGTTCCAAA;SOR=0.922;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=389;TCF=153;TCR=236;TR=306;WE=15726074;WS=15726056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,311:0.79:396
chr7	15726117	rs33970897	A	ATT	4501.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.942;HP=10;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.971;NF=3;NR=88;PP=2985;ReadPosRankSum=-0.945;SC=AAACCGTGTGATTTTTTTTTT;SOR=0.234;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=222;TCF=16;TCR=206;TR=91;WE=15726137;WS=15726107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,148:0.77:192
chr7	15726129	rs11975534	A	C	4002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.206;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.565;NF=11;NR=97;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.534;SC=TTTTTTTTTAACCTCCCAAAG;SOR=0.466;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=152;TCF=15;TCR=137;TR=108;WE=15726137;WS=15726107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,140:0.76:185
chr7	16129153	rs28379235	C	T	346.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.6699;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=116;SC=TATATATGTACGTACATACAT;SOR=2.584;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=6;WE=16129161;WS=16129143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr7	16129172	rs9691136	A	G	343.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=2;PP=235;SC=ATATATATGTATATACATGTA;SOR=3.056;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=16129180;WS=16129162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	16131260	rs1528137	C	T	1335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=16;PP=1028;SC=AGCGGGGGCACAAAGCACAAT;SOR=1.414;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=45;TCF=28;TCR=17;TR=44;WE=16131268;WS=16131250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr7	16298434	rs1295153	T	C	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.05;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	16298438	rs7799150	T	G	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.16;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	16298766	rs5882563	A	AT	323.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=288;SC=AAAAAAATGAAACATGCTGAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=16298774;WS=16298756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	16348059	rs62441885	T	C	2814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=5;PP=2254;SC=CCTTAACTCCTACTCAATGCA;SOR=5.186;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=74;TCR=5;TR=79;WE=16348067;WS=16348049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr7	16348091	rs13437646	A	C	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.464;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=5;PP=699;ReadPosRankSum=1.158;SC=AAATGTACACACACGCAAACA;SOR=1.206;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=131;TCF=105;TCR=26;TR=39;WE=16348099;WS=16348081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,42:0.30:138
chr7	16445673	rs6461252	A	T	2363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=13;PP=1916;SC=TAGACTCAAGAAAAAAGACTT;SOR=2.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=55;TCR=13;TR=68;WE=16445681;WS=16445663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr7	16460893	rs7782939	T	G	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.432;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=623;ReadPosRankSum=0.264;SC=CGCTGACCACTCAGGCAAGGA;SOR=2.235;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=26;WE=16460901;WS=16460883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,26:0.74:35
chr7	16503932	rs67149353	C	G	2233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.524;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=35;PP=1815;ReadPosRankSum=2.199;SC=GATTCTGCCTCCAGCTCACCT;SOR=0.516;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=121;TCF=69;TCR=52;TR=78;WE=16503940;WS=16503922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,80:0.65:124
chr7	16505054	rs111391406	GA	G	365.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.778;NF=20;NR=0;PP=236;ReadPosRankSum=2.266;SC=TACCAGAAAAGAAAAAAAAAA;SOR=1.536;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=20;WE=16505062;WS=16505044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr7	16505341	rs6945425	T	C	1870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.695;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=53;PP=1524;ReadPosRankSum=1.853;SC=ATTCTTTTGCTTCTGCTTCTG;SOR=1.296;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=110;TCF=26;TCR=84;TR=66;WE=16505349;WS=16505331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,68:0.62:109
chr7	16566391	rs6461263	T	G	1359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=0;PP=1129;ReadPosRankSum=-0.977;SC=GGCCACACGCTCAAACGTCAC;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=48;WE=16566399;WS=16566381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr7	16566645	rs2301968	C	G	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=3.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.50;ReadPosRankSum=1.305;SOR=1.070;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,26:0.23:111
chr7	16571973	rs1404173	A	G	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.13;ReadPosRankSum=0.957;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr7	16571976	rs1404172	C	G	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.32;ReadPosRankSum=1.580;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr7	16572051	rs1404171	C	T	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.093;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=358;ReadPosRankSum=-0.128;SC=GTTATTGTTACTGACTGCAAG;SOR=1.225;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=67;TCF=57;TCR=10;TR=20;WE=16572059;WS=16572041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,21:0.29:72
chr7	16577376	rs6961390	G	A	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=484;SC=TCTTAATTTTGTATTCCTAAT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=16577384;WS=16577366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	16598655	rs6979816	G	A	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=406;ReadPosRankSum=-1.057;SC=ATGGCCATAAGTTAAAATAGT;SOR=0.766;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=74;TCF=13;TCR=61;TR=25;WE=16598663;WS=16598645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,25:0.34:74
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chr7	16607177	rs11379958	T	TA	252.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=1.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.13;MQRankSum=3.412;QD=5.49;ReadPosRankSum=-1.866;SOR=1.218;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
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chr7	16684247	rs3807505	G	C	1672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=13;PP=1304;SC=GCCCGGAGTCGCACGCATCAC;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=50;WE=16684255;WS=16684237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr7	16736479	rs7796792	C	G	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=3;PP=483;ReadPosRankSum=-0.570;SC=GGGCAGCTAGCGGGGAGATGG;SOR=0.588;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=76;TCF=67;TCR=9;TR=26;WE=16736487;WS=16736469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,25:0.33:75
chr7	16745589	rs1149510	T	C	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=121;ReadPosRankSum=0.465;SC=AGTATGCTGGTGCAATGGCAG;SOR=0.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=9;WE=16745597;WS=16745579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,9:0.24:37
chr7	16793504	rs6975847	A	G	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=158;ReadPosRankSum=-1.049;SC=CGCCTGGGCCAGGCCCCAAAG;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=16;WE=16793512;WS=16793494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,17:0.34:50
chr7	16793779	rs11405941	G	GC	2788.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=68;PP=2957;SC=GGCTTCCCACGTCTGCGCGCC;SOR=8.526;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=0;TCR=70;TR=68;WE=16793787;WS=16793769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr7	16815786	rs2290836	C	G	1663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=5.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.29;ReadPosRankSum=2.022;SOR=1.135;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,68:0.38:179
chr7	16816000	rs2290837	T	C	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=358;ReadPosRankSum=1.840;SC=TGTTGCTATTTTTTGTATCCT;SOR=0.984;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=82;TCF=9;TCR=73;TR=21;WE=16816008;WS=16815990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,23:0.28:81
chr7	16818799	rs6461276	A	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=162;ReadPosRankSum=-0.839;SC=GTTTTGCATGACAAAGGGCCT;SOR=0.430;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=11;WE=16818807;WS=16818789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,10:0.25:40
chr7	16823095	rs11491	G	A	2013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.172;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=53;PP=1422;ReadPosRankSum=-0.681;SC=ACCCCCGCGCGAATCCTAGTG;SOR=0.993;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=270;TCF=111;TCR=159;TR=83;WE=16823103;WS=16823085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,92:0.33:278
chr7	16834444	rs2272246	C	T	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.726;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=419;ReadPosRankSum=-0.633;SC=AAACTGAGTCCGAGGCGTCCC;SOR=0.192;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=72;TCF=70;TCR=2;TR=22;WE=16834452;WS=16834434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,23:0.32:73
chr7	16834551	rs4719480	C	A	1550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.377;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=18;PP=1125;ReadPosRankSum=-2.268;SC=AATTGAAGGTCACACTTACAC;SOR=1.249;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=228;TCF=142;TCR=86;TR=65;WE=16834559;WS=16834541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,72:0.31:236
chr7	16834597	rs6842	A	G	2563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.383;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=41;PP=1993;ReadPosRankSum=0.436;SC=CATAGAGACGATTTGAATATC;SOR=1.042;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=299;TCF=167;TCR=132;TR=107;WE=16834605;WS=16834587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,110:0.36:305
chr7	16837404	rs819010	C	T	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=94;ReadPosRankSum=0.792;SC=TGTCCATTTCCGGCCAGGCAT;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=7;WE=16837412;WS=16837394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr7	16872913	rs4719482	G	A	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.991;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=435;ReadPosRankSum=-0.121;SC=GCTTGACTCAGCATCAGTGTA;SOR=0.523;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=97;TCF=72;TCR=25;TR=28;WE=16872921;WS=16872903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,27:0.27:100
chr7	16899197	rs11798	C	T	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.378;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=146;ReadPosRankSum=2.494;SC=GGCTTTTTTCCATCATCTCTT;SOR=0.971;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=34;TCF=17;TCR=17;TR=12;WE=16899205;WS=16899187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr7	16901185	rs4236289	C	T	1055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=29;PP=856;SC=TAATTCCATACAACTTTCTGT;SOR=3.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=32;WE=16901193;WS=16901175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr7	16901542	rs13308568	G	A	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=2.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.98;MQRankSum=-4.171;QD=4.09;ReadPosRankSum=0.066;SOR=1.942;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr7	16913394	rs10249749	A	G	2483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=8;PP=2085;SC=TGAGCTGAGAAGCATGTTACC;SOR=3.973;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=62;TCR=8;TR=70;WE=16913402;WS=16913384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr7	16913520	rs4472406	G	A	3895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=75;PP=2965;SC=AGAAGAGCTCGGAAATGGGTA;SOR=1.692;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=34;TCR=76;TR=109;WE=16913528;WS=16913510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr7	16913617	rs4389824	A	G	1364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=40;PP=1141;SC=CACAATTTTCACAAGATATGG;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=40;WE=16913625;WS=16913607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	17854532	rs2723501	G	T	2682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.234;NF=25;NR=55;PP=2164;ReadPosRankSum=1.052;SC=GAGCTAAAGCGGGGGATGCCT;SOR=0.767;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=82;TCF=25;TCR=57;TR=80;WE=17854540;WS=17854522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr7	17854575	.	G	GA,GAAA	770.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.44;QD=38.54;SOR=3.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,7,13:0.35,0.65:20
chr7	17854616	rs2723502	T	C	1208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=43;PP=972;SC=ACTGACAGAATGCTAGAAATT;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=43;WE=17854624;WS=17854606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr7	17869854	rs73081336	C	G	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=168;SC=CCATGGTTTTCTAAGACAGGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=17869862;WS=17869844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr7	17874271	rs4721660	T	C	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=294;SC=ATTGCCATAGTTTATCTTTTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=17874279;WS=17874261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	17874300	rs4721661	G	A	571.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=485;ReadPosRankSum=1.160;SC=TCTACTTTTAGAAAGTTTTTA;SOR=3.056;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=18;WE=17874308;WS=17874290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
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chr7	17908130	rs2389858	T	A	1766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=37;PP=1188;ReadPosRankSum=-0.815;SC=AAAAAGTAAATAACAAAAACA;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=44;WE=17908138;WS=17908120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr7	17913083	rs5882635	A	AC	1792.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=3;PP=1834;SC=GGGTCTTAAGACAAAAATTTT;SOR=4.450;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=42;WE=17913091;WS=17913073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr7	17928509	rs73081395	T	C	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=199;ReadPosRankSum=-0.345;SC=CACAGTCCCATAGCTAGAGGT;SOR=0.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=11;WE=17928517;WS=17928499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr7	17962382	rs11397631	G	GA	2251.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=56;PP=1989;SC=AAACTACTGGGAAAAAAAGAT;SOR=2.124;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=10;TCR=70;TR=64;WE=17962390;WS=17962372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr7	18067479	rs35708479	ACT	A	574.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.346;SOR=0.468;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,18:0.27:66
chr7	18201859	.	C	T	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=0.000;DP=230;ExcessHet=3.0103;FS=1.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.13;ReadPosRankSum=1.692;SOR=0.844;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:168,57:0.25:225
chr7	18300132	rs13240203	C	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.396;NF=11;NR=1;PP=250;ReadPosRankSum=-1.357;SC=TTAGTAGAGACGGGGTTTCAC;SOR=1.863;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=12;WE=18300140;WS=18300122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr7	18630208	rs1726610	A	C	640.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=577;ReadPosRankSum=-0.947;SC=AGACTCGTCAAAATTATCTGT;SOR=4.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=20;WE=18630216;WS=18630198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr7	18631098	.	ATGTG	A,ATG	1198.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.98;QD=29.97;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,11,29:0.28,0.73:40
chr7	18674435	rs2285431	T	C	763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=597;SC=CAAAGTGATATTTCTGAGTTG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=18674443;WS=18674425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	18914251	rs2286213	C	G	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=20;PP=724;SC=TTACGAAAGGCTCTGATATCA;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=18914259;WS=18914241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	18993870	rs2389998	C	T	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=20;PP=575;SC=CTTTAAAGTTCTCTTAAAAAT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=18993878;WS=18993860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	19184707	.	C	G	3335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=0.000;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.688;NF=60;NR=54;PP=2329;ReadPosRankSum=-0.248;SC=CCCTTTTCCTCTTGGGGCGGC;SOR=0.659;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=196;TCF=105;TCR=91;TR=114;WE=19184715;WS=19184697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,128:0.60:215
chr7	19184746	rs34966908	C	CTCT	8213.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.677;NF=44;NR=93;PP=2974;ReadPosRankSum=-0.076;SC=TTCCGCGCTCCTCTTCCTCCT;SOR=0.768;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=154;TCF=45;TCR=109;TR=137;WE=19184754;WS=19184736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,191:0.99:193
chr7	19738359	rs199908969	TA	T	563.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.810;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.317;NF=4;NR=19;PP=682;ReadPosRankSum=-0.207;SC=AACTATAAATTAACAGTTAAA;SOR=0.116;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=83;TCF=8;TCR=75;TR=23;WE=19738367;WS=19738349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,23:0.28:83
chr7	19739947	rs145557463	C	G	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.03;ReadPosRankSum=0.910;SOR=0.378;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,20:0.25:81
chr7	19744417	rs11543308	T	C	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=2.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.08;ReadPosRankSum=-1.017;SOR=1.375;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,10:0.22:45
chr7	19761868	rs76009686	T	C	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.038;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=68;ReadPosRankSum=-0.219;SC=CTTGCTAAGTTTTGGGGAAAG;SOR=0.082;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=6;WE=19761876;WS=19761858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr7	19763783	rs77583258	T	C	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.720;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=306;ReadPosRankSum=-2.234;SC=AGCGATACTTTGAGAAACAAC;SOR=0.143;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=60;TCF=49;TCR=11;TR=21;WE=19763791;WS=19763773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,21:0.35:60
chr7	19768879	rs11401553	G	GT	279.25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=157;ReadPosRankSum=0.212;SC=TTATTTGTCAGTTTTTTTTTT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=10;WE=19768887;WS=19768869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,17:0.85:20
chr7	19813018	rs12673970	T	C	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.22;ReadPosRankSum=0.471;SOR=0.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,12:0.21:58
chr7	19813202	rs117555925	C	T	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=3.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.98;ReadPosRankSum=0.621;SOR=0.393;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,22:0.16:139
chr7	19813338	rs117803408	C	G	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=170;ReadPosRankSum=-1.308;SC=GACGGAAACCCCAGGGGGGTG;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=14;WE=19813346;WS=19813328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr7	20180425	.	T	TAC	255.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=397;ReadPosRankSum=-0.679;SC=CTTTCTTTCCTACACACACAC;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=9;WE=20180433;WS=20180415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr7	20180507	rs55989776	G	GAC	686.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.966;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.566;NF=17;NR=3;PP=789;ReadPosRankSum=-1.030;SC=GACACACACAGACACACACAC;SOR=1.542;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=51;TCF=45;TCR=6;TR=20;WE=20180515;WS=20180497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr7	20180717	rs3735615	C	G	3230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.788;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=73;PP=2509;ReadPosRankSum=-1.516;SC=TAACACATCTCTGTAGTTATT;SOR=0.619;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=143;TCF=51;TCR=92;TR=114;WE=20180725;WS=20180707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,117:0.80:147
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chr7	20403353	rs35420999	AT	A	2094.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=42;PP=1029;SC=GAGGTGTGCCATTTTTTTTTT;SOR=1.101;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=73;TCF=19;TCR=54;TR=60;WE=20403361;WS=20403343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
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chr7	20444532	rs2074424	C	T	2756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=74;PP=2306;ReadPosRankSum=0.823;SC=TGTCCTTTTTCGTTCTGACTT;SOR=1.725;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=90;TCF=15;TCR=75;TR=89;WE=20444540;WS=20444522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
chr7	20668236	rs3033483	T	TTG	46.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.46;ReadPosRankSum=0.056;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,5:0.16:32
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chr7	20739774	rs5882753	AT	A	96.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=2.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.12;ReadPosRankSum=0.771;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr7	20762609	rs73085689	T	C	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=1;PP=1249;SC=GTTAATTGAGTTTTTTCCCCC;SOR=6.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=42;TCR=1;TR=43;WE=20762617;WS=20762599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	20762646	rs62453384	G	T	2196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=6;PP=1980;SC=TAGGCAACAGGTTCCAGGATT;SOR=4.438;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=65;TCR=6;TR=70;WE=20762654;WS=20762636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr7	20762937	rs62453385	T	C	1552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=46;PP=1333;ReadPosRankSum=-1.149;SC=TAACCATCTTTATGATATATT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=46;WE=20762945;WS=20762927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,47:0.96:49
chr7	20778646	rs6461515	G	A	2463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=40;PP=1969;SC=GGCCATCGGAGAAACGCTCGT;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=41;TCR=40;TR=81;WE=20778654;WS=20778636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr7	20778773	rs6461516	C	G	1275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=31;PP=990;SC=GTAAGCACAACTGTGATCTTA;SOR=2.247;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=40;WE=20778781;WS=20778763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	20778844	rs11380694	A	AG	280.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.77;MQRankSum=0.640;QD=21.60;ReadPosRankSum=0.493;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr7	20782474	rs12669866	T	C	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=3;PP=773;SC=GTCATTCTTCTCAACTCTGTC;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=20782482;WS=20782464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	20803107	rs55827389	T	TC	1224.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=33;PP=1503;SC=AGTCTGTTTTTCTTTAGTGTT;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=33;WE=20803115;WS=20803097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr7	20824614	rs34908430	C	T	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.74;ReadPosRankSum=0.257;SOR=0.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:144,44:0.23:188
chr7	20825148	.	AGCCGCGGCTGCTGCCGCGGCC	A	556.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=4.169;NF=14;NR=0;PP=1635;ReadPosRankSum=-1.862;SC=GGGCCGCGGCAGCCGCGGCTG;SOR=1.524;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=45;TCR=3;TR=14;WE=20825176;WS=20825138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr7	20826270	rs112554769	GA	G	69.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.000;QD=0.61;ReadPosRankSum=-0.172;SOR=0.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,20:0.18:114
chr7	20826452	rs34863300	T	G	1644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FS=0.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.98;ReadPosRankSum=0.642;SOR=0.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:244,86:0.26:330
chr7	21468579	rs39303	G	A	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=88;ReadPosRankSum=0.361;SC=CCTCTTTGAGGGTATAACGCT;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=6;WE=21468587;WS=21468569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr7	21468862	rs376953570	CT	C	624.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.444;NF=38;NR=0;PP=1160;ReadPosRankSum=-0.505;SC=AATCCGCCCACTTTTTTTCCC;SOR=1.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=38;WE=21468878;WS=21468852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr7	21468869	rs141294478	TCC	T	167.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.19;MQRankSum=-1.353;QD=3.90;ReadPosRankSum=1.605;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,11:0.26:43
chr7	21470536	rs40245	A	T	1389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=38;PP=1143;SC=TCCTAATTCTAAGGTTTGACG;SOR=5.283;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=40;WE=21470544;WS=21470526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr7	21510666	rs117638907	T	C	1622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.823;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=23;PP=1204;ReadPosRankSum=-1.000;SC=ATGTGTTGGATTCCAGCTATA;SOR=1.151;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=77;TCF=43;TCR=34;TR=57;WE=21510674;WS=21510656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,61:0.73:84
chr7	21516627	rs3214203	AT	A	409.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=224;ReadPosRankSum=2.009;SC=ATGCACATAGATTTTTTTTTT;SOR=0.648;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=19;WE=21516635;WS=21516617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr7	21582963	rs2285943	GA	TT	2140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-5.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.950;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=5;PP=2448;ReadPosRankSum=0.515;SC=GGGCGCTGTGGAGCTCGAGGA;SOR=0.170;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=70;TCF=65;TCR=5;TR=48;WE=21582972;WS=21582953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,53:0.75:71
chr7	21583282	rs2285945	T	G	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=5.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.09;ReadPosRankSum=0.771;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,22:0.22:100
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chr7	21584820	rs7781669	A	G	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=746;ReadPosRankSum=-1.884;SC=ATGACATTTGAAATTATTTAG;SOR=0.495;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=28;WE=21584828;WS=21584810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,35:0.83:42
chr7	21599233	rs10950854	C	T	2414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=11;PP=1924;SC=CACCGTCAAACGAAAGGATAA;SOR=3.471;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=63;TCR=11;TR=74;WE=21599241;WS=21599223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr7	21600902	rs4374884	A	G	2366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=66;PP=1924;SC=GTGATTGCTCATGGCTCTTCT;SOR=4.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=5;TCR=66;TR=71;WE=21600910;WS=21600892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr7	21603666	rs72655979	A	G	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.175;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=74;ReadPosRankSum=-0.456;SC=ATTGTAGGATAAGTAATATAA;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=5;WE=21603686;WS=21603656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr7	21603678	rs5008148	A	G	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=672;SC=GTAATATAAAAGGAACTATGA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=21603686;WS=21603656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	21603886	rs4392792	A	G	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.611;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=308;ReadPosRankSum=-0.614;SC=CGGAATTCCCACAGACACGCA;SOR=0.333;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=85;TCF=24;TCR=61;TR=25;WE=21603894;WS=21603876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,25:0.29:86
chr7	21609691	rs72655982	C	T	3275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.748;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=33;PP=2346;ReadPosRankSum=-0.474;SC=TCCTAGGCAACAGCTTACCTT;SOR=0.301;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=172;TCF=128;TCR=44;TR=114;WE=21609699;WS=21609681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,126:0.66:190
chr7	21611399	rs66476925	G	C	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=712;ReadPosRankSum=0.282;SC=GTAGTGGAAAGGTCTTTACTG;SOR=0.542;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=35;WE=21611407;WS=21611389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,37:0.79:47
chr7	21611626	rs72655985	A	G	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=242;SC=ATTGCATGGGATCCTATAATT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=10;WE=21611634;WS=21611616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	21621453	rs72655986	G	A	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=663;ReadPosRankSum=-0.245;SC=GTAAGGTCACGCTTGTGTGAT;SOR=0.349;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=32;WE=21621461;WS=21621443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,32:0.73:44
chr7	21621631	rs72655988	G	A	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.777;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=564;ReadPosRankSum=-1.309;SC=CTTAGAAGCTGCATTTAAGGT;SOR=0.081;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=29;WE=21621639;WS=21621621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,29:0.71:41
chr7	21627909	rs3810897	A	G	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.250;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=2;PP=22;ReadPosRankSum=0.627;SC=ATATCTAAAGATTAGATATAG;SOR=0.002;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=4;WE=21627917;WS=21627899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,4:0.17:23
chr7	21628237	rs6963535	C	T	11479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=167;NR=189;PP=2965;SC=GGTCAAACTTCGCATCTCTCC;SOR=0.844;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=356;TCF=167;TCR=189;TR=356;WE=21628245;WS=21628227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,368:1.00:368
chr7	21630982	rs4615458	A	G	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=4.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=1.317;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,50:0.28:180
chr7	21639818	rs6461586	T	C	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=9.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.38;ReadPosRankSum=0.086;SOR=0.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,4:0.17:23
chr7	21640405	rs10224537	A	G	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FS=4.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.59;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=1.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:209,64:0.23:273
chr7	21641218	rs3827657	G	A	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=1.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.16;ReadPosRankSum=0.478;SOR=0.934;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,28:0.19:146
chr7	21654602	rs7779983	C	T	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=0;PP=1125;SC=CCAGTAATTACGCTGCAGATT;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=21654610;WS=21654592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	21658855	rs57208694	A	G	5001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=105;PP=2965;SC=TGTCCTCGGGACTGGGTCATT;SOR=2.078;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=40;TCR=105;TR=145;WE=21658863;WS=21658845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr7	21658964	rs68184450	C	T	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=302;ReadPosRankSum=-0.260;SC=AGTTTGTTCCCTGCTGTTCAT;SOR=0.506;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=16;WE=21658972;WS=21658954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr7	21659554	rs112373177	A	ATTAAT	980.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=13.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.819;SOR=2.764;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,29:0.23:127
chr7	21659645	rs56029521	T	C	1721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.043;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=35;PP=1429;ReadPosRankSum=-0.422;SC=GAACAGGCATTCCATTACTAA;SOR=0.773;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=239;TCF=124;TCR=115;TR=78;WE=21659653;WS=21659635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,79:0.32:247
chr7	21695623	.	C	G	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.064;ClippingRankSum=0.000;DP=240;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.71;ReadPosRankSum=-1.206;SOR=0.676;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:177,58:0.25:235
chr7	21695649	rs4385378	G	A	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=5.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.56;ReadPosRankSum=1.225;SOR=1.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,41:0.25:163
chr7	21698319	rs67673671	G	T	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=109;ReadPosRankSum=0.637;SC=AATCCACCTGGGGCATTACCC;SOR=0.142;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=8;WE=21698327;WS=21698309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr7	21723573	rs59447021	A	T	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=1.820;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.07;ReadPosRankSum=1.675;SOR=0.315;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,15:0.23:65
chr7	21727186	rs62445282	A	G	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=378;ReadPosRankSum=-2.070;SC=AAATAGAAAAACATGGAATAA;SOR=0.570;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=15;TCR=65;TR=26;WE=21727194;WS=21727176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,26:0.32:81
chr7	21727271	rs62445283	C	T	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=34;ReadPosRankSum=0.380;SC=AGATTCTGGTCGATTTGGGGG;SOR=0.465;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=4;WE=21727279;WS=21727261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr7	21750079	rs72657349	A	G	268.22	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.7362;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=189;ReadPosRankSum=-0.524;SC=AGGCAGCAAAATCGTTTTTAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=21750087;WS=21750069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
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chr7	21775153	rs2072219	A	C	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=1;PP=887;SC=GATTTCAATTATAAAGTGACT;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=21775161;WS=21775143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	21775210	rs2270022	A	G	2450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=6;PP=1994;SC=TCTCGCACGCACTCTCTCTCT;SOR=4.905;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=73;TCR=6;TR=78;WE=21775218;WS=21775200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr7	21775443	rs2072221	G	A	6812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=128;PP=2965;SC=ACTACTACACGACATCCACAG;SOR=1.244;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=79;TCR=128;TR=207;WE=21775451;WS=21775433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr7	21778449	rs1109806	C	T	2747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.403;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=54;PP=1939;ReadPosRankSum=0.389;SC=TTCAGCCTCACACCCTGATCC;SOR=0.565;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=147;TCF=67;TCR=80;TR=104;WE=21778457;WS=21778439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,109:0.71:154
chr7	21779084	rs2906686	G	A	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=467;ReadPosRankSum=-0.503;SC=GAGTGATTATGAAGATAAGGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=20;WE=21779092;WS=21779074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,19:0.83:23
chr7	21779104	rs933353	C	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=73;ReadPosRankSum=-0.626;SC=AGGTAATCTGCGATGAAGACC;SOR=0.097;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=7;WE=21779112;WS=21779094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chr7	21779278	rs9639393	A	G	2040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=36;PP=1540;ReadPosRankSum=-0.674;SC=TTCACCATCAATCCCAGGCTA;SOR=0.641;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=52;TCR=55;TR=71;WE=21779286;WS=21779268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,76:0.68:112
chr7	21779331	rs933354	T	C	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.389;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=513;ReadPosRankSum=-0.778;SC=TGTAGGTCTGTATTGTATTGT;SOR=0.384;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=91;TCF=26;TCR=65;TR=27;WE=21779339;WS=21779321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,27:0.29:93
chr7	21781807	rs1029598	T	C	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=8.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.74;ReadPosRankSum=0.035;SOR=2.037;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,33:0.20:164
chr7	21783994	rs185588130	A	C	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-4.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=0;PP=1001;ReadPosRankSum=0.437;SC=AAAAGTGTTAAACTCATTTGA;SOR=1.437;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=39;WE=21784002;WS=21783984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,43:0.80:54
chr7	21789442	rs4355679	T	C	4174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.076;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=109;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.518;SC=ACACATTTCTTGAAAGATCTT;SOR=0.522;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=221;TCF=71;TCR=150;TR=165;WE=21789450;WS=21789432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,169:0.75:224
chr7	21813318	rs11374411	A	AT	3428.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=1;PP=2688;SC=CATTTACTTGATTTTTTTTAA;SOR=8.206;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=120;TCF=114;TCR=6;TR=106;WE=21813326;WS=21813308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr7	21818486	rs4273751	A	G	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=436;ReadPosRankSum=-0.982;SC=AAATTGTTAGAGATCCCTGAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=17;WE=21818494;WS=21818476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr7	21824122	rs6965750	G	A	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=4.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.05;ReadPosRankSum=-1.393;SOR=1.099;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,46:0.22:207
chr7	21857776	rs6957850	A	T	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=235;ReadPosRankSum=0.923;SC=CATTTAAAAAATTTTGAACAT;SOR=0.363;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=14;WE=21857784;WS=21857766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,15:0.30:50
chr7	21901566	rs4722067	T	C	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.174;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=729;ReadPosRankSum=-0.013;SC=GCATCACCCATGCTGTCTTCC;SOR=1.402;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=63;TCF=26;TCR=37;TR=41;WE=21901574;WS=21901556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,42:0.64:66
chr7	21907375	rs2074329	G	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=143;ReadPosRankSum=-0.140;SC=AATAAACCTGGTTACTTCTAT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=7;WE=21907383;WS=21907366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr7	21907452	rs5882827	G	GT	1308.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.099;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.579;NF=31;NR=1;PP=1993;ReadPosRankSum=-0.293;SC=CACTGATCATGTTTTTATATT;SOR=2.007;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=49;TCF=47;TCR=2;TR=32;WE=21907466;WS=21907442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,33:0.72:46
chr7	21907458	rs4995598	A	G	1343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.815;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.94;MQRankSum=-0.620;NF=32;NR=1;PP=1732;ReadPosRankSum=0.358;SC=TCATGTTTTTATATTCTTGTT;SOR=1.814;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=48;TCF=46;TCR=2;TR=33;WE=21907466;WS=21907442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,34:0.69:49
chr7	21907696	rs11773744	T	C	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=535;ReadPosRankSum=2.830;SC=CCTGCCCTTCTTTTCAGTTCA;SOR=1.148;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=23;WE=21907704;WS=21907686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,23:0.85:27
chr7	21924014	rs6461613	A	G	2267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=28;PP=1734;SC=AGAAGAATTCATGAATCCATC;SOR=1.416;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=50;TCR=28;TR=78;WE=21924022;WS=21924004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr7	21932044	rs12537531	C	T	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.384;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=420;ReadPosRankSum=-0.273;SC=TGGTTCAAGACTGAAGATGAA;SOR=1.166;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=78;TCF=60;TCR=18;TR=27;WE=21932052;WS=21932034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,26:0.34:76
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chr7	21940557	rs10555456	AACTT	A	3810.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=15;PP=2970;SC=TGCATCAAACAACTTACTTGA;SOR=3.056;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=65;TCF=50;TCR=15;TR=61;WE=21940568;WS=21940547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
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chr7	21941861	rs60370798	ATCTT	A	4698.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=17;PP=2979;SC=CTGTAAAAAAATCTTTCTTAG;SOR=3.056;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=72;TCR=19;TR=80;WE=21941872;WS=21941851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr7	21943722	rs35898649	T	C	4132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=20;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.610;SC=CAAACACTGTTCCTACCGGGT;SOR=0.644;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=148;TCR=27;TR=130;WE=21943730;WS=21943712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,139:0.75:186
chr7	21945840	rs4445125	C	T	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=547;ReadPosRankSum=0.650;SC=GTGACAGTGACGTGCGTTCAC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=22;WE=21945848;WS=21945830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,23:0.68:34
chr7	21946103	.	C	G	3029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=0.000;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.120;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=70;PP=2385;ReadPosRankSum=-0.828;SC=ACAGAGACAACTGGGGACTCT;SOR=1.215;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=143;TCF=56;TCR=87;TR=111;WE=21946111;WS=21946093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,110:0.77:142
chr7	21946177	rs74997026	T	A	1537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.445;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=40;PP=1226;ReadPosRankSum=-0.596;SC=TATAAGGAGTTCTACTTACAG;SOR=1.834;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=74;TCF=27;TCR=47;TR=56;WE=21946185;WS=21946167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,56:0.76:74
chr7	21951105	rs11978167	T	G	2039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=2;PP=1761;ReadPosRankSum=-3.158;SC=TTAGGTTATGTTAATTGCTTG;SOR=1.195;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=96;TCF=93;TCR=3;TR=67;WE=21951113;WS=21951095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,67:0.70:96
chr7	21956405	rs1128250	G	A	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=3.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.89;ReadPosRankSum=-0.050;SOR=0.965;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,54:0.26:206
chr7	21985338	rs3823667	G	A	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=8.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.92;ReadPosRankSum=-1.440;SOR=1.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,38:0.31:123
chr7	21985347	rs1406706	G	A	4666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=81;NR=49;PP=1732;SC=GGTGGCAAAGGGAAGTCAAAC;SOR=1.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=81;TCR=50;TR=130;WE=21985355;WS=21985328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr7	22165363	.	T	C	3716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.733;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=87;PP=2887;ReadPosRankSum=0.209;SC=GGAAGGATAATCTAGCACTCT;SOR=0.282;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=167;TCF=47;TCR=120;TR=126;WE=22165371;WS=22165353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,130:0.76:172
chr7	22165421	rs17146285	G	A	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.08;ReadPosRankSum=0.478;SOR=0.565;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,17:0.21:80
chr7	22170531	rs115033513	G	A	1493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=17;PP=1140;ReadPosRankSum=0.808;SC=AAGCAAATAAGCTCCTTGAAT;SOR=0.703;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=57;TCR=26;TR=54;WE=22170539;WS=22170521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,56:0.65:86
chr7	22190131	.	GAA	G,GA	1330.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=2.665;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.78;MQRankSum=-0.340;QD=19.57;ReadPosRankSum=1.663;SOR=1.839;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:4,36,28:0.53,0.41:68
chr7	22197507	rs7809342	A	G	4134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=89;PP=2965;SC=TACAGTGCTGAAAGGAAAAAT;SOR=2.500;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=115;TCF=25;TCR=90;TR=114;WE=22197515;WS=22197497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr7	22200255	rs955484	G	C	2571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.806;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=31;PP=1992;ReadPosRankSum=0.609;SC=AGACAAATGAGAGCTCAGTGG;SOR=1.006;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=118;TCF=76;TCR=42;TR=90;WE=22200263;WS=22200245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,94:0.76:123
chr7	22206854	rs17709607	T	C	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-5.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=40;PP=791;ReadPosRankSum=-0.375;SC=ACCATGTGCATGGCAGAAATA;SOR=0.340;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=62;TCF=2;TCR=60;TR=42;WE=22206862;WS=22206844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,43:0.67:64
chr7	22242370	rs4722110	G	T	1402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=5;PP=1040;SC=CAAATTAAACGGATATCCACC;SOR=3.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=39;WE=22242378;WS=22242360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	22242535	rs4719687	T	C	1950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.007;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=39;PP=1421;ReadPosRankSum=1.309;SC=CCTCAGTAAATAGAGGGCAGA;SOR=0.578;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=84;TCF=32;TCR=52;TR=65;WE=22242543;WS=22242525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,70:0.79:89
chr7	22259670	rs1859807	C	A	1388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=406;ExcessHet=3.0103;FS=1.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.45;ReadPosRankSum=-0.898;SOR=0.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:319,83:0.21:402
chr7	22357716	rs10950897	T	G	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=443;ReadPosRankSum=1.980;SC=TACCAAAAAATGAAAACATAA;SOR=2.925;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=20;WE=22357724;WS=22357706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,20:0.83:24
chr7	22459324	rs2177142	G	A	2610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=13;PP=2128;SC=GTTCATTGTGGCAGAGGGAAA;SOR=2.955;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=61;TCR=13;TR=73;WE=22459332;WS=22459314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr7	22478207	rs2528843	G	T	5125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=47;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.865;SC=TTGAAGGGCTGGCTGCTGATA;SOR=0.846;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=159;TCF=112;TCR=47;TR=158;WE=22478215;WS=22478197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,160:0.99:161
chr7	22532391	rs183568288	T	C	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=3.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.13;MQRankSum=-4.684;QD=7.61;ReadPosRankSum=-0.347;SOR=0.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,15:0.32:47
chr7	22532434	rs4000921	G	C	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=4.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.873;NF=1;NR=64;PP=1595;ReadPosRankSum=-2.840;SC=TTCCCTGTGTGTACTATGAAG;SOR=0.512;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=98;TCF=1;TCR=97;TR=65;WE=22532442;WS=22532424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,26:0.45:58
chr7	22533452	rs201338533	C	T	2433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=36.418;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-10.428;NF=0;NR=121;PP=2936;ReadPosRankSum=-1.426;SC=CCCGTGTCCTCATGCTACAAA;SOR=5.807;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=178;TCF=13;TCR=165;TR=121;WE=22533460;WS=22533442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,86:0.63:136
chr7	22539781	rs184955254	G	A	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.259;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=830;ReadPosRankSum=-0.614;SC=CGCTGCTGCCGGGAGGTGCCG;SOR=0.465;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=37;WE=22539789;WS=22539771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,37:0.70:53
chr7	22857589	rs7782015	T	C	1312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=14;PP=1089;SC=TGAACATTTGTCCTGAAATGT;SOR=1.501;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=40;TCF=26;TCR=14;TR=39;WE=22857597;WS=22857579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	22857682	rs28617621	A	G	1611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=28;PP=1185;SC=ATCAAGGAAGACAGAAGAGAA;SOR=1.077;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=49;WE=22857690;WS=22857672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr7	22861739	rs35353454	T	C	4727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=23;PP=2965;ReadPosRankSum=0.815;SC=TGTGCGACCTTGGCAAAAAAG;SOR=2.098;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=144;TCF=121;TCR=23;TR=143;WE=22861747;WS=22861729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,144:0.99:145
chr7	22861978	rs4354222	G	A	1689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=45;PP=1391;SC=CCTAGTGCTAGAGAGTGAATT;SOR=4.977;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=48;WE=22861986;WS=22861968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr7	22862192	rs2270106	A	G	2867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=8;PP=2226;SC=CGTGCACGGCAGTGTCCCCTA;SOR=4.493;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=102;TCF=93;TCR=9;TR=99;WE=22862200;WS=22862182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr7	22985868	rs2286491	T	C	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=363;SC=AGTTATGCTTTACATAAATTA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=22985876;WS=22985858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	23000783	rs35493358	G	GCTCT	1928.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=2;PP=1941;SC=ACTATGAATGGCTCTCAATTT;SOR=3.365;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=31;WE=23000791;WS=23000773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	23145837	rs1005786	G	C	3753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=123;PP=2906;ReadPosRankSum=0.367;SC=TTCCCGGGGTGGAACCCCGCG;SOR=3.767;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=10;TCR=124;TR=133;WE=23145845;WS=23145827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,138:0.99:139
chr7	23163270	rs11982002	C	T	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=253;SC=AGAAATTCTGCGCTGGAAAAA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=23163278;WS=23163260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	23164526	rs2058275	C	G	2924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=43;SC=GGAAGAGTTTCAGTATCCTAT;SOR=0.715;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=39;TCR=43;TR=82;WE=23164534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr7	23164701	rs15775	C	T	2579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=38;PP=1995;SC=TCAGTCTTTGCTGGATGCAGC;SOR=0.791;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=43;TCR=38;TR=81;WE=23164709;WS=23164691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr7	23191625	rs2178140	G	C	3014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=17;PP=2412;ReadPosRankSum=2.050;SC=TGGGTATTTCGTTTTCAAAGC;SOR=1.569;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=76;TCR=17;TR=92;WE=23191644;WS=23191615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,96:0.99:97
chr7	23191636	rs2178139	A	G	3081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=20;PP=2494;ReadPosRankSum=0.912;SC=TTTTCAAAGCACTGGTTAGTG;SOR=1.557;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=87;TCR=20;TR=106;WE=23191644;WS=23191615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,110:0.99:111
chr7	23191664	rs2141306	G	A	4283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=40;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.739;SC=TTCTTGAAGCGTTGCCATGTA;SOR=0.836;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=95;TCR=40;TR=134;WE=23191672;WS=23191654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,136:0.99:137
chr7	23191899	rs2141305	T	C	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=753;SC=ACTCACCAACTAGAAGTAGTA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=23191907;WS=23191889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	23195555	rs141774430	CTTTAT	C	2393.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.17;NF=12;NR=28;PP=2073;SC=ACTCTTAGCACTTTATTTTTA;SOR=1.487;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=40;WE=23195567;WS=23195545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr7	23221797	rs200880793	A	ACGGCAGCAACCG	3259.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=4.517;NF=6;NR=53;PP=2971;ReadPosRankSum=1.036;SC=CAGGAGGAGGACGGCAGCAAC;SOR=0.753;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=115;TCF=13;TCR=102;TR=59;WE=23221805;WS=23221787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,74:0.67:111
chr7	23221870	rs7808488	T	C	1361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.944;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=42;PP=1174;ReadPosRankSum=0.297;SC=CCGGGAAGGGTCCGCCGGCGG;SOR=5.330;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=46;TCF=3;TCR=43;TR=44;WE=23221878;WS=23221860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,44:0.96:46
chr7	23226660	rs200255851	C	T	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=57.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-1.721;QD=0.70;ReadPosRankSum=-1.520;SOR=6.415;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,25:0.25:101
chr7	23286315	rs858239	G	A	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=3;PP=627;SC=AGATCAGGCAGTGCCGCTTAA;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=23286323;WS=23286305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	23293098	rs199348	C	A	8011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.643;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=162;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.084;SC=AAGATTCAAACCAAACACCTG;SOR=0.319;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=248;TCF=83;TCR=165;TR=245;WE=23293106;WS=23293088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,262:0.99:264
chr7	23293746	rs199347	A	G	4254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=27;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.664;SC=AACGAAAGGAAAAAGATGCTG;SOR=1.334;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=94;TCR=27;TR=120;WE=23293754;WS=23293736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,124:0.99:125
chr7	23296533	rs199355	G	A	5751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=90;PP=2965;SC=CTGCTGATCCGTATGTTTACA;SOR=0.736;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=179;TCF=89;TCR=90;TR=177;WE=23296541;WS=23296523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr7	23300049	rs199351	A	C	6132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=165;NR=14;PP=2965;ReadPosRankSum=0.736;SC=TGCATTCTTTATTTCTTTGGG;SOR=3.341;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=166;TCR=14;TR=179;WE=23300057;WS=23300039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,181:0.99:182
chr7	23306020	rs156429	T	C	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=3;PP=787;SC=CATAGTATAGTGTTCCTGATA;SOR=4.332;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=28;WE=23306028;WS=23306010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	23307634	rs2307783	ATGGG	A	3348.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=45;PP=2652;SC=CGACAGAGGCATGGGTGGGTC;SOR=2.012;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=61;TCF=10;TCR=51;TR=52;WE=23307645;WS=23307624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr7	23352512	rs199653	C	A	2038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=37;PP=1414;SC=AGTTTTAAAACCTTACTTCCT;SOR=1.117;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=63;TCF=25;TCR=38;TR=62;WE=23352520;WS=23352502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
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chr7	23737795	rs5029444	T	C	3315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=15;PP=2550;ReadPosRankSum=0.803;SC=TTATTCTCCATGTATTGTTTT;SOR=0.678;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=169;TCF=146;TCR=23;TR=114;WE=23737803;WS=23737785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,121:0.68:178
chr7	23740501	rs10244532	G	C	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.17;ReadPosRankSum=-0.911;SOR=0.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,23:0.20:117
chr7	23751736	rs7779633	A	G	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.732;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=328;ReadPosRankSum=0.201;SC=GAATTGTTCAAATGGATGAAG;SOR=1.302;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=66;TCF=58;TCR=8;TR=18;WE=23751744;WS=23751726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,18:0.26:68
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chr7	23757260	rs2058995	T	G	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=8.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.50;ReadPosRankSum=-0.098;SOR=0.208;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,42:0.26:161
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chr7	23793953	rs35995607	C	T	1130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=7.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.18;ReadPosRankSum=-1.424;SOR=0.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,52:0.28:183
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chr7	23808604	rs61564984	C	A	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.258;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=1;PP=971;ReadPosRankSum=-1.020;SC=AGAAGTATATCTCTCTGCAGG;SOR=2.746;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=54;TCF=52;TCR=2;TR=42;WE=23808612;WS=23808594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,42:0.79:53
chr7	23810517	rs7785154	G	A	311.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.54;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr7	23810845	rs1469001	G	A	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=283;SC=TCAGTAAATTGTTATTACTAG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=23810853;WS=23810835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	23823144	rs10950961	A	G	1666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=4;PP=1310;ReadPosRankSum=-0.718;SC=GAAGAGCAACATGTCAAAATT;SOR=3.511;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=57;TCR=4;TR=59;WE=23823152;WS=23823134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr7	23826066	rs1862068	A	G	3435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=8;PP=2789;SC=AATTGGAATGATGTATAATTA;SOR=4.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=88;TCR=8;TR=96;WE=23826074;WS=23826056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr7	23871898	rs35517396	A	G	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.86;ReadPosRankSum=0.691;SOR=0.378;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,18:0.26:68
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chr7	24324808	rs16140	C	G	2061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.610;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=17;PP=1779;ReadPosRankSum=-0.491;SC=AGGTGCTGCGCGTGGGTGCTC;SOR=1.508;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=105;TCF=77;TCR=28;TR=73;WE=24324816;WS=24324798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,73:0.68:107
chr7	24325009	rs5573	G	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=2.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.22;ReadPosRankSum=0.224;SOR=0.953;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,20:0.16:123
chr7	24329001	rs113179092	AT	A	387.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=433;ReadPosRankSum=-0.687;SC=CTTGTTACAGATGAACACCTG;SOR=0.178;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=14;WE=24329009;WS=24328991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
chr7	24329133	rs5574	C	T	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FS=3.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.02;ReadPosRankSum=-0.563;SOR=0.561;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:172,43:0.20:215
chr7	24331417	rs79843953	T	A	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.48;ReadPosRankSum=-0.071;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,16:0.19:83
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chr7	24689391	rs929401	C	T	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.811;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=218;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTGGTGAGTACAGATAAATCA;SOR=0.264;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=13;WE=24689399;WS=24689381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
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chr7	24738615	rs17274530	G	A	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=1.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.52;ReadPosRankSum=1.245;SOR=0.416;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,24:0.24:101
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chr7	24742576	rs66851582	C	T	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.875;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=189;ReadPosRankSum=1.746;SC=GGGAGGTACTCAGCAGTTGCT;SOR=0.048;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=4;WE=24742593;WS=24742566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr7	24742585	rs2074142	C	T	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.836;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=376;ReadPosRankSum=-1.335;SC=TCAGCAGTTGCTGAGTTAGTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=7;WE=24742593;WS=24742566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr7	24746022	rs2269812	A	G	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=186;ReadPosRankSum=-1.408;SC=AAGAAGGGTCATGACACAGCT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=9;WE=24746030;WS=24746012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr7	24746794	rs77096632	A	G	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=144;ReadPosRankSum=-1.495;SC=ATTTCAAGAGAGAAAAATAAT;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=9;WE=24746802;WS=24746784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr7	24746946	rs75743828	C	T	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.13;ReadPosRankSum=0.162;SOR=0.655;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:225,67:0.23:292
chr7	24747156	rs71535708	A	G	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=268;ReadPosRankSum=-1.155;SC=GTAGTGGCCCACCAACATATG;SOR=0.146;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=67;TCF=0;TCR=67;TR=17;WE=24747164;WS=24747146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,20:0.28:72
chr7	24747879	rs55735863	A	G	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.282;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=283;ReadPosRankSum=-1.224;SC=GGTCGCTGTGAAAACAAAGCA;SOR=0.209;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=15;WE=24747887;WS=24747869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr7	24747910	rs2721809	G	A	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=635;ReadPosRankSum=-1.362;SC=TCATGACTGCGATGCACATCT;SOR=0.829;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=25;WE=24747918;WS=24747900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,25:0.71:35
chr7	24756747	rs77166908	T	C	2517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=443;ExcessHet=3.0103;FS=1.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.72;ReadPosRankSum=-0.405;SOR=0.796;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:320,120:0.27:440
chr7	24756810	rs56166822	A	AGTCCCTCTGCTGAGGGATCCTCTGCTGGGG	11779.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=473;ExcessHet=3.0103;FS=0.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=41.19;ReadPosRankSum=1.524;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,213:0.74:286
chr7	24756841	.	A	G	2265	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=59.97;NF=88;NR=86;PP=2265;QD=13.2170759342;SC=TCTGCTGGGGATCCCTCAGCA;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=507;TCF=220;TCR=287;TR=174;WE=24756849;WS=24756831;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:333,174:0.34:507
chr7	24758645	rs876307	G	T	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=177;ReadPosRankSum=-1.696;SC=CATGAACGCAGGGCAGCCCGA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=9;WE=24758653;WS=24758635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr7	24758795	rs876305	T	C	1686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=1284;ReadPosRankSum=0.433;SC=CATTCCTTCCTTCCAGCACCT;SOR=0.698;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=40;TCR=30;TR=59;WE=24758803;WS=24758785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,61:0.85:72
chr7	24784403	rs2521768	C	T	2435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=67;PP=2027;SC=CAGAGGAAGCCGATGATGATA;SOR=4.643;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=6;TCR=67;TR=73;WE=24784411;WS=24784393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr7	24789082	rs2521770	C	T	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=392;SC=GATCACGCCACTGCACTCCAG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=24789090;WS=24789072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	24854765	rs1044956	G	A	3500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=77;PP=2803;ReadPosRankSum=-0.223;SC=ACCTCTGCCCGCTTAAGATGT;SOR=0.846;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=181;TCF=77;TCR=104;TR=134;WE=24854773;WS=24854755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,133:0.73:183
chr7	24860000	rs6979174	G	C	2267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=69;PP=1956;ReadPosRankSum=0.859;SC=CTCATCAAGTGTGTCCTCAAG;SOR=1.074;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=7;TCR=83;TR=75;WE=24860008;WS=24859990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,73:0.84:87
chr7	24874499	rs2285689	C	T	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.600;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=152;ReadPosRankSum=0.223;SC=AGTCAGAAAACCGGCAAAAGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=8;WE=24874507;WS=24874489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr7	24888620	rs757156	T	C	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.456;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=394;ReadPosRankSum=-0.855;SC=GGTCGTGCAATGGGACAGATG;SOR=1.911;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=18;WE=24888628;WS=24888610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr7	24891947	rs6461822	C	T	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=0;PP=780;ReadPosRankSum=-0.801;SC=GCTATTAAGACTTGGATAGGT;SOR=2.511;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=33;WE=24891955;WS=24891937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,36:0.78:46
chr7	24902762	rs2285690	C	T	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=0;PP=732;ReadPosRankSum=0.382;SC=TGCTGGCACACGGCATGCAGA;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=31;WE=24902770;WS=24902752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,31:0.86:36
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chr7	24911526	rs10261181	G	A	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=3.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.87;ReadPosRankSum=0.190;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,16:0.19:85
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chr7	25182172	rs2285736	A	G	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=3.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.14;ReadPosRankSum=-0.461;SOR=0.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,6:0.17:35
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chr7	25194665	rs2523072	G	C	2222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.155;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=37;PP=1688;ReadPosRankSum=-2.884;SC=ATAAGCCTTGGTTGGCACCGT;SOR=0.650;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=105;TCF=55;TCR=50;TR=81;WE=25194673;WS=25194655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,82:0.75:110
chr7	25194857	rs2717899	A	T	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.759;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=463;ReadPosRankSum=0.018;SC=GAACAGAAAGAAGTATGGTTG;SOR=2.383;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=22;WE=25194865;WS=25194847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr7	25194918	rs2523071	A	G	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=257;ReadPosRankSum=0.551;SC=AATGGCAGAAACTGTTCTAAT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=12;WE=25194926;WS=25194908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr7	25198008	rs112337034	G	A	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.610;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=23;HapScore=3;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-2.610;NF=6;NR=0;PP=37;ReadPosRankSum=0.662;SC=AAAAAAAAAAGAAACGTTTTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=6;WE=25198016;WS=25197996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr7	25198089	rs2523066	C	G	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.599;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=790;ReadPosRankSum=0.874;SC=TTGATTATAACAGAGAAGGAA;SOR=1.185;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=33;WE=25198097;WS=25198079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,34:0.72:47
chr7	25200653	rs2717877	G	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.462;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=114;ReadPosRankSum=-0.135;SC=GCTTTTGTTTGTTTGGTCTTG;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=7;WE=25200661;WS=25200643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr7	25207849	rs2717859	G	A	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.477;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=7;PP=942;ReadPosRankSum=-0.572;SC=GACTCACAATGGAAGTAAAGA;SOR=0.460;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=44;WE=25207857;WS=25207839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,46:0.72:64
chr7	25207963	rs3213642	G	A	2816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.493;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=49;PP=2962;ReadPosRankSum=0.204;SC=CCCATGACACGAGGAGGCTCA;SOR=0.772;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=137;TCF=71;TCR=66;TR=103;WE=25207982;WS=25207953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,104:0.74:140
chr7	25207974	rs2717858	T	C	2753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.492;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=50;PP=2962;ReadPosRankSum=0.504;SC=AGGAGGCTCATACTTTGGCCT;SOR=0.382;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=129;TCF=61;TCR=68;TR=99;WE=25207982;WS=25207953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,100:0.76:132
chr7	25207994	rs2717857	G	A	2661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=63;PP=2063;ReadPosRankSum=-0.816;SC=TGTGGTCCTCGGGGAGTGAAA;SOR=0.734;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=122;TCF=44;TCR=78;TR=97;WE=25208002;WS=25207984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,98:0.78:125
chr7	25267934	rs877834	T	C	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=152;ReadPosRankSum=-0.496;SC=AGAATATTTGTCATAATTTTC;SOR=0.481;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=10;WE=25267942;WS=25267924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,11:0.27:41
chr7	25267963	rs886354	G	C	1394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=12;PP=974;SC=GAAGATTGGAGATCACTAATT;SOR=2.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=45;WE=25267971;WS=25267953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr7	25989520	rs6977848	T	G	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=6;PP=928;SC=ACTGGCGGCATCGGCGACCAC;SOR=3.086;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=37;WE=25989528;WS=25989510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	25989732	rs111299611	GA	G	265.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=4.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=2.070;QD=3.69;ReadPosRankSum=-1.011;SOR=0.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,14:0.19:72
chr7	26217450	rs7807030	T	A	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=345;ReadPosRankSum=0.353;SC=TACTGAAATATTGAAATGCCG;SOR=0.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=18;WE=26217458;WS=26217440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,18:0.35:52
chr7	26223294	rs12113404	A	G	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.91;ReadPosRankSum=-2.177;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,20:0.20:99
chr7	26223431	rs73281527	C	T	1604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=421;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;QD=3.86;ReadPosRankSum=0.324;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:324,92:0.22:416
chr7	26224128	rs73281530	G	A	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-7.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.006;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=5;PP=703;ReadPosRankSum=0.952;SC=ATTCATGTTTGAAGTGTTTCT;SOR=0.911;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=128;TCF=107;TCR=21;TR=38;WE=26224136;WS=26224118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,38:0.29:132
chr7	26224668	rs2074566	C	T	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.214;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-9.930;NF=24;NR=32;PP=910;ReadPosRankSum=-2.062;SC=TAGGTTATTGCACTGACCATG;SOR=0.819;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=194;TCF=92;TCR=102;TR=56;WE=26224676;WS=26224658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,58:0.29:202
chr7	26232367	rs12672536	T	C	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=5.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=250;ReadPosRankSum=1.218;SC=CTCGGGTTCATAGACATTTTT;SOR=0.175;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=14;WE=26232375;WS=26232357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,13:0.30:44
chr7	26235592	rs111941879	A	ATT	1183.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=4.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=2.524;QD=6.80;ReadPosRankSum=0.366;SOR=1.378;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,42:0.24:174
chr7	26235637	rs61009175	G	A	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.61;ReadPosRankSum=0.371;SOR=0.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,20:0.20:101
chr7	26236689	rs73281546	A	G	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=6.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.66;ReadPosRankSum=0.986;SOR=2.434;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,29:0.22:130
chr7	26236778	rs73281548	T	A	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.400;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=125;ReadPosRankSum=0.297;SC=ACCTAGCTTTTGAAAAATAAG;SOR=0.434;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=9;WE=26236786;WS=26236768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,10:0.24:41
chr7	26236826	rs139586200	T	C	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.037;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=362;ReadPosRankSum=-0.995;SC=CAACACACCTTTAATAAGAGA;SOR=0.309;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=18;WE=26236834;WS=26236816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,19:0.31:62
chr7	26237238	rs41275982	A	G	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=302;ReadPosRankSum=-0.424;SC=AGTAATTTACATACCACACAG;SOR=0.707;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=51;TCR=21;TR=23;WE=26237246;WS=26237228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,26:0.34:76
chr7	26404071	rs2253569	G	A	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-5.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=217;ReadPosRankSum=-1.073;SC=TAGAGTGAATGTTGAGATCAT;SOR=0.114;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=55;TCR=0;TR=14;WE=26404079;WS=26404061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,15:0.25:60
chr7	26576535	rs740182	T	C	5882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=122;PP=2965;SC=CTTCAAAGTATTTCTCGGTCC;SOR=1.935;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=174;TCF=52;TCR=122;TR=174;WE=26576543;WS=26576525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr7	26578105	rs17153822	A	G	2387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.459;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=59;PP=1900;ReadPosRankSum=1.275;SC=ATCCGTCCCTATCAGTGCCAG;SOR=1.583;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=127;TCF=45;TCR=82;TR=85;WE=26578113;WS=26578095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,89:0.66:135
chr7	26724279	rs212850	T	G	2309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=0;PP=1906;SC=CTTCCCTAGCTCTGTAAATCC;SOR=8.838;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=80;TCF=80;TCR=0;TR=80;WE=26724287;WS=26724269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr7	26724557	rs184271546	T	C	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=8.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.52;ReadPosRankSum=0.029;SOR=0.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,46:0.29:160
chr7	26778406	rs10951145	A	G	3333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=33;PP=2608;ReadPosRankSum=-0.371;SC=ATTGAACACCAACATTACCTT;SOR=0.658;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=192;TCF=146;TCR=46;TR=135;WE=26778414;WS=26778396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,137:0.69:198
chr7	27135314	rs10951154	C	T	2790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.594;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.553;NF=49;NR=107;PP=2962;ReadPosRankSum=4.696;SC=CTGGGGGTGGCGATGGTGGTG;SOR=1.168;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=203;TCF=69;TCR=134;TR=156;WE=27135323;WS=27135303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,109:0.70:155
chr7	27141267	rs706016	C	T	2162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=10;PP=1763;SC=AGACCCCGTCCCCTCCATCTC;SOR=3.091;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=62;TCF=52;TCR=10;TR=61;WE=27141275;WS=27141257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr7	27150003	.	C	A	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.634;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=12;PP=532;ReadPosRankSum=0.469;SC=GGGCGGCTCTCCCAGGCTTGG;SOR=0.748;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=26;WE=27150011;WS=27149993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,27:0.71:38
chr7	27191443	rs146655311	GGTC	G	1311.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=5.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.63;ReadPosRankSum=-0.259;SOR=0.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,40:0.26:152
chr7	27191447	.	T	A	1320.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-6.517;ClippingRankSum=0.000;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=7.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.192;SOR=0.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,41:0.27:153
chr7	27195857	rs35510017	T	C	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=18.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.65;ReadPosRankSum=-1.250;SOR=0.095;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,29:0.24:119
chr7	27196069	rs2301720	A	C	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FS=2.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.83;ReadPosRankSum=-0.161;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:198,61:0.24:259
chr7	27203139	rs7810502	G	A	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.70;ReadPosRankSum=0.893;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,6:0.19:31
chr7	27238691	rs2071265	C	G	4797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=137;NR=3;PP=2965;SC=AGAACAGAAACGCACCCGGGA;SOR=7.068;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=140;TCF=137;TCR=3;TR=140;WE=27238699;WS=27238681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr7	27279191	rs3801321	T	G	2089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=49;PP=1612;SC=TGGGGGCCTATGCCCGGCTTC;SOR=1.819;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=20;TCR=49;TR=69;WE=27279199;WS=27279181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr7	27668850	rs76595683	A	G	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.44;ReadPosRankSum=1.349;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,32:0.74:43
chr7	27668860	rs6415252	C	T	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.18;ReadPosRankSum=0.435;SOR=2.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,41:0.77:53
chr7	27671899	rs7779990	T	C	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=2;PP=1079;ReadPosRankSum=0.307;SC=AGTTCTAACATGTGAAATTCA;SOR=1.645;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=62;TCF=59;TCR=3;TR=46;WE=27671907;WS=27671889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,47:0.76:62
chr7	27702137	rs118068561	G	C	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=112;ReadPosRankSum=0.876;SC=GCAGAGGGGGGTACTCGCGGA;SOR=0.160;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=6;WE=27702145;WS=27702127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
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chr7	27807441	rs7807729	G	A	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.70;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
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chr7	28534501	rs3216916	C	CT	288.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.74;MQRankSum=1.164;QD=13.12;ReadPosRankSum=0.034;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
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chr7	28662583	rs41289	C	T	1125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=33;PP=962;SC=CACTGCAACCCCCGTCTCCCG;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=34;WE=28662591;WS=28662573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr7	28676906	rs41309	A	T	1307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=38;PP=1137;ReadPosRankSum=1.757;SC=TTTCTATTCAATCATTCATTT;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=40;WE=28676914;WS=28676896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
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chr7	28858456	rs10951205	A	G	3316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.694;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=55;PP=2555;ReadPosRankSum=-0.636;SC=AAAAAGACAAAATGGGGAAGT;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=39;TCR=55;TR=93;WE=28858464;WS=28858446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,102:0.99:103
chr7	28995800	rs61742220	G	A	4083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.827;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=67;PP=2962;ReadPosRankSum=0.026;SC=CAAAGAGCAGGCGGAAGCGCG;SOR=0.850;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=204;TCF=107;TCR=97;TR=143;WE=28995808;WS=28995790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,145:0.69:211
chr7	28996220	rs1006521	G	A	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=1.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.55;ReadPosRankSum=0.988;SOR=0.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,28:0.23:121
chr7	28996557	rs3735562	C	T	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=21;PP=1012;ReadPosRankSum=-0.867;SC=GCGCTTCAGGCCTCGCAGCCG;SOR=0.888;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=70;TCF=38;TCR=32;TR=48;WE=28996565;WS=28996547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,51:0.71:72
chr7	28996944	rs740250	T	C	3494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=32;PP=2965;SC=GTGCTGCAGGTTGTTGGCCGA;SOR=1.751;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=70;TCR=32;TR=102;WE=28996952;WS=28996934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
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chr7	28997497	rs67010340	GC	G	8569.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=139;PP=2951;SC=TGGGGGCTCGGCCAGCGAGCT;SOR=1.404;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=204;TCF=55;TCR=149;TR=191;WE=28997505;WS=28997487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr7	28997596	rs5883174	G	GC	3130.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=70;PP=2936;SC=CACGGGCTCGGCAGCGGCGGG;SOR=3.339;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=83;TCF=7;TCR=76;TR=77;WE=28997604;WS=28997586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr7	29070320	rs1052200	C	T	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=7.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.33;ReadPosRankSum=-0.371;SOR=1.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,36:0.23:159
chr7	29103867	rs644763	T	C	2436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5094;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=64;PP=1493;SC=GAAGGGGCATTGGAAAGACAT;SOR=3.528;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=11;TCR=65;TR=75;WE=29103885;WS=29103857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr7	29103877	rs2074783	T	C	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=2.308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQRankSum=-0.465;QD=0.47;ReadPosRankSum=0.017;SOR=1.390;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,8:0.11:74
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chr7	29105776	rs2270027	A	G	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=2.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.478;SOR=1.016;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,35:0.21:170
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chr7	29437867	rs7799981	T	C	876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=0;PP=688;SC=GTCACCCCCCTTCTTCACTCA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=29437875;WS=29437864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
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chr7	29440024	rs56056122	A	G	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=575;ReadPosRankSum=-0.460;SC=CGTTAGGGGAAAAAAAATCAC;SOR=0.573;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=22;WE=29440032;WS=29440014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,25:0.86:29
chr7	29546763	rs11388362	A	AT	914.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.85;MQRankSum=0.039;QD=20.33;ReadPosRankSum=-2.347;SOR=3.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,42:0.93:45
chr7	29552463	rs1420145	C	G	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=453;SC=GCTAGAATTTCCTGGACTGCA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=29552471;WS=29552453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	29605975	rs2302618	C	G	8192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=171;NR=99;PP=2965;SC=CTGGCAGCTCCGGCCCCTGGT;SOR=1.387;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=270;TCF=171;TCR=99;TR=270;WE=29605983;WS=29605965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr7	29606288	rs10271996	C	T	3984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=104;PP=2965;SC=GGGCAGGTCCCCGGAGGAGGC;SOR=4.249;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=12;TCR=104;TR=116;WE=29606296;WS=29606278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr7	29688827	rs1641209	T	C	3562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=43;PP=2830;SC=ACTCAGGCCATAGGCAGGTAT;SOR=1.302;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=67;TCR=43;TR=110;WE=29688835;WS=29688817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr7	29688915	rs1728643	G	A	3581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=62;PP=2956;SC=TGAGCTGCGCGCTGTGGGGGC;SOR=0.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=59;TCR=62;TR=121;WE=29688923;WS=29688905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr7	29689018	rs1641210	T	C	1859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=44;PP=1495;SC=TGGAGCTGTGTGCAAGGTGGG;SOR=1.839;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=18;TCR=44;TR=62;WE=29689026;WS=29689008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr7	29720404	rs850108	A	G	3127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.91;QD=32.92;SOR=4.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr7	29720482	rs70980562	A	AG	1005.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.82;QD=35.92;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	29771533	rs147432542	TGAA	T	8569.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=137;NR=30;PP=2971;SC=AACATTTCATTGAAGAAGAGA;SOR=3.355;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=191;TCF=154;TCR=37;TR=167;WE=29771555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr7	29915593	rs2301922	G	C	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=99;ReadPosRankSum=0.555;SC=GTGAGCAGCCGGGCCAGGCCT;SOR=0.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=10;WE=29915601;WS=29915583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr7	29944062	rs4722959	A	T	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=1.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.60;ReadPosRankSum=1.046;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,27:0.22:125
chr7	30113862	rs149548208	T	TTG	237.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=2.405;QD=3.40;ReadPosRankSum=0.315;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,15:0.21:70
chr7	30177095	rs6954451	G	T	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=0;PP=571;SC=AGGCCACCCAGATTTTAAATA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=30177103;WS=30177085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	30485703	rs55996014	G	GC	3916.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=15;PP=1752;SC=AGCAAGGCCCGCCCCCCACAC;SOR=2.642;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=84;TCF=67;TCR=17;TR=71;WE=30485718;WS=30485693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr7	30485710	rs6958571	A	C	3295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=18;PP=2441;SC=CCCGCCCCCCACACACACAGC;SOR=2.598;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=93;TCF=75;TCR=18;TR=91;WE=30485718;WS=30485693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr7	30485741	rs2907749	A	G	4233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=50;PP=2965;ReadPosRankSum=0.000;SC=ACATACATCCATCCCCTTCTA;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=104;TCR=50;TR=153;WE=30485749;WS=30485731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,154:0.99:155
chr7	30490760	rs2075822	A	G	1217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=2;PP=1079;SC=CTGGTCCATGATGCCATTCCC;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=37;WE=30490768;WS=30490750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	30537214	rs57379358	C	T	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=125;ReadPosRankSum=-0.517;SC=TCGGTTACAACGCCAGAGGTT;SOR=0.289;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=9;WE=30537222;WS=30537204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr7	30537622	.	C	CATATATATAT	293.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;QD=41.96;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr7	30538651	rs38409	T	C	3743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=80;PP=2965;SC=GTGTATGGGATTAAACATTTA;SOR=1.870;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=34;TCR=80;TR=114;WE=30538659;WS=30538641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr7	30540399	rs38410	G	T	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=166;SC=AATTAAAACAGTCAATAAACT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=30540407;WS=30540389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	30544360	rs38414	G	A	10858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=116;NR=220;PP=2965;SC=GCCTGAAGCAGAGTGTAAGGA;SOR=1.528;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=336;TCF=116;TCR=220;TR=336;WE=30544368;WS=30544350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,343:1.00:343
chr7	30634661	rs1049402	C	G	1778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=22;PP=1454;SC=GGCCTCCTGCCCCCCGATCTC;SOR=1.539;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=45;TCR=22;TR=67;WE=30634669;WS=30634651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr7	30635600	rs10265589	C	T	3765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=89;PP=2965;ReadPosRankSum=1.649;SC=ATATAGACCTCCTTTTCCTAG;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=21;TCR=90;TR=110;WE=30635608;WS=30635590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,118:0.99:119
chr7	30643069	rs1558064	C	A	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=1;PP=439;SC=AGTGCATTGTCCTTTTTCCCA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=30643077;WS=30643059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	30651938	rs1986756	G	A	4113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=120;PP=2965;SC=CTGTTTTGAAGCAATTCTGCT;SOR=6.027;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=125;TCF=5;TCR=120;TR=125;WE=30651946;WS=30651928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr7	30660938	rs10951271	A	C	2693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=82;NR=0;PP=2408;SC=TATAATCTGCATGCATTTGTG;SOR=8.789;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=82;TCF=82;TCR=0;TR=82;WE=30660946;WS=30660928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr7	30662237	rs10249885	G	A	1840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=57;PP=1574;SC=TGGCATTATAGCCTGAAAAAA;SOR=8.155;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=0;TCR=57;TR=57;WE=30662245;WS=30662227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr7	30673345	rs2240401	C	T	2803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=20;PP=2256;SC=CTTTCCTTGTCTCTAGATCTC;SOR=2.330;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=68;TCR=20;TR=87;WE=30673353;WS=30673335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr7	30673512	rs70983380	TA	T	845.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=0.603;QD=13.64;ReadPosRankSum=-0.443;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,47:0.76:62
chr7	30694260	rs3779250	C	T	3120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=21;PP=2493;SC=TTTTCTGTGGCAGGTAGCGGG;SOR=2.526;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=78;TCR=21;TR=99;WE=30694268;WS=30694250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr7	30705105	rs8192496	G	A	2160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=20;PP=1940;ReadPosRankSum=0.454;SC=GTGCTGTAGGGGGAGGGATGA;SOR=0.990;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=74;TCF=54;TCR=20;TR=73;WE=30705113;WS=30705095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr7	30728908	rs255100	A	T	2268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=42;PP=1799;SC=TGCCTAGGGGACAGCAAGGAT;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=71;TCF=29;TCR=42;TR=70;WE=30728916;WS=30728898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr7	30739409	rs255117	C	T	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.510;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.327;NF=7;NR=1;PP=140;ReadPosRankSum=1.451;SC=ACCCCCTCACCCAGGCACGGG;SOR=3.026;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=8;WE=30739417;WS=30739399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr7	30739525	rs255119	G	A	918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=11;PP=662;SC=TGCTCCTGGCGCCCCACCTCG;SOR=1.044;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=28;WE=30739533;WS=30739515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	30739691	rs107540	A	G	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=9;PP=281;SC=CCTGCTGCCCAGCACGGTGGT;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=30739699;WS=30739681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	30793228	rs2075005	G	A	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=357;ReadPosRankSum=1.261;SC=CTGCCAATCCGTGATAACCAC;SOR=1.931;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=15;WE=30793236;WS=30793218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr7	30795331	rs2302340	A	G	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=3.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.98;ReadPosRankSum=0.385;SOR=1.015;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,46:0.26:177
chr7	30795436	rs4720015	T	G	1508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=34;PP=1194;SC=GGGGTCTGCTTCATTGTGGCT;SOR=2.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=44;WE=30795444;WS=30795426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr7	30805809	rs146676127	TCTCA	T	542.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.556;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.510;NF=26;NR=1;PP=525;ReadPosRankSum=0.744;SC=GGATATGATTTCTCACACACA;SOR=3.029;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=27;WE=30805820;WS=30805799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr7	30805811	rs2013200	T	A	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.825;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.405;NF=40;NR=0;PP=1528;ReadPosRankSum=-0.801;SC=ATATGATTTCTCACACACACA;SOR=0.100;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=56;TCR=2;TR=40;WE=30805820;WS=30805799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr7	30805849	.	AC	CC	707	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=28;MMLQ=27;MQ=65.68;NF=82,14;NR=18,0;PP=707,130;QD=7.1;SC=ACACACACACACCTACCTTTC;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=114;TCF=93;TCR=21;TR=100,14;WE=30805857;WS=30805839;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:82,14:0.15:96
chr7	30805849	.	AC	ACACACACCC	707	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=28;MMLQ=27;MQ=65.68;NF=82,14;NR=18,0;PP=707,130;QD=7.1;SC=ACACACACACACCTACCTTTC;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=114;TCF=93;TCR=21;TR=100,14;WE=30805857;WS=30805839;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,100:0.88:114
chr7	30805849	rs4582452	A	C,ACACACACC	3877.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=66.26;QD=86.17;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,16,29:0.36,0.64:45
chr7	30805913	rs3901848	G	A	8640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.07;QD=45.72;SOR=1.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
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chr7	30912007	rs3801324	C	A	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=535;ReadPosRankSum=-0.023;SC=CCTCTTGCCCCAGAAAAAGAC;SOR=1.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=22;WE=30912015;WS=30911997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr7	30915262	rs10215354	CA	TG	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.804;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=1242;ReadPosRankSum=-2.065;SC=AGCATTACAACATGTGCCAGG;SOR=0.446;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=27;WE=30915271;WS=30915252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,30:0.79:38
chr7	30922467	rs10252929	G	C	2856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=7;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.433;SC=CTCGGGAGTGGTCAGCGCTGA;SOR=0.882;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=121;TCR=9;TR=99;WE=30922486;WS=30922457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,98:0.77:128
chr7	30922478	rs10252754	C	G	3510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=12;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.191;SC=TCAGCGCTGACCTCAGGGTGA;SOR=0.950;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=157;TCF=141;TCR=16;TR=120;WE=30922486;WS=30922457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,119:0.77:155
chr7	31003819	rs4988494	C	T	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.538;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=504;ReadPosRankSum=1.772;SC=TGGAGCCTGGCGGAGACCCTA;SOR=0.330;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=23;WE=31003827;WS=31003809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,22:0.76:29
chr7	31013590	rs35609199	T	C	2956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.648;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=50;PP=2187;ReadPosRankSum=0.545;SC=ACCCAGGTCCTGGCCCCCAGG;SOR=0.633;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=89;TCR=69;TR=113;WE=31013598;WS=31013580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,116:0.72:161
chr7	31014449	rs35780782	T	C	1272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.550;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=1;PP=1057;ReadPosRankSum=1.632;SC=GGGTGAGACCTTAACTGGCTG;SOR=1.942;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=70;TCF=68;TCR=2;TR=43;WE=31014457;WS=31014439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,44:0.61:72
chr7	31016260	rs34661032	C	A	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=33;PP=816;ReadPosRankSum=-0.782;SC=GAGTTCATGACAGGGTGAGGG;SOR=1.562;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=33;WE=31016268;WS=31016250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,32:0.67:48
chr7	31125082	rs11410563	A	AG	1197.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=29;PP=1388;SC=CAGACCCATTAGGCTCTGCCG;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=32;WE=31125090;WS=31125072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr7	31378933	rs2233404	A	G	4506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=123;PP=2965;ReadPosRankSum=0.349;SC=ATATTTAAAGAGTTTTCATTT;SOR=2.179;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=138;TCF=13;TCR=125;TR=136;WE=31378941;WS=31378923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,139:0.99:141
chr7	31569547	rs12701110	G	A	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=36;PP=1223;ReadPosRankSum=-0.713;SC=GGCAGCGATGGCGTGTTCTGA;SOR=1.112;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=48;WE=31569555;WS=31569537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,52:0.98:53
chr7	31569579	rs2067727	G	T	1227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=26;PP=896;SC=CTGCAGCTGTGTGACTGGGTG;SOR=2.133;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=36;WE=31569587;WS=31569569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr7	31592491	rs7793859	T	A	2504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=0;PP=2048;SC=CAGGTTCATGTATGACTGTGA;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=70;TCR=0;TR=69;WE=31592499;WS=31592481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr7	31592733	rs7811042	C	A	3860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=88;PP=2965;SC=AGCGCGTGGGCTCCGCTGGAT;SOR=2.362;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=29;TCR=88;TR=117;WE=31592741;WS=31592723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr7	31594166	rs2286710	C	T	5686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=101;PP=2965;SC=GTGTGCCTTACATGTTTCTCT;SOR=0.959;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=177;TCF=76;TCR=101;TR=177;WE=31594174;WS=31594156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr7	31594258	rs12155214	G	T	3529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=86;PP=2839;SC=TTAATTGTACGTGAAGTATTA;SOR=3.154;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=17;TCR=86;TR=103;WE=31594266;WS=31594248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr7	31617733	rs6945679	T	C	10725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=183;NR=137;PP=2965;SC=AAGTTTTTGTTCCCTTTACAA;SOR=1.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=320;TCF=183;TCR=137;TR=320;WE=31617741;WS=31617723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,331:1.00:331
chr7	31618008	rs10252720	A	G	3524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=68;PP=2731;SC=AGCTTGTCTCATCTTGCAGGC;SOR=1.208;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=45;TCR=68;TR=113;WE=31618016;WS=31617998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr7	31681765	rs10239388	C	T	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=152;ReadPosRankSum=-1.471;SC=CCTTTAATAACCTCAAGACCT;SOR=1.402;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=7;WE=31681773;WS=31681755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr7	31682453	rs4141001	C	T	4823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.475;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=94;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.276;SC=AGCCAAGAAGCGAATGCCTTG;SOR=0.819;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=224;TCF=107;TCR=117;TR=173;WE=31682461;WS=31682443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,179:0.76:234
chr7	31682601	rs38396	T	C	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=2.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.92;ReadPosRankSum=-0.104;SOR=0.942;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,45:0.22:201
chr7	31682853	rs38397	T	C	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.09;ReadPosRankSum=0.062;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,47:0.26:178
chr7	31683410	rs10247620	G	A	9430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=464;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.288;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=150;NR=187;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.252;SC=TGCATCTGCTGTCATCACCAC;SOR=0.822;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=453;TCF=205;TCR=248;TR=337;WE=31683418;WS=31683400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,342:0.74:460
chr7	31683610	rs38398	G	A	6307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=153;PP=2965;SC=AGATGCACCCGTGATAAACAC;SOR=2.798;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=191;TCF=38;TCR=153;TR=191;WE=31683618;WS=31683600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr7	31691697	rs3735424	T	C	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=32;PP=979;ReadPosRankSum=-1.235;SC=TTTGACTATATCCAGCCTACC;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=18;TCR=41;TR=46;WE=31691705;WS=31691687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,46:0.75:61
chr7	31697913	rs35589779	C	CT	848.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.758;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.316;NF=6;NR=25;PP=501;ReadPosRankSum=0.188;SC=AGCTGGATCCCTTTTTTTTTT;SOR=1.668;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=54;TCF=13;TCR=41;TR=31;WE=31697921;WS=31697903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,38:0.72:53
chr7	31735263	rs34173	G	C	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=11.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.44;ReadPosRankSum=-0.108;SOR=1.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,37:0.25:146
chr7	31855420	rs1860789	A	G	5028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=138;NR=2;PP=2965;SC=AAGGAACTGGATGAGCAGGGA;SOR=6.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=140;TCF=138;TCR=2;TR=140;WE=31855428;WS=31855410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr7	31855569	rs2302450	G	A	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=435;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.02;ReadPosRankSum=-1.778;SOR=0.742;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:333,97:0.23:430
chr7	31855578	rs1860790	G	A	14867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=446;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=214;NR=220;PP=2962;SC=CGGCTTTGGAGTTTTTCCCAC;SOR=0.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=434;TCF=214;TCR=220;TR=434;WE=31855586;WS=31855559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,439:1.00:439
chr7	31876766	rs2270218	T	C	3467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=78;NR=27;PP=2858;SC=ATGATGACAGTCCTGATGGAG;SOR=2.131;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=106;TCF=78;TCR=28;TR=105;WE=31876774;WS=31876756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr7	31890106	rs917756	T	C	1193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=0;PP=1016;SC=TTGAAGCTGATCAGACTGATC;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=31890114;WS=31890096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	31918879	rs1860786	C	T	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=202;ReadPosRankSum=-1.635;SC=TCTGCCTCACCTGCATGTTAG;SOR=0.850;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=11;WE=31918887;WS=31918869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr7	32110115	rs30598	C	G	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=24;PP=696;SC=CGCGTTTGCCCGGCACTTTCT;SOR=3.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=32110123;WS=32110105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	32209227	rs977623	A	C	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=0;PP=905;ReadPosRankSum=0.045;SC=TTCAGGAAATACAGCCAGAAG;SOR=3.664;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=36;WE=32209235;WS=32209222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,36:0.88:41
chr7	32209283	rs977624	T	C	1517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=1;PP=1260;ReadPosRankSum=0.142;SC=TTTTAATTTATTCAGTGCAAA;SOR=1.233;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=66;TCR=1;TR=52;WE=32209291;WS=32209273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,53:0.77:69
chr7	32209359	rs758318	A	G	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=2.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.24;ReadPosRankSum=-0.242;SOR=0.913;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:171,49:0.22:220
chr7	32209376	rs2072312	T	C	5155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.249;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=79;PP=2962;ReadPosRankSum=0.112;SC=AAGGAACACATTGAGTTGCAA;SOR=0.460;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=237;TCF=136;TCR=101;TR=179;WE=32209384;WS=32209366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,193:0.76:254
chr7	32209425	rs977625	A	G	7633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=90;NR=139;PP=2965;SC=AAGACTTCTGAGCTATCCAGC;SOR=1.226;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=230;TCF=90;TCR=140;TR=229;WE=32209433;WS=32209415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr7	32209459	rs977626	C	T	5835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.973;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=131;PP=2965;ReadPosRankSum=0.948;SC=CAGCTAGGATCTCCTCTGGGG;SOR=2.210;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=175;TCF=44;TCR=131;TR=174;WE=32209467;WS=32209449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,181:0.99:182
chr7	32248984	rs10951324	G	A	2306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-6.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.425;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=9;PP=1933;ReadPosRankSum=0.358;SC=GATATTTCCTGCATTACTATT;SOR=0.078;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=101;TCF=92;TCR=9;TR=79;WE=32248992;WS=32248974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,81:0.79:103
chr7	32249216	rs2240676	A	G	1469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5046;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=49;PP=1193;ReadPosRankSum=-0.745;SC=ATATGCCCCAATACAGCCAAT;SOR=3.500;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=0;TCR=56;TR=49;WE=32249224;WS=32249206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,50:0.86:58
chr7	32338337	rs215607	G	A	4815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=122;PP=2965;SC=CCTGTTGCCGGCGTCCGTCAT;SOR=2.540;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=35;TCR=122;TR=157;WE=32338345;WS=32338327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr7	32527009	rs7800049	G	A	1622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FS=0.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.12;ReadPosRankSum=-0.391;SOR=0.632;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:232,85:0.27:317
chr7	32528366	rs35608030	C	T	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=644;ReadPosRankSum=-0.048;SC=GACAAAGTCTCGCTCTGTCAT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=28;WE=32528374;WS=32528356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,29:0.63:46
chr7	32529936	rs1584614	G	C	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FS=1.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.10;ReadPosRankSum=-1.007;SOR=0.553;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:208,73:0.26:281
chr7	32591135	rs3213972	G	A	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.877;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=141;ReadPosRankSum=0.782;SC=ATTACCTTAAGAAAGACATTC;SOR=0.064;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=11;WE=32591143;WS=32591125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr7	32591158	rs3213973	G	A	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=100;ReadPosRankSum=0.000;SC=ATGTGAAAACGCATTTGCATT;SOR=0.054;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=8;WE=32591166;WS=32591148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr7	32593234	rs10717407	CT	C	1612.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=67;NR=1;PP=1041;SC=CATATTCCTACTTTTTTTTTT;SOR=7.024;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=106;TCF=97;TCR=9;TR=68;WE=32593243;WS=32593224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr7	32593271	rs6961786	G	A	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=4.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=1.708;QD=4.79;ReadPosRankSum=-0.257;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,36:0.26:139
chr7	32594278	rs2290210	A	G	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.212;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=96;ReadPosRankSum=-0.563;SC=ACATTATTTCATAAAATTGAA;SOR=0.132;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=9;WE=32594286;WS=32594268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,9:0.27:33
chr7	32598138	rs12673881	C	T	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=3.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.70;ReadPosRankSum=0.159;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,11:0.19:57
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chr7	32598656	rs2290214	C	T	4962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.890;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=96;PP=2962;ReadPosRankSum=0.879;SC=TTTCTGCATCCACTGCTGATG;SOR=0.747;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=231;TCF=109;TCR=122;TR=178;WE=32598664;WS=32598646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,184:0.77:240
chr7	32599204	rs34973430	A	AT	844.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=890;SC=TGTAAAGTACAACCAAATACA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=32599212;WS=32599194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr7	32613020	rs1993050	A	G	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=4.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.577;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=350;ReadPosRankSum=-0.360;SC=TGGCTGCCACACTGCAATTAG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=3;TCR=67;TR=20;WE=32613028;WS=32613010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,20:0.29:70
chr7	32615553	rs6462381	C	T	6374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=182;NR=13;PP=2965;SC=TTCTTTCAAACATTTACTTGA;SOR=5.031;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=183;TCR=13;TR=195;WE=32615561;WS=32615543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr7	32619653	rs6462383	T	A	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=73;ReadPosRankSum=0.129;SC=TAATCTTTTCTGGATGTCGTC;SOR=0.141;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=6;WE=32619661;WS=32619643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr7	32620325	rs35499747	T	TTG	224.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=1.704;QD=6.07;ReadPosRankSum=1.575;SOR=0.509;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,10:0.27:37
chr7	32623250	rs1817046	C	T	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=23;ReadPosRankSum=0.543;SC=GTGACCACTGCACTGCACTCC;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=3;WE=32623258;WS=32623244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr7	32623477	rs34778959	C	G	3298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.279;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=73;PP=2591;ReadPosRankSum=-0.059;SC=TCACCACTTCCACCTCCCAAA;SOR=0.821;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=181;TCF=80;TCR=101;TR=128;WE=32623485;WS=32623467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,129:0.71:182
chr7	32660758	rs2302066	C	A	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.095;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.183;NF=5;NR=17;PP=264;ReadPosRankSum=0.186;SC=AAAAATTCTTCTAAATGATAA;SOR=0.053;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=82;TCF=9;TCR=73;TR=22;WE=32660766;WS=32660748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,20:0.25:80
chr7	32715474	rs34569336	T	C	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.482;NF=12;NR=0;PP=283;ReadPosRankSum=-1.146;SC=AATTAATCAATGATTAACTAT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=12;WE=32715482;WS=32715464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr7	32854758	rs2305336	A	C	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=117;ReadPosRankSum=1.280;SC=GTAACATATTATATGTTTTCT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=7;WE=32854766;WS=32854748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr7	32909182	rs752730	G	A	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=0.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.03;ReadPosRankSum=-0.717;SOR=0.790;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,55:0.26:210
chr7	32914893	.	T	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.77;ReadPosRankSum=-1.246;SOR=0.075;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,11:0.21:53
chr7	32956941	rs139835645	C	T	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.35;QD=30.31;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	33003171	rs3110942	G	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=1.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.49;MQRankSum=-6.746;QD=1.96;ReadPosRankSum=-2.039;SOR=0.967;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,17:0.15:114
chr7	33016120	rs3750116	G	T	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.00;QD=32.40;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr7	33028487	rs35727868	C	T	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.730;NF=0;NR=9;PP=138;ReadPosRankSum=-0.338;SC=ACTACAGGCACGCACCACCAC;SOR=0.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=9;WE=33028495;WS=33028477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr7	33059407	rs2392209	A	G	1808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=50;PP=1553;SC=TTATTACAAAACATTCTTCCA;SOR=4.294;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=55;WE=33059415;WS=33059397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr7	33060946	rs3750117	A	G	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=29;PP=1151;SC=CAATAGCGTAATATTTTTCCT;SOR=1.112;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=48;WE=33060954;WS=33060936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr7	33063492	rs6955792	A	G	128.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=151;SC=ATAATATGGGAAAAAAAACCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=33063500;WS=33063482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	33102462	rs13228639	C	T	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=18;PP=522;SC=CCGCGCAGCTCCGCCCCCACG;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=33102470;WS=33102452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	33102514	rs13228827	G	A	255.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=6;PP=149;SC=GCCAGGACGCGGCGGGAGGGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=33102522;WS=33102504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	33134883	rs150987618	T	C	114.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=28.51;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	33136983	rs6462460	G	A	4274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=90;PP=2965;SC=ACCTAAAAACGAAAAGAGAAA;SOR=1.936;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=38;TCR=90;TR=128;WE=33136991;WS=33136973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr7	33139147	rs17472556	G	A	2775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=62;PP=2119;SC=CTGGGCTTCCGGTGCCAACAT;SOR=2.250;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=22;TCR=62;TR=84;WE=33139155;WS=33139137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr7	33186065	rs77462109	TT	GA	3986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.976;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.963;NF=9;NR=79;PP=2944;ReadPosRankSum=0.294;SC=GTAATCTCAGTTCTTTTGGGA;SOR=0.918;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=138;TCF=15;TCR=123;TR=88;WE=33186074;WS=33186055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,100:0.68:147
chr7	33186082	rs1969575	C	G	3951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=109;PP=2965;SC=GGGAGGCCGACGTGGGCAGAT;SOR=5.265;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=6;TCR=109;TR=115;WE=33186090;WS=33186072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr7	33192502	rs17169881	A	G	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.623;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=42;PP=1115;ReadPosRankSum=-0.648;SC=TACTTGGAGTATGTCAATCCT;SOR=2.345;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=56;TCF=2;TCR=54;TR=43;WE=33192510;WS=33192492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,43:0.75:57
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chr7	33282577	rs7793096	G	A	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.777;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=31;PP=958;ReadPosRankSum=-0.043;SC=TAAATCATTTGAACTTTCTTG;SOR=0.392;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=179;TCF=74;TCR=105;TR=59;WE=33282585;WS=33282567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,59:0.32:184
chr7	33304107	rs7810388	A	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=174;ReadPosRankSum=-1.550;SC=TCTTTCCTATATTATGGTTAT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=33304115;WS=33304097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr7	33385852	rs6974593	C	T	4843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=120;NR=25;PP=2965;SC=CCAAGATATACAACCATGCAA;SOR=3.071;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=120;TCR=25;TR=145;WE=33385860;WS=33385842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr7	33388618	rs9785054	C	T	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=717;SC=TAAGTAGTTACGATAGTCTAT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=33388626;WS=33388608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	33388713	rs11773504	G	A	1609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.458;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=14;PP=1198;ReadPosRankSum=0.526;SC=ATTGCAAAAAGCCAAATTATC;SOR=1.253;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=84;TCF=60;TCR=24;TR=56;WE=33388721;WS=33388703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,60:0.67:89
chr7	33391089	rs35557465	G	A	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=157;ReadPosRankSum=0.586;SC=TTACTTTTATGTGTTATGAGT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=33391097;WS=33391079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr7	33392380	rs11769616	A	G	2643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.333;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=26;PP=2100;ReadPosRankSum=1.145;SC=TTTTAAGCAGATATGTGTCAA;SOR=0.263;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=133;TCF=101;TCR=32;TR=96;WE=33392388;WS=33392370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,97:0.71:136
chr7	34094687	rs17169636	A	C	1773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.946;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=16;PP=1147;ReadPosRankSum=0.538;SC=TGACACAGATAGTTATGAGTT;SOR=0.542;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=67;TCR=23;TR=63;WE=34094695;WS=34094677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,68:0.71:96
chr7	34125420	rs77064045	G	T	6729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=85;PP=2965;SC=TGGCTGCGCCGCATCTCAAGG;SOR=1.076;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=120;TCR=85;TR=204;WE=34125428;WS=34125410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr7	34192762	rs6968741	G	C	5069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=77;PP=2965;SC=GTATCAAGACGTGTGACAACT;SOR=0.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=79;TCR=77;TR=156;WE=34192770;WS=34192752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr7	34685772	rs1582277	A	G	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.842;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=27;PP=887;ReadPosRankSum=-0.237;SC=TGGAAAAACTAAAACGCTCAT;SOR=1.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=34;WE=34685780;WS=34685762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,34:0.79:43
chr7	34697982	rs887020	A	G	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=2.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.36;ReadPosRankSum=0.134;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr7	34698321	rs2530551	A	G	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=32;PP=783;ReadPosRankSum=0.222;SC=AAGTGCTAAAACAACAAGCTG;SOR=2.356;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=32;WE=34698329;WS=34698311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,33:0.77:43
chr7	34699826	rs35018938	AG	A	7316.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.046;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=60.23;MQRankSum=1.742;NF=72;NR=108;PP=2948;ReadPosRankSum=1.567;SC=CCACTGGACAAGGAGAAAAGC;SOR=0.559;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=257;TCF=93;TCR=164;TR=180;WE=34699834;WS=34699816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,224:0.70:319
chr7	34699973	rs2530553	T	C	1355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=40;PP=1024;ReadPosRankSum=0.684;SC=ACTTAGCTTATATTTCTTAGT;SOR=2.080;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=0;TCR=56;TR=40;WE=34699981;WS=34699963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,44:0.73:60
chr7	34724373	rs11290993	CA	C	587.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=0.751;QD=12.24;ReadPosRankSum=2.652;SOR=0.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,32:0.67:48
chr7	34725283	rs17169985	T	A	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.417;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=2;PP=724;ReadPosRankSum=0.236;SC=TTTCAAAAATTTATGACACTG;SOR=2.895;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=30;WE=34725291;WS=34725273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,32:0.86:37
chr7	34725539	rs1419837	C	T	2033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.783;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=63;PP=1635;ReadPosRankSum=-0.156;SC=ACTCCTATAACCGTAGAAGTA;SOR=0.129;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=90;TCF=4;TCR=86;TR=67;WE=34725547;WS=34725529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,70:0.74:94
chr7	34818113	rs324981	A	T	7177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=393;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.924;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=129;NR=133;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.666;SC=ACAGATATTAATTGGCGATTC;SOR=0.559;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=377;TCF=182;TCR=195;TR=262;WE=34818121;WS=34818103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,265:0.69:384
chr7	34867182	rs17170011	C	T	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=29;PP=1002;SC=TCGTGGCCTTCCTGGTGTACT;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=34867190;WS=34867172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr7	34867255	rs5883474	C	CA	599.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=13;PP=390;SC=GGGGGTGGGGCGGGGGGGGCT;SOR=1.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=17;WE=34867263;WS=34867245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	34888010	rs10270521	T	C	2450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=12;PP=1978;SC=AAAGAACCTCTCAGGTAAAAG;SOR=3.228;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=60;TCR=12;TR=72;WE=34888018;WS=34888000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr7	34889182	rs6972158	A	G	3192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=51;PP=2437;SC=TCCAGGGAGCAAAGATCACAG;SOR=0.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=51;TCR=51;TR=102;WE=34889190;WS=34889172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr7	34889222	rs10275028	T	C	2812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=61;PP=2103;SC=GGGAGAGAACTGAGAGGCATG;SOR=1.384;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=97;TCF=36;TCR=61;TR=97;WE=34889230;WS=34889212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr7	34917740	rs7809642	C	T	2279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=50;PP=1902;SC=CTGCCCTCAACGAGAGAACTG;SOR=1.457;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=25;TCR=50;TR=75;WE=34917748;WS=34917730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr7	34979159	rs718812	T	C	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=12;PP=367;SC=AAAGTAGCAGTTGGCAGCCAG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=34979167;WS=34979149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	34979905	rs1637696	C	A	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=16;PP=433;SC=CACAATAGCACCAGGATGTAC;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=34979913;WS=34979895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	34989337	rs2021390	T	G	4227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=95;NR=20;PP=2965;SC=GAGTCTGATATAAGAGGAGCA;SOR=3.047;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=116;TCF=95;TCR=21;TR=115;WE=34989345;WS=34989327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr7	34989364	rs2021391	T	C	5771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=115;NR=56;PP=2965;SC=ATGAAAAATGTATGGGCCAAA;SOR=1.676;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=115;TCR=56;TR=171;WE=34989372;WS=34989354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr7	34995075	rs1637670	A	G	2177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=64;PP=1816;SC=ATTCTCAAGTATCTAAAATTT;SOR=4.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=4;TCR=64;TR=68;WE=34995083;WS=34995065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr7	35050227	rs328939	C	T	2298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=67;PP=2348;SC=AATTACCTTACGTGTCTAGCA;SOR=1.810;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=94;TCF=26;TCR=68;TR=93;WE=35050235;WS=35050217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr7	35053484	rs76882258	CTA	C	1853.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=40;PP=1805;SC=TGTGAAAAAACTATGTATTTT;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=40;WE=35053493;WS=35053474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr7	35057721	rs66718921	AT	A	71	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=91;SC=TAGTATCTATATTTTTTTCAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=35057729;WS=35057711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	35058177	rs10282006	A	G	1852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=21;PP=1473;SC=GAAAAAAACAATCTTACCAGT;SOR=1.199;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=55;TCF=33;TCR=22;TR=54;WE=35058185;WS=35058167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr7	35058349	rs6963995	C	T	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=518;SC=CCCAGGGCTACGTTTAAAATT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=35058357;WS=35058339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	35077333	rs187869379	C	T	158.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=1;PP=115;SC=CCCCGCCGCCCCTCTGCGCCG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=35077341;WS=35077323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	35145811	rs2107636	T	A	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=300;SC=GGAACATACATAAAAATAAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=35145819;WS=35145801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	35225518	rs10262841	C	A	3508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=63;PP=2761;SC=CTCCTGGCGCCCCCTGGCAGT;SOR=1.028;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=47;TCR=63;TR=110;WE=35225526;WS=35225508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr7	35270988	rs2109090	G	A	972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.641;NF=30;NR=1;PP=876;ReadPosRankSum=-0.056;SC=AAGGAATGGGGTGCAGAGAAT;SOR=4.112;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=31;WE=35270996;WS=35270980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr7	35280693	rs2072434	C	T	2305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.142;NF=3;NR=65;PP=1995;ReadPosRankSum=-0.975;SC=CATACTTATACTGCTAAACAG;SOR=4.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=3;TCR=66;TR=68;WE=35280701;WS=35280683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,68:0.99:69
chr7	35288276	rs17675148	T	C	2246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=3;PP=2054;SC=GTGAAAAATCTGGAGGCACGA;SOR=5.580;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=66;TCR=3;TR=69;WE=35288284;WS=35288266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr7	35289889	rs5883498	C	CA	2150.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=47;PP=2301;SC=ACAGCATAACCAAATGGTCAC;SOR=1.911;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=58;TCF=9;TCR=49;TR=56;WE=35289897;WS=35289879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr7	35289941	rs5883499	C	CA	1156.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=28;PP=1303;SC=AAACTCCAGGCAGGCTGTAGG;SOR=4.047;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=35289949;WS=35289931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	35293193	rs336283	A	G	903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=20;PP=771;SC=CGTTGGCCCGAGAGGAGAGTT;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=35293201;WS=35293183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	35414453	rs17608167	T	C	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=2;PP=778;ReadPosRankSum=1.850;SC=TCCTCTTCAATCCCAGTCTTC;SOR=1.179;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=43;TCF=40;TCR=3;TR=33;WE=35414461;WS=35414443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,35:0.76:46
chr7	35414769	rs2553113	C	T	4479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=5.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.72;ReadPosRankSum=-0.033;SOR=1.181;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,110:0.71:156
chr7	35414772	rs2553114	C	T	4483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=2.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.93;ReadPosRankSum=-0.358;SOR=0.996;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,111:0.72:155
chr7	35673799	rs2305333	T	C	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=1;PP=926;ReadPosRankSum=0.240;SC=TATATGTTAGTTTTCTTTCAT;SOR=1.697;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=37;WE=35673807;WS=35673793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,38:0.83:46
chr7	35673870	rs2305334	C	T	2863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.373;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=4;PP=2262;ReadPosRankSum=0.898;SC=GGTCCCATACCGTGCTGGGAA;SOR=0.410;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=107;TCF=103;TCR=4;TR=84;WE=35673878;WS=35673860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,92:0.79:116
chr7	35678214	rs3816422	C	T	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=474;ReadPosRankSum=0.351;SC=AAAATACTTACTTTCAACGAT;SOR=2.400;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=19;WE=35678222;WS=35678204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr7	35840898	rs59008252	G	GC	2426.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=35;PP=2537;SC=TCAGCTTCGGGTGCCGCGACT;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=18;TCR=35;TR=53;WE=35840906;WS=35840888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr7	35851738	rs57121305	CA	C,AA	482.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=5.229;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.49;MQRankSum=-0.178;QD=16.09;ReadPosRankSum=-1.319;SOR=1.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,9,20:0.30,0.67:30
chr7	35928551	rs6945909	A	G	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.977;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=22;PP=758;ReadPosRankSum=0.915;SC=AGTGTTTATCATATCTCAGCT;SOR=0.858;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=61;TCF=27;TCR=34;TR=38;WE=35928559;WS=35928541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,41:0.64:64
chr7	35928678	rs58918750	T	A	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.52;ReadPosRankSum=1.335;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr7	36124292	rs1986593	G	A	4196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=57;PP=2965;SC=CGGAGTTCACGTGGAGGACGC;SOR=0.929;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=70;TCR=57;TR=127;WE=36124300;WS=36124282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
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chr7	36327410	rs196595	A	G	3880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.876;SC=TTTTGCTGTGACTCGGCCACT;SOR=1.778;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=23;TCR=97;TR=119;WE=36327418;WS=36327400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,123:0.99:124
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chr7	36370555	rs196660	G	T	2757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=27;PP=2080;SC=GCTGATCTGGGGTGTTCGGGG;SOR=1.744;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=57;TCR=27;TR=84;WE=36370563;WS=36370545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
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chr7	36456614	rs3779226	C	A	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.497;SOR=0.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr7	36459076	rs17213431	G	A	5647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.172;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=135;PP=2962;ReadPosRankSum=0.108;SC=CAGTTGGTGTGGTAAGTCCAG;SOR=1.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=265;TCF=86;TCR=179;TR=196;WE=36459084;WS=36459066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,200:0.73:273
chr7	36463335	rs2302527	A	G	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=170;ReadPosRankSum=-1.448;SC=AATCAGTTCAATATTCCTTTA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=7;WE=36463343;WS=36463325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr7	36465570	rs6957214	T	C	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.363;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=722;ReadPosRankSum=2.356;SC=ATCTTTGTATTAAATAAGGGA;SOR=1.981;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=26;WE=36465578;WS=36465560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,27:0.82:33
chr7	36552729	rs59476355	A	AT	10206.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=111;NR=159;PP=2936;SC=AGAGAAAGACATTTGCAAAGA;SOR=0.746;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=286;TCF=113;TCR=173;TR=270;WE=36552737;WS=36552719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr7	36552790	rs57543920	G	GT	9861.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=153;PP=2936;SC=CCCCCATAGGGTTGTGGAATG;SOR=0.827;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=274;TCF=111;TCR=163;TR=263;WE=36552798;WS=36552777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr7	36561469	rs6462681	G	T	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=0;PP=534;SC=ATTTCCCTATGGTCCCAAATT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=36561477;WS=36561459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	36569907	rs3735393	G	A	1493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.503;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=4;PP=1157;ReadPosRankSum=-0.129;SC=AGAATAGGCAGGAGTAACCCT;SOR=1.576;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=71;TCF=63;TCR=8;TR=48;WE=36569915;WS=36569897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,51:0.69:74
chr7	36588405	rs5883561	A	AC	178.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.827;NF=0;NR=9;PP=228;ReadPosRankSum=1.311;SC=CCTCTTGGCAACTTTTTGCTA;SOR=0.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=9;WE=36588413;WS=36588395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,9:0.24:37
chr7	36588955	rs3735397	G	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.405;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.15;ReadPosRankSum=-0.718;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr7	36656035	rs3735386	G	C	5668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.449;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=109;PP=2962;ReadPosRankSum=1.326;SC=GTGAAAATGAGCCCCAGCTGA;SOR=0.881;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=262;TCF=119;TCR=143;TR=198;WE=36656043;WS=36656025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,205:0.76:270
chr7	36656147	rs2727818	A	T	4344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=120;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.757;SC=GACTGGGTAGATATAAGAGCG;SOR=3.627;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=132;TCF=9;TCR=123;TR=129;WE=36656155;WS=36656137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,129:0.99:130
chr7	36660502	rs35645334	CATGA	C	233.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.79;ReadPosRankSum=-0.235;SOR=0.142;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr7	36661423	rs2727822	T	C	5551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=116;PP=2965;SC=GGGTTCAGCCTGCTTTGATGT;SOR=1.161;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=78;TCR=116;TR=194;WE=36661431;WS=36661413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr7	36662714	rs58016731	AGTCTT	A	463.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=2.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQRankSum=1.550;QD=9.46;ReadPosRankSum=-0.274;SOR=0.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,15:0.31:49
chr7	36726136	rs60875600	AT	A	199.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.233;SOR=1.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
chr7	36729757	rs7790095	T	C	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.748;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.547;NF=13;NR=7;PP=210;ReadPosRankSum=-1.307;SC=AGGACTCTTATGACAGTTGTG;SOR=0.195;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=73;TCF=55;TCR=18;TR=20;WE=36729765;WS=36729747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,23:0.30:76
chr7	36729822	rs11427708	C	CA	307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=5.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=2.690;QD=2.82;ReadPosRankSum=-0.494;SOR=0.924;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,24:0.22:109
chr7	36729951	rs6462691	C	T	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.67;ReadPosRankSum=-1.456;SOR=0.048;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,5:0.16:31
chr7	36763560	rs6462703	C	T	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=240;ReadPosRankSum=1.059;SC=TGATTTATTACGCAAGCAAAG;SOR=0.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=48;TCR=9;TR=18;WE=36763568;WS=36763550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,17:0.29:58
chr7	36763688	rs2228411	C	T	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=585;ReadPosRankSum=-0.346;SC=CTGGAGAGGCCGAGGACTGAA;SOR=0.625;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=128;TCF=48;TCR=80;TR=38;WE=36763696;WS=36763678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,38:0.30:128
chr7	36934448	rs6462722	A	G	4278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=58;PP=2965;SC=AGTCAATACTAGGTAACTTAC;SOR=0.917;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=133;TCF=75;TCR=58;TR=133;WE=36934456;WS=36934438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr7	37072852	rs146620820	G	A	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=5.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.598;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=310;ReadPosRankSum=-0.426;SC=GAGCGCAGACGGGCTAAGTCC;SOR=1.467;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=67;TCF=64;TCR=3;TR=19;WE=37072860;WS=37072842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,20:0.29:68
chr7	37252929	rs7809365	T	C	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.28;ReadPosRankSum=-1.325;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,4:0.17:24
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chr7	37256392	rs7806425	G	A	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=0.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.65;ReadPosRankSum=1.095;SOR=0.553;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,43:0.25:171
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chr7	37262140	rs2302668	C	T	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=3.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.88;ReadPosRankSum=1.094;SOR=1.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,25:0.24:106
chr7	37283880	.	ATCAG	A	7607.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.000;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.491;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.662;NF=90;NR=47;PP=2967;ReadPosRankSum=-0.119;SC=TAGTTATACAATCAGTCAGAT;SOR=1.000;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=211;TCF=134;TCR=77;TR=137;WE=37283891;WS=37283870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,190:0.72:263
chr7	37298800	rs2717968	C	T	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=1.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.99;ReadPosRankSum=-0.795;SOR=0.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,26:0.22:120
chr7	37299056	rs2717969	C	T	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.15;ReadPosRankSum=1.828;SOR=0.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,14:0.20:71
chr7	37355590	rs11383031	C	CT	1386.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=33;PP=1448;SC=AAAGGAAATACTTGTTAGTTT;SOR=3.312;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=35;WE=37355598;WS=37355580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	37889786	rs10271309	A	G	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=0;PP=1456;SC=GTTTTAAAAGATGTTATTTGC;SOR=7.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=47;WE=37889794;WS=37889776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr7	37901581	rs2249451	G	A	7613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=154;NR=79;PP=2965;SC=TTAGTTCTTGGTGTGTTCTCC;SOR=1.571;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=233;TCF=154;TCR=79;TR=233;WE=37901589;WS=37901571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr7	37903853	rs3816419	A	T	2228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=16;PP=1621;SC=CAATTAACTGATCATTAGAAA;SOR=2.271;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=52;TCR=16;TR=68;WE=37903861;WS=37903843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr7	37903904	rs3816418	C	T	3190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=46;PP=2364;SC=ATCCAGACTTCGTGCCAAGAA;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=52;TCR=46;TR=98;WE=37903912;WS=37903894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr7	37904065	rs3841582	TAAC	T	1122.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=1007;SC=AATTGCAAAATAACAACCTCT;SOR=5.136;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=22;WE=37904075;WS=37904055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	37904099	rs3816417	G	A	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=518;SC=AAAGACAAGCGTACCATTTAG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=37904107;WS=37904089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	37907304	rs10250905	T	C	3357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=3;PP=2866;SC=TATTTTGTAGTGTGACTTCGA;SOR=6.399;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=97;TCF=94;TCR=3;TR=97;WE=37907312;WS=37907294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr7	37924737	rs1530822	T	G	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=7.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.74;ReadPosRankSum=1.571;SOR=0.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,19:0.26:74
chr7	37924879	rs2242027	A	G	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=4.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.79;ReadPosRankSum=-0.618;SOR=0.388;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,35:0.19:185
chr7	37927779	rs2251179	T	G	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=257;ReadPosRankSum=-1.256;SC=GATCTGGAATTATTTGCTGTT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=14;WE=37927787;WS=37927769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr7	37933983	rs10260487	C	G	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.249;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=126;ReadPosRankSum=1.797;SC=ATTAAACTATCATTTTCCTTA;SOR=0.148;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=10;WE=37933991;WS=37933973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,10:0.23:44
chr7	37934146	rs56128139	TA	CT	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.74;ReadPosRankSum=0.925;SOR=0.480;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,12:0.18:66
chr7	37936530	rs3213975	T	C	4234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=32;PP=2962;ReadPosRankSum=0.557;SC=ATGGAGACGATTGATGGGCCC;SOR=0.710;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=198;TCF=154;TCR=44;TR=150;WE=37936538;WS=37936520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,156:0.76:206
chr7	37951726	rs1132553	G	A	2328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=13;PP=1831;SC=CCTACCTTGAGCGCCACTCGT;SOR=2.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=55;TCR=13;TR=68;WE=37951734;WS=37951716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr7	37960262	rs201513905	AAGGCAGTGGCAGC	A	1808.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FS=2.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQRankSum=6.001;QD=7.41;ReadPosRankSum=0.835;SOR=0.905;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:185,59:0.24:244
chr7	37960835	rs13240429	G	A	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.534;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=29;PP=998;ReadPosRankSum=-1.175;SC=CCCGCGGGGCGGGAGTAGGGA;SOR=1.689;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=50;TCF=17;TCR=33;TR=42;WE=37960843;WS=37960825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,43:0.81:53
chr7	37960955	rs4723716	T	G	2601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=62;NR=26;PP=2098;SC=GAGGAGGGTCTCTTGGGGATA;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=62;TCR=26;TR=88;WE=37960963;WS=37960945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr7	37966201	rs12666164	T	C	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.77;ReadPosRankSum=0.547;SOR=0.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,11:0.15:72
chr7	37988589	rs2044831	C	T	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.385;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=342;ReadPosRankSum=-0.899;SC=AGTACTCCATCGGGGGGCCTC;SOR=0.350;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=90;TCF=34;TCR=56;TR=26;WE=37988597;WS=37988579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,29:0.30:96
chr7	37989775	rs1450851	T	C	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.76;ReadPosRankSum=0.246;SOR=0.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,12:0.20:59
chr7	38268224	rs7795457	G	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=263;ReadPosRankSum=-1.203;SC=AGGTTTTCCTGTTACAAGAAA;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=12;WE=38268232;WS=38268222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr7	38268395	rs7795499	C	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=4.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.04;ReadPosRankSum=-0.498;SOR=1.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,12:0.13:93
chr7	38282130	rs35917252	G	GGT	2326.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.801;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.961;NF=4;NR=68;PP=2992;ReadPosRankSum=0.162;SC=TATTTGTCAAGGTGTGTGTGT;SOR=1.259;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=189;TCF=14;TCR=175;TR=72;WE=38282139;WS=38282120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,78:0.66:118
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chr7	38284649	rs112543808	A	T	1495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-8.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.876;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-8.468;NF=62;NR=1;PP=1354;ReadPosRankSum=0.855;SC=TCCTAGAAAAAGAGGGACTAA;SOR=1.533;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=160;TCF=154;TCR=6;TR=63;WE=38284657;WS=38284639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,61:0.38:161
chr7	38284794	rs2008893	C	T	6416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=467;ExcessHet=3.0103;FS=3.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQRankSum=-7.728;QD=13.98;ReadPosRankSum=0.124;SOR=0.952;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:278,181:0.39:459
chr7	38284804	rs4629747	T	C	6440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=441;ExcessHet=3.0103;FS=6.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQRankSum=-9.348;QD=14.84;ReadPosRankSum=1.102;SOR=1.077;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:269,165:0.38:434
chr7	38284808	rs4434531	A	C	6265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=437;ExcessHet=3.0103;FS=5.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQRankSum=-10.080;QD=14.57;ReadPosRankSum=-0.486;SOR=1.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:258,172:0.40:430
chr7	38284834	rs67534383	A	G	4582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.489;HP=1;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-11.787;NF=30;NR=103;PP=2706;ReadPosRankSum=0.420;SC=GGTGACATCTAGAAGAATGAG;SOR=1.258;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=343;TCF=103;TCR=240;TR=133;WE=38284842;WS=38284824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:219,135:0.38:354
chr7	38284854	rs73360756	C	T	3954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-7.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.064;HP=1;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-12.964;NF=16;NR=92;PP=2080;ReadPosRankSum=1.236;SC=GAGCAAGTACCAGTCAATTGT;SOR=1.437;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=308;TCF=73;TCR=235;TR=108;WE=38284862;WS=38284844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,110:0.35:317
chr7	38284887	.	T	G	1052	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=41;MMLQ=28;MQ=54.99;NF=6;NR=56;PP=1052;QD=17.5285679443;SC=TTTGTCAAGGTGTGTGTGTGT;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=201;TCF=29;TCR=172;TR=62;WE=38284895;WS=38284877;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:139,62:0.31:201
chr7	38284902	rs200052170	A	G	1178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=2.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQRankSum=-10.484;QD=8.19;ReadPosRankSum=-2.496;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,34:0.24:144
chr7	38288816	rs35633605	C	T	1966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.352;NF=66;NR=0;PP=1636;ReadPosRankSum=1.141;SC=AAGAAGTGTTCTGACAGATGA;SOR=1.847;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=96;TCF=96;TCR=0;TR=66;WE=38288824;WS=38288806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,66:0.70:94
chr7	38289121	rs1053756	C	T	4130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.549;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-8.453;NF=100;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=0.484;SC=TTTCAGCAATCGAAGGAAGAA;SOR=1.182;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=330;TCF=156;TCR=174;TR=212;WE=38289129;WS=38289111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,158:0.57:277
chr7	38292857	rs12701617	G	A	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.632;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.714;NF=28;NR=1;PP=686;ReadPosRankSum=-0.523;SC=GTCTCTCCTAGGATTTCTACA;SOR=0.123;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=29;WE=38292865;WS=38292847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr7	38295958	rs34053049	C	T	5284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.967;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=68;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.635;SC=TACTATGAGCCTAGTCCCTTT;SOR=0.487;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=262;TCF=171;TCR=91;TR=187;WE=38295966;WS=38295948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,190:0.71:268
chr7	38296130	rs6462828	T	C	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.878;NF=1;NR=39;PP=741;ReadPosRankSum=0.207;SC=TTTTGTGACATGTGATAGTTT;SOR=0.495;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=62;TCF=1;TCR=61;TR=40;WE=38296138;WS=38296120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,40:0.62:64
chr7	38299727	rs138027161	T	C	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.11;MQRankSum=-3.072;QD=2.23;ReadPosRankSum=-0.141;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,4:0.19:21
chr7	38301741	rs2392542	T	A	6608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.704;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.903;NF=137;NR=93;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.168;SC=AACAAAATGATCAGGAGGAAG;SOR=0.451;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=326;TCF=199;TCR=127;TR=230;WE=38301749;WS=38301731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,236:0.71:333
chr7	38304926	rs3901405	C	T	1414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.340;NF=70;NR=0;PP=1723;ReadPosRankSum=-1.278;SC=AGTGTTCTGACAGATGATATG;SOR=1.675;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=93;TCF=93;TCR=0;TR=70;WE=38304934;WS=38304916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,49:0.68:72
chr7	38305043	rs1053760	T	C	1842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=5.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.299;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-10.387;NF=58;NR=58;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.451;SC=TCCAGTGACTTTTCTGGCACC;SOR=0.636;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=201;TCF=105;TCR=96;TR=116;WE=38305051;WS=38305033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,65:0.44:147
chr7	38305340	rs2302343	A	G	1455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.60;MQRankSum=-8.134;QD=18.20;ReadPosRankSum=-1.027;SOR=2.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,50:0.62:80
chr7	38309102	rs2075010	A	C	3155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=0.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.50;MQRankSum=0.837;QD=18.35;ReadPosRankSum=-1.135;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,117:0.68:172
chr7	38315971	rs35130602	C	T	3396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.852;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.044;NF=29;NR=92;PP=2575;ReadPosRankSum=-0.519;SC=CCTCGGGACACGACTAGCAAT;SOR=0.403;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=166;TCF=37;TCR=129;TR=121;WE=38315979;WS=38315961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,126:0.73:173
chr7	38331416	rs76807453	C	T	4175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=86;PP=2962;ReadPosRankSum=0.939;SC=CTGCCAGTACCAGTGTATGAT;SOR=0.702;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=197;TCF=76;TCR=121;TR=139;WE=38331424;WS=38331406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,146:0.70:210
chr7	38339604	rs4723740	C	T	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=4.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.36;ReadPosRankSum=-0.541;SOR=1.094;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:167,51:0.23:218
chr7	38356943	rs34482025	G	GA	3694.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.482;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.053;NF=20;NR=107;PP=2976;ReadPosRankSum=0.315;SC=ACACACTGGGGAAAAAAATGG;SOR=1.749;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=199;TCF=41;TCR=158;TR=127;WE=38356951;WS=38356933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,144:0.73:196
chr7	38357075	rs11769443	T	C	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.761;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=27;PP=599;ReadPosRankSum=1.026;SC=AGCGTTGATGTGTGGAGCAGT;SOR=0.250;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=58;TCF=12;TCR=46;TR=36;WE=38357083;WS=38357065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,36:0.61:59
chr7	38431644	rs79759611	G	GC	568.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=13;PP=640;SC=CCGTGGCGATGCCGGCAGGGC;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=16;WE=38431652;WS=38431634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	38457688	rs10247761	C	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=112;ReadPosRankSum=0.338;SC=TGGAGAAAAGCCCCCATTTGC;SOR=0.317;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=10;WE=38457696;WS=38457678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,10:0.22:46
chr7	38460534	rs117950892	C	T	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.021;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=265;ReadPosRankSum=0.301;SC=AGTCAATGAGCCAAACACTGG;SOR=0.026;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=8;WE=38460554;WS=38460524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,9:0.25:36
chr7	38460546	rs1019287	G	A	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.351;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=1;PP=1065;ReadPosRankSum=1.217;SC=AAACACTGGGGCGTTTTCTTG;SOR=2.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=27;WE=38460554;WS=38460524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,28:0.74:38
chr7	38462154	rs57006229	G	GTATC,GTATCTATC	1560.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.49;MQRankSum=0.432;QD=33.21;ReadPosRankSum=-1.001;SOR=3.958;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:5,28,14:0.60,0.30:47
chr7	38467842	rs1544636	A	G	8529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=139;NR=108;PP=2965;SC=GCTGAATCCAAGCTTGGCTGC;SOR=0.956;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=247;TCF=139;TCR=108;TR=247;WE=38467850;WS=38467832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr7	38467923	rs6958300	A	G	7278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=141;PP=2965;SC=GTATGACTACAGTTCTCAGTT;SOR=1.241;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=235;TCF=94;TCR=141;TR=234;WE=38467931;WS=38467913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr7	38468463	rs2267808	C	T	6072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.867;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=108;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.787;SC=TTTTCATTGGCGTTTGTACTT;SOR=0.854;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=183;TCF=75;TCR=108;TR=181;WE=38468471;WS=38468453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,189:0.99:190
chr7	38468695	rs2392572	C	T	8376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=91;NR=162;PP=2965;SC=GAGAATCTTCCATCTTCTGTT;SOR=1.459;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=253;TCF=91;TCR=162;TR=253;WE=38468703;WS=38468685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr7	38469039	rs2215955	C	A	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=0.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.86;ReadPosRankSum=-0.158;SOR=0.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,37:0.25:147
chr7	38469636	rs10253674	G	T	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=12;PP=358;SC=TTCCAAAATTGTTTAAGACCA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=38469644;WS=38469626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	38471753	rs10232299	A	G	3485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=79;PP=2889;SC=TCTGGGGATCAAGATACATGA;SOR=2.237;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=27;TCR=79;TR=106;WE=38471761;WS=38471743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr7	38505025	rs722334	G	A	2717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=35;PP=2190;SC=AGAAATTTTAGCAAGCAGGAC;SOR=0.979;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=46;TCR=35;TR=81;WE=38505033;WS=38505015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr7	38530568	rs2043786	G	T	3920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=103;NR=10;PP=2965;SC=TTGAGGACTTGTAATAATTCT;SOR=4.542;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=103;TCR=10;TR=113;WE=38530576;WS=38530558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr7	38530807	rs3837078	T	TA	3791.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=108;PP=2979;SC=ACCAAACTTCTAAAAAAATCT;SOR=5.736;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=136;TCF=3;TCR=133;TR=111;WE=38530815;WS=38530797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr7	38543103	rs10225047	TG	GC	4587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=82;NR=10;PP=2947;SC=GGCGGGGGGGTGGGTGGTGGA;SOR=4.069;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=91;TCR=11;TR=92;WE=38543112;WS=38543093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr7	38543371	rs6946268	C	T	3393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=92;PP=2821;SC=GTAAGAAGTGCTAAGTCTCAA;SOR=6.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=95;TCF=3;TCR=92;TR=95;WE=38543379;WS=38543361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr7	38780883	rs6951429	C	T	1663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=23;PP=1290;SC=AACAACAGTCCGAATTTTTAA;SOR=0.808;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=27;TCR=23;TR=50;WE=38780891;WS=38780873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr7	38780924	rs6975410	T	C	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=30;PP=1308;SC=TCTATAGAAGTTACCAGCATC;SOR=1.390;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=48;WE=38780932;WS=38780914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr7	38782951	rs10254567	G	A	3696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=0;PP=2965;SC=GACATAACTGGTTACACTGAG;SOR=9.364;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=105;TCF=105;TCR=0;TR=104;WE=38782959;WS=38782941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr7	38796570	rs2240350	G	A	1649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=22;PP=1271;SC=CATAGTTCTTGTCATAGGTGT;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=29;TCR=22;TR=51;WE=38796578;WS=38796560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	38796748	rs2392599	C	T	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=553;SC=TAACTATACACGACCAATAAG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=38796756;WS=38796738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	38813711	rs976350	C	T	5143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=133;NR=15;PP=2965;SC=TTCATATCTCCTACCTAAATG;SOR=4.076;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=133;TCR=15;TR=148;WE=38813719;WS=38813701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr7	38816441	rs1468347	A	G	3891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=93;PP=2965;SC=CATCTGGAGGAACACAATGAC;SOR=3.219;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=19;TCR=93;TR=112;WE=38816449;WS=38816431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr7	38816487	rs4236355	G	A	2164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=62;PP=1781;SC=AAAAGCTAACGTAAAGGGGAC;SOR=7.024;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=64;TCF=1;TCR=63;TR=63;WE=38816495;WS=38816477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr7	38857364	rs2072248	G	A	5239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.918;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=40;PP=2965;ReadPosRankSum=0.448;SC=TACAGAGTAAGCACACAACAC;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=161;TCF=120;TCR=41;TR=160;WE=38857372;WS=38857354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,167:0.99:168
chr7	38869708	rs7790054	C	T	2934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=79;NR=2;PP=2380;SC=TATTTTACTTCAATTATGACC;SOR=6.666;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=81;TCF=79;TCR=2;TR=81;WE=38869716;WS=38869698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr7	39125327	.	AAG	A	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-2.325;QD=2.52;ReadPosRankSum=1.838;SOR=0.158;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,5:0.15:34
chr7	39125358	.	GGAAGAGAGAGAGA	G	295.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=4.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=-3.952;QD=5.69;ReadPosRankSum=-1.719;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,11:0.21:52
chr7	39125372	.	G	C	300.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=4.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-3.905;QD=5.90;ReadPosRankSum=-1.077;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,11:0.22:51
chr7	39125388	.	GGA	G	435.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=4.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-3.814;QD=6.92;ReadPosRankSum=-0.632;SOR=2.173;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,14:0.22:63
chr7	39125405	.	A	T	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.679;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=5.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-3.816;QD=7.06;ReadPosRankSum=0.737;SOR=1.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,17:0.22:77
chr7	39125413	rs1950001	T	G	2984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.85;NF=63;NR=13;PP=2182;SC=GCACTCTAAATCTGCCACTTT;SOR=3.070;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=63;TCR=13;TR=76;WE=39125431;WS=39125395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr7	39125420	.	CTTTT	C	501.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=0.000;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=2.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-3.913;QD=5.90;ReadPosRankSum=1.227;SOR=1.246;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,18:0.21:85
chr7	39125440	.	A	G	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.806;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=8.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-3.440;QD=6.27;ReadPosRankSum=0.434;SOR=2.052;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,19:0.20:93
chr7	39125447	.	T	C	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.000;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=5.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-3.301;QD=6.64;ReadPosRankSum=-0.659;SOR=1.441;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,22:0.22:101
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chr7	39243978	rs35489214	A	G	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.869;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=30;PP=559;ReadPosRankSum=-1.592;SC=TGGTTTAACCATATAAATCAC;SOR=1.298;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=105;TCF=18;TCR=87;TR=35;WE=39243986;WS=39243968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,34:0.33:104
chr7	39472669	rs2302125	C	T	3871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.917;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=30;PP=2919;ReadPosRankSum=-0.250;SC=TTGGCCCTCTCTTGCAGATTA;SOR=0.288;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=162;TCF=125;TCR=37;TR=123;WE=39472677;WS=39472659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,134:0.77:174
chr7	39472708	rs2302123	A	G	4944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=81;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.012;SC=TGCCTAATCCAGGGCCATCGA;SOR=0.733;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=244;TCF=142;TCR=102;TR=195;WE=39472716;WS=39472698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,203:0.80:254
chr7	39472846	rs2302122	G	A	3371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.636;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=83;PP=2737;ReadPosRankSum=-0.810;SC=TCAACACCCAGGGCATCACGC;SOR=0.641;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=52;TCR=124;TR=118;WE=39472854;WS=39472836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,120:0.67:178
chr7	39490982	rs7801100	A	C	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=247;ReadPosRankSum=1.028;SC=AAAAAAAATGACTGCCTGCTG;SOR=0.914;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=13;WE=39490990;WS=39490973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr7	39500352	rs885689	C	G	811.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.9972;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=679;ReadPosRankSum=0.807;SC=CTTCTAGCCGCCCTGGGCCTC;SOR=1.292;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=29;WE=39500360;WS=39500342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,28:0.90:31
chr7	39606107	rs1051162	G	A	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=1.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.17;ReadPosRankSum=0.221;SOR=0.587;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,51:0.25:200
chr7	39610177	rs6947660	A	G	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=4.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.80;ReadPosRankSum=-0.055;SOR=0.955;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,24:0.24:102
chr7	39610241	rs2971	C	G	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=249;ReadPosRankSum=-0.260;SC=TTTTTAAAGTCTAAATGCTGA;SOR=0.616;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=62;TCF=8;TCR=54;TR=18;WE=39610249;WS=39610231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,18:0.27:66
chr7	39611819	rs60942815	G	A	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.981;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=98;ReadPosRankSum=-0.946;SC=TTGAAAGATAGTCTTATATTT;SOR=0.014;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=8;WE=39611827;WS=39611809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr7	39736796	rs3779203	G	A	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.706;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=128;ReadPosRankSum=0.068;SC=GCACTAAACCGTTCTTACCTC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=8;WE=39736804;WS=39736786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr7	39873126	.	A	AGCG	485.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=-2.846;QD=7.59;ReadPosRankSum=-0.745;SOR=0.282;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,16:0.25:64
chr7	39990722	.	G	T	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.155;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=386;ReadPosRankSum=1.573;SC=CTGCTGGGGGGGGCCAGCGCG;SOR=0.942;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=81;TCF=17;TCR=64;TR=23;WE=39990730;WS=39990712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,24:0.29:83
chr7	40087320	rs57364877	GT	G	86.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=1.175;SC=GTTTACATAGGTTTTTTTTTT;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=7;WE=40087328;WS=40087310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr7	40127710	rs377247573	CT	C	265.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=1.592;QD=3.50;ReadPosRankSum=1.250;SOR=0.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,21:0.28:76
chr7	40220412	rs7778061	T	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=122;ReadPosRankSum=0.954;SC=TTTACTAGAGTCTTGTGGTCT;SOR=0.804;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=10;WE=40220420;WS=40220402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr7	40220507	rs2036041	C	G	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=4.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.31;ReadPosRankSum=-1.055;SOR=1.251;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,14:0.23:60
chr7	40229072	rs4720354	G	A	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.63;ReadPosRankSum=1.088;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr7	40234742	rs11326652	CT	C	108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.405;SOR=0.207;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr7	40314243	rs4637704	A	G	4280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=111;PP=2965;SC=ATTGTAACCTACTGTCATCCC;SOR=3.699;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=18;TCR=112;TR=129;WE=40314251;WS=40314233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr7	40356315	rs10245165	A	T	3920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=104;NR=8;PP=2965;SC=GAGTATAGATAAACTAGCTGT;SOR=4.768;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=104;TCR=8;TR=112;WE=40356323;WS=40356305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr7	41368666	.	T	TGAAAGAAA	1641.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=1583;SC=GAAGCTCAATTGAAAGAAAGA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=23;WE=41368674;WS=41368656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	42007350	.	T	A	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=0.000;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.42;ReadPosRankSum=-0.746;SOR=0.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,28:0.21:131
chr7	42064852	rs846273	C	G	2311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=10;PP=1896;SC=TGTGCGGCCTCGGTGTCCTAC;SOR=3.458;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=59;TCR=10;TR=69;WE=42064860;WS=42064842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr7	42084829	rs699493	A	G	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=292;ReadPosRankSum=-0.673;SC=GCTTCTAGAAAACGAAGGGAA;SOR=0.102;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=72;TCR=0;TR=18;WE=42084837;WS=42084819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,18:0.24:75
chr7	42088222	rs846266	T	C	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=574;ReadPosRankSum=1.139;SC=GAAGCAGCAGTGGGGTTCCGG;SOR=0.739;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=127;TCF=82;TCR=45;TR=38;WE=42088230;WS=42088212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,36:0.28:129
chr7	42187734	rs113509347	GCACACA	G	826.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=496;SC=CATAAAGCGCGCACACACACA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=11;WE=42187747;WS=42187724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	42212210	rs76999720	C	T	3191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=97;PP=2513;ReadPosRankSum=-0.458;SC=GTCGTTTGTGCAGCAGCAGGG;SOR=0.727;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=155;TCF=25;TCR=130;TR=115;WE=42212218;WS=42212200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,118:0.74:159
chr7	42262935	rs11266806	GA	G	251.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.68;ReadPosRankSum=-0.980;SOR=0.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
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chr7	42951515	rs647117	G	A	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=356;SC=GCTCCTCACCGGCAGCGCCAG;SOR=3.258;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=16;WE=42951523;WS=42951505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	42957465	rs71008875	ATT	A	468.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=400;SC=TACTTATATCATTGTTTATAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=42957474;WS=42957455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	42970733	rs619664	C	T	4152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=91;NR=35;PP=2965;SC=GTACAAGCTGCGGTTAGTTCA;SOR=2.045;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=91;TCR=35;TR=126;WE=42970741;WS=42970723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr7	42974827	rs601057	A	C	4154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=111;PP=2965;SC=ATAAATTATTATCAGATTATA;SOR=8.138;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=112;TCF=1;TCR=111;TR=112;WE=42974835;WS=42974817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr7	42976789	rs630191	A	G	6611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.824;SC=AGGTGGAACTAGATGGTGTAT;SOR=0.323;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=201;TCF=89;TCR=112;TR=200;WE=42976797;WS=42976779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,208:1.00:209
chr7	42977091	rs631132	G	A	2628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=67;PP=2230;SC=TGCTGTACACGGGAGAGACAC;SOR=4.351;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=7;TCR=67;TR=74;WE=42977099;WS=42977081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr7	43190479	rs12702015	T	G	1613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=1296;ReadPosRankSum=1.313;SC=TTCAGCATCTTTATCAGCGCC;SOR=0.647;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=42;TCR=37;TR=59;WE=43190487;WS=43190469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,60:0.72:83
chr7	43400656	rs148551048	CGTGTGTGT	C	206.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.823;NF=0;NR=9;PP=1124;ReadPosRankSum=-0.391;SC=CTTGTGCGTGCGTGTGTGTGT;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=9;WE=43400671;WS=43400646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr7	43484310	rs73098706	T	C	3709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.319;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=42;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.720;SC=GAGATGTGTCTACCCTGGAGC;SOR=0.828;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=122;TCR=59;TR=129;WE=43484318;WS=43484300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,130:0.70:186
chr7	43485248	rs6960889	A	G	2211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.179;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=72;PP=1868;ReadPosRankSum=-1.206;SC=AAAAACAAGAAGGGCGGGGGA;SOR=2.687;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=93;TCF=2;TCR=91;TR=73;WE=43485256;WS=43485238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,74:0.79:94
chr7	43495878	rs3214631	C	CT	2782.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=29;PP=2974;SC=TTCTTTTTGCCTTTTTATTAA;SOR=1.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=87;TCF=55;TCR=32;TR=80;WE=43495886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr7	43496138	rs2304331	T	C	1751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-6.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=70;PP=1378;ReadPosRankSum=-0.604;SC=CTGCTCAGACTGTATGAGGAG;SOR=1.159;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=105;TCF=3;TCR=102;TR=72;WE=43496146;WS=43496128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,72:0.69:104
chr7	43506015	rs2304330	C	A	3372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=35;PP=2611;ReadPosRankSum=0.071;SC=TTTCCCAATGCATTCTGTTGC;SOR=0.937;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=68;TCR=36;TR=101;WE=43506023;WS=43506005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,107:0.97:110
chr7	43506059	rs2304329	A	G	3526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=63;PP=2647;SC=TAAGGAGAGAAGGGTCACTTT;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=44;TCR=63;TR=107;WE=43506067;WS=43506049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr7	43506158	rs2304328	T	C	1659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=47;PP=1291;ReadPosRankSum=-0.836;SC=CTGTGCTACATGCCAATTATG;SOR=1.852;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=58;TCF=9;TCR=49;TR=56;WE=43506166;WS=43506148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr7	43519337	rs2304327	T	C	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=2.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.83;ReadPosRankSum=0.733;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,45:0.25:183
chr7	43548832	rs74368380	T	C	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=31;PP=598;ReadPosRankSum=0.125;SC=CCAGATGTTATGAGGGATGAG;SOR=2.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=31;WE=43548840;WS=43548822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,33:0.75:44
chr7	43591832	rs56111512	G	A	1425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.326;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=37;PP=1126;ReadPosRankSum=0.489;SC=TTGTAGACTCGAGGCTGGTGT;SOR=2.200;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=73;TCF=27;TCR=46;TR=51;WE=43591840;WS=43591822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,52:0.68:77
chr7	43591955	rs4724220	A	G	933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=26;PP=811;SC=CAGGAGCTGTAATGATGCAAT;SOR=3.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=43591963;WS=43591945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	43594471	rs9638972	C	T	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=2.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.00;ReadPosRankSum=-0.044;SOR=1.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,12:0.15:78
chr7	43622806	rs10251937	T	C	3050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.291;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=44;PP=1976;ReadPosRankSum=-0.014;SC=CTGCTCGGAGTGAACAGGCGG;SOR=0.317;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=147;TCF=96;TCR=51;TR=117;WE=43622814;WS=43622796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,122:0.79:154
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chr7	43647879	rs11555026	C	T	3705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.952;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=58;PP=2709;ReadPosRankSum=0.358;SC=AAATCTTTGACCAGTGTGTTG;SOR=0.802;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=178;TCF=93;TCR=85;TR=126;WE=43647887;WS=43647869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,137:0.71:194
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chr7	43686194	rs970134	G	A	4415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.122;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=96;PP=2962;ReadPosRankSum=0.799;SC=AGGGAGAAAGGCTGTCACACC;SOR=0.512;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=239;TCF=91;TCR=148;TR=159;WE=43686202;WS=43686184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,167:0.67:248
chr7	43686224	rs970135	C	T	3807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.059;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=95;PP=2877;ReadPosRankSum=-0.079;SC=AACCCTGACCCAAAAGTGCAC;SOR=0.424;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=195;TCF=52;TCR=143;TR=133;WE=43686232;WS=43686214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,141:0.70:202
chr7	43687074	rs143305109	TGGA	T	1093.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.780;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=986;ReadPosRankSum=-1.646;SC=TTTCCTCTGATGGAGGAGCAG;SOR=1.675;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=22;WE=43687084;WS=43687064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr7	43687296	rs2240516	C	T	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=5.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.432;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=37;PP=984;ReadPosRankSum=0.444;SC=GGGATTTGCCCGGCTTGGACC;SOR=2.004;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=53;TCF=4;TCR=49;TR=39;WE=43687304;WS=43687286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,39:0.71:55
chr7	43687967	rs17531127	G	C	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=1;PP=691;ReadPosRankSum=0.732;SC=CTGGGTTATGGAGAGGTTCCC;SOR=1.230;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=28;WE=43687975;WS=43687957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,28:0.78:36
chr7	43810695	rs699511	A	G	1510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.345;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=4;PP=1074;ReadPosRankSum=0.612;SC=GAGTTTGGGCAGGTGCCACCA;SOR=2.122;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=91;TCF=82;TCR=9;TR=59;WE=43810703;WS=43810685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,64:0.67:95
chr7	43810764	rs699512	G	A	3726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.036;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=36;PP=2884;ReadPosRankSum=1.231;SC=CAAGATGAATGCAGAGGTGAG;SOR=1.120;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=180;TCF=122;TCR=58;TR=124;WE=43810772;WS=43810754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,135:0.71:191
chr7	43810820	rs10234057	C	T	5563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=78;PP=2962;ReadPosRankSum=0.153;SC=TATTGTGTCCCTCATTTCTCC;SOR=0.628;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=249;TCF=145;TCR=104;TR=183;WE=43810828;WS=43810810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,194:0.75:260
chr7	43827373	rs17239537	T	C	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=1;PP=1005;ReadPosRankSum=0.427;SC=ATCCTGATGCTGTGGCTTCCT;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=41;WE=43827381;WS=43827363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,42:0.88:48
chr7	43945982	rs200939452	G	GC	44.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=0;PP=68;SC=CCGCGCGGCCGGTCCGCCCAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=43945990;WS=43945972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr7	44098688	rs146866562	GGTGA	G	178.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=195;ReadPosRankSum=-0.377;SC=ATCGGTGACGGGTGAGTGAGT;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=5;WE=44098699;WS=44098678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr7	44147193	rs36040343	G	A	5305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=75;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.312;SC=GGCCTGGGTGGGGTTGTCAGG;SOR=0.702;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=241;TCF=145;TCR=96;TR=186;WE=44147201;WS=44147183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,190:0.76:250
chr7	44147567	rs58863562	C	CG	2505.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=38;PP=2438;SC=GCCATGGCCACGGCGCTCTGG;SOR=1.011;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=66;TCF=22;TCR=44;TR=59;WE=44147575;WS=44147557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr7	44152119	rs11377645	A	AG	2236.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=3;PP=2478;SC=TAGTGGCCGGAGCTGCAGCCC;SOR=4.875;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=52;TCR=3;TR=53;WE=44152127;WS=44152109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr7	44153082	rs67670401	G	GC	1026.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=24;PP=1064;SC=GGAGGGCGGTGCTGGGGGCGG;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=24;WE=44153090;WS=44153072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	44153115	.	G	GC	866	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=61.78;NF=20;NR=0;PP=866;QD=44.65;SC=GGAGGGCGGGGCTGGGGGCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=20;WE=44153123;WS=44153105;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,20:0.91:22
chr7	44154865	rs5883885	A	AG	4959.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=39;PP=2981;SC=TCAGCAAATCAGCCTGGGCCC;SOR=1.758;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=122;TCF=82;TCR=40;TR=116;WE=44154873;WS=44154855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr7	44157770	rs34484835	G	GC	1063.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=27;PP=1154;SC=CAGGGCCCTGGCCTTGCCAGG;SOR=5.486;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=28;WE=44157778;WS=44157760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	44180079	rs5883888	A	AG	3419.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=89;PP=2974;SC=GTCCCCCAGAAGGCCCAGGCC;SOR=5.136;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=5;TCR=95;TR=94;WE=44180087;WS=44180069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr7	44185088	rs2908274	G	A	1368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=13;PP=1132;ReadPosRankSum=-0.101;SC=AGAGCGGGGCGGGCTCACCTG;SOR=0.733;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=71;TCF=52;TCR=19;TR=52;WE=44185096;WS=44185078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,52:0.73:71
chr7	44189329	.	G	A	2854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=0.000;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=21;PP=2264;ReadPosRankSum=2.138;SC=TCAGCAGTCTGGAAGGGGCAG;SOR=0.719;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=101;TCR=28;TR=99;WE=44189337;WS=44189319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,104:0.78:134
chr7	44189692	rs35723429	C	G	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=39;PP=915;ReadPosRankSum=0.684;SC=CTCGTGGCTGCTAACATATAC;SOR=1.688;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=0;TCR=58;TR=39;WE=44189700;WS=44189682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,41:0.68:60
chr7	44259554	rs149624128	T	TG	1013.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=0;PP=849;SC=TTCCCAGGCATGGCTCTGCAC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=21;WE=44259569;WS=44259544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
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chr7	44269103	.	G	A	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=1.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.58;ReadPosRankSum=-0.141;SOR=1.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,20:0.24:84
chr7	44272314	rs5883896	G	GC	523.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=3;PP=641;SC=GGCGGCCAGGGCATGGGACAT;SOR=3.126;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=44272322;WS=44272304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	44280562	rs73095923	C	G	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=252;ReadPosRankSum=-1.195;SC=CACCCTGGGCCTAAACCTGTT;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=13;WE=44280570;WS=44280552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr7	44281475	rs2075073	T	A	1869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-6.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.819;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=61;PP=1543;ReadPosRankSum=-0.174;SC=GGGTCCCCACTTGCCAAGAGC;SOR=0.269;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=107;TCF=8;TCR=99;TR=68;WE=44281483;WS=44281465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,69:0.64:108
chr7	44281702	rs35663812	A	G	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=0;PP=1150;ReadPosRankSum=0.308;SC=AGGGGACCCAAGGGAGCTCTT;SOR=2.345;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=56;TCR=0;TR=43;WE=44281710;WS=44281692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,42:0.76:55
chr7	44282369	rs35452037	T	C	2298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.489;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=65;PP=1777;ReadPosRankSum=-1.446;SC=ATTGGGGTCCTCAGCATTCCT;SOR=1.189;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=94;TCF=11;TCR=83;TR=73;WE=44282377;WS=44282359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,76:0.79:96
chr7	44282868	rs11542228	A	G	1976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.004;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=13;PP=1473;ReadPosRankSum=-0.989;SC=AGATGTCCACAGGCTTGCCAT;SOR=1.951;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=108;TCF=85;TCR=23;TR=81;WE=44282876;WS=44282858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,83:0.75:110
chr7	44284564	rs2075069	A	G	2780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.322;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=49;PP=2160;ReadPosRankSum=0.925;SC=GCCACTGGACATGGTGATTTT;SOR=0.350;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=165;TCF=99;TCR=66;TR=114;WE=44284572;WS=44284554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,115:0.69:167
chr7	44294375	.	T	TACCATCATCACCA	759.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.40;QD=37.99;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	44294380	.	C	T	644	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MMLQ=27;MQ=56.16;NF=0;NR=20;PP=644;QD=33.9385606274;SC=CCAACTACCACCATCACCAGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=44294388;WS=44294370;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	44294389	.	G	T	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.86;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	44294400	rs115220947	T	A	107.28	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr7	44294401	rs369955871	C	T	107.28	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr7	44432167	.	G	A	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.418;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=190;ReadPosRankSum=1.257;SC=CCCACTGAGGGATGGGTGTCC;SOR=0.401;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=7;TCR=49;TR=14;WE=44432175;WS=44432157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,14:0.25:55
chr7	44442296	rs1473114	A	C	2727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=57;PP=2085;SC=CTGCTCCATGATCTGCACTGA;SOR=1.967;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=21;TCR=57;TR=78;WE=44442304;WS=44442286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr7	44444122	rs11550029	G	A	5673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.089;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=126;PP=2962;ReadPosRankSum=0.103;SC=ATGAGGACGCGCTCCCCATTT;SOR=0.614;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=282;TCF=112;TCR=170;TR=212;WE=44444130;WS=44444112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,213:0.76:282
chr7	44530193	rs307007	T	G	3827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.818;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=89;PP=2962;ReadPosRankSum=1.669;SC=GCCGCCCCTGTCTCCATGTCG;SOR=0.923;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=191;TCF=68;TCR=123;TR=135;WE=44530201;WS=44530183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,140:0.70:199
chr7	44553238	rs217434	A	G	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.139;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=451;ReadPosRankSum=0.312;SC=GAGCCGGGTTAACGTCAGGCC;SOR=1.445;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=18;WE=44553246;WS=44553228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr7	44555406	rs10264715	G	A	1752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.471;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=10;PP=1355;ReadPosRankSum=-0.159;SC=ACTCACCCACGTAGCTGAGGA;SOR=1.751;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=86;TCF=69;TCR=17;TR=63;WE=44555414;WS=44555396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,63:0.72:87
chr7	44555573	rs217428	T	G	2973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.808;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=55;PP=2269;ReadPosRankSum=0.550;SC=ACCTGGGGGGTTCAGAGCCAG;SOR=0.375;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=133;TCF=56;TCR=77;TR=99;WE=44555581;WS=44555563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,106:0.75:142
chr7	44561600	rs217421	A	G	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=807;ReadPosRankSum=-1.043;SC=AGAGGACTGGAGGGACTCAAA;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=35;WE=44561608;WS=44561590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,37:0.84:44
chr7	44561901	rs217420	A	C	1725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.981;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=51;PP=1444;ReadPosRankSum=1.166;SC=AAAGGGCTCAATCCAGCTCAC;SOR=1.800;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=82;TCF=13;TCR=69;TR=59;WE=44561909;WS=44561891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,59:0.72:82
chr7	44571657	rs55837134	G	A	2966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=49;PP=2319;ReadPosRankSum=1.094;SC=CCCTGCTCTCGTGTGGTTCGA;SOR=0.739;SbPval=0.59;Source=Platypus;TCF=76;TR=109;WE=44571665;WS=44571647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,109:0.77:141
chr7	44579180	rs2072183	G	C	7191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.889;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=150;NR=95;PP=2962;ReadPosRankSum=0.730;SC=AGGTGGAGTCGAGGGCCTGGG;SOR=0.474;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=337;TCF=213;TCR=124;TR=245;WE=44579188;WS=44579170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,254:0.73:350
chr7	44580876	rs41279633	G	T	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.474;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=1019;ReadPosRankSum=-0.284;SC=CTGGGAAGGGGTCAGCGGGGA;SOR=0.101;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=58;TCF=38;TCR=20;TR=48;WE=44580884;WS=44580866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,48:0.83:58
chr7	44580991	rs17655652	T	C	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=291;ReadPosRankSum=0.183;SC=CCAATGAGGCTGAGCCCTGCT;SOR=0.569;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=32;TCR=62;TR=28;WE=44580999;WS=44580981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,31:0.32:98
chr7	44606098	rs6656	C	T	2943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=80;PP=2351;SC=TGTGAGGGCGCACCAGGCCAC;SOR=3.306;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=95;TCF=15;TCR=80;TR=94;WE=44606106;WS=44606088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
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chr7	44612347	rs217374	G	C	7852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=156;NR=86;PP=2965;SC=CACAGCTCTGGAGGTGGACAA;SOR=1.416;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=244;TCF=157;TCR=87;TR=242;WE=44612355;WS=44612337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr7	44612454	rs217373	C	A	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=2.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=0.269;SOR=0.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,53:0.26:204
chr7	44612663	.	A	C	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.184;ClippingRankSum=0.000;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=5.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.14;ReadPosRankSum=1.196;SOR=1.565;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,18:0.22:82
chr7	44612753	rs217372	T	C	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=28;PP=865;SC=CAACACTACTTAGCAGTACTT;SOR=4.112;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=44612761;WS=44612743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	44613103	rs217371	A	G	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=468;ReadPosRankSum=1.875;SC=CCAAGAGAAAACCTCAGACAA;SOR=0.185;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=70;TCR=0;TR=22;WE=44613111;WS=44613093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,22:0.31:72
chr7	44613611	rs11308115	CG	C	6122.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=121;PP=2967;SC=GAAGTGCTGGCGGCCTAGGCT;SOR=2.556;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=15;TCR=129;TR=135;WE=44613619;WS=44613601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr7	44619302	rs217361	T	C	4132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=86;PP=2965;SC=CTGCGTGTAATTACTCAACTC;SOR=1.685;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=37;TCR=86;TR=123;WE=44619310;WS=44619292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr7	44620836	rs8580	C	A	2665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.99;NF=18;NR=60;PP=2333;SC=CGAGATGCACCCGCTACAAGG;SOR=2.419;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=18;TCR=60;TR=78;WE=44620844;WS=44620826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr7	44736236	rs144097169	CCCCA	C	861.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.572;NF=1;NR=14;PP=642;ReadPosRankSum=1.094;SC=TGACCTTGGCCCCCACCCATC;SOR=1.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=15;WE=44736247;WS=44736226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,22:0.81:27
chr7	44737679	rs17133935	A	G	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.363;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=410;ReadPosRankSum=-1.071;SC=GAACCCTGCCATCAAGAAAAA;SOR=3.003;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=23;WE=44737687;WS=44737669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr7	44737716	rs3216978	T	TAAG	1723.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.115;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=5;PP=1674;ReadPosRankSum=0.859;SC=GCTAGTTGGTTGAGGAGGAAC;SOR=1.781;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=33;WE=44737724;WS=44737706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,39:0.68:57
chr7	44737922	rs3213662	G	A	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=584;ReadPosRankSum=-0.520;SC=GGAAACCTGGGGAAGAGCAAT;SOR=1.061;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=24;WE=44737930;WS=44737912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,24:0.75:32
chr7	44746985	.	C	A	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.113;ClippingRankSum=0.000;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=0.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.44;ReadPosRankSum=1.037;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,46:0.23:198
chr7	44747514	rs61756583	C	T	4279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.102;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=94;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.477;SC=CTCCAGCCACCGGCAACAAGA;SOR=1.117;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=196;TCF=77;TCR=119;TR=150;WE=44747522;WS=44747504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,150:0.76:197
chr7	44747578	rs2070607	G	A	4130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.686;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=59;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.041;SC=CGACCTGGACGTCTTCAAGAA;SOR=0.351;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=147;TCF=60;TCR=87;TR=104;WE=44747597;WS=44747568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,106:0.71:149
chr7	44747589	rs61756584	C	T	4091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.665;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=67;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.195;SC=TCTTCAAGAACTTCTCGTAGA;SOR=0.307;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=137;TCF=44;TCR=93;TR=103;WE=44747597;WS=44747568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,104:0.75:139
chr7	44802401	rs4720479	A	C	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=2;PP=569;SC=CTGACACACAACCCCCAGCAC;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=44802409;WS=44802391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	44836314	rs6850	A	G	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=6.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.23;MQRankSum=-0.797;QD=2.88;ReadPosRankSum=-0.993;SOR=0.503;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,9:0.20:45
chr7	44839989	rs17860070	A	G	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=3.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.04;MQRankSum=-1.324;QD=10.06;ReadPosRankSum=-1.012;SOR=1.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr7	44839997	rs57466816	CT	C,CTT	365.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=13.719;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=61.23;MQRankSum=1.092;QD=14.07;ReadPosRankSum=-1.870;SOR=0.541;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:5,9,12:0.35,0.46:26
chr7	44862641	rs2012932	T	G	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=5.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.594;SOR=1.434;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,37:0.25:147
chr7	44869537	rs1297837	C	T	3944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=1;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.737;SC=CAAGGAAAAGCGCTCTGAAAT;SOR=6.853;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=128;TCF=127;TCR=1;TR=124;WE=44869545;WS=44869527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,123:0.99:124
chr7	44875043	rs41280663	C	T	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=202;ReadPosRankSum=-0.114;SC=TCTAGTTAACCGATCAAATAT;SOR=0.481;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=10;WE=44875051;WS=44875033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr7	44880684	rs138616116	CA	C	420.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=352;ReadPosRankSum=0.073;SC=AAAGGCTGAACAATGTAAGCA;SOR=0.798;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=62;TCF=11;TCR=51;TR=15;WE=44880692;WS=44880674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,18:0.25:72
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chr7	45009341	rs3735485	A	G	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.943;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=106;ReadPosRankSum=-0.298;SC=GCGGTGGTGCATGTCCAGGGT;SOR=0.116;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=9;WE=45009349;WS=45009331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr7	45009723	rs11555636	G	A	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=4.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.40;ReadPosRankSum=-0.298;SOR=1.413;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,13:0.17:75
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chr7	45016745	.	C	G	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=714;ReadPosRankSum=1.282;SC=GAGCCCATATCAGGGCCTGGC;SOR=0.422;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=29;WE=45016753;WS=45016735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,31:0.77:40
chr7	45067267	rs2289365	G	C	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=7.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.49;ReadPosRankSum=1.029;SOR=0.604;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,35:0.26:133
chr7	45103481	rs2304689	A	G	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.541;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=489;ReadPosRankSum=1.078;SC=CTCAGCTCCCATTTCTCATGG;SOR=1.077;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=136;TCF=89;TCR=47;TR=40;WE=45103489;WS=45103471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,41:0.28:148
chr7	45104131	rs11552377	G	A	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.815;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=748;ReadPosRankSum=0.120;SC=TGCGTACAACGTCAAGCTGGC;SOR=0.510;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=48;TCF=24;TCR=24;TR=35;WE=45104139;WS=45104121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,38:0.75:51
chr7	45110290	rs28407510	G	A	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.860;NF=1;NR=21;PP=474;ReadPosRankSum=1.277;SC=GCTCATGCCTGTAATCCCAGC;SOR=0.377;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=22;WE=45110298;WS=45110280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr7	45111482	rs1001349	A	T	7338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=144;PP=2965;SC=GTCAGCTGATAAGCATCCTTT;SOR=1.539;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=218;TCF=74;TCR=144;TR=218;WE=45111490;WS=45111472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr7	45112902	rs10272243	T	C	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=2;PP=697;SC=CCACCCTGCATGCCCAGTCAG;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=45112910;WS=45112892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	45113170	rs2289367	G	A	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.574;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=277;ReadPosRankSum=0.895;SC=ACATGCTGACGGTAGGCCTCC;SOR=0.205;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=66;TCF=8;TCR=58;TR=17;WE=45113178;WS=45113160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,18:0.27:67
chr7	45114089	rs2289370	C	T	1397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=45;PP=1204;ReadPosRankSum=-0.433;SC=GCACACGGACCCCTCAGTGGG;SOR=0.576;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=62;TCF=2;TCR=60;TR=47;WE=45114097;WS=45114079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,46:0.74:62
chr7	45119946	rs35199312	T	G	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=3.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=168;ReadPosRankSum=-0.571;SC=GGACACCAGATGGTGGTGAAG;SOR=0.346;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=9;WE=45119954;WS=45119936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr7	45120225	rs73109832	C	T	1178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.224;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=15;PP=849;ReadPosRankSum=-0.207;SC=GGAAAGGGGCCAGTGCTCACT;SOR=1.440;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=163;TCF=101;TCR=62;TR=48;WE=45120233;WS=45120215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,51:0.30:172
chr7	45120248	rs1132130	G	A	3875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.687;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=62;PP=2962;ReadPosRankSum=0.563;SC=CCATGATGGCGTTGACGATGT;SOR=0.237;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=193;TCF=113;TCR=80;TR=138;WE=45120256;WS=45120238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,143:0.70:204
chr7	45120453	rs10264280	C	T	6329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=89;PP=2965;SC=CCCTGCGAGGCCCTGGAGCCC;SOR=0.909;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=199;TCF=110;TCR=89;TR=198;WE=45120461;WS=45120443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr7	45122324	rs3735493	C	A	2267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.801;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=45;PP=1875;ReadPosRankSum=0.404;SC=AGACTCTGGGCAGGAGTCCAG;SOR=0.846;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=111;TCF=53;TCR=58;TR=84;WE=45122332;WS=45122314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,82:0.73:112
chr7	45122464	rs10243185	A	C	2124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.332;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=26;PP=1701;ReadPosRankSum=-1.529;SC=CAGGAGGCGCATCGGGGACCT;SOR=0.333;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=104;TCF=71;TCR=33;TR=73;WE=45122472;WS=45122454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,74:0.69:107
chr7	45122723	rs61740895	G	A	5813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.295;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=121;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.411;SC=AGTGGAATCCGCATCTTCCTG;SOR=0.883;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=287;TCF=124;TCR=163;TR=209;WE=45122731;WS=45122713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,213:0.74:289
chr7	45123937	.	T	C	373	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=13;MMLQ=24;MQ=40.18;NF=12;NR=0;PP=373;QD=33.9809343789;SC=TTGGGGCTGATGAGAGATCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=12;WE=45123945;WS=45123915;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr7	45124008	rs7777835	T	C	4228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=99;NR=27;PP=2965;SC=AGGTCCTCTTTAGCCTGCCTG;SOR=2.531;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=99;TCR=27;TR=126;WE=45124016;WS=45123998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr7	45124286	rs3735494	A	G	3887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.293;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=81;PP=2962;ReadPosRankSum=0.104;SC=TCTGGTAGCCACCTCCACCTG;SOR=0.561;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=186;TCF=73;TCR=113;TR=136;WE=45124294;WS=45124276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,144:0.73:198
chr7	45124465	rs3735495	A	T	2010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.866;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=51;PP=1521;ReadPosRankSum=0.251;SC=ACACAGTCCCATCCTGAGCCT;SOR=1.561;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=107;TCF=34;TCR=73;TR=70;WE=45124473;WS=45124455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,75:0.68:111
chr7	45125466	rs11760885	G	C	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.989;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=175;ReadPosRankSum=0.097;SC=TCCGTGGACAGAGCCTGGGAA;SOR=0.287;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=49;TCF=18;TCR=31;TR=12;WE=45125474;WS=45125456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,12:0.24:51
chr7	45125665	rs34135761	G	A	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.783;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=435;ReadPosRankSum=-0.400;SC=GCTCCCGCCGGTCCCCTCCCA;SOR=0.495;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=94;TCF=54;TCR=40;TR=29;WE=45125673;WS=45125655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,31:0.31:99
chr7	45125775	rs9791417	G	A	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.916;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=33;PP=875;ReadPosRankSum=0.507;SC=GGCCAGGCCCGGGGAGATGAA;SOR=1.365;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=49;TCF=6;TCR=43;TR=37;WE=45125783;WS=45125765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,40:0.74:54
chr7	45139892	rs4553	G	A	1772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=2;PP=1428;SC=ACCTCCGGCGGAGAGGCACGC;SOR=5.670;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=46;TCR=2;TR=48;WE=45139900;WS=45139882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr7	45139919	rs2289373	A	C	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.278;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=4;PP=1212;ReadPosRankSum=0.133;SC=TGCTGCTGGCACAAGTCACTT;SOR=2.925;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=71;TCF=61;TCR=10;TR=50;WE=45139927;WS=45139909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,54:0.71:76
chr7	45140914	rs1042984	C	T	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FS=0.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.68;ReadPosRankSum=-1.160;SOR=0.632;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:198,62:0.24:260
chr7	45142834	rs2289374	G	C	2249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=16;PP=1708;SC=GGCCCCTCCCGCCTCCACCTA;SOR=2.336;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=51;TCR=16;TR=67;WE=45142842;WS=45142824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr7	45143090	rs59494919	G	GGACAGCC	2614.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=38;PP=2719;SC=TCTCTGCCCAGCACGCTGTCC;SOR=4.029;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=51;TCF=2;TCR=49;TR=39;WE=45143101;WS=45143079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr7	45143093	.	C	G	2401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=35;PP=1107;SC=CTGCCCAGCACGCTGTCCTCC;SOR=5.018;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=36;WE=45143101;WS=45143079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	45143108	rs2119056	T	C	1172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=70;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=39;PP=927;SC=TCCTCCTGCCTGGCTCTGAGT;SOR=5.235;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=40;WE=45143116;WS=45143098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	45144403	rs2289375	C	T	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=25;PP=1039;SC=CAGTGCAGCCCCTGTGACAGC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=34;WE=45144411;WS=45144393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	45144494	rs2289376	T	C	921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=2;PP=757;SC=AGGGAACCCCTGGACCTGGAG;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=45144502;WS=45144484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	45144803	rs73109875	C	T	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=43;ReadPosRankSum=0.968;SC=ATCAGGGAAGCGCCTGTGTTG;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=5;WE=45144811;WS=45144793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr7	45148322	rs142768320	G	GC	592.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.663;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=763;ReadPosRankSum=-0.863;SC=CACAAGAGATGCAAGGCCCCT;SOR=1.343;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=57;TCR=2;TR=21;WE=45148330;WS=45148312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,22:0.34:64
chr7	45197433	rs67477213	G	A	1679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=16;PP=1320;SC=CAGCCATGGAGACTGGAGCGC;SOR=1.835;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=53;WE=45197441;WS=45197423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	45216785	rs17172483	G	T	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.733;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=406;ReadPosRankSum=-0.235;SC=CCGCTGGAACGGTCTCAGGCT;SOR=0.055;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=94;TCF=87;TCR=7;TR=26;WE=45216793;WS=45216775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,28:0.29:97
chr7	45223018	rs11982639	C	G	2872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.998;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=91;PP=2400;ReadPosRankSum=1.217;SC=GTGAGGGTCCCGGTGAGATGG;SOR=1.559;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=121;TCF=7;TCR=114;TR=96;WE=45223026;WS=45223008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,97:0.80:122
chr7	45225609	rs66534022	GGTGTATGT	G	1465.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=4;PP=2288;SC=TGCTTGTGTGGGTGTATGTGT;SOR=3.737;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=28;WE=45225624;WS=45225599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr7	45225708	rs13222185	A	G	4199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=38;PP=2965;SC=TGGAGGCAGCAATAGTGTGTG;SOR=2.082;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=104;TCR=38;TR=142;WE=45225716;WS=45225698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr7	45225788	rs11760627	C	A	1423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.12;ReadPosRankSum=0.198;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,49:0.25:200
chr7	45225822	rs11760688	G	A	1523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.431;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,47:0.24:196
chr7	45225838	rs11767359	AA	CC	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=1.508;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.45;ReadPosRankSum=0.419;SOR=0.525;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,38:0.22:170
chr7	45225854	rs11767365	A	G	1043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=1.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.69;ReadPosRankSum=-0.455;SOR=0.530;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,36:0.23:156
chr7	45225883	rs12702124	C	T	2586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=66;PP=1964;ReadPosRankSum=0.153;SC=CTACTGAATCCAGCCCTGAGA;SOR=0.813;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=29;TCR=84;TR=89;WE=45225891;WS=45225873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,95:0.80:119
chr7	45697295	rs2461131	C	G	2856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.83;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr7	45697295	.	CCT	GCC	2591	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=39;NR=12;PP=2591;QD=20;SC=CAAGGTGGGCCCTAGCCCCAC;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=51;WE=45697305;WS=45697285;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,51:0.91:56
chr7	45697297	rs2471231	T	C	2856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.28;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr7	45701762	rs61729596	C	T	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-6.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.044;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=26;PP=540;ReadPosRankSum=2.022;SC=GGAAAATGTTCAAGGCCGAGA;SOR=1.596;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=110;TCF=27;TCR=83;TR=31;WE=45701770;WS=45701752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,31:0.27:114
chr7	45703971	rs1042009	G	A	1945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=52;PP=1631;SC=GACTGTGCACGTAGCTTCAGG;SOR=3.187;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=11;TCR=52;TR=63;WE=45703979;WS=45703961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr7	45724696	rs2461106	T	C	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.247;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=28;PP=628;ReadPosRankSum=1.145;SC=TGGCATGCGCTGGGGCGGGAG;SOR=1.140;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=55;TCF=12;TCR=43;TR=34;WE=45724704;WS=45724686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,37:0.64:58
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chr7	45743403	rs2461114	G	A	3120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=86;PP=2506;SC=ATCCTGTTGCGTGGGCAGAGC;SOR=5.421;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=5;TCR=86;TR=91;WE=45743411;WS=45743393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
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chr7	45954692	rs10255707	T	C	895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=29;PP=714;SC=ACAAGAGCCATGCGTGCCTAG;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=45954700;WS=45954682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	45957172	rs55719014	TA	T	90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=62.13;NF=1;NR=3;PP=139;SC=TTTTTTTTTTTAAAATACCTC;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=4;WE=45957180;WS=45957162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	45961271	rs11765572	G	A	1694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=10;PP=1390;SC=AGCCGGTGTCGGGGAAACTGG;SOR=2.876;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=45;TCR=10;TR=55;WE=45961279;WS=45961261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	46732428	rs700747	A	G	4370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=96;NR=32;PP=2965;SC=AGGAAGCAAAACAAGCAAGTC;SOR=2.303;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=129;TCF=97;TCR=32;TR=128;WE=46732436;WS=46732418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr7	46736733	rs71003346	GA	G	548.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=625;SC=TTCAGAGGAGGAAAATGATGC;SOR=3.500;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=15;WE=46736741;WS=46736723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	46736789	rs150183242	T	TA	136.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=7;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=177;ReadPosRankSum=0.312;SC=AGCATTTTTTTAAAAAAATCA;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=8;WE=46736797;WS=46736779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr7	47242645	rs4720584	A	G	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.424;NF=10;NR=0;PP=194;ReadPosRankSum=0.064;SC=CTAAATGGTGATTTAACAATT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=10;WE=47242653;WS=47242635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr7	47317510	rs3750163	G	A	2025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=12;PP=1687;SC=TCACGGTGATGTTGTTTGTTC;SOR=2.904;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=52;TCR=12;TR=64;WE=47317518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr7	47319723	rs4720590	C	T	1833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=8;PP=1473;SC=AGTACAACTGCAGACAAGGAG;SOR=3.500;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=49;TCR=8;TR=57;WE=47319731;WS=47319713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr7	47319852	rs6971754	C	T	4080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=47;PP=2965;ReadPosRankSum=1.035;SC=ATTAAGTACACTCCTTGCTCA;SOR=0.579;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=82;TCR=47;TR=128;WE=47319860;WS=47319842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,131:0.99:132
chr7	47323456	rs3750164	A	G	3158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=65;PP=2485;SC=AGTACCACACATTGCAGGCTG;SOR=0.956;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=45;TCR=65;TR=110;WE=47323464;WS=47323446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr7	47332238	rs884824	A	G	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=470;SC=CTGTCAGTGAAGTAGAATCTC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=47332246;WS=47332228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	47336893	rs5883997	C	CT	1819.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=48;PP=2175;SC=GGTAGGTCCTCTCCCCTTACT;SOR=5.018;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=48;WE=47336901;WS=47336883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	47408029	rs2255744	A	G	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=10;PP=976;SC=CCCGGAGCCCACCTCCCACGC;SOR=2.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=42;WE=47408037;WS=47408019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr7	47408974	rs1534136	T	A	7117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=144;PP=2965;SC=GGTCCAACTCTGCCTTCTCCT;SOR=1.808;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=63;TCR=144;TR=207;WE=47408982;WS=47408964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr7	47436558	rs2177795	A	C	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=19;PP=575;SC=CCTCCATCCAACCGACTCCAC;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=47436566;WS=47436548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	47451295	rs834607	A	G	1694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=2;PP=1344;SC=TGGGGACACCAACCCATCTGC;SOR=5.960;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=58;TCF=56;TCR=2;TR=58;WE=47451303;WS=47451285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr7	47451572	rs17544073	C	T	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.636;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=288;ReadPosRankSum=-1.033;SC=GTAAAGAAAGCTCCCAGGCCA;SOR=0.046;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=14;WE=47451580;WS=47451562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr7	47463842	rs834599	T	G	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-5.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.833;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=40;PP=996;ReadPosRankSum=-0.280;SC=ACGTGGGTACTTGACGGGGGA;SOR=0.353;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=63;TCF=5;TCR=58;TR=44;WE=47463850;WS=47463832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,45:0.68:66
chr7	47467864	rs1799370	C	T	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=589;ReadPosRankSum=-0.869;SC=CCATGCAGGCCCAGCTTTTAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=23;WE=47467872;WS=47467854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr7	47479363	rs1810137	A	G	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.715;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=27;PP=611;ReadPosRankSum=-1.681;SC=GGGTGTTCACATCAGCACCTG;SOR=2.712;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=29;WE=47479371;WS=47479353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,31:0.77:40
chr7	47481602	rs11763044	G	A	1619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.556;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=38;PP=1127;ReadPosRankSum=-0.561;SC=GACACTCACCGCAGAGGTTTA;SOR=0.344;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=204;TCF=79;TCR=125;TR=71;WE=47481610;WS=47481592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,75:0.36:208
chr7	47481786	rs1620852	A	T	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.523;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=202;ReadPosRankSum=0.450;SC=TCGTAACTACAAGCCCACCTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=11;WE=47481794;WS=47481776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
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chr7	47546547	rs334497	G	A	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.767;HP=11;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=433;ReadPosRankSum=-0.713;SC=TGCAGGCTGGGAAAAAAAAAA;SOR=0.775;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=118;TCF=60;TCR=58;TR=37;WE=47546555;WS=47546534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,33:0.32:104
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chr7	47596775	rs615300	C	T	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.180;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=27;PP=779;ReadPosRankSum=0.492;SC=TCAGAACAATCCTTAAGACCA;SOR=0.199;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=56;TCF=11;TCR=45;TR=36;WE=47596783;WS=47596765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,40:0.68:59
chr7	47698685	rs12531737	A	G	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.888;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=567;ReadPosRankSum=-0.584;SC=AAGACACTGGATCTCACTGGC;SOR=0.286;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=91;TCF=35;TCR=56;TR=29;WE=47698693;WS=47698675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,30:0.33:91
chr7	47835027	rs9719534	A	G	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=258;ReadPosRankSum=0.580;SC=GAGGCCTCCCAAGTCATGTGG;SOR=0.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=12;WE=47835035;WS=47835017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr7	47840310	rs146576726	C	G	2146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.788;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=28;PP=1615;ReadPosRankSum=-1.439;SC=CCATGGCCCGCTGGTCAGACT;SOR=0.492;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=110;TCF=72;TCR=38;TR=75;WE=47840318;WS=47840300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,78:0.71:110
chr7	47840510	rs1466203	T	C	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=302;ReadPosRankSum=-1.033;SC=GCACTGACCTTGTCACCTCTT;SOR=0.122;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=18;WE=47840518;WS=47840500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr7	47847679	rs1074780	G	A	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=63;ReadPosRankSum=1.282;SC=AAGCTCTTCAGGCCCTTCACT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=47847687;WS=47847669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr7	47851654	rs73103467	A	G	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.564;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=414;ReadPosRankSum=-0.851;SC=TCAGTCCTGTAAAACAGCACA;SOR=1.140;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=6;TCR=47;TR=18;WE=47851662;WS=47851644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,21:0.36:58
chr7	47853413	rs6944477	A	G	1875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.910;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=12;PP=1542;ReadPosRankSum=0.031;SC=GACAATTCCAATTACCACTGA;SOR=1.105;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=128;TCF=101;TCR=27;TR=66;WE=47853421;WS=47853403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,67:0.52:129
chr7	47853498	rs6463449	C	T	6468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=89;NR=106;PP=2965;SC=TCCATTTATTCTTGGAAGCAA;SOR=0.898;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=89;TCR=106;TR=195;WE=47853506;WS=47853488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr7	47869038	rs7788583	T	C	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.728;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=385;ReadPosRankSum=-0.771;SC=CAACCTCGCCTGCACAGTCAG;SOR=1.736;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=83;TCF=59;TCR=24;TR=27;WE=47869046;WS=47869028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,27:0.31:86
chr7	47872845	rs921634	A	G	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.004;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=335;ReadPosRankSum=-0.092;SC=TGGCTGATGCAGGTTGCTAGA;SOR=0.552;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=25;TCR=48;TR=23;WE=47872853;WS=47872835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,22:0.31:70
chr7	47874062	rs34069037	G	A	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=2.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.185;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,19:0.20:93
chr7	47874630	rs66755489	G	A	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.457;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=712;ReadPosRankSum=0.403;SC=GGCAGACCCCGGGGCTTCCTG;SOR=0.536;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=119;TCF=63;TCR=56;TR=43;WE=47874638;WS=47874620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,47:0.36:130
chr7	47878993	rs6960394	C	T	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=0;PP=709;ReadPosRankSum=0.885;SC=AGGTGCCATGCTCTGCCGGTC;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=31;WE=47879001;WS=47878983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,32:0.65:49
chr7	47884539	rs6950328	G	A	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.332;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=498;ReadPosRankSum=-1.126;SC=CATCCTGAGTGAACAGTAAAA;SOR=0.269;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=82;TCF=68;TCR=14;TR=31;WE=47884547;WS=47884529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,31:0.38:82
chr7	47884829	rs1980279	C	A	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=532;SC=ATTCACCTGACACCTAAGTTA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=47884837;WS=47884819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	47886707	rs10280228	G	A	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=38;PP=1123;SC=TACAACCTGAGGTTTGCAGAA;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=38;WE=47886715;WS=47886697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	47898222	rs34177211	T	TG	984.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=1.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.35;ReadPosRankSum=-1.257;SOR=0.908;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,42:0.31:134
chr7	47913579	rs1470859	T	C	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.166;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=30;PP=443;ReadPosRankSum=-0.977;SC=TTGGAGCCTTTGCCATCTGTG;SOR=1.370;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=162;TCF=74;TCR=88;TR=45;WE=47913587;WS=47913569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,47:0.28:168
chr7	47921682	rs10951936	A	T	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=23;PP=1275;SC=TGGTGTCCTTAGCTAGGAAGA;SOR=0.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=29;TCR=23;TR=52;WE=47921690;WS=47921672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr7	47921785	.	T	TCG	1160.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.64;SOR=4.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	47921786	.	GCT	G	1160.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.43;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	47921798	rs12702396	C	A	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.81;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	47921824	rs12702397	C	T	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=105;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=478;SC=CTTCAGCAGCCAAACATATTC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=47921832;WS=47921814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	47924454	rs10464386	G	A	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=2;NR=31;PP=959;SC=TCATTGCCCCGGGGCCCCAGG;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=33;WE=47924462;WS=47924444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	47925331	rs10274334	C	G	2366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=19;PP=1729;SC=TCTCTCAGAGCGGCCAGTCAT;SOR=2.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=50;TCR=19;TR=69;WE=47925339;WS=47925321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr7	47943953	rs11766212	C	T	1530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=4;PP=1263;SC=AGAGAGCACTCCGCCGCCTTG;SOR=4.317;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=45;WE=47943961;WS=47943943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr7	47947863	rs1474283	T	C	896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=25;PP=625;SC=AAAATAAGAATGAACGGACAC;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=47947871;WS=47947853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	47968927	rs2686817	C	A	5092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=79;PP=2965;SC=GCCATATGAACACGGAATCCC;SOR=0.706;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=76;TCR=79;TR=155;WE=47968935;WS=47968917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr7	47971575	rs885337	A	G	3556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=15;PP=2929;SC=TCCCAGTAGCACACAGCCGCC;SOR=4.039;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=108;TCR=15;TR=123;WE=47971583;WS=47971565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr7	47976287	rs2708878	A	G	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=1;PP=1106;SC=TCAGAACACCATTCTTTTTTC;SOR=6.229;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=44;WE=47976295;WS=47976277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr7	47979922	rs2708913	A	G	2338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.654;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=81;PP=1417;ReadPosRankSum=-0.409;SC=CCTCTAGAGAAAAAAAAAAAA;SOR=0.527;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=116;TCF=28;TCR=88;TR=108;WE=47979930;WS=47979910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:8,102:0.93:110
chr7	48004962	rs1056663	C	T	3455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=73;NR=27;PP=2716;SC=GCTAGGACAGCGCAGGGATGA;SOR=2.175;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=73;TCR=27;TR=100;WE=48004970;WS=48004952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr7	48005122	rs2037483	G	A	3578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=83;PP=2694;SC=TTCCCAGCCTGCACCTCCTGT;SOR=2.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=32;TCR=83;TR=115;WE=48005130;WS=48005112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr7	48009018	rs953595	AA	GT	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=19;PP=1257;SC=GTACCCTACAAAACCTCAAAA;SOR=1.688;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=25;WE=48009027;WS=48009008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	48010978	rs2708864	T	C	1911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=2;PP=1600;SC=CATCCCCTCATATACCATCGG;SOR=5.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=54;TCR=2;TR=56;WE=48010986;WS=48010968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr7	48017965	rs2242477	C	T	2984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=82;NR=7;PP=2548;SC=TATGTCTATTCCTTCGAGGCC;SOR=4.664;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=82;TCR=7;TR=89;WE=48017973;WS=48017955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr7	48017989	rs2242478	T	C	3728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=13;PP=2965;SC=ACTTCTGTGTTAGAAACCCTG;SOR=3.892;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=97;TCR=13;TR=110;WE=48017997;WS=48017979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr7	48018455	rs2242479	T	A	2185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=53;PP=1762;SC=AAATGCACATTATGTATCCTA;SOR=3.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=8;TCR=53;TR=61;WE=48018463;WS=48018445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr7	48028512	rs3736547	G	C	2144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=33;PP=1833;SC=AGATTGTAATGAATGGATGCA;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=34;TCR=34;TR=67;WE=48028520;WS=48028502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr7	48035893	rs2708899	T	C	116.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=86;SC=AGGAAAAGTATGACAGTTTTC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=48035901;WS=48035883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	48086077	rs2708912	C	T	4076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=96;NR=29;PP=2965;SC=GTCTCCATGCCGGATTACATG;SOR=2.538;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=96;TCR=29;TR=125;WE=48086085;WS=48086067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr7	48086161	rs10233232	T	C	6810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=104;PP=2965;SC=GACTTCGACATGAAAACAGTT;SOR=0.829;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=122;TCR=104;TR=226;WE=48086169;WS=48086151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr7	48089394	rs909059	T	C	4456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=35;PP=2965;SC=AAGCTTTGTATCTTTGCTACC;SOR=2.127;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=103;TCR=35;TR=138;WE=48089402;WS=48089384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr7	48089542	rs2686788	T	C	3396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=67;PP=2657;SC=GCCCTAAGAATCCTGCAGGAA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=31;TCR=67;TR=98;WE=48089550;WS=48089532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr7	48089571	rs2708890	C	A	2696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=66;PP=2135;SC=TCCTTCCCCCCCGTGTAAGTG;SOR=2.610;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=18;TCR=66;TR=84;WE=48089579;WS=48089561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr7	48092486	rs2686791	T	C	2844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=40;PP=2362;SC=GGCTCCAGGATGCAGAGGCTT;SOR=0.901;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=52;TCR=40;TR=92;WE=48092494;WS=48092476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr7	48092847	rs2686792	C	A	598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=18;PP=513;SC=CAGATCCAAACAATGTTGACC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=48092855;WS=48092837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	48211301	rs141832114	C	T	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=54;SC=AATCAAAACCCGTCCCAAGGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=48211309;WS=48211291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr7	48237802	rs2188	C	T	1518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=5;PP=1159;ReadPosRankSum=1.234;SC=AGCAGGTATACGGACTCATTT;SOR=2.428;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=46;WE=48237810;WS=48237792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr7	48269679	rs60553397	G	C	1100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=36;PP=934;ReadPosRankSum=-1.466;SC=AAAAAAGTATGAATTGTTTCT;SOR=2.004;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=36;WE=48269687;WS=48269669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,37:0.73:51
chr7	48273869	rs7357106	T	C	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=17;PP=525;SC=GAGAGTTCGGTCAAAACCCGA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=48273877;WS=48273859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	48280454	rs62449168	G	A	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.901;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=108;ReadPosRankSum=-0.186;SC=TTTGGTTTCCGAATTTGTAGG;SOR=0.181;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=10;WE=48280462;WS=48280444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,10:0.27:37
chr7	48285664	rs1405127	A	C	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=240;ReadPosRankSum=-0.238;SC=CTAAGGGCACAAATTTAAGAT;SOR=1.765;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=11;WE=48285672;WS=48285654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
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chr7	48311563	rs17712293	T	G	1610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.065;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=31;PP=1228;ReadPosRankSum=-2.137;SC=ACAGAGGATATTCTGAATATA;SOR=0.472;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=234;TCF=142;TCR=92;TR=71;WE=48311571;WS=48311553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,74:0.31:238
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chr7	48352570	rs56322731	G	A	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=200;ReadPosRankSum=-0.741;SC=AATAAAATCAGATAAACAAGT;SOR=0.324;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=11;WE=48352578;WS=48352560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
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chr7	48467634	rs34541457	T	C	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=298;ReadPosRankSum=0.833;SC=AAAAAAAACGTTGAGTTTTAT;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=13;WE=48467642;WS=48467624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr7	48467653	rs34529024	GAA	G	271.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=120;ReadPosRankSum=-2.343;SC=ATCCTGGCTTGAAAAAAAAAA;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=9;WE=48467662;WS=48467643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr7	48506416	rs4917151	G	C	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=173;ReadPosRankSum=2.362;SC=AAAATTAGCTGTATCTCACTT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=8;WE=48506424;WS=48506406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr7	48511297	rs7810026	T	C	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.160;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=26;PP=699;ReadPosRankSum=1.361;SC=AACTGTGTCTTTATAACTTTT;SOR=2.517;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=27;WE=48511305;WS=48511287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr7	48520780	rs4472462	A	T	2571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=6.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.892;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=73;PP=2132;ReadPosRankSum=0.375;SC=TTGGGTCTTTACTTGTTTGGA;SOR=1.288;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=125;TCF=15;TCR=110;TR=82;WE=48520788;WS=48520770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,87:0.66:132
chr7	48522845	rs1918584	CA	GG	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-4.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=1169;ReadPosRankSum=-0.979;SC=GCACAGGGTTCAGAAGGACCA;SOR=0.495;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=22;WE=48522854;WS=48522835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr7	48545976	rs6583448	A	G	3376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=38;PP=2609;SC=CTTGCTGAACAAGGACAAGAT;SOR=1.490;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=72;TCR=38;TR=110;WE=48545984;WS=48545966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr7	48547481	rs76060602	C	T	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=153;ReadPosRankSum=-0.985;SC=GGAGAGCATCCGTCAGTGTGG;SOR=1.347;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=9;WE=48547489;WS=48547471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr7	48654769	rs10046546	A	G	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.976;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=61;ReadPosRankSum=-1.419;SC=GTGTAAAAAAATTAAGTAATT;SOR=0.042;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=6;WE=48654777;WS=48654759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,6:0.19:31
chr7	48886140	rs62454384	T	C	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.07;QD=28.74;SOR=4.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr7	48886383	rs146940015	G	T	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.64;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr7	48886648	rs71537796	G	A	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.05;QD=32.52;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	48886746	rs4320498	C	T	2393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.47;QD=32.35;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr7	48886783	rs62454386	G	A	3274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.34;QD=30.61;SOR=1.008;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr7	48887548	rs4404869	G	C	2143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=61;PP=1674;SC=CGTCGTCCTGGGGGTCCCAGC;SOR=2.895;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=13;TCR=61;TR=74;WE=48887556;WS=48887538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
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chr7	48964255	rs6968293	A	C	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.528;HP=3;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;ReadPosRankSum=-0.204;SC=TTGACCTCGCAGGGTGTGAAG;SOR=0.154;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=12;WE=48964263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
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chr7	48965000	rs10259692	G	A	1617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.45;MQRankSum=-0.280;QD=12.54;ReadPosRankSum=0.549;SOR=0.664;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,59:0.46:129
chr7	48965178	.	A	G	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.462;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=4.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.33;MQRankSum=-0.407;QD=13.82;ReadPosRankSum=-1.027;SOR=0.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr7	49815390	rs769604	C	G	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.404;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=226;ReadPosRankSum=1.640;SC=ACCCCGCAGGCGGAAGCCCTG;SOR=0.190;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=17;WE=49815398;WS=49815380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,17:0.27:63
chr7	49951519	.	G	GCACA	233	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=24;MQ=60.98;NF=9;NR=0;PP=233;QD=26.3333333333;SC=ACAAATACACGCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=9;WE=49951527;WS=49951509;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,9:0.41:22
chr7	49951544	rs7792519	T	C	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.55;MQRankSum=1.986;NF=20;NR=0;PP=375;ReadPosRankSum=1.447;SC=CACACACACATATATATACTG;SOR=0.297;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=20;WE=49951552;WS=49951534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr7	50023122	rs988392	C	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=59;ReadPosRankSum=-0.869;SC=TAGCCTAAAACATAAATACAA;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=50023130;WS=50023112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr7	50070921	rs1351691	C	G	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.82;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr7	50144059	rs3034461	T	TTA	875.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.669;NF=0;NR=20;PP=859;ReadPosRankSum=-2.191;SC=TTTCATTGTATTATATATATA;SOR=0.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=20;WE=50144067;WS=50144049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr7	50156916	rs6959792	C	G	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.920;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=15;PP=1027;ReadPosRankSum=0.515;SC=AGTAGCTAAGCCATATTTTAA;SOR=0.582;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=84;TCF=60;TCR=24;TR=49;WE=50156924;WS=50156906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,49:0.58:84
chr7	50169508	rs1456900	G	A	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.262;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=245;ReadPosRankSum=-1.492;SC=GACATCAAACGCAGACATTTA;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=12;WE=50169516;WS=50169498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr7	50175654	rs12718244	G	A	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=673;ReadPosRankSum=0.442;SC=AAATTATAACGTGCTCATTAA;SOR=0.425;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=51;TCF=24;TCR=27;TR=35;WE=50175662;WS=50175644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,36:0.68:53
chr7	50179609	rs1993445	C	T	91.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=63;ReadPosRankSum=1.282;SC=AAATCACAAACCTTTAAAGGA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=50179617;WS=50179603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr7	50180972	rs1456908	C	T	2575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.427;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=58;PP=1999;ReadPosRankSum=0.404;SC=CCTCTTTATACAAACACAAGT;SOR=0.569;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=139;TCF=50;TCR=89;TR=93;WE=50180980;WS=50180962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,97:0.66:146
chr7	50198626	rs4917120	T	C	3917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=47;PP=2965;SC=CTCCTTTTTTTCCCATCCTGC;SOR=1.225;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=74;TCR=47;TR=121;WE=50198634;WS=50198616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr7	50435617	rs11766800	A	T	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=3.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=133;ReadPosRankSum=1.255;SC=GTTCTTTTTTAAAAAAAAGTA;SOR=0.752;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=8;WE=50435625;WS=50435607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr7	50435777	rs12669559	T	G	1421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=21;PP=1064;ReadPosRankSum=-1.630;SC=AGTATATGCCTTGCTTCTGGA;SOR=0.528;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=80;TCF=52;TCR=28;TR=57;WE=50435785;WS=50435767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,59:0.72:82
chr7	50436033	rs10899750	A	G	2108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=46;PP=1653;SC=GTTACTTCGCAGATGCTGCTG;SOR=1.576;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=21;TCR=46;TR=67;WE=50436041;WS=50436023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr7	50450446	rs113962761	C	T	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=124;ReadPosRankSum=1.156;SC=CTGGGTGTCCCGGGATTCCTC;SOR=0.368;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=8;WE=50450454;WS=50450436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr7	50512857	rs10230307	C	T	275.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=237;SC=AAGTACAGAACTTAGAATATA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=50512865;WS=50512847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	50512929	rs10230343	C	A	1907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=4;PP=1593;SC=GAAGACTGTACTACAGAGATG;SOR=4.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=57;TCF=53;TCR=4;TR=57;WE=50512937;WS=50512919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr7	50537677	rs11378977	C	CA	719.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQRankSum=-0.021;QD=16.74;ReadPosRankSum=-0.493;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,34:0.79:43
chr7	50537983	rs3757472	A	C	2445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=71;PP=2095;SC=CTGGTGGCCAACCTGCTCCCA;SOR=8.554;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=0;TCR=71;TR=71;WE=50537991;WS=50537973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr7	50544269	rs5884156	AG	A	1959.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=7;PP=2101;SC=GCTGTGGCGTAGCCCCCCAGC;SOR=3.486;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=47;WE=50544277;WS=50544259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	50545191	rs4992502	C	A	1659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=7;PP=1407;SC=CCATAGCAGGCCCTGACCATG;SOR=3.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=45;TCR=7;TR=52;WE=50545199;WS=50545181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr7	50547584	rs11575457	A	C	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=18;PP=600;SC=AACAAATGAAAGGGCTGATAA;SOR=1.284;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=28;WE=50547592;WS=50547574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	50547661	rs11575456	AGCCCT	A	278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=237;SC=ACCTGCTCCCAGCCCTGCCCT;SOR=2.584;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=5;WE=50547673;WS=50547651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr7	50566671	rs3807562	G	A	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=360;ReadPosRankSum=-0.723;SC=AGGACAGGCTGTATGGCTGGG;SOR=2.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=16;WE=50566679;WS=50566661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr7	50566762	rs2876829	C	T	2016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=23;PP=1562;SC=TAGCAAGAGACTGGACGTCAG;SOR=1.376;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=41;TCR=23;TR=64;WE=50566770;WS=50566752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr7	50571779	rs11575375	G	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.797;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=282;ReadPosRankSum=1.526;SC=AAAGCAGACAGCCTTTTATTC;SOR=1.445;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=56;TCF=6;TCR=50;TR=18;WE=50571787;WS=50571769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,18:0.31:58
chr7	50611735	rs6264	T	C	2925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=58;PP=2249;SC=TAGTTGGCCATGTAATCCACC;SOR=1.202;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=37;TCR=58;TR=95;WE=50611743;WS=50611725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr7	50671481	rs7456867	C	G	731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=562;SC=TACAGATACACTCTGGGCAGA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=50671489;WS=50671474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	50672907	rs4947709	T	C	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=0;PP=679;SC=CGCATAGAGCTGTTCCTCTGG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=50672915;WS=50672898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	50673029	rs4947710	T	C	4003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=51;PP=2965;SC=TCTGGGCCTCTGCCGGATTCT;SOR=1.284;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=133;TCF=82;TCR=51;TR=132;WE=50673037;WS=50673019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr7	50683850	.	C	G	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.129;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=2;PP=537;ReadPosRankSum=1.594;SC=CTCTGAGGACCTGGGGGGAGT;SOR=0.392;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=28;WE=50683858;WS=50683840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,28:0.70:40
chr7	50685602	rs11770199	T	G	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=137;ReadPosRankSum=-1.301;SC=TTTTAATTTCTGGTTACTCTA;SOR=0.223;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=9;WE=50685610;WS=50685592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr7	50685625	rs2240498	A	C,T	1211.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=14,20;NR=1,0;PP=330,464;SC=CCCTCCCCCCAACCACCCCTC;SOR=5.943;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=15,20;WE=50685633;WS=50685615;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.44,0.56:39
chr7	50694457	rs1468450	A	G	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=1;PP=726;SC=TGGCAGCAGCAGTCTTCATTC;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=33;WE=50694465;WS=50694453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	50737384	rs2072235	C	T	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=262;ReadPosRankSum=0.348;SC=TCTGGCATATCCCTCAGCCTG;SOR=0.518;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=14;WE=50737392;WS=50737374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr7	50742118	rs2715128	A	G	399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=336;SC=CTCTGCCCATAAGGCCTGGAC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=50742126;WS=50742108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	50742180	rs1800504	C	T	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=352;ReadPosRankSum=0.117;SC=CCCTCTGCCTCGGGGACACCT;SOR=0.416;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=15;WE=50742188;WS=50742170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr7	50778697	rs77396015	G	A	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=312;ReadPosRankSum=1.160;SC=CCTGGAGAACGGCACAGAAGG;SOR=0.551;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=17;WE=50778705;WS=50778687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,18:0.33:54
chr7	50799889	rs2074777	C	T	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=3.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.082;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=491;ReadPosRankSum=1.607;SC=AGAAACGATCCATGGCTGCTG;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=20;WE=50799897;WS=50799879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr7	50800100	.	GA	G	648.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=6.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.572;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.521;SOR=1.897;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,37:0.65:57
chr7	50800169	rs2108350	T	C	1227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=35;PP=1039;SC=CAGCTCTTGGTCTTAGCTTGT;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=37;WE=50800177;WS=50800159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	51085127	rs3214180	A	AT	2643.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=36;PP=2485;SC=AACTGTGCGCATTTGGCCTGT;SOR=0.908;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=62;WE=51085135;WS=51085117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr7	51093013	rs2240087	A	T	875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=5;PP=740;SC=CCGAGCCCTGAGCAGAGAGTG;SOR=2.753;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=27;WE=51093021;WS=51093003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	51096036	rs2240089	G	C	1398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.905;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=37;PP=1090;ReadPosRankSum=1.413;SC=GTGTCTCTGAGTGTGGGCTGG;SOR=0.861;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=189;TCF=80;TCR=109;TR=62;WE=51096044;WS=51096026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,63:0.32:198
chr7	51096974	rs2240090	C	T	3383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=58;PP=2687;SC=CCTTTTCCGACGTCATGGGAA;SOR=0.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=47;TCR=58;TR=105;WE=51096982;WS=51096964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr7	51097063	rs10230120	T	G	2941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=42;PP=2389;SC=CGCCAGGGAGTCTCTCCTGCT;SOR=0.906;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=48;TCR=42;TR=90;WE=51097071;WS=51097053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr7	51097216	rs17656599	G	A	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.929;NF=17;NR=24;PP=894;ReadPosRankSum=-1.483;SC=GGCATCCTGTGGGCAGTGGTT;SOR=0.782;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=87;TCF=37;TCR=50;TR=41;WE=51097224;WS=51097206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,42:0.45:93
chr7	51153024	rs59837144	GT	G	1519.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=4.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=0.742;QD=14.07;ReadPosRankSum=-0.223;SOR=1.288;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,42:0.39:108
chr7	51153027	.	CAATCAAAGTACTTTGTACCTATGAAGTACAAAGA	C	1487.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.963;ClippingRankSum=0.000;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=0.783;QD=12.83;ReadPosRankSum=-0.275;SOR=1.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,42:0.36:116
chr7	51153056	.	CAAAGA	C	2033	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=56.78;NF=0;NR=13;PP=2033;QD=160.540649949;SC=CTATGAAGTACAAAGAAGGCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=2;TCR=51;TR=13;WE=51153069;WS=51153014;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:40,13:0.25:53
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chr7	53104078	rs72598686	G	A	3056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.332;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=54;PP=2445;ReadPosRankSum=-1.505;SC=CTCTGAAGCCGAGCCTCGGCC;SOR=0.381;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=192;TCF=87;TCR=105;TR=108;WE=53104086;WS=53104068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,111:0.57:195
chr7	54610293	rs513529	A	G	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=200;ReadPosRankSum=-0.498;SC=AGCCCTCGCCAAGCAAGCAGC;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=12;WE=54610301;WS=54610283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr7	54614510	rs140369297	G	GCCCCTGGTCGCTCCCCTGT	906.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=33.58;ReadPosRankSum=0.709;SOR=0.287;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
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chr7	54614585	rs657449	A	G	2151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=1.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.95;ReadPosRankSum=-0.930;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,54:0.70:77
chr7	54614698	rs11432820	C	CG	881.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=1.626;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.496;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,42:0.28:151
chr7	54618010	rs2293343	C	T	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=296;ReadPosRankSum=-0.754;SC=AGGTGAGCACCGAGCCTGCAC;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=0;TCR=63;TR=19;WE=54618018;WS=54618000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,19:0.31:62
chr7	54621526	rs662136	T	C	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.083;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=10;PP=808;ReadPosRankSum=-0.337;SC=ATATACTAAGTCATTCTCTAC;SOR=0.294;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=162;TCF=138;TCR=24;TR=49;WE=54621534;WS=54621516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,50:0.30:166
chr7	54621692	rs68106607	G	A	3060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=6.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.256;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=90;PP=2431;ReadPosRankSum=-0.022;SC=ACTGTGAAGCGGCTTCCTGCT;SOR=1.512;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=175;TCF=29;TCR=146;TR=103;WE=54621700;WS=54621682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,109:0.59:186
chr7	54823677	rs3834332	TC	T	480.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=514;ReadPosRankSum=-0.717;SC=TATACATTTCTCCTGTTAATA;SOR=1.101;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=15;WE=54823685;WS=54823667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr7	54825019	rs2256906	C	T	122.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=112;SC=AAAATTTAGACGAGTAAAAAA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=54825027;WS=54825010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	54826830	rs2699226	G	C	4222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=45;PP=2965;SC=CGCCCGTACCGACCGGTGGGA;SOR=1.523;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=90;TCR=45;TR=134;WE=54826838;WS=54826820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr7	54826928	rs2709289	C	T	1615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.381;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=40;PP=1284;ReadPosRankSum=-1.830;SC=AACCGGAATCCGGGTTTCTGC;SOR=0.496;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=189;TCF=88;TCR=101;TR=75;WE=54826936;WS=54826918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,75:0.40:187
chr7	55002836	rs35747839	G	GA	239.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=1.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQRankSum=-6.514;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.210;SOR=1.130;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,10:0.18:57
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chr7	55086780	rs712830	A	C	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=3;PP=204;SC=TGAGCGCCCGACGCGGCCGAG;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=55086788;WS=55086770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	55214348	rs2072454	C	T	1599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.405;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=30;PP=1179;ReadPosRankSum=-0.855;SC=CCCTGTGCAACGTGGAGAGCA;SOR=0.493;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=196;TCF=123;TCR=73;TR=74;WE=55214356;WS=55214338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,75:0.38:200
chr7	55218903	rs2075109	T	C	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.543;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=234;ReadPosRankSum=-0.047;SC=ATTTATTGAATGTGCTTAACT;SOR=1.536;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=16;WE=55218911;WS=55218893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,20:0.31:65
chr7	55220177	rs11506105	A	G	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.666;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=16;PP=685;ReadPosRankSum=-0.710;SC=GCTCTGCGACATCCCTGGGAA;SOR=0.814;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=151;TCF=99;TCR=52;TR=50;WE=55220185;WS=55220167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,52:0.34:153
chr7	55221655	rs4947986	G	A	2020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.494;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=5;PP=1518;ReadPosRankSum=1.232;SC=CGTGTGTGGCGCTGAGTGTAC;SOR=0.419;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=111;TCF=104;TCR=7;TR=70;WE=55221663;WS=55221645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,74:0.64:116
chr7	55228053	rs1558544	A	T	1697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=52;PP=1508;SC=CTTTCTGTTTAGTTTATGGAG;SOR=7.903;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=0;TCR=52;TR=52;WE=55228061;WS=55228043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	55229255	rs2227983	G	A	4534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=113;NR=24;PP=2965;SC=CCGGAGCCCAGGGACTGCGTC;SOR=2.883;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=113;TCR=24;TR=137;WE=55229263;WS=55229245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr7	55233863	rs9649769	A	C	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=537;SC=AAAACAAAAAAAAAAGCTACT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=55233871;WS=55233853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	55238268	rs10228436	G	A	1132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=33;PP=920;SC=TGTTCCCCCCGCTTTTCCTTT;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=35;WE=55238276;WS=55238258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	55238874	rs2227984	T	A	3485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=78;NR=26;PP=2763;SC=ACAGATGCACTGGGCCAGGTC;SOR=2.115;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=78;TCR=26;TR=104;WE=55238882;WS=55238864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr7	55240461	rs2241055	G	C	2533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=4;PP=2045;SC=ATGAGGAAAAGTGTGCCTGGT;SOR=5.421;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=71;TCR=4;TR=75;WE=55240469;WS=55240451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr7	55242609	rs2017000	A	G	2749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=80;PP=2294;SC=GACCCTGCTCATCTCCACATC;SOR=7.500;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=82;TCF=1;TCR=81;TR=81;WE=55242617;WS=55242599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr7	55249063	rs1050171	G	A	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.664;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=527;ReadPosRankSum=1.162;SC=CCACCGTGCAGCTCATCACGC;SOR=0.415;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=130;TCF=80;TCR=50;TR=36;WE=55249071;WS=55249053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,37:0.27:136
chr7	55266417	rs1140475	T	C	4561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=79;PP=2965;SC=CAGGGGTGACTGTTTGGGAGT;SOR=0.719;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=158;TCF=79;TCR=79;TR=158;WE=55266425;WS=55266407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr7	55272826	rs2692456	G	A	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=0;PP=574;SC=GGGCCCTCCCGAGGCTCCTGC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=55272834;WS=55272816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	55433880	rs2272262	G	C	4361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.51;SOR=3.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr7	55433884	rs2272263	A	C	4269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.94;SOR=3.755;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr7	55466002	rs6973684	T	C	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=720;ReadPosRankSum=-0.861;SC=GTGTTACCCGTTTGGAAACAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=26;WE=55466010;WS=55465992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr7	55467923	rs2272226	G	C	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=20;PP=644;SC=CTCATCAAAAGTAAGAAATAG;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=55467931;WS=55467913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	55468773	rs815929	C	A	933.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=0;PP=796;SC=GCCTCTCTCTCTATATATGTC;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=29;WE=55468781;WS=55468763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	55499058	rs815988	A	G	907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=26;PP=778;SC=ACCAAAAGCCACCAGATTGCT;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=55499066;WS=55499048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	55540791	rs712819	G	C	3408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=81;PP=2664;SC=CCATCACACCGCAAGTATGTG;SOR=2.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=22;TCR=81;TR=103;WE=55540799;WS=55540781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr7	55750390	rs11238374	A	G	3268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.25;QD=32.69;SOR=2.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr7	55774755	rs112151645	A	G	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.596;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.555;NF=17;NR=0;PP=355;ReadPosRankSum=0.763;SC=GAAAATGCCAACTATAAATCA;SOR=2.189;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=44;TCR=3;TR=17;WE=55774763;WS=55774751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr7	55779220	rs12536949	A	G	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.082;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-5.031;NF=0;NR=14;PP=259;ReadPosRankSum=-0.159;SC=TAATGAGAAAAGGAAAAAGTT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=14;WE=55779228;WS=55779210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,8:0.20:41
chr7	55780176	rs10267547	T	C	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=2.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.00;MQRankSum=-7.132;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.522;SOR=1.130;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,17:0.16:104
chr7	55832429	rs146909187	G	GT	1420.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.88;MQRankSum=-1.923;QD=28.41;ReadPosRankSum=0.856;SOR=1.196;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,48:0.96:50
chr7	55832442	rs200220642	G	T	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=41.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.04;MQRankSum=0.364;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.812;SOR=5.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,24:0.39:61
chr7	55832447	rs199589581	C	T	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=39.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.37;MQRankSum=0.449;QD=7.09;ReadPosRankSum=-3.210;SOR=5.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,22:0.34:64
chr7	55991144	rs2135116	A	G	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.744;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=143;ReadPosRankSum=0.354;SC=TTCTCCTCCAATGGAATGTCT;SOR=1.284;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=9;WE=55991152;WS=55991134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr7	55991292	rs2174460	G	A	1779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.23;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr7	55991292	.	GT	AC,AT	915	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=6,37;NR=5,15;PP=59,915;QD=10.2243522602;SC=TGTTACTCCTGTGAATAGGGT;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=11,52;WE=55991301;WS=55991282;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.21:52
chr7	55991293	rs2174459	T	C	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=8.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.71;ReadPosRankSum=0.566;SOR=0.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,12:0.21:56
chr7	56007576	rs34016595	C	T	1825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.532;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=23;PP=1263;ReadPosRankSum=-0.210;SC=GTAATGAATGCGGGAAAGCCT;SOR=0.755;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=265;TCF=193;TCR=72;TR=81;WE=56007584;WS=56007566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,85:0.31:274
chr7	56022544	rs59849749	T	C	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=2;PP=1008;ReadPosRankSum=-0.182;SC=ATATTACATATTACATTACCA;SOR=1.051;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=61;TCR=3;TR=43;WE=56022552;WS=56022534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,46:0.68:68
chr7	56022981	rs15892	T	C	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=33;PP=1018;SC=CTGTGGTGTTTATGAAATAGC;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=56022989;WS=56022971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
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chr7	56051672	rs150298305	T	TTATATGTATA	125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=584;ReadPosRankSum=-0.524;SC=ATGTCTAGCATTATATGTATA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=2;WE=56051680;WS=56051662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr7	56052410	.	CA	C	54	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=0.9923;HP=18;HapScore=3;MGOF=9;MMLQ=25;MQ=59.42;NF=5;NR=0;PP=54;QD=11.4;SC=GATTCTGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=56052419;WS=56052400;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,5:0.45:11
chr7	56059591	rs10435504	G	C	2622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=57;PP=1884;ReadPosRankSum=-0.870;SC=AGTATGTTTTGTTTGCCTACC;SOR=0.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=56;TCR=86;TR=95;WE=56059599;WS=56059581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,101:0.67:150
chr7	56082992	rs4255091	C	G	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=495;ReadPosRankSum=0.417;SC=GGTAAAGTCACACAGCCTGGA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=20;WE=56083000;WS=56082982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr7	56084856	rs71015158	C	CA	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.402;NF=9;NR=0;PP=315;ReadPosRankSum=-0.275;SC=AGTTGCATTCCAAAGACATTA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=9;WE=56084864;WS=56084850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr7	56085117	.	GA	AA	778	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000,0.5000;HP=20;HapScore=3;MGOF=8;MMLQ=16;MQ=49.79;NF=0,1;NR=47,11;PP=778,418;QD=17.2930045223;SC=TAATACAAAAGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=110;TCF=42;TCR=68;TR=47,12;WE=56085126;WS=56085099;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:63,47:0.43:110
chr7	56085117	.	GA	GAA	778	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000,0.5000;HP=20;HapScore=3;MGOF=8;MMLQ=16;MQ=49.79;NF=0,1;NR=47,11;PP=778,418;QD=17.2930045223;SC=TAATACAAAAGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=110;TCF=42;TCR=68;TR=47,12;WE=56085126;WS=56085099;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:90,12:0.12:102
chr7	56087530	rs7791829	C	G	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=25;ReadPosRankSum=1.909;SC=AAGGAAGATGCTACCAAGAGC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=3;WE=56087538;WS=56087520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr7	56119730	rs3735665	T	A	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.779;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=37;PP=839;ReadPosRankSum=-0.117;SC=GCCGCCGCGCTCCTGGCGGGC;SOR=1.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=7;TCR=49;TR=42;WE=56119738;WS=56119720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,42:0.76:55
chr7	56122058	rs6593297	A	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.179;NF=6;NR=1;PP=114;ReadPosRankSum=-0.522;SC=TTTTCTACTTACAGCAAATTC;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=7;WE=56122066;WS=56122050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr7	56123578	.	C	G	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.584;NF=0;NR=4;PP=46;ReadPosRankSum=-0.077;SC=TTACCAATTTCAATTACAAGG;SOR=0.141;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=4;WE=56123586;WS=56123568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr7	56126360	rs2230197	T	C	2921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.567;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=56;PP=2224;ReadPosRankSum=2.312;SC=AAGGCATAGTTGCTCTGCGCA;SOR=0.673;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=173;TCF=87;TCR=86;TR=115;WE=56126368;WS=56126350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,116:0.64:182
chr7	56132122	rs3813505	C	T	1665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.159;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=44;PP=1279;ReadPosRankSum=-1.390;SC=GGATGGGGCGCTCCGCCCTGA;SOR=0.450;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=88;TCF=26;TCR=62;TR=64;WE=56132130;WS=56132112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,65:0.73:89
chr7	56136260	rs4245575	C	A	3613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=63;PP=2892;SC=GAGATGGTGACGGGCCTGTGC;SOR=0.874;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=53;TCR=63;TR=116;WE=56136268;WS=56136250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr7	56142519	rs4948104	A	G	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.394;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=48;PP=1136;ReadPosRankSum=0.204;SC=GGCTGGGCGCAGTGGCTTATG;SOR=2.194;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=66;TCF=2;TCR=64;TR=49;WE=56142527;WS=56142509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,48:0.74:65
chr7	56147589	rs10800	A	G	2401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=56;PP=1915;ReadPosRankSum=1.192;SC=CACACAAACAATTGGAACAGA;SOR=0.675;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=50;TCR=87;TR=89;WE=56147597;WS=56147579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,89:0.64:140
chr7	56151489	rs2242508	A	G	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=6.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.01;ReadPosRankSum=1.296;SOR=1.397;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,24:0.22:109
chr7	56151526	rs2242509	G	A	1595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.460;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=45;PP=1136;ReadPosRankSum=1.641;SC=GCCACTCTCCGTGGAGAACCA;SOR=1.252;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=81;TCF=22;TCR=59;TR=60;WE=56151534;WS=56151516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,62:0.76:82
chr7	56155219	rs6945795	C	T	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=0;PP=921;ReadPosRankSum=-1.187;SC=TGGGGCCACACTCCCTGGCTT;SOR=2.348;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=50;TCR=0;TR=39;WE=56155227;WS=56155209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,39:0.76:51
chr7	56174115	rs10043	A	C	3209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=75;NR=30;PP=2405;SC=ATCCTAGGTAAGCGACGGCTA;SOR=1.791;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=75;TCR=30;TR=105;WE=56174123;WS=56174105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr7	56174140	rs816407	G	T	3967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.335;NF=77;NR=49;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.622;SC=TCCGGACGTGGGACAACCACC;SOR=0.442;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=78;TCR=49;TR=126;WE=56174148;WS=56174130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,130:0.99:131
chr7	57069935	rs1966122	G	C	294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=365;SC=GGGCGGTGGGGGGAGCTCCTT;SOR=5.136;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=57069943;WS=57069925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	57071494	rs28449491	G	T	45.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.67;QD=22.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr7	57071539	.	C	T	102.74	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.37;MQRankSum=-0.319;QD=25.69;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr7	57071540	rs28370313	A	G	102.74	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.37;MQRankSum=-0.319;QD=25.69;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr7	57071725	rs62463099	C	T	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=4;NR=12;PP=489;SC=ACGGGGGCTGCGGCGCCGGGG;SOR=2.400;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=57071733;WS=57071715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
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chr7	57188718	rs62464802	T	C	5846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=90;PP=2965;SC=GTGCACCTCATATTCACCCAC;SOR=0.725;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=176;TCF=86;TCR=90;TR=176;WE=57188726;WS=57188708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
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chr7	63981563	rs10243954	A	G	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.790;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=10;PP=800;ReadPosRankSum=-0.733;SC=AATTATTGTCACATTTTTCAG;SOR=1.567;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=74;TCF=52;TCR=22;TR=43;WE=63981571;WS=63981553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,48:0.62:78
chr7	63986829	rs73128772	G	C	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=519;ReadPosRankSum=-1.239;SC=CATCTTTAGGGAGGCCAAGGC;SOR=0.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=22;WE=63986837;WS=63986819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,24:0.77:31
chr7	64023371	rs6969879	T	C	2674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.281;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=62;PP=2128;ReadPosRankSum=0.839;SC=GATAACGGAGTCACAGAGGCT;SOR=0.927;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=145;TCF=50;TCR=95;TR=92;WE=64023379;WS=64023361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,96:0.65:147
chr7	64023437	rs6965883	A	G	1823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.942;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.691;NF=14;NR=49;PP=1416;ReadPosRankSum=-0.426;SC=GAGCTCCCGCAGCAGCTAGAG;SOR=0.964;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=97;TCF=24;TCR=73;TR=63;WE=64023445;WS=64023427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,67:0.66:101
chr7	64166642	rs35661712	T	TG	1082.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.838;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=0;PP=1127;ReadPosRankSum=-0.159;SC=AGATTAGATTTTAAAGTACAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=30;WE=64166650;WS=64166637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,31:0.70:44
chr7	64166802	rs73138709	G	T	1567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.776;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.710;NF=40;NR=28;PP=1125;ReadPosRankSum=0.995;SC=GTGAATATGAGAATTTACAGT;SOR=0.857;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=212;TCF=119;TCR=93;TR=68;WE=64166810;WS=64166792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,72:0.33:219
chr7	64169019	rs4717205	G	A	2978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.293;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=43;PP=1648;ReadPosRankSum=0.420;SC=ACAAATGTGAGTATGGCAAAA;SOR=0.832;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=123;TCF=58;TCR=65;TR=77;WE=64169027;WS=64169009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,84:0.65:130
chr7	64169061	rs4717206	G	A	2793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=47;PP=1376;ReadPosRankSum=-0.403;SC=ACTACACATAGGAAAATTCAT;SOR=0.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=34;TCR=70;TR=70;WE=64169069;WS=64169051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,77:0.69:111
chr7	64275284	rs7809431	C	T	3901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=32;PP=2965;SC=TTTGTGTGTGCGTGTTTTTCA;SOR=1.990;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=117;TCF=85;TCR=32;TR=116;WE=64275292;WS=64275275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr7	64275548	rs10236928	A	G	2971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=84;PP=2532;SC=CTGTTTTCAAAAGAATCTTTG;SOR=8.909;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=84;TCF=0;TCR=84;TR=84;WE=64275556;WS=64275538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr7	64276089	rs9654821	A	G	6561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=137;PP=2965;SC=CAAGGAGAAGACCACTCCTTT;SOR=1.655;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=200;TCF=62;TCR=138;TR=199;WE=64276097;WS=64276079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr7	64291225	rs6460193	G	T	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=3;PP=771;SC=GGATGTGTCAGGTCTGAAATT;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=64291233;WS=64291215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	64291267	rs6460194	A	T	1611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=10;PP=1312;SC=TTCTTGTTTCATCTTAATAGT;SOR=2.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=46;WE=64291275;WS=64291257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr7	64291333	rs4483043	T	A	3237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=38;PP=2517;SC=GCATTTACCTTTGATCTCAGT;SOR=1.336;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=65;TCR=38;TR=103;WE=64291341;WS=64291323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr7	64291863	rs183912002	A	G	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=1.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.90;ReadPosRankSum=-1.944;SOR=0.944;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,17:0.24:70
chr7	64291976	rs10949946	G	A	3645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=67;PP=2731;SC=GAGTGTAAGGGACACCAAGGA;SOR=1.377;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=38;TCR=67;TR=105;WE=64291984;WS=64291966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr7	64291991	rs4236203	T	A	3265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=66;PP=2324;SC=CAAGGAGGTTTTAATGGACTT;SOR=1.654;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=33;TCR=66;TR=99;WE=64291999;WS=64291981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr7	64389089	rs2017252	A	C	2588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=43;PP=2107;SC=ACAAATGTGAAGAATGTGGCA;SOR=0.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=40;TCR=43;TR=83;WE=64389097;WS=64389079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr7	64437406	rs4607487	A	G	4360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=75;PP=2965;SC=GTTTGAGGATAAGTTAAAAGC;SOR=1.102;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=55;TCR=76;TR=130;WE=64437414;WS=64437396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr7	64438403	rs4718175	G	A	2060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=19;PP=1668;SC=TGTTTAGTAAGGGTTGAGAAA;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=41;TCR=19;TR=60;WE=64438411;WS=64438393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr7	64438492	rs78721492	G	T	2095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=26;PP=1766;ReadPosRankSum=-0.919;SC=AATGAGTTTTGAGGATCAGGT;SOR=0.769;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=73;TCR=40;TR=73;WE=64438500;WS=64438482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,74:0.64:115
chr7	64438667	rs1404453	G	A	5892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=97;NR=75;PP=2965;SC=GTTGAAGATCGGTTAAAGGCT;SOR=0.997;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=172;TCF=97;TCR=75;TR=172;WE=64438675;WS=64438657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr7	64439938	rs1852016	C	T	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=29;PP=879;SC=AAGTAACAAACTACTTCACTT;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=64439946;WS=64439928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	64441632	rs74364613	A	AT	4001.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=111;NR=1;PP=2974;SC=TGAGAGAAAAATAAAAAAAAA;SOR=8.069;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=117;TCF=116;TCR=1;TR=112;WE=64441640;WS=64441622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr7	64451699	rs4717229	T	C	6839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=138;PP=2965;SC=GTTAGTAAGGTTGAACTTTCC;SOR=1.743;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=206;TCF=68;TCR=138;TR=206;WE=64451707;WS=64451689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr7	64451963	rs4618579	T	C	3605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=64;PP=2779;SC=AGGCCATTCATTGTCCTTCCA;SOR=1.209;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=42;TCR=64;TR=106;WE=64451971;WS=64451953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr7	64452738	rs67047829	G	A	4077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=55;PP=2965;SC=CCGCTGACTCGTGCCCCTAGC;SOR=0.916;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=68;TCR=55;TR=123;WE=64452746;WS=64452728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr7	64452830	rs34639489	C	T	5227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=64;PP=2965;SC=GCTTGTTTTACAATCTGGTTC;SOR=1.186;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=100;TCR=64;TR=164;WE=64452838;WS=64452820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr7	64453136	rs6460219	G	A	3504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=60;PP=2838;SC=TTCAAACCAGGTCCCAGGTGA;SOR=0.865;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=50;TCR=60;TR=110;WE=64453144;WS=64453126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr7	64535312	rs71533998	C	T	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=27.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	64639752	rs201003787	A	T	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.02;MQRankSum=-0.379;QD=1.70;ReadPosRankSum=1.371;SOR=0.379;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,13:0.15:85
chr7	64639915	rs368760026	AC	A	908.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.86;QD=41.31;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	64639926	rs80126668	C	G	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=37.20;MQRankSum=-1.470;QD=33.57;ReadPosRankSum=2.775;SOR=3.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,22:0.85:26
chr7	64864894	rs7796776	C	T	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.523;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=-0.874;SC=ATGGTTGTCACGCTTGATTGT;SOR=0.061;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=6;WE=64864902;WS=64864884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr7	65084152	rs6978207	C	T	1652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=53;PP=1493;SC=TCTATATGGACAATGATGAAT;SOR=7.864;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=53;WE=65084160;WS=65084142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr7	65159983	rs147104756	A	G	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=13.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.17;MQRankSum=-3.906;QD=16.99;ReadPosRankSum=-0.186;SOR=4.332;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr7	65220463	rs4718275	T	C	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.326;NF=19;NR=0;PP=413;ReadPosRankSum=0.167;SC=AATGCTACCATCTGTGAGTTG;SOR=1.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=19;WE=65220471;WS=65220453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr7	65220697	rs4718276	G	A	1732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.033;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.104;NF=36;NR=42;PP=1471;ReadPosRankSum=0.102;SC=TCCAAGAATTGTCTGAACTTT;SOR=0.383;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=111;TCF=48;TCR=63;TR=78;WE=65220705;WS=65220687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,67:0.67:100
chr7	65419353	.	T	TTTA	507.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=0.000;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=2.053;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.405;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr7	65425894	rs9530	A	G	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.150;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=290;ReadPosRankSum=-0.044;SC=TCAAGTAAACAGGCTGTTTTC;SOR=0.967;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=83;TCF=67;TCR=16;TR=24;WE=65425902;WS=65425884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,23:0.28:83
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chr7	65440854	.	G	A	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.880;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=26.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.63;MQRankSum=-5.784;QD=1.67;ReadPosRankSum=-1.601;SOR=4.903;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,16:0.29:56
chr7	65444359	rs139791587	T	TGA	203.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=161;ReadPosRankSum=-0.254;SC=TGGGCCCCGCTGAGAGGATCC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=5;WE=65444367;WS=65444349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr7	65541185	rs1183245	C	T	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.180;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=30;PP=888;ReadPosRankSum=1.786;SC=CTCCAGGAAGCAATTTTGAAA;SOR=1.175;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=80;TCF=24;TCR=56;TR=41;WE=65541193;WS=65541175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,46:0.53:86
chr7	65541307	rs1144895	C	G	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=152;ReadPosRankSum=2.464;SC=GGCAAACCCACCAACCCACAC;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=8;WE=65541315;WS=65541297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr7	65551931	rs313830	T	C	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=28;PP=921;SC=AGCGGGGGACTCTGCATGGAG;SOR=2.899;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=65551939;WS=65551921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr7	65552497	rs313829	A	G	1789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=47;PP=1610;SC=TTCATTGCCTATGGGCACTGA;SOR=3.098;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=57;TCF=9;TCR=48;TR=56;WE=65552505;WS=65552487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	65552614	rs313828	T	C	1081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=4;PP=936;SC=CCCCCAGCTGTTGCCCCACCC;SOR=3.126;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=33;WE=65552622;WS=65552604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	65554352	rs160647	C	T	1515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=35;PP=1311;SC=CTGGCTAGTACGTGCCAGTTC;SOR=2.560;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=45;WE=65554360;WS=65554342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr7	65554385	rs2460432	C	T	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.126;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=364;ReadPosRankSum=-2.595;SC=CACACTCAGGCAGGGCCCCAC;SOR=0.287;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=18;WE=65554393;WS=65554375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr7	65556936	rs1167406	G	C	1492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.134;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=5;PP=1078;ReadPosRankSum=0.418;SC=TCCTGGGCCTGGCAGCTTCAG;SOR=2.093;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=80;TCF=69;TCR=11;TR=48;WE=65556944;WS=65556926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,52:0.60:86
chr7	65579987	rs160639	C	G	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.46;ReadPosRankSum=-1.103;SOR=0.856;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,11:0.23:47
chr7	65599446	rs6958484	G	A	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=32;ReadPosRankSum=-0.652;SC=ATTGATATTCGGCTGGGTTTG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=65599454;WS=65599436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr7	65841981	rs6974355	A	G	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.99;ReadPosRankSum=0.024;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,5:0.14:37
chr7	65842128	rs11769079	G	A	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.55;ReadPosRankSum=-0.158;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr7	65842221	rs11765965	A	G	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=95;ReadPosRankSum=1.452;SC=GGGCCGCCGGAAAGCCGAAGG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=5;WE=65842229;WS=65842211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr7	65842543	rs112115083	C	CAT	1277.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.98;ReadPosRankSum=-1.841;SOR=0.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,39:0.30:128
chr7	65842545	rs3815685	T	C	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.13;ReadPosRankSum=-1.822;SOR=0.600;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,38:0.30:127
chr7	66094008	rs35526611	C	T	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=6.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.02;ReadPosRankSum=-0.896;SOR=0.083;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr7	66098482	rs3764903	G	A	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.948;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=630;ReadPosRankSum=-1.188;SC=GGTGATTAGCGTAGGCTTGAG;SOR=1.274;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=30;WE=66098490;WS=66098472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr7	66136372	rs148855688	G	GACC	1121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.142;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.484;NF=15;NR=7;PP=1020;ReadPosRankSum=0.560;SC=CATCTGTGTGGAGAGGAATAA;SOR=1.011;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=60;TCF=38;TCR=22;TR=22;WE=66136380;WS=66136362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
chr7	66136549	rs2707832	G	A	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.115;NF=1;NR=11;PP=190;ReadPosRankSum=0.624;SC=GACTGATATAGTGTTGTTCTC;SOR=0.641;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=12;WE=66136557;WS=66136539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr7	66147057	rs1882655	T	C	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.862;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=353;ReadPosRankSum=1.488;SC=CCGGAAGTGATGTTTGCGCGC;SOR=0.654;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=22;WE=66147065;WS=66147047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,24:0.83:29
chr7	66147101	rs2420827	G	A	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.41;ReadPosRankSum=-1.215;SOR=0.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr7	66147110	rs3800823	C	A	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.57;ReadPosRankSum=-1.389;SOR=0.573;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr7	66147149	rs3800822	A	G	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=344;ReadPosRankSum=1.757;SC=GGACTGGGGAACCCAGACCTG;SOR=0.671;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=25;TCF=13;TCR=12;TR=17;WE=66147157;WS=66147139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr7	66147178	rs3800820	C	T	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=317;ReadPosRankSum=-0.745;SC=CGTGGGCGAGCGGTGACCTGG;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=17;WE=66147186;WS=66147168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr7	66147656	rs2003301	G	C	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=33;PP=1031;ReadPosRankSum=-1.262;SC=AACGCGCCGGGATGGGACGCT;SOR=0.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=76;TCF=22;TCR=54;TR=46;WE=66147664;WS=66147646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,56:0.63:89
chr7	66147697	rs5884599	A	AG	1835.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.74;QD=33.38;SOR=3.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr7	66147746	rs2003300	C	G	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.053;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.883;NF=3;NR=26;PP=653;ReadPosRankSum=1.056;SC=AGAAGCGTCCCGGAGTTGGGA;SOR=1.455;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=29;WE=66147754;WS=66147736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,31:0.70:44
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chr7	66762050	rs10245535	A	T	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.482;NF=15;NR=11;PP=381;ReadPosRankSum=-1.038;SC=TAAAGTAAGGACTAAGATACC;SOR=0.608;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=99;TCF=51;TCR=48;TR=26;WE=66762058;WS=66762040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,19:0.25:76
chr7	66773745	rs7791853	G	T	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.304;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.971;NF=3;NR=9;PP=196;ReadPosRankSum=0.281;SC=TTAGAAGGTGGAGTTCAGTCT;SOR=1.352;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=12;WE=66773753;WS=66773735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr7	66774157	rs2041575	T	C	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=114;ReadPosRankSum=-0.818;SC=CGGACATTCTTCTGGGGATTT;SOR=0.418;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=8;WE=66774165;WS=66774147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr7	66774604	rs1045513	G	C	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.306;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.569;NF=26;NR=15;PP=752;ReadPosRankSum=-0.814;SC=GAGTCTGCACGAAGATATCAA;SOR=1.314;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=107;TCF=60;TCR=47;TR=41;WE=66774612;WS=66774594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,42:0.39:108
chr7	66785029	rs2537522	G	T	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.714;NF=13;NR=0;PP=191;ReadPosRankSum=1.097;SC=CGGGTTCTTAGAATAGCAATG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=13;WE=66785037;WS=66785019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,10:0.23:43
chr7	66785137	rs9443	C	A	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=4.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.31;MQRankSum=-1.386;QD=4.70;ReadPosRankSum=0.668;SOR=1.145;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,35:0.26:137
chr7	70193932	rs4718987	T	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=109;ReadPosRankSum=-1.803;SC=ATGTCTCCTCTCCTCCCAGTT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=70193940;WS=70193930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr7	70194024	rs4718988	G	A	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=568;ReadPosRankSum=-0.825;SC=TAGCAGCCTGGGAGGAGCCAC;SOR=0.752;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=27;WE=70194032;WS=70194014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr7	70229595	rs1983487	T	G	213.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=1;PP=170;SC=GAAAGTGTGCTCGTACAGGGA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=70229603;WS=70229585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	70231070	rs2293509	C	T	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.597;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=8;PP=818;ReadPosRankSum=-0.372;SC=AAGGAAAAGGCGTCATCGTCT;SOR=0.399;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=77;TCF=65;TCR=12;TR=46;WE=70231078;WS=70231060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,50:0.60:83
chr7	70233139	rs3750170	G	A	3037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.994;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=74;PP=2223;ReadPosRankSum=0.618;SC=ATGACTAGCAGCCTTCCTTAA;SOR=1.055;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=167;TCF=59;TCR=108;TR=109;WE=70233147;WS=70233129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,114:0.66:172
chr7	70249707	.	G	C	228	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=11;NR=0;PP=228;QD=23.8882920497;SC=GAGAAAGAGGGATGATTGATT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=11;WE=70249715;WS=70249706;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,11:0.55:20
chr7	70249760	rs9886311	C	A	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.14;MQRankSum=2.776;QD=11.56;ReadPosRankSum=0.389;SOR=1.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr7	70249868	rs3817575	G	A	1796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.355;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=39;PP=1462;ReadPosRankSum=0.057;SC=AGTAGAAGCCGGTTGCATCTT;SOR=1.050;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=116;TCF=51;TCR=65;TR=65;WE=70249876;WS=70249858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,67:0.55:121
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chr7	70598059	rs2903458	A	G	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=242;ReadPosRankSum=-0.659;SC=CCGGGGCTCGACGCGGGCGGG;SOR=0.830;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=13;WE=70598067;WS=70598049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr7	70772565	rs55690472	A	G	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=148;SC=GCAATCGAGGAAGACTTCCTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=70772573;WS=70772555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	70800407	rs13240200	T	G	970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=0;PP=801;SC=CTGAGTTGGATAAATTGAGGA;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=70800415;WS=70800397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	70853118	rs77859267	C	T	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.907;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=131;ReadPosRankSum=0.472;SC=CGCCTTGGGACGACTGGATGA;SOR=0.165;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=10;WE=70853126;WS=70853108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr7	70885883	rs11455717	C	CT	3118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.750;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.729;NF=71;NR=10;PP=2970;ReadPosRankSum=1.830;SC=GTCTATTTCTCTATGTTTCAG;SOR=0.354;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=129;TCF=115;TCR=14;TR=81;WE=70885891;WS=70885873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,96:0.66:145
chr7	70886107	rs11455716	G	GC	2084.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=56;PP=2344;SC=TGGCTGGTGAGCCTGGCGGCC;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=0;TCR=61;TR=56;WE=70886115;WS=70886097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr7	71036473	rs10277319	C	T	2299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=60;PP=1831;SC=ATTTAAAGCTCCTTACAGCTG;SOR=3.943;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=7;TCR=60;TR=67;WE=71036481;WS=71036463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr7	71571436	rs10950296	G	C	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.42;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	72040764	rs141509781	A	T	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=3.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.052;NF=1;NR=25;PP=615;ReadPosRankSum=1.587;SC=AAAAAAATGAATGTTTTTAAA;SOR=0.420;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=26;WE=72040772;WS=72040754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr7	72093957	rs28535321	A	G	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.56;MQRankSum=-1.377;QD=27.84;ReadPosRankSum=0.374;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr7	72178848	rs138896426	A	G	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.492;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.859;NF=7;NR=46;PP=1213;ReadPosRankSum=-1.060;SC=TATAGAGCAAATTCATTTTTG;SOR=0.358;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=77;TCF=8;TCR=69;TR=53;WE=72178856;WS=72178838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,48:0.66:73
chr7	72193864	rs3015858	T	C	1667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=2.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQRankSum=-3.334;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.567;SOR=0.900;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,49:0.29:168
chr7	72193868	rs2960999	G	A	1658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=2.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQRankSum=-3.592;QD=9.76;ReadPosRankSum=0.230;SOR=0.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,49:0.29:170
chr7	72209527	rs11354897	CA	C	1933.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.86;MQRankSum=-1.913;QD=7.89;ReadPosRankSum=0.275;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:172,73:0.30:245
chr7	72267637	rs200906243	C	CT	74.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=0.042;QD=2.67;ReadPosRankSum=-0.127;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr7	72277630	rs67852668	C	A	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.587;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=8;PP=743;ReadPosRankSum=1.146;SC=GGGGGAAAGCCTCAAGAGATG;SOR=1.374;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=131;TCF=100;TCR=31;TR=42;WE=72277638;WS=72277620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,43:0.31:137
chr7	72277981	rs2286317	T	C	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.712;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.339;NF=16;NR=34;PP=744;ReadPosRankSum=-1.523;SC=GCTAAAAGCATGGTTCTCTAA;SOR=0.446;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=132;TCF=39;TCR=93;TR=50;WE=72277989;WS=72277971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,40:0.33:123
chr7	72280978	rs11281952	G	GTGTGTT	668.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=3.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQRankSum=1.744;QD=10.96;ReadPosRankSum=-2.270;SOR=0.139;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,17:0.28:61
chr7	72281355	rs35534997	C	T	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.356;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.221;NF=0;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=-0.147;SC=GAACAAAGGGCACCTTCATAA;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=72281363;WS=72281345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr7	72297549	rs73131518	G	A	2398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.657;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.114;NF=32;NR=60;PP=1789;ReadPosRankSum=1.939;SC=GAGGTCCCATGTATCCGCAGA;SOR=0.787;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=51;TCR=96;TR=92;WE=72297557;WS=72297539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,94:0.64:148
chr7	72304470	rs5884895	GT	G	759.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.217;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.109;NF=7;NR=13;PP=731;ReadPosRankSum=-0.073;SC=ACTGATCAAGGTCATAGAAAG;SOR=0.425;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=20;WE=72304478;WS=72304460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr7	72395886	.	CGCGCCCCTTGTCCTCCTTCGTTCGGAAGGCGCGTCATCG	C	122.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.20;MQRankSum=-2.823;QD=12.27;ReadPosRankSum=-0.108;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr7	72413443	rs62463429	G	A	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.742;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.990;NF=46;NR=3;PP=1034;ReadPosRankSum=-0.567;SC=CCCCCAGCCCGCATTTGGGGC;SOR=0.160;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=103;TCF=98;TCR=5;TR=49;WE=72413451;WS=72413433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,47:0.47:101
chr7	72413581	rs71554687	G	A	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=32.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.89;MQRankSum=-12.234;QD=2.94;ReadPosRankSum=-0.406;SOR=2.837;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:192,43:0.18:235
chr7	72413593	rs71554688	T	C	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=13.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.90;MQRankSum=-12.914;QD=2.55;ReadPosRankSum=3.348;SOR=1.951;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:178,35:0.16:213
chr7	72413874	.	T	C	125	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=40.65;NF=7;NR=2;PP=125;QD=17.7523569497;SC=TTGGGATCAATGTGGCCACCC;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=9;WE=72413882;WS=72413864;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:21,9:0.30:30
chr7	72416333	rs237934	C	G	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=9;PP=230;SC=TCTGAGGCCCCGTGAAGATCA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=72416341;WS=72416323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr7	72861849	rs2237279	T	C	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=174;ReadPosRankSum=-0.147;SC=GGAGGGAACCTGAATGTAAGC;SOR=0.446;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=12;WE=72861857;WS=72861839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr7	72891754	rs2074754	C	T	2930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.685;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=66;PP=2308;ReadPosRankSum=0.147;SC=AGGGGATTTCCGACAGCTTCA;SOR=1.073;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=167;TCF=66;TCR=101;TR=102;WE=72891762;WS=72891744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,106:0.61:173
chr7	72985148	rs35607697	C	T	2798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.316;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=47;PP=2228;ReadPosRankSum=-0.584;SC=AAGGCCAAGACCTGGGCGTTG;SOR=0.565;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=81;TCR=71;TR=98;WE=72985156;WS=72985138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,102:0.65:157
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chr7	73096993	rs8891	T	C	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.658;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=361;ReadPosRankSum=0.548;SC=AGACTATCAATGGCCAAGGGT;SOR=1.336;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=64;TCR=2;TR=20;WE=73097001;WS=73096983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,23:0.34:67
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chr7	73118033	rs35459363	G	A	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.022;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=306;ReadPosRankSum=-0.407;SC=GGTCATGGACGTAGGGAACAT;SOR=0.922;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=66;TCF=38;TCR=28;TR=20;WE=73118041;WS=73118023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,20:0.29:68
chr7	73118398	rs7807316	T	C	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=0;PP=506;SC=GCAGCAGCCTTGAGCCACGCA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=73118406;WS=73118388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	73122923	rs2228607	A	G	3427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=103;NR=17;PP=2650;SC=ACTCACTCTCATCGGGGTTGG;SOR=3.370;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=104;TCR=17;TR=120;WE=73122931;WS=73122913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
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chr7	73151195	rs3215356	AG	A	597.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.229;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=695;ReadPosRankSum=1.660;SC=CTCCCCTGGTAGGGTCCCCAG;SOR=0.067;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=20;WE=73151203;WS=73151185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr7	73151644	rs6460052	A	G	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.337;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=20;PP=680;ReadPosRankSum=-0.818;SC=TGGCTGCCACATAGGTTGCAA;SOR=0.846;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=163;TCF=90;TCR=73;TR=49;WE=73151652;WS=73151634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,50:0.30:168
chr7	73152578	rs367606949	AC	A	209.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.109;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=163;ReadPosRankSum=-0.455;SC=GAGAAGCGGGACCCCCCCTGC;SOR=0.396;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=10;WE=73152586;WS=73152568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr7	73153228	rs3812318	G	T	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=49;ReadPosRankSum=-0.622;SC=CTTGAGCCCCGCCCTCTCCCC;SOR=0.665;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=6;WE=73153236;WS=73153218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr7	73243786	rs4717822	T	G	2715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=64;PP=2095;SC=CCCAGCATGGTTGGGAAGAGA;SOR=3.153;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=13;TCR=64;TR=77;WE=73243794;WS=73243776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr7	73245519	rs8629	T	C	2888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=47;NR=50;PP=2188;SC=TCAACTCCCGTGGACGCTGAA;SOR=0.775;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=47;TCR=50;TR=97;WE=73245527;WS=73245509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr7	73249165	rs13246460	T	A	5139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=104;PP=2965;SC=GGATACCACCTCCAGCTCGGA;SOR=1.475;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=162;TCF=56;TCR=106;TR=160;WE=73249173;WS=73249155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr7	73249299	rs13232463	G	C	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=32;PP=980;SC=AAGGTTGGACGAGTTGGTCCT;SOR=3.556;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=36;WE=73249307;WS=73249289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr7	73254459	rs199796446	GTGT	G	170.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.83;MQRankSum=3.065;QD=4.38;ReadPosRankSum=-2.463;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,10:0.26:39
chr7	73254464	rs73140869	G	T	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.81;MQRankSum=-2.484;QD=16.56;ReadPosRankSum=2.956;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr7	73254812	rs13241921	T	C	2649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=62;PP=1991;ReadPosRankSum=-0.841;SC=GCCGGGGGCCTGGGCCTGTTC;SOR=0.622;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=98;TCF=35;TCR=63;TR=97;WE=73254820;WS=73254802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,98:0.99:99
chr7	73254910	rs13242043	T	A	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=27;PP=752;SC=TCAGTCATGGTTCACACCTGC;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=73254918;WS=73254900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	73255647	rs4717823	G	C	1776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=52;PP=1359;SC=AAGCCTGGCTGGGGCTAGCGT;SOR=2.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=13;TCR=52;TR=65;WE=73255655;WS=73255637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr7	73275396	rs4324825	G	A	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=85;ReadPosRankSum=1.364;SC=GCAGTGGAGCGGCAGGAGCCA;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=6;WE=73275404;WS=73275386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr7	73275501	rs11770024	T	C	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=20;PP=834;SC=TTCTCCCAGCTGGAGTAGGTG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=38;WE=73275509;WS=73275491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	73275565	rs11770052	T	A	1471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=24;PP=1068;SC=CTTTTGGGGATCCTGTTGCAG;SOR=0.733;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=22;TCR=24;TR=46;WE=73275573;WS=73275555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr7	73275769	rs11767129	C	T	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=8;PP=379;SC=AACTACAGTGCTGACATTTTC;SOR=0.976;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=14;WE=73275777;WS=73275759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	73279233	rs10675041	C	CA	549.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.10;MQRankSum=0.497;QD=16.66;ReadPosRankSum=-1.197;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,30:0.91:33
chr7	73279482	rs13227841	T	C	3261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=75;PP=2620;ReadPosRankSum=-0.806;SC=CCAGGCTCTCTGGGCTGGGCT;SOR=0.807;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=109;TCF=33;TCR=76;TR=108;WE=73279490;WS=73279472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,111:0.99:112
chr7	73280020	rs1136647	C	T	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.07;ReadPosRankSum=-0.727;SOR=0.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,39:0.27:144
chr7	73457255	rs28763981	G	A	2179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=10;PP=1761;SC=ATGCAGCCCCGGGCCCTTCTG;SOR=3.360;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=55;TCR=10;TR=65;WE=73457263;WS=73457245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr7	73467650	.	C	CTG	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=-0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=1.068;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.712;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr7	73472050	rs28763986	C	T	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=206;ReadPosRankSum=-0.326;SC=ACCCCCGCCACTGGCTCACGG;SOR=0.976;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=11;WE=73472058;WS=73472040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr7	73474825	rs17855988	G	C	2402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=38;PP=1855;SC=TCCTGGCTTCGGGGCAGGTGC;SOR=0.742;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=41;TCR=38;TR=79;WE=73474833;WS=73474815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr7	73513242	rs34911416	CA	C	342.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQRankSum=-0.821;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.749;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,27:0.84:32
chr7	73530046	rs149618	A	G	1227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=3;PP=924;SC=GGCTGTCTACAGGTTGGCTTG;SOR=3.767;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=40;WE=73530054;WS=73530036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr7	73631177	rs144269935	C	G	1663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.842;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=18;PP=1285;ReadPosRankSum=-2.012;SC=CAGAGAAAATCTACCAGCAGA;SOR=0.881;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=92;TCF=61;TCR=31;TR=57;WE=73631185;WS=73631167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,60:0.63:95
chr7	73646626	.	TAAAAAC	T	1204.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.820;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.837;NF=2;NR=28;PP=1287;ReadPosRankSum=0.557;SC=AAAATAAAAATAAAAACAGAA;SOR=1.511;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=30;WE=73646639;WS=73646616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,32:0.74:43
chr7	73731906	rs148561130	C	T	1236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.529;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=10;PP=888;ReadPosRankSum=0.665;SC=TGAAGCCCCCCGGCCGTGGGG;SOR=0.873;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=161;TCF=122;TCR=39;TR=51;WE=73731914;WS=73731896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,55:0.33:169
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chr7	73803303	rs7790414	C	T	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.287;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=354;ReadPosRankSum=-1.140;SC=ACCGTCAAAACTATGCAGTGG;SOR=1.609;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=16;WE=73803311;WS=73803293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
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chr7	73932683	rs61438591	T	C	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=31;PP=651;ReadPosRankSum=0.752;SC=GGGGCTGGGCTGGGGCTGGGC;SOR=0.654;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=67;TCF=16;TCR=51;TR=40;WE=73932691;WS=73932673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,49:0.64:77
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chr7	73944185	rs2240357	T	C	4538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=73;PP=2965;SC=CCTGCACTTATGGAGTCCCCA;SOR=0.785;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=82;TCR=73;TR=155;WE=73944193;WS=73944175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
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chr7	73950398	rs73135382	G	C	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=316;ReadPosRankSum=0.264;SC=CCCTATCCCCGGGATTCCCCC;SOR=0.664;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=80;TCF=70;TCR=10;TR=23;WE=73950406;WS=73950388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,24:0.29:82
chr7	73950636	rs2074667	G	A	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=47;PP=1380;SC=CCGGAGGCCCGCGGCCAGCCC;SOR=4.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=50;WE=73950644;WS=73950626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr7	73959331	rs2074665	A	G	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=590;SC=AGAACCAGGAAGTTCCTGGTC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=73959339;WS=73959321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	73969418	rs56140607	T	C	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.744;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=24;PP=967;ReadPosRankSum=1.040;SC=TGCAGGGCTGTGTAGACTGAG;SOR=0.492;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=87;TCF=50;TCR=37;TR=54;WE=73969426;WS=73969408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,58:0.62:94
chr7	73969541	rs2301895	A	G	1664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=1343;ReadPosRankSum=-0.754;SC=AGAGCCCATCATGGATAGTCA;SOR=0.252;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=57;TCF=27;TCR=30;TR=56;WE=73969549;WS=73969531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
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chr7	74016623	rs80354921	A	G	3197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.326;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=37;PP=2415;ReadPosRankSum=1.507;SC=CCAAAAGCAGAACTAAGCATT;SOR=0.373;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=169;TCF=118;TCR=51;TR=111;WE=74016631;WS=74016613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,118:0.68:174
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chr7	74193668	rs17295741	G	A	487.31	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=2.935;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.36;MQRankSum=-0.831;QD=25.65;ReadPosRankSum=0.685;SOR=0.191;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,17:0.89:19
chr7	74197598	.	T	A	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=35.78;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr7	74212194	.	C	G	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.72;MQRankSum=0.982;QD=6.82;ReadPosRankSum=-1.525;SOR=0.192;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,16:0.31:52
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chr7	75028240	rs116984258	T	C	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=2.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.57;MQRankSum=-2.603;QD=2.84;ReadPosRankSum=1.664;SOR=0.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,4:0.15:26
chr7	75028241	rs117463977	G	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=2.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.57;MQRankSum=-2.603;QD=2.84;ReadPosRankSum=1.549;SOR=0.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,4:0.15:26
chr7	75044385	rs236649	C	T	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.74;QD=32.03;SOR=3.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	75068514	rs182220897	C	G	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.875;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.045;NF=9;NR=31;PP=734;ReadPosRankSum=-0.517;SC=TGCGACAAATCAAAAAAGTCT;SOR=1.487;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=143;TCF=49;TCR=94;TR=40;WE=75068522;WS=75068504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,39:0.27:144
chr7	75071460	.	G	C	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.402;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.04;MQRankSum=0.296;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.350;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr7	75115226	rs55838432	G	A	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.48;QD=31.67;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	75145136	rs142522525	C	A	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=5.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.88;MQRankSum=-0.687;QD=18.90;ReadPosRankSum=-1.323;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,34:0.65:52
chr7	75168764	rs3757603	G	T	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FS=4.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.59;ReadPosRankSum=-2.152;SOR=1.087;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,61:0.24:256
chr7	75168788	rs3757602	G	T	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=6.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.71;ReadPosRankSum=-0.825;SOR=1.365;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:160,44:0.22:204
chr7	75171427	rs11762702	C	G	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.636;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=128;ReadPosRankSum=-0.158;SC=ATGAAAGTAACTGAGGGGGCC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=75171446;WS=75171417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
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chr7	75176196	rs1167800	G	A	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.41;ReadPosRankSum=0.382;SOR=0.036;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,7:0.15:48
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chr7	75510561	rs7807392	G	A	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=223;ReadPosRankSum=2.063;SC=GTTTACCTGTGAGATCGGATA;SOR=0.387;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=11;WE=75510569;WS=75510551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
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chr7	75511667	rs77273947	C	T	1168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.586;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.754;NF=6;NR=34;PP=828;ReadPosRankSum=-0.511;SC=TTTTTCGAAACAGAGTCTCTG;SOR=1.706;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=67;TCF=13;TCR=54;TR=40;WE=75511675;WS=75511657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,44:0.62:71
chr7	75513062	rs42183	A	G	5342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=65;PP=2965;SC=AGCGAGTGGCACTGAAGCTCG;SOR=1.450;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=181;TCF=116;TCR=65;TR=181;WE=75513070;WS=75513052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr7	75513216	rs4728517	T	A	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQRankSum=-0.281;QD=20.09;ReadPosRankSum=-0.217;SOR=2.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,41:0.73:56
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chr7	75597545	rs10954724	C	T	293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=259;SC=TTCCTCCTGGCGGGGACCTGC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=75597553;WS=75597535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr7	75609677	rs1135612	A	G	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.446;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=17;PP=748;ReadPosRankSum=-0.408;SC=GCAGCCTGCCAGAGATCGACA;SOR=0.521;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=153;TCF=107;TCR=46;TR=53;WE=75609685;WS=75609667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,55:0.35:159
chr7	75610763	rs2286819	G	A	1952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.717;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=12;PP=1648;ReadPosRankSum=-1.316;SC=GGGTCGGGGCGTGCCTGGCAC;SOR=3.021;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=68;TCF=55;TCR=13;TR=66;WE=75610771;WS=75610753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,63:0.97:65
chr7	75612770	rs13223707	C	G	2449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=1;PP=1550;SC=CAACCAGAAGCGTCCTTGGAG;SOR=6.593;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=51;TCR=1;TR=52;WE=75612791;WS=75612760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	75612783	rs13240147	G	A	2775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=2;PP=1835;SC=CCTTGGAGACGGAGACTCAGA;SOR=6.154;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=65;TCF=63;TCR=2;TR=65;WE=75612791;WS=75612760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr7	75613998	rs4732514	C	T	2016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=3;PP=1771;SC=CACCTGTTGCCGCAGAGCTGG;SOR=5.318;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=60;TCF=57;TCR=3;TR=60;WE=75614006;WS=75613988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr7	75614029	rs4732515	T	C	3030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=5;PP=2634;SC=CACCCCCTCCTGCCGCAGCCA;SOR=5.353;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=92;TCF=87;TCR=5;TR=92;WE=75614037;WS=75614019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr7	75614082	rs4732516	C	G	5816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=133;NR=39;PP=2965;SC=TCCTGCCTGTCTCTTCCCTGC;SOR=2.544;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=172;TCF=133;TCR=39;TR=172;WE=75614090;WS=75614072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr7	75614288	rs2286822	C	T	2498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=0.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.68;ReadPosRankSum=-0.203;SOR=0.755;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,71:0.36:197
chr7	75614296	rs2286823	G	A	2457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.589;SOR=0.673;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,70:0.35:199
chr7	75614863	rs2302431	TG	CT	1992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=12;PP=1927;SC=AGGGCCTCGGTGTGGCGGTGG;SOR=1.714;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=41;WE=75614872;WS=75614853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr7	75614953	rs2228104	T	C	2441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=29;PP=1814;SC=AGACCAAGGCTGGCCGCATCA;SOR=1.310;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=49;TCR=29;TR=77;WE=75614961;WS=75614943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr7	75615287	rs1057870	G	A	1552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=1275;ReadPosRankSum=-1.118;SC=GCCGCCGCTCGGATGAGGACT;SOR=0.690;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=47;TCR=33;TR=59;WE=75615295;WS=75615277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,60:0.74:81
chr7	75616778	rs11767816	AC	TA	2113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.332;NF=30;NR=18;PP=2144;ReadPosRankSum=-1.566;SC=TACTCAGAAGACCCAGTCCCT;SOR=0.720;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=114;TCF=67;TCR=47;TR=48;WE=75616787;WS=75616768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,56:0.47:118
chr7	75616817	rs201142190	GGACA	G	5703.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=52;PP=2979;SC=CGCAGAGGACGGACAGACAGA;SOR=1.005;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=114;TCF=56;TCR=58;TR=105;WE=75616828;WS=75616807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr7	75621661	rs2286826	G	C	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=13;PP=468;SC=AGGGCAAACAGGGCCCAGAGA;SOR=1.292;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=19;WE=75621669;WS=75621651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	75621827	rs4732519	A	G	994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=21;PP=736;SC=CAATTGTTCTAAAGTTTGGTC;SOR=1.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=32;WE=75621835;WS=75621817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	75621979	rs6467956	T	C	256.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=211;SC=CTGGGAGGGTTTCGCTCAGCG;SOR=2.833;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=75621987;WS=75621969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	75628457	.	A	AAAAT	924	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=58.65;NF=16;NR=2;PP=924;QD=52.1111111111;SC=CTCCGTCTCAAAAAAAAATAA;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=18;WE=75628469;WS=75628447;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr7	75628460	.	A	AT	1171.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.847;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQRankSum=-0.814;QD=27.90;ReadPosRankSum=0.530;SOR=0.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,31:0.74:42
chr7	75628461	rs4728538	A	T,AAAT	1804.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=37;NR=4;PP=1136;SC=GTCTCAAAAAAAAATAAATAA;SOR=3.056;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=41;WE=75628469;WS=75628447;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.26,0.74:42
chr7	75629778	rs3801472	T	C	3323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=55;PP=2679;SC=AGTTAGGAGCTCCGAGTTCCG;SOR=0.994;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=44;TCR=55;TR=99;WE=75629786;WS=75629768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr7	75630274	rs8565	T	C	6865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=134;NR=86;PP=2965;SC=GGCTGATACCTTGGGTGGAAA;SOR=1.210;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=221;TCF=134;TCR=87;TR=220;WE=75630282;WS=75630264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr7	75633209	rs2058389	T	C	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=39;PP=1191;SC=TCAGGTGGAATGCAGAATGCA;SOR=2.670;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=51;WE=75633217;WS=75633199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	75643313	rs7798794	C	T	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=27;PP=905;SC=TATTTATTTTCTGAGACAGAG;SOR=2.362;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=75643321;WS=75643303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr7	75658197	rs13240967	C	T	1785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=50;PP=1459;SC=AACCCCAGCACTTTGGAAGGC;SOR=7.978;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=50;WE=75658205;WS=75658187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr7	75659815	rs1044483	T	C	3235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=81;PP=2510;SC=AAAGCTCTGTTGGTTCACATA;SOR=2.221;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=27;TCR=81;TR=108;WE=75659823;WS=75659805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr7	75677430	rs10231092	C	G	2050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=33;PP=1524;SC=AGTCACTTCCCCGTCACCAGC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=37;TCR=33;TR=70;WE=75677438;WS=75677420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr7	75692927	rs1637037	C	T	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.337;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=386;ReadPosRankSum=-0.713;SC=GCATATGACCCTGTGAGGGGC;SOR=1.105;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=64;TCF=10;TCR=54;TR=22;WE=75692935;WS=75692917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,26:0.37:71
chr7	75693009	rs1637039	C	T	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=3.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=211;ReadPosRankSum=-0.196;SC=GGCCTGGCCACGTGCCAGGTT;SOR=0.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=12;WE=75693017;WS=75692999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr7	75693963	rs2286830	T	C	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=199;ReadPosRankSum=-0.924;SC=GAGTCAATTCTACACCATTCA;SOR=0.904;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=9;WE=75693971;WS=75693953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr7	75694079	rs11972240	T	G	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.982;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=163;ReadPosRankSum=0.181;SC=GGGCGTCACGTTTGTGGCACC;SOR=0.155;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=10;WE=75694087;WS=75694069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr7	75694345	rs3214335	TC	T	828.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.758;NF=1;NR=25;PP=898;ReadPosRankSum=0.574;SC=TCAGGAGCTCTCCCTGGCCCT;SOR=0.622;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=26;WE=75694353;WS=75694335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,28:0.67:42
chr7	75806299	rs12538908	A	G	1309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=7;PP=1007;SC=TCAAGGTGCCATACTCCAAGT;SOR=2.985;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=44;WE=75806307;WS=75806289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr7	75877354	rs1859795	A	G	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=41;ReadPosRankSum=0.167;SC=AGTGCTGAAGACCTGGCTTGA;SOR=0.052;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=5;WE=75877362;WS=75877348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr7	75889151	rs150272766	G	GC	111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.650;NF=7;NR=0;PP=165;ReadPosRankSum=-1.448;SC=GCTAGGTCAGGCCCCCTGCGC;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=7;WE=75889159;WS=75889142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr7	75889184	rs6950229	T	C	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=51;ReadPosRankSum=1.765;SC=TGAAGAAAAGTCGTCCCGAGA;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=6;WE=75889192;WS=75889174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,6:0.19:32
chr7	75894946	rs6465068	G	A	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=98;ReadPosRankSum=-1.859;SC=CACTGCTGTAGTCTCAGCACT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=7;WE=75894954;WS=75894936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr7	75896466	rs6955911	A	G	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=334;ReadPosRankSum=-1.711;SC=AGGCAGGTGGAGGGCTGCTCT;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=15;WE=75896474;WS=75896456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr7	75896535	rs6974346	C	T	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.008;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=497;ReadPosRankSum=-0.183;SC=AAGCGGGTGTCCCACGCCGAC;SOR=0.180;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=69;TCF=53;TCR=16;TR=31;WE=75896543;WS=75896525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,32:0.46:70
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chr7	75914934	rs75544239	G	GC	674.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=2;PP=841;SC=TCCCGGCAGCGCCGCAAGCGT;SOR=3.716;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=20;WE=75914942;WS=75914924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr7	76023131	rs35508921	A	AG	2692.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=28;NR=42;PP=2915;SC=CCGCAGACCCAGGCACCGCCA;SOR=0.693;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=76;TCF=33;TCR=43;TR=70;WE=76023139;WS=76023121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
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chr7	76131650	rs6958774	G	A	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.18;QD=40.23;SOR=3.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	76131695	rs4728775	A	G	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=16;PP=984;SC=TCGGGTCCCTAGCTGTGGGCC;SOR=1.121;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=37;WE=76131703;WS=76131685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	76131812	rs6963784	C	G	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=399;SC=GGTGGCCCGCCCCCACAGTCC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=76131820;WS=76131802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	76132898	rs17855260	T	C	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.71;QD=34.39;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	76132962	rs2690526	A	G	260.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.50;QD=28.98;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	76134673	rs73140090	C	G	1904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=2.958;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.14;ReadPosRankSum=0.597;SOR=0.450;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,79:0.67:118
chr7	76135134	rs7398	G	A	3168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=63;PP=2401;SC=TGGGGGCTTAGGATGCAGCTA;SOR=1.540;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=30;TCR=63;TR=93;WE=76135142;WS=76135124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr7	76140186	rs12666503	T	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=1.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.64;MQRankSum=1.796;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.699;SOR=1.018;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr7	76142536	rs2286988	G	A	3216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=84;PP=2492;SC=TCTCTGGGCCGCCTCTGCTGA;SOR=2.750;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=22;TCR=84;TR=106;WE=76142544;WS=76142526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr7	76144228	.	A	G	343	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5006;HP=18;HapScore=3;MGOF=11;MMLQ=29;MQ=57.89;NF=8;NR=0;PP=343;QD=47.2214015684;SC=ATCTCAAAAAAAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=8;WE=76144237;WS=76144225;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr7	76144229	rs2004545	A	G	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.38;QD=38.47;SOR=6.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	76144455	rs1799125	A	C	7045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=59.98;NF=101;NR=138;PP=2965;SC=TCCCACCCAGAGAGGCCGCCA;SOR=1.076;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=240;TCF=101;TCR=139;TR=239;WE=76144463;WS=76144445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr7	76144483	rs1636632	A	G	6066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=133;PP=2965;SC=GGTGGGCTGCAAGCCTGGCCT;SOR=2.000;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=52;TCR=133;TR=185;WE=76144491;WS=76144473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr7	76144560	rs1799126	T	C	2255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=79;PP=1912;SC=GATGGGGCGCTGGGAGTGAGT;SOR=7.378;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=80;TCF=1;TCR=79;TR=80;WE=76144568;WS=76144550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr7	76256006	rs147578134	G	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.546;NF=6;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=0.042;SC=GATGATCTGGGAAAATCAGCG;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=6;WE=76256014;WS=76255996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr7	76607938	rs56083327	C	T	334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=305;SC=GGGAAGATGGCCATGGCCCCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=76607946;WS=76607928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	76608143	rs2245368	C	T	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=25;PP=797;SC=CCCTCGCTGGCCCGTTACATT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=37;WE=76608151;WS=76608133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr7	76610299	rs62473743	A	G	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.62;QD=31.66;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	76610346	rs71552449	C	T	302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.36;QD=30.28;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr7	76610407	rs62473744	A	G	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.58;QD=27.40;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	76610621	rs6956966	T	C	34.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=17.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr7	76619795	rs149365700	G	A	44.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=22.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr7	76632543	rs3748124	G	A	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.823;NF=4;NR=1;PP=68;ReadPosRankSum=0.084;SC=ATCTGATGGTGGAGGTGACGG;SOR=0.412;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=76632551;WS=76632533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr7	76632601	rs2430258	C	G	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.144;NF=7;NR=0;PP=74;ReadPosRankSum=-2.170;SC=GTCTGCCTCTCTCAGGATGGA;SOR=0.534;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=7;WE=76632609;WS=76632591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,6:0.19:32
chr7	76632736	rs3748126	C	G	3869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.736;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.894;NF=55;NR=76;PP=2906;ReadPosRankSum=-0.746;SC=GGACCATCCTCATAGTTTACA;SOR=0.770;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=135;TCF=58;TCR=77;TR=131;WE=76632744;WS=76632726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,129:0.99:130
chr7	76634033	rs1861028	A	G	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=13;PP=352;SC=CTGGGCGCCCACCCCCCTCCG;SOR=1.739;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=16;WE=76634041;WS=76634023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	76634077	rs62474183	T	C	45.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.26;MQRankSum=-1.150;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr7	76635003	rs76696965	A	T	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.41;QD=44.97;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	76635006	rs200111237	C	T	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.15;QD=40.48;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr7	76635139	rs62474189	CG	TA	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.78;QD=39.38;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr7	76742649	rs142960161	A	G	289.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.30;QD=32.20;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr7	76885769	rs3108428	A	G	5671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.367;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=86;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.022;SC=AACAAAAGCAATTATTAAAAG;SOR=0.906;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=293;TCF=161;TCR=132;TR=200;WE=76885777;WS=76885759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,211:0.69:308
chr7	76958730	rs10274222	A	G	2113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=39;PP=1750;ReadPosRankSum=-1.149;SC=AACACGTCAGAAATGTGGAAG;SOR=0.634;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=100;TCF=43;TCR=57;TR=70;WE=76958738;WS=76958720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,73:0.70:105
chr7	76984752	rs35161141	CA	C	1410.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=4.275;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.16;MQRankSum=0.435;QD=19.06;ReadPosRankSum=0.799;SOR=0.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:5,69:0.93:74
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chr7	77247821	rs9640663	G	A	3326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.581;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=41;PP=2633;ReadPosRankSum=-0.116;SC=TGAAAACATGGTCAGCTCCAT;SOR=0.795;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=189;TCF=124;TCR=65;TR=122;WE=77247829;WS=77247811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,123:0.64:192
chr7	77326410	rs3750128	T	C	103.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5267;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=70;ReadPosRankSum=-1.383;SC=GAGGGCGCCGTGGGTCCCCGC;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=5;WE=77326418;WS=77326400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr7	77365770	rs3764824	A	G	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.20;ReadPosRankSum=0.063;SOR=0.658;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,57:0.63:90
chr7	77397906	rs10538970	ATAT	A	325.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=319;ReadPosRankSum=1.590;SC=CAGGGGAACAATATTATTATT;SOR=0.446;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=7;WE=77397916;WS=77397896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr7	77402746	rs10953349	A	G	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=320;ReadPosRankSum=0.100;SC=TTTTACCCGTATTTGGATATC;SOR=1.519;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=15;WE=77402754;WS=77402736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr7	77407556	rs11970824	A	G	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=0;PP=460;SC=AGACAGTACTATGGTATTGAC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=77407564;WS=77407546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	77423574	rs7953	G	A	6691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.496;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=141;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.834;SC=AGACTGGAATGAATATGAGGA;SOR=0.875;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=367;TCF=154;TCR=213;TR=238;WE=77423582;WS=77423564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,241:0.64:375
chr7	77469472	rs117427153	T	C	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.126;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=542;ReadPosRankSum=1.173;SC=TATGTCTGCATGCTGTTCAGT;SOR=1.239;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=120;TCF=76;TCR=44;TR=36;WE=77469480;WS=77469462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,36:0.28:129
chr7	77523521	rs10267180	A	G	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=421;ReadPosRankSum=0.380;SC=ATGTAATCATATCTCTTATGC;SOR=1.284;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=19;WE=77523529;WS=77523511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr7	77539631	.	A	G	1289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.226;ClippingRankSum=0.000;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.014;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=24;PP=890;ReadPosRankSum=-0.586;SC=CAGATAACACACAAGAGGGAG;SOR=0.297;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=158;TCF=105;TCR=53;TR=58;WE=77539639;WS=77539621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,61:0.37:165
chr7	77539744	rs711309	G	A	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.113;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=29;PP=556;ReadPosRankSum=0.015;SC=TTTATTTAAGGTTTTATATGG;SOR=0.978;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=103;TCF=21;TCR=82;TR=35;WE=77539752;WS=77539734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,36:0.34:105
chr7	77552127	rs848486	G	A	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=253;ReadPosRankSum=1.329;SC=GTATACATACGTATCTATTTT;SOR=0.507;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=13;WE=77552135;WS=77552117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr7	77567265	rs34381093	C	G	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=389;ReadPosRankSum=-1.068;SC=TTTCTTCACCCTGAAAAAAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=17;WE=77567273;WS=77567255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,19:0.83:23
chr7	77708105	.	A	ATGTGTGTGTG	221.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=7.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=-2.006;QD=11.09;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.010;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr7	77708131	rs73136595	A	G	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.160;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.290;NF=11;NR=1;PP=199;ReadPosRankSum=0.945;SC=GTGTGTGTGTATATATATACC;SOR=0.013;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=12;WE=77708139;WS=77708121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
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chr7	80285850	rs3173798	T	C	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=320;ReadPosRankSum=1.017;SC=ATTTTCTTTTTCATAGCAAGT;SOR=0.295;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=16;WE=80285858;WS=80285840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
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chr7	80374342	rs1949971	A	G	4979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=88;PP=2965;SC=TGTCTTTGCAATATTGGTTAA;SOR=1.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=69;TCR=88;TR=157;WE=80374350;WS=80374332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr7	80374438	rs1949972	T	C	3415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=48;PP=2658;SC=CCCAGGTCCATGGGGACCATT;SOR=0.946;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=60;TCR=48;TR=108;WE=80374446;WS=80374428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr7	80378148	rs1405743	T	C	1554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=3;PP=1271;SC=TGAGCCTCGCTGAGGGACAGT;SOR=4.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=43;TCR=3;TR=46;WE=80378156;WS=80378138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
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chr7	80391070	rs10954319	C	T	122.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5325;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=122;ReadPosRankSum=-0.566;SC=GAAGAAATCACTTTTCTTTAT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=80391078;WS=80391060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr7	80456841	rs4461841	C	T	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=44;PP=1746;SC=ATAATCTCACCTGGACATATG;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=22;TCR=44;TR=66;WE=80456849;WS=80456831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr7	80545861	.	C	G	262.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=211;ReadPosRankSum=-0.253;SC=CTATTGTCCTCCAAAACGCAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=80545869;WS=80545858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr7	80804928	rs1509912	G	T	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.834;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=336;ReadPosRankSum=0.964;SC=TCCACAGACTGCTTCCTCCTT;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=8;TCR=64;TR=19;WE=80804936;WS=80804918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,19:0.26:74
chr7	80805175	rs1509911	T	A	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.769;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=15;PP=789;ReadPosRankSum=-0.976;SC=AAGCTCTTACTAGATGATCTT;SOR=0.462;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=98;TCF=67;TCR=31;TR=43;WE=80805183;WS=80805165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,45:0.44:103
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chr7	80805381	rs11976314	A	C	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=30;PP=550;ReadPosRankSum=1.362;SC=ATGTGGACTCAGAAAAATCTC;SOR=0.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=104;TCF=25;TCR=79;TR=39;WE=80805389;WS=80805371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,40:0.37:108
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chr7	81350223	rs10272030	G	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.397;HP=6;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=185;ReadPosRankSum=-1.270;SC=AAACAAAAAGGTTTTTTACAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=10;WE=81350231;WS=81350213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr7	81355066	rs2887069	G	A	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=147;ReadPosRankSum=0.284;SC=GAAAAATCCAGCTTCAAACTT;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=7;WE=81355074;WS=81355056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr7	81359116	rs5745686	CA	C	108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=2.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.73;ReadPosRankSum=-1.648;SOR=1.552;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr7	81372156	rs5745676	A	G	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.561;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=349;ReadPosRankSum=1.077;SC=ATCAGCTATAAAGATTAGAGA;SOR=2.572;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=15;WE=81372164;WS=81372146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr7	81372452	rs2214826	A	G	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=128;ReadPosRankSum=1.064;SC=AATGTTTTCTATGGATGTGTG;SOR=0.836;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=81372460;WS=81372442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr7	81374500	rs4732406	G	C	1956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=54;PP=1666;ReadPosRankSum=0.575;SC=CACCACTGTTGCATTTAAAGA;SOR=3.477;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=4;TCR=55;TR=58;WE=81374508;WS=81374490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,59:0.98:60
chr7	81381326	rs5745646	C	T	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.258;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=411;ReadPosRankSum=0.029;SC=TGCATTTGCACGAACAACATA;SOR=0.208;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=75;TCF=72;TCR=3;TR=23;WE=81381334;WS=81381316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,26:0.33:79
chr7	81588636	rs1229502	G	A	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=0.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.483;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,47:0.25:185
chr7	81591114	rs72063149	GTAATGATTATAACAGTATATACAATTTCT	G	619.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=31;SC=AGTTTTTTCTGTAATGATTAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=2;WE=81591150;WS=81591111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	81591716	rs1229503	T	G	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=1.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.02;ReadPosRankSum=-0.071;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,8:0.18:45
chr7	81596813	rs17240387	T	C	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=4;PP=330;SC=TGTAGTGGTATTGAGAATGTA;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=81596821;WS=81596803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	81600197	rs37067	A	G	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.04;ReadPosRankSum=1.400;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr7	81603945	rs61006565	AT	A	84.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.97;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	81626356	rs6944326	G	A	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=3.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.00;ReadPosRankSum=0.584;SOR=1.480;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,28:0.25:112
chr7	81634822	rs201578104	G	A	130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=33.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-1.104;QD=1.84;ReadPosRankSum=-2.362;SOR=5.601;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,26:0.37:71
chr7	81642634	rs37135	A	C	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.40;ReadPosRankSum=0.108;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr7	81642949	rs37136	C	T	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=30;ReadPosRankSum=-0.366;SC=CACTTCAAAACTGAGCTAATA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=3;WE=81642957;WS=81642939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr7	81964578	rs5885290	G	GA	759.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=30;PP=479;ReadPosRankSum=-1.508;SC=CTGTGTGAAAGAAAAAAAAAA;SOR=0.540;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=68;TCF=2;TCR=66;TR=32;WE=81964586;WS=81964568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,37:0.59:63
chr7	82497343	rs4628206	T	A	2139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.086;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=17;PP=1634;ReadPosRankSum=1.008;SC=ATCAACATGATATGTGGTCTG;SOR=1.015;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=104;TCF=79;TCR=25;TR=74;WE=82497351;WS=82497333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,77:0.72:107
chr7	82508938	.	T	C	279	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=6;NR=11;PP=279;QD=18.4571301498;SC=ATTCTGATTTTGATAATATAA;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=17;WE=82508946;WS=82508937;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,17:0.71:24
chr7	82544987	rs17156844	A	G	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.783;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=32;PP=722;ReadPosRankSum=-1.182;SC=TCACATAACTATGCAATCTAG;SOR=1.249;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=148;TCF=50;TCR=98;TR=44;WE=82544995;WS=82544977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,46:0.30:155
chr7	82581488	rs10630259	T	TTCA	8733.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=72;PP=2969;SC=CAACGGGTTTTTCATCTTCTA;SOR=1.087;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=179;TCF=93;TCR=86;TR=152;WE=82581496;WS=82581478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr7	82581859	rs976714	C	T	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=6.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.00;ReadPosRankSum=-0.753;SOR=1.325;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,33:0.24:140
chr7	82582846	rs10954696	C	T	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=5.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.970;QD=3.04;ReadPosRankSum=-1.800;SOR=1.246;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,33:0.20:163
chr7	82763534	rs149498958	A	AAT	200.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.577;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=14;NR=0;PP=272;ReadPosRankSum=0.790;SC=CTCCATATGTAATATATATAT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=14;WE=82763545;WS=82763524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr7	82764425	rs2877	C	G	5839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.720;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=104;PP=2962;ReadPosRankSum=0.460;SC=ATCAAATGGGCTGACTTTTTC;SOR=0.304;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=295;TCF=159;TCR=136;TR=210;WE=82764433;WS=82764415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,209:0.70:297
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chr7	82785099	rs61741653	T	G	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=6.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.28;ReadPosRankSum=1.802;SOR=1.232;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,45:0.24:188
chr7	82785719	rs59705796	TA	T	441.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=2.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.414;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,28:0.80:35
chr7	83021799	rs375518443	TAAAA	T,TA	2460.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.23;QD=34.18;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,30,42:0.42,0.58:72
chr7	83023587	.	TAC	T	3314.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.28;QD=36.83;SOR=0.935;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr7	83026100	rs150931802	C	CAA	891.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=674;SC=GTACGGTTTTCAAAAAAACCA;SOR=3.442;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=20;WE=83026108;WS=83026090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	83029280	rs2255906	T	G	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.26;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	83029438	rs2722974	C	T	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=768;ReadPosRankSum=-0.551;SC=CTGTTTTTACCAATATTGGTT;SOR=0.616;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=89;TCR=34;TR=39;WE=83029446;WS=83029428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,43:0.34:126
chr7	83029639	rs2255820	A	C,T	2125.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=1,3;NR=48,24;PP=912,480;SC=AATTATGAGAAGAATCAGAAA;SOR=5.084;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=76;TCF=4;TCR=72;TR=49,27;WE=83029647;WS=83029629;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.65,0.35:80
chr7	83031907	rs2709930	T	C	1604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=2;PP=1367;SC=ACCAAAAGTATACTTAAAAAT;SOR=5.590;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=49;TCR=2;TR=49;WE=83031915;WS=83031897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr7	83032187	rs2722976	T	C	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=27;PP=661;SC=TCAAGTCTTTTGGGTAAAGTG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=83032195;WS=83032177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	83034754	rs2245441	T	A	2033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=32;PP=1733;SC=ATTGACTGTATAAATTTCTCA;SOR=0.724;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=32;TCR=33;TR=64;WE=83034762;WS=83034744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr7	83034899	rs2709935	T	G	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=26;PP=808;SC=CAAAGAAAATTTATTCACCTA;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=32;WE=83034907;WS=83034889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	83035177	rs3735512	G	A	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=0;PP=839;SC=TACACAGAAAGCAAGTTTCTA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=83035185;WS=83035167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	83036367	rs2245312	C	G	7325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=159;NR=62;PP=2965;SC=AAAGGCCTGACCATAAATTGT;SOR=1.976;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=221;TCF=159;TCR=62;TR=221;WE=83036375;WS=83036357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr7	83036602	rs2709941	T	A	1427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=41;PP=1202;SC=ATATTACAACTAAATGCTAAC;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=41;WE=83036610;WS=83036592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	83037751	rs2722985	C	A	3803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=72;PP=2965;SC=TGCGGAAGATCGCAGCGTCTC;SOR=1.297;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=41;TCR=72;TR=113;WE=83037759;WS=83037741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr7	83047583	rs2723033	T	C	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.65;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	83047583	.	TCA	CCC	542	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=9;NR=1;PP=542;QD=59.5467874862;SC=GCTTCGAGCATCAGAAAATAG;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=10;WE=83047593;WS=83047573;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr7	83047585	rs2713146	A	C	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.14;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	83047666	rs2713145	C	T	2511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=9;PP=2024;SC=TTTTAAAATCCTTATGACTAC;SOR=3.442;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=63;TCR=9;TR=72;WE=83047674;WS=83047656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr7	83095968	rs2713180	C	A	5079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=124;PP=2965;SC=AAACATGTTTCGTCCTTTTTG;SOR=3.581;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=19;TCR=124;TR=143;WE=83095976;WS=83095958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr7	83098428	rs3842170	A	AT	416.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=482;SC=ATGCCTATATATTTTTTCTTC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=15;WE=83098436;WS=83098418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	83098696	rs12534772	T	A	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=33;PP=927;SC=CACTTTCTTCTACAGTTCAAA;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=34;WE=83098704;WS=83098686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr7	83098714	.	CTT	C	654.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.329;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=14;HapScore=3;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=237;ReadPosRankSum=1.085;SC=AAAACATTTCCTTTTTTTTTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=19;WE=83098725;WS=83098704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr7	83098749	rs13225391	G	A	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=569;SC=ATAAGATACAGTGGGTCTTTG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=83098757;WS=83098739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	83277699	rs372307036	CT	C	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=10.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQRankSum=-0.745;QD=0.83;ReadPosRankSum=0.745;SOR=2.819;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,14:0.21:66
chr7	83590852	rs797821	T	C	4830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.855;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=100;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.656;SC=ACTCATCCATTGTGTTGAGAT;SOR=0.703;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=254;TCF=122;TCR=132;TR=183;WE=83590860;WS=83590842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,185:0.73:255
chr7	83606353	rs35361892	T	TGA	1355.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=2;PP=1279;SC=TTAAGTATTCTGAGAGATGCA;SOR=3.611;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=26;WE=83606361;WS=83606343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
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chr7	83614801	rs141423527	AG	A	738.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=8.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.648;QD=7.24;ReadPosRankSum=-0.503;SOR=1.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,28:0.27:102
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chr7	86544248	rs1029367	C	T	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=199;ReadPosRankSum=0.100;SC=GTATATATTACAAATGTATTC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=10;WE=86544256;WS=86544238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr7	86571235	rs2373361	C	A	1514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=0;PP=1137;ReadPosRankSum=1.467;SC=TTTCTTAAAACGTTATGAAAG;SOR=1.416;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=76;TCF=76;TCR=0;TR=47;WE=86571243;WS=86571225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,52:0.64:81
chr7	86577346	rs1557665	A	T	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=27;PP=669;ReadPosRankSum=-0.837;SC=TGCCACACTCAAACGAAAGCC;SOR=1.179;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=29;WE=86577354;WS=86577336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,28:0.70:40
chr7	86594379	rs6976741	G	A	3001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=3.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.80;ReadPosRankSum=-1.211;SOR=0.348;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,78:0.70:112
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chr7	86781423	rs2286267	G	A	923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=1;PP=813;SC=CGGCTCCCTCGGCTCGGAGCC;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=86781431;WS=86781413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	86795947	rs3058402	TAG	T	4159.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=55;PP=2965;SC=TTAAGAGCCATAGAGTTCCCT;SOR=1.847;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=76;TCF=16;TCR=60;TR=71;WE=86795956;WS=86795937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr7	86800351	rs3747807	A	G	5595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=89;PP=2965;SC=CCATGACTGCAACCACAGAAG;SOR=0.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=186;TCF=97;TCR=89;TR=186;WE=86800359;WS=86800341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr7	86811262	rs147167900	G	A	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=11;PP=872;ReadPosRankSum=-0.021;SC=GGGAGATTGTGTCAGTAACCT;SOR=0.849;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=51;TCR=17;TR=45;WE=86811270;WS=86811252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,47:0.70:67
chr7	86820459	rs1558050	G	A	1876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=53;PP=1579;SC=ATGAATGGTAGACTAAATCAG;SOR=6.666;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=54;TCF=1;TCR=53;TR=54;WE=86820467;WS=86820449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr7	86978347	rs802037	C	A	1067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=8;PP=880;SC=TGTGAGGGCTCTCTCTCTTTT;SOR=2.494;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=36;WE=86978355;WS=86978337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	86983715	rs7808249	A	G	2766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=42;PP=2427;SC=GCTTGGATTTAACTGGACCTA;SOR=0.959;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=54;TCR=42;TR=96;WE=86983723;WS=86983705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr7	86998842	rs6966140	G	A	3619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=91;PP=2948;SC=GTCTTATGGTGTTGCTTGAAT;SOR=2.774;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=22;TCR=91;TR=113;WE=86998850;WS=86998832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr7	86998936	rs35374737	AT	A	1323.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=33;PP=1444;SC=TTAAAAAAAAATCTATTTGTA;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=86998944;WS=86998926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr7	87005287	rs59190666	C	CT	1180.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=1;NR=44;PP=847;SC=ACTACCTTCTCTTTTTTTTTT;SOR=4.615;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=69;TCF=3;TCR=66;TR=45;WE=87005295;WS=87005277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	87006567	rs802042	G	C	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=232;SC=TTTGGTTGACGTGAAGAGGAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=87006575;WS=87006557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	87011349	rs31630	G	A	3620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=79;NR=28;PP=2896;SC=TCTCCTAATAGTTCTATAGAT;SOR=2.100;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=108;TCF=80;TCR=28;TR=107;WE=87011357;WS=87011339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr7	87022024	rs31644	G	C	4007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=28;PP=2965;SC=TTTCTAACCTGAGATTTGGGG;SOR=2.342;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=93;TCR=28;TR=121;WE=87022032;WS=87022014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr7	87027419	rs5885580	C	CT	281.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.66;ReadPosRankSum=1.832;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr7	87031690	rs45549641	A	G	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.238;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=322;ReadPosRankSum=1.470;SC=AGTAAATTTGAAAATGTTACC;SOR=1.609;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=52;TCF=10;TCR=42;TR=18;WE=87031698;WS=87031680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,19:0.36:53
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chr7	87046896	rs5885584	GC	G	805.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.522;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.851;NF=1;NR=28;PP=949;ReadPosRankSum=0.263;SC=TCCAGCCTTAGCCTCTTGGTC;SOR=0.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=2;TCR=74;TR=29;WE=87046904;WS=87046886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,29:0.38:77
chr7	87047813	rs7788404	T	C	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.347;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;PP=582;ReadPosRankSum=0.888;SC=TCTAAAACCATGTTATGTAAA;SOR=0.979;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=137;TCF=82;TCR=55;TR=45;WE=87047821;WS=87047803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,46:0.33:138
chr7	87053150	rs31667	A	G	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.994;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=3;PP=708;ReadPosRankSum=0.979;SC=GGAGCCAGTCAGTGAGGTTGG;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=48;TCR=4;TR=38;WE=87053158;WS=87053140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,37:0.70:53
chr7	87053206	rs31668	G	A	3590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=38;PP=2868;SC=CTGTTATGTGGTGTTTGCAAA;SOR=1.508;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=72;TCR=38;TR=110;WE=87053214;WS=87053196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr7	87056011	rs1017054	T	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.40;ReadPosRankSum=-1.009;SOR=0.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,13:0.24:55
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chr7	87056260	rs111542896	A	AGTGT,AGT	388.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;NF=0,0;NR=10,10;PP=106,199;SC=AAGACATTAAAGTGTGTGTGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=10,10;WE=87056268;WS=87056250;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:7
chr7	87069758	rs31675	T	C	2643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=74;PP=2381;SC=ATTTAACCATTTAATAGCTGA;SOR=8.635;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=74;TCF=0;TCR=74;TR=74;WE=87069766;WS=87069748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr7	87072840	rs3834727	GA	G	176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=3.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=1.556;QD=4.53;ReadPosRankSum=-2.086;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr7	87082292	rs1202283	G	A	2586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.681;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=23;PP=1976;ReadPosRankSum=1.055;SC=CAGTGGTGTCGTTGATGTCAA;SOR=1.381;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=140;TCF=101;TCR=39;TR=92;WE=87082300;WS=87082282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,96:0.66:146
chr7	87138511	rs2235048	G	A	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.006;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=170;ReadPosRankSum=-0.690;SC=ACTTCTGGGAGACCAGCCCCT;SOR=0.048;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=11;WE=87138519;WS=87138501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr7	87138645	rs1045642	A	G	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=372;ReadPosRankSum=-1.044;SC=CTGCCCTCACAATCTCTTCCT;SOR=0.731;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=49;TCR=49;TR=28;WE=87138653;WS=87138635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,29:0.29:100
chr7	87160618	rs2032582	A	C	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=259;ReadPosRankSum=-0.463;SC=ACCTTCCCAGAACCTTCTAGT;SOR=0.776;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=15;WE=87160626;WS=87160608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr7	87168749	rs4728699	C	T	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=465;ReadPosRankSum=0.815;SC=AGCAGGAGATCAGACAAAGTC;SOR=0.814;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=26;WE=87168757;WS=87168739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,27:0.40:68
chr7	87174066	rs2235046	T	C	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.092;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=5;PP=753;ReadPosRankSum=-0.771;SC=CCACTCCTACTGTAGCCCTAG;SOR=0.891;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=100;TCF=85;TCR=15;TR=38;WE=87174074;WS=87174056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,38:0.38:99
chr7	87179443	rs2032588	G	A	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=1.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.06;ReadPosRankSum=0.359;SOR=0.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,47:0.29:162
chr7	87179601	rs1128503	A	G	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.767;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=391;ReadPosRankSum=2.494;SC=TCAGGTTCAGACCCTTCAAGA;SOR=0.301;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=56;TCF=14;TCR=42;TR=23;WE=87179609;WS=87179591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,22:0.40:55
chr7	87180198	rs10276036	C	T	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-5.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.934;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=32;PP=694;ReadPosRankSum=0.597;SC=GAGATAGTGACAGCAATTTTT;SOR=0.312;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=117;TCF=17;TCR=100;TR=40;WE=87180206;WS=87180188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,42:0.33:126
chr7	87192731	rs11975994	G	A	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=415;ReadPosRankSum=-0.264;SC=AATATCCTCAGCAAAATCCTG;SOR=0.618;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=40;TCR=53;TR=27;WE=87192739;WS=87192721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,29:0.29:101
chr7	87199564	rs2235015	C	A	952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.882;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=663;ReadPosRankSum=1.827;SC=AACAAACATACCATTTATGTC;SOR=0.534;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=98;TCF=26;TCR=72;TR=36;WE=87199572;WS=87199554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,39:0.39:99
chr7	87215114	rs1211152	A	C	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=26;PP=785;SC=ACTGATACCAACCTAGTCCAA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=87215122;WS=87215104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	87229501	rs2214102	T	C	2675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=48;PP=2196;SC=CAAGATCCATTCCGACCTGAA;SOR=1.112;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=32;TCR=48;TR=80;WE=87229509;WS=87229491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr7	87479083	.	C	T	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=-0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=142;ReadPosRankSum=0.572;SC=AACAATACCTCAGAAAATGAA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=8;WE=87479091;WS=87479073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr7	87526550	rs11422356	T	TA	285.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.35;ReadPosRankSum=-0.418;SOR=0.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr7	87564497	rs2279542	C	G	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=196;ReadPosRankSum=-1.040;SC=CTCGGTGGCCCGCAGGTGAGA;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=13;WE=87564505;WS=87564487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,13:0.25:53
chr7	87594188	rs1637500	T	G	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=12;PP=359;SC=GGCAGATTTATGTCATACTGA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=87594196;WS=87594178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr7	88964510	rs62469518	T	C	3193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=55;PP=2485;ReadPosRankSum=0.023;SC=GCAGAGGTAATTTGCTCTGCT;SOR=0.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=178;TCF=92;TCR=86;TR=113;WE=88964518;WS=88964500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,118:0.63:186
chr7	88964816	.	T	C	1170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.497;ClippingRankSum=0.000;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=4.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.80;ReadPosRankSum=-0.645;SOR=1.081;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,57:0.28:202
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chr7	89797144	rs259136	G	T	1618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=35;PP=1131;SC=TATGGCCTATGAAGTGTGGAA;SOR=2.393;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=46;WE=89797152;WS=89797134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr7	89854446	rs194520	T	G	5522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.848;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=51;PP=2965;ReadPosRankSum=1.336;SC=AGTGAAACTTTTTTACCTAAT;SOR=1.513;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=163;TCF=110;TCR=53;TR=161;WE=89854454;WS=89854436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,170:0.99:171
chr7	89856608	rs110360	C	T	5147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=86;PP=2965;SC=TAGTATACCTCGCAGGTCTTC;SOR=0.927;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=157;TCF=70;TCR=87;TR=155;WE=89856616;WS=89856598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr7	89861832	rs194524	G	A	3154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=50;PP=2603;SC=TGTATAAGCCGAAAGCTAAAA;SOR=0.919;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=40;TCR=50;TR=90;WE=89861840;WS=89861822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr7	89861890	rs194525	G	T	3184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=55;PP=2484;SC=AAGAAGGTATGGGAGGAACAA;SOR=1.167;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=39;TCR=55;TR=94;WE=89861898;WS=89861880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr7	89861942	rs194526	C	T	1810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=39;PP=1398;SC=AATGTGATGACAAATGGTGTT;SOR=1.727;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=57;WE=89861950;WS=89861932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr7	89867446	rs35403811	T	TCTG	2052	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=38;PP=2198;ReadPosRankSum=1.590;SC=CTAAAGAGTTTCTGCTGCTGC;SOR=0.507;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=73;TCF=8;TCR=65;TR=44;WE=89867454;WS=89867436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,49:0.94:52
chr7	89887587	rs11771963	G	T	222.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=182;SC=CCATAAATTTGATGGCTTAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=89887595;WS=89887577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	89901039	rs10280053	A	C	1834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=28;PP=1559;SC=ACTTTTGTTTATGTCTAAAAA;SOR=0.808;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=52;WE=89901047;WS=89901029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr7	89912301	rs1029365	G	A	3546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=57;PP=2779;SC=CCTGAGAGCCGTGGTCTACCT;SOR=0.747;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=50;TCR=58;TR=107;WE=89912309;WS=89912291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr7	89927191	rs6465256	T	A	1268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=26;PP=951;SC=AATATGTCTATTAAAGGCCGT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=37;WE=89927199;WS=89927181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	89929110	rs36006782	C	CT	102.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=135;SC=GTGTTTCTCTCTTTTTTTTTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=89929118;WS=89929108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	89933957	rs71961054	GTAGATAGA	G,GTAGA	703.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=10,10;NR=0,0;PP=566,241;SC=TTTTAGATAGGTAGATAGATA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=10,10;WE=89933972;WS=89933947;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.42,0.58:19
chr7	89937027	rs35441907	CA	C	601.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.424;NF=23;NR=2;PP=381;ReadPosRankSum=1.414;SC=GGTTCTGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=2.910;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=25;WE=89937036;WS=89937017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr7	89938588	rs7803620	C	G	1916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=19;PP=1508;SC=AAGCAAAAAGCCTTCAAGAAA;SOR=1.888;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=65;TCF=45;TCR=20;TR=64;WE=89938596;WS=89938578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr7	89938680	rs1134956	C	T	1567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=37;PP=1228;SC=CTTAACACAACGGTAAGATTC;SOR=2.004;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=51;WE=89938688;WS=89938670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	89969831	rs42637	A	G	2009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=32;PP=1384;SC=GGTGGATTGCATATGAGGGTG;SOR=0.836;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=37;TCR=32;TR=69;WE=89969839;WS=89969821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr7	89969878	rs2285399	A	G	1914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=37;PP=1443;SC=TGCTGCTGAAAGAAATCAAGG;SOR=1.092;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=23;TCR=37;TR=60;WE=89969886;WS=89969868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr7	89971556	rs1557650	A	C	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=1;PP=529;SC=TATTTATTTAAAGACAGTCTC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=89971564;WS=89971546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	89983808	rs42663	T	G	1946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=17;PP=1478;SC=GAAAAGACTGTGAAATCCCTG;SOR=2.019;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=59;WE=89983816;WS=89983798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
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chr7	90003694	rs11563547	A	C	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.316;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=916;ReadPosRankSum=-0.348;SC=GTAAAACACTATATTAGAAGT;SOR=0.399;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=35;WE=90003702;WS=90003684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,34:0.72:47
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chr7	91503228	rs10266424	C	T	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.345;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=863;ReadPosRankSum=-0.666;SC=TTGATGTTTGCGTAGCTTCTT;SOR=0.631;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=142;TCF=73;TCR=69;TR=53;WE=91503236;WS=91503218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,55:0.38:146
chr7	91509232	rs12672603	G	A	2634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.607;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=19;PP=2024;ReadPosRankSum=0.764;SC=ATTTACGTTCGCCTCTGCCCC;SOR=1.003;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=144;TCF=113;TCR=31;TR=94;WE=91509240;WS=91509222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,99:0.65:153
chr7	91570290	rs4727267	G	C	4474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=112;NR=18;PP=2965;SC=GCGGGGGAGCGCCGGACCGAA;SOR=3.643;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=112;TCR=18;TR=130;WE=91570298;WS=91570280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr7	91632306	rs1989779	C	T	2818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=52;PP=2257;SC=GAGTTGTGACCATGACAAGCA;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=36;TCR=52;TR=88;WE=91632314;WS=91632296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr7	91669960	.	GT	G	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.037;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=5.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQRankSum=-2.923;QD=0.84;ReadPosRankSum=-0.569;SOR=0.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,14:0.26:53
chr7	91714911	rs1063242	C	T	1896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=45;PP=1577;SC=GGTTTCAGAACCTTGGCTAGA;SOR=2.958;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=55;WE=91714919;WS=91714901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr7	91728923	rs3750111	C	T	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.370;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=2;PP=784;ReadPosRankSum=-1.793;SC=CTGTTGTTCTCGGTGCCTATT;SOR=0.142;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=57;TCF=55;TCR=2;TR=34;WE=91728931;WS=91728913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,41:0.63:65
chr7	91758422	rs4729021	C	A	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=25;PP=712;ReadPosRankSum=-1.054;SC=TGCAACACTACGACAGTAACT;SOR=1.038;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=31;WE=91758430;WS=91758412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,31:0.70:44
chr7	91761305	rs66673218	CA	C	310.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=226;SC=AAAAAGTTACCAAAAAAAAAG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=12;WE=91761313;WS=91761295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	91788596	rs1013524	G	A	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=35;ReadPosRankSum=0.484;SC=AAAATCAAATGAAAGAGTTTT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=91788604;WS=91788586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr7	91842554	rs11542682	T	C	1632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.813;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=15;PP=1222;ReadPosRankSum=0.272;SC=TATTCACTCCTACATACACAG;SOR=0.804;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=78;TCR=28;TR=56;WE=91842562;WS=91842544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,61:0.55:110
chr7	91843060	rs74603220	T	C	159.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5174;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=94;ReadPosRankSum=-0.489;SC=ATCTTGCTACTTTCAATTTCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=91843068;WS=91843050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr7	91863700	rs2027950	G	C	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=1;PP=966;ReadPosRankSum=-1.060;SC=TGAAAAGAAGGACTAACATTT;SOR=1.352;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=66;TCF=65;TCR=1;TR=41;WE=91863708;WS=91863690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,43:0.63:68
chr7	91863860	.	C	T	3198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-6.238;ClippingRankSum=0.000;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.390;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=83;PP=2351;ReadPosRankSum=0.351;SC=GAATCTCCTTCACAGGCGCTT;SOR=0.867;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=170;TCF=44;TCR=126;TR=109;WE=91863868;WS=91863850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,121:0.66:184
chr7	91864314	rs143990719	T	C	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.75;ReadPosRankSum=2.048;SOR=0.297;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr7	91865662	rs17164451	C	G	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=91;ReadPosRankSum=-1.025;SC=GTATCTATGACAACTAATTTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=91865670;WS=91865652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr7	91936656	rs191428526	C	T	1348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=5;PP=988;ReadPosRankSum=1.009;SC=TTATTTTTCCCTTTCTTTCCA;SOR=0.321;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=69;TCF=62;TCR=7;TR=42;WE=91936664;WS=91936646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,47:0.64:73
chr7	91937038	rs201863693	G	GT	159.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.63;MQRankSum=0.849;QD=10.65;ReadPosRankSum=0.491;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr7	91948920	rs144102934	GTTC	G	1174.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=1039;ReadPosRankSum=-0.439;SC=CAGTTTGTGTGTTCTTCTTTA;SOR=1.464;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=25;WE=91948930;WS=91948910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
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chr7	92027537	rs1861635	C	G	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.406;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=454;ReadPosRankSum=-0.849;SC=CTCTGAGTTCCTTGGATGAAG;SOR=1.609;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=25;WE=92027545;WS=92027527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
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chr7	92135802	rs6465359	T	A	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=533;SC=ATACTTCCCATCTCATTTTAT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=92135810;WS=92135792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	92147584	rs38809	C	T	1494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=42;PP=1162;SC=AACCAACAGACGAAAAGATCA;SOR=4.450;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=46;WE=92147592;WS=92147574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
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chr7	92760502	rs4268	G	A	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=4.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=102;ReadPosRankSum=-0.036;SC=ATAAATAAACGTATTTGAACT;SOR=0.823;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=8;WE=92760510;WS=92760492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr7	92760738	rs10282508	T	G	2434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.027;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=37;PP=1920;ReadPosRankSum=0.255;SC=TTTGACTTCATTTTTTTTCCA;SOR=0.821;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=317;TCF=196;TCR=121;TR=100;WE=92760746;WS=92760727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:223,103:0.32:326
chr7	92764982	rs1133906	C	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.274;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=404;ReadPosRankSum=-2.181;SC=TTGGATTTTTCTGGTGTTCTG;SOR=0.410;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=72;TCF=42;TCR=30;TR=18;WE=92764990;WS=92764972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,19:0.26:73
chr7	92838201	rs78714737	T	TA	94.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.817;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=74;ReadPosRankSum=0.424;SC=TGCATCAATATAAAAAAAAAT;SOR=1.954;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=7;WE=92838209;WS=92838191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr7	92855820	rs77036910	G	C	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.140;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=356;ReadPosRankSum=0.846;SC=TATTTGCTAGGGAAATTAGCA;SOR=0.291;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=61;TCF=10;TCR=51;TR=23;WE=92855828;WS=92855810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,22:0.39:57
chr7	92861626	rs17165189	C	T	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=33;ReadPosRankSum=0.818;SC=CAGAAGACTACAGTTCCCAGC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=4;WE=92861634;WS=92861616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr7	92886812	rs722263	A	G	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.592;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=212;ReadPosRankSum=-1.143;SC=CTTTAAGCTGAACAATATTTC;SOR=0.262;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=14;WE=92886820;WS=92886802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr7	92970847	rs2106432	C	T	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=5.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.46;ReadPosRankSum=0.692;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,21:0.25:84
chr7	93055650	rs1042138	G	A	1179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.527;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=6;PP=864;ReadPosRankSum=0.635;SC=TGATCACGATGCTGTGTTTGC;SOR=1.130;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=47;TCR=9;TR=39;WE=93055658;WS=93055640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,43:0.72:60
chr7	93055753	rs1801197	A	G	2174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.109;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=33;PP=1710;ReadPosRankSum=0.607;SC=TTCATTCCTCAGCTCCTGATG;SOR=0.994;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=141;TCF=84;TCR=57;TR=87;WE=93055761;WS=93055743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,90:0.62:145
chr7	93063701	rs200558502	G	GA	260.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQRankSum=0.083;QD=14.49;ReadPosRankSum=-2.271;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr7	93065192	rs16868394	T	C	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.43;MQRankSum=1.083;NF=12;NR=0;PP=232;ReadPosRankSum=0.194;SC=TAAAAGATCATGGGCTTTAGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=12;WE=93065200;WS=93065182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr7	93067334	rs10713823	TA	T	1252.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.486;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.867;NF=39;NR=1;PP=1437;ReadPosRankSum=-0.468;SC=AACTAAGAGATAATACTACTA;SOR=1.781;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=69;TCF=66;TCR=3;TR=40;WE=93067342;WS=93067324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,40:0.59:68
chr7	93070870	rs3068357	GAA	G	1769.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.533;NF=18;NR=30;PP=724;ReadPosRankSum=-0.456;SC=GGCTAAAAGAGAAAAAAAAAA;SOR=0.686;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=90;TCF=37;TCR=53;TR=48;WE=93070879;WS=93070860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,59:0.64:92
chr7	93091238	rs1108233	G	A	779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=0;PP=755;SC=CACCATGTGAGAGCGTAAAAC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=93091246;WS=93091228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	93091485	rs3802052	T	C	1702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.66;SOR=3.967;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr7	93091488	rs3802051	C	T	1668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.10;SOR=3.855;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	93098135	rs139734304	T	TAAACAAACAAAC	3211.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=34;PP=2975;SC=CAACAAAAAGTAAACAAACAA;SOR=3.750;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=4;TCR=68;TR=34;WE=93098143;WS=93098125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr7	93101650	rs972945	A	G	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=360;ReadPosRankSum=1.345;SC=AAATAATGACATTCTCACTCA;SOR=0.669;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=74;TCF=59;TCR=15;TR=25;WE=93101658;WS=93101640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,25:0.32:78
chr7	93107093	rs2074120	A	C	1503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=43;PP=1338;SC=GTCATAACCAACCACATTTCA;SOR=6.184;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=44;WE=93107101;WS=93107083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr7	93116138	rs9691220	G	A	1761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=14;PP=1331;SC=GGCTTCTGGAGACCAATGCCT;SOR=1.961;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=53;WE=93116146;WS=93116128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
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chr7	93116391	rs3214144	A	AT	233.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.19;NF=0;NR=7;PP=208;SC=TTTCATTTTCATTTTTTCTAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=93116399;WS=93116381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	93346095	rs2027984	C	A	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=190;ReadPosRankSum=0.632;SC=ATCTATCTATCTATATATGCA;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=9;WE=93346103;WS=93346085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr7	93540348	rs2798	T	G	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.606;NF=0;NR=13;PP=253;ReadPosRankSum=0.579;SC=ATTTTTAAATTTATAGATGTA;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=13;WE=93540356;WS=93540338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr7	93551428	rs4262	C	T	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.551;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=524;ReadPosRankSum=-0.118;SC=AGAGCTAGCCCGAGCCCGGTT;SOR=2.683;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=22;WE=93551436;WS=93551418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr7	93555311	rs180233	A	C	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=300;SC=TTAAAAACTTATTGTATTCAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=93555319;WS=93555301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	94027531	rs79831951	T	C	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=68;ReadPosRankSum=-0.623;SC=GACATGTTGGTAAAATTTTAA;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=4;WE=94027539;WS=94027521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr7	94028427	rs4729131	G	A	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.220;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=450;ReadPosRankSum=2.114;SC=AAAGGGCTTCGTCCCGTATTT;SOR=0.382;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=65;TCF=23;TCR=42;TR=23;WE=94028435;WS=94028417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,25:0.36:70
chr7	94033800	rs406226	A	G	112.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=1;PP=86;SC=AGTTGGTCATATCTGACCCCA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=94033808;WS=94033790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	94034848	rs810687	A	G	985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=3;PP=748;SC=TTAATTTGTCACTCTGTGCTT;SOR=4.294;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=33;WE=94034856;WS=94034838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	94038934	rs42518	C	T	4414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=82;PP=2965;SC=AGTATACCTGCGTAGCTAAAA;SOR=1.301;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=45;TCR=82;TR=127;WE=94038942;WS=94038924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr7	94039032	rs42519	C	T	3173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=69;PP=2525;SC=TTTTCCTTCACAGGGCCTTCC;SOR=1.935;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=26;TCR=69;TR=95;WE=94039040;WS=94039022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr7	94039900	rs42520	C	T	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=83;SC=TACCCCTTCACTGGGAATTGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=94039908;WS=94039890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	94040133	rs389328	T	A	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=0;PP=857;SC=TGCTATTTTTTACAAACTCTA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=94040141;WS=94040123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	94040179	rs41316935	T	C	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.813;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=2;PP=918;ReadPosRankSum=-0.495;SC=TAATTCTCTCTATTTCATGTA;SOR=2.584;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=58;TCF=52;TCR=6;TR=36;WE=94040187;WS=94040169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,36:0.60:60
chr7	94040287	rs34026686	G	A	2067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.485;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.830;NF=32;NR=43;PP=1589;ReadPosRankSum=0.146;SC=CCTAGAAAGGGGCTTGCTGCT;SOR=0.936;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=123;TCF=57;TCR=66;TR=75;WE=94040295;WS=94040277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,77:0.60:128
chr7	94040345	rs35587403	GT	G	188.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=1.179;QD=5.72;ReadPosRankSum=1.138;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr7	94040509	rs77347506	C	T	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=173;ReadPosRankSum=2.039;SC=CCTGGCATTACTTCCTTCTTT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=9;WE=94040517;WS=94040499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr7	94041937	rs412777	A	C	1569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.400;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=19;PP=1123;ReadPosRankSum=1.701;SC=CAATTGGCCCAGCTGGAGCAA;SOR=1.539;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=84;TCF=53;TCR=31;TR=58;WE=94041945;WS=94041927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,59:0.69:86
chr7	94043239	rs42524	C	G	1716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=31;PP=1413;SC=ACAGGGTCCCCCTGGTCCTCC;SOR=0.914;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=58;TCF=27;TCR=31;TR=57;WE=94043247;WS=94043229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr7	94044667	rs41317156	C	T	1715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.936;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=43;PP=1325;ReadPosRankSum=0.861;SC=CCACTGATGACCCTGCAACAA;SOR=1.105;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=96;TCF=29;TCR=67;TR=58;WE=94044675;WS=94044657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,62:0.62:100
chr7	94045576	rs42526	G	A	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=0.366;SC=CTAGTGGAGAGATTAGGAACA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=94045584;WS=94045566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr7	94046962	rs41317171	GA	G	902.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=955;ReadPosRankSum=-0.400;SC=GTTTAAATTGGAATTCTTCTA;SOR=0.693;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=27;WE=94046970;WS=94046952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,28:0.78:36
chr7	94047677	rs42527	C	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=44;ReadPosRankSum=-0.722;SC=GGTAAGGAATCGAGACATTGC;SOR=0.434;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=5;WE=94047685;WS=94047667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr7	94047913	rs68023599	TA	T	388.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.091;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.391;NF=0;NR=15;PP=517;ReadPosRankSum=0.696;SC=ATTTTTTTTTTATGTTTGAAT;SOR=1.901;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=15;WE=94047921;WS=94047903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr7	94056006	rs400218	A	G	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=228;ReadPosRankSum=-0.199;SC=GCTATTTCATACCAACATGAA;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=11;WE=94056014;WS=94055996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr7	94056244	rs413826	C	G	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQRankSum=-0.596;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.590;SOR=0.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr7	94056251	rs199900944	GAA	G,GA	496.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.60;MQRankSum=0.588;QD=20.70;ReadPosRankSum=1.260;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:2,10,12:0.42,0.50:24
chr7	94058395	.	T	C	413	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=29;MQ=57.5;NF=15;NR=0;PP=413;QD=29.8514141698;SC=GATCTGAGTCTACTCTTCCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=94058403;WS=94058385;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr7	94157585	rs57770781	CT	C	396.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=-0.629;QD=11.67;ReadPosRankSum=-0.829;SOR=0.341;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,23:0.68:34
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chr7	94176627	rs6958243	G	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.88;ReadPosRankSum=-2.260;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr7	94178749	rs10272136	T	C	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=0;PP=716;ReadPosRankSum=0.743;SC=GACTCTTATATAATCCAAACT;SOR=2.362;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=30;WE=94178769;WS=94178739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,30:0.77:39
chr7	94178761	rs7801436	C	T	1968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=2;PP=1490;SC=ATCCAAACTTCAGAAAACTAT;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=46;TCR=2;TR=48;WE=94178769;WS=94178739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr7	94182373	rs6465417	A	G	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.452;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=282;ReadPosRankSum=0.665;SC=GCGTTGTACAACTTATGCAAT;SOR=1.765;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=13;WE=94182381;WS=94182363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr7	94183993	rs10280843	G	A	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=392;ReadPosRankSum=-1.538;SC=TATGAAAATCGGACGTACTTT;SOR=0.275;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=17;WE=94184001;WS=94183983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr7	94184691	rs10238176	T	A	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=303;ReadPosRankSum=0.118;SC=AATAAAATGGTTTTAGGAAAG;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=12;WE=94184699;WS=94184681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr7	94217190	rs7783198	A	T	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.088;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=316;ReadPosRankSum=-1.112;SC=CACATTTCTGAATGTGCCTGA;SOR=0.849;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=67;TCF=33;TCR=34;TR=24;WE=94217198;WS=94217180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,25:0.36:70
chr7	94227276	rs10247562	T	G	182.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=57.57;NF=6;NR=1;PP=143;SC=CCAAGATCGCTCCATTGCACT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=94227284;WS=94227266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr7	94227509	rs10232398	G	A	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=110;SC=CCTCACCCTTGTCTACTCCTT;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=94227517;WS=94227499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	94247971	rs6465421	C	A	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=0;PP=609;SC=CTTATTAAAACGAAAAATGCA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=94247979;WS=94247961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	94252712	rs17166384	A	G	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=154;ReadPosRankSum=1.240;SC=GCAGTTATCTATTATAAAAGG;SOR=0.919;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=18;TCR=13;TR=12;WE=94252720;WS=94252702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr7	94257449	rs138881114	T	TAC	402.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.971;NF=14;NR=1;PP=636;ReadPosRankSum=-0.658;SC=CAAATTACAATACACACACAC;SOR=0.922;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=15;WE=94257457;WS=94257439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr7	94879225	rs12690919	A	T	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=395;SC=TCTCAAGTGGATTCAGTGATT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=94879233;WS=94879215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	94897803	rs7793427	G	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=93;ReadPosRankSum=-0.227;SC=AGTGTCTGTGGTCTCTTCATC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=6;WE=94897811;WS=94897793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr7	94898811	rs854524	G	A	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.031;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=31;PP=653;ReadPosRankSum=-0.421;SC=AAAATATTACGAGAAAAAGGT;SOR=0.409;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=25;TCR=99;TR=39;WE=94898819;WS=94898801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,40:0.32:126
chr7	94931433	.	ACC	A	286.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.46;MQRankSum=-4.001;QD=13.03;ReadPosRankSum=-0.114;SOR=0.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr7	94931437	.	AG	A	275.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.19;MQRankSum=-4.966;QD=10.21;ReadPosRankSum=-1.083;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr7	94931440	.	ATTGAGAATTATGTTGTCAACTG	A	190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=2.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.63;MQRankSum=-6.271;QD=4.65;ReadPosRankSum=-2.419;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,7:0.17:41
chr7	94937446	rs662	T	C	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.532;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=36;PP=743;ReadPosRankSum=-1.373;SC=CTCCCAGGATTGTAAGTAGGG;SOR=1.211;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=148;TCF=49;TCR=99;TR=49;WE=94937454;WS=94937436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,51:0.33:155
chr7	94941038	rs1157745	G	T	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=53;ReadPosRankSum=-0.086;SC=GAGAAGCATTGGTGATTGCTC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=5;WE=94941046;WS=94941028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr7	94944923	rs854556	C	T	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.166;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=30;PP=657;ReadPosRankSum=-0.923;SC=GCCAGATGGCCACATAGGAAG;SOR=3.145;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=30;WE=94944931;WS=94944913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,32:0.70:46
chr7	94946084	rs854560	A	T	4301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=87;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.805;SC=AGTATCTCCAAGTCTTCAGAG;SOR=0.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=265;TCF=125;TCR=140;TR=163;WE=94946092;WS=94946074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,165:0.59:280
chr7	94953913	rs705380	G	C	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=26;PP=690;SC=CCGCCGGGTCGGCAGCTAGCT;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=94953921;WS=94953903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	94989255	.	CT	C	131.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=2.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.87;ReadPosRankSum=1.439;SOR=1.449;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
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chr7	95024189	rs17885341	TG	T	401.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=329;ReadPosRankSum=-1.177;SC=ATTTACATAATGTAGACATTA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=10;WE=95024197;WS=95024179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr7	95025600	rs13226149	G	A	4794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=95;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.888;SC=TAAACGCCAGGAACATCTCCC;SOR=0.877;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=260;TCF=119;TCR=141;TR=173;WE=95025608;WS=95025590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,175:0.67:260
chr7	95034775	rs7493	G	C	2480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.712;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=64;PP=2115;ReadPosRankSum=-1.434;SC=AGGCTTCTCAGATAGAATGTT;SOR=0.629;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=137;TCF=39;TCR=98;TR=90;WE=95034783;WS=95034765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,89:0.64:140
chr7	95035582	rs3735586	A	T	1414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.273;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=45;PP=1133;ReadPosRankSum=1.071;SC=AAATTGTCAAAATCTAAATGA;SOR=1.888;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=73;TCF=13;TCR=60;TR=52;WE=95035590;WS=95035572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,52:0.70:74
chr7	95039445	rs2286232	C	T	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.567;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=31;PP=967;ReadPosRankSum=0.094;SC=TGAGAGGAAACAAAAGGCCTG;SOR=1.464;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=67;TCF=23;TCR=44;TR=46;WE=95039453;WS=95039435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,49:0.71:69
chr7	95041016	rs12026	G	C	2144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=4.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.802;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=50;PP=1686;ReadPosRankSum=1.379;SC=AGAATTTTCTGCTTCTTCAAA;SOR=0.551;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=113;TCF=29;TCR=84;TR=68;WE=95041024;WS=95041006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,75:0.62:120
chr7	95041542	rs2068604	G	T	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-5.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=1;PP=894;ReadPosRankSum=-0.821;SC=TCTCTTCCTAGAAATATGATC;SOR=1.426;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=51;TCF=49;TCR=2;TR=36;WE=95041550;WS=95041532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,41:0.73:56
chr7	95115499	rs143019035	CT	C	298.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.901;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.509;NF=1;NR=9;PP=307;ReadPosRankSum=-1.512;SC=TATTGTAGAACTGTTAGAAAA;SOR=0.051;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=10;WE=95115507;WS=95115489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr7	95125050	rs10577347	CTT	C,CT	1118.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=6.690;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.112;QD=24.32;ReadPosRankSum=0.454;SOR=2.676;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,31,14:0.67,0.30:46
chr7	95221269	rs2301630	C	T	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=183;ReadPosRankSum=1.010;SC=GAATTTTCCACAGGTTAAAAT;SOR=1.123;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=11;WE=95221277;WS=95221259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr7	95442405	rs11452827	C	CT	39.52	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQRankSum=-0.566;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.328;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr7	95442690	rs35397709	T	TA	310.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=4.380;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.69;MQRankSum=2.451;QD=5.45;ReadPosRankSum=-0.444;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr7	95447785	rs10590197	ATT	A	706.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=5.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.95;MQRankSum=-1.497;QD=22.09;ReadPosRankSum=-0.351;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,26:0.81:32
chr7	95447788	.	T	A	715.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=5.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.95;MQRankSum=-1.497;QD=22.37;ReadPosRankSum=1.178;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,26:0.81:32
chr7	95457198	rs41278815	C	T	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=0;PP=870;ReadPosRankSum=0.887;SC=GATGGCTCCTCGATTTCTCTT;SOR=1.651;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=36;WE=95457206;WS=95457188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,38:0.68:56
chr7	95499066	rs3757696	C	A	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=2.920;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.160;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=116;ReadPosRankSum=0.825;SC=TGCTTCATGACCCTGCCCCTT;SOR=3.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6;WE=95499074;WS=95499062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr7	95499234	rs3757697	A	G	2125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.724;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=27;PP=1519;ReadPosRankSum=-0.674;SC=AGGTCACCCAAGTGGATTTCC;SOR=1.016;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=107;TCF=64;TCR=43;TR=71;WE=95499242;WS=95499224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,75:0.69:109
chr7	95616309	rs17705339	T	C	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=315;ReadPosRankSum=-1.137;SC=TCAGTGCTTCTATATGAGCAG;SOR=0.527;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=15;WE=95616317;WS=95616299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr7	95709602	rs42083	C	T	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.247;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=466;ReadPosRankSum=1.077;SC=TCCAGTTAAACGTATTATTGT;SOR=2.179;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=20;WE=95709610;WS=95709592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,22:0.81:27
chr7	95709666	rs42082	C	A	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=3;PP=701;ReadPosRankSum=-0.442;SC=GTTGTGAACCCTTTGGCAGGT;SOR=0.748;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=29;WE=95709674;WS=95709656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,32:0.74:43
chr7	95727014	rs7794344	T	C	1034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=824;SC=ATTGCTGTGATATTTTGGGTG;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=95727022;WS=95727004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	95739400	rs114714671	A	G	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=2.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.856;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,51:0.27:189
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chr7	95775848	rs72289549	TA	T	354.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.43;ReadPosRankSum=-1.497;SOR=0.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,28:0.35:80
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chr7	97369341	rs62499562	G	A	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=163;ReadPosRankSum=-0.338;SC=ACAATTGTTTGGGGTTGAAAA;SOR=1.473;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=9;WE=97369349;WS=97369331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr7	97484128	rs41278824	A	C	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=337;ReadPosRankSum=-1.716;SC=AACTGAACAGAGGTAAGCAAT;SOR=0.941;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=20;WE=97484136;WS=97484118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,25:0.74:34
chr7	97498162	rs77495690	G	A	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=427;ReadPosRankSum=0.063;SC=TAACATCATCGTAACCAACAA;SOR=0.359;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=52;TCR=0;TR=19;WE=97498170;WS=97498152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,22:0.39:56
chr7	97593821	rs147917056	A	G	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=1.545;SC=ATATTCCAACAGGATGTTACT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=97593829;WS=97593811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr7	97614356	rs115162473	C	T	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.831;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.363;NF=9;NR=27;PP=645;ReadPosRankSum=-0.148;SC=ACAGACATGCCGTGGCCAGTG;SOR=1.407;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=130;TCF=47;TCR=83;TR=36;WE=97614364;WS=97614346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,37:0.28:133
chr7	97783958	rs10499943	G	A	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=366;ReadPosRankSum=1.787;SC=AGAATAGAAGGTCACCTGCTT;SOR=0.289;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=59;TCF=57;TCR=2;TR=20;WE=97783966;WS=97783948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,22:0.37:60
chr7	97784061	rs17435590	T	C	3094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=54;PP=2238;ReadPosRankSum=0.372;SC=AACTGTTCTTTGATTTTAGGT;SOR=0.568;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=186;TCF=105;TCR=81;TR=117;WE=97784069;WS=97784051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,122:0.64:192
chr7	97800993	rs35943072	A	C	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.969;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=143;ReadPosRankSum=2.464;SC=ACAGGTGGGTACCTGCGTCAG;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=8;WE=97801001;WS=97800983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr7	97816327	rs6465657	C	T	2491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.799;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=73;PP=1926;ReadPosRankSum=-0.307;SC=ATTGGCTTACCGTTTTATTAG;SOR=0.809;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=141;TCF=25;TCR=116;TR=88;WE=97816335;WS=97816317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,93:0.62:149
chr7	97820868	rs11451148	C	CA	138.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.65;MQRankSum=2.763;QD=3.56;ReadPosRankSum=0.589;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr7	97821855	rs56204700	T	C	2447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.849;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=73;PP=1941;ReadPosRankSum=0.364;SC=CCCCGTAAGATTTTTGACAGT;SOR=1.510;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=303;TCF=113;TCR=190;TR=100;WE=97821863;WS=97821845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:215,101:0.32:316
chr7	97822115	rs11765552	T	A	5455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.266;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=94;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.346;SC=TAAGCCAGGCTTGTCTTTGTT;SOR=0.453;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=274;TCF=148;TCR=126;TR=195;WE=97822123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,202:0.71:285
chr7	97822210	rs3801294	G	A	5018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=6.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.544;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=75;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.814;SC=AGTCTTCCCCGGAAGTGCAGG;SOR=0.584;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=258;TCF=144;TCR=114;TR=169;WE=97822218;WS=97822200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,176:0.65:270
chr7	97823125	rs3801296	G	A	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=22.131;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=34;PP=894;ReadPosRankSum=-0.126;SC=CCGAGAAAAGGTCTGAGGAGG;SOR=1.135;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=181;TCF=96;TCR=85;TR=54;WE=97823133;WS=97823115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,56:0.30:185
chr7	97823629	rs10268268	A	G	2372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.152;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=46;PP=1770;ReadPosRankSum=-0.987;SC=GGATGGATGCAGACGAGGAGG;SOR=0.893;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=313;TCF=170;TCR=143;TR=111;WE=97823637;WS=97823619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,114:0.35:324
chr7	97841618	rs10270045	G	C	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.725;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=353;ReadPosRankSum=-1.173;SC=GCCAGTCCAGGGCCATGAAGA;SOR=0.916;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=100;TCF=47;TCR=53;TR=28;WE=97841626;WS=97841608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,31:0.29:107
chr7	97846856	rs11471393	CGAG	C	2012.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.549;NF=12;NR=30;PP=1810;ReadPosRankSum=-0.501;SC=CTCGGGGACTCGAGGATCCTG;SOR=0.638;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=57;TCF=16;TCR=41;TR=42;WE=97846866;WS=97846846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,50:0.79:63
chr7	97846936	rs116762009	G	A	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.936;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=74;ReadPosRankSum=-0.375;SC=CACAGTGGTCGTCCCGTCTTC;SOR=1.405;SbPval=0.03;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=7;WE=97846944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,7:0.21:33
chr7	97851109	rs4729416	T	C	998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=32;PP=731;SC=TTCTCCTCCTTGCATGGGCCA;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=97851117;WS=97851099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
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chr7	97874143	rs3816944	C	A	2148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.009;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=20;PP=1785;ReadPosRankSum=1.752;SC=CAGGGACAGGCGGGAGGCACC;SOR=0.924;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=71;TCR=27;TR=74;WE=97874151;WS=97874133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,74:0.76:97
chr7	97920270	rs7778015	T	C	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=209;ReadPosRankSum=0.065;SC=TGTAGCTGGGTGGTGGGGTGG;SOR=0.892;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=9;WE=97920278;WS=97920260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr7	97921834	rs6465664	A	G	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=361;ReadPosRankSum=-1.668;SC=TTGGCAGCCAAAGATGATTTC;SOR=0.412;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=15;WE=97921842;WS=97921824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr7	97922773	rs12873	T	C	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=157;ReadPosRankSum=0.366;SC=GCAGACAGGATGCGCCCATCA;SOR=0.180;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=9;WE=97922781;WS=97922763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr7	97922851	rs12728	C	T	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.377;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=365;ReadPosRankSum=0.637;SC=TGATGGGTGCCGAGCGATCAT;SOR=2.115;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=18;WE=97922859;WS=97922841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr7	97923312	rs73147337	G	A	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.023;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=326;ReadPosRankSum=-1.014;SC=GCTGGGCACCGAAGGCCCTTC;SOR=0.160;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=16;WE=97923320;WS=97923302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr7	97933601	rs1045916	C	T	3767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=45;PP=2914;SC=CCCCCATGGACAAGCATTCCA;SOR=1.379;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=79;TCR=45;TR=124;WE=97933609;WS=97933591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr7	97935671	rs13232181	C	G	2070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.133;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=11;PP=1705;ReadPosRankSum=-0.453;SC=GCCTGCGACACAGCTAGATGG;SOR=0.491;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=105;TCF=90;TCR=15;TR=71;WE=97935679;WS=97935661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,71:0.69:103
chr7	97937258	rs6465666	T	C	3922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.520;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=55;PP=2962;ReadPosRankSum=0.768;SC=TGAGAATCAATAGGCACATTC;SOR=0.655;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=217;TCF=133;TCR=84;TR=141;WE=97937266;WS=97937248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,146:0.65:225
chr7	97939998	rs139666268	C	CTATTTATT	435.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=397;ReadPosRankSum=-0.271;SC=AAATAATAGGCTATTTATTTA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=7;WE=97940006;WS=97939988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr7	97944744	rs2107716	G	A	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.519;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=536;ReadPosRankSum=0.009;SC=TTATTAATACGCTCAAGGCAA;SOR=0.151;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=26;WE=97944752;WS=97944734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr7	97944931	.	A	AAATAATAAT	2994	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=12;HapScore=4;MGOF=5;MMLQ=29;MQ=63.7;NF=3;NR=20;PP=2994;QD=20;SC=CATACTAAAAAAAAAAAAATA;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=23;WE=97944945;WS=97944921;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr7	97944933	rs11385557	A	AT	1155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.70;MQRankSum=3.250;QD=24.08;ReadPosRankSum=0.554;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr7	97944935	rs11385558	A	AT	1152.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.87;MQRankSum=3.250;QD=24.02;ReadPosRankSum=0.288;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr7	97944937	.	A	ATAATAAT	1153.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.598;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.87;MQRankSum=3.250;QD=24.04;ReadPosRankSum=-0.181;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr7	97944986	rs6963210	G	A	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.435;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=54;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=89;ReadPosRankSum=-0.114;SC=ATCAGATAGCGTGCAGCCTGA;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6;WE=97944994;WS=97944976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr7	97984427	.	T	G	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.477;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.410;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=945;ReadPosRankSum=-0.984;SC=AGGCTTTTCCTGCCAGGATCA;SOR=0.379;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=45;WE=97984435;WS=97984417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,46:0.66:70
chr7	97991792	rs3801257	A	G	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=31;PP=853;ReadPosRankSum=-0.306;SC=AAAATAAACCAAGTCATCTTC;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=61;TCF=13;TCR=48;TR=40;WE=97991800;WS=97991782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,43:0.63:68
chr7	98254562	rs11763387	C	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=130;ReadPosRankSum=-0.947;SC=CCGTCCTCGCCCTCCTCGGGC;SOR=1.071;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=8;WE=98254570;WS=98254552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
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chr7	98460824	rs10238224	C	A	3678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=41;PP=2776;ReadPosRankSum=0.403;SC=CGTGGCCGACCACACGGATGG;SOR=0.673;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=139;TCR=62;TR=133;WE=98460832;WS=98460814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,142:0.67:213
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chr7	98503707	rs3214239	TG	T	1194.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=1;PP=1305;SC=CATATCAGACTGGCGGGCTGG;SOR=5.610;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=32;WE=98503715;WS=98503697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	98504025	rs139837317	TTTTATTTATTTA	T,TTTTATTTA	508.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;MQ=59.92;NF=0,0;NR=7,7;PP=265,777;SC=TTTGTTTTTGTTTTATTTATT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=7,7;WE=98504044;WS=98504015;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.75,0.25:12
chr7	98513300	rs1859662	C	T	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.082;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=435;ReadPosRankSum=-1.112;SC=GGGTATAGACCCTCCTCATTT;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=18;WE=98513308;WS=98513290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr7	98522893	rs6967096	C	T	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=539;ReadPosRankSum=0.422;SC=CCAAGTATGTCGGCCACTTCC;SOR=0.616;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=7;TCR=58;TR=26;WE=98522901;WS=98522883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,26:0.38:69
chr7	98522922	rs114389277	A	T	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=273;ReadPosRankSum=-1.239;SC=GGTTGGGTGGATCCTGTTTTA;SOR=0.307;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=15;WE=98522930;WS=98522912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr7	98527918	rs73395107	G	A	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=293;ReadPosRankSum=-1.243;SC=TAAGAATTGCGGCCAGACGCA;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=15;WE=98527926;WS=98527908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr7	98534920	rs310736	T	A	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=613;ReadPosRankSum=1.111;SC=TGTGCGTGCGTGTATGCGCAC;SOR=0.532;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=84;TCF=16;TCR=68;TR=33;WE=98534928;WS=98534910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,32:0.37:86
chr7	98548682	.	C	CTGTGTG	149	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=59.73;NF=0;NR=3;PP=149;QD=50.6666666667;SC=GGATGAACATCTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=3;WE=98548690;WS=98548672;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:16,3:0.16:19
chr7	98550654	rs66469618	TTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG	T,TTGTGTGTGTG	1906.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.063;HP=1;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.372;NF=5;NR=1;PP=1635;ReadPosRankSum=-0.861;SC=TCATGTTACATTGTGTGTGTG;SOR=2.106;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=6;WE=98550693;WS=98550644;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.74,0.18:57
chr7	98553739	rs3214240	T	TC	140.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=200;SC=GCTCCCATGTTCCGGCGTGAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=98553747;WS=98553729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	98558880	rs160384	G	C	2565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=15;PP=2241;ReadPosRankSum=-0.620;SC=GTTGTCCATTGCAGGAGCAGC;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=80;TCF=65;TCR=15;TR=79;WE=98558888;WS=98558870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,78:0.99:79
chr7	98563626	rs160387	A	G	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=184;ReadPosRankSum=1.559;SC=TTTCTGCTGTAATTGCACTCA;SOR=0.560;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=11;WE=98563634;WS=98563616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,12:0.29:42
chr7	98574830	rs219842	C	G	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.878;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=99;ReadPosRankSum=-0.441;SC=TGTCGCCCAGCCTGGAGTGCA;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=98574838;WS=98574820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr7	98588337	.	A	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.930;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=189;ReadPosRankSum=-0.899;SC=TGAGTGTTCAAAGTATTAAAA;SOR=1.286;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=11;WE=98588345;WS=98588327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr7	98602990	rs219838	G	C	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.152;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=31;PP=635;ReadPosRankSum=0.376;SC=GAGAGCCACAGCTCGCTGGGT;SOR=0.482;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=113;TCF=14;TCR=99;TR=37;WE=98602998;WS=98602980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,38:0.32:118
chr7	98608606	rs62472037	T	A	2267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.006;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=17;PP=1771;ReadPosRankSum=-0.786;SC=GAATTGCAATTTGAGAATTTT;SOR=1.438;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=120;TCF=91;TCR=29;TR=80;WE=98608614;WS=98608596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,83:0.69:121
chr7	98637916	rs3033104	ACG	A	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.93;MQRankSum=2.997;QD=2.09;ReadPosRankSum=-0.601;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr7	98643446	rs369114967	T	A	1709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.186;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=47;PP=1323;ReadPosRankSum=-0.142;SC=CATCACAGTTTCAGAGAGAAG;SOR=0.601;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=201;TCF=69;TCR=132;TR=72;WE=98643454;WS=98643436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,74:0.36:204
chr7	98645517	rs219824	G	A	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=785;ReadPosRankSum=-0.787;SC=TTGAGAAGAAGAGATGCAGAA;SOR=5.353;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=29;WE=98645525;WS=98645507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr7	98647139	rs219826	C	T	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.838;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=4;PP=874;ReadPosRankSum=-0.105;SC=AGAAAGCATTCGATTACCAAT;SOR=0.299;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=64;TCF=59;TCR=5;TR=40;WE=98647147;WS=98647129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,43:0.66:65
chr7	98647355	.	G	C	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.336;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=253;ReadPosRankSum=0.193;SC=AAGATACAGAGAGGTTTGTCC;SOR=0.434;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=60;TCF=11;TCR=49;TR=17;WE=98647363;WS=98647345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,17:0.27:63
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chr7	98650051	rs219797	G	C	2284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=69;PP=1864;SC=TCCCAGGCCCGGAGTCTTCAT;SOR=3.456;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=12;TCR=69;TR=81;WE=98650059;WS=98650041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr7	98650099	rs219798	T	C	1513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=56;PP=1327;SC=GCAGGCATGGTGTCACCATGG;SOR=8.015;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=0;TCR=56;TR=56;WE=98650107;WS=98650089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	98655223	rs61690993	G	T	2677.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.72;MQRankSum=0.054;QD=42.50;ReadPosRankSum=1.679;SOR=1.917;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr7	98655224	rs34014072	T	TG	2668.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.72;MQRankSum=0.054;QD=42.36;ReadPosRankSum=1.679;SOR=1.917;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr7	98655231	rs71537231	T	TG	2382.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.67;QD=44.96;SOR=3.300;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr7	98655235	.	T	G	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=5.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=0.023;QD=4.77;ReadPosRankSum=-0.136;SOR=1.969;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr7	98775511	rs62473048	T	C	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=3;PP=860;ReadPosRankSum=-0.486;SC=CCAAGACCCCTGGATACTCCT;SOR=0.499;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=61;TCF=57;TCR=4;TR=37;WE=98775519;WS=98775501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,39:0.63:62
chr7	98779740	rs6465740	G	T	2394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=58;PP=1879;SC=AACCTAAATAGAGGACACCAA;SOR=2.630;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=74;TCF=15;TCR=59;TR=73;WE=98779748;WS=98779730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr7	98782943	rs373292564	T	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=186;ReadPosRankSum=0.000;SC=CATTATTCAATTCATCCATGG;SOR=0.195;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=12;WE=98782951;WS=98782933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr7	98790607	rs369709836	TA	T	357.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=6.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=1.464;QD=4.16;ReadPosRankSum=-1.024;SOR=0.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,28:0.33:86
chr7	98790650	rs202149995	T	G	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=67.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=1.706;QD=0.84;ReadPosRankSum=1.733;SOR=6.431;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,45:0.26:174
chr7	98870997	rs28608208	A	G	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.169;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=536;ReadPosRankSum=-1.478;SC=CAGAACGTGCACAAGTTCCTG;SOR=1.148;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=84;TCF=33;TCR=51;TR=32;WE=98871005;WS=98870987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,31:0.38:81
chr7	98955804	rs2286162	T	C	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.618;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=330;ReadPosRankSum=0.303;SC=GCCCCTGTCTTGAGAGGCCTG;SOR=0.133;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=49;TCF=45;TCR=4;TR=18;WE=98955812;WS=98955794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,18:0.38:48
chr7	98963340	rs10268984	C	T	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=242;ReadPosRankSum=-1.799;SC=GGGGGAGCCCCGGCCTGGAGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=13;WE=98963348;WS=98963330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
chr7	98984399	rs4765	C	T	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=366;ReadPosRankSum=1.589;SC=AGGAGCACAACGGGCAGGTGA;SOR=0.570;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=20;WE=98984407;WS=98984389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr7	98985580	rs73710454	T	C	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=200;ReadPosRankSum=-0.152;SC=TGGTGGCCTTTCAGCCTCTCC;SOR=0.653;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=11;WE=98985588;WS=98985570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr7	98987465	rs73710455	C	T	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=1.222;SC=GTCCCTGGTGCTGAGGTCCAT;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=5;WE=98987473;WS=98987455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr7	98991944	rs10243678	C	T	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=49;ReadPosRankSum=-0.120;SC=TCCAACCCAGCTGACAGACTC;SOR=0.446;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=4;WE=98991952;WS=98991934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr7	98992253	rs704798	G	T	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.651;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=183;ReadPosRankSum=0.669;SC=AAAGGGAGGGGACAGATGGGG;SOR=0.330;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=12;WE=98992261;WS=98992243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr7	99002476	rs116176931	C	A	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=152;ReadPosRankSum=-1.111;SC=TGGACAGGCACGTACTCACCC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=9;WE=99002484;WS=99002467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr7	99009409	rs149676939	C	T	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=394;ReadPosRankSum=0.912;SC=CTCACTGCAACCTCTGCCTCC;SOR=1.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=17;WE=99009417;WS=99009399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr7	99013565	rs144723806	CTTATT	C	744.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.813;NF=19;NR=0;PP=828;ReadPosRankSum=0.023;SC=TATAACTATTCTTATTTTATT;SOR=0.481;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=54;TCR=0;TR=19;WE=99013577;WS=99013558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr7	99022641	rs114157830	G	A	1746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.815;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=54;PP=1363;ReadPosRankSum=0.433;SC=CAGCAGCAAGGACTCTGCAGG;SOR=0.955;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=201;TCF=56;TCR=145;TR=72;WE=99022649;WS=99022631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,74:0.36:207
chr7	99023246	rs28457808	C	G	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.495;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=99;ReadPosRankSum=-0.291;SC=ACACCTGCCACGGAAGAGACA;SOR=0.502;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=7;WE=99023254;WS=99023236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr7	99026837	rs2240385	G	A	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.417;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=49;PP=1184;ReadPosRankSum=-0.412;SC=CCTGGGGGAGGGAACAAAGAC;SOR=1.119;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=159;TCF=42;TCR=117;TR=62;WE=99026845;WS=99026827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,65:0.40:162
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chr7	99047978	rs883403	T	C	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.777;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=487;ReadPosRankSum=-1.642;SC=GGTATGACCGTGGCTTCTGCA;SOR=0.499;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=103;TCF=34;TCR=69;TR=34;WE=99047986;WS=99047968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,34:0.30:112
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chr7	99081730	rs6962772	A	G	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=2.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.24;ReadPosRankSum=-0.232;SOR=0.984;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,22:0.24:93
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chr7	99145611	rs146034331	A	G	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.789;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=30;PP=980;ReadPosRankSum=0.217;SC=GTTGGATTGCAAAGTCTATAC;SOR=0.432;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=174;TCF=76;TCR=98;TR=62;WE=99145619;WS=99145601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,61:0.33:184
chr7	99145845	rs10238965	C	T	1362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.083;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=20;PP=1058;ReadPosRankSum=-0.613;SC=AATACGATGACAATAAGGCTC;SOR=0.478;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=145;TCF=94;TCR=51;TR=53;WE=99145853;WS=99145835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,57:0.36:157
chr7	99158402	rs3800960	G	A	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.333;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=151;ReadPosRankSum=-0.512;SC=GTTTGAGAGAGGCCAAGAACT;SOR=0.162;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=12;WE=99158410;WS=99158392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,12:0.24:49
chr7	99293475	rs2740565	T	A	4818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=96;NR=50;PP=2965;SC=ACAAACTGAATCAGAAATCAG;SOR=1.486;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=96;TCR=51;TR=146;WE=99293483;WS=99293465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr7	99293859	rs11401860	C	CT	997.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=4.760;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.20;MQRankSum=0.430;QD=18.82;ReadPosRankSum=0.329;SOR=0.203;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:7,46:0.87:53
chr7	99297601	rs2037500	A	C	5182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=62;PP=2965;SC=AGAGGAGCACAAGGCTGACAG;SOR=1.262;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=102;TCR=62;TR=163;WE=99297609;WS=99297591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr7	99297804	rs2177180	C	T	1007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=28;PP=784;SC=GAGAAGGAGGCGGGGCTGCAG;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=99297812;WS=99297794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	99302994	rs10211	C	T	3962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=95;NR=23;PP=2965;SC=ACAGAATCCCCGATTATTTAT;SOR=2.853;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=120;TCF=97;TCR=23;TR=118;WE=99303002;WS=99302984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr7	99303094	rs12360	G	A	4713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=88;PP=2965;SC=CAGCTTTCTTGAAGAGCAAAC;SOR=1.340;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=49;TCR=88;TR=137;WE=99303102;WS=99303084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr7	99306566	rs2687077	C	T	1680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=0;PP=1401;SC=GACAAGCAAACGATTGTACAA;SOR=7.903;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=50;TCR=0;TR=50;WE=99306574;WS=99306556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	99306685	rs2257401	C	G	5538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=94;NR=73;PP=2965;SC=CTCAGGCTCTCTCCAGTACTT;SOR=0.983;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=94;TCR=73;TR=167;WE=99306693;WS=99306675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr7	99308452	rs61737520	G	T	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.892;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.781;NF=25;NR=26;PP=963;ReadPosRankSum=0.287;SC=AACACTGCTCGTGGTTTCATA;SOR=0.467;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=179;TCF=99;TCR=80;TR=51;WE=99308460;WS=99308442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,53:0.28:187
chr7	99314986	rs2687075	A	G	7426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=121;NR=98;PP=2965;SC=GTGACATTGTATAATGAATTT;SOR=0.896;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=219;TCF=121;TCR=98;TR=219;WE=99314994;WS=99314976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr7	99365943	rs2687116	C	A	2703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=29;PP=2107;SC=TTTAAGAGAGCAAGATAAATA;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=51;TCR=29;TR=80;WE=99365951;WS=99365933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr7	99370493	rs2738258	T	C	927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=31;PP=904;SC=CAGGAGCCACTCAAGTCTTCA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=99370501;WS=99370483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	99490501	rs6957718	T	A	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=72;ReadPosRankSum=0.265;SC=GCTGCCCAACTGATCCTCAGC;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=99490509;WS=99490491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr7	99499799	rs117674278	T	C	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.153;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=218;ReadPosRankSum=1.043;SC=TTTTAGTTGCTGCAGACAAGA;SOR=0.204;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=30;TCF=12;TCR=18;TR=15;WE=99499807;WS=99499789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr7	99499872	rs2527913	A	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=58;ReadPosRankSum=0.800;SC=GGTTCTTTTTAGTTTGTTTGT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=5;WE=99499880;WS=99499862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr7	99500911	rs2247761	A	G	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.891;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=26;PP=924;ReadPosRankSum=-0.829;SC=CAGCTTCAAGAGAATAGTTCA;SOR=0.495;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=162;TCF=74;TCR=88;TR=52;WE=99500919;WS=99500901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,55:0.32:170
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chr7	99507353	rs2572001	T	G	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=5.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.39;MQRankSum=0.596;QD=3.87;ReadPosRankSum=0.942;SOR=0.034;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,13:0.28:47
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chr7	99694784	rs115073631	C	G	1457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=4;PP=1639;ReadPosRankSum=-0.125;SC=TCAAAATCCTCGCCTCAAATG;SOR=0.693;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=56;TCF=51;TCR=5;TR=36;WE=99694792;WS=99694761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,38:0.63:60
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chr7	99699626	rs2293481	T	C	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=613;ReadPosRankSum=-0.585;SC=AGGAGCGGGGTCCCGTCGGGC;SOR=0.353;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=67;TCF=12;TCR=55;TR=33;WE=99699634;WS=99699616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,38:0.55:69
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chr7	99706303	rs4134923	A	G	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.675;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=221;ReadPosRankSum=-0.696;SC=GCCCCTGTTGAAGGCCAAATT;SOR=0.346;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=9;WE=99706311;WS=99706293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr7	99707712	rs2272338	A	G	3454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.012;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=48;PP=2724;ReadPosRankSum=-0.494;SC=AGAAGGGAAAAGGACAAGCAA;SOR=0.427;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=173;TCF=109;TCR=64;TR=121;WE=99707720;WS=99707702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,123:0.70:176
chr7	99707950	rs4134917	C	T	1545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-5.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=43;PP=1091;ReadPosRankSum=0.538;SC=GGATGATTGACAGGGACCTAA;SOR=0.495;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=82;TCF=15;TCR=67;TR=54;WE=99707958;WS=99707940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,58:0.67:86
chr7	99710584	rs4134904	A	AG	1117.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.465;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=33;PP=1352;ReadPosRankSum=-0.008;SC=TGAGCATAGTAGAAAAGTAAA;SOR=2.443;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=5;TCR=51;TR=33;WE=99710592;WS=99710574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,36:0.63:57
chr7	99720309	rs76702812	C	G	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=335;ReadPosRankSum=0.522;SC=TGGAACTCACCCTTGAATCTC;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=15;WE=99720317;WS=99720299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr7	99720640	rs1569055	C	G	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=239;ReadPosRankSum=-0.629;SC=GGGGAAGGGGCCAGAGTGAGG;SOR=1.244;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=11;WE=99720648;WS=99720630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr7	99725146	rs78225095	C	G	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.817;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=325;ReadPosRankSum=0.480;SC=GCCGACGGCTCCGTGACCCTG;SOR=0.153;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=15;WE=99725154;WS=99725136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr7	99746444	rs58185311	CG	C	548.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=638;ReadPosRankSum=-1.348;SC=GGTCTGACGACGTGGCCACTG;SOR=0.326;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=18;WE=99746452;WS=99746434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr7	99747130	rs12878	G	A	4036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.246;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=59;PP=2965;ReadPosRankSum=0.060;SC=AGACTTCTGCGCTGACCCAGG;SOR=0.605;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=131;TCF=70;TCR=61;TR=127;WE=99747138;WS=99747120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,133:0.98:136
chr7	99747378	rs7785392	G	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=82;ReadPosRankSum=-0.045;SC=TGGAATCTTAGTCTCCTAACG;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=6;WE=99747386;WS=99747368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr7	99751017	rs3736591	A	G	1619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=8;PP=1251;SC=CTCCGTCTGCATGCAGTCATC;SOR=3.076;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=49;TCR=8;TR=57;WE=99751025;WS=99751007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr7	99751281	rs3736590	G	T	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.447;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=32;PP=829;ReadPosRankSum=1.063;SC=GGGACTCCCTGGTATCAGAAT;SOR=1.159;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=152;TCF=56;TCR=96;TR=47;WE=99751289;WS=99751271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,48:0.30:162
chr7	99753121	rs2272337	A	G	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.869;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=519;ReadPosRankSum=-0.081;SC=GGCTTCCAGGACCCAGGCCTC;SOR=2.584;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=80;TCF=29;TCR=51;TR=28;WE=99753129;WS=99753111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,28:0.33:86
chr7	99754637	rs885566	G	A	3291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=60;PP=2618;ReadPosRankSum=-0.677;SC=AAGAGGACAAGGCATGGTCTC;SOR=0.595;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=192;TCF=91;TCR=101;TR=115;WE=99754645;WS=99754627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,121:0.60:202
chr7	99757612	rs3823646	G	A	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.130;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=419;ReadPosRankSum=0.160;SC=GAACTGCTTGGCATCCAGCTT;SOR=0.963;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=65;TCF=47;TCR=18;TR=22;WE=99757620;WS=99757602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,22:0.33:67
chr7	99758136	rs3800951	T	G	2270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.126;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=43;PP=1785;ReadPosRankSum=0.872;SC=AGTCCAGCCATGCCAGACCCC;SOR=0.833;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=264;TCF=140;TCR=124;TR=97;WE=99758144;WS=99758126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,97:0.36:269
chr7	99771305	rs71126309	C	CTCTT	150.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.34;MQRankSum=0.566;QD=21.53;ReadPosRankSum=0.484;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr7	99772298	rs10252037	A	C	3527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=59;PP=2715;SC=ATACTCAGGCACCCTCCAACC;SOR=1.069;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=46;TCR=59;TR=105;WE=99772306;WS=99772288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
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chr7	99780282	rs4729579	C	G	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.002;NF=35;NR=0;PP=679;ReadPosRankSum=0.511;SC=TGAAACCAAGCGTTAATGTCA;SOR=1.103;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=108;TCF=106;TCR=2;TR=35;WE=99780290;WS=99780272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,34:0.31:109
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chr7	99810643	rs1618851	T	G	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.354;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=820;ReadPosRankSum=-0.187;SC=ACTGGTGTCTTACAAACAGCA;SOR=1.026;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=47;TCF=25;TCR=22;TR=32;WE=99810651;WS=99810633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,35:0.69:51
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chr7	99811313	rs1624099	G	A	2781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.534;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=43;PP=2255;ReadPosRankSum=-0.846;SC=CGAAGTGACAGGAGTGTGTAA;SOR=0.441;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=174;TCF=107;TCR=67;TR=104;WE=99811321;WS=99811303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,105:0.59:179
chr7	99811464	rs1727130	C	G	4787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.357;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=58;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.212;SC=ATGTATCCTTCGGAAATGCTG;SOR=0.947;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=220;TCF=136;TCR=84;TR=158;WE=99811472;WS=99811454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,169:0.72:235
chr7	99816179	rs1727142	T	C	3404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.599;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.178;NF=76;NR=45;PP=2472;ReadPosRankSum=-1.620;SC=TGAGCTCTGCTGGAAGTGACT;SOR=1.051;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=183;TCF=111;TCR=72;TR=121;WE=99816187;WS=99816169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,132:0.67:196
chr7	99816256	rs1727143	C	A	1637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=6.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.759;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.549;NF=17;NR=44;PP=1397;ReadPosRankSum=-2.030;SC=GAGAGTCTTCCGTTACTAGGT;SOR=0.862;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=34;TCR=85;TR=61;WE=99816264;WS=99816246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,60:0.50:120
chr7	99816272	rs1636986	A	G	1208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=3.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.01;MQRankSum=-7.030;QD=13.43;ReadPosRankSum=-2.793;SOR=1.203;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,35:0.39:90
chr7	99816275	rs1636987	G	C	1223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=11.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.45;MQRankSum=-7.557;QD=14.74;ReadPosRankSum=-3.084;SOR=2.403;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,31:0.37:83
chr7	99816285	rs79649688	A	T	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=8.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.91;MQRankSum=-7.207;QD=10.92;ReadPosRankSum=-3.113;SOR=2.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,19:0.31:62
chr7	99817859	rs2906645	A	G	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.770;NF=9;NR=9;PP=327;ReadPosRankSum=-1.723;SC=GGGGGGCCCCAACGGTGCTGG;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=15;TCR=15;TR=18;WE=99817867;WS=99817849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr7	99818137	rs2906646	G	A	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.081;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.473;NF=5;NR=19;PP=520;ReadPosRankSum=-0.953;SC=CTCGGGAACTGGCCACCCATC;SOR=2.129;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=24;WE=99818145;WS=99818127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
chr7	99818927	rs705867	C	T	1889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.916;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.436;NF=18;NR=51;PP=1462;ReadPosRankSum=-0.375;SC=CTGGGTGTCACCCCCTTACTT;SOR=1.445;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=118;TCF=38;TCR=80;TR=69;WE=99818935;WS=99818917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,72:0.60:120
chr7	99819004	rs141918023	CTCTG	C	892.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.566;NF=2;NR=21;PP=1028;ReadPosRankSum=-1.179;SC=CGGATGTGGTCTCTGTGTGTG;SOR=0.546;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=23;WE=99819015;WS=99818994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr7	99821128	rs118107707	T	C	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=504;ReadPosRankSum=0.280;SC=AGAGCAAGGCTGGTCTACGGC;SOR=0.462;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=21;WE=99821136;WS=99821118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr7	99821381	rs858508	C	G	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.536;NF=6;NR=31;PP=826;ReadPosRankSum=-0.829;SC=AACCTCTCACCCTGAGACTCT;SOR=0.772;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=57;TCF=10;TCR=47;TR=37;WE=99821389;WS=99821371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,39:0.66:59
chr7	99821470	rs858509	A	G	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.283;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-5.012;NF=22;NR=7;PP=511;ReadPosRankSum=-0.062;SC=AGGCGGGCCCAAGTGTGCAAG;SOR=0.412;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=29;WE=99821478;WS=99821460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr7	99821685	rs863450	C	T	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.258;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.639;NF=8;NR=36;PP=1010;ReadPosRankSum=0.953;SC=TCAGGTGCTCCGAGGAGGGCA;SOR=1.394;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=66;TCF=15;TCR=51;TR=44;WE=99821693;WS=99821675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,45:0.66:68
chr7	99821894	rs858510	C	T	61.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5032;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=38;ReadPosRankSum=1.150;SC=GGCTGGAGTGCCTGGAGTGGT;SOR=0.446;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=3;WE=99821902;WS=99821884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr7	99971313	rs2405442	T	C	1802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.685;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=19;PP=1384;ReadPosRankSum=-1.810;SC=CCTACTGCCCTTGCTGCTGCC;SOR=0.975;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=117;TCF=82;TCR=35;TR=68;WE=99971321;WS=99971303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,71:0.60:118
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chr7	99987805	rs7783550	C	T	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=309;ReadPosRankSum=-0.759;SC=AGCTATGGGGCTCCTGAAATA;SOR=1.508;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=15;WE=99987813;WS=99987795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
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chr7	100014846	rs73161762	C	T	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.292;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=27;PP=692;ReadPosRankSum=0.641;SC=AGCAAAAAAACGAAAAAGCCA;SOR=1.666;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=32;WE=100014854;WS=100014836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,33:0.65:51
chr7	100016844	rs11763414	C	G	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.560;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.291;NF=10;NR=38;PP=2842;ReadPosRankSum=0.501;SC=AGGAAAACCACTTATCTTTCC;SOR=0.351;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=75;TCF=14;TCR=61;TR=48;WE=100016864;WS=100016834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,52:0.63:82
chr7	100016856	.	TA	T	829.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.714;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.230;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.291;NF=3;NR=16;PP=1420;ReadPosRankSum=-1.250;SC=TATCTTTCCATAGTTTTCCCC;SOR=1.058;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=9;TCR=50;TR=19;WE=100016864;WS=100016834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,27:0.39:70
chr7	100017454	rs7783159	G	A	2053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.747;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=45;PP=1604;ReadPosRankSum=-1.923;SC=GTAACAGGCTGTAAGATTTTT;SOR=0.794;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=111;TCF=47;TCR=64;TR=77;WE=100017462;WS=100017444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,78:0.68:115
chr7	100028187	rs6975729	C	T	2639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.623;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=44;PP=2043;ReadPosRankSum=-0.035;SC=CTGTGTTACCCTCCAACTTCC;SOR=0.802;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=149;TCF=77;TCR=72;TR=93;WE=100028195;WS=100028177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,95:0.63:151
chr7	100028484	rs6962151	T	C	3228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=55;PP=2518;ReadPosRankSum=-1.165;SC=GGAGTGAGAGTCACCCCGTGC;SOR=0.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=174;TCF=87;TCR=87;TR=110;WE=100028492;WS=100028474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,115:0.64:179
chr7	100054637	rs150726853	GT	G	1829.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.134;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.172;NF=9;NR=38;PP=1829;ReadPosRankSum=-1.126;SC=ATGTGCATGCGTAAATAGCTG;SOR=0.433;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=81;TCF=14;TCR=67;TR=47;WE=100054645;WS=100054627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,53:0.60:88
chr7	100061715	.	T	G	82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;FR=0.5000;HP=8;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=18;MQ=59.76;NF=0;NR=8;PP=82;QD=14.5964015684;SC=GGGTGGCGGGTGGGGGATGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=8;WE=100061723;WS=100061705;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,8:0.42:19
chr7	100064719	rs7806537	A	G	2498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.620;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=36;PP=1884;ReadPosRankSum=-0.146;SC=CGCTCCGCCAATTCCCGGATC;SOR=1.009;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=148;TCF=76;TCR=72;TR=88;WE=100064727;WS=100064709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,93:0.60:154
chr7	100065443	rs7811142	A	T	1580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.981;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=1288;ReadPosRankSum=0.185;SC=TGGGGGATGCACCCCGGGGAG;SOR=0.966;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=84;TCF=39;TCR=45;TR=55;WE=100065451;WS=100065433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,56:0.64:87
chr7	100072031	rs7809801	T	C	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.014;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=673;ReadPosRankSum=-0.275;SC=AGTAGAGGGCTGGGGAGCTGG;SOR=0.330;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=56;TCF=19;TCR=37;TR=38;WE=100072039;WS=100072021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,39:0.67:58
chr7	100074813	rs373241572	GAGGAGA	G	62.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=8.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.32;ReadPosRankSum=-2.838;SOR=1.088;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
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chr7	100088640	rs2897358	C	G	2173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.139;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=51;PP=1589;ReadPosRankSum=-0.523;SC=TGGGGCGCTCCGCCTCCACCT;SOR=0.458;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=139;TCF=53;TCR=86;TR=86;WE=100088648;WS=100088630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,91:0.62:147
chr7	100091215	rs73405353	G	A	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=186;ReadPosRankSum=0.399;SC=GTCCGGTCATGCTGAGGTCCC;SOR=1.751;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=10;WE=100091223;WS=100091205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr7	100150876	.	T	C	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=171;ReadPosRankSum=0.813;SC=AAAATGAGCATAGATTTTGAC;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=9;WE=100150884;WS=100150866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,10:0.26:38
chr7	100173481	rs2075668	A	G	1536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.943;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=39;PP=1232;ReadPosRankSum=-0.391;SC=CCTCTTCCCCAGCCCCAACTG;SOR=0.862;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=83;TCF=28;TCR=55;TR=57;WE=100173489;WS=100173471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,57:0.69:83
chr7	100175473	rs909152	T	C	3255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.020;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=62;PP=2515;ReadPosRankSum=2.299;SC=GTTCTCTGGGTCCCCGGGGCT;SOR=0.869;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=171;TCF=82;TCR=89;TR=117;WE=100175481;WS=100175463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,120:0.69:175
chr7	100227188	rs7457868	A	C	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=18;PP=394;SC=TGGGTGCCTGAGGTCATTCTG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=100227196;WS=100227178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	100230770	rs143294407	C	G	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=604;ReadPosRankSum=0.297;SC=GACGGTGAGGCGCGCTCCCCG;SOR=0.706;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=99;TCF=41;TCR=58;TR=32;WE=100230778;WS=100230760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,33:0.34:98
chr7	100240771	rs1052897	A	T	2675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=25;PP=2089;SC=CATCACCATTAATGAGGACAA;SOR=1.725;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=55;TCR=25;TR=79;WE=100240779;WS=100240761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr7	100276059	rs150086689	C	T	1773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.104;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=31;PP=1273;ReadPosRankSum=-1.553;SC=CCGGCTCTGACGACGCCACGT;SOR=0.874;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=198;TCF=102;TCR=96;TR=72;WE=100276067;WS=100276049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,76:0.37:208
chr7	100280624	rs12531792	G	A	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=62;ReadPosRankSum=-0.630;SC=GGAGGTTCCCGGCCTGCTCAC;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=5;WE=100280632;WS=100280614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr7	100280896	rs221793	A	C	3903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=39;PP=2965;SC=AGGGTTGTCCACCCAGCCAGC;SOR=1.590;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=78;TCR=39;TR=117;WE=100280904;WS=100280886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr7	100281768	rs221794	T	C	2704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=47;PP=2023;SC=GCGCGCACTGTGGGAGCTGGC;SOR=0.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=43;TCR=47;TR=90;WE=100281776;WS=100281758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr7	100283261	rs221795	C	T	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=112;SC=AGAGGGAATGCGGTGCCCTGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=100283269;WS=100283251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	100284510	rs35436931	TG	T	2871.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.75;NF=40;NR=44;PP=2464;SC=CAAGAAACGTTGGGGGGGCCA;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=45;TCR=49;TR=84;WE=100284518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr7	100284913	rs221796	C	G	4351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=28;PP=2965;SC=GCCCCCTCCCCGCCCCACCTG;SOR=2.468;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=143;TCF=115;TCR=28;TR=141;WE=100284921;WS=100284903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr7	100285974	rs221797	A	C	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=3;PP=1339;SC=ACGAAGGAGAACTTTAAAGCG;SOR=5.464;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=44;TCR=3;TR=47;WE=100285982;WS=100285964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr7	100319680	.	CT	C	84.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.537;QD=1.02;ReadPosRankSum=-0.525;SOR=0.599;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,17:0.20:83
chr7	100319722	rs373163118	G	A	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.086;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=543;ReadPosRankSum=-0.809;SC=TCTCATTTGCGAGCCTGATTT;SOR=0.183;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=86;TCF=24;TCR=62;TR=30;WE=100319730;WS=100319712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,29:0.34:86
chr7	100346117	rs148669435	C	T	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.345;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=181;ReadPosRankSum=-0.681;SC=GGAGCGCTCACGCCAAGAAAT;SOR=0.446;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=12;WE=100346125;WS=100346107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,14:0.34:41
chr7	100370885	rs150729133	C	T	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.677;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=997;ReadPosRankSum=-0.429;SC=CCCCACTCTTCCTAATGCTCT;SOR=0.077;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=62;TCF=49;TCR=13;TR=44;WE=100370893;WS=100370875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,44:0.71:62
chr7	100371100	rs2734880	C	A	1835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=38;PP=1387;SC=ACTGACCCAGCGGGCTCCTAC;SOR=2.522;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=48;WE=100371122;WS=100371090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr7	100371114	rs314298	C	T	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=30;PP=1109;SC=CTCCTACCACCCGGTGAGAGG;SOR=2.461;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=38;WE=100371122;WS=100371090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr7	100371473	rs314299	C	T	3318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.836;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=91;PP=2595;ReadPosRankSum=-0.611;SC=TGGGCTGCTCCGTTTCGGGCC;SOR=0.931;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=194;TCF=55;TCR=139;TR=124;WE=100371481;WS=100371463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,127:0.64:199
chr7	100374087	rs314300	A	G	4550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=51;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.335;SC=GGGAACTTCAATGATGAGGAA;SOR=0.730;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=252;TCF=174;TCR=78;TR=160;WE=100374095;WS=100374077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,167:0.64:261
chr7	100374265	rs149853621	TCCCTC	T	1909.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.84;QD=42.44;SOR=5.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr7	100376978	rs314303	T	C	2264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=5;PP=1840;SC=CCAGCCTGGGTGACAGAGCAA;SOR=4.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=61;TCR=5;TR=66;WE=100376986;WS=100376968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr7	100383605	rs160602	T	A	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.785;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=1;PP=685;ReadPosRankSum=-0.598;SC=TTTCTCTTCCTGTAACTTCTA;SOR=2.362;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=43;TCF=40;TCR=3;TR=27;WE=100383613;WS=100383595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
chr7	100383852	rs60918541	C	T	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=49;ReadPosRankSum=-0.573;SC=AGGGGCTTAGCCTGAACCCCA;SOR=0.770;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=6;WE=100383860;WS=100383842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,6:0.18:34
chr7	100385561	rs72364644	GGCTTCAGCTACCGCTTGCAAGGCCGCATGACCTAT	G	3473.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.125;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.452;NF=8;NR=11;PP=2905;ReadPosRankSum=0.796;SC=CACATTTGACGGCTTCAGCTA;SOR=0.409;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=75;TCF=44;TCR=31;TR=19;WE=100385603;WS=100385551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,89:0.59:150
chr7	100386900	rs191137	T	C	1655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=21;PP=1432;SC=GGTCACCCTGTGGGGCCAACG;SOR=1.445;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=56;WE=100386908;WS=100386890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	100389590	rs76325149	C	T	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.674;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=162;ReadPosRankSum=-0.952;SC=TACTGCAGGGCTATACCAGCG;SOR=1.270;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=12;WE=100389598;WS=100389580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr7	100391389	.	CCT	C	726.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=0.000;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.732;NF=16;NR=4;PP=766;ReadPosRankSum=0.587;SC=TGACCTTGCCCCTGTTTGGCC;SOR=0.716;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=77;TCF=61;TCR=16;TR=20;WE=100391398;WS=100391379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,22:0.26:86
chr7	100391408	rs140238171	C	T	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.678;NF=20;NR=6;PP=480;ReadPosRankSum=-0.307;SC=CCTGCCCAGCCCCAGCCAGTT;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=74;TCR=22;TR=26;WE=100391416;WS=100391398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,27:0.27:101
chr7	100391581	rs314339	T	C	2348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=59;PP=1853;SC=ATGCCTACAGTGGCACCCAGA;SOR=2.245;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=78;TCF=19;TCR=59;TR=77;WE=100391589;WS=100391571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr7	100391644	rs314340	T	C	2807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=43;PP=2136;SC=CTACCAGGTCTGAGCTGGCAG;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=45;TCR=43;TR=88;WE=100391652;WS=100391634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr7	100393141	rs314343	C	G	282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=211;SC=ATTAATATATCTTGTATATTA;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=100393149;WS=100393131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr7	100395003	rs314344	G	C	1485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=11;PP=1136;SC=AACCTGGTGGGCGTCCTACTG;SOR=2.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=44;WE=100395011;WS=100394993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr7	100401098	rs112803997	C	A	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=4.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.12;ReadPosRankSum=1.185;SOR=1.474;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,21:0.26:80
chr7	100401270	rs314348	T	G	1718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=43;PP=1384;SC=CGCTCTCCTCTCTTGGCTCCT;SOR=3.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=52;WE=100401278;WS=100401260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	100410657	rs314358	A	G	4753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=91;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.824;SC=CTCCCGCTCCAGTGTGGCCCT;SOR=0.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=67;TCR=92;TR=158;WE=100410665;WS=100410647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,159:0.99:160
chr7	100410928	.	G	GT	30	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=0.9999;HP=20;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=56.82;NF=0;NR=3;PP=30;QD=11.0;SC=TGTCTCCGTGGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=3;WE=100410936;WS=100410918;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,3:0.21:14
chr7	100411278	rs314359	T	C	2146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=15;PP=1777;SC=ACCCACCATGTCCGATGAGAT;SOR=2.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=50;TCR=15;TR=65;WE=100411286;WS=100411268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr7	100414748	rs117772736	T	G	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=464;ReadPosRankSum=-0.798;SC=TTTGGAGACCTGGGGTCTTCC;SOR=0.534;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=27;WE=100414756;WS=100414738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr7	100416139	rs3857809	T	C	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=7;PP=675;ReadPosRankSum=-0.922;SC=GGGATGGCCTTACCTTCTCAT;SOR=0.769;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=119;TCF=93;TCR=26;TR=38;WE=100416147;WS=100416129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,38:0.32:120
chr7	100416250	rs144173	A	G	5365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=105;PP=2965;SC=CCCGGATGTCAGACACTGCAG;SOR=1.242;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=171;TCF=66;TCR=105;TR=171;WE=100416258;WS=100416240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr7	100416332	rs314364	T	A	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=2.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.95;ReadPosRankSum=1.675;SOR=1.110;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,42:0.52:81
chr7	100416354	rs314365	G	C	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.304;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=628;ReadPosRankSum=-0.718;SC=AGACGGAGTCGTGCTCTATCA;SOR=1.061;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=28;WE=100416362;WS=100416344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr7	100417157	rs148107002	C	T	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=4.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.648;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=360;ReadPosRankSum=0.285;SC=GACCACCAGCCGCCCCAGCCC;SOR=2.147;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=18;WE=100417165;WS=100417147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
chr7	100420408	rs141965435	C	T	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=53;ReadPosRankSum=0.381;SC=AGAATCTTCCCTCCACCTTCC;SOR=0.283;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=4;WE=100420416;WS=100420398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr7	100424586	rs35907339	CG	C	2957.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=30;PP=2983;SC=CGCCCCCCCCCGCAAGGAAAC;SOR=1.292;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=80;TCF=49;TCR=31;TR=73;WE=100424594;WS=100424576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr7	100451890	rs147177626	A	G	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.180;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=597;ReadPosRankSum=-0.883;SC=CTCCCTGCCAATGGGGCCGGG;SOR=0.477;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=67;TCF=55;TCR=12;TR=30;WE=100451898;WS=100451880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,31:0.41:75
chr7	100456635	rs201575741	G	C	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.796;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=568;ReadPosRankSum=-0.526;SC=GGGATGGCTGGAGGGCTGACC;SOR=0.852;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=102;TCF=62;TCR=40;TR=33;WE=100456643;WS=100456625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,34:0.32:105
chr7	100458795	rs314378	T	C	2167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-6.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.648;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=32;PP=1509;ReadPosRankSum=0.432;SC=ACACACTGGCTGCTGTGGTCA;SOR=1.363;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=214;TCF=121;TCR=93;TR=90;WE=100458803;WS=100458785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,93:0.42:220
chr7	100463549	rs34803625	C	T	1540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.538;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=32;PP=1173;ReadPosRankSum=2.261;SC=CGGTGGCCGACGCCCTCAAGA;SOR=0.613;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=207;TCF=111;TCR=96;TR=69;WE=100463557;WS=100463539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,70:0.33:212
chr7	100467975	rs10627414	C	CCT	547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=710;SC=GGACCGAGCCCGATTCCCACC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=100467983;WS=100467965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	100468136	.	CAG	C	902.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.817;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=790;ReadPosRankSum=0.011;SC=GGCTGGGAGACAGAGGGGACA;SOR=2.569;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=66;TCF=51;TCR=15;TR=20;WE=100468145;WS=100468126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,26:0.35:75
chr7	100468398	rs7783543	T	C	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-3.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=206;ReadPosRankSum=0.606;SC=AGGGAGTCAGTGGCTGGATGC;SOR=0.869;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=16;WE=100468406;WS=100468388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr7	100469306	.	G	A	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.522;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.968;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=517;ReadPosRankSum=-0.320;SC=CACAGTGGATGCTACGAGCCA;SOR=0.432;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=87;TCF=48;TCR=39;TR=30;WE=100469314;WS=100469296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,30:0.34:87
chr7	100470474	rs3757862	C	T	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.88;MQRankSum=-2.323;QD=3.81;ReadPosRankSum=-1.950;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr7	100478763	.	C	CG	207.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=15;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=182;ReadPosRankSum=0.093;SC=TGGCGGGGGGCGGGGGGGGGT;SOR=2.461;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=12;WE=100478771;WS=100478753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr7	100479471	rs149503941	T	C	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=201;ReadPosRankSum=2.011;SC=GCCTGGGGGATGGATGGGGTT;SOR=0.235;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=16;WE=100479479;WS=100479461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr7	100479641	rs112314053	A	C	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=324;ReadPosRankSum=0.417;SC=CGTTCCCCAAAAACCAAGCCT;SOR=0.804;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=17;WE=100479649;WS=100479631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr7	100482026	rs15624	T	C	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=26;PP=741;ReadPosRankSum=-0.659;SC=AGAATGATCTTCGCATCCTGG;SOR=0.958;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=140;TCF=62;TCR=78;TR=44;WE=100482034;WS=100482016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,44:0.31:140
chr7	100485265	rs115529219	G	A	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.265;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=329;ReadPosRankSum=-0.214;SC=TCCAGCTCGGGCCTGGGAGCG;SOR=0.863;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=78;TCF=66;TCR=12;TR=24;WE=100485273;WS=100485255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,24:0.30:79
chr7	100486016	rs17882992	A	G	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.644;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=28;PP=1216;ReadPosRankSum=-0.257;SC=TGAGGAGGGCAGACGCCCAAG;SOR=0.139;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=81;TCF=48;TCR=33;TR=58;WE=100486024;WS=100486006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,59:0.70:84
chr7	100486035	rs2720392	C	A	1648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.534;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=1358;ReadPosRankSum=0.200;SC=AGCTTTGTTGCCGCCTGCAGA;SOR=0.130;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=83;TCF=53;TCR=30;TR=56;WE=100486043;WS=100486025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,58:0.67:86
chr7	100486656	rs13241786	T	G	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=3.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.72;ReadPosRankSum=0.178;SOR=0.891;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,32:0.23:139
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chr7	100490822	rs17880119	C	T	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=26;PP=1151;ReadPosRankSum=-0.553;SC=TGATGAGGGCCTCTGGGGTGT;SOR=0.485;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=180;TCF=110;TCR=70;TR=62;WE=100490830;WS=100490812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,65:0.35:188
chr7	100491671	rs17228574	A	G	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.190;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=26;PP=518;ReadPosRankSum=-0.452;SC=CCAGGAAAGCAGAGACAGGGC;SOR=1.019;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=81;TCF=14;TCR=67;TR=31;WE=100491679;WS=100491661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,29:0.36:81
chr7	100494222	rs66793456	G	GC	4186.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=24;PP=2965;SC=GCTGGGCGAGGCGCACTCCGC;SOR=2.411;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=80;TCR=25;TR=102;WE=100494230;WS=100494212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr7	100547278	rs73163737	G	A	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.95;ReadPosRankSum=-0.382;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr7	100547281	rs73163738	C	A	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.34;ReadPosRankSum=-0.234;SOR=1.034;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr7	100547299	rs78614597	G	T	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=1.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-1.099;QD=16.20;ReadPosRankSum=-1.319;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr7	100547307	rs76308179	GT	AG	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=4.075;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=-1.131;QD=15.73;ReadPosRankSum=-0.692;SOR=0.190;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
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chr7	100547342	rs76223352	T	C	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=3.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQRankSum=-2.213;QD=15.93;ReadPosRankSum=1.320;SOR=0.850;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr7	100547349	rs75600589	A	G	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=1.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQRankSum=-2.567;QD=13.69;ReadPosRankSum=0.959;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr7	100547374	rs79199072	A	G	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=15.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQRankSum=-3.250;QD=9.06;ReadPosRankSum=0.501;SOR=3.952;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr7	100547375	rs77005489	A	G	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=15.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQRankSum=-3.250;QD=9.15;ReadPosRankSum=0.327;SOR=3.952;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr7	100547385	rs80263712	A	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=14.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQRankSum=-3.526;QD=7.70;ReadPosRankSum=0.045;SOR=3.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr7	100547388	rs78920296	A	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=11.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.32;MQRankSum=-3.776;QD=7.96;ReadPosRankSum=0.516;SOR=3.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
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chr7	100547397	rs78708089	A	G	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=8.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQRankSum=-4.086;QD=6.58;ReadPosRankSum=0.754;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
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chr7	100547408	.	AGG	A	142.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=12.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQRankSum=-4.002;QD=5.10;ReadPosRankSum=-1.008;SOR=3.586;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr7	100547417	rs76739658	A	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=12.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQRankSum=-4.394;QD=4.29;ReadPosRankSum=-0.937;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,5:0.19:27
chr7	100547420	rs76184926	A	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=12.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQRankSum=-4.394;QD=4.29;ReadPosRankSum=-1.155;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,5:0.19:27
chr7	100547423	.	GCAC	G	100.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=9.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQRankSum=-5.125;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.783;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,4:0.14:28
chr7	100547427	.	C	G	70.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=9.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQRankSum=-4.924;QD=2.72;ReadPosRankSum=-0.606;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,4:0.15:26
chr7	100547430	rs36194634	TTGGG	T	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=9.997;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQRankSum=-4.924;QD=2.49;ReadPosRankSum=-0.893;SOR=3.247;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,4:0.15:26
chr7	100547438	.	C	CCCAGCTT	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQRankSum=-4.378;QD=1.51;ReadPosRankSum=-0.957;SOR=2.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,3:0.14:21
chr7	100547525	rs142704104	ACC	A	495.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=302;SC=TGCAGGGAAAACCCCGAGGTT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=100547534;WS=100547515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	100549414	rs75254397	CA	AT	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=13.884;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.33;ReadPosRankSum=-0.254;SOR=0.024;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,15:0.15:101
chr7	100549421	rs75196671	GA	CT	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=8.225;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.106;SOR=0.045;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,16:0.14:111
chr7	100549426	rs78724937	A	G	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=7.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.07;ReadPosRankSum=-1.055;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,19:0.16:117
chr7	100549505	rs74588241	T	C	2587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FS=36.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-2.626;QD=7.27;ReadPosRankSum=-1.676;SOR=2.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:276,80:0.22:356
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chr7	100550203	rs75141335	T	A	5731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FS=8.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;QD=15.75;ReadPosRankSum=-0.236;SOR=1.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:214,150:0.41:364
chr7	100550203	.	TCA	ACC	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=56;MMLQ=28;MQ=58.98;NF=54;NR=84;PP=2944;QD=20;SC=CATCACTTCTTCAATCACTTC;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=439;TCF=228;TCR=211;TR=138;WE=100550213;WS=100550174;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:301,138:0.31:439
chr7	100550205	rs77471356	A	C	5676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FS=7.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;QD=15.77;ReadPosRankSum=-0.376;SOR=1.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:210,150:0.42:360
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chr7	100551793	rs73398735	G	T	9271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=625;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=160;NR=98;PP=2962;ReadPosRankSum=1.384;SC=AACATCACAGGTTCCTATTCC;SOR=0.736;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=599;TCF=369;TCR=230;TR=258;WE=100551801;WS=100551783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:353,262:0.43:615
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chr7	100552135	rs62483700	T	C	9716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=553;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=140;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.639;SC=CAGCACTTCTTCAACCAGCTC;SOR=0.681;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=535;TCF=238;TCR=297;TR=252;WE=100552143;WS=100552125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:290,257:0.47:547
chr7	100552251	rs9691900	T	C	7120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=400;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.707;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=125;PP=2962;ReadPosRankSum=1.138;SC=TCCCTGCCTCTCCCACTGATC;SOR=0.770;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=380;TCF=186;TCR=194;TR=243;WE=100552259;WS=100552241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,255:0.64:396
chr7	100552311	rs12535515	C	T	3547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.414;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=78;PP=2780;ReadPosRankSum=0.148;SC=CTCCCACCACCCCATTAACAG;SOR=0.930;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=361;TCF=173;TCR=188;TR=139;WE=100552319;WS=100552301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:225,144:0.39:369
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chr7	100552358	rs73714254	C	G	4822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.449;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=72;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.623;SC=ACCTGTCCTACCTCCATCAGT;SOR=0.835;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=326;TCF=138;TCR=188;TR=120;WE=100552398;WS=100552348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,125:0.37:335
chr7	100552371	rs73714255	C	G	5076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=70;PP=2962;ReadPosRankSum=0.223;SC=CCATCAGTATCCAAACTACTC;SOR=0.700;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=344;TCF=148;TCR=196;TR=124;WE=100552398;WS=100552348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:221,130:0.37:351
chr7	100552384	rs75597914	A	G	4933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FS=1.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.190;SOR=0.573;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:205,125:0.38:330
chr7	100552388	rs145584597	C	T	1788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FS=4.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.52;ReadPosRankSum=-0.219;SOR=0.464;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:234,90:0.28:324
chr7	100552390	rs73714257	T	C	4789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FS=4.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.06;ReadPosRankSum=0.175;SOR=0.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,123:0.39:318
chr7	100552412	rs73714259	T	C	4885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.370;HP=1;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=64;PP=2014;ReadPosRankSum=0.680;SC=TCTTCCATGATGCCAGAAAGT;SOR=0.783;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=305;TCF=145;TCR=160;TR=122;WE=100552420;WS=100552402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,124:0.40:313
chr7	100552435	rs76244845	TC	AT	5313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FS=6.514;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.434;SOR=1.013;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:198,140:0.41:338
chr7	100552440	rs80290400	C	T	5136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FS=5.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.52;ReadPosRankSum=-0.188;SOR=0.973;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,136:0.41:331
chr7	100552535	rs73163758	GT	AC	8774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=533;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.846;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=134;NR=67;PP=2944;ReadPosRankSum=-0.613;SC=CTGAGCAACAGTTCTGTGATC;SOR=0.862;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=500;TCF=323;TCR=177;TR=201;WE=100552558;WS=100552525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:300,227:0.43:527
chr7	100552549	rs73163760	C	A	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=584;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.20;ReadPosRankSum=-0.846;SOR=0.658;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:497,78:0.14:575
chr7	100552550	rs73163762	T	C	9138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=591;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.823;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=149;NR=79;PP=2962;ReadPosRankSum=0.422;SC=GTGATCCCCCTACCTCTTCCT;SOR=0.826;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=562;TCF=359;TCR=203;TR=228;WE=100552558;WS=100552525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:335,248:0.43:583
chr7	100552577	rs144580177	C	T	4182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=673;ExcessHet=3.0103;FS=0.592;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.31;ReadPosRankSum=-1.318;SOR=0.626;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:468,195:0.29:663
chr7	100552644	rs2904850	C	A	14080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=860;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.096;QD=16.53;ReadPosRankSum=-1.056;SOR=0.625;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:466,386:0.45:852
chr7	100552657	rs75471530	A	G	15321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=882;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.143;QD=17.53;ReadPosRankSum=0.490;SOR=0.715;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:496,378:0.43:874
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chr7	100552659	rs78182596	T	C	15147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=883;ExcessHet=3.0103;FS=0.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.138;QD=17.33;ReadPosRankSum=0.172;SOR=0.745;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:494,380:0.43:874
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chr7	100552837	rs73714264	G	A	8863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=550;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=166;PP=2962;ReadPosRankSum=1.441;SC=TGTCACTGAGGTCAGGCTTTA;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=531;TCF=159;TCR=372;TR=237;WE=100552845;WS=100552827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:304,243:0.44:547
chr7	100552854	rs73714265	G	A	9334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-7.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=502;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.580;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=161;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.493;SC=TTTATCCTGAGCTTCCCTTTC;SOR=0.621;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=486;TCF=139;TCR=347;TR=227;WE=100552875;WS=100552844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:265,234:0.47:499
chr7	100552867	rs73714266	T	C	8229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=448;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=152;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.694;SC=TCCCTTTCTTTCTGTGTTTTC;SOR=0.699;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=436;TCF=123;TCR=313;TR=210;WE=100552875;WS=100552844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:231,214:0.48:445
chr7	100552915	rs2904852	A	C	12455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=134;NR=230;PP=2965;SC=GGGAACAGGGACAGTGTGCTT;SOR=1.402;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=364;TCF=134;TCR=230;TR=364;WE=100552923;WS=100552905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,372:1.00:372
chr7	100552978	rs73163765	T	C	4069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.927;HP=5;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=59;PP=1908;ReadPosRankSum=-1.703;SC=GATGCCAGAATGGGGGTCAGT;SOR=0.680;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=270;TCF=132;TCR=138;TR=116;WE=100552992;WS=100552968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,118:0.43:276
chr7	100552984	rs73163766	T	C	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FS=4.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.67;ReadPosRankSum=-1.520;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:241,32:0.12:273
chr7	100553002	rs68094465	A	G	3780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.463;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=59;PP=2163;ReadPosRankSum=-0.836;SC=ATGGCCTCAAATGCCAGTGCC;SOR=0.789;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=268;TCF=125;TCR=143;TR=110;WE=100553010;WS=100552992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,112:0.41:274
chr7	100553073	rs73714269	T	A	4019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FS=1.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.14;ReadPosRankSum=1.244;SOR=0.590;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,106:0.43:249
chr7	100553077	rs73714270	A	C	3963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FS=1.012;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.86;ReadPosRankSum=1.025;SOR=0.612;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,107:0.43:250
chr7	100553117	rs73400705	G	A	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=49;PP=1200;ReadPosRankSum=-0.098;SC=GGGTGTCACTGACTCTCCCCA;SOR=0.748;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=157;TCF=34;TCR=123;TR=62;WE=100553125;WS=100553107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,63:0.40:159
chr7	100555116	rs34281234	A	AT	612.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5110;FS=5.059;HP=14;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-1.530;NF=4;NR=27;PP=330;ReadPosRankSum=0.276;SC=AAGAGAGGGGATTTTTTTTTT;SOR=0.148;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=67;TCF=10;TCR=57;TR=31;WE=100555124;WS=100555106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,33:0.79:42
chr7	100555512	.	C	T	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=1.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.71;MQRankSum=-1.332;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.685;SOR=0.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,16:0.36:44
chr7	100606332	.	ATTTTTT	A	866.14	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=20;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.935;NF=0;NR=14;PP=234;SC=AAGAGAGGGGATTTTTTTTTT;SOR=4.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=4;TCR=43;TR=14;WE=100606345;WS=100606322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,22:0.92:24
chr7	100606396	rs77999826	C	T	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.105;NF=2;NR=15;PP=373;ReadPosRankSum=-0.509;SC=AGTGCAATGGCGTGATCTTGG;SOR=1.201;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=17;WE=100606404;WS=100606386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr7	100606705	rs117680348	C	T	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.78;MQRankSum=0.746;QD=5.52;ReadPosRankSum=0.288;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr7	100606854	rs138351777	C	T	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.955;NF=6;NR=16;PP=449;ReadPosRankSum=-0.372;SC=GGGAAATGTGCGCACACAAAA;SOR=0.614;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=22;WE=100606862;WS=100606844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr7	100606918	rs4316092	A	G	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.641;NF=1;NR=11;PP=233;ReadPosRankSum=1.061;SC=GGGGTGGAGGAGGTACATAAG;SOR=0.602;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=12;WE=100606926;WS=100606908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr7	100606945	rs145860742	AT	A	111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.495;NF=0;NR=7;PP=127;ReadPosRankSum=-0.505;SC=CTCCCTGGGTATTTTTTTGGA;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=100606953;WS=100606935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
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chr7	100607640	.	G	GCT	1733.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.386;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=1.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.43;MQRankSum=6.762;QD=20.64;ReadPosRankSum=-2.712;SOR=0.403;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,40:0.48:84
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chr7	100607903	rs6961167	G	A	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=32;PP=829;ReadPosRankSum=-1.160;SC=GAGTGAGCCCGGGCTGGAGGG;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=77;TCF=9;TCR=68;TR=36;WE=100607911;WS=100607893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,39:0.49:79
chr7	100608154	rs10250885	G	A	2028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=-0.843;QD=30.74;ReadPosRankSum=0.949;SOR=2.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,56:0.85:66
chr7	100608154	.	GGATAAGGGAGAG	AGATAAGGGAGAG,AGATGAGGCAGGC	1908	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000,0.5000;HP=5;HapScore=1;MGOF=25;MMLQ=29;MQ=59.12;NF=40,15;NR=1,0;PP=1122,1908;QD=28.2139320133;SC=TATTCAGGGGGGATAAGGGAG;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=69;TCF=68;TCR=1;TR=41,15;WE=100608188;WS=100608144;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.59:69
chr7	100608158	rs79221376	A	G	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=-2.374;QD=16.19;ReadPosRankSum=-1.049;SOR=1.190;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,30:0.42:71
chr7	100608162	rs79761591	G	C	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQRankSum=-2.227;QD=17.41;ReadPosRankSum=-2.061;SOR=1.365;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
chr7	100608165	rs76431635	A	G	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=-2.323;QD=16.60;ReadPosRankSum=-1.231;SOR=1.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,35:0.43:81
chr7	100608166	rs75884804	G	C	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=-2.323;QD=16.60;ReadPosRankSum=-1.231;SOR=1.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,35:0.43:81
chr7	100608180	rs77646533	C	G	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=-2.240;QD=17.23;ReadPosRankSum=-1.238;SOR=0.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,40:0.45:89
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chr7	100608190	.	C	T	1605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.547;ClippingRankSum=0.000;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=-2.321;QD=16.90;ReadPosRankSum=0.741;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,41:0.43:95
chr7	100608194	.	C	CGTCTGGG	1758.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=5.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQRankSum=-2.393;QD=18.32;ReadPosRankSum=1.458;SOR=2.325;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,40:0.42:96
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chr7	100608197	.	A	AGGG	1751.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=4.568;ClippingRankSum=0.000;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=8.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=-1.957;QD=17.17;ReadPosRankSum=1.133;SOR=2.952;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,45:0.44:102
chr7	100608201	rs77005990	C	T	1712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=14.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=-1.969;QD=16.31;ReadPosRankSum=1.147;SOR=3.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,46:0.44:105
chr7	100608247	rs73163788	T	C	2671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=3.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.04;MQRankSum=4.868;QD=16.29;ReadPosRankSum=-1.608;SOR=1.026;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,70:0.43:164
chr7	100608255	rs79638688	C	G	3094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=0.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.85;MQRankSum=6.647;QD=18.10;ReadPosRankSum=-2.019;SOR=0.789;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,77:0.45:171
chr7	100608264	rs73163789	T	A	1566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.562;NF=49;NR=18;PP=2549;ReadPosRankSum=1.269;SC=CCCTAACCCCTTGACCTGCCC;SOR=0.691;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=192;TCF=140;TCR=52;TR=67;WE=100608276;WS=100608237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,69:0.35:195
chr7	100608268	rs141757611	C	CCTTAACCCCTTGAT	4161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.933;HP=1;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=8.985;NF=33;NR=16;PP=2897;ReadPosRankSum=-0.546;SC=AACCCCTTGACCTGCCCCGCC;SOR=0.865;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=167;TCF=110;TCR=57;TR=49;WE=100608276;WS=100608237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,90:0.44:203
chr7	100608370	rs73714276	A	C	6045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FS=1.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.21;ReadPosRankSum=-0.079;SOR=0.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:173,159:0.48:332
chr7	100608375	rs75592954	G	A	5919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.56;ReadPosRankSum=-0.582;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:167,152:0.48:319
chr7	100608406	rs77168191	AT	GC	3432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=7.598;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.75;ReadPosRankSum=-0.685;SOR=1.363;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,90:0.44:205
chr7	100608411	rs79831534	C	T	3371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=5.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.38;ReadPosRankSum=-0.436;SOR=1.196;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,85:0.44:194
chr7	100608416	rs77070494	C	T	3302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=3.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.95;ReadPosRankSum=-0.801;SOR=1.163;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,82:0.45:184
chr7	100608419	rs79505270	CT	GG	3230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=0.817;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.25;ReadPosRankSum=-0.132;SOR=0.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,77:0.44:177
chr7	100608423	rs77841377	C	T	2831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=0.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.27;ReadPosRankSum=-0.227;SOR=0.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,73:0.45:164
chr7	100608426	.	C	T	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.981;ClippingRankSum=0.000;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=2.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.87;ReadPosRankSum=-0.057;SOR=0.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,46:0.29:160
chr7	100608467	rs139602002	C	CT	703.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=55;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=828;ReadPosRankSum=-1.602;SC=AGGGAGAGACCTTTGCGGGAG;SOR=0.698;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=85;TCF=11;TCR=74;TR=26;WE=100608480;WS=100608457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,30:0.38:79
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chr7	100608493	rs77278976	T	C	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=1.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.51;ReadPosRankSum=-1.594;SOR=1.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,28:0.44:64
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chr7	100608920	rs2904863	T	C	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=2.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.12;ReadPosRankSum=-0.140;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,14:0.15:93
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chr7	100608953	rs78404383	TA	CT	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=13.254;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.927;QD=21.29;ReadPosRankSum=0.009;SOR=3.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
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chr7	100609966	rs10274451	T	C	3316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.043;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=74;PP=2677;ReadPosRankSum=0.233;SC=GACGCCCTCCTTGCCTTCCTC;SOR=0.510;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=232;TCF=81;TCR=151;TR=117;WE=100609974;WS=100609956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,120:0.51:236
chr7	100609987	rs10274460	T	C	6001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.786;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=111;PP=2962;ReadPosRankSum=0.786;SC=GCATTTACTCTGTCCCCCTCT;SOR=0.565;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=198;TCF=65;TCR=133;TR=167;WE=100609995;WS=100609977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,173:0.85:203
chr7	100610026	rs10229209	A	C	2497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=6.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.203;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=51;PP=1955;ReadPosRankSum=-0.739;SC=CTCCCCTTCTATTTCTCCGCT;SOR=0.600;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=165;TCF=65;TCR=100;TR=86;WE=100610034;WS=100610016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,92:0.53:174
chr7	100610069	rs10258821	C	T	2246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.907;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=44;PP=1717;ReadPosRankSum=-0.818;SC=TACAAATTTCCATGTGGCCTT;SOR=0.449;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=143;TCF=59;TCR=84;TR=78;WE=100610077;WS=100610059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,84:0.56:151
chr7	100612719	rs75025483	T	C	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=-1.200;QD=16.36;ReadPosRankSum=-0.254;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr7	100612722	rs78932709	C	T	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=-1.109;QD=14.13;ReadPosRankSum=-0.636;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr7	100612723	rs6949119	A	T	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=80;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.850;NF=8;NR=0;PP=198;ReadPosRankSum=0.342;SC=ACCACGTGCCACCGACCCAAC;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=8;WE=100612731;WS=100612713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr7	100612726	rs75900388	G	T	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=-1.052;QD=15.34;ReadPosRankSum=-0.683;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr7	100612727	rs79419298	A	G	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=-1.052;QD=15.34;ReadPosRankSum=-0.652;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr7	100612729	rs80202469	C	T	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=-1.052;QD=15.34;ReadPosRankSum=-0.373;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr7	100612732	.	A	ATG	374.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=-1.052;QD=16.29;ReadPosRankSum=-0.186;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr7	100612733	.	CAG	C	374.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.921;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=-1.048;QD=14.99;ReadPosRankSum=-0.145;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr7	100612766	rs71901679	CTGTCCAGGCACTT	C	867.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.055;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.165;NF=16;NR=0;PP=2975;ReadPosRankSum=-0.830;SC=GGGACAGGCACTGTCCAGGCA;SOR=2.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=16;WE=100612794;WS=100612756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
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chr7	100615311	rs79784813	A	G	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.60;ReadPosRankSum=0.346;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
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chr7	100615321	rs75376427	G	A	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=3.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.28;ReadPosRankSum=-0.053;SOR=0.096;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr7	100615353	rs73168339	C	T	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.99;ReadPosRankSum=-0.365;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
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chr7	100615387	rs75466554	C	T	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.193;HP=2;HapScore=4;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=792;ReadPosRankSum=0.275;SC=ACCCCCTGCCCTCCTCTTGCA;SOR=0.141;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=16;WE=100615395;WS=100615367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,18:0.41:44
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chr7	100615453	rs5021605	T	C	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=3.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQRankSum=-4.711;QD=11.91;ReadPosRankSum=1.294;SOR=0.686;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,20:0.34:58
chr7	100615454	rs5021604	G	C	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=3.711;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQRankSum=-4.766;QD=11.76;ReadPosRankSum=1.298;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,20:0.34:59
chr7	100615458	rs5021603	A	C	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=3.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQRankSum=-4.645;QD=12.21;ReadPosRankSum=0.342;SOR=0.834;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,21:0.35:60
chr7	100615460	rs5021602	A	G	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=2.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQRankSum=-4.536;QD=13.36;ReadPosRankSum=-0.227;SOR=0.953;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,21:0.36:58
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chr7	100615477	rs5021600	G	A	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.507;HP=3;HapScore=1;MGOF=63;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-5.010;NF=6;NR=14;PP=268;ReadPosRankSum=-1.283;SC=TAAGGAAGTCGGGGCAGATGA;SOR=1.563;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=61;TCF=25;TCR=36;TR=20;WE=100615485;WS=100615467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,22:0.34:65
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chr7	100616199	rs78022349	T	C	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=9.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQRankSum=-2.278;QD=8.36;ReadPosRankSum=-1.884;SOR=1.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,13:0.28:47
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chr7	100616258	rs73168346	C	T	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.791;HP=2;HapScore=4;MGOF=44;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=687;ReadPosRankSum=1.109;SC=TGCAGGAATGCCCTGAAAGAT;SOR=1.149;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=13;WE=100616266;WS=100616235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr7	100616277	rs117288840	A	G	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=-0.941;QD=18.58;ReadPosRankSum=-0.948;SOR=0.567;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
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chr7	100616288	rs201235128	G	T	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=1.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=-0.941;QD=18.99;ReadPosRankSum=-0.896;SOR=0.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr7	100616310	rs199943216	G	C	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQRankSum=-1.003;QD=16.14;ReadPosRankSum=0.386;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr7	100616313	rs200896810	T	A	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQRankSum=-1.090;QD=14.95;ReadPosRankSum=1.325;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr7	100616320	rs200695576	G	A	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=1.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQRankSum=-1.052;QD=15.21;ReadPosRankSum=2.240;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
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chr7	100616336	.	G	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=7.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQRankSum=-1.158;QD=13.25;ReadPosRankSum=1.137;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr7	100616338	.	A	G	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=7.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQRankSum=-1.205;QD=12.57;ReadPosRankSum=1.016;SOR=2.391;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr7	100616344	.	G	A	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=4.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQRankSum=-1.326;QD=12.57;ReadPosRankSum=0.920;SOR=2.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr7	100616362	.	TAA	T	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQRankSum=0.000;QD=3.98;ReadPosRankSum=-1.530;SOR=1.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr7	100616366	.	A	ACATGTTTGTTTATT	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQRankSum=0.000;QD=4.61;ReadPosRankSum=-1.761;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr7	100624718	rs4363124	G	C	1211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=11;PP=935;SC=AGAGCCGAGGGCTTTAGCCTG;SOR=1.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=35;WE=100624726;WS=100624708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr7	100634358	rs61746937	C	T	1531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.655;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=37;PP=1147;ReadPosRankSum=-0.082;SC=CCACAGCCGACCAGGCCCAAC;SOR=0.507;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=188;TCF=75;TCR=113;TR=67;WE=100634366;WS=100634348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,68:0.35:196
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chr7	100634640	rs1791	T	G	6677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=132;NR=64;PP=2965;SC=ACTGTCCCCTTCCAGCTCTAC;SOR=1.705;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=132;TCR=64;TR=196;WE=100634648;WS=100634630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
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chr7	100635375	rs10808115	A	C	9566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=208;PP=2965;SC=CTTACCTGCCAGCATGACAAG;SOR=1.351;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=328;TCF=120;TCR=208;TR=327;WE=100635383;WS=100635365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,329:1.00:329
chr7	100635591	rs10953312	C	A	4974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=113;NR=33;PP=2965;SC=CTTCCACAGCCGCCCAGGCTC;SOR=2.553;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=113;TCR=33;TR=146;WE=100635599;WS=100635581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr7	100635661	rs10953313	T	C	14115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=258;NR=70;PP=2965;SC=GAAGCATCTATGCCCGTCCAC;SOR=2.689;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=329;TCF=259;TCR=70;TR=328;WE=100635669;WS=100635651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,332:1.00:332
chr7	100635679	rs10953314	C	G	10324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=7.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=410;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.924;NF=266;NR=75;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.854;SC=CACAGCAGCACCAGATCGCCA;SOR=0.753;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=400;TCF=313;TCR=87;TR=341;WE=100635687;WS=100635669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,346:0.85:408
chr7	100647819	rs11766024	C	T	1727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.027;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.216;NF=47;NR=13;PP=1469;ReadPosRankSum=-0.516;SC=TACCAGCTACCACAGCAGCCC;SOR=1.678;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=89;TCF=67;TCR=22;TR=60;WE=100647827;WS=100647809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,59:0.67:88
chr7	100647875	rs11766048	C	A	4758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=87;NR=52;PP=2965;SC=CCACAACCTCCGGCCGTAGTG;SOR=1.242;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=87;TCR=52;TR=139;WE=100647883;WS=100647865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr7	100647920	rs11772963	A	C	3230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.571;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.734;NF=62;NR=52;PP=2652;ReadPosRankSum=0.458;SC=GCCCAGATACAAATGGAATCA;SOR=0.605;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=96;TCR=79;TR=114;WE=100647928;WS=100647910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,117:0.64:182
chr7	100648029	rs10953315	G	A	6336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=89;PP=2965;SC=AGCCAGCACTGCCACAACACC;SOR=0.861;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=194;TCF=103;TCR=91;TR=192;WE=100648037;WS=100648019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr7	100648117	rs11766125	C	G	3586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.209;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=66;PP=2767;ReadPosRankSum=-0.032;SC=GCCAGCATGACAAGCTCCAGC;SOR=0.919;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=161;TCF=74;TCR=87;TR=118;WE=100648125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,124:0.74:168
chr7	100648875	rs6964653	A	T	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=400;ReadPosRankSum=0.395;SC=ATCCATTACAACCTCTCTTGG;SOR=1.121;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=2;TCR=67;TR=22;WE=100648883;WS=100648865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,22:0.31:71
chr7	100651855	rs12532750	A	G	2372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=9;PP=1909;ReadPosRankSum=1.942;SC=GAATGTATCAATCCTGGGGGA;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=107;TCR=13;TR=81;WE=100651863;WS=100651845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,82:0.67:122
chr7	100652107	rs112142057	C	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.24;ReadPosRankSum=-0.711;SOR=0.639;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,12:0.17:69
chr7	100652317	rs12540832	T	G	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=241;SC=TCAAGAAGGGTAACAGGAGAG;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=100652325;WS=100652307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	100656003	rs3924886	G	C	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.853;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=1;PP=894;ReadPosRankSum=0.481;SC=CATTGGCCCAGGGGAGGGCAT;SOR=2.737;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=54;TCF=51;TCR=3;TR=38;WE=100656011;WS=100655993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,38:0.70:54
chr7	100656361	rs112092593	G	A	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.602;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=38;PP=880;ReadPosRankSum=-0.291;SC=CCAAAGGAACGAAGTCGCAAA;SOR=0.505;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=147;TCF=35;TCR=112;TR=51;WE=100656369;WS=100656351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,52:0.34:151
chr7	100658717	rs10229453	T	C	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=371;SC=TGGCCAGTGCTTGCCTTGGTA;SOR=5.421;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=100658725;WS=100658712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	100661013	rs200258005	CGGGACTCCCTTCTCCCCCT	C	281.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=2.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.90;MQRankSum=3.334;QD=9.09;ReadPosRankSum=-1.087;SOR=0.155;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr7	100663606	rs13242391	T	G	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.772;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=97;ReadPosRankSum=0.701;SC=CCAATAGGGGTGTGCCCTCTG;SOR=0.030;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=8;WE=100663614;WS=100663596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr7	100675128	rs76440115	G	A	3408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.846;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=72;PP=2708;ReadPosRankSum=-0.141;SC=ACTCCTGAAGGCACCGACGTG;SOR=0.563;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=352;TCF=182;TCR=170;TR=144;WE=100675136;WS=100675118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,144:0.40:357
chr7	100675376	rs10229731	A	C	2707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.038;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=52;PP=2328;ReadPosRankSum=-3.342;SC=CAGCACCATGAAGGTGGCCAG;SOR=0.427;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=333;TCF=198;TCR=135;TR=115;WE=100675384;WS=100675366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:224,114:0.34:338
chr7	100677279	rs76184171	G	C	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=589;ExcessHet=3.0103;FS=13.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQRankSum=-11.742;QD=1.43;ReadPosRankSum=0.999;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:502,85:0.14:587
chr7	100677378	rs143956720	C	A	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=572;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.46;MQRankSum=-13.966;QD=1.86;ReadPosRankSum=-1.033;SOR=0.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:505,65:0.11:570
chr7	100677405	rs141963257	G	A	4779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=644;ExcessHet=3.0103;FS=20.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.28;MQRankSum=-19.277;QD=7.45;ReadPosRankSum=-0.614;SOR=1.991;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:491,151:0.24:642
chr7	100677409	rs150735476	G	A	1613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=656;ExcessHet=3.0103;FS=5.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.32;MQRankSum=-13.354;QD=2.48;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=1.410;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:566,84:0.13:650
chr7	100677415	rs57597607	T	C	1399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=664;ExcessHet=3.0103;FS=15.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.51;MQRankSum=-11.309;QD=2.11;ReadPosRankSum=-3.064;SOR=2.237;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:582,80:0.12:662
chr7	100677455	rs61075804	G	A	6199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=794;ExcessHet=3.0103;FS=3.623;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQRankSum=-17.966;QD=7.86;ReadPosRankSum=1.477;SOR=0.995;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:552,237:0.30:789
chr7	100677457	rs59155935	G	T	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=806;ExcessHet=3.0103;FS=3.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQRankSum=-15.177;QD=0.77;ReadPosRankSum=2.497;SOR=1.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:709,95:0.12:804
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chr7	100677516	rs58478927	A	G	2973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=983;ExcessHet=3.0103;FS=6.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQRankSum=-22.027;QD=3.07;ReadPosRankSum=1.777;SOR=1.381;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:836,134:0.14:970
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chr7	100680132	rs75782138	G	A	3452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=501;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.565;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-9.668;NF=69;NR=81;PP=2905;ReadPosRankSum=-1.272;SC=CCATTAACAAGCACACCTGTC;SOR=0.665;SbPval=0.49;Source=Platypus;TCR=275;TR=150;WE=100680140;WS=100680122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:344,154:0.31:498
chr7	100680248	rs146323653	C	A	1682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=401;ExcessHet=3.0103;FS=2.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.09;MQRankSum=-10.125;QD=4.20;ReadPosRankSum=-2.504;SOR=0.632;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:332,69:0.17:401
chr7	100680256	rs148675022	A	C	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FS=1.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.27;MQRankSum=-10.256;QD=3.52;ReadPosRankSum=-4.560;SOR=0.558;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:343,55:0.14:398
chr7	100680261	.	C	G	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.185;ClippingRankSum=0.000;DP=395;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.25;MQRankSum=-9.804;QD=2.15;ReadPosRankSum=-5.217;SOR=0.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:350,45:0.11:395
chr7	100680268	.	AG	GC	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.281;ClippingRankSum=0.000;DP=396;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.75;MQRankSum=-8.928;QD=0.91;ReadPosRankSum=-5.480;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:364,31:0.08:395
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chr7	100680296	.	A	AC	108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.115;ClippingRankSum=0.000;DP=421;ExcessHet=3.0103;FS=2.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.34;MQRankSum=-10.152;QD=0.26;ReadPosRankSum=4.228;SOR=0.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:388,32:0.08:420
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chr7	100686777	rs138142210	C	T	6100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.984;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=110;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.784;SC=TCTGCATCAACGCTTTCTGCA;SOR=0.697;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=313;TCF=156;TCR=157;TR=215;WE=100686785;WS=100686767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,221:0.69:321
chr7	100687107	rs117326437	G	A	4063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.697;NF=23;NR=118;PP=2962;ReadPosRankSum=0.412;SC=ACATGTAAGTGATTTCTTGAA;SOR=0.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=212;TCF=35;TCR=177;TR=141;WE=100687115;WS=100687097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,144:0.67:216
chr7	100687132	rs60062023	A	T	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.106;HP=8;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.673;NF=8;NR=44;PP=946;ReadPosRankSum=1.210;SC=CCTTTTTTTTAAAATTATACT;SOR=0.301;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=156;TCF=19;TCR=137;TR=52;WE=100687140;WS=100687122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,46:0.30:152
chr7	100691089	rs55908140	G	T	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.674;NF=5;NR=0;PP=80;ReadPosRankSum=-0.366;SC=TCCAGCCTGGGTGACAAGGGT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=100691097;WS=100691079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr7	100691431	rs59742420	C	G	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=0.497;SC=CCACCCCATGCCCTGGGACCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=4;WE=100691439;WS=100691421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr7	100692553	rs77235403	A	G	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.120;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=222;ReadPosRankSum=0.751;SC=GATGTCCCACAGAACGGCCCC;SOR=0.299;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=15;WE=100692561;WS=100692543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr7	100692680	rs10246021	T	G	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.471;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=326;ReadPosRankSum=-0.171;SC=GTCTGGGCCCTTGGGAAGAGG;SOR=1.127;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=49;TCF=19;TCR=30;TR=22;WE=100692688;WS=100692670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr7	100695058	rs6966570	T	C	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=829;ReadPosRankSum=1.524;SC=ATCACGGCTGTTCCCTGTCCC;SOR=0.641;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=60;TCR=58;TR=45;WE=100695066;WS=100695048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,48:0.40:120
chr7	100730992	rs36004695	C	T	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=5.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.221;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=536;ReadPosRankSum=-1.753;SC=CCTGTGCCGACGGGCACCGCT;SOR=1.121;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=81;TCF=30;TCR=51;TR=28;WE=100731000;WS=100730982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,28:0.35:81
chr7	100731505	rs4524722	C	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.908;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=177;ReadPosRankSum=-0.921;SC=TGGCCAGGGCCGCAGCCGCCT;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=12;WE=100731513;WS=100731495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr7	100731829	rs6948536	T	C	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=693;ReadPosRankSum=1.545;SC=AGCCCCAGGCTGGAGATGGAG;SOR=0.468;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=121;TCF=83;TCR=38;TR=43;WE=100731837;WS=100731819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,44:0.33:135
chr7	100775018	rs41281004	C	T	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.98;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	100800131	rs4727481	T	C	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=21;PP=506;SC=ATGGTCGTCCTGTAGGTCAGG;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=100800139;WS=100800121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	100800635	rs2074686	G	A	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.300;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=412;ReadPosRankSum=-0.051;SC=TTGTAGCGATGTCTCATGCGC;SOR=2.617;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=19;WE=100800643;WS=100800625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr7	100803614	rs2074683	C	T	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=2;PP=842;ReadPosRankSum=1.676;SC=CTGGGGCTGGCCCTGGGAGGC;SOR=1.287;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=35;WE=100803622;WS=100803604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,35:0.71:49
chr7	100803710	rs2074684	C	T	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.609;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=10;PP=646;ReadPosRankSum=-1.080;SC=GTGCCTCCCCCGTCTGACTCT;SOR=0.917;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=145;TCF=105;TCR=40;TR=42;WE=100803718;WS=100803700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,44:0.30:148
chr7	100804140	rs1048303	C	T	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.708;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=584;ReadPosRankSum=0.931;SC=TGATGTCACCCCAGATGTCCT;SOR=0.328;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=57;TCF=24;TCR=33;TR=32;WE=100804148;WS=100804130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr7	100804240	rs113505007	T	TACCTCC	231.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.31;ReadPosRankSum=-0.624;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr7	100816527	rs2009973	A	G	1465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=8;PP=1097;SC=GGGTCTCCCCATATGCCCCAG;SOR=3.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=43;TCR=8;TR=51;WE=100816535;WS=100816517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr7	100817901	rs34985488	A	G	1781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.539;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=35;PP=1330;ReadPosRankSum=0.713;SC=CACTTCCTCAAACTCCCGTTC;SOR=0.772;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=196;TCF=103;TCR=93;TR=77;WE=100817909;WS=100817891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,77:0.40:194
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chr7	100841389	rs2158612	A	C	2501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=16;PP=1938;SC=CGGATCCCCCATGCAGGGACC;SOR=2.554;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=58;TCR=16;TR=74;WE=100841397;WS=100841379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
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chr7	100850215	rs41281007	G	A	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=28;PP=839;ReadPosRankSum=1.292;SC=AGGCTGCAGGGACAGCTGCGG;SOR=0.846;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=40;WE=100850223;WS=100850205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,41:0.65:63
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chr7	100858544	rs141654216	G	C	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.363;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=543;ReadPosRankSum=1.689;SC=GCTTAGGCTGGAGTGCAATGG;SOR=2.975;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=22;WE=100858552;WS=100858534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr7	100860401	rs28361887	C	T	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.371;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=440;ReadPosRankSum=-0.418;SC=GGCAGGCACGCCAGCCTCTGC;SOR=0.078;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=20;WE=100860409;WS=100860391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr7	100860636	rs1056678	T	C	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=318;ReadPosRankSum=1.575;SC=AGGGGAGCTCTGGAAAGGGGG;SOR=0.678;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=19;WE=100860644;WS=100860626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr7	100861213	rs17319250	T	C	2044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.349;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=37;PP=1523;ReadPosRankSum=-1.057;SC=TAAGATTTCTTGTAAGAACAC;SOR=0.495;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=133;TCF=78;TCR=55;TR=85;WE=100861221;WS=100861203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,84:0.64:131
chr7	100861452	rs11769624	T	C	2280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.041;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=26;PP=1800;ReadPosRankSum=-0.494;SC=GCGCAGCAGTTTCTTCCGACA;SOR=1.290;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=121;TCF=78;TCR=43;TR=80;WE=100861460;WS=100861442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,83:0.65:127
chr7	100865847	rs10953329	T	C	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=341;ReadPosRankSum=-0.397;SC=TGCTCTTTCTTGGAAGCCCTG;SOR=1.112;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=15;WE=100865855;WS=100865837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr7	100867295	rs12410	A	G	1642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.215;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=53;PP=1300;ReadPosRankSum=2.210;SC=CTTCAGAAAGACAGAATTTCA;SOR=1.609;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=84;TCF=4;TCR=80;TR=55;WE=100867303;WS=100867285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,57:0.66:86
chr7	100875772	rs1047319	T	G	2340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=55;PP=1800;ReadPosRankSum=-0.768;SC=TCACGGACACTGGAGCCTGGT;SOR=0.632;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=50;TCR=82;TR=89;WE=100875780;WS=100875762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,91:0.67:136
chr7	100877456	rs2302428	T	C	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=30;PP=640;ReadPosRankSum=1.267;SC=GTAGGGGAGGTGAGCATGAGG;SOR=0.724;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=51;TCF=10;TCR=41;TR=38;WE=100877464;WS=100877446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,39:0.75:52
chr7	100953944	rs112091937	CAT	C	1769.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=1476;ReadPosRankSum=-2.033;SC=CAAGAAATGTCATATAGAGAA;SOR=0.555;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=34;WE=100953953;WS=100953934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,45:0.80:56
chr7	100965096	rs11369267	A	AG	2206.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=51;PP=2349;SC=AGAGGCCCGCAGGGCCGACGG;SOR=3.545;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=61;TCF=6;TCR=55;TR=57;WE=100965104;WS=100965086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr7	101006216	rs4989271	G	C	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.65;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	101006223	rs4989270	C	T	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.40;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	101006230	rs4989269	T	G	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.83;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	101006233	rs4989268	C	T	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.55;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	101006376	rs4989267	C	T	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.44;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	101006382	rs4989266	C	T	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.82;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	101006488	rs4989265	C	G	145.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=115;SC=AGCTCGGGGCCGAGGGGCCGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=101006496;WS=101006478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	101123749	rs36085186	G	A	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=216;ReadPosRankSum=-0.897;SC=TGTTGCTGGGGCTTTAATCTT;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=10;WE=101123757;WS=101123739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr7	101123784	rs6963889	T	C	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.10;ReadPosRankSum=-0.887;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr7	101125074	rs10241622	C	T	1733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.615;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=43;PP=1226;ReadPosRankSum=0.454;SC=GTGTTTGTAGCAGAGGTTTTT;SOR=0.866;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=261;TCF=128;TCR=133;TR=79;WE=101125082;WS=101125064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,86:0.32:271
chr7	101126347	rs34682212	C	T	1821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=2;PP=1617;SC=CAACCTCTTACAACTTAACTG;SOR=5.820;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=54;TCR=2;TR=56;WE=101126355;WS=101126337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr7	101126480	.	C	CT	696.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.000;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.289;HP=13;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.851;NF=17;NR=21;PP=412;ReadPosRankSum=-0.425;SC=AAGAAATTAGCTTTTTTTTTT;SOR=0.144;SbPval=0.03;Source=Platypus;TC=98;TCF=25;TCR=73;TR=38;WE=101126488;WS=101126470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,38:0.58:65
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chr7	101187190	rs58676608	G	A	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5042;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=508;ReadPosRankSum=-0.728;SC=CTGGGGGAACGTAGGCTGACA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=22;WE=101187198;WS=101187180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,24:0.86:28
chr7	101188852	rs9886175	T	C	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=15;PP=408;SC=TAAAGGATCCTGGGAAGTGGA;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=101188860;WS=101188842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	101194424	rs17135626	C	T	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=357;ReadPosRankSum=0.228;SC=TGGGGCCGTCCGTAAGTGTGG;SOR=1.329;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=16;WE=101194432;WS=101194414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr7	101194446	rs115991188	G	C	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=63;ReadPosRankSum=0.253;SC=CTGTGCAGATGGGCCTGGGCC;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=101194454;WS=101194436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr7	101194461	rs73715304	C	A	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.148;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=103;ReadPosRankSum=-0.847;SC=TGGGCCACTCCCAGGCAGAGG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=101194469;WS=101194451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr7	101196488	rs12674244	T	C	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=546;ReadPosRankSum=-0.382;SC=AGCACCCGTTTCCCAGGCCCT;SOR=0.307;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=23;WE=101196496;WS=101196478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr7	101196688	rs13235234	C	T	1705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=49;PP=1348;ReadPosRankSum=-1.740;SC=CGTTCCCTCCCGCCTCCTTGG;SOR=1.026;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=101;TCF=20;TCR=81;TR=60;WE=101196696;WS=101196678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,63:0.61:104
chr7	101196756	rs3800980	A	G	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.130;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=686;ReadPosRankSum=-1.277;SC=ACCGTCAGCCAGCCCCGAGCT;SOR=2.472;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=26;WE=101196764;WS=101196746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr7	101199257	rs4729728	G	A	1019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=29;PP=722;ReadPosRankSum=-0.660;SC=TCCCTCCCTTGCCCCTAGTCT;SOR=2.948;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=32;WE=101199265;WS=101199247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr7	101200669	rs36008849	A	AG	7335.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=132;PP=2969;SC=GCCTCCCCAGAGGAGGTTCTG;SOR=1.680;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=178;TCF=38;TCR=140;TR=164;WE=101200677;WS=101200659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr7	101200835	rs7809926	A	G	1701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=44;PP=1336;SC=AGGACACCCTATCCTGGCTAG;SOR=3.139;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=9;TCR=44;TR=53;WE=101200843;WS=101200825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr7	101256833	rs2240389	T	C	2538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.320;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=28;PP=1926;ReadPosRankSum=-0.573;SC=CTGGGGGAAATGCTGCAAACA;SOR=1.029;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=145;TCF=99;TCR=46;TR=94;WE=101256841;WS=101256823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,97:0.64:151
chr7	101257075	rs2240390	T	C	1433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=46;PP=1150;SC=GAGGGGCAAGTGGGGGCAGGG;SOR=4.133;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=5;TCR=46;TR=51;WE=101257083;WS=101257065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	101265350	rs4263675	T	C	2820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=13;PP=2235;SC=CTGCTGCCCCTCCAGGACTCC;SOR=3.134;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=85;TCF=72;TCR=13;TR=84;WE=101265358;WS=101265340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr7	101267435	rs876825	T	C	920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.004;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=22;PP=749;ReadPosRankSum=0.721;SC=AACAGCCCCATGGGGCAGCAG;SOR=0.556;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=38;WE=101267443;WS=101267425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,37:0.62:60
chr7	101272465	rs848644	T	C	1438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=20;PP=925;SC=AGTGGTGAAGTGAAAAAGTTC;SOR=0.732;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=24;TCR=20;TR=44;WE=101272473;WS=101272455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	101459161	rs28650922	T	C	202.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=8;NR=0;PP=198;SC=GCTGCGGCGGTGCCGTGAGGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=101459169;WS=101459151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	101559302	rs10231075	C	G	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.93;ReadPosRankSum=-0.973;SOR=0.572;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,12:0.21:57
chr7	101671585	rs448877	A	G	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=19;PP=716;SC=TCTGTGATGTAATTTTCCATT;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=101671593;WS=101671575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	101713590	rs377612	T	C	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=14;NR=0;PP=397;SC=GCTCTTTGTTTTTCTTTTCTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=101713598;WS=101713580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	101740606	rs1637257	T	G	3103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.98;SOR=4.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr7	101740610	rs1734879	C	A	3241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.81;SOR=4.921;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr7	101740827	rs10638510	T	TTC	4416.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.62;QD=42.88;SOR=3.755;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr7	101747575	rs201480	A	G	2166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=0;PP=1868;SC=ATGGAATTGTATGCTTCTCTT;SOR=8.287;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=60;TCR=0;TR=59;WE=101747583;WS=101747565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
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chr7	101758584	rs201501	G	A	3920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.663;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=89;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.082;SC=TCCCTTATCCGTACACATTTC;SOR=0.585;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=231;TCF=89;TCR=142;TR=145;WE=101758592;WS=101758574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,152:0.63:241
chr7	101821970	.	A	AG	418.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.716;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=548;ReadPosRankSum=1.525;SC=GGGTGGCCCGAGGAGGCAGGG;SOR=0.239;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=16;WE=101821978;WS=101821960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr7	101843536	rs34285499	A	AT	559.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=6.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.447;QD=5.77;ReadPosRankSum=0.249;SOR=0.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,32:0.33:97
chr7	101870599	rs430841	A	G	1975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=7;PP=1675;SC=TGGTCGTGGTAAAAGACAGCT;SOR=3.841;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=54;TCR=7;TR=61;WE=101870607;WS=101870589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr7	101892328	rs368214	C	T	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=28;PP=745;ReadPosRankSum=-0.079;SC=TCTGAGGGGCCGCGGCCCTGG;SOR=0.593;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=15;TCR=46;TR=37;WE=101892336;WS=101892318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,38:0.61:62
chr7	101916647	rs813000	A	G	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.376;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=13;PP=846;ReadPosRankSum=-1.404;SC=GACGCTGTGCAGAGCTGCAAG;SOR=1.139;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=66;TCF=45;TCR=21;TR=44;WE=101916655;WS=101916637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,46:0.68:68
chr7	101916798	rs2974957	C	A	2866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.723;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=56;PP=2174;ReadPosRankSum=-0.664;SC=GCCCATCTCGCTACCTGCCCA;SOR=0.416;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=173;TCF=93;TCR=80;TR=114;WE=101916806;WS=101916788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,116:0.66:175
chr7	101917647	rs712839	A	G	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=32;PP=974;ReadPosRankSum=-0.404;SC=GATACCGCCTAAGAACACAGA;SOR=0.686;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=18;TCR=48;TR=44;WE=101917655;WS=101917637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,45:0.64:70
chr7	101917772	rs712840	A	G	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.424;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=112;ReadPosRankSum=-0.723;SC=CTATAGTCCCAGCTACTTTGG;SOR=4.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=6;WE=101917780;WS=101917762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr7	101923315	rs57030737	T	TC	2425.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.679;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.775;NF=22;NR=40;PP=2392;ReadPosRankSum=1.529;SC=TCTCTTCCCCTCCTGTCTGTG;SOR=0.626;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=106;TCF=36;TCR=70;TR=62;WE=101923323;WS=101923305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,80:0.63:126
chr7	101925338	rs2257738	A	G	1252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=38;PP=968;ReadPosRankSum=-0.288;SC=CTAGCTTGCGACCATGCCTCT;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=0;TCR=52;TR=38;WE=101925346;WS=101925328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,43:0.74:58
chr7	101925356	rs60275604	G	A	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=162;ReadPosRankSum=-1.120;SC=TCTCCCCTTCGAGAGCCTTGG;SOR=0.117;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=10;WE=101925364;WS=101925346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr7	101926228	rs803070	T	C	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.494;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=74;ReadPosRankSum=-0.488;SC=ATCCACTACCTCCTAGCCCCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=101926236;WS=101926218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr7	101928495	rs803074	G	C	2447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=8.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.816;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=14;PP=1988;ReadPosRankSum=0.060;SC=ATCTCAGGACGCTCTCTGGCC;SOR=0.804;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=126;TCR=24;TR=87;WE=101928503;WS=101928485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,88:0.58:152
chr7	101928585	rs803075	G	A	4152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.294;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=77;PP=2962;ReadPosRankSum=0.128;SC=CCCCTCTCCCGGGAGGGTGGA;SOR=0.413;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=245;TCF=114;TCR=131;TR=157;WE=101928593;WS=101928575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,160:0.63:252
chr7	101928668	.	C	A	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-5.668;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.003;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=31;PP=657;ReadPosRankSum=0.194;SC=CCTTCCCGGCCTCATTCATAG;SOR=0.305;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=112;TCF=15;TCR=97;TR=37;WE=101928676;WS=101928658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,38:0.34:113
chr7	101953534	rs809120	T	G	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=1;PP=562;SC=GGAGGCAGAGTTTGCAGTGAG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=101953542;WS=101953524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	101957574	rs116333997	T	C	2733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=452;ExcessHet=3.0103;FS=4.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.09;ReadPosRankSum=-1.594;SOR=1.031;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:319,130:0.29:449
chr7	102036396	rs28366045	AC	A	718.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.607;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.001;NF=11;NR=7;PP=662;ReadPosRankSum=0.328;SC=AAGCTCAGTGACATGTTTGCG;SOR=1.609;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=18;WE=102036404;WS=102036386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr7	102036769	rs56992893	CGGAGACTGCGTATGCG	C	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=3;NR=0;PP=958;SC=TTCCCCTCTGCGGAGACTGCG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=102036792;WS=102036759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	102038153	rs67961431	CTGTG	C	2335.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=1.141;QD=22.68;ReadPosRankSum=-1.718;SOR=0.827;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,65:0.63:103
chr7	102046070	rs6971258	T	A	717.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=2;PP=693;ReadPosRankSum=0.639;SC=AATTTTTTTTTAAAAAGCACC;SOR=0.344;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=30;WE=102046078;WS=102046060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,29:0.71:41
chr7	102046359	rs6955864	G	C	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.009;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=39;PP=1067;ReadPosRankSum=0.643;SC=ATTTGAAGAAGTCTTGGAAAG;SOR=1.312;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=78;TCF=14;TCR=64;TR=45;WE=102046367;WS=102046349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,47:0.57:82
chr7	102063363	rs143532608	GGAAACATCC	G	1437.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.050;NF=25;NR=0;PP=2980;ReadPosRankSum=-0.583;SC=TCCAAAGTCTGGAAACATCCG;SOR=1.528;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=59;TCR=0;TR=25;WE=102063379;WS=102063353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,37:0.66:56
chr7	102063527	rs7384395	G	C	4789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=103;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.613;SC=AACGAGTATTGTATTCATCAG;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=49;TCR=104;TR=151;WE=102063535;WS=102063517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,154:0.99:155
chr7	102065322	rs1983476	A	G	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=2;PP=449;SC=GGACTGGTGGACGTGAGGCAT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=102065330;WS=102065312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	102086891	rs12672132	C	T	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=538;SC=CTCTGCCTGGCAGGTGGCCCT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=20;WE=102086899;WS=102086881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	102105984	rs10953368	T	G	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=507;SC=TTAAGTGGTGTGGAGTCGGGA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=102105992;WS=102105974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	102106857	rs140459331	CTTTA	C	460.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=10;PP=441;SC=TGATGTGCTACTTTATTTATT;SOR=3.611;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=11;WE=102106868;WS=102106847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	102107697	rs11761361	G	C	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=407;SC=GCTTCCAGCAGGTGGCGGGAT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=102107705;WS=102107687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	102112980	rs3800987	G	A	2562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.485;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=32;PP=1902;ReadPosRankSum=-0.472;SC=GCCAGTCCACGGTGGCAGTGG;SOR=0.550;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=82;TCR=48;TR=86;WE=102112988;WS=102112970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,94:0.68:138
chr7	102113093	rs3800988	T	C	2845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.411;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=59;PP=2282;ReadPosRankSum=0.067;SC=TCCCGCGGGCTTCCGGGAGCT;SOR=0.916;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=176;TCF=83;TCR=93;TR=106;WE=102113101;WS=102113083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,108:0.58:185
chr7	102113563	rs61229695	TG	T	1386.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.276;NF=7;NR=45;PP=782;ReadPosRankSum=1.507;SC=CCGATGGGGGTGGGGGGGGGT;SOR=0.811;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=13;TCR=85;TR=52;WE=102113571;WS=102113553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,56:0.66:85
chr7	102120821	rs11767570	T	G	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.94;MQRankSum=-2.769;QD=19.12;ReadPosRankSum=-0.183;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr7	102136550	rs77782294	G	A	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=31.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.67;MQRankSum=-10.334;QD=8.87;ReadPosRankSum=1.361;SOR=3.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,56:0.35:158
chr7	102158233	.	CA	C	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.80;QD=35.75;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	102158237	.	G	C	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.80;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	102235692	.	G	GCT	368.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.494;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.67;MQRankSum=-4.854;QD=7.85;ReadPosRankSum=-4.630;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,11:0.23:47
chr7	102235910	.	G	C	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.718;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.12;MQRankSum=-0.329;QD=9.75;ReadPosRankSum=-1.348;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr7	102318861	rs374405684	G	A	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=6.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.10;MQRankSum=-1.849;QD=1.39;ReadPosRankSum=1.346;SOR=1.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:169,26:0.13:195
chr7	102319079	rs368279784	G	A	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.93;MQRankSum=1.230;QD=10.78;ReadPosRankSum=-0.849;SOR=0.435;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,47:0.42:111
chr7	102343967	rs4729850	A	G	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.189;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.389;NF=3;NR=36;PP=867;ReadPosRankSum=2.451;SC=ATTTAGGAGTATCTTCACCTA;SOR=0.038;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=71;TCF=3;TCR=68;TR=39;WE=102343975;WS=102343957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr7	102389833	rs28695887	G	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.422;NF=6;NR=8;PP=163;ReadPosRankSum=0.709;SC=CCTGGCCCGGGGCGCCGAACT;SOR=0.495;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=14;WE=102389841;WS=102389823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr7	102398410	rs199537059	C	CT	754.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.58;MQRankSum=-5.736;QD=11.10;ReadPosRankSum=-1.285;SOR=0.417;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,39:0.57:68
chr7	102518909	rs72580510	A	AGT	748.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.923;NF=1;NR=19;PP=900;ReadPosRankSum=1.218;SC=TGTAGGAAAGAGAGAAAAATT;SOR=0.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=2;TCR=51;TR=20;WE=102518917;WS=102518899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,22:0.36:61
chr7	102574999	rs3832497	TGAA	T	6591.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.001;NF=73;NR=67;PP=2970;ReadPosRankSum=-1.281;SC=AGTTGTGTAATGAAGAAGAAA;SOR=0.693;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=284;TCF=140;TCR=144;TR=140;WE=102575009;WS=102574989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,172:0.60:286
chr7	102616469	rs2228687	G	A	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.247;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=5;PP=926;ReadPosRankSum=0.093;SC=GTAAACCCACGAGGCCATGCC;SOR=1.368;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=61;TCF=53;TCR=8;TR=41;WE=102616477;WS=102616459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,43:0.66:65
chr7	102668001	rs7805950	A	C	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.082;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=588;ReadPosRankSum=-0.332;SC=TCCGCAATAGAATATCTGAAG;SOR=3.258;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=23;WE=102668009;WS=102667991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,25:0.83:30
chr7	102722505	rs4729868	G	A	3460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=102;PP=2702;ReadPosRankSum=0.176;SC=AATTCTTTCCGTTCTAAAAAG;SOR=0.658;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=176;TCF=25;TCR=151;TR=119;WE=102722524;WS=102722495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,125:0.68:185
chr7	102722516	rs4729869	T	C	5858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=143;PP=2962;SC=TTCTAAAAAGTTGTGTTTTTA;SOR=4.073;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=18;TCR=143;TR=161;WE=102722524;WS=102722495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr7	102724326	rs10248567	G	C	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.222;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=33;PP=874;ReadPosRankSum=-0.458;SC=TTACACACTAGCGGTAATTGT;SOR=0.898;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=164;TCF=57;TCR=107;TR=49;WE=102724334;WS=102724316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,52:0.32:165
chr7	102724372	rs4729871	A	T	2182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=60;PP=1706;ReadPosRankSum=-0.326;SC=TCAGACCCTCAATTTCCTCAT;SOR=0.620;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=32;TCR=87;TR=82;WE=102724380;WS=102724362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,83:0.67:124
chr7	102738574	rs10808123	A	C	105.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=0;PP=54;SC=CTAAGTTATGAAATTTTGGGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=102738582;WS=102738564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr7	102738590	rs10808124	G	A	173.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=87;SC=TGGGTTTTCTGTGACAAAATT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=102738598;WS=102738580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	102738763	rs10278727	T	G	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.342;NF=8;NR=3;PP=150;ReadPosRankSum=0.653;SC=CATCATTCCTTTCCCTTTATG;SOR=0.693;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=11;WE=102738771;WS=102738753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr7	102739043	rs4729879	C	T	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.65;MQRankSum=-0.576;QD=11.79;ReadPosRankSum=0.824;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr7	102739085	.	A	G	168	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MMLQ=29;MQ=47.96;NF=0;NR=11;PP=168;QD=18.4337465952;SC=CCCAGCTGCTAAATTTAAACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=11;WE=102739093;WS=102739075;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:34,11:0.24:45
chr7	102743893	rs3181009	C	T	117.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=1;PP=53;SC=TTTTCATCATCATTATTTAGG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=102743901;WS=102743883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr7	102760722	rs1974715	A	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=189;ReadPosRankSum=-0.908;SC=AAAAAGTATTATATCATCATA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=8;WE=102760730;WS=102760712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr7	102789752	rs114427579	G	C	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=-0.108;SC=CCGGGAGCGCGCGCCGCCTCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=3;WE=102789760;WS=102789742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr7	102825871	rs4317507	T	C	4423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=119;NR=18;PP=2965;SC=AAGAAATACTTATCAGCTGCC;SOR=3.947;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=119;TCR=18;TR=137;WE=102825879;WS=102825861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr7	102874366	rs3987883	C	T	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.24;MQRankSum=-4.418;QD=13.99;ReadPosRankSum=-0.745;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr7	102883362	rs10271013	C	G	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.123;NF=15;NR=0;PP=302;ReadPosRankSum=-1.801;SC=ATTAAATATTCTTTTGATGAG;SOR=0.287;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=15;WE=102883370;WS=102883352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr7	102883497	.	T	TA	230.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=3.110;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=0.881;QD=4.91;ReadPosRankSum=-1.879;SOR=1.356;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr7	102920642	rs189562738	G	C	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQRankSum=0.084;QD=7.16;ReadPosRankSum=-0.210;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr7	102939019	rs62622397	T	C	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.403;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=237;ReadPosRankSum=-0.773;SC=AACCAGTCATTATATTTTGGA;SOR=0.035;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=12;WE=102939027;WS=102939009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr7	102948040	rs11489600	T	C	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=4;PP=1129;ReadPosRankSum=-1.096;SC=TCTTTCAATTTAGGTGTTTCC;SOR=0.876;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=67;TCF=61;TCR=6;TR=47;WE=102948048;WS=102948030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,49:0.71:69
chr7	102953607	rs112905186	TGTG	T	349.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=697;ReadPosRankSum=1.438;SC=AGACAAGTCTTGTGGTCCACA;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=10;WE=102953629;WS=102953597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr7	102953621	rs2878	A	G	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=697;ReadPosRankSum=0.537;SC=GTCCACAAGTATTCGCTAAGT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=11;WE=102953629;WS=102953597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr7	102961209	rs72437079	CAT	C	270.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.912;NF=11;NR=1;PP=439;ReadPosRankSum=0.680;SC=TATATATACACATATATATAT;SOR=1.179;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=12;WE=102961218;WS=102961199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr7	102994236	rs71572234	C	A	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=-0.253;SC=TATGTATCATCATAATCTTGC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=102994244;WS=102994226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr7	103007949	rs4520097	A	C	2263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.463;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.340;NF=62;NR=13;PP=1622;ReadPosRankSum=0.032;SC=TTTTGATCCTAGAGGCAATAT;SOR=1.265;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=112;TCF=90;TCR=22;TR=75;WE=103007957;WS=103007939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,80:0.69:116
chr7	103018016	rs10273883	A	G	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.870;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=2;PP=633;ReadPosRankSum=-0.656;SC=GCATAGAGGTATTAAATGACT;SOR=1.552;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=42;TCF=38;TCR=4;TR=27;WE=103018024;WS=103018006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr7	103019613	rs12705120	A	G	1853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=11;PP=1545;SC=GTATATACAAAGGTATACTAG;SOR=2.794;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=47;TCR=11;TR=57;WE=103019621;WS=103019603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr7	103033573	rs13240456	T	C	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=492;ReadPosRankSum=-0.324;SC=AAAAAAAACCTTGCGACTGCA;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=19;WE=103033581;WS=103033563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr7	103053435	rs7779997	A	G	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=349;ReadPosRankSum=-1.691;SC=AGAATATCAAATGTAAGCTTT;SOR=0.769;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=71;TCF=66;TCR=5;TR=19;WE=103053443;WS=103053425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,19:0.25:76
chr7	103113414	rs142951997	C	T	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.605;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=609;ReadPosRankSum=-0.654;SC=ATGTAAGTCCCATCATTGAAC;SOR=0.502;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=138;TCF=45;TCR=93;TR=38;WE=103113422;WS=103113404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,41:0.28:145
chr7	103113432	rs146221588	C	T	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.910;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=526;ReadPosRankSum=-2.137;SC=AACGTGCAATCTATTCTAGGT;SOR=0.550;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=113;TCF=26;TCR=87;TR=31;WE=103113440;WS=103113422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,35:0.29:121
chr7	103118723	rs11340961	AT	A	83.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.23;ReadPosRankSum=-0.567;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr7	103130403	rs736707	A	G	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.15;ReadPosRankSum=-0.659;SOR=0.291;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,8:0.21:39
chr7	103132305	rs75878120	A	T	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.23;MQRankSum=0.842;QD=12.54;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr7	103132307	rs113372034	A	T	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.33;MQRankSum=1.282;QD=14.63;ReadPosRankSum=-1.645;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr7	103136102	rs2528873	C	A	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=10;PP=617;ReadPosRankSum=-0.212;SC=AGTTGTCTGACTAACCATTCT;SOR=0.756;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=116;TCF=85;TCR=31;TR=39;WE=103136110;WS=103136092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,39:0.33:119
chr7	103138342	.	C	G	1916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.529;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=38;PP=1508;ReadPosRankSum=-1.011;SC=ATGTTGTTCTCACTACCGATG;SOR=0.487;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=109;TCF=48;TCR=61;TR=70;WE=103138350;WS=103138332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,71:0.63:112
chr7	103138517	rs2711885	C	G	5312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=111;NR=43;PP=2965;SC=ACAAAAAATTCACTTACTTTG;SOR=1.996;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=111;TCR=43;TR=154;WE=103138525;WS=103138507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
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chr7	103155944	rs2528862	C	G	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.708;HP=2;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=328;ReadPosRankSum=-0.458;SC=AATATCTTCTCTGAGTAAAAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=8;WE=103155959;WS=103155934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr7	103155951	rs78832383	A	AAAG	130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=329;ReadPosRankSum=0.232;SC=TCTCTGAGTAAAAGATTTACA;SOR=1.071;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=4;WE=103155959;WS=103155934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr7	103155977	rs2528863	A	C	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=44;ReadPosRankSum=-0.071;SC=CCATAAGATAATGTATGTCAC;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=4;WE=103155985;WS=103155967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr7	103162370	rs10282605	C	T	2409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=1;PP=2070;SC=GGTAACTAACCCTGCATCTTG;SOR=6.244;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=67;TCF=66;TCR=1;TR=67;WE=103162378;WS=103162360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr7	103175965	rs362706	C	T	2712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=59;PP=1960;SC=GATATAAACACATATCTGCAG;SOR=2.414;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=19;TCR=59;TR=78;WE=103175973;WS=103175955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr7	103181016	rs2075044	C	T	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=160;ReadPosRankSum=0.537;SC=ATAAATATGGCGATTTAATGA;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=9;WE=103181024;WS=103181006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr7	103185751	rs116716038	C	T	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.853;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=596;ReadPosRankSum=-0.873;SC=GGCTGAGAGCCGGCAGGGTAA;SOR=0.930;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=83;TCF=49;TCR=34;TR=32;WE=103185759;WS=103185741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,32:0.39:83
chr7	103191428	rs362721	C	T	182.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=147;SC=GGAAATTTCCCCATGATAAAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=103191436;WS=103191418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	103198251	rs6964157	C	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=-0.876;SC=TTAAGATAAACTTACATTAAA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=103198259;WS=103198241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr7	103205617	rs362725	A	G	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=193;ReadPosRankSum=0.621;SC=ACTTCCATGCATAATTATCAT;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=13;WE=103205625;WS=103205607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr7	103206001	rs35268159	G	GA	327.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=9.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=2.016;QD=4.75;ReadPosRankSum=1.006;SOR=0.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,22:0.32:69
chr7	103207234	rs362726	T	C	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.550;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=674;ReadPosRankSum=-0.798;SC=AATCCAGTTATTTGGACACTT;SOR=0.414;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=135;TCF=45;TCR=90;TR=41;WE=103207242;WS=103207224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,43:0.31:140
chr7	103234985	rs35588028	C	CT	428.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.734;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.759;NF=2;NR=15;PP=213;ReadPosRankSum=-0.296;SC=AAAAGCTGTGCTTTTTTTTTT;SOR=0.171;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=17;WE=103234993;WS=103234975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr7	103251983	rs10673432	A	ATT	551.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.47;QD=34.48;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	103275803	rs362646	T	C	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=2;PP=522;SC=TTTTATACCATTTGAATTATG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=103275811;WS=103275793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	103280896	rs145527	C	T	1468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.259;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=4;PP=1151;ReadPosRankSum=0.764;SC=AAAAGATCCCCGATCCTAAAA;SOR=0.075;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=83;TCF=79;TCR=4;TR=49;WE=103280904;WS=103280886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,52:0.60:86
chr7	103368482	rs3213613	A	G	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.302;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=1;PP=786;ReadPosRankSum=0.141;SC=CTTTAAGAGCATAAGAAAAAC;SOR=2.137;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=55;TCF=53;TCR=2;TR=41;WE=103368490;WS=103368472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,41:0.73:56
chr7	103389954	rs607755	A	G	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=374;ReadPosRankSum=0.257;SC=TATTTCAGCTAAAAGAAAAAG;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=18;WE=103389962;WS=103389944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,23:0.70:33
chr7	103417736	rs139254967	A	C	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.780;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=240;ReadPosRankSum=1.424;SC=AGTCTTATTAAAGGAATAATT;SOR=2.303;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=13;WE=103417744;WS=103417726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr7	103557697	rs711443	A	G	2420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=73;PP=2070;SC=TATTTCTGAAATGTTAGACAT;SOR=8.635;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=73;TCF=0;TCR=73;TR=73;WE=103557705;WS=103557687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr7	103805605	rs11980018	T	C	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=117;ReadPosRankSum=0.837;SC=AAATGACAAATACAATTACAG;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=7;WE=103805613;WS=103805595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr7	103809007	rs2307409	A	G	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=1.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.35;ReadPosRankSum=1.564;SOR=1.099;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,21:0.36:59
chr7	103824722	rs34556202	C	T	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=119;ReadPosRankSum=0.140;SC=GGAAATTTTACTTAACACATT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=103824732;WS=103824712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr7	103824724	rs11384924	T	TA	348.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=288;SC=AAATTTTACTTAACACATTTG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=103824732;WS=103824712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	103828548	rs10255806	A	G	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=164;ReadPosRankSum=-0.686;SC=TCTAGAGGCCATATGCAAATT;SOR=0.593;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=10;WE=103828556;WS=103828538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr7	103828643	rs34643155	T	TAC	209.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-1.882;QD=3.28;ReadPosRankSum=0.115;SOR=0.909;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,13:0.20:64
chr7	103835732	rs2307400	C	T	1550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=43;PP=1283;SC=AAAGTAACTTCGCATTTAAAA;SOR=5.464;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=45;WE=103835740;WS=103835722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
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chr7	103844557	rs2245659	T	G	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.337;HP=5;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=254;ReadPosRankSum=0.043;SC=ACACTAAAAATGGCAAAGAAA;SOR=2.694;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=11;WE=103844565;WS=103844547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr7	103848094	rs2075217	T	A	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.89;ReadPosRankSum=-0.305;SOR=0.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr7	103848102	rs971813	C	G	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.25;ReadPosRankSum=0.176;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr7	103848133	rs10953406	C	G	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=275;ReadPosRankSum=0.149;SC=GTGGGTGAAGCTGCAGTACAG;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=16;WE=103848141;WS=103848123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr7	104110392	rs4727601	C	T	6250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=129;NR=42;PP=2962;SC=ATAGCACAATCATAGAAAACT;SOR=2.344;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=129;TCR=42;TR=171;WE=104110414;WS=104110382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr7	104110406	rs6949376	C	G	1637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.572;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=23;PP=1289;ReadPosRankSum=-0.201;SC=GAAAACTGTACGGAAATAGGT;SOR=0.760;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=203;TCF=136;TCR=67;TR=73;WE=104110414;WS=104110382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,71:0.35:203
chr7	104110492	rs6949536	C	T	2050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.510;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=44;PP=1499;ReadPosRankSum=-0.622;SC=CGGGTGTTTACTGCCTTGTGC;SOR=0.766;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=202;TCF=96;TCR=106;TR=80;WE=104110500;WS=104110482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,85:0.39:216
chr7	104110584	rs75804341	G	T	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=35;PP=762;ReadPosRankSum=-0.767;SC=GAAGAACATGGGTGTTGTTGG;SOR=0.648;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=111;TCF=19;TCR=92;TR=44;WE=104110592;WS=104110574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,45:0.37:121
chr7	104110657	rs6949602	A	G	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=176;ReadPosRankSum=-0.799;SC=AAATGGAAAAAAATGATCAGT;SOR=0.542;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=12;WE=104110665;WS=104110647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,13:0.28:46
chr7	104263425	rs1073012	T	C	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=3;PP=255;SC=TTATTATAGCTATCCTGGAGG;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=104263433;WS=104263415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	104377453	rs4236573	A	C	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=3.680;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=323;ReadPosRankSum=1.282;SC=GCTTCCCCTGAGGTTCTAATT;SOR=2.419;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=16;WE=104377461;WS=104377443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr7	104681214	rs10264273	G	A	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=202;ReadPosRankSum=0.473;SC=AATAAAGAATGTTTTCTTCAT;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=14;WE=104681222;WS=104681204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,13:0.28:47
chr7	104681497	.	C	A	101	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=16;HapScore=4;MGOF=2;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=0;NR=11;PP=101;QD=12.3428375043;SC=GTTACATAAGCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=11;WE=104681505;WS=104681486;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:19,11:0.37:30
chr7	104704314	rs7805792	G	C	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=100;ReadPosRankSum=1.092;SC=CATAAACATAGCAGTAGACAA;SOR=0.025;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=8;WE=104704322;WS=104704304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr7	104715018	rs9641341	A	G	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=22;ReadPosRankSum=0.849;SC=ACTTTGTCATATGGAATGCTG;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=3;WE=104715026;WS=104715008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr7	104717517	rs2240455	C	T	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.059;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=35;PP=1011;ReadPosRankSum=-0.857;SC=ACAACCAGTACAGTGAGGGTG;SOR=0.893;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=159;TCF=85;TCR=74;TR=59;WE=104717525;WS=104717507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,61:0.37:166
chr7	104741842	rs10953468	A	T	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.080;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=470;ReadPosRankSum=0.542;SC=ATTGATATTTATGATGTCACT;SOR=0.130;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=19;WE=104741850;WS=104741832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr7	104742054	rs11976329	C	T	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=166;ReadPosRankSum=-1.590;SC=TTATTCAGGTCGTTTTATTTT;SOR=0.260;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=11;WE=104742062;WS=104742044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr7	104745818	rs2299298	G	A	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=0;PP=683;SC=TTCAAATCTGGTATTAGAATA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=104745826;WS=104745808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	104746522	rs11340728	AT	A	409.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.862;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=382;ReadPosRankSum=0.437;SC=TAACAGGCATATTTCTAGTTA;SOR=1.230;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=12;WE=104746530;WS=104746512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr7	104748407	rs34102092	GT	G	924.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.52;MQRankSum=1.643;QD=11.71;ReadPosRankSum=0.787;SOR=1.885;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,53:0.67:79
chr7	104751419	rs2299299	C	T	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=30;PP=641;ReadPosRankSum=-1.064;SC=CAAGTATCAACTTGTGACTTC;SOR=0.665;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=92;TCF=9;TCR=83;TR=33;WE=104751427;WS=104751409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,37:0.39:95
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chr7	104785779	rs7780887	T	G	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=409;ReadPosRankSum=2.064;SC=AAACAAAATCTGTATTTAGCA;SOR=0.904;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=18;WE=104785787;WS=104785769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr7	104800939	rs4730071	C	T	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.277;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=702;ReadPosRankSum=0.311;SC=TAGGGGCTGCCGTCAAAAGTC;SOR=1.055;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=31;WE=104800947;WS=104800929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr7	104808045	.	C	CTTTA	455.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.36;MQRankSum=2.172;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.228;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr7	104844328	rs2240463	C	T	1259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.110;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=32;PP=995;ReadPosRankSum=-1.258;SC=AAAAATAAAACTTGTCACATA;SOR=0.551;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=66;TCF=18;TCR=48;TR=45;WE=104844336;WS=104844318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,46:0.69:67
chr7	104844416	rs34581245	CA	C	386.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=0.754;QD=11.37;ReadPosRankSum=0.084;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,23:0.68:34
chr7	104844519	rs10281422	G	A	2053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.737;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=35;PP=1539;ReadPosRankSum=1.098;SC=ATTTCAGTGCGCTCCACTCAA;SOR=0.788;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=116;TCF=63;TCR=53;TR=77;WE=104844527;WS=104844509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,80:0.68:117
chr7	104845094	rs41562	T	C	1491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.165;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=50;PP=1097;ReadPosRankSum=1.271;SC=TTGCCCGACATGTGAGTGCCA;SOR=1.399;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=93;TCF=15;TCR=78;TR=58;WE=104845102;WS=104845084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,64:0.65:99
chr7	104845124	rs2237611	A	C	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.884;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=38;PP=998;ReadPosRankSum=1.150;SC=GCATTTCTGCAACGGCAGCCC;SOR=2.472;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=58;TCF=5;TCR=53;TR=40;WE=104845132;WS=104845114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,43:0.69:62
chr7	104845943	rs138465150	TTCTC	T	302.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.46;MQRankSum=-0.605;QD=5.50;ReadPosRankSum=-0.597;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,12:0.22:55
chr7	104845960	.	TCTCTCACA	T	321	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=53.5;NF=19;NR=0;PP=321;QD=17.1578947368;SC=TCTCTCTCTCTCTCTCACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=72;TCR=0;TR=19;WE=104845985;WS=104845938;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:53,19:0.26:72
chr7	104845964	.	TCACACACACACACA	T	59.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.000;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.38;MQRankSum=0.541;QD=1.49;ReadPosRankSum=0.913;SOR=0.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,7:0.17:40
chr7	105146359	rs818471	C	G	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.695;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=313;ReadPosRankSum=0.096;SC=CAAAAAGCAACTAAAACCCTA;SOR=0.330;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=18;WE=105146367;WS=105146349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,17:0.34:50
chr7	105146593	rs11421080	A	AT	3654.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=28;PP=2969;SC=AGGAAATGCTATTTTTATACA;SOR=2.448;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=117;TCF=80;TCR=37;TR=100;WE=105146601;WS=105146583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr7	105172685	rs818620	G	C	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.740;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=45;ReadPosRankSum=-0.071;SC=GCTGGGTAGTGAGTGTGTCGC;SOR=0.027;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=4;WE=105172693;WS=105172675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr7	105173029	rs818621	T	C	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.686;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=199;ReadPosRankSum=-0.886;SC=GGGAGGTGGCTCTAGTGAGCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=11;WE=105173037;WS=105173019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr7	105175990	rs148400331	TTTTG	T	220.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.098;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=187;ReadPosRankSum=0.408;SC=TTTTTTACTTTTTTGTTTGTT;SOR=0.223;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=5;WE=105176001;WS=105175980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr7	105177041	rs11556986	A	T	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.869;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=13;PP=608;ReadPosRankSum=-0.417;SC=TCTTATTGGAAGTAAACAAGT;SOR=0.908;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=75;TCF=45;TCR=30;TR=34;WE=105177049;WS=105177031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,37:0.47:79
chr7	105182995	rs7805216	G	A	2061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.044;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=42;PP=1545;ReadPosRankSum=-0.306;SC=TGCTGACTGCGCAACCTTGGA;SOR=0.598;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=222;TCF=119;TCR=103;TR=86;WE=105183003;WS=105182985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,90:0.39:228
chr7	105205917	rs864687	A	C	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.101;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=370;ReadPosRankSum=0.291;SC=AAGTAAGAATAGACTGTTTTT;SOR=0.933;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=63;TCF=16;TCR=47;TR=26;WE=105205925;WS=105205907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,26:0.40:65
chr7	105205955	rs861761	T	C	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.773;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=353;ReadPosRankSum=1.445;SC=ACAACTGTTATATGAATTATT;SOR=1.531;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=20;WE=105205963;WS=105205945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,20:0.36:55
chr7	105248528	rs78943266	C	T	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.380;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=157;ReadPosRankSum=0.057;SC=AATGAGGTGACGGATCCATGC;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=5;TCR=46;TR=12;WE=105248536;WS=105248518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,12:0.23:52
chr7	105250824	rs10216257	G	C	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.997;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=4;PP=757;ReadPosRankSum=1.531;SC=AGGGCACACAGCTAACTAGAA;SOR=1.445;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=42;TCR=6;TR=35;WE=105250832;WS=105250814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,36:0.75:48
chr7	105250904	rs10215543	AG	GA	3971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=34;PP=2947;SC=GTCTGACCCCAGTGTCCAAAC;SOR=1.080;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=84;TCF=50;TCR=34;TR=80;WE=105250913;WS=105250894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr7	105254085	rs57819574	T	C	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.530;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=0;PP=632;ReadPosRankSum=-1.036;SC=AGTGAGGTAATAACCGTAAAG;SOR=3.228;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=67;TCR=4;TR=31;WE=105254093;WS=105254075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,31:0.42:74
chr7	105516082	.	C	CCA	172.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=245;SC=TACCCCCCCCCCAGTTGTATT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=8;WE=105516090;WS=105516072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	105517025	rs200970750	G	C	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=132;ReadPosRankSum=0.804;SC=TTCCGACATTGAGTGTTCTGA;SOR=0.362;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=9;WE=105517033;WS=105517015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr7	105636861	rs73412250	G	A	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=132;ReadPosRankSum=1.554;SC=AGGCGGCCTCGTCTCCTCCGG;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=8;WE=105636869;WS=105636851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
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chr7	105903904	rs2302559	T	C	5847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=142;PP=2965;SC=GTGTACTTCTTGATACTATTA;SOR=2.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=59;TCR=142;TR=200;WE=105903912;WS=105903894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr7	105904150	rs4730153	A	G	2652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=73;PP=2167;SC=CATGTTTACTATACCAAACCA;SOR=5.136;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=5;TCR=73;TR=78;WE=105904158;WS=105904140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr7	105909736	.	T	A	2073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.011;ClippingRankSum=0.000;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.102;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.109;NF=29;NR=47;PP=1515;ReadPosRankSum=1.092;SC=TGTGATTGGATACCAGGACTG;SOR=1.228;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=132;TCF=58;TCR=74;TR=76;WE=105909744;WS=105909726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,81:0.58:139
chr7	106508319	.	C	T	2639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.169;ClippingRankSum=0.000;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.781;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=56;PP=2091;ReadPosRankSum=-0.714;SC=GAAGAAGGGGCAGTGGTACGA;SOR=0.310;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=160;TCF=72;TCR=88;TR=108;WE=106508327;WS=106508309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,112:0.68:164
chr7	106508978	rs849389	A	G	7683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.16;SOR=0.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr7	106508987	rs849390	T	C	7520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.47;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr7	106509291	.	C	T	2610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.014;ClippingRankSum=0.000;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.646;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=35;PP=2071;ReadPosRankSum=1.334;SC=AGGGGCTCTACTGAACCTCCA;SOR=1.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=124;TCF=74;TCR=50;TR=90;WE=106509299;WS=106509281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,92:0.72:127
chr7	106510076	rs1526083	A	G	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.578;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=32;PP=780;ReadPosRankSum=-0.703;SC=CACTCCATTCAGTTGTCATCA;SOR=0.293;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=49;TCF=3;TCR=46;TR=35;WE=106510084;WS=106510066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,37:0.73:51
chr7	106519943	rs849370	T	C	5417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=126;NR=43;PP=2965;SC=GTGTGGGGAATATGTGACTGC;SOR=2.261;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=126;TCR=43;TR=169;WE=106519951;WS=106519933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr7	106522592	rs28763991	A	G	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.543;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=645;ReadPosRankSum=-1.485;SC=TATTTGGGAGACTGAATCTTT;SOR=1.313;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=100;TCF=70;TCR=30;TR=35;WE=106522600;WS=106522582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,39:0.36:109
chr7	106685448	rs75385144	G	T	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=570;ReadPosRankSum=-0.978;SC=TGGAGTTCGCGCTGCAGCACT;SOR=0.663;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=26;WE=106685456;WS=106685438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr7	106768839	rs34736852	G	GAC	3444.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=59;PP=2957;SC=TTTGTAAGCTGATCACCCTGG;SOR=2.395;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=72;TCF=12;TCR=60;TR=70;WE=106768847;WS=106768829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr7	106781445	rs2302453	G	A	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.137;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=639;ReadPosRankSum=0.551;SC=AACCTTTTGTGTAAAATCTCA;SOR=1.400;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=34;WE=106781453;WS=106781435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,34:0.62:55
chr7	106793847	rs55816289	G	T	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.441;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=90;ReadPosRankSum=0.180;SC=TGTTAAAAATGGTTTCATTTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=106793855;WS=106793837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr7	106799997	rs257376	G	A	7929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=90;NR=148;PP=2965;SC=TGTTTGGAACGAACATGGATA;SOR=1.336;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=239;TCF=91;TCR=148;TR=238;WE=106800005;WS=106799987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr7	106826381	rs7794598	C	T	4599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=107;PP=2965;ReadPosRankSum=0.449;SC=CAGTAAGACACGAAAGGGTAA;SOR=0.453;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=144;TCF=34;TCR=110;TR=141;WE=106826389;WS=106826371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,147:0.98:150
chr7	106826439	rs7794965	G	A	2184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=56;PP=1695;SC=AACAGTTGAAGTACATTAACA;SOR=3.849;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=6;TCR=56;TR=62;WE=106826447;WS=106826429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr7	106851754	rs1018946	T	C	2475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=62;PP=1922;SC=CCTTGTAGAATAGCATTTTTC;SOR=3.826;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=9;TCR=62;TR=71;WE=106851762;WS=106851744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr7	106897037	rs17428126	C	T	183.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=179;SC=TATCTATTCTCTTTAGGATAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=106897045;WS=106897027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	106897237	rs17349904	A	C	891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=726;ReadPosRankSum=1.827;SC=GACTGGAAACAACCTAGAACA;SOR=0.487;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=28;WE=106897245;WS=106897227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
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chr7	106898895	rs142552893	T	TCA,TCTCA	2046.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.246;NF=0,0;NR=79,79;PP=324,1486;ReadPosRankSum=0.359;SC=TCTCTCTCTCTCACACACACA;SOR=4.664;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=98;TCF=0;TCR=98;TR=79,79;WE=106898903;WS=106898885;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.19,0.74:43
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chr7	107053157	rs372240169	CA	C	246.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.60;QD=20.56;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr7	107194911	rs2520270	C	A	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=389;ReadPosRankSum=0.421;SC=AAAGAAAAAACCACAGGTTTT;SOR=1.071;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=18;WE=107194919;WS=107194901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr7	107198405	rs2520272	A	T	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.385;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=782;ReadPosRankSum=-0.747;SC=ATAGGGACCCAGAAGATCAGA;SOR=1.067;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=52;TCF=33;TCR=19;TR=35;WE=107198413;WS=107198395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,41:0.69:59
chr7	107207695	rs4730250	A	G	1519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=39;PP=1246;ReadPosRankSum=-0.550;SC=TGACTTTTTAAAAGTACTGTA;SOR=0.675;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=83;TCF=20;TCR=63;TR=52;WE=107207703;WS=107207685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,54:0.59:91
chr7	107208118	rs1468335	T	C	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=293;ReadPosRankSum=0.270;SC=TACCTCTCGATCATTTTTAAG;SOR=0.266;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=16;WE=107208126;WS=107208108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr7	107208250	rs1468336	T	C	4715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=74;PP=2965;SC=CCACTGTTCCTCACAGCAGCC;SOR=0.733;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=67;TCR=74;TR=141;WE=107208258;WS=107208240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr7	107216738	rs10276604	C	T	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=0;PP=889;SC=AGATGAAATACCATTTTAGTC;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=107216746;WS=107216728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	107217068	rs3839819	TG	T	4860.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=116;PP=2983;SC=TTCTTTTAATTGGGGGGGGAA;SOR=2.215;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=149;TCF=21;TCR=128;TR=134;WE=107217076;WS=107217058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr7	107255548	rs3801944	T	C	3758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=1;PP=2965;SC=CAGTTTCTTATGGCCAGTGTC;SOR=8.086;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=112;TCF=111;TCR=1;TR=111;WE=107255556;WS=107255538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr7	107303622	rs2248464	A	T	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.60;ReadPosRankSum=0.062;SOR=1.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr7	107303628	rs2248465	C	T	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=4.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.86;ReadPosRankSum=1.613;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr7	107336428	rs77407094	C	T	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.596;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=590;ReadPosRankSum=-0.551;SC=GGCTGGATCTCGGTTTACTAG;SOR=0.314;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=102;TCF=69;TCR=33;TR=34;WE=107336436;WS=107336418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,34:0.31:108
chr7	107340372	rs35161285	CAAA	C	1148.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=25;NR=0;PP=413;SC=AACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=25;WE=107340396;WS=107340362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	107344921	.	CT	C	115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.312;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=1.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.48;ReadPosRankSum=0.425;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,17:0.22:78
chr7	107384849	rs756872	C	T	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=81;ReadPosRankSum=-0.921;SC=CGCTCCTACTCTGGTTCTGCT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=6;WE=107384857;WS=107384839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr7	107392891	rs10594774	CTG	C	606.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.825;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.076;NF=21;NR=1;PP=787;ReadPosRankSum=-0.417;SC=ATGTGTCTCTCTGTGTGTGTG;SOR=1.238;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=84;TCF=75;TCR=9;TR=22;WE=107392902;WS=107392881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,26:0.34:76
chr7	107414419	rs41669	A	G	7055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=110;PP=2965;SC=CTGAAAAGTCAAGAATGAGGC;SOR=0.853;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=234;TCF=124;TCR=110;TR=234;WE=107414427;WS=107414409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr7	107417189	rs114350360	T	C	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=45;ReadPosRankSum=0.054;SC=CATTCATGTATGTTTGTTAAG;SOR=0.892;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=6;WE=107417197;WS=107417179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr7	107420354	rs10247487	C	T	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=174;ReadPosRankSum=-1.011;SC=TGCGATGCCACGCAAGACACA;SOR=0.141;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=12;WE=107420362;WS=107420344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,13:0.27:48
chr7	107434217	rs116793431	T	C	1820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.585;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=23;PP=1419;ReadPosRankSum=1.055;SC=CCTGTGCTGATACCAGAAACA;SOR=0.602;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=207;TCF=149;TCR=58;TR=79;WE=107434225;WS=107434207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,78:0.38:208
chr7	107531832	rs11373214	G	GC	2263.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=58;PP=2603;SC=GCTGGCGGAGGCGGGCGCCTG;SOR=8.318;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=1;TCR=60;TR=58;WE=107531840;WS=107531822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
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chr7	107545586	rs17412104	G	A	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.622;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=182;ReadPosRankSum=-0.237;SC=TTTGAACTTGGTTACAGGGGA;SOR=1.981;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=8;WE=107545594;WS=107545576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
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chr7	107569517	rs1131398	A	G	1392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=5;PP=1178;SC=ACCGAAGTTAACAGGTTCTGG;SOR=3.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=43;WE=107569525;WS=107569507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	107569698	rs112587816	A	T	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.784;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=490;ReadPosRankSum=0.728;SC=ACATGAAAAAAGTACTCTCAG;SOR=0.915;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=112;TCF=69;TCR=43;TR=30;WE=107569706;WS=107569688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,29:0.25:114
chr7	107570193	rs17154628	T	A	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=46;ReadPosRankSum=-0.854;SC=TAACTTCCTGTTTAAGAGTTT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=5;WE=107570201;WS=107570183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr7	107575792	rs200599445	GTTTTTTTTTTTTT	G	353.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=0.000;QD=17.69;ReadPosRankSum=0.826;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr7	107577448	rs34337564	CT	C	2493.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.083;NF=55;NR=0;PP=2640;ReadPosRankSum=1.481;SC=TATTAGAAAACTTTTTTTTTT;SOR=2.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=86;TCF=85;TCR=1;TR=55;WE=107577464;WS=107577438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,62:0.73:85
chr7	107577456	rs56285692	T	C	2615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.371;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=1.134;NF=61;NR=0;PP=2617;ReadPosRankSum=1.334;SC=AACTTTTTTTTTTCCCCAAAA;SOR=3.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=88;TCF=87;TCR=1;TR=61;WE=107577464;WS=107577438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,66:0.71:93
chr7	107580839	rs2158836	A	G	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=705;SC=TGATCTACTTAATCATGAACC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=107580847;WS=107580829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	107592607	rs34532909	G	A	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=484;ReadPosRankSum=-0.380;SC=TGGCTTTGTCGCACTGGCAGT;SOR=0.756;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=104;TCF=55;TCR=49;TR=33;WE=107592615;WS=107592597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,34:0.32:106
chr7	107593989	rs20556	T	C	2406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=21;PP=1716;SC=ACAGTCCTGCTGGAGGGCATC;SOR=2.026;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=56;TCR=21;TR=77;WE=107593997;WS=107593979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr7	107601523	.	T	C	207	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=11;NR=0;PP=207;QD=21.9792011407;SC=AAAGTAACCGTGGAGGCAAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=11;WE=107601531;WS=107601522;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,11:0.52:21
chr7	107603431	rs2230156	A	C	1863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=29;PP=1531;ReadPosRankSum=1.348;SC=AAGCCCCTTCAGGCACTCGGA;SOR=0.307;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=37;TCR=29;TR=65;WE=107603439;WS=107603421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr7	107613379	rs2701034	G	A	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=11;PP=872;ReadPosRankSum=-1.695;SC=ACCCATTCCTGTAAGTCATGA;SOR=0.581;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=70;TCF=55;TCR=15;TR=42;WE=107613387;WS=107613369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,45:0.62:73
chr7	107626770	rs25659	G	A	4588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.584;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=0.575;SC=TCCCAAAGTCGGACGATCGTT;SOR=1.067;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=259;TCF=83;TCR=176;TR=160;WE=107626778;WS=107626760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,166:0.62:268
chr7	107738801	.	A	ACATAGGGGTTGATGGACGCCCCCTCCCCGCCCTCCCACTATGGACTTACGCTGGCAGCC	940.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.012;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=13.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-1.615;QD=26.88;ReadPosRankSum=-0.969;SOR=1.806;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr7	107738836	rs6974722	T	C	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=4.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.87;ReadPosRankSum=-0.901;SOR=0.353;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr7	107738882	rs1735499	G	A	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.445;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=567;ReadPosRankSum=0.441;SC=CGCTTAGTCCGTAGTGGTTGG;SOR=1.034;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=30;WE=107738890;WS=107738872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,32:0.78:41
chr7	107738948	rs451252	G	A	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.028;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=396;ReadPosRankSum=-0.049;SC=GGCACTGGCCGGCCACAGACC;SOR=1.609;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=19;WE=107738956;WS=107738938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr7	107743409	rs401487	A	G	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=1;PP=785;ReadPosRankSum=-1.471;SC=TTAAGCAGATAAGGTGCGGGC;SOR=1.140;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=32;WE=107743417;WS=107743399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,35:0.76:46
chr7	107743664	rs402113	A	G	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.283;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=744;ReadPosRankSum=-0.276;SC=TGGAGTGGCTATTACAGCTGC;SOR=0.432;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=34;WE=107743672;WS=107743654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,33:0.62:53
chr7	107744876	rs78039310	C	T	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.653;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=278;ReadPosRankSum=-1.215;SC=CAGAAGTGAACGAAGTGTTTC;SOR=0.346;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=64;TCF=48;TCR=16;TR=20;WE=107744884;WS=107744866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,20:0.29:70
chr7	107746214	rs430628	TG	GC	1044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=1356;ReadPosRankSum=1.020;SC=ACCAGGACAGTGAAAGGCAGG;SOR=2.012;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=25;WE=107746223;WS=107746204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr7	107746246	rs370495	T	C	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=9.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.09;ReadPosRankSum=0.372;SOR=3.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,34:0.64:53
chr7	107746253	rs420753	A	G	1497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=7.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.77;ReadPosRankSum=0.253;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,40:0.63:63
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chr7	107748337	rs402264	G	A	1551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.607;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=50;PP=1265;ReadPosRankSum=-0.264;SC=TTGAATATTTGTATTTTCTAA;SOR=1.192;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=83;TCF=7;TCR=76;TR=54;WE=107748345;WS=107748327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,56:0.65:86
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chr7	107752477	rs369508	A	G	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.04;ReadPosRankSum=-0.118;SOR=1.312;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr7	107791018	rs443552	G	C	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=1;PP=853;SC=TGTGAATGGAGCATGATTTTG;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=33;WE=107791026;WS=107791008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr7	107800953	rs12670313	A	G	2897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=70;PP=2410;SC=AAACAAATCAATGGTGTTGGT;SOR=2.461;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=21;TCR=70;TR=91;WE=107800961;WS=107800943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr7	107808639	rs12537654	A	G	985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=0;PP=765;SC=AAGATGATCCATAGTAAATTC;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=33;WE=107808647;WS=107808629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr7	107815858	rs11983886	T	A	5615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=109;PP=2965;SC=AACACACCCATGAGCATGTAT;SOR=1.334;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=62;TCR=109;TR=171;WE=107815866;WS=107815848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr7	107818851	rs428459	T	C	3793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=21;PP=2965;SC=CAGTACTTGTTTGACGCATGA;SOR=2.432;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=86;TCR=21;TR=107;WE=107818859;WS=107818841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr7	107820911	rs414077	G	T	2436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=61;PP=1956;SC=GCAGAAAGGAGCAAACAAGAT;SOR=3.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=8;TCR=61;TR=69;WE=107820919;WS=107820901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr7	107822198	rs2839850	A	G	1304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=7;PP=1054;SC=CTCCTGTGGTATGCATGACAA;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=41;WE=107822206;WS=107822188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	107822396	rs2142325	G	A	3337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=69;PP=2644;SC=GAAAAGGACAGGGAAGTGGTA;SOR=1.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=33;TCR=69;TR=102;WE=107822404;WS=107822386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr7	107823410	rs125686	G	A	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.611;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=33;PP=683;ReadPosRankSum=-0.221;SC=CAAATCAACTGCACAATCTTT;SOR=1.356;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=115;TCF=30;TCR=85;TR=41;WE=107823418;WS=107823400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,42:0.35:119
chr7	107824556	rs10561815	TTA	T	769.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=556;SC=ATATGTATCTTTATATATATA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=23;WE=107824579;WS=107824549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	107824678	rs6970656	A	G	5477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=125;NR=33;PP=2965;SC=AAGGCATCATAGCTCACCTTC;SOR=2.670;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=159;TCF=126;TCR=33;TR=158;WE=107824686;WS=107824668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr7	107824889	rs401433	C	G	4357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=90;PP=2965;SC=ACTGCTCAGACGCCTCGCTGG;SOR=1.893;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=37;TCR=90;TR=127;WE=107824897;WS=107824879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr7	107825108	rs427909	T	C	269.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=211;SC=TTCAGTCAACTCAGGGGTAGC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=107825116;WS=107825098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	107831520	rs6962066	T	C	146.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=55;SC=GAAAAATCTGTGGTTATGATG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=107831528;WS=107831518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	107834613	rs6958498	G	C	7709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=151;PP=2965;SC=ATCCATGTAGGATCTGAAATG;SOR=1.549;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=227;TCF=75;TCR=152;TR=226;WE=107834632;WS=107834603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr7	107834624	rs6978315	T	C	7279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=149;PP=2965;SC=ATCTGAAATGTAGAGTCATCG;SOR=1.686;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=215;TCF=66;TCR=149;TR=215;WE=107834632;WS=107834603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr7	107834734	rs404287	C	T	4946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=84;PP=2965;SC=CTTCATTCTTCGCCATCCCTA;SOR=1.135;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=62;TCR=84;TR=146;WE=107834742;WS=107834724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr7	107836062	rs34038577	A	G	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.968;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQRankSum=-0.000;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.691;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr7	107836064	rs34680676	G	GA,GAA	455.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=30.38;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,6,9:0.40,0.60:15
chr7	107836117	rs35825013	GT	G	1179.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=0;PP=1350;SC=TTCCCTGTTTGTTTTTTGAAT;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=46;TCR=2;TR=43;WE=107836125;WS=107836107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	107838464	rs381318	G	T	2218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=40;PP=1711;SC=TGCACTGATAGACTGCACTTG;SOR=0.971;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=29;TCR=41;TR=69;WE=107838472;WS=107838454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr7	107838637	rs388557	C	A	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=10;PP=281;SC=ATAAAGACTGCTCTAAGTACA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=107838645;WS=107838627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	107847861	rs115042173	T	C	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=73;ReadPosRankSum=-0.382;SC=TTAACATACATGTGGCTTCCT;SOR=0.155;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=7;WE=107847869;WS=107847851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
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chr7	108212353	rs1043615	G	A	3858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.544;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=83;PP=2962;ReadPosRankSum=0.548;SC=ATAAGAGCCCGGATGCTGAAG;SOR=0.759;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=204;TCF=80;TCR=124;TR=134;WE=108212361;WS=108212343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,139:0.66:211
chr7	108213926	rs3763457	A	G	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=365;ReadPosRankSum=0.333;SC=TAGCTATTAAATATATTTAAG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=19;WE=108213934;WS=108213916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr7	108524462	rs368132144	G	A	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=105.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQRankSum=-3.241;QD=8.32;ReadPosRankSum=-2.256;SOR=7.873;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,59:0.44:133
chr7	108524470	rs200301270	G	A	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=51.834;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQRankSum=-4.038;QD=6.76;ReadPosRankSum=-4.897;SOR=5.924;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,30:0.24:127
chr7	110303527	rs1044729	T	C	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=280;ReadPosRankSum=0.535;SC=TACAGATCGTTTTAATGTGCT;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=12;WE=110303535;WS=110303517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr7	110526569	rs258974	C	G	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=6.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.350;NF=27;NR=0;PP=632;ReadPosRankSum=0.802;SC=GGCTGAGTTACCTGAATAACC;SOR=0.253;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=76;TCF=76;TCR=0;TR=27;WE=110526577;WS=110526559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,28:0.35:81
chr7	110603427	rs10225614	G	A	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=670;ReadPosRankSum=-1.965;SC=CACTAAAGATGTACCAGCTCA;SOR=0.848;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=32;WE=110603435;WS=110603417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,34:0.76:45
chr7	110763563	rs214865	T	C	3256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.096;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=54;PP=2766;ReadPosRankSum=0.946;SC=CTTTTTACGATAACAGGCTTA;SOR=0.317;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=49;TCR=54;TR=102;WE=110763571;WS=110763553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
chr7	111031846	rs75042175	C	G	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.264;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=11;PP=936;ReadPosRankSum=-0.679;SC=AGTATGAGTTCAAGGAAACCT;SOR=1.038;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=44;WE=111031854;WS=111031836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,46:0.63:73
chr7	111031968	rs77913960	C	T	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.987;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=563;ReadPosRankSum=1.098;SC=GAGCACTGCCCGCCTTGTCCT;SOR=1.579;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=96;TCF=47;TCR=49;TR=32;WE=111031976;WS=111031958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,35:0.33:105
chr7	111032703	rs37675	A	T	551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=1;PP=496;SC=TAGCATCAGAATTTTTAGTGC;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=111032711;WS=111032693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	111372095	rs10953696	T	C	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=300;SC=TGGCTGCGTTTGTGCAGGAGG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=111372103;WS=111372088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	111372467	rs74504826	G	C	1273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.624;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=47;PP=963;ReadPosRankSum=-0.170;SC=CTAAGCAAAGGGGGTGGTGAG;SOR=2.129;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=68;TCF=8;TCR=60;TR=52;WE=111372475;WS=111372457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,53:0.75:71
chr7	111375308	rs77158426	C	T	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=218;ReadPosRankSum=-1.453;SC=TCAGAATTATCCAGAATGAAA;SOR=0.628;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=16;WE=111375316;WS=111375298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr7	111376840	rs2301678	T	C	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.484;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=3;PP=640;ReadPosRankSum=0.216;SC=CATTAATCCCTTAAAGAGCAT;SOR=1.700;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=79;TCF=67;TCR=12;TR=32;WE=111376848;WS=111376830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,32:0.40:80
chr7	111379634	rs10246451	C	A	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.920;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=376;ReadPosRankSum=1.236;SC=AAATTAGCAACAAAAAGTCCG;SOR=1.734;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=17;WE=111379642;WS=111379624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr7	111382306	rs7803753	C	T	1749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.741;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=53;PP=1360;ReadPosRankSum=-1.144;SC=TCCTCTGCCTCTGACAAGGTA;SOR=0.077;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=99;TCF=9;TCR=90;TR=62;WE=111382314;WS=111382296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,63:0.62:102
chr7	111382324	rs3757648	C	T	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.327;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=36;PP=802;ReadPosRankSum=-0.071;SC=GTAGGAACAGCTGTCACTTTA;SOR=2.414;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=95;TCF=4;TCR=91;TR=36;WE=111382332;WS=111382314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,36:0.37:97
chr7	111400501	rs17158794	T	A	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=190;ReadPosRankSum=0.319;SC=ATAACAAAAATTACGCTGGAA;SOR=0.095;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=11;WE=111400509;WS=111400491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
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chr7	111406948	rs73432093	T	A	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=555;ReadPosRankSum=1.567;SC=TTTCTCTATATAAATAGCTAA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=23;WE=111406956;WS=111406938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
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chr7	111418462	rs2078985	A	G	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.669;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=319;ReadPosRankSum=1.001;SC=TAGTTCCTCAACAATCTGGCC;SOR=1.407;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=68;TCF=35;TCR=33;TR=21;WE=111418470;WS=111418452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,23:0.33:70
chr7	111423078	rs75529262	A	G	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=8.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=0.000;QD=12.01;ReadPosRankSum=2.230;SOR=2.628;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,43:0.62:69
chr7	111462314	rs113026478	C	CA	473.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=4.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.64;ReadPosRankSum=1.818;SOR=0.065;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,29:0.35:84
chr7	111462465	rs17158877	C	T	2009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=58;PP=1569;ReadPosRankSum=1.236;SC=GAAACATCTCCGGGCGTATCA;SOR=0.705;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=275;TCF=97;TCR=178;TR=89;WE=111462473;WS=111462455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,92:0.32:285
chr7	111487026	rs10275038	G	A	1872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=3;PP=1604;SC=TTTGAAGGGAGCTATATACTA;SOR=4.731;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=52;TCR=3;TR=55;WE=111487034;WS=111487016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr7	111512165	rs58173189	GC	G	2130.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=52;PP=2313;SC=AGAAAATTGAGCTTTATAAAA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=0;TCR=54;TR=52;WE=111512173;WS=111512155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	111535497	rs2074131	A	G	1267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=1;PP=1027;SC=ATATGTTCTAAAATATAACCC;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=35;WE=111535505;WS=111535493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	111535863	rs2074132	T	C	708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=636;ReadPosRankSum=0.320;SC=GAAATATAACTCATACACAAC;SOR=3.442;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=111535871;WS=111535853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr7	111541860	rs78380304	A	G	4996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=123;PP=2965;ReadPosRankSum=0.068;SC=CATTTCACCTATAAGGAAAGG;SOR=1.233;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=153;TCF=28;TCR=125;TR=151;WE=111541868;WS=111541850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,157:0.99:159
chr7	111555724	rs75444484	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.076;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=105;ReadPosRankSum=2.006;SC=TCATTCTTCAGCATGGCCCAT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=111555732;WS=111555714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr7	111580132	rs73428869	T	C	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=554;ReadPosRankSum=-1.177;SC=CCCCTGTGCCTACCCCAGCCA;SOR=2.165;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=24;WE=111580140;WS=111580122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,24:0.75:32
chr7	111580451	rs74866281	C	A	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=276;ReadPosRankSum=0.301;SC=TGCTTCAGTTCTGGATTCTCC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=13;WE=111580459;WS=111580441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr7	111585013	rs10627423	A	AAGAC	1338.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=30;PP=1655;ReadPosRankSum=1.010;SC=TAAAAGAAGAAAGAGATGGAC;SOR=1.565;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=30;WE=111585021;WS=111585003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,34:0.67:51
chr7	111585949	rs17159030	T	C	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=312;ReadPosRankSum=1.338;SC=GTAAGCTAAATATTAGGTTGT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=13;WE=111585957;WS=111585939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr7	111624522	rs2074127	T	C	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.131;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=439;ReadPosRankSum=-1.380;SC=TTTTTTACTATATCACTTGGA;SOR=0.076;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=20;WE=111624530;WS=111624512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr7	111629025	rs17401943	T	A	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=727;ReadPosRankSum=-1.368;SC=GTCACTTCCATTGTGTTCACC;SOR=0.553;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=35;WE=111629033;WS=111629015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,35:0.73:48
chr7	111629366	rs2074129	G	A	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=194;ReadPosRankSum=-0.382;SC=CAAACTGTTCGCTCACTATCC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=10;WE=111629374;WS=111629356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr7	111634067	rs566714	A	G	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=236;ReadPosRankSum=-0.083;SC=GTTAATATCTATATCCCCAAG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=11;WE=111634075;WS=111634057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr7	111634368	rs847541	A	G	184.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=149;SC=AGATAACTAGAAAAGAAAGCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=111634376;WS=111634358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	111634389	rs847542	T	C	120.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=5;PP=92;SC=GCCTAGCTATTGTTCGTTCTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=111634397;WS=111634379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	111663757	rs254867	G	T	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.116;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=42;PP=1021;ReadPosRankSum=-1.210;SC=CAGGCATTTTGTGCTCCATCC;SOR=0.899;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=182;TCF=57;TCR=125;TR=59;WE=111663765;WS=111663747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,58:0.31:188
chr7	111926916	.	G	T	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=21.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.83;MQRankSum=-2.976;QD=14.63;ReadPosRankSum=-2.838;SOR=5.036;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr7	111926917	.	G	T	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=15.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.48;MQRankSum=-3.135;QD=13.93;ReadPosRankSum=-2.142;SOR=4.310;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr7	111926919	.	C	T	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=11.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.26;MQRankSum=-3.256;QD=12.22;ReadPosRankSum=-2.652;SOR=3.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr7	111926921	.	A	T	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=7.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=-1.891;QD=10.73;ReadPosRankSum=-2.651;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,7:0.21:34
chr7	111935913	rs10253360	G	A	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.797;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=203;ReadPosRankSum=0.508;SC=CTTATTTTATGTTGTTCTAAG;SOR=3.562;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=12;WE=111935921;WS=111935903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr7	111936435	rs11295465	GT	G	84.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.146;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=0.623;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.731;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
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chr7	112096043	rs11773535	A	C	2317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.612;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=29;PP=1773;ReadPosRankSum=-0.233;SC=TGGCTGTTTTATATTATTTCT;SOR=0.441;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=119;TCF=78;TCR=41;TR=78;WE=112096051;WS=112096033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,84:0.67:126
chr7	112096882	rs79917788	A	G	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=305;ReadPosRankSum=1.200;SC=ATACATAGGTAAAGTTTAGAA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=15;WE=112096890;WS=112096872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr7	112099136	rs34627083	TATA	T	319.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.681;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=325;ReadPosRankSum=-0.673;SC=GTGGTGCGCCTATAGTACTGT;SOR=0.275;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=8;WE=112099146;WS=112099126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr7	112101909	rs2708609	T	A	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.51;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr7	112108291	rs1024570	C	T	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=519;ReadPosRankSum=1.078;SC=TCTCATTTTACGACCTAGCAG;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=23;WE=112108299;WS=112108281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr7	112108325	rs3214248	C	CTT	420.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5735;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=151;ReadPosRankSum=0.000;SC=TAAGTGAAGACTTTTTTTTTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=112108333;WS=112108315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr7	112112279	rs2074796	G	A	2069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.045;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=32;PP=1512;ReadPosRankSum=0.233;SC=GTTAGGAACGGGATTTTCCAA;SOR=0.454;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=212;TCF=134;TCR=78;TR=78;WE=112112287;WS=112112269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,87:0.39:222
chr7	112115658	rs7817	C	T	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=173;ReadPosRankSum=1.675;SC=AGTTTTTATCCTGGATTAACT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=112115666;WS=112115648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr7	112130009	rs11767398	A	C	9438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=124;NR=165;PP=2965;SC=AACTAAAGGAATGATTTTCTG;SOR=1.014;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=289;TCF=124;TCR=165;TR=289;WE=112130017;WS=112129999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr7	112575149	rs10231221	A	C	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=313;SC=ATTTATTTCAATGATCAGGCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=112575157;WS=112575139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	112575484	rs140143179	C	A	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=118;ReadPosRankSum=0.940;SC=TTCCCCTTCCCCCACAATTCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=112575492;WS=112575474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr7	112724417	rs2256044	A	G	3566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.543;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=46;PP=2962;ReadPosRankSum=0.658;SC=CGATAGCTAAATATCTGGTGA;SOR=0.772;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=204;TCF=131;TCR=73;TR=126;WE=112724425;WS=112724407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,126:0.61:208
chr7	112724525	rs1608890	A	G	5689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.553;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=76;PP=2962;ReadPosRankSum=0.544;SC=TCCAGGTAGAACCATTTTTGA;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=315;TCF=188;TCR=127;TR=195;WE=112724533;WS=112724515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,205:0.64:322
chr7	112724795	rs1575012	G	T	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-4.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=40;PP=1006;ReadPosRankSum=0.946;SC=GGAGGATAAGGATACAGCCTC;SOR=0.576;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=77;TCF=14;TCR=63;TR=51;WE=112724803;WS=112724785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,55:0.67:82
chr7	112757387	rs1051878	T	G	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.224;NF=28;NR=0;PP=591;ReadPosRankSum=-0.834;SC=ACACACCAAATCTCAGGTTTA;SOR=0.349;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=74;TCF=74;TCR=0;TR=28;WE=112757395;WS=112757377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,30:0.39:77
chr7	112758324	rs2462665	G	C	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=117;ReadPosRankSum=1.219;SC=GCAGAGCGTGGAGGCCATATG;SOR=0.693;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=7;WE=112758332;WS=112758314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr7	112758694	rs2250343	A	G	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=56;ReadPosRankSum=-0.414;SC=CGTTCCCCCTATAAGTAGCAG;SOR=0.330;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=112758702;WS=112758684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr7	113091076	rs73717828	C	G	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=44;ReadPosRankSum=0.056;SC=CATTACATTGCACCCACAGTG;SOR=0.193;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=5;WE=113091084;WS=113091066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
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chr7	113518502	rs2974938	A	T	3835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=69;NR=45;PP=2965;SC=AACCTGCCTAAGATCTCTGTT;SOR=1.208;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=69;TCR=45;TR=114;WE=113518510;WS=113518492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
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chr7	114138751	rs2040658	G	C	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=0;PP=1602;SC=CCAAAAGAAAGATTTTAGTTA;SOR=8.189;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=56;TCR=0;TR=56;WE=114138759;WS=114138748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
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chr7	114269545	.	G	T	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.687;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.597;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=417;ReadPosRankSum=0.788;SC=GTAGAGTATAGCCTAGTTTTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=18;WE=114269553;WS=114269535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,19:0.83:23
chr7	114271726	rs61732741	C	T	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.364;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=492;ReadPosRankSum=0.799;SC=TTCCACCTGGCCAGGCAGCAC;SOR=1.279;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=86;TCF=47;TCR=39;TR=28;WE=114271734;WS=114271716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,29:0.31:93
chr7	114303617	rs35518337	CT	C	117.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=16.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=1.455;QD=3.92;ReadPosRankSum=1.927;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr7	114562833	rs35262508	G	GTT	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=3;NR=2;PP=217;SC=AACTTGCGCTGTAACAGTTTT;SOR=1.863;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=5;WE=114562841;WS=114562823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	114619598	rs2594449	C	A	2614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=25;PP=2099;SC=AGACTTCAGCCCAGGTGCCAA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=57;TCR=25;TR=82;WE=114619606;WS=114619588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr7	115608355	rs10248479	T	G	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.087;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=605;ReadPosRankSum=-0.843;SC=GTGTGGAAACTTCTACACTAA;SOR=1.314;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=28;WE=115608363;WS=115608345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,28:0.67:42
chr7	115624211	rs73716895	C	T	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=562;ReadPosRankSum=1.947;SC=TCTTTTGTTACATTTGCAATC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=24;WE=115624219;WS=115624201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr7	115624439	rs34738022	C	T	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.790;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=505;ReadPosRankSum=-1.264;SC=CACCACTTGGCACTGCAGGTT;SOR=0.810;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=113;TCF=45;TCR=68;TR=32;WE=115624447;WS=115624429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,33:0.29:114
chr7	115874560	rs2030978	C	T	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.054;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=4;PP=541;ReadPosRankSum=-2.801;SC=AATCTAATAACAGATTCATGA;SOR=0.879;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=96;TCF=80;TCR=16;TR=31;WE=115874568;WS=115874550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,33:0.32:102
chr7	115874817	rs3030639	TAA	T	940.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=22;PP=889;SC=GAATACAACATAAAAAGTGTT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=22;WE=115874826;WS=115874807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	115890157	rs57512222	G	A	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.624;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=139;ReadPosRankSum=-0.618;SC=TGTGTGTTATGAAACATCACA;SOR=0.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=9;WE=115890165;WS=115890147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr7	115890187	rs73222310	A	G	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.496;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=3;PP=602;ReadPosRankSum=-0.909;SC=GGCCAATCCCAGTTAACATTG;SOR=0.356;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=47;TCF=44;TCR=3;TR=34;WE=115890195;WS=115890177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,36:0.75:48
chr7	115892650	rs1048508	T	G	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=146;ReadPosRankSum=-0.119;SC=GAAAGCAAATTATTCCTACCA;SOR=0.053;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=7;WE=115892658;WS=115892640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr7	115897222	rs2402058	A	G	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=0.037;SC=GCCACCCTCCATTGTGTATTT;SOR=0.465;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=9;WE=115897230;WS=115897212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr7	115897242	rs2402059	T	G	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=225;ReadPosRankSum=-0.208;SC=TCTGAGGTTGTCATTATGAGT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=11;WE=115897250;WS=115897232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr7	115897287	rs2402060	T	G	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=434;ReadPosRankSum=-0.605;SC=TGTCCTAAGATGAAAATGTTA;SOR=1.022;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=51;TCF=47;TCR=4;TR=20;WE=115897295;WS=115897277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,20:0.38:52
chr7	115897392	rs4710	G	C	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.031;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=607;ReadPosRankSum=-0.627;SC=AAGTGCAGCGGGTGACCTATA;SOR=0.780;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=108;TCF=55;TCR=53;TR=35;WE=115897400;WS=115897382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,36:0.33:110
chr7	116140076	rs2535220	T	C	3291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=88;PP=2758;SC=CCACCATTGCTACCGGGTCGG;SOR=5.158;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=6;TCR=88;TR=94;WE=116140084;WS=116140066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr7	116140275	rs11767363	T	C	1433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=3;PP=1165;SC=GGCGTCAGGTTGGCTGACAGT;SOR=4.223;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=40;WE=116140283;WS=116140265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr7	116140524	rs2270188	G	T	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=462;ReadPosRankSum=0.074;SC=ACACCGGGTGGACCGGCTTTC;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=20;WE=116140532;WS=116140514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr7	116145937	rs75396674	T	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=261;ReadPosRankSum=-0.625;SC=AGTAAATGGGTCAGTATTTTA;SOR=0.382;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=14;WE=116145945;WS=116145927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
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chr7	116165158	rs200963614	T	TG	822.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=1.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=2.080;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.493;SOR=0.552;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,41:0.32:128
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chr7	116165463	rs2742125	T	C	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=447;ReadPosRankSum=0.059;SC=GGATGCTCCCTTGTCGCGGGA;SOR=0.869;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=23;WE=116165471;WS=116165453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr7	116166858	rs138907327	GCA	G	98.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=3.330;QD=1.73;ReadPosRankSum=-0.788;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,9:0.16:57
chr7	116199014	.	T	C	1889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=0.000;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.808;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=25;PP=1339;ReadPosRankSum=-1.707;SC=ACTTTGAAGATGTGATTGCAG;SOR=0.847;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=106;TCF=68;TCR=38;TR=71;WE=116199022;WS=116199004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,74:0.69:108
chr7	116336013	rs62469056	G	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=128;ReadPosRankSum=-0.282;SC=TACAACCTCCGCTTCCCAAGT;SOR=0.368;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=7;WE=116336021;WS=116336003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr7	116397572	rs13223756	A	G	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.206;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=531;ReadPosRankSum=0.369;SC=GGACAACACAATACAGTACAT;SOR=1.024;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=22;WE=116397580;WS=116397562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr7	116409675	rs72220100	CT	C	322.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=-2.077;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.956;SOR=0.404;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chr7	116421967	rs6947629	T	C	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=0;PP=781;SC=TATAAATAAATATTTCAGAAT;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=116421975;WS=116421957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	116502628	rs192510686	T	C	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.824;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=79;ReadPosRankSum=1.154;SC=AGGTGGCCGCTGCCGCCGCCG;SOR=0.330;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=7;WE=116502638;WS=116502618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr7	116528240	rs4808	C	T	1562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.563;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=38;PP=1209;ReadPosRankSum=1.746;SC=ATGAGGTTTTCAATGGTGAGT;SOR=1.996;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=52;WE=116528248;WS=116528230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,53:0.98:54
chr7	116533204	rs12706110	A	G	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=525;ReadPosRankSum=1.552;SC=TTTTGTTTTGAGATGGAGTCT;SOR=0.487;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=21;WE=116533212;WS=116533194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr7	116550456	rs2074025	C	T	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=7;PP=196;SC=GTATATCATACACATTTCTTT;SOR=1.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=116550464;WS=116550446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	116557939	rs3173936	C	T	3320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=99;PP=2678;ReadPosRankSum=-1.086;SC=ATTGCATGACCGGATCATTTT;SOR=0.766;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=178;TCF=33;TCR=145;TR=120;WE=116557947;WS=116557929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,121:0.66:182
chr7	116596697	rs6960131	A	G	2948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=67;PP=2291;SC=TTCTGGAGTCATTCTTGGATA;SOR=2.069;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=22;TCR=67;TR=89;WE=116596705;WS=116596687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr7	116596812	rs140065630	G	T	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-4.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=249;ReadPosRankSum=-1.420;SC=TTTTAATTTAGATGCCTCCTA;SOR=0.874;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=13;WE=116596820;WS=116596802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr7	116598735	rs6466595	A	G	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=631;ReadPosRankSum=0.955;SC=GGCCACTGCAATAAAGTGAGT;SOR=1.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=27;WE=116598743;WS=116598725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr7	116600049	rs10262671	A	T	2112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=0;PP=1787;SC=GACTCTTAATACTTAGTGAAT;SOR=8.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=60;TCR=0;TR=60;WE=116600057;WS=116600039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr7	116607501	rs10259502	T	C	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=30;PP=949;SC=GTCAGGCAGCTTGTGCAGGTC;SOR=4.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=33;WE=116607509;WS=116607491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	116608500	rs75426396	A	G	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.269;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=301;ReadPosRankSum=0.214;SC=GGGCTCAAGCAATCCTTCTGC;SOR=0.118;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=23;WE=116608508;WS=116608490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,21:0.38:55
chr7	116660464	rs5886844	AC	A	3180.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=5;PP=2967;SC=TTTCAATCACACCGGGAGAAA;SOR=5.259;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=85;TCF=79;TCR=6;TR=80;WE=116660472;WS=116660454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr7	116660803	rs7788320	A	G	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.828;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=421;ReadPosRankSum=0.431;SC=TTTTGGCTCTAATTACAAAGG;SOR=0.098;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=19;WE=116660811;WS=116660793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr7	117066718	rs7784156	C	G	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=368;ReadPosRankSum=0.370;SC=CAAATGCAAGCAGAGAGGAAG;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=17;WE=117066726;WS=117066713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr7	117188660	.	ATGTG	A,ATG	1553.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.03;MQRankSum=0.306;QD=31.07;ReadPosRankSum=-0.069;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,8,41:0.16,0.82:50
chr7	117188681	.	TG	T	745	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=28;MQ=53.7;NF=27;NR=12;PP=745;QD=19.2307692308;SC=TGTGTGTGTGTGTTTTTTTAA;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=39;WE=117188689;WS=117188671;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:16,39:0.71:55
chr7	117199533	rs213950	G	A	4125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.617;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=47;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.906;SC=ACTTCTAATGGTGATTATGGG;SOR=0.329;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=131;TCF=84;TCR=47;TR=128;WE=117199541;WS=117199523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,133:0.99:135
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chr7	117235196	rs4148712	CAT	C	228.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=213;SC=TATGCACACACATAAATATGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=117235205;WS=117235186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr7	117254527	rs213981	A	C	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=1;PP=610;ReadPosRankSum=-0.652;SC=TGATGAACTGAGATTTAAAAA;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=28;WE=117254535;WS=117254517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,31:0.69:45
chr7	117307108	rs1800136	G	A	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=29;PP=860;ReadPosRankSum=-0.713;SC=CTAAGCCCCAGATTGCTGCTC;SOR=0.688;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=73;TCF=24;TCR=49;TR=42;WE=117307116;WS=117307098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,46:0.59:78
chr7	117361034	rs112341621	A	ATAAT	442.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=579;ReadPosRankSum=1.248;SC=AGTCATTCAAATGAGAACATG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=12;WE=117361042;WS=117361024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr7	117375374	rs62617115	A	C	1834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=50;PP=1419;ReadPosRankSum=-0.509;SC=AGAGGTGCCAAAAAGTCCCTC;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=21;TCR=81;TR=63;WE=117375382;WS=117375364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,66:0.62:107
chr7	117420784	rs17140422	T	C	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=100;ReadPosRankSum=0.742;SC=CATATATCAATTATTATGGAT;SOR=0.202;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=7;WE=117420792;WS=117420774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr7	117426484	rs149142354	AAAAC	A	547.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.282;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=559;ReadPosRankSum=0.739;SC=TATTTTCTTAAAAACAAACAA;SOR=0.191;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=14;WE=117426495;WS=117426474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr7	117451124	rs6973399	T	C	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=85;SC=TTTGTGATTATACTTCCAAAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=117451132;WS=117451114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	117824239	rs2896242	G	C	6270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=139;NR=58;PP=2965;SC=GCTTGCTGTCGGCACCGCTGC;SOR=1.887;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=197;TCF=139;TCR=58;TR=197;WE=117824247;WS=117824229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
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chr7	117825681	rs45604739	A	G	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=13;PP=1202;SC=ATTCCCTAAGAAACACTTTCT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=40;WE=117825689;WS=117825671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	117825834	rs2041527	A	G	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=30;PP=1136;SC=TCTAATGCCTAGACAGCACAT;SOR=2.191;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=40;WE=117825842;WS=117825824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	117832138	rs1061731	G	A	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=27;PP=802;SC=GTTTTTATGAGTGTGTCACTG;SOR=3.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=30;WE=117832146;WS=117832128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	117867960	rs60066163	C	CT	249.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=2.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.57;MQRankSum=1.766;QD=12.49;ReadPosRankSum=1.285;SOR=0.191;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr7	120380961	rs3834346	ATTTG	A	513.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=2.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQRankSum=2.022;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.900;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
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chr7	120428799	rs41623	C	A	3161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=63;PP=2516;SC=GGTCTGTCCCCGGCTCCCTTC;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=28;TCR=63;TR=91;WE=120428807;WS=120428789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
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chr7	120450678	rs112555207	T	TCA	1690.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=1.385;NF=0;NR=57;PP=2621;ReadPosRankSum=0.511;SC=AGACACAGATTCACACACACA;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=106;TCF=0;TCR=106;TR=57;WE=120450686;WS=120450668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:7,59:0.89:66
chr7	120590786	rs11408222	C	CG	643.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=1;PP=756;SC=AGGCAAGCGCCTCAGGCGCCA;SOR=5.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=120590794;WS=120590776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	120590816	rs77359106	C	T	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=2.481;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQRankSum=-1.535;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.321;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr7	120613419	rs2721369	A	G	241.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=220;SC=TATTAGTTATATTATGCTAAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=120613427;WS=120613409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr7	120739962	rs199844199	GTT	G,GT	1926.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=8.164;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.40;MQRankSum=0.264;QD=25.35;ReadPosRankSum=0.809;SOR=4.921;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:2,48,26:0.63,0.34:76
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chr7	120773954	rs61128227	A	G	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.579;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=312;ReadPosRankSum=1.844;SC=AAAGGTAAAAATATAGATATT;SOR=0.105;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=15;WE=120773962;WS=120773944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
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chr7	120979089	rs2707466	C	T	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.021;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=290;ReadPosRankSum=-0.799;SC=TCAGACAAAACAAAGAGGAAA;SOR=0.916;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=80;TCF=57;TCR=23;TR=22;WE=120979097;WS=120979079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,23:0.28:83
chr7	121000084	rs111415936	A	AAAGTTTT	216.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=3.703;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.37;ReadPosRankSum=0.938;SOR=1.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,7:0.21:34
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chr7	121002910	rs2536163	C	T	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.680;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=557;ReadPosRankSum=-0.226;SC=GTGATTAAGTCAGTGCCAGCA;SOR=0.665;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=100;TCF=49;TCR=51;TR=34;WE=121002918;WS=121002900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,36:0.35:104
chr7	121004324	rs2109806	G	T	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.06;ReadPosRankSum=0.928;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr7	121011615	rs2536155	G	T	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=207;ReadPosRankSum=-1.131;SC=AAGCTAATTTGTTCCCCTGAG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=11;WE=121011623;WS=121011605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr7	121011655	rs181358696	A	T	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.175;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.48;ReadPosRankSum=1.394;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr7	121080929	rs6961822	A	G	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.869;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=172;ReadPosRankSum=0.258;SC=CCTCTGGCATACTCGAACTTC;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=8;WE=121080937;WS=121080919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr7	121081052	rs6962156	C	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.740;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=172;ReadPosRankSum=-1.675;SC=AGGACGGTGCCGCAGACCTTG;SOR=0.925;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=9;WE=121081060;WS=121081042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr7	121081115	rs6466786	A	C	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=12;PP=795;SC=CCCACCCTGAAGATGTGGCTG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=34;WE=121081123;WS=121081105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr7	121160919	rs150652155	G	A	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.501;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=30;PP=888;ReadPosRankSum=-0.761;SC=ACCACAGCCAGTTCCTGTGTA;SOR=0.946;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=114;TCF=41;TCR=73;TR=43;WE=121160927;WS=121160909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,47:0.39:119
chr7	121164363	rs2896305	C	G	2770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=14;PP=2219;SC=GAAAAGTCAACACCTGAGGGT;SOR=3.003;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=67;TCR=14;TR=81;WE=121164371;WS=121164353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr7	121513382	rs3069073	T	TCA	132.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=3;PP=171;SC=TCTCTCTCTCTCACACACACA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=3;WE=121513390;WS=121513372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr7	121513455	rs145879375	AAAAC	A	184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=0;PP=90;ReadPosRankSum=-1.037;SC=CTGGAGGATTAAAACAAACAA;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=3;WE=121513466;WS=121513445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
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chr7	121942234	.	G	C	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.000;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.674;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=20;PP=790;ReadPosRankSum=0.201;SC=CATGCTTCTTGAGGTCAAAGT;SOR=0.604;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=136;TCF=74;TCR=62;TR=42;WE=121942242;WS=121942224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,43:0.29:147
chr7	121942832	rs10685687	G	GACA	7110.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=85;NR=29;PP=2969;SC=AACCATGAGAGACATTTCCTG;SOR=2.505;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=126;TCF=97;TCR=29;TR=114;WE=121942840;WS=121942822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr7	121942847	rs6968786	G	C	2647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.964;HP=3;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.406;NF=77;NR=28;PP=2288;ReadPosRankSum=-0.010;SC=TTCCTGGTTTGCATACCTTTT;SOR=1.171;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=185;TCF=129;TCR=56;TR=105;WE=121942855;WS=121942837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,100:0.55:181
chr7	121943642	rs111662975	A	G	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.69;ReadPosRankSum=-0.529;SOR=2.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
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chr7	121960407	rs1348442	T	G	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=4.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=316;ReadPosRankSum=1.262;SC=AGAAAGAAGATAAAATTTGCT;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=16;WE=121960415;WS=121960397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr7	121960438	rs1443749	C	T	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=102;ReadPosRankSum=0.405;SC=AGATTATATGCGTGTACATAG;SOR=0.297;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=8;WE=121960446;WS=121960428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr7	121985541	rs798685	T	C	1432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=3;PP=784;SC=AAGGAGACTATGCTTTGCAAA;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=121985549;WS=121985531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	121985556	rs798684	C	G	1787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=5;PP=1123;SC=TGCAAACATACCATCAAAATT;SOR=3.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=39;WE=121985564;WS=121985546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	122303321	rs2251761	C	T	1408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.284;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=4;PP=1142;ReadPosRankSum=0.805;SC=GCTGGTGTTCCAGTTTTTTAA;SOR=1.398;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=69;TCF=62;TCR=7;TR=47;WE=122303329;WS=122303311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,48:0.67:72
chr7	122376925	rs113773528	T	C	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=304;ReadPosRankSum=-1.518;SC=CCAGCAAGCTTCTTTAAAATG;SOR=0.190;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=52;TCF=50;TCR=2;TR=16;WE=122376933;WS=122376915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,16:0.31:51
chr7	122634843	rs1204014	C	T	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.368;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=15;PP=1055;ReadPosRankSum=-1.183;SC=TCCTTTTCAACGTAGGGCTGC;SOR=1.036;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=145;TCF=104;TCR=41;TR=60;WE=122634851;WS=122634833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,61:0.41:148
chr7	122635024	rs860170	C	T	6409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=90;PP=2965;SC=GGCAGTGAAGCGCGCTTTCAT;SOR=0.840;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=194;TCF=103;TCR=91;TR=191;WE=122635032;WS=122635014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr7	122635173	rs846664	A	C	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.252;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=930;ReadPosRankSum=-0.046;SC=ACTGATGAAAATTTTCAAGTT;SOR=0.836;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=173;TCF=86;TCR=87;TR=57;WE=122635181;WS=122635163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,58:0.33:178
chr7	122635386	rs2692396	C	G	2649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.15;ReadPosRankSum=0.210;SOR=0.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:185,76:0.29:261
chr7	122635389	rs2233988	G	A	2630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.04;ReadPosRankSum=0.168;SOR=0.685;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:185,77:0.29:262
chr7	122769378	.	CTGTGTGTGTGTG	C,CTGTGTGTG	1255.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.11;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=17;NF=22,22;NR=2,2;PP=627,2224;SC=TCTCTCTTCTCTGTGTGTGTG;SOR=3.003;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=74;TCF=64;TCR=10;TR=24,24;WE=122769397;WS=122769368;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.80,0.20:41
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chr7	122774729	rs2470984	C	A	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-5.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=374;ReadPosRankSum=-0.273;SC=AAATAGAGTACTTTTACCCCT;SOR=0.749;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=18;WE=122774737;WS=122774719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
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chr7	123092969	rs1525626	C	G	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=139;ReadPosRankSum=0.188;SC=AATAAATGAGCGTTCATATCC;SOR=0.296;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=9;WE=123092977;WS=123092959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,9:0.27:33
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chr7	123109242	rs10243987	C	T	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.786;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=176;ReadPosRankSum=-0.418;SC=GAACTCTACCCCCAAACTAAG;SOR=1.016;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=11;WE=123109250;WS=123109232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,11:0.24:45
chr7	123120070	rs12155170	C	T	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=354;ReadPosRankSum=0.540;SC=AAAATCCCATCTTGAATGATC;SOR=0.256;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=2;TCR=53;TR=19;WE=123120078;WS=123120060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr7	123196787	rs113495801	C	CA	167.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.051;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.416;NF=8;NR=1;PP=195;ReadPosRankSum=-0.773;SC=TCAAATGTGTCAAAAAACGCT;SOR=0.046;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=9;WE=123196795;WS=123196777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr7	123254536	rs994344	C	T	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.682;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=80;ReadPosRankSum=1.903;SC=GAACTTGTCTCGTTCAAAATT;SOR=1.501;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=6;WE=123254544;WS=123254526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr7	123256427	rs6962756	C	T	2753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=66;PP=2240;SC=GGTCACATTCCTGAGCTCCAG;SOR=3.126;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=14;TCR=66;TR=80;WE=123256435;WS=123256417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr7	123264804	rs11769381	C	T	1775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=45;PP=1460;ReadPosRankSum=-0.945;SC=GATTTGGAGTCACACCACTAG;SOR=0.783;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=108;TCF=38;TCR=70;TR=69;WE=123264812;WS=123264794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,69:0.63:110
chr7	123269118	rs4731112	G	C	9298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=178;PP=2965;ReadPosRankSum=1.602;SC=CTGTATTTTGGCGTTTCTAAT;SOR=0.571;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=281;TCF=101;TCR=180;TR=279;WE=123269126;WS=123269108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,290:1.00:291
chr7	123269976	rs3993666	G	GGC	1037.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=953;SC=TTATGTATATGATATTAAAAA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=19;WE=123269984;WS=123269966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	123295964	rs7779099	C	T	1127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=26;NR=6;PP=876;SC=TGCTTCTGGCCGCCTTGAATG;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=123295972;WS=123295954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr7	123296320	rs12538876	C	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.943;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=72;ReadPosRankSum=1.349;SC=CCTTGGCTAACCCCACCTCCC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=123296328;WS=123296310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr7	123301940	rs7809453	A	G	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.157;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=4;PP=931;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGGAAAGTGAAGAAGAGCTTA;SOR=1.662;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=61;TCF=50;TCR=11;TR=35;WE=123301948;WS=123301930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,34:0.57:60
chr7	123303052	rs61745020	G	A	1470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=10;PP=1191;ReadPosRankSum=0.641;SC=AGTGCCCAACGGGCATTACAA;SOR=0.567;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=59;TCR=14;TR=51;WE=123303060;WS=123303042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,54:0.69:78
chr7	123324546	rs5887151	AAT	A	469.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.577;NF=9;NR=4;PP=505;ReadPosRankSum=-1.231;SC=TCACCTTAAAAATATATATAT;SOR=0.352;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=13;WE=123324555;WS=123324536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
chr7	123324745	rs147291543	CCAG	C	1273.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=25;PP=1313;ReadPosRankSum=-1.198;SC=AATGTGACTCCCAGAAGAATC;SOR=0.668;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=29;WE=123324755;WS=123324735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,32:0.74:43
chr7	123329060	rs67743898	GTC	G	525.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;QD=30.93;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	123334696	rs35280100	GT	G	748.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.953;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=767;ReadPosRankSum=-0.974;SC=ATGTATGAATGTTAACTGGTT;SOR=0.349;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=22;WE=123334704;WS=123334686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr7	123336804	rs10270793	G	A	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=313;ReadPosRankSum=0.646;SC=ATTAGGACCTGCAAATAAAAC;SOR=0.485;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=17;WE=123336812;WS=123336794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr7	123360398	rs34980321	CA	C	45.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.52;ReadPosRankSum=0.755;SOR=0.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr7	123388732	rs1054706	G	A	2976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.623;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=55;PP=2314;ReadPosRankSum=0.026;SC=TGAGCAACAGGGACCCCACGT;SOR=0.599;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=73;TCR=81;TR=105;WE=123388740;WS=123388722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,111:0.68:163
chr7	123593633	rs34404662	G	A	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=1;PP=599;ReadPosRankSum=-0.757;SC=CAATGGGAGTGCTAAAATTCA;SOR=0.440;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=28;WE=123593641;WS=123593623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,30:0.71:42
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chr7	123594638	rs17146510	T	C	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=293;ReadPosRankSum=-1.035;SC=TTGATTGAAATTTAATATTAT;SOR=0.760;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=13;WE=123594646;WS=123594628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr7	123595086	rs34978112	T	C	2392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.863;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=41;PP=1937;ReadPosRankSum=0.589;SC=AAACTGTTGCTCTGGGTGCTT;SOR=0.723;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=171;TCF=87;TCR=84;TR=88;WE=123595094;WS=123595076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,90:0.51:175
chr7	123610348	rs11975640	C	T	4705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=105;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.886;SC=CCTTGGCTTACAGGTGACTAT;SOR=0.863;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=149;TCF=43;TCR=106;TR=148;WE=123610356;WS=123610338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,155:0.99:156
chr7	123610388	rs55987967	T	C	1935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.534;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=56;PP=1592;ReadPosRankSum=-0.836;SC=TATGTTTCTGTCTGTGACCTT;SOR=0.320;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=84;TCF=10;TCR=74;TR=65;WE=123610396;WS=123610378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,65:0.76:86
chr7	123672456	.	CGCTGCT	C	2855.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=35;PP=2855;SC=CGCGCCCCTCCGCTGCTGCTG;SOR=1.318;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=82;TCF=24;TCR=58;TR=51;WE=123672469;WS=123672446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr7	124386815	rs143006442	A	G	1366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.569;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=1088;ReadPosRankSum=0.017;SC=AACAAAAGGAACTGGCTGATG;SOR=0.623;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=196;TCF=114;TCR=82;TR=59;WE=124386823;WS=124386805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,61:0.30:205
chr7	124387374	rs724356	A	G	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-4.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=426;ReadPosRankSum=-0.990;SC=ATAAGGTGAAAGTGGTGACTC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=19;WE=124387382;WS=124387364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr7	124404371	rs61744942	G	A	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=625;ReadPosRankSum=1.113;SC=ATCCATTCTGGGCCAGCGCCC;SOR=0.381;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=93;TCF=25;TCR=68;TR=35;WE=124404379;WS=124404361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,34:0.36:95
chr7	124462443	.	T	C	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=106;ReadPosRankSum=-0.022;SC=AAAGAAATCATGATAAGGTGG;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=9;WE=124462451;WS=124462433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,9:0.27:33
chr7	124462582	.	C	T	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.519;ClippingRankSum=0.000;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.117;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=22;PP=977;ReadPosRankSum=0.739;SC=CTTTGGACCTCTACTCTTCTA;SOR=0.429;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=146;TCF=89;TCR=57;TR=52;WE=124462590;WS=124462572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,54:0.36:149
chr7	124465509	rs10250202	A	C	34.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr7	124469267	rs10263573	A	T	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=21;PP=1613;SC=TAACCTTGTAAACAAACAGTT;SOR=1.646;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=63;WE=124469275;WS=124469257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr7	124475296	rs142780416	TAAACA	T	2228.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=1;PP=1812;SC=AAAAGTATAATAAACAAAACA;SOR=5.630;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=34;WE=124475308;WS=124475286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	124477182	rs7787804	A	G	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=14;PP=822;SC=ACATTTATTAAGTCTTTAACC;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=33;WE=124477190;WS=124477172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	124481245	rs3815221	G	A	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=25;PP=968;SC=AAAATTATTGGCAATGAAATG;SOR=1.721;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=36;WE=124481253;WS=124481235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	124483001	rs147003926	C	T	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=197;ReadPosRankSum=-1.449;SC=TCTCCAAATACTGATGATCTG;SOR=0.666;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=54;TCF=9;TCR=45;TR=13;WE=124483009;WS=124482991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,13:0.23:57
chr7	124486980	rs7794637	T	C	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=16;PP=667;SC=ATCTCAAAAATGATACATAGT;SOR=0.811;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=14;TCR=16;TR=30;WE=124486988;WS=124486970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr7	124499002	rs6977407	AT	CA	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=5.303;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.81;ReadPosRankSum=-1.874;SOR=2.380;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr7	124537349	.	CACTT	C	127.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=123;ReadPosRankSum=0.941;SC=TAAAAGTACACACTTACTTGT;SOR=0.465;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=4;WE=124537360;WS=124537339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr7	125588504	.	CAAGA	C	1192.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=2;PP=653;SC=AGCAAGCAAGCAAGAAAGAAA;SOR=2.833;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=18;WE=125588541;WS=125588494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	125588512	.	A	C	1239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.00;QD=45.92;SOR=2.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	125588526	.	GAAGAAAGA	G,GAAGA	380.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=54.22;MQRankSum=1.024;QD=29.29;ReadPosRankSum=-1.208;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,6,6:0.46,0.46:13
chr7	125753485	rs1419526	C	A	1303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=0;PP=1166;SC=AGGCTCTGTTCATGAATTTCA;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=37;WE=125753493;WS=125753475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	125753551	rs1419527	A	G	5056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.19;MQRankSum=0.201;QD=44.75;ReadPosRankSum=0.475;SOR=1.592;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr7	125753556	rs5887285	A	AG	5324.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.17;MQRankSum=0.194;QD=43.65;ReadPosRankSum=0.128;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,121:0.99:122
chr7	125753603	rs1419528	A	G	6180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.151;NF=115;NR=75;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.165;SC=AGAGAAGGAGATAAGATTTTA;SOR=0.477;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=116;TCR=75;TR=190;WE=125753611;WS=125753593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,198:0.99:199
chr7	125753636	rs1419529	A	G	6272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=98;PP=2965;SC=AGAGTTACAAACATGAACCAA;SOR=0.703;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=92;TCR=98;TR=190;WE=125753644;WS=125753626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr7	125753737	rs4395830	A	C	2316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=65;PP=1999;SC=TGGGCATGACAAAGGTTTTGA;SOR=5.580;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=68;TCF=3;TCR=65;TR=68;WE=125753745;WS=125753727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
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chr7	126544012	rs769199	T	C	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.08;QD=31.67;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr7	127026342	rs6962137	G	A	1235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=42;PP=1098;ReadPosRankSum=0.000;SC=ACACACACACGCATATATAAT;SOR=5.235;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=42;WE=127026350;WS=127026332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,40:0.95:42
chr7	127222521	rs33973710	G	A	1920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.158;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=37;PP=1330;ReadPosRankSum=-0.888;SC=CCCCAGGACCGCCACCACCCA;SOR=0.454;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=190;TCF=106;TCR=84;TR=76;WE=127222529;WS=127222511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,83:0.42:197
chr7	127224193	rs3735643	A	G	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.279;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=580;ReadPosRankSum=-0.828;SC=TGAAAGAGATATGGATAATTA;SOR=0.100;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=57;TCF=54;TCR=3;TR=25;WE=127224201;WS=127224183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chr7	127228728	rs12536382	C	T	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=49;ReadPosRankSum=0.566;SC=CCCCGAGTCACCCACCTCATA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=127228736;WS=127228718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr7	127234121	rs806212	C	T	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=3.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.543;NF=0;NR=8;PP=98;ReadPosRankSum=-0.101;SC=TGTGCGCGCGCGCGTGTGTGT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=8;WE=127234129;WS=127234111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr7	127250907	rs712700	T	C	1485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=22;PP=1148;ReadPosRankSum=-1.431;SC=CTCTTAAGGCTAGTGTGAGAA;SOR=0.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=47;TCR=34;TR=52;WE=127250915;WS=127250897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,54:0.65:83
chr7	127251188	rs712701	T	G	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.503;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=606;ReadPosRankSum=1.108;SC=ACTGGCCAGGTGACAGTGGGA;SOR=0.345;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=31;WE=127251196;WS=127251178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,35:0.70:50
chr7	127251792	rs327518	G	A	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=663;ReadPosRankSum=0.954;SC=AGAGAACGCCGGGACCCCAGA;SOR=0.953;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=31;WE=127251800;WS=127251782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,32:0.70:46
chr7	127253433	.	G	C	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.736;ClippingRankSum=0.000;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.256;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=533;ReadPosRankSum=-0.330;SC=CCACCTCATTGGAACCCAAAG;SOR=0.466;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=135;TCF=81;TCR=54;TR=41;WE=127253441;WS=127253423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,45:0.32:142
chr7	127253451	rs78594665	C	T	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.536;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=521;ReadPosRankSum=-0.870;SC=AAGCCCTGGCCGGCCCAGACT;SOR=0.919;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=127;TCF=66;TCR=61;TR=37;WE=127253459;WS=127253441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,42:0.31:134
chr7	127253714	rs3835004	A	AG	380.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.830;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.873;NF=5;NR=5;PP=369;ReadPosRankSum=-1.441;SC=GGCCACTCACACCTGCACCTC;SOR=0.368;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=10;WE=127253722;WS=127253704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr7	127254457	rs594141	G	A	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=209;ReadPosRankSum=-0.188;SC=ATCCAAGAAAGAACGAGAAAG;SOR=0.430;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=13;WE=127254465;WS=127254447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr7	127254551	rs2233578	G	A	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.309;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=259;ReadPosRankSum=-1.124;SC=GACCTGAGCCGTGTGCACGGT;SOR=0.402;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=16;WE=127254559;WS=127254541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr7	127255285	rs698406	C	G	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.684;HP=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;ReadPosRankSum=0.373;SC=TCCAGCCTCACCTTTGAGGGC;SOR=0.886;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=37;TCF=20;TCR=17;TR=26;WE=127255293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr7	127255795	rs327516	C	G	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.876;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=465;ReadPosRankSum=-0.324;SC=TTGCCCATACCCGCCAACTCT;SOR=0.399;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=24;WE=127255803;WS=127255785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,25:0.71:35
chr7	127347733	rs11972774	G	C	1579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.709;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=44;PP=1305;ReadPosRankSum=1.480;SC=GATATGCATAGTGGACATTGC;SOR=1.700;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=111;TCF=42;TCR=69;TR=62;WE=127347741;WS=127347723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,62:0.55:113
chr7	127361269	rs918793	G	A	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=491;ReadPosRankSum=-0.739;SC=CTGTGAGGGTGGTGGGCCTTG;SOR=0.760;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=26;WE=127361277;WS=127361259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,27:0.75:36
chr7	127447499	rs325440	A	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.81;ReadPosRankSum=-0.207;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,9:0.21:43
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chr7	127669857	rs3823994	A	T	1495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-5.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.239;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=33;PP=1184;ReadPosRankSum=-0.315;SC=GGGGCAAAGAAGAGAGGTTAT;SOR=0.806;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=166;TCF=80;TCR=86;TR=61;WE=127669865;WS=127669847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,62:0.37:169
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chr7	127957893	rs2290226	T	C	2251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.430;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=63;PP=1868;ReadPosRankSum=0.310;SC=CTTTTTTTTGTCCACTTGCCA;SOR=2.033;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=112;TCF=23;TCR=89;TR=74;WE=127957901;WS=127957883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,77:0.68:113
chr7	127963515	rs17152005	G	A	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=230;ReadPosRankSum=-0.530;SC=TCTAGCATTCGATAACTATTT;SOR=0.422;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=13;WE=127963523;WS=127963505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr7	127973133	rs359650	T	C	1398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=1;PP=1187;SC=GAAATCTAAATGAAAACGTGA;SOR=6.138;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=41;WE=127973141;WS=127973123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr7	127976119	rs359651	G	T	3804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=98;PP=2965;SC=GTAAAGAAAGGAGGAATTCAT;SOR=3.414;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=17;TCR=98;TR=115;WE=127976127;WS=127976109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr7	127977352	rs2402890	T	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.854;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=122;ReadPosRankSum=-0.429;SC=ATGGAACCAGTGGAGACAAAG;SOR=0.172;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=13;WE=127977360;WS=127977342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr7	127978445	rs41281731	C	T	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.302;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=30;PP=587;ReadPosRankSum=-0.561;SC=AGGAGGTAGCCAGAATACTAA;SOR=2.380;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=89;TCF=18;TCR=71;TR=32;WE=127978453;WS=127978435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,34:0.35:96
chr7	127981255	rs73721364	G	A	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.174;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=883;ReadPosRankSum=0.793;SC=CTTTGACACAGGACACTGATC;SOR=1.045;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=152;TCF=64;TCR=88;TR=47;WE=127981263;WS=127981245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,47:0.31:151
chr7	127991133	rs891215	G	A	1628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.738;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=28;PP=1246;ReadPosRankSum=-0.285;SC=AGGGCAGCGCGGGGGCCTGTC;SOR=0.812;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=94;TCF=49;TCR=45;TR=61;WE=127991141;WS=127991123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,63:0.66:96
chr7	127992437	rs1651945	C	G	3012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=47;PP=2330;SC=CGGGCGGGCACCGCCAGGGCA;SOR=0.826;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=42;TCR=47;TR=89;WE=127992445;WS=127992427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr7	127998671	rs60687097	A	G	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=-1.056;SC=AACACTGATGAGTGACTAGCA;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=5;WE=127998679;WS=127998661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr7	127999645	rs56272205	C	T	2599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=51;PP=2146;SC=CCCAGAGCGCCGGGATGTGGA;SOR=1.387;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=29;TCR=51;TR=80;WE=127999653;WS=127999635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr7	127999815	.	G	C	2235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.484;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.880;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=22;PP=1697;ReadPosRankSum=0.464;SC=GCCCAAGAGAGAGTGGCTGGG;SOR=0.586;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=104;TCF=74;TCR=30;TR=74;WE=127999823;WS=127999805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,80:0.73:110
chr7	128000004	rs190063022	G	A	1575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.739;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=52;PP=1271;ReadPosRankSum=0.630;SC=CAAACAGGACGCAGCAGAACA;SOR=2.670;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=70;TCF=4;TCR=66;TR=54;WE=128000012;WS=127999994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,56:0.78:72
chr7	128000091	rs359642	G	A	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=17;PP=510;SC=GGACTCAGTTGTTCAGCAGCT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=128000099;WS=128000081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	128034629	rs2228075	C	T	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=521;ReadPosRankSum=-0.446;SC=AGACACCCTGCGCGATCTTCA;SOR=0.760;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=42;TCF=19;TCR=23;TR=25;WE=128034637;WS=128034619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr7	128038555	rs2288550	C	G	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.456;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=12;PP=401;ReadPosRankSum=0.230;SC=CCCCACAGAGCAGCTGCTTCT;SOR=0.350;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=72;TCF=44;TCR=28;TR=26;WE=128038563;WS=128038545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,26:0.34:76
chr7	128040699	rs2278294	C	T	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.551;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=404;ReadPosRankSum=1.588;SC=GAAGCCAGGACCCTCAGTGGG;SOR=2.712;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=18;WE=128040707;WS=128040689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr7	128043612	.	CA	C	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=7.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.60;MQRankSum=1.863;QD=0.67;ReadPosRankSum=-0.374;SOR=2.849;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,13:0.25:53
chr7	128095843	rs2288554	G	A	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=344;ReadPosRankSum=-0.275;SC=GTGCGTCCCGGGCGTGCGTGC;SOR=0.368;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=17;WE=128095851;WS=128095833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr7	128095876	rs2732393	A	G	1571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=5;PP=1231;SC=GCGTGCGCGTACCCTCCTGGG;SOR=4.003;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=41;TCR=5;TR=46;WE=128095884;WS=128095866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr7	128102508	rs10647404	C	CTCTT	748.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.91;QD=44.04;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	128117010	.	G	GCCGGCCACGAGTCAAGCTGCCCTAC	233.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=5.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.59;MQRankSum=0.777;QD=9.74;ReadPosRankSum=1.460;SOR=2.683;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr7	128120810	rs139670586	G	T	44.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.50;QD=22.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr7	128128133	rs2732429	T	C	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.54;QD=31.72;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	128128286	rs140236081	AG	A	313.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.246;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.431;NF=7;NR=6;PP=346;ReadPosRankSum=-1.496;SC=CTAAAAATCAAGGTCTCTGGC;SOR=0.065;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=13;WE=128128294;WS=128128276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr7	128133984	rs2562741	G	A	3221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=84;PP=2716;SC=TCTTTCAGCAGTTGTTCCAGA;SOR=3.634;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=13;TCR=84;TR=97;WE=128133992;WS=128133974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr7	128141865	rs1053124	T	C	6541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=157;NR=72;PP=2965;SC=AAGTTCAGAATCTGGTGGACC;SOR=1.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=229;TCF=157;TCR=72;TR=229;WE=128141873;WS=128141855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr7	128142023	rs12539729	A	T	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.812;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=59;PP=1273;ReadPosRankSum=1.942;SC=GAGCTTTTTTAAAAAAAAATT;SOR=0.861;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=176;TCF=31;TCR=145;TR=71;WE=128142031;WS=128142013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,60:0.36:167
chr7	128220111	rs139965573	G	T	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=10.772;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.54;MQRankSum=0.614;QD=14.53;ReadPosRankSum=-0.182;SOR=1.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr7	128298600	rs73723614	T	A	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.948;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.383;NF=16;NR=8;PP=434;ReadPosRankSum=-1.121;SC=GCACTCCCTGTCCCACCTGGT;SOR=0.328;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=24;WE=128298608;WS=128298590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr7	128298973	rs58211466	G	GT	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=-0.000;QD=8.97;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr7	128312450	rs11769769	C	T	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=5.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=345;ReadPosRankSum=-0.404;SC=TACCAAGAACCAATGAGTAAA;SOR=0.880;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=17;WE=128312458;WS=128312440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,18:0.36:50
chr7	128312703	rs67851440	AG	A	303.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.744;NF=1;NR=13;PP=265;ReadPosRankSum=0.395;SC=GCCCTGGGGGAGGGGGGGGCG;SOR=0.776;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=14;WE=128312711;WS=128312693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr7	128315588	rs13308199	T	A,C	1331.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=29;NF=30,12;NR=0,0;PP=744,183;SC=GGGAGGCCAATGAAAAGGATC;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=30,12;WE=128315596;WS=128315578;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.72,0.28:43
chr7	128315672	rs78302479	A	ATTC	3693.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.663;NF=49;NR=23;PP=2921;ReadPosRankSum=-0.235;SC=CAGCATCTGTATTCCACCCCT;SOR=0.797;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=111;TCF=74;TCR=37;TR=72;WE=128315680;WS=128315662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,91:0.71:129
chr7	128315791	rs61738927	C	G	2247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.561;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=57;PP=1680;ReadPosRankSum=-0.590;SC=TCCTCGGGGTCACCTCCTCGG;SOR=0.885;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=126;TCF=43;TCR=83;TR=84;WE=128315799;WS=128315781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,86:0.66:130
chr7	128315882	rs17169357	C	A	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.559;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=559;ReadPosRankSum=1.806;SC=CTGGAGCACACCTGGTGACGC;SOR=2.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=25;WE=128315890;WS=128315872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr7	128317575	rs368780631	G	A	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQRankSum=-1.150;QD=2.65;ReadPosRankSum=-1.562;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr7	128317658	rs6467210	C	T	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.458;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=516;ReadPosRankSum=0.380;SC=AATCTACGACCGGCTCCAGCG;SOR=1.586;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=23;WE=128317666;WS=128317648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr7	128317882	rs7797745	T	C	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.908;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=552;ReadPosRankSum=-0.271;SC=GTGGGCCTCCTTCCGGGACCT;SOR=1.314;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=24;WE=128317890;WS=128317872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,25:0.74:34
chr7	128318006	rs67602452	G	T	31.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr7	128319982	rs2290229	A	T	1683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.039;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=13;PP=1181;ReadPosRankSum=0.818;SC=TTAGGGTGTGAAACTCAACTG;SOR=0.992;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=70;TCR=20;TR=60;WE=128319990;WS=128319972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,64:0.67:96
chr7	128322918	rs4554406	A	G	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.666;NF=22;NR=0;PP=428;ReadPosRankSum=1.424;SC=GGTGTGAGCCACTGCACCCAG;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=22;WE=128322926;WS=128322908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr7	128323034	rs1109552	A	G	2264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.599;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=45;PP=1629;ReadPosRankSum=0.055;SC=TGACACTGCCATTGAAATAGA;SOR=0.729;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=78;TCR=76;TR=91;WE=128323042;WS=128323024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,95:0.60:158
chr7	128358891	rs745229	C	A	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-6.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.966;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=460;ReadPosRankSum=1.081;SC=TCAGGATTCTCCCATTGAGGT;SOR=0.508;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=86;TCF=64;TCR=22;TR=32;WE=128358899;WS=128358881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,33:0.38:88
chr7	128359133	rs6949056	C	T	1446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=41;PP=1070;ReadPosRankSum=0.518;SC=TCAGGAGATTCGAAGGTAAGT;SOR=0.902;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=66;TCF=6;TCR=60;TR=45;WE=128359141;WS=128359123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,50:0.71:70
chr7	128363287	rs6971091	G	A	1589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=38;PP=1124;ReadPosRankSum=0.460;SC=CCAGCCCAGCGAGAGTCTCAT;SOR=0.661;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=75;TCR=96;TR=69;WE=128363295;WS=128363277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,72:0.41:176
chr7	128371206	rs339066	G	A	7618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=134;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.774;SC=TGCAAGCCTCGTCAACACCAC;SOR=0.292;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=245;TCF=110;TCR=135;TR=244;WE=128371214;WS=128371196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,247:1.00:248
chr7	128416008	rs62617076	T	C	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=328;ReadPosRankSum=0.100;SC=CCTAAACCTTTTGTGGCCCCA;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=14;WE=128416016;WS=128415998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr7	128434900	rs3736279	T	C	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.04;ReadPosRankSum=1.933;SOR=0.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,9:0.19:47
chr7	128444820	rs2291573	A	G	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.331;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=391;ReadPosRankSum=0.203;SC=TGAGAGGTACAGCTGTCTCTG;SOR=1.040;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=23;WE=128444828;WS=128444810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,23:0.40:57
chr7	128445370	rs1565629	G	A	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=335;ReadPosRankSum=-1.415;SC=GTGATGCCAGGCAGAACTCCC;SOR=0.542;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=14;WE=128445378;WS=128445360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr7	128450532	rs7799186	G	A	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=4.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.973;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=756;ReadPosRankSum=-1.321;SC=CCAGGGGTAAGGATAAGGCAA;SOR=3.026;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=29;WE=128450540;WS=128450522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr7	128451353	rs111409895	C	CAGAGAGCCTGGGA	2783.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=11;NR=12;PP=2974;SC=AAGCCAGGCCCAACATGCCCA;SOR=1.159;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=33;TCF=18;TCR=15;TR=23;WE=128451361;WS=128451343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr7	128451741	rs17165198	T	C	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=67;ReadPosRankSum=1.994;SC=GAGGTGGAAATGTAGGTGTGC;SOR=0.627;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=6;WE=128451749;WS=128451731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr7	128455767	rs4728137	C	G	2485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=21;PP=1954;SC=GGAAAAAAAGCAAGTGAAAGA;SOR=1.936;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=53;TCR=21;TR=74;WE=128455775;WS=128455757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr7	128455916	rs2270590	G	A	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.697;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=732;ReadPosRankSum=-1.262;SC=AAGAGGAGGAGGATGACGCCG;SOR=0.602;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=135;TCF=82;TCR=53;TR=43;WE=128455924;WS=128455906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,42:0.30:141
chr7	128470838	rs3734972	C	T	1485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.093;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=27;PP=1227;ReadPosRankSum=-0.471;SC=GCAATGAGCACCTCAAGTGCG;SOR=0.417;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=141;TCF=82;TCR=59;TR=59;WE=128470846;WS=128470828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,58:0.40:144
chr7	128477472	rs2291560	T	C	2227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.264;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=23;PP=1482;ReadPosRankSum=-1.059;SC=CTGAGGAGATTGTGGACCCCA;SOR=0.460;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=273;TCF=212;TCR=61;TR=91;WE=128477480;WS=128477462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,99:0.34:288
chr7	128477547	rs2291561	T	C	2733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=443;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=61;PP=1780;ReadPosRankSum=-0.648;SC=TCAAACCTGGTGCCCCTGTTC;SOR=0.684;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=432;TCF=232;TCR=200;TR=133;WE=128477555;WS=128477537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:301,139:0.32:440
chr7	128477620	rs55907818	G	A	2389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.958;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=72;PP=1656;ReadPosRankSum=-1.365;SC=TGAGCCCCTGGCGGCCCTCCT;SOR=0.825;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=353;TCF=127;TCR=226;TR=110;WE=128477628;WS=128477610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:241,115:0.32:356
chr7	128479982	rs61448157	C	G	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=4.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=279;ReadPosRankSum=-0.896;SC=ACTGCCTGTGCCTGGGAGGGG;SOR=0.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=14;WE=128479990;WS=128479972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr7	128481480	.	C	G	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.060;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.619;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=590;ReadPosRankSum=-2.989;SC=CCTCCCCTCCCCAACTCAGCC;SOR=0.530;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=105;TCF=46;TCR=59;TR=37;WE=128481488;WS=128481470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,38:0.35:108
chr7	128483227	rs2291567	T	C	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=125;ReadPosRankSum=0.255;SC=AGCATCTAGCTGAGAGCAGGG;SOR=0.746;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=9;WE=128483235;WS=128483217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr7	128484816	rs3734973	A	G	1468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.547;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=37;PP=1122;ReadPosRankSum=1.346;SC=GGCTGACCGTAGAGGGCCCCT;SOR=0.922;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=189;TCF=100;TCR=89;TR=63;WE=128484824;WS=128484806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,63:0.33:189
chr7	128486363	rs34373805	C	T	1341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.439;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=18;PP=966;ReadPosRankSum=0.045;SC=AGGCGTGCATCTGGTGGAGGT;SOR=1.244;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=142;TCF=86;TCR=56;TR=55;WE=128486371;WS=128486353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,58:0.38:152
chr7	128487866	rs2249128	T	C	2582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=42;PP=2006;SC=TCACAGTGGATTGCAGTCAAG;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=37;TCR=42;TR=79;WE=128487874;WS=128487856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr7	128491324	rs181067717	C	T	1860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=31;PP=1523;ReadPosRankSum=0.561;SC=CATCAACAGCCGCCATGTCAG;SOR=0.628;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=66;TCR=51;TR=70;WE=128491332;WS=128491314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,69:0.59:117
chr7	128498630	rs145777348	TACACAC	T	106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.431;NF=0;NR=2;PP=87;ReadPosRankSum=-1.465;SC=ACACACACATTACACACACAC;SOR=0.048;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=2;WE=128498643;WS=128498620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr7	128506970	rs4323418	T	C	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=206;ReadPosRankSum=-0.978;SC=GGGTCCAGACTATAAACAGAG;SOR=0.765;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=11;WE=128506978;WS=128506960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr7	128525182	rs73721647	T	C	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.379;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=282;ReadPosRankSum=0.025;SC=CATGGGGCCCTTGGCGGGGCT;SOR=0.990;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=14;WE=128525190;WS=128525172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,15:0.31:48
chr7	128527093	rs11982744	T	G	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.931;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=30;PP=896;ReadPosRankSum=1.351;SC=CTACTGAGCCTGCAGGGGCCC;SOR=0.486;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=171;TCF=69;TCR=102;TR=52;WE=128527101;WS=128527083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,55:0.31:176
chr7	128533514	rs34061445	T	TC	2663.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=47;PP=2973;SC=GATACTGGTGTCCTGGTACTC;SOR=1.673;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=75;TCF=22;TCR=53;TR=68;WE=128533522;WS=128533504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr7	128542746	rs17165895	G	A	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=335;ReadPosRankSum=0.527;SC=ACACCTCTGCGAAGTACTCCA;SOR=0.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=84;TCF=63;TCR=21;TR=24;WE=128542754;WS=128542736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,26:0.29:89
chr7	128546187	rs57686934	C	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=116;ReadPosRankSum=0.446;SC=CTGATTTGTGCATGGGTTCTG;SOR=0.730;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=11;WE=128546195;WS=128546177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr7	128546255	rs73721654	T	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.71;ReadPosRankSum=0.532;SOR=0.487;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,12:0.23:53
chr7	128546298	rs60636713	C	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=4.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.98;ReadPosRankSum=-0.219;SOR=1.700;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,13:0.23:57
chr7	128546338	rs59986883	T	C	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=5.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-2.162;QD=2.05;ReadPosRankSum=1.215;SOR=2.140;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,6:0.17:36
chr7	128548304	.	G	GAAGAAAGA,GAAGAAAGAAAGAAAGAAAGA	3701.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=0.000;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=53.54;MQRankSum=-1.476;QD=72.58;ReadPosRankSum=0.544;SOR=6.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,37,13:0.73,0.25:51
chr7	128548463	rs7786945	A	C	3954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=9.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=503;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=98;PP=2962;ReadPosRankSum=0.222;SC=GCAAACCAGCACTGTCTCCAT;SOR=0.644;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=486;TCF=191;TCR=295;TR=163;WE=128548471;WS=128548453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:331,167:0.34:498
chr7	128550680	rs11335250	GC	G	581.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=5;PP=704;SC=CAGCGCCAGGGCCCCCGAGGT;SOR=1.981;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=19;WE=128550688;WS=128550670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	128552723	.	C	T	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.250;NF=7;NR=3;PP=158;ReadPosRankSum=0.932;SC=CTCAAGGGACCTTGACTTTGA;SOR=0.869;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=10;WE=128552731;WS=128552713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr7	128553100	rs142966946	T	G	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.45;MQRankSum=-1.499;QD=8.14;ReadPosRankSum=-0.328;SOR=0.503;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr7	128587351	rs199508964	CACTCTGCAGCCGCCCACTCTGCGGCCGCCT	C	3118.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=25;PP=2957;SC=AGTGGCCGCCCACTCTGCAGC;SOR=0.801;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=68;TCF=34;TCR=34;TR=42;WE=128587388;WS=128587341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr7	128607384	rs8043	G	A	2783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=35;PP=2075;SC=TCACTGTGACGGCTCCCACGG;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=51;TCR=35;TR=86;WE=128607392;WS=128607374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr7	128610484	rs1691779	A	G	876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=28;PP=840;SC=GTGTGTGTGCACGCGTGGCTG;SOR=5.211;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=29;WE=128610492;WS=128610474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	128630227	rs1154329	C	T	3153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=59;PP=2416;SC=CAGGCTGTGACGACACACAGC;SOR=1.562;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=33;TCR=59;TR=92;WE=128630235;WS=128630217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr7	128630313	rs6969930	T	C	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=34;PP=1055;SC=TTTTCAAATCTTCAAAAAAGA;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=128630321;WS=128630303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr7	128640334	rs4728144	A	T	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=337;ReadPosRankSum=1.686;SC=TAATTTTTTTAAAAAATTCCA;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=15;WE=128640342;WS=128640324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr7	128641226	rs2305324	G	C	4221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=88;PP=2965;SC=CAATGGCATAGAGAGCTGAGC;SOR=1.701;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=42;TCR=88;TR=130;WE=128641234;WS=128641216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr7	128645292	rs11768572	A	C	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.57;MQRankSum=0.645;NF=0;NR=15;PP=370;ReadPosRankSum=1.033;SC=TTACAAGTATAATAATGAGAA;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=15;WE=128645300;WS=128645282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr7	128694976	rs2242028	C	T	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=26;PP=762;SC=GGGCAGAAGGCTCTCCGTGGA;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=128694984;WS=128694966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	128766505	rs6952057	A	C	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=50.51;MQRankSum=-2.965;NF=7;NR=0;PP=121;ReadPosRankSum=-0.473;SC=TAGGCGCCGAACGCTCCCGGC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=128766513;WS=128766495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr7	128766528	rs10464697	G	C	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.32;MQRankSum=-2.383;QD=27.13;ReadPosRankSum=0.427;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr7	128766533	rs10464698	A	C	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.04;MQRankSum=-2.443;QD=27.32;ReadPosRankSum=0.525;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr7	128766553	rs6952077	A	G	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.13;MQRankSum=-2.463;QD=17.60;ReadPosRankSum=1.188;SOR=2.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,25:0.76:33
chr7	128767410	rs10247566	A	G	3071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.994;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.270;NF=46;NR=69;PP=2444;ReadPosRankSum=-0.970;SC=ATCTTTGGCCAGCCCGTGGTC;SOR=1.227;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=171;TCF=74;TCR=97;TR=115;WE=128767418;WS=128767400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,118:0.66:178
chr7	128767490	rs7809681	T	C	3733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.538;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=58;PP=2866;ReadPosRankSum=-1.668;SC=CAACAGCGGTTACGGGATGGA;SOR=0.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=113;TCR=88;TR=131;WE=128767498;WS=128767480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,134:0.65:207
chr7	128767506	rs7809687	T	G	3487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=-0.717;NF=74;NR=63;PP=2669;ReadPosRankSum=0.977;SC=ATGGACAGCCTGCCCGCCATG;SOR=0.735;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=211;TCF=116;TCR=95;TR=137;WE=128767514;WS=128767496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,142:0.65:217
chr7	128784723	.	A	G	176	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=9;NR=0;PP=176;QD=23.4190236164;SC=GGGCTCCTGCACGGCGCGGCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=128784731;WS=128784713;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr7	128785008	rs13243618	C	T	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=162;ReadPosRankSum=-0.179;SC=GCGCGGGAGCCGCACTGCCGA;SOR=0.395;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=12;WE=128785016;WS=128784998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr7	128802936	rs919551	T	C	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=675;SC=TTTAAGATCATAAGGTGCTTT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=128802944;WS=128802926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	128804218	rs2566892	G	A	1667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=17;PP=1392;SC=GGCAGACTCAGTTAAGAAGGA;SOR=1.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=53;WE=128804226;WS=128804208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr7	128845018	rs2703091	C	T	2668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=13;PP=2143;SC=TGCCTTGACACCGTCTTTTCC;SOR=3.126;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=68;TCR=13;TR=81;WE=128845026;WS=128845008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr7	128845277	rs2075777	G	C	1993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=26;PP=1629;SC=GGGCAGGCCCGGGGGGCCCTC;SOR=1.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=37;TCR=26;TR=63;WE=128845285;WS=128845267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr7	128845325	rs2566872	G	A	3198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=19;PP=2730;SC=GGGAAGGGGGGCAAAGAGGTC;SOR=2.694;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=76;TCR=19;TR=95;WE=128845333;WS=128845315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr7	128845907	rs2075779	T	C	1436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=1;PP=1135;SC=CCTCAGCAGCTGAGGGTCTGG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=39;WE=128845915;WS=128845897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr7	128846328	rs2228617	G	C	6998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=132;PP=2965;SC=CTGTGAGTGGGATTTGTTTTG;SOR=1.032;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=225;TCF=92;TCR=133;TR=224;WE=128846336;WS=128846318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr7	128846469	rs2735842	A	G	1691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=53;PP=1452;SC=GCAACAAAATATACTGGGCAC;SOR=5.747;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=54;TCF=1;TCR=53;TR=54;WE=128846477;WS=128846459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
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chr7	129028857	rs35404531	AT	A	1125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.478;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.639;NF=40;NR=7;PP=617;ReadPosRankSum=-0.335;SC=TAGAGGAAGCATTTTTTTTTT;SOR=0.078;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=80;TCF=70;TCR=10;TR=47;WE=129028865;WS=129028847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,54:0.73:74
chr7	129029093	rs10954231	A	G	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.357;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=425;ReadPosRankSum=-0.399;SC=CTTTTTGTCCATATTAATCCC;SOR=0.077;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=57;TCF=1;TCR=56;TR=22;WE=129029101;WS=129029083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,22:0.37:60
chr7	129029391	rs1541711	C	T	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.452;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=0;PP=762;ReadPosRankSum=0.853;SC=AGGATCTTAACTTAAGAAAAC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=57;TCR=1;TR=34;WE=129029399;WS=129029381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr7	129037029	rs17168750	G	C	1483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.620;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=23;PP=1182;ReadPosRankSum=-1.078;SC=GTTTGGCCCAGGCTTGCTCAT;SOR=0.990;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=102;TCF=62;TCR=40;TR=61;WE=129037037;WS=129037019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,61:0.59:104
chr7	129049507	rs6467244	A	G	1723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=50;PP=1413;SC=ATAGTAGCCCACAAAGCCAGC;SOR=7.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=50;WE=129049515;WS=129049497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr7	129067053	rs4728164	T	C	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=7.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.823;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=47;PP=1172;ReadPosRankSum=-0.059;SC=CCTGTGCCTGTAGTGTTGGCC;SOR=2.584;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=88;TCF=7;TCR=81;TR=48;WE=129067061;WS=129067043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,49:0.52:95
chr7	129091302	rs4731578	A	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=166;ReadPosRankSum=-1.270;SC=TCCTTTTCCCATACCTTATTC;SOR=0.527;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=10;WE=129091310;WS=129091297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr7	129091615	rs59179950	GA	G	96.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=124;ReadPosRankSum=0.000;SC=GCTAGCTTTAGAGGGGTGGAG;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=5;WE=129091623;WS=129091605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr7	129094195	rs581829	T	C	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=4;PP=613;SC=AGAGACCATCTCTGAGGTCTG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=129094203;WS=129094185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	129098313	rs3214796	AC	A	268.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=242;ReadPosRankSum=-2.048;SC=AGCATCAGGGACCCCTATGCT;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=8;WE=129098321;WS=129098303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr7	129098439	rs691124	T	C	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=165;ReadPosRankSum=0.778;SC=GATTGCTGCCTTTTTCCACTG;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=9;WE=129098447;WS=129098429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr7	129122570	rs62489116	C	G	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=469;ReadPosRankSum=-0.832;SC=ACCATAGATTCCTGAAAGCTC;SOR=2.400;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=18;WE=129122578;WS=129122568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr7	129125314	.	G	A	46	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;FR=0.5000;HP=19;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=17;MQ=58.45;NF=7;NR=0;PP=46;QD=11.5387446496;SC=AAAAAAAAAAGAATTTCTGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=7;WE=129125322;WS=129125304;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,7:0.37:19
chr7	129125352	rs10500117	C	G	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=429;ReadPosRankSum=-1.853;SC=TCCCATAGACCATGCTCTGTG;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=23;WE=129125360;WS=129125342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,26:0.81:32
chr7	129125750	rs692625	G	T	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=25;ReadPosRankSum=0.210;SC=CCATACAGGCGCTGTTACCAG;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=129125758;WS=129125740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr7	129142694	rs691332	C	G	2154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=44;PP=1589;SC=CTAAAGTACCCGGGGCCAGGG;SOR=1.745;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=64;WE=129142702;WS=129142684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr7	129142775	rs610591	G	A	937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=708;SC=CCCTGGGGTCGACCTCAACGC;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=129142783;WS=129142765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	129297332	rs1882094	T	G	2507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=54;PP=1887;SC=CGCCTTCTTCTCCCGAGGACA;SOR=1.816;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=24;TCR=54;TR=78;WE=129297340;WS=129297322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr7	129410144	rs4467881	G	A	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=4.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.12;ReadPosRankSum=0.829;SOR=0.074;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr7	129410195	rs4541843	G	A	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=140;ReadPosRankSum=0.114;SC=CAGCATGGCCGGCCCTTCCCT;SOR=0.446;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=11;WE=129410203;WS=129410185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,13:0.32:40
chr7	129519555	rs62491504	C	T	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=195;ReadPosRankSum=-0.414;SC=GTAAATTAAACATTATCCCCT;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=10;WE=129519563;WS=129519545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr7	129658655	rs2242488	A	G	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=306;ReadPosRankSum=0.589;SC=AATGATCTGGATATGTCTAGG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=13;WE=129658663;WS=129658645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr7	129664312	rs1464890	T	C	2164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=48;PP=1765;ReadPosRankSum=-0.280;SC=TGCGAACATGTTATCAGGGAG;SOR=0.760;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=37;TCR=67;TR=75;WE=129664320;WS=129664302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,76:0.72:105
chr7	129680994	rs34409527	A	ATG	583.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.783;NF=0;NR=19;PP=822;ReadPosRankSum=0.239;SC=ATGTGTGTGTATGTGTGTGTG;SOR=0.540;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=0;TCR=57;TR=19;WE=129681002;WS=129680984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr7	129736880	rs12531444	G	A	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.448;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=27;PP=639;ReadPosRankSum=-0.772;SC=TCTGTGCTTCGTATGGGTTAA;SOR=1.055;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=126;TCF=51;TCR=75;TR=40;WE=129736888;WS=129736870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,43:0.32:134
chr7	129806441	rs4507710	C	T	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=721;SC=ACATGTTTAACTGATATTTAA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=129806449;WS=129806431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr7	129841939	rs11375003	G	GA	679.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.841;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.230;NF=5;NR=21;PP=414;ReadPosRankSum=1.951;SC=CAACTAGAAGGAAAAAAAAAG;SOR=0.312;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=26;WE=129841947;WS=129841929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr7	129847482	rs2727837	C	T	225.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=181;SC=GAAAATATAGCATATACAAGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=129847490;WS=129847479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	129853233	rs13224721	T	C	2475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=2;PP=1259;ReadPosRankSum=-0.326;SC=ACATTATAAATGGGCCTCAGC;SOR=0.660;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=72;TCF=70;TCR=2;TR=53;WE=129853241;WS=129853223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,59:0.76:78
chr7	129853251	rs6969994	T	G	2770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=6.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=2;PP=1648;ReadPosRankSum=0.297;SC=AGCAATAGTGTTTTATAACAA;SOR=0.551;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=91;TCF=89;TCR=2;TR=64;WE=129853259;WS=129853241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,73:0.73:100
chr7	129855837	rs4728190	C	T	2405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.421;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=27;PP=1934;ReadPosRankSum=0.899;SC=TTCCTGTAAGCGGCAAAGCAA;SOR=1.329;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=129;TCF=84;TCR=45;TR=85;WE=129855845;WS=129855827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,88:0.68:130
chr7	129906915	rs7788519	G	A	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=358;ReadPosRankSum=0.843;SC=TAGATTTGGGGATAAGTCAAT;SOR=0.854;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=18;WE=129906923;WS=129906905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr7	129910818	rs3816830	G	A	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=70;ReadPosRankSum=-0.175;SC=TTCATGTAGGGCCTGAAGTCC;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=129910826;WS=129910808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr7	129916515	rs17590	T	C	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.65;ReadPosRankSum=-0.112;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,33:0.22:151
chr7	129938598	rs34587586	G	T	5677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=70;PP=2965;SC=ACCAAGTTTTGAGGATTAATG;SOR=1.073;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=170;TCF=100;TCR=70;TR=169;WE=129938606;WS=129938588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr7	129940561	rs12538292	G	A	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=1;PP=767;SC=TGAAAGGGCCGCCATCTTGGC;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=129940569;WS=129940551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	129948013	rs1038628	G	T	3640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=102;NR=5;PP=2941;SC=TGCTCAATGAGGACTAGGAGC;SOR=5.458;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=102;TCR=5;TR=107;WE=129948021;WS=129948003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr7	129950740	rs2171492	G	T	2301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=52;PP=1955;SC=GAATTTCAAGGGCTTCATCGA;SOR=2.082;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=19;TCR=52;TR=71;WE=129950748;WS=129950730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr7	129950879	rs901800	G	A	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=356;SC=CCCTCCTGGCGCTGCTAAGGT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=129950887;WS=129950869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	129962360	rs1569133	A	G	3274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=48;PP=2451;SC=TCGACTGGGCATATGACAACG;SOR=0.903;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=59;TCR=48;TR=106;WE=129962368;WS=129962350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr7	129987764	rs12532645	C	T	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=28;PP=893;SC=TGTCCTGCCCCCCTTTATCCC;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=129987772;WS=129987754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	130002317	rs1544705	T	C	3478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=52;PP=2595;SC=CCATCTGGATTGACACTGGAA;SOR=0.856;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=62;TCR=52;TR=114;WE=130002325;WS=130002307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr7	130042738	.	C	T	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.288;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.166;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=347;ReadPosRankSum=-0.637;SC=TGCTCAATGTCTTTTCAAAGG;SOR=3.202;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=15;WE=130042746;WS=130042728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr7	130136107	rs3807348	G	A	78.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=1;PP=26;SC=TACTGTTTTAGAAAACTAATG;SOR=1.179;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=130136115;WS=130136097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr7	130136902	rs2072573	G	T	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=9;SC=GGTCACAGTTGCTTGTTCTTT;SOR=2.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=48;WE=130136910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr7	130138155	rs6968284	A	G	10450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=180;NR=133;PP=2965;SC=GATGCTAGGAAAGTACATTGT;SOR=1.015;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=314;TCF=181;TCR=133;TR=313;WE=130138163;WS=130138145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,319:1.00:319
chr7	130140766	rs765205	C	A	2126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=38;PP=1671;SC=TTTCCAGAGACGTGTTTTTGT;SOR=1.249;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=61;WE=130140774;WS=130140756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr7	130147307	rs2302826	T	G	2615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=65;PP=2070;SC=GGTGGAAGGGTTTGTTGGTGA;SOR=3.994;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=10;TCR=65;TR=75;WE=130147315;WS=130147297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr7	130148507	rs2072575	G	A	978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=23;PP=824;SC=GCAACTGGAGGAGAAGGGAGG;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=130148515;WS=130148497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	130148562	rs58927323	T	TTCTTAGGAAGTG	1897.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=6;PP=2976;SC=TTTCCATCATTCCATCTGTAC;SOR=1.209;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=20;WE=130148570;WS=130148552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	130148869	.	C	CA	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQRankSum=-2.453;QD=2.81;ReadPosRankSum=-0.549;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,3:0.13:23
chr7	130148903	rs12706941	A	G	3349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=74;PP=2965;SC=CTGTGGTAAAAAGCATACAGA;SOR=1.732;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=103;TCF=29;TCR=74;TR=103;WE=130148911;WS=130148893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr7	130149061	rs12706942	G	C	3654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=70;PP=2914;SC=TGAGTTTCTAGTATTGGTAAA;SOR=1.282;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=43;TCR=70;TR=113;WE=130149069;WS=130149051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr7	130150705	rs12706944	G	A	3105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=24;PP=2441;SC=GCCTTTCCATGGCAAGAAAAT;SOR=2.256;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=73;TCR=24;TR=97;WE=130150713;WS=130150695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr7	130292531	rs12706946	T	C	4339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=81;NR=38;PP=2965;SC=GTGATTTTTGTAGAGTTTAAA;SOR=1.807;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=81;TCR=38;TR=119;WE=130292539;WS=130292521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr7	130292802	rs35780462	C	T	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.342;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=32;PP=676;ReadPosRankSum=-0.329;SC=CACCACTCCCCAATATTTTCA;SOR=0.251;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=115;TCF=18;TCR=97;TR=40;WE=130292810;WS=130292792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,41:0.35:118
chr7	130297119	rs34699820	GA	G	2699.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=96;PP=1652;ReadPosRankSum=1.567;SC=GCTAAATACAGAAAAAAAAAA;SOR=2.303;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=127;TCF=8;TCR=119;TR=100;WE=130297128;WS=130297109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,110:0.98:112
chr7	130298550	rs4731696	C	T	1893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=47;PP=1509;SC=GAAAAACATGCTTATGCAAAA;SOR=5.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=50;WE=130298558;WS=130298540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr7	130354106	rs10232683	G	C	4226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=103;PP=2965;SC=TAAAGGAGACGCACTTGGAGG;SOR=3.241;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=20;TCR=103;TR=123;WE=130354114;WS=130354096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr7	130356691	.	CTTTAT	C	124	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.98;NF=0;NR=3;PP=124;QD=44.3333333333;SC=GAACTATTCACTTTATTTTAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=130356703;WS=130356681;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,3:0.33:9
chr7	130418525	rs76603546	G	A	2666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=52;PP=2152;ReadPosRankSum=1.869;SC=CGGAGAAGCCGGACGAGGCGC;SOR=1.302;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=33;TCR=53;TR=84;WE=130418533;WS=130418515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,85:0.98:87
chr7	130418720	rs111359117	A	C	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=7;PP=259;SC=CGGACTCCGGATGCGCCGCAC;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=11;WE=130418728;WS=130418710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	131060277	rs3823557	G	A	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.264;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=835;ReadPosRankSum=1.081;SC=ATCCCTTAATGCTGTTTAGAA;SOR=0.174;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=66;TCF=19;TCR=47;TR=42;WE=131060285;WS=131060267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,46:0.65:71
chr7	131155588	rs1733861	G	T	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.857;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=644;ReadPosRankSum=-0.614;SC=TTATCCTTGTGTACATTTTCT;SOR=0.128;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=31;WE=131155596;WS=131155578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,31:0.72:43
chr7	131155764	rs1684172	T	C	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=285;ReadPosRankSum=-0.065;SC=TCCTAACTTATATTTAATGAT;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=12;WE=131155772;WS=131155754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr7	131190554	rs7799613	C	G	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=44;ReadPosRankSum=0.203;SC=TTCTGCAACTCGGGAATCACG;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=4;WE=131190562;WS=131190544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr7	131190696	rs6651125	T	C	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.825;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=463;ReadPosRankSum=0.416;SC=GCAGGAATGATGCCATGCAGA;SOR=1.395;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=123;TCF=78;TCR=45;TR=37;WE=131190704;WS=131190686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,38:0.29:129
chr7	131191536	rs3212303	A	G	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=261;ReadPosRankSum=0.128;SC=ACAGCAGCCTAGGCCTGTGGG;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=14;WE=131191544;WS=131191526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr7	131191554	rs56231781	TC	T	122.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=151;ReadPosRankSum=-0.153;SC=GGGGCTGCCCTCCCAGCTAAG;SOR=0.395;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=7;WE=131191562;WS=131191544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr7	131195535	rs3847113	G	T	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=474;ReadPosRankSum=-1.635;SC=GAGCCATCACGCCTGGCCCTG;SOR=0.616;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=22;WE=131195543;WS=131195525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr7	131195712	rs12670788	G	A	1810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.416;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=18;PP=1523;ReadPosRankSum=0.852;SC=AGGATGCGTCGAAGTGGGTTG;SOR=0.357;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=105;TCF=79;TCR=26;TR=64;WE=131195720;WS=131195702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,64:0.61:105
chr7	131195959	rs3735035	C	T	2938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.235;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=63;PP=2433;ReadPosRankSum=-0.735;SC=TTGCCTGAGCCGCCTCCTCTA;SOR=0.355;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=165;TCF=65;TCR=100;TR=111;WE=131195967;WS=131195949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,108:0.66:164
chr7	131241029	.	G	GGGCGAC	548.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=4.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.46;MQRankSum=1.851;QD=14.07;ReadPosRankSum=-1.098;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr7	131815118	rs10954359	C	T	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=1;PP=715;SC=GAGAGAGAAACAGCGCTGCTC;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=131815126;WS=131815108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	131815220	rs10954360	G	A	2373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=31;PP=1735;SC=CTCCAGGGCGGCCCTGGAAGG;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=40;TCR=31;TR=71;WE=131815228;WS=131815210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr7	131815310	rs2671103	A	G	2250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=46;PP=1597;SC=CACACTGGTCATCGTGGTCCA;SOR=1.550;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=23;TCR=46;TR=69;WE=131815318;WS=131815300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr7	131815343	rs10954361	G	A	1868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=14;NR=38;PP=1416;SC=TCTGCGGAAGGGCCAAGAACA;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=53;TCF=14;TCR=39;TR=52;WE=131815351;WS=131815333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr7	131832627	rs1450882	A	G	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=3;PP=854;SC=CAGGACACCCAGGCCTCCCTA;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=36;WE=131832635;WS=131832617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	131849204	rs896167	T	A	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.597;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=536;ReadPosRankSum=0.551;SC=CTTCTCTCCATCTCCTCATCC;SOR=3.229;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=22;WE=131849212;WS=131849194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr7	131859496	rs7808586	G	A	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=6;PP=1030;ReadPosRankSum=-0.727;SC=TTGCCAACACGCTCCCCTGCT;SOR=0.946;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=54;TCR=8;TR=45;WE=131859504;WS=131859486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,46:0.75:61
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chr7	131866972	rs3734983	A	G	2673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.972;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=60;PP=2022;ReadPosRankSum=-0.824;SC=AAAGAAGGAGATGTGTAAATG;SOR=1.324;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=138;TCF=55;TCR=83;TR=93;WE=131866980;WS=131866962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,99:0.68:145
chr7	131888297	rs145554743	G	C	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=425;ReadPosRankSum=-0.357;SC=GGCCAAGACTGTGCTTGTGTG;SOR=1.697;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=17;WE=131888305;WS=131888287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
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chr7	131908566	rs2290233	A	T	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=247;ReadPosRankSum=-1.474;SC=ACTCCCCAAGACCTCAGGAAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=11;WE=131908574;WS=131908556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr7	131915507	rs1868781	A	G	1960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.967;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=63;PP=1573;ReadPosRankSum=-0.179;SC=GAGAGCTGGTACGGGCTTAAA;SOR=1.927;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=119;TCF=26;TCR=93;TR=75;WE=131915515;WS=131915497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,74:0.63:117
chr7	131926112	rs3925378	C	G	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=145;ReadPosRankSum=-2.000;SC=ACATATGCATCCAGGGAGACA;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=8;WE=131926120;WS=131926102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr7	132070054	rs741664	T	C	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.207;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=27;PP=815;ReadPosRankSum=-1.787;SC=GTACCAGGCATCTGGAAAAGA;SOR=0.679;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=141;TCF=72;TCR=69;TR=48;WE=132070062;WS=132070044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,49:0.35:139
chr7	132192231	rs156960	A	G	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.418;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=364;ReadPosRankSum=-0.200;SC=CTACACTCCCAACCATCCCAG;SOR=0.425;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=58;TCF=48;TCR=10;TR=24;WE=132192239;WS=132192221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,23:0.38:60
chr7	132192295	rs156961	G	A	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.083;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=672;ReadPosRankSum=0.770;SC=CCTTCACCTTGAGCCAGGCCA;SOR=0.347;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=102;TCF=64;TCR=38;TR=38;WE=132192303;WS=132192285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,40:0.36:110
chr7	132192949	rs156962	T	C	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=7.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.22;ReadPosRankSum=-0.406;SOR=0.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,37:0.25:147
chr7	132409606	rs594208	T	C	1453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.981;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=3;PP=1244;ReadPosRankSum=-0.345;SC=CAGGGGTGACTCCAACAGCAC;SOR=1.643;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=81;TCF=75;TCR=6;TR=53;WE=132409614;WS=132409596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,51:0.66:77
chr7	132570358	rs12707059	T	C	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.20;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr7	132706981	rs17421819	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CAAAATGTACGTACGTAGATG;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=132706989;WS=132706971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr7	132709293	rs13235276	C	T	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=176;ReadPosRankSum=-1.029;SC=CTCTCTGATACCACAAAACTC;SOR=0.317;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=10;WE=132709301;WS=132709287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr7	132766584	rs11769814	C	G	2821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=58;PP=2222;SC=CCGAGTCCAACCACTGGCCCT;SOR=1.691;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=27;TCR=58;TR=85;WE=132766592;WS=132766574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr7	132938039	rs10641096	C	CCCTT	488.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.352;NF=1;NR=11;PP=503;ReadPosRankSum=0.262;SC=ACCCTGCTCTCCCCTTTCCTC;SOR=0.569;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=12;WE=132938047;WS=132938029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr7	132990498	rs10229242	G	A	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=1.718;SC=TATACTCTACGAAGTCTTTTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=3;WE=132990506;WS=132990488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr7	132990536	rs5887620	C	CT	556.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=0;PP=753;SC=CGTAAGCTCCCTTTGTTAGTA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=18;WE=132990544;WS=132990526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	133580447	rs2042456	G	A	1766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=53;PP=1413;ReadPosRankSum=-0.038;SC=TGGTGTGCGTGAAGCTCCAGG;SOR=0.483;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=27;TCR=93;TR=69;WE=133580455;WS=133580437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,68:0.56:122
chr7	133580545	rs2042455	A	G	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=357;ReadPosRankSum=1.065;SC=GGTGGTTCCAATTGGTGAAAT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=17;WE=133580553;WS=133580535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr7	133622923	rs76261442	T	C	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=253;ReadPosRankSum=-0.824;SC=TATGGGGGCGTGTCCCAAGCT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=14;WE=133622931;WS=133622913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr7	133682181	rs3735050	T	C	3242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=13;PP=2542;ReadPosRankSum=-0.943;SC=CAAAATAATATGTCATTTCAG;SOR=2.362;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=89;TCR=13;TR=101;WE=133682189;WS=133682171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,106:0.99:107
chr7	133749164	rs6953296	G	A	3917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=39;PP=2965;SC=ACCGCAGCCAGACTGGGGTGG;SOR=1.530;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=72;TCR=40;TR=111;WE=133749172;WS=133749154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr7	133821619	rs13246630	A	G	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=305;SC=TAATATGTATATGTTATCAAC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=133821627;WS=133821615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr7	133868368	rs1222420	C	T	1019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=0;PP=853;SC=TATTCTTCTACGCAGGGTCTT;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=31;WE=133868376;WS=133868358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	133868507	rs1222419	C	T	3056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=44;PP=2397;SC=GCCTGGATGCCCCTTATCCCA;SOR=0.757;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=90;TCF=46;TCR=44;TR=90;WE=133868515;WS=133868497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr7	133881919	rs10611703	ATG	A	877.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.62;QD=35.11;SOR=6.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	133976714	.	GCA	G	47	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=47;QD=30.0;SC=GCACACAGGTGCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=2;WE=133976723;WS=133976704;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,2:0.17:12
chr7	134136584	rs1732035	A	C	1724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=45;PP=1448;SC=AGCCACCGATACCTGCTGACC;SOR=4.133;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=50;WE=134136592;WS=134136574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	134225788	rs4732036	C	T	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.947;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.124;NF=8;NR=32;PP=757;ReadPosRankSum=-0.007;SC=GTTTTTTGTTCTTTCCTGCAG;SOR=0.842;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=93;TCF=20;TCR=73;TR=40;WE=134225796;WS=134225778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,42:0.43:97
chr7	134225827	rs4728329	A	G	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=409;ReadPosRankSum=-0.673;SC=CTATCCCTTCAATGCAGAATA;SOR=0.422;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=19;WE=134225835;WS=134225817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr7	134576441	rs6953822	T	C	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=11;PP=521;SC=CCTCATTTCGTCTCTTTGGTT;SOR=0.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=22;WE=134576449;WS=134576431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	134612759	rs11438725	G	GT	2177.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=13;PP=1981;SC=CAAAGTCCCGGTTGGTAGTGT;SOR=2.985;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=49;WE=134612767;WS=134612749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr7	134618710	rs6973420	A	G	2318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-5.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.210;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=27;PP=1658;ReadPosRankSum=-0.238;SC=GAGAAAAAACATGCCATGCAA;SOR=1.389;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=143;TCF=95;TCR=48;TR=88;WE=134618718;WS=134618700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,97:0.61:159
chr7	134645319	rs2230186	C	T	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=2.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.71;ReadPosRankSum=0.163;SOR=0.972;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,33:0.25:133
chr7	134673958	rs12671813	T	C	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.576;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=56;ReadPosRankSum=0.257;SC=ATTTGAAAACTGTTGGTTTTT;SOR=1.773;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=6;WE=134673966;WS=134673948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
chr7	134678253	rs2348049	T	A	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=382;ReadPosRankSum=0.636;SC=GCTGACTCTTTTGGTGATCCC;SOR=0.783;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=68;TCF=43;TCR=25;TR=25;WE=134678261;WS=134678243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,26:0.37:71
chr7	134678463	rs12540686	T	C	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=4.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=25;PP=726;ReadPosRankSum=-0.022;SC=ATTCAGACATTAGCAAACTTA;SOR=0.855;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=10;TCR=43;TR=31;WE=134678471;WS=134678453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,37:0.61:61
chr7	134678523	rs2252826	C	T	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=736;SC=TAGAAAACAGCACATTCCAAC;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=134678531;WS=134678513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	134694773	rs34139471	CT	C	101.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=3;NR=1;PP=60;SC=GAGGATGACACTTTTTTTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=134694781;WS=134694763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	134694939	rs6958457	T	C	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=6;PP=172;SC=GCCACCACGCTCAGCTAATTT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=134694947;WS=134694929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr7	134701856	rs4236655	G	C	7107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=102;PP=2965;SC=CTTAGAAACGGAACCCCTTTA;SOR=0.854;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=220;TCF=118;TCR=102;TR=220;WE=134701864;WS=134701846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr7	134719551	rs9656447	C	G	4737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=87;PP=2965;SC=TACCCATGCTCAATCCAGATG;SOR=1.132;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=55;TCR=87;TR=142;WE=134719559;WS=134719541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr7	134730151	rs2348054	G	C	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=0;PP=744;SC=TTTGTTTATAGTGTTTTGCAA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=134730159;WS=134730141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	134730441	rs2348055	A	G	2700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=64;SC=TTGGGGTTTTAGCACTTAATT;SOR=3.456;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=11;TCR=64;TR=75;WE=134730449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr7	134849280	rs292501	T	A	7125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=149;NR=70;PP=2965;SC=GCCTGATGTTTTACGCTCTTC;SOR=1.651;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=219;TCF=149;TCR=70;TR=219;WE=134849288;WS=134849270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr7	134852432	rs292505	C	T	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=2;PP=700;SC=AGGGTCTAGCCTCTGCCCATG;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=134852440;WS=134852422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	134878237	rs2278128	G	C	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=17;PP=916;SC=ATCCTGCACAGGAGATGGGGC;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=35;WE=134878245;WS=134878227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr7	134882680	rs292582	A	G	4324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=106;NR=22;PP=2965;SC=AGAAGAGAAGACCCCCCACAG;SOR=2.996;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=106;TCR=22;TR=128;WE=134882701;WS=134882670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr7	134882693	rs292583	T	C	4958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=108;NR=40;PP=2965;SC=CCCCACAGTGTTCCTCAGTAG;SOR=2.109;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=148;TCF=108;TCR=40;TR=148;WE=134882701;WS=134882670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr7	134882847	.	G	T	2364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=0.000;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.993;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=60;PP=1892;ReadPosRankSum=-0.764;SC=TGGCCAGCCCGCTGAGGAGGC;SOR=0.205;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=116;TCF=26;TCR=90;TR=81;WE=134882855;WS=134882837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,85:0.70:122
chr7	134891961	rs2278130	G	A	5828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=95;PP=2965;SC=ACTGGTGCACGAAGTTAAAGA;SOR=0.997;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=78;TCR=95;TR=173;WE=134891969;WS=134891951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr7	134895532	rs292601	T	C	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.99;ReadPosRankSum=-0.086;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:157,61:0.28:218
chr7	134896383	rs292602	T	C	423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=14;PP=325;SC=CCGCACGCACTGGGCGACCAG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=134896391;WS=134896373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	134925241	rs34330846	C	CA	1198.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.861;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.535;NF=41;NR=9;PP=731;ReadPosRankSum=-1.126;SC=TTATCTAGGGCAAAAAAAAAA;SOR=1.967;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=104;TCF=79;TCR=25;TR=50;WE=134925249;WS=134925231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,58:0.56:104
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chr7	134930169	rs113633449	A	AGAG	2859.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.28;QD=44.00;SOR=1.999;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
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chr7	134943087	rs11979453	C	G	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.553;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=417;ReadPosRankSum=0.823;SC=CTGGGCACACCGGAGATGCAG;SOR=0.099;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=23;WE=134943095;WS=134943077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr7	134943116	rs11979480	C	G	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.886;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=671;ReadPosRankSum=-1.390;SC=CTATCTGCCTCGGGCCCAAGA;SOR=0.078;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=30;WE=134943124;WS=134943106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,31:0.72:43
chr7	134943328	rs58802664	C	T	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.679;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=466;ReadPosRankSum=-0.866;SC=GTTGCACCTGCCTTGGCCTCC;SOR=0.249;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=19;WE=134943336;WS=134943318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr7	134962043	rs10239950	C	G	1044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.346;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=790;ReadPosRankSum=0.651;SC=GGCCACTAGGCAGTTAGTTGG;SOR=0.514;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=126;TCF=66;TCR=60;TR=46;WE=134962051;WS=134962033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,47:0.37:128
chr7	134968479	rs11762990	A	C	1439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.930;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=39;PP=1068;ReadPosRankSum=1.543;SC=TGAAGGTGGAACTCAATTAAC;SOR=0.340;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=206;TCF=68;TCR=138;TR=66;WE=134968487;WS=134968469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,68:0.31:217
chr7	135047703	rs6969632	T	C	2688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=53;PP=2171;SC=GTCTGAAGGCTGTCTGAAAGC;SOR=1.046;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=38;TCR=53;TR=91;WE=135047711;WS=135047693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr7	135047964	rs3750067	G	A	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.011;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=277;ReadPosRankSum=0.251;SC=AAAAAAGAGGGAAAATGGTGA;SOR=0.278;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=14;WE=135047972;WS=135047954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,15:0.30:50
chr7	135048033	rs2059367	G	C	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=571;SC=CAAAAGGAAAGACAGAAGAGA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=135048041;WS=135048023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	135069272	rs7798560	T	C	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.194;NF=40;NR=0;PP=978;ReadPosRankSum=-0.008;SC=CTCCTGACCTTGTGATCTGCC;SOR=1.249;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=63;TCR=0;TR=40;WE=135069280;WS=135069262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,40:0.62:65
chr7	135069311	rs7779374	A	G	1746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.509;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.358;NF=52;NR=3;PP=1389;ReadPosRankSum=-0.281;SC=TGTTGGGATTACAGGCGTGAG;SOR=2.044;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=84;TCF=77;TCR=7;TR=55;WE=135069319;WS=135069301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,58:0.66:88
chr7	135095270	rs2696877	A	G	1080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=6;PP=799;SC=CTTACGTATCATACCTCTGCA;SOR=2.613;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=35;WE=135095278;WS=135095260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr7	135242592	rs372392099	G	A	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=458;ReadPosRankSum=-1.299;SC=CAGCGTGGAGGGGACAGTGTG;SOR=0.914;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=19;WE=135242600;WS=135242582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr7	135242910	rs6961420	C	T	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.062;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=383;ReadPosRankSum=0.019;SC=GGCTCCAGCCCTCGAGTTGGG;SOR=3.996;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=18;WE=135242918;WS=135242900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr7	135262533	rs10252250	T	C	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.352;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=4;PP=1061;ReadPosRankSum=-1.029;SC=TAGTCATGTTTTTATTTCTAG;SOR=2.080;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=76;TCF=66;TCR=10;TR=45;WE=135262541;WS=135262523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,46:0.59:78
chr7	135272270	rs10271506	T	C	1664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=3;PP=1420;ReadPosRankSum=-0.104;SC=TTCATTATTATTAGCATGTAC;SOR=0.584;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=89;TCF=85;TCR=4;TR=57;WE=135272278;WS=135272260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,59:0.65:91
chr7	135276239	rs146225677	G	A	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.556;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=16;PP=860;ReadPosRankSum=0.571;SC=GTGACCTGTTGCCTCCAACTA;SOR=1.407;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=123;TCF=73;TCR=50;TR=50;WE=135276247;WS=135276229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,53:0.42:126
chr7	135279315	rs7800214	A	C	2081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=35;PP=1631;ReadPosRankSum=-0.182;SC=CTCGCTTGGCACTCTGTGAAC;SOR=0.768;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=107;TCF=56;TCR=51;TR=74;WE=135279323;WS=135279305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,77:0.69:112
chr7	135285788	rs4296989	T	C	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=13;PP=370;SC=CTATGTTATATATAAATTAAA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=135285796;WS=135285778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	135286170	rs35467082	G	A	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=9.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.31;ReadPosRankSum=-0.887;SOR=0.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,50:0.27:188
chr7	135301521	rs35690290	TA	T	51.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.31;ReadPosRankSum=0.393;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
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chr7	135311120	rs7810260	G	A	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.932;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=590;ReadPosRankSum=0.820;SC=GTAAGTGTCTGTATAGATTAA;SOR=0.554;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=81;TCF=22;TCR=59;TR=33;WE=135311128;WS=135311110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,34:0.41:83
chr7	135311167	rs10234309	G	A	1699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=43;PP=1378;SC=ATTAAGGGAAGAAAAAATTCC;SOR=3.830;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=48;WE=135311175;WS=135311157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
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chr7	135345319	rs10258155	A	G	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=704;ReadPosRankSum=1.243;SC=GGAAAGTGCCATAAGTTCCAC;SOR=0.639;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=33;WE=135345327;WS=135345309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,35:0.65:54
chr7	135347239	rs141207942	G	GC	243.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.47;MQRankSum=0.962;QD=11.61;ReadPosRankSum=-0.320;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr7	135375909	.	C	CA	2052	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=58.42;NF=38;NR=14;PP=2052;QD=39.6346153846;SC=AAGACTGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=163;TCF=115;TCR=48;TR=52;WE=135375939;WS=135375899;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:111,52:0.32:163
chr7	135375921	rs56341417	C	A	2311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=6.016;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.45;MQRankSum=-0.990;QD=19.26;ReadPosRankSum=0.865;SOR=1.905;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:11,109:0.91:120
chr7	135375925	rs35065926	A	C	2257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=3.307;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.39;MQRankSum=-1.203;QD=19.98;ReadPosRankSum=1.226;SOR=1.555;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:12,101:0.89:113
chr7	135378854	rs3800763	G	A	1394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=11;PP=1164;SC=TTCTGCTGGAGAAGGAGGGAA;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=43;WE=135378862;WS=135378844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr7	135387473	rs3112345	A	G	2187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=8;PP=1843;SC=CCTCACTGAAAGGAACTCTAA;SOR=3.511;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=65;TCF=56;TCR=9;TR=63;WE=135387481;WS=135387463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr7	135387495	rs3112346	A	G	2750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=12;PP=2387;SC=GTGGATCTGTAGCTGTTGAAA;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=70;TCR=12;TR=82;WE=135387503;WS=135387485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr7	135387656	rs3112347	G	A	2491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=63;PP=1992;SC=GAGGACACAGGAGCCACGTCA;SOR=2.862;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=16;TCR=63;TR=79;WE=135387664;WS=135387646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr7	135392876	rs3110800	T	C	4801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=59;PP=2965;SC=CCGGCTTGGCTCCGGCCATCA;SOR=1.127;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=84;TCR=59;TR=143;WE=135392884;WS=135392866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr7	135406176	rs4596594	A	G	3912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=64;PP=2965;SC=AGAACGGGTAAAGGAAGGCCG;SOR=0.845;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=120;TCF=56;TCR=64;TR=120;WE=135406184;WS=135406166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr7	135412273	rs3112369	T	C	2410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=27;PP=1858;SC=AGCTCGTCCTTGGACCCCGCT;SOR=1.639;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=54;TCR=27;TR=81;WE=135412281;WS=135412263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr7	135413626	rs3807338	C	T	2495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=69;NR=5;PP=2126;SC=AAAAGGAAACCGAAGACCTTC;SOR=4.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=69;TCR=5;TR=74;WE=135413634;WS=135413616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr7	135421790	rs4338044	A	G	2114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=20;PP=1746;ReadPosRankSum=-0.715;SC=CAAAAAAGATAGAGAAAGTGC;SOR=0.812;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=45;TCR=20;TR=64;WE=135421798;WS=135421780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr7	136587843	rs10488598	T	C	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=7;PP=700;SC=CAGAAACTCATTTGGGCTAGT;SOR=2.066;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=28;WE=136587851;WS=136587833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	136588109	rs6963819	G	A	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=540;SC=TCAAAAGGAAGTCTTACTCTT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=136588117;WS=136588099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	136921062	rs322295	C	T	1866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=46;PP=1576;SC=ACTTTCTTTACACAGTAGAGT;SOR=2.342;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=13;TCR=46;TR=59;WE=136921070;WS=136921052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr7	136939582	rs1162122	G	T	3971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=80;NR=44;PP=2965;SC=TGAAGCATCTGGCCTTCAGAA;SOR=1.467;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=80;TCR=44;TR=124;WE=136939590;WS=136939572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr7	137092745	rs3217275	CA	C	1417.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.949;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.167;NF=4;NR=39;PP=1510;ReadPosRankSum=-0.247;SC=CTATTAGCTGCAAAGAGAGAC;SOR=1.329;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=64;TCF=10;TCR=54;TR=43;WE=137092753;WS=137092735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,47:0.70:67
chr7	137092781	rs7800454	T	C	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.988;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.891;NF=2;NR=23;PP=642;ReadPosRankSum=-1.682;SC=CAGGCAGAATTCGGAACAAGG;SOR=1.645;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=25;WE=137092789;WS=137092771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr7	137097086	rs1731959	G	C	1350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=37;PP=1153;SC=ATATCTTGGTGAAGCAGACCG;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=37;WE=137097094;WS=137097076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr7	137128830	rs1918837	T	C	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.717;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=330;ReadPosRankSum=-0.391;SC=TACCATGATCTTCTGAAGAGA;SOR=1.960;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=19;WE=137128838;WS=137128820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,21:0.37:57
chr7	137154572	rs2293546	T	C	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=36;PP=867;SC=AAAATTAGCATGAGGTTTTTA;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=137154580;WS=137154562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	137170049	rs28434741	A	G	1643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.081;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=11;PP=1275;ReadPosRankSum=0.435;SC=AAATCAAAATAAGACATTAAT;SOR=0.551;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=72;TCR=17;TR=56;WE=137170057;WS=137170039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,58:0.64:90
chr7	137172245	rs7802865	A	T	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.559;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=667;ReadPosRankSum=0.689;SC=AAGCCACCACATTTCCACTTC;SOR=2.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=26;WE=137172253;WS=137172235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr7	137304765	.	G	GCACACACA	274.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.157;NF=0;NR=5;PP=267;ReadPosRankSum=-0.489;SC=ATGTACACACGCACACACACA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=137304773;WS=137304755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr7	137339598	.	G	GA	126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=-1.205;QD=5.28;ReadPosRankSum=0.090;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
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chr7	137600690	rs273957	C	T	1223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=944;ReadPosRankSum=-0.919;SC=TCGTCTGTAACTGGCTCTGTC;SOR=0.919;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=66;TCF=36;TCR=30;TR=45;WE=137600698;WS=137600680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,47:0.68:69
chr7	137607183	.	CGT	C	251	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=1;HapScore=4;MGOF=43;MMLQ=29;MQ=42.43;NF=6;NR=0;PP=251;QD=49.0;SC=TATATATATACGTATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=137607195;WS=137607181;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	137607187	.	T	C	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=2;HapScore=4;MGOF=43;MMLQ=29;MQ=52.06;NF=6;NR=0;PP=143;QD=29.6285354245;SC=TATATACGTATATATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=6;WE=137607195;WS=137607181;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:12,6:0.33:18
chr7	137607217	.	C	T	1167	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MMLQ=28;MQ=54.99;NF=41;NR=0;PP=1167;QD=29.311492989;SC=TATATATATACACACATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=41;WE=137607241;WS=137607207;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,41:0.91:45
chr7	137607233	.	C	T	1363	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MMLQ=28;MQ=56.73;NF=58;NR=0;PP=1363;QD=24.0995036646;SC=TATATATATACACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=65;TCR=1;TR=58;WE=137607241;WS=137607207;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,58:0.88:66
chr7	137607429	.	G	C	1918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.000;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.775;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=52;PP=1577;ReadPosRankSum=-0.526;SC=AATAAACGTGGATTGAAAATA;SOR=1.282;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=98;TCF=25;TCR=73;TR=67;WE=137607437;WS=137607419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,68:0.68:100
chr7	137612913	rs66593747	CTGG	C	1067.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=0;PP=1085;SC=GAAGCTGTCACTGGTGGTAAT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=24;WE=137612923;WS=137612903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	137613219	.	C	G	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.138;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=537;ReadPosRankSum=-0.949;SC=GAAGTCCCTTCTACACACACA;SOR=2.517;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=23;WE=137613227;WS=137613209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,26:0.79:33
chr7	137641123	rs274003	C	T	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=399;SC=CCAACTACCACTCTTGCCAGA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=137641131;WS=137641121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	137642759	rs274004	T	A	467.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=394;ReadPosRankSum=1.916;SC=GCTGTTCAACTGAATCAGTCA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=15;WE=137642767;WS=137642749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr7	137773291	rs2120846	T	G	3784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=86;NR=23;PP=2965;SC=GATTAATGATTATTAAAGGAA;SOR=2.657;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=86;TCR=23;TR=109;WE=137773299;WS=137773281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr7	137773563	rs2166188	T	G	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=653;SC=AAGGTTTCAGTTGTTCATTTT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=137773571;WS=137773553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	137773587	rs35802315	C	CGTGT	456.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=8;PP=550;SC=ATTCATCTTCCGTGTGTGTGT;SOR=3.442;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=9;WE=137773595;WS=137773577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	137776411	rs202194493	C	CA	690.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.69;MQRankSum=0.453;QD=23.82;ReadPosRankSum=-1.612;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,26:0.90:29
chr7	137782593	rs35402657	CT	C	483.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=19.35;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	137798593	rs2306847	A	T	3267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=79;PP=2520;SC=AAGGCTCATAAGAACCCTGAC;SOR=2.663;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=19;TCR=79;TR=98;WE=137798601;WS=137798583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr7	137801413	rs1872929	A	C	2585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=51;PP=2031;SC=TACTGACTGCAGGGAGTTCCT;SOR=1.046;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=38;TCR=51;TR=89;WE=137801421;WS=137801403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr7	137801444	rs1872930	C	T	2628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=52;PP=2113;SC=TTCACTCCCACGAGTGCCAAG;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=29;TCR=52;TR=81;WE=137801452;WS=137801434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr7	138145778	rs112619223	C	T	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=290;ReadPosRankSum=-1.231;SC=GGGGGAGGGGCGAGCAGGAGG;SOR=0.877;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=17;WE=138145786;WS=138145768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr7	138188932	rs10488642	A	G	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=0;PP=857;ReadPosRankSum=1.674;SC=TGAATTTAAAAAGAATGGACA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=50;TCR=0;TR=35;WE=138188940;WS=138188929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,35:0.67:52
chr7	138189189	rs148040062	GCTC	G	500.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=12.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.50;MQRankSum=5.038;QD=11.92;ReadPosRankSum=-0.742;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr7	138200117	rs3757381	A	T	2567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=69;PP=2114;ReadPosRankSum=-0.802;SC=AATAAATGAGATCTTTGCATT;SOR=3.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=7;TCR=70;TR=76;WE=138200125;WS=138200107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,78:0.99:79
chr7	138229990	rs6959574	G	A	649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=605;SC=TCTTCCTGGCGTGGAGGCACC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=138229998;WS=138229980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	138261319	rs59147816	TAAC	T	406.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.863;NF=0;NR=10;PP=342;ReadPosRankSum=-0.608;SC=AAAATTTTAATAACTACTATA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=10;WE=138261329;WS=138261309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr7	138268563	rs3213902	A	G	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=331;ReadPosRankSum=-0.749;SC=GAATTTAGCTATTTGTATTAT;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=14;WE=138268571;WS=138268553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr7	138270657	rs1673203	G	A	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.785;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=21;PP=689;ReadPosRankSum=-1.448;SC=AAAGGGACTCGTTTTTGTGGT;SOR=0.571;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=93;TCF=41;TCR=52;TR=37;WE=138270665;WS=138270647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,39:0.41:95
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chr7	138281355	rs1659832	A	G	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=25;PP=734;SC=GAGAAAATACAGATTCACTTC;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=138281363;WS=138281345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	138281906	rs1659831	T	C	4654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=81;PP=2965;SC=TCTCATACTTTAGTTTCTCTT;SOR=1.203;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=51;TCR=81;TR=132;WE=138281914;WS=138281896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr7	138305743	rs3734946	A	T	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.071;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=500;ReadPosRankSum=0.806;SC=GGTTCCTCTTACCCCCTCTCT;SOR=0.458;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=64;TCF=37;TCR=27;TR=28;WE=138305751;WS=138305733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,28:0.42:66
chr7	138305782	rs3734945	T	C	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=462;ReadPosRankSum=0.612;SC=GCAGGGTCCTTGGCTGTACCT;SOR=0.781;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=28;WE=138305790;WS=138305772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,28:0.40:70
chr7	138305806	rs3734944	T	C	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=451;ReadPosRankSum=-0.811;SC=ATATAAATGGTGCCACCATTG;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=27;WE=138305814;WS=138305796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,27:0.42:65
chr7	138310629	rs1673162	G	A	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FS=3.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.44;ReadPosRankSum=0.975;SOR=0.944;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:204,77:0.27:281
chr7	138312122	rs2305816	A	C	3743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=82;NR=28;PP=2791;SC=GAGGAGAAGGAAGAATAAAGC;SOR=2.041;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=82;TCR=28;TR=110;WE=138312130;WS=138312112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr7	138314999	rs1673164	A	T	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=6.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.722;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=32;PP=594;ReadPosRankSum=-0.464;SC=CTCAGCTCCTATGAGTACAGC;SOR=0.950;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=119;TCF=6;TCR=113;TR=33;WE=138315007;WS=138314989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,34:0.29:119
chr7	138333933	rs58569190	GA	G	564.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=6.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=2.005;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.584;SOR=1.819;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,32:0.44:73
chr7	138356659	rs5887893	AG	A	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.89;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	138356662	rs5011821	G	A	548.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.73;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	138356663	rs5011820	G	C	582.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.56;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	138356664	rs5887894	C	CA	573.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.13;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	138356730	rs202122915	T	TG	1582.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.22;SOR=7.168;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr7	138356732	.	CTG	GCT	2484	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=28;NR=0;PP=2484;QD=90.9809955308;SC=CCCTCAGTTGCTGTGTTCACG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=28;WE=138356742;WS=138356722;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,28:0.85:33
chr7	138356733	rs5887896	TG	T	1582.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.96;SOR=7.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	138363767	rs10250576	A	G	1532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.129;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=15;PP=1194;ReadPosRankSum=-0.091;SC=GGATCGTGACAGGCTCTGTTG;SOR=1.391;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=82;TCF=60;TCR=22;TR=61;WE=138363775;WS=138363757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,63:0.77:82
chr7	138391554	rs73166921	G	A	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=30;PP=699;ReadPosRankSum=-0.319;SC=GAAGCAGAGCGTTCGTAAAAT;SOR=1.094;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=32;WE=138391562;WS=138391544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr7	138394695	rs141195167	G	GCAAT	415.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=505;ReadPosRankSum=0.783;SC=CTGGCCTGAAGCAATCCTCCT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=10;WE=138394703;WS=138394685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr7	138417718	rs3807154	A	G	952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=685;ReadPosRankSum=0.706;SC=GCTGAGATACATGGACGTCAA;SOR=0.643;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=128;TCF=89;TCR=39;TR=45;WE=138417726;WS=138417708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,47:0.34:137
chr7	138418910	rs1026435	G	A	2657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=52;PP=1970;ReadPosRankSum=1.389;SC=GGATGACACCGAAAACCATCT;SOR=0.676;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=307;TCF=159;TCR=148;TR=106;WE=138418918;WS=138418900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,112:0.35:317
chr7	138419085	rs1037692	A	G	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=407;ReadPosRankSum=0.898;SC=AACTTTCCCTAAGCAAACCGC;SOR=0.267;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=0;TCR=57;TR=20;WE=138419093;WS=138419075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr7	138441124	rs296910	A	G	2562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-7.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.430;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=13;PP=1962;ReadPosRankSum=-0.828;SC=AGCCACAGTCATGTGCATTTG;SOR=1.296;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=165;TCF=139;TCR=26;TR=106;WE=138441132;WS=138441114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,108:0.65:167
chr7	138453892	rs374123555	GAA	G,GA	747.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=8.258;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.19;MQRankSum=0.354;QD=19.68;ReadPosRankSum=0.065;SOR=1.115;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:2,14,22:0.37,0.58:38
chr7	138455988	rs10258719	A	G	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.899;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=26;PP=738;ReadPosRankSum=-2.169;SC=AAACACAGACACCATCTTGGC;SOR=1.118;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=113;TCF=53;TCR=60;TR=42;WE=138455996;WS=138455978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,40:0.36:112
chr7	138485954	rs6945259	G	T	2192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=1;PP=1860;SC=ATGCCCATGCGGGAGCTTCTA;SOR=6.932;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=63;TCF=62;TCR=1;TR=63;WE=138485962;WS=138485944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr7	138486096	rs61729750	G	C	7689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=142;PP=2965;SC=AACAGCTCAAGCTTGACCGCT;SOR=1.067;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=246;TCF=104;TCR=142;TR=246;WE=138486104;WS=138486086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr7	138555816	rs35334186	GC	G	285.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=164;ReadPosRankSum=0.476;SC=GCCTGCCTTGGCCCCCCCAAG;SOR=1.911;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=8;WE=138555824;WS=138555806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr7	138588558	.	T	C	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.300;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=0.000;QD=22.04;ReadPosRankSum=2.434;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,17:0.89:19
chr7	138588560	rs368877120	T	C	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;QD=24.63;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:0,17:1.00:17
chr7	138588562	rs371873359	T	C	437.98	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.10;QD=25.76;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	138588564	rs375662924	T	C	437.98	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.04;QD=31.28;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	138588568	.	T	C	207.41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;QD=20.74;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:0,10:1.00:10
chr7	138596064	rs6969074	G	A	2632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=74;PP=2133;SC=TAAATAGTTCGTAAACCTAGG;SOR=5.918;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=77;TCF=2;TCR=75;TR=76;WE=138596072;WS=138596054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr7	138597036	rs3735013	A	G	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=1;PP=704;SC=TTCCATGGCCATAATCACCTG;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=138597044;WS=138597026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr7	138601473	rs1958658	C	T	2495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=13;PP=2003;ReadPosRankSum=-1.135;SC=CCCAGAGAGGCGGCAGGAAGC;SOR=1.040;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=84;TCF=71;TCR=13;TR=79;WE=138601481;WS=138601463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,84:0.98:86
chr7	138601826	rs2251220	G	A	5758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=80;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.727;SC=AGAAACAAACGAGGATCCTGA;SOR=0.305;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=93;TCR=80;TR=172;WE=138601834;WS=138601816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,178:0.99:179
chr7	138602417	rs2774960	G	A	4500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=78;PP=2965;ReadPosRankSum=0.894;SC=CAAGTCACTCGGCATCAGAGA;SOR=0.389;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=53;TCR=79;TR=131;WE=138602425;WS=138602407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,136:0.99:137
chr7	138602523	rs2774962	T	C	5735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=58;PP=2965;ReadPosRankSum=0.598;SC=AAAGCACCTCTGGGTTTATGC;SOR=0.760;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=129;TCR=58;TR=186;WE=138602531;WS=138602513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,186:0.99:187
chr7	138602916	rs2718131	G	C	4826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=65;PP=2965;SC=GGTCTGGAGGGGAAAAGCGTA;SOR=1.094;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=90;TCR=65;TR=155;WE=138602924;WS=138602906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr7	138665736	.	G	C	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.722;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=573;ReadPosRankSum=-0.010;SC=GAGAATAAAAGAGGATGGGCG;SOR=0.760;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=29;WE=138665744;WS=138665726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr7	138707177	rs10249949	G	A	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=178;ReadPosRankSum=0.263;SC=CTATAGTCCCGGCTACTAGGG;SOR=0.760;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=11;WE=138707185;WS=138707167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr7	138713476	rs17856272	C	T	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.041;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=312;ReadPosRankSum=0.523;SC=TGTGCAGCTTCATATGCTTGT;SOR=1.387;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=72;TCF=59;TCR=13;TR=19;WE=138713484;WS=138713466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,19:0.25:75
chr7	138713715	rs11767739	G	C	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=2.325;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.56;ReadPosRankSum=1.279;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,27:0.24:111
chr7	138719194	rs10713373	AG	A	637.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.415;NF=19;NR=2;PP=635;ReadPosRankSum=0.786;SC=GTTGCTTCGAAGGCAATTAAA;SOR=0.788;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=70;TCF=59;TCR=11;TR=21;WE=138719202;WS=138719184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,24:0.34:70
chr7	138719231	rs7810237	T	C	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.885;HP=8;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.388;NF=26;NR=13;PP=613;ReadPosRankSum=-0.973;SC=AAAAGAAAAATAAATGGGGAA;SOR=0.401;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=114;TCF=83;TCR=31;TR=39;WE=138719239;WS=138719221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,41:0.35:118
chr7	138732274	rs3087999	C	G	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.038;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=567;ReadPosRankSum=-0.346;SC=CTCCTGTCTGCGGCAATTTAG;SOR=0.279;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=105;TCF=79;TCR=26;TR=34;WE=138732282;WS=138732264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,36:0.32:113
chr7	138732457	rs3735008	G	A	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.03;ReadPosRankSum=-0.021;SOR=0.842;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,52:0.25:205
chr7	138732497	rs3735007	G	A	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=7.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.84;ReadPosRankSum=-0.081;SOR=0.361;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:159,62:0.28:221
chr7	138739816	rs10261597	C	G	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=149;ReadPosRankSum=-0.132;SC=GATTACAGGGCTGAGCCACTG;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=8;WE=138739824;WS=138739814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr7	138740037	rs2297236	G	C	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.579;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=23;PP=458;ReadPosRankSum=-1.441;SC=TTTGCTGGCTGATGGCTACAA;SOR=2.021;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=103;TCF=36;TCR=67;TR=29;WE=138740045;WS=138740027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,31:0.30:105
chr7	138740186	rs2297237	A	G	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.28;ReadPosRankSum=1.252;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,3:0.18:17
chr7	138740195	rs2297238	T	G	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.12;ReadPosRankSum=1.204;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr7	138818744	rs7789074	G	A	570.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=422;ReadPosRankSum=-0.171;SC=TTCCCACGGGGGACAGGGATG;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=16;WE=138818752;WS=138818734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr7	138819610	rs28571193	T	G	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=565;ReadPosRankSum=-1.496;SC=GTGAATGCTGTTTGCTATGCT;SOR=1.432;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=25;WE=138819618;WS=138819600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr7	138822504	rs10674402	T	TGTTC	646.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=760;ReadPosRankSum=-0.352;SC=GATTGCCTGTTGTCAGTAACC;SOR=0.468;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=13;WE=138822512;WS=138822494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr7	138822762	rs7809077	A	G	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=31;PP=759;ReadPosRankSum=-0.013;SC=AATAATACATATTCATGGTAA;SOR=2.110;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=31;WE=138822770;WS=138822752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,34:0.74:46
chr7	138824842	rs3217610	GA	G	466.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.695;NF=0;NR=22;PP=310;ReadPosRankSum=-0.756;SC=TTTCTCTTGAGAAAAAAAAAA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=22;WE=138824850;WS=138824832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
chr7	138826913	rs2354977	G	A	2061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.327;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=10;PP=1701;ReadPosRankSum=-0.381;SC=AGTAAGGTTTGGGAAGATTCA;SOR=0.290;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=117;TCF=104;TCR=13;TR=75;WE=138826921;WS=138826903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,76:0.63:120
chr7	138831707	rs10248924	C	T	4656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.052;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=72;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.052;SC=CCTCCAGAGGCTATTTCCATT;SOR=0.799;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=247;TCF=139;TCR=108;TR=169;WE=138831715;WS=138831697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,174:0.69:253
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chr7	138853315	rs112942380	CA	C	835.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=2.415;QD=11.61;ReadPosRankSum=0.539;SOR=0.750;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,49:0.68:72
chr7	138872345	rs2249070	C	A	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-5.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.574;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=30;PP=724;ReadPosRankSum=0.417;SC=AGGGAAAATACTTGTTCTCTT;SOR=0.377;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=56;TCF=8;TCR=48;TR=36;WE=138872353;WS=138872335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,35:0.64:55
chr7	138950992	.	G	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.538;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.60;MQRankSum=-2.373;QD=3.89;ReadPosRankSum=1.214;SOR=2.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr7	138957240	.	TTATG	T	659.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=0.000;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=1.224;QD=21.99;ReadPosRankSum=-0.586;SOR=1.143;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr7	139026152	rs10265	T	G	3688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=91;NR=23;PP=2965;SC=AGGGTCCCCGTCGCACACTTT;SOR=2.733;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=91;TCR=23;TR=114;WE=139026160;WS=139026142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr7	139077240	rs4732370	C	A	1948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=35;PP=1498;SC=TTATTTGGTCCACATTTCATG;SOR=1.010;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=27;TCR=35;TR=62;WE=139077248;WS=139077230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr7	139077317	rs4732371	T	A	947.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=31;PP=907;SC=AAGCATTTTTTAAAAAATCTA;SOR=4.047;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=139077325;WS=139077307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	139097282	rs11409457	A	AC	1166.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.82;MQRankSum=0.000;QD=22.01;ReadPosRankSum=-0.185;SOR=0.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,49:0.92:53
chr7	139102490	rs3778931	A	G	2594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.61;SOR=3.226;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr7	139102490	.	ATCAGAGGA	GTCAGAGGA,GTCAGAGGT	802	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=9,1;NR=56,32;PP=456,802;QD=7.55032634688;SC=TGATGTGTCAATCAGAGGATA;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=9;TCR=57;TR=65,33;WE=139102506;WS=139102480;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.98:66
chr7	139102498	rs73154180	A	T	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=4.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.28;ReadPosRankSum=-0.604;SOR=1.933;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,36:0.57:63
chr7	139102555	rs73154181	T	C	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=3.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=275;ReadPosRankSum=1.088;SC=TACTTATGTTTAGAGTTCAGA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=11;WE=139102563;WS=139102545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr7	139138551	rs10954649	C	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=129;ReadPosRankSum=0.644;SC=TCACCTCTACCGGCCTGGGCA;SOR=1.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=8;WE=139138559;WS=139138541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr7	139138871	rs11763327	T	G	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.722;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=318;ReadPosRankSum=0.157;SC=GGGGCGGGAGTGGGGCCTCGT;SOR=1.678;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=60;TCF=31;TCR=29;TR=20;WE=139138879;WS=139138861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,20:0.32:63
chr7	139164345	rs12707445	C	A	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.784;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=13;PP=611;ReadPosRankSum=-0.416;SC=AGATCTGTACCCCCTTAGATT;SOR=1.027;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=99;TCF=59;TCR=40;TR=35;WE=139164353;WS=139164335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,37:0.38:98
chr7	139167928	rs141268710	G	A	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=11.725;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.80;ReadPosRankSum=0.164;SOR=2.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr7	139167934	rs1860150	T	G	1796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.23;SOR=2.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr7	139168063	rs12707447	G	A	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=382;ReadPosRankSum=-0.247;SC=AGCCCCGGGCGCCTCGCCATT;SOR=0.721;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=69;TCF=39;TCR=30;TR=23;WE=139168071;WS=139168053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,23:0.34:68
chr7	139415775	rs7456421	G	C	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.497;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=20;PP=995;ReadPosRankSum=2.285;SC=CAGCCTTGGAGACGTGGCTGG;SOR=0.530;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=74;TCR=47;TR=51;WE=139415783;WS=139415765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,52:0.42:124
chr7	139478175	rs1860509	T	G	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.561;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=40;ReadPosRankSum=0.266;SC=GTGCGAGGGTTCGCGCGTGTG;SOR=1.170;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=5;WE=139478183;WS=139478165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr7	139605869	rs35857550	CT	C	374.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.43;NF=2;NR=11;PP=179;SC=ACTCTAGCATCTTTTTTTTTT;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=13;WE=139605877;WS=139605859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	139613164	rs41316459	A	G	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=570;ReadPosRankSum=1.329;SC=AGAAGCCAATAAGTCAAAGTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=23;WE=139613172;WS=139613154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,23:0.82:28
chr7	139653196	rs5768	A	C	4990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=48;PP=2965;SC=AAGCCTGCGAACTTCTCCTGG;SOR=1.670;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=104;TCR=48;TR=152;WE=139653204;WS=139653186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr7	139724169	rs13760	A	G	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=231;ReadPosRankSum=2.282;SC=CTTCTGGTTAATCCACTAGTG;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=11;WE=139724177;WS=139724159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr7	139724358	rs2269996	G	A	2524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.749;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=34;PP=2017;ReadPosRankSum=-0.951;SC=ACTCCTGTGCGCTCACTGTCG;SOR=0.227;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=127;TCF=84;TCR=43;TR=88;WE=139724366;WS=139724348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,91:0.71:129
chr7	139724555	rs3735352	C	T	3638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.547;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=78;PP=2874;ReadPosRankSum=0.858;SC=CCTTGGCCGGCGGACGGACAA;SOR=0.646;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=200;TCF=79;TCR=121;TR=130;WE=139724563;WS=139724545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,134:0.65:206
chr7	139724742	rs3735351	G	C	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=42;PP=1063;ReadPosRankSum=-1.556;SC=GGAAGGGTCAGCACACTGCGA;SOR=0.589;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=59;TCF=2;TCR=57;TR=44;WE=139724750;WS=139724732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,44:0.75:59
chr7	139726207	rs2286198	G	A	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=583;ReadPosRankSum=-0.865;SC=AAATACAGCCGGCCTGATGCA;SOR=0.495;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=26;WE=139726215;WS=139726197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr7	139727135	rs2286196	G	A	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=24.283;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=11;PP=1351;ReadPosRankSum=1.340;SC=GAACAAAGTAGAAAGGCAGCG;SOR=2.648;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=100;TCF=68;TCR=32;TR=59;WE=139727143;WS=139727125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,60:0.59:101
chr7	139728584	rs2286195	A	C	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=27;PP=603;ReadPosRankSum=-0.857;SC=ACCAGTCTTGAGTCTCAGCAC;SOR=0.646;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=32;WE=139728592;WS=139728574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,35:0.80:44
chr7	139746599	.	A	AGT	268	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MMLQ=27;MQ=53.55;NF=15;NR=4;PP=268;QD=14.2631578947;SC=GGCTGCTCACAGTGTGTGTGT;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=19;WE=139746610;WS=139746589;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr7	139746633	.	T	TGTGTGTGTGTCA	1887.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.463;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=7.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.23;MQRankSum=5.870;QD=26.59;ReadPosRankSum=-1.456;SOR=0.206;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,41:0.58:71
chr7	139754451	rs2362460	T	C	3630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.706;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=24;PP=2933;ReadPosRankSum=-0.556;SC=AAGGAGCCTCTTCCAACTTAC;SOR=0.826;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=196;TCF=158;TCR=38;TR=123;WE=139754459;WS=139754441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,129:0.64:201
chr7	139757980	rs11979771	T	C	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=4.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=584;ReadPosRankSum=0.567;SC=AAGAGGTCCATAGGGTGGGCC;SOR=0.560;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=24;WE=139757988;WS=139757970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr7	139762273	rs737321	A	G	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.04;ReadPosRankSum=0.211;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr7	139762282	rs6945590	A	G	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.89;ReadPosRankSum=1.208;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr7	139791109	rs12703533	G	A	1431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.469;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=41;PP=1128;ReadPosRankSum=-0.987;SC=TGCATGGACAGAGTCATACTT;SOR=0.397;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=70;TCF=10;TCR=60;TR=49;WE=139791117;WS=139791099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,51:0.70:73
chr7	139794009	rs12375063	T	G	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.428;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=536;ReadPosRankSum=1.369;SC=GCCTAATGCTTAAAAATGAAA;SOR=1.863;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=22;WE=139794017;WS=139793999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr7	139797225	rs3214226	TA	T	257.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=245;ReadPosRankSum=-1.046;SC=GACCCTGTGCTAATGTAAGTC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=8;WE=139797233;WS=139797215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr7	139797431	rs6950119	G	T	1586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=36;PP=1313;ReadPosRankSum=0.754;SC=GATTTCACACGTGTAAAAAAC;SOR=0.602;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=84;TCF=30;TCR=54;TR=57;WE=139797439;WS=139797421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,59:0.67:88
chr7	139801777	rs1062277	T	G	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-6.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.451;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=2;PP=556;ReadPosRankSum=-0.805;SC=ATCTCTAATCTTTTGAGGACC;SOR=1.850;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=52;TCF=47;TCR=5;TR=31;WE=139801785;WS=139801767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,34:0.62:55
chr7	139810796	rs2301893	G	A	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=198;ReadPosRankSum=0.113;SC=TCTTCTAAGTGTGTAAGAGTT;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=10;WE=139810804;WS=139810786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr7	139811092	rs3815213	C	T	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=165;ReadPosRankSum=0.481;SC=TTACAGACATCGCCAAATACT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=8;WE=139811100;WS=139811082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr7	139820354	rs59225858	C	G	3893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.256;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=103;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.187;SC=AATATATAAACCAGTCATTTT;SOR=0.965;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=194;TCF=44;TCR=150;TR=131;WE=139820362;WS=139820344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,141:0.68:208
chr7	139838805	rs6974217	T	C	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=382;ReadPosRankSum=-1.697;SC=GGGTGTAATATAACTCCTCAG;SOR=1.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=16;WE=139838813;WS=139838795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr7	140036999	rs4332050	G	A	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=5;PP=1025;SC=GCAATCAACAGTTTTGCTGAA;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=36;WE=140037007;WS=140036989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	140037162	rs73737575	A	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.107;HP=8;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=190;ReadPosRankSum=-0.018;SC=GAAAGGGAGGAAAAAAAAATT;SOR=1.850;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=11;WE=140037170;WS=140037152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr7	140043373	rs11772729	T	C	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=871;ReadPosRankSum=-0.125;SC=CCTGAAGTCATAAACAGGTTC;SOR=0.724;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=42;WE=140043381;WS=140043363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,43:0.63:68
chr7	140044811	rs61024048	G	A	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=-1.739;SC=AATAGGGACCGCTTCTGTCAC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=140044819;WS=140044806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr7	140044979	rs6974016	C	T	4171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=63;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.599;SC=ATTTACAGAGCAACAGAAGCA;SOR=0.261;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=68;TCR=63;TR=130;WE=140044987;WS=140044969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,134:0.99:135
chr7	140051790	rs73472791	T	C	1486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.864;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=21;PP=1218;ReadPosRankSum=0.016;SC=AGAGATTCGATTTCTTGGCCT;SOR=0.869;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=81;TCF=46;TCR=35;TR=52;WE=140051798;WS=140051780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,54:0.64:84
chr7	140069361	rs4448174	G	C	1543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.930;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=18;PP=1146;ReadPosRankSum=1.041;SC=TTTTTCTTTAGCTTTAAGCCC;SOR=0.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=80;TCF=53;TCR=27;TR=55;WE=140069369;WS=140069351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,60:0.71:85
chr7	140082363	rs6968618	G	A	3073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.315;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=81;PP=2478;ReadPosRankSum=-0.910;SC=TTGACCTTAAGGTTTGGATGA;SOR=1.038;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=166;TCF=41;TCR=125;TR=105;WE=140082371;WS=140082353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,109:0.63:172
chr7	140110677	rs2971690	G	A	2986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=4;PP=2494;ReadPosRankSum=1.387;SC=GTGAGAGGCTGTGTGAATTGG;SOR=4.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=84;TCR=4;TR=87;WE=140110685;WS=140110667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,91:0.99:92
chr7	140110781	rs2971689	G	C	3214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.488;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=55;PP=2274;ReadPosRankSum=-1.286;SC=AGAACAGTTCGGCCAGTATTA;SOR=0.747;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=222;TCF=127;TCR=95;TR=131;WE=140110789;WS=140110771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,133:0.58:231
chr7	140111486	rs2948389	A	T	121.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=79;SC=TCCCCAACCAAGGAGGATATC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=140111494;WS=140111476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	140111509	rs2971688	G	C	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=288;SC=AGTCATCCAGGGAGCAACTGA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=140111517;WS=140111499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	140125750	rs2948386	T	C	3115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.659;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=44;PP=2419;ReadPosRankSum=-0.338;SC=GGCTGAGAAGTACGGCCTCCT;SOR=0.920;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=181;TCF=108;TCR=73;TR=112;WE=140125758;WS=140125740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,115:0.62:186
chr7	140156723	rs78256678	G	A	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.081;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=410;ReadPosRankSum=-0.725;SC=TGAAAAACTTGAGCAACAGTT;SOR=0.851;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=79;TCF=19;TCR=60;TR=25;WE=140156731;WS=140156713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,23:0.30:77
chr7	140173010	.	CA	C	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=0.000;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=3.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.57;ReadPosRankSum=1.462;SOR=1.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,12:0.20:61
chr7	140218464	rs6852	C	A	2625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.133;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=33;PP=2023;ReadPosRankSum=-0.124;SC=GTTTTTAAAGCATAGGGCTGC;SOR=0.392;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=122;TCF=80;TCR=42;TR=92;WE=140218472;WS=140218454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,95:0.76:125
chr7	140225750	rs2252397	G	A	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=86;ReadPosRankSum=-1.087;SC=GTAGCCACAGGTAATGAAGAG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=7;WE=140225758;WS=140225740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr7	140255623	rs4342501	T	C	4169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=100;PP=2965;SC=CCACATATCATAGCTCTGGAA;SOR=2.611;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=26;TCR=101;TR=126;WE=140255631;WS=140255613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr7	140257841	rs10252031	A	G	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=214;SC=GTGCCTCATCAGGGAATCTCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=140257849;WS=140257831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	140257907	rs12704002	C	T	1684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=4;PP=1356;SC=AGGAAGTCCACGAGGCTCTTG;SOR=4.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=48;TCR=4;TR=52;WE=140257915;WS=140257897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr7	140258000	rs12704003	T	C	4252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=49;PP=2965;SC=TTAAGACAAATGAGAATGTTT;SOR=1.481;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=90;TCR=49;TR=139;WE=140258008;WS=140257990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr7	140301731	rs269243	G	T	11627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.977;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=204;NR=177;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.931;SC=CACGGAGAGGGGATCGTTCTG;SOR=0.049;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=386;TCF=208;TCR=178;TR=381;WE=140301739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,395:0.99:399
chr7	140395554	rs373239942	CT	C	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.73;ReadPosRankSum=1.972;SOR=0.375;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,14:0.23:61
chr7	140396472	rs57717083	C	CG	497.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=60.67;NF=11;NR=2;PP=529;SC=ACGGGAGGCGCGGGCGGAGCG;SOR=3.258;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=13;WE=140396480;WS=140396462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	140404576	rs376083178	C	T	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQRankSum=-1.140;QD=3.38;ReadPosRankSum=-1.858;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr7	140426257	rs3829814	A	G	2524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.646;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=23;PP=1907;ReadPosRankSum=1.942;SC=CGAACACAAGACTTAAGAAAT;SOR=0.509;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=132;TCF=98;TCR=34;TR=86;WE=140426265;WS=140426247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,91:0.66:137
chr7	140434597	rs60814637	G	GA	590.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=9.542;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.83;MQRankSum=-1.010;QD=21.88;ReadPosRankSum=2.260;SOR=5.630;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,24:0.89:27
chr7	140774467	rs477223	C	G	2075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=50;PP=1769;SC=GCTTCGACCCCGAGATCGCCG;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=20;TCR=50;TR=70;WE=140774475;WS=140774457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr7	141137460	rs13233459	C	T	1326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.295;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=23;PP=1001;ReadPosRankSum=-0.045;SC=CCATCATCCTCTTTGGCTGGA;SOR=0.368;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=76;TCF=46;TCR=30;TR=52;WE=141137468;WS=141137450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,53:0.67:79
chr7	141137554	rs1727491	A	G	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=4.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.00;ReadPosRankSum=-0.611;SOR=0.274;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,42:0.69:61
chr7	141137554	.	ACG	GCA	1565	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=8;NR=26;PP=1565;QD=47.6019963195;SC=AGGTAAGGCTACGGGCTCGGC;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=55;TCF=12;TCR=43;TR=34;WE=141137564;WS=141137544;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:21,34:0.62:55
chr7	141137556	rs1619668	G	A	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=5.131;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.39;ReadPosRankSum=-0.967;SOR=0.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,41:0.71:58
chr7	141362431	rs6949729	T	C	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=2;PP=815;SC=CCACGTGAAGTGGCTCCCAGT;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=141362439;WS=141362421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	141362693	rs2269984	A	T	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=6.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.66;ReadPosRankSum=1.203;SOR=0.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,25:0.28:90
chr7	141374030	.	AAC	A	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=147;ReadPosRankSum=0.072;SC=CCTGCAGAAAAACACACACAC;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=5;WE=141374039;WS=141374020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr7	141386264	rs35707772	AC	A	1936.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=2;PP=1863;SC=TACACACAGCACACGAAGACC;SOR=4.450;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=42;WE=141386272;WS=141386254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr7	141439003	rs75358342	C	T	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=10;PP=1120;SC=AGTCACTTGTCTGTATTAATA;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=42;WE=141439011;WS=141438993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	141442213	rs2301924	G	A	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=97;SC=CTGAGCCCCTGTTCTCCTTAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=141442221;WS=141442203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	141463914	rs765007	T	C	1964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=1;PP=1700;SC=GGAGATTCTATGTATCAACAG;SOR=6.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=59;TCF=58;TCR=1;TR=59;WE=141463922;WS=141463904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
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chr7	141478308	rs2233998	T	C	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=3;PP=795;SC=TTATTCTATTTCTCTGCTATT;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=141478316;WS=141478298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr7	141478800	rs2234002	G	A	4145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=49;PP=2965;SC=TTTAATATCAGTGAGGGCATC;SOR=1.152;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=75;TCR=49;TR=124;WE=141478808;WS=141478790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr7	141490107	rs2234012	A	G	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=398;SC=GTGTGTTATCACTACCAGGGG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=141490115;WS=141490100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	141490238	rs2227264	G	T	3223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=29;PP=2470;SC=GGAAATGGAAGCCTGGTGGTC;SOR=1.902;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=101;TCF=72;TCR=29;TR=100;WE=141490246;WS=141490228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr7	141536351	rs10657416	C	CAG	624.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=813;ReadPosRankSum=-0.391;SC=GGAGATCATGCAGAGAGAGAG;SOR=0.859;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=20;WE=141536359;WS=141536341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr7	141536855	rs7806186	C	A	1447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.886;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=0;PP=2714;ReadPosRankSum=1.824;SC=CATCAAGAGTCAATAGTTAAC;SOR=2.943;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=76;TCF=75;TCR=1;TR=50;WE=141536874;WS=141536845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,52:0.68:77
chr7	141536866	rs7806190	C	T	1759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=4;PP=2714;ReadPosRankSum=1.838;SC=AATAGTTAACCGGGCATATGC;SOR=0.936;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=79;TCR=6;TR=56;WE=141536874;WS=141536845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,59:0.68:87
chr7	141537116	rs7805542	G	A	1524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=42;PP=1242;ReadPosRankSum=0.632;SC=CTGACCACCAGCCTCTATTTC;SOR=0.628;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=81;TCF=18;TCR=63;TR=55;WE=141537124;WS=141537106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,55:0.66:83
chr7	141537169	rs7806657	C	T	1283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.100;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=25;ReadPosRankSum=-0.023;SC=ATAAGGAATGCGACAAAGGAG;SOR=0.278;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=62;TCF=26;TCR=36;TR=46;WE=141537177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,47:0.73:64
chr7	141537237	rs7806797	C	T	1363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.096;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=10;PP=1116;ReadPosRankSum=-0.614;SC=AAAGGCTTTACGTCTCTTTAA;SOR=1.022;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=74;TCF=58;TCR=16;TR=49;WE=141537245;WS=141537227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,50:0.66:76
chr7	141537297	rs3823668	T	G	2545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.675;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=37;PP=1996;ReadPosRankSum=1.142;SC=CTAAATGACCTGAGGCAATTC;SOR=0.779;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=142;TCF=86;TCR=56;TR=98;WE=141537305;WS=141537287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,102:0.69:147
chr7	141537541	rs3800990	A	G	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=257;ReadPosRankSum=-0.519;SC=CTCAGGTAGCATCTCTATTGG;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=12;WE=141537549;WS=141537531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr7	141537735	rs12669721	T	G	2613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=13;PP=2149;SC=GTGGCGAGGGTAAGGGGCTGG;SOR=3.116;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=62;TCR=13;TR=75;WE=141537743;WS=141537725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr7	141537942	rs145160047	T	TCAA	1239.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=5.566;NF=11;NR=24;PP=1377;ReadPosRankSum=-0.685;SC=GAAGTAATCATCATCATCATC;SOR=0.753;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=36;TCR=82;TR=35;WE=141537950;WS=141537932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,39:0.30:131
chr7	141537968	rs11765575	A	G	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.992;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.716;NF=10;NR=22;PP=523;ReadPosRankSum=-0.322;SC=CATTGCTAAGATACTGAATGT;SOR=1.109;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=111;TCF=41;TCR=70;TR=32;WE=141537976;WS=141537958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,33:0.29:112
chr7	141538089	rs75612846	TG	T	350.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=412;ReadPosRankSum=0.694;SC=CATGAATTAATGGGGGCACAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=14;WE=141538097;WS=141538079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr7	141538741	rs73171695	T	C	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.037;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=688;ReadPosRankSum=-1.641;SC=CTCACCTCAATTGACCCAATT;SOR=0.525;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=60;TCF=41;TCR=19;TR=33;WE=141538749;WS=141538731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,35:0.56:62
chr7	141538812	rs36029840	TA	T	38.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=3.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=-2.001;QD=0.90;ReadPosRankSum=-1.930;SOR=0.277;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,9:0.21:43
chr7	141538865	rs12703412	A	G	1333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=30;PP=1139;SC=ATAACATGTAACACAGGGTTC;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=39;WE=141538873;WS=141538855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	141539075	rs62478495	G	A	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=485;ReadPosRankSum=0.190;SC=ACCCTTATATGAGAACCACTG;SOR=0.903;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=27;WE=141539083;WS=141539065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr7	141539400	rs6946479	G	A	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=45;ReadPosRankSum=-0.000;SC=AAGTGTTAACGTATTTGACAT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=141539408;WS=141539390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr7	141540680	rs10454323	G	A	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.834;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=6;PP=877;ReadPosRankSum=-0.279;SC=GATGGAGTCTGAGAGGCAGGA;SOR=1.316;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=67;TCF=55;TCR=12;TR=40;WE=141540688;WS=141540670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,43:0.61:71
chr7	141540741	rs10454324	G	A	2546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.328;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=25;PP=1919;ReadPosRankSum=0.520;SC=TGCACCCTTCGCAATCCTGCC;SOR=0.923;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=145;TCF=103;TCR=42;TR=90;WE=141540749;WS=141540731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,95:0.62:152
chr7	141540774	rs10454325	A	C	2809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=44;PP=2126;ReadPosRankSum=0.224;SC=CATCCATTAAACTGTGCCTTA;SOR=0.727;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=91;TCR=69;TR=102;WE=141540782;WS=141540764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,108:0.64:168
chr7	141629982	rs118162062	G	T	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=467;ReadPosRankSum=0.455;SC=TTAGGCCAATGGTCGCACAGT;SOR=0.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=66;TCF=5;TCR=61;TR=26;WE=141629990;WS=141629972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,26:0.37:71
chr7	141635534	rs200523567	T	TC	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.26;ReadPosRankSum=0.767;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,7:0.21:34
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chr7	141672604	rs10246939	T	C	4771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=79;PP=2965;SC=GAGATCAGGATGGCTGCATGC;SOR=0.769;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=85;TCR=79;TR=164;WE=141672612;WS=141672594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr7	141673345	rs713598	C	G	7019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=132;NR=78;PP=2965;SC=TTGCTCAGTGCCTGCCTCTTC;SOR=1.268;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=211;TCF=132;TCR=79;TR=210;WE=141673353;WS=141673335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr7	141705515	rs1285964	A	T	1575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=38;PP=1198;SC=CAAACCTTCAACAATGTCAGG;SOR=2.348;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=49;WE=141705523;WS=141705505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	141705540	rs1285965	A	C	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.445;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=176;ReadPosRankSum=-2.687;SC=TAATGCTTTCATGCTCATGTG;SOR=0.148;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=13;WE=141705548;WS=141705530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,13:0.30:44
chr7	141708625	rs1465093	A	C	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=111;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTTATGTTGCAGCCATTAGTG;SOR=0.204;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=9;WE=141708633;WS=141708615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr7	141718951	rs1358305	C	T	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=295;ReadPosRankSum=0.189;SC=TATAAATGATCATGTTCTACA;SOR=1.292;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=13;WE=141718959;WS=141718941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr7	141720643	rs1852508	T	C	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.893;NF=12;NR=2;PP=210;ReadPosRankSum=0.697;SC=CCACCTGCCTTGGCCTCCCAA;SOR=0.787;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=14;WE=141720651;WS=141720633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
chr7	141721340	.	G	C	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.251;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=285;ReadPosRankSum=0.475;SC=GGGAAGCTCTGACAAGTTTTT;SOR=0.565;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=61;TCF=54;TCR=7;TR=19;WE=141721348;WS=141721330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,18:0.30:61
chr7	141727679	.	AT	A	43	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;FR=1.0000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=19;MQ=62.13;NF=0;NR=3;PP=43;QD=17.3333333333;SC=AATACTAGACATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=141727687;WS=141727669;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,3:0.50:6
chr7	141730618	rs111279755	CTG	C	273.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.44;ReadPosRankSum=0.623;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr7	141731340	rs4374898	G	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=1.126;SC=TGTGAGCACCGCACCTTCTTA;SOR=0.197;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=5;WE=141731348;WS=141731332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr7	141733994	rs10693852	T	TTG	1452.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=8;PP=1318;SC=TCATTTCGGATTGTGATAGTC;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=28;WE=141734002;WS=141733984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr7	141736798	rs4132774	T	C	2313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.172;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=50;PP=1787;ReadPosRankSum=0.088;SC=CTAACCTCCTTAAATTTTATT;SOR=0.364;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=111;TCF=41;TCR=70;TR=83;WE=141736806;WS=141736788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,84:0.74:114
chr7	141738504	rs8180874	C	T	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.515;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=26;PP=884;ReadPosRankSum=-0.381;SC=TCCAAACTCACTTCTGACATC;SOR=0.382;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=68;TCF=26;TCR=42;TR=44;WE=141738512;WS=141738494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,47:0.67:70
chr7	141740409	rs10215116	A	G	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=355;ReadPosRankSum=1.305;SC=TGGCTAGACCATAATTCAGCT;SOR=0.437;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=20;WE=141740417;WS=141740399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr7	141747499	rs62477571	A	G	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=0;PP=1003;ReadPosRankSum=0.313;SC=AACTTTTCCAATTTGAAATTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=36;WE=141747507;WS=141747489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,38:0.76:50
chr7	141747658	rs2960746	A	G	9065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=120;NR=144;PP=2965;SC=TTTCTGGGATAATGGGGAAAC;SOR=0.895;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=265;TCF=120;TCR=145;TR=264;WE=141747666;WS=141747648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr7	141750316	rs6948116	C	T	358.53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5041;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=286;ReadPosRankSum=-0.490;SC=TTTTTATGATCGTTTTAAATT;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=9;WE=141750324;WS=141750306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr7	141750472	rs62477572	A	G	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=21;PP=952;ReadPosRankSum=-0.954;SC=ACCTTTATGCATACTTGGACT;SOR=0.787;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=71;TCF=42;TCR=29;TR=52;WE=141750480;WS=141750462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,57:0.75:76
chr7	141752016	rs79975318	T	A	1527.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=12;PP=1256;ReadPosRankSum=-0.450;SC=ATTTTTTTTTTATCGAAAAAA;SOR=0.615;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=78;TCF=64;TCR=14;TR=57;WE=141752028;WS=141752006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,58:0.73:79
chr7	141755358	rs67998329	T	C	1839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.680;NF=58;NR=8;PP=1562;ReadPosRankSum=-1.213;SC=TGTGTTTCAGTTGGGACTCTC;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=87;TCR=12;TR=66;WE=141755366;WS=141755348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,65:0.67:97
chr7	141755795	rs2961081	C	T	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.220;NF=23;NR=0;PP=524;ReadPosRankSum=-0.783;SC=CCCATGACTCCCCAGTACAAG;SOR=1.850;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=23;WE=141755803;WS=141755785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr7	141755987	rs2961080	G	T	2054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.202;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.654;NF=10;NR=65;PP=1659;ReadPosRankSum=-0.020;SC=TTCCTTGAAGGCAAAATCTTC;SOR=1.092;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=123;TCF=19;TCR=104;TR=75;WE=141755995;WS=141755977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,76:0.59:128
chr7	141759676	rs62477620	T	C	1609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-6.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.166;NF=12;NR=55;PP=1212;ReadPosRankSum=0.401;SC=TTTCTGGCAATGAGACACAGC;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=20;TCR=92;TR=67;WE=141759684;WS=141759666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,68:0.60:114
chr7	141760228	rs6959057	T	C	2806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.780;NF=52;NR=60;PP=2030;ReadPosRankSum=0.026;SC=CAGGGGCAGCTGTTCCTGGGA;SOR=0.493;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=166;TCF=73;TCR=93;TR=112;WE=141760236;WS=141760218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,115:0.67:172
chr7	141760293	rs2961073	TG	GC	2974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.483;NF=6;NR=60;PP=2944;ReadPosRankSum=1.850;SC=AACACTTAGGTGATGTGTCTT;SOR=0.906;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=97;TCF=9;TCR=88;TR=66;WE=141760302;WS=141760283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,74:0.71:104
chr7	141760312	rs62477621	T	G	1520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.078;NF=3;NR=49;PP=1214;ReadPosRankSum=0.053;SC=TTGGGTGTCATTCTGTATGCC;SOR=0.420;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=69;TCF=3;TCR=66;TR=52;WE=141760320;WS=141760302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,54:0.76:71
chr7	141762625	rs62477625	A	G	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=229;ReadPosRankSum=1.454;SC=TGGACATAGCAGACACTTCTT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=11;WE=141762633;WS=141762615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr7	141763262	rs28446896	T	G	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=53;ReadPosRankSum=0.743;SC=CGTAATTATCTTAAAAAGTGA;SOR=0.446;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=6;WE=141763270;WS=141763252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr7	141765410	rs62477626	T	C	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.565;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.182;NF=0;NR=13;PP=215;ReadPosRankSum=0.134;SC=TCAGCCTCTTTGGCATATCCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=13;WE=141765418;WS=141765400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr7	141765772	rs35944134	T	TG	159.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=142;SC=TGTTTTGTTTTTTTTTTTGAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=141765780;WS=141765762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	141794763	rs138070479	ATT	A	1168.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.54;QD=43.29;SOR=6.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	141794790	rs4259331	A	G	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=617;SC=TTTGAGACAAAGACTCATTCT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=141794798;WS=141794780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	141796131	rs6975672	G	A	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.46;QD=32.53;SOR=3.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	141796244	rs75355762	G	T	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.34;MQRankSum=-2.227;QD=14.38;ReadPosRankSum=0.000;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr7	141796250	rs6976953	C	T	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.28;QD=34.76;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr7	141799396	rs62479371	C	T	1744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.416;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.641;NF=37;NR=28;PP=1435;ReadPosRankSum=2.502;SC=TCATCTCTTACCTTCTTCTGC;SOR=1.097;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=98;TCF=54;TCR=44;TR=65;WE=141799404;WS=141799386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,65:0.66:99
chr7	141831661	rs4473940	A	G	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-3.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=214;ReadPosRankSum=-0.325;SC=GAGATGGAACATCTTTTGTAG;SOR=0.627;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=13;WE=141831669;WS=141831651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr7	141838362	rs6464465	C	G	2722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.787;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=56;PP=2160;ReadPosRankSum=-0.038;SC=GGCCATTCTTCCCTCCCTATT;SOR=0.846;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=190;TCF=89;TCR=101;TR=102;WE=141838370;WS=141838352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,103:0.54:190
chr7	141840581	rs73158439	T	C	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.969;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=5;PP=580;ReadPosRankSum=-1.406;SC=TAGGTTCTGATTGACCAGAGC;SOR=0.936;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=93;TCF=71;TCR=22;TR=34;WE=141840589;WS=141840571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,36:0.38:95
chr7	141847418	rs62479416	G	A	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.043;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=383;ReadPosRankSum=-0.968;SC=GTGGAGGTGGGAGGTGGAGGT;SOR=0.217;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=18;WE=141847426;WS=141847408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr7	141847512	rs13241102	G	A	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=-1.358;SC=TTCTTACAGAGTATTTAAGAG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=141847520;WS=141847502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr7	141854436	rs61281471	A	T	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.076;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=139;ReadPosRankSum=-1.691;SC=ATGATGTGACAAAGAGGTTCT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=141854444;WS=141854426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr7	141854659	rs11770705	A	G	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.882;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=846;ReadPosRankSum=0.533;SC=AGGTCACCAAAAGAAGTGATG;SOR=0.634;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=118;TCF=54;TCR=64;TR=40;WE=141854667;WS=141854649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,41:0.33:123
chr7	141857846	rs7811706	A	G	3865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=73;PP=2965;SC=CTTTTCTACCATGCTCACACC;SOR=0.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=132;TCF=59;TCR=73;TR=131;WE=141857854;WS=141857836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr7	141857985	rs10282156	A	G	1866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=32;PP=1407;ReadPosRankSum=-2.061;SC=TTGTTGTTACATAATGTGCCA;SOR=0.802;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=123;TCF=67;TCR=56;TR=73;WE=141857993;WS=141857975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,76:0.60:126
chr7	141860199	rs60403744	A	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=31;ReadPosRankSum=-0.139;SC=TCCTTTCAAAATTGATCCAAA;SOR=0.175;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=5;WE=141860207;WS=141860189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr7	141860861	rs34106041	T	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=175;ReadPosRankSum=-0.321;SC=GGGATGAAGGTGGCTGGTTTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=11;WE=141860869;WS=141860851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr7	141861072	rs12703440	C	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=127;ReadPosRankSum=0.375;SC=GAAAATTAGTCATCATAGGCT;SOR=0.375;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=9;WE=141861080;WS=141861062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr7	141873000	rs9986803	T	A	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.218;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=422;ReadPosRankSum=0.404;SC=TAAGAAATCTTTCTGGATGCA;SOR=2.172;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=61;TCF=53;TCR=8;TR=23;WE=141873008;WS=141872990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,23:0.37:62
chr7	141896059	rs4236467	A	G	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.396;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=305;ReadPosRankSum=-2.302;SC=ACACAGCTGCATGGGACCAGC;SOR=1.169;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=81;TCF=57;TCR=24;TR=25;WE=141896067;WS=141896049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,27:0.33:83
chr7	141897595	rs3110843	T	C	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.598;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=365;ReadPosRankSum=0.572;SC=AAAAGCATTTTAAAGATCATC;SOR=1.453;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=3;TCR=60;TR=19;WE=141897603;WS=141897585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,18:0.29:62
chr7	141898023	rs4260813	C	A	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.401;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=32;PP=813;ReadPosRankSum=0.286;SC=TGTGAAGAACCAGTTTGGTCT;SOR=0.881;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=143;TCF=51;TCR=92;TR=49;WE=141898031;WS=141898013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,52:0.34:152
chr7	141898522	rs2960768	T	A	2450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=59;PP=2074;SC=AAGAGCCTGCTATGAACACTC;SOR=2.073;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=20;TCR=59;TR=79;WE=141898530;WS=141898512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr7	141901322	rs6963175	G	A	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.502;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=339;ReadPosRankSum=-1.954;SC=AATACAGTTAGGTTTTGACAA;SOR=0.368;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=17;WE=141901330;WS=141901312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr7	141901506	rs6464469	C	T	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=96;ReadPosRankSum=0.639;SC=TTTCTTGTTACTATTTTGTAA;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=7;WE=141901514;WS=141901496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr7	141952110	rs1052406	G	A	1708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=20;PP=1231;ReadPosRankSum=-0.751;SC=TGCCAACATCGGCTCTCAAAA;SOR=0.651;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=176;TCF=125;TCR=51;TR=67;WE=141952118;WS=141952100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,72:0.39:186
chr7	141954756	rs62476761	A	G	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.100;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=386;ReadPosRankSum=0.030;SC=GTACAGAGAAAAGGAAAGGGG;SOR=0.048;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=75;TCF=71;TCR=4;TR=24;WE=141954764;WS=141954746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,25:0.32:77
chr7	141955250	rs4470937	C	T	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.623;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=163;ReadPosRankSum=-0.516;SC=TCCCAAAGGCCTTTCTAATCC;SOR=0.956;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=25;TCF=13;TCR=12;TR=9;WE=141955258;WS=141955240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr7	141957504	rs7786497	A	G	1632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.510;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=43;PP=1230;ReadPosRankSum=0.205;SC=GATTCAAGAGAGCCCAGAGGA;SOR=1.191;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=83;TCF=22;TCR=61;TR=57;WE=141957512;WS=141957494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,60:0.69:87
chr7	142001030	rs56095598	A	G	3575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=58;PP=2802;SC=GTGATCTTGCACTGTGTCCCC;SOR=0.798;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=53;TCR=59;TR=111;WE=142001038;WS=142001020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr7	142008403	rs376053846	C	G	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=5.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.87;ReadPosRankSum=-1.111;SOR=0.094;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,18:0.33:54
chr7	142008408	rs370407588	T	G	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=5.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.00;ReadPosRankSum=-1.001;SOR=0.094;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,18:0.33:54
chr7	142008434	.	G	A	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.592;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=2.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.91;ReadPosRankSum=1.382;SOR=0.232;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,19:0.28:68
chr7	142008440	.	T	C	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.118;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.59;ReadPosRankSum=1.105;SOR=0.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,21:0.27:78
chr7	142008442	.	T	C	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.46;ReadPosRankSum=1.138;SOR=0.516;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,21:0.26:80
chr7	142008453	.	C	G	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.308;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=1642;ReadPosRankSum=-1.338;SC=TCTGCCTCCTCCAAGCAGGTG;SOR=0.419;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=85;TCF=69;TCR=16;TR=27;WE=142008461;WS=142008424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,31:0.33:93
chr7	142008469	.	C	T	1566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.137;ClippingRankSum=0.000;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.87;ReadPosRankSum=-2.592;SOR=0.806;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,42:0.37:113
chr7	142008477	.	G	A	1767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.070;ClippingRankSum=0.000;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.39;ReadPosRankSum=-1.543;SOR=0.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,48:0.36:132
chr7	142008484	.	T	A	1943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.773;ClippingRankSum=0.000;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.79;ReadPosRankSum=-0.410;SOR=0.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,50:0.35:141
chr7	142008491	.	A	G	1842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.171;ClippingRankSum=0.000;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=1.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.04;ReadPosRankSum=1.158;SOR=0.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,52:0.34:153
chr7	142008502	rs370591069	TA	CG	1988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=0.634;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.50;ReadPosRankSum=2.753;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,54:0.31:173
chr7	142008529	rs367608484	C	G	2326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=1.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.24;ReadPosRankSum=0.016;SOR=0.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,67:0.32:207
chr7	142008533	.	CCG	C	2380.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.000;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=0.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.230;SOR=0.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,66:0.31:215
chr7	142008536	.	T	TAC	2371.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.068;ClippingRankSum=0.000;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=1.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.51;ReadPosRankSum=-0.946;SOR=0.596;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,66:0.32:206
chr7	142008542	rs373709044	A	G	2309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=0.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.90;ReadPosRankSum=-1.178;SOR=0.637;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:147,65:0.31:212
chr7	142008573	rs375153223	G	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.12;ReadPosRankSum=-1.026;SOR=0.525;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,18:0.11:157
chr7	142008577	rs369645839	G	A	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.00;ReadPosRankSum=0.163;SOR=0.626;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:144,19:0.12:163
chr7	142008581	rs371566486	CT	AC	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.18;ReadPosRankSum=0.126;SOR=0.763;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,22:0.14:161
chr7	142008593	rs368999058	T	C	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.553;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=2962;ReadPosRankSum=0.559;SC=TGGACACAGCTGTTTCCCAGA;SOR=1.064;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=178;TCF=83;TCR=95;TR=55;WE=142008601;WS=142008563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,34:0.21:159
chr7	142008634	.	ACG	A	1668.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.526;ClippingRankSum=0.000;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=2.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.30;ReadPosRankSum=0.423;SOR=0.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,48:0.30:162
chr7	142008638	.	C	A	1734.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.252;ClippingRankSum=0.000;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=1.430;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.12;ReadPosRankSum=-0.401;SOR=0.524;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,49:0.31:156
chr7	142008639	.	A	AGG	1731.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.000;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=1.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.32;ReadPosRankSum=-0.472;SOR=0.521;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,48:0.31:153
chr7	142008644	.	CA	TC	1686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=0.000;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=1.478;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.17;ReadPosRankSum=-0.441;SOR=0.539;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,46:0.30:151
chr7	142008653	rs370721246	T	A	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=1.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.98;ReadPosRankSum=-0.104;SOR=0.521;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,46:0.30:155
chr7	142008672	.	G	A	1549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.044;ClippingRankSum=0.000;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=3.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.381;SOR=0.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,45:0.30:151
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chr7	142008783	.	AAA	GAC	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=17;NR=24;PP=2944;QD=20;SC=CTTCTCACCTAAATCTCCAGA;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=124;TCF=55;TCR=69;TR=41;WE=142008811;WS=142008773;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:83,41:0.33:124
chr7	142008785	.	A	C	1589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.706;ClippingRankSum=0.000;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.32;ReadPosRankSum=0.885;SOR=0.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,44:0.34:129
chr7	142008803	.	C	T	1289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.721;ClippingRankSum=0.000;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.506;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=1980;ReadPosRankSum=0.013;SC=ACAAAGCTCACTTAAATCTTC;SOR=1.121;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=118;TCF=51;TCR=67;TR=47;WE=142008811;WS=142008773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,49:0.40:123
chr7	142008879	.	C	T	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.084;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.49;ReadPosRankSum=-1.515;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr7	142008881	.	G	A	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.157;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.16;ReadPosRankSum=-1.869;SOR=0.661;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,28:0.44:63
chr7	142008884	.	A	G	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=1.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.72;ReadPosRankSum=-2.035;SOR=0.348;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr7	142008887	.	T	C	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=1.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.23;ReadPosRankSum=-0.874;SOR=0.297;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,28:0.44:64
chr7	142008932	rs375535167	GC	G	490.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=641;ReadPosRankSum=0.036;SC=CCAGGAAGCTGCAGGGCAGCG;SOR=0.798;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=6;WE=142008949;WS=142008922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr7	142008934	.	A	T	499.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.14;ReadPosRankSum=0.109;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr7	142008939	.	A	C	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.313;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=3.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.56;ReadPosRankSum=-0.377;SOR=2.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr7	142008941	.	C	T	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.858;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.95;ReadPosRankSum=-0.234;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr7	142008959	.	G	A	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=40;ReadPosRankSum=-1.427;SC=CCTGCACCCAGGGCTCCAGTC;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=142008967;WS=142008949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr7	142013130	rs361400	C	T	2558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=25;PP=1983;ReadPosRankSum=2.383;SC=AACCCTTTTCCTTGTGGCTGC;SOR=0.647;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=99;TCR=42;TR=85;WE=142013138;WS=142013120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,90:0.61:147
chr7	142013384	rs361401	G	C	8887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.96;NF=107;NR=164;PP=2965;SC=GAAAGTGTGCGAAGTCGCTTC;SOR=1.246;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=271;TCF=107;TCR=164;TR=271;WE=142013392;WS=142013374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr7	142021521	rs72430962	TCA	T	329.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=212;ReadPosRankSum=-0.152;SC=TTTCTGCAACTCAGGGCTGGG;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=7;WE=142021530;WS=142021511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr7	142028108	rs361428	A	C	1660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.84;QD=44.89;SOR=5.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	142028118	rs361429	C	A	1782.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.78;MQRankSum=6.104;QD=36.39;ReadPosRankSum=-0.857;SOR=3.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,46:0.94:49
chr7	142028472	.	C	T	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.213;ClippingRankSum=0.000;DP=245;ExcessHet=3.0103;FS=0.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQRankSum=-14.706;QD=0.61;ReadPosRankSum=-1.644;SOR=0.548;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:224,20:0.08:244
chr7	142028474	.	TC	GG	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=0.000;DP=246;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQRankSum=-14.773;QD=0.58;ReadPosRankSum=-1.463;SOR=0.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:224,21:0.09:245
chr7	142028485	.	C	A	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.282;ClippingRankSum=0.000;DP=264;ExcessHet=3.0103;FS=2.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQRankSum=-15.068;QD=1.22;ReadPosRankSum=0.918;SOR=0.428;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:238,25:0.10:263
chr7	142028490	.	A	C	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=0.000;DP=273;ExcessHet=3.0103;FS=0.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQRankSum=-15.368;QD=1.22;ReadPosRankSum=1.967;SOR=0.541;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:246,26:0.10:272
chr7	142028500	.	A	G	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.459;ClippingRankSum=0.000;DP=279;ExcessHet=3.0103;FS=2.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQRankSum=-15.638;QD=1.46;ReadPosRankSum=2.427;SOR=0.604;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:249,29:0.10:278
chr7	142028506	.	CA	TG	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.616;ClippingRankSum=0.000;DP=285;ExcessHet=3.0103;FS=2.485;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQRankSum=-15.838;QD=1.59;ReadPosRankSum=2.551;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:254,30:0.11:284
chr7	142028533	.	C	A	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.634;ClippingRankSum=0.000;DP=277;ExcessHet=3.0103;FS=5.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQRankSum=-15.579;QD=1.22;ReadPosRankSum=0.527;SOR=1.234;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:249,28:0.10:277
chr7	142028538	.	G	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.000;DP=263;ExcessHet=3.0103;FS=6.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQRankSum=-15.105;QD=1.27;ReadPosRankSum=0.139;SOR=1.417;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:237,26:0.10:263
chr7	142028540	.	G	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.775;ClippingRankSum=0.000;DP=264;ExcessHet=3.0103;FS=6.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQRankSum=-15.134;QD=1.27;ReadPosRankSum=-0.205;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:238,26:0.10:264
chr7	142028542	.	G	T	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=0.000;DP=264;ExcessHet=3.0103;FS=5.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQRankSum=-15.105;QD=1.22;ReadPosRankSum=-0.703;SOR=1.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:237,26:0.10:263
chr7	142028546	.	TC	CT	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DP=265;ExcessHet=3.0103;FS=5.640;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQRankSum=-15.056;QD=1.02;ReadPosRankSum=-0.795;SOR=1.276;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:240,24:0.09:264
chr7	142032610	.	A	G	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=4.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-2.436;QD=3.49;ReadPosRankSum=1.356;SOR=0.251;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,15:0.14:106
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chr7	142032646	rs78118526	G	A	2520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.91;QD=35.01;SOR=3.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr7	142032646	.	GTGTACATAGTGCAA	ATGTACATAGTGCAA,ATGTACATGGTGAAG	2962	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MMLQ=28;MQ=59.93;NF=9,2;NR=54,8;PP=2962,699;QD=20;SC=TTAAAAATGTGTGTACATAGT;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=9;TCR=54;TR=63,10;WE=142032668;WS=142032636;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:63
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chr7	142032658	.	C	A	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=7.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-1.826;QD=6.79;ReadPosRankSum=-0.135;SOR=0.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,12:0.22:54
chr7	142032660	.	A	G	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=4.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-1.710;QD=7.09;ReadPosRankSum=-0.755;SOR=0.129;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,13:0.25:53
chr7	142032677	rs375896144	G	A	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.361;HP=2;HapScore=2;MGOF=52;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.555;NF=1;NR=10;PP=167;ReadPosRankSum=0.014;SC=AATCTAGCTAGTTAACATATG;SOR=0.054;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=11;WE=142032685;WS=142032667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
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chr7	142032729	.	A	G	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=63;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=123;ReadPosRankSum=1.339;SC=GAGAATACTTAAAATGTACTC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=6;WE=142032737;WS=142032719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr7	142045446	rs56060483	G	C	2893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=0.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.16;ReadPosRankSum=0.871;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,75:0.50:151
chr7	142045449	rs371824542	A	G	2928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.40;ReadPosRankSum=0.709;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,76:0.50:151
chr7	142045518	.	G	A	2350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.670;ClippingRankSum=0.000;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.504;HP=7;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.924;NF=52;NR=37;PP=1860;ReadPosRankSum=-0.387;SC=CTTTCCCCCCGCAGTCCCCAT;SOR=0.509;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=193;TCF=118;TCR=75;TR=89;WE=142045526;WS=142045508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,92:0.46:202
chr7	142045613	.	G	T	4261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-7.869;ClippingRankSum=0.000;DP=423;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.862;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=133;NR=40;PP=2962;ReadPosRankSum=1.704;SC=AACATCTGGGGCATAACGCTA;SOR=1.195;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=402;TCF=289;TCR=113;TR=173;WE=142045621;WS=142045603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:235,182:0.44:417
chr7	142045678	rs61750018	ACT	GTC	8670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=542;ExcessHet=3.0103;FS=0.525;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.626;QD=16.30;ReadPosRankSum=0.170;SOR=0.652;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:303,229:0.43:532
chr7	142045683	rs61750019	A	G	8728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=543;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.628;QD=16.38;ReadPosRankSum=0.257;SOR=0.566;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:304,229:0.43:533
chr7	142045690	rs61750021	A	G	9238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.604;QD=17.33;ReadPosRankSum=0.010;SOR=0.576;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:300,233:0.44:533
chr7	142045692	rs61750022	AC	GT	9079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=550;ExcessHet=3.0103;FS=0.528;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=-1.613;QD=16.85;ReadPosRankSum=0.392;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:305,234:0.43:539
chr7	142045802	rs2855871	T	C	2671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.041;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-6.377;NF=23;NR=91;PP=1978;ReadPosRankSum=-0.355;SC=TGTATCTCTGTGCCAGCAGCC;SOR=1.339;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=230;TCF=60;TCR=170;TR=114;WE=142045810;WS=142045792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,118:0.51:232
chr7	142045848	rs17225	T	C	3805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=6.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.232;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.259;NF=40;NR=77;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.103;SC=CTTTCCTGTGTAGAAACCTTA;SOR=1.012;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=186;TCF=78;TCR=108;TR=117;WE=142045856;WS=142045838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,134:0.66:202
chr7	142045877	rs17226	G	T	1380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.481;HP=2;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=1101;ReadPosRankSum=-0.425;SC=CCAGGAAGCTGTGGGGGCCAC;SOR=0.564;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=155;TCF=59;TCR=96;TR=61;WE=142045885;WS=142045867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,60:0.34:179
chr7	142045897	rs361402	C	T	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=1.029;QD=3.13;ReadPosRankSum=1.804;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:144,37:0.20:181
chr7	142045899	rs2974900	A	G	1725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.436;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.442;NF=9;NR=42;PP=2892;ReadPosRankSum=0.254;SC=AAAGCCTTCGATGAACATTTC;SOR=1.074;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=154;TCF=58;TCR=96;TR=51;WE=142045932;WS=142045887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,72:0.40:178
chr7	142045912	rs374368376	A	G	1496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=5.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.858;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.953;NF=5;NR=38;PP=2892;ReadPosRankSum=-0.298;SC=AACATTTCCTACAAGAGCCCC;SOR=1.101;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=143;TCF=47;TCR=96;TR=43;WE=142045932;WS=142045887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,62:0.37:168
chr7	142045924	rs1811089	A	G	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=0.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=1.286;QD=4.29;ReadPosRankSum=-0.595;SOR=0.576;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,36:0.24:149
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chr7	142099438	.	A	G	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.218;ClippingRankSum=0.000;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=7.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQRankSum=-9.949;QD=3.99;ReadPosRankSum=-2.070;SOR=0.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,44:0.25:177
chr7	142099484	.	G	C	1319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.000;DP=320;ExcessHet=3.0103;FS=19.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.73;MQRankSum=-13.246;QD=4.14;ReadPosRankSum=3.781;SOR=0.201;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:242,77:0.24:319
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chr7	142099533	.	T	C	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.000;DP=381;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQRankSum=-15.495;QD=1.64;ReadPosRankSum=-2.648;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:335,42:0.11:377
chr7	142099537	.	G	T	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.909;ClippingRankSum=0.000;DP=393;ExcessHet=3.0103;FS=3.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQRankSum=-16.245;QD=1.24;ReadPosRankSum=-2.755;SOR=0.469;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:352,37:0.10:389
chr7	142099541	.	T	C	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.485;ClippingRankSum=0.000;DP=392;ExcessHet=3.0103;FS=4.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQRankSum=-16.835;QD=0.74;ReadPosRankSum=-3.179;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:356,32:0.08:388
chr7	142099968	rs361367	C	T	2736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.926;NF=32;NR=41;PP=1470;ReadPosRankSum=-1.672;SC=GGGGGCTTTACCAGATCAGTG;SOR=0.729;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=57;TCR=75;TR=73;WE=142099976;WS=142099958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,77:0.57:136
chr7	142099988	rs361366	A	G	2412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.614;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.614;NF=23;NR=36;PP=1290;ReadPosRankSum=0.794;SC=GTCACTGTGAACAGAAGCAGA;SOR=1.174;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=117;TCF=50;TCR=67;TR=59;WE=142099996;WS=142099978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,63:0.52:121
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chr7	142104571	rs361433	G	A	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.881;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.481;NF=6;NR=47;PP=1187;ReadPosRankSum=-1.535;SC=GCTGCAGGACGTAGGGGTCTT;SOR=2.215;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=80;TCF=13;TCR=67;TR=53;WE=142104579;WS=142104561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,55:0.68:81
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chr7	142120155	rs361386	A	T	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=8.390;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQRankSum=1.234;QD=15.20;ReadPosRankSum=-1.052;SOR=0.778;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,40:0.58:69
chr7	142120168	.	TCACA	T,TCACACA	1296.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.691;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.05;MQRankSum=0.169;QD=27.59;ReadPosRankSum=0.047;SOR=0.397;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:3,29,15:0.62,0.32:47
chr7	142124170	rs361452	C	T	6632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=154;NR=51;PP=2965;SC=CACAGATGTCCGGGAGGGAGC;SOR=2.362;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=207;TCF=155;TCR=52;TR=205;WE=142124178;WS=142124160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr7	142124424	rs361449	T	G	4275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=58;PP=2965;SC=CAGCATTCACTGGACCTGCAG;SOR=1.226;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=89;TCR=58;TR=146;WE=142124432;WS=142124414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr7	142131774	rs56274419	G	T	3464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.850;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=4.411;NF=64;NR=71;PP=2694;ReadPosRankSum=-0.167;SC=TAAAGTGGAGGACACAGGGGT;SOR=0.678;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=260;TCF=130;TCR=130;TR=135;WE=142131787;WS=142131764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,138:0.54:254
chr7	142131779	.	A	C	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.607;ClippingRankSum=0.000;DP=259;ExcessHet=3.0103;FS=14.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQRankSum=-9.014;QD=0.60;ReadPosRankSum=0.220;SOR=1.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:207,32:0.13:239
chr7	142131991	.	A	G	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=7.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQRankSum=-1.922;QD=3.67;ReadPosRankSum=1.622;SOR=0.011;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,3:0.19:16
chr7	142131999	.	T	G	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.082;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=7.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=-2.006;QD=3.28;ReadPosRankSum=1.840;SOR=0.010;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,3:0.18:17
chr7	142132011	.	T	G	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.116;ClippingRankSum=0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQRankSum=-1.741;QD=4.63;ReadPosRankSum=1.452;SOR=0.016;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr7	142132011	.	TGC	GGA	243	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=30;MQ=59.08;NF=1;NR=2;PP=243;QD=98.8226249541;SC=GTCCTCCCCATGCAGCCTTCC;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=3;WE=142132021;WS=142131981;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr7	142139259	rs361374	G	A	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=7.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=0.904;QD=6.20;ReadPosRankSum=-0.546;SOR=2.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,27:0.28:96
chr7	142139271	rs146977487	TG	CA	4220.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.601;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=6.179;NF=82;NR=8;PP=2944;ReadPosRankSum=0.872;SC=GACTATGCCATGCTGTGGCTA;SOR=1.857;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=108;TCF=98;TCR=10;TR=90;WE=142139280;WS=142139249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,101:0.93:109
chr7	142139296	rs374460258	C	A	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.29;MQRankSum=-6.558;QD=0.50;ReadPosRankSum=0.841;SOR=0.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,15:0.11:135
chr7	142139315	.	G	C	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.318;ClippingRankSum=0.000;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=9.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.30;MQRankSum=-8.421;QD=1.22;ReadPosRankSum=1.639;SOR=1.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:169,24:0.12:193
chr7	142139334	.	CG	C	507.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.000;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=11.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.36;MQRankSum=-8.747;QD=2.37;ReadPosRankSum=1.617;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:187,27:0.13:214
chr7	142139337	.	C	CCA	422.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.000;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=9.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.49;MQRankSum=-8.481;QD=1.98;ReadPosRankSum=2.166;SOR=1.778;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:189,25:0.12:214
chr7	142139339	.	GA	G	395.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.000;DP=226;ExcessHet=3.0103;FS=9.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.72;MQRankSum=-8.653;QD=1.76;ReadPosRankSum=2.037;SOR=1.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:200,25:0.11:225
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chr7	142139349	.	G	A	206.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=0.000;DP=241;ExcessHet=3.0103;FS=16.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.17;MQRankSum=-8.427;QD=0.86;ReadPosRankSum=2.442;SOR=2.390;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:218,22:0.09:240
chr7	142139357	.	C	T	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.666;ClippingRankSum=0.000;DP=244;ExcessHet=3.0103;FS=19.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.24;MQRankSum=-8.506;QD=0.90;ReadPosRankSum=0.614;SOR=2.590;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:221,22:0.09:243
chr7	142143639	rs377139967	T	G	1773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=4.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQRankSum=-6.653;QD=13.54;ReadPosRankSum=1.895;SOR=0.224;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,50:0.38:131
chr7	142143646	rs369634458	G	A	1741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=6.926;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQRankSum=-6.942;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.275;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,49:0.36:136
chr7	142143675	.	A	C	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.560;ClippingRankSum=0.000;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=1.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQRankSum=-12.255;QD=3.50;ReadPosRankSum=-2.274;SOR=0.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,27:0.15:183
chr7	142143681	.	A	T	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.626;ClippingRankSum=0.000;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=10.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.33;MQRankSum=-13.487;QD=3.05;ReadPosRankSum=-3.706;SOR=0.161;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:169,24:0.12:193
chr7	142143684	.	C	T	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.000;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=15.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQRankSum=-13.120;QD=2.41;ReadPosRankSum=-3.418;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:167,18:0.10:185
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chr7	142143804	rs73742281	A	C	9451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=115;NR=168;PP=2965;SC=AGTAGTAAATAAGCCTCAGCC;SOR=1.117;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=283;TCF=115;TCR=168;TR=283;WE=142143812;WS=142143794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
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chr7	142144004	rs368631399	T	A	7299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=6.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.392;HP=2;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-14.066;NF=87;NR=102;PP=2962;ReadPosRankSum=1.779;SC=TGGGCCTTGATATCCACACAA;SOR=0.539;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=355;TCF=160;TCR=195;TR=189;WE=142144012;WS=142143983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,185:0.52:358
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chr7	142144025	.	C	A	2395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.798;ClippingRankSum=0.000;DP=336;ExcessHet=3.0103;FS=4.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.89;MQRankSum=-7.957;QD=7.19;ReadPosRankSum=0.611;SOR=0.472;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:223,110:0.33:333
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chr7	142144059	.	A	C	3519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=5.987;ClippingRankSum=0.000;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.584;HP=3;HapScore=1;MGOF=60;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-11.131;NF=28;NR=104;PP=2825;ReadPosRankSum=-3.167;SC=AGAAAAGGCCACACAGCACAG;SOR=0.762;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=248;TCF=55;TCR=193;TR=132;WE=142144067;WS=142144046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,117:0.49:237
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chr7	142144135	.	G	A	1437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.501;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.99;MQRankSum=-8.017;QD=18.92;ReadPosRankSum=-0.949;SOR=0.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,37:0.49:76
chr7	142144142	.	T	A	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.98;MQRankSum=-7.531;QD=19.56;ReadPosRankSum=-2.426;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
chr7	142149160	rs17217	T	G	4699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.634;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=3.119;NF=62;NR=86;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.269;SC=TCAGAGTCACTTGCTGTCCTC;SOR=0.119;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=154;TCF=62;TCR=92;TR=148;WE=142149168;WS=142149150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,158:0.98:161
chr7	142149349	rs140504979	A	C	3005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=69;PP=2482;SC=CTCACCTGCTACCAGGAGACA;SOR=2.409;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=19;TCR=69;TR=88;WE=142149357;WS=142149339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr7	142162001	rs73742263	A	C	8815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=145;NR=117;PP=2965;SC=AGCGGGAAATACTCTGTGGTT;SOR=0.937;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=263;TCF=145;TCR=118;TR=262;WE=142162009;WS=142161991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr7	142162148	rs71877	C	T	4732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=69;PP=2965;SC=ATATCCTGGGCACACTGCAGT;SOR=0.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=71;TCR=69;TR=139;WE=142162156;WS=142162138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr7	142162278	rs361443	C	T	5000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=95;PP=2965;SC=GGGGCTGGGCCTTGAAATCTA;SOR=1.369;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=55;TCR=95;TR=150;WE=142162286;WS=142162268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr7	142162306	rs361442	A	G	4151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=99;PP=2965;SC=GGCCCTGTCCAGGACCCACCT;SOR=2.356;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=31;TCR=99;TR=130;WE=142162314;WS=142162296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr7	142168348	.	G	A	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.681;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.64;MQRankSum=-10.172;QD=5.55;ReadPosRankSum=-0.832;SOR=0.438;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,20:0.19:106
chr7	142168351	.	T	C	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.000;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQRankSum=-10.255;QD=6.56;ReadPosRankSum=-0.851;SOR=0.506;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,22:0.20:108
chr7	142168362	.	A	T	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.163;ClippingRankSum=0.000;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=2.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQRankSum=-11.244;QD=7.47;ReadPosRankSum=0.413;SOR=1.454;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,31:0.22:141
chr7	142168365	.	C	T	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.056;ClippingRankSum=0.000;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=2.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.48;MQRankSum=-11.548;QD=7.53;ReadPosRankSum=0.408;SOR=1.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,34:0.23:148
chr7	142168371	.	C	T	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.215;ClippingRankSum=0.000;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.05;MQRankSum=-11.967;QD=7.88;ReadPosRankSum=-0.209;SOR=0.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,42:0.26:163
chr7	142168414	rs374005717	G	C	3154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FS=2.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.40;MQRankSum=-11.962;QD=9.77;ReadPosRankSum=-1.659;SOR=0.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:194,129:0.40:323
chr7	142168429	rs55634899	A	G	6837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-5.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=388;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.889;HP=2;HapScore=1;MGOF=55;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=6.181;NF=161;NR=102;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.383;SC=GCTCCAAGGCATTCACATTCA;SOR=0.769;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=344;TCF=199;TCR=145;TR=263;WE=142168437;WS=142168419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,279:0.72:385
chr7	142168452	rs361355	C	A	18622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=433;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=186;NR=188;PP=2965;SC=TCAGAGCTATCATTAGGGAAC;SOR=0.800;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=374;TCF=186;TCR=188;TR=374;WE=142168482;WS=142168442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,430:1.00:430
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chr7	142168474	rs377511417	G	A	6445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=419;ExcessHet=3.0103;FS=1.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQRankSum=-9.988;QD=15.46;ReadPosRankSum=-1.361;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:246,171:0.41:417
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chr7	142168540	.	C	G	1373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.909;ClippingRankSum=0.000;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=28.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQRankSum=-7.388;QD=6.42;ReadPosRankSum=-3.252;SOR=3.032;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:169,45:0.21:214
chr7	142168544	.	T	A	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.353;ClippingRankSum=0.000;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=31.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQRankSum=-8.466;QD=5.80;ReadPosRankSum=-2.610;SOR=3.945;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:164,34:0.17:198
chr7	142168662	rs73742240	C	T	4307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.57;MQRankSum=4.507;QD=37.79;ReadPosRankSum=0.757;SOR=0.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,104:0.91:114
chr7	142168662	.	CG	TC	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=29;MQ=50.17;NF=52;NR=44;PP=2944;QD=20;SC=GTGACTCCAGCGTCCACTGAG;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=112;TCF=62;TCR=50;TR=96;WE=142168686;WS=142168652;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:16,96:0.86:112
chr7	142168663	rs361352	G	C	5103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.49;QD=45.17;SOR=0.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr7	142168671	.	A	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.331;ClippingRankSum=0.000;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.72;MQRankSum=-4.529;QD=0.47;ReadPosRankSum=-0.241;SOR=0.525;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,10:0.09:116
chr7	142168677	.	TG	CA	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.910;ClippingRankSum=0.000;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=1.299;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.07;MQRankSum=-4.597;QD=0.25;ReadPosRankSum=0.523;SOR=0.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,10:0.08:123
chr7	142168818	.	C	T	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.639;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=2.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.91;MQRankSum=-1.585;QD=0.93;ReadPosRankSum=1.294;SOR=0.208;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,7:0.10:72
chr7	142168819	rs361350	G	A	1649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.979;HP=4;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.285;NF=12;NR=45;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.115;SC=ACAAAGCAGCGCCCAGCAGAG;SOR=1.483;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=14;TCR=51;TR=57;WE=142168847;WS=142168808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,59:0.89:66
chr7	142168825	.	C	A	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.226;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=2.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.03;MQRankSum=-1.097;QD=1.61;ReadPosRankSum=1.202;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,7:0.11:62
chr7	142168835	.	CA	TG	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.514;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.78;MQRankSum=-0.500;QD=3.22;ReadPosRankSum=-0.042;SOR=0.413;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,9:0.15:59
chr7	142168839	.	G	T	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.544;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.50;MQRankSum=-0.405;QD=3.43;ReadPosRankSum=0.107;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,9:0.16:58
chr7	142168856	rs73742239	C	G	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.168;NF=5;NR=32;PP=1649;ReadPosRankSum=-0.213;SC=GCACAGTGGGCCAGGCAGCAC;SOR=0.892;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=49;TCF=6;TCR=43;TR=37;WE=142168870;WS=142168846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,40:0.80:50
chr7	142168862	.	A	G	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-3.628;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.328;NF=1;NR=11;PP=486;ReadPosRankSum=-0.445;SC=TGGGCCAGGCAGCACTGCACC;SOR=0.476;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=12;WE=142168870;WS=142168846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,10:0.22:45
chr7	142176378	rs361393	A	G	6961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=156;NR=75;PP=2965;SC=TGCTCTGTGCACTGGATCTTC;SOR=1.659;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=232;TCF=156;TCR=76;TR=231;WE=142176386;WS=142176368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr7	142180547	rs375981942	C	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FS=5.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQRankSum=-17.338;QD=0.62;ReadPosRankSum=1.388;SOR=1.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:278,24:0.08:302
chr7	142180566	.	A	T	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.803;ClippingRankSum=0.000;DP=399;ExcessHet=3.0103;FS=22.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQRankSum=-19.831;QD=0.72;ReadPosRankSum=2.347;SOR=2.812;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:361,34:0.09:395
chr7	142180567	.	G	C	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DP=403;ExcessHet=3.0103;FS=22.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQRankSum=-19.931;QD=0.63;ReadPosRankSum=2.398;SOR=2.810;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:365,34:0.09:399
chr7	142180570	.	G	A	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=0.000;DP=424;ExcessHet=3.0103;FS=16.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQRankSum=-20.428;QD=0.70;ReadPosRankSum=2.739;SOR=2.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:385,34:0.08:419
chr7	142180573	.	T	C	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.023;ClippingRankSum=0.000;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=16.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQRankSum=-20.620;QD=1.06;ReadPosRankSum=2.075;SOR=2.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:391,36:0.08:427
chr7	142180574	.	G	C	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.395;ClippingRankSum=0.000;DP=430;ExcessHet=3.0103;FS=18.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQRankSum=-20.568;QD=1.21;ReadPosRankSum=1.103;SOR=3.139;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:386,39:0.09:425
chr7	142180578	.	G	A	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.954;ClippingRankSum=0.000;DP=457;ExcessHet=3.0103;FS=23.425;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQRankSum=-21.205;QD=1.74;ReadPosRankSum=-0.883;SOR=3.577;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:404,48:0.11:452
chr7	142180584	rs373875376	TCC	T	1172.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=22.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQRankSum=-21.710;QD=2.47;ReadPosRankSum=-2.203;SOR=3.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:419,55:0.12:474
chr7	142180591	.	TGG	T	1412.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.023;ClippingRankSum=0.000;DP=499;ExcessHet=3.0103;FS=14.464;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQRankSum=-22.151;QD=2.86;ReadPosRankSum=-3.753;SOR=2.476;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:430,64:0.13:494
chr7	142180593	.	G	GTTTT	1418.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.264;ClippingRankSum=0.000;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=16.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQRankSum=-21.969;QD=2.92;ReadPosRankSum=-3.580;SOR=2.509;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:422,64:0.13:486
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chr7	142180618	.	TG	CA	2740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.603;ClippingRankSum=0.000;DP=559;ExcessHet=3.0103;FS=12.457;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQRankSum=-21.407;QD=4.96;ReadPosRankSum=-1.176;SOR=1.773;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:460,93:0.17:553
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chr7	142197606	rs373222208	T	C	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=24.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQRankSum=-5.180;QD=7.34;ReadPosRankSum=-0.379;SOR=0.933;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,16:0.24:66
chr7	142197613	rs376535639	T	C	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=39.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQRankSum=-5.990;QD=6.07;ReadPosRankSum=0.441;SOR=1.761;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,15:0.21:70
chr7	142197835	rs17280	C	T	5376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.93;QD=31.82;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr7	142197835	.	CGGGAGACTGGGCA	TGGGAGACTGAACC,TGGGAGACTGGGCA	2962	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MMLQ=28;MQ=58.32;NF=1,78;NR=8,92;PP=350,2962;QD=47.0519860958;SC=ATCTTATATCCGGGAGACTGG;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=170;TCF=78;TCR=92;TR=9,170;WE=142197856;WS=142197825;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.05:170
chr7	142197897	rs17279	C	T	2870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.485;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.532;NF=27;NR=60;PP=1960;ReadPosRankSum=-0.204;SC=AATTTGAAAACAGAAGGAAAT;SOR=1.156;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=141;TCF=52;TCR=89;TR=87;WE=142197905;WS=142197887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,102:0.68:149
chr7	142197910	.	T	C	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.000;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=24.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=-8.225;QD=0.98;ReadPosRankSum=-0.668;SOR=2.233;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,14:0.10:144
chr7	142197912	.	G	A	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.601;ClippingRankSum=0.000;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=20.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQRankSum=-8.102;QD=1.43;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=2.239;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,14:0.10:140
chr7	142197913	.	A	G	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.611;ClippingRankSum=0.000;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=23.799;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=-8.397;QD=1.40;ReadPosRankSum=-0.569;SOR=2.393;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,15:0.11:141
chr7	142197921	.	A	ACT	306.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.425;ClippingRankSum=0.000;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=32.614;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQRankSum=-8.137;QD=2.27;ReadPosRankSum=0.086;SOR=2.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,17:0.13:135
chr7	142197923	.	A	G	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.000;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=30.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQRankSum=-7.782;QD=2.82;ReadPosRankSum=1.132;SOR=2.533;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,16:0.12:131
chr7	142197928	.	TCC	T	324.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=0.000;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=34.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQRankSum=-7.390;QD=2.56;ReadPosRankSum=1.243;SOR=2.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,17:0.13:127
chr7	142197931	.	A	T	345.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=33.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQRankSum=-7.162;QD=2.88;ReadPosRankSum=0.907;SOR=2.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,17:0.14:120
chr7	142197935	.	T	TGAG	354.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.000;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=36.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQRankSum=-7.195;QD=2.93;ReadPosRankSum=1.298;SOR=2.661;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,17:0.14:121
chr7	142197961	.	TGC	T	528.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=22.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQRankSum=-7.325;QD=4.20;ReadPosRankSum=0.767;SOR=1.317;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,21:0.17:126
chr7	142197965	.	C	CCA	612.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.000;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=25.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQRankSum=-7.259;QD=4.94;ReadPosRankSum=0.637;SOR=1.315;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,21:0.17:124
chr7	142197978	.	G	A	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.000;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=14.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQRankSum=-8.382;QD=5.30;ReadPosRankSum=-0.406;SOR=0.295;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,21:0.18:115
chr7	142197983	rs369385273	G	A	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=9.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQRankSum=-7.748;QD=5.27;ReadPosRankSum=-1.248;SOR=0.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,20:0.20:102
chr7	142197986	rs148941368	T	C	3410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=58;PP=2962;SC=GAGGGCCGCCTAGCAGAGGAG;SOR=1.585;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=30;TCR=59;TR=88;WE=142197994;WS=142197968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr7	142198003	rs377018956	G	A	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=1.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQRankSum=-7.479;QD=5.79;ReadPosRankSum=-0.807;SOR=0.380;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,16:0.20:81
chr7	142198022	.	A	C	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.364;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=1.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQRankSum=-7.575;QD=4.65;ReadPosRankSum=1.713;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,11:0.17:66
chr7	142198030	.	G	A	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQRankSum=-7.563;QD=3.88;ReadPosRankSum=1.698;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,10:0.17:59
chr7	142198040	.	C	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=1.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQRankSum=-6.944;QD=4.22;ReadPosRankSum=1.038;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,9:0.18:50
chr7	142198041	.	A	G	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.045;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=1.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQRankSum=-6.944;QD=4.28;ReadPosRankSum=0.988;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,9:0.18:50
chr7	142206473	rs11764626	G	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=5.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.539;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=355;ReadPosRankSum=1.715;SC=TCTAACTGCCGTTTCCGTGCA;SOR=0.146;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=79;TCF=71;TCR=8;TR=22;WE=142206481;WS=142206463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,21:0.30:71
chr7	142211193	rs6977669	C	T	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=209;ReadPosRankSum=-0.051;SC=CTGGGTCACCCTCCCACCGCT;SOR=0.770;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=12;WE=142211201;WS=142211183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr7	142223942	rs368751965	A	G	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQRankSum=-8.469;QD=4.32;ReadPosRankSum=-3.003;SOR=0.706;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,25:0.18:142
chr7	142223948	.	TAC	T	722.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.000;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQRankSum=-8.503;QD=5.05;ReadPosRankSum=-3.146;SOR=0.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,25:0.17:143
chr7	142223951	.	A	G	689.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=5.870;ClippingRankSum=0.000;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=1.879;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=-8.284;QD=4.69;ReadPosRankSum=-2.626;SOR=0.468;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,25:0.17:147
chr7	142223953	.	T	TTC	719.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.000;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=3.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQRankSum=-8.909;QD=4.96;ReadPosRankSum=-2.809;SOR=0.380;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,25:0.17:145
chr7	142223959	.	C	T	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.125;ClippingRankSum=0.000;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=11.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQRankSum=-9.399;QD=4.63;ReadPosRankSum=-1.999;SOR=0.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,26:0.18:147
chr7	142223962	.	G	C	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.348;ClippingRankSum=0.000;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=11.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQRankSum=-9.504;QD=4.56;ReadPosRankSum=-1.453;SOR=0.482;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,26:0.17:150
chr7	142223964	.	A	T	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.509;ClippingRankSum=0.000;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=10.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQRankSum=-9.469;QD=4.51;ReadPosRankSum=-1.289;SOR=0.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,26:0.17:149
chr7	142223967	rs361467	T	C	3163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.643;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.014;NF=52;NR=27;PP=1691;ReadPosRankSum=-0.906;SC=ATCCTGAAATTGAACCAGAAG;SOR=0.776;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=145;TCF=89;TCR=56;TR=79;WE=142223975;WS=142223957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,101:0.66:153
chr7	142223971	.	C	T	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=0.000;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=13.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=-9.645;QD=4.68;ReadPosRankSum=0.665;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,25:0.16:157
chr7	142223995	.	G	A	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=0.000;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=15.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQRankSum=-10.766;QD=4.05;ReadPosRankSum=2.958;SOR=1.073;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,29:0.16:180
chr7	142223997	.	A	T	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.000;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=13.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQRankSum=-10.635;QD=4.07;ReadPosRankSum=2.673;SOR=1.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:147,29:0.16:176
chr7	142224011	rs361466	G	A	3510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.318;HP=1;HapScore=4;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=4.490;NF=56;NR=36;PP=2859;ReadPosRankSum=1.024;SC=GCCGGTACCAGTAAAGGGTAG;SOR=0.998;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=172;TCF=102;TCR=70;TR=92;WE=142224032;WS=142223985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,93:0.52:179
chr7	142224020	.	A	ATT	536.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.312;ClippingRankSum=0.000;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=15.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=-10.797;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.675;SOR=1.403;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,24:0.14:174
chr7	142224021	.	GCA	G	509.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.522;ClippingRankSum=0.000;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=13.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQRankSum=-10.898;QD=2.83;ReadPosRankSum=0.255;SOR=1.313;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:157,23:0.13:180
chr7	142224024	rs361465	T	C	3369.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=4.325;NF=49;NR=41;PP=2859;ReadPosRankSum=3.086;SC=AAGGGTAGCATGGCCAGAAAT;SOR=0.727;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=169;TCF=95;TCR=74;TR=90;WE=142224032;WS=142223985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,91:0.52:176
chr7	142224040	.	CA	TG	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.692;ClippingRankSum=0.000;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=21.635;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQRankSum=-11.728;QD=0.81;ReadPosRankSum=-1.795;SOR=2.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:158,16:0.09:174
chr7	142231523	.	A	T	694	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=29;MQ=53.48;NF=8;NR=0;PP=694;QD=91.0964015684;SC=AACCTCAGTCATTCTAACTGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=8;WE=142231548;WS=142231513;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:27,8:0.23:35
chr7	142231625	rs17249	C	A	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=10.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.46;ReadPosRankSum=-0.436;SOR=1.820;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,28:0.30:92
chr7	142231668	.	G	A	506	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=55;MMLQ=25;MQ=58.22;NF=18;NR=22;PP=506;QD=13.5192803137;SC=TAGAGACACTGTAGCCATCTG;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=138;TCF=74;TCR=64;TR=40;WE=142231676;WS=142231658;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:98,40:0.29:138
chr7	142231694	.	T	C	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=3.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-2.905;QD=5.30;ReadPosRankSum=1.053;SOR=1.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,22:0.19:115
chr7	142231698	.	G	A	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.941;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=3.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-2.905;QD=6.40;ReadPosRankSum=2.052;SOR=1.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,22:0.19:115
chr7	142231701	rs17248	G	T	2521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.169;NF=42;NR=46;PP=1815;ReadPosRankSum=0.136;SC=TGTTAGTGTCGTGAACACCAT;SOR=0.763;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=123;TCF=57;TCR=66;TR=88;WE=142231711;WS=142231684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,79:0.69:115
chr7	142231703	.	G	T	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.420;ClippingRankSum=0.000;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=5.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=-3.239;QD=6.66;ReadPosRankSum=1.553;SOR=1.379;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,26:0.22:116
chr7	142231725	.	C	T	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.910;ClippingRankSum=0.000;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=-3.844;QD=1.61;ReadPosRankSum=1.145;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,20:0.17:119
chr7	142231740	rs372096379	T	C	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQRankSum=-4.230;QD=8.59;ReadPosRankSum=-0.216;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,29:0.26:112
chr7	142231744	rs376782927	A	G	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=-4.230;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.603;SOR=0.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,28:0.26:108
chr7	142231762	.	A	T	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.808;ClippingRankSum=0.000;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQRankSum=-4.503;QD=6.14;ReadPosRankSum=0.695;SOR=0.592;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,15:0.17:89
chr7	142231769	.	T	A	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.000;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=2.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQRankSum=-4.037;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.584;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,14:0.16:89
chr7	142231771	.	T	C	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.078;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=1.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=-4.134;QD=3.78;ReadPosRankSum=0.629;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,13:0.15:86
chr7	142231772	.	T	G	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=1.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=-4.245;QD=3.99;ReadPosRankSum=0.843;SOR=0.424;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,12:0.14:83
chr7	142231780	.	C	T	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=-4.941;QD=4.19;ReadPosRankSum=-0.290;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,11:0.14:76
chr7	142231781	.	A	C	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.951;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQRankSum=-4.904;QD=3.13;ReadPosRankSum=-0.594;SOR=0.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,11:0.15:75
chr7	142231793	.	A	AT	184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQRankSum=-4.904;QD=2.72;ReadPosRankSum=-2.032;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,10:0.15:68
chr7	142231795	.	G	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=4.422;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQRankSum=-5.487;QD=2.94;ReadPosRankSum=-1.295;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,8:0.12:66
chr7	142231796	.	CCA	C	157.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.257;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQRankSum=-5.487;QD=2.39;ReadPosRankSum=-1.488;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,8:0.12:66
chr7	142231800	.	G	GA	84.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.353;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=1.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQRankSum=-5.769;QD=1.34;ReadPosRankSum=-1.240;SOR=0.315;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,7:0.11:63
chr7	142231805	.	C	CTG	39.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.430;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=1.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=-4.687;QD=0.66;ReadPosRankSum=-0.536;SOR=1.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,5:0.08:60
chr7	142231806	.	C	G	45.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.901;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=5.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=-5.241;QD=0.78;ReadPosRankSum=-0.030;SOR=2.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,4:0.07:59
chr7	142232163	rs144354683	T	C	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=255;SC=TTCTCTTCCCTGCAGGAACAA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=142232171;WS=142232153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	142242442	rs17220	C	A	2862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-6.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.059;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=73;PP=2228;ReadPosRankSum=0.937;SC=AAACTGGGGCCCCTGACCCGG;SOR=1.328;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=159;TCF=58;TCR=101;TR=108;WE=142242450;WS=142242432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,110:0.69:159
chr7	142242670	rs17219	T	G	5724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=91;NR=91;PP=2965;SC=ATCTGAGAATTGGGCTGCTGT;SOR=0.715;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=182;TCF=91;TCR=91;TR=182;WE=142242678;WS=142242660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr7	142247125	rs361365	A	G	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=5.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.80;ReadPosRankSum=-0.699;SOR=0.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,55:0.66:83
chr7	142247134	rs361363	T	C	3398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=19;PP=1209;SC=CAGAGATACATGGCTGAGTCC;SOR=2.414;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=62;TCR=19;TR=80;WE=142247156;WS=142247115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr7	142247148	rs361361	C	T	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.470;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=2473;ReadPosRankSum=-1.173;SC=TGAGTCCCCCCGCTCTGTGCG;SOR=0.210;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=86;TCF=63;TCR=23;TR=57;WE=142247156;WS=142247115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,63:0.68:93
chr7	142247213	rs361360	G	T	2642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.486;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=39;PP=1989;ReadPosRankSum=1.380;SC=AGAACCGATCGTTGGGCAGCC;SOR=0.516;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=136;TCF=80;TCR=56;TR=85;WE=142247221;WS=142247203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,94:0.69:137
chr7	142247263	.	G	A	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.889;ClippingRankSum=0.000;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQRankSum=-10.375;QD=2.30;ReadPosRankSum=-4.429;SOR=0.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:165,23:0.12:188
chr7	142247270	rs375846702	TG	CA	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQRankSum=-10.347;QD=4.43;ReadPosRankSum=-3.913;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:170,33:0.16:203
chr7	142247288	.	T	C	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.171;ClippingRankSum=0.000;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=2;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.335;NF=54;NR=10;PP=1950;ReadPosRankSum=-1.959;SC=GCCCCAGGCTTTGTCGGTACC;SOR=0.808;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=213;TCF=129;TCR=84;TR=64;WE=142247296;WS=142247278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,58:0.27:216
chr7	142247347	rs361359	A	C	7368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FS=15.801;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQRankSum=-2.551;QD=28.90;ReadPosRankSum=0.260;SOR=1.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,207:0.81:255
chr7	142247347	.	AT	CC,CT	2962	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000,0.5000;HP=5;HapScore=1;MGOF=48;MMLQ=27;MQ=57.98;NF=27,60;NR=40,99;PP=2163,2962;QD=33.0816100726;SC=AGCTCTACATATTTTCCCTTC;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=209;TCF=83;TCR=126;TR=67,159;WE=142247356;WS=142247337;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.32:209
chr7	142247348	rs371674308	T	C	2887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FS=12.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=-5.514;QD=11.51;ReadPosRankSum=1.069;SOR=1.365;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,115:0.46:251
chr7	142247380	.	T	A	1451	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=5;HapScore=1;MGOF=62;MMLQ=28;MQ=58.4;NF=9;NR=41;PP=1451;QD=29.7154242509;SC=TTACTGGGGGTCTGGGAGACT;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=167;TCF=49;TCR=118;TR=50;WE=142247388;WS=142247370;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:117,50:0.30:167
chr7	142247417	.	AC	A	2964	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MMLQ=28;MQ=56.68;NF=5;NR=32;PP=2964;QD=20;SC=CTGCGGAGACACAAGTTGAGA;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=123;TCF=23;TCR=100;TR=37;WE=142247440;WS=142247386;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:86,37:0.30:123
chr7	142247455	.	T	TCACACACA	900.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-1.262;QD=15.27;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr7	142247529	.	GGC	G	99.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.473;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=15.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.99;MQRankSum=-6.470;QD=1.35;ReadPosRankSum=2.081;SOR=2.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,8:0.11:74
chr7	142247535	.	G	GAA	138.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=12.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.75;MQRankSum=-6.252;QD=1.90;ReadPosRankSum=2.642;SOR=2.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,8:0.11:73
chr7	142247538	.	CTG	C	39.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=1.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.03;MQRankSum=-4.047;QD=0.52;ReadPosRankSum=-0.517;SOR=1.301;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,6:0.08:76
chr7	142247539	.	T	C	279.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=15.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQRankSum=-6.074;QD=4.11;ReadPosRankSum=2.301;SOR=3.048;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,9:0.13:68
chr7	142247540	.	G	A	276.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=9.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.99;MQRankSum=-6.483;QD=3.79;ReadPosRankSum=0.708;SOR=1.943;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,12:0.16:73
chr7	142247541	.	C	CAT	54.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=3.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.87;MQRankSum=-4.176;QD=0.74;ReadPosRankSum=-0.638;SOR=1.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,7:0.09:74
chr7	142247546	.	C	A	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=13.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.53;MQRankSum=-6.176;QD=5.01;ReadPosRankSum=0.635;SOR=2.286;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,14:0.18:77
chr7	142247554	rs10265119	C	G	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.868;HP=1;HapScore=4;MGOF=55;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.656;NF=27;NR=20;PP=673;ReadPosRankSum=-1.269;SC=AGCAGAGGAGCCTGGTGCCCA;SOR=0.713;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=88;TCF=48;TCR=40;TR=47;WE=142247579;WS=142247520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,38:0.50:76
chr7	142247567	rs372792593	A	G	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=19.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.56;MQRankSum=-7.684;QD=18.78;ReadPosRankSum=-1.204;SOR=0.819;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,37:0.48:77
chr7	142247571	rs376050671	A	G	1483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=19.391;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.37;MQRankSum=-7.838;QD=18.78;ReadPosRankSum=-1.526;SOR=0.470;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,40:0.51:79
chr7	142247605	rs370122363	G	A	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.275;HP=2;HapScore=1;MGOF=79;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.109;NF=9;NR=16;PP=363;ReadPosRankSum=2.371;SC=CCAGATCAGGGTCACTGTGAG;SOR=0.255;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=81;TCF=24;TCR=57;TR=25;WE=142247613;WS=142247595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,26:0.32:82
chr7	142250680	rs361440	G	A	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.612;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=3;PP=840;ReadPosRankSum=1.223;SC=TGTACAGAGAGGAGATGGCTG;SOR=0.262;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=51;TCF=48;TCR=3;TR=36;WE=142250688;WS=142250670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,37:0.71:52
chr7	142250938	rs361439	T	G	2824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=46;PP=2246;ReadPosRankSum=1.386;SC=AGTGTCATGCTCCGTCCTGCT;SOR=0.250;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=93;TCF=45;TCR=48;TR=91;WE=142250946;WS=142250928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,93:0.99:94
chr7	142250988	rs361437	G	A	3754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=49;PP=2965;SC=GATCCCAGCAGTCACTGGACC;SOR=0.984;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=63;TCR=49;TR=112;WE=142250996;WS=142250978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr7	142251132	rs361436	G	T	2377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=53;PP=1999;SC=GGAGCCTGATGCTCATGGCAG;SOR=2.206;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=18;TCR=53;TR=71;WE=142251140;WS=142251122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr7	142326607	rs17260	C	T	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=437;ReadPosRankSum=-0.696;SC=GGTCCTTTGTCTCCTGGGAGC;SOR=0.755;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=71;TCF=59;TCR=12;TR=26;WE=142326615;WS=142326597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,26:0.36:72
chr7	142326783	rs17262	A	G	2826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=52;PP=2138;ReadPosRankSum=-0.906;SC=CTCAGTCCCCAAAGTACCTGT;SOR=0.724;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=74;TCR=73;TR=105;WE=142326791;WS=142326773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,108:0.71:153
chr7	142326909	rs76454382	C	G	4959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=73;NR=74;PP=2965;SC=ACTACTCACACATAGTAAATG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=73;TCR=74;TR=147;WE=142326917;WS=142326899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr7	142334648	rs17210	A	T	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.799;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.311;NF=15;NR=1;PP=296;ReadPosRankSum=0.874;SC=ACATCCGAGCAGGGTTATCTG;SOR=0.180;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=50;TCF=48;TCR=2;TR=16;WE=142334656;WS=142334638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,16:0.31:52
chr7	142334744	rs17211	C	A	3375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.592;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=50;PP=2711;ReadPosRankSum=-0.681;SC=GTTCCCGAAACAGAGTCTCAT;SOR=0.387;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=193;TCF=124;TCR=69;TR=127;WE=142334752;WS=142334734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,128:0.65:196
chr7	142353577	.	C	CTTTGTTTTGT	2805.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=0.000;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=9.790;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.541;QD=26.98;ReadPosRankSum=1.112;SOR=1.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,69:0.66:104
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chr7	142378831	rs76429157	C	G	7978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=109;NR=126;PP=2965;SC=TTGTTATAGGCACAGGAAAGA;SOR=0.826;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=235;TCF=109;TCR=126;TR=235;WE=142378839;WS=142378821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr7	142423161	rs112325538	A	G	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=257;SC=AGGTGGAGACATTACAGAAAC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=142423169;WS=142423151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	142423289	rs17251	C	A	1473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=20;PP=1187;ReadPosRankSum=-1.191;SC=ACATAGGCAACTTTTGGCCTT;SOR=0.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=54;WE=142423297;WS=142423279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,55:0.71:77
chr7	142423562	rs62001054	C	T	2354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=38;PP=1838;SC=AATGTTGAGGCGACTGATAAG;SOR=0.855;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=36;TCR=38;TR=73;WE=142423570;WS=142423552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr7	142428611	rs361326	C	T	3202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=38;PP=2652;SC=CCTACTATTTCGAGGTCTTTT;SOR=1.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=55;TCR=38;TR=93;WE=142428619;WS=142428601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr7	142428626	rs361327	A	C	3479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=40;PP=2796;SC=TCTTTTATACAAAGCTCTTTT;SOR=1.127;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=60;TCR=40;TR=100;WE=142428634;WS=142428616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr7	142429001	rs17213	C	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.810;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=125;ReadPosRankSum=-2.083;SC=GCAGCACAGCCGCATCCTCTC;SOR=0.175;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=7;WE=142429009;WS=142428991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr7	142448199	rs112413030	GGGTGGAAA	G	1539.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=20;PP=2978;SC=TGTTAACACTGGGTGGAAAGG;SOR=2.649;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=23;WE=142448214;WS=142448189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr7	142458304	.	T	A	638	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=61;MMLQ=29;MQ=51.81;NF=12;NR=0;PP=638;QD=56.0642677123;SC=AGCCTCACTGTGCTTGTTAAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=12;WE=142458324;WS=142458294;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:21,12:0.36:33
chr7	142458316	.	A	T	638	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=61;MMLQ=28;MQ=51.71;NF=19;NR=2;PP=638;QD=32.036724407;SC=CTTGTTAAGGATTTCTAATTA;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=46;TCF=43;TCR=3;TR=21;WE=142458324;WS=142458294;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:25,21:0.46:46
chr7	142458371	rs367779270	T	C	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.031;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.360;NF=33;NR=13;PP=781;ReadPosRankSum=-0.973;SC=TAACATGCTATTGACTTGCCT;SOR=0.521;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=105;TCF=77;TCR=28;TR=46;WE=142458379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,16:0.21:76
chr7	142458437	rs372637371	C	T	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.54;MQRankSum=-3.512;QD=1.33;ReadPosRankSum=-1.189;SOR=0.562;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,16:0.12:136
chr7	142458451	rs111033566	A	T	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=80.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.88;MQRankSum=-8.314;QD=2.64;ReadPosRankSum=2.017;SOR=4.886;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,23:0.17:135
chr7	142458511	rs138464021	G	T	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQRankSum=-9.696;QD=2.47;ReadPosRankSum=-0.133;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,22:0.14:158
chr7	142458523	rs149246646	T	A	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQRankSum=-10.398;QD=1.52;ReadPosRankSum=0.273;SOR=0.792;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,17:0.11:160
chr7	142458526	rs144422014	AC	GG	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=0.998;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQRankSum=-10.720;QD=1.24;ReadPosRankSum=-0.026;SOR=0.891;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,16:0.10:159
chr7	142458531	rs147366981	C	T	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQRankSum=-10.892;QD=1.41;ReadPosRankSum=-0.815;SOR=0.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,15:0.10:153
chr7	142458666	rs372944704	G	A	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=5.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQRankSum=-5.626;QD=2.62;ReadPosRankSum=0.814;SOR=0.842;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,10:0.18:56
chr7	142458697	rs373299247	T	A	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.16;MQRankSum=-6.610;QD=10.21;ReadPosRankSum=-0.753;SOR=1.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,16:0.31:51
chr7	142458700	rs376748793	G	T	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.53;MQRankSum=-6.902;QD=9.36;ReadPosRankSum=0.174;SOR=0.769;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,16:0.29:55
chr7	142458719	rs373298203	G	A	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=1.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.82;MQRankSum=-4.390;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.500;SOR=0.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,12:0.19:62
chr7	142458737	rs370066365	C	G	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=7.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.77;MQRankSum=-5.189;QD=2.39;ReadPosRankSum=0.963;SOR=2.428;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,9:0.11:81
chr7	142458739	rs374137559	T	C	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=9.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQRankSum=-5.472;QD=2.36;ReadPosRankSum=-0.020;SOR=2.658;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,11:0.13:82
chr7	142458829	rs377669553	A	G	2412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=0.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQRankSum=-7.134;QD=11.89;ReadPosRankSum=1.853;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,70:0.34:203
chr7	142458837	rs370580835	A	T	2443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQRankSum=-7.449;QD=12.22;ReadPosRankSum=2.942;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,67:0.34:200
chr7	142458841	rs375181092	AT	A	2355.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.738;NF=24;NR=28;PP=2954;ReadPosRankSum=2.799;SC=GCAGGCAAGTATCTTTTGCTG;SOR=0.735;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=185;TCF=77;TCR=108;TR=52;WE=142458851;WS=142458819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,67:0.34:200
chr7	142458873	rs373388800	A	C	1890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=0.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQRankSum=-8.728;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.886;SOR=0.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,56:0.32:176
chr7	142458881	rs376074412	A	T	1916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=3.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQRankSum=-8.788;QD=11.62;ReadPosRankSum=-2.046;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,51:0.31:165
chr7	142458884	rs370405149	C	G	1712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=0.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQRankSum=-9.364;QD=10.38;ReadPosRankSum=-1.655;SOR=0.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,48:0.29:165
chr7	142458886	rs373808731	TT	AC	1697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=1.442;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQRankSum=-9.612;QD=10.35;ReadPosRankSum=-1.458;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,46:0.28:164
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chr7	142458902	.	G	C	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.269;ClippingRankSum=0.000;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=2.564;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.04;MQRankSum=-11.167;QD=8.68;ReadPosRankSum=-2.525;SOR=0.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,43:0.27:162
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chr7	142460495	.	A	C	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.838;ClippingRankSum=0.000;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=1.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQRankSum=-10.750;QD=1.47;ReadPosRankSum=2.532;SOR=0.972;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,11:0.09:117
chr7	142460503	.	T	C	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.235;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQRankSum=-10.070;QD=1.00;ReadPosRankSum=2.024;SOR=0.558;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,11:0.10:111
chr7	142460531	rs374907758	CA	C	122.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=2.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQRankSum=-7.217;QD=2.08;ReadPosRankSum=-1.407;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,8:0.14:59
chr7	142460556	rs374121411	C	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=2.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQRankSum=-5.792;QD=2.26;ReadPosRankSum=-0.551;SOR=0.175;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,5:0.10:50
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chr7	142468205	.	A	C	2941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.000;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQRankSum=-9.971;QD=18.27;ReadPosRankSum=-0.279;SOR=0.717;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,78:0.48:161
chr7	142468206	.	G	C	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.142;ClippingRankSum=0.000;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=10.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.47;MQRankSum=-6.930;QD=2.73;ReadPosRankSum=-0.341;SOR=0.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,22:0.14:162
chr7	142468213	.	A	G	2845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.680;ClippingRankSum=0.000;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.60;MQRankSum=-10.090;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.462;SOR=0.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,74:0.46:161
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chr7	142468221	.	T	A	1778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=0.000;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=6.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.72;MQRankSum=-5.673;QD=10.98;ReadPosRankSum=1.186;SOR=1.225;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,50:0.31:162
chr7	142468228	.	A	G	2445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.708;ClippingRankSum=0.000;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=2.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.92;MQRankSum=-10.491;QD=14.91;ReadPosRankSum=1.762;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,65:0.40:164
chr7	142468232	.	C	T	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.488;ClippingRankSum=0.000;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=14.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQRankSum=-7.377;QD=1.82;ReadPosRankSum=0.926;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,18:0.11:161
chr7	142468241	.	C	G	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.000;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=14.419;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQRankSum=-6.828;QD=0.73;ReadPosRankSum=1.839;SOR=1.103;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,14:0.09:159
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chr7	142470290	rs11769872	T	C	1627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=19;PP=1169;SC=GGAAGGAGGGTTAAGGAGCAT;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=31;TCR=19;TR=50;WE=142470298;WS=142470280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
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chr7	142470614	.	C	T	8413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.831;ClippingRankSum=0.000;DP=905;ExcessHet=3.0103;FS=2.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.48;MQRankSum=-3.987;QD=10.37;ReadPosRankSum=-0.726;SOR=0.491;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:569,242:0.30:811
chr7	142470645	rs368963025	T	C	15102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1064;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.944;HP=1;HapScore=1;MGOF=80;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-17.329;NF=228;NR=267;PP=2962;ReadPosRankSum=5.665;SC=AATACAACAGTTGGACTCTGG;SOR=0.494;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=951;TCF=492;TCR=459;TR=495;WE=142470654;WS=142470635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:463,502:0.52:965
chr7	142470646	rs375588069	T	C	2682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1060;ExcessHet=3.0103;FS=1.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.21;MQRankSum=-10.089;QD=2.79;ReadPosRankSum=5.001;SOR=0.573;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:763,199:0.21:962
chr7	142470683	.	C	CCT	2141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.127;ClippingRankSum=0.000;DP=858;ExcessHet=3.0103;FS=0.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.74;MQRankSum=-9.805;QD=2.85;ReadPosRankSum=-5.943;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:641,110:0.15:751
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chr7	142470686	.	T	C	5590.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=4.726;ClippingRankSum=0.000;DP=805;ExcessHet=3.0103;FS=1.322;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.62;MQRankSum=-11.890;QD=7.59;ReadPosRankSum=-0.330;SOR=0.876;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:551,186:0.25:737
chr7	142470687	.	G	A	5599.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-7.995;ClippingRankSum=0.000;DP=785;ExcessHet=3.0103;FS=1.319;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.57;MQRankSum=-11.872;QD=7.76;ReadPosRankSum=-1.238;SOR=0.819;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:539,183:0.25:722
chr7	142470691	rs10952531	G	C	11758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=730;ExcessHet=3.0103;FS=3.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.61;MQRankSum=17.580;QD=17.14;ReadPosRankSum=6.831;SOR=0.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:250,436:0.64:686
chr7	142470693	.	T	C	8979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.796;ClippingRankSum=0.000;DP=702;ExcessHet=3.0103;FS=5.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.68;MQRankSum=-17.972;QD=13.48;ReadPosRankSum=-6.942;SOR=1.084;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:437,229:0.34:666
chr7	142470694	.	G	A	4984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DP=680;ExcessHet=3.0103;FS=1.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.72;MQRankSum=-13.303;QD=7.69;ReadPosRankSum=-4.094;SOR=0.825;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:494,154:0.24:648
chr7	142470703	.	G	T	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=0.000;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=6.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQRankSum=-11.253;QD=0.79;ReadPosRankSum=-6.820;SOR=1.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:527,46:0.08:573
chr7	142470707	.	A	G	250.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=6.357;ClippingRankSum=0.000;DP=531;ExcessHet=3.0103;FS=5.283;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.98;MQRankSum=-11.535;QD=0.48;ReadPosRankSum=-5.809;SOR=1.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:494,31:0.06:525
chr7	142470708	rs375249350	C	T	2896.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-3.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=520;ExcessHet=3.0103;FS=5.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQRankSum=-15.502;QD=5.59;ReadPosRankSum=-6.661;SOR=1.222;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:427,91:0.18:518
chr7	142470709	.	A	G	4196.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=4.417;ClippingRankSum=0.000;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=9.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.14;MQRankSum=-20.594;QD=8.31;ReadPosRankSum=-8.722;SOR=1.626;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:395,110:0.22:505
chr7	142470726	.	A	G	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.717;ClippingRankSum=0.000;DP=350;ExcessHet=3.0103;FS=18.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQRankSum=-18.660;QD=2.04;ReadPosRankSum=-6.488;SOR=2.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:319,31:0.09:350
chr7	142470754	.	A	G	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.176;ClippingRankSum=0.000;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=3.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQRankSum=-15.184;QD=0.15;ReadPosRankSum=2.081;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:215,17:0.07:232
chr7	142470758	.	T	C	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.829;ClippingRankSum=0.000;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=3.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQRankSum=-14.947;QD=1.09;ReadPosRankSum=1.557;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:205,20:0.09:225
chr7	142470768	.	T	C	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.533;ClippingRankSum=0.000;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=3.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQRankSum=-14.514;QD=2.69;ReadPosRankSum=0.085;SOR=1.140;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:184,29:0.14:213
chr7	142470773	.	A	G	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.494;ClippingRankSum=0.000;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=1.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQRankSum=-14.257;QD=3.27;ReadPosRankSum=-0.225;SOR=1.118;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:173,33:0.16:206
chr7	142470789	rs368011190	C	T	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.64;MQRankSum=-13.389;QD=8.23;ReadPosRankSum=-0.800;SOR=0.858;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,54:0.27:197
chr7	142470821	rs371709048	C	A	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-7.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.707;HP=1;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-11.077;NF=0;NR=63;PP=1302;ReadPosRankSum=0.854;SC=TTGTCCTTCTCCTTCCCTCCA;SOR=1.390;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=156;TCF=1;TCR=155;TR=63;WE=142470829;WS=142470811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,54:0.36:150
chr7	142478608	rs73742439	G	A	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=1;PP=757;SC=TGCAGGAAAGGGCCGCTCTCC;SOR=6.518;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=142478616;WS=142478598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	142478755	rs73742441	T	C	4215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=49;PP=2965;SC=GGAATGGTGATCCTCACCTCA;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=82;TCR=49;TR=131;WE=142478763;WS=142478745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr7	142478771	rs201689354	A	AC	5050.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=51;PP=2967;SC=CCTCACAGACACTCCTCTCTG;SOR=1.082;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=63;TCR=57;TR=108;WE=142478779;WS=142478761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
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chr7	142478897	rs73742442	T	C	6930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=126;NR=92;PP=2965;SC=TCATGCCCTGTCTCAGGCCCC;SOR=1.018;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=219;TCF=126;TCR=93;TR=218;WE=142478905;WS=142478887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
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chr7	142479917	rs369591097	C	T	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=15.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.19;MQRankSum=-3.660;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.879;SOR=0.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,24:0.17:142
chr7	142479940	rs58649169	C	T	3158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-6.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=85.875;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=7.509;NF=60;NR=49;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.535;SC=ATGACAAGATCGTTGGGGGCT;SOR=0.001;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=153;TCF=104;TCR=49;TR=109;WE=142479962;WS=142479930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,110:0.73:151
chr7	142479954	rs201779716	C	T	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=38.535;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.421;NF=46;NR=9;PP=2185;ReadPosRankSum=-2.146;SC=GGGGGCTACACCTGTGAGGAG;SOR=3.212;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=154;TCF=99;TCR=55;TR=55;WE=142479962;WS=142479930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,50:0.35:143
chr7	142480002	rs199512312	C	A	1877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-6.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.980;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.619;NF=37;NR=49;PP=2962;ReadPosRankSum=3.169;SC=AATTCTGGCTCCCACTTCTGC;SOR=0.808;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=203;TCF=100;TCR=103;TR=86;WE=142480020;WS=142479992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,84:0.42:201
chr7	142480012	rs56146961	C	T	4077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.421;HP=3;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.937;NF=60;NR=55;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.573;SC=CCCACTTCTGCGGTGGCTCCC;SOR=0.563;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=202;TCF=95;TCR=107;TR=115;WE=142480020;WS=142479992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,117:0.58:200
chr7	142480034	rs10808019	C	A	2611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=24.709;HP=3;HapScore=2;MGOF=44;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=6.829;NF=49;NR=50;PP=2033;ReadPosRankSum=0.891;SC=CATCAGCGAACAGTGGGTGGT;SOR=0.144;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=189;TCF=70;TCR=119;TR=99;WE=142480042;WS=142480024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,97:0.54:180
chr7	142480067	rs201659809	C	T	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.976;HP=1;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.901;NF=4;NR=38;PP=2874;ReadPosRankSum=2.439;SC=CTGCTACAAGCCGTAAGTGTG;SOR=2.495;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=125;TCF=28;TCR=97;TR=42;WE=142480103;WS=142480057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,44:0.35:125
chr7	142480079	rs371397657	T	G	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=16.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.60;MQRankSum=-7.303;QD=9.01;ReadPosRankSum=3.531;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,28:0.28:100
chr7	142480083	.	A	C	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.785;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=20.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.77;MQRankSum=-6.744;QD=9.65;ReadPosRankSum=3.323;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,26:0.28:94
chr7	142480095	rs374574556	G	A	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.376;HP=3;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.853;NF=0;NR=22;PP=1780;ReadPosRankSum=-0.616;SC=TGACTGCAAAGCTCCCAGCCA;SOR=3.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=79;TCF=10;TCR=69;TR=22;WE=142480103;WS=142480057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,22:0.28:79
chr7	142480137	rs57353422	A	G	1623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.13;QD=43.89;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr7	142480141	rs55775033	C	G	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.08;QD=44.22;SOR=4.921;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	142480148	rs10808021	G	C	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.99;QD=44.14;SOR=4.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	142481229	.	GATT	G	97.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=0.000;DP=626;ExcessHet=3.0103;FS=8.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQRankSum=-22.796;QD=0.16;ReadPosRankSum=-4.492;SOR=2.228;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:582,43:0.07:625
chr7	142481234	rs57725689	T	C	19861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=618;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=357;NR=211;PP=2965;SC=AACAGGATTATTCTGAACAAT;SOR=1.341;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=593;TCF=368;TCR=225;TR=568;WE=142481242;WS=142481224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,617:1.00:617
chr7	142481239	rs199829700	A	G	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=623;ExcessHet=3.0103;FS=5.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQRankSum=-22.427;QD=0.32;ReadPosRankSum=-3.562;SOR=1.433;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:577,45:0.07:622
chr7	142481251	rs200856228	A	C	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=641;ExcessHet=3.0103;FS=2.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=-22.646;QD=0.99;ReadPosRankSum=-2.006;SOR=0.487;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:579,61:0.10:640
chr7	142481346	rs200370045	T	C	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FS=8.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.78;MQRankSum=-16.975;QD=0.70;ReadPosRankSum=-4.935;SOR=2.357;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:290,26:0.08:316
chr7	142481376	rs73740310	T	A	6545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=180;PP=2965;SC=CCCTGAGCTCTGGGGGTGAGT;SOR=7.669;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=183;TCF=3;TCR=180;TR=183;WE=142481384;WS=142481366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr7	142481807	rs4726591	C	T	5223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=95;NR=62;PP=2965;SC=AGTGCCTGGACGCTCCTGTGC;SOR=1.193;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=96;TCR=62;TR=157;WE=142481815;WS=142481797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr7	142481867	rs59320698	C	G	6867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=127;NR=71;PP=2965;SC=TTACCAGCAACATGTTCTGTG;SOR=1.410;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=128;TCR=72;TR=198;WE=142481875;WS=142481857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr7	142482184	rs73740312	A	C	1669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=26;PP=1477;SC=TCCATCTCTCAATAAAACTTG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=25;TCR=26;TR=51;WE=142482192;WS=142482174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr7	142494606	rs2071361	C	G	2953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=40;PP=2374;SC=GCTGAAGCCCCGGAACTGGGG;SOR=1.157;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=60;TCR=40;TR=100;WE=142494614;WS=142494596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr7	142495126	rs12532977	GG	AT	4813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=62;NR=26;PP=2184;SC=TGCATGCGGGGGTGCACCTCC;SOR=1.938;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=99;TCF=68;TCR=31;TR=88;WE=142495135;WS=142495116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr7	142495308	rs56352733	G	A	1804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=48;PP=1497;SC=CGCTCCTGGGGAAAGACTGGG;SOR=3.729;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=6;TCR=48;TR=54;WE=142495316;WS=142495298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr7	142498652	rs377324607	CAT	C	51.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.039;NF=18;NR=0;PP=629;ReadPosRankSum=-2.195;SC=CTCTCTCACACATACACAGAG;SOR=0.760;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=67;TCF=61;TCR=6;TR=18;WE=142498661;WS=142498642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,7:0.12:56
chr7	142498673	rs376425724	G	A	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.278;NF=25;NR=1;PP=2104;ReadPosRankSum=-2.016;SC=CCCCTACCAGGACCAGACAGC;SOR=0.632;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=94;TCF=81;TCR=13;TR=26;WE=142498716;WS=142498663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,14:0.16:85
chr7	142498687	rs1799887	T	C	3681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=87;NR=21;PP=2962;SC=AGACAGCTCTTAGAGCAACCC;SOR=2.595;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=110;TCF=89;TCR=21;TR=108;WE=142498716;WS=142498663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
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chr7	142498702	.	C	T	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.302;ClippingRankSum=0.000;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQRankSum=0.014;QD=6.59;ReadPosRankSum=0.348;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,27:0.22:123
chr7	142498705	.	ATT	A	902.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQRankSum=0.013;QD=7.00;ReadPosRankSum=0.144;SOR=0.865;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,29:0.22:129
chr7	142498708	.	A	ACC	905.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.079;ClippingRankSum=0.000;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=1.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQRankSum=0.013;QD=7.02;ReadPosRankSum=0.265;SOR=0.926;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,29:0.22:129
chr7	142498735	rs377360215	A	C	2353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=2.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQRankSum=0.008;QD=13.37;ReadPosRankSum=-2.489;SOR=0.903;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,64:0.36:176
chr7	142498738	rs370415932	C	G	2409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=1.983;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQRankSum=0.008;QD=13.24;ReadPosRankSum=-1.983;SOR=0.855;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,67:0.37:182
chr7	142498813	rs1042955	G	A	3421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.052;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=65;PP=2689;ReadPosRankSum=2.833;SC=CCACACTGGTGTGCCTGGCCA;SOR=0.457;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=225;TCF=120;TCR=105;TR=128;WE=142498821;WS=142498803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,131:0.57:231
chr7	142498833	.	A	T	3179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.223;ClippingRankSum=0.000;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=10.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;QD=14.86;ReadPosRankSum=1.328;SOR=1.239;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,83:0.39:214
chr7	142498837	rs1042957	C	T	3135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=11.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;QD=14.86;ReadPosRankSum=1.081;SOR=1.233;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,86:0.41:211
chr7	142498897	rs1042959	A	G	2836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.684;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=43;PP=2219;ReadPosRankSum=1.192;SC=GGGTCAGCACAGACCCGCAGC;SOR=1.106;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=260;TCF=156;TCR=104;TR=121;WE=142498905;WS=142498887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,125:0.46:269
chr7	142499071	rs1042960	T	C	2257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.258;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=83;PP=1669;ReadPosRankSum=-0.205;SC=GGGCCAAACCTGTCACCCAGA;SOR=1.128;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=144;TCF=21;TCR=123;TR=96;WE=142499079;WS=142499061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,97:0.66:147
chr7	142499729	rs3114480	T	C	1421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=42;PP=1190;SC=GACACAGGGGTGTGAGGGAGG;SOR=3.442;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=52;TCF=10;TCR=42;TR=49;WE=142499737;WS=142499719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr7	142499762	rs706	A	G	1361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=25;PP=1120;SC=GTGCACAGGTACCTACATGCT;SOR=1.312;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=40;WE=142499770;WS=142499752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr7	142500409	rs11327	T	G	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=750;SC=AATAAAAAATTGTGTGTTGGG;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=142500417;WS=142500399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr7	142510174	rs17270	C	T	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=274;ReadPosRankSum=2.182;SC=AAATATCCTCCACCCAGTCCC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=12;WE=142510182;WS=142510164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr7	142510309	rs17269	A	G	1839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.434;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=19;PP=1442;ReadPosRankSum=-0.824;SC=AGTCACTGAGAAGGAGCTTCT;SOR=0.378;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=91;TCF=65;TCR=26;TR=62;WE=142510317;WS=142510299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,63:0.68:93
chr7	142510350	rs17268	G	A	2285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.531;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=33;PP=1788;ReadPosRankSum=0.665;SC=CGGTCCTGGGGTCTGGAGGCT;SOR=0.554;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=122;TCF=75;TCR=47;TR=82;WE=142510358;WS=142510340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,85:0.66:128
chr7	142510446	rs17267	G	A	2104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=51;PP=1650;ReadPosRankSum=0.405;SC=GCAGCCTGTCGGTACCAGTAT;SOR=0.734;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=46;TCR=72;TR=84;WE=142510454;WS=142510436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,82:0.70:117
chr7	142562051	.	CCCT	C	3593.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=0.000;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.616;NF=31;NR=44;PP=2990;ReadPosRankSum=0.127;SC=CGAGAGCTTTCCCTCCTCCTC;SOR=0.683;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=145;TCF=61;TCR=84;TR=75;WE=142562061;WS=142562041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,91:0.74:123
chr7	142583330	rs17881456	A	C	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=32;PP=922;SC=AGCCTTGGGGACACATCAGCC;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=142583338;WS=142583320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	142605840	rs148222818	G	A	1719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.515;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=47;PP=1383;ReadPosRankSum=1.329;SC=AGAGGCTCTGGCTAGAGTCCC;SOR=1.763;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=79;TCF=19;TCR=60;TR=59;WE=142605848;WS=142605830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,61:0.75:81
chr7	142749953	rs11975892	C	T	3712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.076;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=68;PP=2888;ReadPosRankSum=0.342;SC=GCGACGTCATCAACCACTTCT;SOR=0.502;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=221;TCF=115;TCR=106;TR=135;WE=142749961;WS=142749943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,139:0.62:225
chr7	142836440	rs6959713	A	G	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=22;PP=1001;SC=AGATGGGGAAAGCACCCAGGT;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=33;WE=142836448;WS=142836430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr7	142961130	rs17164171	C	G	1824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;PP=1402;ReadPosRankSum=0.115;SC=TCGGCTCTTTCACTTTTCCAT;SOR=0.684;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=97;TCF=54;TCR=43;TR=64;WE=142961138;WS=142961120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,67:0.66:102
chr7	142991361	rs4647297	G	C	2518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.756;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=27;PP=2132;ReadPosRankSum=1.356;SC=AGATGGTCCTGTCTGCCTTCA;SOR=0.622;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=124;TCF=86;TCR=38;TR=87;WE=142991369;WS=142991351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,86:0.68:127
chr7	142997626	rs4647321	T	C	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.430;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=46;PP=1169;ReadPosRankSum=1.519;SC=ATATCCTGTTTTCAGGTCTCT;SOR=2.925;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=79;TCF=1;TCR=78;TR=46;WE=142997634;WS=142997616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,48:0.57:84
chr7	143016928	rs6962852	C	T	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=37;PP=1283;ReadPosRankSum=1.038;SC=CCAGTTCTACCGTGGACAGCA;SOR=0.689;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=88;TCF=33;TCR=55;TR=58;WE=143016936;WS=143016918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,65:0.69:94
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chr7	143017680	.	G	C	33	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=30;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=33;QD=16.9428031368;SC=CTCTCTCTCTGTCTCTACATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=4;WE=143017688;WS=143017678;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,4:0.36:11
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chr7	143020780	rs2272255	T	C	7865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=454;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.823;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=159;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.028;SC=CCCTCTGTGTTAGTTTCCCTC;SOR=0.843;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=440;TCF=195;TCR=245;TR=277;WE=143020788;WS=143020770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,284:0.63:449
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chr7	143029371	rs2367941	G	T	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=4;PP=537;SC=TCAAATATTGGTTTTTTGTGT;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=143029379;WS=143029361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	143036318	rs2272253	G	A	2248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.626;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=12;PP=1767;ReadPosRankSum=0.179;SC=GAGTTGAAAGGGTATTCCAAC;SOR=2.964;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=57;TCR=13;TR=68;WE=143036326;WS=143036308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,72:0.97:74
chr7	143036337	rs2272252	C	T	2493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.699;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=19;PP=1961;ReadPosRankSum=-0.791;SC=ACGCTTCTTTCTACTCCAGTT;SOR=2.064;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=74;TCF=54;TCR=20;TR=73;WE=143036345;WS=143036327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,77:0.99:78
chr7	143036548	rs6464542	T	A	4079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=42;PP=2965;SC=TTCTGAAAACTGAGAGCAAGG;SOR=1.426;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=77;TCR=42;TR=119;WE=143036556;WS=143036538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr7	143039311	rs940864	A	G	2903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=57;PP=2520;SC=CTGAGCTTAGAGTTAAAGTTT;SOR=1.450;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=29;TCR=57;TR=86;WE=143039319;WS=143039301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr7	143042552	rs10952548	G	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=127;ReadPosRankSum=1.434;SC=TCAGGAGTGCGGAGCGCGGTG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=143042560;WS=143042542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr7	143042983	rs45554138	A	G	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.976;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=31;ReadPosRankSum=-0.350;SC=GAGGGAGGGGAGAGTCTGGTA;SOR=0.223;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=6;WE=143042991;WS=143042973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr7	143043240	rs13438232	C	T	5459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=86;PP=2965;ReadPosRankSum=0.782;SC=CAGCTTCCTCCTTCCCTTGCT;SOR=0.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=81;TCR=87;TR=166;WE=143043248;WS=143043230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,175:0.99:177
chr7	143043377	rs56680997	C	G	1769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=48;PP=1414;ReadPosRankSum=0.974;SC=CCCAACTCACCCCTTGTGGGT;SOR=3.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=51;WE=143043385;WS=143043367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr7	143043607	rs2242492	G	C	1494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=1;PP=1221;SC=TTAGGCACTGGGTGGGGCCCC;SOR=6.229;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=42;WE=143043615;WS=143043597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr7	143043890	rs2242491	A	G	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.748;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=1691;ReadPosRankSum=0.309;SC=ATGATGAATGAAAAGGAGGCA;SOR=1.007;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=95;TCF=55;TCR=40;TR=36;WE=143043910;WS=143043880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,37:0.38:97
chr7	143043902	rs2242490	C	T	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.735;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=1691;ReadPosRankSum=1.492;SC=AAGGAGGCATCGGTGGTCCTG;SOR=0.972;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=97;TCF=56;TCR=41;TR=33;WE=143043910;WS=143043880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,34:0.34:101
chr7	143043939	rs2242489	T	C	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.598;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=781;ReadPosRankSum=-0.812;SC=TATTGTTTCATTGGGAGCCAT;SOR=0.490;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=123;TCF=83;TCR=40;TR=43;WE=143043947;WS=143043929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,43:0.34:127
chr7	143044169	.	A	T	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.993;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=129;ReadPosRankSum=-0.210;SC=GTGTTTTGAGAGGATGGAAAT;SOR=0.191;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=9;WE=143044177;WS=143044159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr7	143054585	rs6958357	A	G	1015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=28;PP=887;SC=GGGGTAGGAAAACATCTTAGT;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=31;WE=143054593;WS=143054575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	143078928	rs10808025	C	G	1337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=40;PP=1165;SC=GGGGGGCAGTCGTTTCGGGAA;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=40;WE=143078936;WS=143078918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	143079806	rs6464546	G	A	2051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=15;PP=1657;ReadPosRankSum=0.518;SC=AGGAAAAGCAGGGCTCAGGGC;SOR=0.723;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=93;TCF=73;TCR=20;TR=68;WE=143079814;WS=143079796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,70:0.72:97
chr7	143088526	rs1131885	T	C	1465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.827;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=14;PP=1083;ReadPosRankSum=-0.061;SC=TGCACCCTGATTGGGCATGGG;SOR=0.560;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=76;TCR=25;TR=56;WE=143088534;WS=143088516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,58:0.56:104
chr7	143088823	rs1804527	T	C	5036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=100;PP=2965;SC=CGGTTCGATATGGGATCCCAT;SOR=1.013;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=70;TCR=100;TR=170;WE=143088831;WS=143088813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr7	143088867	rs6967117	T	C	3948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=77;PP=2965;SC=CGAAGAGTCATCCTGTGGGAC;SOR=1.498;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=41;TCR=77;TR=118;WE=143088875;WS=143088857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
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chr7	143094635	rs45497499	A	G	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.235;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=7;PP=941;ReadPosRankSum=1.188;SC=GTGGTTGGGGAGGGGGCAGGA;SOR=0.446;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=54;TCR=12;TR=37;WE=143094643;WS=143094624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
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chr7	143632833	rs13229174	A	G	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.96;MQRankSum=1.430;NF=7;NR=38;PP=1029;ReadPosRankSum=0.634;SC=GCCCATGTGCACTAACAAGTT;SOR=0.910;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=66;TCF=11;TCR=55;TR=45;WE=143632841;WS=143632823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,45:0.66:68
chr7	143633157	rs13235235	T	C	2727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.584;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=61;PP=2146;ReadPosRankSum=-0.147;SC=CTCTGTCTTCTATGCCATTGT;SOR=0.771;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=171;TCF=68;TCR=103;TR=103;WE=143633165;WS=143633147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,104:0.60:172
chr7	143633297	rs984764	A	G	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.467;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=27;PP=718;ReadPosRankSum=0.934;SC=ACATTACTTTAAGAAGAAGCT;SOR=2.042;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=30;WE=143633305;WS=143633287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,31:0.65:48
chr7	143657801	rs2072166	A	G	2886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.011;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.349;NF=65;NR=47;PP=2086;ReadPosRankSum=-1.463;SC=CTCACCTCACAGTGGTTGCCC;SOR=0.368;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=170;TCF=104;TCR=66;TR=112;WE=143657809;WS=143657791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,117:0.67:175
chr7	143701516	rs7787378	C	T	3546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.885;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=50;PP=2769;ReadPosRankSum=-1.422;SC=GCTCTGCTTCCGCCTCGCTCT;SOR=0.563;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=185;TCF=111;TCR=74;TR=119;WE=143701524;WS=143701506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,125:0.65:192
chr7	143701884	rs728275	C	T	3853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.955;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=61;PP=2962;ReadPosRankSum=0.792;SC=TTATCCATGCCTTCAACATGA;SOR=0.612;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=206;TCF=101;TCR=105;TR=128;WE=143701892;WS=143701874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,134:0.63:213
chr7	143747870	rs2961144	A	G	4957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.073;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=119;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.827;SC=GTACATGGCTATCTGCCACCC;SOR=1.296;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=264;TCF=93;TCR=171;TR=175;WE=143747878;WS=143747860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,182:0.67:271
chr7	143748098	rs6464573	G	T	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.317;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.024;NF=10;NR=19;PP=595;ReadPosRankSum=-0.601;SC=CATCTTTGCTGCTTCAGTGTT;SOR=0.382;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=62;TCF=18;TCR=44;TR=29;WE=143748106;WS=143748088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr7	143748257	rs6464574	G	A	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.177;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.736;NF=44;NR=7;PP=1137;ReadPosRankSum=-0.209;SC=CTTTGGCAGCGCCATTGTCAT;SOR=1.659;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=71;TCF=59;TCR=12;TR=51;WE=143748265;WS=143748247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,50:0.71:70
chr7	143748364	rs4407791	T	C	2150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.541;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=47;PP=1718;ReadPosRankSum=1.201;SC=CCTTGATCTATAGCCTGAGGA;SOR=1.040;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=123;TCF=56;TCR=67;TR=80;WE=143748372;WS=143748354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,79:0.64:124
chr7	143771536	rs6951485	G	A	2081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.830;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=15;PP=1736;ReadPosRankSum=-1.368;SC=TGTGCTTGCAGCACGGTGCCC;SOR=0.891;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=118;TCF=91;TCR=27;TR=73;WE=143771544;WS=143771526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,73:0.60:121
chr7	143771937	rs2961135	G	C	3215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.560;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=69;PP=2529;ReadPosRankSum=-0.955;SC=GCTGGTGGGAGCCTTCTTTTC;SOR=0.553;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=146;TCF=51;TCR=95;TR=109;WE=143771945;WS=143771927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,115:0.75:153
chr7	143792991	rs34947817	G	A	1913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.643;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=23;PP=1516;ReadPosRankSum=0.876;SC=CCCAAGTCAAGCCATTCTCAA;SOR=0.303;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=115;TCF=83;TCR=32;TR=72;WE=143792999;WS=143792981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,73:0.61:119
chr7	143793162	rs34470072	A	G	1755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.613;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=51;PP=1305;ReadPosRankSum=-0.943;SC=CTGAGTGTGTAAGCATGGTTC;SOR=0.099;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=82;TCF=5;TCR=77;TR=56;WE=143793170;WS=143793152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,60:0.68:88
chr7	143806688	rs10230228	C	A	2560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=39;PP=2110;ReadPosRankSum=-0.155;SC=GGAAGGCAACCAGACATGGAT;SOR=0.744;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=80;TCR=57;TR=94;WE=143806696;WS=143806678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,95:0.68:139
chr7	143807304	rs10252253	T	C	2928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.578;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=54;PP=2335;ReadPosRankSum=-0.039;SC=GTCGGGCCTCTTTCCTTGATT;SOR=0.768;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=165;TCF=79;TCR=86;TR=101;WE=143807312;WS=143807294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,105:0.61:171
chr7	143807666	rs10249545	A	G	1072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.278;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=31;PP=871;ReadPosRankSum=0.729;SC=AATTTTGAATATATTTTGTAG;SOR=0.460;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=65;TCF=11;TCR=54;TR=39;WE=143807674;WS=143807656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,39:0.57:69
chr7	143826603	rs2961160	G	T	2375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.696;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.976;NF=37;NR=46;PP=1952;ReadPosRankSum=-1.261;SC=CGTTACAATAGCCTCATGAGC;SOR=0.592;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=129;TCF=56;TCR=73;TR=83;WE=143826611;WS=143826593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,84:0.65:129
chr7	143826697	rs2961161	C	G	1469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.612;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.023;NF=14;NR=40;PP=1155;ReadPosRankSum=0.526;SC=TCATCCTGAGCCTGCCCTTCT;SOR=1.230;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=76;TCF=21;TCR=55;TR=54;WE=143826705;WS=143826687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,55:0.68:81
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chr7	143839408	rs1919954	C	T	5924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-6.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.467;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=135;PP=2962;ReadPosRankSum=0.410;SC=GACCTATTTGCATTTCTCTTT;SOR=0.588;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=315;TCF=109;TCR=206;TR=210;WE=143839416;WS=143839398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,224:0.67:333
chr7	143839605	rs1919953	T	C	1682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.895;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.909;NF=35;NR=22;PP=1291;ReadPosRankSum=0.644;SC=TGCCGTTCTGTGGGCCCCGGG;SOR=0.223;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=85;TCF=58;TCR=27;TR=57;WE=143839613;WS=143839595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,62:0.67:93
chr7	143956181	rs201948019	A	C	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.48;MQRankSum=-1.204;QD=4.48;ReadPosRankSum=-0.151;SOR=0.138;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,19:0.27:70
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chr7	144015437	rs150229766	C	T	1164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.25;QD=43.14;SOR=6.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	144068163	rs146660641	T	C	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.08;QD=25.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr7	144068214	rs376311961	T	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=10.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.63;MQRankSum=-0.191;QD=1.43;ReadPosRankSum=0.819;SOR=0.050;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,10:0.18:57
chr7	144075749	rs1635079	A	G	1609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.901;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=5;PP=1335;ReadPosRankSum=-1.521;SC=AACAGCCCAAATCTGTCTCTA;SOR=0.249;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=86;TCF=80;TCR=6;TR=55;WE=144075757;WS=144075739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,55:0.63:87
chr7	144095600	rs2699503	A	G	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=31;PP=1223;SC=GAGAACTGGAAGGGTCCTGGC;SOR=1.436;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=18;TCR=31;TR=49;WE=144095608;WS=144095590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	144095730	rs11979528	C	T	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=10;PP=344;SC=GGGAGCTCCCCGTTCCTACCA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=144095738;WS=144095720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	144096456	rs11769787	C	T	1889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=33;PP=1525;SC=TCTTTAGTTGCCATTTTCCCC;SOR=0.950;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=26;TCR=33;TR=59;WE=144096464;WS=144096446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr7	144096598	rs11769847	C	T	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=29;PP=908;ReadPosRankSum=-0.673;SC=AGAATGAAGACTGTAGCTTTG;SOR=1.007;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=36;WE=144096606;WS=144096588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr7	144096839	rs757388	A	G	2285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=18;PP=1884;SC=AGAAAGAGGAAGAATTCTGAC;SOR=1.946;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=48;TCR=18;TR=66;WE=144096847;WS=144096829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr7	144098896	rs727712	T	C	2350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=20;PP=1833;SC=TTGAAAAATGTAGACAAATTT;SOR=1.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=70;WE=144098904;WS=144098886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr7	144098992	rs727714	G	A	2621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=41;PP=2108;SC=CCAGACACCAGGGGTATGAGT;SOR=0.766;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=41;TCR=41;TR=82;WE=144099000;WS=144098982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr7	144100874	rs375024030	ACGGGC	A	1357.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=1;NR=24;PP=1308;SC=TGCAGCCCGCACGGGCCGGGC;SOR=5.486;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=25;WE=144100886;WS=144100864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	144320214	rs17170295	G	T	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=208;ReadPosRankSum=-1.080;SC=AACACAAATTGTTTTCACATC;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=10;WE=144320222;WS=144320204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr7	144462951	rs3779087	C	T	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=6.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.64;ReadPosRankSum=1.627;SOR=1.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,12:0.22:54
chr7	144532829	rs111798915	A	AG	425.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=508;SC=TCCGGGACCCAGGAGCCAGCT;SOR=3.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=13;WE=144532837;WS=144532819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	144703163	rs35986454	T	G	3596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=74;PP=2884;SC=ACCTGCAGTCTGCCCTGAGCA;SOR=1.510;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=40;TCR=76;TR=114;WE=144703171;WS=144703153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr7	145692004	rs4726777	C	A	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=1.100;QD=11.14;ReadPosRankSum=-2.264;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr7	146805228	rs35167289	T	TG	251.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=267;ReadPosRankSum=-0.239;SC=TTATTTTTTTTTTTGTTTTAG;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=10;WE=146805236;WS=146805218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr7	146997203	rs2692185	T	A	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=4;PP=757;ReadPosRankSum=-0.209;SC=AATTTTAAGATAAAAATGACT;SOR=0.700;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=119;TCF=106;TCR=13;TR=42;WE=146997211;WS=146997193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,43:0.35:123
chr7	147074998	rs6945709	G	T	1625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=8;PP=1257;ReadPosRankSum=1.380;SC=TTATAAAAATGTTTAATTGGG;SOR=1.942;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=48;WE=147075006;WS=147074988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr7	147092861	rs34592169	G	A	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.16;ReadPosRankSum=0.139;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,35:0.26:136
chr7	147183278	rs4015951	CAAA	C	967.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=417;SC=GTCATTTCTCCAAAAAAAAAA;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=20;WE=147183288;WS=147183268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	147259374	rs2074715	A	G	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=55;ReadPosRankSum=0.167;SC=TTTATGTTTTATGAAGATGCT;SOR=0.193;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=5;WE=147259382;WS=147259364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr7	147335933	rs113545270	C	CT	561.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=8.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=-1.252;QD=7.91;ReadPosRankSum=-3.420;SOR=1.429;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,35:0.49:71
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chr7	147674948	rs10240482	A	T	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=629;ReadPosRankSum=-1.478;SC=TTTCCCTGTGATCCAGGAGGA;SOR=0.711;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=33;WE=147674956;WS=147674938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,36:0.61:59
chr7	147674978	rs10240503	A	G	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.356;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=525;ReadPosRankSum=0.884;SC=GTTTCTTATCATACAAAGATC;SOR=0.391;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=57;TCF=37;TCR=20;TR=35;WE=147674986;WS=147674968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,35:0.58:60
chr7	147963925	rs3801974	C	G	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=1;PP=715;SC=CACTTACCATCCTCAGATTTT;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=147963933;WS=147963915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	147963983	rs10248273	G	C	2409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=4;PP=1870;SC=TTTTCTCGGGGTGGTGTTTTA;SOR=4.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=64;TCR=4;TR=68;WE=147963991;WS=147963973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr7	147964016	rs3801975	A	G	3974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=25;PP=2965;SC=ATGAAATAAGATATCAGAAAA;SOR=2.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=89;TCR=25;TR=114;WE=147964024;WS=147964006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr7	147964091	rs3801976	G	A	6707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=83;PP=2965;SC=GTAGAGACGTGCTTCTAAAAG;SOR=1.136;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=204;TCF=121;TCR=83;TR=204;WE=147964099;WS=147964081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr7	148080647	rs1637841	T	G	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=0;PP=801;SC=GAAACCTAAATGTAAGCTTTG;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=148080655;WS=148080637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	148080726	rs77706740	C	A	2318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.154;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=17;PP=1834;ReadPosRankSum=-1.988;SC=ATTTTCATTTCTTTTTTTCTT;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=100;TCF=78;TCR=22;TR=81;WE=148080734;WS=148080716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,84:0.80:105
chr7	148106465	.	C	CTCTT	2974	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.17;NF=51;NR=10;PP=2974;QD=20;SC=TGACACTTGACTCTTTCTTTC;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=144;TCF=112;TCR=32;TR=61;WE=148106498;WS=148106455;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:83,61:0.42:144
chr7	148106475	rs72268642	C	CTT	4391.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=1.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=1.577;QD=27.97;ReadPosRankSum=-0.641;SOR=0.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,106:0.68:157
chr7	148106477	.	C	G	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.11;NF=75;NR=30;PP=2962;QD=20;SC=CTTTCTTTCTCTACAGCCAGT;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=155;TCF=116;TCR=39;TR=105;WE=148106498;WS=148106455;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:50,105:0.68:155
chr7	148106477	.	C	CTG	4817.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.796;ClippingRankSum=0.000;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=1.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=0.714;QD=29.92;ReadPosRankSum=-0.466;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,108:0.67:161
chr7	148106490	rs9648691	G	A	5021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.331;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.710;NF=85;NR=41;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.607;SC=CAGCCAGTGCGGATTTTCCAT;SOR=0.565;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=186;TCF=130;TCR=56;TR=126;WE=148106498;WS=148106455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,129:0.67:192
chr7	148106654	rs13241417	T	C	1610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=50;PP=1287;ReadPosRankSum=0.428;SC=AAAAAAAGTTTTCTAGGTTTT;SOR=0.375;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=88;TCF=1;TCR=87;TR=51;WE=148106662;WS=148106644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,54:0.58:93
chr7	148131742	rs2108673	G	A	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.720;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=30;PP=957;ReadPosRankSum=0.303;SC=GAAACCAACCGGCTGTCCTCC;SOR=1.230;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=40;WE=148131750;WS=148131732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,42:0.71:59
chr7	148143136	rs2530301	A	G	4402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.039;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=72;PP=2965;ReadPosRankSum=1.830;SC=CCTGGGCCTCACGCCAGGGTC;SOR=0.265;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=73;TCR=73;TR=145;WE=148143144;WS=148143126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,152:0.99:153
chr7	148311115	rs11434056	G	GT	1360.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=1325;ReadPosRankSum=0.006;SC=CAATTTGTTTGTTTGTTTGTT;SOR=0.752;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=35;TCR=24;TR=34;WE=148311123;WS=148311105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,49:0.67:73
chr7	148311240	rs73463436	C	T	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=812;ReadPosRankSum=0.037;SC=CAAGGTCCCACGGATGCCCAG;SOR=0.646;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=77;TCF=39;TCR=38;TR=39;WE=148311248;WS=148311230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,40:0.51:79
chr7	148311398	.	G	T	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.320;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=363;ReadPosRankSum=0.134;SC=CGTAAGCTCCGAAGTGTCTTA;SOR=2.043;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=69;TCF=20;TCR=49;TR=21;WE=148311406;WS=148311388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,20:0.29:70
chr7	148312382	rs6962115	T	G	2969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.904;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=24;PP=2364;ReadPosRankSum=0.538;SC=AGGTAAATCATCCTGAGATAA;SOR=1.289;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=165;TCF=121;TCR=44;TR=103;WE=148312390;WS=148312372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,106:0.63:168
chr7	148312520	rs6962292	T	C	2571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=71;PP=1991;ReadPosRankSum=-0.687;SC=AAGAGTCACATCTCTAAATTT;SOR=0.736;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=19;TCR=104;TR=84;WE=148312528;WS=148312510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,89:0.70:128
chr7	148427470	rs17625893	A	T	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=157;ReadPosRankSum=-1.217;SC=ATGTAAAATAATCGCAGGGTT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=148427478;WS=148427460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr7	148463860	rs1014095	T	C	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=352;ReadPosRankSum=0.654;SC=TAATTATCTGTAGTTTTGATA;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=18;WE=148463868;WS=148463850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr7	148464675	rs6956231	T	G	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=1;PP=959;ReadPosRankSum=0.706;SC=TGCAAAATTTTTTTCAGTGCA;SOR=0.414;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=70;TCF=69;TCR=1;TR=41;WE=148464683;WS=148464665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,43:0.60:72
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chr7	148504854	rs55877618	A	AGACTT	1955.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.976;NF=8;NR=29;PP=2035;ReadPosRankSum=0.031;SC=ACATGTGCTGAGACTTAACAC;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=62;TCF=14;TCR=48;TR=37;WE=148504862;WS=148504844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,49:0.69:71
chr7	148504906	.	TAAAA	T	286.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=2.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQRankSum=0.859;QD=14.34;ReadPosRankSum=1.326;SOR=1.659;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
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chr7	148507534	rs146223228	C	CT	841.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.070;NF=3;NR=29;PP=1136;ReadPosRankSum=0.595;SC=GGAGAAAATTCTTTTGGATAA;SOR=0.593;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=32;WE=148507542;WS=148507524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,33:0.61:54
chr7	148508833	rs2072407	A	G	2284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=61;PP=1843;ReadPosRankSum=-0.192;SC=AAACACAATCACATCATCAAA;SOR=0.650;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=32;TCR=90;TR=83;WE=148508841;WS=148508823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,85:0.67:126
chr7	148543693	rs3214332	TA	T	1783.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.856;NF=5;NR=77;PP=1021;ReadPosRankSum=0.060;SC=AACATACTCTTAAAAAAAAAA;SOR=0.618;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=140;TCF=13;TCR=127;TR=82;WE=148543701;WS=148543683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,84:0.68:123
chr7	148638572	rs2035216	G	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=119;ReadPosRankSum=0.631;SC=AGACTCACAGGATAACACAGT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=148638580;WS=148638562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr7	148705221	rs2306172	A	G	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=1;PP=1262;SC=CGGGGTGTCCAGGGCTGGCAT;SOR=6.666;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=55;TCF=54;TCR=1;TR=54;WE=148705229;WS=148705211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr7	148778355	rs34939910	C	A	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.377;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.261;NF=1;NR=9;PP=189;ReadPosRankSum=-0.127;SC=TGGTGAAACCCCACCTCTACT;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=10;WE=148778363;WS=148778345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr7	148801091	rs11525060	G	A	3444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.856;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=69;PP=2720;ReadPosRankSum=-0.754;SC=GGCTTTTCAGGTTTCCCTTGA;SOR=0.827;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=211;TCF=101;TCR=110;TR=125;WE=148801099;WS=148801081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,127:0.58:218
chr7	148801658	rs1137432	C	T	2642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.296;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=40;PP=2093;ReadPosRankSum=-0.131;SC=TCCCAATGTGCTGCAGCCCGT;SOR=0.830;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=158;TCF=92;TCR=66;TR=99;WE=148801666;WS=148801648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,98:0.62:158
chr7	148809451	rs6464938	T	C	3558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=105;PP=2913;SC=TTTGGCCGGGTGTGGTGGCTC;SOR=3.506;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=17;TCR=105;TR=122;WE=148809459;WS=148809441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr7	148823366	rs10251621	A	G	1843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.679;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=55;PP=1478;ReadPosRankSum=-1.266;SC=GCCCCAACCCAACTCCCAGGT;SOR=1.333;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=92;TCF=12;TCR=80;TR=62;WE=148823374;WS=148823356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,65:0.67:97
chr7	148844884	rs2693317	G	A	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=17;PP=598;ReadPosRankSum=-1.019;SC=CGCGAGTGTTGTGAGCCCCCG;SOR=0.716;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=115;TCF=68;TCR=47;TR=42;WE=148844892;WS=148844874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,43:0.37:115
chr7	148848257	rs917122	T	C	1959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.330;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=16;PP=1494;ReadPosRankSum=-0.908;SC=TTAGAAACCATTGGTATGTGG;SOR=1.820;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=110;TCF=79;TCR=31;TR=71;WE=148848265;WS=148848247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,73:0.66:111
chr7	148848358	rs917123	G	A	2159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.271;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=52;PP=1648;ReadPosRankSum=-1.426;SC=ATTCAAGGCCGGAGGTTAGCT;SOR=1.329;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=116;TCF=41;TCR=75;TR=76;WE=148848366;WS=148848348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,79:0.65:121
chr7	148851213	rs917124	G	A	1911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.971;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=33;PP=1474;ReadPosRankSum=0.080;SC=TCCTACACCTGGAAGGTCGGA;SOR=0.617;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=105;TCF=52;TCR=53;TR=71;WE=148851221;WS=148851203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,73:0.66:111
chr7	148863414	rs71990250	CAGCTCCA	C	2914.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.872;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=52;PP=2966;ReadPosRankSum=0.341;SC=GAAGTGACAGCAGCTCCAAGA;SOR=0.956;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=110;TCF=14;TCR=96;TR=58;WE=148863428;WS=148863404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,74:0.59:126
chr7	148873497	rs1568944	T	A	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.457;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=6;PP=1543;ReadPosRankSum=0.427;SC=GCAAACCAACTTGATTATCTT;SOR=0.416;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=108;TCF=100;TCR=8;TR=72;WE=148873505;WS=148873487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,73:0.67:109
chr7	148875632	rs1202461	T	A	359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=272;SC=CCTTCTGCTGTATTTCTGATC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=148875640;WS=148875626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr7	148903984	rs12537763	G	A	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.597;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=34;PP=814;ReadPosRankSum=0.759;SC=ATTTGTCCACGTTAGCACCGC;SOR=0.275;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=37;WE=148903992;WS=148903974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,38:0.72:53
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chr7	148979323	rs61735518	C	T	3507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.284;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=83;PP=2800;ReadPosRankSum=-0.607;SC=ACCACCTGGCCGTGCACATGC;SOR=0.442;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=175;TCF=54;TCR=121;TR=123;WE=148979331;WS=148979313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,125:0.71:175
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chr7	148991712	rs13236978	A	G	1490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=30;PP=1089;SC=AGCTTCGGCCAGAAGGAGCTC;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=47;WE=148991720;WS=148991702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
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chr7	149174265	rs4725816	G	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.231;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=279;ReadPosRankSum=0.163;SC=TGGGCACGAGGACCCAACCTC;SOR=0.223;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=14;WE=149174273;WS=149174255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr7	149174542	rs4727073	G	A	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=231;ReadPosRankSum=0.850;SC=TTCTAAAGTTGTCAGGCCGGA;SOR=0.299;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=13;WE=149174550;WS=149174532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr7	149190098	rs13311996	T	C	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.336;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=846;ReadPosRankSum=0.152;SC=TTTGCCACGTTCCAGTCAAAG;SOR=0.818;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=157;TCF=77;TCR=80;TR=47;WE=149190106;WS=149190088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,49:0.30:161
chr7	149256086	rs1978186	C	T	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.313;NF=0;NR=21;PP=488;ReadPosRankSum=0.103;SC=GGCCAGGAGTCTGAGAGCAGC;SOR=2.235;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=21;WE=149256094;WS=149256076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,25:0.76:33
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chr7	149416771	rs10258658	C	T	1485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.770;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=17;PP=1097;ReadPosRankSum=0.985;SC=TGGGTAAGGACGGGAGGGAGC;SOR=0.307;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=87;TCF=63;TCR=24;TR=55;WE=149416779;WS=149416761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,57:0.64:89
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chr7	149419635	rs75701347	T	G	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.142;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=288;ReadPosRankSum=0.364;SC=GAGAGGGACCTCAGAGGCCGG;SOR=2.179;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=14;WE=149419643;WS=149419625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr7	149419721	rs10240931	G	C	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=588;ReadPosRankSum=0.864;SC=ATGCTGCTCCGCCGCCTGGGC;SOR=0.963;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=25;WE=149419729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr7	149420820	rs11462346	C	CT	1756.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.622;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.866;NF=18;NR=30;PP=1864;ReadPosRankSum=0.147;SC=TTCCTTTTTCCTTAGTGAAGA;SOR=0.611;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=85;TCF=40;TCR=45;TR=48;WE=149420828;WS=149420810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,60:0.58:103
chr7	149421773	rs7791608	A	G	1734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.416;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=34;PP=1274;ReadPosRankSum=-1.448;SC=CCTCCTCCCCATCCTGATCTT;SOR=0.497;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=112;TCF=59;TCR=53;TR=69;WE=149421781;WS=149421763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,73:0.62:118
chr7	149425872	rs17171280	T	C	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=265;ReadPosRankSum=-0.867;SC=CATGGTGCTCTGGAAACAGAC;SOR=1.358;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=16;WE=149425880;WS=149425862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr7	149426305	rs11424737	G	GC	2770.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=14;PP=2720;SC=CTGCGAGTCAGCCGTCTCGGG;SOR=2.690;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=66;TCF=51;TCR=15;TR=64;WE=149426313;WS=149426295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr7	149427409	rs709065	T	G	1988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=6.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.865;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=11;PP=1599;ReadPosRankSum=1.132;SC=CAGAGCCTGATCTCTGGAAGC;SOR=1.393;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=111;TCF=89;TCR=22;TR=66;WE=149427417;WS=149427399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,68:0.59:115
chr7	149427728	rs6966081	T	C	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=332;ReadPosRankSum=-0.629;SC=ACTGGATCCTTTGAGTCCTGC;SOR=0.120;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=15;WE=149427736;WS=149427718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr7	149428602	rs55727837	G	T	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=260;ReadPosRankSum=0.207;SC=GGCGGGCCCTGCCACCAGAAT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=14;WE=149428610;WS=149428592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr7	149430367	rs73725583	C	T	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=21;PP=912;ReadPosRankSum=0.690;SC=CCGGAGCTGCCCCCTCCGGAA;SOR=0.702;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=70;TCF=35;TCR=35;TR=44;WE=149430375;WS=149430357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,46:0.65:71
chr7	149462337	rs855667	G	A	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=263;ReadPosRankSum=0.153;SC=GGGGCACCACGGGATCGGATC;SOR=0.307;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=13;WE=149462345;WS=149462327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr7	149462523	rs855668	C	G	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=0.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.862;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=534;ReadPosRankSum=-1.092;SC=AGTCGGAGCACGCGAAAGGCT;SOR=0.628;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=42;TCF=21;TCR=21;TR=28;WE=149462531;WS=149462513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr7	149462621	rs6965332	T	C	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=11;PP=956;ReadPosRankSum=-1.335;SC=GGGCCGGCCGTCTGGTGCACC;SOR=0.787;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=50;TCR=16;TR=46;WE=149462629;WS=149462611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,45:0.69:65
chr7	149473261	rs73725602	C	T	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=223;ReadPosRankSum=1.060;SC=CATCAGACTCCGTGCCCCCCA;SOR=0.148;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=11;WE=149473269;WS=149473251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr7	149474393	rs709061	A	G	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=248;ReadPosRankSum=-1.038;SC=CCCTGGGGACAAAGCTGGTGG;SOR=0.892;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=15;WE=149474401;WS=149474383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr7	149476666	rs57553723	G	GC	1546.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=26;PP=1792;SC=GGCTGTGACAGCCCCTGGGGC;SOR=0.776;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=45;WE=149476674;WS=149476656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr7	149480903	rs113587880	CA	C	480.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.275;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=442;ReadPosRankSum=1.238;SC=TGCAAAGGCACAGGGGGTGTG;SOR=2.368;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=13;WE=149480911;WS=149480893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr7	149482764	rs75029939	C	T	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=626;ReadPosRankSum=-1.107;SC=GTGGGGCCAGCGGTCTCACCT;SOR=0.880;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=40;TCF=20;TCR=20;TR=31;WE=149482772;WS=149482754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,33:0.77:43
chr7	149483053	rs855684	T	C	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.397;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=250;ReadPosRankSum=-0.433;SC=AGTCTAATGATGTGCCCAAGG;SOR=0.033;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=14;WE=149483061;WS=149483043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr7	149484590	rs10262505	T	C	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=604;ReadPosRankSum=3.038;SC=CTGAACTGGCTGCCCACTCCT;SOR=0.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=20;TCR=23;TR=31;WE=149484598;WS=149484580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,31:0.72:43
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chr7	149486574	rs855694	G	C	1015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=9;PP=921;SC=TCACCTCCCCGCTCCTTTGCC;SOR=1.839;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=149486582;WS=149486564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr7	149487319	rs2579591	C	G	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=334;ReadPosRankSum=-0.791;SC=GGCGCGGTTGCGGGTGGGAGG;SOR=1.179;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=16;WE=149487327;WS=149487309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,18:0.82:22
chr7	149499115	rs61047652	CAT	C	1258.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.634;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.615;NF=5;NR=22;PP=1178;ReadPosRankSum=0.886;SC=CCCCGGCCCCCATGCCCCTGC;SOR=1.597;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=27;WE=149499124;WS=149499105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,32:0.76:42
chr7	149500013	rs2074693	C	G	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.985;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=19;PP=798;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTGGTGGACCCACATGCTACC;SOR=0.159;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=55;TCF=33;TCR=22;TR=41;WE=149500021;WS=149500003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,43:0.77:56
chr7	149500472	rs10952229	A	G	2959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=44;PP=2341;SC=GGACTGTGGGATGCCCACACA;SOR=0.714;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=91;TCF=46;TCR=45;TR=90;WE=149500480;WS=149500462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr7	149500992	rs4725830	A	G	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.916;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=133;ReadPosRankSum=0.943;SC=GCGATAGTGGAAAGATGGTGG;SOR=1.751;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=8;WE=149501000;WS=149500982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr7	149505894	rs74399846	G	A	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=456;ReadPosRankSum=1.691;SC=GACTCCTTGAGGGTCCATTCC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=18;WE=149505902;WS=149505884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr7	149506211	rs71194663	G	GC	2652.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=12;PP=2559;SC=CGAGGCAGCAGCTGCGCAGCC;SOR=2.964;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=51;TCR=14;TR=56;WE=149506219;WS=149506201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr7	149511985	rs10952230	A	G	2864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=47;PP=2341;SC=TGCCCTGGGAACCACACGCAG;SOR=0.997;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=39;TCR=47;TR=86;WE=149511993;WS=149511975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr7	149513434	.	A	C	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=223;ReadPosRankSum=0.298;SC=GGGCCGGAGCAGGTGCTGATG;SOR=0.591;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=14;WE=149513442;WS=149513424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr7	149518041	rs117930273	C	T	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.294;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=675;ReadPosRankSum=0.732;SC=ACAGCTGGGCCCCGGGGAGCC;SOR=1.145;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=128;TCF=66;TCR=62;TR=40;WE=149518049;WS=149518031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,41:0.32:130
chr7	149523195	rs78492471	C	G	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.289;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=21;PP=1028;ReadPosRankSum=0.830;SC=GGTGTGCCCACACCAGGAGTG;SOR=1.156;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=147;TCF=78;TCR=69;TR=52;WE=149523203;WS=149523185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,53:0.34:155
chr7	149524097	rs117000473	G	A	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=537;ReadPosRankSum=-2.053;SC=GTCAAGGCCCGGGACTGGCAC;SOR=1.136;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=23;WE=149524105;WS=149524087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr7	149528139	.	C	A	170	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=11;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=6;NR=0;PP=170;QD=34.1285354245;SC=TTCTCCTGTGCCTCCCCACCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=6;WE=149528160;WS=149528129;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,6:0.43:14
chr7	149544681	.	GGTGTGT	G	198	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=15;MQ=49.42;NF=4;NR=0;PP=198;QD=50.25;SC=AGAAAATTCAGGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=149544694;WS=149544673;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,4:0.67:6
chr7	149556518	rs4725833	C	T	2280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=26;PP=1702;SC=CAGGACCTGCCGCTGCCAAGC;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=41;TCR=26;TR=67;WE=149556526;WS=149556508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr7	149558409	rs2240361	G	C	2994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=50;PP=2459;SC=CGCAGCTGCTGCCTGTCCACT;SOR=1.141;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=36;TCR=50;TR=86;WE=149558417;WS=149558399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr7	149559273	rs2074700	C	T	4848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=71;PP=2965;SC=TCTCCATGCTCTGCAAAAACG;SOR=0.706;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=76;TCR=71;TR=147;WE=149559281;WS=149559263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr7	149559465	rs2074701	C	T	9506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=140;NR=166;PP=2965;SC=CTGTGAACGGCGTGGCCGTCA;SOR=0.893;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=307;TCF=140;TCR=167;TR=306;WE=149559473;WS=149559455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,315:1.00:315
chr7	149561049	rs3857764	C	G	79.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=58;SC=AACAGAGTAGCAACAGATGAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=149561057;WS=149561039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr7	149572842	rs10240203	G	C	3939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=93;PP=2965;SC=AATGCCTCTTGAAAGGCTGAA;SOR=3.219;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=17;TCR=94;TR=110;WE=149572850;WS=149572832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr7	149575707	rs6946997	C	G	923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=54;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=1;PP=787;SC=ACCGAGGCCTCCCCTGGGTGT;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=149575715;WS=149575697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	149575725	rs6947011	C	T	1235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=3;PP=1025;SC=TGTGGGAGGACCCTCCTGTGC;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=39;WE=149575733;WS=149575715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr7	149575747	rs5888369	TG	T	1881.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=6;PP=1847;SC=AGGCTCACCATGCTTTGCTGT;SOR=3.352;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=42;WE=149575755;WS=149575737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr7	149575884	rs10246226	T	C	2573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=52;PP=1791;SC=ACCCAGGTACTGTGTGGGCGA;SOR=1.130;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=35;TCR=52;TR=87;WE=149575892;WS=149575874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr7	149576818	rs7785847	A	G	3091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=67;PP=2600;SC=CGGGGGAGTCAGTGCCCAGTC;SOR=1.454;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=35;TCR=67;TR=102;WE=149576826;WS=149576808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr7	149588429	rs4725317	G	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.99;MQRankSum=-2.515;QD=11.65;ReadPosRankSum=-1.427;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr7	149589343	rs2626759	G	A	748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.80;QD=32.56;SOR=4.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	149589496	rs11428600	A	AC	1943.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.195;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.559;NF=12;NR=42;PP=1836;ReadPosRankSum=-2.309;SC=ACCTTAAAAAAACACACACAC;SOR=1.463;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=91;TCF=22;TCR=69;TR=54;WE=149589504;WS=149589486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,62:0.58:106
chr7	149589599	rs4725318	C	A	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.403;NF=0;NR=16;PP=332;ReadPosRankSum=0.028;SC=TGTTAGGGCTCCATGTGGGGT;SOR=0.770;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=16;WE=149589607;WS=149589589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr7	149606918	rs200320073	T	TA	94.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.07;QD=18.97;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	149981830	rs4725334	T	G	4087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.29;QD=35.55;SOR=5.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr7	150093701	rs940453	A	C	2454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=23;PP=1972;SC=AGGAGAACATATTTCAGCAGC;SOR=1.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=51;TCR=23;TR=74;WE=150093709;WS=150093691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr7	150094853	rs7780011	G	A	3323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=23;PP=2736;SC=CCCGGGACACGCTGTGGGGCC;SOR=2.584;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=83;TCR=23;TR=106;WE=150094861;WS=150094843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr7	150163837	rs2140595	A	G	2070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=8;PP=1727;ReadPosRankSum=1.709;SC=TCCTCCTGGGAAAATGCCGCT;SOR=2.336;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=54;TCR=8;TR=61;WE=150163845;WS=150163827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr7	150167856	.	TCA	T	432	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=20;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=17;MQ=57.67;NF=7;NR=0;PP=432;QD=62.1428571429;SC=TTTTTTTTTTTCAGTTTGTGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=7;WE=150167865;WS=150167846;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:24,7:0.23:31
chr7	150167857	rs12538709	C	T	2390.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.63;QD=30.65;SOR=8.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr7	150167858	rs12533488	A	T	2390.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.63;QD=30.65;SOR=8.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr7	150167859	.	G	T	2390.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-3.124;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.95;MQRankSum=-1.605;QD=28.46;ReadPosRankSum=7.591;SOR=4.855;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:6,78:0.93:84
chr7	150168058	rs111800874	A	AGAAT	6238.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.36;NF=6;NR=102;PP=2957;SC=CATATAAACCAGAAAATTCAC;SOR=4.128;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=134;TCF=9;TCR=125;TR=108;WE=150168066;WS=150168048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr7	150171710	rs60114833	T	C	3245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=72;PP=2475;SC=ACAAGCATTGTGTTTTCAGAG;SOR=1.490;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=38;TCR=73;TR=110;WE=150171718;WS=150171700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr7	150324825	rs3735084	C	T	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.679;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=707;ReadPosRankSum=1.332;SC=CAGCCTTCCCCAGCAGGCATC;SOR=0.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=134;TCF=58;TCR=76;TR=43;WE=150324833;WS=150324815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,45:0.32:141
chr7	150384048	.	A	AAAAG	450.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.94;QD=40.98;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	150384193	.	CGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	C	308.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.722;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=2.062;QD=10.65;ReadPosRankSum=-0.267;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr7	150386627	rs79807098	C	T	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.013;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=433;ReadPosRankSum=-0.053;SC=CAAGCTCCAGCGCGGTGTATC;SOR=0.435;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=79;TCF=45;TCR=34;TR=25;WE=150386635;WS=150386617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,25:0.30:82
chr7	150389677	rs6952002	G	C	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.961;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=411;ReadPosRankSum=0.248;SC=GCTACTTGCTGTCTGCACCAG;SOR=0.473;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=85;TCF=37;TCR=48;TR=26;WE=150389685;WS=150389667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,25:0.29:85
chr7	150389856	rs2075078	A	G	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=1.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.894;SOR=0.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,37:0.26:145
chr7	150416050	rs72264755	GGTGGTTATGCCTATTT	G	149.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=4.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=2.205;QD=3.84;ReadPosRankSum=-1.301;SOR=0.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,7:0.18:39
chr7	150417064	rs78632930	A	C	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=7.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.10;ReadPosRankSum=-0.062;SOR=2.792;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,8:0.21:39
chr7	150417677	rs4725358	G	A	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.907;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=30;PP=772;ReadPosRankSum=0.350;SC=CCACCGGCCGGGAGCAGGAAG;SOR=0.445;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=110;TCF=26;TCR=84;TR=41;WE=150417685;WS=150417667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,42:0.37:113
chr7	150434689	rs9657892	C	T	1758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.735;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=39;PP=1334;ReadPosRankSum=1.361;SC=CGCACACAGACGCAGAGCAGG;SOR=0.503;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=96;TCF=35;TCR=61;TR=64;WE=150434697;WS=150434679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,67:0.65:103
chr7	150438089	rs4725936	T	C	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.095;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=38;PP=1142;ReadPosRankSum=0.783;SC=TCTACCCCCATCTAAAACACA;SOR=0.610;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=232;TCF=100;TCR=132;TR=69;WE=150438097;WS=150438079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,71:0.29:244
chr7	150438138	rs4725359	G	A	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=0.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.28;ReadPosRankSum=-0.469;SOR=0.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,41:0.24:169
chr7	150446703	rs2058450	A	T	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=479;ReadPosRankSum=-0.519;SC=ATGGTGCTTTAGGGGAAGAAG;SOR=0.517;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=99;TCF=87;TCR=12;TR=27;WE=150446711;WS=150446693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,27:0.25:107
chr7	150446792	rs2058449	G	A	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.946;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=22;PP=850;ReadPosRankSum=-1.771;SC=CAACTCTCCCGCGCCCACCTT;SOR=0.859;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=194;TCF=113;TCR=81;TR=57;WE=150446800;WS=150446782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,58:0.29:200
chr7	150446820	rs2058448	C	T	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.707;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=942;ReadPosRankSum=0.564;SC=TCTCCTCTAGCACAATGAAGC;SOR=0.759;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=197;TCF=101;TCR=96;TR=57;WE=150446828;WS=150446810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,58:0.28:207
chr7	150446936	rs2058447	A	G	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.330;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=26;PP=700;ReadPosRankSum=2.106;SC=CTCACTGAAAATCTGAGAAGC;SOR=0.412;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=151;TCF=58;TCR=93;TR=47;WE=150446944;WS=150446926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,47:0.31:154
chr7	150488616	rs2302479	A	G	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=6;PP=594;SC=GGTCTTTGGCAGCTCACAGGA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=150488624;WS=150488606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr7	150489373	rs58004396	C	G	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.944;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=452;ReadPosRankSum=-1.236;SC=CTTGCTGCTCCCACCACAGCT;SOR=0.333;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=59;TCF=4;TCR=55;TR=24;WE=150489381;WS=150489363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,23:0.39:59
chr7	150490075	rs10215370	T	C	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=131;ReadPosRankSum=-0.848;SC=CAGCATGAAGTCCAAGCTCAA;SOR=0.752;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=8;WE=150490083;WS=150490065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr7	150490130	rs10215721	A	C	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=236;ReadPosRankSum=1.053;SC=TCCCTGGGAAAAAAGAGCTGT;SOR=0.859;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=15;WE=150490138;WS=150490120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr7	150490238	rs17256042	G	A	2206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.633;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=33;PP=1496;ReadPosRankSum=0.904;SC=TGACTTCGCCGCATCCATCTG;SOR=0.612;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=132;TCF=74;TCR=58;TR=76;WE=150490246;WS=150490228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,88:0.61:145
chr7	150490376	rs2072443	C	T	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=28;PP=816;ReadPosRankSum=0.463;SC=GCAAAGCCTGCCAGGGTGAGC;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=38;WE=150490384;WS=150490366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,41:0.77:53
chr7	150490424	rs10215381	T	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.68;ReadPosRankSum=2.775;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr7	150490431	rs2072442	C	G	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=22;SC=TCATGACACACGCTCCTTCAA;SOR=1.493;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=35;WE=150490444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr7	150490436	rs10215048	C	T	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.43;ReadPosRankSum=1.846;SOR=1.190;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr7	150490475	rs10215382	T	C	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.047;HP=3;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=195;ReadPosRankSum=-2.740;SC=CCGCCTCAAATCCCTCTCCTC;SOR=0.763;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=10;WE=150490483;WS=150490465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr7	150490497	rs10215385	T	C	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=64;ReadPosRankSum=1.122;SC=TCCCCAGCCCTTGTCCAGGAA;SOR=1.022;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=6;WE=150490505;WS=150490487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr7	150490797	rs72471023	GGACA	G	571.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=555;ReadPosRankSum=-0.529;SC=AGGATCCCAGGGACAGACAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=12;WE=150490808;WS=150490787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr7	150491084	rs3173833	T	G	6862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=177;NR=59;PP=2965;SC=CCTGAGGCACTCAGCACAGTC;SOR=2.197;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=237;TCF=178;TCR=59;TR=236;WE=150491092;WS=150491074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr7	150491775	rs139123517	TC	T	610.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.607;HP=6;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=730;ReadPosRankSum=1.423;SC=GCCTGGGAGCTCCCCCACTGG;SOR=0.065;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=83;TCF=82;TCR=1;TR=25;WE=150491783;WS=150491765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,27:0.35:78
chr7	150491851	rs61057705	T	G	3394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=38;PP=2641;ReadPosRankSum=1.679;SC=CTCTTTTCATTTCATAGGTGT;SOR=0.559;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=181;TCF=125;TCR=56;TR=120;WE=150491859;WS=150491841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,123:0.66:185
chr7	150491995	.	CCACACACACA	C,CCA	1432.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.476;NF=0,0;NR=21,21;PP=935,145;ReadPosRankSum=-1.112;SC=TCCCCTACTACCACACACACA;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=78;TCF=10;TCR=68;TR=21,21;WE=150492012;WS=150491985;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.28,0.68:40
chr7	150493442	rs2075080	C	G	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=224;ReadPosRankSum=-0.087;SC=CCCCGCACCACCCCAGTCTTA;SOR=0.871;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=11;WE=150493450;WS=150493432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr7	150493503	rs140393291	T	A	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.098;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=392;ReadPosRankSum=-0.342;SC=AGGCACAGTGTCCCCAGGGTG;SOR=0.495;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=56;TCF=38;TCR=18;TR=22;WE=150493511;WS=150493493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,22:0.39:57
chr7	150498809	rs1127958	G	A	1712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=49;PP=1383;ReadPosRankSum=0.443;SC=TGGTGGCCTCGTGGGTGAGTG;SOR=2.910;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=54;WE=150498817;WS=150498799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr7	150498836	rs2075079	C	G	1172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=32;PP=973;SC=CCTGCCTCGTCGGGCGGCGGG;SOR=4.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=34;WE=150498844;WS=150498826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr7	150499164	.	T	TTTCTC	1187.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.34;QD=43.99;SOR=2.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	150499267	rs12668797	C	A	2903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=67;NR=23;PP=2352;SC=GGCAGGTCCACCTAGGAGCCG;SOR=2.059;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=67;TCR=23;TR=90;WE=150499275;WS=150499257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr7	150500356	rs741068	T	C	1690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=18;PP=1317;SC=TATCTTACCATGGATAATAAA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=54;WE=150500364;WS=150500346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr7	150500455	rs741067	A	G	2027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.571;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=35;PP=1473;ReadPosRankSum=-0.810;SC=CATTTCCTGTACTAAGCCTGC;SOR=0.677;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=64;TCF=29;TCR=35;TR=62;WE=150500463;WS=150500445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr7	150500520	rs741066	C	T	1537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=27;PP=1191;ReadPosRankSum=-0.648;SC=CCTTCATTTACGAGAAACGGG;SOR=0.435;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=50;TCF=21;TCR=29;TR=48;WE=150500528;WS=150500510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr7	150500729	rs741064	A	G	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=9;PP=1081;SC=GACTCTGCTAACGCTGGCAGC;SOR=2.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=42;WE=150500737;WS=150500719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	150501516	rs9088	A	G	3604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=53;PP=2716;ReadPosRankSum=-0.045;SC=GGCATCTCTGACCCCTCTGTG;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=61;TCR=54;TR=113;WE=150501524;WS=150501506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,118:0.98:120
chr7	150553605	rs10156191	C	T	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.742;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=10;PP=738;ReadPosRankSum=-0.554;SC=ATGCTGCAGACGGCCATGGCG;SOR=0.899;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=117;TCF=87;TCR=30;TR=41;WE=150553613;WS=150553595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,44:0.36:122
chr7	150556055	rs6943147	CG	GC	4228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=46;PP=2947;SC=CACAAGCGCACGTACCGCCTG;SOR=0.947;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=88;TCF=41;TCR=47;TR=85;WE=150556064;WS=150556045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr7	150556790	.	CAA	C	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQRankSum=-1.085;QD=9.75;ReadPosRankSum=1.437;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr7	150557578	rs11771771	G	A	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.748;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=17;PP=506;ReadPosRankSum=-0.166;SC=TGCTTCGCCTGTGCCTGGCAG;SOR=0.555;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=118;TCF=66;TCR=52;TR=36;WE=150557586;WS=150557568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,36:0.30:121
chr7	150654622	rs11462566	A	AG	821.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=3;NR=19;PP=1096;SC=TCAGGCCAGCAGCCCAGGGCC;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=150654630;WS=150654612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	150672162	rs11410979	T	TC	365.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=396;SC=GGGACTGGGGTCCCAGCAGGG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=10;WE=150672170;WS=150672152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	150692444	rs1800781	G	A	2292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=61;PP=1869;SC=CCAGGGAAAGGGTGGGTAAGG;SOR=3.321;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=11;TCR=61;TR=72;WE=150692452;WS=150692434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr7	150695726	rs1549758	T	C	1739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=40;PP=1379;SC=GGCAGCAGGATGGCTCTGTGC;SOR=1.571;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=20;TCR=40;TR=60;WE=150695734;WS=150695716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr7	150696111	rs1799983	T	G	2969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=35;PP=2398;SC=CCCCAGATGATCCCCCAGAAC;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=53;TCR=35;TR=88;WE=150696119;WS=150696101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr7	150699250	rs1800782	G	T	981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=16;PP=819;SC=GGCCTCCGGGGGCCACAGCAC;SOR=0.752;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=17;TCR=16;TR=33;WE=150699258;WS=150699240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr7	150700637	rs73167652	A	G	4562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=47;PP=2965;SC=TTTTTTTAGCATAAAGGTGTA;SOR=1.893;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=112;TCR=47;TR=159;WE=150700645;WS=150700627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr7	150704250	rs2566514	C	G	5755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=118;PP=2965;SC=TTGCTCGTGCCGTGGACACAC;SOR=1.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=61;TCR=118;TR=179;WE=150704258;WS=150704240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr7	150706383	rs753482	C	A	3840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=20.275;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.276;NF=38;NR=90;PP=2924;ReadPosRankSum=1.168;SC=ACCGCCCCCCCACCCCTGTCC;SOR=1.688;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=132;TCF=42;TCR=90;TR=128;WE=150706391;WS=150706373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,134:0.97:138
chr7	150706436	rs142498418	G	GC	1528.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=17;NR=32;PP=1863;SC=ACATTCTCCCGCCCCCACCCC;SOR=1.656;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=49;WE=150706444;WS=150706426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr7	150707488	rs743507	C	T	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=9;PP=258;SC=TTCTCCTGGCCGACATGCACT;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=150707496;WS=150707478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	150708089	rs891512	A	G	1601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.185;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=41;PP=1270;ReadPosRankSum=-0.757;SC=GTGAGATGGAAGACTTGGTGG;SOR=2.369;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=13;TCR=41;TR=54;WE=150708097;WS=150708079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,53:0.98:54
chr7	150708850	rs2256314	G	A	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=301;SC=CTGACCTCACGATCCTCCCAC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=150708858;WS=150708840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr7	150709571	rs7830	G	T	1511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.652;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=23;PP=1096;ReadPosRankSum=0.080;SC=GTGAGGCTGGGGACTAAAGGA;SOR=0.116;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=59;TCF=36;TCR=23;TR=56;WE=150709579;WS=150709561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,58:0.95:61
chr7	150713636	rs3800787	G	C	1377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=9;NR=48;PP=1169;SC=ACATGAAGCAGGTCAAAAGTC;SOR=2.790;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=9;TCR=49;TR=57;WE=150713644;WS=150713626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr7	150713902	rs11393607	G	GC	1004.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=13;PP=1022;SC=GGCCAGGAAGGCTCAGGCTGG;SOR=0.922;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=22;WE=150713910;WS=150713892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	150715817	rs1835428	A	G	2791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=62;PP=2356;SC=CGAAGAGTGCACCCGCGAAGA;SOR=1.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=29;TCR=62;TR=91;WE=150715825;WS=150715807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr7	150720902	rs13307588	A	G	5256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=89;PP=2965;SC=CCAGCCTGGGATAAGTACTGG;SOR=0.985;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=68;TCR=89;TR=157;WE=150720910;WS=150720892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr7	150747746	rs2288645	A	G	6805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=107;PP=2965;SC=ACACCACCTCAGACCCTAAAC;SOR=0.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=223;TCF=116;TCR=107;TR=223;WE=150747754;WS=150747736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr7	150748771	rs58134191	T	C	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=233;SC=GGAGTACAGGTGTGAGCCACC;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=150748779;WS=150748767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr7	150751590	rs2069459	C	A	2384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=60;PP=1942;SC=GAAAGGGCCACAGCTGCATCT;SOR=3.167;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=12;TCR=60;TR=72;WE=150751598;WS=150751580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr7	150752066	rs891507	T	C	7235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=120;PP=2965;SC=CAAAACTCCATGGACTCTCCC;SOR=0.758;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=250;TCF=129;TCR=121;TR=249;WE=150752074;WS=150752056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr7	150759219	rs3217354	CGTGTGTGAGT	C	1213.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=20;PP=2976;SC=GGGGTGTGAGCGTGTGTGAGT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=20;WE=150759236;WS=150759209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	150761150	rs6464122	C	G	150.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=1;PP=144;SC=CTGCTGGGGGCATATAGAGCC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=150761158;WS=150761140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	150761548	.	A	G	27	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=30;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=27;QD=30.8856062736;SC=GAGTGGGGCTAGGGGGCAGGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=150761556;WS=150761538;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr7	150763655	rs2229549	T	A	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=7;PP=644;SC=CCAGTGGCACTGCAGGGGGTG;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=25;WE=150763663;WS=150763645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	150765065	rs2229550	T	C	1427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=25;PP=1129;SC=AGGAGGAGACTGAGCGCTGGG;SOR=0.818;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=48;WE=150765073;WS=150765055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr7	150783756	.	TGCC	T	67	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=15;MQ=65.19;NF=0;NR=2;PP=67;QD=38.5;SC=CGCTCGCCGCTGCCGCCGCCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=150783766;WS=150783746;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr7	150813977	rs76473497	T	TG	2183.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.232;NF=15;NR=54;PP=2041;ReadPosRankSum=1.572;SC=GGCCTGGAGCTGGGGGGGCGA;SOR=1.280;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=77;TCF=18;TCR=59;TR=69;WE=150813985;WS=150813967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,74:0.99:75
chr7	150825567	rs2288650	C	T	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.678;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=212;ReadPosRankSum=-0.329;SC=CCAGGAGAAGCGGGGAGGGGG;SOR=0.046;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=16;WE=150825575;WS=150825557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr7	150847023	rs144875760	C	T	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.286;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=913;ReadPosRankSum=-1.097;SC=CTTTCCCCAGCCAAGGATGCC;SOR=1.112;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=64;TCF=43;TCR=21;TR=43;WE=150847031;WS=150847013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,44:0.65:68
chr7	150864240	rs13241978	G	C	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.478;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=199;ReadPosRankSum=0.610;SC=TGTTTCGGGCGGCAGTGGCGG;SOR=1.069;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=17;WE=150864248;WS=150864230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,18:0.31:59
chr7	150873608	rs310598	A	G	2262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=23;PP=1680;SC=GAGTCTTGGGACCAGGATGAG;SOR=1.426;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=45;TCR=23;TR=68;WE=150873616;WS=150873598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr7	150878260	rs2253592	C	G	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.967;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=345;ReadPosRankSum=-0.026;SC=TGTCCTGGTCCGCAGCATCAG;SOR=0.905;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=76;TCF=42;TCR=34;TR=23;WE=150878268;WS=150878250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,22:0.29:76
chr7	150883761	rs2257090	C	T	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=448;ReadPosRankSum=1.483;SC=GGAGGGGAGACGTGGGCCTCA;SOR=0.567;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=59;TCF=37;TCR=22;TR=25;WE=150883769;WS=150883751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr7	150884266	rs34383739	C	CAG	934.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.734;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.450;NF=24;NR=19;PP=1238;ReadPosRankSum=-0.123;SC=ATGCCAAAGGCAGAGAGAGAG;SOR=0.776;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=146;TCF=73;TCR=73;TR=43;WE=150884275;WS=150884256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,40:0.29:136
chr7	150915102	rs79537035	C	T	2641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=15;PP=2163;ReadPosRankSum=-0.793;SC=CTGCATCACTCCCCTCTTCCT;SOR=1.633;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=83;TCF=68;TCR=15;TR=82;WE=150915110;WS=150915092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,84:0.99:85
chr7	150916114	rs35656219	CAGG	C	4515.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=52;PP=2967;SC=TTCTTTCAGACAGGAGGCCAT;SOR=1.519;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=87;TCF=30;TCR=57;TR=81;WE=150916124;WS=150916104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr7	150916228	rs6949587	G	A	2138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.229;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=49;PP=1731;ReadPosRankSum=-0.755;SC=GCGTCTTCACGTACTGATCAT;SOR=1.778;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=68;TCF=19;TCR=49;TR=67;WE=150916236;WS=150916218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,69:0.99:70
chr7	150918914	rs4726007	G	C	1804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=52;PP=1626;SC=CCTAAGCCACGACTCGACAAT;SOR=4.654;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=4;TCR=52;TR=56;WE=150918922;WS=150918904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr7	150921950	rs6464133	A	G	3974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=54;PP=2849;SC=CATGAAAGGTAAGTGAGAGGT;SOR=0.741;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=61;TCR=54;TR=114;WE=150921958;WS=150921940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr7	150931268	rs2608293	C	G	6029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.630;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=85;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.023;SC=ATCCAGATTCCAGAGCTCGGC;SOR=0.687;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=197;TCF=111;TCR=86;TR=196;WE=150931276;WS=150931258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,202:1.00:203
chr7	150934162	rs2446065	G	C	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=35;PP=843;SC=GAGTCCTTTGGGTGTAGGAGA;SOR=4.514;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=38;WE=150934170;WS=150934152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	150934975	rs2487154	C	G	4687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=81;PP=2965;SC=TCCTCGAGGCCTTTGCAGCCA;SOR=0.730;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=161;TCF=78;TCR=83;TR=159;WE=150934983;WS=150934965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr7	150937074	.	CT	C	51.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.70;ReadPosRankSum=0.702;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr7	150937377	rs61667463	C	CG	1503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=35;PP=1790;SC=TGCCCCCATACGGCCCCAGGG;SOR=2.636;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=43;WE=150937385;WS=150937367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr7	150939193	rs4725398	A	G	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=15;PP=1460;SC=GAGGGTGGCAATTCAAGGGCG;SOR=1.893;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=49;WE=150939201;WS=150939183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr7	150939359	rs219227	C	T	1606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=41;PP=1259;SC=AGAACAGGGACGAGGTGGGAG;SOR=3.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=8;TCR=41;TR=49;WE=150939367;WS=150939349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	150939396	rs219228	C	A	1349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=33;PP=1128;SC=AGTTGGCAGCCGACAGGGCAG;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=38;WE=150939404;WS=150939386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr7	150940657	rs122815	T	C	369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=354;SC=GTGACTGTGATGCTGAAGCTC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=150940665;WS=150940647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	150972189	rs2072298	G	A	2395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=8;PP=1882;SC=GGCAGGGGAGGAAGCACCTAC;SOR=3.412;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=61;TCR=8;TR=69;WE=150972197;WS=150972179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr7	151048484	rs449081	G	A	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.905;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=3;PP=745;ReadPosRankSum=0.105;SC=ATTCAAGTACGTTTTACTTTG;SOR=2.428;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=33;WE=151048492;WS=151048474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,32:0.80:40
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chr7	151049337	rs394259	A	G	658.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5027;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=494;ReadPosRankSum=0.583;SC=ATGGATCTACAGCACTGTGGT;SOR=1.061;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=23;WE=151049345;WS=151049327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,24:0.89:27
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chr7	151053043	rs446886	A	G	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.878;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=913;ReadPosRankSum=-0.505;SC=AGAGGTACCCAGAGCTCTGGG;SOR=0.551;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=75;TCF=44;TCR=31;TR=45;WE=151053051;WS=151053033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,49:0.61:80
chr7	151057396	rs3217033	AC	A	4171.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.437;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.245;NF=14;NR=92;PP=2962;ReadPosRankSum=1.077;SC=TATACAGAACACCCTGCCATG;SOR=0.879;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=155;TCF=21;TCR=134;TR=106;WE=151057404;WS=151057385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,135:0.73:186
chr7	151064064	rs386956	C	T	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=8;PP=1086;ReadPosRankSum=-0.723;SC=TGGATAACTACGCCGTCCTCC;SOR=0.867;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=61;TCR=12;TR=50;WE=151064072;WS=151064054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,55:0.71:78
chr7	151064305	rs367191	A	G	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=354;ReadPosRankSum=0.201;SC=GCCAGAAGGTAATTTCATTTT;SOR=1.931;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=15;WE=151064313;WS=151064295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr7	151074015	rs2240629	G	C	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=487;ReadPosRankSum=0.193;SC=ACGTCACCGGGCCGGCCACCT;SOR=0.816;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=34;TCF=20;TCR=14;TR=20;WE=151074023;WS=151074005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr7	151074296	rs2159158	A	G	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=29;PP=755;ReadPosRankSum=-1.541;SC=GGAAGTCAGCAACAAAGAAAA;SOR=0.536;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=30;WE=151074304;WS=151074286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr7	151078735	rs4141455	A	G	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.060;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=98;ReadPosRankSum=0.154;SC=GAGGCTGCGCATGGGCGGAGG;SOR=2.060;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=7;WE=151078743;WS=151078725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr7	151078845	rs4141454	G	A	1130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=5;PP=950;ReadPosRankSum=-1.557;SC=GCGGGCGCAGGGGCGGGCGTC;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=40;WE=151078853;WS=151078835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,40:0.75:53
chr7	151105916	rs35783364	T	C	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=221;ReadPosRankSum=-0.381;SC=TTTACAGCAATGAGAGGGCTC;SOR=0.481;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=11;WE=151105924;WS=151105906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr7	151106066	rs12533730	C	T	2876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=27;PP=2104;ReadPosRankSum=1.011;SC=CAAGCGTCTACTGTTGCTGTG;SOR=0.776;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=59;TCR=27;TR=85;WE=151106074;WS=151106056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,93:0.99:94
chr7	151106245	rs12533766	C	T	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=25;PP=678;ReadPosRankSum=-1.007;SC=AAATGATCTTCGCCTTTGTAG;SOR=0.551;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=31;WE=151106253;WS=151106235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,33:0.69:48
chr7	151108411	rs917613	T	A	1242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=31;PP=918;SC=GAGGACAGACTCGGTATAGTG;SOR=2.476;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=39;WE=151108419;WS=151108401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	151133271	rs2075001	G	A	1453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=5;PP=1153;ReadPosRankSum=0.051;SC=CTCACGCTCCGTCCCCGTACA;SOR=0.996;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=78;TCF=70;TCR=8;TR=51;WE=151133279;WS=151133261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,53:0.66:80
chr7	151164348	rs17635434	G	A	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.636;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=544;ReadPosRankSum=0.627;SC=GCCGAACTCCGAGAGTATTTT;SOR=0.573;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=116;TCF=53;TCR=63;TR=33;WE=151164356;WS=151164338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,33:0.26:125
chr7	151168415	rs35526149	CAAT	C	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.12;ReadPosRankSum=0.619;SOR=0.175;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,6:0.16:38
chr7	151168534	rs6956899	G	A	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.676;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=335;ReadPosRankSum=0.298;SC=TATTCTATTTGTAAGAAAAAA;SOR=1.380;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=99;TCF=54;TCR=45;TR=30;WE=151168542;WS=151168524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,29:0.28:103
chr7	151195328	rs11772458	G	C	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.477;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=318;ReadPosRankSum=0.821;SC=GGAAGAGGAAGAGAAGCAGCT;SOR=1.162;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=60;TCF=10;TCR=50;TR=17;WE=151195336;WS=151195318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,17:0.28:61
chr7	151254175	rs8961	T	C	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.164;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=10;PP=629;ReadPosRankSum=0.646;SC=AAATACCTATTGTTAAACCCT;SOR=1.680;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=149;TCF=99;TCR=50;TR=46;WE=151254183;WS=151254165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,44:0.29:153
chr7	151254445	rs764801	T	C	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.214;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=72;ReadPosRankSum=1.145;SC=AGGAGGGCGATGTGGGAAGGA;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=151254453;WS=151254435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr7	151254462	rs764800	G	A	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=96;ReadPosRankSum=-0.366;SC=AGGAGCAGGTGGCCCAAGCTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=151254470;WS=151254452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
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chr7	151668180	.	C	CTAGA	391	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=28;MQ=60.15;NF=0;NR=8;PP=391;QD=49.5;SC=CTCTCATTCTCTAGATAGATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=8;WE=151668188;WS=151668170;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:18,8:0.31:26
chr7	151668224	rs58859718	A	AT	265.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.43;QD=37.97;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr7	151668225	.	A	T	280	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=29;MQ=60.98;NF=0;NR=10;PP=280;QD=31.4771212547;SC=GATAGATAGAAAGAAAACAGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=151668233;WS=151668215;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr7	151668225	rs59993749	A	AGAT	265.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.43;QD=37.97;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr7	151680072	rs6960270	T	C	3467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.185;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=64;PP=2665;ReadPosRankSum=-0.629;SC=TGCCTGCAGGTGTCTTCAAAA;SOR=0.625;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=198;TCF=98;TCR=100;TR=132;WE=151680080;WS=151680062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,138:0.66:209
chr7	151680175	rs35682935	C	T	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.307;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=37;PP=921;ReadPosRankSum=-0.654;SC=TCCAGTGTCACGAACCTCACG;SOR=0.843;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=185;TCF=63;TCR=122;TR=55;WE=151680183;WS=151680165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,56:0.29:196
chr7	151680268	rs147547437	TTTG	T	164.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.34;ReadPosRankSum=-0.189;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,7:0.18:38
chr7	151684168	rs4726127	C	A	367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=326;SC=TTTAGGAATACGTCATAATGA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=151684176;WS=151684158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr7	151684256	rs61729490	A	G	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=645;ReadPosRankSum=0.892;SC=GATTTGAAAGAAAAACTAGAC;SOR=0.735;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=31;WE=151684264;WS=151684246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,31:0.69:45
chr7	151723022	rs72200904	TGCG	T	2130.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=36;PP=1825;SC=CCTCGAGAGCTGCGGCGGCGG;SOR=3.126;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=39;WE=151723032;WS=151723012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr7	151791170	rs17173334	T	G	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.435;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=392;ReadPosRankSum=0.618;SC=CCGTTAACTGTACGCATAGTG;SOR=3.967;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=17;WE=151791178;WS=151791161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr7	151805262	.	C	T	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.145;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=687;ReadPosRankSum=0.676;SC=CGCTGGCCTACAGCTCGTCCC;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=46;TCF=21;TCR=25;TR=31;WE=151805270;WS=151805252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
chr7	151818470	rs73478979	T	C	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=412;ReadPosRankSum=-2.004;SC=AAATATCTTATTGTATTGTGC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=18;WE=151818478;WS=151818460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr7	151818777	rs967093	T	C	1675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=55;PP=1325;SC=GATGCTGTGGTGGGAACGTTG;SOR=5.926;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=57;TCF=2;TCR=55;TR=57;WE=151818785;WS=151818767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr7	151859683	rs74483926	G	A	1691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.555;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=28;PP=1283;ReadPosRankSum=-0.275;SC=TGGTTCCACCGACTCTTGGTC;SOR=0.748;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=184;TCF=103;TCR=81;TR=66;WE=151859691;WS=151859673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,70:0.38:186
chr7	151860230	rs142835638	G	C	4358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=73;PP=2962;ReadPosRankSum=1.346;SC=TGCCCCATTTGCTGTTGGTGT;SOR=0.684;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=229;TCF=113;TCR=116;TR=146;WE=151860238;WS=151860220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,153:0.65:235
chr7	151882735	rs62481492	G	A	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.93;MQRankSum=-0.610;QD=4.38;ReadPosRankSum=-2.394;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr7	151945007	rs137949498	C	T	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=1.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.81;MQRankSum=-2.078;QD=5.89;ReadPosRankSum=-0.344;SOR=0.504;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:157,56:0.26:213
chr7	151945071	rs150073007	G	GT	2042.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FS=2.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.37;MQRankSum=-0.189;QD=6.12;ReadPosRankSum=-0.378;SOR=0.840;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:250,84:0.25:334
chr7	151945140	rs57648310	C	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FS=45.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.07;MQRankSum=-5.985;QD=1.14;ReadPosRankSum=-1.750;SOR=3.107;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:286,44:0.13:330
chr7	151945167	rs2537264	G	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FS=68.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.56;MQRankSum=-9.293;QD=0.40;ReadPosRankSum=-0.620;SOR=5.350;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:285,34:0.11:319
chr7	151945204	rs4024453	G	A	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FS=125.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.15;MQRankSum=-11.078;QD=2.82;ReadPosRankSum=-1.588;SOR=7.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:209,43:0.17:252
chr7	151962077	.	C	G	646	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=28;MQ=41.73;NF=35;NR=0;PP=646;QD=19.4506060728;SC=GTAATAGGGTCCCTCTTAAAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=126;TCF=122;TCR=4;TR=35;WE=151962085;WS=151962067;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:91,35:0.28:126
chr7	151962176	rs62478356	T	A	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.48;MQRankSum=-4.435;QD=1.41;ReadPosRankSum=1.076;SOR=0.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:291,56:0.16:347
chr7	151970856	rs10454320	T	A	10948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=5.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=650;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.145;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-14.465;NF=223;NR=347;PP=2962;ReadPosRankSum=3.122;SC=TCCTGAAAGGTGCCGGCTCCT;SOR=1.342;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=812;TCF=355;TCR=457;TR=570;WE=151970864;WS=151970846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:233,415:0.64:648
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chr7	153749753	rs1974615	C	T	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.102;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.217;NF=21;NR=1;PP=487;ReadPosRankSum=0.994;SC=GAGGAGCGGCCGCCGGCGCTG;SOR=2.670;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=22;WE=153749761;WS=153749750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,22:0.79:28
chr7	153749772	rs374262699	TTGC	T	811.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.085;NF=21;NR=2;PP=913;ReadPosRankSum=2.085;SC=TGGGCTTGCCTTGCTGCTGCT;SOR=0.904;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=23;WE=153749782;WS=153749762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr7	153749805	rs4015718	CT	C	415.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQRankSum=-1.422;QD=10.14;ReadPosRankSum=1.627;SOR=0.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr7	153750160	rs199977459	TC	T	907.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=782;ReadPosRankSum=-0.015;SC=TAAGAGCTTCTCGGGGGCGGG;SOR=0.756;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=29;TCF=14;TCR=15;TR=20;WE=153750168;WS=153750150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,27:0.69:39
chr7	153750319	.	G	GC	331.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=10;PP=418;SC=CGCGGTCACCGCGTCCCGGAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=10;WE=153750327;WS=153750309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr7	154002658	.	C	CGT	1385.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.307;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.302;NF=4;NR=32;PP=1649;ReadPosRankSum=0.479;SC=TTTGGGGGTCCGTGTGTGTGT;SOR=1.144;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=79;TCF=10;TCR=69;TR=36;WE=154002666;WS=154002648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,45:0.65:69
chr7	154143557	rs34749902	T	C	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.921;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=103;ReadPosRankSum=-0.193;SC=TGATATAATATGGTTTCAATT;SOR=0.027;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=10;WE=154143565;WS=154143547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr7	154264203	.	C	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.226;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=94;ReadPosRankSum=0.366;SC=GGAAAAAAGTCACATACTTTA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=154264211;WS=154264193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr7	154429560	rs11243339	C	T	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.145;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=10;PP=914;ReadPosRankSum=-1.994;SC=CTGGATATTACGTCCTGAGCA;SOR=1.064;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=63;TCF=45;TCR=18;TR=41;WE=154429568;WS=154429550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,41:0.66:62
chr7	154429657	rs6972501	T	C	1750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=41;PP=1458;ReadPosRankSum=-1.285;SC=GGACGAGCTGTTTAACCCTTA;SOR=0.820;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=86;TCF=32;TCR=54;TR=65;WE=154429665;WS=154429647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,64:0.72:89
chr7	154461112	rs3807218	A	G	4957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=78;NR=67;PP=2965;SC=GCAATGCAAAACTTCAGTATG;SOR=0.864;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=79;TCR=67;TR=145;WE=154461120;WS=154461102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr7	154461248	rs35719981	TTGTGTG	TTG,T	1326.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.4999,0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=0,0;NR=31,31;PP=30,1503;SC=GTACATGGTGTTGTGTGTGTG;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=2;TCR=59;TR=31,31;WE=154461261;WS=154461238;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:33
chr7	154587367	rs10274635	G	A	1420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=2;PP=1113;SC=CCACGCACGAGACAAAGAGGA;SOR=5.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=39;WE=154587375;WS=154587357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	154587502	rs200163118	AAAAAGAAAAG	A	1091.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=0.087;QD=9.49;ReadPosRankSum=3.189;SOR=0.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,61:0.53:115
chr7	154587503	rs201537690	AAAAGAAAAG	A	201.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=9.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=0.838;QD=1.70;ReadPosRankSum=-0.885;SOR=0.226;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,30:0.25:119
chr7	154592965	rs12531589	C	T	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.449;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=195;ReadPosRankSum=0.467;SC=CCTTAGAAATCACATAGAAAA;SOR=0.372;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=12;WE=154592973;WS=154592955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
chr7	154593047	rs77306823	C	A	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=26;PP=1125;ReadPosRankSum=0.184;SC=TGGTTTCATCCGTGGCCTTTG;SOR=0.773;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=42;TCR=35;TR=57;WE=154593055;WS=154593037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,59:0.74:80
chr7	154598908	rs2293357	A	G	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.593;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=238;ReadPosRankSum=-0.123;SC=GGGAGGGGGCAGCGGCTGTGG;SOR=0.034;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=16;WE=154598916;WS=154598898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,16:0.28:58
chr7	154645406	rs6962284	A	G	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-6.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.756;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.557;NF=28;NR=1;PP=1756;ReadPosRankSum=0.901;SC=TCTACGTGGCATAAGAAAAGC;SOR=1.026;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=106;TCF=100;TCR=6;TR=29;WE=154645427;WS=154645396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,33:0.30:111
chr7	154645419	rs145928686	G	GTTTTC	1715.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=7.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=1.463;QD=12.90;ReadPosRankSum=-1.102;SOR=2.064;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,43:0.32:133
chr7	154659565	rs114052231	TTT	CGG	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;JOINED;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=361;ReadPosRankSum=-1.138;SC=CCCAGTTTCTTTTTCTGTACA;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=154659575;WS=154659555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr7	154659971	rs10264311	A	G	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=508;ReadPosRankSum=0.402;SC=TTCAGAACCAAGATGCTCACT;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=21;WE=154659979;WS=154659961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,21:0.81:26
chr7	154667628	rs2293353	A	G	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=774;ReadPosRankSum=-0.739;SC=ATGGCACCCCAGGCAGCCAGA;SOR=0.681;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=40;TCR=29;TR=43;WE=154667636;WS=154667618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,46:0.63:73
chr7	154667842	rs10257999	G	A	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=196;ReadPosRankSum=1.002;SC=AGGAGAGGCCGGGAGGGGACG;SOR=0.269;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=10;WE=154667850;WS=154667832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
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chr7	154672839	rs3817517	C	T	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.144;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr7	154679302	rs4960642	T	C	920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=2;PP=708;ReadPosRankSum=1.110;SC=CCGCACCCGGTCCAGGGCCCT;SOR=0.490;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=29;WE=154679310;WS=154679292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,32:0.73:44
chr7	154679447	rs940378	G	A	4581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=88;PP=2965;SC=CATACGAGGTGTGTATGGGCA;SOR=1.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=61;TCR=88;TR=149;WE=154679455;WS=154679437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr7	154679591	rs77297860	G	A	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=228;ReadPosRankSum=-0.467;SC=AGAAACCTCCGAAGGATCATT;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=12;WE=154679599;WS=154679581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr7	154679610	rs2316537	GA	CC	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=231;ReadPosRankSum=-0.658;SC=TTCCACCAGAGAGTGGATTGA;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=154679619;WS=154679600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr7	154681142	rs11335725	CT	C	288.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=5.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-0.073;QD=4.89;ReadPosRankSum=2.402;SOR=1.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr7	154720259	rs11543936	T	C	145.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=115;SC=TCAATATCAGTCCCACTGAGC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=154720267;WS=154720249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr7	154738343	.	G	A	2085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.546;ClippingRankSum=0.000;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.121;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=52;PP=1618;ReadPosRankSum=-0.405;SC=CGCTGAATGTGATACAGGGCA;SOR=0.906;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=219;TCF=86;TCR=133;TR=81;WE=154738351;WS=154738333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,86:0.38:224
chr7	154738409	rs3501	T	C	2428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.429;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=63;PP=1876;ReadPosRankSum=0.451;SC=TTGTGCTCCATGAGCTTCCGG;SOR=0.536;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=145;TCF=50;TCR=95;TR=98;WE=154738417;WS=154738399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,99:0.66:149
chr7	154748908	rs3817480	G	A	1985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=25;PP=1493;SC=AGCCAGCAATGAAAAATTTAA;SOR=1.057;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=60;TCF=35;TCR=25;TR=59;WE=154748916;WS=154748898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr7	154751774	rs2272174	G	A	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=16;PP=453;SC=AAGGATAAATGTAAGTACTAT;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=19;WE=154751782;WS=154751764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	154755628	rs748811	G	A	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=37;ReadPosRankSum=-0.385;SC=TTCTATTTACGGACTTTTCTA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=154755636;WS=154755618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr7	154759671	rs893942	T	C	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=43;PP=1351;SC=ATGAATATGCTTGCACAAAAG;SOR=4.047;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=4;TCR=43;TR=47;WE=154759679;WS=154759661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr7	154760369	rs935037	A	G	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=10;PP=903;ReadPosRankSum=1.429;SC=GGAGCTGGGCAAGCTGCTGCT;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=42;WE=154760377;WS=154760359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr7	154768100	.	C	A	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.949;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=330;ReadPosRankSum=-0.780;SC=ACATTTCCTACAATTACGCAT;SOR=0.622;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=11;WE=154768108;WS=154768090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr7	154785362	rs306281	A	G	7639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.304;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=202;NR=57;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.756;SC=TTTTCACTCCATTAACTATCA;SOR=2.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=260;TCF=202;TCR=58;TR=259;WE=154785370;WS=154785352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,268:1.00:269
chr7	154794482	rs371145514	GCGGGGA	G	940.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.686;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=879;ReadPosRankSum=-0.567;SC=CGCGGCAGGAGCGGGGACGGG;SOR=0.223;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=18;WE=154794495;WS=154794472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr7	154862188	rs3823534	A	G	3019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=76;PP=2483;SC=GGGCAGGGAGACAACGCGGTG;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=14;TCR=76;TR=90;WE=154862196;WS=154862178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr7	154862508	rs3734967	A	G	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-8.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.561;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=2;PP=1066;ReadPosRankSum=0.204;SC=CCCACTGGCCAGAGGTTGCAA;SOR=1.698;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=208;TCF=196;TCR=12;TR=72;WE=154862516;WS=154862498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,73:0.35:207
chr7	154862591	rs1800883	G	C	13995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=439;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=261;NR=166;PP=2965;SC=GTACCCCAGGGCGGTCTCCTG;SOR=1.181;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=428;TCF=262;TCR=166;TR=427;WE=154862599;WS=154862581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,436:1.00:436
chr7	154863410	rs193294119	A	T	470.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5274;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=345;ReadPosRankSum=1.296;SC=CTATATCCCCAGGCCACCTGC;SOR=1.426;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=16;WE=154863418;WS=154863400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,17:0.89:19
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chr7	154875972	rs113935396	C	T	3796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.96;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=64;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.005;SC=AGCAGCGGGCCGCCCTCATGG;SOR=0.707;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=204;TCF=109;TCR=95;TR=137;WE=154875980;WS=154875962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,139:0.67:207
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chr7	155150765	rs7456618	C	T	4802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.716;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=111;PP=2962;ReadPosRankSum=3.133;SC=CAAGGCCCTCCGTCTGGGAAA;SOR=0.487;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=269;TCF=95;TCR=174;TR=177;WE=155150773;WS=155150755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,179:0.66:273
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chr7	155174801	rs147883222	ATGTGAG	A	220.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.50;ReadPosRankSum=-1.049;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,9:0.18:49
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chr7	155301781	rs6947243	A	G	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.777;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=37;PP=971;ReadPosRankSum=0.665;SC=CCTCCGACTGAGCTAGGGGGA;SOR=0.362;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=56;TCF=8;TCR=48;TR=44;WE=155301789;WS=155301771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,43:0.75:57
chr7	155437475	rs7786826	T	C	341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=1;PP=283;SC=CCCTCCCTTCTCTGTCCTCCG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=155437483;WS=155437465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	155457788	rs73167106	A	T	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=-1.585;SC=AATCCTTAAAAAAGTTGTTTT;SOR=0.122;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=8;WE=155457796;WS=155457778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr7	155465422	rs7811556	C	G	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=436;SC=CTGGGCAACACGGTGAGGCTT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=155465430;WS=155465412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	155473706	rs73167121	A	G	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.87;ReadPosRankSum=-0.334;SOR=0.312;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,12:0.22:55
chr7	155499799	rs4716543	C	T	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.356;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=165;ReadPosRankSum=-1.676;SC=CCTAGAACTTCAGAACAAATG;SOR=0.223;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=10;WE=155499807;WS=155499789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr7	155503920	rs7800753	A	T	1671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.070;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=37;PP=1311;ReadPosRankSum=-1.200;SC=CTCCACCGCCACCGCCGCCTC;SOR=0.207;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=116;TCF=63;TCR=53;TR=73;WE=155503928;WS=155503910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,64:0.66:97
chr7	155530363	rs2249337	A	G	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.838;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=27;PP=574;ReadPosRankSum=-0.262;SC=GGAGGTACAGAAAGAGTGAGT;SOR=1.087;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=117;TCF=31;TCR=86;TR=34;WE=155530371;WS=155530353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,37:0.30:124
chr7	155530954	rs2178428	T	C	1424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.527;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=34;PP=1078;ReadPosRankSum=-0.822;SC=ACGACCAGCCTTGCAGCCTCC;SOR=0.459;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=198;TCF=80;TCR=118;TR=59;WE=155530962;WS=155530944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,64:0.31:206
chr7	155531080	rs3735576	A	G	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.794;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=530;ReadPosRankSum=0.427;SC=GCCCACACACACACAGCCCAA;SOR=0.968;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=114;TCF=35;TCR=79;TR=33;WE=155531088;WS=155531070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,37:0.31:120
chr7	155532361	rs3801906	G	A	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=563;ReadPosRankSum=0.004;SC=GATTATGCCCGGTGTAACCAT;SOR=0.636;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=95;TCF=60;TCR=35;TR=33;WE=155532369;WS=155532351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,34:0.35:96
chr7	155534653	rs73167165	C	G	2192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-7.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.422;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=68;PP=1620;ReadPosRankSum=0.778;SC=CTGCCACGCCCTCAGCACAAG;SOR=0.735;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=359;TCF=137;TCR=222;TR=107;WE=155534661;WS=155534643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:259,112:0.30:371
chr7	155556456	rs73167201	T	G	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.272;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=332;ReadPosRankSum=0.043;SC=GGGGAGGAGCTTTTGGTGGAG;SOR=1.743;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=67;TCF=42;TCR=25;TR=24;WE=155556464;WS=155556446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,24:0.36:67
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chr7	155593438	rs1233560	G	A	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.205;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=28;PP=539;ReadPosRankSum=-0.289;SC=GAGGCCCTGCGCCATCCACCT;SOR=0.086;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=76;TCF=1;TCR=75;TR=29;WE=155593446;WS=155593428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,30:0.38:79
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chr7	155747865	rs7798508	C	G	1629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=4;PP=1285;SC=TGACCATTCTCAGGCTGTCAG;SOR=4.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=45;WE=155747873;WS=155747855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr7	155747907	rs7810074	T	C	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.267;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=493;ReadPosRankSum=0.857;SC=CACAGGGGAGTATGAAGCCGG;SOR=0.204;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=69;TCF=49;TCR=20;TR=30;WE=155747915;WS=155747897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,33:0.46:72
chr7	155749951	rs35655547	C	T	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.76;ReadPosRankSum=-2.130;SOR=0.894;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,26:0.25:104
chr7	155749974	rs10440919	GC	AA	3111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.623;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=33;PP=2944;ReadPosRankSum=-1.269;SC=GGGCAGTGCAGCCAGCTCCAC;SOR=0.475;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=93;TCF=48;TCR=45;TR=66;WE=155749983;WS=155749964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,77:0.77:100
chr7	155750033	rs10256182	A	G	2170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=47;PP=1800;SC=TGGCCACCTCAGATTTTAAAA;SOR=1.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=22;TCR=47;TR=69;WE=155750041;WS=155750023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr7	155755336	rs7807731	C	T	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.332;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=860;ReadPosRankSum=1.841;SC=TTTAGGAGCACGGGTACTACT;SOR=0.255;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=62;TCF=47;TCR=15;TR=41;WE=155755344;WS=155755326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,39:0.63:62
chr7	155755826	rs2007015	A	G	2541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=50;PP=1920;SC=CCAGATTCTCATGTAGGCTGG;SOR=1.259;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=34;TCR=50;TR=84;WE=155755834;WS=155755816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr7	155757502	rs1551630	T	C	1648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=38;PP=1330;SC=TCGCTTGCTGTCACTGCCTGG;SOR=2.655;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=47;WE=155757510;WS=155757492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr7	156432955	rs79924697	G	A	1723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.734;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=43;PP=1349;ReadPosRankSum=2.077;SC=GCAGCGAAGGGGCGGTGCGCT;SOR=0.310;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=232;TCF=85;TCR=147;TR=77;WE=156432963;WS=156432945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,77:0.33:233
chr7	156469096	rs2302149	C	T	2309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.477;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=54;PP=1554;ReadPosRankSum=0.425;SC=GGCCTCTTCCCGTCCTGTGTG;SOR=0.921;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=259;TCF=117;TCR=142;TR=92;WE=156469104;WS=156469086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,100:0.37:270
chr7	156473779	rs71838136	T	TA	698.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.720;NF=22;NR=8;PP=477;ReadPosRankSum=-1.819;SC=ATGTTCACATTAAAAAAAAAA;SOR=1.609;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=30;WE=156473787;WS=156473769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,30:0.91:33
chr7	156518007	rs2072468	T	C	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=196;ReadPosRankSum=0.649;SC=CCAGTTTGTGTTTACGCAACT;SOR=0.197;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=12;WE=156518015;WS=156517997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr7	156529062	rs10640672	C	CAGT	784.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=899;ReadPosRankSum=-0.784;SC=AGCTTGCATTCATTATTTAGT;SOR=0.164;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=59;TCR=0;TR=17;WE=156529070;WS=156529052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,18:0.29:62
chr7	156626273	.	ATTG	A,AGAACCAGTGTTG	367.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=1397;ReadPosRankSum=-0.707;SC=CCAATAGGAGATTGGATTATC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=156626285;WS=156626263;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.62:13
chr7	156626277	.	G	GAACCAGTGCTAA	367.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=28.29;ReadPosRankSum=-0.852;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr7	156685519	rs200299453	G	GC	285.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=49;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=0;PP=303;SC=GGCGCGAGGCGAGGCCCGGAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=156685527;WS=156685509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	156685538	.	TCCGGGGA	T	307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.153;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.98;ReadPosRankSum=1.206;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr7	156685545	.	A	AC	499	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=4;HapScore=4;MGOF=22;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=11;NR=0;PP=499;QD=47.4545454545;SC=GGGTCCGGGGACCGGGGGCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=11;WE=156685553;WS=156685528;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,11:0.73:15
chr7	156685592	rs117913319	A	G	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.890;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=309;ReadPosRankSum=0.932;SC=GGCACGCGGGACTGTCAGGGC;SOR=0.198;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=17;WE=156685600;WS=156685582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr7	156746919	.	C	T	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.000;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=692;ReadPosRankSum=0.370;SC=GTCACTGCCTCGGCCATGCCC;SOR=0.714;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=150;TCF=61;TCR=89;TR=45;WE=156746927;WS=156746909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,49:0.32:155
chr7	156755350	rs12672076	T	C	3241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=33;PP=2476;SC=GCCTCCCTGTTGGAGTGAGTC;SOR=1.655;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=70;TCR=33;TR=103;WE=156755358;WS=156755340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr7	156759597	rs34856615	ATATAT	A	7025.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=122;NR=1;PP=2969;SC=GTTGTTAGTGATATATTATAG;SOR=7.328;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=133;TCF=131;TCR=2;TR=123;WE=156759609;WS=156759587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr7	156761751	rs9969350	C	T	2292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=3;PP=1892;SC=ATCAGTGTAACTTTATTTTTC;SOR=5.699;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=67;TCR=3;TR=70;WE=156761759;WS=156761741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr7	156761818	rs2302445	G	A	3829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=15;PP=2965;SC=CCCAGAGTCCGTTTTTTACGA;SOR=3.748;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=98;TCR=15;TR=112;WE=156761826;WS=156761808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr7	156761913	rs2302444	C	T	7860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=136;PP=2965;ReadPosRankSum=0.642;SC=CCCTTTCCGACGAGACATGGA;SOR=0.877;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=251;TCF=113;TCR=138;TR=247;WE=156761921;WS=156761903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,258:0.99:260
chr7	156762224	rs2302443	G	C	2267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=21;PP=1560;SC=CCTTTCCAGAGTATCTGACAA;SOR=1.810;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=68;WE=156762232;WS=156762214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr7	156762248	rs12919	G	A	2454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=26;PP=1763;SC=AAAGCTGGGGGTGTTACGTGA;SOR=1.252;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=44;TCR=26;TR=70;WE=156762256;WS=156762238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr7	156762446	rs3087905	G	T	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=733;SC=AAATGTCCTTGGTAAACCCAA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=156762454;WS=156762436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	156932094	rs200844106	G	GGGACTCGGGGTT	2204.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=49;PP=2900;SC=GCTCGGGGCTGGGACTCGGGG;SOR=6.439;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=64;TCF=2;TCR=62;TR=50;WE=156932102;WS=156932084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr7	156994331	rs10713758	CT	C	63.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=0.629;QD=3.75;ReadPosRankSum=1.138;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr7	157049530	rs1182373	T	G	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=1;PP=1407;SC=TTTCCGTGGGTGTCTGGACCA;SOR=6.358;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=48;WE=157049538;WS=157049520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr7	157151234	rs3802100	C	T	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.843;NF=10;NR=0;PP=191;ReadPosRankSum=0.945;SC=CCTGTTTTTACTTGCAGGACC;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=10;WE=157151242;WS=157151224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr7	157156151	rs3802096	C	T	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=30;PP=709;ReadPosRankSum=0.964;SC=TAGGTAACCACGAGTGCTGGG;SOR=1.298;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=30;WE=157156159;WS=157156141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr7	157159423	rs3779591	G	A	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=47;PP=1108;ReadPosRankSum=1.564;SC=GCATTTAAAAGTCTTTTACGA;SOR=2.231;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=0;TCR=64;TR=47;WE=157159431;WS=157159413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,48:0.75:64
chr7	157162068	rs9692250	T	C	1719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.108;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=40;PP=1174;ReadPosRankSum=-0.107;SC=GGGCAGTGTTTGGGTTGAAGT;SOR=0.348;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=101;TCF=38;TCR=63;TR=68;WE=157162076;WS=157162058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,72:0.68:106
chr7	157162103	rs12672981	A	G	1519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.166;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=41;PP=1155;ReadPosRankSum=-1.630;SC=GGTGATTCTCATGGTGACCAA;SOR=0.469;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=83;TCF=25;TCR=58;TR=60;WE=157162111;WS=157162093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,60:0.71:84
chr7	157208617	rs1009135	C	T	1850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=9;PP=1858;SC=GCTTTTTGTTCTTAACATGGG;SOR=3.219;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=48;TCR=9;TR=57;WE=157208639;WS=157208607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr7	157208631	rs4716474	A	G	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=331;ReadPosRankSum=-0.335;SC=ACATGGGGAGATATTTAGAAA;SOR=0.780;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=76;TCF=64;TCR=12;TR=21;WE=157208639;WS=157208607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,22:0.29:76
chr7	157234787	rs12698061	G	T	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.909;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.693;NF=5;NR=2;PP=97;ReadPosRankSum=-0.855;SC=CGTAGCGTCTGTGGTGGGCTC;SOR=1.609;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=7;WE=157234795;WS=157234777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr7	157234816	.	A	G	159	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=56.76;NF=9;NR=3;PP=159;QD=16.1476010456;SC=GGCGCCTGGCATAGCGTCTGG;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=12;WE=157234824;WS=157234806;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr7	157234912	rs12669046	A	G	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.391;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=292;ReadPosRankSum=-0.485;SC=GTGGTGGGCTATTCCACGCGG;SOR=0.191;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=17;WE=157234920;WS=157234902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr7	157235034	.	T	G	68	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=46.72;NF=2;NR=3;PP=68;QD=20.5542425094;SC=GCTCTTCCGGTCGGCGCCTGA;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=14;TCF=7;TCR=7;TR=5;WE=157235042;WS=157235024;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,5:0.36:14
chr7	157235146	.	G	A	264	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=22;MQ=52.36;NF=5;NR=6;PP=264;QD=27.1610193225;SC=GGGCTCTTTCGGGCGGCGCCT;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=11;WE=157235154;WS=157235136;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,11:0.69:16
chr7	157235229	rs6974109	T	C	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=50;ReadPosRankSum=0.183;SC=TCGGGGCGGGTGCCTGATGTA;SOR=1.565;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=7;WE=157235237;WS=157235219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr7	157235364	rs6950818	C	G	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=35;ReadPosRankSum=1.282;SC=GCTGCTGGCTCGGGAGGCAGG;SOR=0.991;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=3;WE=157235372;WS=157235354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr7	157261127	rs34002063	C	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=118;ReadPosRankSum=0.221;SC=CCCATCTGCCCGCCCGGCCAG;SOR=0.148;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=9;WE=157261135;WS=157261125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr7	157261201	rs4716743	T	G	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.572;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=440;ReadPosRankSum=0.747;SC=CACCGTCACCTTCACGGGAGA;SOR=1.911;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=25;WE=157261209;WS=157261191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr7	157261258	rs4716744	C	T	2280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.523;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=11;PP=1208;ReadPosRankSum=0.526;SC=GGGACCATCCCTCACCTTTGG;SOR=1.222;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=104;TCF=81;TCR=23;TR=57;WE=157261266;WS=157261248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,60:0.57:106
chr7	157261275	rs4716745	C	T	2915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.721;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=22;PP=1392;ReadPosRankSum=-1.174;SC=TTGGTTTGCCCGCGTTCTCAC;SOR=0.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=83;TCR=39;TR=69;WE=157261283;WS=157261265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,73:0.58:126
chr7	157261292	rs4716746	A	G	3139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.217;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=26;PP=1668;ReadPosRankSum=-0.930;SC=TCACACGGGGACAGCTGTTTA;SOR=1.032;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=139;TCF=90;TCR=49;TR=80;WE=157261300;WS=157261282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,84:0.59:143
chr7	157261945	rs2109830	A	G	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.684;NF=27;NR=0;PP=504;ReadPosRankSum=1.125;SC=CAGCAGGGGCAGGACCCTCGG;SOR=1.923;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=27;WE=157261961;WS=157261935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,28:0.72:39
chr7	157261953	rs11449038	C	CG	1643.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=0;PP=1567;SC=GCAGGACCCTCGGCCTGGCCA;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=35;WE=157261961;WS=157261935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	157262170	rs7801907	T	C	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.805;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=32;PP=684;ReadPosRankSum=-2.028;SC=GAGTAGGGGGTGCAGACCCGG;SOR=0.386;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=64;TCF=13;TCR=51;TR=42;WE=157262178;WS=157262160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,43:0.68:63
chr7	157262226	rs7778458	G	A	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=629;ReadPosRankSum=1.497;SC=AGGACATGCCGGCATCGGAGG;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=24;WE=157262234;WS=157262216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,25:0.81:31
chr7	157262920	rs7806450	T	C	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=39;SC=GCACTGGGTCTGCTCCCTGCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=3;WE=157262928;WS=157262910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr7	157263349	.	C	T	390	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=52;MMLQ=23;MQ=54.79;NF=18;NR=6;PP=390;QD=17.6988005228;SC=GTGTCCGGCGCTGGCCTGCAT;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=24;WE=157263357;WS=157263339;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr7	157263370	.	T	C	397	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=45;MMLQ=23;MQ=53.75;NF=19;NR=7;PP=397;QD=16.606585098;SC=TGGGTGTGTCTGTGTGTCCGG;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=26;WE=157263378;WS=157263360;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:18,26:0.59:44
chr7	157263391	.	G	T	498	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MMLQ=28;MQ=54.77;NF=21;NR=11;PP=498;QD=16.6491003921;SC=CGCTGGCCTGGGTTGGGTGTG;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=32;WE=157263399;WS=157263381;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:25,32:0.56:57
chr7	157263410	.	C	T	700	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=24;MQ=55.63;NF=21;NR=14;PP=700;QD=20.9934632156;SC=TGTCCGTGTGCCCGGTGCTGG;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=65;TCF=43;TCR=22;TR=35;WE=157263418;WS=157263400;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:30,35:0.54:65
chr7	157263532	rs7785035	C	T	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.942;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=658;ReadPosRankSum=-0.598;SC=TTGAATCTCCCAACATCCAAC;SOR=0.357;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=55;TCF=11;TCR=44;TR=35;WE=157263540;WS=157263522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,35:0.62:56
chr7	157318438	.	G	C	509	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=57.36;NF=16;NR=6;PP=509;QD=24.7168732976;SC=GCCGTGTGCAGTGTCGCAGGG;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=22;WE=157318446;WS=157318428;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:23,22:0.49:45
chr7	157333542	rs1124400	C	T	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=18;PP=563;SC=CCTGCCACAGCGTCGGCTCCC;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=157333550;WS=157333532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr7	157361564	rs7789467	C	T	5657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=135;NR=45;PP=2965;ReadPosRankSum=0.464;SC=AGCTCTGAGCCGCAACAAAGC;SOR=1.138;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=181;TCF=136;TCR=45;TR=180;WE=157361572;WS=157361554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,178:0.99:179
chr7	157361734	rs221294	T	C	6720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=129;PP=2965;SC=TAGTGACAGTTCATTTCCTTC;SOR=1.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=71;TCR=129;TR=199;WE=157361742;WS=157361724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr7	157367205	rs146248159	T	TGA	1695.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.297;NF=7;NR=38;PP=2192;ReadPosRankSum=1.145;SC=AGAGTAATAATGAGAGAGAGA;SOR=0.963;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=71;TCF=10;TCR=61;TR=45;WE=157367213;WS=157367195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,51:0.96:53
chr7	157369564	rs221301	C	G	1455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=39;PP=1188;SC=CACGTCTGACCAGAGAAGGGG;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=39;WE=157369572;WS=157369554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	157370645	rs736940	G	A	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=1;PP=671;SC=AATCCCATTCGGAGGAGGAGC;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=157370653;WS=157370635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr7	157370688	rs122004	C	G	1603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=7;PP=1089;SC=GTGGGTCCTGCCCTGGGTGGC;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=40;WE=157370696;WS=157370678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr7	157396697	rs17853260	G	A	2326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=33;PP=1757;SC=CACTTACGATGGGGCTAGCGT;SOR=0.927;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=39;TCR=33;TR=72;WE=157396705;WS=157396687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr7	157406819	rs10247739	A	C	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.07;ReadPosRankSum=-0.335;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr7	157414064	rs1130502	G	A	1408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=5.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.714;NF=48;NR=2;PP=1124;ReadPosRankSum=0.713;SC=AGGTCAGCACGGCCAGGGAGC;SOR=0.883;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=77;TCR=3;TR=50;WE=157414072;WS=157414054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,51:0.65:79
chr7	157414283	rs71538031	T	C	1365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.689;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=47;PP=2025;ReadPosRankSum=1.508;SC=CGGAGGCCTTTGCACTCGCCG;SOR=0.292;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=80;TCF=6;TCR=74;TR=52;WE=157414303;WS=157414273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,58:0.69:84
chr7	157414295	rs34179692	G	A	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.790;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=37;PP=2025;ReadPosRankSum=0.400;SC=CACTCGCCGCGTGGGCCATGC;SOR=0.434;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=61;TCF=5;TCR=56;TR=41;WE=157414303;WS=157414273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,46:0.71:65
chr7	157462117	rs5888726	G	GCA	791.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.215;NF=22;NR=1;PP=908;ReadPosRankSum=-0.821;SC=GTTTGCACGCGCACACACACA;SOR=1.151;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=48;TCF=46;TCR=2;TR=23;WE=157462125;WS=157462107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr7	157462425	rs755703	T	C	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=36;PP=666;ReadPosRankSum=-0.105;SC=CTTCTAAATGTGGAACAGTCT;SOR=1.893;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=36;WE=157462433;WS=157462415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,37:0.71:52
chr7	157462464	rs1079359	A	G	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=533;ReadPosRankSum=0.820;SC=GTAGGAAAAAAGCGGCCTCTC;SOR=1.547;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=23;WE=157462472;WS=157462454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr7	157691523	rs56112490	T	C	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=38;PP=1090;ReadPosRankSum=0.157;SC=AAAATTTCAATTACATGACTG;SOR=0.815;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=72;TCF=14;TCR=58;TR=47;WE=157691531;WS=157691513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,51:0.65:78
chr7	157800838	rs143545915	AGT	A	1866.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.045;NF=51;NR=0;PP=2153;ReadPosRankSum=-1.029;SC=CACATGTGTGAGTGTGTGTGG;SOR=1.522;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=91;TCF=88;TCR=3;TR=51;WE=157800847;WS=157800828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,52:0.66:79
chr7	157800899	rs12666418	C	T	3516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.639;NF=99;NR=29;PP=2900;ReadPosRankSum=-0.734;SC=TGGGCATGTGCATACACACTG;SOR=0.688;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=176;TCF=137;TCR=39;TR=128;WE=157800907;WS=157800889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,130:0.72:181
chr7	157873975	rs3800863	T	C	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=492;ReadPosRankSum=0.483;SC=TACGTGTGTGTGGAAACAGCC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=23;WE=157873983;WS=157873965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr7	157926349	rs17847428	T	G	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=21;NR=3;PP=701;SC=CACAGGAGCTTAGCCAGGGCT;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=157926357;WS=157926339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr7	157959895	rs1130496	C	T	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=458;ReadPosRankSum=-0.452;SC=GAGGTCCTCGCGGAGCTGGGT;SOR=0.726;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=107;TCF=57;TCR=50;TR=32;WE=157959903;WS=157959885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,33:0.29:112
chr7	157959911	rs1130495	A	G	3780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=44;PP=2774;SC=TGGGTCCGGGACCCGGGAGGG;SOR=0.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=56;TCR=44;TR=100;WE=157959919;WS=157959901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr7	157984992	rs3800856	G	A	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=558;SC=AGCCAACCCCGGCCCGGGGAG;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=157985000;WS=157984982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr7	157985149	rs3800855	C	G	5074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=99;NR=58;PP=2965;SC=GCCCTCCCGACTGTACCTCCT;SOR=1.324;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=99;TCR=58;TR=157;WE=157985157;WS=157985139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr7	158109492	.	C	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.528;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=152;ReadPosRankSum=0.000;SC=CGCCGAGCCTCGGCCCACGCC;SOR=0.984;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=9;WE=158109500;WS=158109482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr7	158325310	rs55857496	C	CAA	4115.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.213;NF=63;NR=8;PP=2028;ReadPosRankSum=0.292;SC=AAGAAAAGACCAAAAACGTCA;SOR=2.833;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=88;TCF=79;TCR=9;TR=71;WE=158325324;WS=158325300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
chr7	158325316	rs34189096	C	A	4309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.232;NF=81;NR=10;PP=2525;ReadPosRankSum=0.697;SC=AGACCAAAAACGTCACTAAAC;SOR=2.564;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=82;TCR=10;TR=91;WE=158325324;WS=158325300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
chr7	158325338	rs12670231	G	A	3663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.442;HP=3;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.214;NF=91;NR=24;PP=2945;ReadPosRankSum=1.194;SC=TCAAAAACCCGGGACATGATG;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=116;TCF=91;TCR=25;TR=115;WE=158325346;WS=158325328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,118:0.99:119
chr7	158325572	rs4909238	T	C	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=21;PP=498;SC=CAGACCATCTTGATGGCTCAG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=158325580;WS=158325562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr7	158380138	.	G	GA	51	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=51;QD=47.0;SC=CTCTCCCCCCGACCCCTCAGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=158380146;WS=158380128;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr7	158384305	rs67404380	CTGTG	C	1821.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.424;NF=32;NR=8;PP=1971;ReadPosRankSum=1.118;SC=CTGTGTCTGTCTGTGTAAGAA;SOR=1.654;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=40;WE=158384316;WS=158384295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr7	158384590	rs10277152	T	C	1042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=28;PP=864;SC=TGGGTTATTCTTTGATTACAA;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=158384598;WS=158384580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr7	158424508	rs11973267	A	G	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=170;SC=GTTTGCAACCATGCATTTAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=158424516;WS=158424498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr7	158438186	rs2290393	G	A	4631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=97;NR=41;PP=2965;SC=CCACCTTCCAGATGACAGAGG;SOR=1.745;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=97;TCR=41;TR=138;WE=158438194;WS=158438176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr7	158444975	rs1466210	T	G	1927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=7;PP=1468;SC=TCCTGGGGAGTTCTGAGTACC;SOR=3.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=48;TCR=7;TR=55;WE=158444983;WS=158444965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr7	158445267	rs5888763	C	CA	149.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=179;SC=AAAATGGTAACAAAAAAGAGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=158445275;WS=158445257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr7	158450965	rs12533939	A	T	3975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=93;NR=28;PP=2965;SC=ACATGAATTAATAATTCAGCA;SOR=2.379;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=93;TCR=29;TR=121;WE=158450973;WS=158450955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr7	158455089	rs4484634	G	A	1699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=29;PP=1278;SC=ATTGTGAAAGGATCTAATCAT;SOR=1.061;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=50;TCF=20;TCR=30;TR=49;WE=158455097;WS=158455079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr7	158456710	rs10227735	C	T	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=481;SC=CTACAAAGGACATATAGCAAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=158456718;WS=158456700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr7	158457095	rs2290392	G	C	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=9;PP=362;SC=CTATTTTAAGGGAAATCATTC;SOR=1.371;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=15;WE=158457103;WS=158457085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr7	158473339	rs2305470	G	T	1491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=3;PP=1246;SC=ATTGTAATTTGGACTTAGAGT;SOR=5.330;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=44;WE=158473347;WS=158473329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr7	158476148	rs6969248	G	A	6776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=125;PP=2965;SC=CAAGCAGTGCGGCATTTGAGT;SOR=1.126;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=211;TCF=85;TCR=126;TR=210;WE=158476156;WS=158476138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr7	158528158	rs3816461	C	G	2084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=24;PP=1680;SC=ATTTTACAAACTGCAGGAACT;SOR=1.306;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=40;TCR=24;TR=64;WE=158528178;WS=158528148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr7	158528170	rs7787974	G	A	2450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=26;PP=1980;SC=GCAGGAACTGGTTGAGGATTC;SOR=1.488;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=49;TCR=26;TR=74;WE=158528178;WS=158528148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr7	158534163	rs66689505	T	TG	711.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=24;NR=0;PP=788;SC=CAGCGTGGGGTGGGGGGCGCT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=24;WE=158534171;WS=158534153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr7	158552331	rs896859	C	G	3909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=92;PP=2923;SC=GATACTATTTCTATCTGATTG;SOR=2.948;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=20;TCR=92;TR=112;WE=158552339;WS=158552321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr7	158552398	rs896860	C	T	1894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=53;PP=1564;SC=ATCCATGCAACAGAGACAGAA;SOR=4.840;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=55;TCF=2;TCR=53;TR=55;WE=158552406;WS=158552388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr7	158555706	rs844521	C	T	1880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=6;PP=1406;SC=TTAAAACATACTTTTGATTAT;SOR=4.066;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=48;TCR=6;TR=54;WE=158555714;WS=158555696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr7	158560621	rs2602542	A	C	2032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=57;PP=1758;SC=TACAACCTGCATTTCAATTCT;SOR=8.121;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=0;TCR=58;TR=57;WE=158560629;WS=158560611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr7	158566138	rs842447	T	C	3371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=63;PP=2477;SC=TTCCAATTATTGAATCAGGTG;SOR=1.129;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=42;TCR=63;TR=105;WE=158566146;WS=158566128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr7	158566217	rs842448	C	T	2657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=64;PP=2141;SC=CTTCATCCTTCGTAATATACC;SOR=3.428;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=11;TCR=64;TR=75;WE=158566225;WS=158566207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr7	158586138	rs2602552	T	C	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=299;SC=TTATTTAACATATTTTATGAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=158586146;WS=158586135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr7	158590512	rs2788501	T	A	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=2;PP=712;SC=GCCACTGCACTCCAGCCTGGG;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=158590520;WS=158590502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	158590547	rs11404991	G	GA	699.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=3.667;HP=15;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.756;NF=23;NR=2;PP=389;ReadPosRankSum=0.659;SC=TCCGTCTCAAGAAAAAAAAAA;SOR=2.441;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=59;TCF=51;TCR=8;TR=25;WE=158590555;WS=158590537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,35:0.83:42
chr7	158591851	rs2709855	C	T	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=10;PP=286;SC=TCTCATCATACGTCCTATGTT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=158591859;WS=158591841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr7	158621637	rs4599756	G	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.680;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=131;ReadPosRankSum=1.600;SC=GGGTGGGTGGGGGACTACGAA;SOR=0.065;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=8;WE=158621645;WS=158621627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr7	158622481	rs74811915	T	C	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.774;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=35;ReadPosRankSum=-0.814;SC=CTGCGTCCCCTCGAGCCCCAC;SOR=0.030;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=6;WE=158622489;WS=158622471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr7	158649280	rs2788473	T	C	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.939;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=125;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TGGGCAGTGCTTCTGGGCCCT;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=7;WE=158649288;WS=158649270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr7	158649304	rs2788472	T	C	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=364;SC=CTGCTCCTGCTTGTCGGTTGC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=158649312;WS=158649294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr7	158649373	rs2657385	A	G	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=12;PP=486;SC=TTCGGGGTGGACCGCGCCTGG;SOR=1.127;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=20;WE=158649381;WS=158649363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr7	158662182	rs842695	G	A	2099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=24;PP=1521;ReadPosRankSum=-0.833;SC=CATTTGGGACGTGAGTCTGTT;SOR=0.657;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=75;TCR=35;TR=75;WE=158662190;WS=158662172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,80:0.68:117
chr7	158662250	rs712199	T	C	1848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.500;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=56;PP=1254;ReadPosRankSum=-0.487;SC=ACAGAATATTTGTCCTTCCTC;SOR=1.485;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=110;TCF=34;TCR=76;TR=75;WE=158662258;WS=158662240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,81:0.68:119
chr7	158662511	rs3057377	T	TTTTAAAC	2386.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.39;QD=46.80;SOR=4.133;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr7	158662689	rs2308132	CTT	C	2154.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.103;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=34;PP=1598;ReadPosRankSum=-0.476;SC=CACTGTATAACTTTGGTTATG;SOR=1.134;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=77;TCF=19;TCR=58;TR=43;WE=158662706;WS=158662679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,55:0.59:94
chr7	158662698	rs842696	T	C	3450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=56;PP=2297;SC=ACTTTGGTTATGTGTGCCTCA;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=23;TCR=56;TR=79;WE=158662706;WS=158662679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr7	158664074	rs145233696	TGAA	T	3848.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.15;MQRankSum=0.967;NF=36;NR=42;PP=2954;ReadPosRankSum=0.341;SC=AAAGAAAAGCTGAAGGAGAAA;SOR=0.743;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=58;TCR=67;TR=78;WE=158664084;WS=158664064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,97:0.69:141
chr7	158672476	rs2709859	C	G	6244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=129;NR=53;PP=2965;SC=ATCGAGACAACAAACACCGAG;SOR=1.805;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=182;TCF=129;TCR=53;TR=182;WE=158672484;WS=158672466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr7	158672619	rs2788478	A	G	5265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.787;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.089;SC=GAGAGGCACCAAAGCAACGTG;SOR=0.800;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=171;TCF=70;TCR=101;TR=170;WE=158672627;WS=158672609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,176:0.99:177
chr7	158679943	rs35814547	AATTG	A	312.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQRankSum=1.810;QD=6.95;ReadPosRankSum=-0.053;SOR=0.111;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,11:0.24:45
chr7	158684152	rs12672574	A	G	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=27;PP=563;ReadPosRankSum=-0.952;SC=GAACATGAGCATGAAGGGACA;SOR=0.677;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=16;TCR=87;TR=32;WE=158684160;WS=158684142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,34:0.32:105
chr7	158694530	rs842703	T	C	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=436;ReadPosRankSum=-0.735;SC=GTTAAAACTTTCCTTAGCTTA;SOR=1.022;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=21;WE=158694538;WS=158694520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr7	158704054	rs3815215	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=22;ReadPosRankSum=0.082;SC=TCACACACCAGGTTCCCACGA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=4;WE=158704062;WS=158704052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr7	158711295	rs2301900	T	C	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=292;ReadPosRankSum=0.490;SC=CCGTATCGTTTTTCTTGTAGT;SOR=0.287;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=14;WE=158711303;WS=158711285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr7	158711643	rs3216979	AT	A	275.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.083;NF=0;NR=12;PP=361;ReadPosRankSum=-1.475;SC=ATAATATTTTATTTTAATGTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=12;WE=158711651;WS=158711633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr7	158715219	rs2730238	A	G	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.150;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=241;ReadPosRankSum=-0.620;SC=GGCCACAGAAAGTTCTGATAT;SOR=2.194;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=14;WE=158715227;WS=158715209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,15:0.28:53
chr7	158715264	rs6459913	A	G	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=180;ReadPosRankSum=-1.195;SC=TGAGAGTCGCACGTTTGATGG;SOR=0.324;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=11;WE=158715272;WS=158715254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr7	158719084	rs2244789	C	T	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.492;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=185;ReadPosRankSum=1.153;SC=TTGTTTCTGTCTTCATCAGAA;SOR=0.325;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=52;TCF=10;TCR=42;TR=13;WE=158719092;WS=158719074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr7	158726798	rs34181207	T	TC	122.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.183;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.735;NF=2;NR=1;PP=29;ReadPosRankSum=-0.406;SC=CATCTGTTCATTTTGTTACTT;SOR=0.132;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=3;WE=158726806;WS=158726788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr7	158727015	rs35962377	C	CT	544.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=715;ReadPosRankSum=0.359;SC=TTACTCTTTTCTTTATAAAGT;SOR=0.763;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=74;TCF=67;TCR=7;TR=22;WE=158727023;WS=158727005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,24:0.34:71
chr7	158827326	rs2071624	G	A	2928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=56;PP=2222;SC=CACTGTGGTCGTTTGTATCCC;SOR=1.289;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=35;TCR=57;TR=91;WE=158827334;WS=158827316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr7	158827401	rs1017033	A	G	900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=25;PP=767;SC=ACAGGTACAGAAGAATGAGCG;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=158827422;WS=158827391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr7	158827414	rs2071623	T	C	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=24;PP=577;SC=AATGAGCGCCTGCCCCTCCCA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=158827422;WS=158827391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr7	158829285	rs2730223	T	C	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=0;PP=848;SC=ATGTGTTGTTTGTAGGAGCCT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=158829293;WS=158829275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr7	158835631	rs2540353	A	G	2253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=12;PP=1837;SC=CCCTGACAGGAACCCTGCACC;SOR=3.040;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=57;TCR=12;TR=69;WE=158835639;WS=158835621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr7	158851234	rs2098349	T	G	4534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=63;PP=2965;SC=TGTAGCCCAGTGTATAAATGG;SOR=0.797;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=68;TCR=64;TR=131;WE=158851242;WS=158851224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr7	158851804	rs2730257	C	T	1389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=0;PP=1245;SC=TTAGCAAGGTCCATGGCTTGA;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=43;WE=158851812;WS=158851794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr7	158930629	rs3812310	T	C	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.194;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=224;ReadPosRankSum=-0.081;SC=CCATCAATATTGACATCAGAG;SOR=1.593;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=68;TCF=51;TCR=17;TR=18;WE=158930637;WS=158930619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,21:0.30:70
chr7	158930751	rs3812311	T	C	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.342;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=482;ReadPosRankSum=0.779;SC=CTGCCTTGAATATCTGCTGAG;SOR=1.114;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=74;TCF=19;TCR=55;TR=23;WE=158930759;WS=158930741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,26:0.32:81
chr7	158930775	rs3812312	G	A	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=379;ReadPosRankSum=-0.262;SC=CACGAACAGCGAGCTCCCACC;SOR=0.625;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=61;TCF=14;TCR=47;TR=20;WE=158930783;WS=158930765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,23:0.35:65
chr7	158935029	rs71302077	C	CT	45.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQRankSum=0.660;QD=1.63;ReadPosRankSum=0.186;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr7	158935333	rs439204	G	C	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=613;SC=AACCTCACAGGTTTAAACTGC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=158935341;WS=158935323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	182710	rs140526205	G	C	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=7.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.85;MQRankSum=-1.169;QD=13.07;ReadPosRankSum=0.431;SOR=0.472;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr8	182934	rs75792622	T	C	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.432;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.486;NF=33;NR=6;PP=717;ReadPosRankSum=1.491;SC=CTCGTGCTTCTGCACAATCGC;SOR=1.711;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=94;TCF=69;TCR=25;TR=39;WE=182942;WS=182924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr8	182949	rs3008280	C	A	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.672;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.906;NF=39;NR=7;PP=984;ReadPosRankSum=-0.606;SC=AATCGCCTCCCACTAGCGGTG;SOR=1.739;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=103;TCF=79;TCR=24;TR=46;WE=182957;WS=182939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,43:0.48:89
chr8	194596	rs149135623	C	CT	1510.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.976;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.445;NF=58;NR=7;PP=887;ReadPosRankSum=0.589;SC=TATATAGCATCTTTTTTTTTT;SOR=0.826;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=163;TCF=142;TCR=21;TR=65;WE=194604;WS=194586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,74:0.47:159
chr8	194884	rs2906331	C	T	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=207;ReadPosRankSum=0.703;SC=GACAGGACAACTGTACAAACT;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=11;WE=194892;WS=194874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr8	261290	rs56233128	G	C	2519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.761;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.818;NF=16;NR=75;PP=2052;ReadPosRankSum=-0.270;SC=TGGAAACTGAGAGAAGTGAGT;SOR=0.844;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=159;TCF=30;TCR=129;TR=91;WE=261298;WS=261280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,92:0.56:164
chr8	280241	rs7388619	A	G	4150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=31;PP=2965;SC=ACAGCACACCACTCGCACACT;SOR=2.436;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=113;TCR=31;TR=143;WE=280249;WS=280231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr8	280391	rs4976858	T	G	1497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.004;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=48;PP=1170;ReadPosRankSum=-0.583;SC=AAGATTATGTTCACATACGTG;SOR=0.967;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=113;TCF=20;TCR=93;TR=57;WE=280399;WS=280381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,58:0.50:115
chr8	280468	rs6984826	T	A	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=360;ReadPosRankSum=0.062;SC=AAGATAATTATTGACTACCCA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=16;WE=280476;WS=280458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
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chr8	608018	rs6993769	C	T	2837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=6.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.266;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=32;PP=1722;ReadPosRankSum=1.477;SC=GGGCCCCACCCGATCCCCACG;SOR=0.725;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=152;TCF=75;TCR=77;TR=74;WE=608026;WS=608008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,76:0.49:156
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chr8	608279	rs1703925	A	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.636;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=161;ReadPosRankSum=-0.075;SC=CTGGGGAGAGAGGCTGGTTCC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=608287;WS=608269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr8	609834	.	CATCCTGGGGAGGGGGTGACCATCGAGATCTCCAGTGTGCACTGAAT	C	1635.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=0.000;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=3.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQRankSum=0.925;QD=10.16;ReadPosRankSum=-1.695;SOR=0.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,48:0.30:161
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chr8	609879	.	AT	CC	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=56.47;NF=36;NR=18;PP=2944;QD=20;SC=TGTGCACTGAATATCCTGGGG;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=175;TCF=122;TCR=53;TR=54;WE=609888;WS=609857;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:121,54:0.31:175
chr8	618728	rs2271263	A	G	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.700;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=36;PP=905;ReadPosRankSum=-0.503;SC=TGTGTGACGCAAGGCGGTCCA;SOR=0.295;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=80;TCF=6;TCR=74;TR=40;WE=618736;WS=618718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,43:0.51:85
chr8	623156	rs6559065	G	C	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=204;ReadPosRankSum=-0.801;SC=ACTTATATTAGTTGCCTTACA;SOR=0.560;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=11;WE=623164;WS=623146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
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chr8	676308	rs56948427	G	A	3479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.039;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=85;PP=2555;ReadPosRankSum=-0.492;SC=GTACAAACACGCCACACGCAG;SOR=0.850;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=271;TCF=118;TCR=153;TR=145;WE=676316;WS=676298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,149:0.54:275
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chr8	1617788	.	GAGAGCCGGGCCCGTGCGGCGCTGGTAGCT	G	1386.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=2964;ReadPosRankSum=-1.371;SC=GGAGCGTGCTGAGAGCCGGGC;SOR=1.278;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=12;WE=1617825;WS=1617783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,36:0.62:58
chr8	1749388	rs7017381	C	T	3880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=50;PP=2941;SC=CACTCAGAAGCGGACTCCCTG;SOR=1.117;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=69;TCR=50;TR=119;WE=1749396;WS=1749378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr8	1749410	rs7003112	T	A	4007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=65;PP=2955;SC=CCTGCTAAACTACCCTTGAAA;SOR=0.822;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=56;TCR=65;TR=121;WE=1749418;WS=1749400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr8	1749513	rs12541297	C	T	1554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=42;PP=1199;SC=GTGACTTGCACGTATATGCCC;SOR=6.316;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=43;WE=1749521;WS=1749503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr8	1791433	rs11136431	C	T	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.456;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=36;ReadPosRankSum=0.245;SC=TTCCTTTTTGCGGGGTTCTCT;SOR=0.160;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=5;WE=1791441;WS=1791423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr8	1791638	rs11136432	T	G	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.803;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=151;ReadPosRankSum=-0.983;SC=GTGGGTCAGGTTGTGCTGCTG;SOR=0.169;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=13;WE=1791646;WS=1791628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr8	1791663	rs11136433	G	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=7.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.78;ReadPosRankSum=-0.142;SOR=0.048;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
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chr8	1791685	rs11136435	A	G	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=258;ReadPosRankSum=0.217;SC=GAACCACTGAATTGCTGGTCA;SOR=0.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=6;WE=1791693;WS=1791653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr8	1806045	rs28650492	G	T	264.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.745;NF=25;NR=0;PP=580;ReadPosRankSum=2.407;SC=TAGATCGATCGATCTATCTAT;SOR=0.204;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=25;WE=1806053;WS=1806035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr8	1806229	rs4875950	A	C	3154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.519;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=69;PP=2454;ReadPosRankSum=0.299;SC=GACAGGCCCCATCCGCCCCTG;SOR=0.653;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=204;TCF=83;TCR=121;TR=117;WE=1806237;WS=1806219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,120:0.58:208
chr8	1806332	.	G	GGGTCCCC	1345.76	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.799;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=10.265;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=32.04;ReadPosRankSum=-0.266;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,40:0.95:42
chr8	1806333	.	AG	GA,GG	558	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MMLQ=29;MQ=57.11;NF=0,1;NR=26,49;PP=531,558;QD=22.4795336485;SC=TCCCCAGGTGAGTCCCCAGGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=2;TCR=50;TR=26,50;WE=1806342;WS=1806323;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.50:52
chr8	1806333	.	A	AGGTGG	1345.76	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.925;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=9.233;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=40.78;ReadPosRankSum=-0.416;SOR=5.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,31:0.94:33
chr8	1812475	rs113923099	ACAT	A	5876.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=455;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.424;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.236;NF=96;NR=35;PP=2966;ReadPosRankSum=-0.381;SC=AAGGGTAAAAACATCAACTTC;SOR=0.517;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=411;TCF=304;TCR=107;TR=131;WE=1812485;WS=1812465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:281,163:0.37:444
chr8	1814588	rs67268874	GACAC	G,GAC	1498.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.17;QD=32.58;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,13,33:0.28,0.72:46
chr8	1817286	rs10503168	G	T	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=0;PP=975;ReadPosRankSum=0.361;SC=ATCGGCGACTGTGGCCCTGTA;SOR=0.633;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=89;TCF=89;TCR=0;TR=44;WE=1817294;WS=1817276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,46:0.48:95
chr8	1870956	rs4242549	G	A	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=306;SC=TTCCAAATAAGTGTTAGAAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=1870964;WS=1870946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	1882252	rs3758021	A	T	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=3.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.84;ReadPosRankSum=-0.486;SOR=0.154;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr8	1882261	rs3758022	G	T	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=2.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.99;ReadPosRankSum=-0.457;SOR=0.191;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr8	1900855	rs7832438	A	G	2675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=18;PP=2138;SC=GAAGCCACTCATGTCTTTCCG;SOR=2.882;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=78;TCR=18;TR=95;WE=1900863;WS=1900845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr8	1901110	rs74808197	G	C	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=25;PP=746;SC=ATTATCTGTGGTTTTTCAGTG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=1901118;WS=1901100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	1901177	rs80299596	A	G	272.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=223;SC=ATATTTTTCCATTTTTTACCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=1901185;WS=1901167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr8	1999138	rs140407632	G	GCCA	873.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=1099;ReadPosRankSum=-2.039;SC=CCCAGGTCCTGCCACGGAGCA;SOR=0.954;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=14;WE=1999154;WS=1999128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
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chr8	2007230	rs6558591	A	C	3551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.824;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=33;PP=2759;ReadPosRankSum=1.654;SC=CACACACAAAATACAACTCTG;SOR=0.335;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=244;TCF=193;TCR=51;TR=134;WE=2007238;WS=2007220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,140:0.56:248
chr8	2020366	rs13251504	A	C	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=19.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=-1.178;QD=7.99;ReadPosRankSum=-2.403;SOR=4.553;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
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chr8	2021421	rs2272720	G	T	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=9.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.69;ReadPosRankSum=0.448;SOR=0.229;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,36:0.27:132
chr8	2024207	rs7822836	A	C	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=23;NR=0;PP=672;SC=TGCCTTTTCTATCCCTGCCCC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=2024215;WS=2024197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	2024405	rs3817698	G	A	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.876;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=391;ReadPosRankSum=-0.738;SC=CGTTCCGCATGGAATCTTACC;SOR=1.863;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=18;WE=2024413;WS=2024395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr8	2024437	rs3817699	C	T	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=1.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.56;ReadPosRankSum=-1.033;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr8	2024446	rs3817700	CG	TA	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=2.593;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.57;ReadPosRankSum=0.065;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr8	2027633	rs1440291	C	G	2596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.164;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=20;PP=2013;ReadPosRankSum=1.118;SC=CAACCTTTCTCTCCGCAGCCG;SOR=1.279;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=139;TCF=103;TCR=36;TR=90;WE=2027641;WS=2027623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,93:0.65:144
chr8	2033579	rs59220531	A	G	1627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.273;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=55;PP=1307;ReadPosRankSum=-1.155;SC=CCCCACTGTCATGATCTCTGT;SOR=2.400;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=89;TCF=7;TCR=82;TR=57;WE=2033587;WS=2033569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,59:0.66:90
chr8	2033641	.	T	C	696	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=23;MQ=57.06;NF=1;NR=26;PP=696;QD=27.0656004647;SC=TCGTGATCTCTGCGTGGCCCC;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=27;WE=2033656;WS=2033631;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr8	2033647	.	GCC	G	95	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=23;MQ=55.86;NF=0;NR=7;PP=95;QD=17.1428571429;SC=TCTCTGCGTGGCCCCCCACTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=7;WE=2033656;WS=2033631;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,7:0.37:19
chr8	2037747	rs3817703	C	G	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=0;PP=912;ReadPosRankSum=-0.273;SC=GGGATAGCGACAACAGAGCAT;SOR=1.651;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=54;TCR=0;TR=36;WE=2037755;WS=2037737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,38:0.68:56
chr8	2037833	rs2294061	G	C	2653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=6.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.198;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=12;PP=2162;ReadPosRankSum=0.527;SC=CTTTGTAGTCGGTGGTGGGGA;SOR=1.242;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=169;TCF=143;TCR=26;TR=97;WE=2037841;WS=2037823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,97:0.58:168
chr8	2038052	rs2294063	G	A	2655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.939;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=91;PP=2162;ReadPosRankSum=-0.641;SC=GTCAGGATGGGCTAAGAGTGG;SOR=1.835;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=163;TCF=5;TCR=158;TR=92;WE=2038060;WS=2038042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,96:0.57:168
chr8	2040298	rs2235122	C	T	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.805;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=30;PP=619;ReadPosRankSum=0.932;SC=GCTGTGTGGCCGGAACCAACC;SOR=0.801;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=122;TCF=32;TCR=90;TR=40;WE=2040306;WS=2040288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,41:0.33:126
chr8	2040337	rs6420202	T	C	2253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=58;PP=1709;SC=ACAAGCCCATTGGATACAACA;SOR=2.690;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=15;TCR=58;TR=73;WE=2040345;WS=2040327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr8	2042070	rs7828132	T	C	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=390;ReadPosRankSum=-1.804;SC=TGAAGCCTCTTGGTTGGCTGC;SOR=0.416;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=0;TCR=52;TR=22;WE=2042078;WS=2042060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,22:0.42:53
chr8	2044363	rs7834633	A	G	1830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=51;PP=1534;SC=ACATTAGATAATTTGATACAG;SOR=4.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=4;TCR=51;TR=55;WE=2044385;WS=2044353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr8	2044376	rs7815778	GG	AC	2300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=44;PP=2813;SC=TGATACAGACGGAAAAATGGA;SOR=6.518;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=45;WE=2044385;WS=2044353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr8	2044426	rs7820357	C	A	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=52;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=27;PP=885;SC=TTTTGGAGCTCAAAAGATCCT;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=2044434;WS=2044416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	2046526	rs7817175	T	C	1834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=2;PP=1546;ReadPosRankSum=-0.933;SC=TGCAGCTCGTTGGCCACATCG;SOR=4.370;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=54;TCF=52;TCR=2;TR=53;WE=2046534;WS=2046516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr8	2046880	rs2294067	G	C	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=32;PP=1009;SC=GCCTCTGTGGGTGCGACTCTG;SOR=3.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=36;WE=2046888;WS=2046870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
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chr8	2048811	rs4876227	A	C	10588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=219;PP=2965;SC=GGATCACTGTAAATCAGACGA;SOR=1.639;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=322;TCF=103;TCR=219;TR=322;WE=2048819;WS=2048801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,329:1.00:329
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chr8	2071002	rs6558607	T	C	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=521;ReadPosRankSum=-0.261;SC=CGTCTGAGACTGTCTATAGTA;SOR=0.954;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=22;WE=2071010;WS=2070995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr8	2071261	rs71270475	A	AGAC	8616.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=114;PP=2957;SC=GAGTAACACAAGAAAGCAAAA;SOR=1.661;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=186;TCF=59;TCR=127;TR=164;WE=2071269;WS=2071251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
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chr8	2071673	rs2280898	T	C	1876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=50;PP=1532;SC=CTTTGGTTGCTTTCAGAGTTT;SOR=7.978;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=50;WE=2071681;WS=2071663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr8	2077072	rs2280902	A	G	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.508;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=3;PP=737;ReadPosRankSum=-1.004;SC=TCACACAGCAAGCACTCCTTT;SOR=1.426;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=74;TCF=66;TCR=8;TR=32;WE=2077080;WS=2077062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,33:0.45:73
chr8	2088868	rs3736658	T	G	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=264;ReadPosRankSum=0.241;SC=ATTTAGATGCTGAAGGGAGGG;SOR=0.384;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=14;WE=2088876;WS=2088858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr8	2091139	rs2280903	A	G	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.548;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=339;ReadPosRankSum=-1.301;SC=CTCCTCATCTACCTTCCCTTG;SOR=0.018;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=14;WE=2091147;WS=2091129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr8	2112041	rs1036688	A	G	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.400;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.492;NF=40;NR=11;PP=902;ReadPosRankSum=-1.741;SC=GAAATAGTGAAGTAGTATGCT;SOR=1.049;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=165;TCF=118;TCR=47;TR=51;WE=2112049;WS=2112031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,53:0.31:169
chr8	2112080	rs33945248	G	GTT	1785.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=32;PP=884;ReadPosRankSum=0.038;SC=AGAAAATGAAGTTTTTTTTTT;SOR=0.641;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=208;TCF=92;TCR=116;TR=63;WE=2112088;WS=2112070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,68:0.36:189
chr8	2148429	rs2618847	T	A	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.06;ReadPosRankSum=0.871;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr8	2148429	.	TGC	AGT	349	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=7;NR=1;PP=349;QD=50.3084843578;SC=TGTGTGTGCATGCGTGTGTGC;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=8;WE=2148439;WS=2148419;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,8:0.62:13
chr8	2148431	rs2618846	C	T	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.81;ReadPosRankSum=0.878;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr8	2148550	rs2618845	G	A	1267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=21;PP=836;SC=TGTGCATGCTGTATTTATGTG;SOR=0.883;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=18;TCR=21;TR=39;WE=2148558;WS=2148540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr8	2148587	rs138518302	TATGTGTGTACATATGTAC	T	452.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=2302;ReadPosRankSum=-0.754;SC=TGCAGGTGTGTATGTGTGTAC;SOR=0.693;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=8;WE=2148612;WS=2148577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr8	2148771	rs7008255	C	T	1493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=15;PP=1243;ReadPosRankSum=1.043;SC=CATGTGTTTGCGTCTGTGTGC;SOR=0.849;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=51;WE=2148779;WS=2148761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
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chr8	2796277	rs585000	C	T	4050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=76;PP=2965;SC=CTAAGGAAAACAGAAAACAAA;SOR=1.187;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=49;TCR=77;TR=125;WE=2796285;WS=2796267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr8	2799981	rs6997981	G	C	1991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.437;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=23;PP=1615;ReadPosRankSum=1.159;SC=AACAGATGGTGTTTCTGCAGT;SOR=0.868;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=96;TCR=43;TR=75;WE=2799989;WS=2799971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,76:0.54:141
chr8	2806920	rs5741961	G	GAAAGAAAAGA	1766.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.141;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.087;NF=2;NR=21;PP=2978;ReadPosRankSum=-0.971;SC=TGACACATAGGAAAGAAAAGA;SOR=1.143;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=75;TCF=8;TCR=67;TR=23;WE=2806928;WS=2806910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,44:0.47:94
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chr8	2820745	rs667859	G	C	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.893;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=16;PP=1612;ReadPosRankSum=-0.499;SC=AGAACTTACGGAGACACTGGG;SOR=1.282;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=131;TCF=94;TCR=37;TR=69;WE=2820753;WS=2820735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,73:0.54:136
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chr8	2910020	rs6558703	A	G	3798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=26;PP=2965;SC=TTACTCCACAACCCATCTTCT;SOR=2.554;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=90;TCR=26;TR=116;WE=2910028;WS=2910010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr8	2910223	rs6420209	C	T	3331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=90;PP=2818;SC=TATTTTCCAGCTATTAAAACC;SOR=5.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=6;TCR=91;TR=96;WE=2910231;WS=2910213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
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chr8	2954348	rs3112	C	A	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=283;ReadPosRankSum=-0.187;SC=GGTCACTGCTCTACAAAGATT;SOR=0.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=14;WE=2954356;WS=2954338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr8	2964003	rs10503192	T	C	3237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=15;PP=2618;SC=AATACAATTTTCCATGTTGAA;SOR=3.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=77;TCR=15;TR=92;WE=2964011;WS=2963993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr8	2965122	rs113534820	C	CTGTTTT	661.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=667;SC=TTCTTTGTTTCTGTTTTTGTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=11;WE=2965130;WS=2965112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	2965209	rs1531351	A	G	1736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=7;PP=1346;SC=GTCGTGCTGAATTCATGGTAT;SOR=3.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=50;WE=2965217;WS=2965199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr8	2965244	rs3824271	T	C	2548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=28;PP=1924;SC=TATTACCTATTTCGAAATCAT;SOR=1.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=48;TCR=28;TR=76;WE=2965252;WS=2965234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr8	2966072	rs3802291	G	T	1370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=5;PP=1054;SC=AACACTGCAGGAAACACCACA;SOR=3.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=43;WE=2966080;WS=2966062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr8	2966328	rs3802292	T	C	2396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=66;PP=1859;SC=GTGAGATTTATGGAAACTTTG;SOR=2.503;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=19;TCR=66;TR=85;WE=2966336;WS=2966318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr8	2967639	rs898512	G	T	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=573;SC=CAGAATTGTTGATCACAATTA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=2967647;WS=2967629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	2999929	rs2406569	A	T	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=198;ReadPosRankSum=-0.151;SC=CTTAAATACAATTTACATGTA;SOR=0.892;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=12;WE=2999937;WS=2999919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr8	3038525	rs259859	T	A	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=511;ReadPosRankSum=-0.739;SC=TTTCACAGTTTTAGAAAAATA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=23;WE=3038533;WS=3038515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr8	3038763	rs11785446	G	C	1043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.145;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=30;PP=806;ReadPosRankSum=-0.149;SC=AGATAGAATTGTAACACTACA;SOR=0.389;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=110;TCF=25;TCR=85;TR=41;WE=3038771;WS=3038753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,42:0.37:113
chr8	3038838	rs11785463	G	C	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=5.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=511;ReadPosRankSum=2.050;SC=AATCCCTACAGTTTGTCTGAT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=0;TCR=51;TR=22;WE=3038846;WS=3038828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr8	3045230	rs17319192	G	A	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=70;ReadPosRankSum=-0.483;SC=CCTGTTTCTTGATGGTCTTAC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=3045238;WS=3045220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr8	3045610	rs35871841	G	GTA	198.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=313;ReadPosRankSum=1.899;SC=ATATGTATATGTATATATATA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=7;WE=3045618;WS=3045600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr8	3046635	rs199581353	GTACA	G,TTACA	1987.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2,4;NR=18,30;PP=1534,2572;ReadPosRankSum=0.173;SC=AAGAGAAAATGTACATGAACA;SOR=2.765;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=55;TCF=4;TCR=51;TR=20,34;WE=3046646;WS=3046625;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.40,0.58:60
chr8	3059365	rs5888954	TA	T	1094.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=36;PP=1015;SC=AAGAATTTGGTAAAAAAATAA;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=36;WE=3059373;WS=3059355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	3072107	rs73183587	G	C	1178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.859;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=13;PP=902;ReadPosRankSum=-0.708;SC=GAATCTTATAGCCAGAGTCAC;SOR=0.955;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=79;TCF=52;TCR=27;TR=42;WE=3072115;WS=3072097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,45:0.52:86
chr8	3076959	rs28455997	T	C	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=255;ReadPosRankSum=0.709;SC=GGGCTCCATGTTGAAACTAAA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=12;WE=3076967;WS=3076949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr8	3077005	rs17079639	T	C	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=181;ReadPosRankSum=-1.111;SC=GGCTAACAGATATTTTATCTC;SOR=1.112;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=10;WE=3077013;WS=3076995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
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chr8	3141586	rs4875508	T	A	1561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=3;PP=1195;SC=GAGACGCTGGTGAATATAAAT;SOR=4.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=42;TCR=3;TR=45;WE=3141594;WS=3141576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
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chr8	3267161	rs3839873	A	AC	516.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.47;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=561;ReadPosRankSum=0.417;SC=CCCTTAAAAAAACACACACAA;SOR=0.892;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=15;WE=3267169;WS=3267151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr8	3351147	rs17066296	G	A	1913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.485;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=17;PP=1536;ReadPosRankSum=-0.971;SC=ATACTCACACGTACAAGACCG;SOR=1.141;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=144;TCF=107;TCR=37;TR=75;WE=3351155;WS=3351137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,74:0.50:149
chr8	3351195	rs56109797	C	A	1875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=30;PP=1461;ReadPosRankSum=0.281;SC=CACCAACCGTCAGGGTGTCAT;SOR=0.771;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=163;TCF=96;TCR=67;TR=77;WE=3351203;WS=3351185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,77:0.46:169
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chr8	3351362	rs10503206	C	G	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=446;ReadPosRankSum=-0.953;SC=ATGCCAATGTCAAATGATCCC;SOR=0.984;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=19;WE=3351370;WS=3351352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
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chr8	3565900	rs12674750	C	T	1713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.922;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=19;PP=1326;ReadPosRankSum=-2.631;SC=CTTACAAGGGCGTATCAATCC;SOR=0.368;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=135;TCF=104;TCR=31;TR=72;WE=3565908;WS=3565890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,72:0.53:137
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chr8	3566161	rs10105599	T	G	1836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=52;PP=1517;SC=ACCAAGTCAATGAAGTCAAAG;SOR=8.015;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=0;TCR=52;TR=52;WE=3566169;WS=3566151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr8	3611697	rs2720860	T	C	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=210;ReadPosRankSum=-0.486;SC=CATGTATTAATTGACTTTGAA;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=10;WE=3611705;WS=3611687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr8	3807319	rs2740867	C	G	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=461;SC=GCCTCTAACACATGGAAAGCT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=3807327;WS=3807309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	3807528	rs6984912	C	T	2136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.190;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=40;PP=1531;ReadPosRankSum=1.945;SC=ACTACATTTGCCAGGGTCCAC;SOR=0.588;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=169;TCF=87;TCR=82;TR=81;WE=3807536;WS=3807518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,84:0.49:171
chr8	3807553	rs11786061	G	A	2021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.579;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=48;PP=1425;ReadPosRankSum=-1.501;SC=TTTCCTGTGCGTATTTGCTGT;SOR=0.794;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=160;TCF=66;TCR=94;TR=80;WE=3807561;WS=3807543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,83:0.50:166
chr8	3855302	rs1863475	G	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.096;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=286;ReadPosRankSum=-0.395;SC=AGAGCAAGGCGAAAAAAGGAA;SOR=2.049;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=13;WE=3855310;WS=3855292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr8	3855369	rs11303985	GA	G	401.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.604;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.141;NF=12;NR=4;PP=402;ReadPosRankSum=0.791;SC=CTCGTTGGGGGAAAAAACGGG;SOR=0.211;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=16;WE=3855377;WS=3855359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr8	4494811	rs2617007	T	G	1288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=4;PP=1066;SC=CTAGATTTCATAATCTGTGTA;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=37;WE=4494819;WS=4494801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	4495107	rs2617008	G	C	3947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=83;PP=2965;SC=ACACAAAAAAGCATATTATTC;SOR=2.061;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=31;TCR=83;TR=113;WE=4495115;WS=4495097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr8	4495166	.	ATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	A	893.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.481;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.34;MQRankSum=2.002;QD=14.65;ReadPosRankSum=4.095;SOR=0.919;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,27:0.44:61
chr8	4495190	.	T	G	951.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-3.958;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.66;MQRankSum=5.059;QD=21.63;ReadPosRankSum=2.153;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr8	4495209	rs62486733	G	A	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.600;NF=1;NR=10;PP=111;ReadPosRankSum=0.685;SC=TTTTTGAGACGGAGTCTCGCT;SOR=0.307;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=11;WE=4495217;WS=4495199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr8	4851787	rs3860871	C	G	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=3;PP=794;ReadPosRankSum=1.062;SC=AAAACGCACACTCGCGTCCGC;SOR=0.610;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=61;TCF=56;TCR=5;TR=34;WE=4851795;WS=4851777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,35:0.56:63
chr8	6264130	rs2305023	G	C	2432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=63;NR=13;PP=2062;SC=CAGTGCCCGCGCGCGCCGCCA;SOR=3.116;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=77;TCF=64;TCR=13;TR=76;WE=6264138;WS=6264120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr8	6264358	.	CCTCCCCCGCTGCCTGTCCCACCAAAACCCCCTGCTCCTGCTCT	C	383.14	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.89;MQRankSum=0.000;QD=14.74;ReadPosRankSum=-1.607;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr8	6264378	.	A	C	357	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=55.69;NF=0;NR=13;PP=357;QD=30.136247119;SC=TGCCTGTCCCACCAAAACCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=13;WE=6264386;WS=6264368;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,13:0.87:15
chr8	6266693	rs1550698	C	T	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=665;ReadPosRankSum=1.168;SC=AGGCGTGAGCCACTGTGCCGG;SOR=0.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=27;WE=6266701;WS=6266683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,29:0.63:46
chr8	6266774	rs1550697	G	A	1502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.811;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=16;PP=1175;ReadPosRankSum=0.904;SC=TCAAATGTATGTTTCATGTTC;SOR=0.491;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=101;TCF=74;TCR=27;TR=57;WE=6266782;WS=6266764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,59:0.56:105
chr8	6272185	rs2440437	G	T	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=0;PP=608;SC=TCTGTCAGATGTTGAGAAACA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=6272193;WS=6272176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	6272399	rs2305022	G	T	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.827;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=739;ReadPosRankSum=-0.473;SC=TGCTCTGGGTGGAAAAGTAAG;SOR=0.458;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=93;TCF=27;TCR=66;TR=41;WE=6272407;WS=6272389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,43:0.43:99
chr8	6272457	rs2305021	T	G	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.484;HP=2;HapScore=2;MGOF=48;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=27;PP=657;ReadPosRankSum=1.807;SC=ATTGAAAATGTGTGGAGATAT;SOR=2.494;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=49;TCF=6;TCR=43;TR=29;WE=6272465;WS=6272447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr8	6272477	rs2515415	A	G	1606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.43;SOR=7.276;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
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chr8	6272532	rs2515417	T	A	597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.36;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr8	6357307	rs2916715	T	C	148.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=-0.366;SC=TTCAAAGTGATTCTTGGTTTA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=6357315;WS=6357297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
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chr8	6371129	rs13277236	C	T	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=-2.066;QD=24.77;ReadPosRankSum=0.962;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr8	6371133	rs35473795	C	T	1075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=1.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQRankSum=-1.905;QD=22.89;ReadPosRankSum=0.485;SOR=0.384;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
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chr8	6372112	rs2916735	G	A	1691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-6.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=8;PP=1415;ReadPosRankSum=-1.462;SC=TGGTTAGTTTGGGATTGGTGG;SOR=0.646;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=110;TCF=98;TCR=12;TR=65;WE=6372120;WS=6372102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,67:0.59:113
chr8	6372172	rs2979671	T	C	3631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.398;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=43;PP=2810;ReadPosRankSum=-0.896;SC=GAAATTCTTTTCTGATGCCTT;SOR=0.948;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=210;TCF=138;TCR=72;TR=132;WE=6372180;WS=6372162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,136:0.63:215
chr8	6377433	rs1961222	C	T	4749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=77;PP=2962;ReadPosRankSum=0.261;SC=AGATGCCATTCGTGGTGTGTC;SOR=0.699;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=275;TCF=154;TCR=121;TR=174;WE=6377441;WS=6377423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,181:0.63:288
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chr8	6390079	rs2515482	G	A	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=50;PP=1284;SC=AATGTTTGTCGTCTCCTCCCT;SOR=7.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=0;TCR=51;TR=50;WE=6390087;WS=6390069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr8	6390095	rs10714353	TA	T	90.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=-1.265;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr8	6420534	rs3739391	A	G	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=36;PP=1052;SC=GCTGCCGTCTAAAACGCAGGG;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=6420542;WS=6420524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	6566186	rs2911984	G	A	3871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=78;NR=43;PP=2965;SC=GCCGAGCTGAGAAGATGCTGC;SOR=1.445;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=78;TCR=43;TR=121;WE=6566194;WS=6566176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
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chr8	8176221	rs13269488	C	T	4867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.848;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=139;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.158;SC=TTTGGGGTGCCGCCCGGCTTC;SOR=0.572;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=278;TCF=60;TCR=218;TR=179;WE=8176229;WS=8176211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,183:0.64:286
chr8	8176387	rs143409664	C	CGGGGCG	322.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=23.05;ReadPosRankSum=0.003;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
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chr8	8176825	rs6601691	A	G	1683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=48;PP=1308;ReadPosRankSum=-1.199;SC=AGATCTGTGGAGAGAAGAAGA;SOR=0.604;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=20;TCR=76;TR=61;WE=8176833;WS=8176815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,63:0.62:101
chr8	8186052	.	CTTTAT	C	4077.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.22;QD=45.31;SOR=5.000;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr8	8186053	.	T	TGGAC	2557	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=28;MQ=60.21;NF=0;NR=43;PP=2557;QD=20;SC=CTTGTTTCCCTTTATTTATTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=83;TCF=1;TCR=82;TR=43;WE=8186066;WS=8186043;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:40,43:0.52:83
chr8	8186058	.	T	TGGACCCAAA	4078.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.23;QD=44.82;SOR=5.023;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr8	8186101	rs143704562	T	TTTTCTA	1118.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=81;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=32;PP=1161;SC=ATGTTACTTCTTTTCTATTTC;SOR=4.255;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=34;WE=8186109;WS=8186091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	8197274	rs11325094	GA	G	747.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.98;QD=24.92;SOR=6.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr8	8234077	rs4840952	G	C	4294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-6.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.530;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=130;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.511;SC=CTGACGAGGCGGCAGGCTGGG;SOR=0.445;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=259;TCF=52;TCR=207;TR=165;WE=8234085;WS=8234067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,172:0.65:266
chr8	8234192	rs4840953	G	C	3541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.101;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.658;NF=81;NR=38;PP=2724;ReadPosRankSum=0.049;SC=GCTGCCGCCAGAGCTCCCATC;SOR=0.466;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=176;TCF=122;TCR=54;TR=119;WE=8234200;WS=8234182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,127:0.69:184
chr8	8234218	rs4840954	CG	TA	5302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.365;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.96;MQRankSum=-0.769;NF=78;NR=41;PP=2944;ReadPosRankSum=1.182;SC=GGTCAGCCAGCGGTGACACTG;SOR=0.500;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=135;TCR=70;TR=119;WE=8234227;WS=8234208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,132:0.62:212
chr8	8234714	rs3896980	C	T	4004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.466;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=77;PP=2962;ReadPosRankSum=0.084;SC=TGTAGCCTCCCGGGGGTGGGC;SOR=0.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=248;TCF=119;TCR=129;TR=146;WE=8234722;WS=8234704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,146:0.58:250
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chr8	8643387	rs10903311	G	A	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=1;PP=661;SC=TTCCCCAGTCGTCCAAAAAGC;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=8643395;WS=8643384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	8643582	rs2271340	C	G	6674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=95;NR=105;PP=2965;SC=GGGTGGACAACAAGAAAGCAC;SOR=0.825;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=95;TCR=106;TR=200;WE=8643590;WS=8643572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr8	8643725	rs2271341	T	A	1382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=39;PP=1180;SC=TCAGGCAACTTATGTCCCCAC;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=40;WE=8643733;WS=8643715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr8	8655023	rs3748144	C	T	5724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=118;PP=2965;SC=GAGAGAAAAACGTGTTAGGGA;SOR=1.650;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=56;TCR=119;TR=174;WE=8655031;WS=8655013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr8	8747537	rs399123	T	C	3918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=29;PP=2965;SC=TCTTACAGCATACCACAGAAG;SOR=2.247;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=91;TCR=29;TR=120;WE=8747545;WS=8747527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr8	8747894	rs429433	A	G	9769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=130;NR=153;PP=2965;SC=AAACAACCCAAGTGGAAAAGT;SOR=0.850;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=285;TCF=131;TCR=154;TR=283;WE=8747902;WS=8747884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr8	8860620	rs2288672	T	C	1895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=50;PP=1628;SC=GCCGTGGCTCTCGCGCTGCTG;SOR=3.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=8;TCR=50;TR=58;WE=8860628;WS=8860610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr8	8865443	rs375221583	TCC	T	1734.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.390;NF=52;NR=0;PP=1903;ReadPosRankSum=0.238;SC=ATAAACTACATCCTTTTTTTT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=131;TCF=130;TCR=1;TR=52;WE=8865452;WS=8865433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,49:0.38:129
chr8	8887542	rs140242735	TAAC	T	4969.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.95;NF=11;NR=81;PP=2969;SC=TTTTAGAAAGTAACAACAGTT;SOR=3.139;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=105;TCF=13;TCR=92;TR=92;WE=8887552;WS=8887532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr8	8905786	rs11433078	G	GT	1370.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=0;PP=1207;SC=ATAGGGATTTGTTTTTTTTAA;SOR=7.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=55;TCR=0;TR=48;WE=8905794;WS=8905776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr8	8905926	rs2921379	A	G	6840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=116;PP=2965;SC=AGTTTAAAAAACGTCCTTAAG;SOR=0.926;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=215;TCF=99;TCR=116;TR=215;WE=8905934;WS=8905916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr8	8998262	rs434238	CT	TG	3058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=10;PP=2947;SC=CAGAGCTAGGCTTGTCTGTGG;SOR=3.258;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=55;TCR=11;TR=59;WE=8998271;WS=8998252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr8	8999187	rs330924	G	C	2756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=56;PP=2231;SC=GGCTAGAACCGTGGAAAGGGA;SOR=1.694;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=24;TCR=56;TR=80;WE=8999195;WS=8999177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr8	9435825	rs4840427	T	C	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=6.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=926;ReadPosRankSum=-2.097;SC=AAGTCGAAGTTAGAGAATTAA;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=83;TCF=30;TCR=53;TR=42;WE=9435833;WS=9435815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,43:0.50:86
chr8	9537635	rs12114182	G	A	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=677;SC=AAATCTTTATGTACTTTATAT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=9537643;WS=9537625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	9563797	rs11343041	CT	C	859.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.320;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.356;NF=9;NR=19;PP=352;ReadPosRankSum=0.137;SC=GCATCATTTACTTTTTTTTTT;SOR=0.233;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=28;WE=9563806;WS=9563787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,42:0.93:45
chr8	9564437	rs7006985	A	G	3214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=75;PP=2578;SC=CTGATCCTACATTAGTCAACT;SOR=2.108;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=29;TCR=75;TR=104;WE=9564445;WS=9564427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr8	9564600	rs12542457	T	C	259.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=215;SC=CCTTCCATTCTTACAAGCAGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=9564608;WS=9564590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	9577794	rs72301704	A	AT	475.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=215;SC=TTGAAAGTTGATTTTTTTTTC;SOR=3.767;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=10;WE=9577812;WS=9577784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	9577804	rs5025210	C	A	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=4;PP=410;SC=ATTTTTTTTTCATAAGAATGT;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=15;WE=9577812;WS=9577784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	9577940	rs6601360	T	C	1791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=16;PP=1433;SC=CCCTAGCAGGTCACCTGCAGA;SOR=1.919;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=39;TCR=16;TR=55;WE=9577948;WS=9577930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr8	9593081	rs4841208	A	C	2458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=70;PP=2130;SC=GAGGCCGAGGAAGGTAGATCA;SOR=6.358;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=72;TCF=2;TCR=70;TR=72;WE=9593089;WS=9593071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr8	9629810	rs117475636	A	G	1809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.331;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=20;PP=1326;ReadPosRankSum=0.341;SC=AAAGGGGACAATGCCTTGACC;SOR=0.563;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=162;TCF=116;TCR=46;TR=65;WE=9629818;WS=9629800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,71:0.41:174
chr8	10102863	rs4841293	A	G	1649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=59;PP=1691;SC=TATTATTTGTATATATATACT;SOR=7.864;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=60;TCF=1;TCR=59;TR=60;WE=10102871;WS=10102853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr8	10285825	rs10903326	T	G	5189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=127;PP=2965;SC=AAAAATAATTTCTCCCCACAT;SOR=3.258;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=24;TCR=127;TR=151;WE=10285833;WS=10285815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
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chr8	10383226	rs4521726	C	G	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=531;ReadPosRankSum=-0.694;SC=CCTCAGCCCCCTCATCCCCCC;SOR=0.722;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=31;WE=10383234;WS=10383216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
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chr8	10465190	rs72494282	C	T	3781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.383;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.232;NF=76;NR=71;PP=2859;ReadPosRankSum=0.406;SC=GGCTGGGCCTCCCCTTCAGCC;SOR=0.687;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=349;TCF=179;TCR=170;TR=147;WE=10465198;WS=10465180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:206,155:0.43:361
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chr8	10465771	rs11785822	G	T	19608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=471;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=206;NR=249;PP=2965;SC=CTCCTGGGCCGCCTCTTCTGC;SOR=0.865;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=455;TCF=206;TCR=249;TR=455;WE=10465779;WS=10465761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,463:1.00:463
chr8	10465942	rs28446662	T	A	4642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.587;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.216;NF=81;NR=90;PP=2962;ReadPosRankSum=2.926;SC=GGTCTCTACATCTTCTGACTC;SOR=0.547;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=288;TCF=131;TCR=157;TR=171;WE=10465950;WS=10465932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,174:0.59:293
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chr8	10467588	.	TT	CC	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MMLQ=27;MQ=57.24;NF=145;NR=198;PP=2944;QD=20;SC=TTTCTTTAGTTTCCTCTAACT;SbPval=0.7;Source=Platypus;TCF=459;TR=343;WE=10467597;WS=10467566;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:656,343:0.34:999
chr8	10467589	rs9657518	T	C,TCCTCTAACTGCACCCTCTCTTCTTGCAGCCCTTCTATTACTTTAGTCC	26309.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=6.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=869;ExcessHet=3.0103;FS=7.638;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.57;MQRankSum=5.001;QD=31.97;ReadPosRankSum=10.535;SOR=0.262;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:132,363,328:0.44,0.40:823
chr8	10467627	rs112656102	T	C	6381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=867;ExcessHet=3.0103;FS=1.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQRankSum=-0.654;QD=7.53;ReadPosRankSum=-0.040;SOR=0.844;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:646,202:0.24:848
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chr8	10467652	rs4840501	G	C	15110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=858;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.589;HP=4;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-5.112;NF=401;NR=425;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.371;SC=TAACTGCACCGCCTCTTCTTG;SOR=0.604;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=1056;TCF=504;TCR=552;TR=826;WE=10467660;WS=10467642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:230,608:0.73:838
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chr8	10468964	rs148936402	G	A	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.385;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=35;PP=949;ReadPosRankSum=0.875;SC=CCTGGCCCCCGGGCAGTGCTT;SOR=1.944;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=110;TCF=40;TCR=70;TR=45;WE=10468972;WS=10468954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,46:0.41:113
chr8	10469817	rs6996950	G	A	3798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-7.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.926;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=64;PP=2962;ReadPosRankSum=0.824;SC=CCTGCTCGGTGCCCTGTCCTT;SOR=0.418;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=262;TCF=161;TCR=101;TR=154;WE=10469825;WS=10469807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,153:0.58:263
chr8	10470915	rs11773913	A	G	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.286;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=34;PP=821;ReadPosRankSum=0.242;SC=TGGGGGCAGCATCAGGATAAA;SOR=0.260;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=96;TCF=19;TCR=77;TR=45;WE=10470923;WS=10470905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,46:0.48:96
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chr8	10474042	rs4388421	T	G	1823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.183;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=56;PP=1337;ReadPosRankSum=-0.596;SC=GAAGGCCTCATGCCCGGCACA;SOR=0.462;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=189;TCF=42;TCR=147;TR=74;WE=10474050;WS=10474032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,78:0.40:194
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chr8	10530037	rs11250057	G	A	748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=0;PP=661;SC=CAGGCCCAGCGCATCGCAGGA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=10530045;WS=10530034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	10530218	rs11250058	C	T	4599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=70;PP=2965;SC=AGTCTTCCAACTTCAGGTGAA;SOR=0.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=71;TCR=70;TR=141;WE=10530226;WS=10530208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr8	10532355	rs4841419	T	C	4338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=127;PP=2965;SC=AAAGGTATGGTGTGTCCAGGG;SOR=3.071;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=26;TCR=127;TR=153;WE=10532363;WS=10532345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr8	10532401	rs4840505	A	G	2739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=72;PP=2224;SC=TGGGGTGGGTACACATAGAAC;SOR=4.778;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=5;TCR=73;TR=77;WE=10532409;WS=10532391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr8	10587688	.	G	C	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.548;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=364;ReadPosRankSum=1.181;SC=CAGCCCGCTCGGCCGCGCGCT;SOR=0.646;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=64;TCF=59;TCR=5;TR=21;WE=10587696;WS=10587678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,20:0.31:64
chr8	10859818	.	G	C	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.078;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.423;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=562;ReadPosRankSum=-0.839;SC=CAGATGTGAAGAGCTGGAATG;SOR=0.252;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=62;TCF=42;TCR=20;TR=29;WE=10859826;WS=10859808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,32:0.51:63
chr8	10920326	rs6601555	C	T	2025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=39;PP=1579;ReadPosRankSum=-0.895;SC=CCAGCCTCCTCGGCAATCAGC;SOR=0.647;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=145;TCF=66;TCR=79;TR=74;WE=10920334;WS=10920316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,78:0.52:149
chr8	11142389	rs3021505	C	CG	2815.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=55;NR=23;PP=2910;SC=GCTCCGGCCGCGGGGGAGCAT;SOR=1.954;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=89;TCF=64;TCR=25;TR=78;WE=11142397;WS=11142379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr8	11142625	rs2272594	T	C	2045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=61;PP=1857;SC=CGGGGGTCCCTTGTGGGCGCC;SOR=6.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=62;TCF=1;TCR=61;TR=62;WE=11142633;WS=11142615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr8	11152957	rs2245937	C	T	268.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=219;SC=CCTGGTTCATCGTCATATGAG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=11152965;WS=11152947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	11155613	rs2409754	A	G	779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=22;PP=601;SC=GCAATAAGTTAGTGAAGCTTT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=11155621;WS=11155603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	11157371	rs2736387	A	C	1014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=0;PP=805;SC=AATCAGCTTCAGTAAGACTAA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=11157379;WS=11157363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr8	11157460	rs3808513	T	G	4213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=136;NR=12;PP=2965;SC=TGCTTAATACTAATTTGTCAG;SOR=4.436;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=136;TCR=12;TR=148;WE=11157468;WS=11157450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr8	11162496	rs2164272	A	C	3772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=91;PP=2965;ReadPosRankSum=0.707;SC=TCCCAGTACTAAGCTATTACC;SOR=1.592;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=114;TCF=21;TCR=93;TR=112;WE=11162504;WS=11162486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr8	11162602	rs2256016	C	A	1103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.88;SOR=5.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	11162609	rs2060465	T	C	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.94;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	11164012	rs17797443	T	C	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=663;SC=TCAAATTAACTTCTGCATTAA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=11164020;WS=11164002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	11174484	rs11784572	G	C	3016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=81;PP=2471;SC=CCTAGGAGACGACGATTTGGA;SOR=7.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=82;TCF=0;TCR=82;TR=81;WE=11174492;WS=11174474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr8	11177410	rs2293855	G	A	3006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=67;PP=2338;SC=GCCTGTGAGTGTGTGCTGTTG;SOR=2.278;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=24;TCR=67;TR=91;WE=11177418;WS=11177400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr8	11177447	rs2293856	C	T	2197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=56;PP=1817;SC=GTGAGCTGGACGTGGCCCTCA;SOR=3.226;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=11;TCR=56;TR=67;WE=11177455;WS=11177437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr8	11204165	rs2572387	C	T	6000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=91;PP=2965;SC=CAAAACGAGACAGATTTCACA;SOR=0.808;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=195;TCF=103;TCR=92;TR=193;WE=11204173;WS=11204155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr8	11204184	rs11784458	G	A	6050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=101;PP=2965;SC=CAAAATCACAGATTGTTAATG;SOR=0.857;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=86;TCR=101;TR=187;WE=11204192;WS=11204174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr8	11204755	rs11777746	T	C	11209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.418;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=249;NR=88;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.011;SC=CTCAAGGTCTTCCAACACCCG;SOR=2.195;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=339;TCF=250;TCR=89;TR=337;WE=11204763;WS=11204745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,346:0.99:348
chr8	11295511	rs2001463	A	G	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.673;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=14;PP=1065;ReadPosRankSum=-0.787;SC=TTGTCACACCATGCCACTGTG;SOR=0.815;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=187;TCF=146;TCR=41;TR=66;WE=11295519;WS=11295501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,68:0.35:194
chr8	11295747	rs79145090	A	G	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.328;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=377;ReadPosRankSum=1.502;SC=GGATCCTCCAACTCCCTTCTC;SOR=0.032;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=16;WE=11295755;WS=11295737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr8	11296091	rs1057750	G	A	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=29;PP=636;ReadPosRankSum=-0.817;SC=TTCCTATTTTGGAAACTTCGA;SOR=0.800;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=85;TCF=4;TCR=81;TR=30;WE=11296099;WS=11296081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,31:0.35:89
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chr8	11416428	rs6988443	C	T	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.704;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=14;PP=884;ReadPosRankSum=0.203;SC=TACCCAGTAGCGCCGCTGCAG;SOR=0.822;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=131;TCF=85;TCR=46;TR=47;WE=11416436;WS=11416418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,47:0.35:133
chr8	11416635	rs11785333	G	A	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=26;PP=534;ReadPosRankSum=0.335;SC=ACCCCCTTGGGAAATCTCGTG;SOR=1.067;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=70;TCF=4;TCR=66;TR=27;WE=11416643;WS=11416625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,29:0.40:73
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chr8	11606312	rs3735819	T	C	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=1;PP=1169;ReadPosRankSum=2.217;SC=TGGTCTTCTCTTTCCAAGGAA;SOR=1.300;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=79;TCF=77;TCR=2;TR=48;WE=11606320;WS=11606307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,49:0.62:79
chr8	11612698	rs804280	C	A	1365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-5.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=43;PP=1042;ReadPosRankSum=-1.325;SC=CTCAGAGTGCCTAAGAATCAT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=14;TCR=78;TR=51;WE=11612706;WS=11612688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,53:0.55:96
chr8	11614316	rs3729853	T	C	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.116;HP=3;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=1345;ReadPosRankSum=-0.583;SC=GATAAGGACCTCTGCTGCTGT;SOR=2.857;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=25;WE=11614337;WS=11614306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr8	11614329	rs3729854	C	T	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=2;PP=1345;ReadPosRankSum=-1.997;SC=GCTGCTGTCCCCGGCAAATGT;SOR=1.179;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=51;TCF=47;TCR=4;TR=29;WE=11614337;WS=11614306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr8	11618998	rs804285	G	C	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=2;PP=473;SC=CCCAGCTACTGGGGAAGCGGA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=11619006;WS=11618988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
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chr8	11619261	rs2740431	T	A	9783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=175;NR=129;PP=2965;SC=TTGGAGTGGGTCTGGGTGTTC;SOR=1.048;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=304;TCF=175;TCR=129;TR=304;WE=11619269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
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chr8	11619397	rs36018280	G	A	3136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.515;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=58;PP=2379;ReadPosRankSum=1.049;SC=ACAAGTATGCGTCATGCCTGC;SOR=0.895;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=354;TCF=183;TCR=171;TR=130;WE=11619405;WS=11619387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:224,135:0.38:359
chr8	11619504	rs809203	T	A	3584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.744;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=95;PP=2804;ReadPosRankSum=0.638;SC=TGAGGCCCTGTCCCTTATCCT;SOR=0.394;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=219;TCF=51;TCR=168;TR=128;WE=11619512;WS=11619494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,134:0.59:227
chr8	11619635	rs2645455	T	A	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=623;ReadPosRankSum=1.005;SC=AGAAAAAATCTTCAAAGCGAA;SOR=0.760;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=27;WE=11619643;WS=11619625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr8	11629119	rs804269	T	C	5150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.87;SOR=0.917;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr8	11629119	.	TTGGCTCTGTC	CTGGCTCTGTC,CTGGCTCTGTG	1587	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=61,27;NR=73,40;PP=867,1587;QD=6.72963591453;SC=CTCTGAAGGGTTGGCTCTGTC;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=134;TCF=61;TCR=73;TR=134,67;WE=11629137;WS=11629109;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:134
chr8	11629129	rs804268	C	G	2024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=1.404;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.46;ReadPosRankSum=-0.018;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,74:0.56:131
chr8	11629241	rs804267	G	A	1751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=50;PP=1391;SC=TCAGTCTCACGTGTCTCAGCC;SOR=4.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=54;WE=11629249;WS=11629231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr8	11640611	rs8191639	C	T	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.190;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.257;NF=21;NR=5;PP=483;ReadPosRankSum=1.456;SC=GTTGTGGTAACGATGTGGGGA;SOR=0.291;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=61;TCF=53;TCR=8;TR=26;WE=11640619;WS=11640601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr8	11643915	rs804292	G	A	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.312;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=90;ReadPosRankSum=-0.647;SC=TATAATATTCGTCTCCCTGGA;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=11643923;WS=11643905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr8	11659375	.	AT	A	74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=19;MQ=57.6;NF=3;NR=0;PP=74;QD=33.3333333333;SC=GCTTTTTTGTATTTTTAGTAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=3;WE=11659383;WS=11659366;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,3:0.19:16
chr8	11660051	rs2645429	A	G	5790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=113;PP=2965;SC=GAGCTTCTAGAGTGTTATCAC;SOR=1.240;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=186;TCF=73;TCR=113;TR=186;WE=11660059;WS=11660041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr8	11660168	rs113207154	G	C	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=475;ReadPosRankSum=0.537;SC=AGCCCCGCTGGCGGCCGAGGC;SOR=0.836;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=20;WE=11660176;WS=11660158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr8	11660362	rs1047643	T	C	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.742;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=25;PP=941;ReadPosRankSum=0.225;SC=TGAAATGCCTTGGCCACCCCG;SOR=1.036;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=173;TCF=90;TCR=83;TR=58;WE=11660370;WS=11660352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,57:0.32:176
chr8	11660764	rs2280922	G	C	2276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-7.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.388;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=32;PP=1793;ReadPosRankSum=0.369;SC=ACACATCTGAGGCAATGTGGG;SOR=0.559;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=150;TCF=99;TCR=51;TR=90;WE=11660772;WS=11660754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,91:0.60:151
chr8	11660916	rs2252567	C	T	1575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=51;PP=1277;ReadPosRankSum=-0.312;SC=CGCCTTGCTGCCTTCCATCGC;SOR=0.607;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=83;TCF=5;TCR=78;TR=55;WE=11660924;WS=11660906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,55:0.65:84
chr8	11665959	rs1032577	C	T	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=35;ReadPosRankSum=-1.204;SC=CCGTCCCGCCCCTCGTCGGGC;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=11665967;WS=11665949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr8	11666218	rs71711801	GTCCCAC	G	7675.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.909;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=-1.325;NF=87;NR=106;PP=2990;ReadPosRankSum=1.068;SC=GCCTGCCCCAGTCCCACTCCC;SOR=0.190;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=249;TCF=125;TCR=124;TR=193;WE=11666231;WS=11666208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,252:0.99:254
chr8	11666451	rs1616534	C	T	1958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.198;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=59;PP=1585;ReadPosRankSum=-0.305;SC=TGTCCGGGACCTTTGAGTGTG;SOR=0.445;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=112;TCF=12;TCR=100;TR=67;WE=11666459;WS=11666441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,69:0.58:118
chr8	11667179	rs8417	C	T	2050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.053;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=15;PP=1617;ReadPosRankSum=-0.606;SC=TTTACAGCAACGCAGTGTGCA;SOR=1.190;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=129;TCF=100;TCR=29;TR=75;WE=11667187;WS=11667169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,77:0.58:133
chr8	11679177	rs77559625	C	T	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=362;ReadPosRankSum=-0.163;SC=ATGATTAATTCCGCCATTGTT;SOR=0.790;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=16;WE=11679185;WS=11679167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr8	11683653	rs904011	T	C	4230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=86;PP=2965;SC=GGGCCTGTTTTTGCAGAAAAC;SOR=1.628;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=42;TCR=86;TR=128;WE=11683661;WS=11683643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr8	11687938	rs1293313	G	C	1368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=42;PP=1071;SC=AGGTAGGGAAGGGGGCTCCTC;SOR=4.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=45;WE=11687946;WS=11687928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr8	11687959	rs2294137	C	T	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=4.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.047;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=443;ReadPosRankSum=0.054;SC=TGGGTGGATACGGGGCTAAAG;SOR=0.146;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=19;WE=11687967;WS=11687949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr8	11688994	.	C	T	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=0.000;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.036;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=14;PP=1147;ReadPosRankSum=1.776;SC=GACATCATTTCTTCTTTTTTC;SOR=0.416;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=111;TCF=88;TCR=23;TR=56;WE=11689002;WS=11688984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,60:0.51:117
chr8	11689119	rs9205	G	C	2357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.681;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=50;PP=1945;ReadPosRankSum=-0.994;SC=CAGTGACCCTGATGATGGATG;SOR=0.418;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=66;TCR=91;TR=87;WE=11689127;WS=11689109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,89:0.55:163
chr8	11689228	rs2409836	T	G	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.580;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=29;PP=769;ReadPosRankSum=-0.202;SC=CTTTTATGATTTAGTAATGTC;SOR=0.435;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=56;TCF=7;TCR=49;TR=34;WE=11689236;WS=11689218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,35:0.61:57
chr8	11695872	rs10903343	T	C	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.035;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=3;PP=1289;ReadPosRankSum=0.904;SC=ATAGCACTTATCATTTTTTCC;SOR=0.300;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=103;TCF=99;TCR=4;TR=59;WE=11695880;WS=11695862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,60:0.55:109
chr8	11704457	rs1692816	A	C	1941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=5;PP=1719;SC=CCAGCCCCTCACCTGCCTGCC;SOR=4.443;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=55;TCR=5;TR=60;WE=11704465;WS=11704447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr8	11705139	rs2294138	C	T	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=3;PP=1409;SC=AGGGATGCAGCAGCTCCCCAG;SOR=4.935;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=50;WE=11705147;WS=11705129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr8	11705342	rs1736088	G	C	2972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=57;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=52;PP=2086;SC=CTGATGGGACGCGGGAGAAAG;SOR=0.976;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=41;TCR=53;TR=93;WE=11705350;WS=11705332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr8	11705380	rs149445749	A	AAGCCCCAGCTGGGCGAGGC	3982.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=29;PP=2964;SC=CCCCACGGAGAAGACCTGGGG;SOR=1.952;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=62;TCF=10;TCR=52;TR=34;WE=11705388;WS=11705370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr8	11705442	rs2294139	G	T	1125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=26;PP=897;SC=CCTGCCAGAGGCCTGTGCACC;SOR=2.649;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=32;WE=11705450;WS=11705432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr8	11705677	rs2294140	C	G	8983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=189;NR=89;PP=2965;SC=AAGACAGCCTCTAATGAAAAC;SOR=1.670;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=278;TCF=189;TCR=89;TR=278;WE=11705685;WS=11705667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr8	11706581	rs13332	T	G	3174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=51;PP=2489;SC=TGCCACAGCATGTGAGCAGGT;SOR=0.919;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=40;TCR=51;TR=91;WE=11706589;WS=11706571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr8	11708355	rs2272766	G	A	1377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=3;PP=1111;SC=GCGCTTCCCCGCCAGCCAGCA;SOR=4.664;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=42;WE=11708363;WS=11708345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr8	11710174	rs1803250	T	C	3299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.797;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=68;PP=2622;ReadPosRankSum=1.412;SC=TTCAAGTAGCTCATGTCCACG;SOR=0.728;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=370;TCF=186;TCR=184;TR=139;WE=11710182;WS=11710164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:239,141:0.37:380
chr8	11710301	rs1293291	A	G	3521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=100;PP=2965;SC=AAAACCAGAGACCCTACCCAA;SOR=5.994;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=104;TCF=4;TCR=100;TR=104;WE=11710309;WS=11710291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr8	11710888	rs12338	G	C	7879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=161;PP=2965;SC=TCATCCGACAGGGGATGGAAA;SOR=1.095;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=274;TCF=112;TCR=162;TR=273;WE=11710896;WS=11710878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr8	11710974	rs1137063	G	A	1611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.401;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=50;PP=1314;ReadPosRankSum=-0.341;SC=GTTGGAAGCCGGATCCTAGAT;SOR=0.464;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=102;TCF=8;TCR=94;TR=55;WE=11710982;WS=11710964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,57:0.54:105
chr8	11711059	rs2272767	C	T	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=34;PP=916;SC=ACAGGGGCACCGTCTCGGGCA;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=34;WE=11711067;WS=11711049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	11831661	rs35283519	C	T	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.912;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=30;PP=771;ReadPosRankSum=1.458;SC=AAAGAAAAATCAATCTTAATG;SOR=0.831;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=101;TCF=23;TCR=78;TR=38;WE=11831669;WS=11831651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,39:0.38:103
chr8	11831948	rs7461062	T	C	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=7;PP=1410;ReadPosRankSum=0.419;SC=GGTGGCCCATTTGATATTGGT;SOR=0.589;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=97;TCF=86;TCR=11;TR=59;WE=11831956;WS=11831938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,59:0.60:99
chr8	11832079	rs10108075	A	G	2844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.196;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=68;PP=2367;ReadPosRankSum=1.493;SC=TCACCAGGAAAAAGAGTAATG;SOR=1.220;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=164;TCF=63;TCR=101;TR=105;WE=11832087;WS=11832069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,104:0.63:166
chr8	11853596	rs11250186	A	G	2176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=6.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.788;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=13;PP=1742;ReadPosRankSum=-0.347;SC=GCTTTTTTCTAGCTTGAAAAT;SOR=0.796;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=137;TCF=112;TCR=25;TR=75;WE=11853604;WS=11853586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,78:0.54:145
chr8	11872723	rs11784716	A	G	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=3;PP=139;SC=TGGCTCTCTGACGCCCTCTGC;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=11872731;WS=11872713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr8	12516857	rs1808161	T	C	125.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=56.57;NF=2;NR=3;PP=95;SC=GGGCTGGCCATGGCTCCAGGG;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=12516865;WS=12516847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	12517027	rs2002368	C	G	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.366;NF=2;NR=2;PP=35;ReadPosRankSum=-1.465;SC=CTCTGGCGCCCTCTGCTGGCC;SOR=0.039;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=4;WE=12517035;WS=12517017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr8	12584659	rs10095845	C	T	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=470;ReadPosRankSum=-0.509;SC=AGCATCTGCTCTGCACCCTCA;SOR=0.593;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=23;WE=12584667;WS=12584649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr8	12589179	rs3802269	C	A	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=188;ReadPosRankSum=1.572;SC=ATCCAGCTTGCGGTGAGGTTT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=10;WE=12589187;WS=12589169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr8	12592956	rs13251315	C	A	2251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=44;PP=1611;SC=AAACTATCCACTGAAAAGCTT;SOR=2.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=17;TCR=44;TR=61;WE=12592964;WS=12592946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr8	12593045	rs13272425	A	G	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=5;NR=22;PP=800;SC=GAGGAGAGAAAGGGCAGTGAT;SOR=3.056;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=12593053;WS=12593035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr8	12598608	rs4831354	C	T	1893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=52;PP=1620;SC=AGTGCCGATTCTGGGCCGGGT;SOR=4.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=4;TCR=52;TR=56;WE=12598616;WS=12598598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
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chr8	12600622	rs7837242	C	T	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=386;ReadPosRankSum=0.840;SC=AATGCATGTCCCTTATAGTTA;SOR=0.719;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=18;WE=12600630;WS=12600612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
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chr8	12888743	rs13281744	A	G	1496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.605;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=32;PP=1087;ReadPosRankSum=0.715;SC=CCAGAAACAAACAATCATTTG;SOR=0.498;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=191;TCF=107;TCR=84;TR=67;WE=12888751;WS=12888733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,69:0.35:197
chr8	12888908	rs7826836	T	G	4527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=78;PP=2965;SC=GGGTCATGTCTCGGCTTCATT;SOR=0.830;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=69;TCR=78;TR=147;WE=12888916;WS=12888898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr8	12888997	rs573652	T	C	2980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=75;PP=2418;SC=CTCTCTCAGCTTTCTCTGAGA;SOR=4.905;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=6;TCR=75;TR=81;WE=12889005;WS=12888987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
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chr8	12950110	rs7829535	G	A	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.754;NF=13;NR=0;PP=229;ReadPosRankSum=-0.180;SC=CACCTCCCATGCAGCCCGTAC;SOR=1.077;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=13;WE=12950118;WS=12950100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr8	12952116	rs965672	A	G	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.678;NF=20;NR=0;PP=369;ReadPosRankSum=-0.495;SC=CAGAGGTTGCAGTGAGCCGAG;SOR=2.019;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=20;WE=12952124;WS=12952106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr8	12952174	rs5889417	CA	C	1591.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=2.352;NF=59;NR=4;PP=1039;ReadPosRankSum=1.304;SC=GACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SOR=2.642;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=79;TCF=72;TCR=7;TR=63;WE=12952182;WS=12952164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,69:0.97:71
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chr8	12958025	rs3739298	C	A	1652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.379;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=41;PP=1320;ReadPosRankSum=-1.418;SC=CGCTGGGGGGCGCGTGGCTGG;SOR=1.262;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=88;TCF=33;TCR=55;TR=60;WE=12958033;WS=12958015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,62:0.67:93
chr8	12960281	rs2280335	T	C	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=8.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.13;ReadPosRankSum=0.059;SOR=1.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,16:0.23:69
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chr8	12972972	rs145012061	A	AT	320.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.051;HP=8;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=343;ReadPosRankSum=0.061;SC=TGCTTACAACATTTTTTTTAA;SOR=0.046;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=7;WE=12972989;WS=12972962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
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chr8	13356457	rs117937358	A	T	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=33.02;ReadPosRankSum=1.654;SOR=2.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,31:0.79:39
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chr8	13357587	rs1383942	G	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=250;ReadPosRankSum=-1.508;SC=ACATGTCATCGTAGTTTAACA;SOR=0.602;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=16;WE=13357595;WS=13357577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr8	13424583	rs13273355	C	T	2554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.993;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=37;PP=1887;ReadPosRankSum=0.717;SC=TTGAAGAACTCTACTGATGAG;SOR=0.324;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=129;TCF=80;TCR=49;TR=89;WE=13424591;WS=13424573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,91:0.68:133
chr8	13425353	rs11203497	T	A	4851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=99;PP=2965;SC=AGAGCAGAAGTTGCAGCGAGA;SOR=1.790;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=46;TCR=99;TR=145;WE=13425361;WS=13425343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr8	13959749	rs1973167	A	G	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=91;ReadPosRankSum=0.854;SC=ACCTAATATTACTTTCCTAAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=13959757;WS=13959739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr8	13965510	.	CT	C	150.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.90;MQRankSum=-1.282;QD=15.07;ReadPosRankSum=0.282;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr8	13965581	rs11336839	AT	A	1053.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=3;PP=1148;SC=TGGGAGAAACATTTGTCTAGT;SOR=3.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=30;WE=13965589;WS=13965571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr8	14095008	rs144265627	C	CAACA	2175.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=1.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.11;MQRankSum=6.446;QD=11.89;ReadPosRankSum=0.439;SOR=0.537;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,64:0.35:183
chr8	14095250	rs1478030	A	T	3746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=107;PP=2965;SC=TTACAAAAAAATATACTGCAT;SOR=7.204;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=109;TCF=2;TCR=107;TR=109;WE=14095258;WS=14095240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr8	15590866	rs2111752	T	G	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.28;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	15590962	.	G	A	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.229;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.091;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=440;ReadPosRankSum=-0.988;SC=CAGGAATACCGAGCTGAAGGA;SOR=0.446;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=57;TCF=37;TCR=20;TR=23;WE=15590970;WS=15590952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,23:0.40:57
chr8	15978063	rs4338104	C	T	5088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=119;PP=2965;SC=GTATCTCCACCCTCCCCTCGT;SOR=2.332;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=38;TCR=119;TR=157;WE=15978071;WS=15978053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr8	15978742	rs138603194	T	C	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=319;ReadPosRankSum=1.740;SC=ATTAACGAGATAAAAAATCAG;SOR=0.986;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=16;WE=15978750;WS=15978732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr8	16035302	rs414580	T	A	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=2;PP=851;ReadPosRankSum=-1.454;SC=TAACATCCACTTACATTTAAG;SOR=0.351;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=53;TCF=51;TCR=2;TR=36;WE=16035310;WS=16035292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,36:0.68:53
chr8	16043667	rs435815	C	T	3017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.557;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=26;PP=2361;ReadPosRankSum=1.056;SC=TTCATGCTCACGGTTTTTTGT;SOR=1.334;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=199;TCF=145;TCR=54;TR=116;WE=16043675;WS=16043657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,118:0.58:202
chr8	16043913	rs370067	G	A	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.595;HP=1;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=1050;ReadPosRankSum=0.655;SC=CCCATAGCTCGTCTCTCAACT;SOR=4.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=23;WE=16043935;WS=16043903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,23:0.68:34
chr8	16043927	rs442677	A	G	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.418;HP=2;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=1050;ReadPosRankSum=0.507;SC=CTCAACTACAAACCCATATAT;SOR=4.778;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=18;WE=16043935;WS=16043903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
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chr8	16859398	rs10448135	C	G	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=553;ReadPosRankSum=-0.175;SC=GCCCGCCGCGCGCGCTCCGCT;SOR=0.743;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=25;WE=16859406;WS=16859388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
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chr8	16939284	rs12056715	G	A	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.302;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=472;ReadPosRankSum=1.024;SC=TCTGGATGCAGCTTTATTTTT;SOR=0.440;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=27;WE=16939292;WS=16939274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
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chr8	16942611	rs2285263	A	G	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=181;ReadPosRankSum=-1.004;SC=TAAAGCAGAAATATATATACT;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=10;WE=16942619;WS=16942601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr8	16942837	rs2285264	C	T	6457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=145;PP=2962;SC=GGTATGTATACTAGATGCTGC;SOR=1.906;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=201;TCF=55;TCR=146;TR=200;WE=16942857;WS=16942827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr8	16942849	rs2285265	C	T	2834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.679;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=84;PP=2360;ReadPosRankSum=-2.554;SC=AGATGCTGCACTTTATCAATA;SOR=1.089;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=163;TCF=29;TCR=134;TR=101;WE=16942857;WS=16942827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,102:0.61:167
chr8	16944609	rs62502369	G	A	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=359;ReadPosRankSum=-0.339;SC=TTCATGTTAAGAAACAATAAT;SOR=0.250;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=16;WE=16944617;WS=16944599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr8	17042129	rs75130109	C	CCT	1492.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=0;PP=1371;SC=TTTCCTGCACCCTCTCCACAC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=28;WE=17042137;WS=17042119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	17055248	rs3752613	C	A	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-7.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.915;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=40;PP=878;ReadPosRankSum=-0.911;SC=TCCTGATTATCTTCTCCATAT;SOR=0.107;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=102;TCF=2;TCR=100;TR=42;WE=17055256;WS=17055238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,41:0.41:101
chr8	17063335	rs2904674	A	G	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=346;ReadPosRankSum=0.000;SC=AATAGATAATATAGGCTTTTC;SOR=0.468;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=17;WE=17063343;WS=17063325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr8	17067574	rs73198534	C	T	2293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.476;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=61;PP=1882;ReadPosRankSum=0.743;SC=CAAGGTACTTCTTTGTTAAAA;SOR=0.488;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=148;TCF=35;TCR=113;TR=82;WE=17067582;WS=17067564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,84:0.55:152
chr8	17068013	rs1548350	T	G	1588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-5.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.717;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=61;PP=1269;ReadPosRankSum=0.216;SC=TTTTTTCATTTTACTTTCAAA;SOR=2.084;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=163;TCF=11;TCR=152;TR=62;WE=17068021;WS=17068003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,64:0.38:169
chr8	17090145	rs55922323	T	G	1414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-4.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=46;PP=1087;ReadPosRankSum=1.184;SC=AAAATAAACTTTAGTATGTAA;SOR=1.550;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=0;TCR=70;TR=46;WE=17090153;WS=17090135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,51:0.66:77
chr8	17092164	rs2959606	G	T	14132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=445;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=273;NR=167;PP=2965;SC=GCCTAGGCTCGCATGACAGTC;SOR=1.286;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=441;TCF=273;TCR=168;TR=440;WE=17092172;WS=17092154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,443:1.00:443
chr8	17100357	rs2904701	C	T	3858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=117;NR=13;PP=2965;SC=AAGAAAACCACGCTTTTGAAA;SOR=4.157;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=131;TCF=117;TCR=14;TR=130;WE=17100365;WS=17100347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr8	17100456	rs199607952	G	A	80.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=90.594;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQRankSum=-1.444;QD=0.43;ReadPosRankSum=-5.393;SOR=7.385;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:144,42:0.23:186
chr8	17137413	rs17587086	G	A	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.740;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=757;ReadPosRankSum=0.164;SC=GGCAGCCTTAGGTGTATATGT;SOR=0.563;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=107;TCF=47;TCR=60;TR=40;WE=17137421;WS=17137403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,41:0.37:111
chr8	17137687	rs3213601	G	A	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.158;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=536;ReadPosRankSum=0.391;SC=TCTCCTGAGCGCACATTTCCT;SOR=0.506;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=28;WE=17137695;WS=17137677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr8	17157259	rs6992513	G	A	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=165;ReadPosRankSum=-0.309;SC=CTGCATTAAAGTAGTTCTCAA;SOR=0.207;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=10;WE=17157267;WS=17157249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr8	17157786	rs13257763	T	G	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.306;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=34;PP=753;ReadPosRankSum=2.028;SC=CTTATCTTTTTCTATATATGC;SOR=0.087;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=73;TCF=1;TCR=72;TR=35;WE=17157794;WS=17157776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,38:0.49:78
chr8	17159812	rs6587028	G	A	2337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.102;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=56;PP=1714;ReadPosRankSum=-0.054;SC=GCAAAGCGTCGTGATACCACC;SOR=0.838;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=264;TCF=118;TCR=146;TR=97;WE=17159820;WS=17159802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,103:0.38:272
chr8	17159960	rs7007043	T	C	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=226;ReadPosRankSum=0.232;SC=ATGTTTTTTTTCTTGGGTCAG;SOR=0.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=14;WE=17159968;WS=17159950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,14:0.26:54
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chr8	17170645	rs4921749	T	A	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=7.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=0;PP=741;ReadPosRankSum=0.046;SC=CGCAAAATCATATCTTCAGCG;SOR=0.253;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=102;TCF=102;TCR=0;TR=36;WE=17170653;WS=17170635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,36:0.35:104
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chr8	17270640	rs13268193	A	C	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.657;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=300;ReadPosRankSum=1.945;SC=TGCTCAGGCAATGCCTGCTCC;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=45;TCR=3;TR=17;WE=17270648;WS=17270630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
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chr8	17270764	rs76718364	C	A	1744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=1.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.32;ReadPosRankSum=-0.756;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,48:0.37:131
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chr8	17270837	rs72607374	G	C	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.556;HP=1;HapScore=2;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=530;ReadPosRankSum=0.103;SC=GGGCGGGCGCGGCCTCACGCA;SOR=0.167;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=70;TCF=12;TCR=58;TR=34;WE=17270845;WS=17270827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,37:0.50:74
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chr8	17401878	rs2517252	G	A	1845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-7.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.820;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=9;PP=1494;ReadPosRankSum=0.144;SC=GTGAACTCATGTTTATCCTAT;SOR=0.815;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=191;TCF=166;TCR=25;TR=76;WE=17401886;WS=17401868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,76:0.39:194
chr8	17406367	rs11373918	GT	G	1100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=28.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.41;MQRankSum=3.686;QD=6.25;ReadPosRankSum=-0.306;SOR=0.021;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,67:0.38:176
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chr8	17503431	rs1043883	G	C	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=204;ReadPosRankSum=0.051;SC=ACTTTGGGGAGGTGTCATCTG;SOR=1.022;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=13;WE=17503439;WS=17503421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr8	17507299	rs17590021	A	G	2037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.923;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=6;PP=1594;ReadPosRankSum=-1.352;SC=GCAGGGCTCAATTTCACACAT;SOR=0.165;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=97;TCF=90;TCR=7;TR=61;WE=17507307;WS=17507289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,67:0.65:103
chr8	17532573	rs2269698	T	C	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.99;ReadPosRankSum=1.368;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,4:0.18:22
chr8	17532619	rs2269699	C	T	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.006;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=290;ReadPosRankSum=-0.388;SC=CCAGCCACAACGCAGACAGGA;SOR=1.927;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=43;TCR=2;TR=17;WE=17532627;WS=17532609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
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chr8	17871619	rs71215293	A	AC	456.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.59;QD=38.06;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	17885091	rs3213605	T	C	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=132;ReadPosRankSum=0.791;SC=AGAACAATGTTAAATTCTAGT;SOR=0.836;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=8;WE=17885099;WS=17885081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr8	17891178	rs6586680	C	T	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=234;ReadPosRankSum=-1.798;SC=TATGTAACATCATGTAGTTCA;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=11;WE=17891186;WS=17891168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr8	17891259	rs17635795	C	T	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=437;ReadPosRankSum=-0.125;SC=TTGGTTTTAACCTACAATTCC;SOR=0.788;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=24;WE=17891267;WS=17891249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,27:0.44:61
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chr8	17916553	rs7465164	C	T	5538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=151;PP=2965;SC=CTGTTAGAAACACAGGTAACA;SOR=3.825;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=23;TCR=151;TR=174;WE=17916561;WS=17916543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
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chr8	17927294	rs4921834	C	T	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=1.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.98;ReadPosRankSum=-0.915;SOR=0.995;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,24:0.26:91
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chr8	17928711	rs11785746	G	A	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=47;ReadPosRankSum=0.141;SC=GTGAGACTCTGTCTCAAAACA;SOR=0.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=17928719;WS=17928701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr8	17928753	rs113896339	G	GAAATA	715.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.69;ReadPosRankSum=0.199;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr8	17928762	rs138422571	T	TATA	595.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=2.981;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.28;ReadPosRankSum=-0.372;SOR=1.852;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr8	17928811	rs1071645	C	T	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.126;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=8;PP=679;ReadPosRankSum=0.163;SC=TAGCATACCACTGGTGCCTTG;SOR=0.463;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=88;TCF=71;TCR=17;TR=37;WE=17928819;WS=17928801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,38:0.42:90
chr8	17928920	rs12547845	T	C	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=497;ReadPosRankSum=0.539;SC=AGGTGTATCATCTTGAAATGA;SOR=0.856;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=62;TCF=10;TCR=52;TR=26;WE=17928928;WS=17928910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
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chr8	17930605	rs6586686	A	C	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=0.540;SC=TGCACTAATTAGAATTTGAGA;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=6;WE=17930613;WS=17930595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr8	17930727	rs6586687	G	A	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.74;ReadPosRankSum=1.935;SOR=0.727;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,32:0.29:112
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chr8	17930772	rs3753115	C	T	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.844;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=387;ReadPosRankSum=-2.270;SC=CACCTTATAACAGCAGGGAAG;SOR=1.098;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=102;TCF=44;TCR=58;TR=27;WE=17930780;WS=17930762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,30:0.27:113
chr8	18074536	rs7387461	G	A	6165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.97;NF=56;NR=130;PP=2965;SC=CTCCAGTTTCGCATACAAAAA;SOR=1.796;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=56;TCR=131;TR=186;WE=18074544;WS=18074526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr8	18077007	rs10106882	G	C	2725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=47;PP=2135;SC=AGGTATTAAGGGCCTTTCTGA;SOR=0.878;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=89;TCF=42;TCR=47;TR=88;WE=18077015;WS=18076997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
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chr8	18393159	rs5889802	C	CT	591.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.442;NF=19;NR=2;PP=432;ReadPosRankSum=1.737;SC=TTGTCACAGACTTTTTTTTTT;SOR=3.611;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=21;WE=18393167;WS=18393149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,24:0.96:25
chr8	18413875	rs2260920	A	G	4472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=113;PP=2965;SC=GCAGGAAATCATGATGCCATT;SOR=2.639;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=143;TCF=29;TCR=114;TR=142;WE=18413883;WS=18413865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr8	18414870	rs2717725	T	A	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=454;SC=ATTTTTTACATAAACAGAAAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=18414878;WS=18414860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	18415081	rs2634454	G	T	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=30;PP=1078;SC=AAAAGCAGAGGACACGAATGG;SOR=1.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=43;WE=18415089;WS=18415071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr8	18432578	rs2248559	C	G	3389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=89;NR=7;PP=2868;SC=TTGTTCCTTGCAATAAAGTAG;SOR=4.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=90;TCR=7;TR=96;WE=18432586;WS=18432568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
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chr8	18659882	rs3837206	GA	G	768.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=4.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.39;MQRankSum=2.288;QD=7.93;ReadPosRankSum=-1.291;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,43:0.44:97
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chr8	18725428	rs17127370	A	G	3969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.595;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=103;PP=2962;ReadPosRankSum=1.574;SC=TCTGAGTATAATGTCTCCAGG;SOR=0.637;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=216;TCF=52;TCR=164;TR=135;WE=18725436;WS=18725418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,141:0.64:222
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chr8	18729529	rs78452893	C	G	3298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-5.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=73;PP=2614;ReadPosRankSum=0.343;SC=ATCACATCCCCCTGGGTGCTC;SOR=0.696;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=206;TCF=90;TCR=116;TR=128;WE=18729537;WS=18729519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,129:0.60:215
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chr8	18870837	rs73594632	T	G	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=495;ReadPosRankSum=0.909;SC=AAAGCCGAGGTATGAACTAAA;SOR=0.217;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=91;TCF=91;TCR=0;TR=27;WE=18870845;WS=18870827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,30:0.33:92
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chr8	19362768	rs7017776	C	T	6113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=137;NR=52;PP=2965;SC=CTCTGCAGGACTGTTCAGGGT;SOR=2.044;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=190;TCF=138;TCR=52;TR=189;WE=19362776;WS=19362758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr8	19363029	rs34799877	A	G	4251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.514;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=83;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.121;SC=GTCCAGACCCAGGCCAGCAGC;SOR=0.538;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=261;TCF=136;TCR=125;TR=166;WE=19363037;WS=19363019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,171:0.64:266
chr8	19363425	rs6984644	C	T	1612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=56;PP=1347;ReadPosRankSum=0.046;SC=CTGGGCTAGACCACAGGAAGC;SOR=0.749;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=85;TCF=1;TCR=84;TR=57;WE=19363433;WS=19363415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,57:0.69:83
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chr8	19680736	rs12547934	T	C	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=4;PP=840;ReadPosRankSum=0.563;SC=AAATGAACTCTGAAAGCTTTT;SOR=0.534;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=62;TCF=56;TCR=6;TR=37;WE=19680744;WS=19680726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,38:0.59:64
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chr8	19689821	rs4615593	G	A	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=312;ReadPosRankSum=0.632;SC=CGTGGCTTACGCCTGTAATCC;SOR=0.495;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=15;WE=19689829;WS=19689811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr8	19699191	rs34564004	G	T	1577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.057;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=14;PP=1163;ReadPosRankSum=0.008;SC=CGTGCTTCTGGAAGGTGTATA;SOR=0.469;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=88;TCF=67;TCR=21;TR=55;WE=19699199;WS=19699181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,61:0.64:95
chr8	19699236	rs35843228	T	A	1894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.845;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=25;PP=1361;ReadPosRankSum=0.864;SC=CAACTTCCCATGACCAAGTTG;SOR=0.412;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=102;TCF=65;TCR=37;TR=64;WE=19699244;WS=19699226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,70:0.65:108
chr8	19803996	rs56321069	T	A	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.144;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=722;ReadPosRankSum=0.014;SC=AAATGCCTATTCTTTCACTGT;SOR=0.440;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=65;TCF=39;TCR=26;TR=39;WE=19804004;WS=19803986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,41:0.62:66
chr8	19810826	rs248	G	A	3494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.141;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=41;PP=2732;ReadPosRankSum=0.556;SC=CAAAGGAGGAGTTTAACTACC;SOR=0.986;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=204;TCF=131;TCR=73;TR=124;WE=19810834;WS=19810816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,128:0.60:212
chr8	19813676	rs270	C	A	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.906;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=424;ReadPosRankSum=0.158;SC=CTGATTCTGTCCATTGGAACA;SOR=0.105;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=21;WE=19813684;WS=19813666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,24:0.41:59
chr8	19816934	rs301	T	C	2372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=64;PP=2026;SC=CCAGTCCCTCTCCTGCCATAA;SOR=5.610;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=3;TCR=64;TR=67;WE=19816942;WS=19816924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr8	19818436	rs316	C	A	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=6;PP=1333;SC=CAAATAAGACCTACTCCTTCC;SOR=3.788;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=42;TCR=6;TR=47;WE=19818444;WS=19818426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	19819536	rs327	T	G	4251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=10;PP=2965;SC=TGATCATGTATTATTTAAACA;SOR=4.338;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=111;TCR=10;TR=121;WE=19819544;WS=19819526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr8	19822830	rs4922115	G	A	5618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=103;PP=2965;SC=GAAACTGGGCGAATCTACAGA;SOR=1.083;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=71;TCR=103;TR=174;WE=19822838;WS=19822820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr8	20077940	rs139800615	C	G	2496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-8.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=85;PP=1997;ReadPosRankSum=0.559;SC=GCTCCGCGCTCTTGTGAAATA;SOR=0.668;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=237;TCF=33;TCR=204;TR=98;WE=20077948;WS=20077930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,100:0.41:244
chr8	20107143	rs904003	A	G	1654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=2;PP=1426;SC=GCGTCTCTCAAAGGGGTCTGA;SOR=5.464;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=45;TCR=2;TR=47;WE=20107151;WS=20107133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr8	21766900	rs17853066	G	A	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.584;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=1016;ReadPosRankSum=0.399;SC=AATCCTGCCCGGCTGGCTGGA;SOR=0.175;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=113;TCF=73;TCR=40;TR=49;WE=21766908;WS=21766890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,50:0.43:117
chr8	21767275	rs2242240	C	G	2385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=6.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.630;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=37;PP=1902;ReadPosRankSum=-2.450;SC=GGGGCAGCGACGCGGGGATTG;SOR=1.012;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=162;TCF=87;TCR=75;TR=86;WE=21767283;WS=21767265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,87:0.54:162
chr8	21768380	rs142797319	AAGAG	A	1878.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.65;MQRankSum=1.706;QD=25.39;ReadPosRankSum=-1.047;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,48:0.65:74
chr8	21771309	rs35282792	CT	C	172.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQRankSum=0.000;QD=9.10;ReadPosRankSum=0.423;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr8	21824547	rs4872191	A	G	2320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=66;PP=1917;ReadPosRankSum=0.000;SC=AAAGGATAACAGGCGCTTCGG;SOR=4.323;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=3;TCR=67;TR=69;WE=21824555;WS=21824537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
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chr8	21827833	rs4871903	A	G	3416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.193;NF=10;NR=95;PP=2958;ReadPosRankSum=0.000;SC=TACAGTGTATATATTTGATGT;SOR=2.853;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=10;TCR=96;TR=105;WE=21827841;WS=21827823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,107:0.99:108
chr8	21827880	rs140784168	A	AACAC,AAC	1345.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.408;NF=0,0;NR=24,24;PP=75,775;ReadPosRankSum=1.017;SC=CATATATATAAACACACACAC;SOR=5.353;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=24,24;WE=21827888;WS=21827870;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.97:30
chr8	21833965	rs2306641	C	T	4303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=86;PP=2965;SC=TTGACTTCATCGGCACTTCCA;SOR=1.441;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=45;TCR=86;TR=131;WE=21833973;WS=21833955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr8	21835465	rs733543	A	G	2541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=75;PP=2195;ReadPosRankSum=-0.968;SC=AAGCATAGAAATACTAGGCTA;SOR=7.353;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=76;TCF=0;TCR=76;TR=75;WE=21835473;WS=21835455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,78:0.99:79
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chr8	21842023	rs1872220	TT	GA	1212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=21;NR=2;PP=1393;SC=TCTTCCTTGGTTAAAAGTAAT;SOR=4.332;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=23;WE=21842032;WS=21842013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	21842063	rs13248727	T	C	1510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=4;PP=1270;SC=CAGTCAGAAATGGTGGCTAAG;SOR=4.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=44;TCR=4;TR=47;WE=21842071;WS=21842053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr8	21844924	.	C	G	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.923;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=172;ReadPosRankSum=1.035;SC=TTCTCTTAGTCTTTAAATTCT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=9;WE=21844932;WS=21844914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr8	21845428	rs2306645	T	C	3135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=90;PP=2465;SC=AACTGTAAAATGTGATCTTGG;SOR=2.917;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=20;TCR=90;TR=110;WE=21845436;WS=21845418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr8	21846586	rs2306646	G	C	6467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=119;NR=75;PP=2965;SC=TCAATGACCTGTCCATTGGAT;SOR=1.244;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=196;TCF=119;TCR=77;TR=194;WE=21846594;WS=21846576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr8	21849566	rs17296501	C	T	2047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.322;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=55;PP=1536;ReadPosRankSum=1.776;SC=TGACTGTAAACTATCCACTGC;SOR=0.499;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=157;TCF=37;TCR=120;TR=73;WE=21849574;WS=21849556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,79:0.47:168
chr8	21857267	rs17616085	G	A	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=35;PP=1006;SC=TCTTGCCCCAGTGTCCAAAAA;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=37;WE=21857275;WS=21857257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	21859485	rs11785657	G	A	78.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=57;SC=GAGGTTAAGAGGTTAACAGGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=21859493;WS=21859475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr8	21861663	rs10866837	G	C	2318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=61;PP=1846;SC=GCAATGCAATGCAATAGAAAA;SOR=8.410;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=0;TCR=62;TR=61;WE=21861671;WS=21861653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr8	21862430	.	TAA	T,TA	892.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.35;MQRankSum=0.475;QD=15.13;ReadPosRankSum=0.645;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:7,18,34:0.31,0.58:59
chr8	21862551	rs1058486	A	G	4738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.249;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=85;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.135;SC=TCAACGACTCAATGAAGAATT;SOR=0.629;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=151;TCF=66;TCR=85;TR=149;WE=21862559;WS=21862541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,154:0.99:156
chr8	21890581	rs1947985	T	C	2414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=0;PP=2072;SC=TGCCTGAGGCTAGTCCCCGAG;SOR=8.581;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=71;TCR=0;TR=71;WE=21890589;WS=21890571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr8	21891939	rs10089142	G	A	2350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=21;PP=1898;SC=GGAGCTCAGCGGGGACCTTGT;SOR=1.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=48;TCR=21;TR=69;WE=21891947;WS=21891929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr8	21891968	rs4871915	C	G	2543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=30;PP=2074;SC=GGAATCTGTTCTGGCTCTGGA;SOR=1.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=46;TCR=30;TR=76;WE=21891976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr8	21895146	rs11992609	A	G	1807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=47;PP=1303;ReadPosRankSum=0.140;SC=CACACAGATGAGCCCTACACT;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=137;TCF=48;TCR=89;TR=71;WE=21895154;WS=21895136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,73:0.52:140
chr8	21904212	rs1078363	T	C	1757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=56;PP=1443;SC=TAGGGCATCATGCTCCCCTCT;SOR=4.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=6;TCR=57;TR=62;WE=21904220;WS=21904202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr8	21924297	rs9657287	C	T	203.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=4;PP=164;SC=AAGCGCGCAGCGCCCAGCAGC;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=21924305;WS=21924287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	21924743	rs11135821	G	A	2505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=60;PP=2159;SC=GGCTGCTAGCGTGCCTTCCCG;SOR=2.554;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=19;TCR=60;TR=79;WE=21924751;WS=21924733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr8	21924778	rs11135822	T	G	1768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=45;PP=1517;SC=TGGTGGTCCCTCCGGTGCTGG;SOR=2.221;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=14;TCR=45;TR=59;WE=21924786;WS=21924768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr8	21924944	rs11135823	A	G	3953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=34;PP=2965;SC=ATGGCGGTCCATTTTCTTGGT;SOR=2.319;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=106;TCR=34;TR=140;WE=21924952;WS=21924934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr8	21925214	rs6997244	C	G	2532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=73;PP=2217;SC=TCCTCTTGGGCAGGACTCCGG;SOR=5.339;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=4;TCR=73;TR=77;WE=21925222;WS=21925204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr8	21927137	rs12680100	G	A	11041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=91;NR=240;PP=2965;SC=CTCGCCTCAGGGCTAAGTAGG;SOR=2.075;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=331;TCF=91;TCR=240;TR=331;WE=21927145;WS=21927127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,340:1.00:340
chr8	21927211	rs12681799	C	G	5493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=125;PP=2965;SC=CTCCCCCAGCCGGAAAAGTGT;SOR=2.375;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=165;TCF=39;TCR=126;TR=164;WE=21927219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr8	21927460	rs7386762	C	G	6599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=158;PP=2965;SC=TGAGGGCGCCCCTGGCTCACC;SOR=2.325;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=208;TCF=50;TCR=158;TR=208;WE=21927468;WS=21927450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr8	21930007	rs3824334	G	A	2768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=69;PP=2214;SC=CAGGAGTCTCGCTCTGTTGCC;SOR=2.610;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=18;TCR=69;TR=87;WE=21930015;WS=21929997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr8	21930068	rs3824336	A	G	1555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=45;PP=1298;SC=CTCCGCTCCCAGGTTCAAGTG;SOR=6.316;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=46;WE=21930076;WS=21930058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr8	21931163	.	AG	A	730.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.198;ClippingRankSum=0.000;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=2.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.57;MQRankSum=-6.510;QD=8.21;ReadPosRankSum=4.997;SOR=1.345;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,29:0.33:89
chr8	21931166	.	AAGAAAAAAAAAAAGAG	A	163.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-3.231;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=2.343;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.76;MQRankSum=-5.081;QD=2.07;ReadPosRankSum=4.776;SOR=1.149;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,12:0.15:79
chr8	21931170	rs199820139	AAAAAAAAAAGAG	A	2022.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=4.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=10.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.76;MQRankSum=8.425;QD=22.99;ReadPosRankSum=-0.543;SOR=0.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,58:0.66:88
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chr8	21964802	rs1552286	C	T	3219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=12;PP=2635;SC=TGTCACCTCCCCCACCTCTCT;SOR=3.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=80;TCR=12;TR=92;WE=21964810;WS=21964792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
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chr8	21966707	rs58343576	CG	C	853.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=8;NR=6;PP=518;SC=GCAGCCCGCACGGGGCGCCGG;SOR=1.402;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=14;WE=21966715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	21966891	rs149177341	C	CCCGCTCCCAGTCCCTGCGGAGA	259.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.81;ReadPosRankSum=0.148;SOR=0.344;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
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chr8	21974032	rs6557830	A	C	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=692;ReadPosRankSum=1.257;SC=TCTAATGACAACCACCCCCGA;SOR=0.751;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=69;TCF=21;TCR=48;TR=34;WE=21974040;WS=21974022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
chr8	21976872	rs12677278	G	A	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.019;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=45;PP=1193;ReadPosRankSum=-0.319;SC=CTGTAATCCTGGCACTTTGGG;SOR=0.488;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=100;TCF=17;TCR=83;TR=55;WE=21976880;WS=21976862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,58:0.55:106
chr8	21978072	rs11135859	A	G	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=552;ReadPosRankSum=0.388;SC=GGTGCCCGCCATGGCCAGGCA;SOR=0.788;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=27;WE=21978080;WS=21978062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
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chr8	21984488	rs12681529	G	A	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.781;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=265;ReadPosRankSum=0.699;SC=CGCCCCATGCGAAGCCCCAGC;SOR=0.113;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=14;WE=21984496;WS=21984478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
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chr8	22011787	rs73225826	C	T	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=468;ReadPosRankSum=0.068;SC=CAGCAGCACTCGCCCTACGCC;SOR=0.843;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=52;TCF=7;TCR=45;TR=25;WE=22011795;WS=22011777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr8	22020294	rs2070684	C	A	1973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=35;PP=1581;SC=TGCCAGACAGCGGGGCTAGGT;SOR=1.160;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=60;TCF=24;TCR=36;TR=59;WE=22020302;WS=22020284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr8	22021037	rs4715	C	A	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=24;PP=908;ReadPosRankSum=-0.628;SC=GAGGCTCTCACTAGAAAAGTC;SOR=0.733;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=110;TCF=56;TCR=54;TR=49;WE=22021045;WS=22021027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,49:0.45:109
chr8	22021517	rs1124	G	A	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.542;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=12;PP=517;ReadPosRankSum=-1.971;SC=ATGGCCGTGAGCACCCTGTGT;SOR=0.061;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=23;WE=22021525;WS=22021507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr8	22021739	rs3216166	G	GA	2897.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.487;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.096;NF=51;NR=31;PP=2954;ReadPosRankSum=0.226;SC=CCACTCCCCTGATTCTCTCTG;SOR=0.389;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=182;TCF=122;TCR=60;TR=82;WE=22021747;WS=22021729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,94:0.46:205
chr8	22021883	rs7592	G	A	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.370;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=662;ReadPosRankSum=-0.207;SC=GCAGGGACAAGCCCTGGAGAA;SOR=0.258;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=113;TCF=28;TCR=85;TR=41;WE=22021891;WS=22021873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,42:0.37:113
chr8	22021933	rs1126931	C	T	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.355;HP=3;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=36;PP=1858;ReadPosRankSum=1.867;SC=GCAGAGGTGGCGCCCAGGGGC;SOR=2.004;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=72;TCF=10;TCR=62;TR=40;WE=22021942;WS=22021923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,41:0.58:71
chr8	22021934	rs1139547	G	A	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.404;HP=4;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=25;PP=1285;ReadPosRankSum=-2.135;SC=CAGAGGTGGCGCCCAGGGGCC;SOR=0.141;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=71;TCF=10;TCR=61;TR=31;WE=22021942;WS=22021923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,29:0.42:69
chr8	22064690	.	T	C	1706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.328;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.649;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=3;PP=1335;ReadPosRankSum=0.443;SC=GGGCCCTCCTTCACTGTCATC;SOR=0.117;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=92;TCF=89;TCR=3;TR=53;WE=22064698;WS=22064680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,57:0.60:95
chr8	22066855	rs4463424	C	T	1372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=0;PP=1216;SC=GTGGCCTTCACCCAGGCCTCC;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=43;WE=22066863;WS=22066845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr8	22079355	rs4872422	A	G	3893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=89;PP=2965;SC=CGTGGCTGCCACTGTTGTCCT;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=35;TCR=89;TR=124;WE=22079363;WS=22079345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr8	22081708	rs4075536	G	A	3917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=24;PP=2965;SC=GGAGAGGCCCGGCGGGTCCAG;SOR=2.632;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=92;TCR=24;TR=116;WE=22081716;WS=22081698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
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chr8	22105502	rs1126677	T	C	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.818;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=452;ReadPosRankSum=-1.172;SC=AGGGCCCAGCTGAAATGATGA;SOR=0.525;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=59;TCF=29;TCR=30;TR=28;WE=22105510;WS=22105492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,32:0.47:68
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chr8	22147333	rs4872463	A	G	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.150;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=425;ReadPosRankSum=0.021;SC=CTTCTATTAGAAAACTCATAC;SOR=0.088;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=51;TCF=50;TCR=1;TR=19;WE=22147341;WS=22147323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,20:0.38:52
chr8	22163331	rs12543697	C	T	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=1.252;SC=CTCCTTAGTGCGCAAGGTATA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=6;WE=22163339;WS=22163321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr8	22171984	rs201456555	G	A	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=339;ReadPosRankSum=1.128;SC=GGCACCTCTCGCCTCCCCGAG;SOR=1.688;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=19;WE=22171992;WS=22171974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
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chr8	22277040	rs10101909	G	A	3121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.372;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=53;PP=2300;ReadPosRankSum=0.025;SC=AATTGCAGCTGTGTTGTTTCT;SOR=0.908;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=262;TCF=147;TCR=115;TR=128;WE=22277048;WS=22277030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,130:0.49:268
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chr8	22389900	rs2449340	T	G	1425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=7.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.740;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=45;PP=1162;ReadPosRankSum=1.180;SC=AGTTTTTTTATAATTGGAATG;SOR=1.244;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=109;TCF=16;TCR=93;TR=51;WE=22389908;WS=22389890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,51:0.48:106
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chr8	22396781	rs5890041	TC	T	385.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=413;SC=TTAGAAACTCTCCCCCACCCC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=12;WE=22396789;WS=22396771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	22398414	rs7430	G	C	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=308;ReadPosRankSum=-0.096;SC=CAACTTCAACGTGGAGGTGCA;SOR=0.990;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=13;WE=22398422;WS=22398404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr8	22398462	rs7431	G	A	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.113;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=85;ReadPosRankSum=-0.736;SC=TAAAAAGGTGGCTGTTTTATA;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=22398470;WS=22398452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr8	22419191	rs2469764	T	C	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.620;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=717;ReadPosRankSum=1.150;SC=ATGTAGTAAATGTCGTAAAGC;SOR=1.136;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=62;TCF=49;TCR=13;TR=33;WE=22419199;WS=22419184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr8	22421355	rs2449336	A	G	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=1;PP=585;SC=CCACAGTTTAATCTTGCTTCC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=22421363;WS=22421345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	22421395	rs2469762	G	A	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=1;PP=726;SC=CAGAGGCAGAGTAGACCCCAC;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=22421403;WS=22421385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr8	22424489	rs11779261	A	G	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=15;PP=732;SC=GGGGTGAGAGAACTGGGGTGT;SOR=1.519;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=24;WE=22424497;WS=22424479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	22426859	rs13258049	G	C	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=15;PP=426;SC=ACTAAAAACAGTTTTTTTTTT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=15;WE=22426867;WS=22426849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	22428658	rs2449331	T	C	6731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=82;NR=126;PP=2965;SC=GCTGACCCCATCGACTTGGGG;SOR=1.189;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=208;TCF=82;TCR=126;TR=208;WE=22428666;WS=22428648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
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chr8	22429373	rs2280889	G	C	3116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=102;PP=2567;SC=GACGTGGGGGGGGTCACTGGC;SOR=4.902;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=7;TCR=102;TR=109;WE=22429381;WS=22429363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr8	22430651	rs57425551	C	CA	851.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=1;PP=937;SC=CCTGGCAGCCCACCCTTCCTG;SOR=4.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=22;WE=22430659;WS=22430641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
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chr8	22442661	rs2294047	A	G	7254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=134;PP=2965;SC=CTGGAGAGGCAGCCATCAGCC;SOR=1.145;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=226;TCF=91;TCR=135;TR=225;WE=22442669;WS=22442651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr8	22449181	rs73229817	C	T	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=37;PP=1320;SC=ACCAGCATCGCGTGAGTGTGG;SOR=2.655;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=9;TCR=37;TR=46;WE=22449189;WS=22449171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr8	22462346	rs11555543	T	G	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=350;ReadPosRankSum=0.716;SC=GTCGCTGCCCTGGCCCGCAGG;SOR=0.705;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=20;WE=22462354;WS=22462336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr8	22465011	.	C	T	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.263;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.932;NF=0;NR=12;PP=241;ReadPosRankSum=-0.943;SC=GATGGAGTCTCGCTCTGTTGC;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=12;WE=22465019;WS=22465001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr8	22482851	rs900268	A	C	2236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=22;PP=1781;SC=GTCCAGGATCAGGCTGCGCAG;SOR=1.483;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=50;TCR=22;TR=72;WE=22482859;WS=22482841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
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chr8	22571113	rs2280106	G	A	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.223;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=467;ReadPosRankSum=1.076;SC=AAGCTGGCAGGGGCCTGAGAG;SOR=1.063;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=52;TCF=13;TCR=39;TR=24;WE=22571121;WS=22571103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
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chr8	22785013	rs1553778	T	C	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=0;PP=1315;SC=AGATGGTGCTTCTTGGTTCTG;SOR=7.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=45;WE=22785021;WS=22785003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr8	22785047	rs73218763	C	T	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.536;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=5;PP=600;ReadPosRankSum=0.770;SC=CTGCCATCTACCTGCCTGGTA;SOR=0.261;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=71;TCF=63;TCR=8;TR=31;WE=22785055;WS=22785037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,31:0.42:74
chr8	22785159	rs2175192	G	A	2417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.068;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=42;PP=1939;ReadPosRankSum=0.750;SC=TCTCATCCTCGTCTCCAGTGA;SOR=0.779;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=204;TCF=115;TCR=89;TR=96;WE=22785167;WS=22785149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,97:0.46:209
chr8	22863004	rs2430811	A	G	5141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=90;PP=2965;SC=GAAGGCCTCTAGCCGCCTGCA;SOR=1.165;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=66;TCR=90;TR=156;WE=22863025;WS=22862994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr8	22863017	rs2466179	G	T	4632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=90;PP=2965;SC=CGCCTGCAGAGAACCAACAGG;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=57;TCR=90;TR=147;WE=22863025;WS=22862994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr8	22863191	rs2430812	C	T	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=18;PP=533;SC=GATTGAGTTCCAGCTCTGTGC;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=22863199;WS=22863181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	22864622	rs2466178	T	C	14534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=465;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=235;NR=209;PP=2965;SC=TCTCCACCTCTTCCTCCAAGT;SOR=0.803;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=444;TCF=235;TCR=209;TR=444;WE=22864630;WS=22864612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,458:1.00:458
chr8	22865320	rs2430815	T	G	3122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=76;PP=2499;SC=ATTGCCTGTCTGTCTCAGCTC;SOR=2.424;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=18;TCR=76;TR=94;WE=22865328;WS=22865310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr8	22880162	rs1047275	G	C	7253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=156;NR=59;PP=2965;SC=GGGAAGGTCTGACTTCCTGAA;SOR=1.849;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=215;TCF=156;TCR=59;TR=215;WE=22880170;WS=22880152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr8	22881852	rs6557609	T	C	6192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=81;NR=105;PP=2965;SC=ACCAGCCAGCTCTGAGACCTG;SOR=1.010;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=186;TCF=81;TCR=105;TR=186;WE=22881860;WS=22881842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr8	22885109	rs1105944	A	G	2788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=3;PP=2251;SC=AGCCCAGAGCACCCAGGCCAC;SOR=6.337;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=95;TCF=92;TCR=3;TR=94;WE=22885117;WS=22885099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr8	22885153	rs2293402	G	A	2102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=4.072;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.90;ReadPosRankSum=0.602;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,79:0.48:163
chr8	22885153	.	GG	AA	1591	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=64;NR=9;PP=1591;QD=22.5269571899;SC=AGGACAATGGGGACCCACCCA;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=160;TCF=136;TCR=24;TR=73;WE=22885162;WS=22885143;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:87,73:0.46:160
chr8	22885154	rs1105945	G	A	6270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=132;NR=24;PP=1773;SC=GGACAATGGGGACCCACCCAC;SOR=3.387;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=159;TCF=135;TCR=24;TR=156;WE=22885162;WS=22885143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr8	22885331	rs2293400	A	T	2564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=59.96;MQRankSum=-0.909;NF=10;NR=81;PP=2028;ReadPosRankSum=-1.837;SC=CTCCCAGAGGACAGTGGGGCG;SOR=0.669;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=172;TCF=19;TCR=153;TR=91;WE=22885339;WS=22885321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,92:0.54:170
chr8	22886020	rs13265018	A	G	6193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=79;NR=113;PP=2965;SC=CACAGCTGGGACTTCCCCACT;SOR=1.083;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=192;TCF=79;TCR=113;TR=192;WE=22886028;WS=22886010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr8	22886130	rs2293399	A	G	2088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=56;PP=1616;SC=GTACACACACAGAGGGAGAGG;SOR=6.059;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=0;TCR=57;TR=56;WE=22886138;WS=22886120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr8	22887013	rs6420148	C	G	1281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=3;PP=1076;SC=GCAGCCACAGCCTCAAGGATG;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=38;WE=22887021;WS=22887003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	22888407	rs10866818	G	A	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=16;PP=485;SC=GAGAAAAGCCGGTGAATGAAA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=22888415;WS=22888397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
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chr8	22926498	rs11135695	G	A	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.102;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=28;PP=743;ReadPosRankSum=0.748;SC=TGTGGGCGCAGAGATTGCGGG;SOR=0.057;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=75;TCF=9;TCR=66;TR=35;WE=22926506;WS=22926488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr8	22960704	rs6557616	G	C	7115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=146;PP=2965;SC=AGTGAGTCCCGGCCGCGGTCC;SOR=1.255;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=234;TCF=88;TCR=146;TR=234;WE=22960712;WS=22960694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr8	22960873	rs10109912	G	C	2946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=43;PP=2478;SC=TGGGCAGGAGGGACCCGGCCG;SOR=0.778;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=49;TCR=44;TR=92;WE=22960881;WS=22960863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr8	22969091	rs10111172	T	C	2220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=69;NR=2;PP=1850;SC=AACACAGGTATGAAAGAATGA;SOR=6.273;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=72;TCF=70;TCR=2;TR=71;WE=22969099;WS=22969081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr8	22974325	rs11780493	G	A	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.87;QD=32.49;SOR=3.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	22974450	.	T	C	2965	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=56.68;NF=69;NR=59;PP=2965;QD=20;SC=GAGACAATGATCACCAGCCCG;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=70;TCR=59;TR=128;WE=22974458;WS=22974440;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,128:0.99:129
chr8	22989954	rs4872058	G	A	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=34;SC=GTAGGGACCCGTATCTCAATA;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=47;WE=22989962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr8	22990193	rs36229757	TTGTGTGTG	T	1207.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;QD=40.26;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr8	23049292	rs2230229	C	T	5831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=78;NR=92;PP=2965;SC=AATCTTCTCTCTTGCATGTCT;SOR=0.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=78;TCR=92;TR=170;WE=23049300;WS=23049282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr8	23054779	rs3824218	T	C	9030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=170;PP=2965;SC=TAGTACTGACTCTGACCATCA;SOR=1.127;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=282;TCF=112;TCR=170;TR=281;WE=23054787;WS=23054769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr8	23059265	rs11294851	TC	T	4690.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=22;PP=2951;SC=TTTTTAGGGTTCCTTGCTTCT;SOR=2.442;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=93;TCF=69;TCR=24;TR=90;WE=23059273;WS=23059255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr8	23059280	rs4872078	G	T	4935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=30;PP=2667;SC=GCTTCTGTGGGTTCTTTGAGG;SOR=1.981;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=81;TCR=30;TR=111;WE=23059288;WS=23059270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr8	23059324	rs20575	C	G	3822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=55;PP=2907;SC=GTCTCACCCTCTGCTGCACTT;SOR=0.726;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=113;TCF=57;TCR=56;TR=112;WE=23059332;WS=23059314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr8	23060256	rs17620	T	C	2652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=93;PP=2202;SC=GGCTCCAGGATGTTCTGATCT;SOR=9.087;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=93;TCF=0;TCR=93;TR=93;WE=23060264;WS=23060246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr8	23112662	rs3736025	C	T	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=449;SC=TTCCCGGGTGCTTGCCTTGTG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=23112670;WS=23112652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	23113908	rs4439140	G	A	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=29;ReadPosRankSum=0.724;SC=CACCACCAGCGCTCCTGGTTG;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=5;WE=23113916;WS=23113898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
chr8	23115398	rs56164900	C	T	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=266;ReadPosRankSum=0.547;SC=GAGTTTTTGCCGTCAGCATCA;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=13;WE=23115406;WS=23115388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr8	23115646	rs3736022	G	T	1202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.858;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=947;ReadPosRankSum=-0.760;SC=CAGGCCTGGAGCAATGCCCAG;SOR=0.311;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=74;TCF=25;TCR=49;TR=44;WE=23115654;WS=23115636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,45:0.59:76
chr8	23145320	rs11777755	A	G	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=0;PP=710;ReadPosRankSum=0.333;SC=CCAACATGGAAGAAAAAAAGA;SOR=1.455;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=28;WE=23145328;WS=23145310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr8	23146095	rs11546682	A	G	2254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.536;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=58;PP=1719;ReadPosRankSum=-1.590;SC=GACTTCGTCCACCGGATCCAG;SOR=0.643;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=189;TCF=75;TCR=114;TR=96;WE=23146103;WS=23146085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,98:0.51:194
chr8	23147564	rs3808536	G	A	2920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.034;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=58;PP=2491;ReadPosRankSum=0.085;SC=GTGCTGCGCAGGCAGGAAGAA;SOR=0.592;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=225;TCF=107;TCR=118;TR=114;WE=23147572;WS=23147554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,111:0.50:222
chr8	23148003	rs4469460	G	A	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=441;ReadPosRankSum=-0.776;SC=TCTTGAGCCCGAAAAGGGAGG;SOR=0.631;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=21;WE=23148011;WS=23147993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr8	23148930	rs2272762	A	G	1832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=1.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.50;ReadPosRankSum=1.219;SOR=0.618;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,49:0.52:94
chr8	23148940	rs2272761	G	A	1782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=1.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.03;ReadPosRankSum=0.806;SOR=0.487;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,47:0.53:89
chr8	23148978	rs2272760	G	T	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.179;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=25;PP=608;ReadPosRankSum=0.412;SC=TTGCCCACGTGGTAGAGATCT;SOR=1.078;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=62;TCF=14;TCR=48;TR=31;WE=23148986;WS=23148968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
chr8	23149089	rs2272759	A	G	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=22;ReadPosRankSum=1.340;SC=AGAGGAGCTAAGATACTTCTC;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=3;WE=23149097;WS=23149079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr8	23150671	rs11135720	A	G	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=352;ReadPosRankSum=-0.389;SC=GCTGCAAATGATTGTCTCCGT;SOR=0.760;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=16;WE=23150679;WS=23150661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr8	23150772	rs72237352	CTGCT	C	2676.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.486;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.497;NF=35;NR=15;PP=2252;ReadPosRankSum=-0.480;SC=AGGAGTTTGACTGCTTGCTTT;SOR=0.852;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=125;TCF=84;TCR=41;TR=50;WE=23150783;WS=23150762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,71:0.48:149
chr8	23150878	rs13530	T	G	1726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=44;PP=1318;ReadPosRankSum=-2.615;SC=TTTCCCTGCCTGGCCTCAGGT;SOR=0.675;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=58;TCR=90;TR=72;WE=23150886;WS=23150868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,72:0.48:150
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chr8	23167353	rs1063582	T	G	2892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.510;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=46;PP=2186;ReadPosRankSum=-1.983;SC=CACTGCAGCATGAACATGGGC;SOR=0.741;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=204;TCF=115;TCR=89;TR=107;WE=23167361;WS=23167343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,110:0.53:208
chr8	23167560	rs12548642	T	C	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=5.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=27;PP=606;ReadPosRankSum=1.209;SC=TCCTCAAGGTTACCTTCTTGT;SOR=1.038;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=61;TCF=3;TCR=58;TR=28;WE=23167568;WS=23167550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr8	23174425	rs3824213	T	C	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=428;ReadPosRankSum=0.288;SC=CTGGTCCCCTTGGGAGCCCGG;SOR=0.246;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=19;WE=23174433;WS=23174415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr8	23174748	rs13250587	A	G	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=35;PP=748;ReadPosRankSum=-0.858;SC=TTCAGATCGAAACAGCACGGA;SOR=0.776;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=88;TCF=2;TCR=86;TR=36;WE=23174756;WS=23174738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,39:0.41:94
chr8	23177619	rs13254579	C	A	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=34;PP=780;ReadPosRankSum=1.669;SC=GAGCTTCCCCCCTACGCTGCC;SOR=0.488;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=75;TCF=5;TCR=70;TR=37;WE=23177627;WS=23177609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,39:0.52:75
chr8	23186007	rs1051146	T	C	2043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.009;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=37;PP=1604;ReadPosRankSum=-0.253;SC=CGGTCCCCCATTCTCCATTTT;SOR=0.598;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=152;TCF=72;TCR=80;TR=78;WE=23186015;WS=23185997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,79:0.51:155
chr8	23186222	.	A	ATGTGTG	172.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.01;QD=57.62;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr8	23198732	rs11781891	C	A	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.126;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=3;PP=35;ReadPosRankSum=-1.044;SC=AAGAAAGAGGCGTGGAAGGAG;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=3;WE=23198740;WS=23198722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr8	23225559	rs1063577	G	A	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.607;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=653;ReadPosRankSum=-0.401;SC=TGGCCTCCACGTAGCCCAGCT;SOR=0.206;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=88;TCF=69;TCR=19;TR=37;WE=23225567;WS=23225549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,39:0.42:92
chr8	23282408	rs140472406	AT	A	1797.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.408;NF=50;NR=1;PP=1898;ReadPosRankSum=1.163;SC=CTCATAGGACATACAGTGCCG;SOR=0.231;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=105;TCF=104;TCR=1;TR=51;WE=23282416;WS=23282398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,54:0.51:106
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chr8	23282559	.	C	CAGTATTCCATG	5444.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.273;ClippingRankSum=0.000;DP=282;ExcessHet=3.0103;FS=11.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.38;ReadPosRankSum=-1.844;SOR=1.276;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:157,124:0.44:281
chr8	23282562	.	A	AGTATT	4740.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.519;ClippingRankSum=0.000;DP=273;ExcessHet=3.0103;FS=11.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.43;ReadPosRankSum=-2.645;SOR=1.276;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,117:0.43:272
chr8	23291835	rs1142283	T	C	2165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.379;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=5;PP=1817;ReadPosRankSum=1.042;SC=CCTACCTTAATGGTAGAAAGC;SOR=1.692;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=144;TCF=129;TCR=15;TR=81;WE=23291843;WS=23291825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,80:0.55:145
chr8	23294392	rs2272643	C	T	1391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=6.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=2;PP=1098;ReadPosRankSum=1.900;SC=AACCCGTCACCGTCCACACTG;SOR=0.809;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=87;TCF=83;TCR=4;TR=45;WE=23294400;WS=23294382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,49:0.53:93
chr8	23294412	rs2272642	A	G	1723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.165;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=7;PP=1347;ReadPosRankSum=0.358;SC=GGTCTCTCAAAAGCATGCAGA;SOR=0.488;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=110;TCF=98;TCR=12;TR=57;WE=23294420;WS=23294402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,61:0.52:117
chr8	23307253	rs2293936	A	C	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=234;ReadPosRankSum=-0.078;SC=ATGCATTAAAATACCTCACTG;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=13;WE=23307261;WS=23307243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr8	23423758	rs10992	G	A	9459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=183;NR=108;PP=2965;SC=GTGCAGGGCCGGCCCATGCCA;SOR=1.282;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=291;TCF=183;TCR=108;TR=291;WE=23423766;WS=23423748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,296:1.00:296
chr8	23429448	rs59804560	A	AT	915.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=36;PP=713;ReadPosRankSum=-0.482;SC=CACGTAGATCATTTTTTTTTT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=36;WE=23429456;WS=23429438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr8	23431045	rs1810193	T	C	2335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=5;PP=2003;SC=TGGTGCATCTTACCGAGGAGG;SOR=4.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=64;TCR=5;TR=69;WE=23431053;WS=23431035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
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chr8	23432332	rs8534	C	T	3077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.61;SOR=7.083;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
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chr8	23702603	rs11135775	C	T	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=455;ReadPosRankSum=0.177;SC=GAGAGCCCGGCGAGACCCAGG;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=20;WE=23702611;WS=23702593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr8	24187399	rs11994377	T	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.012;NF=27;NR=1;PP=744;ReadPosRankSum=2.157;SC=TGTGTGTGTGTGAGAGAGAGA;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=28;WE=24187407;WS=24187389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr8	24193264	rs4872222	T	C	3088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=82;PP=2482;SC=TTAGAAGCTTTGAACTCAAAA;SOR=2.393;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=24;TCR=82;TR=106;WE=24193272;WS=24193254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr8	24208649	rs10092862	C	T	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=2;PP=1083;SC=AAGAAAGACACAATGGGAAAA;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=38;WE=24208657;WS=24208639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	24208847	rs7009516	G	A	4328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=77;PP=2965;SC=TCTGGGCTGTGATTACCATGG;SOR=1.027;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=56;TCR=78;TR=133;WE=24208855;WS=24208837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr8	24211278	rs7815643	C	T	3546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=41;PP=2686;SC=TTATAATTAACGTAGCATAAA;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=63;TCR=41;TR=104;WE=24211286;WS=24211268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr8	24211331	rs7814768	G	A	4589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=75;PP=2965;SC=GGATAATCCAGTGTCTACACC;SOR=1.017;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=62;TCR=76;TR=137;WE=24211339;WS=24211321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr8	24211884	rs10694022	A	ATGTC	2246.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=5;PP=2068;SC=TTTAGAAGTTATGTCTTTTTT;SOR=3.486;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=50;TCF=41;TCR=9;TR=44;WE=24211892;WS=24211874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	24211993	rs10610134	ACTAT	A	3028.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=43;PP=2973;SC=AGAGAAATATACTATCTATCT;SOR=1.211;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=18;TCR=53;TR=58;WE=24212004;WS=24211983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr8	24257137	rs17799264	T	C	1147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=36;PP=929;ReadPosRankSum=0.288;SC=GCACTGAAGATCCCTTGGGTT;SOR=0.580;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=58;TCF=1;TCR=57;TR=37;WE=24257145;WS=24257127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,39:0.65:60
chr8	24333601	rs10100176	G	A	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=48;ReadPosRankSum=0.595;SC=AGCTTTAATAGGTTTGTTTCA;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=5;WE=24333609;WS=24333591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
chr8	24339896	rs11348969	GA	G	125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.929;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=106;ReadPosRankSum=1.220;SC=AAAATTAACAGAAAAAAAACA;SOR=0.049;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=10;WE=24339904;WS=24339886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr8	24348221	rs1492401	T	A	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=6.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.441;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=492;ReadPosRankSum=-0.120;SC=TTTAACTCTATCAGAATCCAC;SOR=0.038;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=85;TCF=84;TCR=1;TR=26;WE=24348229;WS=24348211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,26:0.29:91
chr8	24349395	rs12542421	C	G	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.861;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;ReadPosRankSum=0.104;SC=AGGATTTAGTCTCTTTGTTTT;SOR=0.965;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=112;TCF=83;TCR=29;TR=33;WE=24349403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,35:0.29:119
chr8	24350188	rs1352952	C	T	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.079;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=440;ReadPosRankSum=1.018;SC=TGTCCCCAGACCTGTTAATCT;SOR=0.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=62;TCF=17;TCR=45;TR=23;WE=24350196;WS=24350178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,23:0.35:65
chr8	24350715	rs12547971	G	A	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=551;ReadPosRankSum=0.931;SC=GCCTGGTGGCGTCAGGAACAA;SOR=0.756;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=93;TCF=36;TCR=57;TR=32;WE=24350723;WS=24350705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,32:0.34:93
chr8	24365157	rs34338646	TCA	T	892.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=36;PP=837;ReadPosRankSum=-0.024;SC=TCTGTACTTATCACAACAGAT;SOR=0.296;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=75;TCF=1;TCR=74;TR=36;WE=24365166;WS=24365147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,26:0.37:71
chr8	24365181	rs11307556	AT	A	293.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.53;ReadPosRankSum=1.143;SOR=0.520;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,23:0.51:45
chr8	24774683	rs196864	C	A	2207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.145;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=36;PP=1686;ReadPosRankSum=-1.780;SC=GATTCAGAAACCCAAGGTGGA;SOR=0.609;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=179;TCF=106;TCR=73;TR=87;WE=24774691;WS=24774673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,91:0.49:187
chr8	24811064	rs11300136	AG	A	1705.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=13;PP=1323;SC=TCTCCTTCAGAGGGGGGGCTC;SOR=2.221;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=48;WE=24811072;WS=24811054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
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chr8	25156296	rs2956656	T	G	1190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=1;PP=1005;SC=GCCCAGGCTGTTCTCAAATTC;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=35;WE=25156304;WS=25156290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
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chr8	25181356	rs2666174	C	T	1888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=13;PP=1377;SC=GTCTTTCTGCCTTTTCAGCCA;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=57;WE=25181364;WS=25181346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr8	25189963	rs17053410	T	C	985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=797;ReadPosRankSum=0.600;SC=AAATCATTCATTGTAAATATA;SOR=0.802;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=32;WE=25189971;WS=25189953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr8	25200148	rs10110351	A	G	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=23;PP=697;SC=TGCATGCTGAAATGACAGCCC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=25200156;WS=25200138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	25202915	rs2468901	A	G	2071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=10;PP=1598;SC=CTGGTCGAGGAAGAGTTGCAG;SOR=3.021;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=49;TCR=10;TR=59;WE=25202923;WS=25202905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr8	25203022	rs2468902	A	G	5593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=75;PP=2965;ReadPosRankSum=1.977;SC=CACTGCTGACAGACCAGCTCA;SOR=1.167;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=114;TCR=76;TR=188;WE=25203030;WS=25203012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,197:0.99:199
chr8	25209144	rs7012335	A	G	1456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.486;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=8;PP=1195;ReadPosRankSum=2.118;SC=TTGTAGGGAAAAGCCAAAAAG;SOR=0.277;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=113;TCF=100;TCR=13;TR=53;WE=25209152;WS=25209134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,54:0.47:116
chr8	25225804	rs2257081	C	T	1819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.710;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.839;NF=25;NR=41;PP=1249;ReadPosRankSum=0.425;SC=ATCACAACCTCTGAGTGATAA;SOR=0.463;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=168;TCF=55;TCR=113;TR=66;WE=25225812;WS=25225794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,74:0.41:182
chr8	25226261	rs17198394	G	A	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.203;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=297;ReadPosRankSum=-0.995;SC=GGCAGACCGCGTAATATTAGT;SOR=0.235;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=51;TCF=3;TCR=48;TR=18;WE=25226269;WS=25226251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,18:0.35:52
chr8	25227226	rs2048084	G	T	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=4;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=1560;ReadPosRankSum=0.103;SC=CAGGGGTCCTGTTTCACCAAT;SOR=0.162;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=22;WE=25227242;WS=25227216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr8	25227229	rs2048083	T	G	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.14;ReadPosRankSum=0.429;SOR=1.839;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr8	25227234	rs2048082	A	G	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=3.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.49;ReadPosRankSum=1.016;SOR=1.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr8	25227255	rs2659578	C	T	763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=25;PP=673;SC=TGAGTAGTCTCAGAGTCACTA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=25227263;WS=25227245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	25230168	rs2271108	C	T	1510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.316;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=24;PP=1049;ReadPosRankSum=0.037;SC=ACCTGCTGGACTATAGAACCA;SOR=0.917;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=114;TCF=59;TCR=55;TR=54;WE=25230176;WS=25230158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,61:0.50:122
chr8	25230261	rs2271107	G	C	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=27;PP=1284;ReadPosRankSum=-0.550;SC=CGGTGTGATGGGAGGGTACTG;SOR=0.627;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=19;TCR=59;TR=36;WE=25230275;WS=25230251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,36:0.46:78
chr8	25230267	rs2271106	T	C	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=33;PP=2020;ReadPosRankSum=-1.379;SC=GATGGGAGGGTACTGTCAGGC;SOR=0.806;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=75;TCF=18;TCR=57;TR=43;WE=25230275;WS=25230251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,43:0.57:75
chr8	25231044	rs12676152	T	G	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.581;NF=20;NR=0;PP=463;ReadPosRankSum=-0.217;SC=AAGTGAAACTTTTGAAAAGCA;SOR=1.002;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=20;WE=25231052;WS=25231034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr8	25231117	rs3215159	C	CT	1398.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.718;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.522;NF=46;NR=8;PP=1009;ReadPosRankSum=0.610;SC=TTCTGTGATCCTTTTTTTTCC;SOR=1.274;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=97;TCF=79;TCR=18;TR=54;WE=25231125;WS=25231107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,59:0.57:103
chr8	25231385	rs2271105	T	C	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=609;ReadPosRankSum=1.544;SC=TGAGGTCATGTCAGGGATCAG;SOR=0.631;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=0;TCR=61;TR=29;WE=25231393;WS=25231375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr8	25234858	rs2659585	A	G	3915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=81;NR=30;PP=2965;SC=TTGCTTCAGAAGGACAGTTAC;SOR=2.012;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=81;TCR=30;TR=111;WE=25234866;WS=25234848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr8	25235055	rs34962551	T	C	1815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-6.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=69;PP=1391;ReadPosRankSum=-1.163;SC=TTCAGGGCACTGTCTCCAACG;SOR=0.711;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=145;TCF=14;TCR=131;TR=76;WE=25235063;WS=25235045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,78:0.53:146
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chr8	25237963	rs17053525	A	G	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.986;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=719;ReadPosRankSum=-0.125;SC=TAAAATTAGCACTCATGAAAA;SOR=0.429;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=102;TCF=28;TCR=74;TR=39;WE=25237971;WS=25237953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,39:0.38:104
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chr8	25267622	rs2709618	A	G	2852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.715;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.039;NF=64;NR=56;PP=2118;ReadPosRankSum=0.344;SC=TAGGCTCCCCATCGTTGCAGA;SOR=0.544;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=251;TCF=141;TCR=110;TR=120;WE=25267630;WS=25267612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,125:0.48:262
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chr8	25287397	rs1812594	T	C	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.972;NF=15;NR=0;PP=315;ReadPosRankSum=-0.718;SC=GTGACATGTGTAGTGGTGTCA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=15;WE=25287405;WS=25287387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr8	25287556	rs965130	A	G	1450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.856;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=37;PP=1181;ReadPosRankSum=0.220;SC=TTTCTGCTCAAAATGATTTCT;SOR=1.044;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=27;TCR=65;TR=52;WE=25287564;WS=25287546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,53:0.55:96
chr8	25293858	rs2012592	C	T	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.847;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=332;ReadPosRankSum=1.217;SC=TTAAAAAAGACATTAAGAAAT;SOR=0.599;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=39;TCF=22;TCR=17;TR=18;WE=25293866;WS=25293848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr8	25296930	rs2271112	C	T	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=9;PP=885;ReadPosRankSum=0.038;SC=ACACCTGTGTCACCATTATAA;SOR=0.717;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=57;TCR=16;TR=40;WE=25296938;WS=25296920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,41:0.53:77
chr8	25301759	.	C	CT	138	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.9998;HP=17;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=61.29;NF=13;NR=0;PP=138;QD=10.8461538462;SC=GTCATTCCATCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=13;WE=25301767;WS=25301749;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:27,13:0.32:40
chr8	25317614	rs11786622	T	G	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=457;ReadPosRankSum=0.782;SC=CCACAGAAATTAAAATAAAAA;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=20;WE=25317622;WS=25317604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr8	25317691	rs6987936	A	T	4343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=3;PP=2965;SC=TGAATAAGGTACGTGATCGAA;SOR=6.901;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=128;TCF=125;TCR=3;TR=128;WE=25317699;WS=25317681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr8	25317824	rs1506863	A	T	6005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.109;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=126;NR=93;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.970;SC=CTGGTATGTGATGATCTGCCT;SOR=0.812;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=428;TCF=245;TCR=183;TR=219;WE=25317832;WS=25317814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:217,229:0.51:446
chr8	25323777	rs10108752	T	C	3968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=69;PP=2888;SC=TAAAGGAAAATGAGAAAATGA;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=64;TCR=69;TR=133;WE=25323785;WS=25323767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr8	25325656	rs373115180	G	A	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.99;MQRankSum=-3.114;QD=6.02;ReadPosRankSum=2.837;SOR=0.277;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr8	25325661	rs377709330	G	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQRankSum=-4.115;QD=4.41;ReadPosRankSum=1.508;SOR=0.533;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr8	25325730	rs11996213	T	C	2067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=27;PP=1595;ReadPosRankSum=0.401;SC=TTTGTGTTTATAGCCAGAAAG;SOR=0.683;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=144;TCF=98;TCR=46;TR=80;WE=25325738;WS=25325720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,82:0.55:150
chr8	25340833	rs66537174	G	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.878;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=159;ReadPosRankSum=-0.563;SC=AGTTGACAGAGAATTTCAAAA;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=25340841;WS=25340823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
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chr8	25364834	rs3829009	A	T	3393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-7.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.570;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=45;PP=2663;ReadPosRankSum=0.257;SC=TTCAGAGGAGAAATAGTGAAA;SOR=0.589;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=243;TCF=156;TCR=87;TR=128;WE=25364842;WS=25364824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,134:0.53:255
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chr8	25890549	rs7826952	T	C	2420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.449;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=32;PP=1790;ReadPosRankSum=-0.493;SC=AGAGTTGAGGTTCATGAAGAA;SOR=0.429;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=129;TCF=84;TCR=45;TR=86;WE=25890557;WS=25890539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,92:0.67:138
chr8	25898316	rs12544694	C	T	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.218;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=238;ReadPosRankSum=0.594;SC=ACGGTGACCTCCCAATCCCCT;SOR=0.367;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=17;TCF=7;TCR=10;TR=11;WE=25898324;WS=25898306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr8	25902171	rs11135911	CG	C	148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.722;NF=6;NR=0;PP=70;ReadPosRankSum=-0.403;SC=ACGGGGTGCGCGGGGGGGGTG;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=6;WE=25902179;WS=25902166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr8	25902501	rs7007677	G	A	2317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.779;NF=15;NR=76;PP=1897;ReadPosRankSum=-0.957;SC=AAGTGCCCAAGTTTGAGTCTT;SOR=0.749;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=24;TCR=123;TR=91;WE=25902521;WS=25902491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,89:0.61:145
chr8	26240646	rs1055479	A	G	1841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.704;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=31;PP=1395;ReadPosRankSum=-1.835;SC=GCTGTCCGACAATGTCGTCCC;SOR=0.173;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=116;TCF=74;TCR=42;TR=71;WE=26240654;WS=26240636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,74:0.62:120
chr8	26249018	rs2304300	G	A	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.916;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=53;PP=1210;ReadPosRankSum=-0.065;SC=GGAAAAATCTGTTTGCTTAAA;SOR=1.874;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=76;TCF=2;TCR=74;TR=54;WE=26249026;WS=26249008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,54:0.70:77
chr8	26265907	rs9644114	A	G	1433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=42;PP=1107;ReadPosRankSum=-1.106;SC=GTACCGGTCAACTCCTGAAGT;SOR=0.843;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=69;TCF=5;TCR=64;TR=45;WE=26265915;WS=26265897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,49:0.66:74
chr8	26363027	rs2197181	C	T	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=149;ReadPosRankSum=0.127;SC=GTGGTGCTACCGCTTTTAAAA;SOR=0.204;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=9;WE=26363035;WS=26363017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr8	26441275	rs415524	A	G	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=6;PP=769;SC=TTGAGTCCACATTTCATTTAC;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=26441283;WS=26441265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	26441477	rs11786691	G	A	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.772;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=33;PP=1122;ReadPosRankSum=0.054;SC=AGGCGGCCCTGGCTGGGGGAA;SOR=0.876;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=75;TCF=33;TCR=42;TR=53;WE=26441485;WS=26441467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,55:0.71:77
chr8	26481771	rs327222	T	C	1874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=39;PP=1355;SC=TGGACATCAGTGAGTGGCATA;SOR=1.376;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=61;WE=26481779;WS=26481761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr8	26483998	rs72008768	AACACAC	AAC,A	459.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;NF=13,13;NR=0,0;PP=437,101;SC=TCTGTACTGAAACACACACAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=13,13;WE=26484011;WS=26483988;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.92:13
chr8	26485318	rs41276287	C	T	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=341;ReadPosRankSum=-0.568;SC=ACTGCATGCCCGGGCCTCTGC;SOR=0.877;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=15;WE=26485326;WS=26485308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr8	26613995	rs61759708	C	CA	252.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5052;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=307;ReadPosRankSum=-0.494;SC=AACTGATTTACAAAAAATCGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=11;WE=26614003;WS=26613985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr8	26614706	rs11309325	CT	C	2140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.865;NF=9;NR=75;PP=1935;ReadPosRankSum=-0.053;SC=CCGAAAGTGACTTTTTTTCCT;SOR=0.638;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=165;TCF=16;TCR=149;TR=84;WE=26614714;WS=26614696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,95:0.60:159
chr8	26623384	rs3802241	G	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=131;ReadPosRankSum=-0.846;SC=GTGAAAAATTGCCTGCCCAAG;SOR=0.446;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=7;WE=26623392;WS=26623374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr8	26623401	rs17333700	G	C	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=243;ReadPosRankSum=-0.194;SC=CAAGCAAATAGTTCCTAAAAT;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=12;WE=26623409;WS=26623391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr8	26623477	rs34651910	C	CTTGTGAAAAGAAA	2094.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.303;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=2897;ReadPosRankSum=0.190;SC=CCAGTTTTCACTTAGGAACAA;SOR=1.035;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=18;WE=26623485;WS=26623467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,38:0.60:63
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chr8	26636925	rs6989854	T	C	4306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=90;PP=2965;SC=CATTTTTTCCTTCTTGGGCCT;SOR=2.213;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=31;TCR=90;TR=121;WE=26636933;WS=26636915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
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chr8	27097746	rs1562331	G	A	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=181;ReadPosRankSum=0.763;SC=TTTCACCATCGTGGCTGAAAA;SOR=0.238;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=12;WE=27097754;WS=27097736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr8	27099100	rs55727940	T	C	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=333;ReadPosRankSum=-1.278;SC=TCGTCCGTGGTGACAGGCAGG;SOR=1.708;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=15;WE=27099108;WS=27099090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
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chr8	27101204	.	TTA	ATC	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=48;NR=13;PP=2947;QD=20;SC=CCTACGCCCCTTAACACATGG;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=63;TCF=50;TCR=13;TR=61;WE=27101214;WS=27101194;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,61:0.97:63
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chr8	27289963	rs2303882	T	C	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=151;ReadPosRankSum=1.220;SC=ACCAAAAGTCTGTGACACACA;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=10;WE=27289971;WS=27289953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
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chr8	27315900	rs1879181	A	G	1282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.372;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=29;PP=911;ReadPosRankSum=-1.480;SC=TGACCTCCCTAAGTGAGGAGT;SOR=1.659;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=70;TCF=26;TCR=44;TR=41;WE=27315908;WS=27315890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,46:0.61:75
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chr8	27328511	rs2472553	G	A	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.571;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=577;ReadPosRankSum=0.653;SC=ACCTGCTGGGGTCAGAAGGAG;SOR=0.898;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=122;TCF=66;TCR=56;TR=37;WE=27328519;WS=27328501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,38:0.31:123
chr8	27348964	rs17057245	C	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=142;ReadPosRankSum=-0.374;SC=GAAGACCTGGCCCTGAAGTCC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=27348972;WS=27348954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr8	27358505	rs41507953	A	G	1618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.456;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=46;PP=1269;ReadPosRankSum=1.151;SC=CGGCTTATGAAAGGAGAGATC;SOR=1.218;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=80;TCF=9;TCR=71;TR=51;WE=27358513;WS=27358495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,54:0.64:84
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chr8	27369334	rs7816586	A	G	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.341;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=15;PP=1118;ReadPosRankSum=-0.315;SC=CTCTCTCACTATACCTTTCCT;SOR=0.281;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=78;TCF=58;TCR=20;TR=51;WE=27369342;WS=27369324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,52:0.64:81
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chr8	27402132	rs1042064	T	C	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=60;ReadPosRankSum=-1.358;SC=ACACACATCTTGCATGGATGG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=27402140;WS=27402122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr8	27436236	.	G	GTTTGTTTTGT	900.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.93;QD=42.89;SOR=6.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr8	27593650	rs10081527	T	C	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=1;PP=343;SC=GTATTTTATATTTCAGAACAC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=27593658;WS=27593640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	27598042	rs34636629	GA	G	364.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=302;ReadPosRankSum=0.626;SC=CTCCTAGAAGGAAAAAAACAC;SOR=0.816;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=17;WE=27598050;WS=27598032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,21:0.35:60
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chr8	27609830	rs4732744	A	G	1608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=0;PP=1278;SC=CAAAATGACAAGGGTGGGGAG;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=41;WE=27609838;WS=27609822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
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chr8	27630152	rs7842666	G	A	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=0.108;SC=CCTGGCCCCCGGAACTCCTCC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=27630160;WS=27630142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr8	27641609	rs1824449	G	A	2371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=50;PP=2033;SC=TCCAAGCCTTGTAAATTATAC;SOR=1.673;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=23;TCR=50;TR=73;WE=27641617;WS=27641599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
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chr8	27650428	rs4732754	C	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.708;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=134;ReadPosRankSum=-1.083;SC=ATTAATGACACTCTTCCTACT;SOR=1.179;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=10;WE=27650436;WS=27650418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr8	27661066	rs144484866	T	TAC,TACAC	628.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=23;NF=0,0;NR=19,19;PP=49,516;SC=CTCACACTCATACACACACAC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=19,19;WE=27661074;WS=27661056;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.79,0.21:14
chr8	27661085	rs62498042	G	A	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=0.999;QD=7.80;ReadPosRankSum=-0.946;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
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chr8	27767305	rs2726992	A	G	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=149;ReadPosRankSum=-0.264;SC=CTCCCTTCTGAAACAGGACCA;SOR=0.569;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=15;WE=27767313;WS=27767295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,15:0.24:63
chr8	27767339	rs2726993	C	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=167;ReadPosRankSum=-1.007;SC=GGAAACAAAACGCCCTCTCTG;SOR=0.755;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=14;WE=27767347;WS=27767329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,14:0.25:55
chr8	27779545	rs10103504	C	T	2478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=15;PP=2056;SC=GCAGCCCCCACAGCGCGCCCT;SOR=2.975;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=83;TCF=68;TCR=15;TR=82;WE=27779553;WS=27779535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr8	27779811	rs4732613	C	T	3762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=98;PP=2965;SC=GGAGGAAGGCCCCGGGTGACA;SOR=5.192;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=6;TCR=99;TR=104;WE=27779819;WS=27779801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr8	27779880	rs61455593	T	TA	1603.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=27;PP=1105;SC=GATAGACGAATAAAATCACAG;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=27;WE=27779893;WS=27779870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	27779885	rs59195507	T	G	1612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=803;SC=ACGAATAAAATCACAGGTGGT;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=28;WE=27779893;WS=27779870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	27880826	rs921597	C	T	3006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=15;PP=2503;SC=GGGACTAAGCCCCAGGAGTTA;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=91;TCF=75;TCR=16;TR=90;WE=27880834;WS=27880816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr8	27886700	rs9644134	A	G	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=0;PP=965;SC=AATGCCTACTATGCCTTCCAC;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=27886708;WS=27886690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	27886903	rs9314357	C	T	3748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=71;PP=2965;SC=CTTTTTTGCCCGTGATCTGAG;SOR=1.309;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=43;TCR=71;TR=114;WE=27886911;WS=27886893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr8	27887047	rs11786995	G	C	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=623;SC=GGGCAGATCAGCTGAGGTCAG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=27887055;WS=27887037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	27887813	rs7817068	T	C	1986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=9;PP=1751;SC=AATGCTGTCCTCCGCAGCCCC;SOR=3.611;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=53;TCR=9;TR=62;WE=27887821;WS=27887803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr8	27915830	rs4336563	T	C	5383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=78;PP=2965;SC=AATTACTTAATTTTTACTATG;SOR=0.904;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=172;TCF=93;TCR=79;TR=171;WE=27915838;WS=27915820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr8	27918057	rs7817227	T	C	2384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=52;PP=1859;SC=TTCGTGGGCTTGCCCCCCAGA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=26;TCR=52;TR=78;WE=27918065;WS=27918047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr8	27925204	rs4732620	T	C	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.134;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=247;ReadPosRankSum=-1.535;SC=TCTTCTCTGCTCAGCTCCTCC;SOR=1.002;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=63;TCF=21;TCR=42;TR=16;WE=27925212;WS=27925194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,18:0.27:66
chr8	27927849	rs6998705	C	G	1854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=45;PP=1431;SC=TTTTCTCGTTCGTTCTTTATA;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=55;WE=27927857;WS=27927839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr8	28186520	rs2614101	A	G	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=270;ReadPosRankSum=-0.416;SC=AAAGTGAATCACAGGCCCCTA;SOR=1.101;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=16;WE=28186528;WS=28186510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr8	28186607	rs2645721	T	C	1435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.161;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=8;PP=1124;ReadPosRankSum=0.201;SC=TGAGCAGCCCTCCGAGAATGG;SOR=1.364;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=67;TCF=55;TCR=12;TR=49;WE=28186615;WS=28186597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,50:0.75:67
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chr8	28210613	rs6558057	G	C	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=25;NR=2;PP=796;SC=AGGGTCCCCTGCTCTCCACGG;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=28210621;WS=28210603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
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chr8	28633124	rs7462400	T	C	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=0;PP=734;SC=CCACCTTGGCTGCCCAAAGTG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=28633132;WS=28633114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	28635303	rs11785319	G	C	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=242;ReadPosRankSum=0.247;SC=GCCACACCAAGGTGACATGAC;SOR=0.653;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=13;WE=28635311;WS=28635293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr8	28638223	rs241196	C	T	89.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=1.282;SC=TACAGTAGAACAATGTTTGTA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=28638231;WS=28638213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr8	28645271	rs241187	C	T	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.900;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=10;PP=951;ReadPosRankSum=0.475;SC=TTTCATCTAACGACCTGCTGT;SOR=0.067;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=66;TCF=55;TCR=11;TR=45;WE=28645279;WS=28645261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,47:0.69:68
chr8	28651296	rs10694791	C	CA	173.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=15.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.91;MQRankSum=4.178;QD=2.63;ReadPosRankSum=-0.166;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,18:0.27:66
chr8	28651298	rs2665911	A	C	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.682;HP=14;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.261;NF=36;NR=3;PP=538;ReadPosRankSum=0.767;SC=AAAATTCACAAAAAAAAAAAA;SOR=1.160;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=71;TCF=61;TCR=10;TR=39;WE=28651306;WS=28651286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,42:0.58:72
chr8	28651557	rs71551607	TATAAAG	T	544.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.664;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=572;ReadPosRankSum=0.023;SC=AGGGCAGTGTTATAAAGATAA;SOR=1.931;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=12;WE=28651570;WS=28651547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
chr8	28671247	rs7841719	T	G	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=483;ReadPosRankSum=-0.290;SC=ATATAATTGTTCATAGGATTC;SOR=0.216;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=0;TCR=71;TR=24;WE=28671255;WS=28671237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,25:0.32:77
chr8	28692783	rs28522383	C	T	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.200;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=8;PP=985;ReadPosRankSum=0.651;SC=TACAGTCTCTCGGTAAGAGAG;SOR=1.786;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=75;TCF=57;TCR=18;TR=46;WE=28692791;WS=28692773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,47:0.60:78
chr8	28695361	rs3735724	C	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.513;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=131;ReadPosRankSum=-2.850;SC=GACTAAAAAACGACGTTGTCA;SOR=0.343;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=11;WE=28695369;WS=28695351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr8	28707570	rs4732887	C	T	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=67;ReadPosRankSum=-1.178;SC=TTAAAAACAGCAGTTACCATG;SOR=0.113;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=7;WE=28707578;WS=28707560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr8	28707622	.	GA	G	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=1.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.80;ReadPosRankSum=-1.111;SOR=1.222;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,11:0.21:52
chr8	28876221	rs7837237	T	C	1736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=5;PP=1318;ReadPosRankSum=0.558;SC=AAGTAGATGTTATATTGTTTT;SOR=0.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=76;TCR=7;TR=57;WE=28876229;WS=28876211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,59:0.69:86
chr8	28900087	rs1948132	T	C	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.938;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=3;PP=1067;ReadPosRankSum=-0.841;SC=AAATGAGGGTTCCAGTTAAGG;SOR=0.385;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=79;TCF=75;TCR=4;TR=46;WE=28900095;WS=28900077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,50:0.59:85
chr8	28967679	rs3736225	C	T	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-4.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=145;ReadPosRankSum=2.235;SC=GAACGTATTCCAAAATTCCAT;SOR=0.111;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=11;WE=28967687;WS=28967669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,11:0.24:45
chr8	28970865	rs1466627	C	G	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=186;ReadPosRankSum=-0.582;SC=AAAATCTATACCTTCCCTAAA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=9;WE=28970873;WS=28970860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr8	28979949	rs4732905	C	A	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.856;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=330;ReadPosRankSum=1.039;SC=TATGACACACCAATCAGTCCG;SOR=1.338;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=57;TCF=51;TCR=6;TR=18;WE=28979957;WS=28979939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr8	28984042	rs3793435	T	C	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.594;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=256;ReadPosRankSum=0.168;SC=AAAGAAAATATACATTACAAA;SOR=1.179;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=17;WE=28984050;WS=28984032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,16:0.29:56
chr8	28984572	rs3763566	G	A	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=143;ReadPosRankSum=-0.751;SC=AGTTTCGTACGGGTTCCAAAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=9;WE=28984580;WS=28984562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr8	28991405	rs3750265	A	G	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=41;ReadPosRankSum=0.100;SC=AGGAGTATAGATGCATTGACA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=28991413;WS=28991398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr8	29005093	rs6986672	A	G	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.623;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=557;ReadPosRankSum=-2.614;SC=TGTTGTTCTAAGCTGTTTAAT;SOR=1.048;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=115;TCF=44;TCR=71;TR=37;WE=29005101;WS=29005083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,39:0.31:124
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chr8	29927321	rs6468094	A	G	4481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.99;NF=90;NR=50;PP=2965;SC=GGAGTACCACAATGGTAATCA;SOR=1.432;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=90;TCR=50;TR=140;WE=29927329;WS=29927311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr8	29931375	rs986636	T	C	2738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=21;PP=2054;SC=AGACTGCCATTACTGTAGTGG;SOR=2.219;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=57;TCR=21;TR=78;WE=29931383;WS=29931365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr8	29935696	rs71204259	GA	G	1370.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.47;QD=20.77;SOR=8.410;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr8	29940271	rs13279112	A	G	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=4;PP=365;SC=AGGCTCCGGGAAGACGGCGCA;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=29940279;WS=29940261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	29940333	rs148566221	G	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.682;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=72;ReadPosRankSum=0.537;SC=AAGGGCGAACGAAGCGCCTGA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=6;WE=29940341;WS=29940323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr8	29953256	rs56969689	C	T	1189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=4;PP=964;SC=GGCTTCGCCCCGCAGCCCCCA;SOR=3.855;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=37;WE=29953264;WS=29953246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr8	29989399	rs13272159	G	A	3680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=6;PP=2965;SC=TTATCGATGCGTCATCTGGCA;SOR=5.439;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=101;TCR=6;TR=107;WE=29989407;WS=29989389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr8	29989564	rs7844812	A	G	8724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=121;NR=153;PP=2965;SC=GAGAGGAGAGACTCCTGACCT;SOR=0.979;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=275;TCF=121;TCR=154;TR=274;WE=29989572;WS=29989554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,275:1.00:275
chr8	29996158	rs4733141	A	G	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=27;PP=919;SC=CTTGCTGAGGAGCCAGGGAAC;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=29996166;WS=29996148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	29996256	rs7813902	T	C	195.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=6;PP=153;SC=CCTCCTCCAGTCAGGAGAAAG;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=29996264;WS=29996246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	30001915	rs12546113	T	G	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=3;PP=1036;SC=GCCTCCCAAATTGCAGGGATT;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=35;WE=30001923;WS=30001905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr8	30013759	rs7012749	A	C	222.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=5;NR=2;PP=169;SC=ACGCGACGCAAACAAGAGTCG;SOR=1.863;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=30013767;WS=30013749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	30209519	.	T	C	1544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.131;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=18;PP=1089;ReadPosRankSum=-0.828;SC=AATTAAATTTTAACCATGAGG;SOR=0.207;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=76;TCF=55;TCR=21;TR=55;WE=30209527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,58:0.74:78
chr8	30210274	rs4349946	T	C	3883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=93;PP=2965;SC=TGCTGACCTCTGCAAGTTGGC;SOR=1.893;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=38;TCR=93;TR=131;WE=30210282;WS=30210264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr8	30503194	rs4733196	T	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=144;ReadPosRankSum=-1.471;SC=AGGCCAACTGTTGCTACAAAA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=30503202;WS=30503184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr8	30539623	rs2250192	T	G	1491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=39;PP=1163;SC=CTGTCTGTTTTAACATAGCTA;SOR=5.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=41;WE=30539631;WS=30539613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
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chr8	30546636	rs2551715	T	C	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.544;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=388;ReadPosRankSum=-0.334;SC=ATAAGACTCCTAGTAGATTCA;SOR=1.844;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=64;TCF=51;TCR=13;TR=22;WE=30546644;WS=30546626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,24:0.36:66
chr8	30554006	rs8190996	G	A	2990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.450;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=62;PP=2388;ReadPosRankSum=1.309;SC=GCTGAGACGCGAGCAGAGGGT;SOR=0.154;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=151;TCF=52;TCR=99;TR=104;WE=30554014;WS=30553996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,108:0.69:156
chr8	30560887	rs3779647	C	T	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=28;PP=656;ReadPosRankSum=0.274;SC=CACAATTCTCCGTTTTTCAAG;SOR=0.726;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=29;WE=30560895;WS=30560877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,31:0.69:45
chr8	30565624	rs8190955	G	A	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.785;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=26;PP=1424;ReadPosRankSum=-2.179;SC=GCATTCAGGCGGCTCACATAG;SOR=0.846;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=210;TCF=137;TCR=73;TR=79;WE=30565632;WS=30565614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,85:0.39:217
chr8	30567423	.	TA	T	94.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.203;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.51;ReadPosRankSum=2.305;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr8	30584944	rs2280856	C	G	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.681;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=2;PP=493;ReadPosRankSum=0.729;SC=AGAGGAAAGCCCAGCGCCGGG;SOR=2.596;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=90;TCF=74;TCR=16;TR=33;WE=30584952;WS=30584934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,32:0.36:89
chr8	30585092	rs2280855	A	G	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.916;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=31;PP=753;ReadPosRankSum=0.925;SC=CGGCCCTGGCACCCAGCTCGG;SOR=0.922;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=103;TCF=24;TCR=79;TR=39;WE=30585100;WS=30585082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,39:0.36:107
chr8	30585164	rs2280854	G	A	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=433;ReadPosRankSum=2.133;SC=AGTCATAGGAGGCCACGGCGC;SOR=0.804;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=20;WE=30585172;WS=30585154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr8	30601610	rs3217273	TC	T	409.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=411;ReadPosRankSum=0.128;SC=ATTGACCCTCTCCCAGCCGGC;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=12;WE=30601618;WS=30601604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr8	30601805	rs2278092	C	T	2449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.119;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=57;PP=1916;ReadPosRankSum=-0.832;SC=GTAAGTGTGACTTTTTCCCTT;SOR=0.327;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=127;TCF=44;TCR=83;TR=92;WE=30601813;WS=30601795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,94:0.72:130
chr8	30601999	.	G	C	36	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=36;QD=35.3856062736;SC=TTACGTGTAAGAGGGTAGAGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=2;WE=30602007;WS=30601989;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,2:0.33:6
chr8	30608773	rs1991111	A	G	267.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=253;SC=GCTCATGCCTATAATCCTAGC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=30608781;WS=30608763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	30608976	rs2911690	C	T	2542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=51;PP=2003;SC=CTTACTTTAACTATTTCTGTG;SOR=1.367;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=29;TCR=51;TR=80;WE=30608984;WS=30608966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr8	30609061	rs2911689	T	G	1373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=30;PP=856;SC=ATTCTACCCTTTTATACCATT;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=30609069;WS=30609051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	30609078	rs2911688	A	T	1238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=712;SC=CATTCTACTCAAATTTATTTA;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=30609086;WS=30609068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	30620840	rs11388922	G	GT	1872.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=27;PP=1872;SC=TGAGGAGAAGGTTTTGAAGTC;SOR=0.871;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=53;TCF=26;TCR=27;TR=48;WE=30620848;WS=30620830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr8	30620964	rs2956010	T	C	1420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=35;PP=1142;SC=GTCATCTGCATCTCCCATCAG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=47;WE=30620972;WS=30620954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr8	30623996	rs2956016	T	C	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=20;PP=643;SC=CAAATCACACTATACCTTGAT;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=30624004;WS=30623986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	30655363	rs1116003	G	A	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.065;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.472;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=62;ReadPosRankSum=-0.726;SC=TAAACACGGCGCTTTTGGCCA;SOR=0.061;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=5;WE=30655371;WS=30655353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr8	30670163	rs1131305	G	T	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.051;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=63;ReadPosRankSum=0.059;SC=ACCCCCGCCCGCCCTTCCCCG;SOR=0.042;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=5;WE=30670171;WS=30670153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr8	30694758	rs138707908	T	C	1982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.149;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=47;PP=1411;ReadPosRankSum=1.283;SC=CATTCCAATATGTGGCAGCAT;SOR=0.460;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=262;TCF=114;TCR=148;TR=87;WE=30694766;WS=30694748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,93:0.34:273
chr8	30695226	rs2720593	C	T	8602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=127;NR=139;PP=2965;SC=TCTGCAAAAGCGTCCCATGGT;SOR=0.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=266;TCF=127;TCR=139;TR=266;WE=30695234;WS=30695216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr8	30702525	rs323344	A	C	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.587;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=26;PP=1030;ReadPosRankSum=0.444;SC=GCGGCTGATAACTGAGGAATA;SOR=0.622;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=170;TCF=96;TCR=74;TR=57;WE=30702533;WS=30702515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,60:0.34:178
chr8	30702602	rs323345	T	C	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.410;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=33;PP=943;ReadPosRankSum=1.186;SC=TGTAATAATGTTTTGTTTGGG;SOR=0.948;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=135;TCF=43;TCR=92;TR=44;WE=30702610;WS=30702592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,49:0.34:143
chr8	30702785	rs61736163	T	C	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.387;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=222;ReadPosRankSum=-1.480;SC=ATCACAATCGTTGCCTGTACT;SOR=0.446;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=13;WE=30702793;WS=30702775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,12:0.27:44
chr8	30703431	rs323346	T	C	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=12.199;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.90;ReadPosRankSum=-0.614;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,18:0.24:74
chr8	30703845	rs144234582	T	C	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.422;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=878;ReadPosRankSum=-0.028;SC=TTTGATTTTGTAAAGAAACAT;SOR=0.484;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=55;TCF=29;TCR=26;TR=40;WE=30703853;WS=30703835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,43:0.72:60
chr8	30704725	rs62000451	C	T	1622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.170;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=24;PP=1266;ReadPosRankSum=1.864;SC=CACTAGCTATCTGTATTGCAG;SOR=0.598;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=205;TCF=133;TCR=72;TR=69;WE=30704733;WS=30704715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,71:0.33:216
chr8	30705897	.	C	A	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.000;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.794;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.569;SOR=0.596;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,28:0.22:128
chr8	30706224	rs323347	A	G	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.481;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=593;ReadPosRankSum=-0.460;SC=AGAACAGCACAATCACCAGGG;SOR=1.019;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=131;TCF=54;TCR=77;TR=37;WE=30706232;WS=30706214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,39:0.29:136
chr8	30717452	rs16877429	A	G	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.356;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=347;ReadPosRankSum=2.217;SC=TTGCAGTTCAATGGTATCTTT;SOR=2.080;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=16;WE=30717460;WS=30717442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr8	30725122	rs323368	C	T	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=129;ReadPosRankSum=-0.701;SC=AGAGAAGTAGCGATATTCAGA;SOR=0.250;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=7;WE=30725130;WS=30725112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
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chr8	30854033	rs2725371	A	G	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.318;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=612;ReadPosRankSum=-1.122;SC=CTGAGGCCTTACATTCATGAT;SOR=1.161;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=25;WE=30854041;WS=30854023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,28:0.61:46
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chr8	30999280	rs1801195	G	T	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=31;PP=999;SC=CAAAGAAGTTGCTTCTGCCTA;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=36;WE=30999288;WS=30999270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	30999394	rs2725363	A	G	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=0.566;SC=AAAATGAATTACCTGTTTGTT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=30999402;WS=30999384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr8	31000012	rs2725364	T	C	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=192;ReadPosRankSum=0.174;SC=GAAAAAAAAATCAGTTTTAAG;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=10;WE=31000020;WS=31000002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr8	31000243	rs2725365	T	C	1594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=35;PP=1253;SC=ATTGTTCTGATTTATTTCATT;SOR=3.080;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=43;WE=31000251;WS=31000233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr8	31005017	rs3087415	T	TC	4023.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=68;PP=2972;SC=GCATGTGTTCTATTTATTTCC;SOR=2.303;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=91;TCF=15;TCR=76;TR=79;WE=31005025;WS=31005007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
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chr8	32406382	rs73234136	T	C	1034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.394;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=34;PP=862;ReadPosRankSum=2.165;SC=ACGATCCTCCTCCTGCTCCTC;SOR=3.312;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=2;TCR=53;TR=34;WE=32406390;WS=32406372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,35:0.61:57
chr8	32453358	rs3924999	G	A	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=3.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.64;ReadPosRankSum=-0.326;SOR=1.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,20:0.22:93
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chr8	33313421	rs11337905	GA	G	1068.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=20;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=28;PP=672;ReadPosRankSum=1.080;SC=GGCCAAAAAAGAAAAAAAAAA;SOR=0.495;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=82;TCF=31;TCR=51;TR=44;WE=33313430;WS=33313410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:7,58:0.89:65
chr8	33347907	rs2732274	T	G	2538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=4;NR=69;PP=2130;SC=TTTCTGGGGGTCTCTTATAGA;SOR=5.367;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=4;TCR=70;TR=73;WE=33347915;WS=33347897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr8	33354873	rs11987085	C	A	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.9996;FS=0.000;HP=21;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=2;NR=22;PP=247;SC=AAAAAAAAAACAAAAACAGGG;SOR=4.615;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=24;WE=33354881;WS=33354858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr8	33356074	rs6468171	A	G	2300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=48;PP=1810;SC=GGACCACTGCAGAGAAAACGA;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=28;TCR=48;TR=76;WE=33356082;WS=33356064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
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chr8	33369994	rs3098657	A	G	6832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.979;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=138;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.843;SC=CATCTTTTACATTGCCTCGTC;SOR=0.929;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=228;TCF=90;TCR=138;TR=226;WE=33370002;WS=33369984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,229:1.00:230
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chr8	33370990	rs78806096	A	G	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.59;ReadPosRankSum=0.827;SOR=0.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,30:0.37:82
chr8	33371082	rs57302450	A	G	1542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.699;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=28;PP=1136;ReadPosRankSum=0.686;SC=ACGTGGGCACATTACCCGTCT;SOR=0.852;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=240;TCF=152;TCR=88;TR=77;WE=33371090;WS=33371072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,82:0.32:254
chr8	33371146	rs2581897	T	G	11642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=43.93;ReadPosRankSum=1.700;SOR=0.524;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,264:1.00:265
chr8	33371150	rs2581898	A	G	11549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=44.94;ReadPosRankSum=1.530;SOR=0.566;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,256:1.00:257
chr8	33371199	rs2581899	T	C	4832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=127;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.765;SC=TCGGGTGCCCTTTTTTCTGGC;SOR=2.749;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=144;TCF=15;TCR=129;TR=142;WE=33371207;WS=33371189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,145:0.99:146
chr8	33416189	rs3735950	G	A	2843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=32;PP=2453;SC=TGCCTGTGCCGAAGATGACCA;SOR=1.408;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=56;TCR=32;TR=88;WE=33416197;WS=33416179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr8	33416222	rs3735951	C	T	2918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=39;PP=2320;SC=GCGGAAGGTCCTGGAAACTGA;SOR=0.965;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=49;TCR=39;TR=87;WE=33416230;WS=33416212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr8	33416303	rs35879627	G	GA	2012.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=46;PP=1444;SC=CAAAGGGAGAGAAAAAAAAAT;SOR=1.426;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=76;TCF=19;TCR=57;TR=64;WE=33416311;WS=33416293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr8	33451026	rs2044162	C	T	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=286;ReadPosRankSum=1.485;SC=CCTGTTCTTTCCTGCTCCCAG;SOR=0.573;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=47;TCF=44;TCR=3;TR=15;WE=33451034;WS=33451016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,17:0.36:47
chr8	35401930	.	T	TA	1361.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=0.000;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.576;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.779;NF=32;NR=18;PP=680;ReadPosRankSum=0.096;SC=AGGGATTGTTTAAAAAAAAAA;SOR=0.417;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=146;TCF=107;TCR=39;TR=50;WE=35401938;WS=35401920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,67:0.49:136
chr8	35425870	rs2589340	T	A	1680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=48;PP=1403;SC=AAATGAGAGGTCTTAAATTTA;SOR=5.018;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=51;WE=35425878;WS=35425860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	36661686	rs12543523	A	C	1882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.940;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=45;PP=1410;ReadPosRankSum=-0.323;SC=CTCAGGAATAATGCTTAATAT;SOR=1.371;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=141;TCF=56;TCR=85;TR=68;WE=36661694;WS=36661676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,72:0.50:145
chr8	36662680	rs16885430	G	T	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=175;ReadPosRankSum=0.681;SC=TAAAAATGTTGATCTTCACAA;SOR=0.330;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=11;WE=36662688;WS=36662670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr8	36664713	rs1079679	A	C	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.554;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=421;ReadPosRankSum=0.705;SC=CTTAGGTTACAACAGCGTCAG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=19;WE=36664721;WS=36664703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr8	36666183	rs1111121	G	A	1275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-7.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.609;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=7;PP=974;ReadPosRankSum=0.314;SC=TGAGGTGTTTGTGTTGTTCTG;SOR=0.129;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=114;TCF=104;TCR=10;TR=50;WE=36666191;WS=36666173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,52:0.45:116
chr8	36691189	rs10089594	C	T	3095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.132;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.906;NF=23;NR=92;PP=2389;ReadPosRankSum=0.533;SC=TAAGATCTAGCTGTTTTTGTT;SOR=1.053;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=256;TCF=60;TCR=196;TR=115;WE=36691197;WS=36691179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,121:0.45:266
chr8	36767024	rs28608091	T	C	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=33;PP=760;ReadPosRankSum=0.645;SC=GCGATTTCTCTGGAATTTTCC;SOR=0.558;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=13;TCR=51;TR=41;WE=36767032;WS=36767014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,44:0.60:73
chr8	36767085	rs62490754	A	G	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=315;ReadPosRankSum=0.060;SC=GTTAATATTTATAAGGATTTC;SOR=0.346;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=16;WE=36767093;WS=36767075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr8	36767145	rs13257544	C	G	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=205;ReadPosRankSum=-0.195;SC=GTTCTACAGTCCTTGCCAGAT;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=10;WE=36767153;WS=36767135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr8	36776267	rs10108041	T	G	2605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=0;PP=2101;SC=CAAGTTACATTATATTCTTCT;SOR=8.662;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=70;TCR=0;TR=70;WE=36776275;WS=36776257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr8	36779848	rs60216672	GA	G	491.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.46;MQRankSum=1.224;QD=11.18;ReadPosRankSum=0.991;SOR=1.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr8	36780209	rs1010669	A	G	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=503;SC=GTGAACAGGTAGTATAAGGCT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=36780217;WS=36780199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr8	36786396	rs10089755	C	T	1027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=0;PP=848;SC=ATTCTGATTCCCATTCCTGTC;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=36786404;WS=36786386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr8	37730368	rs12541651	G	A	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.788;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=841;ReadPosRankSum=-0.753;SC=TGATCCCAGGGCAGAAGAACC;SOR=1.262;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=74;TCF=32;TCR=42;TR=42;WE=37730376;WS=37730358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,44:0.58:76
chr8	37730456	rs7341564	G	T	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.937;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=496;ReadPosRankSum=-0.753;SC=GACTTGGCCTGGCCCCTGTCT;SOR=0.217;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=50;TCF=20;TCR=30;TR=23;WE=37730464;WS=37730446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr8	37888017	rs3750243	C	G	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.162;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=182;ReadPosRankSum=-0.557;SC=GGCGGGGCGGCACGGGGCGAG;SOR=1.609;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=10;WE=37888025;WS=37888007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr8	37985897	rs2843740	A	G	4679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=57;PP=2965;SC=GAGTACGGAAAGGTGCCTGGT;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=84;TCR=57;TR=141;WE=37985905;WS=37985887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
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chr8	38005729	rs146872295	CCTT	C	2043.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.072;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=1767;ReadPosRankSum=-1.473;SC=TGCTGACTCTCCTTCTTCCAG;SOR=0.980;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=100;TCF=42;TCR=58;TR=40;WE=38005739;WS=38005719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,54:0.47:116
chr8	38005835	rs2229620	T	C	2100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=51;PP=1697;SC=GAGTCTCTTCTAGCCGAGAAC;SOR=3.056;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=63;TCF=11;TCR=52;TR=61;WE=38005843;WS=38005825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
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chr8	38095662	rs2306899	C	T	2976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.834;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=60;PP=2088;ReadPosRankSum=1.104;SC=TCAACACCCACGGAGCAGGGT;SOR=0.434;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=246;TCF=114;TCR=132;TR=119;WE=38095670;WS=38095652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,128:0.50:258
chr8	38103239	rs7006757	T	A	2059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=10;PP=1585;ReadPosRankSum=-1.255;SC=TTCCTGCTTATATTATTTTTC;SOR=0.725;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=135;TCF=115;TCR=20;TR=71;WE=38103247;WS=38103229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,77:0.55:141
chr8	38110215	rs2898674	T	C	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.933;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=428;ReadPosRankSum=0.000;SC=CAGAGGTAAATGTAGCTCTTG;SOR=0.297;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=66;TCF=57;TCR=9;TR=29;WE=38110223;WS=38110205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,29:0.43:68
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chr8	38369831	rs4733951	A	C	2112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=4;PP=1606;SC=GAGAGGAATAAGAAGGAATTC;SOR=4.648;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=58;TCR=4;TR=62;WE=38369839;WS=38369821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
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chr8	38385795	rs2445020	T	C	2362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=2;PP=1831;ReadPosRankSum=-0.693;SC=ATTACACACATGGAATGACTC;SOR=4.949;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=67;TCF=65;TCR=2;TR=66;WE=38385803;WS=38385785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,72:0.99:73
chr8	38458552	.	G	GTCT	7475.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=69;PP=2970;SC=TTCTGGCCGTGCCAGCCACTG;SOR=0.717;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=142;TCF=58;TCR=84;TR=125;WE=38458560;WS=38458542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
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chr8	38697649	rs13262797	T	C	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=0.092;SC=TGTCAGTGTATGTTAATGTGT;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=7;WE=38697657;WS=38697639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr8	38709451	rs112953621	TTGAC	T	1426.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.166;NF=17;NR=10;PP=1203;ReadPosRankSum=-0.982;SC=CCAAAAAGGTTTGACTGGCCT;SOR=0.770;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=74;TCF=48;TCR=26;TR=27;WE=38709462;WS=38709441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,39:0.43:90
chr8	38793682	rs4633027	T	G	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=82;ReadPosRankSum=-0.547;SC=TGCATGGTGTTGAAATGCTCC;SOR=0.175;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=6;WE=38793690;WS=38793672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
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chr8	38814694	.	A	G	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.103;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=135;ReadPosRankSum=1.098;SC=AGTGTTTTTCAAGGCAGGAGC;SOR=1.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=11;WE=38814702;WS=38814684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
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chr8	38827185	rs5891050	GC	G	3410.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=64;PP=2967;SC=GGAGGGCAGCGCCTCCTGGGG;SOR=1.906;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=91;TCF=25;TCR=66;TR=87;WE=38827193;WS=38827175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr8	38835456	rs4733960	T	C	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=6;PP=987;SC=CCCCATCCCTTTTTGGGCACG;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=35;WE=38835464;WS=38835446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr8	38835666	rs4733961	T	C	2246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=54;PP=1592;SC=CCACAATTAATGTAAGTCACT;SOR=1.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=23;TCR=54;TR=77;WE=38835674;WS=38835656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
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chr8	38845519	rs139374339	G	C	1493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.572;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=27;PP=1152;ReadPosRankSum=0.374;SC=TACTACAACTGATGTTGTTAA;SOR=0.526;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=125;TCF=57;TCR=68;TR=56;WE=38845527;WS=38845509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,59:0.44:133
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chr8	38845716	rs7823125	A	G	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=34;ReadPosRankSum=1.645;SC=AAGTTTTTGGATCTTTTTCTT;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=3;WE=38845724;WS=38845706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
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chr8	38853620	rs6991968	G	A	1714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=5;PP=1384;ReadPosRankSum=0.575;SC=AACGACCTCAGAGAGGCAGGG;SOR=0.557;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=101;TCF=95;TCR=6;TR=60;WE=38853628;WS=38853610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,61:0.57:107
chr8	38853983	rs7840270	C	A	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-4.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.632;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=56;PP=1355;ReadPosRankSum=-0.217;SC=GAGCGGAGACCCGGCCTCAAC;SOR=0.897;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=135;TCF=29;TCR=106;TR=70;WE=38853991;WS=38853973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,73:0.52:140
chr8	38854041	rs10105311	C	T	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=36;PP=828;ReadPosRankSum=0.840;SC=GTGGTCAGGCCTTTCCGCGTA;SOR=0.246;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=69;TCF=1;TCR=68;TR=37;WE=38854049;WS=38854031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr8	38872186	rs7833611	C	A	1537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=46;PP=1293;SC=GGTATTATACCTTTTTTTCTT;SOR=6.358;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=47;TCF=1;TCR=46;TR=47;WE=38872194;WS=38872176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr8	38876466	rs6474518	T	C	3395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=7.818;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.46;ReadPosRankSum=-1.473;SOR=0.340;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,91:0.49:184
chr8	38876466	.	TCC	CCT	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=24;NR=44;PP=2944;QD=20;SC=TTTCTTCTTTTCCATGAAAAG;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=171;TCF=57;TCR=114;TR=68;WE=38876476;WS=38876456;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:103,68:0.40:171
chr8	38876468	rs6474519	C	T	3395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=7.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.40;ReadPosRankSum=-0.819;SOR=0.348;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,85:0.49:175
chr8	38884342	rs10652213	G	GTTCT	9163.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=143;PP=2974;SC=GAGTACCTGGGTTCTTCTTCT;SOR=2.970;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=209;TCF=28;TCR=181;TR=164;WE=38884350;WS=38884332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr8	38899772	rs34138150	G	A	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=129;ReadPosRankSum=-1.353;SC=TATTTTGTTTGTATGGCTGTG;SOR=0.204;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=9;WE=38899780;WS=38899762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr8	38911953	rs9643905	C	A	2067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-8.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.258;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=3;PP=1630;ReadPosRankSum=1.161;SC=AATGAGTATTCATGTCAATTA;SOR=1.436;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=139;TCF=132;TCR=7;TR=73;WE=38911961;WS=38911943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,76:0.54:142
chr8	38912121	.	GAAA	G	99.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=0.000;DP=239;ExcessHet=3.0103;FS=4.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=1.358;QD=0.70;ReadPosRankSum=2.267;SOR=1.282;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,23:0.16:143
chr8	38940292	rs72459173	GAAATCTCAGGACTAGA	G	3943.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.291;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.194;NF=15;NR=41;PP=2962;ReadPosRankSum=0.127;SC=TAAATAATGAGAAATCTCAGG;SOR=1.025;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=180;TCF=51;TCR=129;TR=56;WE=38940315;WS=38940282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,106:0.42:255
chr8	38959498	rs4733905	G	A	2751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.649;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=73;PP=2073;ReadPosRankSum=0.442;SC=AAACCTAGGGGTTAATGTCTA;SOR=0.409;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=207;TCF=50;TCR=157;TR=101;WE=38959506;WS=38959488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,108:0.50:216
chr8	38987474	.	CT	C	50	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=15;MQ=61.07;NF=0;NR=5;PP=50;QD=10.6;SC=ATCACATTTCCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=38987482;WS=38987464;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,5:0.71:7
chr8	38988463	rs10101239	G	A	269.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=246;SC=GGAGACTGAGGCAGGAGGATG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=38988471;WS=38988453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	39022522	rs10088854	G	A	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.338;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=679;ReadPosRankSum=-1.126;SC=TATTAATTATGCATGTATTTA;SOR=0.387;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=68;TCF=44;TCR=24;TR=36;WE=39022530;WS=39022512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,38:0.54:71
chr8	39027541	rs74356030	T	C	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=179;ReadPosRankSum=-0.634;SC=AATCTTATTTTTTAAATTAAC;SOR=1.061;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=9;WE=39027549;WS=39027531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr8	39080632	rs7845771	C	G	6878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=110;PP=2965;SC=TGTAATGGAACCTCACCAGAA;SOR=0.811;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=207;TCF=97;TCR=110;TR=206;WE=39080640;WS=39080622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr8	39080824	rs4476978	T	A	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=574;SC=GATAATGGGGTATATTTTCAT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=39080832;WS=39080814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	39089700	.	AT	A	481.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=847;ReadPosRankSum=1.171;SC=ATTCTATTAGATTTTTAAAAA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=13;WE=39089715;WS=39089690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr8	39089707	rs180673888	A	C	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=843;ReadPosRankSum=1.610;SC=TAGATTTTTAAAAACTTTGCC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=13;WE=39089715;WS=39089690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr8	39311600	rs7813010	C	T	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=8;PP=590;SC=CTGTTACTACCGCTGTCTTCT;SOR=1.460;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=39311608;WS=39311590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr8	39311677	rs7834545	T	C	1295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=19;PP=1016;SC=TCAAGAAAAGTTTAAAAAGCT;SOR=0.968;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=37;WE=39311685;WS=39311667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr8	39312965	rs76855595	CA	C	642.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=8;PP=668;SC=AGAAACTGATCAAAAGACCAT;SOR=0.990;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=18;WE=39312973;WS=39312955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	39323484	rs141960707	AC	A	1556.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=39;PP=1686;SC=CAAATCTAAAACCAAAACAAA;SOR=4.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=42;WE=39323492;WS=39323474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
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chr8	39331093	rs7845028	T	C	592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=503;ReadPosRankSum=1.689;SC=ACGTGACCTCTAAGGTAAGTA;SOR=0.622;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=18;WE=39331101;WS=39331083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr8	39331226	rs12541604	T	C	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=2;PP=24;SC=GTCACTTAGGTACACAATTAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=39331234;WS=39331216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr8	39332895	rs199887672	G	GA	162.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.27;ReadPosRankSum=-1.645;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr8	39442292	rs7007924	T	G	4613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=112;PP=2965;SC=ACCCTCCCCCTCTCCCTTCTG;SOR=3.105;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=26;TCR=112;TR=138;WE=39442300;WS=39442282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr8	39463043	rs77993598	T	C	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=56;ReadPosRankSum=0.366;SC=CATATGTATGTATATATTAAA;SOR=0.105;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=39463051;WS=39463033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr8	39463063	rs4236751	T	C	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=2;PP=226;SC=AATTTGTTACTGGTTCGTTAT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=39463071;WS=39463053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr8	39463823	rs13268577	T	C	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.096;NF=18;NR=5;PP=487;ReadPosRankSum=-0.154;SC=TGTTTTATTTTAGATGATTTA;SOR=0.770;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=23;WE=39463831;WS=39463813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr8	39466794	rs73605937	G	T	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=231;ReadPosRankSum=-0.344;SC=ATGAAACCCAGCTGCAAGCGA;SOR=0.538;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=11;WE=39466802;WS=39466784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr8	39468128	rs73605945	A	T	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.028;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=578;ReadPosRankSum=-0.383;SC=ATAATTTATCAAATGAAAAAT;SOR=0.866;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=63;TCF=44;TCR=19;TR=28;WE=39468136;WS=39468118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,29:0.45:64
chr8	39487022	rs3735881	C	T	2521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.839;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=52;PP=1870;ReadPosRankSum=-1.446;SC=AAGAACTTTCCTTCTTGCATT;SOR=0.865;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=174;TCF=78;TCR=96;TR=92;WE=39487030;WS=39487012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,99:0.54:183
chr8	39495325	rs3824144	G	A	1386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=41;PP=1233;SC=AGCCCCTTTGGAAGTGTTTAA;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=42;WE=39495333;WS=39495315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr8	39496029	rs12708194	T	C	1490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=28;PP=1151;SC=TTCCTGGCACTGTATGCAATA;SOR=0.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=23;TCR=28;TR=51;WE=39496037;WS=39496019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	39496202	rs13278646	G	A	149.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=117;SC=TTATTTTATTGGGACAAAATT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=39496210;WS=39496192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	39503079	rs6474161	G	A	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=21;PP=564;SC=TTTATATTCGGCACCACATCA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=39503087;WS=39503069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	39505826	rs3735880	C	A	1832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=10;PP=1448;SC=TTTTATTAGCCAGGCTTATTT;SOR=2.644;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=46;TCR=10;TR=56;WE=39505834;WS=39505816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr8	39521419	rs6988389	T	C	3159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=54;PP=2366;SC=GGTAAGTTACTAACATTCATT;SOR=1.059;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=41;TCR=54;TR=95;WE=39521427;WS=39521409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr8	39525750	rs2305392	C	A	2361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=56;PP=1994;SC=TTTTACCTTACATTTGCATCT;SOR=3.458;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=10;TCR=56;TR=66;WE=39525758;WS=39525740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr8	39537616	rs28454772	C	T	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=7;PP=749;ReadPosRankSum=-0.194;SC=ATAAAAGTGACGCTCAATCTA;SOR=0.688;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=105;TCF=87;TCR=18;TR=42;WE=39537624;WS=39537606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,44:0.41:108
chr8	39607105	rs112217136	C	CATGT	568.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=3.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.047;QD=15.37;ReadPosRankSum=0.862;SOR=1.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr8	39618637	rs10093751	G	T	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.396;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=379;ReadPosRankSum=0.347;SC=TTGTTTGATGGTATTTTCAAA;SOR=1.668;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=20;WE=39618645;WS=39618627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr8	39694610	rs13255763	C	T	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=290;ReadPosRankSum=-0.221;SC=GAAACAAAATCTTTACATCAT;SOR=0.588;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=14;WE=39694618;WS=39694600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr8	39694860	rs61429352	C	A	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=160;ReadPosRankSum=-0.221;SC=CTTCCCATTTCTTTCTAAAAA;SOR=0.155;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=9;WE=39694868;WS=39694850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr8	39776286	.	AAAC	A	388.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=1.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQRankSum=0.000;QD=10.51;ReadPosRankSum=-1.684;SOR=0.301;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr8	39777529	rs7820268	C	T	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=416;ReadPosRankSum=0.518;SC=AGCATTCAATCAAATAGCAAC;SOR=0.607;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=21;WE=39777537;WS=39777519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chr8	39779989	rs10108662	C	A	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.072;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=486;ReadPosRankSum=-0.286;SC=TATGTTGAAACTAAAATAGCA;SOR=2.154;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=22;WE=39779997;WS=39779979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
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chr8	39785321	rs3739319	G	A	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=487;ReadPosRankSum=-0.217;SC=TGTGACCTCCGTATTTCCTCT;SOR=0.850;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=26;WE=39785329;WS=39785311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
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chr8	39871298	rs5891075	T	TTTAA,TTTTAA	4541.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.92;QD=63.08;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,43,29:0.60,0.40:72
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chr8	39872676	rs5891076	GA	G	1049.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=2;PP=672;SC=CTCATCTAGAGAAAAAAAAAA;SOR=5.283;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=45;TCF=43;TCR=2;TR=36;WE=39872684;WS=39872658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
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chr8	40389933	rs4038741	TAA	T	2157.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=47;PP=1935;SC=CCTGTATATATAAAATATCTC;SOR=7.903;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=47;WE=40389942;WS=40389923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	40438757	rs17851751	T	C	2646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=55;PP=1833;ReadPosRankSum=-0.859;SC=CTGCAGATGGTACATCTGTAA;SOR=0.703;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=202;TCF=88;TCR=114;TR=96;WE=40438765;WS=40438747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,106:0.49:216
chr8	40554742	rs11781516	C	T	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.867;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=596;ReadPosRankSum=-0.531;SC=GGTCTCCCCACGATCACTGTT;SOR=0.883;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=35;WE=40554750;WS=40554732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,35:0.42:84
chr8	40554994	rs12546561	C	G	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.206;NF=1;NR=8;PP=163;ReadPosRankSum=-0.458;SC=CTTACCCAGACGAACTAGTGT;SOR=0.132;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=9;WE=40555002;WS=40554984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr8	40665997	rs1512214	A	G	2420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=3;PP=2026;SC=CTAACGGTTGACAATGCAGTA;SOR=5.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=70;TCR=3;TR=72;WE=40666005;WS=40665987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr8	40666189	rs11777437	T	C	1387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.631;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=42;PP=1116;ReadPosRankSum=-0.656;SC=TCAGGGGAGGTAACAAGAAAG;SOR=1.253;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=90;TCF=18;TCR=72;TR=50;WE=40666197;WS=40666179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,51:0.54:94
chr8	40666257	rs11776726	A	C	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=157;ReadPosRankSum=0.943;SC=AATGTGAAGAAGGAAAAAGAG;SOR=0.593;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=14;WE=40666265;WS=40666247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr8	41128710	rs11779707	T	C	2302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=40;PP=1823;ReadPosRankSum=-2.016;SC=AAGTGAGGCCTAACAAATCAC;SOR=0.689;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=161;TCF=87;TCR=74;TR=88;WE=41128718;WS=41128700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,89:0.55:163
chr8	41297486	rs10637700	T	TTTTG	3001.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.756;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.21;MQRankSum=0.344;NF=2;NR=47;PP=2640;ReadPosRankSum=1.031;SC=AAGGGTATGTTTTTGTTTGTT;SOR=5.226;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=123;TCF=15;TCR=108;TR=49;WE=41297494;WS=41297476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,71:0.97:73
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chr8	41363690	rs111703526	A	AT	232.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=200;ReadPosRankSum=0.740;SC=TGTCTCCAACATTTTTTTTTA;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=12;WE=41363698;WS=41363680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr8	41364486	rs17657160	G	A	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=609;ReadPosRankSum=-0.223;SC=CAAACTGAAAGCAAAGTCTGC;SOR=0.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=78;TCF=63;TCR=15;TR=32;WE=41364494;WS=41364476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,36:0.43:83
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chr8	41391588	rs10096250	A	G	835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=2;PP=685;ReadPosRankSum=-0.918;SC=GGGCGGACACACTTCAGCCCG;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=31;WE=41391596;WS=41391578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
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chr8	41472375	rs11995712	G	A	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.560;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=506;ReadPosRankSum=0.745;SC=TCTTACTGGAGGAACCATTAG;SOR=1.104;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=27;WE=41472383;WS=41472365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr8	41513435	.	C	T	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.428;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.668;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=464;ReadPosRankSum=-0.249;SC=GCACTTGCAGCCCGACTTCCT;SOR=0.378;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=54;TCF=6;TCR=48;TR=23;WE=41513443;WS=41513425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr8	41517958	rs59908561	A	AG	2957.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=17;PP=2957;SC=TCCCACCCCGAGTATCCTGTA;SOR=2.391;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=70;TCF=52;TCR=18;TR=64;WE=41517966;WS=41517948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr8	41519248	rs516946	T	C	8025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=133;NR=126;PP=2965;SC=GGAGGTGTCATGCAGACGGCC;SOR=0.787;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=260;TCF=133;TCR=127;TR=259;WE=41519256;WS=41519238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr8	41519462	rs515071	A	G	6393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=124;PP=2965;SC=CGAATGATCTAGGAAAGGAAG;SOR=1.435;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=192;TCF=68;TCR=124;TR=192;WE=41519470;WS=41519452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr8	41529856	rs508112	A	G	4546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=134;NR=22;PP=2965;SC=CCCTGCTCCCACAGTCAAGCT;SOR=3.542;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=134;TCR=22;TR=156;WE=41529864;WS=41529846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr8	41553835	rs2304883	G	A	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=5;PP=1080;SC=CGTGGCCTCCGTGGCACAGGG;SOR=3.467;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=42;WE=41553843;WS=41553825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr8	41555740	rs492008	A	G	2679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=72;PP=2179;SC=TTTCCACTCCAGAGCCTGACT;SOR=5.918;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=75;TCF=3;TCR=72;TR=75;WE=41555748;WS=41555730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr8	41574736	rs575817	A	C	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=45;PP=1096;SC=TGTGTGCATGAGCATGTATGT;SOR=6.556;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=46;WE=41574744;WS=41574726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr8	41575420	rs2304876	A	C	1549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=24;PP=1045;SC=ACTTGCAAAAATTGTGTCTGA;SOR=1.371;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=36;WE=41575428;WS=41575410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	41580607	rs7826127	T	C	2712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=24;PP=2164;SC=TGGAGCCCTGTCTAGAAAATG;SOR=1.697;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=78;TCF=54;TCR=24;TR=77;WE=41580615;WS=41580597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr8	41585438	rs2304871	G	A	3864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=56;PP=2965;SC=GTGACTGGGCGTTGACGTTGG;SOR=0.865;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=65;TCR=56;TR=121;WE=41585446;WS=41585428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr8	41585571	rs1872877	C	T	2024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=60;PP=1722;SC=CCACTGGGCCCGCTACGGGAC;SOR=5.421;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=63;TCF=3;TCR=60;TR=63;WE=41585579;WS=41585561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr8	41615429	rs486223	G	A	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=3;PP=812;SC=CCACAGGCAGGAGCCCTGGGG;SOR=3.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=41615437;WS=41615419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	41798202	rs2929896	G	T	1865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=2;PP=1638;SC=AATGTTCACTGGGAAGATCTT;SOR=6.593;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=55;TCF=53;TCR=2;TR=55;WE=41798210;WS=41798192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr8	41804047	rs2980902	C	T	608.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.42;MQRankSum=4.023;QD=21.74;ReadPosRankSum=-0.815;SOR=2.468;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,22:0.79:28
chr8	41834902	rs34473679	T	C	1786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=47;PP=1465;SC=GTAAGGTTCCTTTTTAATACA;SOR=3.912;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=6;TCR=48;TR=53;WE=41834910;WS=41834892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr8	42013563	rs150778126	T	TATG	13024.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=148;PP=2973;SC=AAAACGTAAGTATAAGTCCCA;SOR=0.922;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=236;TCF=79;TCR=157;TR=224;WE=42013571;WS=42013553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr8	42037924	rs2020922	T	A	4770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=70;NR=78;PP=2965;SC=TTAGAATGCTTTTTTTGCTGT;SOR=0.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=70;TCR=78;TR=148;WE=42037932;WS=42037914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr8	42044954	rs1058720	G	A	3180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=70;PP=2524;SC=GCCTGATGGCGTCTGGCCTCC;SOR=1.632;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=32;TCR=70;TR=102;WE=42044962;WS=42044944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr8	42045655	rs2070713	C	T	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=35;PP=1059;SC=GTGGAACACGCGTATACCAGT;SOR=5.838;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=36;WE=42045663;WS=42045645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr8	42172017	rs7814513	C	G	5484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=154;PP=2965;SC=TCTTGGCTGGCCGTGGTGGCT;SOR=6.907;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=4;TCR=154;TR=158;WE=42172025;WS=42172007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr8	42175303	rs2294100	A	T	5828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=120;PP=2965;SC=AGAATTTGTTATGTTTTGTTT;SOR=1.927;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=169;TCF=48;TCR=121;TR=168;WE=42175311;WS=42175293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr8	42186579	rs2272732	T	C	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=1;PP=1697;SC=TATTTTAAAATAGCAGTGTTA;SOR=6.901;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=62;TCF=61;TCR=1;TR=61;WE=42186587;WS=42186569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr8	42188550	rs1057741	A	G	1973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=59;PP=1691;SC=GGCCTTGTGCAGTGGGGGGAC;SOR=5.960;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=61;TCF=2;TCR=59;TR=61;WE=42188558;WS=42188540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr8	42196183	.	G	C	5536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.202;ClippingRankSum=0.000;DP=429;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.525;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=89;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.718;SC=CTCAACGGGGGAATCACCGAC;SOR=0.752;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=412;TCF=234;TCR=178;TR=209;WE=42196191;WS=42196173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:209,216:0.51:425
chr8	42196441	rs3136717	C	T	3945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=49;PP=2965;SC=GTCACTGTCTCTTAGAGGCTG;SOR=0.960;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=65;TCR=49;TR=114;WE=42196449;WS=42196431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr8	42227777	rs67383545	GTT	G	214.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQRankSum=-0.410;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.108;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
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chr8	42552633	rs4950	G	A	8461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=113;NR=143;PP=2965;SC=CCCTTTTCCAGTGGAAATGCT;SOR=0.931;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=259;TCF=115;TCR=144;TR=256;WE=42552641;WS=42552623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr8	42587796	rs4954	G	A	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=396;SC=TAAATGTGACGTTATATAAGA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=42587804;WS=42587786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr8	42868455	rs5891200	CT	C	1064.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.051;HP=14;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=518;ReadPosRankSum=0.470;SC=TTTACATGTGCTTTTTTTTTT;SOR=1.684;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=61;TCF=36;TCR=25;TR=38;WE=42868463;WS=42868445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr8	42882555	rs111931018	A	ATTTGT	4256.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.242;NF=51;NR=15;PP=2974;ReadPosRankSum=-0.793;SC=ACATTCTGTCATTTGTTCTGT;SOR=1.412;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=75;TCF=56;TCR=19;TR=66;WE=42882563;WS=42882545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,93:0.99:94
chr8	42911470	.	C	T	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=44;ReadPosRankSum=-0.429;SC=GCCACCACCTCAGCTGCGGAC;SOR=0.465;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=5;WE=42911478;WS=42911460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr8	42959007	rs5024011	C	A	4783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=115;PP=2965;SC=TGCTGTCATCCTGTTATTTCG;SOR=2.333;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=149;TCF=33;TCR=116;TR=148;WE=42959015;WS=42958997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
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chr8	43047593	rs17603428	G	A	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.914;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=586;ReadPosRankSum=-1.053;SC=ACTCGAGTTCGCTTAGAACTG;SOR=0.925;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=72;TCF=40;TCR=32;TR=33;WE=43047601;WS=43047583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,31:0.44:71
chr8	43048987	.	G	T	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.000;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.165;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=597;ReadPosRankSum=1.281;SC=AGGAGTTCAGGTATTTGTTCA;SOR=1.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=87;TCF=30;TCR=57;TR=33;WE=43048995;WS=43048977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,33:0.38:87
chr8	43054553	rs1126058	T	C	2675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=30;PP=1961;SC=TTCTGGTATATGTCGGCCACG;SOR=1.364;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=84;WE=43054561;WS=43054543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr8	43147599	rs200539958	G	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=152;ReadPosRankSum=0.484;SC=GACACCATCTGCTCGCTACTA;SOR=0.223;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=10;WE=43147607;WS=43147589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr8	47759712	rs3849804	T	G	1615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.305;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=47;PP=1295;ReadPosRankSum=0.810;SC=ACTATTTGAGTCTATACCCAG;SOR=1.795;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=92;TCF=21;TCR=71;TR=57;WE=47759720;WS=47759702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,58:0.61:95
chr8	47842316	rs884920	G	A	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.145;NF=12;NR=0;PP=214;ReadPosRankSum=0.820;SC=GTTGTTTAACGAAGTAAGAAG;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=12;WE=47842324;WS=47842306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr8	47842901	rs6995866	A	G	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=2;PP=428;ReadPosRankSum=0.148;SC=AAACAAGGGCATGGACATGGA;SOR=0.814;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=57;TCF=52;TCR=5;TR=27;WE=47842909;WS=47842891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr8	48114035	rs4379458	G	C	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.262;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=3;PP=557;ReadPosRankSum=1.042;SC=AGAGGTTTTAGTTGCACCTCC;SOR=0.193;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=63;TCF=59;TCR=4;TR=26;WE=48114043;WS=48114025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,26:0.39:66
chr8	48309042	.	A	G	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.513;ClippingRankSum=0.000;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=6.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.33;ReadPosRankSum=-0.211;SOR=0.381;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:168,57:0.25:225
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chr8	48805816	rs11411516	A	AG	3861.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=33;PP=2936;SC=TGGCCCCCGAAGTACAAGAGG;SOR=1.279;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=87;TCF=50;TCR=37;TR=82;WE=48805824;WS=48805806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr8	48846519	rs1231202	T	C	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=3;PP=505;SC=CAATGGTAAATGTTACCATCA;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=48846527;WS=48846509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	48852225	rs8178017	C	T	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.736;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=36;PP=974;ReadPosRankSum=-0.678;SC=TATTTTTATGCATTTCTGCAT;SOR=0.324;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=59;TCF=10;TCR=49;TR=45;WE=48852233;WS=48852215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,46:0.77:60
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chr8	52321243	rs2977020	T	C	6901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.607;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=118;PP=2965;ReadPosRankSum=1.173;SC=TCCGTGGCCATCCTGTTGTGT;SOR=0.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=209;TCF=91;TCR=118;TR=208;WE=52321251;WS=52321233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,217:1.00:218
chr8	52325879	rs1560511	T	G	3445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=84;PP=2656;SC=GGCATGATATTATATGAATGG;SOR=4.977;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=7;TCR=85;TR=91;WE=52325887;WS=52325869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr8	52336041	rs2060107	G	C	1815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=1;PP=1533;SC=AAGTATAAGAGAGCATGATTA;SOR=6.701;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=55;TCR=1;TR=56;WE=52336049;WS=52336031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr8	52361772	rs1431636	G	A	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=35;PP=1027;SC=TATGTCATGTGATCAGAATTT;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=52361780;WS=52361762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	52366200	rs6473599	G	A	2195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=30;PP=1742;SC=ACGTTGCCACGTGCCTGGATC;SOR=0.904;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=39;TCR=30;TR=69;WE=52366208;WS=52366190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr8	52396048	rs1431632	C	T	1122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=3;PP=914;SC=GGTTCTCTATCGCTCTGCAGT;SOR=4.174;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=52396056;WS=52396038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	52412226	rs755311	G	T	4497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=96;NR=51;PP=2965;SC=ATGTAAAGCAGAAGCAAAGGA;SOR=1.531;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=96;TCR=51;TR=147;WE=52412234;WS=52412216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr8	52469683	rs10504123	G	A	33.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr8	52721958	rs13252785	T	C	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=17;PP=433;SC=GAGCAGCAGCTGCAGCTGCAG;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=19;WE=52721966;WS=52721948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	52730521	rs4401853	C	T	8757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=228;PP=2965;SC=ATGATACTTACTGTTTTAACT;SOR=3.733;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=264;TCF=35;TCR=229;TR=263;WE=52730529;WS=52730511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr8	52733050	rs12335014	T	A	3099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=10.247;NF=47;NR=53;PP=2288;ReadPosRankSum=1.478;SC=CTCTTCTTTGTTATCCTCTTC;SOR=0.752;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=107;TCF=53;TCR=54;TR=100;WE=52733058;WS=52733040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,103:0.98:105
chr8	52733076	rs77409139	T	C	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=37.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQRankSum=-10.327;QD=1.99;ReadPosRankSum=-2.894;SOR=3.231;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,16:0.14:114
chr8	52733128	rs62506083	T	G	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.514;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.967;NF=27;NR=30;PP=783;ReadPosRankSum=2.050;SC=TACGTAAGTGTTAATTCTCTG;SOR=0.300;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=135;TCF=50;TCR=85;TR=57;WE=52733136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,44:0.35:126
chr8	52733148	rs76104220	C	T	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=6.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.83;MQRankSum=-3.671;QD=0.46;ReadPosRankSum=0.043;SOR=0.217;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,14:0.12:115
chr8	52733340	rs35006940	A	AT	876.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=25;PP=789;SC=TCTATTGTTTATTTTTTTCAT;SOR=3.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=27;WE=52733348;WS=52733330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr8	52746153	rs9298462	C	T	2140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=34;PP=1684;SC=GGTCTTTCTGCACTCCAGCTC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=32;TCR=34;TR=66;WE=52746161;WS=52746143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr8	52811681	rs10106734	A	G	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=22;PP=643;SC=TGCGCAGAGAACCACGGGCAC;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=52811689;WS=52811671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr8	52811758	rs13263909	C	T	213.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;MQ=58.21;NF=0;NR=7;PP=175;SC=GCCCCGCCCCCCTCAGGGCTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=52811766;WS=52811748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	53055353	rs7006725	C	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=163;ReadPosRankSum=1.326;SC=AGGTTAGATGCGTGTTTAACG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=9;WE=53055361;WS=53055343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr8	53055483	rs7010548	C	T	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.261;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=674;ReadPosRankSum=-1.514;SC=CATTGGGCACCACTTACGTGA;SOR=0.899;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=135;TCF=73;TCR=62;TR=46;WE=53055491;WS=53055473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,46:0.33:139
chr8	53077680	.	T	C	2678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.386;ClippingRankSum=0.000;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.724;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=21;PP=2118;ReadPosRankSum=-0.596;SC=ATGATTATCATCTAATGAGAA;SOR=0.541;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=140;TCF=111;TCR=29;TR=93;WE=53077688;WS=53077670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,97:0.67:144
chr8	53447256	rs1440798	C	A	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.247;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=417;ReadPosRankSum=-0.967;SC=TGCTTAAAGACTCTGTGGACT;SOR=1.085;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=39;TCF=21;TCR=18;TR=22;WE=53447264;WS=53447246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr8	53450969	rs13280500	A	C	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=331;ReadPosRankSum=1.575;SC=AAACAGGATAAGAAAAATAAA;SOR=0.765;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=18;WE=53450977;WS=53450959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr8	53452359	rs34430102	T	TA,TAA	2076.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=1.503;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.39;MQRankSum=-0.215;QD=20.16;ReadPosRankSum=-0.963;SOR=1.236;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:14,66,23:0.64,0.22:103
chr8	53454826	rs16917962	C	A	2418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=26;PP=1857;ReadPosRankSum=-1.056;SC=AGCATCCGTCCATCTCCCCAA;SOR=0.715;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=103;TCR=40;TR=92;WE=53454834;WS=53454816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,94:0.64:148
chr8	53537316	rs1129660	A	G	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.823;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=263;ReadPosRankSum=0.049;SC=TTACTTTTCCAAGTACCCAGG;SOR=1.499;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=65;TCF=19;TCR=46;TR=19;WE=53537324;WS=53537306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,20:0.30:66
chr8	53548691	rs7818347	T	C	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=93;ReadPosRankSum=-1.150;SC=TTCAAGATTTTAGAAATTAAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=53548713;WS=53548681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr8	53548705	rs12677465	T	C	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=151;ReadPosRankSum=-0.842;SC=AATTAAAATATTAATACAGAT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=53548713;WS=53548681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
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chr8	53570529	rs12708142	C	A	1911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=40;PP=1478;SC=ACACTAATGACGAAAACTGTT;SOR=2.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=54;WE=53570537;WS=53570519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
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chr8	54866491	rs6981243	C	A	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=0;PP=872;SC=TGAGGAAATGCGAACAGTTCT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=54866499;WS=54866481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr8	55047719	rs2292589	C	G	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=92;ReadPosRankSum=0.705;SC=CTCTGCCCGACTCCCGGGCTT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=55047727;WS=55047716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
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chr8	55539395	rs2293869	A	T	8460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=172;NR=90;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.654;SC=GACAGGAGATAATCTATGTAA;SOR=1.557;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=264;TCF=173;TCR=91;TR=262;WE=55539403;WS=55539385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,271:0.99:273
chr8	55542540	rs61739567	G	A	2745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=31;PP=2253;SC=GAAAGGTTTTGTATGAATTTC;SOR=1.504;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=56;TCR=31;TR=87;WE=55542548;WS=55542530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr8	55590975	rs382476	G	A	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=298;SC=GTATTATTAGGCCATATTTAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=55590983;WS=55590965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr8	55592336	rs405226	A	G	998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=4;PP=873;SC=TGGTGTTTTCATTTGTTTTGC;SOR=3.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=35;WE=55592344;WS=55592326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr8	55613902	rs858396	C	T	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=194;SC=ATAAAACCTACTGAATTTCAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=55613910;WS=55613895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	55671690	.	CTG	C	140	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=0.9993;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=18;MQ=56.28;NF=0;NR=4;PP=140;QD=35.75;SC=GTGGATGATGCTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=4;WE=55671699;WS=55671680;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,4:0.33:12
chr8	56015099	rs77468937	G	A	2221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.503;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=34;PP=1607;ReadPosRankSum=-1.139;SC=GCAGCGACGTGGCGTTCACCC;SOR=1.049;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=128;TCF=69;TCR=59;TR=82;WE=56015107;WS=56015089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,88:0.66:134
chr8	56047961	rs78435240	T	C	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=28;ReadPosRankSum=0.142;SC=ATAGTAGATATGCAATATATA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=4;WE=56047969;WS=56047951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr8	56074325	rs7837220	C	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.948;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=9;PP=246;ReadPosRankSum=0.115;SC=TCACTAAATTCTTTTCTCCAC;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=10;WE=56074333;WS=56074315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr8	56076791	rs2291183	G	A	1798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.761;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=25;PP=1379;ReadPosRankSum=-0.808;SC=GAATTCTGTCGGCATTGAGAC;SOR=0.215;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=104;TCF=70;TCR=34;TR=65;WE=56076799;WS=56076781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,66:0.63:105
chr8	56076886	rs2291184	A	G	2514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.025;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=37;PP=2046;ReadPosRankSum=0.410;SC=TGCTATTTGGAGGGTGAGATG;SOR=0.967;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=142;TCF=79;TCR=63;TR=87;WE=56076894;WS=56076876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,89:0.61:147
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chr8	56435718	.	G	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.96;MQRankSum=-2.572;QD=4.15;ReadPosRankSum=-1.375;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
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chr8	59352506	rs71557723	TATTA	T	196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=186;ReadPosRankSum=-2.065;SC=TATATCATAATATTAATTGTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=59352517;WS=59352496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
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chr8	59549792	rs75712986	C	T	2087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=19;PP=1669;ReadPosRankSum=-0.048;SC=ACCTTCCTTACTTGCCAGTAT;SOR=0.643;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=112;TCF=85;TCR=27;TR=75;WE=59549800;WS=59549782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,75:0.66:113
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chr8	59739438	rs56215946	A	C	1087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.124;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=37;PP=831;ReadPosRankSum=0.334;SC=CCTTCTTCGCAGCCTCGGTTT;SOR=0.512;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=73;TCF=15;TCR=58;TR=48;WE=59739446;WS=59739428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,46:0.64:72
chr8	59750932	rs72649459	C	T	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=398;ReadPosRankSum=-0.563;SC=CAAGACATATCGTTGTTTTCC;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=17;WE=59750940;WS=59750922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr8	59764368	rs3837195	CAATA	C	188.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=247;SC=CTGGCATCTACAATAAATAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=59764379;WS=59764358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	59852168	rs3832587	A	AAC	1163.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=23;PP=1139;SC=CATCATATCAAACACTTGACC;SOR=5.283;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=24;WE=59852176;WS=59852158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	59872615	rs3780001	T	G	3528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=79;PP=2846;SC=ACTGCGGGTATGTTTGGTTTT;SOR=2.480;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=25;TCR=79;TR=104;WE=59872623;WS=59872605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr8	61139280	rs12549573	C	T	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=225;SC=TGCTTTTTGACCTATTTCTTT;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=61139288;WS=61139270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr8	61139319	rs12549574	C	T	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=131;ReadPosRankSum=-1.387;SC=ACCACAAGGACAGCAGCTTTT;SOR=0.818;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=8;WE=61139327;WS=61139309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr8	61144790	rs73683396	G	T	2036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.722;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=12;PP=1671;ReadPosRankSum=-0.347;SC=TTTACAAAATGATTTAGAAAT;SOR=0.960;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=154;TCF=129;TCR=25;TR=77;WE=61144798;WS=61144780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,77:0.50:155
chr8	61178567	rs61743130	G	A	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=4.616;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.825;SOR=0.327;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,35:0.44:80
chr8	61178574	rs7464181	T	C	2916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=55;PP=739;SC=ACAGTTCAAATTCATGCCCTT;SOR=1.996;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=77;WE=61178582;WS=61178557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr8	61178676	rs5891756	CT	C	340.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=15;PP=247;SC=ACATTAGAGACTTTTTTTTTT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=15;WE=61178684;WS=61178666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	61192534	rs28429093	C	T	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=315;ReadPosRankSum=0.264;SC=CCCTTGATATCATGAAGAGAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=61192550;WS=61192524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr8	61192542	rs55948763	G	A	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=113;ReadPosRankSum=-0.718;SC=ATCATGAAGAGAGTAATGATA;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=3;WE=61192550;WS=61192524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr8	61193453	rs7002846	A	G	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=394;SC=CCCGAAACGCACCAGGGGAGT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=61193461;WS=61193451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	61193522	rs7002871	A	G	3070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.00;SOR=6.618;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr8	61193522	.	AGCGG	GGCGA,GGCGG	930	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=39,76;NR=1,2;PP=930,905;QD=24.5866968716;SC=CGGAGCGCGCAGCGGCAGCAG;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=80;TCF=78;TCR=2;TR=40,78;WE=61193534;WS=61193512;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.50:80
chr8	61193526	rs7003287	G	A	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=2.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.32;ReadPosRankSum=0.931;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,48:0.54:89
chr8	61193570	rs74792169	C	T	2434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.888;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=28;PP=1842;ReadPosRankSum=-0.053;SC=CTGACGCCGCCGCGGGACCCC;SOR=0.470;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=184;TCF=135;TCR=49;TR=97;WE=61193578;WS=61193560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,100:0.53:189
chr8	61193588	rs10086200	C	T	2350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.163;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=26;PP=1747;ReadPosRankSum=-1.078;SC=CCCGGACACCCCGACTCGCGG;SOR=0.811;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=212;TCF=151;TCR=61;TR=94;WE=61193596;WS=61193578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,96:0.44:217
chr8	61193760	rs10101374	T	G	2090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=55;PP=1626;SC=GCGCCTTCGCTGGGCGCGGGG;SOR=4.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=6;TCR=55;TR=61;WE=61193768;WS=61193750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr8	61193809	rs10086341	A	G	1304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=31;PP=982;SC=GAGTGTGAGCACGCGTGAGCG;SOR=3.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=61193817;WS=61193799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	61655690	rs7836586	G	A	2668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=77;PP=2171;SC=CTGCATTGCAGTGTGAAATTC;SOR=8.814;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=77;TCF=0;TCR=77;TR=77;WE=61655698;WS=61655680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr8	61707725	rs4540437	G	A	5675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=147;PP=2965;SC=TTGGTTATTTGGCATGGGTAA;SOR=3.747;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=20;TCR=147;TR=167;WE=61707733;WS=61707715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr8	61713126	rs5891777	A	ATGGACT	4410.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=43;PP=2957;SC=CATTTTAAAGATGGACTAGAA;SOR=0.999;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=85;TCF=23;TCR=62;TR=62;WE=61713134;WS=61713116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr8	61714245	rs10448027	A	G	2857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.47;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr8	61732521	rs6471902	A	G	1444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=2;PP=1048;SC=ATTTCATCTTAGGAAATAAGT;SOR=5.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=36;WE=61732529;WS=61732511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr8	61734295	rs4509369	A	G	1174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=2;PP=966;ReadPosRankSum=2.200;SC=ATATATGTATATGTATGTATG;SOR=1.098;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=68;TCF=64;TCR=4;TR=40;WE=61734303;WS=61734285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,42:0.58:72
chr8	61748893	rs7005873	C	A	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=30;PP=892;SC=AATTACCTTCCCAGGGGTCCA;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=32;WE=61748901;WS=61748883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr8	61750860	rs7844902	A	G	4725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=113;PP=2965;SC=GAAGCATGACAGAGTTCATGT;SOR=2.928;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=25;TCR=113;TR=138;WE=61750868;WS=61750850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr8	61764076	rs4342642	A	G	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=192;ReadPosRankSum=1.512;SC=TAGGATAACTATTTCTTTGAT;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=10;WE=61764084;WS=61764066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr8	61769195	rs2272727	A	G	3384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.115;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=79;PP=2710;ReadPosRankSum=0.736;SC=GAGAGGCAACAAGCTCTACCT;SOR=0.960;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=312;TCF=144;TCR=168;TR=139;WE=61769203;WS=61769185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,140:0.44:316
chr8	61851466	rs3748648	T	C	2541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=2.806;NF=27;NR=52;PP=1916;ReadPosRankSum=0.820;SC=GAGTCTGATCTCCTACAGCTG;SOR=0.659;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=81;TCF=27;TCR=54;TR=79;WE=61851474;WS=61851456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr8	62003453	rs1367972	A	G	7383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=146;NR=80;PP=2965;SC=TGAAGCTGTAATGAGTTAAGA;SOR=1.372;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=226;TCF=146;TCR=80;TR=226;WE=62003461;WS=62003443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr8	62003547	rs35220668	G	GC	3980.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=105;PP=2979;SC=AATGACCCATGCCCCCCCACC;SOR=2.851;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=145;TCF=14;TCR=131;TR=118;WE=62003555;WS=62003537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr8	62289060	rs10957192	C	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=-0.046;SC=ACCCTCCAGGCGGGGTTCATG;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=62289068;WS=62289052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr8	62371260	rs2291607	C	T	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=536;ReadPosRankSum=1.426;SC=AAACTGAAAACAAATGGGGCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=21;WE=62371268;WS=62371250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr8	62411925	rs71559334	G	GAAAT	2005.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.065;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.000;NF=31;NR=9;PP=1912;ReadPosRankSum=1.062;SC=ATTAAAAAGAGAAATATAAAA;SOR=1.012;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=104;TCF=84;TCR=20;TR=40;WE=62411933;WS=62411915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,51:0.51:100
chr8	62416074	rs7005617	G	A	1733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=24;PP=1285;SC=AGGTCCTGCAGCAGAAAGACA;SOR=0.877;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=30;TCR=24;TR=54;WE=62416082;WS=62416064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr8	62416173	rs16918881	G	A	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.191;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=293;ReadPosRankSum=-0.431;SC=AACAACCTTTGGGACATAACC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=13;WE=62416181;WS=62416163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr8	62430440	.	C	T	1572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.013;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=0;PP=1234;ReadPosRankSum=0.171;SC=TCAATTCTGACGTCAACCACA;SOR=3.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=128;TCF=124;TCR=4;TR=58;WE=62430448;WS=62430430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,60:0.45:132
chr8	62438530	rs4738904	A	G	2227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=3;PP=1913;ReadPosRankSum=-0.657;SC=GAAGTCAGAAACTCACCTTGC;SOR=4.143;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=63;TCR=3;TR=65;WE=62438538;WS=62438520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr8	62460886	rs10113272	A	G	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=4.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.25;ReadPosRankSum=0.155;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr8	62460894	rs16927479	G	A	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=4.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.85;ReadPosRankSum=-0.652;SOR=2.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr8	62465580	rs4289805	T	C	1752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.347;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=28;PP=1351;ReadPosRankSum=0.676;SC=GAAATTCATATACCCATTACC;SOR=1.091;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=181;TCF=101;TCR=80;TR=72;WE=62465588;WS=62465570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,75:0.41:184
chr8	62465795	rs4291265	T	C	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=4.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=205;ReadPosRankSum=2.434;SC=CAGAAAAATATATCTCCATAT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=9;WE=62465803;WS=62465785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr8	62465814	rs4379440	G	T	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=157;ReadPosRankSum=0.653;SC=ATTAAACTTTGGGAATGAGGT;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=8;WE=62465822;WS=62465804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr8	62475160	rs3802287	A	G	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.42;ReadPosRankSum=1.016;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
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chr8	62475518	rs3824269	G	C	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=128;ReadPosRankSum=0.656;SC=TAAGTCATGAGAGACTATTCA;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=7;WE=62475526;WS=62475508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
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chr8	62489214	rs55767984	T	A	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=2;PP=1135;ReadPosRankSum=-0.327;SC=TGCATATACATGAGAAACTGA;SOR=0.856;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=104;TCF=99;TCR=5;TR=50;WE=62489222;WS=62489204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,49:0.46:106
chr8	62489334	rs16927574	C	T	4041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.855;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=82;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.377;SC=AGAATACCTGCGCCTTCCCAT;SOR=0.743;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=311;TCF=155;TCR=156;TR=161;WE=62489342;WS=62489324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,163:0.52:314
chr8	62496415	rs6471962	C	T	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.14;ReadPosRankSum=0.068;SOR=1.308;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr8	62545288	rs2882462	C	T	2227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=57;PP=1860;SC=AGGCATCCCACATATAACTAA;SOR=3.393;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=10;TCR=57;TR=67;WE=62545296;WS=62545278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr8	62550924	rs34108497	T	TA	1072.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=6.310;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.33;MQRankSum=0.565;QD=21.03;ReadPosRankSum=-0.132;SOR=2.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:6,45:0.88:51
chr8	62555431	.	G	A	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.177;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=26.339;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQRankSum=-3.902;QD=0.62;ReadPosRankSum=-0.998;SOR=4.571;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,21:0.25:84
chr8	62556590	rs7825861	C	T	1419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=39;PP=1167;SC=TAGGAAATTACGTCTCAAATA;SOR=4.664;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=41;WE=62556598;WS=62556580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr8	62563718	rs7016408	G	T	1260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=30;PP=1066;SC=AAGTAGAAAAGCTCAAACATC;SOR=2.419;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=62563726;WS=62563708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	62563764	rs7016141	A	G	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=536;SC=TGACATTGGTACATACACATT;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=62563772;WS=62563754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	62595068	rs3750278	C	T	6159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=161;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.787;SC=AACATGAAAACTGTTATTTGT;SOR=2.248;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=187;TCF=24;TCR=163;TR=185;WE=62595076;WS=62595058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,189:0.99:190
chr8	62626962	rs3829051	C	T	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=17;PP=590;SC=TGAGGGCTGGCGGACCTCCTT;SOR=0.906;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=13;TCR=17;TR=30;WE=62626970;WS=62626952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr8	62627004	rs3750279	A	G	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=2;NR=14;PP=418;SC=CGACGCGGGAACCGCTGGCGG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=62627012;WS=62626994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	63161462	rs2272014	G	A	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=464;SC=CCGCCCCGCCGGGAAACTAAC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=63161470;WS=63161452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr8	63161829	rs5020321	C	A	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=23;PP=618;SC=CTCCCCACCGCCTGGCTGGGC;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=63161837;WS=63161819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	63257441	rs4442138	T	G	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=601;SC=CATTAAATTGTTAGATAACTT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=63257449;WS=63257431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	63296132	rs10808724	T	G	2659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=42;PP=2060;SC=CCTTTTGGTTTGAAGAACATG;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=37;TCR=42;TR=79;WE=63296140;WS=63296122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr8	63502151	rs2306401	C	T	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-3.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=189;ReadPosRankSum=0.975;SC=CTTTTCTGAGCGCTCCGTCAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=63502159;WS=63502141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr8	63659610	rs1319275	G	A	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.855;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=676;ReadPosRankSum=1.672;SC=ACGATTACACGTACGTCTCTG;SOR=0.584;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=35;WE=63659618;WS=63659600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,40:0.53:76
chr8	63942717	rs4617146	C	T	1398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=18;PP=1050;ReadPosRankSum=0.627;SC=ACCAATGCTGCCAACTTACCC;SOR=0.686;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=112;TCF=77;TCR=35;TR=56;WE=63942725;WS=63942707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,57:0.51:111
chr8	63948134	rs6998383	A	G	2821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=6;PP=2408;SC=AAAGTGCTAGAATTACAGGCA;SOR=4.778;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=74;TCR=6;TR=80;WE=63948142;WS=63948124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr8	63948185	rs34822356	TA	T	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=8.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.52;ReadPosRankSum=0.475;SOR=1.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,14:0.17:80
chr8	63951116	rs190945668	T	G	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.545;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=476;ReadPosRankSum=-0.282;SC=CATCTGGGGGTTTTTCCCGGC;SOR=0.162;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=57;TCF=54;TCR=3;TR=23;WE=63951124;WS=63951106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,23:0.40:58
chr8	63976677	rs4606052	C	T	1438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=4;PP=1080;SC=TGGGCAGGTACGAGGAAAGAT;SOR=3.865;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=41;WE=63976685;WS=63976667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
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chr8	63978658	rs5891887	TA	T	4703.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=150;PP=2983;SC=CCCAGTGTGCTAAAAAAAATA;SOR=4.099;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=185;TCF=16;TCR=169;TR=162;WE=63978666;WS=63978648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
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chr8	67361264	rs3739338	T	C	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=353;ReadPosRankSum=0.212;SC=GATAGTATTTTGTTGCTCAAC;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=21;WE=67361272;WS=67361254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
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chr8	67404732	rs1559886	T	C	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.580;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=144;ReadPosRankSum=-0.944;SC=ATGATATATATGATATCATAT;SOR=1.473;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=12;WE=67404740;WS=67404722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
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chr8	69020496	rs4260880	T	C	1837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.520;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=51;PP=1273;ReadPosRankSum=-0.215;SC=CTTTGGGAAGTGCATTTGGTG;SOR=0.226;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=132;TCF=37;TCR=95;TR=78;WE=69020504;WS=69020486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,82:0.58:142
chr8	69033084	rs1160174	G	A	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=591;ReadPosRankSum=1.462;SC=ACAGAAGAAGGTTTTGAAGCC;SOR=0.293;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=26;WE=69033092;WS=69033074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
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chr8	71486568	rs268566	G	C	1486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.783;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=1162;ReadPosRankSum=-2.594;SC=GTGTTGTAACGATTATTATGT;SOR=0.598;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=47;TCR=43;TR=52;WE=71486576;WS=71486558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,54:0.59:92
chr8	71506540	.	GTT	G	45.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.86;ReadPosRankSum=2.506;SOR=0.023;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
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chr8	71510093	rs268626	A	G	3752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=6.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.641;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=26;PP=2910;ReadPosRankSum=0.906;SC=AATCTTAGATAAGGAAGGAGA;SOR=0.768;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=213;TCF=170;TCR=43;TR=130;WE=71510101;WS=71510083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,133:0.62:216
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chr8	71646461	rs74975207	C	T	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=565;ReadPosRankSum=0.279;SC=TCTGGGTTTGCCCCCTCACTA;SOR=0.744;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=83;TCF=36;TCR=47;TR=31;WE=71646469;WS=71646451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,32:0.36:89
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chr8	72111678	rs10090382	T	C	1742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.589;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=34;PP=1212;ReadPosRankSum=-0.871;SC=CACACATACATGTGAGGACAG;SOR=0.439;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=161;TCF=95;TCR=66;TR=77;WE=72111686;WS=72111668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,78:0.47:166
chr8	72111710	rs10103644	C	T	1892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.159;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=40;PP=1382;ReadPosRankSum=0.974;SC=CCAGCCCTGCCAGCTTTTTTG;SOR=0.572;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=173;TCF=90;TCR=83;TR=78;WE=72111718;WS=72111700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,81:0.44:183
chr8	72111739	rs10103852	G	C	1739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.221;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=40;PP=1234;ReadPosRankSum=-0.050;SC=CTCCCATGCTGACCCCCATTT;SOR=0.798;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=156;TCF=72;TCR=84;TR=71;WE=72111747;WS=72111729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,73:0.45:163
chr8	72127563	rs7846086	G	A	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.187;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=156;ReadPosRankSum=0.263;SC=ATTGCCTTTCGTTTTTATTAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=8;WE=72127571;WS=72127558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr8	72127764	rs3735935	C	A	3535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.512;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=27;PP=2855;ReadPosRankSum=-0.490;SC=AAAAAGAAAACAAAGACTGTT;SOR=0.891;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=235;TCF=178;TCR=57;TR=124;WE=72127772;WS=72127754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,130:0.53:247
chr8	72128874	rs4737312	G	A	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.014;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=591;ReadPosRankSum=1.099;SC=AGTACTTTTGGAATTGTATCT;SOR=4.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=54;TCR=6;TR=27;WE=72128882;WS=72128864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,30:0.48:63
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chr8	72211178	rs17783968	G	A	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=0;PP=942;SC=CTTGCCAAAAGCTGCCAAAAT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=72211186;WS=72211168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	72755040	rs7812453	A	C	2825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.931;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=62;PP=1965;ReadPosRankSum=-0.507;SC=AAACCGAAACAGCTCTCCTAC;SOR=0.626;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=256;TCF=123;TCR=133;TR=121;WE=72755048;WS=72755030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,127:0.48:267
chr8	72914433	rs35305136	CT	C	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=1.340;QD=1.32;ReadPosRankSum=-0.018;SOR=0.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,9:0.24:37
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chr8	72935045	rs10086177	G	C	2785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.86;SOR=8.380;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
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chr8	72936237	rs1384001	C	A	1889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=42;PP=1432;ReadPosRankSum=1.570;SC=CCACTGGTACCAATATGCATA;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=54;TCF=11;TCR=43;TR=53;WE=72936245;WS=72936227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr8	72938357	rs2305018	A	C	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=25;PP=708;SC=TAGTATATGGAATTTTTATAT;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=72938365;WS=72938347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	72942210	rs3824151	G	T	5671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.970;NF=65;NR=140;PP=2965;ReadPosRankSum=1.343;SC=CCAATCTGAAGTATGACACAA;SOR=0.796;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=206;TCF=65;TCR=141;TR=205;WE=72942218;WS=72942200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,184:0.99:185
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chr8	72963258	rs1025928	T	C	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=350;SC=GGAACCAACATGTAAAGCAAG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=72963266;WS=72963248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr8	72971527	rs12548486	C	T	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=59;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=298;SC=AGCAAGAAATCAAAATTTGCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=72971535;WS=72971517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	72971570	rs9298198	C	T	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.77;SOR=6.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
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chr8	72975619	rs34929058	GA	G	1184.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.333;NF=40;NR=4;PP=770;ReadPosRankSum=-0.748;SC=CATCTCAAAAGAAAAAAAAAA;SOR=3.139;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=55;TCF=51;TCR=4;TR=44;WE=72975627;WS=72975609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr8	72975801	rs7819749	T	G	2431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=64;PP=2030;SC=TAGCTCCTTTTTTAAGCTGGA;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=12;TCR=64;TR=76;WE=72975809;WS=72975791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr8	72981327	rs1811457	A	G	4425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=71;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.781;SC=AGTTTCGGAGATTTGGGTTTG;SOR=0.223;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=66;TCR=72;TR=136;WE=72981335;WS=72981317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,146:0.99:147
chr8	72981584	rs1373297	C	T	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=389;SC=TCAGTTCTAACGAAACATTTA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=72981592;WS=72981574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	72987369	rs2278654	C	T	2641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=2;PP=2146;SC=AAAGCAGGCGCTGTGTGGGCG;SOR=5.499;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=77;TCF=75;TCR=2;TR=77;WE=72987377;WS=72987359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr8	72987384	rs2278653	A	T	2956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=10;PP=2364;SC=TGGGCGCGTCATTAGTAGGGT;SOR=3.442;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=75;TCR=10;TR=84;WE=72987392;WS=72987374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr8	73117447	rs11783602	T	G	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.575;NF=35;NR=1;PP=933;ReadPosRankSum=-1.089;SC=TCCTACAAAATGCCCATTTTT;SOR=0.818;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=50;TCR=1;TR=36;WE=73117455;WS=73117437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,36:0.71:51
chr8	73117525	rs1842716	T	G	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.727;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.830;NF=30;NR=13;PP=620;ReadPosRankSum=0.281;SC=GGGGAGGCACTGCACTTACCT;SOR=0.778;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=127;TCF=86;TCR=41;TR=43;WE=73117533;WS=73117515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,45:0.35:129
chr8	73142278	rs276658	T	G	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.575;NF=31;NR=1;PP=571;ReadPosRankSum=-1.078;SC=TCATATATCCTCACCTGAGAA;SOR=0.324;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=53;TCF=52;TCR=1;TR=32;WE=73142286;WS=73142268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr8	73142382	rs12541758	C	T	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.232;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.594;NF=15;NR=21;PP=574;ReadPosRankSum=0.512;SC=AGGTCCCCTTCATTCAGAAGC;SOR=1.200;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=108;TCF=49;TCR=59;TR=36;WE=73142390;WS=73142372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,33:0.38:88
chr8	73146170	rs375770708	A	AT	1180.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=8;PP=961;SC=TAATCATATGATTTTTTCAAC;SOR=2.419;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=31;WE=73146178;WS=73146160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	73150491	rs6989765	G	A	2135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=47;PP=1743;ReadPosRankSum=2.431;SC=ATAATAGGGAGGGTTTTTTAT;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=32;TCR=65;TR=70;WE=73150499;WS=73150481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,72:0.73:99
chr8	73150781	rs17751056	G	A	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.996;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=519;ReadPosRankSum=0.843;SC=CCAGTTAAACGTCAAATCACA;SOR=0.163;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=25;WE=73150789;WS=73150771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr8	73152837	rs4559286	A	G	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=214;ReadPosRankSum=0.210;SC=GCTTTTGTAAATAATAATAAT;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=10;WE=73152845;WS=73152827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
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chr8	73850203	rs11782118	G	A	5836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=59;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.736;SC=ACCATGCTGTGAGTGAAGTCA;SOR=0.760;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=183;TCF=124;TCR=59;TR=182;WE=73850211;WS=73850193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,186:0.99:187
chr8	73921534	rs113373855	G	GGAGGTCGGGAGA	688.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=7;PP=2972;SC=CGTCGCCGAGGGAGGGGCTGC;SOR=1.765;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=10;WE=73921542;WS=73921524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr8	74335014	rs60338415	T	TAGAAAGAC	399.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=342;ReadPosRankSum=-0.798;SC=AAAGCTGAGATAGAAAGACTC;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=74335022;WS=74335004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr8	74440125	rs143916422	T	TCAGGAAAATTCAAATAATTTA	1289.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=4.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.52;ReadPosRankSum=0.602;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,37:0.36:103
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chr8	74463082	.	G	A	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.21;ReadPosRankSum=1.459;SOR=0.539;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,24:0.33:72
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chr8	74888616	rs8075	G	C	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.856;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=246;ReadPosRankSum=-0.504;SC=AGGTCCCCGGGCCTCTGTCTC;SOR=3.682;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=14;WE=74888624;WS=74888606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
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chr8	74890961	rs62509309	A	G	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.300;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.486;NF=22;NR=2;PP=418;ReadPosRankSum=-1.279;SC=TAAGAAGGTTAGTTGACCATA;SOR=0.192;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=75;TCF=71;TCR=4;TR=24;WE=74890969;WS=74890951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,24:0.32:75
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chr8	74893850	rs1053077	C	G	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=207;ReadPosRankSum=-0.476;SC=ATAAAGATGACAAATGAGCCT;SOR=0.892;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=12;WE=74893858;WS=74893840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,12:0.26:46
chr8	74893880	rs7108	C	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=63;ReadPosRankSum=0.194;SC=TGTTCGTGCTCAAATGTGATT;SOR=0.283;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=6;WE=74893888;WS=74893870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
chr8	74917084	rs6472812	A	G	2892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=33;PP=2303;SC=AGAATTGAAAAGATCCAAAGG;SOR=1.295;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=52;TCR=33;TR=85;WE=74917092;WS=74917074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr8	75262798	rs7828201	G	C	4745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=75;PP=2965;SC=GGACGCATTCGTTCAGCTCTC;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=67;TCR=75;TR=142;WE=75262806;WS=75262788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr8	75262841	rs4321999	G	A	3982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=84;PP=2965;SC=GGCGGAGGGTGGCGCGGATCG;SOR=1.821;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=36;TCR=84;TR=120;WE=75262849;WS=75262831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr8	75272282	rs145768916	AATG	A	313.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=10;NR=0;PP=371;ReadPosRankSum=0.335;SC=TGAAAATGTTAATGATGAGTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=10;WE=75272292;WS=75272280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr8	75274141	rs11554166	T	G	1706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-7.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.666;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=27;PP=1203;ReadPosRankSum=-1.401;SC=ACACAGAGTCTGAGCTGAAGA;SOR=0.824;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=264;TCF=176;TCR=88;TR=85;WE=75274149;WS=75274131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,88:0.33:269
chr8	75275312	rs4463412	C	T	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=17;NR=27;PP=1202;SC=TATATTCTTTCTCTCTTTTCA;SOR=1.154;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=44;WE=75275320;WS=75275302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr8	75460784	rs150212729	T	TG	314.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=356;SC=GTGAAGTTTTTGAAGAGTATT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=75460797;WS=75460774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	75460789	rs150990986	A	AG	314.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=287;SC=GTTTTTGAAGAGTATTGCCAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=75460797;WS=75460774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	75614614	rs269198	C	A	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.538;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=1424;ReadPosRankSum=-2.048;SC=CCTTTGCCAGCTGAAGCTATG;SOR=0.479;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=29;WE=75614625;WS=75614604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,29:0.71:41
chr8	75614617	rs2162147	A	G	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.531;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=531;ReadPosRankSum=1.584;SC=TTGCCAGCTGAAGCTATGCCA;SOR=0.970;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=12;WE=75614625;WS=75614604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,13:0.30:44
chr8	75618116	rs34916429	CT	C	203.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=60.57;MQRankSum=1.230;NF=0;NR=8;PP=218;ReadPosRankSum=-0.623;SC=AAAAACTAAACTTCTGAAATG;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=75618124;WS=75618106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr8	75664694	rs34841297	CA	C	1060.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=2.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.33;ReadPosRankSum=2.154;SOR=0.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,43:0.22:199
chr8	75737770	rs36083765	C	CT	180.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=18.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.06;ReadPosRankSum=-1.109;SOR=0.020;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,16:0.27:59
chr8	75737818	rs1991860	C	T	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.168;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=362;ReadPosRankSum=1.051;SC=TATTGTACATCTGCAGAATCT;SOR=0.086;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=47;TCF=1;TCR=46;TR=18;WE=75737826;WS=75737808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr8	75761295	rs34728422	C	T	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.940;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=5;PP=852;ReadPosRankSum=-0.325;SC=TAAGGACAATCTACTTTTAAA;SOR=0.293;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=127;TCF=116;TCR=11;TR=43;WE=75761303;WS=75761285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,43:0.34:126
chr8	76452313	rs2943549	G	A	2857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=78;PP=2329;SC=TATAATTCAAGTGGTGAGTTA;SOR=4.664;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=7;TCR=78;TR=85;WE=76452321;WS=76452303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr8	76452421	rs2943551	G	A	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=399;SC=TTGCTGGAGAGTTTAGGGCTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=76452429;WS=76452411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	76459726	rs1800922	G	A	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=372;SC=TTATCGAACCGAATTTGACAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=76459734;WS=76459716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	76465522	rs1800924	T	G	694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=530;SC=TAATGCATATTCTATATTACT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=76465530;WS=76465512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	76465570	rs62515061	T	C	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=183;ReadPosRankSum=-0.728;SC=AAGGATTGGGTTTCCTTACCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=8;WE=76465578;WS=76465560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
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chr8	76468282	rs1805098	G	A	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=8;PP=268;SC=GATCCATGATGTATAAAGATA;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=13;WE=76468290;WS=76468272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr8	77620372	.	A	G	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.749;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=221;ReadPosRankSum=-0.110;SC=CAACTTAAGGAAAAAAAAAGA;SOR=0.100;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=13;WE=77620380;WS=77620362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,12:0.26:47
chr8	77690380	rs12679822	C	G	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=0;PP=631;SC=GGGTGGGTGTCACCTGTTTTG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=77690388;WS=77690370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr8	77745635	rs2733733	G	A	4056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=83;PP=2965;SC=AGTTGAGATCGACCTCAGGTA;SOR=1.845;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=38;TCR=83;TR=121;WE=77745643;WS=77745625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr8	77755152	rs2248913	T	C	2781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=84;PP=2327;ReadPosRankSum=0.145;SC=CTACTATTCATTGCATGTGCA;SOR=0.687;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=142;TCF=9;TCR=133;TR=90;WE=77755160;WS=77755142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,92:0.64:144
chr8	77765865	rs2728455	C	T	5093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.286;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=77;PP=2962;ReadPosRankSum=0.582;SC=TTACTGACTACCAGCTTAGGG;SOR=0.955;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=274;TCF=154;TCR=120;TR=182;WE=77765873;WS=77765855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,188:0.67:281
chr8	77879257	rs7000529	T	C	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=22;PP=651;SC=CCATTGCCTTTTCCTTTGGTA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=77879265;WS=77879247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	77895865	rs10087163	A	G	7010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=152;NR=83;PP=2965;SC=CCAACTTCACATATGTTTTGA;SOR=1.395;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=235;TCF=152;TCR=83;TR=235;WE=77895873;WS=77895855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr8	77896472	rs10957830	C	A	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=208;ReadPosRankSum=-0.527;SC=CAAAGAGTTGCAATCTTGTAC;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=12;WE=77896480;WS=77896462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr8	77912230	rs12718	G	T	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.609;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=26;PP=666;ReadPosRankSum=0.321;SC=ACTGACCTTAGGAGTCTGCGA;SOR=0.139;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=70;TCF=9;TCR=61;TR=32;WE=77912238;WS=77912220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
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chr8	86089787	rs12926	C	G	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=69;ReadPosRankSum=0.835;SC=TCGGGGGCGCCGGGGGCGGCA;SOR=0.495;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=8;WE=86089795;WS=86089777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr8	86114525	rs3217409	T	TTTA	541.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=459;SC=TTCTGAAACCTTTTTTCTTCT;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=11;WE=86114533;WS=86114515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr8	86126827	rs112611553	C	CAACATT	3199.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=16;PP=2777;SC=GTAGCTTCATCAACTGGTTTG;SOR=1.609;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=40;WE=86126835;WS=86126817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
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chr8	86135132	rs1021583	A	G	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.736;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=196;ReadPosRankSum=0.339;SC=CAGACCAGAGAACTCTGATGC;SOR=0.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=10;WE=86135140;WS=86135122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr8	86158217	rs34150174	TTAAAC	T	583.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=1.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=1.564;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.907;SOR=1.361;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,18:0.30:60
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chr8	86171786	rs4739698	T	C	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.766;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=388;ReadPosRankSum=-0.086;SC=ATAAGACATATCTGTGATTCA;SOR=1.043;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=69;TCF=36;TCR=33;TR=24;WE=86171794;WS=86171776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,23:0.31:74
chr8	86171816	rs4739699	A	G	1913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=32;PP=1387;SC=CACATGGTGGAATTTAAGGGG;SOR=0.933;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=25;TCR=32;TR=57;WE=86171824;WS=86171806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr8	86180944	rs2006767	A	G	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.546;NF=0;NR=6;PP=80;ReadPosRankSum=0.920;SC=CTTAATTTCTACTGTGTTTTG;SOR=0.197;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=6;WE=86180952;WS=86180934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr8	86250709	rs4740049	T	C	3648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=84;PP=2891;SC=AAAATCAATGTCTTATCAAAT;SOR=2.985;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=19;TCR=84;TR=103;WE=86250717;WS=86250699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr8	86253707	rs142346369	T	TA	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=684;ReadPosRankSum=0.699;SC=TATAATTATTTAAAGCAGACA;SOR=2.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=18;WE=86253715;WS=86253697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,21:0.88:24
chr8	86253982	rs1496532	C	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.199;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=157;ReadPosRankSum=0.179;SC=TAGAAACTTACTTGCTTTTAA;SOR=0.021;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=11;WE=86253990;WS=86253972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr8	86254062	rs1496531	T	A	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=93;ReadPosRankSum=0.132;SC=TTGTAAAAAATTCTACAAGGG;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=86254070;WS=86254052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr8	86351997	rs20571	G	A	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.978;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=481;ReadPosRankSum=-0.067;SC=CCAGTCGCCCGTTGAGCTGCA;SOR=0.497;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=65;TCF=40;TCR=25;TR=31;WE=86352005;WS=86351987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,31:0.48:64
chr8	86360458	rs11340759	TC	T	169.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.976;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=158;ReadPosRankSum=1.085;SC=CTTCTGGTGCTCCTTACTCCA;SOR=0.293;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=7;WE=86360466;WS=86360448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr8	86386697	rs112597132	C	T	1078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-7.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.039;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=41;PP=831;ReadPosRankSum=-2.089;SC=AAAGAATGACCAGACAGAGTA;SOR=0.180;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=128;TCF=10;TCR=118;TR=47;WE=86386705;WS=86386687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,47:0.36:132
chr8	86388228	rs2307075	A	C	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=340;ReadPosRankSum=-1.383;SC=GTAGAATATTACTTAAATATT;SOR=0.906;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=16;WE=86388236;WS=86388218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,16:0.36:44
chr8	86389195	rs11780942	C	T	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=120;ReadPosRankSum=1.224;SC=GTTAATTTCTCTTTATTTTGT;SOR=0.321;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=7;WE=86389203;WS=86389185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr8	86389403	rs703	T	C	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=994;ReadPosRankSum=-0.374;SC=TCCTGAATCCTTGGATTACTG;SOR=0.693;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=148;TCF=75;TCR=73;TR=48;WE=86389411;WS=86389393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,51:0.33:155
chr8	87060672	rs3802225	A	G	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.960;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=168;ReadPosRankSum=-0.225;SC=AGGCAAAAATAGTTTTAGAGG;SOR=0.152;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=12;WE=87060680;WS=87060662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,12:0.30:40
chr8	87076150	rs981711	C	G	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=132;ReadPosRankSum=0.038;SC=TGGAGAAGCCCCACTCTAAAC;SOR=0.207;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=10;WE=87076158;WS=87076140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr8	87076520	rs6998760	C	A	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.598;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=1087;ReadPosRankSum=-0.206;SC=ATCTGCAGCGCATGCAAATAC;SOR=0.542;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=177;TCF=96;TCR=81;TR=61;WE=87076528;WS=87076510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,61:0.34:182
chr8	87081699	.	G	A	2113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.269;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.902;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=50;PP=1631;ReadPosRankSum=-0.268;SC=ACTTGGCTCGGAAGCGAGCCA;SOR=1.393;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=113;TCF=46;TCR=67;TR=77;WE=87081707;WS=87081689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,79:0.69:115
chr8	87111368	rs11382900	G	GA	350.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=-1.291;QD=3.62;ReadPosRankSum=-0.814;SOR=0.831;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,29:0.30:97
chr8	87151606	rs2466326	G	C	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=105;ReadPosRankSum=-1.631;SC=TGTACCTAAAGAGTGTGTGTT;SOR=0.321;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=7;WE=87151614;WS=87151596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr8	87155094	rs1483779	T	C	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=181;ReadPosRankSum=-2.128;SC=TATGATCTTTTTTCTTTTTAA;SOR=1.562;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=10;WE=87155102;WS=87155084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr8	87165011	rs10504820	T	C	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.530;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=5;PP=1187;ReadPosRankSum=1.288;SC=TCCAAATAAGTTGATGATCTG;SOR=1.132;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=80;TCF=72;TCR=8;TR=54;WE=87165019;WS=87165001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,54:0.68:79
chr8	87226700	rs9656982	A	G	1589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-5.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.920;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=19;PP=1120;ReadPosRankSum=1.224;SC=ATAGCAAGTCATCTTCTCAAA;SOR=0.236;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=91;TCF=66;TCR=25;TR=60;WE=87226708;WS=87226690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,67:0.65:103
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chr8	87230034	rs141623545	G	A	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.118;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=686;ReadPosRankSum=1.471;SC=GGAAAAGCTCGATCAGCCCAT;SOR=0.228;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=32;WE=87230042;WS=87230024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
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chr8	87241847	rs7814198	G	A	3205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=6;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=47;PP=2628;ReadPosRankSum=1.318;SC=AGCATGCCCCGCCTGAATATG;SOR=0.615;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=184;TCF=115;TCR=69;TR=122;WE=87241855;WS=87241837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,123:0.63:195
chr8	87443026	rs76615540	CCATATATATATA	C	144.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5165;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.712;NF=0;NR=5;PP=884;ReadPosRankSum=0.674;SC=ATATATCTCTCCATATATATA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=87443045;WS=87443016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr8	87452766	rs4961191	A	G	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=4;PP=484;SC=GCCCCTTGTAAGAACCTTATT;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=87452774;WS=87452756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	87453030	rs10092164	A	G	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.178;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=177;ReadPosRankSum=0.718;SC=TTATCTTTGCACTTTTCCATT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=87453038;WS=87453020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr8	87455070	.	TAA	T	93.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.41;ReadPosRankSum=2.655;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr8	87474085	rs7460650	A	G	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=471;ReadPosRankSum=-0.068;SC=GGTAAGTTCAAGAATCCTAAA;SOR=0.681;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=22;WE=87474093;WS=87474075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr8	87480890	rs7017706	C	T	2076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=47;PP=1569;ReadPosRankSum=0.349;SC=GTGCTGGTCTCCCTCAAGTAA;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=56;TCR=79;TR=80;WE=87480898;WS=87480880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,83:0.60:138
chr8	87482324	rs6471352	C	T	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=533;ReadPosRankSum=-0.166;SC=TATAGAATCACGGCCATTTTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=22;WE=87482332;WS=87482314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,23:0.77:30
chr8	87484669	rs13282351	C	T	2414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.330;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=40;PP=1849;ReadPosRankSum=-0.226;SC=CCTAGAAAGACCCACTTCCTG;SOR=0.692;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=132;TCF=69;TCR=63;TR=90;WE=87484677;WS=87484659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,92:0.68:136
chr8	87489562	rs66648775	AAC	A	858.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=785;ReadPosRankSum=0.537;SC=GCCTGTCAAAAACACAAAGAG;SOR=0.892;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=19;WE=87489571;WS=87489552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr8	87497176	rs11539113	G	A	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=527;ReadPosRankSum=-0.300;SC=CATCACTAAGGCAGATTGCAT;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=27;WE=87497184;WS=87497166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,26:0.79:33
chr8	87507366	rs7837569	C	T	128.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5165;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=117;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TGAACAGATACTCAGAAAGAA;SOR=0.941;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=6;WE=87507374;WS=87507356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr8	87517679	rs34596274	C	T	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.083;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=716;ReadPosRankSum=-0.764;SC=AGAAGATATACATATGAGTGT;SOR=0.260;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=67;TCF=27;TCR=40;TR=42;WE=87517687;WS=87517669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,44:0.64:69
chr8	87517700	rs35592191	C	G	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.966;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=737;ReadPosRankSum=0.037;SC=GGAAGGCAGACGGGGTTTATG;SOR=0.150;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=66;TCF=19;TCR=47;TR=41;WE=87517708;WS=87517690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,41:0.63:65
chr8	87520894	rs68008113	C	A	658.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.656;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=480;ReadPosRankSum=0.356;SC=CAGGCAGCTACGGAGGCGGGC;SOR=0.212;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=20;WE=87520902;WS=87520884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,22:0.85:26
chr8	87520948	.	C	CCCGCCTCCTGCACAGCACCTCTT	164.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQRankSum=-0.674;QD=41.18;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr8	87567031	rs2304790	G	A	2850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=8;PP=2354;SC=TAAACACATTGTGCTTGAGAA;SOR=4.199;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=77;TCR=8;TR=85;WE=87567039;WS=87567021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr8	87567193	rs2304789	C	T	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=6.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=30;PP=753;ReadPosRankSum=0.901;SC=GCTGCAGCCACGCAACAGCAG;SOR=0.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=134;TCF=34;TCR=100;TR=40;WE=87567201;WS=87567183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,41:0.30:136
chr8	87567305	rs3816240	A	C	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=32;PP=761;SC=CATAATACAAAGTCAGGGCAA;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=87567313;WS=87567295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	87568644	rs2304787	T	G	3596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=74;PP=2853;SC=AGGCAGTTGATTAGGTGTGCA;SOR=1.928;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=31;TCR=74;TR=105;WE=87568652;WS=87568634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr8	87570665	rs1062850	A	C	9516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=186;PP=2965;SC=CTTTTGTGTTATGTGGAGCAA;SOR=1.718;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=276;TCF=90;TCR=186;TR=276;WE=87570673;WS=87570655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr8	87570728	rs1062851	C	T	4583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=122;PP=2965;SC=CTTTTTACCCCCAGCATTTAT;SOR=5.151;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=9;TCR=122;TR=131;WE=87570736;WS=87570718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr8	87581682	rs10660354	T	TCA	1615.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=39;PP=1877;SC=ACATGCACACTCACACACACC;SOR=6.043;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=2;TCR=51;TR=39;WE=87581690;WS=87581672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
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chr8	87588519	rs974279	T	C	231.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=187;SC=TATCATTTGATGAAGTTTCTG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=87588527;WS=87588509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr8	87666251	rs4961206	T	G	3297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=42;PP=2551;SC=TGAAATTTTGTAGAAGTCCTG;SOR=1.015;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=58;TCR=42;TR=100;WE=87666259;WS=87666241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr8	87679098	rs3735967	G	A	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=1;PP=24;SC=ACTTTTTGTAGCCCAATTAGA;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=87679106;WS=87679088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr8	87679303	rs6471482	A	C	1382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=12;PP=985;SC=GTGGTATAAAACAGCAGTTCC;SOR=2.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=42;WE=87679311;WS=87679293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr8	87680112	rs7815125	T	A	1873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=0;PP=1566;SC=TGCAGGTTATTTAATTTAAAT;SOR=8.121;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=55;TCR=0;TR=55;WE=87680120;WS=87680102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr8	87680406	rs36008065	G	GA	768.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.435;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=2.447;NF=1;NR=41;PP=505;ReadPosRankSum=0.284;SC=GCTTCATAGGGAAAAAAAAAA;SOR=2.235;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=77;TCF=4;TCR=73;TR=42;WE=87680414;WS=87680396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,40:0.54:74
chr8	87683465	rs1441242	C	T	137.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=107;SC=ACAATTCAAACATTAGGTTTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=87683473;WS=87683455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	87751848	.	GTT	G	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.300;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=4.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=0.000;QD=2.12;ReadPosRankSum=1.225;SOR=0.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,6:0.19:31
chr8	87899871	rs66493340	T	G	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.940;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=412;ReadPosRankSum=0.402;SC=TTTTCTGTCATTCAAATGAAT;SOR=1.347;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=79;TCF=32;TCR=47;TR=23;WE=87899879;WS=87899861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,23:0.28:82
chr8	87899960	rs67958512	A	G	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=130;ReadPosRankSum=0.000;SC=TATCACACAGATAAAAACAGT;SOR=0.204;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=9;WE=87899968;WS=87899950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr8	87917236	rs10504828	T	G	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=-0.457;SC=ACGTATATATTGAGTTAAAAA;SOR=0.193;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=5;WE=87917244;WS=87917226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr8	87951714	rs4644279	A	C	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=445;SC=TCTGAAAATGACAAATTTTCT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=15;WE=87951722;WS=87951704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	88622001	rs9692781	C	T	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=451;ReadPosRankSum=0.561;SC=TCTTCAACACCGAAAATTCTA;SOR=0.678;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=24;TCR=25;TR=26;WE=88622009;WS=88621991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr8	88622043	rs9694259	T	G	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=27;PP=951;SC=TCAGATTGCATCATGGACAAA;SOR=2.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=88622051;WS=88622033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	88622592	rs72670872	A	G	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.076;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=68;ReadPosRankSum=-0.681;SC=CATGAATTTCAGAAGCCTTTG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=6;WE=88622600;WS=88622582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr8	88624416	rs371667073	TA	T	196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.57;MQRankSum=-1.235;QD=13.12;ReadPosRankSum=0.743;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr8	88624417	.	A	T	176	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=20;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=56.98;NF=0;NR=9;PP=176;QD=23.4190236164;SC=TTTTTTTTTTAAACTCCCAGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=9;WE=88624425;WS=88624407;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr8	89068596	rs2616495	C	T	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=565;ReadPosRankSum=-0.945;SC=ATATTAAATACATATTATACA;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=23;WE=89068604;WS=89068586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr8	89081541	rs2664347	A	T	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=0;PP=549;SC=TTTGGTGTTTACGAATGCAAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=89081549;WS=89081531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	89081730	rs2616490	T	C	4379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=73;PP=2965;SC=TCTTGGATTATAGATAGAGTG;SOR=0.953;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=57;TCR=73;TR=130;WE=89081738;WS=89081720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr8	89339993	rs35847859	GCACA	G	337.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=56;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=493;ReadPosRankSum=2.116;SC=GCGCGCGCGCGCACACACACA;SOR=1.329;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=16;WE=89340004;WS=89339986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
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chr8	90781953	rs40377	C	T	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.619;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=204;ReadPosRankSum=-0.814;SC=GACTTTTGGACTTTTTAAAGA;SOR=0.136;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=15;WE=90781961;WS=90781943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr8	90792127	rs39506	A	C	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=188;ReadPosRankSum=-1.228;SC=GATTCTCAACACTATTCCATT;SOR=0.560;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=10;WE=90792135;WS=90792117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr8	90921778	rs201460887	C	CT	549.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.45;ReadPosRankSum=0.675;SOR=0.915;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr8	90937070	rs77518049	A	G	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.544;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=1064;ReadPosRankSum=1.486;SC=TTGAAGGGGAAGATTTTCCTT;SOR=1.212;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=133;TCF=68;TCR=65;TR=49;WE=90937078;WS=90937060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,50:0.36:137
chr8	91094086	rs7815279	A	C	656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=16;NR=4;PP=504;SC=CCCCTTTCCCATTTCTCTGTA;SOR=2.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=20;WE=91094094;WS=91094076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	91094983	rs3087750	G	A	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=28;PP=842;SC=GTCCGCGCGAGGGGGAGTGAG;SOR=5.353;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=91094991;WS=91094973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr8	91992746	rs2740774	C	T	1540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=45;PP=1268;SC=AGATGCTTTACATGTATACAA;SOR=7.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=45;WE=91992754;WS=91992736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr8	92021036	rs2054805	C	T	1340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=28;PP=946;SC=GTAAAATAAACAAAGAGAGGA;SOR=1.508;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=92021044;WS=92021026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr8	92082753	rs3808378	C	T	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=24;PP=691;SC=GGGCGCGTGGCGGGTCGATTC;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=92082761;WS=92082743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	92083230	rs28429767	C	T	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=287;SC=TCTGTAGCTGCCTGTTACGTG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=92083238;WS=92083220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	92083424	rs11557571	A	G	5869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=114;NR=65;PP=2965;SC=GGAGGAAGCAACTCACCGAAG;SOR=1.434;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=114;TCR=65;TR=179;WE=92083432;WS=92083414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr8	92083592	rs5893159	CT	C	228.14	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=-0.333;QD=12.01;ReadPosRankSum=-0.290;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
chr8	92090573	rs11786324	G	C	2874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=16;PP=2391;SC=CATGCATTCTGCTTTTCTTAG;SOR=2.888;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=65;TCR=16;TR=81;WE=92090581;WS=92090563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr8	92130316	rs55762572	A	G	3365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=15;PP=2637;SC=ATACTAAAAAATTAAATATAG;SOR=3.281;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=77;TCR=15;TR=92;WE=92130324;WS=92130306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr8	92136728	rs11785003	C	T	1103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;PP=878;ReadPosRankSum=-0.673;SC=CAGTTGACAACACTAAATCTG;SOR=0.317;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=37;WE=92136736;WS=92136718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr8	92139254	rs12544236	T	C	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=0;PP=835;SC=TGTAGAAAAGTAGAAAAGTGA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=92139262;WS=92139244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr8	92301249	rs4734009	G	A	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=0;PP=968;SC=TGTTGAGCAAGTAGAATAAAG;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=92301257;WS=92301239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	92307978	rs10107822	C	T	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=15;PP=426;SC=CACAGCGGCACAGGGAAGGCA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=92307986;WS=92307968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	92346593	.	T	C	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.348;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=271;ReadPosRankSum=-1.666;SC=TTGCTGAGCATTGTGGTCCTT;SOR=0.960;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=19;WE=92346601;WS=92346583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,19:0.31:61
chr8	92352887	rs7012287	C	T	1258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=35;PP=1081;SC=CCTAACTGTACAGCAAGAGTG;SOR=3.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=41;WE=92352895;WS=92352877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr8	92972780	rs2977676	G	A	1828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=36;PP=1490;SC=AAGATCCCAAGTTAATACACT;SOR=1.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=23;TCR=36;TR=59;WE=92972788;WS=92972770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr8	92983041	.	T	C	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.520;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=316;ReadPosRankSum=-1.152;SC=TGCAGCTCCGTCATCGCCTGG;SOR=0.622;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=16;WE=92983049;WS=92983031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,17:0.31:55
chr8	93088151	rs13252280	C	T	5277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=144;NR=8;PP=2965;ReadPosRankSum=1.490;SC=TTTTCTGGTACGTAAGTAAAT;SOR=3.716;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=146;TCR=8;TR=152;WE=93088159;WS=93088141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,162:0.99:163
chr8	93328811	.	G	T	83.19	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.10;QD=20.80;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr8	93328829	rs12114425	G	A	2024.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=43.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.04;MQRankSum=-5.761;QD=27.00;ReadPosRankSum=5.259;SOR=6.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,55:0.73:75
chr8	93328993	rs200192945	C	CGAA	2767.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=55;PP=2800;SC=AAGACGAAGACGAAGAAGAAG;SOR=6.059;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=98;TCF=2;TCR=96;TR=55;WE=93329001;WS=93328983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr8	93904087	rs3780016	T	C	258.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=152;SC=CAAAAACCTTTAAGTCTGGCA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=93904095;WS=93904077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	94359032	rs12677732	A	G	3345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=40;PP=2627;ReadPosRankSum=1.380;SC=ATTATCTCACACCAGCAGGAA;SOR=0.566;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=76;TCR=40;TR=115;WE=94359040;WS=94359022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,116:0.99:117
chr8	94715965	rs6997642	C	G	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=34;PP=1066;SC=CTGGCAAAGACTATGAGGTTT;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=40;WE=94715973;WS=94715955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr8	94738629	rs36117362	G	A	2807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=82;NR=0;PP=2371;SC=TAGGTTTTCCGAAATTCTCTG;SOR=8.885;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=82;TCF=82;TCR=0;TR=82;WE=94738637;WS=94738619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr8	94770615	rs34022540	C	G	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=374;SC=TGAATATTCACTGTAGTTACA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=94770623;WS=94770605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	95143172	rs1051624	T	G	5041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=82;PP=2798;SC=GACGACATACTCCCTCTCCTC;SOR=2.127;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=113;TCF=30;TCR=83;TR=112;WE=95143194;WS=95143162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
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chr8	95158146	rs13263145	G	C	2353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=19;PP=1891;ReadPosRankSum=0.173;SC=ATGTATTTCTGACAACTCACC;SOR=0.706;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=103;TCR=31;TR=83;WE=95158154;WS=95158136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,85:0.61:139
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chr8	95188850	rs2243518	T	C	3182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.114;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=35;PP=2537;ReadPosRankSum=1.713;SC=TCCTTCACTTTTATGGTGATA;SOR=1.039;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=95;TCF=59;TCR=36;TR=93;WE=95188858;WS=95188840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,97:0.99:98
chr8	95206799	rs56129387	G	T	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.816;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=516;ReadPosRankSum=1.164;SC=TCCCTGGTGTGGGGTAGAAAG;SOR=1.329;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=22;WE=95206807;WS=95206789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr8	95390921	rs716770	C	T	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.01;ReadPosRankSum=-1.047;SOR=0.505;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,14:0.22:64
chr8	95412728	.	G	C	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.090;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=24;PP=629;ReadPosRankSum=-0.700;SC=AATCACAATAGAAAAATATTT;SOR=0.855;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=80;TCF=15;TCR=65;TR=29;WE=95412736;WS=95412718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,29:0.35:82
chr8	95419698	rs2291439	A	G	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.702;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=2;PP=945;ReadPosRankSum=1.387;SC=GTGGTTTGCAATTTTGGAAAT;SOR=2.379;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=133;TCF=116;TCR=17;TR=44;WE=95419706;WS=95419688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,45:0.34:134
chr8	95470697	rs2919660	C	A	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=12;PP=373;SC=TAAATCAGAACTCAAACCTAA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=95470705;WS=95470687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	95479879	rs3099398	A	G	2721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=66;PP=2026;SC=GATGGAACAGAAACCCCTCTT;SOR=4.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=6;TCR=66;TR=72;WE=95479887;WS=95479869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr8	95504224	rs3098725	G	A	1046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=30;PP=830;SC=TTATATTTCAGTTTTTTTGTA;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=95504232;WS=95504214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr8	95507328	rs4366055	A	C	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=23;PP=742;SC=TCCTGGGCTCAAGTGATCCTC;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=95507336;WS=95507318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	95524209	rs3099412	C	T	3661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=22;PP=2801;SC=TTTTAAAATACAGTAGCCACA;SOR=2.933;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=92;TCR=22;TR=114;WE=95524217;WS=95524199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr8	95541223	rs957447	C	A	2082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=1;PP=1755;SC=GCTAGAAATTCTTTTGCATTT;SOR=6.963;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=64;TCF=63;TCR=1;TR=64;WE=95541231;WS=95541213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr8	95541302	rs957448	A	G	4368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=47;PP=2965;SC=ACCCACCTTCACCTTCTTCAT;SOR=1.688;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=95;TCR=47;TR=142;WE=95541310;WS=95541292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr8	95541371	rs957446	T	A	4974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;PP=2965;SC=TGTCTACTGTTCGTCGATCAT;SOR=1.810;Source=Platypus;TCF=45;WE=95541379;WS=95541361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr8	95541663	rs3098719	T	A	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=309;SC=AATATTTTGGTTGATATAGTT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=95541671;WS=95541653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	95547005	rs58871154	A	AT	554.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=250;ReadPosRankSum=0.270;SC=TCTTCGAATTATTTTTTTTTT;SOR=1.453;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=23;WE=95547013;WS=95546995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,24:0.89:27
chr8	95547119	rs2304764	T	G	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=23;PP=908;SC=GTGGTGGCGGTGGAGGTGGTG;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=34;WE=95547127;WS=95547109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	95550357	rs1866845	A	T	1765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=0;PP=1448;SC=TAATACCACCATGACACAATT;SOR=7.903;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=47;WE=95550365;WS=95550347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	95559092	rs3133651	T	C	11343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=179;NR=165;PP=2965;SC=GATCTTACTGTTGCCAAGCCA;SOR=0.770;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=345;TCF=180;TCR=165;TR=344;WE=95559100;WS=95559082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,349:1.00:349
chr8	95565538	rs3133658	G	C	6415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=91;PP=2965;SC=AAGGAAAAGTGGAGAACGCCT;SOR=1.001;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=206;TCF=115;TCR=91;TR=206;WE=95565546;WS=95565528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr8	95651239	rs7824334	T	G	3077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=39;PP=2429;SC=GCGCTATCTGTTCCACCCGGC;SOR=1.122;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=59;TCR=39;TR=97;WE=95651247;WS=95651229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr8	95651303	rs12679585	G	A	2828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=40;PP=2308;SC=CCTGGGCCCAGCAGAGCTGAG;SOR=0.839;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=42;TCR=40;TR=82;WE=95651311;WS=95651293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr8	95651573	rs13268847	C	G	4134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=73;PP=2965;SC=AAGTTCAGGACAGGGAAGCAC;SOR=1.170;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=50;TCR=73;TR=123;WE=95651581;WS=95651563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr8	95654043	rs62523409	C	T	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=57;ReadPosRankSum=-0.272;SC=GCACCGGAACCGATGGCGAGT;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=4;WE=95654051;WS=95654041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr8	95655415	rs2303451	T	A	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=137;ReadPosRankSum=1.248;SC=CCAGCACCGGTGTCACCCATC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=8;WE=95655423;WS=95655407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
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chr8	95658287	rs149099719	A	AT	399.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=433;SC=TAAATTTTAAATTTTTCCATT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=12;WE=95658295;WS=95658277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr8	95888307	rs1129152	C	T	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=434;ReadPosRankSum=-0.671;SC=TGTAGGTGGCCATTTTATGTC;SOR=1.264;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=17;WE=95888315;WS=95888297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr8	95902819	rs139407777	ATT	A	797.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQRankSum=2.315;QD=11.24;ReadPosRankSum=2.863;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,24:0.34:71
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chr8	97172487	rs62516290	G	T	1908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=13;PP=1430;SC=CAGCGGGAGGGGAGTCGAGCG;SOR=2.448;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=62;TCF=49;TCR=13;TR=61;WE=97172495;WS=97172477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr8	97245322	.	CA	C	299.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=16;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.671;NF=14;NR=1;PP=183;ReadPosRankSum=0.703;SC=CTCAGAAAAACAAAAAAAAAA;SOR=1.022;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=15;WE=97245330;WS=97245312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr8	97332661	rs3735987	A	G	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.829;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=30;PP=729;ReadPosRankSum=-0.705;SC=CCTCTTGTGTATCAAAGTTCC;SOR=1.464;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=52;TCF=6;TCR=46;TR=33;WE=97332669;WS=97332651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,33:0.63:52
chr8	97342536	rs2280263	A	G	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.336;NF=9;NR=48;PP=1083;ReadPosRankSum=-1.811;SC=AGGCATGGCCATTGTTTAAAA;SOR=0.757;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=157;TCF=25;TCR=132;TR=57;WE=97342544;WS=97342526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,56:0.35:158
chr8	97342582	rs7001397	C	T	1543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.678;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=50;PP=1194;ReadPosRankSum=-0.982;SC=GCTCAGAGCACGTGCCTGTAA;SOR=0.298;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=81;TCF=2;TCR=79;TR=52;WE=97342590;WS=97342572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,54:0.65:83
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chr8	97345590	rs3735986	A	G	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=0;PP=837;SC=ATCAGGGAAGAACCTGTTCCC;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=97345598;WS=97345588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr8	97384408	rs2244423	C	T	1649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.796;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=21;PP=1321;ReadPosRankSum=0.093;SC=ATGTGCTGGACGCTTGGTCAA;SOR=0.861;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=101;TCF=65;TCR=36;TR=61;WE=97384416;WS=97384398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,63:0.62:102
chr8	97384625	rs34027129	A	AG	178.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=167;ReadPosRankSum=-1.125;SC=CCTGGATCTCAGGACCCGACT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=97384633;WS=97384615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
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chr8	97398106	rs369856367	TTC	T,TTCTC	4293.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=2.847;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.319;NF=94,94;NR=23,23;PP=2995,1046;ReadPosRankSum=1.350;SC=GGAAAATAGATTCTCTCTCTC;SOR=1.967;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=160;TCF=124;TCR=36;TR=117,117;WE=97398117;WS=97398096;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.80,0.18:161
chr8	97506373	rs880938	C	G	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=300;SC=GTCCCCGAGCCTGAGCCGCAA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=97506381;WS=97506363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	97605800	rs1126681	C	T	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=220;ReadPosRankSum=1.415;SC=ACGATGACTACGCTTCTGCGT;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=14;WE=97605808;WS=97605790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr8	97620540	rs78894418	T	C	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.053;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=5;PP=743;ReadPosRankSum=-0.361;SC=ATCAATGTAATCTTTCCCTGT;SOR=0.505;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=95;TCF=82;TCR=13;TR=37;WE=97620548;WS=97620530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,41:0.40:103
chr8	97847358	rs1864384	G	T	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=31;PP=782;ReadPosRankSum=1.573;SC=CTGCCAAGGTGGGGGCTTTGG;SOR=1.659;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=32;WE=97847366;WS=97847348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,33:0.67:49
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chr8	98673139	rs35824023	G	GATA	521.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=389;ReadPosRankSum=0.853;SC=AAACACTAGGGATAATCTATC;SOR=1.501;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=11;WE=98673147;WS=98673129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
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chr8	98827636	rs7818662	C	A	1911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=38;PP=1433;SC=CAAGGTAAGCCGCTTGCAGTA;SOR=1.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=25;TCR=38;TR=63;WE=98827644;WS=98827626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
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chr8	98828551	rs2331658	C	T	362.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=9;PP=245;SC=TTTCTTTTTTCTTTTTTTTGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=98828559;WS=98828541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr8	98943545	rs2290471	A	G	2493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.007;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=53;PP=1881;ReadPosRankSum=-0.336;SC=TGATCGTGACAGATGGGAGAC;SOR=0.864;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=152;TCF=72;TCR=80;TR=94;WE=98943553;WS=98943535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,99:0.61:163
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chr8	98954012	rs2513845	T	C	3475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=9;PP=2804;SC=CAGCGGCCCATATGTGCAGCA;SOR=4.595;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=94;TCR=9;TR=103;WE=98954020;WS=98954002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
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chr8	98991221	rs1869609	A	G	2206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=52;PP=2962;ReadPosRankSum=1.183;SC=TAACCCAGATAAAAAAACGTG;SOR=0.749;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=131;TCF=44;TCR=87;TR=79;WE=98991231;WS=98991211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,82:0.61:135
chr8	98991223	rs1869608	A	G	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=35;PP=2301;ReadPosRankSum=-1.072;SC=ACCCAGATAAAAAAACGTGCA;SOR=0.624;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=133;TCF=44;TCR=89;TR=52;WE=98991231;WS=98991211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,53:0.39:136
chr8	98991281	rs1869607	C	T	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.818;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=484;ReadPosRankSum=-1.548;SC=TTTGCTGTTACTGCTGTGGTG;SOR=1.387;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=75;TCF=6;TCR=69;TR=26;WE=98991289;WS=98991271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,26:0.35:75
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chr8	99030280	rs2248014	T	C	3578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=59;PP=2609;SC=TGAACAGTGATGACTCATACA;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=64;TCR=59;TR=122;WE=99030288;WS=99030270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr8	99033328	rs6987112	A	G	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=5.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=0;PP=792;ReadPosRankSum=-0.393;SC=AGAGAGGTGTATTTTCTTTAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=50;TCR=0;TR=33;WE=99033336;WS=99033318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,35:0.67:52
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chr8	99045978	rs2255464	A	C	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=89;ReadPosRankSum=0.260;SC=CAACTGAAGTAAATCCCACGA;SOR=0.124;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=7;WE=99045986;WS=99045968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
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chr8	99118654	rs2242196	C	T	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=19;PP=526;SC=CTTAAATAGCCTATGTTGCAG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=99118662;WS=99118644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	99120794	rs77539382	T	TC	335.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=446;ReadPosRankSum=-0.462;SC=ATAAAACAAATCAGGCAAGTG;SOR=0.622;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=10;WE=99120802;WS=99120790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr8	99121035	rs34451943	GC	G	1484.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=1.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=0.801;QD=23.95;ReadPosRankSum=1.459;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,39:0.63:62
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chr8	99121038	rs34397714	A	AG	1484.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=1.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=0.772;QD=26.05;ReadPosRankSum=1.096;SOR=0.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,37:0.65:57
chr8	99121075	rs35654897	TAA	T	566.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.809;NF=0;NR=19;PP=249;ReadPosRankSum=0.537;SC=GTATAAATTGTAAAAAAAAAA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=19;WE=99121084;WS=99121065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr8	99140084	rs75598961	C	G	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=4.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.04;ReadPosRankSum=-0.506;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
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chr8	99162634	rs7000738	T	C	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=308;ReadPosRankSum=-1.247;SC=TTAGGTTGTTTCCATTTTCCC;SOR=1.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=15;WE=99162642;WS=99162624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr8	99162888	rs4735530	A	G	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.782;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=29;PP=596;ReadPosRankSum=0.221;SC=GGCTTCTCTAATTTGATAATG;SOR=1.265;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=95;TCF=22;TCR=73;TR=36;WE=99162896;WS=99162878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,36:0.35:102
chr8	99205111	rs3735885	T	C	2682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=4;PP=2182;ReadPosRankSum=0.537;SC=TAGCACATGTTAGCTTATAAA;SOR=4.099;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=72;TCR=4;TR=74;WE=99205119;WS=99205101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,80:0.99:81
chr8	99205612	rs3735887	C	T	7561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=153;NR=73;PP=2965;SC=CATTCACTCACCTCCAAGCCT;SOR=1.619;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=227;TCF=154;TCR=73;TR=226;WE=99205620;WS=99205602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr8	99208065	rs13264255	T	C	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=233;SC=GAAACTGATGTTTCTTATATT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=99208073;WS=99208055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr8	99208190	rs3779721	A	C	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=274;ReadPosRankSum=-0.309;SC=ATATAAATACAGTGAGAAAAG;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=14;WE=99208198;WS=99208180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr8	99224534	rs1542289	C	A	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.912;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=349;ReadPosRankSum=-1.035;SC=AAATATAAACCATGAGAAAGG;SOR=2.348;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=16;WE=99224542;WS=99224524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr8	100026275	rs12547849	T	C	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=414;ReadPosRankSum=-0.157;SC=TTTCTACTGATGTATTTTGAG;SOR=0.495;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=21;WE=100026283;WS=100026265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr8	100133706	rs7460625	T	G	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=184;ReadPosRankSum=-0.812;SC=TATATCTCTATCAACTTTAAT;SOR=0.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=12;WE=100133714;WS=100133696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,12:0.27:45
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chr8	100548975	rs16897440	C	T	1425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=1109;ReadPosRankSum=1.503;SC=AAACGTATTCCCAGTCATTAA;SOR=0.607;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=92;TCF=40;TCR=52;TR=51;WE=100548983;WS=100548965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,54:0.57:95
chr8	100975002	rs6468700	A	G	3298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=54;PP=2603;SC=AAGCCTGCACAAAAATAAAAG;SOR=0.787;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=49;TCR=54;TR=103;WE=100975010;WS=100974992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
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chr8	100999575	rs12545059	A	T	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=152;ReadPosRankSum=0.091;SC=AGAAGATAGCAAAATTGGGAT;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=8;WE=100999583;WS=100999565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
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chr8	101149939	rs2453629	G	C	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=27;PP=742;ReadPosRankSum=0.740;SC=CATTCTATAGGATTAACATTT;SOR=0.877;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=50;TCF=7;TCR=43;TR=31;WE=101149947;WS=101149929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,36:0.64:56
chr8	101153024	rs1460934	G	A	3247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.896;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=35;PP=2481;ReadPosRankSum=0.425;SC=TTTTCTTGCCGATCAGTCCTG;SOR=0.413;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=189;TCF=137;TCR=52;TR=116;WE=101153032;WS=101153014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,122:0.63:195
chr8	101157227	rs2514689	G	A	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.507;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=578;ReadPosRankSum=-0.721;SC=AGAGAATGAAGTACTTACATT;SOR=0.027;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=23;WE=101157235;WS=101157217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr8	101163986	rs2453641	T	G	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.509;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=104;ReadPosRankSum=0.431;SC=AAATAATACATTTAAGATAAT;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=101163994;WS=101163978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr8	101196824	rs2453656	G	A	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.044;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=1;PP=1245;ReadPosRankSum=-1.216;SC=TAAATTATACGTTTACATATA;SOR=3.767;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=70;TCF=66;TCR=4;TR=51;WE=101196832;WS=101196814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,52:0.74:70
chr8	101203737	rs3802149	T	C	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.913;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=319;ReadPosRankSum=1.025;SC=AAGTATAGAATGTGATTTCTC;SOR=0.291;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=73;TCF=26;TCR=47;TR=27;WE=101203745;WS=101203727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,28:0.36:78
chr8	101206391	rs17335870	G	A	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-7.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.013;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=11;PP=1189;ReadPosRankSum=-0.813;SC=AGCTGCATCTGAGACTCAAAC;SOR=1.287;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=181;TCF=145;TCR=36;TR=71;WE=101206399;WS=101206381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,73:0.38:194
chr8	101206459	rs56246127	A	AGAC	3226.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FS=11.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.57;ReadPosRankSum=0.686;SOR=1.296;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:188,91:0.33:279
chr8	101206531	rs17335911	G	A	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=38;PP=794;ReadPosRankSum=-2.103;SC=TATGTAAAAAGCTGCCTTTTA;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=183;TCF=58;TCR=125;TR=55;WE=101206539;WS=101206521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,55:0.30:186
chr8	101225241	rs11280812	C	CCCGCGGCCT	1366.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=10;NR=2;PP=2338;SC=GTCCTGCACCCCCGCGGCCTC;SOR=3.690;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=12;WE=101225249;WS=101225231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	101225298	rs3098659	C	T	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.949;NF=43;NR=15;PP=1137;ReadPosRankSum=-0.686;SC=CCCTCACTTCCCGCATCCACT;SOR=0.601;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=98;TCF=74;TCR=24;TR=58;WE=101225306;WS=101225288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,59:0.60:98
chr8	101225559	rs2514681	C	G	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.393;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=391;ReadPosRankSum=1.657;SC=AGAACCCTGCCGGCCTGAAGA;SOR=0.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=31;TCF=16;TCR=15;TR=20;WE=101225567;WS=101225549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr8	101225838	rs2514682	C	G	150.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=1;PP=115;SC=CTGGGAATGCCGGCATGTTCC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=101225846;WS=101225833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	101232421	rs141450399	TCAGTACTG	T	202.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.07;ReadPosRankSum=0.591;SOR=0.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,8:0.20:40
chr8	101232701	rs2919471	T	C	2929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=73;PP=2329;SC=AGTTGTTTTATACTGTTTTTC;SOR=6.067;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=76;TCF=3;TCR=73;TR=76;WE=101232709;WS=101232691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
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chr8	101253184	rs1788190	G	A	1751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=38;PP=1452;ReadPosRankSum=2.096;SC=AGGACCTTTCGGACACACCAA;SOR=0.697;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=33;TCR=59;TR=59;WE=101253192;WS=101253174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,61:0.62:99
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chr8	101648308	rs2155881	T	C	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.672;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=339;ReadPosRankSum=-0.108;SC=ATTACTAAAGTCTCCTTTAGG;SOR=3.912;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=14;WE=101648316;WS=101648298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
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chr8	101721839	rs202074479	C	A	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=48.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.55;MQRankSum=-3.342;QD=1.27;ReadPosRankSum=-1.783;SOR=3.318;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,29:0.13:224
chr8	101722092	rs1693557	T	C	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=719;ReadPosRankSum=-0.866;SC=ATCTTGTATTTACCCATTGAG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=26;WE=101722100;WS=101722082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
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chr8	101937370	rs964919	A	T	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.83;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr8	101937455	rs964917	T	C	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=12;PP=368;SC=GGCAGCAATATTTTAAGTTTG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=101937463;WS=101937445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr8	103273341	rs72681163	T	C	4334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.250;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=57;PP=2962;ReadPosRankSum=0.031;SC=AATAGCCTCATTGGATCACAC;SOR=0.484;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=233;TCF=153;TCR=80;TR=156;WE=103273349;WS=103273331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,159:0.66:240
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chr8	103297707	rs2293982	T	C	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=322;ReadPosRankSum=-0.721;SC=CAAAAAAAAATAGTGGAATGG;SOR=0.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=49;TCR=3;TR=17;WE=103297715;WS=103297687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,17:0.31:54
chr8	103301555	rs2168689	T	C	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=343;ReadPosRankSum=1.141;SC=GAATATATAATAAACATCTAC;SOR=0.811;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=16;WE=103301563;WS=103301545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
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chr8	103312181	rs4483125	C	T	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=379;ReadPosRankSum=-2.075;SC=CTTTCATGACCTGCTCTTTTT;SOR=0.636;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=52;TCR=8;TR=22;WE=103312189;WS=103312171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,24:0.38:63
chr8	103316228	rs71268561	G	GT	529.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.664;NF=12;NR=4;PP=386;ReadPosRankSum=-1.768;SC=TCTGTACTTGGTTTTTTCCTC;SOR=0.540;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=16;WE=103316236;WS=103316218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr8	103316437	rs2925786	G	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.699;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=118;ReadPosRankSum=0.183;SC=TTAAGTTTTAGAACTAATACA;SOR=0.030;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=8;WE=103316445;WS=103316427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr8	103316494	rs2925787	T	C	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=79;ReadPosRankSum=-0.545;SC=ATATTTAGTATTCTAATTCAC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=103316502;WS=103316484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr8	103317265	rs3018537	A	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=81;ReadPosRankSum=-1.433;SC=CATTTTCAAAATTGCCTAAAA;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=6;WE=103317273;WS=103317255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
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chr8	103372743	rs6468823	G	A	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=1;PP=419;SC=GAGGGTTACCGAAATCAAAAC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=103372751;WS=103372733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	103373304	rs10090707	A	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.741;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=130;ReadPosRankSum=0.321;SC=GCACAATTCTATTTTAACAGT;SOR=0.184;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=9;WE=103373312;WS=103373294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
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chr8	103541489	rs35497288	A	C	1754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=1.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.37;ReadPosRankSum=0.042;SOR=0.450;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,48:0.67:72
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chr8	104076923	rs151079473	AT	A	505.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=2.121;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.359;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,31:0.31:99
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chr8	104145625	rs2515189	A	G	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=459;ReadPosRankSum=-0.059;SC=GGACAGAAAGAAGACCCAAAG;SOR=0.976;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=19;WE=104145633;WS=104145615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr8	104153194	.	A	G	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=0.000;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=2.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.39;ReadPosRankSum=0.690;SOR=1.155;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,13:0.10:126
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chr8	104166746	rs57787067	C	T	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=1.169;SC=GTTATTCTTCCACTCAAAGCC;SOR=2.925;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=5;WE=104166754;WS=104166736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr8	104166902	rs35605502	G	GC	2244.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=20;PP=2231;SC=TGATCCCACAGCCCACCTGTC;SOR=1.946;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=54;WE=104166910;WS=104166892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr8	104312341	rs3736047	A	G	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.537;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=440;ReadPosRankSum=2.068;SC=AGAAAATGGAAATGTTTACAT;SOR=0.387;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=74;TCF=67;TCR=7;TR=24;WE=104312349;WS=104312331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,24:0.32:76
chr8	104312432	rs827528	A	G	2479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.002;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=52;PP=1951;ReadPosRankSum=-0.346;SC=TCCCAGATGTATGAAAATGGC;SOR=0.896;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=153;TCF=71;TCR=82;TR=93;WE=104312440;WS=104312422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,95:0.59:161
chr8	104319947	rs11312808	GT	G	125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=3.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.40;ReadPosRankSum=0.049;SOR=0.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr8	104331088	rs3104026	G	C	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=136;ReadPosRankSum=1.086;SC=ATGTTAGTGAGAAGCTTTCAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=8;WE=104331096;WS=104331078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr8	104336672	rs827550	G	A	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=0;PP=663;ReadPosRankSum=-0.515;SC=CAATAAAAATGTTGATTTCAT;SOR=1.954;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=29;WE=104336680;WS=104336662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,31:0.72:43
chr8	104337096	rs3808554	A	G	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=10.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.09;ReadPosRankSum=1.404;SOR=1.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,64:0.29:220
chr8	104337367	rs3808553	A	C	2230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.37;ReadPosRankSum=-0.055;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:249,101:0.29:350
chr8	104343686	rs1053917	G	A	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.740;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=832;ReadPosRankSum=0.314;SC=TTGTTCACCCGGTTTCAGGAG;SOR=0.819;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=111;TCF=49;TCR=62;TR=41;WE=104343694;WS=104343676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,41:0.38:109
chr8	104343822	rs2934725	A	G	1216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=31;PP=963;SC=TCACTGTTACATTCTTCTTTT;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=38;WE=104343830;WS=104343812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr8	104384988	rs13278335	G	A	244.22	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=11;PP=231;ReadPosRankSum=-0.674;SC=CAGAGCTACCGTAGTCCTTGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=11;WE=104384996;WS=104384978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr8	104388276	rs6468870	A	T	441.96	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5021;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=458;ReadPosRankSum=-0.457;SC=ATTTTTTTTTAACTAAAAGAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=20;WE=104388284;WS=104388266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,20:0.91:22
chr8	104390224	rs2687364	T	A	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.350;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=372;ReadPosRankSum=-0.570;SC=TAGAAAATGTTAATTAAATCC;SOR=0.409;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=83;TCF=72;TCR=11;TR=25;WE=104390232;WS=104390214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,27:0.31:87
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chr8	104412830	rs10103739	C	T	2234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.997;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=59;PP=1726;ReadPosRankSum=0.380;SC=CTTGAAAACACGGAAGTTCTA;SOR=1.179;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=121;TCF=33;TCR=88;TR=77;WE=104412838;WS=104412820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,82:0.66:125
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chr8	104454794	rs3098214	A	C	32.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
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chr8	105459431	rs76239895	C	T	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=265;ReadPosRankSum=-0.174;SC=ACGGAAAATCCATTTCTGGAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=14;WE=105459439;WS=105459421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr8	105459793	rs7821992	C	A	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=137;ReadPosRankSum=-0.402;SC=TAATTTCAACCTTCTCTAAAA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=8;WE=105459801;WS=105459783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
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chr8	105479149	rs2959023	A	G	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=283;ReadPosRankSum=-0.566;SC=GCGCCGCCATAGCGAGGGGCG;SOR=0.420;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=13;WE=105479157;WS=105479139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr8	105845706	rs145596017	T	TTTTTTTTC	1556.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=16;PP=1170;SC=AATTTTTTCCTTTTTTTTCTA;SOR=1.819;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=20;WE=105845714;WS=105845696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	105907461	rs2290865	G	T	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=143;ReadPosRankSum=0.192;SC=CAAAAGAAAAGTAGCTGCAGG;SOR=0.297;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=9;WE=105907469;WS=105907453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr8	105907786	rs3214884	GT	G	618.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=523;ReadPosRankSum=-0.675;SC=ATGGAAAACAGTTAATTTTAA;SOR=0.612;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=61;TCF=8;TCR=53;TR=17;WE=105907794;WS=105907776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,23:0.34:68
chr8	106431029	rs11783971	A	G	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.203;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=417;ReadPosRankSum=-0.377;SC=TCTTTACCAGATAGTTAATTC;SOR=1.058;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=65;TCF=53;TCR=12;TR=22;WE=106431037;WS=106431019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,23:0.34:68
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chr8	106573578	rs3735953	C	T	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.038;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=6;PP=633;ReadPosRankSum=0.695;SC=CACTTCTGTTCCTTTGTCTGC;SOR=0.938;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=114;TCF=93;TCR=21;TR=36;WE=106573586;WS=106573568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,37:0.31:119
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chr8	107630536	rs3134136	C	T	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.76;ReadPosRankSum=0.714;SOR=0.052;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,5:0.17:30
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chr8	107695648	rs3102433	C	T	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=29;ReadPosRankSum=-1.098;SC=TTTATATGTGCTTTTAACAAA;SOR=0.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=4;WE=107695656;WS=107695638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
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chr8	107754473	rs1681904	G	A	2139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=28;PP=1724;ReadPosRankSum=-0.637;SC=TAGCATCTGAGCCACTGAAAG;SOR=0.868;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=132;TCF=84;TCR=48;TR=82;WE=107754481;WS=107754463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,82:0.61:134
chr8	107754583	rs1784468	T	G	2791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.782;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=73;PP=2199;ReadPosRankSum=0.873;SC=TTATAAAGAGTTGACATAACA;SOR=3.255;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=89;TCF=14;TCR=75;TR=86;WE=107754591;WS=107754573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,89:0.99:90
chr8	107757885	rs1681905	G	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=108;ReadPosRankSum=-0.038;SC=CCTTCTGTGCGGAGCTTTTTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=107757893;WS=107757875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
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chr8	107782395	rs11996466	G	A	985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.115;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=31;PP=634;ReadPosRankSum=1.645;SC=GGCCCTCCCCGCTTTCCTTTT;SOR=0.161;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=108;TCF=17;TCR=91;TR=40;WE=107782403;WS=107782385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,44:0.39:112
chr8	108315277	rs4472483	T	G	176.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=142;SC=AAAAGGTGTGTGGATTGGGGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=108315285;WS=108315273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	108335042	rs7009753	C	T	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.552;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=255;ReadPosRankSum=-0.888;SC=CAGCAATATACATTCTCAATC;SOR=0.776;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=40;TCF=18;TCR=22;TR=15;WE=108335050;WS=108335032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr8	108348256	rs72672536	A	G	65.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.45;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr8	108359026	rs10156232	G	A	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=226;ReadPosRankSum=1.342;SC=AGCATGTCAGGCAGTCATTGT;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=10;WE=108359034;WS=108359016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr8	108970264	rs3039298	T	TCA	2573.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.564;NF=44;NR=9;PP=2474;ReadPosRankSum=-0.438;SC=GCGGGAGAATTCAGGAAGCAC;SOR=0.664;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=79;TCF=67;TCR=12;TR=53;WE=108970272;WS=108970254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,63:0.78:81
chr8	108970367	rs601558	A	G	3202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.012;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=64;PP=2450;ReadPosRankSum=-0.465;SC=GGTTGGACACAGTATTGTGTC;SOR=0.358;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=172;TCF=90;TCR=82;TR=122;WE=108970375;WS=108970357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,126:0.72:175
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chr8	109094747	rs10955475	C	T	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.510;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=420;ReadPosRankSum=1.613;SC=AAGCCCACCACGCACCTTTGG;SOR=1.154;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=65;TCF=56;TCR=9;TR=22;WE=109094755;WS=109094737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,22:0.33:66
chr8	109215368	rs630492	T	C	1390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.274;NF=28;NR=30;PP=1082;ReadPosRankSum=3.014;SC=CACAGGGAAATTGATCCTATA;SOR=0.705;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=75;TCR=79;TR=58;WE=109215376;WS=109215358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,61:0.39:158
chr8	109215441	rs72205512	TGCACTGTATAGAGATGACAATA	T	981.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=1.350;QD=12.75;ReadPosRankSum=1.792;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,28:0.36:77
chr8	109245991	rs612744	G	A	1161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=25;PP=863;SC=TCTCTTGAGCGCAAGAGTTCA;SOR=2.242;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=34;WE=109245999;WS=109245981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr8	109246032	rs587340	C	A	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=294;SC=GGCACCACTGCACTCTTACCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=109246040;WS=109246022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	109247189	.	CAAA	C	361.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.88;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	109252471	rs16877534	C	T	147.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=119;SC=GTCCCCGATCCCTAATTTCTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=109252479;WS=109252461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	109254262	rs615233	C	T	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=15;PP=763;SC=TACGATAAACCATTAACATTC;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=27;WE=109254270;WS=109254252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	109254677	rs627392	C	T	2637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=78;PP=2204;SC=CAAATAGATACATATACACAA;SOR=8.814;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=78;TCF=0;TCR=78;TR=78;WE=109254685;WS=109254667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr8	109260776	rs4735053	A	G	8486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=181;NR=112;PP=2965;SC=TACAGACACCACCTTTCGGCC;SOR=1.316;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=293;TCF=181;TCR=112;TR=293;WE=109260784;WS=109260766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr8	109455802	rs3737501	G	A	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=4;PP=1153;SC=ATGAGAAAAAGCTACGTAACT;SOR=4.174;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=38;TCR=4;TR=42;WE=109455810;WS=109455792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr8	109455863	rs3737502	C	T	2822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=34;PP=2302;SC=GCCCTCTCACCCCGCTGCCTC;SOR=1.191;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=54;TCR=34;TR=88;WE=109455871;WS=109455853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr8	109462215	rs35895559	C	CT	69.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=0.904;QD=4.36;ReadPosRankSum=-0.272;SOR=0.340;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr8	109462791	rs4540386	A	G	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=20;PP=545;SC=GACTTAATGTATGGCTTATAT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=109462799;WS=109462781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	109468230	rs10646253	T	TAGAA	1042.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=16;PP=1085;SC=GAGGAAATAATAGATACATAA;SOR=2.494;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=17;WE=109468238;WS=109468220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	109488937	rs1871685	A	G	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=2;PP=702;SC=CTGAATGCCTATGGTATGATG;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=109488945;WS=109488927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr8	109491399	rs2252767	A	T	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=11;PP=284;SC=TAGTTTTGTTACTACAAACTA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=109491407;WS=109491389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	109498656	rs10111934	T	G	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=392;SC=CAATGTTAAGTTTCATTAACA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=109498664;WS=109498646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	109498717	.	C	CTT	83	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=17;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=61.74;NF=5;NR=1;PP=83;QD=14.3333333333;SC=CCTAATTGAGCTTTTTTTTTT;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=6;WE=109498725;WS=109498707;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:25,6:0.19:31
chr8	110293184	rs3830706	TA	T	577.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.05;ReadPosRankSum=-1.352;SOR=2.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,28:0.78:36
chr8	110302047	rs2980619	T	G	1740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.981;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=19;PP=1401;ReadPosRankSum=-0.637;SC=GAACAAATGTTAAAGACTTGT;SOR=0.478;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=89;TCF=63;TCR=26;TR=61;WE=110302055;WS=110302037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,61:0.67:91
chr8	110376861	rs7008687	G	A	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.314;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.143;NF=18;NR=5;PP=466;ReadPosRankSum=1.018;SC=CTATAAGAGGGGAAGGTATCG;SOR=0.146;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=23;WE=110376883;WS=110376851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr8	110376893	.	TGCCAAGGTTGAGGTA	T	495.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=96.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.01;MQRankSum=1.391;QD=9.01;ReadPosRankSum=-5.783;SOR=6.438;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr8	110412519	rs1379369	G	A	2795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.740;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=72;PP=2292;ReadPosRankSum=1.405;SC=TCTACATCAAGGGTGATGACC;SOR=0.849;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=33;TCR=109;TR=94;WE=110412527;WS=110412509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,96:0.64:149
chr8	110413824	rs2061294	C	T	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=43;PP=1168;ReadPosRankSum=1.406;SC=AAGAGTAAGGCTTTTTCCTGT;SOR=0.829;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=18;TCR=84;TR=52;WE=110413832;WS=110413814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,52:0.50:104
chr8	110416813	rs1457286	C	T	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=2;PP=766;ReadPosRankSum=-0.488;SC=TGCAGGAGTACAGATTAAGTG;SOR=1.199;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=59;TCF=55;TCR=4;TR=35;WE=110416821;WS=110416803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,36:0.60:60
chr8	110425594	rs4604408	G	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=132;ReadPosRankSum=-0.241;SC=TTGAATTGTTGTGAAACAATG;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=110425602;WS=110425584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr8	110437384	rs4735133	A	G	3253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.523;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=70;PP=2485;ReadPosRankSum=0.279;SC=TCAAAAATTCATATTCAAAGA;SOR=0.622;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=205;TCF=92;TCR=113;TR=127;WE=110437392;WS=110437374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,132:0.63:211
chr8	110448635	rs10093885	A	G	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.918;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=551;ReadPosRankSum=-2.139;SC=TGGAAATGAAACCTGCAATGT;SOR=1.609;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=22;WE=110448643;WS=110448625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr8	110448873	rs59237049	G	A	238.53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.9988;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=189;ReadPosRankSum=-0.842;SC=ACAAAATATTGTCTCCACATT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=9;WE=110448881;WS=110448863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr8	110453466	rs11785973	T	C	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=482;ReadPosRankSum=-0.608;SC=TGACAAAATGTTTGCTTTTTA;SOR=0.566;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=20;WE=110453474;WS=110453456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr8	110455321	rs1673408	C	A	2970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.129;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=68;PP=2288;ReadPosRankSum=0.738;SC=GTTTGTGGGTCGCTCTGAAGC;SOR=0.541;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=162;TCF=52;TCR=110;TR=103;WE=110455329;WS=110455311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,110:0.65:169
chr8	110457011	rs72687015	A	G	3630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=58;PP=2884;ReadPosRankSum=0.647;SC=TTGACTGTCTACAACCTGGGC;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=220;TCF=122;TCR=98;TR=137;WE=110457019;WS=110457001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,136:0.62:221
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chr8	110460488	rs1673407	G	T	3663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.327;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=67;PP=2828;ReadPosRankSum=1.125;SC=TGATAGTGTGGTGCAGTGCAT;SOR=0.489;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=195;TCF=85;TCR=110;TR=122;WE=110460496;WS=110460478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,132:0.64:205
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chr8	110476341	rs138148833	AAATAT	A	1132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.094;NF=26;NR=0;PP=1160;ReadPosRankSum=1.568;SC=TGGAAGAAATAAATATATTAA;SOR=1.464;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=26;WE=110476353;WS=110476331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
chr8	110476993	rs1673398	A	G	2707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.017;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=56;PP=2082;ReadPosRankSum=-1.213;SC=CAGTGCCTGCACCTGCAATAT;SOR=0.996;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=145;TCF=66;TCR=79;TR=97;WE=110477001;WS=110476983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,103:0.66:156
chr8	110477352	rs118074609	A	C	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.832;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=22;PP=734;ReadPosRankSum=-0.966;SC=GGAGTTTGTAATGACAGATGT;SOR=0.257;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=158;TCF=98;TCR=60;TR=46;WE=110477360;WS=110477342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,45:0.28:163
chr8	110489620	rs1783148	A	T	5010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.566;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=120;PP=2962;ReadPosRankSum=0.120;SC=GACCAGCCACATATAAGTACA;SOR=0.638;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=240;TCF=70;TCR=170;TR=172;WE=110489628;WS=110489610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,175:0.71:246
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chr8	110492949	rs1026437	G	C	1585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=48;PP=1226;ReadPosRankSum=1.490;SC=CTATTAAGCAGCATTAAAATA;SOR=0.588;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=93;TCF=8;TCR=85;TR=53;WE=110492957;WS=110492939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,55:0.58:95
chr8	110495192	rs2844254	T	A	2016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.835;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=11;PP=1553;ReadPosRankSum=1.777;SC=GGTGAATAAGTAGGAGTGTGC;SOR=0.352;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=105;TCF=90;TCR=15;TR=70;WE=110495200;WS=110495182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,72:0.67:108
chr8	110499063	rs17375750	T	G	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.781;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=39;PP=1021;ReadPosRankSum=-1.180;SC=TGGTATCAATTCAGTTTATTT;SOR=0.270;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=64;TCF=6;TCR=58;TR=45;WE=110499071;WS=110499053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,44:0.69:64
chr8	110504088	rs56235913	CTTT	C	2490.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.077;HP=14;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.320;NF=28;NR=20;PP=1445;ReadPosRankSum=1.527;SC=TTCTTTTTTTCTTTTTTTAAA;SOR=0.428;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=81;TCF=49;TCR=32;TR=48;WE=110504098;WS=110504078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,63:0.71:89
chr8	110505886	rs2607628	C	T	2871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.182;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=14;PP=2361;ReadPosRankSum=0.203;SC=AATCATTGCACTAGATAAATA;SOR=1.483;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=152;TCF=126;TCR=26;TR=101;WE=110505894;WS=110505876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,103:0.68:152
chr8	110516527	rs720139	T	C	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.463;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=181;ReadPosRankSum=-0.313;SC=TTAGAGAAAATAATCACTTAT;SOR=0.275;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=9;WE=110516535;WS=110516517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
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chr8	110520521	rs79467657	A	G	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.720;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=553;ReadPosRankSum=1.611;SC=GTAAACTACAATTACTCAAAA;SOR=1.414;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=74;TCF=2;TCR=72;TR=28;WE=110520529;WS=110520511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,29:0.36:81
chr8	110523207	rs72669109	A	T	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=494;ReadPosRankSum=0.121;SC=GATTATTTGCATGTTATTTCT;SOR=0.829;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=21;WE=110523215;WS=110523197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr8	110527556	rs55932317	A	T	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.847;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=26;PP=719;ReadPosRankSum=-0.351;SC=GAAAAAATACAGTACACATGG;SOR=0.376;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=32;WE=110527564;WS=110527546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,31:0.74:42
chr8	110535444	rs10573846	CT	C	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.65;ReadPosRankSum=-0.534;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
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chr8	110569827	rs2844231	G	A	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=389;ReadPosRankSum=-0.355;SC=TATATTATCTGTTGTTGTGTA;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=17;WE=110569835;WS=110569817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
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chr8	110620037	rs376478633	TCACACACACA	T	86.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.68;ReadPosRankSum=1.150;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
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chr8	113241088	rs1592624	T	G	1236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=27;PP=868;SC=TGAGGTTGATTTGAAGAATTT;SOR=2.191;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=35;WE=113241096;WS=113241078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
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chr8	113254071	.	G	GCA,GCACA	1051.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.42;QD=61.87;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,9,8:0.53,0.47:17
chr8	113254073	rs1007815	G	A	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.31;QD=40.92;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	113254087	rs28698529	G	A	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.77;QD=47.13;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	113256845	rs28684567	G	T	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.849;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=220;ReadPosRankSum=0.231;SC=CTATAGATATGTTAAGAAAAA;SOR=0.235;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=16;WE=113256853;WS=113256835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,19:0.35:54
chr8	113256865	rs28369252	G	C	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-5.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=171;ReadPosRankSum=-0.627;SC=ATTTGAGACAGGAGTCACAAT;SOR=0.287;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=13;WE=113256873;WS=113256855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr8	113259132	rs1895014	A	T	220.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=181;SC=AATATGTTTTATAATCTAAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=113259140;WS=113259122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr8	113266343	rs7830950	C	T	1312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=0;PP=1086;SC=CACTCTTTTGCTGTCTGTTAC;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=39;WE=113266351;WS=113266333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	113267709	rs7006723	A	G	2063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=55;PP=1728;SC=ACAGCAGAGTACACAGTTTGG;SOR=3.947;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=7;TCR=55;TR=62;WE=113267717;WS=113267699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr8	113299275	rs10505181	A	G	1795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.031;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=10;PP=1307;ReadPosRankSum=-1.108;SC=AATATATTTAATTTCTGCTTG;SOR=0.319;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=92;TCF=78;TCR=14;TR=56;WE=113299283;WS=113299265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,60:0.62:97
chr8	113308243	rs4876462	A	G	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=537;ReadPosRankSum=-0.532;SC=CCGCTGAAATACGTTATAAAG;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=21;WE=113308251;WS=113308233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr8	113323089	rs10505180	T	C	1192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.066;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=4;PP=877;ReadPosRankSum=-0.924;SC=ATGAAAAGAGTTCACAATATG;SOR=1.595;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=38;WE=113323097;WS=113323079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,42:0.68:62
chr8	113323471	rs17637578	A	G	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.793;NF=0;NR=24;PP=568;ReadPosRankSum=-0.325;SC=ACACCTATACAGCGACTAGTG;SOR=1.432;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=24;WE=113323479;WS=113323461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr8	113347769	rs62514406	A	T	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=48;PP=1225;ReadPosRankSum=-0.054;SC=TTTGAACCGTATTTAATAAAA;SOR=1.085;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=73;TCF=6;TCR=67;TR=52;WE=113347777;WS=113347759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,52:0.70:74
chr8	113363350	rs7003308	T	C	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=299;ReadPosRankSum=-0.812;SC=CTTTATAGTCTTTTTTTTTAC;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=14;WE=113363358;WS=113363340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr8	113363511	rs7003500	T	C	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.298;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=449;ReadPosRankSum=-0.172;SC=TACACATACATAAAAAGTTTA;SOR=0.141;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=20;WE=113363519;WS=113363501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr8	113420495	rs35988509	TG	T	3038.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=7;PP=2967;SC=GAATACATCATGGGAAAATTA;SOR=3.937;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=77;TCF=69;TCR=8;TR=72;WE=113420503;WS=113420485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr8	113485014	rs11783041	A	C	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.499;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=144;ReadPosRankSum=-0.987;SC=TCTTCATATAAAAAATATATG;SOR=0.204;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=12;WE=113485022;WS=113485004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,13:0.24:55
chr8	113516209	rs10955625	G	A	1108.03	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=47;PP=876;ReadPosRankSum=2.102;SC=TGCTAAAACTGAAAAAAAAAA;SOR=1.542;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=60;TCF=4;TCR=56;TR=51;WE=113516217;WS=113516198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,47:0.87:54
chr8	113585637	rs7014796	A	G	1773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=2;PP=1421;SC=TAATAATCAAATATTGGATAT;SOR=5.670;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=46;TCR=2;TR=48;WE=113585645;WS=113585627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
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chr8	113842114	rs140103189	GCACACACA	G	337.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=1797;SC=TTGTCTCTCTGCACACACACA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=12;WE=113842129;WS=113842104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr8	116635688	rs2737219	G	A	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=338;SC=CTCCCCTAGCGAGTCGTAAGT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=116635696;WS=116635678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	116635872	rs35329862	T	TA	985.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.425;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=1065;ReadPosRankSum=1.046;SC=CATGTGGCTTTAGAGTGCTTT;SOR=0.393;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=26;WE=116635880;WS=116635862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,30:0.70:43
chr8	116635942	rs2721939	C	T	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=15;PP=459;SC=TCTTAGAAGACGCTCAGAAGA;SOR=2.948;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=116635950;WS=116635932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	117657377	rs16888614	T	C	1508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.918;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=37;PP=1209;ReadPosRankSum=1.678;SC=GCCATAATGTTCCACAAATTG;SOR=0.854;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=83;TCF=27;TCR=56;TR=54;WE=117657385;WS=117657367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,54:0.65:83
chr8	117782385	rs4514005	C	T	1853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=0;PP=1603;SC=TTTTTTACACCTTATGTAAAC;SOR=7.978;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=53;WE=117782393;WS=117782375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr8	117791733	rs979866	T	C	5526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=116;NR=45;PP=2965;SC=GGATCTCTGCTAGCTTACTAA;SOR=1.995;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=116;TCR=45;TR=161;WE=117791741;WS=117791723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr8	117799012	rs1867840	A	G	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=449;SC=TTTTTACTTGAATTATTTTAT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=117799020;WS=117799002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	117887121	rs28365847	GC	G	1096.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.244;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.394;NF=17;NR=33;PP=689;ReadPosRankSum=-0.557;SC=GCCAGCCCAAGCCCCCCCCTC;SOR=0.500;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=153;TCF=45;TCR=108;TR=50;WE=117887129;WS=117887111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,52:0.34:151
chr8	118165149	rs6469675	A	G	1493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.383;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=18;PP=1302;ReadPosRankSum=0.053;SC=GCATTCTGGGACCTTAACACA;SOR=1.134;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=81;TCF=53;TCR=28;TR=56;WE=118165157;WS=118165139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,54:0.68:79
chr8	118184783	rs13266634	C	T	1591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.401;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=6;PP=1319;ReadPosRankSum=-0.978;SC=AGCAGCCAGCCGGGACAGCCA;SOR=1.140;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=77;TCF=67;TCR=10;TR=51;WE=118184791;WS=118184773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,54:0.67:81
chr8	118185025	rs3802177	G	A	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=36;PP=826;ReadPosRankSum=0.758;SC=AGAAATTCATGTCATGGTGCA;SOR=1.569;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=58;TCF=2;TCR=56;TR=37;WE=118185033;WS=118185015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,39:0.66:59
chr8	118185041	rs2466295	C	T	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.260;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=32;PP=733;ReadPosRankSum=0.899;SC=GTGCAATGCACATTTTATCTA;SOR=3.202;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=32;WE=118185049;WS=118185031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,33:0.70:47
chr8	118185063	rs2466294	C	G	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=559;ReadPosRankSum=1.435;SC=TTATTTAGTTCCATTCACCAT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=23;WE=118185071;WS=118185053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,23:0.74:31
chr8	118811806	rs71739430	CT	C	77.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.035;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr8	118819578	rs7837891	C	T	3947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=89;PP=2965;SC=CCACAATCCTCTCAGGGAAGC;SOR=2.381;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=29;TCR=89;TR=118;WE=118819586;WS=118819568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr8	118825354	rs4382503	C	T	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=397;SC=CATTTCCCATCAATGCAGATG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=118825362;WS=118825344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	118830820	rs10955837	T	C	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=31;PP=940;SC=TATTTATGTATGCCTCCAACC;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=118830828;WS=118830810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	118832020	rs17439693	G	A	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.870;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=278;ReadPosRankSum=-0.422;SC=TGAATTTGGAGGGGGGCTTTA;SOR=0.339;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=16;WE=118832028;WS=118832010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
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chr8	119209773	rs2514743	C	T	2118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=8;PP=1631;SC=CACAGCAAAGCAAGATTTTTC;SOR=3.643;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=58;TCR=8;TR=66;WE=119209781;WS=119209763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
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chr8	120569877	rs2305129	T	G	248.56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.7370;FS=5.229;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=198;ReadPosRankSum=1.036;SC=TCACGCACCCTAGCTGTGTGC;SOR=1.996;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=9;WE=120569885;WS=120569867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr8	120577030	rs3816330	A	G	1267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=1;PP=1041;ReadPosRankSum=-1.027;SC=TGGGACTTAAAAATCACACAC;SOR=1.995;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=67;TCF=64;TCR=3;TR=40;WE=120577038;WS=120577020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,42:0.62:68
chr8	120580546	rs200158900	T	TA	605.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=18;PP=408;SC=CTATATCAGTTAAAAAAAAAA;SOR=3.258;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=20;WE=120580554;WS=120580536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	120580640	rs2243749	G	T	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.791;NF=1;NR=10;PP=240;ReadPosRankSum=0.000;SC=TCCTAACTGCGTTATACAACA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=11;WE=120580648;WS=120580630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr8	120583148	rs2305125	G	A	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.165;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=31;PP=718;ReadPosRankSum=-0.013;SC=TTAAAGAAATGTTGGAAGAGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=31;WE=120583156;WS=120583138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr8	120592482	rs2289887	G	A	2663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.986;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=63;PP=2110;ReadPosRankSum=-0.645;SC=CCCTTCTGTCGACTTAGCACC;SOR=1.241;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=135;TCF=43;TCR=92;TR=89;WE=120592490;WS=120592472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,93:0.67:139
chr8	120592532	.	C	G	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.357;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=32;PP=684;ReadPosRankSum=-0.190;SC=CCATCTATATCATACATTCTT;SOR=1.402;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=82;TCF=8;TCR=74;TR=34;WE=120592540;WS=120592522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,34:0.41:83
chr8	120596023	rs10283100	A	G	3425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=26;PP=2925;SC=TTAAATGTTGAGCCATAACCT;SOR=2.212;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=104;TCF=78;TCR=26;TR=103;WE=120596031;WS=120596013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr8	120598625	.	G	C	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=486;ReadPosRankSum=-0.869;SC=TCTCTCTCTAGAAAGCTGAAG;SOR=1.542;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=20;WE=120598633;WS=120598615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr8	120599245	rs921044	C	T	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=8;PP=502;ReadPosRankSum=0.289;SC=GGGGCAGAGGCCTGGGCAGGG;SOR=0.706;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=29;WE=120599253;WS=120599235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,35:0.64:55
chr8	120602908	rs935359	C	T	1855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.12;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr8	120602908	.	CTAAAAC	TTAAAAC,TTAAAAT	492	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=22,9;NR=28,16;PP=375,492;QD=8.19542425094;SC=TCAGGCAAGACTAAAACGAAA;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=22;TCR=28;TR=50,25;WE=120602922;WS=120602898;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:50
chr8	120602914	rs935360	C	T	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.11;ReadPosRankSum=1.376;SOR=1.161;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr8	120613679	.	A	G	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.809;ClippingRankSum=0.000;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.491;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=16;PP=844;ReadPosRankSum=-0.071;SC=TATGGTTAATATTCTCCGCTC;SOR=0.458;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=160;TCF=115;TCR=45;TR=49;WE=120613687;WS=120613669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,46:0.29:160
chr8	120613747	rs2289888	C	T	3783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.371;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=75;PP=2820;ReadPosRankSum=-1.148;SC=GTTTCATTTCCGCAAACTCAA;SOR=0.889;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=210;TCF=99;TCR=111;TR=135;WE=120613755;WS=120613737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,143:0.64:225
chr8	120613822	rs2289889	C	T	2531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=75;PP=1986;ReadPosRankSum=-0.591;SC=TCTGTTTTCACTTCATTTGTA;SOR=0.850;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=17;TCR=116;TR=86;WE=120613830;WS=120613812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,90:0.65:138
chr8	120685288	.	G	T	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.408;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.890;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=515;ReadPosRankSum=1.541;SC=TCATTCTCTGGCAATGAAAAC;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=23;WE=120685296;WS=120685278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr8	120744293	rs61753747	C	T	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.718;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=21;PP=726;ReadPosRankSum=-1.299;SC=GCTTCTTCTTCTTTTTCTTGT;SOR=0.593;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=115;TCF=55;TCR=60;TR=42;WE=120744301;WS=120744283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,42:0.36:116
chr8	120754645	rs4871569	A	G	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=85;ReadPosRankSum=0.967;SC=AGCTCAATGTATTACAAGAAA;SOR=0.527;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=120754653;WS=120754635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
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chr8	120790304	rs1509348	T	C	942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=12;PP=751;SC=CTAAAATAAATGTTAAGACTT;SOR=1.284;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=31;WE=120790312;WS=120790294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
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chr8	120814020	rs7813438	A	G	3452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=16;PP=2777;SC=TAAGAGAGGAAAGCTCTGACT;SOR=3.090;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=84;TCR=16;TR=100;WE=120814028;WS=120814010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr8	120816010	rs4871629	A	G	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=1;PP=1055;SC=CTAAATTTGGAAGGGAATAAA;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=37;WE=120816018;WS=120816004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	120816320	.	G	GACAAAGAT	1749.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.766;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=1609;ReadPosRankSum=0.750;SC=ATATAATAAAGACAAAGATTT;SOR=0.257;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=75;TCF=3;TCR=72;TR=23;WE=120816328;WS=120816310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,40:0.63:63
chr8	120818483	rs4871634	G	A	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=5.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.654;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=307;ReadPosRankSum=0.572;SC=TGAATCTAACGTGATTTTAGT;SOR=0.052;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=73;TCF=70;TCR=3;TR=20;WE=120818491;WS=120818473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,20:0.27:75
chr8	120818709	rs71571631	CTT	C	745.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQRankSum=0.583;QD=24.86;ReadPosRankSum=2.564;SOR=3.014;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,23:0.77:30
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chr8	120843775	rs7828086	T	C	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=836;ReadPosRankSum=-0.700;SC=CTTGTAATCATACAGACCCTA;SOR=2.376;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=24;WE=120843787;WS=120843765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,25:0.89:28
chr8	120844590	rs10505374	T	C	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=212;ReadPosRankSum=-0.520;SC=CAAACACCATTTCCATCACAG;SOR=0.430;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=11;WE=120844598;WS=120844580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr8	120844782	rs17818842	G	A	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.639;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=500;ReadPosRankSum=0.757;SC=CATTCTGGCGGGCTCTACACC;SOR=1.402;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=23;WE=120844790;WS=120844772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr8	120847078	rs1055133	C	G	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=445;SC=TATTTTTCTTCTATCCAGCAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=120847086;WS=120847068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	120847123	rs1055131	C	T	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=3;PP=640;SC=AAGAAAAGACCGTTGTTCTTT;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=120847131;WS=120847113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	120847188	rs1055130	T	C	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=22;PP=924;SC=CATCGAAGAATGAGAATATTT;SOR=0.780;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=20;TCR=22;TR=42;WE=120847196;WS=120847178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr8	120862767	rs112349158	T	TA	529.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=615;ReadPosRankSum=2.293;SC=CTAGAAATTATATATATCGTA;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=15;WE=120862775;WS=120862757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr8	120867693	rs55889147	G	A	64.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.20;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr8	120940652	rs16893299	C	T	2106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.323;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=10;PP=1736;ReadPosRankSum=-0.093;SC=TCAGGCTGCACGAAGAAAAGG;SOR=1.684;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=143;TCF=119;TCR=24;TR=80;WE=120940660;WS=120940642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,80:0.54:149
chr8	120940867	rs28461628	G	A	2132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=2.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.93;ReadPosRankSum=0.075;SOR=1.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,55:0.59:93
chr8	120940874	rs62528677	T	C	2144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.94;ReadPosRankSum=-0.037;SOR=1.206;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,52:0.60:86
chr8	120977432	rs62528695	C	T	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.825;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=2;PP=941;ReadPosRankSum=1.581;SC=GTTTTCCTTTCGTATAGGTTT;SOR=2.176;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=57;TCF=51;TCR=6;TR=38;WE=120977440;WS=120977422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,40:0.67:60
chr8	121013770	rs2271900	A	G	1643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=10;PP=1253;SC=CCAGTGTCCAACAAGCACCCA;SOR=2.628;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=52;WE=121013778;WS=121013760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr8	121019300	rs6469889	C	T	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=329;SC=ACTTCACATGCGTTATTATTA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=13;WE=121019308;WS=121019290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	121061879	rs4871827	G	A	2852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=63;PP=2219;SC=CGGACCGTGAGCAATCTGATT;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=19;TCR=63;TR=82;WE=121061887;WS=121061869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
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chr8	121209000	rs2305597	A	C	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=7;PP=702;ReadPosRankSum=1.232;SC=TGACAGTAACACATGCGCTTT;SOR=0.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=96;TCR=21;TR=39;WE=121209008;WS=121208990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,38:0.32:120
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chr8	121220395	rs3765062	G	A	1058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=0;PP=782;SC=TTTGCTGGACGTATTTTCGCT;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=121220403;WS=121220385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr8	121226143	rs71571669	C	CT	293.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=217;ReadPosRankSum=-0.011;SC=AATTATATTGCTTTTTTTTCT;SOR=0.738;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=15;WE=121226151;WS=121226133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,15:0.30:50
chr8	121228679	rs4870723	A	C	5439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=0.886;SC=AAGACAGATCAATGGTTATCG;SOR=1.227;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=163;TCF=65;TCR=98;TR=162;WE=121228687;WS=121228669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,169:0.99:171
chr8	121240812	rs2305602	G	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=109;ReadPosRankSum=1.803;SC=CATTTCTTTCGTCTTCTAACC;SOR=0.446;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=6;WE=121240820;WS=121240802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr8	121256150	rs2305603	T	C	2006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.137;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=45;PP=1552;ReadPosRankSum=-0.180;SC=ACAACCTCCTTCTGAAGCCTC;SOR=0.359;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=109;TCF=38;TCR=71;TR=73;WE=121256158;WS=121256140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,74:0.66:112
chr8	121259843	rs2305604	T	C	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.710;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=473;ReadPosRankSum=-0.200;SC=CCTTTTCTTTTCTACTCAGTA;SOR=0.240;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=70;TCF=52;TCR=18;TR=26;WE=121259851;WS=121259833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,26:0.36:73
chr8	121259862	rs2305605	G	A	1520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.748;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=12;PP=1162;ReadPosRankSum=0.080;SC=TACCATCCTCGGGGCCCCAGA;SOR=1.272;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=86;TCF=63;TCR=23;TR=53;WE=121259870;WS=121259852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,55:0.62:88
chr8	121262775	rs2305607	A	G	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=443;ReadPosRankSum=0.809;SC=AAAAGCAGTCAAGTGAATACA;SOR=1.483;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=23;WE=121262783;WS=121262765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr8	121267617	rs993823	C	T	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=33;PP=1078;SC=CCATCACTTACGTTTTTGTCA;SOR=2.409;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=43;WE=121267625;WS=121267607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr8	121267736	rs3750255	A	G	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=-1.068;SC=GTCATGCTGCATATGGGGTCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=121267744;WS=121267726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr8	121290573	rs2305609	T	A	1330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=9;PP=1056;SC=TTTAAAGATTTTTTTTTTCAT;SOR=2.531;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=40;WE=121290581;WS=121290563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr8	121292407	rs1869831	G	A	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=485;SC=TGGTTAAATAGTGAGTCCGAT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=121292415;WS=121292397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr8	121292805	rs1869832	G	C	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-4.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=449;ReadPosRankSum=1.193;SC=TGAAACCACAGAAAACCATAG;SOR=1.536;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=19;WE=121292813;WS=121292795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr8	121293142	rs3054972	CTT	C	1049.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.16;QD=31.81;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	121293331	rs1563388	G	A	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=22;PP=603;SC=TAAAGTCATCGTATGTTTATT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=121293339;WS=121293321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	121295744	rs17237080	T	C	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=201;ReadPosRankSum=-1.064;SC=AACAGTGATCTAGTTGGTGTT;SOR=0.252;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=12;WE=121295752;WS=121295737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,14:0.34:41
chr8	121309862	rs2219241	A	T	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=19;PP=517;SC=TTGATTTTTTAAATTGTATTT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=121309870;WS=121309852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	121326122	rs3217653	CAG	C	1121.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=2;PP=1016;SC=TTCTAGATGTCAGAGAGTCTA;SOR=3.180;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=22;WE=121326131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	121326427	rs10505379	G	T	344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=256;SC=AGCCATTTTTGTGTCCAATGA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=121326435;WS=121326417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	121327673	rs7844334	C	T	1623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=1;PP=1429;SC=AGTGCAAACGCGATTTACTGT;SOR=6.518;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=50;TCR=1;TR=51;WE=121327681;WS=121327663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr8	121328383	rs78746650	A	AT	1013.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=22;PP=1085;SC=CCTATCCTGCACTATTTCCCT;SOR=4.255;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=23;WE=121328391;WS=121328373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	121353416	rs1563390	G	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.64;ReadPosRankSum=-0.475;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
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chr8	121353692	rs1563392	A	T	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.747;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=31;PP=706;ReadPosRankSum=-0.667;SC=AATACCATTAATATTCATTGC;SOR=1.368;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=116;TCF=34;TCR=82;TR=40;WE=121353700;WS=121353682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,41:0.34:121
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chr8	121426425	.	AGT	A	195	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=1;NR=9;PP=195;QD=23.0;SC=ATACTTCATAAGTGTTAAAAA;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=10;WE=121426438;WS=121426415;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
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chr8	121483196	rs13248998	G	A	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=172;ReadPosRankSum=0.784;SC=TACATGTTTCGGTTGTTTTAA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=10;WE=121483204;WS=121483186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr8	121509825	rs35918868	C	CTTT	627.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=378;SC=AATTTTAGTTCGTGTGTGTGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=121509833;WS=121509815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	121528449	rs10096885	C	T	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.295;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=30;PP=695;ReadPosRankSum=-0.049;SC=ATTACATGCACATAAATAGTA;SOR=3.228;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=30;WE=121528457;WS=121528439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,31:0.70:44
chr8	121530061	rs13258768	C	T	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.21;ReadPosRankSum=0.895;SOR=0.644;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,27:0.27:101
chr8	121530190	rs13258848	A	G	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FS=1.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.55;ReadPosRankSum=2.306;SOR=0.579;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:184,65:0.26:249
chr8	121530384	rs34340354	CTT	C	230.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.432;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.765;NF=0;NR=7;PP=152;ReadPosRankSum=-0.246;SC=CATAGGAAGACTTTTTAAATT;SOR=0.113;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=7;WE=121530393;WS=121530374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,9:0.26:35
chr8	121531154	rs13269481	G	A	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.32;ReadPosRankSum=-0.010;SOR=0.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,14:0.23:61
chr8	121534786	rs4285526	A	G	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TAATCACATTAATACGTGTAG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=121534794;WS=121534776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr8	121535050	rs12681110	C	T	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=291;ReadPosRankSum=0.782;SC=CAGCAGTAATCAGTTACTGGT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=14;WE=121535058;WS=121535040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr8	121550810	rs72680535	A	G	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=331;ReadPosRankSum=1.936;SC=ATGCTGTTCTAATGGTCATGT;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=14;WE=121550818;WS=121550800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr8	121583488	rs72680558	T	C	1357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=0;PP=753;ReadPosRankSum=-0.701;SC=CATTTCAAGATGCTTGGGTCC;SOR=0.749;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=70;TCR=0;TR=35;WE=121583496;WS=121583478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,37:0.51:72
chr8	121583533	rs72680559	G	A	2041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.265;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=8;PP=1083;ReadPosRankSum=0.455;SC=TCCAGTGACTGTGGTCTAATC;SOR=1.090;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=91;TCF=74;TCR=17;TR=50;WE=121583541;WS=121583523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,50:0.54:92
chr8	121583562	rs72680560	C	T	2901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=26;PP=1430;ReadPosRankSum=-0.866;SC=GTTTCTGTTGCGGGAATGTCT;SOR=0.684;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=124;TCF=77;TCR=47;TR=69;WE=121583570;WS=121583552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,70:0.55:127
chr8	121583603	rs72680561	G	A	3287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=45;PP=1618;ReadPosRankSum=0.955;SC=CACGGATGAGGACTGTGGATG;SOR=0.745;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=60;TCR=81;TR=78;WE=121583611;WS=121583593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,83:0.56:148
chr8	121583635	rs73707305	G	T	2919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.647;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=57;PP=1545;ReadPosRankSum=-0.891;SC=AAGCAATAGCGATTGGGCCGA;SOR=0.530;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=131;TCF=27;TCR=104;TR=73;WE=121583643;WS=121583625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,81:0.57:141
chr8	121583719	rs200630168	G	T	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.99;ReadPosRankSum=1.947;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr8	121583725	rs201354068	T	G	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQRankSum=0.000;QD=41.45;ReadPosRankSum=0.599;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr8	124027628	rs7159	T	C	2338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=3;PP=1925;SC=AGTTGTTAAGTGCACCCAGCA;SOR=5.699;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=67;TCR=3;TR=70;WE=124027636;WS=124027618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
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chr8	124114333	rs10956116	G	T	1510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=1;PP=1101;ReadPosRankSum=-0.792;SC=TCCATTTCACGAAAATGCATG;SOR=4.003;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=39;WE=124114341;WS=124114323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
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chr8	124154756	rs10101435	A	G	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.932;NF=1;NR=10;PP=258;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTTTTTTTAAAAGACAGAGTC;SOR=0.527;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=11;WE=124154764;WS=124154746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr8	124157166	.	AT	A	102.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.89;MQRankSum=1.023;QD=2.10;ReadPosRankSum=0.167;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,14:0.29:49
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chr8	124194968	rs3739291	C	T	1716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=6.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=44;PP=1298;ReadPosRankSum=-1.204;SC=CCCTGCACGCCGGTCCTGGGA;SOR=0.686;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=92;TCF=19;TCR=73;TR=56;WE=124194976;WS=124194958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,61:0.62:98
chr8	124195352	rs148011353	G	T	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.783;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=795;ReadPosRankSum=-0.345;SC=AGACACCCTGGGAGGGGCGGA;SOR=0.553;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=94;TCF=52;TCR=42;TR=40;WE=124195360;WS=124195342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,40:0.42:95
chr8	124359749	rs9297666	C	G	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=31;PP=689;ReadPosRankSum=-0.592;SC=AAAAATCAGCCTCGGAATATA;SOR=0.723;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=79;TCF=5;TCR=74;TR=33;WE=124359757;WS=124359739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,35:0.43:81
chr8	124440174	rs6999234	A	G	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=71;ReadPosRankSum=1.946;SC=TGAAGAAAATATTTGGAAGCT;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=6;WE=124440182;WS=124440164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr8	124440336	rs10628888	A	AAG,AAAG	1402.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.90;QD=45.25;SOR=2.694;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,16,15:0.52,0.48:31
chr8	124442114	rs71961566	TGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCC	T	141.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.23;MQRankSum=-0.658;QD=2.62;ReadPosRankSum=1.117;SOR=0.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,13:0.24:54
chr8	124442119	.	CA	C	86.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQRankSum=-0.346;QD=2.63;ReadPosRankSum=-0.089;SOR=0.420;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr8	124442187	rs13278992	A	G	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.209;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.324;NF=40;NR=10;PP=911;ReadPosRankSum=-0.076;SC=TGGTTTAACTAAAGGTATGGC;SOR=0.220;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=123;TCF=106;TCR=17;TR=50;WE=124442195;WS=124442177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,52:0.43:121
chr8	124448689	rs9297669	T	C	1673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=4;PP=1417;SC=ACTTTTACTTTTAGGATTACC;SOR=4.450;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=44;TCR=4;TR=48;WE=124448697;WS=124448679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr8	124448736	rs7014678	A	G	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.079;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=564;ReadPosRankSum=0.539;SC=GGAGGACAGAACTTCATTTAT;SOR=0.461;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=106;TCF=88;TCR=18;TR=33;WE=124448744;WS=124448726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,35:0.32:109
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chr8	124448907	rs10590897	CTT	C	293.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=3.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.54;ReadPosRankSum=0.845;SOR=0.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,14:0.26:53
chr8	124448947	rs6470148	A	G	1374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=38;PP=1101;SC=ATCTCGTCTGACATCACCATT;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=38;WE=124448955;WS=124448937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr8	124449466	rs3824250	C	T	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=2.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.66;ReadPosRankSum=2.143;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,19:0.23:84
chr8	124449672	rs11991520	T	G	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=6.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=484;ReadPosRankSum=1.289;SC=GTTCTTTGAATAAAACTCCAT;SOR=0.716;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=79;TCF=23;TCR=56;TR=25;WE=124449680;WS=124449662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,26:0.30:86
chr8	124449712	rs11987798	G	A	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-3.713;NF=1;NR=16;PP=348;ReadPosRankSum=-1.109;SC=GGGAGGCCGAGGTGGGCGGAT;SOR=0.846;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=17;WE=124449720;WS=124449702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
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chr8	124450364	rs3765212	G	T	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.674;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=573;ReadPosRankSum=-0.567;SC=TCTCATTTATGTGCTTTTAGG;SOR=0.461;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=100;TCF=57;TCR=43;TR=37;WE=124450372;WS=124450354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,38:0.37:102
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chr8	124659329	rs11991744	C	A	1575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=41;PP=1293;SC=GTAGTAATTACGAGGGTGAAC;SOR=3.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=48;WE=124659337;WS=124659319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr8	124663769	rs10109736	A	T	3075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=15;PP=2740;SC=GGTGTGTCCAAGCACACATAC;SOR=3.142;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=82;TCR=15;TR=97;WE=124663777;WS=124663759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr8	124664130	rs11780509	C	T	6576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=118;NR=83;PP=2965;SC=GACCAGACTCCTCCCTGAGCT;SOR=1.107;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=118;TCR=83;TR=201;WE=124664138;WS=124664120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr8	124664167	rs11784192	T	C	6408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=95;PP=2965;SC=AGCACATAGATGCTGCGGTGC;SOR=0.951;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=212;TCF=117;TCR=95;TR=212;WE=124664175;WS=124664157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr8	124664792	rs7387544	C	T	4502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=77;PP=2965;SC=TCTGCAAGTACGAGGAGCAGG;SOR=1.123;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=53;TCR=77;TR=130;WE=124664800;WS=124664782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr8	124664873	rs7387792	AT	GC	5478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=63;PP=2947;SC=CAGTGGCAATATGTGCCTCCC;SOR=1.197;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=48;TCR=69;TR=108;WE=124664882;WS=124664863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr8	124665211	rs7387855	C	T	1432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=37;PP=1140;SC=AAGAGTCAAACCTTTCTCAGC;SOR=4.174;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=41;WE=124665219;WS=124665201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr8	124693410	rs4471017	G	C	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=173;ReadPosRankSum=0.281;SC=AGTCTCATTTGCAAGTTTGAT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=9;WE=124693418;WS=124693400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr8	124693444	rs3739283	C	T	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=1;PP=699;ReadPosRankSum=-1.030;SC=TTGACAAAGGCGGTTCCACCC;SOR=4.174;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=28;WE=124693452;WS=124693434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chr8	124693641	rs4314634	G	A	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.617;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=30;PP=574;ReadPosRankSum=1.576;SC=AACGTTTATGGTGTGTTCACA;SOR=0.948;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=141;TCF=40;TCR=101;TR=39;WE=124693649;WS=124693631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,40:0.28:145
chr8	124696867	rs2294015	C	T	1549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=15;PP=1282;SC=CTGGTCACGACTATGCGAATC;SOR=1.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=49;WE=124696875;WS=124696857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr8	124710729	rs2294013	C	T	2376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.224;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=37;PP=1794;ReadPosRankSum=-0.212;SC=CTCGCTGGGACGGTCCAGAAG;SOR=0.919;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=134;TCF=72;TCR=62;TR=84;WE=124710737;WS=124710719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,89:0.64:140
chr8	124749610	rs6470179	C	T	6648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.220;NF=99;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=0.080;SC=TGTATTTCATCAAGAGATCAG;SOR=0.280;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=100;TCR=114;TR=210;WE=124749618;WS=124749600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,216:1.00:217
chr8	124749651	rs11331268	TC	T	5214.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=107;PP=2975;SC=ACAACAGTTTTCCCCCCGGAC;SOR=1.725;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=157;TCF=33;TCR=124;TR=136;WE=124749659;WS=124749641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr8	124796926	rs17259760	G	C	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=93;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CATGTGGGGAGATCATACCAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=124796934;WS=124796916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr8	124824826	rs1946586	G	A	1494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=14;PP=1300;SC=CAGTCATCGTGTGCTGACATG;SOR=2.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=50;WE=124824834;WS=124824816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr8	124982125	rs7008210	A	C	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=18;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.382;NF=9;NR=0;PP=108;ReadPosRankSum=0.910;SC=AAAAAAAAAAAAGAGAATTGA;SOR=0.315;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=9;WE=124982133;WS=124982115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr8	124982215	rs7008604	G	A	1256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.661;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=16;PP=978;ReadPosRankSum=-0.166;SC=CCACTCCAAGGACAGGATTCT;SOR=0.794;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=150;TCF=101;TCR=49;TR=52;WE=124982223;WS=124982205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,54:0.34:157
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chr8	124987478	rs7465584	T	C	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=193;ReadPosRankSum=0.714;SC=GTGACATCAGTGTCATGGGAA;SOR=0.616;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=16;WE=124987486;WS=124987468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,16:0.29:56
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chr8	125072426	rs4483140	T	C	4230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=57;PP=2965;SC=GGTAGGTTCCTCCTTCTGGGC;SOR=0.978;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=72;TCR=57;TR=129;WE=125072434;WS=125072416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
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chr8	125076589	rs7012186	T	G	1419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=10;PP=1181;SC=TCATTTCAGATATTTCAGATT;SOR=2.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=42;WE=125076597;WS=125076579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr8	125076988	rs4871460	T	C	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=32;PP=983;SC=AGCTTTGTTATAGGATCAGAA;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=125076996;WS=125076978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
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chr8	125094847	rs10956163	C	G	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=653;SC=ATCAGCAGAGCTGGCTTGGGG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=125094855;WS=125094837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr8	125110258	rs10956164	C	T	3609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=90;PP=2889;SC=TTAAGGCCACCTTCTTTGTCT;SOR=4.017;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=11;TCR=90;TR=101;WE=125110266;WS=125110248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr8	125130966	rs13438814	G	C	1746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=3;PP=1465;SC=TCAAAATAAAGCAGCGGGATA;SOR=4.654;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=50;TCR=3;TR=53;WE=125130974;WS=125130956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr8	125334267	rs185398992	T	C	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.476;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=150;ReadPosRankSum=0.327;SC=TCTTTTGTTATGCTTCTCAAT;SOR=0.986;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=14;WE=125334275;WS=125334257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,15:0.25:59
chr8	125463001	rs79997881	C	T	139.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5729;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=-0.792;SC=TCCACAGCAACGGCAACGCCA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=125463009;WS=125462995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr8	125463098	rs3812474	A	T	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=522;ReadPosRankSum=1.490;SC=GCTGCAGGCTACCTTATTTAA;SOR=1.238;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=24;WE=125463106;WS=125463088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr8	125463250	rs3812475	T	C	2590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=34;PP=1879;ReadPosRankSum=1.156;SC=GACTGAGCCTTGGTTTACCCA;SOR=0.741;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=97;TCR=55;TR=94;WE=125463258;WS=125463240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,98:0.62:157
chr8	125463544	rs11556913	T	C	2958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.301;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=48;PP=2350;ReadPosRankSum=0.684;SC=GTCAGCCGAGTTGGAGGCTGA;SOR=0.572;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=158;TCF=87;TCR=71;TR=104;WE=125463552;WS=125463534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,106:0.65:162
chr8	125498547	rs3812471	C	T	2320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.411;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=35;PP=1814;ReadPosRankSum=-0.721;SC=ATCGAATTTACGGATTACAGT;SOR=0.360;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=142;TCF=90;TCR=52;TR=87;WE=125498555;WS=125498537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,88:0.61:145
chr8	125516237	rs76350429	T	C	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.399;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=41;PP=1264;ReadPosRankSum=-1.726;SC=TGAGAATAAATTGGATTACCA;SOR=1.695;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=82;TCF=18;TCR=64;TR=49;WE=125516245;WS=125516227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,54:0.62:87
chr8	125568182	rs141972884	AGG	A	6680.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.314;NF=68;NR=68;PP=2986;ReadPosRankSum=1.315;SC=AGGTTGCTTTAGGGGGGGGGC;SOR=0.970;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=159;TCF=84;TCR=75;TR=136;WE=125568191;WS=125568172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,169:0.99:171
chr8	125570144	rs4870903	G	A	1169.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=5.898;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.78;ReadPosRankSum=-0.743;SOR=2.225;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr8	125574913	rs7015228	G	C	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=0;PP=939;SC=GGTTTCTCAAGTCAGTGGGCA;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=125574933;WS=125574903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr8	125574925	rs7015374	G	C	1489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=1;PP=1225;SC=CAGTGGGCAGGGGATTGTCTA;SOR=6.273;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=46;WE=125574933;WS=125574903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr8	125577869	rs2303952	C	G	1268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=17;PP=979;SC=AATGACCCGTCCTGAAAGCAA;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=21;TCR=17;TR=38;WE=125577877;WS=125577859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
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chr8	128099457	rs61262194	CGTG	C	3282.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.406;NF=13;NR=34;PP=2239;ReadPosRankSum=0.768;SC=AGTCCTTCGTCGTGGTGGTGG;SOR=0.859;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=64;TCF=17;TCR=47;TR=47;WE=128099467;WS=128099445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,78:0.99:79
chr8	128428061	rs4871789	A	G	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.099;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=317;ReadPosRankSum=0.897;SC=ATGAAAAGTAACATAATTGCT;SOR=2.030;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=15;WE=128428069;WS=128428051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr8	128428795	rs6998254	G	A	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.569;NF=22;NR=9;PP=718;ReadPosRankSum=0.936;SC=CCCTCATGCAGGCCCGAAAGA;SOR=0.578;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=31;WE=128428803;WS=128428785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
chr8	128428823	rs7002225	G	C	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.387;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.031;NF=33;NR=9;PP=1027;ReadPosRankSum=0.848;SC=AACCAGTATCGAGAACCGAGT;SOR=1.101;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=42;WE=128428831;WS=128428813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,42:0.74:57
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chr8	128972721	rs9649959	A	G	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.271;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=0;PP=1007;ReadPosRankSum=0.622;SC=GATCACCGAGAGAAGTTAGGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=61;TCR=2;TR=42;WE=128972729;WS=128972711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,41:0.65:63
chr8	129021000	rs1863562	A	G	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.21;ReadPosRankSum=-1.550;SOR=0.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr8	129021000	.	AAG	GAA	752	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=15;NR=0;PP=752;QD=53.6978583241;SC=GCACAATGCTAAGCATGTGCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=15;WE=129021010;WS=129020990;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr8	129021002	rs2033102	G	A	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.20;ReadPosRankSum=-1.140;SOR=0.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr8	129021179	rs2114358	G	A	1739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=36;PP=1302;ReadPosRankSum=1.011;SC=CTTGCAGTAGGTTTTTGCAAG;SOR=0.744;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=46;TCR=57;TR=65;WE=129021187;WS=129021169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,67:0.64:104
chr8	129021262	rs2392823	C	T	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=528;ReadPosRankSum=1.145;SC=AAATATATGGCTGAACTAACA;SOR=0.836;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=26;WE=129021270;WS=129021252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,29:0.62:47
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chr8	130496365	rs6997249	G	A	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.877;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=205;ReadPosRankSum=0.550;SC=TGATCTGTAAGAGAAGGTAAA;SOR=0.223;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=12;WE=130496373;WS=130496355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,12:0.30:40
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chr8	130762291	rs77681114	G	A	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.972;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=965;ReadPosRankSum=1.385;SC=ACCATGCATGGTTTGAATCCT;SOR=0.537;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=72;TCF=35;TCR=37;TR=48;WE=130762299;WS=130762281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,49:0.68:72
chr8	130772882	rs11276511	T	TGCCTGAGTCTTTCCCATA	4104.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=2970;SC=AGGTTATTCCTGCCTGAACCT;SOR=2.993;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=73;TCF=8;TCR=65;TR=26;WE=130772890;WS=130772872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
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chr8	130859185	rs115025292	A	C	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=279;ReadPosRankSum=0.635;SC=CCTTTTCAAAATAGTAAAATA;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=11;WE=130859193;WS=130859175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr8	130868061	rs2306528	G	T	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=-0.180;SC=ATTAAAAAGTGAACAATTCAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=130868069;WS=130868051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr8	130874674	rs298611	A	C	263.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=191;SC=CATAGGAAACACTGGTATAAT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=130874682;WS=130874664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	131020729	rs4733757	T	C	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.785;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=30;PP=870;ReadPosRankSum=0.010;SC=CTCCAAGCTGTTCAGGCCTCA;SOR=0.790;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=32;TCR=79;TR=42;WE=131020737;WS=131020719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,42:0.37:113
chr8	131092026	rs6415509	T	A	1793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=1;PP=1501;SC=TGTTGTGGCCTGCCCCACTTG;SOR=6.593;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=51;TCR=1;TR=52;WE=131092034;WS=131092016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr8	131124559	rs966185	T	C	3193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=67;PP=2589;SC=TCTTTCTTGATAGGGCTTGGC;SOR=1.945;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=25;TCR=68;TR=92;WE=131124567;WS=131124549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr8	131127831	rs2305513	T	C	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=493;ReadPosRankSum=1.396;SC=ACTAGAAAAGTTGGGGTAGTT;SOR=0.580;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=74;TCF=69;TCR=5;TR=25;WE=131127839;WS=131127821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,26:0.34:76
chr8	131128024	rs3217641	G	GA	475.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=1.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.000;QD=4.53;ReadPosRankSum=1.238;SOR=0.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,25:0.24:105
chr8	131130594	rs10956511	C	T	2801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=50;PP=2321;SC=GAGCACACCTCTTCACTCTCA;SOR=1.248;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=31;TCR=50;TR=81;WE=131130602;WS=131130584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr8	131136173	rs34680836	C	CA	104.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQRankSum=-1.076;QD=6.16;ReadPosRankSum=-0.489;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr8	131140180	rs75375911	G	A	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.267;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=19;PP=649;ReadPosRankSum=0.072;SC=AACCTGATGAGCCACAATCGC;SOR=0.925;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=58;TCF=28;TCR=30;TR=32;WE=131140188;WS=131140170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,34:0.57:60
chr8	131149072	rs76830015	C	G	1391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=1;PP=1070;ReadPosRankSum=1.294;SC=GCAGCACATGCAGGAATAACT;SOR=0.470;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=74;TCF=73;TCR=1;TR=45;WE=131149080;WS=131149062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,48:0.62:78
chr8	131165086	rs3935174	A	T	2797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=67;PP=2352;SC=AGATATAGTAACTGATTCACT;SOR=2.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=16;TCR=67;TR=83;WE=131165094;WS=131165076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr8	131172791	rs34161158	GT	G	149.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=1;PP=133;SC=AGTGAAAAGTGTTATGATGTC;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=131172799;WS=131172781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr8	131192905	rs28495072	G	C	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=4;PP=1388;SC=TAATCAAACAGAGTCTGCCTT;SOR=4.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=44;TCR=4;TR=48;WE=131192913;WS=131192895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr8	131193153	rs71572332	T	TA	1078.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.662;NF=0;NR=45;PP=728;ReadPosRankSum=1.494;SC=TGTCATTATTTAAAAAAAAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=1;TCR=68;TR=45;WE=131193161;WS=131193143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,45:0.92:49
chr8	131199416	rs72722371	T	G	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=332;ReadPosRankSum=0.283;SC=AGTTTTTTTTTTTGTTGTCCA;SOR=0.760;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=15;WE=131199424;WS=131199406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr8	131200298	rs113293903	G	GA	188.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.416;NF=12;NR=0;PP=159;ReadPosRankSum=-0.487;SC=CTTGAAAGAGGAAAAAAAAAA;SOR=0.277;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=12;WE=131200306;WS=131200288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
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chr8	131353194	rs373940667	TTTTTTGTTTTTG	T	1040.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.20;ReadPosRankSum=0.675;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,54:0.53:102
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chr8	132996599	rs16904564	A	C	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=106;ReadPosRankSum=-0.366;SC=AAAGCAGACAACATCTTTGAA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=132996607;WS=132996589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr8	133008823	rs2270873	G	A	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.662;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=418;ReadPosRankSum=0.201;SC=CCACACTTTCGAACAGGAGGA;SOR=1.112;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=21;WE=133008831;WS=133008813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr8	133015426	rs74919571	A	T	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=1;PP=736;ReadPosRankSum=-0.963;SC=CATTGATATTATTATATATAG;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=29;WE=133015434;WS=133015416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,30:0.79:38
chr8	133023163	rs4736529	G	C	2955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=76;PP=2469;ReadPosRankSum=0.720;SC=AAGACCTCAGGATATGATTTG;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=147;TCF=35;TCR=112;TR=99;WE=133023171;WS=133023153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,101:0.67:150
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chr8	133041179	rs6471025	A	G	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=0.609;QD=6.96;ReadPosRankSum=-0.816;SOR=0.504;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,18:0.25:72
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chr8	133050900	rs871959	A	G	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=33;ReadPosRankSum=0.189;SC=TCCTAGCCAGAGAAGGCAGGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=133050908;WS=133050897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr8	133053188	rs2334791	C	T	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.863;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=0.671;SC=CCAGTGGTGACGATGATGTGA;SOR=0.027;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=5;WE=133053196;WS=133053178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr8	133053309	rs7386782	T	C	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=7.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.40;ReadPosRankSum=-0.657;SOR=2.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,10:0.12:80
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chr8	133053714	rs1466884	G	A	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=134;ReadPosRankSum=1.187;SC=CAAGGTATCAGCCAGGCCTCC;SOR=0.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=9;WE=133053722;WS=133053704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,9:0.24:38
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chr8	133089975	rs2280851	A	G	3188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=33;PP=2431;SC=TCTCTTACCCAAGGTAGGGCT;SOR=1.632;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=68;TCR=33;TR=101;WE=133089983;WS=133089965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr8	133101818	rs6471038	G	A	5888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=128;PP=2965;SC=TAGAATTGCCGATGATATCTA;SOR=2.080;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=48;TCR=129;TR=176;WE=133101826;WS=133101808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr8	133107830	rs7833441	T	C	3057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=42;PP=2559;SC=TGGCGGGGTCTACTGTCTTCA;SOR=0.845;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=51;TCR=42;TR=93;WE=133107838;WS=133107820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr8	133107893	rs10956634	A	G	3272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=44;PP=2586;SC=CACACAGACCAGCCCTGCAAC;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=66;TCR=44;TR=110;WE=133107901;WS=133107883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr8	133111307	rs2469493	C	G	2222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=56;PP=1741;SC=AACTTCTTTGCACATGTGCTG;SOR=4.375;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=4;TCR=56;TR=60;WE=133111315;WS=133111297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr8	133112359	.	C	G	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.350;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=1.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.52;ReadPosRankSum=1.057;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,35:0.35:101
chr8	133112392	rs1370568	G	A	2694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=54;PP=2011;SC=CTGGGAAGGAGACAGTTTTCA;SOR=1.455;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=29;TCR=54;TR=83;WE=133112400;WS=133112382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr8	133113531	rs34842500	A	T	3803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=90;PP=2965;SC=CTGAAATAAAAGTTTTCATGA;SOR=3.126;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=19;TCR=90;TR=109;WE=133113539;WS=133113521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr8	133116251	rs6998880	C	T	1387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=8;PP=1150;ReadPosRankSum=0.740;SC=GTGTTAGATGCGGATATAATC;SOR=1.938;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=44;WE=133116259;WS=133116241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
chr8	133117603	rs71526236	G	A	3478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.116;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=79;PP=2815;ReadPosRankSum=0.783;SC=AGAACAGTGCGTGAGGAATCA;SOR=2.002;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=30;TCR=80;TR=108;WE=133117611;WS=133117593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,111:0.98:113
chr8	133146798	rs111447844	TGAGGA	T	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.65;QD=32.75;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr8	133175971	rs893391	G	C	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=761;SC=TTTTCAGCCAGTCATTCATTC;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=133175979;WS=133175961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	133184644	.	TAC	T	138	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=10;MMLQ=16;MQ=58.63;NF=7;NR=0;PP=138;QD=20.1428571429;SC=GGCACATTAATACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=7;WE=133184655;WS=133184634;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
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chr8	133584558	rs9297853	A	G	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=0.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.90;ReadPosRankSum=0.316;SOR=0.805;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,41:0.25:166
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chr8	133920321	rs866468	A	G	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=330;ReadPosRankSum=-1.029;SC=GGCAGTGCTTATGTGTTTTGA;SOR=0.906;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=15;WE=133920329;WS=133920311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr8	133920411	rs2261147	T	C	1701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.296;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=59.97;MQRankSum=-0.735;NF=48;NR=12;PP=1315;ReadPosRankSum=0.595;SC=CCTCTGCTGATCTCTGGTGCT;SOR=0.446;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=96;TCF=79;TCR=17;TR=60;WE=133920419;WS=133920401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,63:0.64:99
chr8	133920518	rs2069556	A	G	2176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.419;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=48;PP=1727;ReadPosRankSum=-1.221;SC=GACTACGCGGATTTGCTGCAG;SOR=0.565;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=133;TCF=48;TCR=85;TR=76;WE=133920526;WS=133920508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,83:0.60:139
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chr8	133931748	rs853304	T	C	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.047;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=465;ReadPosRankSum=-0.573;SC=CCATTTCTGCTGGAGCTTTCA;SOR=0.518;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=51;TCF=24;TCR=27;TR=24;WE=133931756;WS=133931738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
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chr8	133960991	rs2246624	C	T	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=174;ReadPosRankSum=-1.914;SC=CTCCATCACACTGACCTCTCC;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=9;WE=133960999;WS=133960981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr8	133961237	rs2246611	G	C	3120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.260;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.727;NF=30;NR=71;PP=2474;ReadPosRankSum=0.699;SC=CTCTTCACACGAGCAAGGCCC;SOR=1.399;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=155;TCF=52;TCR=103;TR=101;WE=133961245;WS=133961227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,108:0.66:163
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chr8	133961299	rs144296671	GAA	G	824.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=1.267;QD=15.27;ReadPosRankSum=0.681;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,33:0.61:54
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chr8	133975406	rs2687814	C	T	2106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=52;PP=1589;ReadPosRankSum=0.020;SC=AATGAACGGACGTATTGACAT;SOR=0.684;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=47;TCR=88;TR=80;WE=133975414;WS=133975396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,83:0.60:138
chr8	133978709	rs138876980	C	CTG	170.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.973;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.366;NF=7;NR=1;PP=453;ReadPosRankSum=0.918;SC=CTGTCTCTCTCTCTGTGTGTG;SOR=0.047;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=8;WE=133978719;WS=133978699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr8	133978711	rs28452373	C	G	295.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.559;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.258;NF=7;NR=1;PP=436;ReadPosRankSum=1.033;SC=GTCTCTCTCTCTGTGTGTGTG;SOR=0.061;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=8;WE=133978719;WS=133978699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr8	133984058	rs2076740	C	T	2885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.554;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=31;PP=2271;ReadPosRankSum=1.340;SC=ATGTGAACGACGGTGCGATGC;SOR=0.526;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=149;TCF=108;TCR=41;TR=106;WE=133984066;WS=133984048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,107:0.69:154
chr8	133984821	rs1554541	G	T	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=14.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQRankSum=-0.374;QD=20.25;ReadPosRankSum=-2.030;SOR=3.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,17:0.89:19
chr8	133984834	.	C	T	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.21;ReadPosRankSum=0.592;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr8	133985115	rs1403486	A	G	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=379;SC=CAACAGAAATAGATTCTGTTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=133985123;WS=133985105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	133995475	rs10105779	A	G	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=0;PP=1190;SC=GGTTGGGACAATCTGTCTGCC;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=133995483;WS=133995465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	134025781	rs10105991	A	T	2595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=8.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.61;ReadPosRankSum=0.154;SOR=1.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,64:0.68:94
chr8	134025781	.	AGA	TGG	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=29;MQ=59.97;NF=46;NR=13;PP=2944;QD=20;SC=GATGACTGGAAGAATGCATGA;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=94;TCF=69;TCR=25;TR=59;WE=134025791;WS=134025771;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:35,59:0.63:94
chr8	134025783	rs10105992	A	G	2595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=6.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.76;ReadPosRankSum=0.772;SOR=1.462;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,65:0.67:97
chr8	134050678	rs3739266	A	G	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=406;ReadPosRankSum=0.635;SC=TGAGGCTCCCAGGGATCAGGG;SOR=1.675;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=23;WE=134050686;WS=134050668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr8	134052163	rs76747313	C	T	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.293;NF=17;NR=0;PP=406;ReadPosRankSum=1.606;SC=GCACACACACCGTTTTGTGCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=17;WE=134052171;WS=134052153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr8	134052217	.	CACACACAT	C	98.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=8.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.33;MQRankSum=1.063;QD=2.24;ReadPosRankSum=1.270;SOR=0.072;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,9:0.20:44
chr8	134052219	rs113099362	CACACAT	C	776.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=14.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.33;MQRankSum=-0.425;QD=17.65;ReadPosRankSum=-0.471;SOR=3.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr8	134057102	rs2256366	G	A	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=176;ReadPosRankSum=0.115;SC=ATTAACGAGAGAGCATATCAT;SOR=0.465;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=9;WE=134057110;WS=134057092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr8	134062266	rs2687836	A	G	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.897;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=507;ReadPosRankSum=0.370;SC=GAACACAGAGATAGGTAAATA;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=103;TCF=27;TCR=76;TR=32;WE=134062274;WS=134062256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,33:0.32:104
chr8	134062327	rs2702972	T	G	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=5.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.064;SOR=2.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,18:0.31:58
chr8	134062331	rs2741194	G	A	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=5.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.871;SOR=2.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,19:0.35:55
chr8	134062912	rs2252807	A	G	2380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=0;PP=1974;SC=TTAAAGAGGAAGGTTGCAGTA;SOR=8.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=63;TCR=0;TR=63;WE=134062920;WS=134062902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr8	134062983	rs2252805	C	T	3600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.151;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=12;PP=2861;ReadPosRankSum=0.347;SC=ACCACTCTAGCTAACAATCAA;SOR=1.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=175;TCF=156;TCR=19;TR=124;WE=134062991;WS=134062973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,127:0.70:181
chr8	134107223	rs2272706	A	G	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=62;ReadPosRankSum=1.465;SC=GGCACTGAGGACTCCAGGTGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=134107231;WS=134107221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr8	134107618	rs10103453	G	A	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=22;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CTGTGCATGCGCCACAGCCTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=134107626;WS=134107608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr8	134108295	rs10106820	A	G	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=83;ReadPosRankSum=-0.030;SC=ACTTTGTCACATGGTGTCCTG;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=134108303;WS=134108285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr8	134108546	rs2069569	T	C	1996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=43;PP=1405;ReadPosRankSum=0.707;SC=GAGGTCTTTATGGGTAGAGGT;SOR=0.655;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=134;TCF=64;TCR=70;TR=82;WE=134108554;WS=134108536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,83:0.61:136
chr8	134114716	rs733735	G	A	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-4.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=490;ReadPosRankSum=1.064;SC=AAGTCCCTCTGAAGACCCTCC;SOR=0.313;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=23;WE=134114724;WS=134114706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
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chr8	134143910	rs17633144	A	G	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=419;ReadPosRankSum=-0.081;SC=TCTCCATTCAACTGGGCCCTA;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=18;WE=134143918;WS=134143900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
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chr8	134266970	rs2272650	C	G	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.833;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=511;ReadPosRankSum=2.573;SC=TCAAGGACATCCCCCTTGATA;SOR=1.839;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=22;WE=134266978;WS=134266960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,23:0.70:33
chr8	134267721	rs16904874	C	T	1567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.069;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=52;PP=1318;ReadPosRankSum=0.851;SC=AAAGACAATCCTCAGGCTTCA;SOR=2.082;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=74;TCF=4;TCR=70;TR=54;WE=134267729;WS=134267711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,54:0.72:75
chr8	134267762	rs3824240	T	C	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=614;ReadPosRankSum=-0.870;SC=CCCCAGACCTTCGAGTCTCAC;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=25;WE=134267770;WS=134267752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr8	134270457	rs10113567	G	A	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.648;NF=12;NR=0;PP=897;ReadPosRankSum=2.687;SC=ATATATACGAGTACCCATGCA;SOR=0.239;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=12;WE=134270479;WS=134270447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr8	134270468	rs139790285	CCA	C	725.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.818;NF=23;NR=0;PP=1478;ReadPosRankSum=-0.712;SC=TACCCATGCACCACACACACA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=23;WE=134270479;WS=134270447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,28:0.67:42
chr8	134270548	rs2272651	T	C	1703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.714;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=17;PP=1297;ReadPosRankSum=-0.575;SC=TTTTCCAATGTCTTCCTTCAT;SOR=0.363;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=147;TCF=115;TCR=32;TR=65;WE=134270556;WS=134270538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,68:0.45:152
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chr8	134292288	rs2977507	T	C	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=1;PP=610;SC=TCCTGATTCTTTGGCCAGCAC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=134292296;WS=134292278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	134292516	rs2272653	A	G	1202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.261;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=933;ReadPosRankSum=-0.060;SC=ATGGTCTGTGAAAAGACAAAA;SOR=0.349;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=103;TCF=31;TCR=72;TR=46;WE=134292524;WS=134292506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,48:0.45:106
chr8	134296722	rs7816664	T	C	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=228;ReadPosRankSum=-0.177;SC=GATGAGGAGGTCCCTTGTACA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=11;WE=134296730;WS=134296712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr8	134296742	rs7820205	T	C	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=52;ReadPosRankSum=0.490;SC=ACACAGCCCATGGACCCAACC;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=6;WE=134296750;WS=134296732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr8	134308600	rs4236901	T	C	1307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=0;PP=1063;SC=CTCGCCCAGGTCACTTCTCCC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=134308608;WS=134308590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr8	134308937	.	G	GAC	92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=92;QD=31.6666666667;SC=CCCAGACACAGACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=134308945;WS=134308927;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,3:0.43:7
chr8	134314037	rs139817736	CCATCAT	C	188.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.044;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=256;ReadPosRankSum=-0.076;SC=GTCATCATCACCATCATCATC;SOR=2.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=5;WE=134314050;WS=134314029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr8	134314352	.	T	TA	94.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=-0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.89;ReadPosRankSum=1.363;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr8	134314369	rs2976580	A	G	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=95;ReadPosRankSum=0.564;SC=AAAAAAAACCATGAAAGGAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=7;WE=134314377;WS=134314359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr8	134474148	rs1048479	C	T	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.669;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=17;PP=788;ReadPosRankSum=0.926;SC=AGAAGATGACCGAGAGGATGC;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=147;TCF=95;TCR=52;TR=49;WE=134474156;WS=134474138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,49:0.32:151
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chr8	134488007	rs2230542	G	A	1694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.816;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.96;MQRankSum=-0.794;NF=45;NR=16;PP=1315;ReadPosRankSum=0.115;SC=CGTTCTGGGCGGTCAGCAGCG;SOR=1.079;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=102;TCF=73;TCR=29;TR=61;WE=134488015;WS=134487997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,65:0.60:108
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chr8	135602794	rs35087145	TCAC	T	106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.765;NF=1;NR=3;PP=120;ReadPosRankSum=-0.700;SC=TCAACAGTCATCACCACCATC;SOR=0.105;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=135602804;WS=135602784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr8	135612595	rs894343	A	G	1736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=5;PP=1486;ReadPosRankSum=-1.269;SC=GACCTGCAGCAGAGACACCTA;SOR=2.494;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=64;TCR=5;TR=67;WE=135612603;WS=135612585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,64:0.97:66
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chr8	135613624	rs894347	A	G	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.144;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=137;ReadPosRankSum=1.703;SC=CTTAGAAGGTATTCTTTGCAA;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=135613632;WS=135613614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
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chr8	135620894	rs3739421	T	C	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=165;ReadPosRankSum=-0.166;SC=CGAACAAGCATGCTGATCCTT;SOR=0.804;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=11;WE=135620902;WS=135620884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,12:0.29:42
chr8	135622640	rs2277138	T	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=156;ReadPosRankSum=-0.155;SC=TGACTCAGACTGTGACATCAG;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=11;WE=135622648;WS=135622630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr8	135649548	rs17698962	A	G	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=208;ReadPosRankSum=0.383;SC=ACTTACGGTAATAGTCATCAT;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=10;WE=135649556;WS=135649543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr8	135649848	rs12541381	G	A	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.671;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=759;ReadPosRankSum=2.579;SC=GGAGCCAGCGGGCTGTCCTCA;SOR=1.321;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=66;TCF=26;TCR=40;TR=41;WE=135649856;WS=135649838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,41:0.62:66
chr8	135669901	rs187529527	C	T	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.951;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=873;ReadPosRankSum=-0.901;SC=CCATGTGCTTCTCTGAAACGT;SOR=0.435;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=71;TCF=41;TCR=30;TR=42;WE=135669909;WS=135669891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,45:0.59:76
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chr8	136561153	rs11166602	A	G	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=37;PP=962;ReadPosRankSum=-2.507;SC=TGTTAGTACCATTTTTCTTGA;SOR=0.949;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=62;TCF=7;TCR=55;TR=42;WE=136561161;WS=136561143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,42:0.64:66
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chr8	136659488	rs1128066	G	A	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=16;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.674;NF=0;NR=9;PP=60;ReadPosRankSum=-1.444;SC=AACCTGGGCAGAAAAAAAAAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=9;WE=136659496;WS=136659478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr8	139149406	rs6577876	G	A	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=17;PP=1164;ReadPosRankSum=1.111;SC=GTCTGTCTTTGAGGGCAGTTT;SOR=0.704;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=187;TCF=138;TCR=49;TR=66;WE=139149414;WS=139149396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,65:0.34:192
chr8	139149510	rs6577877	A	C	2354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.578;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=65;PP=1831;ReadPosRankSum=-2.665;SC=AGCCCTGTAAAAATTAGCCAG;SOR=0.938;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=274;TCF=103;TCR=171;TR=99;WE=139149518;WS=139149500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,100:0.36:278
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chr8	139614436	rs4394401	G	A	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.107;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=462;ReadPosRankSum=-0.173;SC=TCATTGCCCCGGGCCCTCTGC;SOR=0.446;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=92;TCF=17;TCR=75;TR=28;WE=139614444;WS=139614426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,26:0.28:94
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chr8	139635883	rs7836250	A	C	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=328;ReadPosRankSum=-0.008;SC=TATCTTCGAGACTGGTTCAAA;SOR=0.669;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=61;TCF=57;TCR=4;TR=19;WE=139635891;WS=139635873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,20:0.32:63
chr8	139635920	rs7839790	T	A	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.919;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=461;ReadPosRankSum=0.479;SC=AGTAGTTGTTTTTGACATGTA;SOR=0.544;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=94;TCF=70;TCR=24;TR=32;WE=139635928;WS=139635910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,33:0.34:98
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chr8	139642974	rs4131277	T	C	1301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=30;PP=951;ReadPosRankSum=-0.823;SC=CAGCAGCTCCTGCAATTCCAT;SOR=0.766;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=74;TCF=36;TCR=38;TR=56;WE=139642982;WS=139642964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,55:0.76:72
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chr8	139691995	rs140389566	TGTTA	T	6244.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.258;NF=12;NR=103;PP=2957;ReadPosRankSum=-0.867;SC=TCAGCCCCTCTGTTAGGTACT;SOR=1.542;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=120;TCF=13;TCR=107;TR=115;WE=139692006;WS=139691985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,143:0.99:144
chr8	139696502	rs111396507	GAA	G	1074.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=-0.136;QD=29.85;ReadPosRankSum=-1.617;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr8	139696635	rs4506262	T	C	3423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=67;PP=2692;SC=CGGCAACTCGTGGCACCCACA;SOR=1.121;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=47;TCR=67;TR=114;WE=139696643;WS=139696625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr8	139701209	rs4909444	G	T	1540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=32;PP=1126;SC=GAGGCCGGGAGCACCCTGTGG;SOR=1.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=46;WE=139701217;WS=139701199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr8	139712323	rs4909835	A	G	2458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=6;PP=2036;SC=GCCGAGGCACACTGGGCACCC;SOR=4.905;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=82;TCR=6;TR=88;WE=139712331;WS=139712313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr8	139727808	rs5895555	AT	A	1966.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.21;QD=28.10;SOR=8.526;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr8	139727812	.	T	A	2017	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=20;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=53.73;NF=71;NR=0;PP=2017;QD=28.8981860922;SC=ACTCTCATTTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=75;TCF=75;TCR=0;TR=71;WE=139727820;WS=139727802;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,71:0.95:75
chr8	139733062	rs11774914	C	T	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.920;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.386;NF=6;NR=18;PP=352;ReadPosRankSum=3.133;SC=GCAAAGTTAACAGGAGACGGG;SOR=0.213;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=70;TCF=12;TCR=58;TR=24;WE=139733070;WS=139733052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,25:0.35:71
chr8	139733089	rs34929697	CA	C	633.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.095;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.149;NF=1;NR=20;PP=698;ReadPosRankSum=-0.282;SC=TTGGATTAAACAACACAAAGT;SOR=1.410;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=21;WE=139733097;WS=139733079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr8	139734462	rs12678237	T	C	2870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=80;PP=2424;SC=GCTCTTTGATTAGCAGGGCCC;SOR=7.428;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=81;TCF=1;TCR=80;TR=81;WE=139734470;WS=139734452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr8	139736649	rs28726333	C	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=-0.971;SC=GCCAGGGCACCCAGGGAGCCT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=4;WE=139736657;WS=139736640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr8	139736933	rs10112806	C	A	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.989;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=252;ReadPosRankSum=-0.813;SC=CCACATGGACCCTGTTAGCCT;SOR=0.932;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=89;TCF=39;TCR=50;TR=23;WE=139736941;WS=139736923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,25:0.27:94
chr8	139749638	rs4409435	T	C	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.499;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=148;ReadPosRankSum=0.971;SC=ACCCACTGGCTGTTCTTTTTA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=8;WE=139749646;WS=139749628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr8	139767296	rs115678760	T	G	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=1;PP=523;ReadPosRankSum=-1.796;SC=GTGAAGGCGCTTGAGATAATG;SOR=0.900;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=28;WE=139767304;WS=139767286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr8	139767349	rs2318338	T	C	2531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=5;PP=1994;SC=CCAAACCCATTGGTAAGAGAA;SOR=4.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=68;TCR=5;TR=72;WE=139767357;WS=139767339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr8	139768085	rs7825723	G	A	2184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.766;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=60;PP=1726;ReadPosRankSum=-0.113;SC=GCACAGAAACGACAAACATTT;SOR=0.858;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=129;TCF=33;TCR=96;TR=79;WE=139768093;WS=139768075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,81:0.61:132
chr8	139772601	rs77444657	C	G	1880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.942;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=38;PP=1297;ReadPosRankSum=-1.204;SC=TGGGGAGAAACAGGTTGAAAG;SOR=0.526;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=86;TCF=35;TCR=51;TR=65;WE=139772609;WS=139772591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,72:0.77:94
chr8	139833359	.	G	T	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.643;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.530;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=467;ReadPosRankSum=-0.741;SC=CTGGGCTGCAGAAGGCCCCCT;SOR=0.035;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=60;TCF=50;TCR=10;TR=24;WE=139833367;WS=139833349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,25:0.39:64
chr8	139889972	rs4736255	A	G	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=4.190;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.79;ReadPosRankSum=1.060;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,7:0.20:35
chr8	140630990	rs2615374	A	G	5313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=77;PP=2965;SC=TCTGCAGGGCACCCTTGGTCT;SOR=1.080;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=186;TCF=109;TCR=77;TR=185;WE=140630998;WS=140630980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr8	140842414	rs56097365	C	T	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.458;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=696;ReadPosRankSum=0.422;SC=CTGACGTGCACGTGCACACAC;SOR=0.373;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=66;TCF=26;TCR=40;TR=39;WE=140842422;WS=140842404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,40:0.61:66
chr8	140842536	.	G	GCA	299	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=28;MQ=56.47;NF=2;NR=5;PP=299;QD=46.4285714286;SC=GCATACACATGCACACACACT;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=7;WE=140842544;WS=140842526;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,7:0.41:17
chr8	141034189	rs9792174	A	T	3317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FS=0.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.739;QD=14.18;ReadPosRankSum=3.346;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,150:0.64:234
chr8	141407698	rs3779658	T	C	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=3;PP=660;SC=CTCTTCCACTTACAGGTAGAC;SOR=2.753;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=141407706;WS=141407688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
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chr8	141445349	rs11267571	AAGAAAACAAAAAACAAAAACC	A	4568.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=33;PP=2926;SC=GCTGGGCATTAAGAAAACAAA;SOR=3.654;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=9;TCR=62;TR=33;WE=141445377;WS=141445339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
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chr8	141754888	rs79761757	G	A	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=37.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQRankSum=-0.850;QD=6.47;ReadPosRankSum=0.000;SOR=5.131;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr8	141994240	rs13258775	T	C	272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=4;PP=181;SC=GCAGCCTGGGTGACACAGCAA;SOR=1.270;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=141994248;WS=141994230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	141994271	rs13250222	CA	AC	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.23;QD=38.16;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr8	141994393	rs11781807	T	G	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=85;SC=TGACCCCAACTCCATGCCCTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=141994401;WS=141994383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr8	142161032	rs441914	A	C	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.063;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=41;PP=681;ReadPosRankSum=0.182;SC=GCTGTGCTTCAGGCCTGAGAA;SOR=1.110;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=136;TCF=28;TCR=108;TR=48;WE=142161040;WS=142161022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,49:0.35:141
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chr8	142161888	rs2304283	G	A	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.659;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=217;ReadPosRankSum=-0.710;SC=TGGCCCCCACGTCCTTCCTGA;SOR=2.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=6;TCR=44;TR=14;WE=142161896;WS=142161878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,13:0.25:52
chr8	142161957	rs170089	C	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=59;ReadPosRankSum=-0.098;SC=GAACCTTTGACTTGGAATGCT;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=5;WE=142161965;WS=142161947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr8	142166214	rs555399	C	T	1577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=44;PP=1311;SC=ATTTTGTTTTCTGAGATTGAG;SOR=5.507;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=45;WE=142166222;WS=142166204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr8	142170884	rs2289001	C	T	2016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.734;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=38;PP=1535;ReadPosRankSum=-1.667;SC=TGAGCATCTTCAGGTACGTGA;SOR=0.512;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=105;TCF=55;TCR=50;TR=77;WE=142170892;WS=142170874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,78:0.72:108
chr8	142173356	rs428300	C	T	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=372;ReadPosRankSum=1.509;SC=CTAACCATTTCTCTGCTACTA;SOR=1.101;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=16;WE=142173364;WS=142173346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
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chr8	142200205	rs144741369	T	TCATGTTTG	339.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=605;ReadPosRankSum=0.728;SC=CATGTTATTATCATGTTTGCA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=9;WE=142200213;WS=142200195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr8	142202884	rs7014062	T	C	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=534;ReadPosRankSum=-0.329;SC=CCTCTCAGGGTTCCCCTCCTA;SOR=0.799;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=57;TCR=28;TR=27;WE=142202892;WS=142202874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,26:0.30:88
chr8	142222374	rs7017848	A	G	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=194;ReadPosRankSum=-1.282;SC=CGCTGTTCCCACCGGCCCTGC;SOR=0.236;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=16;WE=142222382;WS=142222364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr8	142222445	rs3739238	T	C	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.806;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=696;ReadPosRankSum=-0.121;SC=TCTGACACGTTGGGATAGATC;SOR=0.983;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=94;TCF=63;TCR=31;TR=37;WE=142222453;WS=142222435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,37:0.38:98
chr8	142225990	rs2288998	G	A	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=1.527;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.32;ReadPosRankSum=0.428;SOR=0.917;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,38:0.26:145
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chr8	142228809	rs753779	T	C	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.684;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=735;ReadPosRankSum=-0.049;SC=GCACGTGCAATGCCGAGTCGC;SOR=0.815;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=144;TCF=95;TCR=49;TR=45;WE=142228817;WS=142228799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,48:0.33:147
chr8	142229145	rs3739235	A	G	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.298;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=33;PP=648;ReadPosRankSum=0.576;SC=GGGAGGAAGCAGCAGCCGGTG;SOR=0.188;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=94;TCF=5;TCR=89;TR=36;WE=142229153;WS=142229135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,36:0.39:93
chr8	142229891	rs2304279	A	G	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.869;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=580;ReadPosRankSum=0.466;SC=GCACGATGCCAATGGGCTGCC;SOR=1.196;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=76;TCF=11;TCR=65;TR=29;WE=142229899;WS=142229881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,29:0.38:76
chr8	142229946	rs4961256	G	A	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.551;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=176;ReadPosRankSum=-1.497;SC=GAGCACACGGGAGGGCGGTCA;SOR=0.023;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=11;WE=142229954;WS=142229936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr8	142231944	rs6983780	GC	AG	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=537;ReadPosRankSum=2.231;SC=CCCGCGACAGGCAGGTGCCTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=11;WE=142231953;WS=142231934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr8	142238339	rs34650936	C	A	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=192;ReadPosRankSum=0.608;SC=GACGGGACAGCCCTGAGGCTG;SOR=0.492;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=14;WE=142238347;WS=142238329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,14:0.30:46
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chr8	142445095	rs28592919	C	T	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.22;ReadPosRankSum=-1.360;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
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chr8	142445538	rs11785585	T	C	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.900;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=1.613;QD=6.26;ReadPosRankSum=0.518;SOR=0.864;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,25:0.28:88
chr8	142445540	rs143051012	T	TGCCCGCGGCCCTGGCCC	811.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=2.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=1.715;QD=12.49;ReadPosRankSum=1.315;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,17:0.26:65
chr8	142445680	rs11784911	A	T	1357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.441;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=1044;ReadPosRankSum=0.806;SC=CACAGTCCATATTCACACAAG;SOR=0.435;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=205;TCF=115;TCR=90;TR=61;WE=142445688;WS=142445670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,62:0.30:209
chr8	142446923	rs11782383	C	T	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.348;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=155;ReadPosRankSum=0.242;SC=TGGAAGAAGCCGTCGAGCAAG;SOR=0.941;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=13;WE=142446931;WS=142446913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,12:0.23:52
chr8	142451177	rs7459842	G	A	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=2.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.46;ReadPosRankSum=-1.187;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr8	142457961	rs13259488	A	C	732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=1;PP=643;SC=GCGGAACCCTATGTGTGTCTG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=142457969;WS=142457951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	142458053	rs6578185	A	G	2047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.742;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=20;PP=1598;ReadPosRankSum=0.679;SC=TGCTTGGGCTAGGGCTCGCTG;SOR=1.758;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=65;TCF=44;TCR=21;TR=64;WE=142458061;WS=142458043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,65:0.97:67
chr8	142459814	rs7003306	C	T	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=30;PP=876;SC=CGTGGGCTGCCCAGCCCCCAG;SOR=3.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=33;WE=142459822;WS=142459804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr8	142477752	rs11775650	T	C	1400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=41;PP=1011;SC=CCCAGGATCTTGCAAGTCTCT;SOR=3.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=48;WE=142477760;WS=142477742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	142480610	rs4907398	C	T	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=8;PP=1261;SC=AGTGAGCGAGCGCATTTACCC;SOR=3.171;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=48;WE=142480618;WS=142480600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr8	142481307	rs72685438	G	A	1524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.179;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=35;PP=1137;ReadPosRankSum=-0.719;SC=TTAAGATTACGGGAATCACTG;SOR=1.099;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=79;TCF=28;TCR=51;TR=51;WE=142481315;WS=142481297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,55:0.66:83
chr8	142483063	rs4442176	C	T	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.622;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.324;NF=1;NR=28;PP=641;ReadPosRankSum=-0.083;SC=TGCTGTGGGGCGGGCAGGGTC;SOR=2.303;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=29;WE=142483071;WS=142483053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
chr8	142483145	.	ACC	A	33	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;FR=0.9998;HP=12;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=18;MQ=61.34;NF=0;NR=2;PP=33;QD=19.5;SC=ACCGGCTTTGACCCCCCCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=2;WE=142483154;WS=142483135;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,2:0.40:5
chr8	142484144	rs2126099	T	C	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.865;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=270;ReadPosRankSum=-0.139;SC=AGGTCCCGCCTTGTCTCCTCT;SOR=0.144;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=12;WE=142484152;WS=142484134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
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chr8	142487856	rs11779508	A	G	1993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=35;PP=1479;ReadPosRankSum=-1.485;SC=TGCCCGCCTCACCCAGGGCCT;SOR=0.676;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=69;TCR=50;TR=84;WE=142487864;WS=142487846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,85:0.70:121
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chr8	142489981	rs2748417	C	T	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=8;PP=1224;SC=CAGGTGGTGGCGGGGACAGGG;SOR=3.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=47;WE=142489989;WS=142489971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr8	142490079	rs2613641	G	A	3694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=62;PP=2755;SC=CCGTGGCACCGTTTTTTTCAG;SOR=0.814;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=54;TCR=62;TR=116;WE=142490087;WS=142490069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr8	142490120	rs2748416	G	T	3048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=68;PP=2267;SC=TAGGTAAACAGGAAGGCCTGT;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=29;TCR=68;TR=97;WE=142490128;WS=142490110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr8	142505038	rs6578193	T	C	2341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=42;PP=1772;SC=TGCTGGAGATTTGTGGATGGC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=29;TCR=42;TR=71;WE=142505046;WS=142505028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr8	142505056	rs2246587	T	C	2279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.54;SOR=1.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr8	142505056	.	TG	CG,CT	897	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=21,4;NR=42,15;PP=897,302;QD=14.7900192468;SC=GGCAGAGCAATGGTGGCTTGG;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=21;TCR=43;TR=63,19;WE=142505065;WS=142505046;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.98:64
chr8	142505057	rs2246586	G	T	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=7.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.42;ReadPosRankSum=-1.418;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,23:0.33:69
chr8	142505578	rs2748404	C	A	1607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=31;PP=1241;SC=ATCTTGAAGCCGGTGGCTAAG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=45;WE=142505586;WS=142505568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr8	142506461	rs2613637	A	G	2340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=9;PP=1999;SC=GTGCTCCTGTAGCATCAGTGT;SOR=3.643;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=60;TCR=9;TR=69;WE=142506469;WS=142506451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr8	142517130	rs11355664	TG	T,TGG	1449.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=4.784;HP=11;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.684;NF=43,43;NR=15,15;PP=1116,130;ReadPosRankSum=-0.010;SC=TGAGTACCGGTGGGGGGGGGT;SOR=0.158;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=81;TCF=59;TCR=22;TR=58,58;WE=142517138;WS=142517120;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.28,0.62:74
chr8	142517222	rs2748421	A	G	1788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=10.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.01;ReadPosRankSum=-0.266;SOR=0.938;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,51:0.34:149
chr8	142517227	rs2613648	C	T	1846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=9.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.74;ReadPosRankSum=-0.123;SOR=0.672;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,49:0.34:145
chr8	142524920	rs67192626	C	A	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.847;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=629;ReadPosRankSum=-0.984;SC=GCACCTGGGGCTCTGAGAATG;SOR=1.536;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=31;WE=142524928;WS=142524910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,33:0.72:46
chr8	142525074	rs72685454	G	C	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=2;NR=7;PP=195;SC=TCCTCCCTACGCTCCCCAATG;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=142525082;WS=142525064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	143257568	rs73375434	A	G	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.88;ReadPosRankSum=-1.331;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr8	143257795	rs7007430	G	C	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.688;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=180;ReadPosRankSum=-1.050;SC=AGGCTGAGTTGGTTTAAATCT;SOR=2.133;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=13;WE=143257803;WS=143257785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,13:0.27:48
chr8	143310815	rs11167136	G	A	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.560;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=584;ReadPosRankSum=1.800;SC=GATGGTGTACGGGTAGGTGGG;SOR=0.461;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=117;TCF=72;TCR=45;TR=35;WE=143310823;WS=143310805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,40:0.33:123
chr8	143352978	rs11777062	T	G	1687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=5;PP=1422;SC=AGGGGGTCAGTTTCAGGCAGG;SOR=4.091;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=45;TCR=5;TR=50;WE=143352986;WS=143352968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr8	143353038	rs35674714	C	T	2464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=29;PP=1951;SC=CTGGGGGTCTCGTCCTCCTCA;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=48;TCR=29;TR=77;WE=143353046;WS=143353028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr8	143365913	rs5895710	GT	G	2143.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=41;PP=2037;SC=GCACCTGAAAGTTTCCCATGG;SOR=1.685;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=55;TCF=11;TCR=44;TR=52;WE=143365921;WS=143365903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr8	143381810	rs7822013	T	C	2152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=1;PP=1887;SC=TCATGTGGAGTGTGGAGAGTG;SOR=6.932;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=63;TCF=62;TCR=1;TR=63;WE=143381818;WS=143381800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr8	143396311	rs140648614	G	A	2366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=20;PP=1869;ReadPosRankSum=0.814;SC=TCCGGGAACCGAGGCCGACCC;SOR=0.695;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=108;TCR=32;TR=87;WE=143396319;WS=143396301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,87:0.62:140
chr8	143399752	rs4514123	T	C	1086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=3;PP=867;SC=TTCTGAGCCATGGAGCCATGG;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=35;WE=143399760;WS=143399742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr8	143412377	rs34722595	T	C	3106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=81;PP=2413;SC=GGAGCTTCCCTGCCCCCTGCT;SOR=2.531;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=24;TCR=81;TR=105;WE=143412385;WS=143412367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr8	143413136	rs10435683	C	T	5300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=82;PP=2965;SC=ATTCGGAAGACGTTGGCCGAC;SOR=0.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=167;TCF=85;TCR=82;TR=167;WE=143413144;WS=143413126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
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chr8	143425720	rs10100935	T	C	4371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=70;NR=81;PP=2965;SC=GCCCGGGTAGTGCTGGGCCCC;SOR=0.786;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=70;TCR=82;TR=151;WE=143425728;WS=143425710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
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chr8	143559431	rs10481394	T	C	1274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=2;PP=1028;SC=GGTGTTCTCATCTATGTCCCA;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=36;WE=143559439;WS=143559421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
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chr8	143560898	rs12680973	T	C	1209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.21;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr8	143561206	rs4509377	G	A	1502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=33;PP=1264;SC=CTGTCCTCACGGTGATGCCCA;SOR=2.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=41;WE=143561214;WS=143561196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
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chr8	143563161	rs11776057	G	A	1878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=51;PP=1554;SC=CCCCAACCCTGGCCACAGCCC;SOR=6.593;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=1;TCR=51;TR=52;WE=143563169;WS=143563151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr8	143570281	rs73714305	G	A	1838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=1;PP=1462;SC=GGCCCTGGACGCGACCTTGAA;SOR=5.856;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=53;TCF=52;TCR=1;TR=52;WE=143570289;WS=143570271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr8	143570921	rs7825551	A	G	6223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=152;PP=2965;SC=TTCGAGAGCTACTTTTATCCC;SOR=2.845;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=189;TCF=37;TCR=152;TR=189;WE=143570929;WS=143570911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr8	143599631	rs13281622	A	G	8573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.97;SOR=2.466;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr8	143599634	rs13254098	T	G	8441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.88;SOR=2.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr8	143599651	rs13281652	A	C	4822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=55;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=120;PP=2965;SC=CTCCTGCATCACACGCCTCTT;SOR=3.822;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=17;TCR=120;TR=137;WE=143599673;WS=143599641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr8	143599665	rs13254123	T	C	3813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=55;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=96;PP=2965;SC=GCCTCTTCCCTTGAAGGTCAC;SOR=4.485;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=9;TCR=96;TR=105;WE=143599673;WS=143599641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr8	143599704	rs13281694	A	C	2133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=85;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=53;PP=1662;SC=CCCTCCCTCCATTTGTCCTCA;SOR=4.943;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=56;TCF=3;TCR=53;TR=56;WE=143599724;WS=143599694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr8	143599716	rs13278828	G	C	1556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=85;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=39;PP=1219;SC=TTGTCCTCACGTTCCCAGTCA;SOR=4.758;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=41;WE=143599724;WS=143599694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr8	143599734	rs13281922	A	C	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=86;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=28;PP=868;SC=TCACCTCCGCATTTGCCACGG;SOR=4.743;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=143599761;WS=143599724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	143599746	rs13281935	A	C	1098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.83;QD=42.26;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	143599753	rs13281945	A	C	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.98;QD=43.72;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	143603269	rs7463713	A	G	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=272;SC=CTCAGTGGGGACAGGTGTGGG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=143603277;WS=143603259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	143603318	rs7462471	C	T	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=8;PP=901;SC=GCCCTGGGCCCCACACAGGTG;SOR=2.554;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=36;WE=143603326;WS=143603308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr8	143603418	rs7460600	G	C	2366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=33;PP=1773;SC=CCTACATGGCGGTGACGGGCC;SOR=0.987;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=45;TCR=33;TR=78;WE=143603426;WS=143603408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr8	143695144	rs2234911	G	A	3487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=58;PP=2858;SC=AGTCGTAGCCGTCTGCCTCGT;SOR=0.865;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=53;TCR=59;TR=111;WE=143695152;WS=143695134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr8	143695678	rs28403912	A	G	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.67;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr8	143695681	rs28641083	G	C	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.40;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	143696749	rs28660666	G	A	1942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=28;PP=1469;SC=GACTTCTAAGGGGATGGAAGA;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=30;TCR=28;TR=58;WE=143696757;WS=143696739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
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chr8	143762724	rs2976391	C	A	1261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=12;PP=1018;SC=CCTCTGAGGCCCCTCCCACTC;SOR=1.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=43;WE=143762732;WS=143762714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
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chr8	143857441	rs3214637	A	AGG	1193.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=1128;SC=GATCCAACTCAGGTGGCGCAC;SOR=5.211;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=25;WE=143857449;WS=143857431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
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chr8	143867841	rs2717607	C	G	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.230;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=382;ReadPosRankSum=-0.162;SC=ACACAGGCCACAGCCGCCCAC;SOR=0.525;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=54;TCF=25;TCR=29;TR=24;WE=143867849;WS=143867831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr8	143867905	rs2572925	C	T	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.733;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=299;ReadPosRankSum=0.451;SC=ACAGCCAGGGCTGCAAGGAGC;SOR=1.204;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=19;WE=143867913;WS=143867895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr8	143921804	rs3750246	C	T	4027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.77;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
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chr8	143922788	rs3802226	C	T	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=14;PP=387;SC=CGTTTCTGCACGCTTTGGTCT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=143922796;WS=143922778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	143956808	rs6395	A	C	171.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.80;QD=28.64;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr8	143957405	rs6471570	A	C	5876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.795;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=119;PP=2965;ReadPosRankSum=1.320;SC=ATACCCTGAGAACGACAGAGC;SOR=1.478;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=179;TCF=60;TCR=119;TR=177;WE=143957413;WS=143957395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,180:0.99:181
chr8	143957856	rs7822986	G	A	2263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=55;PP=1825;SC=GGTGCTGGGAGACATCCTTCA;SOR=3.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=12;TCR=55;TR=67;WE=143957864;WS=143957846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr8	143957886	rs10105643	A	C	1599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=37;PP=1298;SC=TCCTGCCCAGACTGCCCCGAC;SOR=3.306;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=44;WE=143957894;WS=143957876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr8	143958427	rs6387	C	T	2300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=40;PP=1929;SC=GATCTTCCCACGTGGCCCACA;SOR=1.042;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=28;TCR=40;TR=68;WE=143958435;WS=143958417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr8	143959250	rs7818826	T	C	2866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=48;PP=2095;SC=CAGCCACATTTCTGCAAAACT;SOR=0.982;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=37;TCR=48;TR=85;WE=143959258;WS=143959240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
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chr8	143959412	rs28551743	G	A	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=242;SC=CACCCATGCCGGCACCTGCAC;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=143959420;WS=143959402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr8	143994419	rs5895735	T	TG	377.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.87;MQRankSum=-0.385;QD=37.77;ReadPosRankSum=1.645;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr8	143994427	rs6394	A	G	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.11;QD=41.86;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	143994702	rs4538	G	T	2054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=0;PP=1767;SC=AGCACCCACCGCAAGGTCTCC;SOR=8.189;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=59;TCR=0;TR=59;WE=143994710;WS=143994692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr8	143994978	.	CAAA	C,CAA	5702.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.17;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=84;PP=2969;SC=ATGCCCTGAGCAAAAACAGAG;SOR=3.947;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=101;TCF=7;TCR=94;TR=91;WE=143994990;WS=143994968;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:128
chr8	143994981	.	AA	CG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=59.84;NF=12;NR=84;PP=2947;QD=20;SC=CCCTGAGCAAAAACAGAGCCC;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=102;TCF=12;TCR=90;TR=96;WE=143994990;WS=143994968;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,96:0.94:102
chr8	143994982	.	A	ACG	5701.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.84;QD=44.54;SOR=3.947;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr8	143995761	rs4536	C	T	3252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=42;PP=2509;SC=ACAGGAGCTCCGCCACGATGC;SOR=0.979;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=55;TCR=42;TR=97;WE=143995769;WS=143995751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr8	143996363	rs6418	A	G	1879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.81;QD=43.72;SOR=1.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr8	143996363	.	AGG	GGA	2522	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=43.32;NF=22;NR=26;PP=2522;QD=20;SC=AGGCAGCCCCAGGCCTCCTGG;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=51;TCF=24;TCR=27;TR=48;WE=143996373;WS=143996353;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,48:0.94:51
chr8	143996365	rs6399	G	A	1879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.91;QD=44.76;SOR=1.005;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr8	143996539	rs4539	T	C	2134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=13;PP=1146;SC=CACCTTCTTCTTCAGGGCCTG;SOR=1.562;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=41;WE=143996561;WS=143996529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr8	143996553	rs4546	G	A	2630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=18;PP=1427;SC=GGGCCTGGGAGAAGTCCCTGG;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=54;WE=143996561;WS=143996529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr8	143997131	rs10086846	C	T	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=423;SC=GGGGCAGCAGCCTCTGCCTGT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=143997139;WS=143997121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	143997877	rs7461740	C	G	2247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=16;NR=54;PP=1666;SC=CCTGACCAGGCGCCACCCTCT;SOR=2.568;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=16;TCR=54;TR=70;WE=143997885;WS=143997867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr8	143997935	rs10099658	T	C	923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.11;QD=27.99;SOR=5.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	143997957	rs10090630	C	T	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.00;QD=39.48;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	143997961	rs10096239	A	G	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.60;QD=45.48;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr8	144064048	rs140972957	A	AT	504.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.15;QD=24.03;SOR=6.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	144097220	.	C	T	665	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MMLQ=27;MQ=54.05;NF=22;NR=0;PP=665;QD=31.8077823885;SC=GAGGGAGTGCCGTGTGAGGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=22;WE=144097228;WS=144097210;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr8	144097333	rs62525085	C	T	4840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.078;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=64;PP=2893;ReadPosRankSum=-0.746;SC=AGTGCTGCTACGTAAGAAGGA;SOR=0.297;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=66;TCR=65;TR=129;WE=144097341;WS=144097323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,129:0.99:130
chr8	144097356	rs75280734	G	A	2158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.434;HP=5;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=49;PP=1651;ReadPosRankSum=-0.160;SC=TAGATGTGTGGGGGGAGAGTT;SOR=1.127;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=129;TCF=54;TCR=75;TR=79;WE=144097364;WS=144097346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,82:0.63:131
chr8	144097377	rs62525087	C	G	4139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.189;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=74;PP=2568;ReadPosRankSum=1.558;SC=GGCATTCGGCCCGGTCAGGAC;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=32;TCR=75;TR=105;WE=144097385;WS=144097367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,108:0.99:109
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chr8	144125727	rs6997455	T	A	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=28;PP=752;SC=GCAGCTGGCGTTGGGAGGCTA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=144125735;WS=144125717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
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chr8	144357213	rs3817675	G	C	4640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=7.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.534;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=49;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.442;SC=GTGGCCCCACGTGGACTCCTG;SOR=0.653;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=242;TCF=169;TCR=73;TR=161;WE=144357221;WS=144357203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,169:0.68:250
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chr8	144357992	rs2293923	A	G	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=340;ReadPosRankSum=-0.831;SC=CTCTGCTCTCACTCCCCGTCC;SOR=0.437;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=20;WE=144358000;WS=144357982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr8	144358302	rs1056146	C	T	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=125;ReadPosRankSum=-1.872;SC=AAGCAGCGGCCGGGCCCGAGG;SOR=0.375;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=9;WE=144358310;WS=144358292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
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chr8	144358863	rs143627825	G	A	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.993;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=33;PP=919;ReadPosRankSum=0.295;SC=ACTTCTTCCGGCACCTGCGGA;SOR=0.459;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=162;TCF=65;TCR=97;TR=59;WE=144358871;WS=144358853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,59:0.36:162
chr8	144378184	rs2235115	C	G	3063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.306;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=45;PP=2551;ReadPosRankSum=-0.909;SC=CAGGCCCCGGCGCAGAGGGCG;SOR=0.841;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=165;TCF=95;TCR=70;TR=109;WE=144378192;WS=144378174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,109:0.66:165
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chr8	144391452	rs11136285	G	A	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.129;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.022;NF=17;NR=2;PP=397;ReadPosRankSum=1.447;SC=CAAAGTGCTGGGATTACAGGT;SOR=0.095;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=19;WE=144391460;WS=144391442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr8	144391728	rs7386475	A	G	2232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.931;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=65;PP=1646;ReadPosRankSum=1.950;SC=GGGAGGCAGCATCAGCCCAGG;SOR=1.350;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=107;TCF=19;TCR=88;TR=78;WE=144391736;WS=144391718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,83:0.73:113
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chr8	144391924	rs10099789	CT	TC	1282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.104;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=1774;ReadPosRankSum=1.072;SC=CTGCTGTGGCCTAGGTGTCCA;SOR=0.123;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=32;WE=144391933;WS=144391914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,32:0.80:40
chr8	144397694	rs7815223	C	T	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.440;NF=7;NR=1;PP=157;ReadPosRankSum=-1.217;SC=GGGGCCACTACCAGTCTCCGC;SOR=0.283;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=8;WE=144397702;WS=144397692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr8	144397696	rs28432960	A	G	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.951;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQRankSum=-1.797;QD=14.86;ReadPosRankSum=0.074;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr8	144397798	rs35506042	G	GGA	1675.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.832;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=4;PP=1728;ReadPosRankSum=1.435;SC=CTCCGCACAAGGAGACAACAA;SOR=2.630;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=73;TCF=61;TCR=12;TR=41;WE=144397806;WS=144397788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,43:0.63:68
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chr8	144406926	rs13250865	T	C	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.774;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=305;ReadPosRankSum=-1.496;SC=TGACCGAGTCTGGCATCAGAG;SOR=2.256;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=18;WE=144406934;WS=144406916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
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chr8	144409934	rs35096181	C	A	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=1775;ReadPosRankSum=0.233;SC=TGGCATCAGGCCAAAGAAGAG;SOR=0.764;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=103;TCF=88;TCR=15;TR=28;WE=144409946;WS=144409924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,31:0.28:110
chr8	144409938	rs11424162	A	AG	1101.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=2.133;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=3.256;QD=8.81;ReadPosRankSum=0.735;SOR=0.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,35:0.28:125
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chr8	144425247	rs7837655	C	A	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=0;PP=1114;SC=CTTATTTCACCATAAAATCTT;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=38;WE=144425255;WS=144425237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr8	144457678	rs72703712	G	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=55;ReadPosRankSum=0.797;SC=AGCCTGGTGCGGGCGCCACGG;SOR=0.927;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=6;WE=144457686;WS=144457668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr8	144459231	.	C	CGT	433.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=404;SC=TCTGTGTGTGCGCGTGTGTGT;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=8;WE=144459241;WS=144459223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr8	144459233	rs3889112	C	T	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=284;SC=TGTGTGTGCGCGTGTGTGTGT;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=10;WE=144459241;WS=144459223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr8	144511389	rs7386685	C	G	43.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr8	144511953	rs141816879	ATGG	A	612.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=8;PP=467;SC=CCGCGCCGCCATGGTGGTGGT;SOR=2.049;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=10;WE=144511963;WS=144511943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	144511995	rs1872900	A	G	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=14;PP=489;SC=CGGCGTGGTGATGGTGGGCGG;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=144512003;WS=144511985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr8	144522387	rs2272754	GA	TT	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.76;ReadPosRankSum=-1.320;SOR=0.999;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,32:0.76:42
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chr8	144566969	rs2294119	C	T	3417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=25;PP=2678;SC=CAGGTCACTGCTGTCTAAAGA;SOR=2.390;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=83;TCR=25;TR=108;WE=144566977;WS=144566959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr8	144618379	rs11774857	A	G	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=2;PP=281;SC=AGCATATCCCATCAGGCAGGC;SOR=2.584;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=144618387;WS=144618369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr8	144620183	rs4874147	T	C	2837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=15;PP=2348;SC=CTTGTGCTGCTGCGTCTCCGG;SOR=3.019;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=76;TCR=15;TR=91;WE=144620191;WS=144620173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr8	144623574	rs2242093	T	C	7988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=136;NR=119;PP=2965;SC=GCCGCCGTAATATCTCCTTTT;SOR=0.841;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=255;TCF=136;TCR=119;TR=255;WE=144623582;WS=144623564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr8	144623735	rs2242092	G	C	1933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=56;PP=1731;SC=CCGCCGTCGCGCTGACAACGG;SOR=6.666;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=57;TCF=1;TCR=56;TR=57;WE=144623743;WS=144623725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr8	144636949	rs7844860	T	C	3131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=90;PP=2298;SC=CCACACAACATGCACGTGCAT;SOR=2.854;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=21;TCR=90;TR=111;WE=144636957;WS=144636939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr8	144641753	rs4874151	A	C	3915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=123;PP=2965;SC=GCAGAGCCCCAGGGAGGCTGG;SOR=4.317;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=139;TCF=14;TCR=125;TR=137;WE=144641761;WS=144641743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr8	144642178	rs11774948	T	C	3200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=74;PP=2584;SC=GGGCCCCACCTACCCCAAGCA;SOR=2.906;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=92;TCF=18;TCR=74;TR=91;WE=144642186;WS=144642168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr8	144642596	rs7835865	T	C	3347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=53;SC=AGTCCACCTTTCCTCATGGGG;SOR=0.905;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=46;TCR=53;TR=99;WE=144642604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr8	144642626	rs7831485	A	G	3083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=55;PP=2421;SC=CGTGGGGAGCACACGGAGAGG;SOR=0.973;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=44;TCR=55;TR=99;WE=144642634;WS=144642616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr8	144642986	rs11136298	T	C	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=23;PP=957;SC=CACGTGGGCATGCGGCGGCGG;SOR=0.883;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=18;TCR=23;TR=41;WE=144642994;WS=144642976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr8	144643321	rs12541790	A	G	2974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=73;PP=2520;SC=TGGCAGAGAAACAGGGAGGCC;SOR=3.309;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=13;TCR=73;TR=86;WE=144643329;WS=144643311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr8	144644182	.	G	A	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.978;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=14;PP=756;ReadPosRankSum=-0.435;SC=CCTACGGGCAGAGGTGGAGAC;SOR=1.173;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=112;TCF=62;TCR=50;TR=37;WE=144644190;WS=144644172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,36:0.32:111
chr8	144644583	rs1349806	G	C	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=7;PP=728;SC=CCCGGTGGGCGTTCAGAAACC;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=26;WE=144644591;WS=144644573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr8	144644787	rs1377663	T	A	5852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=95;NR=74;PP=2965;SC=AGGCACAAGATGCCCAGATTT;SOR=1.005;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=95;TCR=75;TR=169;WE=144644795;WS=144644777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr8	144649550	rs7010602	A	G	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=8;NR=4;PP=260;SC=AGCCCCGGGCACGGGCCAGCA;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=144649558;WS=144649540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr8	144649601	rs13268196	A	G	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=6;PP=338;SC=CCGCGGCCACAGCCGGCTTGG;SOR=1.371;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=17;WE=144649609;WS=144649591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	144649625	rs10097556	T	C	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=8;PP=399;SC=CGCTCTGCAGTCGCCCTAGGT;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=17;WE=144649633;WS=144649615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	144649690	rs13254590	C	T	726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=9;PP=607;SC=AGTGCCCGGGCCCCTGGCCCT;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=25;WE=144649698;WS=144649680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr8	144649968	rs13255489	C	T	1716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=35;PP=1500;SC=ATAAGCACGGCGGCTGCCCGG;SOR=1.118;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=56;WE=144649976;WS=144649958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr8	144650029	.	G	T	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.473;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=463;ReadPosRankSum=-0.114;SC=GGCTCAGGAAGTTGGGCACGT;SOR=1.503;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=65;TCF=32;TCR=33;TR=25;WE=144650037;WS=144650019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,25:0.36:69
chr8	144650510	rs11136301	G	A	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=11;PP=538;SC=GGGGGAGCAAGGGCATCGGGT;SOR=0.963;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=9;TCR=11;TR=20;WE=144650518;WS=144650500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr8	144650547	rs11136302	G	A	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.70;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	144650550	rs10101426	T	C	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.70;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr8	144650925	rs13279011	A	T	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=12;PP=403;SC=AGGCGGAGACAGAGAGGGGCT;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=144650933;WS=144650915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	144651554	.	A	G	27	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=3;HapScore=2;MGOF=30;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=27;QD=30.8856062736;SC=AGAGACTGGAAGGGCGGGGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=144651562;WS=144651544;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr8	144651576	.	C	G	56	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=56;QD=30.2570708491;SC=GTGACAGCGGCAGGGGCGGGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=144651584;WS=144651566;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr8	144653011	rs11777527	C	T	146.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	144653218	rs4874152	A	G	206.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=190;SC=GTGTCCAGGGAATGTAGGGAG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=144653226;WS=144653208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr8	144654249	rs10866911	G	A	3644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.91;SOR=3.285;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr8	144654255	rs4874153	A	G	3665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.70;SOR=3.428;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr8	144654582	rs4874154	C	A	4815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.59;SOR=1.232;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr8	144654586	rs4874155	G	C	4922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.44;SOR=1.300;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr8	144654594	rs4873803	G	T	4764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.12;SOR=1.287;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr8	144654693	rs4873804	G	C	4545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=69;PP=2965;SC=CTGCCTCAGAGGGGGCGGTGA;SOR=0.828;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=80;TCR=69;TR=149;WE=144654701;WS=144654683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr8	144657269	rs2290417	G	C	2806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=56;PP=2131;SC=CACAGCTGCAGGGAGGAGGTA;SOR=1.067;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=38;TCR=56;TR=94;WE=144657277;WS=144657259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr8	144658711	rs872935	G	A	5237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=97;PP=2965;SC=CCCAGGGCCAGGGCGACTGCT;SOR=1.228;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=64;TCR=98;TR=161;WE=144658719;WS=144658701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr8	144659608	rs12678314	A	G	1086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=28;PP=871;SC=CAGGGTGAGGATCACTAGGCC;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=144659616;WS=144659598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr8	144660189	rs896953	A	G	1394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=21;PP=1186;SC=CCACGGGGGGACAAGGACTTC;SOR=0.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=20;TCR=21;TR=41;WE=144660197;WS=144660179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr8	144660523	rs4475500	A	G	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=24;PP=698;SC=CCCCGCCCCGACCCCGTGACG;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=144660531;WS=144660513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr8	144662353	rs1062391	G	A	1298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=28;PP=1013;SC=CCTCCAGCTGGGCCATGTCCG;SOR=1.312;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=43;WE=144662361;WS=144662343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr8	144671244	rs4874160	C	A	2253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=10;PP=1846;SC=ACCAGGCCACCCGCAGGGCCT;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=60;TCR=10;TR=70;WE=144671252;WS=144671234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr8	144671685	rs6985081	G	C	5083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=49;PP=2965;SC=TGCGGCTGCCGTCGGGGGCCA;SOR=1.730;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=161;TCF=112;TCR=49;TR=159;WE=144671693;WS=144671675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr8	144671922	rs3812448	G	A	6786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=91;NR=125;PP=2965;SC=CCAGCCACACGCGTTCGGCCG;SOR=1.018;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=216;TCF=91;TCR=125;TR=216;WE=144671930;WS=144671912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr8	144672541	rs751932	T	C	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=10;PP=355;SC=ATGAACAATATATAATTTTGT;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=144672549;WS=144672531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	144681777	rs10282929	G	T	3443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=55;PP=2837;ReadPosRankSum=1.368;SC=CCTCTGCCATGGGGGGCGGAG;SOR=0.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=58;TCR=56;TR=112;WE=144681785;WS=144681767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,110:0.98:112
chr8	144688736	rs2242090	C	G	2918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=62;PP=2230;SC=GCTGCAGGAGCTTGGTCTCGC;SOR=1.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=27;TCR=62;TR=89;WE=144688744;WS=144688726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr8	144689686	rs4874169	A	G	2369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=38;PP=1801;SC=GCACAAACACATGCACACACA;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=42;TCR=38;TR=80;WE=144689694;WS=144689676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr8	144689914	rs11136305	C	T	2287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=14;PP=1904;SC=CACAAGCGCACGTGCAAACGC;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=54;TCR=14;TR=68;WE=144689922;WS=144689904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr8	144689932	rs34360518	CACAT	C	3084.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=6;PP=2974;SC=CGCACATGAGCACATACATAC;SOR=3.458;Source=Platypus;TCR=8;TR=57;WE=144689943;WS=144689922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr8	144690014	rs4874170	T	C	6168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=145;NR=54;PP=2965;SC=CACTCACACATGCATACACAC;SOR=2.078;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=145;TCR=54;TR=199;WE=144690022;WS=144690004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr8	144690886	rs10097337	A	C	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=2;PP=935;SC=GTGGCAGCCAAACACACCAGT;SOR=4.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=34;WE=144690894;WS=144690876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr8	144695867	rs6558377	A	G	3518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=56;PP=2828;SC=TCCCAGGACAACCTTGGATCC;SOR=0.916;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=45;TCR=56;TR=101;WE=144695875;WS=144695857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr8	144696203	rs4634659	T	C	1119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=15;PP=682;SC=TGGCTCCTCTTGGAGCTCAGC;SOR=0.869;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=14;TCR=15;TR=29;WE=144696211;WS=144696197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr8	144697041	rs1049832	A	G	5403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=111;PP=2965;SC=CGCCCACCTCAAAGGCCGAGT;SOR=1.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=57;TCR=111;TR=168;WE=144697049;WS=144697031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr8	144732026	rs3750203	G	A	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=285;ReadPosRankSum=-1.252;SC=ATCCCCATCTGTTAAGTAAGG;SOR=0.171;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=61;TCR=0;TR=18;WE=144732034;WS=144732016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,18:0.30:61
chr8	144732363	rs4875017	T	C	8145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=140;NR=108;PP=2965;SC=ATATTCTGAATTCAGACCTTC;SOR=0.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=248;TCF=140;TCR=108;TR=248;WE=144732371;WS=144732353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr8	144732418	rs4874084	A	G	7094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.869;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=134;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.764;SC=CAATCCTTGCAATATCTGTGG;SOR=0.853;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=228;TCF=94;TCR=134;TR=226;WE=144732426;WS=144732408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,233:1.00:234
chr8	144772151	rs35228840	TG	T	822.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=6.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=1.423;QD=7.09;ReadPosRankSum=-0.970;SOR=0.240;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,39:0.34:116
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chr8	144773147	rs56377635	C	T	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.978;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=551;ReadPosRankSum=0.627;SC=ATCAGTCCACCGCAGGGCCAC;SOR=2.833;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=23;WE=144773155;WS=144773137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
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chr8	144801347	rs5895782	AC	A	739.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=14;PP=595;SC=GACATCCCCAACCCCCCCTCC;SOR=1.609;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=21;WE=144801355;WS=144801337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr8	144803616	rs11783357	C	T	8050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=155;NR=96;PP=2965;SC=ACGCGGAGCACGGCCCGGGCC;SOR=1.266;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=251;TCF=155;TCR=96;TR=251;WE=144803624;WS=144803606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
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chr8	144808044	rs186583661	G	A	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.49;ReadPosRankSum=0.278;SOR=0.597;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,10:0.19:53
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chr8	144809721	rs142153660	G	A	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.226;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=881;ReadPosRankSum=-1.184;SC=GACCTTGGTGGGGAAGGCTGC;SOR=1.461;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=50;TCF=20;TCR=30;TR=38;WE=144809729;WS=144809711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,40:0.77:52
chr8	144809804	rs13254035	G	A	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.581;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=214;ReadPosRankSum=0.308;SC=CGTCGTCTTCGTAAGCCTCCG;SOR=1.058;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=58;TCF=29;TCR=29;TR=15;WE=144809812;WS=144809794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,15:0.25:59
chr8	144810970	rs11136322	C	G	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.953;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=673;ReadPosRankSum=-2.130;SC=GGGTGGGGCGCGGAGGACGCA;SOR=1.017;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=97;TCF=28;TCR=69;TR=34;WE=144810978;WS=144810960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,32:0.33:98
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chr8	144822092	rs149608943	C	T	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5034;FS=5.058;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=671;ReadPosRankSum=1.273;SC=GAGCCCGCGTCGGCTGAGAGC;SOR=0.160;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=33;WE=144822100;WS=144822082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,33:0.87:38
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chr8	144874366	rs7461245	T	C	2204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=47;PP=1651;SC=CAGGGCGGGGTGGCGACCCCA;SOR=1.432;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=24;TCR=47;TR=71;WE=144874374;WS=144874356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
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chr8	144876159	rs7460093	G	A	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=396;ReadPosRankSum=-0.431;SC=TGGGTGGGGTGAGGATGGGCA;SOR=0.708;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=79;TCF=47;TCR=32;TR=26;WE=144876167;WS=144876149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,28:0.34:83
chr8	144877546	rs115359803	C	T	2135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.396;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=25;PP=1524;ReadPosRankSum=-2.200;SC=CCACCGGCCTCGGGCTCCCTG;SOR=1.138;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=90;TCF=58;TCR=32;TR=72;WE=144877554;WS=144877536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,79:0.79:100
chr8	144877835	rs34691721	G	A	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=180;ReadPosRankSum=0.681;SC=GGCTGACCGCGTGGCTGGGGC;SOR=1.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=10;WE=144877843;WS=144877825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr8	144885580	rs13281371	A	G	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=121;ReadPosRankSum=-1.997;SC=TGCTGGCCTCAAAGCCGTCAC;SOR=0.759;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=10;WE=144885588;WS=144885570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
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chr8	144889172	rs10866915	A	G	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=759;ReadPosRankSum=0.413;SC=GCCGCAGGATAGTGAGGGTCA;SOR=0.673;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=136;TCF=68;TCR=68;TR=45;WE=144889180;WS=144889162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,48:0.34:143
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chr8	144890811	.	C	G	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.682;ClippingRankSum=0.000;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.364;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=23;PP=782;ReadPosRankSum=-1.064;SC=ACGGCCCCCTCCTTGTCCTCC;SOR=0.395;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=121;TCF=54;TCR=67;TR=47;WE=144890819;WS=144890801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,52:0.41:128
chr8	144890873	rs10098508	A	T	3052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.80;SOR=1.585;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
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chr8	144894496	rs4875060	G	A	1754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.857;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=32;PP=1331;ReadPosRankSum=-0.183;SC=CGATGGCCTCGGTCACCTCGC;SOR=0.713;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=174;TCF=87;TCR=87;TR=66;WE=144894504;WS=144894486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,73:0.40:183
chr8	144894641	rs4875061	C	T	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=46;PP=1322;SC=TCAAGGCAGACAGCAAGGCCC;SOR=4.534;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=4;TCR=46;TR=50;WE=144894649;WS=144894631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr8	144894702	rs11404566	C	CT	236.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=216;ReadPosRankSum=1.734;SC=CCTACCTTGCCCCACAAGCCT;SOR=2.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=7;WE=144894710;WS=144894692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr8	144895669	rs56748182	G	A	2451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.487;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=39;PP=1963;ReadPosRankSum=-3.267;SC=GGTTCTCCCGGAGCTCCAGGG;SOR=0.434;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=117;TCF=54;TCR=63;TR=78;WE=144895677;WS=144895659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,83:0.67:124
chr8	144900756	rs7833632	A	G	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=181;ReadPosRankSum=0.032;SC=GGCGGCAGGAAGCTGGGCAGC;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=10;WE=144900764;WS=144900746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
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chr8	144911360	rs7461986	A	G	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=3;PP=629;SC=AGACCGCCGCATTCTTGGGAG;SOR=3.841;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=144911368;WS=144911350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr8	144940779	rs11781942	G	A	2510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.304;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=44;PP=2072;ReadPosRankSum=-0.847;SC=CGCTTGACGCGGTCGTCCTCC;SOR=0.479;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=133;TCF=71;TCR=62;TR=86;WE=144940787;WS=144940769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,90:0.65:138
chr8	144942903	rs6558399	T	C	3392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=38;PP=2908;SC=TCGACCAGGGTGGTGACTGCG;SOR=1.462;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=69;TCR=38;TR=107;WE=144942911;WS=144942893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr8	144944161	rs35221054	C	T	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.546;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=747;ReadPosRankSum=-0.278;SC=CCTGGCCGTCCGGTGTGGGGA;SOR=0.711;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=120;TCF=62;TCR=58;TR=39;WE=144944169;WS=144944151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,40:0.33:122
chr8	144944176	rs12542653	T	C	4692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=63;PP=2965;ReadPosRankSum=0.624;SC=TGGGGAAGGTTTCGGAGGAGC;SOR=0.229;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=67;TCR=63;TR=129;WE=144944184;WS=144944166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,131:0.99:132
chr8	144944292	.	C	T	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=630;ReadPosRankSum=1.102;SC=CCTGTGGCCACTTGAGCCTCC;SOR=1.050;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=104;TCF=47;TCR=57;TR=34;WE=144944300;WS=144944282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,34:0.32:107
chr8	144944409	.	C	T	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.643;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.420;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=464;ReadPosRankSum=-0.406;SC=ATGGCACCCTCAGCCCGCTTC;SOR=0.384;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=31;WE=144944417;WS=144944399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,31:0.39:80
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chr8	144946252	rs11136330	C	T	1899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=24;PP=1565;SC=GCCGCAGTGCCAGTGGCCTGT;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=33;TCR=24;TR=57;WE=144946260;WS=144946242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr8	144946345	rs34753358	G	A	2179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=38;PP=1779;SC=CGGCCTGCTCGGCCACCAGGA;SOR=0.980;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=68;WE=144946353;WS=144946335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
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chr8	144990528	rs7014582	A	G	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=279;ReadPosRankSum=0.342;SC=TGCGGGAGCCAGCGGTAGAGC;SOR=0.564;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=62;TCF=33;TCR=29;TR=19;WE=144990536;WS=144990518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,19:0.32:60
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chr8	144992103	rs6558406	T	C	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.268;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=48;PP=989;ReadPosRankSum=1.058;SC=GCTCAAAGGCTGTGCCGGGGC;SOR=0.581;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=218;TCF=59;TCR=159;TR=68;WE=144992111;WS=144992093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,69:0.32:218
chr8	144992361	rs7822511	T	C	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=242;ReadPosRankSum=2.668;SC=CGTCCGACAGTGGCAGGAGCA;SOR=0.741;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=53;TCF=25;TCR=28;TR=18;WE=144992369;WS=144992351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
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chr8	145007325	rs115492306	G	A	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.568;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=10;PP=935;ReadPosRankSum=-0.216;SC=GCCTGGGGCCGTGTGTACCTG;SOR=1.293;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=70;TCF=53;TCR=17;TR=46;WE=145007333;WS=145007315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,47:0.67:70
chr8	145007534	rs7003580	C	T	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.837;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=271;ReadPosRankSum=0.450;SC=AAGGTCGTTGCCATGACTCGG;SOR=0.145;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=63;TCF=10;TCR=53;TR=20;WE=145007542;WS=145007524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,19:0.31:61
chr8	145008342	rs11782331	C	A	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.242;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=611;ReadPosRankSum=0.856;SC=CCTCCCGCTCCGGTCTCCCTG;SOR=1.695;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=71;TCF=11;TCR=60;TR=29;WE=145008350;WS=145008332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,27:0.38:71
chr8	145008443	rs11783772	A	T	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.009;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=360;ReadPosRankSum=0.048;SC=AGGCAGTGACACACCCTCGGG;SOR=0.492;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=57;TCF=31;TCR=26;TR=20;WE=145008451;WS=145008433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,19:0.35:55
chr8	145008560	rs11783799	A	G	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.880;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=400;ReadPosRankSum=-1.404;SC=CCTTCTCCACATCCAGCGGGT;SOR=0.732;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=87;TCF=45;TCR=42;TR=26;WE=145008568;WS=145008550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,28:0.32:88
chr8	145008706	rs11782433	C	T	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=456;ReadPosRankSum=0.271;SC=CCTGGGACAGCCCTGGTCCCA;SOR=0.600;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=61;TCR=17;TR=26;WE=145008714;WS=145008696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,26:0.32:80
chr8	145008931	rs6994460	G	C	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=30;PP=780;ReadPosRankSum=1.369;SC=CAACCACGCCGGGCTCTCAGG;SOR=0.725;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=183;TCF=86;TCR=97;TR=56;WE=145008939;WS=145008921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,56:0.30:185
chr8	145010305	rs6988767	A	G	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=104;ReadPosRankSum=0.682;SC=GGGCCACCAAACCAGCCAGGG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=7;WE=145010313;WS=145010295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr8	145011204	rs6993938	A	G	1532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.544;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=35;PP=1275;ReadPosRankSum=-0.537;SC=GGTTGCCGTCAGCGATGTCAT;SOR=0.629;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=197;TCF=102;TCR=95;TR=73;WE=145011212;WS=145011194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,71:0.36:197
chr8	145012466	rs11136338	A	G	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.901;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=591;ReadPosRankSum=2.363;SC=ATAGGCCCTGAGTGGCTGATC;SOR=0.213;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=87;TCF=32;TCR=55;TR=32;WE=145012474;WS=145012456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,30:0.35:86
chr8	145012777	rs7823393	C	G	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.620;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=15;PP=742;ReadPosRankSum=-0.722;SC=CCCTGTGACACGCACCAGCAT;SOR=0.538;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=116;TCF=76;TCR=40;TR=41;WE=145012785;WS=145012767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,40:0.34:117
chr8	145019304	.	G	C	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.481;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=183;ReadPosRankSum=-0.143;SC=CATTCTCCCAGAGGGCCCTGC;SOR=0.204;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=11;WE=145019312;WS=145019294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr8	145020477	rs12543539	T	C	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.564;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=528;ReadPosRankSum=-1.485;SC=GCCCCGGCCCTCTCCTCTGCC;SOR=1.488;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=78;TCF=46;TCR=32;TR=31;WE=145020485;WS=145020467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,31:0.38:81
chr8	145020636	rs12549853	G	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.32;ReadPosRankSum=0.038;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,8:0.20:40
chr8	145032631	rs72695404	C	T	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=177;ReadPosRankSum=1.967;SC=CCCACATGACCATCCATTAGG;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=10;WE=145032639;WS=145032621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr8	145057868	rs11544989	A	G	2559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=41;PP=2066;SC=CCCTGGGGTCACCTCCTCCTC;SOR=0.809;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=49;TCR=41;TR=89;WE=145057876;WS=145057858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr8	145058037	rs11989052	A	G	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=538;ReadPosRankSum=1.057;SC=GTTGGAATGGATGAAAGATGG;SOR=0.633;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=68;TCF=28;TCR=40;TR=27;WE=145058045;WS=145058027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,31:0.42:73
chr8	145058986	rs11136343	A	G	1768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.481;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=36;PP=1349;ReadPosRankSum=-0.126;SC=CTCCTGCCCCAGCAACCCCTT;SOR=0.646;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=263;TCF=153;TCR=110;TR=87;WE=145058994;WS=145058976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,87:0.32:268
chr8	145059425	rs11136344	T	C	1606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.747;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=1151;ReadPosRankSum=-0.517;SC=GGCTCCAGGATGTCGTAGTGG;SOR=0.405;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=168;TCF=92;TCR=76;TR=70;WE=145059433;WS=145059415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,73:0.41:176
chr8	145060112	rs11136345	G	A	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.716;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=764;ReadPosRankSum=-0.973;SC=CATGTAGTTCGTGATCTGCCT;SOR=0.793;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=110;TCF=63;TCR=47;TR=43;WE=145060120;WS=145060102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,44:0.39:114
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chr8	145107795	rs11136253	G	A	4243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=41;PP=2965;SC=AGTCAAACACGGCGCTGCCCT;SOR=1.724;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=87;TCR=41;TR=128;WE=145107803;WS=145107785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr8	145114643	rs6558292	G	A	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.773;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=401;ReadPosRankSum=-0.267;SC=GGATGCTGGCGATATGACTGG;SOR=0.823;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=63;TCR=46;TR=31;WE=145114651;WS=145114633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,33:0.28:116
chr8	145114844	rs7004867	C	T	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FS=1.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=0.000;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.944;SOR=0.855;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:188,72:0.28:260
chr8	145114924	rs7003860	G	C	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=44;PP=876;ReadPosRankSum=0.503;SC=AGCGGCCCTCGGGGCTGCCCA;SOR=0.627;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=169;TCF=47;TCR=122;TR=62;WE=145114932;WS=145114914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,61:0.35:173
chr8	145138477	rs11546475	G	C	1573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.297;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=47;PP=1257;ReadPosRankSum=-0.955;SC=GTATCACCTTGCGGGGGTGTC;SOR=0.501;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=83;TCF=11;TCR=72;TR=55;WE=145138485;WS=145138467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,56:0.66:85
chr8	145139522	rs6558295	C	G	1456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.135;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=1044;ReadPosRankSum=1.375;SC=AGTAAGTAGTCTCTGGTCCCC;SOR=0.355;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=152;TCF=93;TCR=59;TR=58;WE=145139530;WS=145139512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,62:0.38:164
chr8	145139727	rs4977165	C	T	2710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=57;PP=2035;ReadPosRankSum=-0.801;SC=TCGTCTCCATCGGCCTCTACA;SOR=0.704;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=298;TCF=145;TCR=153;TR=113;WE=145139735;WS=145139717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,117:0.38:306
chr8	145140472	rs1127096	A	G	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.277;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=766;ReadPosRankSum=-0.576;SC=CCTTTGTCTTACAGGGTGGTA;SOR=0.906;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=152;TCF=88;TCR=64;TR=43;WE=145140480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,43:0.28:155
chr8	145141103	rs113658965	GTC	G	671.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.215;NF=3;NR=11;PP=527;ReadPosRankSum=-0.202;SC=ATAAATGAGTGTCTGTTTCAG;SOR=0.804;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=14;WE=145141112;WS=145141093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr8	145141143	rs55750616	G	A	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=160;ReadPosRankSum=1.348;SC=CCCGCTGTCCGTGTAGGGCCC;SOR=0.467;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=11;WE=145141151;WS=145141133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr8	145149823	rs13256214	G	T	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.63;ReadPosRankSum=-1.111;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr8	145149860	rs6984764	A	G	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=30;ReadPosRankSum=0.328;SC=CGCGACCGGGACCAGCGCGCT;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=4;WE=145149868;WS=145149850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr8	145150101	rs11541475	T	G	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.468;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=338;ReadPosRankSum=-1.191;SC=GCAGCGCGCGTCCCGGGCAGC;SOR=3.244;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=16;WE=145150109;WS=145150091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr8	145150832	rs7820984	A	G	2611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=35;PP=2049;SC=GGGGCTGGCCATGGCTCTGCA;SOR=1.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=57;TCR=35;TR=92;WE=145150840;WS=145150822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr8	145151665	rs200379271	TGGCAGTGGGCATGTGGAATACTTCTCC	TCAGTGGGCATGTGGAATACTTCTCC,T	3472.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.579;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=2915;ReadPosRankSum=0.220;SC=GCCTCCAGTCTGGCAGTGGGC;SOR=0.523;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=88;TCF=4;TCR=84;TR=25;WE=145151701;WS=145151655;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.58:154
chr8	145151668	.	CAGTGGGCATGTGGAATACTTCTCCA	C	3451.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.000;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=4.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.71;ReadPosRankSum=0.322;SOR=0.390;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,89:0.56:159
chr8	145151693	.	A	C	2485	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=24;PP=2485;QD=100.790848502;SC=ATACTTCTCCACTACCCCCAG;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=85;TCF=8;TCR=77;TR=25;WE=145151701;WS=145151655;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:60,25:0.29:85
chr8	145154257	rs11541804	C	G	2816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.434;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=46;PP=2312;ReadPosRankSum=-0.085;SC=AGAGGCAAGGCTGCGCTCAGG;SOR=1.043;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=181;TCF=98;TCR=83;TR=106;WE=145154265;WS=145154247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,104:0.58:178
chr8	145154910	rs11541805	G	A	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=304;ReadPosRankSum=-0.446;SC=GCTTCCGGGGGACTGGGCAGG;SOR=0.593;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=20;WE=145154918;WS=145154900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,21:0.38:56
chr8	145158446	rs12549149	C	T	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=208;ReadPosRankSum=-1.195;SC=CGCCCTCCGCCCCCACTCACC;SOR=1.022;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=12;WE=145158454;WS=145158436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr8	145158503	rs11136254	G	T	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.899;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=4;PP=155;ReadPosRankSum=1.908;SC=CGCCCAGGCCGCTCAGGGTCC;SOR=0.495;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=9;WE=145158511;WS=145158493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
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chr8	145161823	rs11546144	G	A	1780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.156;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=14;PP=1363;ReadPosRankSum=1.563;SC=AAGCAGAAGCGGGGGCAGTGG;SOR=1.580;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=92;TCF=69;TCR=23;TR=66;WE=145161831;WS=145161813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,66:0.72:92
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chr8	145168298	rs5895787	T	TG	872.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=0;PP=939;SC=GTGTCCAGGCTGGGGAATCCA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=24;WE=145168306;WS=145168288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr8	145168611	rs7463214	A	G	2582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=51;PP=2204;SC=GCCATCCCAAACCCAGTGGCA;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=26;TCR=51;TR=77;WE=145168619;WS=145168601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr8	145168824	rs7836836	T	C	2302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.311;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=38;PP=1690;ReadPosRankSum=-0.137;SC=CCACGGGAGGTGGGCTTACAC;SOR=0.923;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=140;TCF=82;TCR=58;TR=94;WE=145168832;WS=145168814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,94:0.68:139
chr8	145169485	rs144716343	T	C	1981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=0.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.87;ReadPosRankSum=1.106;SOR=0.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,56:0.34:167
chr8	145169489	rs148527973	G	C	1929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=0.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.56;ReadPosRankSum=1.642;SOR=0.664;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,55:0.33:167
chr8	145170353	rs59976468	T	A	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.798;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=294;ReadPosRankSum=1.217;SC=CTCTCGCAGGTCTCAGAGGTG;SOR=2.428;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=18;WE=145170361;WS=145170343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,19:0.32:60
chr8	145170440	rs12543080	A	C	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=297;ReadPosRankSum=0.254;SC=CTGGCACCCAAGCGCAGCTGG;SOR=0.999;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=15;WE=145170448;WS=145170430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr8	145170704	rs13278106	A	T	1981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=50;PP=1748;SC=CACCCGCCAGAGCCCTACACG;SOR=1.230;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=24;TCR=50;TR=74;WE=145170712;WS=145170694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr8	145171003	rs4977193	G	C	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=4;PP=764;SC=GGCCCCATGCGGTCCCGGCTC;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=145171011;WS=145170993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr8	145171201	rs1132230	A	G	5546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=99;PP=2965;SC=AGCTGACCGGACTGGTGGCCT;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=177;TCF=78;TCR=99;TR=177;WE=145171209;WS=145171191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr8	145223191	rs6982878	G	A	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=377;SC=AGGCTTTGTCGCTGCAGAGCT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=145223199;WS=145223181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	145223288	rs34819224	C	T	1827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=12;PP=1642;ReadPosRankSum=-0.810;SC=CTCGGGGAGGCGCGGCCGGTG;SOR=1.833;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=69;TCF=57;TCR=12;TR=67;WE=145223296;WS=145223278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr8	145223499	rs6558308	G	A	1551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=45;PP=1276;SC=CTATGTCAGGGTGGGTAACCT;SOR=6.358;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=46;WE=145223507;WS=145223489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr8	145234508	rs7842771	G	C	4801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=96;PP=2965;SC=CAGGCCCTCTGGCCTCGCAGA;SOR=1.035;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=71;TCR=96;TR=167;WE=145234516;WS=145234498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr8	145245631	rs6558318	T	C	1137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=0;PP=1035;SC=ACATAGGTGCTGAGGATCGTC;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=35;WE=145245639;WS=145245621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr8	145245944	rs10108542	A	G	1750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=47;PP=1418;SC=TTGCATTGGCAAGCAGAGGTG;SOR=5.058;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=50;WE=145245952;WS=145245934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr8	145247168	rs6988451	G	A	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=2;PP=187;SC=CAGTTCGGGCGGCTGGAGGTA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=145247176;WS=145247163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	145254033	rs377492905	G	A	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.975;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=517;ReadPosRankSum=1.927;SC=AGATCTGTGTGCCTGTGGAGT;SOR=0.325;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=125;TCF=75;TCR=50;TR=38;WE=145254041;WS=145254023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,43:0.33:132
chr8	145254159	rs7464776	T	C	2526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=61;PP=1877;SC=ACAGGGTCACTGCCTGCTGTA;SOR=2.147;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=19;TCR=61;TR=80;WE=145254167;WS=145254149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr8	145255553	rs6558320	C	G	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=18;PP=604;SC=GCTTTGAATTCTCTAGAAAGA;SOR=2.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=145255561;WS=145255543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr8	145536169	rs35680822	C	G	910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=2;PP=686;SC=TCAGCCACCCCTCCTGCTGCC;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=31;WE=145536177;WS=145536159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr8	145537328	rs62530368	T	G	931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.12;SOR=6.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr8	145541766	rs55962377	G	T	3191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.402;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=74;PP=2513;ReadPosRankSum=-1.071;SC=ACCGCGGTAGGTCAGATTGTC;SOR=1.142;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=187;TCF=70;TCR=117;TR=111;WE=145541774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,116:0.60:194
chr8	145542316	rs141056262	G	A	1497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.833;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=1081;ReadPosRankSum=1.392;SC=TCCCAGGAGCGCACACAGCAG;SOR=0.652;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=84;TCF=41;TCR=43;TR=53;WE=145542324;WS=145542306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,57:0.65:88
chr8	145542375	rs55907012	T	C	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.777;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=367;ReadPosRankSum=0.974;SC=CGCCAGGCGCTTCTCAACCTG;SOR=1.095;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=90;TCF=43;TCR=47;TR=24;WE=145542383;WS=145542365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,26:0.27:95
chr8	145557497	rs7013127	A	C	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=9;NR=5;PP=231;SC=GCGGCGGCAGAGCCGGCATTG;SOR=1.473;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=14;WE=145557505;WS=145557487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr8	145577824	rs880701	C	G	5139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.93;SOR=1.530;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr8	145577829	rs880702	A	C	5087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.43;SOR=1.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr8	145577999	rs2272664	T	A	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=16;PP=517;SC=AGACTGGGGGTGGCGCGGCGC;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=145578007;WS=145577989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	145578296	rs2272663	A	G	1566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=3;PP=1155;SC=CCTGCTGCACAAATGGGTAGA;SOR=4.731;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=48;TCR=3;TR=51;WE=145578304;WS=145578286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr8	145579949	.	G	GGCCGCT	3009.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.08;QD=48.54;SOR=1.057;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr8	145579951	.	A	ACC	3190.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.89;QD=53.18;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr8	145579954	.	G	GGCACGGCACAAGGGCCCCCACACCTCACGTGCCTGGCCACAACCCAGAACAA	4696.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.96;QD=75.75;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr8	145580984	rs2272666	A	G	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=4;PP=647;SC=CAGGCAGGCAAGCAGACATCC;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=145580992;WS=145580974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr8	145581557	rs2280840	G	A	891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=7;PP=756;SC=CCAACTGGGCGCCTAAGGGGC;SOR=2.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=28;WE=145581565;WS=145581547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr8	145582839	rs3817681	T	C	2074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=12;PP=1671;SC=TCTGTTTCTTTCAAGCTAGAA;SOR=2.694;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=49;TCR=12;TR=61;WE=145582847;WS=145582829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr8	145603114	rs6599528	A	C	5285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=110;PP=2965;SC=TGCTGCACAGAAGGCAGAAGC;SOR=1.938;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=157;TCF=46;TCR=111;TR=156;WE=145603122;WS=145603104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr8	145615776	rs1383095	G	A	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=19;NR=2;PP=546;SC=AGGGCTGGCCGGGGTGAGGCT;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=145615784;WS=145615766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr8	145617534	rs148509143	TGGGGGTGCAAGGTGA	T	1385.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=20;NR=1;PP=2969;SC=GCAGCCGCACTGGGGGTGCAA;SOR=4.680;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=21;WE=145617556;WS=145617524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr8	145618309	rs1052951	G	A	1943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.19;SOR=3.516;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr8	145618312	rs1052952	G	A	1943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.28;SOR=4.125;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr8	145618862	rs2272661	C	G	1676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=30;PP=1301;SC=GTGCTGCACGCGGGCGGGGCC;SOR=0.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=20;TCR=31;TR=50;WE=145618870;WS=145618852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr8	145620296	rs2280837	C	G	3405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=61;PP=2880;SC=ACCCCACCCCCGCCGGCCCAG;SOR=0.865;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=52;TCR=63;TR=112;WE=145620304;WS=145620286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr8	145621556	rs2280836	A	G	263.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=1;PP=224;SC=AACCGGCCGGACCCCACCTGT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=145621564;WS=145621546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr8	145622923	rs2977835	T	C	3917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=81;PP=2965;SC=CCCCAGGGACTCAAGCCCCTA;SOR=1.797;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=36;TCR=81;TR=117;WE=145622931;WS=145622913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr8	145623098	rs2977834	T	C	4064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=59;PP=2965;SC=TGGACTGCTGTGGGGAGAGGG;SOR=0.905;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=72;TCR=59;TR=131;WE=145623106;WS=145623088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr8	145623378	.	CCCCACCACCGTCCCCACCCACCTACCTCCTTCCAGCAGGCGGATG	C	1981.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.14;QD=46.09;SOR=3.417;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr8	145623446	rs56293142	C	G	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.45;QD=49.67;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr8	145623881	rs141269368	C	CCCCAGGT	8764.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.256;NF=59;NR=35;PP=2982;ReadPosRankSum=-0.378;SC=GGGACCCCAGCCCCAGGTCCC;SOR=0.745;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=149;TCF=87;TCR=62;TR=94;WE=145623889;WS=145623871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,178:0.99:179
chr8	145623963	rs4317614	G	A	9794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.170;NF=129;NR=178;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.741;SC=GTCTGCGGCCGTCGTCGTCTG;SOR=0.366;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=308;TCF=129;TCR=179;TR=307;WE=145623971;WS=145623953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,324:1.00:325
chr8	145624640	rs2293963	C	T	5405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=58;PP=2965;SC=CTGGCTGGGACGGGGGCCCTG;SOR=1.504;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=111;TCR=58;TR=169;WE=145624648;WS=145624630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr8	145625283	rs2291135	T	C	2195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=30;PP=1766;SC=AATTCTGAGTTGGGGATGGGG;SOR=1.288;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=46;TCR=31;TR=75;WE=145625291;WS=145625273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr8	145639320	rs736676	G	C	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=248;ReadPosRankSum=-0.817;SC=CACCCGCCGGGTACCTTCCCA;SOR=0.871;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=14;WE=145639328;WS=145639310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,14:0.25:55
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chr8	145639726	rs2272662	T	C	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.371;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=750;ReadPosRankSum=1.935;SC=ATGTAGTGGGTGACCCCCCTG;SOR=0.377;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=66;TCF=35;TCR=31;TR=40;WE=145639734;WS=145639716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,43:0.62:69
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chr8	145657761	rs34599999	G	A	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.360;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=36;PP=1069;ReadPosRankSum=-1.013;SC=GGGTGCCGGCGGGCAGGCTCT;SOR=0.437;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=71;TCF=16;TCR=55;TR=49;WE=145657769;WS=145657751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,50:0.66:76
chr8	145660833	rs1010427	G	A	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.359;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=228;ReadPosRankSum=0.250;SC=GGTGGGCTGCGGGGTAGGGCA;SOR=0.941;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=15;WE=145660841;WS=145660823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,15:0.31:49
chr8	145661320	rs2721140	G	A	2039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.127;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=56;PP=1739;ReadPosRankSum=0.858;SC=GCCAGTCCCCGGCCAGGCACT;SOR=1.966;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=107;TCF=28;TCR=79;TR=70;WE=145661328;WS=145661310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,70:0.66:106
chr8	145661675	rs7830832	G	A	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.029;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=15;PP=1062;ReadPosRankSum=1.699;SC=CCTGACATGGGCCTGAGAGGC;SOR=1.345;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=65;TCF=43;TCR=22;TR=48;WE=145661683;WS=145661665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,50:0.74:68
chr8	145663814	rs13255086	A	G	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=117;ReadPosRankSum=1.169;SC=CAGCTCCTCCATGCTAGGCAG;SOR=0.420;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=13;WE=145663822;WS=145663804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr8	145665407	rs2229315	C	T	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.462;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=436;ReadPosRankSum=-0.969;SC=CCCTCACCGCCCTCTGAGAGC;SOR=1.089;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=75;TCF=66;TCR=9;TR=22;WE=145665415;WS=145665397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,23:0.30:77
chr8	145665516	rs2306383	T	C	4422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=82;PP=2965;SC=TGAGCTCCCGTAGTCTGGTTT;SOR=1.204;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=51;TCR=82;TR=133;WE=145665524;WS=145665506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr8	145665637	rs2620650	A	G	2795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=45;PP=2206;SC=GGGGCTGTGGACGCAGAGAAA;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=41;TCR=45;TR=86;WE=145665645;WS=145665627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr8	145665699	rs2721188	C	T	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.536;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=913;ReadPosRankSum=-0.793;SC=CTGGGCTCACCGGGGAGCCAG;SOR=1.055;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=63;TCF=30;TCR=33;TR=41;WE=145665707;WS=145665689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,44:0.66:67
chr8	145665761	rs2229313	G	A	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=481;ReadPosRankSum=1.174;SC=GGGCCTGCTGGGCACAGCTGA;SOR=0.714;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=73;TCF=34;TCR=39;TR=26;WE=145665769;WS=145665751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,26:0.36:73
chr8	145667405	rs2242264	C	G	1558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=2;PP=1311;SC=GCCCCATTCGCACCCCCAGGC;SOR=5.376;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=44;WE=145667413;WS=145667395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr8	145668042	rs741969	G	A	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.91;ReadPosRankSum=0.855;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,39:0.27:143
chr8	145668443	rs760477	G	A	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.020;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=4;PP=1443;ReadPosRankSum=-1.270;SC=GATTGCCCAAGGAGGCTGCGG;SOR=0.175;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=85;TCF=81;TCR=4;TR=59;WE=145668451;WS=145668433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,62:0.70:88
chr8	145668481	rs2242263	C	T	2888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=11;PP=2229;ReadPosRankSum=-0.978;SC=CTCTTCGGCCCGAAGTTCAGG;SOR=0.820;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=141;TCF=125;TCR=16;TR=95;WE=145668489;WS=145668471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,101:0.68:149
chr8	145677469	rs2245052	A	G	1046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=0;PP=940;SC=CCTTGCAGGGATGGTGAAGCC;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=145677477;WS=145677459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr8	145677973	rs2256094	C	T	3637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=93;PP=2965;SC=GCAGGTACATCACTCACAGAC;SOR=2.624;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=24;TCR=93;TR=117;WE=145677981;WS=145677963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr8	145678020	rs1871538	C	T	1921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=55;PP=1674;SC=AGCTGTCCTCCCATATGGCTT;SOR=5.856;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=57;TCF=2;TCR=55;TR=57;WE=145678028;WS=145678010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
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chr8	145690308	rs2721166	C	T	5708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=108;NR=72;PP=2965;SC=GCAGTATGTACGAGGACACAG;SOR=1.161;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=181;TCF=109;TCR=72;TR=180;WE=145690316;WS=145690298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
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chr8	145690396	rs2620645	A	C	5299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=100;PP=2965;SC=CACTCTAGTAAGCCCAGGTTC;SOR=1.042;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=72;TCR=100;TR=172;WE=145690404;WS=145690386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr8	145691915	rs112422823	G	C	2318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=60;PP=1938;SC=AGCGGGGCTGGCCGTGCAGCC;SOR=3.881;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=8;TCR=60;TR=68;WE=145691923;WS=145691905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr8	145692110	rs2306388	C	T	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=365;ReadPosRankSum=0.870;SC=CTGCCTGCCCCCCTCCTCAGG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=14;WE=145692118;WS=145692100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr8	145692296	rs2250895	A	C	2043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=26;PP=1548;SC=GGCCTGGCTCAAGCACGTGAC;SOR=1.092;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=31;TCR=26;TR=57;WE=145692304;WS=145692286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr8	145692385	rs2250891	C	T	1961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=29;PP=1537;SC=CAGCCGAGGGCCGCGCGGCCG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=35;TCR=30;TR=63;WE=145692393;WS=145692375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr8	145692762	rs2291133	G	T	6318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.578;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=64;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.800;SC=GAACTCTGGAGGGAGCAAATC;SOR=1.335;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=192;TCF=127;TCR=65;TR=191;WE=145692770;WS=145692752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,197:0.99:198
chr8	145692812	rs2250779	C	T	8589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=175;NR=91;PP=2965;SC=GGGTCATGTTCCGGAAGATTT;SOR=1.531;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=267;TCF=175;TCR=92;TR=266;WE=145692820;WS=145692802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr8	145693720	rs2250657	A	G	2588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=51;PP=2067;SC=AGGAGGAGGCAGAGGCATTGC;SOR=1.153;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=32;TCR=51;TR=83;WE=145693728;WS=145693710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr8	145697244	rs4925823	G	A	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=8;PP=1052;SC=ACCTGCCTTCGTGGCACTCCC;SOR=2.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=41;WE=145697252;WS=145697234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr8	145699601	rs2721176	T	C	2238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=0;PP=1863;SC=GAGGGAGGAGTGGCCCCTGTC;SOR=8.468;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=66;TCR=0;TR=66;WE=145699609;WS=145699591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr8	145737636	rs4925828	A	G	7154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=106;PP=2965;SC=TCAGCGGTCAAGTCCCCCGGG;SOR=0.702;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=214;TCF=108;TCR=106;TR=213;WE=145737644;WS=145737626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr8	145738767	rs11342077	CG	C	4747.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=54;PP=2951;SC=CACCACCACCCGGCAACTGGC;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=62;TCR=59;TR=112;WE=145738775;WS=145738757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr8	145739188	.	GAGGGGTCGGCGTGGGCGGTGGGGAGTGAGA	G	81.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=13.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQRankSum=0.967;QD=8.17;ReadPosRankSum=2.189;SOR=3.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr8	145739218	rs13267993	A	T,G	70.77	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=15.441;HP=1;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4,5;NR=9,0;PP=269,45;ReadPosRankSum=-2.450;SC=GGGGAGTGAGAAGGGGTCGGC;SOR=3.220;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=13,5;WE=145739226;WS=145739208;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.50:8
chr8	145739392	.	C	T	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=151;ReadPosRankSum=2.883;SC=TCAGGCTCTTCAGCCACAGCC;SOR=0.903;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=11;WE=145739400;WS=145739382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,11:0.22:49
chr8	145742514	rs2721190	A	G	2328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=50;PP=1776;SC=CCTGGCGTAGACTGTGGACTC;SOR=2.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=17;TCR=50;TR=67;WE=145742522;WS=145742504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr8	145742716	rs2721189	C	A	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=3;PP=328;SC=TGCCCCACGGCGGCCTGGCCG;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=145742724;WS=145742706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr8	145742879	rs2306386	T	C	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.152;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=287;ReadPosRankSum=-0.215;SC=GAGTGCGGTATTCCCGGTAGA;SOR=0.509;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=45;TCF=18;TCR=27;TR=19;WE=145742887;WS=145742869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr8	145745182	rs2721172	T	C	4881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=107;NR=36;PP=2965;SC=GGCCCTGCCCTTGCTGCCACG;SOR=2.211;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=107;TCR=36;TR=143;WE=145745190;WS=145745172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr8	145754073	.	GCCC	G	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=5;NR=0;PP=107;SC=ACAGAGCCACGCCCCCCCCCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=145754083;WS=145754063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr8	145754314	.	C	T	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=235;ReadPosRankSum=-0.242;SC=CCTCCCGCGCCGGAAGCGACC;SOR=0.567;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=13;WE=145754322;WS=145754304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr8	145756170	rs873884	G	A	2485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=57;PP=1924;SC=CCTCGGGGCTGTCGTAGTGCG;SOR=1.788;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=23;TCR=57;TR=80;WE=145756178;WS=145756160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr8	145806681	rs2620647	A	G	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=13;PP=452;SC=GACAGGGTTAAGGCGGCTGGA;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=145806689;WS=145806671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr8	145830757	rs4541972	A	G	1618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=4;PP=1283;SC=TGAGGGCTGCACTGTGCACAG;SOR=4.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=51;TCR=4;TR=55;WE=145830765;WS=145830747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr8	145830894	rs5895822	CT	C	6293.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=82;PP=2951;SC=GCCCGGGCAGCTTCCGCAGGT;SOR=0.777;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=141;TCF=57;TCR=84;TR=139;WE=145830902;WS=145830884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr8	145979138	rs35571769	C	T	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.122;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=521;ReadPosRankSum=-0.175;SC=GTTCCTTCCCCTGCTCCAGCT;SOR=1.981;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=26;WE=145979146;WS=145979128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
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chr8	146003567	rs2294120	A	G	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=513;ReadPosRankSum=-1.429;SC=GACAGGGACTACTGCAGCCCA;SOR=0.788;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=20;TCR=63;TR=28;WE=146003575;WS=146003557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,28:0.34:82
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chr8	146218509	rs6599549	C	T	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=50;ReadPosRankSum=0.355;SC=GTGTGAAATACATATTTGGTC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=5;WE=146218517;WS=146218499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
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chr8	146228622	rs2294043	C	A	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FS=7.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.95;ReadPosRankSum=0.201;SOR=0.393;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:257,71:0.22:328
chr8	146228779	rs77308683	T	A	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.459;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=811;ReadPosRankSum=-1.647;SC=CCTATTGCGGTGGAGCTGGAG;SOR=0.522;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=138;TCF=57;TCR=81;TR=46;WE=146228787;WS=146228769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,46:0.33:141
chr8	146279349	rs147393774	G	A	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=8;PP=1125;ReadPosRankSum=0.259;SC=AACTGTACAGGTAATGTTAAT;SOR=0.760;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=88;TCF=73;TCR=15;TR=51;WE=146279357;WS=146279339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,52:0.57:91
chr9	214706	rs540473	G	C	3341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=43;PP=2892;SC=CCCCAGTATCGGGAGGCCAGT;SOR=1.158;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=65;TCR=43;TR=107;WE=214714;WS=214696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr9	214861	.	G	A	8269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=153;PP=2965;SC=TTCCAGCGCCGACCGACAGAC;SOR=0.951;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=270;TCF=117;TCR=153;TR=270;WE=214869;WS=214851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr9	215057	rs481905	T	C	3257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.82;QD=44.02;SOR=1.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr9	215060	rs141134256	G	T	3187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.81;QD=44.90;SOR=1.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	215269	rs636922	A	C	2916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=51;PP=2275;SC=GGATGTCCTCAGCCGCCGGGG;SOR=0.733;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=102;TCF=51;TCR=51;TR=101;WE=215277;WS=215259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr9	271638	rs506121	C	T	4242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=25;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.827;SC=TATTCTTCAGCGGAAATAAGG;SOR=1.639;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=136;TCF=111;TCR=25;TR=133;WE=271646;WS=271628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,135:0.99:136
chr9	286593	rs529208	C	A	5033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=51;PP=2965;SC=GGTGTTCACGCCAAAGGAATG;SOR=1.639;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=102;TCR=51;TR=153;WE=286601;WS=286583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr9	316998	rs2296824	C	T	3734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=70;NR=45;PP=2965;SC=TTGGAGCTCCCCACAGAATTC;SOR=1.208;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=71;TCR=45;TR=115;WE=317006;WS=316988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr9	317195	rs10813355	G	A	1556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=44;PP=1255;SC=CAAATGTTGTGTTTATTATCA;SOR=4.935;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=47;WE=317203;WS=317185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr9	317218	rs3818557	A	C	1001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=28;PP=857;SC=GCTTGAATCAAAGCGGAGCTC;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=317226;WS=317208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	325811	rs3831138	T	TC	3972.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=60.54;NF=3;NR=73;PP=2936;SC=TGTTTTTAAATTTCTTTGCAG;SOR=5.023;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=91;TCF=4;TCR=87;TR=76;WE=325825;WS=325801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr9	325817	rs2360277	T	C	3598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=68;PP=1678;SC=TAAATTTCTTTGCAGCAAGAA;SOR=5.918;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=71;TCF=3;TCR=68;TR=71;WE=325825;WS=325801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr9	328006	rs2296828	T	C	2044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=15;PP=1539;SC=TATTTCACTTTGCTGCTCATT;SOR=2.267;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=47;TCR=15;TR=62;WE=328014;WS=327996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	334337	rs10970979	A	G	3023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=68;PP=2249;ReadPosRankSum=-0.974;SC=AGCTTCTTCAATGTCTCCACC;SOR=0.949;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=95;TCF=26;TCR=69;TR=94;WE=334345;WS=334327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr9	376929	rs7020921	A	G	3525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=33;PP=2672;SC=TCCACTGGTGAACATTGATGG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=70;TCR=34;TR=102;WE=376937;WS=376919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr9	379965	rs10758420	T	C	2850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=91;PP=2283;SC=GGGACTCTGGTGGGCGGGGCA;SOR=4.701;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=8;TCR=91;TR=99;WE=379973;WS=379955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr9	407114	rs374612678	G	C	2642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=66;PP=2203;ReadPosRankSum=-0.750;SC=CAAAAAAACAGATGTTCTTTA;SOR=1.390;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=17;TCR=67;TR=83;WE=407122;WS=407104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr9	421032	rs2297079	C	G	3006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=64;PP=2288;SC=AGGCTTTGCTCCGTGGGGAAG;SOR=1.814;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=92;TCF=27;TCR=65;TR=91;WE=421040;WS=421022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr9	421980	rs2297081	T	A	6040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=107;NR=75;PP=2965;SC=GAGCTTGTTATGAACTTCTGG;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=107;TCR=75;TR=182;WE=421988;WS=421970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr9	422157	rs10217719	T	C	4330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=115;PP=2965;SC=GGCAACTTTCTGCTACTTTTA;SOR=2.494;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=33;TCR=115;TR=148;WE=422165;WS=422147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr9	429719	rs7854035	T	C	1913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=25;PP=1572;SC=ACTTACTCTTTGAAGAGGAGG;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=40;TCR=25;TR=65;WE=429727;WS=429709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr9	432081	rs1329377	T	C	2611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=0;PP=2342;SC=GAGGAGTTGTTTGTGTCTGGC;SOR=8.688;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=74;TCF=74;TCR=0;TR=74;WE=432089;WS=432071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr9	432140	rs34439675	CTT	C	3291.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.245;NF=72;NR=15;PP=1161;ReadPosRankSum=0.678;SC=TTTACTTCATCTTTTTTTTTT;SOR=1.915;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=157;TCF=122;TCR=35;TR=87;WE=432162;WS=432130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,103:0.99:104
chr9	432330	rs7036567	C	G	9353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=190;PP=2965;SC=CCCAGGTACACCGAAGCACAT;SOR=1.634;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=284;TCF=93;TCR=191;TR=283;WE=432338;WS=432320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr9	432503	rs7046598	T	C	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=19;PP=545;SC=AATACATCCATCACTGTCCCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=432511;WS=432493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	433697	rs7020380	T	A	1034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=1;PP=849;SC=TCTCATAAACTCCTGGGCTGG;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=433716;WS=433687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	433708	rs7041371	C	T	1247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=1;PP=969;SC=CCTGGGCTGGCGAAGATGAAA;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=36;WE=433716;WS=433687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	433978	rs2360712	A	G	3969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=68;PP=2965;SC=ATGTACAGGTAAGCTTTCCTG;SOR=1.078;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=49;TCR=68;TR=117;WE=433986;WS=433968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr9	439102	rs10733508	G	C	1223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=2;PP=1022;SC=AGATACTCTCGGGGTAGAATT;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=36;WE=439110;WS=439092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	439453	rs10758598	G	C	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=457;SC=GGGGTGCTGGGAACACCTGGT;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=439461;WS=439443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	441827	rs10974467	C	T	2089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=11;PP=1628;SC=CTCAGTGGCTCCTCAGGATGA;SOR=2.904;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=63;TCF=51;TCR=12;TR=62;WE=441835;WS=441817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	441952	rs1887957	G	A	6546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=134;NR=72;PP=2965;SC=ATGAACAGGAGTTTGTCTACA;SOR=1.456;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=206;TCF=134;TCR=72;TR=206;WE=441960;WS=441942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr9	446352	rs10814952	G	C	3566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=30;PP=2723;SC=TTCTCCCTCCGTGCCTTTTCC;SOR=1.828;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=76;TCR=30;TR=105;WE=446360;WS=446342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr9	450060	rs10121936	A	G	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=202;SC=CCTACACTTAACCTGAACACC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=450068;WS=450050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	451957	rs181571163	A	G	531.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=83;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.794;NF=27;NR=0;PP=719;ReadPosRankSum=0.087;SC=GTGTGTGTGTATATATATATA;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=27;WE=451965;WS=451947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,21:0.88:24
chr9	712137	rs912175	G	C	5380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=66;PP=2965;SC=AAATTGAGCTGCAACAGCAGA;SOR=1.031;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=92;TCR=66;TR=158;WE=712145;WS=712127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr9	712156	rs912174	T	G	6281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=77;PP=2965;ReadPosRankSum=0.977;SC=GACCATAGAATCCTTGAAGGA;SOR=0.383;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=110;TCR=77;TR=186;WE=712164;WS=712146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,192:0.99:193
chr9	740769	rs138751582	CT	C	267.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FS=2.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;QD=2.21;ReadPosRankSum=1.082;SOR=0.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,34:0.28:121
chr9	742342	rs10733535	A	G	4041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=99;PP=2965;SC=GCGAGCACGGACACGTGGAGA;SOR=2.603;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=25;TCR=99;TR=124;WE=742350;WS=742332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr9	842315	rs56130013	AC	A	411.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=413;SC=GCTCACTGCAACCTCCGCTTC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=842323;WS=842305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	2039776	.	A	ACAGCAGCAG,ACAGCAG	1478.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.18;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=21,21;NR=8,8;PP=77,782;SC=AGCAGCAGCAACAGCAGCAGC;SOR=2.833;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=29,29;WE=2039784;WS=2039766;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:37
chr9	2170512	rs3793511	G	C	4264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=55;PP=2965;SC=CTAAATACAGGTATCCCTCGT;SOR=0.983;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=74;TCR=55;TR=129;WE=2170520;WS=2170502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr9	2182062	rs2281786	A	G	1477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=3;PP=1203;SC=AGGGAAAATCAGGCTTTGTTA;SOR=5.097;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=50;TCR=3;TR=53;WE=2182070;WS=2182052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	2717676	rs11793555	T	G	3208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=11;PP=1910;SC=CTAGAGGCAGTGAGCAGGTGA;SOR=3.105;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=55;TCR=11;TR=66;WE=2717684;WS=2717666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	2717698	rs7029012	C	G	3990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=20;PP=2406;SC=GGACCCCTACCACAGCCAGGA;SOR=2.768;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=102;TCF=82;TCR=20;TR=101;WE=2717706;WS=2717688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr9	2717922	rs10967705	C	G	7114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=123;PP=2965;SC=ACGAAGACGGCGAGGAGGAGG;SOR=1.008;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=217;TCF=94;TCR=123;TR=217;WE=2717930;WS=2717912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr9	2718654	rs7859993	G	A	5508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=61;PP=2965;SC=TGGAGCACGTGGAGATGCTGT;SOR=1.382;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=170;TCF=109;TCR=61;TR=170;WE=2718662;WS=2718644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr9	2718717	rs7860945	C	T	5490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.059;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=88;PP=2965;ReadPosRankSum=1.609;SC=CCACGCCCGACCTGAGGCGCT;SOR=0.277;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=174;TCF=86;TCR=88;TR=173;WE=2718725;WS=2718707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,179:0.99:180
chr9	2811505	rs2270888	G	A	4747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=48;PP=2965;SC=CTTCTTGGGCGTGTTCTTGCA;SOR=1.625;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=96;TCR=48;TR=143;WE=2811513;WS=2811495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr9	2828765	rs2173904	C	G	1894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=21;PP=1513;SC=GTCCAGAGTTCGGTGATCTGC;SOR=1.217;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=55;TCF=33;TCR=22;TR=54;WE=2828773;WS=2828755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr9	2831149	rs2292000	A	C	2298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=29;PP=1813;SC=GGAGAAGACAAACCTAAACAA;SOR=0.971;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=68;WE=2831157;WS=2831139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	2833267	rs10217194	T	C	2167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=18;PP=1655;SC=GAAACAATGATAAGATCATCT;SOR=2.173;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=48;TCR=18;TR=66;WE=2833275;WS=2833257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr9	3228700	rs643429	A	C	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=1;PP=344;SC=TGGAGAAATAATGAAAAGACA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=3228708;WS=3228690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	3262803	rs635647	T	C	1238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=36;NR=0;PP=1064;SC=AACTCCTCTCTTTCAGAACAC;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=3262811;WS=3262793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	3263224	rs633893	T	C	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=302;SC=TGAGAGAGTTTACTTGTAAAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=3263232;WS=3263214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	3452432	rs117354426	T	C	983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=19;PP=725;SC=GTCTATAAAATAATAAAAATA;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=3452440;WS=3452422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	3879693	rs4740742	C	T	2978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=76;PP=2491;SC=GAGGGGCTTGCTTGTTTTTCT;SOR=2.935;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=14;TCR=76;TR=90;WE=3879701;WS=3879683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr9	3898509	rs10758532	A	T	1448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=0;PP=1259;SC=TTATGAGAAAAAACAATCTGC;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=42;WE=3898517;WS=3898499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	3932283	rs535978	C	G	3972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=0;PP=2965;SC=ATTTCAAGTGCCCTGCAGAAG;SOR=9.507;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=112;TCF=112;TCR=0;TR=112;WE=3932291;WS=3932273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr9	3932521	rs587571	T	C	6374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=164;PP=2965;SC=ATAAAGGTAATTGGGGAATGT;SOR=4.372;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=182;TCF=18;TCR=164;TR=182;WE=3932529;WS=3932511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr9	4118111	rs6415788	G	T	3194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.602;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=69;PP=2549;ReadPosRankSum=1.715;SC=TGGGGGGCCTGGGGGCGGCGG;SOR=0.335;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=106;TCF=34;TCR=72;TR=103;WE=4118119;WS=4118101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,105:0.98:107
chr9	4118208	rs806052	A	G	3427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=55;PP=2716;SC=AGGCCGGCCGACTGGCTGTCG;SOR=0.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=56;TCR=55;TR=111;WE=4118216;WS=4118198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr9	4118816	.	G	C	6683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=0.000;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.158;SC=CTTCATGCTTGAGGCCGACTG;SOR=0.253;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=96;TCR=102;TR=197;WE=4118824;WS=4118806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,199:1.00:200
chr9	4285986	rs10758591	G	C	6769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=139;NR=73;PP=2965;SC=AATGGGATGGGGGAGAAAAAA;SOR=1.453;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=218;TCF=144;TCR=74;TR=212;WE=4285994;WS=4285976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr9	4490660	.	G	A	3476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=24;PP=2634;SC=CGAGCCCAGCGCACAATAGCG;SOR=2.522;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=82;TCR=24;TR=106;WE=4490668;WS=4490650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr9	4544721	rs45518336	A	T	3367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=97;PP=2961;SC=CCTTGAGAAAACAGATGTTCT;SOR=6.974;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=99;TCF=2;TCR=97;TR=99;WE=4544729;WS=4544711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr9	4564432	rs2228622	G	A	2787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=34;PP=2332;SC=AAGTCAGTACGGTGGATGCCA;SOR=1.127;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=51;TCR=34;TR=85;WE=4564440;WS=4564422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr9	4566210	rs7022772	A	C	6303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=140;PP=2965;SC=GCAGGAAGTAAACCTGTGACT;SOR=2.390;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=181;TCF=41;TCR=140;TR=181;WE=4566218;WS=4566200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr9	4572480	rs3780412	T	C	2955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=95;PP=2365;ReadPosRankSum=1.432;SC=TGTCAACTGATGAAGCTAGAG;SOR=5.689;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=98;TCF=2;TCR=96;TR=97;WE=4572488;WS=4572470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,104:0.99:105
chr9	4646363	rs301469	C	T	1286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=0;PP=980;ReadPosRankSum=1.938;SC=TATAAACTTACAGACACATAA;SOR=6.043;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=37;WE=4646371;WS=4646353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr9	4655915	rs7869353	G	C	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=2;PP=705;SC=ATTTTACGTAGGCTGTCTTGA;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=26;WE=4655923;WS=4655905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	4661749	rs143968076	T	TCCGACTGCGGTTTTGCTTCAAGG	951.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=2408;SC=AAGCAAGTGTTCCGACTGCGG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=4;WE=4661757;WS=4661745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	4661853	rs301489	C	T	4036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=19;PP=2965;ReadPosRankSum=0.126;SC=TAAGAACTCTCAGGTTATCTT;SOR=1.778;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=117;TCF=98;TCR=19;TR=116;WE=4661861;WS=4661843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,123:0.99:124
chr9	4662369	rs301487	A	C	315.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=3;PP=211;SC=CCGGGCCGCCAGCTGCGATGC;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=4662377;WS=4662359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	4662394	rs34250374	A	G	357.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=2;PP=270;SC=TCCCCGGAGGAGCATGGAGGG;SOR=2.093;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=4662402;WS=4662384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	4701841	rs71497545	GT	G	408.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.474;NF=18;NR=0;PP=267;ReadPosRankSum=0.514;SC=CACAGTCTTTGTTTTTTTTTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=18;WE=4701849;WS=4701831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,20:0.91:22
chr9	4713213	rs296827	G	T	2419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=65;PP=1978;SC=GGTAAGTATAGATTTGTGTAA;SOR=4.062;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=7;TCR=65;TR=72;WE=4713221;WS=4713203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr9	4718667	rs465514	A	T	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=307;SC=AACTTTTAAAAAAATGGAATC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=4718675;WS=4718657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr9	4860300	rs15583	A	G	2963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=86;PP=2506;SC=TAAGGCCCCAATGCCTACAGA;SOR=5.716;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=89;TCF=3;TCR=86;TR=89;WE=4860308;WS=4860290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr9	5050706	rs2230722	C	T	5622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=102;NR=69;PP=2965;SC=ATTTTGTGCACGGATGGATAA;SOR=1.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=102;TCR=69;TR=171;WE=5050714;WS=5050696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr9	5069837	rs7869668	G	A	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=346;SC=TTTCTTATACGTAGAACACAT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=5069845;WS=5069827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	5081780	rs2230724	G	A	8361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=185;NR=85;PP=2965;SC=TAGGTGCCCTGGGGTTTTCTG;SOR=1.681;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=270;TCF=185;TCR=85;TR=270;WE=5081788;WS=5081770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
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chr9	5090966	rs146385350	ATTG	A	1347.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=1204;SC=TTCAAACTTTATTGTTGTTAT;SOR=3.981;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=26;WE=5090976;WS=5090956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	5122921	.	T	A	2026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.67;SOR=8.349;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr9	5126343	rs41316003	G	A	3512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=87;NR=25;PP=2898;SC=GAATTTATGCGTATGATTGGC;SOR=2.501;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=87;TCR=25;TR=112;WE=5126351;WS=5126333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr9	5231712	rs12720	T	A	2003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=38;PP=1462;SC=AATCTGGACGTCCCAAAGGTG;SOR=1.230;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=24;TCR=39;TR=62;WE=5231720;WS=5231702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr9	5233557	.	TG	T	1509	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.19;NF=38;NR=0;PP=1509;QD=41.0008131545;SC=ATGGAGGCAATGGGTACATTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=38;WE=5233565;WS=5233556;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,38:0.90:42
chr9	5335639	rs2146074	C	T	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=664;SC=GGCGTATTCACGTCAAAGAGC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=5335647;WS=5335629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	5557672	rs7854303	T	C	5528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=124;NR=38;PP=2965;SC=TTCATCCCCTTCTGCATCATT;SOR=2.375;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=164;TCF=126;TCR=38;TR=162;WE=5557680;WS=5557662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr9	5929167	rs7029054	T	C	1952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=51;PP=1652;SC=TCCCTAAAAATAATGTTTAAA;SOR=4.370;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=5;TCR=51;TR=56;WE=5929175;WS=5929157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
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chr9	5969249	rs10739080	A	G	4619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=53;PP=2965;SC=CAACGTTCCAATTCGTAAAAG;SOR=1.324;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=84;TCR=53;TR=137;WE=5969257;WS=5969239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr9	5969517	rs7030731	C	T	1437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=39;PP=1285;SC=TTATCTTTAGCCAAAAAGGCA;SOR=5.283;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=42;WE=5969525;WS=5969507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	5988333	rs2291055	C	T	5573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=148;NR=15;PP=2965;SC=GAATTTTTTTCTTAACATTTA;SOR=4.501;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=149;TCR=15;TR=163;WE=5988341;WS=5988323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr9	6012734	rs106033	A	C	3428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.856;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=33;PP=2952;ReadPosRankSum=1.715;SC=CTTTTACCAGAAGTGGAACAG;SOR=1.528;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=69;TCR=34;TR=102;WE=6012742;WS=6012724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,103:0.99:104
chr9	6253571	rs10975519	C	T	3222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=45;PP=2429;SC=TACTGAGTTACTATGAGTCTC;SOR=0.916;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=57;TCR=45;TR=102;WE=6253579;WS=6253561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr9	6253710	rs10975520	G	C	963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=33;PP=821;SC=AGTCTCAGAAGGTTATCTCCA;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=6253718;WS=6253700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	6254568	rs10975521	T	A	2294.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=1.600;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.86;MQRankSum=-0.331;QD=20.13;ReadPosRankSum=-0.294;SOR=0.380;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:13,101:0.89:114
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chr9	6328947	rs3847262	T	C	3325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=68;PP=2643;SC=GTCGGCCACATTCAGATCTTT;SOR=1.802;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=27;TCR=68;TR=95;WE=6328955;WS=6328937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
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chr9	6533010	.	C	G	656	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=58.21;NF=23;NR=0;PP=656;QD=30.0335309803;SC=AACTTAGGGACAGAGGACTAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=6533018;WS=6533009;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	6534845	rs2282160	T	C	2032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=43;PP=1720;SC=CTTCTCCTCCTACCCTGCACC;SOR=1.647;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=20;TCR=43;TR=63;WE=6534853;WS=6534835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr9	6874931	.	TA	T	221.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=8.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-1.145;QD=5.28;ReadPosRankSum=0.198;SOR=3.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr9	6875054	rs12553688	A	G	4426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=105;PP=2965;SC=GACTGACCCTAAAGTCAGGAA;SOR=2.716;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=27;TCR=105;TR=132;WE=6875062;WS=6875044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr9	6986464	rs35826653	G	C	6224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=87;PP=2965;SC=CCATTGTCTAGTGGCTATGAG;SOR=0.877;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=192;TCF=105;TCR=87;TR=192;WE=6986472;WS=6986454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr9	6990364	rs2760657	G	T	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.26;ReadPosRankSum=0.777;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,49:0.92:53
chr9	6990548	rs35634202	ATT	A,AT	1474.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=4.447;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.85;MQRankSum=-0.657;QD=19.66;ReadPosRankSum=0.237;SOR=2.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:4,29,42:0.39,0.56:75
chr9	7016001	rs818883	G	T	2351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=58;PP=1888;SC=TTAAGTCTAGGGAAAAGATAA;SOR=3.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=8;TCR=59;TR=66;WE=7016009;WS=7015991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	7076371	rs1570511	T	C	2320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=1;PP=1976;SC=CCCATGCTATTTTCACTATAA;SOR=7.024;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=67;TCF=66;TCR=1;TR=67;WE=7076379;WS=7076361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr9	7076463	rs1570512	G	A	5593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=61;PP=2965;ReadPosRankSum=0.143;SC=CACAGCAACAGTAACAACAAC;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=129;TCR=62;TR=189;WE=7076471;WS=7076453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,178:0.99:180
chr9	7076586	rs1570513	G	A	4939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=124;PP=2965;SC=AGCCAGCATCGTGTTTAGGAT;SOR=2.720;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=32;TCR=124;TR=156;WE=7076594;WS=7076576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr9	7103816	rs3763651	C	T	2832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=59;PP=2277;SC=AGCCTGATGACTGGCCTTATG;SOR=1.485;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=31;TCR=59;TR=90;WE=7103824;WS=7103806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr9	7174673	rs913588	G	A	5778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=117;PP=2965;SC=GGCCGACCCTGTATACCGCAC;SOR=1.597;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=58;TCR=117;TR=175;WE=7174681;WS=7174663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr9	7174773	rs913589	G	A	1631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=44;PP=1325;SC=TGGGTTGGAAGAGAGAAGATG;SOR=5.507;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=46;WE=7174781;WS=7174763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr9	7174813	rs10976088	T	A	835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=22;PP=593;SC=GTGCCGTGAGTTTTGCTGGCA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=7174821;WS=7174803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	7798435	rs1254	C	T	2261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=7;PP=1807;SC=CGATTTTCTTCTCAGTCTTGT;SOR=3.881;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=58;TCR=7;TR=65;WE=7798443;WS=7798425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr9	7798518	rs4742410	G	C	5144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=90;NR=61;PP=2965;SC=CATGCCTGCTGTGTGTGTCAC;SOR=1.108;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=90;TCR=62;TR=151;WE=7798526;WS=7798508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr9	8338778	rs35311961	T	TA	507.27	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=347;ReadPosRankSum=-0.293;SC=ATATTAAACATAAAAAAAAAC;SOR=2.147;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=19;WE=8338786;WS=8338768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,22:0.88:25
chr9	8338847	rs143960430	C	CAGAGAGAG,CAGAGAGAGAG	2773.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=29;NF=23,23;NR=4,4;PP=513,321;SC=GTGCTTCTCCCAGAGAGAGAG;SOR=2.636;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=63;TCF=51;TCR=12;TR=27,27;WE=8338855;WS=8338837;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.38,0.62:48
chr9	8340168	rs4742483	C	A	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=501;SC=TAAATTTAAACACTTGATGTG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=8340176;WS=8340164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	8341280	.	GA	G	651.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=0.000;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=2.344;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=2.935;QD=6.09;ReadPosRankSum=-0.032;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,48:0.45:107
chr9	8341851	.	G	C	7683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=131;PP=2965;SC=TCTTCTGTTTGAACCATATAG;SOR=1.125;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=225;TCF=93;TCR=132;TR=223;WE=8341859;WS=8341841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr9	8389364	rs2279776	C	G	5458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=93;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.693;SC=GCTTCCTATACCCATCTATGT;SOR=0.336;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=166;TCF=72;TCR=94;TR=165;WE=8389372;WS=8389354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,170:0.99:171
chr9	12698363	rs2075508	T	C	1724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=0;PP=1478;SC=AGAGAGCTAATAGAAATAGAC;SOR=7.978;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=53;WE=12698371;WS=12698353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	12775861	rs139315731	T	TGGCGGCGGC	5046.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=34;PP=1741;SC=GCGGTGGTGGTGGCGGCGGCG;SOR=0.731;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=131;TCF=64;TCR=67;TR=52;WE=12775869;WS=12775851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr9	12775889	rs3750501	A	G	3471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=63;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=58;PP=2680;SC=CTGCAGTAGCAGCAGCAGCTA;SOR=0.795;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=54;TCR=59;TR=112;WE=12775897;WS=12775879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr9	13109111	rs10732331	C	T	2292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=67;PP=1927;SC=AAAAACTATACATATATGTTA;SOR=5.699;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=3;TCR=67;TR=70;WE=13109119;WS=13109101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	13112116	rs10809904	A	G	3343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=72;PP=2814;SC=CTCCTCCAGCAATGCTGATTC;SOR=1.725;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=32;TCR=72;TR=104;WE=13112124;WS=13112106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr9	13125201	rs2297003	T	C	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=624;SC=CTCTCATGAGTCCAGAGGCCT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=13125209;WS=13125191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	13126470	rs10738323	C	G	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=1;PP=1077;SC=TAATCATGCCCAAGGATGGGC;SOR=6.273;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=46;WE=13126478;WS=13126460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	13165218	rs10960959	C	T	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=1;PP=821;SC=TATGTTCTTACTTAAACAAAG;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=13165226;WS=13165208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	13175715	rs3831219	TGAG	T	1752.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=0;PP=1437;SC=TCAAGGGGGTTGAGGAGTAGG;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=30;WE=13175725;WS=13175705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr9	13183256	.	A	G	595	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=27;NR=0;PP=595;QD=23.324859724;SC=TCCAACCAACATTAGCTAAAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=13183264;WS=13183255;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	13190235	rs189005767	T	A	6952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=140;PP=2965;SC=CCCGCATCAGTCATCGCCAGC;SOR=1.496;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=74;TCR=140;TR=214;WE=13190243;WS=13190225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr9	13192320	rs1331676	C	G	3201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=86;PP=2616;SC=CATTGTCCAACAAACAACACT;SOR=4.826;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=6;TCR=86;TR=92;WE=13192328;WS=13192310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr9	13928011	rs2382426	T	G	3214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=46;PP=2433;SC=AGTGTTGAAGTTTCAAAAATC;SOR=0.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=49;TCR=46;TR=95;WE=13928019;WS=13928001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr9	13928028	rs2382427	T	C	3343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=54;PP=2608;SC=AATCTTCTAATATTTTAAATG;SOR=0.830;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=46;TCR=54;TR=100;WE=13928036;WS=13928018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr9	14120655	rs6474818	A	G	1633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=38;PP=1192;SC=AGATTGACTCATCAGCTGGTT;SOR=2.628;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=48;WE=14120663;WS=14120645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	14155950	rs10810097	T	C	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=651;SC=AAATAAATGATTATACACTAG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=14155958;WS=14155940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	14306944	rs4741362	A	G	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=1;PP=807;SC=GGAGATTTGTAGGCGGTGTTT;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=14306952;WS=14306934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	14313712	rs2273933	T	G	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=44;PP=1252;SC=GCGTGCTAGATTTCCAGGGGT;SOR=5.464;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=46;WE=14313720;WS=14313702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	14618856	rs3802482	C	T	2069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=8;PP=1580;SC=ATGCCTAAGACTGGTGGGTGG;SOR=3.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=53;TCR=8;TR=61;WE=14618864;WS=14618846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr9	14619168	rs10810187	A	G	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=419;SC=AACAATACAGATTGGCTGGGG;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=14619176;WS=14619158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	14640055	rs6474849	C	T	1392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=32;PP=999;SC=GAGTTGCTTACATTGCTTACA;SOR=2.461;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=38;WE=14640063;WS=14640045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr9	14690419	rs10961672	T	C	1814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=41;PP=1416;SC=AATCAGAAGCTTGGTTGACAT;SOR=2.522;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=53;WE=14690427;WS=14690409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	14690447	rs2382477	G	T	1259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=33;PP=991;SC=GAGCATTTTAGGTTAGATTTA;SOR=3.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=38;WE=14690455;WS=14690437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	14693270	rs71476227	G	A	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=18;NR=7;PP=590;SC=TCTCCCGACCGCCAGCAGCTC;SOR=1.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=25;WE=14693278;WS=14693260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	14737506	rs10961689	T	G	2553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=35;PP=2002;SC=CTTGGAGCGTTGAGAGGGCCC;SOR=0.855;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=37;TCR=35;TR=72;WE=14737514;WS=14737496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr9	14737616	rs10961690	A	G	2147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=44;PP=1763;SC=AAAAGAATGTACCAATTACTT;SOR=1.999;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=62;WE=14737624;WS=14737606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	14737743	rs10511596	C	A	282.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=203;SC=CTCTAAGACACAAACGGTCAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=14737751;WS=14737733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	14740300	rs2270528	A	G	925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=797;SC=CGAAATGCATAACAGAAATAA;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=14740308;WS=14740290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	14756318	rs57793294	C	CA	5518.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.193;NF=166;NR=16;PP=2698;ReadPosRankSum=-1.127;SC=GACATGCCTACAAAAAAAAAC;SOR=1.398;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=242;TCF=216;TCR=26;TR=182;WE=14756326;WS=14756308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,202:0.98:207
chr9	14756483	rs10810233	A	G	9157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=232;PP=2965;SC=GATAAAAATAAATATTCTACA;SOR=4.064;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=260;TCF=27;TCR=233;TR=259;WE=14756491;WS=14756473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr9	14759725	rs7045154	A	G	6446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=169;NR=14;PP=2965;SC=ACACCAAAGAACAACATAAGT;SOR=4.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=169;TCR=14;TR=183;WE=14759733;WS=14759715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr9	14770825	rs7860370	T	C	731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=581;SC=AACAATGACATAAAATGTTGT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=14770833;WS=14770815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	14774329	rs7018782	T	C	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=28;PP=883;SC=AGTTGTAGGCTTTAAGAGAAA;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=14774337;WS=14774319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr9	14775859	rs10733289	G	A	4257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.89;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr9	14801687	rs10738380	T	C	3521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.97;NF=61;NR=56;PP=2644;SC=TGTGAACAGGTGCATGTTTCT;SOR=0.726;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=118;TCF=61;TCR=57;TR=117;WE=14801695;WS=14801677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr9	14846036	rs2779500	C	G	2030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=44;PP=1627;SC=TTGTCGACAACCTGAAACTGT;SOR=2.056;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=17;TCR=45;TR=61;WE=14846044;WS=14846026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr9	14846122	rs2642404	C	G	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=694;SC=GTGTTGGTATCATAGACTGGA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=14846130;WS=14846112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	14851617	rs2818940	T	C	5091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=113;PP=2965;SC=TTTTGAAGGATAGAGAAAATA;SOR=2.108;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=39;TCR=113;TR=152;WE=14851625;WS=14851607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr9	14851703	rs729492	G	A	1575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=48;PP=1366;SC=CCACAGCCTAGCGTCTAGCAG;SOR=6.399;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=49;WE=14851711;WS=14851693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr9	15183462	rs35283660	CA	C	428.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=4.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.300;QD=10.99;ReadPosRankSum=1.333;SOR=0.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,32:0.82:39
chr9	15183532	rs2057478	C	G	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=26;PP=735;ReadPosRankSum=-1.524;SC=TTCCATAGACCTGGAGAAAGA;SOR=2.242;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=28;WE=15183540;WS=15183522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chr9	15188106	rs1407977	T	C	3241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.634;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=90;PP=2440;ReadPosRankSum=-0.810;SC=TGAACTGAAATGCATTTTTGA;SOR=3.169;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=108;TCF=18;TCR=90;TR=107;WE=15188114;WS=15188096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,115:0.99:116
chr9	15190494	rs475932	A	C	1436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=2;PP=1148;SC=CAGGTGTAACACACCATGTCT;SOR=4.664;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=41;WE=15190502;WS=15190484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	15190775	rs7848147	C	T	1350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=39;PP=1140;SC=TCATATATTACGCTGTGGTGA;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=40;WE=15190783;WS=15190765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	15192720	rs566820	A	G	3470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=99;PP=2841;SC=AAGTGACAGCATAAGTTGACC;SOR=4.427;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=9;TCR=99;TR=108;WE=15192728;WS=15192710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr9	15214313	rs199807096	A	AGT	579.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=2.062;QD=14.86;ReadPosRankSum=-0.314;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
chr9	15447361	rs3830477	A	AACT	1908.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=35;PP=1820;SC=GATTCCATCAAACTACACTAT;SOR=6.184;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=36;WE=15447369;WS=15447351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	15457853	rs10756669	G	A	2219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=1;PP=1928;SC=AAAATTGAAAGTATCTATTTT;SOR=6.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=64;TCF=63;TCR=1;TR=64;WE=15457861;WS=15457843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr9	15458080	rs35960449	A	AT	2546.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.361;NF=3;NR=90;PP=1114;ReadPosRankSum=-0.866;SC=GTGATAATGTATTTTTTTTTT;SOR=2.259;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=4;TCR=123;TR=93;WE=15458088;WS=15458070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,94:0.97:97
chr9	15468414	rs34331255	CCTT	C	5355.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=83;PP=2948;SC=ATGGTTTCTGCCTTAGAAGTC;SOR=3.184;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=102;TCF=15;TCR=87;TR=98;WE=15468424;WS=15468404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr9	15468480	rs4741507	T	C	2511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=54;PP=2087;SC=AGTCCTTCAATAGGCCCATCA;SOR=2.271;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=17;TCR=54;TR=71;WE=15468488;WS=15468470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr9	15469328	.	G	C	2779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.000;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=54;PP=2159;ReadPosRankSum=-0.799;SC=AGAATCCATTGATGTTTCTAC;SOR=0.557;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=33;TCR=55;TR=86;WE=15469336;WS=15469318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
chr9	15486958	rs2737828	A	T	1083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=28;PP=793;SC=ATTAATTTCAAAAAATAAGTT;SOR=2.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=15486966;WS=15486948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	15591372	rs4741510	T	A	1733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=18;PP=1279;SC=AGCACAGAATTCAGAACTTCA;SOR=1.571;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=38;TCR=18;TR=56;WE=15591380;WS=15591362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr9	15623461	.	A	ACG	55.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.97;ReadPosRankSum=-1.292;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr9	15623462	rs405352	T	C	1597.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=45;PP=1055;SC=CTTTCACATATGCGCGCGCGC;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=45;WE=15623488;WS=15623452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr9	15623473	.	GCACACACA	G	67.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=484;ReadPosRankSum=2.845;SC=GCGCGCGCGCGCACACACACA;SOR=0.055;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=15623488;WS=15623452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,4:0.16:25
chr9	15623475	rs6474933	A	G	126.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=-0.000;QD=14.09;ReadPosRankSum=-0.241;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr9	15623477	rs199908984	A	G	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.47;MQRankSum=-0.000;QD=14.09;ReadPosRankSum=0.140;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr9	15623479	rs201065789	A	G	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.49;MQRankSum=-0.000;QD=13.97;ReadPosRankSum=0.231;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr9	15678995	rs7037893	C	A	838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=22;PP=658;SC=TAATAGTATGCAAGTTATTTT;SOR=4.255;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=15679003;WS=15678985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	15695418	rs1355172	G	A	3856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=95;PP=2965;SC=GATGCCTCTTGTAGTCCCTCA;SOR=3.164;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=20;TCR=95;TR=115;WE=15695426;WS=15695408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr9	15723547	rs10810436	T	C	1060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=0;PP=908;SC=TTAATTACTATTGAAAAATTT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=15723555;WS=15723537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	15864506	rs770196	C	G	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=0;PP=1258;SC=TCCACTTCTTCTGTCCAAGTG;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=15864514;WS=15864496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	15883263	rs809493	G	A	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=3;PP=109;SC=TCGCTATGCTGCCCAGACTGG;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=15883271;WS=15883253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	16253293	.	G	C	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=366;SC=CTGGCTTATTGAGAAGTGACC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=16253301;WS=16253283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	16431230	rs9298764	A	G	1203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=0;PP=1096;SC=CAATGATAAGAAATATTAGGA;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=16431238;WS=16431220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	16582890	.	GACACACACACACAC	G,GAC	3147.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.15;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=22;NF=49,49;NR=3,3;PP=2547,166;SC=CCTCTAAACAGACACACACAC;SOR=4.202;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=113;TCF=100;TCR=13;TR=52,52;WE=16582913;WS=16582880;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.24,0.76:85
chr9	16664871	rs35822374	T	TG	886.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=859;SC=ACCTATACCATAAGCATTGTG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=16664879;WS=16664861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	16685539	rs7046068	T	C	7065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.953;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=143;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.719;SC=GTTAAGACTCTAACCTGGACT;SOR=1.577;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=210;TCF=67;TCR=143;TR=209;WE=16685547;WS=16685529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,218:1.00:219
chr9	16699287	rs10738447	C	T	5400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.91;SOR=1.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr9	16699292	rs10738448	C	T	5251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.89;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr9	16727698	rs1360285	G	A	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=350;SC=ATTTTAAAAAGTATTTAGAAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=16727706;WS=16727688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	16738269	rs7858914	G	T	1680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=2;PP=1411;SC=GTGGCAGAAAGAAGAGGTGAG;SOR=5.097;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=52;TCF=50;TCR=2;TR=52;WE=16738277;WS=16738259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	16738307	rs7858709	A	C	3484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.28;QD=44.68;SOR=4.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr9	16738312	rs7858712	A	G	3588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.26;QD=42.72;SOR=3.482;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr9	16738338	rs35475650	GA	G	2500.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=27;PP=1584;SC=CTTAAAGGGGGAAAAAAAAAA;SOR=1.935;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=101;TCF=64;TCR=37;TR=82;WE=16738347;WS=16738328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr9	16738556	rs4007684	C	CTTTT	1193.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=23;PP=1282;SC=TACATCAAAACTTTAAGAAAT;SOR=3.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=24;WE=16738564;WS=16738546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	17309336	rs10756860	T	C	1250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=34;PP=1041;SC=AAAATTTAAATATATTTGCAT;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=17309344;WS=17309326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	17309374	rs6475126	T	A	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=22;PP=646;SC=GTGTGCAGATTGTTTTGCATT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=17309382;WS=17309364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	17332484	rs3084508	ATT	A	1752.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.291;NF=50;NR=0;PP=608;ReadPosRankSum=-1.261;SC=TCCATGCAGGATTTTTTTTTT;SOR=6.630;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=68;TCR=1;TR=50;WE=17332494;WS=17332474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr9	17342383	rs1442527	C	T	6024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=101;NR=88;PP=2965;SC=AAGATTCTGACGCTGTGTGGA;SOR=0.834;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=189;TCF=101;TCR=88;TR=189;WE=17342391;WS=17342373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr9	17342517	rs10756869	A	G	2036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=56;PP=1695;SC=AAAAGCTATTAAAGAAACACT;SOR=8.155;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=0;TCR=56;TR=56;WE=17342525;WS=17342507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr9	17366568	rs4961548	A	T	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=0;PP=841;SC=TGATTTTTTTAAATAAAACAA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=17366576;WS=17366558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	17394457	rs72705794	A	G	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.18;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	17394465	rs7035357	G	A	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.43;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	17394536	rs7035276	C	T	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=544;SC=CTTTAGGTCACTGAGTTGGAA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=17394544;WS=17394526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	17394996	rs3739489	T	C	8829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=118;NR=152;PP=2965;SC=TTCTCAATCATTCCATCAAGG;SOR=1.000;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=270;TCF=118;TCR=152;TR=270;WE=17395004;WS=17394986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr9	17395108	rs3739488	C	T	3064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=83;PP=2528;SC=GGGGACACTGCGCATATGTAA;SOR=5.376;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=5;TCR=84;TR=88;WE=17395116;WS=17395098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr9	17409366	rs2780211	G	A	7178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=140;NR=76;PP=2965;SC=TAAGTCCTACGGAAGATGGAA;SOR=1.438;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=216;TCF=140;TCR=76;TR=216;WE=17409374;WS=17409356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr9	17409556	rs2584549	C	T	1202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=34;PP=992;SC=AATGTTACTACTGATTTAATT;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=17409564;WS=17409546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	17457512	rs35399020	TA	T	1739.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=1;PP=1455;SC=TTTCTTTTTTTAAAAAAAAGA;SOR=7.054;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=80;TCR=1;TR=63;WE=17457520;WS=17457502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr9	17464402	rs1442532	G	C	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=1;PP=603;SC=CATTTAAAAAGTAACAGTAGG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=17464410;WS=17464392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	17494792	rs72614236	G	A	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=56;SC=GAAAAGTATAGCGTATACAAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=17494800;WS=17494784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr9	17579190	rs4961573	C	G	3453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.17;SOR=3.042;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr9	17579198	rs4961574	T	G	3900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.94;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
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chr9	18504916	rs2277160	T	A	3102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=75;PP=2475;SC=CCTGCGGGGGTGGGGCCTCCT;SOR=3.258;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=15;TCR=75;TR=90;WE=18504924;WS=18504906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
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chr9	18657558	rs776776	A	G	1067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=1;PP=945;SC=GCACTACCATATACTCTTGTT;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=18657566;WS=18657548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	18680679	rs1412672	C	G	1633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=46;PP=1371;SC=CCAGCATGACCAAAAGTAAAT;SOR=7.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=46;WE=18680687;WS=18680669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
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chr9	18717903	rs530120	G	A	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=409;SC=CAAAGTTGGAGTGTTGGCACT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=18717911;WS=18717893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	18718114	rs4977339	A	C	3615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=39;PP=2947;SC=CAGTTGTTCCATTGTCTTGCT;SOR=1.115;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=59;TCR=39;TR=98;WE=18718122;WS=18718104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr9	18718139	rs532101	C	G	3528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=40;PP=2887;SC=TTTTGACCTTCTTCCTTCCCT;SOR=1.211;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=63;TCR=40;TR=103;WE=18718147;WS=18718129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr9	18775810	rs934472	C	A	7758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=128;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.747;SC=GAAAACCGGCCTCTCAACGGT;SOR=0.249;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=247;TCF=118;TCR=129;TR=245;WE=18775818;WS=18775800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,254:1.00:255
chr9	18776840	rs1549986	A	C	5654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=125;NR=45;PP=2965;SC=AGGTCTACATACAGACTCGCA;SOR=2.066;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=170;TCF=125;TCR=45;TR=170;WE=18776848;WS=18776830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr9	18777368	rs7033684	T	C	10461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=203;NR=133;PP=2965;SC=CGCAGGACTCTGCGGAAAGGA;SOR=1.189;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=336;TCF=203;TCR=133;TR=336;WE=18777376;WS=18777358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,342:1.00:342
chr9	18777595	.	C	T	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.647;ClippingRankSum=0.000;DP=299;ExcessHet=3.0103;FS=0.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.44;ReadPosRankSum=0.386;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:255,41:0.14:296
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chr9	18817372	rs7873880	C	T	1382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=39;PP=1125;SC=ACCTCAGTCGCTCTGAAAGTA;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=39;WE=18817380;WS=18817362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	18826261	rs35525189	GT	G	6001.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FS=1.194;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.23;ReadPosRankSum=2.050;SOR=0.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:11,259:0.96:270
chr9	18826500	rs934469	T	C	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=40;PP=1442;SC=CTGCACCCTGTTGGGAGTGAC;SOR=3.126;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=8;TCR=40;TR=48;WE=18826508;WS=18826490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr9	18829952	rs41304755	A	G	6799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=120;PP=2965;SC=CTGGTCCTGGATCCTGGGAAT;SOR=1.055;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=210;TCF=90;TCR=120;TR=210;WE=18829960;WS=18829942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr9	18830087	rs7026429	G	A	1459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=39;PP=1195;SC=GGCCAACAGGGAATCACTAAA;SOR=4.223;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=43;WE=18830095;WS=18830077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	18887753	rs731370	C	A	1553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=8;PP=1395;SC=TAGAGCCACACAGACAGTAAA;SOR=3.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=47;WE=18887761;WS=18887743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	18889544	rs10963819	A	T	3086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=31;PP=2534;ReadPosRankSum=0.803;SC=TCTTTTCTACACTGCTCCTCC;SOR=0.565;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=92;TCF=60;TCR=32;TR=90;WE=18889552;WS=18889534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,94:0.99:95
chr9	18889789	rs34099646	G	A	250.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=218;SC=CACCCTAGGAGGAGCCCTCCC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=18889797;WS=18889779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	18890376	rs35233264	G	A	831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=0;PP=620;SC=GAGTCCCCCTGTGCACCTCAT;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=18890384;WS=18890371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	18890446	rs7026374	A	G	2366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=12;PP=1807;SC=GCACTGGTGCAGTGCTGAGAG;SOR=3.509;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=70;TCR=12;TR=82;WE=18890454;WS=18890436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
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chr9	18907122	rs1327506	T	C	3393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=94;PP=2596;SC=AGGGCTTCCATGATCTCCATC;SOR=2.872;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=23;TCR=94;TR=117;WE=18907130;WS=18907112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
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chr9	18928441	rs34044510	T	C	5178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=71;PP=2965;SC=GGACCACTGCTTGTAGTCATC;SOR=0.757;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=78;TCR=71;TR=149;WE=18928449;WS=18928431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr9	18928536	rs34932739	G	C	7140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=92;PP=2965;ReadPosRankSum=0.093;SC=CACCCTTAGGGCATGTGTAAT;SOR=0.382;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=221;TCF=129;TCR=92;TR=220;WE=18928544;WS=18928526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,225:1.00:226
chr9	18950787	rs6475273	G	A	2724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=50;PP=2090;ReadPosRankSum=-0.829;SC=ATTGGTATAGGCCCTTTCTGG;SOR=0.312;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=41;TCR=51;TR=91;WE=18950795;WS=18950777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,93:0.99:94
chr9	18950895	rs7021572	T	C	1193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=31;PP=1014;SC=TTCTCTGTTTTATCATAAATC;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=36;WE=18950903;WS=18950885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	18950980	rs6475274	A	T	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=252;SC=TTGGGAGAAAAAAACCCAATT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=18950988;WS=18950970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	19295941	rs10757051	A	G	1490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=0;PP=1374;SC=TGTAATAAGAAAAAAAGAGAA;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=42;WE=19295949;WS=19295931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	19299362	rs10738535	T	C	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=619;SC=GATTAGTATATTATTAATATA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=19299370;WS=19299352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	19341045	rs928128	A	G	4731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=78;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.186;SC=AGGATGATGCAGAAATTCATG;SOR=0.717;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=78;TCR=79;TR=155;WE=19341053;WS=19341035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,168:0.99:170
chr9	19550308	rs4977555	A	T	4586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=108;PP=2965;SC=ACAAAAAAATAAAATGTACAC;SOR=2.286;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=36;TCR=108;TR=144;WE=19550316;WS=19550298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr9	19573483	rs149743267	AACACACACACACACACACACACACAC	A	675.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=0;NR=10;PP=3000;SC=ATATAATTTAAACACACACAC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=10;WE=19573516;WS=19573473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	19576815	rs2247818	C	T	826.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=449;SC=TGTGCTGCAGCGGTGTGTGTG;SOR=4.514;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=17;WE=19576825;WS=19576805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	19576816	rs56172301	GGT	G	817.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=801;SC=GTGCTGCAGCGGTGTGTGTGT;SOR=4.514;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=17;WE=19576825;WS=19576805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	19576949	rs2383101	T	G	3932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=32;PP=2965;SC=CCATTCTGCCTCTCGTTCTCA;SOR=2.477;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=107;TCR=32;TR=139;WE=19576957;WS=19576939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr9	19619509	rs1885220	C	T	2849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=11;PP=2254;SC=AGCACAAACACGTTTTATGCA;SOR=3.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=76;TCR=11;TR=87;WE=19619517;WS=19619499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr9	19622072	rs4977307	A	G	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=1;PP=595;SC=GCATGTGTCCATGAATGCCAG;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=19622080;WS=19622062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	19622268	rs4977308	T	C	3859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=72;PP=2824;SC=CCGGTAGAGTTGGTTCATCCT;SOR=0.892;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=55;TCR=72;TR=127;WE=19622276;WS=19622258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr9	20354796	rs2301550	A	G	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.87;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr9	20988426	rs4977881	A	G	58.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=37;SC=GGCTCTTGACAAGGTAAAATC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=20988434;WS=20988416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	24545695	rs2772579	G	C	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=16;PP=541;SC=CTGGCAACTAGTTCACTTAGT;SOR=3.611;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=24545703;WS=24545685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	24545957	rs2772578	G	C	1672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=40;PP=1260;SC=TCTGTGCAGGGAGATGTCTCA;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=49;WE=24545965;WS=24545947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	25677698	rs72631815	A	C	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=8;PP=1522;SC=CAGGGCCCAGAGGGCTCCGAG;SOR=3.300;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=46;TCR=8;TR=54;WE=25677706;WS=25677688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	25677933	rs35110225	T	C	3254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=82;PP=2526;SC=GGACCCGGCGTGCCTCCGCGG;SOR=2.242;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=28;TCR=82;TR=110;WE=25677941;WS=25677923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr9	25677953	rs34498078	T	C	3040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=65;PP=2347;SC=GGCGTCCCGTTGCCGCCTTCG;SOR=1.436;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=35;TCR=65;TR=100;WE=25677961;WS=25677943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr9	25678122	rs72631814	G	C	1917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=51;PP=1549;SC=CCGCCAGGTCGGCAAACCGCT;SOR=2.517;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=16;TCR=51;TR=67;WE=25678130;WS=25678112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr9	26982270	rs57511456	CT	C	530.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=10.792;HP=17;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.504;NF=17;NR=1;PP=327;ReadPosRankSum=0.072;SC=AGCTTTTTTTCTTTTTTTTTT;SOR=4.887;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=18;WE=26982278;WS=26982260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr9	27047246	rs10812520	T	C	6125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=167;NR=15;PP=2965;SC=TCAGCAGTAATCTCTCTTATG;SOR=4.650;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=182;TCF=167;TCR=15;TR=182;WE=27047254;WS=27047236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr9	27061142	rs112464316	GGTGT	G,GGT	1292.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.87;QD=32.32;SOR=7.428;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,8,32:0.20,0.80:40
chr9	27168315	rs10511802	G	A	1091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=0;PP=937;SC=CAGATTCTTAGAAAGGTACAT;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=27168323;WS=27168305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	27168704	rs10967753	T	C	257.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=213;SC=GGGCAGATGTTTGAATTAAAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=27168712;WS=27168694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	27172838	rs3739542	C	A	2095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=58;PP=1772;SC=TGGGAATGGACGCTAAATGGC;SOR=8.222;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=0;TCR=58;TR=58;WE=27172846;WS=27172828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr9	27173180	rs666478	C	T	3683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=23;PP=2807;SC=CAAGGGGTTGCATATTTGACT;SOR=2.717;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=84;TCR=23;TR=107;WE=27173188;WS=27173170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr9	27183463	rs682632	A	C	2545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=16;PP=1900;SC=TCAGGCATACAGAGGATGACC;SOR=2.642;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=77;TCF=60;TCR=17;TR=76;WE=27183471;WS=27183453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr9	27217516	rs5897224	CTGTT	C	1842.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=0;PP=1786;SC=AGGACTTATACTGTTTGTTTG;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=32;WE=27217530;WS=27217506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	27217522	rs5004610	G	A	1851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=0;PP=974;SC=TATACTGTTTGTTTGCATGTT;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=34;WE=27217530;WS=27217506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	27217791	rs1923331	T	TC	1376.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=38;PP=1588;SC=GGATTTTTTTTCCCTCCCAGA;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=38;WE=27217799;WS=27217781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	27217822	rs681754	G	A	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=643;SC=TTTGACAGAGGTTTTAAAAAG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=27217830;WS=27217812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	27217851	rs681707	G	C	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=424;SC=ATGTCCTGTAGCTCTCGGGAA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=27217859;WS=27217841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	27218726	rs667250	C	T	2246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=10;PP=1815;SC=GGAAAATGAGCGGTGACTCTG;SOR=3.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=61;TCR=10;TR=71;WE=27218734;WS=27218716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr9	27228022	rs2273717	A	G	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=1;PP=455;SC=TAAATCTATGAGGAGTTGAAA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=27228030;WS=27228013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	27296595	rs7044345	C	G	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=1;PP=459;SC=CATTTCTATTCACTTTAAAGA;SOR=4.514;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=27296603;WS=27296585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	27297260	rs7875090	A	T	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=357;SC=GTTTTTAGTTATTTTTTAAAT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=27297268;WS=27297250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	27524731	rs700785	A	G	6106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=103;PP=2965;SC=GGAGGAAGACAAGAATGAAAA;SOR=0.925;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=84;TCR=103;TR=187;WE=27524739;WS=27524721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr9	27556780	rs10122902	G	A	5049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=110;PP=2965;SC=GCAGCACAAAGCTTCCAGTTG;SOR=1.682;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=53;TCR=110;TR=163;WE=27556788;WS=27556770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr9	27561465	rs3063748	A	ATGT	1586.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=2;PP=1463;SC=CAAATACGTAATGTCCCTAGA;SOR=3.797;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=26;WE=27561473;WS=27561455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	27562293	rs10812616	T	A	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=1;PP=314;SC=TCCTTACTATTAAAATTAGAA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=27562301;WS=27562283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	27562352	rs2589050	T	C	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=2;PP=822;SC=ACTCATAAAGTGTATAATTGC;SOR=4.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=32;WE=27562360;WS=27562342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	28863459	rs13285849	A	T	1718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=1;PP=1513;SC=TGTTTGACACAGGTTTGATCA;SOR=6.439;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=50;WE=28863467;WS=28863449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr9	28889060	rs7043805	C	G	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=473;SC=CAGCAGCTTGCCTGGTGCTTG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=28889068;WS=28889050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	32384843	rs913762	A	C	2052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=51;PP=1740;SC=CAGTGGCGGCACGGGGGACAC;SOR=2.338;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=17;TCR=51;TR=68;WE=32384851;WS=32384833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr9	32408496	rs10123372	C	G	6118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=143;NR=37;PP=2965;SC=CTGCATTATTCTCTTTCTTCT;SOR=2.760;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=181;TCF=144;TCR=37;TR=180;WE=32408504;WS=32408486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr9	32427600	rs2375965	A	G	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=2;NR=18;PP=559;SC=ATCTAAAGAGAGCCCTCTTGC;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=32427608;WS=32427590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	32472895	rs10813823	A	G	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=0;PP=676;SC=ATATATATACACACACACATA;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=31;WE=32472903;WS=32472885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	32480429	rs181063624	T	G	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=35;PP=969;SC=ATTCGTTGTATTTAACGAATT;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=32480437;WS=32480419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	32481339	rs61752945	C	T	1564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=9;PP=1332;SC=GGAACGTACCCGCAAATGTGA;SOR=2.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=48;WE=32481347;WS=32481329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr9	32498291	rs2777725	A	G	3749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=81;NR=28;PP=2847;SC=TGGGTCCCATAGAAAGGCATG;SOR=2.183;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=82;TCR=28;TR=109;WE=32498299;WS=32498281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr9	32541325	rs188465835	G	A	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=2;PP=912;SC=TGCAGTAGACGACATTCTTCC;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=33;WE=32541333;WS=32541315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	32552172	rs35415231	CA	C	500.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=23.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQRankSum=0.795;QD=8.94;ReadPosRankSum=1.910;SOR=4.588;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,40:0.71:56
chr9	32552495	rs189362662	C	T	1001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=22;PP=782;SC=CCGGGGATCGCGGGCCCCCAC;SOR=1.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=32552503;WS=32552485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	32973709	.	CAA	C	158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=25.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=0.742;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.926;SOR=1.396;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr9	32974372	rs4878522	C	T	1303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=9;PP=1004;SC=TGAGGTCAGACTGTTATTCAG;SOR=2.476;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=38;WE=32974380;WS=32974362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	32974570	rs34600530	G	GA	937.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=30;PP=668;SC=CTAGTTGAAAGAAAAAAAAAC;SOR=3.737;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=31;WE=32974578;WS=32974560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	32986040	rs1981011	AC	CA	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.70;QD=33.99;SOR=6.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	33113970	rs12379501	C	T	2363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=66;PP=1975;SC=TCCACCATCACCCTTGCTGTT;SOR=8.526;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=0;TCR=66;TR=66;WE=33113978;WS=33113960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr9	33116238	rs34433922	AT	A	1434.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.48;MQRankSum=0.334;QD=23.91;ReadPosRankSum=1.560;SOR=4.548;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,59:0.98:60
chr9	33264540	rs1071545	C	G	2851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=84;PP=2508;SC=GGTGGACGCCCAGAGGGAGGC;SOR=7.452;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=85;TCF=1;TCR=84;TR=85;WE=33264548;WS=33264530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr9	33270479	rs844239	A	G	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=2;PP=369;SC=GTTTTTGCCAATTTTTCTGCG;SOR=4.047;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=33270487;WS=33270469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	33270748	rs831271	G	T	3352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=68;PP=2655;SC=GTTATTTCATGTATTTATTCT;SOR=1.947;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=26;TCR=68;TR=94;WE=33270756;WS=33270738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr9	33290532	rs830576	A	G	9788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=186;NR=125;PP=2965;SC=GACAGTGCTGACTTGGCTGTA;SOR=1.101;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=311;TCF=186;TCR=125;TR=311;WE=33290540;WS=33290522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,317:1.00:317
chr9	33290688	rs4879682	G	C	5414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=114;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.776;SC=CTCATATCGCGAGAGTAGCAC;SOR=0.981;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=160;TCF=45;TCR=115;TR=159;WE=33290696;WS=33290678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,170:0.99:171
chr9	33344252	rs642157	T	A	1624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=45;PP=1309;SC=CCTGCTGTGTTACTGTCTTCA;SOR=5.549;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=47;WE=33344260;WS=33344242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr9	33354070	rs145934546	TTTTTA	T	2801.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=11;PP=2914;SC=TTCCCTTTCTTTTTTATATTT;SOR=3.056;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=56;WE=33354082;WS=33354060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr9	33369943	rs2230122	G	A	5545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=118;NR=53;PP=2965;SC=TAACCAAGGAGCCAATAATTG;SOR=1.735;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=171;TCF=118;TCR=53;TR=171;WE=33369951;WS=33369933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr9	33385863	.	G	T	61	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;FR=0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=57.91;NF=1;NR=2;PP=61;QD=31.9237375157;SC=GGTCAGCCACGCCTGAGGAGC;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=3;WE=33385871;WS=33385842;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,3:0.18:17
chr9	33386053	.	A	G	237	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=6;MMLQ=27;MQ=52.1;NF=5;NR=0;PP=237;QD=54.3542425094;SC=AGGGGGAGGGATACTCATCCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=5;WE=33386072;WS=33386050;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr9	33386064	rs115412820	C	G	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.883;NF=6;NR=0;PP=237;ReadPosRankSum=-1.398;SC=TACTCATCCTCGACCACTGAC;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=6;WE=33386072;WS=33386050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,3:0.18:17
chr9	33386144	.	G	A	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.525;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=20.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.99;MQRankSum=-8.690;QD=7.82;ReadPosRankSum=1.471;SOR=4.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,21:0.23:91
chr9	33386146	rs76608797	C	A	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=22.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.98;MQRankSum=-8.817;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.995;SOR=4.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,22:0.24:93
chr9	33386167	rs79172651	G	C	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=26.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.08;MQRankSum=-10.488;QD=5.55;ReadPosRankSum=0.130;SOR=4.503;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,27:0.20:132
chr9	33386211	rs80148578	G	A	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.389;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-9.429;NF=30;NR=19;PP=668;ReadPosRankSum=-2.759;SC=GACACAGACTGTCATGCGAAC;SOR=1.054;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=169;TCF=99;TCR=70;TR=49;WE=33386219;WS=33386201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,39:0.24:164
chr9	33386226	rs78244036	T	C	1714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.932;HP=4;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-9.085;NF=25;NR=32;PP=912;ReadPosRankSum=-1.038;SC=GCGAACCTGCTCCCAACTAAG;SOR=0.952;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=182;TCF=88;TCR=94;TR=57;WE=33386234;WS=33386216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,50:0.27:182
chr9	33386243	rs76705820	C	T	1895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.030;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.380;NF=18;NR=37;PP=965;ReadPosRankSum=1.473;SC=TAAGCCCCACCGGGGTCCCAG;SOR=1.187;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=179;TCF=74;TCR=105;TR=55;WE=33386251;WS=33386233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,56:0.32:176
chr9	33386284	rs73478964	T	G	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-7.196;NF=11;NR=39;PP=922;ReadPosRankSum=0.873;SC=GGGTGGGGGATCTCCAAGGCT;SOR=0.714;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=139;TCF=34;TCR=105;TR=50;WE=33386292;WS=33386274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,52:0.37:140
chr9	33386378	rs74462413	C	T	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=13.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.47;MQRankSum=-1.496;QD=1.59;ReadPosRankSum=-0.982;SOR=2.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,7:0.13:52
chr9	33386395	rs2484931	T	C	1883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=15;PP=1629;SC=CCGGGCAGGATACTCACTGTA;SOR=2.066;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=60;WE=33386403;WS=33386385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	33386510	rs77962308	CA	TG	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=2.963;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQRankSum=-8.737;QD=1.26;ReadPosRankSum=0.305;SOR=0.956;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,10:0.10:98
chr9	33395031	rs72707429	G	A	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=6.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=-5.497;QD=11.07;ReadPosRankSum=-0.475;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,31:0.31:101
chr9	33395039	rs72707431	C	T	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=4.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQRankSum=-5.848;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.238;SOR=0.212;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,36:0.33:108
chr9	33395196	rs642636	A	G	3938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=90;PP=2965;SC=GGGTGGACCTAAGACAGTGGC;SOR=2.322;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=31;TCR=90;TR=121;WE=33395204;WS=33395186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr9	33442952	rs2228332	G	A	3336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=83;PP=2712;SC=GGTTGTCGGCGAAGTGCCAGA;SOR=3.868;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=11;TCR=83;TR=94;WE=33442960;WS=33442942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr9	33442986	rs2231231	A	C	2396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=60;PP=1999;SC=CAGATTAGACACACAGTGAGT;SOR=4.205;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=6;TCR=60;TR=66;WE=33442994;WS=33442976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	33444000	rs2227285	G	C	694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=19;PP=540;SC=AGGACTAGAGGCGCTTCCTGG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=33444008;WS=33443990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	33447306	rs517210	C	G	3127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=27;PP=2347;SC=GTGGGGGTCACAGCTGGGGAG;SOR=1.945;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=62;TCR=27;TR=89;WE=33447314;WS=33447296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr9	33447424	rs591810	C	G	4009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=76;PP=2965;SC=CACTCACCACCAGGATGAGGG;SOR=1.214;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=49;TCR=77;TR=125;WE=33447432;WS=33447414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr9	33465182	rs2785210	G	A	4769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=127;NR=18;PP=2965;SC=CTTCTCAGCTGGGGAAAAAGT;SOR=3.867;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=127;TCR=18;TR=145;WE=33465190;WS=33465172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr9	33465651	rs560833	T	C	2126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=9;PP=1702;SC=ATCTGGCCCCTGGAGAGACAG;SOR=3.545;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=56;TCR=9;TR=65;WE=33465659;WS=33465641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr9	33467577	rs2275228	T	C	4745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=50;PP=2965;SC=AGAAACCTACTTTCTAGCTAG;SOR=1.527;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=87;TCR=50;TR=137;WE=33467585;WS=33467567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr9	33467983	rs679644	G	A	2292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=9;PP=1792;SC=CTGTAGCCCCGAAGAGACAGG;SOR=3.521;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=62;TCR=9;TR=71;WE=33467991;WS=33467973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr9	33469406	rs2777746	C	T	4949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.430;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=80;PP=2965;ReadPosRankSum=0.915;SC=CCCATCCTGTCCCCCCATACT;SOR=0.549;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=64;TCR=80;TR=143;WE=33469414;WS=33469396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,151:0.99:152
chr9	33473893	rs2777744	T	G	7388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=155;PP=2965;SC=GGTCTATACCTCATAGCTTCC;SOR=1.423;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=241;TCF=86;TCR=155;TR=241;WE=33473901;WS=33473883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr9	33524684	rs3843933	G	A	1894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=42;PP=1572;SC=GTCCGCGACAGAAAAGACAGG;SOR=2.564;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=54;WE=33524692;WS=33524674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	33524725	rs3843934	G	T	1146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=28;PP=923;SC=GTGGGAGGGGGCCCCCAGGCC;SOR=3.026;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=33524733;WS=33524715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	33573160	rs1807130	C	T	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=2;PP=551;SC=ATTTTCTCTGCGGCAACCCTA;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=33573168;WS=33573150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	33573212	rs12378940	G	A	1389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=14;PP=995;SC=GAGCCACCGAGGAAGCACAGG;SOR=1.364;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=39;WE=33573220;WS=33573202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	33573377	rs597219	T	C	258.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=214;SC=GATTAGTCTCTCTGCAGCCTC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=33573385;WS=33573367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	33625082	rs10758216	G	C	14979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=475;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=209;NR=254;PP=2965;ReadPosRankSum=1.923;SC=CTTGTATTTTGCTGATCAGCT;SOR=0.562;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=464;TCF=210;TCR=254;TR=463;WE=33625090;WS=33625072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,470:1.00:471
chr9	33625360	rs10971607	T	C	2664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=74;PP=2261;ReadPosRankSum=0.231;SC=CTACTAAACATACAAAAGTTT;SOR=4.047;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=4;TCR=77;TR=78;WE=33625368;WS=33625350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,78:0.99:79
chr9	33629238	rs10814016	T	C	1777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=14;PP=1377;SC=GACTCTCTCCTGTGGCTGCAG;SOR=2.107;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=55;WE=33629257;WS=33629228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	33629249	rs10814017	T	C	2267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=16;PP=1763;SC=GTGGCTGCAGTATCAGGCTCC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=51;TCR=16;TR=67;WE=33629257;WS=33629228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr9	33638046	rs7044689	G	C	10432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=184;NR=134;PP=2965;SC=CGGGCACCAGGCTTCTCGGCT;SOR=1.042;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=321;TCF=186;TCR=135;TR=318;WE=33638054;WS=33638036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,330:1.00:330
chr9	33649383	rs855547	C	A	3526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-1.314;NF=18;NR=86;PP=2965;ReadPosRankSum=0.546;SC=ATTATGCTGGCATGTTCTCAG;SOR=1.727;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=18;TCR=87;TR=104;WE=33649391;WS=33649373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,104:0.99:105
chr9	33662181	rs113011049	TCTGTAGCCCCAA	T	4688.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.95;NF=70;NR=6;PP=2965;SC=GGAGACATCCTCTGTAGCCCC;SOR=5.038;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=83;TCF=74;TCR=9;TR=76;WE=33662200;WS=33662171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr9	33662389	rs1832325	A	G	10568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=128;NR=185;PP=2965;SC=AAGGAAGCTGAAATCTACCAG;SOR=1.088;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=314;TCF=128;TCR=186;TR=313;WE=33662397;WS=33662379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,320:1.00:320
chr9	33675629	rs7849845	A	C	12790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=174;NR=211;PP=2965;SC=TTCACCTTAAAATTTGGAGAA;SOR=0.923;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=386;TCF=174;TCR=212;TR=385;WE=33675637;WS=33675619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,393:1.00:393
chr9	33676094	rs7853346	C	G	8081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=142;NR=82;PP=2965;SC=CTATAATCCACATGATTCTTT;SOR=1.367;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=143;TCR=83;TR=224;WE=33676102;WS=33676084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr9	33750453	rs113217588	A	ACACAG	668.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=451;ReadPosRankSum=-0.511;SC=CTCCTGAAGCACACAGCCTAG;SOR=0.481;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=8;WE=33750461;WS=33750443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,16:0.94:17
chr9	33794628	.	G	A	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.700;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQRankSum=-5.771;QD=1.34;ReadPosRankSum=-0.058;SOR=0.099;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,4:0.11:35
chr9	33794631	.	G	C	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQRankSum=-5.857;QD=1.13;ReadPosRankSum=0.332;SOR=0.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,4:0.11:36
chr9	33794632	.	G	A	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.987;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQRankSum=-5.942;QD=1.10;ReadPosRankSum=0.474;SOR=0.088;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,4:0.11:37
chr9	33794667	rs369375802	C	G	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQRankSum=-6.951;QD=1.46;ReadPosRankSum=0.546;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,7:0.14:50
chr9	33794717	.	A	G	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.000;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQRankSum=-9.504;QD=2.36;ReadPosRankSum=-2.770;SOR=0.377;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,11:0.12:92
chr9	33794726	.	GC	CA	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.000;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQRankSum=-10.402;QD=2.41;ReadPosRankSum=-2.100;SOR=0.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,14:0.13:110
chr9	33794736	.	A	G	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.367;ClippingRankSum=0.000;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=1.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQRankSum=-10.875;QD=2.26;ReadPosRankSum=-0.826;SOR=0.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,14:0.12:120
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chr9	34011803	rs7029112	C	G	2761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=77;PP=2374;SC=AAGAAAAGTACCATCACTACA;SOR=5.549;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=4;TCR=77;TR=81;WE=34011811;WS=34011793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr9	34011835	rs7029122	C	T	2092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=60;PP=1811;SC=GGATCTCTTACCCATTCATAT;SOR=8.318;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=0;TCR=60;TR=60;WE=34011843;WS=34011825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr9	34017015	rs11432780	G	GA	1578.70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=2.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.77;MQRankSum=0.994;QD=17.74;ReadPosRankSum=-1.182;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,75:0.84:89
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chr9	34088561	rs41316005	G	C	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.84;SOR=6.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	34096597	rs7857551	G	A	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=0;PP=850;SC=GCGAGACTCTGCCTCAAAAAT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=34096605;WS=34096587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	34211942	rs1556439	T	C	2723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=35;PP=2132;SC=AAAAATAGAATATCACTGATA;SOR=1.191;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=90;TCF=55;TCR=35;TR=89;WE=34211950;WS=34211932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr9	34242242	rs7857658	G	A	1416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=39;PP=1170;SC=TGGTGTGATCGTACCTTATTG;SOR=4.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=42;WE=34242250;WS=34242232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
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chr9	34263389	rs10814084	T	A	931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=24;PP=781;SC=CCTCCCAGCTTAGAGGCTGGG;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=34263397;WS=34263379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	34286486	rs6476442	G	T	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=397;SC=TTTACAGATGGGAAGTGGTGG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=34286494;WS=34286476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	34343134	.	C	T	4819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=0.000;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=70;PP=2965;ReadPosRankSum=0.152;SC=CATGTGGAACCAGGAGAGGAT;SOR=0.789;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=80;TCR=71;TR=149;WE=34343142;WS=34343124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,151:0.99:153
chr9	34372783	rs4879781	G	C	6656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=99;NR=104;PP=2965;SC=GCGGCTTCAGGTCTTTGGAAG;SOR=0.761;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=99;TCR=104;TR=203;WE=34372791;WS=34372773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
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chr9	34402173	rs10738926	A	G	1350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=2;PP=1288;SC=ACAGCAGACAACGCAGGCCCC;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=43;WE=34402181;WS=34402163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
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chr9	34655734	rs11575576	G	T	1355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=36;PP=1165;SC=CTCATGTCCCGCCCCTCCCAT;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=9;TCR=37;TR=45;WE=34655742;WS=34655724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
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chr9	34723181	rs2297132	G	A	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=2;PP=1114;SC=GGCTCTGCATGTTCTCCTTGA;SOR=4.073;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=39;WE=34723189;WS=34723171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	34723744	rs4878588	C	A	3663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=35;PP=2965;SC=CCCTGTGAAGCCTGGGGCAAC;SOR=1.568;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=75;TCR=35;TR=110;WE=34723752;WS=34723734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr9	34723935	rs2297134	C	T	2104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.73;QD=33.41;SOR=3.947;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
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chr9	34724241	rs3739881	C	A	4803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=60;PP=2965;SC=CATGTCCCCACTGGGCTGTGA;SOR=1.366;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=92;TCR=60;TR=152;WE=34724249;WS=34724231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr9	34724786	rs72617336	G	A	3536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.75;QD=42.61;SOR=0.766;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr9	34724796	rs150496452	T	A	3302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.71;QD=44.63;SOR=0.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr9	34724987	rs201739024	A	G	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FS=27.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.29;MQRankSum=-4.746;QD=0.23;ReadPosRankSum=-1.036;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:218,25:0.10:243
chr9	34725047	rs78716275	C	T	4293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=32.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.41;MQRankSum=4.146;QD=19.08;ReadPosRankSum=-0.037;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,158:0.70:225
chr9	34725069	rs114933270	T	A	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=23.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.65;MQRankSum=-5.528;QD=3.72;ReadPosRankSum=1.689;SOR=0.109;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,48:0.25:191
chr9	34725742	rs62547039	T	C	5926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.417;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.095;NF=175;NR=131;PP=2965;ReadPosRankSum=1.287;SC=GATGGAGACATCCAGTTTGGG;SOR=2.196;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=309;TCF=177;TCR=132;TR=306;WE=34725750;WS=34725732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,197:0.99:199
chr9	34726204	rs521574	G	A	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.31;QD=26.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr9	34834494	rs77822083	C	T	3726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.346;NF=135;NR=133;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.130;SC=CCAGCGATGGCGAATCGACTG;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=612;TCF=310;TCR=302;TR=268;WE=34834502;WS=34834484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,161:0.45:358
chr9	34834880	rs112468216	A	C	2048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=7.853;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.31;MQRankSum=1.622;QD=33.59;ReadPosRankSum=1.873;SOR=3.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr9	34834937	rs202203144	A	G	1285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=7.460;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.43;MQRankSum=2.620;QD=32.97;ReadPosRankSum=-0.710;SOR=3.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr9	34835273	rs521552	A	C	4661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=7.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=475;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.351;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-11.932;NF=99;NR=109;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.264;SC=GAGAAGTATTATTCAGGTTGA;SOR=0.605;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=497;TCF=268;TCR=229;TR=208;WE=34835281;WS=34835263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:285,190:0.40:475
chr9	34835861	rs924566	C	G	2677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=36;PP=2046;ReadPosRankSum=1.712;SC=AAAGGATACACTAGACAGAGA;SOR=0.321;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=83;TCF=47;TCR=36;TR=82;WE=34835869;WS=34835851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,85:0.99:86
chr9	34836905	rs3802426	A	G	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=0;PP=765;SC=CTCCTGAGATAATTATGCCTT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=34836913;WS=34836901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	35089048	rs556766	A	C	1106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=0;PP=1004;SC=CACTGTTCTCAAGCACTCTCT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=35;WE=35089056;WS=35089038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	35100002	rs664357	T	C	4292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=93;NR=37;PP=2965;SC=GCTTCCTTGTTCCCAGACTCC;SOR=1.946;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=94;TCR=37;TR=130;WE=35100010;WS=35099992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr9	35107340	.	AGT	A	214.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.279;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=2.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.36;MQRankSum=-2.901;QD=6.51;ReadPosRankSum=-0.499;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr9	35107858	rs7039828	C	T	7079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.97;NF=105;NR=118;PP=2965;SC=TCCAGGCCCCCGAAGTCCAAG;SOR=0.777;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=224;TCF=105;TCR=119;TR=223;WE=35107866;WS=35107848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr9	35295984	rs661712	T	C	1914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=44;PP=1631;SC=CATGATGCAATTGGCAAGAAG;SOR=2.342;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=15;TCR=44;TR=59;WE=35295992;WS=35295974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr9	35382559	rs199694785	AT	A	139.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQRankSum=1.859;QD=3.33;ReadPosRankSum=1.649;SOR=0.392;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr9	35546735	rs1535422	A	G	10650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=168;NR=145;PP=2965;SC=CCTGCACTCTACTCCAGGAGG;SOR=0.853;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=315;TCF=170;TCR=145;TR=313;WE=35546743;WS=35546725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,335:1.00:335
chr9	35610523	rs71940749	CCCCTGCTCTGAGT	C	2171.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=1;PP=2978;SC=GGCCCCTGGGCCCCTGCTCTG;SOR=5.549;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=24;WE=35610543;WS=35610513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr9	35610912	rs4879913	A	G	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=321;SC=ACTAAAACAGACTTTAGAACC;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=35610920;WS=35610902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	35616583	rs2095858	A	T	2717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=46;PP=2003;SC=GGAAGTAGGGACAGCCTTACT;SOR=0.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=39;TCR=46;TR=85;WE=35616591;WS=35616573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr9	35650458	rs2297880	G	A	7885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=144;NR=96;PP=2965;SC=CTCGGTAAGAGAGAACTCTCA;SOR=1.151;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=240;TCF=144;TCR=96;TR=240;WE=35650466;WS=35650448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr9	35664624	rs1361338	C	A	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=28;PP=910;SC=ATGCTAAGGCCCTGGGCCAAG;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=35664632;WS=35664614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	35677702	rs2857801	T	A	2542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=4;PP=1410;SC=ATGGGAGAGGTCTATGGGAAC;SOR=4.731;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=47;TCR=4;TR=51;WE=35677719;WS=35677692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	35677711	rs35212337	AC	A	2686.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=5;PP=1700;SC=GTCTATGGGAACCCCCCTTCA;SOR=4.582;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=59;TCF=54;TCR=5;TR=54;WE=35677719;WS=35677692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr9	35681122	rs1048638	C	A	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=319;SC=TTTTAACTGCCAAGAAATTTT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=35681130;WS=35681112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	35682255	rs10972558	G	C	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=20;PP=453;SC=GACATGGAGTGGGTCAAGGAA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=35682263;WS=35682245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	35682296	rs11998	T	A	341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=8;PP=283;SC=TCAGGGCCCCTTGGCAGGGAC;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=35682304;WS=35682286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	35684822	rs3215700	C	CG	2505.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=32;PP=1903;ReadPosRankSum=-0.860;SC=GGGTGTGTGGCGGGGGGGGCA;SOR=1.069;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=99;TCF=53;TCR=46;TR=77;WE=35684830;WS=35684812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,89:0.95:94
chr9	35700527	rs151212820	A	AGTTT	1265.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=1143;SC=GCAACTGGGGAGTTTGTTTGT;SOR=5.353;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=20;WE=35700535;WS=35700517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	35704898	rs3215701	GA	G	1516.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=42;PP=1295;SC=TAAGGACATAGAAAAAAACAT;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=46;WE=35704906;WS=35704888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	35707054	rs741917	C	T	4942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=59;PP=2965;SC=ACACTGGTTCCCCATCCCTCA;SOR=1.106;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=90;TCR=59;TR=149;WE=35707062;WS=35707044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr9	35711806	rs2249250	G	T	2396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=48;PP=1878;SC=GGTGAGAGGGGAAGTCAGACA;SOR=1.704;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=71;WE=35711814;WS=35711796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr9	35712150	rs370229817	C	A	3443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=61;PP=2772;SC=CAGGGTTGCCCAAGTGAAAAG;SOR=0.912;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=50;TCR=61;TR=111;WE=35712158;WS=35712140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr9	35712823	rs2249133	G	A	3607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=60;PP=2886;SC=CCCTTTCCCAGTATCTGACCT;SOR=0.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=57;TCR=60;TR=117;WE=35712831;WS=35712813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr9	35713139	.	C	A	1258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=6;PP=1042;SC=ATCCAGCTCCCATTTTCCTAC;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=37;WE=35713147;WS=35713129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	35713181	.	C	G	1812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=14;PP=1423;SC=GCCTGGCTCTCTGCCCACATA;SOR=2.137;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=52;WE=35713189;WS=35713171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr9	35736758	.	TG	T	1107.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=31;PP=1061;SC=AGCAGGAGCCTGGGGGGCTCC;SOR=4.294;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=33;WE=35736766;WS=35736748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	35739115	rs3833700	G	GC	2491.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=48;PP=2554;SC=AGCTGGGGGAGAGACACAGAA;SOR=2.340;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=56;TCF=8;TCR=48;TR=55;WE=35739123;WS=35739105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr9	35739876	rs3750434	G	A	2528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=39;PP=2035;SC=TCAGCAGAGTGGGATCATCAA;SOR=0.798;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=34;TCR=39;TR=73;WE=35739884;WS=35739866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr9	35751221	rs1570248	C	T	7051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=143;NR=80;PP=2965;SC=CTCTCATCTCCGTTCCCTCTC;SOR=1.447;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=224;TCF=144;TCR=80;TR=223;WE=35751229;WS=35751211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr9	35752252	rs1570249	G	A	643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=543;SC=ACATACCCACGTCTAGCCTCT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=35752260;WS=35752242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	35792423	rs2228580	T	C	2202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=4;PP=1900;SC=TGCCATCACTTCTGCTGTTGG;SOR=4.977;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=58;TCR=4;TR=62;WE=35792431;WS=35792413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr9	35801233	rs1322044	T	C	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=23;PP=716;SC=GTCCCTATAATGTGGGATAGG;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=36;WE=35801241;WS=35801223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	35801856	rs7034957	C	A	10012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=222;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.839;SC=TAATGATAGCCCCTGCACTAC;SOR=0.801;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=325;TCF=100;TCR=225;TR=321;WE=35801864;WS=35801846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,326:1.00:327
chr9	35802092	rs2890702	G	C	3301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=32;PP=2842;SC=CCTCATACCCGACTCTCTGTG;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=64;TCR=32;TR=95;WE=35802100;WS=35802082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr9	35802583	rs5812	C	T	8351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=108;NR=147;PP=2965;SC=TCACTGAATACTGTCCTCGTG;SOR=1.097;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=256;TCF=108;TCR=148;TR=255;WE=35802591;WS=35802573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr9	35807401	rs112946422	AGCTGGGGCC	A	3556.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.742;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.353;NF=15;NR=41;PP=2964;ReadPosRankSum=-0.244;SC=ACAAGGTGAGAGCTGGGGCCG;SOR=1.754;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=60;TCF=15;TCR=45;TR=56;WE=35807417;WS=35807391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,84:0.98:86
chr9	35807542	rs13294264	C	T	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=377;SC=GAGTGTACTTCGTAGACAGAT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=35807550;WS=35807532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	35811485	rs141090907	ACCAGGACCAGAG	A	2575.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=19;PP=2972;SC=CAGAGCCATGACCAGGACCAG;SOR=0.796;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=70;TCF=30;TCR=40;TR=36;WE=35811504;WS=35811475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr9	35826038	rs13294245	T	C	2809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=40;PP=1859;SC=GTGGAAGGCTTCAAGAAGCTT;SOR=1.196;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=24;TCR=40;TR=64;WE=35826046;WS=35826028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr9	35826058	rs13294256	T	C	2969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=44;PP=1617;SC=TTCAGAGATATGGTTCTCCTG;SOR=1.288;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=26;TCR=44;TR=70;WE=35826066;WS=35826048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr9	35829390	rs2381409	C	T	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=8;NR=9;PP=353;SC=GAGCCGCGGGCCAGCTCTGCG;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=17;WE=35829398;WS=35829380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	35841071	rs2236292	C	T	1137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=2;PP=868;SC=TTCTGTTTGCCTTGGTTTAGT;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=35841079;WS=35841061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	35842301	rs2236294	G	A	2063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=16;PP=1606;SC=CACTCTTTGCGAAATCCTGTC;SOR=2.165;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=63;WE=35842309;WS=35842291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr9	35845929	rs7848557	A	C	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=4;PP=1017;ReadPosRankSum=-0.184;SC=GTGGGTGGAGATGGAGGATGT;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=38;TCR=4;TR=41;WE=35845937;WS=35845919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr9	35852670	rs12346647	T	C	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=1;PP=709;SC=TTCTCAGGATTTGGGGAGTCA;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=35852678;WS=35852662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	35870001	rs7044405	T	C	5146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.96;NF=97;NR=66;PP=2965;SC=CATGAGCACGTGGTACCTGAG;SOR=1.118;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=97;TCR=66;TR=163;WE=35870009;WS=35869991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr9	35870225	rs72727089	G	A	7518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=136;PP=2965;SC=AGAAGTACACGGGCGTGTGCA;SOR=1.260;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=224;TCF=88;TCR=136;TR=224;WE=35870233;WS=35870215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr9	35910690	rs10491554	G	A	4441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=94;PP=2965;SC=TTCATGTGACGCCCGAGTCCC;SOR=1.530;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=49;TCR=94;TR=143;WE=35910698;WS=35910680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr9	35910801	rs10814296	G	A	1462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=42;PP=1188;SC=TTCCCCTCCAGTAACCTGTGA;SOR=4.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=45;WE=35910809;WS=35910791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	36063688	rs10814326	A	G	784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=730;SC=CAGTTTTCTTATGGACAGCTG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=36063696;WS=36063678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	36063743	rs942478	C	G	1556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=2;PP=1250;SC=CATGCTATCTCTTTTTATTGC;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=44;WE=36063751;WS=36063733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	36105264	rs11788747	A	G	5531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=110;PP=2965;SC=CCTGTCTTCCATACTTTTGTG;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=185;TCF=75;TCR=110;TR=185;WE=36105272;WS=36105254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr9	36109947	rs10972726	C	A	6627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=131;NR=78;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.668;SC=CTTTCTGTTTCTGTCAGGTCA;SOR=0.514;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=210;TCF=132;TCR=78;TR=209;WE=36109955;WS=36109937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,217:1.00:218
chr9	36110063	rs10972727	T	A	4044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=108;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.123;SC=AAGATGACCGTCGTACCTTCA;SOR=1.762;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=125;TCF=15;TCR=110;TR=123;WE=36110071;WS=36110053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,127:0.98:129
chr9	36110137	rs10972728	C	A	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=31;PP=851;SC=CACATTTTTCCCTTCAAGGCA;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=36110145;WS=36110127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	36141817	rs34562409	A	AT	623.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=5.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQRankSum=-0.335;QD=14.18;ReadPosRankSum=-0.466;SOR=0.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:7,37:0.84:44
chr9	36163002	rs11588	C	T	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=18;PP=654;SC=CACATAAATACAAAGCAGCTT;SOR=1.255;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=29;WE=36163010;WS=36162992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	36169494	rs3739610	G	A	3930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=47;PP=2965;SC=GCCGACAAGAGGCACCATGAA;SOR=1.255;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=74;TCR=47;TR=121;WE=36169502;WS=36169484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr9	36169598	rs3739609	T	C	3850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=83;PP=2965;SC=TGGCCCTGAGTGTGGACAACC;SOR=1.294;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=132;TCF=48;TCR=84;TR=131;WE=36169606;WS=36169588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr9	36191004	rs2274523	C	T	2737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=68;NR=19;PP=2160;SC=GTCGGTGGGTCGGTTGGTTTT;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=68;TCR=19;TR=87;WE=36191012;WS=36190994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr9	36191149	rs2274524	T	C	2391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=56;PP=1887;SC=AAGACCCGGCTGCGGCCTTCT;SOR=1.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=25;TCR=56;TR=81;WE=36191157;WS=36191139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr9	36216324	.	A	ATGTGTGTGTGTGTGTG	938.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.44;QD=67.05;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	36276857	rs7875447	A	G	3460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=9;PP=2785;ReadPosRankSum=0.000;SC=TGCAATTTCAATAATAAAGCT;SOR=3.139;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=89;TCR=9;TR=97;WE=36276865;WS=36276847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,102:0.99:103
chr9	36277171	rs72624019	C	T	1600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=45;PP=1316;SC=GTGTTACTTCCCTGTTTTGGA;SOR=6.358;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=46;WE=36277179;WS=36277161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr9	36369646	rs34904529	CA	C	279.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.63;QD=21.52;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	36372737	rs12001805	C	A	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=271;SC=TTTCAAAGAACTCAAAGCTAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=36372745;WS=36372727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	36378853	rs12379930	G	A	1567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=38;PP=1206;SC=ACAAAGAATGGGAAGTGAAGG;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=48;WE=36378861;WS=36378843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
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chr9	36669228	rs3780133	C	A	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=1;PP=583;SC=AATGTGATACCTGCATTATTA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=36669236;WS=36669218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	36674842	rs2274473	C	T	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=2;PP=889;SC=TTCACTATAACGTGACTACAA;SOR=4.047;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=31;WE=36674850;WS=36674832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	36846910	rs35469494	C	T	1885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=28;PP=1390;SC=TGTAGGGACTCCCGGAAAACT;SOR=0.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=28;TCR=28;TR=56;WE=36846918;WS=36846900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr9	36864066	rs4378045	G	A	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=349;SC=AGATTGCACCGCTACATTCCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=36864074;WS=36864056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	36882264	.	TACAC	T	541.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;QD=38.70;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	37020516	rs62533713	G	A	333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=281;SC=TGCTCTGCGTGTGAAACAAAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=37020524;WS=37020506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	37020622	rs2297105	A	C	1633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=5;PP=1356;SC=GCCTCGAGCTACTGCCTTTAC;SOR=4.003;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=45;WE=37020630;WS=37020612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr9	37302155	rs10814518	C	T	866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=11;PP=636;SC=AAAAGTGCCACGGTTAAGTAA;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=25;WE=37302163;WS=37302145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	37304168	rs11422051	A	AT	1803.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=10;PP=998;ReadPosRankSum=0.420;SC=TTAATTCTTGATTTTTTTTTC;SOR=2.012;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=52;TCR=13;TR=49;WE=37304176;WS=37304158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr9	37305610	.	G	A	1236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-1.076;NF=30;NR=6;PP=974;ReadPosRankSum=-0.881;SC=CCCCCTTTGCGAATACTGTCC;SOR=1.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=36;WE=37305618;WS=37305600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,39:0.98:40
chr9	37305829	rs3837244	GATAT	G	1044.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=22;PP=1182;SC=TACTCCGTGAGATATATATAT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=22;WE=37305840;WS=37305819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	37426524	rs2736664	C	T	3645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=52;PP=2875;SC=CACCAGATGTCTGATTCGTAG;SOR=1.010;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=121;TCF=68;TCR=53;TR=120;WE=37426532;WS=37426514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr9	37441808	rs309450	A	G	3989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=60;PP=2907;SC=CAGTCATTCCATCAGCTTTAG;SOR=0.862;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=69;TCR=60;TR=128;WE=37441816;WS=37441798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr9	37486603	rs1571234	A	G	4642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=74;PP=2965;ReadPosRankSum=2.592;SC=CCCCATTCTGACACTCCCTCC;SOR=0.886;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=64;TCR=74;TR=138;WE=37486611;WS=37486593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,145:0.99:147
chr9	37489562	rs7860865	C	T	441.88	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=366;ReadPosRankSum=-0.774;SC=TTTATATACACACTGTTTTTT;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=16;WE=37489570;WS=37489552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr9	37492721	rs3739575	G	A	2042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=40;PP=1561;SC=AGGTGAGTGTGATAGAATTAA;SOR=1.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=22;TCR=40;TR=62;WE=37492729;WS=37492711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	37498334	rs6476635	C	T	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=293;SC=CAAGTCTTTACTGTCAACTGT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=37498342;WS=37498324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	37501752	rs17412622	T	C	2610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=16;PP=2168;SC=CGAAGATTACTGCATATGTGA;SOR=2.598;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=67;TCR=16;TR=83;WE=37501760;WS=37501742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr9	37503124	rs7047823	G	A	942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=16;PP=784;SC=AAGATCACAAGCTGGGCACCC;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=16;TCR=16;TR=32;WE=37503132;WS=37503114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	37503241	rs11792930	C	T	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=244;SC=GCATCACAGCCACTGGCTGGT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=37503249;WS=37503231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	37512734	rs10973387	G	A	798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=640;SC=GGTGCAAAACGAAAGTCAGTG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=37512742;WS=37512724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	37518032	rs17413149	C	T	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=689;SC=TGAGTGATTACGGTTCTGTTC;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=37518040;WS=37518022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	37529286	rs34323368	G	A	1284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=29;PP=1052;SC=CACCACAGAAGCCAGATCAGA;SOR=1.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=41;WE=37529294;WS=37529276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	37529344	rs28401636	A	G	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=495;SC=CCTCCGCGGCAGGATGAACAC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=37529352;WS=37529334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	37531872	rs11789166	G	A	2620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.854;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=14;PP=2107;ReadPosRankSum=0.000;SC=TGAAAACCAAGAGTCACCCTG;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=78;TCF=63;TCR=15;TR=76;WE=37531880;WS=37531862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,82:0.98:84
chr9	37536998	rs927930	C	T	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=382;SC=GTCAAGCGTGCGTGAATAAGT;SOR=5.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=37537006;WS=37536988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	37780831	rs3208406	A	G	1747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=31;PP=1402;SC=TCCAGTGGATAGAGTTTTCCC;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=22;TCR=31;TR=53;WE=37780839;WS=37780821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	37974743	rs1138374	T	C	2090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=31;PP=1510;SC=TCTCCGAGTCTGAGTCAACAC;SOR=0.898;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=39;TCR=31;TR=70;WE=37974751;WS=37974733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr9	37974810	rs370530548	C	T	1646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=33;PP=1173;ReadPosRankSum=0.677;SC=ATGCTGGGACCGGACACTTTC;SOR=0.641;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=16;TCR=34;TR=49;WE=37974818;WS=37974800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,53:0.98:54
chr9	38015646	rs7047952	C	G	1023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=28;PP=856;SC=CTGCCTACTACGAAGCTCTAA;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=38015654;WS=38015636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	38068532	rs3750444	A	G	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=9;PP=793;SC=GGGGCTGCGAAGGCCGCTCGC;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=38068540;WS=38068522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	38395928	rs2073477	C	T	5572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=61;PP=2965;SC=ACCCTACCACCGGGGAGGTCA;SOR=0.756;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=68;TCR=61;TR=129;WE=38395948;WS=38395918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr9	38395940	rs2228094	T	C	5455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=66;PP=2965;SC=GGGAGGTCATTGGGCACGTGG;SOR=0.790;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=61;TCR=66;TR=127;WE=38395948;WS=38395918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr9	38396002	rs2228093	C	T	3842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=58;PP=2965;SC=GCCCGGGAAGCCTTCCGCCTG;SOR=0.742;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=63;TCR=58;TR=121;WE=38396010;WS=38395992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr9	38396502	rs4878199	G	A	1635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=19;PP=1299;SC=CGCCCAGCACGTGGATGTTGA;SOR=1.220;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=33;TCR=19;TR=52;WE=38396510;WS=38396492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr9	38397355	rs3043	G	C	643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=578;SC=CCACCTTGACGAATGCTTGCC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=38397363;WS=38397345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	38413159	rs7018644	T	G	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=5;PP=1174;SC=CTTTGAAACATGTAATGTGTT;SOR=3.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=43;WE=38413167;WS=38413149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	38414030	rs5897733	T	TCA,TCACA	1954.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=25,25;NR=5,5;PP=959,249;SC=TCCCTCTTTCTCACACACACA;SOR=3.258;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=60;TCF=52;TCR=8;TR=30,30;WE=38414038;WS=38414020;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.20,0.80:46
chr9	38423826	rs7039990	T	A	2013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=0;PP=1726;SC=AGGAGAGATATGAAATACTGC;SOR=8.189;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=59;TCR=0;TR=59;WE=38423834;WS=38423816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr9	38424344	rs35134904	A	G	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=12;PP=749;SC=CGCGGATCCCAAGGCTCGGGG;SOR=1.244;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=33;WE=38424352;WS=38424334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	38571976	rs140529454	T	TTAAA	2581.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=13;PP=2566;SC=GATTTTATGGTTAATCTCTTC;SOR=2.262;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=45;WE=38571984;WS=38571966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	38573141	rs1974262	T	A	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.72;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	40503085	rs139489532	A	G	182.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.17;QD=26.11;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	40503105	rs201003096	G	C	249.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.90;QD=31.22;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	40784183	rs4339693	A	G	768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.38;QD=33.42;SOR=6.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	43853546	rs200740249	C	T	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.39;MQRankSum=-2.199;QD=13.60;ReadPosRankSum=0.632;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr9	43860959	rs145957320	G	C	175.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.51;QD=25.11;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	43861081	rs62536501	T	G	131.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.75;QD=26.38;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	66456982	.	G	C	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=4.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.22;MQRankSum=-1.759;QD=0.99;ReadPosRankSum=-0.916;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,4:0.11:38
chr9	66457014	.	C	T	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.36;MQRankSum=-2.630;QD=4.17;ReadPosRankSum=0.053;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,11:0.17:65
chr9	66457016	rs10436128	C	T	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.51;MQRankSum=-1.128;QD=13.81;ReadPosRankSum=0.950;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,25:0.39:64
chr9	66457019	rs7040398	G	A	1641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.60;MQRankSum=-5.689;QD=28.31;ReadPosRankSum=1.889;SOR=1.241;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,41:0.71:58
chr9	66457027	rs76122331	T	A	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.90;MQRankSum=-5.878;QD=29.43;ReadPosRankSum=3.439;SOR=0.995;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,49:0.73:67
chr9	66457041	.	GT	AC	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.207;ClippingRankSum=0.000;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=4.211;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.19;MQRankSum=-1.103;QD=0.62;ReadPosRankSum=1.701;SOR=0.062;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,7:0.09:79
chr9	66457051	rs79307166	G	C	2180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=6.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.896;HP=1;HapScore=1;MGOF=59;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.937;NF=60;NR=3;PP=802;ReadPosRankSum=1.344;SC=GTGAGTCTGCGGATGCTCCCA;SOR=1.314;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=92;TCF=85;TCR=7;TR=63;WE=66457060;WS=66456993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,57:0.69:83
chr9	66457052	.	G	A	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.53;MQRankSum=-3.688;QD=5.02;ReadPosRankSum=1.522;SOR=0.451;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,16:0.22:72
chr9	66457076	rs76994164	T	C	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.320;HP=3;HapScore=2;MGOF=78;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.664;NF=39;NR=15;PP=1094;ReadPosRankSum=0.316;SC=AATAAAGCCCTTCCTTCTACA;SOR=1.022;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=129;TCF=97;TCR=32;TR=54;WE=66457085;WS=66457066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,38:0.38:99
chr9	66457077	.	T	C	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.000;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.79;MQRankSum=-3.909;QD=1.03;ReadPosRankSum=-1.196;SOR=0.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,10:0.10:102
chr9	66457106	.	C	T	992	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=77;MMLQ=28;MQ=46.86;NF=29;NR=26;PP=992;QD=18.6685675009;SC=CTGAGGGGTTCTGTCTGCAGC;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=177;TCF=111;TCR=66;TR=55;WE=66457120;WS=66457082;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:122,55:0.31:177
chr9	66457110	.	C	G	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.102;ClippingRankSum=0.000;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=4.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.31;MQRankSum=-3.835;QD=0.29;ReadPosRankSum=-1.791;SOR=0.281;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,16:0.12:129
chr9	66457112	rs113087405	G	A	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=7.495;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQRankSum=-4.002;QD=5.77;ReadPosRankSum=-1.129;SOR=0.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,28:0.21:135
chr9	66457126	.	TGC	T	717.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.444;ClippingRankSum=0.000;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=5.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.94;MQRankSum=-3.204;QD=4.92;ReadPosRankSum=2.058;SOR=0.313;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,26:0.18:146
chr9	66457127	rs73447819	G	A	485.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.457;HP=1;HapScore=2;MGOF=75;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.362;NF=61;NR=67;PP=2962;ReadPosRankSum=0.485;SC=TCCTCCTGCTGCAGAAGGAGA;SOR=0.623;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=210;TCF=115;TCR=95;TR=128;WE=66457245;WS=66457117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,23:0.16:145
chr9	66457129	.	A	ATG	725.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.502;ClippingRankSum=0.000;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=5.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.89;MQRankSum=-2.833;QD=4.97;ReadPosRankSum=2.188;SOR=0.313;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,26:0.18:146
chr9	66457151	rs78939328	G	C	1613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=16.365;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQRankSum=-5.359;QD=11.21;ReadPosRankSum=-0.186;SOR=0.898;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,49:0.34:144
chr9	66457169	rs138400587	AGAG	A	1374.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.228;HP=2;HapScore=2;MGOF=75;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.860;NF=42;NR=59;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.172;SC=AAATAGAACCAGAGGGAGAGA;SOR=1.179;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=173;TCF=76;TCR=97;TR=101;WE=66457245;WS=66457117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,40:0.29:136
chr9	66457173	rs199759715	GGAGAGAGAGAGACAGCGATAGAGAGA	G	62.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=8.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.49;MQRankSum=0.162;QD=0.46;ReadPosRankSum=0.707;SOR=1.328;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,12:0.09:137
chr9	66457184	.	G	T	422.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.707;ClippingRankSum=0.000;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.10;MQRankSum=-3.040;QD=3.25;ReadPosRankSum=-0.198;SOR=0.777;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,19:0.15:130
chr9	66457189	rs2874584	C	T	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=15.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.67;MQRankSum=-2.101;QD=3.08;ReadPosRankSum=-1.573;SOR=2.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,16:0.14:115
chr9	66457192	rs148663514	TAGAGAGAG	TAGAGAG,T	322.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.070;HP=2;HapScore=1;MGOF=78;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.462;NF=45;NR=46;PP=2991;ReadPosRankSum=0.721;SC=GAGACAGCGATAGAGAGAGAG;SOR=0.919;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=131;TCF=58;TCR=73;TR=91;WE=66457245;WS=66457179;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.21:80
chr9	66457193	.	A	T	252.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=0.000;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=1.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.88;MQRankSum=-3.272;QD=1.96;ReadPosRankSum=0.985;SOR=0.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,15:0.12:129
chr9	66457200	.	G	C	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.000;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=2.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.47;MQRankSum=-3.863;QD=2.63;ReadPosRankSum=1.029;SOR=0.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,14:0.11:126
chr9	66457205	.	A	AAGGGGGGAG	237.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=0.000;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=3.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.55;MQRankSum=-3.519;QD=1.83;ReadPosRankSum=1.057;SOR=1.059;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,15:0.12:130
chr9	66457216	rs150998016	A	G	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.43;MQRankSum=-2.214;QD=10.55;ReadPosRankSum=-1.012;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,33:0.31:107
chr9	66457228	.	A	C	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=3.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.31;MQRankSum=-1.292;QD=0.88;ReadPosRankSum=-0.456;SOR=1.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,8:0.08:103
chr9	66457231	rs140644333	G	GAC	1133.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=1.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.92;MQRankSum=-0.965;QD=10.50;ReadPosRankSum=1.692;SOR=0.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,33:0.31:108
chr9	66457233	.	G	C	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.639;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=2.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.82;MQRankSum=-1.396;QD=0.73;ReadPosRankSum=-0.217;SOR=0.967;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,10:0.09:108
chr9	66457237	.	G	A	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=2.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.62;MQRankSum=-1.956;QD=3.65;ReadPosRankSum=-1.218;SOR=0.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,15:0.14:108
chr9	66457253	rs73447820	A	G	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=4.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.93;MQRankSum=0.102;QD=9.36;ReadPosRankSum=3.805;SOR=1.236;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,24:0.28:86
chr9	66457259	.	G	T	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.038;ClippingRankSum=0.000;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.67;MQRankSum=0.022;QD=1.09;ReadPosRankSum=1.256;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,12:0.10:120
chr9	66457265	.	C	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=0.000;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=5.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.65;MQRankSum=-1.718;QD=2.37;ReadPosRankSum=2.276;SOR=1.443;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,15:0.13:118
chr9	66457267	rs2002299	C	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.12;MQRankSum=-1.650;QD=3.53;ReadPosRankSum=-1.396;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,22:0.21:107
chr9	66457270	.	G	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.000;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=5.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.83;MQRankSum=-1.090;QD=2.11;ReadPosRankSum=2.491;SOR=1.416;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,15:0.12:121
chr9	66457276	.	G	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.318;ClippingRankSum=0.000;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=9.710;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.09;MQRankSum=-0.822;QD=1.10;ReadPosRankSum=1.043;SOR=1.379;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,15:0.12:127
chr9	66457278	.	G	A	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.510;ClippingRankSum=0.000;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=3.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.89;MQRankSum=-0.413;QD=1.99;ReadPosRankSum=2.368;SOR=1.290;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,15:0.12:128
chr9	66457310	rs75999199	T	G	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=14.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.83;MQRankSum=-2.644;QD=8.11;ReadPosRankSum=1.648;SOR=0.388;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,32:0.25:129
chr9	66457313	rs79959518	G	A	1593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=12.050;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.13;MQRankSum=-3.840;QD=12.07;ReadPosRankSum=0.641;SOR=0.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,48:0.36:132
chr9	66457317	rs77524857	C	T	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=16.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.30;MQRankSum=-3.046;QD=7.86;ReadPosRankSum=0.986;SOR=0.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,33:0.24:135
chr9	66457324	rs80001863	G	A	1036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=23.423;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.87;MQRankSum=-3.066;QD=7.25;ReadPosRankSum=0.800;SOR=0.326;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,32:0.22:143
chr9	66457388	rs1809739	T	G	2178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=5.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.127;HP=3;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-12.112;NF=85;NR=72;PP=2962;ReadPosRankSum=2.038;SC=GGCCGGGGTGTGGTGGAGGGT;SOR=0.505;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=258;TCF=157;TCR=101;TR=157;WE=66457412;WS=66457378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,70:0.41:172
chr9	66457399	rs78461570	T	G	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.543;HP=1;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-8.724;NF=71;NR=55;PP=2962;ReadPosRankSum=3.510;SC=GGTGGAGGGTTCTTGGGCCGG;SOR=0.938;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=262;TCF=161;TCR=101;TR=126;WE=66457412;WS=66457378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,38:0.22:173
chr9	66457451	rs79122745	T	C	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.754;HP=2;HapScore=2;MGOF=46;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.642;NF=67;NR=54;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.881;SC=GGAAAACCAATGGAGCCCTGA;SOR=0.807;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=310;TCF=166;TCR=144;TR=121;WE=66457488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,28:0.12:226
chr9	66457465	rs11262297	T	G	2831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-5.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.905;HP=1;HapScore=2;MGOF=46;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-12.393;NF=74;NR=54;PP=2962;ReadPosRankSum=0.087;SC=GCCCTGAGACTTGTTTTTTTC;SOR=0.743;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=310;TCF=163;TCR=147;TR=128;WE=66457488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,77:0.33:231
chr9	66457467	.	G	GTGTGT	1519.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.794;ClippingRankSum=0.000;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=5.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.71;MQRankSum=-12.299;QD=6.55;ReadPosRankSum=-2.090;SOR=0.947;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:190,42:0.18:232
chr9	66457475	rs55747937	C	T	3600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FS=6.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.15;MQRankSum=-12.911;QD=14.29;ReadPosRankSum=-0.662;SOR=1.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,99:0.39:252
chr9	66457480	rs77629849	G	A	1892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FS=7.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.97;MQRankSum=-13.305;QD=7.57;ReadPosRankSum=-1.143;SOR=1.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:190,60:0.24:250
chr9	66457501	.	G	C	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.784;ClippingRankSum=0.000;DP=276;ExcessHet=3.0103;FS=10.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.18;MQRankSum=-7.153;QD=0.12;ReadPosRankSum=1.183;SOR=1.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:253,21:0.08:274
chr9	66457511	.	T	G	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.576;ClippingRankSum=0.000;DP=269;ExcessHet=3.0103;FS=10.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.23;MQRankSum=-7.050;QD=0.23;ReadPosRankSum=1.771;SOR=2.024;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:246,20:0.08:266
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chr9	66457549	rs77706622	A	G	1638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=5.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.92;MQRankSum=-5.596;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.005;SOR=1.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,48:0.26:185
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chr9	68409923	.	C	A	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.596;ClippingRankSum=0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.25;MQRankSum=-1.814;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.366;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,2:0.14:14
chr9	68409929	.	T	G	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=17.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.09;MQRankSum=-1.907;QD=6.49;ReadPosRankSum=-0.061;SOR=3.225;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr9	68409945	.	C	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.17;MQRankSum=-2.578;QD=7.12;ReadPosRankSum=-0.719;SOR=3.234;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr9	68409949	.	C	G	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.55;MQRankSum=-2.717;QD=6.49;ReadPosRankSum=-0.303;SOR=3.231;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr9	68409954	.	T	G	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.892;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.55;MQRankSum=-2.717;QD=6.49;ReadPosRankSum=-0.304;SOR=3.231;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr9	68409957	.	TC	T	91.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.962;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=11.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.55;MQRankSum=-2.717;QD=5.73;ReadPosRankSum=-0.303;SOR=3.231;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr9	68409964	.	TTTTCTA	T	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=6.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQRankSum=-3.301;QD=2.57;ReadPosRankSum=1.447;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,3:0.18:17
chr9	68409976	.	C	G	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=6.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.33;MQRankSum=-3.883;QD=3.28;ReadPosRankSum=1.702;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,3:0.18:17
chr9	68415193	rs80256038	T	A	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.726;NF=19;NR=5;PP=579;ReadPosRankSum=-0.018;SC=TAATTAATAATTGCATTTTGT;SOR=0.818;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=24;WE=68415204;WS=68415160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr9	68415212	rs143303312	A	T	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=2.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.11;MQRankSum=-0.504;QD=0.70;ReadPosRankSum=0.123;SOR=0.178;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,6:0.13:47
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chr9	68415338	rs75019967	A	C	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=1.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=0.586;QD=1.72;ReadPosRankSum=1.008;SOR=1.034;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,11:0.13:82
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chr9	68427750	rs78840873	T	C	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=3.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.68;MQRankSum=-1.870;QD=3.83;ReadPosRankSum=0.859;SOR=0.141;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,21:0.20:103
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chr9	68427800	rs77055654	C	T	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=0.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.77;MQRankSum=-2.296;QD=1.92;ReadPosRankSum=-0.203;SOR=0.571;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,31:0.16:192
chr9	68427818	rs111699417	G	GA	305.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=7.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.94;MQRankSum=-4.287;QD=1.48;ReadPosRankSum=-1.563;SOR=1.356;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:174,33:0.16:207
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chr9	68427938	rs113084687	CAT	C	217.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=2.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.35;MQRankSum=-1.365;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.424;SOR=0.225;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,12:0.13:93
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chr9	68433620	rs62543351	C	T	3777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-7.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.498;HP=4;HapScore=1;MGOF=50;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.802;NF=34;NR=118;PP=2962;ReadPosRankSum=2.601;SC=GTAGAAGAAACATTAAGTGTT;SOR=0.647;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=384;TCF=86;TCR=298;TR=152;WE=68433634;WS=68433602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,137:0.46:296
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chr9	68433701	rs62543352	A	G	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.21;MQRankSum=1.786;QD=7.54;ReadPosRankSum=-1.359;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,27:0.33:83
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chr9	69002294	.	CGTAGGATTCC	TGTAGGATTCA,TGTAGGATTCC	1233	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MMLQ=29;MQ=59.51;NF=20,45;NR=15,28;PP=1233,392;QD=36.7562249961;SC=TTGTCCCTCACGTAGGATTCC;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=97;TCF=64;TCR=33;TR=35,73;WE=69002325;WS=69002284;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.36:97
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chr9	69002317	rs76266132	T	C	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.789;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=1251;ReadPosRankSum=0.204;SC=AACACTGCCATGAGGGTCTTA;SOR=0.515;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=104;TCF=58;TCR=46;TR=34;WE=69002325;WS=69002284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,34:0.33:103
chr9	69002413	rs62555122	T	C	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.43;ReadPosRankSum=-1.262;SOR=0.487;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,21:0.26:80
chr9	69002423	rs62555123	G	A	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.27;ReadPosRankSum=-1.166;SOR=0.457;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,16:0.24:67
chr9	71114312	rs12685375	C	T	1404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=43;PP=1224;ReadPosRankSum=0.868;SC=CAGTGTGTCTCGCAGCTCCTG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=43;WE=71114320;WS=71114302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr9	71395013	rs3750377	C	G	289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=2;PP=231;SC=CGGCGGCGGCCCTGGACTGCG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=71395021;WS=71395003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr9	71538069	rs2027208	A	G	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=4;PP=579;SC=CCTGGGCCCCACGGGCTACAG;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=71538077;WS=71538059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	71629038	.	C	CGCGGCG	992.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=2;NR=24;PP=1432;SC=GCGGGGGTCTCGCGGCGGCGG;SOR=4.977;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=26;WE=71629046;WS=71629028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	71650752	rs2481598	A	G	191.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=2;PP=135;SC=CACCCAGCCCAGCCCAGGCCC;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=71650760;WS=71650742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr9	71714693	rs10121021	C	T	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=6;PP=1002;ReadPosRankSum=-0.743;SC=TTGGGAACCACAGGCAAGAAT;SOR=1.755;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=38;WE=71714701;WS=71714683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr9	71789156	rs13301644	C	T	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=2;PP=634;SC=GGGGTGGGTCCCCGCGGGTCG;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=71789164;WS=71789146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	71789386	rs144607139	T	TCGTGAG	1050.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=16;PP=1279;SC=GGGAGGAGGGTCGTGAGCGTG;SOR=1.802;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=19;WE=71789394;WS=71789376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	71820008	rs2498440	A	G	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=450;SC=ACGTAACCACATGGAGTGATG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=71820016;WS=71819998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	71827618	rs34883177	T	C	1168.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=37;PP=1122;SC=GCTTTTTTTTTCCCTTGAGGT;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=37;WE=71827626;WS=71827608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	71831398	rs2498417	T	C	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=23;PP=663;SC=CCTCCCTCGCTCCGCAGCCCC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=71831406;WS=71831388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	71843023	rs2309428	C	A	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=32;PP=1161;ReadPosRankSum=0.857;SC=ACCAAGAGGACCCCCCAGGTG;SOR=0.504;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=51;WE=71843031;WS=71843013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,53:0.98:54
chr9	71852760	rs2309421	G	A	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=8;PP=1018;SC=CTAGGCAAGTGTGTATGCTTT;SOR=2.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=39;WE=71852768;WS=71852750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	71854727	rs10867196	C	G	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=443;SC=AAGAATCTATCCCAAATAAGT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=71854748;WS=71854725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	71854737	rs72187140	TAAAC	T	1015.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=834;SC=CCCAAATAAGTAAACAAACAA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=17;WE=71854748;WS=71854725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	71854769	rs2993823	C	G	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=1;PP=1261;SC=ATATCTCATACAGCCTTTACT;SOR=6.229;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=42;WE=71854777;WS=71854759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr9	71862975	rs2282336	C	T	1193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=16;PP=921;SC=CCTACTTAACCGCCATGGGCG;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=40;TCF=23;TCR=17;TR=39;WE=71862995;WS=71862965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr9	71862987	rs2095876	G	A	1356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=19;PP=1055;SC=CCATGGGCGCGGACTATCTGA;SOR=0.836;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=23;TCR=20;TR=42;WE=71862995;WS=71862965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	71986315	rs1034239	TG	CA	1941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=0;PP=2059;SC=TTTAAAAAAATGTTCTCTTGG;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=36;WE=71986324;WS=71986305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	71990645	rs4351475	C	T	2159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=13;PP=1849;SC=ACCTTTCCTCCGTTAAGGTGG;SOR=2.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=53;TCR=13;TR=66;WE=71990653;WS=71990635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	72003036	rs867366	T	C	2104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=39;PP=1787;SC=TCAAAAGGGGTTGGCCAATGG;SOR=1.498;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=61;WE=72003044;WS=72003026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr9	72064749	rs2781532	T	C	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=327;SC=CCTCCATCAGTGACCATCTGG;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=72064757;WS=72064739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	72132199	rs11139063	G	A	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=254;SC=CACTGGGCTGGAAAAACAAGA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=72132207;WS=72132189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	72338180	rs11139996	T	C	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=0;PP=1119;SC=TAACTAACACTTTCTGCAGCT;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=72338188;WS=72338170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	72338610	rs11139997	T	C	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=25;PP=568;SC=TCTCCATTATTGCCTCTGATT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=72338618;WS=72338600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	72373624	rs10735564	A	G	3065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=55;PP=2342;SC=TCATCACCTTAGAGGAAAAGA;SOR=0.930;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=44;TCR=55;TR=99;WE=72373632;WS=72373614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr9	72373775	rs34814489	TA	T	182.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.98;QD=20.30;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	72374677	rs2274745	T	G	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=137;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=0;PP=321;SC=CAGGACCCGCTGTCCGCCCGC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=72374685;WS=72374667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	72374702	rs3831183	T	TGGACGCTTG	1748.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=2;PP=2900;SC=CGAGGTCGGGTGGACGCTTGG;SOR=3.737;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=22;WE=72374710;WS=72374692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	72374969	rs2252130	T	C	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=12;PP=321;SC=CTAGGCCGCGTCCCCGCCGCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=72374977;WS=72374959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	72501698	rs4407955	G	T	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=4;PP=660;SC=CAATAAAAATGTAAAATATTT;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=72501706;WS=72501688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	72501775	rs138837310	A	C	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=21;PP=1233;SC=CAACGTACTCAGAAGATTATG;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=32;TCR=21;TR=53;WE=72501783;WS=72501765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	72740974	rs1927112	A	G	1607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=11;PP=1100;SC=CACCATTCCCACTGGATTATT;SOR=2.604;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=52;WE=72740982;WS=72740964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	72741312	rs1998972	G	A	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=13;PP=486;SC=GTCGAGTTCAGTGCTCCTTAC;SOR=1.493;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=19;WE=72741320;WS=72741302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	72783608	rs10780871	T	C	2100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=12;PP=1644;SC=TTTATTTTTATGAATTTCAGG;SOR=2.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=52;TCR=12;TR=64;WE=72783616;WS=72783598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr9	72785653	rs4744587	T	G	79.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=3;PP=58;SC=CTTGTGTCTATAATGAAATGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=72785661;WS=72785643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	72882642	rs7027209	A	G	257.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=213;SC=ACCTAATATTATTATTGTTGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=72882650;WS=72882632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	72893298	rs10714271	GT	G	544.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=0;PP=466;SC=TATCTCAAATGTTTTTTTTAA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=21;WE=72893306;WS=72893288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	72897434	rs1180116	G	A	2722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=37;PP=2067;SC=GCAGATTCCTGTAACATGTCG;SOR=1.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=49;TCR=37;TR=86;WE=72897442;WS=72897424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr9	72901096	rs1180123	T	C	2557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=37;PP=2020;SC=TCCCCCCCTCTCCCCGGTTTA;SOR=0.718;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=40;TCR=38;TR=77;WE=72901104;WS=72901086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr9	72929503	rs10868801	T	C	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=187;SC=TACAGTATTATCACAGTAAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=72929511;WS=72929493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	72933958	rs7025228	G	C	1749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=46;PP=1448;SC=AATAACAACAGCATTTCCACA;SOR=4.575;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=4;TCR=46;TR=50;WE=72933966;WS=72933948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr9	72965438	rs1536957	A	G	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=21;PP=581;SC=ATCTCCTGTGACATAATCATA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=21;WE=72965446;WS=72965428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	73002648	rs7020167	C	G	1488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=18;PP=1188;SC=GAGTACTTTTCTCCTTTCGGG;SOR=1.085;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=26;TCR=18;TR=44;WE=73002656;WS=73002638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	73150984	rs6560142	C	T	4061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=51;PP=2965;SC=GAAGGGATTTCGCAGGCTTGC;SOR=1.125;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=74;TCR=51;TR=125;WE=73150992;WS=73150974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr9	73151715	rs7033976	C	T	2477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.340;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=41;PP=1959;ReadPosRankSum=-0.762;SC=TTGGCTCGCCCAGCCCAAGGA;SOR=0.502;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=80;TCF=39;TCR=41;TR=78;WE=73151723;WS=73151705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,81:0.99:82
chr9	73151970	rs3739776	C	T	3081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=49;PP=2312;SC=TCATATTGACCGAATAGAAAG;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=42;TCR=49;TR=91;WE=73151978;WS=73151960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr9	73164611	rs1889914	G	A	3070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.095;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.206;NF=34;NR=55;PP=2416;ReadPosRankSum=1.259;SC=AAAAAAAAAGGAAGTCTTGAG;SOR=1.027;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=34;TCR=55;TR=89;WE=73164619;WS=73164586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,94:0.99:95
chr9	73164712	rs1889915	T	C	1522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=38;PP=1226;SC=AGATTCCTTGTTAAGTCTCAA;SOR=4.223;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=42;WE=73164720;WS=73164702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	73213610	rs4744605	A	G	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=17;PP=469;SC=AGGAGAGCAGAGTTAGGTCTG;SOR=4.294;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=73213618;WS=73213600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	73213644	rs4744606	A	C	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=297;SC=TTTTCAGCCCAGTTGGGAAGT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=73213652;WS=73213634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	73234066	rs7849400	G	A	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=20;PP=585;SC=GACTTATAAGGTAAAAGTGGA;SOR=2.226;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=73234074;WS=73234056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	73240312	rs7035025	C	G	1723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=34;PP=1414;SC=AGGGATTCTACTTCACGTATT;SOR=1.179;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=54;WE=73240320;WS=73240302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	73296400	rs10123161	C	T	1764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=4;PP=1459;SC=TTTTCACACTCTCTGGACACA;SOR=4.615;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=48;TCR=4;TR=52;WE=73296408;WS=73296390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	73391409	rs34030044	C	CA	872.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=17;PP=651;SC=TTGAGCTAGTCAAAAAATGAT;SOR=2.621;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=20;WE=73391417;WS=73391399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	73408518	rs10868890	T	G	2294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=17;PP=1691;SC=TGATCAAACATTCCTCTTCCC;SOR=2.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=54;TCR=17;TR=71;WE=73408526;WS=73408508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr9	73424784	rs7861254	C	T	510.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=428;ReadPosRankSum=1.207;SC=CTTTAACATACAGTGTTTTTC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=17;WE=73424792;WS=73424776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr9	73442724	rs1034538	C	T	2006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=13;PP=1514;SC=TTCAGCATACCTCCTACGAGC;SOR=2.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=57;WE=73442732;WS=73442714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr9	73457832	rs1337031	G	A	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=2;PP=538;SC=ATACTATAATGTGCACATTTT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=73457840;WS=73457822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	73457861	rs1337030	A	G	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=10;PP=970;SC=ATTTTATTATACTTTTCTGAT;SOR=1.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=73457869;WS=73457851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr9	73458045	rs3833697	T	TA	1232.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=29;PP=828;SC=GAATAACACCTAAAAAAAAAA;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=38;WE=73458053;WS=73458035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	73461337	rs7862440	T	A	2939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=50;PP=2348;SC=CAGTTGTCATTGCTGCTTTGA;SOR=1.154;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=37;TCR=50;TR=87;WE=73461345;WS=73461327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
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chr9	74314210	rs4263836	A	T	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=110;SC=TTAAGTCTAAACAAAAATTGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=74314218;WS=74314200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr9	74349917	.	CA	C	180.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=3.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQRankSum=2.416;QD=2.82;ReadPosRankSum=0.704;SOR=0.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,22:0.34:64
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chr9	74355185	rs3753006	T	G	4152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.365;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=94;PP=2965;ReadPosRankSum=0.590;SC=TGATTACTTGTCATGGTATTC;SOR=2.165;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=34;TCR=95;TR=127;WE=74355193;WS=74355175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,134:0.99:136
chr9	74360096	rs25689	C	T	3441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=63;PP=2825;ReadPosRankSum=-1.121;SC=GCTCTCATTGCGGTATTCATG;SOR=1.118;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=47;TCR=64;TR=109;WE=74360104;WS=74360086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,110:0.98:112
chr9	74360209	rs3739783	G	C	2478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=35;PP=1910;ReadPosRankSum=-0.783;SC=AGGACCCAAAGGGCAAGCCTG;SOR=0.298;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=43;TCR=35;TR=77;WE=74360217;WS=74360199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr9	74477617	rs10573097	TAAGA	T	892.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=693;SC=AAATCACTCTTAAGATTTTGT;SOR=4.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=15;WE=74477628;WS=74477607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	74490045	rs1404191	G	A	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=30;PP=875;SC=ACTGAATGTAGACTCATACAA;SOR=5.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=74490053;WS=74490035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	74526540	rs4744647	T	A	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=1;PP=764;SC=AGGCTGCGTTTGTTTCTTCCG;SOR=5.421;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=30;WE=74526548;WS=74526530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	74526978	rs10580392	GCA	G	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=61;SC=TTAACTAATTGCACAGAGTGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=74526987;WS=74526968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr9	74561883	rs10120169	G	A	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=3;PP=341;SC=GCTGGCTCACGCGTGAAATTC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=74561891;WS=74561873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	74674427	rs7047632	A	C	1312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=35;PP=1035;SC=AAAATAAGGTACCTGTCTTTA;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=74674435;WS=74674417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	74675604	rs12345527	T	C	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=611;SC=ACTTGAACACTCTGATCTGTT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=74675612;WS=74675594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	74974534	rs3012505	C	T	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=542;ReadPosRankSum=-1.040;SC=TAGAATATTTCCAAAATGAGC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=21;WE=74974542;WS=74974524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr9	74975136	rs2809270	T	C	1128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=15;PP=824;SC=CACTAGCTGTTCCTATTTAAA;SOR=1.121;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=35;WE=74975144;WS=74975126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	74975711	rs1853276	T	C	2412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=46;PP=1722;SC=CTGCTATAGATGAAACGAAAT;SOR=0.954;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=34;TCR=46;TR=80;WE=74975719;WS=74975701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr9	74979593	rs2224603	G	C	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=273;SC=GCTCCCACCCGCAGCCCCGTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=74979601;WS=74979583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	75242814	rs36038786	AT	A	294.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=203;SC=TCTGTATTGGATTTTTTTTTT;SOR=5.283;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=75242822;WS=75242804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	75303653	rs2589615	C	T	3344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=47;PP=2668;SC=AAAAAGAAGACGAGACTGAGG;SOR=0.888;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=61;TCR=47;TR=108;WE=75303661;WS=75303643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr9	75315438	rs1796993	G	A	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=27;NR=10;PP=1034;SC=TTAAAGAGAAGAAGAAGAAAT;SOR=2.133;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=37;WE=75315446;WS=75315428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	75315641	rs66939074	TATATATATATATATATATACACACACACACACACATACAC	T	209.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.51;QD=34.97;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	75357542	rs7848136	A	G	755.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=18;PP=533;SC=TGGGAAGACTAGAAACAAACA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=75357558;WS=75357532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	75357543	rs146170244	GAAACAAAC	G	746.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=2868;SC=GGGAAGACTAGAAACAAACAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=13;WE=75357558;WS=75357532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	75366709	.	T	TTTTG	1441.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=11;PP=1135;SC=ACAAAGCTCTTTTTGTTTGTT;SOR=1.751;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=26;TCF=15;TCR=11;TR=23;WE=75366717;WS=75366699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	75541962	rs8187925	A	C	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=3;PP=463;SC=GTTTTAGAGAAAGCTTCATCA;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=75541970;WS=75541952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	75543974	rs8187922	T	TAA	1449.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=30;PP=1480;SC=TAAAATTCCATAAGTTTTAGA;SOR=4.804;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=32;WE=75543982;WS=75543964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
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chr9	77245162	rs2146777	A	T	2888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=10;PP=2393;SC=GAAAGAAAACATCTGTATGCT;SOR=3.886;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=72;TCR=10;TR=82;WE=77245170;WS=77245152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr9	77257261	rs41287415	G	A	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=313;SC=CCCATGACCCGTTGTACCTGA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=77257269;WS=77257251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	77354308	.	G	T	1678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.000;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.780;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=36;PP=1253;ReadPosRankSum=-0.871;SC=ATGGTTTGTGGTTTCACTTGG;SOR=0.499;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=149;TCF=65;TCR=84;TR=67;WE=77354316;WS=77354298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,72:0.44:163
chr9	77397519	rs12339024	T	C	2052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=13;PP=1720;ReadPosRankSum=-0.886;SC=ATTTAGATGATTGTTTTTCAG;SOR=1.493;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=52;TCR=13;TR=64;WE=77397527;WS=77397509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr9	77407736	rs7858755	A	G	1361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=41;PP=1192;ReadPosRankSum=1.259;SC=TAACTAAAATAGTGACAAGCA;SOR=4.712;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=42;WE=77407744;WS=77407726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr9	77563087	rs2769058	C	T	1688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.532;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=40;PP=1373;ReadPosRankSum=-0.417;SC=TCCTCCAGTACTGGAAGGTAT;SOR=2.572;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=51;WE=77563095;WS=77563077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,53:0.98:54
chr9	77563175	rs67215531	GTTT	G	670.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=435;ReadPosRankSum=-0.599;SC=AAAAAATTAAGTTTTTTTCAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=15;WE=77563185;WS=77563165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,17:0.89:19
chr9	77668969	rs773145	G	C	1080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=12;PP=880;SC=GGAACTGAAAGCTGGGGAAGT;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=37;WE=77668977;WS=77668959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	77669152	rs13294415	G	C	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=309;SC=GAGGCAAAAAGGGAGAATTTG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=77669160;WS=77669142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	77681179	rs7852863	C	T	6390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=110;PP=2965;SC=TAGGCAGATCCCTGTCACTTG;SOR=1.044;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=84;TCR=110;TR=194;WE=77681187;WS=77681169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr9	77684690	rs3752955	A	C	1284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.441;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=11;PP=1086;ReadPosRankSum=1.249;SC=CATATGGAATAGTCAGGAAAT;SOR=1.935;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=41;WE=77684698;WS=77684680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr9	77692555	rs60305501	CT	C	359.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=12;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=1;NR=18;PP=280;SC=TCATTAAACACTTTTTTTTTT;SOR=4.407;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=19;WE=77692564;WS=77692545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	77697929	rs2273767	C	G	1659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=23;PP=1302;SC=CTCCGTCCCCCACTCCATCCA;SOR=1.009;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=30;TCR=23;TR=53;WE=77697937;WS=77697919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	77703431	rs73544571	C	T	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=0;PP=657;SC=GGGCGGAGCACTCGGCGGAGC;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=77703439;WS=77703421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	77742627	rs117710534	A	G	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=454;SC=ATGTACATAGAAATACATATG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=77742635;WS=77742617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	77745424	rs2295861	T	C	1514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=15;PP=1251;SC=CCCTAGGAGCTAGATAATTTG;SOR=1.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=48;WE=77745432;WS=77745414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr9	77752675	rs2025159	A	G	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=38;PP=1058;SC=GTATCATGGAATAGTTATGAT;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=38;WE=77752683;WS=77752665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	78601268	rs1538843	G	A	336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=307;SC=ACCAGGGATTGTTTCCTATTT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=78601276;WS=78601258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	78748962	rs141353765	ACT	A	1461.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.6027;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=2;PP=1355;SC=TTTGCTTGTGACTCTCTGCTT;SOR=4.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=31;WE=78748971;WS=78748952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	78790138	.	A	AAATGGAATGG	1396	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MMLQ=28;MQ=47.25;NF=0;NR=30;PP=1396;QD=47.2333333333;SC=GAATGGAATGAAATGGAATGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=30;WE=78790146;WS=78790128;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:19,30:0.61:49
chr9	78790151	.	T	TG	668.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.86;QD=33.44;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	78790153	.	A	G	953	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=43;MMLQ=29;MQ=43.14;NF=1;NR=34;PP=953;QD=28.2220346442;SC=GAATGGAATGAAATGGAATGG;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=35;WE=78790161;WS=78790143;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr9	78790153	.	A	AATGGAATGG	1093.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.50;QD=39.06;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	78790187	.	G	C	130	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.54;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=79;MMLQ=25;MQ=42.28;NF=0;NR=10;PP=130;QD=16.4771212547;SC=GGAATGGAATGGAATCGAATC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=10;WE=78790195;WS=78790177;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:19,10:0.34:29
chr9	78799566	rs1537183	C	T	1214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=7;PP=957;SC=AACTGATTTACAACTTTCTCT;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=78799574;WS=78799556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	78803466	rs7046850	T	C	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=7;PP=697;SC=CAACAGTCTGTTTGAAGCTCC;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=26;WE=78803474;WS=78803456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	78804206	rs150226536	G	GAAAAT	97.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.78;NF=0;NR=2;PP=100;SC=ATCTTCATAAGAAAATAAGAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=2;WE=78804214;WS=78804196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	78808329	rs3077117	G	GAAAA	1169.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.42;QD=41.78;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	78809822	rs7019429	A	G	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=196;SC=GAGGAATACTATCAACATGGA;SOR=3.442;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=78809830;WS=78809812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr9	78910139	rs9411164	A	G	1162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=1;PP=890;SC=ATTATGGTGAAGAGAAATACA;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=78910147;WS=78910129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	78910241	rs2842480	A	C	2541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=36;PP=2015;SC=TACAGTGAGGAAGTGGAATGC;SOR=0.824;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=40;TCR=36;TR=76;WE=78910249;WS=78910231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr9	78910273	rs2643325	G	A	2180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=35;PP=1786;SC=TAGTAACTGTGGCAGCTGTGA;SOR=0.849;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=31;TCR=35;TR=66;WE=78910281;WS=78910263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr9	78910387	rs2842479	G	A	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.36;SOR=6.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	78910392	rs2643324	C	A	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.82;SOR=6.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	78925814	rs2257775	C	A	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=341;SC=TCACTCTCCTCTGGTACTTTG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=78925822;WS=78925804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	78936358	rs1110222	G	A	1195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=11;PP=896;SC=GCAGAAGACGGCATATGTGAA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=35;WE=78936366;WS=78936348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr9	78936492	rs1110223	A	G	2605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=36;PP=2110;SC=CGTGGCTGTGAAGGGGGTATG;SOR=0.821;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=40;TCR=36;TR=76;WE=78936500;WS=78936482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr9	78937877	rs34797584	A	G	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=72;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=1;PP=665;SC=CAAATCAACCAAAGTGCTGAG;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=78937885;WS=78937867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	78937901	rs55903217	T	C	1904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.35;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	78937901	.	TAC	CAT	1045	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=42;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=35;NR=1;PP=1045;QD=30.512996524;SC=GGAGCTAGCCTACTGCAGACA;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=36;WE=78937911;WS=78937891;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,36:0.90:40
chr9	78937903	rs55805812	C	T	1904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.30;SOR=6.138;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	78937929	rs56332566	AC	A	1388.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=8;PP=1215;SC=CCTTTCTCCTACCCCCCGGGG;SOR=2.935;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=39;WE=78937937;WS=78937919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr9	78937974	rs3001772	C	T	1942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=26;PP=1462;SC=CCAGAGTGCACGCCTGAGTTC;SOR=1.033;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=39;TCR=26;TR=65;WE=78937982;WS=78937964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr9	78938043	rs2495207	G	A	1833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=35;PP=1360;SC=GCAGACTCGCGCCACTGTGTC;SOR=0.976;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=26;TCR=36;TR=61;WE=78938051;WS=78938033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr9	78938186	rs2803429	G	C	1150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=23;PP=855;SC=TTATGAAAAGGAGACTAAGGA;SOR=1.432;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=35;WE=78938194;WS=78938176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	78938236	rs55762660	G	A	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.12;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	78938246	rs2803430	T	C	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.83;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	78938256	rs2259775	C	G	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.86;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	78942956	rs2259969	A	G	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=1;PP=410;SC=CCTGCTCATCATCTGGGACCT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=78942964;WS=78942946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	78965993	rs2257220	G	A	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=363;SC=ACCTTCTACCGTTGCATCATG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=78966001;WS=78965983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	78969059	rs7036921	C	A	1283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=33;PP=1092;SC=ACATGGACGACAGCCACTGCC;SOR=2.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=41;WE=78969067;WS=78969049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	79003324	rs2501926	G	A	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=111;SC=AAAGAAGATAGATTCACGTAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=79003332;WS=79003314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	79003440	rs2501924	G	A	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=343;SC=AGCAGTAGTAGTATTTAAGAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=79003448;WS=79003434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	79008947	rs41288757	C	T	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=367;SC=CCCCGGCTGCCGTCTCTCCCC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=79008955;WS=79008937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	79009106	rs2490582	A	C	1369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=24;PP=1057;SC=CCGCTCGGGGAATGGGCTGCG;SOR=0.990;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=18;TCR=24;TR=42;WE=79009114;WS=79009096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	79009139	rs3739729	A	G	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=15;PP=558;SC=CGTCCTGCGGAGCCGCCGTCG;SOR=1.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=22;WE=79009147;WS=79009129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	79118661	rs1057419	A	G	369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=278;SC=CCTTGTCAGCATCGGGAAGAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=79118669;WS=79118651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	79239877	.	C	T	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=12;PP=921;SC=AGGTCACCCACAAGTAAAACA;SOR=2.038;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=42;WE=79239885;WS=79239867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	79240050	rs700809	T	C	621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=22;PP=520;SC=ATGATTTAAATGACAGTCAAA;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=79240058;WS=79240040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	79251600	rs582011	T	A	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=4;PP=137;SC=ATGCCTATAATCCCAGCACTT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=79251608;WS=79251590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	79259592	rs511040	C	T	2902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=37;PP=2212;SC=AGACTCACTTCATGATTTTAA;SOR=1.038;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=50;TCR=37;TR=87;WE=79259600;WS=79259582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr9	79259850	rs512951	A	G	1744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=36;PP=1361;SC=GCACAGAGCAAGGCTGAAGGA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=53;WE=79259858;WS=79259840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	79306919	rs498266	G	A	1170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=7;PP=890;SC=TAGTCTTTGAGAACAACACTC;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=79306927;WS=79306909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	79307176	rs500952	G	C	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=15;PP=483;SC=TGCAGCCGCTGTGGCTAGGGG;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=79307184;WS=79307166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	79318375	rs11267615	GGTGACAGCCTGCAAC	G	4096.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=48;PP=2933;SC=CATTGTCATGGGTGACAGCCT;SOR=1.994;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=11;TCR=54;TR=58;WE=79318397;WS=79318365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr9	79318471	rs560094	C	T	3102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=40;PP=2384;SC=CCTCTAGTGCCAAAGATTCTA;SOR=0.969;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=51;TCR=40;TR=90;WE=79318479;WS=79318461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr9	79318677	rs561970	T	C	3512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=48;PP=2799;SC=CTCGTATCGCTTTTAGAAGAC;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=57;TCR=48;TR=105;WE=79318685;WS=79318667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr9	79318921	rs620985	A	G	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=24;PP=895;SC=TCTTCTCTGTACATCTTTCTT;SOR=1.547;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=36;WE=79318929;WS=79318911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	79318998	rs620552	A	G	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=10;PP=343;SC=TCCAATTCTGATATTTCCTTG;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=79319006;WS=79318988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	79319050	rs620476	A	C	185.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=150;SC=AAGAGGAGAAAAAGGTTTAAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=79319058;WS=79319040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	79319130	rs59728338	AT	A	86.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.51;QD=28.75;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	79320640	rs512110	C	T	2918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=71;PP=2433;SC=TTATGAGAGGCGGGCTGAGAG;SOR=2.662;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=19;TCR=71;TR=90;WE=79320648;WS=79320630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr9	79321276	rs517634	T	C	3271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=53;PP=2652;SC=GTAAAGGCTGTGTCCGGATGA;SOR=0.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=51;TCR=53;TR=104;WE=79321284;WS=79321266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr9	79321871	rs577993	C	T	2463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=27;PP=1887;SC=TTTCAGTCTCCGTTAATGGTG;SOR=1.402;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=46;TCR=27;TR=73;WE=79321879;WS=79321861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr9	79322068	rs683866	G	T	4573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=57;PP=2965;SC=TCAGCAACGTGGCAGTTGGCC;SOR=1.032;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=79;TCR=58;TR=136;WE=79322076;WS=79322058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr9	79322674	rs680775	A	G	3185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=56;PP=2472;SC=ATCTCAGAACATGTGCTGCTG;SOR=1.064;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=44;TCR=56;TR=100;WE=79322682;WS=79322664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr9	79322720	rs680729	A	G	2348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=40;PP=1911;SC=CGTCCCCAAAATCAAGACTTC;SOR=0.864;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=34;TCR=40;TR=74;WE=79322728;WS=79322710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr9	79324135	rs11267622	A	ATGACTGTTGCAG	4020.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=15;PP=2957;SC=CGATTTCGAGATGACTGTTGC;SOR=0.804;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=36;WE=79324143;WS=79324125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr9	79324179	rs530978	G	A	3973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=61;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=76;NR=47;PP=2965;SC=CTCCTCTGCCGTGGAGTTACC;SOR=1.252;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=76;TCR=47;TR=123;WE=79324187;WS=79324169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr9	79324741	rs557352	T	C	3643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.643;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=63;PP=2822;ReadPosRankSum=0.833;SC=GGGTGCAAATTCCAGGTATTT;SOR=0.707;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=50;TCR=63;TR=112;WE=79324749;WS=79324731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,117:0.99:118
chr9	79325558	rs600859	G	C	2546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=55;PP=1934;SC=TAGACATGTTGGTTCCCATGC;SOR=1.637;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=27;TCR=55;TR=82;WE=79325566;WS=79325548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr9	79325615	rs611461	A	G	1634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=29;PP=1388;SC=CTGACAGGTCACTGTTGGGGA;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=25;TCR=29;TR=54;WE=79325623;WS=79325605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	79471995	rs12238848	T	C	4074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=48;PP=2965;SC=TCATGGTCTCTCATTTCTCTC;SOR=1.224;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=79;TCR=48;TR=126;WE=79472003;WS=79471985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr9	79814799	rs12552898	A	G	115.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=85;SC=TGAAGCATACATATTAACTTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=79814807;WS=79814789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr9	79888396	rs2050831	A	G	174.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=110;SC=TCCTTTTAAAATCTAGGTTCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=79888404;WS=79888386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr9	79922839	rs2275549	A	G	935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=0;PP=750;SC=GCTAAAAAGAACAAATCTTTT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=79922847;WS=79922829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	79935953	rs1890899	A	G	262.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=217;SC=AGTAATTTCAATAAGGCAATA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=79935961;WS=79935943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr9	79938069	rs41289969	G	A	2903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=52;PP=2180;SC=AGAGTCTGGCGTTGAAAGATC;SOR=0.969;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=92;TCF=39;TCR=53;TR=91;WE=79938077;WS=79938059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr9	79954545	rs7025532	T	C	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.680;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=1139;ReadPosRankSum=1.410;SC=TCAATCACGATTGGAAAAGTG;SOR=0.769;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=44;TCF=25;TCR=19;TR=43;WE=79954553;WS=79954535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
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chr9	79959015	rs72746022	A	G	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=422;SC=GATGATTTATATATTTATGGT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=79959023;WS=79959005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr9	79984232	rs17340192	T	C	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=15;PP=1158;SC=AGCAGATGTATGTACTCATTC;SOR=1.791;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=52;WE=79984240;WS=79984222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	79986057	rs3737289	A	G	1421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=1071;ReadPosRankSum=1.168;SC=CATTTCAGGGAATAAAAAGGT;SOR=0.375;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=43;WE=79986067;WS=79986047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
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chr9	80430802	rs2289121	C	A	389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=298;SC=CTGGTCTTTACACTGGTTTAC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=80430810;WS=80430792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	80868354	rs3824547	G	T	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=436;SC=CACAGTATAGGCGTGTGGATA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=80868362;WS=80868344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	80912115	rs2277148	G	C	1050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=27;PP=803;SC=TCACCGCCCTGGCCGCCGCAC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=37;WE=80912123;WS=80912105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	80915403	rs10121107	A	T	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=5;PP=250;SC=TGGGGATGGAAGCCTGGGGAC;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=12;WE=80915411;WS=80915393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	80917096	rs3739473	C	T	99.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=101;SC=TAGTACCTAACGCTTTTTATT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=80917104;WS=80917086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	80921446	rs944513	G	T	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=15;PP=502;SC=CTGACTCGGTGTCTGCAGGGA;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=80921454;WS=80921436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	80923609	rs2039323	CA	TG	481.81	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.8399;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=484;ReadPosRankSum=-0.726;SC=CGGTGGCTCACACCTGTAATC;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=9;WE=80923618;WS=80923599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr9	82187750	rs1934610	A	G	5329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=121;PP=2965;SC=CCAGACACCCAGTGAGTGCGG;SOR=1.805;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=56;TCR=121;TR=177;WE=82187758;WS=82187740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr9	82189914	rs2791566	T	C	2196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=43;PP=1541;SC=AACAAGAATATGTTTAAATTG;SOR=1.300;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=28;TCR=43;TR=71;WE=82189922;WS=82189904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr9	82286286	rs1475674	C	G	2536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=60;PP=2170;SC=CTGACGAGCTCAACGAGTGGC;SOR=2.690;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=18;TCR=60;TR=78;WE=82286294;WS=82286276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr9	82286352	rs2297498	G	A	1153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=34;PP=1109;SC=TTTTATTTTCGTGTCAGATTA;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=36;WE=82286360;WS=82286342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	82308390	rs11138336	G	A	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=5;PP=757;SC=TTGCTTGTACGCATTAGGTTG;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=82308398;WS=82308380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	82308670	rs7025437	A	G	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=0;NR=17;PP=475;SC=TGTCCTTCGAACCATATTTAG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=82308678;WS=82308660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	82320887	rs4877147	A	T	2918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=29;NR=83;PP=2513;SC=AATTTTTTGCACTTGCCCAGC;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=29;TCR=84;TR=112;WE=82320895;WS=82320877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr9	82335294	rs7875032	T	G	189.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=6;PP=142;SC=TAGGTATGGGTGTGTGTGTGT;SOR=2.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=7;WE=82335302;WS=82335284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	84205860	rs8782	G	A	2596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=37;PP=2079;SC=TGATGCGCGGGGTTGGAGCCG;SOR=1.075;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=49;TCR=37;TR=86;WE=84205868;WS=84205850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr9	84207857	rs2796471	A	G	1979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=12;PP=1516;SC=CATAATGGGAATAAAACCCAG;SOR=2.419;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=58;WE=84207865;WS=84207847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr9	84214819	rs9886672	T	A	272.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.31;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	84235255	rs55712377	G	T	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=332;SC=ACAGTATTATGTTTAAGGACA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=84235263;WS=84235246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	84235728	rs59790457	C	T	2355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=32;PP=1860;SC=GTGCTTCTGTCCTATTTACTG;SOR=1.079;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=43;TCR=32;TR=75;WE=84235736;WS=84235718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr9	84248203	.	C	CGT	337	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5010;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=7;NR=1;PP=337;QD=42.5;SC=AGAAGGGGACCGTGTGTGTGT;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=8;WE=84248211;WS=84248193;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr9	84267021	.	TAC	T	60	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=24;MQ=59.4;NF=3;NR=0;PP=60;QD=21.0;SC=AACGTTAAGATACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=3;WE=84267030;WS=84267011;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:17,3:0.15:20
chr9	84267147	rs2228173	T	C	2371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.480;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=32;PP=1768;ReadPosRankSum=0.484;SC=TGGCATTCAATTCTGCCATGG;SOR=0.605;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=74;TCF=40;TCR=34;TR=72;WE=84267155;WS=84267137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,77:0.99:78
chr9	84275014	rs2627002	C	A	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=611;SC=AGCTTTCTACCTAAAAGCCTT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=84275022;WS=84275004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	84275095	rs2796450	C	T	2769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=21;PP=2325;SC=ATTTCTTTGCCGTACCTCCCC;SOR=2.250;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=90;TCF=68;TCR=22;TR=89;WE=84275103;WS=84275085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr9	84303026	rs2279353	G	A	1883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=26;PP=1443;SC=CACCGCTGAGGGCGAGAAGGT;SOR=0.976;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=34;TCR=26;TR=60;WE=84303034;WS=84303016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr9	84528394	rs138629135	C	T	1162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=1;PP=1025;SC=TGGAGAATATCCTCTGTTTTC;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=34;WE=84528402;WS=84528384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	84607758	rs10867826	T	A	4101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.583;NF=44;NR=91;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.489;SC=GTCCGGAGACTTCTTCAGACA;SOR=1.035;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=45;TCR=93;TR=135;WE=84607766;WS=84607748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,140:0.98:143
chr9	85597720	rs66792515	CAGAG	C	1994.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=0;NR=41;PP=2201;SC=TAGAGAGAGACAGAGAGAGAG;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=87;TCF=5;TCR=82;TR=41;WE=85597731;WS=85597710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,50:0.96:52
chr9	85619330	.	T	TTTTATTCTATTA	1305.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=1;PP=2135;SC=TATTCTATTATTTTAATCCAC;SOR=5.136;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=28;WE=85619338;WS=85619319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	85619351	rs141850659	ATTTAC	A	1357.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=80;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=2;PP=944;ReadPosRankSum=1.318;SC=CTCCAAGGAAATTTACTTTCC;SOR=2.712;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=27;WE=85619363;WS=85619341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chr9	85627408	rs4146960	G	A	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=20;PP=989;SC=TGACTTACGCGTTTTGATTGT;SOR=0.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=22;TCR=20;TR=42;WE=85627416;WS=85627398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	85627540	rs10121395	A	C	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=244;SC=CCAATTTTCAACATTATGCAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=85627562;WS=85627530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	85627554	rs4146961	C	T	320.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=198;SC=TATGCAACTTCATAAATCATT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=85627562;WS=85627530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	85630621	rs1976455	C	T	2167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=10;PP=1699;SC=CTGATCTATCCGCCACTTCAA;SOR=2.939;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=52;TCR=10;TR=62;WE=85630629;WS=85630611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
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chr9	85905666	rs942283	A	G	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=22;PP=715;SC=CAAGCCAGACAGAGTTGGTTT;SOR=1.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=34;WE=85905674;WS=85905656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	85905737	rs942282	C	G	555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=15;PP=429;SC=TTTGTGTCTACAGGGAACTAC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=85905745;WS=85905727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	85905786	rs942281	G	A	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=110;SC=TAAAGATGACGTAACATTCAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=85905794;WS=85905776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	85913590	rs11140011	A	G	1330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=12;PP=1086;SC=TCACTACACAAAGGGATGTTA;SOR=1.666;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=41;WE=85913598;WS=85913580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	85914243	rs1359168	A	C	1002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=799;SC=TGTGCACACAAAATATAAGAA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=85914251;WS=85914233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	85924600	rs374884095	GT	G	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=0;NR=6;PP=111;SC=TTTTCCATGGGTTTTTTTTTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=85924619;WS=85924590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	85924611	rs1535749	T	A	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=131;SC=TTTTTTTTTTTCAGGTGTTTA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=85924619;WS=85924590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	85925309	rs11140018	T	C	2492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=9;PP=2004;SC=GTCATGGTCTTTGGCGACTAC;SOR=3.826;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=64;TCR=9;TR=72;WE=85925317;WS=85925299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr9	85926893	rs200178795	GA	G	189.25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=0.134;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.509;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr9	85964450	rs4877253	A	G	1098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=1;PP=896;SC=GTGTAAGAGAAGCATTCCAAG;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=85964458;WS=85964440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	86004993	rs7853850	C	T	1827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=11;PP=1297;SC=ACACATACAACGGCCTAACTG;SOR=2.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=54;WE=86005001;WS=86004983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr9	86153159	rs4529536	T	G	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=19;PP=583;SC=ACCGCGGCCGTGGGGAGCGAG;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=86153167;WS=86153149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	86238086	rs2811903	T	C	1471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=23;PP=1261;SC=GAGCTTGGGTTATGGCGGCGC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=24;TCR=23;TR=47;WE=86238094;WS=86238076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	86241489	rs2780977	A	G	142.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=83;SC=GCACCACCACACCCAGCTAAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=86241497;WS=86241479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	86243933	rs2811905	G	T	2565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=72;PP=2141;SC=GGATGAGCTCGCTACAGCACT;SOR=5.031;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=5;TCR=72;TR=77;WE=86243941;WS=86243923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr9	86278817	rs7866234	C	A	2110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=26;PP=1647;SC=CAAGAGCCTGCAGCATCTGCT;SOR=1.112;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=36;TCR=26;TR=62;WE=86278825;WS=86278807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr9	86279015	rs2781003	C	T	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=22;PP=642;SC=GAAGCCAGTCCGTAAATCAGT;SOR=3.180;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=86279023;WS=86279005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	86279814	rs10868037	G	A	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=0;PP=597;SC=TAGCCTAGGCGAAGGGCGAGA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=86279822;WS=86279804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	86284178	rs1044175	C	A	3294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=54;PP=2719;SC=TGTTTTGCATCAGTTGTGGGT;SOR=0.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=48;TCR=54;TR=102;WE=86284186;WS=86284168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr9	86297739	rs57150962	G	GT	78.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=6;NR=1;PP=97;SC=AGGAATGTATGTTTTTTTTTT;SOR=1.981;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=7;WE=86297747;WS=86297729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	86327898	rs10119344	C	T	3993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=75;PP=2965;SC=GGATTTTATACGACAGCCAGT;SOR=1.342;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=44;TCR=75;TR=119;WE=86327906;WS=86327888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr9	86395380	rs200663185	TA	T	268.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=4.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.33;MQRankSum=0.645;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.251;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,18:0.82:22
chr9	86457387	rs71365387	G	GT	401.76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.19;MQRankSum=-0.264;QD=25.11;ReadPosRankSum=0.000;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr9	86468715	rs295274	A	T	2904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.826;NF=17;NR=79;PP=2470;ReadPosRankSum=0.199;SC=CCAAAGCTTCAATCCCTTCTT;SOR=1.697;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=97;TCF=17;TCR=80;TR=96;WE=86468723;WS=86468705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,92:0.99:93
chr9	86485622	.	C	T	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.658;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=27.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.05;MQRankSum=-3.714;QD=6.37;ReadPosRankSum=-3.302;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr9	86502161	rs185127971	C	T	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=15;PP=506;SC=AAATATTCAACAGAAGTAGAG;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=86502169;WS=86502151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	86559772	.	G	C	3222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.443;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=19;PP=2712;ReadPosRankSum=-0.885;SC=GCAAGAACCTGAGGTAATCTA;SOR=2.500;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=93;TCF=73;TCR=20;TR=92;WE=86559780;WS=86559762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,96:0.99:97
chr9	87285915	rs1187326	C	T	1042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=30;PP=922;SC=CTCCTTGCCCCTAGGGCCCGA;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=87285923;WS=87285905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	87285992	rs1211166	G	A	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=270;SC=CAAAGACAAGGGATGCAGGAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=87286000;WS=87285982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr9	87360106	rs144586764	ACACCT	A	1995.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=37;PP=1994;SC=TAGGGTGTTAACACCTAGGTT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=37;WE=87360118;WS=87360096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	87563252	rs1078947	T	C	745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=570;SC=TTAGCACAAATGTTATTTCCT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=87563260;WS=87563242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	88194066	rs41310057	G	A	1159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.22;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
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chr9	88269902	rs62569179	C	T	91.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=63;ReadPosRankSum=-0.524;SC=CAATTTCTTACATTTAAAGAA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=88269910;WS=88269892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr9	88269947	rs675837	C	T	453.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5447;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=316;ReadPosRankSum=0.335;SC=ATGTTTATCACGTTAAGTAAG;SOR=3.500;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=14;WE=88269955;WS=88269937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,16:0.89:18
chr9	88272309	rs62569183	T	C	98.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=70;ReadPosRankSum=-0.253;SC=CAAATCATATTATTAGTACAT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=88272317;WS=88272299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr9	88272573	rs41282443	G	A	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=34;PP=1092;SC=AACAAAAGAAGATTGAGAAAG;SOR=3.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=41;WE=88272581;WS=88272563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	88275758	rs62569187	T	C	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=206;SC=GCTTTATAACTATAGTCTAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=88275766;WS=88275748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	88276018	rs74431437	A	G	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=343;SC=CTTGTTTAAGATAATTACACA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=88276026;WS=88276008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	88284308	rs117412428	T	C	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=52;SC=CTGGAGACAATTTAATTCAAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=88284316;WS=88284298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	88284326	rs41283645	T	C	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=79;SC=AACCTGCTCATTGTACATATC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=88284334;WS=88284316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	88287602	.	TA	T	2394.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=2;NR=61;PP=1009;SC=TTTATCTGTTTAAAAAAAAAA;SOR=5.892;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=78;TCF=2;TCR=76;TR=63;WE=88287633;WS=88287592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr9	88287625	rs62569207	G	T	2213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=57;PP=1579;SC=GACAATTTATGCACATACAAC;SOR=6.518;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=60;TCF=1;TCR=59;TR=58;WE=88287633;WS=88287592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr9	88292506	.	TA	T	1026.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.753;HP=14;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.814;NF=2;NR=44;PP=552;ReadPosRankSum=-0.689;SC=ACCTAAAAATTAAAAAAAAAA;SOR=2.494;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=63;TCF=5;TCR=58;TR=46;WE=88292515;WS=88292496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,50:0.94:53
chr9	88307771	rs62569243	G	A	1857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=42;PP=1282;SC=TAAATCAATGGTGTAAATTCA;SOR=4.317;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=46;WE=88307779;WS=88307761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	88307792	rs62569244	G	A	1490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=31;PP=978;SC=ATACTATAACGATCACTGTTT;SOR=4.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=88307800;WS=88307782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	88356668	rs10114338	A	C	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.86;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	88356674	rs62570635	G	A	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.78;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	88356677	rs62570655	G	A	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.62;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	88356743	rs10114347	A	G	189.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=3;PP=150;SC=CACCCGGCTCAGCACCTGGAT;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=88356751;WS=88356733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	88356820	rs199589522	AGGC	A	311.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=1;NR=6;PP=300;SC=GGCGAGGCGGAGGCGGCGGCG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=88356830;WS=88356810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	88581620	.	A	G	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=22;PP=659;SC=TTACTAGTATACATTAGCACA;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=88581628;WS=88581610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	88618462	rs1328923	C	G	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=1;PP=210;SC=TTTATTTAATCTATTAATGAC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=88618470;WS=88618452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	88667582	rs10780743	T	G	3063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=71;PP=2510;SC=TACAAACCAATGATGGGGCCT;SOR=2.380;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=19;TCR=71;TR=90;WE=88667590;WS=88667572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr9	88924057	rs4520250	A	C	888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=7;PP=733;SC=TAGTTGTTGAACATCTACACT;SOR=2.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=28;WE=88924065;WS=88924047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	88925534	rs5898926	ATG	A	850.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=1;PP=672;SC=GATGAAATGAATGTGACTTCT;SOR=4.615;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=88925543;WS=88925524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	88938668	rs61730257	G	A	3846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=72;PP=2965;SC=ATCATCTTTTGTTTGTACATC;SOR=1.170;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=49;TCR=72;TR=121;WE=88938676;WS=88938658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr9	89763851	rs458983	C	G	2152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=53;PP=1836;SC=TCATGGGCCCCGGCTTTACAA;SOR=1.745;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=21;TCR=54;TR=73;WE=89763859;WS=89763841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
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chr9	90296193	rs72033969	C	CAAAAAAAA	1072.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=0;PP=610;SC=AACTCCGTCTCAAAAAAGAAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=14;WE=90296201;WS=90296183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr9	90388370	rs7853691	G	A	2061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=7;PP=1677;SC=TTTTAGTGCAGCTGGGGCTCT;SOR=3.575;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=52;TCR=7;TR=57;WE=90388378;WS=90388360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr9	90388539	rs10735592	T	A	3036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=66;PP=2406;SC=CTCTGAGGAATCCTTTTCATA;SOR=1.516;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=32;TCR=66;TR=98;WE=90388547;WS=90388529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
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chr9	90501514	rs4076794	C	G	2541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.369;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=26;PP=1720;ReadPosRankSum=1.669;SC=GGTTCTCTGACAAGGGGTGCT;SOR=0.535;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=34;TCR=27;TR=60;WE=90501522;WS=90501490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
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chr9	90559129	rs7027067	G	A	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=1;PP=54;SC=CTGGCAGCCCGGAGAGGAAGG;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=90559137;WS=90559119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	90588814	rs570184	C	G	3345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.421;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=41;PP=2685;ReadPosRankSum=-0.832;SC=GTGAGAATACCATGCCCCCCC;SOR=1.240;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=74;TCR=42;TR=115;WE=90588822;WS=90588804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,118:0.99:119
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chr9	90588970	rs28364935	C	A	1759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=40;PP=1474;SC=AGAAGGCAGACACTGCCAGCC;SOR=2.259;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=52;WE=90588978;WS=90588960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
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chr9	91653287	rs944481	G	C	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=274;SC=TACAGTGAGAGAGATGGAAAT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=91653295;WS=91653277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr9	91666812	rs7021743	C	A	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=406;SC=CATATCCCAGCACCGACCAGG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=91666820;WS=91666802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	91667136	rs7025214	C	T	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=271;SC=ACCTGGGCTCCTCTACAAAGA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=91667144;WS=91667126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	91680531	rs3818668	C	G	1627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=42;PP=1357;SC=TGTCACTAATCACAAGTGAGA;SOR=4.362;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=46;WE=91680539;WS=91680521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	91680600	rs9410455	A	G	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=20;PP=579;SC=CTCAACCACCAAACAGCTAAA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=91680608;WS=91680590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	92003679	rs11526468	C	T	2635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=44;PP=2156;SC=AGGTTGTAGGCGCACACTGCC;SOR=0.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=38;TCR=44;TR=82;WE=92003687;WS=92003669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr9	92017733	rs41287361	G	A	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=1;PP=375;SC=GGCCAGGAGAGGCTGCCCACT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=92017741;WS=92017723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	92020433	rs7856677	G	A	1418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=35;PP=1148;SC=TGGCCGGGCAGGTGTGCTATT;SOR=3.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=40;WE=92020441;WS=92020423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	92785610	rs586750	G	C	152.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=0;PP=91;SC=AGTGATACCTGGACTCACTCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=92785618;WS=92785600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	93624755	rs914928	T	C	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=2;NR=15;PP=451;SC=AGGCCAGCAGTAGCTCTGGAG;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=93624763;WS=93624745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	93629347	rs1760124	G	A	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=486;SC=GTAGCATGTCGTGGAAGGGAT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=93629355;WS=93629337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	93629789	rs965892	C	G	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=37;PP=1135;SC=TTATCATGTCCGAAAATCTTT;SOR=3.365;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=43;WE=93629797;WS=93629779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	93636431	rs290228	A	G	1754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=11;PP=1273;SC=ATGCAGATCAACTTAACAGTT;SOR=2.480;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=50;WE=93636439;WS=93636421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr9	93636664	rs290227	G	A	1153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=31;PP=855;SC=TCCACACCACGTCCGTGATTG;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=93636672;WS=93636654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	93637282	rs290226	G	T	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=407;SC=TAATGAAAGCGTCCATTACCT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=93637290;WS=93637272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	93639803	rs1760132	A	G	1909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=6;PP=1459;SC=AGATTATCTAAAAGTGAGGCA;SOR=3.422;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=46;TCR=6;TR=52;WE=93639811;WS=93639793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	93639846	rs290223	C	G	3100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=26;PP=2382;SC=TATGATTTCTCTTGCAGAGTT;SOR=1.847;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=62;TCR=26;TR=88;WE=93639854;WS=93639836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr9	94118258	rs10991898	C	T	2329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=47;PP=1870;SC=GATAGCTAAACAGAAATAGGA;SOR=0.995;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=82;TCF=35;TCR=47;TR=82;WE=94118266;WS=94118248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr9	94456490	rs923772	A	G	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=1;PP=413;SC=CCCTATCTCCATCAACAGGAA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=94456498;WS=94456480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	94456643	rs923771	G	C	932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=18;PP=737;SC=CCCAGGGTCTGTCATGCGGTT;SOR=1.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=26;WE=94456651;WS=94456633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
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chr9	94456714	rs923769	C	T	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.99;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
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chr9	94841937	rs41279063	G	A	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=33;PP=1218;ReadPosRankSum=0.794;SC=CTGTTTCTCAGCCCCCTGCGT;SOR=0.618;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=52;WE=94841945;WS=94841927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr9	94877716	rs55740103	A	G	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=18;PP=659;SC=GTCGCTGCTCAGTGTCGTTAT;SOR=1.143;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=12;TCR=18;TR=30;WE=94877724;WS=94877706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	94877836	rs10992234	A	G	179.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=144;SC=AGTTTTTCCAAGAATTGTTTA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=94877844;WS=94877826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	95014731	rs79387288	C	A	1359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=1113;ReadPosRankSum=0.199;SC=AGTTGTGTTGCAGGCTTTTAT;SOR=1.464;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=17;TCR=33;TR=47;WE=95014739;WS=95014721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,46:0.96:48
chr9	95148152	.	A	G	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=733;SC=AAGGAAACCTAAGTCAGAGGT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=95148160;WS=95148142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	95219597	rs4744132	G	A	1420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=14;PP=1061;SC=CAAGCTGAACGCTCATTCTGC;SOR=1.755;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=46;WE=95219605;WS=95219587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr9	95237024	rs3078372	CTCA	C	2206.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=22;PP=1983;SC=GAGAGTTGTCCTCATCATCAT;SOR=0.804;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=75;TCF=26;TCR=49;TR=38;WE=95237037;WS=95237014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	95237222	.	G	A	1455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=35;PP=1154;SC=AAACAGACATGGGATATTAAA;SOR=3.467;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=41;WE=95237230;WS=95237212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	95256519	rs331380	C	T	1873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=36;PP=1433;SC=TGCTGACTCACCTTATTCAGT;SOR=1.692;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=52;WE=95256527;WS=95256509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
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chr9	95572247	rs10821018	G	A	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=325;SC=GGGCACCCTCGGAGCCGCGGA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=95572255;WS=95572237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	95580745	rs71364316	GT	G	1175.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.40;MQRankSum=0.266;QD=21.38;ReadPosRankSum=-0.416;SOR=3.570;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr9	95780465	rs7048975	A	G	3718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=59;PP=2832;SC=TCATCATAACAGGAAGAAAAA;SOR=0.774;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=65;TCR=59;TR=124;WE=95780473;WS=95780455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr9	95869904	rs55971659	C	A	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=422;SC=AGGCTGTCGTCTCTGGTCCCC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=95869912;WS=95869894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	95872744	rs3819011	C	T	1295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=1;PP=1096;SC=GGTGTCCTGACACCCAACAGG;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=40;WE=95872752;WS=95872736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr9	95874070	rs2027585	G	C	344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=4;PP=208;SC=GGCCCCAGGAGGCAGCAGCAA;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=95874078;WS=95874060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	95874311	rs72741078	C	T	136.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=80;SC=TCAGGGGCTTCTCCACCCCAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=95874319;WS=95874301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	95875381	rs56145587	G	C	970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=11;PP=713;ReadPosRankSum=1.812;SC=TGACCTAGGGGGGCTCTGACA;SOR=0.829;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=36;WE=95875389;WS=95875371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr9	95887320	rs2275848	G	T	4319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=89;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.903;SC=GGCGTGCTTGGCCGGGTTGTT;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=134;TCF=43;TCR=91;TR=132;WE=95887328;WS=95887310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,139:0.99:140
chr9	95992213	rs7871272	A	G	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=14;PP=401;SC=ACCATAGCTGAGGGTGAGGTC;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=95992221;WS=95992203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	96000622	rs1539670	C	T	2261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=47;PP=1789;SC=CCCTGAAGGGCTGGGTTCTGG;SOR=1.516;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=72;WE=96000630;WS=96000612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr9	96015256	rs4744201	C	T	2216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=49;PP=1697;SC=CCCTTGCCGACGCAGCGCCGT;SOR=1.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=23;TCR=49;TR=72;WE=96015264;WS=96015246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr9	96015377	rs4744202	A	G	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=17;PP=454;SC=GAGTCAGAGCATCACTCCCAC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=17;WE=96015385;WS=96015367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	96015398	rs4744203	A	T	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=14;PP=424;SC=CCCCTTCCCCATCCCCATTAC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=96015406;WS=96015388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	96019118	rs10122466	A	G	302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=245;SC=GAATGTGAGCATGTGCGTGTG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=96019126;WS=96019108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	96021312	rs10761203	G	A	7234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=147;NR=93;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.784;SC=TGTGCCTCCCGTGCCACCACC;SOR=0.483;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=243;TCF=150;TCR=93;TR=240;WE=96021320;WS=96021302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,235:1.00:236
chr9	96024794	rs7854000	T	C	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=0;PP=860;SC=TGACGCCCCCTGGGTCGTACC;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=96024802;WS=96024784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	96024859	rs1936403	A	G	2117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=52;NR=10;PP=1742;SC=GGGCTGAGGAAGTGGGGAGGG;SOR=3.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=52;TCR=10;TR=62;WE=96024867;WS=96024849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr9	96025717	rs10649709	C	CAG	1218.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=1;PP=931;SC=TCGCACAGGACGGGCTGCCTC;SOR=6.518;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=96025725;WS=96025707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	96025771	rs6479467	G	A	1797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=14;PP=1284;SC=GACTGTTCCAGATAAGCTGAC;SOR=2.147;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=57;TCF=43;TCR=14;TR=56;WE=96025779;WS=96025761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr9	96026122	.	T	TG	115	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=115;QD=47.0;SC=GGGGGAGGGGTACTTGGGGGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=96026130;WS=96026112;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	96030230	rs7856268	T	C	3353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=66;PP=2697;SC=TGGGAGGTGGTGAGAGTGCAG;SOR=1.138;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=44;TCR=66;TR=110;WE=96030238;WS=96030220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr9	96031262	rs1936401	T	C	1725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=38;PP=1364;SC=CCCCACCAAGTAGGTGGCTCG;SOR=2.393;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=50;WE=96031270;WS=96031252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr9	96051521	rs2169756	A	G	1825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=19;PP=1565;SC=CCTTGGGTCAACCTGCTCCCC;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=34;TCR=19;TR=53;WE=96051529;WS=96051511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr9	96052179	rs2306183	G	A	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=10;PP=522;SC=TGAGATGAGGGGAGTGGATTT;SOR=1.051;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=12;TCR=10;TR=22;WE=96052187;WS=96052169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	96097747	rs78436873	C	T	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.24;QD=29.43;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	96209943	rs10821128	T	C	2174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=47;PP=1785;SC=GTGGTTTTCTTTGAGACTTTG;SOR=2.267;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=17;TCR=47;TR=64;WE=96209951;WS=96209933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	96213291	rs10992740	A	G	2990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.377;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=28;PP=2427;ReadPosRankSum=-1.173;SC=ACCTTCAGACATTATGGTGTG;SOR=2.175;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=83;TCR=29;TR=110;WE=96213299;WS=96213281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,108:0.98:110
chr9	96214928	rs1055710	G	A	1153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=15;PP=916;SC=GGCTGGGAGAGAGCCCCGGAC;SOR=1.061;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=35;WE=96214936;WS=96214918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	96238578	rs10821135	C	T	3455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=53;PP=2744;SC=CTTCCTTTCACTGGAGTTTAC;SOR=0.748;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=53;TCR=53;TR=106;WE=96238586;WS=96238568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr9	96238731	rs10821136	C	T	515.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=466;ReadPosRankSum=-0.658;SC=GTTAGCAATACCATGTTTTCC;SOR=2.948;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=17;WE=96238739;WS=96238721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr9	96289269	rs10739950	C	T	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=178;SC=ATCACCTACCCTTTTGAAGCA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=96289277;WS=96289267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	96292025	rs10761232	A	T	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=116;SC=AAAGATGAACATTTATAACTG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=96292033;WS=96292015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	96392182	rs10992812	G	A	1080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=823;ReadPosRankSum=-0.620;SC=TCTCCCTAGAGCTTCGCAGAT;SOR=0.269;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=34;WE=96392190;WS=96392172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr9	96398508	rs2398851	A	G	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=0;PP=505;SC=AGGTCGAGGTAGGGGGTTGAC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=96398516;WS=96398498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	96407822	rs6479500	A	G	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=3;PP=335;SC=ACCCAGGCTCACCTCTCCAGC;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=96407830;WS=96407812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	96407848	rs7851271	A	G	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=9;PP=536;SC=GGCCCTGTCCACACCTGTCCC;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=26;WE=96407856;WS=96407838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	96415653	rs3750354	C	T	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=24;PP=681;SC=TCAAGGTGAGCCACGCCCCTC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=96415661;WS=96415643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	96420390	rs3763605	A	G	1420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=27;PP=1089;ReadPosRankSum=0.967;SC=TGTGGGCAGCAGGCACCCACC;SOR=0.293;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=48;WE=96420398;WS=96420380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr9	96422420	rs10992836	T	C	2387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=17;PP=1790;SC=GTGGACCGTCTTGGGCCACAG;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=52;TCR=17;TR=69;WE=96422428;WS=96422410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr9	96425138	rs3750358	T	C	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=1;PP=783;ReadPosRankSum=-0.686;SC=TCAAGAGAGTTCCACCAGCCC;SOR=3.912;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=28;WE=96425146;WS=96425128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr9	96425363	rs3750359	G	A	2798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=62;PP=2214;SC=GTGAGTGTGAGCAGAGGTGAA;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=24;TCR=62;TR=86;WE=96425371;WS=96425353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr9	96425777	rs7036592	C	T	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=1;PP=372;SC=GGCTCAGGGACGGCCCTGGTC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=96425785;WS=96425767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	96426049	rs112327078	T	TCACA	571.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=645;SC=ACTCTGCATCTCACACACACC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=12;WE=96426057;WS=96426039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	96428457	rs10992840	A	G	359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=332;SC=ATGAGATGGCAAAGGGGCCCC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=96428465;WS=96428447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	96439004	rs149736720	C	CCCTGCCTCCACCACA	792.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=11;PP=445;SC=CCTCTACCACCCCGGCCTCCA;SOR=1.493;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=16;WE=96439012;WS=96438992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	96581893	rs4743934	A	G	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=316;SC=CACCAGCCCCACCAAGCACAG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=96581901;WS=96581883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	96714338	rs59397123	C	T	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=1;PP=480;SC=AATAAAAAGGCTTAGGAAGTA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=96714346;WS=96714333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	96715494	rs148132681	CG	C	208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=268;SC=AATGAGGACCCGGGTGAGCTA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=96715502;WS=96715484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	96717287	rs191789925	C	T	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=15;PP=615;SC=GCAGCGGCGGCTGCGGGCGCG;SOR=0.818;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=14;TCR=15;TR=28;WE=96717295;WS=96717277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	97054922	.	TG	CG	414	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=59.45;NF=2,0;NR=11,6;PP=110,414;QD=11.136247119;SC=TGTGTGTGTGTGCGCGTGCAC;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=13,6;WE=97054930;WS=97054912;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr9	97054922	rs371262494	TG	TGCG	528.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.562;NF=2,0;NR=11,6;PP=110,414;ReadPosRankSum=-0.758;SC=TGTGTGTGTGTGCGCGTGCAC;SOR=1.402;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=13,6;WE=97054930;WS=97054912;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.82:17
chr9	97209066	rs9409546	T	C	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=7;PP=946;SC=CATTAATGTGTATTGGCATTT;SOR=2.948;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=36;WE=97209074;WS=97209056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr9	97213843	rs4744347	A	T	136.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=2;PP=114;SC=TAAAAAATTTAAAAAATATCC;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=97213851;WS=97213833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	97216163	rs7037298	G	T	203.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=164;SC=ATCAGGGAAGGGTCTTCACAC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=97216171;WS=97216153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	97216541	rs7023744	A	G	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=173;SC=TATAAAGACTACCTTTATGTC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=97216549;WS=97216531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	97218342	rs2277182	C	T	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=412;SC=CCATTCGTTTCCTCCAGTGTC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=97218350;WS=97218332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	97219678	rs10570184	CTTTT	C	1212.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=1;PP=685;SC=CCTAAGAGCCCTTTTTTTTAA;SOR=5.283;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=24;WE=97219689;WS=97219668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	97219735	rs112270671	A	ATT	1504.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=35;NR=3;PP=883;SC=TATTCATTGCATTTTTTTTTT;SOR=3.716;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=38;WE=97219743;WS=97219725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	97221434	rs9409765	G	A	2955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=40;PP=2420;SC=TGTTTTCCACGTTCAACAGGG;SOR=0.924;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=55;TCR=40;TR=95;WE=97221442;WS=97221424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr9	97321127	rs1048510	T	C	1255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=7;PP=1029;SC=TTACCTTTTGTATACTCATAG;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=39;WE=97321135;WS=97321117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr9	97349666	rs573212	C	G	1153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=13;PP=975;SC=GAGGATTGGACCATGTTGATC;SOR=1.547;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=37;WE=97349674;WS=97349656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	97365642	rs9695	G	A	1068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=5;PP=887;SC=GCAATTCTCCGGATGCAGGCA;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=97365650;WS=97365632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	97365720	rs1769257	T	C	2089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=31;PP=1550;SC=CGTCGGGGGATCCCAAGATCA;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=37;TCR=31;TR=68;WE=97365728;WS=97365710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	97365985	rs3780554	G	A	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=103;SC=TTTCCTTCCTGTGAGGCTGTA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=97365993;WS=97365975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	97369083	rs2297084	G	A	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=574;SC=CACCCTCCCCGGGCCCTCACT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=97369091;WS=97369073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	97369149	rs1769259	C	T	1459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=14;PP=1161;SC=GTCAAAGTCCCTGGCGTAGCC;SOR=1.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=47;WE=97369157;WS=97369139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	97372172	rs3739747	C	T	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=1;PP=573;SC=AGACACCAGCCAAGCCCCCAG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=97372180;WS=97372162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	97768286	rs10761364	T	C	1630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=13;PP=1326;SC=ACCTAGACTTTAAATTGGAGT;SOR=2.078;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=48;WE=97768294;WS=97768276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr9	97822941	rs1888944	T	C	3828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=53;PP=2745;SC=ATCAACTGAATGGCATTTTCA;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=69;TCR=53;TR=122;WE=97822949;WS=97822931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr9	97849090	rs4657	A	G	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=13;PP=662;SC=CCCTGTTCACATCTTGGTGCT;SOR=0.984;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=32;WE=97849098;WS=97849080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	98638288	rs690528	A	G	1196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=13;PP=893;SC=CGGGTGTTACATGCAGCCGGG;SOR=1.828;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=43;WE=98638296;WS=98638278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	98678164	rs683829	G	T	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=745;SC=AGCTGAATACGGTCTTGTTTG;SOR=5.353;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=98678172;WS=98678154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	98694641	rs10760675	T	C	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=12;PP=367;SC=CCACCATTTCTGCCATCACAT;SOR=1.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=98694649;WS=98694631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	98997910	rs8190570	ATCTTTGTGG	A	2781.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.28;NF=5;NR=43;PP=2974;SC=ACCTCAGTTCATCTTTGTGGT;SOR=3.021;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=60;TCF=7;TCR=53;TR=48;WE=98997926;WS=98997900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr9	99003264	rs2066485	C	T	1839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=52;PP=1456;SC=AACACTCAAGCCCCCATCCCA;SOR=4.443;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=5;TCR=52;TR=57;WE=99003272;WS=99003254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr9	99013663	rs408876	A	G	2292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=13;PP=1871;SC=CAGAACCTGGATAAGAGGAAT;SOR=2.932;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=58;TCR=13;TR=71;WE=99013671;WS=99013653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	99064202	rs8190483	C	CA	4134.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=48;PP=2979;SC=ACAACAGCAGCAAAAAAACAT;SOR=1.461;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=123;TCF=73;TCR=50;TR=115;WE=99064210;WS=99064192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr9	99284785	.	C	G	4516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=66;PP=2965;SC=AACCCAGACTCACGTGAGAGG;SOR=0.811;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=72;TCR=66;TR=138;WE=99284793;WS=99284775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr9	99284829	.	C	G	3561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.958;ClippingRankSum=0.000;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.695;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=75;PP=2965;ReadPosRankSum=0.820;SC=TTCTGCTTTTCAAGGCCCGAA;SOR=1.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=36;TCR=76;TR=110;WE=99284837;WS=99284819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,111:0.98:113
chr9	99925034	rs12555636	A	T	1089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=8;PP=830;SC=TACTTTTCTCATAGATAATAA;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=99925042;WS=99925024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	100041610	rs2255135	C	G	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.71;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	100041617	rs41316960	C	T	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.98;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	100041876	rs2255139	A	G	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=11;PP=396;SC=TTGAATCTTGATAAGTCAAAG;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=100041884;WS=100041866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	100054705	rs2615143	T	C	367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=259;SC=GCCTTGTAAGTGTAAAGCATG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=100054713;WS=100054695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	100069900	rs3214072	A	G	2763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=17;PP=2107;SC=CCGGATGCGAATTCTGCGCCG;SOR=2.542;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=60;TCR=17;TR=77;WE=100069908;WS=100069890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr9	100071728	rs3747507	G	A	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=25;NR=12;PP=899;SC=CGGCCACCAGGAAGCGGGCTG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=37;WE=100071736;WS=100071718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	100071989	rs3747506	T	G	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=183;SC=AGGAATGAAGTCTCAAGTACC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=100071997;WS=100071979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	100074446	rs3747504	C	T	2866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=49;PP=2179;SC=AGAACACCATCGCTGCCCGAG;SOR=1.130;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=35;TCR=49;TR=84;WE=100074454;WS=100074436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr9	100075702	rs7856924	T	C	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=13;PP=381;SC=CTCCCAGCCTTCCTCCCCCTC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=100075710;WS=100075692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	100087211	rs3747499	G	A	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.90;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	100087220	rs3747498	A	G	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.11;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	100087345	rs3747496	A	G	1287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=16;PP=999;SC=GGCAGAGTTCACACCTCTTCA;SOR=1.280;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=44;WE=100087353;WS=100087335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr9	100092968	rs113264216	A	AGAGGAG	1378.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.13;QD=43.09;SOR=2.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
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chr9	100105735	rs1947717	T	C	5375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=85;PP=2965;ReadPosRankSum=1.805;SC=AAGAGCATTGTAGGAAGTCCC;SOR=0.286;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=161;TCF=75;TCR=86;TR=160;WE=100105743;WS=100105725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,170:0.99:171
chr9	100107884	rs10122063	G	A	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=80;SC=TATATATTCTGTAGCCGGGCA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=100107892;WS=100107874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	100108003	rs9696167	T	C	216.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=7;PP=162;SC=GCTGCACTCCTGACTGGGAGA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=100108011;WS=100107993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	100116833	rs10125198	G	C	2189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=10;PP=1714;SC=GCTTTTATTTGTCTTTGATTA;SOR=3.091;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=51;TCR=10;TR=61;WE=100116841;WS=100116823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	100117342	rs2306094	C	G	1572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=41;PP=1234;SC=CACCTGCACACCAGGCACTGT;SOR=4.003;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=4;TCR=41;TR=45;WE=100117350;WS=100117332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr9	100122291	rs3747495	T	C	2141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=30;PP=1669;SC=ACTCCTCAGCTTCGTCCAAAC;SOR=0.874;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=37;TCR=30;TR=67;WE=100122299;WS=100122281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr9	100124787	rs3802471	T	C	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=15;PP=343;SC=AGGCAGGAGATGACCTATGGC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=100124795;WS=100124777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	100132194	rs2169456	C	A	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=6;PP=642;SC=CTTACCCGCACTTCTGGCAGA;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=100132202;WS=100132184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	100132829	rs2306090	T	C	1368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=7;PP=1117;SC=TCAGAGGACATGAGTCTGGCC;SOR=2.935;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=44;WE=100132837;WS=100132819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr9	100133093	rs2306092	A	G	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=27;PP=763;SC=CAGTCCAGGCATGCTCCAAAT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=100133101;WS=100133083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	100139161	rs11581	A	G	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=14;PP=556;SC=ACACTATCCAAGGCCTGTATG;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=100139169;WS=100139151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	100139182	rs898869	C	T	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=369;SC=TGTGACCCTCCGCCCCACCAT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=100139190;WS=100139172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	100190780	rs1381532	A	G	1193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=11;PP=906;SC=CAAAGATGCTACGAGCTGTTC;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=37;WE=100190788;WS=100190770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	100193113	rs7874295	T	C	1815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=9;PP=1501;SC=ACCACTTGACTTGGGATATGT;SOR=2.958;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=54;WE=100193121;WS=100193103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	100194406	rs2045732	T	C	4360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=58;PP=2965;ReadPosRankSum=0.785;SC=GGAAACTCTGTTGGAGTTAAG;SOR=0.283;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=70;TCR=59;TR=127;WE=100194414;WS=100194396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,133:0.99:134
chr9	100227423	rs4743099	G	A	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=27;PP=732;SC=ATAATTAAATGTAGTTTTCAA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=100227431;WS=100227413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	100447396	.	C	G	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=21;PP=622;SC=ACTGTCAAATCCAAAGGTACC;SOR=4.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=100447404;WS=100447386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	101243021	rs2779547	T	C	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=0;PP=543;SC=TCCTCGATGATGGTATTGTTC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=101243029;WS=101243011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	101243364	rs2808557	T	G	1676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=45;PP=1335;SC=CAACATTCCTTCACCTCTGGC;SOR=5.590;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=47;WE=101243372;WS=101243354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr9	101258881	rs1000440	T	C	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=18;PP=570;SC=GGGAAGTCAATTGGGCAAAGC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=101258889;WS=101258871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	101340301	rs2808536	A	C	3010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=36;PP=2323;SC=TCAAGTGGTTAGGCCCGTATT;SOR=1.361;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=60;TCR=36;TR=96;WE=101340309;WS=101340291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr9	101340316	rs3750344	T	C	3279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=53;PP=2494;SC=CGTATTTTATTGCATCGTAGA;SOR=0.822;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=58;TCR=53;TR=111;WE=101340324;WS=101340306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr9	101340425	rs3750343	A	G	2093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=57;PP=1696;SC=GAGCCCAACAAACAAATCTTT;SOR=4.277;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=6;TCR=57;TR=63;WE=101340433;WS=101340415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr9	101340440	rs2808537	A	G	1652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=48;PP=1331;SC=ATCTTTCCTCATGGAAACCTT;SOR=4.615;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=4;TCR=48;TR=52;WE=101340448;WS=101340430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	101470641	rs186943372	A	C	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.36;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	101470648	rs77213774	C	A	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.78;SOR=4.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	101533220	rs6415847	C	T	1914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=10;PP=1515;SC=CTCACACCTACCCCACTGGAG;SOR=2.797;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=50;TCR=10;TR=60;WE=101533228;WS=101533210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr9	101539601	rs4742741	G	A	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=2;PP=879;SC=TACAAAGACAGACAAACACCT;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=31;WE=101539609;WS=101539591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	101546578	rs12056975	G	C	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=439;SC=GGGATACTAAGAGGGCGTCAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=101546586;WS=101546568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	101558609	rs138948716	G	A	88.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=1;NR=3;PP=48;SC=CCCCGGGCCCGGCCACCTCGG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=101558617;WS=101558599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	101585444	rs2295922	G	C	597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=475;SC=GTCCCCTTCCGCAGGGGACCA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=101585452;WS=101585434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	101599211	rs3216734	AT	A	398.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5443;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=472;ReadPosRankSum=-0.938;SC=CCCGCAGCTCATCCCCTGCTC;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=101599219;WS=101599201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,12:0.92:13
chr9	101602171	rs2277189	C	G	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=3;PP=583;SC=TGGCATGCGACGAATGCTCCA;SOR=3.160;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=101602179;WS=101602161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	101606549	rs1885608	G	T	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=560;SC=AAATTAAATAGTTGAATTTTT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=101606557;WS=101606539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	101748356	rs2075663	A	G	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=626;ReadPosRankSum=-0.718;SC=TGGAATCTTCATGGGCAATGC;SOR=0.487;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=29;WE=101748364;WS=101748346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr9	101749498	rs2075664	C	A	3563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.780;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=45;PP=2706;ReadPosRankSum=-0.634;SC=TCTCCATTGCCAAAACAATCA;SOR=0.803;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=65;TCR=46;TR=109;WE=101749506;WS=101749488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,116:0.99:117
chr9	101767385	rs41305481	A	G	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=258;SC=GCAGCTCCTGACCTTCTCAGA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=101767393;WS=101767375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	101785558	rs7848837	T	G	4365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=56;PP=2965;SC=CATTTCCCCATTTTGGAGAAA;SOR=1.038;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=77;TCR=56;TR=133;WE=101785566;WS=101785548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr9	101785598	rs7861925	G	T	4566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=87;PP=2965;SC=CTTGGAGTCTGGCAGTTAAAT;SOR=1.410;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=50;TCR=87;TR=137;WE=101785606;WS=101785588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr9	101785633	rs7851787	T	C	3289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=67;PP=2662;ReadPosRankSum=-0.749;SC=TTTCTTCTCTTTCCAGGCAGG;SOR=0.993;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=94;TCF=26;TCR=68;TR=93;WE=101785641;WS=101785623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,99:0.99:100
chr9	101787017	rs7028686	T	G	2366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=3;PP=1879;ReadPosRankSum=-0.193;SC=CTGAGCCTTATTTTCCGCATC;SOR=3.042;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=63;TCR=3;TR=64;WE=101787025;WS=101787007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,70:0.97:72
chr9	101796906	rs11281933	T	TCTCCCTC	276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=470;SC=AGAACTTTCTTCTCCCTCCTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=101796914;WS=101796896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	101804329	rs7854112	T	C	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=8;PP=673;SC=CCTTCCAGGGTCCTAGAGGAC;SOR=1.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=101804337;WS=101804319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	101804416	rs7851079	A	G	1284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=27;PP=1076;SC=TATCTGAGTGAGATTGGGCGC;SOR=1.501;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=44;WE=101804424;WS=101804406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	101807112	rs16918154	T	C	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=516;ReadPosRankSum=1.200;SC=TTTCATACTTTGATTTGGTTA;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=23;WE=101807120;WS=101807102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,24:0.96:25
chr9	101810339	rs869776	T	C	183.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=6;PP=107;SC=TGAGAGAGTGTGGGGTCCACA;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=101810347;WS=101810329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	101812072	rs13296166	G	A	1468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=8;PP=1208;SC=AGACCTTCCCGATTGGCCTAA;SOR=3.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=47;WE=101812080;WS=101812062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	101814626	rs4142986	C	G	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=567;SC=GCAAACACCACGGCAGAGCTT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=101814634;WS=101814616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	101814852	rs7019613	T	C	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=296;SC=GGATGGCAGCTGAGCCAAGGC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=101814860;WS=101814842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	101818716	rs11788317	T	C	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=17;PP=391;SC=CCCTTGTTCATGCTGTCCCTA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=101818724;WS=101818706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	101822220	rs4480177	C	T	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=26;PP=1004;SC=CAGGGCTTCCCGGATCCAGAA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=39;WE=101822228;WS=101822210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	101822302	rs7031588	C	T	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=18;PP=715;SC=ACTCTGCCTACGATCTCCTGT;SOR=1.528;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=26;WE=101822310;WS=101822292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	101822400	rs7047475	A	G	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=224;SC=ATCTATTTGGATGACTTATTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=101822408;WS=101822390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	101824353	rs200568959	G	A	2044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=44;PP=1707;SC=TTTTTCATTCGTGTTAGAGAT;SOR=1.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=63;WE=101824361;WS=101824343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr9	101831113	rs4742758	G	A	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=496;ReadPosRankSum=-0.662;SC=CTTGGAGTCAGAAGACCCAGG;SOR=4.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=19;WE=101831121;WS=101831103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr9	101908915	rs334354	G	A	5178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=115;PP=2965;SC=CTCTCCCCCAGTAGTTTGTCA;SOR=2.032;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=45;TCR=115;TR=160;WE=101908923;WS=101908905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr9	101909933	.	C	G	2812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=73;NR=9;PP=2399;SC=TAAACTGATACAGGAATTCAT;SOR=3.860;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=73;TCR=9;TR=82;WE=101909941;WS=101909923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr9	101910151	rs56020300	ACTTTT	A	1898.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=36;PP=1802;SC=TTTAAGGAAAACTTTTCTTTA;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=36;WE=101910163;WS=101910141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	101911656	rs868	A	G	2527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=67;PP=2058;SC=TGGGAGGTCAATTGTTCTACC;SOR=4.434;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=7;TCR=67;TR=74;WE=101911664;WS=101911646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr9	102068344	rs790287	C	G	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=385;SC=ATGACCTAAGCCGCACAAAGA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=102068352;WS=102068334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	102068832	rs170462	G	A	1204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=15;PP=954;SC=GTGGTTGTGAGGAAGATCGAG;SOR=1.292;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=39;WE=102068840;WS=102068822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr9	102591042	rs12344570	A	G	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=10;PP=470;SC=CGCGCTTGAGAGCCACCCGTA;SOR=1.061;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=7;TCR=10;TR=17;WE=102591050;WS=102591032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	102595069	rs41274654	G	A	3740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=58;PP=2884;SC=GTCGATTTCAGAAGTGTCTCA;SOR=0.779;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=55;TCR=58;TR=113;WE=102595077;WS=102595059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr9	102625834	rs7032301	T	C	1820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=7;PP=1461;SC=AGACCTCAATTAGGGATTCAA;SOR=3.690;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=47;TCR=7;TR=54;WE=102625842;WS=102625824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	102780721	rs4743375	T	C	186.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=151;SC=CCAAGAAAAGTATACATTTAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=102780729;WS=102780711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	102783113	rs3739795	T	C	907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=20;PP=651;SC=AGTCCAGTCATTGTTCAAATG;SOR=4.255;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=22;WE=102783121;WS=102783103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	102820002	rs942163	T	C	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=1;PP=597;SC=TGGAATACTGTCTTGAAATAG;SOR=4.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=102820010;WS=102819992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	102860928	rs6479001	G	A	2303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=17;PP=1754;SC=GCGAGAGTGAGGGCAGCGGGG;SOR=2.334;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=57;TCR=17;TR=74;WE=102860936;WS=102860918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr9	103059476	rs7864494	A	G	603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=18;PP=477;SC=CCCCCAGAGTACCACATCAGA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=103059484;WS=103059466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	103060386	rs3813712	T	G	3651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=78;PP=2911;SC=TTAGAACAGATATGGCCAGGG;SOR=1.672;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=35;TCR=78;TR=113;WE=103060394;WS=103060376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr9	103064530	rs7472	G	A	1533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=28;PP=1223;SC=TATACACGTTGAAGCAGTAAT;SOR=1.067;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=47;WE=103064538;WS=103064520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr9	103065884	rs3923501	C	T	1953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=10;PP=1584;SC=TATGCTAATACTGCAAAGCCT;SOR=2.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=48;TCR=10;TR=58;WE=103065892;WS=103065874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr9	103091630	rs10819759	A	G	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=43;PP=1461;SC=CTCTGAATGCACCGAAGTACT;SOR=2.194;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=15;TCR=43;TR=58;WE=103091638;WS=103091620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr9	103108941	rs2151131	C	G	4172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=111;NR=13;PP=2965;SC=TTCAATACAGCAAAACTGTGT;SOR=4.056;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=111;TCR=13;TR=124;WE=103108949;WS=103108931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr9	103114793	rs1930244	G	C	2894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=76;PP=2388;SC=CACACTCCGGGCTAAAACTCT;SOR=3.742;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=11;TCR=76;TR=87;WE=103114801;WS=103114783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr9	103275692	rs1999484	T	A	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=120;SC=TTTTTTTTTTTAAATCAGCTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=103275700;WS=103275682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	103340369	rs1226590	G	A	1574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=0;PP=1341;SC=CTGACTTTTTGCTCCAAGTGC;SOR=7.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=48;WE=103340377;WS=103340359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr9	103348634	rs2780956	G	A	3097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=57;PP=2481;SC=ATGAAGGAAGGGAAATCCCCA;SOR=1.132;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=37;TCR=58;TR=94;WE=103348642;WS=103348624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr9	104151901	rs201264838	G	GA	113.92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.9988;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=99;ReadPosRankSum=-0.366;SC=TCTAAAGCTTGAAAAAAAAAT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=104151909;WS=104151891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr9	104153155	rs10989486	G	C	1412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=32;PP=1160;SC=AAAACAAACAGACAAATCCAT;SOR=2.409;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=42;WE=104153163;WS=104153145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	104309445	rs2273976	T	C	4791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=58;PP=2965;SC=ATAAGGTGTATGGAGCGGGGA;SOR=1.244;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=156;TCF=97;TCR=59;TR=155;WE=104309453;WS=104309435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr9	104335682	rs3739722	C	T	1843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=28;PP=1490;SC=CTGGTGGATCCGGATGCCCAG;SOR=0.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=28;TCR=28;TR=56;WE=104335690;WS=104335672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	104449063	rs2506354	C	T	2162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=31;PP=1732;SC=GAGCAATGAGCCCTAAGGGCA;SOR=0.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=35;TCR=31;TR=66;WE=104449071;WS=104449053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr9	104499575	rs1337677	T	C	3030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=38;PP=2490;SC=GACTCTCCCGTGGAAACTCGT;SOR=1.237;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=61;TCR=38;TR=99;WE=104499583;WS=104499565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr9	105757756	rs1341205	A	G	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=285;SC=ATGAAGAGATATTTATTATAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=105757764;WS=105757746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	106857908	rs3739736	G	A	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=19;PP=673;SC=GAGACGTCCCGATATTCTCTT;SOR=2.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=24;WE=106857916;WS=106857898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	106860969	rs10991107	T	C	205.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=162;SC=ACTATTGTGCTGTGTCCGGCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=106860977;WS=106860959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	106878318	rs35784229	TCTC	T	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=445;SC=AATGGCAGCATCTCCTTTTTC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=106878328;WS=106878312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	106885332	rs7350223	A	G	1957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=0;PP=1687;SC=GTTTGAATGTATTTCTCAAAT;SOR=8.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=54;TCR=0;TR=54;WE=106885340;WS=106885322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	106885616	rs10991114	A	G	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=25;PP=729;SC=TATATATGATAAAGTTTATTT;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=106885624;WS=106885606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	106888838	rs146077014	ATTAT	A	514.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.64;NF=11;NR=0;PP=494;SC=GCATGAGATTATTATTTATTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=106888849;WS=106888828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	106894211	rs3780535	A	C	135.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=106;SC=AATAATGAAAACTGTTTATTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=106894219;WS=106894201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	106896809	rs7872034	G	A	3399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=56;PP=2541;SC=AGGTTGCCTTGGGAAATACCT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=51;TCR=56;TR=107;WE=106896817;WS=106896799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr9	106896874	rs11281153	T	TATATTATAA	3324.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=41;PP=2967;SC=ATCACTTTGCTATATTATAAT;SOR=3.167;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=3;TCR=70;TR=43;WE=106896882;WS=106896864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr9	107266503	rs41277749	A	G	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=0;PP=946;SC=TGTGACGTTAATCCTTCTATG;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=107266511;WS=107266493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	107266596	rs7049042	T	C	2367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=20;PP=1996;SC=CTGGGATTTTTTCACTACCCC;SOR=1.965;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=70;WE=107266604;WS=107266586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	107266774	rs1949755	C	G	3376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=70;PP=2630;SC=CCTCTTCTGCCCTCTCTCCAA;SOR=1.336;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=40;TCR=70;TR=110;WE=107266782;WS=107266764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr9	107266844	rs1403812	A	G	2559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=44;PP=2006;SC=CGCCACTCAGATGTACCTCTC;SOR=1.096;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=31;TCR=44;TR=75;WE=107266852;WS=107266834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr9	107266943	rs1403811	G	A	1964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=28;PP=1552;SC=GAGATACCCTGTCATCATGAA;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=34;TCR=28;TR=62;WE=107266951;WS=107266933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr9	107267304	rs7030820	C	T	4133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=63;PP=2965;SC=TTCTATGGGACGGCTCTCTCC;SOR=0.806;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=59;TCR=63;TR=122;WE=107267312;WS=107267294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr9	107510145	rs3753024	G	C	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=4;NR=9;PP=226;SC=TACCGGCCACGGGGGTACCCA;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=107510153;WS=107510135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	107510178	rs147856422	AGGGGC	A	393.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=8;PP=397;SC=ACGGGAGGGGAGGGGCGGGGC;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=9;WE=107510190;WS=107510168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	107515214	rs2274870	G	A	1853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=14;PP=1437;SC=ACTGAAGTTCGGAAAGCCTTG;SOR=2.187;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=43;TCR=14;TR=57;WE=107515222;WS=107515204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr9	107531361	rs2472478	T	C	990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=27;PP=836;SC=AGACCTAAAGTTATAAAGAGT;SOR=4.479;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=107531369;WS=107531351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	107556793	rs3029409	TA	T	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=8.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.99;ReadPosRankSum=1.884;SOR=2.062;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,9:0.26:35
chr9	107576246	rs2297409	G	A	279.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=278;SC=ATGCTGCAAAGAACAAGTGGC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=107576254;WS=107576239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	107599412	rs5899622	AAGG	A	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=259;SC=ACCGCAGAAAAAGGAGGAGAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=107599422;WS=107599402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	107599438	rs4149346	G	GC	125	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=3;PP=124;SC=GACAATGAGCGTTTGGCTCCT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=107599446;WS=107599428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	107602666	rs2246841	C	T	1976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.438;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=1525;ReadPosRankSum=-0.784;SC=TGATCTTCAGCCCCCCTCCCT;SOR=0.583;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=31;TCR=28;TR=58;WE=107602674;WS=107602656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr9	107620867	rs2230806	C	T	1382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=34;NR=4;PP=1115;SC=CAGTTTCTCCCTTGGTAGGCC;SOR=4.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=38;WE=107620875;WS=107620857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	107621140	rs2243313	A	C	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=22;PP=641;SC=CTTTACTGAAACTCAGAATGT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=107621148;WS=107621130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	107624029	rs2230805	C	T	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.004;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=29;PP=864;ReadPosRankSum=0.354;SC=GGTTGTGATACAGGAACCCAG;SOR=1.949;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=39;WE=107624037;WS=107624019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,36:0.95:38
chr9	107624123	.	CA	C	26	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;FR=0.9997;HP=15;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=24;MQ=58.05;NF=0;NR=2;PP=26;QD=14.5;SC=GTAAGTAACTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=2;WE=107624131;WS=107624113;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,2:0.22:9
chr9	107665751	rs2482424	C	T	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=646;SC=ACCACACAGTCCTGTGTCCAT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=107665759;WS=107665741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	108060515	rs2036876	G	A	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=11;PP=540;SC=CTAGGAACAAGATGAAAATGC;SOR=0.776;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=23;WE=108060523;WS=108060505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	108118448	.	A	C	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.930;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.62;ReadPosRankSum=-0.299;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,10:0.16:63
chr9	108147627	rs2771034	G	A	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=0;PP=838;SC=CAAAAATGTAGATGTTCTTTA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=108147635;WS=108147617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	108152199	rs2771040	G	A	3404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.314;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=37;PP=2714;ReadPosRankSum=-1.019;SC=AGTAATGCTGGGAGGAATAAA;SOR=1.171;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=104;TCF=66;TCR=38;TR=103;WE=108152207;WS=108152189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,107:0.99:108
chr9	108210665	rs3831166	GCT	G	485.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=550;SC=CCGCCCGGCCGCTCTCTGGGC;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=12;WE=108210674;WS=108210655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	108223786	rs10991661	A	G	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=856;ReadPosRankSum=1.995;SC=CTCCTACTGTATTTATATTGG;SOR=0.586;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=36;WE=108223794;WS=108223776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr9	108275777	rs10739910	T	C	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr9	108293042	rs2768278	G	A	1526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=46;PP=1315;SC=TGCCTTTTCAGTTGACAATCA;SOR=6.316;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=47;TCF=1;TCR=46;TR=47;WE=108293050;WS=108293032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	110047132	rs10733562	G	C	2346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=39;PP=1931;SC=GCAAATTACGGTTAGTTTCAT;SOR=0.898;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=34;TCR=39;TR=73;WE=110047140;WS=110047122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr9	110047316	rs10739234	A	G	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=11;PP=274;SC=TACATCTTTAATTTTTTAAGA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=110047324;WS=110047306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	110064265	rs11573665	G	A	264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=4;PP=201;SC=TAACTGAAGTGTAAGAGAAAG;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=110064273;WS=110064255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	110080967	rs1805332	A	G	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.34;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	110080976	rs1805331	T	A	876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.75;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	110086149	rs1805334	G	A	1808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=5;PP=1522;SC=CTTTTGTTTAGAAATGTTTAT;SOR=4.332;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=49;TCR=5;TR=54;WE=110086157;WS=110086139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	110093970	rs3056494	CA	C	2668.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=10.220;HP=15;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.277;NF=49;NR=43;PP=1340;ReadPosRankSum=0.778;SC=AAACTGGAAACAAAAAAAAAA;SOR=0.044;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=128;TCF=75;TCR=53;TR=92;WE=110093978;WS=110093959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:7,119:0.94:126
chr9	111616818	rs3750466	T	C	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=55;SC=GACTCCCCCCTACCCTCTGCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=111616826;WS=111616808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	111617650	rs11543179	G	A	3620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=51;PP=2831;SC=TGCCGTAGGAGTAGATGGACA;SOR=0.918;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=62;TCR=51;TR=113;WE=111617658;WS=111617640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr9	111618163	rs3750468	G	A	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=28;PP=846;SC=CCTCTCCAGGGTCACCCTGAG;SOR=2.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=111618171;WS=111618153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	111618209	rs17728850	A	G	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=14;PP=387;SC=CCTTGTCGCCATCTGCCTCCC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=111618217;WS=111618199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	111625913	rs4978370	A	G	3277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=68;PP=2558;SC=GCTTCTGAACAGCGACGAGGA;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=31;TCR=69;TR=99;WE=111625921;WS=111625903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr9	111631647	rs3763644	C	T	915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=749;SC=CTGGAGGCCCCGCCCTGAGAG;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=111631655;WS=111631637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	111637304	rs2027433	G	T	3056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=61;PP=2404;SC=TCTCAAGACTGCCAATACCAA;SOR=1.585;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=31;TCR=62;TR=92;WE=111637312;WS=111637294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr9	111637331	rs1981268	CC	AG	3288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=53;PP=2947;SC=AATCCCTACCCCCAGAAAACA;SOR=3.198;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=68;TCF=11;TCR=57;TR=64;WE=111637340;WS=111637321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr9	111637935	rs12002774	G	A	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=21;NR=4;PP=757;SC=AGCACTTTGGGAGGCCAAGGC;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=111637943;WS=111637925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	111644396	rs2275495	G	A	3231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=63;PP=2398;SC=GGATTTACAAGATTCTTACCA;SOR=1.358;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=35;TCR=63;TR=98;WE=111644404;WS=111644386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr9	111651497	rs3780508	T	C	1491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.21;SOR=5.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	111651497	.	TAT	CAC	746	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=28;NR=1;PP=746;QD=27.5678577539;SC=GGGCAAACACTATCTCTGGAC;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=29;WE=111651507;WS=111651487;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,29:0.94:31
chr9	111651499	rs3780509	T	C	1491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.88;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	111653460	rs3737309	A	G	1751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=10;PP=1400;SC=TGTAGATGTAAACATATAAAT;SOR=2.790;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=51;WE=111653468;WS=111653450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr9	111658963	rs10816764	T	G	4230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=96;PP=2965;SC=CACAATCATTTGGGGAAAAAA;SOR=2.512;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=28;TCR=96;TR=124;WE=111658971;WS=111658953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr9	111659021	rs2275626	T	C	2749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=73;PP=2369;SC=TTTTTCTCAATAGAACTGGAC;SOR=4.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=5;TCR=73;TR=78;WE=111659029;WS=111659011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr9	111659483	rs2230793	T	G	2523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=66;PP=2085;SC=ACAAGGTCTATTTTATTCCCG;SOR=3.528;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=12;TCR=66;TR=78;WE=111659491;WS=111659473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr9	111660851	rs2230792	C	T	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=3;PP=300;SC=TTCCACATTTCCAAGAAACAC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=111660859;WS=111660841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	111661150	rs4978760	G	A	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=9;PP=225;SC=ATGCCAAGCTGCTATCACTGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=111661158;WS=111661140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	111662288	rs55969525	A	C	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=21;PP=554;SC=CTCTAAAATCAGCACACTTTT;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=111662296;WS=111662278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	111662726	rs1341216	CG	TA	4766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=63;PP=2947;SC=CAATTGAAACCGCACACATTA;SOR=1.654;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=105;TCF=33;TCR=72;TR=94;WE=111662735;WS=111662716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr9	111663754	rs2230791	G	A	3486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=27;PP=2669;ReadPosRankSum=-0.765;SC=TATGGGAATGGGTTGTCAACA;SOR=1.038;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=104;TCF=77;TCR=27;TR=103;WE=111663762;WS=111663744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,109:0.99:110
chr9	111663793	rs10979605	C	T	4764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=51;PP=2965;ReadPosRankSum=1.325;SC=CTGCAAATGACGTGATATTTG;SOR=0.577;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=143;TCF=92;TCR=51;TR=142;WE=111663801;WS=111663783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,153:0.99:154
chr9	111665728	rs16913675	G	C	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=0;PP=470;SC=GGGTTTTCCAGGGTAGTTAAA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=111665736;WS=111665718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	111668652	rs838827	C	T	2611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=38;PP=1827;SC=AATGACAGACCGGGGGCTGAA;SOR=0.717;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=37;TCR=38;TR=75;WE=111668660;WS=111668642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr9	111868777	rs2583377	C	T	2033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=6;PP=1626;ReadPosRankSum=1.774;SC=ATAGAATGCCCTATTTCTTAC;SOR=2.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=55;TCR=6;TR=60;WE=111868785;WS=111868767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr9	111882219	.	AG	A	641.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=11;PP=641;SC=GCCGCCCCCGAGGGGCGGTAA;SOR=1.127;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=17;WE=111882227;WS=111882209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	111911775	rs1533641	G	A	1396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=0;PP=1132;SC=CGGGATGGCCGTTACGAAACT;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=39;WE=111911783;WS=111911765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	111929420	rs10979723	C	G	107.28	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	111929420	.	CG	GC	66	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=1;NR=2;PP=66;QD=39.8226249541;SC=CCGCGCCATCCGTGCGCACAG;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=111929429;WS=111929410;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	111929421	rs10979724	G	C	107.28	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	111936732	rs10733569	G	A	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=6;PP=1079;SC=TGGGCGAACAGAGCACACACT;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=40;WE=111936740;WS=111936722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	111936788	rs10979727	C	T	2174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=26;PP=1682;SC=AGAAAGAAGACGGACAGAAGG;SOR=1.163;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=41;TCR=26;TR=67;WE=111936796;WS=111936778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
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chr9	111947704	rs12377767	C	T	317.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=259;ReadPosRankSum=1.942;SC=GCTTCCACCTCGCCTGGTGGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=111947712;WS=111947694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,11:0.92:12
chr9	111956494	rs10979741	C	T	1818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.199;NF=20;NR=41;PP=1479;ReadPosRankSum=-0.765;SC=TTCCACCCCCCAATACCTTGG;SOR=0.669;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=20;TCR=42;TR=61;WE=111956502;WS=111956484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr9	111956599	rs3750447	G	A	1136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=975;ReadPosRankSum=-1.019;SC=CTTGTGTGGCGGCCGTTGTGG;SOR=0.269;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=39;TCF=21;TCR=18;TR=38;WE=111956607;WS=111956589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr9	111962418	rs7864511	G	C	547.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.9972;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=483;ReadPosRankSum=-0.404;SC=TTTGGGGGCTGCTCCCTGGGA;SOR=3.716;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=19;WE=111962426;WS=111962408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,18:0.90:20
chr9	111970046	.	A	T	359	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=12;NR=1;PP=359;QD=30.2900932729;SC=AATTAAAATCATGGTTCACAT;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=111970054;WS=111970045;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	112020713	rs893917	A	G	1189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=29;PP=927;SC=TCCTTTCGGGAAGACTTAACT;SOR=3.086;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=35;WE=112020721;WS=112020703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	112025473	rs1982226	C	A	191.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=142;SC=AAAGGTAGCGCTATTTAGATA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=112025481;WS=112025463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	112041925	rs2014890	A	T	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=433;SC=GGCATCCTACAAGCATTGTGA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=112041933;WS=112041915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	112151349	rs1371787	C	T	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=209;SC=AGGGCTGAGCCTCCCGTCACT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=112151357;WS=112151343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	112170701	rs35463120	T	TAAAC	1906.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=34;PP=1563;SC=TTTTTTAAGTTAAACAAACAA;SOR=3.816;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=36;WE=112170709;WS=112170691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	112172477	rs2275699	T	G	3067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=66;PP=2521;SC=GCCCTGGGTGTGTGGATCACC;SOR=1.735;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=30;TCR=66;TR=96;WE=112172485;WS=112172467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr9	112199146	rs4978809	A	G	2757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=26;PP=2124;ReadPosRankSum=0.383;SC=GAGCCAAGACATAACAAGAAT;SOR=0.892;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=72;TCR=26;TR=97;WE=112199154;WS=112199136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr9	112629397	rs7044189	G	A	762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=18;PP=660;SC=GGATTGAGACGTTTTTATTCT;SOR=2.124;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=24;WE=112629405;WS=112629387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	112629858	rs2769154	A	G	1150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=28;PP=1024;SC=CAAGGTAAGCAGCTGATCCCA;SOR=2.432;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=36;WE=112629866;WS=112629848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	112642756	rs10816904	G	T	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=52;SC=AGCTAAAACAGCACCACTGCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=112642764;WS=112642746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	112852717	rs6477737	C	T	2070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=38;PP=1616;ReadPosRankSum=-0.932;SC=GTTACTTTTACTGTGGACTTT;SOR=0.405;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=66;WE=112852725;WS=112852707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,68:0.99:69
chr9	112898327	rs1475612	A	G	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=339;SC=CTTCCTCTTAATTATGAGTCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=112898335;WS=112898317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	112899361	rs4978872	A	C	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=12;PP=786;SC=GCTGCTGCAGAAGCAGTTACA;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=33;WE=112899369;WS=112899351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	112900199	rs914358	T	C	1992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=44;PP=1526;SC=GACTCTCCGTTGGTTGATGAC;SOR=1.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=64;WE=112900207;WS=112900189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr9	112918531	rs10759392	A	G	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=2;PP=336;SC=TTTATTTGCCAGTTTTCTTTC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=112918539;WS=112918521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	112918581	rs7862044	T	C	822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=6;PP=680;SC=AAAGGGTATTTTCTTCGTGTT;SOR=2.215;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=25;WE=112918589;WS=112918571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	112924558	rs2148989	A	T	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=452;SC=CTGTTCTGAAATATGGGACTG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=112924566;WS=112924548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	112963504	rs10120707	A	G	4325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=67;PP=2965;SC=GGAGCCTTTGATCAGATCCCA;SOR=0.769;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=67;TCR=67;TR=134;WE=112963512;WS=112963494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr9	112963702	rs4978888	G	A	4551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=86;PP=2965;SC=TTCTCTCCTTGTTAATCCAAA;SOR=1.156;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=145;TCF=58;TCR=87;TR=144;WE=112963710;WS=112963692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr9	113006420	rs5843	A	G	1883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=1;PP=1560;SC=GGCTGGTTATATTTTCAGAAA;SOR=6.593;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=51;TCR=1;TR=52;WE=113006428;WS=113006410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr9	113006579	.	T	TTATATATATACATATACATATGTATATATATACATATACATATG	1347.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.06;QD=49.92;SOR=6.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	113007289	rs4135220	T	G	2506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=69;PP=2035;SC=TATAATGGCATTACAAAAGCC;SOR=5.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=3;TCR=69;TR=72;WE=113007297;WS=113007279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr9	113007319	rs4135219	TGAA	T	2337.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=47;PP=2207;SC=ATATTCTCAATGAAGAAGTTT;SOR=7.978;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=47;WE=113007329;WS=113007309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	113139713	rs7873506	T	C	2030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=44;PP=1669;ReadPosRankSum=0.264;SC=GAAAATAGAATTGCCCCTTTA;SOR=0.995;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=17;TCR=45;TR=61;WE=113139721;WS=113139703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr9	113139783	rs2077800	G	A	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=23;PP=677;SC=TCGAATCTCAGGAGGGAATTT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=113139791;WS=113139773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	113141815	rs992883	A	G	3232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=64;PP=2623;SC=ATAACAAAACAACAATTAAGC;SOR=1.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=34;TCR=64;TR=98;WE=113141823;WS=113141805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr9	113149405	rs4978921	T	G	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=0;PP=809;ReadPosRankSum=1.236;SC=AACACAAACATATTTTTAAAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=28;WE=113149413;WS=113149395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr9	113166792	rs3739451	A	T	3828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=63;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.157;SC=TGACAGGTGAATGTATCTGTA;SOR=0.848;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=120;TCF=56;TCR=64;TR=117;WE=113166800;WS=113166782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,123:0.98:125
chr9	113169126	rs2281937	G	A	3323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=46;PP=2653;SC=TGTAGCCCTCGTGACAGTGGA;SOR=0.856;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=55;TCR=46;TR=101;WE=113169134;WS=113169116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr9	113207962	rs7847560	A	C	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=337;SC=TACGTTCTTAAAGAACTTGTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=113207970;WS=113207958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	113209424	rs10980390	A	C	79.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=58;SC=GACTTTGAAAATTGAAATGCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=113209432;WS=113209414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	113212205	rs2095294	G	A	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=604;SC=GGAATATTCAGCTGTAGCCTA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=113212213;WS=113212201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	113213726	rs4421419	A	G	4509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=103;PP=2965;SC=AACTTGACAGAACTTTAAGAC;SOR=2.426;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=28;TCR=103;TR=131;WE=113213734;WS=113213716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr9	113218098	rs112071235	T	TAAAGA	1617.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=1579;SC=TGGGTAGTGGTAAAGGGTAAT;SOR=4.921;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=26;WE=113218106;WS=113218088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	113219779	rs7875113	A	C	218.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=147;SC=TTGCTGCCTGAATAACACTGG;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=113219787;WS=113219769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	113220277	rs11405869	T	TG	706.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=802;SC=ATAAAGCATTTGGTTTAGCTA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=20;WE=113220285;WS=113220267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	113233956	rs7860284	C	T	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=542;SC=TTTTACCAAACAGAAATACTT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=113233964;WS=113233946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	113243438	rs1999598	G	A	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=464;SC=AATTCCTATCGTAAGGCAATT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=113243446;WS=113243428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	113308284	rs2991363	A	T	1690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=1;PP=1423;SC=TGTGCCACTGACCCCACACAC;SOR=6.556;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=51;TCR=1;TR=52;WE=113308292;WS=113308274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	113308525	rs41305611	T	A	3416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=68;PP=2782;ReadPosRankSum=0.795;SC=CACAAAGATATGAGCAGTGGA;SOR=1.418;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=39;TCR=69;TR=106;WE=113308533;WS=113308515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,106:0.98:108
chr9	113449271	rs7869057	G	C	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=311;SC=TTATTCAGAAGTCACTCAAGT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=113449279;WS=113449268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	113457799	rs35176182	A	G	2252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=54;PP=1702;SC=AAAGGGAGACAGCCCTCTCAG;SOR=2.211;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=20;TCR=54;TR=74;WE=113457807;WS=113457789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr9	113459655	rs41279051	C	T	4036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=58;PP=2965;SC=GGATTCATAACGTACAAAAGG;SOR=0.854;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=66;TCR=58;TR=124;WE=113459663;WS=113459645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr9	113490776	rs10817087	C	T	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=372;SC=TGTCATTTAACAGTTTGCTTT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=113490784;WS=113490766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	113547322	rs484010	T	C	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=26;PP=622;SC=CAGCTAACCATGTGTAGTAAT;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=113547330;WS=113547312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	113637662	rs955888	C	A	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=265;SC=TGTTTATCCTCCAAGAGAGGA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=113637670;WS=113637657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	114090279	rs314452	A	G	2980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=40;PP=2382;SC=AGGAGACCGTAGCCATCCGTG;SOR=0.953;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=50;TCR=40;TR=90;WE=114090287;WS=114090269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr9	114124456	rs3837272	GA	G	412	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.573;NF=2;NR=14;PP=237;ReadPosRankSum=0.286;SC=GATTCTGCATGAAAAAAAAAA;SOR=1.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=16;WE=114124464;WS=114124446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,20:0.91:22
chr9	114125835	rs2297524	A	G	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=5;PP=788;SC=ACATGGCTTTATGGTCCCCCA;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=114125843;WS=114125825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	114128759	rs41312224	C	T	3137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=30;PP=2597;SC=TAAAATGCTGCGGGGAGGAAC;SOR=1.832;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=102;TCF=72;TCR=30;TR=102;WE=114128767;WS=114128749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr9	114188227	rs17795846	T	C	114.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=84;SC=TCAACATTAATGCAGATACAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=114188235;WS=114188217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	114301585	rs10441737	C	T	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=2;PP=599;SC=CTATTTATTACGCATTAAATT;SOR=4.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=114301593;WS=114301575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	114311918	rs76345666	G	A	1050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=6;PP=807;SC=GGCAGCGGTCGTGGTGGTGGT;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=32;WE=114311926;WS=114311908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	114326557	rs138156736	TTTATTA	T	233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.96;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	114341033	rs17320021	T	C	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=293;SC=CTTTATATAGTACTTCCATAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=114341041;WS=114341023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	114348513	rs2273786	G	A	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=721;SC=GAGTCAGGATGCTGTGTGGTT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=114348521;WS=114348503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	114356659	rs3739703	C	T	1690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=45;PP=1322;SC=GTTGAGAAACCACCCATGAGG;SOR=3.611;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=7;TCR=45;TR=52;WE=114356667;WS=114356649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr9	114359624	rs1053959	C	A	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=9;PP=962;SC=GGGAGCTCAGCTGTCTTCAAC;SOR=2.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=37;WE=114359632;WS=114359614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	114366028	rs966626	T	C	2970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=20;PP=2334;SC=GTAGACAAGATCACATAGCTA;SOR=2.454;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=93;TCF=72;TCR=21;TR=92;WE=114366036;WS=114366018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr9	114366094	rs966627	G	C	4071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=75;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.728;SC=CTACACTTTTGTCTGTTCCAT;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=125;TCF=49;TCR=76;TR=124;WE=114366102;WS=114366084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,128:0.99:129
chr9	114371322	rs4978450	T	A	1189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=9;PP=929;SC=TTTCTGTTCATTCTGGGCTTC;SOR=2.133;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=114371330;WS=114371312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	114371493	rs12351897	C	T	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=18;PP=726;SC=CTTCTCACATCGTTGTTGGGG;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=28;WE=114371501;WS=114371483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	114454580	rs1475110	A	G	1649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=22;PP=1358;SC=GTCATTCAAAATGGTGGTTTT;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=28;TCR=22;TR=50;WE=114454588;WS=114454570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr9	114811154	rs1980739	C	T	2917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=23;PP=2331;SC=GAGGAGAAAGCATGGGCCATA;SOR=2.160;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=72;TCR=23;TR=94;WE=114811162;WS=114811144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr9	114919707	rs700105	A	G	3231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=10;PP=2465;ReadPosRankSum=-0.487;SC=CCCCAAGGACATCAACTCTTT;SOR=2.269;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=101;TCR=10;TR=109;WE=114919715;WS=114919697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,116:0.98:118
chr9	114986021	rs34621641	C	CAGAA	1570.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=0;PP=1786;SC=ATATCAAACTCAGAGTTATTT;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=28;WE=114986029;WS=114986013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	114994281	rs3983403	G	A	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=52.63;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	114994286	rs372535742	G	A	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.94;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	114994290	rs370701025	AG	A	1130.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.43;QD=47.11;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	114994294	.	GAGAAGAAAAGA	G	1161.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.15;QD=41.49;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	115014799	rs10659246	G	GA	248.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=9;NR=0;PP=184;SC=TTTTAGCTTAGAAAAAAAAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=115014807;WS=115014789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	115051546	rs11792085	A	G	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=25;PP=825;SC=CATATACCTTAGAGCACTGAC;SOR=2.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=35;WE=115051554;WS=115051536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	115060205	rs10981348	C	G	1511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=35;PP=1150;ReadPosRankSum=1.430;SC=CGCTGAAAAGCAAAACCAATG;SOR=0.849;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=50;WE=115060213;WS=115060195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr9	115060682	rs3808881	G	A	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=1;PP=344;SC=GATCTTTAATGCAGACTATTT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=115060690;WS=115060672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	115092577	rs2418204	G	A	146.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=1;PP=116;SC=AAAATCCAAAGTTACCTCAGG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=115092585;WS=115092567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	115092624	rs2900539	T	A	241.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=169;SC=ATTAAAGACTTTTACACAATA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=115092632;WS=115092614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	115095743	rs7040447	T	C	2104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=28;PP=1614;SC=CGCCGCCTAGTACTTACCCAT;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=36;TCR=28;TR=64;WE=115095751;WS=115095733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr9	115142330	rs35979933	CG	C	543.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=4;PP=374;SC=GCACAGGCATCGGGGGGGGCA;SOR=2.419;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=17;WE=115142338;WS=115142320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	115142507	rs7867831	A	G	1678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=36;PP=1379;SC=CGGGCGAAGGACGCGTCTCGG;SOR=1.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=53;WE=115142515;WS=115142497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	115216222	rs10538330	GATTA	G	2025.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=3;PP=1742;SC=CTGTCCTGCTGATTAATTAAT;SOR=4.804;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=34;WE=115216233;WS=115216212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	115249262	rs6477940	T	C	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=325;SC=CACTTACCTTTGGTGCCCGGC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=115249270;WS=115249252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	115249433	rs7031191	T	C	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=12;PP=515;SC=CGGGGACGAGTGCGCCGACGC;SOR=0.874;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=22;WE=115249441;WS=115249423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	115450093	rs786970	C	T	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=6;PP=226;SC=TGGCTGGGCGCGGTGGCTCAC;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=115450101;WS=115450083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	115567015	rs139599865	A	ATG	1011.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=2;PP=769;SC=ACTCTCCAGTATGTTTTCATT;SOR=3.442;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=18;WE=115567023;WS=115567005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	115567184	rs1891402	T	C	1860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=33;PP=1428;SC=TCGTTATAGTTGATGATCCCA;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=27;TCR=33;TR=60;WE=115567192;WS=115567174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr9	115580008	rs10117709	G	C	1529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=13;PP=1218;SC=AGTTTGACCTGCCAGAATATT;SOR=1.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=44;WE=115580016;WS=115579998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	115598447	rs6477961	C	T	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=488;SC=TAGTCCTGCCCATGTGAGTGA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=115598455;WS=115598441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	115600848	rs7023478	T	C	1169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=22;PP=907;SC=GTGAGCTGGCTGAACCCCTGG;SOR=0.954;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=39;WE=115600856;WS=115600838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	115652023	.	G	A	4690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=77;PP=2965;SC=GGTTCCAACCGAGAGGCTCCC;SOR=0.852;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=68;TCR=77;TR=145;WE=115652031;WS=115652013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr9	115652836	rs3802492	G	A	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=48;PP=1557;SC=CCTTCACCACGAGGAGTAGCC;SOR=3.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=8;TCR=48;TR=56;WE=115652844;WS=115652826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr9	115811835	rs2274761	G	C	1806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=45;PP=1518;ReadPosRankSum=0.618;SC=AAATGAAGCCGCAGCATTTGT;SOR=2.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=54;TCF=8;TCR=46;TR=53;WE=115811843;WS=115811825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr9	115818949	rs2282076	A	T	2001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=55;PP=1633;SC=CAGAATCTGGACGCCGCTGGA;SOR=4.909;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=4;TCR=55;TR=59;WE=115818957;WS=115818939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr9	115918144	rs11791765	G	A	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=259;SC=AGCTCCCCTCGGAGGAAACTG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=115918152;WS=115918134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	115918220	rs10817447	C	A	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=4;PP=451;SC=GACTACTATTCTTTACTATCT;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=115918228;WS=115918210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	115918306	rs10121117	G	A	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=16;PP=930;SC=TAGGGCTGTCGTCTGCAAGCA;SOR=1.002;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=36;WE=115918314;WS=115918296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	115928275	rs3810908	T	C	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=12;NR=2;PP=384;SC=CACCCTGTGGTTCGCCTAGAC;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=115928283;WS=115928265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	115934022	rs5900041	A	AACCTGGATT	1132.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=16;PP=2900;SC=TGGCCTCAGGAACCAGGTGAA;SOR=2.833;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=19;WE=115934030;WS=115934012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	115935663	rs11787959	G	A	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=4;PP=577;SC=GGATCGACAGGACTCAAACAG;SOR=2.737;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=21;WE=115935671;WS=115935653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	115938750	rs17762224	T	C	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=1;PP=431;SC=ACTATTGTAATTTGTAAAAGG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=115938758;WS=115938740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	115941046	rs3810912	T	C	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=14;PP=776;SC=GAGAGACCTGTGCAGTGGCCG;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=21;TCR=14;TR=35;WE=115941054;WS=115941036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	115950706	rs10435864	A	C	953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=15;PP=863;SC=GATGGGCCGGATGAAGAGAGG;SOR=0.826;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=17;TCR=15;TR=32;WE=115950714;WS=115950696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	115950778	rs10513188	C	T	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=23;PP=914;SC=CATCCTGAAACAGGAACAAGC;SOR=1.483;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=36;WE=115950786;WS=115950768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	115952644	rs34381175	T	C	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=1;PP=962;SC=ATTAGCTCTCTAAATAATGAT;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=34;WE=115952652;WS=115952634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	115965339	rs67487726	GA	G	1169.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=43;PP=791;SC=ACGACAGATAGAAAAAAAAAA;SOR=5.464;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=45;WE=115965347;WS=115965329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	115968609	rs4281172	C	T	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=427;SC=TTTGTTTTAACGCACAATAGT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=115968617;WS=115968599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	115968862	rs45623732	T	C	2436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=46;PP=1969;SC=ATTTGTGCTATAAAAGGAAGA;SOR=1.223;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=30;TCR=46;TR=76;WE=115968870;WS=115968852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr9	115969433	rs5900043	T	TAGA	1966.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=0;PP=2127;SC=CGAGAAAAAGTAGCTTAACTG;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=39;WE=115969441;WS=115969423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	115973685	rs11794592	G	A	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=168;SC=GTGATCCACCGGCCTCGGCCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=115973693;WS=115973675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	115985417	rs10981693	T	C	274.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=225;SC=TTATCCTGGATGTTTAAGTAG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=115985425;WS=115985407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	115985499	rs4560868	G	C	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=4;PP=468;SC=ACATGCATACGCAGATTATCA;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=115985507;WS=115985489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	115985607	rs5900047	TA	T	147.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=1;NR=7;PP=114;SC=TGGGTGCACCTAAAAAAAAAA;SOR=1.609;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=8;WE=115985616;WS=115985597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	116022860	rs57266996	T	TAC	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.79;MQRankSum=-2.189;QD=4.96;ReadPosRankSum=0.366;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr9	116028559	rs10124895	C	A	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=8;PP=560;SC=TCCCTCTCCCCCTCGTATTAC;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=25;WE=116028567;WS=116028549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	116037894	rs3810919	C	T	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=578;SC=GCGGTGACCCCTCTTGGCCCA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=116037902;WS=116037884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	116038180	rs10116039	C	T	656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=555;ReadPosRankSum=1.061;SC=CGGGACTCAGCGGTGTCCTAC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=20;WE=116038188;WS=116038170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr9	116044998	rs11552582	A	G	1361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=16;PP=1091;SC=AGAAGTCTAAAAAGTCCAAAG;SOR=1.312;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=43;WE=116045006;WS=116044988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	116045088	rs17763934	A	G	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=26;PP=1001;SC=TCTGCTTTCAATGGTTTGTTT;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=17;TCR=26;TR=43;WE=116045096;WS=116045078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	116046780	rs17764013	T	A	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=732;SC=CTGCTTCTCATGATCACACCA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=116046788;WS=116046770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	116048755	rs4979231	G	C	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=653;SC=TCTCTCATGTGCAGTCACACT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=116048763;WS=116048745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	116048874	rs4979232	A	G	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=626;SC=TTCATGTTTTAATAGTTGAAT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=116048882;WS=116048864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	116050720	rs36114176	CT	C	35.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=2;PP=26;SC=GTATATTTGCCTTTTTTTTTT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=2;WE=116050728;WS=116050710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	116059733	rs3750535	A	T	254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=294;SC=GTTTTTTTTTAAAATTGTTCC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=116059741;WS=116059725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	116060124	rs3750534	T	C	2594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=50;PP=2189;SC=CGTGTAGACTTGAGGCTGGCG;SOR=1.055;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=38;TCR=50;TR=88;WE=116060132;WS=116060114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr9	116060221	rs3750533	C	T	1824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=27;PP=1454;SC=CGGAGCAGGGCGAGCATGGCA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=29;TCR=27;TR=56;WE=116060229;WS=116060211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr9	116060487	rs3750532	T	C	1392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=40;PP=1177;SC=ACGGGGAGGCTTCGCGGGAGA;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=40;WE=116060495;WS=116060477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	116082647	rs41307479	C	G	1536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=8;PP=1281;ReadPosRankSum=1.709;SC=CGTGGCTTCACAGCCTTCTCC;SOR=1.823;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=48;WE=116082655;WS=116082637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr9	116091342	rs3810921	T	C	2667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=71;PP=2151;SC=ACTCCCTCTCTGCTCAGGAAC;SOR=2.486;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=22;TCR=71;TR=93;WE=116091350;WS=116091332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr9	116116483	rs10981762	A	G	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=2;PP=658;SC=GCTCAGGTACATGGACCAAGA;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=116116491;WS=116116473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	116116626	rs10981763	C	G	2067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=37;PP=1529;SC=GTGGTAATTCCTCTTCTTTCC;SOR=1.011;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=29;TCR=37;TR=66;WE=116116634;WS=116116616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr9	116124454	.	G	GGT	190	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=0.9999;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=19;MQ=54.07;NF=4;NR=1;PP=190;QD=38.6;SC=ATGTGTTATGGGTGTGTGTGT;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=116124462;WS=116124444;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,5:0.71:7
chr9	116132334	rs3088235	C	T	3135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=68;PP=2378;SC=GCCTCCGGCACAGTGCTCTGT;SOR=1.902;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=28;TCR=68;TR=96;WE=116132342;WS=116132324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr9	116136198	rs1043836	C	T	6209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=88;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.847;SC=GCCAAGGCCCCCCAGGATGCC;SOR=0.267;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=186;TCF=98;TCR=88;TR=185;WE=116136206;WS=116136188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,196:0.99:197
chr9	116136718	.	C	T	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=171;SC=ACCACCTCTGCGCAACCTAAC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=116136726;WS=116136708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	116153352	rs2761016	T	C	141.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=6;PP=107;SC=CACAGAGGACTGACCCTACAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=116153360;WS=116153342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	116153900	rs1139488	A	G	2197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=57;PP=1662;SC=GCTTCACACCATACCTGTGTG;SOR=2.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=14;TCR=57;TR=71;WE=116153908;WS=116153890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr9	116155669	rs72217268	T	TCCCCAA	636.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=5;NR=7;PP=773;SC=CAACACTCCCTCCCCAACCCC;SOR=0.693;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=12;WE=116155677;WS=116155659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	116346287	rs3810927	C	T	1712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=41;PP=1457;SC=ATAGCACCTACAGCCAGAAGG;SOR=2.480;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=55;TCF=14;TCR=41;TR=54;WE=116346295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr9	116356373	rs12350531	G	C	5067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.455;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=98;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.738;SC=GGCTCCTCCTGTCTGAGTCCC;SOR=1.257;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=157;TCF=59;TCR=98;TR=155;WE=116356381;WS=116356363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,158:0.99:159
chr9	116356516	rs12341266	A	G	2869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=34;PP=2342;SC=GGTGCCTCCTACAGACCAATC;SOR=1.101;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=51;TCR=34;TR=85;WE=116356537;WS=116356502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr9	116356529	rs10817493	C	G	2868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=34;PP=2365;SC=GACCAATCTGCGGCCCCAAGG;SOR=1.191;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=90;TCF=56;TCR=34;TR=90;WE=116356537;WS=116356502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr9	116359339	rs1051013	T	C	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=29;PP=666;SC=CCCCAGAGGCTGTGTCTCTGG;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=116359347;WS=116359329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	116764283	rs4978561	C	T	5099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.248;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=77;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.682;SC=CAGGGTCTTACGAATGCGGAA;SOR=0.416;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=168;TCF=90;TCR=78;TR=167;WE=116764291;WS=116764273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,168:0.99:169
chr9	116764883	rs3034072	C	CCT	3409.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=55;PP=2989;SC=CACCCCCATCCCTCTCTCTCT;SOR=1.364;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=102;TCF=26;TCR=76;TR=75;WE=116764891;WS=116764873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
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chr9	116769515	rs4979321	C	T	1413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=2;PP=1151;SC=TTCCTCCCTCCGCTAGCCAGA;SOR=4.664;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=40;WE=116769523;WS=116769505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
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chr9	116770785	rs3748182	G	A	6291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.39;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr9	116770918	rs10817552	G	A	1805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=50;PP=1398;ReadPosRankSum=-0.703;SC=TAGGGCAGGGGTAGCAGTGGG;SOR=4.443;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=53;TCF=2;TCR=51;TR=52;WE=116770926;WS=116770908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr9	116778269	rs4979324	A	G	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=5;PP=666;SC=AAGAGTGGGGACCAGGGCACC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=116778277;WS=116778259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	116794784	rs2116407	A	G	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=496;SC=TCCTGGGGAGATCTGGCTTGA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=116794792;WS=116794774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	116822610	rs2269456	A	G	2875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.57;SOR=1.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
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chr9	116822650	rs2269454	T	C	1722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=40;PP=1397;SC=GCTTGCTGAATCATTTATCTC;SOR=2.628;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=11;TCR=40;TR=51;WE=116822658;WS=116822640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	116840204	rs2251680	A	G	1037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=1;PP=889;SC=CAGCCAAGAGACCCACGGAAT;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=116840212;WS=116840194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	116856889	rs1465660	A	G	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr9	116857656	rs7036734	T	C	1718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=40;PP=1338;SC=ATCACTTGCCTAGGGCCATCA;SOR=2.480;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=49;WE=116857664;WS=116857646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr9	116858625	rs6478062	T	G	3167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=45;PP=2429;SC=GACCCTTGCTTGGTGGCCCCG;SOR=0.936;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=50;TCR=45;TR=95;WE=116858633;WS=116858615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr9	116859769	rs3810929	T	C	1604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=32;PP=1322;SC=AGTCCACCCATCCCCAGATCT;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=47;WE=116859777;WS=116859759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr9	116945454	rs10759688	A	C	101.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=69;SC=GCTTCAGGGGAACTGAGGGGG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=116945462;WS=116945444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	116967263	rs2567719	T	G	1541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=15;PP=1149;SC=GAGTGCACACTCCATCCCGGA;SOR=1.919;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=55;WE=116967271;WS=116967253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	116967952	rs2567720	T	C	2178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=33;PP=1771;SC=TCTTTATTCATTGTCAGCCCC;SOR=0.869;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=38;TCR=33;TR=71;WE=116967960;WS=116967942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr9	116980052	rs10982110	C	T	2086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=39;PP=1626;SC=CCTACCAGGTCCTTCTACCCC;SOR=1.196;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=24;TCR=39;TR=63;WE=116980060;WS=116980042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr9	116997994	rs2015408	T	C	1974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=31;PP=1469;SC=TCCCCTGGTCTTGGCTTCCTT;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=26;TCR=31;TR=57;WE=116998002;WS=116997984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr9	117026581	rs4978576	C	G	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=8;PP=820;SC=CCTGGTTCTCCGCCCGAGGGA;SOR=2.554;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=36;WE=117026589;WS=117026571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	117027165	rs41312228	A	G	1222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=1;PP=1021;SC=GGTCCTCCCAAGCACCCTCTC;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=34;WE=117027173;WS=117027155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	117033096	rs2636866	C	T	3524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=60;PP=2717;SC=CTGGGGACCCCGGCAGGGCAT;SOR=1.009;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=47;TCR=60;TR=107;WE=117033104;WS=117033086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr9	117037820	rs10513241	A	G	1328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=0;PP=1203;ReadPosRankSum=0.950;SC=GGAACTATCGAGAATCTAGGG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=39;WE=117037828;WS=117037810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,39:0.98:40
chr9	117044458	rs1628968	A	G	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=231;SC=GAACCTGGCCATCTGCCTCCA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=117044466;WS=117044448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	117044484	rs72762668	C	T	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=0;PP=797;SC=GACAGTCTGACCGCCTTGCGG;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=117044492;WS=117044474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	117044538	rs2636879	G	T	2229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=11;PP=1827;SC=CTCTTGCTCTGTCCCTCCTCT;SOR=3.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=58;TCR=11;TR=69;WE=117044546;WS=117044528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr9	117044751	rs2787330	T	C	3231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=82;PP=2626;SC=CCAAGGGCTATCAAGGACAGC;SOR=3.023;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=18;TCR=82;TR=100;WE=117044759;WS=117044741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr9	117046170	rs1565502	G	A	1343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=32;PP=1055;SC=AAGATGTGGGGTCTCACCTGC;SOR=2.356;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=42;WE=117046178;WS=117046160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	117051020	rs1687410	A	G	3677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=43;PP=2873;SC=GGGAACCGGGAGACCCTGGGT;SOR=1.238;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=70;TCR=43;TR=113;WE=117051028;WS=117051010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr9	117051271	rs10817583	C	A	1805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=37;PP=1402;ReadPosRankSum=1.312;SC=CGTGTCCCATCCCTGCCTCCC;SOR=0.542;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=60;TCF=22;TCR=38;TR=59;WE=117051279;WS=117051261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr9	117051614	rs1249742	A	G	1944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=30;PP=1456;SC=ACTGAGTCCCAGGAAGGGGGA;SOR=0.880;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=33;TCR=30;TR=63;WE=117051622;WS=117051604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr9	117052738	rs11386651	G	GT	406.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=406;SC=ACATCCAGAAGTTCTCTGGGG;SOR=3.767;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=11;WE=117052746;WS=117052728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	117054195	rs10429546	C	A	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=528;SC=GAGACAGAGACCTTCCTCTTT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=117054203;WS=117054185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	117064405	rs10817586	C	G	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=625;ReadPosRankSum=1.900;SC=TGGAAACCTTCTCTTTTGCCT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=28;WE=117064413;WS=117064395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr9	117072656	rs1000744	C	A	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=80;SC=TGACAGCATTCCTTACAAGAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=117072664;WS=117072646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	117073006	rs1249756	C	T	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=15;PP=419;SC=CTAGGCCTCACGGAGGAGGGA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=117073014;WS=117072996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	117121840	rs2787348	A	C	3770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=60;PP=2830;SC=TAGGGTGGAAACAAACATTCT;SOR=0.924;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=51;TCR=60;TR=111;WE=117121848;WS=117121830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr9	117122202	rs3748177	C	T	3339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=52;PP=2750;SC=GGTAAACTTGCTCCATCTGCA;SOR=0.750;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=106;TCF=54;TCR=52;TR=106;WE=117122210;WS=117122192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr9	117124519	rs2636901	A	T	726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=1;PP=576;SC=GACTCAAATCACAGCTTTTGA;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=117124527;WS=117124509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	117124731	rs3748176	G	A	1653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=33;PP=1398;SC=GCCGGCAAGCGGCTGGGCAGG;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=22;TCR=33;TR=55;WE=117124739;WS=117124721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr9	117127034	rs2787351	C	G	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=4;PP=113;SC=AGCATGGAGACGTGGGTGCTG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=117127042;WS=117127024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	117138278	.	C	T	221	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=58.13;NF=4;NR=9;PP=221;QD=19.6747086575;SC=AGCCAGCCTCCACCCCAGGCC;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=117138286;WS=117138268;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	117150302	rs1886377	C	T	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.41;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	117166246	rs2274159	A	G	2806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=40;PP=2048;ReadPosRankSum=1.063;SC=CTTGGTGGACACCGACTGCCT;SOR=0.408;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=97;TCF=57;TCR=40;TR=95;WE=117166254;WS=117166236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,102:0.99:103
chr9	117166338	rs6478078	G	C	2353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=37;NR=37;PP=1928;SC=TGTCCGAGAGGTGGGAGAGCG;SOR=0.747;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=37;TCR=37;TR=74;WE=117166346;WS=117166328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr9	117168551	rs10982200	C	A	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=1;PP=718;SC=AGCTGGTCCCCCCCTTCACTG;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=117168559;WS=117168541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	117169033	rs942519	A	G	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.548;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=18;PP=1288;ReadPosRankSum=-0.855;SC=GCAGGAAGGCATGGAGGAAGG;SOR=1.351;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=57;WE=117169041;WS=117169023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr9	117186677	rs4979387	A	G	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=2;PP=358;SC=AGACGCTGCCACCACGGTACT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=117186685;WS=117186667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	117188566	rs10817610	C	T	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=9;NR=8;PP=436;SC=GGTGCGGGCACGGGGCAGCCT;SOR=0.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=17;WE=117188574;WS=117188556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	117266337	rs35122928	TA	T	544.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=-0.367;QD=14.72;ReadPosRankSum=0.950;SOR=3.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,31:0.84:37
chr9	117390300	rs7031094	C	A	854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=6;PP=710;SC=TCAGTAGTGTCTGAAAGGTGT;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=117390308;WS=117390290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	117428960	rs1055207	T	C	1154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=6;PP=948;ReadPosRankSum=-0.734;SC=GAATGGCCAGTGCTCCTGGCA;SOR=1.931;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=40;WE=117428968;WS=117428950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,39:0.98:40
chr9	117430524	rs2296947	G	A	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=13;PP=1027;SC=GCTCTTTTTTGTCTGGATCAG;SOR=1.666;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=41;WE=117430532;WS=117430514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	117430611	rs1359992	A	T	2270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=33;PP=1684;SC=CTTCTGAAGCAGCAAATCTGG;SOR=0.927;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=40;TCR=34;TR=72;WE=117430619;WS=117430601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr9	117430743	rs2418316	A	T	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=19;PP=564;SC=GTGGGGGTGTACCTGAAACTA;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=117430751;WS=117430733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	117433685	rs2296948	C	T	1277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=12;PP=988;SC=GCTTGTGCTCCTGGGTTTGAC;SOR=1.666;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=39;WE=117433693;WS=117433675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	117433811	rs3215861	C	CA	2950.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=23;PP=2957;SC=GAATGAGGGGCATGGGTTCCG;SOR=1.439;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=76;TCF=47;TCR=29;TR=68;WE=117433819;WS=117433801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr9	117782836	rs34490502	T	TA	144.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.6276;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.282;NF=6;NR=1;PP=124;ReadPosRankSum=1.732;SC=TGCTTTTATTTAAAAAAAAAA;SOR=2.093;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=7;WE=117782844;WS=117782826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr9	117792583	rs13321	C	G	2580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=38;PP=2009;SC=TCCAGCGCCTCAGCCTTATCA;SOR=0.742;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=39;TCR=38;TR=77;WE=117792591;WS=117792573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr9	117793788	.	C	G	1137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.41;SOR=4.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	117793793	rs147786893	T	G	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	117797359	rs3215885	A	AT	266.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=198;SC=GTCTCTACTAATTTTTTTTTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=117797367;WS=117797349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	117803185	rs35141770	A	AACAC,AAC	870.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17,17;NR=0,0;PP=88,612;ReadPosRankSum=0.387;SC=GAAAAATAGTAACACACACAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=17,17;WE=117803193;WS=117803175;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.95:19
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chr9	117815273	rs11794797	G	A	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=26;PP=827;SC=AAAGATTAGCGTGCCCAACTG;SOR=3.056;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=31;WE=117815281;WS=117815263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	117836188	rs2210108	A	G	868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=22;PP=691;SC=AGGCTGCAAGACAGGGCTGCT;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=117836196;WS=117836178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	117840061	rs2988577	A	G	262.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.85;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	117844239	rs2989519	G	A	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=11;PP=335;SC=GTAAGAGTTAGGGGAGGTGCC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=117844247;WS=117844229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	117846450	rs1755639	A	G	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=0;PP=366;SC=GTGGGCTGACATCAGGTGAGG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=117846458;WS=117846440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	117846580	rs1061494	T	C	3028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=42;PP=2238;SC=CTCCAGCTCCTGGATGATGGT;SOR=0.973;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=60;TCR=42;TR=102;WE=117846588;WS=117846570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr9	117848112	rs1617917	A	T	3571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=35;PP=2689;SC=CATCATGGCCATTATATGCTG;SOR=1.672;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=78;TCR=35;TR=112;WE=117848120;WS=117848102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr9	117848394	rs1757095	T	C	3804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=72;PP=2860;ReadPosRankSum=-0.805;SC=ACAGCGACCCTGGCCATGGCA;SOR=0.402;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=48;TCR=73;TR=120;WE=117848402;WS=117848384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,128:0.99:129
chr9	117849314	rs2992147	T	C	6346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=109;PP=2965;SC=AGACTCCATTTACGCACTTGC;SOR=1.037;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=80;TCR=111;TR=189;WE=117849322;WS=117849304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr9	117853022	rs944510	C	T	7473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=108;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.699;SC=TTTCCCCATCCACTGTGTGCT;SOR=0.294;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=232;TCF=124;TCR=108;TR=231;WE=117853030;WS=117853012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,241:1.00:242
chr9	118054182	rs2285316	G	A	1854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=37;PP=1535;SC=CAGGAATGAAGAGGAAGAGCT;SOR=1.316;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=59;WE=118054190;WS=118054172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr9	118163563	rs2269700	C	T	2498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=51;PP=1927;SC=GTATCTCTTGCCAGGCCCAAG;SOR=1.581;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=24;TCR=52;TR=75;WE=118163571;WS=118163553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr9	118164574	rs3750505	G	A	3469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=68;PP=2622;SC=ATCTAAATCCGTTTAGAATCA;SOR=1.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=32;TCR=68;TR=100;WE=118164582;WS=118164564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr9	119106881	rs7020782	C	A	2258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=49;PP=1725;SC=GAGAATGCTTCTCTCAATTGC;SOR=1.547;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=73;TCF=24;TCR=49;TR=72;WE=119106889;WS=119106871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr9	119124715	.	T	A	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=285;SC=TACCCCTCTTTCAGGGTGGTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=119124723;WS=119124705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	119187839	rs7518	C	T	2106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=22;PP=1659;SC=ACTTCTGCCTCGGGATTGACA;SOR=1.574;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=43;TCR=22;TR=65;WE=119187847;WS=119187829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr9	119199485	rs7034542	T	A	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=544;SC=ATAATAATAATAAAAAATACC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=119199493;WS=119199475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	119199820	rs7018569	C	G	1549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=37;PP=1157;SC=GCGGCCCGGCCGCCTTTCCAG;SOR=2.701;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=47;WE=119199828;WS=119199810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr9	119462112	rs3019	C	T	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=335;SC=TCTAGAACTTCAGAAGCTCCA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=119462120;WS=119462102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	119495697	rs7863560	T	C	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=7;PP=813;SC=GTTGGAGGTCTGGAAGGGGCT;SOR=2.376;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=33;WE=119495705;WS=119495687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	119583072	.	G	C	1634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=41;PP=1418;SC=ACTGCTCAGAGAGAGGGCAAC;SOR=2.701;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=10;TCR=41;TR=51;WE=119583080;WS=119583062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr9	119739015	rs10983437	G	A	1601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=12;PP=1315;SC=GCACACACAGGTGTCTGTGAA;SOR=2.208;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=46;WE=119739023;WS=119739005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr9	119770551	rs7036098	G	A	2426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=54;PP=1939;SC=ATGGGTGAACGGAGAGACAGA;SOR=2.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=20;TCR=54;TR=74;WE=119770559;WS=119770541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr9	119903506	rs10817999	C	T	2308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=15;PP=1890;ReadPosRankSum=1.142;SC=GTTTTATGAGCACAGGGAAGC;SOR=1.533;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=75;TCF=60;TCR=15;TR=73;WE=119903514;WS=119903496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,75:0.99:76
chr9	119903807	rs57782747	A	C	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=550;SC=CACCCTCAGCACCTAGAGCAC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=119903815;WS=119903797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	119977051	rs7856971	G	T	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=41;PP=1232;SC=CACACAAATGGGCCACTGTTC;SOR=4.317;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=4;TCR=41;TR=45;WE=119977059;WS=119977041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	119977077	rs4543613	T	C	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=24;PP=568;SC=AATCGAGGGCTGCAGGGGATT;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=119977085;WS=119977067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr9	120466929	rs5900307	CA	C	675.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.500;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=419;ReadPosRankSum=0.040;SC=TTTATTTTTGCAAAAAAAAAA;SOR=2.910;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=28;WE=120466938;WS=120466919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,32:0.94:34
chr9	120471058	rs2770148	G	A	2511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=70;PP=2171;SC=TCATTGTCCTGTCATTTCATT;SOR=3.940;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=9;TCR=70;TR=79;WE=120471066;WS=120471048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr9	122001000	rs2274157	G	A	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=3;PP=354;SC=GATTGTCATAGCTGTTACAGC;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=122001008;WS=122000990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	122004545	rs3831067	GAGGACAGGGAT	G	862.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=12;PP=2967;SC=TTTCATGTGAGAGGACAGGGA;SOR=1.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=16;WE=122004563;WS=122004535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	122275247	rs10984573	A	T	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=602;ReadPosRankSum=-0.669;SC=CAGAATTGCTACCGCAGGAAA;SOR=0.250;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=28;TCF=13;TCR=15;TR=27;WE=122275255;WS=122275237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr9	123151679	rs4836820	A	G	1371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=26;PP=1056;SC=TGCTTTCAAAAACATAGTTTG;SOR=1.501;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=39;WE=123151687;WS=123151669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	123152099	rs2297457	C	G	1990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=44;PP=1600;SC=ATGATTAGGGCCATGGATATC;SOR=1.681;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=64;WE=123152107;WS=123152089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr9	123152241	rs2297456	A	C	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=11;PP=300;SC=ACCCATCACAAACCCCAGGGC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=123152249;WS=123152231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	123156761	rs4410972	G	C	2065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=17;PP=1656;SC=AAGTGGTCAGGCATAGCGGCC;SOR=2.129;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=48;TCR=17;TR=64;WE=123156769;WS=123156751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	123170733	rs4837768	C	G	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=28;PP=1173;SC=CTCAACTTCACCTCCTCCTGC;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=46;WE=123170741;WS=123170723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr9	123280950	rs2095064	T	C	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=15;PP=588;SC=AGAAGCAAGATGAGCTAATTT;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=24;WE=123280958;WS=123280940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	123291036	rs4836822	C	G	1360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=8;PP=956;SC=ATCCTCTCTTCAAAGCTGTTT;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=38;WE=123291044;WS=123291026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	123313246	rs954214	T	C	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=771;SC=AGATAGTACATACATTAGTCG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=123313254;WS=123313236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	123330813	rs4837782	T	C	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=27;PP=863;SC=GATTTACTGATTTTGCTCCAG;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=123330821;WS=123330803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	123342259	rs932975	C	A	2570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=64;PP=2016;SC=TCCATCATGGCTACAGAGGTG;SOR=3.373;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=11;TCR=64;TR=75;WE=123342267;WS=123342249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr9	123342275	rs932974	A	G	1758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=42;PP=1311;SC=AGGTGGCGACAGCGTTGGTGT;SOR=3.180;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=8;TCR=42;TR=50;WE=123342283;WS=123342265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	123370345	rs991121	C	G	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=302;SC=ATTAAAAATGCAAAACAACTA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=123370353;WS=123370335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	123374639	rs2416760	T	C	2510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=11;PP=1795;SC=GATTTTTTTTTCCCTCTAAAA;SOR=3.228;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=68;TCF=57;TCR=11;TR=66;WE=123374647;WS=123374629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr9	123476542	rs369989873	ACGGCGG	A	2980.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=51;NR=6;PP=2992;SC=GGCTGAGGCGACGGCGGCGGC;SOR=4.438;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=76;TCF=66;TCR=10;TR=57;WE=123476555;WS=123476532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr9	123550027	rs7026635	G	A	3314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=17;PP=2506;SC=AACCCAAAAAGCAGTTTCAAC;SOR=3.111;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=83;TCR=17;TR=98;WE=123550035;WS=123550017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr9	123583192	rs1060817	A	G	3403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.424;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=38;PP=2741;ReadPosRankSum=-0.682;SC=GCTCCAGTGGATCCCGAGATA;SOR=1.245;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=104;TCF=65;TCR=39;TR=103;WE=123583200;WS=123583182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,107:0.99:108
chr9	123586581	rs35903891	CA	C	138.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=1.157;QD=5.34;ReadPosRankSum=0.542;SOR=0.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr9	123586737	rs10760117	T	G	5615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=84;PP=2965;SC=TGTCAAAGATTAAGATATCCC;SOR=0.705;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=85;TCR=84;TR=168;WE=123586745;WS=123586727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr9	123631642	rs3753029	G	C	2405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=44;PP=1861;SC=TCAACCACCAGGTCCGGGTGG;SOR=0.867;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=42;TCR=44;TR=86;WE=123631650;WS=123631632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr9	123632045	rs1056567	A	G	1303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=15;PP=1021;SC=TGGAGCTCAGACTCTGTGATG;SOR=1.206;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=39;WE=123632053;WS=123632035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	123632829	rs4836833	G	C	2635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=52;PP=2045;SC=GAAAGAGAGGGCCTCGAGGGT;SOR=1.259;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=31;TCR=52;TR=83;WE=123632837;WS=123632819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr9	123636121	rs10985070	C	A	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=173;SC=ATCATCATCACAGGTGGGCTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=123636129;WS=123636111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	123670505	rs7866003	A	T	270.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=226;SC=TATCTAAAAAATTTTTTAACT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=123670513;WS=123670495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	123671520	rs2239657	G	A	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=4;PP=478;SC=TGTTCCGGAAGGGCCACGGCA;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=123671528;WS=123671510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	123673571	rs191920069	C	T	1208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=4;PP=989;SC=TCCTGTGGGGCCTGTTTCCCC;SOR=4.021;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=40;WE=123673579;WS=123673561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr9	123676396	rs2416804	G	C	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=6;PP=312;SC=TTAGTACAAAGGACATCCAGA;SOR=1.061;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=15;WE=123676404;WS=123676386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	123676482	rs2416805	T	C	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=11;PP=894;SC=CCATAGTGGATAGATCTCCTT;SOR=1.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=37;WE=123676490;WS=123676472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	123676699	rs758959	C	T	115.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=89;SC=ACTTTGCACACTGCTGTTCCC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=123676707;WS=123676689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	123751800	rs3764912	A	G	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=270;SC=TAAAAATATTAGTTTAGAATC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=123751808;WS=123751790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	123758425	rs10760134	T	C	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=2;PP=519;SC=TTTTAGACAATTCACTTTCTG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=123758433;WS=123758415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	123760086	rs34704763	AT	A	193.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=6;PP=91;SC=ATCAAAATACATTTTTTTTTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=123760094;WS=123760076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	123762321	rs10733649	G	A	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=0;PP=77;SC=TGGGCGACAGGGCGAGACTCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=123762329;WS=123762311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	123769200	rs17611	C	T	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=14;PP=916;SC=GAAATGCCAACGCCTTGAATT;SOR=1.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=39;WE=123769208;WS=123769190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	123780005	rs25681	G	A	4357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=75;PP=2965;SC=CTGTGACGATGTAATAGACCA;SOR=0.980;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=132;TCF=56;TCR=76;TR=131;WE=123780013;WS=123779995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr9	123787697	rs140753263	T	TACACACAC	591.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=506;SC=AAAGAAAGTATACACACACAC;SOR=3.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=6;WE=123787705;WS=123787687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	123789634	rs2416811	C	T	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=112;SC=TTTGAAATTACGTAAAGCACT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=123789642;WS=123789624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	123800094	rs10818499	T	A	336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=2;PP=305;SC=AGGACAGGGTTATGAAATGAG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=123800102;WS=123800084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	123850770	rs10818503	G	A	2699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=53;PP=2115;SC=GTGTGAGCAAGTTGAGATTGC;SOR=1.637;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=26;TCR=53;TR=79;WE=123850778;WS=123850760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr9	123857085	rs10760146	C	T	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=366;SC=ATCAAACAGACCCTGATGCAC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=123857093;WS=123857077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	123860689	rs10818504	C	T	3721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=85;NR=23;PP=2879;SC=AAGTTGAAACCGCTTCAAGAT;SOR=2.677;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=85;TCR=23;TR=108;WE=123860697;WS=123860679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr9	123888242	rs10760150	G	T	2589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=60;PP=2067;SC=CCTATTTTCCGTAGCTTCATA;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=15;TCR=60;TR=75;WE=123888250;WS=123888232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr9	123908345	rs7023214	G	A	1078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=0;PP=917;SC=AAGGAAGTAAGTGATTTCATA;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=123908353;WS=123908335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	123917020	rs3736855	T	A	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=405;SC=ATGGAAATGTTGAGAGTCTTA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=123917028;WS=123917010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	123917355	rs10818512	A	G	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=18;PP=486;SC=GTGAGAATTTATGCAAGTCAT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=123917363;WS=123917345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	123922729	rs35562325	A	ATGT	313.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=395;SC=AAGGAATATGATATTTTCTGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=123922737;WS=123922719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	123923411	rs139754979	A	AGT	1044.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=1107;SC=AATGTGTGAGAGTGTGTGTGT;SOR=4.479;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=23;WE=123923419;WS=123923401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	123924667	rs10586591	CAT	C	1511.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=31;PP=1394;SC=AACTTGGTATCATAATACATT;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=31;WE=123924676;WS=123924657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	123927477	rs4836841	T	A	2912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=77;PP=2440;SC=ATGAGCATGGTGTTTCTTTCT;SOR=6.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=3;TCR=78;TR=80;WE=123927485;WS=123927467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr9	123928486	rs2273988	T	C	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=9;PP=661;SC=AATATTCTAGTAGTATACTGA;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=24;WE=123928494;WS=123928476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	123928569	rs1535655	G	A	927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=20;PP=720;SC=AGCAGATACCGTAGGGCCATT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=29;WE=123928577;WS=123928559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	123929710	rs10818513	A	G	1500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=6;PP=1204;SC=ATTGGCACTGACCACCTCTAG;SOR=3.564;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=44;WE=123929718;WS=123929700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	123937601	rs3789310	T	C	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=20;PP=639;SC=CTGGAGTGCATTGGTACCATC;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=123937609;WS=123937591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	123939336	rs3838267	T	TA	295.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=316;SC=TCCAAAGAGGTACTCAAATAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=123939344;WS=123939326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	123943884	rs2296078	C	T	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=33;PP=1042;SC=ATTGGAGAACCACAGTTTTCT;SOR=3.967;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=37;WE=123943892;WS=123943874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	123945505	rs3215744	C	CAA	1340.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=5;PP=822;SC=AAAAAAAATGCAAAAAAAAAC;SOR=3.383;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=29;WE=123945513;WS=123945482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	123955756	rs10818516	G	A	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.85;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr9	124043867	rs10985200	C	T	4651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=84;PP=2965;SC=AGACACCTGTCGTCCTCTTAA;SOR=1.076;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=61;TCR=84;TR=145;WE=124043875;WS=124043857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr9	124073176	rs306785	T	C	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=304;SC=CCTGGTCTGATCAGGGACTTG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=124073184;WS=124073166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	124088768	rs306769	T	C	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=4;PP=521;SC=GTCCCTGACTTGCTCTCCTGT;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=124088776;WS=124088758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	124089173	rs216784	C	T	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=440;SC=ACACTTTGCACAGTGGACAGC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=124089181;WS=124089163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	124091135	rs306771	G	A	1238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=2;PP=1030;SC=GGGTGATGGCGTCCCTTGGCA;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=38;WE=124091143;WS=124091125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	124218133	rs3747845	C	T	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=5;PP=255;SC=GAAGAAAAAACAGCAACATTA;SOR=0.836;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=11;WE=124218141;WS=124218123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	124222267	rs2289068	A	G	1907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=1;PP=1576;SC=CTAATATGCTAAGGCTCTTTC;SOR=6.666;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=55;TCF=54;TCR=1;TR=55;WE=124222275;WS=124222263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	124519214	rs55835505	A	G	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=2;PP=215;SC=GGGCACGGCCAGGGCAGATGG;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=124519222;WS=124519204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	124622502	rs4381015	C	A	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=223;SC=ATGTCTAGATCTGATGGCATC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=124622510;WS=124622495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	124632735	rs4384052	C	T	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=4;PP=870;SC=TGGACTCCACCCAGCCCAAAG;SOR=3.500;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=35;WE=124632743;WS=124632725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	124633096	rs4370602	G	A	2693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=71;PP=2225;ReadPosRankSum=-0.841;SC=GAGATTTACAGCCTCCTCGGG;SOR=1.632;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=17;TCR=72;TR=88;WE=124633104;WS=124633086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,89:0.99:90
chr9	124736218	rs35609526	C	T	927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=3;PP=688;SC=CAAGAACTTACCTGCTTAGGA;SOR=2.621;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=124736226;WS=124736208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	124895467	rs12380610	C	T	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=434;SC=CAGGTCCCTCCGATCCCAGAT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=124895475;WS=124895457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	124895500	rs10985546	A	G	341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=284;SC=ACCATTCTTGATTTCTGCTTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=124895508;WS=124895490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	124906723	rs3818638	T	C	999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=27;PP=713;SC=TAACCATCAATGCGCCTCCTG;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=124906731;WS=124906713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	124910582	rs3793616	C	A	2276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=44;PP=1746;SC=GGGTTAGGGGCATCTCTTTGC;SOR=1.643;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=66;WE=124910590;WS=124910572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	124914613	rs4679	C	T	2681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=61;PP=1975;SC=AGAGCATAAACTCCTTGTTGG;SOR=2.503;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=15;TCR=61;TR=76;WE=124914621;WS=124914603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr9	124929006	rs2274747	G	C	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=418;SC=TGATCCTCCAGCTGTCACACA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=124929014;WS=124928996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	124929211	rs1411444	A	G	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=24;PP=799;SC=AGCTGGGGGGACGGATGCTGT;SOR=2.910;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=124929219;WS=124929201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	124976475	rs62574050	C	G	263.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=2;PP=238;SC=CCGGGTCCGGCCCGAGGGGCG;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=124976483;WS=124976465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	124990773	rs113188211	C	CG	666.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=18;PP=691;SC=CGACCCCCCCCCCCCGCTCGC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=18;WE=124990781;WS=124990763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	125133479	rs1236913	T	C	3228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=64;PP=2334;SC=TCTCTTGCTCTGGTTCTTGCT;SOR=1.009;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=49;TCR=64;TR=113;WE=125133487;WS=125133469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr9	125144145	rs1238420	A	G	280.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=231;SC=GGGAGTGGGAAGCTTGTGCCA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=125144153;WS=125144135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	125239176	rs2416862	T	G	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=238;SC=TAGTAGAGACTGGGTTTCGCC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=125239184;WS=125239167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	125239253	rs1962091	T	C	1063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=4;PP=864;SC=TCCCAAAGTGTTGAGATTACA;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=125239261;WS=125239243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	125282393	rs1318392	C	T	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=453;SC=GACATATGTACTGACCTATTT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=125282401;WS=125282383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	125289521	rs10818708	G	A	1880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=44;PP=1489;SC=TGCTCTGGAGGCGCTGATATT;SOR=2.546;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=12;TCR=44;TR=56;WE=125289529;WS=125289511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr9	125315376	rs11412445	C	CT	1148.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.28;QD=30.23;SOR=7.328;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	125316179	rs1341044	T	G	3437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=55;PP=2825;SC=GCTGTGTTTGTCATCTCATCT;SOR=0.896;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=49;TCR=55;TR=103;WE=125316187;WS=125316169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr9	125316567	rs11427164	T	TA	112.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=0;NR=6;PP=110;SC=GTTAGGGATGTAAAAAAAAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=125316575;WS=125316557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	125317424	rs10733658	G	T	2367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=18;PP=1819;SC=AAAAAATGTTGCAGTGATAAC;SOR=2.239;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=48;TCR=18;TR=66;WE=125317432;WS=125317414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr9	125317485	rs10760239	G	T	2663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=36;PP=2047;SC=AAGTTCATCCGGGGCCAAATT;SOR=0.742;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=40;TCR=36;TR=75;WE=125317493;WS=125317475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr9	125317661	rs1041355	A	G	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=410;SC=GAGACAACTAAGGAAACCAGA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=125317669;WS=125317651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	125330125	rs10739614	C	G	2830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=39;PP=2322;SC=GCAGAGAAAACGAGTCACCAA;SOR=0.815;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=46;TCR=39;TR=85;WE=125330133;WS=125330115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr9	125330678	rs10985704	T	G	1756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=41;PP=1470;ReadPosRankSum=-0.841;SC=ACAAAGAGTGTCTTTTGGTCC;SOR=1.085;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=56;TCF=13;TCR=43;TR=54;WE=125330686;WS=125330668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr9	125330739	rs1999182	G	A	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=21;PP=650;SC=CACTGCTGGTGTGGTTGATTC;SOR=4.332;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=125330747;WS=125330729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	125330859	rs1999183	G	A	234.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=166;SC=CTTCTGTTTGGTCACAATTAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=125330867;WS=125330849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	125424507	rs70156	A	C	7267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=109;NR=104;PP=2965;SC=TCTGTGCCTCAAATGTCATCC;SOR=0.777;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=213;TCF=109;TCR=104;TR=213;WE=125424515;WS=125424497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr9	125486968	rs2215530	G	A	2702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=50;PP=2140;SC=CTCTGCAGCCGGGAAGTGGAA;SOR=1.248;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=31;TCR=50;TR=81;WE=125486976;WS=125486958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr9	125512193	rs10760252	C	A	5138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=102;PP=2965;SC=TTCCAACCCTCAGCTGCAGAA;SOR=1.373;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=56;TCR=102;TR=158;WE=125512201;WS=125512183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr9	125512575	rs4838012	G	A	6055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=100;PP=2965;SC=TTGGGTTCTTGCAGCATCTCC;SOR=0.810;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=105;TCR=100;TR=205;WE=125512583;WS=125512565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr9	125512788	rs10818740	G	A	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=1;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.00;QD=76.28;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1:1.00:1
chr9	125512795	rs10818741	G	C	200.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.03;QD=28.69;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	125512826	rs28670025	G	A	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=9;NR=24;PP=896;SC=CTCTGCAGCCGGGAAGTGGAA;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=125512834;WS=125512816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	125612129	rs3049156	CAA	C	997.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=60.47;NF=3;NR=14;PP=726;SC=ACATTAAAAACAAATTAGCTT;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=17;WE=125612138;WS=125612119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	125617391	rs1823448	C	G	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=715;SC=GACTCTGTCTCAATTAAAAAA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=125617404;WS=125617381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	125617413	.	A	G	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.637;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=6.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.22;ReadPosRankSum=3.036;SOR=3.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr9	125620105	rs5900549	C	CA	646.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=0;PP=783;SC=CAAACCACTGCAAATATCCAA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=125620113;WS=125620095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	125637471	rs2596699	A	T	2279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=19;PP=1851;SC=TTCTCTAGGCACTTCAAGTGG;SOR=2.082;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=51;TCR=19;TR=70;WE=125637479;WS=125637461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	125637648	rs2596698	T	C	1864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=47;PP=1584;SC=GGGGTTACACTTATGTAAGAT;SOR=3.180;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=9;TCR=47;TR=56;WE=125637656;WS=125637638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	125652429	rs10818758	A	G	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=422;SC=CAAACAAAACAAAACAGCAAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=125652437;WS=125652419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	125652757	rs10818759	G	A	1696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=36;PP=1391;SC=CCAGTTGACAGTTTACAAGTG;SOR=1.371;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=56;WE=125652765;WS=125652747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	125659520	rs2793005	T	C	1337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=1;PP=1078;SC=ATAGTGATTATTTTTGCACCA;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=39;WE=125659528;WS=125659510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	125673614	rs145697117	C	G	6758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=115;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.863;SC=CAGAGAAATACATGCTTGCTT;SOR=0.458;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=75;TCR=116;TR=190;WE=125673622;WS=125673604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,200:1.00:201
chr9	125797918	rs71989983	CGTGTGTGTGT	C	442.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=4;PP=608;SC=ACGGGGTTCCCGTGTGTGTGT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=4;WE=125797935;WS=125797908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	125861741	rs2302590	A	C	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=4;PP=556;SC=TTGTTGTTTTATATTTGTTTC;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=125861749;WS=125861731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	125878488	rs4836912	G	A	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=391;SC=TTACTGTGACGGTGATCCCAT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=125878496;WS=125878478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	125922854	rs11437080	C	CA	503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=548;SC=ATCAGGCAAACAAAAAAATCA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=17;WE=125922862;WS=125922844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	126028395	rs7863265	C	G	1460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=6;PP=1130;SC=CTGGTCTCTTCCAGTTTCACA;SOR=3.516;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=43;WE=126028403;WS=126028385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr9	126118517	rs72433015	AGCAGAGC	A	1269.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=2;PP=1362;SC=ACAGCAGCCGAGCAGAGCGCA;SOR=4.479;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=22;WE=126118531;WS=126118507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	126125318	rs2808415	C	A	2470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=38;PP=2022;SC=CCAGATCCCACCGGCTTCCGC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=38;TCR=38;TR=76;WE=126125326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr9	126131110	rs2488603	T	C	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=194;SC=GAGCTCTGCCTCCTCCCCACT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=126131118;WS=126131100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	126132329	rs7034379	T	C	1320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=5;PP=1097;SC=AAGTTCTGGGTCAGTACTGTG;SOR=3.417;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=41;WE=126132337;WS=126132319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	126132919	rs33984675	G	A	1840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=25;PP=1420;SC=TCCATCTAGCGACCCTGGAGC;SOR=1.034;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=33;TCR=25;TR=58;WE=126132927;WS=126132909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr9	126133497	rs13290763	C	T	4790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=93;PP=2965;SC=CCAATGACTCCGCAGCTGGCC;SOR=1.360;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=146;TCF=52;TCR=94;TR=145;WE=126133505;WS=126133487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr9	126133547	rs2488602	T	C	2883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=62;PP=2378;SC=CGGGCTGAGGTGCCGGGCAGT;SOR=1.361;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=35;TCR=62;TR=97;WE=126133555;WS=126133537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr9	126135715	rs2488601	A	G	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=6;PP=754;SC=CCCGGCGGCCACCACCTCGCG;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=126135723;WS=126135705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	126139065	rs10760283	G	A	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.6;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=112;SC=TGAGGGCCCCGGCGTCCTCCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=126139073;WS=126139061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	126144746	rs2491348	T	C	1664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=11;PP=1270;SC=CCAGGGAGTTTCCGAGCAGGG;SOR=2.078;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=45;WE=126144766;WS=126144736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr9	126144758	rs2808409	T	C	1848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.97;NF=38;NR=19;PP=1434;SC=CGAGCAGGGCTGAGGGCTTCT;SOR=1.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=38;TCR=19;TR=57;WE=126144766;WS=126144736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr9	126145907	rs2797946	C	A	990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=5;PP=746;SC=GGCCCCCGGCCGATACCCTCC;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=126145915;WS=126145897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	126146197	rs2808411	C	G	1509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=41;PP=1201;SC=TGCGGCCTGTCGGGGACAGAG;SOR=7.658;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=42;WE=126146205;WS=126146187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr9	126202551	rs10739633	A	C	1159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=6;PP=934;SC=AACTGAAATGAAAAACCGTCT;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=37;WE=126202559;WS=126202541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	127088493	.	G	C	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQRankSum=-0.566;QD=19.05;ReadPosRankSum=1.930;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr9	127088498	.	T	C	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=-1.228;QD=11.17;ReadPosRankSum=-2.903;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr9	127088499	.	G	C	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=-1.940;QD=11.70;ReadPosRankSum=-1.857;SOR=0.074;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,4:0.19:21
chr9	127101924	rs10760354	C	T	5090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=81;PP=2965;SC=CATCTGGTCCCTGGGCTGTCT;SOR=0.743;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=162;TCF=81;TCR=81;TR=162;WE=127101932;WS=127101914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr9	127177736	rs2236386	G	C	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=27;PP=909;SC=GGTCGGAGGCGGGTGCAAACA;SOR=2.038;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=37;WE=127177744;WS=127177726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	127215167	rs59108500	C	T	161.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=2;PP=99;SC=GACTCTTGGGCAGGGGAACTC;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=127215175;WS=127215157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	127215344	rs7861556	A	G	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=8;PP=733;SC=CTGGTGTTCGACGAGAGGACG;SOR=1.536;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=27;WE=127215352;WS=127215334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	127215772	rs72616654	C	G	3035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.64;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr9	127215778	rs67997410	C	T	3239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.20;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr9	127220952	rs12347840	T	C	4368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=65;PP=2965;SC=GGGACGTCACTGGAGAGGTCA;SOR=0.792;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=71;TCR=66;TR=136;WE=127220960;WS=127220942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr9	127228596	rs4838184	A	G	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=9;PP=843;SC=GGGCCACCACAGGCTGCTCCG;SOR=2.531;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=40;WE=127228604;WS=127228586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	127228824	rs4838185	T	C	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=12;PP=392;SC=CAGGGCTGCATGCAGTAGTTC;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=127228832;WS=127228814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	127230118	rs10818977	C	T	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=14;PP=756;SC=GGAGAGTTCACCACTGTAGCC;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=26;WE=127230126;WS=127230108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	127230891	rs10760365	G	A	1669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=41;PP=1355;SC=GTGGAGGAAGGTGGTAGCTGT;SOR=2.480;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=53;WE=127230899;WS=127230881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr9	127231774	rs1570580	C	G	1701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=33;PP=1430;SC=CCGCCGTGCCCGCATGTTGAG;SOR=1.047;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=25;TCR=33;TR=58;WE=127231782;WS=127231764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	127255448	rs2297605	G	A	3370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=47;PP=2546;SC=AGAGGCACGCGGGGGGCCGGG;SOR=0.970;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=63;TCR=47;TR=110;WE=127255456;WS=127255438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr9	127495508	rs10760374	C	T	1076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=4;PP=914;SC=TTATCAATGACACCTTAAGTT;SOR=3.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=34;WE=127495516;WS=127495498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	127557152	rs7856071	G	T	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=0;PP=1008;SC=CCACCCGCCTGGGCCTCCCAA;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=35;WE=127557160;WS=127557142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	127561559	rs2281923	C	T	2348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=23;PP=1893;SC=CTGCCCCCTCCGCAGAGCATC;SOR=1.771;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=51;TCR=23;TR=74;WE=127561567;WS=127561549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr9	127563364	rs913231	G	A	2655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=48;PP=1942;SC=GTGAGCAGGTGGAGGAGGCTG;SOR=1.165;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=31;TCR=49;TR=79;WE=127563372;WS=127563354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr9	127563431	rs151217528	A	C	1146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=34;PP=810;SC=ACAGGAGTTGAGAAGTGGGAC;SOR=6.043;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=36;WE=127563439;WS=127563421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	127566378	rs7874348	A	G	2473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=35;PP=1902;SC=TGCAGACAACACCCTCCAGGG;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=45;TCR=35;TR=80;WE=127566386;WS=127566368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr9	127572710	rs7020260	C	G	1926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=54;PP=1634;SC=CTGTGCTCCCCGGAGAGGGGC;SOR=5.283;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=3;TCR=54;TR=57;WE=127572718;WS=127572700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr9	127615705	rs10986467	A	G	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=0;PP=54;SC=CGCCCCGATTACCATGGAGAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=127615713;WS=127615700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	127615976	rs3814132	G	A	3041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=45;PP=1838;SC=TCTGGGCAGTGGCTCAGGACA;SOR=1.134;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=30;TCR=45;TR=75;WE=127615984;WS=127615966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr9	127615995	rs3814131	A	G	2810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=48;PP=1601;SC=CATTGAGTCCAGAGTAGACTT;SOR=1.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=19;TCR=48;TR=67;WE=127616003;WS=127615985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr9	127616323	rs10760380	G	C	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=1;PP=554;SC=TACGGGACTCGAGAGAGGGCC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=127616331;WS=127616320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	127616537	rs12375547	A	G	3423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=71;PP=2658;SC=CAGGCTCAGAAGATGGCTGCG;SOR=1.699;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=32;TCR=71;TR=103;WE=127616545;WS=127616527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr9	127618776	rs2274970	A	G	1802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=22;PP=1402;SC=TCCACCGTACACATCTGGGAC;SOR=1.539;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=41;TCR=22;TR=63;WE=127618784;WS=127618766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	127618839	rs10760381	C	G	2518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=34;PP=1833;SC=GGACACAGTGCCAACATCAGC;SOR=0.995;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=44;TCR=34;TR=77;WE=127618847;WS=127618829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr9	127619625	rs35041146	G	GC	1164.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=8;PP=1089;SC=TTCCTGACATGCCCCCCTCCT;SOR=2.494;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=31;WE=127619633;WS=127619615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	127619922	rs944952	T	C	2319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=54;PP=1910;SC=CCAACCACCTTAGATGGTGCC;SOR=2.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=14;TCR=54;TR=68;WE=127619930;WS=127619912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr9	127620480	rs10593927	CAT	C	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=161;SC=GCAGGCCACACATGTCACTAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=127620489;WS=127620470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	127637215	rs581558	T	G	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=457;SC=GGCGGTGCCTTCGCAGCTCTG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=127637223;WS=127637205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	127643456	rs687434	T	C	3036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=26;PP=2370;SC=CTACCTTATATTCCAGAGTTT;SOR=1.872;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=64;TCR=26;TR=90;WE=127643464;WS=127643446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr9	127643989	rs3214725	T	TG	1643.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=5;PP=1780;SC=AGAAAGGGGCTGGGCAGGGGT;SOR=3.745;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=46;TCF=41;TCR=5;TR=42;WE=127643997;WS=127643979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr9	127644882	rs596231	G	A	3119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=60;PP=2470;SC=AAAGCCAATCGTTAGATGCAT;SOR=1.225;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=38;TCR=60;TR=98;WE=127644890;WS=127644872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr9	127652621	rs622280	G	A	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=485;SC=CCTGCTGCCTGTGGGACTGCA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=127652629;WS=127652611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	127661521	rs750884	T	C	1370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.27;SOR=4.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	127661526	rs750883	A	C	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.46;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	127661645	rs634710	G	A	2575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=50;PP=2029;SC=AGCTGCCCGCGTTCTCTCCAG;SOR=1.065;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=35;TCR=50;TR=85;WE=127661653;WS=127661635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr9	127674200	rs583134	A	C	3176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=38;PP=2348;SC=AGTTCTTGCAAGTGTTCTTCT;SOR=1.158;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=60;TCR=38;TR=98;WE=127674208;WS=127674190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr9	127818276	rs589292	C	T	3048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=74;PP=2426;ReadPosRankSum=-0.729;SC=TCTTTAAGAGCAAATTCAGTC;SOR=1.075;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=25;TCR=76;TR=99;WE=127818284;WS=127818266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr9	127904740	rs974826	G	C	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=655;SC=ATCGACTGTAGAGGTAGTAAT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=127904748;WS=127904730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	127923013	rs4837010	TG	CT	503.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=483;ReadPosRankSum=-0.726;SC=TTTAATATACTGAAATAGGGA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=10;WE=127923022;WS=127923003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,12:0.92:13
chr9	127951334	.	G	C	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=24;PP=791;SC=ATTCACCTCTGAATTAGCAAA;SOR=3.477;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=127951342;WS=127951324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	127951863	rs466994	G	A	1562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=7;PP=1337;SC=CTGGAGAAAGGAAGGGCCGGC;SOR=3.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=50;WE=127951871;WS=127951853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr9	127962916	rs501963	G	A	3541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=10;PP=2965;SC=GGTCTATCACGGTCTCGGGCA;SOR=4.407;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=97;TCR=10;TR=107;WE=127962924;WS=127962906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr9	127969785	rs420423	G	A	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=10;PP=1282;SC=AATGGAAAGAGCACACTACTG;SOR=2.560;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=47;WE=127969793;WS=127969775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	127975583	rs359588	T	C	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=5;PP=586;SC=ATGACCCTCCTCAAGTGTGCC;SOR=1.931;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=127975591;WS=127975573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	128069955	rs41306461	C	T	3157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=20;PP=2453;SC=AGCTAATGTTCTTTGCTTTTG;SOR=2.380;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=66;TCR=20;TR=86;WE=128069963;WS=128069945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr9	128074807	rs432757	T	C	2945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=36;PP=2416;SC=AAGAAACCATTCAGGAGGTGC;SOR=0.990;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=49;TCR=36;TR=85;WE=128074815;WS=128074797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr9	128201098	rs7864593	A	G	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=2;PP=504;SC=CACCGGGTGGACTCTAGGGCA;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=128201106;WS=128201088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	128206717	rs907501	C	G	1729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=1;PP=1440;SC=GGCCATGCCGCAAACAGCCTG;SOR=6.439;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=48;TCF=47;TCR=1;TR=47;WE=128206725;WS=128206707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr9	128209870	rs10986761	G	C	256.96	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5731;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=151;ReadPosRankSum=-0.524;SC=CTCGCTAGCAGCCCTGTTTCG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=128209878;WS=128209860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr9	128246786	rs2070113	G	A	1839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=22;PP=1412;ReadPosRankSum=1.451;SC=ACTTGTAATGGTGGCTGCTAA;SOR=0.446;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=57;WE=128246794;WS=128246776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr9	128711809	rs13298715	A	G	1628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=44;PP=1313;SC=TATACTGTGTATATATATATA;SOR=4.977;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=47;WE=128711817;WS=128711799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr9	128724304	rs888230	A	C	971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=5;PP=798;SC=ACTTTTTCTCATCTCCCTGCC;SOR=2.765;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=31;WE=128724312;WS=128724294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	129097817	rs1230752	G	A	285.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=7;PP=206;SC=CCTTGCTTGCGATTTGCCAGC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=129097825;WS=129097807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	129183952	rs147012800	TC	T	524.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.7410;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=493;ReadPosRankSum=-1.431;SC=ACTTCCAAATTCCTTGAGAGG;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=14;WE=129183960;WS=129183942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr9	129184091	rs2286888	T	C	3882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.755;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.98;MQRankSum=-0.062;NF=88;NR=38;PP=2965;ReadPosRankSum=0.748;SC=TCTTGGGGAATGCTCCTTGTA;SOR=1.758;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=89;TCR=39;TR=126;WE=129184099;WS=129184081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,132:0.99:134
chr9	129246177	rs2286886	T	C	3272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=34;PP=2569;SC=GGTGTTACCATTGTCATGCAT;SOR=1.566;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=69;TCR=34;TR=103;WE=129246185;WS=129246167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr9	129595895	rs3118994	T	C	4588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=73;PP=2965;ReadPosRankSum=0.592;SC=TCTCAGCCACTGACAAGCTGT;SOR=0.228;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=73;TCR=74;TR=146;WE=129595903;WS=129595885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,157:0.99:158
chr9	129831659	rs1281158	T	A	5613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=115;PP=2965;SC=TTGGCTTATTTTTTTTTAAGA;SOR=1.661;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=58;TCR=115;TR=173;WE=129831667;WS=129831649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr9	129928600	rs946430	A	C	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=18;PP=558;SC=ATTTTAATATATCGAGCATCA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=129928608;WS=129928590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	130073842	rs181246481	C	G	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=4;PP=1254;SC=GTTCTTTGGCCGCTGGTTCAT;SOR=4.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=47;TCR=4;TR=51;WE=130073850;WS=130073832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr9	130075672	rs2779714	C	T	1626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=4;PP=1389;SC=CCATCTGTGGCTGGCAGGATC;SOR=4.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=46;TCR=4;TR=50;WE=130075680;WS=130075662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr9	130100305	rs3802370	G	A	2614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=9;PP=2220;SC=AGCGCTGGTCGAGAATGACTC;SOR=3.994;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=72;TCR=9;TR=80;WE=130100313;WS=130100295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr9	130106778	rs7863063	C	T	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=386;SC=TTTTGAGAACCGAGTAGGTGC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=130106786;WS=130106768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	130117861	rs58473776	C	A	904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=723;SC=TGTTTAGTAGCCAACTAGGGA;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=130117869;WS=130117851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	130149403	rs4837149	G	A	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=300;SC=TGCAGTGATGGCAGGAGGGCC;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=130149411;WS=130149393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	130155257	rs4074695	T	G	291.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=242;SC=GAGGGTTTGGTGAGCCAAACT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=130155265;WS=130155247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	130155331	rs7864853	A	G	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=3;PP=837;SC=GTACTCCCAAAGATCCTCTTA;SOR=3.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=130155339;WS=130155321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	130160769	rs10987633	G	A	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=209;SC=TTTCATCCCTGGCTTCGGGTC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=130160777;WS=130160759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	130164818	rs3802367	T	C	203.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=143;SC=GCCAGCCTCCTCCACCCACCC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=130164826;WS=130164808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	130165973	rs34064803	T	C	3096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.083;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=18;PP=2472;ReadPosRankSum=1.150;SC=CAGCCCGGCATCTACAAGCCC;SOR=2.072;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=83;TCR=19;TR=99;WE=130165981;WS=130165963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,102:0.97:105
chr9	130166382	rs10819287	C	G	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=23;PP=951;SC=CCCCGCCATGCGGGGGAGGGC;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=36;WE=130166390;WS=130166372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	130167338	rs41302651	C	T	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=28;PP=836;SC=TGTGGCGGCTCCCGGCAGGTG;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=130167346;WS=130167328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	130167390	rs3824413	C	T	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=13;PP=412;SC=AAGTTCCAAGCTCTGCATTTC;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=130167398;WS=130167380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	130168020	.	G	C	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=17;PP=596;SC=GGCTAGGCCAGATGGGGAACC;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=130168028;WS=130168010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	130168326	rs10987637	C	T	1303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.435;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=34;PP=1039;ReadPosRankSum=0.842;SC=TGCCTTCTCACGGATGGACTG;SOR=2.526;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=43;WE=130168334;WS=130168316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr9	130169301	rs4075850	G	A	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=136;SC=TCAGGGGACTGGACCCCCTGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=130169309;WS=130169291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	130169874	rs6635	A	G	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=34;PP=1103;SC=CTGGGCATTCAGTCGCTCCTC;SOR=3.564;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=40;WE=130169882;WS=130169864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	130243534	rs371152397	AT	A	102.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=2.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQRankSum=0.786;QD=3.54;ReadPosRankSum=0.703;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr9	130269786	rs2245051	A	G	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=424;SC=CTGCTCAAAGAAGACCCGTCT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=130269794;WS=130269776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	130287287	rs3765602	C	A	2084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=4;PP=1749;SC=CCCTGGCCAGCTCCAGATGCC;SOR=4.943;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=59;TCR=4;TR=63;WE=130287295;WS=130287277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr9	130341095	rs4240419	C	T	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=6;PP=903;SC=ATGATCATTCCGCTGCACTCC;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=31;WE=130341103;WS=130341085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	130341253	rs4240420	A	G	2599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=62;PP=2079;SC=AGGGACCGGAACTGGCCCAGT;SOR=2.219;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=19;TCR=62;TR=81;WE=130341261;WS=130341243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr9	130423271	rs372510099	CA	C	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=11.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQRankSum=0.052;QD=2.16;ReadPosRankSum=-0.624;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr9	130446493	rs4836575	A	G	289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=278;SC=ATGTGTGTTCATGCGCGCTTG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=130446501;WS=130446483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	130457332	rs138071672	T	TTGA	1791.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.586;NF=0;NR=40;PP=1918;ReadPosRankSum=-0.463;SC=GGCTCAGCCATTGATGATGAT;SOR=6.229;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=134;TCF=1;TCR=133;TR=40;WE=130457340;WS=130457322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr9	130475011	rs522328	T	C	4605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=79;PP=2965;SC=AAGAGGACAGTGACGTTGACG;SOR=0.841;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=71;TCR=79;TR=150;WE=130475019;WS=130475001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr9	130475442	rs497632	A	C	3378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=70;PP=2727;SC=CTGCTGTCATATATCACCCGT;SOR=1.879;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=30;TCR=70;TR=100;WE=130475450;WS=130475432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr9	130477160	rs550045	G	A	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=373;SC=AGGTGAACCCGCGGATCTGTC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=130477168;WS=130477150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	130477768	rs504434	G	A	4976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=63;PP=2965;SC=GGACATAATGGCCGAACTGAA;SOR=1.051;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=89;TCR=63;TR=151;WE=130477776;WS=130477758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr9	130485618	rs537881	G	A	4419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=89;PP=2965;SC=TTCCGGTACTGCATGGGAAGG;SOR=1.163;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=59;TCR=90;TR=148;WE=130485626;WS=130485608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr9	130486384	rs836333	C	T	1432.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=4;PP=639;SC=CCGTCTCCCACGCCCCCCCCG;SOR=2.833;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=27;WE=130486393;WS=130486374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	130486385	rs35761147	G	GC	1423.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=5;PP=546;SC=CGTCTCCCACGCCCCCCCCGA;SOR=2.833;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=24;WE=130486393;WS=130486374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	130486915	rs2256139	T	C	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=7;PP=812;SC=GGACGGAGACTGCGGCGGGGG;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=130486923;WS=130486905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	130488494	rs538927	C	T	1268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=13;PP=1065;SC=CTCATAGCAGCTTGGGACCCA;SOR=1.845;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=42;WE=130488502;WS=130488484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	130489189	rs578997	C	T	1764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=13;PP=1361;SC=AGGGCAGCATCGTGCTGTCTG;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=40;TCR=13;TR=53;WE=130489197;WS=130489179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr9	130489558	rs472144	A	G	1135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=18;PP=943;SC=GGATGCTTAAACGGCACGAGT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=18;TCR=18;TR=36;WE=130489566;WS=130489548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	130489743	rs13298768	A	G	3203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=44;PP=2407;SC=GAGAAAAAAGAGGTAAGTGGA;SOR=0.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=52;TCR=44;TR=96;WE=130489751;WS=130489733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr9	130491726	rs555022	T	C	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=402;SC=CCCACCCCACTCTAACCTGGC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=130491734;WS=130491716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	130491998	rs557630	A	G	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=28;PP=784;SC=GCAGCAGGGTAGTCAAAGCTC;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=130492006;WS=130491988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	130492039	rs557749	G	A	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=24;PP=620;SC=CTAGGTGTGCGTTCGGCCCCG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=130492047;WS=130492029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	130493513	rs482095	A	G	3837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=64;PP=2965;SC=GCCTCAGCAAAACTGAGTATG;SOR=1.081;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=44;TCR=64;TR=108;WE=130493521;WS=130493503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr9	130493724	rs505268	C	T	1953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=50;PP=1604;ReadPosRankSum=-0.747;SC=GGGGAGGGGACGAGTTCTACC;SOR=1.578;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=10;TCR=51;TR=60;WE=130493732;WS=130493714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr9	130494667	rs534652	G	A	141.10	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.680;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=143;ReadPosRankSum=0.180;SC=TCCCTCAGCCGCCTTCTGGGT;SOR=1.108;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=6;WE=130494675;WS=130494657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr9	130494811	rs515182	T	C	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=5;PP=677;SC=GGGGTGAAGCTGCCCGGGAGG;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=130494819;WS=130494801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	130494957	rs538066	T	C	3383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=50;PP=2487;SC=TTGATCTGCTTGCCACCCGTG;SOR=0.978;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=117;TCF=66;TCR=51;TR=115;WE=130494965;WS=130494947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr9	130495633	rs564754	C	G	3587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=66;PP=2906;SC=AGTGGCCCCCCCACTGTGCCC;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=52;TCR=66;TR=117;WE=130495641;WS=130495623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr9	130495890	rs3739812	A	C	115.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=3;PP=59;SC=CTCCCCCAACACCAGACCTCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=130495898;WS=130495880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	130496415	rs482712	G	A	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=322;SC=TCCCTGCCAGGTAGAATGACA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=130496423;WS=130496409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	130504070	rs514024	G	A	1428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=9;PP=1218;SC=TCAGTACCTGGGCCATGTCCA;SOR=2.461;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=44;WE=130504078;WS=130504060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr9	130524817	rs3962613	C	T	2611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=70;PP=2111;SC=GCCAAAAACCCTGTGGTCCTT;SOR=5.421;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=4;TCR=70;TR=74;WE=130524825;WS=130524807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr9	130566458	rs144794595	G	A	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=3;PP=749;SC=AGGCGGGCCTGGTACTGGCCT;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=28;WE=130566466;WS=130566448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	130630233	rs4226	G	T	1359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=11;PP=1087;SC=GGAGGACCTCGAATCAGGACG;SOR=1.954;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=42;WE=130630241;WS=130630223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	130630639	rs913986	A	G	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=10;PP=582;SC=AGGCGATGACAGGTTCTGTGG;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=24;WE=130630647;WS=130630629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	130635540	rs2767398	A	G	2154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=15;PP=1773;SC=GTCAGGGAAGAGAGGGTGCTC;SOR=2.566;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=51;TCR=15;TR=66;WE=130635548;WS=130635530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	130648680	rs913983	G	A	3794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=24;PP=2885;SC=CTGATTAACCGCATAGACTCC;SOR=2.527;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=86;TCR=24;TR=110;WE=130648688;WS=130648670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr9	130649111	rs4837202	G	A	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=28;PP=881;SC=GGTGAGCGCTGGCAGGGTCCT;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=130649119;WS=130649101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	130657020	rs5900777	GC	G	1527.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=44;PP=1695;SC=CAGGCTCAGCGCCCCCACCTC;SOR=4.407;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=2;TCR=49;TR=46;WE=130657028;WS=130657010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr9	130670652	rs1043012	A	G	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=0;PP=508;SC=CGGCATGGCGACTGGCAGGAC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=18;WE=130670660;WS=130670642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	130670903	rs10760511	C	A	1382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=38;PP=1120;SC=AGAACCCACTCGCCTCCGGCC;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=38;WE=130670911;WS=130670893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	130672106	rs7026378	A	G	1416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=4;PP=1181;SC=TATCTGTGCTATGGTCACCCA;SOR=3.816;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=43;WE=130672114;WS=130672096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	130672221	rs10739700	C	T	4621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=47;PP=2965;SC=CCGGCCTGGCCGGTCTGACCT;SOR=1.483;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=95;TCR=47;TR=142;WE=130672229;WS=130672211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr9	130676889	rs140320826	C	G	1602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=18;PP=1201;SC=TTGGGACAAGCCCAGCTCTCA;SOR=1.287;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=33;TCR=18;TR=51;WE=130676897;WS=130676879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	130690412	rs10760515	G	C	1522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=24;PP=1200;SC=CGGGGCCCAGGGCAGCCTGAT;SOR=0.770;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=27;TCR=24;TR=51;WE=130690420;WS=130690402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr9	130698029	rs7997	G	C	2042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=21;PP=1588;ReadPosRankSum=-0.932;SC=CACTCTCTTGGTCTTCAGCAT;SOR=0.739;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=45;TCR=21;TR=65;WE=130698051;WS=130698019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr9	130698043	rs6781	A	G	2139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=30;PP=1585;SC=TCAGCATCACATAGGAGATGA;SOR=1.164;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=44;TCR=30;TR=74;WE=130698051;WS=130698019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr9	130699917	rs2274424	G	A	3115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=35;PP=2430;SC=AGATGGTAGAGGGCTGACTAG;SOR=1.345;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=61;TCR=35;TR=95;WE=130699925;WS=130699907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr9	130700251	rs6478802	T	C	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=473;SC=CGCCTCCTCTTCTTTGCATAT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=130700259;WS=130700241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	130707081	rs2274426	A	G	3928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=54;PP=2937;SC=CATCTGTGAAATCCTGGCTCT;SOR=0.916;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=67;TCR=54;TR=121;WE=130707089;WS=130707071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr9	130710726	rs4837212	A	G	2717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=65;PP=2117;ReadPosRankSum=-0.757;SC=CTATGCCCTGACCACCCACAG;SOR=1.287;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=21;TCR=66;TR=86;WE=130710734;WS=130710716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,87:0.99:88
chr9	130710791	rs4837213	T	C	1076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=39;PP=870;SC=CAGAAGGGCTTGGATTCCAAT;SOR=5.186;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=41;WE=130710799;WS=130710781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	130715922	rs2417062	A	G	3989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=87;PP=2965;SC=AGTTGACTGCAGAATCCCAGG;SOR=1.683;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=40;TCR=87;TR=127;WE=130715930;WS=130715912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr9	130829039	rs1539350	A	G	2386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=47;NR=34;PP=1837;SC=GGCCACCGCCACCACTGCCAC;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=47;TCR=34;TR=81;WE=130829047;WS=130829029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr9	130854127	rs10739712	A	G	289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=257;SC=AGTCGCCATCAGAGGCGTTTG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=130854135;WS=130854117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	130860866	rs947624	T	C	3757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=39;PP=2835;SC=TGTGCCTGTATGTGCCGGTCA;SOR=1.746;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=125;TCF=84;TCR=41;TR=123;WE=130860874;WS=130860856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr9	130861039	rs947623	A	G	2221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=57;PP=1724;SC=GGAGAGGCGCATTCAACCGGT;SOR=3.458;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=10;TCR=58;TR=67;WE=130861047;WS=130861029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr9	130864676	rs7859709	T	C	3359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=45;PP=2359;SC=CGATGACCATTGACTGGAACG;SOR=1.015;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=62;TCR=45;TR=107;WE=130864684;WS=130864666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr9	130868312	rs7864867	G	C	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=15;PP=774;SC=GGCTCACCACGAGTTCCTTAC;SOR=0.997;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=27;WE=130868320;WS=130868302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	130868831	rs1418420	T	C	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=20;PP=639;SC=TTTAGAAACCTCCTCCCAGCA;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=130868839;WS=130868821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	130869499	rs4837239	A	T	2315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=40;PP=1841;SC=GGTCGGGGGGAGCGGACAGAA;SOR=0.818;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=80;TCF=40;TCR=40;TR=75;WE=130869507;WS=130869489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr9	130883511	rs2040004	C	T	2213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=13;PP=1747;SC=GGTCATCGAACGCATCCAGCC;SOR=2.932;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=57;TCR=13;TR=70;WE=130883519;WS=130883501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	130886906	rs4837241	A	G	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=23;PP=698;SC=TTAACAAGACACTCTGGGCAT;SOR=2.985;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=28;WE=130886914;WS=130886896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	130889571	rs4837242	A	G	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=2;PP=712;SC=TTTTACACAAAAGAATACAGA;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=130889579;WS=130889561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	130889600	rs4837243	C	T	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=2;PP=862;SC=AGACTTCAGACCAAGTCACTC;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=32;WE=130889608;WS=130889590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	130889705	rs4837244	G	A	2322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=45;PP=1864;SC=TCCCCGGCCGGGCCAGGCCTT;SOR=1.121;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=30;TCR=45;TR=75;WE=130889713;WS=130889695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr9	130890449	rs11283643	A	AGGTGCGCGGC	5142.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=58;NR=5;PP=2900;SC=ACCCGGCACCAGGTGTTGCGG;SOR=4.701;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=85;TCF=71;TCR=14;TR=63;WE=130890457;WS=130890439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr9	130914170	rs11794980	C	G	1067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=12;PP=802;SC=GACCCCTCACCGTCCACGCCT;SOR=1.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=36;WE=130914178;WS=130914160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	130914434	rs2232629	A	G	1759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=30;PP=1407;SC=GGTGTCTGCCAGCCACTCACT;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=33;TCR=30;TR=63;WE=130914442;WS=130914424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr9	130922952	rs1539351	G	C	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=31;PP=1177;SC=CCCCGTGAGAGCTGCAGGTCA;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=42;WE=130922960;WS=130922942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	130932373	rs45611034	T	G	2527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=31;PP=1900;SC=CACCAGCGCCTTGGTGGAGGC;SOR=1.312;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=52;TCR=31;TR=83;WE=130932381;WS=130932363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr9	130932396	rs144699223	AAC	A	3780.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=32;PP=2967;SC=CCTGAATGACAACAGTCAAAG;SOR=1.127;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=71;TCF=36;TCR=35;TR=67;WE=130932405;WS=130932386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr9	130940121	rs4075428	G	A	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=21;PP=594;SC=ATCTGCCAACGTTGTCTCATC;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=130940129;WS=130940111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	130940630	rs45497192	A	G	4682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=41;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.776;SC=ACACTGCCACATCAGGGCCTC;SOR=1.083;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=125;TCR=41;TR=165;WE=130940638;WS=130940620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,165:0.99:166
chr9	130940822	rs3892074	C	T	2656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=76;PP=2339;SC=CAAGAGCTGCCTTCTCCGTCC;SOR=5.943;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=79;TCF=3;TCR=76;TR=79;WE=130940830;WS=130940812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr9	130942972	rs45585631	T	C	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=7;PP=666;SC=CATGTCCCTCTGAAGGGCCAG;SOR=2.226;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=25;WE=130942980;WS=130942962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	130980937	rs2229917	G	A	3634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=79;PP=2865;SC=TCGAGGCCGAGACCGACAGGG;SOR=1.843;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=31;TCR=79;TR=110;WE=130980945;WS=130980927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr9	130981064	rs3003602	C	T	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=20;PP=611;SC=TGGCCACGCACCTCTGCGTGC;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=130981072;WS=130981054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	130988615	rs77264652	C	A	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=497;SC=GCACTCATGACCCCTCCAGGC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=130988623;WS=130988605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	130994179	rs3003578	C	T	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=267;SC=GCTCCAGGGGCTGTGTCCCTG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=130994187;WS=130994169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	131015279	rs2267958	G	A	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=7;PP=620;SC=CTCACAGCATGTGTGTGCACG;SOR=1.893;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=25;WE=131015287;WS=131015269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	131085373	rs3003601	G	C	1878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=56;PP=1478;SC=CTGCAGAAAGGGCTGTTGGCC;SOR=2.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=13;TCR=56;TR=69;WE=131085381;WS=131085363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr9	131105718	rs147659704	C	A	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=379;SC=TGCTCCACACCCGTACCCTGG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=131105726;WS=131105708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	131193665	rs1009850	A	C	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=28;PP=794;SC=TGAACGAGTGAGTGAATGAAG;SOR=2.531;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=37;WE=131193673;WS=131193655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	131218213	rs10819384	G	A	694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=512;SC=GGCGAGACCCGGCCAGGCCCG;SOR=3.258;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=131218221;WS=131218203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	131222541	rs6478832	A	G	1298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=28;PP=1047;SC=CAGCCCTAAGAACCCTGGGGC;SOR=2.133;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=38;WE=131222549;WS=131222531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	131235321	rs4512487	A	G	1396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=39;PP=1178;SC=AGCTGAAAACAGTAGGTGGCA;SOR=4.664;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=42;WE=131235329;WS=131235311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	131245175	.	CTT	C	121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;ClippingRankSum=-0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQRankSum=2.308;QD=9.36;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
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chr9	131255236	rs62584804	C	T	3013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=81;PP=2482;SC=TCCACTCTACCCTGTGCCTCT;SOR=6.736;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=84;TCF=2;TCR=82;TR=83;WE=131255244;WS=131255226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr9	131287352	rs10988014	C	T	1148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=1;PP=878;SC=AGTATCAATTCGTTGAATGTG;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=131287360;WS=131287342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	131300143	rs7048583	G	A	566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=1;PP=448;SC=CTGCCCTGTGGCAGGTGCTAG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=131300151;WS=131300133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	131331320	rs2152833	C	T	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=382;SC=AGAAGTTACCCGAATCCTGCC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=131331328;WS=131331310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	131337389	rs2297768	C	T	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=674;ReadPosRankSum=0.000;SC=AACATGGCTCCGTCCCTAATG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=24;WE=131337397;WS=131337379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr9	131337661	rs2297769	A	C	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=35;PP=1088;SC=TCACAACATTATTATGTTAAC;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=37;WE=131337669;WS=131337651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr9	131340306	rs4837280	A	G	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=1;PP=691;SC=ATTTGAGAACATAGAATTCAG;SOR=5.421;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=31;WE=131340314;WS=131340296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	131340639	rs1890103	T	C	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=26;PP=834;SC=TCACAGGTGTTTCTCATCATG;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=131340647;WS=131340629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	131344607	rs5900808	GA	G	161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=199;SC=AAAGTTATGAGAAAAAATGTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=131344615;WS=131344600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	131346218	rs10760566	A	C	3171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=69;PP=2711;SC=AGAAACATGCACTGCTAGAGG;SOR=2.204;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=24;TCR=69;TR=93;WE=131346226;WS=131346208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr9	131346479	rs4240431	A	G	3386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=79;NR=15;PP=2616;SC=TCAGGAATGGAAAAAAGACCT;SOR=2.925;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=79;TCR=15;TR=94;WE=131346487;WS=131346469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr9	131347165	rs4836615	G	A	1854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.13;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	131347169	rs4837284	C	T	1829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.74;SOR=4.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr9	131350112	rs4837286	A	G	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=10;PP=304;SC=CAGAGTTTAAAATAAGATTTA;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=131350120;WS=131350102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	131360750	rs2227864	C	T	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=8;PP=572;SC=CTGAAGGTCTCATGGCAGAGG;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=131360758;WS=131360740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	131374165	rs7024498	C	G	1603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=45;PP=1495;SC=AGGAAGATGACCACCGTCACT;SOR=4.849;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=48;WE=131374173;WS=131374155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	131375701	rs1415568	A	G	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=32;PP=1094;SC=GCAAAGACCTAGCTTCTGTGA;SOR=2.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=41;WE=131375709;WS=131375691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	131379967	rs2227862	C	T	1435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=25;PP=1226;SC=GGGACCTAACCGGCGTGCAGA;SOR=0.780;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=21;TCR=25;TR=46;WE=131379975;WS=131379957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	131380149	rs3750332	C	G	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=11;PP=557;SC=GTTCATGACCCCTCAGTCCAA;SOR=0.874;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=22;WE=131380157;WS=131380139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	131380994	rs4837290	T	C	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=2;PP=727;SC=GATCTCCTGATCTCGTGATCT;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=131381002;WS=131380985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	131388643	rs3737308	C	T	1116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=1;PP=852;SC=CTGGCGACTCCGCCAACTCAG;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=131388651;WS=131388633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	131389060	rs10694437	C	CAA	989.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=16;PP=849;SC=CACGACAAGACGAGCAGGATG;SOR=2.400;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=18;WE=131389068;WS=131389050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	131392522	rs41308912	C	T	1485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=26;PP=1096;SC=AGGCATTGCTCTCTCTGAGAG;SOR=1.464;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=41;WE=131392530;WS=131392512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	131392553	rs7866175	G	A	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=21;PP=644;SC=CTGAGCTCTCGGCCAGCTGGG;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=131392561;WS=131392543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	131397479	rs4837291	G	A	1673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=17;PP=1329;SC=CCTTCCCGTCGGTGGCCACAC;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=51;WE=131397487;WS=131397469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	131398343	rs947182	T	A	282.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=3;PP=233;SC=CACAGCCCCCTGTCCTGGCCC;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=131398351;WS=131398333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	131398636	rs10760570	C	T	1615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=26;PP=1234;SC=CGGCCGACGGCTGCTGGGGAC;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=26;TCR=26;TR=52;WE=131398644;WS=131398626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	131403096	rs2298045	A	G	3588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=78;PP=2722;SC=TGGGTATGTCATACTGGGACG;SOR=1.817;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=111;TCF=32;TCR=79;TR=110;WE=131403104;WS=131403086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr9	131418828	rs4837292	A	C	399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=3;PP=300;SC=ACCGTCTCCCAGCGGATGCCC;SOR=1.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=131418836;WS=131418818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	131452121	.	C	CG	85	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=80;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=85;QD=38.0;SC=GCCTGGGTGGCCCGCGCCGCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=131452129;WS=131452111;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	131452137	.	C	CG	53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=91;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=53;QD=26.3333333333;SC=CCGCGGCGGCCGCGCTGCGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=131452145;WS=131452127;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	131453331	rs4837293	G	A	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=10;PP=790;SC=TGGAACGCTTGCCTTTGTACT;SOR=1.681;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=32;WE=131453339;WS=131453321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	131455760	rs10739728	C	T	1312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=0;PP=1083;SC=CTACCTGCTGCACAGTTTTAT;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=39;WE=131455768;WS=131455750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr9	131455903	rs4836618	C	T	3729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=69;PP=2807;SC=AAAGCTCTTCCGGTATTCATT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=35;TCR=69;TR=104;WE=131455911;WS=131455893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr9	131456385	rs10637043	G	GTA	1165.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=26;PP=1387;ReadPosRankSum=-1.398;SC=ATTTTGGGGTGTATATATATA;SOR=0.963;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=62;TCF=9;TCR=53;TR=30;WE=131456394;WS=131456375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,37:0.80:46
chr9	131465167	rs1572915	A	G	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=16;PP=600;SC=TGGCTGAGAGAAGGGCCCCAA;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=131465175;WS=131465157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	131467969	rs56408416	G	A	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=3;PP=560;SC=TGGGGGTCTCGGCTCTGGGTG;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=131467977;WS=131467959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	131468251	rs1572916	T	C	1991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=49;PP=1601;SC=GAGACACCATTCCAGCCTGCA;SOR=2.797;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=11;TCR=49;TR=60;WE=131468259;WS=131468241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr9	131475895	rs12932	G	T	4096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=88;PP=2965;SC=CCTCAGCCTGGTACCGCAGGG;SOR=1.839;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=39;TCR=88;TR=127;WE=131475903;WS=131475885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr9	131475951	rs4837297	T	C	1532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=49;PP=1221;SC=TCTGACTTGGTGGGACCCTGG;SOR=4.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=4;TCR=49;TR=53;WE=131475959;WS=131475941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	131477544	rs7854055	G	A	2593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=37;PP=1974;SC=GGTATGGGACGGGATTGGGGG;SOR=0.846;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=41;TCR=37;TR=78;WE=131477552;WS=131477534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr9	131479023	rs10739729	T	C	3307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=45;PP=2754;SC=CTCTCTCCTGTAGCCTGTACT;SOR=0.884;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=55;TCR=45;TR=100;WE=131479031;WS=131479013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr9	131482467	rs3750325	T	C	1957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=18;PP=1485;SC=AGTGAGCGCCTGTCCTATTGC;SOR=1.721;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=44;TCR=19;TR=62;WE=131482475;WS=131482457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr9	131483749	rs2900268	T	A	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=23;PP=1190;SC=CCGCAACCACTGACCCCAGGG;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=19;TCR=23;TR=42;WE=131483757;WS=131483739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	131502112	rs2298044	A	G	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=333;SC=GACCAGAAGGAAGGTGGGAGC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=131502120;WS=131502110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	131502440	rs3818931	G	C	1757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=34;PP=1263;SC=CACTCCCCCAGTTTCTCTTCA;SOR=2.024;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=48;WE=131502448;WS=131502430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	131502460	rs7027146	G	T	1285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=30;PP=910;SC=AGATACCAGCGGCAGGACCCC;SOR=3.664;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=34;WE=131502468;WS=131502450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	131505092	rs10739731	A	C	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=22;PP=699;SC=TCTAGGAACTATCTAGAGGTA;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=131505100;WS=131505082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	131550722	rs1891076	C	G	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=18;PP=539;SC=GGTTTCCCTACAGCAGCCCTG;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=131550730;WS=131550712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	131553768	rs10760577	A	G	2258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=52;PP=1748;SC=TGCATGTGACAGAGCCAGTAC;SOR=2.012;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=18;TCR=52;TR=70;WE=131553776;WS=131553758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr9	131565554	rs1572912	T	C	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.522;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=24;PP=917;ReadPosRankSum=0.677;SC=AAGAACTCTGTGCCATCATCC;SOR=0.663;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=43;TCF=19;TCR=24;TR=42;WE=131565562;WS=131565544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr9	131570183	rs7862546	C	G	2058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=53;PP=1703;SC=GCCCATGTTCCGGAGAGAAGC;SOR=2.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=13;TCR=53;TR=66;WE=131570191;WS=131570173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr9	131585205	rs2997919	T	C	146.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=111;SC=GCCCGAGACCTGGCCCACTGG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=131585213;WS=131585195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	131585994	rs2997918	T	C	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=4;PP=1014;SC=AAGGCCCCAGTGGCTGGCAGT;SOR=3.967;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=38;WE=131586002;WS=131585984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	131586374	rs7033070	G	A	1512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=9;PP=1240;SC=GCTGGGCAGAGGCCACATCTG;SOR=2.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=48;WE=131586382;WS=131586364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr9	131588652	rs2997914	T	C	2935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=15;PP=2436;SC=GGCGGGCCCATACAGCGTTAC;SOR=3.234;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=78;TCR=15;TR=93;WE=131588660;WS=131588642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr9	131588813	rs6478853	C	G	4654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.914;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=102;PP=2965;ReadPosRankSum=0.322;SC=GGAGTGACCCCCTTACTGTGG;SOR=1.557;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=151;TCF=48;TCR=103;TR=149;WE=131588821;WS=131588803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,154:0.99:155
chr9	131588888	rs6478854	G	C	2142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=48;PP=1763;ReadPosRankSum=-1.047;SC=CCCAACTCCTGTGAATTCCCC;SOR=1.236;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=15;TCR=49;TR=63;WE=131588896;WS=131588878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr9	131589234	rs2977991	C	G	2283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=2;PP=1966;SC=GTGGACGGGGCCATGGTGAAG;SOR=5.580;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=65;TCF=63;TCR=2;TR=65;WE=131589242;WS=131589224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr9	131592193	rs2997906	T	C	2394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=64;PP=2054;SC=GCTGCAGGGGTACGCGGGCTG;SOR=4.528;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=6;TCR=65;TR=70;WE=131592201;WS=131592183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr9	131600322	rs41275926	A	G	876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=7;PP=708;SC=TCTACCTAGCATCCTTACCGG;SOR=2.165;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=131600330;WS=131600312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	131607533	rs76868413	C	T	2284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=31;PP=1712;SC=GTCTGTGTACCGCCACCATCT;SOR=0.927;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=39;TCR=31;TR=70;WE=131607541;WS=131607523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr9	131608905	.	G	A	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.916;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=27.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.36;MQRankSum=-4.803;QD=10.42;ReadPosRankSum=2.089;SOR=5.106;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,36:0.52:69
chr9	131608909	.	G	A	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.224;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=25.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.79;MQRankSum=-5.215;QD=9.18;ReadPosRankSum=-1.002;SOR=4.903;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,36:0.47:76
chr9	131608913	.	G	A	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.837;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=24.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.01;MQRankSum=-5.432;QD=8.65;ReadPosRankSum=-6.608;SOR=4.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,36:0.45:80
chr9	131715001	rs371313511	CA	C	138.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=3.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQRankSum=-0.263;QD=2.27;ReadPosRankSum=0.645;SOR=1.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,16:0.26:61
chr9	131764014	rs12336276	A	C	1148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=16;PP=950;SC=AGCAGGTAGGAGGCCAGCCCG;SOR=0.984;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=36;WE=131764022;WS=131764004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	131772389	rs3750340	T	G	1835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=21;PP=1388;SC=GGGTGGGCAGTGGGACTCACG;SOR=1.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=56;WE=131772397;WS=131772379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr9	131799139	rs10513506	C	T	237.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=219;SC=TGCTTGGGAGCGGAACGAGAA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=131799147;WS=131799129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	131799261	rs11564101	C	T	972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=30;NR=6;PP=868;SC=AAGGAGCAGGCGTGCGGGCCG;SOR=2.964;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=36;WE=131799269;WS=131799251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	131804785	rs11544968	T	C	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=17;PP=695;SC=GTCCCTTCAGTGAAGAAAGGT;SOR=0.752;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=32;WE=131804793;WS=131804775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	131846774	rs10988199	G	A	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=1;PP=975;ReadPosRankSum=1.009;SC=ATCACGTATGGCTGTGACTGA;SOR=4.351;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=34;WE=131846782;WS=131846764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr9	131846957	rs11541836	T	C	2987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=76;PP=2108;SC=GTGATCTCTCTGGCCACCTCC;SOR=2.259;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=25;TCR=76;TR=101;WE=131846965;WS=131846947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr9	131848382	rs7859344	T	A	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=493;SC=TGTGTCTGACTGGCTCTCACA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=131848390;WS=131848372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	131860901	rs3118635	G	T	3234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=65;PP=2507;SC=AGGGGCACCAGGGGAGACCGC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=33;TCR=65;TR=98;WE=131860909;WS=131860891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr9	131862073	rs3118638	G	A	2649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=13;PP=2157;SC=TTCTCTATAAGCTGGTCTATC;SOR=3.202;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=65;TCR=13;TR=78;WE=131862081;WS=131862063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr9	131862730	rs10819462	C	T	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=418;SC=CAGGAAGTCCCGAGGCTGCAG;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=131862738;WS=131862720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	131862781	rs10988204	G	A	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=3;PP=607;SC=AAGCCCTGCCGGGCCTCACCT;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=131862789;WS=131862771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	131863079	rs7866897	T	C	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=15;PP=448;SC=CATTTGTACCTCTCTGGGATG;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=131863087;WS=131863069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	131871144	rs2768629	A	G	1416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=26;PP=1040;SC=CTACAAAGTGAGTGAGCAGAA;SOR=1.414;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=40;WE=131871152;WS=131871134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr9	131871249	rs2541163	A	C	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=12;PP=496;SC=GCTGTGGTGGAATCGGGGGTT;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=19;WE=131871257;WS=131871239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	131871435	rs2541162	A	C	2146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=19;PP=1671;SC=GGGAGTCAGGACAAAAGGTAA;SOR=1.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=64;WE=131871443;WS=131871425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr9	131873222	rs3814492	G	A	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=2;PP=431;SC=AGGGCCGAGGGCGAGTCATTG;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=131873230;WS=131873212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	131873638	rs3124501	T	G	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=0;PP=382;SC=CGTCGCCCGGTTCCGCGCGTC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=131873646;WS=131873634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	131881492	rs10819466	G	C	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=6;PP=173;SC=TGGCCAGCCTGGTCTTGAACC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=131881500;WS=131881482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	131882761	rs9409311	T	C	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=4;PP=1013;SC=ATTCTATTTATCTGTTTGTTT;SOR=3.545;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=36;WE=131882769;WS=131882751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	131882961	rs3739843	G	A	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=25;PP=777;SC=GACGGGCGGTGAGTTCCTGGC;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=131882969;WS=131882951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	131891152	rs7023900	C	G	288.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=2;PP=208;SC=GGGGAGAGTTCCCAGTAGGGG;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=131891160;WS=131891142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	131897221	rs7019373	C	T	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=285;SC=GAGGGGCCATCTGTTTCCTCC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=131897229;WS=131897211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	131898880	rs1536548	A	G	1722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=42;PP=1313;SC=GATAGGTACTAGAGCGGGAGG;SOR=2.564;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=53;WE=131898888;WS=131898870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	131899846	rs3118631	T	C	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=8;PP=847;SC=TGGTTCTGAATGCTGGGGCCC;SOR=2.432;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=36;WE=131899854;WS=131899836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	131900180	rs2297112	G	A	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=8;PP=348;SC=TTCTCCTTCAGTTTCTCCTGA;SOR=1.329;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=13;WE=131900188;WS=131900170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	131904617	rs57365080	T	TTG	474.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=667;ReadPosRankSum=0.952;SC=GCGTGTGCGTTTGTGTGTGTG;SOR=2.531;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=15;WE=131904625;WS=131904607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr9	131905814	rs913272	T	C	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=256;SC=CGGGGAAGGGTGCCAGAGGCC;SOR=5.136;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=131905822;WS=131905804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	132084885	rs913771	A	G	1281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=2;NR=35;PP=1067;SC=GGGTGAGGGAAGCAGAGAGAA;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=37;WE=132084893;WS=132084875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	132374678	rs3087721	T	C	2013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=33;PP=1670;ReadPosRankSum=0.081;SC=ATGGTACCCCTTAGGGCAGCC;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=32;TCR=34;TR=64;WE=132374686;WS=132374668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,64:0.97:66
chr9	132381749	rs4240434	G	A	1646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=6;PP=1323;SC=AAGAAGGAAAGAAATGCCCCT;SOR=3.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=46;WE=132381757;WS=132381739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr9	132382253	rs7467760	C	T	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=13;PP=606;SC=ATCCTTCTAGCCTGGGTGGTG;SOR=1.051;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=22;WE=132382261;WS=132382243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	132396281	rs10819551	G	C	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=5;PP=928;SC=AGGAAGGGCCGCACGTGCGGT;SOR=3.855;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=132396289;WS=132396271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	132396655	rs1558873	A	G	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=39;PP=1123;SC=ATAAGGTGTCAGGACCAGGGC;SOR=5.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=41;WE=132396663;WS=132396645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	132400480	rs3739851	G	A	4133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=66;PP=2965;SC=AGTTGTAGGCGGCTCCGGACT;SOR=0.937;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=53;TCR=66;TR=119;WE=132400488;WS=132400470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr9	132401824	rs2302780	G	A	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=19;PP=638;SC=GGTCCTATCTGTCCGCATTCT;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WE=132401832;WS=132401814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	132402908	rs2241247	C	G	1429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=14;PP=1099;SC=GGGCGTTGCTCACGCCTTCCT;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=47;WE=132402916;WS=132402898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	132404304	rs4837396	C	G	1673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=42;PP=1358;SC=GCAGCAGGGCCGTCGCGCTTT;SOR=3.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=6;TCR=42;TR=48;WE=132404312;WS=132404294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr9	132572629	rs1220509	T	G	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.78;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	132597062	rs41278736	A	C	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=13;PP=600;SC=AAAGAAGAAGAAGCAGCAATG;SOR=0.765;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=27;WE=132597070;WS=132597052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	132615077	rs2296786	C	T	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=11;PP=350;SC=GGCCGCCTTCCGGAGGCTCTG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=132615085;WS=132615067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	132618578	rs4836674	T	C	2123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=18;PP=1657;SC=TCCTCTCAACTCACACAGGGA;SOR=1.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=45;TCR=18;TR=63;WE=132618586;WS=132618568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr9	132618650	rs41278740	C	G	2784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=48;PP=2072;SC=GTAAAAGACCCTTGTGGCCAT;SOR=0.775;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=50;TCR=48;TR=98;WE=132618658;WS=132618640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr9	132618807	rs7862315	G	A	951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=25;PP=799;SC=CAAAGTCAGCGAATCCTGGGC;SOR=3.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=132618815;WS=132618797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	132620224	rs2417150	A	G	2376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=13;PP=1900;SC=TGTGGCCCCTATTCAGGAGAG;SOR=2.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=56;TCR=13;TR=69;WE=132620232;WS=132620214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	132620364	rs10819568	T	C	2581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=59;PP=1873;SC=GAGAATCCTTTGCTGACCACA;SOR=1.828;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=26;TCR=59;TR=85;WE=132620372;WS=132620354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr9	132620458	rs10819569	C	A	1172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.88;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	132620464	rs10760638	C	T	1205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.66;SOR=3.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	132620620	rs2174156	T	C	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=562;SC=AAGCAAAATTTGAGCTTCCGG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=132620628;WS=132620610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	132620707	rs2134601	T	C	2118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=18;PP=1634;SC=CTTGTTAGGCTAGAGTGCCCT;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=67;WE=132620715;WS=132620697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr9	132620990	rs2174157	T	C	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=25;PP=710;SC=GGTGTCTGTTTCTGGGTCAGT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=132620998;WS=132620980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	132623293	rs1503375	C	T	3296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=50;PP=2357;SC=AGTCAGAGGACGATGACCTGA;SOR=0.813;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=44;TCR=50;TR=94;WE=132623301;WS=132623283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr9	132623868	rs10115249	T	C	2595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=65;PP=2036;SC=ACATGAACGCTGCCCTGCAGG;SOR=2.007;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=24;TCR=65;TR=89;WE=132623876;WS=132623858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr9	132623917	rs10124224	C	A	1756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=41;PP=1429;SC=GTCCGAGGGCCGAGAGCTGTC;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=9;TCR=41;TR=50;WE=132623925;WS=132623907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	132625417	rs4837419	CA	TG	366.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=279;SC=TAAACTGCCGCATGCCTCATT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=6;WE=132625426;WS=132625407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	132625602	rs2900279	T	C	2513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=36;PP=1732;SC=TCCCTAGCCTTGGGCGGTGTG;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=43;TCR=36;TR=79;WE=132625610;WS=132625592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr9	132627480	rs913319	C	T	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=6;PP=1409;SC=TGTCAGGAAACGCCACACTCT;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=46;TCR=6;TR=52;WE=132627488;WS=132627470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr9	132627723	rs913320	G	A	1791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=51;PP=1394;SC=TGACTTTGACGCCAAAACCAG;SOR=5.283;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=3;TCR=51;TR=54;WE=132627731;WS=132627713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr9	132630231	rs913325	A	G	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=1;PP=520;SC=GGCGCTGGAGACTGGTTCCTC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=132630239;WS=132630221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	132630664	rs10602985	TGAC	T	4008.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=60;PP=2967;SC=TGGCTGCCCTTGACGACCAGC;SOR=2.546;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=12;TCR=65;TR=71;WE=132630674;WS=132630654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr9	132631680	rs6478920	T	C	2399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=54;PP=1814;SC=TTCTCAGCCTTGTGCAGTGTC;SOR=1.395;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=30;TCR=54;TR=84;WE=132631688;WS=132631670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr9	132632162	rs5900871	G	GC	811.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=23;PP=1054;SC=CATGGGCTGGGCCTGTCCTGG;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=24;WE=132632170;WS=132632152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	132635653	rs1809959	A	G	3381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=16;PP=2635;SC=ATGAGCCACCATGCCCAGCCA;SOR=3.395;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=97;TCR=16;TR=113;WE=132635661;WS=132635643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr9	132635944	rs2296787	C	G	3138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=49;PP=2499;SC=GCCCTGATGCCGGACACTGAT;SOR=0.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=53;TCR=49;TR=102;WE=132635952;WS=132635934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr9	132636031	rs4332226	A	G	5035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.37;SOR=0.951;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr9	132636031	.	AGT	GGC	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=45;NR=56;PP=2947;QD=20;SC=GAGGTGAGCCAGTGGCCTCGG;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=106;TCF=48;TCR=58;TR=101;WE=132636041;WS=132636021;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,101:0.95:106
chr9	132636033	rs4415421	T	C	5035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.56;SOR=0.903;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr9	132652677	rs60841376	G	GGA	188.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=0;PP=264;SC=GGAGCATGCTGGAGAGAGAGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=132652685;WS=132652667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	132658044	rs2047837	T	C	1385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=0;PP=1177;SC=GTAACAGTCATGGTTGTGGGG;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=41;WE=132658052;WS=132658034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	132662786	rs1023000	C	T	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=16;PP=506;SC=CGCCTGCTCGCTGCGTGCTGG;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=132662794;WS=132662776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	132671359	rs3215850	T	TG	428.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=485;SC=CCTGCAGCCATGGGGGGTGCA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=15;WE=132671367;WS=132671349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	132672319	rs7855720	G	A	3344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=78;NR=20;PP=2697;SC=TCCCTTTTCAGAAGCAGCTGC;SOR=2.856;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=78;TCR=20;TR=98;WE=132672327;WS=132672309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr9	132677218	.	A	G	121.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.38;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	132678195	rs7867211	G	A	2636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=29;PP=1970;SC=TAAAAGACACGCCAGAAAACC;SOR=1.364;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=55;TCR=29;TR=84;WE=132678203;WS=132678185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr9	132681619	rs1054874	C	T	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=460;SC=CAAAATCTTTCGGTCAACTTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=132681627;WS=132681609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	132686186	rs4836680	A	G	1926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=32;PP=1518;SC=CGTTGAAGCGATGGGAGAGGG;SOR=0.758;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=30;TCR=32;TR=62;WE=132686194;WS=132686176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr9	132689671	rs4837429	A	G	2059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=57;PP=1733;SC=ATTATTAAACAAAGTTGTTTT;SOR=6.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=59;TCF=1;TCR=58;TR=58;WE=132689679;WS=132689661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr9	132720720	rs11394970	G	GA	1463.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=18;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=11;PP=1124;SC=CAAAAAAAAAGAAAAAAAAAT;SOR=2.437;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=51;WE=132720728;WS=132720710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	132816398	rs5900882	T	TC	1568.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=26;PP=1713;SC=CCGAGGCCACTCCCCGGGTTT;SOR=0.733;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=43;WE=132816406;WS=132816388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr9	132848653	rs11399718	C	CT	1406.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=2;PP=1638;SC=AATTAGCATGCTTCTATGCCG;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=39;WE=132848661;WS=132848643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr9	132854482	rs10988589	T	C	1766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=3;PP=1470;SC=GAATAAGGGATGATATGTTTC;SOR=5.211;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=56;TCF=53;TCR=3;TR=56;WE=132854490;WS=132854472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	132862830	rs10081664	AA	TC	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=1;PP=1371;SC=TAATTTCCCAAATGGGTCCAA;SOR=4.479;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=24;WE=132862839;WS=132862820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	132866883	rs7868997	T	C	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=571;SC=TCAAGCCCAATAGCTGAACTG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=132866891;WS=132866873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	132866906	rs887536	C	T	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=536;SC=CATTCCCAAACTGATCTCAGT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=132866914;WS=132866896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	132871091	rs146664980	TAGGTTCTTTTCAGTGGCTTTAAGC	T	1735.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=39.45;ReadPosRankSum=1.241;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,42:0.95:44
chr9	132872686	rs4837460	A	G	3991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=83;NR=33;PP=2965;SC=GAGCGAATCTAAGAGCAGGAA;SOR=2.010;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=84;TCR=33;TR=116;WE=132872694;WS=132872676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr9	132887249	rs11316087	TA	T	107.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=3;PP=68;SC=TCTTGGTAAGTAAAAAAAAAA;SOR=1.329;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=5;WE=132887257;WS=132887239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	132889631	.	G	A	368	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=14;NR=0;PP=368;QD=28.7693723248;SC=AATTCACACTGTAAGTGTCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=132889639;WS=132889630;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	132891115	rs7853219	T	C	745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=20;PP=605;SC=GTGAATCGGGTCGGCTGCTCT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=132891123;WS=132891105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	132897231	rs1003416	G	A	2967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.781;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=40;PP=2190;ReadPosRankSum=1.075;SC=CCTAATCACCGTGCTGTGGCA;SOR=0.466;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=95;TCF=53;TCR=42;TR=93;WE=132897239;WS=132897221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,100:0.98:102
chr9	132962801	rs7037407	A	T	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=294;SC=AGCTCCCCCCACCCCCCCACA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=132962809;WS=132962791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	132962816	rs7022964	T	C	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=0;PP=356;SC=CCCACATAGGTGGGGCAGCCG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=132962824;WS=132962806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	132963115	rs887534	T	G	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.97;NF=29;NR=4;PP=983;SC=GAGCAGGCCGTTGCCCGGGGA;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=33;WE=132963137;WS=132963105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	132963129	rs887535	G	A	1438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=6;PP=942;SC=CCGGGGACATGGCCGTGGGGA;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=35;WE=132963137;WS=132963105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	132963350	rs4837482	T	C	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=30;PP=853;SC=GTCCAGCTGCTCAGGATGGGG;SOR=3.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=34;WE=132963358;WS=132963340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	132980035	rs2277198	G	A	483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=1;PP=406;SC=CCTGGGCCCCGGGCAGGCGAT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=132980043;WS=132980025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	132985111	rs3829905	T	C	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=21;PP=524;SC=GCCATGCTCCTGCCCAGGGTG;SOR=3.014;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=24;WE=132985119;WS=132985101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	132985258	rs68053432	GC	G	396.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=3;PP=352;SC=GAAGAGGGGGGCGGCCCTCAT;SOR=1.402;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=6;WE=132985270;WS=132985248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	132985262	rs112503385	C	G	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=3;PP=301;SC=AGGGGGGCGGCCCTCATCTGG;SOR=1.981;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=11;WE=132985270;WS=132985248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	133058082	rs10739777	G	A	2691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=54;PP=1953;SC=GAGAAAGGTCGACTAGCTTTA;SOR=1.694;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=24;TCR=54;TR=78;WE=133058090;WS=133058072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr9	133058197	rs7045548	C	A	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=426;SC=ATAGAAGTAACGGGTCAAGGA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=133058205;WS=133058187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	133066939	rs76577761	C	T	123.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5340;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=90;ReadPosRankSum=-0.674;SC=CTGGGCAGCACCAGGGCTTGC;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=5;WE=133066947;WS=133066929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr9	133072426	rs12353455	C	G	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=648;SC=GGGAAGCTCTCTCACACAAGT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=133072434;WS=133072416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	133260316	rs7858563	T	G	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=14;PP=448;SC=CCCGCACAGATCAGCTCTGAG;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=133260324;WS=133260306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	133260353	rs11244109	G	A	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=10;PP=296;SC=ACGGGCCCCAGGAGCCTGGCT;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=133260361;WS=133260343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	133263923	rs7849839	T	C	2908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=77;PP=2278;SC=ACAGGATGCCTGTGGGTGAGC;SOR=2.655;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=18;TCR=78;TR=95;WE=133263931;WS=133263913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr9	133264059	rs35750041	GC	G	254.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=0;NR=10;PP=146;SC=GTGCCGTGTTGCCCCCCCCCC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=10;WE=133264067;WS=133264049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	133270499	rs12552510	G	A	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=10;PP=662;SC=GTTCAAGGTAGGTGGTGGGGG;SOR=1.220;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=26;WE=133270507;WS=133270489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	133270740	rs6597641	T	C	1396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=36;PP=1036;SC=TGCAGGTGGGTGCCAGGCAGG;SOR=1.848;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=51;WE=133270748;WS=133270730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr9	133280580	rs1475732	C	G	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=18;PP=512;SC=CGGGTACAGACAGCCAGAACT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=133280588;WS=133280570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	133281691	rs11244201	C	T	962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=22;PP=691;SC=GGTCTTCCAACGTGGCCCTAT;SOR=1.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=133281699;WS=133281681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	133283255	rs10736862	A	G	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=463;SC=CTGAAGTCCAAGTTCTACTTC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=133283263;WS=133283245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	133284310	rs10793975	G	A	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=507;SC=CTGACCATCCGCAGGACTGAG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=133284318;WS=133284300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	133294244	rs13294886	G	A	2757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=46;PP=2168;SC=CCACTGGAGAGCCCACACCCA;SOR=0.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=92;TCF=45;TCR=47;TR=91;WE=133294252;WS=133294234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr9	133327439	rs1760275	T	C	1307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=32;PP=1025;SC=AGGTCAGGGTTCCCGGGGGTG;SOR=3.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=38;WE=133327447;WS=133327429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	133327835	rs1615006	G	A	2920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=81;PP=2412;SC=ACTCATTCAAGCCTGGCCTCT;SOR=4.502;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=7;TCR=82;TR=88;WE=133327843;WS=133327825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr9	133346920	rs652313	A	G	4339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=81;PP=2965;SC=CCCAAACCCCATCTCCTCCCA;SOR=1.052;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=58;TCR=81;TR=139;WE=133346928;WS=133346910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr9	133346983	rs641510	A	G	2818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=68;PP=2298;SC=TGATGTATTTATAGCCTAATT;SOR=2.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=15;TCR=68;TR=83;WE=133346991;WS=133346973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr9	133347080	rs486889	G	A	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=24;PP=669;SC=TCTGCCCACCGTCTCCTCGCT;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=133347088;WS=133347070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	133472120	rs74743353	G	C	2171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=52;PP=1565;SC=CCTATGTTAAGGTTCTTTTTA;SOR=1.670;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=78;TCF=26;TCR=52;TR=77;WE=133472128;WS=133472110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr9	133488447	rs2304812	G	A	1803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=48;PP=1469;SC=TATCAATTTTGTAGAAATCAG;SOR=3.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=8;TCR=48;TR=56;WE=133488455;WS=133488437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	133710722	.	G	GC	303	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=45;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=7;NR=0;PP=303;QD=47.0;SC=GGTGAGGGCGGCTGGCGGGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=133710730;WS=133710712;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	133710804	rs7866590	T	C	1195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=6;PP=761;SC=GGGAGAGGGGTTCCGGCCCCC;SOR=2.468;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=30;WE=133710812;WS=133710794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	133710819	rs11433463	T	TC	1379.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=6;PP=1273;SC=GCCCCCGACGTGCTGGCGCGG;SOR=2.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=27;WE=133710827;WS=133710809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	133761001	rs1056171	A	G	3783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=60;PP=2773;SC=GCAGTGGTCCAGCGGCCACTC;SOR=0.791;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=119;TCF=58;TCR=61;TR=118;WE=133761009;WS=133760991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr9	133901819	rs2275137	CC	AG	4331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=67;PP=2947;SC=TACGGCCGGCCCGAGGGCCAG;SOR=2.454;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=20;TCR=71;TR=86;WE=133901828;WS=133901809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr9	133907645	rs149260930	TG	T	477.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=3;NR=12;PP=417;SC=GGGTGGGGGGTGGGGGGGCAC;SOR=2.712;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=15;WE=133907653;WS=133907635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	133911598	rs2275132	A	G	1372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=14;PP=1049;SC=CCGACGTGGCAGGCCAGTTGG;SOR=1.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=46;WE=133911606;WS=133911588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	133911821	rs2275130	C	T	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=605;SC=CTCCTGGGTACGCCCCGGGGG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=133911829;WS=133911811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	133914321	rs45603838	C	T	4122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=30;PP=2965;SC=CAGGCCACGGCGGGCGCTGTC;SOR=2.392;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=102;TCR=30;TR=131;WE=133914329;WS=133914311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr9	133936334	rs11244268	G	A	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=1;PP=638;SC=ACTTCTGCCCGGGATGTGCTC;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=133936342;WS=133936324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	133936381	rs3824398	G	A	1163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=8;PP=901;SC=CCATCTCTGGGCATTCTGGGT;SOR=2.242;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=34;WE=133936389;WS=133936371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	133936571	rs3739510	C	G	2315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=54;PP=1868;SC=CCCAGAGAGCCGGGAGGTGGT;SOR=2.211;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=18;TCR=54;TR=72;WE=133936579;WS=133936561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr9	133942624	rs3765569	A	G	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=21;PP=649;SC=CCAGGGTGGCACATGGTGGGC;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=133942632;WS=133942614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	133944522	rs2275142	C	T	268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=215;SC=GGAAAATGGGCGCAGCAGGAA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=133944530;WS=133944512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	133946774	rs4740409	C	T	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=1;PP=655;SC=GAGAAGGGAACCCCCAGGGAG;SOR=4.977;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=24;WE=133946782;WS=133946764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	133946849	rs34910694	C	CT	2419.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.243;NF=43;NR=22;PP=2600;ReadPosRankSum=0.267;SC=CCTCATACACCTTTTCTTCCT;SOR=0.909;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=73;TCF=47;TCR=26;TR=65;WE=133946857;WS=133946839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,77:0.99:78
chr9	133946909	rs10901344	G	A	4374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.32;MQRankSum=0.237;QD=44.64;ReadPosRankSum=1.362;SOR=0.256;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,97:0.99:98
chr9	133946915	rs10901345	C	G	4332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.32;QD=43.77;SOR=0.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr9	133948049	rs2275140	A	G	262.89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.9785;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=183;ReadPosRankSum=-1.036;SC=GCAGATGATGAGCCTCGAGGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=133948057;WS=133948039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr9	133967295	rs710074	C	A	1198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=37;PP=929;SC=TGTGAACTCGCCCCCGTGTGG;SOR=6.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=38;WE=133967303;WS=133967285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	133967310	rs10696088	T	TCA	1232.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=22;PP=1131;SC=GTGTGGATAGTCACTCCCTGC;SOR=5.353;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=23;WE=133967318;WS=133967300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	133972131	rs2478784	G	T	1392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=18;PP=1159;SC=GGGCGGGGACGGGGGCGCGTG;SOR=1.055;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=25;TCR=18;TR=43;WE=133972139;WS=133972121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	133978319	rs146116805	A	T	3237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=42;PP=2679;SC=GCTGCAGCTGATACAGAAAGA;SOR=1.051;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=57;TCR=42;TR=99;WE=133978327;WS=133978309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr9	133981491	rs2872823	G	T	250.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=3;PP=206;SC=GAGTGTCTACGATATGCTGGG;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=133981499;WS=133981481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	133981629	rs2315075	T	C	951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=8;PP=649;SC=CCAGCACAGCTGCTTGCTGGC;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=133981637;WS=133981619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	133981721	rs2315076	T	C	1175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=22;PP=703;SC=GTCTGCTATGTGGAACCTACA;SOR=1.055;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=16;TCR=22;TR=38;WE=133981729;WS=133981711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	133986836	rs353528	C	T	399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=339;SC=CTCCAAGGGGCGACAGGAAGC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=133986844;WS=133986826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	133986980	rs353526	T	G	2716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=39;PP=1925;SC=TCTCACCTCTTTAGGAGTTTC;SOR=0.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=45;TCR=39;TR=84;WE=133986988;WS=133986970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr9	133987060	rs353525	G	A	2172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=45;PP=1585;ReadPosRankSum=-0.931;SC=GGTAAGCTGGGGCGGGCTGCC;SOR=1.030;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=62;TCF=16;TCR=46;TR=61;WE=133987068;WS=133987050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,68:0.99:69
chr9	133996460	rs353511	T	G	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=4;PP=881;SC=CCTGGGGTTTTGGGGGAAAGG;SOR=3.675;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=30;WE=133996468;WS=133996450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	133996503	rs353510	T	A	1616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=13;PP=1305;SC=TTTAGGGAGGTTACTGAGGGG;SOR=2.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=51;WE=133996511;WS=133996493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr9	134003900	rs967174	A	G	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=673;ReadPosRankSum=1.611;SC=TGATGTCAACATGAGAACCCT;SOR=2.448;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=26;WE=134003908;WS=134003890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr9	134004912	rs3736957	A	C	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=26;PP=848;SC=ATGGTCATCTACTTAAGAATT;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=134004920;WS=134004902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	134008720	rs10901353	C	G	30.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.66;MQRankSum=-0.000;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr9	134010236	rs16922	T	C	971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=1;PP=781;SC=CTGTGGGATCTGAGAAAAATT;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=134010244;WS=134010226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	134015781	rs2281903	A	G	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=0;PP=498;SC=CTGGTGCACGAAAGGCTGTTC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=134015789;WS=134015771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	134015899	rs2281902	C	G	1549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=12;PP=1158;SC=CCCTTAAATTCACTTGGTTTT;SOR=1.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=43;WE=134015907;WS=134015889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	134016121	rs2281901	C	T	1426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=38;PP=1169;SC=CCTGCTTTATCAGTAAGGGAA;SOR=3.306;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=46;WE=134016129;WS=134016111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	134021630	rs2296710	A	G	4309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=70;PP=2965;SC=GCCACCCCACACCTCTCTCAG;SOR=0.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=71;TCR=70;TR=140;WE=134021638;WS=134021620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr9	134025595	rs11244305	A	G	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=525;SC=ATTCGTTACAATGAGTGAAGA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=134025603;WS=134025585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	134067795	rs4602942	G	A	1479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=44;PP=1227;SC=AGTTCTTACCGTGGCAGTAAT;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=44;WE=134067803;WS=134067785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr9	134103759	rs11244329	G	A	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=19;PP=519;SC=CCACACGCCAGCCAAAAAGCA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=19;WE=134103767;WS=134103749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	134136515	rs352952	A	G	5028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=83;PP=2965;SC=CCCGGTAGATATTGGTGAGCT;SOR=1.012;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=65;TCR=83;TR=148;WE=134136523;WS=134136505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr9	134136677	rs352951	A	G	2130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=46;PP=1717;SC=AGTTCACCCCATCCGAGTCGC;SOR=1.478;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=23;TCR=47;TR=69;WE=134136685;WS=134136667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr9	134140113	rs7859822	C	T	290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=10;PP=244;SC=CTTTTCTGACCTTTTTTTTTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=10;WE=134140121;WS=134140103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	134165888	rs11244356	T	C	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=19;PP=484;SC=GGAGGCAGCCTGGCCTGCCCA;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=134165896;WS=134165878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	134322324	rs2966340	G	A	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=2;PP=778;SC=ATGAAATGGGGGAGATGGTGG;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=134322332;WS=134322314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	134323240	rs2994064	A	C	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=240;SC=CAAAGTCCATATGTACTTACC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=134323248;WS=134323230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	134342938	rs10793870	T	C	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=479;ReadPosRankSum=-0.640;SC=TCTCTGCTGGTATATTCTCTA;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=20;WE=134342946;WS=134342928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr9	134346315	rs4310250	T	C	5313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=61;PP=2965;SC=TGGACCCACGTATCACGCCCA;SOR=1.242;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=161;TCF=100;TCR=61;TR=161;WE=134346323;WS=134346305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr9	134348807	rs4276727	G	A	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=1;PP=768;SC=CAGGGTAACTGTTAACTTCTT;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=134348826;WS=134348797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	134348818	rs5900941	TG	T	1058.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=30;NR=1;PP=1227;SC=TTAACTTCTTTGGGCCTTTGG;SOR=5.610;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=31;WE=134348826;WS=134348797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	134350323	rs10736851	C	G	4599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=86;PP=2965;SC=ACGGGCAGGACCCGGAGGTCG;SOR=1.237;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=54;TCR=86;TR=140;WE=134350331;WS=134350313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr9	134350458	rs10751478	C	T	3287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=57;PP=2695;SC=GAGCAGAGCCCCACGGCAGAA;SOR=1.103;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=42;TCR=57;TR=99;WE=134350466;WS=134350448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr9	134350647	rs10793873	T	C	2204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=33;PP=1654;SC=GTTCCCCCCATGAAGAGAAAT;SOR=0.920;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=40;TCR=33;TR=73;WE=134350655;WS=134350637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr9	134351065	rs7858488	G	T	4877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=87;PP=2965;SC=CCAACAAGGGGTGCTCTGAGG;SOR=1.129;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=151;TCF=64;TCR=87;TR=149;WE=134351073;WS=134351055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr9	134351343	rs11243403	C	T	7847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=130;PP=2965;ReadPosRankSum=0.072;SC=GACAGCCGCGCGGAGGACAAG;SOR=0.800;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=253;TCF=121;TCR=132;TR=250;WE=134351351;WS=134351333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,255:0.99:257
chr9	134358657	rs10901061	G	C	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=10;PP=622;SC=TTTTGAGTCGGGGAAACTGCA;SOR=1.255;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=29;WE=134358665;WS=134358647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	134359918	rs10751480	G	C	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=0;PP=572;SC=ACACGGAGCTGTAGGTGCTTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=134359926;WS=134359908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	134360015	rs10793874	G	T	1950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=24;PP=1550;SC=GGATGGGTTTGGGCAAAGCCA;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=37;TCR=24;TR=61;WE=134360023;WS=134360005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr9	134361318	rs3808829	C	A	1703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=13;PP=1379;SC=CGTGTGCTTCCGGCACACAGG;SOR=1.938;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=51;WE=134361326;WS=134361308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	134361581	rs10793875	T	A	3164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=65;PP=2622;SC=TGACAGCAGCTAGCCAGGTGG;SOR=1.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=32;TCR=65;TR=97;WE=134361589;WS=134361571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr9	134361627	rs10901062	G	A	2267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=59;PP=1815;SC=CCAGTGCAGGGCGGAATTGGC;SOR=3.321;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=11;TCR=59;TR=70;WE=134361635;WS=134361617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr9	134382673	rs6597501	C	T	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=4;PP=935;SC=AACATGACGGCGCTATGTGAA;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=38;WE=134382681;WS=134382663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr9	134384277	rs11243404	T	C	2359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=15;PP=1768;SC=AAAATTGACATGTGTTTCCTC;SOR=2.743;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=71;TCF=55;TCR=16;TR=70;WE=134384285;WS=134384267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr9	134384500	rs11999204	C	T	3280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=75;PP=2239;SC=TTTTTTGTTTCGTTTTGTGAG;SOR=5.499;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=4;TCR=75;TR=79;WE=134384521;WS=134384490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr9	134384513	rs28447664	A	G	2450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=53;PP=1616;SC=TTTGTGAGACAGTACCTTTTC;SOR=5.211;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=56;TCF=3;TCR=53;TR=56;WE=134384521;WS=134384490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	134385436	rs2296949	A	G	2003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=23;PP=1527;SC=GGGCAGATGCAGATGTCACAG;SOR=1.478;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=42;TCR=24;TR=65;WE=134385444;WS=134385426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr9	134385599	rs2018621	A	G	4516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=52;PP=2965;SC=AGAGGTGGGTACGCTTTTCCA;SOR=1.211;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=84;TCR=52;TR=136;WE=134385607;WS=134385589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr9	134386675	rs4740163	T	G	964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=4;PP=736;SC=TGGCTTAGGGTCATTTTTCTT;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=134386683;WS=134386665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	134386744	rs10901065	T	C	1277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=13;PP=983;SC=CTCGGATCACTCAGGGTCAGC;SOR=1.445;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=37;WE=134386752;WS=134386734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr9	134386903	rs10901066	G	A	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=11;PP=372;SC=TTATTTGCTCGTAGATTTGCT;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=134386911;WS=134386893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	134387315	rs10901068	C	G	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=0;PP=790;SC=CCAGGCTGGTCTCAAACTCCT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=134387323;WS=134387305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	134387488	rs3739494	T	C	2191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=47;PP=1505;SC=CCTTCAAAGATGTCAATAACT;SOR=1.281;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=28;TCR=47;TR=75;WE=134387496;WS=134387478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr9	134394163	rs1547768	A	G	4132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=80;PP=2965;SC=CTTCCAACCCAAGTGGACACG;SOR=1.196;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=53;TCR=80;TR=133;WE=134394171;WS=134394153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr9	134394646	rs2010635	A	G	1709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=3;PP=1451;SC=GCTAAGTGGAATGATGCGGTT;SOR=5.590;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=48;TCR=3;TR=51;WE=134394654;WS=134394636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr9	134395628	rs2277152	C	G	1835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=45;PP=1352;SC=CATCCTGTTTCTTGAGAATTC;SOR=3.076;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=9;TCR=45;TR=54;WE=134395636;WS=134395618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr9	134395687	rs2277153	C	A	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=565;SC=GGGTTTCTCCCAAGCTTTTCC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=134395695;WS=134395677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	134397624	rs4740165	C	T	2891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=75;PP=2363;SC=ACGGGGGCTGCGGAGACAGTG;SOR=3.160;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=15;TCR=75;TR=90;WE=134397632;WS=134397614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr9	134398452	rs147266709	C	T	124.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=2;PP=83;SC=CAAGGCCCTTCGCTGGAAAGA;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=134398460;WS=134398442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	134398534	rs3739495	T	C	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=6;PP=220;SC=GGGGTCGGGATGAGGTTGAAG;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=12;WE=134398542;WS=134398524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	134401335	rs2296957	C	T	2643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=28;PP=2025;SC=CCACTCCTCGCGGGATGATCA;SOR=1.455;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=57;TCR=28;TR=85;WE=134401343;WS=134401325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr9	134404199	rs4740260	A	G	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=389;SC=GTATGTGGCCATAATGAGCCA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=19;WE=134404207;WS=134404189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	134406071	rs7867616	C	G	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=33;PP=981;SC=TGGAACCGCTCGTCCTGTGAC;SOR=3.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=38;WE=134406079;WS=134406061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	134406131	rs3904960	G	T	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=449;SC=CCCCTGGGGGGTATGCTCGGA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=134406139;WS=134406121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	134406647	rs4740261	A	G	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	134406650	rs7041225	C	T	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	134433463	rs4740167	T	C	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=1;PP=487;SC=TGGGCAGGGGTGACCTGGCCC;SOR=3.611;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=134433471;WS=134433453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	134465398	rs3818581	T	C	1222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=24;PP=956;SC=AGCCATGTGGTCGGCTGAGGG;SOR=1.445;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=39;WE=134465406;WS=134465388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr9	134467578	rs3215862	GA	G	1827.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=31;PP=1632;SC=AATCTAGAGGGAAAAAACAAT;SOR=0.723;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=52;WE=134467586;WS=134467568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	134473517	rs2296950	T	C	2598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=18;PP=2080;SC=CAAGATCACATTCTTCTCTGC;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=84;TCF=65;TCR=19;TR=83;WE=134473525;WS=134473507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr9	134477387	rs3842210	AG	A	1318.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=2;PP=1186;SC=CTGCTCAGGCAGGCCTCATGA;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=134477395;WS=134477377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	134479293	rs7037668	A	G	1409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=1;PP=1228;SC=GGGAGGGCAGAGCCCAAGCCC;SOR=6.138;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=42;TCR=1;TR=43;WE=134479301;WS=134479283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	134480221	rs7045121	T	C	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=113;SC=AGGCAGTGTCTTTCAGGAACG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=134480229;WS=134480211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	134497450	rs7023385	C	G	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=25;PP=781;SC=CCCCTCCCCCCATTCTTCCCA;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=134497458;WS=134497440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	134505545	rs11243457	A	C	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=0;PP=385;SC=TGCCCACCCCACCGGGCCCTA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=134505553;WS=134505535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	134585181	rs11243480	C	T	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=321;SC=TCCCAAACCACCCAGCGGCAG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=134585189;WS=134585171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	135073967	rs3739930	C	T	5868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=92;PP=2965;SC=AGTACTTCTACGCCATCTCCA;SOR=0.714;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=91;TCR=92;TR=183;WE=135073975;WS=135073957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr9	135074063	rs3739929	T	C	4142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=82;PP=2858;SC=TGGGACGTTATTGGATACCTG;SOR=3.014;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=18;TCR=82;TR=100;WE=135074071;WS=135074053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr9	135074103	rs3739928	G	A	3167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=61;PP=2041;SC=GAACATGACCGGGTTCTTGGG;SOR=4.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=6;TCR=61;TR=67;WE=135074111;WS=135074093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr9	135102254	rs2149171	C	T	1135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=8;PP=903;SC=GCAACCTGCACGCCAACCTGT;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=27;TCR=8;TR=35;WE=135102262;WS=135102244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	135105964	rs4962173	A	G	1617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=9;PP=1262;SC=CACAGGTGCCACTGCAGGTTC;SOR=3.180;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=44;TCR=9;TR=53;WE=135105972;WS=135105954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	135106054	rs2274854	T	A	2763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=24;NR=62;PP=2218;SC=TGGAAAAAGCTGGAGAGAAAA;SOR=2.076;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=24;TCR=62;TR=86;WE=135106062;WS=135106044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr9	135152543	rs34769225	TA	T	60.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=1.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.65;ReadPosRankSum=0.680;SOR=0.300;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,15:0.16:93
chr9	135202829	rs543573	T	C	2148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=45;PP=1725;SC=GGTACAAATATGTCAGAATTC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=24;TCR=45;TR=69;WE=135202837;WS=135202819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr9	135203231	rs1183768	C	T	7630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=102;NR=129;PP=2965;SC=CTATTCTGTCCTTTTTTGGCA;SOR=0.916;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=232;TCF=102;TCR=130;TR=231;WE=135203239;WS=135203221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr9	135203409	rs1185193	A	C	3403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=58;PP=2928;SC=TTCCCACAAGATCTCTCTTAT;SOR=1.081;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=41;TCR=58;TR=99;WE=135203417;WS=135203399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr9	135204410	.	G	C	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=21;PP=1169;SC=ACATTGTTTTGAGATTTTTGT;SOR=0.788;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=42;TCF=20;TCR=22;TR=41;WE=135204418;WS=135204400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	135206460	rs9411449	A	G	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=6;PP=890;SC=TTTCAGGATTATAATTGTATA;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=135206468;WS=135206450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	135211609	rs111938515	AAC	A	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=238;SC=CAGCCTGGGCAACAGAGTGAG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=135211618;WS=135211599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	135221597	rs497650	G	A	888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=0;PP=758;SC=AATTCTTATGGTACTAAAATA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=135221605;WS=135221587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	135263573	rs556386	G	T	4090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=91;PP=2965;SC=TGCCATAGTAGATACGCCGAC;SOR=1.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=38;TCR=91;TR=129;WE=135263581;WS=135263563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr9	135265876	rs471890	T	C	1004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=1;PP=808;SC=CTAGACACGATTGTTCTTGAC;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=135265884;WS=135265866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	135271987	rs1166321	T	C	3151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=83;PP=2327;SC=TATAACAACATGAACTATCCT;SOR=2.366;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=26;TCR=83;TR=109;WE=135271995;WS=135271977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr9	135272061	rs5900975	GT	G	435.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.44;MQRankSum=0.000;QD=19.81;ReadPosRankSum=1.026;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr9	135273507	rs569288	G	A	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=6;PP=888;SC=ATGGTCAAAGGGTGATTGTTT;SOR=3.086;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=37;WE=135273515;WS=135273497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	135273607	rs504525	C	G	4172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.512;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=43;PP=2965;ReadPosRankSum=1.881;SC=CCGTGTACAGCAGCTTGTCTG;SOR=1.299;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=127;TCF=83;TCR=44;TR=126;WE=135273615;WS=135273597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,129:0.99:130
chr9	135273759	rs5900976	G	GA	1902.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=41;PP=1962;SC=TGTTAATAATGACAAAAGCAA;SOR=4.575;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=43;WE=135273767;WS=135273749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr9	135276710	rs553323	C	T	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=388;SC=CAAATCTCCACCTCAAAAATA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=135276718;WS=135276700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	135470176	rs306549	C	G	148.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=87;SC=TTTTCACAAGCCTCCTCTGAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=135470184;WS=135470166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	135470414	rs306547	T	C	2118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=20;PP=1504;SC=ACCTTGGCGATGTCGGCCTCC;SOR=1.852;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=46;TCR=20;TR=66;WE=135470422;WS=135470404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	135507624	rs35126244	CGT	C	499.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=8;PP=340;SC=ATGCCCAGTACGTGTACACAC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=135507633;WS=135507614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	135522454	rs140712462	AAAGT	A	5642.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=58;PP=2966;SC=ACCTTGGATAAAAGTAAGAAG;SOR=0.709;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=40;TCR=61;TR=96;WE=135522465;WS=135522444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr9	135522573	rs3824573	A	G	1349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=37;PP=1095;SC=GGGTATCACCAAGTCCCAGCA;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=37;WE=135522581;WS=135522563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	135538807	rs2583805	G	C	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=28;PP=671;SC=GCCTGATTGCGGATTACAGGC;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=135538815;WS=135538797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	135544857	rs373110082	T	TAA	2384.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=2;PP=940;SC=GTGGGCAAGATAAAAAAAAAA;SOR=4.648;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=86;TCF=83;TCR=3;TR=61;WE=135544865;WS=135544847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr9	135602727	rs1999121	T	C	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=441;SC=ATAATCGTCCTTCAGTGGTCA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=135602735;WS=135602721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	135603108	rs139398120	TCC	T	473.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=290;SC=AGAGCCTGTGTCCCCCCAACC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=135603117;WS=135603098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	135702490	rs13299768	T	C	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=331;SC=AGGGGCCCTGTGGGCGCTGCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=135702498;WS=135702480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	135730078	rs214640	T	G	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=2;PP=561;SC=CCTTTTCCTTTGACAAAAGCA;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=135730086;WS=135730068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	135739226	rs2251448	T	C	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=15;PP=498;SC=CAAATGACTCTATTAAAATGC;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=135739234;WS=135739216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	135764081	rs1062218	A	G	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=706;ReadPosRankSum=0.853;SC=ACTGGTACCCATGGACCCTGC;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=30;WE=135764089;WS=135764071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr9	135773000	rs3049911	G	GA	288.14	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=2.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.07;MQRankSum=1.818;QD=13.72;ReadPosRankSum=-1.049;SOR=0.333;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr9	135776034	rs1076160	C	T	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=257;SC=CTATGCCATGCGGGAGACATA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=135776042;WS=135776024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	135861998	rs2073577	T	G	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=3;PP=331;SC=TATGGAGGGGTATTGTTCTCT;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=135862006;WS=135861988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	135862592	rs2073578	A	C	1408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=3;PP=1141;SC=CCTCCTAGGAAGGGCGTGCCC;SOR=4.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=44;WE=135862600;WS=135862582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr9	135862632	rs633153	C	T	2314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=17;PP=1805;SC=TCCCAGAAACCGTGGCTATTG;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=52;TCR=17;TR=69;WE=135862640;WS=135862622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr9	135977583	rs2519091	C	T	1637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.26;SOR=3.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	135977586	rs76832424	C	T	1674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.26;SOR=3.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	135978153	rs694881	G	C	1753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=16;PP=1298;SC=CCCATTTGCTGCCCCGGCCTC;SOR=1.961;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=54;WE=135978161;WS=135978143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	135979751	rs598499	C	G	1261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=28;PP=979;SC=CAGCAAGGCCCTATCCCCTCA;SOR=1.845;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=135979759;WS=135979741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	135984970	.	G	A	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=3;PP=862;SC=CCCACTGTTCGGTGGGGACAG;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=135984978;WS=135984960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	135996568	.	CCGGCCCGGCGCGCGGCGGGGG	C	99.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.08;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	136030458	rs651453	C	T	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=19;NR=1;PP=520;SC=CCGAGCCTCCCGGGTGCCCAG;SOR=3.912;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=20;WE=136030466;WS=136030448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	136030716	rs117184386	C	T	1409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=39;PP=1250;SC=GCAGGGGGGCCGTGGGCACTG;SOR=3.564;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=46;WE=136030724;WS=136030706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	136031346	rs2073927	A	G	1955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.424;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=29;PP=1453;ReadPosRankSum=-0.679;SC=AGGACCAGTGATGGAGGAGAG;SOR=0.572;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=66;TCF=36;TCR=30;TR=64;WE=136031354;WS=136031336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr9	136031550	rs2073926	A	T	285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=244;SC=GCGGGTGGGCACCCAGGGTCC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=136031558;WS=136031540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	136036927	rs35602119	TA	T	1068.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=21;PP=765;SC=ACCCTGTGAATAAAAAAAAGA;SOR=0.741;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=34;WE=136036935;WS=136036917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	136037742	rs2073924	G	A	4944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=53;PP=2965;SC=AGGACACTGAGGCTTGTGCCC;SOR=1.364;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=92;TCR=53;TR=145;WE=136037750;WS=136037732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr9	136037845	rs2073923	T	C	3201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=83;PP=2460;SC=AGACCCCCACTGGCCTGGGCG;SOR=2.045;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=31;TCR=83;TR=114;WE=136037853;WS=136037835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr9	136080746	rs1052517	A	G	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.32;QD=28.86;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	136081261	.	AG	A	1879	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MMLQ=29;MQ=45.86;NF=32;NR=24;PP=1879;QD=34.429123212;SC=CCGGGAACCCAGGACTCTGGG;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=128;TCF=81;TCR=47;TR=56;WE=136081269;WS=136081251;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:72,56:0.44:128
chr9	136081364	.	GC	G	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=25;MMLQ=24;MQ=47.82;NF=2;NR=45;PP=2962;QD=20;SC=ATTAGAAGGCGCCCTAGACCA;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=130;TCF=20;TCR=110;TR=47;WE=136081372;WS=136081346;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:83,47:0.36:130
chr9	136081391	rs6597608	G	A	2904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=95;PP=2965;SC=AGACCCCATCGCAGCCCAGAG;SOR=2.571;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=20;TCR=95;TR=115;WE=136081399;WS=136081381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr9	136081416	.	G	C	511	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=46;MMLQ=27;MQ=47.84;NF=0;NR=27;PP=511;QD=20.2137486129;SC=GAGCCCCAGAGCCCATCGCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=92;TCF=11;TCR=81;TR=27;WE=136081424;WS=136081406;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:65,27:0.29:92
chr9	136081436	.	C	T	255	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=44;MMLQ=24;MQ=44.73;NF=0;NR=16;PP=255;QD=18.1107007842;SC=GCCCAGAGCGCGGAGCCCCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=6;TCR=53;TR=16;WE=136081444;WS=136081426;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:43,16:0.27:59
chr9	136081466	rs6597609	C	T	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5245;FS=3.867;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-2.741;NF=6;NR=23;PP=671;ReadPosRankSum=4.365;SC=CAGCCCAGAGCGCGGAGCCCC;SOR=0.259;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=29;WE=136081474;WS=136081456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:9,29:0.76:38
chr9	136081598	rs28507496	C	T	2679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=14;PP=2136;SC=TCGGGGCACACGGGGAATGCG;SOR=2.861;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=67;TCR=14;TR=80;WE=136081606;WS=136081588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr9	136083580	rs2073870	T	G	50.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.66;QD=16.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	136083638	rs72769499	C	G	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.450;NF=3;NR=1;PP=65;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ACACCCATGGCCCATCCTCAG;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=136083646;WS=136083628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr9	136083801	rs4310274	A	G	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=2;PP=899;SC=CACCAGGTGGATCTGGGGAGG;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=32;WE=136083809;WS=136083791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	136132908	rs8176719	T	TC	972.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=21;PP=991;SC=AGCCAAGGGGTACCACGAGGA;SOR=3.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=23;WE=136132916;WS=136132898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	136133380	.	CGGG	C	2282.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=13;PP=1702;SC=GAGGAGAGAACGGGGAAGCAG;SOR=1.893;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=39;WE=136133390;WS=136133370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr9	136133506	rs512770	A	G	1858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=37;PP=1469;SC=AGCACCTTTGACTGGGGGTAG;SOR=1.569;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=55;WE=136133514;WS=136133496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	136133582	rs8176712	AG	A	846.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=877;SC=GCAGGTAAGCAGGGGGTGTGC;SOR=4.332;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=25;WE=136133590;WS=136133572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	136135137	.	GCTTCTGTCCACAC	G	1023.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=2957;SC=GCTCCCACATGCTTCTGTCCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=136135157;WS=136135127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	136135195	rs549331	G	C	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=96;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=6;PP=894;SC=GACATGGGAGGCACTGAAGGG;SOR=2.964;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=136135203;WS=136135185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	136135237	rs549443	AT	GC	2311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=14;PP=2045;SC=GCAACGAGACATGCTGCAGAT;SOR=1.358;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=43;WE=136135246;WS=136135227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr9	136135365	rs624601	A	G	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=30;PP=914;SC=AGTGGAAGGGACACAGCGTCA;SOR=3.145;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=35;WE=136135373;WS=136135355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	136135444	rs551322	G	A	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=224;SC=GATGGGCCTGGCGTGGGCCCG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=136135452;WS=136135434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	136136770	rs688976	A	C	2654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=47;PP=2135;SC=GGGCTTAGGAACCCGTAACTG;SOR=0.922;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=86;TCF=38;TCR=48;TR=85;WE=136136778;WS=136136760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr9	136150466	rs616154	C	T	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=1;PP=133;SC=GCGGCCGGCCCGAAGCCTCGC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=136150474;WS=136150456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	136150484	rs559723	A	G	146.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=1;PP=116;SC=CGCAGCCCTGAGCGCCCCCAC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=136150492;WS=136150474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	136185077	rs9411507	T	G	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=5;PP=457;SC=TCTCCAGCCTTTGGGGTGCGG;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=16;WE=136185085;WS=136185067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	136185358	rs544622	T	C	182.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.13;QD=30.47;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	136201470	rs563666	C	A	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=20;PP=593;SC=GTTAAGTCCCCATCTCATGGC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=136201478;WS=136201460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	136213521	rs616836	T	C	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=22;PP=613;SC=GGGCCATGGCTGAGCCTCAAG;SOR=2.448;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=136213529;WS=136213511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	136214955	rs553877	A	G	1404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=1;PP=1074;SC=GCAGCCTCTCAGCCCCGCCTC;SOR=6.479;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=50;WE=136214963;WS=136214945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr9	136218590	rs484248	CA	AG	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=446;SC=ATGTAACTTGCATATCAAGTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=136218599;WS=136218582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	136223366	rs523304	G	A	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=272;SC=GGACGCAGGAGGCATCTGCAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=136223374;WS=136223356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	136227260	rs12763	A	G	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=860;ReadPosRankSum=-0.685;SC=CACTGATGAGAGCAGGAGAGA;SOR=0.818;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=34;WE=136227268;WS=136227250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr9	136228007	rs61751475	C	T	5394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=94;PP=2965;SC=CTGTAAACAGCCAGGTTAATA;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=73;TCR=94;TR=167;WE=136228015;WS=136227997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr9	136234124	rs1179033	A	G	1726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=13;PP=1160;SC=ACCACCCGCAAAGCCACTCAC;SOR=1.739;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=48;WE=136234132;WS=136234114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	136237783	rs4962046	C	A	3055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=37;PP=2382;SC=TAAGTCTCTCCGAGAACCGCG;SOR=1.090;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=57;TCR=37;TR=94;WE=136237791;WS=136237773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr9	136259340	rs28394600	C	G	1842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=7;PP=1571;SC=GGATACAGTGCTGGGCAGGGT;SOR=3.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=51;TCR=7;TR=58;WE=136259348;WS=136259330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	136267811	.	T	C	142	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=6;NR=1;PP=142;QD=25.2530303639;SC=GGACTGGTGGTCCACGAGATG;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=136267819;WS=136267810;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	136268038	rs3124748	C	T	1601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=32;PP=1187;SC=AGCTGCAGAACGCTGGGCTGC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=48;WE=136268046;WS=136268028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr9	136268912	rs28510482	A	G	2773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=61;PP=2182;SC=GGGAAATGGCAGAAGCCAGCT;SOR=1.890;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=25;TCR=61;TR=86;WE=136268920;WS=136268902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr9	136268962	rs28714280	G	A	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=33;PP=1077;SC=GGTGAGCTGGGTGGGCGCCCT;SOR=2.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=42;WE=136268970;WS=136268952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	136274056	.	C	CTTTGTGTGTG	655	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=66.19;NF=1;NR=13;PP=655;QD=47.0;SC=CAAGTAACATCTGTGTGTGTG;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=14;WE=136274064;WS=136274046;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,14:0.88:16
chr9	136277480	rs2285486	A	G	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=5;PP=587;SC=TCACGGGCTCAGTTGGTTTGA;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=136277488;WS=136277470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	136291063	rs3118667	C	T	4108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=33;PP=2965;SC=CGCAGGGTGCCCCAAATATCA;SOR=2.049;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=87;TCR=33;TR=119;WE=136291071;WS=136291053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr9	136291539	rs3118668	A	G	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=458;SC=AGGTGGTCTTAGCAAGCAGTG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=136291547;WS=136291529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	136295290	rs3124773	A	C	1417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=27;PP=1037;SC=CACGTCCCCCAAAACGTGCAT;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=16;TCR=27;TR=43;WE=136295298;WS=136295280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	136298729	rs739469	G	C	1849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=25;PP=1323;SC=TCACCCTGCTGTCTCACCCTC;SOR=0.871;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=29;TCR=25;TR=54;WE=136298737;WS=136298719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr9	136304497	rs3124768	A	G	2459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=42;PP=1845;SC=AATATGTCACATTTCTGACAG;SOR=0.812;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=43;TCR=42;TR=85;WE=136304505;WS=136304487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr9	136305439	rs2073932	G	A	2378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=12;PP=1888;SC=AGCTCCACACGGCTAACAGGG;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=62;TCR=12;TR=74;WE=136305447;WS=136305429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr9	136308542	rs3124767	C	T	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=16;PP=606;SC=CCTGTGGGGGCGGCCTGCGGG;SOR=0.826;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=28;WE=136308550;WS=136308532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	136328657	rs3124765	T	C	2432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=69;PP=1928;SC=CTCTGAACATTGCGGCCGGCG;SOR=3.482;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=12;TCR=69;TR=81;WE=136328665;WS=136328647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr9	136340200	rs2073935	T	G	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=15;PP=656;SC=GGCACACGTGTGGGGCCCGTG;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=26;WE=136340208;WS=136340190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	136384162	rs11523307	A	G	2701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=67;PP=2119;ReadPosRankSum=0.428;SC=GGCCAGGGAGACACAGGGGGA;SOR=1.004;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=86;TCF=16;TCR=70;TR=83;WE=136384170;WS=136384152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,87:0.98:89
chr9	136385437	rs9802272	A	G	2910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=70;PP=2325;SC=AGGTGGTCACAGCACAAAGAG;SOR=2.229;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=22;TCR=70;TR=92;WE=136385445;WS=136385427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr9	136385453	rs9802273	A	G	2527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=66;PP=2085;SC=AAGAGGCCAGAGCTGGTCCCC;SOR=3.698;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=10;TCR=66;TR=76;WE=136385461;WS=136385443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr9	136401606	rs11507717	A	C	2783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=8;PP=2225;ReadPosRankSum=0.780;SC=GTCTTGCCTGAAGCAGGCATT;SOR=3.009;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=75;TCR=8;TR=82;WE=136401614;WS=136401596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,86:0.99:87
chr9	136402345	rs11516156	T	A	344.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=280;ReadPosRankSum=1.034;SC=TCCTTGGGAGTTCCCCCCAGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=136402353;WS=136402335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr9	136404775	.	A	ACGGCTGTCCCGGCTGTCCCGGCTGTCCCGGCTGTCC	571.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=95.29;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	136409529	rs11522325	C	T	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=2;PP=894;SC=GTGGAGTGGGCGAGTGCCACC;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=36;WE=136409537;WS=136409519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	136409563	rs138789954	G	A	2545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=12;PP=2052;SC=CCAATCAAGAGGGGCTCACTG;SOR=3.116;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=63;TCR=12;TR=75;WE=136409571;WS=136409553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr9	136409580	rs9802778	T	G	2772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=27;PP=2182;ReadPosRankSum=1.163;SC=ACTGTCATCCTTTTGCCTCCA;SOR=0.949;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=71;TCR=27;TR=97;WE=136409588;WS=136409570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr9	136412041	rs11507719	C	T	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=1;PP=1027;SC=TTTCCTGTCTCGGGAGCATTT;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=37;WE=136412049;WS=136412031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	136412170	rs2073874	C	T	6005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=106;NR=88;PP=2965;SC=CTCTTGCAGACGAAGCTGGCT;SOR=0.901;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=106;TCR=88;TR=194;WE=136412178;WS=136412160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr9	136412236	rs2073875	A	T	5367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=109;PP=2965;ReadPosRankSum=0.140;SC=TCAACATCGCAGGCACGGTGG;SOR=0.702;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=53;TCR=110;TR=162;WE=136412244;WS=136412226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,173:0.99:174
chr9	136412255	rs2073876	A	C	3591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=91;PP=2538;ReadPosRankSum=-0.812;SC=GGTCAAGTACAGGCGGCCCAT;SOR=1.110;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=121;TCF=29;TCR=92;TR=120;WE=136412263;WS=136412245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,129:0.99:130
chr9	136412346	rs2073878	C	T	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=33;PP=933;SC=GTACGTGTGCCGCAGGCCTTG;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=36;WE=136412354;WS=136412336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	136412382	rs2073879	T	C	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=639;SC=CTGGGCACTGTTTCCCCAGAA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=136412390;WS=136412372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	136501941	rs2797849	G	C	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=29;PP=862;SC=TCTGTCACCTGTCAGTGTTTG;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=136501949;WS=136501931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	136505114	rs1108580	A	G	1466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=28;PP=1229;SC=ACCTCATTGAAGTAAGGGGTG;SOR=1.251;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=48;WE=136505122;WS=136505104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	136509312	rs1611125	C	T	2664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=12;PP=2192;SC=AGGACACACCCGTCTGTCTGA;SOR=3.174;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=65;TCR=12;TR=77;WE=136509320;WS=136509302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr9	136509514	rs1611128	G	A	3212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.400;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=92;PP=2447;ReadPosRankSum=0.834;SC=AGCAAATCCCGCCCTTCGTCT;SOR=1.675;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=22;TCR=97;TR=113;WE=136509522;WS=136509504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,122:0.97:126
chr9	136518097	rs77905	A	G	1444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=15;PP=1162;SC=CGTACAACACAGAAGACCGGG;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=49;WE=136518105;WS=136518087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr9	136523669	rs129882	C	T	273.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=4;PP=167;SC=CAGCCCTGCACGCCCAGGATG;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=136523677;WS=136523659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	136532107	rs7854480	G	C	259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=206;SC=CGTGGCTCCAGGCAGATAGGG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=136532115;WS=136532097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	136561303	rs2502739	A	T	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=3;PP=1313;SC=GGCTGTGCCCATGGAGTGACA;SOR=4.565;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=42;WE=136561311;WS=136561293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	136561367	rs2502740	G	A	2714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=19;PP=2329;SC=TGACATCTGCGGAGAAGAGCC;SOR=2.503;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=63;TCR=19;TR=82;WE=136561375;WS=136561357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr9	136561567	rs2427998	G	T	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=31;PP=925;SC=CGGGGGCTGTGTCCAACACAC;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=136561575;WS=136561557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	136569974	rs2510248	G	A	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=287;SC=CTGGGGAGGCGGGGCACACGG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=136569982;WS=136569964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	136570004	rs2502747	GT	AC	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=3;PP=896;SC=GACGGGGCACGTGGAGGGGCA;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=136570013;WS=136569994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	136573412	rs2073815	G	A	4190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=22;PP=2965;SC=GCGTTACCTCGTGCAGCGGGT;SOR=3.190;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=105;TCR=22;TR=127;WE=136573420;WS=136573402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr9	136578271	rs582326	G	C	2924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=56;PP=2310;SC=GAGAGGCCTGGAGTCCCTTTT;SOR=1.414;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=32;TCR=56;TR=88;WE=136578279;WS=136578261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr9	136584196	rs2027963	T	G	2597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=55;PP=2023;SC=CTTGGCATCATCCAGAACTGG;SOR=2.026;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=77;WE=136584204;WS=136584186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr9	136590812	rs150689824	A	AAAAC	721.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.57;QD=42.45;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	136594864	rs2427988	A	G	1164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=12;PP=750;SC=AGACTGACACAGAACCCGGGG;SOR=1.259;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=37;WE=136594872;WS=136594854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	136596397	rs916619	G	A	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=0;PP=1032;SC=GCTGGGAACAGGGGACCCAGA;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=136596405;WS=136596387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	136599146	rs573904	C	T	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=21;NR=20;PP=905;SC=CCGAGGTGCCCTGTCCCTCCT;SOR=0.741;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=21;TCR=20;TR=41;WE=136599154;WS=136599136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	136599315	rs2488553	G	A	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=174;SC=AGGCCTCAGCGAAACAGGGAG;SOR=1.863;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=136599323;WS=136599305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	136629256	rs66574029	CTG	C	1009.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=17;PP=1099;SC=AAGATCGTGTCTGTGTGTGTG;SOR=1.536;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=23;WE=136629265;WS=136629246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	136629298	rs2797825	A	G	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=20;PP=668;SC=GTGCATGTCTATGTTGGGGTG;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=136629306;WS=136629288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	136629399	rs2797826	G	A	236.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.88;NF=0;NR=8;PP=192;SC=GGGAGTAAGAGCAACCCAGAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=136629407;WS=136629389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	136637198	rs653967	C	T	3032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=79;PP=2485;SC=CGGCGGTCACCGCGTGAGGGC;SOR=2.742;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=20;TCR=79;TR=99;WE=136637206;WS=136637188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr9	136637242	rs2510244	A	G	1593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=50;PP=1390;SC=AGCCAGGCTCATTCTGTGTTT;SOR=6.439;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=51;WE=136637250;WS=136637232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr9	136640226	rs2488559	G	A	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=22;PP=659;SC=CAGTGTCTGAGGGGTGCCCAG;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=136640234;WS=136640216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	136641313	rs2077065	G	C	1667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=37;PP=1154;SC=CTGCCCTGGAGGGGACTGTCT;SOR=2.001;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=52;WE=136641321;WS=136641303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr9	136648535	rs2488563	T	C	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=2;PP=349;SC=CCGTGGGAGATGGTGCCCGAG;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=136648543;WS=136648525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	136648565	rs680458	G	A	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=60.35;NF=26;NR=4;PP=834;SC=CAGGTGGTAGGGGGCAGAAGT;SOR=3.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=136648573;WS=136648555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	136648606	rs1468128	G	A	2030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.24;QD=45.13;SOR=3.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr9	136648611	rs56145872	A	AG	2083.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=34;NR=7;PP=1400;SC=TGGGGGGGTGAGGGGGGTACT;SOR=3.398;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=41;WE=136648619;WS=136648596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr9	136648746	rs13283160	G	C	2688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=60;PP=2130;SC=TGAGGTCGAGGCTGGGGTCGG;SOR=1.809;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=26;TCR=60;TR=86;WE=136648754;WS=136648736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr9	136654497	rs2072059	G	A	1646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=42;PP=1355;SC=GTCAGCCGGGGCTGGAGCAGC;SOR=2.790;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=10;TCR=42;TR=52;WE=136654505;WS=136654487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr9	136654553	rs10821524	A	C	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=744;SC=TCGTGCACCCAAGGGAACTCC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=136654561;WS=136654543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	136804211	rs2073886	G	A	2666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=9;PP=2160;SC=AGGCTGGAGAGAGTGACTGCT;SOR=3.994;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=68;TCR=9;TR=77;WE=136804219;WS=136804201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr9	136898627	rs433402	A	G	1597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=10;PP=1294;SC=ACCATGGAACAGAAGTAGTAA;SOR=3.219;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=49;TCR=10;TR=59;WE=136898635;WS=136898617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	136905474	rs467379	C	T	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=482;SC=TTGGAGGGGGCTTGGGGCGAT;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=136905482;WS=136905464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	136907005	rs467387	G	A	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=13;PP=897;SC=TGGGGGCCGCGGGGGCAGGCA;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=34;WE=136907013;WS=136906995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	136907108	rs467317	G	A	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=23;PP=775;SC=GAAGACATGGGTGCCCATGGG;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=136907116;WS=136907098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	136913355	rs464826	T	C	1872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=16;PP=1479;SC=CGCAGTAGCGTAGGTGCTCCG;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=39;TCR=16;TR=55;WE=136913363;WS=136913345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr9	137271318	rs35196866	C	A	907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=17;PP=711;SC=TGGAGGAGGGCCCCCAGGACC;SOR=1.143;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=29;WE=137271326;WS=137271308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	137271408	rs34133915	G	C	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=15;PP=390;SC=TCGGCCTCATGGGGGGCTTGC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=137271416;WS=137271398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	137271454	rs34189335	A	G	190.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=6;PP=141;SC=GCTCCCTGACAGCCGCAGGGT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=137271462;WS=137271444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	137293761	rs2234753	G	A	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=30;PP=883;SC=GGGAGGGGGTGGGGCCTGGGG;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=137293769;WS=137293751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	137299949	rs1805352	C	A	2423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=20;PP=1876;SC=GACATAGGGACAAACCTGGTG;SOR=1.905;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=73;TCF=53;TCR=20;TR=71;WE=137299957;WS=137299939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr9	137320855	rs3118570	G	T	1429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=0;PP=1167;SC=AGGATGGGTCGGTGACATGCT;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=137320863;WS=137320845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	137321156	rs1536475	A	G	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=31;PP=887;SC=GAGTTCAGCCACCTTGGCCCC;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=137321164;WS=137321146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	137325822	rs3132293	T	C	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=480;SC=CCAGCGGCATTCCTCCACCAC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=137325830;WS=137325814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	137328286	rs1805343	G	A	3303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=82;NR=25;PP=2649;SC=CCCCTTGCCCGGCCCTCACCA;SOR=2.325;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=82;TCR=26;TR=107;WE=137328294;WS=137328276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr9	137592961	rs4341231	T	C	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=0;PP=791;SC=GCAGCAAAATTGCTTGAGCTG;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=137592969;WS=137592951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	137600270	.	T	G	84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=84;QD=39.5904041824;SC=ACTCCCGGGGTGGGGGCTCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=137600278;WS=137600260;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
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chr9	137620417	rs41310209	G	A	854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=0;PP=703;SC=TGGACGGGGCGTCGTGGCGTG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=137620425;WS=137620407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	137672012	rs3124932	C	T	2037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=50;PP=1561;ReadPosRankSum=1.737;SC=TCCTTGCAGCCACGGGGCCCC;SOR=1.552;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=14;TCR=51;TR=64;WE=137672020;WS=137672002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr9	137715150	rs3128599	AT	TG	3274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=20;PP=2947;SC=GCTGTGGCTGATAGGGCCACC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=47;TCR=22;TR=64;WE=137715159;WS=137715140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr9	137717610	rs7868111	T	C	1287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=12;PP=963;SC=TGACTCTGCCTGCCTCCCTCC;SOR=1.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=44;WE=137717618;WS=137717600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	137733937	rs12554062	T	G	3373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=26;PP=2835;SC=TTGTGGGGGGTGATTGGTAAA;SOR=2.215;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=79;TCR=26;TR=105;WE=137733945;WS=137733927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr9	137742043	.	G	T	1353	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MMLQ=24;MQ=46.46;NF=53;NR=29;PP=1353;QD=16.9240391774;SC=GGAAGCACGGGATCACACCTC;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=195;TCF=125;TCR=70;TR=82;WE=137742051;WS=137742033;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:113,82:0.42:195
chr9	137742124	rs62571442	G	A	6954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.824;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-1.326;NF=147;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.096;SC=GGATCACACCGCTCAGGAAGA;SOR=0.232;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=263;TCF=151;TCR=112;TR=258;WE=137742132;WS=137742114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,231:0.99:233
chr9	137742496	.	TGGGATCAGACCTCCCAGGGAGCACGGGATCACACCTCCCAGGAAAGCAC	T	4015.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.03;QD=44.13;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr9	137742538	.	GA	G	1003	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=29;MQ=55.22;NF=10;NR=14;PP=1003;QD=43.8346208279;SC=CACCTCCCAGGAAAGCACGGG;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=24;WE=137742553;WS=137742528;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,24:0.77:31
chr9	137772664	rs17514136	A	G	3247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=34;PP=2496;SC=AAAGACCAGAAGAGATGGAGC;SOR=1.284;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=59;TCR=34;TR=93;WE=137772672;WS=137772654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr9	137772792	rs3128627	C	T	1190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=32;PP=962;SC=GGGCCTCCTCCTGGAAACTTC;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=137772800;WS=137772782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	137775084	rs7024491	A	G	1879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=17;PP=1481;SC=CGCCAGCTCCAGGGTGGGCCC;SOR=1.758;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=44;TCR=17;TR=61;WE=137775092;WS=137775074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr9	137775212	rs7037264	G	A	1930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=40;PP=1511;SC=GTAAGGAGGGGACAAGAGTGA;SOR=1.903;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=57;WE=137775220;WS=137775202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr9	137779026	rs17549193	C	T	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=9;PP=721;SC=GATTCCCTGACGTTCCACAAC;SOR=1.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=137779034;WS=137779016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	137779306	rs4521835	T	G	2214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=50;PP=1796;SC=CATAGTTGGTTGGGGGGTAGG;SOR=1.965;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=73;TCF=23;TCR=50;TR=72;WE=137779314;WS=137779296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	137801314	rs2989734	A	G	4803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.994;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=57;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.845;SC=TCTGCTAAATAAGGGTCCTGA;SOR=0.947;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=142;TCF=84;TCR=58;TR=141;WE=137801322;WS=137801304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,147:0.99:148
chr9	137801416	rs2989735	T	C	4727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=78;PP=2965;SC=GAAACACACATTGAAACTGGT;SOR=1.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=55;TCR=78;TR=133;WE=137801424;WS=137801406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr9	137801800	rs1071583	T	C	4720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=53;PP=2965;SC=ACCAGGCTCCTTGGAACTTCT;SOR=1.398;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=92;TCR=53;TR=145;WE=137801808;WS=137801790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr9	137804360	rs2274845	A	G	1782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.97;NF=32;NR=29;PP=1386;SC=GGATGTTGTCATTCCCCAGCC;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=32;TCR=29;TR=61;WE=137804368;WS=137804350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr9	137804830	rs2070622	G	C	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=50.66;NF=20;NR=0;PP=539;SC=GGGACTCCCAGGCTGACCGCC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=137804838;WS=137804820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	137806329	rs11421281	T	TC	3967.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.12;NF=11;NR=44;PP=2342;SC=GAAAGGCTGGTCCAGAGTGGG;SOR=1.402;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=74;TCF=14;TCR=60;TR=55;WE=137806352;WS=137806319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr9	137806334	rs2989721	A	G	4096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.55;SOR=1.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr9	137806344	rs3012788	C	T	3505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.38;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr9	137806487	rs2989722	G	A	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=10;PP=368;SC=CTCTGTTGCCGTGTCTCTCTG;SOR=1.022;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=17;WE=137806495;WS=137806484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr9	137808427	rs2382714	T	A	580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=14;PP=448;SC=GAGGCGGAGATGTGATGGGGG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=137808435;WS=137808417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr9	137809861	rs10117466	G	T	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=113;SC=GGAGGTATGAGGTCATCTCAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=137809869;WS=137809851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr9	137978552	rs4446800	A	G	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=33;PP=978;SC=CCTGCGCTTCAGGTGGGACTG;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=43;WE=137978560;WS=137978542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	137978638	rs695156	T	G	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=289;SC=CCTGCCTCTGTGCCTGGGCGC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=137978646;WS=137978628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	137982127	rs500461	T	C	1862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=21;PP=1536;SC=CAGTGGTCGCTCCACAGCAGA;SOR=1.355;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=39;TCR=21;TR=60;WE=137982135;WS=137982117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr9	137982232	rs56337838	T	G	902.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.59;QD=34.72;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	137982234	rs10672761	G	GTT	580.06	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.86;MQRankSum=0.000;QD=27.62;ReadPosRankSum=0.060;SOR=2.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,19:0.90:21
chr9	137988461	.	C	T	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=457;SC=TGAGATCCTGCGCTGCCCGAG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=137988469;WS=137988451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	137988675	rs655559	T	C	2933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=64;PP=2233;ReadPosRankSum=-1.245;SC=AAGAGAGAGATGCCAGCCTCC;SOR=1.499;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=35;TCR=65;TR=98;WE=137988683;WS=137988665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,104:0.98:106
chr9	137998709	rs35408956	T	A	2522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=59;PP=1865;SC=CGGGTGAGTGTCCCCTTATGT;SOR=3.042;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=77;TCF=15;TCR=62;TR=74;WE=137998717;WS=137998699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr9	138236031	rs914398	A	G	2599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=75;NR=17;PP=2321;SC=CCGGACGCCCAGTCCTGGGCT;SOR=2.935;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=76;TCR=17;TR=92;WE=138236039;WS=138236021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr9	138236212	rs914397	T	G	2845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.99;NF=14;NR=70;PP=2390;SC=ACCGCCCCAATGGGGTTGGTT;SOR=3.206;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=14;TCR=70;TR=84;WE=138236220;WS=138236202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr9	138377498	rs34151777	G	T	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=26;PP=779;SC=CAGAAAACACGCAAGGAGGCC;SOR=4.548;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=138377506;WS=138377488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	138378856	rs2078266	A	G	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=20;PP=703;SC=AGTGGACAGCAACGACAGCAT;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=138378864;WS=138378846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	138379002	rs1975518	T	G	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=2;PP=435;SC=GGAAGGAGCCTGCCCCACCGC;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=138379010;WS=138378992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	138387483	rs2274650	G	A	1327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=38;PP=1140;SC=AAAGGAACACGGATTAATGAC;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=38;WE=138387491;WS=138387473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	138391299	rs7037251	T	A	4124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.238;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=51;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.279;SC=CCGACACAAATCAGTGGAGCT;SOR=1.051;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=138;TCF=84;TCR=54;TR=134;WE=138391307;WS=138391289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,134:0.97:138
chr9	138391517	rs2274651	A	C	1466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=28;PP=1092;SC=GCTATCGAGCAGTGGACGCCA;SOR=1.094;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=48;WE=138391525;WS=138391507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr9	138391774	rs2274652	C	T	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=20;PP=539;SC=GGGGAGCGAGCGGAGGGGCCT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=138391782;WS=138391764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	138415201	rs56239374	C	G	942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=13;NR=18;PP=665;SC=GCTGGATGTGCGGGGGCAGCC;SOR=1.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=31;WE=138415209;WS=138415191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	138415238	rs56120410	C	G	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=16;PP=505;SC=GGCCTTTTGGCCTGGGAAGCC;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=138415246;WS=138415228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	138416919	rs3216169	GC	G	1185.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=2;PP=1208;SC=CTGATGAGGGGCCCCGGTCCT;SOR=3.797;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=33;WE=138416927;WS=138416909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	138438976	rs78161279	G	C	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.50;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	138438980	rs4006724	G	T	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.50;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	138438982	rs4006725	T	G	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.50;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	138439005	rs504061	A	C	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=262;SC=CCGCTGCCCGAGTGTCTCCTG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=138439013;WS=138438995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	138439189	rs148884427	G	GC	1537.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=14;PP=1070;SC=CTTCTGCCAGGGTCCCAGCCC;SOR=0.749;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=24;WE=138439198;WS=138439179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	138439190	rs62578296	G	T	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=14;PP=698;SC=TTCTGCCAGGGTCCCAGCCCT;SOR=0.749;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=26;WE=138439198;WS=138439179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	138439806	rs72766543	C	T	1660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.65;QD=44.89;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	138439809	rs72766544	T	C	1693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.68;QD=43.43;SOR=2.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr9	138439904	rs72766546	C	T	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=30;PP=946;SC=ACCATCATCACGCCCTGGCAC;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=34;WE=138439912;WS=138439894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	138440554	rs55695858	G	C	3216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.56;QD=45.31;SOR=5.226;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	138440562	rs3178137	C	T	3344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.86;QD=44.01;SOR=5.367;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
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chr9	138440641	rs2853652	T	C	7552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=59;PP=2965;SC=GACATTTTCATGCCCCTGCAG;SOR=1.557;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=114;TCR=59;TR=173;WE=138440649;WS=138440631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr9	138440726	rs3827838	C	T	6129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.56;QD=44.74;SOR=2.902;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr9	138440726	.	CCA	TCG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=33;MMLQ=24;MQ=59.62;NF=20;NR=95;PP=2947;QD=20;SC=CCCATGACCCCCATGTCCTCC;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=123;TCF=21;TCR=102;TR=115;WE=138440736;WS=138440716;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,115:0.93:123
chr9	138440728	rs3827839	A	G	6174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.54;QD=46.43;SOR=2.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr9	138440748	rs3827840	C	T	4993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.40;QD=48.96;SOR=3.745;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr9	138440756	rs3827841	G	A	4442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.37;QD=45.33;SOR=4.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr9	138441685	rs112851559	G	GC	600.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.079;NF=10;NR=9;PP=602;ReadPosRankSum=1.618;SC=CAGCACAGCAGCCCCCGGGTC;SOR=0.760;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=26;TCF=15;TCR=11;TR=19;WE=138441693;WS=138441675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,23:0.79:29
chr9	138441760	rs7859414	C	A	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.697;NF=12;NR=21;PP=674;ReadPosRankSum=1.091;SC=TACCCTCCAGCCATGACCCTT;SOR=0.593;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=33;WE=138441768;WS=138441750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,33:0.85:39
chr9	138453811	rs697448	A	G	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=14;PP=458;SC=GCGGGCAGGCAGGAAGCCCAG;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=138453819;WS=138453801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	138517853	rs1333241	G	C	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=387;SC=GAGGTTAAAGGCTCGTGAATG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=138517861;WS=138517843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	138518010	rs1333240	A	G	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=15;NR=8;PP=464;SC=CCCATAGGACAGGAGCGAGCC;SOR=1.270;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=23;WE=138518018;WS=138518000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	138518114	rs11103106	G	A	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=13;PP=391;SC=AGCAGGTGCCGAGCAGTAATG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=138518122;WS=138518104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	138523332	rs1333234	C	A	3350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=54;PP=2434;SC=TTCCTGGATACAAAGAGAAAA;SOR=1.008;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=45;TCR=55;TR=99;WE=138523340;WS=138523322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr9	138523411	rs1333233	C	T	1679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=41;PP=1375;SC=TTTGGTGTTTCGTCAACATGC;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=10;TCR=41;TR=51;WE=138523419;WS=138523401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	138557256	rs492708	C	T	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=9;PP=230;SC=CTCTGAAGTCCGGCCCAACCC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=138557264;WS=138557246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	138586198	rs572335	G	A	2717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=15;PP=2249;SC=GTGCTTACGCGGGGGGACCAG;SOR=2.915;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=70;TCR=15;TR=85;WE=138586206;WS=138586188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr9	138586309	rs484524	A	G	5080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=77;PP=2965;SC=CAGACCTGGAAGCGACAAGCT;SOR=0.824;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=82;TCR=77;TR=159;WE=138586317;WS=138586299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr9	138586457	rs548911	T	C	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=32;PP=704;SC=CGGGGAGAAATGCAGAGGCCA;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=138586465;WS=138586447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	138586940	rs55674357	C	A	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=9;NR=2;PP=253;SC=CTGGCTCCCCCAGAGGTGCAG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=138586948;WS=138586930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	138586966	rs3119932	GC	AA	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=3;PP=510;SC=ATGGCCAGGGGCCCAGCCTGG;SOR=2.448;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=12;WE=138586975;WS=138586956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	138587203	rs2769033	A	G	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=264;SC=GTCCACTCACACTGACCGAGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=138587211;WS=138587193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	138587220	rs2483364	T	C	290.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=9;PP=241;SC=GAGCACCTGCTCTGCTGCCTG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=138587228;WS=138587210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	138590138	rs506498	T	C	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=19;PP=1216;SC=ATCACCGTGATGCCGGAGGAC;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=59;TCF=39;TCR=20;TR=58;WE=138590146;WS=138590128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr9	138590347	rs529976	C	T	1747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=41;PP=1440;SC=GAAACAAATACCTCTGGGCCC;SOR=2.522;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=53;WE=138590355;WS=138590337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	138590680	rs474061	G	C	144.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=3;PP=95;SC=TTCCCCAACAGGGCTTTTCTG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=138590688;WS=138590670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	138590928	rs471525	C	T	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=7;PP=200;SC=GCCCGAGCCCCGGGCCGAGTC;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=138590936;WS=138590918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	138591230	rs558113	C	T	2397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=34;PP=1801;SC=ACCCCTTGGCCGCCAGCCCAA;SOR=0.801;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=40;TCR=34;TR=74;WE=138591238;WS=138591220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr9	138591266	rs559326	A	G	2406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=47;PP=1889;SC=CCCTGACGGTAGGGATTCTGG;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=31;TCR=47;TR=78;WE=138591274;WS=138591256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr9	138594266	rs5901089	A	AC	971.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=2;NR=29;PP=1192;SC=CTAACCTAAGACCCCCAAGTT;SOR=3.056;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=31;WE=138594284;WS=138594256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	138662309	rs10776844	A	G	3006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.823;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=77;PP=2286;ReadPosRankSum=1.828;SC=GCCGGGCTGCATCCACAGGGC;SOR=3.657;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=90;TCF=12;TCR=78;TR=88;WE=138662317;WS=138662299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,98:0.98:100
chr9	138662661	rs10858172	G	A	1117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=6;PP=863;SC=GGGACAGGGCGGGTGAGCGGC;SOR=2.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=138662669;WS=138662651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	138669261	rs914428	G	A	3660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=75;PP=2787;SC=CGGCAGAGACGGCCGGCAATG;SOR=1.672;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=34;TCR=75;TR=109;WE=138669269;WS=138669251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr9	138675790	rs10776847	C	G	1719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=0;PP=1099;SC=GGTGCACACACAGTGCCCTCG;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=37;WE=138675809;WS=138675780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	138675801	rs10776848	A	C	1784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=0;PP=1114;SC=AGTGCCCTCGACCCCGTGGCT;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=40;WE=138675809;WS=138675780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	138678016	rs36221684	CGCCCT	C	2372.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=16;PP=2241;SC=CACCCCTCCCCGCCCTGCCCT;SOR=1.692;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=62;TCF=40;TCR=22;TR=42;WE=138678028;WS=138678006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	138679863	rs11103189	A	G	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=4;PP=898;SC=GCACCCGCCCACTGTGCCGGC;SOR=3.816;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=40;WE=138679871;WS=138679853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr9	138679895	rs11103190	T	C	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=10;PP=1331;SC=CGCTTGCTGATATTCTCTCTC;SOR=2.564;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=51;WE=138679903;WS=138679885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	138683575	rs41299048	T	C	2530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=66;NR=3;PP=2001;SC=CCCACACCTCTGGGCCCCTGC;SOR=5.811;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=66;TCR=3;TR=69;WE=138683583;WS=138683565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr9	138683790	rs41306389	T	C	2933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.91;SOR=3.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr9	138683798	rs41310949	C	T	2700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.01;SOR=3.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr9	138707727	rs913342	C	G	2295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=33;PP=1765;SC=GGAGGGCGAACGCCGTCACCT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=33;TCR=33;TR=66;WE=138707735;WS=138707717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr9	138754582	rs2039330	A	C	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=332;SC=CAATTGCAATAATCTAGAAAG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=138754590;WS=138754572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	138816898	rs4842048	T	C	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.53;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	138816906	rs4842049	T	C	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.51;SOR=3.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	138817142	rs11103226	C	T	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=291;SC=TCCCAGGTGCCCACTTGTTTC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=138817150;WS=138817132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	138817178	rs10776854	C	A	192.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=141;SC=GTGAACCTCGCACACACAGCT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=138817186;WS=138817168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	138825117	rs6569	A	C	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=0;PP=877;SC=GAGCAGGAGCAGCTGCAGCAC;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=138825125;WS=138825107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	138837113	rs10776856	T	C	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=283;SC=GGCAAGAGACTCTTTCCAACA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=138837121;WS=138837103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	138837958	rs2297691	C	T	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=30;PP=953;SC=CCCTCAGGCACATCAACAGGA;SOR=3.086;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=34;WE=138837966;WS=138837948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	138838140	rs7028495	T	C	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=9;PP=718;SC=ACAATTCCACTGCATCTGGGT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=138838148;WS=138838130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	138838305	rs2297690	G	A	1155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=24;PP=895;SC=TAGAACTCTTGATTCTGAGAG;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=34;WE=138838313;WS=138838295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	138839888	rs2297689	C	T	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=36;PP=1075;SC=CCTTGATGAGCTGGGGGAGCC;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=37;WE=138839896;WS=138839878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	138898893	rs4842070	C	G	1653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=11;PP=1430;SC=CCATCCAAATCTTCAAGTCAA;SOR=2.448;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=49;WE=138898901;WS=138898883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr9	138903671	rs9626	A	G	3733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=57;NR=65;PP=2965;SC=GTGCCGCGGCAGGCGGGAACT;SOR=0.814;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=122;TCF=57;TCR=65;TR=122;WE=138903679;WS=138903661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr9	138905884	rs11103273	T	C	199.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.20;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	138927183	rs149084098	T	C	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.34;QD=29.99;SOR=2.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	139008803	rs3739466	T	G	1419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=16;PP=1108;SC=TCCAGGCGGCTGTTGGCGTAG;SOR=1.519;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=48;WE=139008811;WS=139008793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr9	139091797	rs1924521	A	C	2862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=21;PP=2425;SC=GGTTGGAGAGAGGCAAGCGGC;SOR=2.435;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=71;TCR=21;TR=92;WE=139091805;WS=139091787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr9	139094773	rs2274115	A	G	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=12;PP=572;SC=CGGTGCAGCCACTCGGCCCGG;SOR=0.922;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=28;WE=139094781;WS=139094763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	139137570	.	G	A	694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.21;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	139142668	rs73560761	C	T	1899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=37;PP=1596;SC=AGCAGCCGCCCCGGGGCTGGA;SOR=1.569;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=19;TCR=37;TR=56;WE=139142676;WS=139142658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr9	139142710	rs62579871	G	A	1752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=21;PP=1454;SC=GCTCCCGGGCGAGGGGTGTCT;SOR=1.077;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=31;TCR=21;TR=52;WE=139142718;WS=139142700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	139222174	rs28495820	T	C	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=3;PP=35;SC=GCCCCGCCCGTGGCCGACGAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=139222182;WS=139222164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr9	139230292	rs28447209	T	G	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=409;SC=ATCACCTCAGTGGTTGCAGGC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=139230300;WS=139230282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	139234130	rs143498173	G	T	964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=13;PP=812;SC=GGCCTGGAGAGGGCGGGTATG;SOR=1.044;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=32;WE=139234138;WS=139234120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	139235526	rs59873903	C	A	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=9;PP=544;SC=GGGGTGGGATCGAGGCCAGGC;SOR=1.426;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=24;WE=139235534;WS=139235516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	139243334	rs28429551	T	A	1577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=40;PP=1291;SC=TGGGAGATAATTGTGCCCTCC;SOR=2.925;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=49;WE=139243342;WS=139243324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr9	139249991	rs28603210	T	C	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=241;SC=GGTGACACGTTCTGGGGGAGG;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=139249999;WS=139249986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	139250186	rs61740929	C	T	3263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=54;PP=2444;SC=GCTTCTTTGACCTGTTGACCA;SOR=0.946;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=44;TCR=54;TR=98;WE=139250194;WS=139250176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr9	139252495	rs3812547	G	A	3483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=67;NR=52;PP=2667;SC=AGCGCTGCCCGCCACCTGACG;SOR=0.973;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=67;TCR=53;TR=119;WE=139252503;WS=139252485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr9	139257411	rs10870202	T	C	3757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=81;NR=40;PP=2965;SC=TGGGTGGCCTTCTGGCCCAGC;SOR=1.629;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=81;TCR=40;TR=121;WE=139257419;WS=139257401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr9	139258127	.	T	TCAGCAACCTCGGCGCGCCGCGCAGCGCAGTCCG	304.76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.54;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	139258214	rs150174514	A	G	218.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=4;PP=174;SC=CCCCGCCGCCATCTTGGAAGT;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=139258222;WS=139258204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	139258462	rs1135314	A	G	2551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=27;PP=2047;SC=CACTAATACAATGCATGCATG;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=50;TCR=27;TR=77;WE=139258470;WS=139258452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr9	139261991	rs3812556	A	G	1946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.702;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=19;PP=1559;ReadPosRankSum=1.729;SC=CGTCACAGAGAAGGGTTGGGT;SOR=1.447;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=59;TCF=39;TCR=20;TR=58;WE=139261999;WS=139261981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,61:0.98:62
chr9	139270806	rs73670241	G	A	1479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=6;PP=1176;SC=CTCACCTGCTGCTCACACCAG;SOR=3.564;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=44;WE=139270814;WS=139270796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	139273402	rs3812567	C	T	1674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=22;PP=1374;SC=GTTTGGCTGCCGCGGGGGCCC;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=31;TCR=22;TR=53;WE=139273410;WS=139273392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr9	139275204	rs3812570	A	C	3720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=43;PP=2965;SC=GCAGAAGATGAACTGGTGGGT;SOR=1.149;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=112;TCF=68;TCR=44;TR=111;WE=139275212;WS=139275194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr9	139275294	rs3812571	G	C	3370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=57;PP=2710;SC=CAGTATCGATGTGGAACAGCT;SOR=1.081;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=39;TCR=57;TR=96;WE=139275302;WS=139275284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr9	139276923	rs76313736	A	G	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=26;PP=800;SC=GCTCTGCCTCATGGGAACGTC;SOR=2.517;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=139276931;WS=139276913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	139288688	rs76179734	G	T	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=8;PP=612;SC=TTGACTTATGGTTTTAGACTT;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=23;WE=139288696;WS=139288678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	139288836	rs116295971	A	C	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=10;PP=261;SC=TCCACGGCCCAGCCCCCACGG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=139288844;WS=139288826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	139290251	rs4498662	C	G	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=736;ReadPosRankSum=-0.768;SC=TGGCATGTGACGAGATGAGAC;SOR=2.517;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=28;WE=139290259;WS=139290241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr9	139292762	rs75200747	T	C	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=7;PP=1270;SC=TGCTTCAGAATCTGACTCGAG;SOR=3.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=46;WE=139292770;WS=139292752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr9	139297266	rs17855450	C	T	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=4;PP=386;SC=TCGTCTTTAACTTCAGAAATT;SOR=2.049;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=16;WE=139297274;WS=139297256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	139298593	rs1051957	A	G	1473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=9;PP=1151;SC=TCAGGCTGGCACCCTGGCCGC;SOR=2.746;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=41;TCR=9;TR=49;WE=139298601;WS=139298583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr9	139298720	rs55913234	G	A	2847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=61;PP=2172;ReadPosRankSum=-0.197;SC=CTGGCGAGGCGAGGGCTTACC;SOR=0.634;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=33;TCR=62;TR=94;WE=139298728;WS=139298710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,96:0.99:97
chr9	139300547	rs10781518	A	G	1060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=32;PP=893;SC=TCAGTGCAGCATCCACCTGCA;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=139300555;WS=139300537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	139301583	rs3087886	T	C	332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=1;PP=248;SC=GAGGGCGCCGTGAGGCTCACT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=139301591;WS=139301573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	139302049	rs11145915	A	T	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=11;PP=456;SC=AATGGAGGCCATGCTTCTGAC;SOR=1.371;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=17;WE=139302057;WS=139302039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	139302094	rs4880155	C	G	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=14;PP=644;SC=TTCTGCCTCGCAACAAGAAGA;SOR=1.136;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=24;WE=139302102;WS=139302084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	139303301	rs4487900	A	G	225.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=1;PP=193;SC=CTACTCTAGGATCAAGACTGA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=139303309;WS=139303291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	139304990	rs144080886	C	G	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=0;PP=439;SC=CCCGCGCCTCCGAGCCTCTCG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=139304998;WS=139304981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr9	139307194	rs56978460	TA	T	665.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=8;PP=526;SC=AAGTAGATTTTAAAAAAAAAT;SOR=1.528;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=26;WE=139307202;WS=139307184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	139309297	rs114108353	G	A	765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=20;PP=669;SC=CAGGACTTTGGGAGGCTCAGG;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=139309305;WS=139309287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	139313475	rs77206127	T	C	2791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=39;PP=2143;SC=CACACTGTTATCGTCTTGCCC;SOR=0.887;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=44;TCR=39;TR=83;WE=139313483;WS=139313465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr9	139313633	rs114329796	C	T	2125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.717;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=51;PP=1509;ReadPosRankSum=0.579;SC=TAGGAGTGGCCACCTGTGGGC;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=67;WE=139313641;WS=139313623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,73:0.97:75
chr9	139316797	rs114154524	G	A	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=17;PP=481;SC=GAATGCCGCTGTACCGTTGCT;SOR=4.294;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=139316805;WS=139316787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	139317768	rs11545501	C	T	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=24;PP=671;SC=AGCCCGTTCCCGTGCGTGTTA;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=139317776;WS=139317758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	139324981	rs200676917	CCT	C	1136.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=27;PP=1199;SC=TTCTGGGACCCCTGACACTCA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=27;WE=139324990;WS=139324971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	139326959	rs35774078	G	A	1646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=13;PP=1312;SC=GGTTGGTGTCGGGCACATTTC;SOR=2.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=51;WE=139326967;WS=139326949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr9	139327034	rs10870194	A	G	2505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=35;PP=1947;SC=CCTTCCCGTCACCTGCTGTGG;SOR=1.204;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=54;TCR=35;TR=89;WE=139327042;WS=139327024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr9	139327062	rs34936112	G	A	4106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=44.64;ReadPosRankSum=-1.583;SOR=0.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,91:0.99:92
chr9	139327062	.	GGA	AGG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=44;NR=39;PP=2947;QD=20;SC=AATGGGGTAGGGACCACAGGG;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=45;TCR=40;TR=83;WE=139327072;WS=139327052;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,83:0.98:85
chr9	139327064	rs34302850	A	G	4106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=43.23;ReadPosRankSum=-1.551;SOR=0.299;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,94:0.99:95
chr9	139327102	rs117128150	C	T	2215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.895;HP=1;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=43;PP=1637;ReadPosRankSum=1.159;SC=CCTAAAGCGCCGCACCTCTGG;SOR=0.897;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=71;TCF=28;TCR=43;TR=70;WE=139327110;WS=139327092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,75:0.99:76
chr9	139327277	rs34619169	G	A	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=3;PP=1094;SC=CTTAGCAAGCGTGGTGCCCAC;SOR=3.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=39;WE=139327285;WS=139327267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	139327439	rs10781542	A	G	6240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=102;PP=2965;SC=AGAGGAAGGAAGTGCCAAAAA;SOR=0.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=186;TCF=84;TCR=102;TR=185;WE=139327447;WS=139327429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr9	139327577	rs144347039	A	T	4872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=43.90;ReadPosRankSum=-0.956;SOR=0.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,110:0.99:111
chr9	139327581	rs140797474	G	A	4894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=42.94;ReadPosRankSum=-0.142;SOR=0.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,113:0.99:114
chr9	139333049	rs5901103	GCCCT	G	1302.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=7;PP=1156;SC=CACCCGCCAGGCCCTCCCTAC;SOR=2.019;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=23;WE=139333060;WS=139333039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	139333269	rs36064831	G	C	4206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=60;PP=2965;SC=AGTCGGAGGCGATGTCCAGGC;SOR=0.840;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=130;TCF=69;TCR=61;TR=129;WE=139333277;WS=139333259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr9	139340351	rs36066734	A	G	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=25;PP=708;SC=AACCCTGTTGACTCTAGACCC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=139340359;WS=139340341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	139341294	rs76035236	C	T	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=3;PP=970;SC=CCTTTCCCACCGTACCCGCTC;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=34;WE=139341302;WS=139341284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	139341529	rs3841203	CA	C	1959.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=48;PP=1301;SC=ACAGGCAAATCAAAAAAAAAA;SOR=1.409;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=80;TCF=29;TCR=51;TR=69;WE=139341537;WS=139341519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr9	139352132	rs117018819	C	T	3935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.078;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=1.659;SC=CCCCTGCATCCGAGCATCGCC;SOR=2.621;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=28;TCR=97;TR=123;WE=139352140;WS=139352122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,126:0.98:128
chr9	139360354	rs3124590	A	G	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=1;PP=545;SC=TTCAGATGCCAGGCTGGGTGG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=139360362;WS=139360344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	139368883	rs7022785	A	G	3077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=65;PP=2477;ReadPosRankSum=0.872;SC=CTGGGGTGGCACCAGCTCCTG;SOR=0.965;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=41;TCR=68;TR=104;WE=139368891;WS=139368873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,106:0.95:111
chr9	139369079	rs73670288	T	C	2531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=36;PP=2066;SC=CTGCTTAAGGTAAAGTCTAGG;SOR=0.798;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=41;TCR=36;TR=77;WE=139369087;WS=139369069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr9	139370127	rs150824286	T	C	4074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=50;PP=2811;SC=GGGCGGCAGCTGGTCTGCACT;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=79;TCR=50;TR=129;WE=139370135;WS=139370117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr9	139371786	rs6560632	A	C	3837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=51;PP=2931;SC=GTGTGTGAGGAACAAGCAAAC;SOR=0.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=62;TCR=51;TR=113;WE=139371794;WS=139371776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr9	139396408	rs3124594	A	G	3412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=57;PP=2778;SC=GCAGCCCGGCAGCAGGTGCCC;SOR=0.745;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=60;TCR=57;TR=117;WE=139396416;WS=139396398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr9	139400219	rs61751542	G	A	2803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=64;PP=2385;ReadPosRankSum=0.342;SC=CCCGTGAAGGGGCCCAGGCAC;SOR=1.042;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=23;TCR=65;TR=87;WE=139400227;WS=139400209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,87:0.99:88
chr9	139401504	rs3124596	G	A	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=2;PP=83;SC=CCCGGAAGACGAGCGCTCAGG;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=139401512;WS=139401494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	139402663	rs3124597	T	C	1153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=8;PP=923;SC=GGACCCGAGCTGGGTGGGCAC;SOR=2.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=34;WE=139402671;WS=139402653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	139402908	rs3812603	T	C	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=22;PP=519;SC=AACGCACATCTGCCAAGGGGC;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=139402916;WS=139402898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	139403268	rs3125000	T	C	141.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=111;SC=CTCCCGCAGGTAGGCACCCAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=139403276;WS=139403258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	139403554	rs3124598	T	C	265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=4;PP=159;SC=GGGGGCTGAGTGGAGGGCATT;SOR=1.609;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=139403562;WS=139403544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	139405261	rs3125001	C	T	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=33;PP=1187;SC=GTCTGCCCTGCGGGGCAGGAG;SOR=1.358;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=51;WE=139405269;WS=139405251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr9	139407452	rs3812608	C	T	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=220;SC=CCCTCCAGCACAGGCCCCACC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=139407460;WS=139407442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr9	139407932	rs2229971	A	G	2638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=49;PP=2054;SC=ATTCACACTCATTGTTGTTGA;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=36;TCR=49;TR=85;WE=139407940;WS=139407922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr9	139410177	rs3124603	T	C	129.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=105;SC=CCCTGGACCGTGGGAGGGGCG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=139410185;WS=139410167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	139410424	rs3125006	A	G	848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=7;PP=566;SC=GGTGGGCGCCAGCCCGCACCT;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=26;WE=139410432;WS=139410414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	139410589	rs4880099	A	G	1055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=24;PP=776;SC=GTGCAACAGCACTATGGCCCT;SOR=3.193;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=139410597;WS=139410579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	139410679	rs4880100	T	C	223.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=6;PP=185;SC=CTCAGCCAGCTCCAGCTCTCC;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=139410687;WS=139410669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr9	139411714	rs11145767	T	C	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=12;PP=1120;SC=GGGGCGGGGGTGGCCCTCACC;SOR=2.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=46;WE=139411722;WS=139411704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr9	139411880	rs9411254	G	A	2186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=43;PP=1688;SC=CGCGGCCCCAGTGCCCCACTG;SOR=1.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=26;TCR=43;TR=69;WE=139411888;WS=139411870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr9	139412197	rs9411208	G	A	1731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.873;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=13;PP=1324;ReadPosRankSum=-0.619;SC=GGCCCCGGCCGACGCACCGGG;SOR=2.181;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=54;WE=139412205;WS=139412187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,57:0.98:58
chr9	139418260	rs4489420	A	G	1441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=12;PP=1145;SC=TGAGGCAGGCATTGTCCAGGG;SOR=2.049;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=51;WE=139418268;WS=139418250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr9	139440845	rs3013306	G	A	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.91;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	139440852	rs3013307	A	G	967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.08;SOR=4.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr9	139563144	rs2297535	C	A	1526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=32;PP=1126;ReadPosRankSum=1.465;SC=CCCACCACACCGAGCTCACCC;SOR=1.034;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=43;WE=139563152;WS=139563134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,46:0.98:47
chr9	139564668	rs2297538	G	A	1328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=19;PP=1157;SC=CCAGCGCTGCGTCAACACCGC;SOR=1.055;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=25;TCR=19;TR=44;WE=139564676;WS=139564658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	139569066	rs9411215	A	G	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=0;PP=577;SC=CATTCGCCACATGGTCACCGT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=139569074;WS=139569056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	139581529	rs118017936	G	C	271.53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=234;ReadPosRankSum=-0.551;SC=GAGCGGGGCGGGACGGGCGGG;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=139581537;WS=139581521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr9	139581758	rs201504151	C	CCAG	2845.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=43;PP=2417;SC=CTCAGCTGCACCAGCAGCAGC;SOR=1.793;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=68;TCF=10;TCR=58;TR=51;WE=139581766;WS=139581748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr9	139581876	rs146341067	C	G	621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=19;PP=525;SC=CTCCCCCGCGCGCTCAGGCCC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=139581884;WS=139581866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	139616742	rs945384	A	G	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=31;PP=1178;SC=GATGACCCTCAGCTTCCTCAA;SOR=1.101;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=55;TCF=24;TCR=31;TR=54;WE=139616750;WS=139616732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	139617379	rs11793962	G	A	1794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=11;PP=1403;SC=CATCAAATCAGCTGGCTTTTC;SOR=2.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=44;TCR=11;TR=55;WE=139617387;WS=139617369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr9	139617662	rs11849	T	C	2037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=35;PP=1675;ReadPosRankSum=-0.797;SC=CGGCCGCCCTTCCACCCCTGT;SOR=0.307;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=29;TCR=36;TR=64;WE=139617670;WS=139617652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr9	139617836	rs6874	C	T	4354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=68;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.361;SC=CACTGGCCAACGTGGGCTACA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=71;TCR=68;TR=138;WE=139617844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,146:0.99:148
chr9	139618283	rs6873	A	G	145.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=115;SC=CCAGGGTCCAACCCTCCCTCA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=139618291;WS=139618273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	139620637	rs72761016	G	A	1249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=24;PP=1014;SC=TCTTTGCCCCGAGGCCACAGG;SOR=1.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=37;WE=139620645;WS=139620627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	139620695	rs2275161	C	T	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=20;PP=499;SC=GGACAGCATCCGCAGGGCAGC;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=139620703;WS=139620685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	139621107	rs138866217	AG	A	684.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=679;SC=AGGCCAGCCTAGCCCAGCGCG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=139621128;WS=139621097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	139621120	rs10781513	A	G	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=581;SC=CCAGCGCGAGAGTTAGAAAGC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=139621128;WS=139621097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	139639532	rs145717467	CGGCCCACGCACCACACAGCTCCCAACGTGGGCCCCGAGT	C	1063.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.94;QD=42.55;SOR=6.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	139639556	.	AACGTGGGCCCCGAGT	CACGCGGCCCCCAAGC,TACGTGGGCCCCGAGT	798	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=53.07;NF=3,13;NR=0,0;PP=471,798;QD=184.822624954;SC=CACAGCTCCCAACGTGGGCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=3,13;WE=139639579;WS=139639546;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.18:17
chr9	139642106	.	A	C	272	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=2;HapScore=4;MGOF=10;MMLQ=28;MQ=55.23;NF=1;NR=9;PP=272;QD=30.6771212547;SC=CAGCCTCCAAACCTCCAGCCT;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=139642124;WS=139642096;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	139642116	.	T	TC	68	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=0.9998;HP=3;HapScore=4;MGOF=10;MMLQ=29;MQ=52.69;NF=1;NR=1;PP=68;QD=47.0;SC=ACCTCCAGCCTCAGCCTCCAC;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=2;WE=139642124;WS=139642096;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,2:0.33:6
chr9	139649580	rs879467	G	A	942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=3;PP=778;SC=TCGGGGGTCAGGCTCACCTCC;SOR=3.407;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=139649588;WS=139649570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	139650060	rs2784068	C	A	3088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=46;PP=2477;SC=ATCCTGCCCCCACCCAGTCCC;SOR=0.802;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=46;TCR=46;TR=92;WE=139650068;WS=139650050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr9	139650167	.	G	A	1380	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=59.08;NF=50;NR=17;SC=AATGTGCAGGGAACAGCATGG;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=206;TCF=130;TCR=76;TR=67;WE=139650175;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:139,67:0.33:206
chr9	139650595	rs35874639	T	G	5825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=81;PP=2965;SC=GAACAGCATGTGGAACAGCGC;SOR=0.738;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=72;TCR=81;TR=153;WE=139650603;WS=139650585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr9	139650619	rs35341952	A	G	7257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=81;PP=2965;SC=GAACAGCATGAGGAACAGTGC;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=87;TCR=81;TR=168;WE=139650627;WS=139650609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr9	139651163	rs57411373	A	AG	494.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.72;NF=0;NR=15;PP=584;SC=GGAGTATCCCAGGCCTGGAGC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=139651171;WS=139651153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	139652338	rs9411272	C	G	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=36;PP=1290;SC=GGAGCCCCACCAACTAAGAAG;SOR=2.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=46;WE=139652346;WS=139652328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr9	139653055	rs11145867	C	T	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=24;PP=711;SC=GCTTGCAGCCCGCCTGGCCTC;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=139653063;WS=139653045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	139656618	rs2484658	T	C	133.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.78;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	139656670	rs2297722	T	C	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=3;PP=775;SC=ATCATGTCCTTGGGGAGCCCC;SOR=3.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=139656678;WS=139656660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	139656706	rs2297723	A	C	1731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=14;PP=1322;SC=TCCTGGAAGGACTTCAGAGCC;SOR=2.342;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=44;TCR=14;TR=58;WE=139656714;WS=139656696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr9	139657834	rs9987876	G	C	1021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=9;PP=599;SC=TGGTGCTGAGGGCCCCCTCCA;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=139657842;WS=139657824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	139658051	rs4880070	G	T	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=234;ReadPosRankSum=-0.964;SC=GGGAGGGCGGGCAGGGGGCTG;SOR=0.707;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=11;WE=139658059;WS=139658041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr9	139658576	rs4880140	G	C	1056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=18;PP=830;SC=GAGTGGCCATGTCTTGGGTGT;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=28;WE=139658584;WS=139658566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	139690840	rs1055995	G	A	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=37;PP=1269;SC=TGGGGGGCCTGAGAGCAGCCA;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=50;WE=139690848;WS=139690830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr9	139699964	rs2811793	T	C	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=25;PP=706;SC=GCCTCTCACGTCTGGGTAATG;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=139699972;WS=139699954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	139700605	rs2811795	T	C	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=4;PP=904;ReadPosRankSum=-0.121;SC=CTGTGAGGAGTGGCGGGTGCA;SOR=2.115;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=31;WE=139700613;WS=139700595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr9	139700890	.	C	T	5970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=100;NR=77;PP=2965;SC=GACTGGGCTCCTGGGTGGCCC;SOR=0.932;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=100;TCR=77;TR=177;WE=139700898;WS=139700880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr9	139701108	rs2254143	A	C	5124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=92;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.147;SC=ATGGGCATTAACTTGCCTGCG;SOR=1.096;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=72;TCR=93;TR=163;WE=139701116;WS=139701098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,162:0.99:164
chr9	139701983	rs3739944	C	G	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=20;NR=6;PP=732;SC=CTGCGCCTAGCTGGGCTAGCC;SOR=1.828;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=139701991;WS=139701973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	139702908	rs7864908	C	T	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=364;SC=GCCCGCCGGGCGCTCCGGGAG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=139702916;WS=139702898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	139726239	rs2811748	A	G	1603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=32;PP=1203;SC=GCGTGCTGGGAAACTACCGGG;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=51;WE=139726247;WS=139726229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr9	139730129	rs2811744	T	C	176.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=4;PP=121;SC=ATTCAGGGGCTGTGGGGCTGG;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=139730137;WS=139730119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	139731969	rs2811742	C	T	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=13;PP=459;SC=CCCTCAATGCCGCCCCACCAT;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=139731977;WS=139731959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	139732331	rs2811741	G	C	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=2;PP=434;SC=CCCGGCCGCAGAGGGCCCAGC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=139732339;WS=139732321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	139739643	rs10870132	T	C	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=3;PP=211;SC=GGCCCCTGCCTGGGCCCCGGG;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=139739651;WS=139739633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	139744807	rs872463	A	G	1669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=2;PP=1407;SC=ACACCCCCAGACATGGCCGGC;SOR=5.549;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=45;TCR=2;TR=47;WE=139744815;WS=139744797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr9	139746992	rs10123375	G	A	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=31;PP=1137;SC=GGCAGTGACGGACACCAGGGC;SOR=1.659;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=45;WE=139747000;WS=139746982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	139748423	.	C	G	3319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=38;PP=2681;SC=GACTTAGGTCCTAAGAGCCTG;SOR=1.630;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=76;TCR=38;TR=114;WE=139748431;WS=139748413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr9	139749067	rs7869864	C	T	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=3;PP=708;SC=GGAACCACCGCGCTGGTGGTC;SOR=2.910;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=28;WE=139749075;WS=139749057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	139752899	rs2275156	T	G	4202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=97;PP=2965;SC=CCACCTGGCCTGGCCCGGCCT;SOR=1.824;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=42;TCR=97;TR=139;WE=139752907;WS=139752889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr9	139760830	rs76229681	CG	C	850.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=25;PP=797;SC=TGGCTGCACGCGGGGGGCGGG;SOR=5.283;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=26;WE=139760838;WS=139760820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	139793030	rs117439227	C	T	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=0;PP=111;SC=TGCGATTCTGCTTCTCTGAGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=139793038;WS=139793020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	139804274	rs4567138	G	A	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=1;PP=632;SC=GTGCTCCTGCGGCCCCTCGGC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=139804282;WS=139804264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	139804346	rs4448378	C	T	1895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=17;PP=1402;SC=CGTCCACCCTCACACTCCTGA;SOR=2.019;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=60;WE=139804354;WS=139804336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr9	139815053	rs10781522	G	A	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=28;PP=937;SC=AGCAGGTCCTGGAGCTTTAGA;SOR=2.964;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=139815061;WS=139815043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	139818169	rs17250631	CTT	C	177.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=122;SC=GGAAAAAAAACTTTTCTTTGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=139818178;WS=139818159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	139820421	rs7852970	G	A	1765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=48;PP=1517;SC=GGGCCACCACGCTGGGCCAGG;SOR=3.383;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=8;TCR=48;TR=56;WE=139820429;WS=139820411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	139836362	rs7040705	G	A	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=3;PP=85;SC=CCCAGGTCTGGGCTTGTGACC;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=139836370;WS=139836352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	139837700	rs11339872	AC	A	125.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=4;NR=0;PP=77;SC=GGCCTGACCCACCCCCCCCCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=4;WE=139837708;WS=139837690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	139837990	rs2271872	G	C	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=20;PP=541;SC=TCCTGGGCCCGGGCCTTCCTC;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=139837998;WS=139837980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	139839904	rs2071006	T	G	1705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=27;PP=1313;SC=ATTTTGATGCTCAGCAGGTAG;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=32;TCR=27;TR=59;WE=139839912;WS=139839894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr9	139840471	rs7862602	G	T	2170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=20;PP=1723;SC=GGGCTGCAGGGCATGTGGGTG;SOR=1.842;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=51;TCR=20;TR=71;WE=139840479;WS=139840461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr9	139840543	rs7850844	A	G	3813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=80;NR=35;PP=2965;SC=CCAGCCCGAGACGCCCGAGGG;SOR=1.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=80;TCR=35;TR=115;WE=139840551;WS=139840533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr9	139840859	rs908830	T	C	3740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=57;PP=2955;SC=AGACCCCGTTTCCAGAGCCCT;SOR=0.728;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=53;TCR=57;TR=110;WE=139840867;WS=139840849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr9	139846707	.	G	C	1411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=18;PP=1178;SC=TGTGCATGAAGAGGTGGGTCT;SOR=1.378;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=49;WE=139846715;WS=139846697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr9	139847570	rs884218	T	C	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=43;PP=1017;SC=CCATGGGCCCTGTCCCAGCAC;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=43;WE=139847578;WS=139847560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	139848273	rs2271869	A	G	2698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=42.17;ReadPosRankSum=0.863;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr9	139848278	rs2271868	T	C	2757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=41.78;ReadPosRankSum=1.157;SOR=0.589;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr9	139848688	rs4880175	C	T	2520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=24;PP=1993;ReadPosRankSum=-0.740;SC=ATGACAACATCGTCTTCCCAG;SOR=0.640;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=53;TCR=24;TR=76;WE=139848696;WS=139848678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,79:0.99:80
chr9	139872048	rs4880179	A	G	1524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=18;PP=1131;SC=CTCATCACACACTGTGGATGG;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=32;TCR=18;TR=50;WE=139872056;WS=139872038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	139875318	rs146717258	C	CCATT	1389.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.359;NF=0;NR=23;PP=1355;ReadPosRankSum=-0.434;SC=GTGAGCCACTCCATTCATTCA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=8;TCR=61;TR=23;WE=139875326;WS=139875308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
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chr9	139878828	rs4880082	T	C	1656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=15;PP=1421;SC=CCATGTCCTCTAAGGATTGTG;SOR=1.938;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=54;WE=139878836;WS=139878818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
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chr9	139879113	rs2049041	G	A	1882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=13;PP=1453;ReadPosRankSum=1.253;SC=GGGGTGCCACGCTCGGGGGGG;SOR=0.914;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=54;WE=139879121;WS=139879103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr9	139887042	rs10870159	G	C	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=14;PP=888;SC=GGGAGGTAGGGGTGCAGGGAG;SOR=1.455;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=42;WE=139887050;WS=139887032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	139902214	rs10870161	A	G	92.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=36;SC=CGCAGTGACCACAGGGCATGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=139902222;WS=139902204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	139902712	rs4880185	A	G	2785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=40;PP=2278;SC=CTCCAGGCCTATCTGCAAGTG;SOR=0.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=49;TCR=40;TR=89;WE=139902720;WS=139902702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr9	139902786	rs4880186	G	C	2232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=36;PP=1811;SC=GTTCTCCCCCGACCCCACCCG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=35;TCR=36;TR=71;WE=139902805;WS=139902776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr9	139902797	rs4880187	C	G	2519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=40;PP=2051;SC=ACCCCACCCGCGGCTGGAGCC;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=38;TCR=40;TR=78;WE=139902805;WS=139902776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr9	139902841	.	G	A	2511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=44;PP=2036;SC=GCAGAGCCCTGGACAGCCATG;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=77;WE=139902849;WS=139902831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr9	139903352	rs59031144	G	GC	1777.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=28;PP=959;SC=GCCTGGCAGCGCCCCCCCACC;SOR=0.726;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=69;TCF=36;TCR=33;TR=54;WE=139903360;WS=139903342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr9	139904037	rs7048567	A	G	5060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=77;PP=2965;SC=TGATGAGGTCAAGGATGAGGT;SOR=0.926;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=96;TCR=77;TR=173;WE=139904045;WS=139904027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr9	139904539	.	C	T	2896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=42;PP=2137;SC=GGGCAGTAGCCGAGGCTCTGC;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=44;TCR=42;TR=85;WE=139904547;WS=139904529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr9	139906359	rs2271862	G	A	4128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=76;NR=48;PP=2965;SC=CAAACTGCAGGTGCTTGGCCT;SOR=1.241;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=76;TCR=48;TR=124;WE=139906367;WS=139906349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr9	139906513	rs2271863	T	C	2108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=41;PP=1749;SC=GGGGCTGCAGTGCCCACCTGC;SOR=0.934;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=32;TCR=41;TR=73;WE=139906521;WS=139906503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr9	139906686	rs45540434	G	A	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.075;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=468;ReadPosRankSum=0.381;SC=GCTCCTCCCCGCCCCGCCCCG;SOR=1.108;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=22;WE=139906694;WS=139906676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr9	139907842	rs4880188	T	C	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=3;PP=417;SC=CTCGCCCGCCTGGCCCACCAA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=139907850;WS=139907832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr9	139908139	rs10870162	A	G	279.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=7;PP=257;SC=AGGAGACAGGACTCCCGGATG;SOR=2.093;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=139908147;WS=139908129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr9	139908265	rs10781531	T	C	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=4;PP=876;SC=CCAGCACCCCTGTCCAGCCGG;SOR=3.545;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=33;WE=139908273;WS=139908255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr9	139910648	rs6560657	T	C	3052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=60;PP=2240;SC=GGCGGGGTCATGACCCCACGC;SOR=1.106;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=42;TCR=60;TR=102;WE=139910656;WS=139910638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr9	139912178	rs879854	G	A	2476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=38;NR=41;PP=1938;SC=GGCAGGCCCCGGGGAGGACGC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=38;TCR=41;TR=79;WE=139912186;WS=139912168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr9	139912484	rs908832	A	G	3695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=56;PP=2832;SC=GCTCCACCACATCGTGCCCCA;SOR=0.879;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=66;TCR=56;TR=122;WE=139912492;WS=139912474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr9	139913239	rs908828	T	G	1670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=8;PP=1334;SC=CTCCTCGTCGTGGAAGCCCTT;SOR=3.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=52;WE=139913247;WS=139913229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr9	139916471	rs142576618	A	ATGGCTCAGATGGGGGTG	1421.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=2735;SC=GTGTGGGGGAATGGCTCAGAT;SOR=3.193;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=13;WE=139916479;WS=139916461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	139923265	rs4880189	A	G	2307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=47;NR=23;PP=1774;SC=GCTCGCCGTGAGCGGAGCAGG;SOR=1.432;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=70;WE=139923273;WS=139923255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr9	139926402	rs7469569	T	C	3861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=23;PP=2965;ReadPosRankSum=1.244;SC=TGTCCCCAGCTTGGGCCTCCC;SOR=1.675;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=121;TCF=98;TCR=23;TR=120;WE=139926410;WS=139926392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,122:0.99:123
chr9	139937795	rs10781535	T	C	2581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.03;SOR=1.942;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr9	139937799	rs10781536	G	A	2613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.56;SOR=2.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr9	139943429	rs7873815	G	A	1177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=24;PP=915;SC=AGGCGCGCTCGTCGAAGCCGT;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=39;WE=139943437;WS=139943419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr9	139943549	rs7390981	G	A	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=11;PP=1053;SC=GCGGGACACCGTCAGGCAGGC;SOR=1.845;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=40;WE=139943557;WS=139943539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	139944496	.	T	C	239	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=1;HapScore=3;MGOF=11;MMLQ=17;MQ=55.78;NF=0;NR=12;PP=239;QD=22.8142677123;SC=GAGCACCTGCTGCCACCCGCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=139944517;WS=139944486;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	139944509	.	T	C	405	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=3;HapScore=3;MGOF=11;MMLQ=28;MQ=45.62;NF=0;NR=15;PP=405;QD=29.3180808365;SC=CACCCGCCTGTCCCTACTCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=139944517;WS=139944486;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	139944548	.	T	C	200	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;FR=0.5020;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=24;MQ=40.46;NF=0;NR=9;PP=200;QD=26.085690283;SC=CCGCCTGCCCTTACCCACGAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=9;WE=139944556;WS=139944538;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,9:0.82:11
chr9	139945051	rs7869520	A	G	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=20;PP=692;SC=CCAGCCTGACAAACCTCCCAC;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=139945059;WS=139945041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr9	139946804	rs2271867	C	G	2438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=25;NR=49;PP=1786;SC=TGCCATACTGCGGGGGAGGGG;SOR=1.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=25;TCR=50;TR=74;WE=139946812;WS=139946794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr9	139946905	rs34679600	C	CA	614.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=641;SC=CTCCCCCCCCCACCCAGTCAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=139946924;WS=139946895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	139946916	rs11145979	G	A	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=338;SC=ACCCAGTCATGTGCCAAGCCT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=139946924;WS=139946895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	139960178	rs2176674	A	G	1930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=41;PP=1645;SC=ACACGTCCACACATGCATGAG;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=24;TCR=41;TR=65;WE=139960186;WS=139960168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr9	139964447	rs71483301	G	C	132.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.01;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	139964450	rs71483302	C	T	132.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.01;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	139973186	rs7390974	T	C	1148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=31;PP=898;SC=GGGAGCGTAGTTGGGGGTCCA;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=139973194;WS=139973176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr9	139973652	rs7390711	A	G	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=29;PP=1276;SC=CCCGCCCCTCACGGAGCCCCG;SOR=1.036;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=21;TCR=29;TR=50;WE=139973660;WS=139973642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr9	139973820	rs7037849	C	T	3040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=50;PP=2273;SC=CAGCTACGTGCCTCCGACGGG;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=46;TCR=50;TR=96;WE=139973828;WS=139973810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr9	139975108	rs9314874	T	C	2165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=17;PP=1581;SC=GCCTCTGTGCTGGGACGTGGG;SOR=2.206;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=68;WE=139975116;WS=139975098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	139977195	rs4390039	T	C	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=413;SC=GCCCAGACTGTCCCCAGACTC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=139977203;WS=139977185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	139981241	rs968732	GT	CG	1004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=17;PP=1075;SC=AGCTACGCTCGTAGCACACCT;SOR=2.925;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=19;WE=139981250;WS=139981231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr9	139981627	rs968733	A	G	1327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=21;PP=950;SC=TTTGGCGAGAACTATGACAAC;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=17;TCR=21;TR=38;WE=139981635;WS=139981617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	139982868	rs3750518	C	T	1793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=43;PP=1327;ReadPosRankSum=1.389;SC=CTGATATGTCCAGCCTCCCTT;SOR=1.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=53;TCF=9;TCR=44;TR=52;WE=139982876;WS=139982858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,57:0.98:58
chr9	139990530	rs7871579	T	C	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=445;SC=GGAGCTGTCTTCTGAAGCTGC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=139990538;WS=139990520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr9	139990906	rs4880199	T	C	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=23;PP=547;SC=AAAACAAGATTGCGGAAACGC;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=139990914;WS=139990896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr9	139994102	rs4880200	G	A	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=2;PP=628;SC=CTGTGCCGACGCCAGGACCAC;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=139994110;WS=139994092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	139996619	.	C	A	1981	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MMLQ=28;NF=60;NR=55;PP=1981;QD=17.5284453265;SC=ACACACATTCCTGCTGTTGCA;SbPval=0.56;Source=Platypus;TCR=170;TR=115;WE=139996627;WS=139996609;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:241,115:0.32:356
chr9	139996641	rs13298199	C	A	7301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=3.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=29.143;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=16.015;NF=109;NR=127;PP=2962;ReadPosRankSum=5.382;SC=GAGTACAGGTCGGTGGTGTTA;SOR=0.415;SbPval=0.58;Source=Platypus;TCR=191;TR=236;WS=139996631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:16,277:0.95:293
chr9	139996653	.	ACG	A	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MMLQ=28;MQ=52.89;NF=35;NR=74;PP=2962;QD=20;SC=GTGGTGTTACACGTGCTGTTG;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=285;TCF=69;TCR=216;TR=109;WE=139996662;WS=139996631;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:176,109:0.38:285
chr9	139996739	.	A	ACG	2954	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.49;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MMLQ=24;MQ=48.45;NF=22;NR=81;PP=2954;QD=20;SC=ACACACATTCACTGTTGCAGG;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=190;TCF=75;TCR=115;TR=103;WE=139996747;WS=139996676;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:87,103:0.54:190
chr9	139996768	.	T	TAC	1078	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.55;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=46;MMLQ=26;MQ=46.19;NF=15;NR=48;PP=1078;QD=17.6349206349;SC=TCGGTGGTGTTACACATTCAC;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=189;TCF=86;TCR=103;TR=63;WE=139996789;WS=139996754;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:126,63:0.33:189
chr9	139996933	rs10118812	T	G	7105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.492;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.209;NF=116;NR=93;PP=2965;ReadPosRankSum=1.164;SC=ACACATTCATTCTGTTGCAGG;SOR=0.588;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=117;TCR=94;TR=209;WE=139996941;WS=139996923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,218:1.00:219
chr9	139997245	.	CAT	C	2968	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.51;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=41;MMLQ=27;MQ=40.49;NF=96;NR=110;PP=2968;QD=20;SC=GTGTTACACACATTCATGCTG;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=668;TCF=315;TCR=353;TR=206;WE=139997255;WS=139997224;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:462,206:0.31:668
chr9	139997563	.	A	ACATT	518.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=2.125;ClippingRankSum=0.000;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=28.850;HP=2;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-9.160;NF=20;NR=91;PP=2968;ReadPosRankSum=-2.498;SC=GGTGTTACACACATGCTGTTG;SOR=2.789;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=356;TCF=130;TCR=226;TR=111;WE=139997574;WS=139997540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:251,28:0.10:279
chr9	140001341	rs5901117	G	GAAC	1259.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=20;PP=1199;SC=ATGTCAAAAAGAACGAAATCC;SOR=1.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=24;WE=140001349;WS=140001331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr9	140002220	rs10117795	A	G	2559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=42;PP=2052;SC=TGTGACCTGGATCCGGGAGGG;SOR=1.040;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=31;TCR=42;TR=73;WE=140002228;WS=140002210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr9	140002501	rs6420280	T	C	114.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=118;SC=AGAGTGTCACTTCCTGGCTCT;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=140002509;WS=140002491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr9	140002989	rs4880091	T	C	3912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=67;PP=2965;SC=TCAGCCTGGATGCCTACGTGT;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=68;TCR=67;TR=135;WE=140002997;WS=140002979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr9	140003427	rs4567	A	G	2441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=47;PP=1823;SC=GAAGCCTCAGATGTCCCCAAT;SOR=1.252;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=27;TCR=47;TR=74;WE=140003435;WS=140003417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr9	140006202	rs13631	G	A	2563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=40;PP=1994;SC=TGGCGGCTCTGAGATCTGCAA;SOR=0.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=36;TCR=40;TR=76;WE=140006210;WS=140006192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr9	140006425	rs10747048	C	G	3121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=59;PP=2376;SC=AGGGCAGGTCCGGGAACATAT;SOR=0.865;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=49;TCR=59;TR=108;WE=140006433;WS=140006415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr9	140008750	rs10747049	G	C	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=3;PP=320;SC=CGCGACGAAGGCCGAGTTGTT;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=140008758;WS=140008740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	140008899	rs10870183	G	A	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.69;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	140040156	rs10870196	G	A	910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=3;PP=670;SC=ACCTCAGCCCGCCGTGCCCCC;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=140040164;WS=140040146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	140055876	rs10747050	G	A	1030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=24;PP=806;SC=CGGGTAGGCTGGACGGCGGGG;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=140055884;WS=140055866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr9	140064219	rs12000091	T	C	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=10;PP=500;SC=GCAGCGAGAGTGCCGAGCAGC;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=21;WE=140064227;WS=140064209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	140108915	rs149701237	CTG	C	2467.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=42;PP=2171;SC=GGCCGTGGGTCTGGGGTTCGG;SOR=3.500;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=47;WE=140108924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr9	140110274	rs7390663	T	C	3299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=47;PP=2685;SC=ACCCAGGGTCTCCGGGCAGGG;SOR=0.813;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=53;TCR=47;TR=100;WE=140110282;WS=140110264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr9	140120396	rs6606566	C	T	1827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.51;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr9	140123132	rs6606565	C	G	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=13;PP=810;SC=GAGGAGAGGACAGACTGCATC;SOR=1.352;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=20;TCR=13;TR=33;WE=140123140;WS=140123122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	140128085	rs28407527	T	C	1920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=27;PP=1511;SC=TGGCCCCCAGTTGGACTCCGA;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=31;TCR=27;TR=58;WE=140128093;WS=140128075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr9	140130606	rs28542318	A	T	3347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=55;PP=2643;SC=GGGGGCATGGAGCTGGCCGCT;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=58;TCR=55;TR=113;WE=140130614;WS=140130596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr9	140139757	rs9775264	G	A	896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=24;PP=736;SC=TCCCCTGGCTGCCTGGTGCTG;SOR=2.621;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=140139765;WS=140139747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr9	140140117	rs114429903	G	A	2258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=36;PP=1850;ReadPosRankSum=-0.772;SC=GTAGGGCTCCGTCAGGTCTTG;SOR=0.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=36;TCR=37;TR=72;WE=140140125;WS=140140107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,72:0.99:73
chr9	140142299	rs9330201	C	T	831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=19;PP=633;SC=CAGGCCACCTCGCTAACCCTG;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=140142307;WS=140142289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr9	140147094	rs71387813	C	CCT	1761.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=11;PP=1755;SC=CCCTGCAGCCCGTCTCCTACC;SOR=2.038;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=36;WE=140147102;WS=140147084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr9	140147152	rs28376526	C	G	1953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=20;PP=1409;SC=TCAGCCGGCCCGCCTTCCCCG;SOR=1.745;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=46;TCR=21;TR=66;WE=140147160;WS=140147142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr9	140148051	rs28631372	A	G	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=495;SC=TGCCCCTGAAAGGTGCTCTCT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=140148059;WS=140148041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr9	140157429	rs13294457	G	A	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=1;PP=1170;SC=CGGGCGTGACGTCCCTGTGTC;SOR=6.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=42;TCR=1;TR=43;WE=140157437;WS=140157419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr9	140157460	rs13296455	T	C	1858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=9;PP=1473;SC=CAGGACGGTCTGGGGGCCTGA;SOR=3.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=49;TCR=9;TR=58;WE=140157468;WS=140157450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr9	140157701	rs56368095	C	T	1053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=31;PP=874;SC=TCCTTCCCCCCTACCCTCCTG;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=33;WE=140157709;WS=140157691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	140158650	rs9695897	C	T	1928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=24;PP=1380;SC=GGTCTCTGGTCATCCTGGGAG;SOR=1.044;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=60;TCF=36;TCR=24;TR=58;WE=140158658;WS=140158640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr9	140158871	rs13295537	T	C	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=309;SC=GGTCTGCGCTTGCTGTGTTTT;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=140158879;WS=140158861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	140161334	rs9330192	C	T	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=3;PP=289;SC=GTGTGTGTCACGTCAGGGTGG;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=140161342;WS=140161324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	140161631	.	TGTGGGGCTGAG	T	1936	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=7;NR=2;PP=1936;QD=216.222222222;SC=CAGGGGTCGGTGTGGGGCTGA;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=9;WE=140161655;WS=140161621;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:20,9:0.31:29
chr9	140161634	.	GGGGCT	G	1294.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.65;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr9	140161641	.	AGGTGGG	A	1293.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.20;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	140161647	.	G	A	679	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=15;NR=5;PP=679;QD=35.6885606274;SC=GCTGAGGTGGGGCTGAGGTGG;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=20;WE=140161655;WS=140161621;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,20:0.69:29
chr9	140161871	rs9802270	C	T	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=591;SC=GCCCAGGGTGCGGGCCCCAGG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=140161879;WS=140161861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr9	140161909	rs9802698	G	T	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=351;SC=TGTCTCCCCAGCCCACCTCCA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=140161917;WS=140161899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	140167022	rs3204123	G	A	1635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=13;PP=1264;SC=GGGTGGCCCCGTCTAAGCTGG;SOR=2.215;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=50;WE=140167030;WS=140167012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr9	140243844	rs28545754	C	T	1612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=32;PP=1276;SC=CTGCTCCTCGCAGAGCGGCCT;SOR=1.118;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=55;WE=140243852;WS=140243834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr9	140246002	.	T	C	2252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=56;PP=1615;SC=GAGGGGCAGATGTGATCATCA;SOR=1.854;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=24;TCR=56;TR=80;WE=140246010;WS=140245992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr9	140246050	rs11534416	T	G	1635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=46;PP=1345;SC=AGCCTGGAGGTCCTGAGCAGC;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=46;WE=140246058;WS=140246040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr9	140247143	rs7020732	T	G	1104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=9;PP=871;SC=GCAGCAAGAGTTCCATGGCAC;SOR=2.179;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=33;WE=140247151;WS=140247133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr9	140249253	rs11537108	AG	CA	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=14;PP=996;SC=CTCAGCACTGAGGGCTCAGGG;SOR=3.912;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=16;WE=140249262;WS=140249243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	140250633	rs13293922	G	A	157.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=1;PP=140;SC=CCTGAACAACGGGCAGCCCCA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=140250641;WS=140250624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr9	140250818	rs7389423	C	T	1820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=27;PP=1310;SC=CTCAGGGTACCGTCTGTGGGG;SOR=0.726;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=28;TCR=27;TR=55;WE=140250826;WS=140250808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr9	140262218	rs11533157	T	C	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=398;SC=GGTCAGCCCATGAGGAGGATG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=140262226;WS=140262208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr9	140262426	rs11533158	C	T	1651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=41;PP=1292;SC=TTCAACGTCGCGCCCAGCGTG;SOR=2.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=56;WE=140262434;WS=140262416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr9	140267650	rs28688091	T	C	301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=5;PP=177;SC=CATCGGGTGGTCTGCAGGGCT;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=140267658;WS=140267640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr9	140268129	rs34481427	GTTT	G	2697.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.16;NF=3;NR=51;PP=2019;SC=CCGCAGAGAGGTTTTTTAAAA;SOR=4.174;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=3;TCR=56;TR=54;WE=140268139;WS=140268119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr9	140268183	rs6606585	T	C	975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=35;PP=808;SC=AGCCGCCATCTGCGCCTCCGT;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=140268191;WS=140268173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr9	140277826	rs13291830	C	T	1656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=35;PP=1376;SC=GAGGGGGTCCCGGCCTGTGGA;SOR=1.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=51;WE=140277834;WS=140277816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr9	140289696	rs9695232	A	C	1139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=34;NR=4;PP=970;SC=CCCCATGCACACCCACGCACC;SOR=3.855;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=38;WE=140289704;WS=140289686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr9	140317979	rs117554356	G	T	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=5;PP=504;SC=GCCACCGGCCGCCATGGCCTC;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=140317987;WS=140317969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr9	140320617	rs9414734	C	T	2219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=63;NR=6;PP=1744;SC=AATTCCGTGGCCCTGTCACCC;SOR=4.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=63;TCR=6;TR=69;WE=140320625;WS=140320607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr9	140329618	rs28589413	A	G	2976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=67;PP=2322;SC=CGACCTGCCCACGCCCACGCC;SOR=2.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=18;TCR=67;TR=85;WE=140329626;WS=140329608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr9	140330976	rs13297080	T	C	1593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=8;PP=1279;SC=AGCTGACCTGTACCAGCCCCA;SOR=3.126;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=48;WE=140330984;WS=140330966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr9	140331833	rs9414731	A	G	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=277;SC=CCCCAAAGACATGACCACCTC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=140331841;WS=140331823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr9	140332478	rs6606582	A	G	3030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=43;PP=2424;SC=CTTGTTCGCCAGCCACTGATA;SOR=1.168;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=62;TCR=43;TR=105;WE=140332486;WS=140332468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr9	140344328	rs28699612	G	A	2982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.716;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=32;PP=2479;ReadPosRankSum=0.801;SC=GTCTGTCCACGTCGGGGGTTT;SOR=1.308;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=100;TCF=65;TCR=35;TR=96;WE=140344336;WS=140344318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,98:0.96:102
chr9	140349874	rs28585539	C	G	2383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.112;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=57;PP=2025;ReadPosRankSum=-0.800;SC=CGGGGCCCGGCAGAGGAGTCC;SOR=2.891;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=71;TCF=14;TCR=57;TR=70;WE=140349882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
chr9	140356374	rs4962240	C	A	1053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=5;PP=902;SC=TCCGGACGCCCGTACTCACCG;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=140356382;WS=140356364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr9	140357848	rs2275781	G	C	1334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=9;PP=1014;SC=TGCCGGGCGTGGTCCCCCCAC;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=42;WE=140357856;WS=140357838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr9	140357972	rs1891627	A	G	2007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=32;PP=1642;SC=CGCACGTACCACCACAGGGAG;SOR=0.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=68;TCF=35;TCR=33;TR=67;WE=140357980;WS=140357962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr9	140374861	rs1891630	A	G	1610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=22;PP=1332;SC=CGTGCCATCTACCTGGTAGAG;SOR=1.007;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=27;TCR=22;TR=49;WE=140374869;WS=140374851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr9	140396212	rs1891629	C	T	3522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=66;PP=2758;SC=GGAACACGGGCGGGAAGCATA;SOR=1.219;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=44;TCR=66;TR=110;WE=140396220;WS=140396202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr9	140705796	rs11789631	G	A	117.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=1;PP=78;SC=TGCTGCGGACGGCCACGCATG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=140705804;WS=140705786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr9	140706127	rs11789684	G	A	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=35;PP=1026;SC=CGCCCAGAGAGACCGCTTGAC;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=40;WE=140706135;WS=140706117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr9	140708768	rs7851955	T	G	2406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=13;PP=1931;SC=GTGGTGCCTTTGAGAAGCACT;SOR=3.026;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=60;TCR=13;TR=73;WE=140708776;WS=140708758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr9	140740886	.	A	T	115	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;FR=0.5436;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=29;MQ=52.37;NF=6;NR=0;PP=115;QD=24.9618687579;SC=TCCCCCAGGAATCCTCCTAAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=140740894;WS=140740876;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:0,6:1.00:6
chr9	140772434	rs187204220	G	A	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=2.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.55;ReadPosRankSum=0.324;SOR=0.176;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,25:0.30:82
chr9	140772442	rs191962352	G	A	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.914;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,27:0.28:95
chr9	140772477	rs201253748	G	T	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=25.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.66;ReadPosRankSum=1.132;SOR=0.024;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,32:0.23:140
chr9	140773764	rs41289997	C	G	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=40;PP=1156;SC=GCAGATAACACCTTCCTCGAG;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=41;WE=140773772;WS=140773754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr9	140777306	rs4422842	C	G	4286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=9.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.443;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=57;PP=2962;ReadPosRankSum=0.108;SC=ACGGCTGGAACGTCATGGACT;SOR=1.479;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=172;TCF=50;TCR=122;TR=82;WE=140777314;WS=140777296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,151:0.62:244
chr9	140777370	rs1110146	A	C	2884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=85;PP=2314;ReadPosRankSum=0.038;SC=CCAGCGTGTGAGGCCCGGGCG;SOR=3.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=5;TCR=86;TR=90;WE=140777378;WS=140777360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,104:0.98:106
chr9	140786918	rs4076712	T	C	172.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=169;SC=TTAGATGGTTTGATGTCTGCA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=140786926;WS=140786908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr9	140991113	.	A	G	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.853;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=471;ReadPosRankSum=-0.483;SC=CCATGCCCATAGATCTTGGGA;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=21;WE=140991121;WS=140991103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr9	141008876	rs2229948	C	T	1871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=27;PP=1349;SC=TGATGATATTCGACTTCTACA;SOR=0.865;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=28;TCR=27;TR=55;WE=141008884;WS=141008866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr9	141016262	rs2278973	T	G	2988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=52;PP=2388;SC=CTGAGGACACTCTCACTTTCG;SOR=0.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=43;TCR=53;TR=95;WE=141016270;WS=141016252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr9	141069905	rs71485051	C	T	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5445;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=11;PP=267;SC=CATCAACGTGCACCACCACGA;SOR=0.914;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=19;WE=141069913;WS=141069895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr9	141069927	rs71485052	C	A	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=12;PP=277;SC=GCCAGCGGTGCGACCCCCGTC;SOR=1.739;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=16;WE=141069935;WS=141069917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr9	141069952	rs9410185	T	C	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=12;PP=290;SC=CCCCACCCAATGTGCACCACC;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=141069960;WS=141069942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr9	141070125	rs10867114	C	T	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=2;PP=600;SC=CGCTCGGGGCCCTTCGGGCAG;SOR=4.615;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=141070133;WS=141070115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr9	141070283	rs7868693	T	C	1927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=45;PP=1749;SC=CCCTCCTATCTGCCGAGTCGA;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=38;TCR=45;TR=83;WE=141070291;WS=141070273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr9	141070335	rs7868705	T	G	1155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.17;QD=32.10;SOR=0.927;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	95074	rs6560828	G	A	234.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=190;SC=CACCTTCCCCGGCCACCCGGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=95082;WS=95064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	95226	rs6560829	A	T	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.67;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	95229	rs6560830	C	T	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.32;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	282897	rs4600135	C	T	4917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=114;PP=2965;SC=TCCCAAAACACATTTTACTAT;SOR=2.444;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=35;TCR=114;TR=149;WE=282905;WS=282887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr10	285200	rs7919436	T	G	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=538;ReadPosRankSum=0.514;SC=TATACTATATTATTAAAACCG;SOR=2.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=22;WE=285208;WS=285190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr10	285479	rs10655220	G	GTGT,GTGTT	4206.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=10,10;NR=125,125;PP=351,1351;SC=GAATATTTTTGTTTTTTTTGT;SOR=4.632;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=10;TCR=126;TR=135,135;WE=285487;WS=285469;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.31,0.69:131
chr10	292927	rs2303990	C	A	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=23;PP=703;SC=AGTGTGTCTCCGGAAGGAAGT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=292935;WS=292917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	294953	rs1017361	A	G	4851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=85;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.872;SC=AGTGTAAGGAAGAATTTGTAG;SOR=0.416;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=147;TCF=61;TCR=86;TR=146;WE=294961;WS=294943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,154:0.99:155
chr10	323283	rs3740304	A	G	2431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.432;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=27;PP=1917;ReadPosRankSum=-0.770;SC=TGTAGGCCACATAGATGGGGT;SOR=0.862;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=160;TCF=116;TCR=44;TR=101;WE=323291;WS=323273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,102:0.63:161
chr10	329188	rs45445697	G	T	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=8;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.446;NF=11;NR=2;PP=783;ReadPosRankSum=-0.109;SC=CTGTTGGGGGGGGGCCGCCAG;SOR=0.090;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=13;WE=329199;WS=329178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr10	329191	rs371065533	GC	G	492.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.235;HP=8;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.902;NF=11;NR=2;PP=804;ReadPosRankSum=0.437;SC=TTGGGGGGGGGCCGCCAGCCT;SOR=0.288;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=13;WE=329199;WS=329178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr10	329487	rs2303991	A	G	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=3.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.17;ReadPosRankSum=-1.385;SOR=2.331;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,33:0.82:40
chr10	329493	rs3815985	C	A	1066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=33.34;ReadPosRankSum=-1.734;SOR=1.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,26:0.81:32
chr10	370737	rs41288725	C	T	6101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.590;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=165;NR=52;PP=2962;ReadPosRankSum=0.664;SC=GCCCTGGTGCCGAGGTAAGGA;SOR=0.817;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=338;TCF=256;TCR=82;TR=217;WE=370745;WS=370727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,219:0.65:337
chr10	370977	rs3123241	A	G	1766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=47;PP=1455;SC=AGGCAAAGGAAGGCGGATCAT;SOR=6.518;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=48;WE=370985;WS=370967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	373048	rs2288681	T	C	2668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.307;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=68;PP=1852;ReadPosRankSum=0.672;SC=ACTGTGTGAGTGCGATCCGAG;SOR=0.578;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=166;TCF=63;TCR=103;TR=110;WE=373056;WS=373038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,113:0.67:169
chr10	375570	rs3832678	GGGAGCTCAGCAAGGCT	G	640.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=4.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=1.396;QD=11.87;ReadPosRankSum=0.520;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,19:0.35:54
chr10	387060	rs7904155	G	A	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=6;PP=777;SC=GCAGTGCTTAGGTTGCCTGGC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=387068;WS=387050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	394714	rs4880610	G	A	5008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=102;PP=2965;SC=TACACAAGGAGAGAAACATCA;SOR=1.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=44;TCR=102;TR=146;WE=394722;WS=394704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr10	395235	rs3802659	G	C	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.295;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=5;PP=958;ReadPosRankSum=0.463;SC=TGACCGGCTTGCCATCTCTCA;SOR=1.863;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=39;WE=395243;WS=395225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,39:0.76:51
chr10	395266	rs4880611	T	C	2402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=57;NR=21;PP=1913;SC=ACCCTGCGCCTGTACCTGGGG;SOR=2.103;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=57;TCR=21;TR=78;WE=395274;WS=395256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr10	395463	rs4242754	G	A	1735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=41;PP=1354;SC=GAGCGCGCACGCGTCATACAA;SOR=2.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=9;TCR=41;TR=50;WE=395471;WS=395453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr10	410825	rs10795053	G	A	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=0;PP=960;SC=CCAATCAGCAGTAACTGATTA;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=410833;WS=410815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	412449	rs1133113	A	G	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=1.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.88;ReadPosRankSum=-0.270;SOR=0.324;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,20:0.29:70
chr10	428503	rs4881200	A	G	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=6;PP=1116;SC=CCTCAGCATCAACTGTTAGGA;SOR=3.830;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=44;TCR=6;TR=50;WE=428511;WS=428493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	429903	.	GAA	G	141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.307;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr10	435880	rs4881219	G	C	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=412;ReadPosRankSum=-0.416;SC=CTTCGTGTCAGGTGTCCCGGT;SOR=0.313;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=21;WE=435888;WS=435870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr10	436848	rs10904093	A	G	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=307;ReadPosRankSum=-0.630;SC=GACCTGCCCCACTCCGCCCAG;SOR=0.529;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=73;TCF=10;TCR=63;TR=22;WE=436856;WS=436838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,23:0.32:72
chr10	444997	rs6560836	C	T	3270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.719;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=34;PP=2490;ReadPosRankSum=-0.867;SC=ATACAGCCACCGTGAAAGCCA;SOR=0.627;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=160;TCF=113;TCR=47;TR=115;WE=445005;WS=444987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,116:0.73:160
chr10	445061	rs6560837	C	T	6661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=131;NR=93;PP=2965;SC=TCCTGGTGAGCGGCACCTCGA;SOR=1.083;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=225;TCF=132;TCR=93;TR=224;WE=445069;WS=445051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr10	459940	rs4881274	G	A	1955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=38;PP=1382;ReadPosRankSum=-0.095;SC=CACCTCTGCAGTGCGGCCTCC;SOR=0.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=43;TCR=52;TR=69;WE=459948;WS=459930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,74:0.74:100
chr10	461912	rs66682704	TC	T	924.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.667;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=27;PP=962;ReadPosRankSum=0.069;SC=CACAGCCCCCTCCCCAGCGCG;SOR=0.199;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=29;WE=461920;WS=461902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,32:0.68:47
chr10	468748	rs4881290	C	T	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=423;SC=AGAAAGACACCGTGAAGCGTG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=468756;WS=468738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	518547	rs10610683	ACT	A	3918.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.607;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.152;NF=19;NR=59;PP=2962;ReadPosRankSum=0.691;SC=GAGTCAGCAGACTCTAACAAA;SOR=0.633;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=35;TCR=109;TR=78;WE=518556;WS=518537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,100:0.61:165
chr10	530644	rs1539231	G	A	888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=1;PP=766;SC=ACGTCTGTACGGGATGGCACT;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=530652;WS=530634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	687569	rs1631975	C	T	2912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=22;PP=2211;SC=CACTGCCAGGCTACCCATGAG;SOR=2.204;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=66;TCR=22;TR=88;WE=687577;WS=687559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr10	696237	rs10904535	G	A	2908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=35;PP=2514;SC=TCAGGGCCAGGGACCATGGTG;SOR=1.192;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=53;TCR=35;TR=88;WE=696245;WS=696227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr10	708192	rs3853289	A	G	2814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=82;PP=2419;SC=TCCTGAAGGTACTGTATGAGG;SOR=6.642;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=84;TCF=2;TCR=82;TR=84;WE=708200;WS=708182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr10	1018585	rs4880745	T	G	1844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.946;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=33;PP=1473;ReadPosRankSum=-1.267;SC=TCCATTTCTATGTAAGCCGTT;SOR=0.977;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=224;TCF=114;TCR=110;TR=75;WE=1018593;WS=1018575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,76:0.33:233
chr10	1038339	.	C	CAA	20	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.6092;HP=17;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=56.29;NF=2;NR=0;PP=20;QD=11.5;SC=GACTCTGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=2;WE=1038347;WS=1038335;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,2:0.29:7
chr10	1042023	rs10665098	A	AAAC	7899.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=121;NR=39;PP=2975;SC=AGTGGAAAAAATAATATTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=165;TCF=123;TCR=42;TR=160;WE=1042031;WS=1042007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr10	1043058	rs1250887	T	C	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=1;PP=747;SC=AATATCACCATAGGCCTGGAC;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=1043066;WS=1043048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	1046712	rs2306409	G	A	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.814;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=9;PP=618;ReadPosRankSum=1.333;SC=TCCGTGCTGCGGTCCTGTATG;SOR=0.852;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=135;TCF=102;TCR=33;TR=39;WE=1046720;WS=1046702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,41:0.29:139
chr10	1052950	rs2306408	G	A	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.775;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=24;PP=1245;ReadPosRankSum=0.533;SC=TCTTTTTTACGTTATTAGGCT;SOR=0.816;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=96;TCF=55;TCR=41;TR=57;WE=1052958;WS=1052940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,57:0.59:97
chr10	1053701	.	C	G	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.75;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr10	1054276	rs10904595	T	C	1409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=1;PP=1189;SC=ACCTGGGAGGTGGAGGTTGCA;SOR=6.138;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=42;WE=1054284;WS=1054266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	1056310	rs3765102	G	C	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=275;ReadPosRankSum=1.812;SC=CGTAGTACTTGAAGATATTAA;SOR=0.622;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=12;WE=1056318;WS=1056300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr10	1061625	.	GCTGAGCA	G	1183	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=47;MMLQ=24;MQ=53.19;NF=23;NR=0;PP=1183;QD=52.5652173913;SC=GGTCCTGAGCGCTGAGCACTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=23;WE=1061639;WS=1061615;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,23:0.82:28
chr10	1061862	rs2306406	A	G	1781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.411;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=53;PP=1338;ReadPosRankSum=-1.450;SC=GTGTAATGTAATAAAATGACA;SOR=1.417;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=93;TCF=19;TCR=74;TR=66;WE=1061870;WS=1061852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,67:0.71:94
chr10	1065458	rs17851563	C	T	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=380;ReadPosRankSum=-0.298;SC=CCCTGCCTCTCACACTCTGTG;SOR=0.643;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=48;TCR=11;TR=21;WE=1065466;WS=1065448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,22:0.37:60
chr10	1065628	.	GA	G	1719.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.177;ClippingRankSum=0.000;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.165;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.05;MQRankSum=1.557;NF=19;NR=31;PP=1725;ReadPosRankSum=-0.426;SC=ACAGGTAGAGGATGCTTTTCG;SOR=0.648;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=169;TCF=79;TCR=90;TR=50;WE=1065636;WS=1065618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,59:0.29:200
chr10	1068802	rs3750729	G	A	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.709;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=530;ReadPosRankSum=-1.244;SC=TCTGTTTCTCGTAGAAAAGCC;SOR=1.270;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=27;WE=1068810;WS=1068792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr10	1068849	rs3829163	C	T	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=178;ReadPosRankSum=-2.123;SC=AAGGGGACTGCTGGATGCCCA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=9;WE=1068857;WS=1068839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr10	1070461	rs3793777	C	T	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=216;ReadPosRankSum=0.569;SC=CTTAGGTTGCCGTCGGGTGGG;SOR=0.317;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=11;WE=1070469;WS=1070451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr10	1070710	rs12357207	C	G	3006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=68;PP=2341;ReadPosRankSum=0.040;SC=ACAAATGCCTCTTTATGTGAA;SOR=0.681;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=59;TCR=111;TR=105;WE=1070718;WS=1070700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,111:0.60:184
chr10	1081791	rs146706331	G	GCCTGGCCCA	1420.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=16.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.46;ReadPosRankSum=-0.438;SOR=3.076;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,30:0.26:114
chr10	1081882	rs7075695	T	C	3640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-6.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.109;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.674;NF=62;NR=94;PP=2703;ReadPosRankSum=-0.134;SC=GAGAGGGAACTGTCTGTACAC;SOR=0.499;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=236;TCF=91;TCR=145;TR=156;WE=1081890;WS=1081872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,155:0.65:240
chr10	1081944	rs11396609	G	GT	919.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQRankSum=-0.874;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.171;SOR=0.950;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,49:0.60:81
chr10	1087551	rs12768746	T	C	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=158;ReadPosRankSum=-0.550;SC=GCAGTATAGTTTTAGGATTAG;SOR=0.512;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=8;WE=1087559;WS=1087541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr10	1089616	rs11250238	T	C	2185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=50;PP=1677;SC=TGAAGGCACATGCTTCCCTGC;SOR=1.409;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=27;TCR=50;TR=77;WE=1089624;WS=1089606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr10	1093992	rs4880759	A	G	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=2;PP=335;SC=GGGTCTTGCTATGTCTGTCGC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=1094000;WS=1093982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	1126293	rs7087381	T	C	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=7;PP=858;ReadPosRankSum=-0.504;SC=GACCCATTTGTGAGGCTATAG;SOR=0.610;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=38;WE=1126301;WS=1126283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,39:0.81:48
chr10	1126619	rs7084283	A	G	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=58.09;MQRankSum=-0.366;NF=2;NR=3;PP=90;ReadPosRankSum=-0.712;SC=GCTGAGGTGGATGGATCACTT;SOR=0.180;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=5;WE=1126627;WS=1126609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr10	1132215	rs11250255	C	T	2040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.817;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=26;PP=1629;ReadPosRankSum=-0.081;SC=TTCTTCATTTCCATCTTGCAG;SOR=0.807;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=65;TCR=37;TR=73;WE=1132223;WS=1132205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,74:0.70:105
chr10	1142208	rs10794716	T	C	2839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=59;PP=2004;SC=TCCTTACCTGTGAATGTGTAG;SOR=1.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=35;TCR=59;TR=94;WE=1142216;WS=1142198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr10	1149390	rs7915650	C	A	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=408;ReadPosRankSum=-0.981;SC=ACATACTCATCACTGTGGCCA;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=17;WE=1149398;WS=1149380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,19:0.79:24
chr10	1170304	rs7916430	C	G	2956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.751;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=66;PP=2249;ReadPosRankSum=-2.057;SC=TAAAGTCAAACTGTTGGTTAA;SOR=0.932;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=167;TCF=67;TCR=100;TR=107;WE=1170312;WS=1170294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,113:0.63:180
chr10	1230968	rs2271275	C	T	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=27;PP=823;SC=CGCGCCTCGGCGTCACTCACG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=35;WE=1230976;WS=1230958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	1245893	rs1983028	A	T	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=298;SC=GCCCCCGGGAAGGGGGTTCTT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=1245901;WS=1245883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr10	1779349	rs3750684	G	A	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.426;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=438;ReadPosRankSum=0.641;SC=GGCCATGGCCGAGACCCAGGC;SOR=1.148;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=83;TCF=18;TCR=65;TR=25;WE=1779357;WS=1779339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,25:0.27:91
chr10	3109705	.	C	T	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.066;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.357;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=926;ReadPosRankSum=0.138;SC=GGCGGGGCGGCGGTTCCGAGT;SOR=2.655;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=19;WE=3109725;WS=3109695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr10	3109717	.	A	G	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.604;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=2;PP=926;ReadPosRankSum=-0.155;SC=GTTCCGAGTCAGGCGCGCGCG;SOR=1.248;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=27;WE=3109725;WS=3109695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,27:0.71:38
chr10	3111351	.	G	C	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.941;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=242;ReadPosRankSum=0.942;SC=CCCCGCGGGAGACCCGGGTGG;SOR=0.481;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=12;WE=3111359;WS=3111341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr10	3111685	rs74504363	G	A	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=215;ReadPosRankSum=-2.781;SC=TACCTGGGCCGCGAAAGACAA;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=11;WE=3111693;WS=3111675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr10	3124516	rs4881074	G	A	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.351;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=404;ReadPosRankSum=1.405;SC=GTCATGGGTAGTTAGTGGCAG;SOR=0.351;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=96;TCF=68;TCR=28;TR=26;WE=3124524;WS=3124506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,27:0.27:99
chr10	3143054	rs71294492	CAAAA	C	677.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=8.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=33.89;ReadPosRankSum=1.741;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,18:0.90:20
chr10	3143643	rs4881080	A	C	1015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=12;PP=752;SC=TGCTGCAGCGAGGCATCACCA;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=32;WE=3143651;WS=3143633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	3145885	rs10903966	T	C	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=282;ReadPosRankSum=-0.132;SC=TCTCTACCCATGGCCATTCTG;SOR=0.954;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=57;TCF=54;TCR=3;TR=18;WE=3145893;WS=3145875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,15:0.28:54
chr10	3145906	rs11251719	A	C	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=440;ReadPosRankSum=-0.837;SC=CCTCACCCCTAGTGGGGCACC;SOR=0.531;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=73;TCF=60;TCR=13;TR=24;WE=3145914;WS=3145896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,23:0.32:73
chr10	3147508	rs4881082	C	T	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.22;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	3147518	rs2388576	GG	CC	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=34.29;ReadPosRankSum=-0.436;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,20:0.87:23
chr10	3149402	rs10903967	A	G	1559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.625;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=25;PP=1069;ReadPosRankSum=0.969;SC=TTCTGTCTCCACAGAACCGTG;SOR=0.960;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=109;TCF=57;TCR=52;TR=58;WE=3149410;WS=3149392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,66:0.55:119
chr10	3150898	rs11251721	C	T	1446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.142;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=34;PP=1086;ReadPosRankSum=0.244;SC=TGCAGCTTGTCGTCACGCAGC;SOR=0.378;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=152;TCF=54;TCR=98;TR=59;WE=3150906;WS=3150888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,61:0.40:154
chr10	3154267	rs2306299	G	A	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=481;ReadPosRankSum=-0.772;SC=GCGGCCGGTCGTCTAGACCAT;SOR=1.681;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=22;WE=3154275;WS=3154257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr10	3154339	rs2306301	C	T	1898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.208;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=10;PP=1475;ReadPosRankSum=-0.036;SC=AGGACCGAGCCAGTCTCTACC;SOR=1.051;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=87;TCF=72;TCR=15;TR=62;WE=3154347;WS=3154329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,64:0.71:90
chr10	3154534	rs2306304	A	G	1649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=47;PP=1424;SC=CCTCAGGCCCAGCCACTGCAA;SOR=5.590;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=2;TCR=47;TR=49;WE=3154542;WS=3154524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	3155173	rs7896691	C	T	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=1;PP=1162;SC=GCACATGGAACCCTGGGGCCT;SOR=6.138;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=42;WE=3155181;WS=3155163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	3155217	rs6602023	T	C	2340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=10;PP=1917;SC=GCAGACACATTGAGTGCTGGC;SOR=3.551;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=63;TCR=10;TR=72;WE=3155225;WS=3155207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr10	3155237	rs6602024	A	G	2844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=25;PP=2199;SC=CAGATAAGCCACCTTTTCTCC;SOR=2.326;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=77;TCR=25;TR=102;WE=3155245;WS=3155227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr10	3155263	rs7906901	T	C	4089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.26;SOR=1.630;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr10	3155263	.	TG	CG,CT	1597	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=76,22;NR=37,10;PP=1597,430;QD=14.4404532084;SC=AGCCCTGAGTTGTGTCCGGTA;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=114;TCF=76;TCR=38;TR=113,32;WE=3155272;WS=3155253;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.99:114
chr10	3155264	rs7915793	G	T	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.75;ReadPosRankSum=1.465;SOR=0.603;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,33:0.28:118
chr10	3155285	rs3816698	G	A	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.307;HP=2;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=822;ReadPosRankSum=-0.375;SC=TCTCGACTCCGGTCCAACGAC;SOR=0.954;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=146;TCF=91;TCR=55;TR=48;WE=3155293;WS=3155275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,48:0.32:150
chr10	3155353	rs3816699	C	T	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.735;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=791;ReadPosRankSum=0.060;SC=GACTTGCCATCAAGCTGCCGG;SOR=0.339;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=139;TCF=55;TCR=84;TR=48;WE=3155361;WS=3155343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,49:0.34:144
chr10	3155408	rs3816700	C	T	1942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.821;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=45;PP=1512;ReadPosRankSum=0.563;SC=CGCGATGCCCCGACCTCTCCT;SOR=0.863;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=100;TCF=34;TCR=66;TR=67;WE=3155416;WS=3155398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,69:0.67:103
chr10	3155428	rs3816701	C	T	1800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.846;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=34;PP=1445;ReadPosRankSum=-0.968;SC=TGCGGGCCTCCCCTCATGGCC;SOR=0.869;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=88;TCF=38;TCR=50;TR=58;WE=3155436;WS=3155418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,61:0.67:91
chr10	3155540	rs4881085	A	G	4045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=57;PP=2965;SC=GTGACCCAGCACTCACCTGCC;SOR=1.016;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=82;TCR=57;TR=139;WE=3155548;WS=3155530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr10	3155620	rs1052309	A	G	2180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.959;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=59;PP=1677;ReadPosRankSum=0.649;SC=GGATGAACGCAGCCGTACGCT;SOR=1.448;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=118;TCF=35;TCR=83;TR=79;WE=3155628;WS=3155610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,82:0.68:121
chr10	3155698	rs4881086	C	T	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.567;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=439;ReadPosRankSum=1.594;SC=TTGACGGCTTCGCCAAGGGCC;SOR=0.399;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=23;WE=3155706;WS=3155688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr10	3155753	rs4881087	G	C	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=22;PP=674;SC=CACCCTGGCTGTGAGCACAGT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=3155761;WS=3155743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	3158848	rs7086902	C	T	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=573;ReadPosRankSum=0.143;SC=CTGTCTCATACGCCTCTCAAA;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=23;WE=3158856;WS=3158838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr10	3160913	rs3829912	G	A	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.52;ReadPosRankSum=2.489;SOR=1.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,27:0.64:42
chr10	3160917	rs3829913	T	C	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.79;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	3161131	rs3829914	C	T	1616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.997;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=38;PP=1102;ReadPosRankSum=0.366;SC=AAACATTAAGCTACTTGTTGG;SOR=1.066;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=86;TCF=32;TCR=54;TR=59;WE=3161139;WS=3161121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,63:0.70:90
chr10	3161148	rs3829915	G	C	2175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=45;PP=1720;SC=TTGGCTACTGGCCACGATCCG;SOR=2.035;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=18;TCR=45;TR=63;WE=3161156;WS=3161138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	3161216	rs3829916	A	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=191;ReadPosRankSum=0.370;SC=GCAGGATAGCAGGTGGTAAGA;SOR=0.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=11;WE=3161224;WS=3161206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr10	3161253	rs9423464	G	A	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=206;ReadPosRankSum=1.249;SC=CCCAGTTCCAGTAAAGCAACT;SOR=0.540;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=11;WE=3161261;WS=3161243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr10	3161270	rs143742962	A	ACT	277.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=44;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=137;ReadPosRankSum=0.121;SC=AACTTAACCGAGAAGCAAAAG;SOR=0.223;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=4;WE=3161278;WS=3161260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr10	3161271	rs141433931	G	T	286.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.06;ReadPosRankSum=1.148;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr10	3162033	rs6602025	T	C	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=1;PP=1206;SC=AGCGAGACCCTCTCCTCCCCA;SOR=6.184;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=41;WE=3162041;WS=3162023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	3167463	rs2306309	T	C	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=2.457;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.74;ReadPosRankSum=-0.958;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,43:0.31:137
chr10	3167463	.	TCA	CCG	720	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=15;NR=24;PP=720;QD=19.8325096119;SC=CCGTTTCCTCTCATTGCTTTT;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=136;TCF=48;TCR=88;TR=39;WE=3167473;WS=3167453;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:97,39:0.29:136
chr10	3167465	rs3816703	A	G	4773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=88;PP=2043;SC=GTTTCCTCTCATTGCTTTTCC;SOR=1.508;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=46;TCR=88;TR=134;WE=3167473;WS=3167453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr10	3167527	rs142773253	ATTC	A	603.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.434;NF=0;NR=16;PP=573;ReadPosRankSum=2.031;SC=AGCCGGATTTATTCTTCTTCT;SOR=0.579;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=4;TCR=56;TR=16;WE=3167537;WS=3167517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,18:0.34:53
chr10	3171995	rs2279211	G	T	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.73;ReadPosRankSum=0.628;SOR=0.324;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,17:0.23:74
chr10	3172121	rs1052333	C	T	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.297;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=21;PP=948;ReadPosRankSum=0.116;SC=GGCTCGCGGCCGGAGCTGATG;SOR=0.964;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=182;TCF=94;TCR=88;TR=56;WE=3172129;WS=3172111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,55:0.30:181
chr10	3172229	rs4598574	G	A	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.717;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=37;PP=731;ReadPosRankSum=-0.203;SC=ACTGGGTGCTGCGGAGTGAAT;SOR=1.387;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=141;TCF=35;TCR=106;TR=45;WE=3172237;WS=3172219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,46:0.32:142
chr10	3172267	rs4381274	A	G	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.959;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=26;PP=475;ReadPosRankSum=-0.279;SC=TTTGCTTTCCAAGGGGCATGG;SOR=1.302;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=102;TCF=13;TCR=89;TR=28;WE=3172275;WS=3172257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,28:0.27:104
chr10	3172299	rs4390256	T	C	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=291;ReadPosRankSum=-0.119;SC=CTACAGAACATGCCACGCTTG;SOR=0.863;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=71;TCF=5;TCR=66;TR=22;WE=3172307;WS=3172289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,22:0.31:72
chr10	3174499	rs3830217	G	GC	421.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=556;ReadPosRankSum=-0.028;SC=GCACTTCCCAGCCTGCAGTGC;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=15;WE=3174507;WS=3174489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr10	3175541	rs3740613	C	A	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.109;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=317;ReadPosRankSum=-1.100;SC=CCACAAAGCCCCTGTCATGTG;SOR=0.465;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=16;TCR=40;TR=21;WE=3175549;WS=3175531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr10	3178534	.	C	A	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.642;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=200;ReadPosRankSum=-1.867;SC=ATTCAGCCGACCCTACAAACC;SOR=0.191;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=11;WE=3178542;WS=3178527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr10	3178729	rs76887485	G	A	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.486;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=242;ReadPosRankSum=-0.784;SC=ATGACGTGTCGGACTCAGGCC;SOR=1.131;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=65;TCF=23;TCR=42;TR=18;WE=3178737;WS=3178719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,18:0.29:63
chr10	3178865	rs543	G	A	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.671;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=23;ReadPosRankSum=-0.314;SC=ACGTATTATTGACATTAATAC;SOR=2.110;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=4;WE=3178873;WS=3178855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,4:0.18:22
chr10	3178905	rs7673	T	A	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=10;PP=193;SC=CTGCCCCACCTGCTCCAGTGC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=3178916;WS=3178895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	3179703	rs4881107	C	T	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=3.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.572;SOR=1.102;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,33:0.24:136
chr10	3179708	rs4881108	A	G	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=5.205;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.09;ReadPosRankSum=-0.734;SOR=1.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,35:0.26:136
chr10	3179738	rs79334726	G	A	2780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.831;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=36;PP=2196;ReadPosRankSum=0.969;SC=TTCTCAGGACGGTTTCCATGC;SOR=1.163;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=130;TCF=79;TCR=51;TR=95;WE=3179746;WS=3179728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,99:0.73:136
chr10	3180227	rs6901	T	C	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.074;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=215;ReadPosRankSum=-0.189;SC=GGCTGCTCATTGGATGATCCA;SOR=0.312;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=60;TCF=51;TCR=9;TR=15;WE=3180235;WS=3180217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,16:0.24:67
chr10	3180298	rs10175	C	T	4035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=49;PP=2965;SC=CGTGTGTGCTCTTCCCAGTGC;SOR=1.241;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=73;TCR=49;TR=122;WE=3180306;WS=3180288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr10	3180316	rs11414	T	C	4122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=62;PP=2965;SC=TGCCGAGGTATCTGAGAGGAA;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=64;TCR=62;TR=126;WE=3180324;WS=3180306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr10	3180343	rs2388559	A	G	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=4.665;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.16;ReadPosRankSum=-0.135;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,38:0.27:140
chr10	3181003	rs2279217	A	G	1034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=3;PP=817;ReadPosRankSum=-1.375;SC=ACCAGAAGCTAGTGCTCCTGC;SOR=0.814;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=107;TCF=96;TCR=11;TR=38;WE=3181011;WS=3180993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,41:0.38:109
chr10	3181282	rs2279220	G	A	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.218;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=31;PP=751;ReadPosRankSum=0.282;SC=CATTTTACCAGTGGACAAGTT;SOR=0.993;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=152;TCF=59;TCR=93;TR=46;WE=3181290;WS=3181272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,47:0.30:155
chr10	3183003	rs71477812	G	A	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.339;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=511;ReadPosRankSum=0.462;SC=AGGATTTTAAGACTGAAATGA;SOR=0.375;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=110;TCF=25;TCR=85;TR=33;WE=3183011;WS=3182993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,32:0.29:112
chr10	3183747	rs7094698	A	G	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.051;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=22;PP=832;ReadPosRankSum=-1.344;SC=GAACAGGGCCAATTTCCTCTG;SOR=0.536;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=175;TCF=114;TCR=61;TR=58;WE=3183755;WS=3183737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,60:0.34:179
chr10	3185393	rs4881110	A	G	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=140;ReadPosRankSum=-1.481;SC=TGGCTCTAAAACTGGGTCTCT;SOR=0.138;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=9;WE=3185401;WS=3185383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr10	3185798	rs3736093	T	C	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.604;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=10;PP=875;ReadPosRankSum=0.697;SC=TCCCACGCACTGCCCACGGCA;SOR=0.326;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=150;TCF=128;TCR=22;TR=50;WE=3185806;WS=3185788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,50:0.33:153
chr10	3186458	rs3752803	C	G	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.159;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=508;ReadPosRankSum=-0.199;SC=CACCCGCTGGCAACCCGGATG;SOR=1.009;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=88;TCF=67;TCR=21;TR=29;WE=3186466;WS=3186448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,30:0.33:91
chr10	3186723	rs9423496	G	C	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=164;ReadPosRankSum=-1.650;SC=AGGCTGGGCAGAGTGGCTCAT;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=9;WE=3186731;WS=3186713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr10	3187924	rs3758631	T	C	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.164;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.158;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=46;ReadPosRankSum=-1.664;SC=TGAAAAATTATGTATACATAA;SOR=1.609;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=6;WE=3187932;WS=3187914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr10	3189380	rs3740607	C	T	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.994;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=390;ReadPosRankSum=0.401;SC=TCTTGATACGCGGGAGCTTCC;SOR=0.481;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=73;TCF=43;TCR=30;TR=23;WE=3189388;WS=3189370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,25:0.31:80
chr10	3190265	rs4881111	A	G	1674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.926;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=41;PP=1152;ReadPosRankSum=0.056;SC=CCTGAACCAAAGAAAACACAG;SOR=0.931;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=218;TCF=109;TCR=109;TR=73;WE=3190273;WS=3190255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,77:0.34:224
chr10	3190298	rs4881112	C	T	1439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.241;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=42;PP=1030;ReadPosRankSum=1.645;SC=AGGGCCGAATCGAACAGTGAC;SOR=0.993;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=206;TCF=82;TCR=124;TR=65;WE=3190306;WS=3190288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,69:0.32:216
chr10	3199555	rs7086470	A	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=7.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.08;ReadPosRankSum=-2.241;SOR=0.847;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr10	3200155	rs9423705	G	C	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.26;ReadPosRankSum=-0.708;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,6:0.14:42
chr10	3200292	rs3182535	G	A	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.509;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=496;ReadPosRankSum=0.123;SC=GTCTTTCTCCGCAATCCCTTG;SOR=1.722;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=108;TCF=63;TCR=45;TR=31;WE=3200300;WS=3200282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,31:0.27:114
chr10	3201010	rs3814592	C	T	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.99;ReadPosRankSum=1.398;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,5:0.18:28
chr10	3201072	rs3814593	G	T	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.618;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=380;ReadPosRankSum=0.537;SC=CCCAACCAATGAGAACTACTG;SOR=1.497;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=86;TCF=77;TCR=9;TR=23;WE=3201080;WS=3201062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,24:0.27:89
chr10	3201097	rs3814594	T	C	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.952;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=6;PP=615;ReadPosRankSum=-1.141;SC=AATCTAATCATAAACTCACCC;SOR=0.906;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=123;TCF=100;TCR=23;TR=38;WE=3201105;WS=3201087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,39:0.31:127
chr10	3202065	rs4242746	T	C	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.762;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=7;PP=499;ReadPosRankSum=0.596;SC=CTAACGCTGATGGTTGTTTGT;SOR=0.883;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=118;TCF=87;TCR=31;TR=34;WE=3202073;WS=3202055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,38:0.31:124
chr10	3202140	rs4242747	C	T	1489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=29;PP=1056;ReadPosRankSum=1.564;SC=TGTAAAATGACGTGACGTTGT;SOR=0.645;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=175;TCF=94;TCR=81;TR=65;WE=3202148;WS=3202130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,69:0.37:187
chr10	3205851	rs6602034	C	G	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=105;ReadPosRankSum=1.496;SC=ATGCCATAAACTGTTAAGAAC;SOR=0.072;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=6;WE=3205859;WS=3205841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr10	3206027	rs4609511	A	G	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.819;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=190;ReadPosRankSum=0.118;SC=ACGTGTGGTCAGGAAGAAGTC;SOR=1.274;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=40;TCF=17;TCR=23;TR=14;WE=3206035;WS=3206017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr10	3207705	rs9423502	G	C	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.774;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=33;PP=779;ReadPosRankSum=-1.785;SC=AATGGATACAGAGTATAATCA;SOR=0.580;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=152;TCF=36;TCR=116;TR=44;WE=3207713;WS=3207695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,46:0.29:158
chr10	3208512	rs1127047	G	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=12.867;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.70;ReadPosRankSum=0.750;SOR=1.463;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,13:0.28:47
chr10	3208557	rs12359035	A	G	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.728;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=143;ReadPosRankSum=-1.804;SC=CCATGGGAGTAGTACGGAACT;SOR=0.158;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=13;WE=3208565;WS=3208547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr10	3208581	rs58131139	G	GA	90.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.49;ReadPosRankSum=1.086;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr10	3208583	.	A	C	35	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=6;PP=35;QD=11.6285354245;SC=CTAGGGAAGGAGAATGACCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=6;WE=3208591;WS=3208573;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr10	3208583	.	A	AGAGGAATGGCACGCTAGGGAAGGC	116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.32;ReadPosRankSum=1.596;SOR=0.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr10	3214369	rs4880599	A	G	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=142;ReadPosRankSum=-0.233;SC=GCGCTGAACTATTACCTTATA;SOR=1.118;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=9;WE=3214377;WS=3214359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr10	3214516	rs4881118	A	G	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.467;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=393;ReadPosRankSum=-1.468;SC=GACTTTAAGTATGGGCTGTGG;SOR=1.418;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=72;TCF=14;TCR=58;TR=23;WE=3214524;WS=3214506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,25:0.34:74
chr10	3214995	rs34460808	AC	A	1153.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.654;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.101;NF=20;NR=20;PP=1031;ReadPosRankSum=-0.219;SC=CTGGCGAGGAACCCCCTCTTA;SOR=0.809;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=126;TCF=60;TCR=66;TR=40;WE=3215003;WS=3214985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,51:0.35:146
chr10	3215111	rs9423713	G	C	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=486;ReadPosRankSum=-1.355;SC=AAAAGGGTAGGCCTCCACTGC;SOR=0.740;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=72;TCF=6;TCR=66;TR=26;WE=3215119;WS=3215101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,28:0.38:74
chr10	4867313	rs2961562	A	T	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=12;PP=372;SC=GCTCACATTGAGGAGATGGAT;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=4867321;WS=4867303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	4868445	rs2924275	G	T	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=626;ReadPosRankSum=0.019;SC=CGCCAGCGCCGCAGTAGCTCG;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=26;WE=4868453;WS=4868435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,26:0.70:37
chr10	4872769	rs3750738	T	C	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.87;ReadPosRankSum=-0.056;SOR=0.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr10	4872887	rs3750739	C	A	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.637;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=575;ReadPosRankSum=-1.318;SC=GGAAAGTGACCGAGGCAGTGA;SOR=1.244;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=71;TCF=46;TCR=25;TR=32;WE=4872895;WS=4872877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,33:0.45:74
chr10	4872911	rs3750740	C	T	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.812;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=571;ReadPosRankSum=2.050;SC=AGGCCATTGACGCAGGGTACC;SOR=0.999;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=81;TCF=47;TCR=34;TR=33;WE=4872919;WS=4872901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,35:0.41:86
chr10	4875591	rs17133693	A	G	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.524;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=851;ReadPosRankSum=-0.677;SC=GCATGCAGAAAGAGTCTCAAG;SOR=0.892;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=123;TCF=74;TCR=49;TR=44;WE=4875599;WS=4875581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,45:0.35:127
chr10	4875664	rs41289263	G	A	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.825;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=557;ReadPosRankSum=-1.376;SC=TCAAGGTACCGTTCAGTAGGT;SOR=0.525;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=110;TCF=32;TCR=78;TR=36;WE=4875672;WS=4875654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,38:0.34:113
chr10	4877814	rs150127444	T	TTTTTG	1511.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=4.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.028;QD=28.00;ReadPosRankSum=-0.725;SOR=0.257;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,36:0.67:54
chr10	4877817	rs76184294	T	G	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=2.780;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.54;MQRankSum=-1.015;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.948;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,18:0.27:67
chr10	4877819	rs74993572	G	T	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=4.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.57;MQRankSum=-1.091;QD=9.72;ReadPosRankSum=-0.118;SOR=1.603;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,19:0.30:64
chr10	4877828	.	TG	T	690.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=2.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.54;MQRankSum=-1.133;QD=10.31;ReadPosRankSum=-1.247;SOR=1.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,21:0.31:67
chr10	4877831	.	TTTG	T	648.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=2.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.52;MQRankSum=-1.096;QD=9.27;ReadPosRankSum=-1.090;SOR=1.155;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,21:0.30:70
chr10	4879465	rs2961584	T	C	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=1;PP=428;SC=CCCAGCATCCTCTAGCCAGAA;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=4879473;WS=4879455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	4881823	rs2290350	C	G	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.540;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=19;PP=773;ReadPosRankSum=-1.955;SC=CCCATGGCTACTCGGTGACAG;SOR=0.368;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=163;TCF=113;TCR=50;TR=50;WE=4881831;WS=4881813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,50:0.30:167
chr10	4881846	rs34882719	C	T	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=11.749;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.217;SOR=0.477;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,51:0.27:188
chr10	4881935	rs2290349	A	G	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=5.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.56;ReadPosRankSum=-1.149;SOR=0.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,35:0.25:138
chr10	4882095	rs2290348	C	T	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=3;PP=33;ReadPosRankSum=-0.633;SC=CTTGGGATGACTGAGGGAGGG;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=3;WE=4882103;WS=4882085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr10	4884076	rs2278869	A	G	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.260;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=326;ReadPosRankSum=-0.944;SC=GTTCTGAGCCAGGTGGGGTTC;SOR=0.212;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=55;TCF=2;TCR=53;TR=18;WE=4884084;WS=4884066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr10	4884642	rs12573669	T	C	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=2.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.34;ReadPosRankSum=-0.138;SOR=0.482;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,41:0.26:157
chr10	4884721	rs12570011	G	A	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=1.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.68;ReadPosRankSum=-2.352;SOR=0.823;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:177,43:0.20:220
chr10	4884784	rs2924269	T	C	4728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=118;PP=2965;SC=GCCTCAGGGTTGCGGAGCTTG;SOR=2.833;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=28;TCR=118;TR=146;WE=4884792;WS=4884774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr10	4884800	rs2961592	A	G	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=4.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.39;ReadPosRankSum=0.402;SOR=0.290;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,30:0.25:121
chr10	4884808	rs12573690	T	C	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=1.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.650;SOR=0.394;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,27:0.24:112
chr10	4884844	rs34722294	T	TC	181.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.63;ReadPosRankSum=0.563;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,11:0.22:50
chr10	4887813	rs74698686	C	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=142;ReadPosRankSum=-1.002;SC=GAGGAGCCACCGAGTGAGCAG;SOR=0.404;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=9;WE=4887821;WS=4887803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr10	4887935	rs17133753	T	C	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.158;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=554;ReadPosRankSum=-1.003;SC=ACGGGGACCTTGGGCCCAGCT;SOR=0.260;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=138;TCF=96;TCR=42;TR=41;WE=4887943;WS=4887925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,38:0.28:137
chr10	4888140	rs2397986	A	G	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=9.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.10;ReadPosRankSum=0.104;SOR=0.021;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,15:0.33:46
chr10	4888149	rs2397985	A	G	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.695;SOR=0.057;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr10	4889475	rs1869217	G	T	2049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.504;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=69;PP=1550;ReadPosRankSum=-0.875;SC=CAGATTGAATGATTGGTGTCT;SOR=0.971;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=263;TCF=61;TCR=202;TR=87;WE=4889483;WS=4889465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,90:0.33:272
chr10	4889525	rs2961597	T	C	5261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=129;PP=2965;ReadPosRankSum=0.730;SC=TTAATTAAACTTTCTCATTAT;SOR=2.847;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=16;TCR=130;TR=145;WE=4889533;WS=4889515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,152:0.99:153
chr10	4889640	rs1869216	T	C	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=5.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.44;ReadPosRankSum=-1.343;SOR=0.245;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,18:0.24:74
chr10	4889662	rs1869215	T	G	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.61;ReadPosRankSum=-0.480;SOR=0.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,17:0.20:83
chr10	4889726	rs34195821	C	CA	678.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=4.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.221;SOR=0.525;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,27:0.22:124
chr10	4889770	rs1869214	T	C	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.37;ReadPosRankSum=0.582;SOR=0.849;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,25:0.23:107
chr10	4889806	rs12569410	C	T	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=328;ReadPosRankSum=-1.100;SC=CATCACAGCGCCAGGGCAGCT;SOR=0.668;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=83;TCF=16;TCR=67;TR=22;WE=4889814;WS=4889796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,21:0.26:80
chr10	5005855	rs116910432	A	G	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.20;MQRankSum=-4.166;QD=7.47;ReadPosRankSum=-1.069;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr10	5005860	rs41305661	G	T	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.78;MQRankSum=-3.708;QD=6.99;ReadPosRankSum=-0.934;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr10	5008383	rs7908994	C	T	2423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.049;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.735;NF=20;NR=74;PP=2048;ReadPosRankSum=0.732;SC=TTATTTATTACGATTTATTCA;SOR=0.428;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=134;TCF=25;TCR=109;TR=94;WE=5008391;WS=5008373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,90:0.68:133
chr10	5009347	rs4445550	A	G	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.663;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=492;ReadPosRankSum=1.161;SC=ATTATAACATAGAAGAAGAAT;SOR=1.763;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=22;WE=5009355;WS=5009337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr10	5009364	rs2904802	T	C	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.859;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=461;ReadPosRankSum=0.621;SC=GAATCCTAAATCTAACTCCTA;SOR=1.445;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=19;WE=5009372;WS=5009354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr10	5009449	rs7076886	T	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=85;ReadPosRankSum=0.355;SC=AGTGCAGAACTCTCAAAGCCT;SOR=0.160;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=5;WE=5009457;WS=5009439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr10	5010572	rs1138600	A	G	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=30.22;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	5019959	rs8483	G	A	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.82;MQRankSum=1.085;QD=16.72;ReadPosRankSum=-0.757;SOR=1.005;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,29:0.62:47
chr10	5041296	rs35767584	C	A	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.29;MQRankSum=-0.464;QD=19.22;ReadPosRankSum=-0.921;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr10	5042664	rs2275929	C	T	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.225;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.282;NF=18;NR=6;PP=421;ReadPosRankSum=-0.970;SC=TAAGAAAAAGCTTAGTTCAAA;SOR=2.130;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=70;TCF=41;TCR=29;TR=24;WE=5042672;WS=5042654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,28:0.37:76
chr10	5042789	rs145355870	A	G	2310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.324;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.191;NF=52;NR=36;PP=1815;ReadPosRankSum=-0.450;SC=ACATAGTCCAATTGAAGATTT;SOR=0.572;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=148;TCF=92;TCR=56;TR=88;WE=5042797;WS=5042779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,87:0.58:150
chr10	5043504	rs67362530	G	A	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.747;NF=19;NR=0;PP=434;ReadPosRankSum=0.000;SC=GCACTTTGAAGGCATGAATTG;SOR=1.893;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=19;WE=5043512;WS=5043499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr10	5045862	rs67165977	A	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=2.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.38;MQRankSum=-1.237;QD=5.41;ReadPosRankSum=0.237;SOR=1.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,10:0.26:38
chr10	5120157	rs4881396	G	T	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.520;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=321;ReadPosRankSum=0.583;SC=CAAGAAGGATGCAAATATCAC;SOR=1.230;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=60;TCF=38;TCR=22;TR=17;WE=5120165;WS=5120147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,18:0.30:61
chr10	5120332	rs7894134	T	G	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.92;ReadPosRankSum=-1.103;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr10	5136651	rs12529	C	G	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.163;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=694;ReadPosRankSum=0.958;SC=ATTCCAAACACCAGTGTGTAA;SOR=0.252;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=101;TCF=67;TCR=34;TR=37;WE=5136659;WS=5136641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,38:0.37:103
chr10	5139685	rs12387	G	A	1930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.110;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=38;PP=1467;ReadPosRankSum=-0.162;SC=ACTCACTGAAGAAAGCTCAAT;SOR=0.601;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=197;TCF=101;TCR=96;TR=76;WE=5139693;WS=5139675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,80:0.40:202
chr10	5141137	rs10508293	A	G	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=520;ReadPosRankSum=0.183;SC=TCCCAGGTTCAATAGGAAAGA;SOR=0.765;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=79;TCF=24;TCR=55;TR=29;WE=5141145;WS=5141127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,30:0.35:86
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chr10	5200059	rs1761601	T	C	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.175;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=319;ReadPosRankSum=0.745;SC=ATCTACAGTGTGCTGCTCCTT;SOR=0.191;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=72;TCF=6;TCR=66;TR=24;WE=5200067;WS=5200049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,24:0.32:74
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chr10	5202241	rs1761599	C	T	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.554;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=301;ReadPosRankSum=0.986;SC=TGGCTTGAGACATGCAATAGT;SOR=0.307;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=10;WE=5202249;WS=5202231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,11:0.26:42
chr10	5203748	rs3750573	A	G	2031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.541;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=9;PP=1570;ReadPosRankSum=-0.487;SC=CCAAGCTAGAATTAGATAATT;SOR=0.299;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=81;TCF=71;TCR=10;TR=62;WE=5203756;WS=5203738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,67:0.77:87
chr10	5204676	rs7080497	A	C	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=290;ReadPosRankSum=-1.326;SC=TCAGAGTAAGAAAGTCTTTTC;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=12;WE=5204684;WS=5204666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr10	5241971	rs61854739	T	G	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=4.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=349;ReadPosRankSum=2.084;SC=CAACGGGTCATAGTCCCACAA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=15;WE=5241979;WS=5241961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr10	5242164	rs17306779	A	G	2071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=43;PP=1568;ReadPosRankSum=0.488;SC=ACAGAGCTGTAGAGGTCACCA;SOR=0.546;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=130;TCF=54;TCR=76;TR=75;WE=5242172;WS=5242154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,77:0.58:133
chr10	5242346	rs7099651	G	A	7666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=129;NR=112;PP=2965;SC=ATGCACATGTGTTTAATGGGA;SOR=0.825;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=242;TCF=129;TCR=113;TR=241;WE=5242354;WS=5242336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr10	5242391	.	T	A	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.644;ClippingRankSum=0.000;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.239;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=40;PP=948;ReadPosRankSum=2.532;SC=ACTGGTTCAGTAGTTGTGGGT;SOR=0.555;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=199;TCF=65;TCR=134;TR=62;WE=5242399;WS=5242381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,66:0.31:211
chr10	5242473	.	G	C	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=0.000;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=39;PP=927;ReadPosRankSum=-0.314;SC=GGCAGAGAATGATGATGCCTT;SOR=0.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=86;TCF=0;TCR=86;TR=39;WE=5242481;WS=5242463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,41:0.45:91
chr10	5244441	rs2151896	A	G	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=249;ReadPosRankSum=-1.218;SC=TCCTTTTCCAATTTGGATTCC;SOR=0.653;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=15;WE=5244449;WS=5244431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,15:0.31:48
chr10	5246584	rs11253042	C	A	3929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.290;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=71;PP=2962;ReadPosRankSum=0.115;SC=AAGTATAATGCCTAAGCCATT;SOR=0.554;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=221;TCF=101;TCR=120;TR=133;WE=5246592;WS=5246574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,144:0.62:233
chr10	5246670	rs1413781	A	C	4919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=103;PP=2965;SC=AAAGCCTCTGATTCAAAAATT;SOR=2.416;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=136;TCF=33;TCR=103;TR=136;WE=5246678;WS=5246660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr10	5255025	rs4880718	A	G	2723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.86;MQRankSum=-0.078;QD=32.04;ReadPosRankSum=1.253;SOR=1.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,84:0.99:85
chr10	5258571	rs2050308	G	A	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=88;ReadPosRankSum=-0.163;SC=AACTTATCAAGTATTTTACAT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=5258579;WS=5258566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr10	5258955	rs2050309	C	G	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=380;SC=GGGTCAGCATCGGTCAACCTG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=5258963;WS=5258945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	5260505	rs5782814	GAA	G	190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=117;SC=TTCTTATTTTGAAAAAAAAAA;SOR=2.584;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=6;WE=5260514;WS=5260495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	5260611	rs72003850	TTCAC	T	1627.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.787;NF=22;NR=11;PP=1546;ReadPosRankSum=0.267;SC=TTCATATAAATTCACTTTGCT;SOR=0.646;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=33;WE=5260622;WS=5260601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,42:0.64:66
chr10	5260812	rs2398157	A	G	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=8;PP=290;SC=CTGGACACACAGCCTCTGGTT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=5260820;WS=5260802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	5415954	rs10904481	A	G	2545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.440;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=27;PP=1811;ReadPosRankSum=-0.148;SC=GGGTGGAGCCAGAGGCACCCG;SOR=0.559;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=109;TCR=43;TR=95;WE=5415962;WS=5415944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,106:0.65:162
chr10	5416202	rs10904482	G	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.548;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=136;ReadPosRankSum=-0.286;SC=CAGCGGGGTGGGGAGGGGGAG;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=5416210;WS=5416192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr10	5435918	rs7097775	G	A	2844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.059;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=54;PP=2285;ReadPosRankSum=-0.117;SC=ACTCAAAGCAGGCAGTGGTGA;SOR=0.810;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=156;TCF=73;TCR=83;TR=98;WE=5435926;WS=5435908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,101:0.64:158
chr10	5436260	rs7910290	A	G	1341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.229;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=23;PP=985;ReadPosRankSum=0.033;SC=GCTCTACCACAGCAGTGGAGA;SOR=0.396;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=73;TCF=40;TCR=33;TR=48;WE=5436268;WS=5436250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,52:0.67:78
chr10	5436487	rs6601957	A	G	1206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.162;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=37;PP=945;ReadPosRankSum=-0.213;SC=TGAATTGGACAGTAGTGGCAG;SOR=1.460;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=65;TCF=8;TCR=57;TR=41;WE=5436495;WS=5436477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,44:0.63:70
chr10	5437365	rs11253156	A	G	2116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=42;PP=1583;ReadPosRankSum=-0.756;SC=CGTAATTGTTAGCAGCATCCT;SOR=0.671;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=46;TCR=61;TR=73;WE=5437373;WS=5437355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,77:0.67:115
chr10	5446632	rs10904491	G	A	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=441;ReadPosRankSum=0.091;SC=AGAAACAAATGTTTCTTTACA;SOR=1.688;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=21;WE=5446640;WS=5446622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr10	5446794	rs7477466	C	T	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.249;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=22;PP=748;ReadPosRankSum=1.778;SC=GTAGTAATGACTGAGGAGCCT;SOR=0.414;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=60;TCF=23;TCR=37;TR=38;WE=5446802;WS=5446784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,38:0.61:62
chr10	5446942	rs4881435	C	T	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=138;ReadPosRankSum=0.469;SC=CTGAACAACCCGGGATAAAGT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=5446950;WS=5446932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr10	5446965	rs4881436	G	A	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=113;ReadPosRankSum=-0.921;SC=GTACACAGCTGCAGATGAACT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=5446973;WS=5446955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr10	5471200	rs4604777	C	T	2347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=36;PP=1758;SC=AAGGTAAGCCCTGCTGCCCTG;SOR=0.774;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=34;TCR=36;TR=70;WE=5471208;WS=5471190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr10	5495157	rs11253185	A	G	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=321;ReadPosRankSum=0.408;SC=CCAAGTATAGATCCCTCATGT;SOR=1.101;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=15;WE=5495165;WS=5495147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr10	5495218	rs4567355	T	C	2489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=19;PP=1963;SC=GACAGGCCTATCATGACCCCA;SOR=2.162;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=79;TCF=59;TCR=20;TR=78;WE=5495226;WS=5495208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr10	5498248	rs4242790	G	T	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=26;PP=630;ReadPosRankSum=0.433;SC=TAAAATGCAGGCCTTCAATAA;SOR=0.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=28;WE=5498256;WS=5498238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr10	5558145	rs5782832	G	GC	5619.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=60;PP=2936;SC=AATCAAACAGGCACCTGGGCA;SOR=1.097;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=129;TCF=68;TCR=61;TR=124;WE=5558153;WS=5558135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr10	5558349	rs4072067	G	A	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=25;PP=763;SC=GAGGCTTGACGGGGAAAGAAG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=5558357;WS=5558339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	5682641	rs7896492	C	T	2586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=17;PP=2062;SC=ACGGGGGCAGCCACGGTCCGG;SOR=2.331;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=60;TCR=17;TR=77;WE=5682649;WS=5682631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr10	5682855	rs4427479	TG	CC	3149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=40;PP=2833;ReadPosRankSum=0.524;SC=ACACCTGCAATGGAACACAAA;SOR=0.624;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=107;TCF=39;TCR=68;TR=66;WE=5682864;WS=5682845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,79:0.67:118
chr10	5684342	rs6602421	C	G	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=0;PP=567;SC=TCTTGCGGGCCCAGGACGGAG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=5684350;WS=5684332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	5684534	rs61006671	T	TA	2807.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=59;PP=954;SC=AAAGTAAAGGTAAAAAAAAAT;SOR=2.864;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=74;TCF=9;TCR=65;TR=65;WE=5684561;WS=5684524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr10	5684553	rs12268809	A	T	1303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.462;HP=9;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=59.99;MQRankSum=-0.567;NF=8;NR=33;PP=954;ReadPosRankSum=0.869;SC=ATTTTTTTTTAAAAAAAAGAG;SOR=0.438;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=67;TCF=10;TCR=57;TR=41;WE=5684561;WS=5684524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,50:0.74:68
chr10	5684616	rs56802263	G	GT	320.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.45;MQRankSum=-0.212;QD=20.05;ReadPosRankSum=-1.474;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr10	5693379	rs6602483	A	G	4170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=79;PP=2965;SC=CACGCAACCCACTTTCCCATC;SOR=1.114;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=55;TCR=79;TR=134;WE=5693387;WS=5693369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr10	5708311	rs6602610	G	A	181.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5731;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=139;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CGGCACCACTGGGACCCTGCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=5708319;WS=5708301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr10	5708420	rs6602613	T	C	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=284;ReadPosRankSum=-0.994;SC=GCGGCCGGCCTCAGGAGCCGG;SOR=0.818;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=16;WE=5708428;WS=5708410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr10	5766313	rs193221853	A	G	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=151;ReadPosRankSum=-0.748;SC=CATTTTTGCAACATATAAAAT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=7;WE=5766321;WS=5766303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr10	5766337	rs10737018	G	A	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=153;ReadPosRankSum=-0.990;SC=CAAATTGACTGTAAGTACATA;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=9;WE=5766345;WS=5766327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr10	5772432	rs45549643	C	T	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=1;PP=1021;ReadPosRankSum=-0.192;SC=ATGTTTAATACGTGTGTATAT;SOR=0.768;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=63;TCF=62;TCR=1;TR=44;WE=5772440;WS=5772422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,43:0.69:62
chr10	5781628	rs2254067	T	G	1694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.631;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=14;PP=1393;ReadPosRankSum=-0.244;SC=TTCAAGAGGTTGTCAAGAAGA;SOR=0.794;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=225;TCF=177;TCR=48;TR=72;WE=5781636;WS=5781618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,74:0.31:235
chr10	5781969	rs2797486	A	T	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=20;PP=1102;ReadPosRankSum=-0.647;SC=CAGACTTAACAGTTAGCCAAG;SOR=0.662;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=101;TCR=59;TR=54;WE=5781977;WS=5781959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,55:0.34:164
chr10	5784509	rs2797488	G	A	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.045;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=403;ReadPosRankSum=-0.356;SC=GCTGAATACCGTTAAATGTTG;SOR=0.293;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=56;TCF=4;TCR=52;TR=21;WE=5784517;WS=5784499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr10	5788608	rs2797491	G	C	2227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=9.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.297;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=51;PP=1781;ReadPosRankSum=-1.424;SC=GCTGATGAACGTACAACCTTT;SOR=1.077;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=262;TCF=128;TCR=134;TR=87;WE=5788616;WS=5788598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,91:0.33:273
chr10	5790420	rs2669142	T	C	5427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=82;PP=2965;SC=GCAGAGCCAGTGTTTCAAGCA;SOR=0.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=89;TCR=82;TR=171;WE=5790428;WS=5790410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr10	5804455	rs3736462	A	G	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=0.807;SC=AAGTACATTAATTATATTAAC;SOR=1.002;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=6;WE=5804463;WS=5804445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr10	5804471	.	G	GTTTTTT	154.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQRankSum=-1.734;QD=5.95;ReadPosRankSum=0.610;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr10	5804474	.	G	T	100	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=17;HapScore=4;MGOF=13;MMLQ=29;MQ=59.44;NF=6;NR=1;PP=100;QD=19.2530303639;SC=ACCAAAAGTTGTTTTTTTTTT;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=7;WE=5804482;WS=5804464;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr10	5804531	rs2797501	G	A	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=251;ReadPosRankSum=2.651;SC=TTTGAAAATAGTGGAATCCTT;SOR=1.104;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=14;WE=5804539;WS=5804521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
chr10	5804865	rs56352451	C	T	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.463;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=376;ReadPosRankSum=-0.967;SC=TAACTTGGATCGTCAGTACAG;SOR=2.910;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=16;WE=5804873;WS=5804855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr10	5805087	rs139115917	AAC	A	930.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.158;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=678;ReadPosRankSum=0.588;SC=TACACATGTGAACAGTCTTAC;SOR=0.186;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=17;WE=5805096;WS=5805077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr10	5810458	rs61836362	C	A	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=391;ReadPosRankSum=-0.225;SC=AAACCATCCTCAAGTTCATAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=17;WE=5810466;WS=5810448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr10	5837038	rs10752110	T	C	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.175;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=28;PP=589;ReadPosRankSum=0.106;SC=ATAAAGAACATTTACTAATAC;SOR=0.509;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=91;TCF=9;TCR=82;TR=31;WE=5837046;WS=5837028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,37:0.38:97
chr10	5853767	rs1567706	T	C	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.828;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=288;ReadPosRankSum=-0.096;SC=GAATATTCTCTAATAATTGCA;SOR=1.508;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=13;WE=5853775;WS=5853757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr10	5853817	rs1567707	G	C	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.967;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=389;ReadPosRankSum=-0.478;SC=AGAAAAACACGATTCTAATTC;SOR=0.305;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=34;TCF=20;TCR=14;TR=20;WE=5853825;WS=5853807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr10	5853923	.	TAA	T	122.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=-0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.49;MQRankSum=0.674;QD=10.23;ReadPosRankSum=0.892;SOR=0.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr10	5855225	rs3736460	G	A	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=1187;ReadPosRankSum=2.874;SC=CATTCATGGCGGGGCAGGCGC;SOR=0.643;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=51;TCR=25;TR=57;WE=5855233;WS=5855215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,56:0.75:75
chr10	5919947	rs2985043	C	T	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=0;PP=791;SC=AACTCCTCAGCAGGAGTGGAA;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=5919955;WS=5919937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	5920121	rs1052420	T	C	3728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=67;PP=2791;SC=GCCAGAGCCCTGAAGGACATC;SOR=0.949;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=53;TCR=67;TR=120;WE=5920129;WS=5920111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr10	5922186	rs811561	T	A	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=3;PP=672;SC=ATTAAAATCATTGTTTTAAAT;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=5922194;WS=5922176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	5924942	rs617165	C	G	4654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=96;NR=48;PP=2965;SC=CAGGGAAGCTCGGACAACGTT;SOR=1.593;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=96;TCR=48;TR=144;WE=5924950;WS=5924932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr10	5925971	rs631947	C	A	5755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=98;PP=2965;SC=CGTCGATGTGCCCACACTGGA;SOR=0.850;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=87;TCR=98;TR=185;WE=5925979;WS=5925961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr10	5932187	rs2253422	C	A	152.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=1;PP=127;SC=AGGAAGTCGGCGGGCGTCTCG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=5932195;WS=5932177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	5932475	rs10905405	T	C	170.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=2;NR=5;PP=158;SC=GGCTCGGCCGTCCGGGCCGTG;SOR=1.329;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=5932483;WS=5932465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	5951025	rs595923	T	C	6652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=99;PP=2965;SC=TACGGTGAGCTTTGCCTGTGC;SOR=0.762;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=202;TCF=103;TCR=99;TR=202;WE=5951033;WS=5951015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr10	5960499	rs2274027	A	G	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=26;ReadPosRankSum=1.282;SC=CTTACGTGCCAGGCCCTGTGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=5960507;WS=5960489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr10	5966190	rs2274029	G	A	1082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.22;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	5966190	.	GCA	ACG	463	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=18;NR=0;PP=463;QD=28.6926597146;SC=CTGCTCTTGCGCAGCTGCTTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=18;WE=5966200;WS=5966180;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,18:0.90:20
chr10	5966192	rs2274030	A	G	1082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.64;SOR=6.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	5967158	rs2669126	C	T	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=204;SC=TTTTCTGTTCCCGACAGTTGT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=5967166;WS=5967151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	5978411	rs646406	T	C	1372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=8;PP=1074;SC=TCGCTCTTTCTTTCTCAGGAG;SOR=2.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=43;WE=5978419;WS=5978401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	5990899	rs4367845	C	T	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=434;SC=TTATACAAGGCACAATGTCAA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=5990907;WS=5990889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	5998285	rs3136627	G	A	3170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=28;PP=2351;SC=GCCAGGTGCAGCTCTTTTCTC;SOR=2.016;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=66;TCR=29;TR=93;WE=5998293;WS=5998275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr10	6000259	rs17320853	T	C	4136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=61;PP=2965;SC=TATGTTTATTTATACAGTCTC;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=66;TCR=61;TR=127;WE=6000267;WS=6000249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr10	6000409	rs12260233	T	C	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=24;PP=614;SC=AGTGCAGTGGTGTGATCACAG;SOR=4.091;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=6000417;WS=6000399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	6001696	rs3136618	C	T	3080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=24;PP=2296;SC=ATAAACATACCGGACAAAGGG;SOR=2.117;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=70;TCR=24;TR=94;WE=6001704;WS=6001686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr10	6002368	rs2228059	T	G	2703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=30;PP=2224;SC=GAGTTCCCAGTTCTTGGCTGT;SOR=1.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=58;TCR=30;TR=88;WE=6002376;WS=6002358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr10	6005674	rs3136614	G	A	3567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=34;PP=2758;SC=GGGAGGGAATGAATGTCCTCG;SOR=1.715;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=75;TCR=34;TR=109;WE=6005682;WS=6005664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr10	6019546	rs8177763	C	T	863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.291;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=621;ReadPosRankSum=-0.204;SC=GGACCTGCCGCCCCGCCAGTC;SOR=0.164;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=56;TCF=36;TCR=20;TR=38;WE=6019554;WS=6019536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,38:0.67:57
chr10	6041873	rs11596136	C	T	1878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.543;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=34;PP=1449;ReadPosRankSum=-2.328;SC=AGGACTTGTACTCCTGGCTGC;SOR=0.601;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=108;TCF=56;TCR=52;TR=66;WE=6041881;WS=6041863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,69:0.62:112
chr10	6041923	rs10905599	T	C	2078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.692;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=41;PP=1508;ReadPosRankSum=1.348;SC=GGCTTTTGGGTATCACAACTG;SOR=0.365;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=116;TCF=46;TCR=70;TR=72;WE=6041931;WS=6041913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,78:0.63:123
chr10	6042034	rs10795731	C	T	1419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.02;SOR=4.664;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	6054912	rs12722599	AT	A	1169.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.383;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.506;NF=5;NR=31;PP=1208;ReadPosRankSum=-0.679;SC=CACCAAAAAAATGTGGTCCTC;SOR=0.272;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=118;TCF=9;TCR=109;TR=36;WE=6054920;WS=6054902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,41:0.31:132
chr10	6054951	rs7076103	C	T	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.72;ReadPosRankSum=-0.535;SOR=0.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,21:0.23:90
chr10	6061277	rs7069976	G	A	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=522;SC=CAACCTACCAGTCAACCAACT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=6061285;WS=6061267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	6061479	rs28360490	A	C	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.422;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=331;ReadPosRankSum=0.235;SC=AAAAGAGATAAAGAGAGACAC;SOR=0.392;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=63;TCF=23;TCR=40;TR=18;WE=6061487;WS=6061469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,18:0.29:63
chr10	6061499	rs28360489	C	T	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.027;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=300;ReadPosRankSum=-0.167;SC=CTCCTGCTACCGTGACTTTAG;SOR=0.319;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=18;WE=6061507;WS=6061489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,17:0.28:60
chr10	6061781	rs10752175	T	C	4198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=42;PP=2965;SC=CCTGGTCACCTCTGCCCTTTT;SOR=1.683;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=84;TCR=42;TR=126;WE=6061789;WS=6061771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr10	6062051	rs9804284	T	A	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=11;PP=336;SC=ATGCCACCCCTCATGGTTCCA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=6062059;WS=6062041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	6063674	rs942200	T	C	1988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=55;PP=1447;SC=ATGGAAGGAATGCTCTGAAGG;SOR=3.105;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=11;TCR=55;TR=66;WE=6063682;WS=6063664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr10	6066462	rs12722574	G	A	1271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.487;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=42;PP=1033;ReadPosRankSum=-0.099;SC=TTACAAATACGAAACCAGAGT;SOR=2.223;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=66;TCF=3;TCR=63;TR=43;WE=6066470;WS=6066452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,44:0.65:68
chr10	6150828	rs374720400	GCTCTGTC	G	220.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.618;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.39;ReadPosRankSum=-0.790;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr10	6150837	.	C	T	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.89;ReadPosRankSum=-0.456;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr10	6150843	.	G	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.86;ReadPosRankSum=0.700;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr10	6150844	.	C	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.86;ReadPosRankSum=0.700;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr10	6150845	.	C	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.86;ReadPosRankSum=0.700;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr10	6150848	rs75593307	ACCTG	A	115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.47;ReadPosRankSum=1.006;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr10	6152220	rs41295353	C	G	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=116;ReadPosRankSum=-0.044;SC=CACACGGTACCTGCCTCAATC;SOR=0.664;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=10;WE=6152228;WS=6152210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,10:0.22:45
chr10	6156118	rs10795823	T	C	2292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=25;PP=1571;SC=GAAGTAAGAGTGTTTTCTTTT;SOR=1.432;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=46;TCR=25;TR=70;WE=6156126;WS=6156108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr10	6188338	rs7074082	A	G	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=302;ReadPosRankSum=-0.090;SC=GTTGGGGTAGAGAGATGGGGG;SOR=1.329;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=16;WE=6188346;WS=6188328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr10	6188591	rs7074372	A	G	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=700;SC=TTGTCGATGTAGGCTCTGGTT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=6188599;WS=6188581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	6245317	rs6602514	G	T	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=525;ReadPosRankSum=1.432;SC=CAGCTGCGCGGAGCCGGGTTG;SOR=0.793;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=24;WE=6245325;WS=6245307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr10	6258015	rs2148293	T	C	2616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=4;PP=2309;SC=TGTCGGGGCGTGTCGGGAGTT;SOR=5.421;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=74;TCR=4;TR=77;WE=6258023;WS=6258005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr10	6258052	rs2148294	G	A	3782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=16;PP=2965;SC=CGGATGCACCGGCGCTGACAT;SOR=3.500;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=98;TCR=16;TR=114;WE=6258060;WS=6258042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr10	6258300	rs2516622	A	C	1450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=34;PP=775;SC=CTCAGGAAGGAGGATGTGGGG;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=6258319;WS=6258290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	6258311	rs2516623	T	C	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=26;PP=587;SC=GGATGTGGGGTGGACTCAGGG;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=6258319;WS=6258290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	6258796	rs2182412	T	C	2371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=62;PP=2068;SC=AGGAAAAGGCTTCAGGAAGCG;SOR=4.174;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=6;TCR=63;TR=68;WE=6258804;WS=6258786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr10	6258840	rs5782881	GC	G	1637.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.22;NF=12;NR=28;PP=1722;SC=CCCTCCTGCTGCCCATGTTCC;SOR=1.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=40;WE=6258848;WS=6258830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr10	6258937	rs2765827	A	G	1191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=7;PP=932;SC=CTTGGGGGCCATGGGGCGTTC;SOR=2.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=6258945;WS=6258927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	6259239	rs2516624	G	A	2290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.19;SOR=8.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	6259239	.	GGCTCGGAAGC	AGCTCGGAAGC,AGCTCGGAAGT	672	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0,0;NR=53,27;PP=227,672;QD=4.93907948202;SC=GACCGGGTCCGGCTCGGAAGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=53,27;WE=6259257;WS=6259229;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:53
chr10	6259249	rs374018806	C	T	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.34;ReadPosRankSum=-1.573;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr10	6261704	rs1557111	T	C	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.658;NF=0;NR=10;PP=217;ReadPosRankSum=0.929;SC=TGAGGGTTCTTACTGAATTCT;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=10;WE=6261712;WS=6261694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr10	6266956	rs4747951	G	T	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=362;SC=GGGGTGGCGGGTGGGGAGGCG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=6266964;WS=6266951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	6268177	rs143645269	C	T	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=6.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.013;SOR=0.988;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,48:0.28:174
chr10	6368707	rs7087657	C	T	1858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=49;PP=1479;SC=AAACAACCCACATTTATAAAG;SOR=4.139;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=5;TCR=49;TR=54;WE=6368732;WS=6368697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr10	6368721	rs7074209	G	T	2140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.69;SOR=4.935;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	6368724	rs7074211	G	T	2086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.40;SOR=5.464;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr10	6368760	rs7087682	C	T	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=63;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=484;SC=TTCGGGCACTCAGGACTTGTT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=6368768;WS=6368750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	6392848	rs744254	G	A	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.709;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=255;ReadPosRankSum=1.007;SC=AGCTGAACCAGATTGGTGTCA;SOR=0.330;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=14;WE=6392856;WS=6392838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,15:0.34:44
chr10	6472891	rs11258747	G	T	2326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.782;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=68;PP=1957;ReadPosRankSum=0.282;SC=TCAGGTTCTCGCACGAAGAGC;SOR=1.189;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=147;TCF=35;TCR=112;TR=85;WE=6472899;WS=6472881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,85:0.58:147
chr10	6472962	rs601150	T	G	1996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=55;PP=1756;SC=CATCAGGAGGTCGTGGTGCTT;SOR=5.926;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=57;TCF=2;TCR=55;TR=57;WE=6472970;WS=6472952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr10	6498723	rs11258943	G	A	2256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.397;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=45;PP=1798;ReadPosRankSum=0.883;SC=CAAAATCCGCGATCTTGATAT;SOR=0.474;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=123;TCF=49;TCR=74;TR=79;WE=6498731;WS=6498713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,83:0.64:129
chr10	6498799	rs2296123	C	G	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=475;ReadPosRankSum=-0.273;SC=TGAAGCAAATCTCACATTAAT;SOR=0.523;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=63;TCF=8;TCR=55;TR=24;WE=6498807;WS=6498789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,27:0.39:70
chr10	6506472	rs41301101	C	T	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=-0.794;QD=20.53;ReadPosRankSum=-1.841;SOR=0.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr10	6506481	rs35896644	G	A	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.91;ReadPosRankSum=-2.262;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr10	6527143	rs2236379	G	A	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.313;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=38;PP=891;ReadPosRankSum=0.118;SC=TAAACATGGCGGCCTTGCTTC;SOR=0.400;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=181;TCF=48;TCR=133;TR=56;WE=6527151;WS=6527133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,57:0.30:187
chr10	6527344	rs661891	A	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=146;ReadPosRankSum=-0.374;SC=CATAGGGTCAACAAAGATCTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=6527352;WS=6527334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr10	6533625	rs527611	T	A	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=0;PP=762;SC=CGGGCCATGCTCATCCCCCAC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=6533633;WS=6533615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	7230524	rs2462712	G	T	875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=0;PP=742;SC=AAGTGGCAAGGTTCAAAGTAG;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=7230532;WS=7230514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	7230824	rs2762607	A	C	1085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=33;PP=819;ReadPosRankSum=-1.641;SC=AAGTGAAGAAACGTGATTAAG;SOR=1.487;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=33;WE=7230832;WS=7230814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,36:0.65:55
chr10	7239386	rs2762604	C	T	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=6;PP=970;ReadPosRankSum=-0.717;SC=ATGGAGAGAACGGAGGTCTCG;SOR=0.598;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=54;TCF=47;TCR=7;TR=42;WE=7239394;WS=7239376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,43:0.78:55
chr10	7285632	rs2248474	A	G	1330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.943;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=38;PP=1047;ReadPosRankSum=-0.027;SC=GTCTTAGGTCATCAATAGTCA;SOR=0.557;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=83;TCF=23;TCR=60;TR=54;WE=7285640;WS=7285622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,54:0.65:83
chr10	7285738	rs117096375	T	C	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=244;ReadPosRankSum=0.643;SC=TATAAAATAGTGGCAGAGCTT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=14;WE=7285746;WS=7285728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr10	7318724	rs7075434	G	A	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.916;NF=27;NR=2;PP=672;ReadPosRankSum=-0.720;SC=TCCTGATGTCGTGATCCGCCC;SOR=0.693;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=29;WE=7318732;WS=7318714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,31:0.77:40
chr10	7318803	rs7097601	T	C	1485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=11;PP=1204;ReadPosRankSum=0.560;SC=ACTTTGTAGATGATTTTATTC;SOR=0.708;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=76;TCR=19;TR=54;WE=7318811;WS=7318793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,56:0.58:97
chr10	7319078	rs4338435	C	G	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.36;ReadPosRankSum=1.130;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
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chr10	7423960	rs2254756	T	C	2236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=52;PP=1599;SC=ATCATATTGATTATATTCACT;SOR=6.593;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=53;TCF=1;TCR=52;TR=53;WE=7423968;WS=7423950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr10	7423984	rs2254760	G	T	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.35;SOR=7.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	7601708	rs7092583	A	G	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.301;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=73;ReadPosRankSum=-0.127;SC=GCCAGCAGACATGGTGTCTGG;SOR=0.178;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=7;WE=7601716;WS=7601698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr10	7601770	rs7074077	G	C	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.865;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.506;NF=3;NR=9;PP=118;ReadPosRankSum=-0.171;SC=CGTATCCCCAGGTGGTGGAGA;SOR=1.341;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=12;WE=7601778;WS=7601760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,15:0.32:47
chr10	7601809	rs201992976	TTTTTG	T	227.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=1.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=1.583;QD=8.76;ReadPosRankSum=0.724;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr10	7605067	rs3824658	C	T	1364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.091;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=11;PP=1106;ReadPosRankSum=0.360;SC=GGACATTCCCCGGCCAAGTGT;SOR=1.925;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=79;TCF=53;TCR=26;TR=47;WE=7605085;WS=7605057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,48:0.58:83
chr10	7605077	rs61199416	TC	T	3396.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=28;PP=2962;SC=CGGCCAAGTGTCCATCCCTGT;SOR=1.559;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=82;TCF=51;TCR=31;TR=76;WE=7605085;WS=7605057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr10	7605101	rs10795551	A	G	3883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=40;PP=2965;SC=AAATGGATGGAATGCCAGGTA;SOR=1.297;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=71;TCR=40;TR=111;WE=7605109;WS=7605091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr10	7605457	rs10737022	G	A	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=29;PP=880;SC=GCCACAGCCCGAGACTGGACT;SOR=2.649;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=36;WE=7605465;WS=7605447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	7614936	rs10737023	T	G	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=0;PP=716;SC=AGACGAGGTTTCACCATGTTG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=7614944;WS=7614926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	7615195	rs4747517	C	A	2131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=44;PP=1735;SC=ATGGTCATTCCTTAAAGAAGA;SOR=1.646;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=64;WE=7615203;WS=7615185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr10	7621578	rs11255201	C	A	2922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=2;PP=2401;ReadPosRankSum=0.447;SC=CATGGTGACACCTCCCATTGC;SOR=5.330;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=87;TCF=85;TCR=2;TR=86;WE=7621586;WS=7621576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,87:0.99:88
chr10	7621771	rs17431370	A	G	5778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.394;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=127;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.094;SC=GTGTGAGGCCACAGTTCTCCA;SOR=0.734;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=364;TCF=168;TCR=196;TR=234;WE=7621779;WS=7621761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,237:0.64:369
chr10	7622047	rs12256183	A	G	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=15;PP=402;SC=ACCAACACGGAACAGCTCAAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=7622055;WS=7622037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	7622075	rs12262854	G	C	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=9;PP=268;SC=ACTCACCTCCGCACTCTGATT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=7622083;WS=7622065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	7627788	.	C	CA	50.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=18.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQRankSum=0.248;QD=2.11;ReadPosRankSum=-0.427;SOR=0.006;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr10	7629168	rs945149	C	A	708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=568;SC=CAGGGATGCTCAGTGATAACA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=7629176;WS=7629158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	7629371	.	A	T	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.328;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.033;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=368;ReadPosRankSum=-1.111;SC=GACTTTCATTATATAATGACC;SOR=0.172;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=76;TCF=20;TCR=56;TR=22;WE=7629379;WS=7629361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,22:0.29:75
chr10	7679393	rs6602256	C	T	1680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.557;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=34;PP=1239;ReadPosRankSum=1.128;SC=CGGCTTTGTCCTTGCTGGGAA;SOR=1.129;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=100;TCF=45;TCR=55;TR=55;WE=7679401;WS=7679383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,61:0.56:108
chr10	7697504	rs11255267	G	A	2842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-7.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=14;PP=2253;ReadPosRankSum=-0.294;SC=TATATGTTTTGGAGGATCTGC;SOR=0.727;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=150;TCF=130;TCR=20;TR=101;WE=7697512;WS=7697494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,105:0.68:155
chr10	7763661	rs7075296	A	G	5376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=67;PP=2965;SC=ATATGCCCTAACTGCCGGGAG;SOR=1.053;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=92;TCR=67;TR=159;WE=7763669;WS=7763651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr10	7769604	rs2277226	A	G	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.015;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=369;ReadPosRankSum=0.976;SC=CTGAATCCAGAATGGGATTTT;SOR=0.271;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=62;TCF=57;TCR=5;TR=19;WE=7769612;WS=7769594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,19:0.30:64
chr10	7773976	rs7098319	A	G	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=1.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.24;ReadPosRankSum=-0.854;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,21:0.27:79
chr10	7776831	rs1926937	C	T	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=341;ReadPosRankSum=3.282;SC=AGCTGACTTGCGCTCCCCCTC;SOR=0.487;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=51;TCR=8;TR=21;WE=7776839;WS=7776821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,21:0.34:61
chr10	7788495	rs7912419	T	C	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.519;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=143;ReadPosRankSum=0.520;SC=GAGTCAATAATGAGCCTCTTT;SOR=1.538;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=11;WE=7788503;WS=7788485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,12:0.24:49
chr10	7795911	rs7342066	A	G	3580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=42;PP=2761;SC=GTTTGGCACCATACCTGTGTC;SOR=1.374;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=73;TCR=42;TR=115;WE=7795919;WS=7795901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr10	7797903	rs138937189	C	CAACT	258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=223;SC=TTTAGCTGAACAACTATACAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=7797911;WS=7797893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr10	7830064	rs2070594	A	T	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.996;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=16;PP=841;ReadPosRankSum=-0.526;SC=CGTAGCGCGAAGAAACGAGAC;SOR=1.015;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=181;TCF=115;TCR=66;TR=52;WE=7830072;WS=7830054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,51:0.28:184
chr10	7830319	rs1475406	G	C	1150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=30;PP=958;SC=GGGGGCAGATGTGGGGTCGCA;SOR=3.797;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=33;WE=7830327;WS=7830309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	7838208	rs1244418	A	G	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=5.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.17;ReadPosRankSum=0.374;SOR=1.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,16:0.23:69
chr10	7838222	rs188599930	C	G	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=1.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.83;ReadPosRankSum=0.220;SOR=0.980;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,14:0.21:67
chr10	7838932	.	C	T	566	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=20;NR=0;PP=566;QD=30.0385606274;SC=CCTTGCACTTCAGAAAAATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=7838940;WS=7838931;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	7844195	rs932971	C	T	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=2;PP=657;SC=CTATTCCTTCCATATAACTTG;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=7844203;WS=7844185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	7844906	rs1244431	T	G	1751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=42;PP=1303;SC=TTTCGTTTTTTTCTTTTGAAG;SOR=3.651;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=6;TCR=42;TR=48;WE=7844914;WS=7844896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	7846152	rs914609	T	C	3524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=78;PP=2682;SC=ACCCACAGAGTGCAGAATACT;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=38;TCR=78;TR=116;WE=7846160;WS=7846142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr10	7848761	rs35152250	G	T	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=168;ReadPosRankSum=0.088;SC=TTTTATAACAGTCATTGAGTC;SOR=1.609;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=9;WE=7848769;WS=7848751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr10	7849054	rs2853759	G	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.528;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=114;ReadPosRankSum=1.425;SC=AGTAATCCTAGAATTGTCCTC;SOR=0.260;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=10;WE=7849062;WS=7849044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr10	7849100	rs35665884	C	T	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=177;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTCACAGTAGCAGCCAACTCA;SOR=0.307;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=10;WE=7849108;WS=7849090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr10	7849688	rs4655	T	C	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=126;ReadPosRankSum=-0.498;SC=CCGAAGAAACTGTTCCTCCAT;SOR=0.569;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=9;WE=7849696;WS=7849678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr10	7866266	.	TTCA	T	1925.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.635;ClippingRankSum=0.000;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=1.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.148;SOR=0.842;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,57:0.28:203
chr10	7866268	rs7070208	C	G	4138.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=1.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.69;ReadPosRankSum=-0.686;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,143:0.71:200
chr10	7866268	.	CA	GA,GG	2962	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=124,30;NR=53,15;PP=2962,2265;QD=20;SC=ATTTGCTTTTCACTTTGTTTC;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=186;TCF=131;TCR=55;TR=177,45;WE=7866277;WS=7866253;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.95:186
chr10	7866269	.	A	AGG	1925.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.000;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=1.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.807;SOR=0.842;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,57:0.28:203
chr10	7866557	rs1244471	T	C	2127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=58;PP=1753;SC=ATGTTAGTGATTATTTTAATG;SOR=8.287;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=0;TCR=58;TR=58;WE=7866565;WS=7866547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	7866576	rs1244472	A	T	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=243;ReadPosRankSum=0.145;SC=TGGATTTTTAATCCTCTTAGC;SOR=0.210;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=14;WE=7866584;WS=7866566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr10	8007559	rs10795583	G	C	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.70;ReadPosRankSum=0.026;SOR=0.592;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,62:0.62:100
chr10	8007560	rs1244229	T	C	4061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.82;SOR=2.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr10	8019124	rs10795584	A	G	2843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=15;PP=2234;SC=TCAGTTTGTGAGAGTGGGAGA;SOR=3.109;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=69;TCR=15;TR=84;WE=8019132;WS=8019114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr10	8050917	rs76960858	G	T	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=406;ReadPosRankSum=0.737;SC=TTCTTGAGCTGCCTCTAGACG;SOR=0.302;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=18;WE=8050925;WS=8050907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr10	8093034	rs501764	G	T	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=21;PP=695;SC=CCGCGCCTCCGCTCTGCGCCA;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=37;WE=8093042;WS=8093024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	8093185	rs485411	T	C	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=8;PP=636;SC=CCCTACCGAGTGGAGAAAGTC;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=8093193;WS=8093175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	8106248	rs201042786	TTTTC	T	562.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.16;QD=40.20;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	8111345	.	C	CT	1021.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.083;ClippingRankSum=0.000;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=1.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.94;MQRankSum=1.859;QD=17.03;ReadPosRankSum=0.515;SOR=0.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,49:0.82:60
chr10	8111409	rs422628	C	T	3318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=43;PP=2667;SC=GTTTTGATTTCACCCTCTCCT;SOR=1.127;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=67;TCR=43;TR=110;WE=8111417;WS=8111399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr10	8115668	rs373223232	TA	T	343.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=6.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=-0.051;QD=3.70;ReadPosRankSum=0.146;SOR=1.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,38:0.41:93
chr10	9449465	.	A	G	2965	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=24;MQ=53.42;NF=169;NR=156;PP=2965;QD=20;SC=GACACAGAGCACCTCAGCGGG;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=326;TCF=170;TCR=156;TR=325;WE=9449473;WS=9449455;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,325:1.00:326
chr10	9449607	.	C	CG	242.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=13.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.34;MQRankSum=0.144;QD=5.28;ReadPosRankSum=-2.710;SOR=0.037;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,11:0.24:46
chr10	9449615	rs377332692	A	G	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=16.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.86;MQRankSum=-0.220;QD=3.58;ReadPosRankSum=-1.537;SOR=0.011;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,6:0.13:46
chr10	9449617	rs370924513	A	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=18.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.31;MQRankSum=-0.360;QD=2.24;ReadPosRankSum=-1.358;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,5:0.11:45
chr10	9449620	rs111226405	C	G	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=19.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.35;MQRankSum=-0.374;QD=1.15;ReadPosRankSum=-1.842;SOR=0.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,5:0.11:46
chr10	11047207	rs2773499	C	G	1192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=0;PP=1069;SC=AGTGGGAAGACAGAGAGAGAG;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=30;WE=11047231;WS=11047197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	11207166	rs57761011	T	TC	178.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=246;ReadPosRankSum=-0.914;SC=CTCCCGAGCCTCCAAGATGTC;SOR=0.399;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=7;WE=11207174;WS=11207156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr10	11299735	rs2277212	A	T	3883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=56;PP=2965;SC=TAGGAATGGTATCGAAGAAAT;SOR=0.778;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=62;TCR=56;TR=118;WE=11299743;WS=11299725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr10	11308790	rs72051267	TTC	T	1073.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.79;SOR=6.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	11316813	rs67013685	TAGTG	T	1423.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=0;PP=1623;SC=GCAGCAGTGTTAGTGAGTTTC;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=11316824;WS=11316803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	11316909	rs2244576	G	C	2072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=19;PP=1707;SC=CATCAGTAGGGAGTAGCAACC;SOR=1.850;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=62;TCF=42;TCR=20;TR=60;WE=11316917;WS=11316899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr10	11316987	rs2244573	G	A	3214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=52;PP=2482;SC=TGCTCTCACCGTCTCCACTTT;SOR=0.731;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=49;TCR=53;TR=101;WE=11316995;WS=11316977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr10	11330525	rs2277214	G	A	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.621;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=520;ReadPosRankSum=0.524;SC=GGTGAGTGTGGGGGGTGCTCT;SOR=0.340;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=107;TCF=20;TCR=87;TR=31;WE=11330533;WS=11330515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,34:0.30:112
chr10	11330548	rs2277215	G	A	1461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.918;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=45;PP=1161;ReadPosRankSum=-0.088;SC=CCTTGCAGGTGATGCAGCAGG;SOR=1.609;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=73;TCF=6;TCR=67;TR=48;WE=11330556;WS=11330538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,50:0.66:76
chr10	11330576	rs2277216	C	T	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=34;PP=787;ReadPosRankSum=-0.368;SC=GGTAGGTTTCCGTGCCTCCAG;SOR=1.278;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=0;TCR=55;TR=34;WE=11330584;WS=11330566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,36:0.62:58
chr10	11356093	rs5783207	T	TTTTG	1015.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=965;SC=TCTGTTTTCCTTTTTTCAGTG;SOR=4.615;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=21;WE=11356101;WS=11356083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	11356160	rs2246449	C	T	1212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.139;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.923;NF=33;NR=9;PP=935;ReadPosRankSum=0.107;SC=TGACCTCTCTCGGGACTCTGC;SOR=2.012;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=61;TCF=44;TCR=17;TR=42;WE=11356168;WS=11356150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,43:0.72:60
chr10	11360673	rs2279809	A	G	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=2;PP=765;ReadPosRankSum=0.836;SC=TTTGGCAAAAAGGAGAAAGAG;SOR=0.663;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=84;TCF=78;TCR=6;TR=33;WE=11360681;WS=11360663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,33:0.36:91
chr10	11362789	rs35548374	GT	G	706.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=14.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=1.525;QD=6.37;ReadPosRankSum=0.754;SOR=0.488;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,53:0.48:111
chr10	11367780	rs3832668	CT	C	544.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=1.637;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=1.732;QD=3.54;ReadPosRankSum=0.561;SOR=0.485;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,39:0.25:154
chr10	11504752	rs12570211	T	C	4539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=78;PP=2965;SC=AATCCACTGGTGGAATGATCA;SOR=0.828;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=71;TCR=78;TR=149;WE=11504760;WS=11504742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr10	11505175	rs3740204	A	G	4350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=60;NR=69;PP=2965;SC=TTCTCGGGCTAGGAGGGTAAA;SOR=0.886;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=129;TCF=60;TCR=69;TR=129;WE=11505183;WS=11505165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr10	11532758	rs882206	C	A	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.471;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=12;PP=824;ReadPosRankSum=-1.076;SC=GAAATGTGCCCACAGGGCCCT;SOR=1.670;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=59;TCF=37;TCR=22;TR=37;WE=11532766;WS=11532748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,38:0.63:60
chr10	11784480	rs76272655	C	T	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=2;PP=145;SC=CGTCGAGTTCCGTCCCGGCCC;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=11784488;WS=11784470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	11784969	rs61846247	G	A	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.72;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr10	11784978	rs7076220	C	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.385;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr10	11789290	rs4750089	G	C	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=2;PP=780;SC=GGAATCGCAGGGGTCCTCACT;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=11789298;WS=11789280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	11789382	rs4750090	G	A	2695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=21;PP=2043;SC=GAAGAGGAACGCGTTGTCACT;SOR=2.330;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=62;TCR=21;TR=83;WE=11789390;WS=11789372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr10	11789405	rs4750091	G	A	2966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=31;PP=2158;SC=CAATGCTGAAGTCTCTCCAAA;SOR=1.313;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=57;TCR=31;TR=87;WE=11789413;WS=11789395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr10	11789511	rs4750092	C	G	2002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=10;NR=47;PP=1635;SC=GCAGTGCCCACAAGAGCTTTC;SOR=3.113;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=58;TCF=11;TCR=47;TR=57;WE=11789519;WS=11789501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr10	11789637	rs4750093	G	A	213.41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.6715;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=166;ReadPosRankSum=0.967;SC=TGGTCCTAACGCTATTAACTG;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=8;WE=11789645;WS=11789627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr10	11791741	rs58243400	CCCAGCAAT	C	1382.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=20;PP=2977;SC=GATCCTTTATCCCAGCAATCC;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=20;WE=11791756;WS=11791731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	11797322	.	CAAAA	C	165.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.82;MQRankSum=2.276;QD=7.21;ReadPosRankSum=2.454;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr10	11797436	rs7899215	T	C	6813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=89;PP=2965;SC=ACCACCCCGTTCCCGTCATTG;SOR=0.959;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=208;TCF=119;TCR=89;TR=208;WE=11797444;WS=11797426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr10	11797467	rs7910140	G	A	5312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=103;PP=2965;SC=TGGCCTGGCCGCGGCTGCCGG;SOR=1.231;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=173;TCF=69;TCR=104;TR=170;WE=11797475;WS=11797457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr10	11797619	rs902892	C	G	2971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=69;PP=2413;SC=TAATTTAACTCCCCCCACCCA;SOR=2.486;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=21;TCR=69;TR=90;WE=11797627;WS=11797609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr10	11797675	rs3750695	G	A	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=147;ReadPosRankSum=0.635;SC=CAGTGCATGCGATGATTCAAG;SOR=0.430;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=10;WE=11797683;WS=11797665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,10:0.25:40
chr10	11805339	rs17850531	C	T	2457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=53;PP=1896;ReadPosRankSum=-1.279;SC=CCATGCGGATCGCTAGGAAGA;SOR=0.633;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=46;TCR=77;TR=85;WE=11805347;WS=11805329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,90:0.70:129
chr10	11805354	rs12258196	A	G	3438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.87;ReadPosRankSum=-0.403;SOR=0.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,87:0.68:128
chr10	11805357	rs10906011	G	A	3404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.24;ReadPosRankSum=0.090;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,84:0.67:125
chr10	11978499	rs7921794	T	G	1334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=14;PP=936;ReadPosRankSum=1.907;SC=AACCTAACTGTATAACTCACA;SOR=0.826;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=65;TCF=44;TCR=21;TR=47;WE=11978507;WS=11978489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,50:0.69:72
chr10	12046455	rs9943399	T	A	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.61;ReadPosRankSum=-0.057;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr10	12068542	rs12415637	C	T	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=491;ReadPosRankSum=0.425;SC=TACTGGTATTCCTCAAACCAT;SOR=0.681;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=97;TCF=71;TCR=26;TR=31;WE=12068550;WS=12068532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,32:0.31:102
chr10	12071397	rs11257490	G	A	3200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.242;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=59;PP=2513;ReadPosRankSum=0.169;SC=AACTTGAGTCGAGGCGGCTGA;SOR=0.559;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=174;TCF=84;TCR=90;TR=117;WE=12071405;WS=12071387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,119:0.66:179
chr10	12111090	rs1279138	T	C	1986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=39;PP=1596;SC=TCTCCCTCTCTTCTGGCGTGG;SOR=1.366;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=23;TCR=39;TR=62;WE=12111098;WS=12111080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr10	12123363	rs1722446	T	A	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=0;PP=1033;ReadPosRankSum=-0.315;SC=AATAAATAAATAAAAAGTAAG;SOR=1.823;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=56;TCR=0;TR=40;WE=12123371;WS=12123353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,40:0.70:57
chr10	12123666	rs10906066	C	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=497;ReadPosRankSum=-1.079;SC=CGGAGCTGCACACCAGGCCAG;SOR=0.172;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=12;WE=12123675;WS=12123656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,12:0.29:41
chr10	12123667	rs1722445	A	C	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=1470;ReadPosRankSum=1.179;SC=GGAGCTGCACACCAGGCCAGG;SOR=1.845;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=28;WE=12123675;WS=12123656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,29:0.71:41
chr10	12126490	rs11257527	A	T	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=187;ReadPosRankSum=1.283;SC=ACATCATGTTAAGGAACATGA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=10;WE=12126498;WS=12126480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr10	12131081	rs3740015	T	G	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=6.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.695;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=35;PP=1178;ReadPosRankSum=0.266;SC=TGTGGACCTGTACTTTGGGGC;SOR=0.554;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=234;TCF=108;TCR=126;TR=67;WE=12131089;WS=12131071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,74:0.30:250
chr10	12140030	rs10906076	C	G	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=372;ReadPosRankSum=0.780;SC=TATTGCTTCTCCTTCCTGCTC;SOR=1.040;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=2;TCR=69;TR=21;WE=12140038;WS=12140020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,22:0.30:74
chr10	12143105	rs2062988	C	G	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.507;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=682;ReadPosRankSum=0.510;SC=GGCATGCAATCGTGGTTTGCC;SOR=0.608;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=131;TCF=63;TCR=68;TR=41;WE=12143113;WS=12143095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,41:0.31:132
chr10	12143320	rs73577257	G	A	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=382;ReadPosRankSum=2.311;SC=GGGTGGATGAGGTGGGTCTGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=15;WE=12143328;WS=12143310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr10	12148259	rs1701472	A	C	3073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=45;PP=2325;SC=GCAACAGCCCACTGTCAGAAG;SOR=0.884;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=101;TCF=55;TCR=46;TR=100;WE=12148267;WS=12148249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr10	12148286	rs1615510	T	C	3206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=53;PP=2485;SC=TCCTGGGATTTGAATATGGGA;SOR=0.750;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=55;TCR=53;TR=108;WE=12148294;WS=12148276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr10	12149939	rs1722462	C	T	3258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=39;PP=2405;SC=AAAGCGGCATCGTCATCCTCC;SOR=0.973;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=55;TCR=39;TR=94;WE=12149947;WS=12149929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr10	12159647	rs2399771	A	G	3515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=40;PP=2841;SC=TGCTTGCTGGATGTGTGGCCT;SOR=1.528;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=75;TCR=40;TR=115;WE=12159655;WS=12159637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr10	12159844	.	GATCTCCCCTCTCCT	G	336	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=59.57;NF=0;NR=17;PP=336;QD=22.2941176471;SC=AGGTGATGCAGATCTCCCCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=17;WE=12159870;WS=12159834;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,17:0.85:20
chr10	12159845	rs34396265	ATCTCCCCTCTCC	A	1663.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.71;QD=43.78;SOR=7.328;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	12159859	rs376672314	ATT	A	1662.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.70;QD=43.76;SOR=7.328;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	12159861	.	T	A	322	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=4;HapScore=3;MGOF=2;MMLQ=29;MQ=59.39;NF=0;NR=7;PP=322;QD=50.9673160782;SC=CCTCTCCTATTTTTATTTATT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=7;WE=12159870;WS=12159834;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,7:0.39:18
chr10	12160602	rs11257543	T	C	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.77;MQRankSum=-2.678;QD=7.80;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr10	12160606	rs11257544	T	C	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.54;MQRankSum=-2.266;QD=7.24;ReadPosRankSum=-1.221;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr10	12160623	rs11257545	C	T	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=5.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.509;NF=11;NR=0;PP=187;ReadPosRankSum=-0.751;SC=CCTCGTGATCCGCCCGCCTTG;SOR=0.533;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=11;WE=12160631;WS=12160613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr10	12191933	rs10466280	C	T	4644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=109;PP=2965;SC=AAATGGGTGCCGGAATCTGTC;SOR=2.335;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=34;TCR=109;TR=143;WE=12191941;WS=12191923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr10	12195881	rs2895501	G	A	1076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=31;PP=876;SC=TTTCATTCACGTGGTTAGTGT;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=12195889;WS=12195871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	12198019	rs3758376	G	A	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=10;PP=278;SC=GCCTAGAGCCGTTCTGGTTTG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=12198027;WS=12198009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	12200125	rs4750175	C	T	2898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=81;PP=2348;SC=TGTTTATTTACATTATTTATA;SOR=4.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=6;TCR=81;TR=87;WE=12200133;WS=12200115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr10	12202866	rs10906092	A	T	1554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=5;PP=1187;SC=GTTTGAAGTGACATGCAAATG;SOR=4.047;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=47;WE=12202874;WS=12202856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	12203197	rs2399784	C	G	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=299;SC=AGCACTTTGGCAGGCTGAGGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=12203205;WS=12203187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	12209752	rs6686	T	C	3415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=45;PP=2728;SC=CATGTTTCAGTGCTAGAGCGT;SOR=1.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=65;TCR=46;TR=110;WE=12209760;WS=12209742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr10	12209936	rs71513318	GT	G	786.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.464;NF=0;NR=32;PP=712;ReadPosRankSum=0.895;SC=TGGTGATAACGTTTTTTTTGG;SOR=5.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=32;WE=12209944;WS=12209926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chr10	12215870	rs35088067	CT	C	320.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=219;ReadPosRankSum=-0.921;SC=TTAAACCCTCCTTTTTTTTTT;SOR=1.981;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=16;WE=12215878;WS=12215860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr10	12227067	rs2140660	C	G	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=22;PP=651;SC=CAATAATCATCTTTCCTTCCC;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=12227075;WS=12227057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	12252217	rs2271804	G	A	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=3;PP=1278;SC=ATTTTTAGATGGAGCACTGCT;SOR=4.849;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=44;WE=12252225;WS=12252207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr10	12288302	rs36042706	A	G	4039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=79;PP=2965;SC=GACAGATACAATGTAAACCTT;SOR=1.503;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=41;TCR=79;TR=120;WE=12288310;WS=12288292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr10	12292286	rs12779647	C	G	4276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.854;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=49;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.806;SC=GCTATTTTAACATCCCCTTGG;SOR=0.851;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=127;TCF=77;TCR=50;TR=126;WE=12292294;WS=12292276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,135:0.99:136
chr10	12292344	rs10951	A	G	4214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=78;PP=2965;SC=TGATGAGCGTACTGGAACTGG;SOR=1.485;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=44;TCR=78;TR=122;WE=12292352;WS=12292334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr10	12292454	rs1051055	A	G	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=32;PP=966;SC=GACATCAGCCACTTTTTATAT;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=37;WE=12292462;WS=12292444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	12595037	rs2815629	G	C	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=2;PP=546;SC=CCACTGCGCCGGGCTGCCCCT;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=12595045;WS=12595027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	12595147	rs2895524	C	T	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=13;PP=466;ReadPosRankSum=0.972;SC=ACTCAAACTTCGGTGGTAGGG;SOR=0.623;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=95;TCF=58;TCR=37;TR=32;WE=12595155;WS=12595137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,32:0.32:101
chr10	12595443	rs1077744	C	T	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=198;ReadPosRankSum=-1.331;SC=AGACTTTCCCCGGGGGCAGAG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=10;WE=12595451;WS=12595433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr10	12695177	rs7896283	A	G	1369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=22;PP=1045;SC=CTTCCTCTTAAAAAACCACCA;SOR=0.954;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=16;TCR=22;TR=38;WE=12695185;WS=12695167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	12856057	rs10795984	G	A	1491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=4;PP=1244;SC=CAAATTGCTGGGATTACCTGC;SOR=4.317;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=45;WE=12856065;WS=12856047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	12866356	rs2482023	A	C	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=287;SC=CACCCTGTCCACGACTGAGCC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=12866364;WS=12866354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	12867598	rs1757051	C	G	3740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=39;PP=2798;SC=CGGCCGTCGTCAGACATATGA;SOR=1.302;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=66;TCR=39;TR=105;WE=12867606;WS=12867588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr10	12870642	rs55888132	G	GA	690.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=3;PP=355;SC=TCCATCTCAAGAAAAAAAAAA;SOR=3.258;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=23;WE=12870650;WS=12870632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	12870659	rs140735308	G	GCC	887.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.27;QD=40.35;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	12870714	rs2482075	A	G	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=13;PP=1078;SC=AGTGGGAAGCAGGGTGAGAAT;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=48;WE=12870722;WS=12870704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr10	12940377	rs10752280	T	C	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=210;ReadPosRankSum=-0.845;SC=TCAATTACCGTCAGGATTGGC;SOR=0.387;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=11;WE=12940385;WS=12940367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr10	12940455	rs10906249	A	G	1281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=2;PP=1026;SC=GCCCCCGGGCATTGATGTGCG;SOR=5.549;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=45;TCR=2;TR=47;WE=12940463;WS=12940445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	13152504	rs34617995	GT	G	595.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=0.760;QD=11.91;ReadPosRankSum=0.868;SOR=1.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,33:0.66:50
chr10	13158262	rs2244380	C	T	2268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=23;PP=1648;SC=TTTCTGTTTTCACAGGAAGGA;SOR=1.547;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=43;TCR=23;TR=66;WE=13158270;WS=13158252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr10	13164596	rs489040	A	G	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.443;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=41;PP=970;ReadPosRankSum=-0.412;SC=TATAGAAATCATGTTGATATT;SOR=1.467;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=68;TCF=8;TCR=60;TR=45;WE=13164604;WS=13164586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,45:0.63:71
chr10	13166076	rs523747	A	G	4035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=98;PP=2965;SC=AAAACTCAGCAAAGCTGAGCT;SOR=3.047;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=22;TCR=98;TR=120;WE=13166084;WS=13166066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr10	13167860	rs676302	G	T	1972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=16;PP=1612;SC=TTTTTCTACTGGAGTGTTCAG;SOR=2.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=60;WE=13167868;WS=13167850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr10	13175682	rs7086894	A	C	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=259;ReadPosRankSum=-0.071;SC=ATTCCAAATCAAGGCACCAAA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=11;WE=13175690;WS=13175672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr10	13178697	rs10906310	C	A	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=631;ReadPosRankSum=-0.746;SC=GAAACAAACACAACTGCCTGC;SOR=0.836;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=25;WE=13178705;WS=13178687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr10	13206233	rs7090944	A	T	5080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=112;PP=2965;SC=GTTTTCTGTTACTCTGTTTCA;SOR=1.974;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=43;TCR=112;TR=155;WE=13206241;WS=13206223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr10	13212884	rs2147279	C	T	2816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.189;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=16;PP=2279;ReadPosRankSum=1.189;SC=TGGAATTAGCCGTGCTTATTC;SOR=2.928;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=87;TCF=70;TCR=17;TR=85;WE=13212892;WS=13212874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
chr10	13214812	rs6602637	A	G	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=379;SC=GTATGTGTTTATGTGTGTGGG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=13214820;WS=13214802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	13222508	rs12248671	T	C	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.674;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=22;PP=891;ReadPosRankSum=1.028;SC=TCAGACTGTCTCAGATCAAGG;SOR=0.588;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=131;TCF=71;TCR=60;TR=46;WE=13222516;WS=13222498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,46:0.34:137
chr10	13224886	rs3765520	G	T	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=249;ReadPosRankSum=-0.809;SC=AAATGAGGACGGCATAACCTA;SOR=1.501;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=12;WE=13224894;WS=13224876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr10	13225119	rs11258235	G	A	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.831;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=842;ReadPosRankSum=-0.309;SC=CTGTTTCTGGGATTTGATTGA;SOR=0.229;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=71;TCF=20;TCR=51;TR=38;WE=13225127;WS=13225109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,43:0.57:75
chr10	13230950	rs2296222	C	T	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.817;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=24;PP=910;ReadPosRankSum=1.276;SC=GCGTGCGGATCTGCAGTCCAC;SOR=0.940;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=155;TCF=76;TCR=79;TR=56;WE=13230958;WS=13230940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,55:0.36:153
chr10	13231194	rs2296221	A	G	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=78;ReadPosRankSum=-0.626;SC=TTTATCTTTCATAACTCACTA;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=7;WE=13231202;WS=13231184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr10	13233471	rs7916762	C	T	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=381;ReadPosRankSum=0.805;SC=AAAGACTACACATTGGGTACA;SOR=2.124;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=17;WE=13233479;WS=13233461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr10	13237015	rs10796036	G	A	1652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.432;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=14;PP=1333;ReadPosRankSum=0.678;SC=CCCTGTTTGCGTATTTTGACT;SOR=2.221;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=58;TCF=43;TCR=15;TR=56;WE=13237023;WS=13237005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,56:0.97:58
chr10	13239917	rs35803060	AT	A	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=3.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=0.722;QD=10.43;ReadPosRankSum=-1.521;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr10	13246190	rs7072097	C	T	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.043;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=229;ReadPosRankSum=0.373;SC=TCTTCACCGGCGGTGTGGGTT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=13;WE=13246198;WS=13246180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr10	13275428	rs76657460	T	C	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=-2.225;SC=GGGTGAGCCCTTCGTGCCCAG;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=6;WE=13275436;WS=13275421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr10	13275510	rs7893239	C	G	2818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.46;SOR=3.647;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	13275514	rs4750327	A	G	2785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.22;SOR=3.682;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr10	13275553	rs3829925	T	G	3264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=27;PP=2635;SC=ACCTCATCTCTGGACTTGGGG;SOR=2.344;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=89;TCR=27;TR=116;WE=13275561;WS=13275543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr10	13275643	rs4750328	G	A	3017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.250;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=47;PP=2399;ReadPosRankSum=1.403;SC=TCTGAAACCCGGGAGAGGCCT;SOR=0.951;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=182;TCF=99;TCR=83;TR=111;WE=13275651;WS=13275633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,112:0.59:189
chr10	13275676	rs3829926	T	C	4984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=95;PP=2965;SC=GTGGGGGTGCTGGGGCTGCTG;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=69;TCR=96;TR=163;WE=13275684;WS=13275666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr10	13275691	rs10796042	G	T	1522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.588;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=41;PP=1107;ReadPosRankSum=1.600;SC=CTGCTGCTTCGCTGGCTGCAC;SOR=1.509;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=157;TCF=64;TCR=93;TR=58;WE=13275699;WS=13275681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,61:0.38:162
chr10	13276179	rs942418	A	G	2058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=45;PP=1546;SC=AACACCCTCCACCTTGACCCT;SOR=1.576;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=23;TCR=45;TR=68;WE=13276187;WS=13276169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr10	13276368	rs2399954	G	A	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.91;ReadPosRankSum=0.143;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
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chr10	13320411	rs825625	A	T	1332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=27;PP=892;SC=GCCCTCCATTAACCTTCAATT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=13320419;WS=13320401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	13325946	rs648173	C	T	1021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=2;NR=26;PP=785;SC=AAGCATTTCTCTCTCCCAAGA;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=13325954;WS=13325936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	13330291	rs7900830	G	T	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=0.589;SC=AAACTCTTTAGAGGTACTGAT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=13330299;WS=13330282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr10	13330402	rs473407	T	C	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.702;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=277;ReadPosRankSum=-0.159;SC=AGCCCTTGTGTGTGCCTGGGA;SOR=0.073;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=18;WE=13330410;WS=13330392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr10	13334058	rs1408364	A	G	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=9;PP=265;SC=TTGCAAACAAAGCATGAAAAA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=13334066;WS=13334048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	13337319	rs654536	A	C	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=139;SC=CAGAGTGAGAACCTTTCTCTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=13337338;WS=13337309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	13337330	rs654553	T	C	181.28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=171;ReadPosRankSum=0.887;SC=CCTTTCTCTATAAAAAATAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=13337338;WS=13337309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr10	13337588	rs1747682	G	A	1152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=24;PP=779;SC=GGGTTAGAACGTTATTATCCA;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=13337596;WS=13337578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	13340236	rs28938169	G	A	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.953;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=400;ReadPosRankSum=-1.372;SC=CCTGAAGTGGGATGAGCTACC;SOR=1.421;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=79;TCF=31;TCR=48;TR=23;WE=13340244;WS=13340226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,24:0.30:81
chr10	13341836	rs511959	G	C	161.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=49;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=2;PP=134;SC=AGGCGGGGACGCGGCGCTGAG;SOR=2.303;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=13341844;WS=13341826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	13341889	rs732704	C	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=139;ReadPosRankSum=-0.723;SC=CCCGAGGCCTCCACCCGGACC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=7;WE=13341908;WS=13341879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr10	13341900	rs512109	A	G	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=1;PP=361;SC=CACCCGGACCAGGGCCACCAC;SOR=5.283;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=13341908;WS=13341879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	13344169	rs3758423	G	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=26;ReadPosRankSum=-0.674;SC=AGCATCACCAGCCCCTTCCTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=13344177;WS=13344159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr10	13350590	rs148418925	ATT	A	107.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.97;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr10	13370315	rs3740211	C	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=0.472;SC=CTGTCTTGGACCCCTGGGACC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=5;WE=13370323;WS=13370311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr10	13375906	rs10752297	T	C	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=7.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=0.000;QD=3.73;ReadPosRankSum=0.642;SOR=1.243;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,17:0.24:72
chr10	13378445	rs2275128	A	G	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=581;ReadPosRankSum=0.390;SC=GAGAACGTGGAGACTTTCCAG;SOR=0.752;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=25;TCR=74;TR=35;WE=13378453;WS=13378435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,38:0.36:105
chr10	13483868	rs7902755	C	G	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.405;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=465;ReadPosRankSum=-0.600;SC=TGTAGCCCCCCAAAAGAAGAA;SOR=0.132;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=20;WE=13483876;WS=13483858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr10	13489148	rs10675399	T	TGCAGA	1251.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=1;PP=1479;ReadPosRankSum=0.644;SC=CCTGGTCCACTGCAGAAGCAG;SOR=0.510;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=56;TCF=54;TCR=2;TR=33;WE=13489156;WS=13489138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,31:0.63:49
chr10	13489201	rs11408564	A	AT	3088.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.367;NF=61;NR=20;PP=2933;ReadPosRankSum=-0.741;SC=ATCGTTTTCAATGCAAATAGT;SOR=0.667;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=86;TCR=28;TR=81;WE=13489209;WS=13489191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,95:0.74:129
chr10	13570569	.	GGCGGCAGCGGCGGCA	G	270.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=4;PP=752;SC=CTGAGGAGGCGGCGGCAGCGG;SOR=4.174;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=4;WE=13570591;WS=13570559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	13570673	rs10906401	A	G	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=5;PP=116;SC=GGAGTCGGCGAGGGGAGGCCG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=13570681;WS=13570663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	13633835	rs10906419	A	G	1678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.036;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=28;PP=1245;ReadPosRankSum=-1.018;SC=CTTCAGGAAGACCGCCCTCTT;SOR=0.719;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=101;TCF=50;TCR=51;TR=61;WE=13633843;WS=13633825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,64:0.62:103
chr10	13633929	rs10796097	T	G	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.536;HP=14;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=772;ReadPosRankSum=0.938;SC=CAACTGAGGGTTTTTTTTTTT;SOR=0.384;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=31;WE=13633937;WS=13633918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr10	13653490	rs2478121	C	A	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=347;ReadPosRankSum=0.090;SC=AAATTCCATCCGATTTTTAAG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=13;WE=13653498;WS=13653480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr10	13658335	rs2253308	G	A	2063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.110;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=7;PP=1664;ReadPosRankSum=-0.644;SC=AATACTTTCAGTAAGAATTTG;SOR=2.481;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=101;TCF=84;TCR=17;TR=68;WE=13658343;WS=13658325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,71:0.66:107
chr10	13693883	rs11258499	C	T	4586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.513;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=101;PP=2962;ReadPosRankSum=0.515;SC=GCAGTAGGAACAAAACTCCCC;SOR=0.801;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=275;TCF=119;TCR=156;TR=177;WE=13693891;WS=13693873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,177:0.64:276
chr10	13702668	rs10796105	T	C	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=146;ReadPosRankSum=-0.153;SC=AACCCACACCTTCACCCCTGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=7;WE=13702676;WS=13702658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr10	13705298	rs10796108	G	T	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-3.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=1168;ReadPosRankSum=0.786;SC=CCCAACCAAAGAGGTGAATAC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=14;WE=13705316;WS=13705288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr10	13705307	rs55876188	ACT	A	901.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=2.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=1185;ReadPosRankSum=-1.496;SC=AGAGGTGAATACTGGGAAATG;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=19;WE=13705316;WS=13705288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
chr10	13735587	rs737376	G	A	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=393;ReadPosRankSum=-0.140;SC=TGACATTCCCGACAGCTTGCC;SOR=0.487;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=19;WE=13735595;WS=13735577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr10	13735603	rs943090	G	C	1249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=2;PP=769;SC=TTGCCATGGGGATTGTGAAAC;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=13735611;WS=13735593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	13735685	rs200663128	CT	C	231.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=1.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=0.359;QD=3.62;ReadPosRankSum=1.104;SOR=1.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,21:0.33:64
chr10	13743517	rs1541004	G	A	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.885;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=35;PP=1122;ReadPosRankSum=-0.436;SC=TCCCATTTCTGTTGAGAGAAA;SOR=0.542;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=87;TCF=33;TCR=54;TR=58;WE=13743525;WS=13743507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,59:0.67:88
chr10	13743646	rs1541005	G	C	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=481;SC=TGCGCACACAGCTTACAGACA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=13743654;WS=13743636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	13749228	rs11258541	G	A	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=176;ReadPosRankSum=-0.044;SC=AACAGAGACCGTAGTCTGTGC;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=9;WE=13749236;WS=13749218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr10	13749257	.	GAC	G	68	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=68;QD=39.0;SC=CCTCTTGCTTGACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=2;WE=13749266;WS=13749247;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,2:0.29:7
chr10	13782110	rs11258567	A	C	3336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.99;QD=44.49;SOR=5.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr10	13782124	rs10906462	A	G	3796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=5;PP=2038;SC=AGAAGAAAACATATAACGAGA;SOR=4.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=84;TCR=5;TR=89;WE=13782132;WS=13782100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr10	13782605	rs6602679	G	A	3772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=48;PP=2965;SC=GAATGCTGTTGTTGGAGTCTC;SOR=1.207;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=74;TCR=48;TR=122;WE=13782613;WS=13782595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr10	13838329	rs3740123	G	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=799;ReadPosRankSum=-0.326;SC=CTGCACCCTCGCACCCCGCCT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=14;WE=13838348;WS=13838319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr10	13838340	rs3740122	T	G	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=799;ReadPosRankSum=-1.321;SC=CACCCCGCCTTTCCATCTATG;SOR=1.214;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=18;WE=13838348;WS=13838319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr10	13838659	rs7079138	T	C	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.316;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=406;ReadPosRankSum=-0.352;SC=TGAAGGTATATATGAAGCAGA;SOR=0.161;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=83;TCF=8;TCR=75;TR=25;WE=13838667;WS=13838649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,28:0.32:88
chr10	14372306	rs35432616	G	GA	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.46;ReadPosRankSum=-0.166;SOR=0.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr10	14425204	rs12780876	T	A	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=604;ReadPosRankSum=2.395;SC=CTTGCTTCAGTCAGGCTGTTC;SOR=0.907;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=28;WE=14425212;WS=14425194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
chr10	14478618	rs11259096	T	C	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=439;ReadPosRankSum=0.920;SC=TTAAGGCATGTTCAGGAACAA;SOR=0.836;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=19;WE=14478626;WS=14478608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr10	14572644	rs7922221	G	A	911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=765;SC=CTGGGGCATCGCTGATAAATA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=14572652;WS=14572634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	14880394	rs45622935	GC	TT	1223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=1120;ReadPosRankSum=-0.341;SC=TGCCGTCCCTGCTGCCTCATG;SOR=1.022;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=27;WE=14880403;WS=14880384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,31:0.79:39
chr10	14882040	rs140243251	AAT	A	525.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.120;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=537;ReadPosRankSum=-0.932;SC=CATACATTGTAATATATATAT;SOR=1.300;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=14;WE=14882049;WS=14882030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr10	14882060	rs3830599	AT	A	185.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.177;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr10	14890523	.	T	C	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=240;ReadPosRankSum=-0.648;SC=TTCAGTGATATTGTGAAATAC;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=10;WE=14890531;WS=14890513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr10	14891406	rs17155992	G	A	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=218;ReadPosRankSum=1.011;SC=ACATTATGACGTTGTGTCTTC;SOR=0.746;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=58;TCF=53;TCR=5;TR=14;WE=14891414;WS=14891396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,16:0.28:57
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chr10	15014369	rs1935401	C	A	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=2;PP=762;ReadPosRankSum=0.910;SC=TTGTGGGTATCATACTTTAAA;SOR=0.565;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=33;WE=15014377;WS=15014359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,35:0.74:47
chr10	15014418	rs1935400	C	G	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.104;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=3;PP=1409;ReadPosRankSum=-0.574;SC=TACTTTGTTTCTGTAAGTCAT;SOR=1.455;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=88;TCF=83;TCR=5;TR=56;WE=15014426;WS=15014408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,59:0.64:92
chr10	15014440	rs1935399	A	G	2138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=13;PP=1683;ReadPosRankSum=-0.803;SC=CTTTTTAACTATTTGATAGTA;SOR=0.638;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=122;TCF=102;TCR=20;TR=74;WE=15014448;WS=15014430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,77:0.61:126
chr10	15014698	rs4418687	C	T	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.08;ReadPosRankSum=0.254;SOR=1.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,32:0.71:45
chr10	15014702	rs4295952	A	G	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.66;ReadPosRankSum=0.608;SOR=1.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,27:0.69:39
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chr10	15256194	rs3814165	G	A	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.313;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=748;ReadPosRankSum=0.340;SC=GCCTTTAAGGGAAAAACCTCC;SOR=0.917;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=133;TCF=68;TCR=65;TR=43;WE=15256202;WS=15256184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,43:0.31:140
chr10	15263100	rs6602828	C	T	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.834;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=566;ReadPosRankSum=-0.169;SC=AAGCACACCACGCTCCTTTGT;SOR=0.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=88;TCF=37;TCR=51;TR=34;WE=15263108;WS=15263090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,33:0.38:88
chr10	15296572	rs3824620	A	T	1068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=0;PP=853;SC=ACAGTTTCAAAGCACTTGAAC;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=15296580;WS=15296563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	15413071	rs192904368	G	A	150.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.14;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	15573050	rs1041135	A	G	3911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=83;NR=30;PP=2965;SC=GATACTCACTACTATGCTTCC;SOR=2.041;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=83;TCR=30;TR=113;WE=15573058;WS=15573040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr10	15590372	rs9333229	G	T	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=241;SC=ATTAGAAATCGCTATGAAAAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=15590380;WS=15590362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	15648243	rs2282383	C	T	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.07;ReadPosRankSum=-0.150;SOR=0.676;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,55:0.28:200
chr10	15650401	rs3041592	TAC	T	184.06	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5020;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.157;NF=2;NR=5;PP=331;ReadPosRankSum=0.489;SC=TATTTCTAATTACACACACAC;SOR=0.693;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=7;WE=15650410;WS=15650391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr10	15658596	rs7099530	G	A	2093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=52;PP=1718;ReadPosRankSum=-0.729;SC=TGCGTGAATCGTATAGAAACA;SOR=1.581;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=13;TCR=53;TR=65;WE=15658604;WS=15658586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,67:0.99:68
chr10	15658659	rs7083600	T	C	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=26;PP=585;SC=TACATGCTGATGGTACGAGAG;SOR=5.421;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=27;WE=15658667;WS=15658649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	15685983	rs4748191	A	T	2191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=6;PP=1725;SC=AATGGACTCTATTTCAGGACG;SOR=3.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=59;TCR=6;TR=64;WE=15685991;WS=15685973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr10	15686258	rs9333142	TATTTA	T	234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.503;NF=0;NR=4;PP=199;ReadPosRankSum=-0.952;SC=TGTGTATATGTATTTAATTCT;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=4;WE=15686270;WS=15686248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr10	15713541	rs6602051	T	C	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.616;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=480;ReadPosRankSum=-0.646;SC=AAAAACTTTATATGCCATTTT;SOR=0.114;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=85;TCF=72;TCR=13;TR=30;WE=15713549;WS=15713531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,32:0.34:93
chr10	15729923	rs1954181	C	T	8056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=125;NR=118;PP=2965;SC=CACAAGCCCACGGCTCATACT;SOR=0.756;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=243;TCF=125;TCR=118;TR=243;WE=15729931;WS=15729913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr10	15761527	rs9333070	T	C	2504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=16;PP=2047;SC=AGCGCCTTCGTCCCCGCGCGC;SOR=2.720;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=61;TCR=16;TR=77;WE=15761535;WS=15761517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr10	15824085	rs11818243	A	G	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=4.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.09;ReadPosRankSum=-1.198;SOR=1.397;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,14:0.22:64
chr10	15824092	rs7912258	C	T	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=4.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.15;ReadPosRankSum=-0.306;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,14:0.21:66
chr10	15879441	rs7903095	G	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.565;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=157;ReadPosRankSum=1.368;SC=GTTTTGGGACGTTTCTAAATT;SOR=0.912;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=9;WE=15879449;WS=15879431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
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chr10	15902303	rs2297882	A	G	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.846;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=790;ReadPosRankSum=0.331;SC=GGACATGATGAGGAACCGGCG;SOR=0.987;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=79;TCF=36;TCR=43;TR=36;WE=15902311;WS=15902293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,36:0.44:82
chr10	16526840	rs2275731	G	A	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=50;ReadPosRankSum=1.783;SC=TTCTTTGACAGTATTTGTTCA;SOR=0.097;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=6;WE=16526848;WS=16526830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chr10	16547058	rs7904014	A	G	1306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.509;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=27;PP=871;ReadPosRankSum=-0.561;SC=AGTTTGCTCAACTTGGCTGCT;SOR=0.308;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=183;TCF=115;TCR=68;TR=55;WE=16547066;WS=16547048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,60:0.31:194
chr10	16556710	rs7909832	T	C	4261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=116;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.804;SC=CACGCACCTATGTGAAACAGA;SOR=1.333;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=34;TCR=117;TR=150;WE=16556718;WS=16556700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,150:0.99:151
chr10	16736977	rs3740173	T	C	1932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=3;PP=1545;SC=TTATAAATACTATAAAATCAC;SOR=5.318;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=51;TCR=3;TR=53;WE=16736985;WS=16736967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr10	16737165	rs72451149	G	GAA	1885.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=65.54;MQRankSum=4.169;QD=20.72;ReadPosRankSum=2.307;SOR=2.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:6,85:0.93:91
chr10	16737166	rs3837313	G	A	4317.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=65.57;MQRankSum=2.271;QD=39.98;ReadPosRankSum=1.727;SOR=1.115;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,106:0.98:108
chr10	16737289	rs3740172	A	C	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=12;PP=346;SC=GATGTCTTTTAAATTTCTTAA;SOR=3.912;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=13;WE=16737297;WS=16737279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	16870912	rs1801232	G	T	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.488;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=23;PP=634;ReadPosRankSum=0.312;SC=TGAAGTAGAAGTTGATGGTGA;SOR=1.005;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=142;TCF=70;TCR=72;TR=40;WE=16870920;WS=16870902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,43:0.29:147
chr10	16876922	rs703060	A	G	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=0.632;SC=GAATCATATAATATTAGCAGC;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=6;WE=16876930;WS=16876917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr10	16878204	rs703062	T	C	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.855;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=8;PP=1131;ReadPosRankSum=1.748;SC=GGCAGCTTTTTTGAATAAAAG;SOR=0.151;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=56;TCF=48;TCR=8;TR=45;WE=16878212;WS=16878194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,47:0.82:57
chr10	16882518	rs703064	T	C	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-5.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.980;NF=1;NR=24;PP=441;ReadPosRankSum=0.540;SC=TTGCATTGTATGTTCCACCAC;SOR=0.404;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=25;WE=16882526;WS=16882508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr10	16911605	rs703075	C	A	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.493;NF=9;NR=0;PP=157;ReadPosRankSum=-0.468;SC=ACAGTCCTGACAAATAGATTT;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=9;WE=16911613;WS=16911595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr10	16943371	rs2796835	G	C	5033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=98;PP=2965;SC=CTCCAACAGCGAAGAGCAGTG;SOR=1.625;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=148;TCF=50;TCR=98;TR=148;WE=16943379;WS=16943361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr10	16945905	rs5783520	TG	T	620.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=716;ReadPosRankSum=-1.002;SC=GAAATCTTTATGGAAAAAAAT;SOR=0.850;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=20;WE=16945913;WS=16945895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr10	16948177	rs780807	A	G	1924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=3;PP=1721;ReadPosRankSum=-1.571;SC=ATAAATGGGAAAACGCATTCT;SOR=1.002;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=93;TCR=4;TR=67;WE=16948185;WS=16948167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,64:0.67:96
chr10	16949401	rs780805	G	A	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=432;ReadPosRankSum=-1.966;SC=AAGATTTCAAGTATCACTAAA;SOR=1.802;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=18;WE=16949409;WS=16949391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,18:0.86:21
chr10	16949447	rs780804	A	C	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=609;ReadPosRankSum=1.918;SC=TTGGCAGTAGATGGGGGCATC;SOR=0.551;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=28;WE=16949455;WS=16949437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,27:0.69:39
chr10	16958085	rs45575134	G	A	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.048;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=474;ReadPosRankSum=1.361;SC=AAGAAAGATTGATTCTATTAC;SOR=1.855;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=83;TCF=4;TCR=79;TR=25;WE=16958093;WS=16958075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,25:0.30:84
chr10	16967401	rs1276712	C	T	4763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=114;PP=2965;SC=GGGTGGAGAACAGATATCAGG;SOR=2.380;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=34;TCR=115;TR=148;WE=16967409;WS=16967391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr10	16967445	rs1276713	T	G	2074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.677;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.266;NF=8;NR=57;PP=1640;ReadPosRankSum=-1.583;SC=AATTAAAATTTCATCAACTCC;SOR=0.051;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=90;TCF=8;TCR=82;TR=65;WE=16967453;WS=16967435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,70:0.73:96
chr10	16979661	rs1801234	T	C	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=668;ReadPosRankSum=-1.068;SC=ATCCCTTCCCTGAGATTGAAG;SOR=0.659;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=121;TCF=78;TCR=43;TR=43;WE=16979669;WS=16979651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,45:0.36:125
chr10	16979714	rs41289305	T	C	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=583;ReadPosRankSum=-0.966;SC=CCAGTGGAGCTGAAAGATTCA;SOR=0.670;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=130;TCF=64;TCR=66;TR=45;WE=16979722;WS=16979704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,48:0.36:133
chr10	16992132	rs74668791	T	G	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.020;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=427;ReadPosRankSum=-0.997;SC=AAGAGAAGACTCTCTCGTAAA;SOR=0.977;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=76;TCF=29;TCR=47;TR=27;WE=16992140;WS=16992122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,27:0.35:77
chr10	17024503	rs1801231	G	A	1664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=11;PP=1231;SC=GAGTCTTGTGGTTCAAGATCA;SOR=2.221;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=49;WE=17024511;WS=17024493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr10	17024615	rs1801229	A	T	2978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=36;PP=2329;SC=TTGGAGAATGAATCTCTCCAC;SOR=1.053;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=53;TCR=36;TR=89;WE=17024623;WS=17024605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr10	17026010	rs2291523	A	C	1328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=0;PP=1143;SC=ACTAAGTTATAAGTGTGTAGC;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=37;WE=17026018;WS=17026000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	17026384	rs3012494	A	G	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=9;PP=235;SC=TATGATTATTAGAGATTGAAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=17026392;WS=17026374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	17032281	rs2291521	C	T	4076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.892;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=37;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.936;SC=GAGTGATTTCCTGTTCTACCC;SOR=1.175;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=217;TCF=157;TCR=60;TR=148;WE=17032289;WS=17032271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,149:0.68:220
chr10	17032559	rs925522	A	C	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.81;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	17032559	.	ACA	CCG	927	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=16;PP=927;QD=61.2792421789;SC=GGGCAACAGCACATGGAAAAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=16;WE=17032569;WS=17032549;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr10	17032561	rs925523	A	G	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.49;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	17110474	rs4747297	C	T	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=3;PP=851;SC=AGAAAATATACATTCTTTGTC;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=17110482;WS=17110464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	17110595	rs10795440	G	A	3972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=39;PP=2965;SC=AAAGGGAACAGTCTCTTACCC;SOR=1.821;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=87;TCR=40;TR=125;WE=17110603;WS=17110585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr10	17113563	rs1801225	C	T	4092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.344;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=77;PP=2962;ReadPosRankSum=1.187;SC=GAAAAAAAGGCGAGCGAATGA;SOR=0.718;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=274;TCF=139;TCR=135;TR=164;WE=17113571;WS=17113543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,164:0.60:275
chr10	17141952	rs1033765	C	A	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=0;PP=572;SC=TGATTAAGAACACTTAATAAC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=17141960;WS=17141942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	17146667	rs4748353	C	T	1442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=44;PP=1269;SC=CTTTAATCAACCCAAATAATA;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=44;WE=17146675;WS=17146657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	17147521	rs1801224	G	T	5018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=82;PP=2965;SC=CATCCATTTGGCCCATAACCA;SOR=0.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=78;TCR=83;TR=159;WE=17147529;WS=17147511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr10	17156151	rs1801222	A	G	1594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.952;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=1321;ReadPosRankSum=1.510;SC=GTTGGGTGAAAACATCCACCC;SOR=0.856;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=55;WE=17156159;WS=17156141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,55:0.71:77
chr10	17157630	rs2295813	C	T	1721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=37;PP=1423;SC=TGTCAGGGCACGCGCTTTGGG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=55;WE=17157638;WS=17157620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	17164760	rs11409967	A	AC	1229.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=12;PP=1523;SC=TCAAAAATATACTGATATTTA;SOR=1.418;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=35;TCF=21;TCR=14;TR=33;WE=17164781;WS=17164750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	17171265	rs2281648	G	C	3977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=88;PP=2965;SC=TAATTCAAACGAGAGAATGCA;SOR=1.807;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=37;TCR=88;TR=125;WE=17171273;WS=17171255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr10	17195428	rs2273736	G	C	2784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.503;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=22;PP=2216;ReadPosRankSum=1.625;SC=GTTTAGGCAAGTCCTAGACAC;SOR=1.174;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=167;TCF=126;TCR=41;TR=101;WE=17195436;WS=17195418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,104:0.61:171
chr10	17199419	rs2295810	C	G	4685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=31;PP=2965;SC=GATACAGGATCAATAGATCTT;SOR=2.544;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=113;TCR=31;TR=143;WE=17199427;WS=17199409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr10	17203598	rs151076824	AAAAGT	A	376.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=368;ReadPosRankSum=0.752;SC=ACTAAGAAGAAAAAGTAAAGA;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=8;WE=17203610;WS=17203588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr10	17204139	rs33993216	G	A	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=2.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.76;ReadPosRankSum=-0.225;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,53:0.28:192
chr10	17204187	rs11254413	G	A	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=2.862;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.09;ReadPosRankSum=0.979;SOR=0.561;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,51:0.25:202
chr10	17204246	rs111781208	TA	T	2900.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.153;HP=15;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-1.269;NF=3;NR=50;PP=1830;ReadPosRankSum=-0.200;SC=CCTAAAGGGGTAAAAAAAAAA;SOR=0.953;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=127;TCF=13;TCR=114;TR=53;WE=17204269;WS=17204236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,87:0.78:112
chr10	17204248	rs200006483	A	T	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-4.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=2.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=-1.098;QD=10.30;ReadPosRankSum=1.453;SOR=1.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,58:0.56:103
chr10	17210822	rs17464824	A	C	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.074;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=6;PP=908;ReadPosRankSum=0.523;SC=ACAACACTGAAATATTTATGA;SOR=2.208;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=40;WE=17210830;WS=17210812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,42:0.70:60
chr10	17211383	rs7084476	T	C	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=342;ReadPosRankSum=0.066;SC=CATCTGTTAATATATTATCAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=17;WE=17211391;WS=17211376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr10	17216419	rs2273735	T	C	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=219;ReadPosRankSum=-0.497;SC=AATGTTAATCTCCTTCTCCTG;SOR=0.269;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=14;WE=17216427;WS=17216409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr10	17216556	rs2273734	C	T	1483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=24.704;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=9;PP=1208;ReadPosRankSum=-0.969;SC=TCACTTCAATCGTCTTGGCAA;SOR=2.393;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=154;TCF=110;TCR=44;TR=60;WE=17216564;WS=17216546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,60:0.38:156
chr10	17243406	rs1885395	C	G	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=1;PP=688;SC=GGGGTGGACACGGCGGCGCGC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=17243414;WS=17243396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	17243443	rs11271712	G	GCCGCCCCACAGTGT	756.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.02;ReadPosRankSum=-1.501;SOR=1.123;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr10	17243480	rs1885394	T	A	2442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=14;PP=1746;SC=GTCCGCCCCTTGCGTCTCGCC;SOR=3.042;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=57;TCR=14;TR=71;WE=17243488;WS=17243470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
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chr10	17365012	rs7085734	TT	AA	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=4;PP=1292;SC=GAGAAACATGTTGAACAATGA;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=22;WE=17365021;WS=17365002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	17365044	rs7085750	T	G	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=9;PP=889;SC=TGATCAGTTATGTAACTTGCA;SOR=1.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=17365052;WS=17365034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	17365169	rs12354751	A	G	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.590;NF=6;NR=11;PP=396;ReadPosRankSum=-0.800;SC=GAAATTTGAAAAGAAAATCAT;SOR=0.538;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=17;WE=17365177;WS=17365159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr10	17365228	.	G	GCGCACGCACACA	2025	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MMLQ=23;MQ=64.62;NF=0;NR=12;PP=2025;QD=169.25;SC=ACATATGCGCGCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=17365236;WS=17365218;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	17369277	.	T	A	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.714;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=479;ReadPosRankSum=-0.576;SC=ATCAACTTACTATGACTTAGC;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=20;WE=17369285;WS=17369267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr10	17373617	rs2120716	G	A	5773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=112;PP=2965;SC=TGCAGACCACGATGGACAATG;SOR=1.530;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=56;TCR=112;TR=168;WE=17373625;WS=17373607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr10	17636182	rs2272144	G	C	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=235;ReadPosRankSum=-0.086;SC=TCAAATCAAAGTACTAATAAG;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=11;WE=17636190;WS=17636172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr10	17636309	rs1053926	G	A	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.982;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=811;ReadPosRankSum=0.646;SC=TTCTTCACATGCGGCAAGGCA;SOR=0.510;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=68;TCF=44;TCR=24;TR=43;WE=17636317;WS=17636299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,47:0.64:73
chr10	17636512	rs11599234	C	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=106;ReadPosRankSum=-0.105;SC=AATAACCTTACGTAAGGTTAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=17636520;WS=17636502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr10	17645814	rs2252808	C	T	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.587;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=779;ReadPosRankSum=1.159;SC=TCAACATTGGCATTCAGCAAA;SOR=0.262;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=58;TCF=34;TCR=24;TR=37;WE=17645822;WS=17645804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,42:0.69:61
chr10	17659131	rs11254692	C	A	2277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=32;PP=1284;SC=GTGGCCAAGACCCCCAGGCGC;SOR=1.217;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=59;TCF=23;TCR=36;TR=55;WE=17659139;WS=17659121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr10	17659149	rs7895850	C	T	1993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=34;PP=1256;SC=CGCCTCCGCTCGCCGGGAGCC;SOR=1.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=49;WE=17659157;WS=17659139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	17686234	rs45579031	G	A	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=6.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.71;ReadPosRankSum=-0.109;SOR=0.083;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,21:0.23:90
chr10	17686334	rs17141457	C	T	1881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=29;PP=1351;ReadPosRankSum=-1.799;SC=CGGCACGCAGCGGAGATGCCT;SOR=0.827;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=241;TCF=147;TCR=94;TR=81;WE=17686342;WS=17686324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,87:0.35:250
chr10	17702640	rs10795500	C	T	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.116;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=536;ReadPosRankSum=1.602;SC=GGCCCAGCCCCTCGGTAGGAT;SOR=2.179;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=45;TCF=4;TCR=41;TR=26;WE=17702648;WS=17702630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
chr10	17746301	rs17141517	C	A	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=144;ReadPosRankSum=0.720;SC=GGGACACTGACAACATAAAAG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=9;WE=17746309;WS=17746291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr10	17746611	rs3824629	A	C	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=477;ReadPosRankSum=0.295;SC=TAATATTAAAAATGGAACATT;SOR=0.298;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=0;TCR=58;TR=22;WE=17746619;WS=17746601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,22:0.37:60
chr10	17747053	rs4748405	G	C	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.091;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=273;ReadPosRankSum=0.545;SC=TTTATGTTGTGTACCTTCTTT;SOR=0.908;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=64;TCF=24;TCR=40;TR=18;WE=17747061;WS=17747043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,18:0.28:64
chr10	17747108	rs11419676	T	TA	147.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.62;ReadPosRankSum=0.463;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr10	17747812	rs10904996	A	G	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.351;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=403;ReadPosRankSum=-0.928;SC=CATGCCTGTAATCTCAGCAAT;SOR=3.312;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=18;WE=17747820;WS=17747802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr10	17747879	rs58504059	T	C	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=56;ReadPosRankSum=-1.718;SC=CCAGCCTGGGTAACATAGTGA;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=4;WE=17747887;WS=17747869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr10	17750635	rs2688791	C	T	99.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=94;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TCAAAATGCCCGTTGACAGAA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=17750643;WS=17750625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr10	17751002	rs2272143	A	T	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=427;ReadPosRankSum=2.101;SC=CAGCTGTTTAAGTGCCCCCAG;SOR=0.433;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=80;TCF=3;TCR=77;TR=24;WE=17751010;WS=17750992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,27:0.33:83
chr10	18087629	rs199734634	CTG	C	2314.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=1.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.07;MQRankSum=-4.813;QD=30.86;ReadPosRankSum=-0.095;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,58:0.77:75
chr10	18242304	rs691112	T	C	2697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=49;PP=2203;SC=CAGCCCAGGATAGCAGAAGCC;SOR=1.055;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=37;TCR=49;TR=86;WE=18242312;WS=18242294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr10	18254655	rs11011754	C	T	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=31;PP=784;ReadPosRankSum=-0.478;SC=TTCCAAGTCACACCTGCTAAA;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=60;TCF=13;TCR=47;TR=40;WE=18254663;WS=18254645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,40:0.68:59
chr10	18266783	rs1926740	G	T	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=493;ReadPosRankSum=1.157;SC=GTGACTATTCGGAACTTATCT;SOR=0.719;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=22;WE=18266791;WS=18266773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr10	18266989	rs2478568	G	A	2460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.170;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=40;PP=1906;ReadPosRankSum=0.253;SC=GGATGGTCCAGTTTCCTGGGA;SOR=0.721;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=142;TCF=74;TCR=68;TR=90;WE=18266997;WS=18266979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,92:0.63:146
chr10	18267096	rs2437260	G	A	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.144;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=36;PP=862;ReadPosRankSum=-1.223;SC=AACTTAAAGAGTATTGTGTAT;SOR=1.493;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=61;TCF=4;TCR=57;TR=38;WE=18267104;WS=18267086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,40:0.65:62
chr10	18270208	rs11011850	G	A	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=288;ReadPosRankSum=-1.230;SC=AATATGCTGAGATTAGTAACA;SOR=0.465;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=16;WE=18270216;WS=18270198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr10	18270422	rs1926739	G	A	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=327;ReadPosRankSum=-1.220;SC=AGTAAGTTCTGGATCTTCCTT;SOR=0.569;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=15;WE=18270430;WS=18270412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr10	18276586	rs17658718	C	T	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.150;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=24;PP=833;ReadPosRankSum=1.076;SC=CTCAGGTAATCTGGTCTTTTC;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=40;WE=18276594;WS=18276576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,40:0.71:56
chr10	18276682	rs10508555	G	C	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=65;ReadPosRankSum=1.997;SC=TTCAAAGAGAGAGTATCGTGG;SOR=0.746;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=6;WE=18276690;WS=18276672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr10	18289821	rs16916742	G	T	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.260;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=49;PP=1227;ReadPosRankSum=-0.317;SC=TCCAGCTATGGTTTACTAGGA;SOR=3.556;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=75;TCF=5;TCR=70;TR=50;WE=18289829;WS=18289811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,49:0.67:73
chr10	18292035	rs11012030	G	A	1482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=1;PP=1244;ReadPosRankSum=1.217;SC=CTAATAGTGCGTTACTTTAGC;SOR=0.507;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=84;TCF=83;TCR=1;TR=51;WE=18292043;WS=18292025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,52:0.63:83
chr10	18429981	rs117750299	C	G	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.323;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.398;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=50;ReadPosRankSum=0.947;SC=GCCTCGGCTTCCATTTTTCTC;SOR=1.609;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=5;WE=18429989;WS=18429971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr10	18430220	rs12572321	G	A	30.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.967;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr10	18550450	rs951046	G	A	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=0.751;SC=GTTTTTATCTGTCTTTTGTGC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=18550458;WS=18550440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr10	18550887	rs12261375	T	C	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.919;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=338;ReadPosRankSum=-0.652;SC=TGGATGCTAATTGCAATATGC;SOR=0.890;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=82;TCF=45;TCR=37;TR=22;WE=18550895;WS=18550877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,24:0.29:84
chr10	18789924	rs185330033	C	G	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-6.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.943;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=26;PP=504;ReadPosRankSum=-1.151;SC=GATTATACCACTATCTGTGTA;SOR=0.204;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=87;TCF=8;TCR=79;TR=30;WE=18789932;WS=18789914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,35:0.38:93
chr10	18795596	rs10741088	G	A	1586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.894;HP=4;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=38;PP=990;ReadPosRankSum=-0.767;SC=GATGTTAAAAGGAATCAGAAG;SOR=1.863;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=57;TCF=2;TCR=55;TR=39;WE=18795604;WS=18795586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,42:0.70:60
chr10	18795612	rs200375169	A	AAC	1526.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=2.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.27;ReadPosRankSum=1.622;SOR=1.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,37:0.69:54
chr10	18795613	.	TGC	ACT	2374	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=1;NR=28;PP=2374;QD=84.0506163746;SC=GAAGTGAGCATGCCCTTTTGG;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=29;WE=18795623;WS=18795603;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:19,29:0.60:48
chr10	18795613	.	TGC	T	1494.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.109;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.18;ReadPosRankSum=1.631;SOR=1.654;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,37:0.67:55
chr10	18804094	rs7088091	T	C	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.101;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=36;PP=1025;ReadPosRankSum=-1.821;SC=GCCTTTGCCATTGGCCATCCA;SOR=1.107;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=79;TCF=20;TCR=59;TR=45;WE=18804102;WS=18804084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,47:0.57:83
chr10	18825202	rs147375257	T	G	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=20;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=840;SC=TTTTTTTTTTTGGGGGACAAG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=17;WE=18825212;WS=18825192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	18825203	.	GG	TT	171	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=20;HapScore=3;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=55.94;NF=0;NR=5;PP=171;QD=44.8935749724;SC=TTTTTTTTTTGGGGGACAAGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=5;WE=18825212;WS=18825192;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr10	18828663	rs4747352	G	T	2427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=4.876;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQRankSum=-0.580;QD=22.07;ReadPosRankSum=0.121;SOR=1.390;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,80:0.73:110
chr10	18828721	rs3841459	C	CAA	1506.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.650;NF=1;NR=42;PP=1583;ReadPosRankSum=1.744;SC=ATCCCCAAAACAAAGTCTTTG;SOR=2.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=1;TCR=56;TR=43;WE=18828729;WS=18828711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,38:0.73:52
chr10	18834811	.	C	A	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.895;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-1.829;QD=12.90;ReadPosRankSum=-0.129;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr10	18834812	rs200609500	C	A	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-1.829;QD=12.77;ReadPosRankSum=-1.514;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr10	18834814	.	C	A	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.781;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=-2.185;QD=12.24;ReadPosRankSum=-2.414;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr10	18834816	.	G	A	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=-1.940;QD=10.23;ReadPosRankSum=-3.044;SOR=0.074;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,4:0.19:21
chr10	18836957	rs4747353	C	T	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=315;ReadPosRankSum=-1.531;SC=TTTTACTTATCTCTTCGTTAA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=14;WE=18836965;WS=18836947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr10	18837285	rs3817494	T	C	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=25;PP=487;ReadPosRankSum=0.759;SC=TGATGTTCTATGTGACAAGGA;SOR=0.324;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=27;WE=18837293;WS=18837275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr10	18898701	rs4748493	T	A	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=111;ReadPosRankSum=1.097;SC=AATTTTAAAATATCCTAGATT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=18898709;WS=18898691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
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chr10	18931512	rs7907153	T	C	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=208;ReadPosRankSum=-0.309;SC=GATTATAAAGTAATCCATACA;SOR=0.527;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=12;WE=18931520;WS=18931502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr10	18937579	rs45468894	A	AAAG	669.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=448;ReadPosRankSum=0.599;SC=CACAATCTAAAAAGAAGTTCA;SOR=0.582;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=11;WE=18937587;WS=18937569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr10	18940157	rs3740102	C	A	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=12;PP=506;ReadPosRankSum=1.508;SC=AGTTCTCCACCAAGAGAAATG;SOR=0.627;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=23;TCR=27;TR=23;WE=18940165;WS=18940147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr10	18940185	rs140572895	G	GT	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.60;ReadPosRankSum=-0.398;SOR=0.839;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr10	18957647	rs10741127	T	G	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.776;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=42;PP=1105;ReadPosRankSum=-0.473;SC=CAAAGGTCCCTAGAGTAAACA;SOR=2.409;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=76;TCF=14;TCR=62;TR=47;WE=18957655;WS=18957637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,46:0.61:76
chr10	18957752	rs34839131	GC	G	209.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.143;NF=0;NR=7;PP=250;ReadPosRankSum=-0.312;SC=AGGCTAGAGTGCAGTGGAGTG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=18957760;WS=18957742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr10	18963021	.	C	T	2585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.505;ClippingRankSum=0.000;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.588;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=49;PP=2038;ReadPosRankSum=-0.136;SC=AATTAAGGATCATCCATGGCA;SOR=0.657;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=127;TCF=64;TCR=63;TR=96;WE=18963029;WS=18963011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,97:0.74:131
chr10	18964097	rs12359433	G	A	1389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.512;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=11;PP=1024;ReadPosRankSum=-0.639;SC=TTTTGTTTAGGTTATGCCAAG;SOR=1.124;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=69;TCF=53;TCR=16;TR=49;WE=18964105;WS=18964087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,52:0.70:74
chr10	19376734	rs112293611	G	GT	1621.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.930;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=12;PP=1145;ReadPosRankSum=1.359;SC=ATTCTTTCTGGTTTTTTTTTG;SOR=1.456;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=71;TCF=52;TCR=19;TR=53;WE=19376742;WS=19376724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:8,66:0.89:74
chr10	19392857	rs10159517	T	C	1139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=10;PP=805;SC=GAGACAGTGATGTTCCTTGCT;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=34;WE=19392865;WS=19392847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	19417181	rs11008573	T	C	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.098;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=342;ReadPosRankSum=0.377;SC=CTAAGCATGGTTTCACTCTTA;SOR=1.402;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=54;TCF=27;TCR=27;TR=18;WE=19417189;WS=19417171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,18:0.32:57
chr10	19492702	rs16918344	C	T	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.770;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=19;PP=987;ReadPosRankSum=-2.132;SC=TGGTTTGAAGCAATTAGTGGT;SOR=0.909;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=87;TCF=54;TCR=33;TR=51;WE=19492710;WS=19492692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,53:0.59:90
chr10	19492832	rs7476259	A	C	1594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.038;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=39;PP=1294;ReadPosRankSum=0.689;SC=CAGGGACTCTACAACCACTGC;SOR=1.365;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=80;TCF=29;TCR=51;TR=56;WE=19492840;WS=19492822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,55:0.71:78
chr10	19493117	rs72786543	T	C	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=193;ReadPosRankSum=-0.631;SC=GATTGATTATTGTATAATTTT;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=9;WE=19493125;WS=19493113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr10	19493215	rs202203955	T	TG	626.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.21;MQRankSum=0.000;QD=12.53;ReadPosRankSum=2.553;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
chr10	19493993	rs4601653	G	C	2433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.138;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=38;PP=1870;ReadPosRankSum=0.735;SC=TTTGTCACTAGATAAAGTCAG;SOR=0.312;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=123;TCF=73;TCR=50;TR=86;WE=19494001;WS=19493983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,89:0.70:128
chr10	19494310	rs7090927	T	C	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=496;ReadPosRankSum=-0.352;SC=CCAAAGCTGATGAATGTTATG;SOR=0.970;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=0;TCR=54;TR=29;WE=19494318;WS=19494300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr10	19498278	rs2358355	G	A	3044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=31;PP=2374;ReadPosRankSum=-0.932;SC=TGGACCAGGAGCCAGGGTCCA;SOR=0.735;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=161;TCF=114;TCR=47;TR=109;WE=19498286;WS=19498268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,112:0.67:167
chr10	19498722	rs2245136	A	G	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=463;ReadPosRankSum=2.043;SC=TCAAAGTTACATTGAGACACA;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=20;WE=19498730;WS=19498712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr10	19546796	rs10763903	T	C	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=5.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.210;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=35;PP=884;ReadPosRankSum=0.088;SC=AAATTTCCAATATGACCTTGC;SOR=2.511;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=0;TCR=52;TR=35;WE=19546804;WS=19546786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,36:0.62:58
chr10	19546877	rs10508582	C	A	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=198;ReadPosRankSum=-0.379;SC=AATTAGTTTTCAAGTGTCAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=8;WE=19546885;WS=19546867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr10	19571940	rs11009290	CA	TG	1484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=1591;ReadPosRankSum=0.369;SC=TGTTCTACCCCATCCAAGTTA;SOR=1.091;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=30;WE=19571949;WS=19571930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,36:0.64:56
chr10	19572207	rs4748570	C	T	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=505;ReadPosRankSum=1.377;SC=GCCAATGCTACTGTAAAGACA;SOR=2.917;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=22;WE=19572215;WS=19572197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
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chr10	19616735	rs1577289	T	C	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=34;ReadPosRankSum=-0.995;SC=GTGGACACCATGCTTAACACT;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=6;WE=19616743;WS=19616725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
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chr10	19620559	rs7082205	G	A	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=0.037;SC=AACTCCCACAGCCTTACTCAA;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=5;WE=19620567;WS=19620549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr10	19636869	rs1609746	G	T	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.263;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=18;PP=867;ReadPosRankSum=1.118;SC=TCTTTATAAAGAGTTTGTTTC;SOR=0.510;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=143;TCF=90;TCR=53;TR=46;WE=19636877;WS=19636859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,48:0.32:151
chr10	19637088	rs1577307	G	A	975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=27;PP=804;SC=TATGTGAAGGGGGGAAAAAAT;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=19637096;WS=19637078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	19641035	rs10827306	T	C	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.711;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=15;PP=849;ReadPosRankSum=-0.410;SC=AACCTCACTGTAGAACAAGGC;SOR=0.824;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=140;TCF=94;TCR=46;TR=48;WE=19641043;WS=19641025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,48:0.33:144
chr10	19641231	rs7092566	A	G	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=534;ReadPosRankSum=-1.809;SC=CAACAGGTACATTCTAATCTG;SOR=0.627;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=25;TCR=81;TR=33;WE=19641248;WS=19641221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,37:0.33:113
chr10	19641239	rs10616221	CTG	C	3050.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=57;PP=2986;SC=ACATTCTAATCTGTGTGTGTG;SOR=3.640;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=81;TCF=4;TCR=77;TR=61;WE=19641248;WS=19641221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr10	19676553	rs12773592	A	G	3794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=9.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.13;ReadPosRankSum=-0.456;SOR=1.457;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,95:0.63:151
chr10	19676561	rs12771333	G	A	3767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=10.821;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.95;ReadPosRankSum=-1.343;SOR=1.525;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,95:0.63:151
chr10	19678286	rs10763974	C	T	3723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=66;PP=2926;SC=TCAGATCATACGAATTGTAAT;SOR=1.238;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=43;TCR=66;TR=109;WE=19678294;WS=19678276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr10	19678497	rs10763975	G	A	1650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=36;PP=1288;SC=CTGGTATTTCGTATCTGCAAA;SOR=2.540;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=48;TCF=11;TCR=37;TR=47;WE=19678505;WS=19678487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr10	19678602	rs7896087	T	C	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=395;SC=AGGGTCTTGCTCTGTCACTCA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=19678610;WS=19678592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	19739459	rs6415957	T	G	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=14;PP=405;SC=AAGCACATTTTTAATCTAGCC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=19739467;WS=19739449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	19778056	rs2151234	G	A	3397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=78;PP=2640;SC=CTCTGCTGAAGGGGCCGCCAC;SOR=2.071;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=29;TCR=79;TR=107;WE=19778064;WS=19778046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr10	19778072	rs2184035	A	G	3004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=77;PP=2505;SC=GCCACAGGAAAAGCCTAACAG;SOR=3.334;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=14;TCR=78;TR=91;WE=19778080;WS=19778062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr10	19884264	rs10827628	G	A	3383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.234;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=38;PP=2475;ReadPosRankSum=-0.695;SC=TGTCCTCTCAGCCCCACCCCT;SOR=1.116;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=69;TCR=40;TR=106;WE=19884272;WS=19884254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,113:0.99:114
chr10	19896830	rs7909976	C	A	1477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=13;NR=30;PP=1114;SC=CCAGCTGCTCCGGTACCCCAT;SOR=1.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=43;WE=19896838;WS=19896820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	19904870	rs10580913	ATT	A	2469.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=28;PP=1292;SC=GCATTGTTTAATTTTTTTTTT;SOR=0.922;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=46;WE=19904887;WS=19904860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr10	19904879	rs62881061	T	G	2534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.70;SOR=0.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	20105936	rs989767	T	C	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=0;PP=1023;SC=GGCCCGGTCGTGCCTATTGCA;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=20105944;WS=20105926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	20105996	rs63234960	TGGC	T	1456.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=3;PP=1406;SC=GGTAGGGAGGTGGCGGCGGCG;SOR=4.174;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=48;TCF=44;TCR=4;TR=31;WE=20106006;WS=20105986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	20290956	rs1409344	T	A	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=108;SC=ATTAATGAATTTATTTCATGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=20290964;WS=20290946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	20336112	rs10740961	G	T	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=393;SC=AATTTAGATTGATTACTGCAT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=20336120;WS=20336102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	20357183	rs7072650	A	G	1519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=39;PP=1194;ReadPosRankSum=1.830;SC=GTGGTTTTCTACCCATTCACC;SOR=0.714;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=89;TCF=25;TCR=64;TR=55;WE=20357191;WS=20357173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,56:0.62:91
chr10	20436838	rs4626974	G	C	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.460;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=868;ReadPosRankSum=-0.748;SC=AGAAGTAAGTGATGCGTTGAT;SOR=0.948;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=137;TCF=67;TCR=70;TR=43;WE=20436846;WS=20436828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,42:0.30:138
chr10	20500743	rs10827997	T	G	1589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=38;PP=1263;SC=TATTCAAAATTTATGCCCTAA;SOR=3.126;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=48;WE=20500751;WS=20500733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	20506326	rs12783379	T	C	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.540;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=354;ReadPosRankSum=-1.719;SC=GATCACTCCATTTGTTTTCCT;SOR=0.039;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=58;TCF=52;TCR=6;TR=21;WE=20506334;WS=20506316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,22:0.37:60
chr10	20506418	rs3817405	G	A	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.176;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=18;PP=609;ReadPosRankSum=-1.090;SC=CACCACAACCGTAGGAGCGAC;SOR=0.995;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=136;TCF=77;TCR=59;TR=46;WE=20506426;WS=20506408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,48:0.33:147
chr10	20534333	rs2778979	A	G	1198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=27;PP=854;SC=TGGCCTCATCATTGGAATCCT;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=20534341;WS=20534323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	20568524	rs2681949	T	C	1683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=0;PP=1233;SC=GATAATTTAATGTGTTAATTA;SOR=7.903;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=44;WE=20568532;WS=20568514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr10	20841150	rs2496601	C	T	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=325;SC=ATCCCGGCTACTCACCCTTGG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=20841158;WS=20841140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	21074724	rs2296614	T	C	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.981;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=177;ReadPosRankSum=0.402;SC=CTGTTCTCCCTGTTCTCTGCA;SOR=1.554;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=61;TCF=40;TCR=21;TR=15;WE=21074732;WS=21074714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,17:0.27:64
chr10	21098879	.	GA	G	418.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=4.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQRankSum=-0.047;QD=6.86;ReadPosRankSum=0.843;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,29:0.48:61
chr10	21108377	rs1006363	C	T	1680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=24;PP=1287;ReadPosRankSum=1.519;SC=CCTGGTTTCGCCTCACTCTCT;SOR=0.635;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=64;TCR=35;TR=67;WE=21108385;WS=21108367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,66:0.65:102
chr10	21141469	rs703089	T	C	1266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=8;PP=1050;SC=CGGGCAAGTGTGTACCTGACT;SOR=2.191;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=36;WE=21141477;WS=21141459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	21148584	rs4748729	C	A	1204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=4;PP=995;SC=ACAGTCGATTCTAAAAAAAAC;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=37;WE=21148592;WS=21148574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	21157492	rs2296609	T	C	1046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=1;PP=855;SC=CTCTGTTTATTCTTGCAATTA;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=21157500;WS=21157482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	21157763	rs5783755	CA	C	55.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.97;ReadPosRankSum=0.792;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr10	21176945	rs703100	G	A	1167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=0;PP=935;SC=TGATGAAAACGTTTTATTAAA;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=21176953;WS=21176935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	21177156	rs67288319	GA	G	824.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=26;PP=763;SC=AAAAAAACAGGAAAAAAATAA;SOR=3.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=28;WE=21177164;WS=21177146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	21185821	rs788971	A	C	1777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=6;PP=1513;SC=CAGCTCTATGACTCTATAACA;SOR=3.952;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=49;TCR=6;TR=55;WE=21185829;WS=21185811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	21414892	rs625223	C	G	3390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.610;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=83;PP=2604;ReadPosRankSum=0.999;SC=TTGCCTGGATCTGGTTCAGGA;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=188;TCF=64;TCR=124;TR=124;WE=21414900;WS=21414882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,128:0.67:191
chr10	21415006	rs11591355	T	C	2163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=48;PP=1542;ReadPosRankSum=0.084;SC=ACCAGCTTCCTGGGAGGCCTC;SOR=0.630;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=125;TCF=52;TCR=73;TR=84;WE=21415014;WS=21414996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,88:0.68:129
chr10	21435340	rs72102767	ACACT	A	8079.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.890;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=82;PP=2962;ReadPosRankSum=0.420;SC=TAAAGCACAAACACTCTCTCT;SOR=0.594;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=283;TCF=136;TCR=147;TR=155;WE=21435351;WS=21435330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,206:0.63:327
chr10	21461232	rs35856892	G	A	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=474;ReadPosRankSum=-0.155;SC=CAGTGAGTCAGTTCTTCAAAA;SOR=0.610;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=20;WE=21461240;WS=21461222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr10	21461410	rs11413698	G	GA	652.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=3.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.79;MQRankSum=1.083;QD=10.88;ReadPosRankSum=0.446;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,38:0.63:60
chr10	21785665	rs200550375	GC	G	437.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.885;NF=9;NR=7;PP=395;ReadPosRankSum=0.529;SC=CCTCTTCCCCGCCCCCCACCG;SOR=0.818;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=32;TCF=17;TCR=15;TR=16;WE=21785673;WS=21785655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr10	21805466	rs112207161	C	CCCTCCT	403.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.269;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.764;NF=4;NR=6;PP=595;ReadPosRankSum=-0.768;SC=CCCGCTGCCCCCCTCCTCCTC;SOR=1.460;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=10;WE=21805474;WS=21805456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr10	21806832	rs946711	A	C	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.652;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=446;ReadPosRankSum=-0.333;SC=GTTAATCCTCAGCCAGATGCT;SOR=0.331;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=23;WE=21806840;WS=21806822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr10	21827796	rs1802669	G	A	2835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.271;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=50;PP=2198;ReadPosRankSum=-0.410;SC=CCACTGGACCGTGGTTTTGCA;SOR=0.723;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=160;TCF=82;TCR=78;TR=108;WE=21827804;WS=21827786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,110:0.69:160
chr10	21884471	rs11592565	A	G	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=312;ReadPosRankSum=-0.590;SC=AAATCCAGGGAGATTTGGAAA;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=13;WE=21884479;WS=21884461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr10	22193422	rs792455	T	C	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=2;PP=610;SC=TTATATGACATTGTTAAAACA;SOR=4.255;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=22193430;WS=22193412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	22208630	rs2807978	T	C	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=567;SC=TGGCACATTATTAGTCTTTTA;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=22208638;WS=22208621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	22498749	rs2478476	A	T	7712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=100;NR=130;PP=2965;SC=TTTTTCAATGACCTTAACATC;SOR=0.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=230;TCF=100;TCR=130;TR=230;WE=22498757;WS=22498739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr10	22635425	rs374066888	CT	C	55.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=4.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.48;MQRankSum=-1.701;QD=2.14;ReadPosRankSum=-3.667;SOR=0.083;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr10	22826093	rs1053454	A	C	2757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=25;PP=2195;SC=ACCTCTGTCCATCCAATGTTC;SOR=1.694;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=55;TCR=25;TR=80;WE=22826101;WS=22826083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr10	22828831	.	AGAGAGAGAGG	A	53.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.862;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQRankSum=0.570;QD=1.99;ReadPosRankSum=2.021;SOR=0.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr10	22828833	.	AGAGAGAGG	A	445.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-3.177;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQRankSum=-0.494;QD=16.51;ReadPosRankSum=-2.052;SOR=2.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr10	22830719	rs943192	G	C	11540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=186;NR=152;PP=2965;SC=AGGGTCCACAGTAATCAAACT;SOR=0.935;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=338;TCF=186;TCR=152;TR=338;WE=22830727;WS=22830709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,357:1.00:357
chr10	22839463	rs10047326	C	A	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=379;SC=TCTGACTTCCCTAAGGTAGAG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=22839471;WS=22839461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	22896779	rs2765997	C	T	1577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.151;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=19;PP=1185;ReadPosRankSum=-0.275;SC=GACAAAAATACAGATCCCAAT;SOR=0.193;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=172;TCF=135;TCR=37;TR=66;WE=22896787;WS=22896769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,68:0.38:181
chr10	23003226	rs1132816	A	G	4365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=118;PP=2962;ReadPosRankSum=1.094;SC=TCGCCAGGACAGAGGACCCTA;SOR=0.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=254;TCF=75;TCR=179;TR=167;WE=23003234;WS=23003216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,168:0.65:260
chr10	23297301	rs11817610	C	T	1087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=16;PP=773;SC=AAGAAAAGAACAAGTAAGAAA;SOR=1.040;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=37;WE=23297309;WS=23297291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	23297336	rs11819616	A	T	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=23;PP=729;SC=GTATGCAAACAGCTTCCCCTT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=34;WE=23297344;WS=23297326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	23303253	rs1054052	T	A	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=33;PP=1007;SC=TCAATGTGCGTCCCTTCTCTC;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=35;WE=23303261;WS=23303243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	23407759	.	G	A	30	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=30;QD=21.5904041824;SC=TTGAATCCCTGGTCAGGCGTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=3;WE=23407767;WS=23407758;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,3:0.60:5
chr10	23408139	rs2296468	A	G	1106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=21;PP=950;SC=GAGTGGGAACAGATCCTGCTG;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=14;TCR=21;TR=35;WE=23408147;WS=23408129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	23482635	rs7918487	T	C	2507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=6;PP=2175;SC=CTGTCCAGGGTCCCCCTCCCC;SOR=4.977;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=71;TCR=6;TR=77;WE=23482643;WS=23482625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr10	23482850	rs10828415	G	A	7849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.827;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=165;PP=2965;ReadPosRankSum=0.028;SC=TCCCAGACTCGGCTGAAGATC;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=238;TCF=72;TCR=166;TR=235;WE=23482858;WS=23482840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,245:0.99:247
chr10	23528589	rs146338373	C	T	1938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=26;PP=1572;SC=AAACCTTAAACGAGAACAGAA;SOR=0.933;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=36;TCR=27;TR=62;WE=23528597;WS=23528579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr10	23556110	rs4382803	A	G	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=16;PP=1080;SC=GAGAGAAAAAACTTAAATACA;SOR=1.075;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=39;WE=23556118;WS=23556100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	23570792	rs11013364	A	G	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=366;SC=CCATTTACATATGTTTATAAT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=23570800;WS=23570782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	23611188	rs5783834	TATTA	T	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=327;SC=AAGCTCTGTGTATTAATTACC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=23611199;WS=23611184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	23621972	rs56268420	A	G	739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=580;ReadPosRankSum=1.472;SC=CAGAAGTTTCAGAACAAATTC;SOR=1.371;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=28;WE=23621980;WS=23621962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr10	23632970	rs11013408	T	G	1085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=29;PP=848;SC=CCGCTCGCTCTCCTGAGTCGG;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=36;WE=23632978;WS=23632960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	23633566	rs2036917	C	A	1017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=8;PP=811;SC=CGCAGCAGACCCGCAGCTCGG;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=23633574;WS=23633556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	23728470	rs147006133	C	T	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=272;ReadPosRankSum=0.000;SC=CACCCGCCGCCGCTACCCCCT;SOR=1.739;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=13;WE=23728478;WS=23728460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr10	24498289	.	GAAA	G	69.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.88;ReadPosRankSum=1.281;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,6:0.16:37
chr10	24498403	rs72774807	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=105;ReadPosRankSum=-0.319;SC=TTCTTAAGCAGCAAAAGAGGT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=24498411;WS=24498393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr10	24564831	rs10764458	C	T	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.474;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=35;PP=915;ReadPosRankSum=1.009;SC=CCTTCTGGTCCTGATATTCCT;SOR=1.316;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=61;TCF=11;TCR=50;TR=42;WE=24564839;WS=24564821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,43:0.72:60
chr10	24564859	rs17583862	A	G	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.282;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=522;ReadPosRankSum=-0.467;SC=CTGTCTTTCCATACCCCTCCC;SOR=0.137;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=26;WE=24564867;WS=24564849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,26:0.70:37
chr10	24669877	rs17506606	C	G	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.01;ReadPosRankSum=-0.330;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,22:0.26:84
chr10	24722205	rs2274830	T	C	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=188;ReadPosRankSum=0.174;SC=GAGGGGTTTTTTTTTACCCAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=10;WE=24722213;WS=24722195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
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chr10	24790491	rs2366916	GC	TT	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=20;PP=1148;SC=CTCATGCACGGCGGCCTCTGT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=20;WE=24790500;WS=24790481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr10	24813454	rs10828663	G	A	2850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.997;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=52;PP=1987;ReadPosRankSum=0.137;SC=GGTTCGCCACGCGCAGAGCTC;SOR=0.634;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=160;TCF=80;TCR=80;TR=101;WE=24813462;WS=24813444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,111:0.65:171
chr10	24822124	rs140819336	GGAA	G	277.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.741;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.52;ReadPosRankSum=1.020;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr10	24833137	rs2250411	C	T	5029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=59;PP=2965;ReadPosRankSum=0.915;SC=AGCCCAGCATCGAGAGTACAT;SOR=0.651;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=90;TCR=60;TR=148;WE=24833145;WS=24833127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,154:0.98:157
chr10	24878129	rs7478260	G	A	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.100;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=533;ReadPosRankSum=-0.956;SC=ATGCATTTGTGTATCAACCAT;SOR=0.283;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=86;TCF=59;TCR=27;TR=32;WE=24878137;WS=24878119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,34:0.37:92
chr10	24879281	rs10734053	A	G	4264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=62;PP=2965;SC=AGAATCGGGGATTTCTGCAGA;SOR=0.785;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=131;TCF=68;TCR=63;TR=130;WE=24879289;WS=24879271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr10	25231171	rs3748223	A	G	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.596;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=476;ReadPosRankSum=-0.989;SC=GCAGCTCAGGAATAGGGTCCT;SOR=0.086;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=23;WE=25231179;WS=25231161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr10	25312630	.	G	T	2898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-7.160;ClippingRankSum=0.000;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.651;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=60;PP=2346;ReadPosRankSum=-0.635;SC=ACCTCTACTAGATCTAATTTG;SOR=0.762;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=57;TCR=87;TR=99;WE=25312638;WS=25312620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,102:0.68:150
chr10	25465327	rs11014433	G	A	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=353;ReadPosRankSum=0.038;SC=GTGCACGTGTGAGGAAGGAAC;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=15;WE=25465335;WS=25465317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr10	25701341	rs2480345	C	G	2062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=53;PP=1706;SC=TCCTTCCAAGCCCTGTGTATG;SOR=3.947;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=7;TCR=53;TR=60;WE=25701349;WS=25701331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr10	25755732	rs67115852	CACAT	C	117.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.54;MQRankSum=1.848;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.524;SOR=0.024;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr10	25877859	rs144466352	TAAAC	T	992.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.015;NF=18;NR=0;PP=755;ReadPosRankSum=0.503;SC=TGTTGAATAATAAACAAAATG;SOR=1.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=18;WE=25877870;WS=25877849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr10	25885496	rs140976958	GTATAGA	G	1044.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.355;NF=26;NR=0;PP=1290;ReadPosRankSum=-0.395;SC=ATAGATATAGGTATAGATATA;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=58;TCR=0;TR=26;WE=25885509;WS=25885486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr10	26286367	rs7911700	G	A	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=-1.036;SC=AGAAGAAAGGGTAACTTCTTT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=26286375;WS=26286357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr10	26310410	rs3737275	T	C	1699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.680;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=13;PP=1328;ReadPosRankSum=0.603;SC=TTTCACCTTTTGATGGTGTGG;SOR=0.395;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=77;TCF=61;TCR=16;TR=59;WE=26310418;WS=26310400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,60:0.75:80
chr10	26310679	rs17666079	A	C	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=476;ReadPosRankSum=0.694;SC=GATATATTCCAACAAGTTGGG;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=20;WE=26310687;WS=26310669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,20:0.83:24
chr10	26312824	rs1339814	G	A	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-6.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=0;PP=927;ReadPosRankSum=0.786;SC=TCTTGGAATTGGGAAAAGATG;SOR=1.467;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=59;TCR=0;TR=39;WE=26312832;WS=26312814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,41:0.65:63
chr10	26355771	rs3824703	C	A	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=366;ReadPosRankSum=-0.725;SC=ATATATTAGGCTATTTTCTGG;SOR=1.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=15;WE=26355779;WS=26355761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr10	26355862	rs3824702	G	T	2344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=1.314;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.95;ReadPosRankSum=-0.467;SOR=1.020;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,55:0.68:81
chr10	26355872	rs3824701	A	G	2603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.84;ReadPosRankSum=-0.947;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,69:0.71:97
chr10	26355906	rs3824700	G	A	2625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.813;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=28;PP=1979;ReadPosRankSum=-0.463;SC=CTCCACAGACGTGAACGTATT;SOR=0.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=87;TCR=39;TR=91;WE=26355914;WS=26355896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,94:0.73:128
chr10	26355992	rs3824699	A	G	2530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=68;PP=1940;ReadPosRankSum=0.047;SC=AACCCTAGAAATTTTGGATGA;SOR=0.703;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=118;TCF=28;TCR=90;TR=90;WE=26356000;WS=26355982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,94:0.78:121
chr10	26356014	rs3824698	CA	TG	3080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.654;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=54;PP=2944;ReadPosRankSum=-0.563;SC=GTAAGAATTTCAGTTTAATTA;SOR=1.937;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=87;TCF=15;TCR=72;TR=63;WE=26356023;WS=26356004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,76:0.80:95
chr10	26356037	rs3824696	C	T	1507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.111;HP=2;HapScore=1;MGOF=59;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=46;PP=1214;ReadPosRankSum=-0.376;SC=CTTAGACATTCCAGATGTTTT;SOR=2.494;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=67;TCF=7;TCR=60;TR=50;WE=26356045;WS=26356027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,52:0.75:69
chr10	26356066	rs3824695	C	T	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=28;PP=683;ReadPosRankSum=-0.302;SC=ATAGAAGACACGGGTATTGGT;SOR=1.559;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=29;WE=26356074;WS=26356056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
chr10	26357625	rs3817421	T	C	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=388;ReadPosRankSum=1.014;SC=CTGTTTATTATTGTTTACTTT;SOR=0.379;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=18;WE=26357633;WS=26357615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr10	26357747	rs35379457	CG	TA	2291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.187;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=2489;ReadPosRankSum=-2.125;SC=ATCAGATCTACGTCTATGTGG;SOR=1.142;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=85;TCF=50;TCR=35;TR=55;WE=26357756;WS=26357737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,57:0.68:84
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chr10	26359200	rs3834403	T	TA	1277.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.652;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.782;NF=20;NR=18;PP=1441;ReadPosRankSum=-1.211;SC=AAATGTCACTTAATTTTGAGG;SOR=0.597;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=63;TCF=27;TCR=36;TR=38;WE=26359208;WS=26359190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,41:0.64:64
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chr10	26432360	.	T	C	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.563;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=4;PP=1239;ReadPosRankSum=1.407;SC=TTTTAAGTGGTTTTGTCTTTA;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=71;TCF=66;TCR=5;TR=52;WE=26432368;WS=26432350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,53:0.73:73
chr10	26436287	rs2368158	G	T	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=1;PP=722;ReadPosRankSum=1.414;SC=TGTTGTTGATGATGATGATGG;SOR=0.871;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=31;WE=26436295;WS=26436277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,33:0.72:46
chr10	26443646	rs3818956	G	A	1965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.414;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=26;PP=1550;ReadPosRankSum=-1.208;SC=TAGATACCAAGGCATCACTGT;SOR=0.992;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=114;TCF=68;TCR=46;TR=69;WE=26443654;WS=26443636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,73:0.60:122
chr10	26446181	rs45472793	C	T	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=462;ReadPosRankSum=0.206;SC=GAAAGGCCTACAAGCTCATAC;SOR=0.462;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=22;WE=26446189;WS=26446171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr10	26446312	rs3758449	G	A	3431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.669;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=48;PP=2834;ReadPosRankSum=0.563;SC=AAACCAAATAGTGAGCGTCAG;SOR=1.159;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=186;TCF=109;TCR=77;TR=125;WE=26446320;WS=26446302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,124:0.66:188
chr10	26457536	rs1342320	C	T	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=90;ReadPosRankSum=0.136;SC=CAGTGATTTCCAAAATCTCAA;SOR=1.022;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=7;WE=26457544;WS=26457526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr10	26462790	rs3740232	G	A	2044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.384;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=37;PP=1709;ReadPosRankSum=1.059;SC=ATGAGGAAGAGGTTAAGCAAG;SOR=0.248;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=113;TCF=65;TCR=48;TR=75;WE=26462798;WS=26462780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,74:0.67:110
chr10	26463043	rs3740231	A	T	3746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.513;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=67;PP=2962;ReadPosRankSum=0.467;SC=CTTTAAAAAAACTTTGGAACC;SOR=0.661;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=209;TCF=104;TCR=105;TR=133;WE=26463051;WS=26463033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,139:0.63:219
chr10	26463130	rs1999240	C	A	4313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.648;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=67;PP=2962;ReadPosRankSum=1.149;SC=AGTTACCCAGCGTGCACCGAT;SOR=0.817;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=227;TCF=120;TCR=107;TR=148;WE=26463138;WS=26463120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,154:0.65:238
chr10	26463443	rs34151474	C	T	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.483;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=585;ReadPosRankSum=0.305;SC=TCGAAAGCAACTTCAGAAAGA;SOR=1.254;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=112;TCF=33;TCR=79;TR=32;WE=26463451;WS=26463433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,35:0.29:119
chr10	26463569	rs3758448	G	A	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=448;ReadPosRankSum=-0.183;SC=ATTAATAACTGGTAGATTGTT;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=19;WE=26463577;WS=26463559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr10	26463587	rs3758447	C	G	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=283;ReadPosRankSum=0.111;SC=GTTTTATCTGCGTTGATGGGC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=13;WE=26463595;WS=26463577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr10	26500658	rs10508715	A	G	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=364;ReadPosRankSum=-1.091;SC=CCTTTCCTAAATGTCCGCGGT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=15;WE=26500666;WS=26500648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr10	26505822	rs2839671	G	A	2271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=44;PP=1926;ReadPosRankSum=-1.260;SC=CAGGTAGGAAGGAGAACGGGG;SOR=0.637;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=55;TCR=61;TR=83;WE=26505830;WS=26505812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,82:0.68:120
chr10	26507847	rs7071922	C	G	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=192;ReadPosRankSum=0.737;SC=AATGTTCTGCCTTTCCAAAAG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=12;WE=26507855;WS=26507843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr10	26512638	.	ATG	A	99	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=10;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=6;NR=0;PP=99;QD=17.6666666667;SC=GTGTATGTGCATGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=26512647;WS=26512628;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr10	26569755	rs8190748	A	G	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.112;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=515;ReadPosRankSum=-0.583;SC=CGCACTATATACGTGTAATAA;SOR=2.093;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=22;WE=26569763;WS=26569745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,21:0.81:26
chr10	26581321	rs3824694	G	C	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.966;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=732;ReadPosRankSum=-0.415;SC=GCAGGATGACGGTCAGTCTCC;SOR=0.280;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=49;TCF=44;TCR=5;TR=30;WE=26581329;WS=26581311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,30:0.61:49
chr10	26589944	rs41279914	C	T	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-6.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=35;PP=751;ReadPosRankSum=0.113;SC=TAAGTTGTCACAAACTGTGTG;SOR=0.702;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=97;TCF=13;TCR=84;TR=40;WE=26589952;WS=26589934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,41:0.40:103
chr10	26781355	rs1775245	T	C	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.568;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=46;PP=1066;ReadPosRankSum=-0.294;SC=ACTGGCAAATTGGAAAACAAA;SOR=2.128;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=76;TCF=16;TCR=60;TR=55;WE=26781363;WS=26781345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,59:0.74:80
chr10	26781388	rs1775246	G	A	1470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.412;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=46;PP=1159;ReadPosRankSum=0.366;SC=GAATTTCATTGTAATATGACA;SOR=1.675;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=61;TCF=4;TCR=57;TR=49;WE=26781396;WS=26781378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,52:0.81:64
chr10	26802633	rs202232214	AT	A	252.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=20.873;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.88;ReadPosRankSum=2.043;SOR=3.373;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr10	26825026	rs144153688	C	T	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.08;ReadPosRankSum=1.491;SOR=0.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,27:0.26:102
chr10	26993725	rs1677730	G	A	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=15;PP=491;SC=TAAATTTATTGTTGTTTAAAA;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=19;WE=26993745;WS=26993715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	26993737	rs1780193	A	T	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=13;PP=410;SC=TGTTTAAAAAATTTTTTTTGT;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=26993745;WS=26993715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	26994150	rs1780192	A	C	1697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=14;PP=1335;SC=ATCTGAGTCTACTAAATATAT;SOR=1.802;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=48;WE=26994158;WS=26994140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	27009334	rs1780196	A	G	2545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=54;PP=1939;SC=TGAATCACACACTTTTCGGAC;SOR=1.356;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=29;TCR=54;TR=83;WE=27009342;WS=27009324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr10	27031214	rs10764638	A	G	36.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr10	27037799	rs3839922	TG	T	637.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=632;SC=TCTTAATTTTTGTATCTATCA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=16;WE=27037807;WS=27037789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	27054375	rs7915128	C	T	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=23;PP=655;SC=CCTTGGAGGACTGGTTTCAAG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=27054383;WS=27054365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	27057952	.	G	A	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=145;ReadPosRankSum=0.105;SC=AAGGAATAATGAATAAAAAAG;SOR=0.551;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=8;WE=27057960;WS=27057942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr10	27059608	rs1324637	C	T	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=22;PP=681;SC=TGCATGAACACAAACTATAGA;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=27059616;WS=27059598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	27065976	rs7096584	G	A	4323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=33;PP=2965;SC=GCTTGTTAATGTAATATAAAA;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=102;TCR=33;TR=135;WE=27065984;WS=27065966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr10	27318371	rs1963735	G	A	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=17;PP=609;SC=AAACCTTATCGGAACACAGTC;SOR=2.636;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=27318379;WS=27318361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	27326108	.	G	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.829;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.915;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=131;ReadPosRankSum=0.248;SC=AAAGGAAATAGAAATACCTCA;SOR=0.114;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=10;WE=27326116;WS=27326098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr10	27326999	rs7096505	T	C	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=16;PP=530;SC=GTTAAATATGTTTATCTTAAA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=27327007;WS=27326989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	27368126	rs3737055	A	C	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=6.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.209;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=28;PP=591;ReadPosRankSum=0.665;SC=GAGTGAATTCATTTCTTTAAA;SOR=0.843;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=110;TCF=13;TCR=97;TR=31;WE=27368134;WS=27368116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,30:0.27:113
chr10	27371623	rs10829173	G	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=158;ReadPosRankSum=1.046;SC=CTGTTGGGACGACTATATGGA;SOR=0.724;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=13;WE=27371631;WS=27371613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr10	27371647	rs10829174	T	C	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=207;ReadPosRankSum=0.056;SC=GCACATAATATGGTGTCTACC;SOR=0.871;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=40;TCF=24;TCR=16;TR=16;WE=27371655;WS=27371637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr10	27375368	rs10443967	C	G	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.69;ReadPosRankSum=-2.019;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,37:0.70:53
chr10	27375377	rs10443987	A	T	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.71;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr10	27375601	rs11015513	T	A	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=-2.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=157;ReadPosRankSum=-0.026;SC=TTACCAAATATCTCAAAATCT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=8;WE=27375609;WS=27375591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr10	27381349	rs2297145	T	C	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.547;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=98;ReadPosRankSum=-1.446;SC=CCAACTTATCTACTGCATTTA;SOR=0.141;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=7;WE=27381357;WS=27381339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr10	27382240	rs2297147	T	C	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.30;ReadPosRankSum=0.600;SOR=0.073;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,10:0.20:49
chr10	27382519	rs2297148	C	T	2294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.748;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=43;PP=1767;ReadPosRankSum=0.551;SC=CCACAGGTTTCACCAATTAGT;SOR=0.317;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=102;TCF=38;TCR=64;TR=72;WE=27382527;WS=27382509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,78:0.74:106
chr10	27389197	rs7897309	T	C	1206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=40;PP=972;SC=GCTGCTCCTCTGCCGCCGCGC;SOR=4.271;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=44;WE=27389205;WS=27389187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	27400861	rs9833	G	A	2236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=34;PP=1711;SC=AATGCTACTTGTATTCTTGCA;SOR=0.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=33;TCR=34;TR=67;WE=27400869;WS=27400851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr10	27401056	rs11015538	C	T	2257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.641;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=41;PP=1649;ReadPosRankSum=-0.012;SC=AGTCCTGAAACAGAAAAGGAG;SOR=0.649;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=133;TCF=67;TCR=66;TR=81;WE=27401064;WS=27401046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,87:0.62:141
chr10	27403680	rs10829187	G	C	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.129;NF=0;NR=13;PP=222;ReadPosRankSum=-0.971;SC=TTTGAGGCCGGGCACAGTGGC;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=13;WE=27403688;WS=27403670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr10	27404927	rs2297151	G	T	60.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5040;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=37;ReadPosRankSum=1.150;SC=ATCAGAACCAGCTCTCAAATC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=27404935;WS=27404924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr10	27405096	rs2297152	A	G	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-5.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=19;PP=979;ReadPosRankSum=0.438;SC=ATTTTAAAACATATCTTTAAG;SOR=0.728;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=96;TCF=64;TCR=32;TR=58;WE=27405104;WS=27405086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,61:0.59:103
chr10	27405310	rs2480718	C	G	1945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=48;PP=1556;SC=AAAAAATAAGCAAAGAGGCTG;SOR=4.029;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=5;TCR=49;TR=53;WE=27405318;WS=27405300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
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chr10	27412669	rs2274743	A	T	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.339;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=39;PP=951;ReadPosRankSum=0.722;SC=AAGTATTTTTAAAAAATCCCT;SOR=1.791;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=56;TCF=2;TCR=54;TR=41;WE=27412677;WS=27412659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,39:0.68:57
chr10	27415906	rs10829192	C	A	31.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.59;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
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chr10	27434483	rs2274634	G	A	1913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.822;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=40;PP=1364;ReadPosRankSum=-0.104;SC=CCAATTTTTAGTTCAGATAAT;SOR=0.307;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=95;TCF=35;TCR=60;TR=67;WE=27434491;WS=27434473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,72:0.71:101
chr10	27436295	rs3780926	A	C	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=203;ReadPosRankSum=0.388;SC=ACAAACAAAGAAACTAGACTG;SOR=0.234;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=46;TCR=3;TR=13;WE=27436303;WS=27436285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,13:0.25:52
chr10	27437994	rs10764675	C	T	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.050;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=56;PP=1408;ReadPosRankSum=0.070;SC=AAGTTAAAAACTAAGTAGTTT;SOR=1.494;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=85;TCF=6;TCR=79;TR=60;WE=27438002;WS=27437984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,59:0.71:83
chr10	27443072	rs11816716	G	A	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=19;PP=954;ReadPosRankSum=0.261;SC=CGGGCAGGGCGGGAGGAAAAA;SOR=0.587;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=41;TCR=29;TR=46;WE=27443080;WS=27443062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,44:0.64:69
chr10	27444303	rs3824593	G	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.214;HP=1;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=131;ReadPosRankSum=0.946;SC=GTTGGCGGGAGTGGCTGCTCG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=8;WE=27444311;WS=27444300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr10	27444328	rs7919803	C	A	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=8.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.69;ReadPosRankSum=0.000;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr10	27444328	.	CT	AC	173	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=34;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=10;NR=0;PP=173;QD=22.6467874862;SC=GGGGCAGTGTCTGCGGGGCCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=10;WE=27444337;WS=27444318;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,10:0.59:17
chr10	27444329	rs7907981	T	C	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.99;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	27444344	rs7907988	T	G	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=2;PP=659;SC=GGCCGCTGTATGCTGTCCAGC;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=27444352;WS=27444334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	27454111	rs7068375	A	T	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.238;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=30;PP=909;ReadPosRankSum=0.895;SC=TAAGTACTTGAGAAGAAAATT;SOR=0.558;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=187;TCF=83;TCR=104;TR=56;WE=27454119;WS=27454101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,58:0.30:193
chr10	27456003	rs788238	G	A	2751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=19;PP=2188;SC=GCTGTAACATGGAATTCAATA;SOR=2.331;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=60;TCR=19;TR=79;WE=27456011;WS=27455993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr10	27459670	rs1981296	C	T	1585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.404;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=17;PP=1240;ReadPosRankSum=0.375;SC=ATAGAAGCATCAAAGAATCCT;SOR=0.845;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=147;TCF=101;TCR=46;TR=59;WE=27459678;WS=27459660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,63:0.41:154
chr10	27461953	rs6482600	T	A	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=314;ReadPosRankSum=-0.351;SC=TAGTAGCCTATGAGCTAGTTA;SOR=0.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=17;WE=27461961;WS=27461943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,19:0.36:53
chr10	27470327	rs59126044	C	CA	146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=135;ReadPosRankSum=0.507;SC=TCTCAAAAAACAAAAAAAAGT;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=8;WE=27470335;WS=27470317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr10	27475444	rs10741130	T	C	1693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-5.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.802;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=62;PP=1107;ReadPosRankSum=-0.468;SC=AGCACCTGACTGTATCTGGAT;SOR=1.201;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=213;TCF=51;TCR=162;TR=74;WE=27475452;WS=27475434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,83:0.36:229
chr10	27475494	rs10764686	T	C	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-6.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.398;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=37;PP=585;ReadPosRankSum=-0.093;SC=AGTCTAGCCTTGTGTTATAGA;SOR=0.261;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=115;TCF=6;TCR=109;TR=41;WE=27475502;WS=27475484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,44:0.36:122
chr10	27497074	rs7919523	C	T	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=164;ReadPosRankSum=0.457;SC=CTAAAAAAATCAGTAAAATAC;SOR=0.776;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=12;WE=27497082;WS=27497064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,13:0.28:46
chr10	27499709	rs76818131	A	G	1612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.804;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=8;PP=1248;ReadPosRankSum=1.492;SC=AAGTAAATCAATAAAGGTGAG;SOR=0.381;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=91;TCF=80;TCR=11;TR=56;WE=27499717;WS=27499699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,56:0.62:90
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chr10	27499804	rs34856168	T	C	3391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.315;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=38;PP=2549;ReadPosRankSum=-0.788;SC=CCCGGTGTGGTGCTCCGCTGT;SOR=0.578;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=182;TCF=126;TCR=56;TR=121;WE=27499812;WS=27499794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,126:0.67:187
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chr10	27506961	rs34037342	G	A	3195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.379;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=59;PP=2359;ReadPosRankSum=1.789;SC=TTTCATCAATGGGCTTTACTT;SOR=0.965;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=176;TCF=81;TCR=95;TR=107;WE=27506969;WS=27506951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,118:0.61:193
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chr10	27507142	rs7068463	A	G	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.106;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=443;ReadPosRankSum=-0.880;SC=AAGATTCATAAAAGTTCACAG;SOR=0.117;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=18;WE=27507150;WS=27507132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr10	27508600	rs12251316	A	G	1179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.509;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=2;PP=992;ReadPosRankSum=0.337;SC=ATGTCTTCATACCCTCTTAGT;SOR=1.697;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=52;TCF=49;TCR=3;TR=39;WE=27508608;WS=27508590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,39:0.76:51
chr10	27508621	rs12243607	C	T	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.094;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=4;PP=1078;ReadPosRankSum=1.553;SC=TTATTTATTGCAAAATTACTA;SOR=1.738;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=67;TCF=60;TCR=7;TR=47;WE=27508629;WS=27508611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,49:0.72:68
chr10	27508758	rs10764690	T	C	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=12.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.74;ReadPosRankSum=-0.672;SOR=0.153;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,31:0.26:120
chr10	27508837	rs788213	T	C	1193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=35;PP=1008;SC=TACAATAATGTCATAATTTCC;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=36;WE=27508845;WS=27508827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	27512014	rs16927646	T	C	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=184;ReadPosRankSum=-0.639;SC=GAACTTCATATAATGTGTTTG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=9;WE=27512022;WS=27512004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr10	27512440	rs12259499	A	G	1574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=39;PP=2304;ReadPosRankSum=-0.614;SC=ATCTCCACTAATATCAAATAA;SOR=1.961;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=39;WE=27512456;WS=27512430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,41:0.72:57
chr10	27512448	rs59068315	TA	T	1411.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=33;PP=2154;ReadPosRankSum=0.441;SC=TAATATCAAATAATCTCCTAT;SOR=1.567;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=33;WE=27512456;WS=27512430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,36:0.67:54
chr10	27529549	rs2797078	C	A	7299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=126;NR=104;PP=2965;ReadPosRankSum=0.007;SC=CCTCCTCCCCCGGGGCGTGAC;SOR=0.305;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=231;TCF=127;TCR=104;TR=230;WE=27529557;WS=27529539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,235:1.00:236
chr10	27529565	rs2489372	T	C	7960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=130;NR=116;PP=2965;SC=GTGACTAAGGTCACGAATCCG;SOR=0.800;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=247;TCF=130;TCR=117;TR=246;WE=27529573;WS=27529555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr10	27539089	rs61737347	C	T	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.772;NF=2;NR=10;PP=224;ReadPosRankSum=-0.222;SC=GCTGTAGCCTCCTGGTGGACT;SOR=0.658;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=12;WE=27539097;WS=27539079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr10	27539507	rs7896532	C	T	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=13;PP=933;SC=GTTCACGCTCCGTAGGATGAC;SOR=1.244;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=20;TCR=13;TR=33;WE=27539515;WS=27539497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	27570130	rs1252880	C	T	70.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.07;QD=23.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	27577568	rs2780686	G	A	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=13;PP=1118;SC=TCTCCACACTGTAGCTTACAT;SOR=1.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=44;WE=27577576;WS=27577558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	27577615	rs11015640	T	G	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.430;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.761;NF=14;NR=16;PP=589;ReadPosRankSum=1.023;SC=GGAAGAGTGCTGAAAAGATTG;SOR=0.936;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=30;WE=27577623;WS=27577605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
chr10	27577640	rs3818746	G	T	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=11.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.67;MQRankSum=0.828;QD=17.85;ReadPosRankSum=-0.908;SOR=0.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr10	27595356	rs7085523	C	T	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.021;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.776;NF=0;NR=38;PP=986;ReadPosRankSum=-1.277;SC=GACAAATTTTCGCAGTAAAAA;SOR=3.660;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=1;TCR=51;TR=38;WE=27595364;WS=27595346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,39:0.75:52
chr10	27622954	rs200224465	C	CTA	693.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.190;NF=17;NR=0;PP=739;ReadPosRankSum=1.249;SC=TAAATCAAAGCTATATATATA;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=50;TCR=0;TR=17;WE=27622962;WS=27622944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr10	27687775	rs1638630	T	C	6910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=137;NR=67;PP=2965;SC=AAAACAAACTTATTGGATGGA;SOR=1.655;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=137;TCR=67;TR=204;WE=27687783;WS=27687765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr10	27692062	rs2429491	T	C	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.433;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=172;ReadPosRankSum=0.931;SC=AGAGCCACCTTAATACAATTC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=8;WE=27692070;WS=27692052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr10	27692099	rs2484179	A	G	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=335;ReadPosRankSum=-0.258;SC=CCCCTACCCCACCACATACAC;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=19;WE=27692107;WS=27692089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr10	27692205	rs11015742	G	A	2430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.429;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=32;PP=1851;ReadPosRankSum=0.560;SC=GCAACAGCAGGCCAAAGCCGC;SOR=0.441;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=130;TCF=86;TCR=44;TR=88;WE=27692213;WS=27692195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,93:0.67:139
chr10	27692256	rs148140519	A	G	1213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.087;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=21;PP=838;ReadPosRankSum=-1.602;SC=CAAAGGCCGCAACACACATTT;SOR=0.894;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=154;TCF=89;TCR=65;TR=54;WE=27692264;WS=27692246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,57:0.36:159
chr10	27692279	rs2484180	A	C	2275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=44;PP=1736;ReadPosRankSum=-0.882;SC=TTTCGTATGCAGTCAAACCTG;SOR=0.683;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=149;TCF=76;TCR=73;TR=90;WE=27692287;WS=27692269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,93:0.60:154
chr10	27692371	rs2484181	T	G	1271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.406;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=37;PP=1047;ReadPosRankSum=0.612;SC=CACCTAGTCATAAATCTCTAA;SOR=0.437;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=77;TCF=15;TCR=62;TR=47;WE=27692379;WS=27692361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,47:0.59:79
chr10	27692403	rs2505307	C	A	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=502;ReadPosRankSum=0.572;SC=CCACACATATCTGCTGGAGAC;SOR=2.376;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=24;WE=27692411;WS=27692393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr10	27700887	rs2429499	G	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.120;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.141;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=147;ReadPosRankSum=-0.059;SC=CAGATAAATAGCTTTTAATTA;SOR=2.022;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=17;TCF=7;TCR=10;TR=9;WE=27700895;WS=27700877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr10	27702169	rs6482625	C	T	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.025;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=21;PP=852;ReadPosRankSum=0.313;SC=GCTTGCTCTGCACGTCGTACT;SOR=0.541;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=188;TCF=116;TCR=72;TR=54;WE=27702177;WS=27702159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,55:0.29:192
chr10	27702688	rs7087552	C	T	1331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=28;PP=923;ReadPosRankSum=0.706;SC=CTAGGTCTTCCTCTTCGTCCT;SOR=0.695;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=172;TCF=83;TCR=89;TR=52;WE=27702696;WS=27702678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,58:0.32:180
chr10	27702725	rs6482626	A	G	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.239;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=21;PP=556;ReadPosRankSum=-0.191;SC=GCCGGTGCCCAGCGCGGCTGT;SOR=0.594;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=151;TCF=72;TCR=79;TR=42;WE=27702733;WS=27702715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,45:0.29:154
chr10	27703234	rs7071851	A	G	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-2.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.108;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=206;ReadPosRankSum=-1.150;SC=GCAGCTGCGGAGATCCCACCA;SOR=0.056;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=14;WE=27703242;WS=27703224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr10	28032136	rs2252651	C	T	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.678;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=219;ReadPosRankSum=-0.050;SC=GCGGGCAGGGCCCCCAGGGGA;SOR=0.252;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=14;WE=28032144;WS=28032126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,15:0.26:57
chr10	28142245	rs7898085	A	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.154;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.335;NF=3;NR=3;PP=46;ReadPosRankSum=0.175;SC=GCAGTGAGCCAAGATCGTTGT;SOR=0.636;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=6;WE=28142253;WS=28142235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr10	28142294	rs143299831	T	TATAAATAA	115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=194;ReadPosRankSum=0.819;SC=AGACTCTGTCTATAAATAAAT;SOR=0.446;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=3;WE=28142302;WS=28142284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr10	28151604	rs34181914	AT	A	113.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=1.765;QD=3.25;ReadPosRankSum=-0.208;SOR=0.129;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,9:0.26:35
chr10	28225897	rs2297646	G	T	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.683;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=437;ReadPosRankSum=1.606;SC=CTAGTAGCTAGGAAACTTCTT;SOR=1.264;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=72;TCF=20;TCR=52;TR=27;WE=28225905;WS=28225887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,28:0.37:75
chr10	28228865	rs7893462	A	G	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.791;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=413;ReadPosRankSum=-0.163;SC=GCAGCTGCTCATTCTCACTAT;SOR=0.859;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=98;TCF=43;TCR=55;TR=29;WE=28228873;WS=28228855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,33:0.31:106
chr10	28233120	rs3824590	A	C	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=21;ReadPosRankSum=0.365;SC=GGCTGGCACTAGATGACGATG;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=3;WE=28233128;WS=28233110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr10	28233469	rs3802517	T	A	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=89;ReadPosRankSum=0.998;SC=TAAGAAATCATTTCCATTCCC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=6;WE=28233477;WS=28233459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr10	28233931	rs34717952	G	A	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=4.600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.52;ReadPosRankSum=-1.179;SOR=1.319;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,38:0.25:151
chr10	28233933	rs34084011	A	G	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.587;SOR=0.919;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,31:0.22:141
chr10	28247957	rs34350686	A	C	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=376;ReadPosRankSum=-1.056;SC=GGACTCTCTTAATTCATCTTC;SOR=0.613;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=18;WE=28247965;WS=28247947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
chr10	28259899	.	TTAAA	T	445	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=28;MQ=61.71;NF=23;NR=1;PP=445;QD=18.75;SC=AGACTCCATCTTAAATAAATA;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=24;WE=28259910;WS=28259898;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,24:0.62:39
chr10	28259936	rs139300652	TAAACAAAC	T	757.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.705;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=5.059;NF=27;NR=1;PP=1256;ReadPosRankSum=3.231;SC=AATAAATAAATAAACAAACAA;SOR=0.061;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=74;TCF=71;TCR=3;TR=28;WE=28259951;WS=28259926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,22:0.34:65
chr10	28276273	rs3808909	G	A	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.025;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=538;ReadPosRankSum=0.985;SC=CAGCAAGATTGTTTCTAAAAG;SOR=0.531;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=100;TCF=83;TCR=17;TR=29;WE=28276281;WS=28276263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,30:0.28:107
chr10	28358548	rs2763318	CA	AC	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=29.79;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr10	28378758	rs2997211	T	C	1331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=42;PP=1094;ReadPosRankSum=0.281;SC=ACGAAAACTTTTTCTAAAACC;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=1;TCR=53;TR=43;WE=28378766;WS=28378748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,45:0.78:58
chr10	28436255	rs17684826	T	C	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=117;ReadPosRankSum=1.108;SC=AATCAAAAGCTCGCCTCTTTC;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=8;WE=28436263;WS=28436251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr10	28491313	rs11598304	C	T	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=324;ReadPosRankSum=0.548;SC=ATTTGTATTCCGGGCCATCAA;SOR=1.519;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=15;WE=28491321;WS=28491303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr10	28822373	rs12767429	A	C	1318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=3;PP=1095;SC=CTGGGAGCTGATGAGAGTCGC;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=37;WE=28822381;WS=28822363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
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chr10	28879838	rs41283724	A	G	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=584;ReadPosRankSum=-1.220;SC=ATCCATTGCCATCTACATATG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=26;WE=28879846;WS=28879828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr10	28899841	rs11371837	A	AT	255.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=1.456;QD=4.83;ReadPosRankSum=-0.460;SOR=0.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,17:0.32:53
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chr10	29136129	rs813935	A	G	4354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=37;PP=2965;SC=CTGAGCTCAAATAGTCCTCCT;SOR=1.999;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=90;TCR=37;TR=127;WE=29136137;WS=29136119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr10	29137085	rs787323	C	T	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=2;PP=431;SC=CTCTTGTGCACGGGATGGGGA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=29137093;WS=29137075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	29162324	rs35236571	TAC	T	450.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.56;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	29580735	rs2148901	C	T	1557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.60;QD=45.82;SOR=2.899;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	29580743	rs2148902	G	A	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.26;QD=44.22;SOR=3.026;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	29581309	rs1751955	C	T	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.781;NF=13;NR=0;PP=188;ReadPosRankSum=-0.165;SC=GCCCCCTGGGCGCATGCCCGC;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=13;WE=29581317;WS=29581299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr10	29581493	rs3818551	A	C	4095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.096;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.303;NF=74;NR=93;PP=2901;ReadPosRankSum=0.088;SC=ACCACAGCCCAGACGGTCCTG;SOR=0.497;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=247;TCF=105;TCR=142;TR=167;WE=29581501;WS=29581483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,170:0.68:249
chr10	29598896	rs2796293	A	G	7237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=186;NR=28;PP=2965;SC=TAATGAAAATAAGATTGTGGC;SOR=3.727;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=215;TCF=187;TCR=28;TR=214;WE=29598904;WS=29598886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr10	29747155	rs139380407	GCTC	G	1074.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.033;NF=22;NR=2;PP=978;ReadPosRankSum=-1.254;SC=TGACCGTGAGGCTCCTCTGGC;SOR=0.752;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=43;TCF=40;TCR=3;TR=24;WE=29747165;WS=29747145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr10	29747221	rs41299212	G	A	2406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.895;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.625;NF=67;NR=18;PP=1919;ReadPosRankSum=-1.026;SC=GCTTCCAGGCGGGCAGGGCGT;SOR=0.836;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=118;TCF=94;TCR=24;TR=85;WE=29747229;WS=29747211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,87:0.71:123
chr10	29747618	rs7098527	T	A	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=33;PP=866;ReadPosRankSum=1.312;SC=ACCTGCATACTGCCTGAGGAT;SOR=0.867;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=57;TCF=7;TCR=50;TR=37;WE=29747626;WS=29747608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,42:0.68:62
chr10	29754535	rs17694739	G	A	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-3.451;NF=7;NR=10;PP=314;ReadPosRankSum=1.820;SC=TGGCTGGGGCGCGCTGTACAG;SOR=0.610;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=30;TCF=12;TCR=18;TR=17;WE=29754543;WS=29754525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr10	29754609	rs1057952	T	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-2.487;NF=5;NR=4;PP=103;ReadPosRankSum=0.412;SC=ACACAAACTCTGTGGCTGCAA;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=9;WE=29754617;WS=29754599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr10	29759174	rs3215848	TG	T	865.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.879;HP=7;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=5;PP=858;ReadPosRankSum=-0.032;SC=GCCCGGTGTGTGGGGGGACTC;SOR=0.311;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=56;TCF=50;TCR=6;TR=32;WE=29759182;WS=29759164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,33:0.67:49
chr10	29759225	rs11007607	A	G	1745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=16;PP=1295;ReadPosRankSum=-0.884;SC=TCTTGTTCGCAGCGGTCCTTC;SOR=0.802;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=90;TCR=25;TR=73;WE=29759233;WS=29759215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,75:0.63:119
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chr10	29762997	rs932794	C	G	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.941;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=361;ReadPosRankSum=0.170;SC=TCACTTTCCCCGGGCCTGCAA;SOR=1.501;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=16;WE=29763005;WS=29762987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr10	29769647	rs10763720	G	A	2343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.095;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=28;PP=1729;ReadPosRankSum=1.287;SC=AGCCACGGCCGACGTTCACTC;SOR=1.405;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=139;TCF=84;TCR=55;TR=82;WE=29769655;WS=29769637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,87:0.59:147
chr10	29770551	rs11007612	A	G	4712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.082;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=-0.661;NF=72;NR=106;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.492;SC=TTCTCATTCGATCTCTTCAGT;SOR=0.504;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=257;TCF=99;TCR=158;TR=178;WE=29770559;WS=29770541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,181:0.69:262
chr10	29776289	rs61192312	T	C	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.470;NF=0;NR=12;PP=272;ReadPosRankSum=0.048;SC=ACGCACCCCATATCGGAAGCA;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=12;WE=29776297;WS=29776279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr10	29777558	rs61737742	G	A	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.556;NF=23;NR=5;PP=528;ReadPosRankSum=0.647;SC=TCAGCCTCTTGTAGGGCACGG;SOR=0.551;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=28;WE=29777566;WS=29777548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
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chr10	29783813	rs6481600	G	A	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.866;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.626;NF=29;NR=9;PP=886;ReadPosRankSum=-1.433;SC=GAGATTCTGAGAGCAAAGCCT;SOR=1.425;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=38;WE=29783821;WS=29783803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,41:0.69:59
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chr10	29783984	rs3031505	GAAACT	G	1060.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=50.276;HP=4;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.695;NF=1;NR=25;PP=1179;ReadPosRankSum=0.918;SC=CTTCTGATCAGAAACTGCTTG;SOR=6.736;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=26;WE=29783996;WS=29783974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr10	29784004	rs28427082	G	A	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=31.890;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.388;NF=9;NR=13;PP=439;ReadPosRankSum=1.595;SC=GGCGTGGCCGGGGCCTTGGCG;SOR=0.003;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=52;TCF=11;TCR=41;TR=22;WE=29784012;WS=29783994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr10	29784072	rs2368406	G	C	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.12;QD=33.85;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	29784114	rs6481601	T	C	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=17;PP=432;SC=GCCAAACCTGTGGAACACACA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=29784122;WS=29784104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	29784188	rs2368401	A	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.94;MQRankSum=-2.369;QD=21.60;ReadPosRankSum=0.319;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr10	29784188	.	AAA	GAG	328	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=28;MQ=48.57;NF=0;NR=7;PP=328;QD=54.4954106946;SC=GGATCTCCAGAAATCCCAGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=29784198;WS=29784178;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr10	29784190	rs2368400	A	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.94;MQRankSum=-2.369;QD=21.60;ReadPosRankSum=0.319;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr10	29785191	rs11007625	G	A	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5011;FS=4.811;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=2;PP=726;ReadPosRankSum=-0.614;SC=TTGATTGATGGTGTCAATAAA;SOR=3.126;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=29;WE=29785199;WS=29785181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,29:0.88:33
chr10	29812602	rs7070678	G	T	3330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=42;PP=2633;ReadPosRankSum=1.880;SC=TCCCTGGCTCGGTTCAGGATG;SOR=0.669;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=177;TCF=115;TCR=62;TR=119;WE=29812610;WS=29812592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,120:0.67:180
chr10	29818604	rs913035	A	C	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=366;ReadPosRankSum=-0.690;SC=GACACTATAGACAAGGCTGAG;SOR=0.859;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=17;WE=29818612;WS=29818594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr10	29818827	rs3780843	C	T	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=332;ReadPosRankSum=0.000;SC=GAGCTGGGCACGGTGGCTCAC;SOR=0.257;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=15;WE=29818835;WS=29818817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr10	29822032	rs1247696	C	T	2300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=19;PP=1824;SC=GACTCGCAGACATGGAGAACT;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=54;TCR=19;TR=73;WE=29822040;WS=29822022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr10	29891160	.	C	T	2112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.720;ClippingRankSum=0.000;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.683;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=28;PP=1540;ReadPosRankSum=0.517;SC=AATGATGTTTCATGAAGTGCC;SOR=0.596;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=130;TCF=83;TCR=47;TR=76;WE=29891168;WS=29891150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,82:0.61:135
chr10	29932841	rs2488690	C	T	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=298;ReadPosRankSum=-0.842;SC=GTGAACTTGCCAGGGGTGAGC;SOR=0.576;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=14;WE=29932849;WS=29932831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr10	29932918	rs2488689	G	A	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.205;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=304;ReadPosRankSum=-0.875;SC=GCAACATCGCGTTCCTGGACA;SOR=0.439;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=18;WE=29932926;WS=29932908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,18:0.31:58
chr10	30306804	rs2478839	G	A	4276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=76;PP=2965;SC=AGCTCCACCGGCATTTCATCA;SOR=0.953;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=58;TCR=76;TR=134;WE=30306812;WS=30306794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr10	30316072	rs3739998	C	G	7386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=121;PP=2965;ReadPosRankSum=0.857;SC=GATTTTCGGACTTTCCTGGGG;SOR=0.310;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=221;TCF=99;TCR=122;TR=220;WE=30316080;WS=30316062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,223:1.00:224
chr10	30317073	rs9337951	G	A	3255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.342;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=52;PP=2378;ReadPosRankSum=-0.634;SC=GCTTTGTAAGGTGGATGAAAC;SOR=0.529;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=256;TCF=152;TCR=104;TR=120;WE=30317081;WS=30317063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,128:0.47:273
chr10	30317949	rs2478835	C	T	9321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.099;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=145;NR=138;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.905;SC=CCTTCTCGGTCGGAGACTGCT;SOR=0.299;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=285;TCF=146;TCR=139;TR=283;WE=30317957;WS=30317939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,295:1.00:296
chr10	30611614	rs2484284	C	T	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=34;PP=1013;SC=AAATTAAACTCAAACCAAGAA;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=30611622;WS=30611604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	30615638	rs1029172	A	G	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=11;PP=331;SC=TTTGTAAAAGAATGCTCTAAA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=30615646;WS=30615628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	30626003	rs12221163	C	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.564;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=67;ReadPosRankSum=0.691;SC=AAGTACAGGTCGCATAAAAAG;SOR=0.582;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=5;WE=30626011;WS=30625993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr10	30629082	rs2689215	C	T	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=0;PP=740;SC=GTAGCTTGAACATTTTACAGG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=30629090;WS=30629072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	30637995	rs10826783	C	G	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-6.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=2;PP=580;ReadPosRankSum=1.929;SC=CCCGTGATCCCAGACTCCTCG;SOR=0.621;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=52;TCR=3;TR=32;WE=30638003;WS=30637985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr10	30653561	rs7094285	C	G	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=767;ReadPosRankSum=0.984;SC=TTGGAGAGAGCGGGGCGGGGA;SOR=0.330;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=17;WE=30653575;WS=30653551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,19:0.86:22
chr10	30653567	rs11592078	G	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.463;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=157;ReadPosRankSum=-1.282;SC=AGAGCGGGGCGGGGATCTGAG;SOR=2.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=6;WE=30653575;WS=30653551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr10	30728101	rs1042058	T	C	3309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=71;PP=2389;ReadPosRankSum=-0.193;SC=CAGTCAGATATGGAACTGTGG;SOR=0.735;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=190;TCF=85;TCR=105;TR=127;WE=30728109;WS=30728091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,133:0.68:197
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chr10	30739058	rs303428	A	G	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=326;ReadPosRankSum=0.439;SC=TGGGCAGTCCATTTTCACACA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=17;WE=30739066;WS=30739048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,17:0.85:20
chr10	30749895	rs3034	G	A	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=138;SC=CCTGTGACCCGTGAATGTGCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=30749903;WS=30749885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr10	30901756	rs9954	G	A	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.439;NF=26;NR=1;PP=522;ReadPosRankSum=0.660;SC=CTTACCAATAGTTCATTCCTT;SOR=0.459;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=81;TCF=78;TCR=3;TR=27;WE=30901764;WS=30901746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,28:0.33:84
chr10	30974174	rs4749580	T	C	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=7;PP=730;SC=TTTTCTCTTCTGTACATTTAT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=31;WE=30974182;WS=30974164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	30978106	rs2368405	G	C	220.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.00;QD=36.80;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:0,6:1.00:6
chr10	30978112	rs2887239	G	A	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.34;MQRankSum=1.611;QD=27.22;ReadPosRankSum=2.100;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr10	30978114	rs4747722	A	G	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.34;MQRankSum=1.611;QD=27.22;ReadPosRankSum=1.611;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr10	30978164	rs28363791	A	G	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.098;NF=19;NR=2;PP=333;ReadPosRankSum=-0.816;SC=TGTGTGTTCCACAGGTTTGGC;SOR=0.646;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=21;WE=30978172;WS=30978154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr10	30978274	rs4988769	T	C	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=35.267;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-7.587;NF=16;NR=29;PP=1678;ReadPosRankSum=0.801;SC=CGCCAAGGCCTCGGCCACGCC;SOR=1.308;SbPval=0.04;Source=Platypus;TC=104;TCF=57;TCR=47;TR=45;WE=30978296;WS=30978264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,44:0.43:102
chr10	30978282	rs11008182	G	T	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.734;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=9.946;NF=35;NR=19;PP=2468;ReadPosRankSum=-1.302;SC=CCTCGGCCACGCCAAGCCTGA;SOR=1.414;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=111;TCF=59;TCR=52;TR=54;WE=30978296;WS=30978264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,59:0.52:113
chr10	30978288	rs71023602	C	CAGTTT	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=22.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.15;MQRankSum=-4.814;QD=0.48;ReadPosRankSum=-0.840;SOR=4.405;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,8:0.07:113
chr10	30985070	rs11008186	G	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=127;ReadPosRankSum=-0.651;SC=CACGTAAGGAGTCCTGACTGT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=30985089;WS=30985060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr10	30985081	rs10826846	G	A	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=203;SC=TCCTGACTGTGTAATTCATCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=30985089;WS=30985060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	30986240	rs138927815	C	T	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.50;QD=43.34;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	30986242	rs11008188	A	G	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.50;QD=43.34;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	30986244	rs11007616	A	G	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.50;QD=44.81;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	30986253	rs4747726	G	A	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.54;QD=41.15;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	30986296	rs4749587	C	T	888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=7;PP=719;SC=GTGTCTGCCTCGTGTTCAGGA;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=27;WE=30986304;WS=30986286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	30986348	rs4749588	G	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQRankSum=-0.377;QD=2.17;ReadPosRankSum=2.968;SOR=1.099;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,9:0.17:53
chr10	30986364	rs7078530	G	A	1252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.315;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.065;NF=31;NR=15;PP=929;ReadPosRankSum=-1.090;SC=CAATAGTGGGGACTGCTTCCT;SOR=0.519;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=46;WE=30986372;WS=30986354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,47:0.80:59
chr10	30989188	rs10740829	G	C	7455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=174;PP=2965;SC=CCGCTTATCCGCAGGTACTAC;SOR=2.183;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=233;TCF=58;TCR=175;TR=232;WE=30989196;WS=30989178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr10	30993404	rs11008192	G	A	3369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.587;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=57;PP=2573;ReadPosRankSum=0.139;SC=TGCCCCAGACGACAGCAGGTG;SOR=0.453;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=177;TCF=95;TCR=82;TR=116;WE=30993412;WS=30993394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,124:0.66:187
chr10	30993448	rs10826848	G	A	5175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=101;PP=2965;SC=GGCTGTGGCTGTGGCCTGGTG;SOR=1.297;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=64;TCR=101;TR=164;WE=30993456;WS=30993438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr10	31001494	rs1826619	A	C	9220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=143;NR=140;PP=2965;SC=CAGGAAAAAAATCTCAAGAAG;SOR=0.741;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=283;TCF=143;TCR=140;TR=283;WE=31001502;WS=31001484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr10	31134557	rs17229657	T	C	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=586;ReadPosRankSum=-1.069;SC=GCAATTGGAATCTTTCCTCTC;SOR=0.622;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=23;WE=31134565;WS=31134547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr10	31138817	rs10160116	G	A	1744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.005;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=15;PP=1387;ReadPosRankSum=-1.351;SC=AATGGACTGGGTTTGTACAGG;SOR=0.515;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=98;TCF=77;TCR=21;TR=64;WE=31138825;WS=31138807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,64:0.65:98
chr10	31146643	rs4237394	T	C	3248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.563;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=60;PP=2567;ReadPosRankSum=-1.623;SC=AGAAAGGCTGTTGGATATTTG;SOR=0.645;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=84;TCR=96;TR=114;WE=31146651;WS=31146633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,118:0.64:183
chr10	31166088	rs10763848	G	A	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=442;ReadPosRankSum=-0.467;SC=GTTTTTTAAAGTTTGTTTTAT;SOR=2.925;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=19;WE=31166096;WS=31166078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,20:0.83:24
chr10	31803516	rs220060	G	A	1266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=11;PP=983;SC=TAAAATACCAGTTCTTTTCTT;SOR=1.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=35;WE=31803524;WS=31803506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	32103077	rs2799012	C	T	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=377;ReadPosRankSum=1.344;SC=CTGCACAGCCCTTTTGTAACA;SOR=1.220;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=16;WE=32103085;WS=32103067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr10	32106851	rs2778650	A	G	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=447;ReadPosRankSum=-0.463;SC=GAGTATGGTCAGTTTGTGCTT;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=23;WE=32106859;WS=32106841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr10	32115133	rs2255544	A	G	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=362;ReadPosRankSum=-1.259;SC=CACACTAGCTATAACTATAAG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=16;WE=32115141;WS=32115128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr10	32143208	rs2808090	A	C	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=36;PP=893;ReadPosRankSum=-0.716;SC=TCTAATAAATAAATTTTACTT;SOR=1.453;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=0;TCR=55;TR=36;WE=32143216;WS=32143198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,37:0.65:57
chr10	32306872	rs211376	G	A	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=376;ReadPosRankSum=0.190;SC=AAATGGCTCAGGGTATAAAAA;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=17;WE=32306880;WS=32306862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr10	32307534	rs11428920	T	TA	1312.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=1048;SC=TTTTATTCTGTATATTGTACT;SOR=5.353;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=24;WE=32307544;WS=32307524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	32307536	rs55938482	T	A	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=735;SC=TTATTCTGTATATTGTACTTA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=24;WE=32307544;WS=32307524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	32309005	rs1775715	A	G	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=242;ReadPosRankSum=0.400;SC=CTGTTATCCTATACCCTATGG;SOR=0.343;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=14;WE=32309013;WS=32308995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr10	32311969	rs176924	A	G	2948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=64;PP=2300;SC=AGGCTGCTGTAAGGAAAAAGT;SOR=2.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=17;TCR=64;TR=81;WE=32311977;WS=32311959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr10	32321495	rs398686	C	T	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.607;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=393;ReadPosRankSum=1.079;SC=TAAAAATTCACTTTATCCATG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=18;WE=32321503;WS=32321485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr10	32323591	rs211277	G	T	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=351;ReadPosRankSum=-0.738;SC=TTAACAAACTGAAGATGACAA;SOR=0.582;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=18;WE=32323599;WS=32323581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr10	32327779	rs45615333	C	G	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=783;ReadPosRankSum=0.019;SC=TAAAAAAACACCGATCAACTA;SOR=0.846;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=53;TCF=22;TCR=31;TR=33;WE=32327787;WS=32327769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,33:0.61:54
chr10	32328389	rs41289023	A	C	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.300;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=662;ReadPosRankSum=-0.935;SC=AGACTTCTTAAATAAATTATA;SOR=1.675;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=29;WE=32328397;WS=32328379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,31:0.70:44
chr10	32337283	rs887492	A	C	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=171;ReadPosRankSum=-0.253;SC=TCTGCAATTAACTTAGAAGAA;SOR=0.622;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=10;WE=32337291;WS=32337273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr10	32575793	rs2986931	A	G	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.759;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.487;NF=27;NR=12;PP=656;ReadPosRankSum=1.228;SC=AATCCAAATTATTTAATTTTG;SOR=1.097;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=120;TCF=77;TCR=43;TR=39;WE=32575801;WS=32575783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,38:0.32:120
chr10	32667234	rs11443059	G	GA	321.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=246;ReadPosRankSum=-1.066;SC=CTTTAACAATGAAAAAAAAAA;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=14;WE=32667242;WS=32667228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr10	32742234	rs2505335	A	G	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=459;SC=ATTTTAAACTATTAAAGTATC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=32742242;WS=32742224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	32742256	rs2490505	T	G	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=1;PP=458;SC=AATTGGCTTTTATTTTTTTTT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=32742264;WS=32742246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	32745396	rs2244153	A	G	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=233;SC=GCATTGGAAAACATTATTTAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=32745404;WS=32745386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	32751901	rs2505380	G	A	3104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=47;PP=2441;SC=TGCAATTTAAGTAGTCACTAT;SOR=0.714;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=47;TCR=47;TR=94;WE=32751909;WS=32751891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr10	32759918	rs2460710	G	A	275.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=268;SC=TAATAAAGGAGATAATGAAAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=32759926;WS=32759911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	32974969	rs1762526	A	G	1971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=40;PP=1539;SC=CAAATTACAAATAAAGAAACA;SOR=1.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=57;WE=32974977;WS=32974959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	32978136	rs1763784	G	A	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=18;PP=485;SC=TTAAAAGTAAGTTCATCCGAA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=32978144;WS=32978126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	33014357	rs191531228	T	C	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.905;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=35;PP=901;ReadPosRankSum=0.615;SC=TTAGTACTTGTTTTTTTGTTC;SOR=2.916;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=61;TCF=14;TCR=47;TR=41;WE=33014365;WS=33014347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,44:0.70:63
chr10	33015782	rs928701	G	A	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=23;PP=774;SC=AATTATAGATGACTTTAAATT;SOR=1.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=33;WE=33015790;WS=33015772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	33015855	rs4145863	G	A	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=426;SC=ATTTTAGCATGTATTTTATGG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=33015863;WS=33015845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	33018351	rs1414548	G	C	163.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=3;PP=119;SC=AATCTCAAACGAAGAAACTTC;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=33018359;WS=33018341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	33093858	rs35054696	TAC	T	823.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=13;NR=6;PP=807;SC=ATTAATTTAATACACACACAC;SOR=2.494;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=19;WE=33093869;WS=33093848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	33123774	rs11009107	T	C	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=8;PP=840;SC=AAGGTGTTAATGGAAAAGATA;SOR=2.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=37;WE=33123782;WS=33123764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	33123824	rs4448627	G	C	2128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=28;PP=1582;SC=AAGAGTCATGGAGGTAAGAAC;SOR=0.949;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=35;TCR=28;TR=63;WE=33123832;WS=33123814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	33134718	.	C	CAG	236.92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.81;MQRankSum=0.589;QD=26.32;ReadPosRankSum=1.593;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr10	33137515	rs2488294	T	G	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.46;ReadPosRankSum=-0.710;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,39:0.95:41
chr10	33137551	rs2504011	T	C	1394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=16;PP=998;ReadPosRankSum=-1.156;SC=AACAAAGATATGTCCGTACAA;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=32;TCR=17;TR=47;WE=33137559;WS=33137541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,49:0.96:51
chr10	33143396	rs1418538	G	A	1041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=13;PP=810;SC=GACCAATACAGTTGGAAAACC;SOR=0.957;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=17;TCR=13;TR=30;WE=33143404;WS=33143386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	33144132	rs34544892	GT	G	641.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.408;NF=28;NR=2;PP=364;ReadPosRankSum=-0.885;SC=AAAAATGTAAGTTTTTTTTTT;SOR=2.038;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=30;WE=33144140;WS=33144121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,32:0.91:35
chr10	33165226	rs2488305	G	A	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=561;SC=TATATCAACTGGAGTAAAATT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=33165234;WS=33165216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	33190567	rs2153875	C	A	1615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=16;PP=1215;SC=TTTCACCCTACAACAAAAAAA;SOR=1.835;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=53;WE=33190578;WS=33190557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr10	33201128	rs2504020	C	G	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=42;PP=1307;SC=CAAACAGGAACAGCTCTAGTC;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=42;WE=33201136;WS=33201118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	33209030	rs45580338	G	A	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.268;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=199;ReadPosRankSum=-0.205;SC=GGAAAAAAAAGATTAACAACC;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=11;WE=33209038;WS=33209020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr10	33209266	rs2230396	G	T	3582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=58;PP=2901;SC=TTATTGTTACGCCTTCTGACA;SOR=0.766;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=54;TCR=58;TR=112;WE=33209274;WS=33209256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr10	33211440	rs2252752	T	C	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=10;PP=804;SC=TAAAAATTAATATAAACCACT;SOR=1.382;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=27;WE=33211448;WS=33211430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	33219008	rs2256455	T	G	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=27;PP=773;SC=TAAATGAAAATTGTAATGGTC;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=33219016;WS=33218998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	33471761	.	G	GCA	120.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=179;ReadPosRankSum=2.042;SC=TTAGGTACATGCACACACACA;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=5;WE=33471769;WS=33471751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr10	33475282	rs2228638	C	T	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.554;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=737;ReadPosRankSum=-0.256;SC=AGTGTGCCGACGTGGGACCCA;SOR=0.919;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=114;TCF=63;TCR=51;TR=41;WE=33475290;WS=33475272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,41:0.34:120
chr10	33481478	rs2243920	A	G	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=299;ReadPosRankSum=1.284;SC=TGAAAATTCCAGGAAAGCCAG;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=14;WE=33481486;WS=33481468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr10	33486667	rs10827208	A	G	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=2.489;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.58;ReadPosRankSum=-1.131;SOR=1.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,10:0.24:41
chr10	33491552	rs11009288	G	A	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=180;ReadPosRankSum=0.780;SC=TTAGCCATGGGGAAATTCTTA;SOR=0.152;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=13;WE=33491560;WS=33491542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,14:0.28:50
chr10	33495267	rs11812166	C	T	2665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=38;PP=2066;ReadPosRankSum=-0.461;SC=CATTCTTGGTCTGTGTTGATA;SOR=0.476;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=44;TCR=39;TR=80;WE=33495275;WS=33495257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,87:0.97:90
chr10	33495304	rs11815912	A	G	2868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=2.847;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=41.58;ReadPosRankSum=-0.072;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,67:0.97:69
chr10	33495304	.	ACA	GCG	1712	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=35;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=16;NR=41;PP=1712;QD=30.9731206116;SC=GGGGTTTGGGACATGACTACA;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=17;TCR=43;TR=57;WE=33495314;WS=33495294;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,57:0.95:60
chr10	33495306	rs2474715	A	G	2868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=2.742;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=42.82;ReadPosRankSum=-0.055;SOR=1.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,65:0.97:67
chr10	33495333	rs11812181	C	A	1909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=55;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=40;PP=1474;ReadPosRankSum=-0.488;SC=AACAACCACACGGTGAAGAAT;SOR=1.121;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=11;TCR=41;TR=51;WE=33495341;WS=33495323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr10	33502240	rs2070303	C	T	2433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=40;PP=2026;ReadPosRankSum=-0.448;SC=AGCCCTTCCTCGGGAGAATGC;SOR=0.684;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=81;TCR=64;TR=90;WE=33502248;WS=33502230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,88:0.61:144
chr10	33510614	rs4934837	G	A	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=2;PP=1771;ReadPosRankSum=-1.435;SC=TCTTCGACTTGGAAGATTCAG;SOR=4.834;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=63;TCF=61;TCR=2;TR=62;WE=33510622;WS=33510604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,68:0.99:69
chr10	33510663	rs2229935	G	A	3871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=27;PP=2965;SC=TCTTGCAACCGTATACTTCAA;SOR=2.080;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=87;TCR=27;TR=114;WE=33510671;WS=33510653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr10	33510768	rs2229934	G	A	4648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=86;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.856;SC=CAACATCTGTGGGGTTGGTGT;SOR=0.380;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=63;TCR=87;TR=149;WE=33510776;WS=33510758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,149:0.99:150
chr10	33542835	rs7074620	T	C	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=108;SC=TTATACCTGATGGCCGTGAAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=33542843;WS=33542825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	33545464	rs10827221	G	C	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=378;ReadPosRankSum=0.476;SC=GCAAGAATTAGCATTTACAAA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=15;WE=33545472;WS=33545454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr10	33552407	rs2070299	G	A	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=139;ReadPosRankSum=-0.393;SC=AGGTCTTCTTGAGCTCAAATA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=33552415;WS=33552397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr10	33552518	rs2070298	A	C	1373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=2.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.10;ReadPosRankSum=-0.332;SOR=0.327;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,35:0.61:57
chr10	33552522	rs2070297	G	A	1437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=2.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.37;ReadPosRankSum=-0.981;SOR=0.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,37:0.63:59
chr10	33552696	rs7079053	A	G	4362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=64;PP=2965;SC=CATCTTTGGCACAAAGACAAT;SOR=0.959;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=85;TCR=64;TR=149;WE=33552704;WS=33552686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr10	33619562	rs1411924	C	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=90;ReadPosRankSum=0.669;SC=TTGTACACACCGACTTCCCCC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=6;WE=33619570;WS=33619552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr10	33623443	rs35320960	G	A	2181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.780;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=55;PP=1679;ReadPosRankSum=-0.009;SC=GCCCGTCTTGGAGAAAAGAAA;SOR=0.398;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=122;TCF=38;TCR=84;TR=83;WE=33623451;WS=33623433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,85:0.67:126
chr10	34400068	rs150058603	G	A	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.454;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=153;ReadPosRankSum=-0.691;SC=CTTTTATTGCGCGACATGAAG;SOR=0.110;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=12;WE=34400076;WS=34400058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr10	34420607	rs970166	G	A	1617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=43;PP=1364;SC=GTGAAATGACGCCATTTAAGA;SOR=4.534;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=47;WE=34420615;WS=34420597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr10	34619946	rs10740885	A	C	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=414;ReadPosRankSum=1.935;SC=CTCAGAGATTACCCTGAAGAA;SOR=0.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=55;TCR=0;TR=21;WE=34619954;WS=34619936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,21:0.36:59
chr10	34620220	rs3781128	C	T	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.453;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=30;PP=729;ReadPosRankSum=-1.011;SC=GACTCTCCAACGAGCTTGACT;SOR=1.065;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=126;TCF=49;TCR=77;TR=45;WE=34620228;WS=34620210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,45:0.34:132
chr10	34636820	rs7077783	C	T	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.579;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=350;ReadPosRankSum=0.726;SC=ATTAATATTACACCAATAACC;SOR=1.048;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=14;WE=34636828;WS=34636810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,15:0.34:44
chr10	34663981	.	A	AACACAC	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQRankSum=-1.287;QD=2.99;ReadPosRankSum=-0.049;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr10	34666864	rs10740890	C	T	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=204;ReadPosRankSum=-0.150;SC=TTTCAAGAATCAGGGAACATC;SOR=0.850;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=61;TCF=31;TCR=30;TR=16;WE=34666872;WS=34666854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,16:0.24:66
chr10	34688287	rs2796011	G	A	3497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=69;PP=2794;SC=AAGGCACTACGTGGATTCCCA;SOR=1.322;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=42;TCR=69;TR=111;WE=34688295;WS=34688277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr10	34985197	rs5784425	C	CA	1846.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.584;HP=12;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.938;NF=56;NR=30;PP=977;ReadPosRankSum=1.089;SC=CCCTAGTCCTCAAAAAAAAAA;SOR=1.108;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=181;TCF=113;TCR=68;TR=86;WE=34985205;WS=34985187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,98:0.59:167
chr10	35314131	rs199618380	A	G	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=5.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=0.873;QD=4.85;ReadPosRankSum=2.500;SOR=0.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr10	35324076	rs2244174	A	G	1696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=2;PP=1316;SC=GGAGGAAAACATTGCAGTTTC;SOR=5.353;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=54;TCR=2;TR=56;WE=35324084;WS=35324066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr10	35625845	rs59114674	C	G	945.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=0;PP=375;SC=GGCCGGCCGCCGTTCCGCCCC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=19;WE=35625854;WS=35625837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	35625846	.	G	GC	936.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.0;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=0;PP=902;SC=GCCGGCCGCCGTTCCGCCCCC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=35625854;WS=35625837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	35772402	rs3802509	G	A	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=3.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.338;SOR=1.143;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,23:0.22:103
chr10	35894666	rs627267	A	G	1485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=40;PP=1261;SC=TCAGTGTGCAAGCACCAAGCT;SOR=3.865;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=46;WE=35894674;WS=35894656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	35894761	rs637881	G	A	203.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=164;SC=GAATGGTTCCGCGGTTCCTCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=35894769;WS=35894751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	35928224	rs625858	C	G	621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=7;PP=489;SC=CTGCACTTGGCTCTCCTCGCC;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=20;WE=35928232;WS=35928214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	35930412	rs142623421	C	CG	106.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQRankSum=-0.366;QD=15.27;ReadPosRankSum=-1.981;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr10	36811731	.	C	G	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.806;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.283;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.565;NF=20;NR=0;PP=357;ReadPosRankSum=-1.385;SC=CAACACACACCCAGTCATAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=20;WE=36811739;WS=36811721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr10	36812362	rs2503084	C	T	7829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.714;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=1.295;NF=120;NR=120;PP=2965;ReadPosRankSum=0.881;SC=TTTTCTCACACGCATTATAAA;SOR=0.149;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=253;TCF=123;TCR=130;TR=240;WE=36812370;WS=36812352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,245:0.98:251
chr10	36813180	rs2503083	T	A	3023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=48;PP=1692;SC=GCCAGGGGCGTGCGCGCCGGG;SOR=2.147;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=18;TCR=49;TR=66;WE=36813188;WS=36813170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr10	36813198	rs2503082	A	G	2761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=43;PP=1406;SC=GGGCTGGCCCAGCAGGGAAAG;SOR=2.722;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=11;TCR=43;TR=54;WE=36813206;WS=36813188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr10	36813218	rs2505569	C	G	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=39;PP=1101;SC=GCCCCGCTCACTCTCCACTGC;SOR=4.664;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=42;WE=36813226;WS=36813208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	36813298	rs10764092	G	A	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.572;NF=0;NR=12;PP=239;ReadPosRankSum=0.885;SC=GGAAGGGCATGCGCTCGCCGG;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=12;WE=36813306;WS=36813288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr10	37425759	.	GTA	G	95	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=28;MQ=59.73;NF=0;NR=6;PP=95;QD=16.8333333333;SC=GTGTGTGTGTGTATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=6;WE=37425768;WS=37425749;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,6:0.32:19
chr10	37433853	.	T	C	195	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=62;MMLQ=28;MQ=50.8;NF=11;NR=0;PP=195;QD=20.8882920497;SC=TGAAAATAGATTTGTATATGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=11;WE=37433861;WS=37433843;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,11:0.39:28
chr10	37434003	rs202194104	G	GTTA	42.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=2.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQRankSum=-6.812;QD=0.89;ReadPosRankSum=-1.322;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,5:0.10:48
chr10	37434025	rs201385549	A	G	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQRankSum=-6.493;QD=3.27;ReadPosRankSum=1.188;SOR=0.057;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,8:0.18:44
chr10	37434048	rs72787523	G	A	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-6.226;NF=0;NR=12;PP=179;ReadPosRankSum=1.520;SC=AAAATATAAAGTCAGAGGCTT;SOR=0.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=12;WE=37434056;WS=37434038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,10:0.24:41
chr10	37434077	rs115413281	A	C	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.99;MQRankSum=-4.750;QD=9.83;ReadPosRankSum=0.934;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr10	37434082	rs201494283	C	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.00;MQRankSum=-4.436;QD=10.03;ReadPosRankSum=1.060;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr10	37434091	rs199688969	G	C	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.66;MQRankSum=-3.481;QD=10.84;ReadPosRankSum=0.590;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr10	37441072	rs1148257	T	G	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=1.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.672;QD=6.56;ReadPosRankSum=-0.079;SOR=0.537;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,49:0.30:162
chr10	37488689	rs1209750	G	C	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.408;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.369;NF=26;NR=19;PP=621;ReadPosRankSum=-0.097;SC=AACAAAAGAAGGTTGAAGAAA;SOR=0.884;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=134;TCF=73;TCR=61;TR=45;WE=37488697;WS=37488679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,49:0.35:140
chr10	37505141	rs1200876	G	A	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=170;ReadPosRankSum=-0.449;SC=CTTGGATACAGTTCATTCTTG;SOR=0.511;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=14;WE=37505149;WS=37505131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,16:0.27:60
chr10	37505192	rs1200875	C	T	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=1.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.56;ReadPosRankSum=0.747;SOR=0.959;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,17:0.21:80
chr10	37508450	rs1148259	A	C	2671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.049;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=57;PP=1935;ReadPosRankSum=0.529;SC=TCAATTATGCAGGAGATGCTC;SOR=0.841;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=160;TCF=75;TCR=85;TR=105;WE=37508458;WS=37508440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,109:0.66:166
chr10	38245870	.	A	G	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.522;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.374;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.306;NF=29;NR=20;PP=1161;ReadPosRankSum=2.047;SC=AAAGTGAGAGATTGCCGAAAA;SOR=0.158;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=73;TCF=49;TCR=24;TR=49;WE=38245878;WS=38245860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,48:0.67:72
chr10	38246545	rs2799499	A	G	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=303;SC=AGACATGTGAACTAGCTCTTA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=38246553;WS=38246535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	38260558	rs4007126	AACAC	A	786.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.323;NF=13;NR=1;PP=646;ReadPosRankSum=-0.687;SC=AAACTCATTAAACACACACAC;SOR=1.609;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=14;WE=38260571;WS=38260548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,26:0.72:36
chr10	38299843	rs2293962	G	T	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=487;ReadPosRankSum=-0.462;SC=GGACGGCGGGGCTGCAGCGTG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=21;WE=38299851;WS=38299833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr10	38306128	rs2738208	A	G	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=2;PP=851;SC=TTCCACTGGCAACTCGAAGCA;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=36;WE=38306136;WS=38306118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	38344700	rs2505232	C	G	5270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.861;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-6.171;NF=105;NR=76;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.576;SC=ACACACAGGGCAGAAACCCTT;SOR=0.492;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=256;TCF=153;TCR=103;TR=181;WE=38344708;WS=38344690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,183:0.70:261
chr10	38385316	rs2474572	A	G	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=391;ReadPosRankSum=1.395;SC=TACAGCATAAATTGTTTTTAA;SOR=0.643;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=17;WE=38385324;WS=38385306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr10	38385441	rs2474573	G	A	2726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.791;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=36;PP=2095;ReadPosRankSum=-1.953;SC=ATGTTTTGCCGGCTGCGAAGT;SOR=0.932;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=165;TCF=102;TCR=63;TR=98;WE=38385449;WS=38385431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,102:0.59:172
chr10	38404112	rs146660315	C	T	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=99;ReadPosRankSum=-0.106;SC=TAATACAATTCTCATTCACAG;SOR=0.358;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=7;WE=38404120;WS=38404102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr10	38407519	rs176889	A	G	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.033;NF=13;NR=14;PP=566;ReadPosRankSum=0.511;SC=GTCAGAAGTCAGCCCTAATTG;SOR=0.765;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=35;TCF=17;TCR=18;TR=27;WE=38407527;WS=38407509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr10	38537070	rs1780145	A	G	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.455;NF=1;NR=17;PP=363;ReadPosRankSum=-0.819;SC=AAGAGAATATATAAACACACA;SOR=0.392;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=18;WE=38537078;WS=38537060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr10	38599101	rs34686283	C	CT	533.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=4.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.33;MQRankSum=-2.663;QD=14.43;ReadPosRankSum=-0.015;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr10	38638905	rs200810091	G	A	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=19.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.40;MQRankSum=0.186;QD=11.23;ReadPosRankSum=-0.233;SOR=4.464;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
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chr10	38650104	rs2804643	A	G	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.50;MQRankSum=1.253;QD=21.21;ReadPosRankSum=1.205;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
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chr10	38740353	rs2754385	T	C	125.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.180;NF=3;NR=3;PP=73;ReadPosRankSum=-1.068;SC=GTCCCGAAGTTGGCCTCTCCA;SOR=0.223;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=6;WE=38740361;WS=38740343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr10	38740382	rs2754386	T	C	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.78;MQRankSum=-0.319;NF=2;NR=4;PP=62;ReadPosRankSum=0.992;SC=TCCGGCCTCCTGGCGGCCTTT;SOR=1.061;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=6;WE=38740390;WS=38740372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr10	42379778	rs200478260	T	C	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=31.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr10	42379782	rs62642391	C	T	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=31.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr10	42379801	rs111137627	C	G	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=31.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr10	42905431	rs3004228	A	T	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=14;NR=4;PP=475;SC=TTTCTTCTTTAGAAAATACCA;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=42905439;WS=42905421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	42905510	rs2419684	A	C	1466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=16;PP=1157;SC=TCAGATGTTAAATTACTCCTC;SOR=1.659;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=48;WE=42905518;WS=42905500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr10	42907201	rs2505860	G	A	1718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.375;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=46;PP=1205;ReadPosRankSum=0.009;SC=AATACAGGCCGTTGTTGTGTG;SOR=0.877;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=225;TCF=97;TCR=128;TR=74;WE=42907209;WS=42907191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,79:0.34:233
chr10	42907260	rs2505861	T	C	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.660;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=38;PP=553;ReadPosRankSum=0.614;SC=CTGTTAGTAATGCTGTTATTA;SOR=0.770;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=158;TCF=43;TCR=115;TR=50;WE=42907268;WS=42907250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,57:0.34:167
chr10	42920832	rs2505872	G	A	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=1.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.88;ReadPosRankSum=-0.394;SOR=0.522;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,18:0.26:68
chr10	42920884	rs2489720	C	T	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.34;ReadPosRankSum=0.156;SOR=0.801;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,11:0.21:53
chr10	42922568	rs2489723	A	G	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=613;ReadPosRankSum=-0.488;SC=CAGTGAGCCAAGATGGCAGCA;SOR=0.236;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=13;WE=42922587;WS=42922558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr10	42922579	rs80120306	C	T	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.586;NF=14;NR=0;PP=613;ReadPosRankSum=0.551;SC=GATGGCAGCACTGCACTCCAG;SOR=0.212;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=14;WE=42922587;WS=42922558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,16:0.32:50
chr10	42922595	rs2489725	A	G	2331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=0;PP=1676;SC=TCCAGCCTGGACAGCAAGATT;SOR=8.287;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=59;TCR=0;TR=59;WE=42922603;WS=42922585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	42922641	.	G	A	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.202;ClippingRankSum=0.000;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=88.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQRankSum=-6.304;QD=6.24;ReadPosRankSum=-6.399;SOR=7.111;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,34:0.39:88
chr10	42922642	.	T	A	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=57.797;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQRankSum=-6.306;QD=7.52;ReadPosRankSum=-6.029;SOR=5.993;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,19:0.26:73
chr10	42922643	.	G	A	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.091;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=30.448;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQRankSum=-6.607;QD=8.18;ReadPosRankSum=-4.615;SOR=4.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,10:0.15:67
chr10	42924560	rs6143878	TCACCTTTGCTTGATATGATAATATAGTGCCAAGG	T	463.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=3.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-2.426;QD=3.24;ReadPosRankSum=-0.178;SOR=1.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,21:0.15:143
chr10	42926170	rs66977053	TGG	T	615.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.698;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.307;NF=4;NR=12;PP=550;ReadPosRankSum=1.195;SC=GTGATTGAGTTGGGGTGAAAA;SOR=0.257;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=16;WE=42926179;WS=42926160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr10	42928605	rs2000380	T	G	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-5.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.096;NF=25;NR=1;PP=433;ReadPosRankSum=-1.153;SC=TATAGTTGACTCCAATTTCTT;SOR=0.324;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=26;WE=42928613;WS=42928595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr10	42928668	rs67090148	GGAGTCTATC	G	1842.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.288;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.496;NF=30;NR=8;PP=2938;ReadPosRankSum=0.043;SC=TTTGAATGAAGGAGTCTATCC;SOR=1.096;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=85;TCF=64;TCR=21;TR=38;WE=42928684;WS=42928658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,50:0.48:105
chr10	42928842	rs4570532	A	T	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=-7.578;QD=0.40;ReadPosRankSum=-0.887;SOR=0.515;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,7:0.08:84
chr10	42928845	.	C	T	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQRankSum=-7.386;QD=0.46;ReadPosRankSum=-1.545;SOR=0.498;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,7:0.09:80
chr10	42928851	.	CA	C	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=2.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQRankSum=-8.334;QD=0.77;ReadPosRankSum=-1.798;SOR=1.102;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,5:0.07:71
chr10	42941685	.	T	TA	65	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2;NR=2;PP=65;QD=22.5;SC=TCACTTCTGATAAAAATACCA;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=4;WE=42941693;WS=42941675;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,4:0.19:21
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chr10	42949789	.	A	G	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.446;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQRankSum=-8.214;QD=1.62;ReadPosRankSum=0.342;SOR=0.317;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,6:0.09:69
chr10	42949797	.	C	T	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQRankSum=-8.091;QD=0.50;ReadPosRankSum=-0.698;SOR=0.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,6:0.09:67
chr10	43075288	rs7921658	T	C	2331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.699;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=28;PP=1789;ReadPosRankSum=-0.358;SC=AAATCGGCAGTCTGGAGTCTA;SOR=0.820;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=131;TCF=85;TCR=46;TR=82;WE=43075296;WS=43075278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,86:0.64:134
chr10	43078525	rs41301639	A	G	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.505;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.700;NF=7;NR=17;PP=415;ReadPosRankSum=-0.880;SC=CAGCACTGCAAGGGTTTAATC;SOR=0.132;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=24;WE=43078533;WS=43078522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr10	43089156	rs7904627	C	T	3200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.723;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.260;NF=76;NR=49;PP=2725;ReadPosRankSum=-0.638;SC=ATGCATTACACTGATAGGGTT;SOR=0.269;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=205;TCF=132;TCR=73;TR=125;WE=43089164;WS=43089146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,117:0.59:198
chr10	43089965	rs210280	G	A	1469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=18;PP=1173;SC=CTCATTCCACGTGAGTCATAC;SOR=1.203;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=27;TCR=18;TR=45;WE=43089973;WS=43089955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	43119123	rs158377	G	T	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.398;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=251;ReadPosRankSum=-1.014;SC=CTGTTGGGAGGGGGGAATGAG;SOR=0.333;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=78;TCF=34;TCR=44;TR=23;WE=43119131;WS=43119113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,24:0.30:79
chr10	43119159	rs158378	T	C	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=4.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.770;SOR=0.233;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,16:0.23:71
chr10	43128395	rs209391	C	G	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=31;PP=888;SC=AAATGGCCTGCTGCTGTCTTG;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=43128403;WS=43128385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	43132232	rs209387	A	G	1675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=1;PP=1407;SC=ACAGAGATGGAGACACTGCGC;SOR=6.358;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=47;WE=43132240;WS=43132222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr10	43230152	rs189650347	A	G	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=228;ReadPosRankSum=0.365;SC=TCCCCCTGCAACAGCATGAAC;SOR=3.014;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=10;WE=43230160;WS=43230142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr10	43232419	rs618687	A	G	4067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.924;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-1.281;NF=102;NR=19;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.853;SC=ACATGGAGGAAGATGAGAGTT;SOR=3.325;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=122;TCF=102;TCR=20;TR=121;WE=43232427;WS=43232409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,123:0.99:124
chr10	43280057	rs55869085	CTT	C	5610.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=90;PP=2979;SC=TCCATTGATTCTTTTTTTAAA;SOR=1.626;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=34;TCR=106;TR=118;WE=43280066;WS=43280047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr10	43281089	rs7074877	T	C	4497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.120;NF=60;NR=91;PP=2965;ReadPosRankSum=1.414;SC=AGAAGTTGACTGAGATCAGAG;SOR=0.417;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=60;TCR=92;TR=151;WE=43281097;WS=43281079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,159:0.99:160
chr10	43287319	rs149863147	TA	T	309.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.377;NF=0;NR=9;PP=356;ReadPosRankSum=-1.802;SC=CCGATTTGAATAGGGGGGATA;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=9;WE=43287327;WS=43287309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr10	43326227	rs144257025	G	A	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=375;SC=CATTTGGATCGTGGGTTGCCT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=43326235;WS=43326217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	43572832	rs12267460	G	A	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.413;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=481;ReadPosRankSum=2.295;SC=AGTTGGCGCCGAGCAGCGGAG;SOR=1.893;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=21;WE=43572840;WS=43572822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr10	43572932	.	T	TGCGGCGG	111	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.9186;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=16;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=111;QD=66.5;SC=GCGCAGTGGCTGCGGCGGGCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=2;WE=43572940;WS=43572922;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr10	43572950	rs12246855	A	G	107.28	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	43572950	.	AA	GC	146	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=146;QD=49.8669687156;SC=GCGGCGGGCGAAGGGCAGGAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=43572959;WS=43572940;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	43572951	rs12246856	A	C	107.28	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	43595968	rs1800858	A	G	2660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=45;PP=2146;SC=TGGACCAGGCAGCCGGCACGC;SOR=0.809;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=41;TCR=45;TR=86;WE=43595976;WS=43595958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr10	43596179	rs2435351	G	A	963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=30;PP=714;ReadPosRankSum=-0.257;SC=CAGTAAGGGAGCCGCCCCAAC;SOR=1.189;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=32;WE=43596187;WS=43596169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,35:0.70:50
chr10	43600689	rs2435352	A	G	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=39;PP=1245;ReadPosRankSum=-1.520;SC=GTCTCCGGCCACAGTTCGTTT;SOR=0.856;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=76;TCF=29;TCR=47;TR=62;WE=43600697;WS=43600679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,63:0.79:80
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chr10	43604390	rs1864404	A	T	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=1;PP=990;ReadPosRankSum=-0.822;SC=CACCAGTGTGAGTGCAGGGCT;SOR=4.514;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=36;WE=43604398;WS=43604380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
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chr10	43608522	rs3026757	G	C	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.610;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=291;ReadPosRankSum=0.852;SC=TATGCATCAAGCTGAGCCTCC;SOR=1.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=3;TCR=53;TR=16;WE=43608530;WS=43608512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,17:0.29:58
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chr10	43613843	rs1800861	G	T	2211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=27;PP=1783;SC=CGAGTGAGCTGCGAGACCTGC;SOR=1.098;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=40;TCR=27;TR=67;WE=43613851;WS=43613833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	43615633	rs1800863	C	G	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=221;ReadPosRankSum=-1.357;SC=AAGAGGATTCCTACGTGAAGA;SOR=0.418;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=12;WE=43615641;WS=43615623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr10	43620551	rs2742236	G	A	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.722;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=99;ReadPosRankSum=-0.723;SC=GGATTGTGCAGAGAGAGAGAG;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=43620559;WS=43620541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr10	43622217	rs2075912	T	C	8481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.970;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=145;PP=2965;ReadPosRankSum=0.708;SC=GCTGTCCCCTTTGCACTATCC;SOR=0.157;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=264;TCF=117;TCR=147;TR=262;WE=43622225;WS=43622207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,271:0.99:273
chr10	43657811	rs2257767	T	G	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=471;SC=ATGGCCAGGTTGGGTGGGGGT;SOR=5.892;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=43657819;WS=43657801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	43659536	rs2503865	C	T	3020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=74;PP=2572;ReadPosRankSum=-0.884;SC=GAATTTAGAACGTTGTCAGCA;SOR=1.569;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=19;TCR=75;TR=93;WE=43659544;WS=43659526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,96:0.99:97
chr10	43671378	rs61579799	GT	G	724.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.772;HP=14;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.348;NF=20;NR=8;PP=386;ReadPosRankSum=0.919;SC=ATTGTTTTCTGTTTTTTTTTT;SOR=2.151;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=28;WE=43671387;WS=43671368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,33:0.97:34
chr10	43694363	rs35825252	C	CA	505.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.992;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=552;ReadPosRankSum=0.373;SC=GCAGCTGTGACGGGGCTCAGG;SOR=1.460;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=13;WE=43694371;WS=43694353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr10	43695049	rs1254964	T	C	2189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.738;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=35;PP=1691;ReadPosRankSum=-1.200;SC=CATCATCTAATTCCTGGGGCA;SOR=0.783;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=112;TCF=61;TCR=51;TR=77;WE=43695057;WS=43695039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,82:0.69:118
chr10	43698980	rs1254961	C	G	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=242;ReadPosRankSum=1.480;SC=CCGCCGGTCCCGAGGCCATGC;SOR=0.307;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=13;WE=43698988;WS=43698970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr10	43932479	rs2244396	A	G	555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=12;PP=442;SC=GGGAGCAGCAAGGCTTCCGGA;SOR=1.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=43932487;WS=43932469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	43978087	rs3750890	A	G	4963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=83;PP=2965;SC=TACATCAGAGAATACATACTG;SOR=0.988;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=63;TCR=84;TR=146;WE=43978095;WS=43978077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr10	43991255	rs9422519	C	T	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=354;SC=AGATTTTTTTCCCACAAATCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=43991263;WS=43991245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	44052903	rs2230661	A	C	2280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.632;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=34;PP=1862;ReadPosRankSum=-0.268;SC=CACTGACTACATTCGTATTGT;SOR=0.909;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=112;TCF=62;TCR=50;TR=77;WE=44052911;WS=44052893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,78:0.68:114
chr10	44053013	rs2230660	G	C	3256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=36;PP=2532;ReadPosRankSum=-0.765;SC=CTCTGTATGAGCTCTCTGCTG;SOR=0.665;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=174;TCF=123;TCR=51;TR=117;WE=44053021;WS=44053003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,119:0.67:177
chr10	44053585	rs2999278	C	T	1623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=42;PP=1398;ReadPosRankSum=-0.117;SC=GTGTTTTCTGCTGAAGATTCT;SOR=0.634;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=20;TCR=59;TR=56;WE=44053593;WS=44053575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,57:0.70:82
chr10	44103923	rs3128239	G	C	1318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=7;PP=1184;SC=CACATCCCCTGAGCCCTCAGC;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=44103931;WS=44103913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	44104513	rs7342073	C	A	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=124;ReadPosRankSum=1.211;SC=TGCCCCCTCCCTTTGCTTTAC;SOR=0.850;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=9;WE=44104521;WS=44104503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr10	44111806	rs10899839	G	A	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.67;ReadPosRankSum=-0.417;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,42:0.27:157
chr10	44112245	rs12354886	G	A	1410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.687;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=980;ReadPosRankSum=-0.565;SC=GAAAGCCTTCGCTCAGAATGC;SOR=0.914;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=172;TCF=89;TCR=83;TR=56;WE=44112253;WS=44112235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,63:0.34:188
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chr10	44341072	rs10535963	CATTGATT	C	4538.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.292;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.534;NF=12;NR=77;PP=2962;ReadPosRankSum=1.560;SC=TTATCGGTCTCATTGATTATT;SOR=1.044;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=160;TCF=23;TCR=137;TR=89;WE=44341086;WS=44341062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,115:0.64:181
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chr10	44880260	rs72790862	T	C	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=91;ReadPosRankSum=1.732;SC=AGCGCCCAGCTAAGCGAGCTG;SOR=1.609;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=5;WE=44880268;WS=44880250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
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chr10	45427548	rs12414447	G	T	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=26;PP=716;ReadPosRankSum=-0.719;SC=CCCCTCCATTGTCCACCCCAG;SOR=1.501;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=30;WE=45427556;WS=45427538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,31:0.84:37
chr10	45466726	rs4948938	G	A	602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=1;PP=480;SC=TACTCACAGGGCCATCACCTT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=45466734;WS=45466723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	45480230	rs138837221	C	G	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.064;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=4;PP=1004;ReadPosRankSum=-0.902;SC=CATCACCCACCCTGCCATTCT;SOR=2.285;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=106;TCF=92;TCR=14;TR=57;WE=45480238;WS=45480220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,57:0.54:106
chr10	45496120	rs12269028	A	T	5425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=82;NR=87;PP=2965;SC=AAATCTCAAAATTTGTGGAAA;SOR=0.741;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=170;TCF=83;TCR=87;TR=169;WE=45496128;WS=45496110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr10	45891484	rs2029253	A	G	1625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.484;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=50;PP=1347;ReadPosRankSum=1.106;SC=ATGGCCTGTCACTGCTGGAAA;SOR=0.478;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=85;TCF=7;TCR=78;TR=55;WE=45891492;WS=45891474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,58:0.66:88
chr10	45924023	rs1565096	G	A	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.410;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=137;ReadPosRankSum=-0.961;SC=TTTTTGGTCCGTCTGCTGAGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=8;WE=45924031;WS=45924013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr10	45935744	rs3780914	C	T	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=228;ReadPosRankSum=-0.526;SC=TTACCCCCTCCAGGCTCTTCT;SOR=0.770;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=12;WE=45935752;WS=45935734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr10	45939136	rs7900977	T	C	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=331;ReadPosRankSum=0.042;SC=CCTGGGGTCCTCAGGGACTGG;SOR=0.582;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=76;TCF=55;TCR=21;TR=22;WE=45939144;WS=45939126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,22:0.29:76
chr10	46135971	rs12354709	C	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=117;ReadPosRankSum=-0.719;SC=GACAGTCTCACTCTTGTCGCC;SOR=0.163;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=7;WE=46135979;WS=46135961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr10	46148326	rs7091141	T	C	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.633;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=454;ReadPosRankSum=0.000;SC=ATGTGAACTATTCAGGAGAAA;SOR=1.118;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=25;WE=46148334;WS=46148316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
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chr10	46960084	rs9422009	G	A	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=1.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQRankSum=-0.808;QD=6.43;ReadPosRankSum=0.369;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,37:0.28:131
chr10	46963738	rs3127783	A	G	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.08;MQRankSum=1.201;QD=13.61;ReadPosRankSum=0.319;SOR=1.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr10	46963951	rs55945664	G	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FS=2.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.65;MQRankSum=0.062;QD=0.17;ReadPosRankSum=-0.249;SOR=0.988;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:265,28:0.10:293
chr10	46965018	rs3127785	C	G	1820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-8.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.688;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=39;PP=1175;ReadPosRankSum=0.442;SC=TGCCTCTGTCCTCCTGGAGCC;SOR=0.806;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=300;TCF=151;TCR=149;TR=91;WE=46965026;WS=46965008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,97:0.31:309
chr10	46965727	rs1889849	G	A	1264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.392;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=18;PP=982;ReadPosRankSum=1.211;SC=CCAGGCTCTCGGCCTCCAGGT;SOR=0.569;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=165;TCF=112;TCR=53;TR=54;WE=46965735;WS=46965717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,55:0.33:168
chr10	46965833	rs199866915	A	G	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=1.763;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.62;ReadPosRankSum=1.023;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:172,24:0.12:196
chr10	46967672	rs2152530	C	T	3022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.817;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=79;PP=2311;ReadPosRankSum=0.266;SC=TTTTGTCCTCCGGGAACTTGT;SOR=0.593;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=369;TCF=136;TCR=233;TR=127;WE=46967680;WS=46967662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:249,132:0.35:381
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chr10	46968879	rs10588658	AAC	A	216.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=641;ReadPosRankSum=-0.302;SC=CATACCAGGCAACACACACAC;SOR=1.302;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=13;WE=46968888;WS=46968869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
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chr10	46970792	rs915450	G	C	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=109;ReadPosRankSum=0.539;SC=GGGCAGGGTGGGGTGAGAGTA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=8;WE=46970800;WS=46970782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr10	46970815	rs915451	C	T	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.45;ReadPosRankSum=-1.606;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,4:0.17:24
chr10	46998719	rs201733825	GTCAC	G	1815.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.437;NF=35;NR=0;PP=1642;ReadPosRankSum=-1.164;SC=CTGGTGTCTTGTCACTCACTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=94;TCF=93;TCR=1;TR=35;WE=46998730;WS=46998710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,48:0.50:96
chr10	46998795	rs3127677	A	G	2885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.514;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.04;MQRankSum=0.968;NF=89;NR=35;PP=2136;ReadPosRankSum=-2.021;SC=TGAACCTAGCACTGTGGGAGT;SOR=0.651;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=240;TCF=175;TCR=65;TR=124;WE=46998803;WS=46998785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,127:0.52:244
chr10	46998894	rs3127817	G	A	2805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.880;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=83;PP=2235;ReadPosRankSum=-1.736;SC=AGCTCCAGCCGCCCCGAGCCG;SOR=0.989;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=279;TCF=108;TCR=171;TR=129;WE=46998902;WS=46998884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,129:0.46:279
chr10	46998995	rs4926045	C	G	1427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.566;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=31;PP=2713;ReadPosRankSum=0.049;SC=GAGGCCAGAGCTCCGCAAGAC;SOR=0.667;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=187;TCF=93;TCR=94;TR=63;WE=46999007;WS=46998985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,63:0.33:191
chr10	46998999	rs3127818	G	A	2559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=47;PP=2962;ReadPosRankSum=0.753;SC=CCAGAGCTCCGCAAGACTGCC;SOR=0.692;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=94;TCR=91;TR=95;WE=46999007;WS=46998985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,99:0.52:190
chr10	46999019	rs3127819	G	A	2545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.074;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=47;PP=2962;ReadPosRankSum=1.287;SC=CAGCAGCACCGTGTGGCAGGC;SOR=0.616;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=198;TCF=106;TCR=92;TR=98;WE=46999049;WS=46999009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,103:0.50:204
chr10	46999030	rs4925989	C	T	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.632;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=28;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.284;SC=TGTGGCAGGCCCAGCTGGGCG;SOR=0.931;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=191;TCF=104;TCR=87;TR=67;WE=46999049;WS=46999009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,67:0.34:196
chr10	46999041	rs139452107	A	C	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=6.931;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.28;ReadPosRankSum=-1.732;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:165,37:0.18:202
chr10	46999151	rs3127820	T	C	2307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.159;HP=4;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=51;PP=1660;ReadPosRankSum=-2.970;SC=AGGCCACTGGTGGAGCAGCAC;SOR=0.586;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=176;TCF=75;TCR=101;TR=91;WE=46999159;WS=46999141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,96:0.52:184
chr10	46999178	rs7090312	A	C	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=7.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.210;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=28;PP=1723;ReadPosRankSum=-0.339;SC=CAATGTGTCCACCATGGGCGG;SOR=1.110;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=156;TCF=71;TCR=85;TR=46;WE=46999206;WS=46999168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,46:0.28:162
chr10	46999189	rs3127678	C	T	3492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=1.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.56;ReadPosRankSum=1.932;SOR=0.594;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,89:0.55:162
chr10	46999190	rs3127679	A	G	5156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.88;ReadPosRankSum=1.228;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,135:0.81:167
chr10	46999198	rs3127680	G	T	3394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=2.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.45;ReadPosRankSum=2.871;SOR=0.885;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,91:0.55:166
chr10	46999306	rs146392312	C	T	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.96;ReadPosRankSum=1.087;SOR=0.692;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:192,34:0.15:226
chr10	46999465	rs3127682	A	G	3064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.239;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=68;PP=2364;ReadPosRankSum=-0.480;SC=GTCAGTTGTCAGTGCCACCAC;SOR=0.872;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=223;TCF=95;TCR=128;TR=115;WE=46999473;WS=46999455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,122:0.52:235
chr10	46999484	rs11204658	G	T	1492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.169;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=36;PP=1046;ReadPosRankSum=-0.162;SC=ACTAGACCTGGGGGACACAAC;SOR=0.605;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=80;TCR=110;TR=63;WE=46999492;WS=46999474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,68:0.34:199
chr10	46999577	rs11204659	G	T	1450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.755;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.698;NF=28;NR=28;PP=2962;ReadPosRankSum=0.140;SC=GCCCCCAGCTGCTCTACTCTG;SOR=0.489;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=165;TCF=91;TCR=74;TR=56;WE=46999612;WS=46999567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,59:0.35:169
chr10	46999591	rs112620425	C	CATGAGGGAG	3653.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.668;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=5.487;NF=30;NR=29;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.118;SC=TACTCTGTGGCATGAGGGAGG;SOR=1.027;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=168;TCF=86;TCR=82;TR=59;WE=46999612;WS=46999567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,86:0.53:163
chr10	46999596	rs7895979	G	A	1441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=2.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.39;MQRankSum=-3.681;QD=7.17;ReadPosRankSum=0.179;SOR=0.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,63:0.31:201
chr10	46999604	rs3127683	A	G	5511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.013;NF=83;NR=66;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.281;SC=GAGGGAGGTGAGGGCTGGTGG;SOR=0.736;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=101;TCR=79;TR=149;WE=46999612;WS=46999567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,168:0.85:197
chr10	46999732	rs4579877	G	A	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.54;ReadPosRankSum=2.459;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:173,60:0.26:233
chr10	46999747	rs3127821	T	C	3119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.029;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=59;PP=2469;ReadPosRankSum=0.089;SC=TCCCTGGGCATTCCCATTGCT;SOR=0.595;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=213;TCF=100;TCR=113;TR=115;WE=46999755;WS=46999737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,119:0.53:225
chr10	46999922	rs4926046	G	T	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.755;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=645;ReadPosRankSum=0.024;SC=CTGCAAGGCTGTGGCCACCAG;SOR=0.793;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=108;TCF=52;TCR=56;TR=38;WE=46999930;WS=46999912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,38:0.35:108
chr10	47000004	rs3127822	T	C	3676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.817;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=44;PP=2655;ReadPosRankSum=0.078;SC=CTGGAGGAGGTGCCGTCCCCT;SOR=0.446;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=160;TCF=107;TCR=53;TR=129;WE=47000012;WS=46999994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,138:0.82:168
chr10	47000071	rs4244614	G	A	2039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.458;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=28;PP=2962;ReadPosRankSum=0.520;SC=ACGGAGCTGCGGTGGACCTGG;SOR=0.879;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=202;TCF=120;TCR=82;TR=76;WE=47000087;WS=47000061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,83:0.40:209
chr10	47000079	rs3127823	T	C	2394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.501;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=42;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.600;SC=GCGGTGGACCTGGAGGTGCTC;SOR=0.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=210;TCF=121;TCR=89;TR=100;WE=47000087;WS=47000061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,102:0.47:218
chr10	47000146	rs3127684	C	T	2361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.675;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=69;PP=1889;ReadPosRankSum=0.018;SC=AGCGGGCGCCCGCCAGCGAGG;SOR=1.638;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=183;TCF=55;TCR=128;TR=89;WE=47000154;WS=47000136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,91:0.48:191
chr10	47000188	rs3127824	A	G	3169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=91;PP=2607;ReadPosRankSum=-0.045;SC=GGAGGGGGCCACTGCGGGCTG;SOR=0.632;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=126;TCF=22;TCR=104;TR=111;WE=47000196;WS=47000178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,111:0.88:126
chr10	47000239	rs7912299	C	T	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.203;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=309;ReadPosRankSum=-0.241;SC=GCGGCTGCTCCGGCGCGGCCC;SOR=0.235;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=51;TCF=4;TCR=47;TR=17;WE=47000247;WS=47000229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,18:0.35:52
chr10	47087474	rs1129838	C	T	11827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=509;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.838;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=190;NR=219;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.811;SC=GGGCTTCATCCTGGTCTGTTA;SOR=0.346;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=501;TCF=222;TCR=279;TR=409;WE=47087482;WS=47087464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,418:0.83:506
chr10	47087501	rs3824733	C	T	3502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=509;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.563;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=90;PP=2757;ReadPosRankSum=0.083;SC=CATCTACCGGCGCCTGCAGAG;SOR=0.651;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=498;TCF=216;TCR=282;TR=161;WE=47087509;WS=47087491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:343,163:0.32:506
chr10	47087608	rs1936339	T	C	11469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=388;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=167;NR=205;PP=2965;SC=TGGCCTTTGCTGTGCTCTGGC;SOR=0.903;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=373;TCF=167;TCR=206;TR=372;WE=47087616;WS=47087598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,385:1.00:385
chr10	47087680	rs1048157	C	T	8897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.637;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=161;NR=141;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.470;SC=CCATCTGCCACGGGAACCTCA;SOR=0.573;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=368;TCF=197;TCR=171;TR=302;WE=47087688;WS=47087670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,313:0.82:380
chr10	47087731	rs1048158	C	T	8082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.601;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=150;NR=138;PP=2962;ReadPosRankSum=1.263;SC=CCTCCACCTGCGTCAACCCAT;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=361;TCF=186;TCR=175;TR=288;WE=47087739;WS=47087721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,293:0.80:364
chr10	47087830	rs1129839	G	A	6498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.468;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=155;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.409;SC=TGGAGGAGTCGGAGCATCTGC;SOR=0.513;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=251;TCF=69;TCR=182;TR=215;WE=47087838;WS=47087820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,228:0.85:267
chr10	47405767	rs199589563	T	A	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.64;ReadPosRankSum=-0.847;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr10	47667508	rs34058224	C	A	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.225;NF=0;NR=18;PP=395;ReadPosRankSum=0.053;SC=TGCCGTCCCCCTGGTGGTCCT;SOR=1.528;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=18;WE=47667516;WS=47667498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr10	47668707	rs4409768	T	C	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=688;ReadPosRankSum=1.271;SC=ATAATCTGGATCAGGTAATTC;SOR=0.295;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=15;WE=47668729;WS=47668697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,16:0.36:44
chr10	47668721	rs4570521	G	A	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=688;ReadPosRankSum=0.784;SC=GTAATTCCAAGCAGGTAACCA;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=14;WE=47668729;WS=47668697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr10	47669277	rs61845226	C	G	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.660;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.698;NF=2;NR=11;PP=210;ReadPosRankSum=0.315;SC=ATCGGTGGAGCCTTCCTCTGA;SOR=0.123;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=13;WE=47669285;WS=47669267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr10	47669320	rs113650392	G	A	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQRankSum=-2.598;QD=8.99;ReadPosRankSum=-1.977;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr10	47669324	rs113530203	A	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQRankSum=-2.988;QD=8.94;ReadPosRankSum=-1.851;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr10	47677955	rs6602879	A	G	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=284;ReadPosRankSum=1.374;SC=CCACAGGGTCAGCCCTGCATG;SOR=0.276;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=60;TCF=57;TCR=3;TR=21;WE=47677963;WS=47677945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,22:0.36:61
chr10	47680257	rs11596494	G	C	1559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.808;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=9;PP=1218;ReadPosRankSum=-1.123;SC=GGCCAGCTAGGGAGAGTGAGG;SOR=0.039;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=76;TCF=67;TCR=9;TR=55;WE=47680265;WS=47680247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,56:0.71:79
chr10	47680513	rs10572939	GCC	G	689.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=570;SC=ACATGTGACTGCCCCCCGTGA;SOR=4.294;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=17;WE=47680522;WS=47680503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	47682811	rs2999446	G	A	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=876;ReadPosRankSum=-0.519;SC=CTCCACTCCCGCCTCCGCCCC;SOR=0.789;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=29;TCR=34;TR=49;WE=47682819;WS=47682801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,49:0.74:66
chr10	47701275	rs10906952	G	A	3498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=56;PP=2965;SC=TCAGGCACACGGCAGAACCCC;SOR=0.729;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=112;TCF=56;TCR=56;TR=111;WE=47701283;WS=47701265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr10	47701302	rs7091749	G	C	2872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=53;PP=2206;SC=CACTCCCCCCGTCAGAGCCCA;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=41;TCR=53;TR=94;WE=47701310;WS=47701292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr10	47756004	rs3013885	T	C	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.16;QD=33.84;SOR=3.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	47756145	rs200192962	T	C	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.00;QD=26.98;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr10	48371277	rs3814160	C	T	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.76;ReadPosRankSum=-0.528;SOR=0.982;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,42:0.25:168
chr10	48386110	rs2070706	T	C	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=511;ReadPosRankSum=-0.059;SC=GCAGGCGCCATGGGAAATATT;SOR=1.280;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=28;WE=48386118;WS=48386100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,29:0.78:37
chr10	48390041	rs2376635	C	T	1841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.351;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=36;PP=1364;ReadPosRankSum=-0.455;SC=ACACGGGCACCGTGAAGAAGA;SOR=0.966;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=269;TCF=141;TCR=128;TR=83;WE=48390049;WS=48390031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,87:0.31:282
chr10	48414570	rs7923671	A	G	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=25;PP=584;ReadPosRankSum=0.436;SC=GTCTGTTTCCATGACACTGAA;SOR=0.560;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=27;WE=48414578;WS=48414560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,27:0.75:36
chr10	48428974	rs61731868	C	T	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.218;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=650;ReadPosRankSum=0.784;SC=CATCCAGCCCCGGCAGCTCGT;SOR=0.617;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=74;TCF=33;TCR=41;TR=30;WE=48428982;WS=48428964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,31:0.41:75
chr10	48429598	rs57078661	A	C	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=353;ReadPosRankSum=-0.309;SC=CAGGCTGTGAAGTTCTCGCTC;SOR=0.495;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=10;TCR=60;TR=26;WE=48429606;WS=48429588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,27:0.36:74
chr10	48429650	rs2236723	G	A	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=21;PP=510;SC=AGGAGCAAACGCCCACCGATC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=48429658;WS=48429640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	48429689	rs60085126	G	A	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=71;ReadPosRankSum=-0.313;SC=CTCCTCCCCCGCTTTGCTTCC;SOR=0.160;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=5;WE=48429697;WS=48429679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr10	48438734	rs1126827	C	T	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=1.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.08;ReadPosRankSum=-0.935;SOR=0.397;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,11:0.23:47
chr10	49392575	rs931743	C	G	2287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=62;NR=4;PP=1924;SC=AACAGGGGAGCCTCTTAAGCT;SOR=4.743;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=62;TCR=4;TR=66;WE=49392583;WS=49392565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	49393002	rs2062704	C	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.56;ReadPosRankSum=0.236;SOR=0.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,12:0.23:53
chr10	49395144	rs11101252	G	A	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=171;ReadPosRankSum=-0.692;SC=CATTGTGTGGGAAGCAAAAAT;SOR=0.828;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=57;TCF=48;TCR=9;TR=14;WE=49395152;WS=49395134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,15:0.25:59
chr10	49420008	rs1864345	T	C	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=2;PP=640;SC=CTCAAGAACTTCAGCTCAGCA;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=49420016;WS=49419998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	49420205	rs72792229	C	T	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=36;PP=908;ReadPosRankSum=-0.674;SC=GGCCGGGGGACTCTGAGAGGA;SOR=0.925;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=57;TCF=10;TCR=47;TR=43;WE=49420213;WS=49420195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,45:0.76:59
chr10	49430608	rs12252237	A	G	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.23;ReadPosRankSum=1.139;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr10	49431095	rs12249536	C	T	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=3;PP=514;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTTGTCGATCCATTACCTCTC;SOR=0.521;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=78;TCF=70;TCR=8;TR=29;WE=49431103;WS=49431085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,29:0.35:82
chr10	49440346	rs6537556	C	T	1437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=35;PP=1114;SC=AAAACAACAACAGTATCAATT;SOR=2.256;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=47;WE=49440354;WS=49440336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	49445966	rs12252932	G	A	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.296;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=216;ReadPosRankSum=0.352;SC=TTCAGCCACCGTGCCAGCCAC;SOR=1.415;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=14;WE=49445974;WS=49445956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,14:0.28:50
chr10	49446204	rs905184	T	C	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=416;ReadPosRankSum=-0.445;SC=CACTTAGCAATGGCAAGGGCT;SOR=1.536;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=22;WE=49446212;WS=49446194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr10	49450443	rs280612	A	G	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=28;PP=877;SC=CAGAGCTGCCACTACGAGGCC;SOR=4.047;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=31;WE=49450451;WS=49450433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	49457202	rs440943	A	G	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.318;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=387;ReadPosRankSum=0.269;SC=ACCAGGGGCAAACCACATAGT;SOR=0.962;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=67;TCF=34;TCR=33;TR=24;WE=49457210;WS=49457192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,26:0.37:70
chr10	49459788	rs12247274	C	T	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.456;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=496;ReadPosRankSum=-1.689;SC=GGAACATGTCCGGGCCCGTAC;SOR=0.012;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=52;TCF=6;TCR=46;TR=27;WE=49459796;WS=49459778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
chr10	49609578	rs3730154	C	A	278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=2;PP=178;SC=ACTATCAGTACGTAAACAGTA;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=49609586;WS=49609568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	49658248	rs1867585	G	A	1405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=9;PP=1099;SC=CCAAGAGCACGGCTCTCCCTG;SOR=2.560;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=44;WE=49658256;WS=49658238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr10	49659559	rs10776601	C	T	5377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=91;PP=2965;SC=GGCTGCCCCACGTCACCCCTC;SOR=0.824;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=177;TCF=85;TCR=92;TR=176;WE=49659567;WS=49659549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr10	49659644	rs72796303	A	G	1955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=66;PP=1532;ReadPosRankSum=-2.391;SC=GAATAGAGCCATCTTTCCTGT;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=112;TCF=14;TCR=98;TR=75;WE=49659652;WS=49659634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,76:0.67:114
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chr10	49661341	rs7092959	A	G	2243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=10;PP=1725;SC=TACACCTCCCACTTACCTTCC;SOR=3.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=66;TCR=10;TR=76;WE=49661349;WS=49661331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr10	49662884	rs11101327	A	G	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=3;PP=202;SC=TCCCCCACCCAAGCAGGATGC;SOR=1.402;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=49662892;WS=49662874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	49663184	rs72796308	G	A	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=398;ReadPosRankSum=-0.204;SC=TGTGCTGTGGGGGGGAAGAGG;SOR=0.660;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=22;WE=49663192;WS=49663174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr10	49663218	rs146396048	C	G	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=306;ReadPosRankSum=1.405;SC=GCCTGGGATGCCAGGGGACTT;SOR=1.461;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=15;WE=49663226;WS=49663208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr10	49667713	rs1867575	G	A	5501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=63;PP=2965;SC=CCTTACCCCCGATCACAAGCT;SOR=1.259;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=102;TCR=63;TR=165;WE=49667721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr10	49667795	rs3853761	T	C	3686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=96;PP=2724;ReadPosRankSum=1.298;SC=TGGCCTGGCCTGGCATGCGGA;SOR=1.048;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=129;TCF=32;TCR=97;TR=128;WE=49667803;WS=49667785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,132:0.99:133
chr10	49687556	rs4240511	A	C	1694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=9;PP=1318;SC=CTGCTGTGAGAAGCACAGGAT;SOR=2.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=41;TCR=9;TR=50;WE=49687564;WS=49687546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr10	49687594	rs4838601	G	A	2329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=27;PP=1755;SC=AGTGAGCAGGGTCTTTGGGGC;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=45;TCR=27;TR=72;WE=49687602;WS=49687584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr10	49687800	rs4080665	G	A	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=208;ReadPosRankSum=-1.213;SC=CCCGCTCCCCGGCACCACCTG;SOR=0.643;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=12;WE=49687808;WS=49687790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,14:0.27:52
chr10	49687964	rs4240513	A	C	7480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.75;SOR=0.777;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr10	49687971	rs4240514	T	C	7509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.70;SOR=0.766;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr10	49688014	rs4838602	C	A	5058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=96;PP=2965;SC=TTTTTCCCTTCGTCTCACTTT;SOR=1.171;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=58;TCR=96;TR=154;WE=49688022;WS=49688004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr10	49690351	rs1445157	T	C	5462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=112;NR=47;PP=2965;SC=GTTCATTCTTTTGCATATGCA;SOR=1.806;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=160;TCF=113;TCR=47;TR=159;WE=49690359;WS=49690341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr10	49701384	rs11812546	G	A	1850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=23;PP=1393;SC=ACCTGGTTGCGGCCACCAAAC;SOR=1.107;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=36;TCR=23;TR=59;WE=49701392;WS=49701374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr10	49732141	rs7089439	C	T	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=285;ReadPosRankSum=1.158;SC=TGCAGCAGCACAGCCCCATGG;SOR=0.744;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=19;WE=49732149;WS=49732131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr10	49763418	rs6143892	GAGGAGTGTCACGA	G	194.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.524;NF=4;NR=0;PP=860;ReadPosRankSum=0.241;SC=GCTCCTGCGGGAGGAGTGTCA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=49763438;WS=49763408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr10	49763618	rs1838570	C	T	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.952;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=724;ReadPosRankSum=0.039;SC=CAAACACAAACACAGGGAGCA;SOR=0.927;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=63;TCF=25;TCR=38;TR=37;WE=49763626;WS=49763608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,38:0.57:67
chr10	49763677	rs1838569	A	C	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.547;HP=3;HapScore=4;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=654;ReadPosRankSum=1.001;SC=TGGAGAGGAGAGGTTAGGACC;SOR=1.101;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=18;WE=49763698;WS=49763667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr10	49763690	rs1838568	G	C	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=654;ReadPosRankSum=0.642;SC=TTAGGACCTGGGGCCCTCCAG;SOR=1.136;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=16;WE=49763698;WS=49763667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr10	49763709	rs1445148	T	A	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.26;ReadPosRankSum=-1.497;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr10	49763717	rs7098068	C	T	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.83;ReadPosRankSum=-0.902;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr10	49790972	rs2289808	C	T	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.256;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=15;PP=887;ReadPosRankSum=-0.076;SC=ACGATGCCCACGGCACACCGG;SOR=0.112;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=65;TCF=48;TCR=17;TR=46;WE=49790980;WS=49790962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,47:0.71:66
chr10	49804554	rs10776627	A	G	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.039;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=721;ReadPosRankSum=0.182;SC=CCTCACTGAGAGGTGGAGTGT;SOR=0.141;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=29;WE=49804562;WS=49804544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,31:0.61:51
chr10	49804785	rs10745280	T	G	4306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=114;PP=2965;SC=CCCATTCTGGTGTCTCTCTCG;SOR=3.678;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=17;TCR=115;TR=131;WE=49804793;WS=49804775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr10	49929331	rs11818741	G	A	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.894;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=521;ReadPosRankSum=1.359;SC=CAGCTGGACAGTTGCTGTGGT;SOR=0.230;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=97;TCF=75;TCR=22;TR=29;WE=49929339;WS=49929321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,31:0.30:103
chr10	49931615	rs111563360	G	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=112;ReadPosRankSum=-2.839;SC=TCGTGCAGGTGAGTTCAAGGA;SOR=0.459;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=9;WE=49931623;WS=49931605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr10	49939077	rs2377628	T	A	2522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=6;PP=2092;SC=TGGCATGCCCTCTTAGTAATG;SOR=4.434;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=71;TCR=6;TR=77;WE=49939085;WS=49939067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr10	49939139	rs1993986	T	A	5289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.340;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=47;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.768;SC=AAGATCATTCTTGTTTTCCTC;SOR=1.825;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=113;TCR=48;TR=160;WE=49939147;WS=49939129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,170:0.99:171
chr10	49944249	rs4838645	C	T	2227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=63;PP=1799;SC=TATTAGGTAGCGTCAGGTGCT;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=5;TCR=63;TR=68;WE=49944257;WS=49944239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr10	49983890	rs1871604	G	T	2805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=72;PP=2235;SC=TTAATGGGAAGTAAAAGATGA;SOR=3.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=9;TCR=72;TR=81;WE=49983898;WS=49983880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr10	49998059	rs114896581	A	C	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=328;ReadPosRankSum=0.342;SC=CTTTGCCGCTATTTGGGAAGC;SOR=0.223;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=16;WE=49998067;WS=49998049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr10	50004540	rs116666378	G	A	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=142;ReadPosRankSum=0.086;SC=TGTGTGTGATGGTAAATATGC;SOR=0.207;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=9;WE=50004548;WS=50004530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr10	50013402	rs2170132	T	C	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.977;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=38;PP=1105;ReadPosRankSum=0.493;SC=CTCCAAGATCTCCACCATCAT;SOR=0.476;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=171;TCF=58;TCR=113;TR=61;WE=50013410;WS=50013392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,61:0.35:173
chr10	50025446	rs12268007	G	T	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=23;PP=630;ReadPosRankSum=0.176;SC=CCCCCTGGGAGCCCAAAAGGT;SOR=0.773;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=104;TCF=40;TCR=64;TR=38;WE=50025454;WS=50025436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,36:0.33:109
chr10	50031145	rs11101515	A	G	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.390;NF=35;NR=20;PP=871;ReadPosRankSum=1.275;SC=ATGTAGGTGTATGTATGTGCA;SOR=0.647;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=162;TCF=108;TCR=54;TR=55;WE=50031153;WS=50031135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,58:0.35:168
chr10	50031212	rs113439641	CT	C	1014.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FS=0.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=2.728;QD=5.29;ReadPosRankSum=-1.440;SOR=0.630;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,68:0.35:192
chr10	50031350	rs45520233	G	A	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.708;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=30;PP=600;ReadPosRankSum=0.583;SC=GGATGTCTGTGATTCTTGGAA;SOR=2.416;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=93;TCF=5;TCR=88;TR=30;WE=50031358;WS=50031340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,32:0.33:98
chr10	50034635	rs6537578	T	A	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=284;ReadPosRankSum=0.016;SC=ATTATACTATTTTTGTGGTAA;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=15;WE=50034643;WS=50034625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr10	50034833	rs6537579	G	A	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.748;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=22;PP=715;ReadPosRankSum=0.046;SC=CGAATGCCTCGGCCTTCTCAG;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=108;TCF=51;TCR=57;TR=37;WE=50034841;WS=50034823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,43:0.37:115
chr10	50034986	rs78512600	TGGTGGTCCATG	T	405.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.54;ReadPosRankSum=0.678;SOR=0.644;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,14:0.23:62
chr10	50035045	rs73310070	T	G	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.268;HP=1;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=163;ReadPosRankSum=0.432;SC=CTGAGTTCTGTATAAATGATA;SOR=0.041;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=12;WE=50035053;WS=50035035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr10	50038800	rs3747874	A	G	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=297;ReadPosRankSum=-0.510;SC=TGGTGGCACAAAGGCAGCAGA;SOR=0.509;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=16;WE=50038808;WS=50038790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,16:0.31:52
chr10	50040562	rs3747873	A	G	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=8.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.007;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=6;PP=903;ReadPosRankSum=0.408;SC=AGCTAGCTATAAAAATAGTGT;SOR=1.044;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=134;TCF=111;TCR=23;TR=43;WE=50040570;WS=50040552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,44:0.32:139
chr10	50040610	rs3747872	T	G	1735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.543;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=27;PP=1233;ReadPosRankSum=-0.242;SC=TTGCTTCCCTTCCCTCAGCAT;SOR=0.612;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=196;TCF=121;TCR=75;TR=69;WE=50040618;WS=50040600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,75:0.36:209
chr10	50075461	rs2663019	G	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=171;ReadPosRankSum=-1.072;SC=TAATTGGAAGGGCCTTTGGTT;SOR=1.214;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=9;WE=50075469;WS=50075451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr10	50098566	rs12761826	C	T	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=142;ReadPosRankSum=0.621;SC=CTGTTTCCCCCAAGAATCATG;SOR=0.984;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=42;TCR=3;TR=10;WE=50098574;WS=50098556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,10:0.22:46
chr10	50108145	rs2671693	G	C	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=3;PP=580;SC=TCAAAAGGACGACCCAGGAAG;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=50108153;WS=50108135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	50109895	rs35423873	A	C	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=1.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.35;ReadPosRankSum=-2.358;SOR=0.923;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,21:0.30:70
chr10	50109902	rs2663046	G	A	2162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=51;PP=948;SC=GACACCCTCAGTCTAAGGTAA;SOR=3.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=9;TCR=51;TR=60;WE=50109910;WS=50109885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr10	50110015	rs7068839	A	T	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=340;SC=CATGCCCAACAGTTTCCCTCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=50110023;WS=50110005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	50121425	rs12774010	G	C	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.107;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=468;ReadPosRankSum=-2.004;SC=TCAGGGTCAGGTTCCAAGTCA;SOR=1.013;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=48;TCF=29;TCR=19;TR=24;WE=50121433;WS=50121415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr10	50121515	rs61730452	G	A	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.863;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=584;ReadPosRankSum=-0.727;SC=CGGTGTCGTCGTGGCCATGTT;SOR=0.512;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=95;TCF=66;TCR=29;TR=35;WE=50121523;WS=50121505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,37:0.38:97
chr10	50121721	rs35986885	G	A	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.027;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=897;ReadPosRankSum=0.292;SC=AGATGCTCACGGGGATGTTGT;SOR=0.793;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=100;TCF=55;TCR=45;TR=44;WE=50121729;WS=50121711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,45:0.44:103
chr10	50121760	rs41283291	G	A	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.716;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=711;ReadPosRankSum=0.614;SC=GCCCTACCTCGTGGAGCTCCT;SOR=1.053;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=97;TCF=45;TCR=52;TR=39;WE=50121768;WS=50121750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,39:0.40:98
chr10	50121784	rs10776653	T	C	2949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=56;PP=2363;SC=GGGCCCCCAGTGTGGTGGGCA;SOR=0.884;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=46;TCR=56;TR=102;WE=50121792;WS=50121774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr10	50122109	rs17772611	C	T	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.047;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=285;ReadPosRankSum=-0.210;SC=CAAGTCAAGGCGCTTTTTCCC;SOR=0.914;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=18;WE=50122117;WS=50122099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,19:0.30:63
chr10	50122181	rs7094610	C	A	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.083;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=531;ReadPosRankSum=-0.532;SC=GCCCTTGGGGCCTTTCTCACC;SOR=2.019;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=24;WE=50122189;WS=50122171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr10	50149674	rs2671717	A	G	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=391;ReadPosRankSum=0.806;SC=GGGTGGGGCAAGAAGAGCTGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=16;WE=50149682;WS=50149664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr10	50154768	rs2663066	A	T	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=628;ReadPosRankSum=2.930;SC=TGAATGTTTTACTTTAGGTCT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=25;WE=50154776;WS=50154758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,24:0.73:33
chr10	50165411	rs3750867	T	C	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.989;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=41;PP=780;ReadPosRankSum=-1.222;SC=CAACATCATCTGGACCTTTGC;SOR=1.926;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=60;TCF=2;TCR=58;TR=42;WE=50165419;WS=50165401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,46:0.71:65
chr10	50186317	rs2292585	G	A	1954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=18;PP=1360;ReadPosRankSum=-1.069;SC=AGACAGGATCGTCTTCCCCGC;SOR=0.700;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=125;TCF=92;TCR=33;TR=73;WE=50186325;WS=50186307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,76:0.62:123
chr10	50186415	rs2292584	C	T	888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.940;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=33;PP=753;ReadPosRankSum=-1.390;SC=GAGGAGCCCCCGGCTCAGCCT;SOR=1.310;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=113;TCF=21;TCR=92;TR=38;WE=50186423;WS=50186405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,38:0.33:116
chr10	50190923	rs61366126	G	GA	871.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.615;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.671;NF=2;NR=37;PP=619;ReadPosRankSum=0.857;SC=CTATTGCACTGAAAAAAAAAA;SOR=1.802;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=58;TCF=2;TCR=56;TR=39;WE=50190931;WS=50190913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,38:0.83:46
chr10	50227785	rs1913525	T	C	1046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=20;PP=859;SC=TCAGCTCCAGTTCGGCATAGG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=31;WE=50227793;WS=50227775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	50227870	rs1913524	C	T	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=384;SC=ACCACAGGAGCTCTACATCAC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=50227878;WS=50227860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	50227927	rs1913523	C	A	256.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=1;NR=7;PP=213;SC=TGGGATTCAGCGAGGGATAAG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=50227935;WS=50227917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	50315893	rs13088	A	G	1034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.650;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=631;ReadPosRankSum=0.023;SC=CTGGGAGTCGAAGGAGTGTGC;SOR=0.607;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=58;TCR=83;TR=43;WE=50315901;WS=50315883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,49:0.32:152
chr10	50341850	rs373793500	A	G	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=311;ReadPosRankSum=-0.245;SC=CTTTTCACCTACCTGGCCAGA;SOR=0.446;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=16;WE=50341858;WS=50341840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr10	50369860	rs59598256	C	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=33;ReadPosRankSum=0.206;SC=TCTGAAAGTCCCTCTATTTGC;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=4;WE=50369868;WS=50369850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr10	50373102	rs76725731	C	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=0.355;SC=AGACCCTACCCGCCCGGAGCT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=6;WE=50373110;WS=50373092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr10	50373738	rs77059741	G	T	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.356;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=513;ReadPosRankSum=1.821;SC=GGGGATGACAGGCAAGGGAGT;SOR=1.542;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=24;WE=50373746;WS=50373728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr10	50531604	rs7093235	T	C	2164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.071;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=42;PP=1717;ReadPosRankSum=0.842;SC=AGAACAGACTTGCAGCAGGGG;SOR=0.683;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=49;TCR=54;TR=80;WE=50531612;WS=50531594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,80:0.76:105
chr10	50532683	rs7921186	T	C	4451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=83;NR=49;PP=2965;SC=CAGAAATTCTTCCCAGGGCCC;SOR=1.364;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=83;TCR=49;TR=132;WE=50532691;WS=50532673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr10	50533617	rs2377940	T	C	7378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=135;NR=116;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.829;SC=TACCCGAGGGTGACATAGAAG;SOR=0.296;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=252;TCF=136;TCR=116;TR=251;WE=50533625;WS=50533607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,248:1.00:249
chr10	50533776	rs10857471	C	G	1981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=57;PP=1682;ReadPosRankSum=1.036;SC=CCGGCTCCCCCGGGGAGAGCA;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=123;TCF=34;TCR=89;TR=78;WE=50533784;WS=50533766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,77:0.63:123
chr10	50534599	rs10857472	G	A	1313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.730;NF=11;NR=36;PP=1027;ReadPosRankSum=-0.346;SC=GCTGTACCCCGGCTTCCAGCC;SOR=0.867;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=74;TCF=18;TCR=56;TR=47;WE=50534607;WS=50534589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,47:0.64:74
chr10	50534969	rs66701434	A	AACACACACACAC	787.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQRankSum=-2.198;QD=56.27;ReadPosRankSum=-1.012;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr10	50683492	rs74750824	G	A	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.907;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=334;ReadPosRankSum=0.443;SC=ACCTGAAGAAGTTAAGGGGAG;SOR=0.502;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=74;TCF=30;TCR=44;TR=26;WE=50683500;WS=50683482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,28:0.35:81
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chr10	50818762	rs1880675	C	T	1525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=3;PP=1324;SC=CGGAGGCGTCCTCGGAAGAGC;SOR=4.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=43;TCR=3;TR=45;WE=50818770;WS=50818752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	50820345	rs8187730	C	A	6745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=111;PP=2965;SC=CCTTTTGATGCGTGCGAGGAC;SOR=0.834;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=207;TCF=96;TCR=111;TR=207;WE=50820353;WS=50820335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr10	50822226	rs7923716	T	G	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=7;PP=425;SC=GGCGGGGAGCTGGGGAAGGGA;SOR=1.493;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=19;WE=50822234;WS=50822216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr10	50830171	rs8178990	C	T	2325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.196;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=40;PP=1806;ReadPosRankSum=-0.125;SC=CTCTGGTGTACTCAGCTACAA;SOR=0.519;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=147;TCF=83;TCR=64;TR=89;WE=50830179;WS=50830161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,89:0.62:143
chr10	50856652	rs4838544	G	A	1704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=36;PP=1310;SC=GCTCAAGCACGTGTGAGTCTG;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=56;WE=50856660;WS=50856642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	50856755	rs150122136	G	GA	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.43;ReadPosRankSum=0.179;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr10	50857835	rs1917813	T	C	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=37;PP=982;ReadPosRankSum=0.330;SC=TGTAGTCAAATTAAAGGAGAG;SOR=1.567;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=0;TCR=55;TR=37;WE=50857843;WS=50857825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,36:0.67:54
chr10	50863083	rs12264845	A	C	2503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.470;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=28;PP=1901;ReadPosRankSum=0.406;SC=TTTCTTTCCGAGTTTATGATT;SOR=0.956;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=137;TCF=94;TCR=43;TR=92;WE=50863091;WS=50863073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,95:0.68:140
chr10	50863147	rs8178992	T	C	5415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=79;PP=2965;SC=GCAGGCTCCATCGAAGACTGG;SOR=0.829;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=169;TCF=90;TCR=79;TR=168;WE=50863155;WS=50863137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr10	50863565	rs7076926	C	T	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=41;PP=1145;SC=ATGGGCACCACGGCATAAGAC;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=42;WE=50863573;WS=50863555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	50863623	rs7094421	A	G	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=50;ReadPosRankSum=-1.688;SC=TGGCAAGGCCACTTCACCACT;SOR=0.197;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=5;WE=50863631;WS=50863613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr10	50887651	rs1153781	G	C	911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=9;PP=662;SC=GGCCCCGCCCGGCGCGTAGCG;SOR=1.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=27;WE=50887659;WS=50887641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	50901809	rs1153797	T	G	1200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=5;PP=976;SC=CTCCTTTTCTTTCCTTCCCAG;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=50901817;WS=50901799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	50902401	rs73303363	G	A	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=67;ReadPosRankSum=-0.575;SC=GGCACTGTGCGTGCCTCTCTG;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=6;WE=50902409;WS=50902391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr10	50916484	rs1258236	A	G	3181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=18;PP=2646;SC=CAGCCCGTGTAGGATGAAAGT;SOR=2.786;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=78;TCR=18;TR=95;WE=50916492;WS=50916474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr10	50916542	rs4838554	C	T	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=786;ReadPosRankSum=-0.352;SC=CTGACTTGTACTGTATTGGCC;SOR=0.723;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=76;TCR=66;TR=50;WE=50916550;WS=50916532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,50:0.35:144
chr10	50943186	rs1258256	C	T	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=536;ReadPosRankSum=-1.326;SC=AGCCCCTCTCCTGGGCAGGAG;SOR=2.584;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=24;WE=50943194;WS=50943176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr10	50944009	rs1258257	T	C	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=600;ReadPosRankSum=-0.798;SC=ATGGGACAGATGGAGCCAGGA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=23;WE=50944017;WS=50943999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr10	50944613	rs1258258	C	T	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.605;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=32;PP=799;ReadPosRankSum=-1.636;SC=CCCAGAGGGGCTGGGGCAGCT;SOR=1.508;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=59;TCF=6;TCR=53;TR=35;WE=50944621;WS=50944603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,35:0.58:60
chr10	50947918	rs1258259	A	G	1001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=22;PP=790;SC=CTTGCTGCACACAGTCACCAA;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=50947926;WS=50947908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	50948987	rs3750757	C	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.294;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=174;ReadPosRankSum=0.754;SC=GCCTCCGTCACTGTCCCAGGA;SOR=0.086;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=10;WE=50948995;WS=50948977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr10	50950976	rs11101224	G	A	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.168;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=289;ReadPosRankSum=1.291;SC=CCAGTCCACCGTCCGGTTCTT;SOR=0.611;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=49;TCF=21;TCR=28;TR=17;WE=50950984;WS=50950966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr10	50952851	rs1268723	C	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=386;ReadPosRankSum=-0.092;SC=CGCAGCCAGACGCCCAGTCCA;SOR=1.220;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=18;WE=50952859;WS=50952841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr10	50953830	rs7910114	G	A	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=359;ReadPosRankSum=-0.327;SC=CTTGGCCTCAGTCCCCAGACC;SOR=0.852;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=57;TCF=47;TCR=10;TR=20;WE=50953838;WS=50953820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,19:0.32:59
chr10	50960166	rs2304635	C	T	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.195;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=24;PP=715;ReadPosRankSum=-0.673;SC=CCCACACACCCGCCTGTGCTC;SOR=0.409;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=153;TCF=59;TCR=94;TR=45;WE=50960174;WS=50960156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,50:0.31:159
chr10	50960209	rs1258184	G	A	2369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.748;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=54;PP=1909;ReadPosRankSum=-0.188;SC=CCCGCAGAGAGAGGGTGTTTT;SOR=0.997;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=111;TCF=38;TCR=73;TR=79;WE=50960217;WS=50960199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,83:0.70:118
chr10	50960354	rs2304636	C	T	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=236;ReadPosRankSum=-1.227;SC=AGGTCAGGCCCAGGTGGAGCC;SOR=1.022;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=11;WE=50960362;WS=50960344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr10	50960581	rs2304637	A	G	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.672;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=278;ReadPosRankSum=-0.097;SC=CTGCTCCCCGAGCTCCATGGA;SOR=1.954;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=15;WE=50960589;WS=50960571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
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chr10	51124153	rs2664655	T	G	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=6.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.729;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.185;NF=3;NR=61;PP=1571;ReadPosRankSum=-0.663;SC=ACAAGCTTCCTACTACCTCCC;SOR=0.275;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=93;TCF=3;TCR=90;TR=64;WE=51124161;WS=51124143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,55:0.64:86
chr10	51537292	rs4131357	C	A	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=285;ReadPosRankSum=-1.852;SC=ACAATAGAGTCTTTTAATCTA;SOR=0.175;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=0;TCR=65;TR=18;WE=51537300;WS=51537282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,20:0.30:67
chr10	51539745	rs35494443	AC	A	92.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.81;ReadPosRankSum=1.147;SOR=0.084;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,7:0.21:33
chr10	51539762	rs10763588	G	T	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=245;ReadPosRankSum=-0.045;SC=ATAGAGAATTGACTCCCTCAT;SOR=0.249;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=14;WE=51539770;WS=51539752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr10	51540291	rs11006274	T	C	1652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=42;PP=1452;SC=CTGTGGGATCTCCCGCATGAA;SOR=2.540;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=54;WE=51540299;WS=51540281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr10	51549496	rs10993994	T	C	5208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=83;PP=2965;ReadPosRankSum=0.658;SC=TTCCCAATGATGTCGAATGCG;SOR=0.761;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=95;TCR=84;TR=176;WE=51549504;WS=51549486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,180:0.99:182
chr10	51549545	rs4935176	G	T	5181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=97;PP=2965;SC=ATGCAGCTTTGCCTGGATGTA;SOR=1.348;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=59;TCR=97;TR=156;WE=51549553;WS=51549535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr10	51568378	rs10761581	T	G	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.053;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=828;ReadPosRankSum=0.908;SC=GTTGACCACTTTTGCTCTAGC;SOR=0.495;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=63;TCF=24;TCR=39;TR=42;WE=51568386;WS=51568368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,43:0.67:64
chr10	51583018	rs34542065	CATT	C	270.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.502;NF=0;NR=8;PP=299;ReadPosRankSum=1.150;SC=TACTATGTGTCATTGTTAACT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=8;WE=51583028;WS=51583008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr10	51592744	rs10995796	T	G	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=558;ReadPosRankSum=-1.105;SC=TCCCAGCACTTCGGGAGGCCG;SOR=2.376;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=22;WE=51592752;WS=51592734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,24:0.77:31
chr10	51623004	rs201547968	T	C	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.034;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.03;MQRankSum=-1.723;QD=9.55;ReadPosRankSum=-0.948;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr10	51623014	rs201512669	G	GA	147.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.03;MQRankSum=2.193;QD=6.16;ReadPosRankSum=-0.311;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr10	51623024	rs146205287	A	C	368.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=2.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.23;MQRankSum=-2.470;QD=10.85;ReadPosRankSum=0.672;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr10	51623052	rs143647852	C	CT	1005.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.77;MQRankSum=-3.963;QD=18.29;ReadPosRankSum=0.346;SOR=0.809;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr10	51623061	rs115719811	G	A	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.90;MQRankSum=-4.424;QD=16.44;ReadPosRankSum=0.763;SOR=0.756;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
chr10	51623147	rs373071373	C	T	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.64;MQRankSum=-2.429;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr10	51631812	rs200391397	A	G	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.47;MQRankSum=-1.068;QD=21.83;ReadPosRankSum=-0.062;SOR=0.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,37:0.77:48
chr10	51632971	rs200644678	A	G	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=4.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.85;MQRankSum=-3.644;QD=6.66;ReadPosRankSum=-1.521;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr10	51633027	rs115081809	T	C	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.34;MQRankSum=-5.129;QD=5.42;ReadPosRankSum=0.373;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,28:0.35:80
chr10	51827763	rs4935425	A	G	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=56;ReadPosRankSum=0.619;SC=CCGGGCGGCTAGGATGGTGAG;SOR=0.105;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=4;WE=51827771;WS=51827753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr10	52002852	rs1436217	A	G	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=417;ReadPosRankSum=0.199;SC=ATTGAAGGTAATAGAATTTCA;SOR=0.213;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=52;TCR=0;TR=18;WE=52002860;WS=52002842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,18:0.32:56
chr10	52002980	rs3739979	T	G	1566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=34;PP=1256;ReadPosRankSum=-0.366;SC=TGAGCCTTTGTGATACCATGC;SOR=0.650;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=204;TCF=109;TCR=95;TR=69;WE=52002988;WS=52002970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,69:0.33:208
chr10	52004877	rs7096899	A	G	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=65;ReadPosRankSum=0.516;SC=TAAAAAGCTAAAAGAAGATAA;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=6;WE=52004885;WS=52004867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr10	52005153	rs7097319	A	G	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=153;ReadPosRankSum=0.540;SC=AGCGTTGGGCAGCTGTGGAGC;SOR=0.631;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=11;WE=52005161;WS=52005143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,11:0.26:43
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chr10	52086939	rs2246994	C	G	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.155;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=25;PP=1007;ReadPosRankSum=0.229;SC=AAACAGAAAGCGAAATTACAG;SOR=0.796;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=216;TCF=131;TCR=85;TR=66;WE=52086947;WS=52086929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,67:0.30:225
chr10	52103707	rs10763354	A	G	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.447;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=377;ReadPosRankSum=0.558;SC=GCCGCTGCCCATTGTCAGAGG;SOR=0.687;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=63;TCF=31;TCR=32;TR=23;WE=52103715;WS=52103697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,24:0.37:65
chr10	52466419	.	G	T	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.797;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.524;NF=12;NR=0;PP=160;ReadPosRankSum=0.331;SC=TGTCATGGTGGTTTACTTTTT;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=12;WE=52466427;WS=52466409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,11:0.28:40
chr10	52566432	rs201036765	CT	C	185.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=2.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.709;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr10	52569637	rs10994563	G	A	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=214;ReadPosRankSum=-0.110;SC=GCCATTTCTGGCACAATTTTC;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=10;WE=52569645;WS=52569627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr10	52576068	rs4245008	G	A	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.834;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=32;PP=729;ReadPosRankSum=-0.859;SC=AAATATCAACGCGAGATGATA;SOR=0.434;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=54;TCF=5;TCR=49;TR=36;WE=52576076;WS=52576058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,38:0.67:57
chr10	52751070	rs79957958	A	AGCC	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=-0.358;QD=1.06;ReadPosRankSum=-0.028;SOR=0.280;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,5:0.17:30
chr10	52751088	rs35361017	C	CGCT	783.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.96;MQRankSum=2.567;QD=16.33;ReadPosRankSum=1.140;SOR=0.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr10	53458047	rs3740228	A	G	6418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=132;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.133;SC=TTTCCATGGCACGAGTCTCCA;SOR=1.436;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=205;TCF=72;TCR=133;TR=202;WE=53458055;WS=53458037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,210:0.99:212
chr10	53458167	rs3824686	C	T	3911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=53;PP=2965;SC=ATGGCCCTCCCCTCATCTCAT;SOR=0.932;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=68;TCR=54;TR=120;WE=53458175;WS=53458157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr10	53458998	rs2292828	A	G	4242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=44;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.803;SC=CTGCAGGCCCAAGGCTCTTTA;SOR=0.704;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=139;TCF=95;TCR=44;TR=138;WE=53459006;WS=53458988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,143:0.99:144
chr10	53667443	rs10823860	C	T	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.740;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=275;ReadPosRankSum=0.240;SC=TAAAAAATTTCTAAGCTCTGG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=13;WE=53667451;WS=53667433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr10	53667476	rs7081919	G	A	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=192;ReadPosRankSum=0.444;SC=ATTTGGCTTCGTATAGAAAGC;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=10;WE=53667484;WS=53667466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr10	53814229	rs1904010	G	T	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.527;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=477;ReadPosRankSum=0.131;SC=TTTTCTTATTGTTTCTACTTT;SOR=0.360;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=69;TCF=54;TCR=15;TR=25;WE=53814237;WS=53814219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,26:0.36:72
chr10	53814383	rs12778630	C	T	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.655;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=319;ReadPosRankSum=0.365;SC=TTAGTAACTCCAGTAGGAACA;SOR=0.244;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=69;TCF=13;TCR=56;TR=19;WE=53814391;WS=53814373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,23:0.31:74
chr10	53841337	rs1904024	A	G	1470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=4;PP=1236;SC=AATACTTACCATATGCCATGT;SOR=3.528;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=47;WE=53841345;WS=53841327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	53841639	rs5784902	AG	A	341.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=473;SC=TCCTGACAATAGGGGTCTCAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=13;WE=53841647;WS=53841629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	53921754	rs10824173	C	A	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=64;ReadPosRankSum=-0.126;SC=ATTTTGATTGCAAAATGATTT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=53921762;WS=53921744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr10	54050079	rs10762675	G	A	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=17;PP=479;SC=TTATAATTGTGTGACATAATT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=54050087;WS=54050069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	54074757	rs2241529	A	G	1658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=21;PP=1315;SC=GAGGGGACGCAGGCGTGCAAA;SOR=1.382;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=58;WE=54074765;WS=54074747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	54076271	rs1569198	A	G	6841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=108;NR=89;PP=2965;SC=TGCAGGTTTAACAGTAACTAT;SOR=0.857;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=198;TCF=108;TCR=90;TR=197;WE=54076279;WS=54076261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr10	54528266	rs930507	G	C	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.689;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=761;ReadPosRankSum=-0.067;SC=GAGAGAAGGTGAGCCCTAAAA;SOR=1.055;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=99;TCF=39;TCR=60;TR=41;WE=54528274;WS=54528256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,41:0.39:106
chr10	54528298	rs930508	G	C	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=476;ReadPosRankSum=-1.455;SC=GGGTGAAACTGACTCATCCTT;SOR=0.729;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=72;TCF=20;TCR=52;TR=27;WE=54528306;WS=54528288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,27:0.35:78
chr10	54528353	rs930509	C	G	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=247;ReadPosRankSum=-0.931;SC=TTCTAGAGTACAGTTGCCGGA;SOR=0.209;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=13;WE=54528361;WS=54528343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
chr10	54530694	rs1982267	G	T	294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=8;PP=230;SC=CTGTATGGTGGGCACCTGAGA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=54530702;WS=54530684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	55566406	rs17704703	T	G	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=1.508;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.93;ReadPosRankSum=2.358;SOR=0.505;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,37:0.20:183
chr10	55587034	rs10740555	A	G	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=6.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=557;ReadPosRankSum=0.339;SC=TCTTGAAAATAATAGAATAAA;SOR=0.420;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=58;TCR=0;TR=25;WE=55587042;WS=55587024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
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chr10	55588484	rs4935096	G	T	57.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.45;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
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chr10	55626367	rs10825135	A	G	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=477;ReadPosRankSum=0.411;SC=CTAGTATCGTAGCTACTTCCC;SOR=0.396;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=21;WE=55626375;WS=55626357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr10	55663198	rs10740559	A	C	1519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.51;ReadPosRankSum=-0.741;SOR=0.555;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,39:0.63:62
chr10	55663202	rs2593124	T	C	1497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.55;ReadPosRankSum=-0.698;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,38:0.62:61
chr10	55719652	rs2593107	C	T	1777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.163;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=59;PP=1452;ReadPosRankSum=0.668;SC=GTAAGAACAGCGTAACAGCAC;SOR=2.714;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=96;TCF=11;TCR=85;TR=63;WE=55719660;WS=55719642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,64:0.67:96
chr10	55755340	rs11003980	C	T	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=3;PP=715;ReadPosRankSum=1.834;SC=TCTTGTGATTCGGTCATTTAT;SOR=0.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=49;TCR=5;TR=31;WE=55755348;WS=55755330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr10	55779915	rs3812658	G	A	2870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=78;NR=7;PP=2434;SC=TGTAGAGAGAGCAAAGCAGGC;SOR=4.382;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=78;TCR=7;TR=85;WE=55779923;WS=55779905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr10	55826470	rs3812657	A	G	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=424;ReadPosRankSum=-2.005;SC=ATAAACTTACACTCTTTGAAA;SOR=1.204;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=80;TCF=78;TCR=2;TR=26;WE=55826478;WS=55826460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,27:0.33:83
chr10	55838950	rs1911433	A	G	1055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=1;PP=948;SC=TAGCCTGTTGAAGAAAAGAGC;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=33;WE=55838958;WS=55838940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	55943184	rs7093302	T	C	1761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=4;PP=1358;ReadPosRankSum=-0.773;SC=AGTGTACACTTATATTATGTG;SOR=0.772;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=89;TCF=82;TCR=7;TR=54;WE=55943192;WS=55943174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,59:0.62:95
chr10	55949151	rs16905686	G	A	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=2.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.66;ReadPosRankSum=-0.010;SOR=1.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,11:0.18:60
chr10	55955444	rs4935502	T	G	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=6.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.897;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=4;PP=705;ReadPosRankSum=-0.196;SC=TTAACTTACATCTTCTATGTC;SOR=1.270;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=104;TCF=87;TCR=17;TR=35;WE=55955452;WS=55955434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,35:0.34:103
chr10	55955543	rs145017164	C	G	2875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.138;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=54;PP=2195;ReadPosRankSum=-0.943;SC=CAGGATATAGCCTTGATAACT;SOR=0.860;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=148;TCF=70;TCR=78;TR=101;WE=55955551;WS=55955533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,105:0.69:153
chr10	55973889	rs10763086	G	A	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.612;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=612;ReadPosRankSum=2.491;SC=CCCTTCATCAGCTGAGGAACA;SOR=0.275;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=27;WE=55973897;WS=55973879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr10	55996761	rs721825	C	T	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.633;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=29;PP=706;ReadPosRankSum=1.173;SC=GAGACAGATGCTTTAGTTTGG;SOR=2.127;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=46;TCF=3;TCR=43;TR=30;WE=55996769;WS=55996751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,29:0.63:46
chr10	56076975	rs10763098	A	C	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=2;PP=870;SC=CTTGAACATGATCCCATTGGG;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=56076983;WS=56076965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	56077209	rs10740579	G	A	3539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=78;PP=2965;SC=GTCCTGTTAGGGAGAAAAACA;SOR=2.036;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=29;TCR=78;TR=107;WE=56077217;WS=56077199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr10	56089166	rs11004239	C	T	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=139;SC=TCAAAGAATACAGTGAATAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=56089174;WS=56089156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	56089223	rs11004240	A	G	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=1;PP=458;SC=TATTATATATAAACACCAAGG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=56089231;WS=56089213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	56089263	rs857395	G	A	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=2;PP=478;SC=GAAGTGAGTGGCACAGAGCTC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=56089271;WS=56089253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	56287569	rs41274636	T	C	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=469;ReadPosRankSum=0.024;SC=AAAACTCACTTACCATTCCGA;SOR=0.711;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=61;TCF=52;TCR=9;TR=25;WE=56287577;WS=56287559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,27:0.42:65
chr10	56287689	rs10825347	A	C	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.842;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=415;ReadPosRankSum=-0.814;SC=GGCACACACAATGAGAAAAAA;SOR=1.402;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=64;TCF=6;TCR=58;TR=22;WE=56287697;WS=56287679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,21:0.34:61
chr10	56335031	rs7070334	A	G	290.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=241;SC=TGCACAATGTACACATGTACC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=56335039;WS=56335021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	56335067	rs7070440	A	G	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=12;NR=0;PP=370;SC=TAATAAAAAAAAAAACTGAAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=56335075;WS=56335057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	56335099	rs10825362	C	T	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=4;PP=471;SC=TATTATTTCTCGTCAGTTCTT;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=56335107;WS=56335089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	56335273	rs7086121	G	A	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=3;PP=52;SC=GATGTTGGTAGCAGGGTTTAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=56335281;WS=56335263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	56345303	rs4570492	T	C	2465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=13;PP=1978;SC=ACTTCATAGCTGTAGGCTAAC;SOR=3.145;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=61;TCR=13;TR=74;WE=56345311;WS=56345293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr10	56345335	rs2026413	T	C	3057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=28;PP=2423;SC=AAATAATTCATTCATTTCATT;SOR=1.993;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=67;TCR=28;TR=95;WE=56345343;WS=56345325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr10	56345378	rs11396767	T	TG	2170.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.308;NF=31;NR=49;PP=1213;ReadPosRankSum=-0.589;SC=ATATGTGTTTTTTTTTTTTTT;SOR=0.786;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=86;TCF=33;TCR=53;TR=80;WE=56345386;WS=56345367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,88:0.98:90
chr10	56345425	rs2026412	G	A	2692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=61;PP=2156;SC=TGAGGACTGTGCAATTACTAG;SOR=2.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=24;TCR=61;TR=85;WE=56345433;WS=56345415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr10	56345491	rs2026411	C	G	1680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=37;PP=1135;SC=CCACAGATAACAGCCGCAATC;SOR=4.615;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=40;WE=56345499;WS=56345481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	56345511	rs2026410	A	G	1343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=27;PP=773;SC=CAACTTCAGCAGGTTCCCAGA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=56345519;WS=56345501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	56423968	rs11004439	A	C	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.561;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=777;ReadPosRankSum=-0.229;SC=TCAAAGAGAGAGCCCAGGATG;SOR=0.742;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=181;TCF=93;TCR=88;TR=59;WE=56423976;WS=56423958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,62:0.32:193
chr10	58118630	rs2241666	T	C	7779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=149;PP=2965;SC=TGAAACACCCTGTCAAGCTCC;SOR=0.968;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=266;TCF=117;TCR=149;TR=266;WE=58118638;WS=58118620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr10	58119087	.	G	A	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=190;ReadPosRankSum=-1.835;SC=TCATGCAGTGGTAAGTGGTGA;SOR=0.430;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=11;WE=58119095;WS=58119077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr10	58119976	rs3861049	G	A	4673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=100;NR=28;PP=2965;SC=CTCTCTGCCAGTGCTGCCCTG;SOR=2.372;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=129;TCF=101;TCR=28;TR=128;WE=58119984;WS=58119966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr10	58120848	rs8181328	G	C	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=90;ReadPosRankSum=-0.116;SC=TCACGGCAGGGTCGAACCTCA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=6;WE=58120856;WS=58120838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr10	58120988	rs11005328	C	A	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=12;PP=481;ReadPosRankSum=0.380;SC=TCTGTCTCCGCTGCCTCCATC;SOR=0.748;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=78;TCF=43;TCR=35;TR=27;WE=58120996;WS=58120978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,28:0.34:82
chr10	58121054	rs77628557	C	T	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=490;ReadPosRankSum=-0.334;SC=ACTTTGAAGTCACAGTCGACT;SOR=0.836;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=81;TCF=34;TCR=47;TR=30;WE=58121062;WS=58121044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,32:0.38:84
chr10	59064371	rs1275284	C	G	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=199;SC=ACATGTATCTCTCTGTGTGTA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=59064379;WS=59064361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	60095143	rs1905456	T	C	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=19;PP=624;SC=CCAGCGGGCATCGGACAGGTG;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=60095151;WS=60095133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	60147934	rs2277256	T	C	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.741;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=131;ReadPosRankSum=0.106;SC=TTTTTTCTTTTTATTTCATTC;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=8;WE=60147942;WS=60147924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr10	60273121	rs7100474	T	C	2858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.913;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.836;NF=32;NR=70;PP=2323;ReadPosRankSum=-1.004;SC=TCTCGGACTCTCCGACTGAGC;SOR=1.152;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=167;TCF=60;TCR=107;TR=102;WE=60273129;WS=60273111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,103:0.60:173
chr10	60273155	rs7079648	C	A	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.408;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.889;NF=14;NR=47;PP=999;ReadPosRankSum=0.012;SC=TCGGACATCCCCACCGCGCGC;SOR=1.664;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=105;TCF=32;TCR=73;TR=61;WE=60273163;WS=60273145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,62:0.57:109
chr10	60273189	rs10571555	ACGGC	A	1442.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.622;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.12;MQRankSum=0.026;NF=0;NR=33;PP=1527;ReadPosRankSum=-1.442;SC=ACTCCAGCCTACGGCCGGCCG;SOR=2.163;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=3;TCR=62;TR=33;WE=60273200;WS=60273179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,37:0.64:58
chr10	60548276	rs11812567	G	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=187;ReadPosRankSum=-0.176;SC=TTTTATAACCGAATCATGTTC;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=8;WE=60548284;WS=60548266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr10	60936778	.	A	G	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.25;ReadPosRankSum=-0.437;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr10	60936785	.	C	T	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.429;ClippingRankSum=0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.67;ReadPosRankSum=0.773;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr10	60937209	rs147249230	T	C	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-5.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.704;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=0;PP=759;ReadPosRankSum=1.187;SC=TTAACAAGTCTTTTTAGCCTC;SOR=2.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=55;TCR=1;TR=33;WE=60937217;WS=60937199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,35:0.57:61
chr10	60966734	rs180837526	T	C	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=2.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=33;ReadPosRankSum=-0.623;SC=AGCAAAACAATACAGTAAGAG;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=60966742;WS=60966724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr10	60996453	rs10763600	G	A	1969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=59;PP=1705;SC=AAAAGCTTTAGTTGTTCTGGG;SOR=8.222;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=0;TCR=59;TR=59;WE=60996461;WS=60996443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr10	61004724	rs189720059	C	T	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=155;ReadPosRankSum=0.618;SC=AGGCCTTTAACAGTAGATGTT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=8;WE=61004732;WS=61004714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr10	61005244	rs2452505	G	C	4739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=63;PP=2965;SC=GGATCTTTCTGTGGGCACCGT;SOR=0.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=139;TCF=74;TCR=65;TR=137;WE=61005252;WS=61005234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr10	61007534	rs1459996	A	G	1866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=53;PP=1455;SC=TTCACAATGAATCAAGTCATT;SOR=4.875;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=57;TCF=4;TCR=53;TR=57;WE=61007542;WS=61007524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr10	61007592	rs2446724	G	A	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=23;PP=662;SC=ATACTGTAACGGCCTCCACTT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=61007600;WS=61007582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	61011225	rs78017050	A	T	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=100;ReadPosRankSum=0.389;SC=CAGTGTGGAAATTATATACAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=61011233;WS=61011215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr10	61014056	rs1903252	C	A	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.403;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=439;ReadPosRankSum=1.169;SC=ATGTGACATCCTGTTAACTAC;SOR=1.071;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=23;WE=61014064;WS=61014046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,26:0.42:62
chr10	61029538	rs114010355	G	A	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=291;ReadPosRankSum=-1.392;SC=TATTGTTCCAGTCTCGCAGTT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=13;WE=61029546;WS=61029528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr10	61029574	rs114253399	C	T	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=321;ReadPosRankSum=1.899;SC=ATTTGTGCTACTTCAGTCACA;SOR=1.519;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=15;WE=61029582;WS=61029564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr10	61043151	rs147149862	G	A	1283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.400;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=12;PP=920;ReadPosRankSum=-0.329;SC=CGGCAAGCACGCTCTGGGTTG;SOR=0.389;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=73;TCF=56;TCR=17;TR=46;WE=61043159;WS=61043141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,49:0.64:76
chr10	61083690	rs34090373	A	AGTTG	1459.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.419;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=5;PP=1687;ReadPosRankSum=1.696;SC=GCAAGCACACAGCATTTCTGA;SOR=0.188;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=30;WE=61083698;WS=61083680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,34:0.77:44
chr10	61111975	rs284606	G	C	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=386;SC=GAACCGTGTGGCCTAGCCTAA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=61111983;WS=61111965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	61120684	rs284614	C	T	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=0;PP=919;ReadPosRankSum=2.322;SC=TTGAACCTGCCGTGCCTGTGA;SOR=1.848;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=35;WE=61120692;WS=61120674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,36:0.71:51
chr10	61120972	rs35736752	GT	G	833.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.599;NF=1;NR=39;PP=503;ReadPosRankSum=-0.656;SC=AGTCAATCCTGTTTTTTTTTT;SOR=0.669;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=87;TCF=4;TCR=83;TR=40;WE=61120980;WS=61120962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,42:0.76:55
chr10	61122268	rs3078330	T	TTA	2372.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=47;PP=2120;SC=TCTCCGGGAGTGAGCACATAC;SOR=5.174;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=50;TCF=1;TCR=49;TR=48;WE=61122276;WS=61122257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	61443751	rs7071865	T	C	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=111;ReadPosRankSum=1.766;SC=AGATATGTTATACTTTGAAAA;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=9;WE=61443759;WS=61443741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,11:0.28:40
chr10	61443808	rs1171660	A	G	1718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=5.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.895;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=10;PP=1358;ReadPosRankSum=1.269;SC=AGTAAATGTAATTAAATGATT;SOR=2.175;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=80;TCF=61;TCR=19;TR=56;WE=61443816;WS=61443798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,59:0.66:89
chr10	61444100	rs74152113	A	G	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.615;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=75;ReadPosRankSum=-0.577;SC=ACAAAAACAAACAGAAAAGAG;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=61444108;WS=61444090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr10	61552692	rs1053266	G	T	4101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=11.506;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=95;PP=2965;ReadPosRankSum=0.824;SC=TGGGAGGAGGGGTGCGCCGAA;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=132;TCF=36;TCR=96;TR=129;WE=61552700;WS=61552682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,132:0.99:134
chr10	61552774	rs1053265	C	T	2033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=36;PP=1748;ReadPosRankSum=-0.951;SC=GAGGTGGAGGCGGAGGTGGCT;SOR=0.223;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=74;TCF=38;TCR=36;TR=71;WE=61552782;WS=61552764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,74:0.99:75
chr10	61574357	.	AAC	A	107.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=1.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=2.604;QD=1.50;ReadPosRankSum=-2.337;SOR=1.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,13:0.18:72
chr10	61665886	rs1171830	C	A	1988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=55;NR=10;PP=1574;SC=TCACGATGGTCACGCTGGCTT;SOR=3.327;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=55;TCR=10;TR=65;WE=61665894;WS=61665876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	61802342	rs2393603	C	A	4594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=122;NR=4;PP=2965;SC=AAGGAAAGGACGGGGAAAATC;SOR=6.533;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=122;TCR=4;TR=126;WE=61802361;WS=61802332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr10	61802353	rs2393604	A	T	5901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=155;NR=9;PP=2965;SC=GGGGAAAATCAGAATCACTTA;SOR=5.586;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=155;TCR=9;TR=164;WE=61802361;WS=61802332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr10	61802374	rs2393605	AA	TT	9851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=174;NR=31;PP=2947;SC=TTTAGTGAAAAATATAAGTTT;SOR=3.452;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=211;TCF=177;TCR=34;TR=205;WE=61802383;WS=61802364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr10	61802550	rs9888033	A	T	5945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.281;NF=19;NR=155;PP=2965;ReadPosRankSum=0.591;SC=AAGATTTCACAGTGAAACAGT;SOR=1.960;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=176;TCF=19;TCR=157;TR=174;WE=61802569;WS=61802540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,183:0.99:185
chr10	61802561	rs2393607	G	T	5141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.306;NF=16;NR=132;PP=2965;ReadPosRankSum=0.478;SC=GTGAAACAGTGTTAGTTATAA;SOR=1.926;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=150;TCF=16;TCR=134;TR=148;WE=61802569;WS=61802540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,155:0.99:157
chr10	61802577	rs5785427	T	TC	4073.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=97;PP=2936;SC=TATAAAGCAGTCCATTCTGAT;SOR=5.531;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=116;TCF=2;TCR=114;TR=99;WE=61802585;WS=61802567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr10	61819049	rs10733757	T	G	3000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=10;PP=2331;SC=TAAGATAAACTATTAACAAGT;SOR=4.174;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=93;TCR=10;TR=103;WE=61819057;WS=61819039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr10	61823109	rs4568956	A	G	963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=20;PP=750;SC=AGCCCTGCTGACATTTTAGCT;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=61823117;WS=61823099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	61841875	.	C	G	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.895;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=2;PP=900;ReadPosRankSum=-0.564;SC=TATTCTACTTCTGATAGAATA;SOR=1.299;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=54;TCF=50;TCR=4;TR=35;WE=61841883;WS=61841865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,39:0.68:57
chr10	61844308	rs76589554	C	T	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.232;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=359;ReadPosRankSum=2.712;SC=CAAAATAAAACCTCATATCTG;SOR=0.066;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=18;WE=61844316;WS=61844298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr10	61868716	rs3750800	C	A	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=28;PP=798;ReadPosRankSum=0.000;SC=GAGTGGGGGCCGTACACTTGC;SOR=0.762;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=71;TCF=15;TCR=56;TR=35;WE=61868724;WS=61868706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,38:0.51:74
chr10	61871430	rs10821675	C	G	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.637;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=122;ReadPosRankSum=-0.619;SC=CTAACTATGGCAAAAATTCAC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=8;WE=61871438;WS=61871420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr10	61893898	rs3213829	T	G	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.037;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=387;ReadPosRankSum=2.361;SC=TTTAACTGGCTAGTACCAGAA;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=22;WE=61893906;WS=61893888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr10	61897132	.	G	GAA	56	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=18;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=15;MQ=59.23;NF=0;NR=4;PP=56;QD=14.75;SC=GTAATTTTAGGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=4;WE=61897140;WS=61897122;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:15,4:0.21:19
chr10	61900356	rs6479694	A	C	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=39;PP=1160;SC=TCAGGCCCCCAAAAAAATCTT;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=39;WE=61900364;WS=61900346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	61932795	rs78795965	T	C	2666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.287;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=44;PP=2171;ReadPosRankSum=2.194;SC=CTTAATTCCTTTGAAGCAAAA;SOR=0.823;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=152;TCF=80;TCR=72;TR=94;WE=61932803;WS=61932785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,96:0.62:156
chr10	61941250	rs10994246	G	A	1390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.991;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=34;PP=1061;ReadPosRankSum=1.883;SC=AGCCATGTTTGAGAAACCATT;SOR=0.271;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=175;TCF=66;TCR=109;TR=62;WE=61941258;WS=61941240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,64:0.35:181
chr10	61960135	rs16914619	A	G	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=193;ReadPosRankSum=0.877;SC=CAAATGCATGAGAATTTCACA;SOR=0.481;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=10;WE=61960143;WS=61960125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr10	62039654	rs1380451	G	C	1897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=3;PP=1542;SC=TAAAGTATAGGCACCTTAAAT;SOR=5.211;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=52;TCR=3;TR=53;WE=62039662;WS=62039644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr10	62060128	rs10994296	A	G	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.43;ReadPosRankSum=-0.629;SOR=0.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,33:0.24:140
chr10	62375033	rs1837947	A	G	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.049;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=313;ReadPosRankSum=-0.218;SC=AATTCCATATATTTACCATGA;SOR=0.479;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=67;TCF=23;TCR=44;TR=22;WE=62375041;WS=62375023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,22:0.31:70
chr10	62540063	rs2448344	T	A	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=3;PP=51;SC=AACCATTAAGTTGTCTTGTAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=62540071;WS=62540053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	62548098	rs2456772	G	C	1796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=48;PP=1397;SC=CTACTCTGTGGCAGTATCAAT;SOR=7.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=48;WE=62548106;WS=62548088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	62551815	rs3212319	GC	G	1729.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.976;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=60.28;MQRankSum=1.066;NF=20;NR=22;PP=1615;ReadPosRankSum=-0.235;SC=TTTTCAGGTAGCTATTAAAAA;SOR=0.602;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=68;TCF=31;TCR=37;TR=42;WE=62551823;WS=62551805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,50:0.65:77
chr10	62551889	rs2456777	AA	GT	6433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=107;NR=18;PP=2947;SC=AGAAATTTTTAATTTCCTGTT;SOR=3.017;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=134;TCF=112;TCR=22;TR=125;WE=62551898;WS=62551879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr10	62553763	rs1871446	A	G	1076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=30;PP=915;SC=CATATGTTATATCAACAGATA;SOR=4.174;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=33;WE=62553771;WS=62553753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	63170292	rs7083475	A	G	3530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=435;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.380;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=75;PP=2692;ReadPosRankSum=-1.191;SC=TAGAGTTGCAACACCACCACG;SOR=0.506;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=412;TCF=186;TCR=226;TR=147;WE=63170300;WS=63170282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:278,153:0.35:431
chr10	63422754	rs151189963	G	GGGGCCGACCCCGGCA	5375.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=14;PP=2969;SC=CGACTCCCTGGGGGCCGACCC;SOR=1.921;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=78;TCF=51;TCR=27;TR=43;WE=63422762;WS=63422744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr10	63519674	rs2588915	G	A	2408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=70;NR=0;PP=2119;SC=AGGACAAAAAGGGCAATGGCA;SOR=8.526;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=71;TCR=0;TR=70;WE=63519682;WS=63519664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr10	63520698	rs1992625	T	C	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=29;PP=1199;SC=TAGTTGGTTTTACCATTGAAG;SOR=1.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=42;WE=63520706;WS=63520688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr10	63699895	rs7073837	A	C	1123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=8;PP=846;ReadPosRankSum=0.274;SC=CATTTCCCTCAAACCTATAAA;SOR=0.574;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=119;TCF=99;TCR=20;TR=45;WE=63699903;WS=63699885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,46:0.38:121
chr10	63700228	rs4360655	A	T	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.941;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=534;ReadPosRankSum=1.655;SC=TTTTCGGTTGAAGATTTTTCT;SOR=1.361;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=71;TCF=10;TCR=61;TR=28;WE=63700236;WS=63700218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,30:0.41:74
chr10	63700245	rs4562771	A	G	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=436;ReadPosRankSum=0.075;SC=TTCTGGAAACACTATCATTTA;SOR=0.169;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=22;WE=63700253;WS=63700235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr10	63818920	rs3832683	GA	G	191.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=159;SC=CTTTCTCGTTGAAAAAAAAAA;SOR=3.056;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=9;WE=63818928;WS=63818910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	63944176	rs3125730	A	C	1683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=21;PP=1229;SC=ACCTTTAGTCACCCACAGAGG;SOR=0.970;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=30;TCR=21;TR=51;WE=63944184;WS=63944166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	63958112	rs3125734	T	C	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=14.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.88;ReadPosRankSum=-0.150;SOR=0.190;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,44:0.28:157
chr10	63959467	.	G	A	2253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-6.100;ClippingRankSum=0.000;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.734;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=18;PP=1882;ReadPosRankSum=2.001;SC=TATGGACAATGTTGTTTTTGT;SOR=0.479;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=137;TCF=111;TCR=26;TR=83;WE=63959475;WS=63959457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,85:0.60:141
chr10	63974950	rs4559572	C	G	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=325;SC=CATTTTTACTCCTCAGCTATT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=63974958;WS=63974940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	63977011	rs148142088	GAAAAA	G	5929.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=18;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.271;NF=10;NR=102;PP=1390;SC=ACCATTTGCTGAAAAAAAAAA;SOR=0.649;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=153;TCF=22;TCR=131;TR=112;WE=63977024;WS=63977001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,143:0.98:146
chr10	63977069	rs1432414	A	T	3863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=110;PP=2965;SC=CACTTTAAATACATCAAAATA;SOR=8.033;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=111;TCF=1;TCR=110;TR=111;WE=63977077;WS=63977059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr10	63978077	rs11355398	GA	G	701.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.34;QD=24.20;SOR=3.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	63982984	rs10740069	A	G	1620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=9;PP=1160;SC=AGTAAAATATATACTGTACTT;SOR=2.701;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=43;WE=63982992;WS=63982974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	63995983	rs3852448	C	T	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=19;PP=658;SC=AGCAACTATACACTTCCACCT;SOR=2.124;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=63995991;WS=63995973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	64000878	rs1368158	T	G	1179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.497;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=10;PP=995;ReadPosRankSum=1.063;SC=AACATTTCAATTACAAATTAA;SOR=1.974;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=38;WE=64000886;WS=64000868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr10	64001114	rs1368157	T	C	182.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=178;SC=TTATAGTTTGTACTTTTAAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=64001122;WS=64001104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	64005582	rs34205992	T	TA	223.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=309;SC=TCTTAAACTCTAAAGTTCTAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=64005590;WS=64005572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	64005711	rs3815999	C	T	1327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=15;PP=972;SC=CATGTAGTTACGTTATAGAAT;SOR=1.455;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=41;WE=64005719;WS=64005701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	64019037	rs10675790	A	ATAAAT	1120.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=3;PP=1148;SC=CTTTTTCTTAATACTCAGTCT;SOR=2.303;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=18;WE=64019045;WS=64019027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	64136710	rs149800343	CAG	C	1296.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=26;PP=1321;SC=GTGTTGCTGACAGGGGATGCT;SOR=2.985;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=29;WE=64136719;WS=64136700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	64136751	rs1873686	G	C	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=518;SC=CACCCCAATCGCCTTACAAGC;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=64136759;WS=64136741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	64148125	rs3852424	C	A	4618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=47;PP=2965;SC=TTATATTTCCCTTTTGTGTTC;SOR=1.755;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=152;TCF=103;TCR=49;TR=150;WE=64148133;WS=64148115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr10	64148369	rs2893897	A	G	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=492;SC=CGAGTGTAAGATCCCTGTGGT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=64148377;WS=64148359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	64415184	rs7076156	A	G	5085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=72;PP=2965;SC=AGACCATCTCACCTTCCAACC;SOR=1.052;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=169;TCF=96;TCR=73;TR=168;WE=64415192;WS=64415174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr10	64426056	rs4746516	G	T	3830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.722;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=80;PP=2965;ReadPosRankSum=0.445;SC=GTCATGGGCTGAATTGCATCC;SOR=0.279;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=127;TCF=45;TCR=82;TR=125;WE=64426064;WS=64426046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,125:0.98:127
chr10	64564934	rs10995311	C	G	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.052;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=341;ReadPosRankSum=-0.177;SC=GGCTTCTGGCCCGGAGGCGCC;SOR=1.030;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=89;TCF=62;TCR=27;TR=27;WE=64564942;WS=64564924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,27:0.29:93
chr10	64573771	rs224083	C	T	2981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=59;PP=2402;SC=GCTTGGGGGACGGATAGGAAG;SOR=1.112;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=38;TCR=59;TR=97;WE=64573779;WS=64573761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr10	64578250	rs71472226	C	CAAGA	2375.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FS=0.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=2.333;QD=9.32;ReadPosRankSum=0.957;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:186,69:0.27:255
chr10	64893433	rs2175197	T	C	1663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=46;PP=1365;SC=GGCTCCAGGCTAGCCACTTCA;SOR=7.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=46;WE=64893441;WS=64893423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr10	64937314	rs35854283	G	A	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=425;SC=TTTCAAAGAGGAGCAAGAGAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=64937322;WS=64937304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	64944317	rs10740107	T	A	3748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=21;PP=2965;SC=GCAAAAATTTTAAAAAATCCA;SOR=2.933;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=93;TCR=21;TR=113;WE=64944325;WS=64944307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr10	64945364	rs3211105	G	A	4272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=100;PP=2965;SC=CTGAAGGCCAGTCTTTCAATT;SOR=2.922;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=20;TCR=100;TR=120;WE=64945372;WS=64945354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr10	64953311	rs4747098	G	A	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=418;SC=ACAATATTTTGTATTATAATT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=64953319;WS=64953301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	64953959	rs2306264	C	G	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=0;PP=529;SC=TCTCTCCACCCTGTTATATTT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=64953967;WS=64953949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	64960536	rs10465990	G	A	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=22;PP=630;SC=GTGATGATACGGTAAGACTTT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=64960544;WS=64960526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	64967445	rs1904294	A	T	7536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=90;PP=2965;SC=TTTCACTAACACGATCTTTAG;SOR=1.149;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=225;TCF=135;TCR=90;TR=225;WE=64967453;WS=64967435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr10	64974537	rs10761725	A	T	4595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=55;PP=2965;SC=TGTTCTGACGAATGAATAATC;SOR=1.132;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=84;TCR=55;TR=139;WE=64974545;WS=64974527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr10	65139945	rs7477425	T	C	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=4;PP=528;SC=TTCAAGCAATTGTCCTGCTTC;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=65139953;WS=65139935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	65225244	rs1061259	GA	CG	2398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=6;PP=2380;SC=GGGGGGCGCTGACTCTCTTAC;SOR=2.670;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=53;TCF=43;TCR=10;TR=46;WE=65225253;WS=65225234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr10	65225450	rs1054693	C	T	6289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=86;PP=2965;SC=CGGCCGCTGCCTCCTCCAGTG;SOR=1.066;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=114;TCR=86;TR=200;WE=65225458;WS=65225440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr10	65322464	rs36027145	A	ATCAG	3458.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.564;NF=8;NR=60;PP=2977;ReadPosRankSum=-0.107;SC=CTCTGCAGCAATCAATCAATT;SOR=2.252;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=76;TCF=11;TCR=65;TR=68;WE=65322472;WS=65322454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,80:0.99:81
chr10	65379304	rs35995927	G	A	2857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=22;PP=2180;SC=TGCAAAAAGAGTAACTGGGGG;SOR=2.383;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=63;TCR=22;TR=85;WE=65379312;WS=65379294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr10	65383515	.	ATG	A	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=-0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.70;ReadPosRankSum=0.365;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr10	65928826	rs10740151	T	C	5119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=42;PP=2965;SC=CACTCTTTTCTGTATAGCTTG;SOR=2.079;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=115;TCR=42;TR=157;WE=65928834;WS=65928816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr10	68535082	rs5785786	C	CT	3008.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=88;NR=4;PP=2716;SC=TATATTTACTCTTTTTTTCCT;SOR=6.399;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=114;TCF=106;TCR=8;TR=92;WE=68535090;WS=68535072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr10	68685929	rs7902006	G	C	4423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=93;PP=2965;SC=AACTGCTGGGGTATGGAATAC;SOR=1.911;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=37;TCR=93;TR=130;WE=68685937;WS=68685919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr10	69583206	rs962608	G	A	1658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=46;PP=1324;SC=AGTGACTCACGCCTATAATCT;SOR=4.575;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=4;TCR=46;TR=50;WE=69583214;WS=69583196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	69647332	rs932657	G	T	1197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=33;PP=998;SC=TAAATGTACGGTTTTTGGTTT;SOR=3.855;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=37;WE=69647340;WS=69647322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	69648569	rs2236318	T	A	1775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=0;PP=1459;ReadPosRankSum=-0.867;SC=GCTAACTCATTACTTCAGAAA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=52;WE=69648577;WS=69648559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr10	69651125	rs7896005	A	G	3275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=9;PP=2631;SC=AAGGTAGAAGATTTAATTTTA;SOR=4.003;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=82;TCR=9;TR=91;WE=69651133;WS=69651115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr10	69668014	rs10997870	G	T	179.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=144;SC=GTTAGCATTTGGGAATTTTGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=69668022;WS=69668004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	69692330	rs3758392	T	C	2820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=82;NR=4;PP=2399;SC=CATTTAACAATATCAGAGATT;SOR=5.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=82;TCR=4;TR=86;WE=69692338;WS=69692320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr10	69699478	.	GAT	G	118	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=6;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=118;QD=25.0;SC=TTTACTTATGGATATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=69699489;WS=69699468;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,5:0.36:14
chr10	69719074	rs7907843	C	T	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=209;SC=TATATATCTACTAATGTAAGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=69719082;WS=69719064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	69750213	rs11422655	G	GAA	246.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.24;QD=24.67;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	69750788	rs5785841	GA	G	5115.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.14;MQRankSum=0.189;QD=24.25;ReadPosRankSum=1.223;SOR=0.962;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,208:0.99:211
chr10	69755112	rs2308195	C	CCTAT	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=449;SC=TTAGTTTCTCCCTATTATATA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=9;WE=69755120;WS=69755102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	69896336	rs12221035	G	A	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.059;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=7;PP=657;ReadPosRankSum=3.165;SC=TCAGAGTGACGGTTACCGATT;SOR=0.455;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=101;TCF=84;TCR=17;TR=35;WE=69896344;WS=69896326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,38:0.36:105
chr10	69902549	rs3814180	T	C	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=408;ReadPosRankSum=-0.134;SC=CTTCTCACTGTTACAAAAAAA;SOR=1.445;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=17;WE=69902557;WS=69902540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,18:0.82:22
chr10	69921335	rs10823142	T	A	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=67;ReadPosRankSum=-0.180;SC=CCTGTCCCTGTTGAGATCATC;SOR=1.022;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=5;WE=69921343;WS=69921327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr10	69925123	rs10823146	C	T	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.237;NF=20;NR=0;PP=465;ReadPosRankSum=0.610;SC=GTAGGAGAATCGCTTGAACCT;SOR=1.040;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=20;WE=69925131;WS=69925113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr10	69925176	rs10823147	T	C	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.498;NF=39;NR=8;PP=1052;ReadPosRankSum=-0.188;SC=GCCACTGCGCTCCAGCCTGGG;SOR=0.855;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=75;TCF=61;TCR=14;TR=47;WE=69925184;WS=69925166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,51:0.65:79
chr10	69926097	rs2673794	T	C	1959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.692;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=23;PP=1601;ReadPosRankSum=0.202;SC=CAGCCAACTCTACCACCAACC;SOR=0.114;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=102;TCF=75;TCR=27;TR=75;WE=69926105;WS=69926087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,72:0.73:98
chr10	69926334	rs10823148	C	G	3247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.355;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=71;PP=2770;ReadPosRankSum=0.600;SC=CCGATTCTTTCCAGGAGAGGT;SOR=1.223;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=150;TCF=62;TCR=88;TR=114;WE=69926342;WS=69926324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,111:0.74:150
chr10	69933921	rs10997975	G	A	4515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.044;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=84;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.207;SC=TTTCCTTTCAGCATGACTGTT;SOR=0.603;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=267;TCF=129;TCR=138;TR=165;WE=69933929;WS=69933911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,169:0.61:277
chr10	69933969	rs7916821	G	A	3888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.514;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=86;PP=2962;ReadPosRankSum=1.139;SC=ACAACATCCAGTAAGCAGGTG;SOR=0.765;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=218;TCF=86;TCR=132;TR=140;WE=69933977;WS=69933959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,144:0.63:228
chr10	69934258	rs3814182	C	G	8795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=139;NR=137;PP=2965;SC=CCATCCCCAGCGGAAACCAGT;SOR=0.700;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=276;TCF=139;TCR=137;TR=276;WE=69934266;WS=69934248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr10	69934467	rs3814183	A	G	1646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=44;PP=1371;SC=GTCGATGTGCACATTGAATAG;SOR=3.486;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=7;TCR=44;TR=51;WE=69934475;WS=69934457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr10	69934535	rs7917519	G	A	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=12;PP=367;SC=ATTCTCTTAGGCACAGAATGG;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=69934543;WS=69934525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	69935059	rs7097776	A	G	3267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=23;PP=2576;SC=TGGGTGTGTCAGGTGTGGATT;SOR=2.584;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=115;TCF=92;TCR=23;TR=113;WE=69935067;WS=69935049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr10	69935235	rs6480306	T	C	6036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=129;PP=2965;SC=TTGTTGGATTTAGAAGGTTTA;SOR=2.059;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=179;TCF=48;TCR=131;TR=177;WE=69935243;WS=69935225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr10	69948844	rs10733838	T	C	2907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=59;PP=2317;SC=GCTCTCCAGTTACATTCACCT;SOR=1.718;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=25;TCR=59;TR=84;WE=69948852;WS=69948834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr10	69954290	rs7081213	G	A	2630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=75;PP=2166;SC=AGGGTTCTGCGCTGTGCTGCA;SOR=5.524;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=4;TCR=75;TR=79;WE=69954298;WS=69954280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr10	69955140	rs7069569	T	A	1977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=6;PP=1564;SC=GGTCCAGAAATTTTTATGTAA;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=52;TCR=6;TR=58;WE=69955148;WS=69955130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr10	69956999	.	C	CA	85	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=26;MQ=62.13;NF=5;NR=0;PP=85;QD=18.2;SC=TTTCCCCCTTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=69957007;WS=69956989;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,5:0.62:8
chr10	69957340	rs7095603	G	A	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.98;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	69957350	rs7095607	G	A	366.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.85;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	69957375	rs7095492	C	T	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=105;SC=CACTTTTTTTCATCATAAGGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=69957383;WS=69957365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	69959097	rs7079549	G	T	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=0;PP=683;SC=CATCAGTCATGTGCCTCAGCT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=69959105;WS=69959087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	69959242	rs7079481	C	A	3023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=46;PP=2414;SC=GCTCATTGACCCACTCACTCA;SOR=0.842;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=54;TCR=46;TR=99;WE=69959250;WS=69959232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr10	69959345	rs11279655	GCTGGGA	G	4047.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=50;PP=2971;SC=AAGGTTTGCTGCTGGGACCCC;SOR=1.389;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=15;TCR=51;TR=65;WE=69959358;WS=69959335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr10	69959397	rs7079974	G	A	1691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=47;PP=1389;SC=AAGAGGCAGAGCCTCTGCCAG;SOR=3.383;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=8;TCR=47;TR=55;WE=69959405;WS=69959387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	69961470	rs7913133	A	G	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=0;PP=614;SC=GGGTGCAGGCAGAGGTTGCAG;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=27;WE=69961478;WS=69961460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	69961501	rs7913146	A	G	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=0;PP=866;SC=TCTTGCCACCACACTCCAGCC;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=69961509;WS=69961491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	69961789	.	C	T	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-6.673;ClippingRankSum=0.000;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=434;ReadPosRankSum=-1.258;SC=CTCCCACTCTCAGTGGGGCTT;SOR=0.538;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=70;TCF=3;TCR=67;TR=25;WE=69961797;WS=69961779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,27:0.36:76
chr10	69966392	rs3814185	T	G	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=1;PP=170;SC=CTGCTCTTCTTTGACGTCTTC;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=69966400;WS=69966390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	70045201	rs7909365	C	A	5811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=122;PP=2965;ReadPosRankSum=0.598;SC=AGACAATCCCCAAGAAAACAG;SOR=0.877;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=174;TCF=51;TCR=123;TR=173;WE=70045209;WS=70045191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,180:0.99:181
chr10	70045264	rs3816299	A	C	2698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=66;PP=2156;SC=TCCAGTTTGAATAAACTCTAG;SOR=3.098;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=80;TCF=13;TCR=67;TR=79;WE=70045272;WS=70045254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr10	70051810	rs3835100	A	G	2674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=31;PP=2117;SC=GATGGGGGGAAAAAAAACAAA;SOR=1.302;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=50;TCR=31;TR=81;WE=70051818;WS=70051800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr10	70051928	rs10823171	A	G	4223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=56;PP=2965;SC=GGACGATGCCATCCTCTGCTC;SOR=1.242;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=89;TCR=56;TR=145;WE=70051936;WS=70051918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr10	70056600	rs2394470	C	T	1965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=2;PP=1704;SC=CACTCCAGCCCGTGCGACAGA;SOR=5.856;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=58;TCF=56;TCR=2;TR=58;WE=70056608;WS=70056590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	70105560	rs1162753	G	A	7569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=146;NR=92;PP=2965;SC=TGAATGAGCAGTGCATGACAG;SOR=1.297;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=239;TCF=147;TCR=92;TR=238;WE=70105568;WS=70105550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr10	70143774	rs7899885	C	T	2082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=52;PP=1699;SC=ATTTCTGACACGAGATTGTCT;SOR=3.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=10;TCR=52;TR=62;WE=70143782;WS=70143764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr10	70166913	rs59831114	T	G	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=12;PP=538;SC=ACTGAGGGCCTAGCGTTCGGT;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=24;WE=70166921;WS=70166903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	70174707	rs1801041	T	A	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=410;ReadPosRankSum=0.162;SC=AAATACTGCATTAAATTTTGT;SOR=0.502;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=24;WE=70174715;WS=70174697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr10	70210007	rs34191745	GA	G	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.99;ReadPosRankSum=-0.955;SOR=0.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr10	70231696	rs201458873	G	A	3990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.534;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=60;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.106;SC=CTTAGAAAAGGGAAAAAGGCG;SOR=0.647;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=211;TCF=120;TCR=91;TR=141;WE=70231704;WS=70231686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,145:0.67:215
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chr10	70332773	rs201408896	A	G	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.766;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=541;ReadPosRankSum=-0.733;SC=GTGGTGAAGGACTATTCTCTG;SOR=0.792;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=108;TCF=54;TCR=54;TR=30;WE=70332781;WS=70332763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,32:0.27:117
chr10	70392319	rs10733844	G	A	2064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=5;PP=1744;SC=TTGGAGTAGGGGGGTTTATCT;SOR=4.548;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=57;TCR=5;TR=62;WE=70392327;WS=70392309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	70405855	rs3998860	A	G	10114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=199;NR=94;PP=2965;SC=AGGGCACAATACAACAGAAAC;SOR=1.739;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=293;TCF=199;TCR=94;TR=293;WE=70405863;WS=70405845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,302:1.00:302
chr10	70442868	rs11284778	GA	G	205.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=144;SC=AAAATAAAGTGAAAAAAAAGA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=70442876;WS=70442858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	70481547	rs1616158	C	T	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=138;ReadPosRankSum=1.022;SC=CGAGCTCTGGCCCTTGAGGGT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=8;WE=70481555;WS=70481537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr10	70497799	rs1149679	C	T	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.841;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=39;ReadPosRankSum=-1.211;SC=AAAAAAGGAACGTCTCCAAGG;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=4;WE=70497807;WS=70497789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr10	70502288	rs1300253	G	A	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.663;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=32;PP=842;ReadPosRankSum=-0.086;SC=TACATGATACGTTTGGATTTG;SOR=1.083;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=122;TCF=38;TCR=84;TR=44;WE=70502296;WS=70502278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,48:0.37:131
chr10	70502426	rs1300252	T	C	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=301;SC=TGGACACAGTTGTGCAATCTC;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=70502434;WS=70502416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	70520636	rs58477996	CAAA	C,CAA	380.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.07;MQRankSum=0.000;QD=23.80;ReadPosRankSum=-0.978;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,7,8:0.44,0.50:16
chr10	70525591	rs1149688	G	A	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.497;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=2;PP=525;ReadPosRankSum=1.022;SC=TCTTGCACATGTATATACATC;SOR=1.032;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=93;TCF=87;TCR=6;TR=31;WE=70525599;WS=70525581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,35:0.35:99
chr10	70531217	rs10823258	C	T	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.542;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=28;PP=555;ReadPosRankSum=-0.264;SC=GTAATAACAACCTGCTTTAGA;SOR=1.501;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=107;TCF=26;TCR=81;TR=33;WE=70531225;WS=70531207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,32:0.30:107
chr10	70532990	rs12570981	G	A	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=61;ReadPosRankSum=-1.003;SC=TCTTCAGTGAGAAAGTTTTTC;SOR=0.197;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=4;WE=70532998;WS=70532980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr10	70534744	rs1782323	A	C	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=118;ReadPosRankSum=0.071;SC=TTTACGGTATATTTTGTTTGC;SOR=0.963;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=9;WE=70534752;WS=70534734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr10	70641860	rs1341667	T	C	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=31;PP=712;ReadPosRankSum=-0.492;SC=GATGAAACATTACCCAGGTAG;SOR=0.601;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=111;TCF=21;TCR=90;TR=39;WE=70641868;WS=70641850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,42:0.37:114
chr10	70645376	rs10509305	A	C	3374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=62;PP=2452;ReadPosRankSum=-0.039;SC=TGAGATATGAAGTGTATGGTG;SOR=0.782;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=205;TCF=107;TCR=98;TR=132;WE=70645384;WS=70645366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,135:0.65:209
chr10	70646393	rs75827490	G	A	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=51;PP=1313;ReadPosRankSum=-0.031;SC=ATACAAAAGTGTCTGATTTAG;SOR=0.816;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=96;TCF=12;TCR=84;TR=58;WE=70646401;WS=70646383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,59:0.59:100
chr10	70652272	rs4472827	G	A	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=321;ReadPosRankSum=-0.140;SC=GTAGCAAATGGAAGTATAATG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=14;WE=70652280;WS=70652262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr10	70673430	rs5030891	G	A	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=87;ReadPosRankSum=1.117;SC=TGTCCCCTGCGTTCTAACAAA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=7;WE=70673438;WS=70673420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr10	70696009	rs7084726	T	C	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=34;PP=819;SC=TTTGGGAGGCTGAGGCGGGCA;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=70696017;WS=70695999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	70696713	rs5030895	C	T	309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=226;SC=CCGTTTCTTACGCTGCTGTTG;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=70696721;WS=70696703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	70696908	rs1539166	G	T	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=13;PP=396;SC=TTGAACATAGGAAATATTGTA;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=70696916;WS=70696898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	70700944	rs5030900	A	G	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.451;NF=8;NR=1;PP=98;ReadPosRankSum=-0.663;SC=TCCTGAAAGGAAATATGGTAG;SOR=0.746;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=9;WE=70700952;WS=70700934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr10	70702853	rs955413	C	T	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.296;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=231;ReadPosRankSum=-0.345;SC=TGTTTAGTTACTTTTTAAATT;SOR=3.424;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=10;WE=70702861;WS=70702843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr10	70716106	rs5030896	A	G	2925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=76;PP=2418;SC=GGGACGCTGAATGGAGCGGAA;SOR=3.185;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=15;TCR=76;TR=91;WE=70716114;WS=70716096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr10	70722939	rs5030897	T	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.229;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=139;ReadPosRankSum=0.000;SC=GAAGGTAGAATTCCTTAATTC;SOR=0.041;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=9;WE=70722947;WS=70722929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr10	70725128	rs3898314	A	G	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=7.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.871;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=1;PP=632;ReadPosRankSum=-0.561;SC=ATTTTTCTTTATCAGGTACTG;SOR=2.972;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=92;TCF=72;TCR=20;TR=29;WE=70725136;WS=70725118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,32:0.33:98
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chr10	70734589	rs3740595	T	A	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=1.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.52;ReadPosRankSum=0.818;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,44:0.43:103
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chr10	70884013	rs5030909	G	A	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.391;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=384;ReadPosRankSum=0.393;SC=GAGTAGGGGGGACGCGGCGGC;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=22;WE=70884021;WS=70884003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr10	70892791	rs5030932	C	T	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=647;ReadPosRankSum=1.491;SC=ACGGAGAATCCGTTTCAGGAA;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=28;WE=70892799;WS=70892781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,30:0.75:40
chr10	70922159	rs61871361	T	C	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.823;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=354;ReadPosRankSum=0.228;SC=TCTTCCCCAATAGGTATCATT;SOR=1.609;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=17;WE=70922167;WS=70922149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr10	70931199	rs34811737	G	A	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=313;ReadPosRankSum=0.412;SC=TGAAATGTTCGTTCATGTATA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=15;WE=70931207;WS=70931189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr10	70945840	rs5030910	C	T	1574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=33;PP=1151;ReadPosRankSum=-0.615;SC=AAAACATCTTCATAGAGGTAT;SOR=0.657;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=35;TCR=56;TR=54;WE=70945848;WS=70945830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,60:0.63:95
chr10	70946014	.	C	T	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.059;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=93;ReadPosRankSum=0.897;SC=GCTGCAGCTGCGGCCTTCCTT;SOR=0.283;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=6;WE=70946022;WS=70946008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr10	70951346	rs11817569	T	C	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=460;ReadPosRankSum=0.074;SC=GAACACCCTGTTAAATATCCA;SOR=1.284;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=21;WE=70951354;WS=70951336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr10	70955056	rs5018859	A	G	2759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.070;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=57;PP=2135;ReadPosRankSum=-0.474;SC=CCCGTGCTTTATGACATCTGC;SOR=1.125;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=149;TCF=65;TCR=84;TR=96;WE=70955064;WS=70955046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,103:0.66:157
chr10	70958327	rs5030911	C	T	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.685;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=33;PP=838;ReadPosRankSum=0.833;SC=TGACTTTCCTCGTGACAAGAT;SOR=1.721;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=53;TCF=10;TCR=43;TR=39;WE=70958335;WS=70958317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,40:0.70:57
chr10	70962381	rs2279928	C	G	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.548;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=490;ReadPosRankSum=0.611;SC=TGAGAAGTTGCTATTTATAAA;SOR=1.350;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=101;TCF=2;TCR=99;TR=29;WE=70962389;WS=70962371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,29:0.28:102
chr10	70968199	rs4746821	G	T	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=161;ReadPosRankSum=0.815;SC=CCTCCGATATGTGGGGGCAGA;SOR=0.207;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=10;WE=70968207;WS=70968189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr10	70968804	rs35757450	G	GT	198.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=115;ReadPosRankSum=0.680;SC=TTCTGTTCCTGTTTTTTTTTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=9;WE=70968812;WS=70968794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr10	70992413	rs874557	G	A	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=459;SC=ATGATACCTAGTGGCTGTGAT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=70992421;WS=70992403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	70992664	rs874556	C	T	5890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=99;PP=2965;SC=GGGAACGGCACAGAGGTACCT;SOR=0.887;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=85;TCR=99;TR=184;WE=70992672;WS=70992654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr10	70992912	rs5030970	A	T	2195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=52;PP=1770;SC=GGGAAGCAGCAGTGCAGGAAT;SOR=2.269;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=69;WE=70992920;WS=70992902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr10	70992949	rs5030971	T	A	2138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=45;PP=1400;SC=TGGGCACGGGTGGGAGTCAGG;SOR=4.133;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=50;WE=70992957;WS=70992939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr10	70992970	rs5030972	G	A	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=41;PP=1186;SC=CTGCACGCAGGAGAGAACAGC;SOR=5.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=43;WE=70992978;WS=70992960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	70998738	rs4145930	G	A	3269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=34;PP=2493;SC=AAGTTTCTGCGGCTCAGTTGC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=68;TCR=34;TR=102;WE=70998746;WS=70998728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr10	71010026	rs4745978	T	C	1117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=6;PP=868;SC=GGAATGCAGCTGCTGCTTTCT;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=71010034;WS=71010016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	71010375	rs5030948	C	T	1437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.998;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=42;PP=1076;ReadPosRankSum=0.498;SC=GCTTCACATTCTCATTTCCCT;SOR=0.975;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=87;TCF=23;TCR=64;TR=55;WE=71010383;WS=71010365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,57:0.64:89
chr10	71016609	rs78505997	C	T	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=274;ReadPosRankSum=2.195;SC=TAGACCTTGTCTGAGTGTTGT;SOR=1.911;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=12;WE=71016617;WS=71016599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr10	71018660	rs1111335	T	C	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=31;PP=869;SC=AGATGACATCTGGACCCGATA;SOR=2.419;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=40;WE=71018668;WS=71018650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	71025536	rs143913672	T	G	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=32;PP=806;ReadPosRankSum=-0.172;SC=TGAGGATCACTGTGGGTGTGG;SOR=0.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=43;TCR=87;TR=48;WE=71025544;WS=71025526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,47:0.36:131
chr10	71027231	rs2611	G	C	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=90;ReadPosRankSum=0.852;SC=TGTGTTGCAGGTGTTGATAGT;SOR=0.527;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=6;WE=71027239;WS=71027221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr10	71055232	rs2894081	T	C	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=253;SC=ATCCAGAGAATTGGTAATCAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=71055240;WS=71055228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	71055459	rs4746837	T	C	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.00;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr10	71060610	rs906220	A	G	3665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=65;PP=2769;SC=AGAGCCCTGCATGATTTTGTA;SOR=0.774;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=58;TCR=65;TR=123;WE=71060618;WS=71060600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr10	71060634	rs906221	G	A	3624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=75;PP=2813;SC=AGAAAATCCTGGAATACCCAC;SOR=1.421;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=40;TCR=75;TR=115;WE=71060642;WS=71060624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr10	71060696	rs906222	G	A	1738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=49;PP=1442;SC=AGGATACAAGGTTAATATACA;SOR=5.136;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=52;WE=71060715;WS=71060686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr10	71060707	rs906223	T	A	1706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=48;PP=1474;SC=TTAATATACATAAATCAATTG;SOR=6.439;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=50;TCF=1;TCR=49;TR=49;WE=71060715;WS=71060686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	71098195	rs906216	G	T	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.774;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=187;ReadPosRankSum=-0.574;SC=GGTTTGAGAGGGAGCATTTGA;SOR=0.111;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=13;WE=71098203;WS=71098185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr10	71098295	rs7912524	T	A	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.339;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=391;ReadPosRankSum=-0.570;SC=CAGCTGGAAGTGGTGCTGTGC;SOR=1.176;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=66;TCF=23;TCR=43;TR=20;WE=71098303;WS=71098285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,21:0.31:67
chr10	71103597	rs1133189	C	G	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.253;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=437;ReadPosRankSum=-0.430;SC=ACAAGTATCTCTATGCCATGC;SOR=1.688;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=21;WE=71103605;WS=71103587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,21:0.43:49
chr10	71124746	rs190810825	G	T	1477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.708;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=46;PP=1245;ReadPosRankSum=0.781;SC=TTTCCCCTTTGTTGGCAGAAT;SOR=1.828;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=61;TCF=3;TCR=58;TR=48;WE=71124754;WS=71124736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,49:0.78:63
chr10	71142420	rs748235	G	A	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.300;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=836;ReadPosRankSum=-0.971;SC=ACCTCACCAAGGACATGCTGC;SOR=0.473;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=143;TCF=63;TCR=80;TR=45;WE=71142428;WS=71142410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,45:0.31:146
chr10	71144263	rs56299619	G	A	1586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.674;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=41;PP=1157;ReadPosRankSum=-1.592;SC=CATAGTGCATGTGCACTGCAC;SOR=0.245;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=107;TCF=29;TCR=78;TR=62;WE=71144271;WS=71144253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,64:0.58:110
chr10	71144324	rs2305196	G	A	1760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=33;PP=1434;SC=CCGCCACGGGGTGCCCACATG;SOR=1.402;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=50;WE=71144332;WS=71144314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr10	71152091	rs2278745	T	C	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.753;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=27;PP=642;ReadPosRankSum=0.251;SC=GAGAGGACACTCACAGTCAGG;SOR=1.761;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=75;TCF=16;TCR=59;TR=30;WE=71152099;WS=71152081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,32:0.40:81
chr10	71158268	rs1227938	C	T	1297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=4;PP=1060;SC=TGATTGGGGGCGGGGGGCGTC;SOR=4.317;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=46;WE=71158276;WS=71158258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	71167119	rs10998762	G	A	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=390;ReadPosRankSum=0.063;SC=AGGACCCCTTGCACCCACCTG;SOR=1.209;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=21;WE=71167127;WS=71167109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
chr10	71168685	rs55953810	A	T	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=521;SC=CACCTTCTTCATGGCCTGCAG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=71168693;WS=71168675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	71168945	rs1549797	C	G	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=40;ReadPosRankSum=1.094;SC=GCGGGCCCACCCTGGGCGCCT;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=4;WE=71168953;WS=71168935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr10	71174674	rs77351317	C	T	1440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.761;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;PP=927;ReadPosRankSum=-2.028;SC=CACACTGTTGCCCTCCACAAT;SOR=0.813;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=98;TCF=56;TCR=42;TR=50;WE=71174682;WS=71174664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,55:0.56:98
chr10	71175609	rs10998765	T	C	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.876;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=173;ReadPosRankSum=0.138;SC=TGCTGTGTAATCACAGGCATG;SOR=1.659;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=10;WE=71175617;WS=71175599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr10	71176012	rs5030920	A	G	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.56;ReadPosRankSum=1.482;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,28:0.25:112
chr10	71264325	.	G	C	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.602;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=26;PP=405;ReadPosRankSum=-1.402;SC=ATTGAGGTCGGGGTCCTGGCC;SOR=0.612;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=78;TCF=6;TCR=72;TR=28;WE=71264333;WS=71264315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,28:0.35:80
chr10	71332204	rs4536103	A	G	1713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.304;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=24;PP=1190;ReadPosRankSum=1.171;SC=GCAGGCGGAAAAGGTGGCCCC;SOR=0.826;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=80;TCF=42;TCR=38;TR=56;WE=71332212;WS=71332194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,63:0.72:87
chr10	71390392	rs1947741	C	T	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=5.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.24;ReadPosRankSum=2.733;SOR=1.170;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,26:0.23:112
chr10	71391707	rs2262274	C	T	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.809;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.623;NF=2;NR=9;PP=724;ReadPosRankSum=-0.616;SC=CTGAAGCCCTCTTTGCAGAGA;SOR=0.330;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=11;WE=71391727;WS=71391697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,11:0.23:47
chr10	71391719	rs144716370	C	CTGGGTAAGACT	185.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=6.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.53;MQRankSum=2.953;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.115;SOR=0.087;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,8:0.20:41
chr10	71392495	rs2616089	T	A	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.70;ReadPosRankSum=-0.013;SOR=0.676;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,31:0.32:96
chr10	71392501	rs2616088	G	C	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.69;ReadPosRankSum=1.212;SOR=0.796;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,34:0.30:115
chr10	71392557	rs12020	C	T	1569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.764;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=22;PP=1010;ReadPosRankSum=0.779;SC=GCTTCTTCAACAGGGGCCATG;SOR=1.162;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=168;TCF=102;TCR=66;TR=67;WE=71392565;WS=71392547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,71:0.40:176
chr10	71392692	rs1052152	T	C	1100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.954;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=710;ReadPosRankSum=0.566;SC=AGTGGCATCTTGGCAACCATG;SOR=0.953;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=151;TCF=72;TCR=79;TR=49;WE=71392700;WS=71392682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,54:0.34:161
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chr10	71620388	rs10762320	G	A	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=466;SC=TCGGGTTGTCGTTCCTCTTGC;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=71620396;WS=71620378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	71620436	rs67173564	A	AC	1726.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=9;PP=1564;SC=CCTGGGCAGAACCTGCAGCCA;SOR=2.701;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=38;WE=71620444;WS=71620426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	71620532	rs12573749	G	A	1444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=1042;ReadPosRankSum=2.806;SC=AGGGATGTGGGACTCTGGCAT;SOR=0.807;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=73;TCF=35;TCR=38;TR=47;WE=71620540;WS=71620522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,53:0.68:78
chr10	71620671	rs4341432	C	G	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=515;SC=GCTAGGCTGGCGAACGGCTTC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=71620679;WS=71620661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	71634969	rs59942449	G	A	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.145;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=34;PP=727;ReadPosRankSum=1.375;SC=TTGCTTCTCCGTGCTGGCCTG;SOR=2.527;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=100;TCF=17;TCR=83;TR=37;WE=71634977;WS=71634959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,36:0.34:105
chr10	71634986	rs59126631	A	T	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.360;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=504;ReadPosRankSum=-1.563;SC=CCTGTCCTCTAAACCATGGCA;SOR=2.012;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=2;TCR=67;TR=27;WE=71634994;WS=71634976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,27:0.37:73
chr10	71637905	rs10823446	C	A	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=27;PP=762;ReadPosRankSum=1.828;SC=AGCCCTCCCCCCCATGAAAGC;SOR=2.517;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=30;WE=71637913;WS=71637895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr10	71647169	rs11813062	C	T	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.758;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=186;ReadPosRankSum=-1.106;SC=GCTCTGTCTCCTCCTTGCTCA;SOR=0.209;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=14;WE=71647177;WS=71647159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,15:0.28:53
chr10	71647196	rs35268667	GT	G	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=3.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.17;ReadPosRankSum=2.010;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,11:0.20:56
chr10	71647223	rs11816811	A	C	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.122;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=296;ReadPosRankSum=-1.196;SC=GTCAACCAGGAACTAGAGGTT;SOR=2.007;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=62;TCF=25;TCR=37;TR=19;WE=71647231;WS=71647213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,18:0.28:64
chr10	71647298	rs10999011	G	A	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=23;PP=614;ReadPosRankSum=1.992;SC=CTGTAGGCCTGATTGGGTTAA;SOR=0.919;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=29;WE=71647306;WS=71647288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,31:0.72:43
chr10	71649046	rs10999015	G	A	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=6;PP=768;SC=ATGGAGCACAGGGGACAGGGA;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=30;WE=71649054;WS=71649036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	71649309	rs2683572	A	G	1811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=42;PP=1292;SC=ATGGCTGTCCATGCTGGTCAC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=19;TCR=42;TR=61;WE=71649317;WS=71649299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr10	71655443	rs1227744	G	A	2675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=67;PP=2031;ReadPosRankSum=-0.630;SC=TCATGGGGGAGCAGGAGCACC;SOR=1.502;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=85;TCF=17;TCR=68;TR=84;WE=71655451;WS=71655433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
chr10	71657272	rs1227746	A	G	9414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=154;NR=129;PP=2965;SC=GCTCCAGCCAAATAATTGCCC;SOR=0.879;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=284;TCF=155;TCR=129;TR=283;WE=71657280;WS=71657262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr10	71658512	rs1227747	G	A	6704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=106;PP=2965;SC=AAAGGCGGACGTTCCAGGTAG;SOR=0.730;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=213;TCF=107;TCR=106;TR=213;WE=71658520;WS=71658502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr10	71662783	rs942576	G	T	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=351;ReadPosRankSum=-0.328;SC=CTCACCACCTGTTGCACTCTG;SOR=1.022;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=15;WE=71662791;WS=71662773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr10	71664661	.	CT	C	166.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=-0.754;QD=6.18;ReadPosRankSum=0.872;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr10	71665676	rs2683575	G	C	1230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=41;PP=924;SC=TTCCAACCTAGGTGGCTGTGC;SOR=6.229;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=42;WE=71665684;WS=71665666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	71678058	rs2274181	C	G	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.941;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=30;ReadPosRankSum=0.346;SC=CCGGAATTGCCGTGGCTGGGA;SOR=0.252;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=6;WE=71678066;WS=71678048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr10	71685532	rs1227778	G	C	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.039;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=12;PP=999;ReadPosRankSum=-0.403;SC=GGTCCAGGCCGTGGGTTGAGA;SOR=0.527;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=58;TCR=18;TR=49;WE=71685540;WS=71685522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,52:0.64:81
chr10	71689645	rs2763339	T	G	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.827;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=771;ReadPosRankSum=0.456;SC=AGAGAGGCAATGCAAATTCAT;SOR=1.521;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=30;WE=71689653;WS=71689635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,29:0.69:42
chr10	71689966	rs59283631	TG	T	220.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=4.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.62;ReadPosRankSum=0.127;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
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chr10	71692556	rs7094009	C	G	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-5.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=27;PP=636;ReadPosRankSum=-0.865;SC=CACAGAGCACCTCCCATGCTT;SOR=0.399;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=28;WE=71692564;WS=71692546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
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chr10	71851734	rs56097817	G	A	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.703;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=91;ReadPosRankSum=-1.457;SC=GCGTGTCCTGGGCCAGGCACT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=71851742;WS=71851724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr10	71851754	rs78381857	A	G	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.52;ReadPosRankSum=-1.139;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr10	71855597	rs4426048	G	A	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.413;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=327;ReadPosRankSum=0.412;SC=TCAACTGGCTGTCCCTCCGCT;SOR=0.240;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=21;WE=71855605;WS=71855587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,24:0.41:59
chr10	71868743	.	G	C	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=762;ReadPosRankSum=-0.717;SC=TATAACCTAGGAAACCTTAGG;SOR=0.795;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=35;WE=71868751;WS=71868733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,39:0.66:59
chr10	71868763	rs2271698	G	A	1989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=23;PP=1451;SC=GAAATAACCCGCGGCATTTTC;SOR=1.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=41;TCR=23;TR=64;WE=71868771;WS=71868753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	71876382	rs2394656	C	T	1202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=2;PP=991;SC=GCTCACCAAACGCTTTGCGGT;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=37;WE=71876390;WS=71876372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	71880757	rs4746962	A	C	2509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=13;PP=1883;SC=GCTCTGAGTAACCCCGTGGCC;SOR=3.098;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=63;TCR=13;TR=76;WE=71880765;WS=71880747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr10	71905569	rs3750774	C	A	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=306;ReadPosRankSum=-0.908;SC=CGGTGCCGGGCAGGCAGCGTG;SOR=0.366;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=18;WE=71905577;WS=71905559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,16:0.31:51
chr10	71905695	rs10999158	A	G	2540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=21;PP=1884;ReadPosRankSum=0.208;SC=GCAATGGCGCACCCTTGGGCA;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=102;TCR=29;TR=97;WE=71905703;WS=71905685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,102:0.75:136
chr10	71906150	rs4746970	T	C	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.200;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=437;ReadPosRankSum=-0.018;SC=CCGGCCGCGGTCAGGACTTCG;SOR=0.414;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=76;TCF=52;TCR=24;TR=26;WE=71906158;WS=71906140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,25:0.32:77
chr10	71921591	rs2271690	G	A	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.627;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=168;ReadPosRankSum=1.266;SC=TTTGAAACCTGTATTTCAAGG;SOR=0.147;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=13;WE=71921599;WS=71921581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr10	71974468	rs7911572	C	T	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=30;PP=915;SC=TCTTTATTCGCATTTAAGAAT;SOR=3.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=34;WE=71974476;WS=71974458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	71989884	rs9415958	T	C	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=33;ReadPosRankSum=1.579;SC=AGGCTGTTCTTGAACTTCTGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=3;WE=71989892;WS=71989882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr10	71990196	rs7904074	G	A	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.806;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=118;ReadPosRankSum=1.245;SC=ATAATTAATTGTATTGCTAAA;SOR=3.198;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=7;WE=71990204;WS=71990186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr10	71993094	rs7077538	T	G	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=488;ReadPosRankSum=-1.718;SC=AGTGCCGGAGTCCTGCCGCCG;SOR=0.841;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=23;TCR=33;TR=29;WE=71993102;WS=71993084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,30:0.57:53
chr10	72015409	rs10999212	C	A	2262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.406;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=43;PP=2962;ReadPosRankSum=1.618;SC=AGGAGTAGAGCGGGTAGGAGC;SOR=0.554;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=131;TCF=59;TCR=72;TR=80;WE=72015422;WS=72015399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,85:0.62:136
chr10	72015414	.	A	G	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.000;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.438;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=2023;ReadPosRankSum=-0.776;SC=TAGAGCGGGTAGGAGCGGTTG;SOR=0.859;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=130;TCF=59;TCR=71;TR=46;WE=72015422;WS=72015399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,47:0.35:135
chr10	72026279	rs3812697	G	C	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=153;ReadPosRankSum=0.509;SC=CCCAGCTCCAGTTGCAACTTG;SOR=0.473;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=9;WE=72026287;WS=72026269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr10	72037687	rs35789490	T	TG	1084.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=1158;ReadPosRankSum=0.463;SC=CTCTAGATGTTGGGGAAGACT;SOR=0.634;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=31;WE=72037695;WS=72037677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,40:0.67:60
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chr10	72043460	rs10999239	T	G	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.577;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=383;ReadPosRankSum=-0.892;SC=GCTCCGGCGGTCTCCGATGGC;SOR=1.828;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=21;WE=72043468;WS=72043450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
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chr10	72061420	rs4746997	A	G	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=23;PP=663;SC=AGCCCTGTGCAAAGGGCCATC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=72061428;WS=72061410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr10	72164470	rs3750766	C	T	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=34;ReadPosRankSum=-0.524;SC=TTCGTGTTCGCTCTTGCCCGC;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=3;WE=72164478;WS=72164460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
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chr10	72181460	rs3793809	G	T	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=35;PP=1075;SC=TCATTTTATTGGTCCTAACTA;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=37;WE=72181468;WS=72181450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	72195439	rs1904589	T	C	2389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.664;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=39;PP=1877;ReadPosRankSum=-0.309;SC=GGCCCCAGGGTGCTTCAGCCA;SOR=1.095;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=126;TCF=69;TCR=57;TR=91;WE=72195447;WS=72195429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,92:0.72:128
chr10	72201219	rs10999338	G	A	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.803;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=640;ReadPosRankSum=0.295;SC=CGCGGCACGCGGCACTGCCTA;SOR=1.525;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=30;WE=72201227;WS=72201209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,32:0.65:49
chr10	72207517	rs34717077	AC	A	2060.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=4;PP=2157;SC=CCACCAGCCTACCAGATTGTG;SOR=4.731;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=51;TCR=4;TR=52;WE=72207525;WS=72207507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr10	72289539	rs12785079	C	T	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.34;ReadPosRankSum=-1.329;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr10	72290978	rs12773720	G	A	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.761;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=5;PP=614;ReadPosRankSum=-0.130;SC=GCCCTGAGGTGGGGCAGTGGT;SOR=1.249;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=123;TCF=100;TCR=23;TR=36;WE=72290986;WS=72290968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,39:0.30:131
chr10	72292258	rs10999378	G	C	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=342;ReadPosRankSum=-0.107;SC=TCCCTCATGGGGGGCAGAAGC;SOR=0.154;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=63;TCR=0;TR=19;WE=72292266;WS=72292248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,19:0.28:67
chr10	72293713	rs12764399	C	T	2931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=63;PP=2330;SC=GTGATGCCCACGGGCCTCCCC;SOR=1.561;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=30;TCR=63;TR=93;WE=72293721;WS=72293703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr10	72298631	rs1122918	T	C	6039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=132;NR=57;PP=2965;SC=GTCCCAGGCTTGGTGCTCTCC;SOR=1.814;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=189;TCF=132;TCR=57;TR=189;WE=72298639;WS=72298621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr10	72307053	rs67684173	T	C	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=759;ReadPosRankSum=-0.748;SC=CCCCCTTCTCTGGCCCCAGGT;SOR=0.317;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=36;WE=72307061;WS=72307043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr10	72307214	rs7478096	C	A	263.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=6;PP=217;SC=TGAGCCCCCACCCCACCCCAC;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=72307222;WS=72307204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	72324143	rs7093516	A	G	2561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=22;PP=2078;SC=AAGAGGCGCAAGAAATGCGGA;SOR=1.893;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=55;TCR=22;TR=77;WE=72324151;WS=72324133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr10	72358577	rs885822	G	A	7550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=119;PP=2965;SC=CCACTTCCGAGTGGCGCTCCC;SOR=0.789;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=228;TCF=109;TCR=119;TR=228;WE=72358585;WS=72358567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr10	72358655	rs885821	G	A	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.579;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=801;ReadPosRankSum=-0.693;SC=CCTTGGCTTCGGCAGAGATGC;SOR=0.260;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=173;TCF=58;TCR=115;TR=50;WE=72358663;WS=72358645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,54:0.30:183
chr10	72432438	rs373452188	AGGCGGCAGC	A	307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.757;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.736;NF=6;NR=1;PP=1092;ReadPosRankSum=-0.596;SC=GAGGCGGCTGAGGCGGCAGCG;SOR=2.093;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=7;WE=72432454;WS=72432428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr10	72432498	rs12762780	C	A	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.965;NF=17;NR=1;PP=406;ReadPosRankSum=1.454;SC=CTAGCCTCGCCGCCCTCAGCC;SOR=0.818;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=18;WE=72432506;WS=72432488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr10	72432521	rs12762616	A	C	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.934;NF=18;NR=8;PP=541;ReadPosRankSum=0.177;SC=GGACTTGGGGATCGGGCGCTT;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=26;WE=72432529;WS=72432511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,26:0.72:36
chr10	72434194	rs614201	G	A	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.928;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=1;PP=598;ReadPosRankSum=0.041;SC=TCAGGCTAAGGGGCCCACCTA;SOR=1.119;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=70;TCF=66;TCR=4;TR=29;WE=72434202;WS=72434184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,28:0.41:69
chr10	72468576	.	G	GGGTGGGCCCC	1447.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.794;ClippingRankSum=0.000;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=7.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=2.564;QD=14.77;ReadPosRankSum=0.547;SOR=0.158;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,38:0.39:98
chr10	72468584	rs117280157	C	G	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.046;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-2.399;NF=4;NR=55;PP=2962;ReadPosRankSum=0.966;SC=TGGGGTGGGCCCCACCCCACC;SOR=1.702;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=107;TCF=11;TCR=96;TR=59;WE=72468592;WS=72468566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,62:0.58:106
chr10	72492212	rs2587478	T	C	1230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=33;PP=1001;SC=TTGGCCTGGTTCCAGTGTCCT;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=37;WE=72492220;WS=72492202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	72492244	rs10740357	A	C	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=23;PP=665;SC=GAGGAGCTGGACTGCCACTGC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=72492252;WS=72492234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	72493509	rs7085143	A	T	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=1;PP=424;SC=GTGGTTGGAAAACTGAGGCCA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=72493517;WS=72493499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	72493876	rs10740358	T	C	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=37;PP=899;SC=TTCCCCACGTTGCCCCTGGCT;SOR=3.967;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=41;WE=72493884;WS=72493866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	72494778	rs12765664	G	A	1915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=2;PP=1527;SC=AAGGCAGCCCGTCCTCCCTGG;SOR=5.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=55;TCF=53;TCR=2;TR=55;WE=72494786;WS=72494768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	72496375	rs1861517	A	G	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=2;PP=1040;SC=CTCCATCACTACCCTTTGTTC;SOR=4.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=35;WE=72496383;WS=72496365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	72500763	rs10823607	T	C	3858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=41;PP=2965;SC=GGAGGCCGCCTGTGCTTAGGG;SOR=1.628;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=83;TCR=41;TR=124;WE=72500771;WS=72500753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr10	72500863	rs10999500	C	G	3516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=78;PP=2799;SC=AGCGCAACTCCTACTATGTGC;SOR=1.692;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=35;TCR=78;TR=113;WE=72500871;WS=72500853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr10	72505315	rs2791183	A	G	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=346;SC=CCCTGGGGGCAGTTTTCTTCC;SOR=2.448;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=72505323;WS=72505305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	72509809	rs2541229	C	T	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=549;SC=GCTACATCTGCTGCCAAGCCA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=72509817;WS=72509799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	72513682	rs2587475	C	T	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.129;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=25;PP=603;ReadPosRankSum=-0.153;SC=CCAAAGCCTGCGCCGGGGACC;SOR=1.215;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=101;TCF=36;TCR=65;TR=35;WE=72513690;WS=72513672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,35:0.34:104
chr10	72517837	rs6480463	C	T	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=21;PP=1226;SC=GCAGCCTGCCCGCCTGTGGAG;SOR=1.007;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=26;TCR=21;TR=47;WE=72517845;WS=72517827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	72532037	rs2253793	C	T	4141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=72;PP=2965;SC=ATGTAAGTTCCGTGACAGCAG;SOR=1.016;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=58;TCR=72;TR=130;WE=72532045;WS=72532027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr10	72532238	rs2253801	T	C	2762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=40;PP=2145;SC=CCTTGGTGAGTCCCCCAAATG;SOR=0.836;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=86;TCF=45;TCR=41;TR=85;WE=72532246;WS=72532228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr10	72533910	rs7077672	C	T	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=0;PP=1124;SC=CCAGGTCCCACTGGCCTCACC;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=40;WE=72533918;WS=72533900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	72535007	rs2254174	C	T	5329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=76;PP=2965;SC=TTCCAGGATCCGACACAGGAG;SOR=0.897;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=90;TCR=76;TR=166;WE=72535015;WS=72534997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr10	72536779	rs2254422	A	C	1445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=0;PP=1208;SC=TGCTGACTCCACAGGGCTGGA;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=42;WE=72536787;WS=72536769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	72537450	rs2254445	T	C	1081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=29;NR=2;PP=880;SC=TAGGTCCTCCTTGCTGCTCCT;SOR=4.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=31;WE=72537458;WS=72537440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	72604263	rs12770335	G	T	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.787;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=8;PP=572;ReadPosRankSum=0.310;SC=GATTTTGGAAGTATACTCCAC;SOR=0.877;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=131;TCF=101;TCR=30;TR=38;WE=72604271;WS=72604253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,39:0.28:137
chr10	72614421	rs2171157	T	C	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=576;ReadPosRankSum=-1.350;SC=CTGTCTCTACTGTACTCTTGC;SOR=2.649;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=25;WE=72614429;WS=72614411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr10	72617256	rs2297842	A	T	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=249;ReadPosRankSum=1.662;SC=TTGGGTTTCCACTCAACATTT;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=14;WE=72617264;WS=72617246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr10	72619205	rs827255	C	T	6624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=99;NR=109;PP=2965;SC=AGGCAGAAATCGTGAGGATAG;SOR=0.811;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=209;TCF=100;TCR=109;TR=208;WE=72619213;WS=72619195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr10	72631626	rs865832	C	T	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=385;ReadPosRankSum=-0.572;SC=CCCTTCATGTCGACGCTTGTC;SOR=0.746;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=28;TCR=20;TR=19;WE=72631634;WS=72631616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
chr10	72633458	rs10762410	C	T	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=139;ReadPosRankSum=-0.439;SC=TTGTCTCCTGCGATATAGAGG;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=8;WE=72633466;WS=72633448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr10	72636450	rs923177	T	G	4576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=89;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.794;SC=TTTCTTCTCTTGGAAATTTAG;SOR=0.663;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=250;TCF=111;TCR=139;TR=162;WE=72636458;WS=72636440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,168:0.65:257
chr10	72643671	rs9712	C	T	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=503;ReadPosRankSum=-1.133;SC=TCAGTCACCCCTTCCCCCGGA;SOR=0.557;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=25;WE=72643679;WS=72643661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr10	72648083	rs2854614	TC	GT	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=8.049;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.62;ReadPosRankSum=-0.353;SOR=3.296;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr10	72648086	rs827239	A	G	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=3;PP=433;SC=GTGGGATTCGAACCCGCCACC;SOR=3.912;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=27;WE=72648094;WS=72648073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	72648134	rs827238	A	G	1250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=17;PP=1013;SC=CCCCGCCGCCAGCGACAGAGA;SOR=1.464;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=47;WE=72648142;WS=72648124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	72813306	rs10762420	G	A	4674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=79;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.687;SC=GCCTCTGTCTGTGTTCCTGGG;SOR=0.234;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=71;TCR=80;TR=150;WE=72813314;WS=72813296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,154:0.99:155
chr10	72813361	rs10740361	A	G	3422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=77;PP=2655;SC=ATCTAATTGCAGGGTCACCCA;SOR=1.949;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=30;TCR=77;TR=107;WE=72813369;WS=72813351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr10	73039860	rs4415677	C	T	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=479;SC=GAGGCACAGGCCTAGCTCCAT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=73039868;WS=73039850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	73044382	rs10823716	T	A	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=327;SC=TGGGCAAGAGTGCCAGCAGGA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=73044390;WS=73044372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	73044413	rs10762434	G	C	737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=4;PP=552;SC=AAGGCCGGGGGTGTCCTGTGC;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=73044421;WS=73044403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	73044580	rs12770025	G	A	2173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=29;PP=1619;ReadPosRankSum=0.922;SC=GGAGCTCCGCGGGCACCACCA;SOR=0.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=73;TCR=42;TR=80;WE=73044588;WS=73044570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,81:0.70:116
chr10	73044674	rs10999762	G	A	3015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=63;PP=2330;SC=CCATCCCTGAGGATGCTGGAG;SOR=1.516;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=32;TCR=63;TR=95;WE=73044682;WS=73044664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr10	73044924	rs7350453	A	G	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.52;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	73044930	rs7350455	C	T	730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.67;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	73044954	rs6480503	A	G	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=0;PP=500;SC=GAAATTTCCCAGGCAAAGGCC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=73044962;WS=73044944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	73047593	rs7074280	G	A	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=46;PP=1520;SC=TGCCAGAGCCGGGACAGCCAT;SOR=2.340;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=62;TCF=15;TCR=47;TR=61;WE=73047601;WS=73047583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr10	73050983	rs3740462	C	T	2029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=52;PP=1655;SC=CCAGAGTTTGCTCTAGAGATA;SOR=4.840;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=3;TCR=52;TR=55;WE=73050991;WS=73050973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr10	73104056	rs2243540	A	G	8448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=134;NR=125;PP=2965;SC=CAGGTAGGCGACTCTCTTCCC;SOR=0.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=261;TCF=135;TCR=126;TR=259;WE=73104064;WS=73104046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr10	73111258	rs780667	G	T	2050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=9;PP=1584;SC=TGGCTCACCAGCCCCAGCCCA;SOR=3.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=54;TCR=9;TR=63;WE=73111266;WS=73111248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr10	73111408	rs780668	C	T	8609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=152;NR=116;PP=2965;SC=GTGGACACTTCCTCCTGGACC;SOR=0.992;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=268;TCF=152;TCR=116;TR=268;WE=73111416;WS=73111398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr10	73115941	rs2252997	TG	CA	5056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=41;PP=2947;SC=TGACGGCCACTGTCTTCCTCG;SOR=0.903;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=58;TCR=44;TR=97;WE=73115950;WS=73115931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr10	73121645	rs2487067	C	A	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=2;PP=661;SC=TGAGTGCCCACCCCTGGCTGT;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=73121653;WS=73121635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	73121913	rs2487068	A	G	8730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=161;NR=127;PP=2965;SC=CTACCCCGCCATCTGCACCAA;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=289;TCF=162;TCR=127;TR=288;WE=73121921;WS=73121903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,295:1.00:295
chr10	73121945	rs1084004	T	C	11502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=194;NR=147;PP=2965;SC=TCAACAAGGGTTCGGGCTCAC;SOR=0.984;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=342;TCF=195;TCR=147;TR=341;WE=73121953;WS=73121935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,349:1.00:349
chr10	73157033	rs147915565	C	CCGAGG	213.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.94;ReadPosRankSum=0.457;SOR=0.840;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,8:0.22:36
chr10	73199501	rs4747153	C	A	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.903;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=727;ReadPosRankSum=-0.835;SC=CTCTCTGGAGCTGCAGAGGTG;SOR=0.406;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=92;TCF=54;TCR=38;TR=39;WE=73199509;WS=73199491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,39:0.41:95
chr10	73269714	rs2297953	T	C	1795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=1;PP=1505;SC=TGTGATGATCTGTGGCCTGCT;SOR=6.556;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=50;TCR=1;TR=51;WE=73269722;WS=73269704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr10	73270906	rs3802720	T	C	6534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.050;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=105;PP=2965;ReadPosRankSum=0.781;SC=ACATCCAGGTTGGGGATGTGA;SOR=0.266;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=214;TCF=108;TCR=106;TR=213;WE=73270914;WS=73270896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,221:1.00:222
chr10	73270982	rs3802719	G	A	7145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=117;PP=2965;SC=AGGAGCCACTGGGGTTACCCT;SOR=2.165;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=43;TCR=117;TR=160;WE=73271003;WS=73270972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr10	73270995	rs3802718	A	G	6487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=106;PP=2965;SC=GTTACCCTTGAGGGTATCAGA;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=35;TCR=106;TR=141;WE=73271003;WS=73270972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr10	73326757	rs7087735	C	T	1764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=46;PP=1376;SC=AAGAGAGTGACGGGGCATTCC;SOR=5.709;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=2;TCR=47;TR=48;WE=73326765;WS=73326747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr10	73330454	rs736717	G	A	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=448;ReadPosRankSum=-1.005;SC=CTTATGTGCTGCACGGTGCAG;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=18;WE=73330462;WS=73330444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,20:0.87:23
chr10	73337850	rs6480531	G	A	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.426;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=28;PP=658;ReadPosRankSum=0.559;SC=AGAGGTCTGCGGGCATGTGGG;SOR=0.440;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=75;TCF=8;TCR=67;TR=32;WE=73337858;WS=73337840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,32:0.43:74
chr10	73403490	rs10823810	A	G	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.824;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=3;PP=678;ReadPosRankSum=-0.588;SC=CTAGGGTGTGATCCTGGGGTC;SOR=0.330;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=68;TCF=63;TCR=5;TR=31;WE=73403498;WS=73403480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,32:0.46:69
chr10	73406599	rs2305210	G	A	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.532;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=53;ReadPosRankSum=-0.057;SC=GAGGGGTGACGAGACTGAGCT;SOR=0.018;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=4;WE=73406607;WS=73406589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr10	73434906	rs10999947	G	A	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.830;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=460;ReadPosRankSum=0.009;SC=GGGGAAGTCAGCTACTTCTTC;SOR=0.808;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=38;TCR=53;TR=28;WE=73434914;WS=73434896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,30:0.32:95
chr10	73439101	rs1227042	T	C	1386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.783;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=8;PP=1041;ReadPosRankSum=0.388;SC=TGGCCCCCAGTCTCCTGCAGG;SOR=1.062;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=165;TCF=135;TCR=30;TR=57;WE=73439109;WS=73439091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,59:0.35:170
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chr10	73455308	rs3752750	T	C	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=1.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.78;ReadPosRankSum=1.255;SOR=1.041;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,55:0.28:196
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chr10	73490310	rs41281316	G	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.133;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=279;ReadPosRankSum=0.657;SC=TCGAGAGACCGCAGGCATTGG;SOR=0.444;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=75;TCF=45;TCR=30;TR=21;WE=73490318;WS=73490300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,21:0.27:78
chr10	73492079	rs1227065	A	G	9416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=176;PP=2965;SC=GTACCGCTTCAACGCCTACAC;SOR=1.078;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=300;TCF=124;TCR=176;TR=300;WE=73492087;WS=73492069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr10	73494159	rs1227062	T	A	2131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=48;PP=1791;SC=TGACACTTCCTAACCCATGTC;SOR=2.494;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=63;TCF=14;TCR=49;TR=62;WE=73494167;WS=73494149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr10	73494229	rs1227061	T	C	1821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=17;PP=1489;SC=AGCCTGAGGCTTCGCCATGTC;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=52;WE=73494237;WS=73494219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr10	73499561	rs10762474	C	G	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=353;ReadPosRankSum=-0.858;SC=ACTGAGAGACCACTGGCTAAG;SOR=0.798;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=80;TCF=29;TCR=51;TR=23;WE=73499569;WS=73499551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,23:0.28:81
chr10	73501374	rs1227052	C	T	2782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=7;PP=2280;SC=GGGGAGCCTTCGGGCTACAGG;SOR=4.539;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=75;TCR=7;TR=82;WE=73501382;WS=73501364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr10	73501556	rs1227051	G	A	6683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=121;PP=2965;SC=CAAGGACATGGCCTTCCGCAT;SOR=1.148;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=206;TCF=84;TCR=122;TR=205;WE=73501564;WS=73501546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr10	73515103	rs3747858	G	T	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.127;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=676;ReadPosRankSum=0.794;SC=CCCAGGCAGGGAGGAATACTC;SOR=0.454;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=64;TCF=43;TCR=21;TR=37;WE=73515111;WS=73515093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,38:0.56:68
chr10	73515124	.	G	A	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.590;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.864;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=549;ReadPosRankSum=0.502;SC=ACGGCGGTTGGAGGCTGCCTG;SOR=0.577;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=77;TCF=49;TCR=28;TR=31;WE=73515132;WS=73515114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,34:0.41:82
chr10	73520391	rs10999987	C	T	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.528;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=281;ReadPosRankSum=-1.180;SC=CAAGGCACAGCCACTCCAGAG;SOR=0.341;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=17;WE=73520399;WS=73520381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr10	73520511	rs41305045	G	A	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.040;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=602;ReadPosRankSum=1.039;SC=GAGGAGGACCGGGGGGTTCTG;SOR=0.404;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=75;TCF=43;TCR=32;TR=30;WE=73520519;WS=73520501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,33:0.41:81
chr10	73520632	rs3747869	A	C	2071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=38;PP=1767;SC=TACTTTCACTATCCTGGGAGG;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=22;TCR=38;TR=60;WE=73520640;WS=73520622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	73521371	rs3747867	C	T	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.435;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=369;ReadPosRankSum=-0.908;SC=GCACCTGCAGCTCCATGGCAC;SOR=3.070;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=16;WE=73521379;WS=73521361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr10	73533177	rs3747862	A	G	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.241;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=703;ReadPosRankSum=-0.905;SC=GCCGGCCTCCAGGGCCGTGGG;SOR=0.285;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=143;TCF=54;TCR=89;TR=48;WE=73533185;WS=73533167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,50:0.34:148
chr10	73537821	rs10999996	G	T	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.037;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=901;ReadPosRankSum=0.007;SC=TGGAGCCTGGGCTAGGGGGTG;SOR=0.497;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=40;WE=73537829;WS=73537811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,44:0.66:67
chr10	73537978	rs10762480	C	T	2601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.397;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=54;PP=2022;ReadPosRankSum=0.022;SC=AGCTGGACTACGAGATCAGCC;SOR=0.559;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=148;TCF=64;TCR=84;TR=99;WE=73537986;WS=73537968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,99:0.67:147
chr10	73538109	rs10740390	C	G	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.667;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=29;PP=674;ReadPosRankSum=-2.232;SC=TGGAGGTTGGCGAAGGATGGG;SOR=0.199;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=32;WE=73538117;WS=73538099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,32:0.68:47
chr10	73538896	rs6480555	T	A	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=365;ReadPosRankSum=-0.442;SC=CATATCCGACTTCCCATATGA;SOR=0.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=19;WE=73538904;WS=73538886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr10	73544086	rs3802711	G	A	2513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.664;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=34;PP=1807;ReadPosRankSum=0.783;SC=CTAAGGGTCCGGAAGGACGTG;SOR=1.067;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=142;TCF=79;TCR=63;TR=88;WE=73544094;WS=73544076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,96:0.64:149
chr10	73544604	rs7068810	T	C	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=460;ReadPosRankSum=2.624;SC=GCACAACATCTGTCGCTCTTC;SOR=0.643;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=22;WE=73544612;WS=73544597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr10	73545236	rs3802709	G	T	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.698;SOR=0.884;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,13:0.21:62
chr10	73550117	rs11592462	C	G	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.738;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=974;ReadPosRankSum=-0.733;SC=GCCGTGGTGACCTACCAGCTG;SOR=1.050;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=159;TCF=87;TCR=72;TR=53;WE=73550125;WS=73550107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,57:0.33:173
chr10	73550969	rs10466026	G	A	2276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.710;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=18;PP=1608;ReadPosRankSum=0.265;SC=GCTGCTGGCTGAGGACATCGG;SOR=1.061;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=124;TCF=92;TCR=32;TR=81;WE=73550977;WS=73550959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,88:0.67:131
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chr10	73558886	rs4747194	G	A	2913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.051;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=11;PP=2301;ReadPosRankSum=1.122;SC=ATTGCCAACCGGACAGTGGAC;SOR=1.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=156;TCF=137;TCR=19;TR=99;WE=73558894;WS=73558876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,104:0.65:160
chr10	73558952	rs4747195	C	T	5313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.201;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=71;PP=2962;ReadPosRankSum=0.129;SC=AACGGGTCCCCGCCCCGGGCA;SOR=0.550;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=283;TCF=179;TCR=104;TR=190;WE=73558960;WS=73558942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,200:0.69:291
chr10	73562538	rs12773941	C	T	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=417;ReadPosRankSum=-1.947;SC=AAGACATTACCTCCCTCCCAG;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=18;WE=73562546;WS=73562528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr10	73562744	rs10823849	G	A	3999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.903;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=49;PP=2962;ReadPosRankSum=2.366;SC=ATGAGCCGGCGGGCACCTCGG;SOR=1.296;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=211;TCF=128;TCR=83;TR=139;WE=73562752;WS=73562734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,145:0.68:214
chr10	73566203	rs4747197	T	A	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.500;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=464;ReadPosRankSum=0.207;SC=AGCAGCTGTGTTACACTATAT;SOR=2.746;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=20;WE=73566211;WS=73566193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr10	73570334	rs11818398	G	A	2114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.885;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=55;PP=1589;ReadPosRankSum=-0.039;SC=CCGGTGAGTCGGGGCCTGTGT;SOR=0.567;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=110;TCF=25;TCR=85;TR=72;WE=73570342;WS=73570324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,76:0.66:115
chr10	73571581	rs140848302	C	CCT	2007.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=23;PP=1938;SC=CCCACCGGAGCCACAAGCCTG;SOR=0.829;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=40;WE=73571589;WS=73571571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	73576307	rs7869	C	T	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.237;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=637;ReadPosRankSum=1.611;SC=CCTAGGAGCTCGCCATCCATA;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=29;WE=73576315;WS=73576297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr10	73578503	rs885828	G	A	1405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.45;ReadPosRankSum=-0.854;SOR=0.590;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,54:0.59:91
chr10	73578672	rs749823	G	A	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.846;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.226;NF=11;NR=12;PP=487;ReadPosRankSum=1.505;SC=TGGCTCTCCCGCAGCAGAACC;SOR=1.049;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=36;TCF=18;TCR=18;TR=23;WE=73578680;WS=73578662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr10	73578704	rs142614739	AAGTCTC	A	451.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.510;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.990;NF=9;NR=2;PP=377;ReadPosRankSum=0.044;SC=CCCCACGGCCAAGTCTCAGAG;SOR=1.651;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=11;WE=73578717;WS=73578694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr10	73578882	rs4747203	T	C	2510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=53;PP=1784;ReadPosRankSum=-1.172;SC=TAAAGGAAAGTGGGGACACAG;SOR=0.646;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=163;TCF=74;TCR=89;TR=99;WE=73578890;WS=73578872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,103:0.62:167
chr10	73579217	rs11000016	C	T	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=556;ReadPosRankSum=-0.533;SC=CAGCCCGGGGCGTACCTGCTT;SOR=0.715;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=25;WE=73579225;WS=73579207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr10	73579405	rs3747860	C	T	2985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.565;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=60;PP=2272;ReadPosRankSum=-0.932;SC=GCGGGCTCAACGCTGGCAGGG;SOR=0.654;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=181;TCF=91;TCR=90;TR=117;WE=73579413;WS=73579395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,117:0.64:183
chr10	73581560	rs2070968	A	T	2332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.107;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=20;PP=1909;ReadPosRankSum=-1.279;SC=GACTCGTAAGATGTGATGTGA;SOR=1.195;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=127;TCF=94;TCR=33;TR=86;WE=73581568;WS=73581550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,85:0.67:126
chr10	73583520	rs2249814	G	C	2789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=1;PP=2272;SC=CAGAGAGGGAGCCTGCCTCTC;SOR=7.523;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=85;TCF=84;TCR=1;TR=85;WE=73583528;WS=73583510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr10	73585324	rs145386313	TGGCTGGCCTGAACG	T	276.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.431;NF=3;NR=1;PP=1572;ReadPosRankSum=-0.967;SC=AGAAACCTGATGGCTGGCCTG;SOR=0.495;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=73585345;WS=73585314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr10	73591829	rs41306532	G	A	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.269;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=343;ReadPosRankSum=-1.264;SC=CACCCTGCATGAGCAGCGCTG;SOR=0.179;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=75;TCF=6;TCR=69;TR=22;WE=73591837;WS=73591819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,25:0.32:79
chr10	73594358	rs3878001	C	T	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.973;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=20;ReadPosRankSum=-0.238;SC=TGTCCTTGAGCTGGACTCTGC;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=3;WE=73594366;WS=73594348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr10	73610982	rs2070188	G	A	1631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.864;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=23;PP=1232;ReadPosRankSum=-0.101;SC=CGTACATAGCGCCGTCTGACT;SOR=0.889;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=92;TCF=57;TCR=35;TR=63;WE=73610990;WS=73610972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,64:0.68:94
chr10	73765773	rs11000129	T	G	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-4.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=28;PP=714;ReadPosRankSum=0.203;SC=TTCATCTTCCTTTCAAGGTGG;SOR=0.621;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=16;TCR=52;TR=37;WE=73765781;WS=73765763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,37:0.54:68
chr10	73767859	rs3740129	G	A	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.234;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=457;ReadPosRankSum=1.594;SC=CTGGGGCTGCGGCAGCCCGCC;SOR=1.371;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=21;WE=73767867;WS=73767849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr10	73822507	rs1530803	C	T	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=464;ReadPosRankSum=-1.545;SC=GCAGCCGGCTCCTGAGGGCGT;SOR=0.551;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=21;WE=73822515;WS=73822497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr10	73822957	rs1530802	G	A	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.764;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=410;ReadPosRankSum=0.645;SC=CAGAGCAGGGGCCCAGGCTGT;SOR=2.576;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=19;WE=73822965;WS=73822947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
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chr10	73824170	rs2242250	G	A	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=282;ReadPosRankSum=-1.368;SC=TCTATGGCACGAAAACGCTCA;SOR=0.223;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=8;WE=73824189;WS=73824160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr10	73824181	rs2242251	C	G	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.548;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=282;ReadPosRankSum=-0.541;SC=AAAACGCTCACTCTCTATTTA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=73824189;WS=73824160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr10	73824203	rs2242252	T	C	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.64;ReadPosRankSum=0.876;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr10	73827292	.	A	G	39	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=30;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=39;QD=36.8856062736;SC=ACAAGGGCAGACTGGCCCAGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=2;WE=73827300;WS=73827284;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr10	73964004	rs4237336	C	T	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=1;PP=916;SC=CGAGACTCTGCCTCAAAAAAT;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=73964012;WS=73963994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	74035041	rs1053639	T	A	1037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=26;PP=782;SC=GACTGATTCCTGTGGTTGGAA;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=74035049;WS=74035031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	74237247	rs35126406	C	CT	4269.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=56;PP=2957;SC=CAGCACTTGTCTACCTTTTTG;SOR=0.859;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=42;TCR=58;TR=98;WE=74237255;WS=74237237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr10	74452931	rs112298026	AGT	A	702.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.11;QD=30.55;SOR=4.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	74666494	rs143316222	G	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-2.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=32;ReadPosRankSum=0.652;SC=TGGGCAAAAAGGGACCCAAAT;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=5;WE=74666502;WS=74666484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr10	74671611	rs3750736	C	T	2211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=56;PP=1772;SC=GTACATGGGGCAGGGGGACTT;SOR=2.537;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=71;TCF=15;TCR=56;TR=70;WE=74671619;WS=74671601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr10	74690437	rs368917423	CT	C	154.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=7.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=1.828;QD=4.99;ReadPosRankSum=-0.207;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr10	74695287	rs2461917	T	C	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=281;SC=GTTGGAAGAATGAATGAGTCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=74695295;WS=74695277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	75283637	rs377326169	AT	A	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.18;ReadPosRankSum=0.319;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr10	75283642	rs371483348	TTA	T	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.18;ReadPosRankSum=0.319;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr10	75335353	.	G	C	1466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=35;PP=1181;ReadPosRankSum=0.249;SC=GTTGAGCTTCGAGGTGCAAAC;SOR=0.659;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=90;TCF=34;TCR=56;TR=56;WE=75335361;WS=75335343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,56:0.62:91
chr10	75490217	rs11814282	T	C	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=2;PP=383;SC=GGCACCGAACTTGCTCACAAC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=75490225;WS=75490207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	75519322	rs10740418	T	C	5548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=107;NR=67;PP=2965;SC=GACACTTCTGTAGACTTCAAA;SOR=1.218;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=175;TCF=108;TCR=67;TR=174;WE=75519330;WS=75519312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr10	75525999	rs3849969	A	G	3161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=52;PP=2541;SC=GTGTTTCCTGAGGTTAATGAT;SOR=0.909;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=45;TCR=52;TR=97;WE=75526007;WS=75525989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr10	75532848	rs145929404	GCCAGGACTCCAGGTGTCCAGGACTCCAGGTGT	G	845.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.29;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	75532870	.	A	C	217	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=58.25;NF=2;NR=7;PP=217;QD=27.9745791719;SC=GGTGTCCAGGACTCCAGGTGT;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=9;WE=75532878;WS=75532860;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,9:0.56:16
chr10	75541781	rs71642203	GT	G	961.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=983;SC=GCCCGTAGGGGTCACGCGAGG;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=75541789;WS=75541771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	75545251	rs12256103	A	G	1990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=0;PP=1627;SC=TTAAATAAAAATGTCCCCTAC;SOR=8.121;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=54;TCR=0;TR=54;WE=75545259;WS=75545241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	75551796	.	C	T	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.655;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=31;PP=816;ReadPosRankSum=0.059;SC=TACAGCGGCACTGACAGGAAG;SOR=0.914;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=120;TCF=37;TCR=83;TR=42;WE=75551804;WS=75551786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,44:0.36:122
chr10	75558867	rs2271271	G	A	3943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=54;PP=2965;SC=GGTTCTGGCTGTATGAGCAAA;SOR=1.033;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=74;TCR=54;TR=128;WE=75558875;WS=75558857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr10	75559662	rs141230821	C	CTCTA	5057.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=1;PP=2965;SC=CAGAGCGAGACTCTATCTCAA;SOR=6.537;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=93;TCF=86;TCR=7;TR=71;WE=75559670;WS=75559652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr10	75562161	rs13013	C	A	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=1;PP=238;SC=TCTGGACCTGCCCCTTAGGGA;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=75562169;WS=75562151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	75585210	rs117740727	G	C	2128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=59;PP=1784;SC=GAGGAGGTAGGCCTGAGGTGG;SOR=4.582;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=5;TCR=59;TR=64;WE=75585218;WS=75585200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr10	75607696	rs67135801	CA	C	1756.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=3;PP=1818;SC=GCCCGAGGAGCAAGGACATCT;SOR=4.407;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=48;TCF=44;TCR=4;TR=44;WE=75607704;WS=75607686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr10	75612881	rs2250140	T	C	2035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=7;PP=1697;SC=TGTTTAGGCCTCTTCCTGAGC;SOR=3.716;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=63;TCF=55;TCR=8;TR=62;WE=75612889;WS=75612871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr10	75620757	rs2664282	T	C	3206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=86;PP=2656;SC=TTGTGATGATTTGCTGAAGTA;SOR=6.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=88;TCF=2;TCR=86;TR=88;WE=75620765;WS=75620747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
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chr10	75673731	rs2227566	C	T	3789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=78;NR=40;PP=2965;SC=GGTATCTTCTCCCACAGTGAT;SOR=1.552;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=78;TCR=40;TR=118;WE=75673739;WS=75673721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr10	75674740	rs2227571	C	T	2482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=58;PP=1929;SC=ATGAGCCCAGCGTGATCAAGG;SOR=3.086;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=71;TCF=12;TCR=59;TR=70;WE=75674748;WS=75674730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
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chr10	75842152	rs2270548	G	A	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=5.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.286;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=5;PP=656;ReadPosRankSum=-0.964;SC=TCTGTCTTACGTTCTATCATG;SOR=1.008;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=57;TCF=46;TCR=11;TR=30;WE=75842160;WS=75842142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr10	75843100	rs1908339	T	A	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=7;PP=957;ReadPosRankSum=0.159;SC=AACAATGTAGTTATTGAATAT;SOR=0.818;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=57;TCF=48;TCR=9;TR=43;WE=75843108;WS=75843090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,45:0.76:59
chr10	75863750	rs2270552	C	T	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=763;SC=GAAATTGGAGCGGGACTGGTT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=75863758;WS=75863740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	75865065	rs767809	G	A	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=200;ReadPosRankSum=-0.165;SC=CCATCTCCCCGATGGTGATGG;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=11;WE=75865073;WS=75865055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr10	75867193	rs2279648	G	T	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.235;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=28;PP=735;ReadPosRankSum=0.721;SC=GTGTTTTAGAGCCTCCATCAC;SOR=1.048;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=37;WE=75867201;WS=75867183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,35:0.62:56
chr10	75871735	rs2131956	C	G	6046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=126;NR=64;PP=2965;SC=ATGCTGCTGGCTTCCCTGTCC;SOR=1.514;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=126;TCR=64;TR=190;WE=75871743;WS=75871725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr10	75874166	rs142879319	CGTGTGTGT	C	385.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.558;NF=1;NR=9;PP=1468;ReadPosRankSum=0.725;SC=AAAGAGGCTGCGTGTGTGTGT;SOR=0.387;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=10;WE=75874181;WS=75874156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr10	75874192	rs28639484	T	C	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=-0.332;QD=3.79;ReadPosRankSum=0.083;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr10	75885817	rs1908331	G	A	1717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.428;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=4;PP=1369;ReadPosRankSum=0.384;SC=TTTTAAACAAGGTGCCAAACC;SOR=0.203;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=82;TCF=78;TCR=4;TR=60;WE=75885825;WS=75885807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,60:0.72:83
chr10	75889760	rs35456205	GA	G	4802.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.237;NF=10;NR=156;PP=2988;ReadPosRankSum=1.540;SC=CCTGAAGAAAGAAAAAAAAAA;SOR=2.014;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=198;TCF=15;TCR=183;TR=166;WE=75889768;WS=75889750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,187:0.99:188
chr10	75896601	rs10762576	A	C	1236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=29;PP=1008;SC=ATGGAAGGCAAAAAGAAAGGC;SOR=2.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=35;WE=75896609;WS=75896591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	75936611	rs10824095	C	T	3113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=36;PP=2237;ReadPosRankSum=-0.780;SC=CGCCGTGGCGCTGGGCAGGAG;SOR=0.483;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=57;TCR=36;TR=92;WE=75936619;WS=75936601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
chr10	76158177	rs2126763	C	T	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=1;PP=400;SC=TCTATTGAAACATATGCTAAG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=76158185;WS=76158167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	76285223	rs147013045	TTTTG	T	159.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=60.49;MQRankSum=1.637;NF=0;NR=6;PP=189;ReadPosRankSum=-1.614;SC=CCTGGGGGTTTTTTGTTTGTT;SOR=0.197;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=6;WE=76285234;WS=76285213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr10	76360304	.	C	CAA	869.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=506;ReadPosRankSum=-1.140;SC=TAATCAATTACAAAAAAAAAT;SOR=0.635;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=83;TCF=7;TCR=76;TR=29;WE=76360312;WS=76360294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,32:0.41:79
chr10	76429870	rs10740443	T	C	4090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=32;PP=2965;SC=GAGCTTCAGATGTTACTGGGT;SOR=2.063;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=94;TCR=32;TR=126;WE=76429878;WS=76429860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr10	76854564	rs3088142	C	T	4177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=56;PP=2965;SC=CATGTTCTCACAGATCATGAG;SOR=1.138;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=79;TCR=56;TR=135;WE=76854572;WS=76854554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr10	76855326	rs3740318	A	G	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=223;ReadPosRankSum=0.575;SC=CTGATCCAGAAGTGCACCTTG;SOR=0.668;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=13;WE=76855334;WS=76855316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr10	76855412	rs3740317	G	A	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=5.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.89;ReadPosRankSum=-1.706;SOR=1.411;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,22:0.25:89
chr10	76855421	rs3740316	G	A	1709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.037;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=27;PP=2575;ReadPosRankSum=2.509;SC=CGTCCGCCTCGATGCCATAGT;SOR=0.270;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=94;TCF=59;TCR=35;TR=66;WE=76855429;WS=76855402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,67:0.71:95
chr10	76857364	rs3824742	C	G	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.953;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=6;PP=822;ReadPosRankSum=-0.062;SC=GGGAGGCAAGCGTGCCACCTC;SOR=0.875;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=132;TCF=110;TCR=22;TR=41;WE=76857372;WS=76857354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,42:0.32:133
chr10	76861680	rs6480771	T	C	1442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=8;PP=1095;SC=TTCGTGCTGCTGGCTTTCAGC;SOR=2.786;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=44;WE=76861688;WS=76861670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
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chr10	76867899	rs7912300	T	C	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=160;ReadPosRankSum=-0.717;SC=GTAGAGGCCCTTGTGGGCGGC;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=10;WE=76867907;WS=76867889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr10	76971844	rs2804535	C	T	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=324;SC=CGTTATAGTTCTATTGTAGCT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=76971852;WS=76971834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	76977658	.	C	G	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.404;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.903;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=391;ReadPosRankSum=-0.369;SC=ATCACAATTTCTGGCTGTAGT;SOR=0.465;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=93;TCF=37;TCR=56;TR=25;WE=76977666;WS=76977648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,26:0.26:99
chr10	76989295	rs11001334	C	T	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.295;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=676;ReadPosRankSum=1.288;SC=TTTATTGTCTCACGTGAATAA;SOR=0.963;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=28;WE=76989303;WS=76989285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr10	77159501	.	C	G	1506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.295;ClippingRankSum=0.000;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.705;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=1183;ReadPosRankSum=-0.515;SC=GGAGCTGGAGCCCGATGAACC;SOR=0.447;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=96;TCF=53;TCR=43;TR=53;WE=77159509;WS=77159491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,55:0.57:97
chr10	77191441	rs55922628	C	A	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.44;ReadPosRankSum=0.092;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr10	77312183	rs56910833	TC	T	112.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=8.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=0.677;QD=0.96;ReadPosRankSum=2.225;SOR=0.365;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,21:0.18:118
chr10	77312184	rs1367290	C	T	1889.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=2.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=-0.779;QD=15.49;ReadPosRankSum=-0.981;SOR=1.106;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,93:0.76:122
chr10	77542558	rs2133705	C	T	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=445;ReadPosRankSum=-0.273;SC=CCGCAACTTTCACTTGTTGAG;SOR=2.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=18;WE=77542566;WS=77542548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,18:0.82:22
chr10	77795995	rs4745806	C	T	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=83;SC=ATGAGTTTTACGTGTCAGCTA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=77796003;WS=77795985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	77807027	rs1898071	T	C	1786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=31;PP=1397;SC=GCTGGTCAGCTTGGAAAAGGA;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=19;TCR=31;TR=50;WE=77807035;WS=77807017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr10	77807092	rs1898070	A	C	1762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.472;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=34;PP=1503;ReadPosRankSum=-0.737;SC=CCATGGTGGGAAAAGGGAAAA;SOR=1.301;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=53;WE=77807100;WS=77807082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr10	77818594	rs7924288	C	T	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=538;SC=CATGGCAGTGCTTACACCCCA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=77818602;WS=77818584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	78649399	rs2288840	C	T	6366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=133;PP=2965;SC=AGCAGGGAAACGGGTCTTTTC;SOR=1.669;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=64;TCR=133;TR=197;WE=78649407;WS=78649389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr10	78729669	rs2288837	A	G	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=117;ReadPosRankSum=-0.942;SC=GGGTGAGGAGAGGGCGAGGGG;SOR=0.760;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=7;WE=78729677;WS=78729659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr10	78778734	rs16934182	G	A	3203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.202;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=35;PP=2463;ReadPosRankSum=0.625;SC=GTCTACAGCCGGGCCAGAAAG;SOR=1.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=93;TCF=57;TCR=36;TR=92;WE=78778742;WS=78778724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,99:0.99:100
chr10	78782876	rs7078109	T	C	1955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=52;PP=1686;SC=TCACATTTCATTGGGTATCTC;SOR=4.768;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=5;TCR=53;TR=57;WE=78782884;WS=78782866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	78839127	.	A	AGTGTGT	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.173;NF=5;NR=1;PP=289;ReadPosRankSum=0.291;SC=GGCATGTGAGAGTGTGTGTGT;SOR=2.147;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=6;WE=78839135;WS=78839117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,11:0.92:12
chr10	78844579	rs34592624	G	GA	567.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=1.079;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-1.820;QD=5.26;ReadPosRankSum=-0.602;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,39:0.36:108
chr10	78868165	rs138226779	CAAA	C	3596.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=9.088;HP=15;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;MQRankSum=0.414;NF=44;NR=31;PP=930;ReadPosRankSum=0.224;SC=AAACAAGAGCCAAAAAAAAAA;SOR=1.414;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=124;TCF=71;TCR=53;TR=75;WE=78868176;WS=78868155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,95:0.96:99
chr10	78880943	rs7907270	A	G	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.403;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=243;ReadPosRankSum=0.706;SC=CTGGTACCTCAGACATATTCC;SOR=0.095;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=13;WE=78880951;WS=78880933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr10	78944590	rs1131824	G	A	3540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.748;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=57;PP=2885;ReadPosRankSum=2.406;SC=CCCGCAAGCCGAAGTAGAGAA;SOR=0.559;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=220;TCF=132;TCR=88;TR=137;WE=78944598;WS=78944580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,136:0.63:217
chr10	78977190	rs16934368	A	C	4980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=77;PP=2965;SC=CACATGGCCAACTTCTCCCAA;SOR=0.744;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=78;TCR=77;TR=155;WE=78977198;WS=78977180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr10	79396401	rs35528388	AC	A	1563.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.283;NF=4;NR=39;PP=1509;ReadPosRankSum=0.442;SC=CCCGTGGGCTACCCCCAATAG;SOR=1.903;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=55;TCF=7;TCR=48;TR=43;WE=79396409;WS=79396391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr10	79492200	rs117430417	T	C	1421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.828;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.099;NF=37;NR=18;PP=1117;ReadPosRankSum=2.185;SC=CCAAAGACTGTGCACCTTGCC;SOR=0.846;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=88;TCF=59;TCR=29;TR=55;WE=79492208;WS=79492190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,55:0.59:94
chr10	79552092	rs2165046	C	T	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=519;SC=ATCCTTCCCCCGCATGTTCAT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=79552100;WS=79552082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	79552151	rs1058202	T	C	2239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=9;PP=1755;SC=CTGAGTCTGGTGTCCCCTCAG;SOR=3.643;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=57;TCR=9;TR=66;WE=79552159;WS=79552141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
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chr10	79566480	rs58116353	CT	C	247.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.704;NF=9;NR=1;PP=297;ReadPosRankSum=-0.137;SC=TCGGCGACCCCTGCCCCACCC;SOR=0.495;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=10;WE=79566488;WS=79566470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,10:0.27:37
chr10	79566632	rs1058198	G	A	1301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.273;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=29;PP=904;ReadPosRankSum=-0.889;SC=AGAGGATGTCGTCCTTCTTAA;SOR=0.421;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=231;TCF=145;TCR=86;TR=67;WE=79566640;WS=79566622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,67:0.29:230
chr10	79571108	rs2289309	C	T	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.690;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=117;ReadPosRankSum=-0.809;SC=TAGCCCTGCACCCTGTGCCCT;SOR=0.413;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=9;WE=79571116;WS=79571098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,9:0.20:45
chr10	79575879	rs1248638	A	G	2606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=34;PP=1986;SC=GGTGCCAGCCACTAACCACGT;SOR=1.204;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=51;TCR=34;TR=85;WE=79575887;WS=79575869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr10	79576826	rs140025014	C	T	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=13;PP=880;ReadPosRankSum=-0.438;SC=TAATGCGTTCCGCCTTGAACT;SOR=0.932;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=66;TCF=45;TCR=21;TR=42;WE=79576834;WS=79576816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,42:0.60:70
chr10	79579047	rs1248635	A	G	3282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=65;PP=2627;SC=GGGCAGCTGGAGTACAGAGAA;SOR=1.127;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=110;TCF=45;TCR=65;TR=109;WE=79579055;WS=79579037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr10	79579251	rs2289308	G	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=104;ReadPosRankSum=-0.464;SC=GAGAAAAGACGCCCCAAAGGA;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=7;WE=79579259;WS=79579241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr10	79584178	rs1248629	G	C	2036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=18;PP=1610;SC=CCTGGCAGCTGCGCAGCAGAG;SOR=2.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=45;TCR=18;TR=63;WE=79584186;WS=79584168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr10	79590685	rs10824579	C	T	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=5.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=26;PP=550;ReadPosRankSum=-0.717;SC=AACATCCCACCGCGTAACGGC;SOR=0.439;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=63;TCF=2;TCR=61;TR=27;WE=79590693;WS=79590675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,26:0.43:61
chr10	79590726	rs1248663	C	G	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=23;PP=689;SC=CCATTTGAAACAGCTAAAATG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=79590734;WS=79590716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	79595417	rs1248661	C	T	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=0;PP=578;SC=TAAATGATTCCGACCCTCCCA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=79595425;WS=79595413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	79601822	rs16935401	C	T	4074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=73;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.438;SC=TGTATTTCTCCGACTCCTTTG;SOR=0.675;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=249;TCF=134;TCR=115;TR=154;WE=79601830;WS=79601812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,156:0.62:251
chr10	79613905	rs139868547	G	C	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=293;ReadPosRankSum=0.274;SC=AGAACCCCTGGCTACTAAGTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=14;WE=79613913;WS=79613895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr10	79614189	rs1248692	A	G	3428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=74;PP=2698;SC=GGATAGAGGAACCAGGTCCTG;SOR=2.193;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=26;TCR=74;TR=100;WE=79614197;WS=79614179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr10	79616605	rs1248696	T	C	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=12;PP=457;SC=ATTCACTTGCTGGTCAGTGAG;SOR=0.770;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=23;WE=79616613;WS=79616595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	79616631	rs41274592	C	T	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=176;ReadPosRankSum=0.951;SC=GTGGTGGGGACGGCGCCTTCC;SOR=1.112;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=10;WE=79616639;WS=79616621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr10	79628875	rs1248655	A	G	1037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=13;PP=854;SC=CTCCCCAGACAGTGGTACTCA;SOR=1.308;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=22;TCR=13;TR=35;WE=79628883;WS=79628865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	79779150	rs1863898	G	A	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=184;ReadPosRankSum=-0.731;SC=ATCCTGGGCAGCCTGCTGCCT;SOR=0.336;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=11;WE=79779158;WS=79779140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr10	79793688	rs3740253	C	T	1612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.853;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=44;PP=1019;ReadPosRankSum=0.240;SC=CCCGTGCAGTCATCTGCCGCG;SOR=0.477;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=255;TCF=98;TCR=157;TR=76;WE=79793696;WS=79793678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:188,81:0.30:269
chr10	80288406	rs1865706	T	G	2683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=19;PP=2029;SC=TGAATATTTGTGTTGTTTCCA;SOR=2.196;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=59;TCR=19;TR=78;WE=80288414;WS=80288396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr10	80310465	rs2670191	T	C	3628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=36;PP=2650;SC=TGGGTGTTGTTGGAACCTACT;SOR=1.713;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=72;TCR=36;TR=108;WE=80310473;WS=80310455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr10	80310636	rs7090749	G	A	4891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=66;PP=2965;SC=TCCAATGTAAGTGTGGAAAAA;SOR=0.843;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=142;TCF=76;TCR=66;TR=141;WE=80310644;WS=80310626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
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chr10	81037229	rs1250539	G	A	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=540;ReadPosRankSum=0.079;SC=TTACATCTTCGTGGGTGAGCC;SOR=1.552;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=24;WE=81037237;WS=81037219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr10	81045207	rs1250569	T	C	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=1;PP=674;ReadPosRankSum=0.880;SC=CCCCATTTCATAGATGAGGTT;SOR=1.609;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=30;WE=81045215;WS=81045197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,32:0.67:48
chr10	81045280	rs1250568	T	C	2414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.003;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=16;PP=1880;ReadPosRankSum=0.374;SC=TCTCTCACTTTCTGGGCCCCA;SOR=1.037;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=114;TCF=90;TCR=24;TR=80;WE=81045288;WS=81045270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,84:0.70:120
chr10	81053475	rs1250560	G	A	1958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.902;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=50;PP=1396;ReadPosRankSum=-0.445;SC=GACATGGGCCGTGGGTACGGC;SOR=0.490;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=100;TCF=27;TCR=73;TR=69;WE=81053483;WS=81053465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,75:0.70:107
chr10	81053560	rs1250559	G	A	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.027;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=548;ReadPosRankSum=1.014;SC=GTGCTCCTGGGTTTGAGACCT;SOR=3.076;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=23;WE=81053568;WS=81053550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr10	81058027	rs1250552	A	G	2082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.514;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=1;PP=1801;ReadPosRankSum=1.645;SC=GAGAGAGAAGAGTTTCCCTGG;SOR=1.887;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=116;TCF=114;TCR=2;TR=70;WE=81058035;WS=81058017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,71:0.61:117
chr10	81060474	rs1250549	T	C	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.662;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=702;ReadPosRankSum=0.794;SC=CTGAGCACCCTCGTTCCCCAC;SOR=0.346;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=29;WE=81060482;WS=81060464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,28:0.78:36
chr10	81060829	rs1782648	G	A	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=3;PP=83;SC=GCCCACAGCCGCCAAAGATAC;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=81060837;WS=81060819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	81064719	rs2296425	G	A	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.494;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=55;ReadPosRankSum=-0.349;SC=GGGAGGTGGTGTGAGGGATGC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=81064727;WS=81064716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr10	81064755	rs2296424	G	A	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=121;ReadPosRankSum=-0.409;SC=AGGACTCTGCGTGGCAGAAAG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=8;WE=81064763;WS=81064745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr10	81065201	rs1250558	G	A	1439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.901;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=13;PP=1206;ReadPosRankSum=0.640;SC=CAGCAGGGGTGGGACCCCACT;SOR=1.870;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=87;TCF=60;TCR=27;TR=53;WE=81065209;WS=81065191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,53:0.61:87
chr10	81065774	rs1250557	G	T	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=1;PP=1087;SC=AAGGTCACCTGGGTGTCTGTC;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=37;WE=81065782;WS=81065764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	81067480	rs1972346	C	G	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=235;ReadPosRankSum=0.000;SC=ACTGAGGCTACGTCGTGCCCT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=12;WE=81067488;WS=81067470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr10	81072242	rs181864055	G	A	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-6.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=2;PP=1127;ReadPosRankSum=0.459;SC=GGGGATACCTGGCAGGCCCAA;SOR=0.564;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=67;TCF=65;TCR=2;TR=48;WE=81072250;WS=81072232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,48:0.74:65
chr10	81108956	rs2233718	A	G	1833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=48;PP=1431;SC=GTCGGGGCTCAGAGACCCCTG;SOR=5.211;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=51;WE=81108964;WS=81108946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr10	81270253	rs373503554	A	G	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.70;MQRankSum=-2.046;QD=1.49;ReadPosRankSum=0.029;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr10	81270319	rs369628215	T	A	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.01;MQRankSum=-1.139;QD=1.17;ReadPosRankSum=-0.939;SOR=0.635;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,6:0.15:40
chr10	81286385	.	C	T	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.376;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=35;PP=968;ReadPosRankSum=1.040;SC=AACACCTTCACGACCTGCAGA;SOR=0.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=20;TCR=58;TR=47;WE=81286393;WS=81286375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,48:0.61:79
chr10	81318545	rs2217231	A	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.27;ReadPosRankSum=0.790;SOR=0.392;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,5:0.16:32
chr10	81318820	rs17880349	G	A	1091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=31;PP=912;SC=GTTGGAGCTAGTGAGACTCGA;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=81318828;WS=81318810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	81318930	rs1250943	C	G	159.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.81;QD=26.64;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	81319214	rs1059046	G	T	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.56;QD=31.08;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	81319267	rs1650232	C	T	113.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=28.26;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	81319423	rs1975008	C	T	1659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=16;PP=1338;SC=CCAAGCATCACCTGGCACCTG;SOR=1.747;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=52;WE=81319431;WS=81319413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	81319483	rs1975007	A	G	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=28;PP=1346;SC=GGGTCTCAAGACTGCTGAGGA;SOR=0.818;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=55;WE=81319491;WS=81319473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	81342369	rs34032311	G	T	2292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=51;PP=2235;SC=TCCGCTCACCGTTGGTCATGA;SOR=1.802;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=90;TCF=38;TCR=52;TR=89;WE=81342377;WS=81342359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr10	81342469	rs2678654	A	G	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.01;QD=27.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	81343036	rs3855862	G	A	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.93;QD=32.98;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	81371729	rs1136450	C	G	208.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.67;QD=29.83;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	81373182	rs4253524	G	C	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=476;SC=GAATGGCCCAGAGGAGACAGA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=81373190;WS=81373172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	81841332	rs145830052	G	A	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=356;ReadPosRankSum=2.234;SC=GCTGAGGTGGGAGGATGGATT;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=15;WE=81841340;WS=81841322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr10	81904638	rs2819874	G	A	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=373;ReadPosRankSum=-1.868;SC=CTCACTGGGGGCCTCTGCTTT;SOR=0.213;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=58;TCR=1;TR=20;WE=81904646;WS=81904628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,20:0.33:61
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chr10	81921918	rs2245168	T	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.855;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=117;ReadPosRankSum=1.329;SC=CTGAACTAGATGGCCTCTAAA;SOR=1.127;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=11;WE=81921926;WS=81921908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,13:0.30:44
chr10	81923205	rs2236558	T	G	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.959;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=552;ReadPosRankSum=1.468;SC=CCTTCCCCATTTATTTTCCCT;SOR=0.931;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=52;TCF=28;TCR=24;TR=31;WE=81923213;WS=81923195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,31:0.61:51
chr10	81923961	rs2236557	G	A	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.153;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=221;ReadPosRankSum=-0.599;SC=CAGCACTCGGGAAGAAGGGTG;SOR=0.260;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=13;WE=81923969;WS=81923951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr10	81925785	rs2573348	C	T	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=5.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQRankSum=1.438;QD=23.21;ReadPosRankSum=0.558;SOR=0.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr10	81925795	rs9421228	C	T	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-4.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=4.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQRankSum=1.835;QD=23.20;ReadPosRankSum=1.339;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr10	81925796	rs138741116	GCGCACACACACA	G,GCACACACACGCACACACACA	1486.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=17;NR=2;PP=2971;SC=GCACACACGCGCGCACACACA;SOR=3.767;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=43;TCR=5;TR=19;WE=81925815;WS=81925775;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.70,0.30:43
chr10	81925798	rs3000941	G	A	620.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQRankSum=-1.950;QD=12.93;ReadPosRankSum=-0.327;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,19:0.40:48
chr10	81926702	rs1049550	G	A	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.340;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=351;ReadPosRankSum=-0.657;SC=TTGTTGGAGCGACTCCCCAGG;SOR=0.940;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=59;TCF=31;TCR=28;TR=25;WE=81926710;WS=81926692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr10	81932790	rs2236556	T	C	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=336;ReadPosRankSum=-0.328;SC=CTCCTGCTGGTGCCTCCAGCT;SOR=1.214;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=20;WE=81932798;WS=81932780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr10	81993489	rs11202256	C	T	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.857;NF=18;NR=15;PP=605;ReadPosRankSum=0.731;SC=GACCAAGGAGCTGCAGCAGCA;SOR=0.679;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=44;TCR=36;TR=33;WE=81993497;WS=81993479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,31:0.39:80
chr10	81995059	rs200784765	A	G	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.03;MQRankSum=-5.758;QD=11.49;ReadPosRankSum=-0.327;SOR=0.847;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,32:0.34:95
chr10	81995062	rs201999517	A	G	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.19;MQRankSum=-5.731;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.297;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,30:0.33:92
chr10	82009543	rs115968930	C	G	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.81;QD=24.73;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	82012599	rs12219032	T	C	1781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.901;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=45;PP=1567;ReadPosRankSum=2.612;SC=CATCCACCTCTCGAAGCTGGT;SOR=0.955;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=227;TCF=104;TCR=123;TR=77;WE=82012607;WS=82012589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,77:0.32:239
chr10	82012748	rs12217395	G	A	2090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.864;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=36;PP=1455;ReadPosRankSum=0.739;SC=ACACCCTGCAGCTGTAGGTCT;SOR=0.905;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=258;TCF=138;TCR=120;TR=86;WE=82012756;WS=82012738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,91:0.34:271
chr10	82012954	rs12773664	A	G	2948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.190;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=64;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.861;SC=GACCTCATCCATCTTTTATAG;SOR=0.946;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=247;TCF=78;TCR=169;TR=88;WE=82012975;WS=82012944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,87:0.34:255
chr10	82012967	rs12411782	G	T	2866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.515;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=63;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.265;SC=TTTTATAGCTGCCTTCCTCTA;SOR=1.306;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=238;TCF=75;TCR=163;TR=82;WE=82012975;WS=82012944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,83:0.34:243
chr10	82013119	rs12411806	G	A	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.459;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=17;PP=1003;ReadPosRankSum=-0.968;SC=GAATCTCCTCGGTTACTTCAA;SOR=1.459;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=166;TCF=97;TCR=69;TR=55;WE=82013127;WS=82013109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,56:0.33:169
chr10	82013134	rs1298908	C	T	5120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.108;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.683;NF=76;NR=53;PP=2962;ReadPosRankSum=0.353;SC=CTTCAATAATCTCCATTTGTG;SOR=0.227;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=191;TCF=123;TCR=68;TR=129;WE=82013154;WS=82013124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,133:0.68:197
chr10	82013146	rs2573326	T	C	5199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.517;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.723;NF=80;NR=47;PP=2962;ReadPosRankSum=1.348;SC=CCATTTGTGGTCCCTGGGACT;SOR=0.293;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=193;TCF=131;TCR=62;TR=127;WE=82013154;WS=82013124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,130:0.65:200
chr10	82033464	rs116371248	C	A	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.34;ReadPosRankSum=1.918;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr10	82033470	rs7087728	G	A	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.18;ReadPosRankSum=0.252;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr10	82033594	rs2993763	G	A	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.295;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=15;PP=919;ReadPosRankSum=-0.241;SC=CGAAATGGCCGTAGCATGCTG;SOR=1.405;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=59;TCF=36;TCR=23;TR=43;WE=82033602;WS=82033584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,43:0.74:58
chr10	82034262	rs2994388	G	A	3741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.527;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=49;PP=2933;ReadPosRankSum=-1.731;SC=TAATAGCAGCGCATGGCACTT;SOR=0.895;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=222;TCF=142;TCR=80;TR=143;WE=82034270;WS=82034252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,144:0.65:221
chr10	82034842	rs10887711	A	G	940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=6;PP=724;SC=CAGCATATGCAGCTGAGCGGT;SOR=2.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=32;WE=82034862;WS=82034832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	82034854	rs10788546	T	C	1333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=9;PP=1074;SC=CTGAGCGGTCTACCTTGGTGT;SOR=2.247;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=39;WE=82034862;WS=82034832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	82040052	rs1143694	A	G	3098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=59;PP=2359;SC=TCTCGTCGGTAGCATAGCCGA;SOR=1.190;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=38;TCR=59;TR=97;WE=82040060;WS=82040042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr10	82040346	rs2282367	A	G	6032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=169;NR=41;PP=2965;SC=GTGCTAGGACAAGAATCCACC;SOR=2.715;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=210;TCF=169;TCR=41;TR=210;WE=82040354;WS=82040336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr10	82045063	.	ATAAT	A	733	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=62.05;NF=14;NR=1;PP=733;QD=50.9333333333;SC=CTTGCTAAAAATAATTATCTA;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=15;WE=82045074;WS=82045062;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,15:0.83:18
chr10	82049251	rs145126070	T	TTTCTTC	1968.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=31;PP=1873;SC=TGAGTTTTTTTTTCTTCTTCT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=0;TCR=65;TR=31;WE=82049259;WS=82049241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	82095968	rs1340383	T	G	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=403;SC=AAGTAAATATTCCTTAATACA;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=82095976;WS=82095958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	82111460	rs11202652	T	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=109;ReadPosRankSum=-0.109;SC=TGTATATGTGTATACAAGAAT;SOR=0.096;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=7;WE=82111468;WS=82111450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr10	82112488	rs1572819	A	G	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=20;PP=537;SC=GACACCTCCCATTGGGGGTGT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=82112496;WS=82112478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	82126808	rs1047952	C	G	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=418;SC=AAGGCAAGTTCAGGGACTCTC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=82126816;WS=82126798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	82182296	rs1870142	G	A	3912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=72;PP=2965;SC=TTCAGAGAAAGGGATCCTGGC;SOR=1.107;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=51;TCR=72;TR=123;WE=82182304;WS=82182286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr10	82182328	rs1870143	G	A	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.673;NF=8;NR=28;PP=662;ReadPosRankSum=1.051;SC=ATTGTTTTCCGGCCAGAACCA;SOR=0.676;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=107;TCF=26;TCR=81;TR=36;WE=82182336;WS=82182318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,35:0.32:108
chr10	82182405	rs5786455	C	CT	720.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=955;SC=CTAGGTATTTCTTTGATTTGT;SOR=4.003;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=23;WE=82182413;WS=82182395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	82185828	rs77000305	G	A	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.702;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=511;ReadPosRankSum=0.559;SC=GTGATAGTCAGGTGGCCCAGG;SOR=0.138;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=21;WE=82185836;WS=82185818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr10	82191643	rs6585994	A	G	2059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=12;PP=1653;SC=GTCCTTTGCTATTCAAGCAAA;SOR=2.833;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=63;TCF=50;TCR=13;TR=62;WE=82191651;WS=82191633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr10	82249160	rs116751473	A	G	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=96;ReadPosRankSum=-0.900;SC=GCCAGACACTATGTAAGGCTC;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=82249168;WS=82249150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr10	82267157	.	G	GA	1050.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.143;ClippingRankSum=0.000;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.535;QD=10.30;ReadPosRankSum=1.030;SOR=0.782;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,31:0.30:102
chr10	82267162	.	G	T	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.142;ClippingRankSum=0.000;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.834;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.479;NF=9;NR=16;PP=1295;ReadPosRankSum=0.140;SC=AGTGGGATAGGATGCAATGGG;SOR=0.844;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=90;TCF=34;TCR=56;TR=25;WE=82267170;WS=82267147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,32:0.32:100
chr10	82267236	rs74143157	C	G	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.548;NF=1;NR=34;PP=844;ReadPosRankSum=-0.208;SC=CTCTTAGGAGCCTCCCCTAGG;SOR=1.487;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=35;WE=82267244;WS=82267226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,37:0.80:46
chr10	82269238	rs10785897	C	T	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=80;ReadPosRankSum=-1.371;SC=GTAAGCACCTCCCCAGCGGGC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=6;WE=82269246;WS=82269228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr10	82276043	rs35179410	T	C	1809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=47;PP=1208;ReadPosRankSum=2.136;SC=ACATTTACATTGTGGCTGGCG;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=31;TCR=67;TR=69;WE=82276051;WS=82276033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,76:0.73:104
chr10	82280188	rs7099280	A	G	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.402;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=3;PP=641;ReadPosRankSum=-0.969;SC=GGCACAGGGCAGGCCTCCTGT;SOR=0.136;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=51;TCF=48;TCR=3;TR=33;WE=82280196;WS=82280182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,31:0.63:49
chr10	82280551	rs76479920	T	G	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.712;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=43;PP=1181;ReadPosRankSum=1.336;SC=CTTATCCCAATTGTCAACTCT;SOR=1.125;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=107;TCF=37;TCR=70;TR=61;WE=82280559;WS=82280541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,66:0.58:113
chr10	82331292	rs72805712	G	A	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.204;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=438;ReadPosRankSum=0.809;SC=AAGACCGCAAGGCTGCCAAAG;SOR=0.114;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=64;TCF=9;TCR=55;TR=24;WE=82331300;WS=82331282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,24:0.36:66
chr10	82363340	rs7069048	C	A	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=3;PP=895;SC=TCCAGTGCGCCGGTCCAAGGC;SOR=4.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=32;WE=82363348;WS=82363330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	82363404	rs7075840	A	G	1627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=19;PP=1306;SC=GAGTACCGACACCACTCGCTC;SOR=1.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=34;TCR=19;TR=53;WE=82363412;WS=82363394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr10	82369420	rs11816639	G	A	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=116;ReadPosRankSum=-0.743;SC=AGGACTTTAAGCAATCTCCAT;SOR=0.602;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=8;WE=82369428;WS=82369410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr10	84118322	rs17099846	T	A	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=377;ReadPosRankSum=-1.594;SC=AATATAGTGGTTACAGCCAGC;SOR=1.708;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=16;WE=84118330;WS=84118312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr10	84625107	rs478010	C	T	6451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=129;NR=70;PP=2965;SC=ATGTATAGAGCTTTTTCTAAC;SOR=1.456;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=200;TCF=130;TCR=70;TR=199;WE=84625115;WS=84625097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
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chr10	84745256	rs2295933	C	T	1123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.316;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=21;PP=847;ReadPosRankSum=2.581;SC=ACAGTGCAAGCGAAAACACAG;SOR=0.549;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=180;TCF=116;TCR=64;TR=55;WE=84745264;WS=84745246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,56:0.30:188
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chr10	85903726	rs2306320	C	G	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=1.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.84;ReadPosRankSum=2.070;SOR=0.984;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,18:0.25:72
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chr10	85971347	rs4933978	G	A	2150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.107;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=32;PP=1549;ReadPosRankSum=-1.072;SC=GGGCATGGGAGCTGCCAACAT;SOR=0.259;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=117;TCF=74;TCR=43;TR=76;WE=85971355;WS=85971337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,83:0.66:125
chr10	85972043	rs10749482	A	G	1762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.852;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=24;PP=1315;ReadPosRankSum=-0.524;SC=AGGACATGGAAGGCAAGTACA;SOR=0.970;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=90;TCF=49;TCR=41;TR=56;WE=85972051;WS=85972033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,63:0.66:96
chr10	85974236	rs3814213	T	C	3244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-7.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.97;MQRankSum=-0.768;NF=44;NR=89;PP=2451;ReadPosRankSum=0.095;SC=CCGTGCCTACTGTCTCTGGCT;SOR=0.689;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=211;TCF=70;TCR=141;TR=133;WE=85974244;WS=85974226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,134:0.62:215
chr10	85974381	rs3814212	A	G	2429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.529;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=63;PP=1685;ReadPosRankSum=-0.122;SC=CTTCTAGTGTATGCCCTATGA;SOR=0.426;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=136;TCF=37;TCR=99;TR=88;WE=85974389;WS=85974371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,97:0.65:149
chr10	85978809	rs4562752	T	G	1510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=1;PP=1188;ReadPosRankSum=-0.296;SC=AGAACACTAATGTACTATTAT;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=60;TCR=1;TR=47;WE=85978817;WS=85978799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,50:0.78:64
chr10	85978939	rs4244947	G	A	4052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.356;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=72;PP=2962;ReadPosRankSum=0.174;SC=GCCAGGGTCTGTTCTTGCATC;SOR=0.621;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=217;TCF=110;TCR=107;TR=143;WE=85978947;WS=85978929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,153:0.66:232
chr10	85978991	rs7895270	C	T	3257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.856;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=92;PP=2445;ReadPosRankSum=0.298;SC=TAATGTGAATCTGTACTCTAG;SOR=1.254;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=167;TCF=40;TCR=127;TR=117;WE=85978999;WS=85978981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,122:0.69:177
chr10	85981801	rs6585847	T	G	1843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=36;PP=1415;ReadPosRankSum=-0.291;SC=GCTGCAGGGGTGCAGCTGGGG;SOR=0.977;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=89;TCF=40;TCR=49;TR=62;WE=85981809;WS=85981791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,67:0.71:94
chr10	85985331	rs7898778	C	T	2126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=65;PP=1759;ReadPosRankSum=-2.043;SC=CCCCAGCTTCCGAGTGGCAAA;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=106;TCF=16;TCR=90;TR=76;WE=85985339;WS=85985321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,76:0.71:107
chr10	85991784	rs3814211	T	C	1202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-5.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.921;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=33;PP=827;ReadPosRankSum=-0.479;SC=TCGCTGACACTGTGCCGGGAC;SOR=0.548;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=178;TCF=82;TCR=96;TR=61;WE=85991792;WS=85991774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,62:0.33:188
chr10	85992390	rs12262099	G	T	3361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.786;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=71;PP=2759;ReadPosRankSum=-0.337;SC=AGGACAGCGGGTTTGGGAATC;SOR=0.440;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=177;TCF=71;TCR=106;TR=122;WE=85992398;WS=85992380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,123:0.67:183
chr10	85992478	rs3814210	T	C	2290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=46;PP=1895;ReadPosRankSum=0.182;SC=CCCATAGTGCTCCTGGGCTCC;SOR=0.691;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=126;TCF=56;TCR=70;TR=84;WE=85992486;WS=85992468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,83:0.65:127
chr10	85992511	rs3814209	T	C	2360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.106;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=55;PP=1720;ReadPosRankSum=-0.563;SC=TGGAAGTCGGTGGCTCAGTGA;SOR=1.003;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=144;TCF=62;TCR=82;TR=94;WE=85992519;WS=85992501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,97:0.65:149
chr10	85993836	rs4933986	A	G	153.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=123;SC=TACCTGTACCATTAAGGGGCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=85993844;WS=85993826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	85993910	rs3814206	G	A	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.759;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=686;ReadPosRankSum=-0.680;SC=CAGCGTAGCAGTGCTGTGCCA;SOR=0.080;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=31;WE=85993918;WS=85993900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,33:0.79:42
chr10	85994142	rs3829858	A	G	1357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=36;PP=1081;ReadPosRankSum=-0.431;SC=GCCCTGCAGGAGTAAAAAAGA;SOR=0.573;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=68;TCF=15;TCR=53;TR=47;WE=85994150;WS=85994132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,48:0.70:69
chr10	85996968	rs4933988	A	C	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=271;ReadPosRankSum=-0.293;SC=AAGGTTGCCGACCCTTACCTA;SOR=0.446;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=14;WE=85996976;WS=85996958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr10	85997250	rs10887259	G	A	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.656;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=651;ReadPosRankSum=-0.625;SC=GGCGTCGCAGGCCCCGCAGCA;SOR=0.382;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=47;TCF=28;TCR=19;TR=31;WE=85997258;WS=85997240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,34:0.69:49
chr10	86001255	rs3841414	G	GGCCCAGCAA	158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.253;NF=1;NR=4;PP=793;ReadPosRankSum=0.842;SC=CCGTCCCACCGGCCCAGCAAG;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=86001263;WS=86001245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr10	86004736	rs2279228	A	G	597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=2;PP=514;SC=CCAAGGTCCAACATAATAACC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=86004744;WS=86004726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr10	86010273	.	TACACACAC	TAC,T	81	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0,0;NR=4,4;PP=74,81;QD=19.25;SC=GACCATCTTATACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4,4;WE=86010288;WS=86010263;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.31:13
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chr10	86259872	rs56347056	C	A	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=147;ReadPosRankSum=1.244;SC=TCTCTTAACACTTCCTTTTAC;SOR=0.668;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=2;TCR=50;TR=12;WE=86259880;WS=86259862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,12:0.23:53
chr10	86273249	rs11557865	T	C	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=766;ReadPosRankSum=0.541;SC=GACCCACAGATCACACCCAGG;SOR=0.757;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=122;TCF=69;TCR=53;TR=45;WE=86273257;WS=86273239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,47:0.36:129
chr10	87362579	rs60453921	T	A	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=256;SC=TGGGCGAGTATCCCTTTCATG;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=87362587;WS=87362569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	88024443	rs2607863	T	C	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=398;ReadPosRankSum=-0.704;SC=CCATGTCCCATGCAGGAGCCG;SOR=0.421;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=21;WE=88024451;WS=88024433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr10	88123951	rs7089364	G	A	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=660;ReadPosRankSum=-1.895;SC=GATGATTGCCGGGTGGTGGGA;SOR=0.527;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=26;WE=88123959;WS=88123941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,26:0.74:35
chr10	88125912	rs61856637	G	C	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=48;ReadPosRankSum=-0.751;SC=CGGCGCGGCCGGTGCACAGCT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=88125920;WS=88125902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr10	88126056	rs11202000	T	G	2030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=31;PP=1212;SC=CGGCCCGGCCTCCAGCCGCGC;SOR=0.884;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=55;WE=88126064;WS=88126046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	88126072	rs61856638	G	A	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.791;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=629;ReadPosRankSum=-1.495;SC=CGCGCTTACCGATGTGGATGA;SOR=0.211;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=34;WE=88126080;WS=88126062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,35:0.61:57
chr10	88197909	rs17422189	T	C	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=589;ReadPosRankSum=0.666;SC=TTATTCTCTTTCCACACTCAC;SOR=1.347;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=25;WE=88197917;WS=88197899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
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chr10	88211984	rs78450388	A	G	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=306;ReadPosRankSum=-1.572;SC=AAAAAGCTGAATATCAGTGTT;SOR=1.609;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=14;WE=88211992;WS=88211974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr10	88213604	rs6586011	A	G	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.992;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=542;ReadPosRankSum=-1.099;SC=AAGGAAATAAAATATAGACTA;SOR=1.395;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=63;TCF=10;TCR=53;TR=26;WE=88213612;WS=88213594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,26:0.41:64
chr10	88220866	rs7922658	C	T	1623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=3;PP=1414;ReadPosRankSum=1.292;SC=TTTTGAAGTACGTCAATGGAG;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=49;TCR=3;TR=51;WE=88220874;WS=88220856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr10	88230874	rs2288362	G	A	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.157;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=1173;ReadPosRankSum=0.934;SC=CAAGAAAATAGAGCAGGTTAG;SOR=0.915;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=88;TCF=15;TCR=73;TR=28;WE=88230893;WS=88230864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,29:0.32:90
chr10	88230885	rs2288361	G	C	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.521;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=41;PP=2383;ReadPosRankSum=-0.713;SC=AGCAGGTTAGGGGGGCTGGAA;SOR=0.434;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=72;TCF=8;TCR=64;TR=47;WE=88230893;WS=88230864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,48:0.65:74
chr10	88230929	rs2288360	A	G	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=28;PP=706;ReadPosRankSum=-0.380;SC=TTTGTGTAATACCAAAACCAG;SOR=0.347;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=30;WE=88230937;WS=88230919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr10	88231871	rs41314481	A	G	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.736;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=168;ReadPosRankSum=-0.914;SC=CCATCATAACAAAATAAAAAA;SOR=2.494;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=10;WE=88231879;WS=88231866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr10	88256943	rs4934215	C	T	2291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=10;PP=1790;SC=AAATCACTGACAGTGCTTTAC;SOR=2.995;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=58;TCR=10;TR=68;WE=88256951;WS=88256933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr10	88281344	rs2289738	C	G	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=2.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.71;ReadPosRankSum=-0.235;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,16:0.29:56
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chr10	88281346	rs4934218	A	G	1834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=29;PP=874;SC=GGCCGGGCCCAGGCCTAGCTC;SOR=1.022;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=52;TCF=23;TCR=29;TR=51;WE=88281354;WS=88281334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
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chr10	88419641	rs3740335	G	A	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=5.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=332;ReadPosRankSum=-1.305;SC=TGGACGATGCGTCCTTCCTAG;SOR=0.386;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=51;TCF=47;TCR=4;TR=17;WE=88419649;WS=88419631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,18:0.34:53
chr10	88421997	rs2675698	C	T	403.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5066;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=289;ReadPosRankSum=0.867;SC=ATCAGATGTGCGGCCCCTGCA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=13;WE=88422005;WS=88421987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,15:0.88:17
chr10	88422116	rs1079610	C	T	1972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=17;PP=1485;SC=TCCACGCTGACCAGCCACACC;SOR=1.839;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=45;TCR=17;TR=62;WE=88422124;WS=88422106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr10	88422307	rs2803550	G	A	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.769;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=308;ReadPosRankSum=-1.188;SC=GGGACACTGAGGACGCTGGCA;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=12;WE=88422315;WS=88422297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr10	88425555	rs2803554	C	A	2481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.915;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=63;PP=1834;ReadPosRankSum=0.128;SC=CCAGCCCCCCCACGTCTCCCT;SOR=0.444;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=124;TCF=35;TCR=89;TR=89;WE=88425563;WS=88425545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,92:0.73:126
chr10	88426614	rs34106786	TC	T	435.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=60.14;MQRankSum=1.559;NF=3;NR=17;PP=508;ReadPosRankSum=-0.532;SC=AGGTACAGCCTCCCCCAGCTC;SOR=0.683;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=9;TCR=58;TR=20;WE=88426622;WS=88426604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,21:0.30:70
chr10	88428303	rs2803556	G	A	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.364;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=1;PP=2623;ReadPosRankSum=-0.165;SC=CACGCAGCCCGGCTGGGCAGC;SOR=2.173;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=67;TCF=65;TCR=2;TR=49;WE=88428323;WS=88428293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,53:0.74:72
chr10	88428315	rs2803557	A	G	1905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.058;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=3;PP=2567;ReadPosRankSum=-0.085;SC=CTGGGCAGCAAGGGACAGAAC;SOR=1.508;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=83;TCF=78;TCR=5;TR=59;WE=88428323;WS=88428293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,62:0.71:87
chr10	88428335	rs2803558	T	C	3572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=19;PP=2704;SC=CAGGCAAGGCTGGGGGTCAGG;SOR=3.026;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=86;TCR=19;TR=105;WE=88428343;WS=88428325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr10	88445385	rs3740345	G	C	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.007;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=5;PP=604;ReadPosRankSum=-1.477;SC=ACTGCCCCTGGTGGAGCCTCT;SOR=0.855;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=130;TCF=111;TCR=19;TR=37;WE=88445393;WS=88445375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,36:0.28:129
chr10	88451869	rs3740346	G	C	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.548;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=29;PP=538;ReadPosRankSum=0.943;SC=AGATGCTGAGGGGCCACCAGG;SOR=1.888;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=51;TCF=3;TCR=48;TR=30;WE=88451877;WS=88451859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,30:0.60:50
chr10	88458996	rs374727638	TTCTC	T,TTC	830.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.036;NF=18;NR=10;PP=364;ReadPosRankSum=-0.826;SC=CTGTCTCTGTTTCTCTCTCTC;SOR=0.593;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=57;TCF=36;TCR=21;TR=28;WE=88459009;WS=88458982;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.35,0.43:54
chr10	88679200	rs35572415	C	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.780;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.034;NF=1;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=1.339;SC=GCATTGCTGACCTGGGCCTTG;SOR=1.565;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=7;WE=88679208;WS=88679190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr10	88702350	rs4934281	G	C	1882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=36;PP=1589;SC=TGGAGGCCGTGAAGGGAGGCG;SOR=1.453;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=54;WE=88702358;WS=88702340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	88702390	rs10887673	G	A	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.847;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=187;ReadPosRankSum=-0.450;SC=CCCCGGCCTCGGCCTCGCAGC;SOR=1.447;SbPval=0.06;Source=Platypus;TC=52;TCF=21;TCR=31;TR=13;WE=88702398;WS=88702380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,13:0.23:56
chr10	88705306	rs3750822	T	G	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.917;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=25;PP=707;ReadPosRankSum=-0.462;SC=TGGCCCACCCTCCCCTACTCA;SOR=0.862;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=189;TCF=109;TCR=80;TR=61;WE=88705314;WS=88705296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,62:0.32:195
chr10	88717140	rs4244973	T	A	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=5;PP=652;SC=CTTACCGTCCTACGGGGTCCT;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=88717162;WS=88717130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr10	88718436	rs1800373	A	C	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=467;ReadPosRankSum=0.796;SC=CTGCAGCAGCACAACCCTGCA;SOR=0.428;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=22;WE=88718444;WS=88718426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr10	88719569	rs760112	G	A	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=268;ReadPosRankSum=-0.307;SC=TGCAGACCATGAGGCTAAACT;SOR=0.551;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=13;WE=88719577;WS=88719559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr10	88719789	rs760113	C	G	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=410;ReadPosRankSum=-0.286;SC=AGGCCAACGCCGTGAGCGAGG;SOR=0.749;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=77;TCF=47;TCR=30;TR=28;WE=88719797;WS=88719779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,29:0.38:77
chr10	88722398	rs9864	A	T	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.53;ReadPosRankSum=-0.766;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,21:0.24:89
chr10	88730106	rs2279602	C	T	3838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.527;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=67;PP=2962;ReadPosRankSum=1.269;SC=CACATCCTCTCCTCTGCAGAG;SOR=0.403;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=235;TCF=134;TCR=101;TR=145;WE=88730114;WS=88730096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,144:0.62:234
chr10	88730177	rs2279601	A	G	4339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.694;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=62;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.607;SC=CTAAGCCTACAGGCACTGTGG;SOR=1.178;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=286;TCF=177;TCR=109;TR=178;WE=88730185;WS=88730167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,180:0.62:291
chr10	88730312	rs4869	T	C	5435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.916;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=122;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.853;SC=TCTCTGGGATTGGGAAAAAAT;SOR=0.906;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=320;TCF=149;TCR=171;TR=215;WE=88730320;WS=88730302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,218:0.66:328
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chr10	88768253	rs2641563	A	G	3178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.940;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.460;NF=43;NR=77;PP=2475;ReadPosRankSum=2.719;SC=ACCCACGCCCATTTGCAAGCA;SOR=0.425;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=173;TCF=58;TCR=115;TR=120;WE=88768261;WS=88768243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,124:0.68:183
chr10	88768657	rs1745901	C	T	3164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.629;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.707;NF=61;NR=52;PP=2462;ReadPosRankSum=-1.329;SC=CCAATTCAGACATCGGGCTGG;SOR=0.753;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=171;TCF=87;TCR=84;TR=113;WE=88768665;WS=88768647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,118:0.66:179
chr10	88834244	rs375835858	CA	C	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.34;MQRankSum=0.062;QD=3.06;ReadPosRankSum=-0.507;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr10	88930249	rs11202365	A	T	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.862;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.258;NF=31;NR=23;PP=1065;ReadPosRankSum=0.161;SC=CAGTGTAGTTAGTGAAGTTGT;SOR=0.825;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=47;TCR=34;TR=54;WE=88930257;WS=88930239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,55:0.65:84
chr10	88935590	rs11202370	C	G	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=1;PP=749;SC=TAATCTGATACTAAGCCTAGA;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=88935598;WS=88935580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	88939962	rs7081609	T	C	2442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=62;PP=2113;SC=TATATACTGGTTGTGCAAAAT;SOR=3.321;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=13;TCR=62;TR=75;WE=88939970;WS=88939952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr10	88973817	rs28668119	C	T	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.016;NF=4;NR=2;PP=71;ReadPosRankSum=-0.204;SC=AACGTCCATGCGTGTGGCTGT;SOR=0.307;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=6;WE=88973825;WS=88973807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr10	88975783	rs28533204	C	T	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.822;NF=33;NR=20;PP=857;ReadPosRankSum=0.980;SC=CGCGGTCAGGCTGAGGCTAGC;SOR=0.683;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=98;TCR=58;TR=53;WE=88975791;WS=88975773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,54:0.35:154
chr10	89267957	rs3843597	C	T	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.303;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=120;ReadPosRankSum=0.029;SC=AGTTTCCTGACCAATATGTGC;SOR=0.446;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=39;TCF=21;TCR=18;TR=10;WE=89267965;WS=89267947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,12:0.27:45
chr10	89269267	rs3843598	G	A	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=274;ReadPosRankSum=-0.481;SC=AGGCTAATGTGGTGAACATCC;SOR=0.157;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=14;WE=89269275;WS=89269257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr10	89269471	.	G	C	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=482;ReadPosRankSum=1.779;SC=TTGTTTTGCAGATTTTAAAAC;SOR=0.610;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=50;TCF=9;TCR=41;TR=23;WE=89269479;WS=89269461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr10	89273012	rs41299159	T	A	254.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=326;ReadPosRankSum=2.431;SC=TTTGCTTTTTTAAAAAAATTT;SOR=1.508;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=18;WE=89273020;WS=89273002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
chr10	89419662	.	T	TGCCGCC	1800.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.000;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.276;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.905;NF=23;NR=8;PP=1682;ReadPosRankSum=1.682;SC=CTGCTGCTGCTGCCGCCGCCG;SOR=1.085;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=55;TCR=19;TR=31;WE=89419670;WS=89419652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,47:0.65:72
chr10	89463460	rs7923151	G	C	4234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=38;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.766;SC=CTCCAAAATCGATACTCATGC;SOR=0.929;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=134;TCF=96;TCR=38;TR=133;WE=89463468;WS=89463450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,137:0.99:138
chr10	89463480	rs7923162	G	A	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.403;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=592;ReadPosRankSum=0.086;SC=CTACTCCGATGCATGCTACAG;SOR=0.400;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=155;TCF=98;TCR=57;TR=43;WE=89463488;WS=89463470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,45:0.28:160
chr10	89469083	rs72025574	CATAT	C	830.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.321;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.44;MQRankSum=1.062;NF=0;NR=19;PP=789;ReadPosRankSum=-0.468;SC=ATGTCATGTTCATATATATAT;SOR=1.688;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=19;WE=89469094;WS=89469073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr10	89472721	rs148721342	CT	C	296.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.117;SOR=0.301;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr10	89475640	rs3214322	GA	G	405.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.147;HP=11;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.819;NF=0;NR=19;PP=235;ReadPosRankSum=-0.715;SC=TGTTGTTAAGGAAAAAAAAAA;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=19;WE=89475648;WS=89475630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr10	89475692	rs2302406	A	G	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.795;NF=0;NR=15;PP=337;ReadPosRankSum=1.380;SC=GTTAGTCTTTAGTTTGCAAAT;SOR=1.519;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=15;WE=89475700;WS=89475682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr10	89475717	rs2302407	G	A	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.754;NF=0;NR=10;PP=208;ReadPosRankSum=-1.049;SC=TTGCAAAACTGTTTGGATCAT;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=10;WE=89475725;WS=89475707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr10	89505873	rs1058801	A	T	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.05;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	89527300	rs1819163	A	G	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.042;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=127;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GACCAGTACCAGTCTGTGGCT;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=8;WE=89527308;WS=89527290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr10	89552283	.	T	C	24	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=24;QD=19.5904041824;SC=GGAATACAACTATATGCCGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=3;WE=89552291;WS=89552273;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,3:0.16:19
chr10	89690952	rs1799734	T	TTTATC	420.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=511;ReadPosRankSum=0.537;SC=GAGATACATATTTAAGAATTA;SOR=0.507;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=10;WE=89690960;WS=89690942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
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chr10	90342837	rs2296545	C	G	3513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.188;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=82;PP=2668;ReadPosRankSum=0.787;SC=CACCTGAGTCCTCAGCCTTGT;SOR=1.053;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=223;TCF=102;TCR=121;TR=139;WE=90342845;WS=90342827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,142:0.63:225
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chr10	90356022	rs138536061	CTTATT	C	394.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=10.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.80;ReadPosRankSum=-0.787;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
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chr10	90425327	rs814624	T	C	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.266;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=36;PP=851;ReadPosRankSum=0.032;SC=GTAGGTTAAGTGTCCTCACTT;SOR=0.818;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=207;TCF=106;TCR=101;TR=64;WE=90425335;WS=90425317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,65:0.31:212
chr10	90427475	rs141150609	C	T	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.09;ReadPosRankSum=1.123;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr10	90429652	rs814628	A	G	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.307;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=579;ReadPosRankSum=1.866;SC=TGTAAAGAAAACTGGACAGAA;SOR=0.877;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=143;TCF=70;TCR=73;TR=41;WE=90429660;WS=90429642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,42:0.29:145
chr10	90438207	rs1228187	A	G	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.800;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=27;PP=1050;ReadPosRankSum=-0.269;SC=TCTAGTCCCAACCTCCCTACT;SOR=0.476;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=188;TCF=111;TCR=77;TR=59;WE=90438215;WS=90438197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,59:0.31:190
chr10	90484243	rs376036	C	T	2131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=9;PP=1641;SC=AATTTCACTTCGTAGAATTTA;SOR=3.091;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=52;TCR=9;TR=61;WE=90484251;WS=90484233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr10	90484420	rs56390975	C	A	2673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=53;PP=1739;SC=GTCATTTATTCAGAAAAAAAT;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=6;TCR=53;TR=59;WE=90484430;WS=90484410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
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chr10	90497588	rs444764	A	G	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.665;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=524;ReadPosRankSum=-1.607;SC=GTTGCACAGAAGTGATGAAAG;SOR=0.320;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=82;TCF=6;TCR=76;TR=28;WE=90497596;WS=90497578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,29:0.33:87
chr10	90497655	rs405147	T	C	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=171;ReadPosRankSum=0.024;SC=ATTTGGAATGTAATTAGTACA;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=10;WE=90497663;WS=90497645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
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chr10	90499928	rs419014	C	T	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=328;ReadPosRankSum=0.042;SC=CCTGCCACTGCCACATTGATG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=15;WE=90499936;WS=90499918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr10	90503075	rs390152	T	C	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.353;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=144;ReadPosRankSum=-0.107;SC=TGCACTTCCATCAGGTACAAA;SOR=0.426;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=11;WE=90503083;WS=90503065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,11:0.23:48
chr10	90512306	rs1214464	G	C	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.420;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=125;ReadPosRankSum=0.285;SC=TTACTAAGATGGAAGTTCCAA;SOR=0.418;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=44;TCF=32;TCR=12;TR=12;WE=90512314;WS=90512296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr10	90522182	rs843782	T	C	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.316;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=145;ReadPosRankSum=0.566;SC=ATTGGATTAGTCTTTAAATAG;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=90522190;WS=90522172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr10	90524237	rs430517	T	C	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.96;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=9;PP=1075;ReadPosRankSum=1.255;SC=AGAATTATGCTAATGGAAGCC;SOR=0.628;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=120;TCR=24;TR=54;WE=90524245;WS=90524227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,53:0.37:144
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chr10	90530660	rs10788611	C	A	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=518;ReadPosRankSum=-1.352;SC=ATAGCTTCTACCAAAATCTGC;SOR=0.862;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=22;WE=90530668;WS=90530650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
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chr10	90568182	rs3899739	A	G	1421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.590;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=42;PP=1102;ReadPosRankSum=0.257;SC=GGTGTGGGTCACCCCATGTCA;SOR=0.054;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=72;TCF=6;TCR=66;TR=48;WE=90568190;WS=90568172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,51:0.65:78
chr10	90574222	rs303524	C	G	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=0;PP=839;SC=AACCTGGTGTCGGGGGGAGCT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=90574230;WS=90574212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	90580144	rs10788615	C	T	1409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.167;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=33;PP=1141;ReadPosRankSum=2.277;SC=AATGGGCTCACGTGGATTTCA;SOR=0.394;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=80;TCF=27;TCR=53;TR=53;WE=90580152;WS=90580134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,54:0.63:86
chr10	90585819	rs7893917	G	A	1617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.779;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=15;PP=1274;ReadPosRankSum=-0.007;SC=TAACTTCGACGCCAGCATCAA;SOR=2.002;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=75;TCF=53;TCR=22;TR=58;WE=90585827;WS=90585809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,59:0.78:76
chr10	90588154	rs1977537	A	G	1257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.37;SOR=6.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	90588161	rs1029025	C	T	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.88;SOR=7.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	90674251	rs11202889	A	C	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=229;ReadPosRankSum=-1.043;SC=TGGGACATATAGTTTGTTTTT;SOR=0.434;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=53;TCF=49;TCR=4;TR=14;WE=90674259;WS=90674241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,14:0.26:54
chr10	90674434	rs143062007	A	AAT	559.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=13.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.99;ReadPosRankSum=-1.185;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr10	90683124	rs1530281	T	C	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=23;PP=500;SC=TTATTGCTGTTGCACATTTTA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=90683132;WS=90683114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	90695265	rs3781211	G	T	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=107;ReadPosRankSum=-0.024;SC=GATGCCAATTGTGTCCTAATT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=7;WE=90695273;WS=90695255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr10	90701645	rs714887	A	G	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.895;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=358;ReadPosRankSum=-0.062;SC=CAATCCAAAGAGCTGAGTTAG;SOR=0.669;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=24;WE=90701653;WS=90701635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,27:0.34:80
chr10	90749256	rs2234767	G	A	2224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.415;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=43;PP=1781;ReadPosRankSum=0.294;SC=AGGCTGGCACGCCCAGGGTCT;SOR=0.470;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=124;TCF=55;TCR=69;TR=82;WE=90749264;WS=90749246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,84:0.66:128
chr10	90767395	rs2031611	G	C	1019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=2;PP=865;SC=TCCCTCTATAGTTCCCACCCT;SOR=4.615;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=31;WE=90767403;WS=90767385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	90767640	rs2296601	C	T	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.825;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=44;PP=1079;ReadPosRankSum=0.175;SC=CTTGGAATTTCATGTAGAACC;SOR=0.342;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=71;TCF=4;TCR=67;TR=47;WE=90767648;WS=90767630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,50:0.68:74
chr10	90770439	rs2296600	C	G	2127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.568;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=43;PP=1605;ReadPosRankSum=-0.836;SC=CTCTTGATTACTAGAAAGTCC;SOR=0.824;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=237;TCF=119;TCR=118;TR=81;WE=90770447;WS=90770429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,86:0.35:245
chr10	90771829	rs2234978	T	C	2752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=51;PP=2230;SC=AATCTCCAACTTTAAATCCTG;SOR=1.356;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=84;TCF=33;TCR=51;TR=83;WE=90771837;WS=90771819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr10	90773303	rs1571019	A	G	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=119;ReadPosRankSum=-1.139;SC=TTTATAATGAATACTCATAGT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=90773311;WS=90773293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr10	90773363	rs9658769	C	A	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr10	90988250	rs2071509	C	G	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=198;ReadPosRankSum=1.556;SC=GATCCATAAGCAAATAATGAA;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=90988258;WS=90988240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr10	91066769	rs1727	C	A	2088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=6.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.396;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=38;PP=1848;ReadPosRankSum=-0.140;SC=AGTATGAAGACGCAGAGTATT;SOR=0.473;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=114;TCF=48;TCR=66;TR=70;WE=91066777;WS=91066759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,73:0.60:122
chr10	91162497	rs303211	A	G	2418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.143;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=44;PP=1759;ReadPosRankSum=2.345;SC=GTGGAGGAAAAAATTATGAAC;SOR=0.382;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=107;TCF=49;TCR=58;TR=84;WE=91162505;WS=91162487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,89:0.77:116
chr10	91352966	rs2296616	G	A	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=5.814;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.29;ReadPosRankSum=-1.702;SOR=1.617;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,16:0.17:92
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chr10	91371844	rs3802655	C	T	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=31;PP=775;ReadPosRankSum=-0.229;SC=GAATGCTATGCGTGCAAAGAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=31;WE=91371852;WS=91371834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,32:0.76:42
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chr10	91465266	rs72818759	G	A	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.148;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=36;PP=925;ReadPosRankSum=-0.186;SC=GCAAACAATGGCCTGTTTTTG;SOR=1.595;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=54;TCF=5;TCR=49;TR=39;WE=91465274;WS=91465256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,39:0.72:54
chr10	91469576	rs10881631	T	C	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=-0.409;SC=GTGGCACCTATTTTAAGAATG;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=91469584;WS=91469569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr10	91470660	rs7089473	T	G	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.509;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=21;ReadPosRankSum=0.153;SC=AATAAACAAGTAAAGTTTCCT;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=2;WE=91470668;WS=91470650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr10	91470834	rs1048057	A	C	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.00;ReadPosRankSum=0.060;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,10:0.17:58
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chr10	91473975	rs11185854	T	C	274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=8;PP=192;SC=CGGTGGCTCATGCCTGTAATC;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=91473983;WS=91473965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr10	91475098	rs3758384	A	G	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.98;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr10	91479211	rs17484219	G	T	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=334;ReadPosRankSum=0.097;SC=CCTCTCAAGAGAAATTATTTG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=15;WE=91479219;WS=91479201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
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chr10	91484780	rs8181361	G	A	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=13;PP=556;ReadPosRankSum=-0.133;SC=TTTGAAGGGAGACTCTGCTTC;SOR=0.624;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=119;TCF=81;TCR=38;TR=38;WE=91484788;WS=91484770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,40:0.33:123
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chr10	91497631	rs1062465	T	A	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.086;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=395;ReadPosRankSum=0.551;SC=ATCTCAGGGATCTGTCAAATG;SOR=1.497;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=57;TCF=25;TCR=32;TR=22;WE=91497639;WS=91497621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,24:0.39:61
chr10	91497902	rs144593231	C	CTAAAAG	733.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.477;NF=5;NR=11;PP=820;ReadPosRankSum=-2.119;SC=AAACAATAGACTAAAGGAGAA;SOR=0.693;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=65;TCF=28;TCR=37;TR=16;WE=91497910;WS=91497892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,22:0.32:68
chr10	91498032	.	GA	G	1714.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.695;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.677;NF=29;NR=23;PP=1789;ReadPosRankSum=-1.119;SC=GTAGTTGAAGGAAAGAGAGCG;SOR=0.985;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=89;TCF=48;TCR=41;TR=52;WE=91498040;WS=91498022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,58:0.60:97
chr10	91498127	rs1886996	T	C	2547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=43;PP=1968;SC=GAAAGTTGAATGTAGTCATTC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=42;TCR=43;TR=85;WE=91498135;WS=91498117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr10	91498254	rs1886997	A	G	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.871;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=482;ReadPosRankSum=-0.924;SC=AAAGATTTAAATGTAAAGGAA;SOR=0.473;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=86;TCF=47;TCR=39;TR=26;WE=91498262;WS=91498244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,28:0.31:90
chr10	91498318	rs1886998	A	G	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.913;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=629;ReadPosRankSum=-1.990;SC=AAGATATGAAACATTTACTTC;SOR=1.046;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=107;TCF=55;TCR=52;TR=36;WE=91498326;WS=91498308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,39:0.35:112
chr10	91498626	rs12415422	T	C	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=2;PP=724;ReadPosRankSum=2.370;SC=TGAAAAGATATAATTTTGTAA;SOR=0.368;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=45;TCF=43;TCR=2;TR=30;WE=91498634;WS=91498616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,33:0.69:48
chr10	91503660	rs1126480	A	G	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.38;ReadPosRankSum=0.914;SOR=0.696;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,21:0.23:90
chr10	91503750	rs10881648	G	T	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=213;ReadPosRankSum=0.684;SC=TGTACAAAAAGGTACAAATTT;SOR=0.209;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=14;WE=91503758;WS=91503740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr10	91505768	rs12414650	C	T	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.535;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=347;ReadPosRankSum=-0.349;SC=TTATTCCCCTCGCAGGGCATG;SOR=0.355;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=17;WE=91505776;WS=91505758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
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chr10	91518388	rs2026549	A	G	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=296;ReadPosRankSum=-0.392;SC=GGTGTTACATATAATAATTTC;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=14;WE=91518396;WS=91518378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
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chr10	92638707	rs75192201	C	CAGT	1018.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=2;PP=864;SC=GCAGAAATGTCAGTATATTAG;SOR=4.804;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=19;WE=92638715;WS=92638697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	92662860	rs4568910	A	G	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.868;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.632;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=81;ReadPosRankSum=-0.163;SC=CAAATTAGATATGAGAAGGAT;SOR=0.105;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=5;WE=92662868;WS=92662850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr10	92663108	rs7089472	C	T	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.248;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=218;ReadPosRankSum=-0.804;SC=TTTTTTGCGACGTCCCACCTT;SOR=1.270;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=13;WE=92663116;WS=92663098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,13:0.28:46
chr10	92672564	rs3939	T	C	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=3;PP=862;ReadPosRankSum=0.781;SC=GTCTCTTCTCTTGGGCCATGC;SOR=0.675;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=57;TCF=53;TCR=4;TR=36;WE=92672572;WS=92672554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,39:0.63:62
chr10	92676127	rs4933200	T	C	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.275;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=206;ReadPosRankSum=0.165;SC=GTTGTCCCCATCTAGATTGAC;SOR=0.425;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=15;TCR=40;TR=14;WE=92676135;WS=92676117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,16:0.27:59
chr10	92678740	rs72003210	AATAAATAAATATATATAT	A	4570.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.124;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.104;NF=42;NR=28;PP=2976;ReadPosRankSum=2.129;SC=CTAAAGCCAAAATAAATAAAT;SOR=1.426;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=83;TCF=51;TCR=32;TR=70;WE=92678773;WS=92678730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,112:0.88:127
chr10	92678765	rs56177217	A	G	4947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.003;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.876;NF=72;NR=33;PP=2962;ReadPosRankSum=2.164;SC=ATATATATATATATATATAGC;SOR=1.338;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=124;TCF=83;TCR=41;TR=105;WE=92678773;WS=92678730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,125:0.89:140
chr10	92680929	rs10881855	A	G	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=15;PP=403;SC=TAACACTCCCACCCCCATTAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=15;WE=92680937;WS=92680919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	93000211	rs10881907	G	A	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=322;ReadPosRankSum=-0.441;SC=CATATGATGCGTTTTAACCTA;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=15;WE=93000219;WS=93000201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr10	93024352	.	G	C	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=421;ReadPosRankSum=-1.390;SC=AACAATATTAGAAACTAAAAA;SOR=2.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=17;WE=93024360;WS=93024342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,18:0.82:22
chr10	93031580	rs80136010	C	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.490;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=141;ReadPosRankSum=-1.094;SC=AAAAACTTATCTTTTCAACTT;SOR=1.281;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=10;WE=93031588;WS=93031570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,9:0.21:43
chr10	93170250	rs7081569	C	G	1219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=19;PP=1012;SC=GGTGGCGGCGCCCGCGCCTGA;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=23;TCR=19;TR=42;WE=93170258;WS=93170240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	93170365	rs71025355	CG	C	635.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=18;PP=764;SC=TCTGGCGCCCCGGACGGCGGG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=93170373;WS=93170355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	93390680	rs3781228	G	A	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=7.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.58;ReadPosRankSum=-0.745;SOR=2.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,10:0.20:50
chr10	93577103	rs1539040	A	T	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=380;ReadPosRankSum=-0.250;SC=GTGTCAGTTCAGTAGCTATCC;SOR=1.445;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=17;WE=93577111;WS=93577093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr10	93577141	rs1539041	T	G	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=336;SC=GCTGACATTTTATTCTCCTCT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=93577149;WS=93577131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr10	93586715	rs2275646	C	T	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=372;ReadPosRankSum=0.256;SC=TTACACAGTACGAATAATTCT;SOR=0.280;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=65;TCR=0;TR=22;WE=93586723;WS=93586705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,24:0.36:67
chr10	93588201	rs1572933	G	C	2936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.50;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	93588208	rs1572934	G	A	2791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.31;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
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chr10	93601285	rs1772182	G	C	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=1.834;SC=CTAGTATAAAGTTAAACTAGT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=93601293;WS=93601275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
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chr10	93605405	rs1770466	A	G	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=477;ReadPosRankSum=0.478;SC=CATTTCCAGAATAAGTTTGAA;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=19;WE=93605413;WS=93605395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr10	93608142	rs3758499	G	A	1974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.562;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=19;PP=1560;ReadPosRankSum=0.000;SC=TACCCTAGGCGGATGATGTCA;SOR=0.986;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=114;TCF=80;TCR=34;TR=69;WE=93608150;WS=93608132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,74:0.61:122
chr10	93609210	rs41286940	G	A	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.85;ReadPosRankSum=-0.621;SOR=0.067;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,4:0.18:22
chr10	93610896	rs3758501	C	T	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=2.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.17;ReadPosRankSum=-0.088;SOR=1.365;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,13:0.23:57
chr10	93611176	rs112177544	A	ATATG	996.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=1023;SC=TAATTTAAAAATATGAGAGAA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=16;WE=93611184;WS=93611166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	93617306	rs1340420	A	G	7665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=163;PP=2965;SC=CCTCCCCACCAACTCTACCAC;SOR=1.619;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=241;TCF=78;TCR=163;TR=241;WE=93617314;WS=93617296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr10	93716412	.	G	C	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.608;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=529;ReadPosRankSum=-1.462;SC=CTTAATTGAAGAGGTACTCTT;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=25;WE=93716420;WS=93716402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,24:0.83:29
chr10	93716899	rs7894570	G	C	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=688;SC=ACTAGACCTAGAAATAAAATT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=93716907;WS=93716889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	93719475	rs5786980	A	ATGTG	166.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=3;MGOF=58;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.555;NF=15;NR=1;PP=235;ReadPosRankSum=-0.528;SC=TGTTAAAAAAATGTGTGTGTG;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=16;WE=93719483;WS=93719465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr10	93719497	rs200052275	GTATATATATA	G	472.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=3.049;NF=13;NR=4;PP=928;ReadPosRankSum=0.635;SC=GTGTGTGTGTGTATATATATA;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=17;WE=93719514;WS=93719487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr10	93719499	rs28696856	A	G	116.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=2.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQRankSum=-3.388;QD=4.49;ReadPosRankSum=1.307;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr10	93719501	rs369413838	A	G	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=2.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQRankSum=-3.182;QD=5.99;ReadPosRankSum=0.647;SOR=1.552;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr10	93752074	rs112721454	GT	G	219.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.99;ReadPosRankSum=0.743;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr10	93754163	rs10882014	G	A	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=336;ReadPosRankSum=-1.185;SC=TAAGGTCATGGCATTTAATTT;SOR=0.544;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=16;WE=93754171;WS=93754156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr10	93768094	rs113804327	T	TG	126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.75;ReadPosRankSum=2.166;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr10	93768096	rs11186794	G	C	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.748;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.91;ReadPosRankSum=-0.803;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr10	93778520	rs140447601	CT	C	2018.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.833;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.810;NF=70;NR=15;PP=1274;ReadPosRankSum=1.190;SC=CTCATATATACTTTTTTTTTC;SOR=0.901;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=153;TCF=121;TCR=32;TR=85;WE=93778528;WS=93778510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,93:0.61:152
chr10	93784488	rs141297800	A	AGTTTTTTT	201.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.712;NF=5;NR=0;PP=85;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ACGCTTATGTAGTTTTTTTTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=93784496;WS=93784478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr10	93784720	.	T	G	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.082;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=2.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.88;ReadPosRankSum=-0.409;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,16:0.21:76
chr10	93786557	rs61876492	A	C	1386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.920;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=28;PP=1149;ReadPosRankSum=-0.608;SC=ATGAAAATATACTCCCCCAGA;SOR=0.530;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=74;TCF=31;TCR=43;TR=50;WE=93786565;WS=93786547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,53:0.67:79
chr10	93812334	rs1711841	G	A	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=40;PP=1196;SC=ACTGGATGGTGGTTGAGAGCA;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=40;WE=93812342;WS=93812324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	93841227	rs2676811	A	G	4035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=80;PP=2965;SC=AGACACCACCATACAAACGGT;SOR=1.301;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=50;TCR=80;TR=130;WE=93841235;WS=93841217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr10	93851714	rs1229578	T	C	3599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=82;PP=2838;SC=GAAAAAAAGTTGTTTACTTGG;SOR=1.553;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=41;TCR=82;TR=123;WE=93851722;WS=93851704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr10	93870699	rs1557178	C	A	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=415;ReadPosRankSum=0.995;SC=GAAAGTCCAACTCTACTGCAT;SOR=0.602;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=20;WE=93870707;WS=93870689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr10	93904940	.	G	A	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=28;PP=669;ReadPosRankSum=0.970;SC=TTAGAAGCCCGAAGTGCAGAG;SOR=0.610;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=51;TCF=2;TCR=49;TR=29;WE=93904948;WS=93904930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,34:0.59:58
chr10	93952455	.	C	T	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.965;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=238;ReadPosRankSum=0.277;SC=AACACCATATCATTTGCTTCC;SOR=0.352;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=12;WE=93952463;WS=93952445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr10	93999562	rs3740302	T	A	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=3.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.24;ReadPosRankSum=0.917;SOR=0.247;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,13:0.24:54
chr10	93999850	rs3824734	A	G	5023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=106;PP=2965;SC=GCTGCTGAGGAGGCTGATGGA;SOR=1.595;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=53;TCR=106;TR=159;WE=93999858;WS=93999840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr10	94070878	rs142934556	CTT	C	1071.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.629;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.846;NF=16;NR=8;PP=801;ReadPosRankSum=-1.070;SC=ATCCTTTTCTCTTTTAATTTA;SOR=0.157;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=24;WE=94070887;WS=94070868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,28:0.61:46
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chr10	94369062	.	T	A	147	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;HP=2;MMLQ=23;NF=4;NR=1;SC=AGAGAGAGAGTGTGTGTGTGT;Source=Platypus;TCR=6;TR=5;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,5:0.23:22
chr10	94372706	rs2275220	A	G	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=56;ReadPosRankSum=-0.812;SC=ACTCATGTGGATTTAGATCTT;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=94372714;WS=94372696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr10	94390242	rs74151667	A	C	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=-0.642;SC=TCCATTTAAAAAACATTATTT;SOR=0.093;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=4;WE=94390250;WS=94390232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr10	94392513	rs113828479	A	ATAATT	906.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=811;SC=TTCAAAACTGATAATTTTGTG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=12;WE=94392521;WS=94392503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	94407865	rs34357393	CA	C	215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=1.515;QD=10.27;ReadPosRankSum=-0.124;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
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chr10	94413380	rs17875344	G	A	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-7.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=392;ReadPosRankSum=-0.735;SC=TGTATCTAATGTTACTTTGTA;SOR=0.288;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=68;TCF=66;TCR=2;TR=23;WE=94413388;WS=94413370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,26:0.37:71
chr10	94413667	rs17875345	G	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.697;NF=0;NR=7;PP=82;ReadPosRankSum=0.817;SC=TCAGCCGGGCGCGGTGGCTCA;SOR=0.113;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=7;WE=94413675;WS=94413657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr10	94490174	rs2488075	T	C	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.535;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=640;ReadPosRankSum=0.336;SC=TCCAATTTCTTGGTGGCAAAA;SOR=0.402;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=125;TCF=73;TCR=52;TR=45;WE=94490182;WS=94490164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,43:0.34:128
chr10	94507612	rs2488066	A	G	4871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=64;PP=2965;SC=CACCACTACCACTGTCAGCCC;SOR=1.259;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=103;TCR=64;TR=167;WE=94507620;WS=94507602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr10	94511683	rs2096177	G	T	10945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=218;NR=119;PP=2965;SC=ATATTTGTATGAAGGCTGCAG;SOR=1.410;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=337;TCF=218;TCR=119;TR=337;WE=94511691;WS=94511673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,354:1.00:354
chr10	94594416	rs11408607	A	AT	593.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.21;ReadPosRankSum=1.196;SOR=0.462;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,37:0.32:114
chr10	94594565	rs2490741	G	A	1710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.725;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=58;PP=1212;ReadPosRankSum=0.367;SC=CGAACTGCCTGTTGAAGCTAC;SOR=0.818;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=257;TCF=83;TCR=174;TR=82;WE=94594573;WS=94594555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,84:0.32:262
chr10	94659515	rs11187206	C	G	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-4.101;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=152;ReadPosRankSum=-0.736;SC=CTTCATTACACTAACCTTTGT;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=9;WE=94659523;WS=94659505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr10	94695617	rs1326331	C	T	1740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=34;PP=1256;SC=AAGAATCTTACTGTAATATTT;SOR=1.528;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=51;WE=94695625;WS=94695607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr10	94714427	rs11187225	C	G	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=301;ReadPosRankSum=-0.229;SC=ATCAACAAATCTGCTGCTGAC;SOR=0.479;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=41;TCF=25;TCR=16;TR=17;WE=94714435;WS=94714417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr10	94773927	rs147232343	C	CT	676.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.456;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=2;PP=431;ReadPosRankSum=0.538;SC=CATTTTTATTCTTTTTTTTTC;SOR=1.116;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=116;TCF=104;TCR=12;TR=35;WE=94773935;WS=94773917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,37:0.33:111
chr10	94816807	rs60582805	G	GA	1118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=32;PP=1995;ReadPosRankSum=0.227;SC=AGTATATTCTGAAACTTTTTT;SOR=0.818;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=57;TCF=4;TCR=53;TR=34;WE=94816825;WS=94816797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,40:0.70:57
chr10	94816817	rs11187263	T	C	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=708;ReadPosRankSum=0.608;SC=GAAACTTTTTTGTATAACATT;SOR=0.527;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=14;WE=94816825;WS=94816797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,16:0.29:56
chr10	94822895	rs12263200	G	T	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.631;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=419;ReadPosRankSum=0.666;SC=GGTGGGAGGCGTTGTGGCGGT;SOR=0.491;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=19;WE=94822903;WS=94822885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr10	94824024	rs11187264	C	A	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=91;ReadPosRankSum=1.757;SC=AGCTGGGAAGCTGTTAACACA;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=7;WE=94824032;WS=94824014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr10	94824166	rs11187265	G	A	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.543;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=18;PP=910;ReadPosRankSum=-0.532;SC=CAGCTGCATCGGCACCTGGAG;SOR=0.861;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=106;TCF=61;TCR=45;TR=46;WE=94824174;WS=94824156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,47:0.43:110
chr10	94826081	.	TCCTGCCG	T	146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.124;ClippingRankSum=-0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQRankSum=0.921;QD=10.48;ReadPosRankSum=0.002;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
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chr10	95070080	rs2797581	C	T	1762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=44;PP=1451;SC=CTTTAACCTACGACAGCTTCC;SOR=3.872;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=6;TCR=44;TR=50;WE=95070088;WS=95070070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr10	95070526	rs787661	G	A	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=25;PP=685;SC=ATTGCCTTCAGTTTTCCTCAA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=95070534;WS=95070516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	95072906	rs787666	T	C	2676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=37;PP=2140;SC=TCATGTCCAATCTGCATTTCT;SOR=1.065;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=87;TCF=49;TCR=38;TR=86;WE=95072914;WS=95072896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr10	95073046	rs787667	A	G	1360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=38;PP=1089;SC=GAACGTTCTTATCAGGAGAGA;SOR=4.664;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=41;WE=95073054;WS=95073036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	95083204	rs148815470	ATTTC	A	527.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=487;SC=AGATGAAACTATTTCTTTCTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=11;WE=95083215;WS=95083194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	95095600	rs787689	G	C	4211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-10.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.540;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=20;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.472;SC=CCTCCCTAGAGCCTGGTTGTC;SOR=0.984;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=222;TCF=191;TCR=31;TR=147;WE=95095608;WS=95095590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,153:0.65:234
chr10	95097537	rs1614065	T	C	4046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.987;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=34;PP=2962;ReadPosRankSum=0.872;SC=CAAAGGATGTTGATTCTCCAC;SOR=1.130;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=213;TCF=159;TCR=54;TR=145;WE=95097545;WS=95097527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,151:0.70:217
chr10	95099822	rs2761330	G	C	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.435;NF=19;NR=1;PP=446;ReadPosRankSum=-0.252;SC=GGGTGAAAGAGCGAGACTCCT;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=20;WE=95099830;WS=95099812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,22:0.79:28
chr10	95099849	rs2761329	G	A	1057.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.598;NF=34;NR=2;PP=848;ReadPosRankSum=2.189;SC=AAAAAGAAAAGAAAAATTCTG;SOR=0.412;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=51;TCF=49;TCR=2;TR=36;WE=95099857;WS=95099839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,37:0.71:52
chr10	95111716	rs787624	C	A	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.500;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=462;ReadPosRankSum=-0.852;SC=GGGCTCTGACCACCTGCCTGG;SOR=2.746;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=20;WE=95111724;WS=95111706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr10	95113491	rs787625	A	G	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.757;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=244;ReadPosRankSum=0.334;SC=AAATGACAAAAAGCATTCACT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=11;WE=95113499;WS=95113481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr10	95115339	rs5787054	A	AAAAAT	1489.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.928;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=888;ReadPosRankSum=0.818;SC=TCAGTCTTGAAAAAATAAAAT;SOR=2.038;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=71;TCF=58;TCR=13;TR=19;WE=95115347;WS=95115329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr10	95119919	rs787634	T	C	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.488;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=32;PP=810;ReadPosRankSum=0.150;SC=TCATTCCCATTCAGCTCCTCA;SOR=3.345;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=32;WE=95119927;WS=95119909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,33:0.72:46
chr10	95121135	rs151121728	CCA	C	628.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=714;ReadPosRankSum=1.058;SC=CCCCTCCCTCCCAAGGAAACT;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=15;WE=95121144;WS=95121125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,16:0.89:18
chr10	95132905	rs787647	C	T	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=33;PP=811;ReadPosRankSum=0.221;SC=GGAGAGGGACCGAAGACCCTG;SOR=2.531;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=33;WE=95132913;WS=95132895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,33:0.79:42
chr10	95136950	rs787622	A	T	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=0;PP=814;ReadPosRankSum=1.453;SC=AGGACTTTTTACGAAGTTTGA;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=33;WE=95136958;WS=95136940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,35:0.73:48
chr10	95152624	rs788084	T	C	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.762;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=436;ReadPosRankSum=-0.087;SC=CTTAATAAGATAATATTAGCT;SOR=0.255;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=21;WE=95152632;WS=95152614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr10	95159025	rs701862	T	G	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=159;ReadPosRankSum=-0.393;SC=CTGTGTTCCCTCAGAGTGCCT;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=10;WE=95159033;WS=95159015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr10	95162496	rs701875	A	T	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=667;SC=AATATTTTTTAAAAAATTCCT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=95162504;WS=95162486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	95162525	rs3841653	TC	T	866.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=3;PP=763;SC=AATTCTTTGATCCCCCCCAAA;SOR=3.841;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=28;WE=95162533;WS=95162515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	95164040	rs788088	A	G	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=20;PP=588;SC=GGAATCTGATACTATAATTTT;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=95164048;WS=95164030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	95216623	rs701882	A	G	2551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=38;PP=2028;SC=CAAAGTTGAAAAAACAATGAA;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=39;TCR=38;TR=77;WE=95216631;WS=95216613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr10	95237861	rs2096181	C	T	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=391;SC=GGTTGTTTATCTTATGTCTAC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=95237869;WS=95237851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	95237899	rs58873758	ATAT	A	1151.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.66;SOR=4.332;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	95237963	rs3938769	A	G	2277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=20;PP=1834;SC=ACTGTTTGGAAGAATCATCAA;SOR=1.997;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=72;TCF=51;TCR=21;TR=71;WE=95237971;WS=95237953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr10	95238050	rs6583893	C	T	1426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=34;PP=1136;SC=CCTGGCTGTCCGCATGGAACT;SOR=2.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=42;WE=95238058;WS=95238040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	95241999	rs947597	A	C	2167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=59;PP=1595;SC=AGTGGAGACTAGGGCGCTGGA;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=16;TCR=59;TR=75;WE=95242007;WS=95241989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr10	95262981	rs7080916	A	G	5256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=59;PP=2965;SC=TAGTACTACCACATTGCTTGA;SOR=1.496;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=172;TCF=113;TCR=59;TR=172;WE=95262989;WS=95262971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr10	95266683	rs947599	A	G	1450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.566;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=30;PP=1272;ReadPosRankSum=0.727;SC=ATTATGGTGAATGTAATGAGG;SOR=0.616;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=189;TCF=103;TCR=86;TR=65;WE=95266691;WS=95266673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,64:0.34:191
chr10	95276742	rs41308663	G	C	1277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.371;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=932;ReadPosRankSum=-0.514;SC=CTTGGCAAGTGCAAAAAAAGA;SOR=1.138;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=72;TCF=46;TCR=26;TR=44;WE=95276750;WS=95276732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,47:0.64:74
chr10	95278596	rs2280604	T	C	2927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=6.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.025;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=18;PP=2223;ReadPosRankSum=0.007;SC=CCGGAAAAGGTTGGATGTGAC;SOR=0.399;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=153;TCF=127;TCR=26;TR=97;WE=95278604;WS=95278586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,104:0.64:163
chr10	95278829	rs2280605	A	G	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=917;ReadPosRankSum=-0.626;SC=AAAGACTTCAATAAAAGTCTT;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=79;TCF=0;TCR=79;TR=21;WE=95278849;WS=95278819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,24:0.29:83
chr10	95278841	rs2280606	C	T	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=917;ReadPosRankSum=-1.158;SC=AAAAGTCTTTCTTCTTCAATA;SOR=0.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=0;TCR=71;TR=20;WE=95278849;WS=95278819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,22:0.30:73
chr10	95279506	rs2293277	A	T	4982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=90;PP=2965;SC=CATCAATTGCATGTAATTCTT;SOR=1.255;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=57;TCR=90;TR=147;WE=95279514;WS=95279496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr10	95279653	rs7068719	A	G	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=472;SC=ACAGCTTAACACACAGCTAGC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=95279661;WS=95279643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	95287643	rs34668129	G	GA	1377.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=18;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=2;PP=876;ReadPosRankSum=0.981;SC=CTCAAAAAAAGAAAAAAAAAA;SOR=1.408;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=87;TCF=83;TCR=4;TR=60;WE=95287651;WS=95287633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,63:0.86:73
chr10	95347381	rs41290218	C	A	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.184;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=326;ReadPosRankSum=-0.629;SC=TCTTTATAGCCGAGTTTCTCA;SOR=0.177;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=82;TCF=21;TCR=61;TR=21;WE=95347389;WS=95347371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,22:0.25:87
chr10	95347475	rs17108973	C	T	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=167;ReadPosRankSum=1.197;SC=GAAAATGAACCTATGCAAATA;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=10;WE=95347483;WS=95347465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr10	95353817	rs12265684	C	G	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.521;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=393;ReadPosRankSum=-1.695;SC=GCCACCATGCCGATCAATGCC;SOR=1.921;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=102;TCF=43;TCR=59;TR=27;WE=95353825;WS=95353807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,28:0.27:103
chr10	95360027	rs36014035	A	C	2634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.855;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=8;PP=2217;ReadPosRankSum=0.725;SC=CGGGTTCCTGACACTTCCAGA;SOR=4.228;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=84;TCF=75;TCR=9;TR=81;WE=95360035;WS=95360017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,81:0.98:83
chr10	95360109	rs57477607	C	G	3258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=46;PP=2580;ReadPosRankSum=-1.289;SC=GCCCGGTAGGCGCCCCATTCC;SOR=0.700;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=183;TCF=113;TCR=70;TR=119;WE=95360117;WS=95360099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,121:0.64:189
chr10	95360380	rs61461737	A	G	1713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.252;HP=4;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=10;PP=1424;ReadPosRankSum=0.844;SC=GCCCTTGGGGAACCCTGGAGC;SOR=0.973;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=60;TCR=13;TR=56;WE=95360388;WS=95360370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,57:0.74:77
chr10	95360396	rs116736522	G	C	1926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.243;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=11;PP=1518;ReadPosRankSum=0.534;SC=GGAGCGCAAAGGGCGCAGCTG;SOR=0.495;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=93;TCF=80;TCR=13;TR=68;WE=95360404;WS=95360386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,70:0.72:97
chr10	95360411	rs57029781	G	A	2403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.331;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=14;PP=1832;ReadPosRankSum=-0.162;SC=CAGCTGCCCCGGCGGCCACTG;SOR=0.395;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=112;TCF=95;TCR=17;TR=81;WE=95360419;WS=95360401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,86:0.72:119
chr10	95360650	rs56401591	C	T	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.554;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=22;PP=947;ReadPosRankSum=-0.394;SC=CCTGGGCCGCCTGGGCCCCCT;SOR=0.292;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=125;TCF=80;TCR=45;TR=49;WE=95360658;WS=95360640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,47:0.38:124
chr10	95360846	.	C	CGG	1255.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.686;NF=0;NR=26;PP=1183;ReadPosRankSum=-0.113;SC=AGCCGACCCCCGCCGCCGTAT;SOR=1.880;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=26;WE=95360854;WS=95360836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,32:0.71:45
chr10	95361588	rs3758539	C	T	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.905;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=215;ReadPosRankSum=-0.026;SC=CGTTAAAACCCTCCCTGTTAA;SOR=1.702;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=11;WE=95361596;WS=95361578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr10	95380790	rs1223306	G	A	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=367;ReadPosRankSum=0.839;SC=TGACAAAGCCGCCCAGAGACA;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=17;WE=95380798;WS=95380780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr10	95381773	rs701865	T	A	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.349;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=34;PP=1158;ReadPosRankSum=0.503;SC=CACGGTTAGATCATATCTGAA;SOR=0.443;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=189;TCF=105;TCR=84;TR=69;WE=95381781;WS=95381763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,68:0.35:197
chr10	95386740	rs2785138	C	A	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=81;ReadPosRankSum=0.778;SC=GCTAGATGGGCCGGGCGCGGT;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=5;WE=95386748;WS=95386730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr10	95388914	rs2857300	A	G	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.24;ReadPosRankSum=0.790;SOR=0.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,23:0.20:114
chr10	95389041	rs714550	G	A	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.887;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=944;ReadPosRankSum=-0.359;SC=ATGCCCCTGCGGATGAATACT;SOR=0.563;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=145;TCF=64;TCR=81;TR=47;WE=95389049;WS=95389031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,50:0.34:149
chr10	95389083	rs714549	A	G	1045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.820;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=741;ReadPosRankSum=0.167;SC=TCTGGGTCAGACCTCACCTCT;SOR=0.431;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=101;TCF=32;TCR=69;TR=39;WE=95389091;WS=95389073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,44:0.42:106
chr10	95389124	rs714551	G	A	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.685;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=25;PP=420;ReadPosRankSum=0.267;SC=GGATGCTCTCGCCTCTCCTCC;SOR=1.193;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=64;TCF=6;TCR=58;TR=27;WE=95389132;WS=95389114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,31:0.46:67
chr10	95394455	rs1856563	T	C	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=0;PP=1159;SC=TCCTGTGAATTTATGATTATT;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=95394463;WS=95394445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
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chr10	95395364	rs3737228	C	G	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.235;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=591;ReadPosRankSum=-0.158;SC=TGAACCAAACCAAAGCCACTC;SOR=0.952;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=155;TCF=83;TCR=72;TR=45;WE=95395372;WS=95395354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,45:0.28:161
chr10	95399642	rs17485621	G	A	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=197;ReadPosRankSum=-1.210;SC=GGAGATAATCGTGTAGGCCTG;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=10;WE=95399650;WS=95399636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr10	95400054	rs2275227	C	G	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.865;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=484;ReadPosRankSum=0.649;SC=AAAAGATGGACTCAGTTTGAA;SOR=1.426;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=21;WE=95400062;WS=95400044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr10	95422245	rs10882298	A	G	144.03	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=9.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=-0.157;QD=18.00;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=4.163;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr10	95432968	rs1572773	T	C	2658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=15;PP=2272;ReadPosRankSum=1.174;SC=AAAAATCTGTTTTTGGGCAGT;SOR=0.658;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=160;TCF=135;TCR=25;TR=95;WE=95432976;WS=95432958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,94:0.59:160
chr10	95433124	rs1326214	A	G	4106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.999;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=0.041;SC=CAGTTCCTCCAACATTCTTCC;SOR=0.483;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=257;TCF=67;TCR=190;TR=155;WE=95433132;WS=95433114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,159:0.60:263
chr10	95443688	rs8181435	C	G	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.026;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=432;ReadPosRankSum=-0.586;SC=GACAATGCCACATTTTCTACA;SOR=0.346;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=19;WE=95443696;WS=95443678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr10	95444931	rs767701	T	G	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.336;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=1;PP=715;ReadPosRankSum=1.587;SC=ATTTGAATTTTAAAGTCTATA;SOR=2.419;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=52;TCF=48;TCR=4;TR=30;WE=95444939;WS=95444921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,32:0.59:54
chr10	95454449	rs11187593	C	T	1179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-4.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.462;NF=38;NR=2;PP=923;ReadPosRankSum=1.645;SC=CCAGCCTGGGCGACAGAGTGA;SOR=0.499;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=58;TCF=56;TCR=2;TR=40;WE=95454457;WS=95454439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,42:0.72:58
chr10	95454681	rs2275438	G	C	2149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.660;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=62;PP=1677;ReadPosRankSum=-0.616;SC=TACGAACTTTGTATGTCTTTG;SOR=0.394;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=88;TCF=10;TCR=78;TR=72;WE=95454689;WS=95454671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,74:0.81:91
chr10	95454768	rs3215997	TA	T	215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=182;ReadPosRankSum=-0.101;SC=TGATTGGTGGTAAAAAAAAGC;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=12;WE=95454776;WS=95454758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr10	95458141	rs11187597	A	G	1961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.955;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=66;PP=1566;ReadPosRankSum=0.663;SC=GCAGTAAGTCATCTTCAACTG;SOR=0.852;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=127;TCF=17;TCR=110;TR=75;WE=95458149;WS=95458131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,77:0.58:132
chr10	95459698	rs2275441	G	C	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=336;ReadPosRankSum=-0.548;SC=CATGTAAACAGAATTCAAAAA;SOR=0.922;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=15;WE=95459706;WS=95459688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr10	95459817	rs726817	C	T	1866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.674;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=22;PP=1364;ReadPosRankSum=-0.974;SC=TTCTCCACAGCGTTCATCATC;SOR=0.783;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=134;TCF=92;TCR=42;TR=72;WE=95459825;WS=95459807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,75:0.55:137
chr10	95549836	rs368174638	C	CTT	497.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.43;MQRankSum=-0.000;QD=33.18;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,13:0.87:15
chr10	95552653	rs1111820	T	C	4797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=119;PP=2965;SC=CGAAGGATTTTGATTGCATCA;SOR=2.137;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=42;TCR=119;TR=161;WE=95552661;WS=95552643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr10	95658258	rs11187724	C	G	3829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=97;NR=10;PP=2965;SC=CCATTTTTCTCAGTTTCTAAG;SOR=4.504;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=97;TCR=10;TR=107;WE=95658266;WS=95658248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr10	95718474	rs829225	A	G	3076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=23;PP=2404;SC=TATTTAGGCTATAATGATTAC;SOR=2.232;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=72;TCR=23;TR=95;WE=95718482;WS=95718464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr10	95718600	rs11815169	T	C	2342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.474;NF=51;NR=56;PP=2066;ReadPosRankSum=-0.172;SC=TCCTTCTTGCTGTCCTTGGTG;SOR=0.761;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=69;TCR=76;TR=107;WE=95718608;WS=95718590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,89:0.70:127
chr10	95720490	rs12570608	C	T	4293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.787;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.037;NF=84;NR=66;PP=2962;ReadPosRankSum=0.089;SC=AGAGGCTTCTCTCGCTCTTTC;SOR=0.493;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=237;TCF=135;TCR=102;TR=150;WE=95720509;WS=95720480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,153:0.64:239
chr10	95720501	rs12571819	T	C	3759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.049;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.307;NF=86;NR=59;PP=2962;ReadPosRankSum=0.931;SC=TCGCTCTTTCTGGGAAGCCCG;SOR=0.593;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=235;TCF=139;TCR=96;TR=145;WE=95720509;WS=95720480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,146:0.62:235
chr10	95987313	rs11187825	C	T	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=246;ReadPosRankSum=0.946;SC=AGCCAGGTAACTGGAAATGAT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=12;WE=95987321;WS=95987303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr10	96044734	rs3736901	C	A	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=570;ReadPosRankSum=0.447;SC=TAAGATTAGGCAATATCATCT;SOR=0.495;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=23;WE=96044742;WS=96044724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,25:0.74:34
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chr10	96201839	rs137964875	CTTT	C	215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.54;ReadPosRankSum=1.638;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,9:0.27:33
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chr10	96305504	rs2274096	T	C	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=110;ReadPosRankSum=0.470;SC=GGAGGGCGGGTGGGGAATGTA;SOR=1.347;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=8;WE=96305512;WS=96305494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr10	96305729	rs10882474	T	C	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.435;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=536;ReadPosRankSum=-0.245;SC=GAAAACCTTTTGGGCGCGGGT;SOR=1.236;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=81;TCF=22;TCR=59;TR=36;WE=96305737;WS=96305719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,37:0.45:82
chr10	96313960	rs11188019	A	C	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=325;ReadPosRankSum=0.045;SC=AAAGCAATATATACTCCAAAT;SOR=0.560;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=20;WE=96313968;WS=96313950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr10	96322404	rs10882477	G	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.147;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=192;ReadPosRankSum=1.259;SC=ATAATACTATGAAGGTCCTTA;SOR=0.264;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=12;WE=96322412;WS=96322394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr10	96334578	rs7079934	T	C	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=425;ReadPosRankSum=-1.162;SC=TGTAGAACTCTTATAATTATA;SOR=0.350;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=0;TCR=52;TR=20;WE=96334586;WS=96334568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
chr10	96343623	rs962234	T	C	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=54;SC=TCCCATTGTCTTGTTCTACTA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=96343631;WS=96343613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	96348254	rs11188036	G	A	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=356;ReadPosRankSum=1.017;SC=AGGCTGTGGTGCAGTGGCACA;SOR=0.301;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=16;WE=96348262;WS=96348244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr10	96353201	rs3781262	G	A	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.748;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=276;ReadPosRankSum=-0.540;SC=TTCTCCTTCAGTCTTGTTGGT;SOR=0.252;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=72;TCF=66;TCR=6;TR=20;WE=96353209;WS=96353191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,23:0.31:75
chr10	96353422	rs11346357	AT	A	209.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQRankSum=-0.324;QD=6.99;ReadPosRankSum=-1.247;SOR=1.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr10	96356571	rs7906968	A	T	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.60;ReadPosRankSum=1.342;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr10	96357022	rs2274417	A	G	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=21;ReadPosRankSum=-0.903;SC=AATCTCAGACATGACATTTTG;SOR=0.061;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=96357030;WS=96357012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr10	96448129	rs1926706	A	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=141;ReadPosRankSum=-0.163;SC=TATGGGGTACATGTAATATTT;SOR=0.336;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=9;WE=96448137;WS=96448119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr10	96466824	rs7904929	C	T	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=452;SC=TATGTACTTACCATGTGTATA;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=96466832;WS=96466814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	96493058	rs1126545	C	T	2042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.455;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=38;PP=1448;ReadPosRankSum=-1.064;SC=TTTCAGGGCACGACCATAATA;SOR=0.632;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=308;TCF=193;TCR=115;TR=95;WE=96493066;WS=96493048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:222,98:0.31:320
chr10	96495232	rs2860840	C	T	1846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.429;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=52;PP=1340;ReadPosRankSum=-0.596;SC=TGCTCCTGTGCTGTCACCTGC;SOR=0.378;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=88;TCF=9;TCR=79;TR=59;WE=96495240;WS=96495222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,66:0.69:96
chr10	96495284	rs1042192	G	A	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.170;SOR=0.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,12:0.23:53
chr10	96541616	rs4244285	G	A	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=130;ReadPosRankSum=-0.486;SC=ATTATTTCCCGGGAACCCATA;SOR=0.641;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=40;TCF=22;TCR=18;TR=10;WE=96541624;WS=96541606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,9:0.22:41
chr10	96580202	rs4417205	C	G	1411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.916;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=4;PP=1050;ReadPosRankSum=-1.358;SC=TTACTGTCATCAAATATGCTG;SOR=0.288;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=160;TCF=151;TCR=9;TR=54;WE=96580210;WS=96580192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,57:0.34:169
chr10	96602622	rs3758580	C	T	1732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.500;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=39;PP=1292;ReadPosRankSum=0.557;SC=TTGAACGTGTCGTTGGCAGAA;SOR=0.630;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=244;TCF=114;TCR=130;TR=76;WE=96602630;WS=96602612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,79:0.32:247
chr10	96701601	rs9332119	G	C	3419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.524;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=45;PP=2717;ReadPosRankSum=0.052;SC=TGTTATCTCTGTCTACTTTCC;SOR=0.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=123;TCR=78;TR=116;WE=96701609;WS=96701591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,124:0.59:211
chr10	96702047	rs1799853	C	T	1866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=5.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.032;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.356;NF=48;NR=13;PP=1495;ReadPosRankSum=0.383;SC=CATTGAGGACCGTGTTCAAGA;SOR=1.074;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=99;TCF=77;TCR=22;TR=61;WE=96702055;WS=96702037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,65:0.62:104
chr10	96707536	.	C	T	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.051;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=58;ReadPosRankSum=0.781;SC=AATTATTTAGCCTCACCCTGT;SOR=0.042;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=5;WE=96707544;WS=96707526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr10	96731788	rs9332172	A	G	3063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=7.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.195;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=1;PP=2573;ReadPosRankSum=0.581;SC=AACTATGTGAATAATTTTGAA;SOR=2.336;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=152;TCF=148;TCR=4;TR=98;WE=96731796;WS=96731778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,100:0.64:157
chr10	96748845	.	C	T	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.723;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=269;ReadPosRankSum=-0.114;SC=TCCTCTGGGGCATTATCCATC;SOR=0.356;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=16;WE=96748853;WS=96748835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr10	96748893	rs9332242	C	G	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=288;ReadPosRankSum=1.252;SC=CCTGTCATCTCACATTTTCCC;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=13;WE=96748901;WS=96748883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr10	96796861	rs1058932	G	A	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=308;ReadPosRankSum=0.531;SC=ATAGCAGATCGGCAGCCAGAT;SOR=0.419;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=17;WE=96796869;WS=96796851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr10	96798749	rs10509681	T	C	2509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.307;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=43;PP=2044;ReadPosRankSum=-1.013;SC=AGGAAATTCTTTGTCATCATG;SOR=0.826;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=148;TCF=79;TCR=69;TR=93;WE=96798757;WS=96798739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,94:0.62:152
chr10	96802598	rs2275620	A	T	1917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=6;PP=1590;SC=AACCAGCACTATGGAAATTTC;SOR=4.066;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=49;TCR=6;TR=55;WE=96802606;WS=96802588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	96827030	rs11572080	C	T	1631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.200;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=34;PP=1254;ReadPosRankSum=0.412;SC=CTCAATGCTCCTCTTCCCCAT;SOR=1.160;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=83;TCF=36;TCR=47;TR=57;WE=96827038;WS=96827020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,60:0.70:86
chr10	96827119	rs11572078	T	TA	447.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=3.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQRankSum=2.076;QD=6.05;ReadPosRankSum=-0.612;SOR=0.364;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,24:0.32:74
chr10	96827178	rs2275622	T	C	3822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=38;PP=2817;SC=CTGCAACACTTGGCAGCCATG;SOR=1.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=118;TCF=79;TCR=39;TR=117;WE=96827186;WS=96827168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr10	96954298	rs591157	A	G	2023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=12;PP=1622;ReadPosRankSum=-0.558;SC=CTGGGATTTGAAGCCTGCTGC;SOR=0.622;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=65;TCF=53;TCR=12;TR=62;WE=96954306;WS=96954288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,64:0.96:67
chr10	96954360	rs11188225	T	A	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=1.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.91;ReadPosRankSum=-0.344;SOR=0.482;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,25:0.22:113
chr10	96954473	rs592041	A	T	2473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.93;SOR=3.076;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr10	96954479	rs592055	G	A	2288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.71;SOR=3.398;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	96954511	rs681838	T	A	1336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=31;PP=961;SC=ATGAGATTCATATCCCATCTA;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=33;WE=96954519;WS=96954501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	96961184	rs602941	G	A	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=373;SC=CTGTTTCTGAGTTATTTCCCA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=13;WE=96961192;WS=96961174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	96966954	rs58102963	GT	G	3948.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.194;NF=75;NR=39;PP=2979;ReadPosRankSum=-0.794;SC=TTCTTTTGTGGTTTTTTTCAG;SOR=0.878;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=126;TCF=79;TCR=47;TR=114;WE=96966962;WS=96966944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,143:0.99:144
chr10	96967024	rs200758572	C	T	1077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.054;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.678;NF=23;NR=31;PP=874;ReadPosRankSum=-0.528;SC=CTATCAATTACGCATGTCTAA;SOR=0.408;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=157;TCF=62;TCR=95;TR=54;WE=96967032;WS=96967014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,53:0.32:164
chr10	96970361	rs16872	A	C	1427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.493;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=21;PP=905;ReadPosRankSum=-0.782;SC=ACTTAATCAGAGAACCTAAAT;SOR=0.954;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=185;TCF=114;TCR=71;TR=59;WE=96970369;WS=96970351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,67:0.34:199
chr10	96971638	rs75252129	G	A	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.079;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=450;ReadPosRankSum=0.098;SC=TCTTTAGACGGTGGATGGATC;SOR=0.980;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=66;TCF=47;TCR=19;TR=24;WE=96971646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,25:0.37:68
chr10	96972889	rs17524438	G	A	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=234;ReadPosRankSum=-0.642;SC=TCCATATCTTGACCCAGAACA;SOR=0.152;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=14;WE=96972897;WS=96972879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,14:0.28:50
chr10	96974518	rs595478	A	T	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=336;SC=TATTGGAATAACTGCATCATT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=96974526;WS=96974508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	96974552	rs595420	C	T	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=1;PP=670;SC=TTCTAACAGACCTGTTATTGG;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=96974560;WS=96974542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	96974803	rs594448	A	G	2949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=61;PP=2222;ReadPosRankSum=1.612;SC=CACACTGTCAAAGCACTAAGC;SOR=1.028;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=83;TCF=20;TCR=63;TR=81;WE=96974811;WS=96974793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,90:0.99:91
chr10	96979504	rs11188228	T	C	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=203;ReadPosRankSum=-1.360;SC=CACTCCTGCTTGATTTTTTTT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=11;WE=96979512;WS=96979494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr10	96979775	rs11188229	C	G	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-5.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=441;ReadPosRankSum=-0.144;SC=TAAGTGAGCTCTTACAGTTGT;SOR=0.815;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=1;TCR=59;TR=24;WE=96979783;WS=96979765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,22:0.35:63
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chr10	96988377	rs17452714	T	C	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=583;ReadPosRankSum=0.699;SC=TAAATGTAGGTTTCTGGATTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=23;WE=96988385;WS=96988367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,23:0.77:30
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chr10	97023552	rs4917682	G	A	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=1;PP=265;SC=ACCTGCCTGGGCAGCCCTGGT;SOR=3.442;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=10;WE=97023560;WS=97023531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	97023630	rs2296961	T	C	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=60;ReadPosRankSum=1.190;SC=CGGTCTGCTGTTCGCCTCCAC;SOR=0.941;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=5;WE=97023638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr10	97023895	rs2296962	C	T	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=15;PP=430;SC=GCAGGCTGAGCGCCAGGGAGA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=97023903;WS=97023885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	97050555	rs45546031	C	T	2026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.779;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=23;PP=1387;ReadPosRankSum=0.858;SC=CCCGCTTCCACGCACGTCCCA;SOR=0.467;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=76;TCR=34;TR=73;WE=97050563;WS=97050545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,79:0.69:115
chr10	97101532	rs2274628	G	A	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=317;ReadPosRankSum=1.159;SC=TTTAAGTGGGGTCAAAGGGTA;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=14;WE=97101540;WS=97101522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr10	97106165	rs726176	T	C	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.45;ReadPosRankSum=-0.514;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,9:0.21:42
chr10	97110879	rs6583995	C	T	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=335;SC=GAGAACTAAACTGGCCTACAG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=97110887;WS=97110869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	97114560	rs2274632	C	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=105;ReadPosRankSum=-0.089;SC=TGTCACCTCTCTGATAGATGT;SOR=0.157;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=7;WE=97114568;WS=97114550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr10	97116219	rs7076888	C	T	2790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.622;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=51;PP=2083;ReadPosRankSum=-2.123;SC=ACCGCTGAATCAGCTGCTCAA;SOR=0.590;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=153;TCF=74;TCR=79;TR=101;WE=97116227;WS=97116209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,106:0.67:159
chr10	97127264	rs6583997	T	C	1037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=0;PP=852;SC=TAGATCACTTTTTATCACCAA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=97127272;WS=97127254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	97127462	rs6583998	C	A	2839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=58;PP=2191;SC=GAGCTCTGTACATGTCCAAAA;SOR=1.460;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=31;TCR=58;TR=89;WE=97127470;WS=97127452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr10	97127577	rs7074224	C	T	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=533;SC=CTAGTTTAGACCAGGACCTCT;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=97127585;WS=97127567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	97137105	rs1536556	A	G	1922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.795;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=46;PP=1469;ReadPosRankSum=-0.414;SC=TACTTACAACACAGTTAACAT;SOR=0.820;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=36;TCR=74;TR=68;WE=97137113;WS=97137095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,71:0.65:110
chr10	97141523	rs2274490	G	A	6563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=149;PP=2965;ReadPosRankSum=0.564;SC=ATTTTCTTGTGTCTACTTTCT;SOR=0.522;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=211;TCF=59;TCR=152;TR=208;WE=97141531;WS=97141513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,214:0.99:216
chr10	97146882	rs149449849	G	GA	189.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=13;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=128;ReadPosRankSum=-0.404;SC=TGTCTCTAAAGAAAAAAAAAA;SOR=1.179;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=12;WE=97146890;WS=97146872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr10	97154682	rs55688714	A	T	1994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.980;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=6;PP=1683;ReadPosRankSum=-0.860;SC=AAAAGCCCAAATCTTATGCCT;SOR=1.394;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=103;TCF=92;TCR=11;TR=68;WE=97154690;WS=97154672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,70:0.66:106
chr10	97154698	rs11188311	G	A	2540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.257;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=10;PP=2119;ReadPosRankSum=-2.047;SC=TGCCTACAATGGAACTATAAG;SOR=1.089;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=130;TCF=113;TCR=17;TR=87;WE=97154706;WS=97154688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,90:0.67:134
chr10	97156908	rs17110707	T	C	1339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=24;PP=868;ReadPosRankSum=0.212;SC=CCTAGCAAAGTGAGTTCAGGC;SOR=0.648;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=199;TCF=124;TCR=75;TR=63;WE=97156916;WS=97156898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,67:0.32:207
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chr10	97165811	rs3818540	G	A	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=641;ReadPosRankSum=-2.134;SC=AATATCGGGCGGTGACCGGAA;SOR=0.573;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=99;TCF=64;TCR=35;TR=39;WE=97165819;WS=97165801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,40:0.39:102
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chr10	97197066	rs73321246	C	T	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=368;ReadPosRankSum=0.556;SC=CTCAGACTCCCGAAATGCAAC;SOR=1.238;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=16;WE=97197074;WS=97197056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr10	97366746	rs7099284	C	T	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=135;ReadPosRankSum=0.082;SC=CCAGCCTCTGCTTCCTGTCCA;SOR=0.086;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=8;WE=97366754;WS=97366736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr10	97369939	rs10882640	C	T	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=3.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.000;QD=5.90;ReadPosRankSum=-1.263;SOR=0.837;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,49:0.28:173
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chr10	97371317	rs11188399	A	G	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.67;ReadPosRankSum=0.261;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr10	97371327	rs11188400	C	G	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.76;ReadPosRankSum=-0.155;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr10	97373966	rs2296692	A	C	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=164;ReadPosRankSum=1.286;SC=TGACCACACAAAATATAAAAA;SOR=0.509;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=10;WE=97373974;WS=97373956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,10:0.27:37
chr10	97385242	rs10509688	A	G	1356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=41;PP=1084;ReadPosRankSum=-0.675;SC=TTAAAAAAACAGAGATGTTAA;SOR=0.717;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=13;TCR=66;TR=49;WE=97385250;WS=97385232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,50:0.61:82
chr10	97392969	rs3750701	G	A	3052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=67;PP=2036;SC=TCTGTCTGCAGAACACACTGT;SOR=5.283;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=4;TCR=67;TR=71;WE=97392977;WS=97392959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr10	97392993	rs3750700	T	C	2407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=54;PP=1597;SC=CTGGCAATCCTTTTTCCAAAC;SOR=6.630;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=55;WE=97393001;WS=97392983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	97393475	rs11188409	C	T	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=558;ReadPosRankSum=-0.529;SC=ATACAAAAGACGCTAAGAGCA;SOR=2.165;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=24;WE=97393483;WS=97393465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,24:0.75:32
chr10	97397227	rs2275273	T	C	1932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=43;PP=1506;SC=GACTGTAAGTTACCGTACTGT;SOR=2.546;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=12;TCR=43;TR=55;WE=97397235;WS=97397217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr10	97397344	rs11188411	T	C	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.98;ReadPosRankSum=-0.974;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr10	97412921	rs9787589	T	G	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=2;PP=780;SC=CTCCAGCCTGTGTGACAAAAT;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=97412929;WS=97412911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	97440097	.	TCA	T	808	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=6;NR=0;PP=808;QD=141.833333333;SC=TTATGTCAGCTCACTTTAAAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=97440116;WS=97440093;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr10	97440098	.	CACT	C	283.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.83;ReadPosRankSum=0.522;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr10	97440103	.	T	TGG	283.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.83;ReadPosRankSum=-0.223;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr10	97440106	.	A	G	292.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.556;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.52;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr10	97440107	.	CA	C	283.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.83;ReadPosRankSum=0.013;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr10	97440493	rs143448527	GA	G	235.14	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=270;ReadPosRankSum=-0.282;SC=CTTAGTGGAAGAACACAAAAG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=8;WE=97440501;WS=97440483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr10	97442995	rs17461546	A	G	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=490;ReadPosRankSum=0.787;SC=TAACAGAAAAAAAAAGGAGGC;SOR=0.676;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=90;TCF=9;TCR=81;TR=25;WE=97443003;WS=97442985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,25:0.29:87
chr10	97446206	rs2297788	G	A	2141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.025;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=13;PP=1720;ReadPosRankSum=-0.436;SC=AGATGCAGAGGAGCCAAATAT;SOR=1.585;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=111;TCF=90;TCR=21;TR=74;WE=97446214;WS=97446196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,76:0.63:120
chr10	97447373	rs10786229	A	T	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.863;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=22;PP=784;ReadPosRankSum=0.670;SC=GTGGTGATTGAGTTTGGAATG;SOR=0.433;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=89;TCF=42;TCR=47;TR=47;WE=97447381;WS=97447363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,48:0.53:91
chr10	97471925	rs12244559	T	C	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=136;ReadPosRankSum=-1.550;SC=TTTTTTGGTATGAATATTCAC;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=97471933;WS=97471915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr10	97602091	rs3181131	T	C	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=363;ReadPosRankSum=0.963;SC=TCTTCTACATTTTTTCCTAGG;SOR=0.400;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=53;TCR=5;TR=20;WE=97602099;WS=97602081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,21:0.34:61
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chr10	97772253	rs3748224	C	T	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.613;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=2;PP=815;ReadPosRankSum=0.672;SC=GAGAACAATACAGTACAATTC;SOR=2.303;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=51;TCF=46;TCR=5;TR=36;WE=97772261;WS=97772243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,37:0.74:50
chr10	97772496	rs10748652	T	A	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=495;ReadPosRankSum=-1.255;SC=TGTAAGTTATTATTATTTTTA;SOR=0.616;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=23;WE=97772504;WS=97772486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr10	97778853	rs1414922	C	T	184.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=149;SC=TATAAGCCACCACACTCCACT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=97778861;WS=97778848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	97779219	rs1414921	G	A	333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=330;SC=ATGGGGCCGGGGCAATCTTTT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=97779227;WS=97779209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	97784596	rs77537360	G	A	1485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.389;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=41;PP=1201;ReadPosRankSum=-0.636;SC=TCTAACTTTGGTTGTCTATTT;SOR=1.154;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=81;TCF=25;TCR=56;TR=58;WE=97784604;WS=97784586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,57:0.69:83
chr10	97804245	.	C	G	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.945;ClippingRankSum=0.000;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=6.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.49;ReadPosRankSum=0.276;SOR=0.946;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,45:0.24:185
chr10	97816368	rs117825405	A	G	2936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.515;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=19;PP=2298;ReadPosRankSum=1.751;SC=AATCCTGGCAATAAGACAGCA;SOR=1.219;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=186;TCF=147;TCR=39;TR=103;WE=97816376;WS=97816358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,105:0.56:187
chr10	97816420	rs7099399	G	A	7967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=145;NR=105;PP=2965;ReadPosRankSum=2.375;SC=TCACTTGCCTGACATTTTCTC;SOR=1.054;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=252;TCF=146;TCR=106;TR=250;WE=97816428;WS=97816410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,256:0.99:258
chr10	97919011	rs41291604	A	G	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=3.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.590;SOR=1.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,25:0.24:105
chr10	97920099	rs67530050	T	TC	8378.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=112;PP=2957;SC=TTGTGAAATGTCTAGGAGAAA;SOR=0.875;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=196;TCF=73;TCR=123;TR=183;WE=97920107;WS=97920089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr10	97959113	rs140166930	TTTTG	T	385.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=293;ReadPosRankSum=0.756;SC=TCCAGGTATTTTTTGTTTGTT;SOR=0.392;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=8;WE=97959124;WS=97959103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr10	97959763	rs112074351	GCAT	G	411.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.626;NF=9;NR=0;PP=281;ReadPosRankSum=-0.721;SC=CAGTGAAACTGCATCATCTCA;SOR=1.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=9;WE=97959773;WS=97959753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr10	97964154	rs10748665	C	T	1922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.06;SOR=6.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr10	97964154	.	CGTA	TGTA,TGTG	754	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=48,29;NR=1,1;PP=418,754;QD=9.24022882749;SC=CCTTTTAACACGTAACTGCAA;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=49,30;WE=97964165;WS=97964144;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:49
chr10	97964157	rs2242137	A	G	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.23;ReadPosRankSum=1.888;SOR=0.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr10	97975167	rs3835127	GTA	G	357.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.69;MQRankSum=0.787;QD=22.36;ReadPosRankSum=0.099;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr10	97983526	rs10882746	C	T	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=193;ReadPosRankSum=-0.171;SC=CTGTCCTGGTCGCTTGCCCCA;SOR=0.941;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=11;WE=97983534;WS=97983516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr10	97987144	rs2305846	C	G	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=157;ReadPosRankSum=0.868;SC=GGCCGAGTGCCCAGGTCTGCG;SOR=0.315;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=13;WE=97987152;WS=97987134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr10	97987378	rs34233512	G	A	2453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.353;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=75;PP=1881;ReadPosRankSum=0.700;SC=CTGCCTGGCCGTCAGGACCAT;SOR=1.201;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=140;TCF=24;TCR=116;TR=89;WE=97987386;WS=97987368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,93:0.64:145
chr10	98006857	rs2168732	A	T	1075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=27;PP=1048;SC=CTGACTTTTTAAAAAAAGTCT;SOR=2.038;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=39;WE=98006865;WS=98006847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	98007727	rs10882762	A	G	1063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=1;PP=847;SC=CAGTAAATCTATGCTTTCATT;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=98007735;WS=98007717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	98007933	rs9663433	G	A	2151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.38;SOR=4.575;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	98007943	rs9664029	T	A	1998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.97;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	98078127	rs7081385	C	T	1956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=5;PP=1656;SC=TCACCCACATCGTAGCAGAGA;SOR=4.443;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=54;TCR=5;TR=59;WE=98078135;WS=98078117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr10	98078239	rs6584066	A	G	6600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=120;NR=79;PP=2965;SC=CGAATGCATAAGAGCAGGGAA;SOR=1.184;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=122;TCR=79;TR=199;WE=98078247;WS=98078229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr10	98082517	rs7097016	T	G	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=31;PP=910;SC=TATTGAAAATTGTTTTTCAGT;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=98082525;WS=98082507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	98084231	rs2181320	A	G	2295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=64;PP=1879;SC=TGCAACTCCAATCTGGGAGAG;SOR=4.499;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=6;TCR=64;TR=70;WE=98084239;WS=98084221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr10	98088387	rs10882773	A	C	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=1;PP=484;SC=CTATGTTGCAAATCTTAAGCA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=98088395;WS=98088377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	98095794	rs10736102	T	C	3283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=70;PP=2688;SC=CCCCCGAGCTTTTTTCATGGA;SOR=2.054;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=25;TCR=70;TR=95;WE=98095802;WS=98095784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr10	98105618	rs56148171	A	C	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=290;ReadPosRankSum=0.361;SC=GCAGCTTGGCATCTTTCCTCT;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=47;TCR=1;TR=16;WE=98105626;WS=98105608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr10	98116076	rs2861575	C	T	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=476;ReadPosRankSum=-0.626;SC=ACAATGCATTCATTAAGTTTT;SOR=0.743;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=21;WE=98116084;WS=98116066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr10	98127809	rs41291624	A	C	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.729;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=284;ReadPosRankSum=0.000;SC=CAAAACAAAAAAAATTCTCAG;SOR=0.976;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=69;TCF=63;TCR=6;TR=18;WE=98127817;WS=98127799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,18:0.25:72
chr10	98144312	rs7085022	G	A	1021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=4;PP=695;SC=CCTCACTCGCGCTGCATCAGC;SOR=3.126;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=98144320;WS=98144302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	98240035	rs2281801	A	T	1077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.91;SOR=6.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	98240045	rs2281800	C	T	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.85;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	98287094	rs10786298	T	A	1356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=11;PP=1059;SC=TACTTTCAACTTAAGGCCTTA;SOR=1.900;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=41;WE=98287102;WS=98287084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	98287261	rs3789957	G	C	2909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=64;PP=2240;SC=TGCCTGGTGGGGGGAGGGGGA;SOR=1.329;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=103;TCF=38;TCR=65;TR=102;WE=98287269;WS=98287251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr10	98312891	rs10736113	C	T	1703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=44;PP=1328;SC=TGAGGACAACCGGATGTTAAT;SOR=3.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=8;TCR=44;TR=52;WE=98312899;WS=98312881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr10	98319236	rs10128106	G	T	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=295;SC=GGAAGTTTTTGATTGCTCCTC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=98319244;WS=98319226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	98319367	rs3818389	A	T	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=14;PP=813;SC=ATGTTTGTTGAACGAATTGGT;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=33;WE=98319375;WS=98319357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	98319503	rs3818390	A	T	526.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=19;PP=627;SC=CCTAAAAAAAATTTTTTCATT;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=98319511;WS=98319493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	98321928	rs7094142	A	T	679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=25;PP=574;SC=TACAAGGTAAAACCACTTAAT;SOR=4.091;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=98321936;WS=98321918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	98346411	rs11188836	A	C	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=261;SC=GCCGCCGGGCACTCCAGGCTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=98346419;WS=98346401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	98380137	rs12784975	T	C	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=783;ReadPosRankSum=-0.808;SC=CTCCGATCGTTTCTTCTGGTT;SOR=0.741;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=44;TCR=43;TR=39;WE=98380145;WS=98380127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,41:0.47:87
chr10	98380277	rs3748234	C	T	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.379;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=451;ReadPosRankSum=-2.668;SC=CATATATACTCGACTGGGGCC;SOR=3.033;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=22;WE=98380285;WS=98380267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr10	98380363	rs7910630	A	G	237.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=6;PP=193;SC=ACTGGGGACCACTCACCAGAA;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=98380371;WS=98380353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	98383329	rs4917745	G	T	2975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=79;PP=2456;SC=TACTGAAAAAGTATCAAAATC;SOR=4.977;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=6;TCR=80;TR=85;WE=98383337;WS=98383319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr10	98386433	rs1469847	C	A	1977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=0;PP=1548;SC=GCTCCAAAGACCCAGTTGGAC;SOR=8.155;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=53;WE=98386441;WS=98386423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	98386558	rs4344416	G	A	7086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=132;NR=87;PP=2965;SC=CTGCTGGCCAGGTCCACAGAA;SOR=1.204;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=220;TCF=133;TCR=87;TR=219;WE=98386566;WS=98386548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr10	98392872	rs6584092	A	C	209.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=172;SC=TTCCAGGGTCACCATGAGAGG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=98392880;WS=98392862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	98408714	rs912483	A	G	1916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=51;PP=1561;SC=GGCAACAGAAAGCACTCAGCC;SOR=4.443;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=5;TCR=51;TR=56;WE=98408722;WS=98408704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr10	98410901	rs3748232	A	G	1093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=6;PP=919;SC=GAAGGGACCCAGAAGAGTTAC;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=39;WE=98410909;WS=98410891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
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chr10	98764694	rs7922903	G	T	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=487;ReadPosRankSum=2.169;SC=TGTGCAGAGCGCTCTTCCCCC;SOR=0.430;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=22;WE=98764702;WS=98764684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
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chr10	98808866	rs2805588	C	G	5520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=116;PP=2965;SC=AAGGGTTCTGCGCCAGGTGCC;SOR=1.596;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=175;TCF=58;TCR=117;TR=174;WE=98808874;WS=98808856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr10	98816786	rs2817675	T	C	900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=2;PP=710;SC=CTCTACCTCCTTCTCTAGCCT;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=98816794;WS=98816776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	98817662	rs59428103	G	A	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.872;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=14;PP=784;ReadPosRankSum=-0.798;SC=GGGGAGGGGGGTTGTATGCCA;SOR=1.280;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=63;TCF=41;TCR=22;TR=42;WE=98817670;WS=98817652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,42:0.68:62
chr10	98819317	rs2817676	A	G	3902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=62;PP=2836;SC=GAGAGGGGGCATCTGAATCCC;SOR=0.784;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=130;TCF=68;TCR=62;TR=130;WE=98819325;WS=98819307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr10	98825940	rs1106375	G	A	2248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=25;NR=46;PP=1646;SC=AGGTGGGCTGGAGGGCACTGA;SOR=1.426;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=25;TCR=46;TR=71;WE=98825948;WS=98825930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr10	98923361	rs2636772	T	C	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=23;PP=521;SC=CACAGGCCTATGCCTGGCCTG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=98923369;WS=98923351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	98979111	.	AT	A	43	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=43;QD=37.0;SC=TTATATGTGGATTTTTCGACT;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=98979119;WS=98979101;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr10	98988759	rs1468069	A	C	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=103;ReadPosRankSum=-0.224;SC=CTGGTGAATGAACTCAAGGGC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=7;WE=98988767;WS=98988752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr10	98989454	rs2297987	A	G	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.094;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=4;PP=602;ReadPosRankSum=-0.126;SC=AGATGACAGTATATCAATTTT;SOR=0.306;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=134;TCF=121;TCR=13;TR=37;WE=98989462;WS=98989444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,40:0.28:141
chr10	98995076	rs946981	A	G	2054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=53;PP=1626;ReadPosRankSum=-0.405;SC=TATTAAACTAAAAGAAAACAT;SOR=0.791;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=22;TCR=85;TR=67;WE=98995084;WS=98995066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,72:0.64:113
chr10	99003613	rs793528	A	C	282.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=9;NR=0;PP=232;SC=GACAAGCCTGATTTCTCAGCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=99003621;WS=99003603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	99006083	rs13439	G	A	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.751;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=37;PP=1252;ReadPosRankSum=0.866;SC=ACTCCCGAATGTAAGCAGGAG;SOR=1.106;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=97;TCF=39;TCR=58;TR=57;WE=99006091;WS=99006073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,61:0.59:104
chr10	99019144	rs3740522	C	T	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.843;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=18;PP=914;ReadPosRankSum=1.003;SC=CTTTACTCTTCCCGTCAACAC;SOR=1.103;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=173;TCF=114;TCR=59;TR=57;WE=99019152;WS=99019134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,61:0.32:188
chr10	99019177	rs2253301	A	G	6478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=94;PP=2965;SC=GCCACAGGACATGGGGTGCAA;SOR=0.927;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=212;TCF=118;TCR=94;TR=212;WE=99019185;WS=99019167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr10	99024572	rs793524	A	G	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=623;ReadPosRankSum=-0.737;SC=TAAAATTTCAAGTAGTCTTAC;SOR=0.722;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=29;WE=99024580;WS=99024562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,32:0.65:49
chr10	99025611	rs10882884	T	A	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-4.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=140;ReadPosRankSum=1.635;SC=CAAACACATCTCCTACCCTTT;SOR=0.134;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=9;WE=99025619;WS=99025601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,10:0.26:38
chr10	99030554	rs793519	C	G	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=25;PP=608;ReadPosRankSum=-0.063;SC=TCTGAGCACTCATCTGCAAGA;SOR=0.346;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=27;WE=99030562;WS=99030544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr10	99079023	rs11189127	G	A	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQRankSum=-1.383;QD=6.86;ReadPosRankSum=-0.241;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr10	99094436	rs1890966	G	A	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=137;ReadPosRankSum=0.480;SC=CGCGGAAGCCGGAGCCCGCCA;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=7;WE=99094444;WS=99094426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr10	99116903	rs1048445	C	T	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=3.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.29;ReadPosRankSum=-0.115;SOR=1.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,30:0.23:131
chr10	99117097	rs7923385	T	A	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=192;ReadPosRankSum=-1.339;SC=TAGGCAGACCTCACGTGGTTC;SOR=0.277;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=13;WE=99117105;WS=99117087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr10	99118382	rs2297988	T	C	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.328;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=18;PP=720;ReadPosRankSum=1.882;SC=GCTTTCTGCTTGCCCAGAGAA;SOR=0.977;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=136;TCF=75;TCR=61;TR=46;WE=99118390;WS=99118372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,46:0.33:138
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chr10	99125722	rs11189167	A	G	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.351;HP=6;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=138;ReadPosRankSum=0.078;SC=TTTCTCAAAAAAAGTTTGAGA;SOR=0.120;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=10;WE=99125730;WS=99125712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,10:0.26:38
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chr10	99125788	rs10882907	G	C	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.268;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=430;ReadPosRankSum=0.253;SC=TCTGTTTTTAGCCACGCTTCC;SOR=0.888;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=75;TCF=62;TCR=13;TR=22;WE=99125796;WS=99125778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,22:0.29:77
chr10	99126249	rs2275581	G	A	1744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.745;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=27;PP=1246;ReadPosRankSum=-1.290;SC=TGAGGGGCTCGTCCCCACCGC;SOR=0.560;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=231;TCF=150;TCR=81;TR=76;WE=99126257;WS=99126239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,79:0.33:243
chr10	99126923	rs2297990	G	A	1889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.871;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=56;PP=1437;ReadPosRankSum=1.957;SC=TCAGGGAGGCGAGCCTTCCAT;SOR=0.066;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=88;TCF=8;TCR=80;TR=64;WE=99126931;WS=99126913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,68:0.73:93
chr10	99129230	rs6584122	T	C	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.098;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=13;PP=1009;ReadPosRankSum=0.558;SC=TGACAGTCACTGCCACCTTGA;SOR=0.532;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=47;WE=99129238;WS=99129220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,52:0.71:73
chr10	99130127	rs3737194	A	G	890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.869;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=10;PP=618;ReadPosRankSum=0.176;SC=GCCAGGGCACAGAGCTCTCCC;SOR=0.852;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=101;TCF=76;TCR=25;TR=39;WE=99130135;WS=99130117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,42:0.42:101
chr10	99132603	rs41300215	G	A	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.220;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=362;ReadPosRankSum=-3.418;SC=TCATTGGGGAGGAGCGAAAGA;SOR=1.049;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=18;WE=99132611;WS=99132593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr10	99139140	rs41300217	G	A	1752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.707;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=33;PP=1363;ReadPosRankSum=2.072;SC=ATGACAGGCAGCAGCCAGCTC;SOR=0.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=57;TCR=59;TR=66;WE=99139148;WS=99139130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,66:0.58:113
chr10	99139600	rs11189174	C	G	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.35;ReadPosRankSum=0.619;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,2:0.25:8
chr10	99140511	rs7078004	A	G	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.541;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=713;ReadPosRankSum=-1.207;SC=ATAGTCCAAGAGCCAGCACCA;SOR=0.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=111;TCF=62;TCR=49;TR=39;WE=99140519;WS=99140501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,40:0.35:115
chr10	99140969	rs7096801	T	C	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=221;ReadPosRankSum=-1.640;SC=ACATGGCAGGTGCTCAAGTCC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=13;WE=99140977;WS=99140959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr10	99141205	rs2275089	A	G	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=46;PP=1020;ReadPosRankSum=0.498;SC=AGCCAATGTCAGCCATGTGGG;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=182;TCF=46;TCR=136;TR=62;WE=99141213;WS=99141195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,63:0.33:191
chr10	99141484	rs12218483	C	T	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.403;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=27;PP=993;ReadPosRankSum=-0.449;SC=TGAGGCTCTGCGTAGCAGCAG;SOR=0.574;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=124;TCF=58;TCR=66;TR=54;WE=99141492;WS=99141474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,55:0.43:127
chr10	99141663	rs11189177	C	T	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=202;ReadPosRankSum=0.495;SC=CTGAGACGGCCCAGCTCTGAA;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=11;WE=99141671;WS=99141653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr10	99147975	rs869967	T	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=43;ReadPosRankSum=-1.298;SC=CCACTGCAGGTCCCCCTTTCT;SOR=0.536;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=5;WE=99147983;WS=99147965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr10	99148151	rs2275090	A	G	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=0.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.492;SOR=0.604;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,39:0.28:139
chr10	99150476	rs41303833	A	G	1424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.555;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=21;PP=1086;ReadPosRankSum=0.510;SC=CAGATGAGAAACTAAACCCCA;SOR=0.368;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=66;TCF=40;TCR=26;TR=49;WE=99150484;WS=99150466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,52:0.71:73
chr10	99153540	rs7898743	T	G	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=17;PP=690;SC=TTGAGGGGGTTTGAATGGATA;SOR=1.893;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=99153548;WS=99153530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	99155984	rs3814553	G	A	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.985;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=648;ReadPosRankSum=0.232;SC=CCAGAGCAGCGAAGTACTCAG;SOR=0.935;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=87;TCF=62;TCR=25;TR=32;WE=99155992;WS=99155974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,34:0.38:90
chr10	99156273	rs11189200	C	G	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=35;ReadPosRankSum=-1.000;SC=TACTAACCTTCTAGAAATACC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=99156281;WS=99156263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr10	99160046	rs2297668	C	T	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.745;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=492;ReadPosRankSum=-0.519;SC=ATGGCCCTCCCGACCCTCGCC;SOR=0.312;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=64;TCR=5;TR=25;WE=99160054;WS=99160036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,28:0.38:73
chr10	99160152	rs1048442	A	G	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=1.277;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.11;ReadPosRankSum=0.091;SOR=0.589;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,53:0.29:182
chr10	99160965	rs2275091	A	G	8311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=120;NR=134;PP=2965;SC=AGACACCAGAAGGCAACTTTC;SOR=0.850;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=255;TCF=120;TCR=135;TR=254;WE=99160973;WS=99160955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr10	99179206	rs4418736	C	T	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.014;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=14;PP=960;ReadPosRankSum=1.144;SC=TGGTTTGCCCCGCTCACTCTA;SOR=0.455;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=80;TCF=56;TCR=24;TR=42;WE=99179214;WS=99179196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,43:0.53:81
chr10	99190490	rs60890987	C	T	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.234;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=870;ReadPosRankSum=-1.814;SC=ACTGAACTTACAATTCATGAT;SOR=0.022;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=38;WE=99190498;WS=99190480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,41:0.76:54
chr10	99198507	rs11316935	AT	A	265.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQRankSum=1.906;QD=6.81;ReadPosRankSum=1.982;SOR=1.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,28:0.72:39
chr10	99205731	rs4919098	A	G	2429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.424;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.707;NF=37;NR=56;PP=1885;ReadPosRankSum=-0.602;SC=AGTATCTCACAGGTGGCGCCA;SOR=0.561;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=144;TCF=56;TCR=88;TR=93;WE=99205739;WS=99205721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,94:0.66:143
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chr10	99219404	rs29001331	TG	T	1755.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.751;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.941;NF=22;NR=24;PP=1645;ReadPosRankSum=0.434;SC=AAGCTCTGCCTGTGGGACTTA;SOR=0.414;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=156;TCF=83;TCR=73;TR=46;WE=99219412;WS=99219394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,59:0.32:184
chr10	99219885	rs2152092	G	A	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.450;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=684;ReadPosRankSum=-0.840;SC=TCCGCACTTCGGCATGGCCAG;SOR=1.697;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=111;TCF=66;TCR=45;TR=38;WE=99219893;WS=99219875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,38:0.33:116
chr10	99220707	rs3740526	C	T	2216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.730;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=54;PP=1734;ReadPosRankSum=0.974;SC=GGGCCCAGAGCCCAGGCCAGC;SOR=1.109;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=116;TCF=43;TCR=73;TR=81;WE=99220715;WS=99220697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,83:0.69:121
chr10	99225738	rs2236575	T	A	3139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.241;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.594;NF=64;NR=53;PP=2332;ReadPosRankSum=-1.782;SC=AGACAAAGGTTTACTGTGTGA;SOR=0.932;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=159;TCF=85;TCR=74;TR=117;WE=99225746;WS=99225728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,119:0.73:163
chr10	99229394	rs2275583	G	A	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=450;ReadPosRankSum=-2.640;SC=TTATCTGAGTGACACTCACCT;SOR=0.829;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=84;TCF=45;TCR=39;TR=27;WE=99229402;WS=99229384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,29:0.33:87
chr10	99240758	rs2275586	G	C	1431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=27;PP=1228;SC=AAGCTGGATTGCTCGTGCCCG;SOR=1.312;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=16;TCR=27;TR=43;WE=99240766;WS=99240748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	99337473	rs10786357	T	C	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=13;PP=681;SC=GGAGGATGTCTCTGTGGGGTG;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=15;TCR=13;TR=28;WE=99337481;WS=99337463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	99337572	rs7094973	G	A	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=8;PP=515;SC=CCGAGGAGACGCACGCCAGAA;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=20;WE=99337580;WS=99337562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	99350017	rs7093840	G	C	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=626;ReadPosRankSum=-0.190;SC=CCACTGATGAGGCCACGTGGG;SOR=0.644;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=143;TCF=48;TCR=95;TR=48;WE=99350025;WS=99350007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,51:0.35:147
chr10	99350128	rs7093643	A	G	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=367;ReadPosRankSum=-0.622;SC=CAGGTCACCTAGAGTCCAAGG;SOR=0.754;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=70;TCF=25;TCR=45;TR=21;WE=99350136;WS=99350118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,20:0.28:71
chr10	99358511	rs11817730	A	G	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.561;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=13;PP=892;ReadPosRankSum=-0.094;SC=GGAAGGAGTTAGTCAGCTGTG;SOR=1.182;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=145;TCF=97;TCR=48;TR=49;WE=99358519;WS=99358501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,52:0.34:151
chr10	99359739	rs2297644	T	C	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=12.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.83;ReadPosRankSum=1.398;SOR=1.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,53:0.27:196
chr10	99359987	rs2297643	G	A	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=28;PP=675;ReadPosRankSum=1.455;SC=TGGGTCTTCCGGGAGAGATCG;SOR=0.340;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=29;WE=99359995;WS=99359977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
chr10	99371147	rs1124116	A	G	1419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=3;PP=1140;SC=TAGAGTTGGCAGTTACTTTCC;SOR=5.018;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=46;TCR=3;TR=49;WE=99371155;WS=99371137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr10	99371344	rs12261752	C	A	3632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.796;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=77;PP=2763;ReadPosRankSum=0.381;SC=CCTGCCGCGCCCCCTTGCAGG;SOR=0.384;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=218;TCF=87;TCR=131;TR=137;WE=99371352;WS=99371334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,146:0.63:230
chr10	99376843	rs4919121	A	C	2318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=2;PP=1974;SC=ACTACTTATTACTCATCTGTG;SOR=5.610;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=66;TCF=64;TCR=2;TR=66;WE=99376851;WS=99376833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	99416303	rs1889475	T	C	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=4.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=211;ReadPosRankSum=1.703;SC=CTGTCTTCCTTATTTCTGTCA;SOR=0.402;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=11;WE=99416311;WS=99416293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr10	99422648	rs7905087	A	G	4321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.691;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=68;PP=2962;ReadPosRankSum=1.721;SC=TGCTAACTTTATATTTCTGTT;SOR=0.581;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=217;TCF=118;TCR=99;TR=145;WE=99422656;WS=99422638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,159:0.68:235
chr10	99426975	rs4254004	C	T	313.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=386;ReadPosRankSum=-1.738;SC=ATACCCCCCCCTTTTTTTTTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=20;WE=99426983;WS=99426965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr10	99433297	rs2065672	C	T	1941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=15;PP=1550;ReadPosRankSum=0.835;SC=ATCTGGAATGCTGAGGCCTCT;SOR=0.747;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=88;TCR=24;TR=70;WE=99433305;WS=99433287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,72:0.62:116
chr10	99437822	rs3750564	A	G	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=586;ReadPosRankSum=0.381;SC=CATCAATAGGAAGAATGGAAT;SOR=0.868;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=29;WE=99437830;WS=99437812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr10	99439541	rs2275047	G	C	2510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.055;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.827;NF=35;NR=54;PP=1860;ReadPosRankSum=-0.827;SC=TTGAAACAGGGCTTGGATCTG;SOR=0.890;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=150;TCF=63;TCR=87;TR=89;WE=99439549;WS=99439531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,95:0.60:158
chr10	99439673	rs3818780	C	G	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.910;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=33;PP=942;ReadPosRankSum=1.071;SC=TGTGGATGCTCTGAGGATGCA;SOR=1.654;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=74;TCF=24;TCR=50;TR=45;WE=99439681;WS=99439663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,48:0.62:77
chr10	99439696	rs45491602	A	G	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=7.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.46;ReadPosRankSum=-0.175;SOR=1.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,37:0.54:69
chr10	99439703	rs11595249	A	T	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=9.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.13;ReadPosRankSum=-0.999;SOR=1.946;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,35:0.53:66
chr10	99439724	rs2151931	C	T	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.289;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=433;ReadPosRankSum=-0.450;SC=CCTTCCCAGACCTGGGGGTCC;SOR=2.062;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=21;WE=99439732;WS=99439714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
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chr10	99504630	rs10882993	G	T	1345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=25;PP=1058;SC=CTGCAGAGAGGTCGCCTGTCT;SOR=0.990;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=43;WE=99504638;WS=99504620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	99504725	rs10882994	A	G	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=14;PP=424;SC=AGCAGCCATGACACTAAGTGC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=99504733;WS=99504715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	99507869	rs11189352	T	C	3600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=11;PP=2965;SC=TAGCCAGGCCTGTTTCTCCCA;SOR=4.077;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=99;TCR=11;TR=110;WE=99507877;WS=99507859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr10	99509457	rs946778	T	G	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=19;PP=555;SC=CTTCCACAAGTGCAACACCAC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=99509465;WS=99509447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	99509969	rs3750615	T	C	1312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=0;PP=1088;SC=GTTAGGAGGGTGACTCTTTCC;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=35;WE=99509977;WS=99509959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	99510068	rs3750614	G	T	4421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=93;NR=46;PP=2965;SC=CTCCTACCTTGTTCTCCATTC;SOR=1.678;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=93;TCR=46;TR=139;WE=99510076;WS=99510058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr10	99510284	rs3829137	T	C	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=119;ReadPosRankSum=1.497;SC=CCCCCTGTTATCAGCTTGTTT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=8;WE=99510292;WS=99510274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr10	99512472	rs1538723	T	C	1159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=6;PP=824;SC=CGTCTGTCAATGTCACCATTT;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=99512480;WS=99512462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	99514645	rs7922907	A	G	2035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=55;PP=1607;SC=TTACAGATGAATAACCTGAGG;SOR=5.421;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=3;TCR=55;TR=58;WE=99514653;WS=99514635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	99516955	rs10882995	G	A	1585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=8;PP=1331;SC=ATTTAGAAGCGCCAGGAGCAG;SOR=3.126;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=49;WE=99516963;WS=99516945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	99517355	rs3750612	A	G	3809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=38;PP=2965;SC=AACTCCAGGTACCTGAGGGTG;SOR=1.630;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=74;TCR=38;TR=112;WE=99517363;WS=99517345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr10	99518810	rs1981238	C	T	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=494;SC=GGCATCATCACCCCCAGGATC;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=99518818;WS=99518801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	99518874	rs10882996	G	A	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=4;PP=1225;SC=AGCTGGGCAGGGAGGGTGTGG;SOR=4.271;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=45;WE=99518882;WS=99518864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	99518891	.	T	TG	670.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.261;HP=9;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.051;NF=19;NR=2;PP=541;ReadPosRankSum=-1.100;SC=GTGGGCTGGGTGGGGGGTCTG;SOR=1.075;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=59;TCF=46;TCR=13;TR=21;WE=99518909;WS=99518881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr10	99518901	rs12412543	G	C	2510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=16;PP=2014;SC=TGGGGGGTCTGTGTGGGGCAT;SOR=2.235;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=50;TCR=16;TR=66;WE=99518909;WS=99518881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	99519097	rs1981237	A	G	1854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=44;PP=1412;SC=CGTCCTTGGGACCAGCAGTAG;SOR=2.381;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=14;TCR=45;TR=58;WE=99519105;WS=99519087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr10	99531571	rs11815012	C	G	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.71;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	99625319	rs56007204	C	T	3400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=53;PP=2640;ReadPosRankSum=0.071;SC=CAGCTGGGCTCGCAGCTCTCC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=171;TCF=97;TCR=74;TR=122;WE=99625327;WS=99625309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,127:0.71:178
chr10	99639573	rs2297934	C	T	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.81;ReadPosRankSum=1.675;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr10	99642731	rs588061	C	T	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=475;ReadPosRankSum=-0.608;SC=AGCCCCCTCCCTTGTAAGACC;SOR=1.536;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=20;WE=99642739;WS=99642721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr10	99655648	rs577537	G	T	2161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.525;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=11;PP=1776;ReadPosRankSum=0.161;SC=GCACCTGATTGCCCCGGAAGA;SOR=1.215;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=89;TCR=15;TR=76;WE=99655656;WS=99655638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,76:0.72:106
chr10	99664456	rs7068503	T	C	863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=18;PP=727;ReadPosRankSum=1.075;SC=GGGTGCTCATTTGCAGATAGA;SOR=0.746;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=157;TCF=92;TCR=65;TR=44;WE=99664464;WS=99664446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,43:0.28:156
chr10	99682981	rs894375	T	C	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.042;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=1;PP=536;ReadPosRankSum=-1.255;SC=CTGGCTCTCATGTGGCTTCTC;SOR=1.670;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=69;TCF=63;TCR=6;TR=28;WE=99682989;WS=99682971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,27:0.39:70
chr10	99683270	rs2289554	G	A	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.759;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=369;ReadPosRankSum=1.158;SC=AGAGGAGGTTGGGTCATCTGC;SOR=1.005;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=80;TCF=6;TCR=74;TR=22;WE=99683278;WS=99683260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,25:0.29:86
chr10	99969568	rs11189513	A	G	1170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.329;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=800;ReadPosRankSum=1.252;SC=GAAACTTCTCACACAGAGGGA;SOR=0.564;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=158;TCF=61;TCR=97;TR=54;WE=99969576;WS=99969558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,57:0.35:162
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chr10	100003785	rs1359508	T	C	2030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.031;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=6;PP=1599;ReadPosRankSum=2.335;SC=GTAATTTGGATTAAGGGAAAG;SOR=2.174;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=113;TCF=97;TCR=16;TR=71;WE=100003793;WS=100003775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,73:0.61:119
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chr10	100144782	rs2296441	C	T	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=542;ReadPosRankSum=0.196;SC=ACGGGGCGGGCGAAGTAGAGC;SOR=0.311;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=37;WE=100144790;WS=100144772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,35:0.61:57
chr10	100146895	rs2296438	T	C	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=498;ReadPosRankSum=-0.628;SC=AGAGAGGTCATAGCCAGGAAG;SOR=1.675;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=22;WE=100146903;WS=100146885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr10	100147060	rs4345897	A	G	1788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.671;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=33;PP=1379;ReadPosRankSum=-1.313;SC=CGATGCAATCAAACACTGGGG;SOR=0.766;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=62;TCR=56;TR=70;WE=100147068;WS=100147050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,72:0.59:123
chr10	100147097	rs4400721	G	A	2045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.556;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=49;PP=1596;ReadPosRankSum=-1.415;SC=ATGAGATGGTGTTAGGAAGAA;SOR=0.903;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=121;TCF=49;TCR=72;TR=81;WE=100147105;WS=100147087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,81:0.66:123
chr10	100148004	rs2182169	T	C	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.035;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=271;ReadPosRankSum=-0.540;SC=CCCTTTGGAATGGCACCTGCA;SOR=3.258;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=14;WE=100148012;WS=100147994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr10	100148058	rs4539242	T	C	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.298;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=2;PP=688;ReadPosRankSum=0.602;SC=CAGGCCCAGTTGGGTCGCATG;SOR=1.802;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=30;WE=100148066;WS=100148048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,32:0.74:43
chr10	100148176	rs2147896	A	G	2093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=37;PP=1548;ReadPosRankSum=-0.146;SC=CGTATAGGGCATGTACTGAGT;SOR=0.664;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=68;TCR=52;TR=84;WE=100148184;WS=100148166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,86:0.70:123
chr10	100148308	rs2147895	T	G	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=32;PP=885;ReadPosRankSum=-0.755;SC=AGAGCAGCAGTGCGGAGGGTA;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=7;TCR=45;TR=37;WE=100148316;WS=100148298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,39:0.72:54
chr10	100148353	rs2182168	C	G	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=460;ReadPosRankSum=-1.454;SC=CAGTGGAGGCCCTGAGATGAC;SOR=0.473;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=21;WE=100148361;WS=100148343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr10	100152373	rs6584192	T	G	1441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.540;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=40;PP=1159;ReadPosRankSum=-1.610;SC=GGGAAATCCATGTTAGATCTT;SOR=0.385;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=77;TCF=16;TCR=61;TR=52;WE=100152381;WS=100152363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,52:0.67:78
chr10	100155296	rs11189591	T	G	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=591;ReadPosRankSum=0.251;SC=GCATGGAGGATGCTGAGACTT;SOR=1.308;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=28;WE=100155304;WS=100155286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,28:0.88:32
chr10	100157329	rs61159293	AC	A	928.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=30;PP=709;ReadPosRankSum=1.161;SC=ATGGCCTGTCACCCCCCCACA;SOR=1.009;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=30;WE=100157337;WS=100157319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,36:0.69:52
chr10	100157368	rs10786418	C	T	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=445;ReadPosRankSum=-0.823;SC=CCTCATTCCCCGCTGTGGCCC;SOR=1.002;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=20;WE=100157376;WS=100157358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr10	100167236	rs10883090	G	C	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=2.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.776;QD=25.78;ReadPosRankSum=0.982;SOR=1.888;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,30:0.60:50
chr10	100167239	rs10883091	C	T	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=2.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-0.718;QD=23.43;ReadPosRankSum=0.317;SOR=2.156;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,35:0.64:55
chr10	100167276	rs10883092	A	C	1442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.303;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=1;PP=1251;ReadPosRankSum=-0.422;SC=GACCCCCCACACAGGTTGGGA;SOR=2.470;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=81;TCF=77;TCR=4;TR=49;WE=100167284;WS=100167266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,51:0.61:84
chr10	100167322	rs11189595	C	T	2382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.571;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=13;PP=1941;ReadPosRankSum=-1.032;SC=GCAATCGGGCCGGCGGGGGGG;SOR=1.290;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=137;TCF=111;TCR=26;TR=83;WE=100167330;WS=100167312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,86:0.61:140
chr10	100167396	.	G	A	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MMLQ=24;MQ=59.92;NF=100;NR=73;PP=2962;QD=20;SC=GGTAGGACGCGCGGGAGAACT;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=269;TCF=156;TCR=113;TR=173;WE=100167404;WS=100167386;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:96,173:0.64:269
chr10	100167436	.	T	C	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=39;MMLQ=24;MQ=58.27;NF=74;NR=88;PP=2962;QD=20;SC=CGATGAAGACTGTCACCAGGG;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=256;TCF=116;TCR=140;TR=162;WE=100167444;WS=100167426;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:94,162:0.63:256
chr10	100167451	.	C	G	2827	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=39;MMLQ=28;MQ=56.99;NF=57;NR=72;PP=2827;QD=20;SC=CCAGGGGTCACCAGGGATGAG;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=210;TCF=89;TCR=121;TR=129;WE=100167459;WS=100167441;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:81,129:0.61:210
chr10	100167466	.	G	A	1961	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=45;MMLQ=27;MQ=53.08;NF=36;NR=59;PP=1961;QD=21.0081180268;SC=GATGAGGACCGTCACCAGGGG;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=175;TCF=67;TCR=108;TR=95;WE=100167474;WS=100167456;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:80,95:0.54:175
chr10	100167553	.	G	A	437	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=29;MQ=43.85;NF=11;NR=13;PP=437;QD=19.6571338561;SC=GATGGAGACCGTCACCCGGGG;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=72;TCF=28;TCR=44;TR=24;WE=100167561;WS=100167543;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:48,24:0.33:72
chr10	100167605	.	G	A	1867	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=58.4;NF=50;NR=32;PP=1867;QD=23.1923318603;SC=AGCAGGGATGGAGACTGTCAC;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=81;TCR=54;TR=82;WE=100167613;WS=100167595;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:53,82:0.61:135
chr10	100167860	rs942810	G	C	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.385;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=29;PP=804;ReadPosRankSum=2.187;SC=GCCAGTATGGGCCACACCCCA;SOR=1.609;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=55;TCF=9;TCR=46;TR=33;WE=100167868;WS=100167850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,33:0.60:55
chr10	100170507	rs7896828	A	T	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=6.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=1;PP=1419;ReadPosRankSum=-0.495;SC=TGTGATGTCCACAGCTGGCTG;SOR=0.776;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=78;TCF=77;TCR=1;TR=54;WE=100170515;WS=100170497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,52:0.69:75
chr10	100170762	rs3814140	C	T	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.002;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=38;PP=1050;ReadPosRankSum=0.079;SC=GGTCAGCGGGCGGGCAGACAG;SOR=0.861;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=17;TCR=65;TR=48;WE=100170770;WS=100170752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,49:0.58:84
chr10	100174721	rs2147900	T	C	3091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.625;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=26;PP=2394;ReadPosRankSum=0.387;SC=AGCAGGGCTGTCTTCCCGCCC;SOR=0.419;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=169;TCF=133;TCR=36;TR=111;WE=100174729;WS=100174711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,116:0.67:174
chr10	100182285	rs2296435	T	C	2889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.125;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=59;PP=2226;ReadPosRankSum=-0.329;SC=AGGTCTGAGTTAAGGTGCTTA;SOR=0.970;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=150;TCF=63;TCR=87;TR=100;WE=100182293;WS=100182275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,103:0.68:151
chr10	100183774	rs10883093	A	G	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=10;PP=289;SC=GGACCACCCCACTCTTGTACC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=100183782;WS=100183764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	100184062	rs2296433	CC	AG	2543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.878;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=29;PP=2751;ReadPosRankSum=0.723;SC=CTGAGGCCCACCACTCACTCC;SOR=0.554;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=77;TCF=40;TCR=37;TR=54;WE=100184071;WS=100184052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,62:0.75:83
chr10	100189138	rs1061135	A	G	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=2;PP=599;ReadPosRankSum=1.041;SC=GGTCTTAACAATCCTTGAGTT;SOR=0.818;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=27;WE=100189146;WS=100189128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,28:0.80:35
chr10	100190264	rs2296431	T	C	4114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=78;NR=55;PP=2965;SC=CCCACCATCTTCAGGCAGGTT;SOR=1.033;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=78;TCR=55;TR=133;WE=100190272;WS=100190254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr10	100190920	rs1801287	G	A	5086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.113;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=106;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.073;SC=TGGAGTGCACGAGCAGGAAGG;SOR=0.815;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=243;TCF=102;TCR=141;TR=180;WE=100190928;WS=100190910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,188:0.74:255
chr10	100193557	rs11593787	T	C	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.863;NF=21;NR=0;PP=343;ReadPosRankSum=2.152;SC=TGTTTTACCATGGGAAAGCCC;SOR=0.167;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=76;TCF=76;TCR=0;TR=21;WE=100193565;WS=100193547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,22:0.29:75
chr10	100193679	rs1886728	G	C	8428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.139;NF=136;NR=129;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.785;SC=GGTCTTAAAGGTGGACGCCCC;SOR=0.229;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=267;TCF=138;TCR=129;TR=265;WE=100193687;WS=100193669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,272:1.00:273
chr10	100194909	rs11594443	T	C	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.47;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr10	100195583	rs2296430	T	A	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.990;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=260;ReadPosRankSum=-0.169;SC=CACCAAGAACTAAGGAAGGGA;SOR=1.525;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=60;TCF=15;TCR=45;TR=17;WE=100195591;WS=100195573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,15:0.26:58
chr10	100242345	rs1932800	C	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.551;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=161;ReadPosRankSum=-0.552;SC=CCCCCTCCCTCAGCTCCTGCT;SOR=2.517;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=8;WE=100242353;WS=100242335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr10	100249773	.	C	T	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.709;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.254;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=7;PP=788;ReadPosRankSum=-0.220;SC=GGGAGCCCCTCAGGTGGCCTT;SOR=1.439;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=112;TCF=88;TCR=24;TR=41;WE=100249781;WS=100249763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,42:0.37:115
chr10	100250019	rs59184373	GACACACACAC	G	933.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=3000;SC=GAGTAAACATGACACACACAC;SOR=2.737;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=14;WE=100250036;WS=100250009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	100401745	rs693656	T	C	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.142;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=247;ReadPosRankSum=1.194;SC=AAGCAAGGGATTATAAATACA;SOR=0.140;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=12;WE=100401753;WS=100401735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr10	100481305	rs11189772	T	C	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=-1.006;SC=CCTCCTTTTTTCTTAAGACCA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=100481313;WS=100481295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr10	100991971	.	TACAC	T	599.94	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.66;MQRankSum=4.131;QD=37.50;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr10	100991976	.	A	G	678.82	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.74;MQRankSum=4.250;QD=39.93;ReadPosRankSum=1.024;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr10	100991979	.	C	T	651.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.71;MQRankSum=4.366;QD=36.21;ReadPosRankSum=0.677;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr10	101090428	rs2862600	T	G	2162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.326;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=29;PP=1658;ReadPosRankSum=0.454;SC=GCACCAAAGTTGTGGAGGAGG;SOR=0.260;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=111;TCF=73;TCR=38;TR=75;WE=101090436;WS=101090418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,78:0.68:115
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chr10	101128362	rs17568778	C	A	5341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.798;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=113;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.625;SC=ATCCTTGGCCCCTGACTCTTT;SOR=0.649;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=357;TCF=157;TCR=200;TR=201;WE=101128370;WS=101128352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,207:0.57:364
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chr10	101420283	.	GCA	G	179	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=18;MQ=59.43;NF=0;NR=7;PP=179;QD=26.0;SC=GAATGGATACGCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=7;WE=101420294;WS=101420273;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chr10	101439252	rs3740079	G	A	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=35;PP=939;ReadPosRankSum=1.554;SC=TTTGTTGTCAGTCTCTTTTAA;SOR=0.643;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=60;TCF=7;TCR=53;TR=40;WE=101439260;WS=101439242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,42:0.67:63
chr10	101462193	rs10748790	C	T	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.681;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=346;ReadPosRankSum=0.528;SC=TGTGGGAATACGGAGTGGCTT;SOR=2.115;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=17;WE=101462201;WS=101462183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr10	101473218	rs2231687	A	G	1289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=31;PP=1050;ReadPosRankSum=-0.212;SC=TTAAAAGTAAAGTTGAATAAG;SOR=0.864;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=17;TCR=44;TR=43;WE=101473226;WS=101473208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,44:0.72:61
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chr10	101492241	rs2231675	G	A	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=267;SC=CGTAGTCAGTGGTGATTTCTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=101492249;WS=101492231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	101542578	rs717620	C	T	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=601;ReadPosRankSum=-0.045;SC=GAAGAGTCTTCGTTCCAGACG;SOR=0.708;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=99;TCF=71;TCR=28;TR=33;WE=101542586;WS=101542568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,37:0.34:109
chr10	101544447	rs927344	A	T	3468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=91;NR=17;PP=2959;SC=CCCTTGGGCTACCTATGGCTC;SOR=3.279;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=92;TCR=17;TR=108;WE=101544455;WS=101544437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr10	101551902	rs2756108	C	T	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=490;SC=CTGCATACCGCTTTTCCTATC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=101551910;WS=101551892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	101553259	rs2804400	C	T	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=175;ReadPosRankSum=0.260;SC=CCCCTCAGTCCTCGGTTAGTG;SOR=0.653;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=11;WE=101553267;WS=101553249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr10	101563815	rs2273697	G	A	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.768;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=8;PP=905;ReadPosRankSum=-0.825;SC=GGAGTACACCGTTGGAGAAAC;SOR=2.368;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=42;WE=101563823;WS=101563805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,43:0.75:57
chr10	101571528	rs3740074	C	T	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.704;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=28;PP=756;ReadPosRankSum=-0.457;SC=AGCAAAGGTTCTCAGCCCCTT;SOR=3.026;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=29;WE=101571536;WS=101571518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,31:0.82:38
chr10	101576960	rs3740073	T	C	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=363;ReadPosRankSum=0.994;SC=CACAGTTATTTAAATTTAAGC;SOR=1.893;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=17;WE=101576968;WS=101576950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr10	101590020	rs11597282	G	A	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=206;ReadPosRankSum=0.091;SC=GGACTGACAGGGATCTATGCA;SOR=0.933;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=12;WE=101590028;WS=101590010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,11:0.27:41
chr10	101591944	rs4148396	T	C	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=558;ReadPosRankSum=0.469;SC=ATCTTTCTGATAGGGAGGAAT;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=23;WE=101591952;WS=101591934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr10	101603781	rs3740067	C	G	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.229;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=-1.139;SC=AGTTTCCTTTCCTCTAACTCA;SOR=0.039;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=6;WE=101603789;WS=101603771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr10	101604207	rs3740066	C	T	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.212;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=142;ReadPosRankSum=1.362;SC=CTTGTGACATCGGTAGCATGG;SOR=0.709;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=55;TCF=26;TCR=29;TR=13;WE=101604215;WS=101604197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,13:0.21:61
chr10	101636917	rs11190304	C	T	1571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.784;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=8;PP=1209;ReadPosRankSum=1.131;SC=CTCAGGTGTACTCGGTTTTGC;SOR=1.679;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=81;TCF=67;TCR=14;TR=56;WE=101636925;WS=101636907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,58:0.71:82
chr10	101639796	rs2255901	G	A	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.639;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=765;ReadPosRankSum=-0.783;SC=GCTGGGAGGTGGAGTCTGGGT;SOR=1.039;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=124;TCF=60;TCR=64;TR=44;WE=101639804;WS=101639786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,46:0.36:127
chr10	101639877	rs11190305	A	C	1087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.702;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=779;ReadPosRankSum=-0.384;SC=TTCCTTGGTCACATTCTTTTG;SOR=0.589;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=120;TCF=48;TCR=72;TR=43;WE=101639885;WS=101639867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,46:0.37:126
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chr10	101654696	rs3758394	T	C	1389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.787;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.777;NF=41;NR=22;PP=954;ReadPosRankSum=-0.656;SC=GTGATGTTGATGCTCACCCGG;SOR=0.932;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=170;TCF=102;TCR=68;TR=63;WE=101654704;WS=101654686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,65:0.37:176
chr10	101655982	rs3740058	G	A	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.825;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=474;ReadPosRankSum=0.383;SC=GCCCTGAAAAGCTGTCAAAGA;SOR=1.238;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=73;TCF=67;TCR=6;TR=24;WE=101655990;WS=101655972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,24:0.32:74
chr10	101657880	rs7919323	G	A	1414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.803;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=41;PP=1142;ReadPosRankSum=-0.751;SC=TAATGTTAACGTTGATTTCCT;SOR=1.023;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=165;TCF=62;TCR=103;TR=61;WE=101657888;WS=101657870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,61:0.35:174
chr10	101658585	rs3740057	T	C	1715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.994;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=58;PP=1422;ReadPosRankSum=-0.527;SC=GTTTCACATTTTTCTCAGAAC;SOR=0.896;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=152;TCF=17;TCR=135;TR=64;WE=101658593;WS=101658575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,64:0.41:158
chr10	101689378	rs7077718	G	C	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.823;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=200;ReadPosRankSum=-0.296;SC=GGGTTTTCTTGCTGTTTTGCA;SOR=0.021;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=11;WE=101689386;WS=101689368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr10	101690379	rs10883428	A	G	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.516;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=35;PP=1157;ReadPosRankSum=2.071;SC=CTGGGATCCAAGTCATTTTCT;SOR=1.094;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=184;TCF=85;TCR=99;TR=61;WE=101690387;WS=101690369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,63:0.33:189
chr10	101690637	rs7085955	C	G	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=103;ReadPosRankSum=1.036;SC=TGTCTCCCAACCATTCCAGAC;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=7;WE=101690645;WS=101690627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr10	101715899	rs2862923	G	A	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=648;ReadPosRankSum=-2.239;SC=GAAGAAGGTCGGGGTACTGTT;SOR=0.608;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=94;TCF=41;TCR=53;TR=35;WE=101715907;WS=101715889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,35:0.36:97
chr10	101731631	.	A	G	65	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=13;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=15;MQ=58.79;NF=6;NR=1;PP=65;QD=14.2530303639;SC=TTTTTTTTTTAAGACAGGGTC;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=7;WE=101731639;WS=101731621;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr10	101823543	rs4462272	T	C	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=212;ReadPosRankSum=2.069;SC=GCAATGCTCCTACTCACAACT;SOR=0.350;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=12;WE=101823551;WS=101823533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr10	101825160	rs3829161	C	G	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.449;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=30;PP=578;ReadPosRankSum=-1.637;SC=CGGTGAAGGGCCAACTGGGGC;SOR=1.040;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=94;TCF=13;TCR=81;TR=34;WE=101825168;WS=101825150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,34:0.34:99
chr10	101841153	rs10883439	A	G	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.15;ReadPosRankSum=-0.908;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr10	101912064	rs2862954	T	C	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.844;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=421;ReadPosRankSum=-0.622;SC=TTAGAAGCAATGGCCTGGTAC;SOR=0.996;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=89;TCF=37;TCR=52;TR=28;WE=101912072;WS=101912054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,30:0.32:94
chr10	101912194	rs1408579	C	T	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=110;ReadPosRankSum=0.997;SC=TCACCTATTGCTCTCCTGAGT;SOR=0.922;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=7;WE=101912202;WS=101912184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr10	101953705	rs11597086	A	C	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=177;ReadPosRankSum=0.601;SC=ATAGCAACTCAATGTCACATT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=11;WE=101953713;WS=101953695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,13:0.32:40
chr10	101967212	rs7909855	C	G	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.59;ReadPosRankSum=-0.499;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,7:0.20:35
chr10	101977883	rs2230804	C	T	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=34;PP=724;ReadPosRankSum=0.272;SC=GGTTCTACTACTAAACTAGAA;SOR=0.622;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=21;TCR=91;TR=42;WE=101977891;WS=101977873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,44:0.37:120
chr10	101980459	rs986266	A	G	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=38;PP=1154;SC=AATATACTTTAAAGTAACAGA;SOR=6.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=39;WE=101980467;WS=101980449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr10	101995552	.	CAAT	C	839.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.800;NF=2;NR=19;PP=903;ReadPosRankSum=0.775;SC=TGAGGATGTCCAATAATGCTT;SOR=0.527;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=21;WE=101995562;WS=101995542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr10	102006429	rs4919438	T	C	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=138;ReadPosRankSum=-0.585;SC=TTTCTAAACATCATCATGATT;SOR=0.119;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=9;WE=102006437;WS=102006419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,10:0.25:40
chr10	102016268	rs2270961	G	A	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.697;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=28;PP=586;ReadPosRankSum=0.465;SC=ATTTTAGTCAGAATTGCAGAA;SOR=0.133;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=112;TCF=10;TCR=102;TR=33;WE=102016276;WS=102016258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,34:0.29:116
chr10	102027407	rs12784396	C	T	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.530;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=340;ReadPosRankSum=0.580;SC=CGAATCCGCGCTCCCCGGAAA;SOR=1.130;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=65;TCF=34;TCR=31;TR=21;WE=102027415;WS=102027397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,23:0.33:69
chr10	102054452	rs11597005	A	G	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.613;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=41;PP=1116;ReadPosRankSum=-0.418;SC=AGCCTAACAAACACCCCCCAT;SOR=0.472;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=188;TCF=63;TCR=125;TR=67;WE=102054460;WS=102054442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,70:0.36:192
chr10	102088906	rs3829159	C	T	2456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.290;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=17;PP=1910;ReadPosRankSum=-0.065;SC=AATGTTTATACATATAGTGCA;SOR=0.198;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=114;TCF=95;TCR=19;TR=86;WE=102088914;WS=102088896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,89:0.77:116
chr10	102089174	rs574122	C	A	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=66;ReadPosRankSum=-1.831;SC=AGCCCCTTTCCACCCCTGCCC;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=6;WE=102089182;WS=102089164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
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chr10	102262136	.	C	G	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.172;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.008;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=612;ReadPosRankSum=-1.509;SC=ATCAGGAATTCAGATTCTGTG;SOR=0.506;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=82;TCF=37;TCR=45;TR=32;WE=102262144;WS=102262126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,33:0.40:83
chr10	102265056	rs140191147	AAC	A	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQRankSum=0.779;QD=2.46;ReadPosRankSum=1.319;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
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chr10	102295836	rs2295778	C	G	2221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=50;PP=1801;ReadPosRankSum=1.380;SC=CCCGACTAGGCCCATTCCGCG;SOR=0.624;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=115;TCF=43;TCR=72;TR=82;WE=102295844;WS=102295826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,83:0.72:116
chr10	102307921	rs11190609	A	G	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.243;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=593;ReadPosRankSum=0.036;SC=GCCTCCTGCCAGGTGACTGCT;SOR=0.436;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=83;TCF=18;TCR=65;TR=32;WE=102307929;WS=102307911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,33:0.39:85
chr10	102505875	.	G	C	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.342;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.04;ReadPosRankSum=-1.415;SOR=0.957;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,18:0.28:64
chr10	102506070	rs4472867	G	C	1818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.963;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=52;PP=1268;ReadPosRankSum=-0.140;SC=CGTGAGTACCGGCGCCCGGCT;SOR=0.609;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=299;TCF=124;TCR=175;TR=92;WE=102506078;WS=102506060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,94:0.31:304
chr10	102672718	rs3802724	T	C	2699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=36;PP=2157;ReadPosRankSum=-0.283;SC=CACGCCGGAGTCACTTCCGAA;SOR=0.648;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=169;TCF=109;TCR=60;TR=98;WE=102672726;WS=102672708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,100:0.58:171
chr10	102684380	rs10883563	C	A	1762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-8.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=42;PP=1338;ReadPosRankSum=0.903;SC=GGGAAAATTTCTGGGGGACCT;SOR=0.812;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=207;TCF=95;TCR=112;TR=77;WE=102684388;WS=102684370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,78:0.37:212
chr10	102689504	rs10786614	G	A	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.922;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=43;ReadPosRankSum=-0.021;SC=CTTAAAAAATGGTTTTCTTTG;SOR=0.180;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=4;WE=102689512;WS=102689494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr10	102705058	rs55950013	A	AT	146.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=170;ReadPosRankSum=0.091;SC=CTCCTAAAATATTTTTGTCTG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=102705066;WS=102705048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr10	102732813	rs41291460	A	C	5695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.709;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=108;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.356;SC=TCAACCTCAAAAGGCAGCAGA;SOR=0.743;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=321;TCF=158;TCR=163;TR=205;WE=102732821;WS=102732803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,212:0.64:333
chr10	102733407	rs41291462	C	A	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=973;ReadPosRankSum=-0.153;SC=TCCTCCCCTTCTTCCTCAATC;SOR=0.825;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=22;TCR=42;TR=47;WE=102733415;WS=102733397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,48:0.74:65
chr10	102734778	rs4919510	C	G	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=690;ReadPosRankSum=0.991;SC=TGGGACAGCTCCGTTTAAAAA;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=28;TCR=23;TR=31;WE=102734786;WS=102734768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr10	102738551	rs67813203	A	G	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.066;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=710;ReadPosRankSum=0.354;SC=CCTCAGAGTGAGGGAAAGGAA;SOR=2.030;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=30;WE=102738559;WS=102738541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,30:0.73:41
chr10	102739841	rs34389611	G	A	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.923;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=23;PP=945;ReadPosRankSum=0.268;SC=GGCAGGTGGTGGAGTCCCGAG;SOR=0.435;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=174;TCF=107;TCR=67;TR=51;WE=102739849;WS=102739831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,54:0.30:178
chr10	102740271	rs67692077	T	C	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.616;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=384;ReadPosRankSum=0.362;SC=GTATTAGGCCTCTTGCAGGGT;SOR=1.402;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=21;WE=102740279;WS=102740261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr10	102743494	rs41291464	G	A	1670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.985;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=43;PP=1328;ReadPosRankSum=0.917;SC=AGACGAGGGCGCCGACGGAAA;SOR=1.416;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=103;TCF=33;TCR=70;TR=61;WE=102743502;WS=102743484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,64:0.58:110
chr10	102744214	rs2295716	T	C	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=328;ReadPosRankSum=-0.902;SC=TCCTGTTCCATTCATCTGCCC;SOR=1.519;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=15;WE=102744222;WS=102744204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr10	102744376	rs11190780	T	C	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.815;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=419;ReadPosRankSum=0.864;SC=CATGCACACATGGAAGAATGT;SOR=1.118;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=120;TCF=64;TCR=56;TR=33;WE=102744384;WS=102744366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,33:0.27:121
chr10	102746503	rs2863095	C	T	3993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.084;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=73;PP=2943;ReadPosRankSum=-0.063;SC=ACTGTGCTTGCACCTGGGCTG;SOR=0.513;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=214;TCF=105;TCR=109;TR=151;WE=102746511;WS=102746493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,157:0.70:224
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chr10	102750621	.	CGT	TGC	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=32;NR=34;PP=2944;QD=20;SC=GTTGGGATGGCGTAGGATCGC;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=111;TCF=58;TCR=53;TR=66;WE=102750631;WS=102750611;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:45,66:0.59:111
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chr10	102750783	rs3740487	C	A	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=515;ReadPosRankSum=-0.127;SC=TGGCCTTTAGCGGAGCTCAAG;SOR=1.075;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=22;WE=102750791;WS=102750773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr10	102750851	rs3824783	G	A	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=207;ReadPosRankSum=-1.554;SC=AGCCTTAATCGTCTTGACTGT;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=10;WE=102750859;WS=102750841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr10	102764047	rs807029	C	T	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=526;ReadPosRankSum=0.236;SC=ACCCCCCTGCCCTCCCCACCA;SOR=0.465;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=23;WE=102764055;WS=102764037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr10	102766574	rs807024	A	G	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.540;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=547;ReadPosRankSum=-1.442;SC=TCCTCCTGGCAGAGAGTGATG;SOR=1.022;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=25;WE=102766582;WS=102766564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,26:0.70:37
chr10	102767155	rs14177	C	G	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.046;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=530;ReadPosRankSum=-0.634;SC=CCCAGAGGCTCTTGTTACTAC;SOR=2.437;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=20;WE=102767163;WS=102767145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr10	102770082	rs807023	T	G	4020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.923;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=70;PP=2962;ReadPosRankSum=1.438;SC=GCCACTGGGGTTCTTCATGGC;SOR=0.679;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=237;TCF=120;TCR=117;TR=148;WE=102770090;WS=102770072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,154:0.63:245
chr10	102770327	rs807022	A	G	1941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=5.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.278;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=47;PP=1644;ReadPosRankSum=2.821;SC=GGCTGCGGCTACGGCTCTGAG;SOR=1.908;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=86;TCF=29;TCR=57;TR=67;WE=102770335;WS=102770317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,67:0.64:104
chr10	102771573	rs807020	G	A	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=31;ReadPosRankSum=-0.523;SC=GCTCCGGGACGGAGGCAGCTC;SOR=0.748;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=72;TCF=22;TCR=50;TR=44;WE=102771581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,43:0.60:72
chr10	102780312	rs7075685	G	T	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=123;ReadPosRankSum=-0.337;SC=TCTTCAGAGAGCCGGGCCCCA;SOR=0.919;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=10;WE=102780320;WS=102780302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,10:0.26:39
chr10	102780638	rs1998249	A	C	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.444;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr10	102783678	rs6584410	T	C	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=561;ReadPosRankSum=-0.106;SC=CTGGGGGTTCTGCTTACCTGC;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=62;TCR=54;TR=40;WE=102783686;WS=102783668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,41:0.33:123
chr10	102792295	rs807014	G	A	3686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=60;PP=2869;SC=CAGAGAAGGAGGCCTGCCTTG;SOR=0.965;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=49;TCR=60;TR=109;WE=102792303;WS=102792285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr10	102796774	rs2275383	C	T	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.618;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=208;ReadPosRankSum=-0.434;SC=GCTGCTCATTCGGGCATTGCA;SOR=0.298;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=11;WE=102796782;WS=102796764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr10	102797259	rs2275382	C	T	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.517;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=134;ReadPosRankSum=-1.638;SC=CCAACTCTCTCTCCAGCCTCG;SOR=0.150;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=11;WE=102797267;WS=102797249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,11:0.26:42
chr10	102824349	rs807037	G	C	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.293;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=247;ReadPosRankSum=-1.758;SC=CGCTGCCTTGGCCGCAATGCC;SOR=0.908;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=62;TCF=15;TCR=47;TR=16;WE=102824357;WS=102824339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,17:0.27:64
chr10	102893840	rs12415670	G	A	1780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.467;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=10;PP=1396;ReadPosRankSum=0.216;SC=TTGGGCCTGGGACGCTTCCTG;SOR=0.028;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=91;TCF=81;TCR=10;TR=63;WE=102893848;WS=102893830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,65:0.69:94
chr10	102997581	rs678741	G	A	1832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.757;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=5;PP=1517;ReadPosRankSum=-1.698;SC=GCCTGTGTTGGGACCTAAGGA;SOR=0.116;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=86;TCF=81;TCR=5;TR=62;WE=102997589;WS=102997571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,64:0.74:87
chr10	103221870	rs5787432	CAGG	C	4002.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=43;PP=2969;SC=AAACAAAAGACAGGAGGAAAC;SOR=1.166;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=73;TCF=23;TCR=50;TR=66;WE=103221880;WS=103221860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr10	103281308	rs9419923	A	G	1739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=0;PP=1430;ReadPosRankSum=0.236;SC=ATGTAGACATAATATAGCATG;SOR=1.725;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=81;TCF=81;TCR=0;TR=56;WE=103281316;WS=103281298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,57:0.69:83
chr10	103281722	rs9420854	C	G	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.719;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=132;ReadPosRankSum=1.239;SC=TCTTTATTGGCTTGATTTTTA;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=103281730;WS=103281712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr10	103291249	rs9420859	T	C	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.563;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=684;ReadPosRankSum=-1.422;SC=AATCCCAGCATTTTTGGAGGC;SOR=3.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=27;WE=103291257;WS=103291239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,26:0.72:36
chr10	103292661	.	A	G	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.881;ClippingRankSum=0.000;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.447;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=15;PP=826;ReadPosRankSum=-1.270;SC=AAGTCTCCACAGCACCCCATC;SOR=0.522;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=187;TCF=145;TCR=42;TR=63;WE=103292669;WS=103292651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,65:0.33:195
chr10	103294744	.	A	G	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=100;ReadPosRankSum=-1.153;SC=GGGCAATTTCATATTTAAACG;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=8;WE=103294752;WS=103294734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr10	103542959	rs935445	CC	GG	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.589;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=731;ReadPosRankSum=1.425;SC=TTGAAACCCTCCGCATTCCCG;SOR=0.365;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=52;TCR=19;TR=18;WE=103542968;WS=103542949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,18:0.25:73
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chr10	103550604	rs1124714	T	C	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=2.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.47;ReadPosRankSum=-0.112;SOR=0.208;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
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chr10	103588734	rs1562364	A	G	1711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.222;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=9;PP=1257;ReadPosRankSum=0.988;SC=CCTTCCGCCCACACCTCAAGC;SOR=1.106;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=103;TCF=89;TCR=14;TR=70;WE=103588742;WS=103588724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,72:0.70:103
chr10	103599325	rs874885	A	T	778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=590;ReadPosRankSum=-0.219;SC=CCTCCTGCTCAGTAAGGAGGC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=25;WE=103599333;WS=103599315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,27:0.64:42
chr10	103609704	rs7918620	G	T	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.975;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=28;PP=616;ReadPosRankSum=-1.091;SC=CCACAACCCTGAGCCCCATTC;SOR=0.087;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=31;WE=103609712;WS=103609694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr10	103717493	rs376923161	T	TA	294.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.68;MQRankSum=1.757;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.460;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr10	103799758	rs11191190	C	T	2386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.690;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=34;PP=1785;ReadPosRankSum=0.136;SC=ACAACAAGGCCGCAGGCCTTA;SOR=0.624;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=123;TCF=76;TCR=47;TR=85;WE=103799766;WS=103799748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,88:0.66:133
chr10	103869633	rs78325172	C	T	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=248;ReadPosRankSum=1.869;SC=CACCCTTCCCCCGCCTGCCTT;SOR=0.499;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=11;WE=103869641;WS=103869623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,11:0.24:45
chr10	103904763	rs11357964	TC	T	576.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=7.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQRankSum=2.470;QD=6.27;ReadPosRankSum=-1.001;SOR=1.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,31:0.34:92
chr10	103908080	rs3740405	G	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.872;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=1.217;SC=GATAAGCAGAGTATACCTGAA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=5;WE=103908088;WS=103908070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr10	103908944	rs61756437	C	T	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.267;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=465;ReadPosRankSum=1.336;SC=GGGACAACTACGGCTTCGTCA;SOR=0.450;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=21;WE=103908952;WS=103908934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr10	103991381	rs2281983	G	A	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.511;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=10;PP=926;ReadPosRankSum=1.622;SC=TCCACACGGCGATCTCCTCGC;SOR=0.287;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=40;WE=103991389;WS=103991371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,41:0.69:59
chr10	104121792	.	A	ATTTTC	80.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.066;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=0.849;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.491;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr10	104122842	rs1890060	A	G	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=103;ReadPosRankSum=-1.297;SC=AGAGAATCTAATGCTTGGCTG;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=6;WE=104122850;WS=104122832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr10	104127171	rs2273555	G	A	3038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.643;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=28;PP=2369;ReadPosRankSum=-0.447;SC=TGAAAACCCAGGAGTTCCTTA;SOR=0.395;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=154;TCF=115;TCR=39;TR=104;WE=104127179;WS=104127161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,108:0.68:160
chr10	104128954	rs7902882	T	A	1971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=17;PP=1482;SC=GTCTGTTCTCTTCCTCTTTTC;SOR=1.999;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=63;TCF=46;TCR=17;TR=62;WE=104128962;WS=104128944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr10	104136469	rs2180707	T	C	5217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=119;PP=2965;SC=TGTCCTTCATTGTGCGTGATG;SOR=1.762;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=171;TCF=52;TCR=119;TR=171;WE=104136477;WS=104136459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr10	104157711	rs7897947	T	G	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=381;ReadPosRankSum=-0.023;SC=TTGCATCATCTCAACTAATCC;SOR=0.386;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=26;WE=104157719;WS=104157701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr10	104157727	rs4919632	C	T	1774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=17;PP=1377;SC=AATCCATATCCCACTCCATAG;SOR=1.692;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=55;WE=104157735;WS=104157717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	104159196	rs4919633	A	G	1435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=11;PP=1111;SC=CCGCGGAGCCAAGCGCCCCCT;SOR=2.256;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=45;WE=104159204;WS=104159186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	104159696	rs11574849	G	A	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.019;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=447;ReadPosRankSum=0.810;SC=GCTGCGAAACGTTAAGTGCAG;SOR=0.303;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=61;TCF=57;TCR=4;TR=23;WE=104159704;WS=104159686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,23:0.38:61
chr10	104160434	rs4919634	A	G	2099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=43;PP=1611;SC=TACACCTGGCAGTCCGAGCCC;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=68;WE=104160442;WS=104160424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr10	104161724	rs41287457	A	G	1951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.722;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=30;PP=1575;ReadPosRankSum=0.423;SC=TCCCGATCTGAGTCCAGGTGC;SOR=1.121;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=226;TCF=129;TCR=97;TR=77;WE=104161732;WS=104161714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,81:0.34:235
chr10	104161967	rs7077329	T	C	8216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=142;PP=2965;SC=GCCGGAGGCCTGAGGCTTTGA;SOR=0.743;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=277;TCF=135;TCR=142;TR=277;WE=104161975;WS=104161957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
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chr10	104164488	rs41287460	G	A	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.647;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=32;PP=854;ReadPosRankSum=1.053;SC=CAGGCTCCTGGGGAGAAAGCA;SOR=1.057;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=137;TCF=40;TCR=97;TR=43;WE=104164496;WS=104164478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,45:0.32:140
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chr10	104214080	rs148334455	CT	C	1734.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.53;QD=24.09;SOR=6.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr10	104215075	rs151146512	CTCTT	C	360.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=5.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=0.392;QD=8.20;ReadPosRankSum=0.301;SOR=1.588;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,12:0.27:44
chr10	104229057	rs35597970	C	CA	86.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=134;ReadPosRankSum=-0.869;SC=CCCACCCAGTCAGAGGCCTGG;SOR=0.117;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=5;WE=104229065;WS=104229047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr10	104229785	rs41306870	C	T	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.185;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=19;PP=841;ReadPosRankSum=0.686;SC=TCAATGACCCCCTCTTCGGTT;SOR=0.514;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=109;TCR=58;TR=54;WE=104229793;WS=104229775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,53:0.31:170
chr10	104230930	rs68007409	TTCGGTGCTGGG	T	1168.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.57;ReadPosRankSum=-0.289;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,33:0.35:93
chr10	104231054	rs11191295	A	G	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=192;ReadPosRankSum=-0.029;SC=AGCTGCTTGTAGGCAGTGAGG;SOR=0.698;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=15;WE=104231062;WS=104231044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,15:0.25:59
chr10	104231234	rs913028	T	C	294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=212;SC=GCTGGGAACTTGGCCACGCAT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=104231242;WS=104231224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	104231651	rs7081110	A	G	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.52;ReadPosRankSum=-0.954;SOR=0.050;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr10	104231662	rs7081467	G	C	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.441;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=25;ReadPosRankSum=0.148;SC=TGTGATCTTAGGCAGGTCTCA;SOR=0.033;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=4;WE=104231670;WS=104231652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr10	104232716	rs3740415	G	A	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.627;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=35;PP=799;ReadPosRankSum=-0.540;SC=GGGTGAGTGTGGACCTTGGGT;SOR=1.104;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=160;TCF=44;TCR=116;TR=45;WE=104232724;WS=104232706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,45:0.28:162
chr10	104232809	rs3740414	T	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=111;ReadPosRankSum=-1.008;SC=GGTCTCCATTTCCCGACCCAG;SOR=0.389;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=10;WE=104232817;WS=104232799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,10:0.24:41
chr10	104240498	rs12162	A	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.148;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=39;ReadPosRankSum=0.040;SC=TCGCATGTGCACACACACTCA;SOR=0.941;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=5;WE=104240506;WS=104240491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr10	104240974	rs2296578	C	G	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.504;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=24;PP=592;ReadPosRankSum=0.137;SC=CCAGCCCTCCCGCTCCCTTTC;SOR=1.863;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=30;WE=104240982;WS=104240964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr10	104241983	rs12763720	T	C	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=444;ReadPosRankSum=-2.425;SC=CCAAGGTCCCTTTGGGAGTGG;SOR=0.604;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=89;TCF=33;TCR=56;TR=28;WE=104241991;WS=104241973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,29:0.32:90
chr10	104242886	rs2296581	G	A	2345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.615;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=49;PP=1769;ReadPosRankSum=0.066;SC=AGACAGTCAGGCTGGCAGGAA;SOR=0.409;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=125;TCF=47;TCR=78;TR=83;WE=104242894;WS=104242876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,87:0.68:128
chr10	104243883	rs7079810	C	T	1520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=8;PP=1308;ReadPosRankSum=-2.072;SC=TCCCAACCCCCACTCCATCCC;SOR=0.688;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=69;TCR=11;TR=57;WE=104243891;WS=104243873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,54:0.70:77
chr10	104244139	rs2296582	G	T	2552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.236;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=66;PP=1979;ReadPosRankSum=-0.269;SC=CGTAACTGAAGCAAAGGGGCA;SOR=0.998;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=154;TCF=46;TCR=108;TR=92;WE=104244147;WS=104244129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,94:0.61:154
chr10	104245549	rs2296585	C	T	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.561;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=472;ReadPosRankSum=-0.749;SC=CTTCATTAGTCTTAGGGGAGA;SOR=1.075;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=21;WE=104245557;WS=104245539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr10	104245575	rs2296586	G	A	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.078;HP=1;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=784;ReadPosRankSum=0.508;SC=CTGCCTTGCTGGTTTGAGAGC;SOR=0.141;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=14;WE=104245596;WS=104245565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr10	104245588	rs2296587	G	A	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.528;HP=3;HapScore=4;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=784;ReadPosRankSum=0.461;SC=TTGAGAGCCCGGGGACTTCAG;SOR=0.116;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=15;WE=104245596;WS=104245565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr10	104248087	rs2296588	T	C	1629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.810;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=38;PP=1369;ReadPosRankSum=0.824;SC=CAGGACCCTGTTCTCCCAAGA;SOR=0.458;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=96;TCF=29;TCR=67;TR=58;WE=104248095;WS=104248077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,59:0.60:99
chr10	104248106	rs2296589	T	A	1380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.410;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=34;PP=1120;ReadPosRankSum=1.115;SC=GACTAAGCAGTGCAAGCTGAA;SOR=0.392;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=78;TCF=21;TCR=57;TR=49;WE=104248114;WS=104248096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,50:0.61:82
chr10	104250209	rs111446950	CT	C	655.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.678;NF=17;NR=3;PP=678;ReadPosRankSum=-1.340;SC=AACTGTTTTCCTTTGTTGACT;SOR=0.643;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=20;WE=104250217;WS=104250199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr10	104264107	rs2274351	C	T	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.786;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=30;PP=676;ReadPosRankSum=0.552;SC=CTCTGGGCCGCGGGGAGACGG;SOR=1.038;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=103;TCF=34;TCR=69;TR=41;WE=104264115;WS=104264097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,41:0.39:104
chr10	104268877	rs2281879	G	C	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=230;ReadPosRankSum=-0.078;SC=GCTTGACATTGTCTGATTTCC;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=10;WE=104268885;WS=104268867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr10	104356822	rs10786690	A	G	1766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=8;PP=1407;SC=CTGTAAGAGCAGTGGCTGAAA;SOR=3.647;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=53;TCR=8;TR=61;WE=104356830;WS=104356812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	104375258	rs2001389	G	A	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=523;ReadPosRankSum=-0.464;SC=CCCAGCAGGCGTCCTCCAGGG;SOR=0.735;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=24;WE=104375266;WS=104375248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr10	104378750	rs10786698	G	A	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.290;NF=17;NR=5;PP=397;ReadPosRankSum=1.170;SC=GTTCAAGCACGTTTTCCTGGG;SOR=0.638;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=22;WE=104378758;WS=104378740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr10	104387019	rs12414407	T	C	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.214;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=36;PP=1068;ReadPosRankSum=-1.101;SC=GTTTGACTTTTCCTGACAACA;SOR=0.245;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=180;TCF=46;TCR=134;TR=56;WE=104387027;WS=104387009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,56:0.31:183
chr10	104389932	rs4917980	T	G	1164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=31;PP=1018;SC=GGCCCTGCAGTGGCCAGCAGG;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=35;WE=104389940;WS=104389922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	104414221	rs3850699	A	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=73;ReadPosRankSum=0.190;SC=ATAAATATGCATGGGAAGCTA;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=7;WE=104414229;WS=104414211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr10	104415093	rs34032774	CT	C	694.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=788;ReadPosRankSum=-0.034;SC=CAGGACCAGGCTGGTGGCACC;SOR=0.718;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=57;TCF=7;TCR=50;TR=22;WE=104415101;WS=104415083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,23:0.35:66
chr10	104415720	rs4274160	T	C	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=4;PP=1067;SC=TGGCCACCCCTACCCCTGCCA;SOR=4.021;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=39;WE=104415728;WS=104415718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	104415810	rs3217079	GCTCTCCCTGGA	G	1396.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=1.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.46;MQRankSum=4.385;QD=8.73;ReadPosRankSum=0.022;SOR=0.927;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,44:0.28:160
chr10	104445545	rs3832710	AG	A	332.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.121;NF=11;NR=1;PP=407;ReadPosRankSum=-0.109;SC=TCATGTTGCCAGGTGGCCAAG;SOR=0.616;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=12;WE=104445553;WS=104445535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr10	104449836	rs61869211	A	G	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.034;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=151;ReadPosRankSum=-1.655;SC=GGTGAGTCTCATCTCATTTAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=104449844;WS=104449826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr10	104459079	rs59504153	TAA	T	1807.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=6;PP=1646;SC=TCCATGTTTCTAACACATGGC;SOR=3.003;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=36;WE=104459088;WS=104459069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	104465374	rs12761195	T	C	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=0.872;SC=TTTTTCATTCTAATGCCACTT;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=6;WE=104465382;WS=104465364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr10	104473813	rs2248684	C	A	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=3;PP=811;SC=GCCTCGGACCCGCTGCAAGCC;SOR=3.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=104473821;WS=104473803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	104474046	rs71019606	CCCT	C	479.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=1.571;QD=9.59;ReadPosRankSum=1.822;SOR=0.809;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,15:0.30:50
chr10	104474107	rs2248679	G	A	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=27;PP=763;SC=CTGCGGCGCCGCCCCCGACGT;SOR=2.494;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=34;WE=104474115;WS=104474097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	104486304	rs2244647	G	C	1542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=1;PP=1248;SC=ACAGTGGGACGTGCTCAGGTC;SOR=6.316;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=45;WE=104486312;WS=104486294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr10	104487072	rs2244518	G	T	215.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=6;PP=176;SC=TTTAACCCTCGCAACAACCCT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=104487080;WS=104487062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	104489011	rs2244254	G	C	1584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=7;PP=1214;SC=CTTTCTCCCTGAAGCCCGTGG;SOR=2.985;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=42;WE=104489019;WS=104489001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	104492707	rs2778037	G	C	2795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=58;PP=2186;SC=CCCAGAGTGCGTCCAGCCACA;SOR=1.533;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=31;TCR=58;TR=89;WE=104492715;WS=104492697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr10	104493444	rs11191381	C	T	2937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.554;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=69;PP=2448;ReadPosRankSum=-0.751;SC=TGTTGGAGAACGTGTACTCCT;SOR=1.969;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=27;TCR=69;TR=95;WE=104493452;WS=104493434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,96:0.99:97
chr10	104536365	rs2254563	C	G	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=419;SC=CCACCGTGTTCTTAACCCTCT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=104536373;WS=104536355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	104572276	rs284861	A	G	1955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=17;PP=1542;SC=CAATGCAAATATTCAGTGGGA;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=43;TCR=17;TR=60;WE=104572284;WS=104572266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr10	104590836	.	AGGGAACCCTGATCTGAGGATGTAGCCTTATTATGG	A	1319	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=21;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=1319;QD=470.170023439;SC=GGCCCTGCCCAGGGAACCCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=3;WE=104590878;WS=104590826;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr10	104591152	rs10883783	T	A	999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=1;PP=781;SC=TCCGTATAGTTGGAGCCAAGA;SOR=5.549;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=30;WE=104591160;WS=104591147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	104592249	rs4919686	A	C	1494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=2;PP=1159;SC=GCTAGATGTCACTGGGAGGGC;SOR=5.330;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=41;WE=104592257;WS=104592239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	104595248	rs4919687	G	A	2857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=72;PP=2373;ReadPosRankSum=0.213;SC=GGAGAAGGCAGGTACCTGGCA;SOR=0.512;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=97;TCF=22;TCR=75;TR=94;WE=104595256;WS=104595238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,92:0.97:95
chr10	104596924	rs6163	C	A	1872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=19;PP=1568;SC=CCATACGAACCGAATAGATGG;SOR=1.571;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=58;WE=104596932;WS=104596914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr10	104596981	rs6162	G	A	2859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=31;PP=2438;SC=GCATATGGCCGTGTCTGGGGA;SOR=1.460;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=59;TCR=31;TR=90;WE=104596989;WS=104596971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr10	104597152	rs743572	A	G	2033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=52;PP=1686;SC=GATAGACAGCAGTGGAGTAGA;SOR=2.566;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=14;TCR=52;TR=66;WE=104597160;WS=104597142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr10	104629465	rs3740400	T	G	1943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=12;PP=1578;SC=TGTCCTCCCCTCACCCCTCGG;SOR=2.551;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=54;TCR=13;TR=65;WE=104629473;WS=104629455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr10	104629551	.	G	T	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.280;ClippingRankSum=0.000;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.663;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=18;PP=691;ReadPosRankSum=-0.963;SC=TAACTTTCCCGCTCCCGACAG;SOR=0.814;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=149;TCF=87;TCR=62;TR=44;WE=104629559;WS=104629541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,46:0.30:155
chr10	104629793	rs3832685	G	GCTC	1675.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.349;NF=24;NR=6;PP=1600;ReadPosRankSum=1.067;SC=TGCAGTCACAGCTCTTCTCCC;SOR=1.378;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=30;WE=104629801;WS=104629783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr10	104633053	rs17879781	A	ATTT	1744.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.476;NF=0;NR=32;PP=1556;ReadPosRankSum=-0.785;SC=TATTATTATTATTGAGATGGA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=32;WE=104633061;WS=104633043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr10	104636855	rs3740392	T	C	2057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=62;PP=1634;ReadPosRankSum=-0.765;SC=AACTCCTTTCTGCTAATAGCC;SOR=3.202;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=6;TCR=63;TR=68;WE=104636863;WS=104636845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr10	104637992	rs10786719	A	G	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=1;PP=424;SC=TAGACCTTGGAGGGATGCTCA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=104638000;WS=104637984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	104650251	rs7085854	T	C	1960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=2;PP=1748;SC=TTTTCTTCTATTGAGACTAAA;SOR=5.960;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=61;TCF=59;TCR=2;TR=61;WE=104650259;WS=104650241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr10	104660256	rs10748835	G	A	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=472;SC=TCTCTGTTCTGTGTAAGTCAA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=104660264;WS=104660246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	104814162	rs2275271	T	C	5492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.025;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=126;PP=2965;ReadPosRankSum=1.266;SC=AGACAGACAGTGAGATGAAGG;SOR=1.624;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=54;TCR=126;TR=179;WE=104814170;WS=104814152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,193:0.99:194
chr10	104836047	rs943036	T	C	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=29;PP=696;SC=GTGAGTGCAGTGTGGCTGGAC;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=104836055;WS=104836037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	104836940	rs2296568	C	T	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=28;PP=845;SC=CCATCTAGGCCGCGCTGGCTG;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=31;WE=104836948;WS=104836930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	104849444	.	C	T	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=3.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.81;ReadPosRankSum=-0.318;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr10	104849468	rs3740387	G	A	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=3;PP=578;SC=CATCATCTTCGTCATGGCAGT;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=104849476;WS=104849458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	104850620	rs34758128	A	C	3336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=8.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=31;PP=2686;ReadPosRankSum=1.181;SC=GCTAGTCTCTATAATAAATCA;SOR=0.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=110;TCR=46;TR=105;WE=104850640;WS=104850610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,110:0.67:164
chr10	104850632	rs3736922	G	A	6379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=126;NR=56;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.526;SC=AATAAATCAGGAATGTGAAAA;SOR=0.820;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=183;TCF=127;TCR=56;TR=182;WE=104850640;WS=104850610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,190:0.99:191
chr10	104851285	rs10883830	G	A	1087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=5;PP=871;SC=TGATTCCTGAGTAAGTTTTTG;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=104851293;WS=104851275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	104851396	rs11191553	G	T	1744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=26;PP=1404;SC=GGAAGGAAAAGGAAGACATTT;SOR=0.884;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=28;TCR=26;TR=54;WE=104851404;WS=104851386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	104855656	rs1926030	T	C	2541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=40;PP=2022;ReadPosRankSum=1.726;SC=AATGCATTCATTGTTATTAAA;SOR=0.233;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=83;TCF=42;TCR=41;TR=82;WE=104855678;WS=104855646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr10	104855670	rs1926029	G	A	2630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=47;PP=2121;SC=TATTAAAGCAGTGGTCTATTG;SOR=1.112;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=82;TCF=35;TCR=47;TR=82;WE=104855678;WS=104855646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr10	104857205	rs34202831	GA	G	1861.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=41;PP=2021;SC=TCAAATACTGGATTTCTGTCC;SOR=3.611;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=46;WE=104857226;WS=104857195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr10	104857218	rs10786737	A	C	1604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=42;PP=1308;SC=TTCTGTCCACAACAGGAATGG;SOR=4.362;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=46;WE=104857226;WS=104857195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr10	104857234	rs10883831	C	A	1196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=57;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=35;PP=936;SC=AATGGGGGAACCTTTTAAGGG;SOR=4.514;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=38;WE=104857242;WS=104857224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr10	104860395	rs2863727	T	G	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=1;PP=527;SC=AAATCTTGCCTGGCCTGGGAA;SOR=4.332;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=104860403;WS=104860385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	104864938	.	T	C	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=74;ReadPosRankSum=-1.732;SC=GTTTAAAATATTATTAGCACA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=104864946;WS=104864928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr10	104934709	rs10883841	T	C	7497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=160;PP=2965;SC=CTCCAGGAGGTTGACATTTTA;SOR=2.209;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=217;TCF=57;TCR=160;TR=217;WE=104934717;WS=104934699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr10	105144986	rs7069667	A	G	1032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=0;PP=882;SC=ATAGTCAAATATATATAAAAT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=29;WE=105144994;WS=105144976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr10	105254090	rs2986041	G	T	1652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=1;PP=1403;SC=GCACCTCAGCGCCTGCCCGGC;SOR=6.358;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=46;WE=105254098;WS=105254080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr10	105344756	rs2236209	T	C	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.188;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=633;ReadPosRankSum=-1.077;SC=CCGACCTGCCTTTCAGCCCTG;SOR=1.431;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=82;TCF=56;TCR=26;TR=33;WE=105344764;WS=105344746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,33:0.38:86
chr10	105349161	rs2236210	G	A	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=4;PP=618;ReadPosRankSum=-0.941;SC=TCTTGGCCCTGTGGCTGGGCT;SOR=0.608;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=105;TCF=95;TCR=10;TR=37;WE=105349169;WS=105349151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,35:0.33:105
chr10	105361816	rs4918031	T	G	5100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=77;PP=2965;SC=GGGACACGGGTATGCTGTTGC;SOR=0.731;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=78;TCR=77;TR=154;WE=105361824;WS=105361806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr10	105362179	rs3740473	G	A	4773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.877;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=84;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.135;SC=GTGCTTGGACGCGCCTCTCGA;SOR=0.645;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=249;TCF=127;TCR=122;TR=167;WE=105362187;WS=105362169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,180:0.67:268
chr10	105362209	rs4917396	T	C	8902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=129;NR=130;PP=2965;SC=GGCTGTCTGATTTGCCTTCGT;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=260;TCF=129;TCR=131;TR=259;WE=105362217;WS=105362199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr10	105362287	rs3740472	C	G	3475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.400;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=71;PP=2828;ReadPosRankSum=0.738;SC=CGTTCTCATCCAGCACCAAAT;SOR=0.762;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=234;TCF=119;TCR=115;TR=134;WE=105362295;WS=105362277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,134:0.56:240
chr10	105365386	rs7088714	A	G	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=0;PP=564;SC=AGTTTAGGCCATGGCACTGGC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=105365394;WS=105365376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	105428230	.	G	A	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=353;ReadPosRankSum=0.139;SC=ACAGCAAGTGGCAGACCCCCT;SOR=0.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=15;WE=105428238;WS=105428220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr10	105428453	rs10533306	CAG	C	4625.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.638;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=66;PP=2982;ReadPosRankSum=0.736;SC=AGAGGAGAACCAGAGAGAGAG;SOR=0.318;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=105;TCF=31;TCR=74;TR=92;WE=105428462;WS=105428443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,120:0.98:122
chr10	105614884	rs4918064	A	G	2752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=4;PP=2251;SC=TGGGAGGGGCAAGGGGCCATC;SOR=5.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=92;TCF=88;TCR=4;TR=92;WE=105614892;WS=105614874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr10	105615074	rs10883928	C	T	1915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.223;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=54;PP=1424;ReadPosRankSum=1.131;SC=CTTCTCATCCCGGCCGGGCTC;SOR=0.353;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=249;TCF=78;TCR=171;TR=86;WE=105615082;WS=105615064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,87:0.35:251
chr10	105615105	rs10883929	G	C	4745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=143;PP=2965;SC=TCCAGCTGCCGGGGTCCCGGG;SOR=3.206;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=172;TCF=29;TCR=143;TR=172;WE=105615113;WS=105615095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr10	105657316	rs10786775	G	C	1597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=4;PP=1292;SC=TTGGTCGGAGGAGGCACTGTG;SOR=4.450;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=42;TCR=4;TR=46;WE=105657324;WS=105657306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	105657363	rs11191853	C	G	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.775;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=11;PP=891;ReadPosRankSum=-1.195;SC=GCAAAGACTCCACCATTTCCA;SOR=1.276;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=89;TCF=67;TCR=22;TR=53;WE=105657371;WS=105657353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,55:0.59:93
chr10	105658588	rs2902639	G	C	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.112;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=241;ReadPosRankSum=0.216;SC=AGCTGCTTCAGTTTTCTGCCG;SOR=0.307;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=12;WE=105658596;WS=105658578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr10	105659826	rs2487999	T	C	2730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=39;PP=2157;SC=TTACAGTAAGTGGTGGCATGA;SOR=1.053;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=57;TCR=39;TR=96;WE=105659834;WS=105659816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr10	105727656	rs67597452	AAG	A	678.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.210;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.087;NF=0;NR=16;PP=528;ReadPosRankSum=-0.407;SC=TGTACAAGGTAAGAGGGGGAA;SOR=0.046;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=1;TCR=60;TR=16;WE=105727665;WS=105727646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,21:0.32:65
chr10	105752212	rs2487998	A	G	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=84;SC=TTTTGACAAAATCTTCGTTTA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=105752220;WS=105752202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	105752229	rs2476952	C	T	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=115;ReadPosRankSum=1.622;SC=TTTAGTATATCGTTTCCATAA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=105752237;WS=105752219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr10	105752503	rs2476953	C	T	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=161;ReadPosRankSum=3.087;SC=ATGTAAGTATCGAGTAAAGTT;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=8;WE=105752511;WS=105752493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr10	105759749	rs112226841	A	ATCTC	828.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.881;NF=2;NR=11;PP=712;ReadPosRankSum=-0.046;SC=TTATTTTAACATCTAAGAATG;SOR=0.784;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=13;WE=105759757;WS=105759739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr10	105762591	rs805657	G	A	3893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.810;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=93;PP=2962;ReadPosRankSum=1.013;SC=ATAGGAACATGTGAGGCAGCA;SOR=0.550;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=223;TCF=76;TCR=147;TR=144;WE=105762599;WS=105762581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,147:0.65:226
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chr10	105768158	rs805664	A	T	2708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=106;PP=2223;ReadPosRankSum=-0.652;SC=CTTTTTTTTTAAAAAAATTGT;SOR=4.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=4;TCR=109;TR=110;WE=105768166;WS=105768147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,100:0.98:102
chr10	105781532	rs10883961	C	T	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.060;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=35;PP=959;ReadPosRankSum=-0.359;SC=TGTGTGTACTCGTCCGTCTAC;SOR=0.890;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=146;TCF=62;TCR=84;TR=58;WE=105781540;WS=105781522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,62:0.39:159
chr10	105791929	rs805687	C	G	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=329;ReadPosRankSum=0.408;SC=CCTCTGGAGACCTTGGACCTA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=14;WE=105791937;WS=105791919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
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chr10	105792205	rs813943	A	C	3153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=76;PP=2578;SC=GCCCCATTTCAACACCAGCTT;SOR=3.009;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=16;TCR=76;TR=92;WE=105792213;WS=105792195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr10	105793173	rs1747675	T	G	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=348;SC=AGCAGGGATCTCCCAGTACCC;SOR=3.258;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=105793181;WS=105793163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	105796399	rs2274098	G	C	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=176;ReadPosRankSum=2.088;SC=CCCTGGAGAGGAGAGGATGCA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=10;WE=105796407;WS=105796389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr10	105796449	rs2476957	A	G	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=476;SC=CGCAGCCATGATCCAGCCACA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=105796457;WS=105796439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	105796738	rs805714	A	C	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.57;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=0;PP=25;SC=CAAGGTTTGCATGACGAGTGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=105796746;WS=105796728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr10	105796819	rs2476958	A	G	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=301;SC=GCACAGCCAGAATGTCTTCAG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=105796827;WS=105796809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	105797378	rs2282437	G	A	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=5.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=365;ReadPosRankSum=-1.188;SC=GGTGCAGGGCGTGGGGAAGGG;SOR=0.906;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=16;WE=105797386;WS=105797368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr10	105797693	rs61382109	TA	T	420.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=473;SC=GTCCTTCCCCTAAATTACAGA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=13;WE=105797701;WS=105797683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	105797989	rs200030951	TACACACACACACACACACAC	T	359.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=1.781;NF=8;NR=0;PP=735;ReadPosRankSum=-0.665;SC=TAGACACACATACACACACAC;SOR=0.507;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=8;WE=105798016;WS=105797979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr10	105798872	rs2274100	T	C	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=328;ReadPosRankSum=-1.536;SC=CTGGAACACCTGGATCACCTG;SOR=0.783;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=89;TCF=22;TCR=67;TR=26;WE=105798880;WS=105798862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,27:0.30:91
chr10	105799216	rs2296219	G	T	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=217;ReadPosRankSum=0.132;SC=TGTCACCTTTGGGTCCCTGGG;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=12;WE=105799224;WS=105799206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr10	105799524	.	CCA	C	343.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQRankSum=-1.608;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.831;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr10	105799552	.	ACG	A	639	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;MGOF=18;MMLQ=23;MQ=59.01;NF=13;NR=9;PP=639;QD=29.1818181818;SC=ACACACACACACGCACACGCA;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=22;WS=105799542;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:21,22:0.51:43
chr10	105799599	rs11191905	C	A	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=10.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.93;ReadPosRankSum=-0.747;SOR=0.103;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,14:0.23:61
chr10	105800321	rs12763538	C	T	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.950;HP=6;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.759;NF=0;NR=29;PP=557;ReadPosRankSum=0.537;SC=GATGAATGGGCGGGTGGGTGG;SOR=1.816;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=2;TCR=68;TR=29;WE=105800336;WS=105800311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
chr10	105800328	.	G	GTGGA	394.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.703;NF=0;NR=26;PP=1076;ReadPosRankSum=0.083;SC=GGGCGGGTGGGTGGATGGATG;SOR=0.317;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=0;TCR=60;TR=26;WE=105800336;WS=105800311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr10	105800348	rs139480552	ATGGATGGATAGG	A	271.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.324;NF=0;NR=27;PP=1545;ReadPosRankSum=1.215;SC=GGATGGATGGATGGATGGATA;SOR=0.746;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=27;WE=105800367;WS=105800338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr10	105801253	rs4918079	G	A	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.031;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=31;PP=729;ReadPosRankSum=1.274;SC=CTGGTGGCCCGCGTGGGCCGG;SOR=0.418;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=114;TCF=25;TCR=89;TR=42;WE=105801261;WS=105801243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,41:0.35:117
chr10	105803080	rs2147269	A	G	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=105;ReadPosRankSum=-0.684;SC=GTGAAGTAGGATAACTGATCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=6;WE=105803088;WS=105803070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr10	105805328	rs77584565	G	A	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=292;ReadPosRankSum=1.774;SC=TTTGGGGAGGGGTGGGGCTTG;SOR=0.892;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=13;WE=105805336;WS=105805318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr10	105805436	rs805720	G	A	2268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=18;PP=1827;SC=TGGCCAGAGAGAGGCCTCCTC;SOR=2.015;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=48;TCR=18;TR=66;WE=105805444;WS=105805426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr10	105805497	rs813944	C	T	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=2.060;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.41;ReadPosRankSum=-1.793;SOR=0.585;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,21:0.21:99
chr10	105806310	rs805721	C	A	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=1;PP=885;SC=CATTTCTACTCGAATGGTGTT;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=105806318;WS=105806300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	105809671	rs10883963	T	C	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=436;ReadPosRankSum=0.265;SC=TCTGGATACCTCCTTATCCTC;SOR=1.143;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=19;WE=105809679;WS=105809661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr10	105810400	rs805722	T	C	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=128;ReadPosRankSum=-0.053;SC=GGTGGTCCCATTGGTCCTTTG;SOR=0.551;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=9;WE=105810408;WS=105810390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr10	105811218	rs12260615	T	A	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.851;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.45;ReadPosRankSum=-0.034;SOR=0.825;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,26:0.21:125
chr10	105812630	rs182048038	G	A	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=191;ReadPosRankSum=0.582;SC=TATGCCCAGCGTCTCTGCAGG;SOR=0.236;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=12;WE=105812638;WS=105812620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr10	105812690	rs2274101	G	C	1719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.722;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=8;PP=1476;ReadPosRankSum=-0.539;SC=ATGAAGGAAGGGGGGAGAAAC;SOR=1.501;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=97;TCF=83;TCR=14;TR=63;WE=105812698;WS=105812680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,63:0.63:100
chr10	105813001	rs11191909	C	T	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=454;ReadPosRankSum=-0.614;SC=TCCCTGGCCTCCCTGCTTGCT;SOR=1.002;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=20;WE=105813009;WS=105812991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr10	105815201	rs201385541	G	GTC	49.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.84;ReadPosRankSum=2.586;SOR=0.757;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,9:0.15:59
chr10	105815202	.	T	TCA	279.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.000;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=0.850;QD=6.82;ReadPosRankSum=-0.803;SOR=1.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr10	105815241	rs1747677	A	C	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.946;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.078;NF=2;NR=21;PP=542;ReadPosRankSum=-1.371;SC=CACACACACAATAAGGGGATC;SOR=0.064;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=55;TCF=2;TCR=53;TR=23;WE=105815249;WS=105815231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr10	105816685	rs805696	T	C	270.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=2;PP=221;SC=GCAGTGGGGCTGGCCTGCCTC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=105816693;WS=105816675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	105816916	rs805698	C	T	2228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=34;PP=1822;SC=CCACTGCTGCCGTAGCTGTGG;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=39;TCR=34;TR=73;WE=105816924;WS=105816906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr10	105817043	rs805699	C	T	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=15;PP=427;SC=TGGGGGCTTTCAAGTTCCTGT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=105817051;WS=105817033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	105817891	rs11191910	G	A	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.798;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=7;PP=953;ReadPosRankSum=0.024;SC=CAGGGTTCGCGGTTCTCACCC;SOR=1.574;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=63;TCF=50;TCR=13;TR=42;WE=105817899;WS=105817881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,44:0.67:66
chr10	105821136	rs805704	A	T	1404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=18;PP=1108;SC=ACCAGCCTGAACCCTGGCAGC;SOR=1.154;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=24;TCR=18;TR=42;WE=105821144;WS=105821126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	105821294	rs805705	A	G	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=19;PP=595;SC=GAGAAGCCTGATCAGCCCTGG;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=105821302;WS=105821284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	105821836	rs805706	C	T	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=1;PP=739;SC=ACAGCCTTCCCTGTGTGCTTG;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=105821844;WS=105821826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	105837000	rs2274106	A	G	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=441;SC=GCTGCCCAATAGCTGTGTGTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=105837008;WS=105836990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	105882055	rs7901021	A	C	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5123;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=38;ReadPosRankSum=0.272;SC=GGGGAACTCAACCTCACCTTA;SOR=1.609;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=3;WE=105882063;WS=105882045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr10	105882765	rs10786783	A	G	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=175;ReadPosRankSum=0.483;SC=AGTCCGTCAGACTCAGCTGTG;SOR=0.632;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=11;WE=105882773;WS=105882755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,12:0.27:45
chr10	105883395	rs1338777	A	C	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=19;NR=6;PP=633;SC=AAATGGAAGGACTTTATTTCT;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=105883403;WS=105883385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	105901936	rs637022	G	A	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-5.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=189;ReadPosRankSum=1.101;SC=GAAGGGAGATGGCTGTAAAGC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=12;WE=105901944;WS=105901926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr10	105905380	rs141870801	TGAC	T	415.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.610;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=342;ReadPosRankSum=-1.564;SC=TTTTATTTGTTGACAATACTC;SOR=1.148;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=10;WE=105905390;WS=105905370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,14:0.24:59
chr10	105920990	rs36092125	G	GT	540.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=2.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.96;ReadPosRankSum=-0.017;SOR=0.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,32:0.29:109
chr10	105921085	rs605712	A	G	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=190;ReadPosRankSum=-0.403;SC=AAAATTTTACAACAGTTCTTC;SOR=0.352;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=11;WE=105921093;WS=105921075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr10	105922056	rs35188172	GT	G	2195.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.402;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.060;NF=37;NR=29;PP=2089;ReadPosRankSum=0.130;SC=TAGGACCTGTGTTAAGCAAAG;SOR=0.340;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=215;TCF=136;TCR=79;TR=66;WE=105922064;WS=105922046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,80:0.32:248
chr10	105932157	rs35761606	CT	C	253.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.225;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=278;ReadPosRankSum=0.047;SC=TTAAATTATACTTTTTCATAC;SOR=0.892;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=45;TCF=28;TCR=17;TR=11;WE=105932165;WS=105932147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,15:0.27:55
chr10	105938913	rs60561340	CAG	C	262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.005;NF=0;NR=11;PP=404;ReadPosRankSum=0.153;SC=AAATATCAGACAGAGAGAGAG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=11;WE=105938922;WS=105938903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr10	105939451	rs624159	C	A	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.598;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=2;PP=571;ReadPosRankSum=1.581;SC=ATTTGCTTTCCGAAAAGTTAC;SOR=1.497;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=59;TCF=52;TCR=7;TR=27;WE=105939459;WS=105939441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr10	105942304	rs569856	T	C	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=6.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=30;PP=659;ReadPosRankSum=2.020;SC=ACAGAGGCTATAAAAATCATA;SOR=0.535;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=97;TCF=10;TCR=87;TR=33;WE=105942312;WS=105942294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,34:0.34:99
chr10	105942337	rs569967	G	C	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=6.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=421;ReadPosRankSum=-1.679;SC=ACATTTAGCTGTATTATTTTC;SOR=0.242;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=0;TCR=64;TR=21;WE=105942345;WS=105942327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,22:0.34:65
chr10	105945985	rs479879	A	C	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=87;ReadPosRankSum=-1.067;SC=TGTAAATAAAATGATATGGCA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=6;WE=105945993;WS=105945975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr10	105956776	rs584309	A	G	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=256;ReadPosRankSum=-0.158;SC=CCAGTGTGCCAATGATTTAGT;SOR=0.714;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=16;WE=105956784;WS=105956766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr10	105957561	rs678292	G	A	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=63;ReadPosRankSum=-1.237;SC=TCTGCCTCCTGTTCGCATTGC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=105957569;WS=105957551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr10	105957613	rs677904	G	A	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=311;ReadPosRankSum=-1.237;SC=ACATATAAATGGGGATTTAAA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=15;WE=105957621;WS=105957603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr10	105967413	rs17824653	A	C	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.027;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=428;ReadPosRankSum=-0.445;SC=GAAGTAGGACAGTTTCTTACC;SOR=0.049;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=71;TCF=70;TCR=1;TR=23;WE=105967421;WS=105967403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,22:0.31:70
chr10	105991884	rs789577	T	G	2791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=38;PP=2052;SC=AGGAGGGGACTTGGGGCAGGA;SOR=1.145;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=56;TCR=38;TR=94;WE=105991892;WS=105991874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr10	106014764	rs144343542	CCGG	C	1042.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=24.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.890;SOR=3.279;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,30:0.33:90
chr10	106022789	rs4925	C	A	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=321;ReadPosRankSum=-0.147;SC=GAAGACTATGCTGGCCTAAAA;SOR=0.739;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=42;TCF=19;TCR=23;TR=16;WE=106022797;WS=106022779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr10	106028154	rs45596840	G	A	3476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FS=2.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.76;ReadPosRankSum=-1.657;SOR=0.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:222,101:0.31:323
chr10	106028157	rs641071	G	T	3359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FS=0.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.57;ReadPosRankSum=-1.152;SOR=0.655;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:221,97:0.31:318
chr10	106034491	rs2297235	A	G	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.093;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=115;ReadPosRankSum=0.097;SC=CCCAGGTTAAATTACCCTAGC;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=106034499;WS=106034481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr10	106037894	rs157077	T	C	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=154;ReadPosRankSum=-1.879;SC=ATTTAAAAAGTCACTCACACT;SOR=0.289;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=9;WE=106037902;WS=106037884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr10	106039185	rs156697	A	G	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.484;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=348;ReadPosRankSum=1.228;SC=AGAATGCACTAATCTGAAGGC;SOR=1.104;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=64;TCF=24;TCR=40;TR=17;WE=106039193;WS=106039175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,17:0.27:63
chr10	106039303	rs276203	A	G	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=0.350;SC=TGGTCACTCTAACACCAGCTT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=5;WE=106039311;WS=106039293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr10	106057295	rs182966519	A	G	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=426;ReadPosRankSum=-0.252;SC=ATGTCAGCAGATATATAAACT;SOR=0.749;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=20;WE=106057303;WS=106057285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr10	106116606	rs17754804	T	A	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.931;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=732;ReadPosRankSum=0.036;SC=ACTCATCTTGTGGATAAGCTG;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=64;TCF=29;TCR=35;TR=38;WE=106116614;WS=106116596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,40:0.59:68
chr10	106124660	rs12769756	G	T	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.037;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=36;PP=921;ReadPosRankSum=-0.201;SC=CTGCCATGGAGGGCAAGAAGA;SOR=1.699;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=54;TCF=6;TCR=48;TR=40;WE=106124668;WS=106124650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,40:0.71:56
chr10	106159305	rs10509772	G	A	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=30;PP=754;ReadPosRankSum=0.982;SC=AACAGACACGGGTATTTAATT;SOR=0.435;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=74;TCF=6;TCR=68;TR=33;WE=106159313;WS=106159295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,33:0.43:77
chr10	106160731	rs41317250	T	C	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=145;ReadPosRankSum=0.976;SC=CACTTCGTAGTCATGCTTGTT;SOR=0.465;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=8;WE=106160739;WS=106160721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr10	106163753	rs7087640	T	C	1243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=34;PP=1059;SC=AAATTGAGTTTTCTCAGAACC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=106163761;WS=106163743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	106214272	rs74741614	C	A	1818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.559;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=44;PP=1330;ReadPosRankSum=0.667;SC=CTCAGGTCAACCAAAATGACG;SOR=0.622;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=181;TCF=68;TCR=113;TR=72;WE=106214280;WS=106214262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,77:0.41:186
chr10	106602496	rs5787553	C	CT	617.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=527;ReadPosRankSum=0.541;SC=AGTAAGCTTCCTTTTTTCCCT;SOR=0.844;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=72;TCF=35;TCR=37;TR=23;WE=106602504;WS=106602486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,30:0.34:87
chr10	106675585	rs6584635	C	T	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.769;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=25;PP=1036;ReadPosRankSum=-0.112;SC=TCTCTTTTACCTGCAGGTCGA;SOR=0.412;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=178;TCF=110;TCR=68;TR=58;WE=106675593;WS=106675575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,61:0.34:180
chr10	106737026	rs61867171	T	C	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.40;ReadPosRankSum=-2.189;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr10	106849659	rs1574402	C	G	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=262;ReadPosRankSum=-0.089;SC=CTGTCCTCCCCCAATTTGCAT;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=13;WE=106849667;WS=106849649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr10	106907440	rs791125	C	T	3073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=30;PP=2392;SC=GGAACCAGAACGACACGTACA;SOR=1.832;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=66;TCR=30;TR=96;WE=106907448;WS=106907430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr10	106907586	rs791126	C	G	1640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=42;PP=1341;SC=TCCCTTGGGTCTGTCTCTCTT;SOR=3.486;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=7;TCR=42;TR=49;WE=106907594;WS=106907576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr10	106916819	rs2297500	G	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=126;ReadPosRankSum=0.685;SC=GAAATTCTGCGGCTTCTCTAA;SOR=0.193;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=9;WE=106916827;WS=106916809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr10	106917003	rs150165918	G	A	1814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.125;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=46;PP=1445;ReadPosRankSum=-2.002;SC=TGCAAGCTCCGGATGTGGACC;SOR=0.413;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=93;TCF=24;TCR=69;TR=65;WE=106917011;WS=106916993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,67:0.70:96
chr10	106970848	rs3214966	AG	A	655.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.725;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.244;NF=15;NR=3;PP=644;ReadPosRankSum=0.473;SC=CGGTTATTTTAGCGTTTGTAC;SOR=1.179;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=18;WE=106970856;WS=106970838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr10	106974123	rs113804925	A	AACACAC	1675.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=5;PP=1733;ReadPosRankSum=-0.678;SC=TTCCCTTTATAACACACACAC;SOR=0.804;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=94;TCF=73;TCR=21;TR=34;WE=106974131;WS=106974113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,43:0.51:85
chr10	106982814	rs3750260	G	A	1477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=6;PP=1202;ReadPosRankSum=-0.417;SC=ATCTAGGGGTGTGATACAGTT;SOR=0.684;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=78;TCR=9;TR=57;WE=106982822;WS=106982804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,57:0.64:89
chr10	108371571	rs137930414	A	AGTTT	3178.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=8;PP=2441;SC=CTGCTGGGTTAGTTTGTTTGT;SOR=3.675;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=69;TCF=50;TCR=19;TR=48;WE=108371579;WS=108371561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr10	108388923	rs1885351	T	C	1643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=9;PP=1258;ReadPosRankSum=0.468;SC=ACACAATATTTAAGATAGGTC;SOR=0.449;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=79;TCF=66;TCR=13;TR=52;WE=108388931;WS=108388913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,57:0.66:86
chr10	108389249	rs1322004	T	C	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=311;SC=TCAGGCATGATGGCAGCCCTG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=108389257;WS=108389239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	108427682	rs66783381	CA	C	566.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.57;QD=23.61;SOR=6.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	108439103	rs821929	A	C	1845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=45;PP=1287;SC=AGAAAGAGAAAGGTGCCATTA;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=12;TCR=45;TR=57;WE=108439111;WS=108439093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	108447836	rs821935	C	T	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=9;PP=1228;SC=CCCTTCCCCACTCCCTTTTGT;SOR=2.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=48;WE=108447844;WS=108447826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	108466412	rs2756231	C	T	3428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=80;PP=2734;SC=AAAAACAAGACTGTAAGAAGC;SOR=3.171;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=17;TCR=81;TR=97;WE=108466420;WS=108466402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr10	108469161	rs2756232	C	G	2136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=59;PP=1710;SC=CAGAGATTTACAGTCAGGGTG;SOR=4.648;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=5;TCR=59;TR=64;WE=108469169;WS=108469151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr10	111440633	rs115328964	G	A	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.031;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=628;ReadPosRankSum=-0.527;SC=GAGCAGCTAAGGCACCTGCAA;SOR=1.152;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=122;TCF=64;TCR=58;TR=35;WE=111440641;WS=111440623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,38:0.30:126
chr10	111625108	rs483072	T	C	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=28;PP=856;SC=TATTCACCACTACATCTTTAA;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=111625116;WS=111625098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	111631665	rs2274978	C	G	2273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=59;PP=1829;SC=GGACAGATGTCTAATCCTGTA;SOR=3.489;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=10;TCR=59;TR=69;WE=111631673;WS=111631655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr10	111631781	rs2274979	G	A	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=273;SC=GCCTGGCCACGGGACCAATTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=111631789;WS=111631771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	111637635	rs2273740	A	C	4204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.553;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=54;PP=2965;ReadPosRankSum=0.180;SC=CCTGTAACAGAAAGACAGAAA;SOR=0.127;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=140;TCF=86;TCR=54;TR=137;WE=111637643;WS=111637625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,139:0.98:142
chr10	111652610	rs3737153	A	G	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=2;PP=1097;ReadPosRankSum=1.340;SC=CTTGGGGAGCAGGGAAAGACT;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=48;TCF=46;TCR=2;TR=47;WE=111652618;WS=111652600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr10	111667664	rs944969	T	C	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=426;SC=AAGTGCCTTCTACGTTCTGCC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=111667672;WS=111667654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	111667702	rs686155	T	C	218.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=5;PP=147;SC=TTCAAATTGATCACTCCACCA;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=111667710;WS=111667692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	111683280	rs145751207	CGGCG	C	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=4;PP=211;SC=GCGCGAGAGCCGGCGGGCGGG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=111683291;WS=111683270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	111702434	rs148410039	T	C	2449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.664;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=40;PP=1840;ReadPosRankSum=-0.428;SC=GGCTGGACATTGTACCAGGCA;SOR=0.598;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=143;TCF=84;TCR=59;TR=95;WE=111702442;WS=111702424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,97:0.67:145
chr10	111706856	rs12569906	A	T	2138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=7;PP=1792;ReadPosRankSum=1.916;SC=TGTATTTCCTAAAGCATTCCT;SOR=2.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=61;TCR=7;TR=67;WE=111706864;WS=111706846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr10	111711658	rs12257668	C	T	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=2;PP=405;SC=ACCTGGGAGGCGGAGGTTGCA;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=19;WE=111711666;WS=111711648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	111872731	.	A	G	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=310;ReadPosRankSum=-0.125;SC=TTGGACCACTATACATCTCTA;SOR=0.380;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=16;WE=111872739;WS=111872721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr10	111878510	rs12268910	T	G	4598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=32;NR=111;PP=2965;SC=TCAATGAAAGTCCAAAACTGA;SOR=2.419;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=32;TCR=111;TR=143;WE=111878518;WS=111878500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr10	111886089	rs3731566	G	A	1230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=1;PP=1084;SC=GAAATGTCAAGTAGTAAGCTT;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=37;WE=111886097;WS=111886079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	111890362	rs13306109	C	A	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=33;PP=972;SC=ACCTGTAATCCCAGCACTTTG;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=111890370;WS=111890352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
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chr10	112044842	rs16448	TAAAAC	T	451.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=498;ReadPosRankSum=0.609;SC=GTCTCCTCTTTAAAACAAAAC;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=11;WE=112044854;WS=112044832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr10	112054908	rs7074311	C	A	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=285;ReadPosRankSum=0.813;SC=CAAAAAATCTCCATCTCTTTT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=12;WE=112054916;WS=112054898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr10	112266771	rs1889567	C	T	3211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.055;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=58;PP=2314;ReadPosRankSum=2.148;SC=CCTCGCCAACCTGCACATCAC;SOR=0.483;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=154;TCF=68;TCR=86;TR=108;WE=112266779;WS=112266761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,118:0.71:166
chr10	112266822	rs1889566	GC	AT	5087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.98;NF=35;NR=61;PP=2947;SC=CGAGGCCTGCGCGACCCACCT;SOR=1.356;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=101;TCF=36;TCR=65;TR=96;WE=112266831;WS=112266812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr10	112327678	rs55750861	C	CA	2698.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=58;PP=2420;SC=CGCAGCCTCTCCCCTGTCTCC;SOR=4.112;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=62;TCF=3;TCR=59;TR=60;WE=112327686;WS=112327668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	112328838	rs4917577	C	G	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=25;PP=664;SC=CTGTCCATTTCTATATTGGCT;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=112328846;WS=112328828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	112343329	rs79429105	A	G	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.145;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=377;ReadPosRankSum=-0.863;SC=GCTAAAAATGAAAGATGTGAA;SOR=0.978;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=24;WE=112343337;WS=112343319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,26:0.35:74
chr10	112349204	rs2419572	A	G	555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=440;SC=TTAAGACAATAAACACGTTTA;SOR=4.294;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=112349212;WS=112349194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	112349602	rs3737293	T	C	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=505;ReadPosRankSum=0.130;SC=TGTTAATGCATCCTCATATGT;SOR=0.765;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=23;WE=112349610;WS=112349592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr10	112356331	rs7075340	G	A	2464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=72;PP=2048;SC=TTTGTGCATAGTGATAGATAT;SOR=6.413;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=74;TCF=2;TCR=72;TR=74;WE=112356339;WS=112356321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr10	112357813	rs11195210	G	A	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=375;ReadPosRankSum=-0.097;SC=GAAAAGGAAGGGATACATGGT;SOR=0.356;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=18;WE=112357821;WS=112357803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr10	112361870	rs2419565	A	G	2295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=30;PP=1937;SC=GTTACAAATCAATCATGGAAC;SOR=1.194;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=46;TCR=30;TR=76;WE=112361878;WS=112361860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr10	112362019	rs2039874	G	T	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=23;PP=661;SC=TTTTAAAGCTGTTTTCCTCAT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=23;WE=112362027;WS=112362009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	112543217	rs6585012	G	A	768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=10;PP=604;SC=AGGCTCATGCGTAGGCTCAAC;SOR=1.220;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=26;WE=112543225;WS=112543207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	112544063	rs7898438	A	C	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.609;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=21;ReadPosRankSum=0.385;SC=TGTTTAACTTATTAAGGAGCC;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=3;WE=112544071;WS=112544053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr10	112544344	rs7073950	C	T	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=136;ReadPosRankSum=-0.433;SC=TGCATTGGGCCTGCTGTCTGG;SOR=0.941;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=7;WE=112544352;WS=112544334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr10	112544655	rs7077757	C	T	3275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=6.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.739;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=98;PP=2675;ReadPosRankSum=-0.815;SC=ACTGTGAGTACGGAAACATTT;SOR=0.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=173;TCF=34;TCR=139;TR=121;WE=112544663;WS=112544645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,119:0.68:175
chr10	112572458	rs1417635	G	C	6306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=112;PP=2965;SC=AAAGCCAAGTGGGACAAGTAT;SOR=0.811;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=213;TCF=100;TCR=113;TR=212;WE=112572466;WS=112572448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr10	112579663	rs11195343	C	T	172.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=137;SC=ATCTATAAAACGAAGATGCTG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=112579671;WS=112579656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	112580880	rs10787283	C	T	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=57;ReadPosRankSum=0.674;SC=GAGTTGGTGCCGTGGGACTTG;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=112580888;WS=112580870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr10	112590810	rs7070640	G	C	4060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=39;PP=2965;SC=ATCCCCCATCGTTTCCCAGGG;SOR=1.783;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=84;TCR=39;TR=123;WE=112590818;WS=112590800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr10	112595719	rs942077	G	C	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=30;PP=892;ReadPosRankSum=0.080;SC=GCCACGCTTCGAAAGGAAAAA;SOR=0.602;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=73;TCF=16;TCR=57;TR=38;WE=112595727;WS=112595709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
chr10	112641053	rs7081726	A	G	3071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=9;PP=2496;SC=GACTGAGGAAATAAAGAATGA;SOR=4.199;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=77;TCR=9;TR=86;WE=112641061;WS=112641043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr10	112764594	rs1980869	T	C	1014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=29;PP=853;SC=ATTGCTTTAATTGGTACTTCC;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=112764602;WS=112764584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	113913193	rs17129557	T	C	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=171;ReadPosRankSum=-0.319;SC=AGGAGATCACTTCGGGACAGG;SOR=0.132;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=9;WE=113913201;WS=113913183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr10	113913222	rs2297991	T	C	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=3;PP=951;SC=GACCCTGCGATGGCACCTTCA;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=37;WE=113913230;WS=113913212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
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chr10	113917085	rs2254537	T	A	6345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=129;PP=2965;SC=ACAAAGGTTCTGGAAGCTTCT;SOR=1.573;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=193;TCF=64;TCR=129;TR=193;WE=113917093;WS=113917075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr10	113917982	rs6585140	C	G	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=2.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.76;ReadPosRankSum=-0.345;SOR=1.281;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,9:0.21:43
chr10	113918232	rs17129561	G	A	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.543;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=554;ReadPosRankSum=-0.462;SC=GTACAAGGTAGCTGCCAAAGC;SOR=2.760;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=23;WE=113918240;WS=113918222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr10	113919598	rs3740148	C	T	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=417;ReadPosRankSum=-0.675;SC=AACAGAAAAACACGGGGGGTT;SOR=2.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=19;WE=113919606;WS=113919588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr10	113920465	rs2277207	G	A	1901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.057;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=42;PP=1480;ReadPosRankSum=1.181;SC=AAAACTCATCGTTCCTGCTAG;SOR=0.459;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=252;TCF=142;TCR=110;TR=84;WE=113920473;WS=113920455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,83:0.33:250
chr10	113920652	rs3824626	T	C	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-5.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.480;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=29;PP=422;ReadPosRankSum=0.130;SC=AACGGTATCATGATGGTGGAA;SOR=0.963;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=93;TCF=8;TCR=85;TR=31;WE=113920660;WS=113920642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,31:0.34:91
chr10	113921354	rs2250802	G	A	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=2;PP=704;SC=CTGCCCCTGAGTATGTATCTG;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=113921362;WS=113921344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	113923595	rs10736219	C	G	1514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=35;PP=1122;ReadPosRankSum=-0.711;SC=TTTCAAAAATCAACACACAAC;SOR=0.674;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=204;TCF=93;TCR=111;TR=65;WE=113923603;WS=113923585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,67:0.32:211
chr10	113926012	rs10749108	G	A	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=226;ReadPosRankSum=0.349;SC=AAAAATTTAGGCAACACCACC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=11;WE=113926020;WS=113926002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr10	113928487	rs2251579	A	C	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.870;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=222;ReadPosRankSum=-1.262;SC=TACCAAACTCAAGCAATAATC;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=12;WE=113928495;WS=113928477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr10	113932699	rs2792700	T	C	2180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.589;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=23;PP=1626;ReadPosRankSum=0.787;SC=GAGGGGAAAATGGGGTAATAG;SOR=0.243;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=140;TCF=109;TCR=31;TR=86;WE=113932707;WS=113932689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,86:0.61:142
chr10	113935379	rs10787428	T	C	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.396;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=311;ReadPosRankSum=0.912;SC=CAGCACATTTTCAGTCACATT;SOR=0.379;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=63;TCF=36;TCR=27;TR=18;WE=113935387;WS=113935369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,18:0.29:63
chr10	113937941	rs2487294	G	T	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=16;PP=497;SC=AAAATCTTAGGGAAGAAAAAA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=113937949;WS=113937931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	113940329	rs2792751	T	C	3615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=98;PP=2879;ReadPosRankSum=-0.889;SC=GATCTGAAGATGGTGGGTCTA;SOR=1.222;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=129;TCF=30;TCR=99;TR=128;WE=113940337;WS=113940319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,129:0.99:130
chr10	114059330	rs11279253	TCTCTGTTTTC	T	2216.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.729;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.263;NF=6;NR=30;PP=2979;ReadPosRankSum=0.524;SC=GGAGTAAGCGTCTCTGTTTTC;SOR=0.907;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=14;TCR=72;TR=36;WE=114059347;WS=114059320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,57:0.56:101
chr10	114061979	rs10749114	G	A	2122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=45;PP=1666;SC=CTTTGGCCCCGGCAAAACTTT;SOR=1.644;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=20;TCR=45;TR=65;WE=114061987;WS=114061969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	114136349	rs2277208	G	C	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.607;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=407;ReadPosRankSum=0.346;SC=ACATCATGCTGTCTCCCTCCT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=17;WE=114136357;WS=114136339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr10	114169552	rs7919710	G	A	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=164;ReadPosRankSum=2.126;SC=GGGGTGGCACGTGAGGAGTAG;SOR=0.540;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=9;WE=114169560;WS=114169542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr10	114171599	rs876873	T	C	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.600;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=627;ReadPosRankSum=-0.225;SC=AAAATCTCCATTGGAATTGAA;SOR=0.432;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=27;WE=114171607;WS=114171589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,29:0.62:47
chr10	114181208	rs10885347	C	T	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=387;ReadPosRankSum=-0.192;SC=CATGAGCCACCGCCCCCTCCA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=14;WE=114181216;WS=114181198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr10	114181683	rs2255740	A	G	3854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=46;PP=2958;SC=TTTCTCAGCTAATTCAGCACG;SOR=1.015;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=110;TCF=63;TCR=47;TR=109;WE=114181691;WS=114181673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr10	114185353	.	TAA	T	190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=1.455;QD=10.04;ReadPosRankSum=-0.859;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr10	114185856	rs34341101	T	TG	782.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=904;SC=TACAGTTCCATGGTGTTGAAA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=22;WE=114185864;WS=114185846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
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chr10	114193060	rs11421522	G	GA	638.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.704;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.818;NF=5;NR=11;PP=359;ReadPosRankSum=-1.346;SC=GAAATAAAAAGAAAAAAATGA;SOR=0.768;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=16;WE=114193068;WS=114193050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr10	114197982	rs3736059	A	T	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=296;ReadPosRankSum=1.514;SC=TTTCACTTTTAGGCACTTTTC;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=13;WE=114197990;WS=114197972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr10	114200355	rs2306159	G	A	2553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.101;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=41;PP=1907;ReadPosRankSum=-0.523;SC=AGGCAAACAAGGTGGTAGCAA;SOR=0.535;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=145;TCF=81;TCR=64;TR=91;WE=114200363;WS=114200345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,96:0.63:153
chr10	114202219	rs11195961	C	T	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=340;ReadPosRankSum=-0.583;SC=CCATGAGCTACGAGAGAATTA;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=15;WE=114202227;WS=114202209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr10	114220529	.	AG	A	23	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=23;QD=24.0102999566;SC=TTCTTAGCAAAGGTGATTCAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=3;WE=114220537;WS=114220519;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:16,3:0.16:19
chr10	114224502	rs3740143	C	G	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-4.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=271;ReadPosRankSum=-0.126;SC=AATGCACAGTCTTTTGGGCTC;SOR=0.202;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=16;WE=114224510;WS=114224492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,17:0.31:54
chr10	114297976	rs376037382	AT	A	1705.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.551;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.654;NF=51;NR=20;PP=999;ReadPosRankSum=0.679;SC=CGGCCGTCTGATTTTTTTTTC;SOR=0.935;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=131;TCF=85;TCR=46;TR=71;WE=114297984;WS=114297966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,83:0.60:138
chr10	114724469	.	A	AGAT	666	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=61.13;NF=0;NR=13;PP=666;QD=53.9230769231;SC=CCCCCAACTGAGATAATGATG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=13;WE=114724481;WS=114724459;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:40,13:0.25:53
chr10	114724472	.	T	TG	452.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.974;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.74;MQRankSum=4.412;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.096;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,16:0.33:49
chr10	114724473	.	A	G	667	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=60.52;NF=0;NR=15;PP=667;QD=46.7847475031;SC=CAACTGAGATAATGATGATGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=15;WE=114724481;WS=114724459;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:35,15:0.30:50
chr10	114724473	.	A	ATG	450.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.274;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.37;MQRankSum=0.000;QD=9.59;ReadPosRankSum=1.469;SOR=0.021;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
chr10	114724501	rs12221058	G	A	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=100;ReadPosRankSum=1.828;SC=GATGATGATGGTGGTGGTGGT;SOR=0.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=8;WE=114724509;WS=114724491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,4:0.17:23
chr10	114889837	rs34096467	TC	T	117.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.309;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQ=61.07;MQRankSum=0.431;NF=0;NR=6;PP=91;ReadPosRankSum=-1.732;SC=CTATGCTTTTTCCCCCCCCTT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=114889845;WS=114889827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr10	114903859	.	CTG	C	110.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=-0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=0.674;QD=9.23;ReadPosRankSum=0.784;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr10	115327193	rs2286745	A	G	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.073;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=484;ReadPosRankSum=-1.705;SC=GCTAAGGAGCACGCCCGGCAG;SOR=0.509;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=47;TCR=15;TR=28;WE=115327201;WS=115327183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,29:0.43:67
chr10	115334124	rs3740530	C	T	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.598;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=31;PP=774;ReadPosRankSum=-0.809;SC=CACTTACCCACGCTGAGAATC;SOR=0.445;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=147;TCF=39;TCR=108;TR=45;WE=115334132;WS=115334114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,44:0.29:151
chr10	115335843	rs911709	A	G	2489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=61;PP=2088;SC=AGCACTGCGCAATGCCATGGA;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=12;TCR=61;TR=73;WE=115335851;WS=115335833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr10	115340492	rs2286742	G	A	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.236;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=28;PP=634;ReadPosRankSum=-0.329;SC=GGGTGGGGGGGATGGAGATTT;SOR=1.038;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=81;TCF=13;TCR=68;TR=32;WE=115340500;WS=115340482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,33:0.41:80
chr10	115341753	rs2245056	G	A	5602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=95;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.709;SC=GAGGCTTTAAGAGCACGGCGG;SOR=0.335;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=74;TCR=96;TR=169;WE=115341761;WS=115341743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,179:0.99:180
chr10	115341846	rs2245058	G	A	2985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=73;PP=2420;SC=GTGGTGGGGCGCTGATCCACC;SOR=2.808;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=17;TCR=74;TR=90;WE=115341854;WS=115341836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr10	115348726	rs3832698	GA	G	3034.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=40;PP=2951;SC=AATCAGGGTGGACATGGCTCA;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=25;TCR=41;TR=65;WE=115348734;WS=115348716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr10	115348916	rs10885478	G	A	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=216;ReadPosRankSum=-0.257;SC=CACAGGACACGCTAAGAAGCA;SOR=0.120;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=11;WE=115348924;WS=115348906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr10	115349397	rs11196388	AG	A	1167.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=2;PP=1292;SC=CTTGCAAGCCAGGGGTGGCTT;SOR=4.863;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=34;WE=115349405;WS=115349387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	115350597	rs1885434	G	A	5312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=116;PP=2965;SC=TCGACACTGCGGTACCCGATC;SOR=2.440;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=35;TCR=116;TR=151;WE=115350605;WS=115350587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr10	115352005	rs11196389	A	G	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.530;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=618;ReadPosRankSum=-0.703;SC=GATGGCATCCAGCCTGAAGTC;SOR=0.257;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=61;TCF=48;TCR=13;TR=33;WE=115352013;WS=115351995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr10	115352167	rs11196390	C	T	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=5.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=559;ReadPosRankSum=-0.188;SC=GTTCCTAGGACGGCACAGCCT;SOR=0.874;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=54;TCF=6;TCR=48;TR=28;WE=115352175;WS=115352157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr10	115355328	rs11196391	A	G	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.426;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=671;ReadPosRankSum=1.653;SC=CACATTGGGCACAGATCATTT;SOR=0.563;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=156;TCF=99;TCR=57;TR=47;WE=115355336;WS=115355318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,46:0.29:157
chr10	115370254	rs12243176	A	G	1831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.393;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=40;PP=937;ReadPosRankSum=-1.477;SC=TCCTCCCTTCAATCTCTAACG;SOR=1.135;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=218;TCF=94;TCR=124;TR=62;WE=115370262;WS=115370244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,62:0.27:227
chr10	115370274	rs10749138	T	C	1792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.867;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=43;PP=733;ReadPosRankSum=0.748;SC=GTGCCTGGAATGACACATGCA;SOR=1.022;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=202;TCF=65;TCR=137;TR=59;WE=115370282;WS=115370264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,59:0.29:207
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chr10	115374670	rs3121453	A	G	1503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.453;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=46;PP=1034;ReadPosRankSum=-1.690;SC=TATAGCCACCATCTCGAAGTT;SOR=1.106;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=193;TCF=70;TCR=123;TR=67;WE=115374678;WS=115374660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,71:0.35:203
chr10	115381747	rs868738	G	A	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.118;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=422;ReadPosRankSum=2.290;SC=TGAGCTTTGCGGGCATGCACG;SOR=0.477;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=67;TCF=39;TCR=28;TR=23;WE=115381755;WS=115381737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,24:0.34:70
chr10	115392919	rs2270182	T	A	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.437;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=359;ReadPosRankSum=-2.853;SC=ATTCAACTTATTTTTCTCATA;SOR=1.465;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=21;WE=115392927;WS=115392909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,22:0.39:57
chr10	115401031	rs5788038	AT	A	279.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.09;ReadPosRankSum=1.095;SOR=0.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
chr10	115409840	rs2275799	C	T	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.950;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=42;PP=943;ReadPosRankSum=1.032;SC=ATGCCCTCAGCTCCAATGGCT;SOR=1.130;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=176;TCF=60;TCR=116;TR=61;WE=115409848;WS=115409830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,62:0.35:176
chr10	115411598	rs4918861	C	A	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.093;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=13;PP=545;ReadPosRankSum=-0.576;SC=TGCTCCGTAGCAGCTCAGGAG;SOR=1.194;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=109;TCF=61;TCR=48;TR=35;WE=115411606;WS=115411588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,35:0.32:108
chr10	115411614	rs2154028	A	G	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.743;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=20;PP=520;ReadPosRankSum=1.455;SC=AGGAGTATCCACCACCGTGGA;SOR=0.753;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=115;TCF=58;TCR=57;TR=38;WE=115411622;WS=115411604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,38:0.33:114
chr10	115412686	rs3121488	G	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=157;ReadPosRankSum=-0.451;SC=AAGCACCCAGGCACTCACTTG;SOR=0.573;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=12;WE=115412694;WS=115412676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,12:0.29:41
chr10	115412793	rs3737322	A	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.028;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=302;ReadPosRankSum=0.507;SC=AGTCTTCTGTATATTCCTGTT;SOR=0.869;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=67;TCF=32;TCR=35;TR=17;WE=115412801;WS=115412783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,18:0.26:69
chr10	115413901	rs41310308	T	C	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.016;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=777;ReadPosRankSum=0.079;SC=AGGAAGCACATGAAGGGATAC;SOR=0.884;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=152;TCF=80;TCR=72;TR=56;WE=115413909;WS=115413891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,60:0.36:165
chr10	115417289	rs1891762	G	A	1525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.046;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=51;PP=1145;ReadPosRankSum=0.661;SC=TCATGTCCCAGTGAAAAACTG;SOR=1.276;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=170;TCF=40;TCR=130;TR=62;WE=115417297;WS=115417279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,64:0.36:176
chr10	115422277	rs10430683	G	A	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=394;ReadPosRankSum=1.101;SC=TAACTCCCAAGCTCAAACCAT;SOR=0.746;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=57;TCR=1;TR=20;WE=115422285;WS=115422267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr10	115422474	rs3127122	A	G	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.244;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=49;PP=1191;ReadPosRankSum=3.366;SC=TCACATTTAGATTTAATGGAG;SOR=0.996;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=212;TCF=78;TCR=134;TR=71;WE=115422482;WS=115422464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,74:0.34:218
chr10	115439569	rs7921977	C	T	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=3;PP=389;SC=GAGCGCACTACCCCGAGCCAG;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=15;WE=115439577;WS=115439559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	115439640	rs10553596	CTT	C	1350.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.906;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.572;NF=15;NR=14;PP=1100;ReadPosRankSum=1.361;SC=AGCGCCGAGACTTTTAGTTTC;SOR=0.092;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=29;WE=115439649;WS=115439630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,34:0.79:43
chr10	115457264	rs11555408	T	G	2333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.715;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=46;PP=1692;ReadPosRankSum=0.340;SC=TGGCAGATGATCAGGGCTGTA;SOR=0.741;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=60;TCR=66;TR=87;WE=115457272;WS=115457254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,90:0.70:129
chr10	115515120	rs3981351	G	A	3105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=72;PP=2413;SC=AATGCCCCACGGTTTCCTTCA;SOR=3.142;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=14;TCR=72;TR=86;WE=115515128;WS=115515110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr10	115525175	rs4631835	T	C	5191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=112;PP=2965;SC=TCTGAATCTCTGATGTATTTT;SOR=1.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=178;TCF=66;TCR=112;TR=178;WE=115525183;WS=115525165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr10	115526177	rs10885500	A	G	2806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=7;PP=2319;SC=TAGGCAAACAATTTACATTTT;SOR=4.514;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=73;TCR=7;TR=80;WE=115526185;WS=115526167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr10	115528428	rs10885501	G	A	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=523;SC=TGGAGGTGGCGAGGCCATTTA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=115528436;WS=115528418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	115609915	rs3750898	C	G	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.814;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=30;PP=915;ReadPosRankSum=-1.230;SC=TGTGAATCATCCGGTTTTTCA;SOR=0.850;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=159;TCF=78;TCR=81;TR=55;WE=115609923;WS=115609905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,57:0.33:173
chr10	115618246	rs2301180	T	C	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=1;PP=518;ReadPosRankSum=0.668;SC=AAATTTTATCTTTCTCTTTAA;SOR=0.247;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=78;TCF=76;TCR=2;TR=27;WE=115618254;WS=115618236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,27:0.35:78
chr10	115644040	rs7913176	G	A	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.426;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=14;PP=748;ReadPosRankSum=0.712;SC=GGTGAGCACTGTAGCTGGTAT;SOR=0.551;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=162;TCF=120;TCR=42;TR=50;WE=115644048;WS=115644030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,57:0.33:172
chr10	115675025	rs7895609	G	A	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=378;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTCCCTACCTGTACAAGCAGC;SOR=0.654;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=80;TCF=24;TCR=56;TR=23;WE=115675033;WS=115675015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,23:0.28:82
chr10	115804036	rs1801252	A	G	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.455;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=4;PP=848;ReadPosRankSum=-1.557;SC=CGCCAGCGAAAGCCCCGAGCC;SOR=0.182;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=54;TCF=50;TCR=4;TR=39;WE=115804044;WS=115804026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,41:0.72:57
chr10	115805056	rs1801253	G	C	2408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.556;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=76;PP=1726;ReadPosRankSum=-0.622;SC=GGCCTTCCAGGGACTGCTCTG;SOR=0.938;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=153;TCF=39;TCR=114;TR=100;WE=115805064;WS=115805046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,103:0.66:156
chr10	115950697	.	G	C	1497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.990;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=13;PP=1082;ReadPosRankSum=-1.401;SC=GCTTTTATTTGAAATTGTGTT;SOR=0.330;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=70;TCF=53;TCR=17;TR=48;WE=115950705;WS=115950687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,54:0.70:77
chr10	115981071	rs76762468	C	T	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=279;ReadPosRankSum=-1.490;SC=AACAACAGTACATTTTTTTTA;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=13;WE=115981079;WS=115981061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr10	116044587	rs10787521	C	T	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=1;PP=208;ReadPosRankSum=1.486;SC=CTCTGTGCTGCGGTGCTTAGC;SOR=1.445;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=10;WE=116044595;WS=116044577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr10	116058933	rs1889450	G	A	877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=1;PP=738;SC=TTGAGAAGGTGTGGTGACAGC;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=116058941;WS=116058923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	116060194	rs3214266	A	AG	5159.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=76;PP=2936;SC=CCTGCAGGGGAGGCCTGTACC;SOR=0.857;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=138;TCF=60;TCR=78;TR=126;WE=116060202;WS=116060184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr10	116060387	rs2286396	T	C	8272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=144;NR=104;PP=2965;SC=CCAGGTACACTCGGTCAGATT;SOR=1.105;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=248;TCF=144;TCR=104;TR=248;WE=116060395;WS=116060377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr10	116061306	rs41314503	G	T	2593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.233;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=83;PP=2057;ReadPosRankSum=0.493;SC=TCCCAGTGAGGAGTGGTTGCC;SOR=1.397;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=127;TCF=15;TCR=112;TR=92;WE=116061314;WS=116061296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,94:0.72:130
chr10	116068176	rs581327	A	G	1900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=4;PP=1520;SC=TTCCCCTCCCAACCACATGAT;SOR=5.136;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=63;TCR=4;TR=67;WE=116068184;WS=116068166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	116073696	rs3813722	C	T	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;PP=763;ReadPosRankSum=0.298;SC=CATTCATCGGCGTGATCTTCA;SOR=0.620;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=86;TCR=46;TR=45;WE=116073704;WS=116073686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,45:0.34:133
chr10	116073801	rs621375	T	C	1995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.227;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=52;PP=1588;ReadPosRankSum=0.806;SC=CCTTGGAGGATTTGTAGCACT;SOR=1.686;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=107;TCF=27;TCR=80;TR=65;WE=116073809;WS=116073791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,70:0.62:113
chr10	116075228	rs694883	A	G	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=607;SC=GAAACCTCTGAGGTCAGGGAC;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=116075236;WS=116075218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	116075271	rs377755078	T	TCC	1360.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=6;PP=1208;SC=CCCTGCCCCTTCCCCAAGGAG;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=27;WE=116075279;WS=116075261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	116079505	rs10885547	G	A	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=314;ReadPosRankSum=-0.049;SC=AGACCCAGATGTGGCAACTCG;SOR=0.551;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=18;WE=116079513;WS=116079495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr10	116085784	rs74928179	C	CCCG	2354.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=33;PP=2453;ReadPosRankSum=0.148;SC=GAGATCTGGCCCAAGGTCAGG;SOR=0.682;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=180;TCF=72;TCR=108;TR=59;WE=116085792;WS=116085774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,63:0.31:204
chr10	116091555	rs10787524	T	C	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=4.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.24;ReadPosRankSum=-0.675;SOR=0.778;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,14:0.23:62
chr10	116100320	rs4752395	T	G	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.228;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=406;ReadPosRankSum=-0.159;SC=AACCATCTCTTTTGGCGTGGA;SOR=2.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=46;TCR=5;TR=19;WE=116100328;WS=116100310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,18:0.35:52
chr10	116196198	rs74160409	G	A	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.895;NF=1;NR=27;PP=595;ReadPosRankSum=-1.715;SC=GGCCTTGAGCGTTGCTCTATA;SOR=0.354;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=28;WE=116196206;WS=116196188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,30:0.58:52
chr10	116199175	rs941853	G	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=119;ReadPosRankSum=-1.803;SC=TTGCTGTATAGGAACAGGAAT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=116199183;WS=116199165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr10	116203911	rs57563904	G	GA	495.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=5.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQRankSum=-0.942;QD=8.13;ReadPosRankSum=0.207;SOR=0.089;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,35:0.57:61
chr10	116209978	.	A	AAC	387.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.741;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.26;MQRankSum=1.228;QD=24.23;ReadPosRankSum=0.816;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr10	116210018	rs10885568	T	C	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.489;NF=0;NR=5;PP=72;ReadPosRankSum=-0.703;SC=AAAGCAAGCGTATGGTTTAAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=116210026;WS=116210008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr10	116222749	rs7920878	G	A	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.484;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=223;ReadPosRankSum=2.521;SC=CCTTCCCAGGGTGCTAATAAA;SOR=1.179;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=14;WE=116222757;WS=116222739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr10	116225365	rs7899255	G	A	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=577;ReadPosRankSum=0.498;SC=ATGTTTAGTCGTTGATTTTTC;SOR=0.377;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=30;WE=116225373;WS=116225355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr10	116304958	rs10885579	C	T	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=418;SC=AAGGGCAGGACATATTTCTCC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=116304979;WS=116304948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	116304971	rs2483595	T	C	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=279;SC=ATTTCTCCCCTGCCCAGTGTT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=116304979;WS=116304948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	116307504	rs2247528	A	G	4161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=75;PP=2965;SC=GCGCCTGCCCATTCTTGATAT;SOR=1.059;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=133;TCF=58;TCR=75;TR=133;WE=116307512;WS=116307494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr10	116593175	rs11196939	C	T	5795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=131;PP=2965;SC=AGTTCCTGATCCACACCATGT;SOR=2.485;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=40;TCR=131;TR=171;WE=116593183;WS=116593165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr10	116596071	rs17095662	A	C	3068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=86;PP=2720;SC=AAATTGAATTATGTGAATAAT;SOR=7.523;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=87;TCF=1;TCR=86;TR=87;WE=116596079;WS=116596061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr10	116605103	rs2420069	A	G	1841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=13;PP=1381;SC=CTTTGGACTTAGCAATTCTTC;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=55;WE=116605111;WS=116605093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	116606173	rs3834423	C	CT	2258.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=51;PP=2457;SC=CTTTGAAATACGGTTTTAATG;SOR=5.856;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=2;TCR=54;TR=53;WE=116606181;WS=116606163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	116615045	rs3180654	T	C	3910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=82;PP=2836;ReadPosRankSum=0.176;SC=CTGCTTTCTTTGAAGGTCATT;SOR=1.246;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=54;TCR=84;TR=135;WE=116615053;WS=116615035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,137:0.99:139
chr10	116621153	rs189881633	G	A	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=1.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.70;ReadPosRankSum=-0.992;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,46:0.66:70
chr10	116621153	.	GC	AA	838	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=9;NR=28;PP=838;QD=24.0937263476;SC=ATGATCGGCTGCTATCTTGAA;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=64;TCF=17;TCR=47;TR=37;WE=116621162;WS=116621143;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:27,37:0.58:64
chr10	116621154	rs34064819	C	A	2826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.38;SOR=2.173;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr10	116622339	rs41284358	A	G	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=21;PP=606;SC=TAAATGTCCTATTTACATGTT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=116622347;WS=116622329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	116659253	rs10885629	A	G	3703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=50;PP=2867;SC=CCTCAGGCAGACGTTGCCTTC;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=57;TCR=50;TR=107;WE=116659261;WS=116659243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr10	116853177	rs2484265	C	G	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=1;PP=557;SC=CCCTCCTCCTCCCGGTCAGGT;SOR=4.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=22;WE=116853185;WS=116853168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	116856543	rs1264777	T	C	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=603;ReadPosRankSum=0.751;SC=TCTTCTGTTTTCATTTGAAAA;SOR=3.528;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=24;WE=116856551;WS=116856533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr10	116931101	rs3086141	C	CTT	2946.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=44;PP=2577;SC=ATGTTTTTCTCTAATAAAATC;SOR=2.448;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=56;TCF=8;TCR=48;TR=50;WE=116931109;WS=116931091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	117075175	rs1953758	G	A	1643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=34;PP=1249;SC=ATGCACCACAGTGAGATGGTT;SOR=1.524;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=51;WE=117075183;WS=117075165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr10	117228794	rs10885721	A	G	1296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=21;PP=967;SC=CTAACATTACATTCTATGTGT;SOR=0.829;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=20;TCR=21;TR=41;WE=117228802;WS=117228784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	117278988	rs6421370	G	C	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=10;PP=274;SC=TCCCACAGAGGAGAGGTAACA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=117278996;WS=117278978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	117309098	rs1336108	G	A	768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=18;PP=569;SC=CAAATATATGGATCTCTATTG;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=117309106;WS=117309088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	117486763	rs2254619	G	T	1268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.941;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=21;PP=920;ReadPosRankSum=0.586;SC=TCCAGCAACTGCTTCGAGAAC;SOR=1.067;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=144;TCF=74;TCR=70;TR=52;WE=117486771;WS=117486753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,55:0.36:151
chr10	117856379	rs66851912	TGCACAC	T	223.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.187;NF=3;NR=21;PP=261;ReadPosRankSum=0.047;SC=TGCCTTTTTCTGCACACGCAC;SOR=2.712;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=24;WE=117856401;WS=117856369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr10	117856386	rs376047022	GCACACGCA	G	48.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=15.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.14;MQRankSum=-0.839;QD=2.44;ReadPosRankSum=1.755;SOR=0.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr10	117856388	rs72411923	ACACG	A	51.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.41;MQRankSum=-0.709;QD=3.04;ReadPosRankSum=-0.398;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr10	117971016	rs7090693	T	C	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.222;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=643;ReadPosRankSum=-0.815;SC=CCTCATGGTGTCCCTGAGGGC;SOR=0.163;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=30;WE=117971024;WS=117971006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr10	117986207	rs7094346	G	T	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=2;PP=456;SC=ATTTCTATTAGTACTACATTG;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=117986215;WS=117986197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	118031376	rs2532691	C	A	2299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=15;PP=1802;SC=CCCAAAAAGACACTTCTTCCT;SOR=2.432;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=71;TCF=55;TCR=16;TR=70;WE=118031384;WS=118031366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr10	118031619	rs2577360	G	A	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=18;PP=516;SC=GGAGCTCAGCGTGCAGCGATC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=118031627;WS=118031609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	118187399	rs10787669	T	G	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.08;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	118187405	rs10787670	T	C	599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.98;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	118215150	rs34077637	C	CT	235.37	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.9994;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.612;NF=10;NR=1;PP=171;ReadPosRankSum=-0.274;SC=CATGTTGATCCTTTTTTTTTT;SOR=1.609;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=11;WE=118215158;WS=118215140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr10	118231360	rs10736251	G	A	2709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.16;SOR=1.355;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr10	118231363	rs1897519	A	G	2807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.29;SOR=1.234;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	118231406	rs10749217	A	C	1706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=34;PP=1521;SC=GCAGAGTGAGAAACTGACGCT;SOR=1.314;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=52;WE=118231414;WS=118231396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr10	118310802	rs34277255	CA	C	122.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.55;MQRankSum=0.696;QD=8.77;ReadPosRankSum=0.000;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
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chr10	118359548	rs3816355	T	C	2195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=14;PP=1807;ReadPosRankSum=1.488;SC=TCTCCTTATTTGTTTTCCCAG;SOR=1.473;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=55;TCR=14;TR=68;WE=118359556;WS=118359538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,68:0.99:69
chr10	118359601	.	A	G	1960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.127;ClippingRankSum=0.000;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.605;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=27;PP=1558;ReadPosRankSum=-1.213;SC=AGAAGCTACAAGTATTACTTG;SOR=0.498;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=118;TCF=77;TCR=41;TR=74;WE=118359609;WS=118359591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,74:0.62:119
chr10	118363642	rs3010501	T	C	2206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.859;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=58;PP=1692;ReadPosRankSum=-0.467;SC=ACCAGTACAGTATCTTCAGGT;SOR=1.002;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=114;TCF=26;TCR=88;TR=74;WE=118363650;WS=118363632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,79:0.65:121
chr10	118363744	rs35096619	T	TC	452.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=505;ReadPosRankSum=-1.779;SC=TCTTTATATGTCACTGGTTTT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=13;WE=118363752;WS=118363734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr10	118364818	rs2915754	G	T	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=250;ReadPosRankSum=-0.557;SC=TAATCTAGAAGAGAAAACAGC;SOR=0.481;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=11;WE=118364826;WS=118364813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr10	118364967	rs2305204	G	C	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.096;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=11;PP=1105;ReadPosRankSum=-1.611;SC=GAACAATTGAGAAAGTCAAGT;SOR=0.493;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=76;TCF=60;TCR=16;TR=50;WE=118364975;WS=118364957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,53:0.67:79
chr10	118368493	rs5003367	C	A	3961.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.57;SOR=8.189;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr10	118368711	.	C	A	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=6.383;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.786;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=555;ReadPosRankSum=-0.600;SC=TCTCCTGCCGCGGCCGCCTCC;SOR=0.115;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=25;WE=118368719;WS=118368701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,23:0.42:55
chr10	118380345	rs12415178	C	T	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.054;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=219;ReadPosRankSum=-0.159;SC=TATGTGTTTACGATAAGTTAG;SOR=1.550;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=11;WE=118380353;WS=118380335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr10	118380511	rs3010502	A	G	1210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=28;PP=999;SC=GCCCCATGTGAGCAGGGGATT;SOR=2.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=38;WE=118380519;WS=118380501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	118380629	rs3214321	TC	T	170.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.276;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=155;ReadPosRankSum=-0.763;SC=GCTGTCTAACTCCCTGTGCAC;SOR=0.595;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=6;WE=118380637;WS=118380619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr10	118380701	rs2286774	G	A	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.080;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=669;ReadPosRankSum=-0.662;SC=CCGGGTTGCGGGGCGTCTGTT;SOR=0.074;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=28;WE=118380709;WS=118380691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,29:0.67:43
chr10	118380785	rs2286775	G	C	1557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.916;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=14;PP=1231;ReadPosRankSum=-0.917;SC=TGTGCGCATGGGTCTGTGTGT;SOR=0.897;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=93;TCF=69;TCR=24;TR=59;WE=118380793;WS=118380775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,59:0.61:96
chr10	118383463	rs56189579	A	AG	3572.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=40;PP=2957;SC=CTAGGAAAAGAGTCTGCTACG;SOR=1.076;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=39;TCR=41;TR=78;WE=118383471;WS=118383453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr10	118387137	rs7092580	A	G	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=0.066;SC=TGCAAATAGGAAGCGGGGTCG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=6;WE=118387145;WS=118387127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr10	118394551	rs2286779	G	C	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=197;ReadPosRankSum=-0.138;SC=TAGAACAGAAGAAAGAGATGT;SOR=0.616;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=14;WE=118394559;WS=118394541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,15:0.31:49
chr10	118396278	rs11197776	G	T	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.612;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=0;PP=629;ReadPosRankSum=-0.419;SC=ACAAATTATGGTTTTTTTTTT;SOR=1.813;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=82;TCF=79;TCR=3;TR=29;WE=118396286;WS=118396266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,29:0.35:84
chr10	118397884	rs4751995	A	G	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=8.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.15;ReadPosRankSum=-1.493;SOR=0.149;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,17:0.27:64
chr10	118397894	rs4751996	A	G	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=18.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.25;ReadPosRankSum=-1.562;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,18:0.30:60
chr10	118397971	rs10885997	A	G	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.752;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=246;ReadPosRankSum=-0.351;SC=ATGAAAACTCAAAACAATATG;SOR=0.430;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=61;TCF=25;TCR=36;TR=19;WE=118397979;WS=118397961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,19:0.31:61
chr10	118398046	rs7910135	C	A	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.551;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=139;ReadPosRankSum=0.229;SC=ATTATTCAAACTTGATTGAGT;SOR=1.639;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=10;WE=118398054;WS=118398036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,10:0.25:40
chr10	118404620	rs2301179	A	G	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.424;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=225;ReadPosRankSum=0.444;SC=AACGTGGTGCAGCTATTGCGG;SOR=0.368;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=18;WE=118404628;WS=118404610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,18:0.30:61
chr10	118436068	rs2166634	G	T	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.351;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=229;ReadPosRankSum=0.439;SC=ACGATACCCAGGCTTATCTGC;SOR=0.967;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=52;TCF=13;TCR=39;TR=15;WE=118436076;WS=118436058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr10	118451699	rs740595	T	C	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=0;PP=749;SC=AGGAAAGGGATGGCTCCTTGT;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=118451707;WS=118451689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	118451810	rs733216	A	G	4553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=44;PP=2965;SC=ACCACCCTGGACATCTTGAGT;SOR=1.593;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=93;TCR=44;TR=137;WE=118451818;WS=118451800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr10	118452044	rs2240711	G	T	2393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=59;PP=1856;SC=GCCTCCTGTGGCTTCACTGAA;SOR=3.352;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=11;TCR=59;TR=70;WE=118452052;WS=118452034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr10	118452099	rs2240710	C	G	1077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=30;PP=863;SC=GTTTCAGGGTCCCCCAAACTT;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=118452107;WS=118452089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	118466659	rs146552482	TGC	T	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.402;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQRankSum=-0.000;QD=6.75;ReadPosRankSum=2.198;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr10	118501765	rs3095121	A	C	195.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=6;NR=2;PP=103;SC=GGTCCACCGGACCCCGGCCCC;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=118501773;WS=118501755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	118616110	rs7083543	C	T	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.773;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=33;PP=739;ReadPosRankSum=-0.721;SC=TGAGCACCGCCGTGCAGTGGG;SOR=0.579;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=136;TCF=34;TCR=102;TR=45;WE=118616118;WS=118616100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,46:0.33:141
chr10	118620459	rs11197835	A	C	3408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.656;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=41;PP=2794;ReadPosRankSum=-2.656;SC=ATATCGCTCTACTGAAGCACA;SOR=0.793;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=164;TCF=105;TCR=59;TR=116;WE=118620467;WS=118620449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,121:0.72:169
chr10	118628036	rs1637571	G	A	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=543;ReadPosRankSum=0.444;SC=GTGTGTGTGCGTGTATGTGTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=24;WE=118628044;WS=118628026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr10	118633548	rs1637574	A	G	2225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=1;PP=1705;SC=TGAATTCATTATTTATCCCTT;SOR=6.963;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=59;TCF=58;TCR=1;TR=59;WE=118633556;WS=118633538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr10	118643670	rs2257791	G	A	1928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=16;PP=1484;ReadPosRankSum=-0.705;SC=TAAGCAGGACGTATGTAAGTT;SOR=0.706;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=85;TCR=25;TR=69;WE=118643678;WS=118643660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,74:0.63:118
chr10	118646129	rs2531685	G	C	1979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=57;PP=1531;ReadPosRankSum=-0.021;SC=AGAGAAAATAGTTGTCTCTGA;SOR=0.873;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=83;TCF=5;TCR=78;TR=61;WE=118646137;WS=118646119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,65:0.76:86
chr10	118667346	rs2531690	A	C	4516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.576;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.98;MQRankSum=-0.711;NF=122;NR=53;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.072;SC=TTGTCCACCAAGGCTAATAAT;SOR=1.485;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=262;TCF=168;TCR=94;TR=175;WE=118667354;WS=118667336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,174:0.66:264
chr10	118708315	rs10595325	GAGA	G	2418.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=5;PP=1967;SC=CACAATATAGGAGAAGATTTT;SOR=4.294;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=56;TCF=47;TCR=9;TR=41;WE=118708325;WS=118708305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	119001151	rs2619094	A	C	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=22;NR=1;PP=577;SC=TGGGGGGTCCACGGCCGCCTT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=119001159;WS=119001141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	119003564	rs363387	T	G	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.777;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=16;PP=1222;ReadPosRankSum=0.442;SC=CAGTGCACACTGCCTCCATCT;SOR=1.951;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=116;TCF=80;TCR=36;TR=70;WE=119003572;WS=119003554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,77:0.63:123
chr10	119003845	rs11568723	CAA	C	2058.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.832;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=36;PP=1640;ReadPosRankSum=0.730;SC=CTACTTTAGTCAAAGAGTTTG;SOR=1.269;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=66;TCF=12;TCR=54;TR=43;WE=119003854;WS=119003835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,52:0.64:81
chr10	119013079	.	GT	G	20	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5141;HP=7;HapScore=4;MGOF=20;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=20;QD=18.5;SC=GGCGGGGGGGGTCGTGGTTGG;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=2;WE=119013088;WS=119013069;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,2:0.29:7
chr10	119014023	rs2072362	C	T	1140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=29;PP=814;SC=GTAAGGCCCCCGTGTAGGCAA;SOR=2.554;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=36;WE=119014031;WS=119014013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	119014931	rs363420	C	T	6682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=112;PP=2965;SC=TGCTGGCACGCGCTTGGGCCA;SOR=2.058;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=43;TCR=114;TR=154;WE=119014939;WS=119014921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr10	119014948	rs363343	C	A	6549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=106;PP=2965;SC=GCCACACCTGCTTTCTGAAGA;SOR=1.989;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=42;TCR=107;TR=148;WE=119014956;WS=119014938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr10	119026186	rs11568725	T	G	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=2.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.63;ReadPosRankSum=-0.376;SOR=0.492;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,48:0.26:188
chr10	119026401	rs363266	T	C	2017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=34;PP=1741;SC=TTTCTGCCTTTGCTGTTACAA;SOR=0.822;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=30;TCR=34;TR=64;WE=119026409;WS=119026391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr10	119036625	rs363279	T	C	413.98	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=345;ReadPosRankSum=0.945;SC=AACCATCTTATCTTTATGAAA;SOR=2.584;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=14;WE=119036633;WS=119036615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr10	119042761	rs363293	C	T	4289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=87;NR=44;PP=2965;SC=CATTTGAAAGCTTAAATAGAC;SOR=1.497;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=87;TCR=44;TR=131;WE=119042769;WS=119042751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr10	119044800	rs151173634	C	T	6985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=409;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.823;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=143;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.596;SC=AACCCGGCAGCTTCCTCTTCA;SOR=0.842;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=392;TCF=175;TCR=217;TR=253;WE=119044808;WS=119044790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,260:0.64:404
chr10	119078593	rs10082507	T	C	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=443;SC=ATTACTATTATAGCTTTAGTA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=119078601;WS=119078583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	119133968	rs3814230	G	C	4567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=55;PP=2965;SC=CTTCAAACTGGGAGCGCACCT;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=148;TCF=92;TCR=56;TR=147;WE=119133976;WS=119133958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr10	119134058	rs3814229	T	C	6158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=88;PP=2965;SC=AGCGCAGCCTTCCCACCACGC;SOR=0.769;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=97;TCR=88;TR=185;WE=119134066;WS=119134048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr10	119307524	rs2240776	T	A	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=278;ReadPosRankSum=-0.532;SC=AGGCACTTGATAGAAGGGTGC;SOR=0.096;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=14;WE=119307532;WS=119307514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr10	119768551	rs7923321	C	T	5347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=82;PP=2965;SC=ATGGTTCATACGGCACTCTGA;SOR=0.705;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=82;TCR=82;TR=164;WE=119768559;WS=119768541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr10	119793629	rs2928118	C	T	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=581;SC=ACGCTACCACCGTACACAATT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=119793637;WS=119793619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	120070427	rs4751651	G	T	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=15;PP=776;SC=AAACCTAAAAGGAAGAACATA;SOR=0.811;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=16;TCR=15;TR=31;WE=120070435;WS=120070417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	120070709	rs3213691	G	A	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=421;SC=AAAATCTTAAGTAAACTCACC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=120070717;WS=120070699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	120070843	rs34120011	G	GA	1396.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.280;NF=19;NR=26;PP=919;ReadPosRankSum=-0.200;SC=TTACAAAGGAGAAAAAAAAAG;SOR=0.354;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=61;TCF=28;TCR=33;TR=45;WE=120070851;WS=120070833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr10	120081948	rs853911	C	T	4944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=114;PP=2965;SC=TAACCTAAAACTAATCATGAG;SOR=2.974;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=27;TCR=114;TR=141;WE=120081956;WS=120081938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr10	120353910	rs1613448	T	C	3915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=62;NR=62;PP=2965;SC=ACCACCACGATCACCACCAGC;SOR=0.725;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=62;TCR=62;TR=124;WE=120353918;WS=120353900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr10	120460715	rs2274314	G	T	1520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=5;PP=1359;SC=TTCAGAAGATGTTAACATTGG;SOR=3.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=46;WE=120460723;WS=120460705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	120467212	.	AC	A	62	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5039;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=20;MQ=59.08;NF=0;NR=2;PP=62;QD=55.515449935;SC=TTCACAATTAACAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=2;WE=120467220;WS=120467202;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,2:0.12:16
chr10	120796572	rs11336519	TC	T	738.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.58;QD=23.83;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	120803746	rs3740553	T	C	1597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=42;PP=1271;SC=TTTGTACTTATAACAATATGA;SOR=6.316;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=43;WE=120803754;WS=120803736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr10	120817450	rs10886375	A	G	4715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=122;NR=12;PP=2965;SC=ATTTTTTAATAACTAAGATGC;SOR=4.407;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=123;TCR=12;TR=134;WE=120817458;WS=120817440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr10	120818609	rs6585524	C	T	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=1;PP=483;SC=CTATAGGAAACATATCATAAA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=120818617;WS=120818599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	120819453	rs10787901	A	G	97.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	120819458	rs10787902	T	C	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr10	120820224	rs3740555	C	A	2000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=6;PP=1582;SC=GAGCACATAACATCACAAAAC;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=52;TCR=6;TR=58;WE=120820232;WS=120820214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr10	120828969	rs7908387	A	G	1060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=4;PP=743;SC=TTTGCATCTCATCTTGTGTGA;SOR=3.556;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=35;WE=120828977;WS=120828959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	120832872	rs1397616	T	C	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=575;SC=AAACATCTACTTCAAAAGGAA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=120832880;WS=120832862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	120864868	rs1511033	T	C	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=422;SC=AGCGCAATCATCGCTCTCTGC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=16;WE=120864876;WS=120864858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	120892209	.	G	A	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.785;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=19;PP=412;ReadPosRankSum=1.274;SC=AAGCAGAGTGGGGGGCTGTGG;SOR=0.562;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=79;TCF=14;TCR=65;TR=24;WE=120892217;WS=120892199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,29:0.34:85
chr10	120896027	rs11198799	G	A	4215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=85;PP=2965;SC=ACCTAGCACCGTTTTCAGAAG;SOR=1.364;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=48;TCR=86;TR=133;WE=120896035;WS=120896017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr10	120905940	rs10654248	C	CGT	174.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-1.577;NF=1;NR=30;PP=871;ReadPosRankSum=0.313;SC=TGAATCAGGGCGTGTGTGTGT;SOR=0.533;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=102;TCF=8;TCR=94;TR=31;WE=120905949;WS=120905930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr10	120905972	rs141608372	T	TGTGC	953.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.71;MQRankSum=1.597;QD=15.90;ReadPosRankSum=1.515;SOR=0.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
chr10	120905975	rs61874341	A	G	1252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.76;MQRankSum=3.351;QD=20.88;ReadPosRankSum=2.462;SOR=0.831;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,32:0.53:60
chr10	120907173	rs150807690	T	TG	168.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=223;ReadPosRankSum=-0.036;SC=TGTGTGTTTATGGGAAGGTTA;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=8;WE=120907181;WS=120907163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr10	120907203	rs61874342	C	T	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=180;ReadPosRankSum=1.283;SC=CTTCTCCCCACCCTCCACCAG;SOR=0.207;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=12;WE=120907211;WS=120907193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr10	120914692	rs17668734	G	A	2418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.624;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=61;PP=1888;ReadPosRankSum=-2.012;SC=GGCTTGCACTGTAGATGTAAA;SOR=0.626;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=61;TCR=97;TR=99;WE=120914700;WS=120914682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,98:0.63:156
chr10	120916467	rs2297696	A	G	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=30;PP=737;ReadPosRankSum=-1.275;SC=GCTTAGAGAGAGGTATGGAAG;SOR=2.780;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=30;WE=120916475;WS=120916457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,34:0.81:42
chr10	120917269	rs2420494	A	T	2824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=12;PP=2324;SC=AAAGTACTTAATTAGCAAATA;SOR=3.391;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=73;TCR=12;TR=85;WE=120917277;WS=120917259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr10	120917616	rs2275112	G	A	2840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.403;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=73;PP=2330;ReadPosRankSum=-0.936;SC=GTGTTGCTGTGGAAGGAGAAC;SOR=0.418;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=161;TCF=42;TCR=119;TR=103;WE=120917624;WS=120917606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,104:0.64:163
chr10	120919246	rs2181118	T	C	3661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=65;PP=2708;SC=TCACCGTGGGTGCCATGAAAG;SOR=0.790;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=127;TCF=62;TCR=65;TR=127;WE=120919254;WS=120919236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr10	120922017	rs12413842	T	C	2777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.982;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=62;PP=1953;ReadPosRankSum=-0.989;SC=CTCACCAGCATGCACTGGACT;SOR=0.374;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=162;TCF=65;TCR=97;TR=109;WE=120922025;WS=120922007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,117:0.66:176
chr10	120922075	rs35233430	T	C	1952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.256;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=57;PP=1562;ReadPosRankSum=0.620;SC=AGGCTCTCTATCCATTAGGAT;SOR=0.474;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=93;TCF=13;TCR=80;TR=67;WE=120922083;WS=120922065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,69:0.70:99
chr10	120923780	rs59832388	C	CT	410	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=2.634;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.96;MQRankSum=0.942;QD=15.19;ReadPosRankSum=-0.650;SOR=0.166;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,23:0.85:27
chr10	120924874	rs933092	G	C	2639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=33;PP=2127;SC=TGCGTCCCCTGCCGCGCCCTA;SOR=1.048;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=47;TCR=33;TR=80;WE=120924882;WS=120924864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr10	120933324	rs3758609	G	A	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=3;PP=764;SC=CACAGTTCACGTCGTGAAATT;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=120933332;WS=120933314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	120933561	rs4752257	T	G	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.40;ReadPosRankSum=1.855;SOR=0.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr10	120936402	.	G	A	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.695;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=313;ReadPosRankSum=0.045;SC=GGGGTGGGACGGGGGCAGTGC;SOR=1.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=16;WE=120936410;WS=120936392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr10	120967376	rs2230347	C	T	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=532;ReadPosRankSum=2.611;SC=AGCGGCAGCACCCCAGGCGCT;SOR=0.501;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=51;TCR=8;TR=28;WE=120967384;WS=120967366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr10	121093160	rs10886461	A	C	895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=9;PP=719;SC=CAGGGAGACTACTTAGGTGCT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=27;WE=121093168;WS=121093150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	121140511	rs4751714	A	G	2215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=37;PP=1313;SC=CAAAGGAAAAAATAGATCTCA;SOR=2.393;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=50;WE=121140519;WS=121140501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	121140534	rs2275037	C	G	2017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=37;PP=1137;SC=GGTTAGAAGACTGAGGAATAA;SOR=3.865;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=43;WE=121140542;WS=121140524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	121156151	rs41284420	C	T	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.114;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=626;ReadPosRankSum=-0.317;SC=GGTTCTGTAACTATAAGAAGC;SOR=0.512;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=48;TCF=25;TCR=23;TR=30;WE=121156159;WS=121156141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr10	121184780	rs112640010	T	TACAC	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.75;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr10	121190113	rs915120	T	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.922;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.6715;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=133;ReadPosRankSum=-1.335;SC=TCAGTGGCCTTGGGGCTATCA;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=9;WE=121190121;WS=121190103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr10	121191073	rs12721550	C	A	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.92;ReadPosRankSum=-1.845;SOR=0.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,12:0.23:53
chr10	121199189	rs2245364	T	C	5499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=115;NR=59;PP=2965;SC=GATGCCAGTGTATCCTACCTG;SOR=1.504;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=115;TCR=59;TR=174;WE=121199197;WS=121199179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr10	121199437	rs915116	T	C	1287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=42;PP=1037;SC=AAGCTGTGAGTGTGAACAGAG;SOR=5.376;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=44;WE=121199445;WS=121199427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	121201616	rs2275043	C	T	2709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=69;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.942;SC=TGCTGGGCTGCCTGTGTCAAT;SOR=0.661;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=134;TCF=31;TCR=103;TR=90;WE=121201634;WS=121201606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,98:0.69:143
chr10	121201626	rs2275044	T	C	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=33;PP=1705;ReadPosRankSum=2.440;SC=CCTGTGTCAATGCACCTTGAG;SOR=0.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=124;TCF=27;TCR=97;TR=42;WE=121201634;WS=121201606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,43:0.33:132
chr10	121202970	.	C	T	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.225;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.014;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=1;PP=558;ReadPosRankSum=-0.104;SC=GAGTTGGTGGCGGCCATGAAA;SOR=0.152;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=28;WE=121202978;WS=121202960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr10	121287019	rs3009921	G	A	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=21;PP=623;SC=CAGCACTGCCGTCACCATCAC;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=121287027;WS=121287009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	121287044	rs112504614	G	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.039;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=124;ReadPosRankSum=-1.246;SC=GACATACACCGACTTATGCGT;SOR=0.160;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=9;WE=121287052;WS=121287034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr10	121302244	rs77190301	G	A	96.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.14;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr10	121338401	rs4752334	T	A	4095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=104;PP=2965;SC=AATAAGACTCTGTAAGATGAA;SOR=3.470;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=18;TCR=104;TR=122;WE=121338409;WS=121338391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr10	121341531	.	G	C	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.016;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=1021;ReadPosRankSum=-0.235;SC=TCTGAAATCAGAGCATTTGGT;SOR=0.273;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=64;TCF=29;TCR=35;TR=43;WE=121341539;WS=121341521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,43:0.65:66
chr10	121341671	.	G	C	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=34;PP=1054;ReadPosRankSum=0.696;SC=AATGCAGCAGGAGTACTTACT;SOR=0.665;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=18;TCR=44;TR=48;WE=121341679;WS=121341661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,48:0.76:63
chr10	121347839	rs146020828	TTTTC	T	1652.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=34;PP=1569;SC=ATTCATCACCTTTTCTTTCTT;SOR=5.186;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=72;TCF=1;TCR=71;TR=35;WE=121347850;WS=121347829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	121429633	rs2234962	T	C	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.159;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=364;ReadPosRankSum=-0.462;SC=AGATAAACAGTGTGGACAGGT;SOR=1.030;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=83;TCF=22;TCR=61;TR=28;WE=121429641;WS=121429623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,29:0.32:91
chr10	121435955	rs196294	A	C	3839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=35;PP=2965;SC=TTAAAAATATATTTTTGTGTC;SOR=1.733;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=78;TCR=35;TR=113;WE=121435963;WS=121435945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr10	121436362	rs196295	A	G	3971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=52;PP=2965;SC=TGGAGAAGGTACAGGGGCTGG;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=119;TCF=67;TCR=52;TR=119;WE=121436370;WS=121436352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr10	121564859	rs2273748	A	G	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=563;SC=CTATGATTAAATTAAAGATTT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=121564867;WS=121564849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	121565015	rs2273749	C	G	1859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=31;PP=1434;SC=ACTCTGGGATCTGTAAAATAG;SOR=1.034;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=23;TCR=31;TR=54;WE=121565023;WS=121565005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr10	121597897	rs11199103	A	G	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=497;SC=TTAGTTTATAACATATGCTTT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=121597905;WS=121597887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	121657801	rs144326454	CTG	C	760.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=757;SC=AAAGAAAAAACTGTTTTTTTC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=121657810;WS=121657791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	121663483	rs2475304	C	T	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=22;NR=0;PP=631;SC=CCACCTCTCTCGGCCTCCCAG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=121663491;WS=121663473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	121678896	rs2475300	C	G	2248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=2;PP=2059;SC=CGTAGATCAGCAGTCATTATA;SOR=6.091;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=61;TCR=2;TR=63;WE=121678904;WS=121678886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr10	121679013	rs2475298	A	G	6147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=107;NR=79;PP=2965;SC=TGTTGAAAATAAAGAAGTCCT;SOR=1.014;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=188;TCF=108;TCR=80;TR=186;WE=121679021;WS=121679003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr10	121685448	rs6585564	A	T	1087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=3;PP=869;SC=CCTAAGAAGTAGCTAATCATT;SOR=4.047;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=121685456;WS=121685438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	121717932	rs11199132	G	A	2081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=19;PP=1652;SC=CCAAGGGAATGTGAGCCTCTG;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=65;TCF=45;TCR=20;TR=64;WE=121717940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr10	121717956	rs34665773	GT	G	1690.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=25;PP=961;SC=GCAAGTGATGGTTTTTTTTTT;SOR=1.098;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=38;TCR=30;TR=56;WE=121717964;WS=121717946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	121718112	rs11199134	C	T	1943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=44;PP=1598;SC=GCAGAAGTCACGAGCAGGGTG;SOR=2.119;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=17;TCR=44;TR=61;WE=121718120;WS=121718102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr10	122216790	rs10886691	A	T	2109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=4;PP=1683;SC=GCACCAGCTGACGCCGCGGGA;SOR=5.549;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=59;TCR=4;TR=63;WE=122216798;WS=122216780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	122263555	rs2478418	A	T	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=37;PP=1038;SC=AAAGAGAAGGAGAGCAGCCCA;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=37;WE=122263563;WS=122263545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	122273276	rs5788426	CT	C	1185.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=0;PP=858;SC=ATACATCATCCTTTTTTTTTT;SOR=7.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=46;WE=122273284;WS=122273266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr10	122334561	rs4751791	C	T	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=324;ReadPosRankSum=1.495;SC=GTGTGCAAGACGGCAGACGGA;SOR=0.456;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=19;WE=122334569;WS=122334551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr10	122348969	rs1047369	C	T	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.596;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=625;ReadPosRankSum=-0.864;SC=CAGCTGACAGCGCACCCAGCT;SOR=0.313;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=27;WE=122348977;WS=122348959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr10	122619466	rs3217470	TAC	T	1739.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=0;PP=2022;SC=GGAATATTGATACACACACAC;SOR=7.903;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=59;TCR=0;TR=43;WE=122619475;WS=122619456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr10	122622121	rs3816173	A	C	270.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=222;SC=TATGTTATGAATGCATAACAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=122622129;WS=122622115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	122626079	.	A	C	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.579;ClippingRankSum=0.000;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.341;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=12;PP=648;ReadPosRankSum=-0.069;SC=TTTTATGTGAAGATCCAGATC;SOR=0.965;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=164;TCF=114;TCR=50;TR=46;WE=122626087;WS=122626069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,49:0.28:173
chr10	122630587	rs4281410	A	G	953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=0;PP=788;SC=TTATACTTTTAGACCTGAAGA;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=122630595;WS=122630577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	122649482	rs2289337	A	G	2322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.494;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=48;PP=1903;ReadPosRankSum=0.412;SC=AATTAATAGCAATGTACAATG;SOR=1.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=73;TCF=25;TCR=48;TR=72;WE=122649490;WS=122649472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,75:0.99:76
chr10	122663585	rs1652727	G	A	1910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=22;PP=1503;SC=GGGTTAATCTGCAGGAAGTGA;SOR=1.467;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=40;TCR=22;TR=62;WE=122663593;WS=122663575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr10	122664694	rs10788127	G	A	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=86;SC=TTATGTTTCAGAATTTAAATC;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=122664702;WS=122664684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	122664939	rs138045075	C	T	1273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=964;ReadPosRankSum=0.072;SC=GTAGGTGGTTCCAAGTTTCAA;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=86;TCF=52;TCR=34;TR=49;WE=122664947;WS=122664929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,50:0.59:85
chr10	122664967	rs1866516	C	T	2828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=51;PP=2137;SC=CCTCAACATTCGGGATAGAAA;SOR=0.848;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=42;TCR=51;TR=93;WE=122664975;WS=122664957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr10	122665285	rs1652726	A	C	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=5;PP=955;SC=CAAGCAGAGCATAGCCTGTAT;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=35;WE=122665293;WS=122665275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	123238968	rs3135826	T	C	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=450;ReadPosRankSum=-1.471;SC=ATACATAATTTGAATATATTT;SOR=0.831;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=21;WE=123238976;WS=123238958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
chr10	123239112	rs1047057	G	A	3578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=55;PP=2825;SC=TCCACAGCCAGTACGCACGGC;SOR=0.951;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=48;TCR=55;TR=103;WE=123239120;WS=123239102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr10	123243197	rs2278202	G	A	1380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=10;PP=1233;SC=GGGGCTTCTAGAAGGAAGTTC;SOR=2.476;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=43;WE=123243205;WS=123243187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr10	123246732	rs148450955	TTTCTAAGGCCAGCTCCTGCACC	T	772.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=2925;SC=AAATCTGTCCTTTCTAAGGCC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=123246761;WS=123246722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	123247037	rs2981461	C	T	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.75;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	123247044	rs2981460	T	C	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.27;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	123277666	rs60468962	G	GTA	1178.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.857;NF=2;NR=24;PP=1135;ReadPosRankSum=1.476;SC=GTAGCGTCCAGTAGTACATTC;SOR=0.798;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=49;TCF=3;TCR=46;TR=26;WE=123277674;WS=123277656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,30:0.60:50
chr10	123277742	rs2420942	C	T	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=475;SC=AAGGATCAACCATGCAACCAA;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=123277750;WS=123277732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	123279745	rs2981448	C	T	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=10;PP=265;SC=AATAAATAAGCTGTGTTGTCC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=123279753;WS=123279735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	123298158	rs1047100	T	C	4844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=67;PP=2965;SC=CATTCTCCACTACACAGGTAT;SOR=0.803;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=144;TCF=77;TCR=67;TR=144;WE=123298166;WS=123298148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr10	123549691	rs35350755	T	G	1845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=13;PP=1536;SC=TACCTGCTTCTGGGTCCTGGT;SOR=2.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=53;TCR=13;TR=66;WE=123549699;WS=123549681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	123596254	rs4237536	T	C	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=7;PP=662;SC=TCTTGGGACATGAATGAATGT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=123596262;WS=123596244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	123673202	rs112026227	A	C	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=3.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.61;ReadPosRankSum=-0.295;SOR=1.233;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,39:0.35:110
chr10	123673206	rs11200251	C	T	4129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=97;NR=10;PP=1597;SC=AGTAGCAGTACATGACTGTAT;SOR=4.504;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=98;TCR=10;TR=107;WE=123673214;WS=123673192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr10	123673339	rs10749435	T	C	6671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=120;PP=2965;SC=CCCCTTTAGCTAGAAATTTCA;SOR=1.115;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=205;TCF=84;TCR=121;TR=204;WE=123673347;WS=123673329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr10	123681962	rs10887023	T	C	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=17;PP=660;SC=ATGTCTTATATATTTTTCACT;SOR=1.697;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=123681970;WS=123681952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	123719835	rs10887033	T	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=0.700;SC=AAATATATTTTCTCTAAAACT;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=7;WE=123719843;WS=123719825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr10	123724701	rs34074742	AC	A	2695.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=1;PP=2619;SC=CTGGCTCCAGACCCGCACACT;SOR=7.083;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=67;TCF=66;TCR=1;TR=63;WE=123724713;WS=123724691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr10	123724705	rs11351821	G	A	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=489;ReadPosRankSum=0.186;SC=CTCCAGACCCGCACACTTAGA;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=70;TCR=1;TR=24;WE=123724713;WS=123724691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,29:0.40:73
chr10	123724767	rs4752626	T	G	5573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=138;NR=20;PP=2965;SC=TTAACTTTAATGTGTTTTTTT;SOR=3.858;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=159;TCF=139;TCR=20;TR=158;WE=123724775;WS=123724757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr10	123781339	rs2461221	A	G	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=683;ReadPosRankSum=-0.615;SC=ATGTGACCGTAGAGATAAACA;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=26;WE=123781347;WS=123781329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,29:0.81:36
chr10	123792487	rs5788528	A	AAAC	231.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.07;ReadPosRankSum=-0.099;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr10	123792509	.	A	AACT	147.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.03;ReadPosRankSum=-0.747;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr10	123792527	rs11361502	AC	A	1002.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.30;QD=33.42;SOR=4.548;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr10	123842065	rs2459103	A	G	940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=2;PP=819;SC=AGGGCACTTGATGCCCTTTTG;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=123842073;WS=123842055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	123845322	rs7073433	T	C	3777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=80;PP=2965;SC=AATGGAGTGCTGGGCCACTTC;SOR=1.299;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=52;TCR=80;TR=132;WE=123845330;WS=123845312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr10	123892060	rs12416172	G	A	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.054;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=534;ReadPosRankSum=0.127;SC=GCGAAACTCCGTCTCAAAACA;SOR=1.424;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=77;TCF=63;TCR=14;TR=29;WE=123892068;WS=123892050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,29:0.35:82
chr10	123970530	rs2295873	T	C	2359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.398;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=55;PP=1641;ReadPosRankSum=-1.174;SC=GAGCCCGCTGTGGGGCCCAAA;SOR=0.551;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=145;TCF=58;TCR=87;TR=94;WE=123970538;WS=123970520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,97:0.66:148
chr10	123970569	rs2295874	C	T	2230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-7.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=60;PP=1697;ReadPosRankSum=0.861;SC=TCAGAGAGTGCAGAAGGGGTT;SOR=0.685;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=33;TCR=89;TR=82;WE=123970577;WS=123970559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,85:0.68:125
chr10	123970722	rs2295876	T	A	2546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.209;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=22;PP=1991;ReadPosRankSum=-0.098;SC=GCCAAAGGGCTCTCCGTAAGG;SOR=1.438;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=129;TCF=92;TCR=37;TR=89;WE=123970730;WS=123970712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,93:0.70:132
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chr10	123984442	rs2281671	G	A	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=398;SC=GTGCACAGCAGTGATGGACTG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=123984450;WS=123984432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr10	124001363	rs4752674	C	G	1277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.191;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=6;PP=1010;ReadPosRankSum=-0.115;SC=TGAAGGTGACCCTGGAAGTTG;SOR=1.096;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=93;TCF=81;TCR=12;TR=57;WE=124001371;WS=124001353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,56:0.61:92
chr10	124001539	rs11200496	G	C	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=27;PP=606;ReadPosRankSum=-0.399;SC=ACCTGCGGGGGCTCAGGCCGG;SOR=0.583;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=106;TCF=25;TCR=81;TR=36;WE=124001547;WS=124001529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,40:0.35:113
chr10	124008927	rs2273794	T	C	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=154;ReadPosRankSum=0.057;SC=TCTCATGGGCTCCTGTGCTCC;SOR=0.132;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=9;WE=124008935;WS=124008917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr10	124008959	rs2273795	G	T	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.904;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=308;ReadPosRankSum=0.291;SC=GTGGCAGCTGGGGCCAGACCA;SOR=0.283;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=17;WE=124008967;WS=124008949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr10	124009261	rs10887111	G	C	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=204;ReadPosRankSum=-1.196;SC=GACAGGCTGGGCTTCCCTGGC;SOR=0.275;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=11;WE=124009269;WS=124009251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr10	124013604	rs3763763	C	A	1461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FS=9.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.09;ReadPosRankSum=1.212;SOR=0.318;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:171,69:0.29:240
chr10	124036226	rs7086403	T	C	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=648;ReadPosRankSum=0.502;SC=GATTTCCTTCTTGCTATACAA;SOR=0.751;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=81;TCF=66;TCR=15;TR=34;WE=124036234;WS=124036216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,39:0.45:86
chr10	124036494	rs7090214	T	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.414;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=91;ReadPosRankSum=-2.699;SC=AATGGCCCATTATTCCTGGGA;SOR=0.016;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=7;WE=124036502;WS=124036484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr10	124043629	rs7098436	T	C	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=66;ReadPosRankSum=0.540;SC=GTGAGTGAAGTCAAGCTTGGT;SOR=0.089;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=6;WE=124043637;WS=124043619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr10	124058583	rs147355457	G	T	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.916;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=438;ReadPosRankSum=-0.994;SC=GTTCCTCTAGGGGGGACGCAG;SOR=0.830;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=28;WE=124058591;WS=124058573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,28:0.41:69
chr10	124066652	rs7082865	G	A	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.254;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=283;ReadPosRankSum=0.909;SC=TACAAGCAGCGTGATTTTGTG;SOR=1.127;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=65;TCF=35;TCR=30;TR=20;WE=124066660;WS=124066642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,20:0.29:68
chr10	124089036	rs2421013	G	A	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.831;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=377;ReadPosRankSum=-0.741;SC=GACATAGGACGGAGCTTGAGG;SOR=2.096;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=82;TCF=30;TCR=52;TR=23;WE=124089044;WS=124089026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,25:0.28:90
chr10	124091855	rs5788544	A	AG	396.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=11;NR=1;PP=381;SC=AAACCTGGTGAGGGGGGCAGG;SOR=3.912;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=12;WE=124091863;WS=124091845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	124091921	rs4627016	C	T	1740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=12;PP=1452;SC=AGGATCCCACCGTGGTCAGCT;SOR=2.480;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=42;TCR=12;TR=54;WE=124091929;WS=124091911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr10	124094283	rs10788282	C	T	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.990;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.207;NF=18;NR=6;PP=443;ReadPosRankSum=0.187;SC=ATGATCTGCCCGCCTCAGCCT;SOR=0.154;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=58;TCF=49;TCR=9;TR=24;WE=124094291;WS=124094273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr10	124095982	rs3817280	A	G	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=2.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.07;ReadPosRankSum=1.277;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,16:0.18:87
chr10	124096035	rs3817281	T	C	1437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.93;ReadPosRankSum=1.642;SOR=0.745;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,44:0.27:161
chr10	124096041	rs1129973	T	C	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=2.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.98;ReadPosRankSum=2.126;SOR=0.900;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,45:0.28:162
chr10	124096061	rs1048347	A	C	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.162;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=17;PP=951;ReadPosRankSum=1.944;SC=GAGCACAACCACGTCAGCCTG;SOR=0.897;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=173;TCF=112;TCR=61;TR=54;WE=124096069;WS=124096051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,52:0.30:175
chr10	124096160	rs10510108	A	G	2075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.171;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=52;PP=1556;ReadPosRankSum=-0.460;SC=CAGATCAAGCAGAAGTTTGGG;SOR=0.562;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=249;TCF=109;TCR=140;TR=96;WE=124096168;WS=124096150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,99:0.39:255
chr10	124096209	rs3817284	C	T	1725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.959;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=57;PP=1302;ReadPosRankSum=0.565;SC=CAAGTGTTCACGTTGTCTTTT;SOR=0.876;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=212;TCF=60;TCR=152;TR=77;WE=124096217;WS=124096199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,77:0.36:215
chr10	124096306	rs3817285	T	C	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=40;PP=911;SC=TGAAGATCCCTGGAAAATCTG;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=40;WE=124096314;WS=124096296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	124097427	rs11200559	G	T	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.038;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=388;ReadPosRankSum=1.249;SC=CCATAGTTGAGAGCCAGCATT;SOR=0.152;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=18;WE=124097435;WS=124097422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr10	124097755	rs2271597	G	A	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=29;PP=882;SC=ATTTGAGGGTGGAACGTGCCA;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=124097763;WS=124097745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	124152936	rs3838776	G	GA	1117.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=30;PP=1350;SC=ACAGGCTTTAGATTTGTCTTC;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=124152944;WS=124152926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr10	124166018	rs41310276	T	G	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.329;HP=4;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=138;ReadPosRankSum=0.111;SC=TTAGCAAGGTTTTTCAGCTAC;SOR=0.877;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=34;TCF=20;TCR=14;TR=10;WE=124166026;WS=124166008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,10:0.26:38
chr10	124175273	rs4751892	G	A	209.28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.6272;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=162;ReadPosRankSum=-0.282;SC=ATCTGTTTCTGACTAATCTAA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=124175281;WS=124175263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr10	124176452	rs4612730	G	A	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.885;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=521;ReadPosRankSum=0.857;SC=TGAGGGCAGGGGTTTCTTACT;SOR=0.307;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=27;WE=124176460;WS=124176442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,28:0.67:42
chr10	124183690	.	T	TC	148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=17.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQRankSum=0.436;QD=5.95;ReadPosRankSum=3.224;SOR=4.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr10	124183732	rs4405249	T	C	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.222;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=456;ReadPosRankSum=0.795;SC=AACCTCTTCGTGTAATACCAC;SOR=0.483;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=37;TCF=17;TCR=20;TR=24;WE=124183740;WS=124183722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr10	124186714	rs2292626	C	T	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=596;ReadPosRankSum=-0.017;SC=TTTAATGCTTCCTTGTAGTAT;SOR=1.923;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=23;WE=124186722;WS=124186704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,28:0.72:39
chr10	124189197	rs1045216	A	G	1626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.015;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=24;PP=1188;ReadPosRankSum=-0.212;SC=CAACGCAGCCACCGCCACCTC;SOR=1.231;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=112;TCF=67;TCR=45;TR=66;WE=124189205;WS=124189187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,69:0.60:115
chr10	124214355	rs2736911	C	T	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.457;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=591;ReadPosRankSum=1.920;SC=TTCCACTCTGCGAGAGTCTGT;SOR=0.541;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=112;TCF=59;TCR=53;TR=39;WE=124214363;WS=124214345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,41:0.33:123
chr10	124214448	rs10490924	G	T	1620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.039;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=33;PP=1213;ReadPosRankSum=0.761;SC=GATCCCAGCTGCTAAAATCCA;SOR=1.142;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=90;TCF=40;TCR=50;TR=56;WE=124214456;WS=124214438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,59:0.63:94
chr10	124214600	rs144224550	G	GGT	1250.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.147;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=998;ReadPosRankSum=0.500;SC=ATTCTGGAGTGGTGCCCTGCA;SOR=0.497;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=24;WE=124214608;WS=124214590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
chr10	124216384	rs72511653	C	CTA	1437.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=1;PP=1388;SC=CGTCATGTGTCTTTAAAAATG;SOR=4.680;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=31;WE=124216392;WS=124216374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	124221270	rs1049331	C	T	104.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	124221276	rs2293870	G	T	104.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	124266991	rs147948338	GTTGT	G	239.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=2.859;QD=4.89;ReadPosRankSum=-0.254;SOR=0.073;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,10:0.20:49
chr10	124271589	rs2672586	G	A	1789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.29;SOR=2.208;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr10	124271589	.	GGAGTCG	AGAGTCA,AGAGTCG	367	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=5,11;NR=16,33;PP=332,367;QD=18.3556130887;SC=AGCGTGAGTTGGAGTCGTTTT;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=21,44;WE=124271603;WS=124271579;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.48:44
chr10	124271595	rs2272599	G	A	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.02;ReadPosRankSum=0.555;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr10	124320194	rs2981745	T	C	2448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=7;PP=2048;SC=ATAGCAGCAGTAGAAATATAC;SOR=4.003;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=64;TCR=7;TR=71;WE=124320202;WS=124320184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr10	124325409	rs3019515	T	G	4028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=49;PP=2965;SC=ACGGTGAAGCTAAAGCCAATT;SOR=1.345;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=86;TCR=49;TR=135;WE=124325417;WS=124325399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr10	124325569	rs3019516	A	G	1557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=42;PP=1245;SC=CTCCTCTGCTACTGTTGGCTA;SOR=4.849;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=3;TCR=43;TR=45;WE=124325577;WS=124325559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr10	124325631	rs2981768	T	C	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=20;PP=446;SC=CCTTGTCGAATGCAGGAATGC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=124325639;WS=124325621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	124329580	rs11524819	C	A	1898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.16;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	124329583	rs11524820	G	A	1933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.95;SOR=4.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	124329672	rs3740220	TC	CT	4038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=50;PP=2947;SC=CTTTTCCACCTCGCAGCTTCA;SOR=1.038;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=40;TCR=54;TR=87;WE=124329681;WS=124329662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr10	124329710	rs11523871	C	A	2109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=46;PP=1722;SC=GCCCTTGGATCCAACTGTAGC;SOR=1.478;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=25;TCR=46;TR=71;WE=124329718;WS=124329700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr10	124329746	rs3740222	A	T	1524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=41;PP=1321;SC=TTATGGGGGAACCCTGTGGGC;SOR=2.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=9;TCR=41;TR=50;WE=124329754;WS=124329736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	124329801	rs3740223	G	A	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=727;SC=ATCCAGAAGAGATGCAGAAGC;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=124329809;WS=124329791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	124330240	rs2981790	A	G	2127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=2;PP=1749;SC=CCCAGCCTGGAGCCAGTACGG;SOR=6.059;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=59;TCF=57;TCR=2;TR=59;WE=124330260;WS=124330230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr10	124330252	rs2981791	A	G	2516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=3;PP=2045;SC=CCAGTACGGTAACACAGTGAT;SOR=5.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=67;TCR=3;TR=70;WE=124330260;WS=124330230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr10	124330427	rs3013236	C	T	4346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=84;PP=2965;SC=CCCTCGGAGTCGACCCTGGAG;SOR=1.461;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=131;TCF=47;TCR=84;TR=130;WE=124330435;WS=124330417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr10	124331867	rs7084792	C	T	2748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=46;PP=2231;SC=TGGAGTCAACCGTAGCAGAAG;SOR=0.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=40;TCR=46;TR=86;WE=124331875;WS=124331857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr10	124331944	rs2277229	C	T	2819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=41;PP=1441;SC=TCATCTCTGACCCAGATGAGG;SOR=1.376;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=23;TCR=41;TR=64;WE=124331971;WS=124331934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	124331957	rs2277230	T	C	2629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.14;SOR=1.823;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	124331963	rs2277231	A	G	2325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.60;SOR=2.348;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr10	124332035	rs2277232	T	C	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=550;SC=TATGTGCAACTCTGAGTCCAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=124332043;WS=124332025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	124333308	rs2277235	G	A	1904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=28;PP=1412;SC=ATCCCTGTAGGCTCATTACCC;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=28;TCR=29;TR=56;WE=124333316;WS=124333298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr10	124335866	rs1985025	C	T	2431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=10;PP=2038;SC=GCCCTGAGACCTTGTGCCTCA;SOR=3.136;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=60;TCR=10;TR=70;WE=124335874;WS=124335856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr10	124399467	rs2261655	C	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.99;ReadPosRankSum=-1.539;SOR=0.297;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,4:0.19:21
chr10	124399985	rs2261660	G	T	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.371;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=413;ReadPosRankSum=-0.855;SC=GTCTTTATGCGATGGCCTTAA;SOR=1.035;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=64;TCF=16;TCR=48;TR=28;WE=124399993;WS=124399975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
chr10	124402677	rs1052715	A	G	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.895;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=30;PP=1091;ReadPosRankSum=1.723;SC=ACTCCTCGCCATCTCTTCGCA;SOR=0.965;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=247;TCF=154;TCR=93;TR=81;WE=124402685;WS=124402667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,83:0.33:252
chr10	124402944	rs8441	G	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=135;ReadPosRankSum=1.061;SC=ACTGTCCACCGGGGCGCAGAC;SOR=1.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=8;WE=124402952;WS=124402934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr10	124436375	rs72836153	G	A	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.661;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=561;ReadPosRankSum=0.497;SC=TGAACCCCGGGGAGATAGTCA;SOR=0.853;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=79;TCF=42;TCR=37;TR=28;WE=124436383;WS=124436365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,29:0.36:80
chr10	124436530	rs3019500	G	T	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=226;ReadPosRankSum=0.633;SC=ACAATTTGACGACATTTTCAC;SOR=0.432;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=12;WE=124436538;WS=124436520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr10	124457452	rs2947594	C	T	6411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=132;PP=2965;SC=GGTTTCTTTGCGGGGAGGAAT;SOR=1.422;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=71;TCR=132;TR=203;WE=124457460;WS=124457442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr10	124457906	rs2901343	C	T	2648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.970;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=61;PP=2054;ReadPosRankSum=-0.453;SC=GTTTGTAGTCCGGAGACAGCA;SOR=1.029;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=153;TCF=59;TCR=94;TR=95;WE=124457914;WS=124457896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,99:0.63:158
chr10	124459139	rs11813597	T	C	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=703;ReadPosRankSum=-0.931;SC=ACCGCAACGGTGAAGCAGAAC;SOR=0.593;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=33;WE=124459147;WS=124459129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,37:0.66:56
chr10	124595874	rs11365591	GA	G	226.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=0;NR=13;PP=136;SC=ATGCTGTCAGGAAAAAAAAAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=13;WE=124595882;WS=124595864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	124653938	rs77686627	T	C	352.53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=321;ReadPosRankSum=-0.609;SC=GCAGCCCAGCTTCATGAAGGC;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=124653946;WS=124653928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr10	124671379	rs77069200	G	A	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.195;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=411;ReadPosRankSum=0.658;SC=ACCCCTGAGTGAGTGAGGACA;SOR=1.927;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=20;WE=124671387;WS=124671369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,21:0.41:51
chr10	124711589	rs147647614	CTTTTAA	C	190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=191;ReadPosRankSum=1.412;SC=TATATTGTCACTTTTAATAGT;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=124711602;WS=124711579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr10	124749740	rs11190	A	C	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.097;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=672;ReadPosRankSum=-0.989;SC=AGAACTTAACAAGCTCAAAGC;SOR=0.984;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=28;WE=124749748;WS=124749730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr10	124768583	rs12263012	G	A	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.778;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=604;ReadPosRankSum=-0.637;SC=CGCGGCAGCAGGCTGGTGAGT;SOR=0.245;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=54;TCF=32;TCR=22;TR=35;WE=124768591;WS=124768573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,37:0.66:56
chr10	124787047	rs10794584	T	C	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.281;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=163;ReadPosRankSum=-0.493;SC=CTGCTGCTGCTATGTAAGAAG;SOR=0.941;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=14;WE=124787055;WS=124787037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr10	124787118	rs10902863	G	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.909;NF=1;NR=9;PP=198;ReadPosRankSum=-2.801;SC=TGTAAGTCCAGTTAAACCTCT;SOR=0.191;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=10;WE=124787126;WS=124787108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr10	124810746	rs3833736	C	CT	113.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5464;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.282;NF=1;NR=6;PP=92;ReadPosRankSum=0.282;SC=GTAATTCAGCCTTTTTTTTTT;SOR=0.859;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=7;WE=124810754;WS=124810736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr10	124812487	rs2421166	A	G	1931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=0;PP=1728;SC=CACTAACAGTAAATCCATGTT;SOR=8.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=57;TCR=0;TR=57;WE=124812495;WS=124812477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	124812685	rs11307362	AT	A	2350.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.864;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.290;NF=4;NR=84;PP=1402;ReadPosRankSum=2.061;SC=TGGTAAATAGATTTTTTTTTT;SOR=3.679;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=114;TCF=8;TCR=106;TR=88;WE=124812693;WS=124812675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,99:0.98:101
chr10	124896817	rs45492702	G	A	3018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.546;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=43;PP=2219;ReadPosRankSum=1.109;SC=TGGAAGAAGGGCGCTGAAAGT;SOR=0.740;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=175;TCF=98;TCR=77;TR=100;WE=124896825;WS=124896807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,110:0.59:186
chr10	125425822	rs10902974	T	G	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
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chr10	125426565	rs4980313	G	C	2297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=54;PP=1733;SC=TGCAGACGCTGGTGCTGCTGG;SOR=1.795;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=24;TCR=54;TR=77;WE=125426573;WS=125426555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr10	125426627	rs3808964	G	T	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=582;ReadPosRankSum=-1.189;SC=GGGAACAGCCGCGCGGGATCT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=27;WE=125426635;WS=125426617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr10	125473208	rs12256385	G	A	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.770;NF=0;NR=12;PP=257;ReadPosRankSum=0.705;SC=TACAATTCAAGATGGGATTTG;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=12;WE=125473216;WS=125473198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr10	125506302	rs7088479	T	C	2188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=5;PP=1755;SC=TCGTCTCTTCTGCCCCCGCAG;SOR=4.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=62;TCR=5;TR=67;WE=125506310;WS=125506292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr10	125521533	rs10794566	G	A	2699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.064;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=42;PP=2004;ReadPosRankSum=1.141;SC=ACACGTGGTCGTCGGGGGTGG;SOR=1.018;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=151;TCF=85;TCR=66;TR=102;WE=125521541;WS=125521523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,105:0.67:157
chr10	125521590	rs10794567	G	A	4559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=79;PP=2965;SC=GGTCGTAGGGGTACGCCACCA;SOR=0.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=70;TCR=80;TR=149;WE=125521598;WS=125521580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr10	125521721	rs10751743	G	A	1893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=47;PP=1467;SC=AAAATAAGCAGGAAGTCATTT;SOR=3.500;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=7;TCR=48;TR=54;WE=125521729;WS=125521711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr10	125521751	rs10794568	C	G	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=38;PP=1106;SC=AGCTGTCAAACAGGGACATAG;SOR=5.283;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=40;WE=125521759;WS=125521741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	125526689	rs1896392	G	A	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=395;ReadPosRankSum=-0.771;SC=GTGAGAGTGTGAAGAATGCAC;SOR=1.893;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=16;WE=125526697;WS=125526679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr10	125527964	rs1219727	G	A	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=376;ReadPosRankSum=-0.358;SC=ATTTTGCATAGCCCTAGGGCC;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=19;WE=125527972;WS=125527954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr10	125528007	rs1219726	A	G	1360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-5.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=4;PP=546;ReadPosRankSum=-0.323;SC=CTCGCTGCCCATGTCCTATTG;SOR=1.064;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=54;TCF=47;TCR=7;TR=33;WE=125528015;WS=125527997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,34:0.63:54
chr10	125528048	rs1219725	G	A	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=822;ReadPosRankSum=0.865;SC=TTACCCCTTCGTAGGCCTTCT;SOR=0.657;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=40;WE=125528056;WS=125528038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,42:0.61:69
chr10	125528297	rs1219724	T	G	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.506;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=534;ReadPosRankSum=0.348;SC=GGCCAAACGGTGCTTGTCACA;SOR=0.199;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=27;WE=125528305;WS=125528287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,28:0.82:34
chr10	125530746	rs727416	C	T	1050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=32;PP=922;SC=GGATAATGCCCACTTTCCTTC;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=125530754;WS=125530736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	125602021	rs10794571	C	T	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=181;ReadPosRankSum=1.061;SC=AGAAAGAAAGCGGTGTTCTTC;SOR=0.874;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=55;TCF=12;TCR=43;TR=13;WE=125602029;WS=125602011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,14:0.24:58
chr10	125602943	rs6599625	G	A	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=4.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-1.219;QD=9.40;ReadPosRankSum=1.455;SOR=0.359;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,35:0.39:89
chr10	125622250	rs11299200	CA	C	5951.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=120;PP=2951;SC=CTGGAAAGGACAAATGCTTGT;SOR=2.179;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=147;TCF=24;TCR=123;TR=144;WE=125622258;WS=125622240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr10	125650793	rs28513406	A	C	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-4.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=2;PP=625;ReadPosRankSum=0.638;SC=GACACACACAATGGGAGAAGC;SOR=0.446;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=28;WE=125650801;WS=125650783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,28:0.72:39
chr10	125651063	rs143257438	T	C	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=936;ReadPosRankSum=0.511;SC=CCAGATCTCCTGCCCGTAATA;SOR=0.642;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=90;TCF=44;TCR=46;TR=53;WE=125651071;WS=125651053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,57:0.61:94
chr10	125673492	rs7893288	A	G	1477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.246;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=1122;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGTGAGCACCAGAGTCAGGCC;SOR=0.180;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=83;TCF=46;TCR=37;TR=58;WE=125673500;WS=125673482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,60:0.71:84
chr10	125673547	rs4329614	T	G	1348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.887;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=1045;ReadPosRankSum=-0.376;SC=AATCCAACCTTAAAGGCAGGA;SOR=0.874;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=71;TCF=32;TCR=39;TR=43;WE=125673555;WS=125673537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,46:0.61:76
chr10	125780752	rs5788645	CG	C	2956.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=22;NR=33;PP=2031;SC=TCGGGGGGTACGGGGGGGGGG;SOR=0.949;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=91;TCF=42;TCR=49;TR=55;WE=125780772;WS=125780742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	125780759	rs4072194	G	C	3065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=34;PP=1730;SC=GTACGGGGGGGGGGGGTACAC;SOR=0.869;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=67;TCF=32;TCR=35;TR=62;WE=125780772;WS=125780742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr10	125780958	rs9422312	C	T	5545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.682;SC=ATATTTTTACCACCCATGAAC;SOR=0.396;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=69;TCR=100;TR=166;WE=125780966;WS=125780948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,180:0.99:181
chr10	126086730	rs2459217	G	A	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=44;PP=1396;SC=ATCCCTTGCCGTATGTATGGG;SOR=3.300;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=7;TCR=44;TR=51;WE=126086738;WS=126086720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr10	126089656	rs2459215	T	G	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=16;PP=529;SC=CTAGATAAAATACCAGAGGAA;SOR=2.030;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=126089664;WS=126089646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	126089703	rs2491158	G	A	258.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=8;PP=197;SC=GCCTGTATTAGTTTCTAATTA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=126089711;WS=126089693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	126090430	rs17619406	A	G	6598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=129;PP=2965;SC=TCAATTCACCATGTCATTTCT;SOR=1.061;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=224;TCF=95;TCR=129;TR=224;WE=126090438;WS=126090420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr10	126090465	rs17681531	T	A	5078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=125;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.851;SC=CTACTAAGCATCCTTTTCCCC;SOR=1.157;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=167;TCF=41;TCR=126;TR=166;WE=126090473;WS=126090455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,168:0.99:169
chr10	126090562	rs2491159	T	C	1318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=45;PP=1106;SC=GCAATTCTCCTGCCTCAGCCT;SOR=6.273;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=47;TCF=1;TCR=46;TR=46;WE=126090570;WS=126090552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	126093939	rs113080459	T	C	595.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5032;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=457;ReadPosRankSum=-0.987;SC=GTACTTTTAATTCATATATTC;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=24;WE=126093947;WS=126093929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,23:0.88:26
chr10	126093991	rs9422807	T	C	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=8;SC=AGCACTATGATGCTAGTGAAA;SOR=2.242;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=34;WE=126093999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	126150338	rs2459213	C	T	233.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=149;SC=CCTGCCCCGCCCGCGGGACTA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=126150346;WS=126150328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	126150388	rs2491156	C	A	354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=2;PP=218;SC=GCGCCGGCGCCGGCGTCGGTT;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=126150396;WS=126150378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	126172863	rs6597801	A	G	2133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=43;PP=1704;SC=CTGAAGGAGCAAGGCCTGCGA;SOR=1.385;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=21;TCR=43;TR=64;WE=126172871;WS=126172853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr10	126301951	.	CCTCCTCCACCCCTGCCT	C	1213	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=19;MQ=62.07;NF=2;NR=15;PP=1213;QD=73.0588235294;SC=GAGAGCCCCGCCTCCTCCACC;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=54;TCF=3;TCR=51;TR=17;WE=126301975;WS=126301941;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:37,17:0.31:54
chr10	126301970	rs200382546	T	C	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=65.19;MQRankSum=3.605;QD=22.85;ReadPosRankSum=1.271;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr10	126301987	.	C	T	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.415;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.86;MQRankSum=1.833;QD=29.32;ReadPosRankSum=-3.618;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr10	126395123	rs7897256	T	C	3431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=26;PP=2597;SC=TTTGCTAAGCTTAGGTGCTCA;SOR=2.049;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=74;TCR=27;TR=100;WE=126395131;WS=126395113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr10	126454248	rs11245358	G	C	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=233;ReadPosRankSum=1.497;SC=GTGACAACCTGTAAAAGGTTA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=11;WE=126454256;WS=126454238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr10	126480233	rs2277264	C	T	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=203;ReadPosRankSum=0.501;SC=CCGCCGTCCCCTTCTCGGGGC;SOR=0.763;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=11;WE=126480241;WS=126480223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr10	126480556	rs10901821	T	C	147.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=138;SC=CGACGCCCTCTGCTCTACCCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=126480564;WS=126480546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	126505062	rs11451694	T	TA	446.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=297;ReadPosRankSum=-0.458;SC=AGATTTTGATTAAAAAAAAAA;SOR=2.494;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=17;WE=126505070;WS=126505052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,20:0.91:22
chr10	126508148	rs11597901	A	G	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=70;ReadPosRankSum=-0.031;SC=GTTAACCTACATAGATTTTTT;SOR=0.536;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=6;WE=126508156;WS=126508138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr10	126517989	rs2303611	G	A	3751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.379;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=96;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.249;SC=AGGATGGAGTGATGAAAGACA;SOR=1.233;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=219;TCF=74;TCR=145;TR=139;WE=126517997;WS=126517979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,140:0.63:223
chr10	126629204	rs7074163	G	A	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.371;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=550;ReadPosRankSum=0.422;SC=CACTATAAATGGTGTATGGAC;SOR=3.300;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=22;WE=126629212;WS=126629194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr10	126660781	rs3802700	A	T	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=31;PP=702;ReadPosRankSum=0.591;SC=GAAAGCACATAACATAGCTAC;SOR=1.954;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=31;WE=126660789;WS=126660771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,31:0.72:43
chr10	126662451	rs3740534	C	T	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=16;PP=456;SC=TTCACTGTTACAGAGTGAACA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=126662459;WS=126662441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	126673560	.	G	GA	1056.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.979;ClippingRankSum=0.000;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.638;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.678;NF=6;NR=35;PP=542;ReadPosRankSum=-0.524;SC=GAAGATGAATGAAAAAAAAAA;SOR=0.454;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=121;TCF=23;TCR=98;TR=41;WE=126673568;WS=126673550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,53:0.42:126
chr10	126686762	rs72828989	C	T	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.140;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=548;ReadPosRankSum=-0.080;SC=AGGCCAAGGCCGGAGATGAGA;SOR=1.819;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=112;TCF=37;TCR=75;TR=35;WE=126686770;WS=126686752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,38:0.32:119
chr10	126686827	rs1982225	T	A	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=34;PP=887;ReadPosRankSum=1.447;SC=CTCCTGAGACTCGGTTGTTGG;SOR=0.495;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=53;TCF=6;TCR=47;TR=39;WE=126686835;WS=126686817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,40:0.73:55
chr10	126692066	rs750600	C	A	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=378;ReadPosRankSum=-0.080;SC=GGATACCTGCCAGGAGGGAAG;SOR=0.627;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=21;WE=126692074;WS=126692056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,21:0.36:59
chr10	126692193	rs750599	C	T	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=79;ReadPosRankSum=0.663;SC=GAGGGCACCGCCTCCACCTGC;SOR=0.551;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=7;WE=126692201;WS=126692183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr10	126714714	rs2946994	G	C	1397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.506;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=12;PP=1108;ReadPosRankSum=0.254;SC=GCCACCTTCTGGTACGGTGAG;SOR=1.651;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=79;TCF=56;TCR=23;TR=50;WE=126714722;WS=126714704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,50:0.62:80
chr10	126714966	rs3012075	A	G	1544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.016;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=37;PP=1303;ReadPosRankSum=1.543;SC=TGCAGGGGGTACGTGGGGCTC;SOR=0.478;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=86;TCF=27;TCR=59;TR=56;WE=126714974;WS=126714956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,55:0.65:85
chr10	126715075	rs3781413	T	C	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.015;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=137;ReadPosRankSum=0.260;SC=AATAGGTGGCTGCCGTCTCCA;SOR=0.161;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=15;WE=126715083;WS=126715065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,15:0.25:61
chr10	126715159	.	A	AGCCGCAGGCTGGGGCTGCAGG	235.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.253;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.62;ReadPosRankSum=0.682;SOR=0.821;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,5:0.10:51
chr10	126715436	rs3781411	C	T	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.662;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=19;PP=1040;ReadPosRankSum=0.091;SC=CCCCTCCGCCCGCAGAAAGGC;SOR=0.622;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=95;TCR=51;TR=54;WE=126715444;WS=126715426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,54:0.37:146
chr10	126716337	.	A	C	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.351;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.889;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=1038;ReadPosRankSum=0.608;SC=ATTGGAAAAAAAATGACTGCG;SOR=1.549;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=81;TCF=23;TCR=58;TR=24;WE=126716354;WS=126716327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,26:0.31:85
chr10	126716346	rs2938006	C	T	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.688;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=36;PP=2509;ReadPosRankSum=-0.981;SC=AAAATGACTGCGGATGAGGCA;SOR=0.368;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=75;TCF=20;TCR=55;TR=53;WE=126716354;WS=126716327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,56:0.70:80
chr10	126721441	rs2839737	C	A	2311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.836;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=59;PP=1716;ReadPosRankSum=-0.573;SC=AAAGCCCAAACAGCCCCATTT;SOR=0.424;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=122;TCF=33;TCR=89;TR=83;WE=126721449;WS=126721431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,87:0.70:125
chr10	127419052	.	T	TTA	3247.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.441;ClippingRankSum=0.000;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=60.09;MQRankSum=0.662;NF=6;NR=50;PP=2954;ReadPosRankSum=0.174;SC=GGCCCTGAAGTACTAAGGTGC;SOR=0.826;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=98;TCF=13;TCR=85;TR=56;WE=127419062;WS=127419042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,80:0.71:113
chr10	127419054	rs188234716	C	G	3256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.980;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=51;PP=2962;ReadPosRankSum=0.639;SC=CCCTGAAGTACTAAGGTGCAT;SOR=0.896;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=102;TCF=20;TCR=82;TR=64;WE=127419062;WS=127419042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,79:0.71:112
chr10	127426430	rs3740181	A	G	3358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=7;PP=2764;ReadPosRankSum=1.135;SC=AACAAAAACAATATGTTGACC;SOR=3.486;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=84;TCR=7;TR=90;WE=127426438;WS=127426420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,96:0.99:97
chr10	127426588	rs3740180	C	A	4964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=115;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.844;SC=TCACTTTTTTCGTAAAGTTTG;SOR=1.498;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=31;TCR=116;TR=146;WE=127426596;WS=127426578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,154:0.99:155
chr10	127426835	rs3943225	G	T	1612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=8;PP=1288;SC=AAGTTAGATAGATAGTGAATG;SOR=2.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=48;WE=127426843;WS=127426825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr10	127436048	rs2296833	C	T	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.427;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=1;PP=530;ReadPosRankSum=0.806;SC=TATTTTAATGCAGTATTGGTA;SOR=1.012;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=102;TCF=94;TCR=8;TR=29;WE=127436056;WS=127436038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,31:0.29:106
chr10	127436411	rs2296832	T	C	6651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=127;NR=75;PP=2965;SC=ATTTTTTTCTTCCCCCTCAAA;SOR=1.257;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=202;TCF=127;TCR=75;TR=202;WE=127436419;WS=127436401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr10	127441573	rs10751530	G	T	3397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=96;PP=2868;ReadPosRankSum=-0.797;SC=TATGTGTGTGGGTATATATAC;SOR=4.235;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=101;TCF=4;TCR=97;TR=100;WE=127441581;WS=127441563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,103:0.99:104
chr10	127445408	rs4962313	G	T	2028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=46;PP=1605;SC=TTGAGACAAGGTCTCACTCTG;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=15;TCR=46;TR=61;WE=127445416;WS=127445398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr10	127460753	rs7922546	G	A	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.633;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=84;ReadPosRankSum=-0.166;SC=AGTGTCCTCCGCTAGCTCAGG;SOR=0.351;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=9;WE=127460761;WS=127460743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,9:0.20:44
chr10	127460952	rs10901424	G	T	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.473;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=400;ReadPosRankSum=-0.980;SC=CACACCATGGGTGCTGGGTGA;SOR=0.264;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=18;WE=127460960;WS=127460942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr10	127462525	rs10901425	A	G	3593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=80;PP=2872;ReadPosRankSum=-0.867;SC=CTGGTCGGCCACGGACAGTTG;SOR=0.927;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=32;TCR=81;TR=112;WE=127462533;WS=127462515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,116:0.99:117
chr10	127462833	rs28381281	C	T	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=189;ReadPosRankSum=-0.132;SC=ACCTGCGCACCGCCTCGGCCA;SOR=1.445;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=9;WE=127462841;WS=127462823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr10	127478064	rs35711389	C	G	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=1.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.42;ReadPosRankSum=-0.010;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,13:0.21:61
chr10	127483573	rs3740179	G	A	2072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.029;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=55;PP=1587;ReadPosRankSum=-0.440;SC=AACAAGATCAGTCCTTGCCAT;SOR=0.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=26;TCR=70;TR=75;WE=127483581;WS=127483563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,77:0.78:99
chr10	127484617	rs2281955	C	G	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=437;ReadPosRankSum=-0.832;SC=CCTTCACCCTCTGCTTCCCCA;SOR=0.976;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=18;WE=127484625;WS=127484607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr10	127484653	rs2281954	G	A	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.207;HP=7;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=635;ReadPosRankSum=2.268;SC=TGCCAGAACCGCCCCCAAACG;SOR=1.688;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=29;WE=127484661;WS=127484643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,31:0.77:40
chr10	127491732	rs74366862	CT	C	1250.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.632;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.699;NF=1;NR=35;PP=1288;ReadPosRankSum=0.871;SC=AGCTCTGTTCCTTATGGACAA;SOR=0.234;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=36;WE=127491740;WS=127491722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,39:0.70:56
chr10	127500718	rs10901444	C	G	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=6.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=0;PP=1234;ReadPosRankSum=1.458;SC=CTGAGTTAAACTGTTTTTTAA;SOR=1.751;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=67;TCF=67;TCR=0;TR=47;WE=127500726;WS=127500708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,47:0.69:68
chr10	127504660	rs2366044	A	G	3115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=19;PP=2677;SC=ATAAAATAAGAAGACAGTAAA;SOR=2.694;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=97;TCF=77;TCR=20;TR=96;WE=127504668;WS=127504650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr10	127515069	rs10159992	C	T	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=242;ReadPosRankSum=0.360;SC=TTGTATTCTTCACAGATGGCA;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=11;WE=127515077;WS=127515059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr10	127520313	rs11596442	A	G	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=298;ReadPosRankSum=0.835;SC=AGGGGAGTGGAAGAAACATCC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=13;WE=127520321;WS=127520303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr10	127522572	rs3740206	T	G	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=452;ReadPosRankSum=0.694;SC=TGAAAATGATTTATCAAGATT;SOR=1.214;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=20;WE=127522580;WS=127522562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr10	127524612	rs4075326	C	T	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.643;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=0;PP=921;ReadPosRankSum=0.764;SC=TGCCGTAGATCAAATGGGTTT;SOR=3.430;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=37;WE=127524620;WS=127524602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,40:0.73:55
chr10	127527600	.	C	T	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.364;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.232;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=303;ReadPosRankSum=-0.416;SC=GAAGAGCTTTCTTTATGTTTA;SOR=0.404;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=84;TCF=70;TCR=14;TR=24;WE=127527608;WS=127527590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,24:0.28:85
chr10	127529756	rs146907010	T	TTG	849.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=2.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=2.494;QD=6.16;ReadPosRankSum=0.220;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,34:0.25:138
chr10	127530325	rs3208565	T	C	3183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-6.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.486;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=41;PP=2181;ReadPosRankSum=0.052;SC=TTACCATGGCTGCGATTGTTA;SOR=0.257;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=177;TCF=123;TCR=54;TR=117;WE=127530333;WS=127530315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,127:0.67:189
chr10	127548587	rs1539315	C	G	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=14;PP=399;SC=CTTATGCTAACTCATGCAAAA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=127548595;WS=127548577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	127584978	rs5006357	A	G	1745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=1.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.48;MQRankSum=-3.288;QD=24.25;ReadPosRankSum=0.596;SOR=1.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,50:0.69:72
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chr10	127585015	rs79042596	G	T	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=1.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.31;MQRankSum=-4.497;QD=12.27;ReadPosRankSum=0.260;SOR=0.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,26:0.38:69
chr10	127585035	rs113524015	C	G	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=2.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.45;MQRankSum=-4.899;QD=9.41;ReadPosRankSum=-0.230;SOR=1.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,27:0.29:94
chr10	127585040	rs5006358	G	A	1651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=10.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.25;MQRankSum=-6.252;QD=17.39;ReadPosRankSum=-0.441;SOR=1.918;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,44:0.46:95
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chr10	127585099	rs79920605	A	G	1582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=3.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.27;MQRankSum=-10.289;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.592;SOR=0.695;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,41:0.37:112
chr10	127585106	rs78181470	C	A	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=4.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.18;MQRankSum=-4.453;QD=1.16;ReadPosRankSum=1.455;SOR=1.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,12:0.11:113
chr10	127585112	rs72832617	T	C	1484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.94;MQRankSum=-10.388;QD=12.91;ReadPosRankSum=0.087;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,43:0.37:115
chr10	127585120	rs80288044	G	C	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.81;MQRankSum=-9.934;QD=12.82;ReadPosRankSum=-0.216;SOR=0.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,40:0.37:107
chr10	127585121	rs75261051	G	T	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=1.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.88;MQRankSum=-3.915;QD=0.77;ReadPosRankSum=1.763;SOR=1.034;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,10:0.09:110
chr10	127585150	rs74162870	C	A	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=58;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.145;NF=31;NR=51;PP=1731;ReadPosRankSum=-2.717;SC=GCGACGCCGGCCCTGGCTGAG;SOR=0.707;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=147;TCF=62;TCR=85;TR=82;WE=127585158;WS=127585140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,23:0.21:112
chr10	127585173	rs78146775	T	C	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=10.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.23;MQRankSum=-5.312;QD=2.38;ReadPosRankSum=2.277;SOR=1.341;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,15:0.14:107
chr10	127585179	rs74162871	G	C	1427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.24;MQRankSum=-7.125;QD=13.86;ReadPosRankSum=0.111;SOR=0.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,53:0.51:103
chr10	127585240	rs5013161	G	A	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=2.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.97;MQRankSum=-2.412;QD=5.63;ReadPosRankSum=0.153;SOR=0.388;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,20:0.22:92
chr10	127585260	rs4986789	G	A	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.63;MQRankSum=-2.177;QD=9.89;ReadPosRankSum=1.038;SOR=0.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,22:0.30:74
chr10	127585263	rs5013162	C	T	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.59;MQRankSum=-1.606;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.522;SOR=0.612;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,22:0.28:78
chr10	127585273	rs5013163	G	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.50;MQRankSum=-1.151;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.300;SOR=0.612;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,22:0.28:78
chr10	127585288	rs5013590	C	A	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=2.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQRankSum=-0.462;QD=1.85;ReadPosRankSum=-0.759;SOR=0.191;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,12:0.16:73
chr10	127585304	rs5013164	G	A	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=7.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.85;MQRankSum=-1.242;QD=3.29;ReadPosRankSum=-1.412;SOR=0.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,12:0.21:58
chr10	127585307	rs74579856	C	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.02;MQRankSum=-1.546;QD=2.17;ReadPosRankSum=0.979;SOR=0.441;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,7:0.13:52
chr10	127585360	rs78190003	C	A	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.69;MQRankSum=-2.416;QD=3.12;ReadPosRankSum=-0.369;SOR=0.245;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,4:0.17:23
chr10	127585363	rs74162872	G	A	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.29;MQRankSum=-2.899;QD=2.08;ReadPosRankSum=0.419;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,3:0.14:21
chr10	127668317	rs11244744	G	A	1398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.277;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=6;PP=1180;ReadPosRankSum=-0.735;SC=TACAGCATAGGTGTCAACCCT;SOR=1.035;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=81;TCF=71;TCR=10;TR=50;WE=127668325;WS=127668307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,49:0.60:81
chr10	127668431	rs11244745	A	G	2795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.568;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=54;PP=2167;ReadPosRankSum=-0.957;SC=AGCAGGTCAAATACAACCTTA;SOR=0.751;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=163;TCF=79;TCR=84;TR=102;WE=127668439;WS=127668421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,105:0.61:173
chr10	127668487	rs2176097	G	A	2327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=62;PP=1927;ReadPosRankSum=-0.790;SC=CAGTGGGGGTGGTATGATATT;SOR=0.681;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=125;TCF=34;TCR=91;TR=84;WE=127668495;WS=127668477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,84:0.65:129
chr10	127668610	rs2138275	C	T	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.163;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=721;ReadPosRankSum=0.169;SC=GAGGTATGCTCATATGTGTGC;SOR=0.297;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=60;TCF=35;TCR=25;TR=33;WE=127668618;WS=127668600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr10	127677374	rs2280173	A	G	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.815;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=32;PP=737;ReadPosRankSum=1.213;SC=AAACACTGCAATAATATTTGC;SOR=1.814;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=34;WE=127677382;WS=127677364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,34:0.69:49
chr10	127685091	rs3736477	T	C	3905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.163;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=68;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.291;SC=ACTGAGCATGTTTATCTCTTT;SOR=0.606;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=194;TCF=94;TCR=100;TR=132;WE=127685099;WS=127685081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,136:0.68:201
chr10	127693432	rs2138283	C	T	2237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=31;PP=1760;SC=TGTCAAATGCCGCTTCTTCCA;SOR=0.934;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=40;TCR=31;TR=71;WE=127693440;WS=127693422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr10	127697165	rs2292690	T	G	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=496;ReadPosRankSum=-0.485;SC=GTGGAATTAATGTCAGAGCTT;SOR=1.085;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=23;WE=127697173;WS=127697155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr10	127706028	rs3781001	C	T	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=152;ReadPosRankSum=0.840;SC=TGTCAGATACCACTGCCCCTC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=127706036;WS=127706018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr10	127708091	rs2176099	AG	GT	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.324;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=679;ReadPosRankSum=-0.180;SC=ATAAGCTCACAGGGACTGCTT;SOR=4.450;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=16;WE=127708100;WS=127708087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,22:0.81:27
chr10	127708428	rs2138280	A	T	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=540;ReadPosRankSum=-0.196;SC=AGGGTCACTTACCAGGAGCCA;SOR=0.628;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=26;WE=127708436;WS=127708418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,29:0.71:41
chr10	127708468	rs35835884	G	A	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.702;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=393;ReadPosRankSum=-0.217;SC=AGGGCCTGCCGCTTGGCACAG;SOR=0.138;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=20;WE=127708476;WS=127708458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr10	127708503	rs2292694	G	C	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=247;ReadPosRankSum=0.266;SC=ATATCATCCTGTCACCATACA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=11;WE=127708511;WS=127708493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr10	127727752	rs11594171	G	A	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=5.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.653;NF=18;NR=0;PP=356;ReadPosRankSum=0.192;SC=TCCTGACCTCGTGATCCGCCC;SOR=0.437;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=18;WE=127727760;WS=127727742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr10	127730972	rs150225509	CTGTG	C	322.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=276;ReadPosRankSum=-1.520;SC=ACAGGCAGACCTGTGTGTGTG;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=7;WE=127730983;WS=127730962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr10	127730991	rs45535336	A	G	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=120;ReadPosRankSum=0.207;SC=TGTAAATCTTAGCGAGATCAC;SOR=0.850;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=8;WE=127730999;WS=127730981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr10	127731012	rs11244780	T	A	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=570;SC=ATTAGGCAAATTACTTAACTT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=127731020;WS=127731002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	127731535	rs7911793	TG	CA	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=256;ReadPosRankSum=0.420;SC=CCTGCACCCATGCTGACAGCT;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=6;WE=127731544;WS=127731525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr10	127731803	rs112022474	GC	G	232.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.717;HP=9;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=289;ReadPosRankSum=-0.462;SC=CATGGTCAGAGCCCCCCCCCA;SOR=0.030;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=8;WE=127731819;WS=127731793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,13:0.32:40
chr10	127731811	rs7923954	C	G	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.557;HP=8;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=919;ReadPosRankSum=0.261;SC=GAGCCCCCCCCCAACACTGAC;SOR=3.334;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=25;WE=127731819;WS=127731793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr10	127731846	rs10901522	G	A	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=219;ReadPosRankSum=1.017;SC=CACACGCCATGGTGCGAATAA;SOR=1.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=10;WE=127731854;WS=127731836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr10	127734513	rs1710313	A	C	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=0.651;SC=TTCAAACACAATAACTGCTCT;SOR=0.266;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=7;WE=127734521;WS=127734503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,7:0.19:36
chr10	127734716	rs11244787	A	G	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.656;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=709;ReadPosRankSum=-0.554;SC=AGGAGGAGGAAAACACAGCAA;SOR=1.775;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=98;TCF=37;TCR=61;TR=37;WE=127734724;WS=127734706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,37:0.36:102
chr10	127734834	rs11244788	C	T	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.742;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr10	127734834	.	CGG	TGA	307	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=0;NR=7;PP=307;QD=51.4954106946;SC=TCAGTTAATACGGATGGAGCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=7;WE=127734844;WS=127734824;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr10	127734836	rs11244789	G	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.11;ReadPosRankSum=1.279;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr10	127737930	rs2292692	G	A	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.654;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=607;ReadPosRankSum=-0.480;SC=CTTGCTGCAGGGGGATGTTTG;SOR=0.902;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=101;TCF=56;TCR=45;TR=34;WE=127737938;WS=127737920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,37:0.35:105
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chr10	127759943	rs7903316	T	A	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=1;PP=737;ReadPosRankSum=1.049;SC=CTTCCTGAGTTCTAGTACTTT;SOR=1.562;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=47;TCF=45;TCR=2;TR=32;WE=127759951;WS=127759933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,33:0.66:50
chr10	127786969	rs2290842	A	G	3027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=50;PP=2358;SC=ACCAGCTCCCAATGCCCTTGG;SOR=0.773;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=103;TCF=53;TCR=50;TR=102;WE=127786977;WS=127786959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr10	127829012	rs1551678	C	G	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.478;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=173;ReadPosRankSum=-0.150;SC=CAACAACTCACTTGAAGTATT;SOR=0.141;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=8;WE=127829020;WS=127829002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr10	127843973	.	C	CT	112	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=13;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=15;MQ=60.07;NF=0;NR=10;PP=112;QD=11.7;SC=TTGTGACCTCCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=10;WE=127843981;WS=127843963;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:29,10:0.26:39
chr10	128147884	rs7077404	C	A	4288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=57;PP=2965;SC=GCAAGCACAACACTCAGAGAC;SOR=0.889;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=69;TCR=57;TR=126;WE=128147892;WS=128147874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr10	128147905	rs55945416	G	A	2481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.258;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=44;PP=1951;ReadPosRankSum=-1.493;SC=CAAAAGCCACGGTGCAAAAGT;SOR=0.407;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=130;TCF=59;TCR=71;TR=85;WE=128147913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,88:0.64:138
chr10	128148056	rs7098669	T	C	5974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=97;PP=2965;SC=AAGCTGGGAGTGCAGAGGCAA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=99;TCR=97;TR=195;WE=128148064;WS=128148046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr10	128153623	rs7079392	G	A	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=23;PP=571;SC=GACTTCTACCGCACATGGTGC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=128153631;WS=128153613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	128191222	rs61863954	A	G	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.246;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=321;ReadPosRankSum=0.226;SC=ACCATGACACATGGTTTAAAA;SOR=0.914;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=99;TCF=85;TCR=14;TR=27;WE=128191230;WS=128191212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,30:0.29:102
chr10	128191368	rs10510159	T	C	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=25;PP=582;ReadPosRankSum=0.739;SC=CTTTGGAACATTGATAGCTGC;SOR=0.710;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=102;TCF=21;TCR=81;TR=31;WE=128191376;WS=128191358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,33:0.31:105
chr10	128192985	rs11245007	C	T	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.242;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=840;ReadPosRankSum=0.736;SC=TAGATTGAATCTGGACACTGC;SOR=0.704;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=141;TCF=70;TCR=71;TR=44;WE=128192993;WS=128192975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,45:0.31:145
chr10	128202435	rs1436803	T	C	2934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=47;PP=2022;SC=AGTCAGATTTTGCCTCTGTGA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=47;TCR=48;TR=94;WE=128202443;WS=128202425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr10	128209769	rs2099552	T	C	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=5;PP=405;SC=TGGGGCCTCATACAGTACTGG;SOR=1.292;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=128209777;WS=128209759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr10	128209797	rs2099553	C	T	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=5;PP=614;SC=AGATACTCAGCGTGGACAGAA;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=128209805;WS=128209787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	128209959	rs4962342	G	T	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=16;PP=467;SC=TGTATTTGGCGACATGAAAGA;SOR=2.030;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=128209967;WS=128209949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr10	128335225	rs2842149	T	C	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.498;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=34;PP=887;ReadPosRankSum=0.117;SC=CAAACAGAAATATTTCCCAAT;SOR=0.218;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=49;TCF=5;TCR=44;TR=39;WE=128335233;WS=128335215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,40:0.74:54
chr10	128797717	rs2275540	T	C	2685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.274;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=71;PP=2003;ReadPosRankSum=0.269;SC=CACCCAAAGATGCTTAGTTGA;SOR=0.821;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=170;TCF=60;TCR=110;TR=108;WE=128797725;WS=128797707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,112:0.64:176
chr10	128797809	rs41282888	T	C	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.273;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=26;PP=549;ReadPosRankSum=0.449;SC=CTGGGATGCCTGTATACAGGT;SOR=0.216;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=34;WE=128797817;WS=128797799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,35:0.64:55
chr10	128806888	rs9418761	G	C	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.99;ReadPosRankSum=1.433;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,6:0.18:34
chr10	128807096	rs9418679	G	C	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.926;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=540;ReadPosRankSum=-1.204;SC=CAAGTACTTAGCCAGATATAA;SOR=0.310;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=26;WE=128807104;WS=128807086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,26:0.79:33
chr10	128810642	rs9418773	C	T	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.09;ReadPosRankSum=0.575;SOR=0.711;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,39:0.27:146
chr10	128810669	rs9418691	C	T	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=3.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.01;ReadPosRankSum=-1.067;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,30:0.26:115
chr10	128821616	rs9418791	T	G	3303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=7.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.182;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=85;PP=2621;ReadPosRankSum=0.851;SC=GGCTCATCTGTAGTGTTTCAG;SOR=1.212;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=188;TCF=50;TCR=138;TR=112;WE=128821624;WS=128821606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,117:0.60:196
chr10	128821636	rs9418698	C	T	2599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.080;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=76;PP=2145;ReadPosRankSum=-0.362;SC=GTTTTACTTGCCAAGTGCTCA;SOR=1.619;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=143;TCF=22;TCR=121;TR=86;WE=128821644;WS=128821626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,89:0.61:147
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chr10	128822873	rs3818879	A	G	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=823;ReadPosRankSum=-0.984;SC=CTGTCCCCCCACATATATAGT;SOR=1.528;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=17;WE=128822894;WS=128822863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
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chr10	128830409	rs2229597	A	G	1720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.768;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=23;PP=1318;ReadPosRankSum=-2.755;SC=AGGCCGAAGCAAAGAAGCTGG;SOR=0.831;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=109;TCF=71;TCR=38;TR=69;WE=128830417;WS=128830399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,71:0.63:112
chr10	128830592	rs9418802	C	T	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=187;ReadPosRankSum=1.423;SC=ACGGTGCGTTCGAGAGGAGAA;SOR=1.557;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=12;WE=128830600;WS=128830582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
chr10	128835834	rs77532250	A	G	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.131;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=428;ReadPosRankSum=1.824;SC=GCTACAAAGGAATGGAATATT;SOR=0.076;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=19;WE=128835842;WS=128835824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr10	128836214	rs7085407	G	C	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=28;PP=654;SC=TAGTGACATAGGGATTGGGTG;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=128836222;WS=128836204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	128840842	rs880272	A	G	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=0;PP=490;SC=TGTGTGGGGGAAGTCCGGTGG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=128840850;WS=128840832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	128841245	rs144019822	CAG	C	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.674;NF=2;NR=1;PP=112;ReadPosRankSum=-0.842;SC=TATCCTAACACAGGGGTGCAG;SOR=0.132;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=3;WE=128841254;WS=128841235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr10	128841570	rs882052	T	C	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=100;ReadPosRankSum=-0.319;SC=TTTTTAGTATTGTTTCCCTCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=128841578;WS=128841560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr10	128850841	rs9418817	T	C	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=169;ReadPosRankSum=0.675;SC=TACTGATAGATGGAAACCAAA;SOR=0.186;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=13;WE=128850849;WS=128850831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr10	128859743	rs4751523	C	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=73;ReadPosRankSum=-1.903;SC=TGTGGAGGCACGCTGCCTTGG;SOR=0.157;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=6;WE=128859751;WS=128859733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr10	128908472	rs3740012	A	G	1701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=6.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=6;PP=1356;ReadPosRankSum=-0.107;SC=TCCTTTTGCTATGTGTCTCAA;SOR=0.850;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=105;TCF=94;TCR=11;TR=58;WE=128908480;WS=128908462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,59:0.57:103
chr10	128923954	rs1186355	A	C	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=454;ReadPosRankSum=1.115;SC=TAAAAATGAAAGGTCTTGATT;SOR=0.622;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=76;TCF=20;TCR=56;TR=31;WE=128923962;WS=128923944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,33:0.42:79
chr10	128925761	rs1153016	A	T	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=315;ReadPosRankSum=-0.619;SC=ATTAATAAAAACCCCTGAGTT;SOR=0.356;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=16;WE=128925769;WS=128925751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr10	128926013	rs1060561	A	G	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.66;ReadPosRankSum=0.593;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,31:0.25:123
chr10	128952219	rs34225417	C	T	1483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.650;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=40;PP=1044;ReadPosRankSum=0.506;SC=GCATTACAAGCGGTGGCTGGG;SOR=0.922;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=175;TCF=76;TCR=99;TR=68;WE=128952227;WS=128952209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,72:0.39:184
chr10	128952265	rs7068954	A	G	4046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=94;PP=2965;SC=CCTCAAATCAAATGCCTTCCC;SOR=2.500;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=122;TCF=27;TCR=95;TR=121;WE=128952273;WS=128952255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr10	128974220	rs11594560	G	A	1834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.717;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=50;PP=1322;ReadPosRankSum=-1.052;SC=CTTCTCTTTCGCATCTGTTAG;SOR=1.184;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=227;TCF=107;TCR=120;TR=83;WE=128974228;WS=128974210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,86:0.37:233
chr10	128974716	rs2489384	A	G	2193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.255;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=63;PP=1745;ReadPosRankSum=1.045;SC=ATACACACTCAAGCACCGGCC;SOR=1.438;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=113;TCF=17;TCR=96;TR=72;WE=128974724;WS=128974706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,78:0.64:121
chr10	129160313	rs2296636	C	T	1366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.801;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=8;PP=1053;ReadPosRankSum=0.929;SC=GAATATTGTACCTCTTTTTTC;SOR=0.136;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=64;TCF=54;TCR=10;TR=45;WE=129160321;WS=129160303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,48:0.70:69
chr10	129160458	rs2296635	G	A	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.814;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=47;PP=1382;ReadPosRankSum=-0.759;SC=AATTCCATTCGACCCGAAGCT;SOR=0.861;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=103;TCF=34;TCR=69;TR=69;WE=129160466;WS=129160448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,69:0.65:106
chr10	129172272	rs41282892	A	C	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=1.467;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.250;SOR=0.978;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,14:0.23:60
chr10	129179739	rs1998864	T	G	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=434;ReadPosRankSum=1.122;SC=TAACTTAAGGTTTTATGAAAT;SOR=2.124;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=18;WE=129179747;WS=129179729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr10	129183002	rs878563	C	T	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5014;FS=5.704;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=1;PP=734;ReadPosRankSum=-0.653;SC=ACCATTCTGACGTCCCTGGGT;SOR=3.611;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=31;WE=129183023;WS=129182992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,30:0.86:35
chr10	129183015	rs878562	T	G	1310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=2;PP=1146;SC=CCCTGGGTGTTTCCGCCTCGG;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=40;WE=129183023;WS=129182992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr10	129200964	rs11017876	G	A	4393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.134;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=85;PP=2962;ReadPosRankSum=0.474;SC=TCACCCTACGGTTCCTTTTCC;SOR=0.801;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=223;TCF=101;TCR=122;TR=157;WE=129200972;WS=129200954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,162:0.71:228
chr10	129202729	rs2296630	G	T	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=5.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.959;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=33;PP=809;ReadPosRankSum=2.300;SC=AGCCATGATTGTTCCCCCAGC;SOR=0.373;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=3;TCR=58;TR=35;WE=129202737;WS=129202719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,41:0.59:70
chr10	129207514	rs2296629	G	A	1490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.802;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=45;PP=1069;ReadPosRankSum=0.402;SC=TGGGTGTGGTGGGGGGCCTCT;SOR=1.316;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=175;TCF=49;TCR=126;TR=58;WE=129207522;WS=129207504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,63:0.34:186
chr10	129207564	rs12774391	C	T	2173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.095;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=57;PP=1805;ReadPosRankSum=-0.019;SC=GATCCTTAACCCCCTCACCTC;SOR=1.227;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=116;TCF=32;TCR=84;TR=75;WE=129207572;WS=129207554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,76:0.64:119
chr10	129208894	rs6482874	A	G	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=0;PP=524;SC=GAGGGTTGGCAGGGACAGGGA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=129208902;WS=129208886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	129208954	rs11017943	T	G	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=893;ReadPosRankSum=1.678;SC=TTTCCCTGGCTGGGAGAGGAC;SOR=0.948;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=61;TCF=54;TCR=7;TR=22;WE=129208973;WS=129208944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,23:0.37:62
chr10	129208965	rs11017944	A	G	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.485;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=6;PP=2039;ReadPosRankSum=-1.979;SC=GGGAGAGGACACCAAGGCGAT;SOR=0.496;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=72;TCF=64;TCR=8;TR=49;WE=129208973;WS=129208944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,48:0.67:72
chr10	129209084	rs2296628	A	G	1252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.974;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=24;PP=874;ReadPosRankSum=-1.617;SC=ATATCTAATGATCTGTCTGTC;SOR=0.484;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=156;TCF=88;TCR=68;TR=53;WE=129209092;WS=129209074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,55:0.35:159
chr10	129209213	rs11017952	C	A	1879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=2.804;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.78;ReadPosRankSum=-0.516;SOR=1.010;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,74:0.66:112
chr10	129209237	rs10830001	G	A	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.179;HP=4;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=42;PP=1074;ReadPosRankSum=-2.179;SC=ATATCATTCCGCCACCAGTAG;SOR=1.056;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=81;TCF=14;TCR=67;TR=50;WE=129209245;WS=129209227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,51:0.63:81
chr10	129209256	rs11017953	C	T	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=33;PP=844;ReadPosRankSum=-1.051;SC=AGAACTGCCACTGGAGAAGCG;SOR=1.329;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=52;TCF=2;TCR=50;TR=34;WE=129209264;WS=129209246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,35:0.62:56
chr10	129213586	rs3736940	C	T	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=249;ReadPosRankSum=0.198;SC=GCTCATGCCCCGTGGTCACTG;SOR=0.484;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=6;TCR=49;TR=16;WE=129213594;WS=129213576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,19:0.32:60
chr10	129213631	rs3736939	A	G	1116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=35;PP=943;SC=TACAGTTCCCATAACCACCCC;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=36;WE=129213639;WS=129213621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr10	129216658	rs2229600	T	C	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.662;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=745;ReadPosRankSum=-0.583;SC=AGAATGCCATTGAGACCATGC;SOR=0.603;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=152;TCF=87;TCR=65;TR=45;WE=129216666;WS=129216648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,45:0.29:154
chr10	129237572	rs1926427	G	A	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=39;PP=2040;ReadPosRankSum=0.524;SC=CAGGGCTGACGGTGGGCTCTT;SOR=0.538;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=84;TCF=2;TCR=82;TR=40;WE=129237588;WS=129237562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,38:0.46:83
chr10	129237580	rs2275052	C	T	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.279;HP=3;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=38;PP=2115;ReadPosRankSum=-0.883;SC=ACGGTGGGCTCTTATTGAACT;SOR=1.452;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=77;TCF=3;TCR=74;TR=39;WE=129237588;WS=129237562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,41:0.54:76
chr10	129242515	rs11371	G	A	1577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.314;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=38;PP=1178;ReadPosRankSum=1.532;SC=TTACACCAAGGGCCAAGCTCA;SOR=0.484;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=221;TCF=87;TCR=134;TR=68;WE=129242523;WS=129242505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,71:0.31:229
chr10	129242555	rs2275053	G	A	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.943;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=35;PP=656;ReadPosRankSum=-0.619;SC=TAAGTGGAACGCTCCCCACAT;SOR=1.054;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=150;TCF=30;TCR=120;TR=42;WE=129242563;WS=129242545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,47:0.30:159
chr10	129249662	rs2229603	G	A	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.228;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=1128;ReadPosRankSum=0.509;SC=TCGCAAGCAGGCATCGGTGGA;SOR=0.277;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=108;TCF=79;TCR=29;TR=30;WE=129249684;WS=129249652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,31:0.28:111
chr10	129249676	rs2229604	C	T	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=8.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.07;ReadPosRankSum=-0.218;SOR=0.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,31:0.26:117
chr10	129249693	rs2229605	G	A	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=11.061;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.421;SOR=0.194;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,33:0.25:132
chr10	129249701	rs2229606	C	G	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=4.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.41;ReadPosRankSum=1.068;SOR=0.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,30:0.21:140
chr10	129249914	rs3824814	T	C	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=443;ReadPosRankSum=0.634;SC=CGGGATGTGCTATCGTAGTTA;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=9;WE=129249933;WS=129249904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr10	129249925	rs10765104	T	C	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=443;ReadPosRankSum=0.641;SC=ATCGTAGTTATCAGAGTTGGG;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=9;WE=129249933;WS=129249904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr10	129350641	rs4080381	C	A	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=389;ReadPosRankSum=1.644;SC=TATCGCCATACGATTTTGAAA;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=15;WE=129350649;WS=129350639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr10	129534478	rs147236104	A	AGCGCGGC	727.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=721;SC=TACCCAGCCCAGCGTCAGCCT;SOR=2.584;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=10;WE=129534486;WS=129534468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	129534679	rs4751501	T	C	2732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=64;NR=23;PP=2248;SC=AGCTTGGCGCTCTCCGCTCTG;SOR=2.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=64;TCR=23;TR=87;WE=129534687;WS=129534669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr10	129534739	rs4751502	C	G	3766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=51;PP=2965;SC=CCGGACTCCCCGGCTTGGGAA;SOR=1.110;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=74;TCR=51;TR=125;WE=129534747;WS=129534729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
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chr10	129846010	rs7911904	G	A	5070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.257;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=79;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.172;SC=GAAACCTAACGCATCCTGTGT;SOR=0.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=167;TCF=85;TCR=82;TR=162;WE=129846018;WS=129846000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,166:0.99:168
chr10	129854369	rs4424589	T	C	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.785;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=10;PP=521;ReadPosRankSum=-1.746;SC=TTCATACTAATGCTACATTTT;SOR=0.848;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=123;TCF=84;TCR=39;TR=36;WE=129854377;WS=129854359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,36:0.29:126
chr10	129854550	rs11016041	G	A	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=462;ReadPosRankSum=-0.308;SC=GCAGCTCCCCGTGACTGCAGG;SOR=0.606;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=76;TCF=14;TCR=62;TR=27;WE=129854558;WS=129854540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,27:0.35:77
chr10	129859061	rs28411949	T	C	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.046;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr10	129859065	rs11016046	T	C	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.09;ReadPosRankSum=0.164;SOR=0.206;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr10	129859992	rs4462251	T	C	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.019;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=336;ReadPosRankSum=-0.270;SC=AAGCTTTTTATTAATTTCTCA;SOR=0.515;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=39;TCR=25;TR=22;WE=129860000;WS=129859982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,22:0.33:66
chr10	129864515	rs10764743	C	T	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.737;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=39;PP=933;ReadPosRankSum=1.036;SC=AGCATCATGCCCAGAGTTAAC;SOR=1.224;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=155;TCF=44;TCR=111;TR=50;WE=129864523;WS=129864505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,53:0.33:159
chr10	129869233	rs10829325	A	G	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=63;ReadPosRankSum=-0.107;SC=TTCATCCTGGAGAAGCCATTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=5;WE=129869241;WS=129869223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr10	129883370	rs1129205	A	G	1505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.581;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=38;PP=1157;ReadPosRankSum=1.947;SC=CCAGGACGCAAGACTCTCCCC;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=174;TCF=68;TCR=106;TR=62;WE=129883378;WS=129883360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,64:0.35:183
chr10	129899482	rs41282876	T	A	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=395;ReadPosRankSum=0.542;SC=CATCAAAACATTCTGTGTCTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=16;WE=129899490;WS=129899472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr10	129899578	rs8473	T	C	2711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=29;PP=2016;SC=TGCACAGATTTGCTCTCCAAA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=58;TCR=29;TR=86;WE=129899586;WS=129899568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr10	129899629	rs16912247	G	A	2036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=32;PP=1602;ReadPosRankSum=-0.401;SC=CTTGATCTCAGGCACATGGAG;SOR=0.700;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=62;TCR=51;TR=71;WE=129899637;WS=129899619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,74:0.61:121
chr10	129899778	rs11106	G	C	1397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.238;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=29;PP=1033;ReadPosRankSum=0.598;SC=TTTGTTCTCAGTGACTTTGTC;SOR=0.578;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=169;TCF=93;TCR=76;TR=62;WE=129899786;WS=129899768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,63:0.36:173
chr10	129901066	rs114687140	C	A	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.806;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=32;PP=1055;ReadPosRankSum=2.122;SC=TGGCATGCAGCGCAGCCTCTT;SOR=0.404;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=171;TCF=73;TCR=98;TR=60;WE=129901074;WS=129901056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,61:0.36:169
chr10	129901393	rs11016071	T	C	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.463;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=19;PP=616;ReadPosRankSum=-0.746;SC=TGCTCTTGGCTGTCTCCTGCT;SOR=0.484;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=120;TCF=67;TCR=53;TR=41;WE=129901401;WS=129901383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,41:0.33:125
chr10	129901722	rs10082432	G	A	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=3.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,34:0.29:117
chr10	129901726	rs10082533	C	T	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=2.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.59;ReadPosRankSum=-1.027;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,36:0.29:124
chr10	129901825	rs10082391	T	C	1924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.336;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=31;PP=1441;ReadPosRankSum=-1.422;SC=GATGCCTTTATCTTCACCTGC;SOR=1.229;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=273;TCF=159;TCR=114;TR=90;WE=129901833;WS=129901815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,91:0.33:276
chr10	129901946	rs1050767	T	G	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.115;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=33;PP=904;ReadPosRankSum=0.275;SC=TGCCTCTTTGTGCTTGCTGTG;SOR=0.424;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=168;TCF=59;TCR=109;TR=55;WE=129901954;WS=129901936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,55:0.32:171
chr10	129902158	rs12777740	C	T	1683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.336;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=38;PP=1329;ReadPosRankSum=-0.254;SC=CTTCTTTGCACGTTGCTTCAA;SOR=0.628;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=195;TCF=101;TCR=94;TR=71;WE=129902166;WS=129902148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,73:0.37:199
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chr10	129902368	rs79661992	T	A	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.903;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=651;ReadPosRankSum=-0.820;SC=TGTGTTTTTGTCAATAGTCAT;SOR=1.148;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=130;TCF=68;TCR=62;TR=40;WE=129902376;WS=129902358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,42:0.31:135
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chr10	129906468	rs4750936	C	T	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.718;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=16;PP=773;ReadPosRankSum=-0.120;SC=CCTTAGGAGTCTGTAGCTGTC;SOR=0.420;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=103;TCF=66;TCR=37;TR=40;WE=129906476;WS=129906458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,42:0.40:106
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chr10	129907489	rs2853344	G	A	3924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.845;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=65;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.635;SC=TGACCTGTTTGCAGTGGATAC;SOR=0.310;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=205;TCF=115;TCR=90;TR=136;WE=129907497;WS=129907479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,146:0.68:214
chr10	129907544	rs2240	G	C	1485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.543;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=34;PP=1169;ReadPosRankSum=-0.125;SC=TTTGTCTCCAGAGAAGTCATT;SOR=0.744;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=204;TCF=100;TCR=104;TR=65;WE=129907552;WS=129907534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,65:0.31:212
chr10	129911856	rs11016076	C	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=206;ReadPosRankSum=0.648;SC=AAGGTATTCCCTCACTCTCAT;SOR=0.513;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=68;TCF=12;TCR=56;TR=17;WE=129911864;WS=129911846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,16:0.22:72
chr10	129913960	rs7095325	A	T	3373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=46;PP=2613;SC=TAAAGCTTCCAAAAGGGAGAT;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=51;TCR=46;TR=97;WE=129913968;WS=129913950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr10	129917670	rs41282878	A	G	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=702;ReadPosRankSum=-0.252;SC=TCCAAGGATCAACGAACAAAC;SOR=0.602;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=33;WE=129917678;WS=129917660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,37:0.73:51
chr10	131265545	rs16906252	C	T	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.920;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=14;PP=994;ReadPosRankSum=0.431;SC=TCGCGGTGCGCACCGTTTGCG;SOR=1.191;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=110;TCF=77;TCR=33;TR=56;WE=131265553;WS=131265535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,55:0.50:110
chr10	131265665	rs16906255	T	G	2268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=54;PP=1813;SC=CCGTCGGGTGTGGGGCCGCCC;SOR=2.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=14;TCR=54;TR=68;WE=131265673;WS=131265655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr10	131334789	rs10734087	T	C	407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=276;SC=CTCAAAACAGTGTGCTGCGAC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=131334797;WS=131334779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr10	131506192	rs1803965	C	T	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.650;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=5;PP=636;ReadPosRankSum=0.094;SC=CTGCGGTTCTCGGAGGTCCGG;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=31;WE=131506200;WS=131506182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,32:0.70:46
chr10	131506283	rs12917	C	T	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.961;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=881;ReadPosRankSum=1.072;SC=CGTGCCGGCTCTTCACCATCC;SOR=1.038;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=75;TCF=35;TCR=40;TR=44;WE=131506291;WS=131506273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,45:0.60:75
chr10	131564998	rs2296675	A	G	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=216;ReadPosRankSum=1.148;SC=CTTGACCCCAAAGACCTCGTT;SOR=2.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=10;WE=131565006;WS=131564988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr10	131638788	.	C	CG	185.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.925;ClippingRankSum=-0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=195;ReadPosRankSum=1.093;SC=TCGCCTCGGACGGGGGGGCAG;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=9;WE=131638796;WS=131638778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr10	131641361	rs35210769	T	TG	591.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=498;ReadPosRankSum=-0.237;SC=GGTTCTGGCATGGGGGGGAGG;SOR=1.002;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=20;WE=131641369;WS=131641351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr10	131760352	rs573370	A	G	1813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=8;PP=1391;SC=CACGAGATCCATTTGTCAGTG;SOR=3.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=55;TCR=8;TR=63;WE=131760360;WS=131760342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr10	131904286	rs61749960	G	A	723.28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.9987;FS=6.854;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=572;ReadPosRankSum=0.043;SC=TTACTGCGGCGACCGCCAGAG;SOR=4.255;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=25;WE=131904294;WS=131904276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,25:0.89:28
chr10	131943719	rs7922450	T	G	158.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=4;PP=115;SC=CTGAGTTCAGTAGTTTGAGAC;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=131943727;WS=131943709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	131958422	rs1013563	G	A	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=182;ReadPosRankSum=2.402;SC=TCTAATCCCCGAATATTAGGT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=9;WE=131958430;WS=131958412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr10	131958985	rs12245251	C	T	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=0;PP=21;ReadPosRankSum=1.304;SC=ACTGTTGTCCCCTTTAAAAAT;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=3;WE=131958993;WS=131958975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr10	131967640	rs16910163	G	A	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.276;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=723;ReadPosRankSum=-1.331;SC=CGAAGCGGAGGAAAAGTGGTG;SOR=0.673;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=133;TCF=64;TCR=69;TR=45;WE=131967648;WS=131967630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,46:0.33:140
chr10	131973052	rs28548207	T	C	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.150;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=138;ReadPosRankSum=-1.113;SC=CTTGATTATTTTAAAAACATC;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=7;WE=131973060;WS=131973042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr10	132760953	rs11017616	G	C	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.556;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=123;ReadPosRankSum=-0.626;SC=GGAGGATTCCGTGGGTGGCCC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=9;WE=132760961;WS=132760943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,8:0.22:36
chr10	132915050	rs2298192	G	A	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.741;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=684;ReadPosRankSum=0.471;SC=CCCCTCAGCCGCTGTGCCTTA;SOR=0.368;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=51;TCF=37;TCR=14;TR=35;WE=132915058;WS=132915040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,34:0.65:52
chr10	132915202	rs2298193	A	G	1509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.987;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=1152;ReadPosRankSum=0.032;SC=TCGGTCCTTCAGGAACACAAG;SOR=0.567;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=76;TCF=38;TCR=38;TR=56;WE=132915210;WS=132915192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,59:0.75:79
chr10	132944958	rs41282898	C	G	1924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.637;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=47;PP=1448;ReadPosRankSum=1.434;SC=CAGTCGCTCTCGGAGACACTT;SOR=1.070;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=118;TCF=39;TCR=79;TR=67;WE=132944966;WS=132944948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,71:0.58:122
chr10	132961555	rs11416735	C	CA	1380.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=27;PP=1484;SC=GAGGAATAAACAAATCTCCTG;SOR=1.455;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=36;WE=132961563;WS=132961545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr10	133109602	rs148913526	G	A	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=10;PP=518;SC=CGGCGGCGGCGGAGTCTGGCG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=21;WE=133109610;WS=133109592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	133607892	rs4897739	T	C	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=269;SC=GGACGTGGGCTTCTGTGTCAC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=133607912;WS=133607882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	133607904	rs4897781	G	A	277.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=229;SC=CTGTGTCACCGCCTCAGGGCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=133607912;WS=133607882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	133607937	rs4897782	G	A	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.11;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	133607947	rs4897740	T	G	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.61;SOR=3.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	133608210	rs4897741	A	G	3250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=51;PP=2640;SC=GGCCCAGGGCACAGGCTGCAT;SOR=0.749;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=57;TCR=51;TR=108;WE=133608218;WS=133608200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr10	133608237	rs4897783	G	A	3521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=54;PP=2887;SC=AGGCCCCTCCGCAGAGAGGCG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=57;TCR=54;TR=111;WE=133608245;WS=133608227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr10	133608291	rs4897742	TT	GG	4670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=54;PP=2947;SC=CTGGCTGGGCTTCTGCACAGT;SOR=0.876;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=102;TCF=46;TCR=56;TR=94;WE=133608300;WS=133608281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr10	133608495	rs4897744	A	T	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=23;PP=639;SC=GGTGGCCACGACTTTGAGGAC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=133608503;WS=133608485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	133754334	rs10870270	G	A	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=38;PP=941;ReadPosRankSum=0.364;SC=CCTGAAAGTCGTTTGCACTCA;SOR=1.823;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=0;TCR=55;TR=38;WE=133754342;WS=133754324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,40:0.70:57
chr10	133769347	.	C	T	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.485;ClippingRankSum=0.000;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=18.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.91;ReadPosRankSum=1.469;SOR=2.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,41:0.28:147
chr10	133769482	rs7894	G	C	1755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.167;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=47;PP=1318;ReadPosRankSum=1.021;SC=GCGAACGTGAGGACCAAGTCT;SOR=1.005;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=131;TCF=50;TCR=81;TR=73;WE=133769490;WS=133769472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,75:0.54:138
chr10	133769568	rs11146336	G	A	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=495;ReadPosRankSum=0.630;SC=GAACAGTGACGCACCTGCTAC;SOR=0.614;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=5;TCR=46;TR=28;WE=133769576;WS=133769558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr10	133918420	rs11146177	G	A	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.772;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=22;PP=657;ReadPosRankSum=1.082;SC=CAGACATCCAGATCGAGCTGC;SOR=0.598;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=96;TCF=38;TCR=58;TR=38;WE=133918428;WS=133918410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,39:0.39:101
chr10	133918466	rs10870253	T	C	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=442;ReadPosRankSum=0.072;SC=TCCCCAGACCTCCACCCTTGA;SOR=0.657;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=20;TCR=50;TR=24;WE=133918474;WS=133918456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,24:0.33:72
chr10	133918585	.	C	A	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.589;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=170;ReadPosRankSum=-0.705;SC=TTGGGACAGACCACTTGGTGG;SOR=0.836;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=8;WE=133918593;WS=133918575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr10	133948439	rs11146206	C	T	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=188;ReadPosRankSum=-1.698;SC=GAGGTAAAGGCGCGCGTCCCA;SOR=0.317;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=11;WE=133948447;WS=133948429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr10	133948456	rs2637643	C	T	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=223;ReadPosRankSum=1.385;SC=CCCACGGCAGCGTTTTTGTTC;SOR=0.693;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=14;WE=133948464;WS=133948446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr10	133948634	rs2814182	T	C	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=29;PP=788;SC=AGGACCGCAATGCATTGCTGT;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=34;WE=133948642;WS=133948624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	133948689	rs2637644	C	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=82;ReadPosRankSum=1.770;SC=GGGCTTCTGGCTCCTGGGGGT;SOR=0.193;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=6;WE=133948697;WS=133948679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr10	133951501	rs57086821	CA	C	1003.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=5;PP=959;SC=GGTGTGGGGACAAGCCAGCCC;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=24;WE=133951509;WS=133951491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	133954011	rs2818387	C	T	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.776;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.564;NF=11;NR=25;PP=487;ReadPosRankSum=-0.983;SC=TGGAATCCGACGGCTCCTCCG;SOR=1.078;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=129;TCF=47;TCR=82;TR=36;WE=133954019;WS=133954001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,36:0.29:126
chr10	133954111	.	G	C	136	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=58.01;NF=0;NR=10;PP=136;QD=17.0771212547;SC=CCGGGTCCTGGGCTTGGAGGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=10;WE=133954119;WS=133954101;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,10:0.43:23
chr10	133955427	rs11592585	A	G	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.163;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=18;PP=499;ReadPosRankSum=0.306;SC=TCTCCAGGGCATGGCCAAGGA;SOR=0.454;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=160;TCF=107;TCR=53;TR=47;WE=133955435;WS=133955417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,53:0.32:167
chr10	133955569	rs5789117	C	CCG	2100.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=39;PP=1977;SC=GTGACTTCCACCGCGCGTTCC;SOR=3.528;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=73;TCF=4;TCR=69;TR=42;WE=133955577;WS=133955559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr10	133958472	.	C	G	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.610;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=3;PP=979;ReadPosRankSum=-0.516;SC=TAGAAAGCATCTCTTCCAAAG;SOR=0.257;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=56;TCF=53;TCR=3;TR=40;WE=133958480;WS=133958462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,41:0.71:58
chr10	133958541	rs2637627	CC	TG	2886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.738;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=25;PP=2944;ReadPosRankSum=-0.774;SC=TTCTGACGTCCCACGAGTGTG;SOR=0.233;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=102;TCF=63;TCR=39;TR=61;WE=133958550;WS=133958531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,71:0.64:111
chr10	133961494	rs2818384	C	T	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.957;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=914;ReadPosRankSum=0.772;SC=GGCTCAGACACGAGGTGCAGG;SOR=0.523;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=67;TCF=29;TCR=38;TR=44;WE=133961502;WS=133961484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,47:0.66:71
chr10	133961564	rs2818383	T	C	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=429;ReadPosRankSum=-1.403;SC=GGTAGCTGAGTGGATGGCCAG;SOR=0.743;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=25;WE=133961572;WS=133961554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,27:0.84:32
chr10	133961636	rs111344225	C	CTGAACA	318.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=292;ReadPosRankSum=0.303;SC=ACACAAAGCCCTGAACATGAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=133961644;WS=133961626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr10	133963042	.	GC	G	1232	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=0;NR=33;PP=1232;QD=38.1212121212;SC=TGCCCACTCCGCCCCCACCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=33;WE=133963050;WS=133963032;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,33:0.79:42
chr10	133963466	rs9419380	A	G	1898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=8;PP=1597;ReadPosRankSum=-0.921;SC=ACTCACCCCTACCTGTCCTCT;SOR=2.235;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=54;TCR=8;TR=61;WE=133963474;WS=133963456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,59:0.98:60
chr10	133966552	rs56317371	G	A	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.366;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=568;ReadPosRankSum=0.143;SC=GTGGACAGTCGGGAGAGGGCC;SOR=1.467;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=71;TCF=25;TCR=46;TR=30;WE=133966560;WS=133966542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,33:0.43:76
chr10	133967539	rs7082416	C	G	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=9.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.53;ReadPosRankSum=-0.658;SOR=2.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,14:0.22:64
chr10	133967555	rs77155409	G	C	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.469;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=133;ReadPosRankSum=-2.242;SC=CGGCCACGTGGCTCAGGTGCC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=10;WE=133967563;WS=133967545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,9:0.21:43
chr10	133967593	rs7906747	C	T	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=18;PP=486;SC=CCCATGTGGGCCAGGTCGCAG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=133967601;WS=133967583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr10	133976706	rs12776458	G	T	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.6979;FS=3.424;HP=6;HapScore=2;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=161;ReadPosRankSum=-0.495;SC=CTCCCCTTCCGCCCCAGCACA;SOR=0.728;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=7;WE=133976714;WS=133976696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr10	133976737	.	C	T	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=55;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=1.040;SC=GGAAGCCATGCTGTATGATGC;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=5;WE=133976745;WS=133976727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr10	133976769	.	T	C	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.172;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=6.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.084;SOR=0.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr10	133976772	.	G	A	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=3.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.056;SOR=0.991;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr10	133976784	.	G	A	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.682;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.63;ReadPosRankSum=0.957;SOR=1.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr10	133976793	.	G	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=1.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.70;ReadPosRankSum=0.829;SOR=1.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr10	133976796	.	G	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.511;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=3.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.76;ReadPosRankSum=1.251;SOR=1.579;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr10	133976799	.	G	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=3.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.87;ReadPosRankSum=1.384;SOR=1.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr10	133976802	rs372743812	C	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=3.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.69;ReadPosRankSum=1.690;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,7:0.21:33
chr10	133976857	.	C	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.826;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=-3.251;QD=2.62;ReadPosRankSum=0.118;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,3:0.16:19
chr10	133976859	.	C	A	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.639;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQRankSum=-3.145;QD=2.60;ReadPosRankSum=0.062;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,3:0.17:18
chr10	133976862	.	G	A	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=-3.251;QD=2.46;ReadPosRankSum=0.677;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,3:0.16:19
chr10	133976865	.	G	C	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.020;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=2.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=-3.251;QD=2.46;ReadPosRankSum=1.175;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,3:0.16:19
chr10	133976868	rs138755886	C	T	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=2.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=-3.251;QD=2.62;ReadPosRankSum=1.231;SOR=2.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,3:0.16:19
chr10	133976871	.	C	A	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQRankSum=-3.145;QD=2.93;ReadPosRankSum=0.890;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,3:0.17:18
chr10	133976895	.	G	A	121	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=28;MQ=59.14;NF=0;NR=2;PP=121;QD=77.8856062736;SC=AGCGCATGGAGCTGCTGCAGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=2;WE=133976903;WS=133976840;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,2:0.15:13
chr10	133976905	.	C	A	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQRankSum=-2.287;QD=3.18;ReadPosRankSum=-1.501;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,2:0.20:10
chr10	133976907	.	G	T	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.924;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQRankSum=-2.287;QD=3.18;ReadPosRankSum=-1.501;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,2:0.20:10
chr10	133978080	rs77822814	G	A	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=2.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.78;ReadPosRankSum=1.158;SOR=0.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,21:0.22:94
chr10	133981361	.	C	CCTCTCGG	547.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.85;MQRankSum=2.959;QD=21.91;ReadPosRankSum=2.010;SOR=0.072;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr10	133981368	rs45456394	G	C	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=3.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.36;MQRankSum=2.294;QD=21.73;ReadPosRankSum=0.049;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr10	133981422	rs2637650	C	T	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.199;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.017;NF=22;NR=5;PP=433;ReadPosRankSum=-1.272;SC=AGCGGAGCCTCGCTGACTCTG;SOR=0.215;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=78;TCF=69;TCR=9;TR=27;WE=133981430;WS=133981412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,27:0.35:78
chr10	133981682	rs4880338	G	A	2225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.558;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=48;PP=1855;ReadPosRankSum=0.680;SC=TCTCCGGGACGGGCCTGGCCT;SOR=1.340;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=102;TCF=38;TCR=64;TR=72;WE=133981690;WS=133981672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,76:0.70:108
chr10	134000498	.	TCCCCCCGCCCGC	T	136	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5051;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=62.65;NF=1;NR=1;PP=136;QD=80.5;SC=GGCTCACGCGTCCCCCCGCCC;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=2;WE=134000517;WS=134000488;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr10	134010224	rs1552681	C	G	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=0;PP=511;SC=GGGACTGCTCCCAGGGCTGGC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=134010232;WS=134010214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	134010435	rs78726081	AG	A	1016.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.777;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.400;NF=7;NR=26;PP=1032;ReadPosRankSum=-0.097;SC=AGGTAAGGGCAGGCGTGGGGA;SOR=0.990;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=92;TCF=25;TCR=67;TR=33;WE=134010443;WS=134010425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,37:0.35:106
chr10	134013906	rs56326856	C	T	1826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=32;PP=1440;ReadPosRankSum=-0.402;SC=TGGGCACCGACGGTTCACACT;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=286;TCF=182;TCR=104;TR=87;WE=134013914;WS=134013896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,87:0.30:290
chr10	134013990	rs2247705	G	A	8637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=178;PP=2965;SC=CCACCACGGCGGACCACCTCA;SOR=1.540;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=270;TCF=91;TCR=179;TR=269;WE=134013998;WS=134013980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr10	134014653	rs11592988	T	C	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=625;ReadPosRankSum=-0.518;SC=CTCAGACACGTGGTTCTGGCC;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=14;WE=134014669;WS=134014643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr10	134014661	rs76037184	G	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=203;ReadPosRankSum=-0.349;SC=CGTGGTTCTGGCCCCTCCAGA;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=5;WE=134014669;WS=134014643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr10	134016115	rs2637629	G	A	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=264;ReadPosRankSum=0.178;SC=GGGCCCCAGCGTGGAGGCACT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=12;WE=134016123;WS=134016105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr10	134016396	rs3736258	G	A	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=33;PP=827;ReadPosRankSum=-0.605;SC=GGCCCAGAACGCACCCCTGGT;SOR=0.612;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=70;TCF=10;TCR=60;TR=39;WE=134016404;WS=134016386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,41:0.57:72
chr10	134017295	rs12313	A	G	2035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=8;PP=1602;SC=TGCCCCGTGGACTGTATGACG;SOR=3.716;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=63;TCF=54;TCR=9;TR=62;WE=134017303;WS=134017285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr10	134018447	rs146929318	G	GGCC	893.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-1.552;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.184;SOR=0.642;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,27:0.29:94
chr10	134018483	rs114235518	G	A	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=4.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.50;ReadPosRankSum=-1.193;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,14:0.23:61
chr10	134021506	rs79220014	G	A	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.563;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=71;ReadPosRankSum=1.065;SC=GACCACGGGCGTCCCGGCCTA;SOR=0.031;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=6;WE=134021514;WS=134021496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr10	134021740	rs923659	G	A	875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=26;PP=748;SC=GGCTCATGGGGTAGGCCATGG;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=134021748;WS=134021730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	134021810	rs923660	T	C	134.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=4;PP=102;SC=ATGCTCCCGATACACTGGCAG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=134021818;WS=134021800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	134022455	rs41306840	G	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=180;ReadPosRankSum=-0.655;SC=ACAGGTGCCCGCTCACGTGGC;SOR=0.941;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=11;WE=134022463;WS=134022445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr10	134036053	rs2814197	G	A	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.98;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	134036057	rs2637635	C	T	580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.48;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr10	134036073	rs2814196	G	A	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=563;SC=GTCCCCACACGCCTTGCTCGG;SOR=4.804;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=21;WE=134036081;WS=134036063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr10	134036193	rs2818401	A	G	3424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=34;PP=2700;SC=TCTTGGCCAGACGCTTCTTCT;SOR=1.544;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=104;TCF=70;TCR=34;TR=103;WE=134036201;WS=134036183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr10	134036596	rs1994688	G	C	79.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=2;PP=58;SC=CACCAAGCCTGAGGTTCAGAA;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=134036604;WS=134036586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr10	134038715	rs902629	A	G	2201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=10;PP=1828;SC=AGCCAAGCCCAGGGGCTGCAG;SOR=3.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=70;TCR=10;TR=80;WE=134038723;WS=134038705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr10	134040290	rs2306982	C	A	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=7.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.600;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=10;PP=956;ReadPosRankSum=-0.461;SC=CCGTCTGCCACGCACACACCT;SOR=0.900;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=154;TCF=116;TCR=38;TR=49;WE=134040298;WS=134040280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,49:0.32:154
chr10	134040367	rs12413251	C	T	1494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.125;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=42;PP=1097;ReadPosRankSum=1.916;SC=ACAGCCTCACCGTGTCCTCGG;SOR=0.979;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=214;TCF=91;TCR=123;TR=68;WE=134040375;WS=134040357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,71:0.32:224
chr10	134059616	rs3814609	G	A	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.40;ReadPosRankSum=-1.991;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr10	134062574	rs4880361	G	A	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=3.434;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.621;SOR=1.504;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,19:0.20:96
chr10	134137627	rs7914257	T	C	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.079;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=429;ReadPosRankSum=-1.063;SC=CCCACTCCAATCACAGCAGCT;SOR=0.129;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=19;WE=134137635;WS=134137617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr10	134143942	rs1052281	C	T	1187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=820;ReadPosRankSum=-0.017;SC=GCCCGGGTGGCTGGCCTCCCC;SOR=0.687;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=201;TCF=113;TCR=88;TR=59;WE=134143950;WS=134143932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,61:0.29:208
chr10	134143985	rs1132165	GC	TT	1572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=0.614;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.56;ReadPosRankSum=-0.506;SOR=0.628;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:158,50:0.24:208
chr10	134145136	rs7086691	A	G	1941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=7.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.77;ReadPosRankSum=-0.233;SOR=1.046;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,54:0.36:152
chr10	134145136	.	ACC	GCG	2244	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=29;NR=22;PP=2244;QD=45.0483897032;SC=GGCAGCGAGGACCGCTCCAAA;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=147;TCF=74;TCR=73;TR=51;WE=134145146;WS=134145126;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:96,51:0.35:147
chr10	134145138	rs7080014	C	G	1941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=8.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.61;ReadPosRankSum=-0.388;SOR=1.079;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,55:0.36:154
chr10	134145153	rs7100410	G	A	1174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.784;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=20;PP=2248;ReadPosRankSum=-0.764;SC=CAAAGGTGGTGCCTCAGCAGC;SOR=1.212;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=138;TCF=71;TCR=67;TR=53;WE=134145174;WS=134145143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,53:0.37:144
chr10	134145166	rs13882	T	C	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.337;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=25;PP=2248;ReadPosRankSum=-0.701;SC=TCAGCAGCAATTCTTTTCTGC;SOR=0.917;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=147;TCF=72;TCR=75;TR=58;WE=134145174;WS=134145143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,59:0.38:154
chr10	134145288	rs12778987	C	A	1642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.86;ReadPosRankSum=-0.145;SOR=0.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,45:0.49:92
chr10	134145293	rs12784130	G	T	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.26;ReadPosRankSum=-0.975;SOR=0.724;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,42:0.51:83
chr10	134145314	rs11146335	A	G	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.504;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.452;NF=5;NR=25;PP=636;ReadPosRankSum=0.662;SC=TTGCCCGTCGACCACCACCCC;SOR=0.368;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=57;TCF=7;TCR=50;TR=30;WE=134145322;WS=134145304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr10	134145336	rs12784321	G	T	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.631;NF=0;NR=20;PP=386;ReadPosRankSum=0.617;SC=TCAAGGCCGCGGGCGCGGAAA;SOR=1.341;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=20;WE=134145344;WS=134145326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr10	134145398	rs199941683	A	AC	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.501;NF=0;NR=5;PP=118;ReadPosRankSum=-2.450;SC=ACCCCCTGCCACCCCCGCGCA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=134145406;WS=134145388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr10	134145420	.	AC	A	36	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=30;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=1;NR=2;PP=36;QD=19.0;SC=GCGCACCACAACCCCCCCACC;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=3;WE=134145428;WS=134145410;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,3:0.38:8
chr10	134145441	.	C	CT	23	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=37;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=23;QD=24.0;SC=GCAAGCGCAACCCCCCGCCCC;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=2;WE=134145449;WS=134145431;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr10	134151034	rs2259594	A	G	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.35;ReadPosRankSum=1.124;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,16:0.19:84
chr10	134151288	rs2259600	A	G	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=345;ReadPosRankSum=1.001;SC=ACTCTTGATTAAATTTTTACC;SOR=1.071;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=17;WE=134151296;WS=134151278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr10	134157875	rs2698779	G	A	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=29;ReadPosRankSum=-1.118;SC=ATCTGTTAACGTGATTTTCCC;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=5;WE=134157883;WS=134157865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
chr10	134161517	rs2474329	C	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=120;ReadPosRankSum=0.850;SC=GATGACCCTCCGTGACCTCCC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=7;WE=134161525;WS=134161507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr10	134161633	rs2474328	A	G	2905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=28;PP=2327;SC=GCTTTCTCCCACCTGTGGAAA;SOR=2.086;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=104;TCF=76;TCR=28;TR=103;WE=134161641;WS=134161623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr10	134165291	rs2261222	C	G	2718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=78;PP=2301;SC=CCGCACAGCCCGCCCAGTGCA;SOR=7.403;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=79;TCF=1;TCR=78;TR=79;WE=134165299;WS=134165281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr10	134166273	rs72479351	A	G	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.989;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.231;NF=30;NR=5;PP=594;ReadPosRankSum=-0.044;SC=TCCCTGTGGGACAGGCCGGTT;SOR=0.314;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=87;TCF=77;TCR=10;TR=35;WE=134166281;WS=134166263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,35:0.39:90
chr10	134180353	rs45626936	C	T	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.810;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=9;PP=757;ReadPosRankSum=0.126;SC=CTCCTAGAGCCGGAGATGGGA;SOR=0.575;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=144;TCF=113;TCR=31;TR=43;WE=134180361;WS=134180343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,44:0.30:148
chr10	134188874	rs1054038	G	A	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5164;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=37;ReadPosRankSum=0.385;SC=CTGATTTCGCGCAGCCTGTTG;SOR=0.991;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=3;WE=134188882;WS=134188864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr10	134218269	rs11146363	C	T	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=219;ReadPosRankSum=-0.787;SC=CCCTCCTGCCCGCGGGGTTCA;SOR=0.859;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=54;TCF=13;TCR=41;TR=16;WE=134218277;WS=134218259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,16:0.32:50
chr10	134237240	rs1881746	T	C	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=0;PP=799;SC=GCTGTGTGTGTGTGTGTGGCT;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=32;WE=134237257;WS=134237230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	134237249	rs150298334	C	CTGTG	2404.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.14;QD=49.08;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr10	134237276	rs1574449	T	G	3512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.36;QD=38.60;SOR=3.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr10	134237425	rs1574448	A	G	3366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=85;PP=2695;SC=TGCCAGCTTCAGCCTGAAGAG;SOR=3.215;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=103;TCF=17;TCR=86;TR=102;WE=134237433;WS=134237415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr10	134239228	rs12775406	T	C	1532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=38;PP=1117;SC=TGTACCCACGTGTGCGCGTGC;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=53;WE=134239236;WS=134239218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr10	134563122	rs3829130	C	T	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;ReadPosRankSum=1.360;SC=GGAAGGTGAGCGGGGCCTGTG;SOR=0.683;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=91;TCF=21;TCR=70;TR=35;WE=134563130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,35:0.38:91
chr10	134563366	rs3750578	A	G	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.928;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=29;PP=617;ReadPosRankSum=0.406;SC=TTGTGGTCCAATGTGGCAGCT;SOR=1.071;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=105;TCF=31;TCR=74;TR=38;WE=134563374;WS=134563356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,38:0.34:112
chr10	134591389	rs4880427	T	C	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=115;ReadPosRankSum=-0.182;SC=GGGCACCCAGTCTGGGGAATG;SOR=0.283;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=8;WE=134591397;WS=134591379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr10	134594316	rs3793687	A	G	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.421;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=605;ReadPosRankSum=-0.643;SC=AGGGTGCCCCACCTCCCCACA;SOR=0.487;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=124;TCF=68;TCR=56;TR=41;WE=134594324;WS=134594306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,42:0.33:126
chr10	134598628	rs2804003	A	G	3375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=75;PP=2710;SC=CGCCATCTCCACCGCGTGCCG;SOR=2.153;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=28;TCR=75;TR=103;WE=134598636;WS=134598618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr10	134622408	rs2767434	T	C	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.620;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=27;PP=753;ReadPosRankSum=-0.678;SC=AGAAGCCTCGTCTGTGGAGAA;SOR=1.136;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=60;TCF=13;TCR=47;TR=33;WE=134622416;WS=134622398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr10	134622507	rs2767431	A	G	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=125;ReadPosRankSum=-1.545;SC=CAGCTGCTCCAACTGAGGGCG;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=134622515;WS=134622497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr10	134623959	rs2254419	T	C	2832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.932;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=59;PP=1924;ReadPosRankSum=2.026;SC=GGAGACGCACTGTTTCTCCAA;SOR=0.403;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=163;TCF=71;TCR=92;TR=109;WE=134623967;WS=134623949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,115:0.68:169
chr10	134624504	rs2274429	C	T	1974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.507;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=36;PP=1598;ReadPosRankSum=1.689;SC=GGTAGGACCGCGCCAGGTCCA;SOR=0.571;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=116;TCF=56;TCR=60;TR=73;WE=134624512;WS=134624494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,73:0.61:119
chr10	134626453	rs3750586	C	T	1736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=57;PP=1408;ReadPosRankSum=-1.133;SC=CTGTACCAGACCCCACCGTGC;SOR=0.872;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=82;TCF=1;TCR=81;TR=58;WE=134626461;WS=134626443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,59:0.71:83
chr10	134627593	rs11146529	G	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=261;ReadPosRankSum=-0.140;SC=GGGGGCAGTGGCTCCCCGCTG;SOR=0.846;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=14;WE=134627601;WS=134627583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr10	134627882	rs7070307	G	T	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=447;ReadPosRankSum=0.060;SC=TGCCATGCCCGGGTGGGGTGA;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=19;WE=134627890;WS=134627872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr10	134646988	rs4880433	C	T	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=625;ReadPosRankSum=0.447;SC=TGTCTGTCTGCGACCAGGACT;SOR=0.604;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=89;TCF=20;TCR=69;TR=36;WE=134646996;WS=134646978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,36:0.39:93
chr10	134647453	rs3750583	C	T	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=30;ReadPosRankSum=-2.092;SC=CTGACCCCCCCTGGCGTTCCC;SOR=0.223;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=4;WE=134647461;WS=134647443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr10	134647771	rs3793690	G	T	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=58;ReadPosRankSum=-0.808;SC=TCCCACTGAGGTGGGGCCGGG;SOR=0.784;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=5;WE=134647779;WS=134647761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr10	134648048	rs3793688	C	T	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.368;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=451;ReadPosRankSum=0.817;SC=GAGTCCTGAACAAAGGCGGCC;SOR=0.249;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=78;TCF=56;TCR=22;TR=30;WE=134648056;WS=134648038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,29:0.36:80
chr10	134650440	rs3750580	T	C	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.537;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=570;ReadPosRankSum=-0.291;SC=AAAACGGCCATCAGGGGATGC;SOR=1.272;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=83;TCF=29;TCR=54;TR=31;WE=134650448;WS=134650430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,31:0.36:85
chr10	134660951	rs2892211	A	C	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=66;ReadPosRankSum=-0.165;SC=GGGGTACCGCAGGCCACAGCA;SOR=0.241;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=8;WE=134660959;WS=134660941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr10	134664875	rs7913626	A	G	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.852;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=267;ReadPosRankSum=0.974;SC=ACATCCCCACAACTTGGATGA;SOR=1.805;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=43;TCF=16;TCR=27;TR=16;WE=134664883;WS=134664865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr10	134672798	rs2001324	G	T	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.384;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=384;ReadPosRankSum=-0.276;SC=CCCCAGGGCCGCGTCAGGGCT;SOR=0.039;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=73;TCF=1;TCR=72;TR=22;WE=134672806;WS=134672788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,22:0.29:76
chr10	134681093	rs4880454	C	T	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.568;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=27;PP=560;ReadPosRankSum=1.296;SC=GAAACGCAAACGAAAACAGCC;SOR=1.067;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=72;TCF=7;TCR=65;TR=29;WE=134681101;WS=134681083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,30:0.39:76
chr10	134682855	rs7908950	C	T	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=159;ReadPosRankSum=-1.010;SC=TCAGCTTCAGCTCGGAGCACG;SOR=0.357;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=13;WE=134682863;WS=134682845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr10	134691434	rs142539335	T	C	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.378;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=507;ReadPosRankSum=-0.155;SC=CTTGTCCTTCTCTTTACTCCT;SOR=1.807;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=23;WE=134691442;WS=134691424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr10	134699270	.	GGGGAGCACTCAGGCGGTGGA	G	544	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=5;HapScore=3;MGOF=15;MMLQ=18;MQ=62.0;NF=10;NR=2;PP=544;QD=47.4166666667;SC=CAGGCGGTGGGGGGAGCACTC;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=12;WE=134699309;WS=134699250;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:24,12:0.33:36
chr10	134699301	rs45547444	A	T	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=4.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.60;MQRankSum=-2.482;QD=3.32;ReadPosRankSum=1.212;SOR=0.175;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,9:0.24:37
chr10	134706077	rs7076681	C	T	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=8.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=36;PP=673;ReadPosRankSum=2.311;SC=AATGTTGTACCGGCCACTATT;SOR=0.577;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=124;TCF=4;TCR=120;TR=37;WE=134706085;WS=134706067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,38:0.30:126
chr10	134722022	rs7075277	A	G	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.694;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=508;ReadPosRankSum=1.273;SC=CCCTGTGAGCACAGGCCATGG;SOR=0.960;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=109;TCF=41;TCR=68;TR=32;WE=134722030;WS=134722012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,35:0.31:114
chr10	134726108	rs72401137	CCTCTCTCTCT	C	544.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=5.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.19;MQRankSum=2.229;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.382;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,18:0.38:48
chr10	134726335	rs12254100	T	C	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=184;ReadPosRankSum=-2.772;SC=CTGGGAGACATGCTTGTCAGA;SOR=0.246;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=16;WE=134726343;WS=134726325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,19:0.35:55
chr10	134726369	rs56300950	T	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.368;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=58;ReadPosRankSum=0.634;SC=CCCGCAGGCCTCGCCCCGATC;SOR=0.020;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=6;WE=134726377;WS=134726359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr10	134726841	rs61863089	G	T	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.75;ReadPosRankSum=-0.551;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,16:0.21:78
chr10	134732968	.	G	C	1551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=29;PP=1047;ReadPosRankSum=0.898;SC=GAACCCAAACGAGTGAAAGGT;SOR=0.793;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=76;TCF=32;TCR=44;TR=52;WE=134732976;WS=134732958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,58:0.71:82
chr10	134733109	rs34347971	A	G	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.05;ReadPosRankSum=0.192;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr10	134733131	rs35970466	T	C	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.08;ReadPosRankSum=1.054;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr10	134735672	rs7915371	A	G	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.894;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=531;ReadPosRankSum=1.173;SC=CCAGGCCTGCATTCACCAGGA;SOR=0.855;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=73;TCF=47;TCR=26;TR=33;WE=134735680;WS=134735662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,35:0.45:77
chr10	134736026	rs4880286	G	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.425;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=233;ReadPosRankSum=-1.357;SC=CGCGCTCAGGGGCCTGGTATA;SOR=0.425;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=15;WE=134736034;WS=134736016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
chr10	134736052	rs4880287	G	T	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=262;ReadPosRankSum=0.677;SC=GTGCACAGACGCAGCCGGGTG;SOR=0.636;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=15;WE=134736060;WS=134736042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr10	134736076	rs4880288	T	G	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.024;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=477;ReadPosRankSum=-0.773;SC=GCCATCTGGATCCTGTCCCGG;SOR=0.839;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=24;WE=134736084;WS=134736066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,25:0.38:66
chr10	134736164	rs117918463	G	A	1447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.071;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=30;PP=1147;ReadPosRankSum=0.598;SC=CGTCCTCCTCGATCTGCGCCA;SOR=0.740;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=88;TCF=42;TCR=46;TR=52;WE=134736172;WS=134736154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,53:0.60:89
chr10	134738232	rs4075501	A	G	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.966;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=172;ReadPosRankSum=-0.684;SC=CCGCAACGCCAGCCAGGGGCT;SOR=1.343;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=13;WE=134738240;WS=134738222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr10	134740393	rs4295969	C	T	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=351;ReadPosRankSum=-1.013;SC=CACCTGAGAGCGGCACGGGAG;SOR=0.302;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=47;TCR=2;TR=19;WE=134740401;WS=134740383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
chr10	134740483	.	G	A	3018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.400;ClippingRankSum=0.000;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.281;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=38;PP=2249;ReadPosRankSum=1.724;SC=GCTGCTTGGCGGCCCGGGGCT;SOR=0.567;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=172;TCF=113;TCR=59;TR=110;WE=134740491;WS=134740473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,118:0.66:180
chr10	134740618	rs7071677	G	C	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.514;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=30;PP=608;ReadPosRankSum=-0.967;SC=CCTTACAAAAGCTGGGGAGCA;SOR=0.956;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=83;TCF=7;TCR=76;TR=32;WE=134740626;WS=134740608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,32:0.38:85
chr10	134741099	rs11146048	A	G	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=207;ReadPosRankSum=2.366;SC=CCATGCCACTAAGGAAGCCAT;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=10;WE=134741107;WS=134741089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr10	134748331	rs12781609	C	T	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.339;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=175;ReadPosRankSum=0.973;SC=CAGAATGACACTGATGTCACC;SOR=0.941;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=12;WE=134748339;WS=134748321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,12:0.22:55
chr10	134750604	rs10870211	C	A	1585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=44;PP=1352;SC=TCAAACAATTCGGTAGAGGTT;SOR=6.273;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=45;WE=134750612;WS=134750594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	134752007	rs60993054	TC	T	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.52;ReadPosRankSum=-0.738;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr10	134755298	rs4880292	C	G	2414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=61;PP=1905;SC=GCACCACGGGCCCGCTTTCAG;SOR=4.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=7;TCR=61;TR=68;WE=134755306;WS=134755288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr10	134756013	rs7898115	T	C	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.495;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=90;ReadPosRankSum=-1.076;SC=GCTCGTCCGCTCTCTCCGGGG;SOR=1.012;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=37;TCF=20;TCR=17;TR=8;WE=134756021;WS=134756003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,8:0.21:38
chr10	134884516	rs4271312	G	A	2027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=37;PP=1545;ReadPosRankSum=-1.175;SC=CACAGATGGCGCACGGTGCAC;SOR=0.705;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=101;TCF=48;TCR=53;TR=70;WE=134884524;WS=134884506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,77:0.73:106
chr10	134884546	rs4576736	A	G	1640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.281;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=23;PP=1121;ReadPosRankSum=-0.415;SC=GGGGCCGGACACCACAGTCAC;SOR=0.973;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=88;TCF=48;TCR=40;TR=57;WE=134884554;WS=134884536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,66:0.69:96
chr10	134884595	rs4271313	G	A	1868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=29;PP=1427;ReadPosRankSum=0.576;SC=CCACACCCGGGGCAGATGGAC;SOR=0.614;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=53;TCR=43;TR=64;WE=134884603;WS=134884585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,69:0.67:103
chr10	134884610	rs4486541	C	G	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.818;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=1182;ReadPosRankSum=1.221;SC=ATGGACGTACCGGCCCATCGA;SOR=0.485;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=92;TCF=49;TCR=43;TR=61;WE=134884618;WS=134884600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,65:0.66:98
chr10	134884755	rs11101751	C	G	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=571;ReadPosRankSum=1.266;SC=GCCTCGCAGCCAGGGAGGAGA;SOR=1.380;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=25;WE=134884763;WS=134884745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr10	134885677	rs7069085	A	C	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=126;ReadPosRankSum=-0.376;SC=GGGGAGAGTGAGGCCCAGACA;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=10;WE=134885685;WS=134885667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
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chr10	134902314	rs10745302	A	G	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.988;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=541;ReadPosRankSum=2.836;SC=TTGACCTTCCAGAGGCCATGG;SOR=3.040;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=27;WE=134902322;WS=134902304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr10	134902396	rs10776692	C	G	3737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=1.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=32.50;ReadPosRankSum=0.669;SOR=0.433;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,91:0.79:115
chr10	134902396	.	CGC	GGT	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=72;NR=12;PP=2944;QD=20;SC=CTCACGCTTCCGCAACTTTGC;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=112;TCF=98;TCR=14;TR=84;WE=134902406;WS=134902386;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:28,84:0.75:112
chr10	134902398	rs10776693	C	T	3737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=7.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=32.50;ReadPosRankSum=0.529;SOR=0.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,92:0.80:115
chr10	134906581	rs371329462	C	A	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.789;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.263;NF=20;NR=14;PP=628;ReadPosRankSum=2.600;SC=GGTTCCTCAGCCAGTTGGAGC;SOR=0.843;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=96;TCF=54;TCR=42;TR=34;WE=134906589;WS=134906571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,37:0.38:98
chr10	134910629	rs11101914	G	A	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.106;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=38;PP=990;ReadPosRankSum=-0.851;SC=GGGCAAGGGCGCCCCCTGTGC;SOR=1.638;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=78;TCF=24;TCR=54;TR=51;WE=134910637;WS=134910619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,50:0.66:76
chr10	134915993	rs7905581	G	C	1441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=33;PP=1178;SC=AGAAGGGGAGGAAAGCTGAGC;SOR=2.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=44;WE=134916001;WS=134915983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	134916121	rs7918862	T	A	1103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=7;PP=881;SC=ATTCTTGAAGTTGCAAGCCCG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=33;WE=134916129;WS=134916111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	134916366	rs12219529	G	A	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.444;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=38;PP=839;ReadPosRankSum=1.312;SC=GCACATGGGCGCGAGGCCCCG;SOR=2.049;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=56;TCF=4;TCR=52;TR=40;WE=134916374;WS=134916356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,40:0.71:56
chr10	134940862	rs11101942	A	G	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.292;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;PP=882;ReadPosRankSum=0.053;SC=CAGAACCGGGAGCTGGGAGCA;SOR=0.363;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=73;TCF=27;TCR=46;TR=43;WE=134940870;WS=134940852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,42:0.56:75
chr10	134942166	rs2806452	A	G	2384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.381;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=37;PP=1745;ReadPosRankSum=-0.784;SC=TGGCGGTGTCACAGGGCCACT;SOR=0.287;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=141;TCF=93;TCR=48;TR=93;WE=134942174;WS=134942156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,99:0.67:148
chr10	134942340	rs10776696	C	T	1456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.934;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=41;PP=1161;ReadPosRankSum=1.727;SC=CCAACGGGGCCGCGCTGGGCC;SOR=1.049;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=93;TCF=25;TCR=68;TR=55;WE=134942348;WS=134942330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,57:0.59:96
chr10	134942832	rs45586231	G	A	1514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.353;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=8;PP=1190;ReadPosRankSum=2.034;SC=CCACGCAGCCGGGCAGGGAGG;SOR=0.090;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=66;TCF=58;TCR=8;TR=50;WE=134942840;WS=134942822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,54:0.77:70
chr10	134943085	rs73399158	G	A	1364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=41;PP=1077;ReadPosRankSum=-0.424;SC=TGCCACATGAGGTCACTGGGG;SOR=0.495;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=66;TCF=5;TCR=61;TR=45;WE=134943093;WS=134943075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,47:0.68:69
chr10	134974187	rs56406605	A	T	307.31	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9992;FS=10.792;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=221;ReadPosRankSum=-0.779;SC=GGCGCCCTCCATGGCCGAGGG;SOR=4.972;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=10;WE=134974195;WS=134974177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr10	134981690	rs2998152	T	C	2356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.736;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=28;PP=1956;ReadPosRankSum=-0.418;SC=CAGGCCCTTCTCAGCTGGCGG;SOR=0.378;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=142;TCF=102;TCR=40;TR=91;WE=134981698;WS=134981680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,89:0.63:141
chr10	134981837	rs2998151	T	C	2675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.394;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=79;PP=1986;ReadPosRankSum=1.173;SC=GTGGGGGTAATGTGCCACACC;SOR=0.558;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=170;TCF=50;TCR=120;TR=114;WE=134981845;WS=134981827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,114:0.67:171
chr10	134981942	rs3008303	C	T	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=34;PP=859;ReadPosRankSum=0.790;SC=GGAGCGGAGCCGCTGCTGCCC;SOR=1.412;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=36;WE=134981950;WS=134981932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,38:0.73:52
chr10	134996785	rs149228737	T	C	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=37;ReadPosRankSum=2.139;SC=GGAGAAGTGCTGGCCGCGGTC;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=4;WE=134996793;WS=134996775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr10	134997480	rs57510763	C	T	1343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=18;PP=884;SC=TCGAGTCCTTCGGAGCGCTGC;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=20;TCR=18;TR=38;WE=134997488;WS=134997470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr10	134997514	rs67800134	A	G	1958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=25;PP=898;SC=GAACCCACACACGTGCATCCT;SOR=1.203;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=42;WE=134997532;WS=134997504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr10	134997524	rs138319019	T	TCTTG	1966.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=23;PP=1717;SC=ACGTGCATCCTCATGCACATA;SOR=1.280;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=29;WE=134997532;WS=134997504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr10	134997641	.	CCA	C	130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=131;ReadPosRankSum=1.312;SC=CACACACATGCCACACACACC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=4;WE=134997650;WS=134997631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr10	134999602	rs3008393	G	C	2700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=48;NR=29;PP=2106;SC=AGTCTGAGACGAGCCGGGGCC;SOR=1.248;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=48;TCR=29;TR=77;WE=134999610;WS=134999592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr10	135000148	rs3810965	T	C	7700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=155;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.733;SC=CAGAAGGAGCTAGGCAGCTGG;SOR=0.628;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=241;TCF=85;TCR=156;TR=239;WE=135000167;WS=135000138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,239:1.00:240
chr10	135000159	rs3810964	A	G	7347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=157;PP=2965;ReadPosRankSum=0.806;SC=AGGCAGCTGGAAAGTGCAGCC;SOR=0.930;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=224;TCF=66;TCR=158;TR=223;WE=135000167;WS=135000138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,224:1.00:225
chr10	135012162	rs2998139	T	C	3117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=68;PP=2420;SC=AAGCTCTCCCTGGAGGCCCAC;SOR=1.380;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=38;TCR=68;TR=106;WE=135012170;WS=135012152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr10	135012429	rs3008390	TT	AC	3142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=24;PP=2909;SC=CCACCTGGAGTTGCTTCCGGG;SOR=1.085;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=66;TCF=38;TCR=28;TR=61;WE=135012438;WS=135012419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr10	135012652	rs3008388	T	C	2791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=38;PP=1845;SC=CCTGCGTGGATGCCTCGCCAC;SOR=1.038;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=50;TCR=38;TR=88;WE=135012660;WS=135012642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr10	135015427	rs9418941	C	A	3071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=36;PP=2475;SC=TTGGCACTGCCGGGTGGGGCA;SOR=1.053;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=94;TCF=58;TCR=36;TR=93;WE=135015435;WS=135015417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr10	135015667	rs9419023	C	T	7747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=134;PP=2965;SC=CTCTCATGGTCGCCCGGGCGA;SOR=1.037;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=237;TCF=102;TCR=135;TR=236;WE=135015675;WS=135015657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr10	135016089	rs3008386	T	C	5763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=100;PP=2965;SC=GAACCTCTCCTACCACCGTCT;SOR=0.920;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=186;TCF=85;TCR=101;TR=185;WE=135016097;WS=135016079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr10	135016175	rs3008385	T	G	4016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=86;PP=2965;SC=TCCTCCTTGCTCCTCTCCTGC;SOR=1.488;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=43;TCR=86;TR=129;WE=135016183;WS=135016165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr10	135020315	rs3008375	T	C	4427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=58;PP=2965;SC=TCCGAGACCCTGGCTGCAGGC;SOR=1.103;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=83;TCR=58;TR=140;WE=135020323;WS=135020305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr10	135032376	rs3008370	A	G	2533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.703;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=33;PP=1864;ReadPosRankSum=0.000;SC=TGATTGCAAAATCTTGCTATG;SOR=1.052;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=120;TCF=73;TCR=47;TR=88;WE=135032384;WS=135032366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,95:0.74:128
chr10	135038088	rs11597218	C	T	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=0;PP=894;ReadPosRankSum=-0.043;SC=CCTAAGAACGCGGGGGGACTC;SOR=2.137;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=38;WE=135038096;WS=135038078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,40:0.74:54
chr10	135043802	rs7092433	C	A	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=83;SC=GATGCTGCTCCGGCCCCGCAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=135043810;WS=135043792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr10	135051562	rs2998143	A	G	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=129;ReadPosRankSum=0.857;SC=TCCCTGGCCCAGGCCAGACAT;SOR=0.787;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=12;WE=135051570;WS=135051552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr10	135061112	rs12355840	C	T	1245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=32;PP=1169;SC=GAACGGCGGGCGGCTCTGAGG;SOR=1.390;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=60;TCF=28;TCR=32;TR=51;WE=135061120;WS=135061102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	135076523	rs2995300	C	A	1146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=0;PP=965;SC=TAGATGCATTCCTGAGGTTAG;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=35;WE=135076531;WS=135076513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	135076596	rs2230576	T	C	2477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=31;PP=1856;SC=GACCGTGGAATGCTGGAACGC;SOR=1.127;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=48;TCR=31;TR=79;WE=135076604;WS=135076586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr10	135076758	rs3008318	T	C	1594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=31;PP=1200;ReadPosRankSum=-0.686;SC=GAAAAGATAATTGATGTTGAA;SOR=0.892;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=45;WE=135076766;WS=135076748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr10	135076903	rs3121298	A	G	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=371;SC=GGCAGTCACAATATATACAGC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=135076911;WS=135076893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	135077121	.	C	T	333	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=29;MQ=59.97;NF=15;NR=0;PP=333;QD=24.5180808365;SC=GCAGTGCCACCGTCAGCCCCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=15;WE=135077129;WS=135077111;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr10	135077121	rs3216041	C	CGTCAGCCCCGTGGGGAGGCCGTGCCACT	1076.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=67.30;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	135077311	rs2995301	C	G	5192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.306;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=86;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.662;SC=CCCCCAGGCACTCCCGGCTCT;SOR=0.458;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=162;TCF=76;TCR=86;TR=161;WE=135077319;WS=135077301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,166:0.99:167
chr10	135077387	rs72864780	G	A	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.163;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=40;PP=1368;ReadPosRankSum=-0.734;SC=TGCCCCCCAGGGAGCCTGCAG;SOR=0.273;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=94;TCF=30;TCR=64;TR=63;WE=135077395;WS=135077377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,64:0.67:95
chr10	135081684	rs2995309	T	C	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=10;NR=26;PP=732;SC=CACCACACCCTGAGTCTCTCC;SOR=2.242;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=135081692;WS=135081674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr10	135081754	rs11101672	G	C	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.66;NF=4;NR=12;PP=447;SC=ATGAGAGACAGACAGGCCCAG;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=135081762;WS=135081744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	135082346	rs2275720	A	G	6737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=118;PP=2965;SC=ACCACCACGAAGACGGGGAGG;SOR=0.918;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=214;TCF=96;TCR=118;TR=213;WE=135082354;WS=135082336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr10	135082810	rs2995310	C	T	1796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=11;PP=1440;SC=TCTGCCTATACCTGTGTGTCG;SOR=2.794;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=46;TCR=11;TR=57;WE=135082818;WS=135082800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	135082874	rs2995311	G	A	2763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=35;PP=2151;SC=CCGGGCCCGCGGCTTCTGCCT;SOR=1.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=54;TCR=35;TR=88;WE=135082882;WS=135082864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr10	135083164	rs2275719	C	T	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=11;PP=335;SC=CCACATGCGCCGACGGCGAGG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=135083172;WS=135083154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	135083812	rs885023	C	A	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=7;PP=724;SC=CCACGTGGGGCACATGCCCGG;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=27;WE=135083820;WS=135083802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	135084232	rs5789159	C	CAGA	2994.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=18;PP=2525;SC=AGGGCGGTCTCAGCTCACCTG;SOR=1.721;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=44;WE=135084240;WS=135084222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr10	135084322	rs3008321	A	G	2891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=34;PP=2271;SC=GTGGGACCAGAAGCGGGTTAG;SOR=1.005;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=49;TCR=34;TR=82;WE=135084330;WS=135084312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr10	135084601	rs2995314	T	C	4713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=100;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.690;SC=CAGCTCACCATGGGGACAGGT;SOR=0.483;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=60;TCR=101;TR=160;WE=135084609;WS=135084591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,168:0.99:169
chr10	135085321	rs1131720	C	T	2765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=28;PP=1920;SC=CAATGCTGCCCGCCATGATGC;SOR=1.455;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=84;TCF=53;TCR=31;TR=81;WE=135085329;WS=135085311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr10	135085426	rs1131719	A	G	5254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=69;PP=2965;SC=GGGCCATGGTACAGGCCACGC;SOR=0.918;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=88;TCR=69;TR=157;WE=135085434;WS=135085416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr10	135085754	rs1131718	G	A	3092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=73;PP=2380;SC=CAAACCCCACGGTAGTCCCGG;SOR=2.786;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=16;TCR=73;TR=89;WE=135085762;WS=135085744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr10	135086380	rs3008324	C	T	2889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=19;PP=2369;SC=ACTGGGGACACGAGACCCTCA;SOR=2.520;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=71;TCR=19;TR=90;WE=135086388;WS=135086370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr10	135087521	rs3008326	G	A	3506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=54;PP=2798;ReadPosRankSum=0.773;SC=TGTAGCCGGAGCCCAGCAGGT;SOR=0.293;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=120;TCF=64;TCR=56;TR=117;WE=135087529;WS=135087511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,115:0.99:116
chr10	135089035	rs2275725	A	G	3088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=55;PP=2318;SC=GGCAGACGCCACGGCAACACG;SOR=0.946;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=45;TCR=55;TR=100;WE=135089043;WS=135089025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr10	135090183	rs2995317	A	G	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=1;PP=775;SC=GCGGGGTGCGAGCAGGCCAGG;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=135090191;WS=135090173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr10	135093511	rs41299173	C	T	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.106;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=358;ReadPosRankSum=1.057;SC=ACCCCTTCTGCGGGTGCGTGC;SOR=2.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=17;WE=135093519;WS=135093501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr10	135096784	rs2995325	A	G	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=54;PP=1461;ReadPosRankSum=0.469;SC=CGGGCCCTGCATGCGCACGTG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=0;TCR=55;TR=54;WE=135096792;WS=135096774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr10	135097224	rs56403249	T	G	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.40;QD=46.52;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr10	135097227	.	CGCA	C	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.54;QD=41.89;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	135097232	.	T	TCG	537.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.54;QD=44.81;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	135097434	rs2995326	A	G	1915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=40;PP=1505;SC=CCATCACTTCAAACATCATGT;SOR=1.306;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=23;TCR=40;TR=63;WE=135097442;WS=135097424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr10	135098519	rs72864790	G	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=258;ReadPosRankSum=-0.323;SC=CAAGGGGGGCGCTGCACCACT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=13;WE=135098527;WS=135098510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr10	135098672	rs3008334	G	A	4931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=100;NR=52;PP=2965;SC=CGTGCTTGCAGTAGAACATGT;SOR=1.475;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=101;TCR=52;TR=152;WE=135098680;WS=135098662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr10	135098830	rs3008335	T	C	7387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.540;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=129;NR=94;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.083;SC=CGTGAATCTCTCGGACACTGA;SOR=0.728;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=225;TCF=129;TCR=96;TR=223;WE=135098838;WS=135098820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,226:0.99:228
chr10	135098845	rs2995327	C	T	7356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.911;HP=4;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=133;NR=90;PP=2965;ReadPosRankSum=0.960;SC=CACTGAAGGCCGGGGAGAGCC;SOR=0.866;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=134;TCR=92;TR=223;WE=135098853;WS=135098835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,226:0.99:228
chr10	135103311	.	C	T	440	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=20;NR=5;PP=440;QD=18.9908485019;SC=CCCAAGTCCCCGCCCGCTGCG;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=25;WE=135103319;WS=135103301;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr10	135103311	rs141370078	C	CGCCCGCTGCGCCGCGGACGCCAAGTCCCT	1617.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=95.16;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	135105944	.	C	T	200	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=106;MMLQ=24;MQ=51.24;NF=9;NR=0;PP=200;QD=26.085690283;SC=ACTCCGTGTCCCCCATGTCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=9;WE=135105952;WS=135105934;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr10	135105961	.	T	TC	1653	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=55.25;NF=24;NR=0;PP=1653;QD=69.7916666667;SC=TCCCTCCGTGTCCCCGTGTCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=24;WE=135105999;WS=135105951;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,24:0.96:25
chr10	135105966	.	G	A	1239	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=55.41;NF=25;NR=0;PP=1239;QD=50.9508485019;SC=CCGTGTCCCCGTGTCCCTCCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=25;WE=135105999;WS=135105951;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr10	135105979	.	T	TC	2779	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=57.75;NF=24;NR=3;PP=2779;QD=20;SC=TCCCTCCGTGTCCCCGTGTCC;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=27;WE=135105999;WS=135105951;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,27:0.66:41
chr10	135105983	rs2864768	C	T	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=1068;SC=TCCGTGTCCCCGTGTCCCGGG;SOR=0.693;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=13;WE=135105999;WS=135105951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr10	135105991	.	G	A	2844	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=58.13;NF=30;NR=6;PP=2844;QD=20;SC=CCCGTGTCCCGGGGAGCCCTA;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=36;WE=135105999;WS=135105951;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,36:0.71:51
chr10	135107034	rs72864794	G	A	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.857;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=0;PP=650;ReadPosRankSum=-1.294;SC=CCACAACAGCGCAGGCTCCCA;SOR=3.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=28;WE=135107042;WS=135107024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,31:0.63:49
chr10	135141572	rs2298122	G	T	1793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=45;PP=1449;SC=GGACCCAAGAGAGCCCTGAAC;SOR=2.604;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=12;TCR=45;TR=57;WE=135141580;WS=135141562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	135160950	rs4838721	C	T	3327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=71;PP=2602;SC=CATCCCTGAGCCCCAATCCCC;SOR=1.265;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=39;TCR=72;TR=110;WE=135160958;WS=135160940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr10	135165790	rs4369319	A	G	7097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=106;PP=2965;SC=ACCCTGGGCCATGTCCTGAGT;SOR=0.881;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=234;TCF=127;TCR=107;TR=233;WE=135165798;WS=135165780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr10	135171364	rs1891372	T	C	146.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=1;PP=138;SC=GGGGTCCCCGTGCAAGCCTCG;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=135171372;WS=135171354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr10	135178087	rs10745294	A	C	3096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=87;NR=5;PP=2487;SC=TTAATGATAAAATTTAAAAGG;SOR=4.849;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=92;TCF=87;TCR=5;TR=92;WE=135178095;WS=135178077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr10	135179458	rs6537598	G	C	1919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=4;PP=1491;SC=CCTCTCCAGTGTCTTCCTGGC;SOR=4.029;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=54;TCF=49;TCR=5;TR=52;WE=135179466;WS=135179448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr10	135180430	rs2230261	A	G	1919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=36;PP=1525;SC=TCCGGTCACCAGTGAGGACCA;SOR=0.957;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=30;TCR=36;TR=66;WE=135180438;WS=135180420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr10	135184126	rs1049951	G	A	3496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=18;PP=2783;SC=CTCCTCGAAGGTCTTCAGGGC;SOR=3.342;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=90;TCR=18;TR=108;WE=135184134;WS=135184116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr10	135186806	rs10466126	A	G	1558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=38;PP=1243;SC=CGGGCCGCGGACGCAGGACAG;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=12;TCR=39;TR=50;WE=135186814;WS=135186796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	135192762	rs12250188	C	G	31.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=15.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr10	135194890	rs10745295	A	G	895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=0;PP=754;SC=GTGGGAACTCAGAGCACGTAT;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=135194898;WS=135194880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr10	135197419	rs4240520	G	A	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=7;PP=529;SC=GGACTTCCGTGGAGGGCTTTA;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=25;WE=135197427;WS=135197409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr10	135202594	rs10776679	T	C	1418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=35;PP=1120;SC=CCACACACGCTGGTTCCTGCC;SOR=1.656;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=51;WE=135202602;WS=135202584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr10	135204799	rs6537600	C	T	6335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=95;PP=2965;SC=CATTCTAACCCTGGCTCTTCT;SOR=0.799;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=197;TCF=102;TCR=95;TR=197;WE=135204807;WS=135204789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr10	135204950	rs1046175	C	G	2874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=68;PP=2425;SC=AGCCCAGGCCCAGGCTCTAGC;SOR=2.915;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=15;TCR=68;TR=83;WE=135204958;WS=135204940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr10	135205009	rs1046178	C	G	1956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=41;PP=1563;SC=GGCTGGGACCCTCATTTCTTC;SOR=1.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=20;TCR=42;TR=61;WE=135205017;WS=135204999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr10	135207936	rs10160083	T	C	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=24;PP=859;SC=TCCCGGTCGTTCTGGGCTGGC;SOR=1.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=35;WE=135207944;WS=135207926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	135209105	rs4838742	A	G	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=2;PP=508;SC=TCCCTCAGATATAGTCTTTTT;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=135209113;WS=135209095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	135211892	rs2252852	A	G	2433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=11;PP=1828;SC=TGACAGAGCCAAGACTCCAGT;SOR=3.560;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=74;TCR=11;TR=84;WE=135211900;WS=135211882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr10	135213263	rs2814206	T	C	1884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=55;PP=1722;SC=CCAGAGCACATCTTGTCTCGT;SOR=5.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=57;TCF=2;TCR=55;TR=57;WE=135213271;WS=135213253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	135232934	rs2243619	C	T	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=328;SC=TGGCTGGCCGCGCGGTGTCAG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=135232942;WS=135232924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr10	135233541	rs2255246	A	G	5108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=85;PP=2965;SC=TAACGTGAACATTATTCAGCC;SOR=0.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=171;TCF=86;TCR=85;TR=171;WE=135233549;WS=135233531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr10	135237166	rs2492666	G	A	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=4;PP=195;SC=AGCCCAGCACGTTGCGGGTGC;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=135237174;WS=135237156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr10	135237196	rs4838682	C	T	234.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.6715;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=4;PP=157;SC=CTTCGTGGGGCTAAACCTGCG;SOR=0.892;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=9;WE=135237204;WS=135237186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	135267445	rs2253522	T	C	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=1;PP=947;SC=CTGTGACCTCTGCCATTGCCC;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=35;WE=135267453;WS=135267435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	135267738	rs2253529	T	C	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=22;PP=588;SC=TCCACATGGCTGGATCCCTGT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=135267746;WS=135267728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr10	135271789	rs2480245	C	T	2347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=29;PP=1701;SC=TGAAGCCTTCCGCAGTCTGAG;SOR=0.927;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=68;WE=135271797;WS=135271779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr10	135272908	.	G	A	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.335;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=284;ReadPosRankSum=0.246;SC=GACAGAGGGGGCGGAGAGGTA;SOR=0.713;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=17;WE=135272916;WS=135272898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr10	135272947	rs2257044	CC	AG	1169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=12;PP=1228;SC=GGTCCTGGGTCCCTCCCGCTG;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=24;TCF=11;TCR=13;TR=23;WE=135272956;WS=135272937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr10	135273463	rs731947	C	G	1089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=16;PP=932;SC=ATGCCTGGGACCTGCGGGACG;SOR=0.752;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=17;TCR=16;TR=33;WE=135273471;WS=135273453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr10	135278193	rs2492654	A	G	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.962;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=395;ReadPosRankSum=1.118;SC=CTGGGGCGCCATGTGCAGCAA;SOR=0.569;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=65;TCF=30;TCR=35;TR=24;WE=135278201;WS=135278183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,24:0.38:64
chr10	135279283	rs2243812	T	C	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.750;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=403;ReadPosRankSum=0.952;SC=TTTTTGGGAATTCCCTTTTGT;SOR=1.488;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=21;WE=135279291;WS=135279273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,22:0.39:57
chr10	135279695	rs118036728	G	T	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=545;ReadPosRankSum=2.635;SC=GGGTGTGCAGGTCCCCCCCAC;SOR=0.454;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=27;WE=135279703;WS=135279685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr10	135279810	rs2243909	T	G	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=15;PP=719;ReadPosRankSum=-0.474;SC=CGTCCTGGGATCCCTTCTTGG;SOR=0.629;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=87;TCR=47;TR=43;WE=135279818;WS=135279800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,48:0.34:142
chr10	135280765	rs2246634	C	T	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.911;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=299;ReadPosRankSum=0.200;SC=GAAATGCCGCCAGCAGGACTG;SOR=0.565;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=85;TCF=38;TCR=47;TR=24;WE=135280773;WS=135280755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,24:0.30:80
chr10	135281637	rs10776682	A	C	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=282;ReadPosRankSum=1.219;SC=CTGGCTCTAAACCTCATCCCC;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=13;WE=135281645;WS=135281627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr10	135340866	rs11445593	T	TC	299.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=435;SC=CACAGGATTGTCTCCCGGGCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=135340874;WS=135340856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr10	135347397	rs915909	T	C	2897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=59;PP=2131;SC=ACCCTGAGATTGAAGGTAGGC;SOR=1.284;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=35;TCR=60;TR=94;WE=135347405;WS=135347387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr10	135347533	rs943976	A	G	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=693;SC=TGAGATGGCTAGATGCACTGC;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=135347541;WS=135347523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr10	135350490	rs147973606	A	AGATGGGTGGAT	904.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=0;PP=2885;SC=GTGATTGAATAGATGGGTGGA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=9;WE=135350498;WS=135350480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr10	135351137	rs2070676	G	C	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=1;PP=545;SC=TCCTTCAACTGGAAATATACT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=135351145;WS=135351127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr10	135351174	rs2070677	T	A	1863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=1;PP=1565;SC=TATTCAAAACTACATTCTTCA;SOR=6.630;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=54;TCF=53;TCR=1;TR=54;WE=135351182;WS=135351164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr10	135351362	rs2515641	T	C	4064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=80;PP=2965;SC=ATGGAAAGTTTAAGTACAGTG;SOR=1.572;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=40;TCR=80;TR=120;WE=135351370;WS=135351352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr10	135352153	rs2249694	A	G	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=590;SC=TAGGCAGAGAAGGGTGAGTCC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=20;WE=135352161;WS=135352148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr10	135352168	rs2249695	T	C	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=0;PP=771;SC=GAGTCCTGCCTTGTGATGGCC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=135352176;WS=135352158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr10	135352509	rs2480257	T	A	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.20;SOR=7.328;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr10	135352514	rs2480256	A	G	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.83;SOR=7.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr10	135368290	rs117862014	C	T	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=334;ReadPosRankSum=0.890;SC=GGGCCTGCATCCCTCTGCCTG;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=13;WE=135368298;WS=135368280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr10	135369054	rs3020514	A	G	1995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=19;PP=1494;SC=ATACAACATCAGTCATCTTCC;SOR=1.751;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=62;WE=135369062;WS=135369044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr10	135370060	rs2987791	G	C	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=2;PP=167;SC=ACTTGACCTTGGTCTCATCAG;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=135370068;WS=135370050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	135371466	rs2987792	T	C	1123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=21;PP=937;SC=TGTCAAGGTATTGGGTTTTGG;SOR=1.418;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=33;WE=135371474;WS=135371456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr10	135381215	rs3020499	A	G	171.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=132;SC=CTGGGCAGGCATGGGGAGCTG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=135381223;WS=135381205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr10	135381276	rs3020500	T	C	301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=6;PP=200;SC=GGCTCTGGAGTGTGGCTGGGC;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=13;WE=135381284;WS=135381266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr10	135381574	rs148528483	G	A	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-6.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.313;NF=44;NR=3;PP=1060;ReadPosRankSum=1.033;SC=GGGGCCAGATGTGGTCACCGA;SOR=0.488;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=76;TCF=72;TCR=4;TR=47;WE=135381582;WS=135381564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,48:0.62:77
chr10	135381592	rs3020501	C	G	2758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=7;PP=2200;SC=CGAGCCCAGCCAGGCCTAGGG;SOR=4.637;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=87;TCR=7;TR=94;WE=135381600;WS=135381582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr10	135381623	rs3020502	T	C	4101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=37;PP=2965;SC=CCCAGGGCACTGAGGGCGCCA;SOR=2.134;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=99;TCR=37;TR=136;WE=135381631;WS=135381613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr10	135381766	rs3020503	C	T	3776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=88;PP=2965;SC=CCGCGTTCCCCGGGTCCCGCG;SOR=2.342;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=116;TCF=26;TCR=90;TR=114;WE=135381774;WS=135381756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr10	135381927	rs2987800	T	G	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=14;PP=373;SC=AGAGGAAGGCTGCCTCCTGTA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=135381935;WS=135381917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr10	135438888	rs150376644	C	T	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=6.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.91;MQRankSum=-8.465;QD=1.49;ReadPosRankSum=-0.834;SOR=1.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:214,34:0.14:248
chr10	135438929	rs201901202	T	G	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FS=2.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.85;MQRankSum=-11.592;QD=1.61;ReadPosRankSum=0.281;SOR=0.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:297,54:0.15:351
chr10	135438951	rs200483318	G	A	2009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FS=7.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.54;MQRankSum=-10.157;QD=5.35;ReadPosRankSum=-1.240;SOR=1.068;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:306,70:0.19:376
chr10	135438955	rs201563622	C	T	2009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FS=6.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.58;MQRankSum=-10.450;QD=5.29;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=1.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:308,72:0.19:380
chr10	135438967	rs145018822	C	T	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=388;ExcessHet=3.0103;FS=6.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.13;MQRankSum=-10.715;QD=4.08;ReadPosRankSum=1.788;SOR=1.133;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:323,64:0.17:387
chr10	135438977	rs79631365	G	A	1519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=386;ExcessHet=3.0103;FS=11.980;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.06;MQRankSum=-11.187;QD=3.95;ReadPosRankSum=3.086;SOR=1.391;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:325,60:0.16:385
chr11	193096	rs2280539	T	C	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.296;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=33;PP=1171;ReadPosRankSum=-1.194;SC=CTGAGACTGCTGGCATGAAGG;SOR=0.810;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=145;TCF=76;TCR=69;TR=72;WE=193104;WS=193086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,71:0.49:144
chr11	193146	rs61736219	G	A	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.396;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=36;PP=1001;ReadPosRankSum=0.631;SC=ACCCTGTTCTGCATCTGCCGT;SOR=1.046;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=125;TCF=47;TCR=78;TR=55;WE=193154;WS=193136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,54:0.43:125
chr11	193194	rs2686896	T	C	1991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=72;PP=1586;ReadPosRankSum=0.525;SC=CATTCAGGGGTGGGGGGGAGT;SOR=2.184;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=87;TCF=12;TCR=75;TR=84;WE=193202;WS=193184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,84:0.99:85
chr11	193863	rs2294081	T	C	3011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.12;SOR=1.893;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr11	193863	.	TAT	CAG,CAT	786	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=9,22;NR=27,56;PP=657,786;QD=19.7352187462;SC=TCAAGTCCTGTATAGATGGCC;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=79;TCF=22;TCR=57;TR=36,78;WE=193873;WS=193853;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.46:79
chr11	193865	rs2686894	T	G	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.96;ReadPosRankSum=1.083;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,39:0.49:80
chr11	193979	.	C	T	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.697;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=96;ReadPosRankSum=-0.073;SC=CAACACAGCACCCACACAGCC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=193987;WS=193969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr11	194332	.	C	CCA	363.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.503;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.087;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.37;MQRankSum=1.281;NF=8;NR=1;PP=395;ReadPosRankSum=-1.481;SC=GACCCCCCCCCACTGAGGGCC;SOR=1.700;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=9;WE=194340;WS=194322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr11	194640	rs2979429	G	A	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=197;ReadPosRankSum=0.000;SC=AACACACTCGGGGCCACAGCC;SOR=0.527;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=10;WE=194648;WS=194630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr11	197557	rs7103852	A	G	2282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=15;PP=1874;SC=CATTGCGTCCACAGGCTTCAT;SOR=2.425;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=59;TCR=15;TR=74;WE=197565;WS=197547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	198062	rs11605246	C	G	3026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=39;PP=2204;SC=TGGACACCCCCTGACCCGACT;SOR=0.994;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=59;TCR=39;TR=98;WE=198070;WS=198052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr11	207359	rs375304678	C	CGGCCACAGCCGCCTCAGACGT	590.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.23;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	207400	rs71487219	A	G	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=5;PP=145;SC=GCGGGGAAAGAGCTTCCGGCC;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=207408;WS=207390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	207462	rs11245998	A	G	123.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=3;PP=52;SC=GCCCCTAGATAGCCCAGCCCC;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=207470;WS=207452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	209002	rs2177173	A	G	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=14;PP=441;SC=GTGCGCGGGTAGCAGGGAGGG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=209010;WS=208992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	214421	rs3216	G	C	4621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=76;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.788;SC=GTTGCAACCTGGGGAAGCCAC;SOR=0.284;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=83;TCR=76;TR=158;WE=214429;WS=214411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,159:0.99:160
chr11	219089	rs511744	T	C	175.03	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.6272;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=181;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CTTTACAAGCTCCTCAGGATG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=8;WE=219097;WS=219079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr11	223832	rs144507767	C	A	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=24;PP=696;SC=TGCCCTCCAGCCTCCTCCCTG;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=223840;WS=223822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	223854	rs201048317	C	T	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.31;QD=55.85;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	223856	.	A	ACAAACCTC	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.31;QD=40.34;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	223976	.	ACTCCTCCCTGCACAGGCCTGCCGACAGCCCATGAGATGACTCCTGTACCCCTCCCTTCCCCTGCCCTCCAGC	A	261.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=3.581;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.03;SOR=0.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr11	224048	.	C	A	884	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=58.0;NF=12;NR=17;PP=884;QD=31.6817659499;SC=TGCCCTCCAGCCTCCTCCCTG;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=29;WE=224056;WS=224038;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,29:0.94:31
chr11	233067	rs11246020	C	T	2862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=33;PP=2330;SC=TAGTGAGTGACGTTGGGCTTG;SOR=1.464;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=57;TCR=33;TR=90;WE=233075;WS=233057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	233212	rs11555236	C	A	2767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=44;PP=2422;SC=CACTCCCCGGCGATCTGCAGG;SOR=0.741;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=40;TCR=44;TR=84;WE=233220;WS=233202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr11	233298	rs12365010	T	G	3209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=46;PP=2545;SC=AGGGCAGGAGTCAGGGGAGGG;SOR=0.859;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=98;TCF=51;TCR=47;TR=97;WE=233306;WS=233288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr11	235894	rs9795476	T	G	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=359;SC=CCCCCATAAGTGACGTCCACA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=235902;WS=235884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	236343	rs7118852	A	G	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=14;PP=372;SC=CGCGCAGTCCAAGGAGTCCTC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=236351;WS=236333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	236370	.	C	CCGGCGCCCCGCCCG	354.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.19;QD=39.42;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	236871	rs2272563	T	C	125.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=1;PP=85;SC=GAGAGTTTTGTCCGGAGCGCA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=236879;WS=236866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	237087	rs1045288	A	G	1608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=28;PP=1268;SC=CAGAGCCAGAACTCCGGGCCC;SOR=0.853;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=52;WE=237095;WS=237077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	243987	rs6598060	G	A	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=441;SC=TGGGGTCTTCGTTTTGCAGAA;SOR=4.615;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=17;WE=243995;WS=243977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr11	244115	rs7128044	G	A	2101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=42.04;ReadPosRankSum=-0.889;SOR=0.361;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr11	244129	rs7116130	C	T	1387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=27;PP=1300;ReadPosRankSum=0.213;SC=TGATGCTCGGCGGTGCTCAAA;SOR=0.390;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=47;WE=244149;WS=244096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr11	244141	rs7128029	G	A	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=1245;ReadPosRankSum=1.221;SC=GTGCTCAAAGGCTGGTGGCTT;SOR=0.446;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=17;TCR=26;TR=42;WE=244149;WS=244096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr11	244167	rs1128320	C	T	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.23;SOR=2.226;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	244171	rs1128321	T	C	1285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.92;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	244197	rs1128322	T	C	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=100;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=16;PP=522;SC=TCATTCTTCATGTAGTTAGAC;SOR=1.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=21;WE=244205;WS=244187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	244414	rs2272565	C	T	2446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=30;PP=1985;SC=CTGATTGTTCCTTCTTTTCCA;SOR=1.091;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=41;TCR=30;TR=71;WE=244422;WS=244404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	244490	rs3830667	ATACCTTTTAG	A	3524.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.35;NF=22;NR=30;PP=2981;SC=CATGTGGGCAATACCTTTTAG;SOR=0.743;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=52;WE=244507;WS=244480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	244552	rs2272566	A	G	2717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=97;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=49;PP=2393;SC=CTCACTGTCCAGACCTTTAGA;SOR=0.997;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=39;TCR=49;TR=88;WE=244560;WS=244542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	247200	rs3830001	G	T	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=0;PP=816;SC=CTAGGCAACAGAGTGAGACCC;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=247208;WS=247192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	250877	rs12793187	C	T	1481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=35;PP=1161;SC=TAAGCGAACACCCAGGAGCCA;SOR=2.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=46;WE=250885;WS=250867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	252318	rs6598055	C	T	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=3;PP=516;SC=TTTTTTCTAACGTTCCTGTGA;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=252326;WS=252308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	280221	rs6421985	A	C	1665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=30;PP=1342;SC=GGAGGAGGCGATGGGGCCCGC;SOR=1.287;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=20;TCR=30;TR=50;WE=280229;WS=280211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	280673	rs12807092	C	T	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=2;PP=627;SC=GGCTGCTGAGCAAGGCGCTGC;SOR=4.174;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=24;WE=280681;WS=280663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	280816	rs7482965	AT	TC	6660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=48;PP=2947;SC=TTCTACAAGTATTTCCGGGAT;SOR=1.314;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=86;TCR=49;TR=133;WE=280825;WS=280806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr11	284093	rs9734280	A	G	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=1;PP=671;SC=AGGCTCTGCGAGGTCCAGGGA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=284101;WS=284083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	284716	rs760059	C	T	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=17;PP=513;SC=CCTGGGGGCTCCCCCTGGACC;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=284724;WS=284706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	290816	rs10902120	A	G	1496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=25;PP=1133;SC=TCCTGACAGCAGTGGGCGGCA;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=26;TCR=25;TR=51;WE=290824;WS=290806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	292798	rs11602423	A	G	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=10;PP=451;SC=AGGTGTCTCAATGCCAGGCCT;SOR=0.914;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=16;WE=292806;WS=292788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	293001	rs35259273	A	AG	2519.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=29;PP=2380;SC=CTGAGGGGTGAGGCCATGGTG;SOR=0.971;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=59;TCF=30;TCR=29;TR=56;WE=293009;WS=292991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	294512	rs149098966	A	ACCCCAGGCTGTCCCTCACCCCCAGACTGCCCTCTCAC	2907.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.91;QD=54.86;SOR=1.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	294523	.	C	T	1625	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=59.68;NF=10;NR=30;PP=1625;QD=41.4942803137;SC=CCCCAGGCTGCCCCTCACCCC;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=79;TCF=34;TCR=45;TR=40;WE=294545;WS=294513;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:39,40:0.51:79
chr11	294537	.	G	A	1625	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=59.67;NF=7;NR=22;PP=1625;QD=57.2334900878;SC=TCACCCCCAGGCTGCCTCTCT;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=78;TCF=38;TCR=40;TR=29;WE=294545;WS=294513;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:49,29:0.37:78
chr11	308065	rs9704108	T	C	288.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=209;SC=GTTCTGCCCTTATCTGGCCCT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=308073;WS=308055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	308290	rs1058900	T	C	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=29;PP=910;SC=ATGCTGGGGGTGCCCCACAAC;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=41;WE=308298;WS=308280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	308314	rs14408	T	C	1476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=24;PP=811;SC=GCTCCCCCGATGTCCACCGTG;SOR=1.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=36;WE=308322;WS=308304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	308363	rs1058935	G	C	1195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=22;PP=945;SC=CTGACCATGTGGTCTGGTCCC;SOR=0.968;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=37;WE=308371;WS=308353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	308426	rs1058964	G	C	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=22;PP=1208;SC=TAGCATTCGCGTACTCCGTGA;SOR=0.909;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=26;TCR=22;TR=48;WE=308434;WS=308416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	314207	rs9667990	C	G	7002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=86;NR=140;PP=2965;SC=TGTGCTGGGGCCACCCCCCAG;SOR=1.312;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=226;TCF=86;TCR=140;TR=226;WE=314215;WS=314197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr11	320166	rs28655829	T	C	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=27.76;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	320237	rs28688930	C	G	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=28.65;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	372095	rs72847391	T	C	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=253;SC=ACAGGCCTCATGTGCCACCTG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=372103;WS=372085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	372225	rs79491678	C	T	1488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=20;PP=1117;SC=GAGCAGAGCCCTGGGGAGAAC;SOR=0.909;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=27;TCR=20;TR=47;WE=372233;WS=372215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	373317	rs72847393	G	T	1824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=47;PP=1505;SC=CCCTGGTGTCGTCCCGGGCCT;SOR=3.690;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=7;TCR=47;TR=54;WE=373325;WS=373307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	373408	rs376849299	AC	A	551.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.99;SOR=2.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	375804	rs61876283	G	A	2909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=36;PP=2310;SC=GGGCGAGGGCGGGGGTGCCTG;SOR=1.105;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=52;TCR=37;TR=87;WE=375812;WS=375794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	377095	.	G	A	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=7;PP=756;SC=CCCGGGCGACGAGGCCGCGTC;SOR=1.893;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=27;WE=377103;WS=377085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	377437	rs61876284	T	C	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=301;SC=GGCCCAGTGGTGTACCGGCCT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=377445;WS=377427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	379598	rs1134699	A	G	2263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=26;PP=1768;SC=AAAGTCCCGAACCCGCTCCCG;SOR=1.308;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=42;TCR=26;TR=68;WE=379606;WS=379588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr11	379841	rs144602584	G	GCC	3066.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.480;HP=9;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=45;PP=777;ReadPosRankSum=-0.211;SC=TCGGCTCAGCGCCCCCCCCGC;SOR=0.354;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=110;TCF=52;TCR=58;TR=64;WE=379849;WS=379831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,91:0.98:93
chr11	380242	rs111471551	G	A	5116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=55;PP=2965;SC=AAAACGGGGCGTGCCCGGGGA;SOR=1.424;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=100;TCR=55;TR=155;WE=380250;WS=380232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr11	380461	rs111901818	T	TC	3379.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=74;PP=2936;SC=GCCCCGAGCGTCCCACCCTGT;SOR=2.903;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=99;TCF=17;TCR=82;TR=90;WE=380469;WS=380451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr11	396701	rs11246147	C	T	1578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=21;PP=1226;SC=AGCGATGGGCCCAGCCCGAGG;SOR=0.952;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=50;WE=396709;WS=396691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	396915	rs12419281	C	T	1471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=20;PP=1135;SC=CAGCCCACAACGGGGGCAGCG;SOR=0.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=21;TCR=20;TR=41;WE=396923;WS=396905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	397331	rs200371913	G	C	1817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=11;PP=1451;SC=CCAGTGGCTCGAGCGCCATCT;SOR=2.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=54;WE=397339;WS=397321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	397706	rs9795298	T	C	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=19;PP=538;SC=GGTGACCTCCTTCGTGGGCCC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=397714;WS=397696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	397732	rs9795299	T	G	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=319;SC=CCTCCCACTGTCCTCTGCTCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=397740;WS=397722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	400109	rs8858	A	G	131.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=3;PP=101;SC=CCTCGGAGGCAGAGATCTTCT;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=400117;WS=400099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	403046	.	C	T	232	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=41;MMLQ=28;MQ=62.65;NF=8;NR=0;PP=232;QD=33.3464015684;SC=CCGCTCACCCCGACCCCGCCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=403054;WS=403036;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	403939	rs7479832	A	G	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=19;PP=1177;SC=CCGGCCTCCCACAGCCACGAA;SOR=1.132;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=48;TCF=29;TCR=19;TR=46;WE=403947;WS=403929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	403980	rs11748	G	A	2669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=23;PP=2215;SC=AGAAGCTGCCGGGCAGCGTGG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=54;TCR=23;TR=77;WE=403988;WS=403970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	404317	rs1134578	C	T	3052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=61;PP=2448;SC=ACCGTGACTTCCGGGCGGTAC;SOR=1.337;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=95;TCF=34;TCR=61;TR=94;WE=404325;WS=404307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr11	406043	rs7947	G	A	2307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=38;PP=1793;SC=GCTCTCCAAAGACAGGCCCCC;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=38;TCR=38;TR=76;WE=406051;WS=406033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	406473	rs3087588	A	C	3047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.54;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	406483	rs3210908	T	C	2986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.58;SOR=1.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	406500	.	C	G	2193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=36;PP=1236;SC=TCCGCGGCAGCGCCAGCTGCA;SOR=2.655;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=45;WE=406508;WS=406490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	406684	.	C	T	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.73;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	406692	.	C	T	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.65;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	407708	rs6421977	A	C	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=11;PP=610;SC=CGCACAGAGCACCCGGGGGCT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=22;WE=407716;WS=407698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	409385	rs6421976	C	G	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=9;PP=259;SC=TGGATGGGCACAGCTGGGAGC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=409393;WS=409375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	409720	rs6598024	T	G	2243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=22;PP=1779;SC=AAGGGCCCAGTGGGAGGGGTG;SOR=1.678;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=46;TCR=22;TR=68;WE=409728;WS=409710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	428385	rs10794323	A	G	1736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=9;PP=1384;SC=AGGGCCACGCACCTGTTGATC;SOR=3.370;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=51;TCR=9;TR=60;WE=428393;WS=428375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	428489	rs10794324	T	C	3472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=66;PP=2547;SC=GTCATGATGATGATGGTCACA;SOR=1.010;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=50;TCR=66;TR=116;WE=428497;WS=428479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr11	429659	rs7111432	C	T	3007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=61;PP=2342;SC=GTGGCTGCGGCGGGGGCAAGG;SOR=2.019;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=27;TCR=61;TR=88;WE=429667;WS=429649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	430339	rs113926353	C	G	2077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=39;PP=1572;SC=GCGGCCGGCACCAGCATGTAG;SOR=0.980;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=30;TCR=39;TR=69;WE=430347;WS=430329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	430456	rs11603743	A	G	275.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=10;PP=255;SC=GGGGAGGGACAGGAAAGGGAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=430464;WS=430446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	431577	.	T	A	52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=60;MMLQ=24;MQ=52.37;NF=3;NR=0;PP=52;QD=28.9237375157;SC=GTGTGGGGGCTCCCGCGGGTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=431585;WS=431572;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	431622	.	C	T	480	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=31;MMLQ=23;MQ=58.68;NF=19;NR=0;PP=480;QD=27.093221713;SC=GGGGCGTCCGCGGGTATCTGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=431630;WS=431612;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	431834	rs55914928	A	G	2453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=42;PP=1938;SC=TCTCCAGGCCAGCCCACCCCT;SOR=0.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=45;TCR=42;TR=87;WE=431842;WS=431824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr11	433387	rs7395065	A	G	4635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=69;PP=2965;SC=TCCAGGAGGAAAGTGCGGTAC;SOR=0.707;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=137;TCF=68;TCR=69;TR=136;WE=433395;WS=433377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr11	433554	rs12576389	C	T	1037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=22;PP=617;SC=TCAGAACCCTCCCCCCTCTAT;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=433576;WS=433544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	433568	rs7396813	G	A	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=20;PP=509;SC=CCTCTATTCCGCCTCAGAACC;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=433576;WS=433544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	433867	rs12575508	G	A	2961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=50;PP=2410;SC=TTGCTGCCGCGCCTGCCGGGG;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=105;TCF=53;TCR=52;TR=103;WE=433875;WS=433857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr11	433965	rs7396778	G	A	1857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=32;PP=1456;SC=GGGGCCAGGCGCAGGTGAAGG;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=23;TCR=33;TR=55;WE=433973;WS=433955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	433995	rs7396776	G	A	1959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=31;PP=1577;SC=GGGCCAGGTGGGGCCCGGGAG;SOR=1.034;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=24;TCR=31;TR=55;WE=434003;WS=433985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	460303	rs11821341	T	C	1083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=32;PP=822;SC=GCTGCCCTCTTGTCCTGCCTT;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=38;WE=460311;WS=460293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	473993	.	C	T	1479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=0.000;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.737;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=43;PP=1036;ReadPosRankSum=1.171;SC=TTGCCATTTCCTTTTCCGTGT;SOR=0.822;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=125;TCF=34;TCR=91;TR=58;WE=474001;WS=473983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,63:0.48:131
chr11	474033	rs72851118	C	T	2421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=63;PP=1973;ReadPosRankSum=-0.780;SC=TCTGAGCGGCCACTCTGTGTC;SOR=2.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=8;TCR=64;TR=71;WE=474041;WS=474023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,76:0.99:77
chr11	479240	rs3216784	GC	G	1112.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=685;SC=TGCCCACACAGCCCTCGAGTG;SOR=3.528;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=17;WE=479254;WS=479230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	479245	rs2301169	C	T	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.14;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	479245	.	CG	TT	978	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=1;NR=16;PP=978;QD=60.6745808742;SC=ACACAGCCCTCGAGTGATGGG;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=17;WE=479254;WS=479230;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,17:0.81:21
chr11	479246	rs2301170	G	T	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.87;SOR=3.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	486826	rs55653405	C	T	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.87;QD=47.09;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	486835	rs55976759	G	A	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.86;QD=43.66;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	486843	rs56352613	A	G	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.32;QD=49.64;SOR=3.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	486855	rs55961417	T	A	1653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=11;PP=986;SC=CTCAAAAAAATAAAATAAATA;SOR=1.675;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=37;WE=486863;WS=486816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	486874	rs55830538	T	C	1849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=18;PP=1033;SC=TAAACAACCATGATCTCCCGT;SOR=1.203;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=30;TCR=18;TR=48;WE=486882;WS=486864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	486975	.	G	C	2093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=23;PP=1781;SC=AAAGTATGTTGACCCCAAGCT;SOR=1.392;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=38;TCR=23;TR=61;WE=486983;WS=486965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	487666	rs112145905	C	T	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=335;SC=GTCGGGTCCCCGCTCCGTCCT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=487674;WS=487656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	488135	rs11820122	G	A	1568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.23;QD=46.14;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	488140	rs11821959	C	T	1731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.19;QD=42.24;SOR=5.186;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	488389	rs11822000	C	A	1441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=18;SC=CCAGCGCGGCCCCTGGACCCC;SOR=1.038;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=44;TCF=26;TCR=18;TR=43;WE=488397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	489386	rs67492572	T	C	3467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=24;PP=2811;SC=GGCTGCCGGCTCTGTGGTTCC;SOR=2.501;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=84;TCR=24;TR=108;WE=489394;WS=489376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr11	489829	rs56005321	C	A	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=25;PP=1201;SC=TGGGCAAGTCCGCCTGGAGGA;SOR=1.005;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=43;WE=489837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	494942	rs7983	G	C	1629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=38;PP=1251;SC=GCAGGATGCCGGCGTCCCCCA;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=58;WE=494950;WS=494932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	495103	rs11246165	A	G	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=11;PP=389;SC=CTGGCACCGCACTGACCGGCA;SOR=1.371;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=17;WE=495111;WS=495093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	498383	rs11825121	C	T	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=1;PP=773;SC=GAGTCGCTCACTCCTCCCCTG;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=498391;WS=498373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	499059	rs17584	C	T	1979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=33;PP=1503;SC=GGCCCTGGCACAGCACACGGA;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=64;WE=499067;WS=499049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	499547	rs61876345	A	C	1765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=31;PP=1265;ReadPosRankSum=0.755;SC=ACTCACGGCCAGGCATCTGTT;SOR=0.277;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=30;TCR=32;TR=61;WE=499555;WS=499537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr11	499583	rs61876346	G	A	1682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=35;PP=1237;SC=TGGGGCAGCTGTGCCTTGCAA;SOR=1.421;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=55;WE=499591;WS=499573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	500056	rs12417451	G	A	235.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=219;SC=CACGCCCTTCGCCTGCCAGAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=500064;WS=500046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	502013	rs7930593	G	A	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=3;PP=396;SC=GCCGCCACCCGCCAGCCTGCC;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=502021;WS=502003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	502217	rs7944548	C	T	2152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=41;PP=1629;ReadPosRankSum=-0.752;SC=ACGTCTTGGCCGAATCCCCTC;SOR=0.471;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=26;TCR=42;TR=67;WE=502225;WS=502207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,72:0.99:73
chr11	534242	rs12628	A	G	4195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=69;PP=2965;SC=CGTCCACAAAATGGTTCTGGA;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=61;TCR=69;TR=130;WE=534250;WS=534232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr11	534403	rs146677294	GCCCAGGCCCAGC	G	1090.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=2979;SC=GCTCAGCCAGGCCCAGGCCCA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=16;WE=534422;WS=534393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	549959	rs7942030	C	T	2566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=22;PP=1971;SC=GCTGTGGCCTCGCTGACCTGG;SOR=1.854;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=54;TCR=22;TR=76;WE=549967;WS=549949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr11	550028	rs11246180	C	G	3968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=52;PP=2965;SC=GCTGGGGAGGCCTGGGCTGGG;SOR=1.092;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=75;TCR=52;TR=126;WE=550036;WS=550018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr11	551235	rs35537971	G	A	1948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=28;PP=1572;SC=CGGCCCCCCCGCGGCTGAGCC;SOR=0.822;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=34;TCR=28;TR=62;WE=551243;WS=551225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	551405	rs7396875	G	A	2158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=45;PP=1659;SC=CATCTCATGCGCTTCTCCAGC;SOR=1.576;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=67;WE=551413;WS=551395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	552547	rs3740652	T	C	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=2;PP=301;SC=GGCTGGAGCTTCTCCTCCTCT;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=552555;WS=552537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	552756	rs12361381	T	C	1586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=32;PP=1313;SC=AACACCCCACTTCTATAGGGG;SOR=1.562;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=48;WE=552764;WS=552746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	552787	rs12361383	T	C	1282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=34;PP=956;SC=CCAGATCAGATGTGTCAACCT;SOR=2.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=47;WE=552795;WS=552777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	552875	rs28575794	A	G	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=357;SC=GCTCACGACCAAGGGAGGCCC;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=552883;WS=552865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	554047	rs12793222	G	A	2241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.188;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=39;PP=1832;ReadPosRankSum=-0.642;SC=AGCTCCCCGCGGTGGTCGACA;SOR=0.395;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=74;TCF=35;TCR=39;TR=73;WE=554055;WS=554037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,74:0.99:75
chr11	554166	rs10902170	C	G	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=29;PP=1291;SC=GGTGGCCTCACGCCTGAGCCC;SOR=0.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=22;TCR=29;TR=51;WE=554174;WS=554156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	554214	rs10902171	G	C	1673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=24;PP=1343;SC=GCCAGCACCAGATGCAGCAGC;SOR=0.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=30;TCR=24;TR=54;WE=554222;WS=554204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	554299	rs10902172	C	G	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=29;PP=937;ReadPosRankSum=-0.569;SC=TGCCAGGCTTCCCTGTGCTGG;SOR=0.846;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=41;WE=554307;WS=554289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr11	555223	rs55731724	AC	A	319.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=392;SC=GGACGAGGAGACAGAGGGGAG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=555231;WS=555213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	556121	rs936467	G	A	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=11;PP=475;SC=CAGACCTGGAGGGGCGTGGAG;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=22;WE=556129;WS=556111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	556457	rs28407128	T	C	1717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=21;PP=1344;SC=CCAGCTCCAGTCCGGCGCCGG;SOR=1.077;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=30;TCR=21;TR=51;WE=556465;WS=556447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	556521	rs28406183	C	G	2228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=28;PP=1775;SC=TCCAGTGGTCCGGGTCTGTGC;SOR=1.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=51;TCR=28;TR=79;WE=556529;WS=556511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	556857	rs7938269	G	C	2745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=54;PP=2259;SC=TGCTGTAGCTGCCGGCCTGCA;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=31;TCR=54;TR=85;WE=556865;WS=556847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr11	557342	rs936466	T	C	1801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=12;PP=1434;SC=GCGTCTTCACTTGCCAAGGTG;SOR=2.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=52;WE=557350;WS=557332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	558165	rs79820513	T	G	3380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=56;PP=2671;ReadPosRankSum=-0.816;SC=CCTCACCCACTGGGCTCGCTC;SOR=0.237;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=57;TCR=57;TR=113;WE=558173;WS=558155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,114:0.99:115
chr11	558884	rs2061586	C	T	1923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=14;PP=1612;SC=ACCACCGGTGCGGGGTGGGGC;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=50;TCR=14;TR=64;WE=558892;WS=558874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	559016	rs3943356	C	T	3479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=65;PP=2741;SC=TCGGTTTCTTCAACCTCCTGG;SOR=1.109;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=46;TCR=65;TR=111;WE=559024;WS=559006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr11	562437	rs11246189	G	A	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=17;PP=972;SC=TGGAGCTCAGGGTGCAGAGGA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=35;WE=562445;WS=562427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	587425	rs12800061	C	A	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=16;PP=603;SC=AGAACTGTGCCCATTACTTCT;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=24;WE=587433;WS=587415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	601785	rs2396545	T	C	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=29;PP=693;SC=AGCCTCCCGCTGGCCTTGGCA;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=601793;WS=601775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	606656	rs936470	G	C	1206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=28;PP=1010;SC=CAGGCTGTTCGCAAGCACTCA;SOR=2.242;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=37;WE=606664;WS=606646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	606749	rs936469	G	A	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=330;SC=TTCCCTTCTTGAGCAGTTTCT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=606757;WS=606739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	607175	rs936468	G	A	1907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=18;PP=1565;SC=CCCAAGGCCCGTCAGGAAACA;SOR=1.850;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=61;WE=607183;WS=607165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	609068	rs7928902	G	A	2750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=41;PP=2112;SC=CTTCCCCAGCGCCCCTTGCAC;SOR=0.786;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=44;TCR=41;TR=85;WE=609076;WS=609058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	609353	rs11539530	G	A	7665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=148;PP=2965;SC=ACTCTTCCCCGGAGCGAGACT;SOR=1.417;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=231;TCF=83;TCR=148;TR=231;WE=609361;WS=609343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr11	610277	rs11246212	T	C	2884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=60;PP=2045;SC=GTCAGGCAGGTGTTCTCCGAG;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=39;TCR=60;TR=99;WE=610285;WS=610267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr11	611503	rs7941547	G	A	1320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=0;PP=1091;SC=CTCTGCCGCCGTCTGTCTGCG;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=611511;WS=611493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	611531	rs12419618	G	A	1964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=4;PP=1610;SC=CCTAGGGCCTGCTCCTGAGCA;SOR=5.010;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=60;TCR=4;TR=64;WE=611539;WS=611521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	612680	.	C	T	2033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=40;PP=1593;SC=AGGAAGCACTCGATGTCGTCA;SOR=1.410;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=25;TCR=40;TR=65;WE=612688;WS=612670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	612843	rs10902178	T	G	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=14;PP=672;SC=CCGGCGTGTGTCCTCCCCTCC;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=11;TCR=14;TR=25;WE=612851;WS=612833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	612967	rs11246213	A	G	1801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=14;PP=1399;SC=GCCTGAGCACATGGCCTCCCC;SOR=2.340;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=64;TCF=50;TCR=14;TR=62;WE=612975;WS=612957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	613165	rs1051390	G	C	3845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=65;PP=2965;ReadPosRankSum=0.940;SC=GTGCTCCCAAGGACCCCTGGA;SOR=0.242;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=134;TCF=69;TCR=65;TR=133;WE=613173;WS=613155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,133:0.99:134
chr11	613192	rs12422022	A	G	3741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.358;HP=3;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=64;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.312;SC=CCCCCAGGCAAGGGCCTCACT;SOR=0.504;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=53;TCR=64;TR=116;WE=613200;WS=613182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,116:0.99:117
chr11	613208	rs1131665	T	C	3128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.842;HP=2;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=65;PP=2513;ReadPosRankSum=-0.929;SC=TCACTGACCTTGGAAGAAGAC;SOR=0.849;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=109;TCF=44;TCR=65;TR=108;WE=613216;WS=613198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,108:0.99:109
chr11	613297	rs1061505	T	G	3334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=59;PP=2640;ReadPosRankSum=0.619;SC=AGCCTGGGGGTCCGCCCACCT;SOR=0.316;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=47;TCR=60;TR=106;WE=613305;WS=613287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,109:0.99:110
chr11	613491	.	C	G	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=34;PP=1013;SC=ACAGCTGGGTCTGGGGGGCCG;SOR=2.200;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=45;WE=613499;WS=613481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	613742	.	G	A	380	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=28;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=16;NR=1;PP=380;QD=24.3983066204;SC=GTGAGTGACGGGGGTGGGCGG;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=613750;WS=613732;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	613757	.	A	G	465	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=22;NR=2;PP=465;QD=20.8238005228;SC=GGGCGGGGACAGGCTGCCCCT;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=613765;WS=613747;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	614318	rs1061502	T	C	1728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=23;PP=1363;SC=AGGTCCCCCTTGTCACCAGCT;SOR=1.101;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=33;TCR=23;TR=56;WE=614326;WS=614308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	614864	rs1061501	C	T	4732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.774;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=60;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.770;SC=CCGAGTTATCCCGCAGCATCA;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=146;TCF=85;TCR=61;TR=145;WE=614872;WS=614854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,154:0.99:155
chr11	615010	rs12290989	GA	TT	3637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=46;PP=2947;SC=GCCCAGGCCTGAAGAGGGGGA;SOR=1.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=27;TCR=47;TR=72;WE=615019;WS=615000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	616970	rs1610161	A	T	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=26;PP=842;SC=GAGGTCTGAGATGAGCCGGGT;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=616978;WS=616960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	617214	rs35600572	A	G	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.38;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	617221	rs34449380	T	G	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.18;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	617228	rs112006329	G	A	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.43;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	617378	rs61877856	C	T	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=21;PP=1354;SC=CACCACCGGGCGCATCGTAGG;SOR=1.220;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=54;TCF=32;TCR=22;TR=53;WE=617386;WS=617368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	617420	rs61877857	A	G	1760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=29;PP=1423;SC=CCTCGCCCTCATCGCCGCTGC;SOR=0.906;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=32;TCR=29;TR=61;WE=617428;WS=617410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	617519	rs34889521	A	G	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=30;PP=1058;SC=CAAACCAGACAGCCTTGTACC;SOR=1.414;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=45;WE=617527;WS=617509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	617967	rs2740379	C	G	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=10.280;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=2;PP=873;ReadPosRankSum=0.941;SC=AGCTTTGCCACAGCAGCACTT;SOR=4.608;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=30;WE=617975;WS=617957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr11	618013	rs7108757	C	T	2288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=15;PP=1808;SC=ACAAGGACGGCGAGGCCAAGG;SOR=2.494;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=61;TCR=15;TR=75;WE=618021;WS=618003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	619671	rs1124816	C	T	3150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=52;PP=2453;ReadPosRankSum=-1.168;SC=GCCTTGGATGCACTCTCTACC;SOR=0.772;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=52;TCR=53;TR=103;WE=619679;WS=619661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,104:0.98:106
chr11	621634	rs2740373	G	A	2100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=37;PP=1613;SC=GTTGCGTCTCGGGGATGACGG;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=28;TCR=37;TR=65;WE=621642;WS=621624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	621795	rs12801890	G	A	1649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=15;PP=1282;SC=CAGTCCCCGCGGCTTCGCTGG;SOR=1.848;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=48;WE=621803;WS=621785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	626220	rs12280580	C	G	183.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=2;PP=148;SC=GTCAGTCCCTCCTGGGTGGAT;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=626228;WS=626216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	627517	rs112888889	C	T	952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=5;PP=674;SC=GTTCCGGAGGCCCCTGGAGCA;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=627525;WS=627507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	636496	rs936461	A	G	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=693;ReadPosRankSum=0.984;SC=AGCCGAACCTACTGTCCGGTC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=25;WE=636504;WS=636486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr11	636701	rs3842250	CG	C	1473.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=23;PP=1392;SC=CCAGAGGCTGCGGGGGGGGGG;SOR=2.115;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=27;WE=636711;WS=636691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	636703	rs2396543	G	T	1482.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=22;PP=818;SC=AGAGGCTGCGGGGGGGGGGCG;SOR=2.115;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=28;WE=636711;WS=636691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	636784	rs1800955	T	C	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=11;PP=279;SC=GCGTGGAGGGTGCGCACGAGG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=636792;WS=636774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	639372	rs146876215	GGC	G	1888.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=2;PP=1919;SC=TAAGAGTGGGGGCGGGTCACA;SOR=5.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=42;WE=639381;WS=639362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	640349	rs1870723	G	A	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=1;PP=380;SC=GGAGGGGGGGGGTACGAGGCC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=640357;WS=640339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	651491	rs11246240	C	G	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=3;PP=51;SC=GATAAAAGAGCTAATTCATCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=651499;WS=651481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	653968	rs10615	T	C	2163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=28;PP=1722;ReadPosRankSum=1.242;SC=CTACCTTGCGTTGGCAGAAGG;SOR=0.422;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=39;TCR=28;TR=66;WE=653976;WS=653958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,69:0.99:70
chr11	654109	rs7109899	A	G	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.447;NF=2;NR=20;PP=587;ReadPosRankSum=0.745;SC=CCCCTGAGACACCGGGGACAG;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=22;WE=654117;WS=654099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr11	654147	rs7106020	T	G	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.09;MQRankSum=-0.156;QD=33.70;ReadPosRankSum=-0.373;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr11	654160	rs56079259	ACCC	A	300.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.58;MQRankSum=-0.282;QD=33.42;ReadPosRankSum=1.221;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,8:0.89:9
chr11	654511	rs7951023	G	A	4365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=71;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.791;SC=TGCTCAGAACGTTCTTGTCAC;SOR=0.283;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=66;TCR=72;TR=137;WE=654519;WS=654501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,146:0.99:147
chr11	674454	rs11246258	G	T	367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=283;ReadPosRankSum=-0.466;SC=CCAAGGTGGGGCTTGCGCAGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=674462;WS=674452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr11	686798	rs7121608	G	A	1467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=8;PP=1122;SC=TGGCTGGGCCGCCTCAGAGGG;SOR=2.985;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=43;WE=686806;WS=686788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	686839	rs7121478	G	A	2148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=26;PP=1679;SC=CTGAGCACAGGTGAGGTCACG;SOR=1.284;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=38;TCR=26;TR=64;WE=686847;WS=686829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	688217	rs7126455	A	G	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=5;PP=473;SC=ATCTATTAATAGATGATATTC;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=688225;WS=688207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	688312	rs7116631	G	A	1791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=12;PP=1473;SC=CGAGGCCTGGGGTGCAGGCAC;SOR=2.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=52;WE=688320;WS=688302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	695842	rs7928305	G	A	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=8;PP=225;SC=CGGCCCCGCGGCGAGGTGAGC;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=695862;WS=695832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	695854	rs7945422	C	T	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=138;SC=GAGGTGAGCTCGGGCGGGGTG;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=695862;WS=695832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	700146	.	C	G	2206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=27;PP=1719;ReadPosRankSum=1.744;SC=CACCAGCTCTCTTCAGTTCCC;SOR=0.383;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=40;TCR=28;TR=66;WE=700154;WS=700136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,69:0.99:70
chr11	700247	rs7482162	A	C	1965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=40;PP=1485;SC=TAAGTCAGGGACGGGCACAGT;SOR=1.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=16;TCR=40;TR=56;WE=700255;WS=700237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	703175	rs7107522	A	G	2285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=48;PP=1703;ReadPosRankSum=0.841;SC=GATACCCCACACTGGGGCCCT;SOR=0.604;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=72;TCF=23;TCR=49;TR=71;WE=703183;WS=703165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,77:0.99:78
chr11	704753	rs7941896	G	A	1308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=37;PP=1062;SC=GGCCCGAGAGGCCAGCCTGGA;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=39;WE=704761;WS=704743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	709401	rs10902202	A	G	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=7;PP=1004;SC=CCGCCACCCAAGACACCATGA;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=39;WE=709409;WS=709391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	709680	rs11605783	T	C	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=33;PP=899;SC=GGGGGACAGCTGCTCCTGCCC;SOR=2.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=42;WE=709688;WS=709670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	710558	rs7395822	G	A	2532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=75;PP=2106;ReadPosRankSum=0.979;SC=TCAGGTTCTCGTCTCCACAAA;SOR=3.160;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=7;TCR=76;TR=82;WE=710566;WS=710548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,82:0.99:83
chr11	720197	rs3087546	C	T	2577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=65;PP=2216;SC=CGACCAGTCGCTGCGGCTGCT;SOR=3.316;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=13;TCR=65;TR=78;WE=720205;WS=720187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	720978	.	G	GC	772	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=23;MQ=52.86;NF=17;NR=2;PP=772;QD=43.9918821301;SC=GAGGGGAGGAGCCGGCAGGGG;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=19;WE=720986;WS=720968;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr11	723429	rs4078520	C	T	1607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=39;PP=1375;SC=CATATGGGTACGCTGCCACCA;SOR=2.494;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=11;TCR=40;TR=50;WE=723437;WS=723419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	725877	rs66512023	G	GC	185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=4;PP=242;SC=TGGGGTCGCAGCCCCCAGCTT;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=725885;WS=725867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	726178	rs28498399	G	C	2512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=46;PP=2070;SC=ACGGTGAGAGGTGCTGCTTCG;SOR=1.136;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=34;TCR=46;TR=80;WE=726186;WS=726168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr11	792831	rs370410648	C	T	1055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.027;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=939;ReadPosRankSum=-0.895;SC=CACCTCTTCCCGCACCTCTGC;SOR=1.689;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=33;WE=792839;WS=792821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr11	802125	rs28498421	T	C	2783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=54;PP=1984;SC=ACTGGAGCCATGCCCGGGCCC;SOR=1.044;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=41;TCR=54;TR=95;WE=802133;WS=802115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr11	823809	rs1135628	C	G	2580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=47;PP=2130;SC=CGCAGCTGCCCGGAGAAGATC;SOR=0.867;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=37;TCR=47;TR=84;WE=823817;WS=823799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	836023	rs28475448	C	T	1076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=6;PP=847;SC=GTCAGGGGCCCGGTGCTGTGG;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=35;WE=836031;WS=836013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	836227	rs28434354	A	G	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=15;PP=921;SC=GGCAGATGCGATGACCTTTGT;SOR=0.869;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=19;TCR=15;TR=34;WE=836235;WS=836217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	836539	rs56063221	TG	T	1137.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=18;NR=18;PP=672;SC=TGTGCTCACCTGGGGGGGGGG;SOR=0.741;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=51;TCF=29;TCR=22;TR=36;WE=836547;WS=836529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	842653	rs35249369	C	G	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=27;PP=742;SC=ACCGGCCCCGCCACCGCTGGC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=842661;WS=842643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	849090	rs28402197	C	G	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=17;PP=480;SC=GGTGGGTGCGCGCGACTGCCC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=849098;WS=849080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	850170	rs28704105	T	G	3551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=115;NR=5;PP=2721;SC=CGCCGGGGGCTCCTTCTTCGG;SOR=6.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=116;TCR=5;TR=120;WE=850178;WS=850160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr11	862652	rs28505621	T	C	2212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=27;PP=1769;SC=GGCTGCCAACTTGCTCATCAT;SOR=1.308;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=42;TCR=27;TR=69;WE=862660;WS=862642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr11	864626	rs28377158	A	G	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=25;PP=805;SC=CCTCACGGGCAGCCAGGACAG;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=864634;WS=864616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	865447	rs28423070	G	A	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=3;PP=443;SC=GGGCCGGCGAGGGGGTCTGGA;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=865455;WS=865437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	865503	rs28581489	G	A	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=5;PP=308;SC=GACCCCCCCCGCACCCCCAGA;SOR=1.112;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=13;WE=865511;WS=865493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	866044	rs28457111	A	G	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=7;PP=264;SC=CCACTTTGTTAGGACCTTCTG;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=12;WE=866052;WS=866034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	866183	rs28439203	T	C	197.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=2;PP=118;SC=GGGCTCCCTCTTAGTGGACAG;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=866191;WS=866173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	866498	rs28663055	TG	CA	2883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=11;PP=2947;SC=GGACAGGGACTGCTCTGGGCT;SOR=2.531;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=59;TCF=46;TCR=13;TR=57;WE=866507;WS=866488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	870446	rs6682	G	A	1076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=22;PP=893;SC=GTGCTCTGAGGCCTGGCTGTC;SOR=1.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=37;WE=870454;WS=870436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	900894	rs28454252	T	G	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=5;PP=792;SC=ACCCCCGCAGTTTGAGCCATC;SOR=2.985;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=30;WE=900902;WS=900884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	900929	rs10794339	C	G	1167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=11;PP=926;SC=TGGCCTGCCGCACTTACCTAT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=36;WE=900937;WS=900919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	903070	rs28380110	G	C	4521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=69;PP=2965;SC=GGTCCGTCACGACCAAACCCC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=65;TCR=69;TR=134;WE=903078;WS=903060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr11	993745	rs7104956	C	G	1502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=6;PP=1195;SC=TGTGCCTCCCCGTCCCCAGCC;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=47;TCR=6;TR=53;WE=993753;WS=993735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	1010649	rs72842410	C	T	1947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=36;PP=1371;SC=AGACCAGGCTCGTGTGTCTTG;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=26;TCR=36;TR=62;WE=1010657;WS=1010639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	1016609	rs73403291	C	G	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=5.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.27;MQRankSum=-9.440;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.027;SOR=1.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,28:0.23:122
chr11	1016640	rs111704427	G	A	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=2.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.55;MQRankSum=-10.133;QD=4.82;ReadPosRankSum=5.510;SOR=0.980;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,31:0.19:167
chr11	1016655	rs77024070	G	A	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=6.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQRankSum=-10.675;QD=3.93;ReadPosRankSum=1.423;SOR=1.347;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:158,31:0.16:189
chr11	1016665	rs77438942	C	T	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=3.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.09;MQRankSum=-9.710;QD=2.89;ReadPosRankSum=-1.826;SOR=1.133;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:174,28:0.14:202
chr11	1016722	rs144616203	T	G	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FS=38.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.85;MQRankSum=-9.856;QD=0.27;ReadPosRankSum=-0.819;SOR=4.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:235,21:0.08:256
chr11	1016724	rs3208810	A	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=4.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=37.446;HP=1;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-9.460;NF=101;NR=25;PP=2540;ReadPosRankSum=-0.568;SC=GTGGGTAGTGATGATGACTGT;SOR=4.225;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=334;TCF=255;TCR=79;TR=126;WE=1016732;WS=1016714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:239,22:0.08:261
chr11	1016756	.	G	A	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.253;ClippingRankSum=0.000;DP=387;ExcessHet=3.0103;FS=48.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.88;MQRankSum=-7.059;QD=0.14;ReadPosRankSum=-4.067;SOR=5.452;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:346,39:0.10:385
chr11	1016776	rs33988517	C	T	7053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=5.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=576;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.305;HP=2;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.957;NF=207;NR=63;PP=2962;ReadPosRankSum=2.343;SC=AAAGGTGGAACGTGAGTGGGA;SOR=0.543;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=664;TCF=512;TCR=152;TR=270;WE=1016784;WS=1016766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:255,247:0.49:502
chr11	1016800	rs199626069	G	A	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=915;ExcessHet=3.0103;FS=2.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.29;MQRankSum=-2.946;QD=1.44;ReadPosRankSum=1.029;SOR=0.428;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:827,87:0.10:914
chr11	1016802	rs77342817	T	A	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=934;ExcessHet=3.0103;FS=4.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.30;MQRankSum=0.281;QD=0.22;ReadPosRankSum=-0.234;SOR=0.297;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:864,69:0.07:933
chr11	1016834	rs34740154	G	A	9945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1001;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.141;HP=2;HapScore=1;MGOF=55;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.136;NF=239;NR=157;PP=2962;ReadPosRankSum=1.235;SC=TGGTGGTCTGGAAGGATGTTG;SOR=0.604;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=1188;TCF=727;TCR=461;TR=396;WE=1016842;WS=1016824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:587,409:0.41:996
chr11	1016869	rs35469308	A	T	15627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-6.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=960;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.428;HP=3;HapScore=1;MGOF=70;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.453;NF=310;NR=301;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.404;SC=GTGGAAGAGAAGGGACTGCTC;SOR=0.772;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=1210;TCF=594;TCR=616;TR=611;WE=1016877;WS=1016859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:432,453:0.51:885
chr11	1016890	rs113508205	G	A	7181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=778;ExcessHet=3.0103;FS=5.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.72;MQRankSum=-0.088;QD=9.28;ReadPosRankSum=1.371;SOR=1.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:539,235:0.30:774
chr11	1016894	rs34281988	G	A	12461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=765;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.454;HP=1;HapScore=1;MGOF=79;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.264;NF=170;NR=186;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.529;SC=TAGGTGGGGAGTGTGTGGTGA;SOR=0.536;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=1006;TCF=442;TCR=564;TR=356;WE=1016902;WS=1016880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:403,353:0.47:756
chr11	1016908	rs79018624	G	T	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=679;ExcessHet=3.0103;FS=7.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.41;MQRankSum=-2.836;QD=0.48;ReadPosRankSum=2.012;SOR=1.773;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:622,54:0.08:676
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chr11	1016914	rs74632841	G	T	6039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=660;ExcessHet=3.0103;FS=13.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.02;MQRankSum=1.347;QD=9.19;ReadPosRankSum=-1.678;SOR=1.640;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:481,176:0.27:657
chr11	1016918	rs34375705	C	T	1829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=659;ExcessHet=3.0103;FS=10.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.83;MQRankSum=0.384;QD=2.79;ReadPosRankSum=-0.606;SOR=0.480;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:568,88:0.13:656
chr11	1016928	rs34053383	C	G	21155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=615;ExcessHet=3.0103;FS=14.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.89;MQRankSum=-11.434;QD=34.51;ReadPosRankSum=0.205;SOR=1.482;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,495:0.81:613
chr11	1016928	.	CTGGCC	GTGGCC,GTGGCT	2962	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=80;MMLQ=28;MQ=48.05;NF=269,56;NR=468,195;PP=2962,2944;QD=20;SC=CCTGCTGCTGCTGGCCGAGGT;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=856;TCF=330;TCR=526;TR=737,251;WE=1016942;WS=1016900;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.86:856
chr11	1016933	rs199579978	C	T	4146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=598;ExcessHet=3.0103;FS=21.370;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.63;MQRankSum=0.950;QD=6.96;ReadPosRankSum=-0.333;SOR=2.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:465,131:0.22:596
chr11	1016934	.	G	A	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.350;ClippingRankSum=0.000;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=11.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.57;MQRankSum=-4.444;QD=1.24;ReadPosRankSum=0.153;SOR=2.075;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:544,58:0.10:602
chr11	1016957	rs200695483	T	G	3936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=582;ExcessHet=3.0103;FS=72.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.45;MQRankSum=-4.715;QD=6.80;ReadPosRankSum=-0.364;SOR=4.530;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:454,125:0.22:579
chr11	1016959	rs201219964	T	C	1213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=580;ExcessHet=3.0103;FS=43.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.42;MQRankSum=-1.566;QD=2.10;ReadPosRankSum=-1.159;SOR=5.363;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:512,65:0.11:577
chr11	1016963	rs76273000	G	T	2728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=561;ExcessHet=3.0103;FS=68.038;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.58;MQRankSum=-6.674;QD=4.89;ReadPosRankSum=-0.016;SOR=4.568;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:463,95:0.17:558
chr11	1016968	rs34243203	T	G	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=558;ExcessHet=3.0103;FS=38.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.76;MQRankSum=-4.930;QD=1.04;ReadPosRankSum=0.324;SOR=4.756;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:473,45:0.09:518
chr11	1016976	rs78728217	T	G	2629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=44.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.54;MQRankSum=-7.402;QD=4.66;ReadPosRankSum=1.218;SOR=3.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:469,95:0.17:564
chr11	1016978	rs76461263	T	G	5088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=569;ExcessHet=3.0103;FS=10.409;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.79;MQRankSum=-19.553;QD=10.43;ReadPosRankSum=0.768;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:338,150:0.31:488
chr11	1016991	rs74788171	T	G	5007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=591;ExcessHet=3.0103;FS=0.593;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.63;MQRankSum=-17.635;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.768;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:430,155:0.26:585
chr11	1017023	rs78989655	G	A	5455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=684;ExcessHet=3.0103;FS=7.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.46;MQRankSum=-22.158;QD=8.04;ReadPosRankSum=-0.184;SOR=1.309;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:509,170:0.25:679
chr11	1017029	rs35621365	T	G	10667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=689;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.244;HP=1;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=11.549;NF=188;NR=185;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.390;SC=GATGGTGTGTTGAGGAAGTGT;SOR=0.499;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=789;TCF=419;TCR=370;TR=373;WE=1017053;WS=1017013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:347,337:0.49:684
chr11	1017035	.	A	AAT	6221.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.884;ClippingRankSum=0.000;DP=678;ExcessHet=3.0103;FS=10.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.63;MQRankSum=-23.577;QD=9.24;ReadPosRankSum=0.910;SOR=1.393;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:501,172:0.26:673
chr11	1017040	.	GGT	G	6420.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.769;ClippingRankSum=0.000;DP=708;ExcessHet=3.0103;FS=9.728;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.80;MQRankSum=-24.114;QD=9.19;ReadPosRankSum=0.265;SOR=1.355;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:514,185:0.26:699
chr11	1017045	rs77885750	G	T	6297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=691;ExcessHet=3.0103;FS=7.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.99;MQRankSum=-22.930;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.315;SOR=1.219;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:502,184:0.27:686
chr11	1017069	rs80333708	G	A	2696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=743;ExcessHet=3.0103;FS=0.638;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.70;MQRankSum=5.206;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.232;SOR=0.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:576,163:0.22:739
chr11	1017084	rs34649796	G	A	2755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=722;ExcessHet=3.0103;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.83;MQRankSum=6.324;QD=3.83;ReadPosRankSum=-0.002;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:560,159:0.22:719
chr11	1017110	rs36130410	C	T	8112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=6.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQRankSum=-4.940;QD=13.34;ReadPosRankSum=1.258;SOR=0.353;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:386,222:0.37:608
chr11	1017112	rs77753732	G	C	7930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=607;ExcessHet=3.0103;FS=3.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQRankSum=-3.424;QD=13.17;ReadPosRankSum=0.751;SOR=0.450;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:387,215:0.36:602
chr11	1017113	rs74202058	T	C	12852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=604;ExcessHet=3.0103;FS=1.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQRankSum=-8.933;QD=21.60;ReadPosRankSum=0.161;SOR=0.520;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:255,340:0.57:595
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chr11	1017154	rs112965257	T	G	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=472;ExcessHet=3.0103;FS=12.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQRankSum=-10.183;QD=1.82;ReadPosRankSum=-0.576;SOR=2.308;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:420,49:0.10:469
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chr11	1017220	rs56238842	T	C	8048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.304;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-11.710;NR=140;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.761;SC=GCCATCTGTGTGTGGGTAGGG;SOR=0.538;Source=Platypus;TCR=189;WE=1017248;WS=1017210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,200:0.71:280
chr11	1017231	rs35840539	A	G	8414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FS=6.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.95;MQRankSum=-13.063;QD=30.94;ReadPosRankSum=0.094;SOR=0.415;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,198:0.73:272
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chr11	1017240	rs62891761	G	A	4441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FS=3.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.27;MQRankSum=-8.212;QD=16.39;ReadPosRankSum=0.140;SOR=0.505;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,157:0.58:271
chr11	1017280	rs199539548	G	T	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FS=7.697;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.69;MQRankSum=-6.009;QD=1.06;ReadPosRankSum=-0.639;SOR=1.366;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:295,31:0.10:326
chr11	1017294	rs200241162	A	T	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FS=9.842;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.08;MQRankSum=-7.004;QD=0.97;ReadPosRankSum=-0.841;SOR=1.459;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:341,37:0.10:378
chr11	1017302	rs35330958	G	C	4237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=5.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=388;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.287;HP=2;HapScore=1;MGOF=50;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-14.028;NF=104;NR=41;PP=1522;ReadPosRankSum=1.271;SC=GAAGTGTGGTGTGAGGGTGTG;SOR=1.302;SbPval=0.81;Source=Platypus;TCF=270;TR=145;WE=1017310;WS=1017270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:267,118:0.31:385
chr11	1017317	rs33943903	G	T	5866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=438;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.477;HP=3;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-14.025;NF=108;NR=53;ReadPosRankSum=0.163;SC=GGTGTGATGGGGTTGGATAGG;SOR=1.024;SbPval=0.68;Source=Platypus;TCF=293;TR=161;WS=1017307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:280,154:0.35:434
chr11	1017325	rs55903826	A	C	4205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=451;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=8.933;NF=108;NR=69;PP=2962;ReadPosRankSum=2.596;SC=GGGGTTGGATAGGTAGTGGTG;SOR=0.672;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=474;TCF=293;TCR=181;TR=177;WE=1017346;WS=1017307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:269,178:0.40:447
chr11	1017337	rs76686156	TC	CA	7989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=503;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.534;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-14.355;NF=122;NR=85;PP=2944;ReadPosRankSum=-1.838;SC=GTAGTGGTGGTCTGGAAGGAT;SOR=0.789;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=526;TCF=304;TCR=222;TR=207;WE=1017346;WS=1017307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:293,207:0.41:500
chr11	1017381	rs34912894	G	C	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=563;ExcessHet=3.0103;FS=3.362;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQRankSum=-14.003;QD=0.09;ReadPosRankSum=3.016;SOR=1.074;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:507,53:0.09:560
chr11	1017384	rs34095361	G	C	3666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=555;ExcessHet=3.0103;FS=0.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.33;MQRankSum=-14.833;QD=6.67;ReadPosRankSum=3.293;SOR=0.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:404,146:0.27:550
chr11	1017421	rs35549382	G	T	4113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=457;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.662;HP=2;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-14.027;NF=123;NR=95;PP=2962;ReadPosRankSum=2.267;SC=AAGGGTGTGGGTAGCCTGCTG;SOR=0.578;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=643;TCF=390;TCR=253;TR=218;WE=1017429;WS=1017411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:325,128:0.28:453
chr11	1017440	rs78729877	C	T	3683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=419;ExcessHet=3.0103;FS=6.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQRankSum=-14.703;QD=8.90;ReadPosRankSum=-1.512;SOR=0.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:308,106:0.26:414
chr11	1017443	rs80266715	C	G	3680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=14.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=431;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.386;HP=1;HapScore=1;MGOF=57;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-14.574;NF=176;NR=63;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.873;SC=TGGTGGCCGACGTGGTGTGGG;SOR=0.350;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=597;TCF=413;TCR=184;TR=239;WE=1017451;WS=1017441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:319,107:0.25:426
chr11	1017458	.	AGG	A	1848.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.000;DP=465;ExcessHet=3.0103;FS=4.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQRankSum=-14.279;QD=4.19;ReadPosRankSum=-1.773;SOR=1.111;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:374,67:0.15:441
chr11	1017514	.	A	G	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=53;MMLQ=28;MQ=46.57;NF=154;NR=158;PP=2962;QD=20;SC=GTAGAAGTTGAGGTGACTTCA;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=783;TCF=451;TCR=332;TR=312;WE=1017522;WS=1017504;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:471,312:0.40:783
chr11	1017552	rs35868469	T	C	3120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=681;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQRankSum=3.006;QD=4.64;ReadPosRankSum=2.558;SOR=0.678;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:500,173:0.26:673
chr11	1017596	rs201522029	T	G	4718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=692;ExcessHet=3.0103;FS=9.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQRankSum=3.747;QD=6.90;ReadPosRankSum=-1.847;SOR=0.663;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:474,210:0.31:684
chr11	1017608	.	ACTGGTGGTCACTGTCATTGGTGGG	A	669.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.347;ClippingRankSum=0.000;DP=703;ExcessHet=3.0103;FS=23.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.22;MQRankSum=-18.397;QD=0.96;ReadPosRankSum=-2.799;SOR=2.740;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:637,61:0.09:698
chr11	1017655	rs201234174	G	A	3483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=562;ExcessHet=3.0103;FS=6.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.26;MQRankSum=3.095;QD=6.30;ReadPosRankSum=0.346;SOR=1.186;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:390,163:0.29:553
chr11	1017691	rs77359624	C	G	2056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=707;ExcessHet=3.0103;FS=11.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQRankSum=-10.507;QD=2.93;ReadPosRankSum=-0.093;SOR=0.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:571,131:0.19:702
chr11	1017746	rs78848170	T	G	6287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=905;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.644;HP=2;HapScore=1;MGOF=54;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.910;NF=153;NR=196;PP=2962;ReadPosRankSum=1.181;SC=TGGCTGTGTTTAATGAGCTCA;SOR=0.607;SbPval=0.3;Source=Platypus;TCF=404;TR=349;WE=1017754;WS=1017736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:693,204:0.23:897
chr11	1017767	rs75637734	G	C	7480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=849;ExcessHet=3.0103;FS=0.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=-8.970;QD=8.87;ReadPosRankSum=1.436;SOR=0.805;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:622,221:0.26:843
chr11	1017773	rs57384288	G	A	4711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=781;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=0.067;QD=6.08;ReadPosRankSum=-2.114;SOR=0.703;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:605,170:0.22:775
chr11	1017783	rs36101709	A	G	13249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=736;ExcessHet=3.0103;FS=6.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.96;MQRankSum=-7.846;QD=18.15;ReadPosRankSum=1.744;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:388,342:0.47:730
chr11	1017789	rs78819924	A	C	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=705;ExcessHet=3.0103;FS=11.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQRankSum=3.043;QD=0.84;ReadPosRankSum=0.773;SOR=0.178;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:603,92:0.13:695
chr11	1017833	rs373775476	C	T	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=411;ExcessHet=3.0103;FS=16.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQRankSum=-12.793;QD=3.20;ReadPosRankSum=-1.455;SOR=2.203;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:348,62:0.15:410
chr11	1017844	rs200752571	T	C	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FS=56.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQRankSum=-12.060;QD=2.39;ReadPosRankSum=-2.739;SOR=4.300;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:338,45:0.12:383
chr11	1017845	rs74610224	C	G	2130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=80.189;HP=1;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-11.698;NF=43;NR=174;PP=2962;ReadPosRankSum=0.392;SC=GTGGAGGAATCGTGCCTGTTG;SOR=3.748;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=508;TCF=167;TCR=341;TR=217;WE=1017866;WS=1017823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:288,80:0.22:368
chr11	1017858	rs79583615	A	G	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=59.007;HP=2;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-11.373;NF=48;NR=113;PP=2962;ReadPosRankSum=-4.058;SC=GCCTGTTGGCATTGAGTGGAT;SOR=3.676;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=430;TCF=157;TCR=273;TR=161;WE=1017866;WS=1017823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:243,52:0.18:295
chr11	1017921	rs112301388	C	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=26.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.07;MQRankSum=-1.731;QD=0.33;ReadPosRankSum=-2.008;SOR=2.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:215,18:0.08:233
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chr11	1017963	rs61869008	G	A	2108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=23.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.59;MQRankSum=5.557;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.688;SOR=1.532;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,58:0.33:176
chr11	1017968	rs61869009	T	A	2266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=22.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.76;MQRankSum=6.170;QD=13.57;ReadPosRankSum=1.395;SOR=1.392;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,61:0.37:167
chr11	1017981	rs61869010	T	A	2628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=29.260;HP=4;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=7.807;NF=57;NR=31;PP=2962;ReadPosRankSum=2.820;SC=GGTCTGAGGGTGTGATGGGGT;SOR=1.579;SbPval=0.01;Source=Platypus;TC=218;TCF=96;TCR=122;TR=88;WE=1017996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,72:0.47:154
chr11	1017988	rs112579249	G	T	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=22.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.93;MQRankSum=-6.383;QD=0.47;ReadPosRankSum=-0.399;SOR=3.257;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,16:0.11:143
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chr11	1018025	rs10751677	C	A	1864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=9.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.86;MQRankSum=-8.994;QD=13.13;ReadPosRankSum=-0.119;SOR=1.459;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,50:0.35:142
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chr11	1018042	rs200364398	A	G	1635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=16.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQRankSum=-8.477;QD=12.58;ReadPosRankSum=0.771;SOR=1.969;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,45:0.35:130
chr11	1018048	rs12787400	A	G	1899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=13.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.46;MQRankSum=-7.936;QD=13.97;ReadPosRankSum=0.701;SOR=1.661;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,52:0.38:136
chr11	1018059	rs78336072	C	T	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=4.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.105;HP=2;HapScore=1;MGOF=53;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-7.449;NF=32;NR=15;PP=2962;ReadPosRankSum=0.973;SC=GGGACTGCTCCCTGTAGGTGG;SOR=1.645;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=151;TCF=83;TCR=68;TR=47;WE=1018067;WS=1018002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,49:0.36:136
chr11	1018116	rs10902269	T	G	2683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.798;HP=1;HapScore=2;MGOF=48;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.702;NF=40;NR=48;PP=2018;ReadPosRankSum=1.153;SC=GGTGGCTGAGTTGGTGTGGGC;SOR=1.385;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=195;TCF=95;TCR=100;TR=88;WE=1018124;WS=1018106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,72:0.41:177
chr11	1018138	rs71454075	T	C	2759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=17.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQRankSum=-5.075;QD=14.68;ReadPosRankSum=-1.640;SOR=1.683;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,74:0.39:188
chr11	1018144	rs12807084	G	C	2939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=10.137;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQRankSum=-7.272;QD=15.89;ReadPosRankSum=0.050;SOR=1.345;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,74:0.40:185
chr11	1018169	rs77647814	C	G	2270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=7.894;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQRankSum=-8.121;QD=12.14;ReadPosRankSum=1.568;SOR=0.967;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,62:0.33:187
chr11	1018175	rs12418172	A	G	2510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=11.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQRankSum=-9.184;QD=13.57;ReadPosRankSum=0.404;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,70:0.38:185
chr11	1018182	.	G	T	2111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=10.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQRankSum=-8.248;QD=11.60;ReadPosRankSum=1.186;SOR=0.940;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,58:0.32:182
chr11	1018186	.	G	T	1982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=0.000;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=9.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.83;MQRankSum=-8.345;QD=11.40;ReadPosRankSum=1.094;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,55:0.32:174
chr11	1018192	.	C	T	1799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=0.000;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=6.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQRankSum=-9.041;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.790;SOR=0.978;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,52:0.31:167
chr11	1018196	.	A	T	1892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.129;ClippingRankSum=0.000;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=7.635;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQRankSum=-9.526;QD=11.83;ReadPosRankSum=0.510;SOR=1.094;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,50:0.31:160
chr11	1018215	.	G	GCA	1551.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.952;ClippingRankSum=0.000;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=5.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQRankSum=-8.873;QD=10.93;ReadPosRankSum=-1.042;SOR=1.226;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,43:0.30:142
chr11	1018218	.	T	G	1378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.200;ClippingRankSum=0.000;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=6.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQRankSum=-8.721;QD=10.29;ReadPosRankSum=-0.304;SOR=1.312;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,36:0.27:134
chr11	1018220	.	T	A	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.019;ClippingRankSum=0.000;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=7.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQRankSum=-8.542;QD=9.48;ReadPosRankSum=-0.762;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,37:0.28:134
chr11	1018222	.	AAT	A	1174.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.215;ClippingRankSum=0.000;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=3.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.43;MQRankSum=-8.791;QD=8.33;ReadPosRankSum=-0.195;SOR=1.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,36:0.26:141
chr11	1018226	.	T	G	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.979;ClippingRankSum=0.000;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=2.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQRankSum=-8.675;QD=8.41;ReadPosRankSum=-0.016;SOR=1.010;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,36:0.25:142
chr11	1018229	rs77630889	C	G	1319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=0.712;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQRankSum=-9.304;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.444;SOR=0.812;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,38:0.26:146
chr11	1018232	rs113063572	G	T	1589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=5.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.61;MQRankSum=-8.899;QD=11.04;ReadPosRankSum=-1.260;SOR=1.190;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,41:0.28:144
chr11	1018237	rs79892432	GT	AG	1796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=3.224;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQRankSum=-9.175;QD=12.22;ReadPosRankSum=-2.349;SOR=0.983;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,46:0.31:147
chr11	1018245	rs76423553	TT	GC	2196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=3.284;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.81;MQRankSum=-9.356;QD=14.45;ReadPosRankSum=-2.011;SOR=1.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,51:0.34:152
chr11	1018256	.	T	G	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.386;ClippingRankSum=0.000;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=17.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.70;MQRankSum=-3.730;QD=5.59;ReadPosRankSum=0.585;SOR=2.331;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,31:0.21:151
chr11	1018262	rs78003962	GT	CG	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.43;MQRankSum=-6.660;QD=8.44;ReadPosRankSum=-2.941;SOR=0.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,36:0.24:153
chr11	1018266	.	G	A	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.032;ClippingRankSum=0.000;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=20.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.01;MQRankSum=-1.431;QD=4.22;ReadPosRankSum=2.320;SOR=2.936;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,25:0.16:159
chr11	1018279	rs201852389	C	T	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=29.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.06;MQRankSum=-0.664;QD=3.74;ReadPosRankSum=2.490;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,22:0.14:154
chr11	1018290	.	G	A	500.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.000;ClippingRankSum=0.000;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=32.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.76;MQRankSum=-0.455;QD=3.36;ReadPosRankSum=0.388;SOR=4.961;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,22:0.15:149
chr11	1018291	.	G	C	701.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=5.380;ClippingRankSum=0.000;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=33.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.87;MQRankSum=-1.224;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.833;SOR=4.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,27:0.17:157
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chr11	1018340	rs77556339	TG	CA	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=10.405;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.91;MQRankSum=-2.698;QD=3.50;ReadPosRankSum=-2.427;SOR=2.202;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,15:0.13:116
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chr11	1018390	rs111785507	C	A	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=22.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQRankSum=-7.280;QD=1.09;ReadPosRankSum=-1.390;SOR=4.403;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,8:0.10:84
chr11	1018408	.	G	T	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.796;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=30.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQRankSum=-7.181;QD=0.77;ReadPosRankSum=0.406;SOR=4.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,9:0.10:93
chr11	1019375	rs9704308	C	T	2803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=69;PP=2343;SC=TGGCGGTCGACGCCGTGGCCC;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=18;TCR=69;TR=87;WE=1019383;WS=1019365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	1023682	rs72842416	G	A	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=7;PP=206;SC=CAGCTGGTGGGGTTCCTGGCC;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=1023690;WS=1023672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	1031602	rs149883855	C	T	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=238;SC=CCCTTCTCTCCTCACCATGAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=1031610;WS=1031592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	1079809	rs10902081	C	T	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=20;PP=701;SC=GGCCCCGCCCCGGCACTGCCC;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=1079817;WS=1079799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	1093393	rs199525790	G	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=5.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.23;MQRankSum=0.007;QD=0.50;ReadPosRankSum=1.481;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:159,25:0.14:184
chr11	1093430	rs199573018	C	A	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=19.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.89;MQRankSum=1.753;QD=5.78;ReadPosRankSum=2.267;SOR=1.189;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,54:0.33:165
chr11	1093452	.	G	A	977	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MMLQ=26;MQ=43.74;NF=2;NR=52;PP=977;QD=18.7365039361;SC=CCCCAACCCCGACACCCACCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=191;TCF=76;TCR=115;TR=54;WE=1093460;WS=1093442;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:137,54:0.28:191
chr11	1093512	rs34493663	C	A	1928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-6.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.575;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.713;NF=26;NR=37;PP=896;ReadPosRankSum=-0.466;SC=CTACGATGACCCCAACCCCAA;SOR=0.347;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=151;TCF=79;TCR=72;TR=63;WE=1093520;WS=1093502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,74:0.46:162
chr11	1093569	rs72842460	A	C	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=26.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQRankSum=-2.742;QD=6.19;ReadPosRankSum=0.176;SOR=1.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,30:0.21:143
chr11	1093575	rs201450769	G	C	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=24.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQRankSum=-2.212;QD=5.27;ReadPosRankSum=-0.602;SOR=1.797;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,25:0.18:140
chr11	1093582	rs55641679	G	C	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=23.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=-2.492;QD=4.43;ReadPosRankSum=-2.040;SOR=1.834;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,22:0.15:145
chr11	1093710	rs7944723	C	G	7809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=161;NR=97;PP=2965;SC=GCACAGCACCCATTGCTGAGT;SOR=1.277;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=259;TCF=162;TCR=97;TR=258;WE=1093718;WS=1093700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr11	1093945	rs7934606	T	C	2661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=87;PP=2164;SC=TAAGCAGAGCTGCTTGGTTCC;SOR=5.092;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=6;TCR=87;TR=93;WE=1093953;WS=1093935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	1094629	rs11245950	T	C	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=0;PP=729;SC=AGATGTGCAATGTCTCAGCCC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=1094637;WS=1094619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	1094690	rs10794291	C	T	2202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=7;PP=1713;SC=GTACCACGACCGGGTCATCTT;SOR=4.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=54;TCR=7;TR=61;WE=1094698;WS=1094680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	1094753	rs10794292	A	C	3794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=65;NR=52;PP=2922;SC=CCTGGACCCCAACGCCGACCC;SOR=1.028;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=118;TCF=65;TCR=53;TR=117;WE=1094761;WS=1094743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr11	1095082	rs6597999	A	C	1334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=6;PP=1067;SC=CTGCCTCCGGATAGCCCTGCC;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=39;WE=1095090;WS=1095072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	1096494	rs6421972	T	C	4726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.835;SC=AGGTGTCCTGTCCCCGCACCC;SOR=0.714;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=152;TCF=49;TCR=103;TR=150;WE=1096502;WS=1096484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,147:0.99:148
chr11	1098637	rs12418069	A	G	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=15;PP=859;SC=CTCTCCCTGCACAGCCTGTTT;SOR=1.312;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=39;WE=1098645;WS=1098627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	1103786	rs9988872	A	G	1156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=7;PP=996;SC=GCCCTGCCCTAAGCCGCTGCC;SOR=2.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=28;TCR=7;TR=35;WE=1103794;WS=1103776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	1151695	rs28737416	C	T	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=745;ReadPosRankSum=-0.939;SC=GCACCCGGCACACAGGTACGG;SOR=0.739;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=33;WE=1151703;WS=1151685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chr11	1154073	rs33962059	A	AC	483.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.471;NF=11;NR=3;PP=457;ReadPosRankSum=1.021;SC=GCCTCCTAGGACCCCCCAACC;SOR=1.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=14;WE=1154081;WS=1154067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr11	1155289	rs28468624	A	G	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=30;PP=943;SC=GGGTGGAGAGAGGCCCCAGCT;SOR=4.047;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=33;WE=1155297;WS=1155279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	1157476	rs28707071	C	G	2302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=59;NR=14;PP=1884;SC=TGCAGGCAGACCCCGCCTCTG;SOR=2.802;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=74;TCF=60;TCR=14;TR=73;WE=1157484;WS=1157466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr11	1158073	rs28691231	T	C	3582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=50;PP=1657;SC=GCTCCCCCTGTGCAGACACCT;SOR=1.166;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=31;TCR=51;TR=81;WE=1158081;WS=1158063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	1158092	rs55863018	C	G	3174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=41;PP=1561;SC=CTGCTCCAACCAGGAGCACTC;SOR=1.276;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=23;TCR=41;TR=64;WE=1158100;WS=1158082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	1159150	rs28542750	A	T	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=8;PP=602;SC=GCCGGCAGGCACCCTCGTCTG;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=21;WE=1159158;WS=1159140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	1159210	rs56002968	C	T	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=6;PP=683;SC=CCTCCTGACGCGGAGGCTGGA;SOR=2.215;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=24;WE=1159218;WS=1159200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	1161201	rs28653550	G	A	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=1;PP=611;SC=CTGGTGTGTCGTGTTCCGCAG;SOR=3.442;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=1161209;WS=1161191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	1161315	rs28403537	T	C	2294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=24;PP=1683;ReadPosRankSum=-0.846;SC=CTGGATGGGGTGCAGACGGTG;SOR=0.712;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=76;TCF=52;TCR=24;TR=74;WE=1161323;WS=1161305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,77:0.99:78
chr11	1161335	rs28663568	T	G	2292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=28;PP=1746;SC=GAGTGGAGCCTGGCAGGGCAA;SOR=1.339;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=51;TCR=28;TR=79;WE=1161343;WS=1161325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr11	1161477	rs28464760	G	C	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=25;PP=756;SC=ATGGGTCCACGTGACTGTCCC;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=1161485;WS=1161467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	1161713	rs28404876	G	C	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=1;PP=681;SC=GCCGCAGCTGGAGGGAAAGGC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=1161721;WS=1161703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	1212877	rs77623982	A	G	6294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=489;ExcessHet=3.0103;FS=39.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.29;MQRankSum=-1.583;QD=13.54;ReadPosRankSum=5.281;SOR=1.370;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:201,264:0.57:465
chr11	1213115	rs113511365	C	T	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FS=1.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.74;MQRankSum=-5.520;QD=0.54;ReadPosRankSum=-5.803;SOR=0.853;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:325,44:0.12:369
chr11	1213125	rs78716500	G	A	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=32.168;HP=1;HapScore=1;MGOF=54;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-13.963;NF=113;NR=105;PP=2962;ReadPosRankSum=1.508;SC=CAACCAGCACGACCTCTGGTC;SOR=2.760;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=565;TCF=276;TCR=289;TR=218;WS=1213115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:302,32:0.10:334
chr11	1213245	.	T	A	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=44;MMLQ=28;MQ=59.31;NF=316;NR=245;PP=2962;QD=20;SC=CAGTCACCAGTGACTGTCATC;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=835;TCF=448;TCR=387;TR=561;WE=1213325;WS=1213235;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:274,561:0.67:835
chr11	1213293	.	C	T	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=44;MMLQ=28;MQ=59.57;NF=170;NR=179;PP=2962;QD=20;SC=ACGTGGACTTCCCATCCCCTG;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=886;TCF=492;TCR=394;TR=349;WE=1213325;WS=1213235;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:537,349:0.39:886
chr11	1213314	.	C	T	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=6;HapScore=1;MGOF=44;MMLQ=24;MQ=59.83;NF=318;NR=220;PP=2962;QD=20;SC=GACCCCACGGCGGGGACAAGG;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=949;TCF=520;TCR=429;TR=538;WE=1213325;WS=1213235;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:411,538:0.57:949
chr11	1213405	rs67262263	G	A	10175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=880;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.103;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=186;NR=212;PP=2962;ReadPosRankSum=2.027;SC=GTGCCGAGCCGAGAGCCACCC;SOR=0.610;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=862;TCF=396;TCR=466;TR=398;WE=1213448;WS=1213395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:475,401:0.46:876
chr11	1213416	rs78511643	G	A	9244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=826;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.143;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.810;SOR=0.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:467,356:0.43:823
chr11	1213424	rs61867531	A	G	26780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=837;ExcessHet=3.0103;FS=6.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.780;QD=32.15;ReadPosRankSum=1.869;SOR=1.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,638:0.77:833
chr11	1213428	rs61867532	T	C	26671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=825;ExcessHet=3.0103;FS=5.118;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.780;QD=32.53;ReadPosRankSum=1.348;SOR=1.113;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:192,628:0.77:820
chr11	1213440	rs61867533	T	C	25926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=5.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=812;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.924;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.819;NF=227;NR=364;PP=2962;ReadPosRankSum=1.232;SC=AACACCTGGGTCAGGTGGTGC;SOR=1.017;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=796;TCF=323;TCR=473;TR=591;WE=1213448;WS=1213395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:204,606:0.75:810
chr11	1213461	rs61867534	T	G	8044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=8.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=783;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.765;HP=2;HapScore=2;MGOF=59;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=183;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.294;SC=AGTGCAGCCGTGAAGAGGGCC;SOR=0.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=765;TCF=311;TCR=454;TR=303;WE=1213469;WS=1213451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:347,311:0.47:658
chr11	1213533	rs73395699	C	T	4049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=455;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.976;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=311;PP=2962;ReadPosRankSum=-5.690;SC=ACGAGGTGCGCGTGCTCTGCT;SOR=1.579;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=632;TCF=187;TCR=445;TR=362;WE=1213547;WS=1213523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:274,174:0.39:448
chr11	1214924	rs2075841	C	T	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=14;PP=360;SC=GCAGCCGGGGCAGCCACTCCC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=1214932;WS=1214914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	1215271	rs71025716	GA	G	736.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=1;PP=835;SC=CTGTTGGGAGGAAAGCCCCAG;SOR=4.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=22;WE=1215279;WS=1215261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	1215580	rs1132433	A	G	2776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=44;NR=47;PP=2234;SC=GGGTGATGACAAACGAGGTGG;SOR=0.807;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=44;TCR=47;TR=91;WE=1215588;WS=1215570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	1215698	rs28452143	A	G	3721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=87;NR=44;PP=2965;SC=CCCGTCGACCACGCCCTGCGT;SOR=1.488;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=87;TCR=44;TR=131;WE=1215706;WS=1215688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr11	1216316	rs58550179	G	GC	4487.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=40;PP=2965;SC=GAGATGTCCGGCTCTGGAACG;SOR=1.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=48;TCR=41;TR=87;WE=1216324;WS=1216306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr11	1216333	rs60138698	TA	T	4500.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.21;NF=51;NR=37;PP=2957;SC=AACGTGAGCATACCCTGACCA;SOR=1.431;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=89;TCF=51;TCR=38;TR=88;WE=1216341;WS=1216323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr11	1217084	rs28652890	T	C	1866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=53;NR=9;PP=1579;SC=CCCAGCACCCTGCCCATCCCT;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=53;TCR=9;TR=62;WE=1217092;WS=1217074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	1217228	rs28592983	T	C	1883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=54;PP=1478;ReadPosRankSum=-0.932;SC=CGGCACTCTGTGCGTCCCACG;SOR=1.347;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=15;TCR=55;TR=69;WE=1217236;WS=1217218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,68:0.99:69
chr11	1218128	rs28503875	G	A	2527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=50;PP=2048;SC=ACGGAGAGCCGGTGAAGGTGA;SOR=1.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=23;TCR=50;TR=73;WE=1218136;WS=1218118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	1218613	rs28668687	A	G	88.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=1;PP=52;SC=TGGCTGCCCCAGCACTGCATG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=1218621;WS=1218603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	1218631	rs28429550	C	G	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=1;PP=50;SC=ATGAGCCGGGCTGGCTGCTGC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=1218639;WS=1218621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	1219118	rs28742281	T	C	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.41;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	1219632	rs2075843	G	A	3307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=64;PP=2630;SC=ACTCCGGCCGGGGCCAGGGAC;SOR=1.279;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=38;TCR=64;TR=102;WE=1219640;WS=1219622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	1220599	rs28633254	T	C	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.599;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=785;ReadPosRankSum=0.659;SC=CCCTCCAGCCTGGCGAGACCT;SOR=2.964;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=34;WE=1220607;WS=1220589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,35:0.95:37
chr11	1220760	rs28514396	T	C	1967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=42;PP=1532;SC=GGCTTCACCCTTAGATGGGTT;SOR=1.888;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=57;WE=1220768;WS=1220750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	1220796	rs28502687	T	C	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=21;PP=659;SC=ATCCCTGCAGTGCCAGCAGAC;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=1220804;WS=1220786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	1220923	rs1132435	C	T	1363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=9;PP=1136;SC=CGGCACAGGACGAGGCCCGCA;SOR=2.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=44;WE=1220931;WS=1220913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	1220997	rs28457780	G	A	2692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=13;PP=2203;SC=AACCGTGAGTGCCCAGCCTGC;SOR=3.442;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=91;TCF=77;TCR=14;TR=90;WE=1221005;WS=1220987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	1221038	rs28439383	C	T	3797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=44;PP=2965;SC=CTCAGAGGTCCAGGAGCAGCT;SOR=1.374;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=79;TCR=44;TR=122;WE=1221046;WS=1221028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr11	1221305	rs2075844	A	G	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=11;PP=301;SC=GAGGGGCCAGACAAAGGGCTC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=1221313;WS=1221295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	1221592	rs28728088	T	C	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=2;PP=257;SC=GCCCAGAGCTTGGCACGGCGC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=1221600;WS=1221582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	1246941	rs2672785	A	G	3308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=71;PP=2625;SC=CCGAGCTGGGAGAATGCAGGG;SOR=1.654;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=34;TCR=71;TR=105;WE=1246949;WS=1246931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr11	1248197	rs908224	G	T	366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=6;PP=305;SC=AGGGCTGGGGGGGGGTTGGGT;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=12;WE=1248205;WS=1248187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	1248491	rs908223	T	G	2351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=29;PP=1902;SC=GTTGCCAGTGTGGGGATCAGA;SOR=1.379;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=49;TCR=29;TR=78;WE=1248499;WS=1248481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr11	1248960	rs2075855	G	A	4543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=77;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.748;SC=ATGGGCCCACGGAGCAGTGCC;SOR=0.365;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=61;TCR=78;TR=138;WE=1248968;WS=1248950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,147:0.99:148
chr11	1250384	rs2471912	A	G	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=6;PP=666;SC=GCCCAGCCCCACCTCCTTTTG;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=1250392;WS=1250374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	1250603	rs2075860	G	C	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=11;PP=338;SC=CTCATCAGGCGTGGAAGCAGA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=1250611;WS=1250593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	1250679	.	C	T	53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=53;QD=29.2570708491;SC=GGGAGGGTGCCGGAAGACCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=1250687;WS=1250669;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	1252047	rs2672807	T	C	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=3;PP=1135;SC=CAGGTCCAGGTCTGAGCTTCT;SOR=4.514;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=40;WE=1252055;WS=1252037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	1252708	rs2735709	G	C	4700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=84;PP=2965;ReadPosRankSum=1.515;SC=AGACAGGCCTGGGGCTGCAGC;SOR=0.330;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=67;TCR=85;TR=151;WE=1252716;WS=1252698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,160:0.99:161
chr11	1253136	rs2735711	C	T	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=552;SC=CCAGCCGTTCCACCCTGTGTG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=1253144;WS=1253134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	1253856	rs1318321	T	C	2684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-4.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=62.173;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=85;PP=1922;ReadPosRankSum=2.640;SC=GACGCCCCGATGCCTCCCACC;SOR=2.684;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=123;TCF=38;TCR=85;TR=104;WE=1253864;WS=1253846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,109:0.92:119
chr11	1253858	.	C	A	48.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.020;ClippingRankSum=0.000;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=63.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.41;ReadPosRankSum=-2.080;SOR=4.796;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,10:0.08:119
chr11	1253859	.	CT	C	129.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-3.012;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=66.244;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.07;ReadPosRankSum=-1.724;SOR=4.796;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,10:0.08:121
chr11	1253863	.	CA	C	279.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.000;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=92.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.37;ReadPosRankSum=-3.136;SOR=5.545;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,15:0.13:118
chr11	1253866	.	C	T	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.779;ClippingRankSum=0.000;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=93.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.68;ReadPosRankSum=-3.259;SOR=5.545;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,15:0.14:110
chr11	1253869	.	C	CCT	306.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.001;ClippingRankSum=0.000;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=95.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.81;ReadPosRankSum=-2.451;SOR=5.545;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,15:0.14:109
chr11	1253942	rs908229	T	C	2394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=47;PP=2005;SC=TGTCCTCCTATGTGCACGCCT;SOR=1.638;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=26;TCR=47;TR=73;WE=1253950;WS=1253932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	1253969	rs72846370	A	G	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=11.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.94;ReadPosRankSum=-0.546;SOR=2.506;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
chr11	1253976	rs76956995	A	G	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=15.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.45;ReadPosRankSum=-1.015;SOR=3.390;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr11	1253980	rs202127660	A	G	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=17.479;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.64;ReadPosRankSum=-0.308;SOR=4.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,10:0.27:37
chr11	1254599	rs2672806	T	C	92.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=3;PP=66;SC=TTCTGAGACATGAGGGGCCAG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=1254607;WS=1254589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	1254940	rs2735719	G	A	913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=2;PP=731;ReadPosRankSum=-0.669;SC=GAGGCCCAGCGTTCGGCGGGG;SOR=3.126;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=28;WE=1254948;WS=1254930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr11	1255089	rs147340559	CCCCTG	C	852.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=19;PP=1023;SC=GTAAGTGCCACCCCTGCCCTG;SOR=4.615;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=20;WE=1255101;WS=1255079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	1257867	rs2672803	T	C	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=26;PP=785;SC=CCAGGTGGGGTCTGTGGGACT;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=1257875;WS=1257857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	1258061	rs56021061	C	T	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=0;PP=1113;SC=CTCCATCCCCCGAGGGCTCTG;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=38;WE=1258069;WS=1258051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	1258175	rs80092233	C	T	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=8.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.47;ReadPosRankSum=-1.349;SOR=1.364;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,45:0.28:160
chr11	1258192	rs76589014	AT	TC	1655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=9.008;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.05;ReadPosRankSum=1.518;SOR=1.381;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,47:0.26:183
chr11	1258197	rs78674028	A	G	1898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=11.490;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.99;ReadPosRankSum=1.038;SOR=1.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,52:0.27:190
chr11	1258199	rs80200632	C	T	1988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=9.627;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.41;ReadPosRankSum=0.383;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,55:0.29:191
chr11	1258217	rs74648489	T	G	2483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=7.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.21;ReadPosRankSum=-0.237;SOR=1.023;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,63:0.34:188
chr11	1258226	rs55700357	C	T	2585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=6.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.90;ReadPosRankSum=-0.859;SOR=0.777;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,69:0.37:186
chr11	1258240	rs77287508	CA	TG	2367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.021;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=23;PP=2944;ReadPosRankSum=0.453;SC=GTGGGGGACGCACTGGAGTTT;SOR=0.743;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=164;TCF=81;TCR=83;TR=55;WE=1258249;WS=1258207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,65:0.37:174
chr11	1258283	rs78669250	G	A	2310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=7.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.39;ReadPosRankSum=-0.208;SOR=0.318;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,60:0.43:141
chr11	1258286	rs77996005	C	T	2289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=8.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.47;ReadPosRankSum=-0.767;SOR=0.290;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,61:0.44:139
chr11	1258295	rs79118814	A	G	2177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=7.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.01;ReadPosRankSum=-1.351;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,58:0.45:128
chr11	1260145	rs75799984	T	C	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-2.523;QD=0.54;ReadPosRankSum=-2.044;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,11:0.13:83
chr11	1260157	rs78678736	G	C	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-2.523;QD=2.61;ReadPosRankSum=0.471;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,11:0.13:83
chr11	1260160	rs78177850	T	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-2.523;QD=2.80;ReadPosRankSum=1.129;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,11:0.13:83
chr11	1260163	rs79220674	C	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-2.450;QD=2.71;ReadPosRankSum=1.229;SOR=0.642;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,12:0.14:86
chr11	1260175	rs75760167	T	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=2.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-2.268;QD=1.53;ReadPosRankSum=1.347;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,14:0.16:88
chr11	1260193	rs74763753	T	C	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=2.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-2.000;QD=1.94;ReadPosRankSum=0.071;SOR=1.140;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,14:0.19:72
chr11	1260214	rs79585387	C	T	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=-2.670;QD=5.92;ReadPosRankSum=-0.612;SOR=0.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,12:0.22:55
chr11	1260217	rs79638064	C	A	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=-2.723;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.067;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,11:0.21:52
chr11	1260219	rs75935363	C	T	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=3.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=-2.857;QD=5.78;ReadPosRankSum=0.736;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,10:0.20:51
chr11	1260220	.	G	A	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.008;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=5.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=-3.157;QD=5.51;ReadPosRankSum=1.743;SOR=1.855;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,9:0.17:54
chr11	1260244	rs76590120	T	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=8.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-2.310;QD=2.89;ReadPosRankSum=1.555;SOR=3.037;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,6:0.15:40
chr11	1260248	.	G	A	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=8.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-2.416;QD=2.55;ReadPosRankSum=1.474;SOR=2.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,6:0.14:43
chr11	1260249	rs77875446	A	G	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=8.144;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-2.381;QD=2.61;ReadPosRankSum=1.224;SOR=2.872;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,6:0.14:42
chr11	1260252	rs78681629	C	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=8.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-2.416;QD=2.62;ReadPosRankSum=0.983;SOR=2.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,6:0.14:43
chr11	1260263	.	T	TG	59.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=5.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-2.531;QD=1.53;ReadPosRankSum=-0.378;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,5:0.13:39
chr11	1260265	.	G	GAGTGGGCACCTGGGGAAGAACAGGAAGCGCC	59.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.773;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=5.252;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-2.491;QD=1.57;ReadPosRankSum=-0.865;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,5:0.13:38
chr11	1260632	rs34074919	TG	T	3085.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=19;PP=2883;SC=TGAGGGCTGGTGGGCGCCTCC;SOR=2.356;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=75;TCF=53;TCR=22;TR=71;WE=1260640;WS=1260622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	1261640	rs2735733	C	T	2768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=61;PP=2120;SC=GGCCCAGTACCGTCTGGGTGA;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=22;TCR=61;TR=83;WE=1261648;WS=1261630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr11	1262189	rs12363494	C	T	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=13;PP=928;SC=GACTTTGAGACGTTTGAAAAC;SOR=1.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=34;WE=1262197;WS=1262179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	1262907	rs2037089	T	C	4284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.016;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=79;PP=2965;ReadPosRankSum=0.100;SC=TCTGCTGCAGTGACGACCACT;SOR=0.311;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=66;TCR=82;TR=144;WE=1262915;WS=1262897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,146:0.97:150
chr11	1263523	rs1541314	G	A	4537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=73;PP=2965;SC=AGGGGTTGCAGGCGGGGACAT;SOR=0.831;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=138;TCF=64;TCR=74;TR=137;WE=1263531;WS=1263513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr11	1263776	rs2943510	C	T	4171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=88;PP=2965;SC=CCCAGTACCCCAGCCACCAGC;SOR=1.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=41;TCR=88;TR=129;WE=1263784;WS=1263766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr11	1267193	rs2943492	C	G	5377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-1.010;NF=133;NR=72;PP=2965;ReadPosRankSum=0.800;SC=CTGACCAGCACGGCCACCACA;SOR=0.423;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=207;TCF=135;TCR=72;TR=205;WE=1267201;WS=1267183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,172:0.99:173
chr11	1267325	rs55813014	T	C	2651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=3.349;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.82;MQRankSum=-1.716;QD=33.15;ReadPosRankSum=-0.614;SOR=0.509;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,79:0.99:80
chr11	1271218	rs199629887	GCCA	G	6482.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=98;PP=2969;SC=GACCACGAAGGCCACCACGAC;SOR=1.546;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=150;TCF=43;TCR=107;TR=135;WE=1271228;WS=1271208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr11	1271321	rs2943517	C	G	2419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=64;PP=2597;SC=ACAACTGCAGCCACTGGCCCC;SOR=0.855;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=37;TCR=64;TR=101;WE=1271329;WS=1271311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	1272226	rs2943512	A	C	4802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=32;PP=2842;SC=AACACCCATCACCCCAGTGCT;SOR=1.743;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=75;TCR=33;TR=106;WE=1272234;WS=1272216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr11	1272245	rs2943511	C	T	5275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=41;PP=2965;SC=CTGACCAGCACGGCCACCACA;SOR=1.498;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=82;TCR=41;TR=123;WE=1272253;WS=1272235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr11	1272709	rs3021155	G	A	1512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=30;PP=1247;SC=CACGGCCACCGCCTCCTCCAC;SOR=0.853;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=24;TCR=30;TR=54;WE=1272717;WS=1272699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	1272754	rs3021156	A	G	1595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=59.98;NF=33;NR=22;PP=1172;SC=AGTGGTGACCACCATGGCCAC;SOR=1.047;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=33;TCR=22;TR=55;WE=1272762;WS=1272744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	1279486	rs2249550	A	G	1762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=11;PP=1371;SC=GGGGTGGGGGAGTGCAGGATG;SOR=2.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=40;TCR=11;TR=51;WE=1279494;WS=1279476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	1280301	rs2249686	G	A	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=30;PP=955;SC=GGTGAGACCCGAGGCACCTGC;SOR=2.133;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=40;WE=1280309;WS=1280291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	1281134	rs2857476	T	C	5012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=61;PP=2965;SC=TCACCCCCAATGGGGCTCTGC;SOR=1.357;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=108;TCR=61;TR=168;WE=1281142;WS=1281124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr11	1284227	rs12417955	A	G	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=8;PP=659;SC=TAGGCATAGCAGGATGCAGGG;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=1284235;WS=1284217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	1411501	rs112066837	C	T	1002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=29;NR=6;PP=772;SC=TGGCCGGCGCCGGGCCCCAGA;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=35;WE=1411509;WS=1411491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	1471154	rs11028332	C	T	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=24;PP=723;SC=GGCAGCCTCGCGGACCCTGGG;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=1471162;WS=1471144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	1472050	rs61869028	A	G	621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=466;SC=GAGGCGCCAGAGTGGGGCTGG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=1472058;WS=1472040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	1472475	rs3838784	TG	T	1893.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=8;PP=1603;SC=CCAGTGCCCCTGGGGGGGCTG;SOR=3.647;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=70;TCF=58;TCR=12;TR=58;WE=1472483;WS=1472465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	1475628	rs66529968	C	T	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=1;PP=543;SC=TGGAAGATTCCGCCGTTCCAA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=1475636;WS=1475618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	1477768	rs67861777	C	T	2681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=46;PP=2039;SC=GGTGAGCTGGCGCCCCCAGGG;SOR=0.887;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=38;TCR=47;TR=84;WE=1477776;WS=1477758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	1481610	rs28555282	T	C	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=5;PP=236;SC=CGTCGAGGCCTCTTCGTTCAT;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=11;WE=1481618;WS=1481600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	1481691	rs112514854	C	T	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.38;QD=27.78;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	1481930	rs4963048	A	G	209.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.22;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	1481962	rs34875491	GC	G	85.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=2;PP=61;SC=AGACACACTAGCCCCCCCCCC;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=5;WE=1481970;WS=1481952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	1491096	rs9440	G	A	3525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=54;PP=2965;SC=GGGGCTGCACGGAGACCAGAG;SOR=0.927;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=62;TCR=54;TR=116;WE=1491104;WS=1491086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr11	1492445	rs4881724	A	G	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=1;PP=663;SC=CCGGCACAGGAGCTTGGTCAC;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=1492453;WS=1492435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	1501670	rs10742185	G	C	3259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=65;PP=2351;SC=TGCAGAACTCGGAGATGGTGC;SOR=1.230;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=41;TCR=65;TR=106;WE=1501678;WS=1501660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	1502097	rs10767696	A	G	1606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=39;PP=1256;SC=TCTTGCCATTAGGCTTGGCTT;SOR=2.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=48;WE=1502105;WS=1502087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	1502401	rs4881735	A	C	1856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=7;PP=1468;SC=CCCCTCACCAAGTCCTCCAAC;SOR=3.500;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=49;TCR=7;TR=56;WE=1502409;WS=1502391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	1507512	rs1881502	T	C	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=1;PP=202;SC=CCTGGACAGCTTGCGTGTGGC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=1507520;WS=1507507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	1507731	rs1881503	A	G	2361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=43;PP=1797;SC=TCCACTTTGCAGGGACTGGCC;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=29;TCR=43;TR=72;WE=1507739;WS=1507721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	1509238	rs2334554	T	C	3801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=64;PP=2457;SC=CCCTAAGCCATGCTCTGAGCA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=64;TCR=64;TR=128;WE=1509246;WS=1509228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr11	1509421	rs2334553	G	A	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=12;PP=417;SC=CCAACAGCAGGGACACAGGTG;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=1509429;WS=1509411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	1576005	rs59483236	T	C	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=257;SC=AACAGACATATGGGAGGCAAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=1576013;WS=1575995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	1576137	rs11604635	C	T	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=3;PP=136;SC=ACAGAGGGAACGGGAACAGGA;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=1576145;WS=1576127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	1576235	rs6578504	T	C	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=6;PP=397;SC=GGCGGCTGGCTGGGGCGGGAT;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=16;WE=1576243;WS=1576225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	1576283	rs11603496	G	A	336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=238;SC=CTCAGGACTGGGTCCTGCCCT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=1576291;WS=1576273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	1576863	rs12576976	A	G	179.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=3;PP=144;SC=CTCTCCTGCAATGGTGCCACC;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=1576871;WS=1576853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	1578090	rs7129499	G	A	170.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=1;PP=105;SC=CTGGGGAGTCGAGCGGCGGTG;SOR=1.329;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=1578098;WS=1578080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	1585277	rs3740620	C	T	1670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=35;PP=1230;ReadPosRankSum=0.297;SC=GCCCTGGCCCCGTCCCAGATA;SOR=1.651;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=52;WE=1585285;WS=1585267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,56:0.97:58
chr11	1606120	.	ACCACAGCCACCCTTGGATCCCCCACAAGAG	A	575.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=11;PP=954;SC=CACAGCCGGAACCACAGCCAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TCF=0;TR=11;WE=1606157;WS=1606110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	1619172	.	ACCCCCACAGGAGCCACAGCCCCCCTTGGAG	A	445.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.16;QD=37.14;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	1619202	.	G	A	32	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=56.12;NF=1;NR=4;PP=32;QD=13.3542425094;SC=CCCCCTTGGAGCCCCCACAGG;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=5;WE=1619210;WS=1619192;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,5:0.25:20
chr11	1628844	rs1989592	A	G	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=10;PP=1537;SC=CACAGCTGCAATCATTCCTGG;SOR=2.644;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=52;WE=1628852;WS=1628834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	1628965	rs57186801	G	A	4103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=53;PP=2577;SC=GCTTGCAGCAGCTGGACTGGC;SOR=0.957;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=45;TCR=53;TR=98;WE=1628973;WS=1628955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr11	1628992	rs60210378	G	A	3974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=53;PP=2293;SC=ATGACCCACAGCCTGAGGAGC;SOR=1.143;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=40;TCR=53;TR=93;WE=1629000;WS=1628982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	1630342	rs10837527	T	A	1004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=15;PP=772;SC=AGTTTTCCTCTATTAATTCTT;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=19;TCR=15;TR=34;WE=1630350;WS=1630332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	1651169	rs71454095	T	C	745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=9;PP=352;SC=GCTGTGGCTCTGGCTGTGGGG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=15;WE=1651177;WS=1651161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	1651199	.	A	G	34	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=47;MMLQ=18;MQ=52.81;NF=2;NR=1;PP=34;QD=22.9237375157;SC=CCGGCTGTGGAGGCTGTGGGG;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=3;WE=1651207;WS=1651189;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr11	1651199	.	A	AGGCTGTGGCTCC	84.27	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.19;QD=28.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	1651228	.	C	G	172	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=25;MQ=59.78;NF=5;NR=2;PP=172;QD=29.5387446496;SC=TCCGGCTGTGCGGGCTGTGGG;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=1651236;WS=1651218;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	1651540	rs61867581	C	G	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.43;QD=29.60;SOR=2.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	1651613	.	TTACTGCTGCCAGTCCAGCTGCTGTAAGCCC	T	2342.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.95;QD=36.61;SOR=1.306;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	1651643	.	C	T	1181	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=56.12;NF=29;NR=19;PP=1181;QD=25.3285669281;SC=GCTGTAAGCCCTACTGCTGCC;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=63;TCF=39;TCR=24;TR=48;WE=1651651;WS=1651633;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,48:0.76:63
chr11	1651830	rs4752770	G	T	1286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=36;PP=1094;SC=GAAGGGCCCGGCTGCCCAGCT;SOR=4.461;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=39;WE=1651838;WS=1651820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	1651917	rs4752769	C	T	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=365;SC=CACCAGTGCTCCCGAAACTGA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=1651925;WS=1651907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	1756681	rs7943617	G	A	1503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=37;PP=1202;SC=AGGAGGACAGGAAATGGGCAG;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=44;WE=1756689;WS=1756671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	1770224	rs111693235	C	G	1136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=21;PP=888;SC=TGCCGCAGCCCCCCGGACGGC;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=40;WE=1770232;WS=1770214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	1771797	rs3740621	T	C	3037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=98;PP=2477;SC=CCTGTCTGCCTGCCTGTGCCT;SOR=4.635;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=8;TCR=98;TR=106;WE=1771805;WS=1771787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr11	1776024	rs55725229	TC	T	426.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=425;SC=CTTGCCCAGCTCCCACTACTC;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=1776032;WS=1776014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	1853107	rs616594	C	T	2025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=32;PP=1528;SC=TGGCCGGCCACAGGAAGTGGT;SOR=0.880;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=35;TCR=32;TR=67;WE=1853129;WS=1853097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	1853121	rs867839	C	T	2034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=35;PP=1591;SC=AAGTGGTGGGCGTCAGGTGAG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=32;TCR=35;TR=67;WE=1853129;WS=1853097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	1855854	rs2063551	G	C	1437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=17;PP=1112;SC=TGTGGTGCGTGCTGGGGTAGA;SOR=1.154;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=42;WE=1855862;WS=1855844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	1857042	rs907605	G	T	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=4;PP=509;SC=GTCATGCAAGGGCTGCCCGGG;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=1857050;WS=1857032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	1857173	rs564271	T	C	2680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=26;PP=2134;SC=GCAATGGGGGTGCCTGCAGCT;SOR=1.809;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=59;TCR=26;TR=85;WE=1857181;WS=1857163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr11	1857243	rs907608	G	A	4667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=52;PP=2965;ReadPosRankSum=1.151;SC=CAGGACCAGCGGTTCTGCGAG;SOR=0.510;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=144;TCF=92;TCR=52;TR=142;WE=1857251;WS=1857233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,148:0.99:149
chr11	1857270	rs907609	C	T	4358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=56;PP=2965;ReadPosRankSum=2.032;SC=GAAAGGGTGACGGGGGAAGGG;SOR=1.016;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=81;TCR=57;TR=136;WE=1857278;WS=1857260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,140:0.99:142
chr11	1857747	rs3741232	T	C	2512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.87;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	1857751	rs3741231	C	G	2512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.08;SOR=1.140;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	1857930	rs3741229	G	A	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=9;PP=810;SC=GGGGGTCTGAGCCCCAACTCG;SOR=1.536;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=30;WE=1857938;WS=1857920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	1858572	rs2292474	C	T	2846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.310;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=39;PP=2279;ReadPosRankSum=-0.809;SC=CATTGCCCAGCGGCACCCCCT;SOR=0.477;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=87;TCF=47;TCR=40;TR=86;WE=1858580;WS=1858562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,89:0.99:90
chr11	1861760	rs907610	T	C	2056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=20;PP=1597;SC=CACCGCAGAGTGTGATGCTGC;SOR=1.681;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=44;TCR=20;TR=64;WE=1861768;WS=1861750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	1861912	rs2271441	G	A	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=25;PP=817;SC=CGGCCACCCCGCCTCCCCAGC;SOR=1.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=35;WE=1861920;WS=1861902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	1874221	rs907612	C	T	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=165;SC=CAAGCCGAGACAGGTTCCAAA;SOR=1.863;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=1874229;WS=1874211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	1880730	rs75966923	C	A	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=9;PP=598;SC=GTTTCTGAGGCAAGGCTGCCT;SOR=1.220;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=25;WE=1880738;WS=1880720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	1880811	rs571122	G	A	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=19;PP=547;SC=TAGCCAATTCGTTCCAGATGA;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=1880819;WS=1880801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	1888058	.	G	C	2947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.99;NF=36;NR=51;PP=2298;SC=CCCCTGCCTGGCTGTGCGGTG;SOR=1.130;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=36;TCR=51;TR=87;WE=1888066;WS=1888048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	1890990	rs592373	G	A	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=28;PP=842;SC=CAAGGAGAGGGCGGGCGAGGA;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=37;WE=1890998;WS=1890980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	1891035	rs61278563	G	GA	1009.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=23;PP=921;SC=GGGCGTGGGGGGGGCTGGTTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=23;WE=1891043;WS=1891025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	1891599	rs7929436	A	C	2918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=58;PP=2198;SC=CCTGGGAAAGAAGTGCCGGCC;SOR=1.916;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=23;TCR=58;TR=81;WE=1891607;WS=1891589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	1901165	rs72843957	G	A	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=440;SC=AGATGGACAAGGTGAGGCCTG;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=1901173;WS=1901155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	1901467	rs2271439	A	C	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=16;PP=511;SC=GAGCAGCCCCATAACGCGTGC;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=1901475;WS=1901457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	1905292	rs661348	T	C	5135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=88;PP=2965;SC=TTCTCCCCTCTCCCGTACTCA;SOR=0.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=68;TCR=88;TR=156;WE=1905300;WS=1905282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr11	1961701	.	TCTCACACA	T	383.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=977;SC=TCTCTCTCTCTCTCACACACA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=1961716;WS=1961694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	1961869	rs11041941	T	C	2449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=37;PP=1856;SC=CATGGCTGTCTATGTAGATTA;SOR=0.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=39;TCR=37;TR=76;WE=1961877;WS=1961859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr11	1968490	rs190924294	C	T	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.91;SOR=5.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	1971977	.	A	C	378	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=27;MMLQ=28;MQ=57.71;NF=14;NR=0;PP=378;QD=29.4836580391;SC=CCCGCCCACCACTGTTGGGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=1971985;WS=1971967;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	1973205	rs217205	T	C	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=2;PP=262;SC=CTGCCTGGCCTCACTAGTGCC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=1973213;WS=1973195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	1976988	rs177720	A	G	1975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=43;PP=1501;SC=TGATTTATCAACTGCCGCACG;SOR=1.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=15;TCR=43;TR=58;WE=1976996;WS=1976978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	1977651	rs116624254	C	A	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=22;PP=634;SC=CGGGCTGTGACGGGGTGGCCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=1977659;WS=1977641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	1993975	rs190063	C	A	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=17;PP=685;SC=TCAGGATGGACGTCTTCTACT;SOR=1.284;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=28;WE=1993983;WS=1993965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	2161858	rs3741212	A	G	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=5;PP=369;SC=CTTTCCCCACAAATGAGATCT;SOR=1.127;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=15;WE=2161866;WS=2161848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	2167641	rs17880206	C	T	1744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=49;PP=1347;ReadPosRankSum=0.626;SC=GGGAAGGACACACTCGCTGGC;SOR=1.739;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=59;TCF=7;TCR=52;TR=56;WE=2167649;WS=2167631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,58:0.97:60
chr11	2181060	rs3842753	T	G	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=31;PP=1716;SC=GCGGCGGGTGTGGGGCTGCCT;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=34;TCR=31;TR=65;WE=2181068;WS=2181050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	2182004	rs5506	A	G	1792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=12;PP=1387;SC=AGCAATGGGCAGTTGGCTCAC;SOR=2.869;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=50;TCR=12;TR=62;WE=2182012;WS=2181994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	2182224	rs689	A	T	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=32;PP=902;SC=GTGATCTGGGAGACAGGCAGG;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=2182232;WS=2182214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	2187071	rs6578990	T	C	1837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=23;PP=1558;SC=GTGACCAGGATACCACCCCCA;SOR=1.009;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=57;TCF=33;TCR=24;TR=56;WE=2187079;WS=2187061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	2187398	rs4072823	T	G	1161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=34;PP=960;SC=GACACTTCCCTGGCGGCAGAG;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=2187406;WS=2187388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	2187439	rs4072824	C	A	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=305;SC=ATCCGCACCTCCACCGGGCCT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=2187447;WS=2187429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	2187855	rs12419447	G	C	2346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=24;PP=1765;SC=GCCAGGGCGCGCACTCACGGC;SOR=1.578;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=47;TCR=24;TR=71;WE=2187863;WS=2187845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	2188566	rs7925924	C	T	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=1;PP=336;SC=TTAGTCTCTCCTGTTGTGCCA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=2188574;WS=2188556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	2189185	rs4074905	G	A	1089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=20;PP=886;SC=GGGGATGCACGGGTCAGGAGG;SOR=1.542;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=32;WE=2189193;WS=2189175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	2190951	rs6356	C	T	2166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=35;PP=1643;SC=AGGTTTAGCACGGCCTTCCCC;SOR=0.874;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=31;TCR=35;TR=66;WE=2190959;WS=2190941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	2321650	rs2651823	A	G	177.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=0;PP=144;SC=TTGCAGAGGGAATGTTGGGGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=2321658;WS=2321640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	2323029	rs756924	T	C	3276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=67;PP=2953;SC=CCACACCAGGTCCTGCCCATG;SOR=1.808;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=34;TCR=67;TR=101;WE=2323037;WS=2323019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr11	2323220	rs734094	G	A	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=10;SC=CCCTTCTTCCGGGGCACCCAG;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=2323228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	2323528	rs2074021	T	C	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=17;PP=541;SC=ACAGGGATTATCCCTCCCCTG;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=2323536;WS=2323518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	2324041	rs2074022	A	G	1971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=17;PP=1437;SC=CAGCAGTCCCATGCCCCACAC;SOR=2.239;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=53;TCR=17;TR=70;WE=2324049;WS=2324031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr11	2324852	rs2651824	A	C	294.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=245;SC=GAGGTCAGGGATACTGCCTTA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=2324860;WS=2324842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	2325427	rs61744929	T	C	1767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=47;PP=1407;SC=CAGGGCCTCATGGCAGGGGTG;SOR=2.157;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=66;TCF=17;TCR=49;TR=64;WE=2325435;WS=2325417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	2325581	rs2074023	C	T	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=258;SC=GAGACCCCCACGTCAACCCCA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=10;WE=2325589;WS=2325571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	2329894	.	GC	G	52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=63.51;NF=3;NR=0;PP=52;QD=23.0;SC=ACAGTGACCGGCCCCCCCCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=2329902;WS=2329884;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	2329995	rs11554947	C	T	1327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=9;PP=992;SC=TGGCGTTCTGCGCACAGGTGC;SOR=2.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=42;WE=2330003;WS=2329985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	2330077	rs2234297	C	G	1129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=17;NR=19;PP=905;SC=AGTGGAGGGTCCCCCAGTAAG;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=17;TCR=19;TR=36;WE=2330085;WS=2330067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	2330400	rs2521273	G	A	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=12;PP=987;SC=CTTGGCCTTAGGGGTTGACTA;SOR=1.954;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=42;WE=2330408;WS=2330390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	2330479	rs2521274	G	A	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=22;PP=1216;SC=TGGGGCAGACGGTACCAGTGG;SOR=0.776;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=23;TCR=22;TR=45;WE=2330487;WS=2330469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	2330563	rs2521275	C	T	1744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=27;PP=1392;SC=CCCATCCTTCCGTCCTGGATG;SOR=0.846;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=24;TCR=27;TR=51;WE=2330571;WS=2330553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	2334740	rs739546	G	A	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=1;PP=480;SC=TCCGCTTTGGGGAGATCCACC;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=2334748;WS=2334730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	2337012	rs11022252	G	C	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=195;SC=GAACCAGGAAGCTGGGACTGT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=2337020;WS=2337002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	2356603	rs2651795	T	C	1959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=3;PP=1657;SC=TCCAACTTGTTGAGACTTGGC;SOR=5.283;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=55;TCR=3;TR=58;WE=2356611;WS=2356593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	2356769	rs2651794	T	C	4578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=53;PP=2965;SC=TACACCTGGATTACCTTGCCA;SOR=1.286;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=86;TCR=53;TR=139;WE=2356777;WS=2356759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr11	2357108	rs2173888	C	G	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=25;PP=707;SC=TGTTGGACATCCTCACCAACA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=2357116;WS=2357098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	2424684	rs2234283	A	C	1853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=23;PP=1482;SC=TGGGGCAGCCACCATGGAGGC;SOR=1.061;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=31;TCR=23;TR=54;WE=2424692;WS=2424674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	2542605	rs10400376	TA	GG	2552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=6;PP=1285;SC=CACTGTGTGTTATCCGGTGTC;SOR=3.422;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=53;TCF=45;TCR=8;TR=48;WE=2542614;WS=2542595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	2789856	rs163161	A	G	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=458;SC=CCACTCACAGATGAGGTGAAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=2789864;WS=2789849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	2797237	rs1057128	G	A	1224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=28;PP=950;SC=AGCAGTACTCGCAGGGCCACC;SOR=1.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=2797245;WS=2797227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	2798448	rs163148	A	G	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=17;PP=468;SC=TCCAAAGTACATTTTACAAAG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=2798456;WS=2798438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	2868878	rs3852520	T	C	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=507;SC=GCATACAGCATGCACTTGCAG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=2868886;WS=2868868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	2905204	rs34289096	G	GC	2129.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.515;NF=11;NR=48;PP=1722;ReadPosRankSum=-0.433;SC=GGCCCTCCGCGCCCCCCCAGG;SOR=0.582;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=13;TCR=57;TR=59;WE=2905212;WS=2905194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,75:0.97:77
chr11	2906196	.	ACCGCGACCGGAG	A	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=0;PP=569;SC=CAGGACCGCGACCGCGACCGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=2906215;WS=2906186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	2924610	rs1048047	G	A	2648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=10;PP=2131;ReadPosRankSum=1.729;SC=GACCAGGGCCGGTCCCCCGGC;SOR=2.277;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=80;TCF=70;TCR=10;TR=79;WE=2924618;WS=2924600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,81:0.99:82
chr11	2924850	rs34816459	T	TC	896.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=897;SC=CAGTTGGGACTCATGCCACGC;SOR=5.058;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=20;WE=2924858;WS=2924840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	2929552	rs429886	A	G	2266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=57;PP=1839;SC=GCGGGCCGGTATTTGGCAGGT;SOR=3.458;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=10;TCR=57;TR=67;WE=2929574;WS=2929542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	2929659	rs424663	G	A	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=12;PP=378;SC=ACCCCACACCGGACCCCCCTG;SOR=3.258;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=2929667;WS=2929649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	2930594	rs67769451	CG	C	340.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=9;PP=321;SC=CAGGTAGGGCCGGGGGGACTG;SOR=1.981;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=11;WE=2930602;WS=2930584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	2930656	rs2286660	T	G	252.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=6;PP=230;SC=CCGGGACACCTCCAGGGAGGT;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=2930664;WS=2930646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	2939392	rs445679	G	A	2582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=63;PP=2132;SC=GCCAGGGCCCGGCCCTTCCTC;SOR=3.014;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=78;TCF=15;TCR=63;TR=77;WE=2939400;WS=2939382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr11	2940492	rs450244	T	C	1934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=16;PP=1613;SC=GGCGCCAAGGTCGGGGTGTGG;SOR=2.041;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=60;WE=2940500;WS=2940482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	2979798	rs7940694	G	T	3098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=62;PP=2438;SC=ACAGCTGTCAGGAACACACAA;SOR=1.261;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=36;TCR=62;TR=97;WE=2979806;WS=2979788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr11	2991219	rs2071110	C	G	900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=26;PP=828;SC=AACAATGCAGCGGCTTCACGT;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=2991227;WS=2991209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	2999507	rs3814964	G	T	1869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=35;PP=1545;SC=ATGTGCAGTGGACTGACCTGT;SOR=1.107;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=60;WE=2999515;WS=2999497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	3026692	rs4758458	T	G	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=26;PP=792;ReadPosRankSum=1.139;SC=GTGAGAAGAGTCTGGGCTCTG;SOR=1.923;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=30;WE=3026700;WS=3026682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,33:0.97:34
chr11	3027889	rs756693	A	G	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=0;PP=709;SC=GGGAGGTGACACCACCACACG;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=30;WE=3027897;WS=3027885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	3028140	rs729662	G	A	3797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=70;PP=2930;SC=CCCCAAGCTCGGGCAGGATGT;SOR=1.589;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=38;TCR=70;TR=108;WE=3028148;WS=3028130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr11	3028270	rs7950766	A	G	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=18;PP=493;SC=GTGCTGGGGAAGGAGGGGCCG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=3028278;WS=3028260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	3033594	rs12808132	G	T	1021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=25;PP=806;SC=GCGACACAGGGCAGGGACTGG;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=3033602;WS=3033584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	3050210	rs434114	A	G	580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=421;SC=TCCCTAGGGAAGGCCCTTGTG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=15;WE=3050218;WS=3050200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	3061780	rs399565	C	T	2531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=18;PP=1924;SC=CTGAGTGTCACGGGAACTCAG;SOR=2.448;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=62;TCR=18;TR=79;WE=3061788;WS=3061770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	3061949	rs2285390	C	A	1947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=47;PP=1618;SC=TTACTTATGGCATTAAAATTT;SOR=3.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=8;TCR=47;TR=55;WE=3061957;WS=3061939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	3061992	rs369461	T	C	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=24;PP=626;SC=AATTCAGTCTTGATTCCTCAA;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=3062000;WS=3061982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	3076018	rs7934892	T	C	145.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=86;SC=GAGCAGTGCCTGGCACAGACT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=3076026;WS=3076008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	3076257	rs7945933	C	T	2027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=30;PP=1616;SC=CCTTCAAGACCGCAAAGGAAA;SOR=0.756;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=33;TCR=30;TR=63;WE=3076265;WS=3076247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	3076285	rs406598	G	A	1680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=29;PP=1416;SC=CACCCAGTGAGATCAGGAAAG;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=23;TCR=29;TR=52;WE=3076293;WS=3076275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	3109279	rs11553374	G	A	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=147;SC=ACCTGGGCCCGCAGCGCCTTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=3109292;WS=3109269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	3109284	rs3217567	G	GC	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=235;SC=GGCCCGCAGCGCCTTGTGGCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=3109292;WS=3109269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	3109403	rs2289999	A	G	1260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.47;SOR=2.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	3109408	rs2289998	C	T	1260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.03;SOR=2.468;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	3109426	rs10160757	T	C	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=9;PP=744;SC=AGCTCTGCCCTCAGGGCTCCT;SOR=1.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=3109434;WS=3109416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	3110976	rs895563	A	G	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=4;PP=275;SC=TGACAACCCCAGCCGCGGCCT;SOR=1.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=3110984;WS=3110966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	3114670	rs75015961	G	C	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=0;PP=608;SC=CTGGGGCCATGCTCACAGCAC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=3114678;WS=3114661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	3115354	rs9795009	T	C	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=514;SC=CTGCTCCCCTTATGTGCACTG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=3115362;WS=3115344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	3121248	.	CAA	C	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=-0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=9.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.81;MQRankSum=1.050;QD=3.83;ReadPosRankSum=0.464;SOR=3.246;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr11	3128774	rs3741353	T	C	1603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=43;PP=1390;SC=TGCTCCGCACTTCACATACGT;SOR=4.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=48;WE=3128782;WS=3128764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	3143030	rs6578322	T	C	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=235;SC=TTCCTACCACTGGTGTCCTTA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=3143038;WS=3143027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	3150482	rs11025526	A	G	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=145;SC=GCCCCTGGCTAAGAAGTCCCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=3150490;WS=3150472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	3382069	rs6578335	C	G	2905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=66;PP=2305;SC=CCCACTGCAGCCCCCGCTCCT;SOR=2.610;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=17;TCR=66;TR=83;WE=3382077;WS=3382059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	3398795	rs7932797	G	A	1909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=12;PP=1384;SC=TGTGTCTCCAGGGATTGAAAG;SOR=2.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=42;TCR=12;TR=54;WE=3398803;WS=3398785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	3661140	rs4910876	T	C	4827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=75;PP=2965;SC=GGACAGAGTCTCCCAGCCTCT;SOR=0.706;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=75;TCR=75;TR=150;WE=3661148;WS=3661130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr11	3661585	rs3062849	A	ATGG	5451.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=74;PP=2957;SC=CAGGGGCAGGATGGGAACAGC;SOR=1.812;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=103;TCF=19;TCR=84;TR=91;WE=3661593;WS=3661575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr11	3663170	rs7111519	G	C	178.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=115;SC=TCGAGGGGCTGGAGGCAGATC;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=3663178;WS=3663160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	3681519	rs2280134	T	C	2755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=68;PP=2102;SC=GCCAGCAGACTGGCCCAGGGC;SOR=2.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=26;TCR=68;TR=94;WE=3681527;WS=3681509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr11	3704775	rs35532049	CT	C	312.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.6753;FS=0.000;HP=13;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=1;NR=14;PP=218;SC=AACTGCAGGTCTTTTTTTTTT;SOR=3.611;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=15;WE=3704784;WS=3704765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	3838910	rs7946577	G	C	1382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=28;PP=1081;SC=GTCAGAGTCAGAGATAATTCA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=42;WE=3838918;WS=3838900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	3838953	rs10835147	T	C	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=28;PP=840;SC=AGAATCACAGTCCTCCCTGAG;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=3838961;WS=3838943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	3844254	rs142559551	C	T	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.41;MQRankSum=-3.749;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.367;SOR=0.138;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr11	3877756	rs117698578	A	C	366.96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=340;ReadPosRankSum=0.703;SC=GGATTCACACATGGCACTGCC;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=3877764;WS=3877746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr11	4103524	rs2304891	A	G	694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=11;PP=532;SC=TGGAGGTGCAATATTACAACA;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=22;WE=4103532;WS=4103514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	4104060	rs2898950	A	C	1349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=3;PP=1143;SC=TTTCTCATTTATTCCATTCTC;SOR=4.514;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=38;WE=4104068;WS=4104050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	4104087	rs10767828	T	C	1607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=9;PP=1275;SC=CTGCTCTTTTTGAGCTGGGGG;SOR=2.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=41;TCR=9;TR=50;WE=4104095;WS=4104077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	4104319	rs2289571	A	C	1715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.510;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=49;PP=1360;ReadPosRankSum=-0.733;SC=GTGGAGGGACAGCTCTGGTCT;SOR=3.118;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=59;TCF=10;TCR=49;TR=58;WE=4104327;WS=4104309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,61:0.98:62
chr11	4104355	rs894455	T	C	1553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=31;PP=1208;SC=ATTTATCTCCTGCCTTGCTCT;SOR=1.436;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=47;WE=4104363;WS=4104345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	4104745	rs2289570	C	G	1574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=33;PP=1208;SC=GACCTCTTTGCGGGGATGAAG;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=45;WE=4104753;WS=4104735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	4116335	rs12801088	A	C	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=2;PP=55;SC=TGATGCCCAGACCGCCCGCCC;SOR=1.179;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=4116343;WS=4116325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	4123345	rs1348310	C	G	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=19;PP=1021;SC=TGGGTTCCTTCTTTCATGTGT;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=20;TCR=19;TR=39;WE=4123353;WS=4123335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	4123458	rs58075299	AT	A	387.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=306;SC=TGCTTAAAACATTTTTTTTTC;SOR=2.584;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=16;WE=4123466;WS=4123448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	4128845	rs725518	G	A	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=204;SC=TTTAAACACTGCAAAAGATAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=9;WE=4128853;WS=4128835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	4132640	.	C	CAA	47	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=26;MQ=55.11;NF=2;NR=1;PP=47;QD=16.6666666667;SC=GACTCTGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=3;WE=4132648;WS=4132630;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,3:0.60:5
chr11	4133317	rs56336381	C	A	1899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=41;PP=1585;SC=TAGGGAAATACGCCTTGACCT;SOR=2.107;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=13;TCR=41;TR=54;WE=4133325;WS=4133307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	4150238	.	G	GT	81	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;FR=0.9999;HP=14;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=62.5;NF=6;NR=0;PP=81;QD=14.1666666667;SC=TCATTTGTGGGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=6;WE=4150246;WS=4150228;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,6:0.40:15
chr11	4153767	rs10835662	A	G	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=32;PP=944;SC=AACTTTGATAAAGACAGTCAT;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=4153775;WS=4153757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	4159466	rs1042858	G	A	2001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=14;PP=1429;SC=CAAGACCAGCGGCTAATCCAA;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=46;TCR=14;TR=60;WE=4159474;WS=4159456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	4159764	rs1042919	A	T	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=349;SC=GTTAATGATGATAATGATTTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=4159778;WS=4159754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	4159770	rs866902	AT	A	269.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=198;SC=GATGATAATGATTTTTTTTTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=4159778;WS=4159754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	4185766	rs7948314	G	A	274.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=9;PP=225;SC=CATCTCCTTGGTTCTAGGTCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=4185774;WS=4185756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	4388905	rs11031960	C	T	2783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=41;PP=2133;ReadPosRankSum=-0.741;SC=AGACCACCGTCGACATTAGAA;SOR=0.232;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=43;TCR=41;TR=83;WE=4388913;WS=4388895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,87:0.99:88
chr11	4389587	rs7929171	G	C	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=24;PP=795;SC=GATAAAATCTGCAACATTCTT;SOR=2.910;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=4389595;WS=4389577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	4389639	rs4910623	G	A	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=284;SC=CATAATCTTCGTCTTCTTTGA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=4389647;WS=4389629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	4510285	rs96489	A	G	2283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=40;PP=1833;SC=TTCATTATCCAGGCTGATGCA;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=35;TCR=40;TR=75;WE=4510293;WS=4510275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	4510587	rs331510	C	T	4655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=57;PP=2965;SC=TGCTGTGGCCCGGGCTGTGAC;SOR=1.110;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=86;TCR=57;TR=143;WE=4510595;WS=4510577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr11	4562831	rs2657172	A	G	1002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=4;PP=710;SC=GTCTAAGGCAAGACTCAGGAA;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=4562839;WS=4562821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	4562947	rs2641414	G	T	1259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=24;PP=1050;SC=CAAGACCTTTGAATACATCAC;SOR=1.292;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=38;WE=4562955;WS=4562937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	4562970	rs67163911	A	ATTT	1469.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.979;HP=4;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.449;NF=11;NR=20;PP=1527;ReadPosRankSum=0.495;SC=TGTTCTTTAAATTTTATTTTA;SOR=1.000;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=31;WE=4562978;WS=4562960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr11	4566377	rs2657168	C	T	831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=1;PP=712;SC=AAACATCCTGCTGCGTTTAGT;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=4566385;WS=4566367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	4566711	rs2709182	C	T	2369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=46;PP=1872;SC=TTGGCCTGGACGCCTGCTTGG;SOR=1.270;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=27;TCR=46;TR=73;WE=4566719;WS=4566701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	4567335	rs2657167	C	G	2140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.164;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=49;PP=1593;ReadPosRankSum=-0.861;SC=TCCGAGAGAGCCTTCTCCAAA;SOR=2.124;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=15;TCR=51;TR=63;WE=4567343;WS=4567325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,69:0.96:72
chr11	4594739	rs919519	C	T	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=356;SC=GCACAGGAGTCTTTTTTACCC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=4594747;WS=4594729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	4608262	rs12793957	A	C	2651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=3.480;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.44;MQRankSum=-3.043;QD=34.00;ReadPosRankSum=1.251;SOR=0.605;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,77:0.99:78
chr11	4615390	rs2010722	C	T	1708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=32.86;SOR=5.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	4615508	rs2010719	C	G	1369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.81;QD=29.14;SOR=1.378;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	4621485	rs2231978	C	G	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=210;SC=CCAAGCCTCTCTGGTTAGGGT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=4621493;WS=4621475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	4622159	rs2231972	T	C	2181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=23;PP=1798;SC=GATGAAGGGGTGAGGCTGGAT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=46;TCR=23;TR=69;WE=4622167;WS=4622149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	4661285	rs905871	A	G	2483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=34;PP=2078;SC=CCTCTCCTCTATCACCATGCC;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=38;TCR=34;TR=72;WE=4661293;WS=4661275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	4674575	rs3817098	G	A	2716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=30;PP=2128;SC=GTGACTCTCCGCTGCCCGTCA;SOR=1.356;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=55;TCR=31;TR=85;WE=4674583;WS=4674565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr11	4674652	rs149616162	A	G	2558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.006;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=48;PP=1911;ReadPosRankSum=1.897;SC=GTGAAGACAAAGGAGATTCGA;SOR=0.970;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=30;TCR=48;TR=77;WE=4674660;WS=4674642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,82:0.99:83
chr11	4703165	rs1123991	C	A	2084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=25;PP=1613;SC=AGCGGTGTACCACTGAGAGGC;SOR=1.214;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=37;TCR=25;TR=62;WE=4703173;WS=4703155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	4711986	rs11033350	T	C	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=9;PP=710;SC=AATTCTACAATTTTATGTTTC;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=27;WE=4711994;WS=4711976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	4712353	rs11033352	T	C	3016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=48;PP=2312;SC=TTGATTCTGGTGTCTGTGCAT;SOR=0.713;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=46;TCR=48;TR=94;WE=4712361;WS=4712343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr11	4730985	rs4619142	C	T	4657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=85;PP=2965;SC=ACCCATGTATCATTTTCTCTC;SOR=1.282;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=52;TCR=85;TR=137;WE=4730993;WS=4730975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr11	4731180	rs4432013	G	A	3372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=44;PP=2492;SC=CTTTATTGCCGTCTGTAACCC;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=63;TCR=44;TR=107;WE=4731188;WS=4731170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	4731468	rs4436535	G	A	2147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=28;PP=1652;SC=TGTTCTGATCGTCCGCTCTGT;SOR=0.910;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=35;TCR=28;TR=63;WE=4731476;WS=4731458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	4731583	rs4471413	C	T	4213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=41;PP=2965;SC=AGTTTGTCACCAGTGCACAGA;SOR=1.384;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=78;TCR=41;TR=119;WE=4731591;WS=4731573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr11	4791111	rs17324812	T	C	3638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=61;PP=2776;ReadPosRankSum=-0.916;SC=AACAAGAAGGTTGGAAATTTA;SOR=0.520;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=40;TCR=62;TR=101;WE=4791119;WS=4791101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr11	4869649	rs12361955	G	A	3225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=53;PP=2562;ReadPosRankSum=-0.789;SC=AGTGCCAGGAGGATCATAGGG;SOR=0.293;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=99;TCF=45;TCR=54;TR=97;WE=4869657;WS=4869639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,102:0.99:103
chr11	4869906	rs7117260	A	C	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=27;PP=791;SC=GACCTGTGGGAGGCAGTAGGG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=35;WE=4869914;WS=4869896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	4870139	rs11602455	G	A	1823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=23;PP=1475;SC=CTGAGGCAGGGACAGTGTGAG;SOR=1.009;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=30;TCR=23;TR=53;WE=4870147;WS=4870129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	4870261	rs11602499	G	C	2047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=32;PP=1676;SC=AGGGCGGGCTGCAGGGCAATG;SOR=0.790;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=30;TCR=32;TR=62;WE=4870269;WS=4870251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	4870298	rs11601065	T	G	2004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=32;PP=1611;SC=CATTTCCCAGTGCAGAGAGAA;SOR=0.822;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=31;TCR=32;TR=63;WE=4870306;WS=4870288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	4880892	rs11034368	T	C	2375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=24;PP=2069;ReadPosRankSum=0.559;SC=TTCTTCAAATTTGCTTGGTCT;SOR=1.547;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=52;TCR=25;TR=75;WE=4880900;WS=4880882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,74:0.97:76
chr11	4928866	rs7941509	C	T	3763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.384;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=41;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.837;SC=TGTTCAATGCCATGGGAATTT;SOR=1.216;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=74;TCR=42;TR=115;WE=4928874;WS=4928856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,117:0.99:118
chr11	4945196	rs1378739	T	G	2008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=37;PP=1678;SC=GACGGCCACGTAGCGGTCAAT;SOR=1.107;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=25;TCR=37;TR=62;WE=4945204;WS=4945186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	4964627	rs2595993	C	A	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=1;PP=268;SC=TATCAGATTGCCCCTAGGTGC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=4964635;WS=4964617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	4964649	rs2595992	G	T	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=316;SC=GTGTAGGTGAGCTCAAGGTAA;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=4964657;WS=4964639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	4964753	rs2605301	A	G	1610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=18;PP=1249;SC=ATTTTGTGCTAGATAATTCTT;SOR=1.358;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=52;WE=4964761;WS=4964743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	4964784	rs2605302	A	T	1770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=28;PP=1391;SC=GCTATCCTGTACATTAAAGAA;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=55;WE=4964792;WS=4964774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	4965239	rs2570581	G	T	1274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=19;PP=1039;SC=CTGCCTATCCGCACACTGGGA;SOR=0.798;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=18;TCR=19;TR=37;WE=4965247;WS=4965229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	4965301	rs2605303	G	T	1360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=17;PP=1045;SC=ACTACTGCTTGGTTGTACTAC;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=24;TCR=17;TR=41;WE=4965309;WS=4965291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	4967468	rs28698374	G	A	9012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=195;NR=122;PP=2965;SC=AATTGGGTTCGTCAGTGGAGG;SOR=1.111;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=317;TCF=195;TCR=122;TR=317;WE=4967476;WS=4967458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr11	4968198	rs3845246	C	A	4659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.11;QD=33.28;SOR=3.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr11	4976013	rs55827480	A	G	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.50;QD=21.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr11	4976077	rs2570573	T	G	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.50;QD=39.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	4976086	rs2570572	C	T	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.50;QD=39.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	4976145	rs56066301	C	G	96.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.85;QD=24.01;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	4976291	rs55889636	G	A	1933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=77;PP=2965;SC=CAGGGTGTAAGACACAGCAAT;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=41;TCR=77;TR=118;WE=4976299;WS=4976281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	4976768	rs112749434	C	T	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.93;QD=33.45;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	4976811	rs28482315	C	A	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.97;QD=32.74;SOR=6.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	5013421	rs5789346	G	GT	1511.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.311;NF=3;NR=44;PP=1028;ReadPosRankSum=-0.448;SC=ATTTACTGTTGTTTTTTTTTT;SOR=1.946;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=4;TCR=62;TR=47;WE=5013429;WS=5013411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,57:0.98:58
chr11	5020416	rs2445290	A	G	2520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=39;PP=2020;SC=TTTCCATCTTAGCAGTGAATG;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=38;TCR=39;TR=77;WE=5020424;WS=5020406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr11	5020933	rs61729748	A	T	2214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=32;PP=1832;SC=AAAGGCACTCAACACATGTGT;SOR=0.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=34;TCR=32;TR=66;WE=5020941;WS=5020923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	5079946	rs2445332	C	T	1236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=23;PP=991;SC=ATATTTTCTTCACACATTTAT;SOR=0.788;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=21;TCR=23;TR=44;WE=5079954;WS=5079936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	5080844	rs16909440	T	C	2587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=34;PP=2099;ReadPosRankSum=1.803;SC=CTGGGTGTCATTGGGAAGGAA;SOR=0.446;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=48;TCR=34;TR=81;WE=5080852;WS=5080834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr11	5172786	rs10768611	A	G	3565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=36;PP=2897;SC=ATATAAGGGGAGATGTGAGAC;SOR=1.343;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=68;TCR=36;TR=104;WE=5172794;WS=5172776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr11	5173149	rs77308879	C	A	2338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.259;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=32;PP=1815;ReadPosRankSum=1.586;SC=GCCCTGAGTACGACCATAGTT;SOR=0.448;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=70;TCF=37;TCR=33;TR=69;WE=5173157;WS=5173139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
chr11	5199222	rs7924390	A	C	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=414;SC=TGAAACACTGAGTGAAGGATC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=5199230;WS=5199214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	5199340	rs113029548	A	AATGCCC	3368.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.072;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.245;NF=44;NR=13;PP=2906;ReadPosRankSum=0.272;SC=CCAATCTGGCAATGTGCTCAC;SOR=3.228;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=69;TCF=50;TCR=19;TR=57;WE=5199348;WS=5199330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,75:0.97:77
chr11	5199645	rs6578560	T	C	2709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=56;PP=2242;SC=GCCAGCACCTTAGGGGCTGCA;SOR=1.788;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=23;TCR=56;TR=79;WE=5199653;WS=5199635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	5199660	rs6578561	T	C	2054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=50;PP=1582;SC=GCTGCAGCAGTGGCGAGCAGG;SOR=1.965;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=19;TCR=50;TR=69;WE=5199668;WS=5199650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	5199675	rs6578562	C	T	1877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=39;PP=1475;SC=AGCAGGAAGTCGGCTGAGGCC;SOR=1.773;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=17;TCR=39;TR=56;WE=5199683;WS=5199665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	5199708	rs6578563	T	A	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=27;PP=1132;SC=AAGAGATACATGGGCTCATGG;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=42;WE=5199716;WS=5199698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	5199817	rs5789371	GC	G	562.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=581;SC=AGGTATGCAAGCCTTCCAGCC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=5199825;WS=5199807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	5221645	rs11512276	C	A	4966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=90;PP=2965;SC=CGAATGATCCCCCACAGGATC;SOR=0.964;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=68;TCR=90;TR=158;WE=5221653;WS=5221635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr11	5221825	rs11036212	G	A	2106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.680;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=38;PP=1700;ReadPosRankSum=-0.858;SC=GGGATGGAAAGCCAGGGGTAT;SOR=0.750;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=28;TCR=39;TR=65;WE=5221833;WS=5221815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,69:0.99:70
chr11	5247141	rs1609812	G	A	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=299;SC=TATATGCAGAGATATTGCTAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=5247149;WS=5247131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	5247733	rs7480526	A	C	1154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=4;PP=946;SC=CCTGTTACTTATCCCCTTCCT;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=5247741;WS=5247723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	5247791	rs10768683	C	G	2024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=20;PP=1545;SC=AAACATCAAGCGTCCCATAGA;SOR=1.467;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=36;TCR=20;TR=56;WE=5247799;WS=5247781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	5248243	rs713040	A	G	1970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=57;PP=1684;SC=CAGGAGTCAGATGCACCATGG;SOR=4.174;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=6;TCR=57;TR=63;WE=5248251;WS=5248233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	5263577	rs10128555	C	G	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=709;SC=CATCCTTTTTCACCAGAGTTT;SOR=6.439;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=5263585;WS=5263567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	5269533	rs3841756	GT	G	1850.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.500;NF=35;NR=7;PP=1860;ReadPosRankSum=0.567;SC=TTTATTATTTGTATTGCTTGC;SOR=2.066;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=46;TCF=37;TCR=9;TR=42;WE=5269541;WS=5269523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr11	5269582	rs371855998	AG	A	3563.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.73;QD=44.55;SOR=1.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	5269584	rs1065686	T	A	3609.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.69;QD=44.57;SOR=1.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr11	5269586	rs371890964	A	AG	3600.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.30;QD=46.16;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	5269799	rs28440105	A	C	277.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.90;QD=39.69;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	5269806	rs28379094	C	T	311.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.04;QD=44.54;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	5274717	rs2070972	A	C	289.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.69;QD=32.20;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	5289896	rs3061750	A	AAAAC	1874.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=34;PP=1872;SC=ACTTGATGAAAAAACAAACAA;SOR=3.109;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=36;WE=5289904;WS=5289886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	5322520	rs12283334	G	A	3435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.918;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=59;PP=2829;ReadPosRankSum=1.334;SC=TCACTGTCTTGAGGATTAGTA;SOR=0.902;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=101;TCF=42;TCR=59;TR=100;WE=5322528;WS=5322510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,105:0.99:106
chr11	5323071	rs7118113	C	T	2711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=37;PP=2282;SC=CCAAAAAGGACGGAGAAGTAG;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=83;TCF=46;TCR=37;TR=83;WE=5323079;WS=5323061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	5344552	rs7934105	C	T	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.53;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	5344561	rs7933257	G	A	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.98;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	5344772	rs10742622	T	C	3929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=66;PP=2909;SC=AACCCATCACTGTAACATAGA;SOR=0.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=129;TCF=63;TCR=66;TR=128;WE=5344780;WS=5344762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr11	5344847	rs10768793	A	G	3070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=57;PP=2516;SC=CTTCACCAGAAGCAATGCCTA;SOR=1.414;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=30;TCR=57;TR=87;WE=5344855;WS=5344837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr11	5344902	rs7937237	C	G	3476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=38;PP=2933;SC=GATGATCAGACAGTCTAGGAA;SOR=1.167;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=57;TCR=38;TR=95;WE=5344910;WS=5344892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr11	5345128	rs10837814	G	A	5691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=91;PP=2965;SC=GTATTGGTGAGAATGGAAGCA;SOR=0.983;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=72;TCR=91;TR=163;WE=5345136;WS=5345118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr11	5345170	rs7952293	A	G	4405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=86;PP=2965;SC=GCAATGAAACAATCATATGCC;SOR=1.296;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=53;TCR=86;TR=139;WE=5345178;WS=5345160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr11	5345486	rs4910750	G	A	1695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=32;PP=1324;SC=GCCCTGGAAAGCCAGTCAGCA;SOR=1.402;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=50;WE=5345494;WS=5345476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	5364742	rs11036913	C	T	912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=731;ReadPosRankSum=-0.694;SC=TGGGAGCTGCCGCTGGACGAC;SOR=1.371;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=28;WE=5364750;WS=5364732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr11	5364776	rs78253695	T	TGTC	589.50	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5167;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=599;ReadPosRankSum=-1.042;SC=ATAGAAGAAATGTCTTTCTGT;SOR=2.584;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=12;WE=5364784;WS=5364766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr11	5373713	rs12802177	A	T	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=38;PP=1221;SC=AATTCAGGGGACCTGGACAGG;SOR=2.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=46;WE=5373721;WS=5373703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	5410934	rs1498467	T	G	4346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=80;PP=2965;SC=TTAACTCCCATAGTATCTACT;SOR=1.537;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=41;TCR=80;TR=121;WE=5410942;WS=5410924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr11	5411031	rs1498468	C	T	2636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=45;PP=2157;SC=CTTTGACCGCCTTGTGGCCAT;SOR=1.068;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=78;WE=5411039;WS=5411021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr11	5411239	rs1498469	T	C	1950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=28;PP=1589;SC=TGCACAGATATCACCTTCAAT;SOR=0.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=28;TCR=28;TR=56;WE=5411247;WS=5411229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	5411395	rs9783355	C	A	1784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=29;PP=1431;SC=TGCACCGCTCCTCTCTGTGCT;SOR=0.800;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=25;TCR=29;TR=54;WE=5411403;WS=5411385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	5411579	rs10768906	GT	AC	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=23;PP=1420;SC=CCATTATCAAGTTCCTAGGTC;SOR=3.767;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=26;WE=5411588;WS=5411569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	5451875	rs1498474	G	A	2537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=16;PP=1990;ReadPosRankSum=-0.800;SC=CTGACTCCTTGCAGTGATTCA;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=66;TCR=16;TR=81;WE=5451883;WS=5451865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr11	5452017	.	T	C	4063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=60;PP=2965;SC=GTGTGGACAATGGGAGAAGCA;SOR=0.867;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=132;TCF=72;TCR=60;TR=132;WE=5452025;WS=5452007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr11	5461991	rs1498486	C	A	4768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=84;PP=2965;SC=ACATAAAAGGCCAGCACTGCA;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=63;TCR=84;TR=147;WE=5461999;WS=5461981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr11	5490077	rs2736569	A	C	184.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=4;PP=88;SC=TAGTGTCTCCACAGGGCAGCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=5490085;WS=5490067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	5510284	rs417425	A	G	1760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=23;PP=1408;SC=TGGAGTCCTCAATTCTACTTG;SOR=1.355;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=36;TCR=23;TR=59;WE=5510292;WS=5510274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	5510497	rs2467219	T	C	2269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=39;PP=1595;SC=ATATGGGCATTGCCCGACTGG;SOR=0.828;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=70;WE=5510505;WS=5510487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr11	5510540	rs146317894	G	GGGCT	3983.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=35;PP=2918;SC=TATTGTCTATGGGCTAACTGT;SOR=0.739;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=79;TCF=34;TCR=45;TR=65;WE=5510548;WS=5510530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	5510626	rs444878	T	C	3671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=49;PP=2760;SC=CAGTCTTTCATCTTCCATCTC;SOR=0.763;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=61;TCR=49;TR=110;WE=5510634;WS=5510616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr11	5510928	rs392296	G	A	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=26;PP=891;SC=AAAAAAAAGTGTAGGATGGCT;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=5510936;WS=5510918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	5511003	rs426886	G	A	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=449;SC=ATGGCAGGAAGCTCTGGAAGG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=5511011;WS=5510993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	5529152	rs2234455	A	G	4486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=82;PP=2965;SC=TAGGCAAGGCATGAACCAGAG;SOR=0.988;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=63;TCR=82;TR=145;WE=5529160;WS=5529142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr11	5529865	rs186434	G	A	1692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=32;PP=1375;SC=CTCCATGTGTGGAAGTCCAGG;SOR=1.118;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=22;TCR=32;TR=54;WE=5529873;WS=5529855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	5536537	rs393044	A	C	2211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=30;PP=1766;SC=GCTGGTATCCAAGCTGGCTGC;SOR=0.880;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=36;TCR=30;TR=66;WE=5536545;WS=5536527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	5536848	rs2017433	G	A	2171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=27;PP=1796;SC=ATTGATATCAGCATAGTTCTG;SOR=1.000;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=65;TCF=37;TCR=28;TR=64;WE=5536856;WS=5536838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	5566076	rs139835065	G	A	3460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.189;NF=55;NR=51;PP=2714;ReadPosRankSum=-0.788;SC=GGATGTGTGCGTAGGAAACAG;SOR=0.269;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=56;TCR=51;TR=106;WE=5566084;WS=5566066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr11	5602968	rs10769086	G	A	2528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=47;PP=1960;SC=TGGGAGAAGCGTCCCATGCTA;SOR=1.151;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=32;TCR=47;TR=79;WE=5602976;WS=5602958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	5625847	rs3751006	A	G	2007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.638;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=40;PP=1532;ReadPosRankSum=-0.761;SC=GAGAGAAGAAAACATCCTGGA;SOR=1.404;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=60;TCF=20;TCR=40;TR=59;WE=5625855;WS=5625837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr11	5625988	rs17304278	T	C	184.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=6;PP=180;SC=CTTTGCCTGGTCCTCCACTAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=5625996;WS=5625978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	5631479	rs3740999	A	C	2146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=28;PP=1642;ReadPosRankSum=0.308;SC=TGTAGAGGTAAGGAGATTCAG;SOR=0.408;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=70;TCF=42;TCR=28;TR=69;WE=5631487;WS=5631469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr11	5631520	.	G	A	2093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=32;PP=1533;SC=AATTACTGTCGTGGGAAGAAA;SOR=0.840;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=35;TCR=32;TR=67;WE=5631528;WS=5631510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	5631622	rs7125403	G	T	1579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=29;PP=1341;SC=AGAAGATGCGGTTTGTATTTA;SOR=1.225;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=48;WE=5631630;WS=5631612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	5632212	rs10769124	G	A	2559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=38;PP=2106;SC=CCTGGATCCTGGGGGTATGCA;SOR=0.798;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=41;TCR=38;TR=78;WE=5632220;WS=5632202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	5653417	rs4287358	AT	GA	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=1;PP=1011;SC=GCCAGTCTTTATTGTCTGTGC;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=14;WE=5653426;WS=5653407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	5662319	rs7108834	C	T	883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=5;PP=744;SC=CATTTTTTTTCCTACTGTTCT;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=5662327;WS=5662309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	5662611	rs7128128	T	G	409.18	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=370;ReadPosRankSum=1.437;SC=CGATCCTATGTTAGTAAATTC;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=14;WE=5662619;WS=5662601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr11	5663920	rs66637086	CT	C	1303.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=4;PP=1435;SC=TCTGGTTTATCTTTTTAATTC;SOR=4.223;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=39;WE=5663928;WS=5663910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	5664356	.	T	TATATA	543.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.98;QD=45.31;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	5664831	rs3740998	C	A	4007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=79;NR=40;PP=2965;SC=CAAGCCATGGCTCCCTCATTT;SOR=1.571;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=80;TCR=41;TR=119;WE=5664839;WS=5664821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr11	5664974	rs7109861	T	C	3711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=90;PP=2806;SC=CCCTTTGTCTTGACTTATCTC;SOR=1.802;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=36;TCR=90;TR=126;WE=5664982;WS=5664964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr11	5691191	rs4309185	C	T	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=1;PP=321;SC=GGCAACAGAGCGAGACTTCAT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=5691199;WS=5691181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	5700340	rs3740995	T	C	1402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=13;PP=1111;ReadPosRankSum=0.364;SC=TGTCAGCTTCTAACTCTTCAG;SOR=0.906;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=45;WE=5700348;WS=5700330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,46:0.98:47
chr11	5701074	rs11601507	C	A	2498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.121;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=23;PP=1912;ReadPosRankSum=1.392;SC=CAGCAAATGACCTTCCCGTCC;SOR=2.010;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=60;TCR=24;TR=82;WE=5701082;WS=5701064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,83:0.98:85
chr11	5701409	rs3824949	G	C	3188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=71;PP=2519;SC=AGAAGCCATAGTAGCTATTCC;SOR=2.030;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=24;TCR=71;TR=95;WE=5701417;WS=5701399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	5717762	rs10838543	T	C	4503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.270;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=79;PP=2965;ReadPosRankSum=1.810;SC=GTGAGCACCATGGAAAAAAAC;SOR=0.434;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=151;TCF=72;TCR=79;TR=150;WE=5717770;WS=5717752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,154:0.99:155
chr11	5718517	rs7935564	G	A	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=17;PP=802;SC=GATAAAGGAGGATCAAGAGGC;SOR=0.811;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=30;WE=5718525;WS=5718507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	5719750	rs1063303	G	C	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=19;PP=608;SC=CGGAGGTTGAGGGGATCGTCA;SOR=1.460;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=29;WE=5719758;WS=5719740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	5719848	rs7950912	C	T	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=263;SC=CTTCCCTTCCCAGTCTCTAGG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=5719856;WS=5719838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	5729946	.	CTT	C	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.25;ReadPosRankSum=0.480;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr11	5755605	rs1498552	A	G	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=381;SC=ATAGAGGATTAGAGGGCCTTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=5755613;WS=5755595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	5758062	rs7397032	T	C	2820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.150;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=45;PP=2157;ReadPosRankSum=0.769;SC=CCTCCCTGAGTGCTTTGCTCA;SOR=0.359;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=93;TCF=47;TCR=46;TR=92;WE=5758070;WS=5758052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,94:0.99:95
chr11	5758118	rs7396766	A	C	3169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.476;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=41;PP=2596;ReadPosRankSum=0.588;SC=CTGGTATCCTACTCTGCATGG;SOR=0.735;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=99;TCF=56;TCR=43;TR=97;WE=5758126;WS=5758108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,99:0.98:101
chr11	5776287	rs7936512	C	T	4247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=75;PP=2965;SC=ATGTTCTTCACCCACACCTTC;SOR=0.994;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=56;TCR=75;TR=131;WE=5776295;WS=5776277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr11	5776470	rs7394584	T	G	2570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=39;PP=2041;ReadPosRankSum=-0.799;SC=CTCACCAAGCTCCTGCCCTAC;SOR=0.330;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=49;TCR=39;TR=87;WE=5776478;WS=5776460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
chr11	5776623	rs7396938	A	T	2869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=53;PP=2339;SC=TGTATCACCAACTCCTATACC;SOR=1.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=35;TCR=53;TR=88;WE=5776631;WS=5776613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	5777023	rs10742782	C	T	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=376;SC=TTTCTGGAAGCACTGTATTGA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=5777031;WS=5777013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	5777053	rs10742783	A	G	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=303;SC=GGAGTTTGTTAACTGGTGCAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=5777061;WS=5777043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	5809308	rs7934670	A	T	2739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=37;PP=2173;SC=ATGGCACAGAAGTGGGCAGTG;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=50;TCR=37;TR=87;WE=5809316;WS=5809298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	5809548	rs7948009	G	A	4020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=56;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.806;SC=TATGGAAGGCGCTTGGTGAGG;SOR=0.421;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=82;TCR=58;TR=137;WE=5809556;WS=5809538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,135:0.99:136
chr11	5810105	rs61619938	TA	T	409.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=328;SC=GAGCAGGAAATAAAAAAAAGA;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=15;WE=5810113;WS=5810095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	5841856	rs4758435	C	T	3501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=42;PP=2731;ReadPosRankSum=1.383;SC=TTGACTTTAACGCCTGCCTGG;SOR=0.473;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=68;TCR=42;TR=109;WE=5841864;WS=5841846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,113:0.99:114
chr11	5842310	rs8181529	T	G	4212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=27;PP=2965;SC=TCACATGTGTTCCATTGTGAT;SOR=2.341;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=91;TCR=27;TR=118;WE=5842318;WS=5842300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr11	5842356	rs8181512	A	G	4417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=48;PP=2965;SC=TTTTTCACTCATCGTTTTGTA;SOR=1.688;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=99;TCR=48;TR=147;WE=5842364;WS=5842346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr11	5862731	rs10838719	A	G	3306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.641;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-1.089;NF=61;NR=42;PP=2553;ReadPosRankSum=-0.824;SC=ATGGTGTACCAAAGAGGTTTG;SOR=0.707;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=61;TCR=43;TR=103;WE=5862739;WS=5862721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,110:0.99:111
chr11	5877909	rs12417880	C	T	983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=1;PP=776;SC=ATGTTATTGGCTGCAGCATTC;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=5877917;WS=5877899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	5877979	rs12419602	T	A	1663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=12;PP=1313;SC=CTCCAACTGGTTAGTGATTGG;SOR=2.540;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=49;WE=5877987;WS=5877969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	5905412	rs17233457	C	T	1527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=0;PP=1343;SC=ATACCATTACCTCTAGCACAC;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=43;WE=5905420;WS=5905402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	5906048	rs4758168	G	A	5011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=63;PP=2965;SC=GCATAACATCGTACCTCACAC;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=50;TCR=63;TR=113;WE=5906056;WS=5906038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr11	5906073	rs4757986	G	T	5107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=64;PP=2965;SC=TGTGAGCACAGGGGTCTGGCC;SOR=0.865;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=55;TCR=64;TR=119;WE=5906081;WS=5906063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr11	5906143	rs11823809	T	C	5244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=54;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.999;SC=TGATTTCTTATATTATTGTGG;SOR=0.560;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=97;TCR=54;TR=150;WE=5906151;WS=5906133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,162:0.99:163
chr11	5906192	rs1453435	A	C	8709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=70;PP=2965;SC=GCTTATCCTTAGAGCTGTTTT;SOR=1.115;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=110;TCR=70;TR=179;WE=5906211;WS=5906182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr11	5906203	rs11823828	T	G	8870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=83;PP=2965;SC=GAGCTGTTTTTCGCCTTCCCT;SOR=0.850;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=106;TCR=83;TR=188;WE=5906211;WS=5906182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr11	5906291	rs11823842	T	C	5988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.808;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.053;SC=CACACCAGCATTTTTTTCTTT;SOR=0.240;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=174;TCF=71;TCR=103;TR=172;WE=5906299;WS=5906281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,185:0.99:187
chr11	5922222	rs10160336	T	C	2761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=45;PP=2345;SC=CCGGCACTGATCTGGGCTTGT;SOR=0.815;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=83;TCF=38;TCR=45;TR=82;WE=5922230;WS=5922212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	5922707	rs7106300	C	T	3113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=56;PP=2407;ReadPosRankSum=-0.677;SC=GATGCCCGGCCTAAGGCACTC;SOR=0.375;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=39;TCR=57;TR=95;WE=5922715;WS=5922697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,99:0.99:100
chr11	5923297	rs4601752	A	G	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=26;PP=980;SC=TTACATATCCAAAGCTGAAGT;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=41;WE=5923305;WS=5923287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	5968728	rs1840178	T	C	2341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=71;PP=1834;SC=ACCCTCCTGATGACCATCTGG;SOR=4.021;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=8;TCR=71;TR=79;WE=5968736;WS=5968718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	5969185	rs10769378	A	G	5883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=81;PP=2965;SC=ACCTTTACCAATTTGCTGGAG;SOR=0.774;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=169;TCF=88;TCR=81;TR=168;WE=5969193;WS=5969175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr11	5989293	rs7113548	G	A	3366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=65;PP=2773;ReadPosRankSum=2.090;SC=CAGCCCTAGCGACAAATTGAT;SOR=1.279;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=41;TCR=66;TR=104;WE=5989301;WS=5989283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,105:0.98:107
chr11	5989415	rs7114672	C	T	1617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=38;PP=1412;SC=ATGATGAACACCTGAAGGAAG;SOR=1.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=53;WE=5989423;WS=5989405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	6007272	rs4237768	A	G	1533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=23;PP=1188;SC=AGGAGATACCATGTGGCCAGA;SOR=0.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=29;TCR=23;TR=52;WE=6007280;WS=6007262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	6007613	rs4354673	T	G	3292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=46;PP=2512;SC=GAAGATAAGTTTTCCCAACAA;SOR=0.936;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=56;TCR=46;TR=102;WE=6007621;WS=6007603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr11	6007680	rs4436524	A	G	2784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=45;PP=2287;SC=ATTCCGATGCACCCTATGACC;SOR=0.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=92;TCF=46;TCR=46;TR=91;WE=6007688;WS=6007670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr11	6007743	rs4436525	A	G	3072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=40;PP=2553;SC=GCTACATAGCAATCCAGAGCC;SOR=1.007;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=58;TCR=40;TR=98;WE=6007751;WS=6007733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr11	6023581	rs11040248	A	G	4434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.898;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=41;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.783;SC=CAATAAGGATAAGATCAGAGC;SOR=1.549;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=87;TCR=42;TR=128;WE=6023589;WS=6023571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,138:0.99:139
chr11	6023640	rs11040249	T	C	4528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=77;PP=2965;SC=TTGAAAGTGATGTCATCACAA;SOR=0.758;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=71;TCR=77;TR=148;WE=6023648;WS=6023630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr11	6023818	rs10839221	G	A	2810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.534;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=46;PP=2277;ReadPosRankSum=0.947;SC=TGATAGACGGGTATCTCAATG;SOR=0.639;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=84;TCF=38;TCR=46;TR=83;WE=6023826;WS=6023808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,87:0.99:88
chr11	6150015	rs189759697	T	A	625.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.993;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.727;NF=14;NR=9;PP=554;ReadPosRankSum=-0.963;SC=CATGAACCCATGTACCATTTG;SOR=0.172;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=23;WE=6150023;WS=6150005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,21:0.91:23
chr11	6173346	rs11826453	G	T	3888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=57;PP=2965;SC=TCCCCAGATTGTCAGGGTCAT;SOR=0.743;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=119;TCF=61;TCR=58;TR=116;WE=6173354;WS=6173336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr11	6173364	rs325695	T	A	3672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=50;PP=2965;SC=CATTTTTCCATTTACCATAGA;SOR=0.899;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=114;TCF=63;TCR=51;TR=113;WE=6173372;WS=6173354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr11	6220376	rs325610	G	C	1562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=5;PP=1321;SC=GCCACTGTGAGACCCCCAAAA;SOR=3.702;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=49;TCF=43;TCR=6;TR=48;WE=6220384;WS=6220366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	6221169	rs10839531	A	G	2881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=50;PP=2200;ReadPosRankSum=1.274;SC=CGGGAGGCCCATGCCAAGGCC;SOR=0.239;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=49;TCR=51;TR=99;WE=6221177;WS=6221159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,102:0.99:103
chr11	6221214	rs11040799	T	A	3561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=52;PP=2933;SC=TGTGTCATTCTGGCCTTCTAC;SOR=0.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=51;TCR=52;TR=103;WE=6221222;WS=6221204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr11	6227083	rs10742968	C	T	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=22;PP=600;SC=TGGCACGAACCGCCCCATTTA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=6227091;WS=6227073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	6231731	rs10769671	C	T	3689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=81;PP=2965;ReadPosRankSum=1.362;SC=CACATCAGCACCTGCTGATAC;SOR=0.912;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=31;TCR=82;TR=112;WE=6231739;WS=6231721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,115:0.99:116
chr11	6239139	rs11040809	A	G	3955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=64;NR=58;PP=2965;SC=CCACACCACGACGTGCCTCAC;SOR=0.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=64;TCR=58;TR=122;WE=6239147;WS=6239129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr11	6243804	rs3750945	A	G	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=963;ReadPosRankSum=2.199;SC=AAAGTTCCAGATAGGCGGTAC;SOR=0.264;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=39;TCF=21;TCR=18;TR=38;WE=6243812;WS=6243794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr11	6243843	rs3750946	C	G	1259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=995;ReadPosRankSum=-0.756;SC=CAGAGGTCTGCACAAAAAGAA;SOR=0.223;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=40;TCF=20;TCR=20;TR=39;WE=6243851;WS=6243833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr11	6243963	rs3750947	G	A	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=10;PP=517;SC=TCTACCCACCGCCTCCTACGT;SOR=0.784;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=20;WE=6243971;WS=6243953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	6243982	rs325606	T	G	817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=9;PP=652;SC=GTTAGTCCTGTCACTGAGGTT;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=24;WE=6243990;WS=6243972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	6281108	rs2929180	T	G	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=304;SC=TGGAGCCGCGTTGGGAGCCCG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=6281116;WS=6281098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	6281400	rs11040819	T	C	2718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=66;PP=2145;SC=CACACTACCTTCTCAAACGTC;SOR=2.625;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=16;TCR=66;TR=82;WE=6281408;WS=6281390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	6340525	rs12570	A	T	1848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=20;PP=1512;SC=GCTGGGCTTCAGCGCTCCGGC;SOR=1.302;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=55;WE=6340533;WS=6340515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	6340706	rs1051992	A	G	2349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=35;PP=1926;SC=TTCGGCCTCCAGCTGCTCTGG;SOR=0.798;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=42;TCR=35;TR=77;WE=6340714;WS=6340696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	6341684	rs2682123	C	G	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=369;SC=CACAGGCCCCCGCTCCAACGC;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=6341692;WS=6341674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	6411935	rs1050228	T	C	3432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=40;PP=2139;SC=ATGGGCCTGGTGCTGGCGCTG;SOR=1.371;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=111;TCF=71;TCR=40;TR=109;WE=6411943;WS=6411920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr11	6416959	rs1800606	C	T	3633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=46;PP=2965;SC=GCAGTCACTCCCCAGCCTACC;SOR=1.129;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=115;TCF=68;TCR=47;TR=114;WE=6416967;WS=6416949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	6499215	rs2303493	A	G	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=26;PP=1034;SC=CTAATGCCCAAATTTCCACCC;SOR=1.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=38;WE=6499223;WS=6499205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	6500309	rs2253104	A	G	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=16;PP=1024;SC=ACGATCACGAAGAAAAGGGAA;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=17;TCR=16;TR=33;WE=6500317;WS=6500299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	6503127	rs2303492	G	A	1626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=29;PP=1311;SC=AGAGTTTAGCGGTAGACTGCT;SOR=1.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=45;WE=6503135;WS=6503117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	6519642	rs11604149	G	A	1848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=18;PP=1587;SC=GCTGAGCTCCGAACTCTGTTC;SOR=1.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=53;WE=6519650;WS=6519632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	6520015	rs11040899	G	T	2530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=35;PP=2025;SC=CATTGACACTGCCTGAGCTAC;SOR=0.801;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=37;TCR=35;TR=72;WE=6520023;WS=6520005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	6520164	rs2555158	T	A	2843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=48;PP=2265;SC=AATGCAGAGGTGGAGCCTGTT;SOR=1.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=35;TCR=48;TR=83;WE=6520172;WS=6520154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr11	6520346	rs10769693	C	G	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.55;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	6524240	rs11040900	C	T	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=16;PP=454;SC=TCTCCACGTGCGCACCCTTCT;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=6524248;WS=6524230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	6530278	rs10839568	C	T	5089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=90;NR=60;PP=2965;SC=TCATTCCATTCTTTAAGTATT;SOR=1.122;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=90;TCR=60;TR=150;WE=6530286;WS=6530268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr11	6532519	rs4758423	C	T	1761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=7;PP=1476;SC=GCAGGAGCTACACTCTGTGTC;SOR=3.952;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=49;TCR=7;TR=56;WE=6532527;WS=6532509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	6541580	rs2555143	T	G	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=17;PP=563;SC=GCACAAGTACTAATGGCATGG;SOR=1.893;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=6541588;WS=6541570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	6549634	.	GGT	G	310.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;QD=28.25;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	6554941	rs4282961	C	A	3011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=18;PP=2208;SC=GTACGTCGAGCTGGAGGAGCG;SOR=2.535;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=67;TCR=18;TR=85;WE=6554949;WS=6554931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr11	6555365	rs7103810	A	G	5134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=86;PP=2965;SC=ACAGTCAGCGACCTCAGTGAA;SOR=0.837;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=73;TCR=86;TR=159;WE=6555373;WS=6555355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr11	6560141	rs11040914	A	C	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=3;NR=6;PP=215;SC=AACACCTTTCATCCCCAAGTT;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=6560149;WS=6560131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	6561270	rs10839577	A	G	2630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=62;PP=2115;SC=GCAGCCCCCAATGGGAGGTAG;SOR=2.168;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=22;TCR=62;TR=84;WE=6561278;WS=6561260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	6567895	rs11270441	C	CTGCCCTACTGCA	3668.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=11;PP=2957;SC=ATTGAGGAGGCTGCCCTACTG;SOR=0.750;SbPval=0.04;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=26;WE=6567903;WS=6567885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	6568213	rs58186801	T	C	3378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=60;NR=51;PP=2576;SC=CTGGCAGCCATGGAGGACACC;SOR=0.899;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=60;TCR=51;TR=111;WE=6568221;WS=6568203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr11	6579106	rs11040920	C	A	3946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=70;PP=2965;ReadPosRankSum=1.817;SC=GTTGAGCCCCCACCTGGCCCG;SOR=0.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=49;TCR=71;TR=119;WE=6579114;WS=6579096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,124:0.99:125
chr11	6579539	rs10839583	A	G	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=21;PP=751;SC=TGAGGCCAAGAACCCCATATG;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=6579547;WS=6579529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	6585502	rs7107072	T	C	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=4;PP=735;SC=CCCTCTGCCATATCTCTGCCT;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=6585510;WS=6585492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	6587252	rs12292436	C	G	1956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=57;PP=1676;SC=ACCCTGGCCCCTTTTTGACTT;SOR=4.909;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=4;TCR=57;TR=61;WE=6587260;WS=6587242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	6588228	rs10769699	G	A	3129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=44;PP=2456;SC=TGCCAGCTGCGTGCTCATTGT;SOR=0.985;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=53;TCR=44;TR=97;WE=6588236;WS=6588218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr11	6621516	rs11040933	G	A	2152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=42;PP=1521;SC=AAAAGACCCAGTGAGAACCAA;SOR=1.209;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=28;TCR=42;TR=70;WE=6621524;WS=6621506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	6622714	rs2288283	G	A	2230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=43;PP=1754;SC=ATCTTCTCTTGTTCTTTTGCC;SOR=1.362;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=68;WE=6622722;WS=6622704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	6630028	rs11314683	TC	T	8423.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=121;PP=2974;SC=GAGGTCCATCTCCCCCATCCC;SOR=0.756;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=219;TCF=95;TCR=124;TR=208;WE=6630036;WS=6630018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr11	6632857	rs1876300	A	T	1328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=16;PP=1128;SC=GAAAGTTTTGACAGCAGGCTA;SOR=1.347;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=25;TCR=16;TR=41;WE=6632865;WS=6632847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	6637518	rs7943955	A	G	402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=5;PP=330;SC=AGGTGTAAGCATTGTCTAAGT;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=14;WE=6637526;WS=6637508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	6638506	rs1800738	A	T	2739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=67;PP=2173;SC=GTGTGCCCCAACCCCCATTCA;SOR=2.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=17;TCR=67;TR=84;WE=6638514;WS=6638496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr11	6703892	rs1567135	T	G	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=760;ReadPosRankSum=-0.579;SC=AGTACCCAAGTTTAATTCTGC;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=34;WE=6703900;WS=6703882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr11	6789294	rs7924459	G	C	2640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.596;NF=23;NR=59;PP=2074;ReadPosRankSum=-1.036;SC=CTCAAGGCCCGCATGACCTCC;SOR=0.981;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=83;TCF=23;TCR=60;TR=82;WE=6789302;WS=6789284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,84:0.99:85
chr11	6790028	rs10839616	C	G	1695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=21;PP=1262;SC=CATGTGGAGCCGGGCTTCTAT;SOR=1.355;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=58;WE=6790036;WS=6790018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	6790106	rs7102536	T	C	1759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=29;PP=1325;SC=AAATGTAGCATAGAGCAGTTC;SOR=0.762;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=27;TCR=29;TR=56;WE=6790114;WS=6790096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	6816778	rs866347	A	G	4639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=87;PP=2965;SC=TGTGGAGGGTAGAATGGTTCC;SOR=1.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=52;TCR=87;TR=139;WE=6816786;WS=6816768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr11	6816875	rs7122644	G	A	1884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=46;PP=1571;SC=CTGTAGTGGCGCAGGAGCAGG;SOR=2.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=13;TCR=46;TR=59;WE=6816883;WS=6816865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	6867894	rs7105094	T	C	2084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=50;PP=1778;SC=CTAAATTCTATTGAATGACAA;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=14;TCR=50;TR=64;WE=6867902;WS=6867884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	6891704	rs10839632	T	C	7617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=120;NR=119;PP=2965;SC=CTTTTCTATATATCATTAAGC;SOR=0.734;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=239;TCF=120;TCR=119;TR=239;WE=6891712;WS=6891694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr11	6898663	rs10839635	G	A	2965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.424;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=40;PP=2180;ReadPosRankSum=-0.900;SC=ACGTATTTCCGACCCCAATCC;SOR=0.556;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=52;TCR=41;TR=92;WE=6898671;WS=6898653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,98:0.99:99
chr11	6913244	rs1965208	A	G	2697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=46;PP=2198;SC=TAGCCTCAGTATGAAGGTGGT;SOR=1.220;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=33;TCR=46;TR=79;WE=6913252;WS=6913234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	6942476	rs10839658	C	A	5561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=100;PP=2965;SC=TCTTAGAAATCTCTCCTTTGC;SOR=1.063;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=76;TCR=100;TR=175;WE=6942484;WS=6942466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr11	6942726	rs10839659	G	C	2017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.046;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=25;PP=1690;ReadPosRankSum=-1.012;SC=TTCAGGTCCTGGGCCAGTGGG;SOR=1.007;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=64;TCF=38;TCR=26;TR=63;WE=6942734;WS=6942716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr11	6953858	rs11041108	A	G	2262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=49;PP=1749;ReadPosRankSum=1.173;SC=CAGTAAAGATATGGTGACCCT;SOR=0.733;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=24;TCR=50;TR=73;WE=6953866;WS=6953848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,75:0.99:76
chr11	6965012	rs2515947	C	G	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=11;PP=349;SC=AGACATTATTCGCTTTTGTTC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=6965020;WS=6965002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr11	7022160	rs2857919	A	G	4028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=76;PP=2965;SC=CATGCTTTACAGATGGAGCAT;SOR=1.066;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=54;TCR=76;TR=130;WE=7022168;WS=7022150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
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chr11	7022717	rs1156526	T	C	4222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=90;PP=2965;ReadPosRankSum=0.334;SC=GCCTTGCCAGTAGGAAAAATT;SOR=0.800;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=128;TCF=37;TCR=91;TR=127;WE=7022725;WS=7022707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,133:0.99:134
chr11	7059960	rs12801277	A	C	2155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=14;PP=1896;SC=ACACCCTGGAATGAAGTGAAG;SOR=2.602;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=53;TCR=14;TR=67;WE=7059968;WS=7059950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	7063755	rs7123944	C	T	1626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=21;PP=1207;SC=AACACTTGTTCGATGTGGATG;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=28;TCR=21;TR=49;WE=7063763;WS=7063745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	7065289	rs6578821	C	A	694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=18;PP=535;SC=AGGGAGGAGGCGTTTAGCTGA;SOR=3.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=7065297;WS=7065279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	7070866	rs1552727	G	A	1417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=0;PP=1248;SC=GAGAGAAATGGTTTTGTAATA;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=40;WE=7070874;WS=7070856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	7071031	rs1552726	G	A	4916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.386;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=95;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.586;SC=CATTGTGTGAGGCCTTGAAAC;SOR=1.212;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=54;TCR=95;TR=148;WE=7071039;WS=7071021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,150:0.99:151
chr11	7079038	rs10839708	G	A	3688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=67;PP=2833;SC=GCTTTTGTGTGAGGCCTTAAG;SOR=1.131;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=46;TCR=68;TR=113;WE=7079046;WS=7079028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr11	7091772	rs10769763	C	A	1561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=38;PP=1267;SC=CCTCAGAATCCACCTAATTGT;SOR=3.306;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=45;WE=7091780;WS=7091762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	7110363	rs4758158	G	A	4193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=58;PP=2965;SC=TGGTTGAAGCGGATCGCCCGG;SOR=0.921;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=74;TCR=58;TR=132;WE=7110371;WS=7110353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr11	7110751	rs11041171	A	G	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=17;PP=691;SC=CGGCGGCTACACGGCGGATTT;SOR=1.382;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=27;WE=7110759;WS=7110741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	7260054	rs10839747	A	G	1717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.602;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=23;PP=1422;ReadPosRankSum=-0.826;SC=TGAGACTTCAATTTGGGAAAG;SOR=0.707;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=54;WE=7260062;WS=7260044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr11	7324475	rs4412741	T	C	3270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=63;PP=2749;SC=ACTTCCTAGATCCTCCCACGC;SOR=1.157;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=42;TCR=64;TR=105;WE=7324483;WS=7324465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr11	7335424	rs2035639	C	G	3465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=38;PP=2630;SC=AGATTCTTAGCTAGCCCCTAA;SOR=1.505;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=68;TCR=38;TR=106;WE=7335432;WS=7335414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr11	7439095	rs35452185	A	G	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=2;PP=252;SC=GGAGTTCAGCATACCATAGTC;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=7439103;WS=7439085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	7439264	rs34058874	C	T	3101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=38;PP=2544;SC=AGAGGAACACCTTGAATCCTG;SOR=1.167;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=93;TCF=54;TCR=39;TR=92;WE=7439272;WS=7439254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr11	7439418	rs12365591	A	G	921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=27;PP=768;SC=CTGGGAAGGCAGAGGGGGAGC;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=7439426;WS=7439408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	7439447	rs12364093	C	T	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=14;PP=425;SC=CAGATTCTTACCTGGTGTCCC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=7439455;WS=7439437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	7441737	rs11041372	T	C	2151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=29;PP=1556;ReadPosRankSum=1.011;SC=ATTTTCACAGTGTAGGTCACA;SOR=0.423;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=43;TCR=29;TR=71;WE=7441745;WS=7441727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,74:0.99:75
chr11	7441952	rs11041373	A	G	798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=23;PP=616;SC=ATATGAGTGCACCAGGATCTA;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=7441960;WS=7441942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	7487968	.	G	A	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.047;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=4.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQRankSum=-5.897;QD=0.63;ReadPosRankSum=-0.706;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,17:0.25:69
chr11	7488224	.	G	T	918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=840;ReadPosRankSum=-0.718;SC=ACCTTCTGCAGGTGGCCCAAG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=29;WE=7488232;WS=7488214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr11	7531344	rs117297258	G	A	2652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=51;PP=1968;SC=CCAGAGATAAGCAGCTCTATG;SOR=1.244;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=34;TCR=51;TR=85;WE=7531352;WS=7531334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	7598952	rs6578880	C	G	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=22;PP=620;SC=GTGTGTGTGCCTGTGTGTGGT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=7598960;WS=7598942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	7614282	rs7939893	TG	CA	1671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=0;PP=1829;SC=ACAAATTACATGCATCCCTTA;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=32;WE=7614291;WS=7614272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	7614531	rs7129888	C	A	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=30;PP=978;SC=GAAGGGAAGCCCAAGAGATTT;SOR=2.531;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=39;WE=7614539;WS=7614521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	7619518	rs4758206	T	C	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=20;PP=735;SC=CTTAATATTATATTTTTCCCA;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=7619526;WS=7619508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr11	7654047	rs376936055	T	G	2339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=30;PP=1718;ReadPosRankSum=0.733;SC=AGATGGTGGGTGGTCCCCAAA;SOR=1.079;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=46;TCR=31;TR=75;WE=7654055;WS=7654037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,77:0.97:79
chr11	7663726	rs4402283	T	C	1565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=46;PP=1202;ReadPosRankSum=-0.759;SC=CAAACCTGCATGGGTGAATCT;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=11;TCR=47;TR=57;WE=7663734;WS=7663716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr11	7670440	rs4758209	A	G	2583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=36;PP=1864;SC=TAGAGTTGACAGACGAATGCT;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=45;TCR=36;TR=81;WE=7670448;WS=7670430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	7677888	.	G	A	3338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=56;PP=2723;ReadPosRankSum=-0.603;SC=CTCTAGTTCCGGTGCAGCTGC;SOR=0.231;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=112;TCF=56;TCR=56;TR=110;WE=7677896;WS=7677878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,107:0.99:108
chr11	7689633	rs10743030	A	C	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=0;PP=640;SC=GTTGTCCCTTAGAGGATCAAA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=7689641;WS=7689623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	7690685	rs4631871	T	C	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=22;PP=801;SC=CTCTGAATTGTTGTACGCAAT;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=7690693;WS=7690675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	7716549	rs4287332	C	G	2972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=70;PP=2443;SC=CAAGAAAAGACGTAGTGCATG;SOR=2.993;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=16;TCR=71;TR=86;WE=7716557;WS=7716539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	7716855	rs4528317	T	A	1941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=32;PP=1594;SC=CCAGCTGCATTATCTGTGGCA;SOR=1.034;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=36;WE=7716863;WS=7716845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	7717219	rs111491832	A	T	101.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.26;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	7720159	rs60610878	C	CT	476.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=13;NR=0;PP=535;SC=GGCATAATGGCTGTAGGTGCT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=13;WE=7720167;WS=7720149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	7720426	rs4367936	C	A	1705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=39;PP=1215;SC=AGTCAATATGCAACTAATAAA;SOR=2.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=48;WE=7720434;WS=7720416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	7721743	rs12279973	C	A	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=568;SC=AGAGGTAGAGCCTGTTGGTTC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=7721751;WS=7721733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	7721870	rs10839849	G	A	2520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=39;PP=2194;SC=TGGATCCAGGGAAGCACTTTA;SOR=0.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=41;TCR=39;TR=80;WE=7721878;WS=7721860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	7723171	rs5789540	GA	G	2227.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=26;PP=2053;SC=ATGCACAATCGATTTTTAAAA;SOR=0.871;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=22;TCR=27;TR=48;WE=7723179;WS=7723161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	7723683	rs4373911	G	A	4171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=45;PP=2965;ReadPosRankSum=1.302;SC=AGACAATTCAGTATGATCCTC;SOR=0.608;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=82;TCR=45;TR=126;WE=7723691;WS=7723673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,131:0.99:132
chr11	7727886	rs7927138	C	T	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.704;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=29;PP=852;ReadPosRankSum=-0.966;SC=AGATTTACCTCGTTCAAAAAA;SOR=3.611;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=33;WE=7727894;WS=7727876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,33:0.94:35
chr11	7794545	rs1482784	C	A	3742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=54;SC=TGTAGGACAGCGATATCAATC;SOR=0.782;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=53;TCR=54;TR=107;WE=7794553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr11	7794724	rs12293183	T	C	6209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=133;NR=71;PP=2965;SC=ATGTAGGAGATGGCTATGGCA;SOR=1.477;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=206;TCF=135;TCR=71;TR=204;WE=7794732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr11	7794976	rs980145	T	A	7905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.67;SOR=1.166;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr11	7794980	rs12285181	C	G	7869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.23;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr11	7817379	rs77840152	A	G	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=251;SC=ATTAAGTTCTAGAAACTGTTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=7817387;WS=7817369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	7818471	rs1482804	C	T	3804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=89;PP=2965;SC=GTGTGATTCCCGTCCTTCAGG;SOR=2.717;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=22;TCR=89;TR=111;WE=7818479;WS=7818461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr11	7847466	rs1482792	A	G	1741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=35;PP=1392;SC=TAGTATCCTCAGATAACCCCA;SOR=1.238;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=56;WE=7847474;WS=7847456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	7847523	rs1482794	T	C	1140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=27;PP=890;SC=TCCCCATCTATATTGGGAATG;SOR=2.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=35;WE=7847531;WS=7847513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	7871011	rs4758022	A	G	3446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=36;PP=2676;ReadPosRankSum=-0.754;SC=ATGGCACACTATTTTTCATGT;SOR=0.544;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=103;TCF=67;TCR=36;TR=101;WE=7871019;WS=7871001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,106:0.99:107
chr11	7949350	rs4758258	A	G	3380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=82;PP=2796;SC=GTAGATAAGCAGATTCAGCAG;SOR=2.281;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=27;TCR=82;TR=109;WE=7949358;WS=7949340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr11	7949791	rs7933807	A	C	4793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=35;PP=2965;SC=TTTCATAAAAACTCCTTTATT;SOR=2.400;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=110;TCR=35;TR=145;WE=7949799;WS=7949781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr11	7949860	rs7928451	G	A	7236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=151;NR=75;PP=2965;SC=ATAAGCCATTGCTCCCAGAAG;SOR=1.650;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=227;TCF=152;TCR=75;TR=226;WE=7949868;WS=7949850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr11	7960043	.	C	A	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.05;SOR=7.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	7960043	.	CAG	AAA	883	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=31;NR=0;PP=883;QD=30.2086411246;SC=ACAAAAAATGCAGTCTGTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=31;WE=7960053;WS=7960033;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr11	7960045	rs6578915	G	A	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.05;SOR=7.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	7961146	rs9787855	A	G	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=31;PP=919;ReadPosRankSum=-0.748;SC=CTGTGAGTTCAAGTCTGGAAT;SOR=3.664;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=33;WE=7961154;WS=7961136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr11	8009420	rs12278319	G	A	258.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=8;PP=225;SC=ACCTTTTGCTGTGACTTATCT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=8009428;WS=8009410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	8014479	rs4758267	C	T	2054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=6;PP=1637;SC=TGCTGATCCACGAGTACTACA;SOR=3.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=54;TCR=6;TR=60;WE=8014487;WS=8014469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	8016080	.	A	G	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=8;PP=682;SC=TAACCTTTCCATACACTCGCG;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=8016088;WS=8016070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	8103104	rs11041733	G	T	1379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=17;PP=1000;SC=AGGTACGCGGGCGCCGGGCCG;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=48;WE=8103112;WS=8103094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	8115699	rs4758289	T	C	1874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=45;PP=1459;SC=GGGGCCAGGGTGGCGCCGCTA;SOR=1.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=19;TCR=45;TR=64;WE=8115707;WS=8115689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	8115762	rs7396690	C	G	1426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=29;PP=1081;SC=CTACAGCCCTCCCCAGCAGGC;SOR=1.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=40;WE=8115770;WS=8115752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	8117228	rs11041739	A	G	3843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=50;PP=2825;SC=CCCCATGGGGACCCAGTGATA;SOR=0.920;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=65;TCR=50;TR=115;WE=8117236;WS=8117218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr11	8118185	rs10160258	C	G	3292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=25;PP=1859;SC=TCAGGGGCAGCGTAGACTTCT;SOR=1.349;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=47;TCR=25;TR=72;WE=8118193;WS=8118175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	8118200	rs7931842	C	A	3560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.99;NF=51;NR=30;PP=2062;SC=ACTTCTCCTCCTTCATCCCTT;SOR=1.165;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=51;TCR=30;TR=81;WE=8118208;WS=8118190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	8119063	rs7950355	A	G	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=15;PP=453;SC=CATATCTACCACTGACCTCTC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=8119071;WS=8119053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	8122234	rs7394561	G	A	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=16;PP=558;SC=GCTGATGTGTGTATGTGGAGG;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=8122242;WS=8122224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	8123005	rs72093838	CTCTG	C	3268.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.268;NF=28;NR=27;PP=2888;ReadPosRankSum=-1.463;SC=CTGTCCTTTTCTCTGTCTGTG;SOR=0.416;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=55;WE=8123016;WS=8122995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,76:0.99:77
chr11	8159892	rs10839976	G	T	3267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=59;PP=2512;SC=TCCCCTTTGAGAGCTGAGAAT;SOR=1.028;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=43;TCR=59;TR=102;WE=8159900;WS=8159882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr11	8161878	rs6578932	C	T	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=282;SC=TAAAAGGATACAGAGGTATCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=8161886;WS=8161868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	8174966	rs10743052	G	A	1148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=23;PP=891;SC=CTCACTCTTAGTTTTCTGCAA;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=32;WE=8174974;WS=8174956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	8246326	rs34544683	G	A	1093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=26;PP=915;SC=GTAAGGGGGGGGCTGCAGACA;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=38;WE=8246334;WS=8246316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	8251921	rs3750952	G	C	2342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=35;PP=1571;SC=AGTCACAGCAGGCACACTTGA;SOR=0.902;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=41;TCR=35;TR=76;WE=8251929;WS=8251911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	8284838	rs204931	A	G	1159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=9;PP=849;SC=GCGCCGCGGCAGGGGGCGAGG;SOR=2.409;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=43;WE=8284846;WS=8284828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	8284981	rs176083	A	C	1685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=29;PP=1267;SC=CGCGCTTTGGAGGGGCGGCCG;SOR=0.762;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=27;TCR=29;TR=56;WE=8285003;WS=8284971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	8284995	rs204929	T	C	1945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=33;PP=1575;SC=GCGGCCGGTCTTCGGGCAGCT;SOR=1.034;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=24;TCR=33;TR=57;WE=8285003;WS=8284971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	8285124	rs2071458	A	C	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=24;PP=571;SC=TTTGTGCCTCAGAATTGGAAG;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=8285132;WS=8285114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	8457237	rs10769907	G	A	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=109;SC=GATGCCAAGTGTACAATAAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=8457245;WS=8457227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	8483335	rs1900273	G	A	1748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=23;PP=1379;SC=AAAATGCAGCGCCTAATAGAG;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=34;TCR=23;TR=57;WE=8483343;WS=8483325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	8486310	rs1446464	C	A	3209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=67;PP=2655;ReadPosRankSum=1.273;SC=CCTTGTCTGTCGCTTCAATGA;SOR=0.958;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=27;TCR=68;TR=94;WE=8486318;WS=8486300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,97:0.99:98
chr11	8639325	rs4929924	G	A	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=2;PP=905;SC=GATGTACTACGGCTCCCAAAT;SOR=4.294;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=34;WE=8639333;WS=8639315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	8641501	rs7946508	C	A	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=349;SC=AATTTTGTGACTCTAGAAAAA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=8641509;WS=8641491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	8641882	rs7943945	G	A	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=9;PP=1007;SC=GGCATAGGACGAAGAAATGTA;SOR=2.242;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=35;WE=8641890;WS=8641872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	8642218	rs7950166	C	T	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=418;SC=ACTGAGTCTCCGGCTTTGCCG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=8642226;WS=8642208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	8644530	rs4929948	T	G	3987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=99;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.578;SC=GCCACACATCTGTCATACAGT;SOR=1.901;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=20;TCR=100;TR=119;WE=8644538;WS=8644520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,125:0.99:126
chr11	8644562	rs10533257	TCATA	T	2799.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=53;PP=2970;SC=CTATAGTCATTCATACATAGT;SOR=6.059;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=66;TCF=3;TCR=63;TR=55;WE=8644573;WS=8644552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	8646237	rs12803166	G	T	2368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=29;PP=1929;SC=AGGAAGTTTGGATAGCATTTC;SOR=1.209;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=44;TCR=29;TR=73;WE=8646245;WS=8646227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	8662090	rs11042022	T	C	369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=1;PP=324;SC=AGGTGGGGGATGGGGGAGGGG;SOR=3.611;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=13;WE=8662098;WS=8662080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	8662516	rs11042023	T	C	627.10	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=473;ReadPosRankSum=0.441;SC=TGGGGAGCAGTGGGAGCAGCA;SOR=0.551;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=23;WE=8662524;WS=8662506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,23:0.92:25
chr11	8669437	rs10840100	A	G	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=0;PP=449;SC=CAGGCACTACATCTGACGGCC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=8669445;WS=8669427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	8670172	rs7950801	T	C	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=472;SC=GCTGCACAGCTCTCAGCCTTC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=8670180;WS=8670162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	8706406	rs4670	T	G	2422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=33;PP=2048;SC=AAAACAAGACTGGGGCTGCTC;SOR=1.264;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=49;TCR=33;TR=82;WE=8706414;WS=8706396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr11	8716968	rs2270955	T	A	4590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=58;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.639;SC=AGCCCCTTCCTTCTTGCTGAA;SOR=0.390;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=79;TCR=58;TR=136;WE=8716976;WS=8716958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,148:0.99:149
chr11	8719615	rs10840113	C	G	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=756;SC=TGAGCCCAGGCAGGTCGAGGC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=8719623;WS=8719605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	8721613	rs6483727	G	T	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.60;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	8721616	rs6483729	G	A	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.95;SOR=5.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	8732341	.	C	CACA	63.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQRankSum=-1.911;QD=1.72;ReadPosRankSum=-2.143;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,8:0.22:37
chr11	8735662	rs931756	G	A	2422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=51;PP=1879;SC=CACCACCCCAGCTTTTCTCAC;SOR=1.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=26;TCR=51;TR=77;WE=8735670;WS=8735652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	8736046	rs931757	C	T	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=435;SC=CTCCCTCCTACGTGGCCATTT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=8736054;WS=8736036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	8751479	rs11042053	C	T	1162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=0;PP=994;SC=TACAACACACCGGAGGGGCAT;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=34;WE=8751487;WS=8751469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	8751889	rs3794153	C	G	2845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.256;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=41;PP=2307;ReadPosRankSum=-0.739;SC=AGGTTCCAGTCTTCCTTTTCC;SOR=0.437;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=89;TCF=47;TCR=42;TR=88;WE=8751897;WS=8751879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,90:0.99:91
chr11	8788168	rs10743089	A	T	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=8;PP=578;SC=CTGGGTGAAGATCTGCACGAA;SOR=1.839;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=8788176;WS=8788158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	8788225	rs10734637	A	C	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=17;PP=777;SC=TATGCGCCCCACCTCCATTCT;SOR=0.811;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=32;WE=8788233;WS=8788215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	8797681	.	ACGCACGTGCG	A	269	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=2;HapScore=4;MGOF=15;MMLQ=23;MQ=52.92;NF=3;NR=0;PP=269;QD=98.0;SC=GCACACAGACACGCACGTGCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=8797703;WS=8797671;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr11	8797684	.	CACGT	C	52.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.61;QD=26.35;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr11	8797693	.	GCA	G	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.99;QD=26.85;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr11	8797695	.	A	G	39	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=2;HapScore=4;MGOF=15;MMLQ=23;MQ=49.12;NF=2;NR=0;PP=39;QD=36.8856062736;SC=ACGTGCGCGCACGCGCGCGCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=2;WE=8797703;WS=8797671;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,2:0.25:8
chr11	8797703	.	G	GCACACACACACACACA	54.52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.19;QD=27.26;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr11	8797705	rs151193662	G	A	63.56	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.40;QD=31.78;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr11	8797707	rs145618051	G	A	276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.40;QD=39.54;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	8933853	rs2742519	T	G	1214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=0;PP=1017;SC=TCTTTTAGAGTTGGAATTCTT;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=8933861;WS=8933843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	8934101	rs2742518	A	G	4650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=107;PP=2965;SC=GTGAACCAAAACTATGCCCCA;SOR=2.544;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=31;TCR=107;TR=138;WE=8934109;WS=8934091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr11	8938787	rs2016942	A	G	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=352;SC=TTTACAATCCAAAAGTGAAAG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=8938795;WS=8938777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	8942999	rs2568023	G	A	2908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=58;PP=2329;ReadPosRankSum=-0.810;SC=CCCCACTACTGCAGTTTGTGC;SOR=0.452;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=96;TCF=36;TCR=60;TR=94;WE=8943007;WS=8942989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,96:0.99:97
chr11	8946950	rs3751068	G	T	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=2;PP=975;SC=ACATGTGGGAGGGAAGGGAGG;SOR=4.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=35;WE=8946958;WS=8946940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	8947021	rs2653588	A	G	4071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=27;PP=2965;SC=TGGCTTCCCAAGGCATGGCTC;SOR=2.379;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=89;TCR=27;TR=116;WE=8947029;WS=8947011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr11	8947283	rs3751066	G	C	1688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=27;PP=1423;SC=TGTGCTGTGGGCTCCAACTCT;SOR=0.853;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=23;TCR=27;TR=50;WE=8947291;WS=8947273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	8948680	rs3751065	A	T	1283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=22;PP=1057;SC=CTGCGACAAGAGGAGCCTCGA;SOR=1.075;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=18;TCR=22;TR=40;WE=8948688;WS=8948670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	8959511	rs4910179	T	G	1466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=15;PP=1169;SC=CACTGTAATTTCCCAGGATAA;SOR=1.414;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=43;WE=8959519;WS=8959501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	8959545	rs4909951	C	A	1573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=16;PP=1269;SC=AAAAGGCAGCCGTGGCAGCTC;SOR=1.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=33;TCR=16;TR=49;WE=8959553;WS=8959535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	8970083	rs2653604	C	A	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=5;NR=15;PP=438;SC=CATAGACACACAACAGTGACC;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=8970091;WS=8970073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	8977691	rs2742488	C	G	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=631;SC=GCAGAAAAGACGTAGACAGAC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=8977699;WS=8977681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	8977707	rs2568069	G	A	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=3;PP=953;SC=CAGACAGACAGACAGGTAGAT;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=34;WE=8977715;WS=8977697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	9001289	rs71062805	TA	T	193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=0.000;QD=9.23;ReadPosRankSum=1.127;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr11	9004376	rs35481824	CT	C	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=0.812;QD=3.52;ReadPosRankSum=0.156;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr11	9005036	rs2568046	T	A	1496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=14;PP=1187;SC=CAGTTTTCTCTATCTGTCAAC;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=48;WE=9005044;WS=9005026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	9051385	rs7479998	C	A	2494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=12;PP=1950;SC=ACCCAGACACCTATCTTCTTA;SOR=3.145;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=61;TCR=12;TR=73;WE=9051393;WS=9051375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	9052170	rs10769983	G	A	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=424;SC=CTGCTGGGGCGAGTGGAGCTG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=9052178;WS=9052160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	9052423	rs7395988	A	C	2507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=44;PP=2028;SC=GGGCACAGAGATGGCAAGGTG;SOR=1.040;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=30;TCR=44;TR=74;WE=9052431;WS=9052413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	9072140	rs3751052	C	T	2081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=13;PP=1686;SC=ACACCAACCACCTGATTCCAT;SOR=2.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=53;TCR=13;TR=66;WE=9072148;WS=9072130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	9081926	rs7112378	C	T	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=4;PP=771;SC=TAACAGGGCACCCAGTCTCCC;SOR=3.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=9081934;WS=9081916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	9096189	rs7930311	G	C	1944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=47;PP=1506;SC=ATTAGCCTTTGCTTTGGTGAC;SOR=3.113;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=8;TCR=47;TR=55;WE=9096197;WS=9096179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	9167399	rs10732517	T	C	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=27;PP=937;SC=TGAGGAGAATTAGGAATCTTT;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=35;WE=9167407;WS=9167389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	9309405	rs5014247	A	G	2077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=57;PP=1691;SC=TCTTACTCACATTGATTTATT;SOR=3.360;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=10;TCR=57;TR=67;WE=9309413;WS=9309395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	9310169	rs10770007	C	A	184.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=149;SC=AGTATAAATACAAAAATTATC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=9310177;WS=9310159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	9316937	rs4601780	G	A	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=12;PP=420;SC=TTTCTTCTCTGAAGAAATAAA;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=9316945;WS=9316927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	9321399	rs10743101	A	G	276.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=196;SC=GGGCACAGTGACTCACGCCTG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=9321407;WS=9321389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	9336071	rs4325312	A	G	952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=25;PP=768;SC=ACTACGCCGAAGCGCCACGGC;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=9336079;WS=9336061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	9406349	rs4606477	T	C	2852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=41;PP=2253;SC=TGCGGGGCACTATGGACCCAG;SOR=0.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=41;TCR=41;TR=82;WE=9406357;WS=9406339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr11	9442388	rs12418581	C	A	78.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=61;SC=GTCTCAGGATCTCTTTATGTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=9442396;WS=9442378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	9450377	rs2290423	T	G	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=14;PP=850;SC=TCTGTGTTTTTCATTCAGATC;SOR=1.040;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=33;WE=9450385;WS=9450367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	9457722	.	CAG	C	2965	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.09;NF=85;NR=0;PP=2965;QD=20;SC=AAGTAATACTCAGAGCCTGTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=101;TCF=101;TCR=0;TR=85;WE=9457731;WS=9457721;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:16,85:0.84:101
chr11	9493100	rs7119680	G	T	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.47;MQRankSum=-0.396;QD=19.79;ReadPosRankSum=-0.715;SOR=1.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,40:0.91:44
chr11	9494461	.	CT	C	144.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.000;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=5.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.808;QD=1.74;ReadPosRankSum=0.124;SOR=0.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,21:0.25:83
chr11	9495961	rs2278900	A	T	7641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=218;NR=1;PP=2965;SC=TACTGAACTTACTTAAATGTT;SOR=9.392;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=219;TCF=218;TCR=1;TR=219;WE=9495969;WS=9495951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr11	9519420	rs10840249	T	C	2854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.06;QD=34.81;SOR=8.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	9522567	rs2290425	T	C	4417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=129;NR=2;PP=2965;SC=CTAGGCAGGATTGAAGGATAA;SOR=7.009;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=131;TCF=129;TCR=2;TR=131;WE=9522575;WS=9522557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr11	9534103	rs148786361	G	A	6862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.763;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=136;NR=108;PP=2962;ReadPosRankSum=0.967;SC=TCTGGACTGAGTCAACAAGTT;SOR=0.969;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=314;TCF=173;TCR=141;TR=244;WE=9534111;WS=9534093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,251:0.78:323
chr11	9537904	rs10743108	G	C	5546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=104;PP=2965;SC=TACAGAAGGGGAACAGGTAAT;SOR=1.385;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=60;TCR=104;TR=164;WE=9537912;WS=9537894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr11	9595732	rs11042428	C	G	2361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=1.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.13;ReadPosRankSum=-0.196;SOR=0.908;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,80:0.85:94
chr11	9603236	rs4370932	C	T	4375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=67;PP=2965;SC=GTAAGTATTGCAGATCTTCTG;SOR=0.750;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=69;TCR=67;TR=135;WE=9603244;WS=9603226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr11	9715628	rs360049	C	T	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=253;SC=GCATGTTGTACTCATGGTGAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=9715636;WS=9715619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	9715646	rs3763865	T	C	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=1;PP=429;SC=GAAGGTGTCATGTGCTGGTTA;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=9715654;WS=9715636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	9751089	rs12360647	G	A	1928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=51;PP=1603;SC=TCTGTTGCCCGGGCTGTAGTG;SOR=6.630;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=1;TCR=51;TR=52;WE=9751097;WS=9751079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	9754221	rs360157	C	T	3199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=87;PP=2762;SC=AGGCCGCCAACGAAAGCAAGC;SOR=4.197;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=10;TCR=87;TR=97;WE=9754229;WS=9754211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	9759608	rs93139	T	C	2721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=80;NR=0;PP=2386;SC=TAGACTGGAATTCTAATGGAG;SOR=8.838;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=80;TCF=80;TCR=0;TR=80;WE=9759616;WS=9759598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	9759713	rs93138	T	G	10224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=210;NR=101;PP=2965;SC=TTAATGTACTTCTACTCTAAC;SOR=1.594;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=313;TCF=210;TCR=103;TR=311;WE=9759721;WS=9759703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,317:1.00:317
chr11	9759918	rs173396	G	A	3389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=93;PP=2965;SC=AGCCTGGGTCGGTGGGAACAG;SOR=5.871;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=4;TCR=94;TR=97;WE=9759926;WS=9759908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr11	9769562	rs415895	C	G	16260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=514;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=250;NR=254;PP=2965;SC=GCAGCTGGAGCAGCTTGAGTT;SOR=0.701;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=505;TCF=250;TCR=255;TR=504;WE=9769570;WS=9769552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,508:1.00:508
chr11	9771687	rs6483656	G	C	1779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=51;PP=1535;SC=GAGTTCAAGAGCAGCCTGGCC;SOR=6.518;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=1;TCR=51;TR=52;WE=9771695;WS=9771677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	9801925	rs3751000	T	G	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=2.415;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.54;ReadPosRankSum=-0.839;SOR=1.079;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,30:0.25:121
chr11	9802228	rs360124	G	C	4527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=123;PP=2965;SC=CTTTACTTTTGTGGTCTCTAG;SOR=8.302;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=124;TCF=1;TCR=123;TR=124;WE=9802236;WS=9802218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr11	9802952	rs3763862	A	C	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=4;PP=1116;ReadPosRankSum=2.242;SC=TCTGTCATCCATCTGTAGTCA;SOR=0.554;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=52;TCF=48;TCR=4;TR=44;WE=9802960;WS=9802942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,46:0.84:55
chr11	9806914	rs71453928	T	TACTG	878.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.71;ReadPosRankSum=-1.171;SOR=0.679;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,30:0.19:154
chr11	9812236	rs2645029	G	A	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=1.848;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.70;ReadPosRankSum=-0.367;SOR=0.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,38:0.24:156
chr11	9830732	rs10770066	A	T	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.15;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,18:0.16:111
chr11	9838591	rs116966215	G	A	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=2.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.18;ReadPosRankSum=0.954;SOR=0.183;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,23:0.23:101
chr11	9861009	rs7483882	G	A	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FS=2.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.67;ReadPosRankSum=1.104;SOR=0.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:218,43:0.16:261
chr11	9875353	rs375686	G	T	6267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=174;PP=2965;SC=AGAAACATGAGCAAAGTGATG;SOR=9.011;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=175;TCF=1;TCR=174;TR=175;WE=9875361;WS=9875343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr11	9878332	rs11322743	AT	A	381.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=22.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.83;MQRankSum=1.502;QD=5.38;ReadPosRankSum=1.614;SOR=4.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,40:0.56:71
chr11	9917620	rs4910073	G	C	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FS=2.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.08;ReadPosRankSum=0.580;SOR=0.474;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:218,50:0.19:268
chr11	10014462	rs56223901	C	A	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=7.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.16;ReadPosRankSum=-0.951;SOR=0.014;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,17:0.19:88
chr11	10019879	rs16907355	G	A	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=427;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.01;ReadPosRankSum=1.265;SOR=0.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:356,65:0.15:421
chr11	10215598	rs4910097	C	T	6768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=220;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.933;SC=ACTCATTCTACTCTTACTTAT;SOR=0.607;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=282;TCF=3;TCR=279;TR=223;WE=10215606;WS=10215588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,225:0.79:285
chr11	10327706	.	C	T	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.695;ClippingRankSum=0.000;DP=301;ExcessHet=3.0103;FS=2.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.98;ReadPosRankSum=-0.024;SOR=0.928;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:262,37:0.12:299
chr11	10472438	rs138176008	C	G	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=2.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.41;ReadPosRankSum=-0.731;SOR=1.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,10:0.17:58
chr11	10472492	rs35417007	GC	G	3908.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=23;PP=2951;SC=TGGCCTCAGTGCCCAGCAGCC;SOR=2.691;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=110;TCF=81;TCR=29;TR=96;WE=10472500;WS=10472482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr11	10508938	rs3802917	T	C	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FS=3.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.70;ReadPosRankSum=1.224;SOR=0.354;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:221,34:0.13:255
chr11	10518289	rs1466426	T	C	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FS=20.241;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.22;ReadPosRankSum=0.951;SOR=0.037;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:194,48:0.20:242
chr11	10518521	rs2071016	C	T	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.15;ReadPosRankSum=0.904;SOR=0.586;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:439,87:0.17:526
chr11	10521764	rs3741041	T	C	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=801;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.56;ReadPosRankSum=-0.500;SOR=0.761;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:694,101:0.13:795
chr11	10521850	rs3741039	G	A	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FS=6.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.85;ReadPosRankSum=0.374;SOR=0.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:254,35:0.12:289
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chr11	10522983	rs1870951	G	T	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=2.735;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.52;ReadPosRankSum=-0.217;SOR=0.163;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:159,33:0.17:192
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chr11	10647702	rs2241489	G	A	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=541;ExcessHet=3.0103;FS=0.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.24;ReadPosRankSum=0.262;SOR=0.572;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:460,74:0.14:534
chr11	10649161	rs1425152	C	A	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FS=2.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.26;ReadPosRankSum=2.429;SOR=0.449;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:273,40:0.13:313
chr11	10650329	rs2278125	C	T	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=0.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.19;ReadPosRankSum=-1.759;SOR=0.821;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:408,80:0.16:488
chr11	10653737	rs35138815	CT	C	149.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=7.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.24;ReadPosRankSum=-0.233;SOR=2.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr11	10655609	rs2162044	C	T	14359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=468;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=352;PP=2962;SC=ACTCCTGCGGCAGGAGGACCC;SOR=2.468;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=460;TCF=105;TCR=355;TR=457;WE=10655631;WS=10655599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,461:1.00:461
chr11	10655623	rs11042902	C	T	9761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=6.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=409;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.069;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=273;PP=2962;ReadPosRankSum=1.596;SC=AGGACCCTGCCGGTTTAGAAC;SOR=1.362;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=398;TCF=79;TCR=319;TR=335;WE=10655631;WS=10655599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,340:0.85:401
chr11	10673739	rs4909945	T	C	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=855;ExcessHet=3.0103;FS=0.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.49;ReadPosRankSum=1.359;SOR=0.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:717,134:0.16:851
chr11	10709194	rs1035694	C	T	2013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.320;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=1;PP=1678;ReadPosRankSum=0.387;SC=CTTCACCAGACACAGATGCCC;SOR=3.196;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=94;TCF=91;TCR=3;TR=68;WE=10709202;WS=10709184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,71:0.76:94
chr11	10711817	rs7123827	A	C	3347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.297;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.595;NF=108;NR=4;PP=2760;ReadPosRankSum=0.421;SC=CTCACCTGTAATCCCAGCTAC;SOR=2.492;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=134;TCF=128;TCR=6;TR=112;WE=10711825;WS=10711807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,114:0.84:135
chr11	10711918	.	TA	T	47.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.590;ClippingRankSum=0.000;DP=324;ExcessHet=3.0103;FS=4.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=0.820;QD=0.18;ReadPosRankSum=-1.983;SOR=1.198;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:225,39:0.15:264
chr11	10715124	rs10770136	T	C	3101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=81;PP=2488;ReadPosRankSum=-0.061;SC=GGCCAGCCTCTCTTCACTCTG;SOR=0.754;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=25;TCR=97;TR=102;WE=10715132;WS=10715114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,104:0.83:125
chr11	10773049	rs2279697	G	A	4705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.196;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=126;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.692;SC=GAACTTGTACGATCGCCCCCA;SOR=0.274;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=188;TCF=37;TCR=151;TR=160;WE=10773057;WS=10773039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,157:0.87:181
chr11	10786023	rs3830388	A	AAGTTG	14571.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=107;NR=110;PP=2912;SC=ATACTGAATCAAGTTGCATGC;SOR=0.706;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=282;TCF=126;TCR=156;TR=217;WE=10786031;WS=10786013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr11	10786142	rs3736326	C	T	17151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=549;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=336;NR=201;PP=2965;SC=AAGCGGAACACGATGAGCATT;SOR=1.301;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=538;TCF=336;TCR=202;TR=537;WE=10786150;WS=10786132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,546:1.00:546
chr11	10794047	.	C	T	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=0.000;DP=307;ExcessHet=3.0103;FS=1.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.66;ReadPosRankSum=0.621;SOR=0.898;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:272,34:0.11:306
chr11	10795431	rs11386264	C	CA	397.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=5.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.71;MQRankSum=-0.189;QD=6.03;ReadPosRankSum=-0.214;SOR=0.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
chr11	10797276	rs72259410	CTTTCTT	C	3373.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=63;PP=2977;SC=ATATACTTTTCTTTCTTTTTC;SOR=8.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=99;TCF=0;TCR=99;TR=63;WE=10797289;WS=10797266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	10820663	rs71034785	T	TAA	3931.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=727;ExcessHet=3.0103;FS=136.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=0.752;QD=10.86;ReadPosRankSum=-2.361;SOR=3.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,206:0.57:362
chr11	10821055	rs3736327	C	T	10682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.358;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=145;NR=170;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.850;SC=GCTTCTTTTCCAGTACATGAA;SOR=0.487;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=318;TCF=146;TCR=172;TR=315;WE=10821063;WS=10821045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,324:1.00:325
chr11	10822202	rs4910190	G	A	16205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=491;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=227;NR=253;PP=2965;SC=TTCCTGTGAAGAACACAAGTA;SOR=0.842;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=480;TCF=227;TCR=253;TR=480;WE=10822210;WS=10822192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,486:1.00:486
chr11	10822350	rs7951708	C	T	24271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=798;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=406;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.913;SC=CCTGGATAAGCGGTGGATTAG;SOR=0.265;SbPval=0.51;Source=Platypus;TCF=408;WE=10822358;WS=10822340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,784:1.00:785
chr11	10823079	rs10840492	T	C	6407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=173;NR=26;PP=2965;SC=AAAAGAAGTATAGAAAAGAGA;SOR=3.611;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=199;TCF=173;TCR=26;TR=199;WE=10823087;WS=10823069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr11	10823576	.	C	CACACTCCTAAAATAGTTTCATGTTTTAATAGCAAATGAAATCACATATATTGCATAATTTAACATTTGTTGCCTAA	6821.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.47;QD=2273.91;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	10823815	rs7105210	C	T	23432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=756;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=367;NR=368;PP=2965;SC=TTCAGCTTAACGCAACCATTG;SOR=0.712;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=736;TCF=368;TCR=368;TR=735;WE=10823823;WS=10823805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,749:1.00:749
chr11	10824540	rs10743150	G	A	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=3;PP=948;SC=TACACACACAGAGTCTATGTG;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=34;WE=10824548;WS=10824530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	10824731	rs2270620	C	T	20273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=619;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=482;NR=129;PP=2965;SC=CTCAGCTTACCAACAAATTTA;SOR=2.639;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=613;TCF=483;TCR=130;TR=611;WE=10824739;WS=10824721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,615:1.00:615
chr11	10826341	rs2242360	A	G	2987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=1;PP=2568;ReadPosRankSum=-1.069;SC=TCAAAAATACATACCTATCTA;SOR=6.556;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=107;TCF=106;TCR=1;TR=105;WE=10826349;WS=10826331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,106:0.99:107
chr11	10827418	rs11042964	T	C	18100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=559;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=456;NR=80;PP=2965;ReadPosRankSum=1.225;SC=TAATCCACACTTCCCATCTTT;SOR=1.460;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=539;TCF=459;TCR=80;TR=536;WE=10827426;WS=10827408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,553:1.00:555
chr11	10828361	rs10743151	C	A	11298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=206;NR=144;PP=2965;SC=TACATGTTTACCACACCTGTT;SOR=1.099;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=350;TCF=206;TCR=144;TR=350;WE=10828369;WS=10828351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,353:1.00:353
chr11	10828490	rs11373962	T	TA	5675.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=138;PP=2936;SC=TCAAAAAGAATAAGCATCTAT;SOR=4.461;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=168;TCF=8;TCR=160;TR=145;WE=10828498;WS=10828480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr11	10830106	rs7127279	A	G	7628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=193;PP=2965;SC=CTTTCCAGGTATCTGAAGCGC;SOR=2.833;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=237;TCF=44;TCR=193;TR=237;WE=10830114;WS=10830096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr11	11292700	rs10831567	G	C	7045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.530;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=192;NR=49;PP=2962;ReadPosRankSum=2.688;SC=GTCAGGACGCGAGGCTCCTCA;SOR=0.977;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=285;TCF=226;TCR=59;TR=241;WE=11292708;WS=11292690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,241:0.84:287
chr11	11292945	rs35408328	A	C	2919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-6.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=109;PP=2252;ReadPosRankSum=0.517;SC=CTGTGTGGCCAGATCCCAGGA;SOR=0.963;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=135;TCF=11;TCR=124;TR=119;WE=11292953;WS=11292935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,121:0.88:137
chr11	11314538	rs10437598	C	T	9224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=252;NR=73;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.611;SC=TGGTTTTCCACGATGGCTGCC;SOR=0.722;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=370;TCF=287;TCR=83;TR=325;WE=11314546;WS=11314528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,330:0.88:375
chr11	11348828	rs745181	A	G	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FS=5.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.73;ReadPosRankSum=-0.165;SOR=1.277;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:240,42:0.15:282
chr11	11354346	rs901553	T	C	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=0.890;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.44;ReadPosRankSum=2.166;SOR=0.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,28:0.19:146
chr11	11354393	rs901554	A	G	2629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=69;PP=2097;SC=ACAGGGACGCAGAAGCAGAGA;SOR=3.611;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=10;TCR=69;TR=79;WE=11354401;WS=11354383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	11373508	rs7948121	T	C	11790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.44;QD=34.08;SOR=10.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,346:1.00:346
chr11	11373587	rs7945066	A	G	32060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=1028;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=689;NR=326;PP=2965;SC=GGGGTGAAGGAGTTGGCACTG;SOR=1.718;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=1015;TCF=689;TCR=326;TR=1015;WE=11373595;WS=11373577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1018:1.00:1018
chr11	11373635	rs1056963	C	T	37867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=1301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=591;NR=690;PP=2965;SC=TGCTGACGGGCGTACTGCCCC;SOR=0.836;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=1286;TCF=596;TCR=690;TR=1281;WE=11373643;WS=11373625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1286:1.00:1286
chr11	11373808	rs1056951	T	G	25568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=863;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=469;NR=375;PP=2965;SC=TGATTTTCACTGTGGACAAAG;SOR=0.943;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=845;TCF=470;TCR=375;TR=844;WE=11373816;WS=11373798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,856:1.00:856
chr11	11373925	rs4243927	A	C	38052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=1192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=629;NR=533;PP=2965;SC=GTCCCCAGAAACTTGGCTATC;SOR=0.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=1163;TCF=629;TCR=534;TR=1162;WE=11373933;WS=11373915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1183:1.00:1183
chr11	11373960	rs2071461	C	T	35052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=1125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=525;NR=581;PP=2965;SC=ATAATTGTCACGTCCATGGAA;SOR=0.812;SbPval=0.51;Source=Platypus;TCF=526;TR=1106;WE=11373968;WS=11373950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1115:1.00:1115
chr11	11374016	rs2896586	T	A	26819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=846;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=306;NR=536;PP=2965;SC=TACAACCCAATCTCCACATAT;SOR=1.443;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=845;TCF=308;TCR=537;TR=842;WE=11374024;WS=11374006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,843:1.00:843
chr11	11374269	rs2071460	A	G	1568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1064;ExcessHet=3.0103;FS=1.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.805;QD=1.48;ReadPosRankSum=1.096;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:912,147:0.14:1059
chr11	11374283	rs2896585	T	G	35636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1036;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.036;NF=509;NR=506;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.057;SC=CATAGTCTGTTAACGTCTGGT;SOR=0.233;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=1016;TCF=509;TCR=507;TR=1015;WE=11374291;WS=11374259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,1025:1.00:1026
chr11	11398698	rs10444245	G	A	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.518;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=642;ReadPosRankSum=0.485;SC=AGGTCAAAGCGGAGAGACCCA;SOR=0.307;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=27;WE=11398706;WS=11398688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,30:0.79:38
chr11	11895575	.	G	C	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=27;ReadPosRankSum=-0.258;SC=ATTTGTATCTGATAGTACCTT;SOR=0.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=4;WE=11895583;WS=11895565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,4:0.17:23
chr11	11954786	rs10741562	G	A	6574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=151;PP=2962;SC=TCATTGAACAGTGTAACCAAC;SOR=5.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=7;TCR=151;TR=158;WE=11954806;WS=11954776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr11	11954798	.	A	G	3247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=0.000;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=106;PP=2635;ReadPosRankSum=-1.462;SC=GTAACCAACTATACTATAAAG;SOR=0.684;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=131;TCF=4;TCR=127;TR=110;WE=11954806;WS=11954776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,112:0.84:133
chr11	11972054	rs11022090	A	G	5239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=123;PP=2965;SC=TTTGGGGGGAAGTATCAGTTA;SOR=2.680;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=33;TCR=123;TR=156;WE=11972062;WS=11972044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr11	11976628	rs7933089	G	A	18904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=587;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=264;NR=304;PP=2965;SC=ATATTCATCAGGATTTAGACT;SOR=0.805;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=570;TCF=265;TCR=305;TR=568;WE=11976636;WS=11976618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,581:1.00:581
chr11	11986061	rs3206824	T	C	21350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=662;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=328;NR=337;PP=2965;SC=GCAGGCTCCCTCAGCGCCATC;SOR=0.724;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=666;TCF=328;TCR=338;TR=665;WE=11986069;WS=11986051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,660:1.00:660
chr11	11989899	rs2291599	T	C	10477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=276;NR=36;PP=2965;SC=CCCAGGTGCCTGAGACCCTGG;SOR=3.756;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=314;TCF=278;TCR=36;TR=312;WE=11989907;WS=11989889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,319:1.00:319
chr11	12115630	rs7104830	C	T	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.080;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=6;PP=1012;ReadPosRankSum=-0.023;SC=AATGCTCAAACGGGGATGTGC;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=48;TCR=8;TR=46;WE=12115638;WS=12115620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,47:0.82:57
chr11	12225946	rs3763823	T	G	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=650;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.25;ReadPosRankSum=0.607;SOR=0.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:558,85:0.13:643
chr11	12243045	.	C	G	4331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.000;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.242;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=8;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.308;SC=GATGAATCCTCATAGGTAGCA;SOR=0.414;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=151;TCF=143;TCR=8;TR=133;WE=12243053;WS=12243035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,136:0.88:155
chr11	12262476	rs2641936	C	A	12811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=405;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=327;NR=66;PP=2965;ReadPosRankSum=1.471;SC=GCACTTGCAACCTTCGTCTCC;SOR=3.155;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=396;TCF=328;TCR=68;TR=393;WE=12262484;WS=12262466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,398:0.99:401
chr11	12264140	rs880963	A	C	10587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=254;NR=61;PP=2965;ReadPosRankSum=0.537;SC=TGCCTCCCTCACCCACTTCTT;SOR=1.628;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=316;TCF=255;TCR=61;TR=315;WE=12264148;WS=12264130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,321:1.00:322
chr11	12313887	rs1874043	C	G	7798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.626;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=243;PP=2962;ReadPosRankSum=0.068;SC=AGGAAGCTAACCTACCTGTAC;SOR=1.891;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=281;TCF=7;TCR=274;TR=249;WE=12313895;WS=12313877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,254:0.89:284
chr11	12315407	rs10741579	G	C	14382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=605;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.719;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=244;NR=249;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.555;SC=GCTGGACAGGGCAAGAGCTAT;SOR=0.599;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=597;TCF=299;TCR=298;TR=493;WE=12315415;WS=12315397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,496:0.83:595
chr11	12315716	rs1493951	C	T	16475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=676;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.593;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=309;NR=252;PP=2962;ReadPosRankSum=0.322;SC=AGAGAGGGGCCCAGGAGAAGA;SOR=0.848;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=669;TCF=362;TCR=307;TR=561;WE=12315724;WS=12315706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,570:0.85:674
chr11	12315891	rs1493953	G	A	24496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=996;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.928;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=501;NR=347;PP=2962;ReadPosRankSum=1.349;SC=AACTTTGCCCGCACAGGCCTG;SOR=1.074;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=981;TCF=569;TCR=412;TR=848;WE=12315899;WS=12315881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,854:0.87:987
chr11	12316389	rs3812754	A	C	1022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.078;NF=4;NR=46;PP=516;ReadPosRankSum=0.994;SC=TCCTCCTCCTACAGCGGGAGG;SOR=1.519;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=62;TCF=4;TCR=58;TR=50;WE=12316397;WS=12316376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,36:0.80:45
chr11	12345459	rs903213	C	T	3424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.339;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=1;PP=2904;ReadPosRankSum=-1.323;SC=AAGCCTATAACGATATTTTGT;SOR=3.377;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=136;TCF=134;TCR=2;TR=114;WE=12345467;WS=12345449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,117:0.84:139
chr11	12379792	rs10741583	G	C	11521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=300;NR=42;PP=2965;SC=CAAGAACTCTGCCGGGGCCCA;SOR=3.912;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=342;TCF=300;TCR=42;TR=342;WE=12379800;WS=12379782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,342:1.00:342
chr11	12474487	rs74370316	G	A	8027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.589;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=208;NR=69;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.591;SC=CAGAAGGGTAGAAACCACAGG;SOR=0.637;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=334;TCF=253;TCR=81;TR=277;WE=12474495;WS=12474477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,286:0.82:349
chr11	12474633	rs142579184	T	TG	6543.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.664;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.961;NF=17;NR=197;PP=2976;ReadPosRankSum=-1.099;SC=GATTCTTTGTTGGGGGGGCGC;SOR=1.330;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=308;TCF=28;TCR=280;TR=214;WE=12474641;WS=12474623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,244:0.85:288
chr11	12495248	rs76849829	C	T	7055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=6.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.983;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=217;NR=15;PP=2962;ReadPosRankSum=0.594;SC=AACCCCCTGCCGTCCGTCAGC;SOR=1.424;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=272;TCF=253;TCR=19;TR=232;WE=12495256;WS=12495238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,230:0.85:271
chr11	12495607	rs2288291	T	C	5119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=6.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=165;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.999;SC=TCTGTGCAGGTACCCCACGAG;SOR=0.762;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=200;TCF=4;TCR=196;TR=169;WE=12495615;WS=12495597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,174:0.85:205
chr11	12495623	rs7109678	G	C	5837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=3;NR=158;PP=2965;SC=ACGAGCCCCTGAGAGAAGGTA;SOR=7.440;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=3;TCR=158;TR=161;WE=12495631;WS=12495613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr11	12517935	rs11406960	G	GT	6187.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=142;NR=11;PP=2957;SC=GAATAACTGAGTAAGTGCATG;SOR=5.322;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=144;TCR=11;TR=153;WE=12517943;WS=12517925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr11	12532912	rs12283539	A	C	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=15.723;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.05;ReadPosRankSum=-0.962;SOR=0.026;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,18:0.24:75
chr11	12534707	rs2243707	G	A	1746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1310;ExcessHet=3.0103;FS=1.770;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.34;ReadPosRankSum=1.475;SOR=0.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1121,180:0.14:1301
chr11	12534808	rs2403631	A	G	43287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=1438;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=637;NR=789;PP=2965;SC=GCCAGGGATCAGCTCTTGTGC;SOR=0.940;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=1427;TCF=637;TCR=790;TR=1426;WE=12534816;WS=12534798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1424:1.00:1424
chr11	12535209	rs2288293	C	T	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=10.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FS=2.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.58;ReadPosRankSum=0.831;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:276,44:0.14:320
chr11	12535415	rs11022380	A	G	2205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=9;PP=1738;SC=TCCTGGGCCCAGGGCTCTTGG;SOR=3.669;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=64;TCR=9;TR=73;WE=12535423;WS=12535405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr11	12886540	rs10500764	C	T	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=404;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.51;ReadPosRankSum=1.476;SOR=0.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:346,55:0.14:401
chr11	12900359	rs11022528	T	C	4724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-0.348;QD=26.54;ReadPosRankSum=-0.577;SOR=2.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,157:0.88:178
chr11	12903443	rs2304733	C	T	21911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=992;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.597;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=479;NR=323;PP=2962;ReadPosRankSum=0.777;SC=CTGTTCCCAGCGTCAAGCCTT;SOR=0.587;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=961;TCF=580;TCR=381;TR=802;WE=12903451;WS=12903433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,823:0.84:979
chr11	12951623	rs2245140	A	C	10595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=310;NR=1;PP=2965;SC=AAGATGATTCATGTTGAAAAA;SOR=10.087;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=312;TCF=311;TCR=1;TR=311;WE=12951631;WS=12951613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr11	12951926	rs2727360	A	G	14221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=465;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=366;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.722;SC=GAGGCTTGACAGAAGTGAGGA;SOR=1.853;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=443;TCF=76;TCR=367;TR=442;WE=12951934;WS=12951916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,449:1.00:450
chr11	12952015	rs2727361	C	T	4054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=114;PP=2965;SC=GGTCAGTCAGCAGTTGAATTT;SOR=7.395;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=117;TCF=3;TCR=114;TR=117;WE=12952023;WS=12952005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr11	13032511	rs55909156	G	C	19434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=777;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.771;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=204;NR=430;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.212;SC=CCTCAAGCCTGCGCCGACATG;SOR=0.862;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=758;TCF=249;TCR=509;TR=634;WE=13032519;WS=13032501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,645:0.84:772
chr11	13032679	.	AGG	A	94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=5;HapScore=4;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=94;QD=41.6666666667;SC=GGGCGGGAACAGGGGGATTCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=13032694;WS=13032669;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	13032686	.	T	TC	110	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=110;QD=45.6666666667;SC=AACAGGGGGATTCTTTTTTCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=13032694;WS=13032669;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	13398129	rs10741617	T	A	10486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=175;NR=142;PP=2965;SC=CCAAGTTGAATGGTGCACAGT;SOR=0.908;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=317;TCF=175;TCR=142;TR=317;WE=13398137;WS=13398119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr11	13399791	rs10832030	A	G	1493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=0;PP=1297;SC=TGAACTGCAAATGGATCATGG;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=43;WE=13399799;WS=13399781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	13514053	rs6256	G	T	1823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.385;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=32;PP=1452;ReadPosRankSum=0.418;SC=TCCTTTTTTCGGGGCCTCTGG;SOR=0.482;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=202;TCF=124;TCR=78;TR=74;WE=13514061;WS=13514043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,75:0.37:205
chr11	13514263	rs6254	C	T	5223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.248;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=125;PP=2962;ReadPosRankSum=2.803;SC=CTCCCCACTTCGAAATGATAA;SOR=0.424;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=286;TCF=90;TCR=196;TR=187;WE=13514271;WS=13514253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,188:0.65:290
chr11	13514417	rs694	C	T	1387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=36;PP=1013;SC=ACTAAAAGGACAAGCAAAATG;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=13514425;WS=13514407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	13716530	rs7130943	A	G	2975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=68;PP=2368;ReadPosRankSum=1.532;SC=CACTCAGAACAAAGAAAAAAG;SOR=1.104;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=24;TCR=69;TR=92;WE=13716538;WS=13716520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,94:0.99:95
chr11	13743325	rs34341612	A	G	1959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.690;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=18;PP=1569;ReadPosRankSum=0.836;SC=TGTTTCTTGAATATTTCACAA;SOR=1.210;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=79;TCF=54;TCR=25;TR=61;WE=13743333;WS=13743315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,65:0.77:84
chr11	13984720	rs10741631	A	C	4050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=111;PP=2965;SC=GCATTAGGAGAGCGGGACCCG;SOR=2.560;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=143;TCF=31;TCR=112;TR=142;WE=13984728;WS=13984710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr11	14101493	rs5789820	G	GC	8773.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=99;PP=2971;SC=AGACTGCTGTGCTGCGGAACT;SOR=0.918;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=202;TCF=96;TCR=106;TR=192;WE=14101501;WS=14101483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr11	14246099	rs11023151	A	G	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=250;ReadPosRankSum=0.780;SC=ATGGGACTGAATTTAGCTTCT;SOR=0.237;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=14;WE=14246107;WS=14246089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr11	14246296	rs1025412	G	A	2663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.850;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=56;PP=2164;ReadPosRankSum=2.632;SC=GTGAAAGACTGAGGGAGATAT;SOR=1.240;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=129;TCF=55;TCR=74;TR=91;WE=14246304;WS=14246286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,95:0.70:135
chr11	14246336	rs2163463	G	A	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.324;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=18;PP=442;ReadPosRankSum=0.039;SC=GGGCCAAAGGGTGAGCCCTTG;SOR=0.321;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=122;TCF=45;TCR=77;TR=33;WE=14246344;WS=14246326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,34:0.28:123
chr11	14264916	rs2303973	A	G	1567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=22;PP=1233;ReadPosRankSum=0.345;SC=CCAAAGCCCAATGGCCAGCCT;SOR=0.716;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=216;TCF=146;TCR=70;TR=69;WE=14264924;WS=14264906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,69:0.32:219
chr11	14264979	rs2303974	C	A	4643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.300;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=92;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.151;SC=CCTGTCTTATCCTAGCCCCTT;SOR=0.663;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=265;TCF=133;TCR=132;TR=169;WE=14264987;WS=14264969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,175:0.65:270
chr11	14278049	rs3763950	T	A	2568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=6;PP=2069;ReadPosRankSum=-1.972;SC=AACTTTGCCATGGCATACGAT;SOR=0.531;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=114;TCF=107;TCR=7;TR=86;WE=14278057;WS=14278039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,87:0.76:115
chr11	14284599	.	TA	T	38	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=20;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=15;MQ=59.84;NF=0;NR=4;PP=38;QD=10.25;SC=TGGACCTGTTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=4;WE=14284607;WS=14284589;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:20,4:0.17:24
chr11	14303282	rs2303972	T	A	1924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.266;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=48;PP=1404;ReadPosRankSum=0.785;SC=ATTCCAACAGTTATGTTTATG;SOR=0.535;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=264;TCF=106;TCR=158;TR=82;WE=14303290;WS=14303272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,87:0.32:272
chr11	14329984	rs2915408	C	G	2732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=73;PP=2308;SC=CTGGCTCTCACCTATAAATGA;SOR=4.487;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=82;TCF=8;TCR=74;TR=80;WE=14329992;WS=14329974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr11	14386145	rs4517475	A	G	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=619;ReadPosRankSum=-0.165;SC=CACACACACAACCCTGAGGAA;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=26;WE=14386153;WS=14386135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,26:0.70:37
chr11	14480292	rs12576926	C	T	1275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.441;NF=2;NR=49;PP=997;ReadPosRankSum=0.531;SC=GAGGCAAAAACCAAACAGCAT;SOR=0.655;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=3;TCR=83;TR=51;WE=14480300;WS=14480282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,52:0.67:78
chr11	14497269	rs2597194	C	T	2898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=8;PP=2374;ReadPosRankSum=-0.052;SC=ATTTGACTGTCTTACATACAA;SOR=0.594;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=161;TCF=149;TCR=12;TR=101;WE=14497277;WS=14497259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,101:0.62:162
chr11	14501296	rs2575857	C	T	2036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-8.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.668;NF=2;NR=76;PP=1787;ReadPosRankSum=1.460;SC=ATGGAACTAACAATTTTCGAA;SOR=0.470;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=112;TCF=2;TCR=110;TR=78;WE=14501304;WS=14501286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,73:0.71:103
chr11	14504774	rs72419983	CCACA	C	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=141;ReadPosRankSum=1.036;SC=CGCGCGCACACCACACACACA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=14504785;WS=14504764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr11	14512060	rs2597189	C	T	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=177;ReadPosRankSum=-0.377;SC=GTAATACTTTCAATTGTCACT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=9;WE=14512068;WS=14512050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr11	14516003	rs10832279	TT	AA	1620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=4.030;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.85;ReadPosRankSum=2.343;SOR=2.372;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,52:0.60:86
chr11	14520566	rs3214792	T	TA	66.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQRankSum=-0.000;QD=5.13;ReadPosRankSum=1.494;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr11	14532338	rs2597218	C	T	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=3;PP=843;ReadPosRankSum=1.826;SC=CAGAATGTTGCATATATACTC;SOR=0.466;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=46;TCF=43;TCR=3;TR=35;WE=14532346;WS=14532328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,39:0.78:50
chr11	14539315	rs59770964	TA	T	419.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=1.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=0.937;QD=7.92;ReadPosRankSum=-0.891;SOR=1.375;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
chr11	14539639	rs2575849	T	A	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.021;HP=9;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=498;ReadPosRankSum=0.133;SC=ATTTTTTTTTTAATCAAGAGA;SOR=3.702;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=21;WE=14539659;WS=14539629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr11	14540671	rs1823466	A	G	6554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=143;NR=45;PP=2965;SC=ATATGCTTGTATTTCCATTCA;SOR=2.415;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=188;TCF=143;TCR=45;TR=188;WE=14540679;WS=14540661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr11	14540942	rs2305305	C	T	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=37;PP=901;ReadPosRankSum=0.236;SC=AAAAGTCTTCCTTTTCTTTAA;SOR=1.197;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=0;TCR=61;TR=37;WE=14540950;WS=14540932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,37:0.61:61
chr11	14632570	rs1403247	A	C	3222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.769;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=71;PP=2526;ReadPosRankSum=-1.275;SC=AGACCAACATACAACATAGGT;SOR=0.221;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=156;TCF=50;TCR=106;TR=112;WE=14632578;WS=14632560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,116:0.70:165
chr11	14810762	rs4757268	A	G	4499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.053;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=102;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.318;SC=ATGGCAAAAGACCTCACCAAG;SOR=0.595;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=249;TCF=87;TCR=162;TR=160;WE=14810770;WS=14810752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,170:0.65:260
chr11	14825704	rs3740823	A	G	1587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=53;PP=1299;ReadPosRankSum=-1.580;SC=AATTTCATGTATTATAAGTTA;SOR=0.977;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=79;TCF=3;TCR=76;TR=55;WE=14825712;WS=14825694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,57:0.66:86
chr11	14852490	rs1037378	G	A	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=30;PP=677;ReadPosRankSum=1.323;SC=TTTTAATATAGTAGTATTTTT;SOR=1.775;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=30;WE=14852498;WS=14852480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,30:0.70:43
chr11	14913575	rs12794714	G	A	1802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.648;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=29;PP=1385;ReadPosRankSum=0.477;SC=GGGGAAGCTCGGATGAGGCTG;SOR=0.501;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=101;TCF=58;TCR=43;TR=62;WE=14913583;WS=14913565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,67:0.64:105
chr11	14990278	.	A	G	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.640;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=584;ReadPosRankSum=1.204;SC=CCAGAGAGGAACCAAACCACA;SOR=0.715;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=75;TCF=60;TCR=15;TR=27;WE=14990286;WS=14990268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,31:0.39:80
chr11	14991539	rs5239	T	C	3385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=86;NR=12;PP=2847;SC=TGCACATAGTTCTGCACCAGT;SOR=3.846;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=86;TCR=12;TR=98;WE=14991547;WS=14991529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr11	14999877	rs7929159	G	A	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.832;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=307;ReadPosRankSum=1.510;SC=TCTGAAGTGAGAGGCATGAAA;SOR=1.241;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=68;TCF=22;TCR=46;TR=18;WE=14999885;WS=14999867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,20:0.28:72
chr11	15096419	rs1540139	C	T	1929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.759;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=44;PP=1622;ReadPosRankSum=-0.043;SC=CTCTGTGCCTCTGAAGTCACG;SOR=0.826;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=107;TCF=36;TCR=71;TR=64;WE=15096427;WS=15096409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,67:0.60:112
chr11	15098718	rs2282653	G	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=93;ReadPosRankSum=-0.923;SC=TTGCATTTTCGAGAAACACTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=7;WE=15098726;WS=15098708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr11	15133939	rs11023439	G	T	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.82;ReadPosRankSum=-0.589;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,32:0.22:143
chr11	15170644	rs1714354	T	C	4951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=79;PP=2965;SC=TCTTTTAGGATCTCGTTGTGC;SOR=0.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=80;TCR=79;TR=159;WE=15170652;WS=15170634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr11	15170879	rs1714353	C	T	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=447;SC=CATCTTCCCACGCAATTTTCT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=15170887;WS=15170869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	15199957	rs1714376	T	C	2023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.541;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=49;PP=1503;ReadPosRankSum=-0.958;SC=AGCACTTTGGTCAGCTGCTGG;SOR=0.370;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=94;TCF=26;TCR=68;TR=70;WE=15199965;WS=15199947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,74:0.74:100
chr11	15247307	rs61748861	CC	AA	1871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.70;ReadPosRankSum=0.185;SOR=0.672;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,53:0.33:160
chr11	15247310	rs61748860	T	G	1865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.73;ReadPosRankSum=-0.020;SOR=0.715;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,52:0.33:159
chr11	15262261	rs80167082	A	G	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=31;PP=710;ReadPosRankSum=-0.420;SC=TGAAAATTATATGAGGTCATA;SOR=0.664;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=0;TCR=64;TR=31;WE=15262269;WS=15262251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,32:0.49:65
chr11	15267597	rs1054952	C	A	5216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=6.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.570;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=111;PP=2962;ReadPosRankSum=0.464;SC=TGAGTGTGGGCGAAGAAATAC;SOR=0.820;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=273;TCF=106;TCR=167;TR=181;WE=15267605;WS=15267587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,187:0.67:279
chr11	15267727	rs1945624	A	G	1529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.682;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=49;PP=1219;ReadPosRankSum=1.475;SC=AATGGAGGACAAAATCTTAGA;SOR=0.295;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=75;TCF=1;TCR=74;TR=50;WE=15267735;WS=15267717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,52:0.65:80
chr11	16117460	rs3059081	TA	T	580.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=2.434;QD=4.65;ReadPosRankSum=1.822;SOR=0.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,50:0.40:125
chr11	16117684	.	GA	G	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.000;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.64;ReadPosRankSum=-1.783;SOR=0.713;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,13:0.19:70
chr11	16133413	rs4617548	A	G	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.882;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=539;ReadPosRankSum=-0.640;SC=CTGCTGCCAGAGTCCGCTGGT;SOR=0.982;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=21;WE=16133421;WS=16133403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr11	16760244	rs1846936	T	G	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=2;PP=859;SC=GCTTGGGCCCTTGGCGGATTG;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=33;WE=16760252;WS=16760234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	16766106	rs2270886	T	C	1298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=12;PP=951;ReadPosRankSum=0.395;SC=GTAATACTTATTTTTATGCAA;SOR=0.750;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=144;TCF=110;TCR=34;TR=52;WE=16766114;WS=16766096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,54:0.37:147
chr11	16775655	rs34665109	TC	T	448.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.06;ReadPosRankSum=0.186;SOR=0.246;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,19:0.26:74
chr11	16812833	.	G	A	1659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.749;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.930;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=47;PP=1398;ReadPosRankSum=0.119;SC=AGGTTTAAAGGGTAGGAACAG;SOR=0.211;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=83;TCF=12;TCR=71;TR=57;WE=16812841;WS=16812823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,57:0.67:85
chr11	16816651	rs75343069	C	T	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=477;ReadPosRankSum=-1.027;SC=AGACAGAGCCCCCCGCCCTGA;SOR=0.968;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=24;WE=16816659;WS=16816641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr11	16837788	rs217750	G	A	1915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.204;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=50;PP=1510;ReadPosRankSum=1.027;SC=AGGGCATGGAGCGTCGGTCCA;SOR=0.281;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=109;TCF=27;TCR=82;TR=71;WE=16837796;WS=16837778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,72:0.67:108
chr11	16837874	rs10832684	A	G	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.866;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=324;ReadPosRankSum=-1.252;SC=CTCCCAGGGAAGCCGCCCCAT;SOR=1.641;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=16;WE=16837882;WS=16837864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr11	16837904	rs10832685	C	A	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=29;ReadPosRankSum=0.387;SC=CCTCTGAGCCCCAGACTTCTC;SOR=0.641;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=5;WE=16837912;WS=16837894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr11	16847558	rs400458	A	G	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=0;PP=644;ReadPosRankSum=-1.283;SC=AGGTAATGGCAGTAAAGAGTT;SOR=1.199;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=55;TCR=0;TR=35;WE=16847566;WS=16847548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,34:0.61:56
chr11	16848077	rs390974	G	A	5230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.051;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=152;PP=2962;ReadPosRankSum=0.092;SC=GGCCACATTCGTGACAGGACT;SOR=1.067;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=294;TCF=66;TCR=228;TR=191;WE=16848085;WS=16848067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,192:0.65:295
chr11	16863049	rs369457	C	T	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=392;ReadPosRankSum=0.087;SC=GGTCCCAATCCTAGTGTAGGA;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=16;WE=16863057;WS=16863039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr11	16863087	rs452745	A	G	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.920;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=579;ReadPosRankSum=0.777;SC=CCTCCATCAGAACTAACCTCT;SOR=0.242;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=28;WE=16863095;WS=16863077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr11	16863362	rs454869	T	A	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=27;PP=677;ReadPosRankSum=1.242;SC=GCCCTTCTAGTCTAAAAGCCC;SOR=1.154;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=57;TCF=12;TCR=45;TR=33;WE=16863370;WS=16863352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr11	16863424	rs431208	C	A	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=144;ReadPosRankSum=0.357;SC=GGCTAGATTTCTCTTTCTTAG;SOR=1.214;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=9;WE=16863432;WS=16863414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr11	16872653	rs35098462	G	A	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=11.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.39;ReadPosRankSum=1.495;SOR=1.522;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,48:0.27:177
chr11	16873799	rs417406	C	T	6769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.448;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=184;NR=55;PP=2962;ReadPosRankSum=1.589;SC=CTGAACACTTCGGCAGGGTAA;SOR=1.032;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=374;TCF=278;TCR=96;TR=239;WE=16873807;WS=16873789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,242:0.64:380
chr11	16874067	rs418113	C	T	3897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=109;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.890;SC=GACATTAGAACTTGGATTAAA;SOR=8.069;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=111;TCF=0;TCR=111;TR=109;WE=16874075;WS=16874057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr11	16876618	rs409354	G	A	5036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.454;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=126;PP=2962;ReadPosRankSum=1.064;SC=TAGGAGGACCGTCGGCTCTCT;SOR=0.649;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=295;TCF=100;TCR=195;TR=192;WE=16876626;WS=16876608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,191:0.63:303
chr11	16892477	rs402973	C	G	2569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=3;PP=2087;ReadPosRankSum=-0.998;SC=TGAAAGAAGTCTGAAGGTTGA;SOR=0.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=127;TCF=122;TCR=5;TR=84;WE=16892485;WS=16892467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,87:0.67:130
chr11	17035493	rs71047521	C	CA	467.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.841;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=528;ReadPosRankSum=2.002;SC=AGGGACCCCCCCCCCGCGGCA;SOR=3.595;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=20;WE=17035501;WS=17035477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr11	17035718	rs61881311	A	G	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=4.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.52;ReadPosRankSum=1.346;SOR=1.228;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,35:0.25:142
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chr11	17096150	rs7125607	T	A	15890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=496;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=301;NR=179;PP=2965;SC=GCACCAAACTTCTGAATACCT;SOR=1.376;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=480;TCF=301;TCR=179;TR=480;WE=17096158;WS=17096140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,493:1.00:493
chr11	17099613	rs16933823	G	A	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.475;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=39;PP=1026;ReadPosRankSum=-0.741;SC=CCTCAGAGTCGGCCCTGCGCC;SOR=1.131;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=74;TCF=8;TCR=66;TR=43;WE=17099621;WS=17099603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,45:0.58:77
chr11	17111272	rs10832733	A	G	3745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=91;NR=21;PP=2965;SC=CCAAAGCTCAAACATTCACTA;SOR=2.938;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=92;TCR=21;TR=112;WE=17111280;WS=17111262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	17113483	rs7113396	C	T	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=2;PP=455;SC=CCACATTCATCGAGAAGTTAC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=17113491;WS=17113473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	17121648	rs17847726	G	A	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.336;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=406;ReadPosRankSum=-0.178;SC=GTTCATTAGTGTATTGGGGAC;SOR=1.697;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=19;WE=17121656;WS=17121638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr11	17131918	rs191337971	T	G	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=346.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.93;ReadPosRankSum=5.552;SOR=9.401;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,109:0.44:247
chr11	17135755	rs61763074	G	A	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.11;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr11	17151073	rs17847718	C	T	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=342;ReadPosRankSum=-1.021;SC=TGAAATTTAACACTTTAATGA;SOR=2.303;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=16;WE=17151081;WS=17151063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr11	17172133	rs2302511	T	C	11193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=246;PP=2965;SC=TGTTTCTTTGTGCTGTGACTG;SOR=1.518;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=372;TCF=126;TCR=246;TR=372;WE=17172141;WS=17172123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,382:1.00:382
chr11	17333663	rs2521998	G	A	3058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=62;PP=2346;SC=CATGTAATGAGTGAGGTATGT;SOR=1.449;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=35;TCR=62;TR=97;WE=17333671;WS=17333653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr11	17339127	rs2634462	T	C	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=3;PP=743;ReadPosRankSum=-0.250;SC=TAATGTCTTTTTAGTCTCCTT;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=108;TCF=98;TCR=10;TR=36;WE=17339135;WS=17339117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,36:0.33:110
chr11	17351683	rs757081	C	G	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=277;ReadPosRankSum=1.825;SC=GACATTAGATCAGCAACAGTT;SOR=0.415;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=68;TCR=1;TR=17;WE=17351691;WS=17351673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,18:0.25:71
chr11	17373438	rs34000454	G	C	6122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-8.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.742;NF=134;NR=122;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.103;SC=ACGCAACAGAGGTCTCCCCCT;SOR=0.696;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=398;TCF=208;TCR=190;TR=256;WE=17373446;WS=17373428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,251:0.64:391
chr11	17393644	rs12791318	A	G	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.871;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;ReadPosRankSum=-1.562;SC=AAGAAAGAGCACCTCATATTC;SOR=0.558;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=82;TCF=57;TCR=25;TR=45;WE=17393652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,51:0.58:88
chr11	17394073	rs10832778	C	G	4032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-7.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.252;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.374;SC=CCTGATGGACCTGGTGCCACT;SOR=0.841;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=223;TCF=60;TCR=163;TR=152;WE=17394081;WS=17394063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,154:0.68:226
chr11	17408404	rs5213	C	T	2659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=16;PP=2030;SC=AGGCCCTGGCCGGGCTACATA;SOR=2.419;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=59;TCR=16;TR=75;WE=17408412;WS=17408394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	17408630	rs5215	C	T	8252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=156;NR=113;PP=2965;SC=GGCACTTTGACGGTGTTGCCA;SOR=0.978;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=269;TCF=156;TCR=113;TR=269;WE=17408638;WS=17408620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr11	17409069	rs5218	G	A	2385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.090;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=34;PP=1802;ReadPosRankSum=0.648;SC=CGTGGCGCAGGGCGATCACCG;SOR=0.823;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=293;TCF=185;TCR=108;TR=97;WE=17409077;WS=17409059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:201,102:0.34:303
chr11	17409572	rs5219	T	C	11248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=386;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=152;NR=226;PP=2965;SC=TACCTGGGCTTGGCAGGGTCC;SOR=1.209;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=379;TCF=152;TCR=227;TR=378;WE=17409580;WS=17409562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,383:1.00:383
chr11	17410283	rs5222	C	T	1752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.210;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=20;PP=1343;ReadPosRankSum=-1.824;SC=GCTAAGAGCCCTTCTCCCCGC;SOR=0.585;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=222;TCF=162;TCR=60;TR=73;WE=17410291;WS=17410273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,77:0.34:225
chr11	17414715	rs1109591	T	C	3458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=5.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.984;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.386;NF=16;NR=109;PP=2791;ReadPosRankSum=0.338;SC=ATGGTGGGAATACCACCCGCG;SOR=0.463;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=191;TCF=22;TCR=169;TR=125;WE=17414723;WS=17414705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,125:0.66:189
chr11	17414757	rs41282912	C	T	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=8.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.372;NF=0;NR=43;PP=848;ReadPosRankSum=-1.928;SC=GGCCCTCCTGCGGCTTGGAGG;SOR=0.810;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=119;TCF=1;TCR=118;TR=43;WE=17414765;WS=17414747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,42:0.35:119
chr11	17415190	rs4148646	C	G	5270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=120;NR=31;PP=2965;SC=ACGGCCACAACAGGCCAGTCC;SOR=2.690;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=153;TCF=122;TCR=31;TR=151;WE=17415198;WS=17415180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr11	17417504	rs739689	A	G	3235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.323;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=88;PP=2504;ReadPosRankSum=1.390;SC=AGGCACCGCCACTGGGACTCT;SOR=0.351;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=152;TCF=36;TCR=116;TR=118;WE=17417512;WS=17417494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,118:0.77:154
chr11	17418477	rs757110	C	A	5428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=139;NR=33;PP=2965;SC=TGTCCAGGGGCGATGAGGGCA;SOR=2.958;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=172;TCF=139;TCR=33;TR=172;WE=17418485;WS=17418467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr11	17419279	rs1799859	C	T	4858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.751;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=79;PP=2962;ReadPosRankSum=1.313;SC=CAGAGAGCTCCCTGTGCAGGG;SOR=0.743;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=250;TCF=128;TCR=122;TR=170;WE=17419287;WS=17419269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,177:0.69:257
chr11	17428163	rs113873225	G	A	2380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.183;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=44;PP=1786;ReadPosRankSum=-0.012;SC=CAGGGGAGACGGGTACCTCAT;SOR=0.457;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=252;TCF=151;TCR=101;TR=98;WE=17428171;WS=17428153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,102:0.39:262
chr11	17429922	rs2106865	T	C	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.174;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=196;ReadPosRankSum=1.098;SC=TGCTTGGCCATCCCTGGATAT;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=31;TCR=20;TR=13;WE=17429930;WS=17429912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,16:0.27:59
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chr11	17436936	rs4148626	A	G	892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.677;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=20;PP=780;ReadPosRankSum=0.108;SC=AGTGAACCATATCCTCCAGGA;SOR=0.814;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=141;TCF=74;TCR=67;TR=44;WE=17436944;WS=17436926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,43:0.30:144
chr11	17452492	rs1799857	G	A	4062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=85;PP=2965;SC=AGAAGCTGACGTGGCCCACGA;SOR=1.703;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=38;TCR=85;TR=123;WE=17452500;WS=17452482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr11	17452603	rs8192694	T	G	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=363;ReadPosRankSum=-2.300;SC=GAGAGGGCTGTCAGGGAGCAG;SOR=0.389;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=18;WE=17452611;WS=17452593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,21:0.41:51
chr11	17496516	rs1048099	A	G	1670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.022;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=51;PP=1264;ReadPosRankSum=1.408;SC=GGTTGTGCCCAGGGAAATGAA;SOR=0.324;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=274;TCF=90;TCR=184;TR=84;WE=17496524;WS=17496506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,88:0.31:282
chr11	17498057	rs77889556	G	A	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=179;ReadPosRankSum=0.677;SC=GGGACCCCGGGAACGAGGCGG;SOR=0.723;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=54;TCF=48;TCR=6;TR=15;WE=17498065;WS=17498047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,14:0.27:51
chr11	17517235	rs10832795	A	G	4463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=87;PP=2965;SC=CTATATATACAGAGCAGAGCA;SOR=1.007;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=62;TCR=88;TR=149;WE=17517243;WS=17517225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr11	17517381	rs10530940	CAT	C	994.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=20;PP=886;SC=TTCTCCAAGACATGTGTAGAG;SOR=4.091;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=21;WE=17517390;WS=17517371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	17517407	rs1859824	G	C	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.72;NF=3;NR=12;PP=372;SC=ATTCTGCTGGGCACGGGGAGC;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=17517415;WS=17517397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	17519742	rs1064074	C	G	4720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-9.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=717;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.576;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=155;NR=85;PP=2962;ReadPosRankSum=1.844;SC=GCAGGGCAGCCTCAGCCTCAG;SOR=0.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=704;TCF=451;TCR=253;TR=240;WE=17519750;WS=17519732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:466,245:0.34:711
chr11	17522638	rs10832796	G	A	4206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=46;PP=2965;SC=CAGCAGAAACGACCACCTTCC;SOR=1.523;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=84;TCR=46;TR=130;WE=17522646;WS=17522628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr11	17522810	rs2072234	T	C	2794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=66;PP=2352;SC=AGCCATGGGGTCACCGGCAGT;SOR=2.948;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=83;TCF=16;TCR=67;TR=82;WE=17522818;WS=17522800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	17547806	rs56114136	C	T	1078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=2;PP=931;ReadPosRankSum=-0.945;SC=AAGGTTTCCTCGGAAGTGGCA;SOR=0.867;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=56;TCF=53;TCR=3;TR=39;WE=17547814;WS=17547796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,38:0.64:59
chr11	17548015	rs6486378	C	T	7496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.98;NF=95;NR=136;PP=2965;SC=AGCAGAATCACGGAGTGTCCA;SOR=1.072;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=232;TCF=95;TCR=137;TR=231;WE=17548023;WS=17548005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr11	17548401	rs5789990	CG	C	7551.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=113;PP=2957;SC=TAGCGAGAGACGTTTGAGGAA;SOR=1.203;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=172;TCF=59;TCR=113;TR=172;WE=17548409;WS=17548391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr11	17548692	.	CATGGAGTACTGCCCTGCTCCCCCGCCCTCCCTCCCTCCCACCGTT	C	888.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.18;SOR=4.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	17548704	.	C	A	118	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=28;MQ=49.63;NF=5;NR=0;PP=118;QD=30.5542425094;SC=TGGAGTACTGCCCTGCTCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=17548712;WS=17548694;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	17548737	.	T	C	698	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=58.3;NF=25;NR=2;PP=698;QD=27.1396745388;SC=CTCCCACCGTTATGGAGTACT;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=17548745;WS=17548727;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	17553105	rs2041027	G	A	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=38;PP=1185;SC=GAGATGCCGGGAATGCCTGGA;SOR=3.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=45;WE=17553113;WS=17553095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	17554910	rs5789992	A	ACC	1124.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.02;MQRankSum=1.680;QD=12.36;ReadPosRankSum=-1.759;SOR=0.573;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,57:0.63:91
chr11	17554911	.	C	CCA	312.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=0.000;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.906;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.02;MQRankSum=-4.405;QD=3.33;ReadPosRankSum=1.855;SOR=0.524;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,29:0.31:94
chr11	17554914	rs2240489	G	C	3775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.20;QD=42.91;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	17554930	rs878546	T	C	2893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=76;PP=2503;SC=ATAGCAGACCTCAGGGAGGAG;SOR=3.258;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=14;TCR=77;TR=90;WE=17554938;WS=17554920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	17555498	rs11024319	C	A	2218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=62;PP=1941;SC=GCAGGGGGAGCGTCAGGTTAC;SOR=6.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=63;TCF=1;TCR=62;TR=63;WE=17555506;WS=17555488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	17573593	.	G	A	1975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.144;ClippingRankSum=0.000;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=49;PP=1508;ReadPosRankSum=0.985;SC=TGGGAAAGGCGGCTCCATCGG;SOR=0.707;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=263;TCF=112;TCR=151;TR=85;WE=17573601;WS=17573583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,88:0.32:274
chr11	17574588	rs4757543	T	C	8553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=179;NR=97;PP=2965;SC=CTGGATCCTGTGAAGCCTGAG;SOR=1.463;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=279;TCF=179;TCR=100;TR=276;WE=17574596;WS=17574578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr11	17580050	rs7130051	A	C	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.239;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=636;ReadPosRankSum=1.162;SC=TGGCTTTGCCAGCCCCTAGCC;SOR=0.370;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=88;TCF=56;TCR=32;TR=35;WE=17580058;WS=17580040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,36:0.40:89
chr11	17580175	rs7130190	A	T	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.012;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=852;ReadPosRankSum=0.636;SC=AGCCAGTTGTACCAGTGATCT;SOR=0.535;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=195;TCF=113;TCR=82;TR=55;WE=17580183;WS=17580165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,54:0.27:198
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chr11	17582470	rs1990180	T	C	4643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=109;NR=23;PP=2965;SC=GGCACTCACTTAGTACCTTTG;SOR=2.973;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=110;TCR=23;TR=132;WE=17582478;WS=17582460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr11	17583423	rs4757545	G	A	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=448;ReadPosRankSum=-0.456;SC=AGAGAGACTGGGACTTAGGAC;SOR=0.556;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=63;TCF=3;TCR=60;TR=22;WE=17583431;WS=17583413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,23:0.36:64
chr11	17593709	rs7106548	T	C	2117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.822;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=62;PP=1673;ReadPosRankSum=-0.016;SC=CCCGCTGGTCTCTGGCTCCCC;SOR=0.959;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=269;TCF=91;TCR=178;TR=89;WE=17593717;WS=17593699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,91:0.33:273
chr11	17594513	rs1076312	A	T	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.724;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=524;ReadPosRankSum=1.058;SC=ACATCCGTACAGCGTGTGCAC;SOR=0.121;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=67;TCF=66;TCR=1;TR=25;WE=17594529;WS=17594503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,28:0.42:66
chr11	17596313	rs4757548	G	A	1973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.620;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=37;PP=1439;ReadPosRankSum=-0.519;SC=GCGTGGCCCCGTGTGGACGTA;SOR=0.571;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=242;TCF=136;TCR=106;TR=84;WE=17596321;WS=17596303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,88:0.35:249
chr11	17598187	rs4756901	G	A	3037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FS=2.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.26;ReadPosRankSum=0.170;SOR=0.553;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:208,88:0.30:296
chr11	17598191	rs4756902	G	A	3017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=2.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.33;ReadPosRankSum=-0.716;SOR=0.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:204,88:0.30:292
chr11	17600033	rs2355466	G	A	1283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.586;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=37;PP=919;ReadPosRankSum=0.859;SC=GAGCGTGTCAGCCCGTGGCCC;SOR=0.781;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=166;TCF=69;TCR=97;TR=61;WE=17600041;WS=17600023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,65:0.37:174
chr11	17612972	rs720460	T	G	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.052;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=18;PP=1016;ReadPosRankSum=-0.308;SC=TGCCCTGTGATCTGGTCTGGG;SOR=0.429;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=201;TCF=148;TCR=53;TR=58;WE=17612980;WS=17612962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,59:0.28:209
chr11	17627613	rs7934079	G	C	3557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=92;PP=2965;SC=TGTGTCGGGCGCGGTGCTGGC;SOR=4.154;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=9;TCR=92;TR=101;WE=17627621;WS=17627603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	17631751	rs2041028	C	T	4043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=489;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.146;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=82;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.369;SC=ACGACACCCCCACAGCCCTCC;SOR=0.789;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=486;TCF=247;TCR=239;TR=172;WE=17631759;WS=17631741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:312,171:0.35:483
chr11	17632306	rs1003490	C	T	4314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-8.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=600;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.551;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=89;PP=2962;ReadPosRankSum=0.861;SC=GCCCCAGTGGCCACACCCGGC;SOR=0.750;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=585;TCF=307;TCR=278;TR=194;WE=17632314;WS=17632296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:397,197:0.33:594
chr11	17632651	rs7111528	C	T	2794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.743;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=79;PP=2038;ReadPosRankSum=0.473;SC=ACAGAGCTCACGCCTGCTACG;SOR=0.906;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=406;TCF=159;TCR=247;TR=125;WE=17632659;WS=17632641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:284,129:0.31:413
chr11	17633012	rs731783	T	C	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.668;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=32;PP=663;ReadPosRankSum=1.622;SC=TATGTGACCCTTCCCTTCATC;SOR=2.525;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=117;TCF=22;TCR=95;TR=34;WE=17633020;WS=17633002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,32:0.28:115
chr11	17653572	rs2058003	A	G	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.264;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=417;ReadPosRankSum=-0.287;SC=CAGGGAGGGGAGGAGCTGGGC;SOR=1.044;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=59;TCF=45;TCR=14;TR=22;WE=17653580;WS=17653562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr11	17655839	rs12277962	A	T	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=5.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.268;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=35;PP=1095;ReadPosRankSum=0.144;SC=GTGAGTGTCCACCTTCACTTC;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=137;TCF=54;TCR=83;TR=55;WE=17655847;WS=17655829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,54:0.40:136
chr11	17656272	rs192487134	G	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.989;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=177;ReadPosRankSum=-1.188;SC=GGTCCTGGGGGCTGGGGGGAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=8;WE=17656280;WS=17656262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr11	17656589	rs183152609	G	C	4910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.827;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=51;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.074;SC=GGCCAGGCAGGTTCCTCTCCC;SOR=0.479;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=281;TCF=205;TCR=76;TR=176;WE=17656597;WS=17656579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,184:0.64:289
chr11	17667439	rs11024357	G	C	5503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-8.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=193;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.802;SC=AATGCCACCTGGGTGCCCTAT;SOR=0.749;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=343;TCF=54;TCR=289;TR=229;WE=17667447;WS=17667429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,230:0.67:345
chr11	17742681	rs10832853	G	C	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.999;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=31;PP=815;ReadPosRankSum=-0.516;SC=CCTGTCTTTTGGATTGTCCCG;SOR=0.409;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=184;TCF=64;TCR=120;TR=53;WE=17742689;WS=17742671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,53:0.28:190
chr11	17757621	rs76929858	G	A	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.622;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=17;PP=1113;ReadPosRankSum=-0.437;SC=CGTACCGCTCGACCCTGCGCA;SOR=0.770;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=202;TCF=149;TCR=53;TR=67;WE=17757629;WS=17757611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,67:0.33:203
chr11	17899795	rs35473390	TA	T	674.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=21.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=1.429;QD=11.06;ReadPosRankSum=1.620;SOR=4.924;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,38:0.62:61
chr11	17940172	.	G	GACACACACAC	877	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MMLQ=27;MQ=58.17;NF=29;NR=0;PP=877;QD=30.3448275862;SC=AGCAGGAACAGACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=88;TCF=88;TCR=0;TR=29;WE=17940181;WS=17940164;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:59,29:0.33:88
chr11	17940200	rs74865487	T	C	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQRankSum=-3.142;QD=1.77;ReadPosRankSum=3.359;SOR=0.171;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,18:0.17:106
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chr11	17940213	rs77640161	T	A	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQRankSum=-2.875;QD=0.82;ReadPosRankSum=2.799;SOR=0.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,16:0.13:127
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chr11	18031494	rs186384857	C	T	1584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.745;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=6;PP=1356;ReadPosRankSum=1.828;SC=CTATAAATGGCCTTATGTCCA;SOR=0.439;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=76;TCF=69;TCR=7;TR=57;WE=18031502;WS=18031484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,57:0.74:77
chr11	18034592	rs3741202	G	C	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.049;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-1.131;NF=1;NR=10;PP=397;ReadPosRankSum=-1.344;SC=CGGGAGGGACGGCACGGGGGC;SOR=1.244;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=11;WE=18034613;WS=18034582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr11	18034605	rs3741201	C	G	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.031;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.143;NF=1;NR=9;PP=397;ReadPosRankSum=-1.407;SC=ACGGGGGCGGCGCCTGCCGGG;SOR=1.214;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=10;WE=18034613;WS=18034582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr11	18044304	rs211101	C	T	7164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=120;NR=103;PP=2965;SC=GGGCTGATCTCTCCCTGAAGA;SOR=0.868;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=224;TCF=120;TCR=104;TR=223;WE=18044312;WS=18044294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr11	18047255	rs1799913	G	T	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.631;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=57;PP=1174;ReadPosRankSum=0.857;SC=ATCTCTGAAAGAGAGGTACAA;SOR=0.782;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=196;TCF=44;TCR=152;TR=72;WE=18047263;WS=18047245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,73:0.37:200
chr11	18054777	rs10832874	A	G	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.007;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=2;PP=519;ReadPosRankSum=-0.254;SC=TCCAGTCTGGACAGCAGAGCA;SOR=1.320;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=99;TCF=87;TCR=12;TR=29;WE=18054785;WS=18054767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,29:0.29:100
chr11	18063977	rs623580	A	T	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=497;ReadPosRankSum=0.155;SC=CGTTGTCCTAAAGCGTGAAAA;SOR=0.666;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=19;TCR=65;TR=25;WE=18063985;WS=18063967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,25:0.29:86
chr11	18159097	.	C	G	3188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.910;ClippingRankSum=0.000;DP=388;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.297;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=84;ReadPosRankSum=0.671;SC=TGAGCGCCATCAGCACCGAGC;SOR=0.768;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=379;TCF=141;TCR=238;TR=131;WE=18159105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:251,133:0.35:384
chr11	18159169	rs2468839	A	G	10436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.038;NF=218;NR=120;PP=2965;ReadPosRankSum=0.039;SC=ACCTGTCATCAGTCATGTGTG;SOR=0.583;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=339;TCF=219;TCR=120;TR=338;WE=18159177;WS=18159159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,351:1.00:352
chr11	18159254	rs4274188	A	G	16580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=522;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=247;NR=264;PP=2965;SC=TAGTGGTGCTAATTCTGTTTG;SOR=0.740;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=513;TCF=247;TCR=266;TR=511;WE=18159262;WS=18159244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,518:1.00:518
chr11	18194827	rs2468774	C	G	4580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=607;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.554;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-15.001;NF=110;NR=89;PP=2962;ReadPosRankSum=1.180;SC=TCCCAGTCTTCGGTACAAAAC;SOR=0.790;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=591;TCF=318;TCR=273;TR=199;WE=18194835;WS=18194817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:398,206:0.34:604
chr11	18194878	rs2445180	T	G	4904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=631;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.888;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-13.753;NF=81;NR=123;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.647;SC=CTTGCTACAATCAGACCCTGA;SOR=0.875;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=615;TCF=263;TCR=352;TR=204;WE=18194886;WS=18194868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:419,210:0.33:629
chr11	18194964	rs1869788	A	G	3631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=11.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=438;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.721;NF=74;NR=70;PP=2837;ReadPosRankSum=-0.524;SC=CTCCTGGGCTACCGCATGCGC;SOR=0.714;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=427;TCF=218;TCR=209;TR=144;WE=18194972;WS=18194954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:291,146:0.33:437
chr11	18195051	rs2445179	T	C	16767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=560;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=295;NR=253;PP=2965;SC=ATTATACGTTTGCCATTACGC;SOR=0.839;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=548;TCF=295;TCR=253;TR=548;WE=18195059;WS=18195041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,556:1.00:556
chr11	18195348	rs11024532	C	T	6657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.632;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.312;NF=78;NR=160;PP=2962;ReadPosRankSum=0.315;SC=ATCCCAGTCGCGTGGCTGATT;SOR=0.896;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=374;TCF=135;TCR=239;TR=238;WE=18195356;WS=18195338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,244:0.64:382
chr11	18195448	rs4630269	C	T	1414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=7.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.108;NF=17;NR=42;PP=1071;ReadPosRankSum=-0.484;SC=CCAGGCTGTACGTGACCATCC;SOR=0.715;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=204;TCF=66;TCR=138;TR=59;WE=18195456;WS=18195438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,64:0.29:220
chr11	18210480	rs2445150	T	C	4030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=89;PP=2965;SC=CTGACGGCGGTGGCGGGGGGT;SOR=1.448;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=49;TCR=89;TR=138;WE=18210488;WS=18210470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr11	18210580	rs2124372	C	T	2227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.447;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.97;MQRankSum=-0.761;NF=53;NR=26;PP=1707;ReadPosRankSum=0.507;SC=GCTGAAGCCGCTGCCCGCGGA;SOR=0.238;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=129;TCF=93;TCR=36;TR=79;WE=18210588;WS=18210570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,83:0.62:133
chr11	18210814	rs7936382	GC	AA	3208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.996;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=38;PP=2944;ReadPosRankSum=1.152;SC=CAAAGTAGGGGCCACGCTGGC;SOR=0.221;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=121;TCF=46;TCR=75;TR=68;WE=18210823;WS=18210804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,80:0.62:128
chr11	18210849	rs6486412	C	T	2274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.149;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=33;PP=1789;ReadPosRankSum=1.151;SC=AAAGAGGCCTCCGCTTCATCC;SOR=0.976;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=130;TCF=72;TCR=58;TR=78;WE=18210857;WS=18210839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,82:0.61:135
chr11	18231188	rs56386150	T	TA	750.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=1.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-2.090;QD=6.53;ReadPosRankSum=0.448;SOR=1.125;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,45:0.39:115
chr11	18231289	rs4757627	C	A	5718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.825;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=90;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.846;SC=CTAACATCTTCGAAACAAGAT;SOR=0.765;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=345;TCF=192;TCR=153;TR=210;WE=18231297;WS=18231279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,214:0.60:355
chr11	18231749	rs2468789	T	G	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=27;PP=737;SC=TTTATCGAGGTTTGGTGCCCA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=18231757;WS=18231739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	18253176	rs2460827	C	T	6100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=95;PP=2965;SC=AAATAAATAGCAGTCTATTAA;SOR=0.774;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=107;TCR=97;TR=201;WE=18253184;WS=18253166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr11	18261584	rs75322055	A	T	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=39;PP=1006;ReadPosRankSum=-0.005;SC=GGGGAAAATCACAGGAGGGTG;SOR=0.963;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=72;TCF=3;TCR=69;TR=41;WE=18261592;WS=18261574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,43:0.56:77
chr11	18267027	rs2468844	C	T	10509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=206;NR=138;PP=2965;SC=CTCCGCACCACGGCCTGTGAG;SOR=1.121;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=344;TCF=206;TCR=138;TR=344;WE=18267035;WS=18267017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,349:1.00:349
chr11	18267135	rs56373142	C	T	6396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.036;NF=35;NR=158;PP=2965;ReadPosRankSum=1.681;SC=CCATTCTCCCCGTTCCAAGGG;SOR=1.713;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=195;TCF=35;TCR=160;TR=193;WE=18267143;WS=18267125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,198:0.99:199
chr11	18267188	rs58546509	GA	G	3500.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=93;PP=2966;SC=AAGGAGGAGTGAAAACACTGA;SOR=4.215;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=104;TCF=8;TCR=96;TR=101;WE=18267196;WS=18267178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr11	18267373	rs1671927	C	T	3090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=4.033;NF=102;NR=3;PP=2830;ReadPosRankSum=4.154;SC=CTAACTTCTCCACAAGGAGCT;SOR=2.468;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=130;TCF=127;TCR=3;TR=105;WE=18267381;WS=18267363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,94:0.94:100
chr11	18267471	rs1136766	A	G	3472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=8.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.61;MQRankSum=-3.919;QD=16.62;ReadPosRankSum=-0.189;SOR=1.248;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,137:0.66:209
chr11	18267651	rs80208174	A	C	2461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.9593;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=74;PP=2087;SC=GACTCCAACAACACCTTAGAG;SOR=3.797;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=92;TCF=8;TCR=84;TR=82;WE=18267659;WS=18267641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	18267702	rs4757631	T	A	1642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=54;PP=1364;SC=ACTTCAAGCTTTCAGCCTGTG;SOR=7.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=0;TCR=57;TR=54;WE=18267710;WS=18267692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	18290880	rs28720026	C	G	2059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.32;QD=34.91;SOR=1.532;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	18312953	rs4757638	G	A	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.77;ReadPosRankSum=-0.466;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,16:0.24:66
chr11	18314579	rs10665418	C	CTT	5984.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=146;PP=2979;SC=GGGATCAGAGCTTTTTTTGAG;SOR=10.048;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=178;TCF=0;TCR=178;TR=146;WE=18314587;WS=18314569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr11	18317458	rs2305564	T	A	863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-6.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=0;PP=657;ReadPosRankSum=-0.444;SC=TTCCTTTTTCTCATTTTCCAT;SOR=0.920;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=88;TCF=87;TCR=1;TR=32;WE=18317466;WS=18317448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,34:0.37:91
chr11	18317699	rs2305565	C	T	1045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-7.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=43;PP=853;ReadPosRankSum=-0.526;SC=AAAAAAGAAACAAAATCTAAT;SOR=0.649;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=121;TCF=7;TCR=114;TR=45;WE=18317707;WS=18317689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,44:0.36:122
chr11	18318287	rs11024607	G	A	2790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.886;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=12;PP=2303;ReadPosRankSum=0.172;SC=CCTGGTAACAGGAGCTCGTGG;SOR=0.865;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=157;TCF=136;TCR=21;TR=98;WE=18318295;WS=18318277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,99:0.62:160
chr11	18319180	rs7128017	G	T	2239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.485;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=29;PP=1627;ReadPosRankSum=1.584;SC=AATTCTTCCAGTTGAGAAATT;SOR=0.464;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=116;TCF=73;TCR=43;TR=75;WE=18319188;WS=18319170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,81:0.65:125
chr11	18319279	rs7128146	G	T	1523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.881;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=44;PP=1205;ReadPosRankSum=-0.282;SC=TAAAACAACAGCGCAATGGAA;SOR=0.902;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=100;TCF=22;TCR=78;TR=56;WE=18319287;WS=18319269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,57:0.54:106
chr11	18327648	rs7122032	T	G	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=8;PP=1044;ReadPosRankSum=1.082;SC=TAGAAGCTCTTCAAACAATCC;SOR=0.629;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=66;TCF=55;TCR=11;TR=44;WE=18327656;WS=18327638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,47:0.69:68
chr11	18327684	rs1140047	G	T	3429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=25;PP=2770;SC=ATCGTTACCTGAGAGTAATCA;SOR=2.415;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=104;TCF=79;TCR=25;TR=103;WE=18327692;WS=18327674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr11	18330385	rs35952141	G	GA	4565.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=127;NR=13;PP=2983;SC=AAAAGAAAAAGAAAAAAAATC;SOR=4.314;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=167;TCF=149;TCR=18;TR=140;WE=18330393;WS=18330375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr11	18354877	rs4150561	T	C	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=39;PP=1167;SC=AAAAATCAACTATGTAGAAAT;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=39;WE=18354885;WS=18354867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	18357180	rs4150579	A	G	1915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=0;PP=1645;SC=AAGCATCAGTATTGGAATAGG;SOR=8.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=53;WE=18357188;WS=18357170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	18357270	rs4150581	A	G	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-6.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.634;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=10;PP=849;ReadPosRankSum=-0.799;SC=TGTGAGTGTCATCATCTAACT;SOR=1.176;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=187;TCF=148;TCR=39;TR=63;WE=18357278;WS=18357260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,65:0.34:193
chr11	18357624	rs200088497	TTTTTG	T	961.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.56;MQRankSum=2.220;QD=22.37;ReadPosRankSum=0.529;SOR=0.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr11	18359983	rs111946613	ATGTT	A	730.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=14;PP=787;SC=TATTATTATTATGTTTGTTTG;SOR=2.712;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=16;WE=18359994;WS=18359973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	18379393	rs4150660	GA	G	1622.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.696;NF=61;NR=1;PP=2039;ReadPosRankSum=0.106;SC=TAAACAAAAGGAAAAGCACTT;SOR=0.765;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=96;TCF=94;TCR=2;TR=62;WE=18379401;WS=18379383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,60:0.69:87
chr11	18379629	rs4150661	C	A	11313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=130;NR=213;PP=2965;SC=CTGCCTAAATCAGCTTTAAAA;SOR=1.268;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=343;TCF=130;TCR=213;TR=343;WE=18379637;WS=18379619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,354:1.00:354
chr11	18422113	rs5790035	C	CA	572.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=731;SC=GCTTGGGGATCAAAAATTTGA;SOR=4.407;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=20;WE=18422121;WS=18422103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	18424451	rs5030621	C	T	8433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=133;NR=134;PP=2965;SC=TTATTGGAAGCGGTTGCAATC;SOR=0.763;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=268;TCF=134;TCR=134;TR=267;WE=18424459;WS=18424441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr11	18424487	rs4820	A	G	8482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=129;NR=122;PP=2965;SC=TCCGTTACCTAATGGGGGAAA;SOR=0.750;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=252;TCF=129;TCR=123;TR=251;WE=18424495;WS=18424477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr11	18424590	rs3758680	T	A	7558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=80;NR=151;PP=2965;SC=TTTTTGTTTTTGAAAAGATTA;SOR=1.483;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=231;TCF=80;TCR=151;TR=231;WE=18424598;WS=18424580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr11	18426626	.	A	G	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.096;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=433;ReadPosRankSum=0.165;SC=TAAGGATGCTATGTTATCTTG;SOR=0.910;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=19;WE=18426634;WS=18426616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr11	18426656	rs6486424	A	T	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.89;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	18426796	rs6486425	T	G	2511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=37;PP=2089;SC=GATTGTCATGTTTTTGCTGTT;SOR=0.772;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=35;TCR=37;TR=72;WE=18426804;WS=18426786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr11	18428552	rs56345574	C	CA	1276.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.482;NF=67;NR=2;PP=1518;ReadPosRankSum=-1.937;SC=GACTCTGCCTCAAAAAAAAAT;SOR=3.877;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=114;TCF=112;TCR=2;TR=69;WE=18428572;WS=18428542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:7,54:0.89:61
chr11	18428637	rs113340412	A	ATTT,ATTTT	10554.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.88;QD=48.20;SOR=1.475;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,73,145:0.33,0.66:219
chr11	18434536	rs10766477	T	C	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.59;QD=33.89;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	18456235	rs4757664	A	T	2487.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=5;PP=2596;ReadPosRankSum=1.410;SC=GAAAAAAAAAATTTTTTTAAG;SOR=3.940;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=87;TCR=5;TR=91;WE=18456243;WS=18456225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,86:0.99:87
chr11	18467821	rs2658565	T	C	9724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=145;NR=149;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.406;SC=TGTGATGGATTTGGTAGGATC;SOR=0.250;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=296;TCF=145;TCR=151;TR=294;WE=18467829;WS=18467811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,308:1.00:309
chr11	18487425	rs2658563	A	G	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.943;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=465;ReadPosRankSum=1.122;SC=TCATTACATGAGTATACTGTG;SOR=0.293;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=88;TCF=3;TCR=85;TR=26;WE=18487433;WS=18487415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,29:0.31:95
chr11	18503159	rs2279900	C	T	4014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.105;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=43;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.289;SC=AATCTTGGAACGTAAAATGAA;SOR=1.519;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=260;TCF=165;TCR=95;TR=148;WE=18503167;WS=18503149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,155:0.57:270
chr11	18505632	rs2279902	G	A	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=45;PP=1196;ReadPosRankSum=-1.114;SC=GCAGGAAACAGAGGCAAAAAA;SOR=0.651;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=68;TCF=1;TCR=67;TR=46;WE=18505640;WS=18505622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,46:0.67:69
chr11	18531028	rs2292176	C	A	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.450;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=351;ReadPosRankSum=0.054;SC=TATTTTTTTACAAAGGTTTCT;SOR=0.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=46;TCR=2;TR=19;WE=18531036;WS=18531018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr11	18536215	rs12574333	G	T	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=3;PP=703;ReadPosRankSum=0.010;SC=AGAACACTATGAATACTTACG;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=49;TCF=45;TCR=4;TR=33;WE=18536223;WS=18536205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,37:0.69:54
chr11	18537800	rs7942548	CA	TG	1553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=27;PP=1579;SC=TAAAATTCATCATTATCCTTG;SOR=4.294;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=29;WE=18537823;WS=18537790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	18537815	rs58515919	G	C	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.058;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=123;ReadPosRankSum=-1.411;SC=TCCTTGAAAGGGGCTGACCTG;SOR=0.089;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=11;WE=18537823;WS=18537790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr11	18548195	.	C	G	1025	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=33;NR=5;PP=1025;QD=27.8887161197;SC=CTGAGGAGGTCGCTAAGGACT;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=38;WE=18548203;WS=18548194;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	18548546	rs2292179	A	G	1874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=56;PP=1426;ReadPosRankSum=-0.784;SC=GCAAGGGTGGACACCGTGTGG;SOR=0.646;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=6;TCR=86;TR=60;WE=18548554;WS=18548536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,65:0.66:98
chr11	18548574	rs1857908	T	C	1673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=62;PP=1332;SC=AGGGGCCTGGTGGGGTGGGTT;SOR=6.184;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=2;TCR=62;TR=64;WE=18548582;WS=18548564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	18555901	rs56151250	C	G	1912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.278;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=12;PP=1515;ReadPosRankSum=0.205;SC=ATACAGAATGCACTTTCTTCT;SOR=0.448;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=104;TCF=88;TCR=16;TR=66;WE=18555909;WS=18555891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,68:0.64:107
chr11	18555949	rs55999230	T	C	2438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=32;PP=1774;ReadPosRankSum=-0.753;SC=CAGCTACTGATAGTCCAACAG;SOR=0.617;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=149;TCF=98;TCR=51;TR=91;WE=18555957;WS=18555939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,96:0.61:157
chr11	18557650	rs56104322	C	G	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.897;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=261;ReadPosRankSum=-0.395;SC=CACTGCACTCCAGCCTGGTGA;SOR=1.551;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=57;TCF=34;TCR=23;TR=17;WE=18557658;WS=18557640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,18:0.31:58
chr11	18586344	rs3832729	C	CAT	7646.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=142;NR=8;PP=2957;SC=GGTTTTCCCACGACAAAATGA;SOR=5.347;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=162;TCF=153;TCR=9;TR=150;WE=18586352;WS=18586334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr11	18591645	rs2305166	A	G	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=329;ReadPosRankSum=-1.681;SC=CAAAGACTACATGAAGAATAT;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=19;WE=18591653;WS=18591638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr11	18591715	rs11445836	T	TA	1392.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=6.871;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=0.000;QD=13.52;ReadPosRankSum=-1.032;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,78:0.76:103
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chr11	18610041	rs61884724	C	T	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.928;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=553;ReadPosRankSum=-0.117;SC=AGACCAGCCGCCCCGGCTCCA;SOR=2.338;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=26;WE=18610049;WS=18610031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr11	18628418	rs17579600	T	C	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.889;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.415;NF=2;NR=25;PP=647;ReadPosRankSum=0.643;SC=CCACATTCTTTTTTTTTTGAC;SOR=0.207;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=27;WE=18628426;WS=18628408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr11	18632984	rs10128711	T	C	1626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FS=1.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.26;ReadPosRankSum=0.586;SOR=0.566;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:230,79:0.26:309
chr11	18633971	rs11605097	G	A	2488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.878;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=57;PP=1804;ReadPosRankSum=-1.404;SC=CATCATCATCGTCATCTTCCT;SOR=0.637;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=310;TCF=148;TCR=162;TR=112;WE=18633979;WS=18633961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,116:0.36:321
chr11	18720304	rs7946446	C	G	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=8;PP=941;SC=GACAGAACCCCGGCGCCGGGC;SOR=2.985;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=47;WE=18720312;WS=18720294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	18728650	rs2289965	T	C	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.181;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=29;PP=986;ReadPosRankSum=-0.444;SC=TTCATGATGATGTAGTGAGCC;SOR=0.811;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=197;TCF=103;TCR=94;TR=64;WE=18728658;WS=18728640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,62:0.30:205
chr11	18730895	rs11024768	A	G	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=449;ReadPosRankSum=0.443;SC=TGGAGGTACAATGTTGGGCAT;SOR=1.692;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=18;WE=18730903;WS=18730889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr11	18731004	rs72880717	C	G	2022.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-5.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.009;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=17;PP=1621;ReadPosRankSum=1.047;SC=CATTCACAGCCCGGATTCGGA;SOR=1.442;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=146;TCF=110;TCR=36;TR=86;WE=18731012;WS=18730994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,87:0.60:146
chr11	18732386	rs56412752	A	C	2749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.703;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=75;PP=2169;ReadPosRankSum=-0.883;SC=CTGTGGGGGAAAGAGAGAGTG;SOR=1.235;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=160;TCF=40;TCR=120;TR=96;WE=18732394;WS=18732376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,101:0.59:170
chr11	18732426	rs4237728	T	G	4156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=107;PP=2965;SC=CATGTAGATATTTGCCCACCT;SOR=3.365;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=125;TCF=17;TCR=108;TR=124;WE=18732434;WS=18732416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr11	18733521	rs7128042	C	T	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=311;ReadPosRankSum=1.073;SC=ATGAGACAGCCAGAGAGATGT;SOR=0.212;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=17;WE=18733529;WS=18733514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,17:0.32:53
chr11	18733579	rs10832972	T	C	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-5.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=4;PP=933;ReadPosRankSum=0.085;SC=GCTTAAGGTCTCCATGCTGAC;SOR=0.685;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=126;TCF=115;TCR=11;TR=46;WE=18733587;WS=18733569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,47:0.38:124
chr11	18735321	rs10766493	A	C	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=228;ReadPosRankSum=2.331;SC=CTGGCCTCCTACTCAGCCTGC;SOR=0.481;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=10;WE=18735329;WS=18735311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr11	18735396	rs10741752	G	T	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=7.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.45;ReadPosRankSum=-1.867;SOR=0.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,21:0.26:82
chr11	18735753	rs7106673	G	A	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.572;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=22;PP=1260;ReadPosRankSum=0.256;SC=CCCATGGGGCGGGGGAGAAGC;SOR=0.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=213;TCF=145;TCR=68;TR=69;WE=18735761;WS=18735743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,70:0.32:221
chr11	18735947	rs7125943	T	C	2274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=411;ExcessHet=3.0103;FS=2.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.56;ReadPosRankSum=-1.337;SOR=0.499;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:293,116:0.28:409
chr11	18736247	rs4265581	G	A	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=31;PP=616;ReadPosRankSum=0.506;SC=GGCTGGTAGCGATGGTCATGG;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=94;TCF=0;TCR=94;TR=31;WE=18736255;WS=18736237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,34:0.35:98
chr11	18736942	rs3887900	G	A	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=444;ReadPosRankSum=0.105;SC=CAGGGTCAGGGGGATTGGTCA;SOR=2.484;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=20;WE=18736950;WS=18736932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr11	18737095	rs4424652	C	T	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.180;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=29;PP=1046;ReadPosRankSum=0.614;SC=CAGCTCTGCTCGCTTGCCCTC;SOR=0.579;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=202;TCF=116;TCR=86;TR=62;WE=18737103;WS=18737085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,64:0.31:208
chr11	18738281	rs10766494	C	T	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.812;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=0;PP=861;ReadPosRankSum=0.015;SC=TCACGGTCAACAGTGAGCTGG;SOR=1.552;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=114;TCF=112;TCR=2;TR=44;WE=18738289;WS=18738271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,44:0.38:115
chr11	18738329	rs61886891	C	T	4209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=23;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.054;SC=GCAGAGAACTCGCCGCTGTCA;SOR=0.875;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=232;TCF=195;TCR=37;TR=147;WE=18738337;WS=18738319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,150:0.63:238
chr11	18738575	rs61886892	A	C	4120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=7.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.231;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=107;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.556;SC=AGTGGTAGTCATTGGGCTGGT;SOR=0.332;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=187;TCF=30;TCR=157;TR=130;WE=18738583;WS=18738565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,138:0.71:195
chr11	18738603	rs10766495	G	A	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.739;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=43;PP=815;ReadPosRankSum=-1.878;SC=GAGGGGTGGAGTGGTGAAGAG;SOR=2.636;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=131;TCF=17;TCR=114;TR=45;WE=18738611;WS=18738593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,46:0.34:137
chr11	18739568	rs116943882	G	A	1958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.694;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=31;PP=1538;ReadPosRankSum=0.882;SC=CTAATAACCAGCATGTACTTG;SOR=0.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=118;TCF=64;TCR=54;TR=69;WE=18739576;WS=18739558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,71:0.60:119
chr11	18741847	rs11024770	G	C	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=3.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.97;ReadPosRankSum=-0.874;SOR=0.288;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,19:0.24:78
chr11	18743180	rs10832975	C	G	11144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=246;PP=2965;SC=TGGGGTTTGGCGTTCCCCTGC;SOR=1.921;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=344;TCF=97;TCR=247;TR=343;WE=18743188;WS=18743170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,353:1.00:353
chr11	18743396	rs66751057	T	TG	1083.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.388;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.879;NF=37;NR=5;PP=1405;ReadPosRankSum=0.428;SC=GGACGGAGGGTGGGGGCACTC;SOR=1.387;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=92;TCF=80;TCR=12;TR=42;WE=18743404;WS=18743386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,43:0.54:79
chr11	18751041	rs1550870	C	T	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=373;ReadPosRankSum=1.654;SC=GGATGTCCACCACACCCTCCT;SOR=0.612;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=51;TCF=28;TCR=23;TR=20;WE=18751049;WS=18751031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
chr11	18754679	rs6483524	A	G	1908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.837;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=5;PP=1496;ReadPosRankSum=1.852;SC=CGGAGTGAACACCGCCGACCT;SOR=1.260;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=122;TCF=112;TCR=10;TR=79;WE=18754687;WS=18754669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,81:0.64:126
chr11	18763698	rs4757706	A	G	1595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=1;PP=1369;SC=GCTAAGCTATAAGGCCAGCTC;SOR=7.701;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=46;WE=18763706;WS=18763688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	18764026	rs4757707	G	C	2008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.363;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=76;PP=1539;ReadPosRankSum=1.593;SC=GGTGGCTCTGGGGGTGTCCTC;SOR=1.431;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=120;TCF=12;TCR=108;TR=83;WE=18764034;WS=18764016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,85:0.69:124
chr11	18764113	rs2278732	G	A	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.723;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=570;ReadPosRankSum=-0.664;SC=TGTTCCTGGAGTGCCCATGGG;SOR=0.094;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=26;WE=18764121;WS=18764103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr11	18771041	rs2028897	G	C	2646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.348;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=97;PP=2224;ReadPosRankSum=0.695;SC=AGGGTGGGGGGCAGAACCTTG;SOR=0.429;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=167;TCF=16;TCR=151;TR=109;WE=18771049;WS=18771031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,110:0.67:165
chr11	18793360	rs4075664	T	C	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=176;ReadPosRankSum=0.582;SC=GCTGGTTTCATGGAAAAGGAA;SOR=0.056;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=11;WE=18793368;WS=18793351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr11	18793399	rs4075663	G	A	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.622;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=2;PP=876;ReadPosRankSum=0.690;SC=CATGAGAATGGGTCACGTGTC;SOR=0.246;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=54;TCF=52;TCR=2;TR=37;WE=18793407;WS=18793389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,40:0.70:57
chr11	18793685	rs77383503	C	T	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.273;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=28;PP=711;ReadPosRankSum=0.409;SC=CAACAATTTGCTTTCAGGTAG;SOR=1.742;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=57;TCF=9;TCR=48;TR=31;WE=18793693;WS=18793675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr11	18955726	rs188512916	A	G	3695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.77;MQRankSum=-12.074;QD=16.43;ReadPosRankSum=-4.783;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,100:0.44:225
chr11	18955734	rs200061528	T	C	4112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.39;MQRankSum=-13.107;QD=18.78;ReadPosRankSum=-6.743;SOR=0.806;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,93:0.42:219
chr11	18955753	rs147288525	CC	AA	6530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=4.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-8.910;NF=108;NR=37;PP=2944;ReadPosRankSum=-4.512;SC=CCAGGCTGGACCCACAGAGAA;SOR=0.842;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=340;TCF=250;TCR=90;TR=145;WE=18955762;WS=18955743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,164:0.49:333
chr11	18956194	rs2014931	T	C	1910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.245;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.342;NF=54;NR=36;PP=1592;ReadPosRankSum=1.404;SC=AGAGCACAACTGCGTTTCCTG;SOR=0.544;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=278;TCF=175;TCR=103;TR=90;WE=18956202;WS=18956184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,88:0.31:285
chr11	18978501	rs12363322	C	A	10592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=211;NR=125;PP=2965;SC=AGCAAGGAGTCTCCTCACGTC;SOR=1.300;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=336;TCF=211;TCR=125;TR=336;WE=18978509;WS=18978491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,343:1.00:343
chr11	18994005	rs7114481	T	C	7807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=132;PP=2965;SC=TGAGGCGGAATGTATAACGTG;SOR=0.724;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=261;TCF=129;TCR=132;TR=261;WE=18994013;WS=18993995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr11	19077755	rs11024969	A	C	2850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.222;SOR=0.683;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:183,84:0.31:267
chr11	19077765	rs10833049	T	C	2887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FS=2.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.691;QD=11.06;ReadPosRankSum=1.274;SOR=0.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:178,83:0.32:261
chr11	19077904	rs11024970	T	G	1875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.699;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=49;PP=1424;ReadPosRankSum=1.244;SC=TCATTTCCATTCACTGTTGTA;SOR=0.579;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=232;TCF=89;TCR=143;TR=80;WE=19077912;WS=19077894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,82:0.35:237
chr11	19078022	rs10833050	T	C	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=404;ReadPosRankSum=0.786;SC=TTCACTGATTTTCATGACCAG;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=1;TCR=60;TR=19;WE=19078030;WS=19078012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,19:0.31:62
chr11	19167850	rs2271001	A	G	2752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FS=6.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.08;ReadPosRankSum=-0.692;SOR=0.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:270,119:0.31:389
chr11	19169319	.	T	C	375.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.002;ClippingRankSum=0.000;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=40.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.90;ReadPosRankSum=-6.025;SOR=1.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:165,33:0.17:198
chr11	19186826	rs2042687	A	T	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=279;ReadPosRankSum=0.295;SC=GGGCCCATGCATCGTTATTAT;SOR=0.382;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=14;WE=19186834;WS=19186816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr11	19188122	rs2242458	A	G	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=458;SC=GTTAGTTCTCAGTACTTTAGG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=16;WE=19188130;WS=19188112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	19191851	rs7114038	A	G	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=68;ReadPosRankSum=1.444;SC=GATCTGTGCCATACTTTCTCT;SOR=0.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=10;WE=19191859;WS=19191841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,10:0.21:47
chr11	19194141	rs7111850	T	C	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=21;NR=0;PP=629;SC=TTTTTCTTTGTCCCTTTTCAA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=19194149;WS=19194131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	19197365	rs78603780	G	A	4214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.930;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=60;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.499;SC=TTTTTTCTTGGCAGTCTTGGA;SOR=0.771;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=293;TCF=187;TCR=106;TR=172;WE=19197373;WS=19197355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,170:0.58:295
chr11	19204403	rs45549043	A	G	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=575;ReadPosRankSum=0.497;SC=CATCCTTTTGATAGATTTATG;SOR=1.038;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=25;WE=19204411;WS=19204393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,27:0.75:36
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chr11	19735987	rs2278132	A	G	1760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.996;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=58;PP=1375;ReadPosRankSum=-0.722;SC=AGAAAAGGGGATCGCGGGTGG;SOR=0.458;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=290;TCF=87;TCR=203;TR=87;WE=19735995;WS=19735977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:204,85:0.29:289
chr11	19798951	rs200083334	C	CT	1088.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=7.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.41;MQRankSum=1.173;QD=11.22;ReadPosRankSum=1.233;SOR=0.077;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,55:0.57:97
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chr11	19854088	rs6483617	G	A	4653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=61;PP=2965;ReadPosRankSum=0.952;SC=CGTCTCATCAGGGATCTCCAG;SOR=0.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=82;TCR=61;TR=142;WE=19854096;WS=19854078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,148:0.99:149
chr11	19890705	rs11025302	C	T	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=672;ReadPosRankSum=-0.608;SC=TTGAGGATGCCAAGGACTCAC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=27;WE=19890713;WS=19890695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr11	19901632	rs11025310	G	A	3010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.540;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=80;PP=2468;ReadPosRankSum=-1.102;SC=ACCAGCCAGCGCCACATCAGC;SOR=0.523;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=163;TCF=41;TCR=122;TR=110;WE=19901640;WS=19901622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,110:0.68:162
chr11	19955500	rs1372989	A	G	10914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=135;NR=180;PP=2965;SC=CAGGAATGAAAAGCATGCCCG;SOR=0.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=316;TCF=135;TCR=181;TR=315;WE=19955508;WS=19955490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,328:1.00:328
chr11	19961457	rs11423145	C	CT	1061.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.079;NF=0;NR=42;PP=543;ReadPosRankSum=0.578;SC=AACTTTCTTTCTTTTTTTTTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=1;TCR=59;TR=42;WE=19961465;WS=19961447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,44:0.96:46
chr11	19970507	rs12284679	C	T	6286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=9.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.088;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=160;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.181;SC=GCCATGTGGACGTCTCAGACA;SOR=0.867;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=365;TCF=109;TCR=256;TR=223;WE=19970515;WS=19970497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,229:0.61:375
chr11	19970558	rs2585773	T	C	8140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=235;PP=2965;SC=TCAGCATGGATGCCCCCGGCT;SOR=3.025;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=285;TCF=49;TCR=236;TR=284;WE=19970566;WS=19970548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr11	19970579	rs2707084	C	T	7366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=196;PP=2965;SC=ACATGAGCGACGGGGATGTTC;SOR=3.671;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=225;TCF=28;TCR=197;TR=224;WE=19970587;WS=19970569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr11	20005802	rs6483629	G	A	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=-0.830;QD=5.11;ReadPosRankSum=1.301;SOR=0.386;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,40:0.26:154
chr11	20005845	rs35295670	GC	G	1543.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=4.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.59;MQRankSum=1.863;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.261;SOR=2.372;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,52:0.60:86
chr11	20005857	rs7940346	G	T	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=4.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=-1.372;QD=9.46;ReadPosRankSum=0.571;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,30:0.38:78
chr11	20005870	rs2568116	T	C	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=4.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.60;MQRankSum=1.386;QD=18.98;ReadPosRankSum=-1.569;SOR=2.570;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,32:0.63:51
chr11	20057371	rs6483634	T	G	4267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=109;NR=10;PP=2965;SC=CACATCTGAGTCAAGAGAGCT;SOR=4.514;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=109;TCR=10;TR=119;WE=20057379;WS=20057361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr11	20065673	rs3802799	G	T	4756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.452;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=85;PP=2962;ReadPosRankSum=0.153;SC=TGTCTGACGAGTCCGACAAAA;SOR=0.745;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=280;TCF=146;TCR=134;TR=178;WE=20065681;WS=20065663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,178:0.64:280
chr11	20065779	rs3802800	C	G	6155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=146;PP=2965;SC=AAGGACGAAGCCTTCAGCCCC;SOR=2.560;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=44;TCR=146;TR=190;WE=20065787;WS=20065769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr11	20067064	rs7125647	C	T	19413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=647;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=346;NR=281;PP=2965;ReadPosRankSum=1.581;SC=ACCAAACAGACAAGGAGAAAG;SOR=0.895;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=630;TCF=348;TCR=282;TR=627;WE=20067072;WS=20067054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,639:1.00:641
chr11	20070225	rs12283929	C	G	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=614;ReadPosRankSum=-0.751;SC=CAGTCCGGTGCCCCTTGGCAC;SOR=0.582;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=99;TCR=21;TR=34;WE=20070233;WS=20070215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,38:0.31:124
chr11	20072779	rs6483635	C	T	4672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.62;SOR=2.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr11	20089792	rs1442711	G	C	5249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=653;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=110;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.960;SC=TCCTCTTTAAGTATTGTCAAT;SOR=0.724;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=628;TCF=327;TCR=301;TR=226;WE=20089800;WS=20089782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:410,236:0.37:646
chr11	20089944	rs1442710	T	C	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-9.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=55;PP=726;ReadPosRankSum=0.313;SC=TGACAGCAAATGTAAGTACAG;SOR=0.668;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=170;TCF=1;TCR=169;TR=55;WE=20089952;WS=20089934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,56:0.32:173
chr11	20089978	rs1442709	A	G	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=523;ReadPosRankSum=-1.365;SC=GCATCGGGACAGGAAGCACCA;SOR=0.633;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=92;TCF=1;TCR=91;TR=29;WE=20089986;WS=20089968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,30:0.31:96
chr11	20099112	rs4757028	A	T	7232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=141;NR=70;PP=2965;SC=ACCTTGTGGCAGCCTTTGAAC;SOR=1.516;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=141;TCR=70;TR=211;WE=20099120;WS=20099102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
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chr11	20104847	rs10657903	A	AGG	255.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=210;ReadPosRankSum=1.417;SC=TTGCTTTAATAGGACTGTGCA;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=7;WE=20104855;WS=20104837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
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chr11	20112417	rs2243624	A	C	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.312;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=31;PP=680;ReadPosRankSum=-0.805;SC=CTAGAATTTCAGAATGCATGG;SOR=0.848;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=166;TCF=73;TCR=93;TR=53;WE=20112425;WS=20112407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,53:0.31:170
chr11	20119373	rs10833241	C	T	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=32;PP=630;ReadPosRankSum=0.438;SC=CTTGTGGCCCCAGTTTTGTTT;SOR=1.101;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=89;TCF=9;TCR=80;TR=35;WE=20119381;WS=20119363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,36:0.37:97
chr11	20122392	rs2245314	C	A	4403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=130;NR=0;PP=2965;SC=GGAGAGGAATCACCTCAGGTC;SOR=9.796;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=130;TCF=130;TCR=0;TR=130;WE=20122400;WS=20122382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr11	20124914	rs2243411	A	C	11893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=413;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=179;NR=225;PP=2965;SC=GCTCTCTGGGAGAGATCTTCA;SOR=0.997;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=404;TCF=179;TCR=225;TR=404;WE=20124922;WS=20124904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,411:1.00:411
chr11	20127046	rs11025385	C	A	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=10;PP=1105;SC=TCACCATCATCAGCTTGAAAA;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=43;WE=20127054;WS=20127036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	20129075	rs4757890	G	A	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=3;PP=685;SC=GTATACCTGCGTTCAGGCCTC;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=20129083;WS=20129071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	20385228	rs3808991	T	C	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=0;PP=582;SC=GGAGTTCGTCTCCAGGTCCCG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=20385236;WS=20385218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	20385606	rs10437608	G	A	68.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=40;ReadPosRankSum=0.326;SC=GCTGGCTCAGGTGCGGGCGAT;SOR=0.283;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=4;WE=20385614;WS=20385596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr11	20398034	rs10741834	T	C	4650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=118;NR=20;PP=2965;SC=TCCATCCTTCTAGGCCTCCCA;SOR=3.426;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=139;TCF=119;TCR=20;TR=138;WE=20398042;WS=20398024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr11	20403825	rs7926967	A	T	2747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=60;PP=2162;SC=TATGCCACTGATGGTTAATCC;SOR=2.698;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=16;TCR=60;TR=76;WE=20403833;WS=20403815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	20403904	rs10766664	G	C	1235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=36;PP=1044;SC=ACATTGGCTAGAGGTAGATTG;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=20403912;WS=20403894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	20404506	rs2403587	T	C	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.99;SOR=3.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	20404613	rs3824886	T	G	3958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=97;NR=19;PP=2965;SC=CTTGGGCCAGTGGGCATTCTG;SOR=3.145;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=97;TCR=19;TR=116;WE=20404621;WS=20404603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr11	20404757	rs3781679	T	C	9544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=301;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=136;NR=155;PP=2965;SC=CATGACCACATTGGAGAAATG;SOR=0.748;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=291;TCF=136;TCR=155;TR=291;WE=20404765;WS=20404747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
chr11	20411199	rs56308542	TAAAA	T	3174.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=48;NR=5;PP=1156;SC=CCAGCAGAGTTAAAAAAAAAA;SOR=4.265;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=80;TCF=72;TCR=8;TR=53;WE=20411211;WS=20411189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	20411418	rs7937501	G	C	3105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.78;QD=41.97;SOR=7.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	20411424	rs7937204	A	G	2803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.72;QD=48.34;SOR=6.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	20419028	rs7934372	T	C	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=0;PP=639;ReadPosRankSum=0.063;SC=CATCACACTGTACTCCCTCCC;SOR=0.856;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=84;TCF=83;TCR=1;TR=31;WE=20419036;WS=20419018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,31:0.36:86
chr11	20424326	rs10833319	A	G	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=1;PP=899;SC=TTTCTTAGGAAAAAAATAAGC;SOR=5.421;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=29;WE=20424334;WS=20424316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	20429454	rs10741836	T	C	7613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=187;NR=41;PP=2965;SC=TTAATTACCCTAGGTAGTTTT;SOR=2.978;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=228;TCF=187;TCR=41;TR=228;WE=20429462;WS=20429444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr11	20448531	rs12797994	G	A	1553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=38;PP=1239;SC=TATTTTTTAAGTAGCTACATT;SOR=3.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=46;WE=20448539;WS=20448521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	20473655	rs1001669	T	G	1720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=5;PP=1381;SC=TAAACTCTTTTTTTCCCCTTT;SOR=3.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=43;TCR=5;TR=48;WE=20473663;WS=20473645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	20483748	rs3758803	T	C	1685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=9.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=63;PP=1377;ReadPosRankSum=1.112;SC=TTTATAATGGTATTGCTATTT;SOR=0.396;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=210;TCF=8;TCR=202;TR=66;WE=20483756;WS=20483738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,68:0.32:214
chr11	20515555	rs6483697	G	A	1708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=25;PP=1323;SC=TAATTATTACGGAAGTACATT;SOR=0.730;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=24;TCR=25;TR=49;WE=20515563;WS=20515545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	20529886	rs6483700	G	A	6467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=140;NR=47;PP=2965;SC=GTTCACAAGAGTAAGAAAGAT;SOR=2.243;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=140;TCR=47;TR=187;WE=20529894;WS=20529876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr11	20622975	rs1443547	G	A	6260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=110;NR=81;PP=2965;SC=AGAGGCGCAAGGCGCGCAGGC;SOR=1.010;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=192;TCF=110;TCR=82;TR=191;WE=20622983;WS=20622965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr11	20623042	rs1443548	T	C	8417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=154;NR=89;PP=2965;SC=AAGATCCCTTTTCTGCGAGGC;SOR=1.348;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=244;TCF=155;TCR=89;TR=243;WE=20623050;WS=20623032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr11	20623156	rs1443549	C	G	7556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=174;PP=2965;SC=GTGGTGCTGGCCACGGATGGA;SOR=2.428;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=230;TCF=55;TCR=175;TR=229;WE=20623164;WS=20623146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr11	20628479	rs2278649	T	C	3488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=96;NR=8;PP=2840;SC=GCTCAGCCCCTAGCCCAGAGG;SOR=4.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=96;TCR=8;TR=104;WE=20628487;WS=20628469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr11	20639400	rs7925597	A	G	2551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=43;PP=1863;SC=TGTATGCATCATTGGCTAAAG;SOR=0.738;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=40;TCR=43;TR=83;WE=20639408;WS=20639390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	20639479	rs11827415	G	A	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.207;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=28;PP=885;ReadPosRankSum=-0.675;SC=ACCCAGGGGCGGTTGCTTTGG;SOR=0.265;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=39;WE=20639487;WS=20639469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,42:0.75:56
chr11	20648364	rs3740870	G	C	1528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.734;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=775;ReadPosRankSum=-1.409;SC=TCACACCCAAGTGGGAGAAAC;SOR=0.570;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=124;TCF=37;TCR=87;TR=44;WE=20648372;WS=20648354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,48:0.36:135
chr11	20648380	rs1805091	G	A	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.066;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=531;ReadPosRankSum=-1.341;SC=GAAACTCACGGATGCCACGGT;SOR=0.162;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=97;TCF=19;TCR=78;TR=33;WE=20648388;WS=20648370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,36:0.33:108
chr11	20648418	rs4923548	C	T	1876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=52;PP=1553;SC=TATAACCAGCCCTGGGGGAGT;SOR=5.820;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=54;TCF=2;TCR=52;TR=54;WE=20648426;WS=20648408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	20649448	rs2276429	G	A	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.023;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=153;ReadPosRankSum=0.651;SC=ACATGATATGGCACTGGGTGT;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=9;WE=20649456;WS=20649438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr11	20658679	rs2000959	C	A	4836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=6.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.770;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=146;NR=18;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.417;SC=CTGGGTGGTACAATTTGACTC;SOR=0.627;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=251;TCF=225;TCR=26;TR=164;WE=20658687;WS=20658669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,172:0.67:258
chr11	20673867	rs2276433	G	A	5648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=82;PP=2965;SC=ACCAGTGGGAGCCCATGACCT;SOR=0.774;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=91;TCR=82;TR=173;WE=20673875;WS=20673857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr11	20676253	rs2276432	T	C	1130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.457;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=4;PP=893;ReadPosRankSum=0.830;SC=TTTGGCTTCTTTGCAGAGGCT;SOR=1.054;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=114;TCF=101;TCR=13;TR=42;WE=20676261;WS=20676243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,44:0.37:119
chr11	20699394	rs1793003	C	G	1130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.785;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=8;PP=927;ReadPosRankSum=-0.302;SC=TCCTTGTATTCCCTGCCACTC;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=51;TCF=42;TCR=9;TR=41;WE=20699402;WS=20699384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,40:0.78:51
chr11	20805286	rs8176785	G	A	9942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=218;NR=86;PP=2965;SC=CAGCTGTTCCGGAACAAGAGT;SOR=1.928;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=304;TCF=218;TCR=86;TR=304;WE=20805294;WS=20805276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
chr11	20949115	rs2293241	C	T	1985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=57;PP=1701;SC=TACCTAGCACCCACTAGCCAT;SOR=6.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=58;TCF=1;TCR=57;TR=58;WE=20949123;WS=20949105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	20949763	rs4363596	C	T	1140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=0;PP=1007;SC=TCATTCGGGCCGGAGAAAACA;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=20949771;WS=20949753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	20959185	rs1880088	A	T	1525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=0;PP=1218;SC=CCTCCACACAATTCCTTTCAC;SOR=7.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=42;WE=20959193;WS=20959176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	20959429	rs1880087	T	C	7529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=142;PP=2965;SC=TTATGGTCCCTATCACTTCTG;SOR=1.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=217;TCF=75;TCR=142;TR=217;WE=20959437;WS=20959419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr11	20959482	rs1880086	G	C	5015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=120;PP=2965;SC=TGAGGTTCTTGAGTGGGGCAT;SOR=3.056;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=25;TCR=120;TR=145;WE=20959490;WS=20959472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr11	20959533	rs1880085	G	A	2300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=63;PP=1920;SC=ACTCTCTGCGGTGGGTTGGAT;SOR=4.499;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=6;TCR=63;TR=69;WE=20959541;WS=20959523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	21305927	rs4151053	T	C	7193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=121;PP=2965;SC=CAAGTCTTTGTGCATTGCTGA;SOR=0.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=231;TCF=110;TCR=121;TR=230;WE=21305935;WS=21305917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr11	21581665	rs7119475	C	T	2769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=4;PP=2294;SC=AATGCTACTGCAAATGATGGT;SOR=5.186;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=80;TCR=4;TR=83;WE=21581673;WS=21581655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr11	21581805	rs8176789	C	T	6233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=96;PP=2965;SC=TGGCAGGGGGCTTTGACTGTC;SOR=0.732;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=107;TCR=96;TR=202;WE=21581813;WS=21581795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr11	21581997	rs8176790	C	T	1181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=34;PP=1002;SC=TTCTACCTCCCCAGCTCTCTC;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=21582005;WS=21581987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	21592228	rs4922847	C	A	2994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=78;NR=10;PP=2459;SC=GGTGACCAAACATCCAAGAAG;SOR=4.011;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=78;TCR=10;TR=88;WE=21592236;WS=21592218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	22214877	rs139514865	A	AAGGAGGAGGGGAATGAGGAGGAGG	14085.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.649;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=3.871;NF=68;NR=24;PP=2971;ReadPosRankSum=0.367;SC=GGAGGAGGAGAAGGAGGCCTG;SOR=1.323;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=273;TCF=219;TCR=54;TR=92;WE=22214885;WS=22214867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,220:0.81:271
chr11	22214903	rs12792259	G	C	12748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=549;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.896;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=6.735;NF=313;NR=126;PP=2962;ReadPosRankSum=0.294;SC=GGAAGAGCAGGCCCTTAGAAG;SOR=0.555;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=509;TCF=366;TCR=143;TR=439;WE=22214911;WS=22214893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,472:0.87:545
chr11	22233029	rs4922980	G	A	3862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=121;PP=2962;ReadPosRankSum=1.846;SC=TTAGGTGGGGGGAAAACACAT;SOR=1.636;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=2;TCR=139;TR=123;WE=22233037;WS=22233019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,123:0.87:142
chr11	22239661	.	T	TCTCACACACACACACACACACA	1432.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.671;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.524;NF=13;NR=1;PP=1446;ReadPosRankSum=0.596;SC=GTTTGAAATATCACACACACA;SOR=1.358;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=14;WE=22239671;WS=22239651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr11	22242729	rs4312063	T	C	5268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=107;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.114;SC=ACGTTGATGATGTAAAGAAAG;SOR=0.680;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=241;TCF=113;TCR=128;TR=203;WE=22242737;WS=22242719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,208:0.84:247
chr11	22296094	rs72105710	CTTTT	C	13084.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=397;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.046;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.132;NF=226;NR=48;PP=2989;ReadPosRankSum=-0.181;SC=TGATCTTCCTCTTTTTTTTTT;SOR=0.392;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=362;TCF=289;TCR=73;TR=274;WE=22296105;WS=22296084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,320:0.85:377
chr11	22297606	rs5790245	AT	A	2672.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.27;QD=24.30;SOR=4.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr11	22297770	rs11026488	G	C	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.97;ReadPosRankSum=0.518;SOR=1.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:304,41:0.12:345
chr11	22301410	rs5790246	CT	C	1261.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.14;MQRankSum=-0.407;QD=19.41;ReadPosRankSum=1.127;SOR=3.290;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,62:0.95:65
chr11	22363396	rs1562447	T	A	12101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-6.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=513;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.032;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=321;PP=2962;ReadPosRankSum=1.698;SC=CATCTCCTGTTTGAGCCCCGT;SOR=0.431;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=502;TCF=131;TCR=371;TR=439;WE=22363404;WS=22363386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,446:0.88:509
chr11	22364744	rs2246710	G	A	11112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=462;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=257;NR=121;PP=2962;ReadPosRankSum=0.001;SC=TGAGCCTTTGGTACTGACTCT;SOR=0.658;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=445;TCF=303;TCR=142;TR=378;WE=22364766;WS=22364734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,393:0.85:460
chr11	22364758	rs2278751	C	T	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=0.846;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.89;ReadPosRankSum=1.250;SOR=0.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:440,62:0.12:502
chr11	22384166	rs2290046	G	A	2620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-6.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=2;PP=2177;ReadPosRankSum=-1.812;SC=GTGCATGGGTGTGAGGCCCAT;SOR=1.163;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=103;TCF=101;TCR=2;TR=89;WE=22384174;WS=22384156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,91:0.87:105
chr11	22696451	rs922571	A	G	13783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=446;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=235;NR=195;PP=2965;SC=TACGCAGTGGACCTGGCCTCT;SOR=0.875;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=432;TCF=236;TCR=196;TR=430;WE=22696459;WS=22696441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,441:1.00:441
chr11	22747745	rs337448	A	C	2349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=2;PP=2026;SC=GGCATGAGGTAATTCCGAAGC;SOR=6.214;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=66;TCF=64;TCR=2;TR=66;WE=22747753;WS=22747735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	22851170	.	G	C	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.233;ClippingRankSum=0.000;DP=261;ExcessHet=3.0103;FS=38.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.41;ReadPosRankSum=-2.663;SOR=5.079;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:190,70:0.27:260
chr11	22851409	rs2286810	A	G	5653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=169;PP=2965;SC=ACCGCCCTCCACTGGCTCGGC;SOR=10.248;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=171;TCF=1;TCR=170;TR=170;WE=22851417;WS=22851399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr11	22880918	rs3213707	T	G	3666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=31;PP=2792;ReadPosRankSum=-1.138;SC=TTCTATTATGTTAGGGACCAC;SOR=0.615;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=136;TCF=103;TCR=33;TR=126;WE=22880926;WS=22880908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:10,126:0.93:136
chr11	24753539	rs2716454	A	G	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=458;ReadPosRankSum=0.890;SC=GGACCATCATAGACTCATTTT;SOR=0.368;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=20;WE=24753547;WS=24753529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr11	24759664	.	T	G	965	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=37;NR=0;PP=965;QD=27.0208435824;SC=TAGTTGTCTATGTCCTAAATG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=37;WE=24759672;WS=24759663;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,37:0.86:43
chr11	24784651	rs11414451	A	AT	128.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=152;ReadPosRankSum=-0.403;SC=GAAGGTTTTGATTAAGGAACA;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=6;WE=24784659;WS=24784641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr11	24784862	rs2716532	A	T	3858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=74;PP=2959;SC=GAGGTAAGATATATTTCATCT;SOR=1.355;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=42;TCR=74;TR=116;WE=24784870;WS=24784852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr11	24784922	rs10500990	G	T	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=1.412;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.188;SOR=1.046;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,19:0.23:82
chr11	24927548	.	G	A	3424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=49;PP=2611;ReadPosRankSum=-0.122;SC=ATAAAAGCTTGAAAAACAAAC;SOR=0.671;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=86;TCR=62;TR=117;WE=24927556;WS=24927538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,125:0.80:157
chr11	26465500	rs4032918	G	A	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.906;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=356;ReadPosRankSum=-0.356;SC=GGTTTTTAACGTAATAGGTGA;SOR=1.708;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=17;WE=26465508;WS=26465490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr11	26481611	rs2047099	G	A	2124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.390;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=45;PP=1640;ReadPosRankSum=-1.018;SC=TTAGAGATCAGATTTCAACAT;SOR=0.898;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=168;TCF=80;TCR=88;TR=79;WE=26481619;WS=26481601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,82:0.48:172
chr11	26547348	rs430563	G	A	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.13;ReadPosRankSum=-0.921;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr11	26547353	rs410617	T	G	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.85;ReadPosRankSum=-1.055;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr11	26552702	rs293937	T	C	3121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=0;PP=2607;SC=AAGGTAGTCATGGCTTTGGAA;SOR=9.108;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=92;TCF=92;TCR=0;TR=92;WE=26552710;WS=26552692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	26558841	rs386635	G	A	1083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=0;PP=920;SC=GAAGTCATTTGGGTTATCTTA;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=26558849;WS=26558831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	26558873	rs375562	T	C	1950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=1;PP=1612;SC=CGATTCATTGTTCCCCGTATA;SOR=5.856;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=54;TCF=53;TCR=1;TR=54;WE=26558881;WS=26558863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	26559172	rs396863	G	A	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=63;PP=1768;ReadPosRankSum=1.161;SC=CTGTGCACTGGCTCCTCTGCC;SOR=5.549;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=65;TCF=1;TCR=64;TR=64;WE=26559180;WS=26559162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr11	26563464	rs410036	A	T	1282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=9;PP=1056;SC=AAAAAATAGAACCAAATGTAT;SOR=2.476;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=41;WE=26563472;WS=26563454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	26563652	rs420143	T	G	1053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=28;PP=855;SC=AGCAAAGTATTCTGTTTTGTG;SOR=4.047;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=31;WE=26563660;WS=26563642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	26568966	rs2663168	A	G	6839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=133;NR=69;PP=2965;SC=CATGCAGGCTATACTTTGGTG;SOR=1.543;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=202;TCF=133;TCR=69;TR=202;WE=26568974;WS=26568956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr11	26574740	rs395770	T	C	1625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=3;PP=1426;SC=AAGTGAATTCTTAGTCACAGT;SOR=4.935;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=50;WE=26574748;WS=26574730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	26574782	rs59938249	TG	T	3203.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=14;PP=2984;SC=TTTTTGTTTTTGTTTTTTCTC;SOR=2.930;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=98;TCF=77;TCR=21;TR=73;WE=26574790;WS=26574772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr11	26581398	rs138818641	C	CAT	119.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.74;MQRankSum=0.619;QD=14.97;ReadPosRankSum=0.921;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr11	26584625	rs444178	C	A	2357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.982;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=7;PP=1819;ReadPosRankSum=1.601;SC=TTAATTAAAACCACTGTGCCC;SOR=0.231;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=131;TCF=121;TCR=10;TR=78;WE=26584633;WS=26584615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,82:0.62:132
chr11	26586801	rs15783	G	A	2909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.479;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=17;PP=2143;ReadPosRankSum=-0.315;SC=TTGATAAGGGGTAAACCCAGT;SOR=0.870;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=184;TCF=149;TCR=35;TR=100;WE=26586809;WS=26586791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,107:0.56:191
chr11	26587133	rs293980	T	C	10650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=152;NR=190;PP=2965;SC=GCTCTGCTGATGAGTTACTGG;SOR=0.938;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=342;TCF=152;TCR=190;TR=342;WE=26587141;WS=26587123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,362:1.00:362
chr11	26587394	rs11029619	T	C	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.353;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=563;ReadPosRankSum=1.069;SC=GAATTTTGGCTAAGGCCAACA;SOR=1.085;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=58;TCF=9;TCR=49;TR=26;WE=26587402;WS=26587384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr11	26588795	rs150988105	C	CT	599.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.69;ReadPosRankSum=1.381;SOR=0.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,30:0.43:69
chr11	26588804	rs293976	C	T	2745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=62;PP=1806;SC=ACTTTTTTTTCCTCAAGCAAT;SOR=5.728;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=2;TCR=62;TR=64;WE=26588812;WS=26588785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr11	26619872	rs7112022	T	C	2974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=3;PP=2376;SC=AGCAATATGATGTGATTTGGG;SOR=5.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=83;TCR=3;TR=86;WE=26619880;WS=26619862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	26620101	rs10835009	T	C	2469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=66;PP=2041;ReadPosRankSum=-0.787;SC=ATTAGATTTTTCCCTTGATCT;SOR=2.975;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=6;TCR=67;TR=72;WE=26620109;WS=26620091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,75:0.99:76
chr11	26645894	rs1012552	A	T	275.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=204;SC=TTCTATTTAAAGTAAAATGTA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=26645902;WS=26645884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	26655624	rs7929611	T	C	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQRankSum=-0.369;QD=25.86;ReadPosRankSum=-0.355;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr11	26655641	rs71047869	A	AT	262.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=0.814;QD=3.41;ReadPosRankSum=4.360;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,25:0.32:77
chr11	26655642	rs79764198	A	T	2133.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-5.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=2.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQRankSum=0.318;QD=21.55;ReadPosRankSum=4.542;SOR=1.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,50:0.51:99
chr11	26655658	rs7943086	G	A	3109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.124;HP=6;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.454;NF=93;NR=5;PP=2162;ReadPosRankSum=0.376;SC=AAATTAAAAAGACAAACTTGA;SOR=1.448;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=171;TCF=159;TCR=12;TR=98;WE=26655666;WS=26655648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,93:0.53:174
chr11	26656370	rs7933233	T	C	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=322;ReadPosRankSum=-0.137;SC=TCTTGACCCATTAGTTCACGC;SOR=0.395;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=16;WE=26656378;WS=26656360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr11	26656563	rs7946841	C	T	1732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.110;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=33;PP=1257;ReadPosRankSum=0.876;SC=CTTACAGATTCGTAGGCCACC;SOR=0.507;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=137;TCF=62;TCR=75;TR=65;WE=26656571;WS=26656553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,70:0.49:144
chr11	26656714	rs10835033	C	G	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=338;ReadPosRankSum=0.320;SC=GTTCAGGGAACTTTATGGATA;SOR=0.425;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=16;WE=26656722;WS=26656704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr11	26663284	rs10835039	T	C	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.51;ReadPosRankSum=-0.191;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr11	26663298	rs11603910	T	A	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.11;ReadPosRankSum=0.048;SOR=0.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,18:0.41:44
chr11	26663304	rs57264690	A	T	700.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.74;ReadPosRankSum=1.022;SOR=0.286;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,23:0.42:55
chr11	26663394	rs10835040	A	G	1872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.251;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=10;PP=1447;ReadPosRankSum=-0.939;SC=ATTGTTAACCAGATGCTTGAA;SOR=1.486;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=168;TCF=141;TCR=27;TR=83;WE=26663402;WS=26663384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,85:0.49:173
chr11	26677867	rs10835050	T	C	3810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=57;PP=2965;SC=CAAGAAAATTTGGGCCTCCAC;SOR=0.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=61;TCR=57;TR=118;WE=26677875;WS=26677857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr11	26677947	rs10835051	C	T	4329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=63;PP=2965;SC=GAGGCCCGCCCTGGAGTTCCA;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=59;TCR=64;TR=121;WE=26677955;WS=26677937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr11	26692594	.	T	TTGTGTGTG	1106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.100;NF=19;NR=2;PP=1002;ReadPosRankSum=-0.399;SC=TATGTGGAGTTTGTGTGTGTG;SOR=0.892;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=66;TCF=61;TCR=5;TR=21;WE=26692603;WS=26692584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
chr11	26692631	rs7128384	A	G	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.946;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.572;NF=41;NR=8;PP=725;ReadPosRankSum=1.028;SC=GTGTGTGTGCATTCATACAGG;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=87;TCR=17;TR=49;WE=26692639;WS=26692621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,49:0.45:108
chr11	26692733	rs7114378	T	C	4385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=0.994;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.51;ReadPosRankSum=0.876;SOR=0.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,118:0.50:237
chr11	26692742	rs7128823	G	A	4531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=1.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.45;ReadPosRankSum=-0.917;SOR=0.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,121:0.52:233
chr11	26692811	rs7128731	C	G	2168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.163;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=60;PP=1620;ReadPosRankSum=-0.069;SC=GAGGGAAATACAAAGACACAT;SOR=0.920;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=166;TCF=41;TCR=125;TR=79;WE=26692819;WS=26692801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,84:0.47:177
chr11	26692933	rs7101361	A	T	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=286;ReadPosRankSum=-0.800;SC=ACTCTGACCTAAGACATTTTC;SOR=0.634;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=15;WE=26692941;WS=26692923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr11	26694812	rs4278475	C	T	1446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=0;PP=1132;SC=AACTCTGAAGCTGAAACTCAA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=26694820;WS=26694802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	26694842	rs4551716	C	T	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.069;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=0;PP=648;ReadPosRankSum=-0.302;SC=AGTTCTCACACTCACTGCTTT;SOR=2.247;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=61;TCR=1;TR=29;WE=26694850;WS=26694832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
chr11	26694903	rs4347341	C	T	2349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.627;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=23;PP=1750;ReadPosRankSum=0.479;SC=AACCAGGAATCCCTTTGAGTC;SOR=0.627;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=123;TCR=45;TR=85;WE=26694911;WS=26694893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,91:0.51:179
chr11	26694979	rs4369354	A	G	2474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.728;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=64;PP=1799;ReadPosRankSum=-1.083;SC=GCTGAACTCCACACCAGCATA;SOR=0.934;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=221;TCF=83;TCR=138;TR=100;WE=26694987;WS=26694969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,107:0.45:237
chr11	26700099	rs12793773	G	A	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.609;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=1;PP=852;ReadPosRankSum=-0.176;SC=AATAATGAAGGGTGCCTTTGT;SOR=0.134;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=96;TCF=95;TCR=1;TR=41;WE=26700107;WS=26700089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,44:0.44:101
chr11	26702482	rs10767569	T	A	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=260;ReadPosRankSum=0.762;SC=GGTACTTCCCTGAGTGAGTCT;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=12;WE=26702490;WS=26702472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr11	26702664	rs10734383	C	T	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=17;PP=859;SC=GGTCTGTTGACAGAGGCAAAG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=17;TCR=17;TR=34;WE=26702672;WS=26702654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	26705124	rs3924552	C	G	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=117;ReadPosRankSum=0.087;SC=TCTTTCATTTCTGTACCCAGA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=26705132;WS=26705114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr11	26705310	rs3924551	A	G	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=402;ReadPosRankSum=-0.257;SC=TTACCTTCCAATTCACAAAAG;SOR=0.848;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=15;TCR=18;TR=19;WE=26705318;WS=26705300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr11	26734209	rs10742156	C	T	8706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=164;PP=2965;SC=TGTAGATGACCGTGGCAGCAT;SOR=1.221;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=267;TCF=102;TCR=165;TR=266;WE=26734217;WS=26734199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr11	27076977	rs2305095	C	T	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=158;ReadPosRankSum=-0.812;SC=AGACCGGAAACATGGCTTGTA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=9;WE=27076985;WS=27076967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr11	27077118	rs10767598	C	T	5146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=95;NR=61;PP=2965;SC=ACCTGGATTCCGCAAAAGCAC;SOR=1.207;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=95;TCR=61;TR=156;WE=27077126;WS=27077108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr11	27078632	.	ATT	A	736.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.01;MQRankSum=-7.063;QD=13.16;ReadPosRankSum=2.202;SOR=0.317;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,21:0.38:56
chr11	27078637	.	G	A	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.717;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.40;MQRankSum=-7.654;QD=10.26;ReadPosRankSum=-4.225;SOR=0.166;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,19:0.29:65
chr11	27078638	.	C	A	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.73;MQRankSum=-7.709;QD=10.12;ReadPosRankSum=-5.434;SOR=0.140;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,18:0.27:66
chr11	27379127	rs3741407	C	G	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=40;PP=904;ReadPosRankSum=-0.024;SC=GTACAAGAACCTCTTTTGCTT;SOR=0.611;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=93;TCF=13;TCR=80;TR=47;WE=27379135;WS=27379117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,49:0.52:95
chr11	27390089	rs2447997	T	C	8123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=99;NR=134;PP=2965;SC=TGCAGTATAGTTTAGTGTAGA;SOR=1.095;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=234;TCF=100;TCR=134;TR=233;WE=27390097;WS=27390079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr11	27393813	rs2448001	G	A	5677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=135;NR=36;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.023;SC=TCTATTTTTTGAAACTCATGC;SOR=1.513;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=172;TCF=136;TCR=36;TR=171;WE=27393821;WS=27393803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,179:0.99:180
chr11	27395377	rs2448003	G	A	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.62;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	27401743	rs2472623	A	T	2849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=8;PP=2307;SC=CATTGTCACTAAAAGACCCTG;SOR=4.357;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=74;TCR=8;TR=82;WE=27401751;WS=27401733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr11	27401927	rs2448005	T	G	3355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.07;SOR=2.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr11	27401940	rs2472622	T	A	3054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=70;PP=2460;SC=TCATATTTTATGTTTTAAACA;SOR=2.597;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=20;TCR=70;TR=90;WE=27401948;WS=27401917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr11	27406844	rs6484295	G	A	3258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=55;PP=2551;SC=AGTCAGGGATGCTTGAGATCT;SOR=0.811;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=48;TCR=55;TR=103;WE=27406852;WS=27406834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr11	27412535	rs12273521	C	T	1769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=1;PP=1446;SC=CTGTTTTTATCTCAGATGAAA;SOR=6.518;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=50;WE=27412543;WS=27412525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	27412782	rs61648905	CTT	C	1878.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.357;NF=2;NR=66;PP=699;ReadPosRankSum=0.262;SC=AATTCAGAGCCTTTTTTTTTT;SOR=3.422;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=104;TCF=3;TCR=101;TR=68;WE=27412792;WS=27412772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,61:0.97:63
chr11	27413855	rs1871251	T	C	1183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=0;PP=982;SC=CTCTGGCCTCTCATACTACTC;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=27413863;WS=27413845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	27523164	rs151336878	T	TGAAGTTAAAATTTCAGGC	3800.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=42;PP=2957;SC=GAGTTCTCTGTGAAGTTAAAA;SOR=1.923;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=77;TCF=16;TCR=61;TR=57;WE=27523172;WS=27523154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	27523186	rs10835188	G	T	2259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=63;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=28;PP=858;SC=TTCAGGCAAAGTTATGCATCT;SOR=2.517;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=27523194;WS=27523176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	27679662	rs2353512	T	C	7262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=111;PP=2965;SC=TTTTGTCTGCTGCCGTTACCC;SOR=0.786;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=240;TCF=129;TCR=111;TR=240;WE=27679670;WS=27679652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr11	27695910	rs10835210	C	A	241.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=197;SC=CAGGAAAGTGCTCATTACTTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=27695918;WS=27695900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	27910923	rs6484341	T	A	2787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.089;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.976;NF=80;NR=22;PP=2163;ReadPosRankSum=-0.601;SC=CTTTTCTTCATCCTCTGGAAG;SOR=1.309;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=215;TCF=157;TCR=58;TR=102;WE=27910931;WS=27910913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,105:0.48:219
chr11	28045419	rs12273233	T	C	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.967;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=650;ReadPosRankSum=1.689;SC=AAGTTTTTAATTTAGTTAAGC;SOR=1.426;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=18;WE=28045438;WS=28045409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr11	28045430	rs34088899	AT	A	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=358;ReadPosRankSum=0.393;SC=TTAGTTAAGCATTTTTTTTAT;SOR=0.252;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=6;WE=28045438;WS=28045409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr11	28106058	rs997555	C	G	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=1;PP=797;ReadPosRankSum=-0.282;SC=AAAGACCCTTCTAACCCTCAG;SOR=0.291;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=64;TCF=63;TCR=1;TR=34;WE=28106066;WS=28106048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,36:0.55:66
chr11	28134974	rs60970073	C	A	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.473;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.440;NF=5;NR=2;PP=139;ReadPosRankSum=0.306;SC=TCTGGCCAAACAGAATACATA;SOR=0.892;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=7;WE=28134982;WS=28134964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr11	28232869	rs11030247	T	C	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=540;ReadPosRankSum=-0.296;SC=ATTTTCTTCTTTTTTCCCCAA;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=49;TCF=5;TCR=44;TR=24;WE=28232877;WS=28232859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr11	30253318	rs611246	A	T	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=0;PP=891;ReadPosRankSum=-1.266;SC=AGGAAAAAAAACTTTTGAAGC;SOR=1.146;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=64;TCR=0;TR=38;WE=30253326;WS=30253308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,40:0.60:67
chr11	30253641	rs609896	T	C	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=482;ReadPosRankSum=-1.223;SC=AGCAAGGGTGTTGAAGGTCTG;SOR=0.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=21;WE=30253649;WS=30253631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr11	30255185	rs6169	C	T	1605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.285;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=28;PP=1218;ReadPosRankSum=-1.132;SC=AACTGGTATACGAAACAGTGA;SOR=0.878;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=124;TCF=63;TCR=61;TR=62;WE=30255193;WS=30255175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,64:0.51:126
chr11	30352473	rs35824273	C	CAG	2458.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=12;PP=2220;SC=CAAAATAAAACGGAAAATTTG;SOR=2.522;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=43;WE=30352481;WS=30352463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	30435599	rs10767842	G	A	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=331;ReadPosRankSum=0.646;SC=CAAGAGAGAAGGTCCATATAA;SOR=0.436;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=15;WE=30435607;WS=30435589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr11	30438948	.	C	T	920	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=3;HapScore=3;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=59.92;NF=31;NR=0;PP=920;QD=30.7990713725;SC=GACTTTTCTTCTCGTATTCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=30438967;WS=30438938;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	30601733	rs66528013	CT	C	1958.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=5;PP=1543;SC=GAATGCTTTTCTTTTTTTTCT;SOR=5.283;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=71;TCF=64;TCR=7;TR=67;WE=30601741;WS=30601723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	30900263	rs5790842	TA	T	211.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.47;MQRankSum=1.699;QD=6.05;ReadPosRankSum=1.060;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr11	30902893	rs273613	T	C	1440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.374;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=42;PP=899;ReadPosRankSum=0.537;SC=GAATACGGAATGGCACAATAT;SOR=0.834;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=132;TCF=50;TCR=82;TR=65;WE=30902901;WS=30902883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,68:0.49:138
chr11	30922081	rs273560	C	T	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=6.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=437;ReadPosRankSum=-1.281;SC=CATTGTTCAACGAATAATGAA;SOR=0.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=21;WE=30922089;WS=30922071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
chr11	30930393	rs175398	T	G	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=125;ReadPosRankSum=-0.852;SC=TCAACTTGTATGAACATAAAG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=30930401;WS=30930383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr11	30942383	rs201281423	G	A	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.786;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=691;ReadPosRankSum=1.297;SC=CTTTTCTTCCGGTTCTGTAAC;SOR=0.514;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=86;TCF=35;TCR=51;TR=39;WE=30942391;WS=30942373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,39:0.45:86
chr11	30953608	rs163877	A	G	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=317;ReadPosRankSum=0.136;SC=CATTCATTCAACAAAAATGTA;SOR=0.760;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=15;WE=30953616;WS=30953598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr11	30965855	rs273605	A	T	2307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.572;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=50;PP=1684;ReadPosRankSum=-0.368;SC=TTAGGAACCAAGTCTATCTCC;SOR=0.899;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=173;TCF=79;TCR=94;TR=88;WE=30965863;WS=30965845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,93:0.51:181
chr11	30974203	rs10767883	T	A	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=250;ReadPosRankSum=1.064;SC=GTACTTACTATACACTAGGCA;SOR=0.560;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=11;WE=30974211;WS=30974193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr11	31326420	rs2616821	T	C	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=23;PP=1094;ReadPosRankSum=0.182;SC=TAGCACTAGATACCAAACTCT;SOR=0.476;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=38;WE=31326428;WS=31326410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,39:0.98:40
chr11	31327316	rs2616815	C	T	4522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=81;PP=2965;SC=CTGTGCACTCCTCCAGCAGCT;SOR=1.123;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=52;TCR=81;TR=133;WE=31327324;WS=31327306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr11	31327766	rs2761592	G	A	3774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=16;PP=2965;ReadPosRankSum=1.530;SC=GAAAACTTTGGAACACTAGTT;SOR=2.394;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=104;TCR=16;TR=119;WE=31327774;WS=31327756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,115:0.99:116
chr11	31451885	rs199583903	A	G	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.008;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=28;PP=768;ReadPosRankSum=-0.024;SC=ATGAAGCGGAAGAAGTTAGCC;SOR=1.588;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=60;TCF=15;TCR=45;TR=35;WE=31451893;WS=31451875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,36:0.57:63
chr11	31458730	rs7479413	T	G	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=32;PP=949;SC=TCAGGTTTCATATATTTAGAT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=31458738;WS=31458720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	31648529	rs2273943	G	A	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=439;SC=ATATAATACTGTTTTGACATT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=31648537;WS=31648519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	31653956	rs4922872	C	A	9406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=94;NR=190;PP=2965;SC=GATCCAGGTACGAAATTTCCA;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=285;TCF=94;TCR=191;TR=284;WE=31653964;WS=31653946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr11	31812215	rs3026393	A	C	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=6;PP=730;ReadPosRankSum=-1.348;SC=CTTCTAGTGAAGAGAGATCGC;SOR=0.831;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=71;TCF=59;TCR=12;TR=38;WE=31812223;WS=31812205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,38:0.53:72
chr11	31812582	rs2071754	C	T	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=24;PP=735;SC=GCTAGTCCTTCCACTGGCCAC;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=31812590;WS=31812572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	31814879	rs3026384	G	A	1979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.154;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=37;PP=1498;ReadPosRankSum=0.498;SC=ACTGTAGTGCGAAAAGCTCTC;SOR=0.653;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=138;TCF=71;TCR=67;TR=69;WE=31814887;WS=31814869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,73:0.53:137
chr11	31838252	rs5790869	C	CG	1247.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=32;PP=1461;SC=GAGCAGGGGGCGCCACCGCTC;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=33;WE=31838260;WS=31838242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	32118925	rs223073	A	G	2929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=70;PP=2375;SC=GGGGGCCCAGATCACAAGCTT;SOR=2.354;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=21;TCR=70;TR=91;WE=32118933;WS=32118915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr11	32449486	rs1799933	C	T	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.754;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=254;ReadPosRankSum=-0.798;SC=AGACGCAGAGCCCAGCGCCTT;SOR=0.043;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=13;WE=32449494;WS=32449476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr11	32449799	rs5030166	G	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.394;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=146;ReadPosRankSum=1.150;SC=CAGTCGCTGCGCTGTGCACCA;SOR=1.863;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=7;WE=32449807;WS=32449789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr11	32450244	rs113549930	C	CG	99.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.75;ReadPosRankSum=-1.096;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr11	32451920	.	T	G	109	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=6;NR=0;PP=109;QD=23.9618687579;SC=TTGCCCGGAGTGAAGGCCGAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=32451928;WS=32451914;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,6:0.55:11
chr11	32452001	rs72267419	GGAGA	G	465.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.34;QD=38.81;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	32456694	rs2234582	C	A	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.022;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=576;ReadPosRankSum=-0.535;SC=CCATTTGCTGCGGCTCAGACC;SOR=0.478;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=70;TCF=44;TCR=26;TR=28;WE=32456702;WS=32456684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,30:0.42:71
chr11	32460575	rs11031784	T	C	4242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=77;PP=2965;SC=TTCTCAACCCTTACTTTCACC;SOR=1.153;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=51;TCR=77;TR=128;WE=32460583;WS=32460565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr11	32623404	rs377514127	C	T	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.569;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=445;ReadPosRankSum=-0.228;SC=TTTTATAGAACGATTTAGTTT;SOR=1.214;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=23;WE=32623412;WS=32623394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,24:0.40:60
chr11	32697291	rs7116464	A	G	932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=21;PP=796;SC=TGCAATATATATGTTATTTAA;SOR=1.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=32697299;WS=32697281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	32704946	rs1396995	C	A	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=195;SC=TATCCCCTTTCATATTACTGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=32704954;WS=32704936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	32722320	rs11031943	A	T	1658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.30;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	32781829	rs11442361	G	GA	249.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=208;SC=GGTCTTAACTGAAAAAAAATT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=9;WE=32781837;WS=32781819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	32949463	rs146740108	A	AT	1001.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.062;NF=40;NR=0;PP=602;ReadPosRankSum=0.523;SC=ATACAAGTAAATTTTTTTTTT;SOR=4.849;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=62;TCR=0;TR=40;WE=32949471;WS=32949453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,44:0.94:47
chr11	32954344	rs1022586	G	A	8068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=169;PP=2965;SC=ATCTCAGACTGTAACTCCTGA;SOR=1.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=241;TCF=72;TCR=169;TR=241;WE=32954352;WS=32954334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr11	32956244	rs7940077	A	G	7641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=128;NR=98;PP=2965;SC=AGTGGAGAGAATGCTACATCA;SOR=0.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=227;TCF=128;TCR=99;TR=226;WE=32956252;WS=32956234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr11	32956620	rs7481878	A	G	8590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=142;NR=133;PP=2965;SC=AAAAACAACCAGAAGTCAAAA;SOR=0.744;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=277;TCF=142;TCR=135;TR=275;WE=32956628;WS=32956610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr11	32975333	rs7395190	T	G	2566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=1;PP=2236;SC=TTAAACTGTTTTGAGTTTTAC;SOR=7.195;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=70;TCF=69;TCR=1;TR=70;WE=32975341;WS=32975323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	32990842	rs6416072	G	T	599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=512;SC=TAGTTTGTCTGCTTAGTGTTA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=32990850;WS=32990832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	33014668	rs7941237	G	A	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=0;PP=1415;SC=TCACAGACTGGGTAGCTTATA;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=49;WE=33014676;WS=33014658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	33038168	rs79223825	G	A	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.885;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=476;ReadPosRankSum=-0.653;SC=CAGTATTTTAGTGAATAGAAG;SOR=0.334;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=59;TCF=42;TCR=17;TR=24;WE=33038176;WS=33038158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
chr11	33050100	rs3802790	A	G	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=187;ReadPosRankSum=-1.335;SC=TGGTGAGCATATAGTAACTAT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=10;WE=33050108;WS=33050090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr11	33053107	rs966191	C	T	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.467;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=39;PP=997;ReadPosRankSum=-0.716;SC=ACTTATCTGACGTTCATAATG;SOR=0.126;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=109;TCF=18;TCR=91;TR=52;WE=33053115;WS=33053097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,53:0.46:114
chr11	33053737	rs4511261	C	T	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.79;ReadPosRankSum=1.440;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr11	33054562	rs2273536	G	A	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.079;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=322;ReadPosRankSum=0.576;SC=CAAATTTCAGGTGTTTTTTGA;SOR=2.115;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=16;WE=33054570;WS=33054552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr11	33054596	rs2273537	G	A	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.162;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.864;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=154;ReadPosRankSum=-0.589;SC=TAAGTAGTTGGACTTTAATTT;SOR=0.037;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=8;WE=33054604;WS=33054586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr11	33054754	rs2273539	C	G	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.214;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=200;ReadPosRankSum=-0.768;SC=GATTTTTCTGCTTAAATATGA;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=10;WE=33054762;WS=33054744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr11	33054794	rs2273540	T	G	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.764;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=363;ReadPosRankSum=-0.584;SC=AACTTTTTACTTTTAAACTTT;SOR=1.398;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=22;WE=33054802;WS=33054784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr11	33055078	rs1059432	C	T	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=4.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=249;ReadPosRankSum=-1.279;SC=CATTTGTAAGCGTGGAAGCTC;SOR=0.990;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=11;WE=33055086;WS=33055068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr11	33065394	rs1064005	C	T	3452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.677;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=38;PP=2842;ReadPosRankSum=1.138;SC=AGGAAGGCCTCGAAGATGCTG;SOR=0.961;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=267;TCF=188;TCR=79;TR=137;WE=33065402;WS=33065384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,135:0.50:270
chr11	33065547	rs7926030	G	A	1731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-7.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.134;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=67;PP=1504;ReadPosRankSum=0.769;SC=GTTTTATGAGGCCTCCTTGTG;SOR=0.899;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=153;TCF=12;TCR=141;TR=72;WE=33065555;WS=33065537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,71:0.47:151
chr11	33076191	rs2273544	T	C	2070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.461;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=41;PP=1465;ReadPosRankSum=0.178;SC=CAGCGAGAGGTGTCACCAACA;SOR=0.274;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=189;TCF=114;TCR=75;TR=85;WE=33076199;WS=33076181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,90:0.46:197
chr11	33078251	rs4471389	A	T	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=591;ReadPosRankSum=0.382;SC=CGGCCTCCAAAAGTGCTGGGA;SOR=0.627;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=26;WE=33078259;WS=33078241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr11	33078643	rs2273546	T	C	2140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=1.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.99;ReadPosRankSum=1.003;SOR=0.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,82:0.54:153
chr11	33079445	rs2273548	G	T	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=464;ReadPosRankSum=0.309;SC=TTGATTAAACGTAGCTGTGTT;SOR=0.527;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=21;WE=33079453;WS=33079435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr11	33079752	rs7395859	C	T	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQRankSum=-2.393;QD=3.85;ReadPosRankSum=-1.324;SOR=0.129;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,9:0.26:35
chr11	33080496	rs11032133	T	C	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.867;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=16;PP=1131;ReadPosRankSum=-2.098;SC=AAATCCTTTTTTCTTTCAGAG;SOR=0.414;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=114;TCF=86;TCR=28;TR=59;WE=33080504;WS=33080486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,59:0.50:117
chr11	33106616	rs3758741	C	T	2430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-7.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.772;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=66;PP=1898;ReadPosRankSum=-0.250;SC=GAGTTTTCTGCAGAGGCGTTT;SOR=1.002;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=219;TCF=82;TCR=137;TR=99;WE=33106624;WS=33106606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,101:0.45:223
chr11	33106908	rs3834432	C	CTTTATAG	1165.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.966;NF=0;NR=17;PP=934;ReadPosRankSum=-0.156;SC=ACTGTGGATACTTTATTTCAT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=1;TCR=56;TR=17;WE=33106916;WS=33106898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr11	33113653	rs7950763	T	C	1709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=0;PP=1498;ReadPosRankSum=-0.260;SC=TAAAAATAATTTTAAACAGGT;SOR=1.090;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=97;TCF=97;TCR=0;TR=57;WE=33113661;WS=33113643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,58:0.59:99
chr11	33113910	rs113144162	A	AT	2219.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=0.962;QD=12.54;ReadPosRankSum=-0.309;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,93:0.53:177
chr11	33118274	rs7103953	A	G	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=357;ReadPosRankSum=0.909;SC=CTGCCTTTACAAAATGGAGCA;SOR=0.610;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=21;WE=33118282;WS=33118264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr11	33118529	rs11363325	GC	G	307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=329;ReadPosRankSum=-0.988;SC=ATATACCTATGCAAAAGAAAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=10;WE=33118537;WS=33118519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr11	33129997	rs11605353	C	T	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=28;PP=771;ReadPosRankSum=1.910;SC=AGAATTAATACTATTTTTTTA;SOR=0.608;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=87;TCF=24;TCR=63;TR=40;WE=33130005;WS=33129987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,40:0.43:93
chr11	33183017	rs3736213	A	G	1498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.711;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=42;PP=1244;ReadPosRankSum=0.979;SC=CGCCCACTCAAATATGAATTA;SOR=0.241;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=91;TCF=11;TCR=80;TR=50;WE=33183025;WS=33183007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,54:0.56:96
chr11	33183073	rs3808985	G	A	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.934;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=474;ReadPosRankSum=0.620;SC=TGTGGCTTCCGCATTAACTTC;SOR=0.091;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=22;WE=33183081;WS=33183063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr11	33307937	rs34512764	CT	C	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=7.040;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQRankSum=1.550;QD=3.22;ReadPosRankSum=0.366;SOR=0.172;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,15:0.31:49
chr11	33360783	rs3847592	A	G	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=308;ReadPosRankSum=0.556;SC=AGATAATTGTAGTTCCCTCTC;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=14;WE=33360791;WS=33360773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr11	33360886	rs5790925	AT	A	4059.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=76;NR=27;PP=2973;SC=TGAAATTTTGATTTTCTTAGG;SOR=2.476;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=114;TCF=83;TCR=31;TR=103;WE=33360894;WS=33360876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr11	33362456	.	C	T	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=114;ReadPosRankSum=1.299;SC=CAATGTACCTCAATTTAAAAC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=33362464;WS=33362446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr11	33362723	rs266470	G	T	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.449;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=622;ReadPosRankSum=0.000;SC=TAATGATTGCGCATTTTACTT;SOR=0.121;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=29;WE=33362731;WS=33362713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr11	33370884	rs4756641	G	A	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=27;PP=568;ReadPosRankSum=0.699;SC=CTACTAAAAAGCCTACGATTT;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=58;TCF=2;TCR=56;TR=28;WE=33370892;WS=33370874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr11	33640104	rs768474	A	C	2680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.629;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=61;PP=1757;ReadPosRankSum=1.305;SC=CTCTGTCTACAGAAGCCGGCA;SOR=0.809;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=206;TCF=91;TCR=115;TR=109;WE=33640112;WS=33640094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,115:0.52:221
chr11	33719821	rs831611	T	C	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.107;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=429;ReadPosRankSum=-1.943;SC=CCACACAAAGTGGGCACTGTA;SOR=0.105;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=21;WE=33719829;WS=33719811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr11	33721175	rs4755893	G	C	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=28;PP=781;ReadPosRankSum=-1.322;SC=GACTTCAGACGTAAGACCAGA;SOR=0.719;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=25;TCR=64;TR=39;WE=33721183;WS=33721165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,41:0.45:91
chr11	33721261	rs4755894	T	G	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=369;ReadPosRankSum=0.411;SC=CCCCCAGCATTGAGAAGTGGA;SOR=0.582;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=15;WE=33721269;WS=33721251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr11	33722084	rs149234067	G	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=80;ReadPosRankSum=1.981;SC=GGCGGGGAGCGCCTGGGACAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=5;WE=33722092;WS=33722074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr11	33773161	rs7479064	G	C	1257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=29;PP=1108;SC=CACCTATAAAGCAGGAAAGGG;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=33773169;WS=33773151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	33775982	rs2272065	A	G	1995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=19;PP=1718;SC=GGGGGAAAAAAGACTTTTTTC;SOR=1.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=62;WE=33775990;WS=33775972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	33777334	rs1402954	C	T	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=384;ReadPosRankSum=1.334;SC=TGGTAGAAAACTTCATTTTTG;SOR=0.941;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=52;TCF=48;TCR=4;TR=20;WE=33777342;WS=33777324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr11	33880896	rs3740616	T	A	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=466;ReadPosRankSum=-0.519;SC=GCCCGGGGACTCGGGCCTATA;SOR=0.439;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=57;TCF=51;TCR=6;TR=24;WE=33880904;WS=33880886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr11	33881016	rs3740617	T	C	1488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.340;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=36;PP=1092;ReadPosRankSum=0.116;SC=AGGCGGCGCATTTGAAACATT;SOR=0.930;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=116;TCF=49;TCR=67;TR=59;WE=33881024;WS=33881006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,62:0.51:121
chr11	33886294	rs2038602	A	G	2401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.496;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=39;PP=1726;ReadPosRankSum=0.249;SC=AGCGGTCCCCAATGTTCTGCT;SOR=0.633;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=210;TCF=125;TCR=85;TR=94;WE=33886302;WS=33886284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,102:0.45:225
chr11	33891357	.	G	C	93	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=1;NR=6;PP=93;QD=18.2530303639;SC=CCGGCCGCCCGGAGCCCCTCG;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=7;WE=33891365;WS=33891347;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,7:0.44:16
chr11	34093349	rs10718447	AT	A	3814.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=61;PP=2974;SC=AAGATGTTATATTTTTTATTT;SOR=0.708;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=110;TCF=45;TCR=65;TR=106;WE=34093357;WS=34093339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr11	34107785	rs4755360	G	A	4717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=87;NR=52;PP=2965;SC=ATTTTAGTCAGACTCTGTAAC;SOR=1.406;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=88;TCR=52;TR=139;WE=34107793;WS=34107775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr11	34113717	rs2982592	C	T	4412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=129;PP=2965;SC=GTTTTAGTAGCAGACCATATG;SOR=5.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=5;TCR=129;TR=134;WE=34113725;WS=34113707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr11	34149199	rs2957512	T	C	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=28;PP=863;SC=CTTGCAGATTTAGGGGCATGT;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=34149207;WS=34149189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	34152939	rs2957516	T	C	2787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=33;PP=2425;SC=GCGGACACTGTATGAGGTTTC;SOR=1.382;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=56;TCR=33;TR=89;WE=34152947;WS=34152929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	34154641	rs2957518	C	T	8072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=122;NR=127;PP=2965;SC=TTCTGCCTCCCGTGCCCCCCA;SOR=0.709;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=249;TCF=122;TCR=127;TR=249;WE=34154649;WS=34154631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr11	34158411	rs2982615	A	G	2326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=43;PP=1945;SC=GGTAGCTGGTATCGGTGCTAG;SOR=1.276;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=27;TCR=43;TR=70;WE=34158419;WS=34158401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	34158431	rs2957521	T	C	2172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=30;PP=1766;SC=GCCTGCTATTTGTGGCGTGCT;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=38;TCR=30;TR=68;WE=34158439;WS=34158421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	34162549	rs79872650	G	A	1420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=15;PP=1068;ReadPosRankSum=-0.169;SC=AATAGCTTTGGTCAAGAGAGT;SOR=0.691;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=86;TCR=32;TR=55;WE=34162557;WS=34162539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,56:0.46:123
chr11	34163705	rs2982612	T	C	4073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=36;PP=2965;SC=TGCAGGTAGATGGAAGAGAAG;SOR=1.954;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=90;TCR=36;TR=126;WE=34163713;WS=34163695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr11	34176214	rs2957525	A	G	2649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=8;PP=2221;SC=TGGGCACCCTAGCCCAGGCCC;SOR=4.174;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=72;TCR=8;TR=80;WE=34176222;WS=34176204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr11	34188982	rs7120749	A	G	2573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=65;PP=2026;SC=ATGGTGAACCAGAGTTAACAA;SOR=3.556;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=12;TCR=65;TR=77;WE=34188990;WS=34188972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	34189564	rs4756111	A	G	6969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=96;NR=118;PP=2965;SC=TGCACGTGCTAAACTGTTTGC;SOR=0.951;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=214;TCF=96;TCR=118;TR=214;WE=34189572;WS=34189554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr11	34226041	rs2955944	A	G	3435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=37;PP=2695;SC=CCCAGCCCTGAGACCTCGCCG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=72;TCR=37;TR=109;WE=34226049;WS=34226031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr11	34470679	rs769218	G	A	1136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=0;PP=912;SC=ACCCGTGACAGTGTAAATGAA;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=34470687;WS=34470671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	34482908	rs769217	C	T	5438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=1.811;SC=ACCAGCGTGACGGCCCGATGT;SOR=0.344;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=76;TCR=97;TR=172;WE=34482916;WS=34482898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,176:0.99:177
chr11	34532993	rs11606405	T	C	1779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.566;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=17;PP=1397;ReadPosRankSum=1.672;SC=GTCATCATTCTAGCTGCCTAG;SOR=0.541;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=137;TCF=105;TCR=32;TR=68;WE=34533001;WS=34532983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,70:0.50:141
chr11	34643780	rs286920	A	G	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-6.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.964;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=0;PP=761;ReadPosRankSum=1.328;SC=CTGATTTACCATGCTCCCAGG;SOR=1.747;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=84;TCF=80;TCR=4;TR=44;WE=34643788;WS=34643770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,48:0.55:87
chr11	34678435	rs435537	C	G	6479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=133;NR=71;PP=2965;SC=CAATTAAACGCCTCTCATTTT;SOR=1.499;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=204;TCF=133;TCR=71;TR=204;WE=34678443;WS=34678425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr11	34680053	rs3818514	G	A	5285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=123;NR=29;PP=2965;SC=TAGATCATTAGTAACCTGCCT;SOR=2.734;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=153;TCF=124;TCR=29;TR=152;WE=34680061;WS=34680043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr11	34680598	rs11032804	C	A	2797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=81;PP=2463;SC=ATGAGGGGAACAAGAAACTAC;SOR=7.403;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=82;TCF=1;TCR=81;TR=82;WE=34680606;WS=34680588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr11	34904399	rs2288667	C	T	1670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.351;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=29;PP=1254;ReadPosRankSum=0.460;SC=CAGTGTTTATCGAAACAGAGT;SOR=0.939;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=125;TCF=66;TCR=59;TR=68;WE=34904407;WS=34904389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,68:0.52:130
chr11	34904509	rs2288668	T	G	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=319;ReadPosRankSum=0.849;SC=ATTCTATTTTTCCCTCAACAT;SOR=0.631;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=15;WE=34904517;WS=34904499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr11	34905145	rs2303957	T	C	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=300;ReadPosRankSum=0.535;SC=CAGTTAGACATGCTGTTTGTG;SOR=0.412;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=18;WE=34905153;WS=34905135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr11	34909827	rs35393135	GA	G	1000.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=1082;ReadPosRankSum=0.066;SC=TAAGAAAAAGGAAAAAAAAAT;SOR=0.280;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=51;TCF=50;TCR=1;TR=24;WE=34909841;WS=34909817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr11	34909833	rs61752923	A	C	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=1;PP=1061;ReadPosRankSum=-0.354;SC=AAAGGAAAAAAAAATACCTAT;SOR=1.022;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=48;TCF=47;TCR=1;TR=27;WE=34909841;WS=34909817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
chr11	34909926	rs1571133	T	G	1801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.129;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=31;PP=1399;ReadPosRankSum=1.113;SC=GAAAGAGAAGTGTGGCCATCA;SOR=0.467;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=125;TCF=70;TCR=55;TR=66;WE=34909934;WS=34909916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,70:0.53:132
chr11	34910077	rs1571134	G	A	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=378;ReadPosRankSum=-1.714;SC=ATATGGTTATGGGCTTATTTT;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=16;WE=34910085;WS=34910067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr11	34910397	rs1977420	C	T	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.490;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=583;ReadPosRankSum=-0.290;SC=ATTTATATCACAAACAAACAT;SOR=1.731;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=78;TCF=53;TCR=25;TR=32;WE=34910405;WS=34910387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,31:0.40:78
chr11	34910433	rs1977421	A	G	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.84;ReadPosRankSum=-0.583;SOR=0.689;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,49:0.46:107
chr11	34910545	.	T	C	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.838;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=554;ReadPosRankSum=0.619;SC=CTTGTGTGTATATTTAGTATA;SOR=0.556;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=23;WE=34910553;WS=34910535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr11	34911967	rs2303958	T	G	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=117;ReadPosRankSum=-0.143;SC=ATAAAATGAATGTTTTCTCTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=34911975;WS=34911964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr11	34912013	rs2303959	A	G	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=266;ReadPosRankSum=1.123;SC=GTAATTAAGAAGAAAAGACAC;SOR=0.874;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=12;WE=34912021;WS=34912003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr11	34912289	rs2915224	T	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=99;ReadPosRankSum=0.774;SC=CTGGTGGCATTGTAGAATATT;SOR=0.458;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=7;WE=34912297;WS=34912279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr11	34916484	rs1326940	A	G	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.329;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=450;ReadPosRankSum=1.656;SC=TGTTCTTTGGATATAACACAT;SOR=0.455;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=24;WE=34916492;WS=34916474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr11	34916710	rs1326941	A	G	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=420;ReadPosRankSum=0.207;SC=TCAAGTAACTATTCCAGCTGG;SOR=0.631;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=22;WE=34916718;WS=34916700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr11	34916785	rs1326942	A	G	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=178;ReadPosRankSum=1.199;SC=AGTACAGTGAAGGAAAAAACT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=9;WE=34916793;WS=34916775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr11	34918273	rs34774694	G	GCAA	2773.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.313;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=19;PP=2782;ReadPosRankSum=1.228;SC=GCATAATAAAGCAACAACAAC;SOR=0.309;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=171;TCF=129;TCR=42;TR=56;WE=34918281;WS=34918263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,72:0.46:157
chr11	34918375	rs2986429	A	G	4103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.321;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=73;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.728;SC=GTGACCTTGAACTTCAATTTT;SOR=0.718;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=312;TCF=159;TCR=153;TR=159;WE=34918383;WS=34918365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,160:0.50:318
chr11	34937813	rs2956114	G	A	1659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.226;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=22;PP=1240;ReadPosRankSum=-1.820;SC=TCTCCCTCCCGAGCATCACAG;SOR=0.909;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=136;TCF=88;TCR=48;TR=67;WE=34937821;WS=34937803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,68:0.48:141
chr11	34937884	rs2956113	G	A	1362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=35;PP=1073;ReadPosRankSum=0.556;SC=CTTTGCGCGCGGCGCTTAGCC;SOR=0.760;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=122;TCF=44;TCR=78;TR=54;WE=34937892;WS=34937874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,55:0.44:126
chr11	34937901	rs2956112	A	G	1248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.698;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=996;ReadPosRankSum=-0.285;SC=AGCCTGGGATACGGCAGCGAG;SOR=0.507;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=104;TCF=32;TCR=72;TR=47;WE=34937909;WS=34937891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,48:0.45:107
chr11	34937931	rs2956111	G	A	1044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=29;PP=866;ReadPosRankSum=0.596;SC=GCAATCAGGCGGCGCTGAGGG;SOR=0.602;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=77;TCF=17;TCR=60;TR=38;WE=34937939;WS=34937921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,38:0.48:79
chr11	34938115	rs2956110	C	A	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.283;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=377;ReadPosRankSum=-0.785;SC=CCGCTAGCGTCTGGGGGCGTG;SOR=0.446;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=17;WE=34938123;WS=34938105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr11	34938265	rs2956109	C	T	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.278;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=524;ReadPosRankSum=-0.716;SC=TGGGCTTCCCCGGCCGCCGAA;SOR=0.412;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=56;TCF=36;TCR=20;TR=28;WE=34938273;WS=34938255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr11	34953088	rs34345153	G	GT	503.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.39;MQRankSum=0.000;QD=8.69;ReadPosRankSum=-0.894;SOR=1.319;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,29:0.50:58
chr11	34963224	rs2915190	C	T	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.532;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=279;ReadPosRankSum=-0.996;SC=TTGTGAAAGCCTCAGGACTTA;SOR=0.069;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=12;WE=34963232;WS=34963214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr11	34963416	rs2986407	T	C	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=41;PP=786;ReadPosRankSum=-0.588;SC=GGCCCCCGGGTGGGCCTCTGC;SOR=0.627;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=26;TCR=82;TR=54;WE=34963424;WS=34963406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,55:0.50:109
chr11	34969271	rs3215780	A	AT	747.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.372;NF=0;NR=23;PP=882;ReadPosRankSum=0.085;SC=TGTCTACTACATAATACATTT;SOR=0.823;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=23;WE=34969279;WS=34969261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr11	34978892	rs2243948	G	A	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=537;ReadPosRankSum=-0.412;SC=GCAGTCATGGGGTTTTACTTC;SOR=0.992;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=68;TCR=1;TR=27;WE=34978900;WS=34978882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,27:0.39:70
chr11	34982146	rs2732554	T	G	2070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.80;ReadPosRankSum=-0.376;SOR=0.947;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,53:0.56:95
chr11	34982146	.	TTC	GTA	2544	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=0;NR=46;PP=2544;QD=20;SC=AAAGAGCTTATTCAGTCTTAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=90;TCF=0;TCR=90;TR=46;WE=34982156;WS=34982136;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:44,46:0.51:90
chr11	34982148	rs2767036	C	A	2070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.51;ReadPosRankSum=-0.202;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,51:0.55:92
chr11	34991727	rs497582	T	C	2801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.640;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=51;PP=2225;ReadPosRankSum=0.090;SC=TTCGAAGAGTTATTGCCAAGA;SOR=0.623;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=210;TCF=106;TCR=104;TR=108;WE=34991735;WS=34991717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,111:0.51:216
chr11	34999484	rs733567	G	T	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.007;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=235;ReadPosRankSum=0.294;SC=TAATATTATTGATCCAGGACC;SOR=1.368;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=13;WE=34999492;WS=34999474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr11	34999745	rs10768108	C	G	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.935;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=557;ReadPosRankSum=1.887;SC=TAGCAGACTTCAAATGATTTT;SOR=0.888;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=65;TCF=29;TCR=36;TR=28;WE=34999753;WS=34999735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,30:0.44:68
chr11	35161076	rs3751031	T	C	2046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.146;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=26;PP=1419;ReadPosRankSum=-0.682;SC=GGATTTGCGCTAAACCGTTGG;SOR=0.916;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=135;TCF=81;TCR=54;TR=71;WE=35161084;WS=35161066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,80:0.56:144
chr11	35161285	rs75624136	A	G	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=434;ReadPosRankSum=0.422;SC=GCCAAGCCCCACCGGGCTGTG;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=8;WE=35161296;WS=35161275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr11	35161288	rs12365962	G	A	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.532;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=377;ReadPosRankSum=-0.257;SC=AAGCCCCACCGGGCTGTGTCT;SOR=0.582;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=8;WE=35161296;WS=35161275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr11	35198007	rs111607249	G	A	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=145;ReadPosRankSum=0.954;SC=TTGTAGGCATGAGCCACCGCG;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=9;WE=35198015;WS=35197997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr11	35198032	rs4756195	A	G	1427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=0;PP=1228;SC=GCCTTATTTGACTTTTTAAGG;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=35198040;WS=35198022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	35198108	rs4756196	A	G	3883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=14;PP=2965;ReadPosRankSum=1.051;SC=TAACATTTCTATTTCTTCCCA;SOR=2.548;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=99;TCR=14;TR=112;WE=35198116;WS=35198098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,116:0.99:117
chr11	35201982	rs76393888	C	T	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=33;PP=826;ReadPosRankSum=-0.548;SC=TGTCTGTTGGCGTGAAAGGCT;SOR=0.723;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=81;TCF=17;TCR=64;TR=41;WE=35201990;WS=35201972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,43:0.51:85
chr11	35223158	rs11033025	T	C	3552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=98;NR=12;PP=2965;SC=AATGGAAGAATAGAATCATTA;SOR=4.057;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=113;TCF=100;TCR=13;TR=110;WE=35223166;WS=35223148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr11	35226155	rs9666607	A	G	9555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=169;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.198;SC=CAAACACCCAAAGAAGACTCC;SOR=1.207;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=277;TCF=107;TCR=170;TR=275;WE=35226163;WS=35226145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,289:0.99:291
chr11	35229673	rs1467558	T	C	13788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=448;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=329;NR=103;PP=2965;SC=AGTCATAGTATAACGCTTCAG;SOR=2.384;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=435;TCF=331;TCR=104;TR=432;WE=35229681;WS=35229663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,445:1.00:445
chr11	35243095	rs139832018	G	A	1491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.549;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=14;PP=1077;ReadPosRankSum=1.831;SC=CCCCTGCAGCGCTGACTGTGG;SOR=0.448;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=103;TCR=31;TR=60;WE=35243103;WS=35243085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,63:0.46:137
chr11	35244044	rs7116739	G	C	4002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=81;PP=2962;SC=CAGTCACCTCGCTAGAACTGA;SOR=2.218;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=27;TCR=81;TR=108;WE=35244066;WS=35244034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr11	35244058	rs7116432	A	G	1045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.054;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=35;PP=780;ReadPosRankSum=-1.616;SC=GAACTGACACATGGGCTGTTT;SOR=0.935;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=97;TCF=16;TCR=81;TR=41;WE=35244066;WS=35244034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,43:0.43:100
chr11	35244145	.	AAT	A	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=-0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.57;MQRankSum=-0.385;QD=4.47;ReadPosRankSum=1.569;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr11	35276299	.	C	G	1988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.800;ClippingRankSum=0.000;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.195;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=20;PP=1449;ReadPosRankSum=-1.251;SC=ACTTCTGACTCTACAAAGCAG;SOR=0.989;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=137;TCF=96;TCR=41;TR=71;WE=35276307;WS=35276289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,76:0.52:145
chr11	35287000	rs35055326	G	GT	380.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.60;ReadPosRankSum=-1.097;SOR=0.262;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,27:0.40:68
chr11	35302668	rs2236273	A	G	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.047;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=100;ReadPosRankSum=-0.433;SC=CCCCCACCCCATACTCTCCAC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=35302676;WS=35302658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr11	35323200	rs2273689	A	G	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.452;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=42;PP=932;ReadPosRankSum=0.491;SC=GACCTGTTGGATGAATCACAT;SOR=1.148;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=93;TCF=8;TCR=85;TR=45;WE=35323208;WS=35323190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,47:0.48:97
chr11	35344345	rs7115450	A	G	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.121;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=626;ReadPosRankSum=-1.144;SC=AGAACCAGGAAGCAGAGATTT;SOR=0.328;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=50;TCF=9;TCR=41;TR=28;WE=35344353;WS=35344335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,29:0.55:53
chr11	35440394	rs41282922	C	G	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.894;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=2;PP=687;ReadPosRankSum=0.779;SC=CCACCACCTCCGAGGCCCGCC;SOR=0.203;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=62;TCF=60;TCR=2;TR=38;WE=35440402;WS=35440384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,38:0.60:63
chr11	35453796	rs11344760	GC	G	1141.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=2;PP=1204;SC=CCCTGGCACAGCCCAAGTTCA;SOR=4.743;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=30;WE=35453804;WS=35453786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	35456453	rs675227	G	C	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.743;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=496;ReadPosRankSum=1.106;SC=AAGGTGAACTGTATGGGCATG;SOR=2.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=18;WE=35456461;WS=35456443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr11	35492351	rs16927500	G	A	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=26;PP=599;ReadPosRankSum=-0.239;SC=CAAACTCCAGGCTCAACATGA;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=67;TCF=11;TCR=56;TR=31;WE=35492359;WS=35492341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,33:0.48:69
chr11	36031593	rs262404	G	A	3375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=86;NR=13;PP=2714;SC=GGACTGAAGAGTATAACCTAC;SOR=3.767;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=86;TCR=13;TR=99;WE=36031601;WS=36031583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr11	36057626	rs262451	G	A	1836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=7.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=10;PP=1386;ReadPosRankSum=-0.706;SC=TTGCTGTGCCGTCTGACCTGT;SOR=0.619;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=188;TCF=162;TCR=26;TR=71;WE=36057634;WS=36057616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,76:0.40:192
chr11	36103228	rs1138807	A	G	8801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.206;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=152;NR=135;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.800;SC=AATGTGGCCCAACCTTCTTCC;SOR=0.377;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=288;TCF=152;TCR=136;TR=287;WE=36103236;WS=36103218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,294:1.00:295
chr11	36103381	rs3740962	A	G	1447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.291;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=45;PP=1207;ReadPosRankSum=-0.569;SC=CCGCCAGCCAAACTTGTCCAC;SOR=0.022;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=94;TCF=6;TCR=88;TR=51;WE=36103389;WS=36103371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,52:0.54:96
chr11	36251046	rs4755444	G	A	3251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=81;PP=2606;SC=ACCTGTAAGGGTGTCTCAAGT;SOR=2.925;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=18;TCR=81;TR=99;WE=36251054;WS=36251036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr11	36293048	rs7107433	G	A	1174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.398;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=13;PP=935;ReadPosRankSum=0.972;SC=AAAAGCCCCAGAGAGATGGTC;SOR=0.960;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=128;TCF=83;TCR=45;TR=45;WE=36293056;WS=36293038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,48:0.36:132
chr11	36298555	rs2289986	C	T	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=2;PP=661;ReadPosRankSum=0.291;SC=TTGGTTTCTGCCAAAATCTCT;SOR=0.663;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=57;TCF=54;TCR=3;TR=33;WE=36298563;WS=36298545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,33:0.60:55
chr11	36310677	rs12418067	C	T	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=268;ReadPosRankSum=-2.098;SC=GGAGGTTGTACTGCGCCTTCA;SOR=0.922;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=14;WE=36310685;WS=36310673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr11	36311014	rs7939948	G	T	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.242;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=335;ReadPosRankSum=-0.945;SC=TCACGTGGCTGTCGCTGTTGT;SOR=0.048;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=21;WE=36311022;WS=36311004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr11	36422792	rs330261	G	A	4894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=98;PP=2965;SC=ATTCCAAGCAGCTCGGCAGGC;SOR=1.310;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=61;TCR=99;TR=159;WE=36422800;WS=36422782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr11	36453247	rs746762	C	A	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=283;ReadPosRankSum=1.104;SC=GAAGCCTTAACCTTCCAAGAG;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=13;WE=36453255;WS=36453237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr11	36453506	rs746761	T	C	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=36;PP=828;ReadPosRankSum=-0.078;SC=TGTGACTCAGTCTTTGATGTC;SOR=0.545;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=98;TCF=13;TCR=85;TR=42;WE=36453514;WS=36453496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,43:0.43:100
chr11	36458777	rs577054	C	A	2836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=3;PP=2337;ReadPosRankSum=-0.879;SC=TCCTGTAGCACCACACCTCTG;SOR=4.664;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=77;TCR=3;TR=78;WE=36458785;WS=36458767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,84:0.99:85
chr11	36458997	rs62621409	A	G	1582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=6.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.762;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=49;PP=1274;ReadPosRankSum=-0.621;SC=GACTCTCCCTACCCTGCAGGC;SOR=1.019;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=123;TCF=26;TCR=97;TR=60;WE=36459005;WS=36458987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,60:0.47:127
chr11	36459130	rs4756316	T	C	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=232;ReadPosRankSum=-0.265;SC=AACTTGGAGATTGGGCGCTTG;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=10;WE=36459138;WS=36459120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr11	36484208	rs514352	T	C	1315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=28;PP=1032;SC=CCAACATCACTGACAACCCTG;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=45;WE=36484216;WS=36484198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	36518824	rs3830511	T	TA	1613.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.369;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.09;MQRankSum=1.638;NF=7;NR=50;PP=1324;ReadPosRankSum=-0.348;SC=ATCCTATAATTAAAAAAATAA;SOR=0.844;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=159;TCF=27;TCR=132;TR=57;WE=36518832;WS=36518814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,72:0.43:167
chr11	36595600	rs3740955	A	G	6317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=73;PP=2965;SC=GCCCGTCAGCACAAGAGAAGA;SOR=1.347;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=209;TCF=135;TCR=74;TR=208;WE=36595608;WS=36595590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr11	36597313	rs2227973	A	G	8047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=156;PP=2965;SC=GAAGTGTATAAGAATCCCAAT;SOR=1.364;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=246;TCF=90;TCR=156;TR=246;WE=36597321;WS=36597303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr11	36612090	rs1818545	C	T	2000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=47;PP=1496;SC=TCTTCTAACACGGCTCATTTG;SOR=2.985;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=9;TCR=47;TR=56;WE=36612098;WS=36612080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	36655089	rs3758874	A	G	966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=26;PP=778;SC=CAGTTATTAGATCTGTAATTC;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=36655097;WS=36655079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	36669778	rs1566245	C	T	6465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=170;PP=2965;SC=AGAAATGCTGCATGCTTCTGT;SOR=3.118;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=207;TCF=37;TCR=170;TR=207;WE=36669786;WS=36669768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr11	36680719	rs61753861	G	A	4369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.833;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=88;PP=2962;ReadPosRankSum=0.022;SC=CCCAGACTTAGAGAAATCCTG;SOR=0.581;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=310;TCF=140;TCR=170;TR=166;WE=36680727;WS=36680709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,172:0.53:326
chr11	40137543	rs2953310	T	C	5473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=103;PP=2965;SC=TTTCCAAGTGTCTCAAGTGCT;SOR=1.248;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=64;TCR=103;TR=167;WE=40137551;WS=40137533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr11	42209105	rs11416548	G	GA	2188.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.767;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.427;NF=79;NR=2;PP=1207;ReadPosRankSum=-0.331;SC=TACTGAAAGAGAAAAAAAAAA;SOR=3.679;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=109;TCF=106;TCR=3;TR=81;WE=42209113;WS=42209095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:7,95:0.93:102
chr11	42259731	rs11036779	G	A	3019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.473;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=66;PP=2288;ReadPosRankSum=-0.755;SC=AAAATAAAGCGGGTCATAAGT;SOR=0.584;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=273;TCF=116;TCR=157;TR=120;WE=42259739;WS=42259721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,123:0.45:274
chr11	42262449	rs10837795	G	C	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=588;ReadPosRankSum=-0.275;SC=CTTTATGAAGGAAAAAAACCT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=27;WE=42262457;WS=42262445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr11	43357020	rs5743252	A	G	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=443;ReadPosRankSum=2.005;SC=AAATATGACTATTAGAAATAT;SOR=0.788;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=22;WE=43357028;WS=43357010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr11	43357037	rs5743253	A	G	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=413;ReadPosRankSum=-0.956;SC=ATATGACTTAAAATGTAAAAT;SOR=0.297;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=19;WE=43357045;WS=43357027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr11	43413157	rs202071795	TTTGCG	T	108.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=3.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.14;MQRankSum=-1.540;QD=2.79;ReadPosRankSum=2.302;SOR=1.341;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr11	43413158	rs67884453	TTGCG	T	491.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=1.326;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.14;MQRankSum=1.641;QD=12.29;ReadPosRankSum=-1.867;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr11	43419451	rs66991822	CGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	C	1034.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=2.376;QD=19.90;ReadPosRankSum=-2.223;SOR=0.355;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr11	43472895	rs6485426	G	C	7485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=191;PP=2965;SC=CTAAGTGTCTGTAACCTCTTC;SOR=3.882;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=216;TCF=25;TCR=191;TR=216;WE=43472903;WS=43472885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr11	43702581	rs4573669	G	A	1846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=48;PP=1598;SC=GCGGCGGCCCGGACCAGGCCT;SOR=2.998;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=59;TCF=11;TCR=48;TR=58;WE=43702589;WS=43702571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	43702615	rs4573668	G	C	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=35;PP=1255;SC=TAGTTCTGGGGTCTGCTCCTG;SOR=2.409;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=47;WE=43702623;WS=43702605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	43772549	rs12801203	A	G	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=4.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.40;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.122;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr11	43775734	rs4643069	A	G	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=270;ReadPosRankSum=0.421;SC=CAGTTATCCGATACTGACATA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=12;WE=43775742;WS=43775724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
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chr11	43876435	rs3736505	A	G	2182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=48;PP=1725;ReadPosRankSum=0.684;SC=TTTTTGAATCACAAATCAATA;SOR=0.692;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=89;TCR=94;TR=93;WE=43876443;WS=43876425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,94:0.51:186
chr11	43876698	rs11555762	C	T	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.039;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=855;ReadPosRankSum=0.691;SC=CCCTAGGGCTCGATAATCTCA;SOR=0.346;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=96;TCF=55;TCR=41;TR=45;WE=43876706;WS=43876688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,47:0.47:100
chr11	43905484	rs2271817	T	G	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-8.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.821;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=10;PP=1398;ReadPosRankSum=-0.825;SC=GTCAGTATCCTTGAGGATTAA;SOR=0.829;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=171;TCF=149;TCR=22;TR=82;WE=43905492;WS=43905474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,85:0.49:174
chr11	43908104	rs3740983	T	G	2499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.597;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=16;PP=1953;ReadPosRankSum=1.154;SC=CCACTGGGTATAGCATATTGT;SOR=1.073;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=162;TCF=129;TCR=33;TR=88;WE=43908112;WS=43908094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,91:0.55:165
chr11	43908230	rs7101434	C	T	2347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=5.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.485;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=76;PP=1878;ReadPosRankSum=0.308;SC=AAGAAGTGACCGTAATTATCA;SOR=1.141;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=190;TCF=34;TCR=156;TR=88;WE=43908238;WS=43908220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,92:0.47:196
chr11	43911211	rs35076527	A	G	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.340;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=242;ReadPosRankSum=1.456;SC=TGTTTCCACTAACATTTAGAG;SOR=0.100;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=13;WE=43911219;WS=43911201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr11	43911365	rs2434478	T	C	2768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=54;PP=1987;SC=AACAGAGGACTGGCATCAGAG;SOR=1.067;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=39;TCR=54;TR=93;WE=43911373;WS=43911355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	43913604	rs16937692	G	A	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.753;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=898;ReadPosRankSum=1.069;SC=TAACTTATCAGCAACCAAGAC;SOR=0.606;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=95;TCF=52;TCR=43;TR=40;WE=43913612;WS=43913594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,41:0.41:100
chr11	43913707	rs3740985	G	A	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.966;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=316;ReadPosRankSum=-0.843;SC=CATTGGTATGGTTTTATAGAC;SOR=0.326;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=18;WE=43913715;WS=43913697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,19:0.39:49
chr11	43940566	rs7926534	T	C	1410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=5;PP=1170;SC=AAACATTTATTACAACAAATG;SOR=3.816;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=44;WE=43940574;WS=43940556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	43940644	rs1048928	G	T	3639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=46;PP=2774;SC=TGGATCATGGGACCTTGTTAA;SOR=1.285;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=120;TCF=74;TCR=46;TR=118;WE=43940652;WS=43940634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr11	43946967	rs1973717	A	G	3194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=65;PP=2540;SC=GATCGTCTCCACGCTGCACCA;SOR=1.148;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=45;TCR=66;TR=110;WE=43946975;WS=43946957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr11	43947990	rs12797684	T	C	4239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=25;PP=2965;SC=CAGGCCACTTTCAAACTCTGT;SOR=2.851;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=100;TCR=25;TR=125;WE=43947998;WS=43947980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr11	43954812	rs2434476	T	C	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=38;PP=985;SC=TACTAGCTGGTGGATGTCCCT;SOR=3.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=43;WE=43954820;WS=43954802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	43964842	rs7077	G	C	2820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.65;SOR=1.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr11	44080210	rs2074051	T	C	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.993;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=32;PP=553;ReadPosRankSum=0.077;SC=AGGCTGGTTCTGCCTCATCTT;SOR=1.341;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=71;TCF=9;TCR=62;TR=36;WE=44080218;WS=44080200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,39:0.53:74
chr11	44089161	rs178514	G	A	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.643;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=566;ReadPosRankSum=0.277;SC=AGGCCTGTGCGTTTTGTCTTT;SOR=0.330;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=99;TCF=79;TCR=20;TR=36;WE=44089169;WS=44089151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,37:0.38:97
chr11	44096115	rs79453091	G	A	1192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=13;PP=913;ReadPosRankSum=0.513;SC=GATGCACCGTGGGTTGGGGAC;SOR=0.763;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=102;TCF=73;TCR=29;TR=48;WE=44096123;WS=44096105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,49:0.46:106
chr11	44096238	rs178521	G	A	3094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.95;NF=21;NR=71;PP=2639;SC=GAATGTGAGTGGCCCCCTCCA;SOR=2.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=21;TCR=71;TR=92;WE=44096246;WS=44096228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr11	44096300	.	T	TTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTC	369.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQRankSum=-0.000;QD=92.43;ReadPosRankSum=1.383;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr11	44097226	rs178523	A	G	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.621;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=26;PP=654;ReadPosRankSum=-2.111;SC=AAGGGCTGCAATAGTATGCTT;SOR=1.238;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=63;TCF=14;TCR=49;TR=32;WE=44097234;WS=44097216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr11	44098751	rs2074041	G	A	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=360;ReadPosRankSum=-0.350;SC=GGCTTGGAGAGGGACTGGGGA;SOR=0.646;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=18;WE=44098759;WS=44098741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr11	44098969	rs2074042	G	A	1544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.100;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=47;PP=1292;ReadPosRankSum=-1.575;SC=GCCTGCCTGTGGTCAAGAGTT;SOR=1.119;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=109;TCF=24;TCR=85;TR=58;WE=44098977;WS=44098959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,58:0.53:109
chr11	44098985	rs2074043	G	A	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.540;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=37;PP=976;ReadPosRankSum=1.132;SC=GAGTTTCCTGGGTCTGAATTT;SOR=1.449;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=94;TCF=16;TCR=78;TR=42;WE=44098993;WS=44098975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,41:0.45:92
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chr11	44104701	rs79395013	C	CCT	6001.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=36;PP=2965;SC=GATCTTCTGGCCTCTTTCACC;SOR=2.076;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=71;TCR=39;TR=101;WE=44104709;WS=44104691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr11	44104981	rs3107275	C	T	2424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.779;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=34;PP=1996;ReadPosRankSum=0.469;SC=CAGTACCTGCCCAAGGGCACC;SOR=1.144;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=208;TCF=120;TCR=88;TR=92;WE=44104989;WS=44104971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,92:0.43:214
chr11	44117898	rs11037860	T	G	1077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=26;PP=844;SC=GGGCATGTTATGCCGGGGACT;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=44117906;WS=44117888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	44129086	rs11037864	A	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.719;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=150;ReadPosRankSum=-2.034;SC=GTGAGCTGAGATTGCACCACT;SOR=0.346;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=8;WE=44129094;WS=44129076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr11	44135994	rs11606743	C	T	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=36;ReadPosRankSum=0.134;SC=ATCTTTCCCACCTCCATGCAG;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=4;WE=44136002;WS=44135984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr11	44146257	rs10769018	A	G	2645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=16;PP=2086;SC=ACTTACTGTCATAAGTTTAAT;SOR=3.009;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=75;TCR=16;TR=91;WE=44146265;WS=44146247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr11	44151457	rs7125352	T	C	4359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=115;NR=13;PP=2965;SC=GGGAAAGAGATAATACTTACC;SOR=4.080;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=115;TCR=13;TR=128;WE=44151465;WS=44151447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr11	44151480	rs11037881	G	T	2151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-5.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.846;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=15;PP=1657;ReadPosRankSum=0.623;SC=AAGGGATGTGGGGCTGAAGGA;SOR=1.652;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=192;TCF=146;TCR=46;TR=82;WE=44151488;WS=44151470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,87:0.43:201
chr11	44151577	rs11037882	T	A	3933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=74;PP=2875;ReadPosRankSum=2.607;SC=ATGTAAACTGTTTTGCTGTTG;SOR=0.690;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=310;TCF=145;TCR=165;TR=143;WE=44151585;WS=44151560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,155:0.47:327
chr11	44255614	rs11037909	T	C	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=394;ReadPosRankSum=0.364;SC=ATTTATCAGCTAAAGGGAACT;SOR=0.643;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=19;WE=44255622;WS=44255604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr11	44257802	rs3740878	T	C	2103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.082;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=38;PP=1612;ReadPosRankSum=0.550;SC=TTATTGTCCTTGACACTGACA;SOR=0.974;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=188;TCF=103;TCR=85;TR=91;WE=44257810;WS=44257792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,91:0.47:195
chr11	44286566	rs3802805	G	A	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.657;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=1122;ReadPosRankSum=-0.409;SC=TCTGGCCCACGTGACTGCCAG;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=123;TCF=64;TCR=59;TR=59;WE=44286574;WS=44286556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,61:0.48:127
chr11	44289289	rs10742699	A	G	3090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=88;PP=2592;SC=CGTTTGGGAAACGGTGCGGCC;SOR=7.636;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=89;TCF=1;TCR=88;TR=89;WE=44289297;WS=44289279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	44289312	rs10769024	C	G	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=524;ReadPosRankSum=0.038;SC=ACATAAATATCAACCTTGGTC;SOR=0.551;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=23;WE=44289320;WS=44289302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr11	44296828	rs11037927	C	T	2430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=8;PP=1923;SC=TCAGGAGACCCCAACTGCAGC;SOR=3.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=59;TCR=8;TR=67;WE=44296836;WS=44296818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr11	44297054	rs10769028	T	C	11524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=197;NR=180;PP=2965;SC=TGTTGCTCTCTGAGTCGGCCT;SOR=0.752;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=377;TCF=197;TCR=180;TR=377;WE=44297062;WS=44297044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,385:1.00:385
chr11	44297253	rs11037929	A	G	2882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=78;PP=2540;SC=GTTGAACCAAACAAGAGAAGG;SOR=3.742;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=11;TCR=79;TR=89;WE=44297261;WS=44297243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr11	44297343	rs11037930	C	A	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=19;PP=670;SC=ATGCGAGGTCCGGAGACTTGG;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=44297351;WS=44297333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	44585933	rs934178	T	C	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=5;PP=747;ReadPosRankSum=1.057;SC=CTTACTCCACTCGTACAAAGC;SOR=0.883;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=32;WE=44585941;WS=44585923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,35:0.62:56
chr11	44608866	rs7930303	T	C	2197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=3;PP=2087;SC=GGAAAGAGGCTACATGAGCCT;SOR=5.549;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=71;TCF=68;TCR=3;TR=71;WE=44608874;WS=44608856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	44609129	rs7118753	T	A	1670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.401;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=53;PP=1335;ReadPosRankSum=2.949;SC=CTGAGAGGAGTGGTGGGTTGG;SOR=1.022;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=102;TCF=8;TCR=94;TR=57;WE=44609137;WS=44609119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,59:0.57:104
chr11	44609198	rs7102843	G	A	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.435;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=273;ReadPosRankSum=2.259;SC=GCCCTCAGGTGTTCAGTCTGA;SOR=0.074;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=16;WE=44609206;WS=44609188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr11	44627168	rs11604994	G	A	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=221;ReadPosRankSum=0.838;SC=CGGCAGGTGTGGGCAGTCCCC;SOR=0.336;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=12;WE=44627176;WS=44627158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr11	44636684	rs12788360	G	T	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.014;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=445;ReadPosRankSum=0.850;SC=CCCTGGGAGCGCCAGGAAAGT;SOR=2.867;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=18;WE=44636692;WS=44636674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
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chr11	44639921	rs2303863	C	T	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.739;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=26;PP=610;ReadPosRankSum=1.179;SC=AGGAGGTGTGCGGGGGGCTGC;SOR=1.501;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=53;TCF=5;TCR=48;TR=28;WE=44639929;WS=44639911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,29:0.51:57
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chr11	44919366	rs11038189	G	A	1642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=42;PP=1240;ReadPosRankSum=0.084;SC=GCTGATGCCCGAAGAACTGCC;SOR=0.652;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=190;TCF=75;TCR=115;TR=72;WE=44919374;WS=44919356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,73:0.37:195
chr11	44919413	rs11038190	T	C	1036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=33;PP=732;ReadPosRankSum=-0.109;SC=CCCTTCTCAGTGTACCTCTGC;SOR=0.629;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=135;TCF=42;TCR=93;TR=50;WE=44919421;WS=44919403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,52:0.37:141
chr11	44919495	rs10838380	C	T	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=405;ReadPosRankSum=-0.100;SC=GTGTCTCCTTCGGTCTTTCCC;SOR=0.340;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=20;WE=44919503;WS=44919485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr11	44924950	rs5791652	GC	G	1357.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.954;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.406;NF=28;NR=11;PP=1488;ReadPosRankSum=-2.257;SC=GAAAGTCAGGGCAGGAATAAC;SOR=0.488;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=58;TCR=22;TR=39;WE=44924958;WS=44924940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,42:0.48:88
chr11	44925038	rs11038198	A	G	1625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.251;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.976;NF=44;NR=25;PP=1201;ReadPosRankSum=1.066;SC=GTTGGGTTCCAGCAAGAGAGG;SOR=0.817;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=162;TCF=99;TCR=63;TR=69;WE=44925046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,72:0.43:166
chr11	44925359	rs11456363	C	CT	3530.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.578;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.382;NF=25;NR=68;PP=2933;ReadPosRankSum=-0.080;SC=GCTGGATTGCCTGGGTTCCAA;SOR=1.384;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=194;TCF=68;TCR=126;TR=93;WE=44925367;WS=44925349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,114:0.52:219
chr11	44928135	rs2306665	G	A	1303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=35;PP=1079;SC=CACAGGGGCCGGCGCTAGAGG;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=40;WE=44928143;WS=44928125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	44940828	rs2291334	G	A	1634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.383;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=18;PP=1166;ReadPosRankSum=-1.632;SC=CGACACAGACGTCTTCTCTGC;SOR=1.234;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=145;TCF=98;TCR=47;TR=66;WE=44940836;WS=44940818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,70:0.45:156
chr11	44948052	rs835988	G	T	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=117;ReadPosRankSum=-0.192;SC=CTGCCAAGTCGCTGTTTCTGG;SOR=0.069;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=7;WE=44948060;WS=44948042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr11	44950784	rs835990	G	A	2423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=57;PP=1930;SC=CCAGCACCCAGTGTCCTCCCG;SOR=1.996;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=21;TCR=57;TR=78;WE=44950792;WS=44950774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr11	44952285	rs10838390	C	T	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.699;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=3;PP=584;ReadPosRankSum=1.369;SC=CAGTGGGAGACGGCAGTGCAA;SOR=0.259;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=61;TCF=56;TCR=5;TR=31;WE=44952293;WS=44952275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,32:0.49:65
chr11	44959213	rs2279363	C	T	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.850;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=177;ReadPosRankSum=1.266;SC=CAGCTCTCAGCGCCCCCACTC;SOR=0.321;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=10;WE=44959221;WS=44959203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr11	44959924	rs2306666	G	A	1363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.793;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=39;PP=1143;ReadPosRankSum=1.216;SC=AGGGCTGAGGGGAGACACCGG;SOR=1.085;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=113;TCF=35;TCR=78;TR=54;WE=44959932;WS=44959914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,53:0.47:112
chr11	44968756	rs4755920	G	A	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=14;PP=419;SC=CTGTCTCGACGGTCATTCACA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=44968764;WS=44968746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	45203848	rs1078931	G	A	2276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=38;PP=1670;ReadPosRankSum=0.698;SC=AGAAACTGAAGGGGAAGCGCG;SOR=0.701;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=188;TCF=108;TCR=80;TR=89;WE=45203856;WS=45203838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,93:0.48:195
chr11	45204071	rs1078930	A	G	1260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=36;PP=1045;SC=GGCTATTGTTAGCCCCATTTT;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=38;WE=45204079;WS=45204061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	45230443	rs12226640	T	C	2252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-7.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.367;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=38;PP=1585;ReadPosRankSum=0.608;SC=CACACCTGGCTGAGCGTAAGA;SOR=0.416;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=177;TCF=110;TCR=67;TR=90;WE=45230451;WS=45230433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,96:0.52:185
chr11	45230862	rs3781705	C	A	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.987;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=41;PP=770;ReadPosRankSum=0.142;SC=TATCACCAGTCCCCCCCGCCA;SOR=0.384;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=121;TCF=29;TCR=92;TR=56;WE=45230870;WS=45230852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,59:0.48:124
chr11	45234671	rs34007448	T	G	3467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.562;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=57;PP=2740;ReadPosRankSum=0.784;SC=GTCTTTCGTGTCCAGGAACAG;SOR=0.841;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=269;TCF=141;TCR=128;TR=129;WE=45234679;WS=45234661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,133:0.48:275
chr11	45234877	rs11038356	T	C	6122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=123;PP=2965;SC=TGTCCCGTGGTGGCAGGCCTT;SOR=1.100;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=210;TCF=85;TCR=125;TR=208;WE=45234885;WS=45234867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr11	45235246	rs7105035	T	C	1806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.062;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=27;PP=1366;ReadPosRankSum=-0.302;SC=CTGGGTGGTCTCAGTGGGGGC;SOR=1.258;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=126;TCF=71;TCR=55;TR=70;WE=45235254;WS=45235236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,71:0.55:128
chr11	45235433	rs3781704	G	C	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=265;ReadPosRankSum=-0.556;SC=GGGAAGAGGAGGCAGGGGGCA;SOR=0.278;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=16;WE=45235441;WS=45235423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr11	45245778	rs35090414	G	T	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=526;ReadPosRankSum=-0.979;SC=GAGAGAAGAGGTTGCAGAGGG;SOR=0.643;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=27;WE=45245786;WS=45245768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr11	45246235	.	G	A	4131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.798;ClippingRankSum=0.000;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.078;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=81;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.373;SC=TGACCCTCATGAACTTCCCAC;SOR=0.581;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=282;TCF=143;TCR=139;TR=151;WE=45246243;WS=45246225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,156:0.54:290
chr11	45290804	rs4755936	G	A	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=0;PP=843;ReadPosRankSum=-0.335;SC=AACCCAATGAGAGGAGGAGGG;SOR=2.004;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=35;WE=45290812;WS=45290794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,37:0.73:51
chr11	45672261	rs3802762	A	G	2053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.492;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=38;PP=1496;ReadPosRankSum=1.064;SC=AGGAGGAGCCACTGCGCGTGG;SOR=0.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=182;TCF=96;TCR=86;TR=83;WE=45672269;WS=45672251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,89:0.46:193
chr11	45832935	rs1139266	G	A	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=14;PP=420;SC=GTACACAGGCGGGGCCAGCAC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=45832943;WS=45832925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	45834044	rs4756027	C	T	2909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=59.98;NF=83;NR=6;PP=2372;SC=GGCTGGGACGCCCAAGATCAA;SOR=5.069;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=83;TCR=6;TR=89;WE=45834052;WS=45834034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr11	45834198	rs7943306	T	C	5141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=106;PP=2965;SC=TTCATGAGGGTTCCGCCCCCA;SOR=1.747;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=48;TCR=106;TR=154;WE=45834206;WS=45834188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr11	45868850	rs11394694	C	CG	3055.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=63;PP=2970;SC=CGTGAGGGGGCGGGCCTGTTC;SOR=2.147;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=90;TCF=19;TCR=71;TR=81;WE=45868858;WS=45868840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	45877529	rs2292913	A	G	4560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=69;PP=2965;SC=TGTGGACTCCACAGGTTCCTA;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=85;TCR=69;TR=154;WE=45877537;WS=45877519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr11	45877688	rs2292912	C	G	1500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=38;PP=1180;SC=CTGTCCCTGACGGTTTCCCCA;SOR=4.271;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=42;WE=45877696;WS=45877678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	45883914	rs4755343	T	C	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=533;SC=CTCAGCATTTTTGGGTTAAGC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=45883922;WS=45883904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	45891508	rs4755345	A	G	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=14;PP=614;SC=CTTGCCTTCAATGGAAGGGTT;SOR=1.508;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=22;WE=45891516;WS=45891498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	45926445	rs2271847	T	C	9526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=190;PP=2965;SC=CCAAGACTTGTGATGAAGAGG;SOR=1.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=322;TCF=132;TCR=190;TR=322;WE=45926453;WS=45926435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,328:1.00:328
chr11	45928306	rs113393431	C	T	2500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.045;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=38;PP=1975;ReadPosRankSum=0.377;SC=TGAAGTCACCCTTGAACAGAT;SOR=0.778;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=218;TCF=126;TCR=92;TR=94;WE=45928314;WS=45928296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,97:0.43:224
chr11	45931800	rs148330888	G	T	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=434;ReadPosRankSum=-0.660;SC=CTTCCGGGAGGTCTGTCAGCC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=43;TCR=21;TR=27;WE=45931808;WS=45931790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,28:0.43:65
chr11	45935253	rs2271845	C	T	976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=1;PP=770;ReadPosRankSum=0.179;SC=CCGGACAACACACAGTGCTTG;SOR=0.418;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=56;TCF=55;TCR=1;TR=35;WE=45935261;WS=45935243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,36:0.60:60
chr11	45935384	rs1132349	A	G	6553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=119;NR=103;PP=2965;SC=AGAAGCGGTCATAGAAAGGAG;SOR=0.802;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=222;TCF=119;TCR=103;TR=222;WE=45935392;WS=45935374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr11	45935652	.	G	C	1582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-8.023;ClippingRankSum=0.000;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=10;PP=1223;ReadPosRankSum=0.525;SC=GCCCAGTGGAGAGTGAAGCCC;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=120;TCR=24;TR=61;WE=45935660;WS=45935642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,63:0.43:145
chr11	45936035	rs3802758	G	A	4678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=90;NR=48;PP=2965;SC=ACACAAGGGCGGCAGATGAGC;SOR=1.402;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=90;TCR=48;TR=138;WE=45936043;WS=45936025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr11	45937267	rs10742772	C	T	13984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=462;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=243;NR=202;PP=2965;SC=GCCAGCTGGACGAGGGCGATG;SOR=0.888;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=447;TCF=244;TCR=203;TR=445;WE=45937275;WS=45937257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,457:1.00:457
chr11	45937968	rs3215273	CTA	C	262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=250;ReadPosRankSum=1.432;SC=CACCCACAGACTATGTGGAAA;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=7;WE=45937977;WS=45937958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr11	45944994	rs33927614	G	GC	1218.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=0;PP=1320;SC=GAGAAGGGGGGCTGCTGCCGA;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=30;WE=45945002;WS=45944984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	45949201	rs884668	C	T	2257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.225;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=42;PP=1742;ReadPosRankSum=1.495;SC=ACGGGGCATGCGTGGGACCCC;SOR=0.420;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=176;TCF=78;TCR=98;TR=83;WE=45949209;WS=45949191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,87:0.47:184
chr11	45949534	rs939105	C	T	3614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.971;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=48;PP=2890;ReadPosRankSum=-1.076;SC=TGCCGGCATTCGAGACCCTGC;SOR=0.907;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=228;TCF=139;TCR=89;TR=130;WE=45949542;WS=45949524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,133:0.56:237
chr11	45959669	rs10742773	C	T	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=2;PP=798;ReadPosRankSum=-0.356;SC=GTGTCTTTGTCCTCCTCGGCC;SOR=0.614;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=70;TCF=66;TCR=4;TR=34;WE=45959677;WS=45959659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr11	45967582	.	G	A	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=1.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.12;ReadPosRankSum=-0.991;SOR=0.852;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,38:0.25:153
chr11	46105688	rs2932515	G	A	1920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.912;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=16;PP=1376;ReadPosRankSum=-0.209;SC=CTTAACAACAGTGTGGGAGAA;SOR=0.228;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=167;TCF=139;TCR=28;TR=72;WE=46105696;WS=46105678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,77:0.44:175
chr11	46329489	rs199951144	G	A	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=487;ReadPosRankSum=-0.260;SC=TGCCGCGGCCGCCATGGCCAC;SOR=0.495;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=27;WE=46329497;WS=46329479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
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chr11	46342081	rs67946579	TG	T	2781.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=57;PP=2781;SC=CCACGACAGGTGGGGTGTGTG;SOR=2.010;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=81;TCF=19;TCR=62;TR=73;WE=46342089;WS=46342071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	46342259	rs79068197	A	AG	7796.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=128;NR=51;PP=2936;SC=TTCTCTCTCCAGGATCTGGGC;SOR=2.336;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=204;TCF=147;TCR=57;TR=179;WE=46342267;WS=46342249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr11	46385941	.	A	G	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=0.000;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=2.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.82;ReadPosRankSum=0.073;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,25:0.23:109
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chr11	46391602	rs12575519	T	G	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=41;PP=1065;ReadPosRankSum=-1.643;SC=GCACCTGCGGTCCTGAGCCCA;SOR=0.682;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=131;TCF=32;TCR=99;TR=55;WE=46391610;WS=46391592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,56:0.42:132
chr11	46392825	rs10838601	C	G	1130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.442;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=1;PP=898;ReadPosRankSum=0.044;SC=TGCTGCTCCACGCCTGCCCTG;SOR=1.697;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=63;TCF=60;TCR=3;TR=36;WE=46392833;WS=46392815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,38:0.58:66
chr11	46393958	rs7936413	T	C	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.762;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=4;PP=850;ReadPosRankSum=0.694;SC=GACTGTCTCTTGGCTCCCCAT;SOR=2.329;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=70;TCF=57;TCR=13;TR=39;WE=46393966;WS=46393948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,38:0.55:69
chr11	46396479	rs2046768	T	C	1836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.603;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.702;NF=29;NR=45;PP=1287;ReadPosRankSum=-0.551;SC=CGCCCGCCTTTGCAGGTACTG;SOR=0.757;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=148;TCF=59;TCR=89;TR=74;WE=46396487;WS=46396469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,79:0.51:155
chr11	46397323	rs3740974	A	C	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.675;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=248;ReadPosRankSum=-0.036;SC=TCTCTCGGCAAGTGGTTTGGT;SOR=0.223;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=15;WE=46397331;WS=46397313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr11	46398916	rs34406563	T	C	1839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-8.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.886;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=74;PP=1388;ReadPosRankSum=-1.036;SC=TTCAGCCCTGTGGTTCTGTGG;SOR=0.291;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=3;TCR=128;TR=76;WE=46398924;WS=46398906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,80:0.60:133
chr11	46399538	rs2279465	T	C	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=0.550;SC=GACTTGTTTGTATCCCTGAAC;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=5;WE=46399546;WS=46399528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr11	46406767	rs2067482	G	A	4374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.932;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=51;PP=2962;ReadPosRankSum=0.620;SC=CAGGGTTGATGGTGCTGTTGA;SOR=0.585;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=344;TCF=244;TCR=100;TR=166;WE=46406775;WS=46406757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,171:0.48:353
chr11	46515902	rs3802888	A	G	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.284;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.06;ReadPosRankSum=0.326;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr11	46534546	rs3802890	A	G	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=657;ReadPosRankSum=0.149;SC=AAGAGCTGCAAAACTCCCACA;SOR=1.118;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=29;WE=46534554;WS=46534536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,32:0.59:54
chr11	46567475	rs61882746	C	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.169;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=149;ReadPosRankSum=-0.210;SC=AGAAGATCAGCGATCTGGTAG;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=8;WE=46567483;WS=46567465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr11	46569434	rs58268270	CA	C	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=3.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=0.852;QD=0.31;ReadPosRankSum=1.791;SOR=0.365;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,21:0.20:104
chr11	46625063	.	C	G	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=14;PP=870;ReadPosRankSum=-0.164;SC=AAGTATCCCTCCTCTCCACCT;SOR=0.655;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=90;TCF=59;TCR=31;TR=42;WE=46625071;WS=46625053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,41:0.46:89
chr11	46637053	rs189678904	G	A	1874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.448;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=11;PP=1522;ReadPosRankSum=0.460;SC=GTGAGCCACCGCCCCCAGCCT;SOR=1.317;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=141;TCF=115;TCR=26;TR=73;WE=46637061;WS=46637043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,73:0.51:142
chr11	46678462	rs150786219	C	CACACAT	692.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.556;NF=19;NR=0;PP=1009;ReadPosRankSum=0.914;SC=TATATATACACACACATACAC;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=19;WE=46678470;WS=46678452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr11	46686260	rs10838610	G	A	1593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=8.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.337;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=5;PP=1202;ReadPosRankSum=0.100;SC=CCCCTATCACGTCAGGCCCCC;SOR=0.436;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=119;TCF=110;TCR=9;TR=55;WE=46686268;WS=46686250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,59:0.48:124
chr11	46694313	rs67065551	GTC	G	1047.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=9;PP=655;SC=TTGGTGTGGAGTCGCAGAAAG;SOR=0.941;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=15;WE=46694322;WS=46694303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	46702691	rs4319473	G	A	1992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.239;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=37;PP=1483;ReadPosRankSum=0.163;SC=TGGGTTGTGGGGGCCCGCTTC;SOR=0.579;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=158;TCF=83;TCR=75;TR=77;WE=46702699;WS=46702681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,79:0.50:159
chr11	46702920	rs4268467	T	C	6691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=91;NR=115;PP=2965;SC=CCTTGATGTTTTTCTTGTACC;SOR=0.961;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=206;TCF=91;TCR=115;TR=206;WE=46702928;WS=46702910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr11	46722731	rs4752928	T	C	4440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=95;PP=2965;SC=TCCTCAGTCTTCTCTCCTCCG;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=39;TCR=95;TR=134;WE=46722739;WS=46722721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr11	46742426	rs3136435	G	A	1685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=46;PP=1384;ReadPosRankSum=1.096;SC=AGCAGGACATGGAGGGGAGCC;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=30;TCR=91;TR=61;WE=46742434;WS=46742416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,62:0.51:121
chr11	46744925	rs2070852	G	C	4872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.446;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=108;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.291;SC=GCAATTTCCTGTTCCAGAATC;SOR=0.880;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=413;TCF=191;TCR=222;TR=193;WE=46744933;WS=46744915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:223,193:0.46:416
chr11	46750819	rs3136474	T	C	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.698;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=349;ReadPosRankSum=1.328;SC=CGTGAACGTCTGTGCCCAGCC;SOR=0.067;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=16;WE=46750827;WS=46750809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr11	46760466	rs3136515	G	T	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=0;PP=641;SC=GGATTGGATGGGTAGGGTGAG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=46760474;WS=46760456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	46760756	rs3136516	G	A	1690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.255;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=31;PP=1315;ReadPosRankSum=-0.608;SC=TGCCTGGCAGGGGAATACTGA;SOR=0.512;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=121;TCF=56;TCR=65;TR=62;WE=46760764;WS=46760746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,66:0.52:126
chr11	46776697	rs4237546	A	G	189.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=7;PP=158;SC=AAACTTCTCCATAAGAATATT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=46776705;WS=46776687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	46783435	rs61884328	T	C	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=-0.178;SC=ATAGGTTGAGTTGACTAAAAA;SOR=0.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=7;WE=46783443;WS=46783425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr11	46802094	rs6485691	C	A	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=666;SC=TACTCAATAACGTTTTATAAA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=46802102;WS=46802084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	46812227	rs7940578	T	C	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=32;PP=942;SC=GTGTCTCATATTGTTGTCGAG;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=46812235;WS=46812217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	46822686	rs10734549	C	A	3070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=81;NR=4;PP=2587;SC=AAGCAAACAGCAAACTAGGCC;SOR=5.330;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=81;TCR=4;TR=85;WE=46822694;WS=46822676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	46837625	rs59649961	AC	A	1199.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.43;SOR=6.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	46837631	.	CCA	C	676	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;FR=1.0000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=26;NR=0;PP=676;QD=26.9615384615;SC=AACGACCCCCCCATTCCCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=26;WE=46837642;WS=46837621;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr11	46837633	rs58152993	AT	A	1347.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.12;SOR=6.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	46837634	.	T	A	667	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=24;NR=0;PP=667;QD=29.2404671895;SC=GACCCCCCCATTCCCCCCAAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=24;WE=46837642;WS=46837621;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,24:0.83:29
chr11	46840119	rs67178247	TG	T	988.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.035;NF=0;NR=38;PP=610;ReadPosRankSum=0.897;SC=ACTATTAATCTGGGGGGGGAG;SOR=0.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=97;TCF=0;TCR=97;TR=38;WE=46840127;WS=46840109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,42:0.49:85
chr11	46889713	rs2306026	T	C	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=26;PP=801;SC=CATAAACATCTACATATGGCC;SOR=3.912;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=46889721;WS=46889703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	46890165	rs3816614	C	T	3872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.064;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=26;PP=2965;ReadPosRankSum=0.011;SC=GGAGCAGGGCCGGCTATCAGG;SOR=2.613;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=96;TCR=27;TR=121;WE=46890173;WS=46890155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,121:0.98:123
chr11	46890388	rs2290884	C	G	3777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=1.077;SC=AGGAGAGATACAACCGCGAGG;SOR=2.213;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=17;TCR=98;TR=114;WE=46890396;WS=46890378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr11	46893108	rs2306029	T	C	1907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.765;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=41;PP=1400;ReadPosRankSum=0.833;SC=GACACATGGCTGACCAAGACC;SOR=0.472;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=160;TCF=75;TCR=85;TR=85;WE=46893116;WS=46893098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,84:0.53:159
chr11	46897253	rs2306032	G	C	3146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=62;PP=2411;ReadPosRankSum=-0.805;SC=AGGAGAGGGTGGGGGGTGGTG;SOR=0.711;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=273;TCF=138;TCR=135;TR=126;WE=46897261;WS=46897243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,131:0.48:275
chr11	46897995	rs964551	G	T	4389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=18;PP=2965;ReadPosRankSum=0.194;SC=ACACTACCCAGTGCGATACAG;SOR=1.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=118;TCR=19;TR=134;WE=46898003;WS=46897985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,140:0.99:142
chr11	46898771	rs6485702	T	C	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;PP=705;ReadPosRankSum=-0.817;SC=TCTACTCCAATGGCAATGGTG;SOR=0.477;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=93;TCF=63;TCR=30;TR=45;WE=46898779;WS=46898761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,46:0.49:94
chr11	46907827	rs2306027	C	T	3435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=72;PP=2872;SC=GAAGCCCTTCCCTGGAGAGGG;SOR=1.893;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=31;TCR=72;TR=103;WE=46907835;WS=46907817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr11	46911457	rs2306035	T	C	3090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=5;PP=2548;SC=ACCTCAACCATGAGGCTACTT;SOR=5.443;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=88;TCR=5;TR=92;WE=46911465;WS=46911447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr11	46911704	rs2306036	C	T	1618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=35;PP=1352;SC=TCAGTCTGGACGTGGTCTGCC;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=49;WE=46911712;WS=46911694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	46914583	rs10838631	T	C	4144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=12;PP=2530;SC=ACAGCAACACTTTCCGGTGGG;SOR=3.732;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=81;TCR=12;TR=92;WE=46914591;WS=46914573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	46914598	rs10769215	A	G	4686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=20;PP=2512;SC=GGTGGGCCCCATCCAGATTGG;SOR=3.066;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=93;TCR=20;TR=112;WE=46914606;WS=46914588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr11	46916693	rs3751097	C	T	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=2;PP=1002;ReadPosRankSum=0.526;SC=TCTGCCCACCCAGCCAAGTGC;SOR=1.078;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=71;TCF=67;TCR=4;TR=42;WE=46916701;WS=46916683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,40:0.58:69
chr11	46917983	rs898604	G	A	2395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=55;PP=1804;SC=AGACAGATGAGACTCAAGGTG;SOR=2.425;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=18;TCR=55;TR=73;WE=46917991;WS=46917973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	46969616	rs2867207	T	C	3451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=23;PP=2649;SC=GTAAGATATATGAAAGGCCAC;SOR=2.411;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=81;TCR=23;TR=104;WE=46969624;WS=46969606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr11	47009041	.	G	GT	523.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=14;PP=611;SC=GGTGCAGCTAGTTTGTCCAGT;SOR=4.294;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=15;WE=47009049;WS=47009031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	47074090	.	T	TTTCC	1432.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.000;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.92;MQRankSum=3.793;QD=19.10;ReadPosRankSum=-0.058;SOR=0.245;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,39:0.52:75
chr11	47185680	rs11039114	G	A	2133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.475;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=30;PP=1620;ReadPosRankSum=-1.317;SC=CCTCACGGCAGCACAGAGCCA;SOR=0.956;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=177;TCF=105;TCR=72;TR=83;WE=47185688;WS=47185670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,86:0.48:179
chr11	47187067	rs7117346	G	A	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.486;QD=11.57;ReadPosRankSum=2.390;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,33:0.42:78
chr11	47187071	rs377653037	GA	G	869.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=12.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.758;QD=12.79;ReadPosRankSum=0.078;SOR=0.072;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,30:0.44:68
chr11	47188314	rs4752820	T	C	4936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=42;PP=2965;SC=CACTTACCTCTGCATCCACCT;SOR=1.944;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=114;TCR=43;TR=156;WE=47188322;WS=47188304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr11	47188411	rs3740691	C	T	8629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.132;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=138;NR=130;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.320;SC=TGAGCTCCGGCTCTCCACTTC;SOR=0.468;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=270;TCF=139;TCR=131;TR=268;WE=47188419;WS=47188401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,280:0.99:283
chr11	47204175	rs2279438	A	T	3115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=49;PP=2478;SC=GGGCTGTCAGATGGGCTCCTC;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=46;TCR=49;TR=95;WE=47204183;WS=47204165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr11	47238522	rs326212	T	C	3693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=59;PP=2703;SC=ACCCCAGCACTGTGGCTGTGG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=61;TCR=59;TR=120;WE=47238530;WS=47238512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr11	47238665	rs326211	A	G	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=23;PP=675;SC=AGTGGTTCGCACCTGTAATCC;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=47238673;WS=47238655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	47251199	rs830085	G	A	2209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=14;PP=1766;SC=AGAGAAACTCGAATCAACTCT;SOR=2.483;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=50;TCR=14;TR=64;WE=47251207;WS=47251189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	47259668	rs326222	T	C	3436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.904;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=75;PP=2698;ReadPosRankSum=-1.777;SC=TCTCCTCATGTTGACACTCTT;SOR=0.581;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=305;TCF=127;TCR=178;TR=131;WE=47259676;WS=47259658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,138:0.44:313
chr11	47260272	rs2013867	T	C	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.575;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=421;ReadPosRankSum=0.752;SC=TTTACCAAATTGTAGGTTTGC;SOR=0.260;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=24;WE=47260280;WS=47260262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr11	47260319	rs901746	A	G	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.155;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=407;ReadPosRankSum=-0.028;SC=GGTAACAGAAAGTGTAAGTCA;SOR=1.010;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=41;TCF=21;TCR=20;TR=22;WE=47260327;WS=47260309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr11	47266337	.	G	A	3220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.907;ClippingRankSum=0.000;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.633;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=65;PP=2530;ReadPosRankSum=-0.404;SC=AAGAGGAAGCGGAAGCTGAAG;SOR=0.432;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=256;TCF=117;TCR=139;TR=131;WE=47266345;WS=47266327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,131:0.50:261
chr11	47267408	.	C	CGT	245.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=0.000;QD=6.83;ReadPosRankSum=0.258;SOR=0.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr11	47270255	rs2167079	C	T	1543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=30;PP=1162;ReadPosRankSum=-0.367;SC=ACTCCGGGCCCGGGTGGGCGG;SOR=0.699;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=65;TCR=65;TR=60;WE=47270263;WS=47270245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,61:0.46:132
chr11	47289414	rs73450115	A	C	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.481;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=339;ReadPosRankSum=-0.373;SC=GAGAGAAGAAAGTTCCTGCTG;SOR=0.336;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=18;WE=47289422;WS=47289404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr11	47298360	rs326214	G	A	2168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.037;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=49;PP=1643;ReadPosRankSum=-0.542;SC=ACCCACTGGAGTATATGTTTC;SOR=0.265;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=171;TCF=54;TCR=117;TR=82;WE=47298368;WS=47298350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,87:0.48:180
chr11	47303401	.	C	CTTTTTTTT	624.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=6;PP=411;SC=ACCAGGGTTCCTTTTTTTTTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=6;WE=47303409;WS=47303391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	47307332	rs148495681	G	GTCATTA	825.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=726;SC=GGACAGATTAGTCATTATGCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=15;WE=47307340;WS=47307322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	47316987	rs73451752	T	C	2064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.867;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=26;PP=1577;ReadPosRankSum=0.851;SC=GTACAGTATTTCTGTGGGAAA;SOR=0.279;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=113;TCF=77;TCR=36;TR=72;WE=47316995;WS=47316977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,75:0.62:120
chr11	47317331	rs184497865	T	C	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.68;ReadPosRankSum=-1.718;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr11	47331116	rs1017594	T	C	5319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=91;PP=2965;SC=AGATCGCTTGTTGGCCACACT;SOR=1.082;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=155;TCF=64;TCR=91;TR=154;WE=47331124;WS=47331106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr11	47350553	rs10838693	G	C	1861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.146;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=23;PP=1408;ReadPosRankSum=-0.348;SC=TATGGAGATGGAGGAGTCTCA;SOR=1.341;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=123;TCF=80;TCR=43;TR=71;WE=47350561;WS=47350543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,72:0.57:126
chr11	47361084	rs2856653	T	C	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=532;ReadPosRankSum=-1.276;SC=GTCTCTCCCATGGGGTAGCCA;SOR=0.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=25;TCR=29;TR=28;WE=47361092;WS=47361074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr11	47362431	rs2697926	A	G	2501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=69;NR=2;PP=2173;SC=GGCAAAGCTGAAGCTGGGCCC;SOR=6.358;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=72;TCF=70;TCR=2;TR=71;WE=47362439;WS=47362421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	47362465	rs10769254	G	C	1595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.157;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=7;PP=1328;ReadPosRankSum=1.982;SC=TTTGATCCTTGCTCTTCCCTC;SOR=1.015;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=120;TCF=105;TCR=15;TR=60;WE=47362473;WS=47362455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,60:0.48:125
chr11	47364762	rs896818	A	G	5313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=118;PP=2965;SC=AGTGCGCCCCATGATAATCCC;SOR=1.836;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=52;TCR=118;TR=170;WE=47364770;WS=47364752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr11	47371333	rs201098973	C	T	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.240;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=512;ReadPosRankSum=1.399;SC=ACCTTGCTGGCGCGGTCGTAG;SOR=0.446;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=60;TCF=49;TCR=11;TR=28;WE=47371341;WS=47371323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr11	47371484	rs11570050	AG	A	3112.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.582;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.242;NF=13;NR=66;PP=2966;ReadPosRankSum=0.258;SC=CTGCAAAGGCAGGGGCGACAG;SOR=1.987;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=83;TCF=15;TCR=68;TR=79;WE=47371492;WS=47371474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,93:0.99:94
chr11	47380061	rs10734557	A	C	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=2;PP=1285;SC=ACACCCACTCACACAGCCACT;SOR=5.507;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=46;WE=47380069;WS=47380051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	47380244	.	C	A	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=0.000;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=6.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=-0.991;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.124;SOR=1.154;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,47:0.25:190
chr11	47380276	rs35282035	G	GCA	1795.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=2.108;NF=10;NR=43;PP=2146;ReadPosRankSum=-0.939;SC=TGGCAAACATGCACACACACA;SOR=0.711;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=136;TCF=29;TCR=107;TR=53;WE=47380285;WS=47380266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,60:0.53:114
chr11	47380340	rs3740688	G	T	2881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=61;PP=2293;SC=CTGGGTGGGGGCAGGGCACAG;SOR=2.250;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=82;TCF=21;TCR=61;TR=81;WE=47380348;WS=47380330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	47380593	rs3740689	G	A	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=179;ReadPosRankSum=-0.226;SC=AGTCAGGAAGGGCCAGCTTAC;SOR=0.275;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=11;WE=47380601;WS=47380583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr11	47380688	rs35284836	GGAA	G	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=307;SC=GGAGACTGGAGGAAGAAGACC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=47380698;WS=47380678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	47397005	rs55957907	G	A	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=217;ReadPosRankSum=0.571;SC=GCTCCATAATGGAGGCTCAGG;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=11;WE=47397013;WS=47396995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr11	47431703	rs61897432	A	G	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.887;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=8;PP=555;ReadPosRankSum=0.066;SC=CCTCTTCCTCACTGCCCTTGC;SOR=1.545;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=99;TCF=74;TCR=25;TR=41;WE=47431711;WS=47431693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,41:0.42:98
chr11	47431728	rs2010519	A	G	4233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=37;PP=2965;SC=GAGCTCTTGGAAAGGGCTGGG;SOR=2.075;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=92;TCR=37;TR=129;WE=47431736;WS=47431718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr11	47432034	rs755554	G	C	1877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=52;PP=1559;SC=GTCACAGAGTGTCTGAGATGG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=0;TCR=52;TR=52;WE=47432042;WS=47432024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	47434986	rs2293576	G	A	1381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.017;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=13;PP=975;ReadPosRankSum=-0.438;SC=CTGCCGCCGCGCTCAATGGAG;SOR=1.501;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=114;TCF=79;TCR=35;TR=52;WE=47434994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,56:0.45:125
chr11	47436531	rs11039228	G	T	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=26;PP=1427;SC=TGTGGCTACCGCACTGCTGGT;SOR=0.733;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=24;TCR=26;TR=50;WE=47436539;WS=47436521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	47440758	rs2293579	G	A	2561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.082;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=70;PP=2158;ReadPosRankSum=-0.191;SC=ACTGGGGACAGGACAGATACC;SOR=0.874;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=181;TCF=48;TCR=133;TR=94;WE=47440766;WS=47440748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,94:0.51:184
chr11	47447346	rs10838709	C	T	1579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.912;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=18;ReadPosRankSum=1.619;SC=TTAGGAAGTACGAGAGGCGAC;SOR=1.447;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=110;TCF=67;TCR=43;TR=57;WE=47447354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,61:0.53:116
chr11	47447955	rs7948705	C	G	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.197;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=187;ReadPosRankSum=0.812;SC=ACTCTTGACCCGACCAGCTCC;SOR=0.105;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=11;WE=47447963;WS=47447945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr11	47459469	rs45617144	G	A	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=630;ReadPosRankSum=0.180;SC=GGCCTCTGGCGTGCAGTGGAG;SOR=0.798;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=28;TCR=36;TR=34;WE=47459477;WS=47459459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr11	47460098	rs10769267	C	T	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=301;ReadPosRankSum=-0.200;SC=GATCTTGAACCCCGGGGCTCA;SOR=0.153;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=14;WE=47460106;WS=47460088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr11	47460306	rs7126210	A	G	1732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.392;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=40;PP=1465;ReadPosRankSum=-0.799;SC=TGTGGGAGCAAGGTAGGGCCT;SOR=0.532;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=133;TCF=50;TCR=83;TR=67;WE=47460314;WS=47460296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,66:0.48:137
chr11	47462744	.	C	G	2981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.947;ClippingRankSum=0.000;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=84;PP=2261;ReadPosRankSum=-1.457;SC=ATCCTGGGCTCTCTCGATGGC;SOR=0.689;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=248;TCF=68;TCR=180;TR=117;WE=47462752;WS=47462734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,118:0.48:247
chr11	47462837	rs10716680	AG	A	2670.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=81;PP=2359;SC=AGCACAGGGTAGGGGGGGCAG;SOR=5.646;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=93;TCF=3;TCR=90;TR=84;WE=47462845;WS=47462827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr11	47463220	rs45603036	C	T	2201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.710;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=43;PP=1611;ReadPosRankSum=0.302;SC=GCGCCTGCACCTGCCCCAGGC;SOR=0.412;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=155;TCF=68;TCR=87;TR=85;WE=47463228;WS=47463210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,86:0.54:160
chr11	47463483	.	AG	A	24	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=30;MQ=61.34;NF=0;NR=2;PP=24;QD=27.0;SC=CCTGCGAGGGAGGCCAGTGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=2;WE=47463491;WS=47463473;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,2:0.40:5
chr11	47469439	rs7111873	A	G	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.478;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=18;PP=929;ReadPosRankSum=0.968;SC=TGTTGTGGGCATAGCGCAGGG;SOR=0.847;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=130;TCF=87;TCR=43;TR=56;WE=47469447;WS=47469429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,56:0.43:129
chr11	47469717	rs45547231	G	A	1571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.897;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=46;PP=1224;ReadPosRankSum=0.815;SC=ACACAGCGACGGTGGGCAGGT;SOR=0.963;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=118;TCF=24;TCR=94;TR=56;WE=47469725;WS=47469707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,58:0.49:119
chr11	47496827	rs7102372	C	T	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=110;ReadPosRankSum=-0.520;SC=TCTGCCTTTCCGTTCTGGTAT;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=6;WE=47496835;WS=47496817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr11	47500400	rs12224672	C	T	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=213;ReadPosRankSum=2.382;SC=CTGGGTGCTGCTGCTCCTCTG;SOR=0.551;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=14;WE=47500408;WS=47500390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr11	47587577	rs58926533	TC	T	2664.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=67;PP=2613;SC=GGGGGCCCGCTCCCCCTCGCC;SOR=4.539;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=80;TCF=7;TCR=73;TR=72;WE=47587585;WS=47587567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	47597058	.	CAAA	C	590.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.944;NF=16;NR=1;PP=180;ReadPosRankSum=-0.015;SC=GACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SOR=0.593;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=56;TCF=52;TCR=4;TR=17;WE=47597068;WS=47597048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr11	47600438	rs2280231	C	T	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=470;ReadPosRankSum=0.469;SC=GGAGCTAGGACCACGCTCACC;SOR=0.534;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=44;TCR=6;TR=23;WE=47600446;WS=47600428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr11	47601977	.	C	T	473	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=18;NR=1;PP=473;QD=26.7248006604;SC=CTTCAGGGAGCCTTTCCTGGA;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=19;WE=47601985;WS=47601976;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr11	47609867	rs4486587	G	A	10200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=154;NR=158;PP=2965;SC=GGGCCGCTGGGCCCAGGTCTT;SOR=0.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=312;TCF=154;TCR=158;TR=312;WE=47609875;WS=47609857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr11	47611316	rs10769279	C	G	1540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=0;PP=1277;SC=TTCGAGCCTCCGGCCCGGCCT;SOR=8.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=55;TCR=0;TR=55;WE=47611324;WS=47611306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	47684450	rs6485766	C	A	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=410;SC=TGTTCACCTGCGCAGAACGAA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=47684458;WS=47684440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	47689343	rs10742817	C	T	4822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=98;PP=2965;SC=GACACAAAGGCTAACTCGGTA;SOR=1.641;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=47;TCR=98;TR=145;WE=47689351;WS=47689333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr11	47736314	rs4752863	C	G	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=1;NR=26;PP=788;SC=TACAAAGCCACAAGAGGACAA;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=47736322;WS=47736304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	47755552	.	CAA	C	192.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=1.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.558;QD=4.48;ReadPosRankSum=-0.097;SOR=1.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr11	47772401	rs11039366	C	T	921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=0;PP=786;SC=AAGGCTTCCACTCCTGTGCTC;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=47772409;WS=47772391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	47774366	rs151189779	A	AAAAC	451.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.161;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=460;ReadPosRankSum=0.087;SC=ATTCCATCTCAAAACAAACAA;SOR=2.262;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=11;WE=47774374;WS=47774357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr11	47776047	rs7928954	G	A	3149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=28;PP=2558;SC=AGTAGCTTCAGTAACTAAAAC;SOR=1.993;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=73;TCR=28;TR=100;WE=47776055;WS=47776037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr11	47776283	rs7929014	C	T	1642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=47;PP=1375;SC=GCATCTAAAGCGGAAGTATAA;SOR=5.590;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=2;TCR=47;TR=49;WE=47776291;WS=47776273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	47786926	rs148666719	A	AAAAAG	2218.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=29;PP=1748;SC=TGGATTAAAAAAAAAGAAAAG;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=109;TCF=3;TCR=106;TR=29;WE=47786934;WS=47786916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	47788663	rs67450550	CGGTGGT	C	2375.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=5;PP=2322;SC=GCAGTCACCGCGGTGGTGGTG;SOR=3.912;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=41;WE=47788676;WS=47788653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	47801101	rs7114813	A	G	2152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=28;PP=1660;SC=AATATTTTAGATAGGCTCAGG;SOR=0.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=33;TCR=28;TR=61;WE=47801109;WS=47801091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	47806342	.	T	A	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.283;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=179;ReadPosRankSum=-1.309;SC=CATCCTCCCCTGTTGGCCTAC;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=9;WE=47806350;WS=47806332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr11	47813436	rs10742821	C	T	3245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=21;PP=2589;SC=ACAATAACAACATTACTACTG;SOR=2.641;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=81;TCR=21;TR=102;WE=47813444;WS=47813426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr11	47814280	rs754434	A	G	2522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=6;PP=2043;SC=GACCAAAACAAGTAGATTTAC;SOR=4.587;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=65;TCR=6;TR=71;WE=47814288;WS=47814270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	47814552	.	T	C	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.375;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=26;PP=678;ReadPosRankSum=0.513;SC=TTTTTCTTTTTTTTGGAGACA;SOR=0.432;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=67;TCF=10;TCR=57;TR=31;WE=47814560;WS=47814542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr11	47826090	rs11039402	A	C	3322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=34;PP=2567;SC=GAAATGTTCAAAGGAACTCAC;SOR=1.374;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=60;TCR=34;TR=94;WE=47826098;WS=47826080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr11	47828558	rs77201654	A	G	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=16;PP=933;ReadPosRankSum=-0.075;SC=GCAAAAGACCACTTTAATGAA;SOR=0.649;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=74;TCR=28;TR=58;WE=47828566;WS=47828548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,61:0.58:106
chr11	47834346	rs10838773	G	A	2011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=2;PP=1692;SC=TATTCTGTACGCTCTGGAACA;SOR=5.994;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=60;TCF=58;TCR=2;TR=60;WE=47834354;WS=47834336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	47834592	rs7110289	G	A	2459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=62;PP=2074;SC=CCCGAGCGATGTCCACATCTA;SOR=3.086;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=12;TCR=62;TR=74;WE=47834600;WS=47834582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	47837333	rs17727140	T	C	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=3;PP=777;ReadPosRankSum=0.053;SC=TTAAAGGCCATAGACTATGCA;SOR=0.846;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=76;TCF=69;TCR=7;TR=36;WE=47837341;WS=47837323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,38:0.47:80
chr11	47837408	rs6485786	G	C	6820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.309;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=176;NR=27;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.760;SC=ACAAGGTCAAGTGAAGAATTC;SOR=3.525;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=205;TCF=177;TCR=28;TR=203;WE=47837416;WS=47837398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,209:1.00:210
chr11	47837638	rs7130715	G	A	2438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=77;PP=2207;SC=AATGGAAAACGTTTCAGTTTA;SOR=8.635;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=77;TCF=0;TCR=77;TR=77;WE=47837646;WS=47837628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	47840864	.	CA	C	86.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQRankSum=0.955;QD=1.64;ReadPosRankSum=0.604;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,13:0.25:53
chr11	47857253	rs3816605	T	C	4859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=39;PP=2965;ReadPosRankSum=0.957;SC=AGTCCCATGGTGGGGGAATAA;SOR=1.314;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=180;TCF=126;TCR=54;TR=164;WE=47857261;WS=47857243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,170:0.99:171
chr11	47869200	rs71045524	TG	T	404.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.30;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	48118160	rs11599936	C	T	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=119;ReadPosRankSum=0.341;SC=GAGTTTTCCTCAAACCAAACC;SOR=0.760;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=7;WE=48118168;WS=48118154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr11	48118199	rs4752806	G	C	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=346;ReadPosRankSum=-1.082;SC=CAGAGCTGTTGAGGCCCTTCC;SOR=0.436;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=16;WE=48118207;WS=48118189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr11	48118347	rs11382316	T	TA	2732.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.082;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.968;NF=59;NR=25;PP=2933;ReadPosRankSum=0.337;SC=CGAGAGCTGATAAGAACAGAG;SOR=1.215;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=168;TCF=110;TCR=58;TR=84;WE=48118355;WS=48118337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,95:0.52:182
chr11	48142528	rs34681195	AT	A	99.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=1.582;QD=2.27;ReadPosRankSum=1.019;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,12:0.27:44
chr11	48145375	rs1566734	A	C	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.603;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=475;ReadPosRankSum=0.236;SC=TATCTTCTACAATCAAATAAG;SOR=1.700;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=23;WE=48145383;WS=48145365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,26:0.36:72
chr11	48146622	rs1503185	G	A	2248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.791;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=36;PP=1758;ReadPosRankSum=-1.562;SC=CAGCAGTCCCGAGACACGGAA;SOR=0.456;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=159;TCF=97;TCR=62;TR=87;WE=48146630;WS=48146612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,88:0.55:161
chr11	48170870	rs4752908	T	G	4898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=34;PP=2965;SC=TGGTGTCAGCTGTGAACTAAT;SOR=2.780;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=135;TCR=34;TR=169;WE=48170878;WS=48170860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr11	48171793	rs10734565	T	C	3491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=103;PP=2715;SC=AGCTGGGATCTGAGGGGAGTT;SOR=3.047;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=21;TCR=103;TR=124;WE=48171801;WS=48171783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr11	48181462	rs374974355	A	C	1859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=32;PP=1434;ReadPosRankSum=2.452;SC=TCTTCTTATAAAAATGCAATT;SOR=0.736;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=176;TCF=101;TCR=75;TR=75;WE=48181470;WS=48181452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,78:0.42:184
chr11	48184983	rs2270990	G	T	3131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-6.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=26;PP=2461;ReadPosRankSum=0.387;SC=TTTCTGTCTGGATCTAAATCA;SOR=0.674;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=230;TCF=179;TCR=51;TR=118;WE=48184991;WS=48184973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,119:0.52:231
chr11	48188872	rs12809012	G	A	3538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.631;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=59;PP=2676;ReadPosRankSum=0.053;SC=AAAACCTTGCGCCCGTGACCA;SOR=0.516;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=332;TCF=210;TCR=122;TR=150;WE=48188880;WS=48188862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,153:0.44:346
chr11	48238421	rs10769329	T	G	1878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=14;PP=1470;SC=AGGATCCAGCTGTGCAGAGTG;SOR=2.267;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=48;TCR=14;TR=62;WE=48238429;WS=48238411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	48238549	rs11606506	G	A	2241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.625;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=28;PP=1774;ReadPosRankSum=-0.782;SC=TTCCTTAGCTGCCTGTCCTTG;SOR=0.434;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=185;TCF=131;TCR=54;TR=91;WE=48238557;WS=48238539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,92:0.49:188
chr11	48238773	rs61731416	C	T	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.688;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=30;PP=1100;ReadPosRankSum=1.199;SC=CAGTCGTCAACTGTGTCACCT;SOR=0.584;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=113;TCF=46;TCR=67;TR=53;WE=48238781;WS=48238763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,56:0.46:121
chr11	48239071	rs12292056	C	A	1941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.685;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=21;PP=1531;ReadPosRankSum=-1.034;SC=GCCCTCTCCACCTGTGCTTCT;SOR=0.799;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=133;TCF=95;TCR=38;TR=71;WE=48239079;WS=48239061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,72:0.52:139
chr11	48239182	rs7130086	C	A	3203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=7.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=50;PP=2739;ReadPosRankSum=-0.079;SC=GTATTCTACACGGTCATCACC;SOR=0.679;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=253;TCF=144;TCR=109;TR=119;WE=48239190;WS=48239172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,123:0.47:261
chr11	48266582	rs7120549	A	C	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=2;PP=1031;SC=GTGAAGAAGTATTTTGTATCA;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=37;WE=48266590;WS=48266572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	48267589	rs1503180	A	G	2092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=48;PP=1697;SC=TTGTATTGATACTTGGGTTTA;SOR=2.483;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=13;TCR=48;TR=61;WE=48267597;WS=48267579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	48285842	rs1503193	A	G	8790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=156;NR=108;PP=2965;SC=TCTCCTCGTGAGGATAGCATG;SOR=1.057;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=265;TCF=156;TCR=109;TR=264;WE=48285850;WS=48285832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr11	48328644	rs753095	C	T	6172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=93;NR=97;PP=2965;SC=TAAGGAACAACGATGTGAAAA;SOR=0.713;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=190;TCF=93;TCR=97;TR=190;WE=48328652;WS=48328634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr11	48346450	rs79776366	A	G	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=5.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.26;ReadPosRankSum=-0.955;SOR=0.031;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,17:0.27:64
chr11	48346458	rs77295176	A	G	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=5.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.50;ReadPosRankSum=-1.478;SOR=0.035;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,21:0.28:76
chr11	48346487	rs33950768	TC	T	1254.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.679;NF=33;NR=1;PP=856;ReadPosRankSum=-0.755;SC=GCAATGTTTTTCCCCCATGCA;SOR=0.353;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=122;TCF=119;TCR=3;TR=34;WE=48346495;WS=48346477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,36:0.30:120
chr11	48346513	rs78206553	T	C	2042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=2.515;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.181;SOR=0.808;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,56:0.33:172
chr11	48346523	rs72911451	C	T	2129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=8.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=2.539;QD=11.21;ReadPosRankSum=0.459;SOR=1.764;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,61:0.32:190
chr11	48346535	rs76964780	G	C	2537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=7.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=2.592;QD=12.56;ReadPosRankSum=0.689;SOR=1.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,63:0.31:202
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chr11	48346579	rs72911452	C	A	4119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=337;ExcessHet=3.0103;FS=9.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=2.819;QD=12.30;ReadPosRankSum=0.050;SOR=1.177;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:222,113:0.34:335
chr11	48346588	rs75900655	A	C	4451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FS=6.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQRankSum=1.400;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.339;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:235,121:0.34:356
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chr11	48346615	rs73463988	G	A	4586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.260;HP=3;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.385;NF=71;NR=52;ReadPosRankSum=0.036;SC=TCATGCTGGGGCTCTCACAGA;SOR=0.765;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=374;TCF=211;TCR=163;TR=123;WE=48346623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:255,134:0.34:389
chr11	48346660	rs138704181	TTTGCTGATC	T	4266.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FS=1.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=2.515;QD=11.41;ReadPosRankSum=0.332;SOR=0.604;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:253,121:0.32:374
chr11	48346681	rs78490540	G	A	4313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.892;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.936;NF=41;NR=66;PP=2962;ReadPosRankSum=0.205;SC=ATGTGGTCACGGTTTGTGGCA;SOR=0.587;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=328;TCF=125;TCR=203;TR=107;WE=48346689;WS=48346650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:227,122:0.35:349
chr11	48346729	rs73463990	G	C	2863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=8.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.861;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.826;NF=48;NR=55;PP=2240;ReadPosRankSum=0.347;SC=CCAGCCCCACGCTGGCTTCCC;SOR=0.283;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=278;TCF=110;TCR=168;TR=103;WE=48346737;WS=48346719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,109:0.38:289
chr11	48346791	rs73463994	C	T	3347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.882;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=51;PP=2636;ReadPosRankSum=0.306;SC=TTTTATTCTTCTTCTATGGCT;SOR=0.928;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=279;TCF=152;TCR=127;TR=122;WE=48346799;WS=48346781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,129:0.44:293
chr11	48346822	rs73463997	A	C	3956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=7.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.292;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=55;PP=2951;ReadPosRankSum=0.560;SC=TTGCTGACTCATTGTATGAGG;SOR=1.044;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=327;TCF=187;TCR=140;TR=143;WE=48346830;WS=48346812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,152:0.45:339
chr11	48346843	rs73463998	C	T	4439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.376;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=74;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.257;SC=GGAGAACCATCTCTTATGAGT;SOR=0.725;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=362;TCF=196;TCR=166;TR=163;WE=48346851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,172:0.46:371
chr11	48346916	rs77069283	G	C	5673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FS=1.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.04;ReadPosRankSum=-1.469;SOR=0.792;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:183,150:0.45:333
chr11	48346924	rs72911454	T	C	5732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FS=0.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.48;ReadPosRankSum=0.093;SOR=0.764;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:183,145:0.44:328
chr11	48346932	rs80285195	G	A	5411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.81;ReadPosRankSum=0.377;SOR=0.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:178,144:0.45:322
chr11	48346961	rs75493089	AA	TG	5841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=65;PP=2944;ReadPosRankSum=0.909;SC=GCCCCTGCACAATACTACCAT;SOR=0.698;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=312;TCF=163;TCR=149;TR=141;WE=48346970;WS=48346951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,153:0.47:326
chr11	48346996	rs12794960	G	A	1338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;QD=3.70;ReadPosRankSum=1.183;SOR=0.711;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:283,79:0.22:362
chr11	48346999	rs72473367	T	G	5169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FS=1.258;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;QD=14.77;ReadPosRankSum=0.840;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:187,163:0.47:350
chr11	48347014	rs72473368	G	A	6679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FS=1.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;QD=18.82;ReadPosRankSum=-0.583;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:187,168:0.47:355
chr11	48347023	rs67077733	C	T	6382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FS=3.400;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;QD=17.98;ReadPosRankSum=-0.722;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:190,165:0.46:355
chr11	48347067	rs73464001	C	T	3489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.987;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=80;PP=2797;ReadPosRankSum=1.095;SC=CTTTGGTTGCCCTTCTGTGGG;SOR=0.873;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=327;TCF=143;TCR=184;TR=134;WE=48347075;WS=48347057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,138:0.41:336
chr11	48347100	rs73465905	C	T	3123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.450;HP=1;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=75;PP=2436;ReadPosRankSum=-1.013;SC=AATCACTTTGCCTGTGACTTG;SOR=1.078;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=317;TCF=143;TCR=174;TR=127;WE=48347108;WS=48347090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,132:0.41:325
chr11	48347124	rs79019124	A	G	4299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FS=12.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.30;ReadPosRankSum=-1.435;SOR=1.288;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,115:0.41:281
chr11	48347130	rs77395846	C	G	4242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FS=3.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.10;ReadPosRankSum=-1.486;SOR=0.895;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,115:0.41:281
chr11	48347140	rs10838874	T	C	10865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=142;PP=2962;SC=CCTGCACCAATACGTATGTCA;SOR=1.110;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=257;TCF=106;TCR=151;TR=247;WE=48347152;WS=48347114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr11	48347142	rs79891698	C	T	4411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FS=4.886;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.93;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=0.974;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:162,115:0.42:277
chr11	48347144	rs79124801	T	C	4411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FS=4.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.93;ReadPosRankSum=-1.159;SOR=0.947;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,116:0.42:277
chr11	48347267	rs73465910	T	C	1616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.504;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=42;PP=1095;ReadPosRankSum=-0.052;SC=AGATGGGAGATGCAAAGCCCT;SOR=0.738;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=225;TCF=102;TCR=123;TR=78;WE=48347275;WS=48347257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,81:0.35:232
chr11	48347306	rs73465911	G	T	1890.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.505;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=48;PP=1397;ReadPosRankSum=0.154;SC=CTTCATTGTTGTTGCCTTGTT;SOR=0.740;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=238;TCF=97;TCR=141;TR=79;WE=48347314;WS=48347296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,82:0.34:241
chr11	48347342	rs76958755	G	A	2534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=7.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.07;ReadPosRankSum=0.183;SOR=1.170;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,74:0.32:229
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chr11	48347358	rs76274696	C	T	2098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=5.859;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.34;ReadPosRankSum=-1.033;SOR=1.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,62:0.34:185
chr11	48347363	rs77814753	C	T	2030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=7.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.74;ReadPosRankSum=-0.609;SOR=1.247;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,56:0.32:173
chr11	48347392	rs79127479	T	C	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.349;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=29;PP=566;ReadPosRankSum=0.440;SC=CATTATTTTATGGTATTCTGA;SOR=1.662;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=121;TCF=35;TCR=86;TR=36;WE=48347400;WS=48347382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,38:0.30:127
chr11	48347419	rs73465913	A	G	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=367;ReadPosRankSum=0.372;SC=TGTTGAATCCACTCATTTATA;SOR=0.610;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=87;TCF=27;TCR=60;TR=23;WE=48347427;WS=48347409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,25:0.27:93
chr11	48347492	rs79775762	G	A	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=7.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.37;ReadPosRankSum=0.052;SOR=2.623;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,12:0.20:61
chr11	48347498	rs78309417	A	T	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=4.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.81;ReadPosRankSum=-0.817;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,12:0.21:58
chr11	48347539	rs79172951	G	A	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.87;ReadPosRankSum=-0.619;SOR=0.854;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,8:0.20:41
chr11	48347583	.	G	A	24	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=28;MQ=58.62;NF=0;NR=4;PP=24;QD=14.6928031368;SC=ATCATGTATAGTTGTATTCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=4;WE=48347591;WS=48347573;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,4:0.22:18
chr11	48349128	rs76530627	G	A	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.51;ReadPosRankSum=-0.797;SOR=0.141;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr11	48349130	rs75661263	A	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.51;ReadPosRankSum=-0.797;SOR=0.141;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr11	48349152	rs73465924	A	C	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=4.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=135;ReadPosRankSum=-1.959;SC=ATTTTAGATTACAAGTATAAG;SOR=0.207;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=9;WE=48349160;WS=48349142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr11	48349171	rs73465926	T	C	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.589;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=295;ReadPosRankSum=-0.780;SC=AGTGAGGTCATGCAGTATTTG;SOR=0.143;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=50;TCF=48;TCR=2;TR=17;WE=48349179;WS=48349161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,21:0.38:55
chr11	48349209	rs73465927	A	C	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=423;ReadPosRankSum=1.979;SC=TATTTCACTTAGCATAATGTC;SOR=1.121;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=65;TCF=55;TCR=10;TR=22;WE=48349217;WS=48349199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,25:0.37:68
chr11	48349230	rs74884553	G	A	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=325;ReadPosRankSum=-0.614;SC=TTCCAGGTCCGTATACCTTGC;SOR=0.913;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=91;TCF=65;TCR=26;TR=32;WE=48349243;WS=48349220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,35:0.37:94
chr11	48349235	rs10769662	C	T	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=8.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.82;ReadPosRankSum=0.228;SOR=1.974;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,13:0.13:97
chr11	48349252	rs76041098	G	A	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.756;HP=3;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=657;ReadPosRankSum=-1.302;SC=GCAAATGACAGAACTTCTTTC;SOR=0.815;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=107;TCF=61;TCR=46;TR=38;WE=48349260;WS=48349242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,39:0.36:107
chr11	48349312	rs79572913	A	G	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.44;ReadPosRankSum=0.108;SOR=0.792;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,37:0.38:98
chr11	48349316	rs76607933	T	A	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.80;ReadPosRankSum=-0.129;SOR=0.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,36:0.39:93
chr11	48349320	rs77184441	A	T	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.939;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.38;ReadPosRankSum=-0.079;SOR=0.553;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,35:0.38:91
chr11	48349329	rs76765071	C	A	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.19;ReadPosRankSum=0.203;SOR=0.586;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,31:0.37:83
chr11	48349377	rs72911466	A	T	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=1342;ReadPosRankSum=-1.681;SC=AAGTTCTTAAAGCAGTTTCTG;SOR=0.418;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=17;WE=48349415;WS=48349367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr11	48349389	rs79223613	A	C	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.573;SOR=0.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr11	48349391	rs76599777	TG	CA	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.650;SOR=0.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr11	48349394	rs78755709	G	A	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=4.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.51;ReadPosRankSum=0.994;SOR=0.050;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr11	48349407	rs72911467	T	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=3;HapScore=3;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=620;ReadPosRankSum=1.106;SC=GAACTCCCAATATGCTTATTT;SOR=0.054;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=8;WE=48349415;WS=48349367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr11	48349425	rs79941850	T	C	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=67;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.140;NF=0;NR=7;PP=115;ReadPosRankSum=1.280;SC=TTTGATATTATCATGTCTACC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=7;WE=48349433;WS=48349415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr11	48349903	rs11039681	G	A	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.615;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.859;NF=28;NR=3;PP=654;ReadPosRankSum=-0.746;SC=GCAGGAGACCGGGGCATATTT;SOR=1.262;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=56;TCF=49;TCR=7;TR=31;WE=48349911;WS=48349893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr11	48366829	.	G	A	220	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=14;NR=0;PP=220;QD=18.1979437534;SC=AAGTTTAATCGATCAAGAAAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=14;WE=48366837;WS=48366828;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:32,14:0.30:46
chr11	48366895	rs72473369	A	C	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.806;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=0;PP=752;ReadPosRankSum=2.368;SC=TTTGTGTCACAAGACTTATTT;SOR=1.543;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=96;TCF=94;TCR=2;TR=38;WE=48366903;WS=48366885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,38:0.38:100
chr11	48366958	rs76319939	T	G	2264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.220;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=19;PP=2962;ReadPosRankSum=0.008;SC=ATTTTTCACTTCTTTATTTTT;SOR=0.809;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=224;TCF=169;TCR=55;TR=86;WE=48366980;WS=48366948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,89:0.39:228
chr11	48366971	rs75689989	GG	CA	3869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=26;PP=2944;ReadPosRankSum=1.489;SC=TTATTTTTGAGGGTGTAGATT;SOR=0.656;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=265;TCF=182;TCR=83;TR=92;WE=48366980;WS=48366948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,103:0.38:269
chr11	48367050	rs113897236	T	TAG	6325.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=452;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=54;PP=2927;ReadPosRankSum=-0.539;SC=GGAAGGAGGTTAGGTCTTAGA;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=389;TCF=220;TCR=169;TR=126;WE=48367058;WS=48367040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:269,166:0.38:435
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chr11	48367363	rs73453183	C	T	3297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.423;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=74;PP=2638;ReadPosRankSum=-0.030;SC=AAGTCTGGATCCCTCCATGCA;SOR=0.790;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=267;TCF=105;TCR=162;TR=116;WE=48367371;WS=48367353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,131:0.45:290
chr11	48367387	rs78788561	C	T	2850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.284;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=59.99;MQRankSum=-1.141;NF=31;NR=72;PP=2341;ReadPosRankSum=1.216;SC=ATCCCAGAATCCCAGCCACCA;SOR=0.948;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=244;TCF=87;TCR=157;TR=103;WE=48367395;WS=48367377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,113:0.43:262
chr11	48367419	rs77576379	G	A	3447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=1.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=-3.102;QD=15.67;ReadPosRankSum=-0.369;SOR=0.588;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,94:0.43:220
chr11	48367424	rs77976451	C	G	3475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=1.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-3.227;QD=16.71;ReadPosRankSum=-1.227;SOR=0.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,92:0.44:208
chr11	48367455	rs79175163	G	A	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=4.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.605;HP=1;HapScore=2;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.553;NF=4;NR=48;PP=2962;ReadPosRankSum=1.115;SC=AAGGGCTTACGGATGGCCACA;SOR=0.229;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=138;TCF=18;TCR=120;TR=52;WE=48367482;WS=48367445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,59:0.40:148
chr11	48367469	rs79686513	TG	CA	1755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=8.024;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQRankSum=-3.680;QD=14.05;ReadPosRankSum=0.983;SOR=0.231;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,48:0.38:125
chr11	48367474	rs75116918	A	G	1737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=14.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQRankSum=-3.623;QD=15.52;ReadPosRankSum=-0.218;SOR=0.102;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,44:0.39:112
chr11	48367499	rs72896822	A	G	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.550;HP=1;HapScore=3;MGOF=83;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.928;NF=0;NR=23;PP=1556;ReadPosRankSum=-1.779;SC=TAATAAGATGATCTCAGCTGC;SOR=0.036;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=78;TCF=4;TCR=74;TR=23;WE=48367519;WS=48367489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,20:0.25:79
chr11	48367511	.	T	G	1556	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=83;MMLQ=24;MQ=57.68;NF=0;NR=15;PP=1556;QD=106.05141417;SC=CTCAGCTGCCTCAAAGAAATG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=3;TCR=48;TR=15;WE=48367519;WS=48367489;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:36,15:0.29:51
chr11	48373632	rs4882248	T	A	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=722;SC=TATAAGTATGTAACAAACCTG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=48373640;WS=48373622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	48373748	rs73453188	C	G	1455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.040;HP=6;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.686;NF=48;NR=3;PP=1455;ReadPosRankSum=-1.441;SC=ATATGGTGTTCTTTTCAGAGA;SOR=0.201;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=170;TCF=139;TCR=31;TR=51;WE=48373756;WS=48373738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,44:0.26:171
chr11	48373770	rs73453191	T	A	1896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.743;HP=1;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.123;NF=50;NR=10;PP=1514;ReadPosRankSum=2.150;SC=CAAGTCAAAGTTCATTTTAGG;SOR=0.421;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=192;TCF=140;TCR=52;TR=60;WE=48373778;WS=48373760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,62:0.31:202
chr11	48373797	rs72896825	C	T	3109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FS=2.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.956;QD=12.69;ReadPosRankSum=0.979;SOR=0.870;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,84:0.34:245
chr11	48373805	rs75618010	G	A	3550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FS=4.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.891;QD=13.25;ReadPosRankSum=-0.352;SOR=0.969;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:172,96:0.36:268
chr11	48373815	rs74350365	A	G	3757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FS=2.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.885;QD=14.07;ReadPosRankSum=-1.058;SOR=0.834;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:171,96:0.36:267
chr11	48373817	rs75951679	C	T	3676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FS=0.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.882;QD=13.52;ReadPosRankSum=-1.339;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:174,98:0.36:272
chr11	48373820	rs3898634	A	C	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FS=0.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.322;QD=1.71;ReadPosRankSum=-0.538;SOR=0.780;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:233,44:0.16:277
chr11	48373827	rs80081241	G	A	3907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FS=2.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.920;QD=13.20;ReadPosRankSum=-0.696;SOR=0.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:192,104:0.35:296
chr11	48373833	rs75965588	GA	AG	3944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FS=0.919;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-1.888;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.713;SOR=0.768;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:191,107:0.36:298
chr11	48373885	rs76292854	A	G	2638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.947;HP=1;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=49;PP=2087;ReadPosRankSum=1.858;SC=ACTGAGATGAACAGGTTACCT;SOR=0.606;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=268;TCF=118;TCR=150;TR=95;WE=48373893;WS=48373875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,107:0.38:282
chr11	48373900	rs77877396	A	G	2436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=49;PP=1920;ReadPosRankSum=1.075;SC=TTACCTGCCAATGTGATCAAG;SOR=0.562;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=248;TCF=94;TCR=154;TR=86;WE=48373908;WS=48373890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,99:0.38:264
chr11	48373936	rs76304554	A	G	1923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=51;PP=1825;ReadPosRankSum=-1.955;SC=ATAACAAACAAGAATTTCTGC;SOR=0.636;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=199;TCF=51;TCR=148;TR=70;WE=48373954;WS=48373926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,79:0.38:210
chr11	48373946	rs12797020	C	A	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=52;PP=1642;ReadPosRankSum=-0.985;SC=AGAATTTCTGCAGTTCTGGAT;SOR=0.727;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=188;TCF=46;TCR=142;TR=68;WE=48373954;WS=48373926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,70:0.36:196
chr11	48373976	rs80225178	T	G	1865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=1.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.52;ReadPosRankSum=1.015;SOR=0.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,54:0.36:149
chr11	48373986	rs12420054	A	G	1903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.31;ReadPosRankSum=0.228;SOR=0.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,52:0.39:133
chr11	48374000	rs112772888	C	CT	922.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.561;HP=6;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=33;PP=2971;ReadPosRankSum=0.323;SC=CATTGTTCATCTTTTTCATAG;SOR=0.250;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=101;TCF=3;TCR=98;TR=35;WE=48374008;WS=48373966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,41:0.41:100
chr11	48374031	rs72896827	G	A	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=3.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.94;ReadPosRankSum=1.301;SOR=0.122;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,31:0.42:73
chr11	48374041	rs72896828	T	C	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.62;ReadPosRankSum=0.471;SOR=0.600;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr11	48386956	.	C	CA	737.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=833;ReadPosRankSum=0.741;SC=CTTAAACTCACTATTCTGACC;SOR=0.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=21;WE=48386964;WS=48386953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr11	48387019	rs71220563	G	T	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=4.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.989;QD=3.14;ReadPosRankSum=0.342;SOR=0.175;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,23:0.21:112
chr11	48387098	rs77594589	A	C	3917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FS=13.225;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.99;ReadPosRankSum=2.044;SOR=0.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,103:0.42:245
chr11	48387107	rs77606603	T	C	4119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FS=5.964;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.97;ReadPosRankSum=1.405;SOR=0.436;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,107:0.41:258
chr11	48387115	rs75003399	G	A	4265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FS=4.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.28;ReadPosRankSum=0.114;SOR=0.488;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,111:0.42:262
chr11	48387118	rs79339252	G	A	4265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FS=4.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.74;ReadPosRankSum=-0.198;SOR=0.470;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,115:0.42:271
chr11	48387154	rs72473370	A	G	3445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FS=6.760;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.327;SOR=0.491;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:181,100:0.36:281
chr11	48387164	rs72473371	G	A	3405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FS=8.893;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.43;ReadPosRankSum=0.039;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:178,96:0.35:274
chr11	48387201	rs77053100	G	A	3269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FS=3.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.59;ReadPosRankSum=-0.841;SOR=0.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:191,91:0.32:282
chr11	48387206	rs76817095	T	C	3350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FS=2.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.44;ReadPosRankSum=-0.559;SOR=0.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:201,92:0.31:293
chr11	48387210	rs78428763	CC	TG	3286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FS=2.146;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.14;ReadPosRankSum=-0.327;SOR=0.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:204,91:0.31:295
chr11	48387237	rs72898877	C	T	3171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FS=2.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-2.090;QD=9.76;ReadPosRankSum=-0.953;SOR=0.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:223,102:0.31:325
chr11	48387254	rs75441735	A	G	3445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FS=0.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-3.137;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.556;SOR=0.777;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:237,97:0.29:334
chr11	48387258	rs78030134	C	T	3577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FS=3.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-3.112;QD=10.62;ReadPosRankSum=0.138;SOR=0.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:238,99:0.29:337
chr11	48387262	rs75430864	G	A	3613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FS=7.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-3.093;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.232;SOR=1.081;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:240,101:0.30:341
chr11	48387278	.	C	CACT	2143.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=5.884;ClippingRankSum=0.000;DP=337;ExcessHet=3.0103;FS=21.737;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-3.148;QD=6.92;ReadPosRankSum=2.861;SOR=1.848;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:238,72:0.23:310
chr11	48387279	.	G	GTCCTT	1039.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=5.262;ClippingRankSum=0.000;DP=324;ExcessHet=3.0103;FS=23.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-1.942;QD=3.26;ReadPosRankSum=2.574;SOR=1.844;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:271,48:0.15:319
chr11	48387284	.	G	GATGTGAGTCTTTAGTA	1241.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.107;ClippingRankSum=0.000;DP=318;ExcessHet=3.0103;FS=22.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-1.828;QD=3.93;ReadPosRankSum=0.448;SOR=1.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:265,51:0.16:316
chr11	48387285	.	A	AGTCTTTAGTAG	855.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DP=323;ExcessHet=3.0103;FS=3.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-2.214;QD=2.67;ReadPosRankSum=-0.896;SOR=0.810;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:279,42:0.13:321
chr11	48387301	rs76220342	G	A	3646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.772;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.851;NF=53;NR=43;PP=1520;ReadPosRankSum=-2.665;SC=GGATTAGGACGTAAGAGGTAA;SOR=0.906;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=311;TCF=161;TCR=150;TR=96;WE=48387309;WS=48387291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:226,112:0.33:338
chr11	48387335	rs73460769	C	A	3337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.054;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=76;ReadPosRankSum=1.737;SC=AATGAGCATACACATCAGCCC;SOR=1.017;Source=Platypus;TCF=191;WE=48387343;WS=48387325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:241,135:0.36:376
chr11	48387370	rs73460772	A	G	3553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-6.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.466;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=55;PP=2679;ReadPosRankSum=-0.102;SC=CAAAGAGTCCAAAGACGTGAG;SOR=1.058;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=375;TCF=227;TCR=148;TR=156;WE=48387378;WS=48387360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:230,161:0.41:391
chr11	48387424	rs61917478	G	T	4095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-8.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=462;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=90;PP=2962;ReadPosRankSum=0.632;SC=GGTCACAGATGAAATGGTCAA;SOR=0.690;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=448;TCF=226;TCR=222;TR=178;WE=48387432;WS=48387414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:278,181:0.39:459
chr11	48387490	rs77144540	G	A	4207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=485;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.660;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=103;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.068;SC=GAATCAGAGCGTGAAGAAATC;SOR=0.855;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=471;TCF=240;TCR=231;TR=181;WE=48387498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:299,182:0.38:481
chr11	48387506	rs72898882	A	G	4261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.320;HP=3;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=89;ReadPosRankSum=0.403;SC=AAATCCCCCGACCCATGCCAT;SOR=0.771;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=439;TCF=224;TCR=215;TR=159;WS=48387496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:284,160:0.36:444
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chr11	48387647	rs75615667	A	G	4441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=8.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=439;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=66;PP=2315;ReadPosRankSum=0.038;SC=GAAATGTTCTACAAAGAGCTG;SOR=0.662;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=427;TCF=201;TCR=226;TR=126;WE=48387655;WS=48387637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:309,127:0.29:436
chr11	48387668	rs10769651	C	G	4740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-6.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=420;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.570;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=57;PP=2962;ReadPosRankSum=0.939;SC=GGTCATGCACCCACTGAAGGA;SOR=0.796;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=407;TCF=204;TCR=203;TR=124;WE=48387697;WS=48387658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:292,126:0.30:418
chr11	48387679	rs76209049	A	G	4932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=429;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.672;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=54;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.026;SC=CACTGAAGGAAATAGTTTTCT;SOR=0.886;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=410;TCF=230;TCR=180;TR=126;WE=48387697;WS=48387658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:289,136:0.32:425
chr11	48387683	rs67755516	GT	G	5158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=426;ExcessHet=3.0103;FS=1.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.725;SOR=0.909;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:283,139:0.33:422
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chr11	48387780	rs76329018	C	T	6417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=0.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.56;ReadPosRankSum=1.273;SOR=0.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:329,182:0.36:511
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chr11	48387825	rs75650204	T	G	6192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=544;ExcessHet=3.0103;FS=1.868;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.51;ReadPosRankSum=0.300;SOR=0.566;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:363,175:0.33:538
chr11	48387833	rs79515387	T	C	6286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=527;ExcessHet=3.0103;FS=1.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.04;ReadPosRankSum=0.563;SOR=0.686;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:351,171:0.33:522
chr11	48387850	rs73460781	G	T	4947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=549;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=92;PP=2869;ReadPosRankSum=0.345;SC=TGGTGAGAAAGTAGATGAGTG;SOR=0.679;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=532;TCF=248;TCR=284;TR=174;WE=48387858;WS=48387840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:367,180:0.33:547
chr11	48387890	rs74623688	T	C	5773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.401;QD=11.83;ReadPosRankSum=-0.435;SOR=0.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:324,164:0.34:488
chr11	48387894	rs75065468	C	T	5692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=0.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.412;QD=12.22;ReadPosRankSum=-0.134;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:311,155:0.33:466
chr11	48387900	rs74338058	G	A	5507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=446;ExcessHet=3.0103;FS=2.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.417;QD=12.40;ReadPosRankSum=-0.060;SOR=0.889;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:297,147:0.33:444
chr11	48387917	rs66829866	AT	A	4983.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=8.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=404;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.349;HP=1;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.401;NF=20;NR=82;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.019;SC=GCCAAGCAAGATGAATTCCGT;SOR=0.799;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=342;TCF=67;TCR=275;TR=102;WE=48387938;WS=48387907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:267,135:0.34:402
chr11	48387919	rs114441034	G	A	5031.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=405;ExcessHet=3.0103;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.391;QD=12.45;ReadPosRankSum=-0.134;SOR=0.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:267,137:0.34:404
chr11	48387930	rs75939575	T	C	4756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-7.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.785;HP=1;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.94;MQRankSum=-1.403;NF=28;NR=91;PP=2962;ReadPosRankSum=0.369;SC=AATTCCGTTATGTTGTTCACT;SOR=0.878;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=367;TCF=91;TCR=276;TR=119;WE=48387938;WS=48387907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:252,127:0.34:379
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chr11	48387946	rs114053360	G	T	3957.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-5.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FS=4.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.397;QD=12.69;ReadPosRankSum=0.079;SOR=0.978;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:207,105:0.34:312
chr11	48387960	rs79688019	T	C	3267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=9.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.378;NF=15;NR=73;PP=2962;ReadPosRankSum=0.151;SC=TCCAGTTTGGTATTTGGATAA;SOR=0.714;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=254;TCF=41;TCR=213;TR=88;WE=48387968;WS=48387935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,89:0.34:260
chr11	48387978	rs78160589	T	A	1485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=0.914;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-1.420;QD=7.50;ReadPosRankSum=0.485;SOR=0.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,65:0.33:198
chr11	48387983	rs75819836	T	C	2247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=9.327;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.28;ReadPosRankSum=1.341;SOR=0.186;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,60:0.33:183
chr11	48388047	rs75982328	T	C	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=17.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.654;SOR=0.010;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,28:0.37:76
chr11	48388047	.	TTA	CTG	1202	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=3;NR=21;PP=1202;QD=52.3111614526;SC=TTGGTCAGGATTATTTTCTGT;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=75;TCF=3;TCR=72;TR=24;WE=48388057;WS=48388037;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:51,24:0.32:75
chr11	48388049	rs77697332	A	G	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=18.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.02;ReadPosRankSum=-0.248;SOR=0.010;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,26:0.36:72
chr11	48388067	rs73460782	G	A	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.895;HP=1;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=392;ReadPosRankSum=2.003;SC=TAACACTGATGGAATCCCTAA;SOR=0.031;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=50;TCF=1;TCR=49;TR=19;WE=48388075;WS=48388057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
chr11	48388487	rs78414756	C	A	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=3;HapScore=2;MGOF=60;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.800;NF=14;NR=1;PP=259;ReadPosRankSum=1.880;SC=GGTGAGTTCACTTTGAAATTA;SOR=0.096;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=15;WE=48388495;WS=48388477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr11	48388524	rs76789954	C	T	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=3.765;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.97;ReadPosRankSum=1.332;SOR=0.118;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,29:0.42:69
chr11	48388524	.	CAA	TAG	1543	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=63;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=28;NR=1;PP=1543;QD=55.0506163746;SC=ATTTCAGAATCAACTGAACTG;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=70;TCF=69;TCR=1;TR=29;WE=48388534;WS=48388514;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:41,29:0.41:70
chr11	48388526	rs77473022	A	G	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.18;ReadPosRankSum=1.212;SOR=0.115;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,30:0.42:72
chr11	48388542	rs77282201	G	A	1356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.645;SOR=0.373;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,37:0.40:92
chr11	48388544	rs74346885	T	C	1392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.14;ReadPosRankSum=0.853;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,36:0.39:92
chr11	48388553	rs80082776	C	G	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.55;ReadPosRankSum=-0.003;SOR=0.952;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,40:0.38:105
chr11	48388563	rs77148147	CT	AG	1716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.43;ReadPosRankSum=-0.680;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,45:0.38:119
chr11	48388567	rs79767657	A	C	1893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.46;ReadPosRankSum=-1.046;SOR=0.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,51:0.39:131
chr11	48388571	rs79079495	C	T	1964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.74;ReadPosRankSum=0.268;SOR=0.829;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,51:0.36:143
chr11	48388583	rs77992774	A	T	1895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-7.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=3;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.004;SC=GTTAGATTTGAGAATTTATGC;SOR=0.669;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=151;TCF=142;TCR=9;TR=53;WE=48388591;WS=48388532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,55:0.35:155
chr11	48388610	rs79108820	T	G	3233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=7.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.50;ReadPosRankSum=-0.986;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,84:0.38:223
chr11	48388612	rs76366705	T	C	3350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=6.849;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.51;ReadPosRankSum=-1.156;SOR=1.201;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,88:0.38:231
chr11	48388614	rs146852809	T	C	3631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FS=7.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.45;ReadPosRankSum=-1.261;SOR=1.259;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,90:0.38:235
chr11	48388621	rs75849499	ACA	GTC	3793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FS=9.444;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.76;ReadPosRankSum=-0.831;SOR=1.267;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:159,98:0.38:257
chr11	48388641	rs80267937	G	A	4816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.414;HP=2;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=41;PP=2039;ReadPosRankSum=-0.574;SC=ACTTCTGGAAGCATATCCTGG;SOR=0.782;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=311;TCF=197;TCR=114;TR=121;WE=48388649;WS=48388631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,126:0.40:318
chr11	48388657	rs80000751	G	A	5247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.314;HP=1;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=50;PP=2245;ReadPosRankSum=1.478;SC=CCTGGAAGAGGATAAAACAGC;SOR=0.781;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=349;TCF=209;TCR=140;TR=132;WE=48388665;WS=48388647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:224,135:0.38:359
chr11	48388681	rs76712816	G	A	5856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.230;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=65;PP=2569;ReadPosRankSum=-0.879;SC=ATGCAAGGCAGCATTCCCCAG;SOR=0.780;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=365;TCF=193;TCR=172;TR=146;WE=48388689;WS=48388671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:225,154:0.41:379
chr11	48388698	rs77483743	C	T	5749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.256;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=75;PP=2653;ReadPosRankSum=-1.842;SC=CCAGATGTATCTGAAACTTTA;SOR=0.765;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=343;TCF=163;TCR=180;TR=144;WE=48388706;WS=48388688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,151:0.42:356
chr11	48388717	rs78132200	T	C	4638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.421;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=76;PP=2472;ReadPosRankSum=1.567;SC=TAGAATTCACTTGGAGAACTG;SOR=0.923;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=311;TCF=126;TCR=185;TR=123;WE=48388725;WS=48388707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,131:0.40:325
chr11	48388782	rs76039310	A	G	1641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.089;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.403;NF=4;NR=59;PP=1268;ReadPosRankSum=-2.146;SC=AAGGATGACTATGAAAAATTA;SOR=0.285;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=154;TCF=8;TCR=146;TR=63;WE=48388790;WS=48388772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,66:0.42:159
chr11	48388833	rs73460789	A	C	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.607;NF=0;NR=32;PP=718;ReadPosRankSum=0.809;SC=GGTGAGGGAAAAAAAGCACCA;SOR=0.326;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=86;TCF=0;TCR=86;TR=32;WE=48388841;WS=48388823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,35:0.38:92
chr11	48453678	rs600750	G	A	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.876;NF=30;NR=0;PP=684;ReadPosRankSum=0.306;SC=TTGTTCTTGCGATAGTTTGCT;SOR=0.884;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=30;WE=48453686;WS=48453668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr11	48453787	rs4882063	G	A	1636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.351;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.903;NF=38;NR=34;PP=1293;ReadPosRankSum=-1.187;SC=TACCTGAAATGTCCTTTCTAC;SOR=0.541;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=206;TCF=117;TCR=89;TR=72;WE=48453795;WS=48453777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,73:0.37:198
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chr11	48511315	rs66756334	C	T	2340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.412;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.038;NF=29;NR=57;PP=1865;ReadPosRankSum=1.191;SC=GACTTTACAGCCTTTCTCCTT;SOR=0.963;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=180;TCF=64;TCR=116;TR=86;WE=48511323;WS=48511305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,90:0.48:189
chr11	48997107	rs2047941	G	A	2624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.147;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=33;PP=2133;ReadPosRankSum=-1.035;SC=AGCAATTAGGGATGGTGTATA;SOR=0.598;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=215;TCF=149;TCR=66;TR=102;WE=48997115;WS=48997097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,103:0.47:217
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chr11	48997592	rs1813231	C	T	2311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=67;PP=1904;SC=ATGTAATTAACAGAAATTAGA;SOR=5.699;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=3;TCR=68;TR=70;WE=48997600;WS=48997582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	48999833	rs12576844	G	A	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.085;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.017;NF=0;NR=29;PP=632;ReadPosRankSum=-0.223;SC=CTCCTGGAAAGCATTTTCTGT;SOR=1.718;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=1;TCR=56;TR=29;WE=48999841;WS=48999823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr11	49000423	rs1965370	C	G	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=5.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=456;ReadPosRankSum=-0.826;SC=TCAGTCCGTACCTGGAATAGC;SOR=0.651;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=20;WE=49000431;WS=49000413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr11	49000522	rs1963629	C	T	1717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.594;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.069;NF=41;NR=25;PP=1198;ReadPosRankSum=-0.435;SC=GCTTTGCTTTCATTGAGTTGC;SOR=0.788;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=156;TCF=95;TCR=61;TR=66;WE=49000530;WS=49000512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,72:0.44:165
chr11	49000558	rs11040198	G	A	2375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.548;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.720;NF=42;NR=49;PP=1834;ReadPosRankSum=0.663;SC=CCCTCCTTTTGCAGCCTCTCC;SOR=0.776;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=173;TCF=83;TCR=90;TR=91;WE=49000566;WS=49000548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,94:0.52:180
chr11	49002343	rs9783302	T	G	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.750;NF=18;NR=0;PP=416;ReadPosRankSum=-0.707;SC=CAAGTGTTTTTTCCTTGTTTG;SOR=1.702;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=18;WE=49002351;WS=49002333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr11	49058904	rs199766197	ATACTT	A	441.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.457;NF=13;NR=0;PP=416;ReadPosRankSum=0.121;SC=AACCATCTCTATACTTTACTA;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=13;WE=49058916;WS=49058894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr11	49059362	rs2696914	C	A	2120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-7.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.679;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.700;NF=22;NR=67;PP=1731;ReadPosRankSum=-0.545;SC=CTCCCCACTTCTGCTGCAATA;SOR=1.381;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=193;TCF=55;TCR=138;TR=89;WE=49059370;WS=49059352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,88:0.45:195
chr11	49075605	rs2851535	G	A	2110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.200;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.960;NF=41;NR=31;PP=1569;ReadPosRankSum=0.032;SC=AATGCTTGCCGGAGGTGAATG;SOR=0.996;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=143;TCF=75;TCR=68;TR=72;WE=49075613;WS=49075595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,77:0.51:150
chr11	49076898	rs7932199	T	G	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=6.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.995;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.705;NF=17;NR=0;PP=305;ReadPosRankSum=0.103;SC=ACTCCAGTTATGCACCATGAA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=61;TCR=5;TR=17;WE=49076906;WS=49076888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,17:0.26:66
chr11	49076963	rs34650085	C	CAA	1704.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.592;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.010;NF=34;NR=23;PP=909;ReadPosRankSum=0.628;SC=ATCAGTTCTGCAAAAAAAAAA;SOR=1.217;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=155;TCF=82;TCR=73;TR=57;WE=49076971;WS=49076953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,67:0.44:154
chr11	49077889	rs36015501	AT	A	1927.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.133;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.503;NF=44;NR=30;PP=1228;ReadPosRankSum=1.378;SC=CAGAAATAGCATTTTTTTTAG;SOR=1.222;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=184;TCF=99;TCR=85;TR=74;WE=49077897;WS=49077879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,96:0.45:213
chr11	49079350	rs1819409	A	G	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.726;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.776;NF=0;NR=6;PP=134;ReadPosRankSum=2.266;SC=ACCCAGTCTTAGTGAAAGGTT;SOR=3.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=6;WE=49079358;WS=49079340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr11	49080565	rs7932738	A	C	1895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.457;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.723;NF=56;NR=16;PP=1427;ReadPosRankSum=-0.310;SC=GGCCTGCAAAAGCTGTGCACA;SOR=0.853;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=143;TCF=109;TCR=34;TR=72;WE=49080573;WS=49080555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,76:0.50:151
chr11	49144969	rs199997495	G	GT	851.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.858;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.658;NF=9;NR=22;PP=454;ReadPosRankSum=0.696;SC=TGATTTTTCTGTTTTTTTTTC;SOR=0.054;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=92;TCF=17;TCR=75;TR=31;WE=49144977;WS=49144959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,39:0.54:72
chr11	49145048	rs6485962	T	G	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-6.027;NF=1;NR=20;PP=462;ReadPosRankSum=-1.603;SC=CACTAGAAAATAAAATATAGT;SOR=0.122;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=21;WE=49145056;WS=49145038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr11	49145838	rs7933115	C	T	2107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.479;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-12.266;NF=51;NR=43;PP=2004;ReadPosRankSum=0.166;SC=TTTCCTGGTGCCTCCTACAGA;SOR=1.078;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=180;TCF=96;TCR=84;TR=94;WE=49145846;WS=49145828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,79:0.47:169
chr11	49170334	rs202694	T	C	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.684;NF=4;NR=39;PP=1026;ReadPosRankSum=0.203;SC=ATGTTTCTACTCAGAAAATAA;SOR=0.991;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=66;TCF=7;TCR=59;TR=43;WE=49170342;WS=49170324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,45:0.66:68
chr11	49175609	rs143005014	T	C	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=5.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.953;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=398;ReadPosRankSum=-0.365;SC=TATATTTTTATATTATAAGAC;SOR=0.230;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=19;WE=49175617;WS=49175599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chr11	49176057	rs2988340	C	T	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.57;MQRankSum=-4.464;QD=3.34;ReadPosRankSum=-2.089;SOR=0.596;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,14:0.21:67
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chr11	49208267	.	G	A	891	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=29;MQ=45.08;NF=38;NR=20;PP=891;QD=15.9615726301;SC=TTCATGTCCCGTTCCAATTTA;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=192;TCF=105;TCR=87;TR=58;WE=49208275;WS=49208257;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:134,58:0.30:192
chr11	49208433	.	A	G	67	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=53.38;NF=0;NR=7;PP=67;QD=14.5387446496;SC=GCACACAGGAAGGTCAGAAAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=7;WE=49208441;WS=49208423;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chr11	49214499	rs4315497	G	A	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.729;NF=1;NR=30;PP=640;ReadPosRankSum=0.757;SC=TTTGATTACTGTAATCAAACA;SOR=1.017;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=64;TCF=3;TCR=61;TR=31;WE=49214507;WS=49214489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,31:0.46:67
chr11	49229488	.	AAAAC	A	1844.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.797;ClippingRankSum=0.000;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.833;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=4.617;NF=4;NR=40;PP=1873;ReadPosRankSum=1.667;SC=GAGAGGTAAAAAAACAAACAA;SOR=0.090;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=108;TCF=7;TCR=101;TR=44;WE=49229499;WS=49229478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,55:0.51:108
chr11	49329521	rs1164671	T	C	1733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.607;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.749;NF=46;NR=26;PP=1485;ReadPosRankSum=0.280;SC=ATTTTGGTCATAAGTCATCCC;SOR=0.593;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=162;TCF=105;TCR=57;TR=72;WE=49329529;WS=49329511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,70:0.42:165
chr11	49329552	rs1164670	G	A	1737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.225;NF=55;NR=33;PP=1874;ReadPosRankSum=0.058;SC=TGGAAATCCGGATGGTCAAAG;SOR=0.911;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=196;TCF=117;TCR=79;TR=88;WE=49329560;WS=49329542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,70:0.38:184
chr11	49356400	rs34397343	GT	G	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.98;MQRankSum=0.489;QD=7.22;ReadPosRankSum=-1.029;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr11	49372872	rs3915110	G	A	2128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.457;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-8.364;NF=38;NR=74;PP=2099;ReadPosRankSum=0.657;SC=TGATGAGGCAGTGGGCATAGT;SOR=0.484;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=208;TCF=68;TCR=140;TR=112;WE=49372880;WS=49372862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,90:0.48:189
chr11	49400965	rs3974576	T	C	2084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.753;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.383;NF=33;NR=47;PP=1696;ReadPosRankSum=-0.320;SC=ATTCACTATCTAAGACTCTTC;SOR=1.108;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=149;TCF=67;TCR=82;TR=80;WE=49400973;WS=49400955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,78:0.50:156
chr11	49401125	rs7102702	T	G	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=586;ReadPosRankSum=0.000;SC=ATCAGACAGCTGTGTTATGCC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=0;TCR=51;TR=26;WE=49401133;WS=49401115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
chr11	49597799	rs7131345	C	T	5481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=134;NR=53;PP=2965;SC=TGTCCTAAAACGGTCCTTCTG;SOR=1.995;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=134;TCR=53;TR=187;WE=49597807;WS=49597789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr11	49598178	rs7101761	G	A	3437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.043;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.704;NF=72;NR=60;PP=2724;ReadPosRankSum=0.315;SC=AGGGCTTGGTGTGCTCTGTGG;SOR=0.847;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=262;TCF=135;TCR=127;TR=132;WE=49598186;WS=49598168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,136:0.51:269
chr11	49598207	rs3750925	T	C	4900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQRankSum=-7.869;QD=18.63;ReadPosRankSum=0.127;SOR=0.679;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,129:0.49:263
chr11	49598207	.	TCT	CCC	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=24;MQ=56.31;NF=60;NR=53;PP=2944;QD=20;SC=TCCTCTTCCTTCTGCTCCAAG;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=257;TCF=129;TCR=128;TR=113;WE=49598217;WS=49598197;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:144,113:0.44:257
chr11	49598209	rs7939515	T	C	4900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FS=0.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQRankSum=-7.699;QD=19.07;ReadPosRankSum=0.518;SOR=0.650;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,124:0.48:257
chr11	49637416	rs7125677	A	G	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.435;NF=0;NR=15;PP=332;ReadPosRankSum=-0.461;SC=ATGCTAAAATACCCTTAATGA;SOR=0.770;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=15;WE=49637424;WS=49637406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr11	49729299	rs67084465	AC	A	1744.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.832;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.597;NF=22;NR=34;PP=1783;ReadPosRankSum=0.689;SC=TCTCATCAACACCCCAACTGG;SOR=0.412;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=137;TCF=45;TCR=92;TR=56;WE=49729307;WS=49729289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,66:0.42:156
chr11	49805668	rs34269909	T	A	1562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.370;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.916;NF=15;NR=50;PP=1214;ReadPosRankSum=1.229;SC=ATACCAGGAATTTGGCAGCAC;SOR=0.322;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=138;TCF=27;TCR=111;TR=65;WE=49805676;WS=49805658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,65:0.47:138
chr11	49813442	rs7943083	A	G	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=0;PP=1406;SC=GGACCCTGCGACCTTCCGCAG;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=45;WE=49813450;WS=49813432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	49813519	.	G	T	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=97.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.69;MQRankSum=0.293;QD=7.51;ReadPosRankSum=-5.488;SOR=7.222;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,36:0.55:66
chr11	49813637	rs11530434	A	G	1977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.72;QD=33.52;SOR=8.189;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	49829193	rs35198519	AT	A	1490.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=41;PP=751;ReadPosRankSum=1.381;SC=ACGTATTTCTATTTTTTTTTA;SOR=0.824;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=153;TCF=52;TCR=101;TR=57;WE=49829201;WS=49829183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,79:0.44:181
chr11	49974371	rs28662375	G	A	5669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=76;PP=2965;SC=CTATACCACCGTCATGAAGCA;SOR=0.953;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=97;TCR=76;TR=173;WE=49974379;WS=49974361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr11	50003191	rs4598671	C	A	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.895;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.488;NF=23;NR=13;PP=725;ReadPosRankSum=-0.377;SC=GTGTAGACCACGGGATTTAAC;SOR=0.535;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=75;TCF=50;TCR=25;TR=36;WE=50003199;WS=50003181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,39:0.51:77
chr11	51411460	rs34285763	G	A	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.152;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.817;NF=28;NR=8;PP=793;ReadPosRankSum=0.772;SC=ACATGAGGACGGACACTCCTC;SOR=0.979;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=62;TCF=48;TCR=14;TR=36;WE=51411468;WS=51411450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,36:0.58:62
chr11	51411740	rs35083184	A	T	2748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.646;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=58;PP=1986;ReadPosRankSum=-0.414;SC=AAGGGAGCTTAGGATGACTCC;SOR=0.586;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=209;TCF=91;TCR=118;TR=105;WE=51411748;WS=51411730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,110:0.50:218
chr11	51459057	rs5009058	G	A	1593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.616;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.904;NF=35;NR=37;PP=1387;ReadPosRankSum=-1.368;SC=GTCAGTGCAGGCCAGTTTCAA;SOR=0.934;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=167;TCF=82;TCR=85;TR=72;WE=51459065;WS=51459047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,68:0.41:167
chr11	51515460	rs11246606	C	T	4150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.147;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-11.494;NF=84;NR=80;PP=2962;ReadPosRankSum=0.723;SC=ATGTACCTTTCCCTGGCCTAT;SOR=0.535;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=361;TCF=194;TCR=167;TR=164;WE=51515468;WS=51515450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,161:0.45:360
chr11	51515640	rs74396937	A	G	1682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=69.101;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-13.267;NF=40;NR=68;PP=2157;ReadPosRankSum=1.143;SC=GCCTATGACCACTATGTGGCC;SOR=3.696;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=254;TCF=107;TCR=147;TR=108;WE=51515648;WS=51515630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,71:0.33:212
chr11	51515912	rs77689730	C	T	2970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.917;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.757;NF=42;NR=71;PP=2341;ReadPosRankSum=-0.199;SC=AAACTTTGCCCTCCTGCTGGT;SOR=1.175;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=249;TCF=106;TCR=143;TR=113;WE=51515920;WS=51515902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,117:0.45:259
chr11	51516144	rs11246609	A	G	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=7.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=52.556;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-10.533;NF=61;NR=7;PP=1597;ReadPosRankSum=1.283;SC=TATACCTTGAAGAATGCCCAG;SOR=4.473;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=180;TCF=137;TCR=43;TR=68;WE=51516152;WS=51516134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,59:0.33:177
chr11	51516257	rs59407432	A	T	2164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.644;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.752;NF=6;NR=71;PP=1709;ReadPosRankSum=0.147;SC=ATGTCCTTTTAGGGACATGGA;SOR=0.391;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=144;TCF=10;TCR=134;TR=77;WE=51516265;WS=51516247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,79:0.53:148
chr11	51527482	rs35049610	C	T	1745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.168;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.617;NF=37;NR=29;PP=1347;ReadPosRankSum=-0.020;SC=ATCTCAGTAGCACCAAAAATG;SOR=0.434;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=126;TCF=74;TCR=52;TR=66;WE=51527490;WS=51527472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,69:0.52:133
chr11	55035723	.	G	A	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=0;PP=885;SC=GAAGAAGGTAGGGAAATAATA;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=55035731;WS=55035713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	55035809	rs11407154	A	AT	1789.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.906;HP=13;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.605;NF=31;NR=29;PP=1054;ReadPosRankSum=1.063;SC=AAATCTTTCTATTTTTTTTTT;SOR=0.197;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=41;TCR=38;TR=60;WE=55035817;WS=55035799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,70:0.97:72
chr11	55111666	.	T	C	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=85;ReadPosRankSum=-1.001;SC=GGCGGTAAAATACTGCAGTCA;SOR=0.175;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=7;WE=55111674;WS=55111656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr11	55322298	rs8181485	C	T	1915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.223;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=34;PP=1478;ReadPosRankSum=-0.030;SC=CAGCCATGGCCTATGATCGTT;SOR=0.495;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=126;TCF=57;TCR=69;TR=64;WE=55322306;WS=55322288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,69:0.53:131
chr11	55322638	rs12225462	C	T	3365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.527;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=61;PP=2527;ReadPosRankSum=-0.825;SC=TTCTGAAGGGCGCTGGAAAGC;SOR=0.785;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=242;TCF=125;TCR=117;TR=127;WE=55322646;WS=55322628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,135:0.54:250
chr11	55339829	rs557590	A	G	16873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=524;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=244;NR=254;PP=2965;SC=TACTTCCATAACCCCTAGAAT;SOR=0.713;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=500;TCF=246;TCR=254;TR=498;WE=55339837;WS=55339819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,517:1.00:517
chr11	55406022	rs76160133	C	G	5215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.292;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.951;NF=112;NR=81;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.438;SC=TCCTCAATTACCTCTCACTCT;SOR=0.862;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=371;TCF=209;TCR=162;TR=193;WE=55406030;WS=55406012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,198:0.52:379
chr11	55418693	rs11230541	T	C	3500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.128;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=46;PP=2846;ReadPosRankSum=-0.189;SC=GTACATTTCTTTGGTTGCACT;SOR=1.333;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=263;TCF=151;TCR=112;TR=127;WE=55418701;WS=55418683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,130:0.47:275
chr11	55541098	rs297118	G	A	7513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=134;NR=100;PP=2965;SC=ACAATCATGTGCTTTTTCCTT;SOR=1.006;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=234;TCF=134;TCR=100;TR=234;WE=55541106;WS=55541088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr11	55563336	rs76383258	A	T	1273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=919;ReadPosRankSum=0.200;SC=TGCATGATGCAGTACTTCCTG;SOR=1.394;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=78;TCF=32;TCR=46;TR=41;WE=55563344;WS=55563326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,46:0.53:87
chr11	55563602	rs68042892	G	A	4295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.923;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=72;PP=2962;ReadPosRankSum=1.109;SC=CTCTGTGTCTGGCTCTGATAT;SOR=0.811;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=288;TCF=153;TCR=135;TR=156;WE=55563610;WS=55563592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,166:0.56:299
chr11	55563738	rs67863827	G	A	2949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.927;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=49;PP=2226;ReadPosRankSum=1.003;SC=GTTAGTGGGCGCCACAAAGCC;SOR=0.696;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=218;TCF=110;TCR=108;TR=105;WE=55563746;WS=55563728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,113:0.49:229
chr11	55563776	rs297054	T	G	7311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=108;NR=105;PP=2965;SC=CCACCTGACTTCTATCACCAT;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=213;TCF=108;TCR=105;TR=213;WE=55563784;WS=55563766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr11	55578987	rs67727364	T	C	4310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=2.432;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.69;MQRankSum=-0.208;QD=20.82;ReadPosRankSum=-0.062;SOR=0.962;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,105:0.51:207
chr11	55578991	rs66537410	C	T	4389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=4.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.16;MQRankSum=0.782;QD=20.23;ReadPosRankSum=-0.817;SOR=1.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,115:0.53:217
chr11	55579102	rs34961497	C	T	4353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.300;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.080;NF=75;NR=90;PP=2962;ReadPosRankSum=1.240;SC=GGTCAGCTCTCGGCTCCACAC;SOR=0.783;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=330;TCF=157;TCR=173;TR=165;WE=55579110;WS=55579092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,164:0.50:331
chr11	55579401	.	G	A	3032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=7.120;ClippingRankSum=0.000;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.034;NF=54;NR=53;PP=2272;ReadPosRankSum=1.015;SC=TCTGTGGGACGGTGTGTTCTC;SOR=0.666;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=229;TCF=117;TCR=112;TR=107;WE=55579409;WS=55579391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,115:0.48:240
chr11	55579419	rs34948392	T	C	2893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.473;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.017;NF=49;NR=59;PP=2163;ReadPosRankSum=-0.719;SC=CTCTGATTCATTTGTGCTTAG;SOR=0.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=226;TCF=102;TCR=124;TR=108;WE=55579427;WS=55579409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,116:0.49:238
chr11	55579801	rs12790505	T	C	3001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.730;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=56;PP=2377;ReadPosRankSum=0.587;SC=TATGCTGAACTCTGTGATCTA;SOR=0.441;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=208;TCF=92;TCR=116;TR=107;WE=55579809;WS=55579791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,112:0.52:215
chr11	55587117	rs297082	T	A	2721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=4;PP=2242;SC=TGCTGCTGACTGATAGAAATA;SOR=5.524;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=74;TCR=4;TR=78;WE=55587125;WS=55587107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	55587511	rs297081	A	G	7833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=124;NR=113;PP=2965;SC=CTACACAGTTAACATGTCCCA;SOR=0.814;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=238;TCF=124;TCR=114;TR=237;WE=55587519;WS=55587501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr11	55594869	rs56711116	G	A	2947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.858;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-13.428;NF=50;NR=81;PP=2564;ReadPosRankSum=0.733;SC=CCACACCCCCGTGTACTTTTT;SOR=1.074;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=281;TCF=129;TCR=152;TR=131;WE=55594877;WS=55594859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,121:0.44:276
chr11	55595012	rs35645945	A	T	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=20.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.33;MQRankSum=-8.439;QD=5.54;ReadPosRankSum=-3.972;SOR=1.759;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,18:0.19:96
chr11	55595017	rs117277709	GA	TG	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=21.584;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQRankSum=-7.538;QD=5.85;ReadPosRankSum=-2.823;SOR=2.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,17:0.18:96
chr11	55595114	rs34929168	GCG	TTC	3630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.525;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=30;PP=2934;ReadPosRankSum=0.315;SC=CTCAGAAGCTGCGTGTGGAGC;SOR=0.772;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=191;TCF=112;TCR=79;TR=77;WE=55595124;WS=55595104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,94:0.47:200
chr11	55595561	.	C	G	1960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.702;ClippingRankSum=0.000;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.347;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=37;PP=1364;ReadPosRankSum=0.230;SC=ACCCCCTGATCTACAGCCTGA;SOR=0.606;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=166;TCF=78;TCR=88;TR=76;WE=55595569;WS=55595551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,80:0.45:178
chr11	55606302	rs6591699	G	T	2226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.783;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=26;PP=1765;ReadPosRankSum=0.389;SC=ACCTGGAACTGCAAATTCCCC;SOR=0.418;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=175;TCF=124;TCR=51;TR=83;WE=55606310;WS=55606292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,84:0.47:179
chr11	55606818	rs11231253	C	T	4021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.378;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=72;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.227;SC=CTTATCTCAGCCAGTTGCTTC;SOR=0.718;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=373;TCF=208;TCR=165;TR=162;WE=55606826;WS=55606808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:215,159:0.43:374
chr11	55656483	rs7483200	T	A	2326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=7.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.972;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.155;NF=7;NR=77;PP=1966;ReadPosRankSum=3.420;SC=CACAGGTGAGTGCACACCAAG;SOR=1.299;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=160;TCF=18;TCR=142;TR=84;WE=55656491;WS=55656473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,82:0.53:155
chr11	55681130	rs34573569	A	T	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.887;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=5;PP=687;ReadPosRankSum=1.217;SC=ATTTCCTTAAAATAAAATTTT;SOR=0.294;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=81;TCF=70;TCR=11;TR=33;WE=55681138;WS=55681120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,35:0.42:83
chr11	55681494	rs2457239	G	A	9153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=145;NR=126;PP=2965;SC=GTATCTGAGCGAGAGAGTAAT;SOR=0.811;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=272;TCF=146;TCR=126;TR=271;WE=55681502;WS=55681484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr11	55681566	rs61749302	G	A	3576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=6.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.229;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=75;PP=2834;ReadPosRankSum=2.530;SC=AAGCATAGGCGGAAGGCCAGT;SOR=0.900;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=273;TCF=119;TCR=154;TR=127;WE=55681574;WS=55681556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,135:0.47:289
chr11	55682111	rs2940752	T	G	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=724;SC=AGAATGACAGTCTAGAACTTG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=55682119;WS=55682101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	55702929	rs34603986	A	G	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=84;SC=GAGATGCTTTATCTCATGAAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=55702937;WS=55702919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	55703049	.	GAT	G	1196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.699;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.046;NF=24;NR=3;PP=1206;ReadPosRankSum=0.967;SC=AGAACACTGAGATAATTTTAT;SOR=1.616;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=59;TCF=47;TCR=12;TR=27;WE=55703058;WS=55703039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,32:0.49:65
chr11	55703247	rs4465383	G	A	2039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.674;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=29;PP=1656;ReadPosRankSum=-0.326;SC=TAAAACAAATGATTTCCACTG;SOR=0.937;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=176;TCF=104;TCR=72;TR=80;WE=55703255;WS=55703237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,81:0.46:177
chr11	55703728	rs4367963	A	G	4592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.727;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=83;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.295;SC=AATCCTGATCAACAGCATCAA;SOR=0.601;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=350;TCF=192;TCR=158;TR=180;WE=55703736;WS=55703718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,189:0.53:359
chr11	55703931	rs35011193	G	A	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=36;PP=857;ReadPosRankSum=-0.922;SC=ATGCTATAATGATGAAAAAAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=77;TCF=1;TCR=76;TR=36;WE=55703939;WS=55703921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,39:0.49:79
chr11	55703981	rs35841857	T	TA	905.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.19;SOR=6.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	55734972	rs11231705	A	T	161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=129;ReadPosRankSum=-1.027;SC=TTAAAAAAAAATTCACTGAAG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=55734980;WS=55734962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr11	55735218	.	A	G	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.721;ClippingRankSum=0.000;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=8.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.29;ReadPosRankSum=0.577;SOR=1.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,35:0.24:147
chr11	55746891	rs7481466	G	A	6803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=150;NR=51;PP=2965;SC=AATGGGGAAGGCAACTGTATA;SOR=2.204;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=202;TCF=150;TCR=52;TR=201;WE=55746899;WS=55746881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr11	55761221	rs2449134	C	T	2500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=16;PP=2001;SC=TACTTCCTTACTCCTGAGGCT;SOR=2.720;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=61;TCR=16;TR=77;WE=55761229;WS=55761211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr11	55761528	rs35607186	T	C	2241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=43;PP=1521;ReadPosRankSum=1.321;SC=TTCAGGATTGTGTCAGAACAA;SOR=0.826;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=204;TCF=111;TCR=93;TR=98;WE=55761536;WS=55761518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,100:0.48:210
chr11	55761738	rs2128152	T	G	2983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=26;PP=2296;SC=GCCGCATACCTGTCATAGGCC;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=74;TCR=26;TR=100;WE=55761746;WS=55761728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr11	55783155	rs34107711	A	G	1792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.027;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.452;NF=40;NR=28;PP=1409;ReadPosRankSum=1.565;SC=AGCCAGCAAAAGAGATGGTTT;SOR=0.989;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=136;TCF=78;TCR=58;TR=68;WE=55783163;WS=55783145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,69:0.49:141
chr11	55798152	rs1482011	G	A	10851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=168;NR=164;PP=2965;SC=CAAACTTCTTGGCATCCAGGA;SOR=0.705;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=332;TCF=168;TCR=164;TR=332;WE=55798160;WS=55798142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,344:1.00:344
chr11	55860780	rs1842700	G	A	7024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=122;NR=95;PP=2965;SC=CTGAGTTGATGTAAATGGCTG;SOR=0.939;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=217;TCF=122;TCR=95;TR=217;WE=55860788;WS=55860770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr11	55872657	rs28681529	A	C	4101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=9.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=43.072;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-10.238;NF=39;NR=126;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.123;SC=TGTGGGGATGATATTGATAAT;SOR=2.187;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=339;TCF=115;TCR=224;TR=165;WE=55872665;WS=55872647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,147:0.46:318
chr11	55872876	rs2512961	C	T	8060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=156;PP=2965;SC=CTCAATGGCCCATGATCGCTA;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=261;TCF=105;TCR=156;TR=261;WE=55872884;WS=55872866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr11	55873024	rs2449148	A	G	13375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=413;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=235;NR=174;PP=2965;SC=TTGCATTTCTACGACTCAAAC;SOR=1.014;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=409;TCF=235;TCR=174;TR=409;WE=55873032;WS=55873014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,412:1.00:412
chr11	55873368	rs1842696	G	A	8154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.529;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.709;NF=164;NR=89;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.811;SC=TGTGATTCCCGTGCTGAATCC;SOR=1.299;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=254;TCF=164;TCR=90;TR=253;WE=55873376;WS=55873358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,260:1.00:261
chr11	55889790	rs2035408	G	T	3690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=113;NR=3;PP=2965;SC=GTAGCTGGGAGTACAGGCGCC;SOR=6.202;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=113;TCR=3;TR=116;WE=55889798;WS=55889780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr11	55890257	rs1842691	C	T	7731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=152;NR=89;PP=2965;SC=AGTTATTATGCCCAAAAGGCT;SOR=1.539;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=241;TCF=152;TCR=89;TR=241;WE=55890265;WS=55890247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr11	55890732	rs11606538	G	A	5093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FS=0.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.61;MQRankSum=-8.935;QD=20.46;ReadPosRankSum=-0.300;SOR=0.637;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,131:0.53:249
chr11	55890736	rs11604579	A	G	5186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FS=1.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQRankSum=-8.921;QD=20.50;ReadPosRankSum=-0.040;SOR=0.577;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,133:0.53:253
chr11	55926840	rs79877849	A	T	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=574;ReadPosRankSum=1.412;SC=TAACAATATTACAAATTGATT;SOR=0.446;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=53;TCF=48;TCR=5;TR=27;WE=55926848;WS=55926830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,29:0.51:57
chr11	55944048	rs10896103	G	C	1415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=1;PP=1176;ReadPosRankSum=-0.739;SC=CAAATTATGAGTCTATCTTTT;SOR=4.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=43;WE=55944056;WS=55944038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr11	56000403	rs10791893	C	G	8617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=149;NR=102;PP=2965;SC=CTAATGACCACTAAAATCAGT;SOR=1.097;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=254;TCF=152;TCR=102;TR=251;WE=56000411;WS=56000393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr11	56000600	rs3919907	G	T	2842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-6.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.142;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=57;PP=2257;ReadPosRankSum=-0.456;SC=ATGACAAAAAGAATGAACAAC;SOR=0.558;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=239;TCF=115;TCR=124;TR=112;WE=56000608;WS=56000590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,115:0.46:248
chr11	56015479	rs1531757	A	G	2014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=52;PP=1658;SC=ATGAGCAGACAACGAAGATTG;SOR=3.407;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=8;TCR=52;TR=60;WE=56015487;WS=56015469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	56043604	rs12360890	A	G	14209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=430;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-2.421;NR=228;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.174;SC=CTATGTTGCTAGCATTTTACA;SOR=0.731;Source=Platypus;TCR=229;WE=56043612;WS=56043594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,428:1.00:430
chr11	56043702	rs7125697	G	C	17831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=554;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=310;NR=229;PP=2965;SC=TGCCTCCTCTGCTTGCTATTT;SOR=1.061;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=542;TCF=312;TCR=230;TR=539;WE=56043710;WS=56043692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,549:1.00:549
chr11	56057419	rs17150286	A	G	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=3;PP=1047;SC=ATTTCTAATTACAATCTGGAT;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=34;WE=56057427;WS=56057409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	56058197	rs1842674	G	A	8944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=159;NR=109;PP=2965;SC=CCATTGATGAGAGAAGAAAAC;SOR=1.097;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=268;TCF=159;TCR=109;TR=268;WE=56058205;WS=56058187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr11	56058535	rs11600896	C	T	2245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.768;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=70;PP=1718;ReadPosRankSum=0.073;SC=TTTCTTCTACCCATGATGTTC;SOR=1.198;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=185;TCF=34;TCR=151;TR=82;WE=56058543;WS=56058525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,87:0.46:189
chr11	56086147	rs960193	T	G	6173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=93;PP=2965;SC=TCCTACGACCTCTATGTGGCC;SOR=0.763;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=103;TCR=93;TR=196;WE=56086155;WS=56086137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr11	56113516	rs1905055	T	C	4148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.898;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=35;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.840;SC=GTTACCAAGATGAATCATGTG;SOR=2.170;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=103;TCR=36;TR=138;WE=56113524;WS=56113506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,139:0.99:140
chr11	56113575	rs10896271	A	G	6810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.857;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=59;PP=2965;ReadPosRankSum=1.078;SC=ATTTATTCTCATGGGGATTAC;SOR=0.851;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=149;TCF=89;TCR=60;TR=148;WE=56113583;WS=56113565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,157:0.99:158
chr11	56113593	rs10896272	C	A	7633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=108;NR=65;PP=2965;SC=TACAGACAACCCTGGGCTGCA;SOR=1.230;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=108;TCR=65;TR=173;WE=56113601;WS=56113583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr11	56127746	rs7942390	A	G	4291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=36;PP=2965;SC=ATTTCACCAGAGTCACTGAGT;SOR=2.063;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=97;TCR=36;TR=133;WE=56127754;WS=56127736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr11	56128524	rs7928704	C	T	6770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=109;NR=98;PP=2965;SC=TAACCATTCACTGGATACTGA;SOR=0.799;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=109;TCR=98;TR=207;WE=56128532;WS=56128514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
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chr11	56143807	rs201727202	G	A	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=74.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=-6.723;QD=5.15;ReadPosRankSum=-0.501;SOR=6.573;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:178,41:0.19:219
chr11	56143810	rs201982103	T	C	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=65.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.50;MQRankSum=-7.265;QD=5.45;ReadPosRankSum=-0.178;SOR=6.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:174,38:0.18:212
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chr11	56143864	rs111260371	C	G	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=32.918;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-4.901;QD=1.83;ReadPosRankSum=0.353;SOR=3.251;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,22:0.11:197
chr11	56143867	rs111341120	T	C	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=29.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-4.901;QD=1.83;ReadPosRankSum=-0.081;SOR=3.254;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,22:0.11:197
chr11	56143882	rs113061820	G	A	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=17.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-5.565;QD=0.78;ReadPosRankSum=0.075;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:164,16:0.09:180
chr11	56143885	rs111871244	T	A	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=17.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-5.514;QD=0.74;ReadPosRankSum=-0.322;SOR=2.579;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,16:0.09:177
chr11	56143891	rs112265664	T	A	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=10.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-6.175;QD=0.30;ReadPosRankSum=0.304;SOR=2.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:164,13:0.07:177
chr11	56143898	rs373392784	G	T	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=13.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-6.061;QD=0.21;ReadPosRankSum=-0.927;SOR=2.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:158,13:0.08:171
chr11	56143900	rs202086525	C	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=8.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-5.221;QD=0.26;ReadPosRankSum=-0.447;SOR=1.778;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,11:0.07:161
chr11	56184888	rs998544	G	A	7751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.382;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=113;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.794;SC=AAATACAGAAGCCATCTTGTC;SOR=0.507;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=242;TCF=128;TCR=114;TR=240;WE=56184896;WS=56184878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,243:1.00:244
chr11	56185345	rs6591324	A	G	5980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=84;PP=2965;SC=GCGACATAGCAATCGTAGGCC;SOR=0.879;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=104;TCR=85;TR=187;WE=56185353;WS=56185335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr11	56310222	rs628524	C	T	4951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=61;PP=2965;SC=GTTGATGACACTGGATCTACA;SOR=1.135;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=90;TCR=61;TR=151;WE=56310230;WS=56310212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr11	56310877	rs66945922	C	CTT	1237.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=1162;SC=CTACCATAAACTGGTTTTGGT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=24;WE=56310885;WS=56310867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	56344993	rs10792043	C	A	9744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=155;NR=150;PP=2965;SC=CAAATGTCTACAAAGGAGAGG;SOR=0.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=305;TCF=155;TCR=150;TR=305;WE=56345001;WS=56344983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr11	56380134	rs4939078	C	G	2158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.278;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.312;NF=50;NR=39;PP=1863;ReadPosRankSum=1.006;SC=CAGCATTGGGCTCAAAAAAGT;SOR=0.388;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=209;TCF=111;TCR=98;TR=89;WE=56380142;WS=56380124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,84:0.45:185
chr11	56431216	rs11228710	C	T	6844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.98;NF=130;NR=70;PP=2965;SC=GGGCATCACCCAGGACCCTCA;SOR=1.478;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=200;TCF=130;TCR=70;TR=200;WE=56431224;WS=56431206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr11	56467757	.	CACG	C	352.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=3.245;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.64;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.072;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr11	56467763	.	A	AGAT	346.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=6.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.51;ReadPosRankSum=-0.177;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr11	56467764	rs78916686	C	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=7.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.17;ReadPosRankSum=0.825;SOR=0.052;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr11	56467787	rs74218731	A	G	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.495;HP=1;HapScore=2;MGOF=83;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=310;ReadPosRankSum=-0.525;SC=ATCTTATGTAACATAATTCTA;SOR=0.071;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=14;WE=56467795;WS=56467777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr11	56467810	rs76085479	A	T	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.43;ReadPosRankSum=0.818;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr11	56467813	rs77180330	A	G	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.07;ReadPosRankSum=1.824;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr11	56467816	rs78119960	G	T	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=1.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.33;ReadPosRankSum=1.835;SOR=1.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr11	56467819	rs78036340	A	G	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=1.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.37;ReadPosRankSum=2.402;SOR=1.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr11	56467833	rs73474897	T	C	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.961;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=1357;ReadPosRankSum=2.774;SC=GAGCTCATTTTCTTTCCCCAT;SOR=1.609;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=16;WE=56467841;WS=56467800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,16:0.33:49
chr11	56467881	rs73474900	T	C	1001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.157;NF=28;NR=8;PP=719;ReadPosRankSum=-1.994;SC=GGAGCAATCATACAGTGACTG;SOR=0.723;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=97;TCF=73;TCR=24;TR=36;WE=56467889;WS=56467871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,41:0.39:104
chr11	56467926	rs1704284	A	G	2128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.641;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.866;NF=47;NR=20;PP=1491;ReadPosRankSum=1.191;SC=CAGACCCAGGAATGCAGCTGG;SOR=0.780;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=147;TCF=100;TCR=47;TR=67;WE=56467934;WS=56467916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,71:0.46:153
chr11	56467945	rs36184181	G	T	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=4.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=-1.852;QD=2.08;ReadPosRankSum=0.769;SOR=1.131;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,26:0.16:163
chr11	56468020	rs532637	TG	CA	2067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.450;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-7.530;NF=12;NR=35;PP=2113;ReadPosRankSum=-0.919;SC=TAATGACTCCTGCCTCCACAC;SOR=1.208;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=147;TCF=51;TCR=96;TR=47;WE=56468029;WS=56468010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,57:0.38:152
chr11	56468044	rs3975155	T	G	6312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.61;QD=46.08;SOR=1.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr11	56468047	rs2865519	AC	GT	6335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.09;QD=46.93;SOR=0.902;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr11	56468111	rs602224	C	T	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.616;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.331;NF=43;NR=26;PP=1324;ReadPosRankSum=-1.324;SC=ATCCTAGTGACCTGCATCTCT;SOR=0.616;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=149;TCF=94;TCR=55;TR=69;WE=56468119;WS=56468101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,71:0.46:154
chr11	56468198	rs4990194	A	G	3524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=4.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-2.930;QD=17.28;ReadPosRankSum=0.064;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,93:0.46:204
chr11	56468200	rs4990195	C	T	3731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=5.029;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-2.979;QD=18.57;ReadPosRankSum=1.015;SOR=1.041;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,90:0.45:201
chr11	56468202	rs4990196	G	A	3651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=8.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-2.726;QD=18.35;ReadPosRankSum=0.775;SOR=1.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,90:0.45:199
chr11	56468212	rs591369	G	A	3393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=5.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-2.683;QD=16.97;ReadPosRankSum=0.821;SOR=1.067;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,92:0.46:200
chr11	56468259	rs503776	C	T	3118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.324;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.125;NF=57;NR=54;PP=2486;ReadPosRankSum=0.417;SC=TGCTTTATGCCCAGGCCATGT;SOR=0.644;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=211;TCF=103;TCR=108;TR=111;WE=56468267;WS=56468249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,113:0.53:215
chr11	56468368	rs11228733	C	T	2719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=54;PP=2067;ReadPosRankSum=1.059;SC=TAACTTCTGCCGTGAAAACAT;SOR=0.670;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=247;TCF=126;TCR=121;TR=105;WE=56468376;WS=56468358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,109:0.43:252
chr11	56468403	rs11228734	G	A	3777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.468;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=51;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.321;SC=TCTGTGATTTGCTTCCCTTGG;SOR=0.638;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=239;TCF=122;TCR=117;TR=102;WE=56468424;WS=56468393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,108:0.44:246
chr11	56468416	rs11228735	G	A	3688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.470;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=54;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.834;SC=TCCCTTGGTGGAGCTGGCCTG;SOR=0.658;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=233;TCF=111;TCR=122;TR=101;WE=56468424;WS=56468393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,105:0.43:242
chr11	56468440	rs12421330	G	T	2938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FS=2.875;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.48;ReadPosRankSum=2.576;SOR=0.642;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:163,93:0.36:256
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chr11	56468720	rs66943455	T	C	5241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=490;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.945;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=0.054;SC=ATGTTGAATCTCATGATCTAC;SOR=0.672;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=477;TCF=243;TCR=234;TR=208;WE=56468728;WS=56468710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:274,212:0.44:486
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chr11	56468877	.	G	A	1467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.000;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-1.917;QD=13.22;ReadPosRankSum=-0.467;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,39:0.35:111
chr11	56468881	.	C	T	1467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.010;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-1.924;QD=14.25;ReadPosRankSum=0.014;SOR=0.797;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,36:0.35:103
chr11	56468883	.	T	C	1398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.980;ClippingRankSum=0.000;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-1.926;QD=13.20;ReadPosRankSum=0.222;SOR=0.794;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,37:0.35:106
chr11	56468893	rs79757227	G	A	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-1.734;QD=14.39;ReadPosRankSum=-0.620;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,33:0.40:83
chr11	56468897	.	G	C	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.578;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=-1.771;QD=14.56;ReadPosRankSum=0.085;SOR=0.343;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,31:0.39:80
chr11	56468909	rs79696743	TG	CA	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=48;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.193;NF=0;NR=24;PP=2944;ReadPosRankSum=1.208;SC=GTTACAGACATGTACAATAAG;SOR=0.375;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=0;TCR=60;TR=24;WE=56468918;WS=56468860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,26:0.40:65
chr11	56508476	rs11228758	T	C	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=456;ReadPosRankSum=1.631;SC=TTCTACCTTTTATACTATGCT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=24;TCR=16;TR=20;WE=56508484;WS=56508466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr11	56508525	rs556056	A	G	2172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=12;PP=1712;ReadPosRankSum=-0.580;SC=AGTCTGAGGAATAAAGACATG;SOR=1.387;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=63;TCF=51;TCR=12;TR=62;WE=56508533;WS=56508515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr11	56508619	rs545772	G	A	2750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=55;PP=2253;SC=GCTAAGTGATGACAAACTGCT;SOR=1.356;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=32;TCR=55;TR=87;WE=56508627;WS=56508609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr11	56508727	rs59062115	GA	G	257.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=341;ReadPosRankSum=0.838;SC=TGTTTGTTATGATTTTGAGAT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=9;WE=56508735;WS=56508717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr11	56510243	rs11228762	A	G	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.187;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=140;ReadPosRankSum=-0.352;SC=ATGCAAATGAACACATTTATA;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=7;WE=56510251;WS=56510233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr11	56510623	rs513873	A	G	2771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.014;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=59;PP=2172;ReadPosRankSum=-0.604;SC=GCTGGAGAGTACTGTGAAGCC;SOR=0.923;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=219;TCF=101;TCR=118;TR=105;WE=56510631;WS=56510613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,107:0.48:221
chr11	56510672	rs577576	T	C	8658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.634;SC=ACCCTGGTGTTTGTACAGGAC;SOR=0.230;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=218;TCF=107;TCR=111;TR=217;WE=56510680;WS=56510662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,226:1.00:227
chr11	56510694	rs1397053	T	C	2707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.989;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=57;PP=1969;ReadPosRankSum=-0.018;SC=TTTTTACCAATGGTGGTGCAT;SOR=0.682;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=231;TCF=112;TCR=119;TR=114;WE=56510702;WS=56510684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,116:0.49:239
chr11	56570067	rs7121576	A	G	4097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=79;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.975;SC=AGACATCCACAAAGGACAAGT;SOR=0.689;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=303;TCF=155;TCR=148;TR=162;WE=56570075;WS=56570057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,168:0.54:312
chr11	56756664	rs2853083	G	A	4779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=82;PP=2965;SC=AGAATTTGATGTTATTTCAGG;SOR=1.088;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=57;TCR=82;TR=139;WE=56756672;WS=56756654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr11	56757021	rs61886711	G	A	2495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.404;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.621;NF=8;NR=84;PP=2006;ReadPosRankSum=0.114;SC=TATTCACTGGGTTGGTCGTCA;SOR=1.517;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=184;TCF=22;TCR=162;TR=92;WE=56757029;WS=56757011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,94:0.49:190
chr11	56954846	rs716745	C	T	4197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.819;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=79;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.676;SC=TCATTGCGTTCGTGGGCTTCG;SOR=0.733;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=320;TCF=160;TCR=160;TR=164;WE=56954854;WS=56954836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,166:0.51:325
chr11	56954985	rs143192258	G	A	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.432;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=44;PP=1021;ReadPosRankSum=-0.318;SC=CCATGCTGCTGACCGCCACAG;SOR=0.429;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=7;TCR=84;TR=48;WE=56954993;WS=56954975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,49:0.53:92
chr11	57004344	rs948847	G	T	2190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.124;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=52;PP=1733;ReadPosRankSum=-1.171;SC=CCAGACCGTTGCCCGTGGTGC;SOR=0.903;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=145;TCF=57;TCR=88;TR=82;WE=57004352;WS=57004334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,84:0.56:149
chr11	57077464	rs10896602	T	C	4276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.396;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=80;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.079;SC=TCCCCAAATCTTGGCCCTGCT;SOR=0.648;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=335;TCF=171;TCR=164;TR=161;WE=57077472;WS=57077454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,164:0.49:334
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chr11	57081475	rs4939135	C	A	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=526;SC=TGGGAGGAGGCAACTGGAACC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=19;WE=57081483;WS=57081465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	57089203	rs141626047	GGCA	G	1224.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=2;PP=1403;SC=AGAAAGAGGGGGCAGCCTCTG;SOR=3.841;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=26;WE=57089213;WS=57089193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	57106214	rs185432795	G	A	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=200;ReadPosRankSum=-0.195;SC=CTCCTGCCTCGGTGCTACCAT;SOR=2.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=9;WE=57106222;WS=57106204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr11	57135663	rs55655702	A	AG	1172.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=20;PP=1398;SC=TCTGGGGGGCAGGGTCTGCTG;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=34;WE=57135671;WS=57135653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	57137296	rs2276040	G	A	6146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=143;NR=40;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.898;SC=GTCAAATGGGGTCACAAAAGA;SOR=1.362;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=184;TCF=144;TCR=40;TR=183;WE=57137304;WS=57137286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,192:0.99:193
chr11	57137538	rs67821929	A	AG	2274.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=61;PP=2497;SC=TGCCTGAGCAAGGGGCATGGG;SOR=7.140;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=0;TCR=65;TR=61;WE=57137546;WS=57137528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	57144152	rs1867126	G	C	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=3;PP=591;SC=ACTCGGCCATGGCTCACTTTC;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=57144160;WS=57144142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	57146202	rs1940145	G	A	1795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-6.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=20;PP=1337;ReadPosRankSum=0.555;SC=GGTTGACTGTGCTAGTGCAGC;SOR=0.683;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=139;TCF=101;TCR=38;TR=71;WE=57146210;WS=57146192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,72:0.51:141
chr11	57147016	rs540687	A	G	6191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=57;PP=2965;SC=GTAGCGGCAGATCTTGCACCT;SOR=1.688;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=119;TCR=57;TR=176;WE=57147024;WS=57147006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr11	57147353	rs544079	G	C	2101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=57;PP=1911;SC=CTCCAGCAACGTCGCTCGAGC;SOR=8.222;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=0;TCR=57;TR=57;WE=57147361;WS=57147343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	57148053	rs571651	G	T	1450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=10;PP=1232;SC=AAATAAAAGCGGGGGGAGGGG;SOR=2.409;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=44;WE=57148061;WS=57148043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	57148175	rs669661	A	G	3223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=48;PP=2447;SC=AGCAAGAGGCATTGCATATCT;SOR=0.903;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=62;TCR=49;TR=110;WE=57148183;WS=57148165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	57155001	rs536455	G	A	6531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=101;NR=82;PP=2965;SC=CGACGCCAGTGGCCTCCTGTG;SOR=0.830;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=101;TCR=82;TR=183;WE=57155009;WS=57154991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr11	57155288	rs630396	T	C	3116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=83;PP=2388;ReadPosRankSum=0.253;SC=CAGCCCAGTATGCAAAGTTCC;SOR=1.195;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=107;TCF=23;TCR=84;TR=106;WE=57155296;WS=57155278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,111:0.99:112
chr11	57156438	rs3741089	A	G	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=316;ReadPosRankSum=1.406;SC=CATATCCCACACCCGTTCCAT;SOR=0.804;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=21;WE=57156446;WS=57156428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr11	57157405	rs490358	A	G	7200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=110;PP=2965;SC=GCCAGAAGTAAGGGGAGTTTC;SOR=0.786;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=212;TCF=102;TCR=110;TR=212;WE=57157413;WS=57157395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr11	57166969	rs3741085	C	T	1880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.238;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=40;PP=1434;ReadPosRankSum=1.173;SC=TGTAACTTACCCTGTAAGTTG;SOR=0.563;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=73;TCR=87;TR=75;WE=57166977;WS=57166959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,76:0.47:163
chr11	57177593	rs62640922	A	G	1490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.699;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=28;PP=1205;ReadPosRankSum=-1.451;SC=AAGTGGAGGAACCTGGGCGAA;SOR=0.624;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=53;TCR=55;TR=56;WE=57177601;WS=57177583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,56:0.51:110
chr11	57184218	rs4938865	C	T	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=753;SC=GAGGGAATAGCATGGTGAATC;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=57184226;WS=57184208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	57185404	rs6591424	T	C	2064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=8.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.019;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=68;PP=1661;ReadPosRankSum=-0.591;SC=CCCACGTTCATAGCAGCACTA;SOR=0.132;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=129;TCF=2;TCR=127;TR=70;WE=57185412;WS=57185394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,72:0.54:134
chr11	57193653	rs12422015	A	G	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=496;ReadPosRankSum=-0.728;SC=CATGAGCAGAAGTGGAGTGGA;SOR=0.518;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=22;WE=57193661;WS=57193643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr11	57243588	rs2258835	A	G	11475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=240;NR=113;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.115;SC=TCTGCACCCTACCTCAGGCCC;SOR=0.740;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=354;TCF=241;TCR=113;TR=353;WE=57243596;WS=57243578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,363:1.00:364
chr11	57258617	rs2729384	T	C	2352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=19;PP=1896;SC=AAGCAACAAGTTGCTGGATGT;SOR=1.810;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=50;TCR=19;TR=69;WE=57258625;WS=57258607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	57265400	rs2581922	C	T	260.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=172;SC=ATACAATAGCCCCAGGAGACG;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=57265408;WS=57265390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	57268170	rs2250673	T	C	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=3;PP=490;SC=CCCCAGCCCATTCATACTGCC;SOR=3.056;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=57268178;WS=57268160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	57310307	rs80123614	A	G	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=1048;ReadPosRankSum=-1.211;SC=GCATGTCAGCAGAACTCCAGG;SOR=0.737;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=116;TCF=49;TCR=67;TR=54;WE=57310315;WS=57310297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,60:0.49:123
chr11	57313469	rs12223229	C	G	1396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.575;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=29;PP=1136;ReadPosRankSum=-2.200;SC=CCGGGGGCCCCGGGCACAGAA;SOR=0.524;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=106;TCF=58;TCR=48;TR=63;WE=57313477;WS=57313459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,60:0.57:106
chr11	57313659	rs2649658	G	A	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.880;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=344;ReadPosRankSum=2.010;SC=GGCCCTTCATGGCCTCCTGCC;SOR=1.244;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=16;WE=57313667;WS=57313649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr11	57317640	rs8890	C	T	1437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=7.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.440;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.019;NF=2;NR=49;PP=1098;ReadPosRankSum=-1.182;SC=TCAGCAGCCACGGCCCGGGGG;SOR=1.127;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=107;TCF=7;TCR=100;TR=51;WE=57317648;WS=57317630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,54:0.48:112
chr11	57320044	rs2234412	T	C	2419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=70;PP=2155;SC=TGGCTGCCCGTTCCCAATGTC;SOR=8.497;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=0;TCR=70;TR=70;WE=57320052;WS=57320034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	57367222	rs1005510	C	T	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=360;ReadPosRankSum=0.213;SC=GCTCATCTGCCGCACTGTCAG;SOR=0.760;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=14;WE=57367230;WS=57367212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr11	57369730	rs11229063	G	A	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.144;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=433;ReadPosRankSum=2.064;SC=AGAAAGGACAGAGGGAATGTT;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=19;WE=57369738;WS=57369720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr11	57374332	rs11603020	T	C	1395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.472;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=34;PP=1097;ReadPosRankSum=-0.983;SC=ATCAGAAGACTCTGGTGGCTT;SOR=0.318;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=103;TCF=33;TCR=70;TR=54;WE=57374340;WS=57374322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,55:0.51:107
chr11	57379170	rs2511988	A	G	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=4;PP=851;ReadPosRankSum=0.203;SC=GACTGTTAAGATGCATCTCTT;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=79;TCF=71;TCR=8;TR=40;WE=57379178;WS=57379160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,41:0.51:80
chr11	57381989	rs4926	G	A	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.534;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=45;PP=1462;ReadPosRankSum=-1.612;SC=CTTCCTCTTCGTGCTCTGGGA;SOR=0.484;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=114;TCF=36;TCR=78;TR=67;WE=57381997;WS=57381979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,73:0.59:124
chr11	57413943	rs12793139	C	G	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=428;ReadPosRankSum=-0.823;SC=AGTCCCCAGACAGCCCAAGGG;SOR=0.608;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=16;WE=57413951;WS=57413933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr11	57414387	rs7947357	A	G	3553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=61;PP=2914;SC=GGTGATGTTCAGGCTAGCCTG;SOR=0.853;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=55;TCR=61;TR=115;WE=57414395;WS=57414377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr11	57424389	rs55969690	GA	G	1186.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.33;MQRankSum=0.173;QD=21.98;ReadPosRankSum=0.940;SOR=5.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,52:0.96:54
chr11	57456244	rs549022	C	T	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=26;PP=602;ReadPosRankSum=-0.075;SC=TGTCTAACTACGTTGGCCACA;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=9;TCR=49;TR=31;WE=57456252;WS=57456234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr11	57461473	rs11287593	GT	G	322.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=0.000;QD=16.99;ReadPosRankSum=1.755;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr11	57463500	rs1783978	T	C	2144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=28;PP=1740;SC=ACACCTCGGCTTGGCTACTAA;SOR=0.854;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=33;TCR=28;TR=61;WE=57463508;WS=57463490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	57467035	rs11604333	C	G	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=319;ReadPosRankSum=1.571;SC=TTGACTCTACCTGCCTTCATG;SOR=0.866;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=17;WE=57467043;WS=57467025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr11	57472185	rs56088923	T	G	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.779;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=362;ReadPosRankSum=-0.479;SC=TAGAACTGCTTCTTACCTGGG;SOR=1.582;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=17;WE=57472193;WS=57472175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr11	57507983	rs4827	C	T	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.125;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.483;NF=1;NR=24;PP=488;ReadPosRankSum=1.599;SC=AAGCTTGGGTCAGTGTGTTAA;SOR=1.550;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=53;TCF=3;TCR=50;TR=25;WE=57507991;WS=57507973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr11	57509429	rs635663	A	G	6121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=146;PP=2965;SC=CGGCAGCAGTAAGTGGGGACC;SOR=2.938;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=33;TCR=146;TR=179;WE=57509437;WS=57509419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr11	57513551	.	C	T	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.227;ClippingRankSum=0.000;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.186;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=36;PP=1166;ReadPosRankSum=0.678;SC=TGGCCTCTCCCGCTCCAGGCG;SOR=0.502;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=146;TCF=53;TCR=93;TR=59;WE=57513559;WS=57513541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,59:0.39:153
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chr11	57571232	rs11229137	C	T	4963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=79;PP=2965;SC=AGCCACGCCACATTGAGTGGG;SOR=0.770;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=157;TCF=77;TCR=80;TR=155;WE=57571240;WS=57571222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
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chr11	57799371	rs1374570	G	C	2954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=74;PP=2358;SC=TTTTGGAAGGGACAGTGAGGA;SOR=4.382;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=7;TCR=74;TR=81;WE=57799379;WS=57799361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
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chr11	57996084	rs61902844	G	A	1737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=29;PP=1321;ReadPosRankSum=-0.610;SC=CCCCCAAAATGTTGGAAAGCA;SOR=0.720;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=175;TCF=105;TCR=70;TR=75;WE=57996092;WS=57996074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,75:0.43:174
chr11	57996312	rs4245219	C	G	6437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=126;PP=2965;SC=ACTCAGTGGGCTCAGACTGGT;SOR=1.405;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=195;TCF=69;TCR=126;TR=195;WE=57996320;WS=57996302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr11	58125533	rs74593998	C	T	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=246;ReadPosRankSum=0.412;SC=AGCATTTTAACATTTGAGTTA;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=14;WE=58125541;WS=58125523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr11	58125620	rs4127353	T	C	1419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.363;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=10;PP=1142;ReadPosRankSum=-0.579;SC=ATCTAGAGAATATTTTGCCTT;SOR=1.238;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=123;TCF=96;TCR=27;TR=55;WE=58125628;WS=58125610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,57:0.45:127
chr11	58126305	rs4939208	A	T	1620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.645;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=32;PP=1248;ReadPosRankSum=-0.796;SC=AACCCAGTTAAAACCTTTGGA;SOR=0.617;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=129;TCF=60;TCR=69;TR=62;WE=58126313;WS=58126295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,63:0.48:131
chr11	58169996	rs12279895	T	C	3124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.364;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=79;PP=2473;ReadPosRankSum=-0.913;SC=GAATGCACTCTTCACTTCCTT;SOR=1.081;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=233;TCF=84;TCR=149;TR=115;WE=58170004;WS=58169986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,119:0.49:242
chr11	58170025	rs12271646	C	G	2003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.299;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=57;PP=1656;ReadPosRankSum=0.292;SC=GACTATAGACCAGAGGGTTCA;SOR=0.845;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=167;TCF=50;TCR=117;TR=79;WE=58170033;WS=58170015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,80:0.46:174
chr11	58170143	rs11229409	C	G	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.816;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=1017;ReadPosRankSum=0.679;SC=ATAGAAGATGCCGACTGCAAT;SOR=1.138;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=100;TCF=38;TCR=62;TR=47;WE=58170151;WS=58170133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,48:0.47:102
chr11	58170291	rs11229410	T	C	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.093;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=1028;ReadPosRankSum=0.295;SC=ACAACATAAATAAGAACAAGC;SOR=0.450;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=116;TCF=63;TCR=53;TR=53;WE=58170299;WS=58170281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,57:0.47:120
chr11	58170342	rs11229411	C	T	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.126;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=24;PP=1118;ReadPosRankSum=-0.803;SC=ACCATGACTGCTGGAATATCA;SOR=0.473;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=126;TCF=72;TCR=54;TR=54;WE=58170350;WS=58170332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,59:0.44:135
chr11	58170374	rs12280114	T	C	1412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=25;PP=1021;ReadPosRankSum=0.611;SC=ATGGACTTCATTGGACTTACA;SOR=0.625;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=134;TCF=73;TCR=61;TR=56;WE=58170382;WS=58170364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,59:0.42:140
chr11	58170469	rs11229412	C	A	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=26;PP=1074;ReadPosRankSum=0.812;SC=GACGAGCACACACAGTTGTTG;SOR=0.541;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=136;TCF=65;TCR=71;TR=54;WE=58170477;WS=58170459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,59:0.40:148
chr11	58170738	rs11229413	A	G	2413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=56;PP=1834;ReadPosRankSum=0.524;SC=CAGGAATCCCAGAATATCAAT;SOR=0.725;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=166;TCF=60;TCR=106;TR=88;WE=58170746;WS=58170728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,94:0.54:175
chr11	58170794	rs17152661	G	A	1487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.675;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=39;PP=1189;ReadPosRankSum=-1.036;SC=ATAGATGAAGGGGAACGTTAT;SOR=0.596;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=135;TCF=42;TCR=93;TR=58;WE=58170802;WS=58170784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,59:0.42:141
chr11	58170927	rs12278966	A	G	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-4.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=319;ReadPosRankSum=-0.856;SC=AATACAAAAAAGAACAGTGTG;SOR=0.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=15;WE=58170935;WS=58170917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr11	58190112	rs10466659	A	G	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.764;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=1248;ReadPosRankSum=0.770;SC=AACTAGAAGAACAAAAAAGAT;SOR=0.280;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=101;TCF=60;TCR=41;TR=51;WE=58190120;WS=58190102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,52:0.50:105
chr11	58190136	rs4298923	A	G	3211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=37;PP=2498;SC=AAAGCTTGACATAAAAACCAG;SOR=1.402;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=65;TCR=37;TR=102;WE=58190144;WS=58190126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr11	58190747	rs1893902	A	G	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.528;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=352;ReadPosRankSum=-0.204;SC=GTATTATCTGAGAAACTTAAG;SOR=0.116;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=15;WE=58190755;WS=58190737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr11	58207203	rs11229457	C	T	2621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=2.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.73;ReadPosRankSum=0.266;SOR=0.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,102:0.50:206
chr11	58207203	.	CA	TG	1877	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=37;NR=51;PP=1877;QD=21.9371349416;SC=TATGGCCAGGCAAGCACATAC;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=200;TCF=92;TCR=108;TR=88;WE=58207212;WS=58207193;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:112,88:0.44:200
chr11	58207204	rs4938895	A	G	7900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.98;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr11	58274710	.	C	G	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.370;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.778;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=745;ReadPosRankSum=-0.989;SC=TTCTTTGTTCCTAAGGCTGTA;SOR=0.800;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=50;TCR=39;TR=43;WE=58274718;WS=58274700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,44:0.48:92
chr11	58345391	.	G	A	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.634;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.600;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=579;ReadPosRankSum=0.450;SC=AGAGCCAACTGAGTAGTGGGC;SOR=0.364;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=47;TCR=16;TR=31;WE=58345399;WS=58345381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr11	58378382	rs2245938	G	C	1316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=1;PP=1100;SC=AGACATGTTCGCTACAACCAG;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=38;WE=58378390;WS=58378372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	58378424	rs8373	A	G	2213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=8;PP=1805;SC=TATTTTTAGTAGTGAAGAGGA;SOR=3.545;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=57;TCR=8;TR=65;WE=58378432;WS=58378414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	58381686	rs1938596	A	G	2990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=23;PP=2499;SC=CGCCCCTTTCACTTTCTCTGT;SOR=2.753;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=94;TCR=23;TR=116;WE=58381694;WS=58381676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr11	58386049	rs11426880	A	AT	924.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.06;MQRankSum=0.525;QD=22.55;ReadPosRankSum=1.125;SOR=2.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,39:0.95:41
chr11	58386161	rs139343104	G	T	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=1.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.51;ReadPosRankSum=-0.513;SOR=0.654;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,33:0.21:158
chr11	58386177	rs3168135	G	A	5117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=81;PP=2965;ReadPosRankSum=1.385;SC=AAGAAGCACAGCCAGCCTCTG;SOR=0.320;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=67;TCR=83;TR=147;WE=58386185;WS=58386167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,154:0.99:155
chr11	58478026	rs675423	G	A	3184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=14;PP=2659;SC=TTACTTGAGAGGTGTGAGTGG;SOR=3.166;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=79;TCR=14;TR=93;WE=58478047;WS=58478016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr11	58478039	rs675757	T	C	3477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=20;PP=2772;SC=GTGAGTGGTATAGACTGGATT;SOR=2.628;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=83;TCR=20;TR=103;WE=58478047;WS=58478016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr11	58478084	rs675815	T	C	4609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=59;PP=2965;SC=TTTGCCACCATTGGGAGATAA;SOR=0.997;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=140;TCF=80;TCR=60;TR=139;WE=58478092;WS=58478074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr11	58492073	rs58778620	GTT	G,GT	1012.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=26.65;SOR=3.145;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,21,17:0.55,0.45:38
chr11	58605922	rs10896850	A	G	2323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=58;PP=1853;ReadPosRankSum=0.706;SC=ATAAGACATGACATGAGAAAT;SOR=3.442;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=4;TCR=59;TR=62;WE=58605930;WS=58605912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr11	58674952	rs35731745	G	GT,GTTTTGT	794.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0,0;NR=27,27;PP=690,233;ReadPosRankSum=-0.625;SC=GCTCTTTTTTGTTTGTTTTGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=27,27;WE=58674960;WS=58674942;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.57,0.36:14
chr11	58715513	rs11229707	T	G	883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=27;PP=769;SC=TCAGACACCATGGCTGCTTTT;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=58715521;WS=58715503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	58877055	rs182851998	C	T	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=226;ReadPosRankSum=-0.360;SC=GTTTCTCCATCTTATCGAGTA;SOR=0.460;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=13;WE=58877063;WS=58877045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr11	58919813	rs10896928	A	G	2832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.765;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=67;PP=2010;ReadPosRankSum=-0.814;SC=TCAAGGATGCACTGTGCAAGG;SOR=0.863;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=362;TCF=180;TCR=182;TR=123;WE=58919821;WS=58919803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:248,132:0.35:380
chr11	58962910	rs3841744	TA	T	1459.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.727;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.35;MQRankSum=1.274;NF=4;NR=49;PP=1665;ReadPosRankSum=1.189;SC=TGTTTGTAGGTAAAAAGTTAC;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=6;TCR=78;TR=53;WE=58962918;WS=58962900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,58:0.66:88
chr11	58978940	rs544864	C	T	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.009;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=17;PP=838;ReadPosRankSum=0.974;SC=TGGCTGCTGGCCACACACCAA;SOR=1.084;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=180;TCF=108;TCR=72;TR=51;WE=58978948;WS=58978930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,50:0.27:182
chr11	59056153	rs1894123	C	T	3956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=48;PP=2965;SC=GGAGTTGGTTCGGTTTGAGAG;SOR=1.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=81;TCR=49;TR=129;WE=59056161;WS=59056143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr11	59132798	rs7941190	G	C	3217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=57;PP=2707;SC=TAAATCCCTTGATTTACAGTT;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=33;TCR=57;TR=90;WE=59132806;WS=59132788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	59132882	rs10896964	A	G	3328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=53;PP=2564;SC=ACAGATTCTGAGATTTCTGCC;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=49;TCR=53;TR=102;WE=59132890;WS=59132872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr11	59189405	rs9988824	T	C	2002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=5;PP=1622;SC=TTTAAAATTATGTAAATGTCT;SOR=4.582;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=56;TCR=5;TR=61;WE=59189413;WS=59189395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	59210550	rs7947825	G	A	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=422;SC=CTCCCTCTCAGGCATTTTGTA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=59210558;WS=59210540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	59211188	rs6591536	G	A	6302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=96;PP=2965;SC=CTTCTTCTGCGACCTCCCACC;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=197;TCF=101;TCR=96;TR=197;WE=59211196;WS=59211178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr11	59211265	rs7941591	T	C	4483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=98;PP=2965;SC=TGGTGGTCACTGTCGGAGGAA;SOR=1.550;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=51;TCR=98;TR=149;WE=59211273;WS=59211255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr11	59224720	rs1453543	A	G	5965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=87;NR=100;PP=2965;SC=TCCTACAATGACTGCATGGCA;SOR=0.829;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=187;TCF=87;TCR=100;TR=187;WE=59224728;WS=59224710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr11	59368218	rs367608218	CA	C	209.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=4.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.000;QD=2.50;ReadPosRankSum=0.000;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,24:0.29:84
chr11	59369401	rs7106463	A	G	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=33;PP=1095;SC=CTTATTCTGGAAACTTTTAAC;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=35;WE=59369409;WS=59369391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	59423525	.	TAA	T	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.22;ReadPosRankSum=0.674;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr11	59480951	rs499033	T	C	4753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=61;PP=2965;SC=CGCTATAAACTGGTCATAAGC;SOR=1.150;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=86;TCR=61;TR=147;WE=59480959;WS=59480941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr11	59562810	rs117785627	G	A	1648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.813;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=8;PP=1262;ReadPosRankSum=0.225;SC=GACCTGAGACGTTTACTTGGT;SOR=1.274;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=74;TCF=61;TCR=13;TR=54;WE=59562818;WS=59562800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,59:0.74:80
chr11	59573827	.	C	G	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.509;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.273;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=460;ReadPosRankSum=0.168;SC=TCACTACACACGTTTGGGCAT;SOR=0.430;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=63;TCF=45;TCR=18;TR=26;WE=59573835;WS=59573817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,28:0.42:67
chr11	59626477	rs370252349	TA	T	350.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=1.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=1.491;QD=4.94;ReadPosRankSum=0.708;SOR=0.502;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,25:0.35:71
chr11	59829804	rs506053	C	T	285.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=242;SC=GATAAGCTCTCGTTCTGTTAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=59829812;WS=59829794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	59830103	rs481950	A	G	2770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=56;PP=2112;SC=TCCCCTGGCTATATGTTATTT;SOR=1.557;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=29;TCR=56;TR=85;WE=59830111;WS=59830093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	59830198	rs533855	T	C	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=30;PP=735;SC=GGTTTTGATTTGCAATTCTTG;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=59830206;WS=59830188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	59831716	rs1151065	C	A	1479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=13;PP=1060;SC=TATCTGTTTTCCTTCCTATTT;SOR=1.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=42;WE=59831724;WS=59831706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	59834318	rs579721	G	A	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=499;SC=TAGGATATCAGTGGGTGTGTA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=59834326;WS=59834308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	59837097	rs528823	C	T	3824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=73;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.068;SC=TATGCGTAACCATCTCTACCA;SOR=1.089;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=50;TCR=74;TR=122;WE=59837105;WS=59837087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,123:0.98:125
chr11	59837721	rs144234019	T	TTATGAAAA	5018.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.203;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.210;NF=52;NR=10;PP=2967;ReadPosRankSum=-1.326;SC=GAATACCTCCTTAATTCTGAG;SOR=2.701;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=75;TCF=62;TCR=13;TR=62;WE=59837729;WS=59837711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,102:0.98:104
chr11	59860178	rs502581	G	T	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=23;ReadPosRankSum=1.054;SC=TACCCCAAATGTTACCTATGT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=3;WE=59860186;WS=59860168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr11	59940396	rs595718	A	G	1681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.83;QD=48.05;SOR=5.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	59940400	rs2044979	C	T	1861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.85;QD=47.74;SOR=4.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	59940403	rs2044978	A	G	1976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.87;QD=44.93;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	59940407	rs592346	A	G	2032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.88;QD=43.25;SOR=4.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	59940599	rs7232	T	A	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=807;ReadPosRankSum=-0.194;SC=AGAGAGAGAGTTCCCTGAAAG;SOR=0.727;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=55;TCR=97;TR=46;WE=59940607;WS=59940589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,47:0.30:155
chr11	59942757	rs662196	C	T	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.6;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=70;ReadPosRankSum=-0.812;SC=ATAAACCTGGCTTTCCCCCAG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=59942765;WS=59942747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr11	59942815	rs7935829	A	G	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=121;ReadPosRankSum=1.216;SC=AAGGAATAACAAGAAATCAAG;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=9;WE=59942823;WS=59942805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr11	59943109	rs2278867	A	T	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=90;ReadPosRankSum=-1.024;SC=TTGGGTAAGGATCATTGCTAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=6;WE=59943117;WS=59943099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr11	59945745	rs12453	T	C	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.356;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=477;ReadPosRankSum=0.551;SC=AAAGCTTGGTTAACCTTTTCT;SOR=1.259;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=96;TCF=58;TCR=38;TR=29;WE=59945753;WS=59945735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,29:0.29:99
chr11	59946302	rs598862	C	T	5175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=102;PP=2962;SC=TCACCATACTCTAAACATCAA;SOR=1.908;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=144;TCF=41;TCR=103;TR=143;WE=59946318;WS=59946292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr11	59946310	rs5792172	CA	C	749.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=5.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=2.174;QD=6.58;ReadPosRankSum=-0.299;SOR=0.289;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,45:0.39:114
chr11	59946466	rs587634	T	A	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=325;SC=TGTAGTGTAATGTAGTAGCTT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=59946474;WS=59946456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	59947252	rs583791	C	T	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-5.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.766;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=11;PP=1036;ReadPosRankSum=-0.296;SC=AAGCTATTGGCATCTTCCTCC;SOR=0.141;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=65;TCF=53;TCR=12;TR=48;WE=59947260;WS=59947242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,54:0.76:71
chr11	59947274	.	C	T	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=0.000;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.694;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=519;ReadPosRankSum=-1.200;SC=CTCTTTGCCCCATCCTGCCCT;SOR=1.598;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=91;TCF=67;TCR=24;TR=29;WE=59947282;WS=59947264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,30:0.31:98
chr11	59997223	rs11230202	A	G	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=645;ReadPosRankSum=0.221;SC=GTGATAGAATATTATATATTT;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=26;WE=59997231;WS=59997213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr11	59997296	rs11230203	G	A	1899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=13;PP=1533;ReadPosRankSum=-1.717;SC=GTATTATGAGGCTAGCGGGAC;SOR=0.803;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=108;TCF=87;TCR=21;TR=69;WE=59997304;WS=59997286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,69:0.63:109
chr11	59997335	rs608659	T	C	4682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=53;PP=2965;SC=TCTGATCAAATGTGAGTTTAC;SOR=1.478;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=97;TCR=53;TR=150;WE=59997343;WS=59997325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr11	60049905	.	C	G	636	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=22;NR=1;PP=636;QD=29.1639657629;SC=GAACATAACACATTTCTTAAA;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=60049913;WS=60049904;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	60050125	rs10792260	A	G	4136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=0.548;SC=CAGATGTCTCAATATAGGAAT;SOR=1.207;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=131;TCF=33;TCR=98;TR=129;WE=60050133;WS=60050115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,132:0.99:133
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chr11	60070176	rs6591561	A	G	2415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.564;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=48;PP=1885;ReadPosRankSum=0.268;SC=TCATGGGACTATGTCCATCTT;SOR=0.887;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=147;TCF=72;TCR=75;TR=86;WE=60070184;WS=60070166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,89:0.59:152
chr11	60073597	rs4644658	C	T	3823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=86;NR=24;PP=2965;SC=GGTGCTCCTCCTAAGTGTGCT;SOR=2.677;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=86;TCR=24;TR=110;WE=60073605;WS=60073587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr11	60073702	rs3018806	A	T	4211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=87;PP=2965;SC=TTTGAAGATGACTGTATTAGT;SOR=1.893;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=39;TCR=87;TR=126;WE=60073710;WS=60073692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr11	60102790	rs1443250	G	A	835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=7;PP=710;SC=TTTCTTTTACGAAAGTAATGG;SOR=1.893;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=23;WE=60102798;WS=60102784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	60107470	rs2289612	C	A	2292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=5.958;NF=5;NR=65;PP=1882;ReadPosRankSum=1.427;SC=CTTAATCTTGCCTAGTGTATC;SOR=3.500;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=5;TCR=66;TR=70;WE=60107478;WS=60107460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,72:0.99:73
chr11	60152482	rs2233243	A	G	1255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=1;PP=1020;SC=TATACTCTTTATACTTTACCG;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=36;WE=60152490;WS=60152472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	60152563	rs950803	T	A	2582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=33;PP=2094;SC=TCTTGTAGACTGTCCAGATCC;SOR=1.085;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=46;TCR=33;TR=79;WE=60152571;WS=60152553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	60152584	rs950802	G	A	2440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=43;PP=1963;ReadPosRankSum=1.688;SC=TGTGTTGCCTGTTGATTTCAA;SOR=0.312;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=79;TCF=35;TCR=44;TR=78;WE=60152592;WS=60152574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,82:0.99:83
chr11	60157107	rs2233252	T	G	6335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.166;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.654;SC=TCATGTGAAATCTCTGTGTCT;SOR=0.353;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=188;TCF=91;TCR=97;TR=187;WE=60157115;WS=60157097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,198:0.99:199
chr11	60157166	rs2233253	C	T	3654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=83;PP=2869;SC=TTGGTCGGTCCGAATGCCTGG;SOR=2.282;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=29;TCR=83;TR=112;WE=60157174;WS=60157156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr11	60161438	.	TA	T	51.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=3.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.81;ReadPosRankSum=0.472;SOR=0.137;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,12:0.19:64
chr11	60163958	rs6591579	G	A	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=0;PP=1319;SC=GCTCATCTCTGAGGGCTCCAT;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=47;WE=60163966;WS=60163948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	60164204	rs2241920	G	A	2136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=60;PP=1727;SC=GTCCTCTCCAGTCAATAGGTC;SOR=5.580;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=63;TCF=3;TCR=60;TR=63;WE=60164212;WS=60164194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	60164302	rs2241921	C	T	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=373;SC=GTTAATTCTACTTTTCCCCCT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=60164310;WS=60164292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	60165352	rs3217518	ATT	A	11176.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.249;NF=89;NR=112;PP=2950;ReadPosRankSum=0.508;SC=TGCTCTAATCATTGTGGGCTT;SOR=0.267;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=206;TCF=92;TCR=114;TR=201;WE=60165361;WS=60165342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,255:1.00:256
chr11	60165480	rs187813587	G	T	1785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-5.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=58;PP=1371;ReadPosRankSum=-0.979;SC=AGAAGCTTTGGAGAAATTGCT;SOR=0.388;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=97;TCF=5;TCR=92;TR=62;WE=60165488;WS=60165470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,65:0.64:101
chr11	60172087	rs10750937	C	T	6229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=100;PP=2965;SC=CAAGTATCCACGGCCCCAAGA;SOR=0.703;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=201;TCF=101;TCR=100;TR=200;WE=60172095;WS=60172077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr11	60172273	rs10897057	A	T	1146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=34;PP=914;SC=CATAGCTCCCAATCCTTCTTC;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=60172281;WS=60172263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	60173360	rs4938941	A	G	3092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=19;PP=2332;SC=CATTATTTGCAGGGAATTTTG;SOR=2.854;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=84;TCR=19;TR=103;WE=60173368;WS=60173350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr11	60173554	rs4939353	A	G	1893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=5;NR=50;PP=1575;SC=TTAGTAGGAAAAGCAGCATGC;SOR=4.370;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=55;WE=60173562;WS=60173544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	60182970	rs7131283	A	T	3118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=29;PP=2237;ReadPosRankSum=0.656;SC=CCCAGAAGAAAATGATCAATT;SOR=0.886;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=66;TCR=29;TR=94;WE=60182978;WS=60182960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,103:0.99:104
chr11	60184191	rs3825020	G	A	8904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=153;NR=113;PP=2965;SC=ATCTAAAGATGGACAAGTTAA;SOR=1.041;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=266;TCF=153;TCR=113;TR=266;WE=60184199;WS=60184181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr11	60198328	rs708229	C	T	1491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=3;PP=1263;SC=TCCTTTTCACCTTGTTAAAAC;SOR=4.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=44;WE=60198336;WS=60198318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	60202747	rs894590	C	A	1746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=15;PP=1373;SC=CAAAAGAGGCCTAAAAAGAAA;SOR=2.107;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=56;WE=60202755;WS=60202737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	60202798	rs11377519	C	CA	1698.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=22;NR=33;PP=747;SC=CAGAACATAGCAAAAAAAAAA;SOR=0.762;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=55;WE=60202806;WS=60202788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	60230722	rs10792278	G	T	2083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=53;PP=1676;SC=TTGGGTTAAAGTAATTAAGAA;SOR=3.682;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=8;TCR=53;TR=61;WE=60230730;WS=60230712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	60268679	rs2186918	G	C	4862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=108;PP=2965;SC=TAGAACACCAGTCCTTCTTGG;SOR=2.319;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=35;TCR=108;TR=143;WE=60268687;WS=60268669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr11	60268765	rs3819092	C	T	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=41;PP=1205;SC=TTGATAAAGCCCTACATCTGA;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=41;WE=60268773;WS=60268755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	60285528	rs10897078	T	G	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=678;ReadPosRankSum=-1.654;SC=GGTACTAACATAATTCTCTTC;SOR=0.874;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=31;WE=60285536;WS=60285518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,35:0.61:57
chr11	60285575	rs10736706	A	G	2000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=26;PP=1539;SC=CATCTTTCACATTTTCATGTG;SOR=1.022;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=39;TCR=26;TR=64;WE=60285583;WS=60285565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	60291413	rs6591595	C	T	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.846;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=63;ReadPosRankSum=0.321;SC=ACAAAGTATCCGACTCGATCT;SOR=0.991;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=8;WE=60291421;WS=60291403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr11	60291548	rs12284816	A	G	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.286;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.796;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=153;ReadPosRankSum=-0.235;SC=AGTAAATGAAAGAATTAAGAA;SOR=2.115;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=9;WE=60291556;WS=60291538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr11	60296879	rs11230364	C	T	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.837;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=219;ReadPosRankSum=-0.808;SC=TGTTCTTCTACGGTTTGGAAT;SOR=1.244;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=13;WE=60296887;WS=60296869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr11	60297090	rs10664717	T	TAGAA	169.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=145;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ATTTTATAAATAGCATAAAAT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=60297098;WS=60297080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr11	60309947	rs4939400	A	T	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=2;PP=1139;SC=GTTGTATAATATTAAGAAACA;SOR=5.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=40;WE=60309955;WS=60309937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	60496788	rs77793415	C	T	1446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=1082;ReadPosRankSum=0.617;SC=AGTTGTACACCATGACCGAAC;SOR=0.386;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=88;TCF=58;TCR=30;TR=52;WE=60496796;WS=60496778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,55:0.59:94
chr11	60504436	rs2077227	T	C	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.985;HP=15;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=24;PP=929;ReadPosRankSum=4.643;SC=TTTTTTTTTTTTTTTGTCTGC;SOR=0.283;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=76;TCF=44;TCR=32;TR=49;WE=60504444;WS=60504426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,50:0.68:74
chr11	60511059	rs11821421	A	T	4872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.054;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=148;NR=35;PP=2962;ReadPosRankSum=0.257;SC=GAAGAAAAAAATTATGGCCAT;SOR=0.929;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=267;TCF=212;TCR=55;TR=183;WE=60511071;WS=60511049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,181:0.68:265
chr11	60531264	rs12363342	A	G	44.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.20;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=2.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr11	60534901	rs4939450	G	C	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=2;PP=1304;SC=CTTTCCCAGTGGCCAACAAGC;SOR=5.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=44;WE=60534909;WS=60534891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	60543367	rs17628721	C	G	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=261;SC=CACACTTTCCCCAGTGCTTTC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=60543375;WS=60543357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	60558375	rs11602321	A	G	1777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=2;PP=1461;SC=CAGTAGGTCCAGGGCACTAGT;SOR=6.091;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=62;TCF=60;TCR=2;TR=62;WE=60558383;WS=60558365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	60559805	rs931861	A	G	6818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=135;PP=2965;SC=GTGAGTGGGCACACTGAGATC;SOR=1.272;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=221;TCF=86;TCR=135;TR=221;WE=60559813;WS=60559795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr11	60561613	rs751026	C	T	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=22;PP=629;SC=CTGACTTCAGCGAAGGTGCTG;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=60561621;WS=60561603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	60562975	rs4939457	G	A	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=338;SC=CACGTGATGCGTGCAGACACC;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=60562983;WS=60562965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	60567230	rs11230483	C	T	2890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=21;PP=2226;SC=TATTTAATCTCAATGTCATTT;SOR=2.147;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=61;TCR=21;TR=82;WE=60567238;WS=60567220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	60567275	rs579967	G	A	4166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=58;PP=2965;SC=AGCTGCTGTTGCTATTAATAT;SOR=0.831;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=71;TCR=59;TR=129;WE=60567283;WS=60567265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr11	60609972	rs2074422	A	G	7616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=127;PP=2965;SC=AGGAGGCACCAAAGTGTTCTC;SOR=0.742;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=254;TCF=127;TCR=127;TR=253;WE=60609980;WS=60609962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr11	60617646	rs495949	T	C	9966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=202;NR=128;PP=2965;SC=AGGCTGCAGCTGCACTAATGT;SOR=1.260;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=330;TCF=202;TCR=128;TR=330;WE=60617654;WS=60617636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,332:1.00:332
chr11	60620585	rs2467642	A	G	4587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.90;QD=44.54;SOR=1.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr11	60620590	rs2428461	C	G	4652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.91;QD=43.48;SOR=1.265;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr11	60635091	rs550479	T	C	2667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=15;PP=2156;SC=TACTGCTGGTTGCCACCCTGG;SOR=2.805;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=65;TCR=15;TR=80;WE=60635099;WS=60635081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	60637164	rs489172	C	T	13047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=431;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=232;NR=185;PP=2965;ReadPosRankSum=0.298;SC=TCTGTCTCAACCCCACAAACC;SOR=0.521;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=419;TCF=232;TCR=187;TR=417;WE=60637172;WS=60637154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,424:1.00:426
chr11	60638470	rs566411	A	G	6397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=146;NR=56;PP=2965;SC=TCGTCCTCGTAGTGTCCCAAG;SOR=2.070;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=202;TCF=146;TCR=56;TR=202;WE=60638478;WS=60638460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr11	60640480	rs2072098	C	A	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=1;PP=851;SC=CTGAGCCTGCCTTGGAAATGC;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=60640488;WS=60640470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	60642325	rs2074418	G	A	6399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=153;NR=56;PP=2965;SC=GGCCCAGCTCGGGGATTCCAT;SOR=2.097;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=209;TCF=153;TCR=56;TR=209;WE=60642333;WS=60642315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr11	60666116	rs3763841	G	T	2025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=50;PP=1613;SC=GGAGGGAAGAGAGACCTGTGG;SOR=3.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=7;TCR=50;TR=57;WE=60666124;WS=60666106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	60666341	rs3763840	G	A	4669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=68;PP=2965;SC=TACAGCAGCCGGAGGTCTCAT;SOR=0.952;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=86;TCR=68;TR=154;WE=60666349;WS=60666331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr11	60670846	rs2240045	C	T	3031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=23;PP=2187;SC=CTAAATAATGCTCCATCCTTC;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=64;TCR=23;TR=87;WE=60670854;WS=60670836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr11	60673868	rs17155470	T	C	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=6;PP=324;SC=GCCGTCACCGTGCTCCGAGGC;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=12;WE=60673876;WS=60673858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	60687572	rs4939478	G	C	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=681;SC=TTATTTGATTGCTGTCCTAGG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=60687580;WS=60687562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	60689445	rs555835	T	C	3571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=62;PP=2688;SC=GGTCGGTGCCTGACCCTTCCA;SOR=0.991;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=53;TCR=62;TR=115;WE=60689453;WS=60689435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr11	60695301	rs575123	C	A	1447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=39;PP=1185;SC=CACACCCTGCCGGCACTGCTC;SOR=4.223;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=43;WE=60695309;WS=60695291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	60696554	rs112814977	CAAACT	C	2186.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=39;PP=1992;SC=ATGTGTCCACCAAACTAAACT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=39;WE=60696566;WS=60696544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	60697905	rs4939480	T	C	3470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=73;NR=32;PP=2664;SC=TGGCTTTGGCTCCTTGTCTTT;SOR=1.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=73;TCR=32;TR=105;WE=60697913;WS=60697895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr11	60698054	rs2074416	G	A	3318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=59;PP=2641;SC=CTGCCAAGCTGGACCGCTTCA;SOR=1.146;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=39;TCR=59;TR=98;WE=60698062;WS=60698044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr11	60700991	rs512233	A	G	61.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=1;PP=40;SC=TAGCCCGCCCACCTGCCCTCT;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=60700999;WS=60700981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	60701136	rs9513	C	G	737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=10;PP=579;SC=TGTGGGCCCCCCTGCTACCGC;SOR=1.302;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=26;WE=60701144;WS=60701126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	60701920	rs2469884	C	T	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=1;PP=79;SC=GCTGGGGCCGCTCAGCGCTGA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=60701928;WS=60701911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	60701987	rs7715	G	A	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=310;SC=CAGAGGCGTCGGATGAGGCCG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=60701995;WS=60701977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	60702346	rs555622	GA	TT	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=1070;SC=GTGTGTGGGGGAGTTGTGCGG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=19;WE=60702355;WS=60702336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	60703260	rs525574	A	G	117.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=3;PP=129;SC=CATGTGGCCTATCTCTGTGGG;SOR=1.981;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=60703268;WS=60703250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	60703882	rs61755079	G	A	2910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.199;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=59;PP=2186;ReadPosRankSum=-0.062;SC=AGTCTTCTGCGTGGCCATCTT;SOR=0.573;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=182;TCF=86;TCR=96;TR=115;WE=60703890;WS=60703872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,115:0.63:182
chr11	60704213	rs2469887	C	T	1841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=30;PP=1506;SC=GTGACATTTGCGCCAGCCCCT;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=26;TCR=30;TR=56;WE=60704221;WS=60704203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	60705454	rs2905692	A	G	2262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=56;PP=1909;SC=CCATGATGGCACCCTGCATGG;SOR=2.505;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=16;TCR=56;TR=72;WE=60705462;WS=60705444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr11	60707243	rs515587	G	A	975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=31;PP=819;SC=GGAAAAGAATGCTGGACTGGG;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=33;WE=60707251;WS=60707233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	60718792	rs150370599	C	T	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=238;ReadPosRankSum=0.743;SC=CCCAGGAATACCAGCGCGGCG;SOR=0.593;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=11;TCR=8;TR=14;WE=60718800;WS=60718782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr11	60750048	rs2905506	T	C	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.507;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=7;PP=883;ReadPosRankSum=0.259;SC=CCCCACTCCATTTGGTGTGCT;SOR=0.446;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=40;WE=60750056;WS=60750038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,42:0.69:61
chr11	60750240	rs3019541	G	A	1388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.813;NF=11;NR=40;PP=1157;ReadPosRankSum=-0.277;SC=GGAGGAAAGCGAGGTGCGAAG;SOR=0.653;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=18;TCR=65;TR=51;WE=60750248;WS=60750230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,50:0.62:81
chr11	60750298	rs72195127	GTCTGCAGGGAC	G	1327.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.749;NF=0;NR=26;PP=2954;ReadPosRankSum=0.050;SC=GAGAAGCCCAGTCTGCAGGGA;SOR=2.888;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=26;WE=60750316;WS=60750288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,34:0.67:51
chr11	60776186	rs11230562	C	T	3710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.012;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=92;PP=2952;ReadPosRankSum=-0.874;SC=TTGCACTTCACGCCCGGCCGC;SOR=1.088;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=187;TCF=56;TCR=131;TR=128;WE=60776194;WS=60776176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,134:0.69:193
chr11	60776209	rs11230563	C	T	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.235;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=33;PP=954;ReadPosRankSum=0.410;SC=GCCTATCCACCGGGACCAGGT;SOR=0.519;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=157;TCF=54;TCR=103;TR=51;WE=60776217;WS=60776199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,51:0.32:160
chr11	60776306	rs2074225	C	T	4956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=94;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.785;SC=GACGCGGGCGCGGTGTGCTCA;SOR=0.408;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=162;TCF=67;TCR=95;TR=161;WE=60776314;WS=60776296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,165:0.99:166
chr11	60776334	rs2905518	A	G	4357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=85;PP=2965;SC=GGGCGGAGTCACTGAAGCCCG;SOR=1.110;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=59;TCR=85;TR=144;WE=60776342;WS=60776324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr11	60776465	rs11230564	A	G	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=583;ReadPosRankSum=-0.124;SC=AGACAAACATAATTCAGGAGA;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=24;WE=60776473;WS=60776455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr11	60778513	rs74860834	T	C	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.493;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=4;PP=860;ReadPosRankSum=-1.003;SC=GTAACATGCATTGAGTGACTG;SOR=1.743;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=65;TCF=56;TCR=9;TR=39;WE=60778521;WS=60778503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,41:0.62:66
chr11	60778650	rs150035626	C	CGTGT,CGTGTGTGTGT,CGT	1489.73	.	AC=1,1,0;AF=0.500,0.500,0.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=5.259;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.462;NF=2,2;NR=27,27;PP=465,316;ReadPosRankSum=-0.372;SC=GAAGCTTGGACGTGTGTGTGT;SOR=3.383;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=82;TCF=9;TCR=73;TR=29,29;WE=60778658;WS=60778640;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.58,0.33:36
chr11	60778718	rs73478336	T	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.556;NF=0;NR=9;PP=137;ReadPosRankSum=-1.804;SC=GGTTTGGTCCTCATCCTCCAC;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=9;WE=60778726;WS=60778708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr11	60783108	rs2074229	C	T	2292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FS=2.186;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.16;ReadPosRankSum=-0.026;SOR=0.858;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:266,106:0.28:372
chr11	60783126	rs3019556	C	T	18074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=413;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.08;SOR=1.496;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,410:1.00:410
chr11	60783135	rs3019557	A	G	18189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=418;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.94;SOR=1.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,414:1.00:414
chr11	60784934	rs2074231	A	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=3.424;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=154;ReadPosRankSum=2.838;SC=CCTCCCCACCACCGCCTCTGC;SOR=2.303;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=9;WE=60784942;WS=60784924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr11	60785038	rs2074232	A	G	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.327;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=772;ReadPosRankSum=-0.860;SC=TCAGGATGGGAAGGGGTGTGA;SOR=0.238;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=54;TCF=44;TCR=10;TR=35;WE=60785046;WS=60785028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,35:0.65:54
chr11	60785352	rs1050922	A	G	1911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.616;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=49;PP=1439;ReadPosRankSum=0.021;SC=GCACCTCTTCAGGGGAGGATT;SOR=0.916;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=116;TCF=38;TCR=78;TR=71;WE=60785360;WS=60785342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,74:0.61:121
chr11	60785464	rs2074233	G	A	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.081;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=407;ReadPosRankSum=-0.817;SC=GGAGCTGGCCGGCACCCAGCC;SOR=0.133;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=18;WE=60785472;WS=60785454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr11	60890563	rs4245224	C	T	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.013;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=572;ReadPosRankSum=-1.278;SC=AGGGGCTGCACTAGAGTCCTC;SOR=0.287;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=93;TCF=23;TCR=70;TR=31;WE=60890571;WS=60890553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,31:0.32:96
chr11	60891310	rs7106643	T	C	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=122;ReadPosRankSum=0.384;SC=CCCCCACCCATACCTGCCCCC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=10;WE=60891318;WS=60891300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,9:0.23:39
chr11	60892606	rs637186	A	G	4393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=94;PP=2965;SC=AGGAACTCCCACCTGTCAGCT;SOR=1.483;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=48;TCR=94;TR=142;WE=60892614;WS=60892596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr11	60893235	rs2229177	C	T	1366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.573;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=44;PP=1107;ReadPosRankSum=0.612;SC=CTGGAAGGGGCTCTGCATCGC;SOR=0.968;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=205;TCF=70;TCR=135;TR=64;WE=60893243;WS=60893225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,65:0.30:215
chr11	60899767	rs754382	A	G	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.364;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=22;PP=910;ReadPosRankSum=1.419;SC=AGGCATGGCTAATGGTGGCTG;SOR=0.591;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=126;TCF=57;TCR=69;TR=49;WE=60899775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,50:0.39:128
chr11	60906450	rs508970	A	G	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=122;ReadPosRankSum=-0.020;SC=GAGAGGCAGAAATCTCTGAGA;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=9;WE=60906458;WS=60906440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,9:0.24:37
chr11	61018328	rs603061	A	C	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=6.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.932;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.576;NF=2;NR=32;PP=746;ReadPosRankSum=-0.027;SC=GCTGAATTCTACCTAAGCCCC;SOR=0.045;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=77;TCF=2;TCR=75;TR=34;WE=61018336;WS=61018318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,32:0.41:79
chr11	61044021	.	TA	T	381.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=0.000;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=1.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=-1.443;QD=3.47;ReadPosRankSum=0.078;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,34:0.31:110
chr11	61058867	rs6591651	T	C	1632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.254;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=26;PP=1178;ReadPosRankSum=-1.609;SC=AACTGGGGCCTCCCGTCTGCC;SOR=0.811;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=157;TCF=90;TCR=67;TR=64;WE=61058875;WS=61058857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,66:0.41:160
chr11	61100308	rs2512810	G	C	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.07;SOR=6.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	61106525	rs2512809	C	T	1476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=14;PP=1151;SC=CACTCCACTCCTTCCACCTCC;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=48;WE=61106533;WS=61106515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	61106892	rs2513329	G	C	5366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=163;PP=2965;SC=TGTGCGGCACGGTGCTTATAC;SOR=3.720;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=188;TCF=25;TCR=163;TR=187;WE=61106900;WS=61106882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr11	61108974	rs2260655	G	A	2635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=56;PP=2216;SC=GAACGTGGTCGCCAAGGCCAT;SOR=1.816;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=25;TCR=57;TR=81;WE=61108982;WS=61108964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	61110169	rs4939514	A	C	15046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=475;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=194;NR=270;PP=2965;SC=ACCCCTCCTAAACCTCTGGGG;SOR=1.060;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=468;TCF=194;TCR=274;TR=464;WE=61110177;WS=61110159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,468:1.00:468
chr11	61111346	rs35723406	C	G	4064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.747;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=72;PP=2922;ReadPosRankSum=0.974;SC=ACCACTGCAGCAGCCTGGCCT;SOR=0.772;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=375;TCF=185;TCR=190;TR=160;WE=61111354;WS=61111336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:222,169:0.43:391
chr11	61112802	rs2305465	C	T	5577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=83;PP=2965;SC=AGTTGTCTGTCCTGCTCCTGG;SOR=0.717;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=83;TCR=83;TR=166;WE=61112810;WS=61112792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr11	61113946	rs139056511	C	T	1726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.969;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=46;PP=1266;ReadPosRankSum=-1.180;SC=TGCCATCCTCCGGGCCATCTT;SOR=0.476;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=104;TCF=22;TCR=82;TR=60;WE=61113954;WS=61113936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,64:0.60:107
chr11	61123965	rs76030461	A	G	1491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=38;NR=6;PP=1238;SC=GTCCAGCCTGAGCCCTATCCC;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=44;WE=61123973;WS=61123955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	61165280	rs3741265	G	A	1956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=14;PP=1690;SC=GAAAGATGCCGCTCAGTATTA;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=50;TCR=14;TR=64;WE=61165288;WS=61165270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	61165731	rs11382548	C	CA	9692.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=81;NR=85;PP=2957;SC=TTTCTGCCATCGTATGGACAG;SOR=0.949;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=174;TCF=85;TCR=89;TR=166;WE=61165749;WS=61165721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr11	61165741	rs10897158	G	C	9874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=111;PP=2965;SC=CGTATGGACAGGATTTGAAGT;SOR=0.710;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=227;TCF=116;TCR=111;TR=226;WE=61165749;WS=61165721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr11	61179285	rs3019198	G	A	1766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=9;PP=1410;SC=ACTTGGCTTCGATGCCATGAA;SOR=3.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=42;TCR=9;TR=51;WE=61179293;WS=61179275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	61197460	rs34378918	GC	G	788.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=18;PP=581;SC=CCCAGGTCCCGCCCCCCCCGC;SOR=1.528;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=26;WE=61197468;WS=61197450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	61204361	rs896831	A	C	1960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=24;PP=1533;SC=ATAAGTTGTCAACTTCTCTGG;SOR=0.986;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=55;WE=61204369;WS=61204351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	61205343	rs112606325	T	C	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=25;PP=727;ReadPosRankSum=0.213;SC=GAGTCTTTTTTTTTAAATCGG;SOR=0.871;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=51;TCF=8;TCR=43;TR=29;WE=61205351;WS=61205333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr11	61205434	rs879647	G	A	1518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=15;PP=1275;SC=ATTAGACACAGCCTTCTCAAC;SOR=1.464;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=44;WE=61205442;WS=61205424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	61205676	rs5792226	C	CT	1133.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.54;MQRankSum=-0.037;QD=22.67;ReadPosRankSum=0.273;SOR=5.590;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,48:0.96:50
chr11	61249383	rs3019200	C	A	4128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=86;PP=2962;ReadPosRankSum=2.285;SC=GCTACTGCACCGCCTACGGTG;SOR=0.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=274;TCF=125;TCR=149;TR=157;WE=61249391;WS=61249373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,159:0.58:276
chr11	61253200	rs3019187	G	A	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.998;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=331;ReadPosRankSum=-0.439;SC=CACCTGCTGGGACACTGAGCC;SOR=0.213;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=16;WE=61253208;WS=61253190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr11	61253973	rs2957858	A	G	3209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.328;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=53;PP=2445;ReadPosRankSum=0.985;SC=TCCTGGTGCCAGTGGCTGCTT;SOR=0.497;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=212;TCF=134;TCR=78;TR=136;WE=61253981;WS=61253963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,137:0.64:215
chr11	61254376	rs3019188	G	C	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=538;ReadPosRankSum=0.646;SC=GCTGCCTCAGGCTGGCCACCT;SOR=0.763;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=24;WE=61254384;WS=61254372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr11	61286328	rs201838981	T	TACCCCACAG	2097.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.734;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.177;NF=4;NR=32;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.113;SC=CTCCACATGCTGTGACAACCT;SOR=0.428;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=120;TCF=12;TCR=108;TR=36;WE=61286336;WS=61286318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,55:0.39:140
chr11	61290781	rs112158469	G	A	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.296;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=30;PP=615;ReadPosRankSum=0.149;SC=TAGAGGGACCGTGGGGGAGGG;SOR=0.012;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=86;TCF=4;TCR=82;TR=34;WE=61290789;WS=61290771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,32:0.38:84
chr11	61291922	rs10897167	A	G	2404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=36;PP=1678;ReadPosRankSum=0.291;SC=ACACCTCCCCAATGGGGTCGT;SOR=0.678;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=270;TCF=179;TCR=91;TR=109;WE=61291930;WS=61291912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,113:0.40:281
chr11	61295316	rs2943812	A	T	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=348;ReadPosRankSum=1.456;SC=TGTGGCCACAAGTGTGGTTGG;SOR=0.941;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=45;TCF=42;TCR=3;TR=19;WE=61295324;WS=61295306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr11	61404161	rs67140840	G	A	1202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.851;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=12;PP=955;ReadPosRankSum=0.272;SC=GATGCCCAGGGAAGACAGGGT;SOR=0.425;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=141;TCF=113;TCR=28;TR=52;WE=61404169;WS=61404151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,52:0.36:146
chr11	61404559	rs141174248	C	A	1506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.958;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.809;NF=31;NR=32;PP=1138;ReadPosRankSum=-0.768;SC=AGAAGACCTCCTTTTTCCAGG;SOR=0.539;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=166;TCF=75;TCR=91;TR=63;WE=61404567;WS=61404549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,66:0.39:170
chr11	61404737	.	G	A	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.275;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=15;PP=877;ReadPosRankSum=-1.373;SC=GTTCGACAACGGCAGCATCTA;SOR=0.611;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=67;TCF=44;TCR=23;TR=42;WE=61404745;WS=61404727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,45:0.63:71
chr11	61405178	.	T	TA	27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5009;HP=13;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=15;MQ=57.34;NF=2;NR=1;PP=27;QD=10.6666666667;SC=CTTACTTCTTTAAAAAAAAAA;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=3;WE=61405186;WS=61405168;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,3:0.43:7
chr11	61490880	rs9735635	C	A	1807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.360;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=34;PP=1405;ReadPosRankSum=2.561;SC=GCGCCCCTACCTAATGCCTCC;SOR=0.550;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=224;TCF=126;TCR=98;TR=76;WE=61490888;WS=61490870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,80:0.35:229
chr11	61491097	rs566009	A	G	1493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=42;PP=1273;SC=CTGTCTGGTGAGCAGAGGTCT;SOR=4.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=46;WE=61491105;WS=61491087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	61505168	rs198444	G	A	2522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.435;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=51;PP=1856;ReadPosRankSum=-0.506;SC=GTGAGGATGCGATGGAGTATT;SOR=0.725;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=284;TCF=145;TCR=139;TR=105;WE=61505176;WS=61505158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,111:0.38:293
chr11	61505583	rs2240287	G	A	1959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=6.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.520;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=13;PP=1459;ReadPosRankSum=1.102;SC=CCTGGCTGACGGCCCTGTCTC;SOR=0.877;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=163;TCF=130;TCR=33;TR=71;WE=61505591;WS=61505573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,76:0.44:174
chr11	61505696	rs198443	G	T	3863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.373;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=68;PP=2859;ReadPosRankSum=-0.368;SC=CCCCACCTGGGCACCCTGCCT;SOR=0.733;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=382;TCF=218;TCR=164;TR=161;WE=61505704;WS=61505686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:224,166:0.43:390
chr11	61511498	rs3741252	C	T	9457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=156;NR=131;PP=2965;SC=GGTGGCGGGCCGGCCTCCCGC;SOR=0.937;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=287;TCF=156;TCR=131;TR=287;WE=61511506;WS=61511488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr11	61523300	rs10709102	GA	G	2392.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=58;PP=2711;SC=GGTGTGCAGGGAGCCTTGGAG;SOR=6.027;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=61;TCF=2;TCR=59;TR=60;WE=61523308;WS=61523290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
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chr11	61534872	rs547589	A	C	2899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=70;PP=2339;ReadPosRankSum=-1.588;SC=GGCCACTGCTACCGTCAGGAT;SOR=0.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=319;TCF=133;TCR=186;TR=121;WE=61534880;WS=61534862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,124:0.37:331
chr11	61536583	rs579383	G	A	1826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.246;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=16;PP=1403;ReadPosRankSum=-1.092;SC=TGGGTGGTGCGGAGAAATGCC;SOR=0.959;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=158;TCF=118;TCR=40;TR=70;WE=61536591;WS=61536573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,75:0.45:165
chr11	61543499	rs174528	T	C	2131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.805;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=11;PP=1600;ReadPosRankSum=-0.136;SC=AGCCCCATCCTGAGGTGCCAC;SOR=1.845;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=139;TCF=110;TCR=29;TR=77;WE=61543507;WS=61543489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,80:0.56:144
chr11	61543961	rs174529	T	C	2398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-7.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.850;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=87;PP=1709;ReadPosRankSum=-0.843;SC=AGGAAGACACTGCCCTGGGTG;SOR=0.442;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=176;TCF=23;TCR=153;TR=101;WE=61543969;WS=61543951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,105:0.57:184
chr11	61548559	rs509360	A	G	1840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=7.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.895;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=13;PP=1430;ReadPosRankSum=0.415;SC=GGAGGTTGCTATGTTCTGTCT;SOR=1.380;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=211;TCF=158;TCR=53;TR=74;WE=61548567;WS=61548549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,74:0.35:213
chr11	61551356	rs174535	T	C	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=16;PP=986;ReadPosRankSum=-0.849;SC=TCCCTGTCAGTAGTGGCACCC;SOR=0.717;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=97;TCF=68;TCR=29;TR=51;WE=61551364;WS=61551346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,52:0.52:100
chr11	61557803	rs102275	T	C	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.938;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=441;ReadPosRankSum=-0.956;SC=GAAATAAGGCTATAACCTGCC;SOR=0.380;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=18;WE=61557811;WS=61557793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr11	61571348	rs174548	C	G	1821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.435;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=57;PP=1484;ReadPosRankSum=-0.887;SC=TCCAGACTCACTCATCTTCAG;SOR=0.390;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=92;TCF=10;TCR=82;TR=65;WE=61571356;WS=61571338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,65:0.69:94
chr11	61572273	rs61695276	G	A	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.404;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=711;ReadPosRankSum=0.580;SC=CATGAGCACAGGAAGGTCATG;SOR=1.179;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=52;TCF=11;TCR=41;TR=30;WE=61572281;WS=61572263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr11	61624414	rs174602	T	C	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=220;ReadPosRankSum=-0.660;SC=GGCTGCAGGATGGGTTGGGGA;SOR=0.754;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=55;TCF=47;TCR=8;TR=16;WE=61624422;WS=61624404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,16:0.30:54
chr11	61624705	rs498793	T	C	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=27;PP=652;ReadPosRankSum=-1.185;SC=CCTCAGCCTGTGTTACAGGCC;SOR=0.614;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=11;TCR=44;TR=34;WE=61624713;WS=61624695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,34:0.61:56
chr11	61624885	rs526126	G	C	2653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=23;PP=2251;SC=GCACAGGCAGGGTGGAATGGA;SOR=1.967;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=61;TCR=23;TR=84;WE=61624893;WS=61624875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	61631282	rs520298	C	T	2618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.475;HP=6;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=75;PP=2130;ReadPosRankSum=-1.458;SC=TGCGGGGAGGCGGGGAGACCC;SOR=0.883;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=158;TCF=43;TCR=115;TR=101;WE=61631290;WS=61631272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,100:0.63:158
chr11	61631331	rs639394	A	G	1693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.178;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=54;PP=1393;ReadPosRankSum=1.165;SC=ACTGGGCAGAATGCAGAATGT;SOR=0.543;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=99;TCF=12;TCR=87;TR=62;WE=61631339;WS=61631321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,62:0.61:101
chr11	61633182	rs482548	C	T	1539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=31;PP=1241;ReadPosRankSum=1.179;SC=CCCGGGACACCGTGGGGAAGG;SOR=0.810;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=36;TCR=45;TR=55;WE=61633190;WS=61633172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,55:0.67:82
chr11	61641211	rs6591665	A	G	592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=18;NR=3;PP=537;SC=TGGAGGGGTGAGGGTATCGAT;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=61641219;WS=61641201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	61641396	rs75306442	C	T	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=695;ReadPosRankSum=1.205;SC=AAGATCCTAACACCCCTGTAT;SOR=0.776;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=37;WE=61641404;WS=61641386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,38:0.69:55
chr11	61647427	rs174635	T	G	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=392;ReadPosRankSum=0.000;SC=CCGAGGGAGCTGCTCCTGGCC;SOR=1.536;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=20;WE=61647435;WS=61647417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr11	61658629	rs693672	T	C	1211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.228;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=814;ReadPosRankSum=0.492;SC=GGCTTCCTTATGGCTTCCTTA;SOR=1.151;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=43;WE=61658637;WS=61658619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr11	61658800	rs174465	C	T	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5026;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=119;ReadPosRankSum=-2.308;SC=TGGGCAGCGGCGCCCCCGGCT;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=8;WE=61658808;WS=61658790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr11	61671956	rs174472	A	G	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=11;PP=1006;ReadPosRankSum=0.443;SC=TCGGCACAGTAAACACACGGC;SOR=0.638;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=70;TCF=52;TCR=18;TR=45;WE=61671964;WS=61671946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,44:0.63:70
chr11	61687454	rs11230827	G	A	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.800;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=464;ReadPosRankSum=-0.706;SC=TCTCACACTGGCTGCCCTGAA;SOR=2.068;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=82;TCF=55;TCR=27;TR=27;WE=61687462;WS=61687444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,27:0.32:84
chr11	61687674	rs2524290	G	A	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=536;ReadPosRankSum=0.751;SC=TGCTTGCAAGGCCAGACTGAG;SOR=1.292;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=27;WE=61687682;WS=61687664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,30:0.77:39
chr11	61719387	rs1800007	T	C	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.376;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=199;ReadPosRankSum=0.834;SC=TGGCGAGTTCTTAATCTTCCT;SOR=1.539;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=12;WE=61719395;WS=61719377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr11	61724514	rs195162	C	T	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=715;ReadPosRankSum=1.475;SC=GTGGGAAGGGCTGTGGTCCAC;SOR=1.845;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=28;WE=61724522;WS=61724504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,29:0.71:41
chr11	61725599	rs113492158	A	ATCCTCCTCC	2194.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=5;PP=2983;SC=TTGCTACCACATCCTCCTCCT;SOR=3.033;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=47;TCR=8;TR=33;WE=61725607;WS=61725589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	61726871	rs195158	G	T	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=4.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=455;ReadPosRankSum=-0.473;SC=CAGGAAGGGCGTCATGGGGTG;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=19;WE=61726879;WS=61726861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr11	61730183	rs1800008	C	T	1116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.817;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=9;PP=892;ReadPosRankSum=-0.949;SC=TCTCAGAGAGCGATGGGGCCT;SOR=0.847;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=127;TCF=101;TCR=26;TR=49;WE=61730191;WS=61730173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,49:0.38:130
chr11	61730234	rs1800009	T	C	2126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.906;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=30;PP=1598;ReadPosRankSum=0.254;SC=GGAGGAAAACTGTGGAGTTTA;SOR=0.308;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=240;TCF=178;TCR=62;TR=92;WE=61730242;WS=61730224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,93:0.38:245
chr11	61730553	rs17185413	T	C	1275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.556;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=43;PP=989;ReadPosRankSum=1.260;SC=AGGGAAGTGTTCGGGACCTTT;SOR=0.643;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=225;TCF=77;TCR=148;TR=65;WE=61730561;WS=61730543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,66:0.28:234
chr11	61731534	rs195155	G	T	1339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=13;PP=1109;SC=GAAATGAAGGGACCTTCCATA;SOR=1.931;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=44;WE=61731542;WS=61731524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	61735553	rs11271453	T	TGCTGCAGATTGGGAA	4125.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=5;PP=2974;SC=TGTGACACCTTGCTGCAGATT;SOR=2.568;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=22;WE=61735561;WS=61735543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	61736135	rs77709427	GT	TG	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=193;ReadPosRankSum=1.688;SC=CAGGGTGGATGTGAATTTATG;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=5;WE=61736144;WS=61736125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr11	61895541	rs1675130	A	G	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.007;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=-3.267;SC=GTTGTGGGTCAGGTGGGTATT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=61895549;WS=61895531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr11	61895741	rs1675131	A	G	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=33;PP=1128;ReadPosRankSum=0.738;SC=GGCTTGAGGAAATCCAAGAGG;SOR=0.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=31;TCR=58;TR=51;WE=61895749;WS=61895731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,49:0.56:87
chr11	61896215	rs1792946	G	A	2211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.008;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=17;PP=1759;ReadPosRankSum=-0.335;SC=AGGCAGCCTCGAGTGACACCC;SOR=1.079;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=119;TCF=90;TCR=29;TR=80;WE=61896223;WS=61896205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,81:0.68:120
chr11	61897197	rs1792944	C	T	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=0;PP=618;ReadPosRankSum=-2.127;SC=CTTGGAGAGACTGGGTGCCAC;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=28;WE=61897205;WS=61897187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr11	61897359	rs1675133	C	T	4622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.447;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=67;PP=2962;ReadPosRankSum=1.008;SC=ACGGCTCCGTCCTGCGGCGTG;SOR=0.732;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=279;TCF=167;TCR=112;TR=169;WE=61897367;WS=61897349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,175:0.61:286
chr11	61906299	rs1614060	A	G	6479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=83;PP=2965;SC=GCTCTGCACTACGGCCATCCT;SOR=0.988;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=193;TCF=110;TCR=83;TR=193;WE=61906307;WS=61906289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr11	61906374	rs1675126	T	C	7232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=119;PP=2965;SC=CTGAGAACAATGGAAATAACT;SOR=0.726;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=243;TCF=124;TCR=119;TR=243;WE=61906382;WS=61906364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr11	61907909	rs1675124	A	G	1736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=49;PP=1465;SC=CCAAGGAGGCAGCTCCATGCT;SOR=5.670;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=2;TCR=49;TR=51;WE=61907917;WS=61907899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	61908672	rs1675123	G	A	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=9;PP=330;SC=TGTGGCCACCGGCTGTCTTGA;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=61908680;WS=61908662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	61913091	rs77765284	G	C	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=1.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.90;ReadPosRankSum=0.629;SOR=1.562;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,6:0.19:32
chr11	61913196	rs7129085	G	T	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=299;ReadPosRankSum=1.166;SC=AGGAAGAGGAGGCACGTAGGC;SOR=0.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=19;WE=61913204;WS=61913186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr11	61914056	rs11230931	G	A	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=312;ReadPosRankSum=-0.642;SC=CCTGGGCTTCGGGGGAGTAGG;SOR=0.560;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=16;WE=61914064;WS=61914046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr11	61958022	rs7932927	C	T	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=29;ReadPosRankSum=0.881;SC=TCAATGCAGGCGAACGTTAGG;SOR=0.120;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=4;WE=61958030;WS=61958012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr11	61960763	rs11441356	T	TC	1894.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=10;PP=2131;SC=CCTCTACCCTTCAATTGTCTT;SOR=2.790;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=53;TCF=43;TCR=10;TR=48;WE=61960771;WS=61960753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	61960809	rs7951859	C	A	1639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.388;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=20;PP=1185;ReadPosRankSum=-1.138;SC=TGGATGTTAACCTGTTGTCTC;SOR=1.219;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=92;TCF=59;TCR=33;TR=60;WE=61960817;WS=61960799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,63:0.67:94
chr11	61960827	rs2232941	T	C	1748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.615;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=26;PP=1182;ReadPosRankSum=-1.802;SC=CTCCAGGAGCTGCATGACCGA;SOR=1.296;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=96;TCF=55;TCR=41;TR=66;WE=61960835;WS=61960817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,69:0.70:99
chr11	62010667	rs2232949	T	C	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=360;ReadPosRankSum=-0.701;SC=TGTGAACATATAACCCAGGGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=17;WE=62010675;WS=62010657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr11	62040694	rs59964144	T	TAC,TACACAC	724.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=0,0;NR=13,13;PP=197,425;SC=ATATTTTACATACACACACAC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=13,13;WE=62040702;WS=62040684;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.67,0.33:21
chr11	62063899	rs35328961	C	CA	1364.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=19;PP=921;ReadPosRankSum=0.235;SC=CACCTGAAATCAAAAAAAAGA;SOR=0.667;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=79;TCF=44;TCR=35;TR=44;WE=62063907;WS=62063889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,56:0.69:81
chr11	62064841	rs4477443	T	C	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=4.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.48;ReadPosRankSum=-1.102;SOR=1.635;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr11	62064844	rs4280004	G	C	1399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=4.198;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.33;ReadPosRankSum=-1.293;SOR=1.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,36:0.60:60
chr11	62105391	rs2513749	C	T	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=0;PP=201;SC=ACCCGCGCGGCTTCCTTGGGC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=62105399;WS=62105385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	62123717	rs2463837	G	A	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.507;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-2.086;NF=9;NR=0;PP=85;ReadPosRankSum=0.057;SC=CTGGCCGGGCGGGGGGCTGAC;SOR=1.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=9;WE=62123725;WS=62123707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr11	62124696	rs143687152	C	CTTTTGTTTTG	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.46;QD=42.34;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	62158886	rs2958531	G	T	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=339;ReadPosRankSum=-0.223;SC=GACCTTTGTCGGTACTTGAGC;SOR=0.565;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=17;WE=62158894;WS=62158876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr11	62158924	rs2958532	C	T	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=515;ReadPosRankSum=-1.608;SC=TTTCATGTAGCGTCCGACTTC;SOR=0.770;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=27;WE=62158932;WS=62158914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr11	62190448	rs11231085	C	G	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=2.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.56;ReadPosRankSum=1.923;SOR=0.506;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,42:0.27:154
chr11	62283814	rs76939572	T	C	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.293;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=11;PP=466;ReadPosRankSum=1.354;SC=CACCCACCCTTACTAACAAAA;SOR=0.707;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=61;TCF=28;TCR=33;TR=25;WE=62283822;WS=62283804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
chr11	62292882	rs566144	G	T	8180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=144;NR=106;PP=2965;SC=ATGTCCACTTGGGGACCCCTG;SOR=1.016;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=250;TCF=144;TCR=106;TR=250;WE=62292890;WS=62292872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr11	62293948	rs486903	G	A	5074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=57;PP=2965;SC=AGCCAGGCATGCTGAACTTTG;SOR=1.465;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=162;TCF=104;TCR=58;TR=161;WE=62293956;WS=62293938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr11	62328038	rs11231144	T	C	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=2.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.96;ReadPosRankSum=0.264;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,13:0.22:60
chr11	62334096	rs7124057	A	G	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=51;ReadPosRankSum=0.541;SC=TGCTCTCCACAATCAAAATTT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=62334104;WS=62334086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr11	62334908	rs1061093	G	C	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.691;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.515;NF=15;NR=12;PP=463;ReadPosRankSum=0.188;SC=GTTTCACTTCGCCCAAGACAG;SOR=0.255;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=72;TCF=47;TCR=25;TR=27;WE=62334916;WS=62334898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,27:0.38:71
chr11	62346131	rs3888173	C	T	3180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.059;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=46;PP=2558;ReadPosRankSum=-0.037;SC=CTCGATACACCCCAGGGACAC;SOR=1.015;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=158;TCF=87;TCR=71;TR=108;WE=62346139;WS=62346121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,112:0.69:162
chr11	62365619	rs11231155	A	G	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.488;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=212;ReadPosRankSum=1.511;SC=CAGTCCTGGAATTGGGGAGAG;SOR=1.112;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=57;TCF=20;TCR=37;TR=17;WE=62365627;WS=62365609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,19:0.31:61
chr11	62365665	rs2849031	G	A	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.129;HP=3;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;ReadPosRankSum=0.364;SC=CATAGGCGGCGGGGAGGGAGG;SOR=0.458;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=27;WE=62365673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr11	62369018	rs12226821	C	G	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.36;ReadPosRankSum=-0.314;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,7:0.21:33
chr11	62369881	rs35156678	G	A	2004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FS=2.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.75;ReadPosRankSum=0.966;SOR=0.509;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:167,62:0.27:229
chr11	62369884	rs35880596	C	G	1983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FS=1.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.14;ReadPosRankSum=0.419;SOR=0.567;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:157,60:0.28:217
chr11	62370155	rs71490394	G	A	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.857;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=21;PP=838;ReadPosRankSum=0.074;SC=CGGCGCCTGGGCCGGAGGGAA;SOR=0.222;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=163;TCF=110;TCR=53;TR=49;WE=62370163;WS=62370145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,46:0.28:162
chr11	62370490	rs71458425	C	CGAGGGCCG	1851.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=5.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=1.725;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.896;SOR=1.245;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,42:0.25:165
chr11	62371773	rs2516633	A	C	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=615;ReadPosRankSum=-0.754;SC=GATGGCAAATAAGAGAAGCTC;SOR=1.802;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=25;WE=62371781;WS=62371763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,26:0.70:37
chr11	62376312	.	C	G	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.061;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.119;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=507;ReadPosRankSum=-0.737;SC=GGGAAAGGGTCTCTCAAGACC;SOR=0.457;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=80;TCF=19;TCR=61;TR=29;WE=62376320;WS=62376302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,32:0.38:84
chr11	62376875	.	C	G	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=0.000;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.042;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=666;ReadPosRankSum=0.249;SC=GGCAGCTCCTCAAGGCTGCGG;SOR=0.221;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=103;TCF=83;TCR=20;TR=34;WE=62376883;WS=62376865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,35:0.34:102
chr11	62378355	.	C	T	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=91;ReadPosRankSum=0.028;SC=ACCCACCTCTCTGTGCTCCCG;SOR=0.243;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=7;WE=62378363;WS=62378345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr11	62378660	rs12808829	G	A	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.557;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=215;ReadPosRankSum=-0.240;SC=ATTGGGTCCCGCTAGGCTCTT;SOR=1.968;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=15;WE=62378668;WS=62378650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,16:0.28:57
chr11	62378801	rs11553576	T	C	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=340;ReadPosRankSum=1.352;SC=GTGGCAGTCCTGGGGGGGCTG;SOR=0.712;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=68;TCF=29;TCR=39;TR=23;WE=62378809;WS=62378791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,25:0.35:72
chr11	62380732	rs4387351	T	C	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=1;PP=370;SC=CACCTCTGCATTCCCTTGGGC;SOR=4.047;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=15;WE=62380740;WS=62380722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	62381106	rs1799959	G	C	2583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=32;PP=2221;SC=CTGGTCGTCGGCCTCGGGCTA;SOR=1.096;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=79;TCF=46;TCR=33;TR=78;WE=62381114;WS=62381096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	62383715	rs12794886	G	C	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.684;NF=43;NR=1;PP=1386;ReadPosRankSum=0.445;SC=GACTCTGTCTGAAAAAAAAAA;SOR=0.981;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=61;TCF=56;TCR=5;TR=44;WE=62383724;WS=62383704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,31:0.74:42
chr11	62384869	rs4963224	T	C	3183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=89;PP=2347;SC=ACCATTTGCCTGCTCCAGCCA;SOR=2.774;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=22;TCR=90;TR=111;WE=62384877;WS=62384859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr11	62397177	rs948683	C	G	2253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=15;PP=1867;SC=AGAGAAGAGACGGGTAGTGAG;SOR=1.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=48;TCR=15;TR=63;WE=62397185;WS=62397167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	62401716	rs2957121	A	G	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=7;PP=929;SC=ACCTCCCCCCAAAGGCTAGAG;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=39;WE=62401724;WS=62401706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	62430659	rs597259	T	A	2005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=20;PP=1416;SC=GGAAGTATTATCCCAAATAAA;SOR=1.341;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=38;TCR=20;TR=58;WE=62430667;WS=62430649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	62437647	rs489778	G	C	51.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	62438819	rs693698	G	T	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=32;PP=1066;SC=TGTTGAAAACGCGCGGGTGAC;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=39;WE=62438827;WS=62438809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	62439569	rs13941	G	A	1416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=35;PP=1180;SC=AGGCGGCGCCGGCGGGAGGTC;SOR=3.109;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=42;WE=62439577;WS=62439559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	62459994	rs2850597	A	G	2108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=35;PP=1662;SC=TCCTGCCGCTAGCACTCTTAC;SOR=1.057;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=57;WE=62460002;WS=62459984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	62460066	rs2850596	T	C	2424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=28;PP=1835;SC=CCTGGAGGCTTCTCAGGTAGA;SOR=1.270;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=42;TCR=28;TR=70;WE=62460074;WS=62460056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	62474514	rs55710428	GCCC	G	460.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.878;NF=9;NR=3;PP=361;ReadPosRankSum=-0.472;SC=CCATCCCCCCGCCCCCTTCAC;SOR=0.641;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=12;WE=62474524;WS=62474504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr11	62488916	rs34425182	T	TG	739.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=32;PP=473;ReadPosRankSum=0.136;SC=TGAGAGGAAGTGAAAAAAAAA;SOR=0.375;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=51;TCF=10;TCR=41;TR=41;WE=62488925;WS=62488906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,35:0.92:38
chr11	62489267	rs496032	C	T	5475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=111;NR=52;PP=2965;SC=ATACTGTATCCGACAAATCCC;SOR=1.739;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=164;TCF=112;TCR=52;TR=163;WE=62489275;WS=62489257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr11	62545346	rs633742	T	C	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=121;ReadPosRankSum=-0.359;SC=CTGGACTTCCTTCAAACGTGG;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=8;WE=62545354;WS=62545336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr11	62546491	rs373542247	GT	G	156.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=2.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQRankSum=1.911;QD=3.01;ReadPosRankSum=1.324;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
chr11	62555059	rs3087924	G	A	235.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=5;PP=161;SC=ACATGGCGAGGCCACTTTCGC;SOR=1.863;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=62555067;WS=62555049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	62563353	rs539465	G	A	1844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=6;PP=1523;SC=CTACAAACTCGGGACTCTAAA;SOR=4.066;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=51;TCR=6;TR=56;WE=62563361;WS=62563343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	62564009	rs4693	T	C	2357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=53;PP=1949;SC=GGAGCCCTTGTCGGTCTCCAG;SOR=2.617;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=15;TCR=53;TR=68;WE=62564017;WS=62563999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	62603653	.	A	G	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=35;ReadPosRankSum=1.282;SC=ACTCATATCAACCAGATTCCC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=62603661;WS=62603643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr11	62638196	.	TA	T	258.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.88;MQRankSum=-0.987;QD=18.48;ReadPosRankSum=0.533;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr11	62638212	.	TGTAGAG	T	215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.377;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=24.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQRankSum=-2.598;QD=7.70;ReadPosRankSum=-3.703;SOR=4.975;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr11	62638330	rs11231260	T	A	199.85	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.67;QD=39.97;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	62638333	rs55725256	T	A	199.85	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.67;QD=39.97;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	62638336	rs199540960	T	A	199.85	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.42;QD=39.97;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	62649463	rs80190679	G	A	2865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=38;PP=2144;ReadPosRankSum=-1.988;SC=CGCTCAGACTGACTTGCTGCA;SOR=0.644;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=89;TCR=53;TR=102;WE=62649471;WS=62649453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,110:0.73:151
chr11	62652063	rs489381	A	G	3296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=61;PP=2650;SC=CTAGAGCCTCATAATATTCTC;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=46;TCR=62;TR=107;WE=62652071;WS=62652053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr11	62652779	rs4726	C	T	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.064;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=574;ReadPosRankSum=-2.671;SC=TACAAAATCCCTAGTCACACA;SOR=1.218;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=102;TCF=62;TCR=40;TR=35;WE=62652787;WS=62652769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,39:0.36:109
chr11	62744899	rs3017670	A	G	779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=22;PP=649;SC=TTAGAGTTCCAGCATGAATGC;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=62744907;WS=62744889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	62747145	rs3017671	A	G	3635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=74;PP=2854;SC=CTTCTGAGATATTGGGTTATG;SOR=1.757;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=35;TCR=74;TR=109;WE=62747153;WS=62747135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr11	62847453	rs7945121	T	C	3519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=101;PP=2755;SC=TCCTGCTTTATGTTTCTTGAA;SOR=3.066;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=21;TCR=101;TR=122;WE=62847461;WS=62847443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr11	62847562	rs7926818	G	T	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=650;SC=TGTGCCTGAGGACAAGCTGCC;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=62847570;WS=62847552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	62848367	rs10897341	A	C	366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=308;SC=TCCCCACTCAAGTGACAGCTA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=62848375;WS=62848357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	62848445	rs11231340	A	G	1454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=12;PP=1153;SC=TGGTTTCTGGAAGGAGGAGGA;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=45;WE=62848453;WS=62848435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	62848487	rs11231341	A	C	2516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=22;PP=2084;SC=GGAAGACTCCATAGGAAATCC;SOR=1.966;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=56;TCR=22;TR=78;WE=62848495;WS=62848477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	62848568	rs11231342	C	G	3984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=61;PP=2965;SC=TCCTACCGGACACTGCATTGA;SOR=0.709;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=63;TCR=61;TR=124;WE=62848576;WS=62848558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr11	62848995	rs6591733	G	C	3274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=80;NR=12;PP=2605;SC=TCAGAAATTTGTGTTTTGAAA;SOR=3.375;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=93;TCF=80;TCR=13;TR=92;WE=62849003;WS=62848985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr11	62850684	rs4963356	C	T	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=0;PP=1127;SC=GGGGTAACTACTTTCTTTCCT;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=62850692;WS=62850677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	62863518	rs7113279	A	G	11139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=146;NR=189;PP=2965;SC=CGGAACAGGGAAAAAATGGAT;SOR=1.000;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=335;TCF=146;TCR=189;TR=335;WE=62863526;WS=62863508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,347:1.00:347
chr11	62871460	rs12283166	C	T	1923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=0;PP=1561;SC=ATCCACTTCTCCCAGTATATT;SOR=8.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=52;TCR=0;TR=52;WE=62871468;WS=62871450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	62886319	rs948060	G	C	3591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=18;PP=2918;SC=CCAGGTGTCAGAATTTTCCTT;SOR=3.066;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=92;TCR=18;TR=110;WE=62886327;WS=62886309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr11	62886800	rs4963245	G	C	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.242;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=26;PP=745;ReadPosRankSum=0.262;SC=ATGATCTTCCGTCCAACCCTA;SOR=0.368;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=102;TCF=27;TCR=75;TR=39;WE=62886808;WS=62886790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,40:0.38:106
chr11	62902172	rs1939782	A	C	5971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=135;NR=54;PP=2965;SC=GACCTCCCAGAAGTGACCCAG;SOR=2.046;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=135;TCR=55;TR=189;WE=62902180;WS=62902162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr11	62910849	rs1939749	T	C	6108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=114;NR=81;PP=2965;SC=GGGCCTCTTATCTCAGTCACG;SOR=1.094;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=195;TCF=114;TCR=81;TR=195;WE=62910857;WS=62910839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr11	62911079	rs1939748	G	C	8493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=145;NR=110;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.828;SC=GTCAGACACAGTGTCATTGTC;SOR=0.380;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=256;TCF=146;TCR=110;TR=255;WE=62911087;WS=62911069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,260:1.00:261
chr11	62951064	rs1525072	C	A	6665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=183;NR=19;PP=2965;SC=ACCCATAACTCTACCTGTGTT;SOR=4.386;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=184;TCR=19;TR=202;WE=62951072;WS=62951054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr11	62995875	rs7106186	G	A	4227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=111;NR=12;PP=2965;SC=TAGATGAAAAGTGTTTCATGA;SOR=4.226;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=111;TCR=12;TR=123;WE=62995883;WS=62995865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr11	63057925	rs1790218	G	A	11658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=137;NR=211;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.852;SC=ATCCCCAGTGGCAGCTTCTTC;SOR=0.458;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=349;TCF=137;TCR=212;TR=348;WE=63057933;WS=63057915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,364:1.00:365
chr11	63064823	rs576641	T	C	9237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=142;NR=141;PP=2965;SC=AGCTTGCCATTACTGACACCT;SOR=0.707;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=283;TCF=142;TCR=141;TR=283;WE=63064831;WS=63064813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr11	63064970	rs575009	T	G	6452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.033;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=90;PP=2965;ReadPosRankSum=1.161;SC=TATGACCCTTTAATTTGACCT;SOR=0.256;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=190;TCF=99;TCR=91;TR=189;WE=63064978;WS=63064960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,194:0.99:195
chr11	63066903	rs515213	T	C	2371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=2;PP=2054;SC=AAAGGGAACATATTTCTCTTG;SOR=6.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=73;TCF=71;TCR=2;TR=73;WE=63066911;WS=63066893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr11	63067138	rs513338	T	G	4171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=111;PP=2965;SC=CATTAAAAGTTTGGTGACATG;SOR=3.862;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=14;TCR=112;TR=125;WE=63067146;WS=63067128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr11	63067181	rs140991402	A	AGTGTGTGT,AGTGTGTGTGT	1145.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.96;QD=63.65;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,11,7:0.61,0.39:18
chr11	63069715	rs557658	A	G	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=524;SC=ACTGACCAATAACTGCCTGGG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=63069723;WS=63069705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	63072310	rs1201559	C	T	9501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.723;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=170;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.806;SC=TTCCTCCTACCAGAAACCAAG;SOR=0.747;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=299;TCF=127;TCR=172;TR=295;WE=63072318;WS=63072300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,303:1.00:304
chr11	63129782	rs517655	A	G	3289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=14;PP=2572;ReadPosRankSum=0.629;SC=GAAAGGCATCACAGTATAAAG;SOR=1.879;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=117;TCF=103;TCR=14;TR=114;WE=63129790;WS=63129772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,119:0.98:121
chr11	63129876	rs516763	T	G	8807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=154;NR=117;PP=2965;SC=CTGCTCAATGTCTGCTCATCA;SOR=1.051;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=271;TCF=154;TCR=117;TR=271;WE=63129884;WS=63129866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr11	63138482	rs566456	G	A	3801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=106;NR=4;PP=2965;SC=GTAATGCTGAGAAAGGAAGCC;SOR=5.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=106;TCR=4;TR=110;WE=63138490;WS=63138472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	63175800	rs7109920	A	G	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=48;PP=997;ReadPosRankSum=0.091;SC=AAAATAAATCATAACAGTCAT;SOR=0.802;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=117;TCF=3;TCR=114;TR=49;WE=63175808;WS=63175790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,51:0.42:121
chr11	63177203	rs61928015	G	A	2110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=9.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.806;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=3;PP=1614;ReadPosRankSum=-0.670;SC=TAAAGAATGCGGGACTTACAT;SOR=0.152;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=166;TCF=162;TCR=4;TR=74;WE=63177211;WS=63177193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,79:0.45:174
chr11	63256441	rs940611	C	G	1569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.377;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=48;PP=1213;ReadPosRankSum=-0.054;SC=CTAACTACAGCCTTCTCCCTA;SOR=0.386;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=169;TCF=41;TCR=128;TR=67;WE=63256449;WS=63256431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,68:0.39:176
chr11	63258416	rs10897424	T	C	4552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=124;PP=2965;SC=GGCCCGGTACTGGCGGTTCGC;SOR=2.613;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=166;TCF=42;TCR=124;TR=166;WE=63258424;WS=63258406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr11	63274096	.	G	A	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.000;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=45;PP=900;ReadPosRankSum=2.000;SC=AAGGACCTCAGTCTTTCTGCT;SOR=0.419;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=4;TCR=104;TR=47;WE=63274104;WS=63274086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,45:0.42:107
chr11	63274120	rs12272556	G	C	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.216;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=32;PP=709;ReadPosRankSum=-0.737;SC=CCCAGCACCTGCCCTGGGTTC;SOR=0.179;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=67;TCF=1;TCR=66;TR=33;WE=63274128;WS=63274110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
chr11	63278621	rs2239679	C	G	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.976;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=52;PP=1078;ReadPosRankSum=1.325;SC=GGGGGCGCAGCCTGGGTGAGC;SOR=2.656;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=149;TCF=5;TCR=144;TR=52;WE=63278629;WS=63278611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,56:0.36:154
chr11	63313644	rs584905	T	C	3015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=34;PP=2389;SC=AGGTTGAAGTTGGTGTGGCCA;SOR=1.493;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=63;TCR=34;TR=97;WE=63313652;WS=63313634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	63357919	rs593759	C	T	4666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=128;PP=2965;SC=CCCAGCCGGGCATCTGCCCTT;SOR=3.566;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=21;TCR=128;TR=149;WE=63357927;WS=63357909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr11	63413962	rs147319344	AAAAT	A	2101.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.22;QD=43.79;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	63487386	rs542998	T	C	8080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=131;NR=108;PP=2965;SC=GTGAAAGTGGTTTTACCTGAT;SOR=0.957;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=239;TCF=131;TCR=108;TR=239;WE=63487394;WS=63487376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr11	63585804	rs643634	C	A	3424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=7.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.562;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=94;PP=2662;ReadPosRankSum=0.906;SC=TAAAAGGAGCCGGCCCAGGGG;SOR=0.850;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=343;TCF=102;TCR=241;TR=134;WE=63585812;WS=63585794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,138:0.39:354
chr11	63589853	.	G	A	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.822;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=7.525;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.08;MQRankSum=-4.246;QD=16.57;ReadPosRankSum=2.854;SOR=2.998;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr11	63589857	.	C	A	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.095;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=3.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.41;MQRankSum=-4.796;QD=13.18;ReadPosRankSum=2.122;SOR=2.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
chr11	63589861	.	G	A	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.294;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=3.006;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.11;MQRankSum=-5.344;QD=11.40;ReadPosRankSum=-2.411;SOR=1.973;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,33:0.44:75
chr11	63636181	rs12792726	G	T	1001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=4.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=6;PP=842;ReadPosRankSum=1.101;SC=GTCTGCCTGCGTTGTTGCTCC;SOR=0.495;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=58;TCF=50;TCR=8;TR=37;WE=63636189;WS=63636171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,36:0.63:57
chr11	63657494	rs4980528	G	A	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=52;ReadPosRankSum=-1.181;SC=TGAGACCCAGGGCCAAGCTGA;SOR=0.446;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=5;WE=63657502;WS=63657484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr11	63668557	rs224174	C	T	3846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=107;PP=2965;SC=TGCTCCCCGCCCCATTCTCTG;SOR=5.229;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=8;TCR=107;TR=115;WE=63668565;WS=63668547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr11	63670387	rs1486936	C	G	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.096;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=336;ReadPosRankSum=-0.571;SC=TCGCTCCCAGCAGTAAATGCA;SOR=1.609;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=61;TCF=49;TCR=12;TR=19;WE=63670395;WS=63670377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,19:0.31:61
chr11	63670724	rs72934177	G	A	1248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.523;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=40;PP=979;ReadPosRankSum=-1.177;SC=CCCTGCCAGCGCATTGCTCCC;SOR=0.483;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=72;TCF=7;TCR=65;TR=45;WE=63670732;WS=63670714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,45:0.62:72
chr11	63673603	.	CTG	C,CTGTG	1109.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=0.000;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.896;NF=3,3;NR=40,40;PP=519,1675;ReadPosRankSum=0.935;SC=GTTGAGCCCGCTGTGTGTGTG;SOR=1.270;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=95;TCF=3;TCR=92;TR=43,43;WE=63673614;WS=63673593;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.28,0.64:50
chr11	63676313	rs56263226	G	GC	795.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=3;PP=728;ReadPosRankSum=0.255;SC=GGGTGCCTCAGCCCCCCCGTG;SOR=0.223;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=79;TCF=70;TCR=9;TR=31;WE=63676321;WS=63676303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,32:0.51:63
chr11	63679369	rs320108	T	C	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=5;PP=206;SC=TCCAGAGGGGTTCCAATCAGG;SOR=1.085;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=63679377;WS=63679359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	63680045	rs320109	C	A	8227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=6.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=546;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=130;NR=163;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.896;SC=AATACCCCTTCGAACTAGTTA;SOR=0.648;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=527;TCF=234;TCR=293;TR=293;WE=63680053;WS=63680035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:244,300:0.55:544
chr11	63680297	rs320110	A	G	12809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=434;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=197;NR=231;PP=2965;SC=CTCTGCCTCCAGAGAGAAACC;SOR=0.879;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=429;TCF=198;TCR=231;TR=428;WE=63680305;WS=63680287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,431:1.00:431
chr11	63681513	rs10897461	T	C	3371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=47;PP=2660;SC=CCGTGAGGCCTTCAGGGCTCA;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=57;TCR=47;TR=104;WE=63681521;WS=63681503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr11	63681648	rs4980533	G	A	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.656;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=19;PP=1040;ReadPosRankSum=0.299;SC=GAGGCTGCCAGTGAAAGGAGA;SOR=0.765;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=141;TCF=90;TCR=51;TR=57;WE=63681656;WS=63681638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,57:0.40:141
chr11	63682312	rs4375445	G	C	17266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.98;QD=45.32;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,381:1.00:381
chr11	63682312	.	GAGCCTG	CAGGCTG,CAGGCTC	2944	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=59.95;NF=145,143;NR=136,133;PP=2944,2934;QD=20;SC=AGGGGCAGCTGAGCCTGAGCT;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=316;TCF=157;TCR=159;TR=281,276;WE=63682327;WS=63682302;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.89:316
chr11	63682315	rs34212439	C	G	17382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.98;QD=45.62;SOR=0.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,381:1.00:381
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chr11	63682319	rs57942405	A	C	7642.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.380;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.870;NF=79;NR=66;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.778;SC=GCTGAGCCTGAGCTGCCCCGG;SOR=0.658;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=322;TCF=152;TCR=170;TR=145;WE=63682327;WS=63682302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,221:0.59:374
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chr11	63706441	rs28683669	G	A	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
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chr11	63713317	rs3740637	G	A	1888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.834;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=21;PP=1352;ReadPosRankSum=-0.409;SC=TGCAGAGAAAGTCAAGCAAAG;SOR=0.559;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=103;TCF=72;TCR=31;TR=68;WE=63713325;WS=63713307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,73:0.67:109
chr11	63714319	rs4980500	T	C	4379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.469;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=69;PP=2962;ReadPosRankSum=0.176;SC=AGTCTCCCGTTGTGGGTCCCC;SOR=0.563;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=319;TCF=197;TCR=122;TR=174;WE=63714327;WS=63714309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,176:0.55:320
chr11	63720086	rs4980513	T	G	7273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=203;PP=2965;SC=CCTGGCGATGTTCCAGGCACT;SOR=4.785;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=220;TCF=17;TCR=203;TR=220;WE=63720094;WS=63720076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr11	63767186	rs709594	A	G	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=522;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CGGCAGCCTGACTGGCGCTGG;SOR=0.551;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=55;TCF=11;TCR=44;TR=26;WE=63767194;WS=63767176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,29:0.51:57
chr11	63767249	rs11600062	C	T	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=146;ReadPosRankSum=0.415;SC=CGGGGGGCGACGGGGTCAGAC;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=9;WE=63767257;WS=63767239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr11	63769144	rs539432	C	G	3203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=9.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.704;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=74;PP=2480;ReadPosRankSum=-0.345;SC=ACGCTGAGAACGGCTCAGGCC;SOR=0.462;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=182;TCF=52;TCR=130;TR=108;WE=63769152;WS=63769134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,113:0.58:196
chr11	63883985	rs614397	T	C	14711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=502;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.02;NF=267;NR=213;PP=2965;SC=TCCCTGATGATGCCACCACCC;SOR=0.943;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=480;TCF=267;TCR=213;TR=480;WE=63883993;WS=63883975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,498:1.00:498
chr11	63884027	rs614035	C	T	4736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=478;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.277;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=110;PP=2962;ReadPosRankSum=0.572;SC=TCAACAACGCCGGCATCCCCC;SOR=0.923;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=460;TCF=205;TCR=255;TR=187;WE=63884035;WS=63884017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:283,193:0.41:476
chr11	63884094	.	G	C	3725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.883;ClippingRankSum=0.000;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.291;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=95;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.559;SC=GAATGACCTGGATGAGTTCCC;SOR=1.077;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=369;TCF=130;TCR=239;TR=138;WE=63884102;WS=63884084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:235,142:0.38:377
chr11	63885287	rs947939	C	T	5926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.425;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=146;NR=76;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.339;SC=GCAATGCCTACGTAGCTGATG;SOR=0.664;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=340;TCF=227;TCR=113;TR=222;WE=63885295;WS=63885277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,225:0.64:349
chr11	63885632	rs4379854	A	G	14309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=446;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=239;NR=198;PP=2965;SC=GCGCCAAAGAAGAGTACGTGG;SOR=0.874;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=437;TCF=239;TCR=198;TR=437;WE=63885640;WS=63885622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,443:1.00:443
chr11	63885704	rs677447	C	T	4223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=7.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=468;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.010;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=143;PP=2962;ReadPosRankSum=0.655;SC=CCATTGGCTACGGCACCACGC;SOR=1.160;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=459;TCF=124;TCR=335;TR=184;WE=63885712;WS=63885694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:280,184:0.40:464
chr11	63918589	rs2282492	T	C	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=1;PP=842;ReadPosRankSum=0.749;SC=GCCAGCAGGCTGTCCTTGCCA;SOR=0.818;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=35;WE=63918597;WS=63918581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,36:0.71:51
chr11	63953816	.	C	G	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.069;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=7.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-0.770;QD=6.47;ReadPosRankSum=-1.892;SOR=3.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr11	63964657	rs2236648	C	T	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=387;ReadPosRankSum=0.385;SC=ATGTTAGTTGCATTTCAGAAC;SOR=1.143;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=17;WE=63964665;WS=63964652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr11	63967770	rs11231722	C	G	2708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=49;PP=1940;ReadPosRankSum=0.026;SC=CTCAAGGTGACGAGACCTGTG;SOR=0.680;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=110;TCR=101;TR=100;WE=63967778;WS=63967760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,106:0.49:217
chr11	63970226	rs145620093	ATGT	A	1166.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.223;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.465;NF=20;NR=5;PP=958;ReadPosRankSum=0.156;SC=GTCTTTCCTGATGTTGTCCCC;SOR=0.983;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=92;TCF=69;TCR=23;TR=25;WE=63970236;WS=63970216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,34:0.32:105
chr11	63971256	rs148030896	C	CTTTG	1467.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.625;NF=6;NR=19;PP=1224;ReadPosRankSum=-0.191;SC=GCTGGAAGGGCTTTGTTAGTC;SOR=0.979;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=25;WE=63971264;WS=63971246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,36:0.75:48
chr11	63978067	rs78038516	C	G	3317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.513;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=18;PP=2739;ReadPosRankSum=-0.115;SC=CCCAGATGTGCCCCCGTGCCC;SOR=1.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=192;TCF=160;TCR=32;TR=118;WE=63978075;WS=63978057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,120:0.60:200
chr11	63978760	.	A	G	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.228;ClippingRankSum=0.000;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.566;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=26;PP=751;ReadPosRankSum=-0.051;SC=TGGCACCTGCACTGTTCCGGG;SOR=0.628;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=197;TCF=113;TCR=84;TR=61;WE=63978768;WS=63978750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,61:0.29:207
chr11	63986713	rs11603538	C	A	1740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.096;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=22;PP=1351;ReadPosRankSum=0.490;SC=CTCCTCTCCCCCCGCTCCAGA;SOR=0.342;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=115;TCF=80;TCR=35;TR=66;WE=63986721;WS=63986703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,68:0.58:118
chr11	63987339	rs11231726	C	T	3416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-8.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.502;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=60;PP=2683;ReadPosRankSum=0.750;SC=GGCGGCCTTTCACAAACCCCA;SOR=0.644;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=212;TCF=108;TCR=104;TR=124;WE=63987347;WS=63987329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,129:0.59:218
chr11	63990996	rs5792315	AC	A	1081.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.906;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.240;NF=2;NR=31;PP=1119;ReadPosRankSum=-0.429;SC=CCTGCTCACCACCCTGTCACA;SOR=0.093;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=64;TCF=2;TCR=62;TR=33;WE=63991004;WS=63990986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,37:0.58:64
chr11	63994692	rs1860368	T	C	2946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FS=2.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.34;ReadPosRankSum=-0.228;SOR=0.849;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:169,116:0.41:285
chr11	63994696	rs2429456	T	C	11039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=149;NR=127;PP=2962;SC=GTTTCCTCATTCCTTAAAGGG;SOR=0.848;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=278;TCF=150;TCR=128;TR=276;WE=63994704;WS=63994682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr11	63995302	rs2429455	C	G	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.368;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=419;ReadPosRankSum=-1.772;SC=AATTCTAGCCCTCAGTACCCT;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=20;WE=63995310;WS=63995292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr11	63997329	rs633561	A	G	4956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.47;SOR=2.750;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr11	63997338	rs633557	T	C	5089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.50;SOR=2.364;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr11	63997882	rs11311686	AT	A	930.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=15.348;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=1.182;QD=6.95;ReadPosRankSum=2.142;SOR=0.692;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,62:0.46:134
chr11	63999240	rs3741404	G	C	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=524;ReadPosRankSum=0.163;SC=TTTCAGCCCTGTCAGCTCCTG;SOR=0.984;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=22;WE=63999248;WS=63999230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr11	63999529	rs3741403	C	T	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=35;PP=720;ReadPosRankSum=0.953;SC=GCATCTCTGGCGGGTGCCACA;SOR=0.750;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=109;TCF=12;TCR=97;TR=39;WE=63999537;WS=63999519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,40:0.36:110
chr11	64002238	rs7482791	T	C	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=83;SC=GCTCTGGCTGTCGCCGCCCCC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=64002246;WS=64002228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	64003843	rs11603042	G	T	3341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.672;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=111;PP=2961;ReadPosRankSum=0.242;SC=GGCCAGGCTTGGGGGGTGCTG;SOR=0.330;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=192;TCF=13;TCR=179;TR=121;WE=64003851;WS=64003833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,119:0.62:192
chr11	64004555	.	CAAAGAG	C	412	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=28;MQ=63.62;NF=11;NR=1;PP=412;QD=37.25;SC=AACACAGTCTCAAAGAGAGAG;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=12;WE=64004568;WS=64004545;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,12:0.86:14
chr11	64004557	rs68046749	A	G	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.82;QD=33.17;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	64004692	rs12366035	C	T	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=35.507;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=10;PP=660;ReadPosRankSum=-0.606;SC=TGAAGCCAGACAGGTGAGTCT;SOR=2.501;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=118;TCF=66;TCR=52;TR=41;WE=64004700;WS=64004682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,42:0.33:128
chr11	64011441	rs654573	T	C	3393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=86;PP=2735;SC=CCCCTACAGGTGGTGCAACCC;SOR=2.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=32;TCR=86;TR=118;WE=64011449;WS=64011431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr11	64012225	rs605187	G	C	2609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=3;PP=2249;SC=GTCGGGGACCGTCACTTCTTC;SOR=6.492;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=79;TCF=76;TCR=3;TR=79;WE=64012233;WS=64012215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	64012910	rs60031276	A	G	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.547;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=60.25;MQRankSum=-1.077;NF=0;NR=24;PP=523;ReadPosRankSum=-0.612;SC=GGAGGAAAACAGATCAGGCCC;SOR=2.070;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=24;WE=64012918;WS=64012900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr11	64012949	rs57467371	TG	T	531.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=1;NR=17;PP=346;SC=CAAAGCGGGGTGGGGGGGGGA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=64012957;WS=64012939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	64019351	.	G	A	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.503;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.779;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=395;ReadPosRankSum=1.004;SC=GCGGCGCCCCGGAAACTTAAG;SOR=0.031;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=21;WE=64019359;WS=64019341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr11	64022459	rs632439	A	G	4895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=84;PP=2965;SC=GGCCAGACCCAGTGAACACAG;SOR=0.866;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=73;TCR=85;TR=156;WE=64022467;WS=64022449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr11	64023971	rs7943988	G	A	3021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-9.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=52;PP=2190;ReadPosRankSum=-0.183;SC=AGGCCCGGCTGCTCATCGAAA;SOR=0.715;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=312;TCF=182;TCR=130;TR=126;WE=64023979;WS=64023961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,131:0.41:320
chr11	64024056	rs588177	C	A	10205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=161;NR=147;PP=2965;SC=CAGGTGGGACCCCAGCTGACC;SOR=0.790;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=308;TCF=161;TCR=147;TR=308;WE=64024064;WS=64024046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr11	64026144	rs2244625	G	A	13884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=490;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=205;NR=253;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.369;SC=TCAAGACCTCGCCCTACCCCG;SOR=0.325;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=471;TCF=206;TCR=265;TR=458;WE=64026152;WS=64026134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,477:0.99:481
chr11	64026634	rs61755082	C	T	2968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=2.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.32;ReadPosRankSum=-0.115;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,77:0.58:133
chr11	64026639	rs12146487	G	A	2900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.39;ReadPosRankSum=-1.303;SOR=0.624;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,74:0.60:124
chr11	64026685	rs28395882	C	T	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.326;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=27;PP=540;ReadPosRankSum=-0.628;SC=GCGAGAGCTCCGCGGCCACCG;SOR=1.042;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=65;TCF=9;TCR=56;TR=31;WE=64026693;WS=64026675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,33:0.48:69
chr11	64027666	rs117874826	A	C	3170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=60;PP=2322;ReadPosRankSum=-0.156;SC=GATGAGGAAGAGGAGGAACAG;SOR=0.697;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=245;TCF=137;TCR=108;TR=134;WE=64027674;WS=64027656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,135:0.53:254
chr11	64030944	rs2510067	T	C	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=3;PP=1012;SC=GTCAGCCCTGTGGCTCAGCTC;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=37;WE=64030952;WS=64030934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
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chr11	64039175	rs2286615	G	A	1976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.160;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=54;PP=1595;ReadPosRankSum=-0.115;SC=CCGAGCGCGAGCGGCCCCGAA;SOR=0.902;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=152;TCF=49;TCR=103;TR=77;WE=64039183;WS=64039165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,79:0.50:157
chr11	64044284	rs72922077	C	A	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.422;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=307;ReadPosRankSum=0.068;SC=CCTGCCCACTCTTGCCATCCG;SOR=0.025;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=16;WE=64044292;WS=64044276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr11	64052306	rs652611	T	G	9571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=231;PP=2965;SC=CTCGTCCGCATCCTTTTTCCT;SOR=2.857;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=293;TCF=61;TCR=232;TR=292;WE=64052314;WS=64052296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr11	64056203	rs371609453	G	A	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=4.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.65;ReadPosRankSum=-1.809;SOR=0.254;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,22:0.15:145
chr11	64066859	rs2232417	G	A	1836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=2;PP=1505;SC=GGACTGGCACGGTGACAGCGC;SOR=5.856;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=54;TCR=2;TR=56;WE=64066867;WS=64066849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	64070940	rs11231746	T	C	1388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=4.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.048;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=31;PP=1148;ReadPosRankSum=0.385;SC=TAACCCTTTTTTCTCTTCTCC;SOR=0.845;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=143;TCF=75;TCR=68;TR=56;WE=64070948;WS=64070930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,56:0.39:144
chr11	64072248	.	G	A	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.878;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=617;ReadPosRankSum=-1.826;SC=CATGGTCCGTGAGTCAGTGCA;SOR=0.717;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=30;WE=64072256;WS=64072238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,32:0.57:56
chr11	64082437	rs650008	C	T	1830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=38;PP=1415;SC=CTCTGGTGCGCTTGCTCAGCC;SOR=1.460;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=19;TCR=38;TR=57;WE=64082445;WS=64082427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	64085074	rs550819	T	A	8261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=198;PP=2965;ReadPosRankSum=1.751;SC=GGGATGCTCCTCTCGATGCTA;SOR=1.263;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=267;TCF=64;TCR=203;TR=262;WE=64085082;WS=64085064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,270:1.00:271
chr11	64085148	rs28364831	A	C	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-8.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=39;PP=598;ReadPosRankSum=0.891;SC=GTGGGAGCTGAGGTAGGTAGG;SOR=0.469;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=91;TCF=0;TCR=91;TR=39;WE=64085156;WS=64085138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,40:0.43:92
chr11	64085785	rs7938623	A	G	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=14;PP=1454;SC=GCAAGACGGTACAGTGAAGGA;SOR=1.938;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=51;WE=64085793;WS=64085775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	64085938	rs7941847	T	C	2083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=44;PP=1687;SC=AGAGTATCGCTTTATTTCCTG;SOR=1.410;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=22;TCR=44;TR=66;WE=64085946;WS=64085928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	64088435	rs566049	A	G	5172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=98;PP=2965;SC=GGGGGCCCTTAGCCTCTTCAA;SOR=1.383;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=58;TCR=98;TR=156;WE=64088443;WS=64088425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr11	64107735	rs663743	G	A	1072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=701;ReadPosRankSum=1.085;SC=ACCCCGACCCGGGCATGGAGG;SOR=0.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=75;TCF=42;TCR=33;TR=39;WE=64107743;WS=64107725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,43:0.55:78
chr11	64108539	rs66493355	C	T	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.565;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=28;PP=1380;ReadPosRankSum=0.130;SC=AGAGGAGCCCCTTCGGGAAGG;SOR=0.783;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=176;TCF=95;TCR=81;TR=63;WE=64108547;WS=64108529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,67:0.36:184
chr11	64109118	rs647152	T	G	2397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.710;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=43;PP=1904;ReadPosRankSum=-0.925;SC=CTGGGCCAGATCCTGGGGAGC;SOR=0.452;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=158;TCF=84;TCR=74;TR=88;WE=64109126;WS=64109108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,90:0.56:160
chr11	64109315	.	GGTTGTGGTCTGAGGTCTTGGGCCATCAGTGATGTCACAACCAGATGGCCCAAGACCCCAGACCACAACCCCATGTCTGGT	G	1567.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.491;ClippingRankSum=0.000;DP=247;ExcessHet=3.0103;FS=38.529;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.88;ReadPosRankSum=-2.321;SOR=2.810;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:177,51:0.22:228
chr11	64110348	rs11602301	T	G	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=15;PP=438;SC=TGTAGGGGAGTGGGGGGGCTG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=64110356;WS=64110338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	64110422	rs11601860	A	T	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=71;ReadPosRankSum=-0.619;SC=CATGGACAGAAGGGCGGGGCC;SOR=1.179;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=6;WE=64110430;WS=64110412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr11	64110668	rs574835	G	A	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.504;HP=4;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=2;ReadPosRankSum=-2.028;SC=GGGTGCTCTCGGGGGTGCTGG;SOR=2.240;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=70;TCF=62;TCR=8;TR=37;WE=64110676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr11	64110683	rs479552	G	C	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.314;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=4;PP=1058;ReadPosRankSum=-1.472;SC=TGCTGGAGGCGTCCAAGGCGC;SOR=1.356;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=82;TCF=71;TCR=11;TR=45;WE=64110691;WS=64110673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,46:0.54:85
chr11	64111928	rs685870	T	C	3423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=66;PP=2866;SC=GCCTGAGGCCTGGGGGTTGAG;SOR=1.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=48;TCR=66;TR=114;WE=64111936;WS=64111918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr11	64116843	rs1318165	A	C	2267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=23;PP=1733;SC=GAGTTGGGGGACCGGCTGGAG;SOR=1.516;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=71;WE=64116851;WS=64116833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	64117284	rs4930155	G	A	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=361;ReadPosRankSum=0.210;SC=GGGCCTGTTGGAGAGAGCACT;SOR=0.917;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=19;WE=64117292;WS=64117274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,20:0.36:55
chr11	64118422	rs614047	G	C	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=0;PP=746;SC=CTGCCGCAGAGAGACAGAAGT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=64118430;WS=64118419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	64120435	rs489419	T	C	1271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=27;PP=1048;SC=TGGGGTCCTGTCTGGCCTCCC;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=38;WE=64120443;WS=64120425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	64120800	rs80181608	G	A	1336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=19;PP=990;ReadPosRankSum=1.235;SC=CCCACCCTCCGAGCCATGGTG;SOR=0.756;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=86;TCF=51;TCR=35;TR=48;WE=64120808;WS=64120790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,50:0.55:91
chr11	64124515	rs612448	T	C	2512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.265;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=31;PP=1856;ReadPosRankSum=-1.252;SC=CTCTAGGCCCTGAGGTACAGG;SOR=1.268;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=159;TCF=101;TCR=58;TR=98;WE=64124523;WS=64124505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,99:0.60:164
chr11	64124823	rs519763	C	T	2217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.900;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=31;PP=1806;ReadPosRankSum=-0.700;SC=GTGGCTCCCGCTGAGGCAGCG;SOR=1.196;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=125;TCF=71;TCR=54;TR=81;WE=64124831;WS=64124813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,81:0.65:124
chr11	64124940	rs600377	T	G	2556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.042;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=58;PP=1996;ReadPosRankSum=0.809;SC=GACTGTGGCCTGGGCTGATCT;SOR=0.863;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=162;TCF=78;TCR=84;TR=100;WE=64124948;WS=64124930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,101:0.62:164
chr11	64124980	rs542907	G	A	2226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.525;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=57;PP=1796;ReadPosRankSum=-1.076;SC=AGGGGCATGAGAATAAAGCTG;SOR=1.434;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=140;TCF=51;TCR=89;TR=83;WE=64124988;WS=64124970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,84:0.59:142
chr11	64127744	rs521950	A	G	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.776;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=4;PP=845;ReadPosRankSum=-1.338;SC=CCAAGACGCAAGAGCACACGC;SOR=1.532;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=32;WE=64127752;WS=64127734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,35:0.76:46
chr11	64127881	rs564687	T	G	5187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=61;PP=2965;SC=CCCAACGGGGTTGGGGTGGCT;SOR=1.363;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=99;TCR=61;TR=160;WE=64127889;WS=64127871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr11	64128423	rs516124	G	T	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.239;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=261;ReadPosRankSum=0.120;SC=GATCCACGGGGCCCTCCTTCT;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=14;WE=64128431;WS=64128421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr11	64135435	rs508168	G	A	1066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=0;PP=803;ReadPosRankSum=-0.491;SC=ATAAAACCAGGTGGAATAAAA;SOR=1.234;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=59;TCR=0;TR=35;WE=64135443;WS=64135426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,38:0.61:62
chr11	64135541	rs3217512	GTC	G	5233.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.532;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=26;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.030;SC=CCCCACCAGAGTCTCCTCACC;SOR=0.775;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=219;TCF=158;TCR=61;TR=107;WE=64135550;WS=64135531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,137:0.55:248
chr11	64136877	rs11606015	C	G	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=186;ReadPosRankSum=-2.774;SC=GGCTTGCCGCCGTGGGTGGGT;SOR=0.460;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=13;WE=64136885;WS=64136867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr11	64137875	rs11606081	T	C	1913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=41;PP=1645;ReadPosRankSum=0.605;SC=CTGGAGGTCATAGACCATGGT;SOR=0.642;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=116;TCF=46;TCR=70;TR=69;WE=64137883;WS=64137865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,69:0.60:115
chr11	64138805	rs11542299	T	C	3517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.447;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=86;PP=2399;ReadPosRankSum=-1.220;SC=GCGTGGAGAATGCACCCCTGG;SOR=0.745;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=269;TCF=111;TCR=158;TR=146;WE=64138813;WS=64138795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,154:0.56:277
chr11	64138905	rs17857342	T	G	1277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.085;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=41;PP=1053;ReadPosRankSum=-0.375;SC=CCCCGTCGCCTCCAAAGGGGC;SOR=0.442;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=99;TCF=20;TCR=79;TR=53;WE=64138913;WS=64138895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,53:0.54:99
chr11	64326795	rs2277312	A	G	4327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=99;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.839;SC=AATGTCAGGCAAACACCCCAT;SOR=1.395;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=128;TCF=28;TCR=100;TR=127;WE=64326803;WS=64326785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,137:0.99:138
chr11	64332862	rs71456318	A	C	1537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=22;PP=1039;SC=GGCAGGAGGCAGAGCTGGGAC;SOR=1.262;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=32;TCR=22;TR=54;WE=64332870;WS=64332852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	64359286	rs3825016	C	T	3682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=66;PP=2965;SC=AGAGGCCCCACCAGTGCCGCC;SOR=1.219;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=112;TCF=46;TCR=66;TR=111;WE=64359294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr11	64360274	rs11231825	T	C	10589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.084;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=177;NR=180;PP=2965;ReadPosRankSum=0.384;SC=GTGACTCTCATGCTCTGAAGC;SOR=0.413;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=362;TCF=180;TCR=182;TR=357;WE=64360282;WS=64360264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,366:0.99:369
chr11	64361384	rs2021860	G	T	4124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=113;PP=2965;SC=TAGAGGCCAGGGGTGCATGGG;SOR=3.811;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=16;TCR=113;TR=129;WE=64361392;WS=64361374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr11	64365943	rs1529909	T	C	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=2;PP=834;SC=GGCCAGGCACTGGGGGCCACA;SOR=4.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=32;WE=64365951;WS=64365933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	64367325	rs1630320	A	G	5313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=137;PP=2965;SC=TGTTGCTGGCAGGGCTCTGCA;SOR=3.401;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=26;TCR=137;TR=163;WE=64367333;WS=64367315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr11	64387932	rs2277311	G	A	3826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=95;PP=2965;SC=ACGGTGGCACGGGGGATGCCC;SOR=3.145;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=19;TCR=95;TR=114;WE=64387940;WS=64387922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr11	64418900	rs526338	G	A	7437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=135;NR=92;PP=2965;SC=GATCGGCCACGATGGCACGCA;SOR=1.064;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=227;TCF=135;TCR=92;TR=227;WE=64418908;WS=64418890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr11	64480308	rs2666560	C	T	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=24;PP=958;SC=AGCCCTGGAGCGCTCGCACCC;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=64480316;WS=64480298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	64480641	rs2518907	G	A	2569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=44;PP=2092;SC=TGGCCAAGAGGCCGCGGAAGG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=45;TCR=44;TR=89;WE=64480649;WS=64480631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr11	64494978	rs34854951	AT	A	30.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQRankSum=-0.180;QD=4.40;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr11	64496587	rs559977	T	C	4082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=105;PP=2965;SC=CGCAGGCTTGTGCCCCCCTAC;SOR=2.127;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=35;TCR=105;TR=140;WE=64496595;WS=64496577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr11	64497161	rs534221	C	T	4354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=45;PP=2965;SC=CCCACCAAAACAGTAACTCTC;SOR=1.461;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=88;TCR=45;TR=133;WE=64497169;WS=64497151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr11	64497189	rs533515	A	C	5281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.63;SOR=1.004;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr11	64503179	rs553618	A	G	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=26;PP=987;SC=GAGGCAGGGGAAGCCCAGAGC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=34;WE=64503187;WS=64503169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	64503496	rs556356	A	G	3183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.528;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.206;NF=29;NR=86;PP=2909;ReadPosRankSum=-0.057;SC=CCCTGCCCACAGCCACAGAGC;SOR=2.899;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=30;TCR=87;TR=115;WE=64503504;WS=64503485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,106:0.98:108
chr11	64503543	rs33956572	CT	C	2261.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=56;PP=2526;SC=CACAGCTCAGCTCAGAGCTCG;SOR=6.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=0;TCR=58;TR=56;WE=64503551;WS=64503533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	64507315	rs550930	T	C	3804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=94;PP=2965;SC=AGCACCTTGCTGGCCTCTCCC;SOR=2.321;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=31;TCR=94;TR=125;WE=64507323;WS=64507305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr11	64507680	rs547280	A	C	9357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=127;NR=165;PP=2965;SC=CATGCGCATGACTCGTGGCCC;SOR=1.037;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=294;TCF=128;TCR=166;TR=292;WE=64507688;WS=64507670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr11	64507799	rs546323	G	C	4719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=93;PP=2965;SC=CATCTCCCCCGACCCCGTCAT;SOR=1.560;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=50;TCR=93;TR=142;WE=64507807;WS=64507789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr11	64510898	rs2904961	C	T	3358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=39;PP=2950;SC=GGCGTCCTGCCCGCCTCGCCC;SOR=1.190;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=61;TCR=39;TR=100;WE=64510906;WS=64510888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr11	64511050	rs2073797	G	C	5738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=98;NR=64;PP=2965;SC=CGGGAAGCCTGAGCCTGGGAA;SOR=1.159;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=98;TCR=64;TR=162;WE=64511058;WS=64511040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr11	64519209	.	G	A	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.688;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=28;PP=639;ReadPosRankSum=0.227;SC=CTGGGACACCGTAGGCCTGAC;SOR=0.572;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=9;TCR=66;TR=32;WE=64519217;WS=64519199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,33:0.42:78
chr11	64519926	rs114138772	G	C	3627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.446;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=68;PP=2865;ReadPosRankSum=1.856;SC=CCACAAAGGAGAGCAGTTTGC;SOR=0.654;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=259;TCF=134;TCR=125;TR=138;WE=64519934;WS=64519916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,141:0.53:266
chr11	64520942	rs2959652	G	T	3610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=35;PP=2906;SC=ACAGAGGCGTGGAGTGGGTGG;SOR=1.761;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=74;TCR=35;TR=109;WE=64520950;WS=64520932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	64522066	rs625172	A	G	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=7;PP=560;SC=CCCAGTCTCCACTCCCTTATC;SOR=1.893;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=25;WE=64522074;WS=64522056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	64525216	rs589691	C	T	4072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=94;NR=29;PP=2965;SC=CCCTCCCCTTCTCTGGGCTCC;SOR=2.229;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=95;TCR=29;TR=123;WE=64525224;WS=64525206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr11	64525464	rs490980	C	T	2757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=62;PP=2181;SC=GGGTGGGGGCCGTGGGCCGGT;SOR=2.330;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=21;TCR=62;TR=83;WE=64525472;WS=64525454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr11	64525644	rs489192	G	T	1807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=6;PP=1413;SC=TTCGGACCTTGCCAGAGATGA;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=43;TCR=6;TR=49;WE=64525652;WS=64525634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	64535357	rs575375	T	C	8713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=178;PP=2965;SC=TGCCTGCGCCTCCTAGTGGCA;SOR=1.524;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=271;TCF=93;TCR=178;TR=271;WE=64535365;WS=64535347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr11	64535849	rs561158	C	T	3124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=87;PP=2677;SC=ATGGAAAGTTCTGAAGAATTC;SOR=5.046;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=92;TCF=5;TCR=87;TR=92;WE=64535857;WS=64535839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr11	64536866	rs484886	T	C	6363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=86;NR=99;PP=2965;SC=AGGTTTCTGCTAGGAGGCTTC;SOR=0.874;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=187;TCF=88;TCR=99;TR=185;WE=64536874;WS=64536856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr11	64540800	rs77231260	T	C	1496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.968;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=8;PP=1186;ReadPosRankSum=0.524;SC=ACAGTCGTCATACTATGATTT;SOR=1.318;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=98;TCF=82;TCR=16;TR=55;WE=64540808;WS=64540790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,56:0.58:97
chr11	64563934	rs483544	A	G	9240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=151;NR=124;PP=2965;SC=GCCCCTGCGGACCCTGCCTCC;SOR=0.947;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=276;TCF=152;TCR=124;TR=275;WE=64563942;WS=64563924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr11	64572018	rs2959656	T	C	5190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=118;PP=2965;SC=GGTGATGCTGTGGGTGCTGGC;SOR=1.759;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=171;TCF=53;TCR=118;TR=171;WE=64572026;WS=64572008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr11	64572403	rs654440	C	G	2353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=29;PP=1813;SC=CATCGGCACCCAAGGGGATGG;SOR=1.108;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=45;TCR=29;TR=74;WE=64572411;WS=64572393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	64572557	rs540012	A	G	2905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=64;PP=2427;SC=CCCAGCCCACATGCAGCACAG;SOR=1.585;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=32;TCR=65;TR=96;WE=64572565;WS=64572547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr11	64591972	rs10792447	T	C	7287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=157;NR=64;PP=2965;SC=ATTCAGGGGATAGGGGGAGGC;SOR=1.905;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=221;TCF=157;TCR=64;TR=221;WE=64591980;WS=64591962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr11	64594490	rs646709	A	G	1400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=4;PP=1376;SC=AGCCTCACCAAAGTGGCTTGT;SOR=4.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=47;WE=64594498;WS=64594480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	64596916	rs10897529	C	T	2436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=10.911;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=3;PP=2009;ReadPosRankSum=1.475;SC=TGCCTGGCCCCCCTGCCAAGC;SOR=4.887;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=71;TCF=67;TCR=4;TR=70;WE=64596924;WS=64596906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr11	64597506	rs3741395	T	C	9518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=197;PP=2965;SC=CAAGGTCAGCTGCTGCACGCG;SOR=1.332;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=315;TCF=118;TCR=197;TR=313;WE=64597514;WS=64597496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr11	64598944	rs684071	A	G	5869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=140;NR=29;PP=2965;SC=CGCAGGCCTGAACTGCTTCCT;SOR=3.037;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=140;TCR=29;TR=169;WE=64598952;WS=64598934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr11	64602782	rs11605623	C	T	14199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=455;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=298;NR=150;PP=2965;SC=TTGCCTTGTCCGTCTGTTGTA;SOR=1.578;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=448;TCF=298;TCR=150;TR=448;WE=64602790;WS=64602772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,454:1.00:454
chr11	64603844	rs138577794	A	ACTCACCCAC	5892.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=42;NR=40;PP=2424;SC=GCCCAGGGCCACTCACCCACC;SOR=1.225;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=173;TCF=91;TCR=82;TR=82;WE=64603869;WS=64603834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr11	64604178	rs2904960	T	C	116.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	64605689	rs541525	A	G	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=12;PP=496;SC=CCCGAGGCCCAAGGCCCAGGA;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=22;WE=64605697;WS=64605679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	64606765	rs676977	T	C	3626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=94;PP=2965;SC=GACTGCTGGCTCCTCGCGATG;SOR=4.174;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=11;TCR=94;TR=105;WE=64606773;WS=64606755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr11	64606910	rs142726755	C	CCTGCTCCCA	3747.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=5;PP=2900;SC=GCTTGGCCCGCCTTGTATCCC;SOR=2.406;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=43;WE=64606918;WS=64606900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	64607024	rs78269641	C	T	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.710;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=37;PP=1319;ReadPosRankSum=-0.421;SC=TCCAGCAGGACGTTGTCTGGC;SOR=0.425;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=237;TCF=136;TCR=101;TR=79;WE=64607032;WS=64607014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,80:0.33:239
chr11	64621856	rs3897618	A	G	9592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=259;NR=66;PP=2965;SC=GCAGGTCGGCAGGCAGCTCGT;SOR=2.698;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=326;TCF=260;TCR=66;TR=325;WE=64621864;WS=64621846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,338:1.00:338
chr11	64622869	rs10897533	G	C	4134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=58;PP=2965;SC=AGATCTCTCCGAGGTTGTTCA;SOR=0.994;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=133;TCF=75;TCR=58;TR=133;WE=64622877;WS=64622859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr11	64645871	rs1211284	A	G	8492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=177;PP=2965;SC=GCAGCCCCTCAGCCACCGTCT;SOR=1.423;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=279;TCF=101;TCR=178;TR=278;WE=64645879;WS=64645861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr11	64658623	rs139493589	G	A	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.297;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=17;PP=1242;ReadPosRankSum=0.764;SC=GCATTGAGGCGAACATACCTG;SOR=1.476;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=103;TCF=67;TCR=36;TR=59;WE=64658631;WS=64658613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,59:0.57:103
chr11	64664774	rs658006	C	T	2605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=14;PP=2053;SC=AGAGGAGAAACTGAGGCCCTG;SOR=3.098;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=68;TCR=14;TR=81;WE=64664782;WS=64664764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	64669417	rs682673	T	C	3452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=9;PP=2935;SC=AACTGGTCCATCCCTCCCACC;SOR=4.575;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=94;TCR=9;TR=103;WE=64669425;WS=64669407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr11	64677293	rs656195	G	C	4706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=66;PP=2965;SC=CCAGGGGTCCGGCTCAGGCCG;SOR=0.948;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=81;TCR=66;TR=147;WE=64677301;WS=64677283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr11	64678920	rs638583	T	C	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=18;PP=555;SC=AGACCAGGCCTTCTGCCCAGG;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=64678928;WS=64678910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	64680407	rs594820	G	C	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=4;PP=921;SC=AGTAAATCCCGCACTTGACAT;SOR=3.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=34;WE=64680415;WS=64680397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	64680819	rs618006	G	A	2517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=76;PP=2156;SC=GCTGATGCACGTCCACCGGCG;SOR=5.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=79;TCF=3;TCR=76;TR=79;WE=64680827;WS=64680809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	64695185	.	GA	G	126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=0.000;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=6.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.000;QD=0.93;ReadPosRankSum=0.460;SOR=0.164;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,29:0.21:136
chr11	64700767	rs675090	G	A	2000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=54;PP=1694;SC=GCAGGGAGGAGTCAGACCCCC;SOR=4.514;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=4;TCR=54;TR=58;WE=64700775;WS=64700757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	64702200	rs673995	C	T	10493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=228;NR=99;PP=2965;SC=CCCACCAGAACGTCAAGCCCT;SOR=1.742;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=328;TCF=228;TCR=100;TR=327;WE=64702208;WS=64702190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,334:1.00:334
chr11	64702765	rs2307669	C	CTCTG	1536.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=15;PP=1507;SC=CCACCGTCCACTCAGCTCTTT;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=25;WE=64702773;WS=64702755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	64707978	rs586616	A	G	2774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=25;PP=2265;SC=GCTGCTCTACATATCAGAGAA;SOR=2.117;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=97;TCF=72;TCR=25;TR=95;WE=64707986;WS=64707968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	64713485	rs596321	T	G	1286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=8;PP=1040;SC=ACCGGAATCCTGACTTGTAAC;SOR=2.985;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=47;WE=64713493;WS=64713475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	64717801	.	C	CA	677.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.000;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=4.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.87;MQRankSum=-1.041;QD=9.68;ReadPosRankSum=0.358;SOR=0.120;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,57:0.81:70
chr11	64718050	rs138174447	TTTTC	T	3049.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.39;QD=41.21;SOR=7.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	64721908	rs495330	G	A	1766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=2;PP=1502;SC=GTTTCCCAGAGCCCTGGAAGG;SOR=5.670;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=52;TCF=50;TCR=2;TR=52;WE=64721916;WS=64721898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	64726701	rs602404	A	C	2753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.877;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=21;PP=2184;ReadPosRankSum=1.415;SC=GGTGAAGGTAAAGAAGAGGTG;SOR=2.167;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=64;TCR=22;TR=85;WE=64726709;WS=64726691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
chr11	64757504	rs574381	G	C	14468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=435;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=132;NR=293;PP=2965;SC=TCCGCCTGCTGTCATCCCACC;SOR=1.735;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=426;TCF=133;TCR=293;TR=425;WE=64757512;WS=64757494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,431:1.00:431
chr11	64761779	rs626670	T	C	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=3;PP=1163;SC=AGCCACAGGATCCTTTTCTCA;SOR=4.664;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=44;WE=64761787;WS=64761769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	64789194	rs664226	T	C	1327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=1;PP=1073;SC=TCCTCCCAGGTCCTGGAGCTG;SOR=5.136;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=38;WE=64789202;WS=64789184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	64799729	rs2276021	G	A	1385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.076;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=1101;ReadPosRankSum=-0.089;SC=TCTGGAAACTGTCAAGGGGCA;SOR=0.263;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=111;TCF=42;TCR=69;TR=53;WE=64799737;WS=64799719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,54:0.47:114
chr11	64808647	rs10160811	A	C	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.98;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	64808681	rs34998502	AC	A	378.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=6;PP=391;SC=GCCGCTCCCCACCCCCCGGCC;SOR=0.836;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=13;WE=64808689;WS=64808671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	64809044	rs3741390	C	T	1594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=32;PP=1166;SC=CGACATCGCCCGCGCCGAGGT;SOR=1.287;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=52;WE=64809052;WS=64809034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	64809090	rs12271134	T	G	1315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=30;PP=1025;SC=CGAGCTGTGCTCCTGGACCTG;SOR=2.419;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=39;WE=64809098;WS=64809080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	64809133	rs10792455	T	G	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=16;PP=682;SC=CCGAGGCAGCTGTGGTGCTGG;SOR=1.302;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=26;WE=64809141;WS=64809123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	64809167	rs10792456	A	G	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=9;PP=599;SC=CACGCTGCTGACCGTAGTGGC;SOR=0.963;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=13;TCR=9;TR=22;WE=64809175;WS=64809157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	64834432	rs573957	T	A	2023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=62;PP=1767;SC=CACCTCCTGCTTCAGCCACCT;SOR=5.453;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=3;TCR=62;TR=65;WE=64834440;WS=64834422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	64835332	rs200668989	C	CAGA	1267.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.138;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.071;NF=4;NR=17;PP=1559;ReadPosRankSum=-1.913;SC=CAGCAGGCCTCTCTGGGCCTC;SOR=0.280;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=12;TCR=53;TR=21;WE=64835341;WS=64835322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr11	64835333	.	T	G	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.899;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=1550;ReadPosRankSum=-1.722;SC=AGCAGGCCTCTCTGGGCCTCC;SOR=0.243;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=59;TCF=12;TCR=47;TR=20;WE=64835341;WS=64835322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,32:0.46:69
chr11	64835415	rs3850946	C	G	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.042;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=691;ReadPosRankSum=0.047;SC=GGAGAAACACCATCCACCTCC;SOR=0.148;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=66;TCF=53;TCR=13;TR=35;WE=64835423;WS=64835405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,35:0.55:64
chr11	64836207	rs12362669	C	G	1034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.411;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=36;PP=896;ReadPosRankSum=1.512;SC=GCAAGCCAGACCCCCTCAAAG;SOR=1.947;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=1;TCR=68;TR=36;WE=64836215;WS=64836197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,37:0.54:68
chr11	64846718	rs111891963	C	T	1893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.599;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=23;PP=1480;ReadPosRankSum=1.123;SC=GCTGGAGCATCTCACCCACAC;SOR=0.627;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=125;TCR=54;TR=76;WE=64846726;WS=64846708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,77:0.43:181
chr11	64851453	rs35819335	CT	C	9785.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=188;PP=2951;SC=CCAGACATAACTTAGGCTCCG;SOR=2.240;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=240;TCF=45;TCR=195;TR=232;WE=64851461;WS=64851443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr11	64856108	rs2282499	A	C	3746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.612;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=87;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.666;SC=GCACCCTCCCACTCCTGCCAC;SOR=0.708;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=374;TCF=189;TCR=185;TR=161;WE=64856116;WS=64856098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:214,159:0.43:373
chr11	64856500	rs525781	A	G	2594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=70;PP=2115;SC=TCTTGCAGCCACATCTTGCCC;SOR=4.202;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=8;TCR=71;TR=78;WE=64856508;WS=64856490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	64856540	rs77065755	C	G	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=239;ReadPosRankSum=1.218;SC=GACTTGAGAGCTGGAGCAAGC;SOR=0.199;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=15;WE=64856548;WS=64856530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr11	64856562	rs7105865	A	G	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=243;ReadPosRankSum=-1.060;SC=GGCCCTGCCCAGGAAAAGCAG;SOR=0.095;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=13;WE=64856570;WS=64856552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr11	64863969	rs61505294	TG	T	126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=127;ReadPosRankSum=0.909;SC=GCACGGGGAGTGGGGGGGTGC;SOR=0.582;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=7;WE=64863977;WS=64863959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr11	64877019	rs79069813	A	G	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.972;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=34;PP=800;ReadPosRankSum=-1.915;SC=GGGAATGCAGATGGCTGGACA;SOR=1.062;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=100;TCF=25;TCR=75;TR=42;WE=64877027;WS=64877009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,46:0.43:106
chr11	64877197	rs61736623	C	T	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.996;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=735;ReadPosRankSum=0.000;SC=CAGTGACGCCCGTGAGCACGC;SOR=0.527;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=52;TCR=18;TR=35;WE=64877205;WS=64877187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,37:0.51:72
chr11	64878661	rs625004	T	C	8587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=144;NR=125;PP=2965;SC=TATCCCTCCCTTCTTATCTGG;SOR=0.902;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=270;TCF=145;TCR=125;TR=269;WE=64878669;WS=64878651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr11	64880090	rs4930284	G	C	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=4;PP=794;SC=CGTCCCTGCCGGGGCTGGAGG;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=64880098;WS=64880080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	64880743	rs11539360	C	T	2647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.797;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=31;PP=2054;ReadPosRankSum=-0.416;SC=GGGATGTCAGCGGGGCTGCCT;SOR=0.552;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=247;TCF=186;TCR=61;TR=112;WE=64880751;WS=64880733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,112:0.45:250
chr11	64882163	rs12270532	T	C	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.096;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=806;ReadPosRankSum=-0.756;SC=GTGGAGACTATTGCCTTGTTC;SOR=0.346;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=137;TCF=98;TCR=39;TR=43;WE=64882171;WS=64882153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,44:0.32:136
chr11	64882789	rs1129195	C	T	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.315;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=358;ReadPosRankSum=0.439;SC=TCACCAGCTACTGGTTACTAC;SOR=1.081;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=82;TCF=60;TCR=22;TR=23;WE=64882797;WS=64882779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,24:0.29:83
chr11	64883864	rs1706937	A	G	3362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.686;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=47;PP=2514;ReadPosRankSum=0.716;SC=CTCAGAAACAAGCAACAGGGC;SOR=0.562;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=218;TCF=135;TCR=83;TR=122;WE=64883872;WS=64883854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,129:0.57:226
chr11	64884052	rs1546532	G	A	8502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=156;NR=94;PP=2965;SC=CGCAGTCTAGGGCCAGGGGTG;SOR=1.363;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=250;TCF=156;TCR=94;TR=250;WE=64884060;WS=64884042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr11	64889416	rs769440	G	C	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.653;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=28;PP=525;ReadPosRankSum=0.213;SC=GGCTCACGTGGGGAAGGCCAG;SOR=1.132;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=54;TCF=6;TCR=48;TR=31;WE=64889424;WS=64889406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr11	64897453	rs1206196	C	T	2648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.180;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=53;PP=2043;ReadPosRankSum=-0.307;SC=CAAGAAGAACCCAGAGAGTGG;SOR=0.573;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=200;TCF=103;TCR=97;TR=104;WE=64897461;WS=64897443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,104:0.52:201
chr11	64898357	rs11369296	G	GC	8889.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=129;NR=82;PP=2974;SC=TGGGGCCTGTGCCTGCTGTGC;SOR=1.470;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=223;TCF=134;TCR=89;TR=211;WE=64898365;WS=64898347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr11	64948277	rs3953797	A	C	2275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.155;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=19;PP=1836;ReadPosRankSum=0.366;SC=CATCCACAACATGCAAGACTG;SOR=0.799;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=240;TCF=182;TCR=58;TR=85;WE=64948285;WS=64948267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,93:0.37:249
chr11	64948555	rs12422027	A	G	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.490;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=40;PP=945;ReadPosRankSum=-1.906;SC=TGGGGGAGAGAACAGGGATGT;SOR=0.331;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=112;TCF=8;TCR=104;TR=44;WE=64948563;WS=64948545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,45:0.39:115
chr11	64950890	rs17884377	T	TC	275.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=5.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.51;MQRankSum=2.761;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.410;SOR=0.219;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,17:0.29:58
chr11	64950970	rs17583	C	T	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.099;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.06;MQRankSum=1.377;NF=38;NR=20;PP=1026;ReadPosRankSum=-0.232;SC=TGGCGGCCATCGCCTCCCTCA;SOR=0.884;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=162;TCF=102;TCR=60;TR=58;WE=64950978;WS=64950960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,58:0.35:166
chr11	64972354	rs2271450	A	T	4110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=90;PP=2965;SC=TCACCGGTGGATCTCACTGAG;SOR=1.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=35;TCR=90;TR=125;WE=64972362;WS=64972344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr11	64977424	rs2271448	C	T	5651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=117;PP=2965;SC=CATGCAGGTGCGGGCCGGGCA;SOR=1.209;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=190;TCF=73;TCR=117;TR=189;WE=64977432;WS=64977414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr11	64977937	rs542380	A	G	8226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=197;PP=2965;SC=AGTGTCCCCAACTGCCTCCCA;SOR=2.698;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=246;TCF=49;TCR=197;TR=246;WE=64977945;WS=64977927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr11	64981522	rs11605576	C	A	8019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=127;NR=130;PP=2965;SC=CACACTGAGGCCTCCACCAAC;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=257;TCF=127;TCR=130;TR=257;WE=64981530;WS=64981512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr11	64981587	rs11605632	G	A	6794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=136;PP=2965;SC=TGGGGCCCCTGAGCCCTGCCG;SOR=1.475;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=211;TCF=75;TCR=136;TR=210;WE=64981595;WS=64981577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr11	64981837	rs12420456	C	T	2065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=50;PP=1667;SC=CGAGACCTGGCGCAGTCCGTC;SOR=2.566;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=13;TCR=50;TR=63;WE=64981845;WS=64981827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	64990002	.	C	G	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=220;ReadPosRankSum=0.529;SC=GTTAGCTGTACAGAATCTGCA;SOR=0.836;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=13;WE=64990010;WS=64989992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr11	64990041	rs514076	G	C	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.66;SOR=2.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	64993195	rs10633296	C	CAGTA	6501.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=96;PP=2957;SC=CTTCTGGAAACAGCAAAAGCC;SOR=2.239;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=125;TCF=18;TCR=107;TR=111;WE=64993203;WS=64993185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr11	65000478	rs2904978	C	T	1174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=0;PP=978;SC=CTTAGGAGACCGTGAAGGGGT;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=65000486;WS=65000468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	65000719	rs2904979	C	T	5289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=139;PP=2965;SC=ATCATCAACACCCCGGCCATG;SOR=2.756;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=34;TCR=139;TR=173;WE=65000727;WS=65000709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr11	65003812	rs625427	T	C	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=6;PP=968;SC=GGCTCCACCCTTCTCCACTAC;SOR=2.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=65003820;WS=65003802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	65004301	rs2904982	G	T	8679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=117;NR=150;PP=2965;SC=GGCCGTCTGCGTCCTGACCGA;SOR=1.032;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=268;TCF=118;TCR=150;TR=267;WE=65004309;WS=65004291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr11	65004386	rs56657874	C	T	4391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=106;PP=2965;SC=ACCAAGAGGCCGAAAGTTACA;SOR=2.670;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=136;TCF=29;TCR=107;TR=135;WE=65004394;WS=65004376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr11	65061841	.	C	T	3164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-9.183;ClippingRankSum=0.000;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=95;PP=2635;ReadPosRankSum=-1.531;SC=GGTGTGCGTACAGCCTGAATC;SOR=0.722;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=20;TCR=137;TR=109;WE=65061849;WS=65061831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,110:0.69:159
chr11	65118971	rs620888	T	C	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=1;PP=516;SC=TGATATTTCATAATATTTGAA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=65118979;WS=65118961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	65143701	rs80042162	CT	C	1889.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=6;PP=1903;SC=CACAGGCCCCCTGGCTTCCGG;SOR=3.745;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=47;TCR=7;TR=47;WE=65143709;WS=65143691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	65144075	rs624307	T	C	11178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=388;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=169;NR=201;PP=2965;SC=GACTTGATCATGTCTAAGGGC;SOR=0.856;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=371;TCF=170;TCR=201;TR=370;WE=65144083;WS=65144065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,381:1.00:381
chr11	65147294	rs547221	G	A	6172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=135;NR=62;PP=2965;SC=AGCCCCAGATGCCTCCCCGAA;SOR=1.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=198;TCF=135;TCR=63;TR=197;WE=65147302;WS=65147284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr11	65147862	rs573864	C	G	1327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=8;PP=1092;SC=GGACAAGGGACTAAGACCCCA;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=37;WE=65147870;WS=65147852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	65154735	.	C	CA	2086.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.095;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=56;PP=2482;ReadPosRankSum=-0.470;SC=GTGGAAAACTCACAGAAGTCA;SOR=1.559;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=93;TCF=3;TCR=90;TR=57;WE=65154743;WS=65154725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,64:0.72:89
chr11	65161129	rs2073800	C	T	8009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=159;NR=98;PP=2965;SC=GTGCCCCAGACGATGACGTGG;SOR=1.240;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=257;TCF=159;TCR=98;TR=257;WE=65161137;WS=65161119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr11	65178620	rs2957274	G	A	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=2;PP=227;SC=GGAAGGAGCCGTCGCGCTGGA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=65178628;WS=65178610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	65211940	rs550894	C	A	3975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.534;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=76;PP=2962;ReadPosRankSum=1.042;SC=CCCATCTGGACCCTGCTGGGC;SOR=0.434;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=266;TCF=123;TCR=143;TR=150;WE=65211948;WS=65211930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,151:0.56:272
chr11	65222952	rs1784858	T	C	3934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.339;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=101;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.758;SC=AAGATAAGGTTGTGCTTCTGG;SOR=0.895;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=280;TCF=103;TCR=177;TR=156;WE=65222960;WS=65222942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,161:0.55:291
chr11	65266169	rs619586	A	G	6674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=8.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=447;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.464;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=131;NR=114;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.638;SC=AACTATACCTACTGTCCCTCA;SOR=0.759;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=429;TCF=222;TCR=207;TR=245;WE=65266177;WS=65266159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,248:0.56:442
chr11	65267278	.	CAAA	C	2148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.063;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.263;NF=33;NR=15;PP=1694;ReadPosRankSum=-1.068;SC=AGCTAGGAAACAAAAAGCTAA;SOR=1.773;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=118;TCF=68;TCR=50;TR=48;WE=65267288;WS=65267268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,58:0.45:130
chr11	65269349	rs664589	C	G	2513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.251;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=49;PP=1931;ReadPosRankSum=-0.871;SC=TGGCAGTGGCCTGTTACGGTT;SOR=0.560;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=165;TCF=87;TCR=78;TR=101;WE=65269357;WS=65269339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,102:0.61:166
chr11	65305309	rs56076708	G	T	2042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-6.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=7;PP=1696;ReadPosRankSum=-0.111;SC=TGGCCCAGCAGGACGACTGGA;SOR=0.679;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=113;TCF=103;TCR=10;TR=75;WE=65305317;WS=65305299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,75:0.67:112
chr11	65308174	rs147365999	C	CGGGCGGGGCCTACAGGAG	1891.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=1.262;QD=25.56;ReadPosRankSum=-0.306;SOR=0.548;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,42:0.57:74
chr11	65320780	rs4244811	G	A	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.845;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=480;ReadPosRankSum=-0.039;SC=ACTGGGGAGGGGCACAGCAGA;SOR=0.540;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=33;TCR=64;TR=31;WE=65320788;WS=65320770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,33:0.33:100
chr11	65338944	rs2236684	T	G	3792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=71;PP=2962;ReadPosRankSum=1.372;SC=GCTCTCGACCTGCGCCCCAGC;SOR=0.662;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=232;TCF=117;TCR=115;TR=144;WE=65338952;WS=65338934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,149:0.63:237
chr11	65340135	rs10896017	C	T	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.632;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=90;ReadPosRankSum=-1.248;SC=CGCGCCGGCCCCGGCCATGAA;SOR=0.180;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=6;WE=65340143;WS=65340125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr11	65347636	rs1194100	G	C	4919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=52;PP=2965;SC=CCAAGTCCCAGTGAGGCTGCG;SOR=1.517;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=152;TCF=100;TCR=52;TR=150;WE=65347644;WS=65347626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr11	65348725	rs79021529	G	A	3242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-6.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.935;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=69;PP=2564;ReadPosRankSum=1.759;SC=CAGCCCCTGTGAGTGCTCCTG;SOR=0.704;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=342;TCF=170;TCR=172;TR=133;WE=65348733;WS=65348715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,133:0.39:345
chr11	65349063	rs3741380	G	A	3341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=46;PP=2624;SC=CCTCGGCTCCGGAAAGGCTCT;SOR=0.795;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=48;TCR=46;TR=93;WE=65349071;WS=65349053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr11	65349756	rs6591182	T	G	3499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=56;PP=2961;SC=AGGCCCCAGGTGAGCAGCTGG;SOR=0.876;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=47;TCR=56;TR=103;WE=65349764;WS=65349746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	65349849	rs1194099	A	T	3411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=44;PP=2771;SC=GGTTCAGGGGACCTGGAAACA;SOR=1.109;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=112;TCF=68;TCR=44;TR=108;WE=65349857;WS=65349839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr11	65357697	rs1151503	A	G	1859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=53;PP=1629;SC=GCATACATCTAGGGATCCCTT;SOR=5.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=56;TCF=3;TCR=53;TR=56;WE=65357705;WS=65357687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	65359625	rs4261292	C	G	5000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=129;PP=2965;SC=CAGAGGGCTGCGTGTGGACCC;SOR=3.640;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=18;TCR=129;TR=147;WE=65359633;WS=65359615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr11	65373621	rs1151527	A	G	2080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=49;PP=1566;SC=CAGGCTTCAGAGATAAACTTT;SOR=2.939;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=11;TCR=49;TR=60;WE=65373629;WS=65373611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	65380916	rs2004649	G	A	14263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=470;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQ=59.98;NF=165;NR=287;PP=2965;SC=GGGGCGGGCCGCCACCCCGAG;SOR=1.338;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=457;TCF=166;TCR=291;TR=452;WE=65380924;WS=65380906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,461:1.00:461
chr11	65383896	rs7947140	G	C	14034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=436;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=194;NR=225;PP=2965;SC=ACCTCTATGTGTGGATCTTCC;SOR=0.862;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=420;TCF=195;TCR=225;TR=419;WE=65383904;WS=65383886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,432:1.00:432
chr11	65385606	rs1151489	A	G	5661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=68;PP=2965;SC=ACCCTGACCCAGCCTGACCGG;SOR=1.452;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=189;TCF=121;TCR=68;TR=188;WE=65385614;WS=65385596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr11	65386404	rs200692281	A	C	1809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.673;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=54;PP=1364;ReadPosRankSum=0.802;SC=TGCAAGGCAGAGCTGGAGGCC;SOR=0.774;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=143;TCF=41;TCR=102;TR=75;WE=65386412;WS=65386394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,79:0.54:147
chr11	65387378	rs61744384	T	A	8638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.192;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=190;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.810;SC=CTGAGGGTGCTGTGCACTATT;SOR=1.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=270;TCF=80;TCR=190;TR=269;WE=65387386;WS=65387368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,270:1.00:271
chr11	65389890	rs11227241	G	C	3336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=78;PP=2801;SC=CTGGACCTTGGCTCCCCAGAC;SOR=2.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=24;TCR=78;TR=102;WE=65389898;WS=65389880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr11	65394322	rs10896024	A	G	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=3;PP=477;SC=GGACTTCCTCAGGGAAGGCAG;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=65394330;WS=65394312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	65412467	rs2306364	G	A	1628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.288;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=30;PP=1255;ReadPosRankSum=-1.461;SC=ACTGCCGGGCGGGCCAGGGCT;SOR=0.576;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=81;TCR=65;TR=66;WE=65412475;WS=65412457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,68:0.45:150
chr11	65415028	rs4930157	T	G	2964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=74;PP=2548;SC=GCGGCCAGACTCTGCCCAGCC;SOR=3.334;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=16;TCR=75;TR=90;WE=65415036;WS=65415018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
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chr11	65423082	rs1144792	G	A	2049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=7;PP=1688;SC=ATGGGGCCCAGGAGTCTTCAT;SOR=3.841;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=53;TCR=7;TR=59;WE=65423090;WS=65423072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	65480090	rs2236682	G	T	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=25;ReadPosRankSum=-1.071;SC=GGCCTGGAAAGGGGTGGCACT;SOR=0.489;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=98;TCF=37;TCR=61;TR=43;WE=65480098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,48:0.44:109
chr11	65480768	rs4244812	A	G	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-7.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.058;HP=4;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=0;PP=782;ReadPosRankSum=-1.425;SC=CCCCTTCCCCATCCCACTGCC;SOR=1.680;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=90;TCF=89;TCR=1;TR=46;WE=65480776;WS=65480758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,46:0.51:91
chr11	65480791	rs551115	A	G	4420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=117;NR=6;PP=2965;SC=CCCCGCCCCAAAGGAAGACCC;SOR=5.736;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=117;TCR=6;TR=123;WE=65480799;WS=65480781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr11	65481166	rs1151500	T	C	2431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FS=1.572;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.11;ReadPosRankSum=0.161;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:168,99:0.37:267
chr11	65481465	rs487264	T	G	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.389;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=367;ReadPosRankSum=0.364;SC=GGCAGAACATTGTTCAAATGA;SOR=1.426;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=18;WE=65481473;WS=65481455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
chr11	65484569	rs563427	A	G	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=418;ReadPosRankSum=0.133;SC=CTCTAGGGGAACCAGCCAGAA;SOR=0.948;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=21;WE=65484577;WS=65484559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,21:0.38:56
chr11	65548108	rs76925283	C	T	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=448;ReadPosRankSum=-0.830;SC=ACCCTCAGGCCGCAGCCACCG;SOR=1.284;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=21;WE=65548116;WS=65548098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr11	65554680	rs10896044	C	G	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.033;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=2;PP=551;ReadPosRankSum=-0.078;SC=GGTGGAACCGCCGCGCGCCGT;SOR=0.144;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=48;TCF=46;TCR=2;TR=27;WE=65554688;WS=65554677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr11	65561468	rs644740	C	T	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.610;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=515;ReadPosRankSum=-0.561;SC=CTCTCTTCTCCACCAAGCCTC;SOR=0.116;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=23;WE=65561476;WS=65561458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr11	65562257	rs2276133	G	A	2439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.277;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=79;PP=2127;ReadPosRankSum=0.685;SC=GCGGCCGTGCGGGAAAAGTCC;SOR=2.449;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=121;TCF=10;TCR=111;TR=84;WE=65562265;WS=65562247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,82:0.68:121
chr11	65562852	rs72922786	G	C	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=367;ReadPosRankSum=0.380;SC=AGCCCCAAGAGCATCCAGGAT;SOR=0.906;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=16;WE=65562860;WS=65562842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr11	65601466	rs59416249	C	T	1389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.653;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=3;PP=1137;ReadPosRankSum=-2.163;SC=CGGTCAGTTCCTCGGGCGAGT;SOR=1.164;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=80;TCF=74;TCR=6;TR=48;WE=65601474;WS=65601456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,48:0.59:81
chr11	65601560	rs17854357	G	C	2501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.619;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=36;PP=1884;ReadPosRankSum=1.436;SC=CGGAGGTTGGGAAGGAGGGCA;SOR=0.437;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=237;TCF=160;TCR=77;TR=101;WE=65601568;WS=65601550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,102:0.42:243
chr11	65617113	rs11327250	AG	A	7047.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=64;PP=2969;SC=GGCCTCCCCCAGGGGGTGGTA;SOR=1.721;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=201;TCF=135;TCR=66;TR=187;WE=65617121;WS=65617103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr11	65623739	rs11227332	A	G	10216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.054;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=170;NR=176;PP=2965;ReadPosRankSum=1.292;SC=CGTATACGTCAAGAAAAGGAT;SOR=0.235;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=350;TCF=171;TCR=179;TR=346;WE=65623747;WS=65623729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,353:0.99:357
chr11	65630098	rs3216088	T	TG	4197.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.275;NF=15;NR=101;PP=2818;ReadPosRankSum=-0.417;SC=CTGTTGAGATTGGGGGGGGTG;SOR=1.243;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=143;TCF=20;TCR=123;TR=116;WE=65630106;WS=65630088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,149:0.98:152
chr11	65632507	rs61754785	G	A	4844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.091;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=131;NR=43;PP=2962;ReadPosRankSum=1.062;SC=CTACGCAGCCGCCCCTGGGGA;SOR=0.406;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=278;TCF=217;TCR=61;TR=174;WE=65632515;WS=65632497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,182:0.63:290
chr11	65636053	rs601314	T	C	5062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=119;PP=2965;SC=GGCTCGTTGATGCAGCGGTAC;SOR=1.749;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=55;TCR=119;TR=174;WE=65636061;WS=65636043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr11	65637273	rs501630	A	G	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=7;PP=899;ReadPosRankSum=0.820;SC=GAGGCACGGCATAGCTAGGGC;SOR=0.619;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=76;TCR=11;TR=54;WE=65637281;WS=65637263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,57:0.63:90
chr11	65637984	rs630394	C	G	1560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=7.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.929;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=8;PP=1275;ReadPosRankSum=0.911;SC=GCCGGGACTACAGAAGCTGCT;SOR=0.565;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=144;TCF=124;TCR=20;TR=55;WE=65637992;WS=65637974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,58:0.40:146
chr11	65639374	rs2234458	C	T	2527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.756;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=24;PP=2059;ReadPosRankSum=1.934;SC=TGGGGCTGTCCCTTGGAAAGC;SOR=0.565;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=139;TCF=103;TCR=36;TR=86;WE=65639382;WS=65639364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,88:0.63:140
chr11	65647260	rs658524	A	G	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=535;ReadPosRankSum=0.293;SC=CTCCAGCCCCACCCTCACACC;SOR=0.555;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=30;WE=65647268;WS=65647250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,31:0.70:44
chr11	65647796	rs201535604	CT	C	1560.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FS=1.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQRankSum=0.026;QD=8.72;ReadPosRankSum=0.973;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,94:0.53:179
chr11	65649774	rs604630	A	G	10645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=225;NR=133;PP=2965;SC=GAAGGTGGCCAGCGCCATCTC;SOR=1.298;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=358;TCF=225;TCR=133;TR=358;WE=65649782;WS=65649764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,369:1.00:369
chr11	65649984	rs687672	T	C	5536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=404;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=109;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.907;SC=ATTTTGTGGATGTCTCCGTGC;SOR=0.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=388;TCF=200;TCR=188;TR=226;WE=65649992;WS=65649974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,232:0.58:399
chr11	65650515	rs35461885	G	T	3005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=36;PP=2293;ReadPosRankSum=0.070;SC=ACATGCCAAGGGTCTGATGAT;SOR=0.657;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=124;TCR=57;TR=114;WE=65650523;WS=65650505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,119:0.64:187
chr11	65651830	rs658938	A	G	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.551;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=5;PP=863;ReadPosRankSum=-1.445;SC=GCTGGGGCAAAGCCAAGCTGG;SOR=0.470;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=58;TCF=51;TCR=7;TR=36;WE=65651838;WS=65651820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,35:0.62:56
chr11	65653242	rs568617	C	T	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.973;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=216;ReadPosRankSum=0.382;SC=CTCTCTGCCTCAAGTCACTGT;SOR=0.050;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=12;WE=65653250;WS=65653232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr11	65655259	rs2308217	G	GCC	5728.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.244;NF=63;NR=59;PP=2974;ReadPosRankSum=-0.608;SC=GTCTGGCGGGGCCTAGCAGGG;SOR=0.691;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=245;TCF=126;TCR=119;TR=122;WE=65655267;WS=65655249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,148:0.57:261
chr11	65655393	rs641018	G	C	2740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-5.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.462;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=62;PP=2203;ReadPosRankSum=0.811;SC=CACCATCCCAGAGGGTGAGCA;SOR=0.754;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=253;TCF=111;TCR=142;TR=108;WE=65655401;WS=65655383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,110:0.42:260
chr11	65661656	rs507062	T	C	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.582;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=29;PP=519;ReadPosRankSum=0.265;SC=TCGCCCCTCATGGTGGCCCAG;SOR=1.332;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=106;TCF=32;TCR=74;TR=38;WE=65661664;WS=65661646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,40:0.37:108
chr11	65664346	rs637571	T	C	3692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=19;PP=2965;SC=CTGGCCGGGGTTGTGGGGGGC;SOR=3.066;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=91;TCR=19;TR=110;WE=65664354;WS=65664336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr11	65667796	rs1058068	G	A	2454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=16;PP=2244;SC=CGGGTTCCCCGAAGTCTCGGA;SOR=2.743;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=61;TCR=16;TR=77;WE=65667804;WS=65667786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	65684929	rs9667389	C	T	2237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=4;PP=1823;ReadPosRankSum=1.069;SC=ATTTGGCCCCCCTAGGTCAGT;SOR=3.321;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=59;TCR=4;TR=61;WE=65684937;WS=65684919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr11	65685225	rs7947504	T	C	8479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=206;PP=2965;SC=CACCTGAAGCTGGCCTTCAAC;SOR=2.047;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=289;TCF=83;TCR=206;TR=289;WE=65685233;WS=65685215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr11	65713207	rs9795469	T	C	7468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.658;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=141;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.797;SC=CCCGTCGGTGTGACCAGGGCA;SOR=0.703;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=248;TCF=107;TCR=141;TR=247;WE=65713215;WS=65713197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,259:1.00:260
chr11	65714281	rs117754316	C	A	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=189;ReadPosRankSum=-1.931;SC=GAGGGAGCACCCGGGTGAGGT;SOR=0.336;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=10;WE=65714289;WS=65714271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr11	65727301	rs491973	A	G	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=5;PP=988;SC=CCACAGGTCAATGGGGGTGAG;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=36;WE=65727309;WS=65727291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	65732651	rs550435	G	A	3161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.829;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=28;PP=2600;ReadPosRankSum=-0.261;SC=AGAAGCTGGCGGCTGCCAAGG;SOR=1.876;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=102;TCF=72;TCR=30;TR=99;WE=65732659;WS=65732641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,102:0.97:105
chr11	65732800	rs552130	T	C	6547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=104;PP=2965;SC=GCATCACTTTTTCCCCTCTTC;SOR=0.884;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=89;TCR=105;TR=192;WE=65732808;WS=65732790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr11	65733289	rs556643	G	A	6592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=140;NR=55;PP=2965;SC=GACACTGGTGGCCTTGCTACC;SOR=1.923;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=197;TCF=140;TCR=57;TR=195;WE=65733297;WS=65733279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr11	65734539	rs1151505	C	T	1663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=2;PP=1402;SC=ACTTAACCTCCCTGTGCCCCA;SOR=5.507;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=46;WE=65734547;WS=65734529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	65735174	rs660118	G	C	2017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=44;PP=1440;SC=CCACCGCCGGGGTCCCCGCAG;SOR=1.226;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=27;TCR=44;TR=71;WE=65735182;WS=65735164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr11	65744275	rs543952	T	C	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=24;PP=881;SC=CGTTTGGGGGTGCTCAAGCTG;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=35;WE=65744283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	65744421	rs542332	C	T	3185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=29;PP=2678;SC=CAGGTGGTGACCAGTGGGTGG;SOR=1.832;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=69;TCR=29;TR=98;WE=65744429;WS=65744411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr11	65746653	rs679581	A	G	1872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=57;PP=1551;SC=AGACCTGGCCATCAAATGACA;SOR=8.155;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=0;TCR=57;TR=57;WE=65746661;WS=65746643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	65767153	rs507672	A	G	2906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=41;PP=2207;SC=TCCCCTGTAGATAAGAAGAGA;SOR=0.919;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=49;TCR=41;TR=90;WE=65767161;WS=65767143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr11	65767215	rs506873	G	T	2123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=44;PP=1612;SC=CCATAGGAAGGGGTTCTATCT;SOR=1.418;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=68;TCF=24;TCR=44;TR=67;WE=65767223;WS=65767205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	65771050	rs147010511	TCACTGAG	T	3995.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=20;PP=2977;SC=CTCTTATCTCTCACTGAGCAC;SOR=1.508;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=80;TCF=52;TCR=28;TR=63;WE=65771064;WS=65771040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	65780702	rs9667817	A	G	1824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=11;PP=1580;SC=GGCCTGGAGCAGCCTGGCAGG;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=53;TCR=11;TR=64;WE=65780710;WS=65780692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	65788072	rs3814747	C	T	11300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=183;NR=176;PP=2965;SC=ATGTAAATTACGAGGATGGGA;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=359;TCF=183;TCR=176;TR=359;WE=65788080;WS=65788062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,370:1.00:370
chr11	65790527	rs2845570	G	T	4258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=114;PP=2965;SC=CGCTGGAGCCGGCCGGCTGAA;SOR=3.750;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=18;TCR=115;TR=132;WE=65790535;WS=65790517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr11	65810209	rs61895584	C	T	5694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=154;PP=2965;SC=TGGGCTGCCACGGCTGCAGCT;SOR=4.370;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=172;TCF=18;TCR=154;TR=172;WE=65810217;WS=65810199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr11	65810749	rs7937692	T	C	10114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=141;NR=161;PP=2965;SC=AGGCGTTGGGTACGCGCCGGA;SOR=0.860;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=302;TCF=141;TCR=161;TR=302;WE=65810757;WS=65810739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr11	65811208	rs4930170	G	T	3017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=72;PP=2380;SC=CTTGACCCCTGCCCTTACCCA;SOR=2.808;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=17;TCR=72;TR=89;WE=65811216;WS=65811198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr11	65812703	.	C	G	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=465;ReadPosRankSum=0.082;SC=CAGGACCCTTCTAGCAGGTGG;SOR=0.502;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=48;TCF=45;TCR=3;TR=22;WE=65812711;WS=65812693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr11	65837928	rs149876307	C	G	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=94;ReadPosRankSum=0.095;SC=GGCGTCGCCTCGGCCTCCGTA;SOR=1.179;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=5;WE=65837936;WS=65837918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr11	65868310	rs475817	T	A	11662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=170;NR=192;PP=2965;SC=GAACACCTGTTATGGCCTTTC;SOR=0.855;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=362;TCF=170;TCR=192;TR=362;WE=65868318;WS=65868300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,370:1.00:370
chr11	65983522	rs548858	A	G	1165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=1;PP=918;SC=GGTCTTGTGCATTCCTTGGCT;SOR=6.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=41;WE=65983530;WS=65983518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	65985000	rs557082	A	C	4818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=49;PP=2965;SC=TAGGGACCAAACCCCTGAGAG;SOR=1.564;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=98;TCR=49;TR=147;WE=65985008;WS=65984990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr11	65997898	rs561948	A	G	937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=2;PP=775;SC=ACTTGCTTTCAGGAAAAGAAA;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=34;WE=65997906;WS=65997888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	66001211	.	C	T	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.721;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=296;ReadPosRankSum=-0.961;SC=CGGGCAGGATCCTGGCACCCC;SOR=0.549;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=62;TCF=52;TCR=10;TR=19;WE=66001219;WS=66001201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,22:0.32:69
chr11	66001560	rs375230947	C	T	2041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=2.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.74;ReadPosRankSum=0.291;SOR=0.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,54:0.44:122
chr11	66001563	rs367833902	C	T	2038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=2.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.71;ReadPosRankSum=-0.538;SOR=0.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,54:0.44:122
chr11	66001817	.	C	T	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.849;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.87;ReadPosRankSum=-0.135;SOR=0.854;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr11	66001817	.	CTC	TTT	674	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=14;PP=674;QD=51.9619910616;SC=CCCTGCAGCTCTCACCTTCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=14;WE=66001827;WS=66001807;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:32,14:0.30:46
chr11	66001819	.	C	T	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.892;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.39;ReadPosRankSum=0.459;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,15:0.33:46
chr11	66003561	.	G	A	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.746;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=345;ReadPosRankSum=-2.238;SC=AGTGTCTGGAGACGTGTTTGG;SOR=0.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=16;WE=66003569;WS=66003551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr11	66010633	rs524268	T	C	7413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=131;PP=2965;SC=CTGTCACCCCTAGTGTCCATC;SOR=1.154;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=218;TCF=87;TCR=131;TR=218;WE=66010641;WS=66010623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr11	66029130	rs572827	G	C	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=192;SC=TTCACTGGGTGCCAGAGCCCA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=66029138;WS=66029120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	66031450	rs525698	T	C	7751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=189;PP=2965;SC=CTGGGCAGGCTGGGGGTCTGG;SOR=2.081;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=261;TCF=71;TCR=190;TR=260;WE=66031458;WS=66031440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr11	66031660	rs1151539	C	T	3614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.609;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=55;PP=2948;ReadPosRankSum=1.265;SC=GGCCCGATGACCCCAATGTGG;SOR=0.565;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=241;TCF=147;TCR=94;TR=135;WE=66031668;WS=66031650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,137:0.56:243
chr11	66033301	rs474005	C	T	4626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.905;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=78;PP=2962;ReadPosRankSum=1.378;SC=CATTCACTGCCTGATGCCCCT;SOR=0.627;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=290;TCF=158;TCR=132;TR=169;WE=66033309;WS=66033291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,175:0.60:294
chr11	66036293	rs55687530	A	AC	1517.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.21;ReadPosRankSum=0.262;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:5,74:0.94:79
chr11	66040049	rs555853	G	C	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.51;ReadPosRankSum=0.203;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
chr11	66040053	rs555826	A	G	1810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=41;PP=525;SC=TTGTCTGCTTACAGGAACTAA;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=41;WE=66040061;WS=66040039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	66043253	rs55931871	T	C	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=0;PP=755;ReadPosRankSum=-0.958;SC=GCAAAATAACTTTGGCCCCTG;SOR=0.620;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=75;TCF=75;TCR=0;TR=34;WE=66043261;WS=66043243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,37:0.48:77
chr11	66050712	rs4073582	G	A	2401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.178;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=53;PP=1951;ReadPosRankSum=1.579;SC=GCCCCTGTCTGCCCCAGGTAC;SOR=0.927;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=59;TCR=85;TR=91;WE=66050720;WS=66050702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,92:0.63:147
chr11	66050948	rs3016315	C	T	2864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=19;PP=2325;SC=CCTTTTGCCCCTGAGGACTGA;SOR=2.503;Source=Platypus;TCR=19;TR=81;WE=66050956;WS=66050938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	66054823	rs510398	C	T	3523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=1;PP=2932;SC=GGGAGGGATACAGTCCAAATC;SOR=7.960;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=105;TCF=104;TCR=1;TR=104;WE=66054831;WS=66054813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr11	66059782	rs6591210	T	C	272.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=5;PP=206;SC=GCCCCCGGCGTCCCCTCATCC;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=9;WE=66059790;WS=66059772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	66063126	rs35383623	AC	A	588.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.897;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=505;ReadPosRankSum=-0.223;SC=GCTCTCTGAGACCCCCCACGG;SOR=0.236;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=51;TCF=9;TCR=42;TR=21;WE=66063134;WS=66063116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr11	66083129	rs3741367	T	C	3483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-7.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.052;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=84;PP=2703;ReadPosRankSum=-0.185;SC=CAGTGTGGGATGCGTGGCAGA;SOR=0.598;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=235;TCF=93;TCR=142;TR=142;WE=66083137;WS=66083119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,142:0.60:235
chr11	66083782	rs3741368	G	A	4348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=93;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.387;SC=CGCAGCCCCCGTTGTCAGGGC;SOR=0.692;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=263;TCF=120;TCR=143;TR=169;WE=66083790;WS=66083772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,169:0.63:267
chr11	66099987	rs1784029	C	T	11220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=249;PP=2965;SC=CAGGCCACTCCGCCCGGCGGT;SOR=2.096;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=339;TCF=89;TCR=250;TR=338;WE=66099995;WS=66099977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,343:1.00:343
chr11	66100152	rs1784030	T	C	6261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=127;PP=2965;SC=CAATCGAGGCTTCTGGGGGCA;SOR=1.514;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=194;TCF=67;TCR=127;TR=193;WE=66100160;WS=66100142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr11	66100170	rs141977246	G	C	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.639;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=42;PP=968;ReadPosRankSum=-0.517;SC=GCACGGCCAGGGTCTTGGAGG;SOR=0.770;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=54;TCR=124;TR=61;WE=66100178;WS=66100160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,60:0.34:179
chr11	66101974	rs3016317	C	T	4454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=51;PP=2965;SC=TATGGAGAGACGGAGCCTCAC;SOR=1.242;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=84;TCR=51;TR=135;WE=66101982;WS=66101964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr11	66103046	rs3016763	C	T	7387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.808;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=160;NR=77;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.825;SC=AGGAGCAGGGCCCGTGGACAC;SOR=1.482;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=238;TCF=160;TCR=78;TR=237;WE=66103054;WS=66103036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,238:1.00:239
chr11	66104057	rs3016316	T	A	2221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=68;PP=1846;ReadPosRankSum=-0.901;SC=GGGTCAGGGGTCCCCTCCATG;SOR=4.921;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=70;TCF=1;TCR=69;TR=69;WE=66104065;WS=66104047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
chr11	66105194	rs1052566	G	A	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=338;ReadPosRankSum=0.939;SC=AGGAGTCCAGGCCAGTGCCAG;SOR=0.909;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=19;WE=66105202;WS=66105184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr11	66105817	rs2276106	C	T	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=326;ReadPosRankSum=-1.613;SC=CCCTGCCCCACCCCCCACCTC;SOR=0.701;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=51;TCF=11;TCR=40;TR=19;WE=66105825;WS=66105807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr11	66107527	rs1785633	C	A	8695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.900;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=175;NR=114;PP=2965;ReadPosRankSum=1.018;SC=CCAACCCCCTCCCCTGGGTCT;SOR=0.871;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=292;TCF=176;TCR=116;TR=289;WE=66107535;WS=66107517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,296:1.00:297
chr11	66107674	rs1784035	A	G	4502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=122;PP=2965;SC=GCAGTTTGTCATCCCACCATT;SOR=3.080;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=27;TCR=122;TR=149;WE=66107682;WS=66107664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr11	66108660	rs947978	C	T	5430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=125;NR=43;PP=2965;SC=GAAGAGGGTACAGAACCACCC;SOR=2.168;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=125;TCR=43;TR=168;WE=66108668;WS=66108650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr11	66109033	rs11537993	T	C	3982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=73;PP=2962;ReadPosRankSum=0.042;SC=ACTGCTTCTCTAGGTCCAGCA;SOR=0.680;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=291;TCF=149;TCR=142;TR=149;WE=66109041;WS=66109023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,147:0.50:293
chr11	66109527	rs112182142	C	CTGTG,CTGTGTG	5437.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=75,75;NR=2,2;PP=252,2991;SC=TGTAGGGGCTCTGTGTGTGTG;SOR=6.238;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=144;TCF=135;TCR=9;TR=77,77;WE=66109535;WS=66109517;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.15,0.85:116
chr11	66109779	rs1784037	AT	GA	4179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=80;PP=2947;SC=AGGCAGCAGGATGCTGAACAC;SOR=5.806;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=4;TCR=85;TR=84;WE=66109788;WS=66109769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	66130718	rs183221431	G	A	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=195;ReadPosRankSum=-1.167;SC=TAGAATGACCGGTGGTGATTT;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=10;WE=66130726;WS=66130714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr11	66130736	rs1039593	A	G	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=0;PP=528;SC=TTTCTTCCCCACAGCACTCCA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=66130744;WS=66130726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	66131149	rs1039594	C	T	2952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=81;PP=2364;SC=CCCTTCTTTCCGGGCCTCAGT;SOR=5.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=4;TCR=81;TR=85;WE=66131157;WS=66131139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	66131906	rs7125100	A	G	2669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=72;PP=2284;SC=CTGTGGTAGAAGCTGAAGTCA;SOR=4.434;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=7;TCR=72;TR=79;WE=66131914;WS=66131896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr11	66133311	rs4930358	T	C	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=0;PP=1199;SC=TACCAGGCCATTTGGACTACC;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=41;WE=66133319;WS=66133301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	66133336	rs2279861	A	G	2005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=4;PP=1627;SC=AATCACCTCCATGCTCTTTCA;SOR=4.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=64;TCR=4;TR=68;WE=66133344;WS=66133326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	66135179	rs2279862	C	T	5465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=70;PP=2965;SC=CTCTCAGGGCCTCAGGCTCAG;SOR=1.068;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=92;TCR=70;TR=162;WE=66135187;WS=66135169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr11	66135898	rs2292123	T	C	1838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=8;PP=1491;SC=CCATATCACCTGCTTACCTCC;SOR=3.500;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=49;TCR=8;TR=57;WE=66135906;WS=66135888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	66138894	rs7946434	G	C	4177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=44;PP=2965;SC=CTACAACCCCGATCACCCCGG;SOR=1.434;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=81;TCR=44;TR=125;WE=66138902;WS=66138884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr11	66188761	rs77600363	G	T	8193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=501;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.563;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=160;NR=145;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.090;SC=AGGTCCGGCTGTCCTACCTGC;SOR=0.507;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=480;TCF=260;TCR=220;TR=305;WE=66188769;WS=66188751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,311:0.63:495
chr11	66188904	rs111442339	T	C	2388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.304;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=80;PP=1933;ReadPosRankSum=0.421;SC=GCTGGGGCTGTCGCATGTCTA;SOR=0.265;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=148;TCF=7;TCR=141;TR=85;WE=66188912;WS=66188894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,86:0.57:150
chr11	66193600	rs3215144	TG	T	172.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=120;ReadPosRankSum=-0.748;SC=TGCAGGATTTTGGGGGGGGGG;SOR=0.307;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=8;WE=66193608;WS=66193590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr11	66236431	rs57724777	G	A	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.313;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=420;ReadPosRankSum=1.084;SC=GGTCTAGTGCGCTTTCACTAA;SOR=0.990;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=34;TCF=17;TCR=17;TR=19;WE=66236439;WS=66236421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr11	66240882	rs2277302	T	C	1930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=69;PP=1450;ReadPosRankSum=-0.829;SC=CTGGCTTCGATGCCTCTAGCA;SOR=0.587;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=13;TCR=115;TR=77;WE=66240890;WS=66240872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,81:0.60:134
chr11	66241699	.	TA	T	570.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=439;ReadPosRankSum=-0.208;SC=GCTGGCAGCTTAAAAAAAATC;SOR=0.729;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=1;TCR=60;TR=26;WE=66241707;WS=66241689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr11	66247844	rs2279864	G	A	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.986;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=1;PP=771;ReadPosRankSum=-1.134;SC=CCGAGGCCAGGCAGTTGGCCA;SOR=2.636;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=61;TCF=56;TCR=5;TR=34;WE=66247852;WS=66247834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,36:0.56:64
chr11	66254085	rs11550299	G	T	2294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.946;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=57;PP=1821;ReadPosRankSum=-0.075;SC=GCCTCTGGCAGACCTGCGGGG;SOR=1.089;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=155;TCF=57;TCR=98;TR=86;WE=66254093;WS=66254075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,89:0.56:158
chr11	66255515	rs4930378	T	C	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.283;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=49;PP=949;ReadPosRankSum=-1.412;SC=TGCTCCCTCCTGGGCATTTCC;SOR=1.445;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=113;TCF=25;TCR=88;TR=59;WE=66255523;WS=66255505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,64:0.54:118
chr11	66258916	rs75546553	G	A	1320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.322;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=20;PP=1057;ReadPosRankSum=0.851;SC=CAGAGCGGGTGTGGAGGTGGG;SOR=1.113;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=125;TCF=75;TCR=50;TR=56;WE=66258924;WS=66258906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,57:0.44:129
chr11	66262806	rs10791878	T	C	3168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=36;SC=AGTGGCCACCTTAAGCCCGAC;SOR=1.352;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=60;TCR=36;TR=96;WE=66262814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr11	66263243	rs11227495	C	T	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=392;ReadPosRankSum=-1.475;SC=GTGGAGCCCCCTGGAGGCGGA;SOR=0.663;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=18;WE=66263251;WS=66263233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr11	66272142	rs1671063	A	G	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.050;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=608;ReadPosRankSum=2.874;SC=GGTATGCAACAGTCACTGATG;SOR=0.549;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=32;WE=66272150;WS=66272132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,32:0.57:56
chr11	66272237	rs2305535	G	A	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.566;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=288;ReadPosRankSum=-0.013;SC=CCCAACACTCGCCTTGAAGGT;SOR=1.104;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=16;WE=66272245;WS=66272227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr11	66277035	rs17065	G	A	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=356;ReadPosRankSum=0.446;SC=CAGGTGGCACGTGACAGCTAG;SOR=0.223;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=17;WE=66277043;WS=66277025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr11	66278059	rs1791688	C	G	1192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=4;PP=1002;SC=TTGTACTCGCCCTTCCCTGTG;SOR=4.271;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=42;TCR=4;TR=46;WE=66278067;WS=66278049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	66282095	rs2298806	G	A	5310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-7.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.815;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=125;PP=2962;ReadPosRankSum=0.671;SC=AGTTCAGCCTGCCCCAATTGC;SOR=0.813;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=347;TCF=142;TCR=205;TR=207;WE=66282103;WS=66282085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,210:0.60:352
chr11	66283257	rs2276406	C	T	3687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=6.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.886;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=63;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.647;SC=AGGAAGCAGCCGCCAGAATGT;SOR=0.523;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=241;TCF=132;TCR=109;TR=133;WE=66283265;WS=66283247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,130:0.54:239
chr11	66285268	rs10736656	G	A	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=430;ReadPosRankSum=0.476;SC=AAGAGATGGGGTCTCACCATG;SOR=1.609;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=18;WE=66285276;WS=66285258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr11	66285417	rs61618756	C	CT	542.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=13.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.06;ReadPosRankSum=1.865;SOR=2.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr11	66288733	rs10896125	G	C	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.684;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=805;ReadPosRankSum=1.953;SC=TGCGCTTCTTGTTTGCAGATG;SOR=1.743;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=62;TCF=36;TCR=26;TR=38;WE=66288741;WS=66288723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,41:0.63:65
chr11	66297363	rs3816492	C	T	2807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.568;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=47;PP=2085;ReadPosRankSum=-0.746;SC=TGCAGGCCCTCGAGTCCAGCC;SOR=0.628;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=172;TCF=97;TCR=75;TR=103;WE=66297371;WS=66297353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,108:0.60:179
chr11	66298594	rs2305532	C	T	1036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=6.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=38;PP=890;ReadPosRankSum=0.437;SC=AGGGTCAGAGCGTGCGGGTGG;SOR=0.352;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=79;TCF=3;TCR=76;TR=40;WE=66298602;WS=66298584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,39:0.50:78
chr11	66298623	rs2305533	A	C	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=27;PP=674;ReadPosRankSum=0.543;SC=TGGCCAGCAGACCTACTCTCC;SOR=0.919;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=52;TCF=4;TCR=48;TR=29;WE=66298631;WS=66298613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr11	66299515	rs8432	A	G	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=228;ReadPosRankSum=1.340;SC=CTGAGACCTGAGCTGCTGTGA;SOR=0.275;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=13;WE=66299523;WS=66299505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr11	66302724	rs12272545	A	G	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=223;ReadPosRankSum=-0.430;SC=CTTGTCACCCAGGCTGGAGTG;SOR=0.896;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=15;WE=66302732;WS=66302714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr11	66302743	rs57596493	C	T	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.207;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=280;ReadPosRankSum=-1.333;SC=TGCAGAAGCACGGTCACAGCT;SOR=1.508;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=15;WE=66302751;WS=66302733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr11	66303854	.	T	C	192	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=9;NR=1;PP=192;QD=22.6771212547;SC=ATGGTGAAACTCCATCTCTAC;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=10;WE=66303862;WS=66303853;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,10:0.67:15
chr11	66303895	rs7116940	T	C	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=575;ReadPosRankSum=-2.318;SC=GGCATGATGGTGGGTGCCTGC;SOR=2.235;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=24;WE=66303903;WS=66303885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,25:0.76:33
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chr11	66318803	rs187286120	C	T	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.569;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=37;PP=914;ReadPosRankSum=1.374;SC=CAAACTCATGCTGCTCCTGGA;SOR=0.884;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=151;TCF=41;TCR=110;TR=49;WE=66318811;WS=66318793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,47:0.32:148
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chr11	66324762	rs677488	C	T	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.966;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=27;PP=669;ReadPosRankSum=-1.152;SC=CCCTGCTAACCCCAAGCGTGG;SOR=1.280;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=3;TCR=43;TR=29;WE=66324770;WS=66324752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,30:0.61:49
chr11	66326581	rs2275998	T	C	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.102;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=244;ReadPosRankSum=-1.511;SC=GCAGAGCAAATCCCTAGGACG;SOR=2.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=11;WE=66326589;WS=66326571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr11	66327673	rs1671064	G	A	2581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.031;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=27;PP=1968;ReadPosRankSum=0.096;SC=ACCATTGACCGGCTGCAACTG;SOR=0.975;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=163;TCF=113;TCR=50;TR=96;WE=66327681;WS=66327663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,100:0.59:169
chr11	66328055	rs2229455	A	G	1520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.861;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=18;PP=1094;ReadPosRankSum=0.635;SC=GCCTGCTGACAGCGCACGATC;SOR=1.244;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=126;TCF=87;TCR=39;TR=65;WE=66328063;WS=66328045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,68:0.52:131
chr11	66328095	rs1815739	T	C	2511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.108;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=48;PP=1773;ReadPosRankSum=-0.995;SC=CGAGGCTGACTGAGAGCGAGG;SOR=0.591;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=103;TCR=87;TR=103;WE=66328103;WS=66328085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,109:0.55:198
chr11	66328719	rs618838	T	C	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=282;ReadPosRankSum=0.183;SC=GGTGCCCAGCTGTGACCAGAC;SOR=1.426;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=13;WE=66328727;WS=66328709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr11	66328741	rs2229456	A	C	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=283;ReadPosRankSum=0.231;SC=CTGCAGGAGGAGCTGGCACGG;SOR=0.582;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=16;WE=66328749;WS=66328731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr11	66329639	rs77239910	G	A	4172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.518;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=96;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.422;SC=ACTTTGACAGGGTCAGCAGGG;SOR=0.817;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=268;TCF=97;TCR=171;TR=149;WE=66329647;WS=66329629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,153:0.56:274
chr11	66329732	rs540874	A	G	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.945;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=50;PP=1212;ReadPosRankSum=0.938;SC=CTACAGAAGCAGAATGGGATG;SOR=0.997;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=116;TCF=23;TCR=93;TR=60;WE=66329740;WS=66329722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,61:0.51:119
chr11	66331458	rs572846	A	G	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-5.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=4;PP=497;ReadPosRankSum=-1.268;SC=CCCCGGACCCACGATGCAAGT;SOR=0.572;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=58;TCR=8;TR=31;WE=66331466;WS=66331448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,32:0.47:68
chr11	66333072	rs4630309	C	A	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=221;ReadPosRankSum=-1.121;SC=GTCTCCCCCCCATTATGAAGT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=12;WE=66333080;WS=66333062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr11	66333598	rs545009	C	T	4731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.200;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=84;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.747;SC=CAGGCTCTTTCCTCAGGAGAG;SOR=0.413;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=289;TCF=163;TCR=126;TR=173;WE=66333606;WS=66333588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,175:0.59:297
chr11	66335548	rs1127894	A	G	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=11.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.71;ReadPosRankSum=-4.823;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,25:0.28:89
chr11	66358126	rs486584	C	T	1787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.889;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=44;PP=1404;ReadPosRankSum=-0.264;SC=CTATCTCCTCCAGGAGGGAAA;SOR=0.554;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=192;TCF=69;TCR=123;TR=73;WE=66358134;WS=66358116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,74:0.38:196
chr11	66373305	rs1127145	G	A	1063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.818;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=33;PP=849;ReadPosRankSum=1.236;SC=AGGAGTCAGCGCAGCCCCCTG;SOR=0.177;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=73;TCF=11;TCR=62;TR=41;WE=66373313;WS=66373295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,41:0.56:73
chr11	66392880	rs11550057	C	T	2210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.757;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=62;PP=1759;ReadPosRankSum=-1.766;SC=CTTCTGCCACCCTGGCAGCTC;SOR=0.982;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=130;TCF=28;TCR=102;TR=77;WE=66392888;WS=66392870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,79:0.59:135
chr11	66406070	rs670900	A	C	5539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=106;PP=2965;SC=AGAGGATCTGAGGGAACGCCG;SOR=1.064;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=78;TCR=106;TR=184;WE=66406078;WS=66406060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr11	66438278	.	CA	C	104.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQRankSum=-0.626;QD=1.42;ReadPosRankSum=-0.494;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,20:0.27:74
chr11	66456387	rs2276138	T	C	2182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-10.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.215;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=76;ReadPosRankSum=0.882;SC=ACAGTGGCCATGGCAACCTCA;SOR=0.819;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=240;TCF=54;TCR=186;TR=98;WE=66456395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,100:0.41:246
chr11	66456738	rs140939152	ATTTC	A	2460.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.145;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.340;NF=7;NR=50;PP=2355;ReadPosRankSum=-1.207;SC=GGGACAGGTGATTTCTTTCTT;SOR=0.449;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=139;TCF=14;TCR=125;TR=57;WE=66456749;WS=66456728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,66:0.66:100
chr11	66458676	rs76228630	T	C	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.260;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=489;ReadPosRankSum=-0.219;SC=AGCTCTACCCTAGCTCCTGGG;SOR=0.276;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=48;TCF=45;TCR=3;TR=23;WE=66458684;WS=66458673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr11	66458696	rs12804382	C	T	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.152;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=487;ReadPosRankSum=0.681;SC=GAACTCTCCCCGGCATTTCCC;SOR=1.297;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=47;TCF=44;TCR=3;TR=23;WE=66458704;WS=66458686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr11	66469032	rs532439	T	C	5658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=66;PP=2965;SC=GTCAGTTTCCTGGTCCTGCCC;SOR=1.305;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=181;TCF=115;TCR=66;TR=181;WE=66469040;WS=66469022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr11	66472274	rs4930388	T	C	3644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=59;PP=2965;SC=GGCACCCGGCTCTGCACCTCG;SOR=0.787;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=53;TCR=60;TR=111;WE=66472282;WS=66472264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr11	66481264	rs615536	C	T	1156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=31;PP=905;SC=TGTGAGATCTCGAAGAGGAAG;SOR=3.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=35;WE=66481272;WS=66481254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	66483265	rs12805133	A	G	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=627;ReadPosRankSum=0.310;SC=ACACTTTTCTAAGGCCCCCCC;SOR=0.622;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=66;TCR=23;TR=34;WE=66483273;WS=66483255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,34:0.38:89
chr11	66512290	.	G	GGGCGGC	541.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=1.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.18;ReadPosRankSum=1.093;SOR=0.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,16:0.27:59
chr11	66583779	rs543191	T	G	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.921;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=497;ReadPosRankSum=-0.531;SC=GTAGAATAAATAAGTTCAGTG;SOR=2.342;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=21;WE=66583787;WS=66583769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr11	66611177	rs145986460	G	C	2792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.187;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=33;PP=2211;ReadPosRankSum=-0.685;SC=CCGGGGGCGGGTCCGTGCTCA;SOR=0.832;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=179;TCF=116;TCR=63;TR=99;WE=66611185;WS=66611167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,104:0.55:189
chr11	66627483	rs3802743	C	T	1275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.39;ReadPosRankSum=-1.717;SOR=0.640;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,53:0.51:103
chr11	66812338	rs11227668	A	G	2087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=59;PP=1759;SC=ATGCAGATGGATAGGGGGTGG;SOR=5.486;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=4;TCR=59;TR=63;WE=66812346;WS=66812328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	66833265	rs12803688	G	A	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.270;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=4;PP=649;ReadPosRankSum=-0.245;SC=AAACAACTACGCTCCACTGAC;SOR=0.107;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=70;TCF=65;TCR=5;TR=34;WE=66833273;WS=66833255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,35:0.48:73
chr11	66833327	rs12287978	G	A	2003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.377;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=15;PP=1526;ReadPosRankSum=-1.034;SC=GTGCCTCTCCGAAGCCTCCTC;SOR=1.157;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=173;TCF=133;TCR=40;TR=79;WE=66833335;WS=66833317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,81:0.46:177
chr11	66834252	rs2282502	C	T	1964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.129;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=25;PP=1412;ReadPosRankSum=1.054;SC=TCTACCCTGACGCCAGCGTCC;SOR=1.122;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=192;TCF=120;TCR=72;TR=77;WE=66834260;WS=66834242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,83:0.40:209
chr11	66837965	rs4930409	T	C	3478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=54;PP=2340;SC=GACTGACCTGTGCAAGGACAA;SOR=0.761;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=54;TCR=54;TR=108;WE=66837973;WS=66837955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr11	66995603	rs3741189	T	C	5042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=74;PP=2965;SC=CCCACCTAACTAAGGAATTTC;SOR=0.826;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=84;TCR=74;TR=158;WE=66995611;WS=66995593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr11	67017445	rs34463980	C	CA	5514.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=121;NR=6;PP=2957;SC=CCCTCTCCAACGTGACCTTTC;SOR=5.768;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=132;TCF=126;TCR=6;TR=127;WE=67017453;WS=67017435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr11	67034266	rs2228418	C	A	1994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.076;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=30;PP=1417;ReadPosRankSum=0.722;SC=GCAAGAAGATCCTGCTGCCCG;SOR=0.318;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=32;TCR=31;TR=62;WE=67034274;WS=67034256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr11	67050292	rs2071007	G	A	8087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=182;PP=2965;SC=TGACGATGGTGGGTGCAGGTC;SOR=2.421;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=238;TCF=56;TCR=182;TR=238;WE=67050300;WS=67050282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr11	67052466	rs10896164	G	A	5075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=62;PP=2965;SC=TAAGGAGCCCGTGCGGGGGTC;SOR=1.287;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=107;TCR=62;TR=169;WE=67052474;WS=67052456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr11	67068859	rs2298815	T	C	9524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=181;PP=2965;SC=GCTCTGCTGTTGCCGCATCAG;SOR=1.036;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=316;TCF=135;TCR=181;TR=316;WE=67068867;WS=67068849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr11	67071584	rs4244822	C	G	4818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=113;PP=2965;SC=CTGCTCTCTCCGCAGGACCAG;SOR=2.058;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=42;TCR=113;TR=155;WE=67071592;WS=67071574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr11	67076810	rs3737460	T	G	4802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=131;NR=9;PP=2965;SC=CAGGTCCGATTGCCAGTGGGC;SOR=4.962;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=131;TCR=9;TR=140;WE=67076818;WS=67076800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr11	67141184	.	CT	C	119.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.895;ClippingRankSum=0.000;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.799;QD=1.71;ReadPosRankSum=0.405;SOR=1.096;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,17:0.24:70
chr11	67177278	rs7122299	G	A	3322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=69;PP=2645;SC=GGCTGATGCCGGCCCGGCAAA;SOR=1.958;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=29;TCR=69;TR=98;WE=67177286;WS=67177268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr11	67220274	.	G	C	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.061;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.716;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=213;ReadPosRankSum=1.467;SC=GAGTATGGGAGAGACGGTGCT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=11;WE=67220282;WS=67220264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr11	67257273	rs611697	G	T	1797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=47;PP=1486;SC=CATGATCTCTGCGAGGGCAGG;SOR=4.615;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=4;TCR=47;TR=51;WE=67257281;WS=67257263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	67257823	rs641081	C	A	6461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=115;PP=2965;SC=CCAGCTGGACCAGCAGATCAC;SOR=0.880;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=209;TCF=94;TCR=115;TR=209;WE=67257831;WS=67257813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr11	67258391	rs4930199	A	G	5537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=134;NR=63;PP=2965;SC=CGAGAGCTGCAGGCCCTGGAG;SOR=1.646;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=134;TCR=63;TR=197;WE=67258399;WS=67258381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr11	67262264	.	T	TGAGTGGGCGA	2982	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MMLQ=23;MQ=61.66;NF=55;NR=0;PP=2982;QD=20;SC=GCCTCTCTGGTGAGTGGGCGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=80;TCF=77;TCR=3;TR=55;WE=67262272;WS=67262254;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:25,55:0.69:80
chr11	67262282	rs202207490	C	CGA	5828.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=0;PP=2979;SC=CGAGAGTGGGCGAGTGGGCGA;SOR=5.170;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=149;TCF=135;TCR=14;TR=54;WE=67262297;WS=67262272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr11	67262289	.	GC	AC	2976	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=23;MQ=60.84;NF=156,49;NR=15,0;PP=2112,2976;QD=12.5542176172;SC=GGGCGAGTGGGCGAGGGGGCG;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=174;TCF=159;TCR=15;TR=171,49;WE=67262297;WS=67262272;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,171:0.98:174
chr11	67262289	.	GC	GCGAGTGGAC,GCGAGGGGAC	7217.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.15;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=156,49;NR=15,0;PP=2112,2976;SC=GGGCGAGTGGGCGAGGGGGCG;SOR=4.365;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=174;TCF=159;TCR=15;TR=171,49;WE=67262297;WS=67262272;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:155
chr11	67263767	rs618633	A	G	2227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=60;PP=1861;SC=CGCAGGGGTCAGCCGCGTGGA;SOR=3.643;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=9;TCR=60;TR=69;WE=67263775;WS=67263757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	67266090	rs61749182	G	A	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=226;ReadPosRankSum=-1.120;SC=CATAGGCGGCGGCGCAGATGG;SOR=0.892;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=14;WE=67266098;WS=67266080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr11	67267043	rs79324721	T	A	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=355;SC=CATCCATCCATCCATCCATCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=67267051;WS=67267033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	67288594	rs2276118	C	T	10164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=199;NR=109;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.802;SC=GTAGCCGTCCCGGTCTCGGTC;SOR=0.608;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=310;TCF=200;TCR=110;TR=308;WE=67288602;WS=67288584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,315:1.00:316
chr11	67351529	rs145589007	A	AG	1852.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=2;PP=1054;SC=GGGGGCGGGGAGGGGGGGCAG;SOR=5.136;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=36;WE=67351548;WS=67351519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	67351540	rs1871041	A	G	2075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=2;PP=1294;SC=GGGGGGGCAGACTGCGCTCAC;SOR=5.549;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=46;WE=67351548;WS=67351519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	67351585	rs4147581	C	G	3778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=13;PP=2898;SC=CTCCAGCAAACTTTTCTTTGT;SOR=3.553;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=92;TCR=13;TR=105;WE=67351593;WS=67351575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr11	67372477	rs12421329	G	T	2607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.158;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=67;PP=1880;ReadPosRankSum=0.075;SC=TGCTCCAGTGGGTGGGGACCA;SOR=0.907;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=158;TCF=45;TCR=113;TR=91;WE=67372485;WS=67372467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,99:0.59:167
chr11	67372593	rs12793832	A	C	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=4.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.960;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=459;ReadPosRankSum=-0.034;SC=AACAGGGCTCATCATTCCTGA;SOR=0.180;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=17;WE=67372601;WS=67372583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr11	67374581	rs1871043	T	C	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=61;PP=1443;ReadPosRankSum=-0.350;SC=CACGGGTGTTTGGGGCCGGGT;SOR=0.665;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=25;TCR=94;TR=77;WE=67374589;WS=67374571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,79:0.64:123
chr11	67375162	rs1382089	T	C	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=16;PP=345;SC=AGGGCCAAGCTGCCACACTCG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=67375170;WS=67375152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	67375184	rs7948073	T	G	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=156;ReadPosRankSum=-0.543;SC=CTTGTGGGGCTGTGTGGTGCC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=67375192;WS=67375174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr11	67397251	rs17851655	G	C	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.655;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=339;ReadPosRankSum=0.059;SC=GCAGCGCCGGGACCCCACGCA;SOR=1.222;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=18;WE=67397259;WS=67397241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr11	67399735	rs2514021	T	C	6859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=85;PP=2965;SC=CCCTTTGCCTTCCGCCCACTG;SOR=1.179;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=213;TCF=128;TCR=85;TR=211;WE=67399743;WS=67399725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr11	67399914	rs11227869	G	T	1457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.340;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=1213;ReadPosRankSum=-0.702;SC=GGGGGGAGGGGATCAAGGGGA;SOR=0.356;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=119;TCF=51;TCR=68;TR=64;WE=67399922;WS=67399904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,66:0.52:126
chr11	67399970	rs3765088	C	T	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.497;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=895;ReadPosRankSum=-0.469;SC=GGTGGGGCCCCAGGATGGGTC;SOR=0.417;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=114;TCF=62;TCR=52;TR=45;WE=67399978;WS=67399960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,47:0.41:116
chr11	67400235	rs10896189	T	C	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.706;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=664;ReadPosRankSum=-0.183;SC=CCCTGGCACCTGGGCCTCTTG;SOR=1.352;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=51;TCF=22;TCR=29;TR=33;WE=67400243;WS=67400225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,33:0.67:49
chr11	67400622	rs61894500	G	A	1821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=62;PP=1530;ReadPosRankSum=-0.112;SC=GGAGTACAGCGGACTCCCTGA;SOR=1.306;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=99;TCF=0;TCR=99;TR=62;WE=67400630;WS=67400612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,63:0.62:101
chr11	67402744	rs59223436	G	A	1961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.784;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=52;PP=1459;ReadPosRankSum=-0.216;SC=GCTGTGGAGAGAGGACGGAAG;SOR=0.813;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=35;TCR=86;TR=73;WE=67402752;WS=67402734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,74:0.61:121
chr11	67406829	rs1993839	T	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=10;NR=0;PP=218;ReadPosRankSum=0.681;SC=CCCACCCTCTTGTGAAGGACC;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=10;WE=67406837;WS=67406819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr11	67407146	rs2447591	T	C	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=23;PP=684;SC=GTGGTCTTCCTACTCGAGCTG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=23;WE=67407154;WS=67407136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	67412203	rs143278298	C	CCA	287.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=-0.615;QD=16.93;ReadPosRankSum=0.553;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr11	67414492	rs948445	C	T	2495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=62;PP=2079;SC=CAGGGGCTCCCGGGGCACAGG;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=15;TCR=62;TR=77;WE=67414500;WS=67414482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	67430589	rs78402723	A	G	2426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=15;PP=1888;SC=GGCTGGGGGAACCTGCGGTCT;SOR=2.524;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=56;TCR=15;TR=71;WE=67430597;WS=67430579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr11	67430762	rs1551886	T	C	5598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=116;PP=2965;SC=GGGTGGGTAGTGGATCTCCTT;SOR=1.190;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=78;TCR=116;TR=194;WE=67430770;WS=67430752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr11	67431038	rs1979375	G	A	4333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=25;PP=2965;SC=GAGGCCCAGGGTGTGGATCAA;SOR=2.636;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=106;TCR=25;TR=131;WE=67431046;WS=67431028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr11	67431110	rs1979376	G	A	5886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=70;PP=2965;SC=CTTCCCTAGGGGTGGAAATGG;SOR=1.172;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=105;TCR=70;TR=175;WE=67431118;WS=67431100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr11	67432804	rs2447571	T	C	8169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=118;NR=147;PP=2965;SC=GCCACGCGGCTGCAGCCCAGC;SOR=0.982;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=265;TCF=118;TCR=147;TR=265;WE=67432812;WS=67432794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr11	67432854	rs6591270	T	C	5179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=137;PP=2965;SC=GTTGATGATGTGGCCCAGGTT;SOR=2.967;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=170;TCF=33;TCR=137;TR=170;WE=67432862;WS=67432844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr11	67433708	rs5792424	C	CG	6832.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=112;NR=74;PP=2981;SC=GGGGCGGGCTCGGGGCCAGCC;SOR=1.407;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=214;TCF=129;TCR=85;TR=186;WE=67433720;WS=67433697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr11	67433758	rs1551887	G	A	9409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=170;NR=121;PP=2965;SC=TGGGGACGTCGGGCACTGCTG;SOR=1.019;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=293;TCF=171;TCR=122;TR=291;WE=67433766;WS=67433748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,294:1.00:294
chr11	67433869	rs1551888	C	T	7776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=160;PP=2965;SC=CACCACGCAACTCCCTGCAGG;SOR=1.619;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=239;TCF=78;TCR=161;TR=238;WE=67433877;WS=67433859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr11	67434416	rs4646823	C	A	5352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=83;PP=2965;SC=TCCAGGCCTGCAGGTTCTTGA;SOR=0.876;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=73;TCR=83;TR=156;WE=67434424;WS=67434406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr11	67434475	rs145359673	C	T	1366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=40;PP=1076;ReadPosRankSum=-0.499;SC=GATATGTCTGCCTCGAAAGCT;SOR=0.698;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=38;TCR=95;TR=56;WE=67434483;WS=67434465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,57:0.41:138
chr11	67564104	rs10896235	C	T	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.07;QD=31.25;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	67564135	rs77521350	G	C	779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.52;QD=32.49;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	67564162	rs75324740	A	G	1087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=16;PP=1202;SC=CACATAGCTCAGTGGTGAACA;SOR=1.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=59;WE=67564170;WS=67564152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	67564197	rs72657419	T	C	1566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=40;PP=1514;SC=GGGTTGCAGATGGTAAGGGCC;SOR=0.950;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=37;TCR=40;TR=77;WE=67564205;WS=67564187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	67564293	rs117919932	T	A	265.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.23;QD=29.53;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	67765163	rs5792426	A	AG	1831.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=11;PP=1957;SC=ATGGCCAGGAAGCCACTGCCA;SOR=2.494;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=44;WE=67765171;WS=67765153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	67770384	rs3751085	C	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=183;ReadPosRankSum=1.028;SC=CTCCCTTGTTCCCTCGCCCCA;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=9;WE=67770392;WS=67770374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr11	67782947	rs2286170	G	T	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.517;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=620;ReadPosRankSum=-0.311;SC=GGGGTTGGGGGTATGAGAGGG;SOR=0.368;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=34;WE=67782955;WS=67782937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,35:0.54:65
chr11	67786064	rs11433668	A	AC	5121.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=51;PP=2936;SC=GCCCTCAGGAACTCCGGGCCT;SOR=0.980;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=110;TCF=56;TCR=54;TR=106;WE=67786072;WS=67786054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr11	67786764	rs1636207	A	G	1398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=44;PP=1063;ReadPosRankSum=0.638;SC=GGAACAGGCAAGGCTCAAGGG;SOR=0.593;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=87;TCF=4;TCR=83;TR=46;WE=67786772;WS=67786754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,50:0.55:91
chr11	67789293	rs58160034	G	GC	8344.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=104;PP=2967;SC=CTGGGCTGCGGCGTGTGGCCA;SOR=0.796;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=196;TCF=84;TCR=112;TR=182;WE=67789301;WS=67789283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr11	67790243	rs3764818	C	T	1498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.957;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.212;NF=13;NR=38;PP=1122;ReadPosRankSum=-0.727;SC=GGGGTGCGGCCGGGCTGGGCA;SOR=1.059;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=91;TCF=28;TCR=63;TR=51;WE=67790251;WS=67790233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,55:0.57:96
chr11	67795299	rs308341	G	A	4173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.523;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.916;NF=83;NR=75;PP=2941;ReadPosRankSum=1.253;SC=TGCGCAGCCCGGGGATGGAGA;SOR=0.691;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=282;TCF=139;TCR=143;TR=158;WE=67795307;WS=67795289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,162:0.55:296
chr11	67795353	rs3751082	G	A	3255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-6.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.599;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.174;NF=38;NR=82;PP=2628;ReadPosRankSum=1.482;SC=CGCGCCGCCTGAGGATGCTGC;SOR=1.063;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=191;TCF=63;TCR=128;TR=120;WE=67795361;WS=67795343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,119:0.62:192
chr11	67795378	rs11436139	G	GC	5787.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=102;PP=2974;SC=GGCCATGGAGGCCAAGGCTGC;SOR=1.427;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=162;TCF=53;TCR=109;TR=150;WE=67795386;WS=67795368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr11	67799584	rs117961226	C	T	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.231;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=3;PP=168;ReadPosRankSum=1.337;SC=GGTTCTTGGGCACACCCCACC;SOR=0.175;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=9;WE=67799592;WS=67799574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr11	67799731	rs3133266	C	G	2374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=39;PP=1830;SC=CCTGGTATGACGTCACGCCCT;SOR=0.772;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=39;TCR=39;TR=78;WE=67799739;WS=67799721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr11	67800494	rs3115545	T	G	5451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=85;NR=78;PP=2965;SC=GTCCTGGGCATGAGGGGACAG;SOR=0.768;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=85;TCR=78;TR=163;WE=67800502;WS=67800484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr11	67801282	rs3133267	C	T	1245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=1;PP=1082;SC=GCAGCCGCCGCCGCTACTTTC;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=39;WE=67801290;WS=67801272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	67801517	rs3115546	G	T	6352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=121;PP=2965;SC=GACAGACCCGGTGCTGTGCCA;SOR=1.333;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=73;TCR=121;TR=194;WE=67801525;WS=67801507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr11	67804156	rs3133269	C	T	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.017;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=117;ReadPosRankSum=-1.749;SC=GGGCCGTTCCCGGCCTGCCTG;SOR=0.293;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=8;WE=67804164;WS=67804146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr11	67814979	rs2471829	G	C	11655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=182;NR=165;PP=2965;SC=TCATGTTCCTGTTCGCCCTGG;SOR=0.774;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=348;TCF=183;TCR=165;TR=347;WE=67814987;WS=67814969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,356:1.00:356
chr11	67815086	rs12418239	G	A	6220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=146;NR=89;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.686;SC=GGGCCAGGCAGCCCCTCACCA;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=389;TCF=238;TCR=151;TR=235;WE=67815094;WS=67815076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,238:0.61:389
chr11	67815499	rs146840711	C	G	1722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=63;PP=1340;ReadPosRankSum=-0.071;SC=GGGGCTGGGGCTCCCCTCGGT;SOR=0.853;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=131;TCF=14;TCR=117;TR=70;WE=67815507;WS=67815489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,71:0.53:133
chr11	67837771	rs3819255	A	T	1814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.574;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=39;PP=1420;ReadPosRankSum=-0.723;SC=CTATTAAAAAATTTTCAAAAA;SOR=0.554;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=107;TCF=42;TCR=65;TR=67;WE=67837779;WS=67837761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,69:0.62:111
chr11	67842369	rs2512611	C	T	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-4.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.724;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=251;ReadPosRankSum=0.530;SC=AGCACTCTCACAGGAGTGTTT;SOR=0.116;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=13;WE=67842377;WS=67842359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr11	67888793	.	G	GCTGCGGCGA	111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.501;NF=1;NR=2;PP=400;ReadPosRankSum=-1.122;SC=GGCGGCGGCGGCTGCGGCGAC;SOR=0.078;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=3;WE=67888801;WS=67888783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr11	67933642	rs1114399	C	A	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=86;ReadPosRankSum=1.292;SC=GTGGCAACTACAGAAAACTGG;SOR=0.627;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=6;WE=67933650;WS=67933632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr11	67941390	rs3832715	G	GA	1971.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.582;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.276;NF=32;NR=32;PP=1359;ReadPosRankSum=-0.594;SC=CCTAAAACAGGAAAAAAAAAT;SOR=0.679;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=37;TCR=38;TR=64;WE=67941398;WS=67941380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,72:0.99:73
chr11	67957518	rs2512606	A	T	8634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=82;NR=176;PP=2965;SC=CACCACCATGATCTTGGATTC;SOR=1.700;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=258;TCF=82;TCR=176;TR=258;WE=67957526;WS=67957508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr11	68030173	rs3802746	C	A	6463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=148;NR=55;PP=2965;SC=ATCAGCTGCACCTCCTGAAGT;SOR=1.993;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=204;TCF=148;TCR=56;TR=203;WE=68030181;WS=68030163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr11	68131167	rs10791978	A	T	2261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=3;PP=1926;SC=GCAATGACTGACGGGGGACCC;SOR=5.640;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=66;TCR=3;TR=69;WE=68131175;WS=68131157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	68153710	rs17848255	C	T	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.711;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=615;ReadPosRankSum=-0.965;SC=TTCCCTTGCCCGGCCCACCCC;SOR=1.609;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=27;WE=68153718;WS=68153700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,27:0.64:42
chr11	68157299	rs4988320	G	A	2580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.699;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=16;PP=2100;ReadPosRankSum=0.848;SC=TGGGGATGCTGCAGAGACCAG;SOR=0.958;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=157;TCF=128;TCR=29;TR=93;WE=68157307;WS=68157289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,95:0.60:159
chr11	68170825	rs687482	A	G	1878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.97;SOR=4.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	68170833	rs686921	G	T	2058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.89;SOR=4.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	68171013	rs545382	T	C	8751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=136;NR=159;PP=2965;SC=CGCACATTTTTGGGTTCACGC;SOR=0.841;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=296;TCF=137;TCR=159;TR=295;WE=68171021;WS=68171003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,303:1.00:303
chr11	68173861	rs471966	C	T	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.003;NF=12;NR=0;PP=250;ReadPosRankSum=-1.674;SC=GGACCTGACCCGGGGGTGAGT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=12;WE=68173869;WS=68173851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr11	68174122	rs2277268	G	A	4965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.033;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=85;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.425;SC=TCGTGCCTGAGGCCTTCTTGG;SOR=0.547;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=298;TCF=145;TCR=153;TR=178;WE=68174130;WS=68174112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,188:0.60:312
chr11	68177614	rs4988322	T	C	2186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-6.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=89;PP=1709;ReadPosRankSum=0.781;SC=AAGGGGTAAGTGTTTGCCTGT;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=8;TCR=143;TR=94;WE=68177622;WS=68177604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,94:0.63:150
chr11	68179125	rs2242339	C	T	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.599;HP=7;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=27;PP=604;ReadPosRankSum=-0.517;SC=TCATGGAGGGCGGGGCAGCCG;SOR=1.609;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=59;TCF=14;TCR=45;TR=32;WE=68179133;WS=68179115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,32:0.53:60
chr11	68179166	rs689179	A	G	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=30;PP=861;SC=CTCGCCGCACATACCCTGTGG;SOR=4.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=33;WE=68179174;WS=68179156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	68192518	rs554734	T	G	2375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.594;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=19;PP=1964;ReadPosRankSum=-0.772;SC=CTCCGTGCTGTCCGAGGAGAC;SOR=1.366;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=141;TCF=104;TCR=37;TR=88;WE=68192526;WS=68192508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,87:0.62:140
chr11	68192690	rs556442	G	A	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.845;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=771;ReadPosRankSum=-0.682;SC=CCCTGGTGGTGGACAACACAC;SOR=0.240;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=95;TCF=25;TCR=70;TR=41;WE=68192698;WS=68192680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,41:0.44:94
chr11	68200945	rs12416761	G	A	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.302;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=525;ReadPosRankSum=0.410;SC=GCAGCACCCCGTACAGCAGGG;SOR=3.134;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=24;WE=68200953;WS=68200935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr11	68201007	rs12417014	C	T	1613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.052;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=13;PP=1317;ReadPosRankSum=-0.461;SC=AGCCCAGTCACGCCATTGCCT;SOR=0.969;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=86;TCF=66;TCR=20;TR=60;WE=68201015;WS=68200997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,59:0.69:86
chr11	68206173	rs901824	T	C	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=495;ReadPosRankSum=-0.974;SC=AGATATGGAATGATCTGGAGG;SOR=0.648;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=29;WE=68206181;WS=68206163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr11	68206197	rs901825	G	C	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=513;ReadPosRankSum=-1.651;SC=CAGGAGAGTAGTCTGGGCAGC;SOR=0.514;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=25;WE=68206205;WS=68206187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr11	68207438	rs2291466	C	A	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=195;ReadPosRankSum=2.723;SC=GGGCCCCTCCCACCGTCAGTG;SOR=0.307;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=10;WE=68207446;WS=68207428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr11	68214119	rs2242340	C	T	1774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=7.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=61;PP=1484;ReadPosRankSum=-0.849;SC=GGGCAGGTGCCGGGCCCAGCC;SOR=0.654;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=105;TCF=2;TCR=103;TR=62;WE=68214127;WS=68214109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,63:0.59:106
chr11	68305494	rs60212556	C	T	2262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=7.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.597;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=76;PP=1872;ReadPosRankSum=0.603;SC=ATGACAGGCTCGGTGGAGCGC;SOR=0.213;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=116;TCF=3;TCR=113;TR=79;WE=68305502;WS=68305484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,80:0.67:119
chr11	68305521	rs11403965	G	GT	719.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=841;ReadPosRankSum=0.754;SC=CATTCTAGCAGTAAGTCCAGG;SOR=1.204;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=84;TCF=1;TCR=83;TR=24;WE=68305529;WS=68305511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,27:0.33:83
chr11	68312645	rs10896340	A	G	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=33;PP=732;ReadPosRankSum=1.548;SC=AAGCACTCACATACTATTTGT;SOR=0.723;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=0;TCR=66;TR=33;WE=68312653;WS=68312635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,34:0.51:67
chr11	68315798	rs10736668	C	A	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=32;PP=1071;SC=TCTGGGGAGCCGGTAACAGGG;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=34;WE=68315806;WS=68315788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	68326236	rs12271290	C	T	1756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=8.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=57;PP=1402;ReadPosRankSum=-0.143;SC=GCTGTAATAGCGTACCTTTGA;SOR=0.490;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=91;TCF=1;TCR=90;TR=58;WE=68326244;WS=68326226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,62:0.62:100
chr11	68331715	rs10501398	C	G	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=8.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.792;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=5;PP=1069;ReadPosRankSum=0.278;SC=TGGTCGATAACCTTGAATGAT;SOR=0.151;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=151;TCF=142;TCR=9;TR=51;WE=68331723;WS=68331705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,51:0.34:151
chr11	68341722	rs3740631	T	G	2073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=65;PP=1708;ReadPosRankSum=-1.106;SC=TGAATTACATTTTTGTTGGGT;SOR=0.790;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=22;TCR=118;TR=77;WE=68341730;WS=68341712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,77:0.54:142
chr11	68343593	rs3740629	C	T	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=266;ReadPosRankSum=-0.403;SC=AAAAGATCTTCCATTTACCTC;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=13;WE=68343601;WS=68343583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr11	68358106	rs5792446	CTTTTA	C	828.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.257;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.062;NF=14;NR=3;PP=706;ReadPosRankSum=-0.918;SC=GCTTCCTACACTTTTATTTTG;SOR=1.781;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=17;WE=68358118;WS=68358096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr11	68377602	rs7104877	A	C	2580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-6.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.494;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=89;PP=1923;ReadPosRankSum=0.716;SC=CTCAAGTCTTAGGCCGCTGAC;SOR=0.884;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=182;TCF=35;TCR=147;TR=110;WE=68377610;WS=68377592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,111:0.60:185
chr11	68382193	rs12941	C	T	2670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.709;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=18;PP=2075;ReadPosRankSum=2.047;SC=TTGCACGCCTCCTCAGGAACC;SOR=1.182;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=167;TCF=131;TCR=36;TR=96;WE=68382201;WS=68382183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,97:0.57:171
chr11	68382591	rs1996	C	T	2225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.491;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=54;PP=1643;ReadPosRankSum=-1.047;SC=TTTTGTCTTTCGTAGCAGGGA;SOR=0.444;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=181;TCF=57;TCR=124;TR=84;WE=68382599;WS=68382581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,91:0.47:192
chr11	68456410	rs3136540	T	C	12462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=190;NR=180;PP=2965;SC=TGAAATATCATCAACTTAACA;SOR=0.746;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=371;TCF=190;TCR=181;TR=370;WE=68456418;WS=68456400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,388:1.00:388
chr11	68458470	rs1042577	T	C	2379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-8.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=79;PP=1732;ReadPosRankSum=-1.243;SC=CTCCTGGGCATGTTTGTCTGT;SOR=0.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=238;TCF=68;TCR=170;TR=110;WE=68458478;WS=68458460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,109:0.46:238
chr11	68476011	rs4930597	A	G	1295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=40;PP=1110;SC=ACAGTGCACCATTTCTACCTA;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=40;WE=68476019;WS=68476001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	68522216	rs75022915	T	C	3211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.949;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=41;PP=2305;ReadPosRankSum=0.187;SC=GCCCAGCACATGAACTTGGTG;SOR=1.028;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=211;TCF=135;TCR=76;TR=125;WE=68522224;WS=68522206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,131:0.60:220
chr11	68530257	rs2924699	C	T	2939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.307;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=68;PP=2201;ReadPosRankSum=1.196;SC=CTTCAGTGCACGGCAGGGCAT;SOR=0.930;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=191;TCF=75;TCR=116;TR=109;WE=68530265;WS=68530247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,113:0.57:198
chr11	68530318	rs7112615	C	A	1631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.235;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=50;PP=1273;ReadPosRankSum=0.238;SC=GGCAAGGAGACGTGGACTTCA;SOR=1.331;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=139;TCF=36;TCR=103;TR=63;WE=68530326;WS=68530308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,65:0.45:143
chr11	68548260	rs3019576	C	A	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.131;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=37;PP=1078;ReadPosRankSum=0.286;SC=AAAGAGGCAACAATGAGGAGA;SOR=0.420;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=152;TCF=45;TCR=107;TR=57;WE=68548268;WS=68548250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,62:0.38:164
chr11	68549340	rs2228502	A	G	3175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.825;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=74;PP=2433;ReadPosRankSum=-1.628;SC=CTAACGTCACAAAGAACGCTG;SOR=0.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=335;TCF=162;TCR=173;TR=140;WE=68549348;WS=68549330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,144:0.42:340
chr11	68552486	rs2305507	G	A	3145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.306;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=76;PP=2562;ReadPosRankSum=-1.467;SC=TGTCTGAGCCGGCCGCAGGTT;SOR=0.498;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=212;TCF=67;TCR=145;TR=114;WE=68552494;WS=68552476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,117:0.54:216
chr11	68566647	.	GAAA	G	2901.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=53.74;SOR=8.015;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	68566648	.	A	AC	1191	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=26;NR=0;PP=1191;QD=47.0;SC=CTTCATACGGAAAAATTTCAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=26;WE=68566659;WS=68566638;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,26:0.76:34
chr11	68566649	.	AAA	GCT	2191	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=28;NR=0;PP=2191;QD=80.5167098165;SC=TTCATACGGAAAAATTTCATC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=53;TCR=2;TR=28;WE=68566659;WS=68566638;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:27,28:0.51:55
chr11	68566651	.	A	ACGCT	2901.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=51.82;SOR=8.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	68566839	rs3019603	G	A	4249.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.702;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=116;PP=2751;ReadPosRankSum=0.932;SC=ATTATTGGGGGAAAAAAAAAT;SOR=0.506;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=178;TCF=57;TCR=121;TR=172;WE=68566847;WS=68566824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,163:0.96:169
chr11	68665480	rs117105758	T	C	2126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.385;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=33;PP=1655;ReadPosRankSum=-0.985;SC=TAGGAACATATCTGTAAAACA;SOR=0.416;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=186;TCF=123;TCR=63;TR=82;WE=68665488;WS=68665470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,85:0.44:194
chr11	68668208	rs668576	A	G	5084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.174;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=136;PP=2965;ReadPosRankSum=0.345;SC=CCACAGAAACACCTAGGTGAG;SOR=4.393;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=152;TCF=14;TCR=138;TR=149;WE=68668216;WS=68668198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,157:0.99:159
chr11	68671104	rs629426	A	G	1488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=1;PP=1200;SC=ACAAGGCACCAGGTCGGACCC;SOR=6.556;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=50;TCR=1;TR=51;WE=68671112;WS=68671094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	68671280	rs111612765	G	GCCGCCGCCATCTTC	9142.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=57;PP=2900;SC=TGCTGCCATGGCCGCAGCCTC;SOR=0.736;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=158;TCF=69;TCR=89;TR=106;WE=68671288;WS=68671270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr11	68671477	rs1249463	T	C	4314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=96;PP=2965;SC=TGCTGGAGCTTGAGAGAGACG;SOR=1.460;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=153;TCF=55;TCR=98;TR=151;WE=68671485;WS=68671467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr11	68678962	rs560096	T	C	2993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=30;PP=2414;SC=GAAGCGGTTTTATTTGCGCTG;SOR=1.683;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=96;TCF=66;TCR=30;TR=95;WE=68678970;WS=68678952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr11	68703009	rs598255	C	G	1803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=51;PP=1507;SC=TCATGGTGCACCTTCTGTCCT;SOR=5.747;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=2;TCR=51;TR=53;WE=68703017;WS=68702999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	68703959	rs622082	A	G	6533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.98;NF=73;NR=127;PP=2965;SC=GGGACCTGCTACGTCCACCAG;SOR=1.408;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=73;TCR=127;TR=200;WE=68703967;WS=68703949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr11	68704264	rs546382	C	T	7318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=162;PP=2965;SC=ACGACAGTTCCGGGGAAGGGA;SOR=2.150;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=222;TCF=59;TCR=163;TR=221;WE=68704272;WS=68704254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr11	68705504	rs513615	G	T	820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=0;PP=741;SC=ACTCCTGGCCGCAAGCAGTCC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=68705512;WS=68705494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	68773403	rs11544722	G	A	8180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=155;NR=97;PP=2965;SC=TAAGGAACATGCAGAGCCCCA;SOR=1.282;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=252;TCF=155;TCR=97;TR=252;WE=68773411;WS=68773393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr11	68773740	rs60308539	G	A	1223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=33;PP=994;SC=CTGCGCAGGTGCAGAGAGGGA;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=38;WE=68773748;WS=68773730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	68816370	rs4930642	A	G	2689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=27;PP=2138;SC=GCGTCAGCAAAAACGCCAGGG;SOR=1.666;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=55;TCR=27;TR=82;WE=68816378;WS=68816360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr11	68821648	rs12285715	G	C	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=132;ReadPosRankSum=-0.922;SC=CGACTGACTGGGTCCAAGGCC;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=9;WE=68821656;WS=68821638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr11	68822739	rs1470892	T	C	13824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=438;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=142;NR=290;PP=2965;SC=ACCGCGCTGCTCCCTGGGAGC;SOR=1.626;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=433;TCF=142;TCR=291;TR=432;WE=68822747;WS=68822729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,436:1.00:436
chr11	68822831	rs72917389	C	T	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=7.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=37;PP=606;ReadPosRankSum=-0.405;SC=GTGAGGCGGGCGCCAGGCCCT;SOR=0.954;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=128;TCF=2;TCR=126;TR=37;WE=68822839;WS=68822821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,39:0.29:135
chr11	68825037	rs3750973	A	C	4816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=31;PP=2965;SC=CCGCCCGTCTATCTTGCAGGG;SOR=2.400;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=116;TCR=31;TR=147;WE=68825045;WS=68825027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr11	68831364	rs72928978	G	A	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.685;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=19;PP=892;ReadPosRankSum=0.078;SC=CTCCCCCAGCGTCGGGCTGCT;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=122;TCF=73;TCR=49;TR=48;WE=68831372;WS=68831354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,50:0.39:129
chr11	68834831	rs7950657	G	A	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=331;ReadPosRankSum=1.899;SC=CTGGCCATGAGCTCAGCCTGC;SOR=1.329;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=14;WE=68834839;WS=68834821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr11	68834968	rs6591368	T	C	5255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=109;NR=46;PP=2965;SC=CTTCTGCTCTTAGCAGGATGA;SOR=1.810;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=110;TCR=46;TR=155;WE=68834976;WS=68834958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr11	68837794	rs61881024	A	G	1659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=18;PP=1282;ReadPosRankSum=-0.380;SC=ACGCTCAGCAATGGAGACCTC;SOR=0.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=71;TCR=32;TR=59;WE=68837802;WS=68837784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,60:0.58:104
chr11	68838028	rs3829236	C	T	2202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=62;PP=1886;SC=ACCGATACACCCTGCTGCCTC;SOR=5.518;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=3;TCR=62;TR=65;WE=68838036;WS=68838018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	68839949	rs896969	C	T	2929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=18;PP=2400;SC=GCAGGATGCTCGTTACAGGGG;SOR=2.808;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=75;TCR=18;TR=93;WE=68839957;WS=68839939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr11	68840160	rs3750965	A	G	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.603;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=48;PP=1423;ReadPosRankSum=-0.704;SC=AGCTCCCACAAACAGGCCATG;SOR=1.154;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=131;TCF=41;TCR=90;TR=65;WE=68840168;WS=68840150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,66:0.51:130
chr11	68846098	rs4930649	A	G	11728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=144;NR=232;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.063;SC=CAGAGCTGGCACGGAAGTGCC;SOR=0.733;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=380;TCF=146;TCR=234;TR=376;WE=68846106;WS=68846088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,387:0.99:390
chr11	68846399	rs35264875	A	T	3524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=425;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.152;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=84;PP=2796;ReadPosRankSum=0.136;SC=CCTGTTGGAGATGCTGCTCAA;SOR=0.578;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=417;TCF=180;TCR=237;TR=152;WE=68846407;WS=68846389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:268,154:0.36:422
chr11	68846519	rs7124310	A	C	4054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=103;PP=2965;SC=GCCGGCCTCTACTGGGCGGGT;SOR=4.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=12;TCR=103;TR=115;WE=68846527;WS=68846509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
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chr11	68853504	rs2290421	C	T	3187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=90;PP=2658;SC=GTGGCTGGGACGGGGACTCGG;SOR=6.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=93;TCF=2;TCR=91;TR=92;WE=68853512;WS=68853494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr11	68854012	rs35337391	A	G	1421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=30;PP=1092;ReadPosRankSum=0.428;SC=TCTATTTTGTATTGTGGTGGC;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=123;TCF=56;TCR=67;TR=55;WE=68854020;WS=68854002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,56:0.44:126
chr11	68855197	rs1123665	T	G	656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=4;PP=480;SC=ACATCCATCCTGAGGCTCATC;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=68855205;WS=68855187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	68855483	rs1551306	G	A	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=434;SC=ACAGGTGCCCGTCATGGAAGA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=68855491;WS=68855473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	69462910	rs9344	G	A	3256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.234;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=84;PP=2613;ReadPosRankSum=0.222;SC=AGTGTGACCCGGTAAGTGAGG;SOR=1.062;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=168;TCF=53;TCR=115;TR=119;WE=69462918;WS=69462900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,119:0.70:170
chr11	69466115	rs7177	C	A	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.124;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=173;ReadPosRankSum=-0.360;SC=CAGGTGCTCCCCTGACAGTCC;SOR=1.371;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=11;WE=69466123;WS=69466105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr11	69518564	.	G	A	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.321;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.143;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=365;ReadPosRankSum=-1.090;SC=CCGCGTCCGAGAAGGCGAGGG;SOR=0.473;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=21;WE=69518572;WS=69518554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr11	69588729	rs2073464	G	A	2935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=26;PP=2249;SC=GAGAAGCCACGAGCCTGCTAG;SOR=2.033;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=64;TCR=26;TR=90;WE=69588737;WS=69588719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	69625511	rs7932320	T	C	3006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.873;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=89;PP=2325;ReadPosRankSum=0.577;SC=GGGGAGACTGTGGCAGCGTCA;SOR=3.835;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=104;TCF=14;TCR=90;TR=102;WE=69625519;WS=69625501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,107:0.99:108
chr11	69630973	rs3926882	G	A	5411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.10;SOR=7.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr11	69630978	rs7483837	G	A	5542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.70;SOR=6.374;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr11	69924226	rs2509134	C	T	150.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=1;PP=104;SC=CCCCCTTTCACACCCGGTATG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=69924234;WS=69924216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	69924352	rs11233117	C	G	1556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=18;PP=1294;SC=AAAATCTGACCGGCGCGGCCA;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=59;WE=69924360;WS=69924342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
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chr11	69949327	rs2509147	C	T	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=39;PP=1178;ReadPosRankSum=0.328;SC=GTCACTTGGACGCCTGGCAGT;SOR=0.676;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=27;TCR=76;TR=53;WE=69949335;WS=69949317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,53:0.51:103
chr11	69949444	rs12293326	C	A	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.432;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=180;ReadPosRankSum=1.181;SC=GGCCCCCAGGCTCTGGGGTCC;SOR=0.346;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=9;WE=69949452;WS=69949434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr11	69951994	rs61034641	G	T	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=346;ReadPosRankSum=-0.439;SC=GTGGAAGCCGGCTCTAATTGT;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=18;WE=69952002;WS=69951984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr11	69954412	rs2509182	A	G	4469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=26;PP=2965;SC=CTGCTCGTGGAAGGTGCCTTA;SOR=2.636;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=101;TCR=26;TR=127;WE=69954420;WS=69954402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr11	69957940	rs2515251	C	A	2079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=17;NR=49;PP=1687;SC=CACACCCCCCCGGGAGCTGCA;SOR=2.035;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=17;TCR=49;TR=66;WE=69957948;WS=69957930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	69962642	rs2515245	A	G	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=444;ReadPosRankSum=1.882;SC=TGGCTCTGTCAGAGCCTGGAG;SOR=1.402;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=21;WE=69962650;WS=69962632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr11	69970412	rs2509160	G	A	1786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=7.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.717;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=13;PP=1441;ReadPosRankSum=1.027;SC=GAGCAACCTCGGAGTGCCACA;SOR=1.705;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=215;TCF=155;TCR=60;TR=76;WE=69970420;WS=69970402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,76:0.35:220
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chr11	69978265	rs2509174	C	T	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.732;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=43;PP=1096;ReadPosRankSum=1.307;SC=TCTGTCTTTGCGAAATCATCC;SOR=0.427;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=134;TCF=29;TCR=105;TR=56;WE=69978273;WS=69978255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,60:0.44:137
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chr11	69999122	rs10160639	A	C	1282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=2;PP=1034;SC=CTCAGACTCAAAATTAACAAG;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=37;WE=69999130;WS=69999112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	69999252	rs3781663	G	A	4529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=76;NR=64;PP=2965;SC=GGCCACTGTGGGTTAACTTTC;SOR=0.827;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=141;TCF=77;TCR=64;TR=140;WE=69999260;WS=69999242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr11	70001976	rs10751195	A	G	1907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=8;PP=1572;SC=GCCGCCTCCCACTTCACCGCA;SOR=3.578;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=59;TCR=8;TR=66;WE=70001984;WS=70001966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
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chr11	70007311	rs2276066	A	G	2423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.460;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=26;PP=1950;ReadPosRankSum=1.342;SC=TCATCTACAGAATCTCCATGG;SOR=0.225;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=172;TCF=134;TCR=38;TR=90;WE=70007319;WS=70007301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,91:0.51:177
chr11	70007392	rs2276067	A	G	3115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.924;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=63;PP=2377;ReadPosRankSum=-1.666;SC=CAGCCACCGCAGTCATCATCA;SOR=0.711;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=262;TCF=133;TCR=129;TR=132;WE=70007400;WS=70007382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,135:0.50:271
chr11	70007562	rs2276069	C	A	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-6.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.655;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=670;ReadPosRankSum=-0.493;SC=TGCTTAACTTCTCTGGGCCCC;SOR=0.121;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=32;WE=70007570;WS=70007552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,33:0.48:69
chr11	70007865	rs2155461	A	C	3657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=92;PP=2965;SC=GCCTTTCCCCAACCTCGCTTC;SOR=3.160;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=18;TCR=92;TR=110;WE=70007873;WS=70007855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	70015951	rs56751551	C	T	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.794;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=4;PP=826;ReadPosRankSum=-1.134;SC=GCCAGGCACACGGTGACATTC;SOR=0.016;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=99;TCF=95;TCR=4;TR=42;WE=70015959;WS=70015941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,42:0.41:102
chr11	70016058	rs17333013	A	C	3377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.838;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=43;PP=2590;ReadPosRankSum=0.276;SC=TTCCACTCAGAAACCTTTTCC;SOR=1.001;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=349;TCF=225;TCR=124;TR=135;WE=70016066;WS=70016048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:222,139:0.39:361
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chr11	70016345	rs57900749	T	C	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.016;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=113;ReadPosRankSum=0.429;SC=CTTCCCAGCATGGGCAGGGGG;SOR=0.084;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=9;WE=70016353;WS=70016335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr11	70028543	rs1317743	C	T	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=7.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=0;PP=690;ReadPosRankSum=0.220;SC=GGGTCACCCCCTGTTGCGGCC;SOR=0.898;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=94;TCF=93;TCR=1;TR=32;WE=70028551;WS=70028533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,37:0.37:100
chr11	70049523	rs1131677	A	G	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.384;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=310;ReadPosRankSum=0.533;SC=CAGAGGGCGCACGGAGGGCCG;SOR=0.095;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=64;TCF=58;TCR=6;TR=22;WE=70049531;WS=70049513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,24:0.37:65
chr11	70118251	rs670012	T	G	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=145;ReadPosRankSum=0.086;SC=TGAGCTTAATTACTGTAGCCT;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=6;WE=70118259;WS=70118241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr11	70118489	rs546502	G	A	2005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.880;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=42;PP=1553;ReadPosRankSum=2.044;SC=GTTACACGAGGTTGGTCATGA;SOR=0.456;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=146;TCF=61;TCR=85;TR=76;WE=70118497;WS=70118479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,77:0.52:147
chr11	70118630	rs148865428	G	A	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=231;ReadPosRankSum=1.031;SC=TTTCAGATGAGTATTTTCCGT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=14;WE=70118638;WS=70118620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr11	70179672	rs2282481	C	T	2654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.376;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=73;PP=2132;ReadPosRankSum=-0.411;SC=GAGCATGCAGCCCTGAGGGTG;SOR=0.510;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=165;TCF=35;TCR=130;TR=95;WE=70179680;WS=70179662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,99:0.58:171
chr11	70200594	rs7943389	C	T	4138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=118;PP=2965;SC=CAGAGCGCACCTGTCTTTTCG;SOR=8.206;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=119;TCF=1;TCR=118;TR=119;WE=70200602;WS=70200584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr11	70208311	rs7130178	G	A	2381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.030;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=31;PP=1867;ReadPosRankSum=0.025;SC=ATGCAGTTGCGTGGGTTACAG;SOR=0.242;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=156;TCF=108;TCR=48;TR=85;WE=70208319;WS=70208301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,91:0.55:164
chr11	70208350	rs10751231	G	A	6621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=125;NR=77;PP=2965;SC=TACTTTGTAGGCTGTACCTCA;SOR=1.274;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=125;TCR=78;TR=202;WE=70208358;WS=70208340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr11	70211574	rs670310	A	G	2688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.948;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=68;PP=2201;ReadPosRankSum=-0.040;SC=CACTCCTCCCAGCGCGTTTTC;SOR=1.238;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=178;TCF=75;TCR=103;TR=106;WE=70211582;WS=70211564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,109:0.60:182
chr11	70222604	rs664130	G	A	1541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.972;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=19;PP=1193;ReadPosRankSum=1.420;SC=TAGATTTGATGAAAGTTTTAT;SOR=0.414;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=97;TCF=68;TCR=29;TR=59;WE=70222612;WS=70222594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,60:0.61:99
chr11	70229171	rs552282	G	A	3400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.612;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=91;PP=2747;ReadPosRankSum=-0.449;SC=ACTACATTTTGGAATCCAGTG;SOR=0.405;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=215;TCF=50;TCR=165;TR=124;WE=70229179;WS=70229161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,126:0.57:221
chr11	70253389	rs2298396	C	T	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.523;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=85;ReadPosRankSum=-0.900;SC=TAACCCTCCCCGGCTGCTCTT;SOR=0.061;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=6;WE=70253397;WS=70253379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr11	70253475	rs2298397	C	T	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.976;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=579;ReadPosRankSum=-0.504;SC=ACTGGGAGACCGACCCTGATT;SOR=0.935;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=85;TCF=62;TCR=23;TR=30;WE=70253483;WS=70253465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,30:0.35:86
chr11	70253586	rs569732	T	C	3654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=57;PP=2815;SC=TGTGTCACAATCCAGGCTGTG;SOR=0.899;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=52;TCR=57;TR=109;WE=70253594;WS=70253576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr11	70260609	rs7932550	T	C	1936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.837;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=9;PP=1507;ReadPosRankSum=1.121;SC=GCCGCAGTGTTGTTGGTGTCT;SOR=1.413;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=188;TCF=157;TCR=31;TR=77;WE=70260617;WS=70260599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,77:0.41:188
chr11	70268910	rs12802851	C	T	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.089;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=325;ReadPosRankSum=0.951;SC=CAAGTGAAGCCTCGCTTGGCC;SOR=0.312;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=16;WE=70268918;WS=70268900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr11	70279766	rs643301	C	T	5400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.354;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=127;PP=2962;ReadPosRankSum=1.233;SC=ACAGCACCTACGATGAGTACG;SOR=0.939;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=328;TCF=125;TCR=203;TR=199;WE=70279774;WS=70279756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,202:0.59:341
chr11	70280992	rs3802780	G	A	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=622;ReadPosRankSum=0.210;SC=GAGGCAGCAGGAGCCTCCGCG;SOR=0.489;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=26;WE=70281000;WS=70280982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr11	70281007	rs7131282	T	C	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=282;ReadPosRankSum=2.075;SC=TCCGCGGTGGTCCGCATCTCT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=42;TCR=1;TR=15;WE=70281015;WS=70280997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr11	70282629	rs6894	A	C	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.270;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=26;PP=703;ReadPosRankSum=1.230;SC=AGCACACCTCATAGGTATGAT;SOR=0.209;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=66;TCF=9;TCR=57;TR=32;WE=70282637;WS=70282619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
chr11	70349061	rs7110158	A	G	2204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=38;PP=1650;SC=AGAGGATGGCATCAGTGAGAG;SOR=0.864;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=32;TCR=38;TR=70;WE=70349069;WS=70349051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	70506206	rs525304	G	T	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=246;ReadPosRankSum=0.331;SC=CCCCAGGAAGGGCTTGAGATT;SOR=0.693;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=12;WE=70506214;WS=70506196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr11	70507605	rs3837380	TACACACACACACACACACACACACACACACAC	T,TACACACACACACACACACACACACACAC	2988.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.45;MQRankSum=2.864;QD=35.58;SOR=2.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,77,6:0.92,0.07:84
chr11	70544599	.	A	G	207	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=9;NR=0;PP=207;QD=26.8634680608;SC=GACACAAACCAAAGGTGGCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=70544607;WS=70544598;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	70544937	rs7117514	A	G	1970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=52;PP=1523;SC=CCCACAGCACATGAGGCTGGT;SOR=3.947;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=5;TCR=53;TR=57;WE=70544945;WS=70544927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	70666569	.	C	T	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.314;ClippingRankSum=0.000;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.138;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=41;PP=1291;ReadPosRankSum=-0.571;SC=ACGTAGCTCCCAATGGTCTTC;SOR=1.428;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=165;TCF=74;TCR=91;TR=64;WE=70666577;WS=70666559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,65:0.40:164
chr11	70666894	.	G	A	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.406;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=450;ReadPosRankSum=-0.148;SC=GCCCCCATGCGAGCCCAGCAG;SOR=0.741;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=23;WE=70666902;WS=70666884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr11	70672399	rs3019835	G	A	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=1;PP=747;SC=GTTATATTCCGGACCAACTCA;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=70672407;WS=70672396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	70757620	rs4409861	T	C	3881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=7.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.432;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=79;PP=2962;ReadPosRankSum=1.539;SC=GTGTGTGAAGTAGGTGGTTTT;SOR=1.032;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=227;TCF=104;TCR=123;TR=138;WE=70757628;WS=70757610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,141:0.60:235
chr11	70757705	rs4246962	C	T	6504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=117;PP=2965;SC=ATTAATTATCCGTTTTCCCAG;SOR=1.146;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=201;TCF=84;TCR=117;TR=201;WE=70757713;WS=70757695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr11	70761233	rs111533103	C	T	4354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.185;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=140;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.647;SC=TTTCTGGGTACTGCTGGCTTG;SOR=2.519;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=231;TCF=4;TCR=227;TR=141;WE=70761241;WS=70761223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,147:0.62:236
chr11	70766554	rs4077321	C	T	1661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.354;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=39;PP=1193;ReadPosRankSum=1.124;SC=AAAGGAGAGGCGGAGGGTGGA;SOR=0.273;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=139;TCF=47;TCR=92;TR=63;WE=70766562;WS=70766544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,68:0.46:147
chr11	70766664	rs4495913	A	G	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=36;PP=1157;SC=AAGTCATTAAAAATCAAAAAT;SOR=4.223;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=39;WE=70766672;WS=70766654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	70777553	rs10899691	A	C	7217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=472;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.534;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=158;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.314;SC=TACCCCTCCGAACAGCCCTCA;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=465;TCF=191;TCR=274;TR=266;WE=70777574;WS=70777543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,269:0.57:471
chr11	70777566	rs12287441	A	G	6361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=433;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.563;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=155;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.699;SC=AGCCCTCAGAAGGTGGCAGCG;SOR=0.879;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=423;TCF=150;TCR=273;TR=234;WE=70777574;WS=70777543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,237:0.55:431
chr11	70777723	rs10793403	C	T	1822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=1346;ReadPosRankSum=1.661;SC=GCCAGCCCTTCGTAGGTCATC;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=106;TCF=53;TCR=53;TR=61;WE=70777731;WS=70777713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,67:0.58:115
chr11	70789000	rs11238042	G	A	1453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.334;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=26;PP=1112;ReadPosRankSum=2.230;SC=GTTACTGAGGGTTCTGGGTCT;SOR=0.363;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=138;TCF=83;TCR=55;TR=57;WE=70789008;WS=70788990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,59:0.40:146
chr11	70794485	rs67223333	C	G	2259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.649;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=50;PP=1707;ReadPosRankSum=0.078;SC=GTGGCTCTTACGAGAAACTCC;SOR=0.590;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=145;TCF=50;TCR=95;TR=79;WE=70794493;WS=70794475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,83:0.56:148
chr11	70798895	rs35132270	CG	C	2601.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.831;NF=39;NR=19;PP=2920;ReadPosRankSum=0.349;SC=TTCGTGTGTCCGGGGGGGCCT;SOR=0.640;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=93;TCR=45;TR=58;WE=70798910;WS=70798885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,66:0.48:138
chr11	70798902	rs34650500	G	T	2685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.833;NF=48;NR=21;PP=2906;ReadPosRankSum=0.777;SC=GTCCGGGGGGGCCTGAGCAGC;SOR=0.685;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=103;TCR=45;TR=69;WE=70798910;WS=70798885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,73:0.48:153
chr11	70829858	rs3924047	T	C	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-5.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=11;PP=965;ReadPosRankSum=-0.480;SC=GTCCATGCACTGTGGGCTGAA;SOR=0.600;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=120;TCR=30;TR=54;WE=70829866;WS=70829848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,53:0.35:150
chr11	71146577	rs909217	G	A	8229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=133;PP=2965;SC=GCAGGTGGCCGCCGCCACAGG;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=262;TCF=129;TCR=133;TR=262;WE=71146585;WS=71146567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr11	71146691	rs760241	A	G	7163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=122;PP=2965;SC=GCCTCTGCCCATCGGCGGATG;SOR=0.827;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=231;TCF=108;TCR=123;TR=230;WE=71146699;WS=71146681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr11	71146952	rs1792268	G	A	5415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=93;PP=2965;SC=TGTGGGCTCGGGGGCCCAGCG;SOR=1.373;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=150;TCF=57;TCR=93;TR=149;WE=71146960;WS=71146942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr11	71149069	rs949176	A	G	3651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=98;PP=2965;SC=CACTCCACGCAGATGCAGCAG;SOR=5.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=7;TCR=98;TR=105;WE=71149077;WS=71149059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr11	71150217	rs2852853	C	T	2390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=67;PP=1955;SC=CCAGCACTGGCCCAGGGTCCT;SOR=7.140;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=68;TCF=1;TCR=67;TR=68;WE=71150225;WS=71150207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	71152461	rs949177	A	G	3965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=85;PP=2965;SC=CTTGCAGGCCATTGATCTGAT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=38;TCR=85;TR=123;WE=71152469;WS=71152451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr11	71153459	rs11603330	C	A	9238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=185;PP=2965;SC=AAGGGGGACGCATAGCAGGAA;SOR=1.668;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=273;TCF=88;TCR=185;TR=273;WE=71153467;WS=71153449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr11	71155153	rs1790334	A	G	12077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=221;NR=186;PP=2965;SC=CCACAGGGCCAGTCAGGGCGC;SOR=0.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=407;TCF=221;TCR=186;TR=407;WE=71155161;WS=71155143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,411:1.00:411
chr11	71155171	rs1044482	C	T	13350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=434;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=216;NR=212;PP=2965;ReadPosRankSum=0.109;SC=CGCAGCTGTACTGGTCACAAG;SOR=0.290;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=429;TCF=216;TCR=213;TR=428;WE=71155179;WS=71155161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,431:1.00:432
chr11	71164471	rs12789751	G	A	3145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=75;PP=2640;SC=GTGGCGCACGGGCACCGTGGC;SOR=2.646;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=20;TCR=75;TR=95;WE=71164479;WS=71164461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr11	71164544	rs12791871	A	C	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=38;PP=1069;SC=GGCCCTGGGCATGGGATCAGG;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=40;WE=71164552;WS=71164534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	71166060	rs2276359	T	TG	3207.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=18;PP=2451;SC=GTTTGTTTTTTTTTTTATCCT;SOR=2.542;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=73;TCF=53;TCR=20;TR=71;WE=71166068;WS=71166050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	71166337	rs1790373	A	G	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=36;PP=1184;SC=CGCCACACCCACTGTTGGGCC;SOR=3.664;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=41;WE=71166345;WS=71166327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	71169547	rs2276360	G	C	5778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=103;PP=2965;SC=AGCGGCCCTTGTGGAGTCTCC;SOR=1.426;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=57;TCR=103;TR=160;WE=71169555;WS=71169537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr11	71169648	rs2276361	A	G	1690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=52;PP=1496;SC=GCTCAAGGGCATGACCCACCC;SOR=7.978;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=0;TCR=52;TR=52;WE=71169656;WS=71169638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	71174452	rs2276362	A	G	6080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=101;NR=96;PP=2965;SC=GGGCAGACACACATGTACCTC;SOR=0.742;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=198;TCF=101;TCR=97;TR=197;WE=71174460;WS=71174442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr11	71174589	rs1629304	T	C	1713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=60;PP=1408;SC=GGCTCTCAGCTGAGGGCTGCC;SOR=4.277;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=7;TCR=60;TR=67;WE=71174597;WS=71174579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	71183463	.	C	T	1955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.203;ClippingRankSum=0.000;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.984;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=39;PP=1447;ReadPosRankSum=0.477;SC=CTGAGATGCTCATCCTCAGCT;SOR=0.341;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=117;TCF=48;TCR=69;TR=71;WE=71183485;WS=71183453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,74:0.62:119
chr11	71183474	rs2282621	C	T	4757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.47;SOR=1.265;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr11	71183477	rs2282620	C	T	4788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.34;SOR=1.287;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr11	71183645	rs2282619	T	C	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=15;PP=382;SC=ATCCAGGTAATGGAAGGCACC;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=71183653;WS=71183635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	71184190	rs7935125	C	A	4382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=117;NR=11;PP=2965;SC=AGGGCACCCACCTCTTCGGAA;SOR=4.632;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=117;TCR=11;TR=128;WE=71184198;WS=71184180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr11	71184678	rs7950441	A	C	4521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=59;PP=2965;SC=GCAGCCACCAAGTGCTGCGCA;SOR=1.156;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=88;TCR=59;TR=147;WE=71184686;WS=71184668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr11	71185479	rs2276354	T	C	10471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=230;NR=107;PP=2965;SC=AGAAGGGTTGTGACGGGGACC;SOR=1.745;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=338;TCF=231;TCR=107;TR=337;WE=71185487;WS=71185469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,344:1.00:344
chr11	71185518	rs2186778	T	C	13921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=463;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=247;NR=199;PP=2965;SC=GTGCCATGATTGCCATGAACG;SOR=0.928;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=447;TCF=248;TCR=199;TR=446;WE=71185526;WS=71185508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,461:1.00:461
chr11	71188502	rs3794065	G	A	6927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=160;PP=2965;SC=CCCCTGTTACGGCGGTAGGAG;SOR=2.451;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=209;TCF=49;TCR=160;TR=209;WE=71188510;WS=71188492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr11	71189436	rs2276353	T	C	4180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=62;PP=2965;SC=AATTTCCTTCTCCAGGAAGTC;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=67;TCR=62;TR=129;WE=71189444;WS=71189426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr11	71192529	rs368250598	AT	A	498.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=1.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=0.783;QD=9.78;ReadPosRankSum=1.425;SOR=0.370;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,40:0.78:51
chr11	71192602	rs3814731	T	C	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=41;PP=1126;SC=GCTTAGTCTGTGCTAGCCAGA;SOR=3.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=47;WE=71192610;WS=71192592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	71192851	rs3814734	A	G	4884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=118;NR=30;PP=2965;SC=GGAAAGTGCTAACACCCACGT;SOR=2.697;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=150;TCF=120;TCR=30;TR=148;WE=71192859;WS=71192841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr11	71259822	rs10792769	A	G	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.562;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=423;ReadPosRankSum=-0.840;SC=GCACCCGTCTACTGCTGCAAG;SOR=0.076;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=63;TCF=49;TCR=14;TR=25;WE=71259830;WS=71259812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr11	71260243	rs2664	T	C	1923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.881;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=57;PP=1296;ReadPosRankSum=-0.824;SC=AGGTAGCTCCTGAAGATCTGT;SOR=0.436;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=248;TCF=74;TCR=174;TR=86;WE=71260251;WS=71260233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,93:0.36:261
chr11	71260348	rs2665	T	A	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=656;ReadPosRankSum=1.868;SC=CCTGAGGAAATGGAATGAACC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=0;TCR=65;TR=29;WE=71260356;WS=71260338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,31:0.44:71
chr11	71276909	rs12289712	G	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.80;MQRankSum=-0.155;QD=3.51;ReadPosRankSum=-1.227;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr11	71498500	rs12786196	G	T	184.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=170;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=2;PP=125;SC=CTGCCCCGGTGCACTGCCCTG;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=71498508;WS=71498490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	71498562	rs12786239	G	C	219.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.62;QD=36.64;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	71498567	rs12788471	A	C	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.78;QD=38.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	71498591	rs12270466	C	G	367.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.70;QD=45.97;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	71498601	rs12283300	G	T	358.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.40;QD=39.86;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	71498648	rs12277291	A	G	270.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=0;PP=61;SC=GCTTCCTGGCAGCGCGCGCCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=71498656;WS=71498638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	71498671	rs12283346	G	C	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=7;PP=264;SC=CGCTCCTTCCGCTGGCAGGTG;SOR=0.836;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=13;WE=71498679;WS=71498661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	71498694	rs11234942	A	G	367.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=58.52;NF=3;NR=6;PP=201;SC=CGGCGGGGCTAGCGGAGAGGT;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=71498702;WS=71498684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	71507232	rs113587125	C	G	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=14.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.19;MQRankSum=-7.473;QD=1.73;ReadPosRankSum=0.095;SOR=0.789;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,15:0.18:83
chr11	71507261	rs111708284	A	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.342;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.606;NF=7;NR=11;PP=222;ReadPosRankSum=-1.547;SC=AGCTGTCCCTACAGGACTCCA;SOR=0.126;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=63;TCF=15;TCR=48;TR=18;WE=71507269;WS=71507251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,13:0.21:62
chr11	71634606	rs11446262	G	GT	472.50	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.91;MQRankSum=0.054;QD=16.87;ReadPosRankSum=-0.954;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,24:0.86:28
chr11	71668362	rs3216157	CT	C	2552.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=54;PP=2417;SC=GTTAACCCAGCTTAATTGAGT;SOR=2.899;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=61;TCF=6;TCR=55;TR=59;WE=71668370;WS=71668352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	71701523	rs2276384	G	A	1236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=2;PP=964;SC=TAGTTTGCCCGCACTTGCTCT;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=33;WE=71701531;WS=71701513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	71707465	rs1055452	T	C	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=25;PP=641;SC=CTCAAAGGGGTGCTTGGGCCA;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=71707473;WS=71707455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	71712175	rs1892919	G	A	3757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=10;PP=2965;SC=GAGCTGGCAGGGAGGGCACAG;SOR=4.351;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=112;TCF=101;TCR=11;TR=111;WE=71712183;WS=71712165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr11	71714526	rs949324	G	C	16259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.68;SOR=3.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,341:1.00:341
chr11	71714526	.	GGT	CGG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=267;NR=37;PP=2947;QD=20;SC=GACCAGGTGAGGTCAGCATCG;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=328;TCF=285;TCR=43;TR=304;WE=71714536;WS=71714516;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:24,304:0.93:328
chr11	71714528	rs949323	T	G	16259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.30;SOR=3.315;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,367:1.00:367
chr11	71715215	rs2845857	C	G	10149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.71;SOR=0.794;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr11	71715218	rs2852365	T	C	10112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.55;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr11	71719619	rs2155145	G	T	1815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=0;PP=1530;SC=CCCGTTTTTCGTTATTCTTCT;SOR=7.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=50;TCR=0;TR=50;WE=71719627;WS=71719609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	71724183	.	C	T	3361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.431;ClippingRankSum=0.000;DP=422;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.693;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=113;PP=2611;ReadPosRankSum=0.241;SC=TTGGCCCGCTCACCCAGCCCC;SOR=0.995;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=416;TCF=129;TCR=287;TR=155;WE=71724191;WS=71724173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:264,156:0.37:420
chr11	71724696	.	C	T	5037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.925;ClippingRankSum=0.000;DP=411;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.368;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=131;NR=56;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.858;SC=GAGCTGCGTTCTGCAGCTCTG;SOR=1.183;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=397;TCF=260;TCR=137;TR=187;WE=71724704;WS=71724686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,192:0.47:408
chr11	71727422	rs1057992	A	C	1129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=3;PP=978;SC=CACACCAACCAGCAGCACACA;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=34;WE=71727430;WS=71727412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	71728543	rs34393610	G	GA	4251.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=24.513;HP=10;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.632;NF=154;NR=7;PP=2716;ReadPosRankSum=-0.107;SC=ATTGACTGGGGAAAAAAAAAA;SOR=5.721;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=220;TCF=206;TCR=14;TR=161;WE=71728551;WS=71728533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:8,163:0.95:171
chr11	71728908	rs11278712	AGTCAAC	A	2151.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=37;PP=2395;SC=CATCACCCAGAGTCAACGCTG;SOR=4.935;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=40;WE=71728921;WS=71728898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	71729656	rs949325	A	G	794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=23;PP=642;SC=AAGGGAGGAGACGGCATAGGG;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=71729664;WS=71729646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	71730715	rs2298456	T	A	913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=26;PP=795;SC=TAAGAAGGTGTAAAGATTTGC;SOR=2.910;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=71730723;WS=71730705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	71733519	rs10128658	C	T	2329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=66;PP=1977;SC=CTTCTCAGTGCCCCCATTCTG;SOR=5.699;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=3;TCR=66;TR=69;WE=71733527;WS=71733509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	71734211	rs2298457	T	C	5080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=67;PP=2965;SC=GACAACAACGTAGAAAACAGG;SOR=0.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=86;TCR=67;TR=153;WE=71734219;WS=71734201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr11	71740378	rs35948003	A	AAC	8846.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=91;PP=2930;SC=CGTTAGAAGCAACATGGTTTG;SOR=0.765;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=164;TCF=64;TCR=100;TR=155;WE=71740386;WS=71740368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr11	71740521	rs1939247	A	T	1706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=48;PP=1425;SC=AGCCACCTGAAATGCAACCAT;SOR=6.518;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=49;WE=71740529;WS=71740511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	71797422	rs597513	T	A	12481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=183;NR=198;PP=2965;SC=CAGCAAGCACTCAACAAATGT;SOR=0.766;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=383;TCF=185;TCR=198;TR=381;WE=71797430;WS=71797412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,394:1.00:394
chr11	71805893	rs74366316	T	A	2288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.631;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=36;PP=1904;ReadPosRankSum=-1.415;SC=GGAGGGCAGGTTGTTCCCCAC;SOR=0.807;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=88;TCR=60;TR=89;WE=71805901;WS=71805883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,86:0.59:146
chr11	71849741	rs652197	C	T	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=0;PP=509;SC=TTATTTGAGCCCAGGATGTTG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=71849749;WS=71849731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	71850130	rs61734430	C	T	9488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=634;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.531;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=182;NR=182;PP=2962;ReadPosRankSum=0.890;SC=CACCTGCAAGCGCCACTTTAT;SOR=0.632;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=623;TCF=309;TCR=314;TR=364;WE=71850138;WS=71850120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:261,371:0.59:632
chr11	71883540	rs633738	G	A	2692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=56;PP=2279;SC=TGGCTTTGGTGACTGCTGCGG;SOR=1.501;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=28;TCR=56;TR=84;WE=71883548;WS=71883530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr11	71932120	rs2508202	G	C	2483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=54;PP=1945;SC=GTCTCCCCCCGACCCACCCCA;SOR=2.400;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=13;TCR=54;TR=67;WE=71932128;WS=71932110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	72018348	rs74559788	G	A	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.544;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=448;ReadPosRankSum=0.906;SC=GTGACTAACCGCTGGAATGAA;SOR=1.061;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=22;WE=72018356;WS=72018338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr11	72281818	rs380126	A	G	8378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=198;NR=80;PP=2965;SC=GAATCCCAACACTCATCCTGC;SOR=1.977;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=279;TCF=199;TCR=80;TR=278;WE=72281826;WS=72281808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr11	72281884	rs433640	C	T	14623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=460;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=274;NR=170;PP=2965;SC=AGCAGGGATTCGCTGTATGGG;SOR=1.277;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=444;TCF=274;TCR=170;TR=444;WE=72281892;WS=72281874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,457:1.00:457
chr11	72282039	rs409512	T	C	7833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=188;PP=2965;SC=CCTTCATTCCTGCCCCAACCC;SOR=1.831;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=270;TCF=82;TCR=188;TR=270;WE=72282047;WS=72282029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr11	72289176	rs379276	C	G	1080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=1;PP=895;SC=ATCAGTTGGACCTGGGCCAGG;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=72289184;WS=72289166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	72289291	rs1135029	T	C	4759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=34;PP=2965;SC=AGATGGGCATTGCAATGTGCT;SOR=2.335;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=112;TCR=34;TR=145;WE=72289299;WS=72289281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr11	72290199	rs11605051	G	A	3257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=27;PP=2773;ReadPosRankSum=1.716;SC=TCTGCCTGGGGGGGGCCGTGC;SOR=0.958;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=71;TCR=27;TR=97;WE=72290207;WS=72290189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,97:0.99:98
chr11	72290493	.	G	A	1165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-4.414;ClippingRankSum=0.000;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=1008;ReadPosRankSum=-1.257;SC=CCATCCCAGTGAGCCTCCACT;SOR=0.883;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=83;TCF=33;TCR=50;TR=46;WE=72290501;WS=72290483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,45:0.54:83
chr11	72291477	rs56350365	G	A	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=2;PP=893;SC=CCAGGAAAATGAGCCAGACAT;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=34;WE=72291485;WS=72291467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	72291883	rs644698	C	A	1836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=15;PP=1531;SC=ATGAGACTCCCAGACACCCCA;SOR=1.919;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=55;WE=72291891;WS=72291873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	72291927	rs577536	T	C	2664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=11;PP=2116;SC=GGCAGGGTCTTACCGAGGCCA;SOR=3.528;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=64;TCR=11;TR=75;WE=72291935;WS=72291917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr11	72292167	rs3781939	G	T	2417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.42;SOR=5.247;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	72292176	rs7108477	C	T	2345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.11;SOR=5.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	72292185	rs3781938	C	A	2143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.66;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	72292353	rs57803658	G	GA	4264.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=93;NR=14;PP=2970;SC=CTGTCCCAGGGAGGGGACCCC;SOR=3.592;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=115;TCF=99;TCR=16;TR=107;WE=72292361;WS=72292343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr11	72292860	rs376724	C	T	992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=5;PP=789;SC=CCGGGGGCAACGGATGTGACA;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=72292868;WS=72292850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	72293039	rs379638	G	A	2223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=46;PP=1808;SC=GTATCAAGACGGGGCCCTTGC;SOR=1.451;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=70;WE=72293047;WS=72293029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	72293079	rs414178	A	G	1532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=36;PP=1251;SC=CCACACTCAAAATCTGGAGTC;SOR=2.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=44;WE=72293087;WS=72293069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	72293324	.	T	C	145	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=5;NR=1;PP=145;QD=29.9618687579;SC=GGGCAGGCCCTATGGCTTCCT;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=72293332;WS=72293323;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	72293602	rs4944557	A	G	2495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=53;PP=1779;SC=TATACTCATCATCGGAGACCT;SOR=1.556;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=30;TCR=53;TR=83;WE=72293610;WS=72293592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr11	72294714	rs408269	C	T	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=27;PP=770;SC=AGTAAAGACCCCACCCCCACT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=72294722;WS=72294704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	72294734	rs56267207	A	AC	452.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=15;PP=581;SC=TTTCATCCAGACCCCGCGCCG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=15;WE=72294742;WS=72294724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	72295502	rs366711	T	C	8968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=111;NR=192;PP=2965;SC=TCCGGGACGCTGGAGGCGGTG;SOR=1.398;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=303;TCF=111;TCR=192;TR=303;WE=72295510;WS=72295492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr11	72295906	rs452228	A	G	8343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=133;NR=140;PP=2965;SC=CTCCCTCCACACCCTCTCACC;SOR=0.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=275;TCF=135;TCR=140;TR=273;WE=72295914;WS=72295896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr11	72296039	rs907850	G	T	3534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=91;PP=2876;SC=CCCTCTGATCGCCCTCACGTC;SOR=3.549;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=15;TCR=92;TR=106;WE=72296047;WS=72296029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr11	72296700	rs424234	C	T	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=52;PP=1576;SC=TATCCAACCTCCTGCCTCCAA;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=54;TCF=2;TCR=52;TR=54;WE=72296708;WS=72296690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	72326210	rs572421	A	G	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=31;PP=1020;SC=GGGTGTCCCCATCCACAGGAG;SOR=2.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=41;WE=72326218;WS=72326200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	72347154	.	C	G	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.027;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.997;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=928;ReadPosRankSum=-1.229;SC=ATGCCTGCCCCCTGAAGCCAC;SOR=0.895;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=25;TCR=40;TR=48;WE=72347162;WS=72347144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,49:0.69:71
chr11	72354028	rs907853	C	A	4618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=59;NR=82;PP=2965;SC=GACACGTGCGCACAGACACCG;SOR=1.082;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=59;TCR=82;TR=141;WE=72354036;WS=72354018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr11	72361883	rs341038	T	C	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=2;PP=684;SC=GTGCCTCAGGTTAGAGTCAGT;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=72361907;WS=72361873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	72361893	rs72349218	TCCCTGAC	T	1482.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=2;PP=1280;SC=TTAGAGTCAGTCCCTGACCCC;SOR=4.804;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=24;WE=72361907;WS=72361873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	72361920	.	TAC	TACAC,T	411	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.03;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=37;MMLQ=26;MQ=55.57;NF=20,20;NR=2,2;PP=411,142;QD=18.8181818182;SC=CAGTCCCCACTACACACACAC;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=46;TCR=4;TR=22,22;WE=72361931;WS=72361910;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.44:50
chr11	72363759	rs12146545	G	A	8196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=113;NR=143;PP=2965;SC=GAGGTCATTCGTCCAAAGTCA;SOR=0.929;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=256;TCF=113;TCR=143;TR=256;WE=72363767;WS=72363749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr11	72366929	rs907858	C	A	2527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=54;PP=2116;SC=ACCCTCGGGCCCCCCAGAGTG;SOR=1.395;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=85;TCF=29;TCR=56;TR=83;WE=72366937;WS=72366919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	72367102	rs907857	C	T	735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=21;PP=699;SC=GCCCGGCATCCGGAGAGGAAT;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=72367110;WS=72367092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	72368986	rs3781916	T	G	3777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=31;PP=2965;SC=GGGCAGGGCATGTCCCTCCTG;SOR=2.066;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=82;TCR=31;TR=113;WE=72368994;WS=72368976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr11	72396800	rs12802369	A	G	7565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=100;NR=146;PP=2965;SC=AAGCTGCTGCAGCTGCTGCAG;SOR=1.138;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=246;TCF=100;TCR=146;TR=246;WE=72396808;WS=72396790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr11	72396990	rs12805218	G	A	8135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=144;NR=105;PP=2965;SC=GAGGGCAATCGGGGAGGGCAA;SOR=1.042;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=250;TCF=145;TCR=105;TR=249;WE=72396998;WS=72396980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr11	72399607	rs2306609	G	A	2546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.358;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=71;PP=2115;ReadPosRankSum=-1.012;SC=GGAGAAGAGGGCACTTTAGTC;SOR=2.859;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=85;TCF=12;TCR=73;TR=82;WE=72399615;WS=72399597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,83:0.97:86
chr11	72404003	rs11235567	A	G	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=41;PP=1235;SC=AATGAGGGAGAAGGGTGGCCC;SOR=6.184;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=42;WE=72404011;WS=72403993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	72404958	rs12276972	A	C	2284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=58;PP=1921;SC=CTCCAACCATATGCAAGTGCC;SOR=3.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=12;TCR=58;TR=70;WE=72404966;WS=72404948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	72405868	rs2306608	C	T	1404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=0;PP=1235;SC=TGCCAGCACCCTATCACCACC;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=41;WE=72405876;WS=72405858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	72407770	rs2306612	G	C	2900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=68;PP=2394;SC=CTGGGCTGCTGTGCCTCTCAT;SOR=3.030;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=15;TCR=68;TR=83;WE=72407778;WS=72407760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	72407977	rs11602233	C	A	3140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=9;PP=2619;SC=CGCAGGAGTCCGGAGGGATGG;SOR=4.317;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=83;TCR=9;TR=92;WE=72407985;WS=72407967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	72408657	rs2291289	C	T	5735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=77;PP=2965;SC=TTCGCTCCACCAGCACCAGCA;SOR=0.787;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=165;TCF=88;TCR=77;TR=165;WE=72408665;WS=72408647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr11	72408840	rs200428900	AGGATGGCGG	A	1342.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.900;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=2938;ReadPosRankSum=1.037;SC=ATGAGAGGGCAGGATGGCGGC;SOR=0.524;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=72;TCF=23;TCR=49;TR=29;WE=72408856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,36:0.45:80
chr11	72411082	rs7110501	T	C	5674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=63;PP=2965;SC=CAGAAGCATCTATCACTCTGT;SOR=1.408;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=111;TCR=63;TR=174;WE=72411090;WS=72411072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr11	72411099	rs10898866	C	T	5771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.900;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=74;PP=2965;ReadPosRankSum=1.401;SC=CTGTACTCTGCCTCCTGCTAC;SOR=0.877;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=181;TCF=106;TCR=75;TR=180;WE=72411107;WS=72411089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,188:0.99:189
chr11	72412675	rs11235574	A	G	2124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=5;PP=1694;SC=GCTAAAGCAGAGTCTGGGGTG;SOR=4.582;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=56;TCR=5;TR=61;WE=72412683;WS=72412665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	72414189	rs3765105	G	A	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.329;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=427;ReadPosRankSum=0.172;SC=AAGGGGCTACGGGGGAGGAGA;SOR=2.147;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=22;WE=72414197;WS=72414179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr11	72416732	rs4598696	GG	CT	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=1;PP=1387;ReadPosRankSum=1.366;SC=TTATCACAAAGGGTCTCTTCC;SOR=0.257;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=52;TCF=51;TCR=1;TR=27;WE=72416741;WS=72416722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr11	72528973	rs891655	C	T	1772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=48;PP=1455;SC=ACGGGTACTCCTGTGTTTGCT;SOR=4.615;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=3;TCR=48;TR=51;WE=72528981;WS=72528963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	72532569	rs1864651	G	T	4932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=66;PP=2965;SC=CCTGTGCAAGGTCCCAAACCT;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=151;TCF=85;TCR=66;TR=151;WE=72532577;WS=72532559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr11	72532621	rs1864652	T	G	4089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=82;PP=2965;SC=GGCGGGCAGGTGAGCAGCCGA;SOR=1.574;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=41;TCR=82;TR=123;WE=72532629;WS=72532611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr11	72532708	rs11235603	C	T	1602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=44;PP=1356;SC=CCTGTCCGCCCCCAGATGGCC;SOR=4.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=48;WE=72532716;WS=72532698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	72533711	rs4944806	A	G	2417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=24;PP=2015;SC=ATGTGGTCGGAGCCCACGAGA;SOR=1.451;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=71;TCF=46;TCR=25;TR=70;WE=72533719;WS=72533701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	72536272	rs2303969	G	A	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.095;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=3;PP=681;ReadPosRankSum=-0.748;SC=CACAGGCACCGGTAAGAGGGC;SOR=0.273;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=54;TCF=51;TCR=3;TR=30;WE=72536280;WS=72536262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr11	72537072	rs3765638	G	A	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.042;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=372;ReadPosRankSum=-0.848;SC=GCCCAGGCCCGCAGAACAGAC;SOR=0.152;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=22;WE=72537080;WS=72537062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr11	72538141	rs3862793	T	C	1631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=2;PP=1418;SC=GGGAGGACACTGGGTTCTGGG;SOR=5.549;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=50;TCF=48;TCR=2;TR=50;WE=72538149;WS=72538131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	72540225	rs891657	G	T	2366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=27;PP=1879;ReadPosRankSum=-0.867;SC=GAGCTAACTTGACAGATGAGG;SOR=0.501;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=50;TCR=28;TR=76;WE=72540233;WS=72540215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,79:0.99:80
chr11	72554407	rs3217361	A	AGGG	10655.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=437;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.128;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.265;NF=89;NR=117;PP=2973;ReadPosRankSum=0.627;SC=ACAAGTTTACACACACAATTT;SOR=0.785;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=360;TCF=155;TCR=205;TR=206;WE=72554415;WS=72554397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,265:0.61:432
chr11	72598704	rs7129851	G	A	2363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=63;PP=1905;SC=ATAATTCAAAGGGCTTTAGTG;SOR=8.468;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=0;TCR=63;TR=63;WE=72598712;WS=72598694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	72788823	rs6592510	C	T	5989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=113;PP=2965;SC=ATTATAAGGACACACAGGAAA;SOR=1.190;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=188;TCF=75;TCR=113;TR=188;WE=72788831;WS=72788813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr11	72945341	rs2511241	C	T	9996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.95;NF=189;NR=112;PP=2965;SC=GTGTGCGTGCCTGGGCTGTGT;SOR=1.322;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=301;TCF=189;TCR=112;TR=301;WE=72945349;WS=72945331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr11	73020058	rs12272360	C	T	3570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.976;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.99;MQRankSum=1.262;NF=105;NR=27;PP=2796;ReadPosRankSum=0.559;SC=CCTGGCCCAGCGTCACCGAGA;SOR=0.987;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=214;TCF=167;TCR=47;TR=132;WE=73020066;WS=73020048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,135:0.61:221
chr11	73020375	rs139105330	G	GCTC	3073.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.188;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.005;NF=24;NR=33;PP=2733;ReadPosRankSum=-0.438;SC=CGGGCCTCCTGCTCCTCCTCC;SOR=0.342;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=136;TCF=50;TCR=86;TR=57;WE=73020383;WS=73020365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,76:0.67:113
chr11	73063780	rs75771454	G	A	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=2;PP=1044;ReadPosRankSum=0.908;SC=CTGCAGGCCCGGGTGATTCTG;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=75;TCR=3;TR=47;WE=73063788;WS=73063770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,48:0.61:79
chr11	73072965	rs10553377	CCACA	C	1780.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=0;PP=1660;ReadPosRankSum=0.826;SC=TATAGGGCATCCACACACACA;SOR=0.897;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=83;TCF=83;TCR=0;TR=36;WE=73072976;WS=73072955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,46:0.55:84
chr11	73076590	rs61749197	C	T	6487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=413;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=121;PP=2962;ReadPosRankSum=1.471;SC=TCACTCCTCCCGTGCACAGGA;SOR=0.724;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=397;TCF=196;TCR=201;TR=242;WE=73076598;WS=73076580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,250:0.61:410
chr11	73100232	rs11826896	C	T	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.325;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=593;ReadPosRankSum=0.180;SC=TTATGGTGAGCTGGGGATGGG;SOR=1.061;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=55;TCF=34;TCR=21;TR=30;WE=73100240;WS=73100222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
chr11	73100320	rs11826909	C	G	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.086;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=705;ReadPosRankSum=1.745;SC=GGGGAACCCCCTGCTGGGCAG;SOR=0.446;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=64;TCF=29;TCR=35;TR=40;WE=73100328;WS=73100310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,44:0.64:69
chr11	73106088	rs28641751	C	G	1572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.545;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=9;PP=1151;ReadPosRankSum=-0.348;SC=CTCTGTGCCCCGGGATCCCCG;SOR=1.694;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=95;TCF=79;TCR=16;TR=62;WE=73106096;WS=73106078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,67:0.65:103
chr11	73106690	rs7101831	T	C	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=312;ReadPosRankSum=-0.451;SC=TGGGAGCGTCTGCCCCAGTGA;SOR=0.404;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=18;WE=73106698;WS=73106680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr11	73120653	rs10793060	A	G	2571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.318;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=64;PP=2065;ReadPosRankSum=-0.704;SC=CGACCGTGGTATGGTGGATGA;SOR=1.469;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=160;TCF=59;TCR=101;TR=93;WE=73120661;WS=73120643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,96:0.58:166
chr11	73179426	rs1939383	G	A	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.073;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=647;ReadPosRankSum=-0.394;SC=TTCTCAAAATGAGAGCCATTC;SOR=0.899;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=67;TCF=52;TCR=15;TR=31;WE=73179434;WS=73179416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr11	73362766	rs670811	C	T	7469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.591;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=150;NR=73;PP=2965;ReadPosRankSum=1.630;SC=CTATTCCTGTCCCTGCTTTAC;SOR=1.341;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=225;TCF=150;TCR=75;TR=223;WE=73362774;WS=73362756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,235:1.00:236
chr11	73364368	rs6592527	C	G	2227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=5;PP=1831;SC=TCCAGCTGCTCCTCACAACAG;SOR=4.648;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=57;TCR=5;TR=62;WE=73364376;WS=73364358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	73364629	rs7942217	T	A	2329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=66;PP=1937;SC=ATTTGCAGTGTCTGGCCCTTT;SOR=5.699;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=3;TCR=66;TR=69;WE=73364637;WS=73364619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	73364673	rs7952228	G	A	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=38;PP=1096;SC=GGCTTAAACCGAGGACTGAAG;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=38;WE=73364681;WS=73364663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	73366697	rs2008734	G	A	1633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=0;PP=1336;ReadPosRankSum=-0.442;SC=GTTACCATGAGCTGAGGAGAA;SOR=1.450;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=84;TCF=84;TCR=0;TR=54;WE=73366705;WS=73366687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,55:0.65:85
chr11	73390772	rs71469461	GAA	G	7521.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=102;PP=2950;SC=AGAGCTGTGGGAAAGAGAGAA;SOR=1.502;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=138;TCF=33;TCR=105;TR=135;WE=73390781;WS=73390762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr11	73415073	.	CA	C	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=2.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=-1.262;QD=2.04;ReadPosRankSum=-0.440;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr11	73441772	rs2037709	A	C	3190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=41;PP=2434;SC=ACTTGTAACAAAAAATAGACA;SOR=0.776;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=49;TCR=41;TR=90;WE=73441780;WS=73441762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	73611349	rs2067912	G	C	1738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.653;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=18;PP=1296;ReadPosRankSum=0.798;SC=GATGTGAATTGTTGCAGGTTT;SOR=0.595;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=150;TCF=105;TCR=45;TR=62;WE=73611357;WS=73611339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,67:0.43:156
chr11	73669310	rs10793068	C	A	2283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.720;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=33;PP=1762;ReadPosRankSum=1.422;SC=CTCTGGTCCGCCCTCAGAAAC;SOR=0.570;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=220;TCF=147;TCR=73;TR=93;WE=73669318;WS=73669300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,95:0.42:225
chr11	73669334	rs10793069	A	C	2394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.880;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.98;MQRankSum=0.888;NF=58;NR=47;PP=1760;ReadPosRankSum=0.244;SC=CCAGCTGATAAGACTTGTATT;SOR=0.525;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=238;TCF=138;TCR=100;TR=105;WE=73669342;WS=73669324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,106:0.44:243
chr11	73670645	rs653263	T	C	1817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=22;PP=1341;ReadPosRankSum=-1.502;SC=ACGTCTTCCATGGCAAACCTG;SOR=0.680;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=183;TCF=127;TCR=56;TR=76;WE=73670653;WS=73670635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,79:0.42:187
chr11	73670793	rs112136608	TTATTA	T	1691.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.17;MQRankSum=5.455;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.143;SOR=0.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,52:0.38:138
chr11	73675810	.	CTGTGTG	C,CTG	202.74	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.27;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;NF=8,8;NR=1,1;PP=69,375;SC=GATAGGGAGGCTGTGTGTGTG;SOR=4.174;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=9,9;WE=73675823;WS=73675800;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:8
chr11	73675860	.	G	GCGCGCGCGCGCC	340	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=19;MQ=56.76;NF=8;NR=1;PP=340;QD=39.7777777778;SC=GTGTGTGTGCGCGCGCGCGCA;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=9;WE=73675868;WS=73675850;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr11	73686859	rs10535527	ACTT	A	424.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=333;ReadPosRankSum=0.026;SC=GTAATCCAGGACTTCTTTTGG;SOR=0.560;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=9;WE=73686869;WS=73686849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr11	73689104	rs660339	G	A	2450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=47;PP=1929;ReadPosRankSum=-2.091;SC=CTGGGCGCTGGCTGTAGCGCG;SOR=0.674;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=226;TCF=116;TCR=110;TR=95;WE=73689112;WS=73689094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,98:0.43:230
chr11	73715542	rs2075577	G	A	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=5;PP=605;ReadPosRankSum=-0.989;SC=TGAGCAGGTGGTAGTCCAGCA;SOR=0.594;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=83;TCR=15;TR=32;WE=73715550;WS=73715532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,33:0.33:101
chr11	73717024	rs1726747	AT	TC	3995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=37;PP=2947;SC=ACTAAGCAGCATTCTGGGACA;SOR=0.990;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=80;TCF=36;TCR=44;TR=70;WE=73717033;WS=73717014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	73717074	rs11235972	G	A	2728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=16;PP=2281;SC=CTTCCTTGATGTCCACTCAGA;SOR=2.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=67;TCR=16;TR=83;WE=73717082;WS=73717064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	73717121	rs2075576	C	T	4224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=25;PP=2965;SC=CTTCCCCCCGCCCCTGGCTCT;SOR=2.833;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=133;TCF=108;TCR=25;TR=132;WE=73717129;WS=73717111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr11	73717254	rs1800006	A	G	8041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=142;PP=2965;SC=TGACGGAGTCATAGAGGCCGA;SOR=0.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=264;TCF=122;TCR=142;TR=264;WE=73717262;WS=73717244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr11	73785326	rs4453265	T	C	4540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=61;PP=2965;SC=TTGCTCTTTCTACTAGGATGC;SOR=0.971;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=78;TCR=61;TR=139;WE=73785334;WS=73785316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr11	73789777	rs1726735	T	G	5297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=17;NR=138;PP=2965;SC=CGGGAGAAAATAAAGATTCTC;SOR=4.027;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=17;TCR=138;TR=155;WE=73789785;WS=73789767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr11	73796608	rs1095424	T	C	4674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=7;PP=2965;ReadPosRankSum=0.123;SC=AGGGCTATACTATTCACAATG;SOR=4.265;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=129;TCR=7;TR=134;WE=73796616;WS=73796598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,140:0.99:141
chr11	73803389	rs7941525	C	T	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=602;SC=TGTGAACCACCGCACCCGGCT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=73803397;WS=73803379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	73805145	.	T	C	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=5.531;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=524;ReadPosRankSum=1.575;SC=AATTCCCTAGTAGTTATGGTT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=22;WE=73805153;WS=73805135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr11	73806443	rs11235995	C	T	3096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=63;PP=2410;SC=TCCATTTCCTCGGTCCTCTGC;SOR=1.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=29;TCR=63;TR=92;WE=73806451;WS=73806433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	73825503	rs10898957	T	C	4710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=47;PP=2965;SC=GAGGACTATCTGGAGGAACTC;SOR=1.771;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=105;TCR=47;TR=151;WE=73825511;WS=73825493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr11	73833944	rs60834556	G	A	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=404;SC=GGTAAGTTATGTAAAATGCAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=15;WE=73833965;WS=73833934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	73833957	rs145193996	C	CTGTCTGGCAAGTGA	1122.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=2957;SC=AAATGCATAGCTGTCATGCCT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=11;WE=73833965;WS=73833934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	73844434	rs61901246	A	G	2159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=5;PP=1786;SC=CTATTAAGAAATGAACTGTTA;SOR=4.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=54;TCR=5;TR=59;WE=73844442;WS=73844424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	73850973	rs11236018	C	G	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=455;SC=CCATTCCCTACAGGATTGTAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=73850981;WS=73850963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	73872701	rs147282233	G	GA	507.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=412;ReadPosRankSum=0.245;SC=TTTCTAACTTGAAAAAAAATA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=20;WE=73872709;WS=73872691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr11	73881580	rs3814724	T	A	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=550;SC=ATTAATCGCCTGTCTGTGGCC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=73881588;WS=73881571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	73881848	rs113789115	A	G	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.198;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=42;PP=1061;ReadPosRankSum=-0.746;SC=GATGAGCCCGAGCTCTTCTTC;SOR=2.454;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=107;TCF=23;TCR=84;TR=47;WE=73881856;WS=73881838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,49:0.43:113
chr11	73882260	rs1726746	T	G	4921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=102;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.720;SC=TTTGTATGAGTGCTGTTGCGC;SOR=0.675;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=52;TCR=103;TR=154;WE=73882268;WS=73882250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,158:0.99:159
chr11	73947080	rs2302508	C	G	9588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=184;PP=2965;SC=CAGATTGCTTCTTTTGTCTTA;SOR=1.377;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=295;TCF=111;TCR=184;TR=295;WE=73947088;WS=73947070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr11	73964689	rs3741133	G	A	2473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=69;PP=2070;SC=CGGGCACCCCGAGATGTACCA;SOR=8.581;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=0;TCR=69;TR=69;WE=73964697;WS=73964679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr11	73978243	rs3741132	G	A	2945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.449;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=60;PP=2202;ReadPosRankSum=-1.170;SC=TTTGGCTCCTGGCTTCTCTGG;SOR=0.654;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=262;TCF=123;TCR=139;TR=114;WE=73978251;WS=73978233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,119:0.45:264
chr11	73988167	rs2282488	C	T	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.661;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=35;PP=1074;ReadPosRankSum=0.586;SC=AGTTTTGGGTCAACAGTGTCC;SOR=0.939;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=171;TCF=84;TCR=87;TR=63;WE=73988175;WS=73988157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,64:0.37:172
chr11	74000249	rs11419151	T	TA	275.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.01;MQRankSum=0.884;QD=14.52;ReadPosRankSum=-1.456;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
chr11	74015599	rs10898976	G	C	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=137;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CAACCAAAAAGCCATGCAAGC;SOR=0.245;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=10;WE=74015607;WS=74015589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr11	74047683	rs1044782	A	G	9805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=178;NR=158;PP=2965;SC=GTGTCATGACATATTGGTGTA;SOR=0.779;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=336;TCF=178;TCR=158;TR=336;WE=74047691;WS=74047673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,338:1.00:338
chr11	74049569	rs3867270	A	G	4739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=44;PP=2965;SC=GTTCTGTTCCACTTGTCCGAA;SOR=1.967;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=159;TCF=114;TCR=45;TR=158;WE=74049577;WS=74049559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr11	74053547	rs592644	C	T	2896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=46;PP=2396;SC=CCAGTGGTAACGTCCCGTACA;SOR=0.736;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=48;TCR=46;TR=93;WE=74053555;WS=74053537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	74054346	rs641271	G	T	3992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=101;NR=23;PP=2965;SC=AAATTTTGAAGATTTTAATAT;SOR=2.889;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=102;TCR=23;TR=124;WE=74054354;WS=74054336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr11	74057647	rs519083	T	C	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=0;PP=1287;SC=GTGGTTATTTTGGGATAATGG;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=43;WE=74057655;WS=74057637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	74057931	rs3741130	C	T	5987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=136;PP=2965;SC=TCAATGTTAACGTTCCTGTAT;SOR=2.473;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=39;TCR=136;TR=175;WE=74057939;WS=74057921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr11	74079475	rs11236077	A	G	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.899;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=10;PP=793;ReadPosRankSum=0.128;SC=TACTCAACACATATTATTTGA;SOR=0.280;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=120;TCF=102;TCR=18;TR=51;WE=74079483;WS=74079465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,53:0.43:124
chr11	74085384	rs61288268	C	T	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.041;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=0;PP=716;ReadPosRankSum=0.872;SC=GCCTCAGCCTCCCAAACTGCT;SOR=2.570;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=66;TCR=3;TR=29;WE=74085392;WS=74085374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,32:0.44:72
chr11	74085420	rs35170680	T	G	3726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=10;PP=2965;SC=AGCCACCATGTCCAGTCAAAA;SOR=4.235;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=96;TCR=10;TR=106;WE=74085428;WS=74085410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr11	74109166	rs12049823	A	G	1825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=30;PP=1301;ReadPosRankSum=0.089;SC=GGGGGCGTGGAGCAGGTTGGA;SOR=0.715;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=119;TCR=72;TR=80;WE=74109174;WS=74109156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,79:0.41:193
chr11	74109342	rs904155	C	T	1955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=54;PP=1648;SC=GCAGGGTGTTCGTAACAGCTC;SOR=5.318;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=3;TCR=54;TR=57;WE=74109350;WS=74109332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	74110353	rs515924	A	G	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.615;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=12;PP=1106;ReadPosRankSum=0.402;SC=AAAAACGGCAATGACTTTTGT;SOR=0.518;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=164;TCF=131;TCR=33;TR=57;WE=74110361;WS=74110343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,62:0.36:172
chr11	74110542	rs676103	T	C	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=421;ReadPosRankSum=-1.711;SC=AAAAGGAAATTGGTTCACCCA;SOR=0.597;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=0;TCR=54;TR=25;WE=74110550;WS=74110532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr11	74203308	rs586088	T	A	5606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=82;PP=2965;SC=GTGACGCCTGTCCCAACCAGT;SOR=0.773;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=173;TCF=90;TCR=83;TR=172;WE=74203316;WS=74203298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr11	74204198	rs10736797	G	A	2851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=32;PP=2095;SC=CCTCACCTCCGTTGGTCCAGC;SOR=1.396;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=58;TCR=32;TR=90;WE=74204206;WS=74204188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	74204269	rs10736798	T	G	3080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=57;PP=2247;SC=ACCGCCCTGCTCCGCGGCGCT;SOR=1.201;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=37;TCR=57;TR=94;WE=74204277;WS=74204259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr11	74204727	rs4944895	A	G	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=16;PP=904;SC=AGGCGCACCAACCGAACGGCG;SOR=0.826;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=16;TCR=16;TR=32;WE=74204735;WS=74204717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	74207856	rs643738	G	A	8583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=202;NR=55;PP=2965;SC=AACATCCCCAGTGGGAAAAAA;SOR=2.694;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=258;TCF=203;TCR=55;TR=257;WE=74207864;WS=74207846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr11	74208029	rs655025	C	T	9477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=132;NR=149;PP=2965;SC=GCATTACTCACTGCATTTTTT;SOR=0.820;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=281;TCF=132;TCR=149;TR=281;WE=74208037;WS=74208019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr11	74208214	rs656506	G	A	6101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=97;NR=76;PP=2965;SC=AACATCTTACGGAAGAGTATG;SOR=0.897;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=97;TCR=76;TR=173;WE=74208222;WS=74208204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr11	74208592	rs657339	G	T	1806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=23;PP=1427;SC=TTACTGGCAAGTTCAGTAATG;SOR=0.922;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=28;TCR=23;TR=51;WE=74208600;WS=74208582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	74340076	rs61903865	G	T	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=519;ReadPosRankSum=0.312;SC=GTCACCTCATGAAGTGACTTA;SOR=0.735;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=22;WE=74340084;WS=74340066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr11	74407676	rs3819242	C	T	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=309;ReadPosRankSum=-0.654;SC=TGTGTCTGCACGTGCACAACA;SOR=1.721;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=14;WE=74407684;WS=74407666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr11	74408384	rs10751240	C	T	2451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.850;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=48;PP=1934;ReadPosRankSum=-0.171;SC=AGGCAAAAACCTACAGTCGGT;SOR=1.132;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=130;TCF=59;TCR=71;TR=83;WE=74408392;WS=74408374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,88:0.65:136
chr11	74408619	rs3741124	C	G	6754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=457;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.756;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=130;PP=2962;ReadPosRankSum=0.654;SC=AATCCTAGCTCTGGTCATTAG;SOR=0.568;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=438;TCF=200;TCR=238;TR=248;WE=74408641;WS=74408609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,261:0.58:453
chr11	74408633	rs3741123	A	G	6518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=478;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.530;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=146;PP=2962;ReadPosRankSum=0.403;SC=TCATTAGAACATGTATACGTC;SOR=0.637;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=455;TCF=193;TCR=262;TR=258;WE=74408641;WS=74408609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:201,273:0.58:474
chr11	74408740	rs3741122	C	T	2443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-9.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=73;PP=1864;ReadPosRankSum=0.162;SC=CTGTCACCTGCACCATCCTGC;SOR=0.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=29;TCR=122;TR=90;WE=74408748;WS=74408730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,95:0.61:156
chr11	74417396	rs11236223	A	T	4465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.961;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=52;PP=2962;ReadPosRankSum=2.053;SC=AATATAGTGGATGTTCATGTA;SOR=0.774;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=285;TCF=198;TCR=87;TR=168;WE=74417404;WS=74417386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,178:0.59:301
chr11	74460469	.	G	C	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.490;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.740;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=174;ReadPosRankSum=-1.017;SC=GAGCGAGGCCGAGCGCGCCCC;SOR=0.991;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=10;WE=74460477;WS=74460459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr11	74617195	rs11236266	C	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=183;ReadPosRankSum=-0.543;SC=GTGATATTCACCATGACCAAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=9;WE=74617203;WS=74617185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr11	74645032	rs140602440	G	GTTCA	3935.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.349;NF=3;NR=65;PP=2993;ReadPosRankSum=0.953;SC=TTGTTTGCTTGTTCATTCATT;SOR=4.340;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=131;TCF=7;TCR=124;TR=68;WE=74645040;WS=74645022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,90:0.99:91
chr11	74660504	rs1282689	A	C	8614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=187;NR=72;PP=2965;ReadPosRankSum=1.696;SC=GCGGCGAGCCAACCTTCCCAT;SOR=1.322;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=262;TCF=189;TCR=73;TR=259;WE=74660512;WS=74660494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,270:0.99:273
chr11	74660631	rs1282690	G	A	13098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=421;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=162;NR=241;PP=2965;SC=ACCTGGACCCGGTCCTCTTTA;SOR=1.154;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=404;TCF=163;TCR=241;TR=403;WE=74660639;WS=74660621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,416:1.00:416
chr11	74674612	rs71848982	GTTTA	G	579.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=63.51;NF=15;NR=0;PP=674;SC=TTGTTTGTTTGTTTATTTATT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=15;WE=74674623;WS=74674602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	74676794	rs514534	G	C	7634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=109;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.717;SC=TTGATTCCTTGTTTTTCTCAC;SOR=0.273;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=235;TCF=125;TCR=110;TR=233;WE=74676802;WS=74676784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,244:1.00:245
chr11	74700896	rs681566	A	G	6462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=170;NR=17;PP=2965;SC=AGAAAGCGGGAAGGACTTGAT;SOR=4.340;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=188;TCF=171;TCR=17;TR=187;WE=74700904;WS=74700886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr11	74705696	rs544115	T	C	13321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=435;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=175;NR=248;PP=2965;SC=AGAAGCGTTCTACGAGGAGAG;SOR=1.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=423;TCF=175;TCR=248;TR=423;WE=74705704;WS=74705686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,429:1.00:429
chr11	74862356	rs2851069	T	C	2187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=16;PP=1794;SC=GAAGATTTGCTTCCTCTCCCC;SOR=2.200;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=65;WE=74862364;WS=74862346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	74862391	rs1944612	A	G	2730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=31;PP=2244;SC=TCCTGAGATTAAATTAGGGGC;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=53;TCR=31;TR=84;WE=74862399;WS=74862381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr11	74904362	rs1621378	T	C	9819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=184;NR=130;PP=2965;SC=GGCATGGCCATCTTCCTGCCC;SOR=1.073;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=315;TCF=184;TCR=131;TR=314;WE=74904370;WS=74904352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,325:1.00:325
chr11	74988021	rs34053901	G	GTCCCC	859.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.597;NF=1;NR=17;PP=855;ReadPosRankSum=-0.304;SC=TCTCACAGGCGTCCCCGGGTT;SOR=0.751;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=58;TCF=3;TCR=55;TR=18;WE=74988029;WS=74988011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr11	74989590	.	G	T	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.004;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.234;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=1;PP=853;ReadPosRankSum=1.944;SC=GGAGAGAGCTGGGATCTGAGG;SOR=2.517;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=54;TCF=51;TCR=3;TR=36;WE=74989598;WS=74989580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,36:0.68:53
chr11	74994352	rs877711	G	A	2793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.532;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=46;PP=2243;ReadPosRankSum=0.532;SC=AAGGGTAAGCGTGCTCGCCCA;SOR=0.774;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=196;TCF=112;TCR=84;TR=109;WE=74994360;WS=74994342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,109:0.55:197
chr11	74995350	rs647630	C	T	2228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=41;PP=1856;ReadPosRankSum=-0.801;SC=GAGTAAGCGGCCTCTCCCAAC;SOR=0.713;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=234;TCF=132;TCR=102;TR=94;WE=74995358;WS=74995340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,95:0.38:247
chr11	74995509	rs899115	C	G	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-4.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=34;PP=825;ReadPosRankSum=-1.229;SC=TTCCCCCATCCCAGGCCAGTA;SOR=1.436;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=0;TCR=52;TR=34;WE=74995517;WS=74995499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,33:0.65:51
chr11	75023093	rs546812	A	G	14249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=239;NR=203;PP=2965;ReadPosRankSum=0.063;SC=CCCCTCCTCTAAGTGCTGATC;SOR=0.294;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=445;TCF=241;TCR=204;TR=442;WE=75023101;WS=75023083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,445:1.00:446
chr11	75023291	rs71467873	G	T	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=34;PP=795;ReadPosRankSum=-0.981;SC=CTGAGAACAGGCCTGCCCCTG;SOR=0.551;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=35;WE=75023299;WS=75023281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,36:0.64:56
chr11	75141630	rs11236430	T	C	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.656;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=14;PP=549;ReadPosRankSum=-0.330;SC=CGCACGGCGCTTCGCAGCCCG;SOR=0.442;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=29;WE=75141638;WS=75141620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,31:0.43:72
chr11	75141762	rs3018101	T	C	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.873;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=204;ReadPosRankSum=-0.458;SC=TTATTTCCTCTCTTGACCATT;SOR=0.214;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=12;WE=75141770;WS=75141752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr11	75152243	rs571353	C	T	5611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=151;NR=44;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.848;SC=TGGGACAGGGCGTGGGAGTTG;SOR=1.332;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=202;TCF=157;TCR=45;TR=195;WE=75152251;WS=75152233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,202:1.00:203
chr11	75154067	rs532454	C	T	4420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=21;PP=2965;SC=GTGGAGGTCGCGAAAGCTCTG;SOR=3.308;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=140;TCF=119;TCR=21;TR=139;WE=75154075;WS=75154057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr11	75155743	rs479574	T	C	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=22;PP=725;SC=GCCTACCTCATTGGTTTTACT;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=75155751;WS=75155733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	75160213	rs473462	G	A	2400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=66;PP=1966;SC=CCCTGGGCAGGTTGGGGTGCA;SOR=4.062;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=8;TCR=66;TR=74;WE=75160221;WS=75160203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	75160575	rs518611	G	A	4954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.367;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=58;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.540;SC=TCCGCTCTGCGCGGGCGAACT;SOR=1.198;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=162;TCF=101;TCR=61;TR=159;WE=75160583;WS=75160565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,163:0.99:164
chr11	75167704	rs1793410	T	C	8380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=143;NR=128;PP=2965;SC=ATTCTAACGGTGATCCAGGGG;SOR=0.808;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=271;TCF=143;TCR=128;TR=271;WE=75167712;WS=75167694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr11	75188569	rs1790149	C	T	3659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=40;PP=2754;SC=CTGTCCAGAGCGAGTCAGCAG;SOR=1.648;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=122;TCF=82;TCR=40;TR=119;WE=75188577;WS=75188559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr11	75277628	rs584961	A	G	1400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=19;PP=1233;SC=CCTCGTCGCTAGGGCTCGTGT;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=41;WE=75277636;WS=75277618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	75277992	rs651581	C	T	10666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.03;NF=87;NR=242;PP=2965;SC=CGGCGCCCTGCTAGTCAACGC;SOR=2.149;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=329;TCF=87;TCR=242;TR=329;WE=75278000;WS=75277982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,332:1.00:332
chr11	75278040	rs35462148	G	GTCC	6426.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.907;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.05;MQRankSum=0.219;NF=18;NR=95;PP=2983;ReadPosRankSum=0.709;SC=GCGTTCAGGGGTCCTCCTCCT;SOR=0.155;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=176;TCF=21;TCR=155;TR=113;WE=75278048;WS=75278030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,150:0.97:155
chr11	75378674	rs12225010	A	C	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.180;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=27;ReadPosRankSum=-0.393;SC=CGCGGCGCACAATCCAGGCAG;SOR=1.925;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=18;TCF=10;TCR=8;TR=4;WE=75378682;WS=75378664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr11	75428958	rs554202	A	G	2926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.127;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=33;PP=2286;ReadPosRankSum=0.141;SC=GCCCTTGTTTATGCCGTGGGA;SOR=1.001;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=160;TCF=106;TCR=54;TR=104;WE=75428966;WS=75428948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,107:0.65:164
chr11	75430950	rs650861	A	G	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-6.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=4;PP=1036;ReadPosRankSum=-1.809;SC=TGCTAGTGCCAGGCCTATGGG;SOR=0.566;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=86;TCF=80;TCR=6;TR=54;WE=75430958;WS=75430940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,51:0.60:85
chr11	75501852	rs2510635	A	G	1552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=43;PP=1360;SC=ACCCACCCACAGGGAAGCAAG;SOR=3.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=7;TCR=43;TR=50;WE=75501860;WS=75501842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	75902539	rs11236648	A	G	1103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=1;PP=864;ReadPosRankSum=-0.366;SC=TGTGTGCGTGACCCTGAGCTG;SOR=0.410;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=59;TCF=58;TCR=1;TR=35;WE=75902547;WS=75902529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,37:0.60:62
chr11	75902571	rs2508779	A	G	3234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=9;PP=2613;SC=GTGCAACACCAGTGACCCTTT;SOR=4.768;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=104;TCR=9;TR=113;WE=75902579;WS=75902561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr11	75905800	rs1533767	G	A	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=179;ReadPosRankSum=1.518;SC=AGGAGCAGCCGGGCAGGTCGC;SOR=0.657;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=10;WE=75905808;WS=75905790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr11	75907438	rs3215303	AC	A	1703.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.651;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=60.12;MQRankSum=0.732;NF=47;NR=7;PP=1946;ReadPosRankSum=2.293;SC=CCACCCATGAACCCATCCCTC;SOR=1.530;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=84;TCF=71;TCR=13;TR=54;WE=75907446;WS=75907428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,56:0.67:84
chr11	75917189	rs1717626	G	C	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=0.919;SC=TCGCAAGCCTGCGGGAGGCAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=6;WE=75917197;WS=75917179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr11	75917334	rs1879633	T	C	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.763;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=618;ReadPosRankSum=0.991;SC=CCCCAGTCCCTGGCCTGTGCG;SOR=0.659;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=103;TCF=52;TCR=51;TR=40;WE=75917342;WS=75917324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,39:0.38:102
chr11	76207633	rs10899226	G	A	2854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=74;PP=2514;SC=TTTTTCATCAGTGTTTTACAG;SOR=3.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=15;TCR=74;TR=89;WE=76207641;WS=76207623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr11	76207709	rs72930511	G	A	1520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=29;PP=1214;SC=TTTTCTTGTCGTGATTATAAT;SOR=1.298;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=47;WE=76207717;WS=76207699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	76237725	rs11363199	CA	C	5456.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=14.037;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.313;NF=1;NR=135;PP=2974;ReadPosRankSum=0.635;SC=TAAATATTTTCAATTCTTATA;SOR=7.798;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=140;TCF=1;TCR=139;TR=136;WE=76237733;WS=76237715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,149:0.99:151
chr11	76257215	rs3753051	T	C	6550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=130;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.199;SC=GTCCATCCACTGTTGGCTCTT;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=95;TCR=131;TR=224;WE=76257223;WS=76257205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,226:0.99:228
chr11	76370792	rs4304809	A	G	6745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=122;PP=2965;SC=CACAGTCCTCAGGACGCACGT;SOR=0.890;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=223;TCF=100;TCR=123;TR=222;WE=76370800;WS=76370782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr11	76427731	rs10751261	T	C	16293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=516;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=350;NR=157;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.116;SC=GATGCCAACGTCCCCTCCCAG;SOR=1.729;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=513;TCF=355;TCR=158;TR=507;WE=76427739;WS=76427721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,512:1.00:514
chr11	76429160	rs10899266	T	A	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.02;SOR=4.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	76430529	rs7122287	C	G	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=0;PP=1340;SC=GTCTGCACGACGAGCATGCCT;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=45;WE=76430537;WS=76430519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	76430684	rs35033550	A	C	2008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.022;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=36;PP=1493;ReadPosRankSum=0.840;SC=CTATGGGGCCAGACTCCTGGC;SOR=0.887;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=149;TCF=80;TCR=69;TR=80;WE=76430692;WS=76430674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,83:0.54:154
chr11	76506548	rs75410995	G	A	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=237;ReadPosRankSum=-0.810;SC=CCAGGAGGTCGGGGTCTGTGA;SOR=0.277;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=13;WE=76506556;WS=76506538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr11	76506572	rs1149620	T	A	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.143;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=291;ReadPosRankSum=0.818;SC=CTTCCAACAGTGTCTAGACTG;SOR=0.007;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=55;TCF=52;TCR=3;TR=19;WE=76506580;WS=76506562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,18:0.33:54
chr11	76507403	rs11236938	G	A	3296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.736;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=83;PP=2523;ReadPosRankSum=0.496;SC=CTGGCGCCCAGTGGCTTCCGT;SOR=0.893;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=327;TCF=121;TCR=206;TR=129;WE=76507411;WS=76507393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,135:0.40:334
chr11	76507692	rs1149621	T	A	2097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=44;PP=1552;SC=ACACCCGGGATTCTGCTGCCA;SOR=1.576;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=21;TCR=44;TR=65;WE=76507700;WS=76507682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	76579419	rs376319450	ATCTC	A	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.842;NF=1;NR=18;PP=184;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TAGTTTTAATATCTCTCTCTC;SOR=0.446;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=19;WE=76579446;WS=76579409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
chr11	76579431	rs201919657	CTCTCTGTG	C	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.85;MQRankSum=0.566;QD=9.68;ReadPosRankSum=1.036;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr11	76637651	rs4379869	G	A	9140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=190;NR=85;PP=2965;SC=GTTCGGTGCAGTTCAGAGTGT;SOR=1.695;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=275;TCF=190;TCR=85;TR=275;WE=76637659;WS=76637641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr11	76637680	rs4479014	G	A	10003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=171;NR=143;PP=2965;SC=GTCTGGAAAAGCGGTACATTG;SOR=0.837;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=314;TCF=171;TCR=143;TR=314;WE=76637688;WS=76637670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr11	76637730	rs4604914	C	G	7788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=176;PP=2965;SC=AACACTGTATCTGAAGAAATG;SOR=2.179;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=241;TCF=65;TCR=176;TR=241;WE=76637738;WS=76637720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr11	76637785	rs4457775	G	A	4526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=120;PP=2965;SC=TTCTAAAAGCGGTTTTCAATT;SOR=5.267;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=8;TCR=121;TR=128;WE=76637793;WS=76637775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr11	76668478	rs4945125	C	T	1515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=38;PP=1213;SC=TAATTTTTAACTTTTTGTGTG;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=47;WE=76668486;WS=76668468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	76669891	rs3740768	A	G	1042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=0;PP=876;SC=AGAGTCAGCTATATCTTGCCA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=76669899;WS=76669881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	76687399	rs1517909	A	C	1578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=41;PP=1322;SC=AGTACTTTTAAAATTTCATTG;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=47;WE=76687407;WS=76687389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	76687448	rs1517908	A	C	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=21;PP=622;SC=CTCATAGTGGATTAATATAAC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=76687456;WS=76687438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	76701365	rs3824889	G	T	1473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=0;PP=1168;SC=TAAAACATTCGACTCACCATA;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=76701373;WS=76701355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	76701606	rs3740767	G	A	2834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=71;PP=2228;SC=TAAAAGAGCCGATATTCCATC;SOR=3.716;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=83;TCF=10;TCR=73;TR=81;WE=76701614;WS=76701596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr11	76701657	rs3740766	G	A	1224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=31;PP=965;SC=GATTGTTTACGATACATGGCT;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=76701665;WS=76701647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	76705180	.	CT	C	27	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=0.9998;HP=16;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=27;QD=16.0;SC=ATTAAACTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=2;WE=76705188;WS=76705170;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,2:0.25:8
chr11	76751166	rs73493606	G	A	3951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.389;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=57;PP=2962;ReadPosRankSum=0.651;SC=GTGGGCCTTCGCGGACACCTT;SOR=0.929;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=323;TCF=200;TCR=123;TR=158;WE=76751174;WS=76751156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,160:0.49:327
chr11	76751541	rs11292198	CT	C	7866.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=90;PP=2951;SC=GGGCATGTGTCTTGGAGCGCG;SOR=1.004;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=99;TCR=93;TR=187;WE=76751549;WS=76751531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr11	76751584	rs11292199	CT	C	11316.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=115;PP=2951;SC=CGAGGGCATCCTGGCCCTTCG;SOR=0.876;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=87;TCR=115;TR=202;WE=76751595;WS=76751574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr11	76751587	rs34153015	G	A	4110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.234;HP=3;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=80;PP=2926;ReadPosRankSum=0.850;SC=GGGCATCCTGGCCCTTCGGCG;SOR=0.340;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=239;TCF=125;TCR=114;TR=151;WE=76751595;WS=76751574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,164:0.65:253
chr11	76751603	rs11292200	CT	C	10941.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=118;PP=2951;SC=CGGCGTGCAGCTTGCCTGGCG;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=206;TCF=86;TCR=120;TR=204;WE=76751611;WS=76751593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr11	76799004	rs7121748	T	C	4018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=79;PP=2965;SC=GGCCATTCGCTGGCCCCTCAC;SOR=1.154;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=56;TCR=80;TR=135;WE=76799012;WS=76798994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr11	76804629	rs3832735	AGTCTGTGTCTGTCAC	A	1642.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=3.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.36;MQRankSum=3.778;QD=9.96;ReadPosRankSum=0.619;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,50:0.30:165
chr11	76827223	rs11606456	G	C	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.744;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=694;ReadPosRankSum=0.929;SC=TTCTGGTGGGGCTGCCTCTTA;SOR=0.819;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=124;TCF=83;TCR=41;TR=40;WE=76827231;WS=76827213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,43:0.33:130
chr11	76827360	rs11604536	A	G	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.673;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=35;PP=873;ReadPosRankSum=0.348;SC=GTGAGTGTGTATGTGCCCTGG;SOR=0.618;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=48;TCR=87;TR=54;WE=76827368;WS=76827350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,55:0.39:140
chr11	76867745	rs34477144	G	A	1911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-6.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.309;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=9;PP=1458;ReadPosRankSum=-1.133;SC=GCACAAAGCTGATCCTGCAGT;SOR=1.113;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=126;TCF=107;TCR=19;TR=68;WE=76867753;WS=76867735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,73:0.55:132
chr11	76885779	rs2276283	G	A	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=455;ReadPosRankSum=1.408;SC=TGGCCCTGATGCCCTTGGCTG;SOR=0.483;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=56;TCR=2;TR=24;WE=76885787;WS=76885769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr11	76886323	.	C	G	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=576;ReadPosRankSum=1.122;SC=GGGCAGAGCTCGGGAAGAGCC;SOR=0.342;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=49;TCF=46;TCR=3;TR=25;WE=76886331;WS=76886313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr11	76890242	rs10793239	T	C	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.748;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=371;ReadPosRankSum=-1.318;SC=GCCATGGCAGTGGGACTGGCC;SOR=1.456;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=68;TCF=2;TCR=66;TR=26;WE=76890250;WS=76890232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,25:0.36:69
chr11	76891308	rs3831388	T	TCTGCCAAATTATTTGG	1223.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=5.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.30;ReadPosRankSum=0.088;SOR=0.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,25:0.31:80
chr11	76891585	rs1109163	G	A	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.137;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=31;PP=781;ReadPosRankSum=1.253;SC=TCCCCTCCCCGAGGCTGGCTT;SOR=0.391;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=107;TCF=20;TCR=87;TR=40;WE=76891593;WS=76891575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,42:0.38:111
chr11	76891661	rs1109162	A	G	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=281;ReadPosRankSum=0.242;SC=AGACCCACTCAGCCAGCATTG;SOR=0.436;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=16;WE=76891669;WS=76891651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr11	76892943	rs7117606	A	G	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=243;ReadPosRankSum=-0.228;SC=CGATCCTCCCACCTGAGCTTC;SOR=0.330;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=16;WE=76892951;WS=76892933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr11	76893280	rs57741157	A	AG	2561.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=63;PP=2957;SC=TGGTGGCCGTAGTGATGAGGG;SOR=5.196;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=2;TCR=67;TR=65;WE=76893288;WS=76893270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	76893401	rs2276287	G	A	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.461;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=186;ReadPosRankSum=0.595;SC=TCCCCAAACCGCCAGGTCATT;SOR=1.075;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=10;WE=76893409;WS=76893391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr11	76893731	rs112227803	G	GA	255.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.795;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.388;NF=0;NR=13;PP=359;ReadPosRankSum=1.336;SC=CTCCTCTGCAGAAAAAGGATC;SOR=1.536;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=13;WE=76893739;WS=76893721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr11	76894235	rs948972	G	C	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-4.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=245;ReadPosRankSum=0.800;SC=TGGCAGCCCAGGGGTGGCTGC;SOR=0.551;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=18;TCR=58;TR=24;WE=76894243;WS=76894225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,23:0.32:73
chr11	76895770	rs143953991	GGGAGGCGGGGACACCAGGGCCT	G	2385.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=1.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.51;MQRankSum=4.463;QD=11.75;ReadPosRankSum=-0.455;SOR=0.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,70:0.34:203
chr11	76901273	rs2276286	C	T	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.047;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=168;ReadPosRankSum=0.584;SC=CTCGAGTGCCCCAGAAACATT;SOR=0.199;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=47;TCF=8;TCR=39;TR=12;WE=76901281;WS=76901263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,12:0.25:48
chr11	76901623	rs55637648	T	TGCTGGGGCCTGGAGC	810.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.92;MQRankSum=3.997;QD=11.75;ReadPosRankSum=1.754;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,20:0.29:69
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chr11	76905725	rs948958	C	T	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.076;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=23;ReadPosRankSum=-0.866;SC=ACTCATTCTCCTTCCATCTGT;SOR=0.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=3;WE=76905733;WS=76905715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr11	76910766	rs7927472	C	T	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-6.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.022;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=30;PP=1001;ReadPosRankSum=-0.103;SC=TCACCTCCAGCAATGCTGAGG;SOR=0.437;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=144;TCF=77;TCR=67;TR=59;WE=76910774;WS=76910756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,58:0.41:143
chr11	76912636	rs2276288	A	T	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.692;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=47;PP=1234;ReadPosRankSum=-0.234;SC=CCCCACCGACAGTGTGTACGT;SOR=0.473;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=156;TCF=30;TCR=126;TR=60;WE=76912644;WS=76912626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,61:0.39:158
chr11	76916424	rs11237121	A	G	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=359;ReadPosRankSum=1.598;SC=TGAGGGGTACATGGCCCCCTC;SOR=1.542;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=22;WE=76916432;WS=76916414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,22:0.48:46
chr11	76917220	rs2276293	A	G	3363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.276;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=65;PP=2482;ReadPosRankSum=0.678;SC=TTTTCCACAAAGTCTACTTCC;SOR=0.625;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=349;TCF=185;TCR=164;TR=134;WE=76917228;WS=76917210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:222,137:0.38:359
chr11	76918322	rs2276291	T	C	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.257;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=570;ReadPosRankSum=-2.365;SC=CAGTGCTCACTGCCCCTCCCA;SOR=0.470;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=68;TCF=56;TCR=12;TR=31;WE=76918330;WS=76918312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
chr11	76918497	rs2276290	G	A	1360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.917;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=39;PP=1060;ReadPosRankSum=-0.111;SC=TGGGGCCATAGGAACTTACGG;SOR=1.919;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=136;TCF=47;TCR=89;TR=52;WE=76918505;WS=76918487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,54:0.40:135
chr11	76919468	rs1320703	A	T	2720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=0.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.33;ReadPosRankSum=1.058;SOR=0.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,71:0.45:157
chr11	76919478	rs948962	C	A	2965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.14;ReadPosRankSum=-0.089;SOR=0.723;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,83:0.48:173
chr11	76919619	rs948961	G	A	1467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=1.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.65;ReadPosRankSum=0.654;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,43:0.37:116
chr11	76919629	rs948960	C	T	1483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.30;ReadPosRankSum=-0.315;SOR=0.591;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,40:0.41:97
chr11	76919865	rs1320702	T	A	3743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-6.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.846;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=85;PP=2684;ReadPosRankSum=0.690;SC=ACCTCTGCACTCTAGTTGCCT;SOR=0.546;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=354;TCF=143;TCR=211;TR=146;WE=76919873;WS=76919855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:209,159:0.43:368
chr11	76920003	rs11237122	T	C	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=33;PP=606;ReadPosRankSum=-1.113;SC=CCCCAAGGGATGGCCCAACCC;SOR=0.176;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=73;TCF=1;TCR=72;TR=34;WE=76920011;WS=76919993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,36:0.47:76
chr11	76924130	rs2276289	A	T	1271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=35;PP=1065;SC=TGCCTGAACCACAGACACGGT;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=76924138;WS=76924120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	76925075	rs948959	G	T	3380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=90;PP=2859;SC=TGCCTGCAGCGTAGCCAGCCT;SOR=3.890;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=11;TCR=90;TR=101;WE=76925083;WS=76925065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr11	76927876	rs142202405	ATTC	A	652.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=2;PP=464;SC=GATGTGGCTAATTCTTCTTTG;SOR=3.258;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=76927886;WS=76927866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	76928149	rs2282576	A	G	6119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=72;PP=2965;SC=CCAGGCTTCAAAGGTGTGACA;SOR=1.038;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=102;TCR=72;TR=173;WE=76928157;WS=76928139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr11	76944015	rs4945161	G	A	2698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=17;PP=2017;ReadPosRankSum=-0.780;SC=AGGGCTGGGGGGCCTGCACTG;SOR=1.265;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=79;TCF=62;TCR=17;TR=77;WE=76944023;WS=76944005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,86:0.99:87
chr11	76954788	rs34784710	T	TA	5243.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=37;PP=2965;SC=ATTATACTGATATTGTTTTTA;SOR=2.087;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=80;TCR=39;TR=114;WE=76954796;WS=76954778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr11	76954812	rs11237145	T	C	4663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=52;PP=2965;SC=AGGGTTTCAATGGATACTAAA;SOR=1.536;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=100;TCR=52;TR=152;WE=76954820;WS=76954802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr11	76954833	rs11237146	G	A	5457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=65;PP=2965;SC=CGGCCCACATGCTGAAAACCA;SOR=1.294;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=170;TCF=105;TCR=65;TR=170;WE=76954841;WS=76954823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr11	76990492	rs111279475	G	C	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=30;PP=658;ReadPosRankSum=-0.679;SC=GAAATCAGTAGCATCTGTGTC;SOR=0.544;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=7;TCR=77;TR=33;WE=76990500;WS=76990482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,36:0.40:89
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chr11	77060169	rs34167967	C	CA	95.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.92;MQRankSum=1.105;QD=7.36;ReadPosRankSum=1.485;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
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chr11	77069790	rs2250639	G	A	2376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=4;PP=1946;SC=CATACAGAAAGTACCTTTAGT;SOR=5.196;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=63;TCR=4;TR=67;WE=77069798;WS=77069780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
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chr11	77335982	rs2013296	C	A	2509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=3;PP=2077;SC=AAACAAAAAACCCACTTTAAA;SOR=5.838;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=70;TCR=3;TR=73;WE=77335990;WS=77335972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	77389020	rs12286317	T	C	3105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=3;PP=2594;ReadPosRankSum=-0.493;SC=GTACTAATCATGATACATAAC;SOR=0.866;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=178;TCF=173;TCR=5;TR=109;WE=77389028;WS=77389010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,110:0.61:180
chr11	77389238	.	CTTT	C,CT	1441.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=0.000;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.55;MQRankSum=0.969;QD=25.29;ReadPosRankSum=0.093;SOR=4.029;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:6,20,31:0.35,0.54:57
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chr11	77409832	rs10899399	C	T	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.254;NF=0;NR=31;PP=692;ReadPosRankSum=0.799;SC=AATATTCAGCCAATATACCAA;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=31;WE=77409840;WS=77409822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr11	77412851	rs7950873	A	G	6028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.602;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=109;PP=2962;ReadPosRankSum=1.137;SC=CTGTCCTTAGAGGGGCTATAG;SOR=0.528;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=377;TCF=180;TCR=197;TR=219;WE=77412859;WS=77412841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,221:0.59:377
chr11	77531810	rs10751277	T	G	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=17;PP=500;SC=GGGGAAGTTGTGGTGCCGAGG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=77531818;WS=77531800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	77553638	rs585721	T	C	4048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.278;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=64;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.768;SC=GGCCAGGGGGTAGTCGGACTT;SOR=0.872;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=209;TCF=112;TCR=97;TR=141;WE=77553646;WS=77553628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,150:0.68:219
chr11	77583376	rs588217	G	A	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.960;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=28;PP=719;ReadPosRankSum=-1.206;SC=GCCTTAAGAGGAGAATAAATC;SOR=0.957;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=78;TCF=22;TCR=56;TR=38;WE=77583384;WS=77583366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,39:0.50:78
chr11	77583476	rs668701	G	A	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=32;ReadPosRankSum=0.908;SC=GCCAGGTCCTGTGCTAGGCTC;SOR=0.138;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=4;WE=77583484;WS=77583466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr11	77587973	rs616354	T	C	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.589;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=18;PP=861;ReadPosRankSum=-0.375;SC=GCAGCAGCCATGGTTCTTCAT;SOR=0.909;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=101;TCF=64;TCR=37;TR=51;WE=77587981;WS=77587963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,54:0.50:109
chr11	77595642	rs608389	A	G	3710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=10.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.366;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=4;PP=2881;ReadPosRankSum=-1.270;SC=TGCTCTATGTAAATATACTTA;SOR=0.074;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=207;TCF=203;TCR=4;TR=119;WE=77595650;WS=77595632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,125:0.59:212
chr11	77595717	rs658398	C	T	6282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=432;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.525;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=129;NR=110;PP=2962;ReadPosRankSum=0.422;SC=GTTGAAACTGCGGAAGGCATG;SOR=0.633;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=431;TCF=236;TCR=195;TR=239;WE=77595725;WS=77595707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,244:0.57:430
chr11	77605501	rs1793336	T	C	1708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=44;PP=1370;SC=TAGCATATTATACTATAAAAA;SOR=4.133;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=48;WE=77605509;WS=77605491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	77614770	rs2276349	T	G	2178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.729;NF=7;NR=80;PP=1748;ReadPosRankSum=0.818;SC=CCCATGAACATGACTTCTCAA;SOR=0.633;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=211;TCF=17;TCR=194;TR=87;WE=77614778;WS=77614760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,86:0.41:212
chr11	77629132	rs60400274	A	AT	5115.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=61;PP=2957;SC=GCACAGTTAGATCTGAATTGT;SOR=0.783;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=105;TCF=41;TCR=64;TR=101;WE=77629140;WS=77629122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr11	77635882	rs7119720	A	C	1604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.287;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.051;NF=37;NR=28;PP=1280;ReadPosRankSum=-0.639;SC=CTTTGGTTGAAACATTAGTAC;SOR=0.503;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=137;TCF=84;TCR=53;TR=65;WE=77635890;WS=77635872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,65:0.50:131
chr11	77639466	rs11607043	A	G	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.699;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-9.187;NF=11;NR=44;PP=1133;ReadPosRankSum=0.470;SC=TGGTATGTATAGACTGCAGAC;SOR=1.088;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=169;TCF=47;TCR=122;TR=55;WE=77639474;WS=77639456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,52:0.33:156
chr11	77639511	rs11607479	T	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=15.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.99;MQRankSum=-4.929;QD=7.34;ReadPosRankSum=1.304;SOR=0.024;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,20:0.31:64
chr11	77652420	rs112337042	C	T	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.465;NF=0;NR=27;PP=668;ReadPosRankSum=-0.752;SC=AGTAAAGATGCTATGGGTTCT;SOR=1.251;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=27;WE=77652428;WS=77652410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,29:0.62:47
chr11	77671217	rs72939500	A	G	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=409;ReadPosRankSum=0.482;SC=CATAACCTCCATTCTCTTCCT;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=20;WE=77671225;WS=77671212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr11	77671281	rs12796422	A	G	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=6.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.246;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=4;PP=961;ReadPosRankSum=-0.636;SC=CGCTGCCACTATTAACTAGCG;SOR=1.037;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=104;TCF=93;TCR=11;TR=45;WE=77671289;WS=77671271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,46:0.45:103
chr11	77671544	rs2305317	T	C	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=30;PP=798;ReadPosRankSum=-0.367;SC=GCTAACATGGTTCCTTTTAGC;SOR=0.646;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=61;TCF=9;TCR=52;TR=36;WE=77671552;WS=77671534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,37:0.58:64
chr11	77672189	.	T	TAA	1337.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.643;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=7.570;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.50;MQRankSum=0.956;QD=83.61;ReadPosRankSum=-1.511;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,14:0.88:16
chr11	77674421	rs200349657	C	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQRankSum=-1.587;QD=6.29;ReadPosRankSum=0.374;SOR=1.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr11	77692775	rs17825404	G	T	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=1167;ReadPosRankSum=-2.222;SC=CTTCTGGAGAGACAGCTTTCT;SOR=1.552;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=21;WE=77692800;WS=77692765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr11	77692785	rs201089096	TTTTATTTA	T	471.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.22;ReadPosRankSum=-2.890;SOR=1.044;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr11	77698524	rs7938133	C	T	4792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=135;NR=10;PP=2965;SC=TTATTGGTAACAGATCTTTAA;SOR=5.079;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=135;TCR=10;TR=145;WE=77698532;WS=77698514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr11	77698651	rs6592756	T	C	10468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.039;NF=116;NR=201;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.259;SC=GTAGCTCACGTCTGTAATCCC;SOR=1.396;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=319;TCF=117;TCR=202;TR=317;WE=77698659;WS=77698641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,330:0.99:332
chr11	77698694	rs11606909	T	C	3729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.553;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=113;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.005;SC=GGAGGGTTGCTTGAGCTCAGG;SOR=1.341;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=208;TCF=25;TCR=183;TR=125;WE=77698702;WS=77698684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,128:0.60:215
chr11	77702033	rs2276441	T	A	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=0;PP=785;SC=TACCTAGCACTTGGAAGACAC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=28;WE=77702041;WS=77702023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	77705734	rs3832725	C	CG	2141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.791;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.269;NF=7;NR=65;PP=2389;ReadPosRankSum=1.058;SC=AGGAGGGAGGCGGGGGTGGAC;SOR=0.825;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=145;TCF=15;TCR=130;TR=72;WE=77705742;WS=77705724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,80:0.56:143
chr11	77734209	rs11237362	T	C	6480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=126;NR=93;PP=2965;SC=CACTTACCGTTGGCCGCCTGG;SOR=1.059;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=220;TCF=127;TCR=93;TR=219;WE=77734217;WS=77734199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr11	77775466	rs545869	C	G	1557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=43;PP=1210;SC=GTGCAACCCACTGGGAGAGGA;SOR=7.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=43;WE=77775474;WS=77775456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	77790653	rs534418	T	C	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.13;ReadPosRankSum=-0.162;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
chr11	77790653	.	TAG	CAC	571	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=11;NR=1;PP=571;QD=52.0389895719;SC=TCCGCCGGATTAGGTTATCAA;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=52;TCF=45;TCR=7;TR=12;WE=77790663;WS=77790643;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:40,12:0.23:52
chr11	77790655	rs8875	G	C	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=3.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.53;ReadPosRankSum=-0.263;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,18:0.32:56
chr11	77790863	rs499799	C	G	2432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.283;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=69;PP=1924;ReadPosRankSum=0.640;SC=ACCACTACCCCGGCCTAAGCG;SOR=0.850;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=247;TCF=84;TCR=163;TR=103;WE=77790871;WS=77790853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,104:0.41:252
chr11	77811990	rs1263505	T	C	3358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=88;NR=11;PP=2674;SC=GCTTGGCACATATCTAAGCAG;SOR=4.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=88;TCR=11;TR=99;WE=77811998;WS=77811980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr11	77813941	rs640016	T	C	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.164;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.971;NF=16;NR=0;PP=391;ReadPosRankSum=-0.527;SC=AGGTTTCAGTTAGCTGAGATC;SOR=2.948;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=16;WE=77813949;WS=77813931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr11	77813997	rs35218171	CA	C	154.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=12.767;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQRankSum=0.564;QD=4.55;ReadPosRankSum=0.791;SOR=3.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr11	77815196	rs660061	C	T	1130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.198;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=32;PP=912;ReadPosRankSum=1.369;SC=CTATATAGTGCTAATAATACT;SOR=1.287;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=117;TCF=42;TCR=75;TR=45;WE=77815204;WS=77815186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,46:0.39:119
chr11	77820670	rs1783515	T	C	2188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.54;ReadPosRankSum=-2.615;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,56:0.60:93
chr11	77820673	rs1789032	T	C	2126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.90;ReadPosRankSum=-2.495;SOR=0.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,53:0.60:89
chr11	77823557	rs624350	G	A	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=249;ReadPosRankSum=-0.244;SC=TGCTCCCCCTGTTCATCCTGA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=14;WE=77823565;WS=77823547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr11	77824907	.	G	GAAA	1280.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=0.000;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=8.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.782;QD=12.43;ReadPosRankSum=0.890;SOR=0.119;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,59:0.57:103
chr11	77825064	rs572693	A	G	5530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.402;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=147;PP=2962;ReadPosRankSum=0.524;SC=ATCAGTAACCAGGAAGATGGA;SOR=0.656;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=371;TCF=118;TCR=253;TR=216;WE=77825072;WS=77825054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,218:0.58:379
chr11	77825320	rs665278	T	C	1957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=37;PP=1505;ReadPosRankSum=0.952;SC=GCCTGGTTTATTTGCAGTGAA;SOR=0.724;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=197;TCF=107;TCR=90;TR=81;WE=77825328;WS=77825310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,83:0.41:202
chr11	77825508	rs678277	A	G	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.137;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=437;ReadPosRankSum=-0.262;SC=GTGGTATTCTAGATTGAATCC;SOR=2.303;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=19;WE=77825516;WS=77825498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr11	77825642	rs653721	A	G	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.247;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=410;ReadPosRankSum=-1.307;SC=TGGGTGAGGGATATATAGGAA;SOR=0.207;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=19;WE=77825650;WS=77825632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr11	77825697	rs653368	C	T	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=785;ReadPosRankSum=3.968;SC=CTAAAATTATCCTACAAAAAG;SOR=1.048;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=35;WE=77825705;WS=77825687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,37:0.51:72
chr11	77832076	rs518624	T	A	1985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=8;PP=1593;SC=ACATCAGAATTAGTAAGGGAA;SOR=3.442;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=52;TCR=8;TR=60;WE=77832084;WS=77832066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	77834994	rs498278	G	A	1380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=2;PP=1095;ReadPosRankSum=-1.297;SC=TAAATTGGGAGTAAGTTAATA;SOR=0.527;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=61;TCF=59;TCR=2;TR=44;WE=77835002;WS=77834984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,46:0.73:63
chr11	77838373	rs59662312	TA	T	681.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.795;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.806;NF=32;NR=2;PP=402;ReadPosRankSum=0.455;SC=AGATGAATCTTAAAAAAAAAA;SOR=1.402;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=58;TCF=51;TCR=7;TR=34;WE=77838381;WS=77838363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,37:0.63:59
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chr11	77920563	rs2510045	G	T	4940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=7.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.767;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=53;PP=2962;ReadPosRankSum=1.407;SC=CGCCCTCTCCGCCCGAGGAGC;SOR=0.898;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=339;TCF=229;TCR=110;TR=180;WE=77920571;WS=77920553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,187:0.55:343
chr11	77920863	rs2512527	C	A	2987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=76;PP=2590;ReadPosRankSum=-0.805;SC=ACACCCCCCCCACCAGCCTGT;SOR=0.966;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=172;TCF=57;TCR=115;TR=109;WE=77920871;WS=77920853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,108:0.62:173
chr11	77920930	rs2511188	A	G	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=3.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.92;ReadPosRankSum=-0.974;SOR=1.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,57:0.56:102
chr11	77921527	rs2512526	G	C	15933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=496;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=249;NR=234;PP=2965;SC=CCGCCCTGCCGCTTCTCTGGG;SOR=0.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=484;TCF=250;TCR=234;TR=483;WE=77921535;WS=77921517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,492:1.00:492
chr11	77924544	rs2450139	G	A	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=392;ReadPosRankSum=0.592;SC=TGTCCACCCCGGATATCCTGC;SOR=0.428;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=18;WE=77924552;WS=77924534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr11	77924607	rs901105	A	C	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.353;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=4;PP=1026;ReadPosRankSum=0.361;SC=TAGAGGAAACATTGAAAGGTG;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=75;TCF=66;TCR=9;TR=45;WE=77924615;WS=77924597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,46:0.59:78
chr11	77924656	rs72075084	TTCTAAG	T	3214.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.059;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.479;NF=44;NR=18;PP=2975;ReadPosRankSum=-0.811;SC=AGGGTGTGAATTCTAAGTCTA;SOR=1.493;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=123;TCF=80;TCR=43;TR=62;WE=77924669;WS=77924646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,83:0.58:142
chr11	77924870	rs2450138	C	T	1412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.742;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=42;PP=1103;ReadPosRankSum=1.060;SC=TGTGAACCTGCTGCCAACCTG;SOR=0.847;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=118;TCF=34;TCR=84;TR=58;WE=77924878;WS=77924860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,58:0.47:123
chr11	77930345	rs2450122	T	C	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.273;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=500;ReadPosRankSum=1.792;SC=TGGAAGGCTCTGAGGACTGCC;SOR=2.322;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=25;WE=77930353;WS=77930335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr11	77930499	rs901104	G	A	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.155;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=30;PP=834;ReadPosRankSum=-0.017;SC=GTAGCTGTGAGTTACCAGTTA;SOR=1.385;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=41;WE=77930507;WS=77930489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,40:0.67:60
chr11	77931346	rs901103	C	T	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=215;ReadPosRankSum=0.943;SC=TACTGCCCCCCCAACTCTACT;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=11;WE=77931354;WS=77931336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr11	77936064	rs1385601	A	C	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=322;ReadPosRankSum=0.304;SC=GACGCCATCAATCTTTTGGGG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=15;WE=77936072;WS=77936055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr11	77936166	rs1385600	A	G	1858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-7.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.702;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=15;PP=1357;ReadPosRankSum=-0.282;SC=GGAAAGAGCCAACTCCATCAC;SOR=0.337;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=128;TCF=109;TCR=19;TR=78;WE=77936174;WS=77936156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,82:0.61:134
chr11	77937800	rs2248407	G	A	4138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.975;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=77;PP=2962;ReadPosRankSum=1.016;SC=GGAGGTCCCCGAACTCCCTGC;SOR=0.810;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=230;TCF=111;TCR=119;TR=142;WE=77937808;WS=77937790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,151:0.63:239
chr11	78128775	rs11237488	C	T	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.159;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=481;ReadPosRankSum=1.566;SC=ATGCTGCCGGCCTGGAGCCCC;SOR=0.280;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=53;TCF=18;TCR=35;TR=30;WE=78128783;WS=78128765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,30:0.57:53
chr11	78128797	rs881338	C	T	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=442;ReadPosRankSum=-0.872;SC=CGCCGGGTCGCGCGGACGAGG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=23;WE=78128805;WS=78128787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr11	78180179	rs11237514	A	G	1622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-6.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=5;PP=1293;ReadPosRankSum=-1.112;SC=AGCAAATGCCATATTTTGCTA;SOR=0.922;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=117;TCF=108;TCR=9;TR=70;WE=78180187;WS=78180169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,69:0.59:116
chr11	78180507	rs10899517	AA	TC	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=834;ReadPosRankSum=-0.630;SC=CCTATGAAAGAATGATCTGCC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=16;WE=78180516;WS=78180497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr11	78189558	rs4944202	T	C	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=5.361;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.97;ReadPosRankSum=0.982;SOR=2.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr11	78204073	rs66546995	CACAGAT	C	3078.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.393;NF=55;NR=11;PP=2962;ReadPosRankSum=0.591;SC=ATTTTAATGTCACAGATACCT;SOR=0.640;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=150;TCR=30;TR=66;WE=78204086;WS=78204063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,84:0.42:202
chr11	78204299	rs56279811	T	TA	1471.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.918;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.958;NF=2;NR=52;PP=1892;ReadPosRankSum=0.180;SC=TTTAAGTATTTAAATATTCAG;SOR=0.194;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=136;TCF=3;TCR=133;TR=54;WE=78204307;WS=78204289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,57:0.45:128
chr11	78204380	rs4474465	C	T	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-5.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.120;NF=0;NR=15;PP=274;ReadPosRankSum=-0.336;SC=TTTGCTGCTACATATTTCTCT;SOR=0.436;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=15;WE=78204388;WS=78204370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr11	78277277	rs10751296	A	G	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.335;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=52;PP=1282;ReadPosRankSum=1.425;SC=ATTGTCGCAGATACTCCAGAG;SOR=1.793;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=140;TCF=32;TCR=108;TR=61;WE=78277285;WS=78277267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,63:0.44:144
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chr11	78399121	rs1792148	G	A	1951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.966;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=12;PP=1574;ReadPosRankSum=0.592;SC=TGTAGAAGGCGCCTGAGGCAG;SOR=0.551;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=125;TCF=107;TCR=18;TR=73;WE=78399129;WS=78399111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,73:0.57:128
chr11	78433599	rs482605	G	A	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=503;ReadPosRankSum=0.065;SC=AGAGCCTGACGGGCAAGGCTC;SOR=0.495;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=23;WE=78433607;WS=78433591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
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chr11	78440736	rs512004	G	C	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.404;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=530;ReadPosRankSum=-1.530;SC=TCGACTCACCGAGTGGAGGGA;SOR=0.349;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=25;WE=78440744;WS=78440726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr11	78443235	rs1790557	C	T	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=2;PP=374;SC=TTTTGCATAACAGGCTGATGG;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=78443243;WS=78443225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	78489793	rs1573527	C	A	4612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.93;SOR=4.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	78489798	rs1573528	C	A	4475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.61;SOR=4.317;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	78516318	.	CTT	C	87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=29;MQ=62.41;NF=3;NR=0;PP=87;QD=38.6666666667;SC=ACCCATGCTTCTTCTCCCCCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=3;WE=78516327;WS=78516308;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,3:0.33:9
chr11	78567367	rs505093	T	C	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=363;ReadPosRankSum=1.043;SC=CTCCCCACCCTGGCCCTCCCC;SOR=0.749;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=20;WE=78567375;WS=78567357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr11	78602525	rs10736817	C	A	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.954;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=32;PP=709;ReadPosRankSum=1.473;SC=GGTCAGTGTGCAAGCCACATG;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=78;TCF=2;TCR=76;TR=32;WE=78602533;WS=78602515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,31:0.42:74
chr11	78776192	rs7130258	T	C	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=-0.393;SC=CATGCCTTTGTTCAAGTGATT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=5;WE=78776200;WS=78776182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr11	82443417	rs3780	C	T	3108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.002;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=12;PP=2528;ReadPosRankSum=1.897;SC=CATCGTTCTTCAGATTTAGGA;SOR=0.588;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=155;TCF=138;TCR=17;TR=106;WE=82443425;WS=82443407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,108:0.68:158
chr11	82443672	rs6592081	C	G	4796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.209;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=89;PP=2962;ReadPosRankSum=0.075;SC=CAAATGGCCCCGCCCGTCCTC;SOR=0.692;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=274;TCF=139;TCR=135;TR=190;WE=82443680;WS=82443662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,191:0.69:275
chr11	82443817	rs2291793	G	A	4320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.989;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=78;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.494;SC=TCGGGGTACAGTAGGTTTCCC;SOR=0.646;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=256;TCF=130;TCR=126;TR=160;WE=82443825;WS=82443807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,159:0.63:254
chr11	82444021	rs66918959	T	G	2430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=57;PP=1941;ReadPosRankSum=-0.865;SC=TCGCCCAAGCTCACGTCCGGC;SOR=0.656;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=67;TCR=91;TR=98;WE=82444029;WS=82444011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,96:0.62:156
chr11	82444216	rs986097	C	G	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=16.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.63;ReadPosRankSum=-0.968;SOR=3.497;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,36:0.77:47
chr11	82444226	rs986096	C	A	1356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=11.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.55;ReadPosRankSum=-1.380;SOR=2.964;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,33:0.77:43
chr11	82560312	rs10792653	T	G	8476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=225;PP=2965;SC=TCAACAGATGTCTTTACAGAT;SOR=3.983;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=255;TCF=30;TCR=225;TR=255;WE=82560320;WS=82560302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr11	82560858	rs10736757	A	G	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=424;SC=TGTACATTATACTTTAACAAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=82560866;WS=82560848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	82561156	rs57878596	A	AAT	58.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.566;NF=0;NR=4;PP=125;ReadPosRankSum=1.368;SC=GAAAAGAAAAAATATATATAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=4;WE=82561164;WS=82561146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr11	82561339	rs13306597	G	A	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.649;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=436;ReadPosRankSum=-1.603;SC=ATTAAGAAACGTTCATGTCCA;SOR=1.247;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=63;TCF=49;TCR=14;TR=23;WE=82561347;WS=82561329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,24:0.36:66
chr11	82561661	rs10792655	T	C	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=36;PP=1064;SC=AAATAGAATTTCTAGGCAATT;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=82561669;WS=82561651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	82564294	rs2229437	T	G	1230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.605;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=1010;ReadPosRankSum=-1.412;SC=TAGCTTTCAGTTCCTCAGCCA;SOR=0.760;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=174;TCF=100;TCR=74;TR=55;WE=82564302;WS=82564284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,55:0.32:172
chr11	82595975	rs6592087	T	A	8026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=137;PP=2965;ReadPosRankSum=0.889;SC=TTTGAAAGGTTTTACTAGCAC;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=248;TCF=110;TCR=138;TR=246;WE=82595983;WS=82595965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,257:0.99:259
chr11	82641001	rs2127363	C	A	500.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=381;ReadPosRankSum=-0.633;SC=TACTTTACTCCCACTTGATCA;SOR=3.056;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=17;WE=82641009;WS=82640993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr11	82641157	rs2170009	A	G	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=35;PP=1675;SC=GTAAAATTTCAAAGTTCATTG;SOR=0.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=35;TCR=35;TR=70;WE=82641165;WS=82641147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	82643760	rs7947780	G	T	5835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.383;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=102;PP=2962;ReadPosRankSum=0.417;SC=ACCACAGCAGGTTATCTGTGA;SOR=0.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=360;TCF=185;TCR=175;TR=212;WE=82643768;WS=82643750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,218:0.60:365
chr11	82644764	rs11826199	C	G	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-8.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.218;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=35;PP=1259;ReadPosRankSum=-0.919;SC=TTCAAAAAACCTGTATTTTAT;SOR=0.494;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=217;TCF=124;TCR=93;TR=74;WE=82644772;WS=82644754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,76:0.34:222
chr11	82644904	rs7130899	G	A	17117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=571;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=345;NR=202;PP=2965;SC=TGTATCTGGTGTTTCACAACC;SOR=1.306;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=551;TCF=346;TCR=205;TR=547;WE=82644912;WS=82644894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,563:1.00:563
chr11	82704967	rs3793986	CA	AT	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=1;PP=1445;ReadPosRankSum=-0.879;SC=TGGCTGAGTGCATTGTTTCCA;SOR=0.368;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=56;TCF=55;TCR=1;TR=28;WE=82704976;WS=82704957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr11	82752734	rs34023989	TA	T	728.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.012;QD=6.07;ReadPosRankSum=-0.198;SOR=0.103;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,48:0.40:120
chr11	82874970	rs10898088	G	A	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=50;PP=872;ReadPosRankSum=-0.805;SC=GAATTCTTCTGCAGAACTTAC;SOR=0.511;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=167;TCF=0;TCR=167;TR=50;WE=82874978;WS=82874960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,48:0.29:168
chr11	82921538	rs553484	C	T	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.539;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=443;ReadPosRankSum=0.326;SC=GTTATCTCTTCCTGACTTTTT;SOR=1.315;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=85;TCF=3;TCR=82;TR=24;WE=82921546;WS=82921528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,25:0.28:90
chr11	82952108	rs625102	T	C	2141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=58;PP=1879;SC=TTGGAGGAACTAGAACTAATA;SOR=6.837;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=59;TCF=1;TCR=58;TR=59;WE=82952116;WS=82952098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	82959338	rs202087105	TACACACAC	T,TACAC	929.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.68;QD=34.43;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,21,6:0.78,0.22:27
chr11	82967023	rs565276	A	G	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.771;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=30;PP=691;ReadPosRankSum=2.912;SC=TCTTTCATTAAAAAAATTGAT;SOR=1.501;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=96;TCF=7;TCR=89;TR=31;WE=82967031;WS=82967013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,32:0.33:97
chr11	82968164	rs628223	G	A	1271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=4;PP=973;SC=ACTTGCTTACGGACCCTTAGC;SOR=3.967;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=37;WE=82968172;WS=82968154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	82968418	rs657824	G	A	2178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.01;SOR=1.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	82973004	rs8789	C	T	1739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.791;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=55;PP=1354;ReadPosRankSum=1.449;SC=AAGTAAACACCGAAGCTGTGA;SOR=0.954;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=204;TCF=60;TCR=144;TR=74;WE=82973012;WS=82972994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,75:0.35:213
chr11	82973045	rs645954	C	T	4041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=106;PP=2965;SC=GGTCTTGTATCTGTAATTATT;SOR=4.139;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=13;TCR=106;TR=119;WE=82973053;WS=82973035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr11	82984985	rs543562	T	A	1993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.784;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=37;PP=1555;ReadPosRankSum=-2.210;SC=AGAAAAAAAATTCACTTACCA;SOR=0.558;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=57;TCR=52;TR=76;WE=82984993;WS=82984975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,75:0.69:108
chr11	82985161	rs34416960	GA	G	126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=165;ReadPosRankSum=-0.039;SC=AATTGATAAGGAAAAAAATCT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=9;WE=82985169;WS=82985151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr11	82985959	rs573871	C	T	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=25;ReadPosRankSum=1.465;SC=GAAAGAGATTCAAGGAAGAAA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=3;WE=82985967;WS=82985949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr11	82996986	rs494791	A	C	17929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=561;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=280;NR=263;PP=2965;SC=CTTGGGAGAGAAAGAGCCGCC;SOR=0.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=543;TCF=280;TCR=263;TR=543;WE=82996994;WS=82996976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,558:1.00:558
chr11	83180169	rs11464149	C	CA	290.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=1.241;QD=2.91;ReadPosRankSum=-1.469;SOR=0.659;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,28:0.28:100
chr11	83183676	rs2888834	T	C	2264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=7.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=18;PP=1867;ReadPosRankSum=-0.149;SC=TTAAGCCGAGTTTATTCTCCT;SOR=0.689;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=254;TCF=202;TCR=52;TR=93;WE=83183684;WS=83183666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,91:0.36:256
chr11	83197194	rs35251277	TC	T	869.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.770;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.537;NF=11;NR=16;PP=805;ReadPosRankSum=0.302;SC=CCCCAAATTTTCCTAGTTAAA;SOR=0.838;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=86;TCF=32;TCR=54;TR=27;WE=83197202;WS=83197184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,35:0.32:108
chr11	83197307	rs141813606	GA	G	783.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.711;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.22;MQRankSum=0.634;NF=4;NR=27;PP=573;ReadPosRankSum=-0.037;SC=GAAAATAAAAGAAAAAAAATC;SOR=1.371;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=31;WE=83197315;WS=83197297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,35:0.74:47
chr11	83197394	rs61265208	C	CA	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.065;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=12;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=-0.702;SC=ACTTGTCATGCAAAAAAAAAA;SOR=0.120;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=4;WE=83197402;WS=83197384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr11	83585289	rs144508115	G	GGGAAGGAAGGAAGGAGAGAGGGAA	2478.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.66;QD=63.56;SOR=4.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	83585583	rs11447183	T	TA	1940.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQRankSum=1.503;QD=24.57;ReadPosRankSum=0.153;SOR=1.700;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,54:0.68:79
chr11	83585585	rs112496782	A	T	1949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQRankSum=1.527;QD=25.32;ReadPosRankSum=-0.809;SOR=1.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,53:0.69:77
chr11	83641608	rs66861805	G	A	2475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.875;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=64;PP=1836;ReadPosRankSum=0.487;SC=ATCTCAGCATGTGCAAAAGTA;SOR=0.256;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=137;TCF=35;TCR=102;TR=91;WE=83641616;WS=83641598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,96:0.67:144
chr11	83810113	rs3750917	T	G	1682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=34;PP=1233;SC=AAAGCAGATATTAAATGATGT;SOR=2.137;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=48;WE=83810121;WS=83810103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	83878075	rs1869472	G	A	2787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=53;PP=2128;SC=TTCCAGTTCTGGCCCTAACTG;SOR=1.557;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=28;TCR=53;TR=81;WE=83878083;WS=83878065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	83962251	rs7933566	A	G	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=8;PP=778;SC=CACAGTTTTAAAAGAAGGTAG;SOR=1.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=30;WE=83962259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
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chr11	84245584	rs17734921	T	C	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.592;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=0;PP=723;ReadPosRankSum=-0.431;SC=TGTCACCAACTATAAAGTCGG;SOR=1.795;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=116;TCF=113;TCR=3;TR=39;WE=84245592;WS=84245574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,41:0.35:118
chr11	84822798	rs601375	T	G	3702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.92;SOR=2.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
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chr11	85418591	rs3069561	AACAG	A	6833.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=116;PP=2947;SC=AGGAGAATTGAACAGACAAAG;SOR=4.091;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=126;TCF=7;TCR=119;TR=122;WE=85418602;WS=85418581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr11	85419193	rs290197	C	T	3046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=13;PP=2317;SC=TGAAACTCCACCTCAAAAAAA;SOR=3.634;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=84;TCR=13;TR=96;WE=85419204;WS=85419183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr11	85431755	rs7116742	C	T	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.546;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=3;PP=962;ReadPosRankSum=-1.016;SC=GCCTCTTCAGCGCACTTTGGA;SOR=0.125;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=67;TCF=64;TCR=3;TR=42;WE=85431763;WS=85431745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,40:0.62:65
chr11	85435001	rs34653849	T	TA	1784.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=0;PP=1533;SC=TAATCCCAATTAAAAAAAATC;SOR=8.318;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=77;TCF=76;TCR=1;TR=60;WE=85435009;WS=85434991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	85435730	rs550404	C	T	10976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=191;NR=157;PP=2965;SC=CAGTTATTAACGGAGCCTCGG;SOR=0.856;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=349;TCF=192;TCR=157;TR=348;WE=85435738;WS=85435720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,355:1.00:355
chr11	85436352	rs641393	G	A	7011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=134;PP=2965;SC=CGAAATTTCCGTTTGAGAAGG;SOR=1.369;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=210;TCF=76;TCR=134;TR=209;WE=85436360;WS=85436342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr11	85436394	rs556669	T	C	6490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=103;PP=2965;SC=AAGATGAGCATCCTGGGGAAA;SOR=0.905;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=85;TCR=103;TR=188;WE=85436402;WS=85436384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr11	85436500	rs580459	T	C	6566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=115;NR=82;PP=2965;SC=TCTGCAGCCATCTGAATCAAA;SOR=1.128;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=199;TCF=117;TCR=82;TR=197;WE=85436508;WS=85436490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr11	85436699	rs598346	A	G	9142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=161;NR=136;PP=2965;SC=CAGTGATAACAGGCGCCAACT;SOR=0.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=297;TCF=161;TCR=136;TR=297;WE=85436707;WS=85436689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr11	85436868	rs597480	G	C	8838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=149;PP=2965;ReadPosRankSum=0.609;SC=CTCAGTATCAGCAAAATCTGT;SOR=0.383;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=262;TCF=112;TCR=150;TR=261;WE=85436876;WS=85436858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,270:1.00:271
chr11	85437896	rs491867	A	G	13134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=434;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=196;NR=229;PP=2965;SC=TGGATGATACACCCTGTGACT;SOR=0.848;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=426;TCF=197;TCR=229;TR=425;WE=85437904;WS=85437886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,429:1.00:429
chr11	85439123	rs78874199	T	C	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=135;ReadPosRankSum=1.037;SC=TCTATACCAATAGCTGTTTAT;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=8;WE=85439131;WS=85439113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr11	85447611	rs680498	T	C	3625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=58;PP=2660;SC=TTTGTTGTGATGAGTGACCTT;SOR=0.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=62;TCR=58;TR=120;WE=85447619;WS=85447601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr11	85456703	rs647912	T	C	3849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=105;NR=6;PP=2965;SC=GTGCTGCATCTTCTTCTGGCT;SOR=5.477;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=105;TCR=6;TR=111;WE=85456711;WS=85456693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	85576113	rs11389838	C	CT	4132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.891;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.605;NF=111;NR=6;PP=2933;ReadPosRankSum=0.312;SC=GAATTTTTCACTTTCGTATGT;SOR=1.267;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=180;TCF=166;TCR=14;TR=117;WE=85576135;WS=85576103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,145:0.74:196
chr11	85576127	rs36093844	C	T	4926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.135;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.631;NF=140;NR=16;PP=2962;ReadPosRankSum=0.285;SC=CGTATGTCTCCTTTCTAAACA;SOR=1.168;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=222;TCF=197;TCR=25;TR=156;WE=85576135;WS=85576103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,166:0.72:230
chr11	85576209	rs142636291	G	A	2826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=2.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.07;ReadPosRankSum=0.561;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:332,134:0.29:466
chr11	85584151	rs142446208	G	GT	395.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=498;ReadPosRankSum=-1.766;SC=CCCTAAATGTGTTTTCATAAT;SOR=0.997;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=15;WE=85584159;WS=85584141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr11	85593529	rs17817308	G	A	3918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=8.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.306;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=10;PP=2962;ReadPosRankSum=0.973;SC=TTGATCAAACGTGAATTACTG;SOR=1.083;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=193;TCF=177;TCR=16;TR=134;WE=85593537;WS=85593519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,137:0.70:195
chr11	85597163	rs17744699	C	T	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=268;ReadPosRankSum=-1.665;SC=AATATCAGATCTTAACTTCTT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=12;WE=85597171;WS=85597153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr11	85609806	rs10501601	A	T	1703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=0;PP=1396;SC=ACAGTGTAAAACAGCAAAAGC;SOR=7.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=50;TCR=0;TR=50;WE=85609814;WS=85609799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	85610109	rs725459	G	C	5599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=148;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.851;SC=ATTTTTTTAAGTGGAAATGAC;SOR=5.499;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=153;TCF=4;TCR=149;TR=152;WE=85610117;WS=85610099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,159:0.99:160
chr11	85622236	.	G	A	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQRankSum=-2.168;QD=2.05;ReadPosRankSum=1.393;SOR=0.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr11	85622518	rs140532988	C	CA	893.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=28;PP=939;SC=TTTTTTAAAACAAAAAAAGAT;SOR=5.486;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=29;WE=85622526;WS=85622508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	85626569	rs60185300	G	A	2236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=56;PP=1806;SC=TAATGATGATGATTTTTTTCA;SOR=4.047;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=7;TCR=56;TR=63;WE=85626577;WS=85626559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	85627108	rs7927222	T	C	16648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=543;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=331;NR=194;PP=2965;ReadPosRankSum=-2.029;SC=AAGTAGAAAGTAGAGACTTGA;SOR=0.827;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=529;TCF=334;TCR=195;TR=525;WE=85627116;WS=85627098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,533:0.99:536
chr11	85671702	rs618679	A	C	1722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=21;PP=1217;ReadPosRankSum=-0.627;SC=CCATCTCCCAAAACAAGTAGC;SOR=0.407;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=28;TCR=21;TR=48;WE=85671710;WS=85671692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr11	85685574	rs4944550	C	T	3038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=83;PP=2580;ReadPosRankSum=0.691;SC=TATCCTTTCCCTCCAAATAAT;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=6;TCR=85;TR=89;WE=85685582;WS=85685564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,89:0.98:91
chr11	85692061	rs17817690	A	G	3270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=93;NR=0;PP=2848;SC=TTATACTTCTAAACTCAGTAA;SOR=9.087;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=93;TCF=93;TCR=0;TR=93;WE=85692069;WS=85692051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr11	85692342	rs2508688	A	C	3226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=102;PP=2654;SC=ATACTTATATAGAACAGAGTA;SOR=5.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=5;TCR=102;TR=107;WE=85692350;WS=85692332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr11	85714288	rs7951988	T	C	4936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=137;NR=9;PP=2965;SC=TATGATTAAATCCATTTTATA;SOR=5.339;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=137;TCR=9;TR=146;WE=85714296;WS=85714278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr11	85722238	rs57263198	G	GA	246.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.78;NF=0;NR=10;PP=206;SC=CCCAAAAAAGGAAAAAAAAAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=10;WE=85722246;WS=85722228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	85723527	rs17745153	C	T	1222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=36;PP=1027;SC=ACAGTAAATTCATGCATTAGG;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=38;WE=85723535;WS=85723517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	85725937	rs592297	C	T	3345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=15;PP=2715;SC=GTGCATCCATCTGATTCTGAA;SOR=3.148;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=81;TCR=15;TR=96;WE=85725945;WS=85725927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr11	85968382	.	CTT	C	120.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQRankSum=-0.381;QD=6.04;ReadPosRankSum=0.297;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr11	86013361	rs291241	A	G	4332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=38;PP=2965;SC=TGGCCCAGTCACTATGTAGTG;SOR=2.182;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=112;TCR=38;TR=150;WE=86013369;WS=86013351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr11	86017658	rs291247	A	T	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=47;PP=1354;SC=ATTGTTTTTTAAAAAAGACAA;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=2;TCR=47;TR=49;WE=86017666;WS=86017648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	86037733	rs11419370	G	GC	767.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=15;PP=676;SC=GATTTGGATGGGATGGAAGTG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=86037741;WS=86037723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	86098680	rs292109	T	C	7594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=172;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.839;SC=TAGTGCAGATTCATGGACTCA;SOR=1.096;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=237;TCF=63;TCR=174;TR=233;WE=86098688;WS=86098670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,235:1.00:236
chr11	86098732	rs11234627	G	A	4052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=117;PP=2965;ReadPosRankSum=1.747;SC=ATTCTGATATGTAGGATTTTC;SOR=5.010;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=4;TCR=118;TR=121;WE=86098740;WS=86098722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,125:0.99:126
chr11	86111700	rs12272824	A	T	2984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=7.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=8;PP=2373;ReadPosRankSum=0.822;SC=ACTCGTTTTCATTCATTCTTT;SOR=0.409;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=132;TCF=122;TCR=10;TR=92;WE=86111708;WS=86111690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,98:0.72:137
chr11	86119396	rs4412777	G	A	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=33;PP=1010;SC=TTTTATTGGCGCAGGGTCTCA;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=36;WE=86119404;WS=86119386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	86120280	rs57270595	C	CT	1133.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=3.049;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=-0.713;QD=9.69;ReadPosRankSum=0.703;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,63:0.54:117
chr11	86123464	rs11234644	T	C	1390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=10;PP=2579;ReadPosRankSum=-0.005;SC=CACTCAGTCCTGCGCTTAATG;SOR=0.726;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=163;TCF=133;TCR=30;TR=56;WE=86123475;WS=86123454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,59:0.36:166
chr11	86123467	rs3741006	G	A	3139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.749;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=20;PP=2962;ReadPosRankSum=0.156;SC=TCAGTCCTGCGCTTAATGCTC;SOR=0.616;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=175;TCF=145;TCR=30;TR=113;WE=86123475;WS=86123454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,113:0.63:178
chr11	86133784	rs1056194	C	T	10803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=142;NR=196;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.779;SC=CTTCGTTTCCCGGGGAAAGTT;SOR=0.381;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=339;TCF=142;TCR=197;TR=338;WE=86133792;WS=86133774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,343:1.00:344
chr11	86153911	rs7548	G	A	2351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.756;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=63;PP=1785;ReadPosRankSum=-0.839;SC=TGAGTGGTGGGTAGAGTCTCC;SOR=0.580;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=133;TCF=43;TCR=90;TR=95;WE=86153919;WS=86153901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,94:0.71:133
chr11	86157998	rs4944580	T	C	1227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=3;PP=1016;SC=CTTTCTGAAATTCAGTTTGCT;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=37;WE=86158006;WS=86157988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	86161147	rs4944581	A	C	2235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=29;PP=1822;SC=CCCCCACCTCAATGACTCCCA;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=38;TCR=29;TR=66;WE=86161155;WS=86161137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	86161388	rs1042780	C	G	5917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.964;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=132;PP=2962;ReadPosRankSum=0.270;SC=AAAGCTTGTTCTTGGTGATTC;SOR=1.001;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=337;TCF=139;TCR=198;TR=214;WE=86161396;WS=86161378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,223:0.64:346
chr11	86175193	rs11234662	A	G	8917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.727;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=158;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.743;SC=AAGTTGGCCAACCTTTAGCAA;SOR=0.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=273;TCF=115;TCR=158;TR=272;WE=86175201;WS=86175183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,275:1.00:276
chr11	86175300	rs605251	G	A	4008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=105;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.894;SC=ATTTGTTAAAGCATCATCAAG;SOR=2.687;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=13;TCR=106;TR=118;WE=86175308;WS=86175290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,124:0.99:125
chr11	86198596	rs2279048	A	G	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=39;PP=1130;SC=GAGAGGGGGGAGTAAGAAGGT;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=39;WE=86198604;WS=86198586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
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chr11	86270684	rs34249558	C	T	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=0;PP=644;ReadPosRankSum=1.364;SC=AGGAAACAGACAGCTCAGCCC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=29;WE=86270692;WS=86270674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr11	86518986	.	G	A	1524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.000;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.275;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=33;PP=1207;ReadPosRankSum=0.578;SC=AGAGACGCAGGTGGGCATCTA;SOR=0.693;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=206;TCF=107;TCR=99;TR=63;WE=86518994;WS=86518976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,66:0.32:207
chr11	86649986	rs77433857	T	C	2008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=3;PP=1634;ReadPosRankSum=0.872;SC=CATTAAAAGATAGCCAAATGG;SOR=1.159;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=90;TCF=86;TCR=4;TR=68;WE=86649994;WS=86649976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,70:0.75:93
chr11	86650282	rs4631906	T	C	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=52;PP=1389;ReadPosRankSum=0.668;SC=AACAAAAAATTCTAATTACAG;SOR=0.854;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=3;TCR=82;TR=54;WE=86650290;WS=86650272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,55:0.64:86
chr11	86782716	rs5793233	AT	A,ATT	4317.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=2.419;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.031;NF=7,7;NR=88,88;PP=2945,870;ReadPosRankSum=-1.069;SC=CCCAACTATAATTTTTTTTTT;SOR=1.688;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=11;TCR=138;TR=95,95;WE=86782736;WS=86782706;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.67,0.30:132
chr11	86782728	rs2513239	T	G	3678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.485;NF=15;NR=72;PP=2913;ReadPosRankSum=1.826;SC=TTTTTTTTTTTTAATTATCAC;SOR=0.631;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=25;TCR=119;TR=87;WE=86782736;WS=86782706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,99:0.65:153
chr11	86802260	rs10898595	G	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=0.589;SC=AAATTAGTTCGGCATAATTTA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=86802268;WS=86802256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr11	86868347	rs556139	C	T	2157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.556;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.920;NF=65;NR=16;PP=2576;ReadPosRankSum=0.714;SC=GATTGTAGATCATATATTTTT;SOR=0.535;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=175;TCF=143;TCR=32;TR=81;WE=86868370;WS=86868337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,84:0.46:181
chr11	86868361	rs59532014	GT	G	1528.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.145;NF=52;NR=22;PP=2606;ReadPosRankSum=1.128;SC=TATTTTTGCTGTTTTTTTTTT;SOR=0.681;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=189;TCF=126;TCR=63;TR=74;WE=86868370;WS=86868337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,88:0.44:198
chr11	87006776	rs10792935	G	A	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=14;PP=927;ReadPosRankSum=0.636;SC=ATAGGTACTTGTATCTCAAAA;SOR=0.701;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=58;TCR=24;TR=47;WE=87006784;WS=87006766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,47:0.56:84
chr11	87007008	rs10792936	A	T	364.96	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=275;ReadPosRankSum=-0.213;SC=AAGCCTGCGGATAAATAGCTC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=11;WE=87007016;WS=87006998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr11	87013438	rs2276102	G	A	8874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=578;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.474;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=150;NR=179;PP=2962;ReadPosRankSum=1.324;SC=GGAAAAACCCGGAAGAATGAA;SOR=0.884;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=550;TCF=262;TCR=288;TR=329;WE=87013446;WS=87013428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:232,340:0.59:572
chr11	87016818	rs111653145	A	AAAATAAAT	201.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=28.82;ReadPosRankSum=0.842;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr11	87020470	rs3758656	G	A	2265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-8.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=3;PP=1716;ReadPosRankSum=-0.326;SC=TTTCTATTTTGAGATGGTAAA;SOR=0.910;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=102;TCR=4;TR=74;WE=87020478;WS=87020460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,80:0.71:112
chr11	87032215	rs7112344	T	C	4849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=146;NR=0;PP=2965;SC=TATATTAATATTTGTTTACTG;SOR=9.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=146;TCF=146;TCR=0;TR=146;WE=87032223;WS=87032205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr11	87032287	rs11235097	G	C	5364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.578;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=140;NR=52;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.816;SC=TTTGGTACTGGTGCATCTAAA;SOR=0.464;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=309;TCF=230;TCR=79;TR=192;WE=87032295;WS=87032277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,195:0.62:313
chr11	87847018	rs3740925	C	T	6386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=125;PP=2965;SC=TTCTCTCTCACTGAAAAAACA;SOR=1.790;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=56;TCR=125;TR=181;WE=87847026;WS=87847008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr11	87847194	.	T	C	4838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.463;ClippingRankSum=0.000;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.672;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=71;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.479;SC=GCAACCTTGGTTGATGTGAGA;SOR=0.548;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=276;TCF=160;TCR=116;TR=163;WE=87847202;WS=87847184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,173:0.61:284
chr11	87908305	rs36069323	G	C	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=5.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.428;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=596;ReadPosRankSum=-0.705;SC=ACTGGAAACCGGCCGCGAGGC;SOR=1.651;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=47;TCF=44;TCR=3;TR=26;WE=87908313;WS=87908295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr11	87908448	rs302646	A	G	7824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=140;NR=110;PP=2965;SC=GGTAGTGCGAAGAGAAGTTCT;SOR=0.998;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=250;TCF=140;TCR=110;TR=250;WE=87908456;WS=87908438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr11	87908563	rs3812730	G	A	3282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=94;PP=2652;ReadPosRankSum=0.449;SC=CCTGGCGGCCGGCCAGACGTG;SOR=0.847;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=152;TCF=24;TCR=128;TR=110;WE=87908571;WS=87908553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,113:0.73:154
chr11	88033661	rs217116	A	G	2847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=6;PP=2266;SC=AAATAGTTCCAAACAAATTAA;SOR=4.935;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=90;TCR=6;TR=96;WE=88033669;WS=88033651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr11	88045583	rs217086	A	G	9261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=198;NR=80;PP=2965;SC=AAGGTGTGCTATGTTGACATA;SOR=1.891;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=278;TCF=198;TCR=80;TR=278;WE=88045591;WS=88045573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr11	88045815	rs5793312	C	CT	2423.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=68;PP=2856;SC=AAATGTGCCCCTTTCAAAACA;SOR=8.662;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=82;TCF=0;TCR=82;TR=68;WE=88045823;WS=88045805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	88059362	.	A	G	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.232;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.82;ReadPosRankSum=-1.212;SOR=0.073;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,7:0.20:35
chr11	88059683	rs217060	G	A	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=22;PP=580;SC=AATCATATCAGTTTCTTTAAG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=88059702;WS=88059673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	88059694	rs34320214	T	TA	83.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.61;ReadPosRankSum=0.008;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr11	88061405	rs580743	A	C	2304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-9.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.836;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=91;PP=1770;ReadPosRankSum=-1.193;SC=CATTATGTTGAGATTAAGCAT;SOR=0.395;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=144;TCF=5;TCR=139;TR=95;WE=88061413;WS=88061395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,97:0.64:151
chr11	88068052	rs217076	G	T	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=0;PP=1166;SC=ATCAGAAGAGGTTTCAGATAT;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=41;WE=88068060;WS=88068042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	88068256	rs201763299	G	A	335.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=75.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=-0.970;QD=2.52;ReadPosRankSum=-0.932;SOR=7.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,52:0.39:133
chr11	88068329	rs217077	T	A	1841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=56;PP=1682;SC=AATTTCAATTTTAATTGTGCT;SOR=8.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=0;TCR=56;TR=56;WE=88068337;WS=88068319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	88070563	rs580808	C	T	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.188;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=267;ReadPosRankSum=-1.027;SC=ATGCTCTGGCCACCCACAAGC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=13;WE=88070571;WS=88070553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr11	88242024	rs2941563	T	G	8938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=182;NR=123;PP=2965;SC=GCTGCGCGCCTCCCGTGACTT;SOR=1.171;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=307;TCF=183;TCR=124;TR=305;WE=88242032;WS=88242014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
chr11	88258689	rs4753486	C	T	1405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=42;PP=1293;SC=AATGGGGGTTCCTGCTTCTCA;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=42;WE=88258697;WS=88258679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	88338165	rs3816649	G	A	2872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=71;PP=2321;SC=TAGCTTTGAGGTACAAATCTA;SOR=3.611;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=12;TCR=71;TR=83;WE=88338173;WS=88338155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	88645129	rs626218	T	A	3660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.46;QD=32.40;SOR=5.477;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	88911696	rs1042602	C	A	4227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-11.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=565;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.888;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=98;PP=2962;ReadPosRankSum=0.136;SC=CTTGGGGGATCTGAAATCTGG;SOR=0.535;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=556;TCF=239;TCR=317;TR=183;WE=88911704;WS=88911686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:379,185:0.33:564
chr11	88925242	rs10765196	G	C	1754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=36;PP=1331;ReadPosRankSum=0.147;SC=CAGCACATAGGTAAAGCCTCC;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=34;TCR=53;TR=59;WE=88925250;WS=88925232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,63:0.67:94
chr11	88925328	rs10765197	A	C	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=28;PP=721;ReadPosRankSum=-0.174;SC=CTAAATATTTATCCTACAAAT;SOR=0.900;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=29;WE=88925336;WS=88925318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr11	89017961	rs1126809	G	A	4118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.620;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.868;NF=104;NR=44;PP=2962;ReadPosRankSum=1.706;SC=CAGTGGCTCCGAAGGCACCGT;SOR=0.525;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=229;TCF=163;TCR=66;TR=148;WE=89017969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,155:0.65:237
chr11	89133449	rs317139	C	T	14374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=457;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.859;NF=193;NR=265;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.714;SC=AGGGATGACTCATGACCGAAA;SOR=0.375;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=459;TCF=193;TCR=266;TR=458;WE=89133457;WS=89133439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,456:1.00:457
chr11	89221958	rs597046	G	C	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=361;SC=TATTCATTAAGTTACACCTAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=89221966;WS=89221953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	89223616	rs490934	C	G	5319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=120;NR=30;PP=2965;SC=TCCAAGTTCACCTTACTTACC;SOR=2.833;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=120;TCR=30;TR=150;WE=89223624;WS=89223606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr11	89223931	rs2304500	G	A	3739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=24;PP=2965;SC=CTGAGACTAAGCATTTGGGTT;SOR=2.411;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=108;TCF=84;TCR=24;TR=107;WE=89223939;WS=89223921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr11	89224101	rs3816123	G	T	13208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=418;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=200;NR=200;PP=2965;SC=CTGTATTCACGGAAAATGACC;SOR=0.708;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=401;TCF=201;TCR=200;TR=400;WE=89224109;WS=89224091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,413:1.00:413
chr11	89224131	rs34495256	T	TCTC	15088.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=177;PP=2969;SC=TTCCTCCACATCTCTCCCATC;SOR=1.256;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=291;TCF=84;TCR=207;TR=249;WE=89224139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,334:1.00:334
chr11	89224229	rs35177439	G	GT	9722.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=128;NR=108;PP=2974;SC=ATAAAGTTTTGTAAGTTGAGA;SOR=0.977;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=249;TCF=136;TCR=113;TR=236;WE=89224237;WS=89224219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr11	89224326	rs10830279	G	A	10450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=144;NR=182;PP=2965;SC=AGGACAGAGAGAACGCAAGGA;SOR=0.912;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=327;TCF=144;TCR=183;TR=326;WE=89224334;WS=89224316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,331:1.00:331
chr11	89224453	rs2289125	A	C	3124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=84;PP=2670;SC=TGCCCGCCGGACCGAGAAGGA;SOR=4.294;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=9;TCR=84;TR=93;WE=89224461;WS=89224443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr11	89370552	rs72971036	G	C	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.85;SOR=2.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	89370598	rs12363392	T	C	2624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=6;PP=2227;SC=CTCACTCTGTTACCAGGCTCC;SOR=4.379;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=69;TCR=6;TR=74;WE=89370606;WS=89370588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr11	89370719	rs12363079	A	G	4309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=98;PP=2965;SC=CAGGTCAGCAATCTGGACAGG;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=71;TCR=98;TR=169;WE=89370727;WS=89370709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr11	89371726	rs10765221	G	A	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.01;QD=30.60;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	89372210	rs7924505	C	T	1330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=10;PP=1538;SC=AATTGGTTTGCAACTTAAAAA;SOR=3.109;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=50;TCR=10;TR=60;WE=89372218;WS=89372200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	89372292	rs7942274	T	C	2643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=37;PP=2965;SC=TCACCTAATGTCAGAGGTAAT;SOR=1.552;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=115;TCF=78;TCR=37;TR=114;WE=89372300;WS=89372282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	89372341	rs7942295	T	G	4219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=90;NR=57;PP=2965;SC=CATACAACAATAATGAAAAAT;SOR=1.342;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=90;TCR=57;TR=147;WE=89372349;WS=89372331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr11	89372524	rs7945304	T	C	2127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=87;PP=2412;SC=AGCACATTCTTGAAAGTTTAT;SOR=3.611;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=17;TCR=87;TR=104;WE=89372532;WS=89372514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
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chr11	89392653	rs10765230	A	G	333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.87;QD=27.81;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	89392799	rs10830330	G	A	2534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=32;PP=2205;SC=CTATCCAGACGGTTGGAATCT;SOR=1.519;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=46;TCR=32;TR=78;WE=89392807;WS=89392789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	89402557	rs80292557	G	T	5503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=176;NR=53;PP=2965;SC=TAATAATGTTGTTTTGTGTCC;SOR=2.154;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=231;TCF=176;TCR=55;TR=229;WE=89402565;WS=89402547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr11	89402687	rs11018718	T	C	3873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.96;QD=34.28;SOR=4.504;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	89402728	rs11018719	A	G	737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.37;QD=33.53;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	89403414	rs10734120	C	T	784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=669;SC=ACGCCTTTTCCCCTGTTAATC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=89403422;WS=89403404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	89404941	rs11325465	CT	C	920.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.14;MQRankSum=-0.115;QD=20.46;ReadPosRankSum=1.495;SOR=3.109;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr11	89405190	rs10047486	A	G	3704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.37;QD=31.13;SOR=2.953;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr11	89407164	rs59743058	C	CT	2560.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.257;HP=12;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-3.018;NF=96;NR=8;PP=1621;ReadPosRankSum=-1.362;SC=CCATCAATGACTTTTTTTTTT;SOR=0.476;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=159;TCF=140;TCR=19;TR=104;WE=89407172;WS=89407154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:15,106:0.88:121
chr11	89407391	rs2075536	A	C	5861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=157;PP=2965;SC=GTAGCCAGGAATTATTTGCCA;SOR=3.978;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=18;TCR=157;TR=175;WE=89407399;WS=89407381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr11	89409158	rs4753234	A	G	1148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.65;QD=42.55;SOR=5.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	89409166	rs4753235	G	C	1427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.71;QD=41.99;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	89413781	rs10830339	C	G	1730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=1;PP=1556;SC=TTTCAGGAAACTACACTCTGA;SOR=6.399;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=47;TCR=1;TR=48;WE=89413789;WS=89413771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	89413850	rs10830340	C	T	3566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=34;PP=2206;SC=AAGAGGTATACAATTACATAT;SOR=1.165;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=48;TCR=34;TR=82;WE=89413858;WS=89413840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	89413867	rs7128813	G	A	3890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=43;PP=2626;SC=ATATAATTTAGGAAAACCCAA;SOR=0.953;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=51;TCR=43;TR=94;WE=89413875;WS=89413857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr11	89413975	rs10830341	C	T	1977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=53;PP=1622;SC=TATGACATCACATCTTCACAG;SOR=3.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=7;TCR=53;TR=60;WE=89413983;WS=89413965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	89420649	rs370982372	C	T	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.053;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-7.840;NF=5;NR=31;PP=586;ReadPosRankSum=-0.487;SC=AGTGTGGGATCGTTTTGAAAA;SOR=1.048;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=116;TCF=24;TCR=92;TR=36;WE=89420657;WS=89420639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,35:0.30:116
chr11	89424716	rs2035677	A	G	7633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=140;PP=2962;SC=ACATATATGTACATATGTGTA;SOR=2.796;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=39;TCR=140;TR=179;WE=89424769;WS=89424706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr11	89424736	rs6144434	GTGTGTATATATATATATATATATATA	GTA,G	5776.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=14,14;NR=57,57;PP=1088,42;SC=ATATGTGTGTGTGTGTATATA;SOR=5.353;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=85;TCF=15;TCR=70;TR=71,71;WE=89424769;WS=89424706;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.99:135
chr11	89443429	rs10830355	G	A	6568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=177;NR=17;PP=2965;SC=TATGCCATGGGGGAAAGAATG;SOR=4.497;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=177;TCR=17;TR=194;WE=89443437;WS=89443419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr11	89443808	rs11018745	A	C	8230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.71;QD=35.33;SOR=2.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr11	89443939	rs10830356	C	A	2032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=62;PP=1844;SC=ACAGGTAATACGGAAAGATAT;SOR=6.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=63;TCF=1;TCR=62;TR=63;WE=89443947;WS=89443929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	89444754	rs7111680	G	A	3772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.18;QD=33.39;SOR=4.504;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	89447256	rs1967075	A	G	1892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=2;PP=1575;SC=GCATTAAACTATATTTAGTAG;SOR=5.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=54;TCF=52;TCR=2;TR=54;WE=89447264;WS=89447253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	89447313	rs1967074	A	G	4027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.768;NF=109;NR=5;PP=2965;ReadPosRankSum=1.001;SC=TAAGGAAAGAATAAAACCACT;SOR=4.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=110;TCR=5;TR=114;WE=89447321;WS=89447303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,115:0.99:116
chr11	89447375	rs17221124	C	T	4141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.615;NF=116;NR=35;PP=2962;ReadPosRankSum=0.249;SC=TATAAATTTGCGGAGCATGAT;SOR=0.702;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=228;TCF=176;TCR=52;TR=151;WE=89447383;WS=89447365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,151:0.67:225
chr11	89451057	rs3881253	A	G	9158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=209;PP=2965;SC=ACAGGTCACAAACCTGACCAA;SOR=4.235;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=238;TCF=29;TCR=209;TR=238;WE=89451079;WS=89451047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr11	89451071	rs3881254	C	A	7782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=171;PP=2965;SC=TGACCAAGGCCTTGGGAATTC;SOR=5.372;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=12;TCR=172;TR=183;WE=89451079;WS=89451047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr11	89531540	rs12417980	C	T	15194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=483;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=221;NR=253;PP=2965;SC=CCCGCCTTTCCATCTATCTTC;SOR=0.825;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=475;TCF=221;TCR=254;TR=474;WE=89531548;WS=89531530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,482:1.00:482
chr11	89531801	.	CA	C	45.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=1.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.18;MQRankSum=-2.047;QD=0.80;ReadPosRankSum=0.986;SOR=1.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,14:0.25:57
chr11	89774197	rs200350663	CT	C	328.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=10.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.90;MQRankSum=0.901;QD=7.83;ReadPosRankSum=0.640;SOR=0.428;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr11	89896537	rs80078229	A	G	2799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.990;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=53;PP=2040;ReadPosRankSum=0.099;SC=TATTGACCCAACCAGTGGGGT;SOR=0.873;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=349;TCF=178;TCR=171;TR=117;WE=89896545;WS=89896527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:239,122:0.34:361
chr11	89914894	rs367579951	TA	T	182.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=0.983;QD=6.09;ReadPosRankSum=-0.388;SOR=1.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr11	89935645	.	C	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.665;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.527;NF=5;NR=0;PP=44;ReadPosRankSum=1.183;SC=CCCACTGCATCGGTTCAGCTT;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=5;WE=89935653;WS=89935635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr11	89946502	rs35305859	CA	C	409.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=1.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.871;QD=5.85;ReadPosRankSum=1.211;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr11	91545212	rs4753345	C	G	3702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=88;PP=2940;SC=CACAGCAAGACTATTTAACTG;SOR=2.604;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=112;TCF=23;TCR=89;TR=111;WE=91545220;WS=91545202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr11	92257703	rs561408	T	G	1912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=1;PP=1619;SC=GTTTTTCATATGCCAAGATTA;SOR=6.593;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=50;TCR=1;TR=51;WE=92257711;WS=92257693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	92292618	rs508848	A	G	207.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=139;SC=TGGCATGATCATAGCTCACTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=92292626;WS=92292608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	92497990	rs3847524	C	G	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=1;PP=869;SC=CAGATCCAAACTCTACAACAA;SOR=4.615;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=30;WE=92497998;WS=92497986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	92531356	rs7949157	A	G	12149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=410;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=213;NR=176;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.032;SC=ATCACCACTCAGAAGGCCCTG;SOR=0.554;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=390;TCF=213;TCR=177;TR=389;WE=92531364;WS=92531346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,400:1.00:401
chr11	92532677	rs12362722	T	C	15425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=473;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=262;NR=205;PP=2965;SC=GCGGAAAACCTTCTTTGTCTA;SOR=0.933;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=467;TCF=262;TCR=205;TR=467;WE=92532685;WS=92532667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,471:1.00:471
chr11	92534442	rs3847531	A	G	13765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=473;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=304;NR=162;PP=2965;SC=CAAAGGGGGCATATTCGTCAT;SOR=1.472;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=467;TCF=305;TCR=162;TR=466;WE=92534450;WS=92534432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,471:1.00:471
chr11	92538405	rs62622785	C	A	1783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=41;PP=1441;ReadPosRankSum=0.687;SC=CAGAGAAGAACAGGACATTTA;SOR=0.706;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=206;TCF=89;TCR=117;TR=73;WE=92538413;WS=92538395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,75:0.35:212
chr11	92539384	rs4753415	A	G	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=368;SC=TAATATATTGAAATATGTTTC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=92539392;WS=92539377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	92564767	rs6483189	T	G	4429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=5;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.706;SC=GCCCACTCATTTTCCTGTGTC;SOR=4.680;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=122;TCR=5;TR=126;WE=92564775;WS=92564757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,128:0.99:129
chr11	92568149	rs75651194	A	G	2311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.599;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=61;PP=1655;ReadPosRankSum=-1.423;SC=CACTGTCAACATCAACCTCAC;SOR=0.507;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=131;TCF=39;TCR=92;TR=89;WE=92568157;WS=92568139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,94:0.69:137
chr11	92573911	rs10765565	G	T	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=32;PP=796;ReadPosRankSum=-1.209;SC=TCTGGAATACGTGTTGTGTGT;SOR=0.573;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=20;TCR=72;TR=41;WE=92573919;WS=92573901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,41:0.43:96
chr11	92590448	rs4753069	A	G	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=737;ReadPosRankSum=-0.409;SC=GCAGTGTGTCAGTTATGAAGC;SOR=0.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=116;TCF=63;TCR=53;TR=46;WE=92590456;WS=92590438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,44:0.38:115
chr11	92592536	rs35216054	GT	G	889.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=1.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=1.599;QD=5.89;ReadPosRankSum=-1.040;SOR=0.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,43:0.28:151
chr11	92599851	rs3847553	G	A	1478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.912;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=10;PP=1059;ReadPosRankSum=0.896;SC=CAGGGTGTAGGGAACATATTC;SOR=1.283;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=185;TCF=143;TCR=42;TR=58;WE=92599859;WS=92599841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,63:0.34:188
chr11	92615762	.	A	C	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.656;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQRankSum=-1.231;QD=7.34;ReadPosRankSum=-1.785;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr11	92615764	.	CAA	C	106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQRankSum=-2.006;QD=6.28;ReadPosRankSum=-2.207;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,3:0.18:17
chr11	92623608	rs7118363	A	G	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=41;ReadPosRankSum=1.615;SC=CCAGCAAAGCACCAACTCCAG;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=6;WE=92623616;WS=92623599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr11	92915017	rs17631593	C	T	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=599;ReadPosRankSum=1.257;SC=ATAAAACCACCTCTTGAAATA;SOR=0.297;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=76;TCF=0;TCR=76;TR=29;WE=92915025;WS=92915007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,29:0.37:79
chr11	93118515	rs3020057	G	A	2238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=11;PP=1698;SC=TGCATTGTACGTTATGATAAC;SOR=3.040;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=67;TCF=55;TCR=12;TR=65;WE=93118523;WS=93118505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	93122446	rs3020056	TC	AA	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=1122;SC=CCGACATTTTTCTGTGTGAGA;SOR=4.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=19;WE=93122455;WS=93122436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	93141580	rs2259633	C	A	3940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=95;PP=2965;SC=AAAAGTGGAACAAAATGAAGA;SOR=3.376;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=114;TCF=17;TCR=97;TR=112;WE=93141588;WS=93141570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr11	93170909	rs375443728	T	TCC	183.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.99;ReadPosRankSum=0.489;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr11	93170925	rs2605584	G	A	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=13;PP=352;SC=CCCCACCCCCGCCAAGAAAAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=93170933;WS=93170915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	93212161	rs2605594	A	G	10982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=400;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=286;NR=103;PP=2965;SC=TGGGGTCCGCAGCCGGCTGCG;SOR=2.190;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=389;TCF=286;TCR=103;TR=389;WE=93212169;WS=93212151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,395:1.00:395
chr11	93212245	rs3207348	C	T	4704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=621;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=122;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.930;SC=CCACGGCCAGCGTGGGCAGCA;SOR=0.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=601;TCF=259;TCR=342;TR=212;WE=93212262;WS=93212235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:398,217:0.35:615
chr11	93212254	rs2658797	C	T	9824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-7.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=594;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.558;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=154;NR=217;PP=2962;ReadPosRankSum=1.060;SC=GCGTGGGCAGCACCACTGTAG;SOR=0.620;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=573;TCF=235;TCR=338;TR=371;WE=93212262;WS=93212235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,384:0.65:589
chr11	93400052	rs7123801	G	A	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=32;PP=869;SC=TTACATTAGAGTGTTCTAAAT;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=93400060;WS=93400042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	93400796	rs67112133	C	T	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.862;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=11;PP=830;ReadPosRankSum=0.897;SC=AAAGAGATATCGCCTTACAGA;SOR=0.427;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=137;TCF=109;TCR=28;TR=47;WE=93400804;WS=93400786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,50:0.36:140
chr11	93402006	rs61743303	A	G	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.661;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=348;ReadPosRankSum=0.366;SC=CACAGCGGGCAGCAGAAAGGA;SOR=0.239;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=56;TCF=34;TCR=22;TR=23;WE=93402014;WS=93401996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,23:0.40:58
chr11	93402096	rs1944101	C	A	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=32;PP=1013;SC=AACAAAAAACCTGGTAAAGTA;SOR=3.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=37;WE=93402104;WS=93402086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	93403067	rs1954994	G	A	2084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=60;PP=1692;SC=TTGTACAGGAGTATATCTGGA;SOR=8.318;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=0;TCR=60;TR=60;WE=93403075;WS=93403057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	93408743	rs62622500	G	A	2372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.642;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=8;PP=1909;ReadPosRankSum=-0.871;SC=CCAGAACATCGAAGTAAAAAG;SOR=1.526;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=124;TCF=109;TCR=15;TR=82;WE=93408751;WS=93408733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,86:0.66:130
chr11	93408831	rs10831088	G	A	7333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=133;PP=2965;SC=GACACAAAACGGGTGATTGAC;SOR=1.104;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=229;TCF=95;TCR=134;TR=227;WE=93408839;WS=93408821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr11	93408958	rs35646565	C	CA	1213.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=36;PP=1420;SC=TAATAATAATCAAAACCTTTT;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=36;WE=93408966;WS=93408948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	93412774	rs1944100	A	G	5798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=163;PP=2965;SC=ATAGCATTGCAGGACTGATTA;SOR=5.832;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=172;TCF=8;TCR=164;TR=171;WE=93412782;WS=93412764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr11	93425159	rs4753495	C	A	7563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=100;NR=126;PP=2965;SC=CCTCAAGAAGCAGCAGCCAGG;SOR=0.948;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=227;TCF=100;TCR=127;TR=226;WE=93425167;WS=93425149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr11	93430715	.	GG	AA	15102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.900;ClippingRankSum=0.000;DP=587;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.739;NF=145;NR=195;PP=2944;ReadPosRankSum=1.608;SC=AGAAAGAAGTGGAACAGCAAA;SOR=0.993;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=555;TCF=249;TCR=306;TR=340;WE=93430724;WS=93430705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,375:0.64:582
chr11	93454831	rs59894789	GGTGT	G	1635.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;QD=34.80;SOR=3.014;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,44:0.94:47
chr11	93460160	rs67879380	A	C	3013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.520;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=29;PP=2200;ReadPosRankSum=-0.261;SC=CAATGTTTTGAACAGCTTCAG;SOR=1.489;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=354;TCF=232;TCR=122;TR=120;WE=93460168;WS=93460150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:246,129:0.34:375
chr11	93462607	rs7131178	A	T	2528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-6.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.593;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=9;PP=1940;ReadPosRankSum=-0.039;SC=TAGGTGAGTGAGTTTCTGCCT;SOR=0.433;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=129;TCF=117;TCR=12;TR=89;WE=93462615;WS=93462597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,94:0.68:138
chr11	93463145	.	AT	A	366.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=0.000;DP=287;ExcessHet=3.0103;FS=4.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.492;QD=1.95;ReadPosRankSum=0.739;SOR=1.278;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:144,44:0.23:188
chr11	93463332	rs7101779	A	G	4131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=65;PP=2965;SC=TAACTGAGGGAGAAGGACTTA;SOR=0.856;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=122;TCF=57;TCR=65;TR=122;WE=93463340;WS=93463322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr11	93463666	rs7119918	C	A	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=11;PP=549;SC=GGCAACAATCCTGGATTATTA;SOR=0.776;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=23;WE=93463674;WS=93463656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	93464175	rs1944108	A	C	2957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-6.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.640;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=28;PP=2093;ReadPosRankSum=0.257;SC=TTGCTAGCAAAGTAGCAGATA;SOR=0.631;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=170;TCF=126;TCR=44;TR=107;WE=93464183;WS=93464165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,115:0.63:182
chr11	93464806	rs72974686	T	C	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=28;PP=619;ReadPosRankSum=-0.600;SC=TAAGTGGTGATAGATGTTGCA;SOR=0.637;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=5;TCR=76;TR=30;WE=93464814;WS=93464796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,31:0.36:87
chr11	93466866	rs2155248	G	T	2925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=81;PP=2403;SC=AGGGGTTCGAGGCTACAGTGA;SOR=5.283;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=5;TCR=82;TR=86;WE=93466874;WS=93466856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	93474570	rs11280945	T	TGCGTGA	21728.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=471;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=190;NR=154;PP=2965;SC=ACTGGCCTGGTGTCCTAGAGC;SOR=1.482;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=374;TCF=209;TCR=165;TR=344;WE=93474578;WS=93474560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,456:1.00:456
chr11	93474678	rs630648	G	C	10349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=262;PP=2965;SC=TATTTCCGTGGCCCAAGTAAT;SOR=3.611;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=302;TCF=40;TCR=262;TR=302;WE=93474686;WS=93474668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr11	93474791	rs623510	G	T	1792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=52;PP=1435;SC=GCGCAGGGAGGACTGACTAAC;SOR=5.856;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=54;TCF=2;TCR=52;TR=54;WE=93474799;WS=93474781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	93474827	rs631116	T	C	1247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=35;PP=1028;SC=GCTCGCGTATTCTGAGGAGGC;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=36;WE=93474835;WS=93474817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	93483346	rs681321	G	A	1021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=0;PP=906;SC=TGTATCTTGTGATTATGTCTA;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=93483354;WS=93483336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	93487008	rs623993	G	A	3127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=33;PP=2577;SC=CTGTTGATCAGTTGGCAAGGA;SOR=1.305;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=57;TCR=33;TR=90;WE=93487016;WS=93486998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr11	93490682	rs604414	T	A	6327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=180;PP=2965;SC=GTGTGTGCACTTACTTAAGAT;SOR=4.364;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=199;TCF=18;TCR=181;TR=198;WE=93490690;WS=93490672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr11	93490699	rs369459092	AT	A	441.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=5.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=0.813;QD=4.75;ReadPosRankSum=1.589;SOR=0.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,35:0.38:93
chr11	93521405	rs676586	C	T	2780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=80;PP=2397;SC=GGCTTTGTGCCTGTTGTTCCA;SOR=8.789;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=81;TCF=0;TCR=81;TR=80;WE=93521413;WS=93521395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	93527219	rs657177	T	C	9316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=88;NR=191;PP=2965;SC=TATGTTCTATTCTCTAATTTC;SOR=1.718;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=279;TCF=88;TCR=191;TR=279;WE=93527227;WS=93527209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr11	93527282	rs5793656	GA	G	3617.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=120;PP=2975;SC=ATATAGGTAGGAAAAAATAGA;SOR=8.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=127;TCF=0;TCR=127;TR=120;WE=93527290;WS=93527272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr11	93534929	.	T	TGA	1211.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=57.70;SOR=6.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	93534930	.	TTC	GAT	1592	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=19;NR=0;PP=1592;QD=87.1298881506;SC=TCATAAAATTTTCGAATCATT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=19;WE=93534940;WS=93534920;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,19:0.76:25
chr11	93534930	.	TTC	T	1211.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.28;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	93534990	rs655699	G	A	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.482;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=211;ReadPosRankSum=-0.072;SC=TTAACTTCTTGTATTTAAAAG;SOR=0.343;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=13;WE=93534998;WS=93534980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,15:0.29:51
chr11	93540914	rs72978409	T	G	2887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-10.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=99;PP=2344;ReadPosRankSum=0.171;SC=AAAAAAATTTTTTTCCAGTAG;SOR=0.517;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=161;TCF=1;TCR=160;TR=100;WE=93540922;WS=93540904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,102:0.63:163
chr11	93583493	rs112543723	G	C	2370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.508;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=10;PP=1906;ReadPosRankSum=-0.343;SC=GGGCCAGGGGGGCCGCTGCTA;SOR=1.207;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=123;TCF=107;TCR=16;TR=86;WE=93583501;WS=93583483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,86:0.70:123
chr11	93583529	rs113556447	C	T	3983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.140;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=30;PP=2962;ReadPosRankSum=0.089;SC=CCCGTGCCCCCCTACCCATTC;SOR=1.847;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=195;TCF=143;TCR=52;TR=138;WE=93583537;WS=93583519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,138:0.71:194
chr11	93583790	rs10831106	T	G	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=244;ReadPosRankSum=-0.579;SC=CAGATGCAGATGAGCTGGTTG;SOR=0.793;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=11;WE=93583798;WS=93583780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr11	93754508	rs2511403	G	A	1567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=0;PP=1246;SC=TGTGCAGGCTGCCTGCCTGCT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=44;WE=93754516;WS=93754498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	93797619	rs1945783	A	G	9868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=209;NR=128;PP=2965;SC=TTTCTGCACCAACCCTGATTC;SOR=1.334;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=337;TCF=209;TCR=128;TR=337;WE=93797627;WS=93797609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,340:1.00:340
chr11	93801012	rs10765650	C	T	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.588;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=40;PP=787;ReadPosRankSum=0.434;SC=TTAGATAGAGCCTTGTATGTA;SOR=1.081;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=138;TCF=13;TCR=125;TR=43;WE=93801020;WS=93801002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,42:0.30:138
chr11	93801062	rs10765651	C	T	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=6.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=624;ReadPosRankSum=2.342;SC=GAAAATATAACGCTCATCTCT;SOR=0.374;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=0;TCR=70;TR=29;WE=93801070;WS=93801052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,30:0.40:75
chr11	93803717	rs1878799	C	G	4844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=125;PP=2965;SC=AGGTAAGCACCCTTTGTTGGT;SOR=3.495;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=19;TCR=125;TR=144;WE=93803725;WS=93803707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr11	93803771	rs1878800	T	C	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-6.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=41;PP=731;ReadPosRankSum=-2.154;SC=AGGCTTTCTCTGTGATCTAAT;SOR=0.455;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=67;TCF=1;TCR=66;TR=42;WE=93803779;WS=93803761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,44:0.61:72
chr11	93806416	rs1914725	T	C	11436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=219;PP=2965;ReadPosRankSum=0.310;SC=CTCTTCTGCTTTACTTCTTTC;SOR=0.725;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=324;TCF=103;TCR=221;TR=322;WE=93806424;WS=93806406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,335:1.00:336
chr11	93834223	rs7927016	G	A	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=1;PP=704;ReadPosRankSum=-0.567;SC=CTCTAAAGTGGAGTAGAGTTA;SOR=0.871;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=43;TCF=42;TCR=1;TR=30;WE=93834231;WS=93834213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,33:0.72:46
chr11	93862493	rs1138800	A	C	3583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.994;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=29;PP=2901;ReadPosRankSum=0.199;SC=CCATCGCTCAACTGGCCACGG;SOR=0.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=211;TCF=161;TCR=50;TR=131;WE=93862501;WS=93862483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,134:0.61:221
chr11	93886838	rs7928030	G	C	1778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.793;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=44;PP=1341;ReadPosRankSum=-1.570;SC=TTGCTTTATAGATAAGGAAAC;SOR=0.859;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=103;TCF=32;TCR=71;TR=63;WE=93886846;WS=93886828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,68:0.61:111
chr11	93913458	rs3020015	T	C	1392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=6.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.049;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=48;PP=1076;ReadPosRankSum=-1.176;SC=TACGGGAGTCTACCGAGAGCC;SOR=0.935;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=142;TCF=15;TCR=127;TR=52;WE=93913466;WS=93913448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,55:0.37:147
chr11	94113466	rs3740868	G	T	2093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.330;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=36;PP=1571;ReadPosRankSum=2.287;SC=TGGGGAGGGTGGCCTGTCCTC;SOR=0.856;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=217;TCF=115;TCR=102;TR=82;WE=94113474;WS=94113456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,85:0.38:225
chr11	94170484	rs13447714	TTC	T	1041.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.148;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=892;ReadPosRankSum=-1.107;SC=GCTAAAGATTTTCTGAGTCCT;SOR=0.376;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=95;TCF=22;TCR=73;TR=26;WE=94170493;WS=94170474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,32:0.29:111
chr11	94179125	rs1014666	T	C	4643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=108;PP=2965;SC=CATACAACACTAAAAAATGAA;SOR=2.767;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=28;TCR=109;TR=136;WE=94179133;WS=94179115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr11	94194303	rs529126	G	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=62;ReadPosRankSum=-0.366;SC=CCAAACTTTAGCAACTGCCAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=94194311;WS=94194293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr11	94197568	rs640627	C	T	1553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=51;PP=1326;ReadPosRankSum=0.411;SC=ATTTATCCTACTGAGAAACTA;SOR=0.656;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=78;TCF=1;TCR=77;TR=52;WE=94197576;WS=94197558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,52:0.67:78
chr11	94203868	rs610611	A	T	10100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=248;PP=2965;SC=GTGATGTGCAAACGAAAGCTT;SOR=2.577;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=317;TCF=69;TCR=248;TR=317;WE=94203876;WS=94203858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
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chr11	94212154	rs680695	A	G	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=35;PP=919;ReadPosRankSum=0.038;SC=AAAAACATAGATGAGGATAGT;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=39;WE=94212162;WS=94212144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,40:0.80:50
chr11	94223855	rs608452	A	G	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=1;PP=492;SC=ATACAAAATCAGCTTTGAGCT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=94223863;WS=94223845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	94225807	rs496797	C	T	1543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=1;PP=1218;SC=ATTCCAAATACCCTTTTTGAT;SOR=6.316;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=44;WE=94225815;WS=94225797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	94225888	.	C	A	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.252;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=21;PP=991;ReadPosRankSum=2.129;SC=TTACTGTGATCACAGTTGACG;SOR=0.717;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=87;TCF=40;TCR=47;TR=50;WE=94225896;WS=94225878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,52:0.58:90
chr11	94225920	rs497763	C	T	2367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=56;PP=1869;SC=CCCCAAATAACAAGGGATTCC;SOR=2.568;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=15;TCR=57;TR=71;WE=94225928;WS=94225910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	94229665	rs540199	A	G	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=284;ReadPosRankSum=1.146;SC=GAGAAAAACAAGAGTTTAGAC;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=12;WE=94229673;WS=94229657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr11	94261255	rs647484	C	G	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.377;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=15;PP=727;ReadPosRankSum=-0.179;SC=GACAGTGGCCCTGGAAGGGAT;SOR=0.827;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=167;TCF=117;TCR=50;TR=54;WE=94261263;WS=94261245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,55:0.31:176
chr11	94261280	rs11605546	G	A	1750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.707;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=19;PP=1439;ReadPosRankSum=0.561;SC=AGCATTAAAAGGAATCTGCCT;SOR=1.447;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=210;TCF=136;TCR=74;TR=72;WE=94261288;WS=94261270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,73:0.33:219
chr11	94277440	.	G	A	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.429;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.049;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=799;ReadPosRankSum=0.387;SC=GACGGGCGGTGCCCGGTTGGG;SOR=0.519;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=37;WE=94277448;WS=94277430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,36:0.62:58
chr11	94320237	rs7110167	T	C	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.268;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=15;PP=1224;ReadPosRankSum=1.067;SC=GGCCTGGGTTTGCCATTTCTG;SOR=0.316;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=161;TCF=132;TCR=29;TR=66;WE=94320245;WS=94320227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,66:0.42:159
chr11	94322352	rs11020845	AG	TA	5601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=504;ExcessHet=3.0103;FS=2.638;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.25;ReadPosRankSum=-0.074;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:338,160:0.32:498
chr11	94326627	rs11020851	G	A	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-7.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.633;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=534;ReadPosRankSum=-1.546;SC=ATGTAAGGATGCTCACCTGGC;SOR=0.016;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=74;TCF=73;TCR=1;TR=24;WE=94326635;WS=94326617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,27:0.36:75
chr11	94326654	rs111738403	CT	C	613.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=4.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.521;QD=5.90;ReadPosRankSum=1.256;SOR=0.251;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,32:0.31:104
chr11	94326848	rs11020852	C	T	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-6.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.947;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=430;ReadPosRankSum=-0.796;SC=CTCCTGGATACAGGCCCCTGA;SOR=0.131;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=87;TCF=12;TCR=75;TR=28;WE=94326856;WS=94326838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,33:0.36:92
chr11	94328651	rs1015714	T	C	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=579;ReadPosRankSum=-0.452;SC=AGATGGCCTATGTAACACTGA;SOR=0.640;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=141;TCF=42;TCR=99;TR=44;WE=94328659;WS=94328641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,46:0.31:147
chr11	94337220	rs593690	C	T	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.308;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=373;ReadPosRankSum=1.651;SC=TGATGTTCAGCTGGTAAGTAC;SOR=0.402;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=69;TCF=53;TCR=16;TR=23;WE=94337228;WS=94337210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,26:0.34:76
chr11	94474044	rs11300560	GT	G	4561.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=10;PP=2965;SC=GCTGGTGCTTGTGCGGGTTCG;SOR=4.523;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=96;TCR=10;TR=105;WE=94474052;WS=94474034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr11	94501849	rs2915239	G	A	3614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=101;PP=2965;SC=TGGGGGCCCGGGGCTGAGATC;SOR=7.903;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=103;TCF=1;TCR=102;TR=102;WE=94501857;WS=94501839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr11	94533373	rs2303960	C	T	3991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=547;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.858;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=98;PP=2962;ReadPosRankSum=0.918;SC=ACCAGCACCCCGGGATGCTCC;SOR=0.848;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=531;TCF=244;TCR=287;TR=174;WE=94533381;WS=94533363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:365,177:0.33:542
chr11	94699507	rs34805065	A	AT	3093.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=38;PP=2965;SC=GGCCAGTGAGATAAGGAGAGG;SOR=0.717;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=25;TCR=39;TR=63;WE=94699515;WS=94699497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	94704092	rs4753645	T	A	12694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.94;QD=46.33;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,274:1.00:274
chr11	94704092	.	TAG	AAA	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=59.95;NF=215;NR=29;PP=2947;QD=20;SC=TATTTTAGAATAGCATGGTAA;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=269;TCF=236;TCR=33;TR=244;WE=94704102;WS=94704082;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:25,244:0.91:269
chr11	94704094	rs4753646	G	A	12694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.94;QD=44.70;SOR=3.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr11	94730403	rs11371511	C	CA	348.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=0;PP=303;SC=ATCTCATTTGCAAAAAAAAAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=14;WE=94730411;WS=94730397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	94731759	rs3740853	G	A	11660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=174;NR=171;PP=2965;SC=CTCCCACGCCGATCTGCAGTT;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=346;TCF=174;TCR=172;TR=345;WE=94731767;WS=94731749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,356:1.00:356
chr11	94758710	rs12364644	T	C	3948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=109;NR=16;PP=2965;SC=CAGCTGCTTCTTGTGTGCAGC;SOR=3.667;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=109;TCR=16;TR=125;WE=94758718;WS=94758700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr11	94758838	rs16921265	C	T	14729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=496;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.396;NF=303;NR=189;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.803;SC=AGTCCCAAGGCGCACATCAAG;SOR=0.947;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=494;TCF=304;TCR=190;TR=492;WE=94758846;WS=94758828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,493:1.00:494
chr11	94759059	rs10752685	A	G	5178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.16;MQRankSum=-1.202;QD=30.83;ReadPosRankSum=-0.846;SOR=0.650;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,167:0.99:168
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chr11	94800902	rs5793709	G	GC	24643.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=671;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=291;NR=257;PP=2973;SC=TCGCGCTACAGCGCTCTCCCT;SOR=1.129;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=581;TCF=313;TCR=268;TR=548;WE=94800910;WS=94800892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,656:1.00:656
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chr11	94823448	rs3016947	A	T	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=325;SC=GCCGCTGGACATGCCCCCAGT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=94823456;WS=94823438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	94861491	rs599281	C	T	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=629;ReadPosRankSum=0.891;SC=CTAGTGCTGCCTCTGTGCTGT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=25;WE=94861499;WS=94861484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr11	94908658	rs11021065	G	T	4278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=6.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.557;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=39;PP=2962;ReadPosRankSum=0.692;SC=ACTGAAACACGTACTTTTTCT;SOR=0.620;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=243;TCF=184;TCR=59;TR=153;WE=94908666;WS=94908648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,158:0.63:251
chr11	94915241	rs10831316	T	G	1496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.891;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=15;PP=1110;ReadPosRankSum=-0.063;SC=TCCAAGACTTTCTAGTCAAAA;SOR=0.825;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=83;TCF=58;TCR=25;TR=53;WE=94915249;WS=94915231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,57:0.63:90
chr11	95509037	rs3789960	C	G	1264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=9;PP=973;SC=TGCTATTACTCAAGTTTAGCC;SOR=1.923;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=37;WE=95509045;WS=95509027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	95512060	rs1150360	A	G	7714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.287;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=109;PP=2965;ReadPosRankSum=1.305;SC=TCTTCTTTCAATTGACTTATA;SOR=0.439;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=234;TCF=124;TCR=110;TR=233;WE=95512068;WS=95512050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,242:1.00:243
chr11	95519195	rs3748252	A	T	3207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=91;NR=0;PP=2796;SC=GAATAGATCCAGTCTCAGTAG;SOR=9.044;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=91;TCF=91;TCR=0;TR=91;WE=95519203;WS=95519185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	95519506	rs3748253	G	A	3521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=103;PP=2965;SC=TATACCCAGTGTTGTAGACAT;SOR=7.960;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=104;TCF=1;TCR=103;TR=104;WE=95519514;WS=95519496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr11	95520695	rs1313288	T	C	1998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=15;PP=1620;SC=TGAGCCACTGTGCCCAGCCAG;SOR=2.376;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=48;TCR=15;TR=63;WE=95520703;WS=95520685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	95521648	rs1727165	A	G	1803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=11;PP=1418;SC=GTCAAAAACTATTCAGTATAC;SOR=2.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=52;WE=95521656;WS=95521638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	95521953	rs3748256	A	G	5601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.889;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=132;NR=33;PP=2965;ReadPosRankSum=1.484;SC=TATATTACAGACAAATTAAGA;SOR=2.745;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=133;TCR=34;TR=165;WE=95521961;WS=95521943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,170:0.99:171
chr11	95524067	rs12272061	G	T	3351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=96;PP=2904;SC=CATTCACTGTGGCTGTGTCGA;SOR=5.570;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=101;TCF=5;TCR=96;TR=101;WE=95524075;WS=95524057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr11	95528663	rs5793747	C	CT	1391.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.501;NF=37;NR=12;PP=638;ReadPosRankSum=1.535;SC=AGCTGTTATTCTTTTTTTTTT;SOR=1.308;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=49;WE=95528671;WS=95528653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,58:0.94:62
chr11	95528714	rs522536	C	T	3102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=46;PP=2256;SC=CAATGTTGACCAGAATTGATG;SOR=0.876;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=55;TCR=46;TR=101;WE=95528722;WS=95528704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	95551136	rs666398	C	T	4194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.96;NF=4;NR=119;PP=2965;SC=AATTATTTTACATCACTGGAT;SOR=6.439;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=4;TCR=119;TR=123;WE=95551144;WS=95551126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr11	95555088	rs11742	G	A	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.614;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=581;ReadPosRankSum=0.669;SC=AGGCAACTCCGTGTGTTCCCA;SOR=0.411;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=25;WE=95555096;WS=95555078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr11	95555841	rs56284050	G	GTGCCTTTACCAGTGTGTGGATCA	4373.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.27;QD=48.60;SOR=4.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	95561265	rs34100857	TA	T	1100.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=32;PP=1268;SC=TTGACTTTATTAAATCTTACT;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=32;WE=95561273;WS=95561255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	95562205	.	CA	C	140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=4.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.38;MQRankSum=-1.810;QD=4.40;ReadPosRankSum=-1.590;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr11	95562327	rs534488	G	A	5678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=64;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.781;SC=ACTTAACCATGTTCTACTTCT;SOR=0.596;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=115;TCR=65;TR=178;WE=95562335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,186:0.99:187
chr11	95562535	rs5793749	G	GA	1159.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.436;NF=2;NR=38;PP=787;ReadPosRankSum=-2.032;SC=TAATGATTAAGAAAAAAAAAA;SOR=2.179;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=51;TCF=4;TCR=47;TR=40;WE=95562543;WS=95562525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,45:0.96:47
chr11	95564259	rs644799	A	G	6121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=135;NR=40;PP=2965;SC=TGATGAAGAAAGAAACAGCAG;SOR=2.490;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=176;TCF=136;TCR=40;TR=175;WE=95564267;WS=95564249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr11	95569183	rs499637	G	A	3078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=85;NR=0;PP=2493;SC=TCTACTATACGATTGTTAACT;SOR=9.044;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=86;TCF=86;TCR=0;TR=85;WE=95569191;WS=95569173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	95569253	rs627568	A	C	7298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=167;NR=69;PP=2965;SC=GCTGCTTTTAAGGAGACAAAG;SOR=1.847;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=236;TCF=167;TCR=69;TR=236;WE=95569261;WS=95569243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr11	95580926	rs566204	G	A	11731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=124;NR=224;PP=2965;SC=ACAACCAGTGGGTTTCCTCAA;SOR=1.445;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=349;TCF=125;TCR=224;TR=348;WE=95580934;WS=95580916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,362:1.00:362
chr11	95590766	rs186380748	G	C	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=457;ReadPosRankSum=-0.507;SC=CCATTTTCAGGGAATACTTCT;SOR=1.121;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=79;TCF=32;TCR=47;TR=30;WE=95590774;WS=95590756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,31:0.39:80
chr11	95598629	rs687559	A	G	6435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=161;NR=26;PP=2965;SC=TAAGATGCTGAGAAGACTGCA;SOR=3.588;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=161;TCR=26;TR=187;WE=95598637;WS=95598619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr11	95657111	rs3824874	T	G	3785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=91;PP=2965;SC=GCTCGAGCTCTTCTCCATCGC;SOR=2.381;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=29;TCR=91;TR=120;WE=95657119;WS=95657101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr11	95825374	rs10557243	TTGCTGCTGC	T	2460.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=19;PP=2754;SC=GCTGCTGCTGTTGCTGCTGCT;SOR=1.875;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=100;TCF=66;TCR=34;TR=61;WE=95825390;WS=95825364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	95825797	rs7931870	A	G	8322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.146;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=131;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.858;SC=GTCCAGCAGAAGAGGGCAAGG;SOR=0.335;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=251;TCF=120;TCR=131;TR=250;WE=95825805;WS=95825787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,259:1.00:260
chr11	96086935	.	G	A	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.591;ClippingRankSum=0.000;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.510;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=309;ReadPosRankSum=-0.314;SC=GACAAACTGGGCCTTTGCAAA;SOR=0.362;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=86;TCF=27;TCR=59;TR=24;WE=96086943;WS=96086925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,24:0.28:87
chr11	96092376	rs10765801	C	T	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.620;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=32;PP=820;ReadPosRankSum=-0.369;SC=TATCTGACAACGAATATATAT;SOR=0.052;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=37;WE=96092384;WS=96092366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,39:0.66:59
chr11	96106661	rs11021560	C	G	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.780;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=662;ReadPosRankSum=-0.625;SC=AATATTAGAACAGAGCAGACA;SOR=1.675;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=27;WE=96106669;WS=96106651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr11	96123734	rs3842515	T	TG	895.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.541;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.867;NF=26;NR=1;PP=1174;ReadPosRankSum=-0.738;SC=TTAAGACTGTTGAAGTGAGCC;SOR=1.863;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=27;WE=96123742;WS=96123724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr11	96125435	rs10545425	CTT	C	622.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=609;ReadPosRankSum=1.371;SC=GTGACAAACTCTTTGCAATAT;SOR=2.531;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=14;WE=96125444;WS=96125425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr11	99427091	rs2047166	A	G	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=436;ReadPosRankSum=-0.688;SC=ATCCTCAGGTATTAATTTAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=19;WE=99427099;WS=99427081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,19:0.83:23
chr11	99428929	rs11375374	C	CT	3102.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.28;QD=29.00;SOR=3.035;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr11	99690212	rs12292548	C	T	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.61;ReadPosRankSum=-0.373;SOR=0.020;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,8:0.11:70
chr11	99690286	rs10790978	T	G	5524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=7.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.470;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=159;NR=9;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.474;SC=GTATTCAAAATCTCTTCCTGG;SOR=0.236;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=204;TCF=195;TCR=9;TR=168;WE=99690294;WS=99690276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,179:0.83:215
chr11	99690376	rs12292659	C	T	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=0.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.53;ReadPosRankSum=-1.299;SOR=0.835;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:412,54:0.12:466
chr11	99690428	rs7125822	T	G	4994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=472;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.155;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=125;PP=2962;ReadPosRankSum=1.551;SC=CCCAGCTGGCTAGGGGCAGCT;SOR=1.012;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=406;TCF=145;TCR=261;TR=165;WE=99690436;WS=99690418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:257,206:0.44:463
chr11	99690450	rs12222337	T	C	2471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=408;ExcessHet=3.0103;FS=6.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-2.735;QD=6.16;ReadPosRankSum=-0.123;SOR=1.122;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:286,115:0.29:401
chr11	99690461	rs10893933	A	G	2049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FS=7.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-2.810;QD=5.60;ReadPosRankSum=-0.185;SOR=1.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:265,101:0.28:366
chr11	99827810	.	G	GT	531.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.401;NF=1;NR=20;PP=348;ReadPosRankSum=-0.052;SC=ATTAGTGTGTGTTTTTTTTTT;SOR=0.240;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=57;TCF=1;TCR=56;TR=21;WE=99827818;WS=99827800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr11	99872630	rs72994870	A	G	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=492;ReadPosRankSum=0.217;SC=ACTTATTTCAATACATCGAAA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=19;WE=99872638;WS=99872620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr11	99941322	rs2059014	C	T	2028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=42;PP=1446;ReadPosRankSum=0.942;SC=ACCTGTTCTGCTGTAATTTTA;SOR=0.689;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=44;TCR=60;TR=72;WE=99941330;WS=99941312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,77:0.69:111
chr11	100061827	rs3031278	G	GAA	1939.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=0.000;QD=9.15;ReadPosRankSum=1.857;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,69:0.33:212
chr11	100168289	rs1944178	C	T	5575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=140;NR=23;PP=2965;SC=TCTGACTTATCTCAGGATTTT;SOR=3.664;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=140;TCR=23;TR=163;WE=100168297;WS=100168279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr11	100168320	rs75986029	T	TC	8855.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=136;NR=62;PP=2979;SC=GGTTGGGAGTTTTTTTCTCCT;SOR=2.079;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=200;TCF=136;TCR=64;TR=198;WE=100168328;WS=100168310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr11	100169829	rs1944180	A	G	2716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=1;PP=2372;SC=TTAATTAAGAATTTGGAGAAA;SOR=7.302;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=79;TCF=78;TCR=1;TR=78;WE=100169837;WS=100169819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr11	100641200	rs7944598	A	T	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=12;PP=314;ReadPosRankSum=0.696;SC=AAGTTCTATTACTAATATTTA;SOR=0.672;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=79;TCF=40;TCR=39;TR=23;WE=100641208;WS=100641190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,23:0.29:80
chr11	100665888	rs61999341	G	A	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.949;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=14;PP=965;ReadPosRankSum=-1.488;SC=AAGAAGAAAGGCGAAGACTGG;SOR=0.849;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=73;TCF=50;TCR=23;TR=48;WE=100665896;WS=100665878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,51:0.65:79
chr11	100730087	rs661237	G	A	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=126;ReadPosRankSum=-1.049;SC=TCACATTGTTGTTAGGATCAA;SOR=0.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=10;WE=100730095;WS=100730077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,11:0.26:42
chr11	100730213	rs646392	G	A	4059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=60;PP=2965;SC=ACATTGGATAGAGTAGCCATT;SOR=0.725;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=60;TCR=60;TR=120;WE=100730221;WS=100730203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr11	100804088	rs626529	A	G	2369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=53;PP=2038;SC=CTAGTGGAAAATACAACCCAC;SOR=1.842;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=22;TCR=53;TR=75;WE=100804096;WS=100804078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	100807130	rs581921	T	C	4700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=6.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.212;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=130;PP=2962;ReadPosRankSum=0.281;SC=GTGACTTGGTTAGTAGTATTT;SOR=0.843;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=257;TCF=58;TCR=199;TR=166;WE=100807138;WS=100807120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,169:0.65:260
chr11	100811574	rs35159175	CAT	C	3104.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=53;PP=2638;SC=ATTAAGAACTCATATTCTAGT;SOR=2.899;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=3;TCR=55;TR=56;WE=100811583;WS=100811564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	100811690	rs661973	G	T	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=10;PP=282;SC=TTCAGACAGTGATAACCGCTA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=100811698;WS=100811680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	100812338	rs151209547	A	AAC	817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.04;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	100812340	.	GAC	CAG	738	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=13;NR=0;PP=738;QD=60.8821442202;SC=CTGATTCTAAGACACTCTACC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=13;WE=100812361;WS=100812330;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr11	100812342	rs370937549	CACTCTACCCTAT	C	817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.04;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	100812344	.	CTCTACCCTAT	C	2965	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=12;NR=0;PP=2965;QD=20;SC=TTCTAAGACACTCTACCCTAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=100812361;WS=100812330;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	100812446	rs143636655	A	C	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.641;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=207;ReadPosRankSum=-1.523;SC=ATAGCACTGGAGAATGTGCAA;SOR=0.732;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=47;TCF=26;TCR=21;TR=14;WE=100812454;WS=100812436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,14:0.28:50
chr11	100814409	rs619066	G	A	4547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=112;NR=30;PP=2965;SC=ACATTTTAATGTGGCAACTTG;SOR=2.560;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=143;TCF=113;TCR=30;TR=142;WE=100814417;WS=100814399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr11	100814570	rs543146	A	G	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.271;NF=1;NR=36;PP=693;ReadPosRankSum=-0.145;SC=TTGACAAACGATTCTGCTTTG;SOR=0.499;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=101;TCF=4;TCR=97;TR=37;WE=100814578;WS=100814560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,39:0.38:104
chr11	100814609	rs618155	G	T	2171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=62;PP=1820;SC=GGTTTGAGCTGTTCTTTTCAC;SOR=8.349;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=0;TCR=62;TR=62;WE=100814617;WS=100814599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	100819305	rs633967	T	C	2573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=46;PP=1977;SC=GGTTTTATTGTCCTAATAATT;SOR=1.151;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=32;TCR=46;TR=78;WE=100819313;WS=100819295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr11	100819392	rs504081	A	G	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=35;PP=1087;SC=AAAGGAAATCAGGGGAGTAGA;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=37;WE=100819400;WS=100819382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	100819430	rs482050	A	G	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=17;PP=503;SC=AGTCTCACTCATGGCCCATAA;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=100819438;WS=100819420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	100819447	rs481991	C	A	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=337;SC=ATAACTCTACCTTTCTGACTT;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=100819455;WS=100819437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	100820555	rs11820715	C	G	8279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=447;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.896;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=160;NR=139;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.819;SC=TCAAGACACTCTTTTCATCTA;SOR=0.534;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=440;TCF=241;TCR=199;TR=299;WE=100820563;WS=100820545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,302:0.68:444
chr11	100820725	rs694556	A	T	2530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=75;PP=2104;SC=TTTTATCATGAAGTTATTTTT;SOR=8.714;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=75;TCF=0;TCR=75;TR=75;WE=100820733;WS=100820715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr11	100827326	rs151243237	AAATAT	A	12839.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=104;NR=100;PP=2965;SC=GGGTGCTGAGAAATATAATCT;SOR=1.109;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=221;TCF=108;TCR=113;TR=204;WE=100827338;WS=100827316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr11	100830440	rs7950832	T	C	2676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.987;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=9;PP=2148;ReadPosRankSum=-0.898;SC=GAGGGTGAAGTTCCCTCCTCT;SOR=0.301;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=135;TCF=124;TCR=11;TR=92;WE=100830448;WS=100830430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,95:0.68:140
chr11	100830579	rs6590829	G	A	5930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.090;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=161;PP=2962;ReadPosRankSum=1.093;SC=TGAGTTCAGCGTAAACACCTA;SOR=0.935;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=334;TCF=104;TCR=230;TR=227;WE=100830587;WS=100830569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,224:0.66:338
chr11	100830693	rs563460	T	C	1691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=54;PP=1340;SC=GTTGCCTGATTGGTACAGCAT;SOR=6.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=55;WE=100830701;WS=100830683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	100833059	rs540866	A	G	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=6.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=462;ReadPosRankSum=-0.839;SC=ACAGTCACCTAATTCTTAAAG;SOR=0.354;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=63;TCF=59;TCR=4;TR=23;WE=100833067;WS=100833049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,23:0.33:70
chr11	100847050	rs569270	A	G	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.946;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=1;PP=316;ReadPosRankSum=-0.631;SC=GTGTTGCTTCAGTCACTAGCC;SOR=3.019;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=93;TCF=76;TCR=17;TR=27;WE=100847058;WS=100847040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,27:0.29:94
chr11	100847069	rs569336	G	A	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=6.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.265;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.201;NF=36;NR=2;PP=647;ReadPosRankSum=-0.787;SC=CCCAGGAGACGTTTCCCCACC;SOR=1.999;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=126;TCF=109;TCR=17;TR=38;WE=100847077;WS=100847059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,37:0.29:127
chr11	100847749	rs575734	A	G	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.514;NF=14;NR=26;PP=728;ReadPosRankSum=-1.167;SC=GGATACAGAGAGGAGTTGAGT;SOR=0.694;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=128;TCF=47;TCR=81;TR=40;WE=100847757;WS=100847739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,41:0.31:133
chr11	100847829	rs3216738	CA	C	781.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.16;MQRankSum=1.233;NF=0;NR=21;PP=715;ReadPosRankSum=-1.200;SC=AGAGTGGGTACAGTCCACTTC;SOR=0.394;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=0;TCR=56;TR=21;WE=100847837;WS=100847819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
chr11	100849673	rs10791440	A	C	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=480;ReadPosRankSum=0.087;SC=AGCAGAACTGAATGTGATTGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=76;TCF=75;TCR=1;TR=24;WE=100849681;WS=100849664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,26:0.32:80
chr11	100856955	rs551632	C	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=91;ReadPosRankSum=-1.092;SC=ATGATAGTTCCCTGGGCAGCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=7;WE=100856963;WS=100856945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr11	100858098	rs145797581	G	C	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-6.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=526;ReadPosRankSum=-1.352;SC=AGTGCAAAAAGCACCGATGTA;SOR=0.327;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=68;TCF=68;TCR=0;TR=27;WE=100858106;WS=100858088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,27:0.38:71
chr11	100863096	rs515552	A	G	2801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=7.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=42;PP=2409;ReadPosRankSum=-1.622;SC=CAGGTCACGAAAAAGAACACA;SOR=0.697;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=373;TCF=242;TCR=131;TR=118;WE=100863104;WS=100863086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:262,115:0.31:377
chr11	100863354	rs471933	C	A	2944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=425;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.568;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=85;PP=2168;ReadPosRankSum=0.956;SC=CCCTCATTGTCACCGTTATCC;SOR=1.162;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=408;TCF=168;TCR=240;TR=131;WE=100863362;WS=100863344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:288,136:0.32:424
chr11	100922404	rs578029	A	T	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=334;SC=TAGGGTAATAAAATGTTTTCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=100922412;WS=100922394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	100933598	rs11571221	G	GAATGA	455.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=353;SC=AGCATCAATCGAATGAAATAG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=100933606;WS=100933588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	100998105	rs11571153	C	T	1671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=44;NR=5;PP=1337;SC=TGGCGGCCGCCGCCGCCAACG;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=44;TCR=5;TR=49;WE=100998113;WS=100998095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	100998623	rs1379130	G	A	12198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=407;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=240;NR=157;PP=2965;SC=AGGCCTCCGCGCCTTCCTCCT;SOR=1.204;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=398;TCF=241;TCR=157;TR=397;WE=100998631;WS=100998613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,405:1.00:405
chr11	100999838	rs11437764	A	AG	2767.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=58;PP=2780;SC=CCCCGTCTCCAGGAGGAGGGA;SOR=3.014;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=66;TCF=5;TCR=61;TR=61;WE=100999846;WS=100999828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr11	101323770	rs12805398	C	T	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FS=6.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.94;ReadPosRankSum=1.135;SOR=0.510;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:173,64:0.27:237
chr11	101323856	rs59743346	TAAG	T	1998.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.921;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.433;NF=14;NR=37;PP=1995;ReadPosRankSum=0.942;SC=GCAAGAGTGATAAGAAGTCAA;SOR=1.005;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=157;TCF=40;TCR=117;TR=51;WE=101323866;WS=101323846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,57:0.33:172
chr11	101323983	rs12804391	G	A	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=565;ReadPosRankSum=0.173;SC=TAATTGAGCAGGTTTTTGTTT;SOR=0.560;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=0;TCR=54;TR=25;WE=101323991;WS=101323973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr11	101340007	rs11224773	A	G	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=445;ReadPosRankSum=-1.719;SC=CTACCTCTCAATAACAGAATT;SOR=1.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=20;WE=101340015;WS=101339997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,19:0.40:48
chr11	101344177	rs12362848	G	A	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.735;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=510;ReadPosRankSum=0.261;SC=TTACATAAACGCTGTTAAACT;SOR=1.339;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=107;TCF=58;TCR=49;TR=33;WE=101344185;WS=101344167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,33:0.30:110
chr11	101347093	rs12366144	A	G	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.510;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=348;ReadPosRankSum=0.871;SC=TCAAAGTATCATTTGCGTCAA;SOR=1.363;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=99;TCF=48;TCR=51;TR=26;WE=101347101;WS=101347083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,26:0.25:104
chr11	101359750	rs36111323	G	A	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=17;PP=564;ReadPosRankSum=-0.003;SC=GAACTTGACCGCCATTGTCTG;SOR=0.763;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=108;TCF=56;TCR=52;TR=36;WE=101359758;WS=101359740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,38:0.34:111
chr11	101359932	rs7931830	C	T	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=120;ReadPosRankSum=0.740;SC=CAATGAAATACATTGTTAGAA;SOR=0.297;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=8;WE=101359940;WS=101359922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr11	101362164	rs71056610	CA	C	165.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQRankSum=1.344;QD=6.14;ReadPosRankSum=0.024;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr11	101374626	rs4542378	G	A	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=151;ReadPosRankSum=0.090;SC=TAAAGAGCTTGTTGAATAAAC;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=12;WE=101374634;WS=101374616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,13:0.25:53
chr11	101375549	rs10501986	T	C	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=35;PP=827;ReadPosRankSum=1.023;SC=AACAGAAAGATTGTAAACAAA;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=75;TCF=0;TCR=75;TR=35;WE=101375557;WS=101375539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,35:0.47:74
chr11	101390471	rs11224815	C	T	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.633;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=302;ReadPosRankSum=-1.243;SC=CTGAACACCTCTTGCTACCAC;SOR=0.254;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=17;WE=101390479;WS=101390461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,17:0.36:47
chr11	101771248	rs3858418	G	A	74839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=2440;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1132;NR=1251;PP=2965;SC=ATCACAGTCCGTCCACCTCCT;SOR=0.799;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=2386;TCF=1132;TCR=1254;TR=2383;WE=101771256;WS=101771238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2414:1.00:2414
chr11	101775673	rs11225057	A	C	27524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=8.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=868;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=781;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.235;SC=GTAAATTTATATTTGAAGAAA;SOR=2.256;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=855;TCF=41;TCR=814;TR=818;WE=101775681;WS=101775663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:36,830:0.96:866
chr11	101832478	rs7926728	G	T	16803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=514;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=415;NR=81;PP=2965;SC=CCAGAAATTTGGTGATGAAGT;SOR=3.240;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=496;TCF=415;TCR=81;TR=496;WE=101832486;WS=101832468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,510:1.00:510
chr11	101833644	rs7109233	C	T	51015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=1519;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1056;NR=427;PP=2965;SC=TTCCAAAGACCATTAAAAAAC;SOR=1.959;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=1485;TCF=1058;TCR=427;TR=1483;WE=101833652;WS=101833634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1503:1.00:1503
chr11	101857758	rs6590942	G	A	12093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=346;PP=2965;SC=AATGATCTCAGTGAAAGACTA;SOR=5.625;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=366;TCF=19;TCR=347;TR=365;WE=101857766;WS=101857748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,368:1.00:368
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chr11	101982041	rs34558896	T	TGGA	27368.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=634;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=492;PP=2924;SC=CGAGGCGAAGTGGAACTGGAG;SOR=6.642;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=629;TCF=14;TCR=615;TR=505;WE=101982049;WS=101982031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,600:1.00:600
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chr11	102080325	.	GAA	G,GA	9647.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.479;ClippingRankSum=0.000;DP=737;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.208;HP=15;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.392;NF=26;NR=396;PP=3000;ReadPosRankSum=0.481;SC=TTTAGCACTGGAAAAAAAAAA;SOR=0.715;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=695;TCF=58;TCR=637;TR=422;WE=102080336;WS=102080313;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.20,0.75:495
chr11	102098354	rs3858420	G	C	29919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=1057;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=281;NR=743;PP=2965;SC=ACTTAACAGTGGGATATGTTA;SOR=2.073;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=1024;TCF=281;TCR=743;TR=1024;WE=102098362;WS=102098344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1038:1.00:1038
chr11	102199608	rs60157696	TA	T	6301.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=476;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQRankSum=0.433;QD=23.17;ReadPosRankSum=3.408;SOR=0.902;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,237:0.87:272
chr11	102199610	rs59068554	TA	T	4740.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=471;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=2.440;QD=18.66;ReadPosRankSum=3.469;SOR=0.630;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,221:0.87:254
chr11	102207024	rs7124969	C	T	9509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=16.545;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=258;PP=2965;ReadPosRankSum=2.029;SC=TAATTTATGACTACTGAAAAT;SOR=3.433;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=298;TCF=31;TCR=267;TR=285;WE=102207032;WS=102207014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:12,291:0.96:303
chr11	102207851	rs1055088	G	A	14134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=475;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=400;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.972;SC=CCAAAACATCGTCTAAACTTT;SOR=1.093;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=465;TCF=49;TCR=416;TR=447;WE=102207859;WS=102207841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:18,456:0.96:474
chr11	102248377	rs34510872	C	T	27896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=953;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=479;NR=423;PP=2965;ReadPosRankSum=0.573;SC=CCTTTACAAGCGAGAGAACTG;SOR=0.779;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=948;TCF=503;TCR=445;TR=902;WE=102248385;WS=102248367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:43,899:0.95:942
chr11	102323160	rs2436036	C	T	21244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=686;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=486;NR=181;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.840;SC=CAGACACACGCGGAACTTTCT;SOR=1.036;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=669;TCF=488;TCR=181;TR=667;WE=102323168;WS=102323150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,682:1.00:683
chr11	102391425	rs14983	G	A	34631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.228;NF=707;NR=422;PP=2965;ReadPosRankSum=2.439;SC=ATGGAGTGGAGGAACAGTGCT;SOR=0.618;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=1192;TCF=747;TCR=445;TR=1129;WE=102391433;WS=102391415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:62,1150:0.95:1212
chr11	102398433	rs3216144	C	CT	156642.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=4003;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.215;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1447;NR=1379;PP=2963;ReadPosRankSum=1.740;SC=CAATGTTTGACCCCTAGGAAA;SOR=0.601;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=3379;TCF=1662;TCR=1717;TR=2826;WE=102398444;WS=102398421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:217,3686:0.94:3903
chr11	102398436	rs78978042	C	T	156177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=3953;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1824;NR=1406;PP=2962;ReadPosRankSum=1.344;SC=TGTTTGACCCCTAGGAAACAG;SOR=0.556;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=3764;TCF=2071;TCR=1693;TR=3230;WE=102398444;WS=102398421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:217,3685:0.94:3902
chr11	102398593	rs10502001	C	T	76628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=8.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=2694;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=755;NR=1744;PP=2965;ReadPosRankSum=1.310;SC=TTCTATGACGCGGGAGTTTAA;SOR=0.549;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=2639;TCF=794;TCR=1845;TR=2499;WE=102398601;WS=102398583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:134,2524:0.95:2658
chr11	102465281	rs7116339	G	A	7650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=198;NR=27;PP=2965;ReadPosRankSum=0.283;SC=AATGCTGGCAGGGCTAGATAT;SOR=1.118;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=229;TCF=202;TCR=27;TR=225;WE=102465289;WS=102465271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,235:0.98:239
chr11	102465502	.	CAAA	C	2104.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.505;ClippingRankSum=0.000;DP=417;ExcessHet=3.0103;FS=3.475;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-0.247;QD=15.71;ReadPosRankSum=0.598;SOR=0.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,86:0.64:134
chr11	102562700	rs2509010	C	T	21643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=741;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=202;NR=477;PP=2965;ReadPosRankSum=0.347;SC=GTCTTAATGTCGTATTCAAAT;SOR=0.774;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=715;TCF=213;TCR=502;TR=679;WE=102562708;WS=102562690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:36,700:0.95:736
chr11	102563739	rs1276289	C	T	51848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1853;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1032;NR=685;PP=2965;ReadPosRankSum=0.448;SC=TCTGCGGGAACCCTTTGTCCA;SOR=0.541;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=1813;TCF=1092;TCR=721;TR=1717;WE=102563747;WS=102563729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:92,1735:0.95:1827
chr11	102565856	rs10895351	A	T	15250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=510;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.376;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=459;PP=2965;ReadPosRankSum=1.372;SC=CACTTTACACATGCAGCCTAT;SOR=3.443;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=500;TCF=14;TCR=486;TR=470;WE=102565864;WS=102565846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:28,476:0.94:504
chr11	102567207	rs1276286	T	A	56646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-8.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=2095;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=803;NR=1139;PP=2965;ReadPosRankSum=0.288;SC=CTTAGCAGGTTCCTTAGGCAG;SOR=0.732;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=2052;TCF=845;TCR=1207;TR=1942;WE=102567215;WS=102567197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:102,1967:0.95:2069
chr11	102567626	rs1940480	C	G	31457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-9.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=136;NR=882;PP=2965;ReadPosRankSum=0.576;SC=ATGGCTGCATCTGAGATTAGA;SOR=1.090;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=1075;TCF=146;TCR=929;TR=1018;WE=102567634;WS=102567616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:58,1036:0.95:1094
chr11	102573396	rs2701994	C	G	11212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=306;NR=4;PP=2965;SC=GGGAACTTTACAGTTAAAAAG;SOR=8.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=310;TCF=306;TCR=4;TR=310;WE=102573404;WS=102573386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,313:1.00:313
chr11	102573569	rs3809018	C	A	59472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=2042;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.409;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1239;NR=660;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.881;SC=CATGGCCAAGCACTCCCAAGG;SOR=1.031;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=2007;TCF=1303;TCR=704;TR=1899;WE=102573577;WS=102573559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:103,1924:0.95:2027
chr11	102573912	rs61893941	C	T	23145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=755;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=701;PP=2965;ReadPosRankSum=0.944;SC=ACACACATAACTACAAAAAAC;SOR=4.147;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=742;TCF=5;TCR=737;TR=705;WE=102573920;WS=102573902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:36,713:0.95:749
chr11	102576375	rs1939015	G	A	51065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1657;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1213;NR=398;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.013;SC=TTCATTTTCCGTCATCCGGAC;SOR=2.297;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=1615;TCF=1216;TCR=399;TR=1611;WE=102576383;WS=102576365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,1634:1.00:1636
chr11	102576468	rs11225389	C	A	61606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=2240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1014;NR=1052;PP=2965;ReadPosRankSum=0.740;SC=TCAGCTGAAGCCGGTTCTGTT;SOR=0.684;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=2189;TCF=1075;TCR=1114;TR=2066;WE=102576476;WS=102576458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:119,2092:0.95:2211
chr11	102584023	rs1939018	T	A	57878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=1844;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1320;NR=488;PP=2965;SC=ACGAAAATGCTTGCTGAACTT;SOR=2.098;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=1812;TCF=1323;TCR=489;TR=1808;WE=102584031;WS=102584013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1824:1.00:1824
chr11	102587154	rs58281905	G	GAA	1600.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1012;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQRankSum=-3.415;QD=9.36;ReadPosRankSum=1.297;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,113:0.66:171
chr11	102591994	rs1892886	A	T	11721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.782;NF=336;NR=8;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.251;SC=ATCATGAGGTAGCAAAAATTT;SOR=1.981;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=357;TCF=349;TCR=8;TR=344;WE=102592002;WS=102591984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:13,358:0.96:371
chr11	102592049	rs72369292	TTGTG	T,TTGTGTGTG	27853.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=807;ExcessHet=3.0103;FR=0.5018,0.4982;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.25;NF=501,501;NR=35,35;PP=2992,14;SC=GTTACCTTTATTGTGTGTGTG;SOR=4.877;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=749;TCF=668;TCR=81;TR=536,536;WE=102592062;WS=102592039;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.99:645
chr11	102594427	rs6590984	T	C	37218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=1109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=488;NR=609;PP=2965;SC=CAAAAATTAATCCAGTCACAC;SOR=0.938;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=1097;TCF=488;TCR=609;TR=1097;WE=102594435;WS=102594417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1101:1.00:1101
chr11	102595413	rs11225394	C	T	16420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=541;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.192;NF=491;NR=18;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.279;SC=TTTTAATTAACAAGAGAAAAC;SOR=1.891;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=531;TCF=512;TCR=19;TR=509;WE=102595421;WS=102595403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:21,516:0.96:537
chr11	102595666	rs2155052	C	G	27183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=810;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=735;PP=2965;ReadPosRankSum=1.519;SC=AGCACCCTGACGTTCACAGCA;SOR=3.677;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=794;TCF=58;TCR=736;TR=793;WE=102595674;WS=102595656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,803:1.00:804
chr11	102623115	rs531335	A	G	11939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=324;PP=2965;SC=TTCTCAAGCTACACAGGTGTG;SOR=5.326;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=345;TCF=20;TCR=325;TR=344;WE=102623129;WS=102623105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,350:1.00:350
chr11	102641452	rs470171	G	C	44375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1501;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1246;NR=152;PP=2965;ReadPosRankSum=0.091;SC=AACCATTTTGGCTCATAATAC;SOR=0.905;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=1466;TCF=1306;TCR=160;TR=1398;WE=102641460;WS=102641442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:67,1407:0.95:1474
chr11	102642716	rs17860997	A	AT	41695.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=1129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=818;NR=159;PP=2957;SC=AGATTCCTGCATGACAATGAA;SOR=3.336;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=1031;TCF=860;TCR=171;TR=977;WE=102642724;WS=102642706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1115:1.00:1115
chr11	102647310	rs470154	T	G	20329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=609;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.97;NF=338;NR=255;PP=2965;SC=TCATTGTAGATCTGCAATGCC;SOR=1.019;SbPval=0.52;Source=Platypus;TCF=338;TR=593;WE=102647318;WS=102647300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,604:1.00:604
chr11	102649543	rs470277	T	A	9489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=248;PP=2965;SC=CTGTTCCAATTAAACAACAGT;SOR=4.735;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=271;TCF=23;TCR=248;TR=271;WE=102649551;WS=102649533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr11	102650424	rs486055	C	T	44666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1557;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=422;NR=1010;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.502;SC=ACTGTCCTTTCTTCTAAACTG;SOR=0.819;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=1513;TCF=448;TCR=1065;TR=1432;WE=102650432;WS=102650414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:78,1457:0.95:1535
chr11	102661099	rs470215	T	C	6005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.443;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=155;NR=26;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.585;SC=GAAAACACCTTCTTTGGACTC;SOR=0.228;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=191;TCF=165;TCR=26;TR=181;WE=102661107;WS=102661089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:9,186:0.95:195
chr11	102661595	rs470747	A	G	38422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1325;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.228;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=162;NR=1087;PP=2965;ReadPosRankSum=0.378;SC=CACTCTGAAAATCATTACAGA;SOR=0.556;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=1307;TCF=168;TCR=1139;TR=1249;WE=102661603;WS=102661585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:58,1248:0.96:1306
chr11	102663476	rs17884110	A	AG	84278.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=2157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=2.697;NF=465;NR=1221;PP=2971;ReadPosRankSum=0.621;SC=GAATCTGATTAGAAAAAAAGC;SOR=0.679;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=1878;TCF=517;TCR=1361;TR=1686;WE=102663490;WS=102663465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:115,1977:0.95:2092
chr11	102663482	rs1144391	A	T	84188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-8.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=2158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=1.769;NF=697;NR=1274;PP=2962;ReadPosRankSum=0.742;SC=GATTAGAAAAAAAGCAAGAAA;SOR=0.640;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=2095;TCF=741;TCR=1354;TR=1971;WE=102663490;WS=102663465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:121,2019:0.94:2140
chr11	102666043	rs491152	A	G	36395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=1070;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=662;NR=396;PP=2965;SC=TAAAATACCTAGAGTTAGTTT;SOR=1.322;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=1061;TCF=664;TCR=397;TR=1058;WE=102666051;WS=102666033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1059:1.00:1059
chr11	102666316	rs470558	T	C	37444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1319;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=300;NR=997;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.122;SC=GTTCATGAGCTGCAACACGAT;SOR=1.300;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=1299;TCF=300;TCR=999;TR=1297;WE=102666324;WS=102666306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,1308:1.00:1309
chr11	102668603	rs5794198	CA	C	5326.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.281;HP=14;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.523;NF=198;NR=26;PP=2878;ReadPosRankSum=0.380;SC=CTGTTTCTAGCAAAAAAAAAA;SOR=0.290;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=350;TCF=296;TCR=54;TR=224;WE=102668612;WS=102668593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:13,265:0.95:278
chr11	102668702	rs470358	T	C	22302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=755;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=423;NR=303;PP=2965;SC=TATTGTCACATGCAATGCAGC;SOR=1.063;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=729;TCF=424;TCR=305;TR=726;WE=102668710;WS=102668692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,742:1.00:742
chr11	102707305	rs569444	G	A	48550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1725;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=711;NR=909;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.035;SC=TTCTGCTTCCGATCAGATAAA;SOR=0.681;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=1705;TCF=747;TCR=958;TR=1620;WE=102707313;WS=102707295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:85,1628:0.95:1713
chr11	102707339	rs639752	C	A	43374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1372;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=407;NR=945;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.037;SC=TGGAAACTCTCATCACCTATT;SOR=0.861;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=1356;TCF=407;TCR=949;TR=1352;WE=102707347;WS=102707329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,1363:1.00:1364
chr11	102707366	rs563096	A	T	28353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=992;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=170;NR=758;PP=2965;ReadPosRankSum=2.098;SC=TTCCCCAAAAATCCTCCTCCC;SOR=0.951;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=979;TCF=181;TCR=798;TR=928;WE=102707374;WS=102707356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:52,934:0.95:986
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chr11	102709425	rs520540	A	G	41551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1321;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=344;NR=939;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.585;SC=TTCCTCTGATAGCCCAGAATT;SOR=2.104;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=1287;TCF=345;TCR=942;TR=1283;WE=102709433;WS=102709415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,1302:1.00:1304
chr11	102709522	rs646910	T	A	8878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=267;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.770;SC=TTTAGCATCTTTGATTTTCAT;SOR=1.473;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=289;TCF=8;TCR=281;TR=275;WE=102709530;WS=102709512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:14,283:0.95:297
chr11	102710083	rs3025094	G	A	6470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=189;PP=2965;ReadPosRankSum=0.198;SC=TCATCTTCTAGGCTGGATGAC;SOR=1.371;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=209;TCF=7;TCR=202;TR=196;WE=102710091;WS=102710073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:13,198:0.94:211
chr11	102711338	rs591058	T	C	12995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=462;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=362;PP=2965;SC=TTTAAGAAATTGAGAACAATA;SOR=2.844;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=449;TCF=87;TCR=362;TR=449;WE=102711346;WS=102711328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,455:1.00:455
chr11	102713046	rs3020919	C	T	25533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=960;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=141;NR=703;PP=2965;ReadPosRankSum=-2.444;SC=AGATATGTAACAAGGATCCCT;SOR=0.835;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=896;TCF=150;TCR=746;TR=844;WE=102713054;WS=102713036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:53,861:0.94:914
chr11	102713465	rs602128	A	G	54742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1871;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.078;NF=900;NR=931;PP=2965;ReadPosRankSum=1.330;SC=AGTGACCAACATCAGGAACTC;SOR=0.237;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=1832;TCF=900;TCR=932;TR=1831;WE=102713473;WS=102713455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,1852:1.00:1853
chr11	102713620	rs679620	T	C	42423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=1488;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=425;NR=1023;PP=2965;SC=ACATCTTTTTTGAGGTCGTAG;SOR=1.891;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=1451;TCF=425;TCR=1026;TR=1448;WE=102713628;WS=102713610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1475:1.00:1475
chr11	102713777	rs678815	G	C	5055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=139;PP=2965;SC=TGAAATAATGGCAAATTTTAT;SOR=6.722;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=143;TCF=4;TCR=139;TR=143;WE=102713785;WS=102713767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr11	102735103	rs476185	A	G	27703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=839;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=126;NR=699;PP=2965;SC=CTCTGATGAAAAAAACCAAGG;SOR=3.470;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=825;TCF=126;TCR=699;TR=825;WE=102735111;WS=102735093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,827:1.00:827
chr11	102737192	rs28381684	A	T	57436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=2100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=1.816;NF=946;NR=1003;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.351;SC=GACATGAAAGACATTTGACAC;SOR=0.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=2069;TCF=1001;TCR=1068;TR=1949;WE=102737200;WS=102737182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:117,1966:0.94:2083
chr11	102737276	rs28381683	CTTTCCAT	C	47291.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.53;MQRankSum=1.819;NF=88;NR=766;PP=2967;ReadPosRankSum=0.244;SC=CCCAATATTTCTTTCCATTGT;SOR=0.503;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=964;TCF=95;TCR=869;TR=854;WE=102737290;WS=102737266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:58,1127:0.95:1185
chr11	102738075	rs17368582	T	C	61723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-7.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=2359;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1117;NR=1059;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.094;SC=CACAGAGAGCTGGTTCTGAAT;SOR=0.680;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=2292;TCF=1177;TCR=1115;TR=2176;WE=102738083;WS=102738065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:117,2215:0.95:2332
chr11	102738793	rs5794199	G	GT	64360.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=1469;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=283;NR=823;PP=2967;SC=TGAGGAACAAGTGGTGCCTAA;SOR=1.797;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=1285;TCF=307;TCR=978;TR=1106;WE=102738803;WS=102738783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1412:1.00:1412
chr11	102738795	rs5003690	G	T	64369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=1439;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.99;NF=385;NR=854;PP=2965;SC=AGGAACAAGTGGTGCCTAAGA;SOR=1.843;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=1291;TCF=390;TCR=901;TR=1239;WE=102738803;WS=102738783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1426:1.00:1426
chr11	102742761	rs17368659	G	T	16928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=537;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=504;PP=2965;ReadPosRankSum=0.001;SC=ATTTTTGCTAGCACAATTGGA;SOR=2.933;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=533;TCF=4;TCR=529;TR=508;WE=102742769;WS=102742751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:23,509:0.96:532
chr11	102745469	rs28360358	GCAAA	G	8906.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.364;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=1.618;NF=241;NR=10;PP=2990;ReadPosRankSum=-0.053;SC=ATACGTAAAAGCAAACAAACA;SOR=2.801;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=406;TCF=385;TCR=21;TR=251;WE=102745484;WS=102745459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:20,283:0.93:303
chr11	102745791	rs2276109	T	C	5597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=162;PP=2965;ReadPosRankSum=0.734;SC=GAGTGACTCATAGTTGATATC;SOR=2.426;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=178;TCF=3;TCR=175;TR=165;WE=102745799;WS=102745781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:12,169:0.93:181
chr11	102815970	rs61571704	CA	C	2603.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=431;ExcessHet=3.0103;FS=12.538;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.707;QD=14.39;ReadPosRankSum=-0.507;SOR=0.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:21,160:0.88:181
chr11	102954096	rs139214495	CAACATAA	C	20907.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=603;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=1.032;NF=41;NR=330;PP=2973;ReadPosRankSum=1.231;SC=GTTATAATATCAACATAAAAC;SOR=1.006;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=479;TCF=65;TCR=414;TR=371;WE=102954110;WS=102954086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:22,498:0.96:520
chr11	102985018	rs2245404	A	G	4001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=120;PP=2965;ReadPosRankSum=0.410;SC=TGTCTCATTAATACATTAGTA;SOR=1.236;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=136;TCF=7;TCR=129;TR=127;WE=102985026;WS=102985008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:9,131:0.94:140
chr11	102991516	rs116888435	A	G	9113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.612;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=169;PP=2965;ReadPosRankSum=1.276;SC=CAGAAATTCAAGACAGTCCAC;SOR=0.979;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=317;TCF=133;TCR=184;TR=290;WE=102991524;WS=102991506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:27,298:0.92:325
chr11	102996095	.	CTT	C	593.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=0.000;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=2.298;QD=9.90;ReadPosRankSum=1.513;SOR=0.348;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr11	103123999	rs648387	G	T	23545.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1098;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=968;NR=27;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.980;SC=CCAATTGTGTGTTTTTTTTAA;SOR=1.626;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=1084;TCF=1054;TCR=30;TR=995;WE=103124007;WS=103123987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:86,946:0.92:1032
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chr11	103128510	rs650238	C	T	10593.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=324;PP=2965;ReadPosRankSum=0.117;SC=GTACCAGAGACTGAATTACAG;SOR=1.393;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=361;TCF=5;TCR=356;TR=329;WE=103128518;WS=103128500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,338:0.92:369
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chr11	103173782	rs11225673	A	C	12860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=440;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.98;MQRankSum=-0.258;NF=379;NR=19;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.821;SC=TTAATAATGCATACTGCTTTT;SOR=0.322;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=430;TCF=411;TCR=19;TR=398;WE=103173801;WS=103173772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:29,407:0.93:436
chr11	103173793	rs4754906	A	C	14952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=7.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=501;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;MQ=59.98;MQRankSum=-0.254;NF=423;NR=32;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.882;SC=TACTGCTTTTATTTTTAATTT;SOR=0.491;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=487;TCF=454;TCR=33;TR=455;WE=103173801;WS=103173772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:32,465:0.94:497
chr11	103174000	rs11225674	C	T	31838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=8.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.062;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=305;NR=761;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.615;SC=CATATTGTCCCGCTGTTTTTG;SOR=0.545;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=1183;TCF=334;TCR=849;TR=1066;WE=103174008;WS=103173990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:111,1083:0.91:1194
chr11	103175289	rs11392425	G	GT	13599.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=522;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.086;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.479;NF=377;NR=35;PP=2969;ReadPosRankSum=-0.306;SC=TAGCAGATCTGTTTTTAAATT;SOR=0.438;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=492;TCF=448;TCR=44;TR=412;WE=103175297;WS=103175279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:35,468:0.93:503
chr11	103175465	rs10690307	T	TGTG	21800.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=615;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.710;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=390;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.274;SC=TTCAGATAAATGTACAAATAA;SOR=1.431;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=546;TCF=40;TCR=506;TR=410;WE=103175473;WS=103175455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,522:0.94:557
chr11	103175497	rs3758862	C	T	9886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-7.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.019;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=315;PP=2965;ReadPosRankSum=0.581;SC=CTCAACTTAGCAATCTCCAAG;SOR=2.736;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=344;TCF=7;TCR=337;TR=321;WE=103175505;WS=103175487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:24,324:0.93:348
chr11	103178339	rs7118015	C	T	3114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=0;PP=2748;ReadPosRankSum=-0.086;SC=TTAAGAAATACATCAGAATGT;SOR=6.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=101;TCF=101;TCR=0;TR=99;WE=103178347;WS=103178329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,97:0.97:100
chr11	103182774	rs79978663	C	A	8708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=226;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.098;SC=TAAGTAAGAACATGTCTTGAA;SOR=0.905;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=285;TCF=48;TCR=237;TR=272;WE=103182782;WS=103182764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:13,279:0.96:292
chr11	103187205	rs7103282	C	T	8635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=244;NR=21;PP=2965;ReadPosRankSum=0.444;SC=AATTTAAAGACAGTGATACAT;SOR=0.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=273;TCF=251;TCR=22;TR=265;WE=103187213;WS=103187195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:7,271:0.97:278
chr11	103191672	rs4754913	G	T	1856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=0;PP=1604;ReadPosRankSum=-0.114;SC=AAATACATTTGGCTACATGTT;SOR=5.353;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=61;TCR=0;TR=57;WE=103191680;WS=103191662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,57:0.95:60
chr11	103192039	rs313407	T	C	3973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=150;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.822;SC=GTTAAATACATGTTACTTCTT;SOR=3.050;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=162;TCF=2;TCR=160;TR=152;WE=103192047;WS=103192029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:10,149:0.94:159
chr11	103229027	rs2566913	T	C	42348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1558;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1007;NR=412;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.022;SC=CCAAATTTGATAGAGAAATCT;SOR=0.689;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=1531;TCF=1087;TCR=444;TR=1419;WE=103229035;WS=103229017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:107,1431:0.93:1538
chr11	103229110	rs2671333	G	A	58150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-6.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=2118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=896;NR=1043;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.265;SC=ATATTCTTCTGATTCTTTTGC;SOR=0.632;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=2073;TCF=956;TCR=1117;TR=1939;WE=103229118;WS=103229100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:133,1959:0.94:2092
chr11	103229173	rs2514408	A	C	36510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-7.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1551;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=411;NR=1007;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.225;SC=GAGTCATACAAGTAATCACAT;SOR=0.670;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=1518;TCF=439;TCR=1079;TR=1418;WE=103229181;WS=103229163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:100,1430:0.93:1530
chr11	103229188	rs2512128	G	C	51745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.359;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=282;NR=926;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.741;SC=TCACATTGCAGAGGTTCCTAA;SOR=0.214;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=1283;TCF=291;TCR=992;TR=1208;WE=103229196;WS=103229178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:75,1216:0.94:1291
chr11	103229238	rs2512129	G	A	18820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=660;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=593;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.053;SC=CTTCATACCAGTGCACATCAA;SOR=1.435;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=643;TCF=7;TCR=636;TR=600;WE=103229246;WS=103229228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:41,607:0.94:648
chr11	103270607	rs10895417	G	A	39739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=260;NR=943;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.495;SC=AAAGGTAAGCGAGTACTAACT;SOR=2.626;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=1206;TCF=261;TCR=945;TR=1203;WE=103270615;WS=103270597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,1207:1.00:1209
chr11	103306594	rs501413	C	T	13466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=378;NR=6;PP=2965;SC=AATTTTTCTCCATCACACTAG;SOR=7.984;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=387;TCF=380;TCR=7;TR=384;WE=103306602;WS=103306584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,384:1.00:384
chr11	103326160	rs1384074	C	G	7351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-7.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=11.761;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=232;PP=2965;ReadPosRankSum=0.943;SC=TTCTTATTCTCTACTTTAAAT;SOR=6.674;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=249;TCF=1;TCR=248;TR=232;WE=103326168;WS=103326150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:17,238:0.93:255
chr11	103339246	rs3740942	G	A	20126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=689;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=620;NR=11;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.864;SC=AGCTCTTAAGGTAGAATAGAG;SOR=2.417;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=680;TCF=666;TCR=14;TR=631;WE=103339254;WS=103339236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:46,634:0.93:680
chr11	103780455	rs10791649	A	G	22702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=888;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=530;NR=280;PP=2965;ReadPosRankSum=0.046;SC=AGATACAATCACATCGTTCAT;SOR=0.667;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=856;TCF=558;TCR=298;TR=810;WE=103780463;WS=103780445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:44,829:0.95:873
chr11	103780610	rs4754997	C	T	27772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=964;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.454;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=250;NR=641;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.720;SC=CAGATGCCACCTACTTATTAC;SOR=1.248;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=944;TCF=270;TCR=674;TR=891;WE=103780618;WS=103780600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:50,903:0.95:953
chr11	103780695	rs4754998	G	A	8714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=275;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.017;SC=TGCACACGTTGCTATTAGAAT;SOR=1.229;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=309;TCF=6;TCR=303;TR=281;WE=103780703;WS=103780685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:25,288:0.92:313
chr11	104757836	rs5794352	T	TA	1409.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=5;PP=1794;SC=CAAGATGAATTAGAGCTTTGG;SOR=3.383;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=38;WE=104757844;WS=104757826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	104758035	rs484438	G	A	3509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=69;PP=2752;SC=AACATTATCTGCAAATAAAAG;SOR=1.371;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=42;TCR=69;TR=111;WE=104758043;WS=104758025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr11	104758111	rs147443677	G	GA	92.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=2.122;QD=1.75;ReadPosRankSum=-0.569;SOR=0.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,10:0.19:53
chr11	104761013	rs635846	T	G	4090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=1;PP=2965;SC=GAAATGCTCTTTTCGGTGATA;SOR=8.138;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=115;TCF=114;TCR=1;TR=115;WE=104761021;WS=104761003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr11	104761100	rs513131	T	C	12472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=406;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=300;NR=94;PP=2965;SC=AAATCACTTATGTGGTGTGGA;SOR=2.387;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=395;TCF=300;TCR=95;TR=394;WE=104761108;WS=104761090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,404:1.00:404
chr11	104761206	rs647039	C	T	11067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=268;PP=2965;SC=GTATCTGCACCGGCTTTTCCA;SOR=2.960;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=334;TCF=66;TCR=268;TR=334;WE=104761214;WS=104761196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,341:1.00:341
chr11	104761271	rs693506	A	C	5440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=151;PP=2965;SC=CATTATGTCTAATTAAAGAAG;SOR=7.903;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=153;TCF=2;TCR=151;TR=153;WE=104761279;WS=104761261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr11	104762228	rs544216	G	A	1312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=34;PP=1049;SC=AGCCAGCACTGAGGAATCAGA;SOR=5.084;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=104762236;WS=104762218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	104763117	rs497116	G	A	11619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=375;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=259;NR=108;PP=2965;SC=AGTAGATCTCGCATCCCCAAA;SOR=1.861;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=368;TCF=259;TCR=109;TR=367;WE=104763125;WS=104763107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,371:1.00:371
chr11	104763716	rs617983	A	G	11385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=79;NR=247;PP=2965;SC=ATTTCCAGAAAAGCTGAAAGA;SOR=2.418;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=326;TCF=79;TCR=247;TR=326;WE=104763724;WS=104763706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,338:1.00:338
chr11	104768000	rs693001	G	A	19905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=643;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=321;NR=299;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.843;SC=TTTGCCTGCAGTTTGAGCTGT;SOR=0.261;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=621;TCF=322;TCR=299;TR=620;WE=104768008;WS=104767990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,636:1.00:637
chr11	104768098	rs555367	T	C	14354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=440;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=326;PP=2965;SC=CTGTATTTAATACATTATTTT;SOR=2.620;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=420;TCF=93;TCR=327;TR=419;WE=104768106;WS=104768088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,432:1.00:432
chr11	104768909	rs650940	T	C	3896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=111;NR=1;PP=2965;SC=AGAACAGAAATCCAGGTGTTT;SOR=8.155;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=112;TCF=111;TCR=1;TR=112;WE=104768917;WS=104768899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr11	104819327	rs9507	T	C	11424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=212;NR=124;PP=2965;SC=CATCTTCCTCTAGGTTCTCAG;SOR=1.327;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=337;TCF=213;TCR=124;TR=336;WE=104819335;WS=104819317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,355:1.00:355
chr11	104819542	rs5794358	G	GAAAC,GAAACAGAC	3020.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=50;PP=2146;SC=CACACACAGAGAGAGACACAC;SOR=6.059;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=58;TCF=3;TCR=55;TR=51;WE=104819554;WS=104819532;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:63
chr11	104819544	.	GAG	CAC	1209	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=29;MQ=61.08;NF=1;NR=38;PP=1209;QD=32.3709711503;SC=CACACAGAGAGAGACACACAC;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=64;TCF=2;TCR=62;TR=39;WE=104819554;WS=104819532;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:25,39:0.61:64
chr11	104819544	rs33955446	G	GACAC	2955.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.28;QD=44.12;SOR=5.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	104819546	rs5004914	G	C	3063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.28;QD=45.73;SOR=5.580;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	104820163	rs649739	A	C	5981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=165;NR=1;PP=2965;SC=AATGTACTTTATTTACACTGG;SOR=8.885;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=166;TCF=165;TCR=1;TR=166;WE=104820171;WS=104820153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr11	104839222	rs658560	A	G	8558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=148;NR=126;PP=2965;SC=CTACTCCCAAACTCCTAGTCA;SOR=0.959;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=275;TCF=149;TCR=126;TR=274;WE=104839230;WS=104839212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr11	104866461	rs540819	A	T	11412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=283;NR=54;PP=2965;SC=AACTCTCAATACTTACATTTT;SOR=3.245;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=338;TCF=283;TCR=55;TR=337;WE=104866469;WS=104866451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,344:1.00:344
chr11	104869708	rs523104	G	C	21956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=704;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=323;NR=375;PP=2965;SC=GAAGAGATGAGTGCCAAGGAT;SOR=0.855;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=702;TCF=326;TCR=376;TR=698;WE=104869716;WS=104869698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,703:1.00:703
chr11	104872981	rs544211	C	T	5795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=131;PP=2965;SC=CTTTTCAACCCCCATATGCCT;SOR=2.128;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=48;TCR=132;TR=179;WE=104872989;WS=104872971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr11	104877717	rs2282658	C	G	4480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=9.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.698;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=132;NR=2;PP=2962;ReadPosRankSum=0.237;SC=AGAAATGAAACTGTAGGTAGA;SOR=1.822;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=174;TCF=171;TCR=3;TR=134;WE=104877725;WS=104877707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,141:0.77:182
chr11	104877803	rs2282657	A	G	13913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=7.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=613;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=377;NR=74;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.318;SC=GTTAGATGCAACCTTACGTTT;SOR=0.794;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=589;TCF=491;TCR=98;TR=451;WE=104877811;WS=104877793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,468:0.77:609
chr11	104877927	rs507879	T	C	18273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=11.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=805;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.691;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=218;NR=400;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.566;SC=TCAATTTTGGTATCATAATAT;SOR=0.568;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=777;TCF=269;TCR=508;TR=618;WE=104877935;WS=104877917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,632:0.79:797
chr11	104896375	rs2509648	G	T	1999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=53;PP=1630;SC=GAAAGAATTTGGTTAAAGACA;SOR=4.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=6;TCR=53;TR=59;WE=104896383;WS=104896365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	104971210	rs1792771	C	T	12727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=413;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-1.473;NF=341;NR=55;PP=2965;ReadPosRankSum=0.599;SC=AGGCCCTAGGCGAACTTGAGT;SOR=1.628;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=400;TCF=345;TCR=55;TR=396;WE=104971218;WS=104971200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,408:1.00:410
chr11	104971233	rs34491690	C	T	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=4.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.58;MQRankSum=-0.079;QD=2.83;ReadPosRankSum=-0.434;SOR=0.388;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:411,93:0.18:504
chr11	104972190	rs1792773	C	T	16922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=565;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=317;NR=229;PP=2965;SC=AAAGCATGCACCACCTTTCTT;SOR=1.070;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=547;TCF=317;TCR=230;TR=546;WE=104972198;WS=104972180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,563:1.00:563
chr11	105481921	rs78093474	T	C	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.829;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=819;ReadPosRankSum=0.053;SC=AGCAGTTCCCTTCCCCTCTGT;SOR=1.280;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=35;WE=105481929;WS=105481911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,36:0.84:43
chr11	105732835	rs114323282	T	G	7474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.177;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=136;NR=121;PP=2962;ReadPosRankSum=0.238;SC=ATTTTAATGATGTCAGCTATA;SOR=0.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=333;TCF=176;TCR=157;TR=257;WE=105732843;WS=105732825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,261:0.77:338
chr11	105774533	rs61751525	T	C	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=1.570;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.38;ReadPosRankSum=0.096;SOR=0.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:187,47:0.20:234
chr11	105789750	rs674307	A	T	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.97;ReadPosRankSum=2.375;SOR=0.163;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,11:0.16:68
chr11	105836923	rs632549	G	A	3455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=100;PP=2855;SC=TACGTATGCAGTTACTGTCAA;SOR=7.922;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=101;TCF=1;TCR=100;TR=101;WE=105836931;WS=105836913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	105836960	rs1939826	A	G	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=34;PP=821;ReadPosRankSum=-1.368;SC=ACCATTATCAATTTAGTGACA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=34;WE=105836968;WS=105836950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,38:0.76:50
chr11	105842740	rs61736488	G	A	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FS=0.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.590;QD=1.77;ReadPosRankSum=0.863;SOR=0.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:277,47:0.15:324
chr11	105842916	rs559190	C	T	2129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=57;PP=1774;SC=GGATGGTCTTCCCAGGAAACT;SOR=5.453;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=60;TCF=3;TCR=57;TR=60;WE=105842924;WS=105842906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	105965214	rs72977065	T	G	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=327;ReadPosRankSum=-0.822;SC=TATATATATATAGAGAGAGAG;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=8;WE=105965224;WS=105965204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,9:0.24:37
chr11	105965216	rs1893175	G	T	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=1137;ReadPosRankSum=0.613;SC=TATATATATAGAGAGAGAGAG;SOR=1.132;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=26;WE=105965224;WS=105965204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,29:0.76:38
chr11	106407855	rs201392082	AATAT	A,AAT	1951.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.000;QD=23.23;ReadPosRankSum=0.329;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:9,30,45:0.36,0.54:84
chr11	106408031	rs11279851	TCAAATG	T	4327.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1036;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.01;MQRankSum=2.257;QD=4.26;ReadPosRankSum=1.624;SOR=0.685;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:849,167:0.16:1016
chr11	106408071	rs1791468	C	T	1970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=934;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.12;ReadPosRankSum=-0.142;SOR=0.685;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:773,156:0.17:929
chr11	106408212	rs2852371	A	G	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.29;ReadPosRankSum=-0.472;SOR=0.153;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,22:0.16:135
chr11	106579204	rs12420232	C	A	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=1.069;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.24;ReadPosRankSum=-0.859;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,38:0.26:147
chr11	106680653	rs141065153	CAATTT	C	3278.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.944;NF=68;NR=0;PP=2943;ReadPosRankSum=0.657;SC=GTAAAAAAATCAATTTAATTC;SOR=3.080;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=95;TCF=95;TCR=0;TR=68;WE=106680665;WS=106680643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,81:0.83:98
chr11	106695697	rs77535954	A	G	4291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.322;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.855;NF=40;NR=172;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.931;SC=GAATGTTACTAAATTTTCTAA;SOR=0.273;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=253;TCF=45;TCR=208;TR=212;WE=106695705;WS=106695687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,149:0.86:173
chr11	106697172	rs61678754	T	C	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=1.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.78;MQRankSum=-0.357;QD=3.96;ReadPosRankSum=0.054;SOR=0.902;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,37:0.24:156
chr11	106807443	rs11331245	AT	A	7321.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=624;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.450;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.12;MQRankSum=1.366;NF=68;NR=275;PP=2992;ReadPosRankSum=1.158;SC=CTTGCTCTTGATTTTTTTTTT;SOR=0.971;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=577;TCF=113;TCR=464;TR=343;WE=106807452;WS=106807431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,371:0.78:477
chr11	107309761	.	GAA	G	362.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.58;MQRankSum=1.258;QD=3.59;ReadPosRankSum=-0.947;SOR=0.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,27:0.27:101
chr11	107313608	rs144259680	G	GAGGAAGGA	7724.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=10.960;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.70;MQRankSum=0.235;QD=39.61;ReadPosRankSum=0.394;SOR=6.326;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,191:0.98:195
chr11	107396158	rs12574614	T	C	6664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=161;NR=35;PP=2965;SC=GATAAGAGTATATACTTACTA;SOR=2.890;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=161;TCR=35;TR=196;WE=107396166;WS=107396148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr11	107420530	rs645056	A	G	26746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=856;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=349;NR=484;PP=2965;SC=CGGAATGTGTATCAATATGAG;SOR=1.068;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=833;TCF=349;TCR=484;TR=833;WE=107420538;WS=107420520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,846:1.00:846
chr11	107422431	rs10890737	A	T	700.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.42;QD=29.20;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	107431637	rs662349	C	A	2277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=64;PP=1335;SC=TGTAAAAAAACAAGACAGTAA;SOR=4.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=5;TCR=66;TR=69;WE=107431645;WS=107431626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	107462878	rs542650	A	C	5683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=132;PP=2965;SC=CTCAGTGTTTATGCTCAACCT;SOR=6.608;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=3;TCR=132;TR=135;WE=107462886;WS=107462868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr11	107462895	rs4085361	G	A	4615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=95;PP=2965;SC=ACCTCTAAGCGGCGAGTTCGG;SOR=5.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=6;TCR=95;TR=101;WE=107462903;WS=107462885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr11	107462977	rs5794560	G	GT	1075.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=19;PP=1349;SC=TAATGAATATGTTGTCAGCCT;SOR=1.284;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=30;WE=107462985;WS=107462967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	107502123	rs10539761	ACCC	A,ACC	1993.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=19;NF=74,74;NR=0,0;PP=152,1295;SC=AAATTGCACTACCCCCCCCCC;SOR=8.410;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=118;TCF=118;TCR=0;TR=74,74;WE=107502142;WS=107502120;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.29,0.71:66
chr11	107578721	rs583362	C	G	5690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=123;PP=2965;ReadPosRankSum=1.328;SC=CCTCTGGCTTCTCCTCACCTC;SOR=0.868;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=175;TCF=51;TCR=124;TR=173;WE=107578729;WS=107578711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,179:0.99:180
chr11	107643102	rs28695914	T	A	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=20;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=6.398;NF=35;NR=2;PP=991;ReadPosRankSum=3.938;SC=TTTTTTTTTTTGACAGAGTGT;SOR=0.426;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=59;TCF=57;TCR=2;TR=37;WE=107643110;WS=107643092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,37:0.77:48
chr11	107643289	rs60511673	T	G	5471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=106;PP=2965;SC=AACCATGTTGTCCAGGCTGGT;SOR=1.555;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=58;TCR=106;TR=164;WE=107643297;WS=107643279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr11	107646894	rs34492014	C	CA	1781.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQRankSum=0.566;QD=16.20;ReadPosRankSum=1.307;SOR=1.589;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,91:0.83:110
chr11	107646918	rs484427	G	A	7025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=180;NR=7;PP=2965;SC=ATTTAGTCAGGTGTGATGATG;SOR=6.262;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=180;TCR=7;TR=187;WE=107646926;WS=107646908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr11	107650473	rs650686	G	A	11676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.99;NF=150;NR=205;PP=2965;SC=GCGCCTGGCCGGGACCCCAGT;SOR=0.982;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=355;TCF=150;TCR=205;TR=355;WE=107650481;WS=107650463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,374:1.00:374
chr11	107650505	rs519422	C	G	10361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=214;PP=2965;SC=TTTTTTCTAACCGACATAGTC;SOR=1.624;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=313;TCF=98;TCR=215;TR=312;WE=107650513;WS=107650495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,333:1.00:333
chr11	107652394	rs11381266	GT	G	1706.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=3.641;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.24;MQRankSum=0.250;QD=23.06;ReadPosRankSum=-0.539;SOR=0.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr11	107663631	rs148577551	TTTTCTTTC	T	6042.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=108;PP=2992;SC=AATCTTTTTATTTTCTTTCTT;SOR=4.758;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=239;TCF=15;TCR=224;TR=117;WE=107663646;WS=107663621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr11	107673628	rs556153	T	C	3216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=4;PP=2723;SC=GCCAAGAAGATGAGAAGGTTT;SOR=5.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=91;TCR=4;TR=95;WE=107673636;WS=107673618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	107675566	rs495836	C	T	6925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=158;PP=2965;SC=GCATTTTAGTCACTATACTTC;SOR=2.281;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=213;TCF=54;TCR=159;TR=212;WE=107675574;WS=107675556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr11	107677399	rs34066069	C	CA	34366.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=1085;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=629;NR=238;PP=2973;SC=AAAACATAAACAAATTTGCTG;SOR=2.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=943;TCF=681;TCR=262;TR=867;WE=107677407;WS=107677389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1042:1.00:1042
chr11	107686741	rs371223301	TAC	T	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=7.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQRankSum=-0.769;QD=1.45;ReadPosRankSum=-1.384;SOR=0.010;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,9:0.17:53
chr11	107904646	rs10890800	C	T	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=469;ExcessHet=3.0103;FS=1.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.28;ReadPosRankSum=1.707;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:405,61:0.13:466
chr11	107917087	rs7117111	A	G	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=2.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.79;ReadPosRankSum=1.267;SOR=0.951;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:183,33:0.15:216
chr11	107925327	rs3847562	C	T	912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=0;PP=745;SC=ACTCAAAATACTGATTTTGAT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=107925335;WS=107925317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	107925729	rs7125285	G	A	1569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.961;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=43;PP=1294;ReadPosRankSum=-1.102;SC=TTTGAAATACGGAAGCATAGG;SOR=0.061;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=69;TCF=9;TCR=60;TR=52;WE=107925737;WS=107925719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,53:0.76:70
chr11	107969300	rs11302777	GT	G	1760.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.51;MQRankSum=-0.158;QD=14.55;ReadPosRankSum=2.396;SOR=2.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:13,108:0.89:121
chr11	107992312	rs3741054	C	G	6011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.718;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=135;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.451;SC=CCTGTGGAGCCGATACTCAGC;SOR=0.832;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=294;TCF=123;TCR=171;TR=229;WE=107992320;WS=107992302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,235:0.78:301
chr11	108004798	rs7931681	A	C	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=2.689;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.67;ReadPosRankSum=-1.748;SOR=0.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,32:0.25:126
chr11	108004927	rs201199156	CT	C	5366.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=394;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=13;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.159;NF=200;NR=31;PP=2466;ReadPosRankSum=-0.014;SC=GCCTTTTTGACTTTTTTTTTT;SOR=0.595;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=374;TCF=308;TCR=66;TR=231;WE=108004936;WS=108004917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,275:0.82:335
chr11	108006047	rs10890817	A	C	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FS=1.282;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.71;ReadPosRankSum=-1.396;SOR=0.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:287,74:0.20:361
chr11	108009660	rs35188041	C	A	7222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.124;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=163;NR=85;PP=2962;ReadPosRankSum=0.956;SC=AGAGCATGTCCAATGTTCCAT;SOR=1.145;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=330;TCF=210;TCR=120;TR=248;WE=108009668;WS=108009650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,263:0.76:347
chr11	108012510	rs34420529	A	AAAGT	2168.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=43;PP=1868;SC=GGATTTTGAAAAATTCTAGAA;SOR=7.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=43;WE=108012518;WS=108012500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	108013006	rs55854804	T	A	1926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=1;PP=1575;ReadPosRankSum=-2.355;SC=GTCTTGCAGTTAGCTGTGTAC;SOR=1.028;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=87;TCR=1;TR=65;WE=108013014;WS=108013002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,67:0.74:91
chr11	108014662	rs5794587	T	TA	245.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=30.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.84;MQRankSum=-2.064;QD=2.06;ReadPosRankSum=0.168;SOR=0.028;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,27:0.23:119
chr11	108014684	rs374107553	AC	A	1140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=3.632;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.84;MQRankSum=3.494;QD=8.98;ReadPosRankSum=-1.183;SOR=0.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,71:0.56:127
chr11	108044091	rs4144901	T	A	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FS=1.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.988;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:201,57:0.22:258
chr11	108058769	rs371572857	CT	C	300.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=4.337;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=2.446;QD=2.23;ReadPosRankSum=-1.884;SOR=0.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,32:0.24:135
chr11	108061065	.	G	A	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.182;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=3.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.79;MQRankSum=-6.756;QD=11.35;ReadPosRankSum=1.980;SOR=1.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
chr11	108061069	.	G	A	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.284;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.08;MQRankSum=-7.490;QD=9.65;ReadPosRankSum=-1.093;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,39:0.46:84
chr11	108061379	rs659584	C	T	1592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=49;PP=1388;SC=ATTTTTTGGGCAAGCAACTGT;SOR=4.935;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=52;WE=108061387;WS=108061369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	108068954	rs683312	T	C	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.12;ReadPosRankSum=2.006;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,45:0.23:199
chr11	108114661	.	AT	A	78.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=2.748;QD=0.79;ReadPosRankSum=-1.489;SOR=0.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,18:0.18:100
chr11	108114792	rs144709948	C	T	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.68;ReadPosRankSum=-1.288;SOR=0.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:242,56:0.19:298
chr11	108119615	rs35813860	CA	C	100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=5.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=1.644;QD=2.72;ReadPosRankSum=1.115;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr11	108141955	rs373881770	CT	C	272.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FS=0.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=2.936;QD=1.52;ReadPosRankSum=-1.327;SOR=0.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,38:0.21:180
chr11	108183167	rs659243	A	G	5422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=77;PP=2965;SC=GGAAGCCAGAATACAACTATT;SOR=0.799;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=167;TCF=89;TCR=78;TR=166;WE=108183175;WS=108183157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr11	108195976	.	GTT	G	292.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.132;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=-0.696;QD=6.51;ReadPosRankSum=-0.169;SOR=0.356;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr11	108224697	rs179108	G	A	6917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=194;PP=2965;ReadPosRankSum=0.095;SC=AATCCCAGCTGCTCAAGAGGC;SOR=3.155;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=219;TCF=20;TCR=199;TR=214;WE=108224705;WS=108224687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,218:1.00:219
chr11	108276091	rs9667658	C	G	3504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=15;PP=2951;SC=AGCAATACCTCATTTCAAATT;SOR=3.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=89;TCR=15;TR=103;WE=108276099;WS=108276081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	108352160	rs3901850	C	T	3676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=93;PP=2875;SC=TTTAATATGGCAAGCATAATC;SOR=4.010;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=12;TCR=93;TR=105;WE=108352168;WS=108352150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr11	108353018	rs3765632	C	A	1686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=43;PP=1322;SC=TACAACAGTTCTTTGGTTTTC;SOR=4.133;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=4;TCR=43;TR=47;WE=108353026;WS=108353008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	108380335	rs1943382	T	C	17625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=535;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=248;NR=270;PP=2965;SC=GTGTCACAATTTGAGTCCACT;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=520;TCF=248;TCR=272;TR=518;WE=108380343;WS=108380325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,530:1.00:530
chr11	108381247	rs2640779	C	T	13266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=600;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.164;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=212;NR=244;PP=2962;ReadPosRankSum=0.859;SC=ACATGCTTTCCGTTCTCACTC;SOR=0.772;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=576;TCF=276;TCR=300;TR=456;WE=108381255;WS=108381237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,466:0.79:591
chr11	108384207	rs2846412	C	T	14831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=657;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.668;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=291;NR=220;PP=2962;ReadPosRankSum=0.053;SC=TGAATTGCTGCTGGTCACAGT;SOR=0.799;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=641;TCF=362;TCR=279;TR=511;WE=108384215;WS=108384197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,519:0.80:650
chr11	108412369	rs12804124	T	G	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=2.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.80;ReadPosRankSum=0.649;SOR=0.316;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,15:0.17:87
chr11	108464209	rs2640738	T	C	10997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=542;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.195;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=217;NR=195;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.046;SC=AGGATCTTCCTGGCCTCTTCG;SOR=0.415;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=518;TCF=280;TCR=238;TR=412;WE=108464217;WS=108464199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,426:0.79:536
chr11	108535792	rs2306118	C	T	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=3.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.15;ReadPosRankSum=1.517;SOR=0.103;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,28:0.25:113
chr11	108722851	rs10890899	C	G	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.33;ReadPosRankSum=0.327;SOR=0.742;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:190,37:0.16:227
chr11	109964007	rs7116424	A	G	1706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=36;PP=1346;SC=TGTGCAACCCAGGGAGGGGGC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=54;WE=109964015;WS=109963997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	109964079	rs7116552	C	A	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=21;PP=715;SC=GGGAGGGCCGCGGTGGCCGCT;SOR=2.226;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=109964097;WS=109964069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	109964089	rs11395531	T	TG	1333.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=10;NR=19;PP=1214;SC=CGGTGGCCGCTTCTCCGCGGG;SOR=1.536;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=29;WE=109964097;WS=109964069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	109964187	rs7116896	G	A	1129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=17;PP=825;SC=GGTGGGGGACGCGGACCGCGG;SOR=0.968;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=22;TCR=17;TR=39;WE=109964195;WS=109964177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	109964257	rs7116683	A	G	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=15;PP=565;SC=CCCGGGCGCCAGGCGGAGGGC;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=23;WE=109964265;WS=109964247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	110035262	rs1026608	A	G	4097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=26;PP=2965;ReadPosRankSum=0.177;SC=ATGTCAAACGAGGTGCTCCAA;SOR=1.238;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=91;TCR=27;TR=116;WE=110035270;WS=110035252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,126:0.99:127
chr11	110035301	rs1026607	A	G	4948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=50;PP=2965;ReadPosRankSum=0.498;SC=GCATAAGGACACAAGTCTACC;SOR=0.413;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=165;TCF=115;TCR=50;TR=163;WE=110035309;WS=110035291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,171:0.99:173
chr11	110050502	rs11213291	C	T	1390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=13;PP=1156;ReadPosRankSum=2.259;SC=GTCTAAAAAACAATTATAATA;SOR=1.101;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=35;TCR=14;TR=46;WE=110050510;WS=110050492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,48:0.94:51
chr11	110134593	rs36094903	C	CA	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQRankSum=0.748;QD=4.98;ReadPosRankSum=0.166;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr11	110486120	rs326944	G	C	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=81;SC=TAGCAAGTAAGTAGCTAGTGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=110486128;WS=110486110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	110697305	rs120434	C	G	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=585;ReadPosRankSum=0.564;SC=GAATGCTGATCCTTAACCATG;SOR=0.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=22;WE=110697313;WS=110697295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr11	110697444	rs120436	G	A	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=11;PP=336;SC=TGTATCCACCGGTAGTCACTT;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=110697452;WS=110697434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	111154724	rs7926730	C	A	1398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=4;PP=1177;SC=GTTTCCCAGGCAGAGACTCAG;SOR=4.125;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=38;TCR=4;TR=42;WE=111154732;WS=111154714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	111156836	rs3087967	T	C	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=26;PP=591;SC=TTCCAAAGATTGTTTTAGGTG;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=111156844;WS=111156826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	111229470	rs12282082	T	C	1392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=1;PP=879;SC=CACATTCTCTTTCACACACAC;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=111229491;WS=111229460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	111229483	rs80223743	A	T	1579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=1;PP=1040;SC=ACACACACACACTCACACTCT;SOR=5.031;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=37;WE=111229491;WS=111229460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	111249819	rs10789825	A	G	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=2;PP=478;SC=CCAATTCCAGACCAAGCTGTG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=111249827;WS=111249809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	111250085	rs74368417	C	G	233.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=7;PP=220;SC=CCTCAGGCACCGGTGCAACGT;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=111250093;WS=111250075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	111326284	rs7925584	T	C	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=0;PP=546;SC=TCAGCAGCAGTTGAAAGCACA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=111326292;WS=111326279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	111327213	rs11213913	G	A	1739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=5;PP=1348;SC=GCCCAGGGCTGAGCAGGCAAT;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=45;TCR=5;TR=50;WE=111327221;WS=111327203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	111327261	rs12270679	C	A	2974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=27;PP=2346;SC=CCTCCTGGTGCTGATGACATC;SOR=1.956;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=67;TCR=27;TR=94;WE=111327269;WS=111327251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr11	111338328	rs12803406	A	G	2162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=33;PP=1860;SC=CCTGCCATGGAAGCCCAAGGC;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=33;TCR=33;TR=66;WE=111338336;WS=111338318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	111368047	rs489078	G	T	1998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=27;PP=1461;SC=CTCTACTAACGGCATAACTGA;SOR=0.826;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=29;TCR=27;TR=56;WE=111368055;WS=111368037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	111368169	rs77609070	G	A	915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=780;SC=GCTAATTAGCGATTCAACTTT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=111368177;WS=111368159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	111383756	rs72550778	G	A	1058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=16;PP=704;SC=CAGCATCACCGCCGCCCGGCC;SOR=1.040;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=37;WE=111383764;WS=111383746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	111383813	rs72550779	T	G	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=18;PP=614;SC=CGAGAGAAGATGCCTGAGAAG;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=24;WE=111383821;WS=111383803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	111384006	.	G	A	172	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=9;NR=1;PP=172;QD=20.6771212547;SC=TCCATGTAACGGTTAATACTG;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=111384014;WS=111384005;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	111385503	rs150481647	AG	A	4278.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=6;PP=2957;SC=AAGCGTCCTCAGTTGCCATGG;SOR=5.382;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=100;TCF=93;TCR=7;TR=99;WE=111385511;WS=111385493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr11	111405065	rs140132406	CA	C	387.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=391;SC=AGCTTTTTTTCAAATGAGTAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=111405073;WS=111405055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	111412383	rs117134558	C	A	2096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=39;PP=1557;SC=GCCCTTTTCTCAGATCCTTTT;SOR=1.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=24;TCR=39;TR=63;WE=111412391;WS=111412373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	111420364	rs634679	A	G	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=0;PP=796;SC=TGGATGAGCCATCCTGCGGCA;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=35;WE=111420372;WS=111420354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	111428510	rs77632452	T	C	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=25;PP=729;SC=CTCTGACAGGTCAGGGCATTC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=111428518;WS=111428500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	111558961	rs117543048	G	A	1449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=36;PP=1184;SC=CAGACCTGCAGGCGCAGATTC;SOR=3.816;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=40;WE=111558969;WS=111558951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	111591054	rs117509376	T	C	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=510;SC=GATGACTAAATTGGCCAGTAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=111591062;WS=111591044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	111597667	rs145597836	TTC	T	1522.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=11;PP=1402;SC=ATTTTTTATGTTCTTTTTTTA;SOR=1.547;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=30;WE=111597676;WS=111597657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	111618517	rs118173434	C	T	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=110;SC=TTGGTAGAAACGTCAAATTTA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=111618525;WS=111618507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	111623088	rs4936675	T	A	4839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=88;PP=2965;SC=AAGACCACATTTAAAAATCAA;SOR=0.855;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=160;TCF=71;TCR=89;TR=159;WE=111623096;WS=111623078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr11	111631499	rs149925929	A	G	2811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=14;PP=2290;SC=ATAGCTTACTACCTGATTTCT;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=64;TCR=14;TR=78;WE=111631507;WS=111631489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	111635619	rs61757743	A	G	1760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=43;PP=1430;SC=CATCTTCATCATAAATTGTAT;SOR=2.564;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=12;TCR=43;TR=55;WE=111635627;WS=111635609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	111636627	rs643506	T	G	1775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=49;PP=1443;SC=CGTCTCGGCCTGGCACCGCGC;SOR=5.136;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=52;WE=111636635;WS=111636617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	111636950	rs117554466	G	C	3212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=31;PP=2675;SC=CTCGCCTCGGGTCCCCGGCCT;SOR=1.755;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=103;TCF=72;TCR=31;TR=102;WE=111636958;WS=111636940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr11	111637117	.	T	TCCCGCCCCGCGCCCAGGCCCCGCCCCGCGCCCAGGC	662.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.34;QD=60.25;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	111659476	rs2554996	C	A	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.76;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	111707031	rs187507214	A	G	3498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=72;PP=2736;ReadPosRankSum=1.403;SC=TCAGAAACACAAGGAGAATAA;SOR=0.472;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=45;TCR=74;TR=117;WE=111707039;WS=111707021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,118:0.99:119
chr11	111731540	rs117436950	G	A	923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=764;SC=TTCTGACACAGAAGAGAAGCT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=111731548;WS=111731530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	111742145	rs10708475	CG	C	1145.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=3;PP=1116;SC=GCAGCCGGGGCGCGTATCCCC;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=111742153;WS=111742135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	111746041	rs117189763	A	G	5991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=114;PP=2965;ReadPosRankSum=0.646;SC=AGCATGGCTAATAAGTCCAAG;SOR=1.220;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=187;TCF=72;TCR=115;TR=184;WE=111746049;WS=111746031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,194:0.99:196
chr11	111746231	rs118065273	G	A	3253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.802;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=42;PP=2413;ReadPosRankSum=1.621;SC=TCAGCTTAGAGCTCTCCGGCA;SOR=0.821;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=59;TCR=43;TR=101;WE=111746239;WS=111746221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,107:0.99:108
chr11	111747297	rs7124696	A	G	1682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=31;PP=1323;SC=GAGAACCTTCAAAAGGTAAGC;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=24;TCR=31;TR=55;WE=111747305;WS=111747287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	111747427	rs634983	C	T	940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=20;PP=801;SC=TTTTAGAGACCGAATCAATTA;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=111747435;WS=111747417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	111747587	rs75258745	C	T	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.104;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=24;PP=1206;ReadPosRankSum=-0.593;SC=GGATACACGTCGCTTAAAATG;SOR=0.359;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=48;TCF=24;TCR=24;TR=47;WE=111747595;WS=111747577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,46:0.98:47
chr11	111749349	rs611010	A	T	3644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=74;PP=2856;SC=ATGCGGGAAGATGAAATAAAT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=113;TCF=39;TCR=74;TR=112;WE=111749357;WS=111749339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr11	111750349	rs145607394	T	C	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=36;PP=1344;SC=TCTCCTATCTTCTATTCGTTC;SOR=2.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=13;TCR=36;TR=49;WE=111750357;WS=111750339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	111750430	rs7107213	A	G	784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=18;PP=632;SC=GGATGAACAAAATGTGGCCTA;SOR=1.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=26;WE=111750438;WS=111750420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	111753246	rs117090799	G	A	4175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=82;PP=2965;SC=TATTCAAACCGTACCCTGATG;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=50;TCR=82;TR=132;WE=111753254;WS=111753236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr11	111754368	rs11600652	A	T	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=562;SC=AGTAAACAGGATTTTTTCTTC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=111754376;WS=111754358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	111780083	rs78041974	C	A	1110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=29;PP=947;SC=GGTTCCAGAACAATAGGACTG;SOR=4.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=31;WE=111780091;WS=111780073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	111780104	rs57155014	TAA	T	760.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=22;PP=340;SC=CTGCTGAAATTAAAAAAAAAA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=22;WE=111780113;WS=111780094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	111782139	rs117865217	C	T	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=336;SC=CACATTTGGACACACATGTGC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=111782147;WS=111782137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	111795148	rs7124433	C	G	2062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.882;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=24;PP=1688;ReadPosRankSum=-0.788;SC=CAATAGAACTCCAATCTTTGG;SOR=0.894;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=64;TCF=39;TCR=25;TR=63;WE=111795156;WS=111795138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr11	111796231	rs118009277	C	G	1037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=3;PP=867;SC=TTGGATTTAGCACTAGTAGAC;SOR=4.047;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=32;WE=111796239;WS=111796221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	111796618	rs147007936	C	T	1465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=12;PP=1256;SC=TTGACCTGCCCCTGCATTGGA;SOR=2.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=45;WE=111796626;WS=111796608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr11	111796689	rs117666512	T	C	3029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=42;PP=2217;SC=CGCAGGGCCATGAAACAACAG;SOR=0.973;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=54;TCR=42;TR=96;WE=111796697;WS=111796679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr11	111800518	rs148804082	C	A	1364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=22;PP=984;SC=TTATTTTGTACATTTCTTATT;SOR=0.780;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=21;TCR=22;TR=43;WE=111800526;WS=111800508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	111839382	rs117856005	C	T	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=33;PP=1051;SC=TCATCACATCCTTGGTGCATG;SOR=2.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=41;WE=111839390;WS=111839372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	111845098	rs80062744	T	G	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=143;SC=GAAAAGAACATGGAGTGGGGA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=111845106;WS=111845088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	111848361	rs11364849	AG	A	262.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=2;PP=287;SC=TAGCTTTGCTAGGCTGGCCTT;SOR=1.863;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=8;WE=111848369;WS=111848351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	111853106	rs11455434	G	GC	1332.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=16;PP=1124;SC=CGGCCAGGGAGCCTGGAACCT;SOR=1.022;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=27;WE=111853114;WS=111853096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	111857541	rs147514078	G	C	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=11;PP=1512;ReadPosRankSum=1.240;SC=TGAATGAGTGGCTCTGTACTT;SOR=1.542;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=57;TCF=46;TCR=11;TR=56;WE=111857549;WS=111857531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr11	111863504	rs75726856	C	T	876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=4;PP=796;SC=TGTGGTTCTACAGTCTAATTA;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=111863512;WS=111863494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	111889635	rs650461	C	G	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=365;SC=TTTAGTGAATCAGATTCCCTG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=111889643;WS=111889625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	111889654	rs476581	C	T	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=514;SC=TGTTTTTTCACTGTGGCTTTT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=111889662;WS=111889644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	111896251	rs61757217	G	C	1409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=13;PP=1255;SC=GGCGGGACTCGAGGCTCGGTG;SOR=1.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=43;WE=111896259;WS=111896241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	111897028	rs113392665	GT	G	224.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.32;QD=28.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	111897050	rs1974426	A	T	264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.95;QD=26.48;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	111899635	rs11553595	A	G	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=29;PP=960;SC=CCTTCTGCTCAGGCTCCTGGT;SOR=2.133;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=36;WE=111899643;WS=111899625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	111903995	rs478941	T	C	279.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=230;SC=TATTGAGGTGTGAAGCTTTTG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=111904003;WS=111903985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	111904072	rs12098930	T	C	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=4;PP=675;SC=CTGCCAGACTTTTATTATGTA;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=111904080;WS=111904062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	111908162	rs627441	T	C	3377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=69;PP=2494;ReadPosRankSum=-0.802;SC=AAACCACAAGTGCCACCACCT;SOR=0.510;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=115;TCF=45;TCR=70;TR=114;WE=111908170;WS=111908152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,119:0.99:120
chr11	111909819	rs6589260	C	A	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=13;NR=0;PP=364;SC=GTTAAGCTGGCGAAAAGTACA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=111909827;WS=111909809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	111915765	rs11455845	C	CA	1293.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=7.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.000;QD=23.96;ReadPosRankSum=-0.980;SOR=3.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,53:0.98:54
chr11	111916001	rs11335731	AG	A	1787.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=32;PP=1726;SC=GGGCATCTTTAGGTTGTTTAG;SOR=1.755;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=39;WE=111916009;WS=111915991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	111916559	rs116892694	T	C	1997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=30;PP=1514;SC=CTCAAGATAATTGATTTTTTA;SOR=0.849;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=36;TCR=30;TR=66;WE=111916567;WS=111916549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	111921906	rs78285712	A	C	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=138;SC=GAAACTTAAAATTAAAATTAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=111921914;WS=111921896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	111930576	rs3882890	C	T	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=424;SC=ACCTGGCACACAGGCTCTTAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=111930584;WS=111930566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	111931730	rs112722744	C	CAA	1543.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=3;PP=1468;ReadPosRankSum=-0.149;SC=TGTTGACAAACTATAATTTAT;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=31;WE=111931738;WS=111931720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr11	111942362	rs117706566	A	G	2668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.319;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=22;PP=2219;ReadPosRankSum=-0.062;SC=TTTGTACCTGATATCTCAGTT;SOR=2.140;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=85;TCF=62;TCR=23;TR=83;WE=111942370;WS=111942352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,84:0.98:86
chr11	111946418	rs73568071	G	A	2120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.502;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=49;PP=1701;ReadPosRankSum=-0.646;SC=GGCAAGCAGTGTGCCAAGCAT;SOR=1.947;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=69;TCF=20;TCR=49;TR=68;WE=111946426;WS=111946408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr11	111952836	rs4025979	G	A	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=145;SC=TAACTTTTACGAAGAATATAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=111952844;WS=111952826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	111956291	rs7127061	A	G	183.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=87;SC=TCTTTAAATCAACCACGGAGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=111956299;WS=111956281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	111956817	rs117661257	G	C	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=194;SC=TAGCCAGCAAGAAGTCAGGCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=111956825;WS=111956807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	111956989	rs14396	C	A	2019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=15;PP=1642;SC=GTGACGGCGACACCAAAACCC;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=47;TCR=15;TR=62;WE=111956997;WS=111956979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	111957111	.	C	G	2084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.315;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=47;PP=1687;ReadPosRankSum=1.351;SC=TAACTAGTCTCCCGTACCCTT;SOR=1.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=66;TCF=19;TCR=47;TR=65;WE=111957119;WS=111957101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,67:0.99:68
chr11	111957143	rs487201	T	C	1566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=41;PP=1372;SC=ATCTTCCCTGTTTTACACCTT;SOR=3.657;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=5;TCR=41;TR=46;WE=111957151;WS=111957133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	111957665	rs34677591	G	A	1624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.458;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=26;PP=1264;ReadPosRankSum=-0.905;SC=TGCCGTTTGCGGTGCCCTAGG;SOR=0.610;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=46;TCF=20;TCR=26;TR=45;WE=111957673;WS=111957655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr11	111959625	rs9919552	C	T	334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=276;SC=ACTGGACTAGCGAGAGGGTTG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=111959633;WS=111959615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	111959859	rs118074328	T	C	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.25;SOR=6.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	111963860	rs592626	A	G	160.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=3;PP=104;SC=GCACGATCTCAGCTTACTGCA;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=111963868;WS=111963850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	111963883	rs111659413	C	T	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=3;PP=83;SC=CTCCGCCTTTCGGGTTCAAGC;SOR=2.833;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=111963891;WS=111963873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	112041128	rs149903853	TTTTGTCCTG	T	1776.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=15;PP=2966;SC=GTTTTCTTTATTTTGTCCTGT;SOR=1.347;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=33;WE=112041144;WS=112041118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	112064431	rs7105056	T	C	2581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=54;SC=GTGATAGTGATGATTATTTAA;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=29;TCR=54;TR=83;WE=112064439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr11	112065434	rs10891338	T	C	3122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=45;PP=2237;SC=CATTATGACCTGGATGGAACA;SOR=0.791;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=54;TCR=45;TR=99;WE=112065442;WS=112065424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	112065483	rs7123686	A	C	2638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=66;PP=1973;SC=CATATGGTAAAGTTGCAATAA;SOR=2.277;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=22;TCR=66;TR=88;WE=112065491;WS=112065473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr11	112071570	rs7948124	AA	TT	2713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=54;PP=2152;SC=TTGATTTTTTAAAAATCTTCC;SOR=5.994;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=60;TCF=1;TCR=59;TR=55;WE=112071579;WS=112071559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	112072930	rs4935984	G	A	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=32;PP=994;SC=ATTAGAATTTGTCAAGAGTCA;SOR=4.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=34;WE=112072938;WS=112072920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	112087101	rs2676377	T	A	1761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=49;PP=1401;SC=TAGCACTGAGTCATCTGATAA;SOR=5.136;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=3;TCR=50;TR=52;WE=112087109;WS=112087091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	112088499	rs2217401	A	C	1036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=8;PP=800;SC=AAGCAATTTTATCCTAGTTTT;SOR=2.235;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=32;WE=112088507;WS=112088489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	112099410	rs3819331	T	C	1930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=25;PP=1500;SC=AGAGAAAAACTGATGACATTT;SOR=1.127;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=38;TCR=25;TR=63;WE=112099418;WS=112099400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	112123095	rs2564872	A	G	2699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=49;PP=2100;ReadPosRankSum=-0.830;SC=TTCAGAGTAGAAAGTATAGGC;SOR=0.420;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=34;TCR=50;TR=83;WE=112123103;WS=112123085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,86:0.99:87
chr11	112130987	rs2518361	G	C	471.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=400;ReadPosRankSum=-0.688;SC=CTCATTCTTTGTCTTCCTTCC;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=16;WE=112130995;WS=112130977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr11	112832307	rs11381910	G	GA	3605.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=39;PP=2957;SC=ACCGCGGCAAGACATCCCTCC;SOR=0.919;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=47;TCR=40;TR=85;WE=112832315;WS=112832297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr11	112832339	rs11284059	GC	G	4107.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=52;PP=2967;SC=TTACAATGCTGCCAAACTAAG;SOR=0.901;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=25;TCR=53;TR=77;WE=112832366;WS=112832329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr11	112832353	rs7105734	T	C	4029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.28;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	112832358	rs6589347	T	C	3910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.01;SOR=1.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr11	113067854	rs973461	T	C	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=2;PP=679;SC=TGGGGGAAACTGCCCCCATGA;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=113067862;WS=113067851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	113073066	.	T	TTTTTGTTTTG	1250.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.59;QD=46.32;SOR=5.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	113076982	rs1975259	G	C	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=22;PP=593;SC=ACTTCCTCTTGGGTCTGTAAA;SOR=3.180;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=113076990;WS=113076972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	113085244	rs686050	C	G	2169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=37;PP=1746;SC=GTATCATGCTCCCCAGGAGTT;SOR=1.066;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=64;WE=113085252;WS=113085234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	113103996	rs584427	T	G	1476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=21;PP=1155;SC=GGAGAGCAGTTGGTGAAGAAG;SOR=0.963;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=26;TCR=21;TR=47;WE=113104004;WS=113103986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	113113515	rs635596	G	A	3576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=70;NR=44;PP=2824;SC=TCTGTCTGTCGTGTTTCCATA;SOR=1.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=70;TCR=44;TR=114;WE=113113523;WS=113113505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr11	113114313	rs61902540	C	G	2270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=25;PP=1788;SC=ATGTTCCAAGCTGGTCTTCAT;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=39;TCR=25;TR=64;WE=113114321;WS=113114303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	113200558	rs7928978	A	G	1704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=13;PP=1392;SC=CTGACATTCTACTGTTCGAAT;SOR=2.170;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=47;WE=113200566;WS=113200548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	113200709	rs2303380	G	A	2740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=39;PP=2184;SC=AAGGTAAGAGGGTATTTCTTT;SOR=0.717;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=40;TCR=39;TR=79;WE=113200717;WS=113200699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	113211329	rs2288159	G	T	2213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=15;PP=1812;SC=GTGTTGCAGCGAGACACCAGC;SOR=2.338;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=50;TCR=15;TR=65;WE=113211337;WS=113211319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	113212553	rs6589372	T	C	3736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=32;PP=2965;SC=CCTTTGTCCATTCTAGGTGTT;SOR=2.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=84;TCR=32;TR=116;WE=113212561;WS=113212543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr11	113230600	rs2276070	C	T	1238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=19;PP=956;SC=GAAGAAGCTCCGCTGAGAATT;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=41;WE=113230608;WS=113230590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	113233059	rs2298490	G	A	1067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=7;PP=869;SC=CTCCCCGTTAGCTTTTAAAGG;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=33;WE=113233067;WS=113233049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	113234466	rs713233	G	A	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.91;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	113234471	rs719803	A	G	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.25;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	113234679	rs719802	T	C	2039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=42;PP=1514;SC=AGGGAGCCCTTGTCCCAGAGG;SOR=1.512;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=66;WE=113234687;WS=113234669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	113235419	rs2298489	A	G	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=305;SC=GCTGATGAGTAAGTGAACAAG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=113235427;WS=113235409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	113235864	rs7949242	A	G	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=15;PP=427;SC=CTGGGACTGCATGCCACACAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=113235872;WS=113235854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	113264272	rs17115439	T	C	2489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=32;NR=40;PP=1984;SC=ACATCGTGTCTATCTACGGGG;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=32;TCR=40;TR=72;WE=113264280;WS=113264262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	113264470	rs4938013	A	C	1587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=33;PP=1227;SC=CGGGCAACATACTCCTGGACA;SOR=2.030;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=45;WE=113264478;WS=113264460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	113264521	rs4938014	G	A	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=23;PP=632;SC=CCAATCCTCCGCTCCCTTTCA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=113264529;WS=113264511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	113265292	rs10891546	T	C	256.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=150;SC=ATGAATAGCTTACCGAAGGTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=113265300;WS=113265282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	113265999	rs11214597	G	A	3130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=30;PP=2489;SC=GTGAACTGTAGCCCCCCGACC;SOR=1.679;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=99;TCF=69;TCR=30;TR=97;WE=113266007;WS=113265989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr11	113270374	rs2734848	C	T	2209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=41;PP=1840;SC=AGAGCGGCTACGGCCCACTGC;SOR=0.971;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=30;TCR=41;TR=71;WE=113270382;WS=113270364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	113270828	rs1800497	G	A	1794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=40;PP=1450;SC=AGTGCTGGTCGAGGCAGGCGC;SOR=2.480;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=52;WE=113270836;WS=113270818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	113271065	rs2734847	T	G	117.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.75;NF=1;NR=3;PP=91;SC=GATCACCTGATATCAAGAGTT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=113271073;WS=113271055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	113281397	rs6276	C	T	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=1;PP=358;SC=TGAGGCTGGCCGGCCTGGGCA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=113281405;WS=113281387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	113283477	rs6275	A	G	1772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=40;PP=1451;SC=TGTGGAGACCATGGTGGGACG;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=19;TCR=40;TR=59;WE=113283485;WS=113283467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	113285299	rs2511521	G	A	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=702;SC=CAGAGATCAGGAGGGTGGGGG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=113285307;WS=113285289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	113561054	rs7110736	A	G	2720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=44.60;ReadPosRankSum=-0.741;SOR=1.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr11	113561057	rs7110738	A	G	2684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=41.95;ReadPosRankSum=-0.761;SOR=0.902;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr11	113561481	rs45570834	AG	A	824.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=0;PP=902;SC=TCATGTGGCCAGGGGATGTGG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=113561489;WS=113561471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	113565322	rs17115841	C	A	2140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=32;PP=1738;SC=CCACAGACTGCCCACCAACTA;SOR=0.723;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=35;TCR=32;TR=67;WE=113565330;WS=113565312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	113566205	rs45515199	C	T	3700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.06;SOR=1.075;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr11	113566205	.	CGC	TGA	1843	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=30;NR=43;PP=1843;QD=25.9790119844;SC=GGGCAGGGGCCGCCCTGCAGC;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=79;TCF=32;TCR=47;TR=73;WE=113566215;WS=113566195;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,73:0.92:79
chr11	113566207	rs4936279	C	A	3700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.85;SOR=1.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr11	113570405	rs4936280	T	C	1953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=56;PP=1626;SC=GCCAGCACACTGCCTGAGAAA;SOR=2.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=14;TCR=56;TR=70;WE=113570413;WS=113570395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	113570490	rs3802856	T	C	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=15;PP=482;SC=AAGTCACCACTATGGGGCTAG;SOR=2.636;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=113570498;WS=113570480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	113576932	rs7926267	A	G	1508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=22;PP=1235;SC=TGGCACAGAGACGTAACCTTA;SOR=0.866;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=25;TCR=22;TR=47;WE=113576940;WS=113576922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	113609854	rs4351850	T	A	963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=0;PP=757;SC=ATTTCTAATTTTCTCATTCAA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=113609862;WS=113609844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	113618470	rs2459977	T	A	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=363;SC=AAAGAATCATTTACATATATT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=113618478;WS=113618460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	113618968	rs2513584	G	C	2424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=7;PP=1981;SC=TGTGCTGTCTGGGCTCTTTAC;SOR=4.235;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=64;TCR=7;TR=71;WE=113618976;WS=113618958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr11	113644261	rs2136445	G	A	4069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=70;PP=2965;SC=CTTCCAGTCAGCAGACAGCTG;SOR=0.838;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=58;TCR=70;TR=128;WE=113644269;WS=113644251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr11	113670052	rs2459971	T	A	1824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=17;PP=1528;SC=TGGGTCGAATTGTTGGAGGCT;SOR=1.850;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=44;TCR=17;TR=61;WE=113670060;WS=113670042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	113678924	rs2513582	G	T	587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=5;PP=494;SC=GTTGGTTAAAGGCAGCAGAGA;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=113678932;WS=113678914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	113679119	rs2465647	C	T	2687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=32;PP=1942;SC=CATGCTCAGACGACAAGCAGC;SOR=1.055;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=48;TCR=32;TR=80;WE=113679127;WS=113679109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	113680018	rs2513581	G	C	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=514;SC=CACAAGGAACGAAAACATCCT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=113680026;WS=113680008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	113706122	rs10789965	G	A	2008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=51;PP=1682;SC=AAAAGCCCCAGGTATATTTCC;SOR=3.575;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=8;TCR=51;TR=59;WE=113706130;WS=113706112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	113802600	rs45597437	CA	TG	5113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=51;PP=2947;SC=GTAAGTGTGCCAGTGTGTATT;SOR=0.862;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=95;TCF=42;TCR=53;TR=93;WE=113802609;WS=113802590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr11	113803028	rs1176744	A	C	4718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=45;PP=2965;ReadPosRankSum=1.105;SC=ATTGAAAGATACCCTGACCTT;SOR=0.683;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=94;TCR=45;TR=138;WE=113803036;WS=113803018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,147:0.99:148
chr11	113848184	rs4020460	G	GCT	1780.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=3;PP=1623;SC=TGGGCCACCTGCTCCGACCTT;SOR=4.073;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=34;WE=113848192;WS=113848174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	113856681	rs10160548	G	T	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=3;PP=366;SC=TCATCACAGGGTCCAGCAGGC;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=113856689;WS=113856671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	114057944	rs682155	A	G	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=274;SC=GGCCCAGCAGAAGTTTACAAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=114057952;WS=114057934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	114310469	rs476200	T	C	177.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=3;PP=143;SC=GTCGAGCCCGTCCTGGGAGAG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=114310477;WS=114310459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr11	114421721	rs78612878	G	A	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.880;HP=1;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=1;PP=2546;ReadPosRankSum=0.021;SC=CAGTAGTTGAGGTGGGGGAGG;SOR=2.757;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=93;TCF=78;TCR=15;TR=33;WE=114421729;WS=114421688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,37:0.37:101
chr11	114421747	rs78105386	G	A	2168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=6.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.72;ReadPosRankSum=-0.917;SOR=1.319;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,58:0.42:138
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chr11	114421768	rs75860289	A	T	2735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=7.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.48;ReadPosRankSum=0.677;SOR=1.237;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,69:0.42:166
chr11	114421769	rs76481835	C	G	2729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=7.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.54;ReadPosRankSum=0.631;SOR=1.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,69:0.42:165
chr11	114421773	rs74572030	A	G	2687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=8.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.63;ReadPosRankSum=0.859;SOR=1.295;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,72:0.42:172
chr11	114421789	rs113431368	A	AC	3098.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.783;HP=2;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=21;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.295;SC=GTGAGGGCTTACTGTGTGATC;SOR=1.445;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=148;TCF=83;TCR=65;TR=60;WE=114421807;WS=114421779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,82:0.45:183
chr11	114421799	rs79701489	C	T	3020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.515;HP=2;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=25;PP=2962;ReadPosRankSum=0.063;SC=ACTGTGTGATCTGCATCAAAG;SOR=1.086;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=165;TCF=97;TCR=68;TR=71;WE=114421807;WS=114421779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,78:0.44:176
chr11	114421817	rs73568242	G	T	3218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.207;HP=3;HapScore=1;MGOF=61;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=34;PP=1589;ReadPosRankSum=-1.014;SC=AAGGTGATTTGCTCCTACCTT;SOR=1.073;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=175;TCF=93;TCR=82;TR=79;WE=114421825;WS=114421807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,87:0.47:186
chr11	114421857	rs78453693	T	C	3652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=6.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.18;ReadPosRankSum=0.013;SOR=0.763;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,95:0.52:181
chr11	114421861	rs76118887	G	A	3620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=8.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.23;ReadPosRankSum=0.642;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,94:0.53:179
chr11	114421895	rs78257939	G	A	2844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=3;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=55;PP=2962;ReadPosRankSum=1.262;SC=GATCAGCAGCGTTTTTTGAAG;SOR=0.671;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=191;TCF=86;TCR=105;TR=100;WE=114421920;WS=114421885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,107:0.54:198
chr11	114421909	rs79082937	T	C	4190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FS=0.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.64;ReadPosRankSum=0.229;SOR=0.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,108:0.53:203
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chr11	114421927	rs78842965	G	A	2694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=56;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=63;PP=2096;ReadPosRankSum=-0.013;SC=AGGACATGACGAATGTCCTAG;SOR=0.698;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=198;TCF=77;TCR=121;TR=103;WE=114421935;WS=114421917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,106:0.52:204
chr11	114421962	rs75409523	G	A	3504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.58;ReadPosRankSum=-0.543;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,91:0.51:179
chr11	114421967	rs79109814	A	G	3504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.91;ReadPosRankSum=-0.497;SOR=0.750;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,90:0.51:176
chr11	114422003	rs73568250	A	C	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=3.121;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.19;ReadPosRankSum=1.108;SOR=0.331;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,50:0.50:101
chr11	114422016	rs76270589	T	A	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=2.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.70;ReadPosRankSum=-0.291;SOR=0.234;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,40:0.52:77
chr11	114422025	rs75158214	C	A	1299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.00;ReadPosRankSum=-1.176;SOR=0.249;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,34:0.52:65
chr11	114422029	rs78778953	T	G	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.06;ReadPosRankSum=-1.446;SOR=0.790;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr11	114422036	rs77481744	C	T	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.69;ReadPosRankSum=-1.053;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
chr11	114422052	rs10790022	G	C	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=76;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=244;ReadPosRankSum=0.749;SC=GTGAGTCACTGTCTTCTTTCC;SOR=0.384;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=12;WE=114422060;WS=114422042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr11	114422068	rs76698432	C	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.74;ReadPosRankSum=0.410;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr11	114422068	.	CTA	TTC	374	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=63;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=8;PP=374;QD=53.4334843578;SC=TTTCCCTCTGCTAACTAACAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=8;WE=114422078;WS=114422058;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr11	114422070	rs75429280	A	C	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.87;ReadPosRankSum=0.930;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr11	114441639	rs508631	A	G	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=426;SC=TAAGTGAATGAATTTCAGACT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=114441647;WS=114441629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	114550334	rs1612325	A	G	359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=332;SC=GCCATGTCGTACTTATTTGAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=114550342;WS=114550324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	114569054	rs1712838	A	G	3160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=52;PP=2535;SC=ACCACTTGGGACACAGGAAGC;SOR=0.919;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=41;TCR=52;TR=92;WE=114569062;WS=114569044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr11	114574819	rs12364744	C	T	4812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.515;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.108;SC=AATTTATCCACGGAAAGGACA;SOR=1.389;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=56;TCR=98;TR=151;WE=114574827;WS=114574809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,154:0.98:157
chr11	114576626	rs1356428	A	T	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=23;PP=904;SC=GAAACAAAAAATATAAATGAC;SOR=1.347;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=15;TCR=23;TR=37;WE=114576634;WS=114576616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	115049180	rs17304149	C	T	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=248;SC=TCCTAATCAGCGGCTGCTAAG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=115049188;WS=115049170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	115061533	rs4936322	T	C	1371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=18;PP=1061;SC=GCAAACCAAATGGCCATTTTG;SOR=1.251;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=48;TCF=30;TCR=18;TR=47;WE=115061541;WS=115061523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	115102224	rs11607928	A	G	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=640;ReadPosRankSum=-0.743;SC=CAAATTAAACATATGTGCTTT;SOR=0.784;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=31;WE=115102232;WS=115102214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,33:0.97:34
chr11	116650623	rs182845671	A	G	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=6.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.91;MQRankSum=-2.971;QD=2.51;ReadPosRankSum=-0.189;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr11	116653731	.	A	G	1493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=36;PP=1304;SC=GGATTTCCACACTGCAAGTCT;SOR=2.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=47;WE=116653739;WS=116653721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	116707684	rs2070665	A	G	1398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=7;PP=1096;SC=TCTGCCCCCTACCCCTGCCCT;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=40;WE=116707692;WS=116707674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	116708020	rs5070	A	G	2321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=24;PP=1601;SC=TTAGGGAGAAAGCCCCCCGAT;SOR=1.240;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=39;TCR=24;TR=63;WE=116708028;WS=116708010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	116720089	rs2289893	T	C	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=25;PP=661;SC=CAAGGGACAATGGGCAAGGCT;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=116720097;WS=116720079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	116732512	rs2075292	G	T	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=22;PP=1060;SC=AAGGGTACCAGGCTATCGAGA;SOR=0.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=21;TCR=22;TR=43;WE=116732520;WS=116732502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	116732856	rs484646	A	G	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=4;PP=519;SC=CAAAATGCACAGGCAAATCAG;SOR=3.352;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=116732864;WS=116732846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	116734545	rs11216164	G	A	1800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=25;PP=1328;SC=CTGAATATATGGGAAGAGAAG;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=26;TCR=26;TR=51;WE=116734553;WS=116734535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	116824884	rs511676	T	G	1888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=47;PP=1516;ReadPosRankSum=-0.686;SC=TACAGGAAGATAAACTAATGA;SOR=1.785;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=57;TCF=9;TCR=48;TR=56;WE=116824892;WS=116824874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr11	117015195	rs2735183	C	T	217.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=184;SC=GAAGGGGCTGCGAGGTGTTAT;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=117015203;WS=117015185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	117030581	rs1871757	T	A	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=301;SC=TGTTGAGAGTTCAAGCATGGG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=117030589;WS=117030571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	117030624	rs35139041	AT	A	909.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=2;PP=597;SC=CCAGTTAATAATTTTTTTTTT;SOR=4.977;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=36;WE=117030632;WS=117030614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	117032125	rs3736120	G	T	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=379;SC=TACTGTCATTGCTTGAGAATA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=117032133;WS=117032115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	117034388	rs3057863	CAAAAAA	C	1123.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=18;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=3;PP=400;SC=GACCCCATCTCAAAAAAAAAA;SOR=3.098;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=15;WE=117034401;WS=117034378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	117034619	rs7122944	G	T	3570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=59;PP=2756;ReadPosRankSum=0.842;SC=GTATGTAGTCGTTGGTGGGTA;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=47;TCR=60;TR=105;WE=117034627;WS=117034609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,112:0.98:114
chr11	117034729	rs10790175	T	C	1433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=39;PP=1226;SC=TATCATACTTTCGTTGACCTC;SOR=3.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=44;WE=117034737;WS=117034719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	117042238	rs10750103	C	T	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=554;SC=GGCAACAGAGCGAGACTCTTG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=117042246;WS=117042228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	117042377	rs4936367	G	A	1947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=26;PP=1454;SC=CTCAGAGATAGTGAGACTAGA;SOR=0.976;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=34;TCR=26;TR=60;WE=117042385;WS=117042367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	117052069	rs35248926	GTCTCT	G	2278.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=10;PP=2337;SC=AGGGCTCATAGTCTCTGGAGC;SOR=2.584;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=42;WE=117052081;WS=117052059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr11	117053165	rs7946257	A	G	1354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=2;PP=1192;SC=ATAGGGGACTATTCCCTTCTA;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=39;WE=117053173;WS=117053155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	117059347	rs90192	C	T	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=0;PP=709;SC=ATAATTGTTACAATTGCCTCA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=117059355;WS=117059337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	117059552	rs474339	G	A	4971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=94;PP=2965;SC=GGTCTGACCCGTGGGCCTGGC;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=54;TCR=94;TR=148;WE=117059560;WS=117059542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr11	117064693	rs521171	C	G	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=33;PP=1266;SC=AGCACTCACCCTCAGGCTCCT;SOR=1.220;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=53;WE=117064701;WS=117064683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	117160347	rs539765	A	G	1741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=14;PP=1298;SC=CGGAGGCAGCACCACTGACAC;SOR=2.157;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=60;TCF=44;TCR=16;TR=57;WE=117160355;WS=117160337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	117241760	rs2305826	T	A	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=3;PP=743;SC=CACATTCCTTTTGTCTTCCTT;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=117241768;WS=117241750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	117251521	rs2061293	G	C	118.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=92;SC=TCAGTGTACAGTTGCTTGGCA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=117251529;WS=117251511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	117252489	rs897836	T	C	679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=13;PP=496;SC=AAGAAGAGCCTCCCCAGGGCC;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=22;WE=117252497;WS=117252479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	117258198	rs501776	T	C	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=1;NR=19;PP=581;SC=GACACCCTCTTAGCCTGGGGA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=117258206;WS=117258188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	117266312	rs2305830	C	G	580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=8;PP=448;SC=AAGGAGCACACCCACCTGTTG;SOR=0.914;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=17;WE=117266320;WS=117266302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	117266754	rs693147	A	C	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=5;PP=791;SC=CCTCTCACTCATCTTTCCTTC;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=31;WE=117266762;WS=117266744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	117267884	rs573455	A	G	2829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=68;PP=2248;SC=TTCCTTGTGCAGCAGACACGC;SOR=3.232;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=14;TCR=68;TR=82;WE=117267892;WS=117267874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr11	117282499	.	C	G	1552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=11;PP=1142;SC=ATGCTCTCCTCTTCCTTCCCA;SOR=2.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=47;WE=117282507;WS=117282489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	117282800	rs522885	G	T	6278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.936;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=114;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.807;SC=CTCTCTTCTCGTCAACACCCA;SOR=0.901;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=80;TCR=114;TR=193;WE=117282808;WS=117282790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,197:0.99:198
chr11	117299015	rs2925768	T	C	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=0;PP=1145;SC=CGCGGCGCGGTCCAGGCGTGG;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=41;WE=117299023;WS=117299005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	117299039	rs3741283	G	C	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=8;PP=1148;SC=CTCTTCCTGCGGGCCCTACAC;SOR=3.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=47;WE=117299047;WS=117299029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	117303242	rs60580523	C	T	2163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=43;PP=1592;SC=AGGACAATTACTGGGAGTCCT;SOR=1.897;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=19;TCR=43;TR=62;WE=117303250;WS=117303232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	117303393	rs880615	C	T	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=297;SC=ATTGTGATCACTGCTCACTGC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=117303401;WS=117303383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	117304196	rs2242133	C	T	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=14;PP=796;SC=ATCTGCAAAACAGTAGAGGGA;SOR=0.811;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=18;TCR=14;TR=32;WE=117304204;WS=117304186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	117306291	rs661789	G	T	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=570;SC=TGTGAGCCAGGGAAGGGGGGG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=117306299;WS=117306281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	117308927	rs10892101	C	A	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.08;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	117309495	rs10892104	G	A	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=0;PP=946;SC=CCCCCAGATCGTTTCTGTCAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=117309503;WS=117309485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	117309989	rs11216386	C	T	2507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=43;PP=1979;ReadPosRankSum=-0.664;SC=CACCTTGCACCAGAAGGTTGA;SOR=0.298;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=36;TCR=44;TR=79;WE=117309997;WS=117309979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr11	117310022	rs11216387	A	G	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=34;PP=1296;SC=CAAAGCCACCAGTGTTGGTGG;SOR=1.835;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=49;WE=117310030;WS=117310012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	117332352	rs588048	A	G	437.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=335;ReadPosRankSum=0.232;SC=CCAGTCAGTCATGGATGTGAG;SOR=2.712;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=14;WE=117332360;WS=117332342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr11	117335722	rs538847	T	C	1717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=20;PP=1300;SC=GATTGAAGGCTTGGACCACCA;SOR=1.342;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=55;WE=117335730;WS=117335712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr11	117342536	rs114831648	T	C	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=473;SC=CCCCTGGTGGTCCTGATCCCT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=117342544;WS=117342526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	117374470	rs2298767	C	T	935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=0;PP=791;SC=GATGAAACGACGGAGACTAAG;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=117374478;WS=117374460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	117395497	rs55642294	C	A	823.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=647;ReadPosRankSum=-1.080;SC=ACTGGGGCTGCAGAAGGGGCT;SOR=1.739;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=28;WE=117395505;WS=117395487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,28:0.93:30
chr11	117580254	rs2508559	T	C	141.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=1;PP=111;SC=TTGCGGGGGTTGGGGGGAGTG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=117580262;WS=117580244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	117580356	rs605500	C	T	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=6;PP=282;SC=GAGAGGGTTACAGAACCATAA;SOR=0.859;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=12;WE=117580364;WS=117580346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	117580509	rs655086	A	G	93.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=3;PP=58;SC=GCGGCTGTGAAAAAGAATGGA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=117580517;WS=117580499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	117668104	rs11216549	C	G	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=4;PP=82;SC=GCGGCCCGGGCCAGACCGCCC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=117668112;WS=117668094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	117691386	rs869789	G	A	1714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=37;PP=1407;SC=CATACCTGCTGTTACGGCTCA;SOR=1.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=54;WE=117691394;WS=117691376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	117698762	rs7117314	G	A	479.41	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=362;ReadPosRankSum=1.405;SC=AGGAGTGCAGGAGAGCAGGGA;SOR=1.371;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=17;WE=117698770;WS=117698752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,17:0.89:19
chr11	117772787	rs71041806	GCA	G	108.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=174;SC=GCACACATATGCACACACACA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=4;WE=117772796;WS=117772783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	117773110	rs494457	G	C	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=258;SC=CAAGGAGGGAGAGCAAAGGGA;SOR=3.442;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=117773118;WS=117773100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	117774146	rs2186627	C	G	2344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=15;PP=1773;SC=GTAGGTCCACCCTTTTTCAAC;SOR=3.003;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=64;TCR=15;TR=79;WE=117774154;WS=117774136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr11	117774291	rs2845712	A	C	4107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=58;PP=2965;SC=TCTGCCTACAACCTGGGTGCT;SOR=0.709;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=119;TCF=60;TCR=59;TR=118;WE=117774299;WS=117774281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr11	117776471	rs3802873	C	T	1227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=36;PP=986;ReadPosRankSum=1.719;SC=GACCTCCAGACGTCAGTGAAG;SOR=5.943;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=36;WE=117776479;WS=117776461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr11	117781435	rs2155194	A	G	1198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=13;PP=1050;SC=AACACTGGAGAGAGATATACC;SOR=1.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=39;WE=117781443;WS=117781425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	117781618	rs2155195	A	G	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=17;PP=506;SC=CCCTTTCCCCATGTGACATTG;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=117781626;WS=117781608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	117782638	rs2277288	A	G	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=21;PP=657;SC=CAAGTCCTCCAGCAGGCTAGA;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=117782646;WS=117782628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	117789312	rs201746372	CGGGCTGGAGATGCCT	C	1940.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=30;PP=2933;SC=CGGAGATGCCCGGGCTGGAGA;SOR=2.352;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=68;TCF=18;TCR=50;TR=40;WE=117789334;WS=117789302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	117790658	rs10790220	C	G	1180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=31;PP=909;SC=ATGGGGCCCCCTGGCCCTGCA;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=38;WE=117790666;WS=117790648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	117790674	rs12418028	A	G	1181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=32;PP=940;SC=CTGCAGGGCCAGGAACACCTT;SOR=3.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=36;WE=117790682;WS=117790664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	117799804	rs722729	C	T	1720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=48;NR=1;PP=1433;SC=AGCAGCTTCTCCTCCCAGGGG;SOR=6.479;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=49;WE=117799812;WS=117799794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	117948080	rs653764	C	T	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=31;PP=1219;SC=CATGTAAGGCCCTTCAAGCAG;SOR=1.562;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=46;WE=117948088;WS=117948070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	117988082	rs642215	T	C	1792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=17;PP=1457;SC=GCATCGTTAGTTGGGGCTATG;SOR=1.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=53;WE=117988090;WS=117988072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	117988223	rs643014	G	A	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=34;PP=1222;SC=TCTACCTGGGGGGTGCCAATC;SOR=2.560;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=44;WE=117988231;WS=117988213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	117996119	rs7944738	C	T	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=20;PP=606;SC=CATCGCCTGACCACCTGTGTT;SOR=4.255;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=117996127;WS=117996109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	118011776	rs668468	G	A	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=1;PP=112;SC=TGAGAGATGGGGAGGGGGTGG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=118011784;WS=118011766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	118015832	rs45539032	G	A	1939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=23;PP=1534;SC=CGAAGCCAAAGCAGCTGGAGA;SOR=1.366;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=39;TCR=23;TR=62;WE=118015840;WS=118015822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	118016068	rs1793137	C	T	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=203;SC=CAGTGCCAACCTCGGGAGGAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=118016076;WS=118016058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	118067426	rs648947	A	G	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=2;PP=423;SC=CACCTGGCTCAGCTGAGGCCA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=118067434;WS=118067416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	118067621	rs951657	A	G	3234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=53;PP=2583;ReadPosRankSum=-0.733;SC=CCTATTTGCTAGGCATCGACC;SOR=0.293;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=46;TCR=54;TR=99;WE=118067629;WS=118067611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,102:0.99:103
chr11	118068949	rs1617182	C	T	1706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=49;PP=1435;SC=GCCAGGGCTACCCGGCTCACC;SOR=7.864;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=49;WE=118068957;WS=118068939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	118071097	rs1626649	T	C	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=395;SC=GAGAATGGCATAAGTAGGGCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=118071105;WS=118071087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	118074117	rs1793173	A	G	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=432;SC=AGGTCCCTCAATGCTCCCCAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=118074125;WS=118074107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	118074337	rs1793174	A	G	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=38;PP=1495;SC=GGAGTACTCCACAGACATCCT;SOR=1.341;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=24;TCR=38;TR=62;WE=118074345;WS=118074327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	118081345	rs17121881	A	T	1993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=27;PP=1557;ReadPosRankSum=-0.715;SC=ATTGCATAAGATGTCCCCCAT;SOR=0.373;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=38;TCR=28;TR=63;WE=118081353;WS=118081335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr11	118081468	rs17121882	C	T	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.711;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=36;PP=1226;ReadPosRankSum=0.470;SC=AAAAGAGGTGCCAGACCGAGG;SOR=1.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=53;WE=118081476;WS=118081458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,55:0.96:57
chr11	118083664	rs1715429	A	G	4779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=95;PP=2965;SC=TTGCTCTTAAATCTCCCACTG;SOR=1.201;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=61;TCR=95;TR=156;WE=118083672;WS=118083654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr11	118175485	.	G	C	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=81;SC=GCCTGCTTCAGAAAATGGTGA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=118175493;WS=118175475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	118186305	rs2231449	C	A	2035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=58;PP=1706;SC=CCTCTCCAGTCCCCCTGCGAC;SOR=3.943;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=9;TCR=58;TR=67;WE=118186313;WS=118186295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	118209960	rs2276424	A	C	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=19;PP=696;SC=AGGAGAAGAGAAAACGGTCAG;SOR=1.536;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=27;WE=118209968;WS=118209950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	118210106	rs2276423	G	C	643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=544;ReadPosRankSum=1.553;SC=CATTCAGTGTGAGCCTCTCTA;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=20;WE=118210114;WS=118210096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr11	118210424	.	T	TACAC,TAC	2635.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.23;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;NF=45,45;NR=3,3;PP=105,1537;SC=AGCTCACTGGTACACACACAC;SOR=5.174;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=74;TCF=67;TCR=7;TR=48,48;WE=118210432;WS=118210414;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:58
chr11	118215075	rs150376137	AGGCT	A	652.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=508;SC=GCTGCTGCACAGGCTGGCTGG;SOR=3.258;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=10;WE=118215086;WS=118215065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	118221137	rs3753060	C	T	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=20;NR=0;PP=582;SC=AGGATCTTCCCTTGCCCTGCC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=118221145;WS=118221127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	118221349	rs3753059	TG	CT	3117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=43;PP=2947;ReadPosRankSum=1.791;SC=TCGTCCTTGCTGTTGGGGTCT;SOR=0.597;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=66;WE=118221358;WS=118221339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
chr11	118221474	rs1561966	G	A	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=421;SC=TGTACCCAATGGAAGAGACTG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=118221482;WS=118221464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	118239266	rs2276421	G	A	2092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.557;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=9;PP=1696;ReadPosRankSum=0.577;SC=CATCTTCTTGGTTACATTTAT;SOR=3.511;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=65;TCF=55;TCR=10;TR=63;WE=118239274;WS=118239256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,65:0.97:67
chr11	118240332	rs11216860	T	C	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=19;PP=444;SC=CTCCAACTTATGCTTGTGTCC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=118240340;WS=118240322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	118243700	.	TA	T	48	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=48;QD=12.75;SC=CCCCCAGCTCTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=118243708;WS=118243690;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	118243716	.	AG	A	44	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=15;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=44;QD=11.75;SC=AAAAAAAAAAAGAATTATTGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=118243724;WS=118243706;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,4:0.57:7
chr11	118255662	rs370025001	TAA	T	115.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=2.688;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=0.786;QD=4.29;ReadPosRankSum=-0.283;SOR=1.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr11	118359161	rs572126	G	A	115.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=89;SC=ATCTCCCGCAGTGTCCAATAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=118359169;WS=118359153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr11	118362414	rs562780	T	C	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=352;SC=TTCCTCTCTCTCATTCTTCAG;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=118362422;WS=118362404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	118391375	rs576950	A	G	268.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=2;PP=299;SC=CAAAAAAAAAAGGGGGGCGCT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=118391383;WS=118391373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	118425418	rs147577488	C	T	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=520;SC=TCATGCTGTACGCAATACTAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=118425426;WS=118425408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	118443075	.	G	C	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.42;ReadPosRankSum=-0.847;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr11	118500963	rs680465	G	A	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=10;PP=310;SC=GCCTGCGGGAGAAGGCAACAA;SOR=2.147;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=118500971;WS=118500953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	118505676	rs58507527	GT	G	743.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=5;PP=808;SC=GAGGCACCTGGTAGGCCCGCC;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=118505684;WS=118505666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	118518964	rs11314049	GC	G	403.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=420;SC=CCCCAAAACAGCACCCACCAG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=118518972;WS=118518954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	118529017	rs6589669	T	G	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=9;PP=656;SC=GCAGGAGGCTTAGCAGGAGGC;SOR=1.460;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=28;WE=118529025;WS=118529007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	118529044	rs11448549	C	CG	1002.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.47;NF=7;NR=12;PP=756;SC=GAAGGGTGGCCCCAGGCAGTG;SOR=0.963;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=19;WE=118529052;WS=118529034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	118529069	rs6589670	G	C	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.77;SOR=2.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	118529078	rs6589671	G	C	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.94;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	118622744	rs6589689	G	A	1520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=28;PP=1100;SC=CACAAAGAGAGGAGCATTCCC;SOR=1.298;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=45;WE=118622752;WS=118622734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	118625609	rs580079	C	T	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=23;PP=678;SC=AAAAAACATGCGTTTAAAAAT;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=118625617;WS=118625599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	118651809	rs555649	T	C	3837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=79;PP=2824;ReadPosRankSum=1.902;SC=TTATTCTACTTGTATTTTACA;SOR=0.437;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=49;TCR=80;TR=128;WE=118651817;WS=118651799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,132:0.99:133
chr11	118757056	.	GAA	G,GA	665.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.34;MQRankSum=0.523;QD=15.85;ReadPosRankSum=-0.172;SOR=1.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:4,13,25:0.31,0.60:42
chr11	118757201	rs3176908	C	G	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=17;PP=495;SC=GGGGTGGGGACGGGCTGCTAA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=118757209;WS=118757191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	118769032	rs11217081	G	A	210.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=142;SC=ACCCCACCCCGCGACCCAGGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=118769040;WS=118769022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	118769604	rs61751532	C	T	5034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.181;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=84;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.092;SC=TGGGGAAGTACTGGAGGGTGC;SOR=0.524;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=77;TCR=85;TR=159;WE=118769612;WS=118769594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,163:0.98:166
chr11	118781601	rs11376918	C	CA	4268.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.08;NF=33;NR=58;PP=2971;SC=GACAGGGAGACAAGACACGCA;SOR=0.885;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=98;TCF=34;TCR=64;TR=91;WE=118781609;WS=118781591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr11	118781638	rs11376919	C	CG	2974.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=58;PP=2872;SC=AGAGGCGCGCCGAGGCCAGGG;SOR=2.133;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=8;TCR=58;TR=66;WE=118781646;WS=118781628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	118781655	rs11376920	C	CG	2219.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=49;PP=2400;SC=AGGGAAGCGCCGCCGGAGCGG;SOR=3.150;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=55;TCF=6;TCR=49;TR=54;WE=118781663;WS=118781645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	118842745	rs36158515	A	AG	1912.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=52;PP=2210;SC=GGCGTGGCGGAGGGTGGCCTA;SOR=8.155;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=1;TCR=60;TR=52;WE=118842753;WS=118842735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr11	118842780	.	A	AG	1156.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=28;PP=1239;SC=CCCGGGGCAGACGGCTCCCCA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=28;WE=118842788;WS=118842770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	118868842	rs58467585	A	AG	197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=232;SC=CCGAGGGGTCAGGGTCAGAGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=118868850;WS=118868832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr11	118885668	.	TA	T	186.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.704;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=3.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=0.048;QD=6.22;ReadPosRankSum=0.270;SOR=2.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr11	118889114	rs10892321	A	G	1628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=36;PP=1243;SC=TCCGGGGCAAAAGGCGGAGCC;SOR=1.848;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=51;WE=118889122;WS=118889104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	118898435	rs56966114	AC	A	3734.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=58;PP=2972;SC=AGACAACCACACCACAGTGCC;SOR=1.125;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=91;TCF=30;TCR=61;TR=88;WE=118898443;WS=118898425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr11	118915755	rs13929	G	C	1374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=7;PP=729;SC=AAAGGAGCTGGATGGGGAATG;SOR=1.911;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=27;WE=118915765;WS=118915745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	118915757	rs11363127	TG	T	1365.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=7;PP=823;SC=AGGAGCTGGATGGGGAATGGG;SOR=1.839;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=21;WE=118915765;WS=118915745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	118919206	rs568922	T	C	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=15;PP=956;SC=CAAATATGAATGCTTCCAAGC;SOR=1.414;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=27;TCR=15;TR=42;WE=118919214;WS=118919196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	118920112	rs670192	A	G	1055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.537;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=747;ReadPosRankSum=0.320;SC=CCTTGGGAGCACCAGTCAAGA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=31;WE=118920120;WS=118920102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,34:0.94:36
chr11	118920453	rs673768	T	C	3208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=53;PP=2573;SC=CACACAAGTATATTCTCTCCC;SOR=0.839;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=101;TCF=47;TCR=54;TR=100;WE=118920461;WS=118920443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr11	118926720	rs470679	A	C	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=18;PP=1326;SC=CCCAAGCTCAATTCCCATCAT;SOR=1.067;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=46;WE=118926728;WS=118926710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	118927013	rs57740718	T	TC	3179.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=62;PP=2977;SC=AGCCTACTTCTCCCTTCTCCC;SOR=1.609;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=90;TCF=20;TCR=70;TR=82;WE=118927021;WS=118927003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	118938882	rs670526	C	T	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=535;SC=GGAAGTCCATCTCCTAACTTG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=118938890;WS=118938872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	118939939	rs5795166	T	TC	1434.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=11;PP=1420;SC=CTTGCCACGTTCCTACAGCTT;SOR=2.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=33;WE=118939947;WS=118939929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	118940957	rs1784302	C	G	1785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=17;PP=1448;SC=TCACAGATGGCAGTGTTACAT;SOR=1.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=38;TCR=17;TR=55;WE=118940965;WS=118940947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	118942638	rs1614264	A	C	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=301;SC=ATGCCTGGATACTGCCAATCT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=118942646;WS=118942628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	118944675	rs3825061	C	T	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=8;PP=224;SC=AGTCTGGAGGCACTTTGGGAT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=118944683;WS=118944665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	118949083	rs1177563	G	A	1181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=34;PP=975;SC=AAGACAGTTCGTGCCGTCTCC;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=118949091;WS=118949073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	118949331	rs1177562	C	T	1603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=17;PP=1287;SC=GTCGCTTCTGCGACGTCTTTG;SOR=1.390;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=48;WE=118949339;WS=118949321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	118949799	rs1168568	G	A	5165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=83;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.928;SC=AGTGCCACACGTGGTTGATTG;SOR=0.254;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=83;TCR=84;TR=165;WE=118949807;WS=118949789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,164:0.99:165
chr11	118952173	rs15818	A	G	4022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.023;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=57;PP=2965;ReadPosRankSum=2.195;SC=CTGCAGCTCAAGTGCTCCAAT;SOR=0.129;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=122;TCF=64;TCR=58;TR=119;WE=118952181;WS=118952163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,127:0.98:129
chr11	118952371	rs4614	A	G	286.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=238;SC=GTGGAGGACCAAGAGAACAGA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=118952379;WS=118952361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	118958869	rs1006195	G	T	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=7;PP=717;SC=AGGTTCTGAAGTTCCTTTCTT;SOR=2.226;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=28;WE=118958877;WS=118958859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	118959331	rs17075	G	A	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=16;PP=1375;SC=ACTAATCCAAGTCTCTACCCG;SOR=1.919;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=41;TCR=16;TR=57;WE=118959339;WS=118959321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	118962230	rs1131488	G	T	2306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=29;PP=1903;ReadPosRankSum=-0.881;SC=ACAACCGGGTGGGGCAGGTAG;SOR=0.488;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=48;TCR=30;TR=76;WE=118962238;WS=118962220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr11	118970875	rs10892330	T	C	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=138;SC=ATAATTACTATGCATATTGCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=118970883;WS=118970865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	118973112	rs3825060	AA	GC	5074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=67;PP=2947;ReadPosRankSum=-0.712;SC=TCCCGGAAACAAAGCTACGAT;SOR=0.586;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=109;TCF=37;TCR=72;TR=104;WE=118973121;WS=118973102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,115:0.99:116
chr11	118973133	rs10790282	G	A	2953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=70;PP=2378;ReadPosRankSum=1.364;SC=TTGGAAGGATGGTGTAAATTC;SOR=1.371;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=93;TCF=20;TCR=73;TR=90;WE=118973141;WS=118973123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,91:0.99:92
chr11	118978411	rs7940073	G	C	237.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=1;PP=195;SC=GGGGCAGCGGGTGAGCCCCAG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=118978419;WS=118978401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	118981025	rs617948	A	G	1533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=40;PP=1180;ReadPosRankSum=-0.861;SC=GGATCTAAGGATTGGTTTCAG;SOR=2.387;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=45;WE=118981033;WS=118981015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr11	118983681	rs682795	C	T	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=342;SC=TTAATTCCAACTCCCCCTGTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=118983689;WS=118983671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	118984287	rs4938630	A	C	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=222;SC=CTCTGAAGCAACTCCCAGCTC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=118984295;WS=118984277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	118986630	rs608444	G	A	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=365;SC=GAGGAAGCCTGGCTTCTGGGC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=118986638;WS=118986628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	118986659	rs608793	C	T	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=655;SC=TGATCCTGTCCACATCCTCTT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=118986667;WS=118986649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	118997869	rs547345	C	T	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=17;PP=573;SC=GGGAGGAGCTCAAGGAAAGGT;SOR=1.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=118997877;WS=118997859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	119005088	rs512703	C	T	5281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=112;PP=2965;SC=AGCAAGAGATCGTCTACTATG;SOR=1.681;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=52;TCR=112;TR=164;WE=119005096;WS=119005078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr11	119031841	rs11383101	G	GC	901.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=22;PP=1140;SC=CTGTACCCCAGCCCTGCAGCA;SOR=2.468;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=27;WE=119031849;WS=119031831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	119065484	rs60630529	A	AC	2882.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=5;PP=2157;SC=CTCACTGCCCACCCTCTCTCA;SOR=5.622;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=93;TCF=88;TCR=5;TR=83;WE=119065492;WS=119065473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr11	119181170	rs2249466	T	C	2381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=44;PP=1846;SC=GAGACGGGGGTAGCGTGCTGG;SOR=0.881;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=77;WE=119181178;WS=119181160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr11	119181674	rs2510146	G	C	7940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=147;PP=2965;ReadPosRankSum=0.604;SC=ACCATCGTTGGCCCAGCCAGT;SOR=0.454;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=243;TCF=95;TCR=148;TR=242;WE=119181682;WS=119181664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,247:1.00:248
chr11	119185133	rs6589731	C	T	1123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=2;PP=918;SC=CCCAAAGCACCGAGATTACAG;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=32;WE=119185141;WS=119185123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	119185347	rs6589732	G	A	4684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=67;PP=2965;SC=CCATCTCAGCGGCTGCGCACC;SOR=0.912;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=82;TCR=67;TR=149;WE=119185355;WS=119185337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr11	119205735	rs12797083	T	C	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=12;NR=0;PP=335;SC=TCATTTTCCTTCCAAATTAAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=119205743;WS=119205725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	119205830	rs12795576	A	G	2700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=23;PP=2142;SC=CCATAGCCCTATCATGGAGGC;SOR=1.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=57;TCR=23;TR=80;WE=119205838;WS=119205820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	119206375	rs2511841	G	A	2872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=34;PP=2469;SC=GGAGGATGACGGACGTAGTGG;SOR=1.218;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=53;TCR=34;TR=87;WE=119206383;WS=119206365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr11	119210583	rs1135258	G	T	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=22;PP=665;SC=GGGCGGCAGGGTGAGAGTAGC;SOR=4.332;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=119210591;WS=119210573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	119214771	rs948413	A	G	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=20;PP=630;SC=GGCTGGGGGGATGGGGTGGTG;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=119214779;WS=119214761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	119215165	rs10790289	C	T	1055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=22;PP=837;SC=ATAGGGCTGGCGGTGATTACA;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=29;WE=119215173;WS=119215155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	119215253	rs2509388	G	C	1180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.41;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	119215256	rs10892350	C	T	1183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.84;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	119216231	rs2510143	A	G	2722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=46;PP=2278;SC=GCTGTATTGCATGGTCTGTGG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=46;TCR=46;TR=92;WE=119216239;WS=119216221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr11	119227844	rs11217253	G	C	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=0;PP=455;SC=TGGAGGAGTGGGGGGAGAGTG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=119227852;WS=119227834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	119229374	rs7937208	T	C	1741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=5;PP=1484;SC=TGTTGAACACTAGGCAGAAAC;SOR=3.872;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=47;TCR=5;TR=52;WE=119229382;WS=119229364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	119229964	rs2241646	G	A	2247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=40;PP=1711;SC=AGCGCGGTGCGTATCTCTGGA;SOR=1.103;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=27;TCR=40;TR=67;WE=119229972;WS=119229954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	119290034	rs1054735	G	C	1416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=17;PP=1029;SC=TGAGGGATTGGGGGGAGGGGG;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=46;WE=119290042;WS=119290024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	119291480	rs3138091	G	A	2943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=26;PP=2074;SC=CCCTCTCTTTGTCACCTGCGC;SOR=1.945;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=62;TCR=26;TR=88;WE=119291488;WS=119291470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	119291688	rs3751026	A	G	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=39;PP=1317;SC=CACACTTACCACCAGGGCTGG;SOR=2.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=49;WE=119291696;WS=119291678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	119509625	rs1022080	C	T	921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=753;SC=AGAGCAGGCCCGGGAGCTCTG;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=119509633;WS=119509615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	119510644	rs7940667	A	C	4392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=72;PP=2965;SC=GAGCACAGCAACTAGGATGAG;SOR=0.825;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=63;TCR=72;TR=135;WE=119510652;WS=119510634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr11	119548052	rs10892429	G	A	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=27;PP=726;SC=AGAGGGAAGTGTGGGTGGGAG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=119548060;WS=119548042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	119584506	rs4245205	T	C	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=1;PP=222;SC=GGGCAGCTCCTATCTCTCCTG;SOR=4.407;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=119584514;WS=119584496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	119879255	rs609066	A	G	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=114;SC=TGCTGCAGAGATCCTGTGTTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=119879263;WS=119879245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	119879327	rs17245368	C	T	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=545;ReadPosRankSum=1.697;SC=TCGCCAGGGACGGCCGCTCTG;SOR=3.352;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=21;WE=119879335;WS=119879317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr11	119984202	rs506127	A	G	34.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr11	119984535	rs519672	G	C	183.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=148;SC=CTTTGAGGAAGATTGGGTCAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=119984543;WS=119984525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr11	119986167	rs503559	T	C	3292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=47;PP=2570;SC=GCGCTGGTGGTCAGGGGTGCC;SOR=0.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=55;TCR=47;TR=102;WE=119986175;WS=119986157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	119987576	rs488222	C	T	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=2;PP=511;SC=GAGAAGGGACCGGCACACCCT;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=119987584;WS=119987566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	119992871	.	T	TGTGTGA	851.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.172;NF=1;NR=14;PP=945;ReadPosRankSum=1.585;SC=TGTGTGTGTGTGAAAGACGTG;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=15;WE=119992879;WS=119992861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr11	119993897	rs66674912	CCT	C	9555.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=85;PP=2967;SC=GTTTCCCCAACCTCTCAGAGA;SOR=0.904;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=86;TCR=93;TR=166;WE=119993906;WS=119993887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr11	119999191	rs569044	A	G	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=5;PP=889;SC=TCCTTTTGCAATGACAGCTCC;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=31;WE=119999199;WS=119999181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	120040695	rs61900479	C	T	2866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=56;PP=2395;SC=CAGAGCAGCCCTAGGTGGAAG;SOR=1.382;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=31;TCR=56;TR=87;WE=120040703;WS=120040685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr11	120041110	rs7949789	T	A	8279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.658;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=146;PP=2965;ReadPosRankSum=1.743;SC=TCTAATCCTCTGACCGAGGCT;SOR=0.703;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=255;TCF=109;TCR=146;TR=254;WE=120041118;WS=120041100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,259:1.00:260
chr11	120041444	rs4936509	C	T	1089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=27;PP=839;SC=ATCTGTCTCACAGAGTGGCTG;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=120041452;WS=120041434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	120099658	rs2508489	A	G	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=20;PP=919;SC=GTGGGGGACCACGGGAAGCCC;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=38;WE=120099666;WS=120099648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	120117394	rs118125468	G	A	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=531;SC=TGATTCTGGAGCCTTTGAACA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=120117402;WS=120117384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	120200671	rs117207582	C	T	2345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=26;PP=1717;SC=TTGCTTCTGTCTTGGTTTGTT;SOR=1.240;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=45;TCR=26;TR=71;WE=120200679;WS=120200661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr11	120292570	rs532006	T	A	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=7;NR=23;PP=780;SC=AGGTAAGGAATAGGCTATTAT;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=120292578;WS=120292560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	120313055	rs199708925	CT	C	1430.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=59;PP=1019;SC=TTACTCTAGACTTTTTTTTTT;SOR=8.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=75;TCF=1;TCR=74;TR=59;WE=120313063;WS=120313045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr11	120338142	rs200434752	C	T	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQRankSum=-0.748;QD=6.98;ReadPosRankSum=-1.803;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr11	120348128	.	G	GT	90.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.600;ClippingRankSum=-0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=9.792;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.30;MQRankSum=1.655;QD=6.98;ReadPosRankSum=1.625;SOR=0.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr11	120355230	rs503473	A	G	3997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.607;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=81;PP=2965;ReadPosRankSum=1.112;SC=TGTAAAAGTTATGAGTTCCAG;SOR=1.362;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=42;TCR=82;TR=122;WE=120355238;WS=120355220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,129:0.99:130
chr11	120530973	rs6589829	C	T	1610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=23;PP=1359;SC=CCCCCTCTCTCGCAGAGTTAT;SOR=0.859;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=53;TCF=29;TCR=24;TR=52;WE=120530981;WS=120530963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	120776001	rs2156634	G	A	2373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=21;PP=1891;SC=TGCTGCAGGAGAACCCATATT;SOR=2.155;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=55;TCR=21;TR=76;WE=120776009;WS=120775991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr11	120823528	rs10750178	A	G	2902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=16;PP=2301;SC=TTGACTGAATATGTGCGGTGA;SOR=2.859;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=72;TCR=16;TR=87;WE=120823536;WS=120823518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	120837821	rs2276319	G	A	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=8;PP=1231;SC=GGGTGGCCAGGAGGTGTGCCG;SOR=2.786;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=46;WE=120837829;WS=120837811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	120856998	rs371012924	CGGGCGGGGCGGGAG	C	1081.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=2;NR=14;PP=2974;SC=GCGCAGAGGCCGGGCGGGGCG;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=16;WE=120857019;WS=120856988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	120924200	rs10502246	T	C	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=1;PP=573;SC=TTCTTGAGCATGATTGCTATT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=120924208;WS=120924190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	121032978	rs526433	G	A	2291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=33;PP=1813;SC=GGCTGCTACAGCCACAAGAAG;SOR=0.721;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=35;TCR=33;TR=67;WE=121032986;WS=121032968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	121178302	rs1061332	A	C	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=18;PP=564;SC=AAAAAATAATATCCATACAGT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=121178310;WS=121178292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	121323277	rs114331262	G	A	2113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=25;PP=1596;SC=CGCTCCGGAGGAAACGGAGCG;SOR=1.296;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=40;TCR=25;TR=65;WE=121323285;WS=121323267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	121340870	rs116967561	A	G	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=15;PP=420;SC=CCTTGGTGCCATCAACATGCC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=121340878;WS=121340860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	121367626	rs12364988	T	C	2909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=10;PP=2243;ReadPosRankSum=-1.168;SC=TTGAACGACATGAACCCTCTG;SOR=2.259;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=87;TCF=76;TCR=11;TR=86;WE=121367634;WS=121367616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,94:0.99:95
chr11	121393212	rs630813	C	G	1015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=7;PP=812;SC=CAGCTGCACTCCCCTCACACA;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=121393220;WS=121393202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	121403229	rs636588	T	C	4198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=58;PP=2965;SC=TCATCACGGCTATTGCCCAGG;SOR=0.838;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=70;TCR=58;TR=128;WE=121403237;WS=121403219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr11	121403345	rs631232	T	C	2008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=50;PP=1696;SC=TATCTCTCTATAGCACTATGT;SOR=2.872;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=12;TCR=50;TR=62;WE=121403353;WS=121403335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr11	121416187	rs11218325	A	C	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=308;SC=TTATTCACTCAGCAGTGTTGG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=121416195;WS=121416177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	121421444	rs58391387	C	T	2215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=47;PP=1755;SC=CACGATCTCACCCAAGTCCGG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=23;TCR=47;TR=70;WE=121421452;WS=121421434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	121425955	rs78274293	A	T	3316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.135;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=53;PP=2638;ReadPosRankSum=-1.621;SC=GCCTGGAGACAGTAGAAGCTT;SOR=0.469;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=58;TCR=55;TR=110;WE=121425963;WS=121425945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,110:0.97:113
chr11	121437819	rs1699107	C	G	2095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=41;PP=1681;SC=CTGTGTCAAACAAGGTACTTC;SOR=1.574;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=24;TCR=41;TR=65;WE=121437827;WS=121437809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	121445084	rs1792126	T	C	1430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=38;PP=1135;SC=TAAGGGGACATCACATCCTGA;SOR=3.516;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=44;WE=121445092;WS=121445074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	121447807	rs1790212	A	G	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=31;PP=987;SC=ACCCATTTGCAGCACACTGAC;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=121447815;WS=121447797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	121454149	rs73595277	C	G	1297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=16;PP=1069;SC=GCGACTGTGTCTCTCTTCTCT;SOR=1.206;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=25;TCR=16;TR=41;WE=121454157;WS=121454139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	121456962	rs1699102	C	T	925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=10;PP=718;SC=GCTGCCCAAACGGCACTTGCA;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=29;WE=121456970;WS=121456952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	121475798	rs1784929	T	A	1156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=10;PP=939;SC=ACTTTGTTTGTCTTTTTCTCC;SOR=2.133;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=38;WE=121475806;WS=121475788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	121475922	rs3824968	T	A	1377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=24;PP=1092;SC=TGCCCTCTGCTTCTTGTGTAT;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=18;TCR=24;TR=42;WE=121475930;WS=121475912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	121478958	rs2282649	C	T	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=23;PP=685;SC=TCAGTATGACCGGAAAATGGA;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=121478966;WS=121478948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	121489416	rs1784933	G	A	1337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=0;PP=1119;SC=CTTAAATTGGGGATTTCAAGG;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=38;WE=121489424;WS=121489406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	121491782	rs1792120	G	A	2451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=19;PP=1806;SC=GTTGTATGCAGTTGCAGTCAA;SOR=2.185;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=52;TCR=19;TR=71;WE=121491790;WS=121491772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	121493072	rs11454566	T	TA	419.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=294;SC=ATAGATAGTGTAAAAAAAAAG;SOR=2.049;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=14;WE=121493080;WS=121493062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	122165766	rs532540	G	A	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=16;PP=632;SC=ATGACAGTATGGACAGCCTCA;SOR=1.460;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=25;WE=122165774;WS=122165756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	122172113	rs558962	T	C	597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=0;PP=583;SC=CCAGCCTGGGTGACAGAGAGA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=122172121;WS=122172103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	122172318	rs615683	C	T	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.99;SOR=7.276;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	122172321	rs693194	T	C	1557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.21;SOR=7.054;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	122653950	rs2156802	C	T	962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=24;PP=750;SC=CACTGTGGTTCCAGAAGCTAC;SOR=2.165;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=122653958;WS=122653940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	122738062	rs57365669	CAA	C	364.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=26.05;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr11	122738261	rs2272094	A	G	1507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=33;PP=1295;SC=ATATGGAAGAAAGGTCAGTGG;SOR=2.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=43;WE=122738269;WS=122738251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	122775227	rs3107630	T	C	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=444;SC=TGTCTAGATATCGCTTCCTTT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=122775235;WS=122775217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	123065730	rs11219061	C	A	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=27;PP=808;SC=GGACCTCGGGCGAGCTGGGCG;SOR=3.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=30;WE=123065738;WS=123065720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr11	123154834	.	CTCCTTCCTTCCT	C	100.14	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.89;QD=33.38;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	123396674	rs35709687	G	C	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=561;SC=GGGAAGAAGGGGCAGTGGCAG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=123396682;WS=123396664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	123454978	rs58457879	T	C	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=7;PP=544;SC=CCCCATTTCTTCCCTGACTAA;SOR=1.508;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=21;WE=123454986;WS=123454968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr11	123455082	.	T	TGGGAGGGGGAATGGAGGTTGGGGGGAAAGGGTGTGGGGTGCGATTGG	361.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.92;QD=40.19;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	123455101	.	T	TG	355	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=5;HapScore=4;MGOF=8;MMLQ=25;MQ=52.98;NF=0;NR=7;PP=355;QD=55.1428571429;SC=GAATGGAGGTTGGGGGAAGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=123455117;WS=123455091;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr11	123455109	.	G	A	272	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=8;MMLQ=26;MQ=52.98;NF=0;NR=6;PP=272;QD=51.1285354245;SC=GTTGGGGGAAGGGGTGTGGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=123455117;WS=123455091;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr11	123455124	.	G	A	29	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=23;MQ=50.14;NF=0;NR=3;PP=29;QD=21.2570708491;SC=GTGGGGTGCGGTTGGGCTTTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=123455132;WS=123455114;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,3:0.60:5
chr11	123464637	rs1148101	G	C	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=1;PP=472;SC=ACACCGAGGCGCCGTTCCTCA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=123464645;WS=123464627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	123471336	rs12420909	C	A	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=28;PP=681;ReadPosRankSum=-0.823;SC=TTCTGGGAATCCCCCACTGAT;SOR=2.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=31;WE=123471344;WS=123471326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr11	123504673	rs1148111	C	G	998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=2;PP=823;SC=ACAGAGCTTTCTGACTTAAAG;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=123504681;WS=123504663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	123504959	rs1148110	C	G	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=13;PP=416;SC=CAGTGCCCAGCGTGGGAACAC;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=123504967;WS=123504949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	123598941	rs2282644	T	C	1972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=32;PP=1604;SC=GGGAAAAGCATACGGCCACAT;SOR=0.787;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=35;TCR=32;TR=67;WE=123598949;WS=123598931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	123676231	rs4936845	G	T	2380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=32;PP=1932;SC=GGTCACCACTGTGATGAGGAC;SOR=0.840;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=34;TCR=32;TR=66;WE=123676239;WS=123676221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	123753937	rs1939927	A	G	1416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=27;PP=1125;SC=ATTGCAGTGCATTCTGGTAAT;SOR=0.909;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=20;TCR=27;TR=47;WE=123753945;WS=123753927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	123754073	rs4587739	A	T	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=25;PP=756;SC=GGGAAAAGAGATTCCAGGGAG;SOR=3.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=123754081;WS=123754063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	123754844	rs10893099	T	C	2531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=45;PP=1852;SC=GATCCTATAATTAGAGAAGTG;SOR=1.236;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=27;TCR=45;TR=72;WE=123754852;WS=123754834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	123777049	rs10750249	G	T	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=599;SC=TTTTCATAGAGAGAAAACACT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=123777057;WS=123777039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	123777497	rs10750250	GC	AT	4115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=54;PP=2947;SC=GCCATGGCCTGCGATCGCTAC;SOR=1.511;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=82;TCF=26;TCR=56;TR=77;WE=123777506;WS=123777487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr11	123777536	rs7926767	G	A	2735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=46;PP=2202;SC=CTGCTCTACAGGGTCATCATG;SOR=0.987;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=35;TCR=46;TR=81;WE=123777544;WS=123777526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr11	123777736	rs10790610	T	C	3387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=37;PP=2754;SC=GCTTTTGATTTTTGTCATTGG;SOR=1.345;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=59;TCR=37;TR=96;WE=123777744;WS=123777726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr11	123777986	rs7942047	T	C	2950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=63;PP=2391;SC=ACTGTGATTCTCATGTTGAAT;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=22;TCR=63;TR=85;WE=123777994;WS=123777976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	123778031	rs7927385	G	A	1810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=37;PP=1396;SC=AATGAAGTAAGAAATGCTCTG;SOR=2.480;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=11;TCR=37;TR=48;WE=123778039;WS=123778021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	123813823	rs7129884	G	A	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=28;PP=1059;SC=GATGCGAGGCGCAAGTGGAAA;SOR=1.464;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=42;WE=123813831;WS=123813813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	123813940	rs7130003	G	C	2518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=20;PP=2055;SC=CCAACGTAGAGAGCATGAAAG;SOR=2.215;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=79;TCF=58;TCR=21;TR=78;WE=123813948;WS=123813930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr11	123814489	rs4936859	A	G	1754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=35;PP=1280;SC=TGAGGTGGCTACTGGGGAAAC;SOR=1.651;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=52;WE=123814497;WS=123814479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	123847392	rs10893117	G	C	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=302;SC=TGTGAGTTTTGATAGCACAGA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=123847400;WS=123847382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	123886308	rs11219407	A	G	3752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=71;PP=2294;SC=TCGTGACAGCATTCATCCTCA;SOR=2.960;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=26;TCR=72;TR=96;WE=123886328;WS=123886298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr11	123886320	rs12224056	A	G	3431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.74;QD=45.15;SOR=6.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr11	123886352	rs547068	T	C	1790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.02;QD=33.79;SOR=7.978;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	123886865	rs4084209	T	A	8078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=130;PP=2965;SC=TCAGCCAACGTGATGGTCATC;SOR=0.741;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=254;TCF=124;TCR=130;TR=254;WE=123886873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr11	123887184	rs4936882	T	G	6639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=138;PP=2965;SC=TGTTGAAACTTAGAGACAAAG;SOR=1.644;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=65;TCR=138;TR=203;WE=123887192;WS=123887174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr11	123887314	rs517598	T	A	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.30;QD=31.74;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	123893984	rs148015773	A	C	591.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=0.000;QD=39.45;ReadPosRankSum=-0.964;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,14:0.93:15
chr11	123893988	rs145930558	C	T	560.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=0.000;QD=35.05;ReadPosRankSum=-1.005;SOR=0.416;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,15:0.94:16
chr11	123894136	rs28499345	A	G	2596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.60;MQRankSum=-3.385;QD=33.72;ReadPosRankSum=-0.798;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,76:0.99:77
chr11	123894234	rs11219413	A	G	6164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=130;NR=88;PP=2965;SC=GGACCCAACCAGATCCAGCAC;SOR=1.344;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=219;TCF=130;TCR=89;TR=218;WE=123894242;WS=123894224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr11	123894402	rs12221656	A	G	5001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=103;PP=2965;SC=CTGCGGATCCACACCTCAGAG;SOR=1.451;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=54;TCR=103;TR=157;WE=123894410;WS=123894392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr11	123909073	rs11219419	C	G	6841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.473;NF=129;NR=63;PP=2965;ReadPosRankSum=1.847;SC=ACAGCACTATCAGGACAAAGC;SOR=0.645;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=194;TCF=131;TCR=63;TR=192;WE=123909081;WS=123909063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,207:1.00:208
chr11	123909172	rs28414940	G	A	7466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.911;NF=107;NR=141;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.475;SC=TGGGCGGTGCGTCACAGAAGT;SOR=1.118;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=266;TCF=120;TCR=146;TR=248;WE=123909180;WS=123909162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,239:0.98:243
chr11	123909342	rs470242	G	A	4096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=78;PP=2965;SC=CTGATGGCCAGGTAGCGATCA;SOR=1.311;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=124;TCF=46;TCR=78;TR=123;WE=123909350;WS=123909332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr11	123909650	rs3894199	C	G	4369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=4.999;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.42;MQRankSum=-0.654;QD=44.59;ReadPosRankSum=-0.818;SOR=1.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,97:0.99:98
chr11	123909653	rs4998340	G	T	4592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=5.035;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.14;MQRankSum=-0.520;QD=45.03;ReadPosRankSum=0.506;SOR=1.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
chr11	123909656	rs3894198	G	A	4606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=4.938;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.02;MQRankSum=-0.361;QD=43.46;ReadPosRankSum=0.689;SOR=1.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,105:0.99:106
chr11	123909695	rs3894197	G	C	4347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=70;PP=2965;SC=TGTCAGTAGGGTGGCGTTGGA;SOR=0.799;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=71;TCR=70;TR=141;WE=123909703;WS=123909685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr11	124086175	rs2508890	T	C	1260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.45;QD=34.07;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	124095414	rs10893172	C	G	5004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.446;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=68;PP=2965;ReadPosRankSum=0.769;SC=TTTCTTTCCTCCGTAGAAACT;SOR=0.560;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=156;TCF=87;TCR=69;TR=155;WE=124095422;WS=124095404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,156:0.99:157
chr11	124095525	rs11219508	T	C	3551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=57;PP=2845;SC=CTCTTCCTCCTGTTCTTAGGA;SOR=0.728;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=114;TCF=57;TCR=57;TR=113;WE=124095533;WS=124095515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr11	124095647	rs2466615	A	C	5637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=92;PP=2965;SC=CTTCATTGATATCTGCCATTC;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=75;TCR=92;TR=167;WE=124095655;WS=124095637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr11	124096122	rs7946182	G	A	1209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.84;QD=31.84;SOR=1.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	124096195	rs7946214	G	A	1477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.58;QD=31.44;SOR=3.958;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	124096247	rs2466613	G	A	3744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=83;NR=28;PP=2965;SC=CATGGACCAGGGGAAAGTGTC;SOR=2.262;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=83;TCR=28;TR=111;WE=124096255;WS=124096237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr11	124120302	rs2512239	A	G	150.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=120;SC=TACTCAAAGGAGATACCTAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=124120310;WS=124120292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	124120821	rs12099154	T	C	2592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=46;PP=1953;SC=TGCTGTACAGTGTCATCATAT;SOR=0.832;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=85;TCF=39;TCR=46;TR=84;WE=124120829;WS=124120811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr11	124252422	rs503220	G	A	2307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.96;QD=32.50;SOR=2.472;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr11	124252718	rs886201	G	A	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.36;QD=32.89;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	124252750	rs886202	G	A	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.61;QD=33.33;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	124252892	rs644147	A	G	3569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-1.762;NF=93;NR=45;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.147;SC=ATGCCATTGAAGTCAACATGT;SOR=0.554;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=140;TCF=95;TCR=45;TR=138;WE=124252900;WS=124252882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,109:0.98:111
chr11	124253100	rs71491826	G	A	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=67.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.33;MQRankSum=-7.257;QD=2.27;ReadPosRankSum=-0.474;SOR=3.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:168,33:0.16:201
chr11	124253147	rs530704	A	G	3773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=4.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=33.138;HP=2;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=6.338;NF=48;NR=84;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.370;SC=AGATCACTAGAAACAGGAAAA;SOR=1.265;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=251;TCF=110;TCR=141;TR=132;WE=124253189;WS=124253137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,139:0.62:223
chr11	124253161	rs530740	G	A	4661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=37.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.98;MQRankSum=5.313;QD=22.52;ReadPosRankSum=-1.170;SOR=1.852;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,120:0.58:207
chr11	124253170	rs530765	G	A	4530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=41.359;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.46;MQRankSum=4.495;QD=22.21;ReadPosRankSum=-1.482;SOR=2.221;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,115:0.56:204
chr11	124253181	rs28373946	T	C	4811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.939;NF=69;NR=142;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.080;SC=GAACTCTGGATGATCTGTTAA;SOR=1.055;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=216;TCF=72;TCR=144;TR=211;WE=124253189;WS=124253137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,175:0.98:178
chr11	124253333	rs645986	G	A	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.082;NF=0;NR=13;PP=250;ReadPosRankSum=-1.095;SC=AGGGGACTCAGGCTGTAGGAA;SOR=1.096;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=13;WE=124253341;WS=124253323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr11	124266906	rs530992	C	T	7601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.00;QD=45.25;SOR=1.395;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr11	124266912	rs28398895	A	G	7773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.42;QD=43.43;SOR=1.257;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr11	124267148	rs77374761	C	T	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.53;QD=33.15;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	124267177	rs61910862	T	C	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.00;QD=26.98;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	124267189	rs507335	T	C	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.00;QD=27.13;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	124293767	rs2188707	G	A	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=317;SC=AAATTCCTCCGCCTATAAATA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=124293775;WS=124293757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	124294236	rs4057749	A	G	1977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=24;PP=1610;SC=AGAACGTCACACAGATAATGG;SOR=1.230;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=41;TCR=24;TR=65;WE=124294244;WS=124294226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	124294377	rs4057750	A	G	2876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=42;PP=2341;SC=GTGACCATGTAGAGCAGGGGG;SOR=0.761;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=45;TCR=42;TR=87;WE=124294385;WS=124294367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	124440617	rs12792184	C	T	2469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=39;PP=2134;SC=GTCTTCTTTTCGGCTGGATTC;SOR=0.864;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=72;WE=124440625;WS=124440607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr11	124624705	rs72422616	TA	T	94.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=1.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=1.810;QD=2.11;ReadPosRankSum=0.446;SOR=1.016;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,11:0.24:45
chr11	124739332	rs11219820	A	C	84.56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=60.86;MQRankSum=-1.383;NF=5;NR=1;PP=147;ReadPosRankSum=0.431;SC=TTCGCCCCCCACCGCCCCGCC;SOR=0.941;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=124739340;WS=124739315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr11	124739988	rs4936957	T	C	4440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=53;PP=2965;SC=ATTTTGACATTATGGGAACAG;SOR=1.078;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=130;TCF=77;TCR=53;TR=128;WE=124739996;WS=124739978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr11	124740410	rs3923890	A	T	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=4;PP=774;SC=CCTGTCTTTAAGTACCTTGAC;SOR=3.126;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=124740418;WS=124740400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr11	124740691	rs7925879	A	G	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=941;ReadPosRankSum=1.140;SC=ATGGTTGGCAAGAGACTGAGG;SOR=0.502;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=32;WE=124740699;WS=124740681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chr11	124747333	rs10790713	A	G	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=11;PP=648;SC=ACTGTCCTGAAACTCCCGAAT;SOR=0.770;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=23;WE=124747341;WS=124747323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	124747837	rs7933204	G	A	5155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=97;PP=2965;SC=CTGCAGAAGCGGGAATCTCCC;SOR=1.267;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=158;TCF=59;TCR=99;TR=156;WE=124747845;WS=124747827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr11	124749584	rs3802905	C	G	1258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=26;PP=1037;SC=CAATCTTGGGCTGTTCATTGG;SOR=1.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=38;WE=124749592;WS=124749574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	124750232	rs4366494	C	T	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=0;PP=522;SC=AGAGCTGAGCCTGTGGTCAGG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=124750240;WS=124750225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr11	124761152	rs117072286	G	T	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=161;SC=TCCTGGGCCCGCCTACCACCA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=124761160;WS=124761142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	124766591	rs4078483	C	G	3741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=68;PP=2765;SC=GAAGGTGACACGGAGCAGGGC;SOR=1.362;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=34;TCR=68;TR=102;WE=124766599;WS=124766581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr11	124789755	rs3802904	T	C	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=22;PP=920;SC=GAGGAGGGAATGGAATACACA;SOR=0.968;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=39;WE=124789763;WS=124789745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	124789828	rs78859654	A	T	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=20;PP=666;SC=GATTACTGCCACTCCTATGAA;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=124789836;WS=124789818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	124792540	rs78569253	C	A	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=4;PP=841;SC=GGGGAAGGGTCCCTGCAGAGC;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=33;WE=124792548;WS=124792530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	124793682	rs10790715	T	C	2373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=29;PP=1705;SC=TTCTCCACCATGCAGCTGTAC;SOR=1.310;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=80;TCF=50;TCR=30;TR=79;WE=124793690;WS=124793672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr11	124793716	rs10790716	G	A	3025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=47;PP=2250;SC=CCATGAGCACGCGGGTGATGG;SOR=0.756;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=95;TCF=46;TCR=49;TR=93;WE=124793724;WS=124793706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr11	124856951	rs4608089	C	T	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=4;PP=604;SC=TTTGATATTTCGATTATTTTG;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=124856959;WS=124856941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	124861269	rs4936967	C	T	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=490;SC=AAAAACTACCCTTTGGCCTTC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=124861277;WS=124861259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	124946809	rs61912692	C	T	1110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=28;PP=849;SC=CCATGGCCACCGAGGTTGCAC;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=124946817;WS=124946799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	124949044	rs33932952	C	T	3501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=79;PP=2810;ReadPosRankSum=1.647;SC=TCCGTTACTACCTCTCAGCTG;SOR=0.869;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=114;TCF=34;TCR=80;TR=113;WE=124949052;WS=124949034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr11	124949665	rs55889403	A	G	1760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=23;PP=1284;SC=AAGTGAGTGTAACAAGGGAGG;SOR=0.922;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=30;TCR=23;TR=53;WE=124949673;WS=124949655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	124951467	rs4396301	C	G	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=377;SC=CTGACCTCACCGACCCAGTGC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=124951475;WS=124951457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	124954282	rs948270	A	G	2884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=71;PP=2287;SC=CCTCTGGCCTATGTGCACGTC;SOR=2.662;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=18;TCR=71;TR=89;WE=124954290;WS=124954272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr11	124954652	rs4936976	G	C	2274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=13;PP=1856;ReadPosRankSum=0.838;SC=GATGGTTGTTGCAGACCTCAG;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=55;TCR=13;TR=67;WE=124954660;WS=124954642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,68:0.99:69
chr11	124955032	rs948268	T	C	3016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=72;PP=2378;SC=TCTCTGCTGATCTGGTGAGTG;SOR=2.535;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=21;TCR=72;TR=93;WE=124955040;WS=124955022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr11	124955274	rs3824925	C	T	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=3;PP=781;SC=CTTCCCCACTCCACTGTCTCT;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=124955282;WS=124955264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	124955977	rs3808995	C	T	3012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=56;PP=2587;SC=ATCAGCCCAGCGCTCAGTTTC;SOR=1.280;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=37;TCR=56;TR=92;WE=124955985;WS=124955967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr11	124957803	rs7929462	C	T	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=222;SC=GCTGGGATTACAGGTGTGAGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=124957811;WS=124957793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	124958122	rs3802808	A	G	1075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=828;ReadPosRankSum=1.013;SC=ACAAGCAGGGAAGGCAAACCC;SOR=5.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=29;WE=124958130;WS=124958112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chr11	124967487	rs1043821	T	A	2332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=28;PP=1745;SC=AGGTTTTCGTTTTCCTGAAGA;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=48;TCR=28;TR=76;WE=124967495;WS=124967477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr11	124967678	rs3737350	A	G	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=28;PP=888;SC=TACCAGTTAGACACCCTGGCT;SOR=2.964;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=124967686;WS=124967668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	124972208	rs14065	A	G	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=24;PP=986;SC=GCTCCAGTGCAACACACTCCC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=36;WE=124972216;WS=124972198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	124972377	rs2155663	C	T	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=5;PP=417;SC=AACCCAAAGCCTTTCTCTTTG;SOR=1.739;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=15;WE=124972385;WS=124972367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	124972518	rs2155664	A	G	2859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.33;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr11	124972522	rs2155665	T	C	2810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.33;SOR=1.234;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr11	124972691	rs2155666	T	C	179.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=145;SC=TTCAAGAGGATGAAAACTCCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=124972699;WS=124972681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	125002920	rs77411432	G	A	1677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=31;PP=1374;SC=ACTTCTCTCCGCAGCCTCGTC;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=23;TCR=31;TR=54;WE=125002928;WS=125002910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	125002985	rs79222191	G	A	1046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=18;PP=824;SC=CCCTGAAGAGGGTGAAGGACT;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=29;WE=125002993;WS=125002975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	125003004	rs653552	A	G	1003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=19;PP=773;SC=CTCTGGAAGTAGGGTTGGGGC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=29;WE=125003012;WS=125002994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	125003127	rs60943855	A	G	281.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=232;SC=GGCGGGATGCAGGGGGTGTGG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=125003135;WS=125003117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	125009529	rs11219919	G	A	763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=23;PP=643;SC=CCCTTCCTCTGTCCGGGACAG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=125009537;WS=125009519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr11	125255715	rs3740892	A	G	2565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=62;PP=2095;SC=ATTTACCAACAAAAGGTTTTG;SOR=3.116;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=12;TCR=62;TR=74;WE=125255723;WS=125255705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr11	125298871	rs595849	A	G	2165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=11;PP=1681;SC=AGATCAGCATATGCCCAGCCC;SOR=2.904;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=49;TCR=11;TR=60;WE=125298879;WS=125298861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	125323965	rs11220082	C	T	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=3;PP=432;SC=CCCTGCGTTGCTGGGGAGGCC;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=125323973;WS=125323955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	125326026	rs2241514	C	T	3607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=69;PP=2727;SC=CCGTCTCCCGCATAACACCTG;SOR=1.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=50;TCR=69;TR=119;WE=125326034;WS=125326016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr11	125452300	rs55912941	A	AC	1720.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=30;PP=1671;SC=TGAAGCAAAGACCCTGGCAAA;SOR=1.287;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=39;WE=125452308;WS=125452290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr11	125462162	rs573173	A	G	2247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=15;PP=1747;SC=GCAGTTACCAAGGCACAGTAA;SOR=2.139;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=51;TCR=15;TR=66;WE=125462170;WS=125462152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr11	125467144	rs513209	C	A	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=23;PP=637;SC=GAAAAAAAAACCCTTAAATTC;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=125467152;WS=125467134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	125482345	rs538232	G	A	273.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=195;SC=TACTGCAACTGTTTCAAGTAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=125482353;WS=125482335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	125514573	rs521102	G	A	1536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=43;PP=1262;SC=ACCTTTTCCTGAAGAAGAATT;SOR=6.229;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=44;WE=125514581;WS=125514563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	125525195	rs506504	A	G	2768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=45;PP=2105;SC=CAGCCAGAAGATTTGGCTTCC;SOR=0.715;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=42;TCR=46;TR=87;WE=125525203;WS=125525185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	125616483	rs498803	G	T	6358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=76;PP=2965;SC=TTGAGTGGATGTTCATAGAAG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=72;TCR=76;TR=148;WE=125616491;WS=125616473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr11	125616502	rs2553829	T	A	6422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=80;PP=2965;SC=AGCTTTGAGATGGGGTTTGGA;SOR=0.850;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=66;TCR=81;TR=146;WE=125616510;WS=125616492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr11	125617317	rs496459	A	G	1193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.607;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=28;PP=919;ReadPosRankSum=0.650;SC=GTAAGTATGAAGAGGACCTGT;SOR=2.040;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=38;WE=125617325;WS=125617307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,39:0.98:40
chr11	125617376	rs5795459	CT	C	676.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=15;PP=669;SC=ATTCCTCCACCTTTCTTTCCC;SOR=3.056;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=125617384;WS=125617366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	125617606	rs537916	G	A	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=592;ReadPosRankSum=1.175;SC=GATAGAAATTGTTCAGTGTAG;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=23;WE=125617614;WS=125617596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,24:0.96:25
chr11	125617769	rs542285	C	T	1516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=29;PP=1155;SC=TATACAGGGACGTATCAGCCA;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=125617777;WS=125617759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	125617881	rs541350	T	C	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=257;SC=GAAAATTAGATGGAGGTGGTC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=125617889;WS=125617871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr11	125647712	rs522690	T	C	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=2;PP=589;SC=AAAAGAACACTACTGTTTCTC;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=125647720;WS=125647702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr11	125648216	rs517463	C	T	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=255;SC=CAGTAATGAACCCCTTATCTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=125648224;WS=125648206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr11	125648503	rs494361	G	A	4443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=76;PP=2965;SC=CCATGTTACAGTCTCACATAC;SOR=0.910;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=61;TCR=76;TR=137;WE=125648511;WS=125648493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr11	125659423	rs495869	A	C	2334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=41;PP=1889;SC=AGGGTCAGGGAAGGTGTTGTA;SOR=1.244;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=66;TCF=24;TCR=42;TR=65;WE=125659431;WS=125659413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr11	125707761	rs11220236	A	C	1239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=6;PP=979;SC=TCCACCCTGCAGTTATGGGTC;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=36;WE=125707769;WS=125707751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	125708198	rs10160391	C	T	1824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=11;PP=1466;SC=TCTTCATTTTCAGGAGACAAA;SOR=2.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=54;WE=125708206;WS=125708188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	125763566	rs141738016	TC	T	596.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=249;SC=CTTTTTTTTTTCTTTTAAGAG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=125763574;WS=125763555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	125763746	rs3088241	C	G	3445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=51;PP=2723;ReadPosRankSum=0.256;SC=AATTAGTATTCTCTTCCTCTA;SOR=0.602;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=60;TCR=54;TR=108;WE=125763754;WS=125763736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,113:0.96:118
chr11	125766044	rs549990	C	A	6576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=105;PP=2965;ReadPosRankSum=0.925;SC=CCAGCTCCTGCTGAATTTTCT;SOR=0.251;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=203;TCF=96;TCR=107;TR=201;WE=125766052;WS=125766034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,211:1.00:212
chr11	125766173	rs622756	A	C	2150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=53;PP=1785;SC=GTGTCATTATAAGCCATGATA;SOR=3.442;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=8;TCR=53;TR=61;WE=125766181;WS=125766163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr11	125766204	rs600761	G	C	2461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.59;SOR=3.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	125766207	rs471980	C	T	2461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.96;SOR=3.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr11	125769354	rs667782	T	C	2993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=49;PP=2166;SC=TACCCACATCTGTGCAGGGCA;SOR=0.773;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=44;TCR=49;TR=93;WE=125769362;WS=125769344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr11	125776216	rs34692223	A	ATT	564.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=13;PP=381;SC=GATATTCAATATTTTTTTTTG;SOR=3.258;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=14;WE=125776224;WS=125776206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr11	125776259	rs681416	G	C	115.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=62.13;NF=0;NR=5;PP=85;SC=CTGTCCCCCAGGCTGGAGTGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=125776267;WS=125776249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr11	125778074	rs5795465	AT	A	1253.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.068;HP=11;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.400;NF=35;NR=10;PP=753;ReadPosRankSum=1.664;SC=TAAGTGTTTGATTTTTTTTTT;SOR=2.628;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=45;WE=125778082;WS=125778064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,53:0.96:55
chr11	125780194	rs2272104	C	T	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=510;SC=ATTTTTATTGCAGTTGAAATT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=125780202;WS=125780184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	125788678	rs683155	T	C	2825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=58;PP=2102;SC=CTAATGTTTGTGCCCGAGGTG;SOR=1.237;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=36;TCR=58;TR=94;WE=125788686;WS=125788668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr11	125821763	rs12797894	C	T	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=4;PP=673;SC=GGGACCAGTTCATCATGCTGA;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=125821771;WS=125821753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	125848419	rs636641	A	C	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=27;PP=614;SC=ACCAACTCCCAGAGCAACGTC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=125848427;WS=125848409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	125850881	rs611548	C	G	990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=3;PP=852;SC=GCATGCTGTCCCTGTTCTAGT;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=37;WE=125850889;WS=125850871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	125851055	rs564214	A	G	2730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=58;PP=2142;SC=CATTGACTGCATTGGGGACCT;SOR=1.802;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=87;TCF=29;TCR=58;TR=86;WE=125851063;WS=125851045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	125851181	rs684805	G	A	1889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=30;PP=1441;SC=CCATCTGCCCGTTCATATCTG;SOR=0.831;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=57;TCF=27;TCR=30;TR=56;WE=125851189;WS=125851171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr11	125851300	rs624070	T	C	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=19;PP=414;SC=CACACACGCATGCACACATGC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=125851308;WS=125851290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr11	125867053	rs11220309	G	T	1013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=1;PP=832;SC=TAAATATATGGATCTAAAGTT;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=125867061;WS=125867043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr11	125871554	rs12274729	C	A	341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=290;SC=CCCCACCTCCCAAAATCTGAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=125871562;WS=125871544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	125871715	rs12274923	G	A	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=19;PP=920;SC=TGGAGAGGATGCCTGGGTGTT;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=21;TCR=19;TR=40;WE=125871723;WS=125871705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	125871735	rs516664	C	T	1223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=19;PP=919;SC=TTTTTGATGACGCTGTTTTTT;SOR=0.741;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=20;TCR=19;TR=39;WE=125871743;WS=125871725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr11	125873639	rs512761	G	T	77.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr11	125891269	rs3740912	C	T	4707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=71;PP=2965;SC=TGAATCTTAACATGTTCCAGG;SOR=0.758;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=82;TCR=71;TR=153;WE=125891277;WS=125891259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr11	126146244	rs56321210	C	T	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=1;PP=637;SC=GGAGGGTTGCCGGCCATGCTG;SOR=4.047;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=126146252;WS=126146234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	126176578	rs637462	G	A	1375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=14;PP=1134;SC=CTGAGCTCCAGTTGCAGTTCT;SOR=1.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=47;WE=126176586;WS=126176568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	126275960	rs10893506	T	C	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=19;PP=826;SC=TTTGTGAAGCTGACCGGACAC;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=19;TCR=19;TR=38;WE=126275968;WS=126275950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr11	126277216	rs2230278	C	T	3231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=61;PP=2548;SC=CATCTGCTTACGAGCTGCCCT;SOR=1.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=44;TCR=61;TR=105;WE=126277224;WS=126277206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr11	126278075	rs2230279	C	T	4988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.030;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=74;PP=2965;ReadPosRankSum=1.537;SC=TCAACAAGTACGATGTGGTCA;SOR=0.075;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=161;TCF=87;TCR=74;TR=156;WE=126278083;WS=126278065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,159:0.98:162
chr11	126279365	rs1316361	A	T	1125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=31;PP=931;SC=AGGAGGGATGATCCTATGGGC;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=126279373;WS=126279355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr11	126283785	rs2236653	C	T	1117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=2;PP=938;SC=TTGGGAGGGGCAGGGAGACTT;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=38;WE=126283793;WS=126283775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	126294817	rs948052	G	A	3681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=64;PP=2950;SC=CACGCTGCTTGCCCGCAGGAC;SOR=0.853;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=55;TCR=66;TR=119;WE=126294825;WS=126294807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr11	126301449	rs3802816	T	C	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=28;PP=614;SC=GCACAGCTGATGACGGATGGG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=126301457;WS=126301439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr11	126301481	rs3802817	T	A	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=426;SC=TATCCCCCCATGATCTCACCC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=126301489;WS=126301471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	126305279	rs4937132	C	G	1715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=40;PP=1261;SC=GCTGCTTGAGCGGGGCTGGGT;SOR=2.917;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=8;TCR=40;TR=48;WE=126305287;WS=126305269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr11	126310299	rs3212313	T	C	6255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=75;PP=2965;SC=AAGTGACTGTTGGGCTGCTGG;SOR=1.212;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=195;TCF=120;TCR=75;TR=195;WE=126310307;WS=126310289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr11	126310670	.	C	T	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=14;PP=404;SC=AGTCAGAACCCCCAGAAGATA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=126310678;WS=126310660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	126316610	rs1574534	C	T	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=3;PP=442;SC=CCACTGTCCCCGCCCCCTGCC;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=126316618;WS=126316600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	126391297	rs12269776	T	G	2291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=38;PP=1719;ReadPosRankSum=-1.055;SC=AGCTCTGCCCTCAGGATCTTC;SOR=0.815;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=44;TCR=39;TR=81;WE=126391305;WS=126391287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,85:0.98:87
chr11	126391409	rs4606486	A	G	1882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=36;PP=1458;SC=TGGAGGGGACACCCATGACAA;SOR=1.162;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=24;TCR=36;TR=60;WE=126391417;WS=126391399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	126391450	rs3839943	GC	G	1718.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=31;PP=1592;SC=CCAAGCAGGGGCCATTCTACA;SOR=1.659;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=38;WE=126391458;WS=126391440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr11	126526181	rs523249	A	G	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=21;PP=673;SC=CATAACCTCCATGATTCAGTT;SOR=1.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=126526189;WS=126526171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	126873592	rs494442	C	T	6815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=125;PP=2965;SC=TGCAAGCCGGCGGGATGCCAG;SOR=0.979;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=219;TCF=94;TCR=125;TR=219;WE=126873600;WS=126873582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr11	126873721	rs11377295	G	GC	1823.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=2;NR=47;PP=2044;SC=TGAGCCCCTGGCCCGCCCCCC;SOR=5.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=2;TCR=53;TR=49;WE=126873729;WS=126873711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr11	126968477	rs10893631	C	T	3520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=36;PP=2557;SC=TCACTCCTGCCATCCTGCTCC;SOR=1.466;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=66;TCR=36;TR=102;WE=126968485;WS=126968467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr11	128333503	rs2230004	T	C	3748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=41;PP=2778;SC=GAAACTGCCATAGCTGGATTG;SOR=1.247;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=67;TCR=41;TR=108;WE=128333511;WS=128333493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr11	128443083	rs7935676	G	C	1660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=25;PP=923;SC=ATGCTCACAGGTTTGTGGATT;SOR=1.552;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=38;WE=128443091;WS=128443073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr11	128443099	rs7935393	A	C	1631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=29;PP=1007;SC=GGATTAGAATACACAAGGAAG;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=128443107;WS=128443089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	128638216	rs35044982	TG	T	2049.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=50;PP=1603;SC=CCCCACTCTCTGGGGGGGCAG;SOR=2.483;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=75;TCF=10;TCR=65;TR=58;WE=128638224;WS=128638206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	128652012	rs639336	G	T	2141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=55;PP=1722;SC=ACCAGCTTGCGTGTTCCACTC;SOR=3.293;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=9;TCR=55;TR=64;WE=128652020;WS=128652002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	128679211	rs630797	G	C	2575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=54;PP=2109;SC=TAACATGCACGTCTTTCCTTG;SOR=1.854;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=23;TCR=54;TR=77;WE=128679219;WS=128679201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr11	128772452	rs11221503	C	T	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=5;PP=385;SC=GGAGACAGGGCTAGTTAGGAC;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=128772460;WS=128772442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr11	128773413	rs4937387	T	C	1900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=44;PP=1437;SC=CTGCCTTAGATGAAGGAGAAT;SOR=1.758;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=19;TCR=45;TR=62;WE=128773421;WS=128773403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	128781339	rs6590357	T	C	5402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=98;PP=2965;SC=TGGAGAAGAGTGGCAAGTGCA;SOR=0.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=81;TCR=99;TR=178;WE=128781347;WS=128781329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr11	128781978	rs7118824	T	G	5337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=64;PP=2965;SC=GCCTCTTCCTTGTGTCTCCTC;SOR=0.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=63;TCR=64;TR=127;WE=128781986;WS=128781968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr11	128782002	rs7118833	T	C	4755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.29;SOR=1.396;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr11	128782012	rs7102584	C	G	4322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.99;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr11	128786139	rs61176061	A	AGATGGATG	310.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=3;NR=0;PP=185;SC=ATAGATGATTAGATGGATGGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=3;WE=128786147;WS=128786131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr11	128786294	rs4937391	G	A	2090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=23;PP=1657;SC=TGTAACTTCCGTTTCCCCAGG;SOR=1.508;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=43;TCR=23;TR=66;WE=128786302;WS=128786284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr11	128804789	rs2155548	C	A	281.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=202;SC=GTCATGTAGACTATGGCTCAG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=128804797;WS=128804779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr11	128855726	.	C	CGT	91.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.13;MQRankSum=0.180;QD=11.47;ReadPosRankSum=0.180;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr11	128855755	.	A	G	68	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=28;MQ=54.6;NF=4;NR=0;PP=68;QD=25.6928031368;SC=GTGTGTGTGTATATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=128855763;WS=128855745;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr11	128934033	.	T	TA	36	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=0.9999;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=36;QD=15.0;SC=CAAAGAGTCTTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=128934041;WS=128934023;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,3:0.38:8
chr11	128993435	rs192361908	A	G	2412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=53;PP=1821;ReadPosRankSum=0.000;SC=CCTGAAACACATGAAATAAAT;SOR=0.749;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=78;TCF=24;TCR=54;TR=77;WE=128993443;WS=128993425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,82:0.99:83
chr11	129312660	rs3827487	C	T	1129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=5;PP=866;SC=CTGGAGCCTGCCAGCAGGATC;SOR=3.026;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=129312668;WS=129312650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr11	129755669	rs1783914	G	A	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=716;SC=CGAAGAATCTGTATTGATTAC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=129755677;WS=129755659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	129940806	rs112826009	A	G	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=18;PP=484;SC=GCGAAGCGGCAGGGCCGGGGG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=129940814;WS=129940796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	129998900	rs651935	T	C	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=2;PP=678;SC=AGGCTTCCTCTGGGTGCCACA;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=129998908;WS=129998890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr11	130060612	rs858704	A	G	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=23;PP=658;SC=GGGGGCGGGTAGGGCTGTGGG;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=130060620;WS=130060602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr11	130064223	rs610005	A	G	1501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=41;PP=1300;SC=CCCTCGGGCCACAGAGAAGGG;SOR=3.564;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=47;WE=130064231;WS=130064213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr11	130064647	rs597661	G	A	2862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=60;PP=2154;SC=GAGCTATGGGGCGTGTGAACG;SOR=1.796;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=25;TCR=60;TR=85;WE=130064655;WS=130064637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr11	130064705	rs597576	A	G	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=33;PP=1076;SC=CTCCCTGTGCAGATGTGTGTG;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=36;WE=130064713;WS=130064695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr11	130064747	rs58417767	ATGTGTGTG	A	568.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=1233;SC=ATATGTGTGCATGTGTGTGTG;SOR=2.303;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=9;WE=130064762;WS=130064737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	130066335	rs476106	C	T	1539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=20;PP=1187;SC=TGGAGATCAACGGGGAGAAGT;SOR=0.952;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=26;TCR=20;TR=46;WE=130066343;WS=130066325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr11	130066372	rs858713	G	A	2071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=27;PP=1652;SC=GGGGGCTGCCGGGCCCATGCT;SOR=0.966;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=35;TCR=27;TR=62;WE=130066380;WS=130066362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr11	130066452	rs11368852	G	GC	2025.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=23;PP=1779;SC=CTTGTGCCCCGCCCCCCCTCC;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=47;TCR=29;TR=60;WE=130066460;WS=130066442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr11	130067892	rs858715	C	T	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=28;PP=937;SC=CCACCCTGCCCGCGTCCCATG;SOR=1.900;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=40;WE=130067900;WS=130067882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	130067987	rs595073	A	C	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=8;PP=502;SC=CTCTGGCCCCACTCCCCACCC;SOR=1.022;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=11;TCR=8;TR=19;WE=130067995;WS=130067977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr11	130069790	rs613501	T	G	1352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=5;PP=1058;SC=TGTCCCCTTGTGGTTTGATGT;SOR=3.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=41;WE=130069798;WS=130069780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	130270855	rs59317921	T	C	1380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=13;PP=1135;ReadPosRankSum=-0.586;SC=AACTTGAAATTTCCAGTGTCC;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=42;WE=130270863;WS=130270845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr11	130271647	rs747249	A	G	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=3;PP=1089;SC=GCTGGCTTAGATGGGTGACTT;SOR=3.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=37;WE=130271655;WS=130271637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr11	130275372	rs77872571	C	T	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=306;SC=GCCAAGGGACCCAGTCACCAC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=130275380;WS=130275362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr11	130281181	rs2291346	A	C	540.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=427;ReadPosRankSum=0.989;SC=AGGAGACCCAATTTACTCCCC;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=17;WE=130281189;WS=130281171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr11	130284344	rs7106106	T	C	1642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=9;PP=1400;SC=GTGGTTTCCTTCTGGAGAACA;SOR=3.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=52;WE=130284352;WS=130284334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr11	130297957	rs7942034	T	C	1288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=22;PP=1049;SC=ACTCGGGCGCTAGGAAGCTGT;SOR=0.788;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=21;TCR=22;TR=43;WE=130297965;WS=130297947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr11	130332338	rs11604959	A	G	4265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.692;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=42;PP=2965;ReadPosRankSum=1.681;SC=ATTCTGGGCTAGCCAAACCTC;SOR=1.714;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=91;TCR=44;TR=132;WE=130332346;WS=130332328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,139:0.99:141
chr11	130339312	rs731446	T	C	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=18;PP=779;SC=GATCCTGCAATCTGGAGCCCT;SOR=0.941;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=15;TCR=18;TR=33;WE=130339320;WS=130339302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr11	130780225	rs681982	C	A	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=357;SC=CCATGTTTCCCAATGGAAGAT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=130780233;WS=130780215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	130780270	.	C	A	147	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=147;QD=36.3542425094;SC=TCACATCTTCCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=130780278;WS=130780260;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,5:0.71:7
chr11	132081873	rs3824870	G	A	1386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=0;PP=1175;SC=ACTAAGAAATGTTTCAGGAGG;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=43;WE=132081881;WS=132081863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr11	132177633	rs2305271	A	C	2595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=50;PP=1937;SC=GGGCATCACCAGGGAGCAGTC;SOR=1.338;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=32;TCR=50;TR=82;WE=132177641;WS=132177623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr11	132184394	rs730253	G	C	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=573;ReadPosRankSum=-0.373;SC=TTCTTCCTATGAGGACACATA;SOR=1.151;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=23;WE=132184402;WS=132184384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr11	132204951	rs61746413	G	A	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=900;ReadPosRankSum=0.013;SC=TCCAGGCGCCGTCAGCGAGGT;SOR=0.641;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=67;TCF=44;TCR=23;TR=44;WE=132204959;WS=132204941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,44:0.63:70
chr11	132306153	rs1940024	T	C	3842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.933;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=86;PP=2962;ReadPosRankSum=0.660;SC=AAGACATTGCTATCAATTCAT;SOR=0.366;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=195;TCF=65;TCR=130;TR=136;WE=132306161;WS=132306143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,141:0.69:203
chr11	132306403	rs2298479	G	A	243.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5082;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=191;ReadPosRankSum=1.139;SC=TTTTTTTCTCGTTGTAAAAAT;SOR=0.582;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=8;WE=132306411;WS=132306393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr11	132306682	rs145479085	AAC	A	70.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.740;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=131;ReadPosRankSum=0.721;SC=ATCTGTGGGAAACACACACAC;SOR=0.027;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=4;WE=132306691;WS=132306672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr11	133788869	rs10791338	A	G	2079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=22;PP=1821;SC=GACGGCAGGGAAGAAGGATGA;SOR=1.539;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=45;TCR=22;TR=67;WE=133788877;WS=133788859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr11	133788992	rs12800905	T	C	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=19;PP=775;SC=TCTGTCTCTCTGCAGCTTCCT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=37;WE=133789000;WS=133788982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr11	133792021	rs596430	T	C	5265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=118;NR=58;PP=2965;SC=GGTCTACCTATGCGCCCCCTG;SOR=1.583;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=118;TCR=58;TR=176;WE=133792029;WS=133792011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr11	133792644	rs34845616	G	A	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=303;SC=AGGGTGGGGAGCACTCATGAG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=133792652;WS=133792634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr11	133794599	rs329670	T	C	3535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=14;PP=2874;SC=AACCAGGCACTGCCTTAGTTT;SOR=3.716;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=91;TCR=14;TR=105;WE=133794607;WS=133794589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr11	133801262	rs329671	G	A	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=429;ReadPosRankSum=0.156;SC=CCCGGGGCTCGCTGGGCCCTC;SOR=0.148;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=18;WE=133801270;WS=133801252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr11	133805585	rs329637	C	T	2890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=32;PP=2388;SC=TGTACTTCCCCGAGTCCTCCG;SOR=1.485;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=60;TCR=32;TR=92;WE=133805593;WS=133805575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr11	133814191	rs595986	A	G	2285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=46;PP=1707;SC=CTTTGCACTCATACCAGCCCT;SOR=1.136;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=29;TCR=46;TR=75;WE=133814199;WS=133814181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr11	134010722	rs646998	A	G	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=146;ReadPosRankSum=0.201;SC=AGACCTGGGTATACACTCTTG;SOR=0.573;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=10;WE=134010730;WS=134010712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr11	134014673	rs3216140	C	CCT	370.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=405;ReadPosRankSum=0.135;SC=AACACCACCCCTTTTTCCCCA;SOR=0.336;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=10;WE=134014681;WS=134014663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr11	134016011	rs11223714	T	C	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.592;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=277;ReadPosRankSum=-0.066;SC=TTTAATATTATACCATCAGCT;SOR=0.262;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=16;WE=134016019;WS=134016001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr11	134018656	rs610382	T	C	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.437;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=37;PP=1064;ReadPosRankSum=-1.392;SC=CTTCTCCTCATAGTTACAAGA;SOR=0.563;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=126;TCF=39;TCR=87;TR=56;WE=134018664;WS=134018646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,59:0.43:136
chr11	134018849	.	T	TC	508.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.639;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.04;ReadPosRankSum=-0.073;SOR=0.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr11	134018850	.	A	C	504	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=59.28;NF=10;NR=4;PP=504;QD=38.4836580391;SC=CCTTCACAGTAACACACACAC;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=14;WE=134018858;WS=134018839;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr11	134031836	rs3214800	C	CAA	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=111;ReadPosRankSum=0.250;SC=TTCTGAAAGACAGGCCTCTCC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=4;WE=134031844;WS=134031826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr11	134038538	rs73731	C	T	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.420;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=30;PP=696;ReadPosRankSum=0.924;SC=CACATGGGCACGGGTGTAAGG;SOR=0.215;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=89;TCF=13;TCR=76;TR=37;WE=134038546;WS=134038528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,38:0.42:91
chr11	134047243	rs2276265	T	C	1397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.614;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=35;PP=1087;ReadPosRankSum=-1.310;SC=GATCGCACATTACAATGATGA;SOR=0.593;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=163;TCF=59;TCR=104;TR=57;WE=134047251;WS=134047233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,59:0.35:171
chr11	134054705	rs10569940	TACACACAC	T,TACACAC	1173.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.01;MQRankSum=0.000;QD=28.63;ReadPosRankSum=-0.824;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,26,14:0.63,0.34:41
chr11	134054715	rs201518163	C	T	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=1.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQRankSum=1.221;QD=12.26;ReadPosRankSum=0.246;SOR=0.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,27:0.39:69
chr11	134055478	rs10894783	C	A	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=201;ReadPosRankSum=0.507;SC=CAAAATGATTCAGATGGGAGC;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=10;WE=134055486;WS=134055468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr11	134062764	rs12292394	C	T	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.040;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=413;ReadPosRankSum=-1.302;SC=GACCACCCCCCGCAACCAGGC;SOR=0.113;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=55;TCF=6;TCR=49;TR=22;WE=134062772;WS=134062754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,22:0.39:56
chr11	134064540	rs1125399	T	C	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=18;PP=677;ReadPosRankSum=-0.925;SC=AAAAAAAAAATGTGCAGAGAA;SOR=0.633;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=157;TCF=100;TCR=57;TR=47;WE=134064548;WS=134064518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,51:0.31:162
chr11	134073019	rs2305379	A	T	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=95;ReadPosRankSum=-1.573;SC=AATATTTGAAAATGTATTGAT;SOR=0.627;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=9;WE=134073027;WS=134073009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr11	134073913	rs896409	C	T	2117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.975;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=45;PP=1561;ReadPosRankSum=-0.345;SC=AAAAAGGACCCAAGGTTTTAT;SOR=0.612;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=273;TCF=138;TCR=135;TR=89;WE=134073921;WS=134073903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:186,92:0.33:278
chr11	134074099	rs10791349	T	C	1438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.314;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=39;PP=1040;ReadPosRankSum=0.082;SC=GACCAACCAATATCCACCCGC;SOR=0.487;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=159;TCF=41;TCR=118;TR=54;WE=134074107;WS=134074089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,60:0.36:166
chr11	134093257	rs75634068	A	C	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.552;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=194;ReadPosRankSum=-0.517;SC=TGAAAGGGGAAGCAGAAATGC;SOR=0.083;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=12;WE=134093265;WS=134093247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr11	134105030	rs1259022	A	G	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=26;PP=782;SC=CCACTTTGAGAATCTTCACAG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=134105038;WS=134105020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr11	134126612	rs473041	T	C	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.139;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=36;PP=760;ReadPosRankSum=-0.280;SC=CTTTGTCTCCTGATAATGTAA;SOR=1.777;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=64;TCF=10;TCR=54;TR=41;WE=134126620;WS=134126602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,42:0.63:67
chr11	134128313	rs11223738	G	T	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.573;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=539;ReadPosRankSum=0.580;SC=TTACTCCACTGCCCTGCCCTT;SOR=1.238;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=100;TCF=70;TCR=30;TR=31;WE=134128321;WS=134128303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,30:0.31:98
chr11	134132559	rs561945	G	A	2610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.832;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=61;PP=2037;ReadPosRankSum=-0.384;SC=CAGAACGGGGGCGGGATCGCT;SOR=1.400;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=127;TCF=46;TCR=81;TR=91;WE=134132567;WS=134132549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,95:0.71:134
chr11	134147371	rs67473835	G	A	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.927;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=25;PP=589;ReadPosRankSum=0.219;SC=ACATCCCTGGGGAGGGAGGGG;SOR=1.832;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=73;TCF=16;TCR=57;TR=29;WE=134147379;WS=134147361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,30:0.40:75
chr11	134151975	rs472287	G	C	952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=1;PP=713;SC=CGTCCAGGCCGCTACATCTGC;SOR=4.479;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=134151983;WS=134151965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr11	134152030	rs10791352	G	A	2159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=24;PP=1620;SC=CGGGGCTACAGTCCCAGAGTC;SOR=1.426;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=46;TCR=24;TR=70;WE=134152038;WS=134152020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr11	134158745	rs3824995	A	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.453;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=155;ReadPosRankSum=-1.255;SC=AGTATGGCTCATTCAATAAGG;SOR=0.408;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=51;TCF=36;TCR=15;TR=13;WE=134158753;WS=134158735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,13:0.26:50
chr11	134158817	rs10894794	A	C	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=254;ReadPosRankSum=0.080;SC=CCATGTTTACATGCCTCCTTC;SOR=0.610;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=62;TCF=27;TCR=35;TR=16;WE=134158825;WS=134158807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,16:0.24:66
chr11	134177205	rs12272129	G	T	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.278;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=361;ReadPosRankSum=-0.494;SC=ATCAGCCGTAGATATTCATGC;SOR=0.102;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=20;WE=134177213;WS=134177195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chr11	134177275	rs2510356	C	T	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=416;SC=ATAGAAATTACATGGTTCCCA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=134177283;WS=134177265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr11	134180695	rs526507	G	C	1640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=43;PP=1347;SC=GAACCCTGGGGTTAAAATCTG;SOR=4.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=46;WE=134180703;WS=134180685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr11	134181101	rs1144218	T	C	2550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.352;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=77;PP=2147;ReadPosRankSum=0.254;SC=GGAGTGGCCATTGGAGGGATG;SOR=1.442;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=119;TCF=14;TCR=105;TR=85;WE=134181109;WS=134181091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,85:0.71:120
chr11	134182135	rs751719	T	C	1188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=4;PP=950;SC=ATTTCCCATTTGAAGAACCCT;SOR=3.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=33;WE=134182143;WS=134182125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr11	134182375	rs2509062	G	A	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=13;PP=454;SC=CGCTCATGACGTGGCACAGGT;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=20;WE=134182383;WS=134182365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr11	134182620	rs188986794	C	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.817;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=115;ReadPosRankSum=0.986;SC=TCCCTGCCTTCATACTGACCT;SOR=1.954;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=6;WE=134182628;WS=134182610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr11	134182856	rs1144216	A	G	1560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=40;PP=1278;SC=TGAGACAGTCAGCCTCCCTTC;SOR=3.126;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=47;WE=134182864;WS=134182846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr11	134183450	rs1144215	T	C	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.461;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=396;ReadPosRankSum=-2.761;SC=CGGGAGAGGGTGGGGAAACCA;SOR=0.111;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=25;WE=134183458;WS=134183440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr11	134184141	rs1144214	C	T	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.298;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr11	134188542	rs481252	T	C	1590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.251;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=7;PP=1195;ReadPosRankSum=1.391;SC=ATTATGGATTTGTGTTCATCA;SOR=1.053;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=85;TCF=73;TCR=12;TR=55;WE=134188550;WS=134188532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,57:0.64:89
chr11	134188851	rs5795879	A	AT	179.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.38;MQRankSum=-0.000;QD=11.23;ReadPosRankSum=0.517;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr11	134201864	rs3098651	T	C	389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=265;SC=AGGCGACCAGTGCGCGGCTCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=134201872;WS=134201854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr11	134217463	rs73030608	C	T	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=124;ReadPosRankSum=0.249;SC=GTCCGAGACTCGTAACTGAGG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=8;WE=134217471;WS=134217453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr11	134225808	.	A	G	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.455;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.406;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=2;PP=744;ReadPosRankSum=0.019;SC=CTTCTTCCCCATGAGGGAGCG;SOR=2.613;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=54;TCF=49;TCR=5;TR=38;WE=134225816;WS=134225798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,41:0.71:58
chr12	176139	rs17852242	A	T	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=4.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.57;MQRankSum=1.865;QD=2.08;ReadPosRankSum=1.015;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,12:0.18:68
chr12	235022	rs12822449	C	T	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=5;PP=510;SC=GGCGCTGTGCCCCCACGCCCC;SOR=1.721;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=235030;WS=235012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	235128	rs11608642	T	C	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=415;SC=GGGGCCCTGCTTTGGGGGCTG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=235136;WS=235118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	235143	rs11610983	G	C	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=14;PP=359;SC=GGGCTGTCGAGGGTACCAGGG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=235151;WS=235133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	247900	rs7313003	G	A	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.378;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=642;ReadPosRankSum=-0.235;SC=GGGCGCCGGAGAGCGCGGGCC;SOR=0.921;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=121;TCF=68;TCR=53;TR=38;WE=247908;WS=247890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,42:0.33:129
chr12	247923	rs75677829	A	G	2665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=35;PP=2157;ReadPosRankSum=-0.473;SC=GGGCCCGGGGATGACGCCGCG;SOR=0.565;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=134;TCF=86;TCR=48;TR=91;WE=247931;WS=247913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,93:0.66:140
chr12	248155	rs55923022	C	T	985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=5.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.091;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=33;PP=800;ReadPosRankSum=-0.579;SC=AAGCCCCCGCCGTGGGCCGGG;SOR=1.298;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=66;TCF=9;TCR=57;TR=37;WE=248163;WS=248145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,37:0.56:66
chr12	248202	rs56204927	C	G	1809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=26;PP=1470;SC=GCAGAGGCTGCGGCTAGTGGG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=26;TCR=27;TR=52;WE=248210;WS=248192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	250130	rs12321262	T	C	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=0;PP=382;SC=ATCCTCTGCGTGAGGACATTC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=250138;WS=250120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	266924	rs74769399	G	A	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.499;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=35;PP=726;ReadPosRankSum=-1.700;SC=TCTGTGCACCGTGCATTCTGT;SOR=0.174;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=91;TCF=3;TCR=88;TR=37;WE=266932;WS=266914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,37:0.40:92
chr12	271022	rs12579600	G	A	96.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=3;PP=77;SC=GGTCTCTTCTGTCTGGCTCCA;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=271030;WS=271015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	271373	rs4980805	A	G	732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=19;PP=520;SC=ACTGTGTGCCAGACACTGCAT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=271394;WS=271363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	272600	rs74408224	G	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.846;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=277;ReadPosRankSum=0.574;SC=AAATGGGCGCGTGGGTGGGGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=15;WE=272608;WS=272590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr12	274572	rs11061700	G	C	2412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=28;PP=1895;SC=TGTTCATCAGGGCATGCCTGT;SOR=1.281;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=49;TCR=28;TR=77;WE=274580;WS=274562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr12	275161	rs114336251	C	T	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=63;ReadPosRankSum=-0.567;SC=GGCCCCACTTCGGACCCTCCC;SOR=0.223;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=5;WE=275169;WS=275151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr12	284058	rs216230	T	C	2623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=50;PP=1995;SC=CCCTGGGCGGTCCCGGCTCTC;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=30;TCR=50;TR=80;WE=284066;WS=284048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr12	301843	rs646569	A	G	1972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=50;PP=1553;SC=AGCCATGGGTAAGATAGGGGG;SOR=4.066;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=55;WE=301851;WS=301833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	305254	rs533572	T	C	708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=2;PP=583;SC=CTCCCTCCCCTGGAGCCTGGC;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=305262;WS=305244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	309753	rs7967868	C	T	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=375;ReadPosRankSum=1.916;SC=CAGAGGGTCCCCCTCAAGTGT;SOR=0.779;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=54;TCR=1;TR=19;WE=309761;WS=309743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,18:0.34:53
chr12	310113	rs4980863	A	G	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=19;PP=580;SC=CCCGTAGACCAAACTACTACC;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=310121;WS=310103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	310901	rs216248	T	C	4406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=56;PP=2965;SC=TTCCTCTTCATATGTGGCAAA;SOR=1.210;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=85;TCR=56;TR=141;WE=310909;WS=310891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr12	311816	rs216249	C	T	333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=275;SC=GGTTCTGCTACACTTATACTC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=311824;WS=311806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	311949	rs216250	A	G	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=789;ReadPosRankSum=1.867;SC=GCAGCTCAGAAGTGAAGGAGC;SOR=0.321;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=30;TCF=17;TCR=13;TR=29;WE=311957;WS=311939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr12	312200	rs216251	C	T	274.89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=250;ReadPosRankSum=-0.692;SC=CCATTCATAGCATATTTTTCT;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=12;WE=312208;WS=312190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr12	347068	rs2289957	T	A	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=6;PP=898;SC=CGGCCCACAGTGGGTGGGGAA;SOR=2.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=30;WE=347076;WS=347058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	351711	rs525797	T	G	1050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=0;PP=867;SC=GGGGATATAGTGACAAGCCCA;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=351719;WS=351701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	431586	rs74894801	T	A	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.867;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=11;PP=867;ReadPosRankSum=-0.550;SC=GGTTTACCTGTGTTTCTGCTT;SOR=0.513;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=112;TCF=90;TCR=22;TR=45;WE=431594;WS=431576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,48:0.40:119
chr12	464254	rs3759371	T	C	5241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=144;NR=15;PP=2965;SC=CCATGATATATCAGGATAGAA;SOR=4.447;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=161;TCF=145;TCR=16;TR=159;WE=464262;WS=464244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr12	495217	rs10774152	G	T	1397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=42;PP=1298;SC=TTAAAGGGGGGTTTTGCCACA;SOR=6.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=43;WE=495225;WS=495207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	496392	rs201508413	CA	C	50.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.15;ReadPosRankSum=-0.195;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr12	496439	rs7965303	A	T	1780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=36;PP=1511;SC=AATCTGCCAAAACTAAAATTA;SOR=1.107;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=61;TCF=25;TCR=36;TR=60;WE=496447;WS=496429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	496533	rs10848877	C	T	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=22;PP=628;SC=AGTAAAAAAACTTTTTTTAAT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=496541;WS=496523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	498281	rs369328611	GGT	G	120.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=123.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.97;ReadPosRankSum=-1.169;SOR=6.089;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,20:0.16:125
chr12	520947	rs4980895	A	C	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.783;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=275;ReadPosRankSum=-0.703;SC=TGTTGCCGTCAGTGGTCCCAC;SOR=0.233;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=60;TCF=53;TCR=7;TR=18;WE=520955;WS=520937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,18:0.30:60
chr12	537828	rs11062934	G	T	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.247;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=436;ReadPosRankSum=-2.228;SC=TTAATTTGGGGTTACAATTGT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=8;WE=537849;WS=537818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr12	537841	rs35713455	T	TA	423.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=459;ReadPosRankSum=-1.995;SC=ACAATTGTTTTAAAAAAAAAA;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=12;WE=537849;WS=537818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr12	540994	rs7310504	A	G	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=520;ReadPosRankSum=-2.210;SC=AGAAAAGCTGAGTAAAATCTT;SOR=0.404;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=23;WE=541002;WS=540984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr12	550911	rs34054482	CT	C	796.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=10.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=-0.688;QD=10.21;ReadPosRankSum=2.174;SOR=0.761;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,58:0.74:78
chr12	619618	rs11830324	T	A	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=204;ReadPosRankSum=-0.785;SC=CATGGGGGGGTTGGACGCTGG;SOR=0.368;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=11;WE=619626;WS=619608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr12	619660	.	AGGGAAACG	AGGGCTGGGCTGGGAAACG,A	534.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.096;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.062;NF=9;NR=4;PP=805;ReadPosRankSum=0.789;SC=CTGGGCTGGGAGGGAAACGGG;SOR=2.049;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=13;WE=619675;WS=619650;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.72:18
chr12	619664	.	A	AGGG	649.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=9.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQRankSum=-1.275;QD=32.49;ReadPosRankSum=1.312;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr12	619665	.	A	AGTTGGCTGGGCTGGG	649.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.146;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=13.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=-1.368;QD=30.94;ReadPosRankSum=1.488;SOR=4.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr12	619667	.	C	G	940.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=4.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQRankSum=-1.399;QD=40.90;ReadPosRankSum=1.202;SOR=1.965;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr12	619668	.	G	GGAGTTGGCTGGGCTGGGA	889.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=4.649;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQRankSum=-1.399;QD=38.68;ReadPosRankSum=1.105;SOR=1.965;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr12	619808	rs7306988	G	A	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=18;PP=707;ReadPosRankSum=0.092;SC=GTATGAGAGGGAGGGGCGGGG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=48;TCF=22;TCR=26;TR=33;WE=619816;WS=619798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,36:0.68:53
chr12	645557	rs34868457	C	T	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=78;ReadPosRankSum=-1.230;SC=TACTAGGGACCTTCTACCGTA;SOR=0.117;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=7;WE=645565;WS=645547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr12	652470	rs34907895	C	T	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=338;ReadPosRankSum=-0.438;SC=CCCAGCCTCCCGGAGCTGAGG;SOR=0.646;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=18;WE=652478;WS=652460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr12	653957	rs1008586	A	G	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=143;ReadPosRankSum=1.020;SC=CCCTCCTGTCATAGTCCCCTC;SOR=0.191;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=11;WE=653965;WS=653947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr12	653984	rs1008587	T	C	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.938;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=248;ReadPosRankSum=1.221;SC=TTCCCGCCAATCCTGGCGGGA;SOR=0.047;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=48;TCF=44;TCR=4;TR=16;WE=653992;WS=653974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr12	661458	.	TACACACACACACAC	T	738.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.083;NF=10;NR=4;PP=1062;ReadPosRankSum=2.402;SC=TCCTGAGTACTACACACACAC;SOR=1.292;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=47;TCF=27;TCR=20;TR=14;WE=661481;WS=661448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr12	662448	rs758790	T	C	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.494;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=591;ReadPosRankSum=1.721;SC=CCAGGATGCTTGAGGGAAGAC;SOR=0.536;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=141;TCF=82;TCR=59;TR=41;WE=662456;WS=662438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,41:0.28:144
chr12	666721	rs34740806	G	A	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=147;ReadPosRankSum=0.057;SC=GCGCTCATCCGCTCATCTTTG;SOR=0.818;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=11;WE=666729;WS=666711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr12	666943	rs7300933	A	G	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=11;PP=364;SC=GGGGACCACCAGCCAGGGGGT;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=666951;WS=666933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	675441	rs4980836	T	A	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.978;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=27;PP=658;ReadPosRankSum=-0.257;SC=CTCTTTCCAATCCAGATGGGA;SOR=1.863;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=30;WE=675449;WS=675431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr12	719663	rs2535404	C	T	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.084;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=30;PP=801;ReadPosRankSum=0.725;SC=GCCTTCTGCCCCCGTGGGTCC;SOR=2.833;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=32;WE=719671;WS=719653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,33:0.79:42
chr12	719681	rs2535405	G	A	1211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=33;PP=1045;SC=TCCCCACAGCGGCCAGCCCAG;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=34;WE=719689;WS=719671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	752327	rs6489690	C	A	1737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=18;PP=1389;ReadPosRankSum=0.427;SC=GTCCCCCTGCCGCTGCCCAAG;SOR=0.618;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=36;TCR=18;TR=53;WE=752335;WS=752317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr12	752998	rs9669247	G	A,T	2810.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=10,9;NR=22,45;PP=616,1315;SC=CCAGCTCATCGCTCAGGTCTT;SOR=2.461;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=86;TCF=19;TCR=67;TR=32,54;WE=753006;WS=752988;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.38,0.62:92
chr12	772673	rs4980959	C	A	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=491;ReadPosRankSum=0.956;SC=ATTCATCCCTCTGATGTGGGA;SOR=0.743;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=20;WE=772681;WS=772663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr12	862989	rs3168640	T	C	5606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=101;PP=2965;SC=GCGTCATCTGTGACTCCAATG;SOR=0.861;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=186;TCF=85;TCR=101;TR=186;WE=862997;WS=862979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr12	863517	rs3858703	G	A	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.159;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=611;ReadPosRankSum=0.004;SC=TTTATTTGACGGTCCTTTGGA;SOR=0.412;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=106;TCF=20;TCR=86;TR=33;WE=863525;WS=863507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,34:0.31:110
chr12	936468	rs2158502	C	G	3098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=54;PP=2571;SC=CTGGCTTTCTCACATTCCTTT;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=37;TCR=54;TR=91;WE=936476;WS=936458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr12	939302	rs10774466	A	G	3587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=96;PP=2965;SC=AAAATGCTGCACAGATCTACC;SOR=3.513;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=14;TCR=96;TR=110;WE=939310;WS=939292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr12	966208	rs2240284	G	A	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=466;SC=TCCTGCAGGCGAGTCAGAAAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=966216;WS=966198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	970093	rs11286613	CT	C	315.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=3;PP=219;SC=TTTACAATGCCTTTTTTTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=14;WE=970101;WS=970083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	974137	rs11441896	C	CA	416.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=293;ReadPosRankSum=0.639;SC=TAGCTCTCCTCAAAAAAAAAA;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=15;WE=974145;WS=974127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr12	974355	rs11441897	T	TC	8358.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=103;PP=2965;SC=CTCCCAGTGCTCTTCCACCCC;SOR=0.805;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=187;TCF=82;TCR=105;TR=180;WE=974363;WS=974345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr12	974404	rs7300829	T	C	3568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.394;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.138;NF=50;NR=81;PP=2904;ReadPosRankSum=-1.412;SC=CCTTCCCTCCTCCGGACTGCC;SOR=0.867;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=217;TCF=87;TCR=130;TR=131;WE=974412;WS=974394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,132:0.60:219
chr12	987482	rs1012729	G	A	5210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=103;PP=2965;SC=CAGTGAGTCAGCCTCAAGCTC;SOR=1.419;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=57;TCR=103;TR=160;WE=987490;WS=987472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr12	987533	rs5795952	C	CT	966.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=1.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=0.015;QD=13.62;ReadPosRankSum=-1.864;SOR=0.410;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,54:0.76:71
chr12	988894	rs9804992	G	A	2032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=26;PP=1690;ReadPosRankSum=-0.961;SC=CTGTCTCTCAGATTCCCATAT;SOR=0.524;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=115;TCF=76;TCR=39;TR=73;WE=988902;WS=988884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,73:0.63:115
chr12	990912	rs956868	A	C	5067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=102;NR=47;PP=2965;SC=AGTAGCACAGACCCAAGCTAC;SOR=1.752;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=102;TCR=47;TR=149;WE=990920;WS=990902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr12	992229	rs34032084	C	T	2596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.880;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=60;PP=2029;ReadPosRankSum=0.441;SC=AATTATGGTACGTCTGCATTT;SOR=1.019;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=154;TCF=62;TCR=92;TR=96;WE=992237;WS=992219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,100:0.62:160
chr12	993930	rs7300444	C	T	1799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FS=3.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.54;ReadPosRankSum=-2.409;SOR=0.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:235,90:0.28:325
chr12	994487	rs7955371	G	C	5156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=81;NR=69;PP=2965;SC=TCACAGCTGTGCATTCAGCTT;SOR=0.903;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=81;TCR=69;TR=150;WE=994495;WS=994477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr12	995291	rs11450919	G	GT	1054.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=32;PP=783;SC=AATATGATCAGTTTTTTTTCT;SOR=5.031;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=32;WE=995299;WS=995281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	996357	rs56375346	C	T	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=7;PP=781;ReadPosRankSum=-0.640;SC=TAGCGTCTCACGGACTTGATT;SOR=0.739;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=35;WE=996365;WS=996347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,39:0.66:59
chr12	998365	rs12828016	G	T	3875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.915;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=102;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.289;SC=GTCCAGAGATGATCACAGTGA;SOR=0.397;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=213;TCF=56;TCR=157;TR=144;WE=998373;WS=998355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,146:0.68:216
chr12	999762	rs2255390	A	G	2477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.428;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=72;PP=1969;ReadPosRankSum=-0.952;SC=TTTCAAAGACACATTTCCACG;SOR=0.573;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=162;TCF=43;TCR=119;TR=99;WE=999770;WS=999752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,97:0.60:161
chr12	1005162	rs35956200	T	C	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=1;PP=1034;ReadPosRankSum=-0.440;SC=ATTCTTTTTTTCCTTTTTTAA;SOR=1.421;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=47;TCR=1;TR=38;WE=1005170;WS=1005152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,39:0.80:49
chr12	1017197	rs4766334	C	T	1706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=41;PP=1353;SC=ACATGAATTACGAGGTAAGTC;SOR=2.480;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=53;WE=1017205;WS=1017187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	1022679	rs6413436	A	G	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=230;ReadPosRankSum=-1.998;SC=CTGACAGCTAATGATTTCTGG;SOR=1.022;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=14;WE=1022687;WS=1022669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr12	1035947	rs6489763	C	A	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=16;PP=789;SC=TGTGTAACTACGTTAACTATG;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=35;WE=1035955;WS=1035937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	1036562	rs11571441	AG	A	529.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.349;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=557;ReadPosRankSum=-0.175;SC=CACGGGCAGAAGGCTGGGTGA;SOR=2.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=16;WE=1036570;WS=1036552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr12	1038766	rs11571425	C	G	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.353;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=3;PP=889;ReadPosRankSum=-1.202;SC=ATGGTGAAAACTTTTAGGTGT;SOR=0.142;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=57;TCF=54;TCR=3;TR=37;WE=1038774;WS=1038756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,38:0.63:60
chr12	1038854	rs11571424	C	T	2218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.415;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=30;PP=1690;ReadPosRankSum=-1.741;SC=AATTCCACCACTCTAGGGAAC;SOR=0.896;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=137;TCF=87;TCR=50;TR=86;WE=1038862;WS=1038844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,88:0.62:142
chr12	1038978	rs35278212	C	CT	2773.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.626;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.510;NF=35;NR=39;PP=2788;ReadPosRankSum=1.934;SC=CTACTCCATCCCCTCACCTTC;SOR=0.768;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=61;TCR=68;TR=74;WE=1038986;WS=1038968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,81:0.57:141
chr12	1040219	rs11571409	G	A	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=147;ReadPosRankSum=0.694;SC=AGGCCCCTTCGGATGAGAATG;SOR=0.054;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=9;WE=1040227;WS=1040209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr12	1040373	rs7303748	T	C	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.942;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=27;PP=1075;ReadPosRankSum=-0.442;SC=TCCAGGCACATGAATTCTCCT;SOR=0.452;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=81;TCF=43;TCR=38;TR=54;WE=1040381;WS=1040363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,56:0.67:83
chr12	1042261	rs56170870	GA	G	63.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=1.726;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=1.970;QD=1.72;ReadPosRankSum=-0.166;SOR=0.320;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,8:0.22:37
chr12	1137048	rs144267759	C	A	1506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=21;PP=1097;ReadPosRankSum=-1.047;SC=TTTCTGCTCACACCTTTCCTG;SOR=0.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=59;TCR=36;TR=55;WE=1137056;WS=1137038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,59:0.59:100
chr12	1221221	rs74679668	T	TAG	837.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=776;SC=CCTGTGAACTTAGAAACTACC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=1221229;WS=1221211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	1589821	rs7315267	T	C	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=1;PP=681;SC=TTAATTTGTATTCTTTCGGAA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=1589829;WS=1589811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	1589868	rs111377772	T	TGAA	1942.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=5;PP=1912;SC=GGGCCTGCCTTGAGGAGGTGA;SOR=3.500;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=33;WE=1589876;WS=1589858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	1589914	rs7315390	T	C	2904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=13;PP=2368;SC=GTGTGGGTAGTGGGCAGGGGG;SOR=3.309;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=71;TCR=13;TR=84;WE=1589922;WS=1589904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr12	1590013	rs11613546	C	T	6907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=100;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.749;SC=CCACAGAATCCGTTGCATCCC;SOR=0.242;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=209;TCF=109;TCR=100;TR=208;WE=1590021;WS=1590003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,221:1.00:222
chr12	1590069	rs11609462	G	A	5407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=117;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.881;SC=CTCATGGTAAGGAAATGCAGA;SOR=0.936;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=45;TCR=118;TR=161;WE=1590077;WS=1590059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,169:0.99:170
chr12	1675847	rs73030956	G	A	1685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=10;PP=1299;ReadPosRankSum=-0.035;SC=CCAGAGTGCCGGAGGCGCAGA;SOR=0.678;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=66;TCR=14;TR=58;WE=1675855;WS=1675837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,62:0.71:87
chr12	1703322	.	A	AGCC	461.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=2;NR=7;PP=448;SC=GCTTCTCCCCAGCCGCCGCCG;SOR=1.445;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=9;WE=1703330;WS=1703312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	1748728	rs58317077	C	T	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=391;ReadPosRankSum=-1.229;SC=GGAAGCGAAGCCCCCTGCCCC;SOR=0.487;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=19;WE=1748736;WS=1748718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr12	1748766	rs6489313	G	A	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.216;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=436;ReadPosRankSum=1.487;SC=CGTGGCGTGCGGGTCCGTCGG;SOR=1.422;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=21;WE=1748774;WS=1748756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr12	1748834	rs2270036	T	C	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=730;ReadPosRankSum=0.134;SC=CTTACCGCCCTGGCCTCATTC;SOR=0.622;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=37;TCR=29;TR=36;WE=1748842;WS=1748824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr12	1889823	rs767870	G	A	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=18;PP=654;SC=TGTAAAGTCCGTATTTTGGCC;SOR=1.893;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=1889831;WS=1889813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	1889920	rs10848575	TT	AA	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.46;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	1902766	rs2058111	T	G	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.552;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=16;PP=614;ReadPosRankSum=0.022;SC=TGCTGACTTTTTGGGATGGCT;SOR=0.881;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=123;TCF=70;TCR=53;TR=40;WE=1902774;WS=1902756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,40:0.33:123
chr12	1902887	rs368886623	T	A	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.259;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=38;PP=1007;ReadPosRankSum=0.899;SC=GCGGCGAGGCTGAGGTGTCCG;SOR=1.018;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=71;TCF=12;TCR=59;TR=45;WE=1902895;WS=1902877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,45:0.63:71
chr12	1904726	rs3078853	G	GAC	820.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=13;PP=737;SC=CCCTGTGGAGGACACGGGCGG;SOR=2.531;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=15;WE=1904734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	1905091	rs3815325	G	A	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=3.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=281;ReadPosRankSum=-3.059;SC=GGGCAGCTAAGGGAACGGGCC;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=13;WE=1905099;WS=1905081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr12	1919543	rs2286377	C	T	2079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.252;NF=5;NR=60;PP=1946;ReadPosRankSum=1.341;SC=ATGCCAGGGCCCTCACCCACC;SOR=3.226;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=5;TCR=61;TR=65;WE=1919551;WS=1919533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr12	1919635	rs147251076	AGCT	A	451.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.267;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=60.25;MQRankSum=1.489;NF=6;NR=6;PP=413;ReadPosRankSum=0.039;SC=GGGAGAGGGAAGCTGGCCTGC;SOR=0.929;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=19;TCR=21;TR=12;WE=1919645;WS=1919625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr12	1937511	rs10437823	T	C	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=25;PP=718;SC=CTTCCTGGGGTACCCGAGGCT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=1937519;WS=1937501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	1950011	rs58188909	A	AC	1048.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.878;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=1147;ReadPosRankSum=-0.487;SC=CAACCCAGTCATGGGGAAGAG;SOR=0.462;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=71;TCF=25;TCR=46;TR=30;WE=1950019;WS=1950001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,33:0.40:82
chr12	1955664	rs7137553	G	T	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=4.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.53;ReadPosRankSum=0.858;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr12	1955668	rs7138458	C	A	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=3.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.15;ReadPosRankSum=-0.760;SOR=0.100;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr12	1955890	rs7137876	T	C	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.847;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=38;PP=925;ReadPosRankSum=1.084;SC=GGTCACCACATGGCTGTGGCA;SOR=0.951;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=152;TCF=68;TCR=84;TR=64;WE=1955898;WS=1955880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,66:0.41:160
chr12	1967947	rs2286369	C	G	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.144;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=254;ReadPosRankSum=2.822;SC=CCTCATGCCCCCTTCTTTACC;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=13;WE=1967955;WS=1967937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr12	1969435	rs2370057	G	C	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.723;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=311;ReadPosRankSum=-1.051;SC=CCCCCACCTCGCCCCCAGGGC;SOR=0.299;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=58;TCF=7;TCR=51;TR=20;WE=1969443;WS=1969425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,19:0.33:58
chr12	1987442	rs34323075	TA	T	1697.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=13;PP=1621;ReadPosRankSum=-0.418;SC=CCAAATCCCATACAGTAAGGA;SOR=0.569;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=60;TCF=42;TCR=18;TR=41;WE=1987450;WS=1987432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,48:0.71:68
chr12	1993337	rs2429184	T	C	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=0;PP=917;SC=TGCTCAGCACTTCCAGGGCTG;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=32;WE=1993345;WS=1993327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	1995403	rs10735005	T	C	2974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=60;PP=2248;SC=ATGATATTAATGAAGTCATTC;SOR=1.257;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=37;TCR=60;TR=97;WE=1995411;WS=1995393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr12	2016550	rs112521420	A	ATTGTC	1214.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=1313;SC=CAGTGCCCCTATTATTTCCAG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=22;WE=2016558;WS=2016540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	2016811	rs146752695	CCTGGTGGGCGTGT	C	1130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.657;NF=2;NR=19;PP=2933;ReadPosRankSum=2.142;SC=GGTGAGGGTGCCTGGTGGGCG;SOR=1.075;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=21;WE=2016831;WS=2016801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,29:0.67:43
chr12	2019322	rs8181786	G	A	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=364;SC=ACAGACAAAAGGCACACACAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=2019330;WS=2019312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	2022411	rs1558142	T	C	1730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=54;PP=1299;SC=TTCCGGCACATGGAGCCTGGT;SOR=5.387;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=2;TCR=54;TR=56;WE=2022419;WS=2022401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	2024316	rs758157	A	G	4507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=73;PP=2965;SC=ATGCATATGCATACACACACG;SOR=0.770;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=82;TCR=73;TR=155;WE=2024324;WS=2024306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr12	2039209	.	GAGGAGGAAGAGGGGGAGA	G	616.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.71;MQRankSum=3.918;QD=12.33;ReadPosRankSum=1.476;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,19:0.38:50
chr12	2058245	rs2240612	T	C	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.117;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=352;ReadPosRankSum=0.090;SC=ATGACGTGCTTGCTTACCTGA;SOR=0.145;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=20;WE=2058253;WS=2058235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr12	2059337	rs112215626	T	C	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=171;ReadPosRankSum=-1.501;SC=GAAGTTGCTGTAATTTTATAA;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=8;WE=2059345;WS=2059327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr12	2059473	rs112888038	A	G	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.575;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=477;ReadPosRankSum=-0.530;SC=AGGTGGAGTCAAGCATTCTGA;SOR=0.237;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=74;TCF=56;TCR=18;TR=31;WE=2059481;WS=2059463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,33:0.42:78
chr12	2059597	rs113447912	G	C	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=388;ReadPosRankSum=0.032;SC=TATATTCATCGCATGCTTCTA;SOR=0.794;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=77;TCF=24;TCR=53;TR=21;WE=2059605;WS=2059587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,25:0.30:83
chr12	2061614	rs113839196	G	A	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.798;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=302;ReadPosRankSum=-1.123;SC=TCTGTGTTGGGTGTCTTGTTG;SOR=1.317;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=54;TCF=47;TCR=7;TR=15;WE=2061622;WS=2061604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,17:0.29:58
chr12	2061982	rs1044950	G	A	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.365;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=291;ReadPosRankSum=0.689;SC=GCTGGCAGGTGCTGGTGTACT;SOR=1.251;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=60;TCF=29;TCR=31;TR=17;WE=2061990;WS=2061972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,19:0.28:67
chr12	2062075	rs715146	C	T	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=3.556;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.12;ReadPosRankSum=0.328;SOR=1.149;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,18:0.19:93
chr12	2062135	rs113147414	G	A	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.871;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=357;ReadPosRankSum=0.897;SC=AAATTCTCCCGCAGAATGGGT;SOR=0.481;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=96;TCF=44;TCR=52;TR=27;WE=2062143;WS=2062125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,26:0.26:99
chr12	2064575	rs11062033	A	G	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=5.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.73;ReadPosRankSum=0.004;SOR=0.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,27:0.23:115
chr12	2064602	rs34730825	T	C	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=4.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.68;ReadPosRankSum=-1.059;SOR=0.357;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,36:0.28:130
chr12	2064616	rs34175323	A	G	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=1488;ReadPosRankSum=-1.770;SC=GCTGAGGTATACGCTGTTGCT;SOR=0.620;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=117;TCF=68;TCR=49;TR=36;WE=2064624;WS=2064592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,39:0.31:125
chr12	2064634	rs35252166	A	G	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.620;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=491;ReadPosRankSum=1.450;SC=GCTGGTTTTCACTGGGTTTCA;SOR=1.082;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=121;TCF=63;TCR=58;TR=36;WE=2064642;WS=2064624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,39:0.30:132
chr12	2064747	rs113460897	C	A	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=290;ReadPosRankSum=-1.092;SC=AAAGAAAATCCCCTCATTTTT;SOR=0.668;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=78;TCF=9;TCR=69;TR=20;WE=2064755;WS=2064737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,20:0.26:78
chr12	2064820	rs112571799	C	T	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=24;ReadPosRankSum=0.983;SC=AATTGGTAGACGGCTGTGTTT;SOR=0.074;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=4;WE=2064828;WS=2064810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,4:0.19:21
chr12	2074543	rs112012351	A	G	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=241;ReadPosRankSum=0.170;SC=TAACCCACTTAAAGGCAAACA;SOR=0.776;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=11;WE=2074551;WS=2074535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr12	2077897	rs2470425	G	C	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.470;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=243;ReadPosRankSum=0.117;SC=AAGTTAGGGAGAGGCCACTGG;SOR=1.179;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=13;WE=2077905;WS=2077887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr12	2077931	rs112299955	C	T	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.107;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=172;ReadPosRankSum=-1.253;SC=TAATAATAAACTTCTGGCTTC;SOR=3.076;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=9;WE=2077939;WS=2077921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr12	2080373	rs112721107	A	G	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.608;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=287;ReadPosRankSum=-0.345;SC=TGGAGGTAAGAAACCCTAAAG;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=5;TCR=51;TR=16;WE=2080381;WS=2080363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,15:0.27:55
chr12	2100509	rs113498916	T	G	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=327;ReadPosRankSum=-0.884;SC=AAACATAAAATAAAATATGAA;SOR=0.266;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=16;WE=2100517;WS=2100499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr12	2102271	rs112637373	T	G	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.308;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=567;ReadPosRankSum=-0.727;SC=TATTCCATCATTAGGGCATGC;SOR=0.090;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=100;TCF=81;TCR=19;TR=34;WE=2102279;WS=2102261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,35:0.34:103
chr12	2102403	rs140441717	C	A	1066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.062;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=26;PP=839;ReadPosRankSum=-1.583;SC=AGAAGTAAAACAACCCACTGT;SOR=0.843;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=159;TCF=80;TCR=79;TR=48;WE=2102411;WS=2102393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,49:0.30:162
chr12	2224228	rs2299661	C	G	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=0;PP=575;SC=GGCCCTCTTCCCTCAGCATCT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=2224236;WS=2224222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	2613521	rs1008832	A	G	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=292;ReadPosRankSum=-0.183;SC=GTCCCCTCCCAATCTGCTCAC;SOR=0.934;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=57;TCR=1;TR=21;WE=2613529;WS=2613511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr12	2659848	rs10848675	T	C	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=26;PP=858;SC=CATTTCTGAATTGCTCCACCT;SOR=2.517;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=2659856;WS=2659838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	2676683	rs2370602	C	T	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=21;NR=5;PP=764;SC=CTGCCTCCCTCTCTGCCTCCT;SOR=2.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=2676691;WS=2676677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	2690702	rs11832738	G	A	2784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=13;PP=2230;ReadPosRankSum=-0.666;SC=AATGAGGCACGATGGGGAGGA;SOR=2.004;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=75;TCR=13;TR=87;WE=2690710;WS=2690692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,89:0.99:90
chr12	2692186	rs3751254	T	G	128.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=3;PP=98;SC=GGCACGCCCCTCAGGTCCGGG;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=2692194;WS=2692176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	2706720	rs215983	G	C	4757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=109;PP=2965;SC=TCTGCTCTGTGTGGCTGGATC;SOR=2.633;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=30;TCR=109;TR=139;WE=2706728;WS=2706710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr12	2743722	rs57723819	C	CT	319.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.14;ReadPosRankSum=-0.558;SOR=0.379;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr12	2750893	rs2239124	C	T	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.254;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=203;ReadPosRankSum=0.981;SC=AGGCGATGCTCAACCTGCAGG;SOR=1.112;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=42;TCF=19;TCR=23;TR=15;WE=2750901;WS=2750883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr12	2757756	rs2239127	T	C	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.89;ReadPosRankSum=0.691;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr12	2757769	rs2239128	T	C	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.91;ReadPosRankSum=2.238;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr12	2757782	rs2239129	C	T	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.21;ReadPosRankSum=0.544;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr12	2760708	rs216045	G	A	2153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.697;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=10;PP=1675;ReadPosRankSum=0.055;SC=CCTGCCTTCCGCCACTGCCAC;SOR=0.139;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=111;TCF=99;TCR=12;TR=78;WE=2760716;WS=2760698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,79:0.71:112
chr12	2760965	rs34428885	GA	G	528.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.560;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=3.269;NF=0;NR=21;PP=1168;ReadPosRankSum=-1.584;SC=GCGGCCCGGGGAATCGCAGGG;SOR=1.362;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=75;TCF=2;TCR=73;TR=21;WE=2760978;WS=2760955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,22:0.28:78
chr12	2760970	rs1990322	G	A	1459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.517;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.340;NF=3;NR=51;PP=2962;ReadPosRankSum=1.145;SC=CCGGGGAATCGCAGGGCTGCC;SOR=0.335;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=73;TCF=3;TCR=70;TR=54;WE=2760978;WS=2760955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,55:0.73:75
chr12	2773855	rs7315556	G	A	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=268;ReadPosRankSum=1.465;SC=GAGCATTCAGGGAATGATGAA;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=12;WE=2773863;WS=2773845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr12	2773870	rs45555233	A	G	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=91;ReadPosRankSum=-0.317;SC=GATGAACATCAAGTTCATTTT;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=8;WE=2773878;WS=2773860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr12	2774668	rs2302728	C	A	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=54;ReadPosRankSum=1.169;SC=CATCAGTAGGCCCCAGCTGGC;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=2774676;WS=2774658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr12	2783476	rs7136355	T	C	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=316;ReadPosRankSum=-0.177;SC=AGGAATGGCATTGGACGGGGC;SOR=2.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=16;WE=2783484;WS=2783466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr12	2788879	rs1051375	G	A	4809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.356;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=123;PP=2962;ReadPosRankSum=0.153;SC=ACCCCAGCACGGTCAGCACTG;SOR=0.495;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=256;TCF=72;TCR=184;TR=174;WE=2788887;WS=2788869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,171:0.67:255
chr12	2791130	rs10848683	C	T	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=36.38;ReadPosRankSum=0.097;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr12	2791130	.	CGA	TGG	609	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5026;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=12;NR=0;PP=609;QD=55.2056562385;SC=AGGCACGTTCCGATGTGTGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=2791140;WS=2791120;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,12:0.92:13
chr12	2791132	rs10774053	A	G	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=34.11;ReadPosRankSum=-0.170;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr12	2791205	rs10774054	A	G	1463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=11;PP=1132;SC=CTGCTCAGGAAAGCAAACCCC;SOR=2.252;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=42;WE=2791213;WS=2791195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	2794791	rs11062315	T	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=22;ReadPosRankSum=0.414;SC=GCACAAAGTGTGCGTCCCTTC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=3;WE=2794799;WS=2794782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr12	2795255	rs2270373	C	T	2685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=33;PP=2032;SC=CTCCTGGCACCCCACCAGGGT;SOR=1.065;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=48;TCR=33;TR=81;WE=2795263;WS=2795245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr12	2799987	rs55830098	C	T	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=-0.068;SC=TACCCCCTCGCTCTAGCCCTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=6;WE=2799995;WS=2799977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr12	2851185	rs12319038	A	G	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=1;PP=735;SC=AGCTGCCCCTATGGGTGGCCA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=2851193;WS=2851175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	2851259	rs12319097	A	G	1224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.73;QD=30.62;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	2851357	rs10774059	C	T	1460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.64;QD=42.96;SOR=1.819;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	2851365	rs4765989	T	C	1426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.31;QD=43.24;SOR=2.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	2876636	rs4313632	A	G	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.055;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=817;ReadPosRankSum=0.280;SC=GGTGAGAAGCAGCTTTGTTCT;SOR=0.506;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=63;TCF=38;TCR=25;TR=43;WE=2876644;WS=2876626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,44:0.69:64
chr12	2907087	rs41456246	G	A	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.860;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=28;PP=579;ReadPosRankSum=0.690;SC=CCTTATCTCAGCCCAATGCCT;SOR=0.877;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=107;TCF=28;TCR=79;TR=37;WE=2907095;WS=2907077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,40:0.36:112
chr12	2936757	rs4765997	G	A	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.615;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=225;ReadPosRankSum=0.132;SC=CTTTTTCCCAGTGCTTTGGGT;SOR=0.368;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=13;WE=2936765;WS=2936747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr12	2937013	rs4765998	G	C	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=60;ReadPosRankSum=-0.647;SC=GCTGCAGGGAGTGAAAGTCTC;SOR=0.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=5;WE=2937021;WS=2937006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr12	2968458	rs2215292	T	C	7293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=132;NR=82;PP=2965;SC=GATGCTGTTTTCTCCGAGACC;SOR=1.312;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=214;TCF=132;TCR=82;TR=214;WE=2968466;WS=2968448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr12	3127652	rs2159411	A	G	1891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=8;PP=1509;SC=CCACCCCCACACCACAGGGCC;SOR=3.816;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=59;TCR=8;TR=67;WE=3127660;WS=3127642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	3130938	rs4759380	A	G	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=0;PP=875;SC=CGTGGTGGGCACGCAGAGCCA;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=39;WE=3130946;WS=3130928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	3131206	rs3741952	T	C	3483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=86;PP=2965;SC=TAACCCCTTCTTTCCTGCCAC;SOR=3.193;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=16;TCR=86;TR=102;WE=3131214;WS=3131196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr12	3131238	rs4759379	A	G	1859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=50;PP=1568;SC=TGGTAGTGAGAACGGGGCGAG;SOR=4.294;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=54;WE=3131246;WS=3131228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	3149483	rs7294804	A	G	3292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=65;PP=2636;SC=CAGCCATGGCATGCCCCTTCT;SOR=1.061;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=46;TCR=65;TR=111;WE=3149491;WS=3149473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr12	3310439	rs740776	C	T	4329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.60;SOR=1.006;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr12	3310482	rs740775	C	G	3327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=82;PP=2778;SC=CTTACCATAGCGTGAATACCC;SOR=2.618;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=22;TCR=82;TR=104;WE=3310490;WS=3310472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr12	3315433	rs2058243	A	G	3843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=49;PP=2929;ReadPosRankSum=-1.089;SC=CTGAATGCCCACTCTGTGCAC;SOR=1.256;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=84;TCR=50;TR=132;WE=3315441;WS=3315423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,135:0.99:137
chr12	3409277	rs7306401	C	T	3215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=77;PP=2574;SC=CTGCAGGTGCCGGAGAAGGCC;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=23;TCR=77;TR=100;WE=3409285;WS=3409267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr12	3490546	rs9804924	T	C	2232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.204;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=13;PP=1649;ReadPosRankSum=1.011;SC=GCTGTTTGAATGTGTGCCAGG;SOR=0.462;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=101;TCF=85;TCR=16;TR=77;WE=3490554;WS=3490536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,82:0.76:108
chr12	3490820	rs10848860	T	C	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=217;ReadPosRankSum=1.129;SC=TTGTTTCAATTAAACTTTTAA;SOR=0.317;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=11;WE=3490828;WS=3490810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr12	3600967	rs757609	T	C	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=584;SC=CTTTCCCCAGTTTCATCCCGC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=3600975;WS=3600957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	3701464	rs34000611	G	A	4191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.476;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=110;PP=2962;ReadPosRankSum=0.028;SC=TCACTGTCCGGAGGGGGGAGG;SOR=1.204;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=202;TCF=53;TCR=149;TR=145;WE=3701472;WS=3701454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,148:0.72:206
chr12	3702219	rs4765741	A	G	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.786;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=637;ReadPosRankSum=-0.380;SC=CTGTGGCTTCATACCCAGACG;SOR=0.449;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=34;WE=3702227;WS=3702209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,34:0.76:45
chr12	3724583	rs11062745	T	C	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-6.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.384;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=38;PP=721;ReadPosRankSum=-2.071;SC=TCTCTCACTGTGTCTTCTTGC;SOR=0.826;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=49;TCR=86;TR=59;WE=3724591;WS=3724573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,61:0.43:141
chr12	3736734	rs10848893	C	T	8183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.455;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=110;PP=2965;ReadPosRankSum=0.663;SC=AGAAGGGCCACGGGTCAGGCA;SOR=0.955;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=189;TCF=78;TCR=111;TR=185;WE=3736753;WS=3736724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,188:0.98:191
chr12	3736745	rs10848894	T	C	7977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=109;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.312;SC=GGGTCAGGCATGCACGGCCTT;SOR=1.235;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=183;TCF=72;TCR=111;TR=180;WE=3736753;WS=3736724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,185:0.99:187
chr12	3736940	rs17836183	C	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=259;ReadPosRankSum=-0.161;SC=AATCAGGAAACAATGCTTCCA;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=13;WE=3736948;WS=3736930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr12	3749874	rs7138453	T	C	2911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.112;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=43;PP=1357;ReadPosRankSum=-0.276;SC=TTTCATTTCATGCTTGCAGTC;SOR=0.448;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=60;TCR=72;TR=81;WE=3749882;WS=3749864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,81:0.58:139
chr12	3749891	rs142228158	G	A	2690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.681;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=41;PP=1423;ReadPosRankSum=-0.222;SC=AGTCTTCAAGGTCTCTCTGGG;SOR=0.367;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=114;TCF=43;TCR=71;TR=69;WE=3749899;WS=3749881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,69:0.57:121
chr12	3750070	rs4766151	T	C	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=245;SC=CAACAAAATGTGTTATGTTTG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=3750078;WS=3750060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	3751046	rs7297853	T	C	6063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=119;PP=2965;SC=GCCTATTTGCTCCGATGTTTG;SOR=1.440;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=66;TCR=119;TR=185;WE=3751054;WS=3751036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr12	3753975	rs7975304	T	G	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=22;PP=593;SC=AGGATAGTTTTTGTGTACAGA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=3753983;WS=3753965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	3757521	rs71534261	C	T	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=181;ReadPosRankSum=1.350;SC=CATGTGTAAACGGACCAAACA;SOR=0.793;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=9;WE=3757529;WS=3757511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr12	3757548	rs887304	T	C	649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=1;PP=487;SC=AGTGGCTACTTGGTGGTCCAA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=3757556;WS=3757538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	3768915	rs7299033	T	C	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=183;ReadPosRankSum=0.489;SC=ACTCTGGAGCTGTGGGTGTGG;SOR=2.235;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=12;WE=3768923;WS=3768905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr12	3787926	rs1160848	G	GGCCCC	988.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=1163;ReadPosRankSum=-1.075;SC=ACAAAGGACAGGCCCCCACTG;SOR=0.582;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=23;WE=3787934;WS=3787916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,25:0.76:33
chr12	3787956	rs242019	A	C	1365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=1;PP=1065;SC=GCGGGCCTTTACCTGCACTGC;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=40;WE=3787964;WS=3787946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	3788145	rs242018	C	T	3026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.283;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=47;PP=2352;ReadPosRankSum=-0.563;SC=TCCTCATCTTCGCCCATGTCG;SOR=0.589;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=93;TCR=69;TR=109;WE=3788153;WS=3788135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,111:0.66:168
chr12	3788222	rs242017	G	A	2821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.023;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=67;PP=2209;ReadPosRankSum=-0.299;SC=CTGTTCACCTGCATCTTCCTG;SOR=0.891;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=164;TCF=65;TCR=99;TR=109;WE=3788230;WS=3788212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,111:0.65:171
chr12	3788260	rs242016	G	A	1806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.984;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=56;PP=1453;ReadPosRankSum=0.498;SC=TGAAGAAGAAGTGACCTGGGG;SOR=0.993;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=110;TCF=19;TCR=91;TR=67;WE=3788268;WS=3788250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,68:0.60:114
chr12	3805904	rs11062767	C	T	2517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.102;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=5;PP=2088;ReadPosRankSum=0.692;SC=ATCTGGCATTCTCAGTGGGCA;SOR=1.312;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=130;TCF=121;TCR=9;TR=87;WE=3805912;WS=3805894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,87:0.66:132
chr12	3948718	rs3809251	G	A	4232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.490;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=78;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.076;SC=GCGATTATAGGAGGATCATTT;SOR=0.657;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=220;TCF=109;TCR=111;TR=150;WE=3948726;WS=3948708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,157:0.70:225
chr12	3950854	rs143956426	A	G	3210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.969;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.749;NF=65;NR=62;PP=2480;ReadPosRankSum=1.044;SC=ATGTTCCCCCAGCCATCTTTT;SOR=0.531;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=184;TCF=98;TCR=86;TR=127;WE=3950862;WS=3950844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,130:0.69:188
chr12	3982657	rs4766179	A	G	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=30;PP=846;SC=ACGCTTATCCATACGCGCGCG;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=3982665;WS=3982647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	4388084	rs3217805	C	G	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.050;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=26;PP=709;ReadPosRankSum=1.087;SC=TGTGTGCCACCGGTAAGATGA;SOR=0.507;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=165;TCF=77;TCR=88;TR=53;WE=4388092;WS=4388074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,56:0.33:170
chr12	4407228	.	C	G	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=130;ReadPosRankSum=-1.930;SC=TATTGTTATACATAATCACGA;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=4407236;WS=4407218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr12	4430547	rs10774222	C	T	4568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=26;NR=116;PP=2962;SC=AAAACGGGTCCACCACCCTCT;SOR=2.959;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=26;TCR=116;TR=142;WE=4430569;WS=4430537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr12	4430561	rs11063080	C	G	2120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-6.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.049;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=63;PP=1612;ReadPosRankSum=0.898;SC=ACCCTCTCCCCTCCCTGCTCG;SOR=0.499;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=118;TCF=17;TCR=101;TR=75;WE=4430569;WS=4430537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,79:0.65:122
chr12	4446116	rs7296163	T	C	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=622;ReadPosRankSum=1.050;SC=AAAATTTAGATAAATGCAGCT;SOR=1.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=26;WE=4446124;WS=4446106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr12	4459032	rs7309402	G	A	1237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=13;PP=982;ReadPosRankSum=-1.071;SC=AAGATATGACGGTAAAGTATG;SOR=0.795;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=61;TCR=24;TR=46;WE=4459040;WS=4459022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,48:0.56:86
chr12	4481966	rs13312787	T	C	2680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.426;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=65;PP=2083;ReadPosRankSum=1.475;SC=GGATTGATTTTAAGGGTGGTG;SOR=0.507;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=146;TCF=41;TCR=105;TR=93;WE=4481974;WS=4481956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,96:0.64:149
chr12	4537421	rs4766248	A	G	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.36;ReadPosRankSum=-0.106;SOR=0.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr12	4537431	rs11615557	C	G	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.87;ReadPosRankSum=0.316;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr12	4537658	rs2970806	G	A	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.321;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=200;ReadPosRankSum=0.041;SC=TTCAACGTCAGACCCACCTGG;SOR=0.467;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=14;WE=4537666;WS=4537648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr12	4553184	rs2241281	C	T	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=5;PP=1066;ReadPosRankSum=1.537;SC=CTCTCACAGCCTTTCCTTTCC;SOR=0.509;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=75;TCF=68;TCR=7;TR=48;WE=4553192;WS=4553174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,48:0.63:76
chr12	4553224	rs2970827	C	T	2370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.734;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=25;PP=1913;ReadPosRankSum=0.336;SC=CTACTCAGGACTTCATATTAT;SOR=0.787;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=129;TCF=90;TCR=39;TR=85;WE=4553232;WS=4553214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,88:0.66:133
chr12	4553332	rs2241280	A	G	2128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.280;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=43;PP=1522;ReadPosRankSum=-0.774;SC=TGTTCATGGCAACGAAGAGGG;SOR=0.913;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=124;TCF=58;TCR=66;TR=77;WE=4553340;WS=4553322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,82:0.63:131
chr12	4553383	rs2241279	A	G	1902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.184;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=56;PP=1554;ReadPosRankSum=0.819;SC=CTCGCTCCACAGTGGAAATTT;SOR=2.012;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=106;TCF=27;TCR=79;TR=69;WE=4553391;WS=4553373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,69:0.65:106
chr12	4554548	rs7358740	G	C	10612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=161;NR=198;PP=2965;SC=CAGCTAGCCCGGCGCGAGACC;SOR=0.882;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=359;TCF=161;TCR=198;TR=359;WE=4554556;WS=4554538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,368:1.00:368
chr12	4645400	rs10849086	G	A	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=649;ReadPosRankSum=-0.398;SC=CAAAAAAGCAGTAGGTTATAA;SOR=1.225;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=29;WE=4645408;WS=4645390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,30:0.61:49
chr12	4653112	rs11063221	G	T	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=30;PP=832;ReadPosRankSum=-0.524;SC=CATTAGATGTGTTAATTTTAA;SOR=0.602;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=17;TCR=50;TR=40;WE=4653120;WS=4653102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,42:0.61:69
chr12	4653216	.	A	AT	108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=99;ReadPosRankSum=0.405;SC=AGGACGTACTATTTTTTTCTG;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=4653224;WS=4653206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr12	4654860	rs11063223	G	A	2426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.866;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=28;PP=1897;ReadPosRankSum=1.352;SC=TAGCACTTTTGAGCAGCTTGA;SOR=0.397;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=123;TCF=85;TCR=38;TR=84;WE=4654868;WS=4654850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,87:0.69:127
chr12	4655670	rs2907492	C	G	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.058;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=777;ReadPosRankSum=-1.167;SC=ACAGAGGAAACAGGTAAAATG;SOR=0.159;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=36;WE=4655678;WS=4655660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,38:0.79:48
chr12	4657203	rs7314915	A	T	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=117;ReadPosRankSum=1.169;SC=ATTTTCCTATATCTAGACATT;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=6;WE=4657211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr12	4667910	rs7308641	A	C	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=346;ReadPosRankSum=0.153;SC=CTTGATAGACACTGGAAAGCA;SOR=1.893;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=15;WE=4667918;WS=4667900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr12	4671611	rs7306848	CG	GA	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.724;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=1330;ReadPosRankSum=-1.197;SC=CTGTGGTGCGCGGACAAGAAA;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=25;WE=4671620;WS=4671601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,30:0.60:50
chr12	4672096	rs7295624	A	G	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.543;NF=40;NR=0;PP=1046;ReadPosRankSum=1.894;SC=TTTAAAGGCTATTCTGTGACA;SOR=2.746;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=50;TCR=0;TR=40;WE=4672104;WS=4672086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,41:0.80:51
chr12	4672394	rs7299185	T	G	2086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.032;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=66;PP=1756;ReadPosRankSum=0.419;SC=CACTCTACCTTATTGTTTCTG;SOR=2.059;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=94;TCF=4;TCR=90;TR=68;WE=4672402;WS=4672384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,69:0.72:96
chr12	4677211	rs10444471	G	T	1905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.620;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=41;PP=1424;ReadPosRankSum=0.426;SC=TCACCTCTGCGAAGGTAAAGA;SOR=0.515;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=111;TCF=41;TCR=70;TR=69;WE=4677219;WS=4677201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,73:0.63:115
chr12	4677255	rs2240766	T	C	2420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=62;PP=2004;SC=AGAGGTATCATTGCGAGGTCC;SOR=4.468;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=6;TCR=62;TR=68;WE=4677263;WS=4677245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr12	4689963	.	AT	A	186.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=0.000;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=2.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.530;QD=1.27;ReadPosRankSum=-0.174;SOR=1.008;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,28:0.19:147
chr12	4697987	rs2041295	A	T	1460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.96;SOR=7.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	4697991	rs2041294	AT	GG	1461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.73;SOR=6.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	4700221	rs2302248	G	T	1917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=9;PP=1577;SC=GGAGAGGTAGGTAAAGAGCCT;SOR=3.407;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=53;TCR=9;TR=62;WE=4700229;WS=4700211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	4702230	rs12306130	G	A	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=481;ReadPosRankSum=1.045;SC=CCTGGGCTACGCGGAGCTGTG;SOR=0.948;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=92;TCF=35;TCR=57;TR=29;WE=4702238;WS=4702220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,30:0.31:96
chr12	4714008	rs2286576	T	G	1679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=4;PP=1305;ReadPosRankSum=1.207;SC=AACTGAGAAGTTGTCCTGGGG;SOR=2.507;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=45;TCR=4;TR=48;WE=4714016;WS=4713998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,52:0.98:53
chr12	4716572	rs997373	C	A	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=38;PP=1176;ReadPosRankSum=-0.952;SC=TAGTGTGTCTCATGAGGTGTC;SOR=2.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=43;WE=4716580;WS=4716562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr12	4722717	rs1801016	A	T	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.807;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=505;ReadPosRankSum=1.611;SC=AAAACAAAAGATAGCCCCACG;SOR=0.570;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=116;TCF=76;TCR=40;TR=32;WE=4722725;WS=4722707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,33:0.28:116
chr12	4725134	rs7301885	G	A	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=42;PP=1338;SC=TGCCAAGGCTGGAGCAGAGAG;SOR=5.376;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=44;WE=4725142;WS=4725124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	4735894	rs2072357	G	A	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=157;ReadPosRankSum=-0.281;SC=AGCTTCTGCTGACCCTGTGCC;SOR=0.829;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=56;TCF=31;TCR=25;TR=15;WE=4735902;WS=4735884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,16:0.29:56
chr12	4735965	rs200178782	T	TC	1754.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.940;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.37;ReadPosRankSum=0.716;SOR=0.905;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,46:0.64:72
chr12	4735968	.	AGA	CAG	2873	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=22;NR=17;PP=2873;QD=20;SC=TGGCATCTCCAGACTTGTCAT;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=71;TCF=40;TCR=31;TR=39;WE=4735978;WS=4735958;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:32,39:0.55:71
chr12	4735969	rs67512580	GA	G	1751.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=1.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.33;ReadPosRankSum=1.502;SOR=0.951;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,45:0.62:72
chr12	4735970	.	A	ACTTGTCATCTCCCAGCTTGTCATCTCCCAG	773.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.305;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=2.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.615;SOR=0.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,22:0.33:67
chr12	4736495	rs1990312	C	T	3293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=43;PP=2693;SC=ATCAGGTCCTCGGCCCAGGAG;SOR=0.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=52;TCR=43;TR=95;WE=4736503;WS=4736485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr12	4736569	rs12366671	A	G	2301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.601;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=19;PP=1718;ReadPosRankSum=1.373;SC=GAGGTTGCCAATATCTTCAGG;SOR=0.415;Source=Platypus;TCF=100;TR=75;WE=4736577;WS=4736559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,81:0.57:141
chr12	4736631	rs11063265	A	G	5341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=57;PP=2965;SC=TGGGAGCTTCAAATGCTGCAT;SOR=1.690;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=119;TCR=57;TR=176;WE=4736639;WS=4736621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr12	4736677	rs11063266	G	C	7678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=137;NR=91;PP=2965;SC=TTTCTGCTGAGTTTTATGCCA;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=229;TCF=138;TCR=91;TR=228;WE=4736698;WS=4736667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr12	4736690	rs10774251	A	G	4506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.952;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=57;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.821;SC=TTATGCCACAAGGTAAGCCCC;SOR=1.341;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=257;TCF=149;TCR=108;TR=158;WE=4736698;WS=4736667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,164:0.61:268
chr12	4737318	rs7960207	A	G	3057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.746;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=54;PP=2330;ReadPosRankSum=-0.035;SC=CATAATCTCCATTACGAGATT;SOR=0.510;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=180;TCF=102;TCR=78;TR=119;WE=4737326;WS=4737308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,123:0.66:185
chr12	4740515	rs11063270	A	T	1713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.750;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=33;PP=1368;ReadPosRankSum=1.095;SC=TTGTGCTCACATGGAAGGAGA;SOR=0.565;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=104;TCF=54;TCR=50;TR=64;WE=4740523;WS=4740505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,65:0.62:105
chr12	4740588	rs11063271	G	T	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.603;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=29;PP=807;ReadPosRankSum=0.283;SC=CCACAAAGTGGGGCTGAAAGT;SOR=1.144;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=65;TCF=13;TCR=52;TR=35;WE=4740596;WS=4740578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,37:0.54:68
chr12	4740690	rs12227238	C	T	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=190;ReadPosRankSum=-0.330;SC=GCAATGTCTTCCCCCAGAGAG;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=4740698;WS=4740680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr12	4747450	rs11063276	C	T	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=189;ReadPosRankSum=1.408;SC=GGCTAAAGCACGGGAAAGATG;SOR=0.195;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=12;WE=4747458;WS=4747440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr12	4762871	rs200108366	CT	C	55.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=5.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=1.701;QD=1.69;ReadPosRankSum=0.985;SOR=0.032;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,9:0.27:33
chr12	4763400	rs2302246	G	C	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.46;ReadPosRankSum=-0.070;SOR=0.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,11:0.20:56
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chr12	4768437	rs7958182	C	T	1439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=36;PP=1072;SC=TTATCACAGACATATGTAGAA;SOR=2.400;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=47;WE=4768445;WS=4768427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	4768504	rs4147683	C	T	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=250;ReadPosRankSum=0.492;SC=GATGTTTTGACGTTTTGATTG;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=12;WE=4768512;WS=4768494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr12	4794351	rs2240760	A	G	1544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=22;PP=1219;SC=GTCTTCCTGCAGTTCTCATAG;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=31;TCR=22;TR=53;WE=4794359;WS=4794341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	4853740	rs34687270	G	A	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.65;ReadPosRankSum=0.254;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,22:0.25:88
chr12	4853790	rs138133023	C	T	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.18;ReadPosRankSum=-0.465;SOR=0.850;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,22:0.25:87
chr12	5021228	rs1048500	T	C	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=3.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.16;ReadPosRankSum=1.962;SOR=0.970;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,46:0.28:166
chr12	5021348	rs2227910	G	C	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.913;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=447;ReadPosRankSum=-1.390;SC=ATTTCATCACGCTGGGCACCG;SOR=1.313;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=87;TCF=47;TCR=40;TR=23;WE=5021356;WS=5021338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,22:0.26:85
chr12	5021984	rs4766309	T	A	1540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.783;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=28;PP=1261;ReadPosRankSum=0.298;SC=ATTGCACCACTGCTAACCAAA;SOR=0.858;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=224;TCF=128;TCR=96;TR=67;WE=5021992;WS=5021974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,68:0.29:232
chr12	5022041	rs4766310	G	A	1206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.043;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=35;PP=847;ReadPosRankSum=-0.524;SC=AAAAAACAAAGGCAAGCAAAC;SOR=0.539;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=192;TCF=66;TCR=126;TR=55;WE=5022049;WS=5022031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,58:0.29:199
chr12	5154462	rs2359641	T	C	4043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=102;PP=2965;SC=AGCCAGGGGGTGGAGGAGGCG;SOR=2.252;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=35;TCR=102;TR=137;WE=5154470;WS=5154452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr12	5721962	rs3741837	A	C,G	1668.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=18,11;NR=21,6;PP=812,316;SC=TTAGAACAAAAGGGAGCTCTG;SOR=0.762;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=56;TCF=29;TCR=27;TR=39,17;WE=5721970;WS=5721952;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.69,0.31:58
chr12	5722181	rs3741838	A	G	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.353;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=32;PP=933;ReadPosRankSum=-1.508;SC=AGGGTGGCTCAAGGACATGTC;SOR=0.417;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=62;TCF=11;TCR=51;TR=40;WE=5722189;WS=5722171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,41:0.64:64
chr12	5756795	rs444834	T	G	903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=4;PP=735;SC=TTTACCAGCCTCTCATTATTT;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=5756803;WS=5756785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	5756824	rs367978	C	T	1883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=9;PP=1560;SC=GAATATAATACCCACAGTAGT;SOR=3.076;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=49;TCR=9;TR=58;WE=5756832;WS=5756814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr12	5756980	rs12825437	G	A	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.549;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=378;ReadPosRankSum=2.386;SC=GGGGAGAAACGGGAGAGTAGA;SOR=0.356;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=86;TCF=17;TCR=69;TR=23;WE=5756988;WS=5756970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,24:0.27:89
chr12	5757029	rs367206	C	T	1646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=48;PP=1377;ReadPosRankSum=-0.762;SC=TTAATTTGCTCTCATTTGCAT;SOR=5.058;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=48;WE=5757037;WS=5757019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr12	5848963	rs57224730	ACT	A	1524.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.782;NF=31;NR=1;PP=2415;ReadPosRankSum=0.333;SC=CTTCATCAGCACTGTCACTTT;SOR=0.693;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=53;TCF=52;TCR=1;TR=32;WE=5848985;WS=5848953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,40:0.68:59
chr12	5848977	rs79853037	C	T	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.542;NF=19;NR=0;PP=1291;ReadPosRankSum=-0.884;SC=TCACTTTTTCCCTACATTTCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=60;TCR=3;TR=19;WE=5848985;WS=5848953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,20:0.31:64
chr12	5849004	rs79278925	C	A	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.280;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.699;NF=32;NR=4;PP=678;ReadPosRankSum=-0.364;SC=CTGTCCCCAGCGCCACTTGCC;SOR=1.682;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=103;TCF=83;TCR=20;TR=36;WE=5849012;WS=5848994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,37:0.36:103
chr12	5916350	rs2277403	G	A	1438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=3;PP=1178;SC=GGTCAGTCAAGGTATTTTAAT;SOR=4.664;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=42;WE=5916358;WS=5916340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	5936762	rs66831021	C	A	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=6;PP=509;ReadPosRankSum=-1.044;SC=AGAAATGGGACCCCCGCTGCT;SOR=0.650;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=79;TCF=62;TCR=17;TR=29;WE=5936770;WS=5936752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,29:0.35:82
chr12	5939600	.	C	A	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.983;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.975;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=437;ReadPosRankSum=0.740;SC=CATTTACTTACAATGCGGCTG;SOR=0.481;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=78;TCF=55;TCR=23;TR=28;WE=5939608;WS=5939590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,30:0.39:76
chr12	5961048	rs7485945	G	A	5293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=86;NR=81;PP=2965;SC=CACTTTTCCTGTGTCTCTAGG;SOR=0.801;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=86;TCR=81;TR=167;WE=5961056;WS=5961038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr12	6030154	rs3825331	G	A	2111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=5.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.046;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=6;PP=2621;ReadPosRankSum=-0.545;SC=CTAGGAGCCCGGTTCTGTGGT;SOR=0.129;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=74;TCF=68;TCR=6;TR=53;WE=6030173;WS=6030144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,53:0.72:74
chr12	6030165	rs3825332	G	A	2208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-5.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.045;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=9;PP=2302;ReadPosRankSum=-0.575;SC=GTTCTGTGGTGCCATTCCATC;SOR=0.280;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=82;TCF=70;TCR=12;TR=56;WE=6030173;WS=6030144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,59:0.70:84
chr12	6030302	rs3741902	T	C	2204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.441;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=38;PP=1733;ReadPosRankSum=0.745;SC=CATCGAGCGGTCCCAGCTCAA;SOR=0.666;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=61;TCR=64;TR=76;WE=6030310;WS=6030292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,81:0.62:130
chr12	6030405	rs3741903	A	G	2122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=44;PP=1712;ReadPosRankSum=-0.409;SC=GGCCAGGTGCACCCCGCGTTT;SOR=0.592;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=67;TCR=72;TR=85;WE=6030413;WS=6030395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,85:0.61:140
chr12	6054395	rs6489680	A	G	2691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=22;NR=66;PP=2162;SC=ATGTGGACGCAGACCCCGCCG;SOR=2.356;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=22;TCR=66;TR=88;WE=6054403;WS=6054385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	6055132	rs6489682	T	G	2970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=2;PP=2567;ReadPosRankSum=-0.871;SC=AGGAGTGCCATCTCCCCGGGA;SOR=5.283;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=85;TCF=83;TCR=2;TR=83;WE=6055140;WS=6055122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,85:0.99:86
chr12	6060960	rs2270151	G	A	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=19;PP=1216;ReadPosRankSum=-0.420;SC=AAGAGCCCCTGGACTTGCTCT;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=57;TCR=28;TR=58;WE=6060968;WS=6060950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,58:0.68:85
chr12	6061069	rs2270152	T	G	3163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.200;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=54;PP=2465;ReadPosRankSum=-0.703;SC=CAGCAAAATTTCAGGTTAGGC;SOR=0.421;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=187;TCF=107;TCR=80;TR=117;WE=6061077;WS=6061059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,121:0.61:197
chr12	6061491	rs2286646	A	G	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.629;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=527;ReadPosRankSum=0.126;SC=TGGGATGCACACTATTCAGAA;SOR=0.173;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=30;WE=6061499;WS=6061481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr12	6062853	rs3759320	C	T	1698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=42;PP=1313;SC=TCATCTCTCTCATCCAGTAGT;SOR=2.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=10;TCR=42;TR=52;WE=6062861;WS=6062843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	6062878	rs3759321	G	A	1286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=32;PP=1021;SC=CCTAGAATTCGGAAAGTCAAC;SOR=3.967;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=6062897;WS=6062868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	6062889	rs12297442	A	G	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.66;ReadPosRankSum=-1.111;SOR=0.075;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr12	6076640	rs55687637	A	G	1215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.114;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=9;PP=963;ReadPosRankSum=-0.122;SC=GTCCCCATTGAGCCTCTCTTA;SOR=0.901;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=75;TCF=59;TCR=16;TR=45;WE=6076648;WS=6076630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,46:0.63:73
chr12	6078616	rs2270239	T	G	2610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=72;PP=2070;SC=CAGGGTCCCATTGGGAATGTG;SOR=5.499;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=76;TCF=4;TCR=72;TR=76;WE=6078624;WS=6078606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr12	6085513	rs216855	A	G	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=22;PP=709;SC=AGCCGCTCTAAGTGCTGAGAA;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=28;WE=6085521;WS=6085503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	6091000	rs216867	A	G	4117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=64;PP=2965;SC=CATTGGTGGCAGTTGAGGCCA;SOR=0.752;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=70;TCR=65;TR=134;WE=6091008;WS=6090990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr12	6092567	rs138350612	G	GGATAGATAGATAGATA	514.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;QD=57.19;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	6092629	rs10535241	TGATA	T	60.27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=68;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=58.56;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=177;ReadPosRankSum=-1.150;SC=GAGATAGATTTGATAGATAGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=6092640;WS=6092619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr12	6094845	rs177702	G	A	2605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=48;PP=2088;SC=AGGGCAAAGCGAGGTTCAGAA;SOR=1.013;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=36;TCR=48;TR=84;WE=6094853;WS=6094835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr12	6121078	rs216305	C	T	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.29;QD=34.24;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	6127943	rs216310	A	G	1371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.71;QD=29.82;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	6128443	rs216311	T	C	4617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=118;PP=2965;SC=AGGAGCAGGGTGATGCGGGAG;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=71;TCR=118;TR=188;WE=6128451;WS=6128433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr12	6128984	rs216312	T	C	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=20;PP=448;SC=CAGTGTACAATGACTTCCATA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=6128992;WS=6128974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	6143984	rs216321	T	C	4580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=78;PP=2965;SC=CTTCCGGTCCTGACAGACACT;SOR=0.801;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=73;TCR=78;TR=151;WE=6143992;WS=6143974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr12	6144164	rs499648	T	C	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.53;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	6144169	rs669667	T	G	1036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.20;SOR=4.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	6145529	rs216325	G	A	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=7;PP=1044;SC=CTGGGTCCCCGGCGCAGCCCC;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=40;WE=6145537;WS=6145519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	6153386	rs71582893	C	G	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=286;ReadPosRankSum=-2.137;SC=TCTGGCTGCACAGCCCCCTCA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=11;WE=6153394;WS=6153376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr12	6153514	rs1063857	A	G	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.849;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=886;ReadPosRankSum=0.286;SC=ACTCCAGGTCATAGTTCTGGC;SOR=0.466;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=83;TCF=54;TCR=29;TR=48;WE=6153522;WS=6153504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,50:0.57:88
chr12	6153534	rs1063856	T	C	1537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.917;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=19;PP=1259;ReadPosRankSum=-0.975;SC=CACGTTTTGGTACACTCGAGC;SOR=1.065;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=85;TCF=53;TCR=32;TR=55;WE=6153542;WS=6153524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,57:0.62:92
chr12	6153659	rs216293	G	T	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.636;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=255;ReadPosRankSum=2.036;SC=GTGAAGGAGAGAATGGACCTA;SOR=0.370;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=16;WE=6153667;WS=6153649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr12	6153738	rs1558519	AC	GT	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=3;JOINED;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=474;ReadPosRankSum=-0.144;SC=TTGCCCACTCACGGGGACCAG;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=10;WE=6153758;WS=6153728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr12	6153750	rs216294	A	G	423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=583;SC=GGGGACCAGCAGCTGCCTGAG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=6153758;WS=6153728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	6161963	rs10622633	G	GAGA	1138.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=10.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.79;ReadPosRankSum=1.758;SOR=0.166;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,31:0.35:89
chr12	6172202	rs1800378	T	C	2336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.953;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=48;PP=1821;ReadPosRankSum=-0.850;SC=CGTCACTGTATGCTGGATGCG;SOR=0.934;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=32;TCR=48;TR=79;WE=6172210;WS=6172192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,81:0.99:82
chr12	6204902	rs5796209	CA	C	511.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.548;NF=0;NR=14;PP=521;ReadPosRankSum=-0.526;SC=GGCTGGAGTGCAGCGGCTATT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=14;WE=6204910;WS=6204892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,15:0.88:17
chr12	6230288	rs6489694	A	G	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=2;PP=1200;SC=CACCAGGGCTAAGCTCAGCCA;SOR=5.376;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=42;WE=6230296;WS=6230278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	6232426	rs2286608	G	A	2930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=60;PP=2244;SC=CTGGTGTGGCGACTATCAGGG;SOR=1.559;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=29;TCR=60;TR=89;WE=6232434;WS=6232416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr12	6352292	rs9668222	T	A	1975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=2;PP=1616;SC=TACTTTGAGTTACAGACGTAT;SOR=6.027;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=61;TCF=59;TCR=2;TR=61;WE=6352300;WS=6352282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	6421495	rs740842	G	A	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.015;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=343;ReadPosRankSum=1.029;SC=TCAGAGCACTGCTGGCAGACT;SOR=0.854;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=22;WE=6421503;WS=6421485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,22:0.32:69
chr12	6422272	rs10849440	T	C	2010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=37;PP=1643;SC=TGGCTGTGGCTTCAGCCTTTC;SOR=1.197;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=24;TCR=37;TR=61;WE=6422280;WS=6422262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	6424577	rs1003563	A	G	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=1.311;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.67;ReadPosRankSum=0.487;SOR=0.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,16:0.24:68
chr12	6427052	rs1468603	C	T	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=2.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.71;ReadPosRankSum=-0.199;SOR=0.756;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,43:0.26:165
chr12	6428116	rs4764497	T	G	1850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.751;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=38;PP=1384;ReadPosRankSum=-1.764;SC=GGGACGGAGATCAAATAAAGG;SOR=0.354;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=178;TCF=67;TCR=111;TR=67;WE=6428124;WS=6428106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,74:0.39:189
chr12	6428621	rs12828469	A	T	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.08;ReadPosRankSum=-0.207;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,16:0.32:50
chr12	6435474	rs141921783	AAAT	A	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.43;ReadPosRankSum=1.707;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,3:0.17:18
chr12	6435571	rs10849441	A	G	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=7.822;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.71;ReadPosRankSum=0.258;SOR=1.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,31:0.24:131
chr12	6435575	rs10849442	C	T	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=4.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.268;SOR=1.210;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,34:0.25:137
chr12	6435753	rs2302350	G	A	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.644;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=340;ReadPosRankSum=-0.212;SC=AGGCTCACACGGACTACAAGG;SOR=0.119;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=18;WE=6435761;WS=6435743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,17:0.36:47
chr12	6437171	rs3067490	T	TGG	714.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.623;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.508;NF=25;NR=0;PP=888;ReadPosRankSum=0.348;SC=TGTATGGTGGTGGGGTGTAGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TCR=4;TR=25;WE=6437179;WS=6437161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,22:0.31:70
chr12	6439255	rs10849443	A	G	3377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=52;PP=2747;SC=AGGTGGCGCAACATTAGTGCG;SOR=0.773;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=48;TCR=52;TR=100;WE=6439263;WS=6439245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr12	6458084	rs3764875	C	T	2903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=49;PP=2213;SC=CAAAGATTCCCTTCTTGTGGC;SOR=1.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=38;TCR=50;TR=86;WE=6458092;WS=6458074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr12	6484709	rs10849447	T	C	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.092;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=19;PP=647;ReadPosRankSum=-3.200;SC=GCCCGCCCGCTGGCCGGCCAG;SOR=1.031;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=153;TCF=87;TCR=66;TR=50;WE=6484717;WS=6484699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,50:0.33:151
chr12	6495275	rs2364480	C	A	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.512;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=578;ReadPosRankSum=0.988;SC=CCTGCAAGGCCGGGCACTTCC;SOR=0.330;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=116;TCF=30;TCR=86;TR=36;WE=6495283;WS=6495265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,34:0.29:116
chr12	6495635	rs5796232	C	CGG	387.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=153;ReadPosRankSum=-0.059;SC=CTGAGGGACACGGGGGGGGCG;SOR=0.459;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=11;WE=6495643;WS=6495625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,10:0.24:42
chr12	6500105	rs12354	T	G	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=32;PP=693;ReadPosRankSum=0.498;SC=CATGACTGACTGAGTCTGAGA;SOR=0.768;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=34;TCR=99;TR=43;WE=6500113;WS=6500095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,43:0.32:134
chr12	6551899	rs2886090	C	T	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=381;ReadPosRankSum=-1.515;SC=CCTGTAATCCCAGCACTTTGG;SOR=0.836;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=18;WE=6551907;WS=6551889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr12	6552048	rs12316584	C	T	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=2.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.49;ReadPosRankSum=-2.181;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr12	6552154	rs3759341	A	G	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.930;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=25;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CCAGTTACTCAGGAGGCTGAG;SOR=0.307;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=3;WE=6552162;WS=6552144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr12	6560473	rs2532502	A	G	2081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=39;PP=1562;SC=GAGCCTTGTCATTACAGCTGC;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=72;WE=6560481;WS=6560463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr12	6562753	rs2532501	A	G	1648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=43;PP=1265;ReadPosRankSum=-1.252;SC=CATGGCCAACATGCAGGTCTC;SOR=0.657;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=23;TCR=57;TR=61;WE=6562761;WS=6562743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,63:0.78:81
chr12	6562810	rs2532500	A	G	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.724;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=28;PP=693;ReadPosRankSum=0.337;SC=TCCCAGGGTCACCAAGAATGA;SOR=2.366;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=31;WE=6562818;WS=6562800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,31:0.79:39
chr12	6565750	rs10774432	A	G	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.220;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.189;NF=19;NR=12;PP=567;ReadPosRankSum=-0.139;SC=GGCTGGTCTCAAACTCCCAAC;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=44;TCF=26;TCR=18;TR=31;WE=6565758;WS=6565740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,33:0.69:48
chr12	6567541	.	T	TA	164.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQRankSum=2.285;QD=3.92;ReadPosRankSum=0.615;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr12	6570163	rs2534710	C	T	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=39;PP=963;ReadPosRankSum=0.862;SC=TCTAACCACCCCCCCGCCCAG;SOR=0.616;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=56;TCF=7;TCR=49;TR=45;WE=6570171;WS=6570153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,47:0.78:60
chr12	6572048	rs1045452	A	G	2369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.341;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=38;PP=1767;ReadPosRankSum=-0.537;SC=CAAGGGCGAAAGGAAAGGAAG;SOR=0.486;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=128;TCF=72;TCR=56;TR=83;WE=6572056;WS=6572038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,89:0.66:134
chr12	6572191	rs12964	T	C	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.554;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=407;ReadPosRankSum=-1.301;SC=CTCCGCTCTGTTCCCAGCCTG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=18;WE=6572199;WS=6572181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr12	6574523	.	AGT	A	105	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=28;MMLQ=18;MQ=59.2;NF=0;NR=5;PP=105;QD=29.6;SC=AAAAGAAAAAAGTATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=5;WE=6574532;WS=6574513;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,5:0.24:21
chr12	6574539	rs10849461	A	C	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.81;ReadPosRankSum=1.363;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr12	6575191	rs2534718	A	T	3003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=54;PP=2442;SC=GAAACAAAGCAGCTAAGCTTC;SOR=1.119;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=93;TCF=39;TCR=54;TR=92;WE=6575199;WS=6575181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr12	6579565	rs2534720	A	G	1400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=3;PP=1198;SC=CCGGTCCGGAAGCGGCGCGCG;SOR=4.565;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=40;WE=6579573;WS=6579555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	6579757	rs2532489	T	C	3683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=88;PP=2697;SC=AGACACCCGGTGAGGGACGCT;SOR=1.875;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=40;TCR=88;TR=128;WE=6579765;WS=6579747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr12	6579812	rs2072376	T	C	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=47;PP=1126;ReadPosRankSum=1.069;SC=TCGCGCCGACTACCCCGCGGT;SOR=0.355;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=72;TCF=2;TCR=70;TR=49;WE=6579820;WS=6579802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,50:0.68:74
chr12	6601743	rs1001127	A	C	964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=23;PP=765;SC=ATAGACAAGGAACATTACAGT;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=6601751;WS=6601733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	6601980	rs4764600	C	G	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.625;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=331;ReadPosRankSum=0.405;SC=TCGTTACAGCCTAATTGCCAT;SOR=0.184;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=72;TCF=55;TCR=17;TR=24;WE=6601988;WS=6601970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,27:0.36:76
chr12	6604418	rs6489718	C	T	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=370;ReadPosRankSum=-0.436;SC=GTCACTGTACCTAGCTCTTTC;SOR=0.638;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=77;TCF=19;TCR=58;TR=20;WE=6604426;WS=6604408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,21:0.25:83
chr12	6618871	rs7309414	C	T	3310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.815;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=58;PP=2718;ReadPosRankSum=-0.414;SC=TTTGTTTTTTCCATCTTCATA;SOR=0.564;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=190;TCF=101;TCR=89;TR=119;WE=6618879;WS=6618861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,121:0.62:194
chr12	6619054	rs7298053	T	C	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.074;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=31;PP=604;ReadPosRankSum=-2.060;SC=ATAGGTTCACTGATAAATGCC;SOR=0.531;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=14;TCR=51;TR=40;WE=6619062;WS=6619044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,43:0.61:71
chr12	6619081	rs144245376	TCTA	T	754.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.591;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=882;ReadPosRankSum=0.000;SC=TATTGATATCTCTACTGATGA;SOR=3.287;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=19;WE=6619091;WS=6619071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,21:0.41:51
chr12	6619284	rs714774	C	G	4138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=57;PP=2965;SC=AGATACTCTGCAATTCCTGAT;SOR=0.886;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=128;TCF=71;TCR=57;TR=128;WE=6619292;WS=6619274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr12	6619402	rs714775	T	C	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.586;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=26;PP=1519;ReadPosRankSum=-0.044;SC=CATGATGATATCAAGGCTGTT;SOR=0.877;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=110;TCF=65;TCR=45;TR=66;WE=6619410;WS=6619392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,65:0.60:108
chr12	6620495	rs7358768	G	T	1211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.57;QD=33.66;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	6623382	rs4764604	A	G	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.82;ReadPosRankSum=1.133;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr12	6623389	rs4764605	T	C	2200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=4;PP=833;SC=ACAATTGGATTCAGACAGCTG;SOR=4.731;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=54;TCR=4;TR=58;WE=6623397;WS=6623372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	6624139	rs9788151	T	C	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.813;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=147;ReadPosRankSum=-0.850;SC=TTAAGTCCAGTGTTGAAAGGC;SOR=0.317;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=13;WE=6624147;WS=6624129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr12	6626369	rs758739	G	C	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=6;PP=522;SC=TTTAAGGACTGTAATGTGTCT;SOR=1.739;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=17;WE=6626377;WS=6626359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	6631169	rs917634	C	A	5853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=89;PP=2965;ReadPosRankSum=0.980;SC=CCATTGGCATCATCAGCAAGA;SOR=0.415;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=190;TCF=99;TCR=91;TR=186;WE=6631177;WS=6631159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,191:0.98:194
chr12	6631888	rs2072373	G	A	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=1;PP=908;ReadPosRankSum=-0.419;SC=CAGGGAAAATGCGGAAGGCCT;SOR=1.609;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=59;TCF=57;TCR=2;TR=39;WE=6631896;WS=6631878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,40:0.67:60
chr12	6635567	rs7311174	A	T	7846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=124;NR=122;PP=2965;SC=CTTGGGCAGAATTGGGCCCTT;SOR=0.701;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=246;TCF=124;TCR=122;TR=246;WE=6635575;WS=6635557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr12	6637845	rs2072374	T	C	2742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=31;PP=2065;SC=CCATTCCTAGTCTCCGGGACC;SOR=1.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=52;TCR=31;TR=83;WE=6637853;WS=6637835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	6638116	rs740850	C	T	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.082;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=328;ReadPosRankSum=-1.721;SC=TACAGGGCAACGCAATCTATA;SOR=1.329;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=58;TCF=15;TCR=43;TR=20;WE=6638124;WS=6638106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,24:0.39:61
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chr12	6639088	rs1043262	A	G	4393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=65;PP=2965;SC=TGTCAGTTGTAGGCAAGCTGC;SOR=0.735;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=71;TCR=65;TR=136;WE=6639096;WS=6639078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr12	6639981	rs2240871	C	G	2506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.596;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=50;PP=2033;ReadPosRankSum=-0.856;SC=AAACCATCCACTGGTACGTAA;SOR=0.750;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=68;TCR=82;TR=92;WE=6639989;WS=6639971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,94:0.60:157
chr12	6640267	rs10849485	G	A	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.256;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=99;ReadPosRankSum=-0.857;SC=CCTGTTCCCGGCCGAGAAGGC;SOR=0.105;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=7;WE=6640275;WS=6640257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr12	6640677	rs1127198	T	A	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=3.388;NF=5;NR=18;PP=394;ReadPosRankSum=1.280;SC=CTCTTTTTTTTAAAAAAAAAA;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=23;WE=6640685;WS=6640666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,24:0.96:25
chr12	6643927	rs3741915	T	G	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=418;ReadPosRankSum=-1.588;SC=GGGAGGCGTGTGTGTCGGCCG;SOR=0.906;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=17;WE=6643935;WS=6643917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr12	6643991	rs1136666	C	G	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.156;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=12;PP=791;ReadPosRankSum=1.336;SC=CCACATCGCTCAGACACCATG;SOR=0.482;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=59;TCF=42;TCR=17;TR=39;WE=6643999;WS=6643981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,40:0.66:61
chr12	6644256	rs3741918	T	A	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.010;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=175;ReadPosRankSum=-0.947;SC=CTTCCCCTAGTCCCCAGAAAC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=6644264;WS=6644246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr12	6646320	rs1065691	T	C	3627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.736;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=46;PP=2738;ReadPosRankSum=-0.039;SC=CCTCTGCTGATGCCCCCATGT;SOR=0.457;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=205;TCF=140;TCR=65;TR=136;WE=6646328;WS=6646310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,138:0.67:206
chr12	6647109	rs1803621	T	C	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.297;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=8;PP=689;ReadPosRankSum=1.058;SC=CCTCCACCTTTGACGCTGGGG;SOR=1.392;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=71;TCF=52;TCR=19;TR=36;WE=6647117;WS=6647099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,37:0.53:70
chr12	6657538	rs2286724	T	G	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.627;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=587;ReadPosRankSum=1.574;SC=GGGAGTGGGCTTCAGGCTGGA;SOR=0.328;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=33;WE=6657546;WS=6657528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr12	6659694	rs2286726	G	C	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=495;ReadPosRankSum=1.338;SC=GACTTTTGTTGCTTGTCTTTC;SOR=2.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=20;WE=6659702;WS=6659687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr12	6660219	rs7312991	C	T	3641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=1.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.81;ReadPosRankSum=-0.393;SOR=0.805;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,94:0.56:167
chr12	6660225	rs7301426	T	C	3659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=1.972;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.32;ReadPosRankSum=-0.950;SOR=0.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,94:0.57:164
chr12	6671154	rs370604185	AT	A	235.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQRankSum=-0.128;QD=8.13;ReadPosRankSum=1.128;SOR=1.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr12	6691463	.	G	C	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.874;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=28;PP=894;ReadPosRankSum=0.415;SC=TAAAGAAGTAGAGAAAGAGTT;SOR=0.752;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=64;TCF=21;TCR=43;TR=40;WE=6691471;WS=6691453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,40:0.62:64
chr12	6704407	.	C	G	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.001;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=172;ReadPosRankSum=0.083;SC=AAGTTACTATCTGCATTTCAT;SOR=1.071;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=8;WE=6704415;WS=6704397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr12	6705122	rs376930091	CA	C	91.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=14.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQRankSum=1.609;QD=0.83;ReadPosRankSum=-0.898;SOR=3.356;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,23:0.21:110
chr12	6709945	rs12816349	G	A	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;ReadPosRankSum=0.723;SC=AGCAAGCACCGTTATACAGGG;SOR=0.319;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=20;WE=6709953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr12	6711147	rs1639122	C	A	1629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.627;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=39;PP=1877;ReadPosRankSum=2.631;SC=CATCATCATCCTCCTCCTCCT;SOR=0.763;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=135;TCF=73;TCR=62;TR=92;WE=6711155;WS=6711137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,64:0.59:108
chr12	6747578	rs1882553	G	C	2871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=54;PP=2376;SC=CACCTACACAGAGATTCAGTG;SOR=1.244;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=32;TCR=55;TR=86;WE=6747586;WS=6747568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	6749093	rs2365087	A	G	835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=3;PP=710;SC=GAGGCAGGAGATTCAGTGAGG;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=6749101;WS=6749086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	6754405	.	G	T	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.455;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.838;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=772;ReadPosRankSum=-0.529;SC=GGGGTGAGATGGGGGAGGTCA;SOR=0.341;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=47;TCF=40;TCR=7;TR=34;WE=6754413;WS=6754395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,34:0.72:47
chr12	6756240	rs3803130	A	G	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=10;PP=329;SC=CGAGACCAGGACAGACAGACC;SOR=2.985;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=13;WE=6756248;WS=6756230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	6762026	rs4764506	T	C	1625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=23;PP=1352;SC=GTGCCAAACTTCCCACCAGAT;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=24;TCR=23;TR=47;WE=6762034;WS=6762016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	6764831	rs4764616	G	A	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=0;PP=1084;SC=TCAGGGAACTGTGTCCAGGGT;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=38;WE=6764839;WS=6764824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	6804902	rs10849498	A	G	1400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=35;PP=1130;SC=CCCCAGCCTCACCCAGTCACT;SOR=2.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=44;WE=6804910;WS=6804892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	6835068	rs7487866	A	G	6331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=134;PP=2965;SC=ATGAAAAAGAAGCACTTGGCT;SOR=4.587;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=149;TCF=13;TCR=136;TR=147;WE=6835089;WS=6835058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr12	6835081	rs2365100	G	A	5280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=108;PP=2965;SC=ACTTGGCTGGGTGCGGTGGCT;SOR=5.549;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=6;TCR=108;TR=114;WE=6835089;WS=6835058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr12	6836852	rs7138427	A	G	8087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=129;PP=2965;SC=GAATTGGATGACGTATGGAGC;SOR=0.816;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=243;TCF=114;TCR=129;TR=243;WE=6836860;WS=6836842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr12	6836913	rs2178691	G	T	5116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=133;PP=2965;SC=CCTGAAGGTGGAAATGAGCCC;SOR=3.316;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=23;TCR=133;TR=156;WE=6836921;WS=6836903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr12	6839453	rs871365	G	A	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=2;PP=629;SC=AAAATGCAGGGATTATGGGGG;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=6839461;WS=6839443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	6840121	rs77365023	C	T	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.140;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.661;NF=7;NR=7;PP=307;ReadPosRankSum=0.119;SC=AGGGGATTCCCTGCATTCTCT;SOR=0.098;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=14;WE=6840129;WS=6840111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr12	6840209	rs3168600	G	A	2178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=9;PP=1742;SC=GAATTGAAAGGACTGTCGTTT;SOR=3.578;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=59;TCR=9;TR=67;WE=6840217;WS=6840199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	6840371	rs11227	G	T	2754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=70;PP=2306;SC=TAGGGAGGAGGCAAATGTAGG;SOR=3.030;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=15;TCR=70;TR=85;WE=6840379;WS=6840361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr12	6883700	rs2365095	C	T	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=3;PP=869;ReadPosRankSum=-0.073;SC=GGCTTGGCAGCCCTGCTGTGT;SOR=0.719;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=59;TCF=54;TCR=5;TR=41;WE=6883708;WS=6883690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,41:0.68:60
chr12	6883722	rs201769189	T	C	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.607;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=452;ReadPosRankSum=-0.140;SC=GGGAAATTGTTTCCAGTGGGC;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=73;TCF=66;TCR=7;TR=25;WE=6883730;WS=6883712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,26:0.35:74
chr12	6909380	rs3216776	TG	T	4678.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=32;PP=2957;SC=GGGGTCTCAATGCAGATGACG;SOR=1.565;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=52;TCR=32;TR=83;WE=6909396;WS=6909370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr12	6909388	rs2365568	A	G	4676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=34;PP=2496;SC=AATGCAGATGACGTGGGAGGA;SOR=1.396;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=63;TCR=34;TR=97;WE=6909396;WS=6909370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr12	6909442	rs2255301	T	C	4117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=52;PP=2965;SC=AGCGGCGACATTGAGACCTGA;SOR=1.010;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=70;TCR=52;TR=122;WE=6909450;WS=6909432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr12	6924718	rs3782736	C	A	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=145;ReadPosRankSum=-0.478;SC=AACCATGTGACCTTGGGTGAG;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=8;WE=6924726;WS=6924708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr12	6926196	rs147732769	C	A	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=1;PP=626;ReadPosRankSum=-0.975;SC=GCATGAAAACCTGCTCTAAAA;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=27;WE=6926204;WS=6926186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,28:0.80:35
chr12	6926363	rs1055141	T	C	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=418;ReadPosRankSum=-0.780;SC=TGATGCTGAGTTTGAAACTGG;SOR=0.787;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=41;TCR=40;TR=24;WE=6926371;WS=6926353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,24:0.29:84
chr12	6927470	rs12226953	C	T	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.55;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr12	6928075	rs12821756	T	C	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.136;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=367;ReadPosRankSum=-2.066;SC=CCTGCCAGTGTCCTCAGTAAG;SOR=0.438;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=83;TCF=27;TCR=56;TR=24;WE=6928083;WS=6928065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,24:0.29:82
chr12	6928135	rs55764611	T	G	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.16;SOR=2.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	6928135	.	TA	GA,GG	469	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=6,2;NR=25,4;PP=469,10;QD=16.2506842757;SC=GGGAGGGAGTTAGAGAGGAGG;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=31,6;WE=6928144;WS=6928125;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.97:32
chr12	6928136	rs2071077	A	G	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=5.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.58;ReadPosRankSum=1.432;SOR=0.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,5:0.19:27
chr12	6928586	rs7136817	CA	AG	1623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=31;PP=1858;SC=AGCAGATCCCCAGCCTCTGGC;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=31;WE=6928595;WS=6928576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	6933589	rs75167863	C	T	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=4.113;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.75;ReadPosRankSum=1.251;SOR=0.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,49:0.27:184
chr12	6935631	rs2071081	A	C	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.810;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=462;ReadPosRankSum=0.492;SC=AGGGCACCATAGAGCTGGGTG;SOR=1.675;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=23;WE=6935639;WS=6935621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr12	6935787	rs2071082	A	T	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.268;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=5;PP=621;ReadPosRankSum=0.177;SC=TCCCTGCAGCACCTTCAGGTC;SOR=0.448;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=81;TCF=70;TCR=11;TR=32;WE=6935795;WS=6935777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,33:0.40:83
chr12	6937532	rs73055793	C	T	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.508;SOR=0.515;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr12	6938023	rs57050687	C	CG	558.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=5;PP=442;SC=GGGCGCGGCGCGCTTCGCGTG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=10;WE=6938031;WS=6938013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	6939850	rs10744716	A	G	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=18;PP=712;ReadPosRankSum=1.227;SC=TGTGGGGGAAACAGCCACACG;SOR=0.673;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=158;TCF=96;TCR=62;TR=46;WE=6939858;WS=6939840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,51:0.31:166
chr12	6940254	rs7305463	A	G	5186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=94;PP=2965;SC=GCCAGTGGGAAGGGGGCTCTT;SOR=1.379;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=58;TCR=94;TR=152;WE=6940262;WS=6940244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr12	6941021	rs1047771	G	A	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.798;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=640;ReadPosRankSum=0.144;SC=GATCCCTGGGGGAGAAGAGGC;SOR=0.866;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=102;TCF=67;TCR=35;TR=33;WE=6941029;WS=6941011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,38:0.35:108
chr12	6942672	rs4963513	A	C	1471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=10;PP=1159;SC=AACAGAAGAAACTTAATGAGA;SOR=2.256;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=48;WE=6942680;WS=6942662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	6942823	rs4963512	A	G	5491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=67;PP=2965;SC=GATATGCCCCATGGTGGGAGG;SOR=1.430;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=117;TCR=67;TR=184;WE=6942831;WS=6942813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
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chr12	6965805	rs66621175	T	C	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=164;ReadPosRankSum=3.092;SC=TGCAGAGCCCTCTCTCTCTGC;SOR=0.495;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=32;TCR=21;TR=14;WE=6965813;WS=6965795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,7:0.15:46
chr12	6969731	rs2071059	A	G	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.707;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=146;ReadPosRankSum=0.989;SC=TTCTCCCTCTATCAGCCCCAA;SOR=0.191;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=11;WE=6969739;WS=6969721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr12	6979010	rs2071069	G	A	2929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=447;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.570;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=60;PP=2158;ReadPosRankSum=0.299;SC=GCCCACATGGGGCAACCCCTT;SOR=0.738;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=427;TCF=223;TCR=204;TR=126;WE=6979018;WS=6979000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:310,133:0.30:443
chr12	6979134	rs72661107	C	G	3896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.354;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=100;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.052;SC=AGAAACCACACTAAGTGTCCA;SOR=0.489;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=195;TCF=41;TCR=154;TR=128;WE=6979142;WS=6979124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,135:0.67:202
chr12	7014962	rs2071071	A	G	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.463;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=695;ReadPosRankSum=0.919;SC=GGGCTGAAGGAGGGGGTTGGG;SOR=0.865;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=121;TCF=51;TCR=70;TR=44;WE=7014970;WS=7014952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,47:0.36:130
chr12	7015915	rs1007924	A	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=277;ReadPosRankSum=-0.761;SC=GCTAGGGCACATGGCAGTCTG;SOR=0.356;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=16;WE=7015923;WS=7015905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr12	7016449	rs3741921	C	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=269;ReadPosRankSum=0.232;SC=TTGGAGTGGCCCTTTGAGCTC;SOR=0.314;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=15;WE=7016457;WS=7016439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr12	7022085	rs1057077	T	A	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=5.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.880;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=539;ReadPosRankSum=0.222;SC=GAGGCTGATGTGATTCGACAG;SOR=0.527;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=98;TCF=30;TCR=68;TR=27;WE=7022093;WS=7022075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,30:0.28:107
chr12	7023123	rs710415	A	G	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.955;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=609;ReadPosRankSum=-0.568;SC=TATGACAGAGAACAGAGGATG;SOR=1.659;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=90;TCF=38;TCR=52;TR=34;WE=7023131;WS=7023113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,32:0.34:94
chr12	7026278	.	C	T	1671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.395;ClippingRankSum=0.000;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.742;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=23;PP=1317;ReadPosRankSum=0.334;SC=AAATGTGAGCCGGGGCCGGGA;SOR=1.018;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=100;TCF=60;TCR=40;TR=61;WE=7026286;WS=7026268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,61:0.62:99
chr12	7026893	rs376463507	A	AG	669.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=895;SC=GCAATAAGCCAGCCTGCGGCT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=7026901;WS=7026883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	7026932	rs2071419	T	C	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=29;ReadPosRankSum=1.524;SC=GGAGGGAGCATGCAACTCATG;SOR=0.412;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=4;WE=7026940;WS=7026922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr12	7043486	rs2071075	C	T	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.825;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=189;ReadPosRankSum=0.669;SC=GGTATTCTGTCCTCAGGTCCT;SOR=1.250;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=9;WE=7043494;WS=7043476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr12	7044647	rs367827860	A	AG	1758.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=4;PP=2083;SC=TATGCAAGAGAGCCCCAAATC;SOR=4.407;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=42;TCR=4;TR=45;WE=7044655;WS=7044637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
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chr12	7049999	rs2071076	C	T	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.980;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=210;ReadPosRankSum=-0.992;SC=TGGTTTGCCCCAAACCTGCCT;SOR=1.835;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=12;WE=7050007;WS=7049989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr12	7053085	rs3087835	A	G	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=219;ReadPosRankSum=0.261;SC=TCACTGTGCAAAAATTATGGG;SOR=0.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=11;WE=7053093;WS=7053075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr12	7053149	rs1044189	A	C	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.296;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=492;ReadPosRankSum=-1.069;SC=GGTTTGGGCCACGCCTGGGCG;SOR=1.426;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=68;TCF=60;TCR=8;TR=25;WE=7053157;WS=7053139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,27:0.38:72
chr12	7053362	rs915997	A	G	2914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=70;PP=2338;SC=GTCAAGGCATAGGCTGCTGGC;SOR=3.134;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=15;TCR=70;TR=85;WE=7053370;WS=7053352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr12	7054859	rs2019743	G	A	2278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=3;PP=1913;SC=TTCATGCTTAGACTACCACCC;SOR=5.580;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=62;TCR=3;TR=65;WE=7054867;WS=7054849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	7055860	rs2301262	T	C	2140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=44;NR=22;PP=1687;SC=TGCGGCCCTCTGCCGTGGCTT;SOR=1.478;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=44;TCR=22;TR=66;WE=7055868;WS=7055850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	7065281	rs10744724	C	T	4069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=98;NR=28;PP=2965;SC=CAGACCATCTCGCCTCCTCTC;SOR=2.303;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=98;TCR=28;TR=126;WE=7065289;WS=7065271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr12	7065406	rs7963446	G	A	6110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=117;PP=2965;SC=GGGCCACGTGGGAGGAGAGGC;SOR=1.208;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=195;TCF=78;TCR=117;TR=195;WE=7065414;WS=7065396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr12	7065576	rs2110071	G	A	4074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=87;NR=38;PP=2965;SC=CCACGCTTGCGTCCAGAACCA;SOR=1.802;Source=Platypus;TCR=38;TR=125;WE=7065584;WS=7065566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr12	7065635	rs2110072	T	C	5150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=82;PP=2965;SC=CCAGCCAGGGTTGTCTGGAGG;SOR=0.754;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=79;TCR=82;TR=161;WE=7065643;WS=7065625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr12	7069422	rs35119590	TG	T	63.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=2.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.95;ReadPosRankSum=-0.286;SOR=0.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,10:0.15:67
chr12	7069425	rs28579154	G	C	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=12.623;HP=13;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=7;PP=1090;ReadPosRankSum=1.179;SC=CAGGGCCTGGGGGGGGGGGGG;SOR=3.021;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=87;TCF=76;TCR=11;TR=73;WE=7069434;WS=7069412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,57:0.81:70
chr12	7069426	.	G	C	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.770;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.97;ReadPosRankSum=-0.402;SOR=0.731;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,12:0.15:78
chr12	7069620	rs759052	T	C	4994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=123;PP=2965;SC=TGACTGCCACTGCCCGGCATC;SOR=1.968;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=50;TCR=123;TR=173;WE=7069628;WS=7069610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr12	7069654	rs759053	G	A	3350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=83;PP=2770;SC=TGCCCAGCCCGATCCTCACTT;SOR=3.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=17;TCR=83;TR=100;WE=7069662;WS=7069644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr12	7079215	rs7301709	T	G	2991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=52;PP=2435;SC=CTGGAGGTTCTCGCAGCACCC;SOR=0.914;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=96;TCF=44;TCR=52;TR=95;WE=7079223;WS=7079205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr12	7080210	rs60117710	A	AG	3359.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=29;PP=2260;SC=CGGAGGCCGTAGTTTATTGTG;SOR=0.836;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=49;WE=7080220;WS=7080200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr12	7080212	rs17857448	T	C	3368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=32;PP=1548;SC=GAGGCCGTAGTTTATTGTGGT;SOR=1.012;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=27;TCR=38;TR=55;WE=7080220;WS=7080200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr12	7090659	rs60570787	A	AG	2183.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=36;NR=13;PP=2248;SC=AATGAGGGAGAGCTCCGCTCT;SOR=2.342;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=40;TCR=14;TR=49;WE=7090667;WS=7090649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr12	7170145	rs117276717	C	T	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=80;ReadPosRankSum=-0.307;SC=TAACTCCATACCAAAATATTA;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=4;WE=7170153;WS=7170135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr12	7173893	rs117907409	G	A	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.070;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=352;ReadPosRankSum=-1.301;SC=TGTCTTTAGAGATGTGGTGCA;SOR=0.483;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=73;TCF=21;TCR=52;TR=21;WE=7173901;WS=7173883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,20:0.26:76
chr12	7242299	rs1801046	G	A	3041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.574;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=63;PP=2300;ReadPosRankSum=-0.935;SC=CTCCTCCCCTGATTTGCTCCG;SOR=0.632;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=178;TCF=73;TCR=105;TR=109;WE=7242307;WS=7242289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,112:0.63:179
chr12	7242740	rs139531404	C	G	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.728;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=341;ReadPosRankSum=-1.498;SC=AGGTCAGCAGCATCTTGTTCC;SOR=0.863;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=72;TCF=37;TCR=35;TR=24;WE=7242748;WS=7242730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,24:0.34:70
chr12	7242950	rs4332595	A	G	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.798;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=54;ReadPosRankSum=-0.065;SC=ATCATGCACCACAATGGCTCT;SOR=0.027;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=5;WE=7242958;WS=7242940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr12	7277236	rs2290237	T	A	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=10.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.65;ReadPosRankSum=-0.289;SOR=1.711;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,39:0.27:142
chr12	7284484	rs10772466	A	C	3351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=60;PP=2621;ReadPosRankSum=1.448;SC=GGTTGGAGGAAAGAATGGAAA;SOR=0.337;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=44;TCR=61;TR=104;WE=7284492;WS=7284474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,109:0.99:110
chr12	7287886	rs6488452	A	C	3944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=20;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.811;SC=AGGCTGGCTGACGTGTCTTCA;SOR=1.852;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=119;TCF=99;TCR=20;TR=118;WE=7287894;WS=7287876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,122:0.99:123
chr12	7287914	rs2278822	C	T	4848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=59;PP=2965;ReadPosRankSum=1.469;SC=TTCTCTCTGGCATATGCAGGG;SOR=0.450;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=94;TCR=59;TR=152;WE=7287922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,161:0.99:162
chr12	7290391	.	T	A	169	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=10;MMLQ=28;MQ=52.67;NF=15;NR=0;PP=169;QD=13.5847475031;SC=TGTGTGTGTGTGAGAGAGAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=15;WE=7290399;WS=7290379;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,15:0.52:29
chr12	7294657	rs63110460	GT	G	468.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=3.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.84;ReadPosRankSum=1.296;SOR=1.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,35:0.66:53
chr12	7301982	rs3816423	A	G	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.143;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=597;ReadPosRankSum=-0.315;SC=TTGCATAATGATATTCTTGAA;SOR=2.194;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=23;WE=7301990;WS=7301978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr12	7309199	rs7296261	G	A	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=2.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.18;ReadPosRankSum=-1.789;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,51:0.28:184
chr12	7309471	rs1868799	C	A	1282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.83;ReadPosRankSum=1.183;SOR=0.757;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,37:0.37:100
chr12	7309471	.	CGG	AGC	1482	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=6;NR=26;PP=1482;QD=47.9833710894;SC=CCAGACGTCCCGGAGCCCCAA;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=97;TCF=20;TCR=77;TR=32;WE=7309481;WS=7309461;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:65,32:0.33:97
chr12	7309473	rs1868800	G	C	1282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=2.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.94;ReadPosRankSum=0.942;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,35:0.38:92
chr12	7342636	rs113752912	T	A	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.080;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=465;ReadPosRankSum=1.470;SC=TCCAGCCTGGTTGTTGAAGCG;SOR=2.925;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=22;WE=7342644;WS=7342626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,23:0.40:57
chr12	7351780	rs73050080	C	T	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.965;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=364;ReadPosRankSum=0.079;SC=CCTCCATCCACGTTCTCGAAC;SOR=0.368;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=18;WE=7351788;WS=7351770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr12	7351843	rs1839623	T	C	172.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=179;SC=GGGTGTTTCTTGCAGAGGGGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=7351851;WS=7351833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	7355898	rs4883087	C	G	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.990;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=654;ReadPosRankSum=0.344;SC=TTTTAAAAAACTTATTCAGAT;SOR=2.235;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=25;WE=7355906;WS=7355888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr12	7360143	rs3825405	C	A	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=508;ReadPosRankSum=-0.897;SC=CAATTAATTCCGGAACCTGTT;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=22;WE=7360151;WS=7360133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr12	7362204	.	G	T	1646	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=28;MQ=59.32;NF=71;NR=3;PP=1646;QD=22.7131244939;SC=CAGAGTTTGAGCTGAGTCGGT;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=115;TCF=111;TCR=4;TR=74;WE=7362212;WS=7362194;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:41,74:0.64:115
chr12	7362204	rs141721291	G	GCTGAGTCGGTGGAGTAATGTGCAGAGTTTGAT	3984.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.48;QD=75.18;SOR=6.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	7463241	rs7968241	A	T	1907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=23;PP=1559;SC=AGGTGGCCCCAGCGGTGGAGT;SOR=1.366;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=42;TCR=23;TR=65;WE=7463249;WS=7463231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	7463491	rs7962994	C	G	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=17;PP=508;SC=GCTGGGTGCGCTGGCTCACAC;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=7463499;WS=7463481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	7470534	rs7968312	A	T	112.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=86;SC=CTTAAGATATAGGGGCAAAGT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=7470542;WS=7470524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	7477298	rs10743732	G	A	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=404;SC=ATTAATTCTCGTTATGAAGCA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=7477306;WS=7477288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	7480828	rs377390929	G	A	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=4.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=300;ReadPosRankSum=-1.225;SC=CCTATCGCACGGACAATTGGA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=14;WE=7480836;WS=7480818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr12	7525795	rs10845007	C	T	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=212;ReadPosRankSum=0.341;SC=TAAATCAGCACTTATTGTCAT;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=11;WE=7525803;WS=7525785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr12	7525865	rs11053518	G	C	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.566;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=512;ReadPosRankSum=0.532;SC=TTTATGGTAAGTTATATTTCA;SOR=1.942;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=27;WE=7525873;WS=7525855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr12	7528471	rs7306824	G	A	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.024;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=44;PP=1299;ReadPosRankSum=-0.987;SC=CATCTCCACAGTTTAATTCTC;SOR=0.459;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=230;TCF=84;TCR=146;TR=77;WE=7528479;WS=7528461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,82:0.34:241
chr12	7551022	rs6488268	A	T	11449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=370;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=167;NR=188;PP=2965;SC=AACACATGCAAAGGCTTTCCA;SOR=0.827;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=355;TCF=167;TCR=188;TR=355;WE=7551030;WS=7551012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,365:1.00:365
chr12	7551050	rs6488269	A	C	11557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=365;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=162;NR=182;PP=2965;SC=ATTGTTTACAAACAACAGCTG;SOR=0.835;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=345;TCF=163;TCR=182;TR=344;WE=7551058;WS=7551040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,360:1.00:360
chr12	7585247	rs58195891	T	C	1928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.621;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=43;PP=1677;ReadPosRankSum=0.614;SC=CACATATAGTTCCCCACCTTT;SOR=0.670;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=256;TCF=131;TCR=125;TR=84;WE=7585255;WS=7585237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,82:0.32:257
chr12	7585971	rs10845159	A	G	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.911;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=20;PP=1316;ReadPosRankSum=-0.890;SC=GACTCTTACCATAACAGTTCA;SOR=0.888;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=75;TCR=29;TR=73;WE=7585979;WS=7585961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,73:0.70:104
chr12	7592035	rs10772330	G	T	1703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.526;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.122;NF=27;NR=39;PP=1433;ReadPosRankSum=0.549;SC=TCCAGGTCTGGTTTGGACTTG;SOR=1.010;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=107;TCF=50;TCR=57;TR=66;WE=7592043;WS=7592025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,66:0.60:110
chr12	7592139	rs10772331	G	A	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.813;NF=29;NR=23;PP=1173;ReadPosRankSum=0.705;SC=CTTCTTTGGGGAAGTATCTTC;SOR=0.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=49;TCR=39;TR=52;WE=7592147;WS=7592129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,50:0.59:85
chr12	7596855	rs7954905	T	C	3100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=83;PP=2621;SC=GTTCATAGTTTTCCAAAGGGG;SOR=5.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=3;TCR=83;TR=86;WE=7596863;WS=7596845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	7632376	rs12304718	T	C	1385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.296;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=4;PP=1057;ReadPosRankSum=0.040;SC=CATTCTTTCTTTCTAATGCCA;SOR=1.685;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=68;TCF=60;TCR=8;TR=45;WE=7632384;WS=7632366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,48:0.66:73
chr12	7638020	rs10743939	G	A	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.166;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=460;ReadPosRankSum=-0.150;SC=ATTCTGCAGCGAAACATAGAA;SOR=0.982;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=86;TCF=25;TCR=61;TR=25;WE=7638028;WS=7638010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,25:0.30:84
chr12	7649484	rs4883263	T	C	2721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=35;PP=2201;SC=CATTGCCAGATAGCAGGTTCA;SOR=1.218;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=53;TCR=35;TR=88;WE=7649492;WS=7649474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr12	7649653	rs4883264	T	C	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.614;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=23;PP=915;ReadPosRankSum=-0.270;SC=TCCCCCATTCTCCTTGGAATC;SOR=0.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=160;TCF=86;TCR=74;TR=51;WE=7649661;WS=7649643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,54:0.33:162
chr12	7655137	rs3210140	A	G	1411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.828;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=27;PP=1012;ReadPosRankSum=1.405;SC=AAGGGACTCAAGTTGACAAAA;SOR=0.621;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=162;TCF=88;TCR=74;TR=56;WE=7655145;WS=7655127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,60:0.36:169
chr12	7655278	rs11836971	T	A	1465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.838;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=30;PP=1071;ReadPosRankSum=1.414;SC=AAACTCTTCATTCTAAATTGC;SOR=0.321;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=207;TCF=122;TCR=85;TR=64;WE=7655286;WS=7655268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,69:0.32:214
chr12	7803562	rs10431308	C	A	1210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=6;PP=863;SC=TCAGGAAAGACCTTTGAAGAA;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=34;WE=7803570;WS=7803552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	7805236	rs2302515	C	G	5578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=92;PP=2965;SC=TGGAGCAGCTCATGGATGGGT;SOR=0.954;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=72;TCR=92;TR=164;WE=7805244;WS=7805226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr12	7805467	rs2080127	C	T	5403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=129;PP=2965;SC=TGTCATGCCACATTTAGAGAG;SOR=2.289;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=42;TCR=129;TR=171;WE=7805475;WS=7805457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr12	7805511	rs5796282	T	TA	4105.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=98;PP=2990;SC=CCCTCTTCTTTTTTTATTTTA;SOR=4.407;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=5;TCR=101;TR=103;WE=7805519;WS=7805501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr12	7807138	rs10845624	G	A	1763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=6;PP=1438;SC=ACCATGCACAGCTCTTAAATA;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=48;TCR=6;TR=54;WE=7807146;WS=7807128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	7847940	rs6488591	C	T	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=168;SC=TTAAATGAGACAAAATATGAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=7847948;WS=7847930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	7864312	rs999074	C	T	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=2.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=-0.944;QD=4.12;ReadPosRankSum=-2.365;SOR=1.037;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,27:0.22:121
chr12	7864316	.	CTTTTTTTTTTTTTT	C	1342.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.294;ClippingRankSum=0.000;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=1.778;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=1.537;QD=24.41;ReadPosRankSum=2.746;SOR=1.345;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,34:0.62:55
chr12	7867847	rs2024320	G	C	1463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.578;NF=29;NR=21;PP=1155;ReadPosRankSum=-0.682;SC=CGCTAGTAGCGAATCTGTTTC;SOR=0.726;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=41;TCR=30;TR=50;WE=7867855;WS=7867837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,51:0.68:75
chr12	7868777	rs34619457	A	ATT	1247.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.275;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=831;ReadPosRankSum=0.313;SC=CAATAAACATATTTTTTTCCC;SOR=0.402;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=28;WE=7868785;WS=7868767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,35:0.73:48
chr12	7894192	rs12823478	C	T	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.347;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=140;ReadPosRankSum=-0.761;SC=ACTATACAATCTTATGCTGTG;SOR=0.160;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=11;WE=7894200;WS=7894182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,11:0.24:45
chr12	7898824	rs7134479	A	G	667.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=2.547;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.94;MQRankSum=4.518;QD=20.24;ReadPosRankSum=-0.117;SOR=0.262;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:6,27:0.82:33
chr12	7917936	rs12818448	G	A	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.843;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.472;NF=0;NR=12;PP=195;ReadPosRankSum=0.398;SC=GGAGGCCGAGGCGGGCAGATC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=12;WE=7917944;WS=7917926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,13:0.30:44
chr12	7942472	rs12826131	AG	GA	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.043;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=31;PP=1693;ReadPosRankSum=-1.090;SC=ATTACTATAAAGAAGTGTTAT;SOR=0.517;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=120;TCF=16;TCR=104;TR=37;WE=7942481;WS=7942462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,41:0.33:126
chr12	7942514	rs12816791	C	A	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.702;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=391;ReadPosRankSum=1.698;SC=CCCCTTTTTCCATTATAACTT;SOR=0.061;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=60;TCF=1;TCR=59;TR=20;WE=7942522;WS=7942504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,21:0.34:62
chr12	7942556	rs12821889	G	C	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-1.388;NF=0;NR=13;PP=297;ReadPosRankSum=-1.229;SC=TATGTCCCAGGTCTCAGGAGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=13;WE=7942564;WS=7942546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr12	7945640	rs2889551	G	T	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-4.113;NF=8;NR=0;PP=80;ReadPosRankSum=-0.817;SC=CTGCAGAGAAGAGTGTCGCAA;SOR=0.163;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=8;WE=7945648;WS=7945638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr12	7945670	rs4354764	G	A	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.45;MQRankSum=-2.627;QD=4.20;ReadPosRankSum=1.478;SOR=0.089;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,13:0.22:58
chr12	7945757	rs4438116	C	T	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=2.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.84;MQRankSum=0.703;QD=4.74;ReadPosRankSum=1.113;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,47:0.25:188
chr12	7945829	rs4242903	G	C	6672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=131;PP=2965;SC=TTTGTCCTTGGAATAAGGTGA;SOR=1.407;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=72;TCR=131;TR=203;WE=7945837;WS=7945819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr12	7945871	rs11831829	C	T	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.563;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.785;NF=3;NR=31;PP=532;ReadPosRankSum=-0.574;SC=ATGGCTAAGACCTCTGTGGAT;SOR=0.136;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=117;TCF=6;TCR=111;TR=34;WE=7945879;WS=7945861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,34:0.28:120
chr12	7945916	rs34261320	G	A	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.93;ReadPosRankSum=-0.100;SOR=0.083;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,14:0.22:64
chr12	7945927	rs58791167	A	G	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.50;ReadPosRankSum=-0.363;SOR=0.092;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,13:0.23:57
chr12	7947017	rs1860931	T	C	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.52;ReadPosRankSum=0.375;SOR=0.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,20:0.21:95
chr12	7947304	rs4012939	T	C	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.050;NF=8;NR=24;PP=412;ReadPosRankSum=0.423;SC=ACCCCAGCCTTTACTCTTCCT;SOR=0.705;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=118;TCF=30;TCR=88;TR=32;WE=7947312;WS=7947294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,22:0.21:105
chr12	7966823	rs34707191	CA	C	454.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.272;NF=14;NR=0;PP=557;ReadPosRankSum=0.301;SC=CATTCAGAAGCAGTCCTGGGT;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=14;WE=7966831;WS=7966819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr12	7966908	rs3741856	T	C	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.419;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.560;NF=16;NR=6;PP=346;ReadPosRankSum=1.853;SC=GAAGGAGGCATGACTTAGACA;SOR=0.347;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=72;TCF=56;TCR=16;TR=22;WE=7966916;WS=7966898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,14:0.22:65
chr12	7966975	rs10845982	C	T	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.087;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-7.793;NF=41;NR=6;PP=1009;ReadPosRankSum=0.016;SC=CGCCGTCCTTCCCAGATCTAT;SOR=1.995;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=131;TCF=91;TCR=40;TR=47;WE=7966983;WS=7966965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,21:0.20:104
chr12	7970331	rs3040823	C	CAA	1326.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.30;MQRankSum=-0.595;QD=35.86;ReadPosRankSum=0.602;SOR=2.774;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,30:0.81:37
chr12	7970335	.	A	AAAAT	2342	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=54.23;NF=27;NR=0;PP=2342;QD=87.1111111111;SC=CAGTCTCAAAAATATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=27;WE=7970355;WS=7970325;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,27:0.64:42
chr12	7970339	rs3040822	T	TAG	1313.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.35;MQRankSum=-0.882;QD=31.28;ReadPosRankSum=1.407;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,33:0.79:42
chr12	7970343	rs3040793	T	G	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.95;MQRankSum=-0.581;QD=34.30;ReadPosRankSum=1.245;SOR=2.891;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,32:0.82:39
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chr12	8043688	rs7297809	G	C	2233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=57;PP=1863;SC=TCACACCCAGGAGTACTTCTA;SOR=3.007;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=11;TCR=57;TR=68;WE=8043696;WS=8043678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr12	8075685	rs741361	A	G	3273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=86;PP=2587;SC=CTAGGTTCCCAGAAGCAATTA;SOR=4.069;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=10;TCR=86;TR=96;WE=8075693;WS=8075675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
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chr12	8197424	rs35642012	C	G	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=601;ReadPosRankSum=-0.676;SC=CTGAGGGTCCCCCTCCCCTCT;SOR=0.738;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=59;TCF=39;TCR=20;TR=37;WE=8197432;WS=8197414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,40:0.66:61
chr12	8235172	rs66928724	GT	G	929.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=38;PP=638;SC=TATTTCTGCCGTTTTTTTTTT;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=0;TCR=52;TR=38;WE=8235180;WS=8235162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	8245239	rs2231750	C	G	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=0;PP=898;ReadPosRankSum=0.068;SC=TTCAGGAAATCTCAAACTAAG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=64;TCR=0;TR=37;WE=8245247;WS=8245229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,39:0.57:68
chr12	8248367	rs2231754	T	C	2062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.065;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=52;PP=1562;ReadPosRankSum=0.550;SC=TCAATTGAAATCTTTGATCTG;SOR=1.295;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=120;TCF=36;TCR=84;TR=68;WE=8248375;WS=8248357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,76:0.58:130
chr12	8276432	rs7295783	C	T	2731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=9;PP=2304;SC=TAAGAAAGATCTGAAACAGAT;SOR=3.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=68;TCR=9;TR=77;WE=8276440;WS=8276422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr12	8278181	rs2024301	A	T	8617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=128;NR=139;PP=2965;SC=ACTGCCCCTCACAAAAGTAAT;SOR=0.801;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=267;TCF=128;TCR=139;TR=267;WE=8278189;WS=8278171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr12	8286762	rs7315526	G	C	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.258;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.913;NF=5;NR=9;PP=154;ReadPosRankSum=2.143;SC=TTTCTCTTTCGGGCCTGCACG;SOR=1.071;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=14;WE=8286770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,14:0.25:56
chr12	8287048	rs11043498	C	T	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.939;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.385;NF=11;NR=15;PP=517;ReadPosRankSum=-1.206;SC=TGGGACTCCTCCGGGTTTTGC;SOR=0.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=26;WE=8287056;WS=8287038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,29:0.42:69
chr12	8288098	rs10840746	T	C	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=204;ReadPosRankSum=0.355;SC=ATGTGCTCTCTCTTGGCTCTT;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=10;WE=8288106;WS=8288093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr12	8289226	rs4322490	G	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=52;ReadPosRankSum=0.097;SC=CGATGTCTTTGATTCTGCCCT;SOR=0.155;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=6;WE=8289234;WS=8289224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr12	8289300	rs4573763	T	C	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.686;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=565;ReadPosRankSum=-1.603;SC=ATCCTCTCCTTTTCTTCTTGT;SOR=0.166;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=80;TCF=71;TCR=9;TR=29;WE=8289308;WS=8289290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,29:0.36:81
chr12	8374770	rs9668474	G	A	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=58.66;NF=12;NR=9;PP=491;SC=CCTCGTGCCTGTCTGGGGTGA;SOR=0.990;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=21;WE=8374789;WS=8374760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr12	8509576	rs2859693	T	C	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQRankSum=-1.389;QD=19.58;ReadPosRankSum=-0.872;SOR=2.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
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chr12	8608482	rs369358959	G	GTTTT	127.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=51;ReadPosRankSum=0.253;SC=TTCCTCTTTTGTTTTTTTTAA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=2;WE=8608490;WS=8608474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
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chr12	8612336	rs10770736	G	C	4991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=111;PP=2965;SC=TTTTTTCTCAGGGAGAGATCA;SOR=1.542;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=171;TCF=60;TCR=111;TR=171;WE=8612344;WS=8612326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr12	8612481	rs12300621	A	G	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.94;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr12	8617982	rs7315873	G	A	1533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.60;SOR=4.921;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	8756791	rs11046349	T	G	1630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=3;PP=1341;ReadPosRankSum=-1.133;SC=AGTTGAAGAATAAAAACAGAG;SOR=0.544;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=65;TCF=62;TCR=3;TR=51;WE=8756799;WS=8756781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,53:0.79:67
chr12	8757481	rs2028373	G	A	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.176;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.733;NF=9;NR=17;PP=429;ReadPosRankSum=-0.427;SC=AAGTTCTTTCGTGGTTTTCTA;SOR=1.199;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=69;TCF=32;TCR=37;TR=26;WE=8757489;WS=8757471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,24:0.37:65
chr12	8765447	rs1345004	T	C	2337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=57;PP=1790;SC=TTCTCTGTCTTAGTCTGACAG;SOR=3.489;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=6;TCR=57;TR=63;WE=8765455;WS=8765437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr12	8808006	rs11046589	T	C	3357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=83;NR=17;PP=2738;SC=TGCGGTAAAATTTACCTGTTT;SOR=3.035;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=83;TCR=17;TR=100;WE=8808014;WS=8807996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr12	8926011	rs2969089	T	C	3753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=31;PP=2892;SC=GTGGCATTGATCTGCTGATGA;SOR=2.133;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=84;TCR=31;TR=115;WE=8926019;WS=8926001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr12	8926119	rs56225306	A	G	1979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.667;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.356;NF=21;NR=53;PP=1534;ReadPosRankSum=0.535;SC=GTATCATAGCAGACTATGCCG;SOR=0.909;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=116;TCF=34;TCR=82;TR=74;WE=8926127;WS=8926109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,77:0.64:120
chr12	8987417	rs17729632	A	G	1017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=28;PP=768;SC=GAGCGCCCACATCCACCTAAG;SOR=4.680;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=30;WE=8987425;WS=8987407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	8988403	rs4883188	A	C	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=18;PP=544;SC=AGGTCAGGAGATCGAGACCAC;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=8988411;WS=8988393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	8989077	.	CTT	C	185.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;ClippingRankSum=-0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQRankSum=1.282;QD=20.64;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,8:0.89:9
chr12	8997841	rs7300139	G	T	3319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.603;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=35;PP=2815;ReadPosRankSum=-0.772;SC=ACCTCCAACTGCAGGAGGAGC;SOR=1.365;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=101;TCF=65;TCR=36;TR=100;WE=8997849;WS=8997831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr12	8998892	rs55906630	A	G	1686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=42;PP=1314;SC=TGCGGTTGGAAACAAGACAAG;SOR=6.399;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=43;WE=8998900;WS=8998882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	9002932	rs6487407	A	G	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=473;SC=TGTAATCCCAACACTTTGGGA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=9002940;WS=9002922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	9004892	rs1860926	C	A	3825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=63;PP=2947;SC=GTGCTGATGACGCAAAAACCC;SOR=0.991;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=114;TCF=51;TCR=63;TR=114;WE=9004900;WS=9004882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr12	9007412	rs200462659	T	C	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.492;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=342;ReadPosRankSum=-0.326;SC=ACACAGCTCATTGCTGTGCCC;SOR=0.269;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=17;WE=9007420;WS=9007402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr12	9009779	rs56179521	C	T	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=122;ReadPosRankSum=0.366;SC=TGGGCACAGCCCTGCAGAACC;SOR=1.329;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=6;WE=9009787;WS=9009769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr12	9009999	rs3079157	T	TAA	2059.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=26;SC=GACAGATTGATGATACAGGGA;SOR=0.929;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=40;WE=9010007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	9010226	rs73038782	A	G	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=34;PP=1011;ReadPosRankSum=0.763;SC=ACTCCAGAGCATAATTCCTGA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=100;TCR=102;TR=68;WE=9010234;WS=9010216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,70:0.34:206
chr12	9010671	rs11612600	G	A	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=31;PP=877;ReadPosRankSum=1.822;SC=ATGCCAACGTGGGAAATCTCC;SOR=0.608;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=10;TCR=54;TR=37;WE=9010679;WS=9010661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,37:0.57:65
chr12	9016318	rs73234371	T	C	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-3.113;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=182;ReadPosRankSum=0.976;SC=TCTAAGATGCTGCATTTACAA;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=9;WE=9016326;WS=9016308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr12	9016456	rs73040625	C	T	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.283;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=240;ReadPosRankSum=1.623;SC=TCTGAGCCTGCGGCTGTAGAT;SOR=0.659;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=48;TCF=21;TCR=27;TR=15;WE=9016464;WS=9016446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,16:0.31:51
chr12	9016573	rs10219561	A	G	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=419;SC=GCCAAGCAACACAATGCATAT;SOR=5.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=9016581;WS=9016563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr12	9020563	rs61749073	T	C	3286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.264;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=62;PP=2419;ReadPosRankSum=-0.045;SC=TACAGTCAGTTAACAGATTGG;SOR=0.857;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=154;TCF=71;TCR=83;TR=111;WE=9020571;WS=9020553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,119:0.73:162
chr12	9020794	rs77655847	G	C	2172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=1.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.49;ReadPosRankSum=-1.492;SOR=0.535;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,54:0.78:69
chr12	9020794	.	GTC	CTT	2265	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=34;NR=11;PP=2265;QD=51.5215083303;SC=TTCTTTCCAAGTCTGATTTGG;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=51;TCR=16;TR=45;WE=9020804;WS=9020784;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:22,45:0.67:67
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chr12	9020912	rs1476910	A	G	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=1.488;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.61;ReadPosRankSum=-0.051;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,39:0.26:148
chr12	9021021	rs73234380	T	C	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.593;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=31;PP=804;ReadPosRankSum=0.832;SC=GGGACACTTGTGTGTGTGTGT;SOR=0.394;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=70;TCF=17;TCR=53;TR=43;WE=9021029;WS=9021011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,45:0.65:69
chr12	9021053	rs5796325	C	CGT,CGTGT	1011.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7,7;NR=18,18;PP=206,830;ReadPosRankSum=1.062;SC=TGTGTGTGTACGTGTGTGTGT;SOR=0.396;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=25,25;WE=9021061;WS=9021043;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.68,0.26:34
chr12	9021283	rs55776445	A	T	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=253;ReadPosRankSum=0.272;SC=GTTATAATTTAAAAAACTGGT;SOR=0.387;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=11;WE=9021291;WS=9021273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr12	9021316	rs10664353	T	TAC	151.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=245;ReadPosRankSum=-0.547;SC=ATGGCGTGTATACACACACAC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=9021324;WS=9021306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr12	9027716	rs73047833	G	A	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=89;ReadPosRankSum=0.628;SC=AGAGTCTCGCGGTGTTGCCCA;SOR=0.052;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=6;WE=9027724;WS=9027706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr12	9068472	rs10771204	G	T	2076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=0;PP=1702;SC=CAGAATTCAGGTTTGGGAAGA;SOR=8.349;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=58;TCR=0;TR=57;WE=9068480;WS=9068462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	9068813	rs7304121	C	T	867.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=606;SC=AAACTAAAGACTGGGGGGGGA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=9068822;WS=9068803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	9068814	rs11431930	T	TG	283.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=207;ReadPosRankSum=0.054;SC=AACTAAAGACTGGGGGGGGAT;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=11;WE=9068822;WS=9068803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr12	9070366	rs4883198	T	A	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.022;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.589;NF=19;NR=11;PP=518;ReadPosRankSum=-0.775;SC=AAATGTCACTTTATGAACGAC;SOR=1.038;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=84;TCF=51;TCR=33;TR=30;WE=9070374;WS=9070356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,29:0.33:88
chr12	9074259	rs1805741	C	T	1330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.610;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.204;NF=37;NR=13;PP=1008;ReadPosRankSum=-0.520;SC=TGAGCTCTCCCAGTGCTACCA;SOR=0.444;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=148;TCF=113;TCR=35;TR=50;WE=9074267;WS=9074249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,53:0.34:156
chr12	9082855	rs1805778	A	G	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=0;PP=507;SC=AATCAGATACAGAGCCAGAGT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=9082863;WS=9082853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	9083336	rs1805777	A	G	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.43;QD=34.31;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	9085099	rs887783	G	A	3116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.013;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=11;PP=2499;ReadPosRankSum=-0.965;SC=TTTTAATTTAGAATGATTATT;SOR=0.883;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=138;TCR=16;TR=105;WE=9085107;WS=9085089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,108:0.67:161
chr12	9086683	rs1805735	A	T	6775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=115;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.931;SC=AAAAGATAAAACTGGTTGAGT;SOR=0.337;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=208;TCF=92;TCR=116;TR=207;WE=9086691;WS=9086673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,211:1.00:212
chr12	9086898	rs1049925	A	G	1420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=6.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.578;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.255;NF=31;NR=35;PP=1197;ReadPosRankSum=1.829;SC=GAATGCTAATACTCCAAGCAG;SOR=0.638;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=215;TCF=88;TCR=127;TR=66;WE=9086906;WS=9086888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,62:0.31:201
chr12	9087906	rs113120861	ATAG	A	773.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=571;ReadPosRankSum=-1.401;SC=TCGGTGTAAAATAGTAGTTAC;SOR=0.558;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=4;TCR=54;TR=15;WE=9087916;WS=9087896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,23:0.35:66
chr12	9090086	rs12371786	G	A	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.18;ReadPosRankSum=-0.472;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr12	9090668	rs3026261	C	T	3594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.164;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.92;MQRankSum=-1.535;NF=22;NR=98;PP=2784;ReadPosRankSum=1.194;SC=TACTGACCCTCTCTTCAACAG;SOR=1.724;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=178;TCF=39;TCR=139;TR=120;WE=9090676;WS=9090658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,125:0.68:183
chr12	9094548	rs1805765	A	G	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.017;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=39;PP=1051;ReadPosRankSum=1.213;SC=TGTAGGGGGAAAAAAAAGAAG;SOR=0.904;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=167;TCF=66;TCR=101;TR=61;WE=9094556;WS=9094538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,62:0.36:174
chr12	9095226	rs1805731	T	C	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.612;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=39;PP=983;ReadPosRankSum=-0.369;SC=TGTCAGCTGTTTCCTAAGATA;SOR=0.324;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=62;TCF=2;TCR=60;TR=41;WE=9095234;WS=9095216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,40:0.67:60
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chr12	9095905	rs113829875	T	TAC	3465.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=4;PP=2964;ReadPosRankSum=0.848;SC=CAGCATAATGTACACATACAA;SOR=1.139;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=122;TCF=110;TCR=12;TR=79;WE=9095913;WS=9095895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,88:0.71:124
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chr12	9258821	rs12427063	A	G	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.706;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=540;ReadPosRankSum=0.403;SC=GTGAACTGGAAAATACTCCAC;SOR=0.914;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=113;TCF=72;TCR=41;TR=33;WE=9258829;WS=9258811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,34:0.29:119
chr12	9262687	.	A	C	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=697;ReadPosRankSum=-2.608;SC=TGGAGCTAATAAAAGATATCT;SOR=0.569;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=45;TCF=7;TCR=38;TR=30;WE=9262695;WS=9262677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,32:0.65:49
chr12	9305473	rs10771357	T	C	4569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=80;PP=2965;SC=CATCGCAAGTTTGGGGCACAG;SOR=1.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=56;TCR=80;TR=136;WE=9305481;WS=9305463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr12	9307373	rs2377741	T	G	2663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=65;PP=2121;SC=GGAGCCTGGGTTTGGTAAAGA;SOR=2.598;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=17;TCR=65;TR=82;WE=9307381;WS=9307363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr12	9310565	rs4882981	C	T	1653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=36;PP=1106;SC=CTCTCTCTCTCTCTCGACAGG;SOR=4.514;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=39;WE=9310584;WS=9310555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	9310576	rs10771364	T	G	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=29;PP=830;SC=TCTCGACAGGTTCTTGCTCTG;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=29;WE=9310584;WS=9310555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	9310959	rs7298673	C	T	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=482;SC=CTCCCTTCACCCCTGGGGGAT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=9310967;WS=9310949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	9311265	rs3741850	A	C	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=31;PP=953;SC=CACAGTGTGCACCCAAGAAAG;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=9311273;WS=9311255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	9313518	rs7972015	T	A	1777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.88;QD=32.92;SOR=8.015;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	9315209	rs10771381	A	G	6691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=80;PP=2965;ReadPosRankSum=1.058;SC=CACAGGTCATAGAACTGAAAG;SOR=0.392;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=114;TCR=80;TR=192;WE=9315217;WS=9315199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,208:1.00:209
chr12	9316773	rs3213831	T	C	3244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=63;PP=2483;SC=TTGTCTCTCATTTCCACAGAT;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=34;TCR=63;TR=97;WE=9316781;WS=9316763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr12	9316907	rs1863839	C	T	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=20;PP=587;SC=TGGAACGACACGAACACATAG;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=9316915;WS=9316897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	9317885	rs2277412	G	A	2429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=36;PP=1912;SC=CAGCATCTTCGGACAGGCAGA;SOR=0.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=32;TCR=36;TR=68;WE=9317893;WS=9317875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr12	9334728	rs3832849	G	GAGTGAGACAAAATGGTCATA	4847.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=41;PP=1372;SC=AACATGGAGAGAGTGAGACAA;SOR=1.942;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=72;TCF=12;TCR=60;TR=48;WE=9334736;WS=9334718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr12	9344878	rs2075394	A	G	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=13;PP=920;ReadPosRankSum=0.120;SC=AGTGAAGGAAATTTCTTGAGC;SOR=0.739;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=162;TCF=116;TCR=46;TR=50;WE=9344886;WS=9344868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,52:0.30:172
chr12	9345273	rs10771407	A	G	3275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=55;PP=2472;SC=TGTGCTGAGCACCCTGGTGGT;SOR=0.786;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=53;TCR=57;TR=107;WE=9345281;WS=9345263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr12	9345408	rs2075395	A	G	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.667;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=201;ReadPosRankSum=0.000;SC=CAAAATGAATAGTTACAACGG;SOR=0.124;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=12;WE=9345416;WS=9345398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr12	9346792	rs12230214	G	C	1500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.563;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=35;PP=1123;ReadPosRankSum=-0.011;SC=ATGAAGAAGAGTTTATTGGGG;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=174;TCF=82;TCR=92;TR=66;WE=9346800;WS=9346782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,66:0.37:180
chr12	9349370	rs11049396	C	CT	383.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=227;ReadPosRankSum=1.090;SC=GACAAGAAAACTTTTTTTTTG;SOR=0.614;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=69;TCF=8;TCR=61;TR=18;WE=9349378;WS=9349360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,22:0.34:65
chr12	9352908	rs6487668	C	A	1675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=1;PP=1402;SC=CTACATAATCCCTCAAAATTG;SOR=6.439;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=49;WE=9352916;WS=9352898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	9353828	rs3759275	A	T	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.431;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=462;ReadPosRankSum=0.661;SC=AGATCTGAAAATTTTTAAAGT;SOR=0.435;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=19;WE=9353836;WS=9353818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
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chr12	9572754	rs55665529	C	T	5974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.108;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.808;NF=51;NR=116;PP=2965;ReadPosRankSum=0.184;SC=CTGCCACCCCCACATGGTCTC;SOR=1.021;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=168;TCF=52;TCR=116;TR=167;WE=9572762;WS=9572744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,187:0.99:188
chr12	9572788	rs145731114	C	CGCACCTGGAT	2537.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.01;QD=48.80;SOR=2.790;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	9572871	rs10843741	T	C	1625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.35;QD=33.87;SOR=3.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	9573224	rs7358609	C	T	1596.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5966;FS=16.047;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=2.016;NF=39;NR=18;PP=1352;ReadPosRankSum=-0.473;SC=GAAACCACACCGCACAGGTTA;SOR=1.414;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=67;TCF=41;TCR=26;TR=57;WE=9573232;WS=9573214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,55:0.90:61
chr12	9573287	rs375873947	AAGGAAGGG	A	1554.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.68;QD=43.19;SOR=0.927;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	9573338	rs4763950	G	A	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=32;PP=954;SC=TCAGCCACCCGCAAACCGCGT;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=38;WE=9573346;WS=9573328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	9574002	rs10771709	C	T	7350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=176;NR=76;PP=2965;SC=GCAGGTCTCTCTTCTGGAACG;SOR=1.779;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=252;TCF=176;TCR=76;TR=252;WE=9574010;WS=9573992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr12	9574119	rs4764050	A	G	6142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=151;PP=2965;SC=CCGAAAACTGAAGATGCAGGT;SOR=2.190;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=203;TCF=52;TCR=151;TR=203;WE=9574127;WS=9574109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr12	9574344	rs4237949	T	G	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=8;PP=465;SC=GCAGTATGAGTTATTACCCAC;SOR=0.818;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=17;WE=9574352;WS=9574334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr12	9586591	rs61914695	G	C	1727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.800;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.768;NF=64;NR=13;PP=1556;ReadPosRankSum=-1.330;SC=TTGTGGAGAGGAGGGTGAGAA;SOR=0.865;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=164;TCF=135;TCR=29;TR=77;WE=9586599;WS=9586581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,71:0.48:148
chr12	9589580	rs12425701	C	T	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.87;QD=30.15;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	9589681	rs77571608	C	G	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.99;QD=28.60;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	9589717	.	G	T	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.10;QD=27.98;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	9590164	.	T	C	392	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MMLQ=24;MQ=45.68;NF=4;NR=17;PP=392;QD=20.3224386927;SC=GCCACTCAGCTCGGCGCCTCC;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=79;TCF=18;TCR=61;TR=21;WE=9590172;WS=9590154;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:58,21:0.27:79
chr12	9590197	rs61914700	T	C	1385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=58;PP=1745;SC=GCTCTCCTTCTCCAACCAGCA;SOR=4.615;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=6;TCR=58;TR=64;WE=9590205;WS=9590187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	9751035	rs3072716	C	CAT	3237.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=2;PP=2846;SC=AATGCACAGACATTAATATGG;SOR=6.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=64;TCR=2;TR=60;WE=9751043;WS=9751025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	9752576	.	TAA	T	30	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=16;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=20;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=30;QD=16.5;SC=AGCGAAGTGGTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=2;WE=9752585;WS=9752566;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,2:0.40:5
chr12	9754221	rs3072720	A	AAAAC	3987.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.69;QD=43.82;SOR=3.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr12	9833426	rs10844424	A	G	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=224;ReadPosRankSum=-0.294;SC=AAAGCGAAGGAATTAAATAAA;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=10;WE=9833434;WS=9833416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
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chr12	9840786	.	ATTTTTTTTT	A	316.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.62;ReadPosRankSum=1.036;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr12	9906350	rs57931161	GA	G	339.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=206;SC=GACAAGAATTGAAAAAAAAAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=10;WE=9906358;WS=9906340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr12	9985915	rs2232548	G	T	1360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.306;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=7;PP=1106;ReadPosRankSum=0.189;SC=AGGGAGTATTGCTAAAATGCC;SOR=1.179;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=71;TCF=59;TCR=12;TR=47;WE=9985923;WS=9985905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,48:0.66:73
chr12	9994445	rs33911869	GTGT	G	1705.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=8;PP=1265;SC=ACCAAGGGAAGTGTTGTTATT;SOR=2.133;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=27;WE=9994455;WS=9994435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	10014936	rs253148	A	T	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=124;ReadPosRankSum=0.319;SC=GATGCCTTACATAGGTCATGT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=10014944;WS=10014930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
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chr12	10015177	rs253146	A	G	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.837;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=13;PP=578;ReadPosRankSum=-0.546;SC=TCATACCTGAAAAATAAAAAT;SOR=0.751;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=39;TCF=20;TCR=19;TR=25;WE=10015185;WS=10015167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr12	10041364	rs1797517	G	A	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.220;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=13;PP=757;ReadPosRankSum=-0.117;SC=GAATGTAAACGTCAGCAGTCT;SOR=1.275;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=121;TCF=79;TCR=42;TR=45;WE=10041372;WS=10041354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,44:0.36:122
chr12	10046052	rs576601	C	A	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.544;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=11;PP=768;ReadPosRankSum=0.715;SC=CAGTTTAAAACCTGGACATTT;SOR=0.973;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=145;TCF=102;TCR=43;TR=43;WE=10046060;WS=10046042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,43:0.28:151
chr12	10051433	rs1407899	A	T	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=162;ReadPosRankSum=1.868;SC=GGATGAAGACAGATTTAACTG;SOR=0.752;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=8;WE=10051441;WS=10051423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr12	10069302	rs526680	C	T	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.111;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=26;PP=1370;ReadPosRankSum=-1.738;SC=AACTCACCAACCATTGAATGT;SOR=0.607;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=235;TCF=166;TCR=69;TR=84;WE=10069310;WS=10069292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,89:0.36:244
chr12	10078946	rs138624907	CAAATT	C	524.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.319;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=60.21;MQRankSum=1.501;NF=1;NR=11;PP=451;ReadPosRankSum=-0.960;SC=TTGGGAACTGCAAATTAAATC;SOR=1.547;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=12;WE=10078958;WS=10078936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,16:0.32:50
chr12	10103970	.	T	C	2309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.695;ClippingRankSum=0.000;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.667;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=50;PP=1687;ReadPosRankSum=-0.292;SC=GTGTCTTTTGTGGATACCGAC;SOR=0.823;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=138;TCF=65;TCR=73;TR=93;WE=10103978;WS=10103960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,96:0.68:142
chr12	10124336	rs2984956	T	C	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=36;ReadPosRankSum=1.440;SC=ATAGAAGTGGTTATAGACTTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=10124344;WS=10124326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr12	10124373	rs2961542	C	T	57.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5025;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=-0.674;SC=GATATAGTTACTATTCAACTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=10124381;WS=10124363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr12	10131684	rs607567	T	G	3202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=86;PP=2821;SC=CCCCTGTTTTTGTCAAGAGGA;SOR=3.779;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=12;TCR=86;TR=98;WE=10131692;WS=10131674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr12	10136672	rs2961544	G	A	1330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=36;PP=1087;SC=AAAGAAAACTGAAAAAGTATA;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=37;WE=10136680;WS=10136662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	10137557	rs479499	A	C	1307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=36;PP=1151;SC=CACTTATAAAAAAAGAATGAT;SOR=4.021;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=40;WE=10137565;WS=10137547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	10137645	rs588272	T	G	278.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=202;SC=CAAATACATTTAAGGAGTGTA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=10137653;WS=10137635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	10138830	rs576031	C	T	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=273;SC=TGCGTCAGAACAGAAAAAGGA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=10138838;WS=10138820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	10146005	rs11412323	C	CA	592.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.62;MQRankSum=-1.195;QD=10.40;ReadPosRankSum=-1.179;SOR=0.825;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr12	10146014	rs11447004	A	AC	634.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.989;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=2.067;NF=34;NR=16;PP=519;ReadPosRankSum=0.893;SC=ACAAAAAAAAAAACGATTCTC;SOR=0.916;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=68;TCF=41;TCR=27;TR=50;WE=10146022;WS=10145995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,26:0.39:66
chr12	10146236	rs617956	C	T	1961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.330;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=32;PP=1524;ReadPosRankSum=-2.189;SC=GGTCAGGACTCAGATGAACTG;SOR=0.866;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=237;TCF=137;TCR=100;TR=83;WE=10146244;WS=10146226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,85:0.36:239
chr12	10146470	rs542700	G	A	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=298;ReadPosRankSum=0.688;SC=TTTATTTGGAGAATACCTGCA;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=50;TCF=6;TCR=44;TR=18;WE=10146478;WS=10146460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,19:0.37:52
chr12	10147722	rs61917158	A	G	1620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.201;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=26;PP=1317;ReadPosRankSum=0.547;SC=TCCTATTCTAAGTGTCCAGTG;SOR=0.593;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=197;TCF=124;TCR=73;TR=67;WE=10147730;WS=10147712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,68:0.34:199
chr12	10147850	rs521040	T	C	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.904;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=31;PP=686;ReadPosRankSum=-0.285;SC=GTACTCCTATTGTAAACATAA;SOR=1.497;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=144;TCF=56;TCR=88;TR=44;WE=10147858;WS=10147840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,46:0.31:150
chr12	10149406	rs581949	T	C	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.269;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=318;ReadPosRankSum=0.477;SC=AGGTTTCTCTTCCTTGCCTCC;SOR=1.360;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=79;TCF=61;TCR=18;TR=21;WE=10149414;WS=10149396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,22:0.27:83
chr12	10149657	rs582968	T	C	1319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=38;PP=1055;ReadPosRankSum=-1.655;SC=TACATTTTCTTCACATTCAAT;SOR=0.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=114;TCF=24;TCR=90;TR=48;WE=10149665;WS=10149647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,48:0.42:114
chr12	10149851	rs583903	C	T	2579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=54;PP=2006;SC=TTCATTCTCACCTTGTAGGTA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=24;TCR=54;TR=78;WE=10149859;WS=10149841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	10150961	rs2273987	G	A	2744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.922;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.267;NF=25;NR=49;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.312;SC=ACGCCACCAGGAGGAGGATGC;SOR=1.183;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=111;TCF=40;TCR=71;TR=74;WE=10150982;WS=10150951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,73:0.65:112
chr12	10150974	rs2273986	A	G	2498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.926;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.530;NF=19;NR=45;PP=2962;ReadPosRankSum=0.875;SC=GAGGATGCAGAGCCAACTGTA;SOR=1.043;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=99;TCF=31;TCR=68;TR=64;WE=10150982;WS=10150951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,63:0.63:100
chr12	10151642	rs612593	T	C	6915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=174;NR=41;PP=2965;SC=TTACCGGAGATGAGAGCTGGT;SOR=2.781;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=215;TCF=174;TCR=41;TR=215;WE=10151650;WS=10151632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr12	10151762	rs11379994	T	TC	6304.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.224;NF=22;NR=125;PP=2933;ReadPosRankSum=0.674;SC=AGTTTCCAACTTTACAATTTC;SOR=0.730;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=235;TCF=35;TCR=200;TR=147;WE=10151770;WS=10151752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,177:0.67:264
chr12	10165469	rs476474	A	G	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=395;ReadPosRankSum=0.976;SC=GGCTGGTGACATTGGGGATGA;SOR=0.859;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=24;WE=10165477;WS=10165459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr12	10165593	rs620449	T	G	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=215;ReadPosRankSum=-0.320;SC=CGTCTGATACTTTTCTGCTGT;SOR=1.061;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=11;WE=10165601;WS=10165583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr12	10167277	rs637790	G	C	3307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.149;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=69;PP=2575;ReadPosRankSum=0.364;SC=GATCTCCAGTGTACTGAAGAG;SOR=0.497;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=167;TCF=65;TCR=102;TR=116;WE=10167285;WS=10167267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,119:0.69:172
chr12	10206925	rs7315231	A	G	2507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=45;PP=1746;SC=GATTATTAACAGCATCCATTT;SOR=1.005;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=34;TCR=45;TR=79;WE=10206937;WS=10206915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr12	10215582	rs10772230	G	A	1078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=0;PP=829;SC=GTGAGGCAAGGGGCTTTTTGG;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=10215590;WS=10215572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	10217326	rs10622534	C	CTT	4791.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=36;PP=2965;SC=ATTTTTGTCTCATAGGATTTT;SOR=1.483;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=87;TCF=51;TCR=36;TR=85;WE=10217334;WS=10217316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr12	10241541	rs11376074	A	AT	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=236;ReadPosRankSum=-0.065;SC=TTGGCAACTGATTTTTTTTTT;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=7;WE=10241561;WS=10241531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr12	10241553	rs5008763	C	A	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.11;ReadPosRankSum=0.272;SOR=0.340;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr12	10241593	rs1352477	A	T	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.472;HP=6;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=199;ReadPosRankSum=-1.321;SC=GTTGCCATTTAAAAAAAGATA;SOR=0.067;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=10;WE=10241601;WS=10241583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr12	10241829	rs2277416	G	T	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.125;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=393;ReadPosRankSum=0.344;SC=GCTCTGCAGGGAACAGAAGAG;SOR=2.576;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=73;TCF=21;TCR=52;TR=24;WE=10241837;WS=10241819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,25:0.33:76
chr12	10245158	rs11347002	GA	G	116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=162;ReadPosRankSum=-0.095;SC=AAGTAGTAATGAAATGAAATG;SOR=0.476;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=6;WE=10245166;WS=10245148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chr12	10245237	.	G	GT	92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=92;QD=39.6666666667;SC=AGGAGTTGTTGTTTTCTGCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=3;WE=10245245;WS=10245227;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr12	10251256	rs10706436	GA	G	116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.31;ReadPosRankSum=0.356;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr12	10251287	rs6488257	C	T	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.442;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=113;ReadPosRankSum=0.071;SC=TGTCACAGGGCGAGTAATTGG;SOR=0.074;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=11;WE=10251295;WS=10251277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr12	10251385	rs3816845	T	C	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=451;ReadPosRankSum=-0.687;SC=GTGGTCTATTTGGACTCCAGG;SOR=0.587;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=63;TCR=25;TR=28;WE=10251393;WS=10251375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,29:0.31:94
chr12	10251445	rs2306894	C	G	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.704;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=16;PP=600;ReadPosRankSum=-0.546;SC=TGTGGCAGAGCCTTGAGAATG;SOR=0.575;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=138;TCF=83;TCR=55;TR=38;WE=10251453;WS=10251435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,40:0.27:146
chr12	10271055	rs7959451	T	C	2997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=17;PP=2421;SC=CCACCCTTCCTCTTACATTGA;SOR=2.808;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=90;TCF=72;TCR=18;TR=89;WE=10271063;WS=10271045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr12	10275684	rs11053608	T	G	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=2;PP=341;SC=CTTTCTCCTCTTGTCCTAGTT;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=10275692;WS=10275680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	10279513	rs35532667	T	TA	545.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.739;NF=28;NR=0;PP=367;ReadPosRankSum=0.213;SC=GGAGGTATAGTAAAAAAAAAA;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=48;TCR=5;TR=28;WE=10279535;WS=10279503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,29:0.76:38
chr12	10282746	rs34645566	ACTGT	A	107.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.674;NF=0;NR=3;PP=87;ReadPosRankSum=-0.697;SC=TCCTGAGATGACTGTCTGTGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=10282757;WS=10282736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr12	10312648	rs13306593	C	A	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=6.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.78;ReadPosRankSum=-0.641;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,19:0.28:68
chr12	10312691	rs17174597	T	C	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.425;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=122;ReadPosRankSum=-1.004;SC=TTCAGAAACTTAGCTTTTGAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=8;WE=10312699;WS=10312681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr12	10312878	rs2634156	C	T	2150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=11;PP=1844;SC=AGGCAGTGACCTCACTAGCAG;SOR=2.904;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=52;TCR=11;TR=63;WE=10312886;WS=10312868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	10312914	rs3816844	G	A	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.119;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=555;ReadPosRankSum=0.637;SC=GGAAACTGACGAGAGAGGCAT;SOR=0.416;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=91;TCF=68;TCR=23;TR=30;WE=10312922;WS=10312904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,30:0.32:93
chr12	10313075	rs3736235	T	C	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.576;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=35;PP=881;ReadPosRankSum=1.869;SC=TGGGGAGTAATGTTTCTGAGT;SOR=0.296;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=157;TCF=62;TCR=95;TR=65;WE=10313083;WS=10313065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,70:0.42:166
chr12	10313134	rs3736234	G	A	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.456;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=598;ReadPosRankSum=0.725;SC=AGTTAGTGTTGGATCCACAAA;SOR=0.351;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=81;TCF=7;TCR=74;TR=29;WE=10313142;WS=10313124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,30:0.36:84
chr12	10313358	rs3736232	C	G	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.751;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=537;ReadPosRankSum=0.392;SC=CAATACTCCACCCCAACAAAT;SOR=0.316;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=78;TCF=66;TCR=12;TR=28;WE=10313366;WS=10313348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,29:0.36:80
chr12	10370763	rs73058099	A	G	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.707;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=963;ReadPosRankSum=1.478;SC=GCCTTCCCTGACCCTTCCTCC;SOR=1.280;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=71;TCF=27;TCR=44;TR=41;WE=10370771;WS=10370753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,42:0.58:73
chr12	10373324	rs7301041	T	A	1196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=29;PP=912;ReadPosRankSum=-0.863;SC=ATTAGATACCTCTTGTTTTTT;SOR=1.094;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=38;WE=10373332;WS=10373314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr12	10461883	rs10734825	A	G	1715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=11;PP=1339;SC=CTCCGTTATCAAATGAAAGAA;SOR=2.948;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=49;TCR=11;TR=60;WE=10461891;WS=10461873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	10462052	rs10772256	T	G	2481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=53;PP=2070;SC=TTCGTTGATGTCTACGTTGGG;SOR=1.802;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=23;TCR=53;TR=76;WE=10462060;WS=10462042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr12	10462431	rs7980604	G	A	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=618;SC=ATTTTACATTGCTCAATCTAA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=10462439;WS=10462421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr12	10532326	rs2255336	T	C	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.651;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=324;ReadPosRankSum=1.495;SC=CTCCATATTGTTACCATAATA;SOR=1.106;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=18;WE=10532334;WS=10532316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,19:0.34:56
chr12	10532434	rs2617151	A	G	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.309;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=348;ReadPosRankSum=1.150;SC=GAAGCATAAAAGGTTTGGGTA;SOR=1.445;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=18;WE=10532442;WS=10532424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,19:0.34:56
chr12	10541251	rs2294147	T	C	1492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=0;PP=1158;ReadPosRankSum=0.941;SC=TCAACATAAATAGAACATGAA;SOR=1.771;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=71;TCR=0;TR=49;WE=10541259;WS=10541241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,52:0.69:75
chr12	10560824	rs2617169	T	A	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.468;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=132;ReadPosRankSum=-0.559;SC=TTATGGCTCATTGTTATAGTT;SOR=0.031;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=9;WE=10560832;WS=10560814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr12	10560957	rs2617170	T	C	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=2.486;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.34;ReadPosRankSum=-0.185;SOR=1.070;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,15:0.21:73
chr12	10562025	rs1841957	C	T	1301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.435;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=14;PP=1050;ReadPosRankSum=0.807;SC=CTTGATGATCCGAAGAAGCAT;SOR=1.465;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=182;TCF=121;TCR=61;TR=56;WE=10562033;WS=10562015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,56:0.31:180
chr12	10562089	rs1841958	A	C	1391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.518;NF=33;NR=33;PP=1160;ReadPosRankSum=1.489;SC=TGAAATGGAGATTTTATTGCC;SOR=0.727;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=217;TCF=109;TCR=108;TR=66;WE=10562097;WS=10562079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,66:0.30:220
chr12	10570965	rs2682495	C	G	5749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=83;NR=89;PP=2965;SC=ATTATCTATACAAAGCAGACT;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=173;TCF=83;TCR=90;TR=172;WE=10570973;WS=10570955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr12	10571042	rs2741882	A	G	3901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=80;PP=2965;SC=TACCAATGTAATAACAACTGT;SOR=1.512;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=39;TCR=81;TR=119;WE=10571050;WS=10571032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr12	10571091	rs2682494	T	G	4162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=69;PP=2847;SC=ATGGCCACAATGACGTGCTAA;SOR=1.469;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=33;TCR=69;TR=102;WE=10571099;WS=10571081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr12	10571106	rs2682493	G	C	3950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=57;PP=2453;SC=TGCTAATAAAGATATGAATTA;SOR=1.130;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=34;TCR=57;TR=91;WE=10571114;WS=10571096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr12	10571158	rs10743890	C	T	3441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=48;PP=2027;SC=AAAATTAGTTCACATATTTGC;SOR=1.112;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=31;TCR=48;TR=79;WE=10571166;WS=10571148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr12	10571177	rs4394921	A	G	3224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=34;PP=1988;SC=GCAACAGTATAAACATATATG;SOR=0.720;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=31;TCR=34;TR=65;WE=10571185;WS=10571167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr12	10571504	rs4579992	C	T	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.29;QD=37.89;SOR=2.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	10571514	rs4275705	C	G	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.70;QD=48.14;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	10571536	rs33947579	A	AT	257.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.74;QD=28.64;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	10571622	rs4093355	G	A	176.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.64;QD=29.47;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	10571745	rs11053795	T	C	31.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=15.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	10572544	rs143188402	T	C	150.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=30.18;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	10572839	rs2253365	A	T	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=3;PP=668;SC=ATATTAGAATATTAGATCCCA;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=10572847;WS=10572829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	10572982	rs2741881	A	G	4906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=46;PP=2965;SC=CATATATTTTATCAATCCCTT;SOR=1.578;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=105;TCR=46;TR=151;WE=10572990;WS=10572972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr12	10573094	rs2682491	C	G	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=9.870;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.24;MQRankSum=0.614;QD=7.47;ReadPosRankSum=-1.278;SOR=0.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
chr12	10573095	rs2682490	A	G	2012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.87;QD=37.27;SOR=5.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	10573145	rs2682489	C	T	1146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.46;QD=32.76;SOR=7.168;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	10573211	rs10734829	A	G	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=31.92;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	10583611	rs3003	C	T	149.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=119;SC=ATTTTTGTATCAGAGCAAATA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=10583619;WS=10583601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	10583696	rs2981593	C	T	656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=3;PP=586;SC=TGATGCACTGCAAACGCAAAT;SOR=2.531;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=10583704;WS=10583686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	10586921	.	C	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.755;HP=1;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.895;NF=9;NR=0;PP=136;ReadPosRankSum=-0.595;SC=TATTTCTACTCACTGGAGAAA;SOR=1.877;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=9;WE=10586929;WS=10586911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,3:0.11:28
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chr12	10586961	rs1356930	T	C	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=25.668;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.39;MQRankSum=4.864;QD=12.25;ReadPosRankSum=-1.186;SOR=0.006;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr12	10586978	rs144149096	A	AT	1533.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=27.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.00;MQRankSum=-2.110;QD=20.18;ReadPosRankSum=-0.006;SOR=5.676;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,53:0.70:76
chr12	10587111	rs61917677	A	G	2991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=87;PP=2766;SC=ATTCGGGGAAAAATTGTTCTG;SOR=3.660;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=11;TCR=87;TR=98;WE=10587119;WS=10587101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr12	10587158	rs35801775	A	T	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.448;NF=0;NR=31;PP=696;ReadPosRankSum=0.296;SC=AATGATTTTTATAAAAACTGA;SOR=1.154;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=0;TCR=54;TR=31;WE=10587166;WS=10587148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr12	10587631	rs144960284	C	T	227.41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.9784;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.221;NF=1;NR=8;PP=206;ReadPosRankSum=0.967;SC=AATTGTTCTGCTCCAGGACTG;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=9;WE=10587639;WS=10587621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr12	10588454	rs111449827	A	G	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=26.367;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.713;NF=18;NR=0;PP=315;ReadPosRankSum=-4.272;SC=GATTTTGAAGATTTAATTCTA;SOR=4.849;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=18;WE=10588462;WS=10588444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,14:0.26:54
chr12	10588530	rs75545535	C	G	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.524;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.233;NF=24;NR=11;PP=387;ReadPosRankSum=0.683;SC=CCTTTGCTGCCGCTTTGGGTC;SOR=1.810;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=122;TCF=70;TCR=52;TR=35;WE=10588538;WS=10588520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,34:0.34:101
chr12	10588581	rs28403159	T	C	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.249;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.214;NF=0;NR=22;PP=431;ReadPosRankSum=0.007;SC=TCTTTGTTTATTCATCTCTGC;SOR=3.588;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=80;TCF=14;TCR=66;TR=22;WE=10588589;WS=10588571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,14:0.19:72
chr12	10588647	rs28730284	A	G	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.46;MQRankSum=1.468;QD=21.08;ReadPosRankSum=-1.129;SOR=2.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr12	10599270	rs7314384	G	A	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.389;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.422;NF=5;NR=26;PP=711;ReadPosRankSum=-0.151;SC=TCCTGTAATGGAGAAAAATCC;SOR=2.584;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=31;WE=10599278;WS=10599260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr12	10599347	rs2682471	T	G	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.123;NF=0;NR=7;PP=120;ReadPosRankSum=0.245;SC=TGTAAGAAAATAATTTCATGG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=7;WE=10599355;WS=10599337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr12	10599425	rs144548572	C	G	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.5032;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=3;PP=37;SC=CAGAGTAGTCCCCCTTCATCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=10599433;WS=10599415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	10600282	rs11053804	C	T	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.318;NF=0;NR=24;PP=532;ReadPosRankSum=-0.858;SC=GAAAACATTACAAAAACAATA;SOR=1.236;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=24;WE=10600290;WS=10600272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr12	10601746	rs187283639	G	T	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=658;ReadPosRankSum=0.082;SC=TAAGCTAAATGTATATACCCA;SOR=0.518;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=26;WE=10601754;WS=10601736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr12	10602077	rs2734440	C	T	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.078;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=281;ReadPosRankSum=0.623;SC=TAAACCTATACGTATGCAACA;SOR=1.585;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=18;WE=10602085;WS=10602067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,19:0.32:59
chr12	10602624	rs3216778	TTTTAAG	T	529.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.808;NF=0;NR=12;PP=583;ReadPosRankSum=-0.825;SC=ATCATAATAATTTTAAGTTTT;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=12;WE=10602637;WS=10602614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr12	10603670	rs2253849	T	C	2987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=42;PP=2351;SC=TAAAATGGAGTTTTTATTGCC;SOR=0.914;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=51;TCR=42;TR=93;WE=10603678;WS=10603660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr12	10659438	rs10772299	T	C	8246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=113;NR=129;PP=2965;SC=CATGTGTAAATCAATCTTTTC;SOR=0.769;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=242;TCF=113;TCR=129;TR=242;WE=10659446;WS=10659428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr12	10659964	rs10772300	C	G	3076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=86;PP=2598;SC=CTGGAAGTTGCAATTTCTCTT;SOR=8.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=87;TCF=0;TCR=87;TR=86;WE=10659972;WS=10659954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	10675250	rs7980396	G	C	5999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=83;PP=2965;SC=ATGGGGCCCAGTTCTTACCAA;SOR=1.014;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=186;TCF=103;TCR=83;TR=186;WE=10675258;WS=10675240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr12	10746385	rs2244387	G	A	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=7;PP=798;SC=CTCACTCTGGGCTCCAGCCTG;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=31;WE=10746393;WS=10746375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	10748314	rs2168749	C	T	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.967;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=399;ReadPosRankSum=-1.164;SC=ACTTTAAAAACGATCTCATTT;SOR=1.708;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=19;WE=10748322;WS=10748304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr12	10748403	rs2682484	A	T	2011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=23;PP=1496;SC=GAGAACGTCAAATTTTAAAGT;SOR=1.044;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=34;TCR=23;TR=57;WE=10748411;WS=10748393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	10759032	rs10772333	T	C	1387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=22;PP=1021;SC=ATTCTTTAAATGCCTAAAACA;SOR=0.823;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=23;TCR=22;TR=45;WE=10759040;WS=10759022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	10760305	rs2290718	G	C	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.006;HP=2;HapScore=2;MGOF=60;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=54;ReadPosRankSum=1.255;SC=AAGATAATAAGCCTTTAATGA;SOR=0.045;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=5;WE=10760313;WS=10760295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr12	10760328	rs3947920	G	A	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.26;SOR=4.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	10760335	rs2125090	T	A	1225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.27;SOR=3.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	10760380	rs2125089	G	A	1261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=10;PP=1013;SC=ATCTTGGCTAGCAAACTGACT;SOR=2.191;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=40;WE=10760388;WS=10760370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	10760624	rs10845180	T	C	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.600;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=138;ReadPosRankSum=-0.530;SC=CCAATTTTAGTTGCAAGTTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=10760632;WS=10760614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
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chr12	10763175	rs11053879	G	A	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=60;ReadPosRankSum=-1.017;SC=TGGGCTAAATGCAAAAAAAAA;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=5;WE=10763183;WS=10763165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr12	10763236	rs10845182	G	C	970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=3;PP=864;SC=TTCTGATCATGACATCATTTT;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=10763244;WS=10763226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	10763419	rs72054859	CTAGACATG	C	818.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=2700;SC=AAGATCATTGCTAGACATGTA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=10763448;WS=10763409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	10763440	rs12811247	G	T	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=128;ReadPosRankSum=1.024;SC=GACAATAAATGTTTGCTGGTT;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=7;WE=10763448;WS=10763409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr12	10766244	rs10772335	A	C	2532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=88;PP=2100;SC=TTCCTCCTGCAGTGCAGCCCT;SOR=6.781;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=90;TCF=2;TCR=88;TR=90;WE=10766252;WS=10766234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr12	10774698	rs2900467	A	G	217.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.6268;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=144;ReadPosRankSum=-0.431;SC=ACTACATACAATTCAGTTGCT;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=7;WE=10774706;WS=10774688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr12	10775195	rs1078437	T	C	3818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.790;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=81;PP=2962;ReadPosRankSum=0.701;SC=CACGCTTGCATATTTGCATAC;SOR=0.548;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=210;TCF=83;TCR=127;TR=137;WE=10775203;WS=10775185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,139:0.64:216
chr12	10783729	rs2290717	A	G	1781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=44;NR=17;PP=1477;SC=CACAGCTACCACTGCAAATCT;SOR=1.888;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=44;TCR=17;TR=61;WE=10783737;WS=10783719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	10786757	rs5796407	T	TGAA	4567.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=65;PP=2974;SC=GAGAAGAGAATGAAGAAGCCT;SOR=2.212;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=94;TCF=14;TCR=80;TR=75;WE=10786765;WS=10786747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr12	10870900	rs11309033	AC	A	204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=210;SC=TCCACAGGCCACCCACCTTCC;SOR=2.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=6;WE=10870908;WS=10870890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	10871667	rs33016	A	G	1933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=30;PP=1502;SC=GCAAATATACACACACACATA;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=35;TCR=30;TR=65;WE=10871675;WS=10871657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr12	10958658	rs2537817	T	C	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=3;PP=617;SC=TTTCATATCATGCAGGCAATT;SOR=3.098;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=24;WE=10958666;WS=10958648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	10959031	rs1548803	C	T	5316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.771;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=52;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.444;SC=TAAAGAGAGTCAAGGGTTCAA;SOR=1.464;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=105;TCR=53;TR=157;WE=10959039;WS=10959021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,164:0.99:165
chr12	10962115	rs3741845	A	G	6550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=111;PP=2965;SC=GGGAACCATCACCCCCAGGTT;SOR=0.827;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=207;TCF=96;TCR=111;TR=206;WE=10962123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr12	10978402	rs597468	G	A	1520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=32;PP=1224;SC=GTCATTCTTCGTTTTATAATC;SOR=1.514;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=48;WE=10978410;WS=10978392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	10999708	rs1047699	T	C	4099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=72;PP=2965;SC=TCTGTCCCTCTGGAAGAATGA;SOR=0.849;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=59;TCR=72;TR=131;WE=10999716;WS=10999698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr12	10999780	rs1063193	C	T	4760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=66;PP=2965;SC=GTGTCCTCGTCGGGGTGGTCG;SOR=0.823;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=138;TCF=72;TCR=66;TR=138;WE=10999788;WS=10999770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr12	11035274	rs28607516	G	T	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.25;QD=32.46;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	11035368	rs11054060	T	G	1156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=29;PP=1161;SC=CTCTCTGTCTTCACCACACGG;SOR=1.308;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=42;WE=11035376;WS=11035358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	11035482	rs10845228	T	C	2954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=16;PP=2531;SC=GATGAAAAATTGAATTTCTTT;SOR=3.334;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=76;TCR=16;TR=92;WE=11035490;WS=11035472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr12	11035533	rs10845229	G	A	5157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.179;NF=119;NR=46;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.258;SC=AAAACTGTTTGTATCTTTGGG;SOR=1.015;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=166;TCF=120;TCR=46;TR=165;WE=11035541;WS=11035523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,166:0.99:167
chr12	11061122	rs1015443	T	C	4899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.759;SC=GATCACTGTGTTCTGATACAG;SOR=0.476;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=60;TCR=88;TR=146;WE=11061130;WS=11061112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,144:0.99:145
chr12	11083677	rs10772391	T	C	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.82;QD=30.73;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	11091432	rs3741843	C	T	5810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=73;PP=2965;SC=CCTTTTTAACCCTCCACTTTA;SOR=1.128;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=101;TCR=73;TR=174;WE=11091440;WS=11091422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr12	11138683	rs10772397	C	T	6224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=113;PP=2965;SC=CCATGACAACCGGGTCATTCC;SOR=1.144;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=188;TCF=75;TCR=113;TR=188;WE=11138691;WS=11138673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr12	11138852	rs1376251	C	T	1808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.830;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=18;PP=1340;ReadPosRankSum=1.891;SC=GAGATGTTTACACAGAGAACA;SOR=1.414;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=103;TCF=67;TCR=36;TR=63;WE=11138860;WS=11138842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,67:0.62:108
chr12	11149532	rs1450839	A	G	1866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-6.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.082;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=12;PP=1408;ReadPosRankSum=-0.322;SC=CACACAATGCACCTCTTGTGA;SOR=0.999;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=124;TCF=104;TCR=20;TR=80;WE=11149540;WS=11149522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,81:0.65:125
chr12	11149711	rs10845279	C	A	3332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=1.450;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.31;ReadPosRankSum=-1.604;SOR=0.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,88:0.62:143
chr12	11149720	rs10845280	A	G	2923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=3.408;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.84;ReadPosRankSum=1.194;SOR=0.424;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,74:0.58:128
chr12	11149769	rs10845281	T	C	2291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.771;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=28;PP=1876;ReadPosRankSum=-0.982;SC=GCAAGTAATATGAGGAAGGAG;SOR=1.446;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=111;TCF=68;TCR=43;TR=82;WE=11149777;WS=11149759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,83:0.73:114
chr12	11150033	rs12226919	G	T	4641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.714;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=107;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.167;SC=ATATACGTGTGTTTCATCACA;SOR=1.145;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=241;TCF=88;TCR=153;TR=158;WE=11150062;WS=11150023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,167:0.66:253
chr12	11150046	rs12226920	G	T	5986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FS=4.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.05;ReadPosRankSum=1.176;SOR=1.021;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,153:0.64:239
chr12	11150054	rs79420812	C	T	6029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FS=2.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.31;ReadPosRankSum=1.365;SOR=0.855;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,156:0.63:248
chr12	11150319	rs11054143	T	C	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.402;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=16;PP=1045;ReadPosRankSum=-0.774;SC=CTCTGGAGACTGCCAGAGCAG;SOR=1.667;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=71;TCF=44;TCR=27;TR=50;WE=11150327;WS=11150309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,54:0.72:75
chr12	11150540	rs34965724	CA	C	744.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.818;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=803;ReadPosRankSum=0.116;SC=CTCTGATATTCAAGACTTTAA;SOR=1.352;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=22;WE=11150559;WS=11150530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr12	11150551	rs4388985	G	A	1419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=32;PP=1356;SC=AAGACTTTAAGTTAAATATGC;SOR=3.383;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=38;WE=11150559;WS=11150530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	11150579	rs1463237	C	T	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=29;PP=874;SC=TCCTGAATGTCCAATAACATT;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=11150587;WS=11150569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	11174168	.	T	C	1198	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=52;MMLQ=29;MQ=56.28;NF=14;NR=2;PP=1198;QD=77.0482007842;SC=GAAAAACTGATAGAAATATAA;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=49;TCF=46;TCR=3;TR=16;WE=11174194;WS=11174167;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:33,16:0.33:49
chr12	11174202	.	G	C	2137	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=7;HapScore=1;MGOF=45;MMLQ=29;MQ=56.34;NF=22;NR=2;PP=2137;QD=90.4904671895;SC=CCATCAGTTTGTTTTCTGCTA;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=78;TCF=73;TCR=5;TR=24;WE=11174231;WS=11174192;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:54,24:0.31:78
chr12	11174213	rs114463974	G	A	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=2.309;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQRankSum=-8.569;QD=1.40;ReadPosRankSum=-2.070;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,8:0.11:75
chr12	11174219	rs79407997	C	A	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQRankSum=-8.892;QD=4.10;ReadPosRankSum=-3.032;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,13:0.16:81
chr12	11174223	rs74363809	G	C	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=1.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQRankSum=-9.322;QD=4.00;ReadPosRankSum=-2.358;SOR=1.222;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,15:0.17:89
chr12	11174261	rs75441696	C	G	1252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=3.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.28;MQRankSum=-9.774;QD=9.21;ReadPosRankSum=0.316;SOR=1.121;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,36:0.26:136
chr12	11174264	rs77074409	C	A	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=5.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQRankSum=-9.531;QD=9.93;ReadPosRankSum=0.114;SOR=1.344;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,39:0.28:138
chr12	11174271	rs79475879	T	C	1766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=3.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.43;MQRankSum=-9.099;QD=11.40;ReadPosRankSum=0.129;SOR=1.050;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,46:0.30:155
chr12	11174276	rs10772420	G	A	3034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.51;MQRankSum=-6.052;QD=17.54;ReadPosRankSum=-0.510;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,87:0.50:173
chr12	11174277	.	T	C	1982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.000;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=7.007;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQRankSum=-8.950;QD=11.40;ReadPosRankSum=-0.102;SOR=1.316;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,55:0.32:174
chr12	11174282	rs74386164	T	C	2383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=9.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQRankSum=-8.442;QD=12.61;ReadPosRankSum=-0.582;SOR=1.365;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,64:0.34:189
chr12	11174286	rs77837442	C	A	2311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=6.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.65;MQRankSum=-8.060;QD=12.30;ReadPosRankSum=-0.746;SOR=1.212;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,66:0.35:188
chr12	11174302	rs72475480	A	G	2000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.174;HP=2;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.722;NF=57;NR=24;PP=1519;ReadPosRankSum=0.328;SC=AACTGAAAGAAAGGTCTGTTT;SOR=1.003;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=228;TCF=153;TCR=75;TR=81;WE=11174310;WS=11174292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,82:0.35:231
chr12	11174327	rs72475481	C	T	2077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.018;HP=2;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.888;NF=52;NR=37;PP=1476;ReadPosRankSum=1.098;SC=TTCCTACTTCCCATAATCAGG;SOR=0.778;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=246;TCF=143;TCR=103;TR=89;WE=11174335;WS=11174317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,90:0.36:252
chr12	11174372	rs74772077	C	G	2637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQRankSum=-5.750;QD=11.37;ReadPosRankSum=-0.104;SOR=0.794;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,79:0.34:232
chr12	11174380	rs76970958	C	T	2532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=6.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQRankSum=-6.412;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.146;SOR=1.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,71:0.33:212
chr12	11174390	rs74992161	G	A	2372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=5.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.29;MQRankSum=-7.082;QD=12.42;ReadPosRankSum=-0.954;SOR=1.145;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,65:0.34:191
chr12	11174397	rs76455106	T	A	2162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=12.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQRankSum=-7.670;QD=12.02;ReadPosRankSum=-0.698;SOR=1.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,59:0.33:180
chr12	11174416	rs112900131	A	G	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=38.871;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-9.203;NF=4;NR=42;PP=867;ReadPosRankSum=0.136;SC=CTGTGTCCTAAGATTCCAAGT;SOR=3.929;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=151;TCF=35;TCR=116;TR=46;WE=11174424;WS=11174406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,47:0.30:156
chr12	11174466	rs199592952	G	A	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=72.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.82;MQRankSum=-11.255;QD=5.29;ReadPosRankSum=1.069;SOR=5.054;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,25:0.19:129
chr12	11174476	rs200081075	G	A	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=69.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQRankSum=-11.619;QD=3.66;ReadPosRankSum=1.336;SOR=4.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,21:0.15:137
chr12	11174478	.	C	A	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.836;ClippingRankSum=0.000;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=69.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQRankSum=-11.619;QD=3.66;ReadPosRankSum=0.901;SOR=4.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,21:0.15:137
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chr12	11175087	rs12313469	G	A	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.278;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.111;NF=24;NR=22;PP=829;ReadPosRankSum=2.065;SC=CATTTACTAGGGCTATGAAGC;SOR=0.291;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=134;TCF=81;TCR=53;TR=46;WE=11175095;WS=11175077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,49:0.35:139
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chr12	11183174	.	C	T	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.850;ClippingRankSum=0.000;DP=363;ExcessHet=3.0103;FS=34.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.43;MQRankSum=-8.168;QD=0.14;ReadPosRankSum=0.182;SOR=3.343;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:334,27:0.07:361
chr12	11183217	rs10772423	C	T	1780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.949;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-11.427;NF=42;NR=50;PP=1567;ReadPosRankSum=0.714;SC=AGAAAGTAAACGGCACATAAC;SOR=0.506;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=313;TCF=124;TCR=189;TR=92;WE=11183225;WS=11183207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:232,81:0.26:313
chr12	11183255	rs10845293	G	A	2275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.533;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-7.203;NF=57;NR=46;PP=2007;ReadPosRankSum=-1.620;SC=AGTTTGCAAAGCTTTTATGTG;SOR=0.997;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=318;TCF=161;TCR=157;TR=103;WE=11183263;WS=11183245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:224,96:0.30:320
chr12	11183286	rs10845294	G	C	2179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.830;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.793;NF=63;NR=31;PP=1803;ReadPosRankSum=0.260;SC=CTGGGATCTTGAGATCCTTTA;SOR=1.331;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=298;TCF=186;TCR=112;TR=94;WE=11183294;WS=11183276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,91:0.30:301
chr12	11183451	rs10743938	A	T	10510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=136;NR=184;PP=2965;SC=TTCCAAGTCAAGTTTCCTTCA;SOR=1.186;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=320;TCF=136;TCR=184;TR=320;WE=11183459;WS=11183441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,319:1.00:319
chr12	11183496	rs199736450	T	C	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=86.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQRankSum=-15.343;QD=1.55;ReadPosRankSum=-0.175;SOR=6.272;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:215,22:0.09:237
chr12	11183506	rs115707514	T	A	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FS=83.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQRankSum=-15.639;QD=2.80;ReadPosRankSum=-1.155;SOR=3.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:213,34:0.14:247
chr12	11183524	rs75159539	T	C	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FS=74.308;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQRankSum=-15.571;QD=3.22;ReadPosRankSum=0.635;SOR=2.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:204,42:0.17:246
chr12	11183576	rs72475488	T	C	1420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.562;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.488;NF=48;NR=38;PP=1349;ReadPosRankSum=1.270;SC=CCTCTTTAAGTGAAGAAAAAT;SOR=1.389;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=257;TCF=126;TCR=131;TR=86;WE=11183584;WS=11183566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,71:0.29:246
chr12	11183642	rs73049067	A	G	3770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.761;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.130;NF=66;NR=65;PP=2962;ReadPosRankSum=2.429;SC=GCTAGTAGCAAGCCAGTTGCT;SOR=0.807;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=331;TCF=168;TCR=163;TR=131;WE=11183650;WS=11183632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,146:0.41:356
chr12	11183676	rs73049072	C	T	3786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.167;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.988;NF=55;NR=64;PP=2549;ReadPosRankSum=-0.578;SC=ACTGCCCAGACATTATAAGCA;SOR=0.476;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=289;TCF=121;TCR=168;TR=119;WE=11183684;WS=11183666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,138:0.43:320
chr12	11183697	rs73049074	C	A	2767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-5.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.871;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-10.003;NF=35;NR=61;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.198;SC=GTAGTTCTTACTTCTACACTA;SOR=0.516;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=248;TCF=85;TCR=163;TR=96;WE=11183730;WS=11183687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,106:0.39:270
chr12	11183708	rs80125932	T	C	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FS=1.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.98;MQRankSum=-6.696;QD=5.02;ReadPosRankSum=-0.230;SOR=0.891;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:180,59:0.25:239
chr12	11183722	rs78562467	A	C	2242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.650;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-10.927;NF=20;NR=56;PP=2962;ReadPosRankSum=0.000;SC=AAGCTGGATTAAACACAGTTG;SOR=0.939;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=206;TCF=62;TCR=144;TR=76;WE=11183730;WS=11183687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,79:0.36:219
chr12	11183752	rs72475489	T	C	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=71.339;HP=3;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-12.480;NF=1;ReadPosRankSum=1.605;SC=TTAATAATAATACCCAGAGCA;SOR=6.559;SbPval=1.0;Source=Platypus;TCF=43;WE=11183760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,45:0.27:166
chr12	11183793	.	G	C	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.405;ClippingRankSum=0.000;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=89.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.41;MQRankSum=-11.588;QD=4.87;ReadPosRankSum=-0.373;SOR=6.803;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,29:0.18:159
chr12	11183797	.	C	T	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.078;ClippingRankSum=0.000;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=88.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQRankSum=-11.467;QD=4.73;ReadPosRankSum=0.058;SOR=6.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,27:0.17:157
chr12	11183809	.	A	G	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.667;ClippingRankSum=0.000;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=81.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.79;MQRankSum=-10.869;QD=3.55;ReadPosRankSum=0.676;SOR=6.357;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,23:0.15:157
chr12	11183827	.	G	C	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=0.000;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=80.387;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.07;MQRankSum=-9.815;QD=2.41;ReadPosRankSum=-0.607;SOR=5.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,17:0.13:135
chr12	11183832	rs10845295	G	A	1457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=8.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQRankSum=-6.311;QD=11.04;ReadPosRankSum=-1.041;SOR=0.263;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,52:0.39:132
chr12	11183836	.	AA	GG	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.000;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=65.997;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQRankSum=-9.240;QD=1.45;ReadPosRankSum=0.189;SOR=5.279;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,13:0.10:131
chr12	11183851	.	T	C	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.072;ClippingRankSum=0.000;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=48.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQRankSum=-9.287;QD=0.41;ReadPosRankSum=-1.086;SOR=4.972;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,11:0.08:142
chr12	11199734	rs2597984	T	C	2266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=71;PP=1769;SC=TTTAAAAAGCTGGCGCCTTCT;SOR=3.834;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=10;TCR=71;TR=81;WE=11199742;WS=11199724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr12	11201689	rs2597986	C	T	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=4;PP=518;SC=AGTAAACCAACTCTGGACACC;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=11201697;WS=11201679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	11201846	rs199838132	A	C	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=22.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQRankSum=-7.861;QD=6.42;ReadPosRankSum=-1.815;SOR=2.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,18:0.22:80
chr12	11201850	.	TATC	T	473.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=0.000;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=26.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQRankSum=-8.209;QD=5.85;ReadPosRankSum=-1.794;SOR=2.095;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,17:0.21:81
chr12	11201865	.	AAT	A	510.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=17.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQRankSum=-7.475;QD=7.40;ReadPosRankSum=-3.389;SOR=1.277;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,15:0.22:69
chr12	11201868	.	G	C	480.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.390;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=14.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQRankSum=-7.326;QD=7.18;ReadPosRankSum=-2.901;SOR=1.103;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,14:0.21:67
chr12	11201872	.	AG	A	435.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.882;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=9.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQRankSum=-7.436;QD=6.92;ReadPosRankSum=-3.077;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,14:0.22:63
chr12	11201875	.	AAG	A	405.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=12.175;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQRankSum=-7.241;QD=6.76;ReadPosRankSum=-3.384;SOR=0.600;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,14:0.23:60
chr12	11201889	rs72475501	C	G	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.145;NF=1;NR=12;PP=158;ReadPosRankSum=0.131;SC=AAAAATGCAGCCTTAATAACA;SOR=0.542;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=51;TCF=7;TCR=44;TR=13;WE=11201897;WS=11201879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,8:0.17:46
chr12	11201928	rs74318546	C	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQRankSum=-4.666;QD=5.34;ReadPosRankSum=-0.054;SOR=0.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
chr12	11201933	rs79649094	T	C	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQRankSum=-4.574;QD=5.63;ReadPosRankSum=-0.504;SOR=0.089;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr12	11201934	rs75574044	G	T	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQRankSum=-4.480;QD=5.84;ReadPosRankSum=-0.905;SOR=0.096;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr12	11201950	rs76847966	C	T	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQRankSum=-3.598;QD=3.92;ReadPosRankSum=-1.448;SOR=0.045;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,2:0.13:15
chr12	11201962	rs2597987	T	C	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=517;SC=TTTAAATGTGTAGTAACATTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=11201970;WS=11201940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	11214066	.	T	C	2442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.109;ClippingRankSum=0.000;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=13.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQRankSum=-20.742;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.042;SOR=1.699;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:411,89:0.18:500
chr12	11214074	rs200528237	T	C	2652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=10.004;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQRankSum=-20.856;QD=5.42;ReadPosRankSum=-0.889;SOR=1.457;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:397,92:0.19:489
chr12	11214080	.	G	A	2864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.994;ClippingRankSum=0.000;DP=496;ExcessHet=3.0103;FS=6.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQRankSum=-21.263;QD=5.80;ReadPosRankSum=-0.937;SOR=1.348;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:398,96:0.19:494
chr12	11214082	.	T	C	2921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.075;ClippingRankSum=0.000;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=8.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQRankSum=-21.357;QD=5.87;ReadPosRankSum=-0.811;SOR=1.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:401,97:0.19:498
chr12	11214091	.	G	C	3158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.788;ClippingRankSum=0.000;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=5.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.34;MQRankSum=-21.846;QD=6.15;ReadPosRankSum=-0.451;SOR=1.140;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:410,104:0.20:514
chr12	11214101	.	C	G	2762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.937;ClippingRankSum=0.000;DP=507;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.50;MQRankSum=-21.846;QD=5.49;ReadPosRankSum=2.132;SOR=0.694;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:408,95:0.19:503
chr12	11214133	rs76020872	C	T	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=448;ExcessHet=3.0103;FS=4.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQRankSum=-20.922;QD=4.41;ReadPosRankSum=1.618;SOR=1.143;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:366,78:0.18:444
chr12	11214137	rs76147157	C	T	1923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=438;ExcessHet=3.0103;FS=4.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQRankSum=-20.693;QD=4.43;ReadPosRankSum=1.221;SOR=1.046;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:360,74:0.17:434
chr12	11214153	.	C	T	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.313;ClippingRankSum=0.000;DP=394;ExcessHet=3.0103;FS=1.146;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQRankSum=-19.683;QD=2.92;ReadPosRankSum=-0.235;SOR=0.780;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:337,54:0.14:391
chr12	11214156	.	G	T	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.590;ClippingRankSum=0.000;DP=380;ExcessHet=3.0103;FS=1.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.79;MQRankSum=-19.337;QD=2.78;ReadPosRankSum=-0.445;SOR=0.844;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:328,49:0.13:377
chr12	11214161	.	TG	CA	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.914;ClippingRankSum=0.000;DP=354;ExcessHet=3.0103;FS=3.085;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQRankSum=-18.669;QD=2.54;ReadPosRankSum=-0.142;SOR=0.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:312,39:0.11:351
chr12	11214167	.	G	C	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.556;ClippingRankSum=0.000;DP=344;ExcessHet=3.0103;FS=2.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQRankSum=-18.400;QD=1.86;ReadPosRankSum=-1.945;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:303,38:0.11:341
chr12	11214212	rs2708380	A	T	2275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-9.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.155;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.041;NF=40;NR=53;PP=1815;ReadPosRankSum=0.049;SC=ACAGTTTGCAAAGCTTTTATG;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=272;TCF=118;TCR=154;TR=93;WE=11214220;WS=11214202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,94:0.35:270
chr12	11214273	rs377505981	T	C	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FS=0.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQRankSum=-12.588;QD=0.11;ReadPosRankSum=-0.175;SOR=0.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:282,25:0.08:307
chr12	11214299	rs376020270	T	C	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FS=25.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.90;MQRankSum=-16.258;QD=3.42;ReadPosRankSum=0.247;SOR=1.974;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:321,60:0.16:381
chr12	11214324	.	C	T	1772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.320;ClippingRankSum=0.000;DP=455;ExcessHet=3.0103;FS=20.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQRankSum=-18.294;QD=3.91;ReadPosRankSum=2.704;SOR=2.305;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:384,69:0.15:453
chr12	11214326	.	G	C	1742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.544;ClippingRankSum=0.000;DP=459;ExcessHet=3.0103;FS=17.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.00;MQRankSum=-18.570;QD=3.81;ReadPosRankSum=2.298;SOR=2.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:386,71:0.16:457
chr12	11214330	.	G	A	1805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.264;ClippingRankSum=0.000;DP=456;ExcessHet=3.0103;FS=20.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQRankSum=-20.123;QD=3.98;ReadPosRankSum=2.738;SOR=2.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:386,68:0.15:454
chr12	11214336	rs371367179	A	T	1636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=474;ExcessHet=3.0103;FS=27.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQRankSum=-21.622;QD=3.47;ReadPosRankSum=1.790;SOR=2.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:401,71:0.15:472
chr12	11214351	.	G	C	1808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.461;ClippingRankSum=0.000;DP=491;ExcessHet=3.0103;FS=26.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQRankSum=-22.009;QD=3.70;ReadPosRankSum=-0.911;SOR=2.672;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:416,73:0.15:489
chr12	11214360	rs73260771	C	T	3154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=479;ExcessHet=3.0103;FS=1.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQRankSum=0.000;QD=7.75;ReadPosRankSum=-2.197;SOR=0.797;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:271,136:0.33:407
chr12	11214363	.	T	C	1934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=0.000;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=22.577;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQRankSum=-20.784;QD=4.09;ReadPosRankSum=-3.538;SOR=1.972;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:397,76:0.16:473
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chr12	11214386	rs200171449	T	G	2150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=445;ExcessHet=3.0103;FS=7.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQRankSum=-17.413;QD=4.87;ReadPosRankSum=-2.114;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:359,83:0.19:442
chr12	11214392	rs200937291	G	A	1864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=432;ExcessHet=3.0103;FS=5.781;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.06;MQRankSum=-16.617;QD=4.37;ReadPosRankSum=0.813;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:352,75:0.18:427
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chr12	11243783	.	C	T	533	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=36;MMLQ=28;MQ=47.99;NF=20;NR=0;PP=533;QD=28.3885606274;SC=TCTAGGTATACGTTTGGAAAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=20;WE=11243791;WS=11243764;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:29,20:0.41:49
chr12	11244001	rs201196515	T	C	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=38.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.42;MQRankSum=-4.911;QD=1.59;ReadPosRankSum=-0.297;SOR=3.939;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:206,24:0.10:230
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chr12	11244017	rs201618803	T	C	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=37.722;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.55;MQRankSum=-5.216;QD=1.08;ReadPosRankSum=0.623;SOR=4.323;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:215,23:0.10:238
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chr12	11244067	.	A	ATT	818.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.558;ClippingRankSum=0.000;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=26.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.44;MQRankSum=-8.228;QD=3.54;ReadPosRankSum=-0.367;SOR=2.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:197,34:0.15:231
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chr12	11244091	rs199768488	C	T	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FS=10.197;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.53;MQRankSum=-8.728;QD=5.93;ReadPosRankSum=0.356;SOR=0.983;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,44:0.18:239
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chr12	11244102	rs199943442	G	C	1727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.49;MQRankSum=-9.195;QD=7.32;ReadPosRankSum=-1.014;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:181,55:0.23:236
chr12	11244126	rs113410031	G	A	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FS=2.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.63;MQRankSum=-5.545;QD=0.60;ReadPosRankSum=0.339;SOR=0.422;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:219,28:0.11:247
chr12	11244149	rs73064964	G	A	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.156;HP=3;HapScore=1;MGOF=56;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-6.806;NF=25;NR=60;PP=1765;ReadPosRankSum=3.808;SC=AGTTTGCAAAGCTTTTATGTG;SOR=1.467;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=251;TCF=88;TCR=163;TR=85;WE=11244157;WS=11244139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,60:0.26:233
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chr12	11244169	rs201144595	G	A	1671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-6.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=24.907;HP=1;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-5.490;NF=22;NR=44;PP=2962;ReadPosRankSum=0.441;SC=GGACCTTGGTGCTGGGATCTT;SOR=2.124;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=213;TCF=94;TCR=119;TR=66;WE=11244177;WS=11244156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,51:0.25:203
chr12	11244190	rs202034865	A	G	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=13.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.01;MQRankSum=-5.661;QD=4.15;ReadPosRankSum=-3.144;SOR=1.664;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,29:0.17:174
chr12	11244194	rs71443637	T	C	3798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.859;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=5.588;NF=73;NR=62;PP=2962;ReadPosRankSum=3.243;SC=TCCTTTACCATGGAGCTGCAT;SOR=0.529;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=170;TCF=87;TCR=83;TR=135;WE=11244202;WS=11244180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,139:0.86:161
chr12	11244369	.	GC	AT	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=0.000;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=2.200;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.71;MQRankSum=-13.168;QD=1.08;ReadPosRankSum=-1.973;SOR=0.984;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:160,15:0.09:175
chr12	11244378	rs201455884	C	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=4.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQRankSum=-13.618;QD=1.71;ReadPosRankSum=-1.203;SOR=1.225;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:174,23:0.12:197
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chr12	11244634	rs200893955	G	A	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=19.986;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQRankSum=-8.484;QD=1.94;ReadPosRankSum=-0.459;SOR=2.406;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,15:0.16:96
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chr12	11244721	rs201281372	G	C	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=5.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQRankSum=-9.484;QD=3.78;ReadPosRankSum=-0.768;SOR=0.212;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,16:0.16:101
chr12	11244723	rs191086711	A	C	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=4.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.69;MQRankSum=-9.389;QD=4.10;ReadPosRankSum=-1.065;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,16:0.16:99
chr12	11244725	rs68157013	C	G	2203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=9.436;NF=68;NR=17;PP=2962;ReadPosRankSum=0.079;SC=TCTCTTGAACCACTCAATGGA;SOR=0.920;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=103;TCF=80;TCR=23;TR=85;WE=11244753;WS=11244711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,87:0.86:101
chr12	11244730	rs199862459	AA	GG	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=1.449;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQRankSum=-9.655;QD=2.08;ReadPosRankSum=0.921;SOR=0.379;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,13:0.12:107
chr12	11244744	rs201819808	GT	AC	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=4.479;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQRankSum=-10.839;QD=3.13;ReadPosRankSum=-0.101;SOR=1.389;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,17:0.14:125
chr12	11244793	rs368569282	C	T	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=25.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.90;MQRankSum=-13.899;QD=2.09;ReadPosRankSum=4.528;SOR=3.087;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:172,23:0.12:195
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chr12	11244805	.	A	T	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0.000;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=31.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQRankSum=-13.587;QD=3.51;ReadPosRankSum=-0.443;SOR=2.821;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:159,28:0.15:187
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chr12	11244855	.	T	A	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.259;ClippingRankSum=0.000;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=1.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQRankSum=-11.759;QD=4.00;ReadPosRankSum=5.226;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,25:0.16:155
chr12	11244871	.	G	A	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.000;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=7.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQRankSum=-10.274;QD=6.01;ReadPosRankSum=5.085;SOR=0.151;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,25:0.21:120
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chr12	11286088	rs2599404	A	C	3216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=406;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=79;PP=2672;ReadPosRankSum=-1.455;SC=CCAGCCTCCCAAAATTACAAA;SOR=0.689;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=389;TCF=162;TCR=227;TR=137;WE=11286096;WS=11286078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:267,137:0.34:404
chr12	11286249	rs77777159	T	C	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.06;MQRankSum=-10.370;QD=2.70;ReadPosRankSum=0.984;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:307,53:0.15:360
chr12	11286274	.	C	T	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.257;ClippingRankSum=0.000;DP=416;ExcessHet=3.0103;FS=14.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQRankSum=-15.039;QD=0.95;ReadPosRankSum=0.222;SOR=2.468;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:375,37:0.09:412
chr12	11286276	.	G	C	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=0.000;DP=415;ExcessHet=3.0103;FS=18.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQRankSum=-15.531;QD=0.86;ReadPosRankSum=0.253;SOR=2.715;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:375,36:0.09:411
chr12	11286280	.	G	A	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=0.000;DP=412;ExcessHet=3.0103;FS=20.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQRankSum=-17.283;QD=0.74;ReadPosRankSum=-0.433;SOR=3.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:372,36:0.09:408
chr12	11286282	.	G	A	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.337;ClippingRankSum=0.000;DP=421;ExcessHet=3.0103;FS=18.046;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQRankSum=-18.224;QD=0.83;ReadPosRankSum=-0.424;SOR=2.971;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:381,36:0.09:417
chr12	11286702	rs113026132	G	C	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=49.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.37;MQRankSum=-13.049;QD=1.80;ReadPosRankSum=-0.119;SOR=4.840;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:160,28:0.15:188
chr12	11286713	rs113799622	A	G	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=49.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.90;MQRankSum=-13.271;QD=3.09;ReadPosRankSum=0.719;SOR=4.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,33:0.18:188
chr12	11286736	rs112605675	G	C	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=39.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.61;MQRankSum=-11.806;QD=5.81;ReadPosRankSum=1.102;SOR=3.890;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,38:0.20:189
chr12	11286745	.	AA	GG	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.675;ClippingRankSum=0.000;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=36.357;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.62;MQRankSum=-11.530;QD=5.62;ReadPosRankSum=2.064;SOR=3.664;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,38:0.20:192
chr12	11286760	.	T	C	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.701;ClippingRankSum=0.000;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=5.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.11;MQRankSum=-10.907;QD=2.46;ReadPosRankSum=0.354;SOR=1.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:170,40:0.19:210
chr12	11286790	rs2600355	A	C	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=13.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.16;MQRankSum=-5.848;QD=1.85;ReadPosRankSum=-0.721;SOR=1.339;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:188,34:0.15:222
chr12	11286797	.	A	G	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.000;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=18.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.79;MQRankSum=-8.974;QD=3.78;ReadPosRankSum=-2.841;SOR=1.866;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:180,35:0.16:215
chr12	11286807	rs113282241	T	C	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=41.882;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.65;MQRankSum=-8.541;QD=4.03;ReadPosRankSum=-1.340;SOR=3.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:186,36:0.16:222
chr12	11286820	rs111958076	A	T	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=62.576;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.48;MQRankSum=-7.705;QD=2.15;ReadPosRankSum=0.640;SOR=6.153;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:187,35:0.16:222
chr12	11286883	.	A	T	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.199;ClippingRankSum=0.000;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=2.264;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.92;MQRankSum=-3.093;QD=2.37;ReadPosRankSum=-3.907;SOR=1.009;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,16:0.13:125
chr12	11286884	.	A	G	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.368;ClippingRankSum=0.000;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=2.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.78;MQRankSum=-3.163;QD=2.37;ReadPosRankSum=-3.656;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,15:0.12:125
chr12	11286887	.	T	TCCGGAGTTGGTTCCTG	264.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.159;ClippingRankSum=0.000;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.21;MQRankSum=-3.223;QD=2.19;ReadPosRankSum=-4.564;SOR=0.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,15:0.12:121
chr12	11338514	rs199861447	GAA	G	643.27	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.43;MQRankSum=0.588;QD=42.88;ReadPosRankSum=-0.766;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,13:0.87:15
chr12	11338539	rs1650016	C	A	2027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=45;NR=2;PP=1242;SC=AAACAGTGGACGTGATCCCCA;SOR=5.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=45;TCR=2;TR=47;WE=11338547;WS=11338529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	11338555	rs1669409	A	T	2387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=4;PP=1584;SC=CCCCAAATGCACCTCGTTGAG;SOR=4.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=56;TCR=4;TR=58;WE=11338563;WS=11338545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	11338613	rs1650017	CA	GG	6512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=38;PP=2947;SC=AAAGGTAAAGCATTTGGTGTT;SOR=1.997;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=142;TCF=101;TCR=41;TR=130;WE=11338622;WS=11338603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr12	11338781	rs1669413	C	A	3371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=70;PP=2744;SC=AAAAATATCCCATTGGCCACT;SOR=1.958;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=28;TCR=70;TR=98;WE=11338789;WS=11338771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr12	11338957	rs5020531	A	G	2429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=33;PP=1889;SC=GGAGGTCAGGAACAGAGAAAA;SOR=0.864;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=37;TCR=33;TR=70;WE=11338965;WS=11338947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	11338983	rs1650019	T	C	2659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=41;PP=1995;SC=TAAAACTGGTTAAGCTGAGAA;SOR=0.846;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=35;TCR=41;TR=76;WE=11338991;WS=11338973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	11339020	rs35969491	T	A	2888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=50;PP=2213;SC=GAGTTTATCATAGAGAGTTTT;SOR=1.204;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=32;TCR=50;TR=82;WE=11339028;WS=11339010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr12	11418954	rs1896551	A	G	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=716;SC=TCATCTTCTTATTCACTTCCT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=11418962;WS=11418944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	11421093	rs61463237	T	TGGG	2336.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=37;PP=2409;SC=CTGGAGGAGGTGGACACACGG;SOR=1.480;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=13;TCR=43;TR=48;WE=11421101;WS=11421083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	11461292	rs1052808	C	G	1702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=25;PP=1301;SC=TTGCCTCCTGCTGGGGGTGGG;SOR=0.841;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=29;TCR=25;TR=54;WE=11461300;WS=11461282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	11461470	rs1052807	A	G	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=22;PP=1311;SC=GGGACTGGTTACCTCCTTGTG;SOR=1.077;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=31;TCR=22;TR=53;WE=11461478;WS=11461460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	11461553	rs11054244	T	C	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=5.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.78;MQRankSum=-1.969;QD=3.93;ReadPosRankSum=-1.835;SOR=1.629;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,11:0.23:47
chr12	11461570	rs59189129	G	T	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.87;MQRankSum=-0.500;QD=13.24;ReadPosRankSum=-1.288;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr12	11461580	rs12303607	T	G	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.064;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.01;MQRankSum=0.090;QD=7.56;ReadPosRankSum=-3.984;SOR=0.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr12	11461706	rs12308381	G	T	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=15.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.73;MQRankSum=-5.827;QD=1.57;ReadPosRankSum=-1.983;SOR=0.900;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,18:0.18:102
chr12	11461802	rs12829245	G	A	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.781;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.547;NF=11;NR=26;PP=529;ReadPosRankSum=0.314;SC=TGTGGGCGTCGTCCTTCTGGC;SOR=0.914;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=95;TCF=29;TCR=66;TR=37;WE=11461810;WS=11461792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,38:0.38:100
chr12	11461836	rs6488386	T	C	3179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=69;PP=2326;SC=GTGGGGGACATACGGCATTCA;SOR=3.206;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=12;TCR=69;TR=81;WE=11461844;WS=11461826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr12	11462275	rs1834857	A	G	3074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=45;PP=2498;SC=AAGGGAGTCAAAACAGATTGA;SOR=0.757;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=49;TCR=45;TR=94;WE=11462283;WS=11462265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr12	11506211	rs76504934	A	C	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.237;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.046;NF=18;NR=14;PP=688;ReadPosRankSum=0.955;SC=CCTGGAGGAGATCGGGCACTT;SOR=0.495;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=32;WE=11506219;WS=11506201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr12	11506893	rs10845341	C	T	1795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=35;PP=1511;SC=GTGGGGGGCCCTGGGGCTTGT;SOR=1.047;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=25;TCR=35;TR=60;WE=11506901;WS=11506883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	11507545	rs144071415	A	G	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=0.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQRankSum=-1.581;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.564;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,44:0.27:164
chr12	11545953	rs185711312	G	T	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.217;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.246;NF=6;NR=9;PP=218;ReadPosRankSum=-1.348;SC=GGGACTTGCTGCCTCCTTGTG;SOR=1.341;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=52;TCF=29;TCR=23;TR=15;WE=11545961;WS=11545943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,12:0.30:40
chr12	11547493	rs2416788	C	A	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=6.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQRankSum=-9.163;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.000;SOR=1.149;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:168,51:0.23:219
chr12	11547624	rs140288820	G	T	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.389;NF=0;NR=16;PP=285;ReadPosRankSum=1.672;SC=GGAGGAAGGTGTAAGGGGAGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=16;WE=11547632;WS=11547614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,17:0.32:53
chr12	11548436	rs2272511	A	G	1635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.58;MQRankSum=0.235;QD=6.24;ReadPosRankSum=-0.338;SOR=0.682;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:185,77:0.29:262
chr12	11803220	rs2856305	A	C	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.90;QD=40.65;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	11903726	rs199664048	CTTTTTTTTTTTTTTT	C	716.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=20;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=3.085;NF=26;NR=0;PP=2348;ReadPosRankSum=0.697;SC=TATGTGTGGGCTTTTTTTTTT;SOR=1.131;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=26;WE=11903760;WS=11903716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr12	11903751	rs149457743	TGC	T	616.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=20;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-4.154;NF=26;NR=0;PP=1422;ReadPosRankSum=-3.773;SC=TTTTTTTTTTTGCTTTTTTCA;SOR=1.121;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=26;WE=11903760;WS=11903716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr12	11904752	rs2856338	T	C	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.384;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=456;ReadPosRankSum=-0.132;SC=ATATTCATTATTGTTGCAGAT;SOR=1.404;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=70;TCF=54;TCR=16;TR=26;WE=11904760;WS=11904742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,27:0.36:76
chr12	11904767	rs10845410	C	T	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=5.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.05;ReadPosRankSum=1.212;SOR=1.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,29:0.31:93
chr12	11904770	rs2724599	A	T	985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=4.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.60;ReadPosRankSum=1.369;SOR=1.222;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,29:0.31:93
chr12	11904983	rs2724600	A	G	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.102;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=232;ReadPosRankSum=1.453;SC=AGAAGAGAAAACATGGCTTTA;SOR=2.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=11;WE=11904991;WS=11904973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr12	12006544	rs17210957	G	A	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=3.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.74;ReadPosRankSum=2.729;SOR=1.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,21:0.28:74
chr12	12044494	rs113420500	C	T	2247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.020;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=28;PP=1777;ReadPosRankSum=-0.328;SC=TTTCCTGCCACGTGGATCAGG;SOR=0.274;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=129;TCF=91;TCR=38;TR=86;WE=12044502;WS=12044484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,87:0.67:130
chr12	12230938	rs1641721	C	G	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.147;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=455;ReadPosRankSum=0.341;SC=GGAAATTGAACAAAATCAGTT;SOR=0.253;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=61;TCF=4;TCR=57;TR=22;WE=12230946;WS=12230928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,23:0.35:65
chr12	12240199	rs879732	C	T	3314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=59;PP=2527;SC=AAATTGTTTACTCCTGGCCAC;SOR=1.036;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=41;TCR=59;TR=100;WE=12240207;WS=12240189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr12	12247594	rs11054682	A	G	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.40;ReadPosRankSum=-2.299;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,20:0.23:88
chr12	12247616	rs11054683	T	C	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.880;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=468;ReadPosRankSum=0.500;SC=AGATAAGGCTTTGATGGGCCA;SOR=0.950;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=95;TCF=50;TCR=45;TR=27;WE=12247624;WS=12247606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,26:0.28:94
chr12	12247921	rs71435888	AT	A	579.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=1.497;QD=8.65;ReadPosRankSum=1.129;SOR=0.612;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,43:0.64:67
chr12	12251711	rs2448031	C	T	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=517;ReadPosRankSum=-0.466;SC=TAGCTGATGTCTTCCTTGCAG;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=21;WE=12251719;WS=12251701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr12	12251761	rs1797646	C	G	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.205;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=9;PP=851;ReadPosRankSum=-0.852;SC=AACCCTCCCCCAAACTAACAT;SOR=0.253;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=62;TCF=51;TCR=11;TR=43;WE=12251769;WS=12251751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,42:0.68:62
chr12	12252078	rs1797647	T	G	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=143;ReadPosRankSum=0.064;SC=TCAGGAGAGGTCTCGTTCGTC;SOR=0.283;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=8;WE=12252086;WS=12252068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr12	12265118	rs55833207	CA	C	703.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.06;SOR=6.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	12278468	rs2302684	A	T	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=208;ReadPosRankSum=-0.941;SC=ACAGTGAAGTAGTCTGATTTT;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=12278476;WS=12278458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr12	12291479	rs2075241	G	C	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.126;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=561;ReadPosRankSum=1.843;SC=CTTGGAAAAGGAGAAAATTCA;SOR=1.884;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=72;TCF=7;TCR=65;TR=26;WE=12291487;WS=12291469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,27:0.38:72
chr12	12301898	rs2302685	C	T	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=1;PP=616;SC=TTTACCACAACGGCTCGAGGT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=12301906;WS=12301888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	12397668	rs10219768	T	A	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.49;ReadPosRankSum=1.482;SOR=1.819;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr12	12397668	.	TTA	ATT	1039	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=20;PP=1039;QD=54.6233937431;SC=TCAAATCGGTTTAAGTGAGCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=20;WE=12397678;WS=12397658;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,20:0.67:30
chr12	12397670	rs10219748	A	T	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.49;ReadPosRankSum=2.370;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,23:0.68:34
chr12	12482876	rs113872597	CCTG	C	599.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.817;NF=14;NR=0;PP=584;ReadPosRankSum=-0.426;SC=AATACAACCTCCTGCTAAGAC;SOR=2.531;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=14;WE=12482886;WS=12482866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr12	12483275	rs1861676	G	A	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.700;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=553;ReadPosRankSum=-1.193;SC=TTCAAAGTTAGGTTGGAGATT;SOR=0.596;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=104;TCF=56;TCR=48;TR=31;WE=12483283;WS=12483265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,33:0.31:108
chr12	12483318	rs3741801	C	T	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.175;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=538;ReadPosRankSum=0.794;SC=AGCTGCCTTTCGAGTCCGTAG;SOR=0.720;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=93;TCF=49;TCR=44;TR=31;WE=12483326;WS=12483308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,31:0.33:95
chr12	12483713	rs4763282	A	G	1554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.264;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=31;PP=1094;ReadPosRankSum=1.148;SC=AGTTTCTCCAAGTGATCTGAG;SOR=0.600;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=226;TCF=121;TCR=105;TR=65;WE=12483721;WS=12483703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,68:0.29:235
chr12	12483764	rs17375215	C	T	1482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FS=1.750;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.13;ReadPosRankSum=-1.963;SOR=0.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:174,68:0.28:242
chr12	12483927	rs4763818	G	A	3091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=84;PP=2557;SC=GAAGGCTTATGTAACTCCATG;SOR=3.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=11;TCR=84;TR=95;WE=12483935;WS=12483917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr12	12496011	rs3741799	G	T	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=27;ReadPosRankSum=0.389;SC=GGATTGCCAAGAAACCACTAT;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=4;WE=12496019;WS=12496001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr12	12496086	rs3741798	C	T	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=6;PP=871;ReadPosRankSum=-0.904;SC=GAAGTATATACGGGCTCATTG;SOR=0.535;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=56;TCR=9;TR=41;WE=12496094;WS=12496076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,43:0.64:67
chr12	12618427	rs3751261	C	T	3010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=11;PP=2412;ReadPosRankSum=-0.900;SC=CCCGGCCCTGCGGAGAGGACT;SOR=2.345;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=83;TCR=11;TR=93;WE=12618435;WS=12618417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,98:0.99:99
chr12	12618715	rs967648	T	C	1468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=49;PP=1177;SC=CTGTAGCTGCTGCCCGGCCTG;SOR=7.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=49;WE=12618723;WS=12618705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	12790427	rs35527447	C	T	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=384;ReadPosRankSum=-1.456;SC=ACCAGTGGTTCCTGAACTCTG;SOR=1.931;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=16;WE=12790435;WS=12790417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr12	12814818	rs4763862	C	T	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.802;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=532;ReadPosRankSum=0.192;SC=GCATCAAAGACCCACGATGCC;SOR=0.798;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=95;TCF=53;TCR=42;TR=32;WE=12814826;WS=12814808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,33:0.35:95
chr12	12871099	rs2066827	T	G	2729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=54;PP=2158;ReadPosRankSum=-1.010;SC=AGCCAGGATGTCAGCGGGAGC;SOR=0.737;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=136;TCF=56;TCR=80;TR=89;WE=12871107;WS=12871089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,94:0.67:140
chr12	12878765	rs66561220	T	C	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.013;SOR=0.253;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,10:0.20:51
chr12	12879057	rs34323	G	A	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.533;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.630;NF=6;NR=6;PP=177;ReadPosRankSum=0.570;SC=CGGGAGGGTGGAGGTGGCCCG;SOR=0.399;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=12;WE=12879065;WS=12879047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr12	12879254	rs7956514	T	G	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.966;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=306;ReadPosRankSum=-0.674;SC=GAGGAATATGTTAAAACAAAC;SOR=0.910;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=79;TCF=36;TCR=43;TR=21;WE=12879262;WS=12879244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,21:0.26:81
chr12	12939892	rs4763876	G	A	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.703;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=575;ReadPosRankSum=0.878;SC=GACGCGCTGCGGCGCTTCCAG;SOR=0.252;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=28;WE=12939900;WS=12939882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,27:0.79:34
chr12	12966967	rs7978823	A	G	2693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.246;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=14;PP=2218;ReadPosRankSum=1.562;SC=TTTAAATCAAATACAATGGTT;SOR=0.259;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=141;TCF=123;TCR=18;TR=93;WE=12966975;WS=12966957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,94:0.66:143
chr12	12982210	rs58862672	T	C	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=0.751;SC=AACATCTTTGTATATTTGGAG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=12982218;WS=12982202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr12	13101454	rs7294444	G	T	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=232;ReadPosRankSum=1.828;SC=TATGTGTGCTGTACAATATAT;SOR=0.696;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=76;TCF=32;TCR=44;TR=21;WE=13101462;WS=13101444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,23:0.29:80
chr12	13102605	rs4630382	G	A	1381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.189;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=25;PP=978;ReadPosRankSum=0.430;SC=CGACCGGGTCGTCCCACTGGG;SOR=0.596;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=192;TCF=115;TCR=77;TR=63;WE=13102613;WS=13102595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,66:0.34:196
chr12	13136623	rs735689	T	C	1865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.940;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=36;PP=1424;ReadPosRankSum=-2.858;SC=AACTCCGTGTTAAAAATTCCA;SOR=0.920;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=251;TCF=135;TCR=116;TR=84;WE=13136631;WS=13136613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,86:0.33:258
chr12	13142174	rs850918	C	G	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=195;ReadPosRankSum=-1.721;SC=CAAAGCTGGTCCCCGAGACCA;SOR=0.160;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=10;WE=13142182;WS=13142164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr12	13153126	.	C	CGGCGGCAGGGCGGCAG	210.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.466;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.40;ReadPosRankSum=-1.023;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr12	13153169	.	T	C	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.846;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=33;PP=1090;ReadPosRankSum=-0.656;SC=GGCGGCAGGGTGGCAGGGCGG;SOR=0.610;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=8;TCR=44;TR=39;WE=13153181;WS=13153148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr12	13153173	.	A	AGGGCGGCAAGGCGGCGGGACGGCG	1082.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.07;ReadPosRankSum=-0.781;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr12	13153388	.	G	T	58	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=6;NR=1;PP=58;QD=13.2530303639;SC=CGGGCAGCAGGGCAGCAGTGC;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=7;WE=13153396;WS=13153378;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr12	13153388	.	G	GGCAGCAGTCCAGCAGTGCAGCAGT	267.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=2.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.64;ReadPosRankSum=-0.971;SOR=2.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr12	13153773	rs1291364	T	C	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=4.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.06;ReadPosRankSum=-0.557;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr12	13154582	rs59113920	CG	C	147.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.854;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.762;NF=9;NR=1;PP=188;ReadPosRankSum=-0.709;SC=ATCTGCTGAGCGGGGGCCCCC;SOR=1.392;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=10;WE=13154590;WS=13154572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,10:0.26:39
chr12	13154790	rs1291363	G	C	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.722;NF=26;NR=32;PP=1092;ReadPosRankSum=0.189;SC=CCAACTACCTGATCGTGTCCA;SOR=0.741;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=173;TCF=80;TCR=93;TR=58;WE=13154798;WS=13154780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,58:0.34:173
chr12	13154911	rs1291362	A	G	1357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FS=0.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.41;ReadPosRankSum=0.146;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:176,75:0.30:251
chr12	13155166	rs1291361	G	T	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.660;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=28;PP=625;ReadPosRankSum=0.057;SC=CTCCACCGCAGTGGCATCCTA;SOR=0.989;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=138;TCF=43;TCR=95;TR=38;WE=13155174;WS=13155156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,38:0.27:142
chr12	13211212	rs6488582	G	A	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=0;PP=966;SC=TTTGTTTTATGTACAGTGTCC;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=35;WE=13211220;WS=13211202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	13214537	rs3741818	A	G	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=3;PP=1212;SC=CTAATCTTGTATGCCTTTCGG;SOR=4.664;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=40;WE=13214545;WS=13214527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	13215685	rs2200498	C	A	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=3;PP=496;SC=TGTTCAGCCCCTTGCGTCTTT;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=13215693;WS=13215675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	13221606	rs1386005	T	C	4198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=74;PP=2965;SC=AGACATTAGATTTCCTTCTGC;SOR=1.317;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=47;TCR=74;TR=121;WE=13221614;WS=13221596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr12	13228933	rs190068067	C	T	2188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.710;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=25;PP=1745;ReadPosRankSum=0.591;SC=GTTACCTTTGCTCTTCCTTTT;SOR=0.622;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=130;TCF=91;TCR=39;TR=79;WE=13228941;WS=13228923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,83:0.62:134
chr12	13256353	rs10772620	A	G	2399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.735;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=13;PP=1942;ReadPosRankSum=0.129;SC=AGCAGTAAAGATATGTGTATG;SOR=0.217;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=116;TCF=101;TCR=15;TR=80;WE=13256361;WS=13256343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,83:0.69:120
chr12	13294280	rs7978768	C	A	2345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=5;PP=1934;SC=CCTCTGGTGCCTGACCATAAC;SOR=4.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=67;TCR=5;TR=72;WE=13294288;WS=13294270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr12	13366599	rs2277395	C	T	4913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=87;NR=62;PP=2965;SC=TTGTTCTCCTCGTCCTGTGTC;SOR=1.012;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=87;TCR=62;TR=149;WE=13366607;WS=13366589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr12	13526328	rs17821405	G	T	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=586;ReadPosRankSum=-0.017;SC=GTCTACGAGCGCTCTGACTCT;SOR=0.616;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=28;WE=13526336;WS=13526318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr12	13529068	rs4763975	A	G	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.523;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=250;ReadPosRankSum=-0.784;SC=AATGAAATCTAAAACTCAGAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=11;WE=13529076;WS=13529062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr12	13529401	rs7957232	T	C	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.472;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=423;ReadPosRankSum=-0.359;SC=ATAGATATAATACAATGAATA;SOR=2.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=18;WE=13529409;WS=13529391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr12	13716638	rs1806191	G	A	2332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.622;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=48;PP=1890;ReadPosRankSum=-0.976;SC=CGTGCTTGATGTGAGACCTGT;SOR=0.612;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=62;TCR=83;TR=85;WE=13716646;WS=13716628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,87:0.58:149
chr12	13717508	rs1806201	G	A	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.358;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=822;ReadPosRankSum=0.131;SC=TCATGGTTGCGGTGGGGGAGT;SOR=0.570;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=158;TCF=72;TCR=86;TR=46;WE=13717516;WS=13717498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,48:0.30:160
chr12	13720272	rs4764010	A	G	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=429;SC=GAGAAAGAGGAGTATTGAGCA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=13720280;WS=13720262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	13764774	rs1805482	G	A	2553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.361;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=50;PP=1772;ReadPosRankSum=-0.384;SC=ATACGTCAGCGCTGAATGGCT;SOR=0.577;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=137;TCF=59;TCR=78;TR=89;WE=13764782;WS=13764764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,99:0.66:150
chr12	13768354	rs1468845	C	T	4314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=116;NR=11;PP=2965;SC=AAAGTGAGCACGTTTTAAACT;SOR=4.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=116;TCR=11;TR=127;WE=13768362;WS=13768344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr12	13769664	rs1805199	T	C	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=413;ReadPosRankSum=1.206;SC=CAGTATTGTCTGAACAATCCC;SOR=2.066;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=22;WE=13769672;WS=13769654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr12	13828659	rs11055581	T	C	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=21;PP=1481;ReadPosRankSum=-0.257;SC=TGCTCAAGAATTGTCAAAGAC;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=124;TCR=49;TR=74;WE=13828667;WS=13828649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,77:0.42:184
chr12	14019157	rs12818068	C	T	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.507;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=26;PP=735;ReadPosRankSum=-0.443;SC=AACTCGTCGACTCCCTGCAAA;SOR=0.532;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=127;TCF=48;TCR=79;TR=44;WE=14019165;WS=14019147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,45:0.34:134
chr12	14576743	.	A	G	455	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=17;NR=0;PP=455;QD=28.8100713263;SC=ATTACATGAAATGTGCTGCTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=14576751;WS=14576742;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	14579463	rs200611526	CT	C	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.19;ReadPosRankSum=1.929;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr12	14587301	rs3213764	A	G	2174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=21;PP=1916;SC=AAGGACAACAAACCTGAGGAA;SOR=1.508;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=63;WE=14587309;WS=14587291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	14587447	rs12815453	A	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=166;ReadPosRankSum=0.100;SC=TTTTTTGCCCATGAAATAATT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=9;WE=14587455;WS=14587437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr12	14590981	rs10734876	T	C	79.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=55.68;NF=1;NR=3;PP=37;SC=AGCGAGACTCTGTCTCAAAAA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=14590989;WS=14590971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	14599904	rs5796595	C	CT	340.14	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=2.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.74;MQRankSum=0.747;QD=14.79;ReadPosRankSum=0.488;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,19:0.83:23
chr12	14628705	rs7298275	A	G	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=525;SC=CAGCCATTTAAGGGTCCAGAT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=14628713;WS=14628695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	14628773	rs7313259	C	T	1587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=8;PP=1271;SC=TTTTTTAACACGTATATCTGC;SOR=3.171;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=49;WE=14628781;WS=14628763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	14634392	rs140044044	C	CAGTT	997.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=1163;SC=ATGCATATGTCAGCTAGATTT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=18;WE=14634400;WS=14634382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	14688644	rs7957558	C	T	3826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=20;PP=2965;ReadPosRankSum=0.876;SC=TTATCTATGACGTTGAAGTCC;SOR=1.931;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=121;TCF=101;TCR=20;TR=120;WE=14688652;WS=14688634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,121:0.99:122
chr12	14689449	rs35754761	T	G	4109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=43;PP=2965;SC=TTGGGCGCTATATAGAAAAAG;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=78;TCR=43;TR=121;WE=14689457;WS=14689439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr12	14694993	rs1862014	G	C	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=230;SC=CATGCCATTAGCAAAAAGTGC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=14695001;WS=14694983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	14720554	rs1141509	G	T	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=520;ReadPosRankSum=1.017;SC=TAACAACAGCGGCAGCAGCAG;SOR=0.425;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=23;WE=14720562;WS=14720544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr12	14720583	rs7954623	T	C	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=411;ReadPosRankSum=-1.011;SC=GCAGAAGCGGTGGCGGCTGTG;SOR=0.906;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=23;WE=14720591;WS=14720573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr12	14769468	rs1558795	G	A	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=389;SC=GAGTACAGAAGAGGATTAGCA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=14769476;WS=14769458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	14774849	rs7302418	T	A	1146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=0;PP=978;SC=ACTAGAGCGGTCAAGAGTAGT;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=14774857;WS=14774839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	14775214	rs2287538	T	C	220.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=179;SC=GTAGTAGTGATTGTCTACCAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=14775222;WS=14775204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	14781503	rs4764105	A	T	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=389;SC=TTCTCATTCTAAGGTGCCACT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=14781511;WS=14781493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	14781678	rs3217210	G	GA	2013.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=47;PP=1312;SC=ACACCTGGAAGAAAAAAAAAC;SOR=1.609;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=69;TCF=19;TCR=50;TR=60;WE=14781686;WS=14781668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr12	14794062	rs10772800	G	A	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=12;PP=654;SC=CTTTCCGCAGGATGATCTCCT;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=15;TCR=12;TR=27;WE=14794070;WS=14794052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	14804994	rs7313027	G	C	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=23;PP=696;SC=TTAGGAGACAGTGTTGTGGTG;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=14805002;WS=14804984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	14822855	rs7314345	G	A	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=555;SC=ACACAATGACGCTTGATTTCC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=14822863;WS=14822845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	14825816	rs375279933	G	T	1766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.945;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=14;PP=1355;ReadPosRankSum=1.586;SC=CTTTCTTGGTGTCCACAGAGG;SOR=0.953;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=81;TCR=22;TR=65;WE=14825824;WS=14825806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,65:0.61:107
chr12	14827463	rs3217157	AATC	A	6240.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.168;NF=71;NR=34;PP=2967;ReadPosRankSum=1.321;SC=TTAGCTGTGGAATCATCTATT;SOR=0.990;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=117;TCF=81;TCR=36;TR=105;WE=14827473;WS=14827453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,142:0.99:143
chr12	14829893	rs1420635	A	C	3254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=53;PP=2478;SC=CATTGTCCTCAAAGTACTGGT;SOR=0.856;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=99;TCF=45;TCR=54;TR=98;WE=14829901;WS=14829883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr12	14832830	rs11336448	CT	C	540.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.52;QD=22.53;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	14834421	rs56944147	GA	G	7823.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=106;PP=2969;SC=CCTGGAATAGGAAAAAGAGAA;SOR=1.516;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=31;TCR=113;TR=135;WE=14834435;WS=14834411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr12	14834427	rs58911033	G	T	7832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=109;PP=2965;SC=ATAGGAAAAAGAGAAACTAAA;SOR=1.556;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=161;TCF=51;TCR=110;TR=160;WE=14834435;WS=14834411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr12	14923522	rs12818627	T	C	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=60;ReadPosRankSum=-1.282;SC=GTTCTCCCCGTGCCCGCCAAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=14923530;WS=14923512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr12	14924028	rs16910259	A	G	1537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.298;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=57;PP=1260;ReadPosRankSum=0.405;SC=TTCTGAAATCACAGCGCCTAC;SOR=1.764;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=206;TCF=51;TCR=155;TR=68;WE=14924036;WS=14924018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,68:0.33:207
chr12	14928195	rs66661591	T	C	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=297;ReadPosRankSum=0.400;SC=TGAGGCCTCCTTCGGAATTAT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=13;WE=14928203;WS=14928185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr12	14976553	rs17761825	G	C	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.248;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=513;ReadPosRankSum=-1.397;SC=TCCAAAAAGCGATAAAGACTA;SOR=0.393;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=113;TCF=24;TCR=89;TR=31;WE=14976561;WS=14976543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,35:0.29:121
chr12	15034996	rs2430735	T	A	1386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=2;PP=1111;SC=TATGTATTTCTGTAATGCTGC;SOR=5.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=39;WE=15035004;WS=15034986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	15067511	rs148149515	T	TGC,TGTGC	1213.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=62.27;QD=50.57;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,5,19:0.21,0.79:24
chr12	15073831	rs2445382	G	C	2812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=16;PP=2136;SC=CCGACTCAGGGTCTGAAGGGA;SOR=2.967;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=67;TCR=16;TR=83;WE=15073839;WS=15073821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	15081897	rs2445371	A	C	6827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=141;PP=2965;SC=CCAGCTGGCAAGTCTCCTTCA;SOR=1.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=228;TCF=87;TCR=141;TR=228;WE=15081905;WS=15081887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr12	15091221	rs11432737	A	AT	5289.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=111;NR=8;PP=2957;SC=GGCAAAATGCACTTATCCAGG;SOR=5.518;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=114;TCR=8;TR=119;WE=15091229;WS=15091211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr12	15095558	rs4703	C	G	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=256;ReadPosRankSum=0.962;SC=ACGTGCCTCGCGCCAGCATGC;SOR=0.779;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=64;TCF=36;TCR=28;TR=17;WE=15095566;WS=15095548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,18:0.27:66
chr12	15095707	rs10772822	T	C	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=36;PP=1144;SC=AGGAAAAACATACACTGCAAA;SOR=2.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=46;WE=15095715;WS=15095697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	15100683	rs2075265	C	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=236;ReadPosRankSum=0.792;SC=CATTCCAGACCCAGCTTGGGG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=5;WE=15100692;WS=15100677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr12	15100684	rs7979291	C	T	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=63;ReadPosRankSum=-0.792;SC=ATTCCAGACCCAGCTTGGGGG;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=2;WE=15100692;WS=15100677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr12	15101034	rs72428197	GCACACACACA	G	754.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.649;NF=0;NR=11;PP=2259;ReadPosRankSum=0.174;SC=TTTAGTCCTTGCACACACACA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=11;WE=15101051;WS=15101024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,19:0.86:22
chr12	15101072	rs4764142	T	G	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=97;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=19;PP=431;SC=ACACACACACTTAATGCCTGA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=15101080;WS=15101062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	15102681	rs28683560	G	C	921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.488;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=769;ReadPosRankSum=0.639;SC=CAGAGACCAAGTTTTCTTTGT;SOR=1.210;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=34;WE=15102689;WS=15102671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,33:0.70:47
chr12	15103605	rs2430711	A	G	2839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=58;PP=2210;SC=GCTCATCATCATCATCCTCCT;SOR=1.354;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=33;TCR=58;TR=91;WE=15103613;WS=15103595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr12	15131995	rs2233623	C	A	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=1;PP=424;SC=GAGTTTCTCACATACAAACAC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=15132003;WS=15131985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	15262179	rs1055151	G	A	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.889;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=439;ReadPosRankSum=-0.221;SC=TCTCTGTGATGTTCCCTTCTC;SOR=0.828;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=84;TCF=51;TCR=33;TR=29;WE=15262187;WS=15262169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,28:0.33:84
chr12	15273932	rs2247574	C	T	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.752;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=8;PP=887;ReadPosRankSum=-1.196;SC=CAACAGAAAACATTATTCTTT;SOR=0.804;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=181;TCF=148;TCR=33;TR=53;WE=15273940;WS=15273922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,57:0.30:188
chr12	15273957	rs2247568	A	G	1963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=18;PP=1436;ReadPosRankSum=-0.733;SC=GGGGCCATAAATTTTTATTGA;SOR=0.705;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=221;TCF=164;TCR=57;TR=74;WE=15273965;WS=15273947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,79:0.34:230
chr12	15652330	rs4764197	T	C	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=1;PP=640;SC=AAGTGTGTGATGTTTAGAAGA;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=15652338;WS=15652320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	15652636	rs3838355	AAT	A	1247.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=1286;SC=AAAGAAAGAAAATATATATGT;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=26;WE=15652645;WS=15652626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	15656832	rs4764199	T	A	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=4;PP=878;SC=CTTTTTTATATATGATTTAGA;SOR=3.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=15656840;WS=15656822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	15661441	rs888163	A	G	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=475;SC=TTTTTAAACCAGAATCTTTTA;SOR=4.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=15661449;WS=15661431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	15677992	rs960666	A	T	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.86;ReadPosRankSum=-2.330;SOR=0.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,6:0.13:45
chr12	15679120	rs6488782	C	A	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.893;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=15;PP=479;ReadPosRankSum=0.380;SC=TGCCTCCAGGCGACATCTATA;SOR=0.544;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=86;TCF=33;TCR=53;TR=25;WE=15679128;WS=15679110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,27:0.30:89
chr12	15679208	rs7134888	G	A	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=2.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.71;ReadPosRankSum=-0.252;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,7:0.16:45
chr12	15731724	rs5796639	T	TG	3566.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=7;PP=2936;SC=AATAAACCAGTTGAACAATAA;SOR=4.664;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=86;TCF=78;TCR=8;TR=84;WE=15731732;WS=15731714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	15731744	rs1024843	C	T	4032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=23;PP=2965;SC=ATCCAATTCACACCACGTATG;SOR=3.003;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=102;TCR=23;TR=125;WE=15731752;WS=15731734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr12	15742313	rs34222753	GA	G	881.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.202;HP=16;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=-0.185;NF=28;NR=6;PP=531;ReadPosRankSum=1.570;SC=CCATCTCAAAGAAAAAAAAAA;SOR=2.965;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=34;WE=15742322;WS=15742303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr12	15747732	.	A	G	34.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr12	15748020	rs1558787	C	T	1671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=38;PP=1336;SC=TCCACGAGTGCTCAGTCTTAG;SOR=2.259;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=52;WE=15748028;WS=15748010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	15777486	rs4623959	T	C	210.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=7;PP=137;SC=TATCCTCGCCTGGTATAAATG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=15777494;WS=15777476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	15803992	rs4237955	T	C	1761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=47;PP=1297;SC=AATGTATCCATGCTCACAGTT;SOR=2.093;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=64;TCF=16;TCR=48;TR=63;WE=15804000;WS=15803982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	15818880	rs4363660	T	A	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=30;PP=943;SC=CTATAACATATCAATTAACTC;SOR=3.383;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=35;WE=15818888;WS=15818870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	15822229	rs4237957	A	C	1780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=1;PP=1407;SC=AAATCTAGTAACTAATATGCA;SOR=6.593;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=50;WE=15822237;WS=15822219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	15822244	rs4237958	T	C	2335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=5;PP=1836;SC=TATGCAGATATATTATCAAAA;SOR=4.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=62;TCR=5;TR=67;WE=15822252;WS=15822234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr12	16036261	rs10734889	C	G	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=20;PP=569;SC=TATTCCCAGCCAATTACAGAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=16036269;WS=16036251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	16050808	rs10772879	T	A	277.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=198;SC=ACTTAAATTTTTTTTCAGTTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=16050816;WS=16050798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	16055926	rs71042275	G	GT	1158.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=17;PP=1038;SC=TCAATCATATGTGCAGTTAGT;SOR=0.957;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=23;WE=16055934;WS=16055916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	16109673	rs2306181	T	G	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=365;SC=GGAGTGATTTTGCATGAAGTA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=16109681;WS=16109663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	16185463	rs57961487	CTT	C	732.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.037;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.901;NF=13;NR=3;PP=533;ReadPosRankSum=0.209;SC=AGTTTTTCCTCTTTTTGTTTT;SOR=0.337;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=16;WE=16185472;WS=16185453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr12	16347308	rs3942536	G	A	5609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=109;PP=2965;SC=ATCCCAGGACGTTCAACAATG;SOR=1.351;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=62;TCR=109;TR=171;WE=16347316;WS=16347298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr12	16369828	rs1671511	A	T	3995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=43;PP=2965;SC=TATTTTTACCATCTGAGATGA;SOR=1.225;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=70;TCR=43;TR=113;WE=16369836;WS=16369818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr12	16392545	rs11056836	C	T	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.823;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=527;ReadPosRankSum=0.197;SC=ATAGCTAGTTCGGATCTTAGC;SOR=3.884;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=22;WE=16392553;WS=16392535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr12	16397677	rs1527014	G	A	2373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=42;PP=1789;SC=GCAGTATTGCGGGTGGCATGT;SOR=1.164;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=28;TCR=42;TR=70;WE=16397685;WS=16397667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr12	16397734	rs1852450	C	A	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.461;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=241;ReadPosRankSum=0.221;SC=GAGAGAACAACCTGCAAGTAA;SOR=1.166;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=60;TCF=12;TCR=48;TR=15;WE=16397754;WS=16397724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,16:0.26:62
chr12	16397746	rs1852451	C	T	1657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=42;PP=1561;SC=TGCAAGTAATCGGAGATATTA;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=10;TCR=42;TR=52;WE=16397754;WS=16397724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	16430284	rs1671487	G	A	7905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=170;NR=77;PP=2965;SC=ACAAGCAAATGTACACCAGTT;SOR=1.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=249;TCF=170;TCR=79;TR=247;WE=16430292;WS=16430274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr12	16510395	rs2075239	T	G	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=582;SC=TAGATATGGGTACTCCCTATG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=16510403;WS=16510385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	16510418	rs2075240	A	G	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=346;ReadPosRankSum=-0.526;SC=GCCCAGGCTGATCTTGAATTC;SOR=0.963;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=14;WE=16510426;WS=16510408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr12	16713487	rs3214385	A	AT	1199.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.844;NF=7;NR=48;PP=772;ReadPosRankSum=-1.787;SC=AATAAGAAACATTTTTTTTTT;SOR=0.988;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=91;TCF=15;TCR=76;TR=55;WE=16713495;WS=16713477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,56:0.86:65
chr12	16713545	rs2302690	T	C	1752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.280;NF=12;NR=39;PP=1509;ReadPosRankSum=0.934;SC=AGAGATGATGTTAATATACTC;SOR=1.214;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=51;WE=16713553;WS=16713535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr12	16743165	rs2058798	A	G	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=8;PP=272;SC=TTCTTGAAGCAAAACTAACAT;SOR=3.442;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=16743173;WS=16743155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	16743217	rs2058799	A	G	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=143;SC=GTTAGTGGTGAGAAATATAAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=16743225;WS=16743207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr12	18234453	rs368363188	CT	C	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=4.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=1.187;QD=0.80;ReadPosRankSum=0.959;SOR=1.855;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,11:0.24:46
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chr12	18435398	rs35277916	GCCC	G	4120.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.473;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.724;NF=16;NR=61;PP=2963;ReadPosRankSum=-0.559;SC=TCCTGGGGAAGCCCCATAGGA;SOR=0.886;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=130;TCF=31;TCR=99;TR=77;WE=18435408;WS=18435388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,103:0.66:155
chr12	18435452	rs11044004	C	T	2581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.057;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=51;PP=1997;ReadPosRankSum=1.203;SC=ATTTTAGCTCCATCATTCACA;SOR=0.355;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=115;TCF=39;TCR=76;TR=81;WE=18435460;WS=18435442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,87:0.72:121
chr12	18478126	rs17475920	A	T	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=305;ReadPosRankSum=1.826;SC=AAGATGACAAAAATGAATAAA;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=13;WE=18478134;WS=18478116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr12	18499777	rs10770357	C	G	3553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=85;PP=2902;SC=ACAGGTGAGTCGTGGTGAGTT;SOR=2.552;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=23;TCR=85;TR=108;WE=18499785;WS=18499767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr12	18641326	rs7137852	T	C	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=0;PP=1058;SC=TCCGGCTGGATGTGGTTTAAA;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=37;WE=18641334;WS=18641316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	18801017	rs501379	T	C	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=19;PP=411;SC=TTTTCACTTCTGGGCCTCTGA;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=18801025;WS=18801007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	18840911	rs2306798	A	G	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=106;ReadPosRankSum=1.898;SC=CATAATGGAAAACCCTTGTCT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=6;WE=18840919;WS=18840901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr12	18848131	rs1487070	T	C	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=56;ReadPosRankSum=-1.309;SC=TATGAGCAAGTATCATTAGCC;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=18848139;WS=18848121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr12	18849071	rs3825081	G	C	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=271;ReadPosRankSum=0.423;SC=ACTCAATATCGTATATAACAT;SOR=0.821;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=12;WE=18849079;WS=18849061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,12:0.27:44
chr12	18889547	rs10841080	C	A	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=5.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=2;PP=654;ReadPosRankSum=0.659;SC=TTACTTAGAACATACATTAAA;SOR=0.451;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=87;TCF=81;TCR=6;TR=32;WE=18889555;WS=18889537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,34:0.38:90
chr12	18889565	rs12306752	A	T	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.450;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=6;PP=948;ReadPosRankSum=-0.512;SC=AAAACATTATAACAATCTATT;SOR=0.389;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=106;TCF=94;TCR=12;TR=43;WE=18889573;WS=18889555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,46:0.42:110
chr12	18890472	rs5796766	GT	G	289.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.030;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=216;ReadPosRankSum=0.535;SC=ACACACAGTGGTTTTTTTTGC;SOR=0.094;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=1;TCR=56;TR=16;WE=18890480;WS=18890462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr12	18891079	rs1075421	T	C	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=43;ReadPosRankSum=0.288;SC=CCTGCTTTCATGGATAGACAT;SOR=0.404;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=5;WE=18891087;WS=18891069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr12	19282670	rs28512290	C	T	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.868;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=3;PP=664;ReadPosRankSum=-0.516;SC=CTCGCTCGTTCCCTCCTCCCT;SOR=1.238;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=86;TCF=75;TCR=11;TR=34;WE=19282678;WS=19282660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,34:0.39:87
chr12	19283135	rs61913270	C	A	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=15;PP=454;SC=CCCGGCTCCCCGCAACCTGCC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=19283143;WS=19283125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	19406863	rs6486942	C	T	2109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=44;NR=17;PP=1670;SC=TTTCTTTTTTCCTTTTTTCAG;SOR=1.999;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=62;TCF=44;TCR=18;TR=61;WE=19406871;WS=19406853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	19410474	rs10706958	AT	A	1059.19	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.605;HP=14;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=31;PP=524;ReadPosRankSum=0.783;SC=ATAAACAGGTATTTTTTTTTT;SOR=1.061;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=63;TCF=16;TCR=47;TR=41;WE=19410482;WS=19410464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:7,53:0.88:60
chr12	19418588	rs6486945	G	A	274.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=225;SC=GTTCATTTATGTACAAGAACC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=19418596;WS=19418581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	19418874	rs7316780	C	T	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=236;SC=AAAAAAGCTACCTTATAGTGA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=10;WE=19418882;WS=19418864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	19423103	rs7978729	A	G	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=158;ReadPosRankSum=-0.225;SC=TTCAAACTGAATGTTCTTTCT;SOR=1.034;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=8;WE=19423111;WS=19423093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr12	19428009	rs2279537	T	A	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=210;ReadPosRankSum=-0.562;SC=AATATTGGTTTAAATTGTGTT;SOR=0.558;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=13;WE=19428017;WS=19427999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr12	19441011	rs201882733	CAAAAAAAAAAA	C	407.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.576;HP=20;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=4.036;NF=11;NR=0;PP=1996;ReadPosRankSum=1.309;SC=GACTCTGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=0.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=11;WE=19441039;WS=19441001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr12	19441032	.	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.858;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.72;MQRankSum=-4.235;QD=2.79;ReadPosRankSum=-2.221;SOR=1.251;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
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chr12	19512563	rs11044515	G	A	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.995;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=28;PP=656;ReadPosRankSum=0.256;SC=AAAATAAAGTGTGTTTCTTTC;SOR=0.160;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=52;TCF=2;TCR=50;TR=30;WE=19512571;WS=19512553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr12	19522484	rs113006194	A	AAAAG	547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=595;SC=TTTAAAAAGAAAAAATCACAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=19522502;WS=19522474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	19522494	rs57357758	A	G	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=290;ReadPosRankSum=-0.851;SC=AAAAATCACAATAGAACCAAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=12;WE=19522502;WS=19522474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr12	19592600	rs143333997	GGGA	G,GGGAGGAGGA	837.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=18;NF=6,6;NR=9,9;PP=1121,890;SC=GGCGGCGGTGGGGAGGAGGAG;SOR=0.963;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=15,15;WE=19592610;WS=19592590;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.74,0.26:23
chr12	19593752	rs12822340	G	C	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.321;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr12	19626309	.	A	AAATT	339	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=1;NR=8;PP=339;QD=46.7820560415;SC=CATGTATATAAAATTTATTTA;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=9;WE=19626334;WS=19626299;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:22,9:0.29:31
chr12	19626311	.	AT	A	431.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.77;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr12	19626313	rs10631217	T	TAA	266.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr12	19626314	rs371291179	T	TTA	266.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.60;ReadPosRankSum=-0.316;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr12	19626315	.	ATTT	A	463.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.483;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.16;ReadPosRankSum=0.572;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr12	19626318	rs57423687	T	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.86;ReadPosRankSum=-0.379;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr12	19626322	rs11044583	T	A	1433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.25;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	19626326	rs12370241	T	A	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.75;ReadPosRankSum=0.778;SOR=0.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr12	19646943	rs66556640	CTGGTGTATTTCA	C	337.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.385;NF=0;NR=7;PP=1279;ReadPosRankSum=-0.785;SC=CTGAGAAAATCTGGTGTATTT;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=7;WE=19646962;WS=19646933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr12	19670944	rs12821385	T	C	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.559;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=134;ReadPosRankSum=-0.217;SC=ATCTTATTAATATTTTTAATG;SOR=0.061;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=7;WE=19670952;WS=19670934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr12	19873411	rs4301848	G	T	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=452;SC=AATTCTCGCAGGTTGTGGGAG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=19873419;WS=19873401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	19873497	rs4369485	A	G	2420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=27;PP=1930;SC=TAAGTCCGATAACATCTGATG;SOR=1.432;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=48;TCR=27;TR=75;WE=19873505;WS=19873487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr12	20522124	rs144106925	CGTGT	C	335.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=294;SC=AGCGTGCGTGCGTGTGTGTGT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=5;WE=20522135;WS=20522114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr12	20522252	rs12305038	G	A	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=11;PP=694;ReadPosRankSum=-0.310;SC=ACGAGTCAGGGACAAGCCCGT;SOR=0.748;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=34;WE=20522260;WS=20522242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,35:0.80:44
chr12	20709733	rs4762972	G	A	4388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=99;PP=2965;SC=AATAAAATGTGGAGCGAGGAA;SOR=2.699;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=26;TCR=99;TR=125;WE=20709741;WS=20709723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr12	20724988	rs7966459	G	A	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=8;PP=621;SC=ATTCATGAAAGCATGTTTTTA;SOR=1.697;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=20724996;WS=20724978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	20766559	rs10743380	C	T	5583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=106;PP=2965;SC=TGAATCCCGTCACTTCGCTCA;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=175;TCF=69;TCR=106;TR=175;WE=20766567;WS=20766549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr12	20766685	rs7308381	G	C	1669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=39;PP=1303;SC=TTTTTTAATTGTCTTCTAGGT;SOR=3.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=45;WE=20766693;WS=20766675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	20769026	rs68125264	TTAGA	T	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=301;SC=CACTCAAATTTTAGATAGATA;SOR=3.442;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=6;WE=20769037;WS=20769018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	20774464	rs10743381	A	G	3558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=95;PP=2886;SC=TGGTTTGTCTATTCTAATAAC;SOR=5.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=6;TCR=95;TR=101;WE=20774472;WS=20774454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr12	20774539	rs10734705	A	G	1211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=28;PP=822;SC=CTTATGTGATAATACAGATTC;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=20774547;WS=20774529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	20783099	rs7304499	AC	CT	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=1486;SC=AATAATAAAAACGATGATAGT;SOR=5.211;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=26;WE=20783108;WS=20783089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	20786787	rs4265636	T	C	2790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=72;PP=2291;SC=AAAACAGTGATCTACATTTCT;SOR=3.560;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=12;TCR=72;TR=84;WE=20786795;WS=20786777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr12	20786841	rs10743382	T	C	1188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=32;PP=1022;SC=ATGATGTTGGTCAGGTCGGTC;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=20786849;WS=20786831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	20790183	.	A	G	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.142;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=382;ReadPosRankSum=0.963;SC=TAAGAAATGCATTCATTCACA;SOR=4.003;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=18;WE=20790191;WS=20790173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr12	20801855	rs9284155	C	T	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.88;QD=31.41;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	20803323	rs9804769	A	C	101.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.38;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	20803549	rs10743384	T	C	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=27;PP=994;SC=CTGACCACTGTTTAATACAGC;SOR=1.378;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=44;WE=20803557;WS=20803539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	20852449	rs113489958	A	ATTTG	787.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.232;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.862;NF=16;NR=1;PP=786;ReadPosRankSum=-0.946;SC=ATTGCGTAGTATTTATTTATT;SOR=0.083;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=53;TCF=52;TCR=1;TR=17;WE=20852457;WS=20852439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr12	20864356	rs7963279	C	T	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.497;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=522;ReadPosRankSum=-0.475;SC=CCTCCAATTCCACTCTCAGCA;SOR=0.671;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=119;TCF=60;TCR=59;TR=34;WE=20864364;WS=20864346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,38:0.30:127
chr12	20893052	rs2037154	C	A	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=4.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=334;ReadPosRankSum=-1.684;SC=ACATTTTTAACATAACTGTCT;SOR=0.081;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=18;WE=20893060;WS=20893042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,18:0.38:48
chr12	20968644	.	AATATTCACTTGGTATCTG	A	332.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.861;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=1.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.40;ReadPosRankSum=-1.187;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr12	20968665	rs4149158	GTTTA	G	336.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=4.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.52;ReadPosRankSum=-1.907;SOR=0.202;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr12	20968828	rs10734710	C	T	1441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=38;PP=1178;SC=AGGCCACTAACTGTCAAAAAG;SOR=2.786;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=46;WE=20968836;WS=20968818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	21011480	rs4149117	T	G	3012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=46;PP=2392;SC=TATTTTGACATCTTTACCACA;SOR=0.797;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=51;TCR=46;TR=96;WE=21011488;WS=21011470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr12	21011581	rs4149118	G	A	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=38;PP=1122;SC=TTTTATACTTGTAAGTGGGCA;SOR=3.306;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=45;WE=21011589;WS=21011571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	21013948	rs3764009	C	T	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=1;PP=488;SC=GTTGCTCTTACAGTTATAGGT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=21013956;WS=21013938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	21014139	rs3764008	C	G	992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=29;PP=827;SC=TATAAAGTTTCTGATATTCTT;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=21014147;WS=21014129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	21014163	rs3764007	T	A	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=516;SC=CAAAATTGATTTAAGAACAAA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=21014171;WS=21014153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	21015610	rs1036261	A	G	2478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=43;PP=2000;SC=AGTGTATTGTATAATATTACT;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=24;TCR=43;TR=67;WE=21015618;WS=21015600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr12	21015760	rs7311358	G	A	2490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=53;PP=1797;SC=TTGCTAAAATGTACGTGGATA;SOR=1.759;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=20;TCR=53;TR=73;WE=21015768;WS=21015750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr12	21031020	rs2417938	A	G	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=364;SC=TCCATCTTGTAATATCATCGT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=21031028;WS=21031010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	21032242	rs4149142	T	G	116.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=86;SC=TCCCAGGTTCTCCACCCTTCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=21032250;WS=21032232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	21036411	rs2053098	A	G	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=1;PP=526;SC=ATTACTCAGCACACTTGGGTG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=21036419;WS=21036401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	21051489	rs4149153	C	T	297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=9;PP=234;SC=ATGTTAAATACTAAAGACTGA;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=21051497;WS=21051479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	21054369	rs3764006	G	A	962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=11;PP=664;SC=GAGCACAAGGGGCTTGTAGGA;SOR=1.352;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=31;WE=21054377;WS=21054359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	21054918	rs2082518	T	C	1351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=35;PP=1106;SC=TTACCTCTTATAGAAGCATTA;SOR=4.514;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=38;WE=21054926;WS=21054908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	21065365	rs10841706	C	A	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=10;PP=514;SC=TGGGTTCAAACAATTCTCGTG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=19;WE=21065373;WS=21065355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	21065429	.	AT	A	35	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=17;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=26;MQ=56.21;NF=0;NR=3;PP=35;QD=12.6666666667;SC=CACCTGGCTAATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=21065437;WS=21065419;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,3:0.43:7
chr12	21168758	rs34168692	T	TA	389.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=319;ReadPosRankSum=0.919;SC=TTGCATATGTTAAAAAAAAAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=15;WE=21168766;WS=21168748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr12	21176135	rs1546308	T	C	5754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=114;NR=62;PP=2965;SC=ACTGTGAATGTAATGGGAATG;SOR=1.481;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=114;TCR=62;TR=176;WE=21176143;WS=21176125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr12	21176247	rs1546307	A	G	3611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=97;PP=2965;SC=ACGAGGTACCATGATAGTGCT;SOR=3.690;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=16;TCR=97;TR=113;WE=21176255;WS=21176237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr12	21201663	rs11045689	G	A	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=5;PP=529;SC=CGCCCTACCTGCTGTTGCAAT;SOR=2.200;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=21;WE=21201671;WS=21201653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	21220349	rs1910163	A	T	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=9;PP=487;SC=GAAATTTAACATGTAAATATT;SOR=0.874;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=21;WE=21220357;WS=21220339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	21242854	rs182332280	C	T	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-1.807;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=3;PP=167;ReadPosRankSum=-0.667;SC=GAGCCTTCTTCGGCTTGAAGG;SOR=0.086;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=8;WE=21242862;WS=21242844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr12	21317810	rs4149033	A	G	1396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=18;PP=1157;SC=GGCAATTATAAAACTCAATAC;SOR=1.127;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=23;TCR=18;TR=41;WE=21317818;WS=21317800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	21327652	rs34728625	T	TA	763.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=1.619;NF=8;NR=24;PP=433;ReadPosRankSum=0.180;SC=TAGTAAGTGTTAAAAAAAAAA;SOR=0.462;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=32;WE=21327660;WS=21327642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,36:0.90:40
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chr12	21331599	rs4149057	T	C	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.780;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=325;ReadPosRankSum=-0.434;SC=CATAGTACCATTGGGGCTTTC;SOR=0.863;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=39;TCF=20;TCR=19;TR=18;WE=21331607;WS=21331589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
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chr12	21331987	rs2291076	C	T	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.307;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=170;ReadPosRankSum=-0.428;SC=ACCATGATAACGTCTTTCTAA;SOR=0.287;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=11;WE=21331995;WS=21331977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr12	21427608	rs3736080	G	T	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=17;PP=498;SC=TTATTTGTACGGCAAAGTTTA;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=21427616;WS=21427598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	21447066	rs722994	C	T	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=48;PP=1278;ReadPosRankSum=-0.177;SC=TAAAATAATGCCATAGATATT;SOR=1.885;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=67;TCF=0;TCR=67;TR=48;WE=21447074;WS=21447056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,51:0.71:72
chr12	21450250	rs4148999	C	G	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=212;ReadPosRankSum=-0.573;SC=TATCCTAAAACACTTCAACTT;SOR=0.317;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=11;WE=21450258;WS=21450240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr12	21457514	rs3833795	TA	T	277.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=8.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.71;ReadPosRankSum=-1.061;SOR=0.108;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,19:0.32:59
chr12	21467666	rs10841789	A	C	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=532;SC=CAAAGTCTTAATTAAGAGCCT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=21467674;WS=21467656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	21472254	rs10505872	G	A	2468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=5.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.558;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=18;PP=1838;ReadPosRankSum=0.495;SC=ACATTATTTCGGTAGCAAATA;SOR=0.475;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=143;TCF=112;TCR=31;TR=82;WE=21472262;WS=21472244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,90:0.60:151
chr12	21487544	rs10841795	A	G	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.195;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=512;ReadPosRankSum=0.836;SC=AAGACATCTTATTCTATGGGT;SOR=0.672;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=70;TCF=37;TCR=33;TR=28;WE=21487552;WS=21487534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,28:0.38:73
chr12	21593404	rs4762702	G	C	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=30;PP=1078;SC=TGTATAACTTGTTAATATTAA;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=21593412;WS=21593394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	21602437	rs147619410	A	G	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=170;ReadPosRankSum=-0.389;SC=GTTTAAAGTGAAGTTGTATCC;SOR=0.350;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=9;WE=21602445;WS=21602427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr12	21609127	rs4367993	T	C	1962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=47;PP=1562;SC=CAACGAACTGTTAGGTCACTT;SOR=3.076;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=10;TCR=48;TR=57;WE=21609135;WS=21609117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr12	21615207	rs3213210	A	G	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=349;SC=CTTGATTTACAGTATTTTTTA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=21615215;WS=21615197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	21623122	rs13035	T	G	1833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=16;PP=2078;SC=TTTAGTAACATTCATATCAGG;SOR=2.147;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=65;TCR=16;TR=81;WE=21623130;WS=21623112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	21624309	rs11046076	A	T	1543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=0;PP=1988;SC=TGCAATTTTTAAAAAAAAACC;SOR=8.287;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=67;TCF=67;TCR=0;TR=67;WE=21624317;WS=21624299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	21626324	rs917852	A	C	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.26;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	21626330	rs917853	C	A	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.31;SOR=6.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	21627745	rs2159943	A	G	1614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=1;PP=1351;SC=GCTTTAATTGATAAAAGTTAT;SOR=6.316;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=47;WE=21627753;WS=21627735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	21628812	rs10160843	G	A	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=54;PP=1749;SC=CCTGGAAGATGGTTTTCAACA;SOR=5.856;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=2;TCR=54;TR=56;WE=21628820;WS=21628802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	21629987	rs917854	T	C	1003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=21;PP=707;SC=TGGCTGTCTATGTACAACTTT;SOR=1.209;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=14;TCR=21;TR=34;WE=21629995;WS=21629977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	21639591	rs7964104	G	C	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=20;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=12;PP=395;SC=AACCATTCACGTTTTTTTTTT;SOR=2.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=15;WE=21639599;WS=21639581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	21644667	rs10841834	G	A	1838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=44;PP=1486;SC=GAGGCAGCGCGGATACAATGA;SOR=3.872;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=6;TCR=44;TR=50;WE=21644675;WS=21644657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	21654831	rs1060126	G	T	3816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=53;PP=2921;SC=CCGAGGTGCTGTCGCCGCTGT;SOR=0.868;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=62;TCR=53;TR=115;WE=21654839;WS=21654821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr12	21657590	rs67392337	AT	A	6271.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.309;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.163;NF=20;NR=122;PP=2951;ReadPosRankSum=0.618;SC=AAGTTACTGAATTACCTCTAG;SOR=2.411;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=150;TCF=23;TCR=127;TR=142;WE=21657598;WS=21657580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,170:0.99:171
chr12	21680609	rs7966780	C	G	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=558;ReadPosRankSum=-0.534;SC=AGGTTTAAGCCCGGGTTGTCC;SOR=0.848;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=44;TCR=15;TR=34;WE=21680617;WS=21680599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,33:0.56:59
chr12	21684029	rs3765093	G	A	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=185;ReadPosRankSum=-0.540;SC=CTATTAAAACGCAGAGTGTAT;SOR=0.165;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=11;WE=21684037;WS=21684019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr12	21689882	rs10431213	T	A	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=423;ReadPosRankSum=0.852;SC=GCAGCACATGTAGAATTCAGT;SOR=0.527;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=18;WE=21689890;WS=21689872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
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chr12	21711009	rs7967170	C	A	405.18	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=337;ReadPosRankSum=-0.854;SC=AAACTGAACCCATTTTCCTTT;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=14;WE=21711017;WS=21710999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr12	21711111	rs7977474	G	C	1745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.372;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=7;PP=1428;ReadPosRankSum=0.015;SC=TTTAAAGTTCGCCACATGAAC;SOR=1.140;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=77;TCR=10;TR=60;WE=21711119;WS=21711101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,62:0.70:89
chr12	21711385	rs7977846	G	C	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=740;ReadPosRankSum=-1.720;SC=TGATGACTAAGTCTTGTGTGT;SOR=2.073;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=28;WE=21711393;WS=21711375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,28:0.74:38
chr12	21712545	rs1871136	A	G	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=570;ReadPosRankSum=-0.971;SC=GAATAGTGAAACCTTAAGTGA;SOR=0.749;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=25;WE=21712553;WS=21712535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr12	21712574	rs1871137	C	T	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.928;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=505;ReadPosRankSum=1.895;SC=GAAAGCATTTCAAGCACCTAC;SOR=0.113;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=21;WE=21712582;WS=21712564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr12	21712728	rs111250042	GACATTCTTTGAAATT	G	366.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=2193;ReadPosRankSum=0.929;SC=TTGTTTTGTTGACATTCTTTG;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=8;WE=21712750;WS=21712718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr12	21713308	rs4639981	T	A	2641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.406;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=36;PP=1953;ReadPosRankSum=-0.613;SC=CATTCACAGGTTGTGAGATTA;SOR=0.481;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=143;TCF=93;TCR=50;TR=98;WE=21713316;WS=21713298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,99:0.68:145
chr12	21713402	rs2306180	T	C	1912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.144;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=51;PP=1441;ReadPosRankSum=-0.263;SC=AAAAACACCATCACTGTGATG;SOR=1.213;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=114;TCF=32;TCR=82;TR=67;WE=21713410;WS=21713392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,72:0.61:119
chr12	21715801	rs1473421	A	G	3183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.148;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=17;PP=2684;ReadPosRankSum=2.024;SC=CTTCCCACAGAAGAAAGTTCT;SOR=1.108;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=151;TCF=125;TCR=26;TR=107;WE=21715809;WS=21715791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,109:0.72:151
chr12	21716055	rs1473422	A	C	1567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=38;PP=1323;ReadPosRankSum=-0.574;SC=TTAATGTACAAAGGGGGCTGG;SOR=0.668;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=74;TCF=20;TCR=54;TR=53;WE=21716063;WS=21716045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,53:0.67:79
chr12	21716098	rs1473423	T	C	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.622;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=921;ReadPosRankSum=0.092;SC=CAATTCTGTTTTCTCTCTACC;SOR=1.179;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=39;WE=21716106;WS=21716088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,41:0.73:56
chr12	21727315	rs7963756	C	A	2055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=58;PP=1723;SC=CTTGATTGTGCTCATGGTCCA;SOR=4.582;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=5;TCR=58;TR=63;WE=21727323;WS=21727305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	21733121	rs2126887	T	G	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=517;SC=TGTCTCAAATTCAATCCATTT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=21733129;WS=21733119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	21789968	rs1677134	G	T	285.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=236;SC=AATACAATGCGAGAAATCATA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=21789976;WS=21789958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	21791272	rs1650289	T	C	1235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=1;PP=1075;SC=TAAAATCAAGTTCCCTTTCAC;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=38;WE=21791280;WS=21791262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	21791410	rs71053332	TA	T	1334.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.410;HP=15;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.044;NF=8;NR=51;PP=612;ReadPosRankSum=1.084;SC=AGCCACTGTTTAAAAAAAAAA;SOR=0.262;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=89;TCF=13;TCR=76;TR=59;WE=21791433;WS=21791400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,69:0.93:74
chr12	21791455	rs1427830	A	T	1981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.48;QD=30.49;SOR=3.511;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	21791565	rs1677129	A	C	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=369;SC=ATAGTTCCCCAAAAAGGCTGA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=21791573;WS=21791555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	21794865	rs1626023	A	T	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=753;ReadPosRankSum=4.035;SC=ACAAGTAATTATTTCTTTTTT;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=26;WE=21794873;WS=21794855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,25:0.78:32
chr12	21796814	rs4762862	G	A	3398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=87;NR=12;PP=2815;SC=AATAACAACAGAAACACCAAA;SOR=3.890;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=87;TCR=12;TR=99;WE=21796822;WS=21796804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr12	21797029	rs1650294	A	G	4313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=114;PP=2965;SC=TAGAATTGGCAGTCACAGAAT;SOR=4.141;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=13;TCR=114;TR=127;WE=21797037;WS=21797019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr12	21799803	rs67155709	T	G	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=3;PP=1004;ReadPosRankSum=0.405;SC=AAAAAAATATTAGATCACTTT;SOR=0.994;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=64;TCF=59;TCR=5;TR=40;WE=21799811;WS=21799793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,42:0.64:66
chr12	21799999	rs1540405	G	C	6022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=113;PP=2965;SC=TCTAGGATGCGTCAGCTCACA;SOR=1.437;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=61;TCR=113;TR=174;WE=21800007;WS=21799989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr12	21807432	rs1677078	T	C	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=1;PP=706;SC=AAACTGTGTATACATGCTGAA;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=21807440;WS=21807422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	21807640	rs1650315	G	A	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=33;PP=1150;SC=AACATTACACGTATATCTGCA;SOR=2.400;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=44;WE=21807648;WS=21807630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	21807687	rs7953579	C	G	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=14;PP=485;SC=TAAAATGTTACTGTTGCAATT;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=21807695;WS=21807677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	21958998	rs4148680	CA	C	179.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=5.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=3.172;QD=1.00;ReadPosRankSum=-0.122;SOR=0.251;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,34:0.19:179
chr12	21995555	rs1643235	C	A	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=652;SC=TCTTCACTCACTTCCCATAGT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=21995563;WS=21995545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	22005510	rs704183	A	G	1417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=37;PP=1120;SC=CCTCTCGAAAATAGTAATACA;SOR=5.283;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=39;WE=22005518;WS=22005500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	22014161	rs2418018	C	A	173.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.78;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	22014163	rs2418019	C	T	173.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=57.97;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	22014165	rs2418020	C	A	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	22017422	rs697250	A	G	981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=19;PP=763;SC=CTGCAAGTATAGCAAACAATG;SOR=1.284;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=31;WE=22017430;WS=22017412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	22017486	rs697251	C	G	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=14;PP=462;SC=CGTCAGGTAACAGATACAATA;SOR=2.636;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=22017494;WS=22017476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	22035873	rs1356368	C	T	3258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=86;PP=2639;SC=TTACTGAACACTTACTCACAT;SOR=4.637;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=8;TCR=86;TR=94;WE=22035881;WS=22035863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr12	22047151	rs704216	G	T	2797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=68;PP=2276;SC=TGGAAAAAGTGTCACACATGC;SOR=2.652;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=18;TCR=68;TR=86;WE=22047159;WS=22047141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr12	22063115	rs10770865	A	G	6491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=135;NR=58;PP=2965;SC=CCCATAGATTAGGACACAGGA;SOR=1.835;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=193;TCF=135;TCR=58;TR=193;WE=22063123;WS=22063105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr12	22063251	rs35857705	CA	C	688.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=4.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.66;ReadPosRankSum=-0.069;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,41:0.87:47
chr12	22063737	rs4762719	G	T	3230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=13;PP=2637;SC=AGGAAACAAAGAGTATTCACA;SOR=3.724;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=86;TCR=13;TR=99;WE=22063757;WS=22063727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr12	22063749	rs4762720	T	C	3389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=87;NR=16;PP=2774;SC=GTATTCACAGTCTTTACATAC;SOR=3.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=87;TCR=16;TR=103;WE=22063757;WS=22063727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr12	22065699	rs3835048	G	GAA	236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=6;NR=0;PP=189;SC=TCAATTCTCTGAAAAAAAGCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=22065707;WS=22065695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	22086976	rs6487252	A	C	1564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=45;PP=1352;SC=GAAACCTTAAAACTTTCTAGA;SOR=5.464;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=47;WE=22086984;WS=22086966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	22089348	rs4586220	G	A	274.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=196;SC=TTGCTTGTTCGTTTCTCACAG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=22089356;WS=22089341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	22354921	rs704219	A	G	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.119;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=38;PP=1187;ReadPosRankSum=-0.763;SC=TGTGGTTATAAATTTTCATGT;SOR=1.022;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=80;TCF=22;TCR=58;TR=51;WE=22354929;WS=22354911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,55:0.65:84
chr12	22401911	rs4762896	C	T	2953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.218;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=44;PP=2334;ReadPosRankSum=-0.479;SC=CATCTTCGTTCGTCACAAACA;SOR=0.373;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=162;TCF=102;TCR=60;TR=109;WE=22401919;WS=22401901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,111:0.67:166
chr12	22440281	rs2287166	A	T	1945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.381;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=63;PP=1661;ReadPosRankSum=-1.036;SC=TGAGGAGCAGATTCATTCACT;SOR=1.134;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=102;TCF=10;TCR=92;TR=69;WE=22440289;WS=22440271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,68:0.67:102
chr12	22440315	rs2072542	A	G	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.546;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=34;PP=817;ReadPosRankSum=0.564;SC=GAGATGTGCCACCTTACCTCA;SOR=3.722;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=2;TCR=49;TR=34;WE=22440323;WS=22440305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,35:0.66:53
chr12	22478425	rs4762904	A	G	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=3.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.11;ReadPosRankSum=0.197;SOR=1.265;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,24:0.27:90
chr12	22478698	rs4762905	C	A	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=70;ReadPosRankSum=-1.347;SC=ACAATAATAACTAATAATAAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=5;WE=22478706;WS=22478688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr12	22489150	rs3809202	A	G	1837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.666;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=39;PP=1420;ReadPosRankSum=0.639;SC=GGGAAGGGGGAGCTTTTCCTA;SOR=0.939;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=104;TCF=46;TCR=58;TR=67;WE=22489158;WS=22489140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,72:0.67:108
chr12	22602796	rs2063573	A	G	1676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.488;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=42;PP=1311;ReadPosRankSum=0.218;SC=AAACCACTGCATCACCACTTA;SOR=0.872;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=116;TCF=43;TCR=73;TR=64;WE=22602804;WS=22602786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,68:0.56:122
chr12	22606738	rs12424580	G	C	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-5.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=656;ReadPosRankSum=-0.550;SC=GGGCTCTAAAGAGCAATTCTC;SOR=0.634;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=32;WE=22606746;WS=22606728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,33:0.63:52
chr12	22635534	.	C	G	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=180;ReadPosRankSum=-0.156;SC=GATCTGAATTCTTAGTCCAAA;SOR=0.522;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=11;WE=22635542;WS=22635524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr12	22696845	rs2271471	G	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=-1.469;SC=TGAGGTCTCGGCGGTCATCCC;SOR=0.169;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=5;WE=22696853;WS=22696835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr12	22778701	rs2271098	C	G	2020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=26;PP=1548;ReadPosRankSum=-1.425;SC=CCCTTCCCGTCGCAGTTGCTC;SOR=0.699;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=128;TCF=81;TCR=47;TR=73;WE=22778709;WS=22778691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,76:0.58:131
chr12	22796994	rs11429701	A	AT	3361.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=76;PP=2936;SC=TTTGAAAAATAGGGCATTTAA;SOR=4.125;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=83;TCF=7;TCR=76;TR=80;WE=22797002;WS=22796984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr12	22814036	rs4963793	A	G	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.506;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=765;ReadPosRankSum=2.565;SC=TTCTCCAGGAAGAGATGACTT;SOR=0.505;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=155;TCF=107;TCR=48;TR=45;WE=22814044;WS=22814026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,47:0.30:158
chr12	23689301	rs4636755	T	C	290.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=241;SC=CAAAATGTCTTTTTGCAACTG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=23689309;WS=23689291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	23737326	rs11046991	C	T	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=134;ReadPosRankSum=-0.497;SC=TTTCTCAGATCTTTGAAAAGT;SOR=0.368;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=10;WE=23737334;WS=23737316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,9:0.24:38
chr12	23737566	rs11046992	G	A	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.208;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=520;ReadPosRankSum=1.139;SC=TGACAGTTACGACAGTTAACT;SOR=0.297;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=84;TCF=9;TCR=75;TR=28;WE=23737574;WS=23737556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,28:0.34:83
chr12	23737664	rs34653390	AGT	A	406.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=541;SC=GACAGGTGTGAGTGTGTGTGT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=13;WE=23737673;WS=23737654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	23757245	rs1479452	C	T	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=53;ReadPosRankSum=-1.544;SC=TGCTGGCATACAATAGACATT;SOR=0.269;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=6;WE=23757253;WS=23757235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr12	23915547	rs71059921	G	GA	595.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.23;MQRankSum=0.482;QD=22.91;ReadPosRankSum=1.134;SOR=0.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr12	23998888	rs7980561	T	C	6301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.872;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=148;NR=49;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.742;SC=GGACACAGCATCAACTTTGTT;SOR=2.148;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=198;TCF=148;TCR=50;TR=197;WE=23998896;WS=23998878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,200:1.00:201
chr12	24102700	.	G	GTCTC	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQRankSum=-0.792;QD=10.96;ReadPosRankSum=-0.328;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr12	24103911	rs72058866	GCACA	G,GCA	710.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.73;QD=29.61;SOR=6.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,6,18:0.25,0.75:24
chr12	24982706	rs35406045	TA	T	1090.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.273;NF=27;NR=1;PP=1951;ReadPosRankSum=0.266;SC=TAAGGTGACATAAAAAAAAGA;SOR=0.335;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=65;TCF=64;TCR=1;TR=28;WE=24982734;WS=24982696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr12	24982721	rs7398085	A	G	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.27;MQRankSum=1.540;QD=17.01;ReadPosRankSum=2.835;SOR=0.576;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,30:0.47:64
chr12	24982726	rs28678340	G	A	1934.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQRankSum=1.604;QD=20.58;ReadPosRankSum=3.521;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,54:0.57:94
chr12	24985557	rs16928089	T	A	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=5.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=0;PP=568;ReadPosRankSum=-1.696;SC=AACTTTTGCATCTTGGGTCTG;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=76;TCF=76;TCR=0;TR=28;WE=24985565;WS=24985547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,29:0.38:76
chr12	24985637	rs3736211	T	C	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.521;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=13;PP=714;ReadPosRankSum=-0.443;SC=TGATAGGAAATGAGGAAATAC;SOR=0.534;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=128;TCR=45;TR=50;WE=24985645;WS=24985627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,50:0.29:174
chr12	25031449	rs6487436	A	G	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=2.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.88;ReadPosRankSum=-1.327;SOR=0.441;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,30:0.26:115
chr12	25047517	rs60686976	A	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.513;NF=0;NR=9;PP=121;ReadPosRankSum=-0.384;SC=TTTAAAGGTTAGCAGCTAACA;SOR=0.120;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=9;WE=25047525;WS=25047507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,9:0.25:36
chr12	25054891	rs2291894	G	A	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=628;ReadPosRankSum=0.650;SC=CCTACGTGACGCTCACCATGA;SOR=3.675;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=28;WE=25054899;WS=25054881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
chr12	25147300	rs699030	G	C	1706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=39;PP=1342;SC=TTTCTGAAGAGACTGCATTTG;SOR=2.393;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=50;WE=25147308;WS=25147290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	25147358	rs11047746	C	T	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.682;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=343;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTTGGGAGGCCGAGGCAGGCA;SOR=0.252;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=16;WE=25147366;WS=25147348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr12	25148755	rs864161	C	G	7427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=100;PP=2965;SC=AGTATATCCCCAACAGGAATC;SOR=1.170;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=250;TCF=150;TCR=100;TR=250;WE=25148763;WS=25148745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr12	25240964	rs866510	G	C	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.373;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=209;ReadPosRankSum=-0.285;SC=GGAGAGGACAGGAAGTAGGAA;SOR=0.951;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=15;WE=25240972;WS=25240954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr12	25241224	rs859154	G	A	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=72;ReadPosRankSum=2.145;SC=CAATAGGACCGATTATTGATT;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=5;WE=25241232;WS=25241214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr12	25242595	rs7969931	C	G	1173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=838;ReadPosRankSum=-0.544;SC=ATCGGTTAACCTTAGACAAAG;SOR=0.409;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=25;TCR=16;TR=41;WE=25242603;WS=25242585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr12	25242776	rs10743538	C	T	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=9;PP=546;SC=CCAGACTCACCTGCTACAGTC;SOR=1.022;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=19;WE=25242784;WS=25242766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	25243115	rs1908946	G	C	6075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=143;PP=2965;SC=ATCACTAACTGTTTAAAACTA;SOR=2.976;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=31;TCR=143;TR=174;WE=25243123;WS=25243105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr12	25249743	rs10842464	T	C	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=313;SC=ACCGAAATAATTGAGATTAGA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=25249751;WS=25249733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	25249785	rs10771166	T	C	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=1;PP=899;ReadPosRankSum=0.161;SC=TAGTCAGTGTTAGAATCACTC;SOR=4.174;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=33;WE=25249793;WS=25249775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chr12	25254975	rs7303889	A	C	4136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=91;PP=2965;SC=TGTTATGAAGAATGAAATGAA;SOR=2.419;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=28;TCR=91;TR=119;WE=25254983;WS=25254965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr12	25257166	rs12828225	T	A	2082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=1;PP=1797;ReadPosRankSum=-1.027;SC=AAGTAGGAGATCTGTGAATGT;SOR=5.486;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=62;TCF=61;TCR=1;TR=61;WE=25257174;WS=25257158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr12	25257182	rs34133737	GA	G	1887.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=0;PP=1883;SC=AATGTGCCAAGAAAAAAATAA;SOR=8.526;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=75;TCF=75;TCR=0;TR=67;WE=25257190;WS=25257172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr12	25260675	rs113123645	C	G	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=5.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=349;ReadPosRankSum=0.563;SC=GATCACCTGACTGGTGGTGTT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=17;WE=25260683;WS=25260665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr12	25261735	rs859146	G	T	2672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=60;PP=2217;SC=CTCAGTACATGCTTCAGTAAG;SOR=2.455;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=17;TCR=60;TR=77;WE=25261743;WS=25261725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr12	25272027	rs2291365	A	G	1129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=1;PP=924;SC=GTTTCAACTTAAGGGTTTTTA;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=25272035;WS=25272017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	25274593	rs2220195	A	G	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=0;PP=831;SC=GTGTTTAATAAGGTTAAAGCT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=25274601;WS=25274583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	25297713	rs7971062	C	T	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=358;SC=TTTAATTTTGCTCCAATTTTG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=25297721;WS=25297703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	25299921	rs11047863	G	A	5663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=118;NR=63;PP=2965;SC=GGAAAGTATTGCCCACAAGGG;SOR=1.485;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=183;TCF=118;TCR=65;TR=181;WE=25299929;WS=25299911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr12	25302481	rs10842485	T	C	241.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=166;SC=CATTTTTCAATTTAAAAAATA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=25302489;WS=25302471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	25343516	rs10842501	C	T	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=3;PP=743;SC=AGTGATTATACAACTATCTAT;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=25343524;WS=25343506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	25343707	rs10842502	C	T	1255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=1051;ReadPosRankSum=1.224;SC=TGTAACTTTCCTTGCAAATCT;SOR=0.729;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=41;WE=25343715;WS=25343697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr12	25362217	rs9266	A	G	1053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=7;PP=736;SC=CTTTACATTCATCAGGGATGA;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=33;WE=25362225;WS=25362207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	25368462	rs4362222	C	T	3905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=49;PP=2965;SC=GTCGGATCTCCCTCACCAATG;SOR=1.064;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=68;TCR=49;TR=117;WE=25368470;WS=25368452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr12	25388290	rs7133635	G	T	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=16;PP=562;SC=CATCAAAGACGGTTGTAGACT;SOR=1.460;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=26;WE=25388298;WS=25388280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	25671759	rs1479500	T	A	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.715;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=9;PP=992;ReadPosRankSum=-0.508;SC=GTTGACCGAGTCCTGGGCTGT;SOR=1.247;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=59;TCF=45;TCR=14;TR=42;WE=25671767;WS=25671749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,44:0.68:65
chr12	25679932	rs1705419	G	A	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=142;ReadPosRankSum=-1.035;SC=CTTCAGATAGGAGTGTCTTTG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=25679940;WS=25679922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr12	25699523	rs278990	A	G	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.580;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=515;ReadPosRankSum=-0.042;SC=GTAACCAGGAAAGAAGTAAAT;SOR=0.260;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=22;WE=25699531;WS=25699513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr12	26027207	rs41379251	C	T	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=34;PP=861;ReadPosRankSum=0.408;SC=GCCTTATATGCTAATACTTTT;SOR=2.687;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=34;WE=26027215;WS=26027197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,36:0.80:45
chr12	26231825	rs11048403	G	C	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.738;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=3;PP=926;ReadPosRankSum=-1.110;SC=TTTCTAGAAGGTTCTCAAAAA;SOR=1.394;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=57;TCF=51;TCR=6;TR=37;WE=26231833;WS=26231815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,40:0.68:59
chr12	26231843	rs7133685	G	T	2145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=12;PP=1638;SC=AAAAAAAGGCGCTAACCGAAA;SOR=2.602;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=50;TCR=12;TR=62;WE=26231851;WS=26231833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr12	26231898	rs4963952	G	A	2791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.405;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=48;PP=2159;ReadPosRankSum=-0.656;SC=TCATGATTATGTATACAAAAA;SOR=0.545;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=88;TCF=40;TCR=48;TR=87;WE=26231906;WS=26231888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,91:0.99:92
chr12	26275555	rs11048413	G	A	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.47;SOR=5.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	26277195	.	G	C	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.891;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=108.070;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=-1.712;QD=2.33;ReadPosRankSum=-3.482;SOR=5.416;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,14:0.25:57
chr12	26277203	.	A	C	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.119;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=54.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=-2.864;QD=2.29;ReadPosRankSum=-3.258;SOR=3.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,5:0.10:48
chr12	26492555	rs34679762	A	AT	277.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.056;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.557;NF=1;NR=12;PP=302;ReadPosRankSum=0.116;SC=CAAAAAAGGGATTTTTTTAAA;SOR=0.154;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=13;WE=26492563;WS=26492545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr12	26568456	rs66797056	TAAGAAAAGA	T	625.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.349;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=2968;ReadPosRankSum=0.170;SC=AAAACACTAATAAGAAAAGAA;SOR=0.076;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=14;WE=26568472;WS=26568446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr12	26581306	rs4963995	G	A	1481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=20;PP=1169;SC=TCATATGAGGGTGATTTGCTA;SOR=1.067;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=26;TCR=20;TR=46;WE=26581314;WS=26581296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	26592288	rs2270960	G	A	1688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=44;PP=1379;SC=TTAGCCTTTCGGACACCTCAG;SOR=5.549;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=46;WE=26592296;WS=26592278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	26596618	rs2220406	C	T	4037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=110;PP=2965;SC=TTTAGGTCTTCTTTTCCCCTT;SOR=4.668;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=22;TCR=110;TR=132;WE=26596626;WS=26596600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr12	26639346	rs36049222	T	TA	350.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=-0.434;QD=14.61;ReadPosRankSum=1.101;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,19:0.79:24
chr12	26639360	rs376239453	C	A	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.53;MQRankSum=-0.706;QD=18.76;ReadPosRankSum=-0.228;SOR=1.819;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr12	26648092	rs2230381	C	T	3260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.087;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=63;PP=2740;ReadPosRankSum=1.631;SC=TACCTCCCACCTGTGCAGTTT;SOR=0.704;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=160;TCF=81;TCR=79;TR=120;WE=26648100;WS=26648082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,118:0.72:164
chr12	26709489	.	AT	A	305	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=12;HapScore=4;MGOF=19;MMLQ=26;MQ=60.87;NF=1;NR=17;PP=305;QD=17.4444444444;SC=CTGGGTCTCTATTTTTTTTTT;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=18;WE=26709507;WS=26709479;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,18:0.86:21
chr12	26709495	.	T	TGTG	107.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.03;MQRankSum=-1.406;QD=5.39;ReadPosRankSum=-0.176;SOR=0.024;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr12	26709497	rs199663645	T	G	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.08;MQRankSum=-1.406;QD=5.84;ReadPosRankSum=-0.263;SOR=0.024;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr12	26709497	.	TTT	GTG	147	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=10;HapScore=4;MGOF=19;MMLQ=27;MQ=60.95;NF=1;NR=2;PP=147;QD=66.8226249541;SC=CTATTTTTTTTTTTGTGTGTG;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=3;WE=26709507;WS=26709479;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:17,3:0.15:20
chr12	26777379	rs2880875	T	C	1208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=34;PP=1020;SC=GTGAAAATATTTTTGTCTTCA;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=26777387;WS=26777369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	26784850	rs2230372	G	A	3241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.145;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=76;PP=2530;ReadPosRankSum=2.469;SC=TCACATCCTCGTGCTCGGTGG;SOR=1.071;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=164;TCF=59;TCR=105;TR=115;WE=26784858;WS=26784840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,119:0.70:170
chr12	26807065	.	T	A	153	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=14;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=17;MQ=59.57;NF=0;NR=14;PP=153;QD=13.4122294677;SC=ACCACCTTAATAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=14;WE=26807073;WS=26807055;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:21,14:0.40:35
chr12	26809537	rs2306550	G	A	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=249;ReadPosRankSum=0.989;SC=ATCTTTAAACGTCATAGTACC;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=15;WE=26809545;WS=26809527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr12	26811045	rs12313993	T	C	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.318;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=31;PP=641;ReadPosRankSum=1.714;SC=CACACAGATCTGACAAATAAT;SOR=2.038;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=38;WE=26811053;WS=26811035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,37:0.67:55
chr12	26816496	rs1375656	T	C	1845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=1;PP=1484;SC=TTGCCCAACATAAAATATTTC;SOR=6.666;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=53;TCF=52;TCR=1;TR=53;WE=26816504;WS=26816486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	26819095	rs34107444	A	ATAGATAGATAGATAGAT	240.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=1931;SC=AGATAGATAGATTTTTTTTTA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=8;WE=26819103;WS=26819085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr12	26834792	rs11048647	A	C	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=2.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.90;ReadPosRankSum=1.733;SOR=0.158;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,33:0.24:138
chr12	26834804	rs111626763	T	TACTC	7723.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=130;NR=11;PP=2915;SC=TTTAAAGAGTTACCTCCTTTC;SOR=4.615;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=155;TCF=144;TCR=11;TR=141;WE=26834812;WS=26834782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr12	26848410	rs1982385	A	C	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=1;PP=341;SC=TTACCTGTGAACCATAGGCTC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=26848418;WS=26848400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	26848663	rs3830260	A	AT	897.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=22;PP=999;SC=AATTCAATTAATATTCTATCC;SOR=5.058;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=22;WE=26848671;WS=26848653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	26874132	rs79501431	A	G	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=488;ReadPosRankSum=-0.455;SC=AAGAAAAAAAAGTAGGGTTTT;SOR=0.665;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=54;TCF=47;TCR=7;TR=16;WE=26874146;WS=26874122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,18:0.32:57
chr12	26874138	rs11407207	G	GT	209.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.68;ReadPosRankSum=0.381;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,15:0.26:57
chr12	26943170	rs7314747	A	T	1777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=47;PP=1236;ReadPosRankSum=-0.640;SC=CCTAGAAGGAAAAGCATGTTT;SOR=0.659;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=225;TCF=101;TCR=124;TR=84;WE=26943178;WS=26943160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,86:0.37:232
chr12	27059149	rs1488053	C	T	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.816;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=1.086;SC=TAATAAAAAACTGCTGATTAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=27059157;WS=27059139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr12	27059224	rs1488052	G	A	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=334;ReadPosRankSum=-1.329;SC=TTGACAATAAGTAACACAAAC;SOR=0.619;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=19;WE=27059232;WS=27059214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr12	27059422	rs1488051	T	C	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=60;ReadPosRankSum=1.710;SC=TAATTTATTATTTCCAAATTT;SOR=0.160;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=27059430;WS=27059412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr12	27064232	rs3210635	C	T	2005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.538;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=62;PP=1656;ReadPosRankSum=0.413;SC=CTTTTCCACGCTCTAAGATTC;SOR=1.821;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=102;TCF=15;TCR=87;TR=70;WE=27064240;WS=27064222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,71:0.70:102
chr12	27066350	rs3736227	C	T	4275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.902;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=28;PP=2962;ReadPosRankSum=0.087;SC=TGTGATATAACAAAAGGCACC;SOR=0.409;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=208;TCF=173;TCR=35;TR=155;WE=27066358;WS=27066340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,156:0.74:210
chr12	27075705	rs7137176	A	T	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=159;ReadPosRankSum=0.035;SC=TTAATTATTCATTTGCTTTTT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=27075713;WS=27075695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr12	27081566	rs2029309	C	G	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=145;ReadPosRankSum=0.804;SC=GCTGTCTCTACTATTCTGAAA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=27081574;WS=27081557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr12	27081873	rs2029310	G	A	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.569;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=319;ReadPosRankSum=-0.029;SC=GTTGACAAGAGTATGTGCAAT;SOR=0.425;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=15;WE=27081881;WS=27081863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr12	27087703	rs708158	T	C	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=118;ReadPosRankSum=-0.742;SC=ATGTGTAGTATATGCCAGGTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=27087711;WS=27087693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr12	27109412	rs5797206	C	CAT	142.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.86;ReadPosRankSum=0.241;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr12	27128594	rs5797208	G	GT	4881.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=90;PP=2979;SC=ATGTTCAGCTGTGGAAGAGTG;SOR=2.017;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=22;TCR=93;TR=111;WE=27128602;WS=27128584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr12	27143579	rs12299714	C	T	1773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=50;PP=1382;SC=AAAAATAACACATGATTAGTG;SOR=4.768;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=3;TCR=50;TR=53;WE=27143587;WS=27143569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	27143632	rs35719635	C	T	924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=26;PP=728;SC=ATCCCACCTACGTGTAATATT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=27143640;WS=27143622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	27152666	rs7314394	T	C	2282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=61;PP=1668;SC=CATAAATTACTGAGCTGATCC;SOR=2.542;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=17;TCR=61;TR=78;WE=27152674;WS=27152656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	27175494	rs3963548	T	C	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=5;PP=1057;SC=TTTTGGCGTCTGTTTGCTGCG;SOR=3.664;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=39;WE=27175502;WS=27175484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	27175640	rs1872191	A	G	2259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=32;PP=1830;SC=GCAAAACTTGAAAGTGGGGAG;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=33;TCR=32;TR=65;WE=27175648;WS=27175630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	27234505	rs34457591	A	T	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=19;PP=563;SC=AAAATAGCCCAAGTGTCAATG;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=27234513;WS=27234495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	27300420	rs841618	T	C	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=0;PP=875;SC=TATGCTCTCTTAATGTTCCTT;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=27300428;WS=27300410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	27461984	rs6487599	T	C	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=409;SC=TTAAGGGAAGTTACTTTTCTT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=27461992;WS=27461974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	27468313	rs2346053	A	G	1725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=51;PP=1487;ReadPosRankSum=1.217;SC=AGAGAATTTTATGCCTTGGTT;SOR=3.334;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=4;TCR=52;TR=55;WE=27468321;WS=27468303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr12	27470866	rs6487601	G	A	3480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=44;PP=2683;SC=CTCAAGAAACGTACAGAAAAG;SOR=1.149;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=68;TCR=44;TR=112;WE=27470874;WS=27470856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr12	27486168	rs62758860	GA	G	125	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=4;PP=131;SC=TCTCGGGCCGGAGCATCGCCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=27486176;WS=27486158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	27553794	rs2927028	C	T	219.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=147;SC=GCTAGTTTTTCTTTTTCTTTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=27553802;WS=27553784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	27569025	rs1256955	G	T	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=210;SC=TTTAAGTGGCGTTGTGGAATA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=27569033;WS=27569015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	27623433	rs35052632	G	GT	976.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=0;PP=1062;SC=TGAACAGCCAGTTGAAAGGGG;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=26;WE=27623441;WS=27623423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	27623490	rs776199	A	G	3865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=11;PP=2965;SC=TCTGGTGTCAATGAAGAGGAT;SOR=3.990;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=99;TCR=11;TR=110;WE=27623498;WS=27623480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr12	27625823	rs386428	A	T	5614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=113;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.703;SC=ACACTGAAAAATGGGTAAGAG;SOR=0.542;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=68;TCR=115;TR=181;WE=27625831;WS=27625813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,184:0.99:185
chr12	27625879	rs381905	G	A	4404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=41.17;ReadPosRankSum=0.741;SOR=1.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,106:0.99:107
chr12	27625887	rs401739	T	C	3957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=43.49;ReadPosRankSum=1.394;SOR=2.170;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,90:0.99:91
chr12	27627805	rs411816	G	A	2384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=51;PP=1987;SC=ACCCTCAAGCGTCTACATCTC;SOR=1.550;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=26;TCR=52;TR=77;WE=27627813;WS=27627795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr12	27647420	.	TTTA	T	528.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.67;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	27788021	rs2075378	G	A	4515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=78;PP=2965;SC=CAGCAGAAACGCTTGTTGAAT;SOR=0.866;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=67;TCR=79;TR=145;WE=27788029;WS=27788011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr12	27800576	rs34792131	C	CT	1552.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=6;PP=1389;SC=AGGATCATTCCTTTTTTTGTT;SOR=3.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=48;TCR=7;TR=47;WE=27800584;WS=27800566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	27800746	rs2194816	G	T	2004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=56;PP=1703;SC=CAGAGAGAAGGTGAATGCCAC;SOR=4.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=5;TCR=56;TR=61;WE=27800754;WS=27800736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	27807906	rs7979973	G	A	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=17;PP=935;SC=TTGAATTTAAGCACCACTGAT;SOR=0.752;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=16;TCR=17;TR=33;WE=27807914;WS=27807896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	27811649	rs10771354	G	T	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=304;SC=TTAGATTTCCGTTATTTTAGG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=27811657;WS=27811639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	27813754	rs7132997	A	G	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=2;PP=538;SC=TGGAGAGTAAATAACTTCTTA;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=27813762;WS=27813744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	27813903	rs7133222	C	T	1684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=28;PP=1328;SC=TTTAAATATACGTGTGGATGT;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=26;TCR=28;TR=54;WE=27813911;WS=27813893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	27813961	rs7133231	A	G	1416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=33;PP=1163;SC=GAGCTATGCCATTTTAAAAGA;SOR=1.931;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=46;WE=27813989;WS=27813951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	27813973	rs7133328	C	T	1608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.25;SOR=2.133;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	27813981	rs7133545	G	C	1454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.93;SOR=1.839;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	27814085	rs6487629	C	T	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=257;SC=CCTGCCCCCACGAATTCAGAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=27814093;WS=27814075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	27817408	rs34613698	CT	C	5151.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.296;NF=33;NR=93;PP=2951;ReadPosRankSum=1.651;SC=AGTTTTTCTACTTTGGTTGAC;SOR=0.548;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=133;TCF=34;TCR=99;TR=126;WE=27817416;WS=27817398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,147:0.99:148
chr12	27820302	rs2033024	C	T	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=18;PP=575;SC=GACTGTGTTACTGAAAAGTTA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=27820310;WS=27820292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	27826780	rs2052673	T	G	4278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.92;ReadPosRankSum=1.251;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,142:0.99:143
chr12	27832308	rs10743607	G	A	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=479;SC=CTCTTTGTAAGTCACTGATTA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=27832316;WS=27832298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	27845924	rs3764010	C	T	1017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=32;PP=866;SC=TTTGTTGTTCCAACTTCTGCT;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=27845932;WS=27845914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	27849795	rs929948	CA	TG	6656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=77;PP=2947;SC=TTTGGGGATCCAACAAGCAAA;SOR=1.082;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=139;TCF=61;TCR=78;TR=131;WE=27849804;WS=27849785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr12	27867706	rs11049106	C	T	2636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=20;PP=2190;SC=TTATCTTTTACGTACAGCGGA;SOR=2.247;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=62;TCR=20;TR=82;WE=27867714;WS=27867696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr12	27908019	rs71438704	G	GA	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.36;ReadPosRankSum=0.303;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr12	27915585	rs35441719	A	ATTT	150.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.933;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=1.072;SC=CGCCCAGCCTATTTTTTTTTT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=6;WE=27915593;WS=27915575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr12	27915718	rs10842975	A	T	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.524;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=290;ReadPosRankSum=-0.457;SC=ATTTGCAAGGATCCTGATTTT;SOR=1.678;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=81;TCF=72;TCR=9;TR=21;WE=27915726;WS=27915708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,22:0.25:89
chr12	27915944	rs11049124	A	G	4274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.580;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=94;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.440;SC=TGTTGAGTCCAGGTGGAACAG;SOR=0.922;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=259;TCF=116;TCR=143;TR=166;WE=27915952;WS=27915934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,169:0.65:262
chr12	27916206	rs11049125	G	A	1773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.873;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=49;PP=1383;ReadPosRankSum=0.104;SC=ACCATTTATCGTGGTGGTTTG;SOR=1.350;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=101;TCF=29;TCR=72;TR=65;WE=27916214;WS=27916196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,66:0.65:101
chr12	27916224	rs11049126	A	G	1310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.015;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=32;PP=1026;ReadPosRankSum=-1.624;SC=TTGTTTATCTAAATTCATAGC;SOR=1.029;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=79;TCF=27;TCR=52;TR=47;WE=27916232;WS=27916214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,47:0.60:78
chr12	27919491	rs9668702	T	G	784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=1;PP=638;SC=GGAAAATAATTATTTTAGGGA;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=27919499;WS=27919484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	27950067	rs138908506	C	CA	244.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQRankSum=-1.384;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.897;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr12	28111319	rs34525777	C	CA	520.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.471;NF=19;NR=0;PP=370;ReadPosRankSum=-1.553;SC=TTAGCCTTGGCAAAAAAAAAA;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=19;WE=28111327;WS=28111309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr12	28115095	rs12812817	C	T	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=487;SC=CCGTGGAATGCCTTGGCTTTC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=28115103;WS=28115085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	28122485	rs6242	T	A	8109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=151;NR=96;PP=2965;SC=AGTGTCAGTCTGGACTCTCCA;SOR=1.252;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=247;TCF=151;TCR=96;TR=247;WE=28122493;WS=28122475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr12	28336945	.	G	T	136	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=8;HapScore=4;MGOF=4;MMLQ=30;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=136;QD=85.3856062736;SC=CAATGAAAAAGAAATGCAAAA;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=2;WE=28336976;WS=28336929;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,2:0.12:16
chr12	28336958	.	C	A	145	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=145;QD=89.8856062736;SC=ATGCAAAAAGCAATGAAAAAA;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=2;WE=28336976;WS=28336929;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,2:0.13:15
chr12	28336964	.	AAAAAT	A	243	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=5;HapScore=4;MGOF=4;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=243;QD=134.5;SC=AAAGCAATGAAAAAATAAATG;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=2;WE=28336976;WS=28336929;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,2:0.13:15
chr12	28336969	rs71438734	T	TAAATGCAAAAAGAAATGAA	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.61;ReadPosRankSum=0.437;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr12	28412415	rs11049489	T	C	1183.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.908;HP=16;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.747;NF=8;NR=45;PP=575;ReadPosRankSum=0.532;SC=TTTTTTTTTTTCCCATGTAAC;SOR=0.093;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=99;TCF=13;TCR=86;TR=53;WE=28412423;WS=28412405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,52:0.58:90
chr12	28457618	rs6487674	A	C	1550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=31;PP=1100;SC=ACTTCACTGAAGTTGCTGATG;SOR=1.262;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=21;TCR=31;TR=52;WE=28457626;WS=28457608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	28603112	rs1133028	A	G	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=3;PP=798;SC=GCTCCTTGAAATGCTAGATAC;SOR=3.841;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=29;WE=28603120;WS=28603102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	28605370	rs144054230	G	GCAGT	100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=163;ReadPosRankSum=-0.142;SC=AAATTATTATGCAGTCTTTCA;SOR=0.148;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=4;WE=28605378;WS=28605360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr12	28605426	rs10771427	G	A	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=214;ReadPosRankSum=0.443;SC=AAAAGAAGCAGTGAAGGATGC;SOR=0.760;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=9;WE=28605434;WS=28605416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr12	28724216	rs6487691	T	C	2826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=26;PP=2022;SC=TACTACTGTATATCCTTCTTG;SOR=1.661;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=59;TCR=26;TR=85;WE=28724224;WS=28724206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
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chr12	29446477	rs10679359	T	TA	173.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=104;ReadPosRankSum=0.995;SC=ATAGTTTCTGTAAAAAAAAAG;SOR=0.741;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=10;WE=29446485;WS=29446467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr12	29462224	rs6487807	C	G	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-6.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.365;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=29;PP=598;ReadPosRankSum=0.603;SC=TAACAAAATTCTTAGTGCTGG;SOR=0.088;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=105;TCF=12;TCR=93;TR=36;WE=29462232;WS=29462214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,38:0.35:110
chr12	29485449	rs10743656	G	A	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.170;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=142;ReadPosRankSum=-0.736;SC=AAGGTCACTCGTCTATGTAGA;SOR=0.098;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=11;WE=29485457;WS=29485439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr12	29519759	rs74474624	G	A	1619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=9;PP=1312;ReadPosRankSum=-0.657;SC=GTCTTCAAGCGTACGATTCCT;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=68;TCR=12;TR=58;WE=29519767;WS=29519749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,58:0.73:80
chr12	29524432	rs77824830	C	T	4051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.103;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=31;PP=2962;ReadPosRankSum=0.569;SC=GTACTTACTACAGAACTTTTA;SOR=1.805;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=200;TCF=148;TCR=52;TR=144;WE=29524440;WS=29524422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,148:0.73:204
chr12	29586952	rs67142894	TTCTC	T	202.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=258;ReadPosRankSum=-0.511;SC=TGGCAAATGTTTCTCTATGAT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=29586963;WS=29586942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr12	29593769	rs2304458	A	C	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=744;ReadPosRankSum=-0.750;SC=TAGCAATTGGATTTTTTACCC;SOR=1.923;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=29;WE=29593777;WS=29593759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,28:0.72:39
chr12	29598373	rs7133304	T	C	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=49;PP=971;ReadPosRankSum=0.427;SC=AAAATAAGAATGAAAATTTGA;SOR=0.883;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=82;TCF=7;TCR=75;TR=54;WE=29598381;WS=29598363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,54:0.64:84
chr12	29618273	rs10771537	G	C	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=27;PP=538;ReadPosRankSum=0.778;SC=GAGGAAAAGAGGTTTATGAAG;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=29;WE=29618281;WS=29618263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr12	29630081	rs7975356	G	A	2954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.577;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=44;PP=2419;ReadPosRankSum=-0.838;SC=ATGACACCTTGTGTTACTGGG;SOR=0.615;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=182;TCF=111;TCR=71;TR=109;WE=29630089;WS=29630071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,110:0.60:182
chr12	29630386	rs16934306	A	G	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.642;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=46;PP=1116;ReadPosRankSum=0.875;SC=GCAATGGTGAAGGCAATATTT;SOR=0.781;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=182;TCF=47;TCR=135;TR=61;WE=29630394;WS=29630376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,62:0.32:191
chr12	29639186	rs3847680	T	C	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=312;ReadPosRankSum=0.192;SC=CACATACCCTTTCCTCTCTGG;SOR=0.803;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=37;TCR=28;TR=18;WE=29639194;WS=29639176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,22:0.31:72
chr12	29642542	rs967182	C	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.501;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=194;ReadPosRankSum=-0.512;SC=GGCTGGTTTACACTTTTGTAC;SOR=1.322;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=30;TCF=16;TCR=14;TR=11;WE=29642550;WS=29642532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr12	29642573	rs967181	A	C	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.447;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=174;ReadPosRankSum=0.182;SC=TCCATTCCCCAATCAGGGAAG;SOR=0.682;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=14;TCR=15;TR=10;WE=29642581;WS=29642563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr12	29648275	rs10843438	G	A	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.882;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=641;ReadPosRankSum=0.170;SC=ATATATTCACGGCTGTTGTAT;SOR=0.559;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=102;TCF=76;TCR=26;TR=37;WE=29648283;WS=29648265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,37:0.36:102
chr12	29650361	rs10771544	A	C	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=35;ReadPosRankSum=-0.898;SC=AATGCAAAAAATTTCAAAAAG;SOR=0.050;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=4;WE=29650369;WS=29650351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr12	29650702	rs822879	C	T	1707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=53;PP=1485;SC=CGCCCTTTATCCCCTCCTGCG;SOR=7.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=53;WE=29650710;WS=29650692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	29725237	rs16934474	C	G	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=1.113;SC=TTTCATGAACCTGTATTTGAA;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=8;WE=29725245;WS=29725227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr12	29736480	rs2113879	A	G	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.402;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=331;ReadPosRankSum=1.052;SC=TGCTCAGTCCATGCACAAAAA;SOR=0.262;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=55;TCF=15;TCR=40;TR=23;WE=29736488;WS=29736470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,23:0.42:55
chr12	29736530	rs2288231	C	T	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=4.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=312;ReadPosRankSum=0.532;SC=GTGGAAGGAACGGGATTACTT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=15;WE=29736538;WS=29736520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr12	29736553	rs2113880	A	G	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=208;ReadPosRankSum=-0.448;SC=GGGGTGCAATAGCTTCCCCCC;SOR=0.481;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=11;WE=29736561;WS=29736543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr12	29756988	rs78720341	A	G	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.084;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.60;ReadPosRankSum=-0.382;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr12	29756995	rs77188229	T	C	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.15;ReadPosRankSum=-1.169;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr12	29814005	rs10843470	C	T	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.34;ReadPosRankSum=-1.431;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr12	29921074	rs302316	A	G	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=19;PP=556;SC=CACAAGGAACACAGACGGAAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=29921082;WS=29921064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	29936613	rs184221	T	G	177.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=2;PP=94;SC=CGGCCGGCGCTAGCCCGCAGC;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=29936634;WS=29936603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	29936626	rs654825	C	A	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=3.979;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=42;ReadPosRankSum=-0.431;SC=CCCGCAGCCCCGCCGCCGGGA;SOR=1.414;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=4;WE=29936634;WS=29936603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr12	30783743	rs2278558	C	T	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=3;PP=595;SC=TCACACTCCTCTTGTGAAATA;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=30783751;WS=30783733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	30809492	rs7974489	G	A	148.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5065;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=110;ReadPosRankSum=1.242;SC=TCCAAAAATTGAAGTGATTAT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=30809500;WS=30809482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr12	30814043	rs67741303	CTATTA	C	723.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=831;SC=TTAAATGCTACTATTATATCA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=30814055;WS=30814033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	30814259	rs10771753	C	T	1434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=31;PP=1086;SC=CCCCGCTTTACAAAAGTTAGC;SOR=1.390;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=47;WE=30814267;WS=30814249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	30815157	rs2118780	A	T	1627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=0;PP=1359;SC=AATGTTGTTAAGCAGCACATG;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=48;WE=30815165;WS=30815147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	30818081	rs10843807	A	G	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=264;SC=AGGTCAATTTATCCAAAAAAC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=30818089;WS=30818071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	30818406	rs10843808	T	G	255.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=272;SC=TATTACCTTATATCAGTTTGA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=30818414;WS=30818396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	30822239	rs376756669	AC	A	112.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.93;ReadPosRankSum=1.148;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr12	30822240	rs7955420	C	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=88;ReadPosRankSum=-0.982;SC=AAAAAAAAAACGTAACAAATG;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=12;WE=30822248;WS=30822229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr12	30823971	rs1054426	A	G	6026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=130;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.224;SC=ATGCTTGCTGAAGAACACGGG;SOR=1.083;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=47;TCR=131;TR=177;WE=30823979;WS=30823961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,184:0.99:185
chr12	30827086	rs2289301	G	C	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=269;SC=AAATATAGTCGCTTATTCAAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=30827094;WS=30827076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	30841285	rs12809355	G	C	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=16;PP=690;SC=GGTAAGAAAGGACATTCACCA;SOR=0.826;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=14;TCR=16;TR=30;WE=30841293;WS=30841275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	30843377	rs2289302	T	C	2283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=9;PP=1949;SC=AATAAAACTCTCATTCTACTC;SOR=3.643;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=60;TCR=9;TR=69;WE=30843385;WS=30843367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	30848675	rs12809335	C	T	3427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=78;PP=2781;SC=TTCCGCGACCCCTGGATTACC;SOR=1.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=35;TCR=78;TR=113;WE=30848683;WS=30848665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr12	30867794	rs10843820	C	T	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=0;PP=574;SC=TACTACGTTGCAAATGACAAA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=30867802;WS=30867784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	30868002	rs13656	C	T	5620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=91;PP=2965;SC=GTCTGGGAAACACATTCGTCT;SOR=0.807;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=176;TCF=84;TCR=92;TR=175;WE=30868010;WS=30867992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr12	30877391	rs7299800	G	T	4569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=108;PP=2965;SC=GACTCCTAAAGATATGATTTT;SOR=2.436;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=31;TCR=108;TR=139;WE=30877399;WS=30877381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr12	30878859	rs7304879	G	C	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=370;SC=CCAGTCAGAAGCCCCATGAAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=30878867;WS=30878849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	30879088	rs10843822	T	C	1565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=37;PP=1314;SC=TAGGAAACAGTTTATCACTAC;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=44;WE=30879096;WS=30879078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	30881809	rs2304630	T	C	3467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=72;PP=2629;SC=TCGCTCTGCATGGAAGGTGTC;SOR=1.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=44;TCR=72;TR=116;WE=30881817;WS=30881799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr12	30888001	rs12146709	T	C	10479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.040;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=161;NR=148;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.265;SC=CAAACCCCCTTTGAAGTCTTT;SOR=0.068;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=312;TCF=163;TCR=149;TR=309;WE=30888009;WS=30887991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,322:0.99:325
chr12	30893875	rs10771762	T	C	1889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=6;PP=1481;ReadPosRankSum=-1.035;SC=ACACCATTACTAGACACTGAC;SOR=2.062;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=60;TCF=54;TCR=6;TR=58;WE=30893883;WS=30893865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,60:0.97:62
chr12	30948848	rs256653	G	C	1469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=11;PP=1247;SC=TCCTTCCCCTGCCCCCATTCC;SOR=2.110;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=46;WE=30948856;WS=30948838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	30949206	rs256654	A	G	1467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=44;PP=1205;SC=CATCCTCTCGATGGCCGCGCC;SOR=6.273;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=45;WE=30949214;WS=30949196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	31131712	rs35097	T	C	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=33;PP=1047;SC=TCCCCCTACATATCTGCATCC;SOR=3.664;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=38;WE=31131720;WS=31131702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	31132479	rs35096	A	C	2099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=51;NR=15;PP=1636;SC=GCTGATGGGGACTTCGCTCCT;SOR=2.517;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=51;TCR=15;TR=66;WE=31132487;WS=31132469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr12	31135418	rs2075332	C	A	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.219;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=463;ReadPosRankSum=-0.044;SC=AGCCTGGGACCCTACGCAGGC;SOR=0.379;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=74;TCF=45;TCR=29;TR=29;WE=31135426;WS=31135408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,31:0.39:80
chr12	31135478	rs35089	T	C	2004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=36;PP=1471;SC=TCAAGTGCTGTGGAAGCAACA;SOR=0.844;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=30;TCR=36;TR=66;WE=31135486;WS=31135468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	31135579	rs2075333	T	C	1235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=31;PP=908;SC=ACAGTGGTGGTGCGCTGCGGC;SOR=2.409;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=41;WE=31135587;WS=31135569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	31135905	rs888473	A	T	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=9;NR=1;PP=272;SC=TCCTCTGGCCAGTCCTCAGCC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=31135913;WS=31135895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	31135925	rs75495170	G	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.291;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=101;ReadPosRankSum=0.097;SC=CTCTGCTGCAGTGACAGCCCG;SOR=0.086;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=6;WE=31135933;WS=31135915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr12	31144884	rs35076	A	G	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=0.583;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.537;SOR=0.785;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:156,56:0.26:212
chr12	31237026	rs28559720	A	G	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=6.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.267;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-10.257;NF=12;NR=39;PP=930;ReadPosRankSum=-0.833;SC=AAGTGGGAGTACTGGAGGAAA;SOR=0.368;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=159;TCF=39;TCR=120;TR=51;WE=31237034;WS=31237016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,28:0.20:138
chr12	31237372	rs3930906	A	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-1.111;NF=11;NR=1;PP=129;ReadPosRankSum=-0.553;SC=AGGTCCCGGGAGGGGATGCGG;SOR=0.840;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=12;WE=31237380;WS=31237362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr12	31237693	rs79540602	C	T	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=1.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQRankSum=-2.718;QD=8.35;ReadPosRankSum=-1.259;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,19:0.28:68
chr12	31237700	rs3881296	G	A	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=1.157;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=-2.127;QD=8.46;ReadPosRankSum=-1.073;SOR=0.933;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,16:0.26:61
chr12	31238075	rs4931428	G	A	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.920;NF=0;NR=9;PP=172;ReadPosRankSum=-1.290;SC=GACAGAGGCGGTAGCACTACC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=9;WE=31238083;WS=31238065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr12	31240862	rs7308754	A	T	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=2.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.32;MQRankSum=-2.761;QD=10.69;ReadPosRankSum=-0.011;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr12	31240925	rs7308773	A	G	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.657;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.986;NF=34;NR=13;PP=678;ReadPosRankSum=-1.757;SC=AAGGTAACACAAGTGTCCTCA;SOR=1.145;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=130;TCF=84;TCR=46;TR=47;WE=31240933;WS=31240915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,48:0.37:129
chr12	31240960	rs7309189	G	A	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.588;NF=22;NR=26;PP=865;ReadPosRankSum=1.165;SC=GGGGGTATAGGCTGGGCTGTG;SOR=0.680;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=57;TCR=69;TR=48;WE=31240968;WS=31240950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,48:0.38:127
chr12	31242271	rs2005896	G	A	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.155;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.766;NF=11;NR=3;PP=201;ReadPosRankSum=-1.186;SC=GCAGGTCCACGTGTGTTGGTA;SOR=0.219;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=51;TCF=42;TCR=9;TR=14;WE=31242279;WS=31242261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,18:0.32:56
chr12	31242314	rs2005897	T	C	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=6.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=-1.920;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.087;SOR=1.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,25:0.31:81
chr12	31242399	rs3881298	T	C	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-10.493;NF=20;NR=19;PP=587;ReadPosRankSum=2.713;SC=ACGACCGCTGTGTGGACATGC;SOR=0.645;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=134;TCF=64;TCR=70;TR=39;WE=31242407;WS=31242389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,34:0.26:132
chr12	31242440	rs2075318	A	G	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.739;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-8.015;NF=12;NR=30;PP=710;ReadPosRankSum=-1.630;SC=CACTGGGACCATGGTGTAGCC;SOR=1.056;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=111;TCF=39;TCR=72;TR=42;WE=31242448;WS=31242430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,40:0.37:109
chr12	31244619	rs61917221	C	T	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.24;MQRankSum=-1.577;QD=2.44;ReadPosRankSum=-3.867;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,5:0.19:27
chr12	31244705	rs150966927	C	T	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=9.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.35;MQRankSum=-0.920;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.642;SOR=1.566;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,48:0.43:111
chr12	31244846	rs1808348	C	G	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=6.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.510;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.685;NF=2;NR=18;PP=393;ReadPosRankSum=2.216;SC=CCTGCTGTGACGTAAAGGGAC;SOR=1.056;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=60;TCF=8;TCR=52;TR=20;WE=31244854;WS=31244836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,20:0.32:63
chr12	31245741	rs2075321	A	G	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.574;NF=11;NR=0;PP=126;ReadPosRankSum=1.089;SC=CTTAGCCCTCAGCTGCTTGCT;SOR=0.563;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=11;WE=31245749;WS=31245731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr12	31245844	.	G	C	1798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.256;ClippingRankSum=0.000;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.596;NF=37;NR=29;PP=1337;ReadPosRankSum=-0.270;SC=GTGACCCTCTGAGGTAGTGGG;SOR=0.663;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=98;TCF=53;TCR=45;TR=66;WE=31245852;WS=31245834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,69:0.68:102
chr12	31246371	rs10843882	C	T	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.409;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.122;NF=5;NR=22;PP=468;ReadPosRankSum=1.461;SC=AAGGGTCGGCCGGGTGCGGTG;SOR=0.283;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=82;TCF=12;TCR=70;TR=27;WE=31246379;WS=31246361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,29:0.35:83
chr12	31246438	rs7970074	T	C	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQRankSum=-3.262;QD=13.24;ReadPosRankSum=0.615;SOR=0.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr12	31249861	rs2075322	C	G	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.381;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.089;NF=20;NR=40;PP=998;ReadPosRankSum=0.947;SC=GATGCACATCCAAGGCTTCCT;SOR=0.540;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=54;TCR=109;TR=60;WE=31249869;WS=31249851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,56:0.34:165
chr12	31250669	rs7971579	G	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.789;NF=10;NR=0;PP=108;ReadPosRankSum=1.603;SC=CTGTGGGCTGGTTGTCCTAGA;SOR=0.646;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=10;WE=31250677;WS=31250661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr12	31250768	rs2909388	C	T	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=4.240;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.22;MQRankSum=-6.296;QD=1.32;ReadPosRankSum=-2.447;SOR=1.429;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,15:0.14:109
chr12	31253995	rs1046456	C	T	2309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-12.711;NF=41;NR=63;PP=1706;ReadPosRankSum=0.131;SC=TCCTGCCCCTCGTCATCTGCA;SOR=0.842;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=295;TCF=125;TCR=170;TR=104;WE=31254003;WS=31253985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,104:0.35:295
chr12	31254642	rs7952861	T	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.549;NF=14;NR=0;PP=284;ReadPosRankSum=-0.523;SC=CCAAGTCCTCTTCCTTGGCTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=14;WE=31254650;WS=31254632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr12	31254701	rs7966366	G	T	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.295;NF=23;NR=2;PP=458;ReadPosRankSum=-0.540;SC=AGGTGAAGACGCGGTTTGTGG;SOR=0.536;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=62;TCR=5;TR=25;WE=31254709;WS=31254691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,25:0.38:65
chr12	31254752	rs7966272	C	T	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=4.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQRankSum=-1.479;QD=7.26;ReadPosRankSum=-0.007;SOR=0.555;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,38:0.35:110
chr12	31255263	rs10771803	G	A	1979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.206;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-5.913;NF=53;NR=35;PP=1459;ReadPosRankSum=-0.599;SC=CGTCATGCTGGGCTTGGGTCT;SOR=0.546;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=282;TCF=172;TCR=110;TR=88;WE=31255271;WS=31255253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,90:0.31:288
chr12	31255405	rs77340729	C	T	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.735;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.808;NF=11;NR=45;PP=986;ReadPosRankSum=0.299;SC=CCCTGCTCCTCTCTGTGGTTG;SOR=0.473;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=178;TCF=31;TCR=147;TR=56;WE=31255413;WS=31255395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,52:0.30:171
chr12	31255772	rs58740356	A	AG	130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.940;NF=5;NR=1;PP=159;ReadPosRankSum=0.637;SC=ACAGTCGGAGAGGCTGAGGGA;SOR=0.723;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=6;WE=31255780;WS=31255762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr12	31256075	rs3825318	G	A	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.80;MQRankSum=1.482;QD=3.75;ReadPosRankSum=0.888;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr12	31256546	rs1046457	G	A	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=5.454;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.11;MQRankSum=-7.005;QD=3.75;ReadPosRankSum=-1.121;SOR=0.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,18:0.21:84
chr12	31256905	rs1046458	T	C	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.958;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.546;NF=0;NR=6;PP=34;ReadPosRankSum=-1.046;SC=GAGTCCAGAGTGCTGCCAGGA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=6;WE=31256913;WS=31256895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr12	31264743	rs4930953	C	T	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.645;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.689;NF=13;NR=20;PP=595;ReadPosRankSum=-0.655;SC=TGCTTCTCCACCTGGGATTTA;SOR=0.311;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=83;TCF=25;TCR=58;TR=33;WE=31264751;WS=31264733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,34:0.40:86
chr12	31264770	rs1053552	A	G	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.212;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.163;NF=5;NR=20;PP=466;ReadPosRankSum=-0.679;SC=CATTTAAACAATAAACACATT;SOR=0.951;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=11;TCR=45;TR=25;WE=31264778;WS=31264760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,25:0.44:57
chr12	31265872	rs2302849	C	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-6.230;NF=11;NR=1;PP=152;ReadPosRankSum=0.229;SC=TAGATATAAACACCACATTCA;SOR=0.223;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=12;WE=31265880;WS=31265862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,10:0.24:41
chr12	31265925	rs2302850	C	G	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.183;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.909;NF=13;NR=5;PP=290;ReadPosRankSum=1.324;SC=CTTTTTCGTACTAATCGTAGA;SOR=0.887;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=71;TCF=50;TCR=21;TR=18;WE=31265933;WS=31265915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,16:0.24:68
chr12	31265983	rs1053534	G	A	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.107;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-7.919;NF=8;NR=15;PP=281;ReadPosRankSum=-0.347;SC=GCTCTGCTCAGCAGAAAAAGT;SOR=1.069;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=84;TCF=35;TCR=49;TR=23;WE=31265991;WS=31265973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,21:0.24:87
chr12	31266042	rs2302853	C	T	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.779;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.170;NF=1;NR=14;PP=217;ReadPosRankSum=-0.661;SC=ATTATAATTACATTGTAGCAG;SOR=1.230;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=15;WE=31266050;WS=31266032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,14:0.25:56
chr12	31267744	rs7968684	A	C	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.195;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.705;NF=2;NR=6;PP=103;ReadPosRankSum=-0.059;SC=TGTCTTTGTGATGAAAGATTA;SOR=0.223;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=8;WE=31267752;WS=31267734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr12	31269189	rs25559	C	CATCAT	127.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQRankSum=-5.379;QD=2.97;ReadPosRankSum=-2.012;SOR=0.016;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,4:0.09:43
chr12	31270149	rs7316147	GC	CA	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=2.302;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.03;MQRankSum=-7.220;QD=1.66;ReadPosRankSum=1.261;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,7:0.12:60
chr12	31270171	rs7301557	T	C	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQRankSum=-6.235;QD=2.93;ReadPosRankSum=-2.678;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,7:0.16:45
chr12	31283446	rs140298932	T	G	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.01;MQRankSum=-3.257;QD=15.15;ReadPosRankSum=-0.054;SOR=0.715;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,36:0.61:59
chr12	31285101	rs2933405	A	G	1634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=0;PP=1416;SC=TCTCTATTCTATTATTTTAAG;SOR=7.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=48;WE=31285109;WS=31285091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	31285169	rs2287449	A	T	3446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.603;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.989;NF=83;NR=29;PP=2899;ReadPosRankSum=-1.526;SC=ACAAAATTTGATCAACTTACC;SOR=1.996;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=113;TCF=83;TCR=30;TR=112;WE=31285177;WS=31285159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,108:0.99:109
chr12	31286189	rs3844571	T	C	1996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.97;QD=32.21;SOR=1.647;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	31288835	rs200865477	G	GA	1028.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=4;PP=914;SC=GAAATATTAAGAATATTTTAG;SOR=2.546;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=22;WE=31288843;WS=31288825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	31288884	rs4931444	G	T	2199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=19;PP=1934;SC=ACAGAACAACGCACCTCTACA;SOR=2.165;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=50;TCR=19;TR=69;WE=31288892;WS=31288874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr12	31288955	rs11051266	G	A	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.753;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.019;NF=42;NR=10;PP=949;ReadPosRankSum=-0.524;SC=TTGAACAACCGAAAAGGGTGA;SOR=0.460;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=171;TCF=138;TCR=33;TR=52;WE=31288963;WS=31288945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,43:0.28:156
chr12	31297722	rs55758709	C	T	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=0;PP=952;SC=ATATAATCCACGAAGGAACAA;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=31297730;WS=31297712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	31297871	rs12309295	G	C	5675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.203;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.379;NF=83;NR=92;PP=2965;ReadPosRankSum=1.456;SC=TCAGATTTCAGTAGAAGGACG;SOR=0.382;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=176;TCF=84;TCR=92;TR=175;WE=31297879;WS=31297861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,183:0.99:184
chr12	31300754	rs116358569	T	C	1055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.79;QD=29.33;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	31300891	rs56144986	C	A	5206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=132;NR=59;PP=2965;SC=GAGTAATGCACAGTAACAACC;SOR=2.410;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=132;TCR=59;TR=191;WE=31300899;WS=31300881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr12	31301888	rs11051274	T	C	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=4.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.024;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.120;NF=1;NR=22;PP=493;ReadPosRankSum=-0.172;SC=AGGTACATTATTGGGATCCGA;SOR=2.753;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=68;TCF=12;TCR=56;TR=23;WE=31301896;WS=31301878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,23:0.33:69
chr12	31359159	rs3065666	C	CAATGGTAA	1335.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=1252;ReadPosRankSum=-0.214;SC=TCATACCAACCAATGGTAAGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=18;WE=31359167;WS=31359149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr12	31359210	rs2164498	A	G	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5027;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.530;NF=0;NR=20;PP=501;ReadPosRankSum=0.531;SC=CTCTTTGTGTAAAGACCCACA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=20;WE=31359218;WS=31359200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,19:0.86:22
chr12	31539122	rs3741877	A	G	2386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.160;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=37;PP=1829;ReadPosRankSum=-0.125;SC=TTTGCTTTTCAGCCACAACTG;SOR=0.991;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=149;TCF=90;TCR=59;TR=101;WE=31539130;WS=31539112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,101:0.67:151
chr12	31539303	rs708200	G	T	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=274;ReadPosRankSum=-0.046;SC=ACAACTTTTGGTCTTTCAAAA;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=15;WE=31539311;WS=31539293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr12	31542191	rs10843937	A	G	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=5.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.623;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=0;PP=1057;ReadPosRankSum=1.759;SC=ATGATCTGGTATAACCTTTTC;SOR=3.373;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=70;TCR=2;TR=44;WE=31542199;WS=31542181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,45:0.62:72
chr12	31545103	rs708218	T	C	883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=1;PP=695;SC=AATATATATATCCTTATCACT;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=31545111;WS=31545093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	31545381	rs792874	A	G	2435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=49;PP=1880;SC=CTATGTCTAAAAAAAACACTA;SOR=2.336;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=16;TCR=49;TR=65;WE=31545389;WS=31545371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr12	31545682	rs7975761	A	G	2262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.466;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=41;PP=1649;ReadPosRankSum=0.265;SC=AATAAACCAAAGTACTATGGG;SOR=0.897;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=123;TCF=60;TCR=63;TR=78;WE=31545690;WS=31545672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,84:0.65:130
chr12	31551002	rs11346977	CT	C	59.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=-0.328;SC=CAACTTTCTTCTTTTTAAAAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=31551010;WS=31550998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr12	31551350	rs1798769	C	T	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=20;PP=686;SC=GACAGGGTTCCCGCTCAGCCC;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=31551358;WS=31551340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	31568221	rs793159	C	T	2589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=5;PP=2278;ReadPosRankSum=-0.857;SC=CAGCCATAATCATTTGAGCAA;SOR=4.047;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=74;TCR=5;TR=78;WE=31568229;WS=31568211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,78:0.99:79
chr12	31577378	rs34764768	A	AT	475.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.077;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.345;NF=20;NR=2;PP=315;ReadPosRankSum=-0.802;SC=AAAAGAGCCTATTTTTTTTTA;SOR=1.635;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=75;TCF=62;TCR=13;TR=22;WE=31577386;WS=31577368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,26:0.35:75
chr12	31586007	rs2682695	C	T	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.931;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=5;PP=544;ReadPosRankSum=1.201;SC=CATTAAGAATCTACACAATGA;SOR=1.270;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=76;TCF=59;TCR=17;TR=31;WE=31586015;WS=31585997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,32:0.42:77
chr12	31600400	rs7976644	G	A	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=0;PP=690;ReadPosRankSum=-0.409;SC=TTTGTTGTACGTAAGGCCAGC;SOR=1.345;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=29;WE=31600408;WS=31600390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,31:0.63:49
chr12	31632449	rs3741878	T	C	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=322;ReadPosRankSum=-1.250;SC=TCTAATAATATACCCCATGGA;SOR=1.931;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=15;WE=31632457;WS=31632439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr12	31633258	rs113784337	G	GT	322.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=315;ReadPosRankSum=-0.138;SC=AATAAATGTTGTTTTTTTAAC;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=14;WE=31633266;WS=31633248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr12	31648723	rs4931506	G	A	2644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-6.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.747;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.435;NF=71;NR=22;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.249;SC=AAGAGTAAATGAGGGGAAAAA;SOR=0.939;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=134;TCF=100;TCR=34;TR=93;WE=31648736;WS=31648713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,101:0.72:141
chr12	31648728	rs143241018	GA	G	2321.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.596;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.594;NF=51;NR=27;PP=2980;ReadPosRankSum=-2.072;SC=TAAATGAGGGGAAAAAAAACA;SOR=0.874;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=126;TCF=79;TCR=47;TR=78;WE=31648736;WS=31648713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,104:0.71:146
chr12	31648826	rs4930979	C	T	2640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.540;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=62;PP=2006;ReadPosRankSum=0.476;SC=GAATGTTCTTCTCAAAGGACT;SOR=0.898;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=137;TCF=45;TCR=92;TR=91;WE=31648834;WS=31648816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,95:0.68:140
chr12	31648948	rs4931507	G	A	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=322;ReadPosRankSum=0.181;SC=GACTGATAATGTTGAGATCTG;SOR=1.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=15;WE=31648956;WS=31648938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr12	31693975	rs34225458	T	TA	1816.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.359;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.248;NF=14;NR=46;PP=988;ReadPosRankSum=0.642;SC=TCTTACCATATAAAAAAAAAA;SOR=0.349;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=100;TCF=20;TCR=80;TR=60;WE=31693983;WS=31693965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,78:0.73:107
chr12	31814741	rs7959989	G	C	768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=2;PP=620;SC=CTCTTCCTCAGAATTCTCAGT;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=31814749;WS=31814731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	31815233	rs56228550	C	T	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=35;PP=1091;SC=TAAGGCGCTACAGATCTTTGC;SOR=4.073;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=40;WE=31815241;WS=31815223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	31825120	rs11551368	G	C	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=165;SC=TATAACTTAAGACAATAAAAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=31825128;WS=31825110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	31826791	rs73090331	T	C	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=27;PP=847;SC=TGTGTTAATGTCCTATTGCTG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=31826799;WS=31826781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	31850220	rs2388926	C	T	1708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=0;PP=1437;SC=ATTGGTTATCCGCTAGGTTTT;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=47;WE=31850228;WS=31850210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	31907659	rs11613702	C	T	1555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=17;PP=1253;SC=ACACCATGAACCACACTGTCC;SOR=1.519;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=50;WE=31907667;WS=31907649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	31908050	rs6488005	A	C	9268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=145;NR=153;PP=2965;SC=CCAAGCCCATAGATAGATCAG;SOR=0.732;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=300;TCF=145;TCR=155;TR=298;WE=31908058;WS=31908040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
chr12	32134207	rs2388981	C	A	5444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.470;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=129;NR=62;PP=2962;ReadPosRankSum=0.866;SC=AACTAACTCACAATTTGCAGA;SOR=1.188;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=303;TCF=194;TCR=109;TR=191;WE=32134215;WS=32134197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,192:0.62:308
chr12	32134240	rs2388982	C	T	5439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.070;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=138;NR=66;PP=2962;ReadPosRankSum=0.024;SC=TTACCCAAAACGTATGGTTGA;SOR=1.396;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=330;TCF=207;TCR=123;TR=204;WE=32134248;WS=32134230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,204:0.61:334
chr12	32134638	rs2166807	T	C	6439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=107;NR=80;PP=2965;SC=AGTCAGCTTCTAAATTCTGTA;SOR=1.026;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=187;TCF=107;TCR=80;TR=187;WE=32134646;WS=32134628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr12	32134926	rs3207618	G	A	1483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.577;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=39;PP=1083;ReadPosRankSum=0.836;SC=AATACCAACAGCAAACAGCCT;SOR=0.771;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=174;TCF=71;TCR=103;TR=64;WE=32134934;WS=32134916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,66:0.36:182
chr12	32135186	rs3759302	T	A	3352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-7.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.015;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=29;PP=2766;ReadPosRankSum=-1.419;SC=GACTAATACTTCTTATAGTGA;SOR=1.049;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=191;TCF=141;TCR=50;TR=122;WE=32135194;WS=32135176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,123:0.64:192
chr12	32135441	rs3759301	T	C	7041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=115;NR=95;PP=2965;SC=AATGCCAGACTCATCTCATGA;SOR=0.959;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=211;TCF=116;TCR=95;TR=210;WE=32135449;WS=32135431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr12	32137565	rs1057994	G	A	1617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.872;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=24;PP=1233;ReadPosRankSum=0.678;SC=TGATAGAGATGTCACTGTTGT;SOR=0.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=80;TCF=43;TCR=37;TR=54;WE=32137573;WS=32137555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,58:0.68:85
chr12	32137852	rs3759297	C	G	2755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.197;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=60;PP=2096;ReadPosRankSum=-1.223;SC=CTCAGGAAACCCGACAGAAGA;SOR=0.822;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=179;TCF=84;TCR=95;TR=110;WE=32137860;WS=32137842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,113:0.62:181
chr12	32138924	rs7302975	T	C	4149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=93;PP=2965;SC=GTGTCTACAATATTGTAAAGA;SOR=2.106;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=33;TCR=93;TR=126;WE=32138932;WS=32138914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr12	32138974	rs35804480	CT	C	2186.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=55;PP=2392;SC=CTCATGCTGTCTTGGGCTGCT;SOR=5.960;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=60;TCF=3;TCR=57;TR=57;WE=32138982;WS=32138964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr12	32261435	rs1144715	A	G	35.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.93;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr12	32446835	rs261877	G	A	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=122;ReadPosRankSum=-1.486;SC=CCCATGAGGTGTTTTTATTAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=7;WE=32446843;WS=32446825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr12	32446901	rs261878	T	C	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.995;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=3;PP=801;ReadPosRankSum=-0.638;SC=GAGAGTTATATATTGACTGTT;SOR=2.144;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=71;TCF=62;TCR=9;TR=36;WE=32446909;WS=32446891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,36:0.47:76
chr12	32490369	rs2388987	G	A	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.846;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=146;ReadPosRankSum=-0.128;SC=TTACTTTTCAGCTTAACTCCC;SOR=0.027;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=9;WE=32490377;WS=32490359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr12	32490850	rs1057779	C	G	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=2.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.55;ReadPosRankSum=-1.321;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr12	32491969	rs2291419	C	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.783;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=57;ReadPosRankSum=-0.169;SC=AATAGACTCTCCCCTTCCTTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=5;WE=32491977;WS=32491959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr12	32639156	rs6488061	C	A	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=20;PP=725;SC=GCAAAGTATACAATAGATGAG;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=32639164;WS=32639146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	32716988	rs61926167	T	A	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.60;ReadPosRankSum=0.236;SOR=1.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr12	32735236	rs904582	C	T	4604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=93;PP=2965;SC=CCACAACAGACAGCTGTGATG;SOR=1.745;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=44;TCR=94;TR=137;WE=32735244;WS=32735226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr12	32755058	rs4931641	T	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.48;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr12	32764184	rs10844253	G	A	6242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=116;PP=2965;SC=TAGCTGCTCGGAACACTTCAG;SOR=1.156;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=190;TCF=74;TCR=116;TR=189;WE=32764192;WS=32764174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr12	32777362	rs11052110	G	A	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=21;PP=638;SC=TTAGTTCTGCGCAAGACAAAG;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=32777370;WS=32777352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	32777416	rs10700807	C	CT	148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.90;QD=21.25;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	32778039	rs7970584	A	G	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=30;PP=863;SC=AACCTCTTTCATATCTTTGCA;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=35;WE=32778047;WS=32778029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	32793164	rs74073032	A	G	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=569;ReadPosRankSum=-0.298;SC=CACACTTAACAAGCGAATACA;SOR=0.641;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=41;TCR=16;TR=32;WE=32793172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,37:0.60:62
chr12	32854200	rs11052192	A	G	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.036;NF=3;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=-1.645;SC=ACAAGAGCGAAACTCCGTCTC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=32854218;WS=32854192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr12	32854366	rs10844308	A	C	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.040;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=634;ReadPosRankSum=-0.984;SC=GAAAGAGCTCAGTGCTAGAAA;SOR=0.479;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=32;WE=32854374;WS=32854356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr12	32854602	rs9737752	G	A	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=14;PP=419;SC=CTGTAGCATAGTTAGAAGTCC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=32854610;WS=32854592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr12	32860302	rs2272238	G	A	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.134;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=555;ReadPosRankSum=-1.320;SC=TTTTTCCAGGGGTGGAAGCAG;SOR=0.473;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=46;TCF=27;TCR=19;TR=24;WE=32860310;WS=32860292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr12	32863824	rs11052197	T	C	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=3;PP=981;ReadPosRankSum=-0.315;SC=TACTTCATAGTTCATTGAAAT;SOR=1.002;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=54;TCR=4;TR=42;WE=32863832;WS=32863814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,44:0.73:60
chr12	32866399	rs7971495	G	A	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.36;ReadPosRankSum=0.369;SOR=1.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr12	32866403	rs7958074	T	C	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.05;ReadPosRankSum=-0.406;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr12	32871481	rs10844314	G	A	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=332;ReadPosRankSum=-0.614;SC=AAGTGGGATTGTAGATGAGGG;SOR=0.922;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=16;WE=32871489;WS=32871471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr12	32875406	rs10844318	A	G	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=98;ReadPosRankSum=2.559;SC=AGTTGAAAACAAGAATAAATG;SOR=1.270;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=7;WE=32875414;WS=32875396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr12	32884187	rs138148657	AAAAAGCATTTTTCATG	A	1338.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.464;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.815;NF=12;NR=6;PP=2966;ReadPosRankSum=-0.080;SC=ATTTGAAATTAAAAAGCATTT;SOR=1.112;Source=Platypus;TCR=11;TR=18;WE=32884210;WS=32884177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,34:0.77:44
chr12	32884741	rs144761384	A	AAAAAAAC	1285.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.780;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.660;NF=16;NR=11;PP=1264;ReadPosRankSum=0.759;SC=ATGACTTAAAAAAAAAACAAA;SOR=1.074;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=49;TCF=28;TCR=21;TR=27;WE=32884749;WS=32884731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,30:0.67:45
chr12	32889911	rs2293341	C	T	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.936;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=92;ReadPosRankSum=-0.009;SC=ATAATTATGGCATGAGTCCCA;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=32889919;WS=32889901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr12	32890161	rs7302970	C	T	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=641;ReadPosRankSum=0.806;SC=CAGAATATTACTCAGTCCTAG;SOR=0.829;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=25;WE=32890176;WS=32890151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,27:0.71:38
chr12	32890685	rs2177704	C	T	1063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=0;PP=909;SC=TTATTTTCATCTTTCATGTTA;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=32890693;WS=32890675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	32896365	rs1059422	GA	CT	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.076;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=1502;ReadPosRankSum=-1.815;SC=GTAATACTGAGACTTTGTTGA;SOR=0.973;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=63;TCF=36;TCR=27;TR=35;WE=32896374;WS=32896355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,35:0.56:63
chr12	32897557	rs11052213	G	T	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-5.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.83;MQRankSum=1.347;NF=26;NR=0;PP=573;ReadPosRankSum=0.068;SC=TGAGGCAGGAGAATTGCTTGA;SOR=1.312;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=26;WE=32897565;WS=32897547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr12	32897586	rs10844336	G	A	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.480;NF=43;NR=0;PP=975;ReadPosRankSum=-0.421;SC=GGTGGAGGTTGTGGTGAGCTA;SOR=1.646;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=63;TCR=0;TR=43;WE=32897594;WS=32897576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,44:0.68:65
chr12	32903635	rs190343859	A	G	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.869;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=6;PP=960;ReadPosRankSum=-0.049;SC=TCAAGTGTTAATCATACTAAA;SOR=1.225;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=65;TCF=55;TCR=10;TR=42;WE=32903643;WS=32903625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,43:0.63:68
chr12	32908237	rs11539445	C	A	2000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=36;PP=1474;ReadPosRankSum=-0.628;SC=GCGGAAGTGACCCCCCACTGC;SOR=0.634;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=120;TCF=58;TCR=62;TR=72;WE=32908245;WS=32908227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,74:0.59:125
chr12	32908518	rs11539444	G	A	3731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.194;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=46;PP=2813;ReadPosRankSum=2.433;SC=AATGAAACAGGCCCAGCAGCG;SOR=0.830;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=204;TCF=133;TCR=71;TR=135;WE=32908526;WS=32908508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,139:0.66:210
chr12	33529647	rs10844567	A	T	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=0;PP=685;SC=AGTGCACATCAAGTTTGTTCA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=33529655;WS=33529637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	33535289	rs10844571	G	A	2987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=30;PP=2389;SC=CATACCTATCGTAATCCATGA;SOR=1.657;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=68;TCR=30;TR=98;WE=33535297;WS=33535279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr12	33576990	rs7980799	A	C	4233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=107;PP=2965;SC=TGATTGATATAAAAGTTCTAG;SOR=3.894;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=14;TCR=108;TR=121;WE=33576998;WS=33576980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr12	38710583	rs7296576	C	T	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=0;PP=577;SC=TATGTGGCCCCGTCTGGCTAG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=38710591;WS=38710573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	38712142	rs6582584	C	G	7424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=117;NR=152;PP=2965;SC=TGGATCTTTGCATGGTCTGAA;SOR=1.122;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=269;TCF=117;TCR=152;TR=269;WE=38712150;WS=38712132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr12	38717898	rs147846597	G	A	2225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=63;PP=1846;SC=GCAATGGCGCGATCTTGGCTC;SOR=6.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=64;TCF=1;TCR=63;TR=64;WE=38717906;WS=38717888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr12	39064434	.	C	G	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.38;ReadPosRankSum=-1.520;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr12	39087687	rs826877	A	C	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=36;PP=1101;SC=AGGGTAAATAAATTTAACAAA;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=39;WE=39087695;WS=39087677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	39117384	rs844115	C	A	1208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=0;PP=910;SC=GTTAAAGTTACAATTTGCCCC;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=39117392;WS=39117374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	39117742	.	AAAGAT	A	508.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=528;ReadPosRankSum=0.670;SC=GAAACTCACTAAAGATATTAT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=13;WE=39117754;WS=39117732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr12	39124173	rs5797589	G	GA	1450.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=38;PP=1362;SC=AAAATTAAAGGAAAAAAGTAC;SOR=3.352;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=41;WE=39124181;WS=39124163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	39154733	rs862332	T	A	2287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=61;PP=1839;SC=CTTAGTAAGATCAAAATAATG;SOR=4.774;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=5;TCR=62;TR=66;WE=39154741;WS=39154723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr12	40037727	rs10735878	A	G	1599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=38;PP=1296;SC=CTGGTAAGTCATTCCAATTGC;SOR=1.938;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=53;WE=40037735;WS=40037717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	40077028	rs10047563	A	G	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=19;PP=635;SC=ATACACACACATCTATATATT;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=40077036;WS=40077018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	40345185	rs11446411	G	GA	1924.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.66;MQRankSum=0.328;QD=26.73;ReadPosRankSum=0.915;SOR=1.694;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
chr12	40619082	rs2256408	G	A	2482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=56;PP=1857;SC=TACTCCGAGCGCGGTAATCAC;SOR=2.191;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=21;TCR=56;TR=77;WE=40619090;WS=40619072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	40619301	rs2723273	G	A	1056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=5;PP=857;SC=CTAAAAAGGAGAGGGGGTGCT;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=40619309;WS=40619291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	40619542	rs2256286	A	G	1628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=46;PP=1423;SC=GGTTATTCCCAAAATTTGGCT;SOR=6.316;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=47;TCF=1;TCR=46;TR=47;WE=40619550;WS=40619532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	40626230	rs1352879	T	C	5541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=121;PP=2965;SC=GAGTATTTATTTGTACACATG;SOR=2.060;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=44;TCR=121;TR=165;WE=40626238;WS=40626220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr12	40626285	rs1352878	C	T	2564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=66;PP=2148;SC=AAGGCTACTCCTGTGGAATTC;SOR=3.345;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=11;TCR=66;TR=77;WE=40626293;WS=40626275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr12	40631791	rs10878245	T	C	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=182;ReadPosRankSum=0.660;SC=CTTGCTGATATTGGATGAAGA;SOR=0.324;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=12;WE=40631799;WS=40631781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr12	40646948	rs7969677	G	A	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=340;SC=ATCTCTATGTGTAGAGATGTA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=40646956;WS=40646938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	40671989	rs10878307	A	G	1237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.940;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=30;PP=977;ReadPosRankSum=1.106;SC=GAATAACAGCATCATGGTTGA;SOR=0.328;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=188;TCF=114;TCR=74;TR=62;WE=40671997;WS=40671979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,63:0.32:199
chr12	40688695	rs7966550	T	C	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=301;ReadPosRankSum=0.076;SC=AAGAAAAATATTATCTTCAGA;SOR=0.976;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=15;WE=40688703;WS=40688685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr12	40703152	rs11175966	C	A	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=110;SC=TCTTTAAATACTTTCTTAAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=40703160;WS=40703142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	40753044	rs111612315	C	CT	595.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=4;PP=429;SC=AGTGTGTTTTCTTTTTTTTTT;SOR=2.833;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=22;WE=40753052;WS=40753034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	40753303	rs3789330	A	G	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=545;SC=TTTTTTCCTTATAATCATTAA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=40753311;WS=40753293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	40757114	rs10626458	A	ACATG	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=370;SC=TAGTGTTTTTACATTAAGAAC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=7;WE=40757122;WS=40757104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	40761358	rs4768238	A	G	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=347;SC=ATCTAAGTCAACTAAAAATAC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=40761366;WS=40761348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	40805209	rs78703257	G	A	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=43;ReadPosRankSum=0.510;SC=CATCCCAAGGGGATATATTTT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=4;WE=40805217;WS=40805199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr12	40811944	rs78851502	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.30;ReadPosRankSum=0.491;SOR=0.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,11:0.21:53
chr12	40815548	rs6581732	T	A	267.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=178;SC=GATAGAATTGTATTTGAGGAG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=40815556;WS=40815538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	40821176	rs7955308	G	A	4762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=121;NR=51;PP=2965;SC=ATTTCTCCAGGAACACAAAGA;SOR=1.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=172;TCF=121;TCR=51;TR=172;WE=40821184;WS=40821166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr12	40821736	rs17444896	A	G	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=218;ReadPosRankSum=0.382;SC=TGATGTTTGTAGAGTTTTGTG;SOR=0.518;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=49;TCF=45;TCR=4;TR=13;WE=40821744;WS=40821726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,14:0.28:50
chr12	40821839	rs11176584	C	T	2214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.383;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=34;PP=1904;ReadPosRankSum=-0.595;SC=CCTGTGAATCCAGTGGAACAG;SOR=0.934;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=122;TCF=70;TCR=52;TR=83;WE=40821847;WS=40821829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,80:0.64:125
chr12	40826116	rs11564239	G	T	278.53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=227;ReadPosRankSum=1.897;SC=TAAAAATTTGGGTTCATATAT;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=40826124;WS=40826106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr12	40827479	rs2162470	T	C	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=5;PP=815;ReadPosRankSum=1.699;SC=TTCACTTGGGTGAAGAACTGA;SOR=0.839;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=57;TCF=49;TCR=8;TR=38;WE=40827487;WS=40827469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,39:0.65:60
chr12	40827579	rs11564110	C	T	2940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.045;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=39;PP=2299;ReadPosRankSum=0.546;SC=TCTGTGGTTCCTACAACAACA;SOR=0.902;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=161;TCF=99;TCR=62;TR=104;WE=40827587;WS=40827569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,107:0.63:169
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chr12	40829785	rs7139097	T	C	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.976;NF=18;NR=0;PP=846;ReadPosRankSum=0.290;SC=TGAGCCGAGATGCCATTGCAC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=18;WE=40829793;WS=40829773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr12	40830583	rs11564168	T	C	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.920;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=3.147;NF=7;NR=37;PP=892;ReadPosRankSum=1.836;SC=TACTTCCTTCTCAGTTTCGCT;SOR=0.866;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=122;TCF=22;TCR=100;TR=44;WE=40830591;WS=40830573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,43:0.34:125
chr12	40830599	rs201817965	CGTGTGT	C	588.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=2.943;NF=0;NR=26;PP=871;ReadPosRankSum=-0.429;SC=TCGCTATAGTCGTGTGTGTGT;SOR=0.092;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=96;TCF=6;TCR=90;TR=26;WE=40830623;WS=40830589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,21:0.35:60
chr12	40832126	rs10878584	C	T	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.630;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=26;PP=639;ReadPosRankSum=-0.111;SC=GTTACATAAACGACGAGGTCA;SOR=1.187;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=138;TCF=57;TCR=81;TR=40;WE=40832134;WS=40832116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,42:0.28:148
chr12	40832161	rs11176635	T	C	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=3.217;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.91;ReadPosRankSum=0.895;SOR=0.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,28:0.23:120
chr12	40834376	rs10878592	C	G	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.369;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=317;ReadPosRankSum=-1.773;SC=TTATTTCCAGCGTCTGTCGGG;SOR=1.364;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=17;WE=40834384;WS=40834366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr12	40834955	rs10784618	C	A	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FS=1.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.83;ReadPosRankSum=-0.435;SOR=0.583;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:160,54:0.25:214
chr12	40835596	rs4768263	T	G	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.834;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=296;ReadPosRankSum=-1.180;SC=ATTATTTTGTTCTTCTTTACA;SOR=0.176;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=55;TCR=1;TR=16;WE=40835604;WS=40835586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,18:0.31:59
chr12	40835734	rs7966110	C	G	1705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.070;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=36;PP=1183;ReadPosRankSum=-0.286;SC=TCTGCCACATCTATGGGGAAG;SOR=0.801;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=227;TCF=114;TCR=113;TR=72;WE=40835742;WS=40835724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,76:0.32:240
chr12	40838146	rs10784620	A	T	1402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=6.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.010;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=28;PP=1106;ReadPosRankSum=-0.225;SC=GCAGTGACTTACACAGGGTTT;SOR=0.548;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=162;TCF=76;TCR=86;TR=55;WE=40838154;WS=40838136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,57:0.34:170
chr12	40838216	rs10784621	T	C	1289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.146;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=28;PP=903;ReadPosRankSum=-0.325;SC=TACCATGATGTGTGCATTGAA;SOR=0.456;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=135;TCF=62;TCR=73;TR=57;WE=40838224;WS=40838206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,59:0.42:141
chr12	40839467	rs7972395	A	G	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.158;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=32;PP=586;ReadPosRankSum=-1.087;SC=CTTTAAGAATATGCATAAAGT;SOR=1.424;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=108;TCF=15;TCR=93;TR=35;WE=40839475;WS=40839457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,36:0.31:115
chr12	40839521	rs1346307	T	C	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=254;ReadPosRankSum=0.579;SC=TTGTTTCTCCTAATTTCGTGT;SOR=0.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=0;TCR=54;TR=15;WE=40839529;WS=40839511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,15:0.27:56
chr12	40840325	rs10878597	T	C	1813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.903;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=33;PP=1484;ReadPosRankSum=1.469;SC=TGCTCCTTACTTGGATGAGAA;SOR=0.981;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=233;TCF=127;TCR=106;TR=80;WE=40840333;WS=40840315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,80:0.34:235
chr12	40841781	rs1820547	A	G	34.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.59;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr12	40844667	rs10784623	A	C	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=-0.599;SC=CGGACCATCCAAACAGTTTCC;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=40844675;WS=40844657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr12	40852398	rs1035811	T	C	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.23;ReadPosRankSum=0.361;SOR=0.175;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr12	40857214	rs10878623	T	C	2226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=17;PP=1790;SC=TATCCATATATATTAAGCACC;SOR=2.239;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=51;TCR=17;TR=68;WE=40857222;WS=40857204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr12	40857943	rs2933353	A	C	1490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=20;PP=1299;SC=GTATCTGGAGAAACCCCTGCA;SOR=1.298;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=31;TCR=20;TR=51;WE=40857951;WS=40857933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	40859036	rs2131202	C	T	3852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=58;PP=2965;SC=GATGTCATTCCGAGGCTGTGG;SOR=0.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=53;TCR=58;TR=111;WE=40859044;WS=40859026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr12	40859551	rs2131203	T	A	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=14;PP=432;SC=CATTGTAACCTTTTATGTAGA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=40859559;WS=40859541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	40859642	.	T	C	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.360;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=413;ReadPosRankSum=-0.548;SC=AGAATGAGTATGTCCCATGCA;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=19;WE=40859650;WS=40859632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr12	40868767	rs1444222	A	G	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;PP=915;ReadPosRankSum=-0.085;SC=AAGTGTCAGAACAAAGGGAAA;SOR=0.706;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=23;TCR=39;TR=40;WE=40868775;WS=40868757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,41:0.65:63
chr12	40868879	rs60890556	C	CA	1026.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.861;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.236;NF=8;NR=18;PP=1063;ReadPosRankSum=-0.456;SC=GAGCCTGAACCATTGTTGTTG;SOR=0.590;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=72;TCF=36;TCR=36;TR=26;WE=40868887;WS=40868869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,36:0.40:89
chr12	40894745	rs111256342	A	ACTGAGAATAC	3271.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=7;PP=2957;SC=TGTCCTCCTGACAGGAAGATT;SOR=2.904;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=39;WE=40894753;WS=40894735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	40894964	rs719228	G	T	1092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=27;PP=766;ReadPosRankSum=-0.235;SC=GCTACGACTGGGGTGGCTCCT;SOR=1.270;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=34;WE=40894972;WS=40894954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,40:0.65:62
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chr12	40912236	rs2588399	G	T	4729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.464;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=94;PP=2962;ReadPosRankSum=1.029;SC=CCCACAATTGGCTTGCCCAAC;SOR=0.645;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=264;TCF=120;TCR=144;TR=173;WE=40912244;WS=40912226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,178:0.65:273
chr12	40914826	rs10878731	G	T	1179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-5.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.153;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=36;PP=965;ReadPosRankSum=-0.857;SC=TGTCTTGATAGAAATATGGCA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=39;WE=40914834;WS=40914816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,42:0.72:58
chr12	40915787	rs2920821	T	C	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=108;ReadPosRankSum=0.799;SC=AGCTTGATACTTTTTTCTCAT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=40915795;WS=40915779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr12	40917312	rs2920820	C	T	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.689;NF=15;NR=27;PP=995;ReadPosRankSum=-1.553;SC=GTCTTTCCTTCTGGTGTTTCT;SOR=0.826;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=42;WE=40917320;WS=40917302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,43:0.80:54
chr12	40918345	rs1492319	G	A	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=460;ReadPosRankSum=0.242;SC=GGAGGAAGTGGCACCACTGGA;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=18;WE=40918353;WS=40918335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr12	40918902	rs2933352	T	C	2608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.983;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=38;PP=2006;ReadPosRankSum=0.253;SC=CACCAGAAAGTAGGACAGGTA;SOR=0.312;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=146;TCF=92;TCR=54;TR=91;WE=40918910;WS=40918892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,96:0.64:150
chr12	40920110	rs2933351	T	C	1763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.382;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=20;PP=1353;ReadPosRankSum=1.288;SC=CGGGGCCACCTGAGCAGGATT;SOR=0.249;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=100;TCF=73;TCR=27;TR=63;WE=40920118;WS=40920100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,66:0.63:104
chr12	40922104	rs1444220	A	C	2340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=65;PP=1954;ReadPosRankSum=-1.108;SC=GCTGGCCCCAACTCAGGTAAG;SOR=0.758;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=122;TCF=27;TCR=95;TR=84;WE=40922112;WS=40922094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,84:0.68:123
chr12	40924470	rs2588403	T	C	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=158;ReadPosRankSum=0.452;SC=ACATATTTAGTAGGTGTTCAA;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=40924478;WS=40924460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr12	40925908	rs7139187	A	C	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.385;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=51;PP=1551;ReadPosRankSum=0.660;SC=AAGGGAATGCATCTTATTTAA;SOR=1.264;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=102;TCF=27;TCR=75;TR=67;WE=40925916;WS=40925898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,65:0.62:105
chr12	40926493	rs4768290	C	T	1888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=17;PP=1411;ReadPosRankSum=2.035;SC=CCTTATTTCCCCTTCTTTCTA;SOR=0.641;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=74;TCR=26;TR=64;WE=40926501;WS=40926483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,68:0.64:106
chr12	40927890	rs7977973	T	G	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.270;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=296;ReadPosRankSum=-0.859;SC=ATCTCATGTATTGACATCCAC;SOR=2.952;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=14;WE=40927898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr12	40929013	rs61730702	G	A	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.17;ReadPosRankSum=-0.472;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,22:0.25:87
chr12	40929482	rs75745549	GTT	G	536.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.92;MQRankSum=1.285;QD=19.17;ReadPosRankSum=0.764;SOR=1.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr12	40930709	rs7971316	G	C	4460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.169;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=60;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.204;SC=CTTCCCTACTGTATTTGTTCC;SOR=1.002;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=246;TCF=144;TCR=102;TR=154;WE=40930717;WS=40930699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,159:0.61:259
chr12	40938944	rs7133943	C	T	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.088;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=23;PP=569;ReadPosRankSum=-0.507;SC=TTTACCAGTACTCAGAGAATA;SOR=1.347;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=56;TCF=14;TCR=42;TR=29;WE=40938952;WS=40938934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr12	40942463	rs35702138	GT	G	828.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=14.151;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.95;MQRankSum=0.043;QD=15.94;ReadPosRankSum=1.158;SOR=2.457;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:6,46:0.88:52
chr12	40943970	rs1492316	G	A	1365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.102;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=35;PP=1033;ReadPosRankSum=1.567;SC=GGTGGGCACTGGCAATCAAAT;SOR=0.551;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=65;TCF=13;TCR=52;TR=43;WE=40943978;WS=40943960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,48:0.69:70
chr12	40944205	rs185359590	T	G	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=6.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=1;PP=1116;ReadPosRankSum=1.689;SC=GAGAAACCTATGATTTTTTTT;SOR=0.569;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=66;TCF=65;TCR=1;TR=43;WE=40944213;WS=40944195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,42:0.65:65
chr12	40950883	rs7487017	A	G	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=516;ReadPosRankSum=0.109;SC=GTAGAAGGGGAAAATCTCTCT;SOR=0.462;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=23;WE=40950891;WS=40950873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,24:0.73:33
chr12	40951950	rs3751172	G	A	5695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.517;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=89;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.198;SC=AGATTACTATGATGGATGCAG;SOR=0.633;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=225;TCF=82;TCR=143;TR=142;WE=40951969;WS=40951940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,151:0.65:234
chr12	40951961	rs3751173	G	C	5503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=87;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.034;SC=ATGGATGCAGGTAATTTTGCT;SOR=0.736;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=70;TCR=141;TR=129;WE=40951969;WS=40951940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,138:0.63:220
chr12	40952934	rs1352938	A	G	1070.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.349;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=2;PP=822;ReadPosRankSum=0.838;SC=TGCAGCACTGACCCAGAAAGT;SOR=2.737;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=78;TCF=64;TCR=14;TR=37;WE=40952942;WS=40952924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,40:0.50:80
chr12	40957272	rs56080664	C	A	3833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.277;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=24;PP=2962;ReadPosRankSum=0.696;SC=GATAACTATACTTGCCCCAAT;SOR=0.349;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=192;TCF=161;TCR=31;TR=133;WE=40957280;WS=40957262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,134:0.69:195
chr12	40957450	rs10083205	A	G	2935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.060;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=86;PP=2287;ReadPosRankSum=0.776;SC=AAAAGTCACTAGCCATGGAAA;SOR=1.310;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=139;TCF=14;TCR=125;TR=94;WE=40957458;WS=40957440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,102:0.69:147
chr12	41330774	rs74587413	G	A	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.040;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=493;ReadPosRankSum=-0.728;SC=GGTAGTCCTGGGATAAATTTA;SOR=1.329;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=94;TCF=24;TCR=70;TR=28;WE=41330782;WS=41330764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,29:0.30:97
chr12	41421642	rs12367345	A	G	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=377;ReadPosRankSum=0.808;SC=CTGATTGCATATTACTACTTT;SOR=0.527;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=74;TCF=63;TCR=11;TR=21;WE=41421650;WS=41421632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,22:0.29:76
chr12	41582590	rs10879830	G	C	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.041;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.396;NF=3;NR=6;PP=382;ReadPosRankSum=-0.217;SC=CTGCCCGCCGGCTCCGCAGCC;SOR=0.116;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=9;WE=41582611;WS=41582580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr12	41582603	rs10879831	G	C	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.385;NF=3;NR=4;PP=357;ReadPosRankSum=0.674;SC=CCGCAGCCGCGGGGGCTGCGC;SOR=0.093;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=7;WE=41582611;WS=41582580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr12	41588124	rs3847980	A	G	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=73;ReadPosRankSum=-0.054;SC=AGGCATTATCATTTTTACTTT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=41588132;WS=41588114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr12	41946453	rs285585	T	C	1718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=15;PP=1453;SC=GTGTTGTTCTTTCAGGAGGTC;SOR=1.893;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=52;WE=41946461;WS=41946443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	41949370	rs285580	T	G	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=2;PP=1405;SC=AGAGAAATATTATGTATACTG;SOR=6.273;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=46;WE=41949378;WS=41949360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	41949688	rs35738715	CA	C	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQRankSum=1.416;QD=5.09;ReadPosRankSum=-1.302;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr12	41957568	rs157971	C	T	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=432;ReadPosRankSum=-0.993;SC=ATCATTATCACGGTTATCTCT;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=19;WE=41957576;WS=41957558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr12	41967677	rs3747556	G	A	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.743;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=833;ReadPosRankSum=0.233;SC=CCTTCTTGTCGGTGACCACTG;SOR=0.570;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=117;TCF=39;TCR=78;TR=45;WE=41967685;WS=41967667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,46:0.38:121
chr12	42481732	rs7972986	G	A	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.147;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=317;ReadPosRankSum=0.577;SC=AACGGATGTTGTCATCTTCAA;SOR=0.957;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=20;WE=42481740;WS=42481722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr12	42481803	rs824722	G	A	1436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=38;PP=1084;SC=AGGTACATATGTAAGTTCAAT;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=47;WE=42481811;WS=42481793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	42499538	rs61942483	TT	AC	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.25;ReadPosRankSum=0.607;SOR=0.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,13:0.25:52
chr12	42499714	rs78536827	T	C	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FS=22.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQRankSum=-14.827;QD=0.14;ReadPosRankSum=0.179;SOR=2.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:288,22:0.07:310
chr12	42499730	rs77940338	G	T	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FS=19.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQRankSum=-14.634;QD=1.07;ReadPosRankSum=2.834;SOR=2.499;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:276,26:0.09:302
chr12	42499738	.	TC	CT	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=0.000;DP=312;ExcessHet=3.0103;FS=22.710;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQRankSum=-14.609;QD=1.55;ReadPosRankSum=2.162;SOR=2.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:267,31:0.10:298
chr12	42499763	rs80202058	T	C	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FS=25.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.07;MQRankSum=-13.686;QD=2.54;ReadPosRankSum=1.107;SOR=3.042;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:225,33:0.13:258
chr12	42499787	rs78536352	G	A	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=15.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQRankSum=-12.524;QD=1.66;ReadPosRankSum=1.276;SOR=2.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:188,22:0.10:210
chr12	42499802	rs78540738	C	A	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=5.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQRankSum=-11.935;QD=0.70;ReadPosRankSum=0.158;SOR=1.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:164,16:0.09:180
chr12	42499809	rs75194020	T	G	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=1.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQRankSum=-11.434;QD=0.56;ReadPosRankSum=-0.702;SOR=1.115;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:157,14:0.08:171
chr12	42499813	.	CGTA	C	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.072;ClippingRankSum=0.000;DP=172;ExcessHet=3.0103;FS=1.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQRankSum=-11.108;QD=0.40;ReadPosRankSum=-1.416;SOR=1.068;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,13:0.08:165
chr12	42503504	rs201103553	T	TA	551.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.945;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=319;ReadPosRankSum=-2.759;SC=CTAAAACAATTTAAAAAAAAA;SOR=0.104;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=25;WE=42503513;WS=42503494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr12	42503505	rs824695	T	A	1693.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=39;PP=1614;SC=TAAAACAATTTAAAAAAAAAC;SOR=2.259;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=61;TCF=21;TCR=40;TR=60;WE=42503513;WS=42503494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	42629550	rs7960176	T	C	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.600;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;ReadPosRankSum=-0.660;SC=TACAAGAGCTTAGATGTACTG;SOR=0.191;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=15;WE=42629558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr12	42632354	rs75085410	C	A	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.684;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=73;ReadPosRankSum=-1.650;SC=CCTTGGTACCCCCGGCTGCCG;SOR=0.090;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=7;WE=42632362;WS=42632344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr12	42707437	rs3761677	C	G	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.248;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=145;ReadPosRankSum=-0.329;SC=AGTAAGCAAGCACTATAAACC;SOR=0.399;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=7;WE=42707445;WS=42707427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr12	42717724	.	GA	G	155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.420;ClippingRankSum=0.000;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=1.627;QD=1.40;ReadPosRankSum=-0.054;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,24:0.22:111
chr12	42717811	rs17091074	A	T	2687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.006;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.043;NF=94;NR=34;PP=2247;ReadPosRankSum=-0.085;SC=ACTCGATAAGATTTACTTACC;SOR=1.109;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=357;TCF=245;TCR=112;TR=128;WE=42717819;WS=42717801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:242,128:0.35:370
chr12	42717961	rs3747557	G	T	2659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.115;NF=5;NR=116;PP=2349;ReadPosRankSum=1.286;SC=TTCTTTTTTTGTTGTTTGAGA;SOR=2.833;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=5;TCR=121;TR=121;WE=42717969;WS=42717950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,100:0.97:103
chr12	42729891	rs7296357	T	G	3209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=90;PP=2587;SC=ACCAGTGTAGTTTACAAAAGA;SOR=6.932;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=92;TCF=2;TCR=90;TR=92;WE=42729899;WS=42729881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr12	42768617	rs199747722	G	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.173;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=156;ReadPosRankSum=0.116;SC=CTTGTATATAGAGGATAGAGT;SOR=0.219;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=12;WE=42768625;WS=42768607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,14:0.27:51
chr12	42768646	rs59428088	G	GT	335.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.48;ReadPosRankSum=0.102;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,25:0.33:75
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chr12	42781149	rs2305423	T	G	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=59;ReadPosRankSum=0.210;SC=AATGAAAAGTTTTAGTACTAA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=42781157;WS=42781139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr12	42781178	rs2243465	A	T	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=-0.628;SC=TATGACCCCCACATTAATTCC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=42781186;WS=42781168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr12	42787579	rs1376931	A	G	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=585;ReadPosRankSum=-1.876;SC=GTTTATTCCTATACTTCAAAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=26;WE=42787587;WS=42787569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr12	42835328	rs60616542	TA	T	197.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=1.528;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.045;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,19:0.34:56
chr12	42839836	rs1669885	A	C	9466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.379;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=139;NR=167;PP=2965;ReadPosRankSum=1.259;SC=GGACCCAACCAAGTACCAGAA;SOR=0.502;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=307;TCF=140;TCR=167;TR=306;WE=42839844;WS=42839826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,306:1.00:307
chr12	42853058	rs68074167	GT	G	1236.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=17;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=5;PP=592;ReadPosRankSum=1.280;SC=AATGTTTTTTGTTTTTTTTTT;SOR=2.352;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=36;WE=42853067;WS=42853048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,43:0.96:45
chr12	42853084	rs12658	C	A	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.719;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=333;ReadPosRankSum=-0.185;SC=CTGTAGCTGGCGCTGATACAA;SOR=1.143;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=21;WE=42853092;WS=42853074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,22:0.39:56
chr12	42853213	rs17091220	C	A	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.336;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=304;ReadPosRankSum=0.502;SC=ACTATCAAGACCTGAGCCGAC;SOR=0.358;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=57;TCF=13;TCR=44;TR=18;WE=42853221;WS=42853203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,18:0.32:57
chr12	42853350	rs1043656	A	G	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=35;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GGAAAACCAAAGCAGCTACGT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=42853358;WS=42853340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr12	42853520	rs1043652	A	G	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=-0.759;SC=AGCACTTTAAACTATTTTCAC;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=42853528;WS=42853510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr12	42854205	rs3747562	A	G	5360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=3.358;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=40.61;ReadPosRankSum=1.182;SOR=2.161;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,130:0.98:132
chr12	42854205	.	AGAA	GGAA,GGAG	2032	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=85,59;NR=31,22;PP=603,2032;QD=5.49802769437;SC=TGACATCATCAGAAAACTTGA;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=122;TCF=90;TCR=32;TR=116,81;WE=42854216;WS=42854195;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.95:122
chr12	42854208	rs3747563	A	G	2788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=0.795;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.21;ReadPosRankSum=-0.755;SOR=0.831;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,98:0.71:138
chr12	42859961	rs12230583	A	G	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=2;PP=908;ReadPosRankSum=-0.402;SC=ACTAATGGCTAGGTGACAGGG;SOR=1.140;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=51;TCF=48;TCR=3;TR=35;WE=42859969;WS=42859951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,36:0.69:52
chr12	42862750	rs2708062	T	G	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=27;PP=743;SC=TGCTACCTCTTTTAGTGATTA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=42862758;WS=42862740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	42863516	rs67128387	G	A	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=229;ReadPosRankSum=0.238;SC=ACACCCCCACGATTTTAAAAT;SOR=0.197;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=13;WE=42863524;WS=42863506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr12	43769718	rs7972295	A	G	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=0;PP=1505;SC=AACAACATCTAGTTTAGGTCC;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=49;WE=43769726;WS=43769708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	43817445	rs6582463	C	T	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=0;PP=539;SC=AACAGAGACACAGTAAGCAGA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=43817453;WS=43817435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	43819298	rs10785430	G	A	6118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=118;NR=67;PP=2965;SC=CATGTTAACAGACAAGAGTGC;SOR=1.442;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=118;TCR=67;TR=185;WE=43819306;WS=43819288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr12	43823316	rs12308771	C	T	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=1;PP=1063;SC=CATCAAAATACCTGAGAATAA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=37;WE=43823324;WS=43823306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	43824042	rs10880489	G	T	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=0;PP=754;SC=ACATACACGTGTTTAAGGCAT;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=43824050;WS=43824032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	43824316	rs11182071	A	G	1373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=40;PP=1260;SC=TTGTTTCCCAAAAGTTACACA;SOR=5.186;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=42;WE=43824324;WS=43824306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	43827506	rs140835441	AACACACACAC	A	220.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.78;QD=36.80;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	43846272	rs7307955	C	T	4388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.379;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=28;PP=2965;ReadPosRankSum=1.508;SC=TGTGTTCTTACGTCTCAGAAA;SOR=2.455;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=134;TCF=105;TCR=29;TR=133;WE=43846280;WS=43846262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,138:0.99:139
chr12	43847941	rs6582464	C	T	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=17;PP=458;SC=TAAAGATCAACAGAAGAACAA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=43847949;WS=43847931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr12	43886199	rs71091159	G	GAAAAA	2569.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.77;QD=43.55;SOR=6.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
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chr12	44130123	rs113047505	GA	G	481.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.014;NF=24;NR=0;PP=629;ReadPosRankSum=0.113;SC=CAGGGCTTTTGAAAAATTCAT;SOR=0.239;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=82;TCF=82;TCR=0;TR=24;WE=44130131;WS=44130115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,25:0.34:74
chr12	44132250	rs10880558	T	A	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=124;ReadPosRankSum=1.394;SC=TTACTTTCTTTAAAAAAAGAT;SOR=1.077;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=8;WE=44132258;WS=44132240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr12	44139805	rs11182246	A	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.96;ReadPosRankSum=2.591;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,10:0.17:59
chr12	44140080	rs59209906	C	T	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.40;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr12	44148259	rs1057190	T	C	1416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=26;PP=1091;ReadPosRankSum=-2.405;SC=CAATTCATTTTAGAAAAAGAT;SOR=0.710;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=192;TCF=101;TCR=91;TR=57;WE=44148267;WS=44148249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,63:0.31:202
chr12	44171602	rs4251500	A	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.257;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=287;ReadPosRankSum=0.878;SC=CTGGAATATTAATATTCATTT;SOR=0.123;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=66;TCF=4;TCR=62;TR=19;WE=44171610;WS=44171592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,18:0.27:66
chr12	44177354	rs4251529	G	A	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=121;ReadPosRankSum=0.191;SC=GAAGTCCGGGGCTCAAGTTAT;SOR=0.340;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=7;WE=44177362;WS=44177348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr12	44180295	rs4251545	G	A	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.123;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=328;ReadPosRankSum=-1.343;SC=TTCAGTTGAAGCTATGTACTC;SOR=1.371;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=66;TCF=38;TCR=28;TR=19;WE=44180303;WS=44180285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,22:0.31:72
chr12	44191625	rs12829856	G	A	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.319;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.174;NF=22;NR=7;PP=498;ReadPosRankSum=0.113;SC=CCACACCCACGTCAGTCTGTA;SOR=1.121;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=65;TCF=48;TCR=17;TR=29;WE=44191633;WS=44191615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
chr12	44196350	rs34291769	T	C	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.26;ReadPosRankSum=1.203;SOR=0.313;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,10:0.22:45
chr12	44199961	rs71435960	C	CCTCCCGGCT	323.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.236;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=831;ReadPosRankSum=-1.244;SC=GTCCTGCAGCCCTCCCGGCTC;SOR=0.876;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=30;TCF=17;TCR=13;TR=6;WE=44199969;WS=44199951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr12	44338153	rs6582491	T	A	2154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=52;PP=1581;SC=GGGGTAGGTTTTCTTTCCCCT;SOR=2.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=14;TCR=52;TR=66;WE=44338161;WS=44338143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr12	44338173	rs72327763	GGTGA	G	394.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.698;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=429;ReadPosRankSum=0.671;SC=TTTCTACTGTGGTGAGTGTTA;SOR=0.293;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=11;WE=44338184;WS=44338163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,13:0.25:51
chr12	44404008	.	A	G	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.963;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=720;ReadPosRankSum=-0.440;SC=GCCACCTCTGACAAATGAGGG;SOR=1.849;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=29;WE=44404016;WS=44403998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr12	44404068	rs73087652	T	A	1628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=3.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.43;ReadPosRankSum=-0.866;SOR=0.359;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,46:0.35:131
chr12	44404074	rs7980005	A	G	1622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=7.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.93;ReadPosRankSum=0.313;SOR=0.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,46:0.34:136
chr12	44537495	rs115427402	C	T	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-4.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.332;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=419;ReadPosRankSum=-0.898;SC=GTTGGACAGACACTGCTTTTG;SOR=1.645;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=60;TCF=9;TCR=51;TR=24;WE=44537503;WS=44537485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,24:0.40:60
chr12	44693604	rs7953992	A	G	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=296;ReadPosRankSum=-0.376;SC=AACAGGCTCCATAAATCTAAA;SOR=0.754;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=71;TCF=8;TCR=63;TR=21;WE=44693612;WS=44693594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,21:0.30:70
chr12	44926334	rs2270479	T	A	2273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=10;PP=1837;ReadPosRankSum=-0.780;SC=AGAGAAGTTCTTAAATTCTAG;SOR=2.191;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=61;TCR=10;TR=70;WE=44926342;WS=44926324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
chr12	45004796	rs2305449	C	T	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=514;ReadPosRankSum=-1.268;SC=GTTATATTTCCAAAGCTATAT;SOR=1.209;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=22;WE=45004804;WS=45004786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr12	45004824	rs2305448	G	A	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=190;ReadPosRankSum=0.913;SC=TACACCTTCAGTCTTGGTTAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=10;WE=45004832;WS=45004814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr12	45059237	rs2290353	T	G	1559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=6.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.115;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=2;PP=1279;ReadPosRankSum=1.006;SC=GACATAAAAATATTTTATTTC;SOR=1.657;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=82;TCF=77;TCR=5;TR=49;WE=45059245;WS=45059227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,52:0.60:87
chr12	45170006	rs4768572	T	C	3986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=92;PP=2965;SC=ACTCCGCAGGTATCTTTTTTT;SOR=2.106;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=34;TCR=93;TR=126;WE=45170014;WS=45169996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr12	45209723	rs34034808	A	G	1369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=7;PP=1122;SC=ATATTCATTTAACCACATATA;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=41;WE=45209731;WS=45209713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	45278173	rs2135546	T	C	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=32;PP=1033;ReadPosRankSum=0.160;SC=ACAATTCCATTTGGAAACATC;SOR=1.343;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=45;WE=45278181;WS=45278163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,49:0.70:70
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chr12	45410075	rs1224442	A	G	3366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.913;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=67;PP=2458;ReadPosRankSum=-0.999;SC=CCATTCAGACAGCCCCAGTAA;SOR=0.554;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=190;TCF=99;TCR=91;TR=135;WE=45410083;WS=45410065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,139:0.70:198
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chr12	45417722	rs34073769	A	T	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.533;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=424;ReadPosRankSum=2.211;SC=TAGCTTTAGAAAGAAGTCAGT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=20;WE=45417730;WS=45417712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr12	45664213	rs10748415	G	A	1323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=3;PP=1087;SC=ATATTGGCCTGTTGTATTTAT;SOR=4.615;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=41;WE=45664221;WS=45664203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	45695735	rs4140756	C	A	3393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=7;PP=2817;SC=TTTAAAAGTACAGAACTACGT;SOR=5.242;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=93;TCR=7;TR=100;WE=45695743;WS=45695725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr12	45771901	rs36059278	GT	G	205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=3.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.77;MQRankSum=0.000;QD=3.61;ReadPosRankSum=1.095;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,23:0.40:57
chr12	46215163	rs2059404	G	A	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=2.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.20;ReadPosRankSum=-0.477;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr12	46317004	rs1062905	T	A	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=172;ReadPosRankSum=1.227;SC=TAGTGATGCATTAGAAATAAC;SOR=0.653;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=11;WE=46317012;WS=46316994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr12	46320944	rs28930670	C	T	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=9.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.02;ReadPosRankSum=0.518;SOR=1.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,35:0.27:129
chr12	46321514	rs7315731	A	T	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=15;PP=1227;ReadPosRankSum=-0.169;SC=AATATTATTGAAATCTTCATT;SOR=0.718;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=80;TCF=57;TCR=23;TR=55;WE=46321522;WS=46321504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,57:0.68:84
chr12	46322449	rs10880868	C	T	3449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.138;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=61;PP=2682;ReadPosRankSum=0.335;SC=GGGCATCACACCCAGAATTGT;SOR=0.435;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=164;TCF=77;TCR=87;TR=119;WE=46322457;WS=46322439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,125:0.74:169
chr12	46322655	rs200795073	A	T	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=1.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.69;ReadPosRankSum=-0.318;SOR=0.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr12	46342440	rs148404978	C	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.863;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=129;ReadPosRankSum=1.691;SC=AAGTGTAGTCCAAATACATAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=46342448;WS=46342430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr12	46367903	rs10880879	T	C	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=538;ReadPosRankSum=1.342;SC=TATGTTTATATTATACTGTAG;SOR=1.179;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=24;WE=46367911;WS=46367893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,26:0.76:34
chr12	46367939	rs11183268	G	T	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;PP=1491;ReadPosRankSum=-0.211;SC=ACAGCATTATGTCTAAAAACT;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=36;WE=46367952;WS=46367929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,37:0.73:51
chr12	46367944	rs11183269	A	G	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.922;SOR=0.698;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,15:0.25:59
chr12	46385848	rs12828693	C	T	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=435;ReadPosRankSum=-0.560;SC=TTCTCGCAGACTACGTTGCGG;SOR=0.602;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=21;WE=46385856;WS=46385838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr12	46582540	rs1045278	T	A	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=315;ReadPosRankSum=2.498;SC=GAAAAAAAAATTTCACAATCC;SOR=0.434;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=15;WE=46582548;WS=46582530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr12	46591906	rs7954255	T	C	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=364;ReadPosRankSum=-1.692;SC=GACATTTCTCTGCAGAGTAAC;SOR=1.230;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=21;WE=46591914;WS=46591896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr12	46601056	rs2289768	C	T	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.019;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=904;ReadPosRankSum=0.508;SC=AAAGAAGATACGAAGGCTTAT;SOR=0.458;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=65;TCF=28;TCR=37;TR=44;WE=46601064;WS=46601046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,43:0.61:71
chr12	46633328	rs7959095	G	T	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=326;ReadPosRankSum=2.873;SC=GTTTCACCATGTTGGTCAGGC;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=14;WE=46633336;WS=46633318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr12	46662485	rs2242355	G	C	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.284;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=0;PP=921;ReadPosRankSum=-2.265;SC=GGCGGATTTCGGAGGAAGGTG;SOR=3.816;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=37;WE=46662493;WS=46662477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,39:0.76:51
chr12	46755112	rs7961994	A	T	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=488;ReadPosRankSum=-0.528;SC=ATCTATAGAAAGAATATTTAA;SOR=1.688;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=21;WE=46755120;WS=46755102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr12	46758494	rs2307061	A	G	3020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.797;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=68;PP=2453;ReadPosRankSum=-0.156;SC=TCCTATAAGGAGGGGTGGCAG;SOR=0.509;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=67;TCR=106;TR=112;WE=46758502;WS=46758484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,112:0.64:176
chr12	46759017	rs7968173	T	A	1484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=5.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.165;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=44;PP=1210;ReadPosRankSum=0.671;SC=AAATATCCTCTGAAAAATATA;SOR=2.357;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=68;TCF=7;TCR=61;TR=47;WE=46759025;WS=46759007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,49:0.69:71
chr12	46759057	rs12307969	G	C	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=604;ReadPosRankSum=1.187;SC=CATTTCATAGGAATACCATGA;SOR=1.552;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=25;WE=46759065;WS=46759047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr12	46761127	rs10880959	G	A	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.770;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=32;PP=738;ReadPosRankSum=-1.381;SC=GAGAATTCTGGTGAGAGAAGG;SOR=1.220;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=63;TCF=10;TCR=53;TR=37;WE=46761135;WS=46761117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,39:0.59:66
chr12	47159123	rs4768756	A	G	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=10;PP=644;SC=ATACTTTTACAGAGAACCACT;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=29;WE=47159131;WS=47159113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	47159196	rs2430921	A	T	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=21;PP=837;SC=ACTGAACTAAATCCTATTTTA;SOR=0.984;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=36;WE=47159204;WS=47159186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	47162211	rs2465583	C	T	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.094;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=876;ReadPosRankSum=0.171;SC=AAACACAGGGCAAGGTCAATG;SOR=0.489;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=109;TCF=60;TCR=49;TR=47;WE=47162219;WS=47162201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,48:0.44:108
chr12	47162889	rs2465582	A	G	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=0;PP=810;SC=GTGGCTCCCAATGTCAGTTAG;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=47162897;WS=47162886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	47162938	rs2216433	T	G	1513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=1;PP=1185;SC=CCAGAGCCTCTCAGGGATAAA;SOR=5.747;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=50;TCR=1;TR=51;WE=47162946;WS=47162928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	47163306	rs180403	C	T	1007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.59;SOR=6.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	47168898	rs180414	G	A	4465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=66;PP=2965;SC=CCATGAGAAGGGGGATGTCTA;SOR=0.753;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=63;TCR=67;TR=129;WE=47168906;WS=47168888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr12	47170887	rs180419	C	A	1864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=55;PP=1632;SC=CTATATTGCTCATCATGAAGA;SOR=8.015;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=0;TCR=55;TR=55;WE=47170895;WS=47170877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	47170910	rs2430922	A	G	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=248;ReadPosRankSum=0.422;SC=TATTTAGTACATAAACTTATA;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=14;WE=47170918;WS=47170900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr12	47172417	rs77503738	A	G	1872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.430;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=30;PP=1467;ReadPosRankSum=1.878;SC=GGTGTAATCCATCATGAAGTT;SOR=0.973;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=121;TCF=71;TCR=50;TR=75;WE=47172425;WS=47172407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,76:0.62:122
chr12	47173662	rs180426	A	G	7109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.806;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=88;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.908;SC=GTGAGAGACAAGGATATTAGA;SOR=0.809;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=209;TCF=120;TCR=89;TR=208;WE=47173670;WS=47173652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,220:1.00:221
chr12	47178307	rs180430	A	G	1850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=14;PP=1358;SC=GGATCCATTGAAAAGTATATC;SOR=1.903;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=53;WE=47178315;WS=47178297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr12	47758032	rs215383	A	G	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=253;ReadPosRankSum=-0.308;SC=CAGACTGCAGATGACCAGGGT;SOR=0.268;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=62;TCF=3;TCR=59;TR=18;WE=47758040;WS=47758022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,17:0.27:64
chr12	47761212	rs58616	G	A	1461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.178;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=20;PP=1019;ReadPosRankSum=-0.520;SC=TTCAAGGTTAGTACCCTGATA;SOR=0.593;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=219;TCF=151;TCR=68;TR=66;WE=47761220;WS=47761202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,71:0.31:232
chr12	47761313	rs11419253	A	AT	440.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=7.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.35;MQRankSum=3.632;QD=3.83;ReadPosRankSum=-0.502;SOR=0.199;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,32:0.28:115
chr12	48080730	rs10875680	T	A	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=1.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=0.000;QD=14.65;ReadPosRankSum=0.200;SOR=1.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,47:0.68:69
chr12	48081539	rs7136422	C	T	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=0;PP=1116;ReadPosRankSum=0.112;SC=GCATTTAATTCCCAATTCCTA;SOR=1.576;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=68;TCF=68;TCR=0;TR=45;WE=48081547;WS=48081529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,46:0.67:69
chr12	48096730	rs2057730	A	C	96.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5032;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=20;ReadPosRankSum=-0.674;SC=TAAGTGGCCAAGATACATGGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=48096738;WS=48096720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr12	48104746	rs1235152	G	C	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=24;PP=760;SC=CCCACTTCACGCTGCCTCTCC;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=48104754;WS=48104736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	48110325	rs1235153	A	G	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=8;PP=279;SC=CCCCAAACACAGGGCAGCGAC;SOR=0.976;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=14;WE=48110333;WS=48110315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	48142026	rs73105859	C	A	1212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=29;PP=974;SC=CCCTTCCCCACATCCCACCAC;SOR=2.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=36;WE=48142034;WS=48142016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	48142418	rs757281	C	G	1826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=39;PP=1491;SC=CATTTTTCTCCATTAGCCAGC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=57;WE=48142426;WS=48142408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	48143095	rs149061709	G	GCTCTGGT	3230.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=7;PP=2898;SC=CAGGCCCTCTGCTCTGGTCCC;SOR=4.277;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=64;TCF=52;TCR=12;TR=42;WE=48143103;WS=48143085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	48143360	rs757280	T	C	68.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=2;PP=70;SC=CTGCCGCCCCTGCCGCCCCCA;SOR=1.179;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=48143368;WS=48143350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	48144243	rs757279	A	C	1372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=27;PP=1165;SC=CACACTGTGAACTGTGGGCCC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=44;WE=48144251;WS=48144233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	48144925	rs2016123	T	C	4761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=66;NR=82;PP=2965;SC=TCATGAGTTCTCACGGGCTCG;SOR=0.878;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=66;TCR=82;TR=148;WE=48144933;WS=48144915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr12	48172778	rs73105899	C	G	2584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=15;PP=2155;SC=CTGGAGCACCCTGGGGATGGG;SOR=3.069;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=78;TCR=15;TR=93;WE=48172786;WS=48172768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr12	48178127	rs3192737	A	G	2916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=80;PP=2485;SC=TCCTCCACTTAGGGTCGGCTC;SOR=5.283;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=6;TCR=80;TR=86;WE=48178135;WS=48178117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	48178465	rs3815138	T	C	5117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=55;PP=2965;SC=GAACACAACATGGGAGAACTG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=110;TCR=55;TR=165;WE=48178473;WS=48178455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr12	48179402	rs3815131	C	T	1611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=32;PP=1321;SC=ACAGAGGCTTCCGCTTCGCCT;SOR=1.755;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=47;WE=48179410;WS=48179392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	48179463	rs3815130	C	T	1655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=14;PP=1393;SC=CATCTGCCTGCTCCTTGGGTA;SOR=1.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=50;WE=48179471;WS=48179453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr12	48180508	rs2240108	C	T	6141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=131;PP=2965;ReadPosRankSum=0.377;SC=CAAGAAGTGGCGATCATCGTA;SOR=0.421;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=196;TCF=63;TCR=133;TR=194;WE=48180516;WS=48180498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,201:0.99:203
chr12	48181778	rs6580637	T	C	2658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.125;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=41;PP=2129;ReadPosRankSum=-1.315;SC=AGAGTAAGTGTCAGGAGGAGG;SOR=1.105;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=187;TCF=105;TCR=82;TR=101;WE=48181786;WS=48181768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,101:0.53:190
chr12	48185167	rs11832133	G	C	2277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.616;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=50;PP=1899;ReadPosRankSum=0.333;SC=GGAGCCCAGAGAGCAGGGCCG;SOR=0.394;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=130;TCF=49;TCR=81;TR=85;WE=48185175;WS=48185157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,84:0.65:130
chr12	48192890	rs144622764	T	C	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=-0.741;SC=TTTCCTCACTTAATCCTGTCG;SOR=0.120;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=48192898;WS=48192880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr12	48195939	rs2525051	G	C	4433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.612;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=79;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.483;SC=AGCTTCTCGCGTTCTTACAGC;SOR=0.426;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=238;TCF=133;TCR=105;TR=165;WE=48195947;WS=48195929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,169:0.68:248
chr12	48238757	rs731236	A	G	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.890;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=44;PP=1141;ReadPosRankSum=-0.533;SC=GGATGGCCTCAATCAGCGCGG;SOR=2.215;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=70;TCF=5;TCR=65;TR=46;WE=48238765;WS=48238747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,46:0.67:69
chr12	48238837	rs7975232	C	A	643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=18;PP=526;SC=TCAGCTGGGCCCCTCACTGCT;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=48238845;WS=48238827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	48249259	rs11168265	C	T	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.386;NF=14;NR=1;PP=336;ReadPosRankSum=0.699;SC=GCCGAGATCGCGCCACTGCAC;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=15;WE=48249267;WS=48249249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr12	48251533	rs11168266	C	T	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.24;SOR=6.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	48251533	.	CTGCGGTTGG	TTGCGGTTGA,TTGCGGTTGG	285	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0,0;NR=7,24;PP=124,285;QD=25.3525535517;SC=AACCTTCCTCCTGCGGTTGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=7,24;WE=48251550;WS=48251523;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.29:24
chr12	48251542	rs11168267	G	A	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.182;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr12	48259124	rs142161130	A	G	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=1034;ReadPosRankSum=0.162;SC=CTGGGCACCAAACGATTCCTA;SOR=0.836;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=24;WE=48259134;WS=48259114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr12	48259126	rs12717991	C	T	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=905;ReadPosRankSum=-1.420;SC=GGGCACCAAACGATTCCTACT;SOR=0.743;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=19;WE=48259134;WS=48259114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr12	48272895	rs2228570	A	G	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.373;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=42;PP=1048;ReadPosRankSum=-0.229;SC=CATTGCCTCCATCCCTGTAAG;SOR=1.107;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=69;TCF=12;TCR=57;TR=50;WE=48272903;WS=48272885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,48:0.72:67
chr12	48298245	rs61262762	TA	T	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=17.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQRankSum=1.038;QD=2.29;ReadPosRankSum=1.678;SOR=2.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr12	48358279	rs11609253	C	A	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.449;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=514;ReadPosRankSum=0.838;SC=GCCCAGACAACTTTTCTTCTA;SOR=2.694;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=23;WE=48358287;WS=48358269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
chr12	48360620	rs2286024	A	G	1289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=35;PP=1098;SC=TCAGCTTTTGACTTATAGGTT;SOR=3.967;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=38;WE=48360628;WS=48360610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	48367829	rs1635560	G	A	3726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=34;PP=2963;SC=TGCTCCAGGCGGTTTGGGCAC;SOR=1.773;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=81;TCR=34;TR=115;WE=48367837;WS=48367819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr12	48371595	rs1793949	G	A	3096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=76;PP=2599;SC=TCCTCCTTCCGGAAGCAGCCC;SOR=2.646;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=19;TCR=76;TR=95;WE=48371603;WS=48371585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr12	48373718	rs11443755	A	AC	693.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=0;PP=788;SC=ATCCCAGAACACCCCCGCCAT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=20;WE=48373726;WS=48373708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	48374513	rs1635554	A	G	2703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=47;PP=2219;SC=CCAGAAGAGCAGGAGACTCTG;SOR=0.809;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=43;TCR=47;TR=90;WE=48374521;WS=48374503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr12	48374826	rs2276458	T	G	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=423;SC=CAAGAGCCCCTTGGGCCCTGC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=48374834;WS=48374816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	48375475	rs1793937	C	G	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.579;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=12;PP=865;ReadPosRankSum=-0.234;SC=TGAGGGAGGACAAGACAGAAC;SOR=0.237;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=39;WE=48375483;WS=48375465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,44:0.71:62
chr12	48375568	rs1635553	A	G	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=766;ReadPosRankSum=1.008;SC=CCTTCTCGCCATTAGCACCAG;SOR=0.735;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=78;TCF=38;TCR=40;TR=43;WE=48375576;WS=48375558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,47:0.57:83
chr12	48375965	rs2276457	C	T	2213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=2.682;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.00;ReadPosRankSum=-0.031;SOR=0.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,59:0.72:82
chr12	48375975	rs2276456	A	G	2083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.35;ReadPosRankSum=0.441;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,51:0.72:71
chr12	48376137	rs2276455	G	A	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.793;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=6;PP=902;ReadPosRankSum=0.215;SC=AAAAGGCAGGGAGCTTTGGAA;SOR=0.423;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=36;WE=48376145;WS=48376127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,38:0.75:51
chr12	48376213	rs12811832	G	A	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.766;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=560;ReadPosRankSum=0.029;SC=ATAAGGGAACGGAAGCGATCA;SOR=0.807;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=109;TCF=69;TCR=40;TR=36;WE=48376221;WS=48376203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,38:0.33:116
chr12	48376291	rs2276454	G	A	1872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.875;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=50;PP=1408;ReadPosRankSum=-0.682;SC=TTACCCTGTCGCCTTTGGGCC;SOR=1.611;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=104;TCF=39;TCR=65;TR=73;WE=48376299;WS=48376281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,76:0.70:109
chr12	48376443	rs3842680	A	AC	1022.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.840;NF=18;NR=8;PP=1617;ReadPosRankSum=1.435;SC=CTCTCCCTGAACCCATGTTCA;SOR=0.719;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=26;WE=48376455;WS=48376433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr12	48376447	rs3829737	A	G	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=1646;ReadPosRankSum=2.193;SC=CCCTGAACCCATGTTCATGGA;SOR=0.569;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=26;WE=48376455;WS=48376433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr12	48376503	rs3829736	C	T	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.263;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=6;PP=1081;ReadPosRankSum=-1.056;SC=CCCTTCCTCCCATGTAGACCT;SOR=0.326;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=74;TCF=66;TCR=8;TR=46;WE=48376511;WS=48376493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,47:0.61:77
chr12	48376530	rs11168337	C	A	1801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.071;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=13;PP=1466;ReadPosRankSum=1.923;SC=CAGCTCCCCCCACTTCTGTTC;SOR=0.104;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=99;TCF=84;TCR=15;TR=64;WE=48376538;WS=48376520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,66:0.65:102
chr12	48376969	rs11168338	C	A	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.00;ReadPosRankSum=-0.204;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:147,51:0.26:198
chr12	48377970	rs1635550	A	G	2079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=36;PP=1519;SC=TTTTCTTCCCACTTGCAGTCC;SOR=0.971;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=29;TCR=36;TR=65;WE=48377978;WS=48377960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr12	48379810	rs3829734	G	A	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=341;ReadPosRankSum=-0.928;SC=CCAGGCTCCAGTGGGTCCATC;SOR=0.631;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=17;WE=48379818;WS=48379800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr12	48379961	rs1635547	A	C	1671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=1.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.54;ReadPosRankSum=-0.376;SOR=0.310;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,42:0.67:63
chr12	48379964	rs1635546	A	G	1671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=1.844;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.96;ReadPosRankSum=-0.677;SOR=0.337;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,42:0.68:62
chr12	48380031	rs1635544	A	G	2249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.751;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=29;PP=1691;ReadPosRankSum=1.855;SC=AAAAGTCACGAGACTTGACCA;SOR=0.569;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=123;TCF=81;TCR=42;TR=83;WE=48380039;WS=48380021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,86:0.68:126
chr12	48380682	rs10875714	G	A	4897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.209;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=116;PP=2962;ReadPosRankSum=1.890;SC=CTTGAAAAGAGAGGCAGGTCC;SOR=0.567;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=281;TCF=101;TCR=180;TR=182;WE=48380690;WS=48380672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,182:0.65:279
chr12	48381045	rs41317915	C	T	3323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.411;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=54;PP=2410;ReadPosRankSum=1.153;SC=CCACGGGCAACACTCACAGCA;SOR=0.881;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=203;TCF=106;TCR=97;TR=122;WE=48381053;WS=48381035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,130:0.61:213
chr12	48383235	rs1635537	A	G	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.343;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=333;ReadPosRankSum=0.601;SC=TCCCCAGGAAACTTTGCCTGG;SOR=0.193;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=16;WE=48383243;WS=48383225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr12	48386553	rs1635534	A	G	1797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=10;PP=1355;SC=TTAAGGGATAACAATACTCCC;SOR=2.958;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=43;TCR=10;TR=53;WE=48386561;WS=48386543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	48386577	rs1793915	G	T	2545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=21;PP=1918;SC=GCCTCACAGGGTTGTTTCGAG;SOR=2.330;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=62;TCR=21;TR=83;WE=48386585;WS=48386567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr12	48387052	rs1793912	A	C	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.51;SOR=6.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	48387052	.	AATGGG	CATGGC,CATGGG	469	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=13;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=16,20;NR=0,0;PP=469,8;QD=32.6542421789;SC=AGTGTGATAAAATGGGTATCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=16,20;WE=48387065;WS=48387042;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.80:20
chr12	48387057	rs1793911	G	C	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.53;ReadPosRankSum=-1.946;SOR=2.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,20:0.83:24
chr12	48388995	rs3216168	TC	T	859.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.386;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=962;ReadPosRankSum=0.443;SC=CCAGGCCCTTTCAAAGGAGGC;SOR=1.938;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=24;WE=48389003;WS=48388985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,28:0.76:37
chr12	48389023	rs10875716	C	T	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.686;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=261;ReadPosRankSum=-1.843;SC=CATTTGTCTACTCGTGTATAC;SOR=0.295;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=62;TCF=53;TCR=9;TR=18;WE=48389031;WS=48389013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,18:0.29:63
chr12	48389643	rs1034762	A	C	7547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=140;PP=2965;ReadPosRankSum=0.567;SC=GGCAAAAAGAATTGCAGATAC;SOR=0.509;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=228;TCF=87;TCR=141;TR=227;WE=48389651;WS=48389633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,232:1.00:233
chr12	48390585	rs2213163	T	A	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=451;ReadPosRankSum=-0.906;SC=TGGGAATGGATTATTAGATGA;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=19;WE=48390593;WS=48390575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr12	48391416	rs3737548	G	T	2979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.243;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=-0.716;NF=63;NR=51;PP=2392;ReadPosRankSum=-0.910;SC=GACCAGGGGGGCCGGGAGGAC;SOR=0.829;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=173;TCF=94;TCR=79;TR=114;WE=48391424;WS=48391406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,115:0.65:176
chr12	48392433	rs1793958	A	G	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=362;ReadPosRankSum=-1.589;SC=GGTGACCCAGACTTTGTTATT;SOR=0.502;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=74;TCF=1;TCR=73;TR=21;WE=48392441;WS=48392423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,22:0.28:79
chr12	48398002	rs3803184	G	C	2137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=46;PP=1690;SC=AGGCAGGCAGGGGCGGGGGAA;SOR=1.288;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=28;TCR=46;TR=74;WE=48398010;WS=48397992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	48398080	rs3803183	T	A	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=34;PP=1179;SC=AGCACCAGCGTCTGGGGAGCC;SOR=2.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=46;WE=48398088;WS=48398070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	48490243	rs63235460	AT	A	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=1.431;QD=1.07;ReadPosRankSum=0.327;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,17:0.21:82
chr12	48512285	rs4760682	C	A	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.706;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=578;ReadPosRankSum=0.749;SC=GGTAGAGATACAAGTAAGCAA;SOR=0.619;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=127;TCF=77;TCR=50;TR=38;WE=48512293;WS=48512275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,41:0.32:129
chr12	48526719	rs11552507	C	T	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=3.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.32;ReadPosRankSum=-1.184;SOR=1.018;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,58:0.28:204
chr12	48537624	rs4075913	A	G	4273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=64;PP=2965;SC=TTGTTCCTAAATGAAGAAGAA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=64;TCR=64;TR=128;WE=48537632;WS=48537614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr12	48539482	rs8716	T	G	1913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=48;PP=1503;SC=CCGGGGAAGCTGCCGTCTAAA;SOR=3.538;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=7;TCR=48;TR=55;WE=48539490;WS=48539472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr12	48547128	rs11168428	C	T	1340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=4;PP=1113;SC=CAAGGACTCTCCTGTCAATAC;SOR=4.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=40;WE=48547136;WS=48547118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	48578325	rs10783231	A	C	1442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.29;SOR=0.900;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr12	48578631	rs7486941	G	C	913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=30;PP=730;SC=ACTCCCTCGAGGAAGGATTTG;SOR=4.680;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=48578639;WS=48578621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	48723324	rs2732441	C	G	5963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=126;PP=2965;SC=GAAGGAGCTCCGAAACGCCGG;SOR=1.750;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=54;TCR=126;TR=180;WE=48723332;WS=48723314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr12	48736985	rs2732481	T	G	5887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.033;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=91;PP=2965;ReadPosRankSum=0.311;SC=TGGGGCACGCTGCCGTTTCCT;SOR=0.256;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=182;TCF=91;TCR=91;TR=181;WE=48736993;WS=48736975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,194:0.99:195
chr12	48737245	rs2732484	A	C	2067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=39;PP=1769;SC=CAAGGTGGGAACCCCATACAA;SOR=1.127;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=66;WE=48737253;WS=48737235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	48738236	rs2634676	A	G	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=0;PP=704;SC=ACATCATTCTATTACACTCCC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=48738244;WS=48738226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	48738555	rs34591795	GA	G	655.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=20;PP=426;SC=CTATATTTCTGAAAAAAAAAT;SOR=3.611;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=22;WE=48738563;WS=48738545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	48739012	rs1489107	G	A	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=0.143;SC=CGGAAGCATAGACAGATTCCC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=48739020;WS=48739002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr12	48740855	rs2634675	A	G	114.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=88;SC=CCTTTCTTGTAGGTCCATTTA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=48740863;WS=48740845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	48741219	rs901962	A	T	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=734;SC=AAGGGTCACAACTTCTGTATC;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=48741227;WS=48741209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	48877056	rs7972785	T	C	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=179;ReadPosRankSum=0.550;SC=AGCTCCAGAGTCCTTGGTTTC;SOR=0.723;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=50;TCF=45;TCR=5;TR=14;WE=48877064;WS=48877046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,14:0.27:51
chr12	48879951	rs11168599	T	G	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=308;ReadPosRankSum=0.162;SC=ATATCATTCTTTCTTTGCAGC;SOR=0.622;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=18;WE=48879959;WS=48879941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,18:0.36:50
chr12	48880381	rs2731091	A	G	2816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.561;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=52;PP=2166;ReadPosRankSum=-0.143;SC=TCCAAGAAACATCTTGTCTTC;SOR=0.635;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=181;TCF=99;TCR=82;TR=113;WE=48880389;WS=48880371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,116:0.63:184
chr12	48880550	rs2731092	T	C	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=41;PP=906;ReadPosRankSum=-0.290;SC=TGGCATGAGGTGGGAGGTGGG;SOR=0.756;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=21;TCR=67;TR=54;WE=48880558;WS=48880540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,55:0.62:88
chr12	48883012	rs2705127	T	C	1867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.667;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=52;PP=1497;ReadPosRankSum=1.723;SC=TATGTGGTTGTATGAAATGCT;SOR=0.200;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=87;TCF=9;TCR=78;TR=60;WE=48883020;WS=48883002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,62:0.70:88
chr12	48884535	rs2731102	G	C	4549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.707;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=83;PP=2962;ReadPosRankSum=1.262;SC=AGCTAATACAGTGCAGGTCTG;SOR=0.569;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=238;TCF=117;TCR=121;TR=165;WE=48884543;WS=48884525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,168:0.70:241
chr12	48884756	rs2731103	C	A	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=553;ReadPosRankSum=1.947;SC=CAAAGTCTCACCCTAGGATCT;SOR=0.622;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=24;WE=48884764;WS=48884746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr12	48888594	rs11458	C	T	1889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=33;PP=1338;ReadPosRankSum=1.066;SC=CATAAGGCCTCCAGATTCCTT;SOR=0.713;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=221;TCF=125;TCR=96;TR=75;WE=48888602;WS=48888584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,82:0.36:230
chr12	48888689	rs9268	C	G	5258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=116;PP=2965;SC=AGACACAGCTCTTCAGTCAAT;SOR=2.003;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=44;TCR=116;TR=160;WE=48888697;WS=48888679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr12	48888763	rs2705132	A	G	2041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=55;PP=1865;SC=CTTCCGCCAGATGCTTTACCC;SOR=3.442;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=9;TCR=55;TR=64;WE=48888771;WS=48888753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	48919556	rs2731073	A	G	6366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=93;PP=2965;SC=GCTGCTGCTCATGATCAGGGC;SOR=1.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=218;TCF=124;TCR=94;TR=217;WE=48919564;WS=48919546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr12	48919659	rs4075258	TG	CA	1962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.548;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=35;PP=2190;ReadPosRankSum=-0.594;SC=CCCAAGATGCTGGAGAACCTC;SOR=1.418;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=147;TCF=47;TCR=100;TR=45;WE=48919668;WS=48919649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,55:0.35:157
chr12	48919796	rs12425460	C	T	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=17;PP=691;ReadPosRankSum=-0.334;SC=TGCCATCTGCCGCCCACTACT;SOR=0.741;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=59;TCR=50;TR=36;WE=48919804;WS=48919786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,38:0.33:114
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chr12	48921533	rs7299323	C	T	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=37;ReadPosRankSum=0.941;SC=TTTACAATTGCCTAACTTACT;SOR=0.124;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=4;WE=48921541;WS=48921527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
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chr12	48954225	rs7312017	G	C	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=3.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.80;ReadPosRankSum=-1.153;SOR=0.474;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,46:0.25:183
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chr12	49048985	rs6580690	G	A	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=123;ReadPosRankSum=-1.265;SC=TTTTACAAGAGCGTCCAACAA;SOR=0.173;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=9;WE=49048993;WS=49048975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr12	49054491	rs3741629	G	C	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.195;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=51;ReadPosRankSum=1.094;SC=AACTCAAGGTGTGGACTATAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=49054499;WS=49054481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr12	49065727	rs7303113	T	C	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.285;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=317;ReadPosRankSum=0.482;SC=CTTCTTCTGCTGTGTAGACAC;SOR=0.419;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=80;TCF=17;TCR=63;TR=23;WE=49065735;WS=49065717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,26:0.29:91
chr12	49072794	rs118067775	T	C	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.567;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=513;ReadPosRankSum=0.657;SC=ACATTTCAAATGCCTTATGTG;SOR=1.236;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=29;WE=49072802;WS=49072784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr12	49073358	rs3741630	A	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.609;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=0.179;SC=TGCCAAATAGATCAAGGCATT;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=6;WE=49073366;WS=49073348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr12	49075983	rs61942052	CT	GG	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=349;ReadPosRankSum=2.007;SC=AGGAGCTGCGCTGCGCCGCAC;SOR=0.892;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=9;WE=49075992;WS=49075973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr12	49076036	rs10783277	T	C	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.07;ReadPosRankSum=0.210;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr12	49086963	rs3741632	G	A	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=5.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.97;ReadPosRankSum=0.000;SOR=1.522;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,14:0.13:105
chr12	49087656	rs3013	G	C	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FS=3.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.05;ReadPosRankSum=-1.002;SOR=0.955;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:174,61:0.26:235
chr12	49093729	rs7308699	C	T	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=254;ReadPosRankSum=0.097;SC=GGTTTCCACACTAAAATATTA;SOR=0.536;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=13;WE=49093737;WS=49093719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr12	49108488	rs7138930	C	T	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.02;ReadPosRankSum=-0.774;SOR=0.035;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,5:0.14:36
chr12	49110223	rs11168699	C	A	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=4.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQRankSum=-1.278;QD=10.47;ReadPosRankSum=0.646;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr12	49110223	.	CAC	AAA	304	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=29;MQ=59.47;NF=6;NR=1;PP=304;QD=51.066839266;SC=TCGTCCCCCCCACAGAGCCTG;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=7;WE=49110233;WS=49110213;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,7:0.30:23
chr12	49110225	rs11168700	C	A	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=5.351;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=-1.467;QD=10.03;ReadPosRankSum=1.680;SOR=0.037;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr12	49110248	rs1110432	G	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.428;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=228;ReadPosRankSum=-0.642;SC=CCGGACGCCAGAGCATGGCGG;SOR=0.153;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=14;WE=49110256;WS=49110238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
chr12	49176872	rs3730308	G	T	1754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.328;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=39;PP=1330;ReadPosRankSum=0.076;SC=CAGCAGGATCGCCCACTCCTG;SOR=0.447;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=277;TCF=164;TCR=113;TR=84;WE=49176880;WS=49176862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,85:0.30:283
chr12	49212806	rs12369114	C	T	949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.370;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=23;PP=691;ReadPosRankSum=0.549;SC=GGTGACACCTCCTCTCCCTTC;SOR=0.564;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=158;TCF=72;TCR=86;TR=45;WE=49212814;WS=49212796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,48:0.31:156
chr12	49212874	rs68162448	AG	A	607.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=495;ReadPosRankSum=-0.664;SC=CAGGGTTTGTAGGGGGGCGCT;SOR=0.555;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=68;TCF=1;TCR=67;TR=22;WE=49212882;WS=49212864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,27:0.38:71
chr12	49221622	rs1045340	G	A	1486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.580;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=42;PP=1153;ReadPosRankSum=-0.747;SC=AGGACTCAGAGCACAACCACA;SOR=0.613;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=195;TCF=68;TCR=127;TR=65;WE=49221630;WS=49221612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,67:0.34:199
chr12	49230035	rs1057908	T	G	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.147;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=252;ReadPosRankSum=-1.679;SC=CCTGACGCTGTATAGGTGTTG;SOR=0.497;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=52;TCF=33;TCR=19;TR=17;WE=49230043;WS=49230025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,17:0.32:53
chr12	49255798	rs1565933	G	C	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=13;PP=400;ReadPosRankSum=1.299;SC=TTACCTTCTTGAGTGCGCTGT;SOR=0.762;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=85;TCF=35;TCR=50;TR=23;WE=49255806;WS=49255788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,22:0.25:87
chr12	49259194	rs2453489	T	G	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.48;ReadPosRankSum=-0.395;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr12	49297720	rs4018506	A	AAAAT	91.37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=129;SC=CTCTATGTCAAAAATAAATAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=3;WE=49297728;WS=49297710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	49308342	rs145100370	G	A	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.098;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=352;ReadPosRankSum=0.570;SC=TAACCAAGGAGTTTGAGACAG;SOR=0.976;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=23;WE=49308350;WS=49308332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,23:0.37:63
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chr12	49334044	rs708242	G	C	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.38;ReadPosRankSum=-0.163;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,5:0.18:28
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chr12	49362779	rs833834	T	G	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=81;ReadPosRankSum=0.216;SC=GGAGAGAGGTTGGGGAGTGAT;SOR=0.241;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=8;WE=49362787;WS=49362769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr12	49364391	rs833843	G	A	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.782;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=332;ReadPosRankSum=1.140;SC=CAGGAATAGGGCGGCTCGCTT;SOR=0.113;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=17;WE=49364399;WS=49364381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr12	49390677	rs10783299	T	C	1433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.413;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=43;PP=1092;ReadPosRankSum=0.759;SC=GTTTCCAACCTCGGGCAGGGT;SOR=0.964;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=164;TCF=40;TCR=124;TR=55;WE=49390685;WS=49390667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,58:0.33:175
chr12	49398862	rs2293445	G	A	1295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.719;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=27;PP=901;ReadPosRankSum=0.047;SC=CCAGAAACCCGCCATCCCTTT;SOR=0.615;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=161;TCF=77;TCR=84;TR=57;WE=49398870;WS=49398852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,61:0.37:167
chr12	49416046	rs34546217	TC	T	956.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.845;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.424;NF=9;NR=22;PP=977;ReadPosRankSum=-0.189;SC=AATCCCTCCTTCCTCGTCATC;SOR=0.569;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=96;TCF=21;TCR=75;TR=31;WE=49416054;WS=49416036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,35:0.34:104
chr12	49418623	.	C	T	4299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.963;ClippingRankSum=0.000;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.727;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.650;NF=51;NR=97;PP=2962;ReadPosRankSum=0.533;SC=CGGCATGCACCGTCAGCCCAA;SOR=0.514;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=210;TCF=70;TCR=140;TR=148;WE=49418631;WS=49418613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,149:0.70:214
chr12	49423460	rs33963995	GT	G	58	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=14.50;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	49424616	rs11614738	G	A	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.215;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=888;ReadPosRankSum=-0.037;SC=TGCACAGCTGGGGGACAGGGT;SOR=0.422;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=157;TCF=97;TCR=60;TR=47;WE=49424624;WS=49424606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,48:0.30:159
chr12	49424873	rs150012622	TTCTG	T	3365.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FS=2.057;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQRankSum=1.464;QD=11.11;ReadPosRankSum=0.101;SOR=0.686;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:206,97:0.32:303
chr12	49425978	rs3741622	T	C	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.862;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=34;PP=919;ReadPosRankSum=-0.177;SC=TGGGAGGTTGTGGCCCTGTAT;SOR=0.948;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=171;TCF=72;TCR=99;TR=57;WE=49425986;WS=49425968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,59:0.34:175
chr12	49427652	rs3782357	C	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.41;ReadPosRankSum=0.790;SOR=0.820;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,25:0.21:120
chr12	49434074	rs10747559	C	A	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.083;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=304;ReadPosRankSum=-1.305;SC=CTGCTGGGAACCCCCCAGCCC;SOR=0.993;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=75;TCF=34;TCR=41;TR=21;WE=49434082;WS=49434064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,22:0.29:76
chr12	49436724	rs12580349	A	G	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=364;ReadPosRankSum=-0.762;SC=CCACAGGTCTACAAATGATCA;SOR=0.631;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=82;TCF=49;TCR=33;TR=23;WE=49436732;WS=49436714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,25:0.29:86
chr12	49437990	rs201686029	G	A	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.229;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=128;ReadPosRankSum=-0.319;SC=CACCCTCGTCGGGCTGCCCAT;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=49437998;WS=49437980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr12	49439659	rs833818	C	T	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=0;PP=657;SC=AGATGATGTCCGACGTCTGGT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=49439667;WS=49439649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	49442356	rs5798089	C	CA	316.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.126;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=503;ReadPosRankSum=-1.360;SC=TGGGTATCCCCAAAGTAGGTC;SOR=2.147;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=53;TCF=40;TCR=13;TR=15;WE=49442364;WS=49442346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,16:0.28:57
chr12	49442813	rs2304275	T	C	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.468;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=2;PP=580;ReadPosRankSum=-0.752;SC=TAGGCAAGCATGCAAGGGACT;SOR=0.037;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=84;TCF=82;TCR=2;TR=31;WE=49442821;WS=49442803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,32:0.38:84
chr12	49444545	rs2241726	G	A	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.751;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=14;PP=784;ReadPosRankSum=-0.524;SC=CAGCTGTGATGATGGGTGAGA;SOR=0.588;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=113;TCF=79;TCR=34;TR=44;WE=49444553;WS=49444535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,47:0.39:121
chr12	49463352	rs71080168	CT	C	9206.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.49;QD=46.26;SOR=3.224;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr12	49463353	.	TC	CT	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=29;MQ=60.77;NF=83;NR=9;PP=2947;QD=20;SC=CACCACCAACTCTTCCAATCC;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=114;TCF=101;TCR=13;TR=92;WE=49463381;WS=49463343;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:22,92:0.81:114
chr12	49463356	.	TCCAATCCTCCACTCTTCC	TTCCTCCACTCTTCC,T	9341.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.17;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=10;PP=2930;SC=CACCAACTCTTCCAATCCTCC;SOR=2.867;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=82;TCF=71;TCR=11;TR=77;WE=49463381;WS=49463343;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:206
chr12	49463361	rs200055056	TCCTCCACTCTTCC	T	9235.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.57;QD=44.62;SOR=2.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr12	49494025	.	T	C	206	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=10;NR=0;PP=206;QD=24.0771212547;SC=TACAGAGCCTTGCTTTCCTCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=10;WE=49494033;WS=49494024;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,10:0.45:22
chr12	49494862	rs35472356	C	CA	95.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=88;ReadPosRankSum=-0.264;SC=GCCCTCCTTTCAAATTAAGTC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=6;WE=49494870;WS=49494852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
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chr12	49521672	rs2753	G	A	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.011;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=7;PP=562;ReadPosRankSum=-0.321;SC=AAGCTTTAACGTCTGTCAGTT;SOR=0.536;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=125;TCF=105;TCR=20;TR=38;WE=49521680;WS=49521662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,37:0.30:125
chr12	49522578	rs1057725	T	C	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.462;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.652;NF=19;NR=0;PP=336;ReadPosRankSum=-0.563;SC=CCTGGGGTGCTGGGTAAATGG;SOR=2.333;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=58;TCR=7;TR=19;WE=49522586;WS=49522568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,16:0.27:60
chr12	49522605	rs1057548	C	T	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.749;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.488;NF=23;NR=0;PP=404;ReadPosRankSum=0.556;SC=CCAGCTTGGACTTCTTGCCAT;SOR=2.674;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=77;TCF=68;TCR=9;TR=23;WE=49522613;WS=49522595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,19:0.25:75
chr12	49522786	rs1865157	C	A	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=477;ReadPosRankSum=0.278;SC=ATTTCTATTTCAACTTTTTAG;SOR=0.511;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=77;TCF=6;TCR=71;TR=26;WE=49522794;WS=49522776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,26:0.32:80
chr12	49523523	rs34070757	GAT	G	1087.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.415;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.356;NF=7;NR=20;PP=1104;ReadPosRankSum=0.711;SC=AAGGAAAAAAGATATCACAAT;SOR=1.665;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=79;TCF=30;TCR=49;TR=27;WE=49523532;WS=49523513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,31:0.36:86
chr12	49525008	rs2241727	G	C	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.213;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=248;ReadPosRankSum=-0.406;SC=GCTGTATACAGGGCCCCAGCG;SOR=2.670;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=14;WE=49525016;WS=49524998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr12	49579696	rs697624	C	G	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=1.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.49;MQRankSum=-2.272;QD=2.60;ReadPosRankSum=0.241;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,25:0.18:142
chr12	49580180	rs1056875	T	C	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.789;NF=8;NR=4;PP=207;ReadPosRankSum=0.532;SC=CAGCATCTTCTTTGCCTGTGA;SOR=0.948;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=33;TCF=20;TCR=13;TR=12;WE=49580188;WS=49580170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr12	49582692	rs1039225	T	G	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.912;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=536;ReadPosRankSum=0.091;SC=AGCTTAAAGGTTTTCCAAGTA;SOR=1.034;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=107;TCF=72;TCR=35;TR=32;WE=49582700;WS=49582682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,33:0.30:111
chr12	49667103	rs9668136	A	T	1837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=50;PP=1509;SC=ATAAAATTGAAGTTTCCATTT;SOR=4.370;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=55;WE=49667111;WS=49667093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	49888504	.	C	G	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.890;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=8;PP=984;ReadPosRankSum=0.247;SC=TTTTCTTTTTCAAATTTTTAA;SOR=1.609;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=81;TCF=64;TCR=17;TR=47;WE=49888512;WS=49888494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,46:0.58:79
chr12	49937392	rs74089562	T	A	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.025;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=101;ReadPosRankSum=-1.622;SC=GGTGCTACAGTGCCCCCCTCG;SOR=0.105;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=6;WE=49937400;WS=49937382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr12	49958370	.	TG	T	188.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=1.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=2.001;QD=3.93;ReadPosRankSum=0.381;SOR=0.436;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,10:0.21:48
chr12	49993552	.	C	T	1566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=0.000;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=29;PP=1172;ReadPosRankSum=0.417;SC=TGTGGGAACTCGGCGGGTCCG;SOR=0.686;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=199;TCF=112;TCR=87;TR=66;WE=49993560;WS=49993542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,68:0.34:202
chr12	50151977	rs2720305	G	A	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=6.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.167;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=3;PP=586;ReadPosRankSum=-1.001;SC=AGAATTGATCGTAATACTGTG;SOR=1.300;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=101;TCF=86;TCR=15;TR=30;WE=50151985;WS=50151967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,30:0.29:102
chr12	50174307	rs111500583	CA	C	694.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=6.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQRankSum=0.720;QD=4.79;ReadPosRankSum=1.699;SOR=1.277;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,58:0.40:145
chr12	50232496	rs17260403	T	C	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.679;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=705;ReadPosRankSum=0.494;SC=GGAACTCCCATAGGCCATGGT;SOR=0.369;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=129;TCF=76;TCR=53;TR=39;WE=50232504;WS=50232486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,41:0.30:137
chr12	50232691	rs4898510	G	A	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.628;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=27;PP=657;ReadPosRankSum=-0.190;SC=GCTTCACCAGGACTGGATCTA;SOR=0.154;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=113;TCF=22;TCR=91;TR=38;WE=50232699;WS=50232681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,40:0.33:122
chr12	50271372	rs1248263	G	T	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=76;ReadPosRankSum=-0.400;SC=TGTGAGGAAGGTAGGGCATAT;SOR=0.399;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=6;WE=50271380;WS=50271362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr12	50271497	rs73116304	C	T	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.953;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=14;PP=404;ReadPosRankSum=1.097;SC=TGTGTGTGCGCGCACACGGCA;SOR=0.563;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=78;TCF=37;TCR=41;TR=29;WE=50271505;WS=50271487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,29:0.38:77
chr12	50290728	rs297935	A	G	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=77;ReadPosRankSum=0.219;SC=CTACGGGCTCAGATTAGGTCA;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=7;WE=50290736;WS=50290718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
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chr12	50297670	rs706795	T	C	351.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=4.027;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=301;ReadPosRankSum=-1.269;SC=GCGTGGGTTCTAGCAACATCC;SOR=2.670;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=12;WE=50297678;WS=50297660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
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chr12	50304949	rs450798	G	A	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=42;PP=1198;SC=TTTCCCCAGGGTCTCACGGGT;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=7;TCR=42;TR=49;WE=50304957;WS=50304939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	50305007	rs394119	C	T	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=580;SC=TCCGTTTCTCCACCAGATGGA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=50305015;WS=50304997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	50345079	rs3782319	G	A	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.528;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=218;ReadPosRankSum=0.354;SC=GAGAGAGATGGAGACAGAGGC;SOR=2.494;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=10;WE=50345087;WS=50345069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr12	50348024	rs369985708	C	T	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=3;PP=855;ReadPosRankSum=-1.317;SC=TCGCCTCCACCGATGAGCGCC;SOR=1.445;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=56;TCF=50;TCR=6;TR=35;WE=50348032;WS=50348014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,38:0.63:60
chr12	50348078	rs426496	T	C	3114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=8;PP=2581;SC=TAGGCTTCTCTGTGGCCCTGG;SOR=4.340;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=84;TCR=8;TR=91;WE=50348086;WS=50348068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr12	50348359	rs12372344	T	C	3123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.031;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=54;PP=2534;ReadPosRankSum=-0.790;SC=GGACAAGGACTTCCTGCCCTG;SOR=0.328;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=177;TCF=99;TCR=78;TR=110;WE=50348367;WS=50348349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,111:0.62:179
chr12	50348674	rs402813	C	T	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=14;PP=396;SC=TCAGTTTCCACGTCTGTGAAT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=50348682;WS=50348664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	50349090	rs410837	A	G	848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=1;PP=724;SC=CGGGGAGGAGAGGTGCGGCCG;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=50349098;WS=50349080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	50349123	rs371777	C	A	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=383;ReadPosRankSum=0.428;SC=CCGGGGCCTGCGGGCTCCGCG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=19;WE=50349131;WS=50349113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr12	50349143	rs403201	C	G	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=49;NR=3;PP=1154;SC=GTGCCGGTGCCGGCGCGGGTG;SOR=4.615;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=49;TCR=3;TR=52;WE=50349151;WS=50349133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	50349411	rs457487	C	A	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=19;PP=588;SC=GCGGCCTCTACGGCCCCGACG;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=50349419;WS=50349401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	50349765	rs467323	C	T	906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=23;PP=724;SC=TTGGGGGTTCCGGGAATGATG;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=50349773;WS=50349755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	50356174	rs139560378	TGGG	T	356.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=163;SC=GTGAGTGCCCTGGGGGGGGGG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=50356184;WS=50356164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	50358073	rs296753	C	G	2194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=57;PP=1785;SC=GGGTGGGCCACGGAGTGGTGG;SOR=4.680;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=5;TCR=57;TR=62;WE=50358081;WS=50358063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr12	50368013	rs296748	C	T	2442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=33;PP=2047;SC=TGTCACCCCCCTCCAGCTGAG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=35;TCR=33;TR=68;WE=50368021;WS=50368003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr12	50384171	rs2292720	T	C	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.042;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=170;ReadPosRankSum=0.711;SC=CTATAAAAAATGGTTGAATAA;SOR=0.859;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=64;TCF=24;TCR=40;TR=20;WE=50384179;WS=50384161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,20:0.32:63
chr12	50386015	rs296737	C	T	2880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=21.351;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=88;PP=2279;ReadPosRankSum=-0.206;SC=CACACACACACGCACCTGCCT;SOR=2.436;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=148;TCF=29;TCR=119;TR=102;WE=50386023;WS=50386005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,107:0.69:155
chr12	50393372	rs378943	G	T	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=155;ReadPosRankSum=-0.102;SC=TTTTACACAGGCCAGTTTAGT;SOR=0.346;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=9;WE=50393380;WS=50393362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr12	50410533	rs2291612	C	T	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=296;ReadPosRankSum=-1.866;SC=CATTAGGGGTCCTGCCTTCTC;SOR=0.653;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=15;WE=50410541;WS=50410523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr12	50452708	rs653576	C	G	5679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=102;PP=2965;SC=TCCTGGGCTCCCTGGCTGTGC;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=87;TCR=102;TR=189;WE=50452716;WS=50452698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr12	50467644	rs706792	G	T	2756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.275;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=46;PP=2169;ReadPosRankSum=1.472;SC=GGTGCTGTGGGCGGTGGCCTT;SOR=0.376;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=144;TCF=80;TCR=64;TR=96;WE=50467652;WS=50467634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,100:0.67:150
chr12	50467769	rs706793	G	A	4878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.888;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=67;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.260;SC=TGGCCTTCCCGGCAGTCACCC;SOR=1.100;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=271;TCF=161;TCR=110;TR=179;WE=50467777;WS=50467759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,180:0.65:279
chr12	50468041	rs145561284	C	T	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.319;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=43;PP=1031;ReadPosRankSum=0.095;SC=AGTGGAGCCCCATGCCTGCCA;SOR=1.670;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=78;TCF=10;TCR=68;TR=48;WE=50468049;WS=50468031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,48:0.62:78
chr12	50471630	rs2272391	A	G	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.416;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=268;ReadPosRankSum=1.193;SC=ACCCAGAAGGAGGCTAGGGGG;SOR=0.072;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=16;WE=50471638;WS=50471622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,17:0.36:47
chr12	50471968	rs76800307	T	G	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.73;ReadPosRankSum=-1.456;SOR=0.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,16:0.24:67
chr12	50473660	rs404751	A	G	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=5;PP=719;SC=CACTCAACTGAGACCTCTCAC;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=50473668;WS=50473650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	50474962	.	G	T	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.909;ClippingRankSum=0.000;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.744;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=20;PP=992;ReadPosRankSum=0.484;SC=CTACGCCTACGAGGTAAGCGG;SOR=0.507;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=92;TCF=59;TCR=33;TR=51;WE=50474970;WS=50474952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,52:0.55:94
chr12	50482211	rs646782	T	C	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.063;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=32;PP=930;ReadPosRankSum=0.456;SC=TGAGTTTTTTTCCATTGTTGT;SOR=1.371;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=58;TCF=10;TCR=48;TR=38;WE=50482219;WS=50482201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,41:0.65:63
chr12	50498139	rs836178	T	G	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=540;ReadPosRankSum=-0.433;SC=AGATGAGAAGTGGGGCTCCCT;SOR=0.705;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=23;WE=50498147;WS=50498129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr12	50503082	rs836179	A	G	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=268;ReadPosRankSum=-0.577;SC=AGAAACTCACAGCCATCCTTC;SOR=1.954;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=16;WE=50503090;WS=50503072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr12	50503269	rs836180	C	T	1629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=39;PP=1175;ReadPosRankSum=-0.227;SC=GTGAATTCATCCACTGCCTGC;SOR=0.589;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=79;TCF=24;TCR=55;TR=57;WE=50503277;WS=50503259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,62:0.75:83
chr12	50513687	rs7961065	C	T	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=140;ReadPosRankSum=-2.103;SC=TTTACCTAGACATAGGGGCCA;SOR=0.247;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=9;WE=50513695;WS=50513682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr12	50524489	.	G	A	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.163;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=9;PP=297;ReadPosRankSum=0.939;SC=TGGGTGGGATGAGACCAAAGA;SOR=0.172;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=61;TCF=17;TCR=44;TR=16;WE=50524497;WS=50524479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,21:0.31:67
chr12	50529314	rs11169281	C	T	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.058;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=24;PP=816;ReadPosRankSum=-0.640;SC=GCTAGAAATACGGTCTGAGGC;SOR=0.535;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=168;TCF=95;TCR=73;TR=52;WE=50529322;WS=50529304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,54:0.31:173
chr12	50529736	rs3741562	G	A	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FS=9.247;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.260;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:189,68:0.26:257
chr12	50529936	rs7136570	A	G	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.491;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=289;ReadPosRankSum=1.307;SC=ATTATTCTCTAAGAATCTTAC;SOR=0.069;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=15;WE=50529944;WS=50529926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr12	50535742	.	G	A	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.265;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=5.372;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.30;MQRankSum=-6.243;QD=8.52;ReadPosRankSum=1.994;SOR=2.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,28:0.37:75
chr12	50535747	.	G	A	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.626;ClippingRankSum=0.000;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=4.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.05;MQRankSum=-7.506;QD=6.81;ReadPosRankSum=-2.285;SOR=1.969;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,23:0.27:85
chr12	50537815	rs7302981	A	G	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-4.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.771;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=26;PP=588;ReadPosRankSum=-1.321;SC=ATGCCAATACAGAGTGCACAG;SOR=0.323;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=79;TCF=11;TCR=68;TR=31;WE=50537823;WS=50537805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,34:0.40:86
chr12	50570667	rs201225828	ATGTGTTTTT	A	466.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=1897;ReadPosRankSum=-2.571;SC=AGTATTTAGAATGTGTTTTTT;SOR=0.627;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=9;WE=50570683;WS=50570660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr12	50599709	rs2302900	T	C	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=94;ReadPosRankSum=0.454;SC=GTCCAAAAGATGTTACTACTA;SOR=0.866;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=10;WE=50599717;WS=50599699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr12	50599984	rs1362984	T	A	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=234;ReadPosRankSum=1.072;SC=GAATTTTTTTTAAATTACAAA;SOR=0.874;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=12;WE=50599992;WS=50599974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr12	50616346	rs3812825	A	G	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.739;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=530;ReadPosRankSum=-0.748;SC=GTAAAATGAAAGTTAAAACTC;SOR=0.829;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=106;TCF=43;TCR=63;TR=33;WE=50616354;WS=50616336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,40:0.34:116
chr12	50727706	rs6580741	G	C	1044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=1.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.821;SOR=0.482;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,48:0.29:166
chr12	50744094	rs7296277	G	A	2183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=7;PP=1858;SC=AAAACTAGACGTAAATAATTA;SOR=4.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=59;TCR=7;TR=66;WE=50744102;WS=50744084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	50744119	rs7296291	G	A	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.599;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=8;PP=1202;ReadPosRankSum=-0.750;SC=TACCTGGCATGCTGGATCAGC;SOR=2.348;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=90;TCF=70;TCR=20;TR=56;WE=50744127;WS=50744109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,56:0.62:90
chr12	50744171	rs7312252	T	C	1948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.697;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=36;PP=1519;ReadPosRankSum=-0.891;SC=CCAACTGAACTGTGTCCATAT;SOR=0.775;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=118;TCF=60;TCR=58;TR=76;WE=50744179;WS=50744161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,79:0.65:122
chr12	50744753	rs10506292	T	C	3318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.604;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=78;PP=2760;ReadPosRankSum=0.283;SC=TTGCCAATCTTTTCTTAGCAA;SOR=0.807;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=180;TCF=57;TCR=123;TR=113;WE=50744761;WS=50744743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,114:0.63:182
chr12	50746348	rs7304951	A	G	3458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=59;PP=2965;SC=TGAGGGGTGAAAGGGATCCCC;SOR=0.921;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=50;TCR=59;TR=109;WE=50746356;WS=50746338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr12	50746917	rs10876023	A	G	2534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.160;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.740;NF=46;NR=43;PP=2007;ReadPosRankSum=0.226;SC=GGCCTGCTGAAGGGTTAGAGT;SOR=0.518;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=145;TCF=78;TCR=67;TR=89;WE=50746925;WS=50746907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,91:0.63:145
chr12	50747005	rs10876024	T	C	2438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.488;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-2.036;NF=38;NR=51;PP=1857;ReadPosRankSum=0.055;SC=AGAGAGACCCTCAGGGCCTGG;SOR=0.873;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=131;TCF=57;TCR=74;TR=89;WE=50747013;WS=50746995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,92:0.69:134
chr12	50749221	rs4435082	G	C	2793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.65;SOR=0.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	50749227	rs4625558	T	G	2698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.98;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr12	50749294	rs4421818	A	G	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.991;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=353;ReadPosRankSum=-0.420;SC=CCTTTCTTCAATGATACGTTA;SOR=0.826;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=79;TCF=41;TCR=38;TR=21;WE=50749302;WS=50749284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,21:0.26:81
chr12	50750040	rs7964439	C	A	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=23;PP=715;SC=TACTGAAGAACAAAACATAAA;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=50750048;WS=50750030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr12	50796423	rs7138887	C	G	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=40;ReadPosRankSum=1.012;SC=TAGGTCTTCTCCTGTCTCTAA;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=4;WE=50796431;WS=50796413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr12	50829263	rs113327207	T	TTATTC	314.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=373;ReadPosRankSum=1.030;SC=ACTATTTTGTTTTTTCAGAGA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=50829271;WS=50829260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr12	50848132	rs17124706	T	A	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.324;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=335;ReadPosRankSum=0.061;SC=TGAATGGCTTTAATTCGCCAG;SOR=0.822;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=46;TCF=23;TCR=23;TR=19;WE=50848140;WS=50848122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr12	50856259	rs5798139	C	CA	446.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.37;MQRankSum=-1.048;QD=12.76;ReadPosRankSum=-1.116;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,26:0.74:35
chr12	51019633	rs34609458	TC	T	922.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=0;PP=606;SC=AACCATACATTCCCCCCCCCA;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=51019641;WS=51019623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	51034721	rs2731436	C	T	1426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=38;PP=1257;SC=TAATACTTGTCTTTTTTTTCC;SOR=3.516;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=44;WE=51034742;WS=51034711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	51034734	rs76110959	A	G	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=2.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.05;ReadPosRankSum=0.925;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,7:0.21:34
chr12	51076844	rs2731447	C	T	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=309;SC=ATAAATATTACATACTTAGAC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=51076852;WS=51076834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	51086931	rs2090852	T	C	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.19;ReadPosRankSum=0.676;SOR=0.064;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,9:0.19:47
chr12	51088979	rs34553264	T	G	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=448;ReadPosRankSum=0.424;SC=GCTAACAAAATACCAGCTCAA;SOR=0.359;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=55;TCR=0;TR=21;WE=51088987;WS=51088969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,22:0.39:56
chr12	51089287	rs2139930	G	T	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.150;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=392;ReadPosRankSum=-1.547;SC=TAGGTACCTTGCCTGTTCATC;SOR=0.042;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=93;TCF=6;TCR=87;TR=27;WE=51089295;WS=51089277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,28:0.28:101
chr12	51089572	rs2684890	G	A	2622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=3;PP=2153;SC=TTATTGTGGTGTATTACATAT;SOR=5.969;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=79;TCF=76;TCR=3;TR=79;WE=51089580;WS=51089562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr12	51089616	rs2684891	T	C	4560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=120;NR=16;PP=2965;SC=AACTTCATCCTTTTTGAATTT;SOR=4.009;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=120;TCR=16;TR=136;WE=51089624;WS=51089606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr12	51089734	rs11169524	T	A	2395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.589;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=60;PP=1788;ReadPosRankSum=-1.463;SC=TAATTGTGACTGATGGAGCTA;SOR=1.111;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=278;TCF=125;TCR=153;TR=99;WE=51089742;WS=51089724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,104:0.36:286
chr12	51121629	rs3832875	CA	C	959.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.778;NF=8;NR=30;PP=844;ReadPosRankSum=-2.034;SC=CCACATCTGCCAAAAAATAGA;SOR=0.677;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=25;TCR=96;TR=38;WE=51121637;WS=51121619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,49:0.35:141
chr12	51128832	rs3742062	A	G	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=467;ReadPosRankSum=-0.849;SC=AGCCCTATATATAGTAAATAC;SOR=0.606;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=35;TCR=50;TR=26;WE=51128840;WS=51128822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,26:0.30:88
chr12	51135167	rs1975351	A	G	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=7;PP=1109;SC=GTATATGTCCAAGCCACATTT;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=45;WE=51135175;WS=51135157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	51135275	rs1866422	T	C	2754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=50;PP=1929;SC=ACCACCCAATTGATATTGAGA;SOR=0.778;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=43;TCR=50;TR=93;WE=51135283;WS=51135265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr12	51138687	rs2280503	A	C	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=150;ReadPosRankSum=-0.781;SC=CCTCTGGCTAAGAGCAGGCTT;SOR=0.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=12;WE=51138695;WS=51138677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr12	51182122	rs10747592	C	T	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=197;ReadPosRankSum=-0.956;SC=TGTGCCATCACATCCGGCTAA;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=13;WE=51182130;WS=51182112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
chr12	51189619	rs3742065	T	C	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=166;ReadPosRankSum=0.149;SC=ATCATTTTTTTCTAAAAGTAA;SOR=0.839;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=11;WE=51189627;WS=51189609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr12	51203226	rs4986837	GT	G	392.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=466;SC=TAGAGTTCTGGTTTTTTTTAC;SOR=4.174;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=20;WE=51203234;WS=51203216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	51203371	rs1129406	C	T	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=3.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.05;ReadPosRankSum=-0.225;SOR=1.420;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,12:0.24:51
chr12	51203376	rs4986838	T	C	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=5.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.236;SOR=1.905;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,12:0.25:48
chr12	51207704	rs829112	A	G	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=171;ReadPosRankSum=0.349;SC=TACCTGTTTTAGTAAATAGTG;SOR=0.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=8;WE=51207712;WS=51207694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr12	51236931	rs829121	G	A	3313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=87;PP=2777;SC=GGCGCATGCAGAGGGCAGTAC;SOR=3.868;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=12;TCR=87;TR=99;WE=51236939;WS=51236921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr12	51237816	rs861204	G	A	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=523;ReadPosRankSum=0.359;SC=CACTAAAGACGCTAGGTACGT;SOR=0.843;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=27;WE=51237824;WS=51237806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr12	51279367	rs79213577	G	A	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=152;ReadPosRankSum=1.948;SC=TCATCAGTAGGCAGAATTTAC;SOR=0.527;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=8;WE=51279375;WS=51279357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
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chr12	51382232	rs161044	T	C	1685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.106;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=36;PP=1304;ReadPosRankSum=-0.258;SC=AAAGACAAAATATGGTCATCA;SOR=0.471;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=72;TCF=24;TCR=48;TR=55;WE=51382240;WS=51382222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,57:0.76:75
chr12	51386527	.	AAAG	A	296.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=1.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQRankSum=-0.794;QD=10.60;ReadPosRankSum=-1.258;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr12	51386839	rs224569	C	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=85;ReadPosRankSum=-1.242;SC=TGCTGTGCTGCGCACTGTGCC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=51386847;WS=51386829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr12	51386868	rs224570	T	C	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.35;ReadPosRankSum=1.036;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr12	51386872	rs1632791	C	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.94;ReadPosRankSum=1.150;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr12	51394038	.	T	C	1347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.518;ClippingRankSum=0.000;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.747;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=12;PP=1099;ReadPosRankSum=0.012;SC=TTTTTGTTTTTATCTCTGCTT;SOR=0.551;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=119;TCR=34;TR=53;WE=51394046;WS=51394028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,55:0.34:163
chr12	51399050	rs224589	T	G	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.497;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=8;PP=887;ReadPosRankSum=-1.169;SC=GATGTGAGAGTGTATTATGTG;SOR=1.942;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=62;TCF=44;TCR=18;TR=38;WE=51399058;WS=51399040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,40:0.63:63
chr12	51399997	rs224590	A	G	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.76;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=146;ReadPosRankSum=-2.093;SC=CAGGAGAATCACTTGAATGCG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=8;WE=51400005;WS=51399987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr12	51400084	rs140582579	AAAAC	A	268.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.349;NF=0;NR=7;PP=308;ReadPosRankSum=-1.501;SC=CTCCGTCTCAAAAACAAACAA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=7;WE=51400095;WS=51400074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr12	51402905	rs445520	T	G	3928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.960;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=45;PP=2962;ReadPosRankSum=0.997;SC=CTTACTCAAATAATCGACCGT;SOR=0.537;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=209;TCF=144;TCR=65;TR=137;WE=51402913;WS=51402895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,140:0.66:211
chr12	51404467	rs427020	C	T	1678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.638;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=10;PP=1346;ReadPosRankSum=0.949;SC=TAACACAAAGCGGTAAATTAC;SOR=1.508;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=104;TCF=84;TCR=20;TR=64;WE=51404475;WS=51404457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,64:0.60:106
chr12	51404679	rs370462	C	T	977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=33;PP=813;ReadPosRankSum=1.061;SC=AATTAGGTAACCTTGAAAATA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=33;WE=51404687;WS=51404669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,33:0.67:49
chr12	51453366	rs3190077	A	C	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5133;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=323;ReadPosRankSum=-0.445;SC=CATGGCACACATGTGGGAACT;SOR=1.292;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=13;WE=51453374;WS=51453356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr12	51461425	rs4768956	C	G	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=4;PP=706;SC=CCCTGGTGTACATATACTATC;SOR=3.180;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=25;WE=51461433;WS=51461415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	51461793	rs2029146	G	A	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.596;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=37;PP=1019;ReadPosRankSum=-1.176;SC=AGACATGAGCGGCATGCACCT;SOR=1.277;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=68;TCF=13;TCR=55;TR=43;WE=51461801;WS=51461783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,45:0.62:72
chr12	51467596	rs11169696	A	C	1584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=8;PP=1299;SC=ATCCCAGAACACTTAGGCACC;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=47;WE=51467604;WS=51467586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	51492509	rs2359189	G	A	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.514;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=299;ReadPosRankSum=-0.115;SC=TGCTCCATGCGCTGACAAATT;SOR=0.963;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=57;TCF=49;TCR=8;TR=19;WE=51492517;WS=51492499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr12	51497573	rs17125370	T	C	1389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.296;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=35;PP=1002;ReadPosRankSum=0.373;SC=GTTTTTTAGATAACCAAATAG;SOR=0.968;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=197;TCF=95;TCR=102;TR=62;WE=51497581;WS=51497563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,65:0.32:200
chr12	51502791	rs7134695	C	T	1090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=0;PP=911;SC=AGACTTTTTGCGTGTGTGTGA;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=51502799;WS=51502781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	51504799	rs7978782	T	C	4041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=97;PP=2965;SC=TTGAACAATTTTGAGGGCCAC;SOR=2.910;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=22;TCR=97;TR=119;WE=51504807;WS=51504789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr12	51504894	rs11308041	GT	G	596.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=357;ReadPosRankSum=-1.675;SC=AAATTTCTTTGTTTTTTTTTT;SOR=5.353;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=24;WE=51504902;WS=51504884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr12	51511244	rs10876138	G	A	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=0;PP=552;SC=TTCTATTTCTGCAGCTCTGAA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=51511252;WS=51511234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	51511269	rs59372312	A	G	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=67;ReadPosRankSum=-0.498;SC=TCATGTGAATACTGGGGCTTA;SOR=0.082;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=6;WE=51511277;WS=51511259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
chr12	51512637	rs3839987	CT	C	1674.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=44;PP=1745;SC=AACTGCAATGCTTTGGAAAGC;SOR=7.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=44;WE=51512645;WS=51512627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	51565892	rs11169734	T	C	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=2;PP=366;SC=AGGCTTCATATCGCCTACAAT;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=51565900;WS=51565882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	51632507	rs7979728	G	A	1296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=2;PP=1062;ReadPosRankSum=0.668;SC=GCGGGACCGCGCGGACCCTCC;SOR=3.816;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=41;WE=51632515;WS=51632497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr12	51636259	rs1049467	C	T	1014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=25;PP=809;SC=AAGGCCACCTCTGTGCCGGGA;SOR=3.407;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=51636267;WS=51636249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	51663215	rs2114876	T	C	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.23;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	51681846	rs4611251	C	T	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=6;PP=685;SC=TTTTAATGTACAAAAAAATAG;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=51681854;WS=51681836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	51681903	rs7954976	T	C	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=8;PP=1171;SC=TCCGAGGAGTTAGCTGAGATA;SOR=2.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=44;WE=51681911;WS=51681893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	51685831	rs3210837	T	C	4322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=72;PP=2965;SC=ACTTGGCCCTTTCAGTGGTAG;SOR=1.117;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=50;TCR=72;TR=122;WE=51685839;WS=51685821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr12	51686204	rs7306505	T	C	3084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=90;PP=2282;SC=TTACGATGCATGTAATAAAAA;SOR=3.026;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=19;TCR=90;TR=109;WE=51686212;WS=51686194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr12	51686285	rs7135343	A	T	904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=739;SC=GTGAAATGAAAAAAGGCCAAA;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=51686293;WS=51686275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	51691149	rs3782469	A	G	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.377;NF=1;NR=18;PP=360;ReadPosRankSum=0.189;SC=TCAGGAGATCAAGACCATCCT;SOR=0.058;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=57;TCF=1;TCR=56;TR=19;WE=51691157;WS=51691139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr12	51693357	rs2288368	G	A	2398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=22;PP=2016;ReadPosRankSum=-0.882;SC=GAACAGGAAGGGTTTACCAGT;SOR=0.823;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=51;TCR=22;TR=72;WE=51693365;WS=51693347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr12	51693632	rs60046549	G	GT	490.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=404;SC=TTTTGCTTTTGTTTTTTTTGA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=18;WE=51693640;WS=51693622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	51707801	rs138541026	CTTAT	C	108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.967;NF=0;NR=4;PP=129;ReadPosRankSum=1.282;SC=AAGGGCTGTACTTATTTATTT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=4;WE=51707812;WS=51707791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr12	51722311	rs7138439	C	T	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=6;PP=886;ReadPosRankSum=0.041;SC=GCAAGTCCTACTGCAGATCTA;SOR=0.861;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=65;TCF=55;TCR=10;TR=41;WE=51722319;WS=51722301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,41:0.62:66
chr12	51723598	rs17860363	A	AG	680.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=2.302;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.788;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,35:0.28:126
chr12	51723727	rs12831721	A	G	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=99;ReadPosRankSum=-1.222;SC=TAAAGCTCCAATGCAAATCTC;SOR=0.165;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=8;WE=51723735;WS=51723717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr12	51733951	rs12816187	A	C	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=184;ReadPosRankSum=-2.399;SC=TTCTCTCTTTATATGGCCGCA;SOR=0.242;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=10;WE=51733959;WS=51733941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr12	51735022	rs934089	A	T	1542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=23;PP=1227;ReadPosRankSum=-0.089;SC=AATGTAGGCAACTTACTCTTG;SOR=0.644;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=91;TCF=58;TCR=33;TR=58;WE=51735030;WS=51735012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,58:0.64:91
chr12	51737520	rs17860301	G	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.372;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=49;ReadPosRankSum=1.448;SC=AGGAAAGCTTGTCTTTGTTTT;SOR=0.093;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=5;WE=51737528;WS=51737510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr12	51737562	rs17860300	T	C	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=71;ReadPosRankSum=-1.116;SC=GCAGCTGTCATCACCCAGTTC;SOR=0.412;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=16;TCF=9;TCR=7;TR=6;WE=51737570;WS=51737552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr12	51739471	rs12582273	T	C	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=107;ReadPosRankSum=-0.030;SC=ACCTAGACAATTGGAGAGCTG;SOR=0.551;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=9;WE=51739479;WS=51739461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,12:0.29:42
chr12	51740387	rs57614420	ACTGG	A	871.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=1.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.81;ReadPosRankSum=1.647;SOR=0.881;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,27:0.27:99
chr12	51740388	rs907354	C	A	1840.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.869;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=29;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.549;SC=AGGGTTGCGACTGGACCATAT;SOR=0.612;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=75;TCF=39;TCR=36;TR=65;WE=51740407;WS=51740377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,69:0.72:96
chr12	51740393	.	CCATATCCACTT	C	843.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.839;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.89;ReadPosRankSum=1.670;SOR=0.865;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,27:0.25:107
chr12	51740407	.	CATAA	C	846.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.000;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.06;ReadPosRankSum=1.762;SOR=0.819;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,26:0.25:105
chr12	51740415	.	A	AAG	943.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.246;ClippingRankSum=0.000;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.07;ReadPosRankSum=0.348;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,28:0.27:104
chr12	51740416	.	C	CG	949.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.813;ClippingRankSum=0.000;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.13;ReadPosRankSum=0.143;SOR=0.872;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,28:0.27:104
chr12	51748326	rs2288369	G	A	2193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=42;PP=1723;SC=ACCTCTTAACGGTGCTACCAG;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=28;TCR=42;TR=70;WE=51748334;WS=51748316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr12	51748395	rs7971653	G	A	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=32;PP=1009;SC=GGCACAAAGAGGACACTTCCC;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=51748403;WS=51748385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	51752897	rs907347	G	A	3115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=34;PP=2298;SC=AAACCTCTCCGAGAACCATTT;SOR=1.449;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=57;TCR=34;TR=91;WE=51752905;WS=51752887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr12	51796904	rs907350	T	C	2216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=12;PP=1812;SC=GTAATAGGTATAAACTGCTCA;SOR=2.932;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=56;TCR=12;TR=68;WE=51796912;WS=51796894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr12	51863643	rs4491281	T	C	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=28;PP=678;SC=CCAGGTCCACTGTGGGGGAAA;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=51863651;WS=51863633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	51879826	rs10783445	G	T	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=349;SC=ACCTTGTCATGTAGAAAAGCA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=51879834;WS=51879816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	52080965	rs4761829	C	T	7699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=146;NR=90;PP=2965;SC=TTTTACGGGACCCATGGAACT;SOR=1.235;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=236;TCF=146;TCR=90;TR=236;WE=52080973;WS=52080955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr12	52099153	rs2291265	C	T	6133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=144;NR=43;PP=2965;SC=GTTTTCAGCCCGGTTCATTTG;SOR=2.392;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=144;TCR=43;TR=187;WE=52099161;WS=52099143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr12	52100566	rs10783474	G	A	1709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=49;PP=1400;SC=ATGTGTATATGTATATTATAC;SOR=6.518;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=50;WE=52100574;WS=52100556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	52156255	rs303767	A	C	4214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=102;NR=22;PP=2965;SC=TCTACTATTTATTTTTCTTAC;SOR=3.102;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=103;TCR=22;TR=124;WE=52156263;WS=52156245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr12	52159438	rs56879517	G	GT	1129.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=3.715;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.06;MQRankSum=0.415;QD=24.56;ReadPosRankSum=0.162;SOR=2.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,44:0.96:46
chr12	52163789	rs303808	G	A	763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=19;PP=609;SC=GATGAGGAGCGGATGGGCTGG;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=52163797;WS=52163779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	52173781	rs76315468	G	GTTC	817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=680;SC=TGGAGCCACAGTTCTTGGGAA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=14;WE=52173789;WS=52173771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	52184271	rs303815	T	C	2264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=37;PP=1688;SC=CACAGAAACCTATTCCCCGCC;SOR=0.747;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=33;TCR=37;TR=70;WE=52184279;WS=52184261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	52200028	rs303828	C	A	1195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=2;PP=936;SC=GGGTGTCTCCCATCTCAATAA;SOR=4.351;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=34;WE=52200036;WS=52200018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	52200742	rs60637	C	A	7513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=109;NR=121;PP=2965;SC=TGCCCAAGCCCAATACCATTG;SOR=0.791;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=230;TCF=109;TCR=121;TR=230;WE=52200750;WS=52200732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr12	52204246	rs172559	T	C	4658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=108;PP=2965;SC=TAAGTGGCAATGCTTTGCCAA;SOR=1.810;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=153;TCF=45;TCR=108;TR=153;WE=52204254;WS=52204236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr12	52215102	rs303819	T	G	2818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=45;PP=2244;SC=CCTTTGGGAGTCTCCCCCGAC;SOR=0.757;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=48;TCR=45;TR=93;WE=52215110;WS=52215092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr12	52225626	rs73107290	A	T	253.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.375;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=583;ReadPosRankSum=-0.757;SC=AAAAGCCCAAAATATATATAC;SOR=0.092;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=17;WE=52225646;WS=52225616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr12	52225638	rs633370	T	A	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.736;HP=4;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=583;ReadPosRankSum=0.000;SC=TATATATACATTTTTGAGACA;SOR=0.209;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=17;WE=52225646;WS=52225616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr12	52281920	rs697633	G	A	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.137;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=2;PP=1068;ReadPosRankSum=0.451;SC=TGGGGCCCCAGTCCCAGCTGC;SOR=1.727;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=64;TCF=59;TCR=5;TR=43;WE=52281928;WS=52281910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,45:0.67:67
chr12	52282060	rs697634	C	T	4009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.234;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=50;PP=2962;ReadPosRankSum=0.875;SC=TTGTGCTCCGCGGAGCCTGGG;SOR=1.073;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=215;TCF=135;TCR=80;TR=145;WE=52282068;WS=52282050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,148:0.68:219
chr12	52282748	rs697635	G	A	2266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.548;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=31;PP=1679;ReadPosRankSum=-0.077;SC=GGGTCTTCACGGGGTTTGGGG;SOR=1.010;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=116;TCF=69;TCR=47;TR=79;WE=52282756;WS=52282738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,84:0.68:123
chr12	52282873	rs697636	A	T	2268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.541;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=45;PP=1671;ReadPosRankSum=-0.607;SC=GTCGCATGCTACCACGGCTTC;SOR=0.860;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=116;TCF=50;TCR=66;TR=78;WE=52282881;WS=52282863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,85:0.69:124
chr12	52283302	rs4762026	C	T	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=518;ReadPosRankSum=-0.399;SC=GGCAGGTGTGCGGGGCCTGGA;SOR=0.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=26;WE=52283310;WS=52283292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr12	52284233	rs706832	T	C	5976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=141;NR=37;PP=2965;SC=CTGGCCTCCCTGATTCCACCT;SOR=2.641;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=141;TCR=37;TR=178;WE=52284241;WS=52284223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr12	52284274	rs7303111	G	A	4872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.290;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=66;PP=2962;ReadPosRankSum=0.195;SC=GGCTTCGAATGTAACCCACAT;SOR=0.408;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=275;TCF=181;TCR=94;TR=180;WE=52284282;WS=52284264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,188:0.66:285
chr12	52284483	rs7303030	A	G	5579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.905;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=80;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.936;SC=GGCGGCCCCAAGTGGAGCAGC;SOR=0.766;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=308;TCF=182;TCR=126;TR=199;WE=52284491;WS=52284473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,204:0.65:316
chr12	52284500	rs34494292	A	G	2391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.403;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=45;PP=1867;ReadPosRankSum=-0.106;SC=CAGCTTAGCCAGCACTACAAG;SOR=0.608;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=315;TCF=189;TCR=126;TR=110;WE=52284508;WS=52284490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,114:0.35:324
chr12	52284668	rs12368048	C	A	4554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.470;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=96;PP=2962;ReadPosRankSum=1.365;SC=ACTGCCACAACCAGCCTGGCC;SOR=0.638;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=260;TCF=103;TCR=157;TR=161;WE=52284676;WS=52284658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,168:0.63:268
chr12	52285086	rs3180417	G	A	702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.100;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=28;PP=519;ReadPosRankSum=-0.951;SC=TGGCACAGAAGTAGGGGAAGA;SOR=1.636;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=111;TCF=29;TCR=82;TR=34;WE=52285094;WS=52285076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,34:0.30:115
chr12	52307145	rs2071218	C	T	1996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=51;PP=1516;ReadPosRankSum=0.291;SC=GTACGTCCAGCTGCCCTAGCA;SOR=0.758;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=126;TCF=44;TCR=82;TR=79;WE=52307153;WS=52307135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,79:0.62:128
chr12	52307308	rs2071219	A	G	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.025;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.081;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=3;PP=127;ReadPosRankSum=-1.081;SC=GAGCTGACCTAGTGGAAGCTG;SOR=0.991;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=8;WE=52307316;WS=52307304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr12	52345497	rs10540557	TGCG	T	1349.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQ=60.28;NF=19;NR=9;PP=1270;SC=GCTGCTGGGCTGCGGCGGCGG;SOR=1.609;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=28;WE=52345507;WS=52345487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	52369300	rs2242106	C	T	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.23;ReadPosRankSum=-1.783;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,41:0.27:153
chr12	52369956	rs3214829	G	GA	90.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=72;ReadPosRankSum=-1.489;SC=CATCTAGGCAGCAAGACTAGC;SOR=0.061;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=3;WE=52369964;WS=52369946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr12	52381026	rs2252518	C	A	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=375;ReadPosRankSum=1.298;SC=CCCCGGTGCGCATAGCACGGG;SOR=0.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=18;WE=52381034;WS=52381016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr12	52404618	rs1298913	T	G	1620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=6;PP=1323;SC=CTATGGGACTTCTACACCTTT;SOR=3.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=45;WE=52404626;WS=52404608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	52405021	rs185268019	C	T	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=440;ReadPosRankSum=1.301;SC=ATCAATTCCTCTTCCTTTTCC;SOR=0.676;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=7;TCR=44;TR=22;WE=52405029;WS=52405011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
chr12	52408422	rs1283166	A	G	64.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	52435691	rs7316491	G	A	2919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.236;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=65;PP=2269;ReadPosRankSum=-0.010;SC=GGTTGGCCAAGGCCTGTTGGT;SOR=0.453;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=150;TCF=49;TCR=101;TR=100;WE=52435699;WS=52435681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,105:0.66:159
chr12	52449681	.	G	A	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=27;ReadPosRankSum=0.842;SC=CCACCCAAATGTTAGAAAAAT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=52449689;WS=52449672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr12	52470531	rs199948446	C	CA	332.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=1.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.44;ReadPosRankSum=-1.385;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,16:0.21:75
chr12	52565322	rs3741737	G	T	2754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.746;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=47;PP=2061;ReadPosRankSum=1.187;SC=GGGAACATAAGGGGTAGGGGA;SOR=0.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=65;TCR=65;TR=95;WE=52565330;WS=52565312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,101:0.75:134
chr12	52566047	rs3741736	G	A	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=745;ReadPosRankSum=-1.784;SC=CCAGCTTGACGTTCATCAGCT;SOR=0.846;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=32;WE=52566055;WS=52566037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,34:0.68:50
chr12	52574780	rs4762060	A	G	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=33;PP=949;SC=TCAGCTGGATATGGTGGGGGC;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=34;WE=52574788;WS=52574770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	52627215	rs7308888	A	G	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.45;ReadPosRankSum=0.832;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,8:0.19:42
chr12	52631313	rs6580870	A	G	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.348;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=15;PP=730;ReadPosRankSum=2.429;SC=GAAATTAACCACCGCACAGCT;SOR=1.137;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=153;TCF=97;TCR=56;TR=51;WE=52631321;WS=52631303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,51:0.34:150
chr12	52631394	rs10637094	C	CAT	957.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=4.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.72;ReadPosRankSum=0.699;SOR=1.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,31:0.25:124
chr12	52631510	.	A	ATG	93.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=-0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=0.524;QD=9.37;ReadPosRankSum=-0.930;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr12	52635241	rs2078201	G	A	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.186;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=419;ReadPosRankSum=2.390;SC=CTGATGTCCCGTCTGGTCCCT;SOR=2.226;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=20;WE=52635249;WS=52635239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr12	52635443	rs2243588	T	C	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.455;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=39;PP=1043;ReadPosRankSum=1.604;SC=CAGGGGCGTATTTCCTCCTGC;SOR=1.476;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=111;TCF=25;TCR=86;TR=47;WE=52635451;WS=52635433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,52:0.44:117
chr12	52639302	rs2608009	G	C	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=361;ReadPosRankSum=0.571;SC=CTGCAGCGGGGCAAGCAGGAT;SOR=0.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=73;TCF=25;TCR=48;TR=24;WE=52639310;WS=52639292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,24:0.32:76
chr12	52641926	.	AAG	A	2148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.753;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.249;NF=20;NR=22;PP=1737;ReadPosRankSum=-0.010;SC=CACGCTAGGAAAGAGCCGTCC;SOR=0.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=38;TCR=42;TR=42;WE=52641935;WS=52641916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,57:0.57:100
chr12	52647197	rs11612499	A	T	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.76;ReadPosRankSum=-0.920;SOR=0.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,30:0.25:119
chr12	52649887	rs2168762	T	C	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.783;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.783;NF=10;NR=57;PP=1035;ReadPosRankSum=0.398;SC=CTCCCACTGTTGGCTTCCATG;SOR=0.807;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=176;TCF=28;TCR=148;TR=67;WE=52649895;WS=52649877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,66:0.37:177
chr12	52649954	rs2242139	T	C	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=440;ReadPosRankSum=-1.402;SC=AGGTTGCTCTTGCAGCACTCA;SOR=0.571;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=76;TCF=14;TCR=62;TR=28;WE=52649962;WS=52649944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,29:0.36:81
chr12	52660904	rs2857686	C	T	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=446;ReadPosRankSum=-0.930;SC=GACTTATGGCCTAACCTTTGT;SOR=0.584;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=92;TCF=18;TCR=74;TR=26;WE=52660912;WS=52660894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,25:0.27:92
chr12	52661192	rs1870222	A	G	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=423;ReadPosRankSum=0.200;SC=CCTTAGCGATAACCGCTGCAA;SOR=0.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=28;TCR=70;TR=28;WE=52661200;WS=52661182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,30:0.30:101
chr12	52661209	rs1870223	T	C	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=267;ReadPosRankSum=-1.086;SC=GCAAGCTGGTTGAGCTGGAGG;SOR=0.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=90;TCF=25;TCR=65;TR=25;WE=52661217;WS=52661199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,27:0.29:94
chr12	52661302	rs1870224	C	A	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.783;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=84;ReadPosRankSum=0.603;SC=CTTCTTGCCACCTTCTAGATG;SOR=0.120;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=10;WE=52661310;WS=52661292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,10:0.24:41
chr12	52679937	rs3660	C	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.180;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
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chr12	52681157	rs138190669	A	G	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=429;ReadPosRankSum=0.179;SC=GGTCTCTCTGATGCTCATCCA;SOR=0.665;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=21;WE=52681165;WS=52681147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr12	52681416	rs7300801	T	C	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.799;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-8.797;NF=25;NR=13;PP=804;ReadPosRankSum=-0.566;SC=CCGTCAGCCTTTGGATCATGC;SOR=0.414;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=129;TCF=89;TCR=40;TR=38;WE=52681424;WS=52681406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,36:0.28:129
chr12	52681437	rs3187034	A	G	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=4.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.07;MQRankSum=-9.222;QD=4.53;ReadPosRankSum=0.132;SOR=0.350;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,37:0.25:146
chr12	52681533	rs7300941	T	C	1511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=21.669;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.673;NF=36;NR=33;PP=1260;ReadPosRankSum=0.766;SC=GCTCATGAGGTTCAGGGTGGG;SOR=0.524;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=200;TCF=79;TCR=121;TR=69;WE=52681541;WS=52681523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,68:0.33:205
chr12	52681714	rs6580872	T	C	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.188;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.149;NF=25;NR=18;PP=936;ReadPosRankSum=-0.651;SC=TTAATAGATATCTCACATCCC;SOR=0.212;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=91;TCF=62;TCR=29;TR=43;WE=52681722;WS=52681704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,44:0.47:93
chr12	52681733	rs7954186	A	C	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.087;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.733;NF=30;NR=14;PP=970;ReadPosRankSum=0.454;SC=CCTCCCACTGACACGTCTAGC;SOR=0.388;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=101;TCF=74;TCR=27;TR=44;WE=52681741;WS=52681723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,43:0.43:100
chr12	52681925	rs6580873	A	C	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.450;NF=7;NR=21;PP=287;ReadPosRankSum=-1.974;SC=CTGGAGAATGAGGATCTCCTG;SOR=0.533;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=99;TCF=20;TCR=79;TR=28;WE=52681933;WS=52681915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,28:0.28:101
chr12	52681968	rs6580874	T	C	1759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=51;PP=1592;SC=TAGTTGAGAATACAGCCCCAC;SOR=5.630;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=3;TCR=51;TR=54;WE=52681976;WS=52681958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr12	52695630	rs1894033	C	T	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.519;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=9;PP=800;ReadPosRankSum=-1.219;SC=GAACGCCTGACGCCCCGACCA;SOR=0.106;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=142;TCF=127;TCR=15;TR=48;WE=52695638;WS=52695620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,51:0.34:150
chr12	52695754	rs74651927	C	T	1320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.138;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.352;NF=15;NR=43;PP=968;ReadPosRankSum=-0.122;SC=TCTCGGCCTGCGGGCCCCGGC;SOR=0.325;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=170;TCF=37;TCR=133;TR=58;WE=52695762;WS=52695744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,60:0.34:174
chr12	52695787	rs112261068	C	T	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=7.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.411;NF=3;NR=33;PP=697;ReadPosRankSum=-0.554;SC=GCATCACCGCCGCCCCCTACC;SOR=0.714;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=100;TCF=10;TCR=90;TR=36;WE=52695795;WS=52695777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,37:0.36:102
chr12	52698799	.	G	T	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.727;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=171;ReadPosRankSum=-1.277;SC=TCCTGAGGCGGCTGTATGAGG;SOR=0.065;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=12;WE=52698807;WS=52698789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr12	52699548	rs2032360	T	C	2663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.359;NF=33;NR=90;PP=2295;ReadPosRankSum=0.390;SC=GGCTGACGGCTGAGGTGGAGA;SOR=0.661;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=175;TCF=46;TCR=129;TR=123;WE=52699556;WS=52699538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,109:0.67:162
chr12	52700100	rs11612715	C	A	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.368;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=37;ReadPosRankSum=-0.187;SC=CCCAGCCCTGCCAGGGTTCTC;SOR=2.964;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=4;WE=52700108;WS=52700090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr12	52708420	rs2857671	G	A	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=389;SC=GCCACTTAATGCCTCCCCTGG;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=52708428;WS=52708410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	52708565	rs2857670	A	G	1080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=16;PP=823;SC=ACACGCAGAGATCCCCGCACA;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=17;TCR=16;TR=33;WE=52708573;WS=52708555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	52708730	rs113407094	A	AGGTGT	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=159;SC=TCTATTCTGAAGGAGGGAACC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=52708738;WS=52708720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	52708978	rs3825221	T	C	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=622;SC=GACCAACCTATCCTCTTTACT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=52708986;WS=52708968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	52709032	rs3741721	T	C	1577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=5;PP=1277;SC=TCTGCATATATTCATAGTCAA;SOR=4.003;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=47;WE=52709040;WS=52709022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	52709222	rs3741720	T	C	1229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.771;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=36;PP=1660;ReadPosRankSum=0.376;SC=ATCTCAGGGCTATTTCTGACC;SOR=1.257;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=51;TCF=7;TCR=44;TR=41;WE=52709237;WS=52709212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,42:0.79:53
chr12	52709229	rs3741719	G	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.11;ReadPosRankSum=-0.381;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,9:0.20:45
chr12	52709880	rs2852468	A	G	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=1.342;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.20;MQRankSum=-4.383;QD=11.73;ReadPosRankSum=0.583;SOR=1.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr12	52709883	rs2248473	T	C	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQRankSum=-4.083;QD=10.74;ReadPosRankSum=0.747;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr12	52709981	rs2270266	C	A	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=253;ReadPosRankSum=0.302;SC=GATCATTCAACTTCTATCTTA;SOR=0.693;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=11;WE=52709989;WS=52709971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr12	52710246	rs2270267	T	C	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.168;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.975;NF=25;NR=1;PP=484;ReadPosRankSum=-1.428;SC=GGCCGGGCTCTGGTACCTGGC;SOR=2.165;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=70;TCF=62;TCR=8;TR=26;WE=52710254;WS=52710236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,25:0.37:67
chr12	52710309	rs2257286	G	A	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=6.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.741;NF=37;NR=13;PP=963;ReadPosRankSum=1.522;SC=GGTTCAGCTCGTTGATCTCCT;SOR=0.660;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=138;TCF=104;TCR=34;TR=50;WE=52710317;WS=52710299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,52:0.37:141
chr12	52710715	rs2857669	G	A	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=0.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=0.492;QD=9.99;ReadPosRankSum=-0.448;SOR=0.686;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,45:0.29:154
chr12	52710721	rs2852464	G	C	1517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=1.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=-0.130;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.333;SOR=0.853;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,46:0.30:153
chr12	52710897	rs2852463	TG	CA	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.922;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=1294;ReadPosRankSum=0.531;SC=TCATCGGGAGTGAACTTCTCA;SOR=0.512;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=97;TCF=23;TCR=74;TR=27;WE=52710906;WS=52710887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,33:0.32:104
chr12	52710913	rs2852462	A	G	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.171;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=517;ReadPosRankSum=-0.639;SC=TCTCATGTTTAGAGAAACAAA;SOR=0.943;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=77;TCF=14;TCR=63;TR=25;WE=52710921;WS=52710903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,27:0.33:83
chr12	52711450	rs2248619	T	C	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=0;PP=198;SC=CCCACCATGGTTGAGAGCCCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=52711458;WS=52711440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	52711549	rs2857667	G	A	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.011;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.030;NF=11;NR=5;PP=194;ReadPosRankSum=-2.125;SC=GGAGGTAGGCGCAGTCCACAT;SOR=0.136;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=16;WE=52711557;WS=52711539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr12	52711624	rs2857666	C	T	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.371;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=202;ReadPosRankSum=1.134;SC=ACCTGGCTGCCATGTGGCAGG;SOR=0.144;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=14;WE=52711632;WS=52711614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,14:0.27:51
chr12	52711776	rs2852459	G	A	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.383;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=312;ReadPosRankSum=-0.695;SC=AGGGAGAACAGGACCTTGTCT;SOR=0.397;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=77;TCF=21;TCR=56;TR=21;WE=52711784;WS=52711766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,22:0.28:78
chr12	52712975	rs3741715	G	A	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=11;PP=913;SC=CCTGCACGTGGTTGAGCTCTG;SOR=1.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=35;WE=52712983;WS=52712965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	52713218	rs10876276	C	T	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=488;ReadPosRankSum=-0.153;SC=GTTCCCAGCACGAGGGCCTGA;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=24;WE=52713226;WS=52713208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr12	52755097	rs1791627	A	T	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=606;ReadPosRankSum=1.389;SC=CACTCAGCTCAGCTTTCTCTA;SOR=1.151;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=25;WE=52755105;WS=52755087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr12	52755341	rs2298796	T	C	2336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-7.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.739;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=73;PP=1707;ReadPosRankSum=-0.474;SC=TTGAGACTGATGGTTGCTTGG;SOR=0.519;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=137;TCF=28;TCR=109;TR=93;WE=52755349;WS=52755331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,98:0.66:149
chr12	52756590	rs115376435	T	C	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.869;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=549;ReadPosRankSum=1.312;SC=TAGGGCCAGGTGCTGCAGCCT;SOR=1.196;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=71;TCF=61;TCR=10;TR=27;WE=52756598;WS=52756580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,29:0.38:76
chr12	52758228	rs17657396	C	T	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=5.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.254;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=27;PP=617;ReadPosRankSum=-0.742;SC=CAAGTTCTTCCGGGGATTGAA;SOR=0.300;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=71;TCF=7;TCR=64;TR=31;WE=52758236;WS=52758218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,32:0.38:84
chr12	52758994	rs2298795	G	C	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.353;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=388;ReadPosRankSum=-0.041;SC=AGGGAGCCTGGGGGGAGGCAC;SOR=1.035;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=26;WE=52759002;WS=52758984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr12	52760949	.	C	G	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQRankSum=-1.624;QD=13.39;ReadPosRankSum=-1.000;SOR=0.385;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr12	52760957	rs61630004	C	T	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.70;MQRankSum=-1.322;QD=12.85;ReadPosRankSum=-0.900;SOR=0.443;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr12	52771728	rs17714415	G	A	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=5.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.52;ReadPosRankSum=-0.448;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,6:0.18:34
chr12	52773702	rs1791611	G	A	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FS=5.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.93;ReadPosRankSum=0.555;SOR=0.935;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,58:0.27:213
chr12	52773774	rs1791661	T	C	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.781;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=27;PP=466;ReadPosRankSum=-1.591;SC=CTTTCTTGTTTGAGTAGATCT;SOR=0.593;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=133;TCF=36;TCR=97;TR=38;WE=52773782;WS=52773764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,40:0.29:140
chr12	52774158	rs951772	G	A	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.594;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=230;ReadPosRankSum=-1.333;SC=GGCTCTCCTCGCCCTCCAGCA;SOR=0.405;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=15;WE=52774166;WS=52774148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr12	52774235	rs951773	A	G	2894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=34;PP=2192;ReadPosRankSum=-0.875;SC=TGGTACTCGCACAGCTGCCGC;SOR=0.665;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=103;TCF=69;TCR=34;TR=101;WE=52774243;WS=52774225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,104:0.99:105
chr12	52774305	rs1732293	A	G	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.702;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=31;PP=816;ReadPosRankSum=0.531;SC=TGCATTTGGCATCACTGAGGG;SOR=0.832;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=114;TCF=46;TCR=68;TR=51;WE=52774313;WS=52774295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,52:0.44:119
chr12	52774370	rs1791657	G	A	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.601;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=524;ReadPosRankSum=-0.186;SC=TTGGCACGCTGCAGGGAAGGC;SOR=0.343;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=57;TCF=6;TCR=51;TR=27;WE=52774378;WS=52774360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,27:0.46:59
chr12	52774993	rs883712	C	G	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=32;PP=900;ReadPosRankSum=0.566;SC=CTTCATACTGCGGAGAGAGGA;SOR=0.664;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=121;TCF=40;TCR=81;TR=47;WE=52775001;WS=52774983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,47:0.39:120
chr12	52775034	rs1791652	G	A	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.935;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=523;ReadPosRankSum=-0.347;SC=GGTCAGGTCAGGATCACAGCC;SOR=0.942;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=97;TCF=30;TCR=67;TR=30;WE=52775042;WS=52775024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,30:0.31:98
chr12	52775062	rs883709	T	C	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.438;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=528;ReadPosRankSum=-0.131;SC=AGTTGGGGGCTTCAAACCTCC;SOR=1.259;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=88;TCF=39;TCR=49;TR=27;WE=52775070;WS=52775052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,27:0.29:92
chr12	52775395	rs883710	C	T	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=257;ReadPosRankSum=-2.228;SC=GGAAGTGGTGCCAGGGGCAGA;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=1;TCR=53;TR=15;WE=52775403;WS=52775385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,17:0.30:56
chr12	52775411	rs949386	T	C	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=177;ReadPosRankSum=-0.210;SC=GCAGAGAGCATCACTCATTGG;SOR=0.162;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=11;WE=52775419;WS=52775401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,12:0.29:42
chr12	52775431	rs2271084	A	G	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=572;ReadPosRankSum=-0.785;SC=GTTCATAAAAAAGCAAGACCA;SOR=1.675;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=23;WE=52775439;WS=52775421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
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chr12	52776679	rs1732297	A	G	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=2;PP=376;SC=CACTGTCTTGATGTGAGTAGT;SOR=3.258;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=52776687;WS=52776674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	52776895	rs1732298	G	A	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=459;ReadPosRankSum=-0.254;SC=TGAACTGAGAGGCAGTTACTC;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=22;TCR=47;TR=25;WE=52776903;WS=52776885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,26:0.33:78
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chr12	52777439	rs1614888	A	G	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=39;ReadPosRankSum=-1.199;SC=GGGCCTGATCACTGACCAGCA;SOR=1.002;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=6;WE=52777447;WS=52777429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr12	52777502	rs1945297	A	G	1816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=20;PP=1434;ReadPosRankSum=1.069;SC=GTGGCTCCAGATTGCTCCTGA;SOR=0.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=59;WE=52777521;WS=52777492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,59:0.98:60
chr12	52777513	rs2245203	T	C	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=149;ReadPosRankSum=0.880;SC=TTGCTCCTGATACATTTCTGC;SOR=0.705;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=58;TCF=38;TCR=20;TR=15;WE=52777521;WS=52777492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,15:0.26:58
chr12	52777578	rs1613931	C	T	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.15;ReadPosRankSum=0.982;SOR=1.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,8:0.15:53
chr12	52777580	rs1613929	A	C	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.21;ReadPosRankSum=1.168;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,8:0.15:52
chr12	52777606	rs1613859	G	A	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=118;ReadPosRankSum=0.773;SC=GCACAGAAATGGCATTTGAAG;SOR=0.956;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=10;WE=52777614;WS=52777596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,9:0.19:48
chr12	52778772	rs1732303	C	T	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=449;SC=AGCACTCTAGCGCATTTTGGC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=52778780;WS=52778762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	52778947	rs1791631	A	G	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.843;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=487;ReadPosRankSum=0.031;SC=TCTTGTTCACAGTCACAGCTG;SOR=0.555;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=94;TCF=64;TCR=30;TR=32;WE=52778955;WS=52778937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,35:0.35:99
chr12	52779244	rs1732304	A	G	1357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.883;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=39;PP=1054;ReadPosRankSum=1.020;SC=CCCGGAATCCAGGCCCACTCC;SOR=0.552;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=208;TCF=78;TCR=130;TR=65;WE=52779252;WS=52779234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,67:0.31:214
chr12	52779391	rs1732305	A	G	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=231;ReadPosRankSum=1.900;SC=GGTTGGGAGCAAAAGAGCAAG;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=12;WE=52779399;WS=52779381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr12	52788945	rs1732263	C	G	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.173;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=396;ReadPosRankSum=-0.433;SC=CCCCACATGGCTCGTACAGGA;SOR=1.017;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=78;TCF=23;TCR=55;TR=25;WE=52788953;WS=52788935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,25:0.29:86
chr12	52789509	rs1732264	T	C	1563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=6;PP=1274;SC=CCCCCAAGACTCCAGAGCCAG;SOR=3.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=41;TCR=6;TR=47;WE=52789517;WS=52789499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	52789597	rs1732265	A	G	4157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.77;SOR=0.848;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr12	52789605	rs1732266	T	A	4063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.66;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr12	52789691	rs34479712	A	C	1522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.864;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=28;PP=2077;ReadPosRankSum=1.029;SC=TTTTCAATGAATGTGGGTAGG;SOR=1.588;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=37;WE=52789701;WS=52789681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,39:0.71:55
chr12	52789693	rs11304728	GT	G	1513.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.344;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=27;PP=2220;ReadPosRankSum=1.359;SC=TTCAATGAATGTGGGTAGGGG;SOR=1.901;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=34;WE=52789701;WS=52789681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,36:0.69:52
chr12	52790029	rs114152116	C	T	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.583;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=476;ReadPosRankSum=0.103;SC=GTGGGAGGGGCGCAGAAAAGC;SOR=0.351;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=80;TCF=20;TCR=60;TR=34;WE=52790037;WS=52790019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,33:0.42:79
chr12	52790868	rs17715689	T	A	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.109;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=37;PP=811;ReadPosRankSum=-0.538;SC=CTGTTCCCAGTCTTTTCTCCC;SOR=0.876;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=164;TCF=55;TCR=109;TR=54;WE=52790876;WS=52790858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,56:0.32:177
chr12	52790899	rs1791635	T	C	4698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=108;PP=2965;SC=AGTTCAGGTGTTCTCTGGTTC;SOR=2.784;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=25;TCR=108;TR=133;WE=52790907;WS=52790889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr12	52818504	rs298104	T	G	2892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-7.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.684;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=54;PP=2158;ReadPosRankSum=-0.104;SC=CTGCTGCCGCTTCCATAGCCA;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=152;TCF=80;TCR=72;TR=115;WE=52818512;WS=52818494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,116:0.75:155
chr12	52822258	rs401926	A	G	2741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.925;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=42;PP=2102;ReadPosRankSum=-0.345;SC=GCAAGCTGGAACACTGTAAGG;SOR=0.491;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=82;TCR=67;TR=92;WE=52822266;WS=52822248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,98:0.63:156
chr12	52824352	rs395623	G	A	2304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=29;PP=1795;ReadPosRankSum=1.509;SC=ACTCAGCCTCGGCCCGGCTGC;SOR=0.759;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=65;TCR=39;TR=77;WE=52824360;WS=52824342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,84:0.74:113
chr12	52824562	rs443084	T	A	1862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.694;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=52;PP=1428;ReadPosRankSum=0.580;SC=TAACTACCCATCTAGGTCAGG;SOR=0.347;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=94;TCF=14;TCR=80;TR=63;WE=52824570;WS=52824552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,66:0.68:97
chr12	52825363	rs1798640	G	A	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.207;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=968;ReadPosRankSum=-0.196;SC=TGATCTCCTCGGGCAGAGATT;SOR=0.704;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=74;TCF=38;TCR=36;TR=43;WE=52825371;WS=52825353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,44:0.59:74
chr12	52827534	rs67876	C	T	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=539;ReadPosRankSum=1.302;SC=ATGGGATGGCCCTTCCAAGAG;SOR=0.582;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=22;WE=52827542;WS=52827524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
chr12	52827818	rs298109	T	C	3308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=75;PP=2515;ReadPosRankSum=0.686;SC=ACTCCAAACCTGTTGCTGGCC;SOR=0.718;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=202;TCF=88;TCR=114;TR=132;WE=52827826;WS=52827808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,134:0.65:206
chr12	52841765	rs388626	G	A	1511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.032;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.476;NF=15;NR=41;PP=1213;ReadPosRankSum=1.365;SC=CAGCAATGGCGGCCTGTAGGT;SOR=1.472;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=97;TCF=33;TCR=64;TR=56;WE=52841773;WS=52841755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,56:0.57:98
chr12	52842736	rs437014	T	C	1475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.443;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.810;NF=0;NR=52;PP=1218;ReadPosRankSum=-0.075;SC=CCTGCTGTGATCTGCAGCTCC;SOR=1.957;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=98;TCF=1;TCR=97;TR=52;WE=52842744;WS=52842726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,52:0.55:95
chr12	52844016	rs4024141	T	C	1704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=6.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.329;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.497;NF=3;NR=59;PP=1564;ReadPosRankSum=0.815;SC=AAATTTGCCATTTCTTTAATC;SOR=3.839;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=106;TCF=6;TCR=100;TR=62;WE=52844024;WS=52844006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,57:0.55:103
chr12	52844243	rs28414881	A	G	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=48.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.54;MQRankSum=-9.272;QD=8.80;ReadPosRankSum=0.185;SOR=4.405;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,28:0.25:114
chr12	52844246	rs28542657	A	G	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=23.774;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.27;MQRankSum=-9.622;QD=8.69;ReadPosRankSum=-1.194;SOR=2.282;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,34:0.29:119
chr12	52844477	rs5798212	G	GC	2011.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.402;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.499;NF=2;NR=54;PP=2380;ReadPosRankSum=0.284;SC=CAGTTTCCTGGAGGTCTGGGA;SOR=0.324;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=71;TCF=3;TCR=68;TR=56;WE=52844485;WS=52844467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,56:0.81:69
chr12	52845801	rs428894	T	C	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.33;MQRankSum=0.243;QD=18.24;ReadPosRankSum=-0.187;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,28:0.70:40
chr12	52862767	rs2567	G	C	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=4.943;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.12;ReadPosRankSum=-0.127;SOR=2.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr12	52862770	rs1053796	T	C	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=7.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.22;ReadPosRankSum=-0.536;SOR=2.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,26:0.74:35
chr12	52862783	rs2568	G	A	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.001;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=1531;ReadPosRankSum=0.318;SC=GCAACCTGAGGAGACGGCTCT;SOR=2.368;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=27;WE=52862791;WS=52862757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,30:0.73:41
chr12	52863038	rs410562	G	A	1887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.253;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.481;NF=39;NR=43;PP=1686;ReadPosRankSum=1.018;SC=TGCCGACACCGCTGGCACCGC;SOR=0.454;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=129;TCF=59;TCR=70;TR=82;WE=52863046;WS=52863028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,74:0.58:127
chr12	52863213	rs412533	C	T	2320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.188;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.821;NF=29;NR=51;PP=1739;ReadPosRankSum=0.417;SC=ACTTGTCCAACGCCTTCGCCA;SOR=0.951;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=135;TCF=53;TCR=82;TR=80;WE=52863221;WS=52863203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,87:0.60:146
chr12	52863621	rs382367	T	G	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=29.264;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.245;NF=27;NR=34;PP=1306;ReadPosRankSum=0.312;SC=CATCCTTGAGTGCCATCTCCC;SOR=0.051;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=100;TCF=32;TCR=68;TR=61;WE=52863629;WS=52863611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,59:0.59:100
chr12	52863709	rs452600	C	T	1492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=44;PP=1143;ReadPosRankSum=1.081;SC=AACTTCTTGTCTGCTCCTCCG;SOR=0.995;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=66;TCF=6;TCR=60;TR=48;WE=52863717;WS=52863699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,51:0.73:70
chr12	52863732	rs434339	C	T	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=27;PP=705;ReadPosRankSum=2.578;SC=GGAGGCTGGCCCTTGTTTAGT;SOR=0.600;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=29;WE=52863740;WS=52863722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,31:0.82:38
chr12	52864240	rs415580	G	T	8166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=448;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=176;NR=121;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.529;SC=ACTGCCTGATGGGTCTAGCAA;SOR=0.690;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=436;TCF=258;TCR=178;TR=297;WE=52864248;WS=52864230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,302:0.68:445
chr12	52864843	rs604303	G	A	2410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.128;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.158;NF=71;NR=15;PP=1925;ReadPosRankSum=1.471;SC=GATGTCCCCAGTGAAGTCTGC;SOR=0.427;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=142;TCF=120;TCR=22;TR=86;WE=52864851;WS=52864833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,87:0.61:143
chr12	52865548	rs28759265	G	C	3772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.367;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-9.226;NF=104;NR=82;PP=2962;ReadPosRankSum=0.619;SC=ACACATATGAGCCAGTGGGTA;SOR=0.786;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=332;TCF=182;TCR=150;TR=186;WE=52865556;WS=52865538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,153:0.50:303
chr12	52865592	rs644414	A	T	2436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.357;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-12.253;NF=40;NR=95;PP=2785;ReadPosRankSum=-1.444;SC=GGATTCAACAATTTCCTGAAT;SOR=0.960;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=259;TCF=79;TCR=180;TR=135;WE=52865600;WS=52865582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,96:0.43:223
chr12	52865687	rs391567	C	T	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-5.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.814;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.510;NF=3;NR=42;PP=980;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTCTTTAATCCCCCCATCCTC;SOR=2.592;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=77;TCF=7;TCR=70;TR=45;WE=52865695;WS=52865677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,41:0.51:80
chr12	52865918	rs425073	G	C	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=6.466;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.23;MQRankSum=-6.671;QD=6.53;ReadPosRankSum=-3.305;SOR=1.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,17:0.27:64
chr12	52865925	rs17099602	C	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=7.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.14;MQRankSum=-4.926;QD=2.44;ReadPosRankSum=0.862;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,6:0.12:49
chr12	52866060	rs11608915	C	T	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=13;PP=630;SC=CTCTAGGAACCGCACCTGGAA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=26;WE=52866068;WS=52866050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	52881376	rs1053857	C	T	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=7.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.07;ReadPosRankSum=1.207;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr12	52881380	rs1053854	A	C	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=7.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.34;ReadPosRankSum=0.105;SOR=3.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr12	52881428	rs28667515	A	C	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.661;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=548;ReadPosRankSum=-1.280;SC=CAGGAGAGGAAAGGCAACCTG;SOR=3.467;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=25;WE=52881436;WS=52881418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr12	52881705	rs374239834	G	A	2940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.945;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.741;NF=51;NR=65;PP=2272;ReadPosRankSum=-0.315;SC=CACTGGCACCGCCATAGCCAC;SOR=0.862;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=177;TCF=80;TCR=97;TR=116;WE=52881713;WS=52881695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,117:0.65:179
chr12	52882410	rs144849815	T	TGAA	1633.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=37;PP=1770;SC=TATTTCCTAGTGAAGGGGCCA;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=37;WE=52882418;WS=52882400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	52884283	rs298119	A	G	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.393;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.403;NF=57;NR=5;PP=1466;ReadPosRankSum=-0.860;SC=TGTCCCCAGTAAAGTCTGCAG;SOR=1.090;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=98;TCF=89;TCR=9;TR=62;WE=52884291;WS=52884273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,63:0.62:101
chr12	52884557	rs298120	T	C	7179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-14.865;NF=148;NR=149;PP=2962;ReadPosRankSum=0.252;SC=TCACTTCCGATATTTACAGAG;SOR=0.720;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=439;TCF=217;TCR=222;TR=297;WE=52884565;WS=52884547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,267:0.65:413
chr12	52885019	rs298121	C	T	4713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.496;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-7.359;NF=96;NR=117;PP=2962;ReadPosRankSum=0.652;SC=GAAAAGCAGCCTGGGATTCAA;SOR=0.501;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=325;TCF=143;TCR=182;TR=213;WE=52885027;WS=52885009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,177:0.62:286
chr12	52885201	rs298122	C	T	1748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.777;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.689;NF=50;NR=12;PP=1428;ReadPosRankSum=0.655;SC=TTCATTTCCACGGACATGGGT;SOR=1.547;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=88;TCF=66;TCR=22;TR=62;WE=52885209;WS=52885191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,61:0.71:86
chr12	52886478	rs376545	T	C	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.816;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.744;NF=20;NR=27;PP=2288;ReadPosRankSum=-0.547;SC=TCTTGATCTGTTCACGCTCCT;SOR=1.458;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=79;TCF=40;TCR=39;TR=47;WE=52886498;WS=52886468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr12	52886490	rs711317	A	G	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.139;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.004;NF=20;NR=30;PP=2288;ReadPosRankSum=-1.510;SC=CACGCTCCTCAGCCCGCACCC;SOR=1.219;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=78;TCF=37;TCR=41;TR=50;WE=52886498;WS=52886468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,36:0.56:64
chr12	52912906	rs641621	G	T	1772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.89;MQRankSum=-2.200;QD=22.73;ReadPosRankSum=-0.195;SOR=0.662;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,46:0.59:78
chr12	52912909	rs641615	G	T	1746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.86;MQRankSum=-1.889;QD=23.29;ReadPosRankSum=0.104;SOR=0.683;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,43:0.57:75
chr12	52913029	rs607860	C	T	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=375;ReadPosRankSum=-0.627;SC=CACCTCTTTCCGTCCCTCTAA;SOR=0.495;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=18;WE=52913037;WS=52913019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,18:0.82:22
chr12	52938320	rs2292506	C	T	3004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.623;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=41;PP=2251;ReadPosRankSum=-0.501;SC=TCTTCTCTACCGACTGGTTTT;SOR=0.763;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=96;TCR=62;TR=104;WE=52938328;WS=52938310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,110:0.67:163
chr12	52938364	rs2292507	T	C	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.597;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=953;ReadPosRankSum=1.361;SC=AACCCTTCCCTAGGGTGTCTT;SOR=0.599;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=177;TCF=96;TCR=81;TR=59;WE=52938372;WS=52938354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,57:0.33:175
chr12	52938497	rs10783518	A	C	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=330;ReadPosRankSum=0.086;SC=GAAGCCATAGACACTGCCGCC;SOR=0.625;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=55;TCF=6;TCR=49;TR=19;WE=52938505;WS=52938487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr12	52938535	rs10783519	A	G	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=134;ReadPosRankSum=0.426;SC=TGGCTGCAGGAGGAGCCGAAG;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=8;WE=52938543;WS=52938525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr12	52939407	rs10580903	AGAG	A	1147.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=9.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=3.483;QD=9.56;ReadPosRankSum=0.528;SOR=0.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,36:0.30:120
chr12	52939994	rs11170171	T	C	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.926;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=452;ReadPosRankSum=1.219;SC=CTCTTCTGGATTGAGATGTGT;SOR=0.509;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=79;TCF=50;TCR=29;TR=28;WE=52940002;WS=52939984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,28:0.35:80
chr12	52941529	rs4761929	T	C	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.895;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=141;ReadPosRankSum=-1.440;SC=CTCACTGGCCTTCTCTCTTCT;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=8;WE=52941537;WS=52941519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr12	52941784	rs3839975	CAG	C	1724.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.631;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.483;NF=19;NR=23;PP=1573;ReadPosRankSum=0.400;SC=CCCCAAAGCACAGAGTCATGA;SOR=0.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=141;TCF=63;TCR=78;TR=42;WE=52941793;WS=52941774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,50:0.32:158
chr12	52942235	rs12308719	G	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=183;ReadPosRankSum=-1.120;SC=CCAGGGCTGTGTGCTTTGCGG;SOR=0.317;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=11;WE=52942243;WS=52942225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,11:0.28:39
chr12	52942998	rs635206	C	T	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=439;SC=TTGAGGGGGGCTAACAGAGCA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=52943006;WS=52942988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	52943144	rs4761930	G	A	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=322;ReadPosRankSum=-1.268;SC=ATACCTGTGGGAATGGCGAGG;SOR=0.775;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=29;TCR=28;TR=22;WE=52943152;WS=52943134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,24:0.40:60
chr12	52944060	rs10747643	T	C	913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=788;SC=TGCTGAACCCTTGCAGTAATA;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=52944068;WS=52944050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	52964718	rs597048	G	A	3067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=89;PP=2594;ReadPosRankSum=-0.827;SC=AGGCTGCTAGGATCCACGGGG;SOR=6.251;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=91;TCF=1;TCR=90;TR=90;WE=52964726;WS=52964708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,91:0.99:92
chr12	52964934	rs669865	T	G	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.18;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	52965173	rs670741	T	G	2775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=30;PP=2152;SC=GGAACTTGATTTCTTTGTCCA;SOR=1.382;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=84;WE=52965181;WS=52965163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	52965722	rs673363	T	C	1582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.91;QD=32.30;SOR=1.007;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	52965761	rs673449	C	T	2243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=31;PP=1379;SC=TCTCTGCTGTCGTGCGCCGGT;SOR=1.159;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=22;TCR=31;TR=53;WE=52965769;WS=52965751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	52965782	rs673476	T	C	2033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=30;PP=1126;SC=TAATCTCCACTTCATATCTGC;SOR=1.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=47;WE=52965790;WS=52965772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	52966137	rs685720	T	A	2092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=9;PP=1903;SC=CTGACCCTGGTGCATACTCCC;SOR=3.511;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=66;TCF=56;TCR=10;TR=65;WE=52966152;WS=52966127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	52966144	rs34211466	TC	T	252.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=13.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.89;ReadPosRankSum=-0.341;SOR=0.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,15:0.23:65
chr12	52966368	rs78832381	C	T	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.321;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.134;NF=22;NR=23;PP=817;ReadPosRankSum=0.767;SC=GCTCCAGGTTCTTCTTGCAGT;SOR=0.664;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=129;TCF=68;TCR=61;TR=45;WE=52966376;WS=52966358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,46:0.35:132
chr12	52966390	rs11170176	A	T	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.944;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.601;NF=24;NR=22;PP=870;ReadPosRankSum=1.130;SC=GTTCAGGTCCAGCTGCTGCAG;SOR=0.323;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=120;TCF=70;TCR=50;TR=46;WE=52966398;WS=52966380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,46:0.38:120
chr12	52966512	rs687127	C	A	1451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.142;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=42;PP=1172;ReadPosRankSum=-0.369;SC=CCCCTGGACACACACCATTGA;SOR=1.009;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=78;TCF=18;TCR=60;TR=53;WE=52966520;WS=52966502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,53:0.69:77
chr12	52979741	rs2292502	G	T	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=224;ReadPosRankSum=0.327;SC=GAAGCCTTCTGCTCACAGAGC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=12;WE=52979749;WS=52979731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr12	52980078	.	T	C	20	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=20;QD=18.2570708491;SC=CTGAGATGGATTCTCTCTGTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=52980086;WS=52980068;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,3:0.50:6
chr12	52984593	rs75211079	T	C	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.994;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=416;ReadPosRankSum=-0.774;SC=ATAAATACTGTTAGTGGATTA;SOR=0.553;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=72;TCF=55;TCR=17;TR=26;WE=52984601;WS=52984583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,29:0.38:77
chr12	52985293	rs12824366	A	G	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.259;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=5;PP=536;ReadPosRankSum=0.297;SC=TCTTTAGGGCAATCTCCTCGT;SOR=1.004;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=99;TCF=82;TCR=17;TR=35;WE=52985301;WS=52985283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,35:0.34:102
chr12	52986132	rs617820	T	A	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=5;PP=1102;SC=GCCAGAAACCTCTTGTTAAAG;SOR=3.398;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=44;WE=52986140;WS=52986122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	52986187	rs12833456	T	C	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=371;ReadPosRankSum=0.095;SC=TACCCCTTCATAAAGGCACTT;SOR=0.723;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=79;TCF=49;TCR=30;TR=22;WE=52986195;WS=52986177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,26:0.29:89
chr12	52986927	rs618502	T	C	402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=11;PP=325;SC=TCCAGCTCCTTTGTGCCTGTG;SOR=3.611;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=12;WE=52986935;WS=52986917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	52992812	rs11170187	T	C	1366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.087;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=37;PP=1005;ReadPosRankSum=-0.835;SC=GGCTCCAGGTTCTTCCTGCAG;SOR=0.373;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=124;TCF=26;TCR=98;TR=50;WE=52992820;WS=52992802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,54:0.42:128
chr12	52994955	rs61747192	G	A	1280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.559;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=32;PP=940;ReadPosRankSum=-0.289;SC=GGATGCCCCCGGGTGGGCACA;SOR=0.646;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=199;TCF=86;TCR=113;TR=57;WE=52994963;WS=52994945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,61:0.29:207
chr12	53002956	rs591636	T	C	1829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=7;PP=1510;SC=CTCAGGGGGCTGGGCGGTGGA;SOR=3.990;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=49;TCR=7;TR=56;WE=53002964;WS=53002946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	53004319	.	T	TC	277.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.34;ReadPosRankSum=-2.117;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr12	53004694	rs9739031	T	C	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.130;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=325;ReadPosRankSum=0.255;SC=CTCTCAATGGTTGAGCCCTCC;SOR=0.226;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=75;TCF=5;TCR=70;TR=20;WE=53004702;WS=53004684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,21:0.28:76
chr12	53011955	rs61736102	G	A	9755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=229;NR=74;PP=2965;SC=CCAGCTCCACGTTCAGGGGTG;SOR=2.189;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=303;TCF=229;TCR=74;TR=303;WE=53011963;WS=53011945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr12	53043636	rs632952	G	A	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.762;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=491;ReadPosRankSum=-1.220;SC=TGGCTGCTTAGACACAATGGG;SOR=0.255;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=21;WE=53043644;WS=53043626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr12	53043663	rs150989489	A	C	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=4;PP=816;ReadPosRankSum=0.130;SC=AAGCACTCCTATCCCCACCCC;SOR=0.544;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=50;TCR=6;TR=36;WE=53043671;WS=53043653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,38:0.64:59
chr12	53044267	rs638043	C	T	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=252;ReadPosRankSum=-0.684;SC=GGGGCGGGTGCCAACATTCAT;SOR=0.836;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=13;WE=53044275;WS=53044257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr12	53069014	rs14024	T	C	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=16.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.66;ReadPosRankSum=1.229;SOR=3.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,13:0.22:60
chr12	53070121	rs698170	T	G	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.287;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=924;ReadPosRankSum=-0.119;SC=GGGCCAGCTTTGTGTTCATCA;SOR=0.842;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=165;TCF=90;TCR=75;TR=53;WE=53070129;WS=53070111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,56:0.33:170
chr12	53071338	rs626480	A	G	2711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=30;PP=2201;SC=AAGCAGTCAGAAAATAAAAGA;SOR=1.040;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=42;TCR=30;TR=72;WE=53071346;WS=53071328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr12	53084872	rs643027	C	T	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.740;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=5;PP=535;ReadPosRankSum=-0.049;SC=GAGAGGGGATCAGGAAGGGCG;SOR=0.254;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=102;TCF=90;TCR=12;TR=31;WE=53084880;WS=53084862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,31:0.30:104
chr12	53085089	rs636127	T	C	2801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=59.99;NF=23;NR=76;PP=2194;SC=CCTCCACTCCTGCCTCGTGCC;SOR=2.424;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=23;TCR=76;TR=99;WE=53085097;WS=53085079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr12	53085262	rs2684339	C	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.918;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=89;ReadPosRankSum=0.534;SC=TCAGAGGGACCGGGCAAGGCC;SOR=0.293;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=9;WE=53085270;WS=53085252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr12	53088484	rs10783528	C	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.626;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=328;ReadPosRankSum=0.749;SC=CGCACTGCATCGATGATGCTG;SOR=0.136;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=74;TCF=56;TCR=18;TR=21;WE=53088492;WS=53088474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,22:0.29:76
chr12	53089460	rs5798218	GACCC	G	712.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=602;SC=TCCCTAGTGGGACCCTAGTGT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=53089471;WS=53089450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	53090068	rs588706	G	A	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=165;ReadPosRankSum=0.000;SC=CCACCCTGCCGTTGTCACAGA;SOR=0.522;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=11;WE=53090076;WS=53090058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,11:0.28:40
chr12	53091730	rs12426129	C	T	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.685;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=313;ReadPosRankSum=-1.212;SC=CAGAGCAGCTCCCCCATAAGT;SOR=1.204;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=14;WE=53091738;WS=53091720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr12	53096913	rs1625862	G	A	4546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=81;PP=2965;SC=CACCAGCCCCGGTGCTGCCAA;SOR=1.108;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=59;TCR=81;TR=140;WE=53096921;WS=53096903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr12	53097263	rs73094689	C	A	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.264;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=32;PP=768;ReadPosRankSum=0.063;SC=AAGAGCCTGGCAGGAAGGAGG;SOR=2.331;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=56;TCF=4;TCR=52;TR=33;WE=53097271;WS=53097253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr12	53162638	rs2280479	G	A	2519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.447;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=56;PP=2070;ReadPosRankSum=-0.528;SC=TGTGGCTCACGGAGATGCTAC;SOR=0.863;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=138;TCF=52;TCR=86;TR=88;WE=53162646;WS=53162628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,88:0.64:138
chr12	53162749	rs140093642	G	A	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=849;ReadPosRankSum=-0.689;SC=AGCCACTGCCGCTGCCGCCAC;SOR=0.648;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=34;TCR=46;TR=46;WE=53162757;WS=53162739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,48:0.59:81
chr12	53162773	rs1464423	A	G	3002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=48;PP=1925;SC=CTCCATAGCCACTGCTGCTGC;SOR=1.151;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=33;TCR=49;TR=81;WE=53162781;WS=53162763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	53164848	rs7313832	G	A	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.759;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.295;NF=24;NR=13;PP=562;ReadPosRankSum=0.104;SC=CCAGCTTGACGTTCATCAGCT;SOR=0.495;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=102;TCF=67;TCR=35;TR=37;WE=53164856;WS=53164838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,37:0.37:101
chr12	53165940	rs6580904	C	T	2179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.348;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=49;PP=1484;ReadPosRankSum=0.934;SC=TCATACTGGGCGCGGACCTCG;SOR=0.937;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=227;TCF=113;TCR=114;TR=83;WE=53165948;WS=53165930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,92:0.39:237
chr12	53166192	rs6580905	G	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.09;ReadPosRankSum=-1.097;SOR=0.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr12	53166603	rs61730600	T	C	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=33;PP=905;ReadPosRankSum=0.607;SC=TGACTTCATCTGTCAGGCTGT;SOR=0.648;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=32;TCR=57;TR=52;WE=53166611;WS=53166593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,55:0.59:93
chr12	53167313	rs7399317	T	C	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=4;PP=1213;SC=ACTCTCTCCATGGGGGCAGCT;SOR=4.174;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=40;TCR=4;TR=44;WE=53167321;WS=53167303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	53167615	rs56913347	CT	C	107.06	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQRankSum=1.335;QD=9.73;ReadPosRankSum=-0.230;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr12	53183811	rs80023802	G	A	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=300;ReadPosRankSum=-0.745;SC=TGGCTGCGATGCTGATGCGTG;SOR=0.687;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=77;TCF=44;TCR=33;TR=23;WE=53183819;WS=53183801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,23:0.29:78
chr12	53184683	rs17119107	G	A	1847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.362;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=48;PP=1386;ReadPosRankSum=0.308;SC=GAGAAAGTGGGCCCCGTCACA;SOR=0.399;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=96;TCF=28;TCR=68;TR=70;WE=53184691;WS=53184673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,73:0.74:98
chr12	53186088	rs3887954	G	C	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.135;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=330;ReadPosRankSum=-1.449;SC=TACTGTGCACGAACTTCAGCA;SOR=0.507;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=63;TCF=45;TCR=18;TR=19;WE=53186096;WS=53186078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,19:0.31:62
chr12	53186122	rs4432093	G	A	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.690;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=399;ReadPosRankSum=2.035;SC=GGTCCAGGGAGCGATTATTGT;SOR=1.264;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=73;TCF=47;TCR=26;TR=22;WE=53186130;WS=53186112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,22:0.30:73
chr12	53186718	rs117079374	C	T	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.208;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=399;ReadPosRankSum=0.636;SC=TCCACTTGAACGGGCAATTTG;SOR=1.519;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=18;WE=53186726;WS=53186708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr12	53187150	rs4919750	C	T	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.036;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=34;PP=678;ReadPosRankSum=-1.122;SC=TCTTTACTATCTCCCTGTTAG;SOR=1.198;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=109;TCF=10;TCR=99;TR=36;WE=53187158;WS=53187140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,37:0.32:115
chr12	53202380	rs2307028	T	C	1638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=12;PP=1310;SC=CTGACTTCTATTGGGCTTGAG;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=46;WE=53202388;WS=53202370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	53204614	rs2307027	C	T	1801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=23;PP=1384;SC=GGGGTGGGCACGGGGAGAAAA;SOR=1.123;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=32;TCR=23;TR=55;WE=53204622;WS=53204604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr12	53204757	rs10783539	T	C	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=612;SC=ATTTAACCTATATTCATTGAA;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=53204765;WS=53204747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	53207583	rs11267392	C	CCACCAAAGCCACCAGTGCCGAAACCAGCTCCGAAGCCGCCGG	4825.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.41;QD=91.05;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	53216184	rs4415849	A	G	1190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=30;PP=988;SC=CAGAAAGGCCAGGAGAGCAGT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=38;WE=53216192;WS=53216174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	53216989	rs17688627	G	A	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.518;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=44;PP=884;ReadPosRankSum=-0.061;SC=ACGCTGCTCCGCTTCCGCAAT;SOR=1.267;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=148;TCF=28;TCR=120;TR=50;WE=53216997;WS=53216979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,51:0.33:153
chr12	53217056	rs10876353	G	A	1660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=46;PP=1405;SC=AGCACCCTCCGGGGTCATCCC;SOR=6.399;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=47;TCF=1;TCR=46;TR=47;WE=53217064;WS=53217046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
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chr12	53241626	rs11170287	A	G	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.617;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=0;PP=580;ReadPosRankSum=-1.339;SC=CTCCTGGCTGACAGACCCAAA;SOR=1.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=115;TCF=108;TCR=7;TR=32;WE=53241634;WS=53241616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,35:0.29:120
chr12	53242440	rs2013335	A	G	7443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=152;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.728;SC=TGGGGTCAGCAGATTCTGGTT;SOR=0.482;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=255;TCF=100;TCR=155;TR=252;WE=53242448;WS=53242430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,258:1.00:259
chr12	53294381	rs8608	T	C	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.097;NF=12;NR=1;PP=247;ReadPosRankSum=2.238;SC=CCTCTTCATATAGCTGCCTGA;SOR=0.460;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=13;WE=53294389;WS=53294371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr12	53294821	rs4351899	T	G	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=315;ReadPosRankSum=-0.699;SC=CCCAAATGTTTACATAAATGA;SOR=1.946;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=17;WE=53294829;WS=53294811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr12	53295917	rs2035875	A	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=272;ReadPosRankSum=-1.062;SC=AGTCTGGAGGAAAGCAAGCAG;SOR=0.368;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=13;WE=53295925;WS=53295907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr12	53400440	rs61927957	T	G	5806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.236;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=150;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.144;SC=TTACTGCCTCTGGATGTTTGG;SOR=2.786;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=27;TCR=152;TR=176;WE=53400448;WS=53400430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,183:0.98:186
chr12	53416119	rs7975725	T	C	4905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=81;PP=2965;SC=CCACCTGGGGTTGAATTGGAG;SOR=1.121;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=61;TCR=82;TR=142;WE=53416127;WS=53416109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr12	53416251	rs10506315	C	T	1515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=36;PP=1189;SC=AGATAACTTACGGTTTTTGTT;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=41;WE=53416259;WS=53416241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	53421746	rs59856997	CT	C	2299.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.455;NF=27;NR=54;PP=1505;ReadPosRankSum=-0.154;SC=GTAACTTTGCCTTTTTTTTTT;SOR=1.143;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=91;TCF=28;TCR=63;TR=81;WE=53421754;WS=53421736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,94:0.98:96
chr12	53432088	rs7968918	T	C	1496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=44;NR=0;PP=1339;SC=TGTTTCTTGGTTGTTTTCTCC;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=44;WE=53432096;WS=53432078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	53432107	rs55927246	A	G	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.696;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=0;PP=936;ReadPosRankSum=1.804;SC=CCCTGAAACAACTGATGAATG;SOR=3.417;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=57;TCR=2;TR=36;WE=53432115;WS=53432097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,37:0.63:59
chr12	53433089	rs1548204	C	A	6021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=45;PP=2965;SC=GTGGTCCAGGCGACGGAGGGA;SOR=2.085;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=129;TCR=45;TR=174;WE=53433097;WS=53433079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr12	53433486	rs8916	C	T	1678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=50;PP=1425;SC=ATCCAGCTTCCGTAAGTGTTG;SOR=7.864;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=50;WE=53433494;WS=53433476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	53433709	rs1356993	C	G	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=0;PP=566;SC=GTTCTCATCCCTTCTGCAAGG;SOR=5.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=53433717;WS=53433702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	53433788	rs1356994	A	G	2667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=13;PP=2063;SC=CTCCTCTCCAATGGACAATGC;SOR=3.174;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=61;TCR=13;TR=74;WE=53433796;WS=53433778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr12	53442956	rs12369033	G	C	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=359;ReadPosRankSum=-1.895;SC=TGTGTTGGGAGGGGGGACCTC;SOR=0.773;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=69;TCF=26;TCR=43;TR=27;WE=53442964;WS=53442946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,26:0.36:72
chr12	53447265	rs187377419	C	G	2314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.734;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=45;PP=1730;ReadPosRankSum=-0.959;SC=GTGGGGAGGGCAAGGAACCTG;SOR=0.534;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=108;TCF=43;TCR=65;TR=77;WE=53447273;WS=53447255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,82:0.73:112
chr12	53448166	rs373949417	C	T	3638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.412;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=74;PP=2807;ReadPosRankSum=0.359;SC=ACAGCGGCACCGGGGCCACCT;SOR=0.924;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=182;TCF=84;TCR=98;TR=128;WE=53448174;WS=53448156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,132:0.71:185
chr12	53448320	rs11170386	C	T	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=441;ReadPosRankSum=0.632;SC=GAGGCGAGGCCGCCAGGGGGC;SOR=1.247;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=21;WE=53448328;WS=53448310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr12	53449735	rs2364153	T	C	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.743;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=111;ReadPosRankSum=-0.966;SC=TGAGAGTCCTTTGCTGTCAGC;SOR=0.004;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=7;WE=53449743;WS=53449725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr12	53451952	rs2280446	C	T	2732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.108;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=50;ReadPosRankSum=0.159;SC=TGTAACGGCACAGTCACCAAT;SOR=0.518;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=158;TCF=83;TCR=75;TR=101;WE=53451960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,105:0.66:159
chr12	53452263	rs66607805	CCAGGTGGCAGG	C	2154.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.855;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.08;MQRankSum=0.821;NF=17;NR=13;PP=2986;ReadPosRankSum=-0.253;SC=GGGCTGGAGTCCAGGTGGCAG;SOR=0.581;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=112;TCF=67;TCR=45;TR=30;WE=53452281;WS=53452253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,55:0.61:90
chr12	53454504	rs142155111	G	C	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.217;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=22;PP=846;ReadPosRankSum=-0.187;SC=CGCCCACTCAGAGACTGAGTC;SOR=0.463;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=138;TCF=62;TCR=76;TR=43;WE=53454512;WS=53454494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,46:0.32:143
chr12	53470777	rs7977070	G	C	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=2.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=256;ReadPosRankSum=2.450;SC=CAAGAGCATCGCCCTTCCCTG;SOR=0.784;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=11;WE=53470785;WS=53470767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr12	53471929	rs7302636	T	C	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.116;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=562;ReadPosRankSum=0.551;SC=TGCCACTACATTCCAGCCTGG;SOR=0.480;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=51;TCF=21;TCR=30;TR=30;WE=53471937;WS=53471919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,30:0.60:50
chr12	53473245	rs28372672	TG	T	1641.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.228;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=38;PP=1579;ReadPosRankSum=1.059;SC=CAACGGCCTCTGACGACGGGC;SOR=1.692;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=62;TCF=6;TCR=56;TR=40;WE=53473253;WS=53473235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,47:0.64:73
chr12	53512099	rs822681	G	A	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-6.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.890;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=7;PP=661;ReadPosRankSum=0.406;SC=CTCTGCCCTTGCCCTTACTAA;SOR=0.100;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=66;TCF=58;TCR=8;TR=38;WE=53512107;WS=53512089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,38:0.57:67
chr12	53512770	rs711315	G	T	853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.808;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=644;ReadPosRankSum=1.317;SC=TGGTGGAGAGGGGACATTTCT;SOR=1.410;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=28;WE=53512778;WS=53512760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,30:0.81:37
chr12	53513148	rs822683	T	C	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=27;PP=704;ReadPosRankSum=0.778;SC=TCTGAGTCTCTCCTCACATCT;SOR=0.781;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=50;TCF=4;TCR=46;TR=29;WE=53513156;WS=53513138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr12	53647373	rs10876422	T	C	3968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.378;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=58;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.105;SC=CGTGCTGCTGTTGGGCACCAT;SOR=0.947;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=211;TCF=122;TCR=89;TR=146;WE=53647381;WS=53647363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,145:0.68:213
chr12	53662624	rs6580942	C	A	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=8;PP=1107;ReadPosRankSum=-0.801;SC=TTGCTGCCCGCCTTGAAGGTG;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=61;TCR=12;TR=48;WE=53662632;WS=53662614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,51:0.67:76
chr12	53662735	rs4758965	C	T	3436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=49;PP=2859;ReadPosRankSum=1.506;SC=CTCTGAGTAACCCTATTTCTA;SOR=0.695;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=116;TCR=69;TR=130;WE=53662743;WS=53662725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,130:0.70:186
chr12	53664015	.	G	A	242	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=8;NR=3;PP=242;QD=25.1610193225;SC=AAACAGCCTAGTCTATCCTGA;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=11;WE=53664023;WS=53664014;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,11:0.69:16
chr12	53664148	rs4758963	G	A	1319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=11;PP=1000;ReadPosRankSum=-0.361;SC=CCAACCTTCCGCTTCCTTCCT;SOR=0.593;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=71;TCF=56;TCR=15;TR=50;WE=53664156;WS=53664138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,50:0.68:74
chr12	53664308	rs146243389	GTTTGGGGTTGCTCCACTGCCCTCAAACAGC	G	1639.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=4.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQRankSum=-1.146;QD=27.79;ReadPosRankSum=-0.226;SOR=1.378;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,41:0.69:59
chr12	53670545	rs1318648	C	A	2814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.615;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=44;PP=2248;ReadPosRankSum=0.555;SC=TGGAGCTGAGCCCCGAGGAGA;SOR=0.623;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=162;TCF=94;TCR=68;TR=103;WE=53670553;WS=53670535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,104:0.65:161
chr12	53671549	rs2272313	A	G	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=660;ReadPosRankSum=2.281;SC=GAGGAAGGGAAGTTCTCTCCA;SOR=0.843;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=29;TCR=20;TR=34;WE=53671557;WS=53671539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,37:0.70:53
chr12	53673424	rs77269929	T	TTGG,TTGGACC	723.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.866;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=918;ReadPosRankSum=1.086;SC=GAGGTCAAACTACAGTCCAAG;SOR=2.888;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=44;TCR=6;TR=12;WE=53673433;WS=53673414;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.33:58
chr12	53673425	rs370889472	A	ACCC	723.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=5.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=3.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.06;ReadPosRankSum=0.824;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,20:0.33:60
chr12	53677072	rs1609473	T	G	3777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=50;PP=2965;SC=AGGGCCCTCTTGGAATGGACA;SOR=0.978;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=64;TCR=50;TR=114;WE=53677080;WS=53677062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr12	53677089	rs4454760	G	A	3989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=46;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.821;SC=GACAGGCTATGTGAGAGGGCT;SOR=0.538;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=79;TCR=46;TR=124;WE=53677097;WS=53677079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,127:0.99:128
chr12	53681683	rs1379610	A	G	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=23;ReadPosRankSum=-1.139;SC=TGCCTCCACTACGCCACCTGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=3;WE=53681691;WS=53681673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr12	53681883	rs1110719	A	T	1201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=16;PP=891;SC=CTGAGCCTAAAGACGGATGCC;SOR=0.968;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=36;WE=53681891;WS=53681873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	53682267	rs3080422	CAA	C	3347.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.202;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.840;NF=43;NR=28;PP=2717;ReadPosRankSum=-0.253;SC=GAAGGAAGAACAAAGAGAATG;SOR=0.942;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=115;TCF=63;TCR=52;TR=71;WE=53682276;WS=53682257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,85:0.59:143
chr12	53682326	rs1110720	G	A	2521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.700;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=43;PP=1980;ReadPosRankSum=0.270;SC=CCCCAGGTGGGAAGACTCCAG;SOR=0.359;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=124;TCF=57;TCR=67;TR=85;WE=53682334;WS=53682316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,89:0.69:129
chr12	53682457	rs56358776	G	A	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.108;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=213;ReadPosRankSum=-1.293;SC=CCTCGGCTCCGGCTCCCCTCA;SOR=1.206;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=56;TCF=13;TCR=43;TR=14;WE=53682465;WS=53682447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,14:0.24:58
chr12	53682986	rs3214023	C	T	2290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.631;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=46;PP=1733;ReadPosRankSum=1.322;SC=TGGCCTTGTGCCTGGGCCACC;SOR=0.538;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=311;TCF=179;TCR=132;TR=104;WE=53682994;WS=53682976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:217,103:0.32:320
chr12	53684619	rs61754164	A	G	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.501;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=56;ReadPosRankSum=0.226;SC=TGCCCTCTGCATTCAGGTTCT;SOR=0.086;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=7;WE=53684627;WS=53684609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr12	53686703	rs1056685	G	A	1812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=49;PP=1472;SC=CTGGCTGTGCGTGGAAACCTG;SOR=3.219;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=8;TCR=49;TR=57;WE=53686711;WS=53686693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	53689190	rs1870240	C	G	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=393;SC=TGAACTCACACAACAGTCTCT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=53689198;WS=53689180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	53690188	rs59765323	CT	C	400.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=2;NR=11;PP=213;SC=TGAGGATACCCTTTTTTTTTT;SOR=1.739;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=13;WE=53690196;WS=53690178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	53691962	rs2694861	C	A	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=38;PP=1111;SC=CACCTCTTGACCCTATCTCCA;SOR=2.655;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=48;WE=53691970;WS=53691952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	53692955	rs1020745	G	A	2236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=13;PP=1703;SC=ACAAACTGTAGTTAGTCGGTC;SOR=2.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=52;TCR=13;TR=65;WE=53692963;WS=53692945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr12	53693277	rs56249432	TG	T	889.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=25;PP=773;SC=GGTGATGAGATGGGGGGTGTG;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=25;WE=53693285;WS=53693267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	53693532	rs1534284	AA	GC	2501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=8;PP=2436;SC=ATGGGACACCAATTCCTGCGC;SOR=3.383;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=54;TCF=46;TCR=8;TR=47;WE=53693541;WS=53693522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	53700848	rs1534282	C	T	4254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=83;PP=2965;SC=AGCGGCTTCACTGGCGGTCAC;SOR=1.455;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=129;TCF=46;TCR=83;TR=129;WE=53700868;WS=53700838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr12	53700860	rs711316	A	G	3175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=68;PP=2548;SC=GGCGGTCACCACACCCGAGAG;SOR=1.702;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=32;TCR=69;TR=100;WE=53700868;WS=53700838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr12	53702371	rs4759287	T	C	2836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=51;PP=2225;SC=ACTGGTCCCCTGCCAGCTCAC;SOR=0.976;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=39;TCR=51;TR=90;WE=53702379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr12	53703021	rs1546808	G	A	1699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=42;PP=1457;SC=CACCTCCTCGGAACCAGGGAA;SOR=3.215;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=8;TCR=42;TR=50;WE=53703029;WS=53703011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr12	53708011	rs7953255	G	C	2699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=17;PP=2118;SC=CCTTTCAGACGTCCTCACCAC;SOR=2.331;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=61;TCR=17;TR=78;WE=53708019;WS=53708001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr12	53708910	rs11540353	A	G	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.860;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=14;PP=493;ReadPosRankSum=-0.158;SC=CAGCGATCAGATCTTCGCTCC;SOR=0.560;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=82;TCF=44;TCR=38;TR=29;WE=53708918;WS=53708900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,29:0.34:85
chr12	53709708	rs7960963	G	T	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=24;PP=712;SC=GCACTCTACGGGCTGTCCTTT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=53709716;WS=53709698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	53714290	rs4759232	T	G	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=418;SC=TAAAGGGGTGTTGACTCATTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=53714298;WS=53714280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	53714496	rs4759231	A	G	2009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=44;PP=1645;SC=AAAAGTGAGGAGTGTGACGGT;SOR=1.681;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=21;TCR=44;TR=65;WE=53714517;WS=53714486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr12	53714509	rs7298879	T	G	1950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=43;PP=1561;SC=GTGACGGTGATTCAGTCTCTT;SOR=1.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=20;TCR=43;TR=63;WE=53714517;WS=53714486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	53714993	rs4759020	C	T	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=1;PP=338;SC=GCCCTTCTAGCCTCCTGCCGG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=53715001;WS=53714988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	53722098	rs7138938	A	G	5171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=78;PP=2965;SC=CTGGTTCTCCATGGGTGCGCT;SOR=0.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=175;TCF=97;TCR=78;TR=175;WE=53722106;WS=53722088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr12	53722128	rs7139272	G	A	6643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=99;PP=2965;SC=TCAGGTGGTCGCTTCGGGTAA;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=208;TCF=108;TCR=100;TR=207;WE=53722136;WS=53722118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr12	53777471	.	C	T	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.816;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.523;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=94;ReadPosRankSum=-0.565;SC=AAACTTGAGTCTAAAGAAAGG;SOR=0.061;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=6;WE=53777479;WS=53777461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr12	53877562	rs784565	C	T	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=10;PP=626;SC=AGGGCCATAACAGATCTCAGT;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=13;TCR=10;TR=23;WE=53877570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	54067544	rs2857000	A	G	221.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=215;SC=GGCAGAGGCTACGGTGAGCCA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=54067552;WS=54067534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	54067603	.	CA	C	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.24;MQRankSum=1.649;QD=2.44;ReadPosRankSum=-0.046;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr12	54109659	rs3741659	C	T	4322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.473;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=102;PP=2962;ReadPosRankSum=1.346;SC=CTCAGCCAGCCTGCCGTTAAC;SOR=1.414;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=251;TCF=99;TCR=152;TR=156;WE=54109667;WS=54109649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,161:0.62:259
chr12	54109733	rs3741658	A	G	1823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.598;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=40;PP=1617;ReadPosRankSum=-0.807;SC=CTGCTGCTGCACTGGCCAACT;SOR=0.348;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=130;TCF=53;TCR=77;TR=73;WE=54109741;WS=54109723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,73:0.55:132
chr12	54109927	rs2277370	C	T	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.746;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=625;ReadPosRankSum=-2.234;SC=CATTAGGACTCGGGGTTGTGT;SOR=1.598;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=28;WE=54109935;WS=54109917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr12	54117592	rs10783596	G	A	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.347;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=1002;ReadPosRankSum=-1.085;SC=ATGGACCCAGGACCCCAATAA;SOR=0.425;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=60;TCF=29;TCR=31;TR=44;WE=54117600;WS=54117582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,48:0.74:65
chr12	54339052	rs4759058	C	A	3879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=76;PP=2965;SC=CACCCACCCGCTGCTTGCCCC;SOR=1.498;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=43;TCR=76;TR=119;WE=54339060;WS=54339042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr12	54348554	rs72049639	CGGGAT	C	817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=610;SC=AGTTAGAGTGCGGGATGGGAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=54348586;WS=54348549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	54348571	rs199806153	G	GA	1152.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=598;SC=GGATGGTGGGGGGGGGGGATC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=19;WE=54348586;WS=54348549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	54348578	rs55661050	G	A	1137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.39;NF=23;NR=0;PP=573;SC=GGGGGGGGGGGATCGGTTGTC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=54348586;WS=54348549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
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chr12	54367061	rs4759315	T	G	4559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=34;PP=2965;SC=ACTTCTGCTCTCCGTCGCGCA;SOR=2.408;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=122;TCR=34;TR=155;WE=54367069;WS=54367051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
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chr12	54379670	rs4564384	C	T	4266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.160;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=82;PP=2962;ReadPosRankSum=1.333;SC=GCCAGACCCCCAGCCCCAATG;SOR=0.809;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=214;TCF=101;TCR=113;TR=151;WE=54379678;WS=54379660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,155:0.71:218
chr12	54385599	rs11614913	C	T	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=201;ReadPosRankSum=1.664;SC=CAAGAAACTGCCTGAGTTACA;SOR=0.560;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=39;TCF=19;TCR=20;TR=13;WE=54385607;WS=54385589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr12	54394497	rs2241820	C	T	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.029;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=37;ReadPosRankSum=0.567;SC=AGGAGAAGGCCGACCTGGACC;SOR=0.269;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=7;WE=54394505;WS=54394487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr12	54405190	rs4142680	C	T	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=130;ReadPosRankSum=-0.045;SC=CCCCCCCCCCCTTAGCAACTC;SOR=0.368;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=8;WE=54405198;WS=54405180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr12	54428011	rs2071449	C	A	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=1.784;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.06;ReadPosRankSum=-1.622;SOR=1.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,13:0.27:49
chr12	54575458	rs971	T	C	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.933;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=474;ReadPosRankSum=-1.253;SC=CAGCTAAAGGTAACTGTTCTA;SOR=0.877;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=83;TCF=28;TCR=55;TR=26;WE=54575466;WS=54575448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,26:0.30:88
chr12	54575800	rs2233921	C	A	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=48;ReadPosRankSum=-0.217;SC=TTGCTCCAGTCCAGGAGATGT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=4;WE=54575808;WS=54575790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr12	54635846	rs2293602	G	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=111;ReadPosRankSum=-0.372;SC=AAGAAGAAATGTAAGTAAATG;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=6;WE=54635854;WS=54635836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr12	54651471	rs1140681	A	G	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=548;ReadPosRankSum=-1.311;SC=TAAGGCCACCAGGTCCCTGCA;SOR=1.053;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=68;TCF=1;TCR=67;TR=27;WE=54651479;WS=54651461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,27:0.40:68
chr12	54677980	rs7967622	C	T	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=24;PP=952;SC=TTTTATTATCCCAAATATGAA;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=54677988;WS=54677970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	54687232	rs10506328	A	C	2251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=52;PP=1750;SC=TCTCTCAGGAACAAGCTGGAT;SOR=2.472;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=69;TCF=15;TCR=54;TR=67;WE=54687240;WS=54687222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr12	54734289	rs11170877	A	G	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.715;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=4;PP=793;ReadPosRankSum=0.653;SC=ACCAGTGGTGATGGGAGGCTT;SOR=1.987;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=112;TCF=91;TCR=21;TR=38;WE=54734297;WS=54734279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,40:0.34:117
chr12	54740379	rs4758958	T	G	1449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.290;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=24;PP=1042;ReadPosRankSum=1.141;SC=CTAGTCCTTGTTTTTTCCCTT;SOR=1.035;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=204;TCF=116;TCR=88;TR=63;WE=54740387;WS=54740369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,66:0.31:215
chr12	54764618	rs2706248	T	C	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=7;PP=1346;SC=TGGGGAAAACTCTGAAGAAGG;SOR=3.171;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=49;WE=54764626;WS=54764612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	54764962	rs2244933	G	T	1612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=37;PP=1315;SC=ACATTCCCAGGTACAATATGA;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=51;WE=54764970;WS=54764952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	54765005	rs3830651	TCTAA	T	1037.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=14;PP=1041;SC=GTGGGTTCTTTCTAACTAAGC;SOR=1.519;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=21;WE=54765016;WS=54764995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	54767613	rs2706258	C	T	964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=2;PP=832;SC=ATCACTGTGCCTGGCTCCAGG;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=54767621;WS=54767603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	54767981	rs3832831	C	CAG	984.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=1223;SC=GATCTCCCCACAGAGCTCCCT;SOR=4.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=25;WE=54767989;WS=54767971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	54772755	rs2706256	C	A	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=8;PP=348;SC=GCAGAGGGAGCGGTAGCCAGC;SOR=0.818;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=15;WE=54772763;WS=54772745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	54796757	rs7306692	C	T	2353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.496;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=36;PP=1848;ReadPosRankSum=0.567;SC=TTACCGTCAGCCCTACTTACC;SOR=0.863;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=126;TCF=70;TCR=56;TR=85;WE=54796765;WS=54796747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,87:0.67:129
chr12	54797393	rs12818138	G	A	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.204;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=13;PP=957;ReadPosRankSum=-0.444;SC=TCCACACCCCGCCCTCTGGGC;SOR=0.195;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=78;TCF=61;TCR=17;TR=52;WE=54797401;WS=54797383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,53:0.68:78
chr12	54799450	rs1249378	A	G	2963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=48;PP=2316;SC=CCACTCACCCATCCCCATTGA;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=46;TCR=48;TR=94;WE=54799458;WS=54799440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr12	54802090	rs10876558	C	A	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.698;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=165;ReadPosRankSum=0.171;SC=TGGGGGCTGACTGGGTAGTAT;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=10;WE=54802098;WS=54802080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr12	54805753	rs1922254	G	T	2027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.102;HP=6;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=32;PP=2590;ReadPosRankSum=-0.681;SC=CTGACCCTGTGGGGGGGAAAA;SOR=1.027;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=87;TCF=42;TCR=45;TR=53;WE=54805773;WS=54805743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,54:0.61:88
chr12	54805765	rs1249181	C	T	2014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.573;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=34;PP=2590;ReadPosRankSum=-1.076;SC=GGGGGAAAAGCGAGGCAGTTG;SOR=1.424;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=85;TCF=37;TCR=48;TR=52;WE=54805773;WS=54805743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,53:0.62:86
chr12	54905815	rs2458409	C	G	2658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=60;PP=1948;SC=AGGGCTCCCTCTACATCACCC;SOR=3.003;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=12;TCR=61;TR=72;WE=54905823;WS=54905805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr12	54910234	rs60294924	C	G	345.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.71;MQRankSum=-0.353;QD=16.47;ReadPosRankSum=-1.739;SOR=2.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,19:0.90:21
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chr12	54911426	rs2270581	C	T	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.949;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=13;PP=344;ReadPosRankSum=1.066;SC=TATGCTGACTCGTTAGTACTT;SOR=0.895;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=89;TCF=44;TCR=45;TR=24;WE=54911434;WS=54911416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,25:0.28:89
chr12	54920566	rs12369172	T	C	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=264;ReadPosRankSum=-1.288;SC=TGCCTTACTTTGTGTTGGCAC;SOR=1.931;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=16;WE=54920574;WS=54920556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr12	54920591	rs12367426	G	A	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=217;ReadPosRankSum=2.229;SC=TCCTTTACACGGTAGGACCTC;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=10;WE=54920599;WS=54920581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr12	54925674	rs2271476	T	G	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.112;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=703;ReadPosRankSum=0.915;SC=GTTTGTATGATAATTTGTGGA;SOR=1.460;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=33;WE=54925682;WS=54925664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,37:0.63:59
chr12	54925750	rs10747697	A	C	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=11;PP=636;SC=GAAGAGGGAGAGTAATTTGGC;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=15;TCR=11;TR=26;WE=54925758;WS=54925740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	54925871	rs35753004	CT	C	341.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=8.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=1.001;QD=5.70;ReadPosRankSum=-0.304;SOR=0.167;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr12	54925887	.	A	T	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=48.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=-1.719;QD=1.08;ReadPosRankSum=-1.077;SOR=6.099;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,22:0.25:89
chr12	54928781	rs112377731	T	TA	101.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5020;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=102;ReadPosRankSum=-0.876;SC=AAAGCATCTTTAAAAAAAAAA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=7;WE=54928789;WS=54928771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr12	54929838	rs34084680	AG	A	463.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=440;ReadPosRankSum=1.400;SC=TCTGTGAAGTAGGACCCCTGT;SOR=0.653;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=13;WE=54929846;WS=54929828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr12	54932788	rs4758966	T	C	3592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=79;PP=2817;SC=GGTGTGAGAATAGGGAATGGA;SOR=2.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=27;TCR=79;TR=106;WE=54932796;WS=54932778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr12	54955324	rs10747699	T	C	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=7;PP=669;SC=CTGGGGCTCCTGGGGTCAGGA;SOR=2.517;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=54955332;WS=54955314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	54955461	rs9668037	A	G	2594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=37;PP=2161;SC=GGAGGAGGGAAAGGACAGGTT;SOR=0.867;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=83;TCF=46;TCR=37;TR=83;WE=54955469;WS=54955451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr12	54955545	rs3036634	C	CGT	966.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.237;NF=3;NR=23;PP=974;ReadPosRankSum=0.916;SC=ATGTTTTGTGCGTGTGTGTGT;SOR=0.560;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=57;TCF=7;TCR=50;TR=26;WE=54955554;WS=54955535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,34:0.79:43
chr12	54955647	rs1552957	G	T	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=17;PP=481;SC=CCCCACCTTTGTAAAAATTGC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=54955655;WS=54955637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	54963491	rs71070829	C	CT	650.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.96;MQRankSum=0.611;QD=20.34;ReadPosRankSum=-1.053;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,30:0.94:32
chr12	54969998	rs1249949	A	G	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.320;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=671;ReadPosRankSum=-1.690;SC=GGGGAGGCAGACTGCTTCAAG;SOR=1.071;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=32;WE=54970006;WS=54969988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,34:0.67:51
chr12	54970454	rs1249950	T	C	1794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.270;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=34;PP=1388;ReadPosRankSum=1.025;SC=TTCAGGAGAATAAGCAGAAAT;SOR=0.205;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=83;TCF=34;TCR=49;TR=64;WE=54970462;WS=54970444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,66:0.78:85
chr12	54971347	rs1249951	C	G	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=25;PP=618;ReadPosRankSum=1.270;SC=AAAGGAGGTACCTTCTCAGAA;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=29;WE=54971355;WS=54971337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,31:0.65:48
chr12	54974803	rs8407	C	T	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=836;ReadPosRankSum=0.730;SC=TACTGCCTCTCTCGTGAGTTT;SOR=0.689;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=65;TCF=13;TCR=52;TR=36;WE=54974811;WS=54974793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,39:0.57:69
chr12	54975837	rs1249958	T	C	2291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=41;PP=1925;SC=CTCCTGGGTTTCTGTGCTCTC;SOR=0.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=30;TCR=41;TR=71;WE=54975845;WS=54975827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr12	54977925	rs2292490	T	G	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.017;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=187;ReadPosRankSum=1.591;SC=CTGCCTTCAGTACTGAGGACA;SOR=0.243;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=10;WE=54977933;WS=54977922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr12	54978225	rs1976821	T	C	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.879;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=443;ReadPosRankSum=0.602;SC=AAAAATGCCATGTTAATGCAG;SOR=0.317;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=26;WE=54978233;WS=54978215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,29:0.78:37
chr12	55002014	rs1795819	C	T	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=-0.600;SC=TTGGATGTGGCGTCTCCCACA;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=6;WE=55002022;WS=55002004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr12	55002053	rs1795818	C	G	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=201;ReadPosRankSum=1.031;SC=GCACCCTCATCATTAGGGCCT;SOR=0.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=11;WE=55002073;WS=55002043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr12	55002065	rs1716356	G	A	1349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=4;PP=1224;SC=TTAGGGCCTCGTGACATCATT;SOR=4.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=39;WE=55002073;WS=55002043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
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chr12	55004150	rs937308	C	A	1789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=28;PP=1509;SC=AGAGAGGTGGCGGCTAGGCTG;SOR=0.729;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=55;WE=55004158;WS=55004140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	55028808	rs11832807	C	A	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=54;ReadPosRankSum=-1.150;SC=TCAACAAGGGCTAGGTTGGGC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=55028816;WS=55028798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr12	55039662	rs76825081	A	C	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=455;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGCATCCCTCAAGCTTTTTCC;SOR=0.756;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=19;WE=55039670;WS=55039652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr12	55041079	rs903768	T	A	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=34;PP=874;ReadPosRankSum=1.418;SC=AATCTCTGCTTCACAAGGGGC;SOR=0.618;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=53;TCF=5;TCR=48;TR=38;WE=55041087;WS=55041069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,40:0.71:56
chr12	55042118	rs78394705	A	G	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.210;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=635;ReadPosRankSum=-0.718;SC=GTATGCCACCAAATCCTTGGA;SOR=1.061;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=33;WE=55042126;WS=55042108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,33:0.55:60
chr12	55248357	rs1048371	G	T	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.006;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=368;ReadPosRankSum=0.048;SC=CTGATCTTCAGGTCACCACCA;SOR=0.517;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=67;TCF=44;TCR=23;TR=26;WE=55248365;WS=55248347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,25:0.36:69
chr12	55248739	rs10783684	T	C	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.624;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=159;ReadPosRankSum=-0.289;SC=TTGGTTTTCATGGGTTTTATC;SOR=0.061;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=9;WE=55248747;WS=55248736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr12	55249002	rs7133564	A	G	3676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.569;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=92;PP=2859;ReadPosRankSum=0.878;SC=TTCCAGCCTCATGTCAAACAG;SOR=0.792;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=206;TCF=76;TCR=130;TR=143;WE=55249010;WS=55248992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,146:0.70:210
chr12	55250549	rs10783685	T	G	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=14.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.44;ReadPosRankSum=1.290;SOR=2.063;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,35:0.26:137
chr12	55250612	rs1349910	A	G	5849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=112;NR=89;PP=2965;SC=CAACCACTGCAACCACTGCTG;SOR=0.971;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=202;TCF=112;TCR=90;TR=201;WE=55250620;WS=55250602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr12	55250714	rs10876639	G	A	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=4.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.470;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=34;PP=787;ReadPosRankSum=0.240;SC=TCCTTTATGTGGCTCCTTGAT;SOR=1.108;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=106;TCF=15;TCR=91;TR=38;WE=55250722;WS=55250704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,38:0.36:107
chr12	55251834	rs2306849	C	T	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=335;ReadPosRankSum=0.404;SC=TTTATCTTCCCGTAATAACAA;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=14;WE=55251842;WS=55251824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr12	55252212	rs60749539	T	G	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=31;ReadPosRankSum=-1.068;SC=CGGTTGTCCATTGTTTAGACA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=55252220;WS=55252202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr12	55368291	rs62623446	C	T	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=24;PP=894;ReadPosRankSum=-0.212;SC=ACGGCTCTGACGGAGCCAGGC;SOR=0.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=39;TCR=39;TR=48;WE=55368299;WS=55368281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,49:0.62:79
chr12	55523414	rs11171309	A	C	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=227;ReadPosRankSum=-0.224;SC=ACTTAAAGAAATAAGAAATGC;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=11;WE=55523422;WS=55523407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr12	55523586	rs58036029	AT	A	2209.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.720;NF=47;NR=20;PP=2264;ReadPosRankSum=0.045;SC=TCATTTGTATATTTTGCCCTG;SOR=0.705;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=110;TCF=75;TCR=35;TR=67;WE=55523594;WS=55523576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,81:0.64:127
chr12	55523685	rs12303066	C	T	5103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.687;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=51;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.852;SC=CTTCAGGGTACGCCCAGAGCT;SOR=1.297;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=255;TCF=176;TCR=79;TR=178;WE=55523693;WS=55523675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,184:0.70:262
chr12	55523860	rs7305779	A	C	4931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.446;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=111;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.543;SC=TCTGTTATTGAACCCAAGGCT;SOR=0.999;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=266;TCF=99;TCR=167;TR=170;WE=55523868;WS=55523850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,174:0.64:272
chr12	55524172	rs7306491	G	A	2810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.585;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=65;PP=2067;ReadPosRankSum=1.484;SC=TGTGATTCTCGCCCACTTCAG;SOR=0.636;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=176;TCF=65;TCR=111;TR=104;WE=55524180;WS=55524162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,109:0.62:175
chr12	55524314	rs7137261	T	C	1939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.548;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=26;PP=1684;ReadPosRankSum=-1.312;SC=TAAAGATACATTCTACTGAGG;SOR=0.970;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=109;TCF=65;TCR=44;TR=68;WE=55524322;WS=55524304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,69:0.62:111
chr12	55641031	rs7302063	G	A	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-6.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.325;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=3;PP=869;ReadPosRankSum=-0.017;SC=TTCCTCTTCTGTTCTAATTTT;SOR=0.146;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=59;TCF=56;TCR=3;TR=38;WE=55641039;WS=55641021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,40:0.63:63
chr12	55641075	rs7301705	A	G	2247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.105;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=11;PP=1828;ReadPosRankSum=-0.467;SC=ATCAACTATGAGAAACCATAC;SOR=1.014;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=115;TCF=96;TCR=19;TR=75;WE=55641083;WS=55641065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,78:0.65:120
chr12	55641255	rs4522268	C	T	5871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=6.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.398;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=105;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.577;SC=TTTCTTCCTCCGAAATTTCTC;SOR=0.613;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=303;TCF=143;TCR=160;TR=199;WE=55641263;WS=55641245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,208:0.65:318
chr12	55641295	rs4388990	A	G	5292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.572;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=104;PP=2962;ReadPosRankSum=1.091;SC=ACAACTGTCTACATTCCCAAA;SOR=0.471;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=260;TCF=103;TCR=157;TR=177;WE=55641303;WS=55641285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,186:0.69:271
chr12	55641328	rs6581025	G	A	5035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=108;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.247;SC=ATGGCAACAGGTGATAAGACC;SOR=0.728;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=262;TCF=101;TCR=161;TR=175;WE=55641336;WS=55641318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,183:0.68:269
chr12	55688267	rs7308594	G	A	3907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.372;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=69;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.681;SC=TACAGCTACCGTATGTCATGG;SOR=0.506;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=200;TCF=102;TCR=98;TR=131;WE=55688275;WS=55688257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,140:0.65:214
chr12	55714406	rs5798345	C	CA	1126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=3;PP=1391;ReadPosRankSum=-0.045;SC=ACAGAAATAACAGAGTTTATT;SOR=0.802;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=61;TCF=55;TCR=6;TR=34;WE=55714414;WS=55714396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,36:0.60:60
chr12	55714772	rs7132431	G	A	4290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=54;PP=2965;SC=CCTCTGCATTGCTTGAGTATC;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=78;TCR=55;TR=131;WE=55714780;WS=55714762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr12	55714876	rs7132347	C	G	4388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=75;PP=2965;SC=TTTAAAGCTTCATTACTGTAG;SOR=1.214;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=51;TCR=75;TR=126;WE=55714884;WS=55714866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr12	55715048	rs7132600	C	T	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.197;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=15;PP=800;ReadPosRankSum=-1.058;SC=ATTATCAGAACAATTTTGAGA;SOR=1.071;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=150;TCF=93;TCR=57;TR=46;WE=55715056;WS=55715038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,52:0.33:158
chr12	55715119	rs7132916	G	A	7153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=133;NR=83;PP=2965;SC=CATGGTTGTTGTCTCCATCTC;SOR=1.245;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=216;TCF=133;TCR=83;TR=216;WE=55715127;WS=55715109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr12	55725690	rs4318060	C	T	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.654;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=22;PP=856;ReadPosRankSum=-0.007;SC=TTAGAAATCTCATTTACAACC;SOR=0.798;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=139;TCF=72;TCR=67;TR=47;WE=55725698;WS=55725680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,48:0.33:145
chr12	55758832	rs7962135	T	C	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=334;ReadPosRankSum=-0.562;SC=GGTGTCATAGTTTTCTGGTTT;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=15;WE=55758840;WS=55758822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr12	55759878	rs10876751	A	G	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=671;ReadPosRankSum=-1.396;SC=AAGCTGAATGAAAAACTCTCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=27;WE=55759886;WS=55759868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,28:0.68:41
chr12	55794264	rs7967395	A	G	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.750;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=134;ReadPosRankSum=-0.120;SC=ACGTATTGACATTCACTCTTC;SOR=2.170;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=9;WE=55794272;WS=55794254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr12	55794976	rs7971073	A	G	3238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=72;PP=2564;ReadPosRankSum=1.091;SC=CATCCTTAAAACAATTCTGAA;SOR=0.717;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=68;TCR=114;TR=115;WE=55794984;WS=55794966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,119:0.64:187
chr12	55805499	rs61956295	G	A	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.79;MQRankSum=-1.125;QD=17.06;ReadPosRankSum=-0.157;SOR=1.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,37:0.61:61
chr12	55805787	rs7300096	C	A	3623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=3.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.10;MQRankSum=0.848;QD=19.80;ReadPosRankSum=1.429;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,124:0.68:183
chr12	55806238	rs7300594	A	G	3477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.877;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.320;NF=97;NR=48;PP=2721;ReadPosRankSum=-0.503;SC=GTGGCTTCTCAGACTCCTTCA;SOR=1.133;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=227;TCF=147;TCR=80;TR=145;WE=55806246;WS=55806228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,149:0.64:234
chr12	55807293	rs3887805	A	G	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=9.768;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.82;MQRankSum=-7.226;QD=15.68;ReadPosRankSum=-0.270;SOR=3.761;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,53:0.67:79
chr12	55808469	rs7132076	C	G	1386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.271;NF=24;NR=25;PP=1063;ReadPosRankSum=-0.093;SC=TGCACTGCTTCTCGTTCATAT;SOR=0.707;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=37;TCR=40;TR=49;WE=55808477;WS=55808459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,52:0.63:83
chr12	55819933	rs10876774	T	C	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=0;PP=938;ReadPosRankSum=0.512;SC=CAATAGTATTTGAAAAAAAAA;SOR=1.893;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=52;TCR=0;TR=36;WE=55819941;WS=55819923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,37:0.71:52
chr12	55820121	rs6581046	C	T	3448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.552;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=66;PP=2658;ReadPosRankSum=-1.229;SC=TTTTCTCGTTCCTATTTCTTA;SOR=0.786;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=185;TCF=85;TCR=100;TR=119;WE=55820129;WS=55820111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,125:0.64:194
chr12	55846623	rs11171467	T	C	1341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.601;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=22;PP=1074;ReadPosRankSum=0.347;SC=ATTATCACCCTAGTTTGTGTG;SOR=0.787;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=178;TCF=111;TCR=67;TR=59;WE=55846631;WS=55846613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,59:0.33:180
chr12	55863381	rs10747756	A	G	2246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=28;PP=1847;SC=TTGTAGGATAAGAGAAATGTC;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=33;TCR=28;TR=61;WE=55863389;WS=55863371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr12	55863398	rs12313730	G	A	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.789;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=18;PP=1069;ReadPosRankSum=0.873;SC=TGTCACAAATGAAATGATCAA;SOR=0.352;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=58;TCF=36;TCR=22;TR=42;WE=55863406;WS=55863388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,44:0.70:63
chr12	55886294	rs7133698	G	A	2204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.377;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=41;PP=1620;ReadPosRankSum=-1.114;SC=GACCATTATCGCCCTCACCAT;SOR=0.617;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=126;TCF=64;TCR=62;TR=81;WE=55886302;WS=55886284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,85:0.66:129
chr12	55944926	rs7313959	G	A	1268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=0;PP=993;SC=TGTTCATTAAGATAAGCTTTA;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=35;WE=55944934;WS=55944916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	55945119	rs7313899	A	G	13219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=234;NR=159;PP=2965;SC=CATGCTAAGTATCCTAGGAAA;SOR=1.118;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=393;TCF=234;TCR=159;TR=393;WE=55945127;WS=55945109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,412:1.00:412
chr12	56030938	rs10876838	C	T	6711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=117;PP=2965;SC=CTGGGCTCCCCGCATCCCCAG;SOR=1.074;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=201;TCF=84;TCR=117;TR=201;WE=56030946;WS=56030928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr12	56031273	rs7970885	G	A	12080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.044;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=188;NR=185;PP=2965;ReadPosRankSum=1.720;SC=CGAGATCTCCGTGATGACAGC;SOR=0.257;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=375;TCF=188;TCR=187;TR=373;WE=56031281;WS=56031263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,382:1.00:383
chr12	56079084	rs3852533	C	G	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.202;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=29;PP=683;ReadPosRankSum=-0.043;SC=TATAAGGACACCAGGCCAGAC;SOR=0.398;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=109;TCF=20;TCR=89;TR=37;WE=56079092;WS=56079074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,37:0.34:110
chr12	56080148	rs3782239	T	C	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.229;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=520;ReadPosRankSum=0.525;SC=GATGGAAAGATTGAGGAAGGA;SOR=0.476;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=71;TCF=12;TCR=59;TR=27;WE=56080156;WS=56080138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,28:0.37:75
chr12	56080164	rs7306191	T	G	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.764;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=478;ReadPosRankSum=0.454;SC=AAGGACAGGATCCCCTATCTC;SOR=0.211;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=64;TCF=7;TCR=57;TR=26;WE=56080172;WS=56080154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,26:0.39:66
chr12	56082506	.	CA	C	386	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=14;HapScore=4;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=59.07;NF=10;NR=1;PP=386;QD=35.4545454545;SC=GACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=11;WE=56082528;WS=56082496;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr12	56082520	rs11306628	A	G	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQRankSum=0.717;QD=3.25;ReadPosRankSum=-0.932;SOR=0.287;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr12	56082785	rs3782240	C	G	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.333;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=224;ReadPosRankSum=0.042;SC=TCAGCTCAACCCTGCTGAGAC;SOR=0.012;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=14;WE=56082793;WS=56082775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr12	56087144	.	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.646;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=5.755;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQRankSum=-1.553;QD=4.06;ReadPosRankSum=-0.771;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr12	56088206	rs7953669	T	C	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.265;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=1106;ReadPosRankSum=2.148;SC=CACCTCACCCTTCCGGCCCCG;SOR=0.850;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=172;TCF=86;TCR=86;TR=58;WE=56088214;WS=56088196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,59:0.35:170
chr12	56088773	rs2293410	C	T	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.542;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=29;PP=683;ReadPosRankSum=-0.237;SC=TCAGACCCCACTCCTGCTAAG;SOR=0.978;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=123;TCF=43;TCR=80;TR=42;WE=56088781;WS=56088763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,43:0.34:128
chr12	56089357	rs1800974	C	T	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.097;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=9;PP=386;ReadPosRankSum=-0.624;SC=GAAGCGGGCGCGGACCAGCTG;SOR=0.440;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=87;TCF=62;TCR=25;TR=26;WE=56089365;WS=56089347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,27:0.30:89
chr12	56089554	rs2293411	T	C	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.556;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=130;ReadPosRankSum=0.256;SC=CTGCTGCTTATTAGCCATGTG;SOR=0.022;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=9;WE=56089562;WS=56089544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr12	56090038	rs7974721	C	T	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.882;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=168;ReadPosRankSum=-0.382;SC=CAGCTCCTCCCCCTGGGCTAA;SOR=0.098;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=9;WE=56090046;WS=56090028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr12	56091617	rs2293412	A	G	2116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-6.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.977;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=47;PP=1638;ReadPosRankSum=-0.212;SC=CTAGAGAACCAGCTGTCAGCC;SOR=0.805;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=313;TCF=158;TCR=155;TR=101;WE=56091625;WS=56091607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:217,104:0.32:321
chr12	56092682	rs3847675	C	T	3483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.855;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=86;PP=2584;ReadPosRankSum=-0.328;SC=CCAGACCTTTCCCCGAGTCAA;SOR=0.552;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=209;TCF=70;TCR=139;TR=135;WE=56092690;WS=56092672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,139:0.65:215
chr12	56093817	rs11171660	T	G	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.159;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=296;ReadPosRankSum=0.165;SC=ACATCCAGAGTAGGGGCCACA;SOR=2.110;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=14;WE=56093825;WS=56093807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,14:0.29:48
chr12	56095367	.	CTT	C	100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=3.123;QD=4.80;ReadPosRankSum=0.457;SOR=0.175;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr12	56096816	rs2293413	T	C	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.778;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=29;PP=589;ReadPosRankSum=-0.757;SC=TCCCCCACTCTGTTCATGCAG;SOR=0.406;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=126;TCF=36;TCR=90;TR=43;WE=56096824;WS=56096806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,45:0.35:129
chr12	56182846	rs3741504	G	C	3191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=89;PP=2570;ReadPosRankSum=0.147;SC=TACTTCCATCGAGCCTACATT;SOR=0.709;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=166;TCF=35;TCR=131;TR=112;WE=56182854;WS=56182836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,114:0.68:167
chr12	56216425	.	C	G	3055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.864;ClippingRankSum=0.000;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=51;PP=2244;ReadPosRankSum=-0.190;SC=ATGCTTGACTCTGCCCAAAAG;SOR=0.650;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=84;TCR=72;TR=110;WE=56216433;WS=56216415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,116:0.72:161
chr12	56216509	.	C	G	2112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.877;ClippingRankSum=0.000;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.724;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=46;PP=1636;ReadPosRankSum=0.458;SC=CGGTCCATTTCAAACCTCCTG;SOR=0.909;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=105;TCF=38;TCR=67;TR=71;WE=56216517;WS=56216499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,76:0.68:111
chr12	56220974	.	CAA	C	282.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=-0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=5.119;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.30;MQRankSum=-1.094;QD=14.14;ReadPosRankSum=-1.173;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr12	56236043	rs2291268	G	A	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=2;PP=608;SC=ATGGTTTAGGGTCAGGAGGAG;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=56236051;WS=56236033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	56236318	rs7310325	T	C	234.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=5;PP=193;SC=AGGAGGGACCTGATATGGAAG;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=9;WE=56236326;WS=56236308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	56236531	rs7294345	A	G	2653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=29;PP=2044;SC=GACTTACCACAGGCGCCACCT;SOR=1.661;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=95;TCF=64;TCR=31;TR=93;WE=56236539;WS=56236521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr12	56295544	rs147424544	GAAGT	G	1476.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=1;PP=1286;SC=GCAGGAGGTGGAAGTAAGCCA;SOR=5.670;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=27;WE=56295555;WS=56295534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	56295734	rs7302270	A	G	4908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=80;PP=2965;SC=GCTCTTTGCTAGGCTGGCTGA;SOR=0.816;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=72;TCR=80;TR=152;WE=56295742;WS=56295724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr12	56298115	rs61956424	T	C	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.24;QD=45.75;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	56298120	rs61956425	A	G	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.39;QD=41.49;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	56320843	.	G	C	684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.451;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=55.228;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-1.583;QD=10.07;ReadPosRankSum=-1.908;SOR=6.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,30:0.44:68
chr12	56320845	.	G	C	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.111;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=36.816;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=-2.216;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.102;SOR=5.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,17:0.29:59
chr12	56320848	.	T	C	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.820;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=36.298;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-2.294;QD=5.88;ReadPosRankSum=-3.540;SOR=5.529;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,17:0.27:62
chr12	56320852	.	G	C	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=9.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.92;ReadPosRankSum=-2.382;SOR=3.024;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,4:0.08:51
chr12	56326493	rs57799285	GCA	G	311.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;QD=28.34;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	56330572	rs7297871	G	A	4583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=76;PP=2965;SC=GCAAGGTCTCGGCTCTCTACC;SOR=0.821;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=68;TCR=77;TR=144;WE=56330580;WS=56330562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr12	56335107	rs1136082	A	G	2941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=75;PP=2491;ReadPosRankSum=0.295;SC=AGCAGGGGCAAAGGTGAGGAG;SOR=2.632;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=13;TCR=76;TR=88;WE=56335115;WS=56335097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
chr12	56348028	rs1052206	G	A	1813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=21;PP=1491;SC=GGAGGGGGCTGTTCTCACCAA;SOR=1.453;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=36;TCR=21;TR=57;WE=56348036;WS=56348018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	56398454	rs773115	G	C	3621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=63;PP=2759;SC=CTGTCCAGTCGGCCATCACAG;SOR=0.848;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=118;TCF=55;TCR=63;TR=117;WE=56398462;WS=56398444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr12	56417403	rs2658479	T	C	2740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.070;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=21;PP=2201;ReadPosRankSum=-0.799;SC=AGGATATGAATGGGAAATGGT;SOR=2.283;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=66;TCR=22;TR=86;WE=56417411;WS=56417393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
chr12	56426577	rs1619653	A	G	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=33;PP=948;SC=AGTATCTCCCACACTGAGGGA;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=34;WE=56426585;WS=56426567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	56428344	rs2452822	G	C	4052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=29;PP=2965;SC=CTGAGTTCCTGTTCTCCACAG;SOR=2.283;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=92;TCR=29;TR=121;WE=56428352;WS=56428334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr12	56435929	rs1131017	C	G	4379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.545;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=71;PP=2965;ReadPosRankSum=1.735;SC=ACCGTCTCCTCTCTCCGGTCC;SOR=0.634;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=133;TCF=62;TCR=71;TR=132;WE=56435937;WS=56435919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,137:0.99:138
chr12	56436472	rs705706	T	G	1058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=31;PP=831;SC=GGCTCTGTTCTTTGGAGCCTC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=56436480;WS=56436462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	56477694	rs2271194	A	T	1705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=47;PP=1497;SC=CAGGTTAGTGAGCCCACCCTC;SOR=3.570;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=7;TCR=47;TR=54;WE=56477702;WS=56477684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	56478658	rs7971751	A	C	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.26;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	56482180	rs2292239	T	G	297.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=1;PP=217;SC=TTTGAATCTATAGGGCAGCAC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=56482188;WS=56482177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	56488913	rs705708	G	A	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.683;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=636;ReadPosRankSum=0.112;SC=GCCATGTCTTGGGATCAGCTC;SOR=0.208;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=27;WE=56488921;WS=56488903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,27:0.69:39
chr12	56492195	rs375692480	CA	C	32.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQRankSum=0.566;QD=2.34;ReadPosRankSum=1.053;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr12	56504143	rs370708635	CA	C	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.38;MQRankSum=-0.381;QD=1.47;ReadPosRankSum=0.336;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr12	56551339	rs28365930	C	CAAA	979.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.213;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,29:0.31:94
chr12	56553984	rs199922384	CACTT	C	1568.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.220;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.082;NF=9;NR=24;PP=1390;ReadPosRankSum=-0.127;SC=TGAGGTACCTCACTTGTCACC;SOR=1.447;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=116;TCF=46;TCR=70;TR=33;WE=56553995;WS=56553974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,46:0.32:144
chr12	56564056	rs60041436	CTTTT	C	1889.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=32;PP=1793;SC=GTGTCTAACACTTTTCTTTTT;SOR=2.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=38;WE=56564067;WS=56564046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	56572452	.	TGAAAGG	T	1996.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.358;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=1.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.52;ReadPosRankSum=-0.785;SOR=0.986;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,49:0.70:70
chr12	56572453	.	GAAAGGGTCAGAGTTTTGAACA	G	2923	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=17;NR=2;PP=2923;QD=20;SC=CCAGGACTCTGAAAGGGTCAG;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=19;WE=56572483;WS=56572443;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr12	56572460	.	TCAGAGTTTTGAACAA	T	1975.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.521;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=2.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.70;ReadPosRankSum=0.722;SOR=1.110;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,51:0.64:80
chr12	56572475	.	A	T	1852	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=19;NR=2;PP=1852;QD=89.8462482165;SC=GTTTTGAACAAAGCTGGAATT;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=71;TCF=62;TCR=9;TR=21;WE=56572483;WS=56572443;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:50,21:0.30:71
chr12	56575742	rs773644	T	G	3310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=43;PP=2820;SC=GGGTAGACTGTTCCTGGCATT;SOR=0.952;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=58;TCR=43;TR=101;WE=56575750;WS=56575732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr12	56601237	rs703823	A	G	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=28;PP=911;SC=CCACCCAAACACATAAGACAT;SOR=2.899;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=33;WE=56601245;WS=56601227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	56604416	rs10532115	GAT	G	2705.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=41;PP=2188;SC=GCCTGGATATGATATAACTCT;SOR=3.575;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=43;WE=56604428;WS=56604406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr12	56604420	rs79677444	T	C	2714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=42;PP=1399;SC=GGATATGATATAACTCTACAA;SOR=3.647;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=47;WE=56604428;WS=56604406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	56607927	rs4759218	C	T	3225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=74;PP=2574;SC=ACACTCATTGCCAAGATCCAT;SOR=2.256;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=23;TCR=74;TR=97;WE=56607935;WS=56607917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr12	56625045	rs1274497	T	C	5034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=46;PP=2965;SC=GCCCCTAAGCTATTCCCCTCA;SOR=1.818;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=106;TCR=46;TR=152;WE=56625053;WS=56625035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr12	56629276	rs901073	A	C	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=8;PP=945;SC=GGCTTGCCACAATCCATGCAA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=34;WE=56629284;WS=56629273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	56647911	rs808919	G	C	2672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=36;PP=1994;SC=CGCCATTGGTGGAGACTGCAG;SOR=1.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=46;TCR=36;TR=82;WE=56647919;WS=56647901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr12	56649601	rs1274490	A	G	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=6;PP=414;SC=CATGGTGCAGAGCACTGCGCC;SOR=1.508;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=19;WE=56649609;WS=56649591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	56650742	rs1274491	C	T	682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=5;PP=569;SC=ACCCTTAACCCCCACCTTTAA;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=56650750;WS=56650732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	56717466	rs773665	C	T	1791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=41;PP=1308;SC=CGTCTTCAAACTGGGATTCCT;SOR=2.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=10;TCR=41;TR=51;WE=56717474;WS=56717456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	56722060	rs1918496	T	G	2285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=35;PP=1776;SC=TCAATCTCTATTATGTGATTC;SOR=0.807;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=33;TCR=35;TR=68;WE=56722068;WS=56722050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr12	56726518	rs2643626	G	A	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=3;PP=626;SC=CTGGCTATCTGCAAAGCAGCT;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=56726526;WS=56726508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	56744091	rs4759016	A	C	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.960;NF=18;NR=19;PP=807;ReadPosRankSum=0.891;SC=CTTTGTCCATATCCCAAATCC;SOR=0.737;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=69;TCF=34;TCR=35;TR=37;WE=56744099;WS=56744081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,38:0.54:71
chr12	56744732	rs2855331	A	G	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.435;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=818;ReadPosRankSum=-0.410;SC=GATAGACTAGATGTTTGAAAA;SOR=0.673;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=41;TCF=21;TCR=20;TR=32;WE=56744740;WS=56744722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,32:0.78:41
chr12	56754896	.	C	T	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.166;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=122;ReadPosRankSum=0.354;SC=CATTTACGTTCTTACGTTTTA;SOR=0.042;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=7;WE=56754904;WS=56754886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr12	56814256	rs10631263	G	GGAT	927.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.869;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=917;ReadPosRankSum=2.430;SC=ATGACGATAAGGATAAGGAGG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=20;WE=56814264;WS=56814246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr12	56814570	rs812279	T	G	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.398;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=660;ReadPosRankSum=0.481;SC=AGGGCTCTTCTCCTAAAAGTG;SOR=0.941;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=116;TCF=56;TCR=60;TR=40;WE=56814578;WS=56814560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,43:0.34:125
chr12	56814653	rs2291739	G	A	2439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.198;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=33;PP=1974;ReadPosRankSum=0.919;SC=CCATAGGAGCGGGATAGAAAA;SOR=0.530;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=142;TCF=90;TCR=52;TR=87;WE=56814661;WS=56814643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,87:0.61:143
chr12	56815281	rs2291738	T	C	2389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=42;PP=1825;ReadPosRankSum=-0.146;SC=AGGACATCTATAAAAAGCAAG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=123;TCF=62;TCR=61;TR=86;WE=56815289;WS=56815271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,90:0.70:128
chr12	56815922	rs774047	C	T	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.331;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=231;ReadPosRankSum=0.308;SC=GTACAGCTCCCGAAGATGAGC;SOR=1.002;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=60;TCF=14;TCR=46;TR=16;WE=56815930;WS=56815912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,16:0.28:58
chr12	56818982	rs12824030	G	C	2349.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=2;NR=59;PP=2214;SC=GCTAAAGAGGGCTTTCCCCAT;SOR=6.059;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=61;TCF=2;TCR=59;TR=61;WE=56818991;WS=56818972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	56818983	rs35382350	C	CT	433.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=2.452;NF=0;NR=20;PP=589;ReadPosRankSum=0.999;SC=CTAAAGAGGGCTTTCCCCATC;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=0;TCR=59;TR=20;WE=56818991;WS=56818972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,20:0.34:58
chr12	56821998	rs774026	A	G	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=95;ReadPosRankSum=0.932;SC=AGCTCTTTCTACATTGTGGGG;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=6;WE=56822006;WS=56821988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr12	56822378	rs774027	T	A	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=880;ReadPosRankSum=-0.522;SC=TCTGGAGATATGTCCATCTCA;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=88;TCF=41;TCR=47;TR=44;WE=56822386;WS=56822368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,46:0.50:92
chr12	56822641	rs774028	G	C	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=2;PP=548;SC=CTAGCTCACTGTATCTCCAGT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=56822649;WS=56822631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	56825311	rs774033	C	T	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.848;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=516;ReadPosRankSum=0.359;SC=GCTGGCGCAACACCTCCAGTT;SOR=0.972;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=78;TCF=42;TCR=36;TR=30;WE=56825319;WS=56825301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,33:0.40:82
chr12	56825981	rs774039	A	G	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.476;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=1.890;SC=AGTAACTGAAATCAAGGAAAG;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=6;WE=56825989;WS=56825973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr12	56826061	rs774040	G	A	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=5;PP=1085;SC=GCCTTCCCCAGATAATGCAGC;SOR=3.664;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=39;WE=56826069;WS=56826051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	56826758	.	A	AAG	1637	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=20;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=30;MQ=60.41;NF=18;NR=39;PP=1637;QD=28.7719298246;SC=AAAAAAAAAAAGGCAGCTCAA;SbPval=0.01;Source=Platypus;TC=124;TCF=69;TCR=55;TR=57;WE=56826766;WS=56826748;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:67,57:0.46:124
chr12	56827694	rs2279665	C	G	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.815;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=48;PP=1334;ReadPosRankSum=1.474;SC=AATAGCGGATCAGATCCTTCA;SOR=1.236;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=82;TCF=11;TCR=71;TR=54;WE=56827702;WS=56827684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,56:0.67:84
chr12	56827974	rs2638312	C	T	3109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=62;PP=2382;SC=GACCAACCAACAGAGAAGGAA;SOR=1.540;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=31;TCR=62;TR=93;WE=56827982;WS=56827964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr12	56845296	rs2643622	T	C	1463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.66;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	56845296	.	TAGCAACG	CAGCAACA,CAGCAACG	388	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=30;MQ=60.0;NF=3,4;NR=15,30;PP=388,304;QD=24.5259930479;SC=GGGGACAGAGTAGCAACGCTG;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=18,34;WE=56845311;WS=56845286;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.53:34
chr12	56845303	rs2088155	G	A	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=4.499;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.83;ReadPosRankSum=-1.478;SOR=0.166;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr12	56845358	rs7953824	T	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=102;ReadPosRankSum=-0.725;SC=ACTTGATATCTACAATAAACT;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=7;WE=56845366;WS=56845348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr12	56862886	rs2657881	T	C	1441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=15;PP=1170;SC=AGAGATGATATGGGTGTCAAA;SOR=1.390;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=49;WE=56862894;WS=56862876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	56865970	rs34265700	C	T	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.17;ReadPosRankSum=-0.952;SOR=0.570;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,19:0.25:75
chr12	56869971	rs79174190	TTTGTCACCC	T	375.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=2163;ReadPosRankSum=-0.540;SC=ACAGTCTTGCTTTGTCACCCT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=7;WE=56869987;WS=56869961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr12	56871314	rs11171862	G	A	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.967;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=2;PP=645;ReadPosRankSum=-0.281;SC=TGTGCCTCATGTGCCTTCTGG;SOR=2.224;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=28;WE=56871322;WS=56871304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr12	56872770	rs57130421	GAA	G	226.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQRankSum=1.745;QD=10.80;ReadPosRankSum=1.734;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr12	56915782	rs808929	G	A	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=4;PP=530;SC=TCTCTCTCTCGCTCGTTCCCT;SOR=2.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=13;WE=56915790;WS=56915751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	56956213	rs3759091	T	C	1017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=0;PP=834;SC=ATATGTGTCATTGGCTCAGCA;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=56956221;WS=56956203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	56956442	rs118006674	G	A	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.63;ReadPosRankSum=-1.075;SOR=0.420;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,15:0.26:57
chr12	56974915	rs76751511	G	A	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=63;ReadPosRankSum=0.579;SC=TTCAATGTGTGGAGAGCACAG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=56974923;WS=56974905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr12	56998366	.	C	G	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.809;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=108;ReadPosRankSum=0.318;SC=CCCAGCCTCTCACTTGATGAT;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=8;WE=56998374;WS=56998356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr12	57009255	.	C	T	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.891;ClippingRankSum=0.000;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=789;ReadPosRankSum=-1.809;SC=GTGAGTAGTTCCAGAGACAGT;SOR=0.725;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=151;TCF=67;TCR=84;TR=46;WE=57009263;WS=57009245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,45:0.29:153
chr12	57058405	.	C	G	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.983;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=736;ReadPosRankSum=1.245;SC=AATAGGTTGTCTTGCTATCAA;SOR=0.731;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=67;TCF=29;TCR=38;TR=39;WE=57058413;WS=57058395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,39:0.59:66
chr12	57065713	rs2958154	C	T	2052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=48;PP=1660;SC=TCTCACCTTTCTCATTTCTTT;SOR=2.494;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=13;TCR=48;TR=61;WE=57065721;WS=57065703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	57106660	rs4788	A	T	7450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.313;NF=107;NR=121;PP=2965;ReadPosRankSum=0.407;SC=TGACCAATTCAATGTCCTTAA;SOR=0.799;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=230;TCF=108;TCR=122;TR=228;WE=57106668;WS=57106650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,236:0.99:238
chr12	57106810	rs898609	G	A	2389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=60;PP=1937;SC=AATGCTATACGGCGAGAGTTA;SOR=5.136;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=4;TCR=60;TR=64;WE=57106818;WS=57106800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr12	57108203	rs4902	A	G	6583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=147;NR=74;PP=2965;ReadPosRankSum=0.619;SC=GTTCTTCATCAATTTCAGCTG;SOR=1.508;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=223;TCF=148;TCR=75;TR=221;WE=57108211;WS=57108193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,228:0.99:230
chr12	57109792	rs2958149	A	G	4840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=93;PP=2965;SC=AATCAGAGGCAGCAGCTCATC;SOR=1.130;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=64;TCR=93;TR=157;WE=57109800;WS=57109782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr12	57109931	rs2926747	A	T	2714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=54;PP=2211;SC=ACTGGTGGGGAGGGTGCTGCA;SOR=1.280;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=88;TCF=34;TCR=54;TR=87;WE=57109939;WS=57109921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr12	57112637	rs11171951	G	A	3926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=48;PP=2965;SC=GGGAAGGGCAGATTCACCACT;SOR=1.052;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=66;TCR=48;TR=114;WE=57112645;WS=57112627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr12	57114100	rs2926743	A	G	6118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=79;NR=102;PP=2965;SC=AGATAATGAAAAAGAGGTAGC;SOR=0.982;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=181;TCF=79;TCR=102;TR=181;WE=57114108;WS=57114090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr12	57114307	rs2958127	A	T	4515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=54;PP=2965;SC=AATGGTCTTCACTGTAGGGTC;SOR=1.204;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=79;TCR=54;TR=132;WE=57114315;WS=57114297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr12	57132186	rs56401813	AT	A	1952.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=23;PP=1720;SC=AAAACCCTGTATTTAAAGTGA;SOR=1.009;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=48;TCF=22;TCR=26;TR=44;WE=57132194;WS=57132176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	57133140	rs1131514	T	G	1928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=41;PP=1576;SC=TAGGCACAGATATGCGACCTG;SOR=1.727;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=21;TCR=41;TR=62;WE=57133148;WS=57133130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	57137828	rs1026565	T	A	1275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=19;PP=1007;SC=CTTAAAGTGCTTGGAGACTTT;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=21;TCR=19;TR=40;WE=57137836;WS=57137818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	57140457	rs63023761	CACAA	C	358.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQRankSum=1.299;QD=16.31;ReadPosRankSum=2.641;SOR=0.191;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr12	57140506	rs2958130	G	A	8363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.422;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=188;NR=41;PP=2965;ReadPosRankSum=1.427;SC=ATAGTTAATAGTAGTCAGAGG;SOR=3.041;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=230;TCF=188;TCR=42;TR=229;WE=57140514;WS=57140496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,231:1.00:232
chr12	57346828	rs4319546	C	T	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-4.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=413;ReadPosRankSum=1.645;SC=GAAGGTAAAACACAAACAATA;SOR=1.022;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=19;WE=57346836;WS=57346818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,26:0.74:35
chr12	57486647	rs324019	A	G	1679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=7;PP=1353;SC=GTGCTCTGCCAGTCGAGTGGC;SOR=3.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=48;TCR=7;TR=55;WE=57486655;WS=57486637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	57488195	rs116608496	C	T	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=3;PP=943;ReadPosRankSum=0.564;SC=GACAGAGCTACGCACAGCCAG;SOR=1.044;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=54;TCF=51;TCR=3;TR=41;WE=57488203;WS=57488185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,40:0.74:54
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chr12	57502182	rs324011	C	T	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=416;ReadPosRankSum=0.290;SC=TCCTAGGGACCGTCCCCACCA;SOR=1.519;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=18;WE=57502190;WS=57502172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr12	57543572	rs10876966	C	T	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.339;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=28;PP=664;ReadPosRankSum=1.923;SC=AAACAAGGAGCATGAGGCCAC;SOR=1.863;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=31;WE=57543580;WS=57543562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,30:0.75:40
chr12	57559809	rs1800174	G	A	2017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.499;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=36;PP=1458;ReadPosRankSum=1.249;SC=ATACTGGAGCGGGCAGGAAGC;SOR=0.635;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=222;TCF=118;TCR=104;TR=77;WE=57559817;WS=57559799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,84:0.36:232
chr12	57561379	rs1800175	G	T	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.108;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=388;ReadPosRankSum=0.764;SC=TCCAGGGAAGGCAAAGGGCTT;SOR=0.109;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=63;TCF=11;TCR=52;TR=22;WE=57561387;WS=57561369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,22:0.32:69
chr12	57561451	rs1800176	C	T	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=171;ReadPosRankSum=0.766;SC=TGGGAGAAAACAGGAGAAGTC;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=10;WE=57561459;WS=57561441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr12	57567180	rs1800177	G	T	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.998;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=370;ReadPosRankSum=-1.049;SC=AATGTGGGCAGGAGGAGACCG;SOR=0.468;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=66;TCF=22;TCR=44;TR=26;WE=57567188;WS=57567170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,26:0.38:69
chr12	57567762	rs1800194	C	T	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=250;ReadPosRankSum=0.496;SC=GCGAGCTCTGCGGTGAGGCCT;SOR=0.634;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=50;TCF=4;TCR=46;TR=16;WE=57567770;WS=57567752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,16:0.31:52
chr12	57569513	rs1800180	G	A	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.529;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=31;PP=958;ReadPosRankSum=-0.526;SC=AGGTGTGGTGGGGCAGGCCGA;SOR=0.843;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=124;TCF=42;TCR=82;TR=45;WE=57569521;WS=57569503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,47:0.37:126
chr12	57578288	rs1800181	C	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=274;ReadPosRankSum=-0.032;SC=GACCCAGGCTCCTGTTCCCTG;SOR=1.077;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=14;WE=57578296;WS=57578278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr12	57578673	rs34577247	G	A	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.976;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=17;PP=1166;ReadPosRankSum=0.169;SC=TGAACGGATCGACCTGGAGAC;SOR=0.522;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=79;TCF=56;TCR=23;TR=54;WE=57578681;WS=57578663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,57:0.67:85
chr12	57579727	rs1800182	A	T	952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.034;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=35;PP=730;ReadPosRankSum=0.130;SC=AGGAAGTGGGACATGGGGCGG;SOR=0.097;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=148;TCF=11;TCR=137;TR=41;WE=57579735;WS=57579717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,43:0.29:149
chr12	57581028	rs6581127	C	G	3600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=11;PP=2965;SC=CCTGACAAATCGCTGCTCCTG;SOR=4.174;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=95;TCR=11;TR=106;WE=57581036;WS=57581018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr12	57585144	rs1800139	C	T	2124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.972;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=48;PP=1691;ReadPosRankSum=0.420;SC=TCGGGCTGGCCGTGTATGGGG;SOR=1.246;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=122;TCF=51;TCR=71;TR=79;WE=57585152;WS=57585134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,80:0.65:123
chr12	57587839	rs1800187	C	T	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.380;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=660;ReadPosRankSum=0.851;SC=TCCTCCCCATCGCTCACTGCA;SOR=0.223;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=31;WE=57587847;WS=57587829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,31:0.70:44
chr12	57588977	rs1799739	CG	C	2916.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.492;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.478;NF=51;NR=35;PP=2694;ReadPosRankSum=0.415;SC=CTGCAGACGACGGCGAACCAT;SOR=0.586;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=279;TCF=168;TCR=111;TR=86;WE=57588985;WS=57588967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,107:0.34:319
chr12	57589659	rs1800154	C	T	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.778;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=535;ReadPosRankSum=1.861;SC=ACCCGACCTGCGGCCCCAGTG;SOR=1.080;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=116;TCF=47;TCR=69;TR=35;WE=57589667;WS=57589649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,35:0.29:119
chr12	57589784	rs7397167	A	C	2958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=38;PP=2250;SC=TGCACCAGCCAAGGTGGGCCC;SOR=1.038;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=50;TCR=38;TR=88;WE=57589792;WS=57589774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr12	57589865	rs1800189	C	T	1586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.862;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=1192;ReadPosRankSum=-1.130;SC=TCCGCCCCTCCGCAGAGCACA;SOR=0.624;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=82;TCF=43;TCR=39;TR=51;WE=57589873;WS=57589855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,57:0.63:91
chr12	57590735	rs7308552	T	C	779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=1;PP=602;SC=CCCTGCCACATGCCCAGCCCA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=57590743;WS=57590725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	57590758	rs1800191	C	T	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=293;ReadPosRankSum=0.053;SC=GCTCCCTGTGCCTGCAGTGCC;SOR=2.066;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=14;WE=57590766;WS=57590748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr12	57590797	rs1800156	C	T	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=3;PP=632;ReadPosRankSum=-0.445;SC=GGCTGAAGGACGACGGCCGGA;SOR=1.981;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=64;TCF=52;TCR=12;TR=30;WE=57590805;WS=57590787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr12	57590869	rs7308698	T	C	5032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=50;PP=2965;SC=GCATCAACACTCATGGCAGCT;SOR=1.625;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=104;TCR=50;TR=154;WE=57590877;WS=57590859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr12	57591226	rs1800165	T	C	1076.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=33;PP=743;ReadPosRankSum=-0.611;SC=ACAGCCTCCCTTGCAAGTCTC;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=135;TCF=28;TCR=107;TR=41;WE=57591234;WS=57591216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,43:0.33:131
chr12	57591458	rs1800166	C	T	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=70;ReadPosRankSum=1.326;SC=GTGAGGCGGGCGGCCCTCGGC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=7;WE=57591466;WS=57591448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chr12	57592557	rs1800168	C	T	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=31;PP=1006;ReadPosRankSum=-0.917;SC=ACATAAAAAGCGGAGGATATG;SOR=0.787;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=61;TCF=15;TCR=46;TR=42;WE=57592565;WS=57592547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,45:0.69:65
chr12	57593101	rs1140648	G	A	2953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.002;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=82;PP=2332;ReadPosRankSum=-0.168;SC=ACAAGACCACGGGCACCAACA;SOR=1.411;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=150;TCF=38;TCR=112;TR=106;WE=57593109;WS=57593091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,107:0.71:150
chr12	57593894	rs1800159	A	G	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.846;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=290;ReadPosRankSum=-0.359;SC=CTCTGTCCTAATGTCCTCATG;SOR=0.148;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=13;WE=57593902;WS=57593884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr12	57594955	rs11172124	G	A	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.736;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=585;ReadPosRankSum=-0.173;SC=CAGAGGTGGTGGTGGGCCGGT;SOR=0.580;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=112;TCF=47;TCR=65;TR=36;WE=57594963;WS=57594945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,39:0.32:120
chr12	57595066	rs9669595	G	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.531;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=196;ReadPosRankSum=0.359;SC=TATATTGGGTGTAACTTGCTT;SOR=0.266;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=59;TCF=15;TCR=44;TR=15;WE=57595074;WS=57595056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,18:0.28:64
chr12	57602815	rs7956957	C	G	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=502;ReadPosRankSum=-0.645;SC=CTTTCCACCCCGAGCCTGGGT;SOR=0.919;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=28;WE=57602823;WS=57602805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr12	57603417	rs1800162	A	G	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.303;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=260;ReadPosRankSum=-0.848;SC=TGTCGTGGACAGCATGGCCAG;SOR=1.528;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=56;TCF=46;TCR=10;TR=20;WE=57603425;WS=57603407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr12	57604802	rs1800164	A	G	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.108;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=717;ReadPosRankSum=0.914;SC=AGCCAGGCCCAAGCTGCTGGC;SOR=0.313;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=48;TCF=28;TCR=20;TR=31;WE=57604810;WS=57604792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr12	57605168	rs10783814	T	C	4793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=69;NR=97;PP=2965;SC=TCCACCCAGCTGGGCCCCTGC;SOR=1.080;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=69;TCR=97;TR=166;WE=57605176;WS=57605158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr12	57605465	rs150806152	G	A	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.358;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=29;PP=778;ReadPosRankSum=2.472;SC=CCCACCCCCCGCCCTGTTTTC;SOR=0.461;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=56;TCF=11;TCR=45;TR=37;WE=57605473;WS=57605455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,38:0.66:58
chr12	57606386	rs7304504	A	G	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=728;ReadPosRankSum=1.675;SC=GCCCCCTGCCAGTGAAGTCCT;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=27;WE=57606394;WS=57606376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr12	57614958	rs7134826	G	T	2783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=21;PP=2181;SC=AGGCTGTCCTGTCCACCCCAC;SOR=2.356;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=65;TCR=21;TR=86;WE=57614966;WS=57614948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	57618619	rs61736007	G	A	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.043;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=207;ReadPosRankSum=0.083;SC=GGATGGCGGGGGACAACCCCA;SOR=1.634;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=12;WE=57618627;WS=57618609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr12	57619209	rs7979061	C	G	3405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=61;NR=55;PP=2943;SC=CGGCGGGGCCCGGGCTTGGGG;SOR=0.710;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=61;TCR=55;TR=116;WE=57619217;WS=57619199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr12	57619362	rs10783816	G	A	1732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.548;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=30;PP=1328;ReadPosRankSum=0.960;SC=TGTACGACCCGTCGCAGGTGT;SOR=1.054;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=254;TCF=141;TCR=113;TR=78;WE=57619370;WS=57619352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,80:0.31:258
chr12	57627717	rs34095989	G	A	2760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.674;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=50;PP=2071;ReadPosRankSum=-0.608;SC=GAGGGAAGGGGCTCCCATGCT;SOR=0.297;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=156;TCF=87;TCR=69;TR=101;WE=57627725;WS=57627707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,108:0.66:164
chr12	57639190	rs7139342	C	T	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=375;SC=GGTCTCCCTCCGTCACCCAGG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=57639198;WS=57639180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	57643318	rs35971501	G	GC	1095.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=5;PP=1024;SC=TGGCTTCCCAGCCCCCCACAC;SOR=3.086;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=31;WE=57643326;WS=57643308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	57691990	rs34608793	AC	A	944.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=1031;SC=AATACATGAAACTGCTTTGCA;SOR=5.058;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=23;WE=57691998;WS=57691980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	57693060	rs4760126	G	A	2022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=15;SC=CAGTAAGGCTGGCAGGTGCCA;SOR=2.129;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=47;TCR=15;TR=62;WE=57693068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	57703935	rs7139302	G	A	1856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=1;PP=1547;SC=TGAGGGTGCAGTGGGCCCTAA;SOR=6.630;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=53;TCF=52;TCR=1;TR=53;WE=57703943;WS=57703925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	57704005	rs57612216	GA	G	2325.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.607;HP=11;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.256;NF=52;NR=31;PP=1362;ReadPosRankSum=0.490;SC=GTCTCTAAAGGAAAAAAAAAA;SOR=1.659;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=111;TCF=69;TCR=42;TR=83;WE=57704013;WS=57703995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,96:0.98:98
chr12	57843014	rs776037	C	T	2774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=25;PP=2142;SC=GTTGGTAGAACTGACAGTCAG;SOR=1.880;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=66;TCR=25;TR=90;WE=57843022;WS=57843004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr12	57845706	rs2280139	G	A	1197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=28;PP=936;SC=ACCTGGGGGGGCTAAATTTTA;SOR=1.981;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=38;WE=57845714;WS=57845696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	57848639	rs3809114	G	A	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=535;ReadPosRankSum=0.695;SC=CCTAGCCCCAGTGCTAGAAAT;SOR=0.880;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=22;WE=57848647;WS=57848629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
chr12	57848708	rs3809113	C	G	2249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=21;PP=1698;SC=CACTGGAACTCACAGCTGCCT;SOR=1.545;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=45;TCR=21;TR=65;WE=57848716;WS=57848698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
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chr12	57858414	rs3817475	A	G	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.56;ReadPosRankSum=2.099;SOR=0.673;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,33:0.28:120
chr12	57858835	rs3817474	G	A	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=346;ReadPosRankSum=-0.381;SC=CCTCCAAATAGCCCAATCCTT;SOR=0.784;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=79;TCF=58;TCR=21;TR=24;WE=57858843;WS=57858825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,26:0.31:84
chr12	57859431	rs2228225	G	A	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=4.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.29;ReadPosRankSum=0.622;SOR=1.150;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,31:0.23:136
chr12	57859932	rs2292657	G	A	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=5.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=292;ReadPosRankSum=-0.042;SC=AGGTGGAGTCGTGGAAGAGGA;SOR=0.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=52;TCR=1;TR=17;WE=57859940;WS=57859922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,18:0.35:52
chr12	57865321	rs2228224	G	A	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.920;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=24;PP=1009;ReadPosRankSum=1.006;SC=TTTCTGGGGGGTTCCCAGGTT;SOR=0.946;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=161;TCF=84;TCR=77;TR=56;WE=57865329;WS=57865311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,57:0.35:162
chr12	57865821	rs2228226	G	C	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=17;PP=342;ReadPosRankSum=-1.006;SC=TGGGGAAACAGAATTCCTCAA;SOR=0.524;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=81;TCF=13;TCR=68;TR=21;WE=57865829;WS=57865811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,23:0.27:85
chr12	57865928	rs474058	A	C	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=647;SC=CTGCAGTCCCATGCACAAGAT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=57865936;WS=57865918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	57868132	rs145106882	C	T	1738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.235;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=39;PP=1352;ReadPosRankSum=-0.705;SC=AGGAATAGTACATGGGGGTTT;SOR=0.995;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=92;TCF=41;TCR=51;TR=63;WE=57868140;WS=57868122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,66:0.69:95
chr12	57869241	rs527226	T	C	2017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=19;PP=1708;SC=GCTCCCGGACTCTCCCTCCCC;SOR=1.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=44;TCR=19;TR=63;WE=57869249;WS=57869231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	57869447	rs2277318	T	C	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.316;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=388;ReadPosRankSum=-0.079;SC=GAGAAATCTGTATCCCTAGCT;SOR=0.407;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=56;TCF=12;TCR=44;TR=21;WE=57869455;WS=57869437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,21:0.36:59
chr12	57869476	rs2277317	G	A	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=17.150;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.875;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,18:0.35:52
chr12	57869486	rs2277316	A	G	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=16.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.82;ReadPosRankSum=0.380;SOR=1.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr12	57869500	rs524522	A	C	1310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=16;SC=CGGCCCAGGCAAGGGCTCTCC;SOR=0.850;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=18;TCR=16;TR=34;WE=57869508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	57869530	rs3216740	CA	C	487.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.871;HP=4;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.478;NF=11;NR=3;PP=447;ReadPosRankSum=0.776;SC=ACCCTGCCCCCAACTGCTCCT;SOR=2.133;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=14;WE=57869538;WS=57869520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr12	57869582	rs2277315	T	C	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.501;NF=28;NR=6;PP=625;ReadPosRankSum=0.600;SC=TCCCGGCCGGTCGGAGCCTCC;SOR=0.602;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=72;TCF=59;TCR=13;TR=34;WE=57869590;WS=57869572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr12	57870121	rs486699	A	C	1439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=11;PP=1256;ReadPosRankSum=1.789;SC=GCCCGCACCCATCCTGCGCCT;SOR=0.960;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=42;WE=57870129;WS=57870111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr12	57870155	rs11544238	A	C	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.245;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=311;ReadPosRankSum=-0.535;SC=ACCCAGCCTGAGGAGGGCGCT;SOR=0.473;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=18;WE=57870163;WS=57870145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,18:0.32:56
chr12	57870463	rs10706671	AG	A	772.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQ=60.12;MQRankSum=1.564;NF=4;NR=22;PP=850;ReadPosRankSum=-0.222;SC=GGGATCTGTAAGTCACCCTCG;SOR=0.466;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=84;TCF=10;TCR=74;TR=26;WE=57870471;WS=57870453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,27:0.30:91
chr12	57870648	rs512490	A	G	1907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=8;PP=1676;SC=GAAATGGGAGATTCACATGGG;SOR=3.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=50;TCR=8;TR=58;WE=57870656;WS=57870638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	57871555	rs3825080	A	G	2139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=47;PP=1582;SC=TCCCTCCCCCATTGTCTTCTC;SOR=1.778;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=68;WE=57871563;WS=57871545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr12	57872815	rs78817014	G	A	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.234;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=541;ReadPosRankSum=0.760;SC=AGAAGCCAGGGAGGTAGGAAG;SOR=0.941;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=68;TCF=57;TCR=11;TR=27;WE=57872823;WS=57872805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,28:0.39:71
chr12	57883801	rs899653	G	A	1869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=44;PP=1496;SC=TGGTGTAGGGGTTACAGAATG;SOR=2.342;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=13;TCR=44;TR=57;WE=57883809;WS=57883791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr12	57891804	rs537161	T	C	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=1;PP=1234;SC=CCTGTGGGTTTGTGTGCAGAA;SOR=6.184;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=41;WE=57891812;WS=57891794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	57905687	rs1284467	A	G	4795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=57;PP=2965;SC=ATTCAGCCTTAGTGTTGAAAC;SOR=1.194;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=91;TCR=58;TR=148;WE=57905695;WS=57905677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr12	57920262	rs2127318	T	G	1200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=14;PP=996;SC=CTTTGAGGGTTTTCTGGGTTG;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=36;WE=57920270;WS=57920252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	57940749	rs775325	C	T	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=10;PP=796;SC=CTGGTTTCTGCTGGGGGTCCT;SOR=1.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=33;WE=57940757;WS=57940739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	57968738	rs11172254	G	A	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=588;SC=GCTAAAGGTCGTTTGGAAAAT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=57968746;WS=57968731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	57969632	.	A	G	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=384;ReadPosRankSum=-1.046;SC=CACTCAAAGCATTAGCTTGAA;SOR=0.614;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=10;TCR=48;TR=22;WE=57969640;WS=57969622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,22:0.36:61
chr12	57975155	rs775246	A	C	2573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=14;PP=2005;ReadPosRankSum=-0.534;SC=GGGCAAATGCAGGGTCATAGC;SOR=0.773;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=141;TCF=121;TCR=20;TR=92;WE=57975163;WS=57975145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,94:0.64:146
chr12	57975570	rs775247	A	G	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=5;PP=507;SC=CAGCTCTATCACTGAGGATGA;SOR=1.828;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=57975578;WS=57975560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	57975910	rs775248	C	G	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=279;ReadPosRankSum=1.098;SC=ACCTGTAGTCCTAGCTACTTG;SOR=2.235;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=12;WE=57975918;WS=57975900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr12	57977003	rs775249	C	T	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=36;PP=850;ReadPosRankSum=1.086;SC=TTTCAGGTAGCGTCAGGCTGC;SOR=0.923;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=58;TCF=5;TCR=53;TR=39;WE=57977011;WS=57976993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,42:0.68:62
chr12	57977040	rs775250	C	A	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=603;ReadPosRankSum=0.524;SC=CAGGTTGCTTCCCTTCTTGCT;SOR=2.899;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=28;WE=57977048;WS=57977030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,28:0.82:34
chr12	57994743	rs775235	T	G	2346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=35;PP=1908;SC=CTCCTGCTCTTGTGGGCTCCT;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=36;TCR=35;TR=71;WE=57994751;WS=57994733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr12	57995089	rs812873	T	C	3149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=41;PP=2473;SC=AGTATGATGCTAAGAAGAAAG;SOR=1.007;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=52;TCR=41;TR=93;WE=57995097;WS=57995079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr12	58000378	rs703834	G	A	3107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=51;PP=2477;SC=GGAGGGGCAAGTTGTTTCTAT;SOR=0.754;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=48;TCR=51;TR=99;WE=58000386;WS=58000368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr12	58003922	rs10437954	G	A	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=4;PP=261;SC=GCAACTCCCCGGACGCGCGCA;SOR=1.270;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=58003930;WS=58003912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	58004563	rs7314872	C	G	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.564;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=441;ReadPosRankSum=0.961;SC=AAGTTCGCATCTAATTTGCAT;SOR=1.880;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=21;WE=58004571;WS=58004553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr12	58005682	rs60586224	G	A	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.470;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=10;PP=903;ReadPosRankSum=0.323;SC=GGCGCCATGCGGGGGGGGCAC;SOR=0.392;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=44;WE=58005690;WS=58005672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,46:0.77:60
chr12	58007678	rs7305391	G	A	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=378;ReadPosRankSum=0.330;SC=TACTCTGGGGGCAGGGCGGCT;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=16;WE=58007686;WS=58007668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr12	58008952	rs703833	C	T	1461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=12;PP=1130;SC=GGCAACTGGCCGAGGAGGCCT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=39;WE=58008960;WS=58008942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	58013175	rs2277324	G	A	820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=1;PP=719;SC=TCCAAGCCGCGGCTCTCGCCA;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=58013183;WS=58013165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	58015494	rs923828	G	A	2029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=19;PP=1568;SC=CTTGCTGACTGCGCTGCCTCG;SOR=1.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=65;WE=58015502;WS=58015484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr12	58019472	rs774895	T	G	3060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=74;PP=2482;SC=GGGGAGCCTGTTAAGGGGCAG;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=25;TCR=74;TR=99;WE=58019480;WS=58019462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr12	58026001	rs2307095	G	A	6167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=114;NR=71;PP=2965;SC=CGTCCTCAGAGGCTCCTGCCG;SOR=1.329;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=186;TCF=115;TCR=71;TR=185;WE=58026009;WS=58025991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr12	58089413	rs3825078	A	T	6199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=89;PP=2965;ReadPosRankSum=0.267;SC=CTCCTTACTGAAAGTCTGGAG;SOR=0.281;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=193;TCF=104;TCR=89;TR=192;WE=58089421;WS=58089403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,199:1.00:200
chr12	58090232	rs72303843	AGTCGG	A	1396.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.06;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	58090246	rs11172303	C	G	2010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.24;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	58112189	rs799265	A	G	2051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=53;PP=1741;SC=GGGAACTGGAAAACATCATCC;SOR=4.139;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=7;TCR=53;TR=60;WE=58112197;WS=58112179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr12	58123376	rs41292013	G	C	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=0.175;SC=CTGATGTTGGGGATGAGGGTT;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=6;WE=58123384;WS=58123366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr12	58124803	rs238523	C	T	1348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=38;PP=1119;SC=AAGCAGTCAACATGGTACAGA;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=41;WE=58124811;WS=58124793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	58126234	rs17852479	C	A	3478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=56;PP=2965;ReadPosRankSum=0.198;SC=GGGAGCTGGGCAGGGACTTGC;SOR=0.288;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=135;TCF=79;TCR=56;TR=124;WE=58126242;WS=58126224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,123:0.99:124
chr12	58127766	rs238526	T	C	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=1;PP=551;SC=GTAGCCTCCTTAGGGCCTCCC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=58127774;WS=58127756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	58135659	rs238530	T	C	3473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=31;PP=2737;SC=TGCTAGTCCCTGATACACCCA;SOR=1.828;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=77;TCR=31;TR=108;WE=58135667;WS=58135649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr12	58145156	rs2270777	C	T	1823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=39;PP=1470;ReadPosRankSum=2.008;SC=CTTTTCAATCCCCTTTAACCC;SOR=0.927;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=55;TCF=15;TCR=40;TR=54;WE=58145164;WS=58145146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,57:0.98:58
chr12	58149446	rs1689582	C	T	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=112;SC=CCTTCGCTGGCTGCTCCACCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=58149454;WS=58149436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	58150989	rs35101706	CCA	C	1054.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=23;PP=1017;SC=CCGCCAGTTACCACAGTCTCC;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=23;WE=58150998;WS=58150979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr12	59197223	rs1148531	A	G	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=11;PP=418;SC=CCTTGGTGCCAGATTTCCATG;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=17;WE=59197231;WS=59197213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr12	59205542	rs10713014	CA	C	48	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.60;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
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chr12	59279529	rs17121655	C	T	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=521;ReadPosRankSum=1.017;SC=AAATTACATTCCAGTTTGTTT;SOR=1.061;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=23;WE=59279537;WS=59279519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,22:0.76:29
chr12	59279660	rs11172796	A	T	1930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.470;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=32;PP=1520;ReadPosRankSum=-0.712;SC=TAGTAATAGAACGGATCCGAT;SOR=0.462;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=110;TCF=63;TCR=47;TR=70;WE=59279668;WS=59279650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,74:0.62:119
chr12	59282525	rs748822	A	G	2719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-8.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=14;PP=2022;ReadPosRankSum=-0.384;SC=AGGATTTCACATAAGACCTGC;SOR=0.696;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=160;TCF=139;TCR=21;TR=109;WE=59282533;WS=59282515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,114:0.69:166
chr12	59284025	rs61921896	T	C	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=31;PP=575;ReadPosRankSum=1.107;SC=TAACCATCAATGGAAACTTAA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=31;WE=59284033;WS=59284015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,35:0.71:49
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chr12	59307673	rs76821508	T	C	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.073;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=3;PP=868;ReadPosRankSum=1.005;SC=TTCCATTTTTTTCTTCTAAGA;SOR=1.893;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=60;TCF=53;TCR=7;TR=37;WE=59307681;WS=59307663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,40:0.63:63
chr12	59307848	rs72005968	CA	C	674.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.703;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.580;NF=6;NR=24;PP=379;ReadPosRankSum=-0.399;SC=CTACAAATGCCAAAAAAAAAA;SOR=1.315;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=30;WE=59307856;WS=59307838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,33:0.79:42
chr12	59307957	rs11834094	C	T	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.579;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=712;ReadPosRankSum=-0.611;SC=TTGAATAACTCACTATAATCC;SOR=1.934;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=48;TCF=30;TCR=18;TR=31;WE=59307965;WS=59307947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,33:0.65:51
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chr12	59917023	rs12580155	T	A	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.136;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=320;ReadPosRankSum=-0.414;SC=TTACACAGGGTTGGATAATTA;SOR=0.046;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=60;TCF=59;TCR=1;TR=18;WE=59917031;WS=59917013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,19:0.31:62
chr12	59917126	rs12580166	T	A	1730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.788;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=24;PP=1325;ReadPosRankSum=-1.545;SC=GTACAGGCAATCAGTGATGGT;SOR=0.823;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=229;TCF=154;TCR=75;TR=76;WE=59917134;WS=59917116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,77:0.32:238
chr12	60127590	rs2706309	A	T	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.127;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=686;ReadPosRankSum=-0.734;SC=CTGAGCAACAAAACAACTCTT;SOR=0.495;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=37;WE=60127598;WS=60127580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,37:0.66:56
chr12	60127612	rs2711672	G	A	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=27;PP=746;ReadPosRankSum=-1.166;SC=GGAGAGCCACGGTGGGCACCT;SOR=0.836;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=33;WE=60127620;WS=60127602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,33:0.67:49
chr12	60129896	rs2706306	A	T	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=237;ReadPosRankSum=0.583;SC=AAGGTATCAGAGGTTGGAAAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=11;WE=60129904;WS=60129886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr12	60161941	rs35166468	G	GA	1135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.651;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.136;NF=19;NR=18;PP=1289;ReadPosRankSum=0.972;SC=ATGAATCTGGGAAAAGGAGAT;SOR=0.677;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=63;TCF=25;TCR=38;TR=37;WE=60161949;WS=60161931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,44:0.62:71
chr12	60173356	rs3763980	A	T	4127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=69;PP=2962;ReadPosRankSum=0.963;SC=AAGGCAGAAGACCAGAGAATC;SOR=0.541;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=276;TCF=155;TCR=121;TR=153;WE=60173364;WS=60173346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,159:0.56:283
chr12	62696477	rs35496480	T	G	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.395;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=157;ReadPosRankSum=-1.058;SC=AAAACTTGTTTTAAATACTTA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=8;WE=62696485;WS=62696467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr12	62696599	rs11174420	C	T	1696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=20;PP=1317;ReadPosRankSum=-0.666;SC=TTAAGGAACACCTTATTGATG;SOR=0.812;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=60;TCR=28;TR=63;WE=62696607;WS=62696589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,66:0.70:94
chr12	62706046	rs73137512	A	T	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=138;ReadPosRankSum=0.500;SC=GAAATTACTTATATTTCTCTT;SOR=1.911;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=8;WE=62706054;WS=62706036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr12	62706108	.	CTT	C	316.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=-0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=5;PP=302;ReadPosRankSum=0.094;SC=TTCCATGAAACTTTTCATACA;SOR=0.495;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=9;WE=62706117;WS=62706098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr12	62706180	rs10431510	A	G	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=141;ReadPosRankSum=-0.551;SC=TGTAAAAAATACCCTAAATAT;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=7;WE=62706188;WS=62706170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr12	62708442	rs10877825	G	A	218.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=148;SC=ATATATATTGGCAGGCTTTAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=62708450;WS=62708434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	62715412	rs111666891	CTGTAT	C	2932.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.456;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.434;NF=10;NR=48;PP=2954;ReadPosRankSum=0.845;SC=TTTAAGCATACTGTATTATAC;SOR=0.348;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=91;TCF=13;TCR=78;TR=58;WE=62715424;WS=62715402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,75:0.67:112
chr12	62717783	rs139681009	CT	C	461.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.739;NF=8;NR=13;PP=238;ReadPosRankSum=0.227;SC=TCTCCTGGACCTTTTTTTTTT;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=21;WE=62717791;WS=62717773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr12	62717976	rs11174424	G	T	67.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5040;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=44;ReadPosRankSum=-0.319;SC=AAAATTTTATGCAGAAAATGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=62717984;WS=62717966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr12	62777565	rs56298756	G	T	2056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.285;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=5;PP=1624;ReadPosRankSum=2.553;SC=TTGTACATATGTTTAAAAATC;SOR=1.002;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=97;TCF=88;TCR=9;TR=67;WE=62777573;WS=62777555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,69:0.68:102
chr12	62778065	rs2044846	A	G	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.339;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=415;ReadPosRankSum=-0.083;SC=GAATGGATCCACTTACCAAAC;SOR=0.148;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=22;WE=62778073;WS=62778055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr12	62797926	rs17717700	G	T	2152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.631;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=7;PP=1643;ReadPosRankSum=-0.794;SC=TGTATTTAACGTGATCTTTGA;SOR=0.039;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=101;TCF=94;TCR=7;TR=69;WE=62797934;WS=62797916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,74:0.70:106
chr12	62810962	rs10459254	G	A	1738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=35;PP=1491;SC=CTGGAGGAAAGAAAAAATGAT;SOR=1.487;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=56;TCF=19;TCR=37;TR=54;WE=62810970;WS=62810952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	62861111	rs6581450	T	C	3176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=49;PP=2333;SC=AAGCTTCAGGTGACGTCAGGA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=50;TCR=49;TR=99;WE=62861119;WS=62861101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr12	62864417	rs12427111	A	C	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.099;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=360;ReadPosRankSum=1.030;SC=GAGGAAGACAACTCTGAAGCT;SOR=2.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=18;WE=62864425;WS=62864407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr12	62883990	rs11393430	C	CT	1159.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=29;PP=1328;SC=AAGAGTTACACTATTGAGGGA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=29;WE=62883998;WS=62883980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	62887608	rs61921910	C	T	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=265;ReadPosRankSum=0.478;SC=TTTTTGAGATCGCTATTACTG;SOR=0.315;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=13;WE=62887616;WS=62887598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr12	62888729	rs7135893	C	T	218.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=147;SC=TGTATACCTTCTCTTATTTAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=62888737;WS=62888719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	62892905	rs4025987	C	G	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=268;SC=GGCCTTTGCTCAGATGATCAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=62892913;WS=62892895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	62894636	rs17120341	T	A	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=3.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.00;ReadPosRankSum=1.144;SOR=0.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,14:0.24:58
chr12	62928747	rs11364534	TA	T	2341.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=74;PP=1777;SC=CTGTGTCAGTTAAAAAAAACA;SOR=3.716;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=86;TCF=6;TCR=80;TR=77;WE=62928755;WS=62928737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr12	62931083	rs73141045	C	G	1331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.584;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=39;PP=1060;ReadPosRankSum=0.000;SC=AATTAGCTATCAAGGAAACTT;SOR=2.080;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=56;TCF=6;TCR=50;TR=42;WE=62931091;WS=62931073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,46:0.75:61
chr12	62943371	rs10877874	G	A	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.782;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=353;ReadPosRankSum=-0.888;SC=CAACCTGAGTGGCAGAGTGAG;SOR=0.160;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=16;WE=62943379;WS=62943361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr12	62965149	rs2270732	T	C	1854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=10;PP=1387;ReadPosRankSum=0.636;SC=TTAATGCTTATATTAAACTGT;SOR=1.852;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=49;TCR=10;TR=58;WE=62965157;WS=62965139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr12	62979216	rs11174557	G	A	1897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.645;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=28;PP=1410;ReadPosRankSum=-1.492;SC=TTTTAAAGAGGTCCCAAGATG;SOR=1.073;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=105;TCF=58;TCR=47;TR=67;WE=62979224;WS=62979206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,72:0.64:112
chr12	62997643	rs7302456	G	T	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.606;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=558;ReadPosRankSum=-0.206;SC=AAGCCTCGGCGCCCGGCCGGC;SOR=0.286;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=25;WE=62997651;WS=62997633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,25:0.74:34
chr12	63083521	rs11174604	G	A	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.873;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=37;PP=859;ReadPosRankSum=0.131;SC=AGATGTTGGAGTCATGCACCT;SOR=1.273;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=148;TCF=44;TCR=104;TR=48;WE=63083529;WS=63083511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,49:0.31:159
chr12	63131354	.	G	C	1683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.418;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.307;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=16;PP=1339;ReadPosRankSum=-1.269;SC=CTCCATTTCTGATGATTATGG;SOR=0.363;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=91;TCF=68;TCR=23;TR=58;WE=63131362;WS=63131344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,61:0.64:95
chr12	63359011	rs699595	A	T	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=645;SC=TGAAAAAAAAAAATCAAACCT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=63359019;WS=63359001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	63359168	rs699596	G	A	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.254;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.628;NF=29;NR=22;PP=947;ReadPosRankSum=1.423;SC=ACCTCATGCCGGAAAATTGGT;SOR=0.947;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=127;TCF=69;TCR=58;TR=51;WE=63359176;WS=63359158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,52:0.39:135
chr12	63359409	rs699597	C	A	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.924;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.594;NF=9;NR=19;PP=522;ReadPosRankSum=-0.076;SC=GAAAGGAAAGCCAAGATGACA;SOR=0.892;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=79;TCF=27;TCR=52;TR=28;WE=63359417;WS=63359399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,29:0.35:82
chr12	63359549	rs143590555	ACTGCTG	A	4038.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=22;PP=2995;SC=TACTAAGGGTACTGCTGCTGC;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=99;TCF=69;TCR=30;TR=74;WE=63359562;WS=63359539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr12	63359803	rs146011434	T	TA	379.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=8.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQRankSum=0.000;QD=10.85;ReadPosRankSum=-0.823;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,25:0.71:35
chr12	63543553	rs10747984	C	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.99;MQRankSum=1.915;QD=9.40;ReadPosRankSum=1.030;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr12	63543578	rs10784341	T	A	591.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.91;MQRankSum=-2.450;QD=23.67;ReadPosRankSum=0.405;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr12	63544209	rs1042615	A	G	3355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=57;PP=2554;ReadPosRankSum=-0.566;SC=AGGCCGACGCAAACATGCCGA;SOR=0.652;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=190;TCF=105;TCR=85;TR=128;WE=63544217;WS=63544199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,132:0.68:194
chr12	64055347	rs112964973	G	GA	239.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.641;NF=0;NR=14;PP=190;ReadPosRankSum=0.135;SC=CTTTTTTTCTGAAAAAAAAAA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=14;WE=64055355;WS=64055337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr12	64174904	rs73122634	C	T	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=4.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=590;ReadPosRankSum=1.467;SC=GATAAATCCACGAAAGGAAAA;SOR=0.783;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=26;WE=64174912;WS=64174894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr12	64377636	.	T	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=66.54;MQRankSum=2.965;QD=15.43;ReadPosRankSum=-0.932;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr12	64383670	rs3741607	T	C	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.427;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=873;ReadPosRankSum=0.482;SC=GTGGTAATTCTGTGTTTCTTC;SOR=0.393;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=68;TCF=51;TCR=17;TR=44;WE=64383678;WS=64383660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,46:0.65:71
chr12	64472803	rs789710	A	T	4930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=106;PP=2965;SC=CCACAGAATCAGTGAAGTCCA;SOR=1.905;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=42;TCR=106;TR=148;WE=64472811;WS=64472793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr12	64485593	rs5798729	A	ACC	2381.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=1;PP=2141;SC=GAATTGTAAGACTATGATCTA;SOR=6.593;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=42;WE=64485601;WS=64485583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	64491002	rs72161524	GT	G	111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=6.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-1.752;QD=1.77;ReadPosRankSum=-0.109;SOR=0.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,15:0.24:63
chr12	64519806	rs789722	T	C	4406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=75;PP=2965;SC=TTGGGCGGTCTGCCAGAGAAC;SOR=0.804;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=65;TCR=75;TR=140;WE=64519814;WS=64519796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr12	64535942	rs3741608	T	G	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=512;SC=TGTTTACATATTCTGCAGACT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=64535950;WS=64535933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	64587633	rs699638	C	A	2674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=18;PP=2195;SC=TAACCTTTGGCTCCAGGTTTC;SOR=2.570;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=63;TCR=18;TR=81;WE=64587641;WS=64587623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr12	64609562	rs2335390	C	T	1198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=14;PP=919;SC=AGAAGTCTGCCATCTCCATCC;SOR=1.387;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=40;TCF=26;TCR=14;TR=39;WE=64609570;WS=64609552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	64661209	rs1657057	AT	CC	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=18;PP=1050;SC=GCATTTTCAGATCTCCAATCT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=64661218;WS=64661199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	64669018	rs5798743	AT	A	326.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=356;SC=ATAATATATAATAGTCATGTA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=64669026;WS=64669008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	64669090	rs1002392	C	A	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=3;PP=804;SC=GCTGAAAGACCAGAAGTATCT;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=64669098;WS=64669080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	64669270	rs10878132	C	G	1312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=33;PP=977;SC=GAGACAAGGTCTCATGCTGCC;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=40;WE=64669278;WS=64669260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	64671412	rs10624687	C	CTA	2414.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=5;PP=2351;ReadPosRankSum=-0.556;SC=GCCAGGGCCCCTATATATATA;SOR=0.519;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=98;TCF=84;TCR=14;TR=56;WE=64671421;WS=64671402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,80:0.88:91
chr12	64697635	rs10878142	T	G	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=335;SC=ATGATTACTGTCAGGTTTGTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=64697643;WS=64697625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	64710319	rs7310610	C	G	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=3.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.89;ReadPosRankSum=-2.715;SOR=1.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,37:0.26:142
chr12	64712511	rs7955105	A	G	4059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=75;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.507;SC=ACTCATTTCCATTCCCATTGC;SOR=0.310;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=62;TCR=76;TR=136;WE=64712519;WS=64712501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,137:0.99:138
chr12	64712546	rs113411861	A	AGTT	1158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=0.720;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.980;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,36:0.26:138
chr12	64724815	rs11392869	T	TA	279.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.458;NF=0;NR=18;PP=212;ReadPosRankSum=0.077;SC=TTCCTTGACTTAAAAAAAAAA;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=4;TCR=54;TR=18;WE=64724823;WS=64724805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr12	64833249	rs10878172	A	G	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=133;ReadPosRankSum=0.045;SC=CACCATTTTGAAATTATGAGT;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=7;WE=64833257;WS=64833239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr12	64838752	rs71092967	TA	T	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQRankSum=-0.353;QD=2.54;ReadPosRankSum=0.918;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr12	64838922	rs6581565	G	T	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=665;ReadPosRankSum=-0.050;SC=GTAGGTATTTGTGAAGCTCAC;SOR=0.612;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=120;TCF=41;TCR=79;TR=36;WE=64838930;WS=64838912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,36:0.30:120
chr12	64854058	.	G	A	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.474;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=182;ReadPosRankSum=-0.377;SC=TTGAAGTGTTGAAAAAACTCA;SOR=1.198;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=9;WE=64854066;WS=64854048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr12	64858100	rs57810028	A	AT	465.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=349;ReadPosRankSum=0.867;SC=CCAATCAATGATTTTTTTTTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=17;WE=64858108;WS=64858090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr12	64875787	rs7486100	T	A	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=469;ReadPosRankSum=-0.179;SC=AGATTTATATTCATAGCTATA;SOR=0.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=1;TCR=61;TR=24;WE=64875795;WS=64875777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,24:0.37:65
chr12	64879165	rs11175411	T	C	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=0;PP=24;SC=ACATTGTGTTTGCTCTATAAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=64879173;WS=64879155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	64879903	rs7487627	A	G	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=325;ReadPosRankSum=-1.008;SC=GATTTTTATTATAATACATTT;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=14;WE=64879911;WS=64879893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr12	65004316	rs3741747	T	C	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=223;ReadPosRankSum=0.894;SC=TGCCCGGGGCTGCGCGCCGGG;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=12;WE=65004324;WS=65004306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr12	65004387	rs3741748	C	T	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.64;ReadPosRankSum=-1.325;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr12	65004520	rs77813527	A	G	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.959;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=43;PP=1187;ReadPosRankSum=-1.096;SC=GCTCCGGCCAACAAGTGAGTG;SOR=0.496;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=90;TCF=25;TCR=65;TR=61;WE=65004528;WS=65004510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,61:0.65:94
chr12	65004550	rs117122731	G	A	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.920;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=36;PP=720;ReadPosRankSum=0.888;SC=GGGCGCTGCAGCCCGCGCCCC;SOR=1.238;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=61;TCF=4;TCR=57;TR=38;WE=65004558;WS=65004540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,37:0.61:61
chr12	65134536	rs1690277	C	G	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=116;ReadPosRankSum=-1.230;SC=TGGATTACTACAGTAGATAAT;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=7;WE=65134544;WS=65134526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr12	65146532	rs1147096	C	T	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.892;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=172;ReadPosRankSum=-1.289;SC=TTTTCTTTAGCGGTGTCTGTA;SOR=2.533;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=12;WE=65146540;WS=65146522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,11:0.26:43
chr12	65146676	rs1147095	T	C	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.816;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=415;ReadPosRankSum=1.035;SC=AAAGAGAGTCTTGTATGATTC;SOR=0.283;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=18;WE=65146684;WS=65146666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,18:0.38:48
chr12	65150485	rs2620733	C	T	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.747;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=617;ReadPosRankSum=-0.912;SC=TGCTCTTGTCCTAGCTCTTCC;SOR=0.563;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=124;TCF=50;TCR=74;TR=36;WE=65150493;WS=65150475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,36:0.29:126
chr12	65222347	rs1144426	C	G	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.726;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=30;PP=744;ReadPosRankSum=0.923;SC=TTCTTTAGAGCCTCTGGAATG;SOR=0.162;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=70;TCF=4;TCR=66;TR=33;WE=65222355;WS=65222337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr12	65224174	rs61730726	A	G	2559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=23;PP=2092;ReadPosRankSum=0.884;SC=TGACCTTGGCAGATCATTATT;SOR=0.770;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=168;TCF=132;TCR=36;TR=105;WE=65224182;WS=65224164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,106:0.62:172
chr12	65232699	rs3741740	C	T	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=5.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=294;ReadPosRankSum=-1.074;SC=TGTGCTCTAACGTGTAAAGCA;SOR=0.668;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=17;WE=65232707;WS=65232689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,18:0.32:57
chr12	65269062	.	G	A	3265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.234;ClippingRankSum=0.000;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.824;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=68;PP=2602;ReadPosRankSum=-0.374;SC=GCTGATAGATGAGCAGAACGA;SOR=1.009;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=172;TCF=73;TCR=99;TR=114;WE=65269070;WS=65269052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,116:0.67:173
chr12	65270436	rs7311657	A	G	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=199;ReadPosRankSum=-0.516;SC=CCAGCTCTAGACTGCAGACGC;SOR=0.206;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=11;WE=65270444;WS=65270426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr12	65460368	rs3782498	A	G	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=2;PP=1309;SC=AACTTATTCTAATCAAACATT;SOR=5.376;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=43;TCR=2;TR=44;WE=65460376;WS=65460358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	65462429	rs72205564	ATGTGTGTGTG	A	732.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.514;NF=11;NR=3;PP=2591;ReadPosRankSum=-0.457;SC=CCAAAAAACCATGTGTGTGTG;SOR=1.609;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=14;WE=65462446;WS=65462419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr12	65477613	rs150722125	TTTC	T	618.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.72;QD=41.25;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	65514266	rs7301320	T	C	3730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=55;PP=2805;ReadPosRankSum=-0.729;SC=TTCTCTGTTGTGCTTTTCTGA;SOR=0.243;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=61;TCR=55;TR=115;WE=65514274;WS=65514256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,125:0.99:126
chr12	65609675	rs67170565	G	GT	142.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.525;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.98;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr12	65609707	rs34604927	G	GT	666.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=4;PP=490;SC=ATTATTTGGTGTTTTTTTTCT;SOR=3.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=23;WE=65609715;WS=65609697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	65633880	rs34562240	GTGAT	G	3782.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.05;NF=39;NR=27;PP=2972;SC=ATTATGTCAAGTGATTGATTC;SOR=1.244;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=77;TCF=47;TCR=30;TR=66;WE=65633891;WS=65633870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	65762703	rs57910895	AC	A	348.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.70;MQRankSum=1.089;QD=13.95;ReadPosRankSum=2.524;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr12	65856899	rs61921506	C	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=92;ReadPosRankSum=0.555;SC=CTGCTTTGTACATGCTTTTCC;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=8;WE=65856907;WS=65856889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr12	65881702	rs11175783	C	T	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.057;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.107;NF=21;NR=9;PP=431;ReadPosRankSum=-1.333;SC=TGAGACTGTGCCTCAAATTAA;SOR=0.403;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=108;TCF=83;TCR=25;TR=30;WE=65881718;WS=65881692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,31:0.28:110
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chr12	66232173	rs60377295	CA	C	381.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.47;MQRankSum=1.224;QD=9.79;ReadPosRankSum=2.322;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
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chr12	66253698	.	T	TA	99.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.99;ReadPosRankSum=-0.294;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr12	66308644	rs10878345	A	G	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=1;PP=400;SC=TAGTAGAGACAGGGTTTCACC;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=66308652;WS=66308634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	66517828	rs2464304	T	A	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=20;PP=675;SC=AACTATTAACTCCATGTATGA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=29;WE=66517836;WS=66517818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	66531694	rs1185629	A	G	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=0;PP=719;SC=CTTTTTTCTCATTAAATTTTT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=31;WE=66531702;WS=66531684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	66547324	rs79407829	T	C	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=106;ReadPosRankSum=0.116;SC=TTTTTACACGTATTCTTTCCT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=6;WE=66547332;WS=66547314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr12	66563103	rs1967338	T	C	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=545;ReadPosRankSum=0.165;SC=ACTTCCTCAATAATCCTCAAA;SOR=0.463;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=83;TCF=31;TCR=52;TR=28;WE=66563111;WS=66563093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,29:0.33:89
chr12	66563835	rs12297278	G	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=141;ReadPosRankSum=0.501;SC=CGGCGTCGGCGGGCGAACACC;SOR=0.818;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=8;WE=66563843;WS=66563825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr12	66597419	rs1185630	T	A	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=102;ReadPosRankSum=1.100;SC=AATAAAACATTAGGTACACAA;SOR=0.096;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=8;WE=66597427;WS=66597409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr12	66603870	rs368370659	T	C	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=498;ReadPosRankSum=0.065;SC=GTGTTGAGGCTCTGTTCTTTC;SOR=0.653;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=38;TCR=29;TR=26;WE=66603878;WS=66603860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,26:0.39:67
chr12	66605228	rs1152888	A	G	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=389;ReadPosRankSum=0.722;SC=TTCCTAAGGAATACTGCTTAA;SOR=0.779;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=17;WE=66605236;WS=66605218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,22:0.76:29
chr12	66641813	rs11465988	C	T	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=36;PP=1071;ReadPosRankSum=-0.435;SC=TAGTTCCATCCCAGGACTTAA;SOR=0.692;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=171;TCF=58;TCR=113;TR=54;WE=66641821;WS=66641803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,54:0.32:170
chr12	66698954	rs1971302	C	G	3746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=95;PP=2931;SC=TTATCATCAACTTTCAGTGTA;SOR=3.611;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=14;TCR=95;TR=109;WE=66698962;WS=66698944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr12	66716345	rs68047161	CAAA	C	1246.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;QD=35.62;SOR=6.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	66717692	rs7969887	T	G	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=455;SC=GTCTGAGTAGTAGTTAATGTT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=66717700;WS=66717682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	66717716	rs7957877	C	T	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=1;PP=714;SC=ACAAGTGAAACGGAGACTTTC;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=66717724;WS=66717706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	66725137	rs17180665	C	T	2524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.836;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=24;PP=1828;ReadPosRankSum=0.640;SC=TCTCCTCTAGCGGCGCACCTC;SOR=1.195;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=120;TCF=80;TCR=40;TR=82;WE=66725145;WS=66725127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,93:0.68:136
chr12	66725160	rs1185244	C	T	4854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=80;NR=53;PP=2965;SC=GCAGATTTTCCGTCCCCACGG;SOR=1.209;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=81;TCR=53;TR=133;WE=66725168;WS=66725150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr12	66731864	rs1168329	C	A	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=16;PP=939;SC=TCAAGCCCACCGATAATCAAG;SOR=0.984;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=37;WE=66731872;WS=66731854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	66732057	rs1183274	C	G	221.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=182;SC=AACACGTCATCATGAGAACTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=66732065;WS=66732047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	66771108	rs35635542	AT	A	1133.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=17;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=16;PP=433;SC=CTTGCCAGACATTTTTTTTTT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=16;WE=66771129;WS=66771098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	66771121	rs148141593	T	C	1211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=18;PP=871;SC=TTTTTTTTTTTTTTTGAGACG;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=18;WE=66771129;WS=66771098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	66786073	rs7970076	A	G	2149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=12;PP=1685;SC=TCTGGGGGACAAAGTAAAGAC;SOR=3.442;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=64;TCR=12;TR=76;WE=66786081;WS=66786063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr12	66786091	rs13277	G	C	2908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=24;PP=2295;SC=GACATACCTTGAGTTCCATAG;SOR=2.200;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=66;TCR=24;TR=89;WE=66786099;WS=66786081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr12	66786341	rs7970771	G	A	1495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=28;PP=1234;SC=AATATACCAAGATACTCCGTG;SOR=1.280;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=44;WE=66786349;WS=66786331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	66786644	rs2270594	G	A	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=34;PP=1017;SC=TCCCTGTATGGTACTGAATAT;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=41;WE=66786652;WS=66786634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	66826527	rs143524823	GAAGT	G	408.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=331;SC=TGTAGGAACTGAAGTAAGATG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=66826538;WS=66826517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	66826555	rs6581694	A	G	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=270;SC=TTAAAATCCTAGTAAATTAAG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=66826563;WS=66826545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	66838243	rs10878422	A	G	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=33.87;QD=27.28;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	66849408	rs1038923	T	C	215.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=146;SC=GCCACACTTGTCAACCAGTAA;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=66849416;WS=66849398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr12	66909389	rs12316942	C	T	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.718;HP=3;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=2684;ReadPosRankSum=-0.055;SC=CCCTCAGGACCCCAACATACC;SOR=0.688;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=93;TCF=46;TCR=47;TR=53;WE=66909397;WS=66909365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,53:0.58:92
chr12	66933149	rs10219689	C	T	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=260;ReadPosRankSum=0.648;SC=TCCTAGGAGACGGTGGGCCCT;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=12;WE=66933157;WS=66933139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr12	66990520	rs111505325	GATTT	G	572.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.949;NF=20;NR=1;PP=714;ReadPosRankSum=1.088;SC=GAAATAACATGATTTATTATT;SOR=0.535;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=62;TCF=59;TCR=3;TR=21;WE=66990532;WS=66990510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,23:0.35:65
chr12	67701103	rs812325	G	A	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.041;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=313;ReadPosRankSum=0.425;SC=GTGTTATTTGGAGTGGTTTAA;SOR=0.164;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=66;TCF=59;TCR=7;TR=20;WE=67701111;WS=67701093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,22:0.31:70
chr12	67706466	rs1060350	G	A	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=21;PP=815;ReadPosRankSum=2.324;SC=TAGCAGCACTGCTAACCATTC;SOR=0.697;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=160;TCF=95;TCR=65;TR=53;WE=67706474;WS=67706456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,57:0.34:168
chr12	68042982	rs141665168	G	A	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.937;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=30;PP=586;ReadPosRankSum=0.968;SC=CCGTGCCGCCGCGCCGCATCC;SOR=0.867;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=95;TCF=21;TCR=74;TR=37;WE=68042990;WS=68042972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,38:0.40:95
chr12	68045403	rs10878641	G	A	1705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=48;PP=1354;ReadPosRankSum=-0.105;SC=TGTAAACTTCGGTATGCTGTT;SOR=0.790;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=17;TCR=75;TR=59;WE=68045411;WS=68045393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,59:0.63:93
chr12	68052178	rs3741644	G	T	1629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=34;PP=1333;SC=GAGAGTGGGGGAACGCGCTGA;SOR=1.445;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=16;TCR=34;TR=50;WE=68052186;WS=68052168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	68552041	rs2234686	TA	T	1220.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.361;NF=2;NR=51;PP=812;ReadPosRankSum=-0.700;SC=ACCTGCATTCTAAAAAAAAAA;SOR=2.794;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=3;TCR=84;TR=53;WE=68552050;WS=68552031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr12	68646521	rs2227491	T	C	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.865;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=23;PP=504;ReadPosRankSum=0.688;SC=CACACGGCCCTGTTCGTCACA;SOR=1.145;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=133;TCF=69;TCR=64;TR=38;WE=68646529;WS=68646511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,39:0.28:138
chr12	68688939	rs7958232	C	T	1134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=1;PP=923;ReadPosRankSum=0.216;SC=AAGTAGAAAACGTTAGGAAAA;SOR=0.625;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=60;TCF=59;TCR=1;TR=40;WE=68688947;WS=68688929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,41:0.66:62
chr12	68707576	rs4575357	G	A	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=35;PP=900;ReadPosRankSum=1.787;SC=GCATTTCCTCGAGAAAATATG;SOR=0.495;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=57;TCF=5;TCR=52;TR=39;WE=68707584;WS=68707566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,39:0.68:57
chr12	68708761	rs2306393	C	T	6083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=383;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.586;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=141;NR=88;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.155;SC=AGATTTCTCACGTACATCCAA;SOR=1.155;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=367;TCF=213;TCR=154;TR=229;WE=68708769;WS=68708751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,240:0.63:382
chr12	68717038	rs80219525	T	C	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=169;ReadPosRankSum=-2.391;SC=CAAAAATTATTTTAGTTTAGT;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=9;WE=68717046;WS=68717028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr12	68719216	rs2870812	G	A	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=282;ReadPosRankSum=-0.578;SC=CATCCATTAAGCTACCTGATT;SOR=0.527;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=13;WE=68719224;WS=68719206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr12	68720335	rs17224845	C	T	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=5;PP=820;ReadPosRankSum=0.455;SC=AAGAAAACAACAATGGAAAAT;SOR=0.719;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=59;TCF=52;TCR=7;TR=38;WE=68720343;WS=68720325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,43:0.68:63
chr12	68720627	rs962976	G	A	3500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.581;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=65;PP=2780;ReadPosRankSum=-1.459;SC=TCTTTCTTGAGTAACATCCTT;SOR=0.639;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=183;TCF=90;TCR=93;TR=128;WE=68720635;WS=68720617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,129:0.69:186
chr12	68721040	rs962977	A	G	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=0;PP=731;ReadPosRankSum=3.103;SC=ATTAAAAATCAGGGGGTCACA;SOR=1.919;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=55;TCR=0;TR=39;WE=68721048;WS=68721030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,40:0.71:56
chr12	68724951	rs3741808	G	T	1977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.694;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=31;PP=1499;ReadPosRankSum=0.360;SC=TACAAGACTCGGACAAATAAG;SOR=0.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=73;TCR=49;TR=77;WE=68724959;WS=68724941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,77:0.61:126
chr12	69042690	rs3213921	T	G	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=34;PP=808;ReadPosRankSum=-0.921;SC=TATAATATTTTTCTTGTAATT;SOR=2.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=34;WE=69042698;WS=69042680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,35:0.74:47
chr12	69080728	rs2259702	T	G	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=216;ReadPosRankSum=-1.483;SC=TTTCTGTGGGTCTGTTTTAGG;SOR=0.382;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=12;WE=69080736;WS=69080718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr12	69081001	rs73136375	C	T	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=190;ReadPosRankSum=1.316;SC=GGAAATTTGGCCACAAATGGG;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=10;WE=69081009;WS=69080991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr12	69082669	rs2259592	A	G	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=158;ReadPosRankSum=-0.211;SC=CTTTACTCCAACTGTGATGAT;SOR=0.191;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=9;WE=69082677;WS=69082659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
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chr12	69084541	rs11608404	A	G	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.241;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=46;PP=1159;ReadPosRankSum=0.422;SC=GTAGAAAAATAGGGCTAAGAA;SOR=1.340;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=79;TCF=8;TCR=71;TR=50;WE=69084549;WS=69084531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,50:0.62:81
chr12	69090573	rs35640989	C	CT	267.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.82;MQRankSum=1.299;QD=19.13;ReadPosRankSum=1.923;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
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chr12	69090803	rs2546527	G	C	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.588;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=105;ReadPosRankSum=0.138;SC=GGTGTCTTAGGGGAACAGTGG;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=69090811;WS=69090793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr12	69109617	rs2701097	T	C	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=3.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=211;ReadPosRankSum=0.365;SC=CTTCTTAATGTAGTAATTCCA;SOR=0.990;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=13;WE=69109625;WS=69109607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
chr12	69115698	rs17851475	G	A	1087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.844;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=9;PP=918;ReadPosRankSum=0.014;SC=TGGTAGAACAGGAGATCCAGA;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=114;TCF=89;TCR=25;TR=42;WE=69115706;WS=69115688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,44:0.35:125
chr12	69119618	rs28514526	T	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQRankSum=0.754;QD=3.58;ReadPosRankSum=1.058;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr12	69125513	rs7976871	GG	TT	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.526;HP=6;HapScore=1;JOINED;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=956;ReadPosRankSum=-0.600;SC=ATTTGGGATGGGGGGGCAGAG;SOR=1.229;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=83;TCF=35;TCR=48;TR=23;WE=69125522;WS=69125503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,27:0.32:85
chr12	69125578	rs7976687	C	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=160;ReadPosRankSum=-0.127;SC=CTTCTCCCTTCGTAAAAGAAG;SOR=1.002;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=11;WE=69125586;WS=69125568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,13:0.28:46
chr12	69136252	rs79419059	T	C	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.096;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=313;ReadPosRankSum=0.876;SC=GTTTAATCTTTGTAATCTCAC;SOR=0.151;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=67;TCF=13;TCR=54;TR=24;WE=69136260;WS=69136242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,24:0.35:68
chr12	69160523	rs10878868	C	T	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.369;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr12	69202164	rs937283	A	G	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.176;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=247;ReadPosRankSum=0.409;SC=GAGTGGAATGATCCCCGAGGC;SOR=1.493;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=13;WE=69202172;WS=69202154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr12	69202326	rs2870820	C	T	1085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.108;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=29;PP=819;ReadPosRankSum=1.347;SC=ACGGTGTCCCCTCTATCGCTG;SOR=1.426;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=51;TCF=12;TCR=39;TR=36;WE=69202334;WS=69202316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,39:0.71:55
chr12	69207162	rs1470383	G	A	294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=241;SC=ATTGGATACTGTCTGTGATCA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=69207170;WS=69207152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	69233215	rs769412	A	G	1924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.968;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=48;PP=1563;ReadPosRankSum=2.168;SC=CACAAGCTGAAGAGGGCTTTG;SOR=0.962;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=225;TCF=93;TCR=132;TR=78;WE=69233223;WS=69233205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,79:0.34:229
chr12	69250481	rs3741599	T	C	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.308;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=43;PP=1223;ReadPosRankSum=-0.651;SC=CAAGAGACAATTATATGAGTG;SOR=0.437;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=181;TCF=43;TCR=138;TR=59;WE=69250489;WS=69250471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,61:0.33:186
chr12	69250548	rs3741598	C	T	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.929;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=60;PP=1470;ReadPosRankSum=-0.662;SC=CACTAAAATGCAGCCTTTGTG;SOR=1.354;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=89;TCF=5;TCR=84;TR=63;WE=69250556;WS=69250538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,63:0.69:91
chr12	69252594	rs58495062	G	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=0.876;SC=TTTCTGTCTCGATGGATCTAC;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=69252602;WS=69252590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr12	69252715	rs1143653	A	G	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.307;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=66;ReadPosRankSum=1.248;SC=TTATTATATAAGACCCAGGCA;SOR=1.721;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=5;WE=69252723;WS=69252705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr12	69265578	rs2228654	A	G	3254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.936;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=53;PP=2570;ReadPosRankSum=0.383;SC=CGATGCTGTAATAACAGTCAG;SOR=0.537;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=184;TCF=105;TCR=79;TR=120;WE=69265586;WS=69265568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,120:0.65:184
chr12	69279736	rs2701085	A	G	1642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=45;PP=1342;SC=GAACTCTGGTAAGACTAGGAA;SOR=5.549;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=47;WE=69279744;WS=69279726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	69279764	rs79448109	C	T	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=120;ReadPosRankSum=-1.166;SC=GCTGCTTCCCCCACTTGATCG;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=9;WE=69279772;WS=69279754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr12	69633379	rs2305642	A	G	1235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=36;NR=11;PP=1039;SC=CGCGGCGGGCAGACCTGCAGG;SOR=2.208;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=47;WE=69633387;WS=69633369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	69645864	rs490872	A	G	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=14;PP=448;SC=TCTTTTTTTCAGGGGGAGACA;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=69645872;WS=69645854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	69646914	rs2305641	G	A	3551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=57;PP=2679;SC=TTGAAAATCGGGCAAATGGCC;SOR=0.800;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=50;TCR=57;TR=107;WE=69646922;WS=69646904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
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chr12	69667075	rs1463335	T	A	2491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=51;PP=2082;ReadPosRankSum=1.832;SC=AATTTCAGGTTGTGGCATTCA;SOR=0.622;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=77;TCF=25;TCR=52;TR=76;WE=69667083;WS=69667065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,78:0.99:79
chr12	69753595	rs622656	C	T	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=100;ReadPosRankSum=0.603;SC=GAGGAGTTGACGGTTACTCAC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=7;WE=69753603;WS=69753587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
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chr12	69753847	rs554591	T	C	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.218;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=473;ReadPosRankSum=-0.130;SC=CTCTCCCGCCTCGGTTCCTCC;SOR=0.892;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=68;TCF=12;TCR=56;TR=26;WE=69753855;WS=69753837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,27:0.39:70
chr12	69756762	rs10784775	G	A	1680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=20;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=46;PP=1397;SC=ACAACCTGTAGTTTTTTTTTT;SOR=4.174;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=64;TCF=5;TCR=59;TR=51;WE=69756770;WS=69756752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	69759551	rs11286051	AT	A	77.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.775;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=68;ReadPosRankSum=0.098;SC=ATAATTTACTATTTTTTTTCT;SOR=1.748;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=8;WE=69759559;WS=69759541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,8:0.23:35
chr12	69764388	rs2291005	A	G	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=1.248;SC=TTTGACATGTATATACTTATT;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=69764396;WS=69764378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr12	69784265	rs117678808	A	G	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=70;ReadPosRankSum=1.169;SC=GCAATCTTTAATGGAAAATAT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=69784273;WS=69784255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr12	69967862	rs547497	G	A	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.051;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=559;ReadPosRankSum=1.426;SC=CATTGGAGGCGAGGGTTTCTA;SOR=0.974;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=105;TCF=56;TCR=49;TR=33;WE=69967870;WS=69967852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,35:0.32:108
chr12	69978623	rs12319536	A	C	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=498;ReadPosRankSum=-0.651;SC=AGTCGTCTCTACTATTGGAGG;SOR=0.968;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=27;WE=69978641;WS=69978613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr12	69979115	rs2601007	G	C	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=151;ReadPosRankSum=0.481;SC=GCCCCCTCCAGTGTGAAAGGC;SOR=0.188;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=11;WE=69979123;WS=69979105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,10:0.31:32
chr12	69980028	rs485288	G	A	2696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=26;PP=2033;SC=TAAACGGAATGCCTCTTGGTT;SOR=1.749;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=58;TCR=26;TR=84;WE=69980036;WS=69980018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr12	69980141	rs484319	G	C	2095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=51;PP=1665;ReadPosRankSum=-0.932;SC=CTTGTTCTAAGCATTGTTTTA;SOR=2.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=61;TCF=9;TCR=52;TR=60;WE=69980149;WS=69980131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr12	69981111	rs11177732	G	A	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.374;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=211;ReadPosRankSum=0.734;SC=GTTTCTAGGGGTAGATACATG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=9;WE=69981119;WS=69981101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr12	69981862	rs530701	G	A	2762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=52;PP=2298;SC=TACTTCCTCTGTCTTTACTAT;SOR=1.375;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=30;TCR=52;TR=82;WE=69981870;WS=69981852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr12	69982129	rs710777	G	C	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.969;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=283;ReadPosRankSum=1.857;SC=ACACTGAAAAGCATACACAAA;SOR=1.159;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=15;WE=69982137;WS=69982119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr12	69985771	rs137875319	CTT	C	258.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.493;NF=9;NR=0;PP=235;ReadPosRankSum=-1.167;SC=AAGCAGACAGCTTTTTATAAG;SOR=0.245;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=9;WE=69985780;WS=69985761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr12	69986788	rs1043434	A	G	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=24;PP=940;ReadPosRankSum=-0.318;SC=TTGACTCTACAGCAAAGGTTG;SOR=0.674;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=38;TCR=37;TR=48;WE=69986796;WS=69986778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,47:0.60:78
chr12	69987494	rs710773	G	A	1055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=29;PP=816;SC=TAGAATTTCAGCAGTTATTCT;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=69987502;WS=69987484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	69991568	rs3217625	AAT	A	1410.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.215;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.965;NF=7;NR=31;PP=1513;ReadPosRankSum=0.707;SC=GAAAATGTTGAATATATTTTT;SOR=0.217;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=66;TCF=11;TCR=55;TR=38;WE=69991577;WS=69991558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,41:0.63:65
chr12	69991627	rs710765	C	T	1372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=18;PP=1138;SC=ATGGTTCTTACAGAAATCTTA;SOR=1.005;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=23;TCR=18;TR=41;WE=69991635;WS=69991617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	69991660	rs11832926	A	T	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.401;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=668;ReadPosRankSum=0.085;SC=ACTAAATTTTAAAATGCTTGG;SOR=1.207;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=28;WE=69991668;WS=69991650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr12	69995039	rs11177742	C	A	4860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-7.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.944;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=134;NR=40;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.991;SC=TCATGCTCTTCATTTTTCACT;SOR=0.877;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=250;TCF=190;TCR=60;TR=174;WE=69995047;WS=69995029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,178:0.69:259
chr12	69995273	rs7200	T	C	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=43;PP=1069;ReadPosRankSum=-1.297;SC=ATTTGCCGTGTCATTTTCCAT;SOR=1.451;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=67;TCF=0;TCR=67;TR=43;WE=69995281;WS=69995263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,46:0.65:71
chr12	70064146	rs17813545	T	C	3038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=32;PP=2398;SC=TTCTCTAAGATGTGCTTTGCG;SOR=1.656;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=68;TCR=32;TR=100;WE=70064154;WS=70064136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr12	70064295	rs3847772	C	T	2463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=53;PP=1862;SC=AGAAGTGCCACAAACCATCAC;SOR=2.155;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=20;TCR=53;TR=73;WE=70064303;WS=70064285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr12	70065072	rs3847773	A	G	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=457;SC=AGCCTCCCCAAGTAGCTAGGA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=70065080;WS=70065062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	70065126	rs200930771	CTT	C	1501.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.04;QD=32.65;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	70070942	rs710718	A	G	5970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=70;PP=2965;SC=AAAGAATTCCATGAAAAGTAT;SOR=1.306;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=193;TCF=123;TCR=70;TR=193;WE=70070950;WS=70070932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr12	70072479	rs3741755	C	G	1787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=5;PP=1436;SC=TTCTTGGTCTCTAATTAGCGT;SOR=4.215;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=46;TCR=5;TR=51;WE=70072487;WS=70072469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	70078172	rs710714	C	T	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=16;NR=0;PP=455;SC=TTATTGCCCTCGAGCCAAAGG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=70078180;WS=70078163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	70078575	rs12425422	T	G	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=22;PP=620;SC=TCCCTGTCAATTGGGAAAATC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=70078583;WS=70078565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	70088344	rs75229567	T	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=115;ReadPosRankSum=0.043;SC=AAATAATCTTTTATTTTTGAA;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=7;WE=70088352;WS=70088334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr12	70091432	rs775429	T	C	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=3;PP=450;SC=AGTACCTGTATACCAAACTTA;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=70091440;WS=70091422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	70188346	rs35394896	T	A	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=248;ReadPosRankSum=1.630;SC=ATAACTGTTTTAAAGATACCT;SOR=1.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=12;WE=70188354;WS=70188336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr12	70190408	rs17120917	A	C	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.452;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=569;ReadPosRankSum=1.192;SC=ACGAATTATCAATAAAAATGA;SOR=0.639;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=42;TCF=20;TCR=22;TR=25;WE=70190416;WS=70190398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,28:0.61:46
chr12	70195293	rs10879014	T	G	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=263;ReadPosRankSum=-0.167;SC=AGTGGAACTTTGGAGAAGAAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=10;WE=70195301;WS=70195283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr12	70273303	rs1240286	C	G	1334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=39;PP=1174;SC=CTCTGGCAGGCACCTAGAGAG;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=39;WE=70273311;WS=70273293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	70274160	rs1240287	G	A	1128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=33;PP=930;SC=GAGCAGCCCTGCAAAAGTTTC;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=70274168;WS=70274150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	70280797	rs1612447	T	C	1563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=34;PP=1124;SC=AAGACAGTGCTAAATCTCAGT;SOR=1.654;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=51;WE=70280805;WS=70280787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	70289063	rs7964113	A	T	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=416;ReadPosRankSum=-2.257;SC=CCAAGCATAGATGAGAGTCTG;SOR=0.185;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=70;TCR=0;TR=23;WE=70289071;WS=70289053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,22:0.31:72
chr12	70289112	rs7979309	T	C	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.161;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.321;NF=39;NR=8;PP=982;ReadPosRankSum=0.811;SC=GGTGTTCTCTTATAGTCTCTT;SOR=0.418;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=129;TCF=110;TCR=19;TR=47;WE=70289132;WS=70289102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,47:0.36:131
chr12	70290875	rs10879038	T	A	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.770;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=11;PP=829;ReadPosRankSum=-1.010;SC=GTGGTATTTGTTTGTACAAAT;SOR=0.823;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=133;TCF=98;TCR=35;TR=46;WE=70290883;WS=70290865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,46:0.33:139
chr12	70291047	rs10879040	T	G	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=1.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.89;ReadPosRankSum=-1.867;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,25:0.25:100
chr12	70304510	rs10879052	T	C	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.625;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=147;ReadPosRankSum=0.551;SC=TTGCTGCAAATGTATTGTAGA;SOR=0.100;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=53;TCF=51;TCR=2;TR=13;WE=70304518;WS=70304500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,13:0.25:53
chr12	70304763	rs74101388	C	T	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.590;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=449;ReadPosRankSum=0.277;SC=AGGGATAAACCCCCTTCTGTG;SOR=0.368;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=74;TCF=15;TCR=59;TR=24;WE=70304771;WS=70304753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,26:0.33:79
chr12	70321450	rs1239822	C	T	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=4;PP=169;SC=AACCAATTTTCTCTCTCTTTT;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=9;WE=70321458;WS=70321440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	70330087	rs813147	A	G	2831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.049;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=49;PP=2300;ReadPosRankSum=-0.360;SC=CACAGGAGCCAGCTCTGCTGC;SOR=0.846;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=157;TCF=83;TCR=74;TR=111;WE=70330095;WS=70330077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,111:0.68:163
chr12	70330485	rs73136746	A	G	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=27;PP=601;ReadPosRankSum=-0.734;SC=ATTTACTTAGATGGTCATTAA;SOR=0.576;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=28;WE=70330493;WS=70330475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
chr12	70351684	rs10879065	C	A	2321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.580;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=36;PP=1729;ReadPosRankSum=-1.055;SC=AACCAAAGGGCTGGAAAGCCA;SOR=0.446;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=120;TCF=71;TCR=49;TR=83;WE=70351692;WS=70351674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,86:0.70:123
chr12	70351905	rs2307086	A	G	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.089;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=452;ReadPosRankSum=-2.041;SC=AGCAACACCCATCAAAAGCTG;SOR=1.473;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=24;WE=70351913;WS=70351895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr12	70351924	rs11177996	A	G	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=2;PP=654;ReadPosRankSum=2.670;SC=TGTGATCCCAATACTTCTCCT;SOR=1.075;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=26;WE=70351932;WS=70351914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr12	70352021	rs2307087	C	T	1917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.770;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=29;PP=1457;ReadPosRankSum=1.561;SC=CTTTTATTCACTATTTAGGGA;SOR=0.598;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=106;TCF=63;TCR=43;TR=70;WE=70352029;WS=70352011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,72:0.67:108
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chr12	70794186	rs710651	G	A	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=115;ReadPosRankSum=-0.557;SC=CTGTTATATCGTAGATTATGC;SOR=1.552;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=8;WE=70794194;WS=70794176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr12	70915347	rs369876	A	G	1615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.918;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=18;PP=1097;ReadPosRankSum=0.210;SC=ATAATTGTTTACGCTGTTTAT;SOR=0.502;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=80;TCF=54;TCR=26;TR=53;WE=70915355;WS=70915337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,60:0.67:89
chr12	70928724	rs582954	A	G	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.787;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=23;PP=1059;ReadPosRankSum=-0.556;SC=GCCAGTAATGATCACACTTTA;SOR=0.803;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=86;TCF=44;TCR=42;TR=51;WE=70928732;WS=70928714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,55:0.60:91
chr12	70930061	rs2278346	T	G	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=269;ReadPosRankSum=-0.491;SC=CAGAAAAAGATACTAACACAA;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=11;WE=70930069;WS=70930051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr12	70933687	rs919595	A	G	3111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.148;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=49;PP=2398;ReadPosRankSum=-0.805;SC=CCATCTTTCAACAAATTATAC;SOR=0.528;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=148;TCF=73;TCR=75;TR=107;WE=70933695;WS=70933677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,113:0.73:155
chr12	70938176	rs4761221	G	A	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=492;ReadPosRankSum=0.519;SC=CTTCTAGAGAGGTTGTACAAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=20;WE=70938184;WS=70938166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr12	70938279	rs10531402	AGAG	A	4470.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.597;NF=64;NR=26;PP=2962;ReadPosRankSum=0.068;SC=TCTCCCCATTAGAGGCTCTTG;SOR=0.675;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=154;TCF=112;TCR=42;TR=90;WE=70938289;WS=70938269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,114:0.62:185
chr12	70948833	rs2278342	A	C	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=4.259;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=184;ReadPosRankSum=0.673;SC=TACAAAAATTACATTTTCTAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=9;WE=70948841;WS=70948823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr12	70949085	rs75994780	G	A	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.512;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=138;ReadPosRankSum=0.852;SC=GTGGAGGAGGGGGGCCTGGAA;SOR=0.293;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=7;WE=70949093;WS=70949075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr12	70984042	rs1465933	G	A	2419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.938;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=68;PP=1907;ReadPosRankSum=0.308;SC=TCAAAAAGGAGATATTACAGA;SOR=1.220;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=142;TCF=35;TCR=107;TR=86;WE=70984050;WS=70984032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,89:0.61:147
chr12	70990135	rs58070382	A	AC	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.25;MQRankSum=-0.000;QD=7.72;ReadPosRankSum=2.369;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr12	71050694	rs5798997	T	TA	333.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.292;NF=0;NR=13;PP=377;ReadPosRankSum=0.195;SC=AAACCACAGTTAAAAGTAGTA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=13;WE=71050702;WS=71050684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr12	71056569	rs7969289	T	C	98.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=70;ReadPosRankSum=-0.253;SC=GATTTTATGGTATATAAATTA;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=4;WE=71056577;WS=71056559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr12	71078134	rs141944378	G	C	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=402;ReadPosRankSum=0.755;SC=GAAATAGCTGGGCTAGTACAA;SOR=0.519;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=11;WE=71078143;WS=71078124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr12	71078135	rs7958846	G	C	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=1025;ReadPosRankSum=-0.650;SC=AAATAGCTGGGCTAGTACAAA;SOR=0.904;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=22;WE=71078143;WS=71078124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr12	71139664	rs3803036	T	C	1716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=30;PP=1407;ReadPosRankSum=1.007;SC=GGTGGTAGCTTTGATCTCAGG;SOR=0.569;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=87;TCF=43;TCR=44;TR=59;WE=71139672;WS=71139654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,60:0.68:88
chr12	71314102	rs12830783	C	T	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=81;ReadPosRankSum=-1.505;SC=CTAAGCCTGGCAACCCCTTAC;SOR=0.527;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=7;WE=71314110;WS=71314092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr12	71509607	rs71931636	ACTCT	A	1473.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.817;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.316;NF=24;NR=6;PP=1406;ReadPosRankSum=-0.681;SC=CAGAGTGTACACTCTCTCTCT;SOR=0.333;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=58;TCF=43;TCR=15;TR=30;WE=71509618;WS=71509597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,38:0.72:53
chr12	71509652	rs34349223	T	A	1670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.036;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.073;NF=37;NR=20;PP=1327;ReadPosRankSum=0.311;SC=CAGCAAGAAGTAGTTCAACTG;SOR=0.507;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=78;TCF=52;TCR=26;TR=57;WE=71509660;WS=71509642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,58:0.73:79
chr12	71509793	rs36021752	A	C	1557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.969;HP=1;HapScore=1;MGOF=68;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.573;NF=6;NR=43;PP=967;ReadPosRankSum=0.138;SC=TTTTGTTATGACAGTCCAAGC;SOR=1.879;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=67;TCF=10;TCR=57;TR=49;WE=71509801;WS=71509783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,55:0.77:71
chr12	71509814	rs141855745	G	GTTCCCTGTATAATTTT	1596.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=0.579;QD=31.93;ReadPosRankSum=1.114;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,39:0.78:50
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chr12	71519096	rs1051344	G	C	2791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.571;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=33;PP=2201;ReadPosRankSum=-0.774;SC=CTGACGATAGGTTGATGCATC;SOR=0.752;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=186;TCF=128;TCR=58;TR=104;WE=71519104;WS=71519086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,104:0.55:189
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chr12	71523199	rs143821581	TAA	T	810.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.636;HP=12;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=277;ReadPosRankSum=-0.199;SC=ACAGGTCTGTTAAAAAAAAAA;SOR=0.257;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=45;TCF=4;TCR=41;TR=25;WE=71523209;WS=71523189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,28:0.67:42
chr12	71526414	rs2270588	T	C	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=447;ReadPosRankSum=-0.872;SC=GTAGGGACTTTAATTGTGAAA;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=17;WE=71526422;WS=71526404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr12	71526677	rs1397566	A	G	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=255;ReadPosRankSum=-0.123;SC=TTAAATTATAATCTTCTGAAA;SOR=0.354;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=14;WE=71526685;WS=71526667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr12	71526709	rs3816942	C	T	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=231;ReadPosRankSum=-0.644;SC=GGTTATTATGCTAAAATACCA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=11;WE=71526717;WS=71526699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr12	71531663	rs2270585	A	T	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=55;ReadPosRankSum=1.242;SC=TTTAAGGAAGATGTTAAAAAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=71531671;WS=71531657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr12	71531889	rs1798093	T	C	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.891;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=643;ReadPosRankSum=-0.996;SC=AGGTAGTATTTCAATTTTTCA;SOR=0.222;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=94;TCF=63;TCR=31;TR=28;WE=71531897;WS=71531879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,29:0.29:99
chr12	71532099	rs2270584	G	A	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.039;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=630;ReadPosRankSum=-0.472;SC=CTCTACAGCTGGGATTATATC;SOR=3.937;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=24;WE=71532107;WS=71532089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr12	71532922	rs2971392	A	C	2258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=319;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.648;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=22;PP=1677;ReadPosRankSum=-0.243;SC=TGATTTTACCACAACCCACAC;SOR=0.942;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=311;TCF=219;TCR=92;TR=92;WE=71532930;WS=71532912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:220,99:0.31:319
chr12	71533534	rs3763978	C	G	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.117;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=736;ReadPosRankSum=1.505;SC=ACCGCAGCATCCCAGGAAGCC;SOR=0.821;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=71;TCF=36;TCR=35;TR=38;WE=71533542;WS=71533524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,43:0.57:76
chr12	71947173	rs1148985	G	A	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=212;ReadPosRankSum=-0.902;SC=ACATTTTAAGGGAGGAAAACC;SOR=0.186;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=12;WE=71947181;WS=71947163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr12	71955394	rs1280603	T	C	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=80;SC=TTTTTTATCCTCTAGAGAGTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=71955402;WS=71955384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	71960208	rs1797372	G	A	768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=8;PP=591;SC=ATCCCATCCAGTTTGTTGGGA;SOR=1.426;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=21;WE=71960216;WS=71960198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	71960329	rs1797373	G	A	1430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=27;PP=1125;SC=AATATTATAGGTTGAAGTGCT;SOR=1.132;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=46;WE=71960337;WS=71960319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	71960533	rs1797374	G	A	7424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=148;NR=78;PP=2965;SC=TGCCATTAGAGCTTGATCAGT;SOR=1.550;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=148;TCR=78;TR=226;WE=71960541;WS=71960523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr12	71960584	rs1726469	T	C	8847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=163;NR=111;PP=2965;SC=GTGTGATGCCTGAATGAAAGA;SOR=1.159;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=274;TCF=163;TCR=111;TR=274;WE=71960592;WS=71960574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr12	71965171	rs3816060	A	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=122;ReadPosRankSum=-1.275;SC=TGTCAGGGCTATGAAAATGTT;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=6;WE=71965179;WS=71965165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr12	71966836	rs11178860	G	A	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.596;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=29;PP=721;ReadPosRankSum=-1.321;SC=GAAACATCAAGTATTTTGCTT;SOR=0.278;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=31;WE=71966844;WS=71966826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,36:0.72:50
chr12	71972513	rs147611388	GT	G	1031.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.422;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.817;NF=25;NR=4;PP=1016;ReadPosRankSum=-2.452;SC=TCTTTAGGTTGTTGTTTTTTT;SOR=0.052;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=51;TCF=47;TCR=4;TR=29;WE=71972521;WS=71972503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,33:0.62:53
chr12	71977787	rs17109924	T	C	2186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=44;PP=1722;ReadPosRankSum=-0.712;SC=GGGTTCTCTGTGAAATATTCT;SOR=0.647;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=54;TCR=61;TR=83;WE=71977795;WS=71977777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,85:0.71:120
chr12	72008421	rs11541286	T	C	3071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.102;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=49;PP=2316;ReadPosRankSum=-1.370;SC=AGTAAAAAATTTGAATTCTTG;SOR=0.526;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=148;TCF=71;TCR=77;TR=101;WE=72008429;WS=72008411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,107:0.69:156
chr12	72012976	rs17815107	G	A	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=0.584;SC=TCTGTTAAGTGGGTATTCAAG;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=5;WE=72012984;WS=72012966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr12	72013832	rs1298463	A	G	1839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=19;PP=1485;SC=ATGCAACAAGAGCTTCCAGCA;SOR=1.382;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=38;TCR=19;TR=57;WE=72013840;WS=72013822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	72017799	rs17110038	A	G	471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=363;ReadPosRankSum=-1.652;SC=TGTGCTTTCAACCATTAAATA;SOR=2.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=15;WE=72017807;WS=72017789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr12	72019989	rs55719302	T	TAC	1068.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.505;NF=29;NR=3;PP=1428;ReadPosRankSum=0.560;SC=CAAATAATTATACACACACAC;SOR=0.836;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=92;TCF=82;TCR=10;TR=32;WE=72019998;WS=72019979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,43:0.56:77
chr12	72023336	.	T	TAC	238.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.549;NF=6;NR=0;PP=158;ReadPosRankSum=-1.025;SC=AGAGATACAGTACACACACAC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=6;WE=72023344;WS=72023326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr12	72026872	rs1011331	T	C	1092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=36;PP=873;SC=TCAAACACCGTGGCTTTTGAG;SOR=5.943;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=72026880;WS=72026862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	72028607	rs34399921	TA	T	246.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=1.791;QD=6.17;ReadPosRankSum=-2.772;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
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chr12	72032085	.	T	C	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.830;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=162;ReadPosRankSum=-2.019;SC=CTATTAATTCTTGGTAAGCAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=72032093;WS=72032075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr12	72051193	rs76744069	G	C	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=86;ReadPosRankSum=-0.525;SC=CAAGAAAAATGAATCGATATT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=72051201;WS=72051183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr12	72058592	rs151136858	G	GT	2449.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.904;NF=54;NR=9;PP=2691;ReadPosRankSum=-0.115;SC=TTACCCCTTAGTAAAAAAAAG;SOR=0.800;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=102;TCF=88;TCR=14;TR=63;WE=72058600;WS=72058582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,78:0.67:116
chr12	72058798	rs17110130	T	C	1700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=54;PP=1361;ReadPosRankSum=-0.118;SC=AATAGTCACATAGTAATTCTG;SOR=0.862;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=97;TCF=6;TCR=91;TR=57;WE=72058806;WS=72058788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,60:0.59:101
chr12	72067966	rs5799053	A	AT	542.92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.500;NF=25;NR=1;PP=384;ReadPosRankSum=-1.679;SC=TTTGAGTTGCATTTTTTTTTT;SOR=3.334;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=26;WE=72067974;WS=72067956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,25:0.86:29
chr12	72070505	rs140783391	AGTT	A	1394.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.383;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.834;NF=21;NR=11;PP=1333;ReadPosRankSum=-0.630;SC=GAAAAACAACAGTTGTTCTCC;SOR=1.127;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=53;TCF=32;TCR=21;TR=32;WE=72070515;WS=72070495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,36:0.61:59
chr12	72090078	rs10506640	T	C	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=1.892;SC=TTGCTAAGAATTTAATTGGTA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=72090086;WS=72090068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr12	72091014	.	C	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=502;ReadPosRankSum=-1.655;SC=GGTTTTTCTTCTAAGGAGGAA;SOR=0.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=10;WE=72091033;WS=72091004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr12	72091025	rs3741690	T	G	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=1019;ReadPosRankSum=-0.161;SC=TAAGGAGGAATCATTTGTTTG;SOR=0.465;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=22;WE=72091033;WS=72091004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr12	72091396	rs77325192	C	T	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=383;ReadPosRankSum=0.826;SC=AACCAAAAAACCTCTTGATGT;SOR=2.124;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=18;WE=72091404;WS=72091386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr12	72094530	rs367801163	TA	T	467.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQRankSum=0.110;QD=8.06;ReadPosRankSum=0.448;SOR=0.403;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,36:0.62:58
chr12	72175697	rs2289078	G	C	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=167;ReadPosRankSum=0.319;SC=GTCTGGTGGGGATTTGCATTA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=72175705;WS=72175693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr12	72248423	rs2468335	T	C	1461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-5.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.065;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=9;PP=1079;ReadPosRankSum=1.166;SC=TTTGGATAGCTGAAGGTCATC;SOR=0.354;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=67;TCF=56;TCR=11;TR=48;WE=72248431;WS=72248413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,52:0.73:71
chr12	72255388	rs7296729	G	C	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.79;ReadPosRankSum=-1.111;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr12	72287159	rs10467177	T	C	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=378;ReadPosRankSum=1.392;SC=TTATATACCCTGTACTTCTCA;SOR=0.896;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=19;WE=72287167;WS=72287149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr12	72287220	rs139574467	A	ATG	308.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=463;ReadPosRankSum=0.805;SC=ATACATAGATATGTGTGTGTG;SOR=0.481;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=10;WE=72287228;WS=72287210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr12	72307616	rs3759171	A	G	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.242;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=782;ReadPosRankSum=-0.276;SC=GATATGTTCAAGGAATGAGTG;SOR=1.036;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=35;WE=72307624;WS=72307606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,39:0.74:53
chr12	72307637	rs11178983	C	G	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=567;ReadPosRankSum=0.924;SC=ATTTACTTTCCCCTCTTTTAT;SOR=0.569;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=20;TCR=23;TR=28;WE=72307645;WS=72307627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,32:0.70:46
chr12	72372601	rs4760816	C	T	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=5;PP=798;ReadPosRankSum=-0.983;SC=ATATGTCACTCAGTTGTCAAG;SOR=0.555;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=34;WE=72372609;WS=72372591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,35:0.74:47
chr12	72372862	rs7305115	A	G	2507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.185;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=68;PP=1893;ReadPosRankSum=0.924;SC=TCTACACCCCAGAACCGTGAG;SOR=0.903;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=48;TCR=108;TR=98;WE=72372870;WS=72372852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,99:0.61:162
chr12	72388374	rs1007023	G	T	1805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.408;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=58;PP=1591;ReadPosRankSum=-0.620;SC=TAAAACCAGTGCTATTTATGT;SOR=1.911;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=88;TCF=6;TCR=82;TR=60;WE=72388382;WS=72388364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,62:0.70:89
chr12	72416235	rs4290270	A	T	3079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.350;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=40;PP=2499;ReadPosRankSum=-1.639;SC=AACTGCGGGCATATGGAGCAG;SOR=0.839;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=153;TCF=93;TCR=60;TR=104;WE=72416243;WS=72416225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,107:0.67:160
chr12	72893531	rs1444607	T	G	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.47;ReadPosRankSum=-0.676;SOR=0.083;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,9:0.21:42
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chr12	75687185	rs7967562	G	A	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.399;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=367;ReadPosRankSum=-0.077;SC=TAGAAAGCATGTAAGAAATAA;SOR=1.802;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=17;WE=75687193;WS=75687175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr12	75692607	rs7485576	G	A	1676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.067;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.684;NF=22;NR=37;PP=1305;ReadPosRankSum=1.024;SC=AGCTTCTCTCGGAAGTGAACA;SOR=1.099;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=88;TCF=34;TCR=54;TR=59;WE=75692615;WS=75692597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,60:0.67:90
chr12	75706720	rs60971359	T	C	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.074;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=20;PP=687;ReadPosRankSum=0.252;SC=TAAAGACAACTTCACCATCCA;SOR=0.964;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=29;WE=75706728;WS=75706710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr12	75710004	rs10879900	C	T	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=305;ReadPosRankSum=2.132;SC=TCAACTGTTGCAATTATTTAT;SOR=0.631;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=14;WE=75710012;WS=75709994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr12	75715330	rs10879901	C	A	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.248;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=176;ReadPosRankSum=-0.738;SC=TTGGTGCTGGCAAATTTTCAG;SOR=1.270;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=12;WE=75715338;WS=75715320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,13:0.28:46
chr12	75760742	rs12366348	G	A	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.795;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=26;PP=813;ReadPosRankSum=0.079;SC=CACCCAAGGGGCAGCTTGCAG;SOR=0.704;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=60;TCF=29;TCR=31;TR=47;WE=75760750;WS=75760732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,51:0.81:63
chr12	75784773	rs7978856	C	T	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.36;ReadPosRankSum=1.083;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,26:0.79:33
chr12	75785100	rs11180483	C	T	2213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.629;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=41;PP=1536;ReadPosRankSum=1.140;SC=GGGGCGACGTCATTCCCCGAG;SOR=0.678;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=130;TCF=63;TCR=67;TR=77;WE=75785108;WS=75785090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,86:0.60:144
chr12	75785468	rs4393363	G	A	978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.056;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=35;PP=801;ReadPosRankSum=-0.356;SC=AATATCAAGGGTAAAGAAAAT;SOR=1.911;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=68;TCF=6;TCR=62;TR=37;WE=75785476;WS=75785458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr12	75796721	rs7135440	G	T	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=508;ReadPosRankSum=-2.561;SC=TGATAGTCTTGCCACCTACCA;SOR=0.350;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=22;WE=75796729;WS=75796711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr12	75816612	rs1543946	C	G	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=1;PP=674;ReadPosRankSum=-0.788;SC=AAATTAGTAACTATATTATTT;SOR=0.489;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=27;WE=75816620;WS=75816602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr12	75816814	rs144850646	G	GACA	967.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=953;ReadPosRankSum=-0.322;SC=TAATGGATTGGACAAGAAAAA;SOR=1.432;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=20;WE=75816822;WS=75816804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
chr12	75874913	rs2242435	G	A	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=333;ReadPosRankSum=1.539;SC=TAATACCTTCGTAATACTGAA;SOR=0.997;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=16;WE=75874921;WS=75874903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr12	75875576	rs1909979	C	T	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.116;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=11;PP=1046;ReadPosRankSum=-1.407;SC=AGTTACATTTCAGATGAACCC;SOR=0.472;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=72;TCF=56;TCR=16;TR=46;WE=75875584;WS=75875566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,48:0.65:74
chr12	75884363	rs55774067	CA	C	449.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.93;MQRankSum=-0.423;QD=15.51;ReadPosRankSum=1.418;SOR=5.353;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr12	75900396	.	CAA	C	71.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=0.674;QD=2.99;ReadPosRankSum=1.772;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr12	75900702	rs2704766	G	A	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.444;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=34;PP=951;ReadPosRankSum=-0.235;SC=ACATGCTACAGAAGGAAAGAG;SOR=1.262;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=82;TCF=23;TCR=59;TR=44;WE=75900710;WS=75900692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,44:0.54:81
chr12	76424937	rs71716769	TTGC	T	3719.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=56;PP=2985;SC=GCTGCTGCTGTTGCTGCTGCT;SOR=1.872;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=106;TCF=26;TCR=80;TR=75;WE=76424947;WS=76424927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr12	76762923	rs10656017	A	AAAT	140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=159;ReadPosRankSum=-0.293;SC=ACCAAATTTTAGTTGGTTGCT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=4;WE=76762931;WS=76762913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr12	76763092	rs11459293	G	GA	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=8.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.94;ReadPosRankSum=0.234;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,12:0.30:40
chr12	76767065	rs71311107	A	AT	369.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.401;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=174;ReadPosRankSum=0.582;SC=TTTAAATGTGATTTTTTTTTT;SOR=0.419;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=15;WE=76767073;WS=76767055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,20:0.34:58
chr12	76769209	rs7299563	G	A	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.602;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=170;ReadPosRankSum=-1.097;SC=TATGGCTCACGATAAACAGTT;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=9;WE=76769217;WS=76769199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr12	76780051	rs72247585	T	TA	100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=1.481;QD=5.04;ReadPosRankSum=2.124;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr12	76780471	rs73137003	A	T	1737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.394;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=41;PP=1397;ReadPosRankSum=0.444;SC=CAAAAATTTTAAAAAATGTAT;SOR=1.410;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=92;TCF=38;TCR=54;TR=64;WE=76780479;WS=76780461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,65:0.68:96
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chr12	76804168	rs35236201	G	A	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.441;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=88;ReadPosRankSum=-0.712;SC=TTTCTAAGTAGCCAACAATAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=76804176;WS=76804158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
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chr12	77209613	.	GT	G	91.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.650;QD=2.18;ReadPosRankSum=-0.548;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,11:0.26:42
chr12	77214788	rs2306142	G	A	2640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=11;PP=2216;SC=TTAGATGACTGGAGGAGTAGT;SOR=3.664;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=71;TCR=11;TR=82;WE=77214796;WS=77214778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
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chr12	77235768	rs33996476	A	G	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=227;ReadPosRankSum=0.086;SC=GCACATCTCAACTTTTTATTT;SOR=0.560;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=10;WE=77235776;WS=77235758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr12	77236968	rs1979743	G	A	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=169;ReadPosRankSum=0.716;SC=CTTTTGATTCGGAGGTGCCGT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=9;WE=77236976;WS=77236958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr12	77239420	rs143729859	AAAAT	A	619.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=732;ReadPosRankSum=0.826;SC=ATATTTTGAGAAAATAAATAG;SOR=0.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=69;TCR=2;TR=19;WE=77239431;WS=77239410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,19:0.29:66
chr12	77243122	rs368198186	C	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQRankSum=-2.627;QD=6.29;ReadPosRankSum=1.294;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr12	77243125	.	G	A	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.556;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQRankSum=-2.581;QD=4.51;ReadPosRankSum=1.227;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr12	77243128	.	T	A	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.955;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQRankSum=-2.928;QD=3.66;ReadPosRankSum=0.963;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr12	77254207	rs35557984	GA	G	1171.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FS=5.766;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=2.198;QD=4.67;ReadPosRankSum=-0.276;SOR=0.428;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:177,74:0.29:251
chr12	77256477	rs2047226	T	C	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=227;ReadPosRankSum=1.085;SC=GAATCAAAAATAAGAAGTAAT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=13;WE=77256485;WS=77256467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr12	77256681	rs2047227	T	G	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.403;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=709;ReadPosRankSum=-0.825;SC=GCTGTGAAATTGAAGTAAATA;SOR=0.638;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=148;TCF=70;TCR=78;TR=41;WE=77256689;WS=77256671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,45:0.29:153
chr12	77438436	rs2242384	T	C	5460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=138;NR=36;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.949;SC=TACTATGGTCTGGGGCATCTT;SOR=1.576;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=175;TCF=139;TCR=36;TR=174;WE=77438444;WS=77438426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,175:0.99:176
chr12	77438607	rs2242383	T	C	3069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=83;PP=2582;ReadPosRankSum=-0.899;SC=AGCATCAAAGTATATGATTTT;SOR=3.398;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=6;TCR=84;TR=89;WE=77438615;WS=77438597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,92:0.99:93
chr12	77439720	rs74544237	T	C	1984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=0;PP=1580;ReadPosRankSum=0.893;SC=CCCTCCAGGGTTGTCAACCTG;SOR=6.837;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=58;TCR=0;TR=57;WE=77439728;WS=77439710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr12	77449790	rs310791	A	G	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=2.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.66;ReadPosRankSum=-0.664;SOR=0.944;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,46:0.28:166
chr12	77966154	rs4761386	G	A	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=15;PP=422;SC=CTGTTTCACGGAAATCAACCC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=77966162;WS=77966144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	78225186	rs17195772	C	A	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.015;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=456;ReadPosRankSum=0.107;SC=TGGAGTCTACCAGACTGAGGT;SOR=1.009;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=100;TCF=73;TCR=27;TR=29;WE=78225194;WS=78225176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,30:0.30:100
chr12	78225374	rs10735309	A	G	4144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=80;PP=2965;SC=TTTGGAACTTACTGAAACAGA;SOR=1.311;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=41;TCR=80;TR=121;WE=78225382;WS=78225364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr12	78334053	rs1731740	G	C	1363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.932;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=15;PP=1147;ReadPosRankSum=-0.646;SC=TATTGTCTCTGTTTTCCCTCA;SOR=1.158;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=105;TCF=71;TCR=34;TR=53;WE=78334061;WS=78334043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,53:0.51:104
chr12	78400884	rs34276383	G	A	2090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=49;PP=1588;ReadPosRankSum=-0.430;SC=GCTTAATTCCGTCTTCCAGTG;SOR=0.694;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=227;TCF=99;TCR=128;TR=87;WE=78400892;WS=78400874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,89:0.39:228
chr12	78510374	rs2694680	T	C	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=200;ReadPosRankSum=-0.250;SC=GTTATTCTTATGTAGACCCTC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=10;WE=78510382;WS=78510364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr12	78510415	rs11835006	T	A	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.729;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=169;ReadPosRankSum=-1.676;SC=TCCCAAAATGTGAAATAAGTG;SOR=0.007;SbPval=0.06;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=10;WE=78510423;WS=78510405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr12	78511755	rs300442	T	C	3192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=5;PP=2652;SC=CCTTAATTCATACTTTATAAA;SOR=5.464;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=88;TCR=5;TR=93;WE=78511763;WS=78511745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr12	78513833	rs55670442	T	TATATA	761.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=910;SC=ATGTATAAGGTATATATATAT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=14;WE=78513841;WS=78513823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	78530979	rs1852464	G	A	3272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=50;PP=2605;SC=ATTTGTCTCAGTTTAACCTTC;SOR=0.795;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=46;TCR=50;TR=96;WE=78530987;WS=78530969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr12	78531156	rs2290103	A	G	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.639;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=296;ReadPosRankSum=0.566;SC=GTAAGCGTTGAGGGGGATTAA;SOR=1.085;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=15;WE=78531164;WS=78531146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr12	78531207	rs300462	T	C	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=17;PP=366;SC=GGGAAACCATTGTGTCACTCA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=78531215;WS=78531197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	78534233	rs1726427	A	G	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=253;ReadPosRankSum=0.294;SC=GTTGTGTAGCAAAATAACGGC;SOR=0.260;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=12;WE=78534241;WS=78534223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr12	78537016	rs451753	A	T	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=155;ReadPosRankSum=-1.141;SC=GCTAGATCTAACCCATTTGTC;SOR=0.257;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=8;WE=78537024;WS=78537006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr12	78537138	rs10661027	C	CGGT	290.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.81;ReadPosRankSum=0.750;SOR=0.738;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,11:0.22:50
chr12	78538648	rs411935	T	C	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=0;PP=386;SC=TACAGTGAGTTGTGAATGCGC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=78538656;WS=78538638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	78538728	rs424514	G	A	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=8.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQRankSum=-1.383;QD=15.58;ReadPosRankSum=0.511;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr12	78538732	.	G	A	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.748;ClippingRankSum=-0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=5.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.98;MQRankSum=-2.205;QD=8.91;ReadPosRankSum=1.314;SOR=2.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr12	78540174	rs34144410	TA	T	468.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.49;NF=7;NR=9;PP=292;SC=CATTCAGAGGTAAAAAAAAAA;SOR=0.892;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=16;WE=78540182;WS=78540164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	78542594	rs444864	T	G	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.028;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=439;ReadPosRankSum=0.692;SC=TACTTGCCTATTCCATTGATT;SOR=1.264;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=11;WE=78542610;WS=78542584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,11:0.22:50
chr12	78542602	rs3214877	A	AT	295.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=3.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.58;ReadPosRankSum=0.149;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,12:0.23:53
chr12	78542699	rs366527	T	C	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-2.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.444;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=93;ReadPosRankSum=0.548;SC=TTTCAGCAAATGTAAGTCACT;SOR=0.403;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=11;WE=78542707;WS=78542689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,11:0.24:45
chr12	78562687	rs1726431	A	G	2854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=71;PP=2200;SC=AATATAATAGACATCTATTTT;SOR=3.937;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=10;TCR=71;TR=81;WE=78562695;WS=78562677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr12	78569059	rs2442134	G	A	2344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=11;PP=1864;SC=TTCATGAGCCGATGTGATACT;SOR=3.105;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=57;TCR=11;TR=68;WE=78569067;WS=78569049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr12	78570914	rs1020462	G	C	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.656;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=14;PP=745;ReadPosRankSum=0.473;SC=TTCTGTCCTTGTTTCAGCTGA;SOR=0.523;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=117;TCF=82;TCR=35;TR=42;WE=78570922;WS=78570904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,42:0.35:120
chr12	78571186	rs1020461	T	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.647;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=53;ReadPosRankSum=0.241;SC=CTGTACCAATTATTTTCAGAT;SOR=0.097;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=6;WE=78571194;WS=78571176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr12	78571490	rs958836	T	C	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.989;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=41;PP=1361;ReadPosRankSum=-0.923;SC=GATGCATGAATACTGCAAAGA;SOR=0.858;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=156;TCF=65;TCR=91;TR=67;WE=78571498;WS=78571480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,69:0.43:162
chr12	78582362	rs300513	T	C	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=8;PP=978;SC=TCTGTTTTGATTTTATTTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=37;WE=78582370;WS=78582352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	78582566	rs400289	A	G	2850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=62;PP=2255;SC=AGGTAAAAGCAATAATGAAAA;SOR=2.250;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=21;TCR=63;TR=82;WE=78582574;WS=78582556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr12	78590946	rs300498	A	C	1087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=0;PP=943;SC=GAGGACAAAGAGTGCTATTCC;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=78590954;WS=78590936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	78590983	rs300497	A	G	1956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=2;PP=1633;SC=TCCTATTAGTATAAATTTATC;SOR=5.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=54;TCR=2;TR=56;WE=78590991;WS=78590973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	79611374	rs2037743	C	T	4522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=62;PP=2965;SC=TGCCAAGCAACGCCACAGAGC;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=145;TCF=80;TCR=65;TR=142;WE=79611382;WS=79611364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr12	79611536	rs2400390	T	C	1285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=36;PP=1089;SC=GGAAAGAAAGTAGAACTCCGT;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=79611544;WS=79611526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	79747487	rs1732664	T	C	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=25;PP=664;ReadPosRankSum=-1.313;SC=ACTCCCCACTTCTTAATTGAT;SOR=0.344;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=27;WE=79747495;WS=79747477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr12	80014907	rs2307223	A	T	3231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=70;PP=2435;SC=CTTCATTCTGAATAGTGTTCT;SOR=2.027;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=29;TCR=70;TR=99;WE=80014915;WS=80014897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr12	80169497	rs5799439	TA	T	559.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=0;PP=499;SC=TGGTCTTGATTAAAAAAAAAA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=27;WE=80169517;WS=80169487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	80175764	rs2111687	G	A	217.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=178;SC=ACAGGTTCGTGAGTAAAGCAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=80175772;WS=80175754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	80201271	rs34190005	TTA	T	343.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=335;SC=AGTACTAAGATTATATACCCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=80201280;WS=80201261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	80216060	rs3849223	C	A	1148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=29;PP=911;SC=TATATAAAGACGTTGGATAAC;SOR=4.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=31;WE=80216068;WS=80216050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	80603406	rs4842344	A	T	172.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=137;SC=GAATTGTACTAAATGATACTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=80603414;WS=80603396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	80613570	.	CT	C	33.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=0.000;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=3.180;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=3.461;QD=0.47;ReadPosRankSum=-0.941;SOR=1.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,14:0.19:72
chr12	80626970	rs1451105	T	G	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=16;PP=435;SC=GTCATAGCTTTGGGAAAATTT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=80626978;WS=80626960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	80645734	rs11438265	A	AT	865.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=2;PP=787;SC=CAAGTATGCAATTTTTTTGCA;SOR=3.841;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=26;WE=80645742;WS=80645724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	80645799	rs2100258	A	T	2643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.14;QD=34.33;SOR=5.394;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr12	80647155	rs10862083	A	G	1796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=1;PP=1404;SC=ATGCGTAGGTATTCAACAGAA;SOR=6.518;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=48;TCF=47;TCR=1;TR=47;WE=80647163;WS=80647145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	80648148	rs144548100	ATTTAT	A	356.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.19;QD=39.64;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	80648399	rs7295623	C	T	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=21;PP=793;SC=TTTCTTTAGACTGGGGAGAAA;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=80648407;WS=80648389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	80650276	rs147846753	T	TCAAACAAA,TCAAA	548.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=0,0;NR=9,9;PP=367,61;SC=TTTCTTTACATCAAACAAACA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=9,9;WE=80650284;WS=80650266;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:12
chr12	80655692	rs10778721	G	A	2281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=4;PP=1773;SC=AATATCTGAAGGTTATGAACA;SOR=5.136;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=59;TCR=4;TR=63;WE=80655700;WS=80655682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr12	80660499	rs7313132	T	C	197.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=7;PP=153;SC=TATTTCTTATTGTCTTTACTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=80660507;WS=80660489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	80661189	rs11114377	T	A	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.18;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	80663825	rs11324174	GA	G	600.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=27;NR=0;PP=402;SC=GAAATTCAGGGAAAAAAAAAA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=27;WE=80663846;WS=80663815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	80665397	rs4483657	A	G	2326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=8;PP=1808;SC=ACAAAAAGTTAAGGACATTTT;SOR=3.521;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=58;TCR=8;TR=65;WE=80665405;WS=80665387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr12	80672064	rs1376384	A	G	1230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=36;PP=965;ReadPosRankSum=-0.917;SC=TGGTAAGGAGATCCATTTATT;SOR=0.712;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=77;TCF=13;TCR=64;TR=44;WE=80672072;WS=80672054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,45:0.57:79
chr12	80707153	rs1037335	C	T	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.660;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.62;ReadPosRankSum=0.389;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr12	80707236	rs11114396	T	A	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.746;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=267;ReadPosRankSum=0.191;SC=AATTAAGTAATCTTTCACCTC;SOR=1.463;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=15;WE=80707244;WS=80707226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr12	80712307	rs7963215	A	C	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.99;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	80712420	rs10778725	G	A	1363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=24;PP=1036;SC=TCTGTTTGCCGAGAAGCAGTG;SOR=0.976;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=42;WE=80712428;WS=80712410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	80722385	rs71094975	C	CT	513.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.134;NF=27;NR=0;PP=395;ReadPosRankSum=-0.847;SC=AAATGTAGTCCTTTTTTTTTT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=27;WE=80722393;WS=80722375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,24:0.60:40
chr12	80726693	rs117863885	A	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=-0.161;SC=AATAATCTATACAAAATTTCT;SOR=0.157;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=6;WE=80726701;WS=80726683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr12	80730664	rs10862093	G	A	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=280;ReadPosRankSum=-1.082;SC=GTTTAACTCCGTAAAGTTTTA;SOR=0.948;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=14;WE=80730672;WS=80730654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr12	80735771	rs10778727	T	C	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.638;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=534;ReadPosRankSum=2.018;SC=GGATGCAAAATGGCACAATTA;SOR=0.307;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=25;WE=80735779;WS=80735761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,28:0.67:42
chr12	80746234	rs147703967	G	GAAT	2339.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=35;PP=2287;SC=ACTGTTAACTGAATATTTTTC;SOR=2.437;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=50;TCF=7;TCR=43;TR=42;WE=80746242;WS=80746224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	80747209	rs7312569	C	G	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.210;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=654;ReadPosRankSum=-0.075;SC=CTGTTTGAATCTAAGAGAAGA;SOR=0.343;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=99;TCF=31;TCR=68;TR=36;WE=80747217;WS=80747199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,37:0.35:105
chr12	80747242	rs7297767	A	G	2345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=58;PP=1934;SC=AGTTGGAACTATTCTTCACAG;SOR=2.864;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=13;TCR=58;TR=71;WE=80747250;WS=80747232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	80749392	rs6539501	A	T	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=601;SC=TCTGAGAAAAACAATAGACTT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=80749400;WS=80749382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	80750659	rs11836060	G	A	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.152;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.142;NF=25;NR=29;PP=965;ReadPosRankSum=-0.210;SC=ATTCAAGTTCGACAGGAAGAA;SOR=0.393;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=142;TCF=58;TCR=84;TR=54;WE=80750667;WS=80750649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,58:0.40:146
chr12	80750741	rs5799468	G	GA	1917.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=58;PP=1831;SC=AAGGATCTAGGAAAAAAATCT;SOR=5.518;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=70;TCF=3;TCR=67;TR=60;WE=80750749;WS=80750731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	80752660	rs2034528	A	G	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=573;SC=TGAAAACCTTATTATGCCAAC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=80752668;WS=80752650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	80760291	.	T	TTATATATATATA	129.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=285;SC=TATATATAGGTTATATATATA;SOR=2.303;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=2;WE=80760299;WS=80760281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	80760470	rs34113015	GT	G	535.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=551;SC=ATTAGTATCTGTTTTTTCACT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=80760478;WS=80760460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	80761411	rs11114416	G	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.863;HP=3;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=237;ReadPosRankSum=1.056;SC=TAAAGTATTTGGAAGAAGACT;SOR=0.207;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=46;TCF=32;TCR=14;TR=17;WE=80761419;WS=80761401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr12	80761430	rs1551118	G	A	1720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=19;PP=1255;SC=CTTTTGTTATGCTATAGAGTG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=36;TCR=19;TR=55;WE=80761438;WS=80761420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	80761465	rs2717482	G	A	2382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=30;PP=1889;SC=ATAACCATACGGGCTTTCACA;SOR=1.091;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=72;TCF=42;TCR=30;TR=71;WE=80761473;WS=80761455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr12	80762163	rs57527553	T	TCC	4590.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=37;NR=81;PP=2235;SC=TTGGAAAATGTCCCCCCCCAC;SOR=1.510;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=135;TCF=42;TCR=93;TR=118;WE=80762171;WS=80762153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr12	80762246	rs10778730	G	A	1914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=58;PP=1732;SC=GTTACATTTTGAAGTATCTGA;SOR=8.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=0;TCR=58;TR=58;WE=80762254;WS=80762236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	80764574	.	C	T	36	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=36;QD=17.6928031368;SC=TACATAATGGCGAATGTGTTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=4;WE=80764582;WS=80764564;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr12	80765683	rs5799469	TGAA	TAA,T	232.80	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=167;SC=TATTTTTCTATGAAGGCTTTG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=80765695;WS=80765673;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:6
chr12	80765685	rs201680829	AAG	A	232.80	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.80;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	80765687	.	G	A	86	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=2;HapScore=4;MGOF=13;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=86;QD=30.1928031368;SC=TTTCTATGAAGGCTTTGTGGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=80765695;WS=80765673;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,4:0.80:5
chr12	80765741	rs1037336	C	T	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=536;SC=TTTTCTAGTACAAGAGAACAT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=80765749;WS=80765731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	80765800	rs1551122	A	G	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=358;ReadPosRankSum=-0.037;SC=TCTTTCTAGAATGAAGGGATT;SOR=0.743;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=34;TCF=16;TCR=18;TR=20;WE=80765808;WS=80765790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr12	80765933	rs10862100	C	G	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=227;ReadPosRankSum=-0.450;SC=AATTCAATTCCTATGATGCAA;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=11;WE=80765953;WS=80765923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr12	80765945	rs10778734	G	A	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=368;SC=ATGATGCAAAGAGAGAAACAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=13;WE=80765953;WS=80765923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	80771813	rs2717477	G	A	4009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=86;PP=2965;SC=TAGACTGTACGTGCCAGTGGA;SOR=2.056;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=123;TCF=35;TCR=88;TR=121;WE=80771821;WS=80771803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr12	80816492	rs4482093	C	T	3778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=58;PP=2932;SC=TCTCTGGAATCGAGTTGATGG;SOR=0.761;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=55;TCR=59;TR=113;WE=80816500;WS=80816482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr12	80816558	rs138741793	C	T	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=2.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.34;ReadPosRankSum=1.260;SOR=0.420;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,20:0.22:90
chr12	80818876	rs10746164	A	G	1838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=39;PP=1452;SC=GGGACTGAAAAGAAGCCATCC;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=55;WE=80818884;WS=80818866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	80818964	rs10746165	G	T	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=289;ReadPosRankSum=-0.371;SC=AGAGAGAAATGGTTGTATTTA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=13;WE=80818972;WS=80818954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr12	80821391	rs61127339	C	CT	1122.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.084;HP=9;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.320;NF=2;NR=34;PP=759;ReadPosRankSum=0.324;SC=TATTTCACTCCTTTTTTTTTG;SOR=3.816;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=55;TCF=4;TCR=51;TR=36;WE=80821399;WS=80821381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,44:0.96:46
chr12	80821446	rs7294514	T	C	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=21;PP=479;SC=TGTGCCACTTTGTTAATGTAG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=80821454;WS=80821436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	80828629	rs4128302	T	C	32.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr12	80828679	rs4128303	C	G	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=404;ReadPosRankSum=-0.090;SC=GCTTTTTAAACTTTGGAAAAT;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=16;WE=80828687;WS=80828669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,18:0.82:22
chr12	80828843	rs9669382	A	G	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=3.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.281;SOR=0.177;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,8:0.19:42
chr12	80838012	rs10746166	T	C	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=340;SC=TTGAGTAATATGGGCTCATTA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=80838020;WS=80838002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	80840771	rs7311270	G	A	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=249;ReadPosRankSum=-0.562;SC=AGAAATCTCCGTACTGTTTCT;SOR=0.743;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=14;WE=80840779;WS=80840761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr12	80842199	rs11513908	A	C	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.289;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=29;ReadPosRankSum=-0.524;SC=ACATGTGCACAATGTGCAGGT;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=80842207;WS=80842189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
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chr12	80849328	rs4482094	G	A	1736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=31;PP=1355;SC=TTCAGTTGTAGCAGCTGAAAC;SOR=0.762;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=28;TCR=31;TR=59;WE=80849336;WS=80849318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
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chr12	80853424	rs4439581	T	C	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=205;ReadPosRankSum=1.185;SC=ATCAAATGTATCATGCCAAAT;SOR=1.276;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=9;WE=80853432;WS=80853414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr12	80853649	rs11837911	G	A	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=64;ReadPosRankSum=-0.912;SC=GTTTCTTACAGCACATTAAAA;SOR=1.154;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=6;WE=80853657;WS=80853639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr12	80855597	rs4499068	T	C	2521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=15;PP=1829;SC=TAATCCTAAATGGAGAAAAGT;SOR=2.419;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=60;TCR=15;TR=75;WE=80855605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	80855803	rs7137294	G	A	1814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.791;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.746;NF=18;NR=50;PP=1396;ReadPosRankSum=1.113;SC=AGGTCAGTGCGTGCAGTGCGC;SOR=0.809;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=112;TCF=30;TCR=82;TR=68;WE=80855811;WS=80855793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,70:0.60:117
chr12	80855818	rs7976388	A	C	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.359;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-2.538;NF=8;NR=25;PP=477;ReadPosRankSum=-2.192;SC=GTGCGCCGTGAGAGAGCCGAA;SOR=0.174;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=89;TCF=14;TCR=75;TR=33;WE=80855826;WS=80855808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,35:0.39:90
chr12	80855835	rs11524045	C	T	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.221;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.149;NF=2;NR=22;PP=430;ReadPosRankSum=-0.235;SC=CGAAGCAGGGCGAGGCATTGC;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=73;TCF=4;TCR=69;TR=24;WE=80855843;WS=80855825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,25:0.34:74
chr12	80855856	rs4448754	G	A	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-5.027;NF=0;NR=18;PP=346;ReadPosRankSum=0.322;SC=CTCACTTGGGGAGCACAAGGG;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=0;TCR=52;TR=18;WE=80855864;WS=80855846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr12	80862469	rs56105723	A	T	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=9.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.77;ReadPosRankSum=0.063;SOR=0.025;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr12	80865948	rs61729291	A	G	2495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.877;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=29;PP=1831;ReadPosRankSum=0.916;SC=CACCATTTACAATGTATGATG;SOR=1.129;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=170;TCF=115;TCR=55;TR=100;WE=80865956;WS=80865938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,106:0.60:176
chr12	80878174	rs7311413	T	A	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=0;PP=900;SC=ATATTTTTAATTTCCCCCTTT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=29;WE=80878189;WS=80878164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	80878181	rs56351124	C	CT	1198.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=27;NR=0;PP=1109;SC=TAATTTCCCCCTTTTCTTTTC;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=27;WE=80878189;WS=80878164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	80889165	rs145970310	T	TTTG	490.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=409;SC=AAAACAATGTTTTGTTGTTGT;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=10;WE=80889173;WS=80889155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	80889829	rs10778752	T	A	1356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=18;PP=1157;SC=TCAACCCACGTTGGAGAAAGT;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=23;TCR=18;TR=41;WE=80889837;WS=80889819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	80890008	.	A	AATGTTCTT	2067.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.274;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=1890;ReadPosRankSum=-1.270;SC=AGGTACTACAAATGTTCTTTT;SOR=0.410;Source=Platypus;TR=29;WE=80890016;WS=80889998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,49:0.61:80
chr12	80890325	rs56929349	T	TG	3589.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=68;PP=2976;SC=GCTTTTGTTTTCTTTGTTTGT;SOR=3.044;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=80;TCF=6;TCR=74;TR=74;WE=80890333;WS=80890315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr12	80900058	rs7964887	T	C	221.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=182;SC=AGTTTAATGTTAATAGTTTCA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=80900066;WS=80900048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	80900335	rs7975096	G	T	970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=5;PP=759;SC=TTACCTATTTGATTTCTCTTT;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=80900356;WS=80900325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	80900348	rs7965277	T	G	1287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=12;PP=1010;SC=TTCTCTTTAGTACTGAAGAAA;SOR=1.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=42;WE=80900356;WS=80900325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	80900495	rs7976085	C	T	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=29;PP=818;ReadPosRankSum=-0.996;SC=CTATAACATTCCAAGAAACAC;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=33;WE=80900503;WS=80900485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr12	80904325	rs7963676	C	T	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=27;PP=774;SC=ACATTAGGAACCTGATTATTA;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=80904333;WS=80904315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	80933785	rs7954867	A	C	333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=279;SC=ATTTTAGGAAATTTTACTATT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=80933793;WS=80933775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	80935345	rs6539524	T	C	2624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=19;PP=2059;SC=ACCTGAAGGGTTTGTTGGAAA;SOR=2.219;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=60;TCR=19;TR=79;WE=80935353;WS=80935335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr12	80936026	rs17713202	A	G	2240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=12;PP=1832;SC=TACTTCTGATAATTACATAAT;SOR=2.939;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=52;TCR=12;TR=64;WE=80936034;WS=80936016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr12	80936082	rs11114503	C	T	3115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=31;PP=2470;ReadPosRankSum=-0.734;SC=TTTTTGCTGCCGCAAGAACTA;SOR=0.771;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=69;TCR=31;TR=99;WE=80936090;WS=80936072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,99:0.99:100
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chr12	81533078	rs2107415	G	C	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-6.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=39;PP=753;ReadPosRankSum=0.334;SC=TCTTGCTTATGGTAATATGCT;SOR=1.162;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=0;TCR=64;TR=39;WE=81533086;WS=81533068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,39:0.60:65
chr12	81552338	rs11835646	C	T	2136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=55;PP=1593;ReadPosRankSum=-1.444;SC=GTGCTTGACTCCTCAGCATTT;SOR=1.051;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=128;TCF=36;TCR=92;TR=74;WE=81552346;WS=81552328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,80:0.58:138
chr12	81624964	rs2293651	A	T	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=258;ReadPosRankSum=-0.209;SC=ACTTTTCTATAATTCTTGCCT;SOR=0.252;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=14;WE=81624972;WS=81624954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr12	81647065	rs2895868	G	A	2252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.924;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=12;PP=1847;ReadPosRankSum=-1.983;SC=TATTCTAAATGAATGCCTTTC;SOR=0.841;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=130;TCF=110;TCR=20;TR=81;WE=81647073;WS=81647055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,84:0.62:135
chr12	81647471	rs2400895	T	A	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=649;ReadPosRankSum=1.439;SC=AAGATATTTATTCCTGGGTTC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=28;WE=81647479;WS=81647461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr12	81655861	rs2272501	G	C	2804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.404;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=62;PP=2132;ReadPosRankSum=-1.178;SC=TTGGATGATTGAGTACAAGAT;SOR=0.201;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=136;TCF=42;TCR=94;TR=96;WE=81655869;WS=81655851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,100:0.70:142
chr12	81660963	rs35647579	C	CA	562.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.336;NF=11;NR=13;PP=406;ReadPosRankSum=-0.369;SC=ATTTTAACTACAAAAAAAACA;SOR=0.846;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=42;TCF=20;TCR=22;TR=24;WE=81660985;WS=81660953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr12	81661039	rs12826016	G	A	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.774;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=511;ReadPosRankSum=-0.548;SC=GAGGTCAAGAGGCTTTGGCCT;SOR=1.211;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=39;TCF=16;TCR=23;TR=24;WE=81661047;WS=81661029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr12	81661903	.	T	TTTTC	331.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=4.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQRankSum=1.243;QD=13.27;ReadPosRankSum=-0.413;SOR=2.120;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr12	81661945	rs6539566	A	T	172.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=32.31;QD=28.81;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	81688958	rs1882188	C	G	252.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=211;SC=CCCTAGAGGACATAGATGCAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=81688978;WS=81688948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	81688970	rs1882187	A	G	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=68;ReadPosRankSum=-0.623;SC=TAGATGCACAAAGAAATTAAA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=81688978;WS=81688948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr12	81695836	rs10862288	G	A	87.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=1;PP=49;SC=CAGAAGAGGTGCTAAATAAAT;SOR=1.609;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=81695844;WS=81695826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	81696399	rs1921053	G	A	4325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=70;NR=60;PP=2965;SC=GTGGAAAAACGGATCAGATGG;SOR=0.864;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=72;TCR=60;TR=130;WE=81696407;WS=81696389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr12	81696487	rs1921052	G	A	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.834;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=47;PP=1335;ReadPosRankSum=0.015;SC=TTTGAGAGAAGTAACAATTAT;SOR=0.572;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=105;TCF=29;TCR=76;TR=66;WE=81696495;WS=81696477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,71:0.64:111
chr12	81751813	rs11835074	C	T	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=95;ReadPosRankSum=0.494;SC=AAAAATGAAACTATGTATTTA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=7;WE=81751821;WS=81751803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr12	81756611	rs17245804	C	A	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=138;ReadPosRankSum=1.841;SC=TATCAGCAAGCAATTATGATA;SOR=0.290;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=11;WE=81756619;WS=81756601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr12	81760844	rs76940768	AT	A	448.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.122;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.48;MQRankSum=2.743;NF=15;NR=5;PP=662;ReadPosRankSum=-1.670;SC=GGAATAGAAAATAAAAATAGA;SOR=0.946;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=20;WE=81760852;WS=81760834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,20:0.29:68
chr12	81761026	rs117679149	T	A	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=-0.711;SC=TAATATCTTATCACTCAAGAA;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=5;WE=81761034;WS=81761016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr12	81769581	rs10862301	C	T	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=4.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.31;ReadPosRankSum=0.564;SOR=0.934;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,26:0.23:114
chr12	81833745	rs2272083	G	T	1103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=1.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.21;ReadPosRankSum=-0.467;SOR=0.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,58:0.27:212
chr12	82617454	rs17009348	T	G	2294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.336;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=39;PP=1744;ReadPosRankSum=0.771;SC=GCATCTTATGTGCAGGCTGGT;SOR=0.491;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=124;TCF=66;TCR=58;TR=80;WE=82617462;WS=82617444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,85:0.65:131
chr12	82751955	rs6539662	A	G	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=405;ReadPosRankSum=-0.405;SC=TTATATCCTAAAACTTAGCAA;SOR=0.313;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=19;WE=82751963;WS=82751945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
chr12	82752037	rs79245219	T	G	2727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.782;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=20;PP=2286;ReadPosRankSum=0.652;SC=TTGCGGGTGGTTAGGCCGCCA;SOR=0.622;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=117;TCR=31;TR=97;WE=82752045;WS=82752027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,98:0.66:149
chr12	82752133	rs139862859	G	C	1782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.665;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=33;PP=1382;ReadPosRankSum=-0.705;SC=CCGCCACTTCGCGGACCGCCT;SOR=0.839;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=242;TCF=131;TCR=111;TR=76;WE=82752141;WS=82752123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,78:0.31:250
chr12	82752633	rs4882530	G	A	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=280;ReadPosRankSum=-1.301;SC=GGGCGGGAAGGGAGGCGGAGG;SOR=0.606;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=18;WE=82752641;WS=82752623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,19:0.39:49
chr12	82780676	rs56337649	A	G	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=747;ReadPosRankSum=0.411;SC=ATTCTGTACAAAACTTGGGAA;SOR=0.740;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=58;TCF=29;TCR=29;TR=34;WE=82780684;WS=82780666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,36:0.59:61
chr12	82783668	rs10778908	C	T	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.882;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=12;PP=429;ReadPosRankSum=-0.371;SC=CAGAGCTGATCAGCAGTATTG;SOR=0.836;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=73;TCF=38;TCR=35;TR=26;WE=82783676;WS=82783658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,28:0.36:78
chr12	82792787	rs4296098	C	A	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.99;ReadPosRankSum=0.786;SOR=0.568;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,24:0.24:100
chr12	82828426	rs10683876	T	TATAAG	4640.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=5;PP=2974;SC=TTATAAATCTTATAAGACTCA;SOR=5.069;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=99;TCF=89;TCR=10;TR=72;WE=82828434;WS=82828416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr12	82832418	rs2717448	G	A	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=2;PP=582;SC=ACAGTCACGTGTGGTTCCAAC;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=82832426;WS=82832408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	82850427	rs2731290	A	G	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.98;ReadPosRankSum=-0.536;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr12	82871063	.	A	C	670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.420;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.057;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=601;ReadPosRankSum=-0.499;SC=ATTTTAGTTGAAAGTTGTACT;SOR=0.985;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=44;TCF=21;TCR=23;TR=25;WE=82871071;WS=82871053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr12	82872913	rs79897492	G	A	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.928;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=509;ReadPosRankSum=-0.352;SC=TGACTGTTATGTATTTTAAAT;SOR=2.338;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=24;WE=82872921;WS=82872903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr12	83251457	rs187015502	G	A	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.743;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=122;ReadPosRankSum=-1.067;SC=CTCTGCAAGCGGAATTTAAAA;SOR=0.066;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=10;WE=83251465;WS=83251447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr12	83324456	rs1682572	C	T	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=588;ReadPosRankSum=-0.745;SC=AATCATGCCTCTGAGACTATT;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=24;WE=83324464;WS=83324446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,25:0.74:34
chr12	83324499	rs10746259	G	T	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=42;ReadPosRankSum=-0.834;SC=CTTTGTTTCGGGCCACATCAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=83324507;WS=83324489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr12	85279121	rs76715880	C	T	121.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=62;ReadPosRankSum=-0.210;SC=GATGTTTCTACATTATTTTAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=85279129;WS=85279111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr12	85285920	rs5799712	TA	T	81.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.57;MQRankSum=2.445;QD=2.92;ReadPosRankSum=-0.028;SOR=0.289;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr12	85638645	rs5799725	GA	G	789.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.080;NF=12;NR=23;PP=403;ReadPosRankSum=-1.546;SC=TGTGAACAGAGAAAAAAAAAA;SOR=0.680;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=94;TCF=39;TCR=55;TR=35;WE=85638653;WS=85638635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,42:0.47:89
chr12	86198594	rs11831336	A	G	2114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.447;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=49;PP=1687;ReadPosRankSum=-0.407;SC=ATACTCTTTGAGTAAAGGGAG;SOR=1.071;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=123;TCF=46;TCR=77;TR=74;WE=86198602;WS=86198584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,76:0.60:126
chr12	86198935	rs7397266	C	T	3639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-6.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.539;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=53;PP=2826;ReadPosRankSum=-1.088;SC=TCTATTTCAGCAGAGAGCTTA;SOR=0.625;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=115;TCR=81;TR=127;WE=86198943;WS=86198925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,135:0.65:208
chr12	86229843	rs1349061	C	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=104;ReadPosRankSum=-0.812;SC=CCACAAAACACATACTTTCAC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=86229851;WS=86229833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr12	86268015	rs2234762	C	G	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=399;ReadPosRankSum=-0.075;SC=AATGTCTGTACAATCAATGAC;SOR=1.721;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=16;WE=86268023;WS=86268005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr12	86270609	rs112838319	G	GA	276.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.641;NF=1;NR=12;PP=227;ReadPosRankSum=0.946;SC=TTTCCTTTTTGAAAAAAAAAA;SOR=1.292;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=13;WE=86270617;WS=86270599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr12	86270629	rs35124959	GT	G	286.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5052;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=297;ReadPosRankSum=-2.063;SC=ATTTCTTTTAGTTAAAAGAAG;SOR=1.329;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=10;WE=86270637;WS=86270619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr12	86272378	rs58553548	A	T	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=606;ReadPosRankSum=-0.419;SC=TAATATGATTATAGTTACACT;SOR=0.735;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=25;WE=86272386;WS=86272368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr12	88177722	rs1796320	G	A	2708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=23;PP=2341;SC=TTGTTTCCACGGCAGTTTGCT;SOR=1.923;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=58;TCR=23;TR=81;WE=88177730;WS=88177712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr12	88177791	rs1675574	C	T	3860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=31;PP=2965;SC=TGCAGGAAGGCGCAGTGCGGC;SOR=2.119;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=91;TCR=31;TR=121;WE=88177799;WS=88177781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr12	88178271	rs112316052	TGCC	T	3520.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=24;NR=35;PP=2748;SC=AGGCCGCTGCTGCCGCCGCCG;SOR=0.718;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=87;TCF=27;TCR=60;TR=59;WE=88178281;WS=88178261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr12	88379566	rs10858676	A	G	299.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=250;SC=CAAGCTGTCAAGAAATTCCAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=88379574;WS=88379564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	88389467	rs55922307	G	GT	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.434;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=81;ReadPosRankSum=-1.569;SC=GTTTCCTTTTGTTTTTTCTTC;SOR=1.802;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=5;WE=88389475;WS=88389457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr12	88440676	rs9262	G	C	3199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.488;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=26;PP=2276;ReadPosRankSum=0.924;SC=CAATGATCTCGTGTCCTGGTT;SOR=0.548;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=159;TCF=120;TCR=39;TR=103;WE=88440684;WS=88440666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,114:0.66:173
chr12	88453608	rs2471512	C	T	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=109;ReadPosRankSum=1.534;SC=GGATCTACTTCCAGTTTTTCC;SOR=0.330;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=6;WE=88453616;WS=88453598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr12	88454594	rs11405846	T	TA	424.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.528;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.713;NF=18;NR=1;PP=380;ReadPosRankSum=-0.121;SC=ATGATCACATTAAAAAAAATT;SOR=3.417;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=19;WE=88454602;WS=88454584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr12	88473049	rs2468245	C	T	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.503;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=31;PP=836;ReadPosRankSum=-0.487;SC=TAAAGGAAAACTGACATTTTA;SOR=2.249;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=32;WE=88473057;WS=88473039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,33:0.65:51
chr12	88478316	rs11356711	TA	T	410.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.574;NF=18;NR=0;PP=414;ReadPosRankSum=0.852;SC=AGCATTTGCTTAAAAAAACTA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=18;WE=88478324;WS=88478306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,19:0.83:23
chr12	88481780	rs186105924	C	T	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5274;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=368;ReadPosRankSum=0.059;SC=TAACATTCCTCCATTGATGAT;SOR=2.948;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=15;WE=88481788;WS=88481770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
chr12	88483272	rs10717563	TA	T	1568.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.236;NF=9;NR=47;PP=1093;ReadPosRankSum=0.942;SC=TGCCTGATATTAAAAAAAATA;SOR=0.845;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=98;TCF=17;TCR=81;TR=56;WE=88483280;WS=88483262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,69:0.73:94
chr12	88496838	rs2471532	C	G	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.408;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=201;ReadPosRankSum=0.810;SC=TTTTTCTGGTCAAGCACTAGC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=9;WE=88496846;WS=88496828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr12	88505078	rs2468255	T	C	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=375;ReadPosRankSum=-1.593;SC=AAACAACATTTGATCCTTCTG;SOR=0.638;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=19;WE=88505086;WS=88505068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr12	88522823	rs71082425	A	AC	736.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.512;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=585;ReadPosRankSum=0.237;SC=CTAAAAGACAAAGTTATTTCA;SOR=0.393;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=17;WE=88522831;WS=88522813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr12	88522936	rs79458642	C	CTTA	279.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.253;NF=1;NR=6;PP=248;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CGTATTCATACTTATATACAC;SOR=1.022;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=7;WE=88522944;WS=88522926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr12	88525048	rs59949315	AT	A	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.41;ReadPosRankSum=-1.242;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr12	88546982	rs2468229	A	G	97.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=-0.842;SC=AGATATTAATATCTTTAATGG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=88546990;WS=88546972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr12	88547277	rs2468230	T	C	735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=16;PP=604;SC=ACCCAATACATACAGAAGCAG;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=88547285;WS=88547267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	88582603	.	T	G	40	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=3;NR=1;PP=40;QD=18.6928031368;SC=CAACAAATGATTGTTTTAAAA;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=4;WE=88582611;WS=88582593;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,4:0.24:17
chr12	88586277	rs11440552	G	GA	65.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=0.325;SC=TGAGTTAAGAGAAAAAAAAGC;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=5;WE=88586285;WS=88586267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr12	89743223	rs704075	G	A	3642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=68;PP=2965;SC=TGTCATAGGCGTCGTTCATCG;SOR=1.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=49;TCR=68;TR=117;WE=89743231;WS=89743213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr12	89745477	rs2279574	C	A	3282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.277;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=68;PP=2554;ReadPosRankSum=-0.133;SC=AGCCCGAGCACCGACTCGCCG;SOR=0.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=169;TCF=71;TCR=98;TR=116;WE=89745485;WS=89745467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,123:0.69:179
chr12	89853408	rs4842658	G	A	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=25;PP=1076;SC=AAAAAAACCCGACTTACTGTG;SOR=2.235;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=38;WE=89853416;WS=89853398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	89853694	rs7953615	G	A	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=6;PP=768;SC=GATCATTTTGGTAAGGTTGAA;SOR=1.942;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=89853702;WS=89853684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	89861265	rs9308287	C	G	1450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=3;PP=1082;SC=CTTCATGGTACTAATTAAAAT;SOR=4.664;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=39;WE=89861273;WS=89861255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	89864432	rs10777167	T	A	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=226;SC=ATCACATAGCTCTAAGCTTCC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=89864440;WS=89864422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	89866054	rs59139895	TAGAAAGAAGA	T	4029.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.056;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.120;NF=22;NR=37;PP=2981;ReadPosRankSum=-0.566;SC=GGTGAAAATCTAGAAAGAAGA;SOR=0.290;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=73;TCF=26;TCR=47;TR=59;WE=89866071;WS=89866044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,94:0.99:95
chr12	89916811	rs2230283	C	T	2040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.446;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=36;PP=1696;ReadPosRankSum=-0.333;SC=TGCTCAGGTACCTCTGCACAT;SOR=0.477;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=113;TCF=51;TCR=62;TR=71;WE=89916819;WS=89916801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,72:0.62:117
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chr12	91334194	rs4520662	T	C	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=29;PP=899;SC=AGTAGACTCCTTGAATAGGAA;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=29;WE=91334202;WS=91334184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	91372042	rs66600255	GA	G	137.92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.79;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr12	91445303	rs2701166	G	A	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.409;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=600;ReadPosRankSum=-0.209;SC=CACCTACAGTGACAAAGAGAA;SOR=0.291;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=30;WE=91445311;WS=91445293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
chr12	91449852	rs35693771	A	G	2327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=46;PP=1901;ReadPosRankSum=1.966;SC=TTCTTGAAGGAATAGCAGGAA;SOR=0.689;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=116;TCF=42;TCR=74;TR=74;WE=91449860;WS=91449842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,79:0.66:119
chr12	91449990	rs2735333	C	T	4404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=66;PP=2965;SC=AGACCTGCCTCACACTTCTAG;SOR=0.752;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=134;TCF=68;TCR=66;TR=134;WE=91449998;WS=91449980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr12	92539344	rs709223	T	C	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=20;PP=478;SC=CCGGGGCGGCTGGGGCTCGGC;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=92539352;WS=92539334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	92539378	rs1049979	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=54;ReadPosRankSum=-0.178;SC=CGGCGGAGCAGCCACCCCGGG;SOR=0.193;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=4;WE=92539386;WS=92539368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr12	92816525	rs73222027	G	C	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=32;PP=824;ReadPosRankSum=-0.438;SC=CATTTTCTTGGTTTGAATTCT;SOR=1.814;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=32;WE=92816533;WS=92816515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,33:0.70:47
chr12	92818482	rs12580153	C	T	1388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=24;PP=1108;ReadPosRankSum=0.903;SC=TCCTTTCATTCCTCTATTTAC;SOR=0.750;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=79;TCF=42;TCR=37;TR=52;WE=92818490;WS=92818472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,51:0.65:79
chr12	92818786	rs1515565	A	G	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.405;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=514;ReadPosRankSum=0.062;SC=TTTTGTCCAAAAATTTTAAAT;SOR=1.863;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=22;WE=92818794;WS=92818776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,23:0.68:34
chr12	92821674	rs61935211	A	G	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.020;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=115;ReadPosRankSum=1.025;SC=GGGCGACAGAACGAGACTCCG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=92821682;WS=92821664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr12	92821860	rs11284604	CT	C	1055.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.076;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.650;NF=9;NR=19;PP=1044;ReadPosRankSum=0.682;SC=TAATTAACCCCTGTTACTTAC;SOR=0.883;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=48;TCF=17;TCR=31;TR=28;WE=92821868;WS=92821850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,32:0.62:52
chr12	93131203	rs2036553	A	C	6600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=70;PP=2965;SC=CTCCCGACCGATCAATTAGAC;SOR=1.563;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=199;TCF=129;TCR=70;TR=199;WE=93131211;WS=93131193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr12	93135410	.	C	G	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.883;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=418;ReadPosRankSum=-0.338;SC=GTAGTAAAATCACCCACCTCC;SOR=1.619;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=69;TCF=7;TCR=62;TR=23;WE=93135418;WS=93135400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,23:0.34:68
chr12	93139392	rs12305577	T	C	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=142;ReadPosRankSum=0.086;SC=TCTTTTCTTTTGTATTTTTGC;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=10;WE=93139400;WS=93139382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr12	93147901	rs74784157	C	T	1223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.83;ReadPosRankSum=-0.224;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,46:0.71:65
chr12	93147907	rs9669519	A	T	2778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.86;SOR=3.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr12	93150060	rs7316541	G	A	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=448;ReadPosRankSum=-0.788;SC=TTATTTTCTCGCTTGTTTTAC;SOR=1.148;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=21;WE=93150068;WS=93150050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr12	93150102	rs924326	T	C	1968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=9;PP=1582;SC=AAAGAACACATGGCAGAAAAC;SOR=3.187;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=59;WE=93150110;WS=93150092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	93150319	.	C	A	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.512;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=33;PP=812;ReadPosRankSum=0.399;SC=GTCACACAGACTCAGGCTTGA;SOR=0.950;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=53;TCF=2;TCR=51;TR=35;WE=93150327;WS=93150309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,35:0.66:53
chr12	93155399	.	GAAGAAAGAAAGAAAGAAAGA	G,GAAGAAAGAAAGA	1196.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.27;QD=35.20;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,24,10:0.71,0.29:34
chr12	93155535	rs1504907	G	A	3588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=72;PP=2729;SC=CAGAAAGCACGAGATTCCTAG;SOR=1.493;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=39;TCR=72;TR=111;WE=93155543;WS=93155525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr12	93163775	rs113934851	AT	A	94.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.765;NF=4;NR=0;PP=120;ReadPosRankSum=0.241;SC=GTCAATAAATATAGCAGAAAA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=93163783;WS=93163765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr12	93192869	rs148365385	G	GA	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=159;ReadPosRankSum=1.161;SC=AAGCCTGAAAGAAAAAAAAAA;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=11;WE=93192877;WS=93192859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr12	93196422	rs10745623	T	G	1400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=28;PP=1044;SC=TTCAGGATTTTTTTTTCTTCC;SOR=1.464;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=44;WE=93196430;WS=93196412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	93203003	rs148610802	C	T	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=570;ReadPosRankSum=-0.760;SC=AATACTATAACATTTTTGTTT;SOR=1.236;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=25;WE=93203011;WS=93202993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,25:0.78:32
chr12	93205063	.	G	A	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.354;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.352;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=-0.989;SC=ACCTTAATTTGACCTTCTAGC;SOR=3.023;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=9;WE=93205071;WS=93205053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr12	93206878	rs3925797	G	A	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=22;PP=655;SC=ATCTGTAACAGCATTTACAAA;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=93206886;WS=93206868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	93236402	rs7300619	C	T	964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=19;PP=692;SC=ACTAAATTGTCTAAAAGATAA;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=93236410;WS=93236392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	93247775	rs3065021	G	GATA	1076.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=1191;SC=AAAAGGAAAAGATAATACTGT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=23;WE=93247783;WS=93247765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	93289284	rs56326442	GA	G	1011.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=1.636;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.81;MQRankSum=0.981;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.239;SOR=1.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:6,55:0.90:61
chr12	93609340	rs7305552	A	C	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.95;ReadPosRankSum=-1.282;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr12	93721801	rs7976742	A	G	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=349;ReadPosRankSum=0.416;SC=AGAGAAACATACCTTGTGTAA;SOR=0.767;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=35;TCF=17;TCR=18;TR=15;WE=93721809;WS=93721791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr12	93721949	rs11380531	A	AC	511.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=600;SC=TGAAGTCCTAACCCCAGTACT;SOR=4.294;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=16;WE=93721957;WS=93721939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	93771112	rs76339746	C	A	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.781;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.458;NF=41;NR=1;PP=685;ReadPosRankSum=0.452;SC=CAAGCCATCCCCAACCAAAGA;SOR=1.366;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=129;TCF=122;TCR=7;TR=42;WE=93771120;WS=93771102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,41:0.35:117
chr12	93771138	.	CA	C	1215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=1.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=1.459;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.208;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,85:0.49:174
chr12	93788450	rs149292149	C	T	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.273;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.538;NF=34;NR=0;PP=707;ReadPosRankSum=0.708;SC=GAATGGAACCCGAGGAGGAAC;SOR=2.142;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=97;TCF=93;TCR=4;TR=34;WE=93788458;WS=93788440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,33:0.34:98
chr12	93792526	.	TTTC	T	511.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.837;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.271;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.501;NF=1;NR=9;PP=314;ReadPosRankSum=-0.792;SC=TTAAAATGCATTTCTTTTTAT;SOR=0.391;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=10;WE=93792536;WS=93792516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,16:0.32:50
chr12	93862989	rs4761720	G	A	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5042;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=559;ReadPosRankSum=0.816;SC=GGTATGCTTAGAAGCAGATTC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=22;WE=93862997;WS=93862979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,23:0.88:26
chr12	93863162	rs4761721	C	G	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=3.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.88;ReadPosRankSum=-0.415;SOR=1.288;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr12	93863170	rs4761722	C	G	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=8.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.13;ReadPosRankSum=-0.392;SOR=1.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr12	93864474	rs1552861	A	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=171;ReadPosRankSum=-1.647;SC=TCCTACTTGTAAGTTAGAACA;SOR=0.321;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=7;WE=93864482;WS=93864464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr12	93894779	rs6538424	A	T	57.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5032;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=-0.319;SC=AGAAAAGAAAACAAATTTTCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=93894787;WS=93894769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr12	93894823	rs6538425	G	C	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=65;ReadPosRankSum=0.241;SC=CTAAGAAATGGCTGATACGTA;SOR=0.527;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=5;WE=93894831;WS=93894813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr12	93897779	rs35963955	C	CT	307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=3.135;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.62;ReadPosRankSum=-0.227;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr12	93898249	rs7971966	A	G	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.680;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=132;ReadPosRankSum=0.114;SC=ATCAGTATATAGAAATATTTT;SOR=0.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=8;WE=93898257;WS=93898239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr12	94132186	rs6538450	T	A	1952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.663;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=52;PP=1412;ReadPosRankSum=-0.312;SC=GCAGTTGCCATCATCAGGCTT;SOR=1.255;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=93;TCF=24;TCR=69;TR=68;WE=94132194;WS=94132176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,73:0.74:98
chr12	94132290	rs12315543	A	G	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=121;ReadPosRankSum=-2.514;SC=AACACTGACCAAAGCAAATCC;SOR=0.399;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=7;WE=94132298;WS=94132280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr12	94253033	rs10859603	T	A	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=416;ReadPosRankSum=0.825;SC=AATTGTTTTTTAAAAAGCTAT;SOR=0.846;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=45;TCF=42;TCR=3;TR=20;WE=94253041;WS=94253023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr12	94562802	rs2361358	G	A	1326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=0;PP=1015;SC=TAGTCTAAGAGAATATATGTG;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=94562810;WS=94562792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	94562875	rs2361359	C	G	3966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=18;PP=2965;SC=ATAATGAGAACTATTGTTGTT;SOR=3.221;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=99;TCR=18;TR=117;WE=94562883;WS=94562865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr12	94563134	rs3214968	A	AT	1686.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.28;QD=29.08;SOR=8.155;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	94575157	rs3794220	C	T	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=0;PP=707;SC=AGCGAGATTCCGTCTCAAAAA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=94575165;WS=94575147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
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chr12	94603406	rs34565975	G	C	1888.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.857;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=46;PP=1494;ReadPosRankSum=-0.872;SC=AGAGAACTTAGAAAACTGGCT;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=100;TCF=31;TCR=69;TR=66;WE=94603414;WS=94603396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,68:0.67:102
chr12	94620766	rs63402960	TC	T	176.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=1;PP=197;SC=GCCACTGCACTCCCAGCCTGG;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=94620774;WS=94620756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	94631352	rs73226254	C	G	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=0;PP=672;SC=CCAGTGATTTCTTCGAACTGC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=94631360;WS=94631342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	94634187	rs66824619	T	C	1642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=0;PP=1384;ReadPosRankSum=-0.844;SC=TGAAATTCATTTGCTGTCACC;SOR=6.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=47;WE=94634195;WS=94634177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr12	94634249	.	A	G	1849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.581;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=15;PP=1343;ReadPosRankSum=1.242;SC=TTCTTTTTCTACTCTTTTCTA;SOR=0.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=82;TCR=26;TR=63;WE=94634257;WS=94634239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,68:0.61:112
chr12	94645255	rs2230757	A	G	2805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.265;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=55;PP=2085;ReadPosRankSum=-0.081;SC=TTCCTTCCACATGGTATTTTC;SOR=0.582;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=166;TCF=86;TCR=80;TR=111;WE=94645263;WS=94645245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,115:0.67:172
chr12	94648493	rs7980141	A	G	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.694;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=944;ReadPosRankSum=-0.945;SC=AACTGTAAAGATTGCTATTTG;SOR=0.250;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=61;TCF=40;TCR=21;TR=43;WE=94648501;WS=94648483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,44:0.69:64
chr12	94648945	rs2291326	T	C	1667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.372;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=4;PP=1328;ReadPosRankSum=1.327;SC=GTTAAAATATTGCTCTTGGGA;SOR=0.239;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=70;TCF=66;TCR=4;TR=55;WE=94648953;WS=94648935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,57:0.78:73
chr12	94649103	rs865569	T	C	4731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.128;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=93;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.690;SC=TTCCGAAGGTTGAGTCTTGAA;SOR=1.037;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=152;TCF=59;TCR=93;TR=151;WE=94649111;WS=94649093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,162:0.99:163
chr12	94653227	rs2306664	T	C	1248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.807;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=30;PP=959;ReadPosRankSum=0.702;SC=CTATCATCTCTATTATTATTA;SOR=0.230;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=54;TCF=16;TCR=38;TR=43;WE=94653235;WS=94653217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,44:0.83:53
chr12	94671565	rs832507	A	G	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.776;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=1;PP=402;ReadPosRankSum=-0.465;SC=CGATACTATCATCAAGCCTTT;SOR=1.071;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=96;TCF=91;TCR=5;TR=31;WE=94671573;WS=94671555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,30:0.30:99
chr12	94671743	rs832506	G	C	3898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=111;PP=2965;SC=CTGAGCCCTAGGCAAATCAGA;SOR=3.007;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=27;TCR=111;TR=138;WE=94671751;WS=94671733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr12	94671922	rs11341959	CA	C	799.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.728;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.834;NF=23;NR=17;PP=561;ReadPosRankSum=0.321;SC=TCCTTAAAACCAAAAAAAACA;SOR=0.844;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=113;TCF=62;TCR=51;TR=40;WE=94671930;WS=94671912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,45:0.36:125
chr12	94673509	rs10713724	GC	G	372.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.392;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=257;ReadPosRankSum=-0.558;SC=CCCCCTCCCTGCCCCCACCAG;SOR=0.387;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=10;WE=94673517;WS=94673499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr12	94673607	rs4761469	C	T	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.760;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=495;ReadPosRankSum=0.613;SC=TCATGGGCATCCTGATTCTTC;SOR=0.050;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=28;WE=94673615;WS=94673597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,29:0.67:43
chr12	94688232	rs1880934	C	A	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.922;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=211;ReadPosRankSum=-0.973;SC=AAATTTTGAACACTCATATAT;SOR=1.329;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=11;WE=94688240;WS=94688222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr12	94697525	rs1057977	T	C	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=16;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.744;NF=25;NR=10;PP=811;ReadPosRankSum=0.941;SC=TTTTTTTTTTTCCCCAGGAAG;SOR=0.791;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=50;TCR=19;TR=35;WE=94697533;WS=94697515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,38:0.62:61
chr12	94698880	rs3803071	C	T	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=439;ReadPosRankSum=-1.270;SC=TTACCACTCACAGCATCAGGT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=20;WE=94698888;WS=94698870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr12	94769758	rs4761611	A	G	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.098;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=11;PP=553;ReadPosRankSum=-0.545;SC=CTTTTTCCAAACGTTCTGCCC;SOR=0.527;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=43;TCF=23;TCR=20;TR=25;WE=94769766;WS=94769748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr12	95044161	rs1274523	A	C	1190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=13;PP=950;SC=CGGCCGGGGTACGAGTAGGTC;SOR=1.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=43;WE=95044169;WS=95044151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	95228007	rs2289031	T	G	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=2;PP=392;SC=CGGCATCCTGTCTGGGTCCAA;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=95228015;WS=95227997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	95322133	rs2033092	C	T	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=4.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=324;ReadPosRankSum=-1.330;SC=TCACATACATCGCATTATCTA;SOR=0.293;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=15;WE=95322141;WS=95322123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr12	95390595	rs11306547	CA	C	202.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQRankSum=0.074;QD=11.26;ReadPosRankSum=-0.653;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr12	95396669	rs6538588	A	T	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=387;ReadPosRankSum=0.000;SC=AAATAAAGTGAGAGTAACAAC;SOR=2.658;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=17;WE=95396677;WS=95396659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr12	95397552	rs835044	T	C	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=584;ReadPosRankSum=-1.044;SC=CAGAAGGTTCTCACGCGAACG;SOR=1.206;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=25;WE=95397560;WS=95397542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr12	95488339	rs55905327	GA	G	169.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=1.661;QD=2.02;ReadPosRankSum=0.608;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,22:0.26:84
chr12	95498747	rs200852853	GAA	G	1643.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=4.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=-0.477;QD=20.05;ReadPosRankSum=-2.130;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:15,67:0.82:82
chr12	95500635	rs61938198	A	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-3.182;NF=8;NR=0;PP=102;ReadPosRankSum=-1.540;SC=GTACCACTGCACTCCAGCCTG;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=8;WE=95500643;WS=95500625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr12	95500700	rs10694512	A	AAACAAAAC,AAACAAAACAAAAC	4642.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=63.13;QD=113.24;SOR=5.186;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,23,18:0.56,0.44:41
chr12	95500727	rs7138545	C	G	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.519;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.552;NF=31;NR=16;PP=695;ReadPosRankSum=-0.002;SC=CAGATGCACACACCTTCATTC;SOR=0.234;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=154;TCF=112;TCR=42;TR=47;WE=95500735;WS=95500717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,48:0.31:153
chr12	95502303	rs11107896	G	A	1797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.710;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=35;PP=1377;ReadPosRankSum=0.650;SC=TGTCATTGGCGTGGTTGGCTA;SOR=0.949;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=99;TCF=47;TCR=52;TR=65;WE=95502311;WS=95502293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,68:0.67:102
chr12	95510811	rs6419371	T	G	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=473;SC=TTGGTCATAGTGAACCACCTA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=95510819;WS=95510801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	95602569	rs11107934	A	G	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.665;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.396;NF=9;NR=1;PP=219;ReadPosRankSum=1.087;SC=CAGGCTGTTGAAGGTTAATTG;SOR=0.593;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=10;WE=95602577;WS=95602562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr12	95604290	rs10507047	T	C	2092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.720;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=30;PP=1536;ReadPosRankSum=-0.238;SC=ACTGTCATCCTGGCAAGTTTC;SOR=0.569;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=118;TCF=72;TCR=46;TR=74;WE=95604298;WS=95604280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,81:0.65:124
chr12	95611141	rs6538617	C	T	1393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=42;PP=1098;ReadPosRankSum=-1.510;SC=GTCCCGCCGCCCCGCGGCGCA;SOR=0.671;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=72;TCF=11;TCR=61;TR=50;WE=95611149;WS=95611131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,51:0.70:73
chr12	95611185	rs6538618	T	C	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=5.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=35;PP=871;ReadPosRankSum=1.158;SC=CGGCCGACTCTAGCGACCCTG;SOR=1.567;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=35;WE=95611193;WS=95611175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,36:0.67:54
chr12	95617829	rs10777677	A	G	1730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=4.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.045;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=11;PP=1235;ReadPosRankSum=0.773;SC=ATACCCAAGTATATAGTTGAG;SOR=0.970;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=84;TCF=66;TCR=18;TR=56;WE=95617837;WS=95617819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,63:0.67:94
chr12	95618094	rs66936338	CTT	C	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.567;NF=2;NR=12;PP=150;ReadPosRankSum=0.116;SC=AAAGCCACAACTTTTTTTTTT;SOR=1.127;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=14;WE=95618103;WS=95618084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr12	95637137	.	CAA	C	708.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.219;ClippingRankSum=0.000;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=13.375;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.99;MQRankSum=-1.227;QD=7.38;ReadPosRankSum=1.123;SOR=3.150;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,37:0.39:96
chr12	95637234	rs1873052	C	T	7509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=420;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.505;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=147;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.074;SC=TCATCTATTCCTCTCACCCTC;SOR=0.678;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=403;TCF=195;TCR=208;TR=275;WE=95637242;WS=95637224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,282:0.68:413
chr12	95637578	rs1873053	C	A	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.413;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=2;PP=1160;ReadPosRankSum=0.188;SC=AGTTCTTGCTCTCTCAAAACT;SOR=1.999;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=68;TCF=64;TCR=4;TR=50;WE=95637586;WS=95637568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,49:0.71:69
chr12	95639261	rs7979908	G	A	3681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=81;NR=34;PP=2797;SC=AAACTCTTTTGGGAAAAACTG;SOR=1.883;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=81;TCR=34;TR=115;WE=95639269;WS=95639251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr12	95651093	rs3751272	T	G	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.160;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=331;ReadPosRankSum=0.808;SC=GAATTTGTTTTGCTATCAATT;SOR=3.611;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=14;WE=95651101;WS=95651083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr12	95651888	rs6538624	T	C	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=0;PP=392;SC=TATTATTTTTTGGCTGACTAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=14;WE=95651896;WS=95651878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	95656936	rs12305760	A	G	1878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=56;PP=1482;ReadPosRankSum=0.652;SC=TGTGCTCTCCATTGTAAAGGC;SOR=0.639;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=94;TCF=16;TCR=78;TR=68;WE=95656944;WS=95656926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,70:0.72:97
chr12	95668406	rs73376208	T	C	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=574;ReadPosRankSum=-0.055;SC=GCTGTAAACCTCCTCATCCAA;SOR=0.624;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=52;TCR=0;TR=26;WE=95668414;WS=95668396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr12	95668437	rs3816838	G	T	1256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.668;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=2;PP=980;ReadPosRankSum=-1.535;SC=TAAAGATTAGGGAATGTGATA;SOR=1.466;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=87;TCF=81;TCR=6;TR=42;WE=95668445;WS=95668427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,47:0.51:92
chr12	95676053	rs3215007	T	TG	961.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.758;NF=25;NR=1;ReadPosRankSum=-0.427;SC=GACCAATATTTTTATTGATCT;SOR=1.609;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=26;WE=95676061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,28:0.67:42
chr12	95693943	rs17344738	G	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.611;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=210;ReadPosRankSum=0.735;SC=ATTTGAAGCCGTGTTGAAATC;SOR=0.155;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=13;WE=95693951;WS=95693933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr12	95694394	rs14121	G	A	1855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=55;PP=1539;SC=ACTTTTGGTGGTGAGGAGGAA;SOR=6.701;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=56;WE=95694402;WS=95694384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	95702385	rs11107973	T	C	5416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=135;PP=2965;ReadPosRankSum=1.758;SC=TTTTTTGGTATGTGTGCCTAC;SOR=1.043;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=187;TCF=51;TCR=136;TR=186;WE=95702393;WS=95702375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,191:0.99:192
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chr12	95867935	rs190910381	C	T	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=476;ReadPosRankSum=1.522;SC=TGTCTCATTCCCTCGCGCTCT;SOR=1.781;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=19;WE=95867943;WS=95867925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
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chr12	95897997	rs2769469	T	C	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=20;PP=621;SC=TTGTCGAGTGTTTTCTTTGGG;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=95898005;WS=95897987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	95918610	rs11108090	T	G	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=41;PP=1084;ReadPosRankSum=-0.378;SC=ATTTAAAGATTCAGGGAAAAG;SOR=0.603;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=76;TCF=9;TCR=67;TR=47;WE=95918618;WS=95918600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,48:0.62:77
chr12	95927037	rs3812814	A	G	2152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.239;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=35;PP=1784;ReadPosRankSum=1.466;SC=CATTCATTTGATATACTACTG;SOR=0.558;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=124;TCF=60;TCR=64;TR=75;WE=95927045;WS=95927027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,76:0.59:128
chr12	95927762	rs3812813	T	C	7017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=137;PP=2965;SC=TCTCCAGTTGTGTTATCATTC;SOR=1.290;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=225;TCF=88;TCR=137;TR=224;WE=95927770;WS=95927752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr12	95966944	rs4762567	A	G	2150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=43;PP=1564;SC=GCTGGACTACATCTCTAGTTT;SOR=1.012;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=33;TCR=43;TR=76;WE=95966952;WS=95966934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr12	96063947	rs3833792	TGTTA	T	556.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.822;NF=0;NR=12;PP=501;ReadPosRankSum=1.229;SC=TTAAAAATGGTGTTAGTTATT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=12;WE=96063958;WS=96063937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr12	96077312	rs17851048	C	T	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=378;ReadPosRankSum=-1.364;SC=CACAGCTCCCCGCACAGTCAC;SOR=0.582;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=20;WE=96077320;WS=96077302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr12	96106943	rs4129599	T	C	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.078;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=865;ReadPosRankSum=2.691;SC=CACAGATGCGTTGACTTTACA;SOR=0.620;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=28;TCR=28;TR=40;WE=96106951;WS=96106933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,44:0.71:62
chr12	96180692	rs59294014	T	C	2761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.479;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=11;PP=2125;ReadPosRankSum=-0.773;SC=TTACTTACAGTGTAGAGTTAA;SOR=1.626;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=134;TCF=113;TCR=21;TR=90;WE=96180700;WS=96180682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,97:0.68:142
chr12	96184102	rs11108265	G	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=128;ReadPosRankSum=0.000;SC=GGGAGGAGCCGGGAGCAGCCG;SOR=0.538;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=9;WE=96184110;WS=96184092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr12	96252723	.	C	A	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.228;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.243;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=1;PP=865;ReadPosRankSum=-0.558;SC=GGTGAAAGGTCATAGTCCTGT;SOR=2.885;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=59;TCF=55;TCR=4;TR=39;WE=96252731;WS=96252713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,37:0.65:57
chr12	96252914	.	C	G	1834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.940;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.013;NF=4;NR=56;PP=1399;ReadPosRankSum=-1.430;SC=AGACCAGCCTCGCGGGGCCTG;SOR=0.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=89;TCF=6;TCR=83;TR=60;WE=96252922;WS=96252904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,64:0.67:95
chr12	96253003	rs66876037	A	AG	1440.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=42;PP=1721;SC=CTCTGCTTTTAGGTTTCTGAG;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=42;WE=96253011;WS=96252993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr12	96259712	rs145705085	TA	T	143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=127;ReadPosRankSum=0.872;SC=ATTTTCATAATAAAAATATAG;SOR=0.093;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=96259720;WS=96259702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr12	96260947	rs7960706	A	G	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=37;ReadPosRankSum=-1.501;SC=GTTTTGAATGAAAGACAAGTC;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=4;WE=96260955;WS=96260937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr12	96263437	rs10735335	G	A	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.58;ReadPosRankSum=0.176;SOR=0.478;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr12	96263437	.	GAC	AAA	695	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=13;PP=695;QD=57.5744519125;SC=TGAGCCATGTGACTAGAAGAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=13;WE=96263447;WS=96263427;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:24,13:0.35:37
chr12	96263439	rs10735336	C	A	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.43;ReadPosRankSum=0.457;SOR=0.468;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr12	96284650	rs6538681	A	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.46;ReadPosRankSum=0.021;SOR=0.617;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,16:0.30:54
chr12	96330311	rs56667838	GA	G	143.50	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=0.000;HP=12;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=79;ReadPosRankSum=0.140;SC=CCTGTTGAAAGAAAAAAAAAT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=96330320;WS=96330301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr12	96337164	rs7955759	G	A	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=3.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.673;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=65;ReadPosRankSum=0.899;SC=GGCGACCCTCGGCGCGAGGCG;SOR=1.755;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=6;WE=96337172;WS=96337154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr12	96337183	rs7955450	A	G	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=6;PP=819;SC=CGACATGGCAAGCGGCCACAG;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=96337191;WS=96337173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
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chr12	96346594	rs1982138	T	C	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.998;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=292;ReadPosRankSum=-1.390;SC=GGAAATGTATTCTACCAGGTA;SOR=0.155;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=61;TCF=21;TCR=40;TR=21;WE=96346602;WS=96346584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,21:0.33:63
chr12	96354455	rs2043608	G	C	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=34;PP=870;ReadPosRankSum=0.992;SC=GCACATTCATGCTATGGGAAA;SOR=2.141;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=1;TCR=58;TR=34;WE=96354463;WS=96354445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,36:0.57:63
chr12	96355949	rs3751266	T	C	73.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.77;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
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chr12	96356060	rs3751265	G	A	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=219;ReadPosRankSum=1.597;SC=AACAAACAAAGCAATTTAATG;SOR=0.420;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=13;WE=96356068;WS=96356038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr12	96356280	rs5800239	A	AC	1991.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=39;PP=2092;SC=CTCACCCCAGACCAAGAGCTG;SOR=1.961;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=51;TCF=9;TCR=42;TR=48;WE=96356288;WS=96356270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	96359301	rs4762657	T	G	1952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=0;PP=1702;SC=CAGGAGTCCTTGGATTATATA;SOR=8.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=55;TCR=0;TR=55;WE=96359309;WS=96359291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	96359426	rs4762658	C	G	7091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=155;NR=85;PP=2965;SC=ACAAAAGCTCCCATTCTAGAG;SOR=1.452;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=240;TCF=155;TCR=85;TR=240;WE=96359434;WS=96359416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr12	96360350	rs1025606	A	T	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=4.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.259;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=459;ReadPosRankSum=-0.602;SC=TGAGGCCTAAATCCCTTTTCC;SOR=1.877;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=20;WE=96360358;WS=96360340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr12	96367900	rs2230885	G	T	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=0;PP=928;ReadPosRankSum=0.806;SC=AGAACTGAATGATACAATGGA;SOR=1.316;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=59;TCR=0;TR=38;WE=96367908;WS=96367890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,37:0.63:59
chr12	96371894	rs4762659	C	T	2462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=55;PP=1909;SC=GTGCTCCTCACAGGATGAGCT;SOR=1.893;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=21;TCR=55;TR=76;WE=96371902;WS=96371884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr12	96372026	rs11454735	A	AT	126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=119;ReadPosRankSum=0.773;SC=GAAGCAGGTCATTTTTTTTCC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=96372034;WS=96372016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr12	96374554	rs6538693	G	A	6473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=42.59;ReadPosRankSum=-1.224;SOR=0.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,150:0.99:152
chr12	96374563	rs6538694	T	C	6452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=42.73;ReadPosRankSum=-1.637;SOR=0.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,149:0.99:151
chr12	96374614	rs7297245	C	T	4448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=81;PP=2965;ReadPosRankSum=1.049;SC=CCTCCAGAAACTGTCTCTCCC;SOR=0.472;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=52;TCR=83;TR=133;WE=96374622;WS=96374604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,141:0.99:142
chr12	96374672	rs6538695	T	C	2243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=64;PP=1925;SC=TTGAAGATAATGTTTGCTGGT;SOR=3.373;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=12;TCR=64;TR=76;WE=96374691;WS=96374662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr12	96374683	rs6538696	C	T	1072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.844;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=34;PP=809;ReadPosRankSum=-0.598;SC=GTTTGCTGGTCACTTCAAGTA;SOR=0.310;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=60;TCF=6;TCR=54;TR=39;WE=96374691;WS=96374662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,42:0.67:63
chr12	96374750	rs2270318	G	A	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=334;ReadPosRankSum=0.601;SC=TACAAATGTGGGGTGGAGGGA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=14;WE=96374758;WS=96374740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr12	96379806	rs3213737	G	A	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=3.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.93;ReadPosRankSum=-1.433;SOR=0.655;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,36:0.25:142
chr12	96384345	rs17676826	T	C	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=34;ReadPosRankSum=0.729;SC=AGTTCAAGAGTACTGCATTCT;SOR=0.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=4;WE=96384353;WS=96384335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr12	96386646	rs111580568	G	GCCCTCCCT	1156.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.901;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.744;NF=2;NR=17;PP=1506;ReadPosRankSum=0.298;SC=CCTGACAATTGCCCTCCCTCC;SOR=0.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=5;TCR=49;TR=19;WE=96386654;WS=96386636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,29:0.67:43
chr12	96387621	rs2302629	A	G	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.411;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=1100;ReadPosRankSum=-0.108;SC=AAACAACTAGAATAAAAAGAG;SOR=0.406;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=73;TCF=37;TCR=36;TR=46;WE=96387629;WS=96387611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,51:0.62:82
chr12	96418447	.	A	AT	45	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9994;HP=16;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=23;MQ=59.11;NF=1;NR=3;PP=45;QD=12.0;SC=ATTTCTTGGGATTTTTTTTTT;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=4;WE=96418455;WS=96418437;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,4:0.29:14
chr12	96429214	rs146423147	G	A	850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.259;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=12;PP=645;ReadPosRankSum=-0.096;SC=GAGTAAAGTCGACGCTGCAGC;SOR=1.501;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=109;TCF=65;TCR=44;TR=39;WE=96429222;WS=96429204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,38:0.35:108
chr12	96617304	rs2302902	C	T	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=320;ReadPosRankSum=0.000;SC=TGGTCGGCATCGTGACCAGCA;SOR=0.631;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=15;WE=96617312;WS=96617296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr12	96653501	rs4762144	C	T	1838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=26;PP=1482;SC=GTTTGCTTTACTTCCCAGACA;SOR=0.906;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=34;TCR=26;TR=60;WE=96653509;WS=96653491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr12	96660711	rs7974921	A	G	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=441;ReadPosRankSum=2.098;SC=TCATCTTCCAATTATTCTGTA;SOR=1.382;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=17;WE=96660719;WS=96660701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr12	96677225	rs66560167	GTT	G	157.25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.66;ReadPosRankSum=-0.489;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr12	96677266	.	T	C	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.746;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=279;ReadPosRankSum=1.969;SC=GCCTTAAGCATAGATAATTTT;SOR=0.100;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=14;WE=96677274;WS=96677256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
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chr12	96894453	rs7959697	A	C	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=290;ReadPosRankSum=0.407;SC=GGAAGCAATAATTTTAACTGT;SOR=0.922;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=15;WE=96894461;WS=96894443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr12	96912598	rs11108564	G	A	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=330;ReadPosRankSum=-0.387;SC=TTTTTGGTTTGAGTAATCAGC;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=15;WE=96912606;WS=96912588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr12	96927498	rs2160500	T	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=85;ReadPosRankSum=0.751;SC=TGCCTGAAAGTGTCTATAGTG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=96927506;WS=96927488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr12	96927778	rs5800251	GT	G	1097.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.424;NF=38;NR=12;PP=739;ReadPosRankSum=-1.719;SC=TATCCTCCTGGTTTTTTTTTT;SOR=0.705;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=92;TCF=67;TCR=25;TR=50;WE=96927786;WS=96927768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,54:0.61:89
chr12	96927817	rs2111146	C	T	2001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.120;NF=56;NR=18;PP=1745;ReadPosRankSum=1.020;SC=TACTAATTAACGTGTGGGATA;SOR=0.764;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=118;TCF=88;TCR=30;TR=74;WE=96927825;WS=96927807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,74:0.62:119
chr12	96927972	rs2160501	A	G	1832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.379;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=58;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.228;SC=AGGACAGTCAACTCAAATTTA;SOR=1.402;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=98;TCF=12;TCR=86;TR=65;WE=96927994;WS=96927962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,66:0.65:101
chr12	96927986	rs2160502	A	T	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=10.811;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.03;ReadPosRankSum=1.410;SOR=2.384;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,54:0.61:88
chr12	96929200	rs11453356	A	AT	632.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.154;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.636;NF=22;NR=0;PP=598;ReadPosRankSum=-0.042;SC=CATTTGTGTCATTTTTTTAGC;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=22;WE=96929208;WS=96929190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,25:0.76:33
chr12	96948163	rs7971858	A	G	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=198;ReadPosRankSum=0.116;SC=AAAGTAGGTAAGTAAAGCATG;SOR=0.892;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=52;TCF=6;TCR=46;TR=13;WE=96948171;WS=96948153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,14:0.26:53
chr12	96974472	rs17025569	G	A	1852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=51;PP=1367;ReadPosRankSum=0.119;SC=GAAGCGGTACGTCAAATTAAA;SOR=0.989;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=92;TCF=20;TCR=72;TR=63;WE=96974480;WS=96974462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,69:0.70:98
chr12	96983402	rs1972587	C	T	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=128;ReadPosRankSum=-1.750;SC=ATGCTGGATGCGAAGCCTGGA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=96983410;WS=96983392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr12	96986190	rs2052293	G	A	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.769;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=177;ReadPosRankSum=-1.118;SC=TAGATACTGAGAACAAATCAA;SOR=0.026;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=12;WE=96986198;WS=96986180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr12	96986229	rs7311111	C	A	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.548;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=654;ReadPosRankSum=-0.797;SC=CCTGCTAAATCAATTTATATT;SOR=1.112;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=32;WE=96986237;WS=96986219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,33:0.62:53
chr12	96988037	rs815896	C	G	3541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=86;NR=15;PP=2836;SC=CACCTATGTTCAATCTGAGTA;SOR=3.507;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=86;TCR=15;TR=101;WE=96988045;WS=96988027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr12	96992494	rs815890	C	T	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.427;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=6;PP=170;ReadPosRankSum=0.298;SC=ATACTGCGAGCTTTGAAAGTA;SOR=0.404;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=11;WE=96992502;WS=96992484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr12	97020673	rs10507074	T	C	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.379;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=6;PP=74;ReadPosRankSum=1.167;SC=AAAAATTTCATCTTATGGTAG;SOR=1.106;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=39;TCF=17;TCR=22;TR=9;WE=97020681;WS=97020663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,11:0.26:43
chr12	97023937	rs9919717	A	C	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.150;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=-0.283;SC=ATAAAAAAGCAAACAAATCTT;SOR=0.148;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=7;WE=97023945;WS=97023927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr12	97023991	rs1362949	C	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=54;ReadPosRankSum=-0.567;SC=GAGTAAGTTTCCTATGAGTTT;SOR=0.446;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=6;WE=97023999;WS=97023981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr12	97024016	rs35205059	TG	T	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=134;ReadPosRankSum=-1.043;SC=TTTTAGGTAATGAAATTAAGA;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=5;WE=97024024;WS=97024006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr12	97079041	rs7974435	C	G	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.71;ReadPosRankSum=-0.170;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr12	97079041	.	CCG	GCA	94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=94;QD=49.1559582874;SC=GGAAGGATCCCCGTACTAGCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=3;WE=97079051;WS=97079031;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,3:0.17:18
chr12	97079043	rs7974634	G	A	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.71;ReadPosRankSum=0.760;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,3:0.17:18
chr12	97085107	rs4762319	A	C	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.42;ReadPosRankSum=-0.572;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,33:0.31:106
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chr12	97098549	rs11108643	T	C	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.406;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=176;ReadPosRankSum=-1.532;SC=TCAGGAAAACTTCTTACCAGT;SOR=1.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=36;TCF=21;TCR=15;TR=11;WE=97098557;WS=97098539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,11:0.28:40
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chr12	97331219	rs67367047	GT	G	860.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.35;MQRankSum=1.118;QD=13.88;ReadPosRankSum=-2.127;SOR=1.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,38:0.61:62
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chr12	97639144	rs1012315	A	G	7136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=127;PP=2965;SC=AAAAAAACTGATTATAGAAGC;SOR=1.055;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=218;TCF=90;TCR=128;TR=217;WE=97639152;WS=97639123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
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chr12	98332704	rs1349299	C	G	3565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=10;PP=2877;ReadPosRankSum=1.276;SC=AACTCCTTTGCTCAATATTTA;SOR=2.891;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=96;TCR=10;TR=105;WE=98332712;WS=98332694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,109:0.99:110
chr12	98332742	.	C	T	1289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.794;ClippingRankSum=0.000;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.700;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=12;PP=879;ReadPosRankSum=-1.575;SC=TTCCTCCTTTCATTATGATTT;SOR=0.774;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=134;TCF=97;TCR=37;TR=49;WE=98332750;WS=98332732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,55:0.38:144
chr12	98332904	rs3072891	TCA	T	2327.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=48;PP=2292;SC=TTTCTTAGCCTCAGTTTTCTC;SOR=7.978;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=48;WE=98332913;WS=98332894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	98389341	rs1477006	A	T	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=535;SC=CAAGACCCAAAGCAAAAGTTT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=98389349;WS=98389331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	98880901	rs36109874	TA	T	341.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,20:0.83:24
chr12	98897462	rs17458880	C	G	2247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.973;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=31;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.211;SC=GTGCACAACCCTGTCTTCAAA;SOR=0.989;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=151;TCF=94;TCR=57;TR=91;WE=98897481;WS=98897452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,97:0.61:160
chr12	98897473	rs249820	A	G	2479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.001;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=30;PP=2962;ReadPosRankSum=1.224;SC=TGTCTTCAAAATGGTGACTTT;SOR=1.128;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=147;TCF=89;TCR=58;TR=87;WE=98897481;WS=98897452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,93:0.60:156
chr12	98925650	rs3213901	G	T	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.782;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=572;ReadPosRankSum=-0.949;SC=CAAATGTATGGAATTTTTTCA;SOR=0.336;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=32;WE=98925658;WS=98925640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,35:0.69:51
chr12	98927830	rs17459334	C	G	1874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.147;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=38;PP=1471;ReadPosRankSum=1.692;SC=AGACATTAGTCAAGCTGCACA;SOR=0.200;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=88;TCF=28;TCR=60;TR=61;WE=98927838;WS=98927820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,64:0.67:95
chr12	98938416	rs34340378	G	GT	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.61;ReadPosRankSum=0.705;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
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chr12	98985084	rs4586219	A	G	963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=31;PP=718;ReadPosRankSum=-0.483;SC=CATTTCCTAGATTCCTTTCCC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=31;WE=98985092;WS=98985074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,34:0.71:48
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chr12	99007356	rs1048908	T	C	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=603;ReadPosRankSum=-0.560;SC=ATCTCAATAATGTCAAACTAA;SOR=0.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=31;WE=99007364;WS=99007346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,32:0.74:43
chr12	99007623	rs1048906	C	T	2095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=37;PP=1692;ReadPosRankSum=-0.006;SC=GCTCTGTCACCTTCTAAGCTT;SOR=0.698;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=59;TCR=56;TR=76;WE=99007631;WS=99007613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,76:0.65:117
chr12	99056125	rs10745833	T	A	174.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.6;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=52;SC=CTATTTGTTTTAAAAAAAATT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=99056133;WS=99056120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	99119340	rs2304006	G	A	1797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=37;PP=1426;SC=GCTGACATGAGAGCACTGCTC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=52;WE=99119348;WS=99119330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	99129497	rs10860361	G	A	1191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=33;PP=1015;SC=CATGTGCCTGGCATTGTGGTA;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=35;WE=99129505;WS=99129487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	99129541	rs7300187	G	T	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=16;PP=489;SC=CAAAACAAAAGTCTTGCTCTA;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=99129549;WS=99129531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	99166805	rs2287574	G	T	1370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=10;PP=1071;ReadPosRankSum=1.571;SC=CTGTTGAAAGGGGGTGGGTAC;SOR=1.107;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=46;WE=99166813;WS=99166795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr12	99175840	rs7954506	A	G	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=10;PP=969;SC=ACCAGCAGTCAGTTTACTTCA;SOR=2.461;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=44;WE=99175848;WS=99175830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	99478889	rs7970088	G	A	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=628;SC=GAGAAAACCAGTGAGTGACCT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=99478897;WS=99478879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	99638276	rs2712643	C	A	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.931;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=0.291;SC=ATGAAGGGAGCAAATATTTTT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=5;WE=99638284;WS=99638266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr12	99639930	rs923724	G	C	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-7.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=0;PP=1084;ReadPosRankSum=1.811;SC=TTTCATTCCAGTTGGAGCCGT;SOR=0.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=89;TCF=88;TCR=1;TR=30;WE=99639952;WS=99639920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,30:0.33:90
chr12	99639944	rs35408837	CT	C	658.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.892;HP=10;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=1;PP=1107;ReadPosRankSum=-0.068;SC=GAGCCGTATGCTTTTTTTTTT;SOR=1.279;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=104;TCF=96;TCR=8;TR=35;WE=99639952;WS=99639920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,38:0.38:100
chr12	99640557	rs1552759	T	C	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=220;ReadPosRankSum=0.196;SC=ACTCACAGGCTGGAGAGGATC;SOR=0.746;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=69;TCF=18;TCR=51;TR=21;WE=99640565;WS=99640547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,20:0.28:71
chr12	100551357	.	G	A	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.590;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=613;ReadPosRankSum=-1.500;SC=CCCCACACATGGGATCACCCC;SOR=0.721;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=96;TCF=36;TCR=60;TR=30;WE=100551365;WS=100551347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,32:0.31:102
chr12	100635627	rs56098115	GAA	G	270.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=3.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=1.112;QD=7.74;ReadPosRankSum=-0.316;SOR=0.172;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr12	100636485	rs7958895	T	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.08;ReadPosRankSum=-1.028;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,11:0.22:49
chr12	100646134	rs66721214	CA	C	466.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.043;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.851;NF=8;NR=15;PP=257;ReadPosRankSum=-0.221;SC=AAAAAAATAGCAAAAAAAAAT;SOR=0.859;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=73;TCF=33;TCR=40;TR=23;WE=100646142;WS=100646124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,29:0.38:77
chr12	100676960	rs7965910	C	A	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-7.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=22.362;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=34;PP=862;ReadPosRankSum=0.682;SC=TGGAAAAAACCCACATGCTAA;SOR=0.081;SbPval=0.06;Source=Platypus;TC=137;TCF=27;TCR=110;TR=50;WE=100676968;WS=100676950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,50:0.36:137
chr12	100709313	rs7968030	T	A	243.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.67;ReadPosRankSum=1.449;SOR=0.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr12	100709420	rs10860577	C	T	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.706;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=17;PP=638;ReadPosRankSum=3.009;SC=GCCCAATGTTCTACTTATTGC;SOR=0.607;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=119;TCF=66;TCR=53;TR=36;WE=100709428;WS=100709410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,40:0.31:131
chr12	100709540	rs146132921	ATCTACTGTTATTTATGAT	A	740.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.306;SOR=0.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,21:0.38:56
chr12	100717260	rs11110340	A	T	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=71;ReadPosRankSum=-0.147;SC=GAGAGAAAAGATGAGTCTTTC;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=6;WE=100717268;WS=100717250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr12	100732327	rs10860580	C	T	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=380;ReadPosRankSum=0.213;SC=GACAGACACACTGATGGATAA;SOR=0.648;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=58;TCF=34;TCR=24;TR=23;WE=100732335;WS=100732317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,23:0.37:63
chr12	100787095	rs1998925	T	C	1315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=3;PP=1038;SC=TTAGCTGAAGTAGCACATCCA;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=37;WE=100787103;WS=100787085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	100795699	rs11568544	A	G	2664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=67;PP=2007;SC=ATTTTACTGCATATGGGTTTG;SOR=2.807;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=15;TCR=67;TR=82;WE=100795707;WS=100795689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr12	100795794	rs11110366	A	G	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.21;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	100806503	rs11568536	C	T	2600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=14;PP=2085;SC=TTGGGTTGACCGATATGAAAA;SOR=2.920;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=63;TCR=14;TR=77;WE=100806511;WS=100806493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr12	100811727	rs11110371	C	T	1814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=1;PP=1559;ReadPosRankSum=0.713;SC=TTGGTAAAGGCTGGGGCAACT;SOR=5.960;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=61;TCF=60;TCR=1;TR=59;WE=100811735;WS=100811717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,58:0.97:60
chr12	100813487	rs7967828	A	G	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=0;PP=298;SC=CTAGAGCATCACCTTCCAAAT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=100813495;WS=100813477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	100813976	rs11568537	A	C	1427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=38;PP=1157;SC=TACTTTAGAAACAGAAAGTAT;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=41;WE=100813984;WS=100813966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	101012490	rs7961640	G	A	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=37;PP=1070;SC=AATATAAACCGGTACTATTCT;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=37;WE=101012498;WS=101012480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	101017445	rs1469385	T	C	3873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=87;NR=23;PP=2965;SC=GTTTGCCACATTAGAACAAAA;SOR=2.644;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=88;TCR=23;TR=110;WE=101017453;WS=101017435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr12	101018014	rs1045602	T	C	9723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=178;PP=2965;SC=TGAAACATAATCATATTTCTT;SOR=1.362;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=278;TCF=100;TCR=178;TR=277;WE=101018022;WS=101018004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr12	101111183	rs12310954	G	A	142.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5165;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=4;NR=1;PP=67;SC=CAGCCGCGGAGCGCCCGGGCG;SOR=1.329;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=101111191;WS=101111173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	101133494	rs17478305	C	T	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=222;ReadPosRankSum=-0.103;SC=ATGATGCCTGCCTGTTTATTA;SOR=0.336;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=11;WE=101133502;WS=101133484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr12	101133748	rs73145643	A	C	1277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.641;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=32;PP=983;ReadPosRankSum=-1.308;SC=AGATGCAGGCATCCCTGTGTA;SOR=0.871;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=196;TCF=99;TCR=97;TR=57;WE=101133756;WS=101133738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,57:0.29:198
chr12	101133912	rs4764751	G	A	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=244;ReadPosRankSum=-0.615;SC=TTGGAGATTCGGGACTGGGTG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=14;WE=101133920;WS=101133902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,17:0.33:52
chr12	101315859	rs199679837	C	T	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQRankSum=-0.847;QD=8.99;ReadPosRankSum=1.264;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr12	101365007	rs10778090	A	G	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=416;ReadPosRankSum=0.138;SC=AGGTCCATGCATTCTAAGTTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=23;WE=101365015;WS=101364997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,23:0.68:34
chr12	101433990	rs665071	A	G	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=121;ReadPosRankSum=-0.459;SC=TCTTCACAAGAGGAAACTCAT;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=7;WE=101433998;WS=101433980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr12	101473272	rs651784	G	A	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=229;ReadPosRankSum=0.597;SC=TGATTAAGTGGAGAATTCCAC;SOR=0.336;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=10;WE=101473280;WS=101473262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr12	101491375	rs1842888	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=150;ReadPosRankSum=0.250;SC=TGTAATATTCGCTGAAAGCTT;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=8;WE=101491383;WS=101491365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr12	101510371	rs349661	T	G	1965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=11;PP=1541;SC=ACAATTGCAGTGACGTCTGGG;SOR=2.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=46;TCR=11;TR=57;WE=101510379;WS=101510361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr12	101520648	rs3832861	C	CTG	706.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.803;QD=7.07;ReadPosRankSum=0.404;SOR=0.541;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,24:0.24:100
chr12	101550961	rs150497001	A	AAC	264.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=379;ReadPosRankSum=0.496;SC=CTCATGATACAACACACACAC;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=12;WE=101550969;WS=101550951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr12	101551854	rs10860693	T	C	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=43;ReadPosRankSum=0.454;SC=ATAAAACAGATATAGATCATC;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=4;WE=101551862;WS=101551844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr12	101552075	rs2671444	G	A	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=1.055;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.537;SOR=0.968;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,19:0.25:76
chr12	101584223	rs12313149	A	C	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.021;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=448;ReadPosRankSum=-0.702;SC=TTAATGATTCATATACCATGG;SOR=0.476;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=102;TCF=81;TCR=21;TR=28;WE=101584231;WS=101584213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,31:0.30:104
chr12	101683929	rs703715	C	T	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=2;PP=799;SC=CTGATAAAAACGCACTTTTCA;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=101683937;WS=101683919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	101750814	rs10082778	T	A	5010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=100;PP=2965;SC=CACTTCCTCCTATATGTTTTA;SOR=1.536;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=54;TCR=100;TR=154;WE=101750822;WS=101750804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr12	101870804	rs7979430	G	A	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.349;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=352;ReadPosRankSum=0.202;SC=TATCGATCATGTTAATAAGGA;SOR=1.828;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=17;WE=101870812;WS=101870794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr12	101988639	rs74354770	G	A	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=196;ReadPosRankSum=1.349;SC=ATGTGAGAAAGGTCCCCATAG;SOR=0.481;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=10;WE=101988647;WS=101988629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr12	101988774	rs1697477	G	T	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=1160;ReadPosRankSum=-1.473;SC=ACCATCTCTCGCCTGCCTGTG;SOR=0.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=54;TCR=35;TR=55;WE=101988782;WS=101988764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,57:0.61:93
chr12	102008103	.	T	A	50	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=50;QD=21.1928031368;SC=TGTGTGTGTGTGAGAGAGAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=102008111;WS=102008093;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,4:0.40:10
chr12	102020488	rs825073	A	T	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.433;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=168;ReadPosRankSum=0.382;SC=TTGCCTGAAAAACTCAGGTTT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=9;WE=102020496;WS=102020479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr12	102020810	rs825074	G	A	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=343;ReadPosRankSum=-0.219;SC=AACAGTTTTCGCCTGTGCTGG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=16;WE=102020818;WS=102020800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
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chr12	102041967	rs3834936	C	CA	766.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.520;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.869;NF=2;NR=26;PP=698;ReadPosRankSum=0.548;SC=GTTTAATAGACAAAAAAATTG;SOR=0.340;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=28;WE=102041975;WS=102041957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,30:0.75:40
chr12	102042985	rs3215353	A	AT	952.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=2;PP=1037;ReadPosRankSum=0.582;SC=TGGACAAGGTATTTTTCCTGA;SOR=1.160;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=62;TCF=58;TCR=4;TR=32;WE=102042993;WS=102042975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,37:0.60:62
chr12	102043301	rs2272336	G	A	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=734;ReadPosRankSum=-0.391;SC=TTCTATTTGCGATGATTTTTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=29;WE=102043309;WS=102043291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,29:0.67:43
chr12	102045231	rs10860759	C	T	1044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=30;PP=796;ReadPosRankSum=-0.853;SC=TCTCCATTTTCTAAATTACAT;SOR=1.101;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=32;WE=102045239;WS=102045221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,35:0.69:51
chr12	102046303	.	C	CCTCT	559.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.967;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.715;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.561;NF=12;NR=0;PP=622;ReadPosRankSum=-1.091;SC=GGCTTCTCATCCTCTCTCTCT;SOR=3.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=12;WE=102046311;WS=102046293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr12	102046394	rs1997205	C	T	2086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=8;PP=1852;SC=GTCTTTTCAGCTTGGGTCATA;SOR=3.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=58;TCR=8;TR=66;WE=102046402;WS=102046384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	102046595	rs1997204	T	C	2691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=77;PP=2099;SC=TGCATAGTTGTGTTCTTTTTT;SOR=3.564;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=11;TCR=77;TR=88;WE=102046603;WS=102046585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr12	102046874	rs3835190	AC	A	1788.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.980;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=7;PP=1825;ReadPosRankSum=1.556;SC=GATAACAAAGACTATGCTTAA;SOR=1.381;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=68;TCF=55;TCR=13;TR=46;WE=102046882;WS=102046864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,51:0.71:72
chr12	102053675	rs17511481	C	T	1994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.181;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=69;PP=1711;ReadPosRankSum=-0.379;SC=AGTAGACTTTCCTTCTTTGTC;SOR=2.002;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=121;TCF=11;TCR=110;TR=73;WE=102053683;WS=102053665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,71:0.59:120
chr12	102053753	rs12372616	C	G	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.27;ReadPosRankSum=-0.650;SOR=1.893;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr12	102053753	.	CAT	GAC	908	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=0;NR=17;PP=908;QD=56.5569338154;SC=GAGGACTTATCATTGGAGAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=17;WE=102053763;WS=102053743;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr12	102053755	rs12367753	T	C	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.27;ReadPosRankSum=-0.599;SOR=1.893;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr12	102054812	rs10778135	C	T	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=0;PP=22;SC=ATTCAGTAAACATGGGAAAGT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=102054820;WS=102054802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr12	102057166	rs2254631	T	C	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=330;SC=AGCTGTGTAGTAAATAGTTTA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=13;WE=102057174;WS=102057156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	102060668	rs148269135	T	TACAC	69.86	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.30;QD=23.29;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	102060672	.	TACAC	CACAC,CACAT	328	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=27;MQ=56.68;NF=2,2;NR=21,15;PP=68,328;QD=4.46831358901;SC=ATCACATACATACACACACAC;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=23,17;WE=102060684;WS=102060662;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.85:27
chr12	102061793	rs147564199	GTTAATGCT	G	188.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=335;SC=TTGATATTTTGTTAATGCTTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=102061808;WS=102061783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	102063718	rs10860765	G	A	261.22	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.92;QD=29.02;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:0,9:1.00:9
chr12	102063730	.	G	A	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.024;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.32;MQRankSum=-2.205;QD=11.34;ReadPosRankSum=0.527;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr12	102064118	rs7139095	T	C	6314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=98;PP=2965;SC=AGATTCGCATTCCAAGACACC;SOR=0.777;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=92;TCR=98;TR=190;WE=102064126;WS=102064108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr12	102069077	rs764291	A	G	2327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.418;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=44;PP=1797;ReadPosRankSum=-0.798;SC=TAGACCGTCCAGGTCCACCCC;SOR=0.848;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=139;TCF=73;TCR=66;TR=95;WE=102069085;WS=102069067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,95:0.67:141
chr12	102074442	rs2303631	A	G	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=111;ReadPosRankSum=1.313;SC=TGGTGAGGGCAAGGGAAGCAG;SOR=0.368;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=7;WE=102074450;WS=102074432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr12	102078094	rs2303629	G	C	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.439;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=14;PP=1057;ReadPosRankSum=0.781;SC=AAGTACTCAAGTTTGGTGTTA;SOR=1.189;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=72;TCF=48;TCR=24;TR=46;WE=102078102;WS=102078084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,47:0.63:75
chr12	102079418	rs2764	G	A	2010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.720;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=52;PP=1583;ReadPosRankSum=1.807;SC=TAATTGATTCGTATCTGCGAG;SOR=0.481;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=120;TCF=30;TCR=90;TR=72;WE=102079426;WS=102079408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,74:0.60:124
chr12	102108301	rs2066920	T	C	2701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.803;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=25;PP=1997;ReadPosRankSum=0.167;SC=CAGTGGGAGCTTCAATTGCCG;SOR=1.092;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=123;TCF=85;TCR=38;TR=86;WE=102108309;WS=102108291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,95:0.71:133
chr12	102108345	rs3205421	T	C	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.387;HP=7;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=745;ReadPosRankSum=1.631;SC=TGGTTTTTTTTCTGCTCTTTT;SOR=0.533;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=153;TCF=88;TCR=65;TR=48;WE=102108353;WS=102108335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,47:0.29:160
chr12	102110335	rs2041150	T	C	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=31;ReadPosRankSum=-0.292;SC=GTTCTGTAACTTTTTTAACTT;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=4;WE=102110343;WS=102110325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr12	102111173	rs1544921	G	C	4699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=78;PP=2965;SC=TTACCACAACGTAAGTCCACC;SOR=1.088;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=58;TCR=78;TR=136;WE=102111181;WS=102111163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr12	102117589	rs11082	C	T	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=28;PP=848;SC=ACTTTAATAACTTTATAGACG;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=102117597;WS=102117579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	102120289	rs7965541	C	A	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.000;QD=2.74;ReadPosRankSum=0.424;SOR=0.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,9:0.19:47
chr12	102120363	rs8181675	C	T	177.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.16;ReadPosRankSum=-0.799;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr12	102120363	.	CA	TG	66	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=4;HapScore=3;MGOF=5;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=66;QD=29.8669687156;SC=ATGAAGCCCCCATTGTATCAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=102120372;WS=102120353;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr12	102120364	rs222508	A	G	409.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.98;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	102127262	rs10860779	C	A	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.821;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=247;ReadPosRankSum=0.211;SC=GTTAATGAAACCTGGCTCAGT;SOR=1.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=17;WE=102127270;WS=102127252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr12	102147088	rs11110997	T	C	1489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=2;PP=1292;ReadPosRankSum=-0.481;SC=CACTAACATATAGATACATAT;SOR=0.392;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=86;TCF=84;TCR=2;TR=58;WE=102147096;WS=102147078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,55:0.69:80
chr12	102150878	rs3736475	G	C	79.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=58;SC=AACACTGCCTGCACTGTTAGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=102150886;WS=102150868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr12	102151113	rs3736476	A	G	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=2.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.76;ReadPosRankSum=-2.106;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,5:0.17:30
chr12	102154900	rs759935	A	G	3346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=19;PP=2537;SC=AAGACAATACAACACCTGCAA;SOR=3.145;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=113;TCF=93;TCR=20;TR=112;WE=102154908;WS=102154890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr12	102158763	rs10778148	T	C	4663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=57;PP=2965;SC=CCTTCTGGGCTGTAGAATTCA;SOR=1.216;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=153;TCF=94;TCR=59;TR=150;WE=102158771;WS=102158753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr12	102163937	.	G	A	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.907;ClippingRankSum=0.000;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.637;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=28;PP=808;ReadPosRankSum=1.568;SC=GTGAACTAAAGGTAGGCAAGT;SOR=0.962;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=122;TCF=38;TCR=84;TR=38;WE=102163945;WS=102163927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,40:0.31:127
chr12	102182181	rs2108694	G	A	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=1;PP=188;SC=AAAATTTCCTGTCTAATAGAT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=102182189;WS=102182171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	102182228	rs4015837	AAC	A	161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.842;NF=4;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=-1.675;SC=ATGGATAATAAACACAAAATC;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=4;WE=102182237;WS=102182218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr12	102183938	rs11111024	C	A	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=34;PP=821;ReadPosRankSum=-0.581;SC=AAAAAAATCTCTGAAGAAGTA;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=57;TCF=1;TCR=56;TR=35;WE=102183946;WS=102183928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,36:0.61:59
chr12	102224436	rs4764655	C	T	1462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.782;NF=10;NR=42;PP=1125;ReadPosRankSum=0.014;SC=TCTGTCTCTGCAGGAGCTTGA;SOR=1.646;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=83;TCF=20;TCR=63;TR=52;WE=102224444;WS=102224426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,54:0.64:85
chr12	102224491	rs76300806	AGCC	A	404.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.39;QD=40.47;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	102295218	rs7295569	T	C	3466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.38;SOR=1.945;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr12	102295218	.	TC	CC,CT	1470	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=27,7;NR=62,16;PP=1470,330;QD=16.907541714;SC=TCAGGTATAATCTGGAGCTTT;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=90;TCF=27;TCR=63;TR=89,23;WE=102295227;WS=102295208;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.99:90
chr12	102295219	rs11111078	C	T	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=2.019;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.47;ReadPosRankSum=-0.966;SOR=0.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,29:0.30:98
chr12	102301019	rs61936567	G	A	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.957;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=12;NR=1;PP=276;ReadPosRankSum=-1.769;SC=AGCTGCATTTGCATAACAAAA;SOR=0.368;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=13;WE=102301027;WS=102301009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr12	102301257	rs61936568	G	A	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.431;NF=3;NR=5;PP=102;ReadPosRankSum=-0.493;SC=GGTGGCTCACGCCTGTAATCC;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=8;WE=102301265;WS=102301247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr12	102301910	rs61936574	T	C	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.78;ReadPosRankSum=-1.210;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr12	102301915	rs61936575	T	C	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.98;ReadPosRankSum=-1.541;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr12	102304685	rs56695970	T	C	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.363;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=46;PP=930;ReadPosRankSum=0.697;SC=TAAACATTAGTGTGGTATTTA;SOR=1.460;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=76;TCF=9;TCR=67;TR=51;WE=102304693;WS=102304675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,52:0.68:77
chr12	102305523	rs61134285	AT	A	162.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.493;NF=8;NR=0;PP=195;ReadPosRankSum=0.253;SC=TATCTCAATAATTTTTTATAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=8;WE=102305531;WS=102305513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr12	102308095	rs7955730	C	T	3588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.198;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=56;PP=2873;ReadPosRankSum=0.849;SC=AGATCACTGCCGTTCCTTAGA;SOR=0.597;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=194;TCF=112;TCR=82;TR=131;WE=102308103;WS=102308085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,132:0.68:195
chr12	102433811	rs4237982	T	C	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=35;PP=898;SC=GGGTCTATCATGTTACTTAAA;SOR=2.935;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=42;WE=102433819;WS=102433801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	102444064	rs7958593	C	T	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=162;ReadPosRankSum=0.318;SC=CAAAGTGAGACCCTGTCTGAC;SOR=0.627;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=23;TCF=14;TCR=9;TR=9;WE=102444072;WS=102444054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr12	102455729	rs3751129	G	A	3807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.103;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=92;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.692;SC=GAGGAAGCCCGTCCTCATCCA;SOR=0.787;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=223;TCF=79;TCR=144;TR=142;WE=102455737;WS=102455719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,142:0.63:227
chr12	102514184	rs4764863	A	G	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=2;PP=927;SC=GTGGGACCGAAGTATTATGGT;SOR=4.294;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=32;WE=102514192;WS=102514174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
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chr12	102544003	rs34287857	G	A	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.790;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=458;ReadPosRankSum=0.884;SC=AACCGTGGAAGATCAACAACT;SOR=0.323;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=82;TCF=54;TCR=28;TR=26;WE=102544011;WS=102543993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,26:0.31:84
chr12	102545563	rs55772007	A	G	1134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.182;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=27;PP=925;ReadPosRankSum=0.831;SC=AGAAGCTGGCAGCTGTCATGC;SOR=1.096;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=66;TCF=25;TCR=41;TR=43;WE=102545571;WS=102545553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,43:0.64:67
chr12	102548700	rs2102476	G	T	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.327;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.658;NF=6;NR=37;PP=969;ReadPosRankSum=1.867;SC=CCTATGAGACGTCATCTACAT;SOR=1.008;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=64;TCF=10;TCR=54;TR=43;WE=102548708;WS=102548690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,44:0.68:65
chr12	102559708	rs3794201	A	C	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=356;ReadPosRankSum=-1.597;SC=TCTATCTTTAAAACTTTACAG;SOR=0.368;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=16;WE=102559716;WS=102559698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr12	102576307	rs35297380	C	CT	396.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=4.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.64;MQRankSum=1.865;QD=8.10;ReadPosRankSum=-0.725;SOR=1.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr12	102589619	rs147960534	T	TTAAAAA	409.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=318;ReadPosRankSum=0.061;SC=TTATTTTACTTTAAAAATTTG;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=7;WE=102589627;WS=102589609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr12	102589675	rs17438988	A	G	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.590;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=498;ReadPosRankSum=0.177;SC=GTTCTCGTAAATATTAATACT;SOR=1.928;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=19;WE=102589683;WS=102589665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr12	102872155	rs67214112	C	CT	774.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.394;NF=30;NR=0;PP=584;ReadPosRankSum=-1.369;SC=TTTAAAAGTTCTTTTTTTTTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=30;WE=102872163;WS=102872145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,29:0.94:31
chr12	103234479	rs798709	A	G	1566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=45;PP=1313;SC=AAGCCTCTGTATGTGTGTATG;SOR=7.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=45;WE=103234487;WS=103234469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	103237468	rs772897	G	C	2814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=42;PP=2282;SC=CCACGTAATAGAGGGGCTGGA;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=47;TCR=42;TR=89;WE=103237476;WS=103237458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr12	103240630	rs1522306	C	A	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=3;PP=1088;ReadPosRankSum=-0.748;SC=AGGGCCATAGCCTATAGCACT;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=38;WE=103240638;WS=103240620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr12	103248924	rs1126758	C	T	1648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=14;PP=1302;SC=TCTGCAGGAACTGAGAAACGT;SOR=2.004;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=48;WE=103248932;WS=103248914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr12	103249164	rs2251905	C	T	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=26;PP=751;SC=CACAGCAGAACGCAGGTTAGG;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=103249172;WS=103249154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	103260608	rs2247836	T	C	1077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=31;PP=934;SC=CTACCAGATATTGTGAGTGAC;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=103260616;WS=103260598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	103271193	rs1718301	G	A	2105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=15;PP=1699;SC=GGAGGGGAGTGGAGGAGAGGC;SOR=2.105;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=49;TCR=15;TR=64;WE=103271201;WS=103271183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr12	103298374	.	T	C	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=568;ReadPosRankSum=1.515;SC=CCTACTATCATACAGATTTTG;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=23;WE=103298382;WS=103298372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr12	103352171	rs71438488	C	CGCA	844.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.307;NF=14;NR=4;PP=731;ReadPosRankSum=0.637;SC=GCGCAGAGCGCGCAGCAGCAG;SOR=0.779;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=18;WE=103352179;WS=103352161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr12	103762056	rs34385446	CTCTT	C	244.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=183;ReadPosRankSum=0.379;SC=ACTATTCTCTCTCTTTATCTG;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=7;WE=103762067;WS=103762046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr12	103762095	.	TCA	T	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.792;NF=0;NR=6;PP=70;ReadPosRankSum=0.366;SC=TCTCTCTCTCTCACACACACA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=103762104;WS=103762085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr12	103762638	rs12317808	C	G	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.808;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=166;ReadPosRankSum=-0.640;SC=AAACTCTGGTCTGTCTTGGGA;SOR=0.117;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=46;TCF=41;TCR=5;TR=12;WE=103762646;WS=103762628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,14:0.28:50
chr12	103872172	rs10778257	T	G	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=361;ReadPosRankSum=0.385;SC=AGAATTCTTCTTCCCTTTGTT;SOR=0.685;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=92;TCF=37;TCR=55;TR=26;WE=103872180;WS=103872162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,27:0.29:93
chr12	104014402	.	AAC	A	128.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=144;SC=ATCCTCCTTAAACACACACAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=104014411;WS=104014392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	104015999	rs703612	T	C	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=343;ReadPosRankSum=-1.089;SC=AAAAAAGAAATTTCAGCAGAA;SOR=0.235;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=50;TCF=1;TCR=49;TR=18;WE=104016007;WS=104015989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,18:0.34:53
chr12	104025219	rs10668571	T	TA	130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQRankSum=-1.109;QD=5.94;ReadPosRankSum=1.103;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr12	104044241	rs12829198	G	A	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=408;ReadPosRankSum=-0.142;SC=CTCATTTGGCGTTTTCTTTCT;SOR=0.866;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=78;TCF=67;TCR=11;TR=25;WE=104044249;WS=104044231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,26:0.33:79
chr12	104048592	rs831425	C	T	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=238;ReadPosRankSum=-1.225;SC=GCTAGGATCCCGAGCAGAGAG;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=14;WE=104048600;WS=104048582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
chr12	104064698	rs703639	C	T	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.47;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.141;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr12	104067812	rs11614418	C	T	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.815;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=578;ReadPosRankSum=-0.139;SC=GTGGGCCCTACGTGCAGTTCT;SOR=0.572;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=84;TCF=41;TCR=43;TR=33;WE=104067820;WS=104067802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,33:0.38:87
chr12	104071158	rs72177976	TTCTC	T	889.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.255;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=925;ReadPosRankSum=-1.023;SC=TGTCTGGAAATTCTCTCTTAT;SOR=0.960;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=20;WE=104071169;WS=104071148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr12	104077109	rs59684257	TA	T	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=1.597;QD=1.41;ReadPosRankSum=-1.583;SOR=0.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,11:0.24:46
chr12	104081793	rs697206	A	G	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=293;ReadPosRankSum=-1.469;SC=ACGCATTCACATCAGCATCAG;SOR=0.752;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=73;TCF=72;TCR=1;TR=23;WE=104081801;WS=104081783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,26:0.34:77
chr12	104086631	rs703651	C	T	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.005;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=22;PP=867;ReadPosRankSum=-0.776;SC=ATGGGGACAACGCAGCCACAA;SOR=0.910;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=171;TCF=101;TCR=70;TR=59;WE=104086639;WS=104086621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,61:0.34:178
chr12	104092996	rs697210	T	C	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.948;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=1069;ReadPosRankSum=0.632;SC=TCTTTCTCCATAATGACCAGG;SOR=1.064;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=79;TCF=49;TCR=30;TR=50;WE=104093004;WS=104092986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,53:0.60:89
chr12	104100617	rs697212	C	T	6674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=109;NR=96;PP=2965;SC=GCCAGCCCTGCCCAGGGAATG;SOR=0.820;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=205;TCF=109;TCR=96;TR=205;WE=104100625;WS=104100607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr12	104111687	rs703653	C	A	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=33;PP=994;SC=CCCCACTTCTCGGGGATGCAG;SOR=4.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=36;WE=104111695;WS=104111677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	104124061	rs4981042	A	G	1174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.965;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=871;ReadPosRankSum=-0.982;SC=TTATGTTTTCAGCCTGGAGTG;SOR=1.464;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=41;WE=104124069;WS=104124051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,46:0.79:58
chr12	104129471	rs1946820	G	A	108.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.67;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=54;SC=CATTCATAGCGGGCTCATTTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=104129479;WS=104129461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	104131378	rs201602050	C	T	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=2.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQRankSum=-1.582;QD=25.72;ReadPosRankSum=-2.836;SOR=0.208;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr12	104131381	rs368185753	TCTC	T	556.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=1.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQRankSum=-1.469;QD=23.20;ReadPosRankSum=-3.010;SOR=0.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr12	104131403	.	C	T	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.945;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=38.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=0.820;QD=4.81;ReadPosRankSum=-3.185;SOR=4.797;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr12	104131609	rs2271640	G	T	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=367;ReadPosRankSum=0.617;SC=CCAAAGAATGGCCCTCATGAT;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=17;WE=104131617;WS=104131599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr12	104133305	rs151040830	CTGTGTGTGTGTGTG	C	285.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.75;MQRankSum=0.654;QD=21.98;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr12	104133350	.	T	C	51	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=40;MMLQ=24;MQ=55.21;NF=0;NR=6;PP=51;QD=14.2952020912;SC=TGTGTGTGTGTGCCCGTGCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=6;WE=104133358;WS=104133340;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,6:0.32:19
chr12	104133350	.	T	TGC	80.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.23;MQRankSum=0.993;QD=4.49;ReadPosRankSum=2.176;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr12	104136316	rs2292688	C	T	2044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.703;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=52;PP=1525;ReadPosRankSum=1.097;SC=CGGGGAGATTCGGGCCTGATT;SOR=0.622;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=127;TCF=37;TCR=90;TR=74;WE=104136324;WS=104136306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,79:0.59:135
chr12	104138918	rs2292687	C	T	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=851;ReadPosRankSum=1.247;SC=GTCTCAACCCCTGATGACTGA;SOR=0.713;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=34;TCR=23;TR=39;WE=104138926;WS=104138908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,41:0.69:59
chr12	104140517	rs2056128	A	G	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.315;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=232;ReadPosRankSum=0.400;SC=AAATAGCAGCATGGTGTGGGA;SOR=3.334;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=11;WE=104140525;WS=104140507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr12	104147178	rs3751199	C	A	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=703;ReadPosRankSum=2.268;SC=TCTGCAGGGGCGGAAGTGCAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=27;WE=104147186;WS=104147168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr12	104147207	rs3751198	A	G	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=41;ReadPosRankSum=-0.388;SC=TAAGATGGGGAAGACTTGAGC;SOR=0.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=4;WE=104147215;WS=104147197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr12	104149022	rs11111748	G	A	8290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=174;NR=80;PP=2965;SC=CATTAACCAAGTGATGCCACA;SOR=1.703;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=254;TCF=174;TCR=80;TR=254;WE=104149030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr12	104149251	rs7296626	C	T	7520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=125;PP=2965;SC=GAAAGGTAACCGCCCCAGCTA;SOR=0.966;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=226;TCF=101;TCR=125;TR=226;WE=104149259;WS=104149241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr12	104149520	rs7313163	T	G	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.25;ReadPosRankSum=-0.226;SOR=0.449;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,8:0.17:47
chr12	104151931	rs12425537	T	C	1087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=936;ReadPosRankSum=1.008;SC=CTCTGATGACTTCCTTCTTCT;SOR=0.412;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=54;TCF=40;TCR=14;TR=39;WE=104151939;WS=104151921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,40:0.71:56
chr12	104155075	rs55724382	T	C	2131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.209;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=43;PP=1656;ReadPosRankSum=0.635;SC=CTCATTTCCCTAGACGGAGAC;SOR=0.385;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=100;TCF=41;TCR=59;TR=75;WE=104155083;WS=104155065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,76:0.76:100
chr12	104157170	rs7300663	G	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.006;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=80;ReadPosRankSum=0.880;SC=AAAAGGAAAAGCTCCCAGAGG;SOR=0.045;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=6;WE=104157178;WS=104157160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr12	104157234	rs1057892	G	C	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.424;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=2;PP=707;ReadPosRankSum=-0.605;SC=CTGCTTTGGGGATGCTCCTGG;SOR=1.923;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=44;TCF=40;TCR=4;TR=30;WE=104157242;WS=104157224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,30:0.70:43
chr12	104157502	rs3751196	G	A	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=353;ReadPosRankSum=0.821;SC=TAGAATGTATGTCAGGTAACA;SOR=1.382;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=17;WE=104157510;WS=104157492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr12	104159716	rs10861094	C	A	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=188;ReadPosRankSum=0.352;SC=ATATTATTAGCCACCTTTTGT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=10;WE=104159724;WS=104159706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr12	104171742	rs17034524	C	T	2571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=25;PP=1965;ReadPosRankSum=-0.525;SC=GGAGGCAGCTCAGAGACGCCA;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=136;TCF=96;TCR=40;TR=88;WE=104171750;WS=104171732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,94:0.66:143
chr12	104171941	rs141837728	CTT	C	462.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=5.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.86;MQRankSum=5.491;QD=9.85;ReadPosRankSum=0.434;SOR=2.153;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,15:0.32:47
chr12	104171947	.	TT	AT	403	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000,0.5000;HP=6;HapScore=4;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=62.16;NF=0,0;NR=13,16;PP=389,403;QD=32.5977855806;SC=ACTTCTTTTTTTAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=13,16;WE=104171956;WS=104171937;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:39,13:0.25:52
chr12	104171947	.	TT	TAT	403	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000,0.5000;HP=6;HapScore=4;MGOF=4;MMLQ=27;MQ=62.16;NF=0,0;NR=13,16;PP=389,403;QD=32.5977855806;SC=ACTTCTTTTTTTAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=13,16;WE=104171956;WS=104171937;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:33,16:0.33:49
chr12	104171948	rs57944247	T	A,TAAA	1761.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=4;NR=42;PP=1682;SC=CTTCTTTTTTTAAAAAAAAAA;SOR=4.615;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=52;TCF=4;TCR=48;TR=46;WE=104171956;WS=104171937;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.60,0.40:53
chr12	104181389	rs143184388	ATTG	A	752.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.914;NF=0;NR=19;PP=767;ReadPosRankSum=2.355;SC=ACTTTTAAAAATTGTTGTTTT;SOR=2.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=19;WE=104181399;WS=104181379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr12	104182458	rs2888792	T	C	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=1;PP=1348;ReadPosRankSum=0.455;SC=AATATATTGATTTAAACCTAA;SOR=1.639;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=80;TCF=78;TCR=2;TR=54;WE=104182466;WS=104182448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,55:0.67:82
chr12	104186995	rs61748068	G	A	3871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.608;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=46;PP=2915;ReadPosRankSum=1.286;SC=TGACCACATCGAACAGGTCCC;SOR=0.532;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=216;TCF=148;TCR=68;TR=141;WE=104187003;WS=104186985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,146:0.65:226
chr12	104187092	rs1866296	G	A	5659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-6.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.895;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=90;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.906;SC=GAGATTAACTGTGTCTGTAAC;SOR=0.469;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=287;TCF=160;TCR=127;TR=197;WE=104187100;WS=104187082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,210:0.68:307
chr12	104187419	rs12426059	G	T	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.711;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=192;ReadPosRankSum=-0.619;SC=CCCTAAGGAAGAAGCTTTGTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=10;WE=104187427;WS=104187409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr12	104187440	rs11111781	C	T	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.531;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=391;ReadPosRankSum=-1.307;SC=CGGTGGAACACGGGTACATCT;SOR=0.074;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=18;WE=104187448;WS=104187430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr12	104190523	rs12425205	G	A	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=1;PP=638;SC=CATCTTTCTTGTAATGTTCAA;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=104190531;WS=104190513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	104190869	rs17034593	C	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=210;ReadPosRankSum=-1.409;SC=GACAGAGCCACGAAGCACCAG;SOR=0.481;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=11;WE=104190877;WS=104190859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr12	104192506	rs10082821	A	G	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.119;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=181;ReadPosRankSum=0.199;SC=GAAACCAATGATTTTCACACC;SOR=0.045;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=12;WE=104192514;WS=104192496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr12	104235207	rs35015549	G	A	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=228;ReadPosRankSum=0.719;SC=CGCCCAGCCTGCTGCGGTCAA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=54;TCR=1;TR=16;WE=104235215;WS=104235197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,14:0.28:50
chr12	104235229	rs34187551	C	G	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.436;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=379;ReadPosRankSum=-0.244;SC=TTCAGGGTGGCGCGGGGGTGG;SOR=0.899;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=84;TCF=76;TCR=8;TR=23;WE=104235237;WS=104235219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,25:0.30:84
chr12	104237512	rs1370784	T	C	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=33;ReadPosRankSum=-0.614;SC=AAAACAGATGTCAAAAAGCCC;SOR=0.117;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=5;WE=104237520;WS=104237502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr12	104237829	rs1370780	T	G	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=25;PP=945;ReadPosRankSum=-1.383;SC=AGAGGAATAGTCTGTCTTTTT;SOR=0.657;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=119;TCF=52;TCR=67;TR=46;WE=104237837;WS=104237819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,46:0.38:121
chr12	104237882	rs2576974	G	A	4120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=67;PP=2965;SC=TTTCAGCATTGTTTTGTGTCT;SOR=0.822;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=129;TCF=62;TCR=67;TR=128;WE=104237890;WS=104237872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr12	104251076	rs2252327	G	A	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=64;ReadPosRankSum=-0.840;SC=GCATGCATTCGTTCATTCATT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=104251084;WS=104251066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr12	104254753	rs11111816	G	A	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=686;ReadPosRankSum=0.188;SC=TGAATCCCCAGGCTTCTGAGC;SOR=5.353;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=25;WE=104254761;WS=104254743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr12	104254871	rs117881778	C	T	1910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.995;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=25;PP=1463;ReadPosRankSum=1.738;SC=AGACACACTTCTTGAAACATT;SOR=0.361;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=103;TCF=67;TCR=36;TR=67;WE=104254879;WS=104254861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,70:0.65:107
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chr12	104260208	rs11612613	C	T	1927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=19;PP=1454;SC=GAGTGAAAGACGCAGCATGCT;SOR=1.758;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=61;WE=104260216;WS=104260198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	104309383	rs9788014	C	T	2247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.642;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=21;PP=1844;ReadPosRankSum=0.884;SC=ACGTTGGGAGCGAAGACAAGA;SOR=1.609;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=143;TCF=100;TCR=43;TR=88;WE=104309391;WS=104309373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,86:0.62:139
chr12	104309712	rs2583273	C	T	2062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.528;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=55;PP=1605;ReadPosRankSum=0.282;SC=CAGCCACCGACCCCCACTGCT;SOR=2.416;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=108;TCF=25;TCR=83;TR=65;WE=104309720;WS=104309702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,71:0.61:116
chr12	104324148	rs2722187	G	A	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.365;NF=24;NR=4;PP=723;ReadPosRankSum=0.727;SC=CCCGCCCGCGGGAAGTGGGGG;SOR=2.115;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=28;WE=104324156;WS=104324138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr12	104324182	rs2070908	C	G	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.548;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=1.236;NF=14;NR=4;PP=392;ReadPosRankSum=0.603;SC=GACCTGCTTGCGGTGTAGTGG;SOR=0.368;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=18;WE=104324190;WS=104324172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr12	104324230	rs62747560	AGGGGTGG	A	524.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=1.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=1.681;QD=8.33;ReadPosRankSum=0.214;SOR=0.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,17:0.27:63
chr12	104325649	rs2722188	T	G	1431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=40;PP=1167;SC=TTATAGAAGATACTTTCAGTT;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=40;WE=104325657;WS=104325639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	104326862	rs117886928	T	C	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=99;ReadPosRankSum=-0.691;SC=CATCAAACTATGGCCAAATCT;SOR=1.802;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=7;WE=104326870;WS=104326852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr12	104327979	rs6615	C	T	2538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.150;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.769;NF=50;NR=39;PP=1937;ReadPosRankSum=-0.522;SC=ACAACGATACCCAGCACATCT;SOR=0.501;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=146;TCF=86;TCR=60;TR=89;WE=104327987;WS=104327969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,93:0.62:150
chr12	104335750	rs58392270	TAA	T	2255.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=38;PP=1688;SC=ATTTGTGGAGTAAAACCAGAT;SOR=2.790;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=41;WE=104335759;WS=104335740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	104337222	rs3842649	GTAAT	G	169.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.54;ReadPosRankSum=0.482;SOR=0.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,8:0.17:48
chr12	104337667	rs1882019	G	A	2886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.685;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=50;PP=2262;ReadPosRankSum=2.057;SC=GCATCCTCGGGAAAGTCCCTG;SOR=0.927;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=177;TCF=96;TCR=81;TR=113;WE=104337675;WS=104337657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,112:0.62:180
chr12	104341015	rs1165694	T	C	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.416;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=306;ReadPosRankSum=3.333;SC=ACATTAATTATGATTTTATAC;SOR=0.241;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=76;TCF=66;TCR=10;TR=21;WE=104341023;WS=104341005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,22:0.28:78
chr12	104341103	rs7645	C	T	1549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.046;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=18;PP=1215;ReadPosRankSum=-0.637;SC=AAGAAGAGCCCGAAGAAGAAC;SOR=0.891;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=197;TCF=138;TCR=59;TR=66;WE=104341111;WS=104341093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,68:0.34:202
chr12	104341187	rs201427769	TGAA	T	5511.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.559;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.275;NF=22;NR=86;PP=2975;ReadPosRankSum=0.855;SC=TGGGAACAGATGAAGAAGAAG;SOR=0.614;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=191;TCF=44;TCR=147;TR=108;WE=104341197;WS=104341177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,139:0.65:213
chr12	104341398	rs1165695	T	A	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.293;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=211;ReadPosRankSum=-0.613;SC=GGGTTTTTTTTATTTATTTAC;SOR=0.458;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=64;TCF=51;TCR=13;TR=16;WE=104341406;WS=104341388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,19:0.28:69
chr12	104341644	rs35780385	AACTG	A	241.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=244;ReadPosRankSum=0.058;SC=TGTACTATTTAACTGACTATT;SOR=0.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=7;WE=104341655;WS=104341634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr12	104345412	rs3830654	C	CA	726.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.783;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.338;NF=6;NR=26;PP=484;ReadPosRankSum=0.027;SC=GTATTGTCTGCAAAAAAAACA;SOR=0.328;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=108;TCF=15;TCR=93;TR=32;WE=104345420;WS=104345402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,38:0.37:104
chr12	104345538	rs2583227	C	A	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-4.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=173;ReadPosRankSum=0.067;SC=AATGATAACTCTTTATTATGA;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=10;WE=104345546;WS=104345528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr12	104349688	rs2700505	T	C	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=500;ReadPosRankSum=0.055;SC=AAATTTCTCCTTCCTTTGAAT;SOR=0.239;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=0;TCR=71;TR=24;WE=104349696;WS=104349678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,25:0.34:74
chr12	104359931	rs4135039	T	A	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=32;PP=1729;ReadPosRankSum=-0.410;SC=GTCTTTTAAATCCCGGCCGGA;SOR=0.687;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=10;TCR=53;TR=38;WE=104359940;WS=104359921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,41:0.62:66
chr12	104359932	rs322102	C	G	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=956;ReadPosRankSum=0.678;SC=TCTTTTAAATCCCGGCCGGAA;SOR=0.663;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=10;TCR=49;TR=23;WE=104359940;WS=104359921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,23:0.37:62
chr12	104359982	rs4135040	C	A	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=5.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=488;ReadPosRankSum=-1.493;SC=GTGGCCTGGTCGGCCTTTCCT;SOR=1.112;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=21;WE=104359990;WS=104359972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr12	104370850	rs3829300	A	G	2265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.706;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.860;NF=44;NR=50;PP=1777;ReadPosRankSum=-0.609;SC=TAGTTTCACCATGAGAGCTTA;SOR=0.368;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=160;TCF=69;TCR=91;TR=94;WE=104370858;WS=104370840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,96:0.57:169
chr12	104373462	rs4135094	T	C	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=304;ReadPosRankSum=-2.247;SC=AGGGAAGATATTGCAGAGGAG;SOR=0.368;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=15;WE=104373470;WS=104373452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr12	104373728	rs151041931	G	GA	42.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=28.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.07;MQRankSum=-5.606;QD=1.29;ReadPosRankSum=3.200;SOR=3.895;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,6:0.18:33
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chr12	104380734	rs2888805	G	A	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.657;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.677;NF=21;NR=45;PP=1235;ReadPosRankSum=0.459;SC=AGTTGAGAGCGTGGAGTTAAG;SOR=0.946;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=103;TCF=39;TCR=64;TR=66;WE=104380742;WS=104380724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,71:0.63:112
chr12	104387138	rs79806135	G	A	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=3;PP=682;ReadPosRankSum=-2.200;SC=GGACATTTGCGTTTTTCTAAA;SOR=1.132;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=48;TCF=43;TCR=5;TR=31;WE=104387146;WS=104387128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
chr12	104388291	rs2583277	C	A	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=416;ReadPosRankSum=0.644;SC=TGTAAGGGAACAGGATGTGCA;SOR=0.638;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=21;WE=104388299;WS=104388281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr12	104393304	rs3215372	AC	A	251.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.795;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=239;ReadPosRankSum=0.974;SC=TAAAAAGATGACCAAAAAAAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=104393312;WS=104393294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr12	104413436	rs11553765	C	T	2270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.966;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=70;PP=1801;ReadPosRankSum=0.594;SC=TGTGTATTCACGCGGATAAGA;SOR=0.868;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=18;TCR=103;TR=82;WE=104413444;WS=104413426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,84:0.67:125
chr12	104461711	.	CT	C	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.995;ClippingRankSum=0.000;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=2.310;QD=0.30;ReadPosRankSum=-0.103;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,18:0.15:124
chr12	104476264	rs2253274	T	C	3078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.39;ReadPosRankSum=-0.133;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,105:0.70:151
chr12	104476453	rs12303142	G	A	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=19;PP=794;ReadPosRankSum=-0.442;SC=ATTTTGTTAAGAACAAAAGAT;SOR=0.701;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=68;TCR=59;TR=41;WE=104476461;WS=104476443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,42:0.32:132
chr12	104529395	rs74241079	T	G	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.53;ReadPosRankSum=1.668;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr12	104618454	rs6539128	A	G	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.504;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=277;ReadPosRankSum=-0.540;SC=GAGCCACCGCACCTATAGCTG;SOR=2.121;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=20;WE=104618462;WS=104618444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr12	104645363	rs7960443	G	A	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.678;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=32;PP=868;ReadPosRankSum=1.181;SC=TCACCAGCACGGCCACTGCAG;SOR=0.766;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=156;TCF=52;TCR=104;TR=46;WE=104645371;WS=104645353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,47:0.30:159
chr12	104645405	rs7975161	T	C	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=30;PP=490;ReadPosRankSum=-1.431;SC=CCTATATAGATGGTCACTCTG;SOR=0.783;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=105;TCF=20;TCR=85;TR=36;WE=104645413;WS=104645395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,35:0.33:107
chr12	104681300	rs186062313	G	C	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=8.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.117;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=39;PP=876;ReadPosRankSum=-0.161;SC=TATTAAGAAAGTATAACTATG;SOR=2.786;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=99;TCF=4;TCR=95;TR=39;WE=104681308;WS=104681290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,38:0.37:102
chr12	104684773	rs11111981	A	C	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=358;ReadPosRankSum=-0.836;SC=TTCTTTAGAGATGGAGGTCTC;SOR=0.520;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=17;WE=104684781;WS=104684763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr12	104698582	rs11111987	A	G	1757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.025;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=32;PP=1300;ReadPosRankSum=0.958;SC=ATGTTAACCAAATGGGTGAGG;SOR=0.767;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=261;TCF=148;TCR=113;TR=78;WE=104698590;WS=104698572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:190,81:0.30:271
chr12	104705331	rs184398884	A	G	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=265;ReadPosRankSum=0.616;SC=TGGGCAGGACATGGACATCGT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=13;WE=104705339;WS=104705321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr12	104707151	rs5018287	A	G	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.614;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=253;ReadPosRankSum=-0.356;SC=TCCCCTGGCAATAATCTAACT;SOR=1.051;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=14;WE=104707159;WS=104707141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr12	104707180	rs6539137	A	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=145;ReadPosRankSum=-0.421;SC=AAGCCTAATTAAAAAAATCAA;SOR=0.479;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=10;WE=104707188;WS=104707170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr12	104714847	.	CT	C	197.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.470;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.44;MQRankSum=3.713;QD=2.25;ReadPosRankSum=0.521;SOR=0.655;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,22:0.25:88
chr12	104733165	rs10861202	A	G	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.148;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=439;ReadPosRankSum=0.473;SC=TGATTCCTCAAAAGAGGGCTT;SOR=0.399;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=78;TCF=24;TCR=54;TR=28;WE=104733173;WS=104733155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,28:0.36:78
chr12	104985655	rs313323	C	T	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.57;ReadPosRankSum=-0.967;SOR=0.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr12	104995800	rs5800627	A	AT	527.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=2.982;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=1.902;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.467;SOR=0.416;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,33:0.36:91
chr12	105260159	rs149586274	TACACAC	T	345.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQ=59.14;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=390;ReadPosRankSum=0.882;SC=CAGACAGACGTACACACACAC;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=12;WE=105260172;WS=105260149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr12	105431835	rs10861315	T	G	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-7.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.157;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=8;PP=631;ReadPosRankSum=0.099;SC=GTGAGCCACCTCACCTGGCCC;SOR=0.099;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=106;TCF=94;TCR=12;TR=43;WE=105431843;WS=105431825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,43:0.40:108
chr12	105433463	rs4964120	C	T	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=7;PP=886;ReadPosRankSum=-0.434;SC=ACAGGATCTGCAGTGAATCAA;SOR=0.579;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=123;TCR=20;TR=48;WE=105433471;WS=105433453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,49:0.34:146
chr12	105433523	rs4964317	T	A	2444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.579;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=36;PP=1714;ReadPosRankSum=0.971;SC=TAGGAGTGGATCCAGTGAAAC;SOR=0.580;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=271;TCF=183;TCR=88;TR=106;WE=105433531;WS=105433513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,108:0.39:274
chr12	105433607	rs4964318	G	A	1676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.258;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=53;PP=1309;ReadPosRankSum=0.525;SC=GGAATAAAACGGGAATTAAAA;SOR=0.820;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=218;TCF=58;TCR=160;TR=71;WE=105433615;WS=105433597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,72:0.32:227
chr12	105433702	rs7315784	A	T	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=313;ReadPosRankSum=0.590;SC=AGGTCAGGAGATCGAGACCCG;SOR=0.195;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=0;TCR=57;TR=18;WE=105433710;WS=105433692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,18:0.31:58
chr12	105434467	rs11112330	C	T	1357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.580;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=23;PP=972;ReadPosRankSum=0.670;SC=CAGTCAAGGGCGTGACCTGAG;SOR=0.769;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=175;TCF=102;TCR=73;TR=58;WE=105434475;WS=105434457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,63:0.35:181
chr12	105434533	rs10861316	C	A	1478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.554;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=38;PP=1062;ReadPosRankSum=-0.014;SC=TAGCCCAGAACCCAGTTTTCC;SOR=0.618;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=198;TCF=76;TCR=122;TR=64;WE=105434541;WS=105434523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,70:0.34:206
chr12	105440421	rs10861324	T	G	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=114;ReadPosRankSum=0.094;SC=ATAAATATATTTCACTTTTTT;SOR=0.307;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=7;WE=105440429;WS=105440411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr12	105443914	rs11112344	C	T	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=575;ReadPosRankSum=-0.891;SC=ATCCTAAGGACGGAGAATTCA;SOR=0.840;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=26;WE=105443922;WS=105443904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,28:0.61:46
chr12	105443940	rs11112345	G	A	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=412;ReadPosRankSum=0.922;SC=AAACACATATGGATCAGATCT;SOR=1.044;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=19;WE=105443948;WS=105443930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr12	105443966	rs7485673	T	C	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=65;ReadPosRankSum=0.851;SC=CTTATAGAGATCATGGTCCAG;SOR=0.193;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=5;WE=105443974;WS=105443956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr12	105445798	rs61938827	C	A	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=1;PP=1070;SC=CCAGCCTGGCCAACGTAGTGA;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=38;WE=105445806;WS=105445788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	105446092	rs140372840	AT	A	2084.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=64;PP=2608;SC=AGTATTACTGATTTTAAAAAA;SOR=8.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=0;TCR=70;TR=64;WE=105446100;WS=105446082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	105446552	rs56188643	T	C	3883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=108;NR=14;PP=2965;SC=TAAAAATCCATGACCAGTGAT;SOR=3.740;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=123;TCF=108;TCR=15;TR=122;WE=105446560;WS=105446542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr12	105446719	rs56118650	G	T	3829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.475;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=0.774;SC=TCTGAGAGAAGTATATTAATA;SOR=2.321;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=21;TCR=99;TR=117;WE=105446727;WS=105446709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,120:0.98:123
chr12	105454627	.	G	A	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.302;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=5.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.61;MQRankSum=-7.762;QD=9.26;ReadPosRankSum=0.903;SOR=2.441;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,33:0.43:77
chr12	105454629	.	T	A	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.871;ClippingRankSum=0.000;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=5.692;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.02;MQRankSum=-8.057;QD=8.51;ReadPosRankSum=-5.591;SOR=2.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,33:0.40:82
chr12	105454630	.	G	A	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.272;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=5.444;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.38;MQRankSum=-8.338;QD=8.02;ReadPosRankSum=-6.534;SOR=2.059;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,33:0.38:87
chr12	105455651	rs6539183	A	G	1136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=33;PP=944;SC=GGAAAAATACAGATTAAAAGC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=105455659;WS=105455641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	105456866	rs12372293	G	A	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=306;ReadPosRankSum=-0.995;SC=GTATGTATAAGCATCATTCTC;SOR=0.446;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=15;WE=105456874;WS=105456856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr12	105477951	rs11112362	C	T	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=1;PP=485;SC=AGACAATGGCCTGCGTGCCAG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=105477959;WS=105477941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	105478327	rs7303961	C	T	126.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=4;PP=96;SC=GACTGCCTGGCTCGCGGCTCG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=105478335;WS=105478317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	105504764	rs1196839	G	A	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=659;SC=TTTAACTTTGGAACTTTATTT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=23;WE=105504772;WS=105504754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	105504787	rs1196838	G	A	1229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=4;PP=855;SC=AGGAAGTCCAGACATTCCAGA;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=105504795;WS=105504777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	105509160	rs1196801	G	T	495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=448;SC=AGGTAAAAAAGCTGAGGAAGC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=105509168;WS=105509150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	105514480	rs1196837	A	G	942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=26;PP=731;SC=ACTCTTAAAGAGGCGTGTGTG;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=105514488;WS=105514470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	105514786	rs1196836	G	T	985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=2;PP=777;SC=TACTAATTCAGTAATCAGCCC;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=105514794;WS=105514776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	105527385	rs1211276	G	C	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=1;PP=751;SC=CAGTACCTGGGATGTTTGTTG;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=105527393;WS=105527375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	105534025	rs1196808	G	A	3011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=4;PP=2618;SC=AATTTTGCCTGAAATTTTTAA;SOR=5.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=85;TCR=4;TR=88;WE=105534033;WS=105534015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr12	105536430	rs5800652	C	CTA	347.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.94;QD=38.64;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	105538417	rs148267591	AGTT	A	1242.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=3;PP=1155;SC=TTCAAGGACAAGTTGTTGTTT;SOR=2.226;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=24;WE=105538427;WS=105538407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	105538468	.	C	T	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=524;ReadPosRankSum=-1.121;SC=TCTACTGTTTCACAAGTTGAA;SOR=0.509;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=24;WE=105538476;WS=105538458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,26:0.74:35
chr12	105540322	rs199922129	A	AT	1361.19	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.503;HP=12;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.614;NF=16;NR=37;PP=563;ReadPosRankSum=0.423;SC=GGGTTTATAAATTTTTTTTTT;SOR=1.290;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=74;TCF=21;TCR=53;TR=53;WE=105540330;WS=105540312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:9,63:0.88:72
chr12	105543326	rs1196802	T	G	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=544;SC=CAGTAAAATTTATTTGAATTG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=105543334;WS=105543316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	105546172	rs1663564	G	A	7502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=138;NR=96;PP=2965;SC=AAAACTTGGAGTAACACCTGA;SOR=1.118;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=234;TCF=138;TCR=96;TR=234;WE=105546180;WS=105546162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr12	105568122	rs935241	G	A	3688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=29;PP=2965;SC=CTCTATGTTCGTTTGGATTTC;SOR=2.127;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=85;TCR=29;TR=114;WE=105568130;WS=105568112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr12	105568176	rs935240	G	A	5018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=63;PP=2965;SC=CATATTTTCCGTCATTGGTTA;SOR=1.222;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=158;TCF=95;TCR=63;TR=158;WE=105568184;WS=105568166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr12	105582245	rs1196852	A	G	6391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=138;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.720;SC=AGCATTTTCCACTCAGGATCT;SOR=0.769;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=203;TCF=64;TCR=139;TR=201;WE=105582253;WS=105582235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,206:1.00:207
chr12	105611551	rs117675758	T	C	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.732;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=524;ReadPosRankSum=0.125;SC=AATGTATACATAGTCACTGAA;SOR=1.141;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=82;TCF=13;TCR=69;TR=28;WE=105611559;WS=105611541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,28:0.33:86
chr12	105742457	rs75924647	G	A	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=327;ReadPosRankSum=0.836;SC=GGAAGTTGCTGTTTTTCATGA;SOR=0.399;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=21;WE=105742465;WS=105742447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr12	105759838	rs1432588	C	T	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.657;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=150;ReadPosRankSum=0.435;SC=ATGCATGTGGCGTGTGCTAAT;SOR=1.545;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=10;WE=105759846;WS=105759828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr12	105760369	rs7962661	A	G	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=5.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.25;ReadPosRankSum=-0.657;SOR=1.295;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,41:0.26:157
chr12	105789562	rs1534253	C	T	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=301;ReadPosRankSum=0.362;SC=CTGACTTTGGCAAGCAGAATG;SOR=0.263;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=16;WE=105789570;WS=105789552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
chr12	106460856	rs7136283	A	G	2559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.254;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=35;PP=1878;ReadPosRankSum=-0.201;SC=CGCTGATGACACTGGAAGGGC;SOR=0.270;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=170;TCF=119;TCR=51;TR=100;WE=106460864;WS=106460846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,106:0.61:175
chr12	106464785	rs4964437	G	C	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.939;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=502;ReadPosRankSum=-0.805;SC=ACCCCCAGCAGCCCCAGGAAC;SOR=0.368;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=22;WE=106464793;WS=106464775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr12	106500158	rs35769739	GT	G	681.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.760;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.493;NF=25;NR=34;PP=1494;ReadPosRankSum=0.280;SC=TGATATGGGGGTTAAAAAAAA;SOR=0.798;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=40;TCR=55;TR=59;WE=106500168;WS=106500148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,44:0.46:96
chr12	106532072	rs1215597	C	A	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=2;PP=986;SC=CGGGGCTTCCCAATGAGCCCC;SOR=5.031;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=38;WE=106532080;WS=106532062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	106704974	rs4964460	G	A	2909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=59;PP=2252;SC=GCAGAGCTTTGCAAGTGACTC;SOR=1.511;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=31;TCR=60;TR=90;WE=106704982;WS=106704964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr12	106706035	rs7138696	A	T	1609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQRankSum=-2.736;QD=18.72;ReadPosRankSum=0.846;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,59:0.69:86
chr12	106706035	.	ATTTT	TTTTT	1764	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000,0.5000;HP=20;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=6;MQ=57.72;NF=8,58;NR=0,0;PP=150,1764;QD=19.125;SC=TTTAGTTTCCATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=93;TCF=87;TCR=6;TR=8,58;WE=106706048;WS=106706025;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:28,58:0.67:86
chr12	106706035	.	ATTTT	A	1764	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000,0.5000;HP=20;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=6;MQ=57.72;NF=8,58;NR=0,0;PP=150,1764;QD=19.125;SC=TTTAGTTTCCATTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=93;TCF=87;TCR=6;TR=8,58;WE=106706048;WS=106706025;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:85,8:0.09:93
chr12	106708278	rs2253838	T	G	2675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.354;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=66;PP=2050;ReadPosRankSum=0.797;SC=AGAGGTAACCTGGGGGCATTT;SOR=3.020;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=80;TCF=14;TCR=66;TR=79;WE=106708286;WS=106708268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,86:0.99:87
chr12	106717524	.	A	AAT	549.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.331;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=-0.966;QD=18.96;ReadPosRankSum=3.303;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr12	106717526	rs144794557	A	AAAT,AATAAAT	1281.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.28;QD=49.30;SOR=6.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,11,15:0.42,0.58:26
chr12	106730031	rs34332844	AG	A	2828.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=44;PP=2948;ReadPosRankSum=-1.747;SC=TCTTGTATTAAGGCTCTGCAT;SOR=0.730;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=77;TCF=11;TCR=66;TR=50;WE=106730042;WS=106730021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,71:0.70:101
chr12	106730034	rs10717199	C	T	2837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=44;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.625;SC=TGTATTAAGGCTCTGCATGTG;SOR=0.730;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=87;TCF=21;TCR=66;TR=57;WE=106730042;WS=106730021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,71:0.70:101
chr12	106820957	rs202125845	CT	C	46.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=-0.586;QD=2.12;ReadPosRankSum=-0.283;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr12	106848414	rs17038460	A	G	1925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.493;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=28;PP=1505;ReadPosRankSum=0.235;SC=ACAGAATGCAACAGTTGCTGT;SOR=0.874;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=111;TCF=61;TCR=50;TR=66;WE=106848422;WS=106848404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,70:0.59:118
chr12	106995136	rs7295853	G	C	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.228;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=124;ReadPosRankSum=1.623;SC=TAATGACCAGGGCCCAGGGAC;SOR=0.148;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=10;WE=106995144;WS=106995126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr12	107002558	rs55993073	CT	C	140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=2.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=1.508;QD=4.02;ReadPosRankSum=0.336;SOR=1.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
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chr12	107078562	rs5800715	A	AAAG	3657.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=24;PP=2837;SC=CGCTCAGCACAAAGAATTTTC;SOR=1.581;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=72;TCF=37;TCR=35;TR=56;WE=107078570;WS=107078552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr12	107080617	rs56287989	CTTT	C	490.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.87;ReadPosRankSum=0.437;SOR=0.420;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr12	107080638	rs55658229	TCC	T	436.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=1.619;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.48;ReadPosRankSum=2.862;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr12	107083031	rs9804754	G	A	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=4;PP=576;ReadPosRankSum=0.369;SC=ATTAATGTATGTCTTTGTTGT;SOR=0.555;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=94;TCF=81;TCR=13;TR=31;WE=107083039;WS=107083021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,35:0.34:103
chr12	107083059	rs7961392	C	T	2178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.584;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=16;PP=1618;ReadPosRankSum=0.630;SC=CTACACACCCCCACAGGTTTC;SOR=1.521;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=108;TCF=80;TCR=28;TR=72;WE=107083067;WS=107083049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,77:0.66:116
chr12	107087087	.	G	T	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.738;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=38;ReadPosRankSum=0.056;SC=ACTGAGGATGGATCAGCCTTC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=5;WE=107087095;WS=107087077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr12	107090201	rs10778502	T	C	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.550;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=589;ReadPosRankSum=1.628;SC=TGATGCCCACTGTGCTGCAGG;SOR=0.173;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=89;TCF=21;TCR=68;TR=38;WE=107090209;WS=107090191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,40:0.43:94
chr12	107126065	rs7307472	A	G	1396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.644;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=40;PP=1075;ReadPosRankSum=1.542;SC=ACCACTTGGTAATGTTATTTG;SOR=0.627;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=158;TCF=47;TCR=111;TR=58;WE=107126073;WS=107126055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,60:0.37:162
chr12	107144328	rs12424114	A	G	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=3.716;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.32;ReadPosRankSum=1.358;SOR=0.123;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,34:0.43:80
chr12	107361070	.	C	T	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.587;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=287;ReadPosRankSum=-0.136;SC=GAGTCTTACTCTGTCAACCCA;SOR=0.399;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=14;WE=107361078;WS=107361060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr12	107364873	rs10778520	C	T	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.753;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=299;ReadPosRankSum=-1.057;SC=ATGATATTTTCTCTCATTAGG;SOR=0.360;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=16;WE=107364881;WS=107364863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr12	107395106	rs8192440	A	G	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.264;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=24;PP=732;ReadPosRankSum=1.446;SC=CAGTTTCTCCACCTGGCCACA;SOR=0.807;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=178;TCF=94;TCR=84;TR=53;WE=107395114;WS=107395096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,53:0.28:186
chr12	107712880	rs10082935	C	T	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=31;PP=778;ReadPosRankSum=-0.160;SC=CTGGCCGCCTCTAGCTGACTC;SOR=0.753;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=135;TCF=36;TCR=99;TR=42;WE=107712888;WS=107712870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,43:0.32:135
chr12	107713511	rs961498	G	C	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=37;PP=1102;SC=AGTGGCCCTGGGTCAGGCTCG;SOR=2.303;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=48;WE=107713519;WS=107713501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	107713696	rs111260184	G	A	1486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=9;PP=1262;SC=AGTCCCGCCGGCAGCCGCCGC;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=48;WE=107713704;WS=107713686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	107713963	rs71442718	A	G	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.920;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=641;ReadPosRankSum=-3.325;SC=TGCTGTCCCAAGCCGCTGAGG;SOR=0.020;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=28;WE=107713971;WS=107713953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr12	107714310	rs11383016	T	TC	1494.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=2;PP=1819;SC=TGCTCCCACTTCCCCACTCCC;SOR=4.362;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=46;TCR=2;TR=43;WE=107714318;WS=107714300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	107714450	rs7358583	G	T	2603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.676;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=49;PP=1921;ReadPosRankSum=-0.960;SC=AAGACTTGTCGGTGCCAAGTT;SOR=0.586;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=134;TCF=63;TCR=71;TR=95;WE=107714458;WS=107714440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,97:0.69:141
chr12	107914141	rs1861586	C	T	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.480;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=161;ReadPosRankSum=-1.383;SC=CCTACATTGGCTTTCTTTGCA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=8;WE=107914149;WS=107914131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr12	108003911	rs4964599	T	C	1159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=2;PP=832;SC=CGGAGTTTGCTCCTGTGCCCC;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=32;WE=108003919;WS=108003901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	108008772	rs10492158	C	T	1461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=1;PP=1308;SC=GCCACAGATACGTCAAATTTG;SOR=6.273;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=49;WE=108008780;WS=108008762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	108029186	rs73187339	C	A	1567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=38;PP=1269;SC=TTCCCCCAGGCCTGTGTTGGC;SOR=1.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=52;WE=108029194;WS=108029176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr12	108045336	rs2241185	T	C	2010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=10;PP=1612;SC=GTCCCCTACCTGTGACACTGC;SOR=3.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=54;TCR=10;TR=64;WE=108045344;WS=108045326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	108091653	rs7959279	C	G	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=334;ReadPosRankSum=-0.955;SC=GAAGGACTTTCGGATTATGAG;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=15;WE=108091661;WS=108091643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr12	108096769	rs11547907	G	C	3587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.539;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=62;PP=2756;ReadPosRankSum=0.593;SC=ATATGTCCTTGGGGAAACCAG;SOR=0.765;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=202;TCF=108;TCR=94;TR=134;WE=108096777;WS=108096759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,141:0.67:210
chr12	108096890	rs3741786	T	C	1805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.119;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=62;PP=1348;ReadPosRankSum=-1.556;SC=CGTTTATATATGGCTTTGAAA;SOR=0.527;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=106;TCF=17;TCR=89;TR=75;WE=108096898;WS=108096880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,75:0.71:105
chr12	108097379	rs73187399	C	T	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.740;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=0;PP=1129;ReadPosRankSum=0.765;SC=GAAATACTGTCAAATAGATTC;SOR=3.486;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=62;TCR=1;TR=45;WE=108097387;WS=108097369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,44:0.73:60
chr12	108600237	rs1106752	A	G	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.194;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=33;PP=976;ReadPosRankSum=0.714;SC=TCAGATTCCCACCTGTGGTAT;SOR=0.290;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=60;TCF=12;TCR=48;TR=43;WE=108600245;WS=108600227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,43:0.72:60
chr12	108626431	rs10861882	G	A	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=59;ReadPosRankSum=0.079;SC=GCAGGGGTGTGACTCATACCC;SOR=1.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=7;WE=108626439;WS=108626421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chr12	108675724	rs12816282	A	G	4594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=86;PP=2965;SC=TACTCTGAGCAGGGACTCCAG;SOR=0.980;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=65;TCR=86;TR=151;WE=108675732;WS=108675714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr12	108686008	rs1057401	C	G	4487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=63;PP=2965;SC=GCAGTTTGCACACGATGGTGA;SOR=0.770;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=59;TCR=63;TR=122;WE=108686016;WS=108685998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr12	108687449	.	GAA	G	211.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-0.110;QD=4.50;ReadPosRankSum=0.403;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
chr12	108917520	rs34982944	G	GA	519.06	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.89;MQRankSum=0.313;QD=19.22;ReadPosRankSum=0.581;SOR=3.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,23:0.85:27
chr12	108918146	rs2303633	C	T	2447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=15;PP=1967;SC=TCCTGGTCTCCGGCTTCTCTG;SOR=2.690;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=61;TCR=15;TR=76;WE=108918154;WS=108918136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr12	108919166	rs17040655	T	C	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=31;ReadPosRankSum=-0.674;SC=TAAATCATCTTTGAACCGATA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=2;WE=108919174;WS=108919163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr12	108923950	rs1549096	A	G	7686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=153;PP=2965;SC=CTTTCTCATCATCCTCATCTG;SOR=1.153;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=259;TCF=106;TCR=153;TR=259;WE=108923958;WS=108923940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr12	108931779	rs2287550	C	A	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=5.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.28;ReadPosRankSum=-0.544;SOR=1.373;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,41:0.25:163
chr12	108932053	rs2287551	C	T	1023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=32;PP=929;SC=ATTGCCAGCACGACCAAGTGA;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=108932061;WS=108932043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	108932916	rs7133076	C	T	1938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=48;PP=1435;SC=GGAAGCACAACACATCTGCAA;SOR=2.869;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=10;TCR=48;TR=58;WE=108932924;WS=108932906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	108936428	rs11113982	T	C	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=183;ReadPosRankSum=0.028;SC=TTCCAATATATAAAAGTTCAA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=10;WE=108936436;WS=108936418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr12	108936484	rs888555	G	A	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.480;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=3;PP=745;ReadPosRankSum=0.810;SC=TACTTTCATAGCTTGTAAAAC;SOR=1.923;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=29;WE=108936492;WS=108936474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,31:0.69:45
chr12	108936516	rs888556	T	G	2700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.56;SOR=2.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	108936519	rs888557	C	T	2743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.98;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	108943028	rs2052423	G	A	2126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=59;PP=1791;SC=TTAAAACACCGTCATCAAGTA;SOR=3.578;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=9;TCR=59;TR=68;WE=108943036;WS=108943018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	108954502	rs1160332	G	A	2981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=3;PP=2412;SC=GTCACGAAAAGCGGGTTTGCA;SOR=6.161;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=83;TCR=3;TR=86;WE=108954510;WS=108954492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr12	108954823	rs1063936	C	T	4456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=61;PP=2965;SC=ATAACACCTTCCTCCTTGTCC;SOR=0.877;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=134;TCF=73;TCR=61;TR=134;WE=108954831;WS=108954813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr12	108954862	rs2072579	G	C	2788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.159;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=51;PP=2089;ReadPosRankSum=-1.135;SC=CCTCCTCTCCGTCAGCCTTGG;SOR=0.748;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=149;TCF=74;TCR=75;TR=98;WE=108954870;WS=108954852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,104:0.68:154
chr12	108956417	rs10778647	TT	GG	2446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=0;PP=1495;SC=GGCTGGGGCTTTCCGTCTGAG;SOR=8.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=52;TCR=0;TR=51;WE=108956426;WS=108956407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	108956526	rs60547936	A	AG	4300.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=73;PP=2975;SC=GGGACAAAAGAGGGACGCGCG;SOR=1.206;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=35;TCR=74;TR=106;WE=108956534;WS=108956516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr12	108956610	rs2287556	C	G	1586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=42;PP=1326;SC=TGGGAGCTGTCCCCTCCCACG;SOR=4.047;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=47;WE=108956618;WS=108956600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	108960906	rs10861945	G	T	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=396;SC=TTTTTTATTGGCTGGCCCTCA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=108960914;WS=108960896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	108961293	rs888546	C	T	2078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=31;PP=1732;SC=ATTTCTAAACCTCACAAATAT;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=27;TCR=31;TR=58;WE=108961301;WS=108961283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr12	108961354	rs888547	T	C	2836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=18;PP=2400;SC=ATGAGGAAGCTAAGGCTTGGG;SOR=2.448;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=63;TCR=18;TR=81;WE=108961362;WS=108961344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr12	108961383	rs888548	A	G	2526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=21;PP=1913;ReadPosRankSum=1.574;SC=CCCACATCACATGGCTAATAA;SOR=1.028;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=65;TCR=21;TR=85;WE=108961391;WS=108961373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,90:0.99:91
chr12	108985785	rs73191224	C	T	3168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.592;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=50;PP=2564;ReadPosRankSum=0.389;SC=GGTAATAGGCCGAGGCCTTCT;SOR=0.633;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=178;TCF=103;TCR=75;TR=118;WE=108985793;WS=108985775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,118:0.67:177
chr12	108985945	rs7975237	A	G	3028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.329;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.97;MQRankSum=-0.662;NF=34;NR=76;PP=2344;ReadPosRankSum=-0.508;SC=CCCCAGGGTTATGGGCTGGGG;SOR=0.444;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=159;TCF=46;TCR=113;TR=110;WE=108985953;WS=108985935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,114:0.69:166
chr12	109017898	rs2228315	C	T	4657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.612;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=97;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.315;SC=TGTTCCTCAGCATTTCTGGAG;SOR=0.572;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=259;TCF=114;TCR=145;TR=177;WE=109017906;WS=109017888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,180:0.68:264
chr12	109025432	rs8179115	T	C	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=365;ReadPosRankSum=-0.032;SC=CCCCCCTCCCTACCCTCCACC;SOR=0.598;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=19;WE=109025440;WS=109025430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr12	109042354	rs139820945	G	T	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=1.813;SC=AACCAGCCAAGCACCCCTGCA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=7;WE=109042362;WS=109042344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr12	109050968	rs74939224	C	T	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.690;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=178;ReadPosRankSum=0.903;SC=GACAATCAGGCGTTTAGAAAA;SOR=1.371;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=55;TCF=47;TCR=8;TR=13;WE=109050976;WS=109050958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,15:0.27:56
chr12	109182049	rs3741778	T	C	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.295;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=39;PP=843;ReadPosRankSum=0.192;SC=CAATCTCCTGTGTCCGCTGCT;SOR=0.581;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=186;TCF=59;TCR=127;TR=58;WE=109182057;WS=109182039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,62:0.33:186
chr12	109186023	rs149188196	G	T	2456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.698;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=26;PP=1955;ReadPosRankSum=2.203;SC=GGGATGGAAGGGATGGGGTGT;SOR=0.814;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=155;TCF=113;TCR=42;TR=97;WE=109186031;WS=109186013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,98:0.64:154
chr12	109194449	rs3217206	TC	T	121.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=2;PP=135;SC=CCCGTTAGGATCCCCCCTCCC;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=109194457;WS=109194439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	109201326	rs1549087	T	C	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=125;ReadPosRankSum=0.432;SC=CCAATGCAGGTTCAGGGTCGG;SOR=0.175;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=7;WE=109201334;WS=109201316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr12	109211031	rs12316621	T	C	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.636;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=430;ReadPosRankSum=-1.426;SC=GTGTTCTACCTTTCCCTCTGG;SOR=0.399;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=54;TCF=6;TCR=48;TR=21;WE=109211039;WS=109211021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,23:0.42:55
chr12	109219903	rs6539455	C	G	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=380;ReadPosRankSum=-0.522;SC=ACGCTGGAAACAGCCAACCAT;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=38;TCR=26;TR=22;WE=109219911;WS=109219893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,23:0.33:69
chr12	109270506	rs7136681	A	G	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.430;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=0;PP=593;ReadPosRankSum=-1.230;SC=CTCATCTAGCACACAGACACC;SOR=2.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=93;TCF=90;TCR=3;TR=36;WE=109270514;WS=109270496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,36:0.38:95
chr12	109270730	rs78387138	A	G	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=552;ReadPosRankSum=-0.568;SC=TGATTGATCAATTGATTGATT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=1;TCR=68;TR=28;WE=109270738;WS=109270720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,29:0.39:74
chr12	109293109	rs11420034	G	GA	926.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=9.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=0.000;QD=4.75;ReadPosRankSum=1.093;SOR=1.366;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,56:0.29:195
chr12	109293320	rs3918347	A	G	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=289;ReadPosRankSum=0.501;SC=TTTTCAGGGAACAGTCATGTC;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=13;WE=109293328;WS=109293310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr12	109309424	rs4964773	T	C	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.567;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=277;ReadPosRankSum=-1.133;SC=ATTTCTTCTGTCCTCGGGTGT;SOR=0.321;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=62;TCF=45;TCR=17;TR=18;WE=109309432;WS=109309414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,19:0.28:68
chr12	109331162	rs3918305	C	T	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=361;ReadPosRankSum=-0.181;SC=TACAGATGCACGGGAGATGGG;SOR=0.775;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=83;TCF=14;TCR=69;TR=25;WE=109331170;WS=109331152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,26:0.30:87
chr12	109338835	rs36131538	C	T	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=538;ReadPosRankSum=2.951;SC=AACCTCCTGCCGGAATCCACA;SOR=0.610;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=22;WE=109338843;WS=109338825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr12	109339023	rs36191519	C	T	2513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.620;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=55;PP=1801;ReadPosRankSum=2.719;SC=AATTTGCAGCCGACATTCCTC;SOR=0.778;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=147;TCF=54;TCR=93;TR=86;WE=109339031;WS=109339013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,96:0.61:157
chr12	109354632	rs36181716	T	C	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.973;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=609;ReadPosRankSum=-2.306;SC=TAACTCCTGATCCAGACCATG;SOR=3.026;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=27;WE=109354640;WS=109354622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr12	109371381	rs149284306	C	A	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.193;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=30;PP=712;ReadPosRankSum=0.229;SC=CCCTCTCTACCCATTGCCAAG;SOR=2.080;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=53;TCF=8;TCR=45;TR=33;WE=109371389;WS=109371371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
chr12	109371442	rs36182807	G	T	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=231;ReadPosRankSum=1.105;SC=TTAAAACCATGCATTACCATT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=11;WE=109371450;WS=109371432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr12	109458559	.	A	ACCCCCCC	441.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=53.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=-1.473;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.751;SOR=5.889;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr12	109458569	rs11612998	A	C	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=36.261;HP=15;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-2.109;NF=26;NR=0;PP=368;ReadPosRankSum=-3.397;SC=ACCCCCCCCCACCCCCCTTGC;SOR=5.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=26;WE=109458577;WS=109458549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr12	109490426	rs140371213	C	CCGGCGG	731.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.623;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=602;ReadPosRankSum=1.842;SC=ATCCCTCGGTCCGGCGGCGGC;SOR=0.010;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=9;WE=109490434;WS=109490416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr12	109511144	rs7967182	T	C	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=146;ReadPosRankSum=1.019;SC=TATTTTTTCTTAAGAGGTAGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=7;WE=109511152;WS=109511134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr12	109511256	rs7967322	T	C	1684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.344;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=10;PP=1394;ReadPosRankSum=1.323;SC=CACCTCACCCTACATCCAATC;SOR=1.101;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=89;TCF=73;TCR=16;TR=60;WE=109511264;WS=109511246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,61:0.67:91
chr12	109530278	rs145676752	G	GCA	1746.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.018;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.972;NF=46;NR=7;PP=1840;ReadPosRankSum=0.424;SC=AGCCCTCAATGCACACACACA;SOR=0.937;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=117;TCF=99;TCR=18;TR=53;WE=109530287;WS=109530268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,62:0.54:115
chr12	109541171	rs2569987	T	C	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=162;ReadPosRankSum=0.167;SC=TGGATTTAGCTCCTGTTGCTG;SOR=0.086;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=9;WE=109541179;WS=109541161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr12	109547568	.	CA	C	543.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.051;ClippingRankSum=0.000;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=28.643;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQRankSum=-0.750;QD=5.61;ReadPosRankSum=-0.379;SOR=5.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,47:0.48:97
chr12	109547586	rs2878959	A	T	2670.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=19.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQRankSum=-2.055;QD=16.69;ReadPosRankSum=2.004;SOR=3.203;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,110:0.69:160
chr12	109547845	.	A	G	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=476;ReadPosRankSum=-0.836;SC=TCCACTGAAAATTTTCCTATT;SOR=0.368;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=21;WE=109547853;WS=109547835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr12	109577735	rs2878960	C	T	6953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.823;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=133;PP=2965;ReadPosRankSum=0.353;SC=ACTACTCCTCCGACGAGGACT;SOR=0.232;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=221;TCF=86;TCR=135;TR=219;WE=109577743;WS=109577725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,221:0.99:223
chr12	109605898	rs34285	C	T	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=773;ReadPosRankSum=-0.452;SC=CCCTCGCCTCCTTCCCCTGTG;SOR=0.830;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=12;TCR=43;TR=36;WE=109605906;WS=109605888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,36:0.63:57
chr12	109617865	rs11065772	T	C	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=141;ReadPosRankSum=-0.127;SC=TGATTGCTGATGTTAATCTGC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=9;WE=109617873;WS=109617855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr12	109625976	rs373209583	CTCCT	C	541.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=0.633;QD=28.51;ReadPosRankSum=-0.301;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr12	109629457	rs7135947	C	T	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.633;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=28;PP=1365;ReadPosRankSum=0.521;SC=CCATCCGAGGCGACTTTAGGA;SOR=0.453;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=104;TCF=64;TCR=40;TR=69;WE=109629465;WS=109629447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,72:0.65:111
chr12	109634834	rs17848802	A	G	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.427;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=201;ReadPosRankSum=-0.914;SC=GTCTCTGACCATGTTCGTTCT;SOR=0.369;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=48;TCR=12;TR=19;WE=109634842;WS=109634824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,16:0.28:58
chr12	109635031	rs2268393	A	G	1914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=44;PP=1495;SC=AAAACACAGCACTGGCCTGTG;SOR=2.546;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=13;TCR=44;TR=57;WE=109635039;WS=109635021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr12	109635076	rs2268392	T	C	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=33;PP=814;SC=GGTGCCTTTCTGGTAAATTCT;SOR=3.967;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=37;WE=109635084;WS=109635066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	109637188	rs7299171	G	C	3346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=34;PP=2510;SC=CTCCCTACCCGACTCCTCCTC;SOR=1.588;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=67;TCR=35;TR=101;WE=109637196;WS=109637178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr12	109639521	rs2284691	G	A	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.703;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=159;ReadPosRankSum=-0.354;SC=GTGGCTCCACGGCCCAAGTGC;SOR=0.011;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=10;WE=109639529;WS=109639511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,10:0.27:37
chr12	109644447	rs12818490	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.46;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=55;ReadPosRankSum=-0.674;SC=CCTGCCTCCCGTTCTGCCCGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=4;WE=109644455;WS=109644444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr12	109670468	rs3742027	T	C	7122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=105;PP=2965;SC=TGCCATCACCTTACAGGATGA;SOR=0.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=209;TCF=103;TCR=106;TR=208;WE=109670476;WS=109670458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr12	109670657	rs3742026	G	C	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=123;ReadPosRankSum=-0.699;SC=ATGGGGGCTGGGCAGACTTCC;SOR=0.527;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=12;WE=109670665;WS=109670647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr12	109672951	rs7138373	T	G	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=120;ReadPosRankSum=-1.378;SC=ATTTGCCTATTCTGGACGTTT;SOR=0.169;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=9;WE=109672959;WS=109672941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr12	109675029	rs2241220	T	C	4599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=36;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.644;SC=AGCTGGAACTTAACCGGATGC;SOR=1.002;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=143;TCF=107;TCR=36;TR=141;WE=109675037;WS=109675019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,143:0.99:144
chr12	109683575	rs10744772	A	G	1467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=31;PP=1133;SC=GCGGAGCCTAACCCCTGGCTG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=40;WE=109683583;WS=109683565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	109683871	rs118115444	C	T	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=574;ReadPosRankSum=-2.346;SC=CTCTGGCCTGCGCAACAGAGC;SOR=0.269;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=25;WE=109683879;WS=109683861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr12	109685545	rs2284689	A	G	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=19;PP=498;SC=AATTTTGCTCATGGTTAATTT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=109685553;WS=109685535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	109691991	rs2075259	A	G	10321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=224;NR=86;PP=2965;SC=ACCACAGACTAAGTCAGAGAC;SOR=1.932;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=311;TCF=225;TCR=86;TR=310;WE=109691999;WS=109691981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,317:1.00:317
chr12	109694230	rs10849967	T	G	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=154;ReadPosRankSum=-1.519;SC=TCAGCCAGCCTCCTCCTGAGG;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=10;WE=109694238;WS=109694220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr12	109695891	rs11066004	A	G	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=75;ReadPosRankSum=1.225;SC=AAAGGGCACCAATAGGTCTGC;SOR=0.250;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=7;WE=109695899;WS=109695881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr12	109696838	rs2075260	G	A	8976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.99;NF=146;NR=135;PP=2965;SC=CGCCCAGGCCGTCAAGGACTT;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=281;TCF=146;TCR=135;TR=281;WE=109696846;WS=109696828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr12	109697796	rs2075261	A	G	4218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=61;PP=2965;SC=CCGAGGTAAGAGTCTGATGAG;SOR=0.774;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=125;TCF=64;TCR=61;TR=125;WE=109697804;WS=109697786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr12	109701959	rs35795929	CA	C	480.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=1.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.449;QD=7.18;ReadPosRankSum=-1.536;SOR=1.140;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,32:0.48:67
chr12	109704177	rs2075262	G	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.087;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=259;ReadPosRankSum=0.413;SC=ACCGTGGCCCGCCCAGCCACT;SOR=1.345;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=15;WE=109704185;WS=109704167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr12	109717697	rs10774641	A	G	3211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=46;PP=2407;ReadPosRankSum=-2.296;SC=AGTGTGTCCAAGCTGAATCCC;SOR=0.715;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=160;TCF=90;TCR=70;TR=109;WE=109717705;WS=109717687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,114:0.68:167
chr12	109723077	rs10774643	T	C	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.31;MQRankSum=-0.524;QD=24.28;ReadPosRankSum=1.803;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr12	109723077	.	TGT	CGC	296	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=23;MQ=58.47;NF=6;NR=0;PP=296;QD=58.2446458104;SC=TGTGTGTGTGTGTGCGCGCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=109723087;WS=109723067;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,6:0.60:10
chr12	109723079	rs10774644	T	C	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQRankSum=-0.473;QD=22.07;ReadPosRankSum=0.019;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr12	109725601	rs66482033	G	T	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=406;ReadPosRankSum=-1.128;SC=GCCAGCCCAAGGCAGGGTGTC;SOR=1.022;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=18;WE=109725609;WS=109725591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr12	109826634	rs11611277	C	A	1179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.992;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=34;PP=923;ReadPosRankSum=1.494;SC=AGCGTTTCAGCGAGAACCTCA;SOR=0.519;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=199;TCF=76;TCR=123;TR=57;WE=109826642;WS=109826624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,57:0.28:206
chr12	109835590	rs11611358	A	G	1684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=39;PP=1217;ReadPosRankSum=0.556;SC=GATTTGGGAAATACATGGATA;SOR=0.673;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=205;TCF=95;TCR=110;TR=74;WE=109835598;WS=109835580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,76:0.36:212
chr12	109843594	rs9888353	G	A	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=336;ReadPosRankSum=-0.126;SC=TGGTTCTGTGGGCTCAGGTGT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=16;WE=109843602;WS=109843584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr12	109844432	rs11066505	A	G	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=26;ReadPosRankSum=0.135;SC=TCCAGCCTGGATGACAGAGTG;SOR=0.307;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=3;WE=109844440;WS=109844422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr12	109844702	rs12425103	C	T	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=194;ReadPosRankSum=-1.311;SC=GCCAGCCCTCCCTGCTGCTGC;SOR=0.733;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=12;WE=109844710;WS=109844692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr12	109845778	rs75978659	C	CATT	1583.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.871;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.079;NF=4;NR=31;PP=1528;ReadPosRankSum=-1.096;SC=TTATAATCATCGTTTCTTTAA;SOR=0.497;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=100;TCF=15;TCR=85;TR=35;WE=109845786;WS=109845768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,44:0.40:110
chr12	109848000	rs7967632	C	G	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.34;ReadPosRankSum=-0.163;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr12	109848567	rs7315991	T	C	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.467;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=685;ReadPosRankSum=-1.868;SC=GAATCATATCTATTCTGGTGA;SOR=0.316;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=95;TCF=56;TCR=39;TR=33;WE=109848575;WS=109848557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,34:0.35:98
chr12	109883374	rs3825393	T	C	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.649;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=597;ReadPosRankSum=0.142;SC=GACACTGGACTGGAAGAACAA;SOR=1.107;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=129;TCF=81;TCR=48;TR=40;WE=109883382;WS=109883364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,40:0.30:133
chr12	109893919	.	T	G	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-8.390;ClippingRankSum=0.000;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.103;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;PP=636;ReadPosRankSum=0.493;SC=CTCGAGGCTCTTACCTTGGTC;SOR=0.227;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=127;TCF=91;TCR=36;TR=45;WE=109893927;WS=109893909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,42:0.33:127
chr12	110029080	rs104895304	T	C	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=9.346;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.33;ReadPosRankSum=-0.216;SOR=2.139;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,13:0.21:62
chr12	110221631	rs10774894	G	C	2688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=64;PP=2344;ReadPosRankSum=1.322;SC=GGTGGAGAGAGAGCGTGCGTA;SOR=1.683;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=82;TCF=17;TCR=65;TR=80;WE=110221639;WS=110221621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,81:0.99:82
chr12	110231717	rs10850750	C	G	1621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=23;PP=1314;ReadPosRankSum=-0.977;SC=GTGGGGGGCACGGGGGCCAGG;SOR=0.668;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=98;TCF=60;TCR=38;TR=61;WE=110231725;WS=110231707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,61:0.62:99
chr12	110238481	rs1344554	G	A	4743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.518;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=104;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.335;SC=GGGCCTGGGCGTGGACATCAG;SOR=0.630;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=245;TCF=97;TCR=148;TR=174;WE=110238489;WS=110238471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,182:0.71:255
chr12	110240838	rs3825394	T	G	3660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=44;PP=2727;SC=ATGAACTCCCTCATGTTGCCG;SOR=1.347;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=78;TCR=44;TR=122;WE=110240846;WS=110240828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr12	110293678	rs3782893	G	C	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=261;ReadPosRankSum=-0.530;SC=CAGGAACATGGGCGCCCCAGA;SOR=1.426;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=16;WE=110293686;WS=110293668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr12	110296095	rs4766488	G	C	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=203;ReadPosRankSum=0.757;SC=CTGGGCCCTAGGTGGATTCTC;SOR=0.299;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=13;WE=110296103;WS=110296085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr12	110341933	rs10774978	A	G	1867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.780;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=39;PP=1437;ReadPosRankSum=-1.239;SC=AAATCAGCCAAAGAAGAGCAG;SOR=0.382;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=106;TCF=42;TCR=64;TR=69;WE=110341941;WS=110341923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,70:0.64:109
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chr12	110342627	rs57860034	T	C	1539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.418;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=48;PP=1251;ReadPosRankSum=-0.577;SC=CATTGATTTATCTAAGTAGAT;SOR=1.120;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=85;TCF=9;TCR=76;TR=53;WE=110342635;WS=110342617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,54:0.63:86
chr12	110342685	rs16940657	C	T	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=286;ReadPosRankSum=-1.049;SC=TATCTTGTACCGGGTTGAAAC;SOR=0.627;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=14;WE=110342693;WS=110342675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr12	110344240	rs2271320	C	T	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.60;ReadPosRankSum=-0.366;SOR=0.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr12	110344287	rs2271319	C	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.550;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=80;ReadPosRankSum=-0.792;SC=GCCACGTTCCCGCAGGTGGCA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=110344295;WS=110344277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr12	110344339	rs2271318	T	C	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.853;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=469;ReadPosRankSum=0.467;SC=CCCATCTGTCTGGTGAGGAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=20;WE=110344347;WS=110344329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr12	110344552	rs57957298	G	A	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=337;ReadPosRankSum=-0.326;SC=GTTAAGGAGTGTAGTGTACTC;SOR=0.569;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=18;WE=110344560;WS=110344542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr12	110345232	rs2271317	A	T	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=465;ReadPosRankSum=1.081;SC=TCAGGCAGGAACTGCCTGGGC;SOR=0.368;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=24;WE=110345240;WS=110345222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,27:0.69:39
chr12	110345305	rs3830479	A	ACCT	2130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.101;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=18;PP=1795;ReadPosRankSum=0.324;SC=ACAGATATTGACCTGTGTTCA;SOR=0.387;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=76;TCF=43;TCR=33;TR=39;WE=110345313;WS=110345295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,53:0.62:86
chr12	110346787	rs1567471	T	A	1544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.086;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=37;PP=1146;ReadPosRankSum=0.773;SC=GCCTCTTTTGTAAAAAAGGCC;SOR=0.420;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=92;TCF=27;TCR=65;TR=55;WE=110346795;WS=110346777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,57:0.62:92
chr12	110352361	rs16940680	G	A	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.476;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=453;ReadPosRankSum=-1.244;SC=GGAGGTGAGAGAGTTGGCTCG;SOR=1.911;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=20;WE=110352369;WS=110352351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr12	110403264	rs10851035	C	G	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=9;PP=936;ReadPosRankSum=1.812;SC=AACCTGCATTCAGAGTAGGTA;SOR=1.314;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=41;WE=110403272;WS=110403254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,41:0.57:72
chr12	110405226	rs73419574	C	T	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.060;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=732;ReadPosRankSum=0.605;SC=GAAATATTAGCGATAGACAAA;SOR=1.041;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=53;TCF=29;TCR=24;TR=37;WE=110405234;WS=110405216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,40:0.69:58
chr12	110418635	rs7960775	A	G	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=0;PP=519;SC=ATTAAAAGCCATATGTATAGC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=110418643;WS=110418625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	110418891	rs56017297	A	C	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.926;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=34;PP=1222;ReadPosRankSum=0.786;SC=ATTGCTCACTATTCACTGACT;SOR=0.920;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=77;TCF=26;TCR=51;TR=50;WE=110418899;WS=110418881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,51:0.64:80
chr12	110427301	rs2271321	G	A	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=54;ReadPosRankSum=-0.674;SC=ACTTACTCCTGCTGGGTGGCC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=110427309;WS=110427291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr12	110429632	rs16940760	G	A	1698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.798;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=53;PP=1406;ReadPosRankSum=0.757;SC=GATGGCAAAAGATGACTGAAG;SOR=0.455;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=86;TCF=5;TCR=81;TR=57;WE=110429640;WS=110429622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,58:0.67:87
chr12	110434033	.	T	G	1501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.499;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=38;PP=1121;ReadPosRankSum=-0.528;SC=TCGACATGGCTCCCACCTCCC;SOR=0.631;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=94;TCF=36;TCR=58;TR=63;WE=110434041;WS=110434023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,63:0.66:96
chr12	110449739	rs3759385	A	G	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=517;ReadPosRankSum=-0.907;SC=TACTTGAAATATCTGTCAAGC;SOR=1.697;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=18;WE=110449747;WS=110449731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr12	110456175	rs2302689	A	G	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.108;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=14;PP=882;ReadPosRankSum=-1.581;SC=GAATATGCCCAAATGATGTCT;SOR=1.435;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=76;TCF=48;TCR=28;TR=48;WE=110456183;WS=110456165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,53:0.68:78
chr12	110473899	rs113289184	GTGT	G	595.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.884;NF=14;NR=0;PP=538;ReadPosRankSum=-1.761;SC=TCCCACTTAGGTGTTGTTTTT;SOR=2.948;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=14;WE=110473909;WS=110473889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
chr12	110474147	rs79504243	G	A	2147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.737;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=67;PP=1682;ReadPosRankSum=-0.062;SC=ATTGACTGACGTGACTCTGGA;SOR=1.994;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=115;TCF=20;TCR=95;TR=77;WE=110474155;WS=110474137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,79:0.66:119
chr12	110486272	rs7137233	T	C	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.739;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=299;ReadPosRankSum=0.617;SC=GAGGCCAAGGTACAGCCACGG;SOR=1.865;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=14;WE=110486280;WS=110486262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr12	110489134	rs77981767	C	A	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-6.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.558;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=40;PP=984;ReadPosRankSum=0.956;SC=TCATACCTGCCTCATGAATTG;SOR=0.497;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=142;TCF=33;TCR=109;TR=55;WE=110489142;WS=110489124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,59:0.39:150
chr12	110495171	rs41436646	C	G	1580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=42;PP=1209;ReadPosRankSum=0.264;SC=ATATCCCTTACCTCATGACTA;SOR=0.693;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=87;TCF=22;TCR=65;TR=57;WE=110495179;WS=110495161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,58:0.67:86
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chr12	110572913	rs56076213	G	A	2704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.730;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=73;PP=2086;ReadPosRankSum=1.331;SC=AAGCATGAGTGTACATCTGAG;SOR=0.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=141;TCF=31;TCR=110;TR=93;WE=110572921;WS=110572903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,98:0.68:145
chr12	110573340	rs12300649	G	T	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=224;ReadPosRankSum=1.090;SC=AGACGTTCACGTTCCTTTTGC;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=10;WE=110573348;WS=110573330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr12	110618512	rs7299230	A	T	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=352;ReadPosRankSum=1.102;SC=TACAGACATGACATATAAGTT;SOR=1.519;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=14;WE=110618520;WS=110618502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr12	110778383	rs11065631	A	G	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=0;PP=967;ReadPosRankSum=1.589;SC=ACCTGTCTCAATGTTTAACTG;SOR=1.565;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=57;TCR=0;TR=39;WE=110778391;WS=110778373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,34:0.67:51
chr12	110824112	rs56130410	C	T	2690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.421;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=26;PP=2189;ReadPosRankSum=-1.087;SC=CACTGTCTTCCTGCCCCAAGA;SOR=1.700;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=140;TCF=94;TCR=46;TR=94;WE=110824120;WS=110824102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,96:0.68:142
chr12	110826208	rs28569834	TC	GG	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=960;ReadPosRankSum=0.998;SC=ATCACTCTCTTCAGGGGAACT;SOR=0.379;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=18;WE=110826217;WS=110826198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr12	110826463	rs28670753	C	T	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.348;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=37;PP=919;ReadPosRankSum=0.527;SC=GCAAAATAAGCGTATATTGCA;SOR=1.015;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=9;TCR=58;TR=43;WE=110826471;WS=110826453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,44:0.65:68
chr12	110905869	rs7958683	G	A	9057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=155;NR=147;PP=2965;SC=AGGGTTCCCAGTACACACACC;SOR=0.812;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=304;TCF=155;TCR=149;TR=302;WE=110905877;WS=110905859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,301:1.00:301
chr12	110906880	rs7963504	C	A	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.85;ReadPosRankSum=-1.534;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr12	110922742	rs34734286	T	C	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.017;NF=11;NR=1;PP=203;ReadPosRankSum=0.157;SC=CCTGACCTCGTGATCCACCCA;SOR=0.207;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=12;WE=110922750;WS=110922732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr12	110931054	rs56017652	C	T	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=35;PP=852;ReadPosRankSum=0.420;SC=AAGAAAAAGACGTAAGAAAAT;SOR=1.214;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=63;TCF=4;TCR=59;TR=37;WE=110931062;WS=110931044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,41:0.60:68
chr12	110939421	rs6606687	T	C	8524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=164;NR=84;PP=2965;SC=TGTTCTGCATTCGAGAGGCCA;SOR=1.537;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=249;TCF=165;TCR=84;TR=248;WE=110939429;WS=110939411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr12	110939583	.	C	G	4807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.452;ClippingRankSum=0.000;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.558;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=104;PP=2962;ReadPosRankSum=0.206;SC=TGTCTCGTGACAGGTCGGGCT;SOR=0.425;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=260;TCF=90;TCR=170;TR=166;WE=110939591;WS=110939573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,169:0.65:261
chr12	110946121	rs73191828	G	A	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=536;ReadPosRankSum=0.983;SC=ACCTGCCCCAGGGGGAGTACT;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=21;WE=110946129;WS=110946111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr12	110956370	rs56379265	G	A	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=210;ReadPosRankSum=-0.531;SC=GTTAGGGTACGTAGGGCAGGA;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=10;WE=110956378;WS=110956360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr12	110968180	rs149557420	TAATG	T	1041.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.747;NF=21;NR=2;PP=1008;ReadPosRankSum=-0.390;SC=GTTGGACCAATAATGAAGGTT;SOR=0.324;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=23;WE=110968191;WS=110968170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr12	110968344	rs201984831	C	A	3174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-6.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.902;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=51;PP=2285;ReadPosRankSum=-0.129;SC=CTTGCATGTTCTTTGGAGCAG;SOR=0.409;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=166;TCF=97;TCR=69;TR=115;WE=110968352;WS=110968334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,123:0.69:178
chr12	110974890	rs10849900	T	C	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.122;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=46;PP=803;ReadPosRankSum=-0.581;SC=TGATGTCATCTGGCTTTCCAC;SOR=0.914;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=192;TCF=56;TCR=136;TR=62;WE=110974898;WS=110974880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,63:0.31:200
chr12	111082694	.	G	A	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.950;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=9.296;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.34;ReadPosRankSum=1.190;SOR=0.119;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr12	111093020	rs138065255	A	G	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=14;PP=923;ReadPosRankSum=0.386;SC=AAGACCCCAGAAGAGCTGTCA;SOR=0.678;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=168;TCF=117;TCR=51;TR=50;WE=111093028;WS=111093010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,51:0.29:175
chr12	111100040	rs112306425	GA	G	144.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.611;NF=0;NR=10;PP=137;ReadPosRankSum=0.777;SC=TTGTCAATAGGAAAAAAAAAT;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=10;WE=111100048;WS=111100030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr12	111100627	rs73194012	T	C	1635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.888;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=41;PP=1182;ReadPosRankSum=-0.533;SC=AGTTAAAAGATATACTACAGA;SOR=0.940;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=22;TCR=65;TR=55;WE=111100635;WS=111100617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,61:0.63:97
chr12	111100677	rs73194013	T	C	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=447;ReadPosRankSum=-1.180;SC=AGACAAAGAGTAACCAGAATA;SOR=0.671;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=20;WE=111100685;WS=111100667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr12	111121119	rs1018134	G	A	1540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.758;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=46;PP=1103;ReadPosRankSum=0.013;SC=GCTGCCATCTGCCTTGGTATG;SOR=0.406;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=68;TCF=3;TCR=65;TR=48;WE=111121127;WS=111121109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,57:0.73:78
chr12	111160003	rs1973505	G	A	4385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.850;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=77;PP=2962;ReadPosRankSum=1.153;SC=CAAACTCTCCGCAATAATTGG;SOR=0.645;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=251;TCF=126;TCR=125;TR=161;WE=111160011;WS=111159993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,165:0.64:259
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chr12	111375170	rs1056618	A	G	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.03;ReadPosRankSum=0.890;SOR=0.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,9:0.17:53
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chr12	111747963	rs3742007	C	T	2121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.315;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=36;PP=1699;ReadPosRankSum=-1.265;SC=CTCCCAGCCCCGGGCAGCCCC;SOR=0.324;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=115;TCF=63;TCR=52;TR=76;WE=111747971;WS=111747953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,78:0.68:115
chr12	111757647	rs10849933	A	C	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=3;PP=149;ReadPosRankSum=1.192;SC=GTGGCTGCCTAATATTCTGCC;SOR=0.093;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=8;WE=111757655;WS=111757637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr12	111758620	rs4766505	A	G	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.424;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=5;PP=200;ReadPosRankSum=1.046;SC=GCTCTGGGAGAAGATGTCGGA;SOR=0.495;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=9;WE=111758628;WS=111758610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr12	111760251	rs3742006	G	C	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.175;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=457;ReadPosRankSum=-0.306;SC=AGGGCAGCGTGAGCGACATGC;SOR=1.352;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=24;WE=111760259;WS=111760241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr12	111785586	rs3803167	T	C	1975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=26;PP=1433;ReadPosRankSum=-1.421;SC=TGGAGGAGGATGCTGAGGAAG;SOR=0.679;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=104;TCF=69;TCR=35;TR=76;WE=111785594;WS=111785576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,79:0.73:108
chr12	111786082	rs6490073	G	C	4252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=65;PP=2965;SC=CATTTACCGAGTAGAGCGGGC;SOR=0.738;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=67;TCR=65;TR=131;WE=111786090;WS=111786072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr12	111799524	rs11576045	C	CTGT	1081.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=868;ReadPosRankSum=0.078;SC=CGGTGTGCGGCTTTTTCTCCG;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=20;WE=111799532;WS=111799514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,27:0.84:32
chr12	111799681	rs874286	T	C	2771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.701;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=36;PP=2283;ReadPosRankSum=-0.396;SC=GCCCCAGGCCTAGGGGCCAAG;SOR=0.616;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=90;TCR=51;TR=100;WE=111799689;WS=111799671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,100:0.70:142
chr12	111800826	rs139032867	TGCCACCCCC	T	1567.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=2971;ReadPosRankSum=-0.595;SC=GGCAGGGCCATGCCACCCCCG;SOR=0.929;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=28;WE=111800842;WS=111800816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,39:0.78:50
chr12	111884608	rs3184504	T	C	3207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.557;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=48;PP=2236;ReadPosRankSum=0.883;SC=GGAGGTCCGGTGGTGCACACG;SOR=0.612;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=190;TCF=114;TCR=76;TR=118;WE=111884616;WS=111884598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,126:0.64:198
chr12	111885351	rs111340708	ATGGGG	A	2118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.171;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.977;NF=23;NR=15;PP=1720;ReadPosRankSum=0.109;SC=TAGCCAAGGTATGGGGTGGGG;SOR=1.031;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=73;TCF=39;TCR=34;TR=38;WE=111885363;WS=111885341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,54:0.77:70
chr12	111894072	rs2073950	C	T	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.512;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=34;PP=802;ReadPosRankSum=0.749;SC=TGCAAAGCGACAGGAAAGAAT;SOR=1.826;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=58;TCF=3;TCR=55;TR=35;WE=111894080;WS=111894062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,35:0.59:59
chr12	111895203	rs2301622	C	G	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.715;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=544;ReadPosRankSum=1.342;SC=CAACCGATGTCTGACAACCTC;SOR=1.765;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=28;WE=111895211;WS=111895193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,29:0.63:46
chr12	111895272	rs2301621	C	T	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.142;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=309;ReadPosRankSum=0.110;SC=GCATAACTCACGCCACTACCA;SOR=2.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=14;WE=111895280;WS=111895262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr12	111993571	rs11610849	G	A	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=364;ReadPosRankSum=1.713;SC=AAACAGTCAAGTTATCTATGA;SOR=0.141;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=16;WE=111993579;WS=111993561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr12	111993589	.	C	G	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.958;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=483;ReadPosRankSum=0.651;SC=TGACAAAATTCAAAAGAAGGG;SOR=0.334;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=21;WE=111993597;WS=111993579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr12	112036753	rs10560189	GGCT	G	315.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.898;NF=9;NR=13;PP=1244;ReadPosRankSum=-0.942;SC=CGCGGGCGGCGGCTGCTGCTG;SOR=0.673;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=22;WE=112036767;WS=112036743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr12	112036759	.	T	G	246	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=23;MQ=59.76;NF=4;NR=7;PP=246;QD=25.5246556861;SC=CGGCGGCTGCTGCTGCTGCTG;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=11;WE=112036767;WS=112036743;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,11:0.41:27
chr12	112036782	rs76696028	T	C	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=0.000;QD=8.93;ReadPosRankSum=0.435;SOR=1.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr12	112036797	rs4098854	C	T	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=44;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=173;ReadPosRankSum=0.198;SC=GCTGCTGCTGCTGCTGCTGCT;SOR=0.495;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=11;WE=112036805;WS=112036787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr12	112036929	rs695872	G	A	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.701;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=150;ReadPosRankSum=0.977;SC=GCGGGGACGCGCGGGCGCCGA;SOR=0.742;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=9;WE=112036937;WS=112036919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr12	112037000	rs695871	G	C	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.969;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=94;ReadPosRankSum=-0.361;SC=GGGAGAAGGAGGACGACGAAG;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=8;WE=112037008;WS=112036990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr12	112119387	rs368877992	CA	C	166.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=1.044;QD=5.95;ReadPosRankSum=1.025;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
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chr12	112235783	rs4646778	C	A	991.28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.366;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=2;PP=850;ReadPosRankSum=-0.206;SC=GACCTTGGTCCATTTCCCAGT;SOR=3.442;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=32;WE=112235791;WS=112235773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,34:0.89:38
chr12	112280773	rs3213628	G	T	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=365;ReadPosRankSum=-0.295;SC=TCCGACTCCCGCCAGCTTCCC;SOR=1.519;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=16;WE=112280781;WS=112280763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr12	112306495	rs34689630	G	GT	536.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.868;NF=26;NR=3;PP=715;ReadPosRankSum=-0.262;SC=ATGTTTCAGGGTTTTTTGTTT;SOR=0.399;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=29;WE=112306503;WS=112306485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr12	112318239	rs373700402	G	C	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.095;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=682;ReadPosRankSum=-0.316;SC=CCTTTGGTCTGACTCTTGACA;SOR=0.912;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=30;WE=112318247;WS=112318229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,32:0.51:63
chr12	112338539	rs3742000	T	C	4478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.859;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=90;PP=2962;ReadPosRankSum=1.298;SC=ATATCCTTGCTGTCCTTCTAG;SOR=0.348;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=257;TCF=141;TCR=116;TR=182;WE=112338547;WS=112338529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,181:0.69:262
chr12	112338734	rs3832867	T	TA	7980.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.697;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.761;NF=120;NR=92;PP=2933;ReadPosRankSum=-2.115;SC=ACAAGAGTGTTACAATTCAAT;SOR=0.910;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=331;TCF=183;TCR=148;TR=212;WE=112338742;WS=112338724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,244:0.66:368
chr12	112339015	rs12321677	G	A	4149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.329;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=89;PP=2962;ReadPosRankSum=0.092;SC=AAGTCTGCCTGAATTCCGCCT;SOR=0.934;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=209;TCF=79;TCR=130;TR=142;WE=112339023;WS=112339005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,151:0.68:222
chr12	112375990	rs3752630	A	C	1338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=28;PP=1090;ReadPosRankSum=0.412;SC=GCCATTTGACAAACTCGACAA;SOR=0.769;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=24;TCR=45;TR=43;WE=112375998;WS=112375980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,45:0.63:71
chr12	112416586	rs11066112	C	T	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.461;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=615;ReadPosRankSum=0.200;SC=CTTCCAGCCTCCAGAACTGTA;SOR=1.255;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=25;WE=112416594;WS=112416576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr12	112429469	rs12423126	C	G	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=424;ReadPosRankSum=-0.806;SC=TAAACAAATACGTCTCCACTT;SOR=0.551;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=19;WE=112429477;WS=112429459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr12	112441688	rs7313773	T	C	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=908;ReadPosRankSum=-0.969;SC=TAGAAGATGATTGATCATTAA;SOR=0.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=41;WE=112441696;WS=112441678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,43:0.62:69
chr12	112443017	rs10849992	C	T	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=551;ReadPosRankSum=0.236;SC=AATTGACGAACTTTGCTTATA;SOR=0.752;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=28;WE=112443025;WS=112443007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr12	112450754	rs11066128	T	C	1238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.997;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=8;PP=859;ReadPosRankSum=1.081;SC=TGGGTCAGGGTGGTGACGGAG;SOR=0.246;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=62;TCF=52;TCR=10;TR=40;WE=112450762;WS=112450744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,45:0.67:67
chr12	112451190	rs3832865	G	GC	747.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=690;ReadPosRankSum=-0.220;SC=GCGTGAGTCCGCCCCCCCAGT;SOR=0.685;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=58;TCF=43;TCR=15;TR=28;WE=112451198;WS=112451180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr12	112515912	rs74636821	T	C	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=226;ReadPosRankSum=-1.318;SC=TATATCCTTATGTGGAAATTT;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=11;WE=112515920;WS=112515902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr12	112530702	rs79624283	A	G	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5085;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.760;NF=20;NR=0;PP=397;ReadPosRankSum=-0.052;SC=GGCTGGTCTCAAACTCCTGAC;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=20;WE=112530710;WS=112530692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,20:0.87:23
chr12	112580071	rs7970397	C	T	1915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.056;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=47;PP=1507;ReadPosRankSum=0.580;SC=AGTCTCATGGCGGTCCCAGGT;SOR=1.093;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=91;TCF=31;TCR=60;TR=70;WE=112580079;WS=112580061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,71:0.75:95
chr12	112583447	rs79680080	A	C	1903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=40;PP=1544;ReadPosRankSum=0.412;SC=TACCCAGAGGAACTGCTGATT;SOR=0.668;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=101;TCF=43;TCR=58;TR=70;WE=112583455;WS=112583437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,70:0.69:101
chr12	112601250	rs2272308	G	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=222;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGCTGAGACAGGCCACTGCCG;SOR=0.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=10;WE=112601258;WS=112601240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr12	112608312	rs3215348	TCCC	T	1217.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.599;NF=1;NR=25;PP=914;ReadPosRankSum=-1.166;SC=TCCTTCCCAGTCCCCCCAAGA;SOR=1.225;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=26;WE=112608322;WS=112608302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,31:0.77:40
chr12	112610714	rs11066188	G	A	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.131;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=309;ReadPosRankSum=-0.433;SC=AGGGCACACCGGGATGACTGT;SOR=2.613;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=15;WE=112610722;WS=112610704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr12	112621886	rs3741993	C	T	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=0;PP=844;ReadPosRankSum=-0.618;SC=AGCCCCCAACCGCTCCACCAT;SOR=1.747;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=35;WE=112621894;WS=112621878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,36:0.69:52
chr12	112638688	.	CGTGTGT	C	665.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.39;QD=27.74;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr12	112638698	.	T	C	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.640;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.47;MQRankSum=0.756;QD=25.03;ReadPosRankSum=0.535;SOR=0.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr12	112641707	rs12423268	G	A	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=169;ReadPosRankSum=-0.165;SC=ATAGCTCTACGGGCTTTAACA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=112641715;WS=112641697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
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chr12	112668343	rs4767522	T	C	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=324;SC=AGTACTACAGTAAAGCAACTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=112668351;WS=112668341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	112685781	rs151176253	T	TAC	142.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.98;ReadPosRankSum=-0.976;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr12	112708331	rs10850023	T	C	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.976;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=27;PP=786;ReadPosRankSum=1.456;SC=GAATAGACCTTTGACTTACAA;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=49;TCF=4;TCR=45;TR=30;WE=112708339;WS=112708321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr12	112843363	rs2301723	G	A	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=76;ReadPosRankSum=-1.732;SC=TGTAATAAAAGTAGCTCTTAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=112843371;WS=112843353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr12	112843998	rs2233861	A	T	2777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.339;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=42;PP=2055;ReadPosRankSum=-0.266;SC=ACTTGTGGCAATAAGTGTCTA;SOR=0.800;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=145;TCF=77;TCR=68;TR=96;WE=112844006;WS=112843988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,104:0.66:158
chr12	112888273	.	G	C	3494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.511;ClippingRankSum=0.000;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.775;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=49;PP=2658;ReadPosRankSum=0.878;SC=AGATGTCATTGAGCTTAAATA;SOR=0.574;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=194;TCF=115;TCR=79;TR=115;WE=112888281;WS=112888263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,123:0.60:204
chr12	113313470	rs2891411	C	T	2786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.204;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=58;PP=2096;ReadPosRankSum=0.797;SC=TGTTTGTCTCCTCTCCCTGCT;SOR=0.799;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=170;TCF=80;TCR=90;TR=107;WE=113313478;WS=113313460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,111:0.63:177
chr12	113319471	rs886476	G	A	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=154;ReadPosRankSum=-0.590;SC=AGCACACAGCGTGGACCAACA;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=8;WE=113319479;WS=113319461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr12	113319600	rs2240194	C	T	1938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.119;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=13;PP=1544;ReadPosRankSum=0.525;SC=TGGATTCAAACGGCTTGGCTG;SOR=1.114;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=112;TCF=88;TCR=24;TR=70;WE=113319608;WS=113319590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,72:0.63:115
chr12	113319778	rs10850088	G	A	4278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=107;PP=2962;ReadPosRankSum=0.915;SC=CATCCTGTGAGTAGCAAAGCC;SOR=0.698;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=227;TCF=73;TCR=154;TR=157;WE=113319786;WS=113319768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,159:0.70:228
chr12	113325460	rs7979186	T	C	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=403;ReadPosRankSum=-0.054;SC=AGGTACTTGGTCCAGTGATAA;SOR=2.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=17;WE=113325468;WS=113325450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,18:0.82:22
chr12	113325629	rs4141253	T	C	3458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.898;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=52;PP=2507;ReadPosRankSum=0.912;SC=AGGACAAATTTGGCCACAATG;SOR=0.322;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=200;TCF=128;TCR=72;TR=130;WE=113325637;WS=113325619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,134:0.65:205
chr12	113328981	rs3741982	G	A	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=502;ReadPosRankSum=-1.880;SC=ATGTGGGTCTGGAGTCTCAGG;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=19;WE=113328989;WS=113328971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr12	113348870	rs1131454	G	A	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=23;PP=1041;ReadPosRankSum=-0.786;SC=GTTGACTGGCGGCTATAAACC;SOR=0.709;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=154;TCF=84;TCR=70;TR=53;WE=113348878;WS=113348860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,59:0.36:165
chr12	113357193	rs10774671	G	A	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.610;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=3;PP=556;ReadPosRankSum=0.659;SC=CACCCTTTCAGGCTGAAAGCA;SOR=1.739;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=68;TCF=55;TCR=13;TR=26;WE=113357201;WS=113357183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,28:0.40:70
chr12	113357209	rs1131476	G	A	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.862;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=5;PP=547;ReadPosRankSum=-0.605;SC=AAGCAACAGTGCAGACGATGA;SOR=1.280;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=83;TCF=66;TCR=17;TR=32;WE=113357217;WS=113357199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,33:0.40:83
chr12	113357237	rs1051042	G	C	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.779;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=733;ReadPosRankSum=-0.759;SC=GATCCCAGGAGGTATCAGAAA;SOR=0.568;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=113;TCF=79;TCR=34;TR=43;WE=113357245;WS=113357227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,44:0.38:116
chr12	113357442	rs2660	G	A	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.059;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=12;PP=370;ReadPosRankSum=-0.573;SC=GATCCAGAGAGGACAAAGCTC;SOR=0.461;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=23;WE=113357450;WS=113357432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,24:0.32:75
chr12	113369644	rs7968145	C	T	1508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=16;PP=1096;SC=ACAGGCTCCTCAATATGAGAG;SOR=1.473;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=45;WE=113369652;WS=113369634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	113369715	rs11352835	TA	T	699.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=624;ReadPosRankSum=0.161;SC=GAAGGAACTATACCAATAATT;SOR=0.674;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=50;TCF=12;TCR=38;TR=18;WE=113369723;WS=113369705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,23:0.36:64
chr12	113369759	rs7967461	G	C	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.107;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=77;ReadPosRankSum=0.940;SC=ACAGACAAGAGGAGCCTCATT;SOR=0.148;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=11;WE=113369767;WS=113369749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr12	113376320	rs3815178	C	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.228;HP=1;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=409;ReadPosRankSum=1.591;SC=TCCCCTTGCACCTGCGCCGGG;SOR=0.148;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=9;WE=113376339;WS=113376310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr12	113376331	rs1859331	C	A	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=409;ReadPosRankSum=1.624;SC=CTGCGCCGGGCGGCCATGGAC;SOR=0.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=22;TCF=12;TCR=10;TR=10;WE=113376339;WS=113376310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr12	113376388	rs1859330	G	A	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.234;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=315;ReadPosRankSum=-0.955;SC=GTGGCCAGAAGGCTGCAGCCG;SOR=0.990;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=16;WE=113376396;WS=113376378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr12	113376452	rs1859329	C	T	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=208;ReadPosRankSum=0.798;SC=TGGCCGCTGCCCTGAGGGAGC;SOR=0.610;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=33;TCF=17;TCR=16;TR=13;WE=113376460;WS=113376442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr12	113376543	rs3038120	C	CCAAAGGG	374.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=60.43;MQRankSum=1.171;NF=1;NR=5;PP=223;ReadPosRankSum=-0.929;SC=CTTTATGTGTCCAAAGGGGAG;SOR=0.904;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=6;WE=113376551;WS=113376533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr12	113385918	rs7961861	C	T	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.295;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=496;ReadPosRankSum=-1.515;SC=AGTGAGGGGGCCCCAGGACCC;SOR=0.426;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=68;TCF=10;TCR=58;TR=27;WE=113385926;WS=113385908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,29:0.39:74
chr12	113386616	rs34647135	T	C	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=358;ReadPosRankSum=-0.368;SC=ATTGGGTTGATGCAGAAACCA;SOR=0.606;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=64;TCR=1;TR=20;WE=113386624;WS=113386606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,20:0.30:66
chr12	113386950	rs2285932	T	C	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.877;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=375;ReadPosRankSum=-0.033;SC=AAAAGGCCATTGACATCATCT;SOR=0.283;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=97;TCF=38;TCR=59;TR=27;WE=113386958;WS=113386940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,28:0.27:103
chr12	113387034	rs3214199	A	AG	401.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=343;ReadPosRankSum=-0.517;SC=GTGGAGACACAGGGGGGACCC;SOR=0.693;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=14;WE=113387042;WS=113387024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr12	113398919	rs2072136	G	A	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.784;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=34;PP=1198;ReadPosRankSum=-0.439;SC=AGGTCTACTCGAGGCTCCTCA;SOR=0.500;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=159;TCF=85;TCR=74;TR=63;WE=113398927;WS=113398909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,66:0.40:164
chr12	113400824	rs113210418	CA	C	148.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.752;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=306;ReadPosRankSum=-0.355;SC=TCCCACTCCTCACTCTGCTTC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=113400834;WS=113400814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr12	113400826	rs61942232	C	T	157.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.385;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=298;ReadPosRankSum=-0.424;SC=CCACTCCTCACTCTGCTTCCC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=113400834;WS=113400814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr12	113405181	rs1557866	A	C	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=0;PP=544;ReadPosRankSum=-0.784;SC=CACTGGGACAACATGGGAGCC;SOR=0.642;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=83;TCF=82;TCR=1;TR=28;WE=113405189;WS=113405171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,27:0.31:86
chr12	113425154	rs1293767	C	G	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.496;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=331;ReadPosRankSum=-0.112;SC=GCCAAAGAAGCGGGTGCCAGA;SOR=0.360;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=18;WE=113425162;WS=113425144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr12	113435293	rs1293756	C	A	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.601;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=700;ReadPosRankSum=1.283;SC=CTAGATCCCCCAATGAGCTGC;SOR=1.400;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=142;TCF=90;TCR=52;TR=44;WE=113435301;WS=113435283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,44:0.30:145
chr12	113435450	rs1293755	A	T	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=31;PP=795;ReadPosRankSum=0.551;SC=TCAGAACCGTACTGGAGCTGA;SOR=0.456;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=156;TCF=57;TCR=99;TR=52;WE=113435458;WS=113435440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,54:0.35:156
chr12	113444418	rs929291	T	C	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.706;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=24;PP=820;ReadPosRankSum=0.553;SC=AAGGACAGTCTTTGTTCTGAC;SOR=0.606;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=121;TCF=51;TCR=70;TR=44;WE=113444426;WS=113444408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,44:0.36:122
chr12	113445768	rs1293746	G	A	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.717;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=632;ReadPosRankSum=0.429;SC=CCCTAGCCCCGTACTTTTCTT;SOR=0.826;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=129;TCF=48;TCR=81;TR=42;WE=113445776;WS=113445758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,43:0.33:132
chr12	113447199	rs34600329	GC	G	88.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=95;ReadPosRankSum=0.386;SC=AGCCCCCTAAGCCCCCACTAC;SOR=0.141;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=5;WE=113447207;WS=113447189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr12	113448288	rs15895	A	G	1523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.853;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=16;PP=1143;ReadPosRankSum=1.070;SC=AGAAACTTCTAGAGATCATCT;SOR=1.029;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=176;TCF=122;TCR=54;TR=61;WE=113448296;WS=113448278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,65:0.35:187
chr12	113530845	rs3217697	C	CAG	4816.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=30;PP=2934;SC=CTGCAGTTGGCAGAGAGGTAC;SOR=1.713;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=66;TCR=34;TR=86;WE=113530857;WS=113530835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr12	113530899	rs1628639	A	G	4151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=59;PP=2965;SC=GACAGAAGGCAAGCCAGGTCC;SOR=0.877;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=133;TCF=74;TCR=59;TR=131;WE=113530907;WS=113530889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr12	113531295	rs1625170	T	C	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.98;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	113531305	rs1674095	A	T	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.38;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	113533050	rs2243397	C	T	10001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=126;NR=184;PP=2965;SC=GCCCCCACACCCCTCCAACTC;SOR=1.074;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=312;TCF=127;TCR=185;TR=310;WE=113533058;WS=113533040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr12	113533124	rs2243396	C	T	10351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=143;NR=160;PP=2965;SC=CTGTCCCTCTCTGCAGGGCCC;SOR=0.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=304;TCF=144;TCR=160;TR=303;WE=113533132;WS=113533114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,317:1.00:317
chr12	113539822	rs1674101	A	G	2718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=59;PP=2190;SC=CGGCTGAGGGAACACAGCTTC;SOR=2.084;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=21;TCR=59;TR=80;WE=113539830;WS=113539812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	113541940	rs1613480	C	T	5510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=91;NR=69;PP=2965;SC=GGACGCCCCCCGCTCCCCATC;SOR=0.957;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=91;TCR=69;TR=160;WE=113541948;WS=113541930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr12	113544874	rs2468355	C	T	4118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.982;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=39;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.065;SC=GCTGAGAAGCCAGATGTGGCC;SOR=1.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=94;TCR=40;TR=132;WE=113544882;WS=113544864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,134:0.99:136
chr12	113545393	rs736285	A	G	1614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=9;PP=1308;SC=GTGCCACTGCACTCCAGCCTG;SOR=3.219;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=55;WE=113545401;WS=113545383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	113553408	rs1284878	C	T	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=159;SC=CCATTGAGGGCGGTGATGTCG;SOR=2.093;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=7;WE=113553416;WS=113553398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr12	113589598	.	C	CA	53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;FR=0.9996;HP=18;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=18;MQ=60.38;NF=4;NR=1;PP=53;QD=11.2;SC=AAACAAGTCTCAAAAAAAAAA;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=5;WE=113589606;WS=113589596;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,5:0.42:12
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chr12	113706847	rs7306525	C	T	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=258;ReadPosRankSum=-1.860;SC=CAGGAGAAAGCGGTATTCCTA;SOR=1.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=12;WE=113706855;WS=113706837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr12	113740442	rs7953252	A	G	2788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.250;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=41;PP=2190;ReadPosRankSum=0.314;SC=GACATGAGGTACCGTGTGGGC;SOR=0.573;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=169;TCF=103;TCR=66;TR=103;WE=113740450;WS=113740432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,105:0.61:173
chr12	113740467	rs7966103	G	A	3102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.537;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=53;PP=2349;ReadPosRankSum=1.918;SC=TCTAGGCACCGTGGCGTTTCG;SOR=0.623;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=195;TCF=108;TCR=87;TR=116;WE=113740475;WS=113740457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,118:0.60:197
chr12	113756706	rs2288364	C	G	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=534;ReadPosRankSum=-0.603;SC=CTGGGCAGCACTGAAGGGCAC;SOR=2.925;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=20;WE=113756714;WS=113756696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr12	113825392	rs12812648	C	T	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.867;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=214;ReadPosRankSum=-0.124;SC=GGGGTCCGGGCCCCAGGCAGA;SOR=0.053;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=14;WE=113825400;WS=113825382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,15:0.33:46
chr12	113826535	rs35106464	C	T	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=406;ReadPosRankSum=-0.055;SC=CTGGGGGCTTCGTTCTCTGAT;SOR=0.357;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=20;WE=113826543;WS=113826525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr12	113834864	rs12820484	T	C	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.645;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=535;ReadPosRankSum=0.682;SC=GCCTCCATTGTCTCATCTGTG;SOR=0.193;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=79;TCF=60;TCR=19;TR=32;WE=113834872;WS=113834854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,31:0.40:77
chr12	113837171	.	C	A	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.438;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.264;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=42;PP=1066;ReadPosRankSum=1.035;SC=GCTCTGGGATCAGTCCCAAGG;SOR=3.801;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=42;WE=113837179;WS=113837161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,42:0.76:55
chr12	113863514	rs16942799	A	T	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.982;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=44;PP=956;ReadPosRankSum=0.266;SC=AACCTCTCAAAGGGCTGAGCG;SOR=1.445;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=149;TCF=29;TCR=120;TR=50;WE=113863522;WS=113863504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,54:0.35:156
chr12	113863573	rs12831704	A	G	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.774;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=489;ReadPosRankSum=-1.032;SC=CGAGGTGGGCAGATCACTTGA;SOR=0.047;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=58;TCF=2;TCR=56;TR=24;WE=113863581;WS=113863563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chr12	113863963	rs12831817	C	G	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.49;ReadPosRankSum=1.756;SOR=0.661;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,20:0.32:63
chr12	113863969	rs12831825	C	T	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.44;ReadPosRankSum=0.888;SOR=0.607;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,22:0.32:68
chr12	113874497	rs11833132	T	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.371;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=161;ReadPosRankSum=1.174;SC=GAGAGACCTGTTTCACCAGCT;SOR=0.034;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=11;WE=113874505;WS=113874487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr12	114261237	rs2059598	A	C	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.074;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=476;ReadPosRankSum=-0.606;SC=GAGCAGAACAAGGGTGCGGGG;SOR=1.483;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=28;WE=114261245;WS=114261227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,29:0.62:47
chr12	114261286	rs930004	T	G	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=22;PP=658;SC=AGAGGGAAGTTGGGGAGAGCG;SOR=4.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=114261294;WS=114261276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	114282496	rs2075387	C	T	1208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.902;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=939;ReadPosRankSum=2.047;SC=GGCCGTCTTCCGCCGCAGGGC;SOR=0.897;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=74;TCF=34;TCR=40;TR=46;WE=114282504;WS=114282486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,46:0.61:75
chr12	114282678	rs2075386	G	A	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.735;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=522;ReadPosRankSum=1.537;SC=GCCTGCCTGCGTCTCAGATGC;SOR=4.534;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=23;WE=114282686;WS=114282668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr12	114296745	rs10744803	C	T	1486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.289;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=34;PP=1109;ReadPosRankSum=-0.463;SC=AATAGAGGCCCGCAAGGGAGG;SOR=1.241;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=99;TCF=44;TCR=55;TR=54;WE=114296753;WS=114296735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,56:0.54:103
chr12	114356357	rs10774721	T	C	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=396;ReadPosRankSum=-1.280;SC=GGGAGCCTGATTGTTCCCCGG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=16;WE=114356365;WS=114356347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr12	114362483	rs3782456	C	T	2225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.141;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=19;PP=1752;ReadPosRankSum=0.668;SC=GAACACTTTCCGAATTTCATG;SOR=1.298;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=135;TCF=98;TCR=37;TR=77;WE=114362491;WS=114362473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,79:0.58:137
chr12	114362621	rs1458713	A	G	5716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=124;PP=2962;SC=AGGCAAGGGCACCTGTCAAAC;SOR=1.622;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=183;TCF=59;TCR=124;TR=183;WE=114362640;WS=114362611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr12	114362632	rs3782458	A	G	2929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.172;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=79;PP=2343;ReadPosRankSum=-2.181;SC=CCTGTCAAACACTATACCCCC;SOR=0.442;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=172;TCF=44;TCR=128;TR=109;WE=114362640;WS=114362611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,111:0.63:177
chr12	114362699	rs10774723	G	T	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=35;PP=507;ReadPosRankSum=-0.260;SC=GATGAGTGATGACCTCCTTTA;SOR=1.270;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=59;TCF=2;TCR=57;TR=36;WE=114362707;WS=114362689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,40:0.62:65
chr12	114377885	rs2290790	G	C	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.118;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=619;ReadPosRankSum=-0.027;SC=AATGGCCGAAGGTCTCCTGCA;SOR=1.666;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=55;TCF=21;TCR=34;TR=37;WE=114377907;WS=114377875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,41:0.69:59
chr12	114377899	rs7299217	G	C	1490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=27;PP=1287;SC=TCCTGCAGCTGGGCCGCCAGG;SOR=0.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=22;TCR=27;TR=49;WE=114377907;WS=114377875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	114379991	rs2290791	T	C	1025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.350;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=5;PP=751;ReadPosRankSum=-0.743;SC=ACATTTCTTCTTTTCTTTAGA;SOR=0.999;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=35;WE=114379999;WS=114379981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,38:0.64:59
chr12	114383559	rs898081	A	G	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.473;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=175;ReadPosRankSum=-2.080;SC=CAACAGCAGTACAACGAGCCT;SOR=1.659;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=9;WE=114383567;WS=114383549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr12	114384426	rs11066842	G	A	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=107;ReadPosRankSum=-1.470;SC=CAGGTAGAACGTGGCCACTCT;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=7;WE=114384434;WS=114384416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr12	114393028	rs1037747	C	G	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=316;ReadPosRankSum=-1.897;SC=TGAGTGATCACAAAAACAAAC;SOR=0.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=15;WE=114393036;WS=114393018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr12	114395571	rs2290786	C	T	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=408;ReadPosRankSum=0.593;SC=TCATCACCTGCGGGATACACA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=19;WE=114395579;WS=114395561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr12	114823187	rs2277377	G	T	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.851;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=316;ReadPosRankSum=0.328;SC=CGGGCAGGAAGGCTGGTGGAG;SOR=0.064;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=17;WE=114823195;WS=114823177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr12	114832510	rs2236017	C	A	1208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=2;PP=1031;ReadPosRankSum=-1.785;SC=AAAGAGCAGACGGCCCCAGGC;SOR=0.744;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=64;TCF=61;TCR=3;TR=41;WE=114832518;WS=114832500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,42:0.62:68
chr12	114841619	.	C	T	1391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.000;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=35;PP=922;ReadPosRankSum=0.517;SC=AGCGCGCTCTCGGGTTTCGAA;SOR=0.730;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=113;TCF=38;TCR=75;TR=50;WE=114841627;WS=114841609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,58:0.47:123
chr12	115118997	rs515746	G	A	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=253;ReadPosRankSum=1.051;SC=TAAACCACCCGTAATCTTGGG;SOR=0.287;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=14;WE=115119005;WS=115118987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr12	116408538	rs2304460	A	G	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.864;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=159;ReadPosRankSum=-0.551;SC=TGTTCAGTGCAGTACTTCGGC;SOR=0.277;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=13;WE=116408546;WS=116408528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,14:0.29:48
chr12	116412921	rs1992068	AT	TC	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=1060;ReadPosRankSum=0.664;SC=GTTAATGACAATAGCTGAGCC;SOR=0.551;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=50;TCR=13;TR=24;WE=116412930;WS=116412911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,29:0.43:67
chr12	116420448	rs56159580	T	C	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=317;ReadPosRankSum=-0.045;SC=AAAATAAATATAAATTACACG;SOR=0.551;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=57;TCF=7;TCR=50;TR=18;WE=116420456;WS=116420438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr12	116429689	rs1865787	A	G	1398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.032;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=42;PP=1164;ReadPosRankSum=-0.866;SC=GCGCTGTTCAACGTCACGGGT;SOR=1.026;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=235;TCF=102;TCR=133;TR=69;WE=116429697;WS=116429679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,67:0.28:238
chr12	116446445	rs3741768	C	T	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.781;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=664;ReadPosRankSum=0.424;SC=GAGTAGACAACTGCTGGAGTT;SOR=0.813;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=97;TCF=58;TCR=39;TR=36;WE=116446453;WS=116446435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,37:0.36:103
chr12	116586414	rs113328518	CTATATA	CTA,C	170.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;NF=0,0;NR=6,6;PP=72,142;SC=ATGGAGATATCTATATATATA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6,6;WE=116586427;WS=116586404;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:5
chr12	116714815	.	A	AC	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.978;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.823;NF=7;NR=2;PP=84;ReadPosRankSum=-0.376;SC=GAGGTCGGGGACCCCCCCCCT;SOR=0.606;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=9;WE=116714823;WS=116714805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,8:0.21:38
chr12	116866112	rs202127912	CCA	C	33.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=2.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.59;MQRankSum=-1.037;QD=0.28;ReadPosRankSum=0.493;SOR=1.036;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,17:0.14:121
chr12	116866113	rs370202370	CA	C	470.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.756;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.61;MQRankSum=4.795;QD=3.99;ReadPosRankSum=-1.854;SOR=0.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,34:0.29:118
chr12	117013730	rs7303998	G	C	2134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.120;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=9;PP=1741;ReadPosRankSum=-0.169;SC=TCGCCGCCGCGGCCCAGATCC;SOR=1.608;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=130;TCF=110;TCR=20;TR=78;WE=117013738;WS=117013720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,80:0.60:133
chr12	117014131	rs55717114	G	GA	2030.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.662;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.828;NF=16;NR=59;PP=1751;ReadPosRankSum=0.773;SC=TGTAAAACCAGAAAAAATGCA;SOR=0.929;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=226;TCF=63;TCR=163;TR=75;WE=117014139;WS=117014121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,93:0.36:256
chr12	117014174	rs139308338	GA	G	934.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.41;MQRankSum=-11.185;QD=6.63;ReadPosRankSum=-0.248;SOR=0.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,52:0.37:141
chr12	117175828	rs111959200	C	T	107.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.58;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	117175856	rs11832734	G	A	125.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.57;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=2;PP=55;SC=CGGCAGCCTTGGGCGCAGCCC;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=117175864;WS=117175846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	117186316	rs1532395	A	G	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=0;PP=752;SC=CCACCCCCAGAAATTCTATTC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=117186324;WS=117186306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	117187907	rs111256849	T	C	2397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=34;PP=1906;SC=CCCACCACCATTTCCACCATG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=34;TCR=34;TR=68;WE=117187915;WS=117187897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr12	117286981	rs4767461	C	T	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=0;PP=509;SC=TTTGGAGTCGCATTGTCTCCC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=117286989;WS=117286971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	117287112	rs73220476	C	T	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=25;PP=1007;ReadPosRankSum=-1.632;SC=GATTGCTGTCCCCGCAGCACG;SOR=0.575;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=28;TCR=36;TR=45;WE=117287120;WS=117287102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,48:0.71:68
chr12	117289613	rs903775	G	C	3059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=60.02;MQRankSum=-5.025;NF=65;NR=33;PP=2550;ReadPosRankSum=0.048;SC=AGAAAGAAAGGTCAGCTTTGG;SOR=1.473;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=67;TCR=33;TR=98;WE=117289621;WS=117289603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,100:0.98:102
chr12	117290601	rs903772	T	C	2595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=76;PP=1947;SC=TCAGCCTCCCTGTAGCCATCT;SOR=3.383;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=14;TCR=76;TR=90;WE=117290609;WS=117290591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr12	117349014	rs11068230	C	G	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=18;PP=711;SC=GCTGGCCCAGCGTCTCCTGGA;SOR=1.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=26;WE=117349022;WS=117349004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	117383320	rs4076700	G	A	1437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=29;PP=1150;SC=CACATGTTACGAACCAACTGG;SOR=1.559;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=117383328;WS=117383310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	117402755	rs6490101	T	C	176.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=113;SC=TCCCTCCATATGTACACGTGG;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=117402763;WS=117402745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	117423264	rs7131746	G	A	1554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=40;PP=1255;SC=TGGGTCTAATGTAAGCACGTA;SOR=2.701;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=50;WE=117423272;WS=117423254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	117465857	rs4529958	T	C	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.782;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=8;PP=692;ReadPosRankSum=0.871;SC=TCCGCGCCTATGAGTTTGCGG;SOR=0.888;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=139;TCF=108;TCR=31;TR=42;WE=117465865;WS=117465847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,41:0.29:143
chr12	117593216	rs4767506	C	A	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=3;PP=512;SC=CAGCCACAGCCTTGGGAGGCC;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=117593224;WS=117593206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	117593387	rs79478437	G	A	1479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=4.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.14;ReadPosRankSum=0.617;SOR=0.313;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,55:0.79:70
chr12	117593391	rs4767507	A	G	2947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.94;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr12	117595930	rs2279765	G	A	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=228;ReadPosRankSum=-0.078;SC=TCTTTTTTGCGGCGAGGGATT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=12;WE=117595938;WS=117595920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr12	117595978	rs2279766	A	C	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=11;PP=334;SC=CAAAGGACCAAAAGGGGTGGC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=117595986;WS=117595968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	117603561	rs4767511	G	A	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=346;SC=TCAGCTCAACGAAGAGATACA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=117603569;WS=117603551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	117611934	rs57632063	C	T	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=272;ReadPosRankSum=1.025;SC=AGAGCGAGACCCTGTCTCTAA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=13;WE=117611942;WS=117611927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr12	117612357	rs3817015	T	C	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.287;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=708;ReadPosRankSum=2.223;SC=TTATCACTTTTTCATGACATA;SOR=1.445;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=27;WE=117612365;WS=117612347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr12	117646227	.	G	GTGTGTGTGTGT	288.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.15;MQRankSum=-0.660;QD=26.25;ReadPosRankSum=0.875;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr12	117660467	rs816363	C	G	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.900;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=373;ReadPosRankSum=-1.952;SC=AGTAGGATGTCCAAGTGTGCA;SOR=2.356;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=16;WE=117660475;WS=117660457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr12	117681353	rs34385734	A	ACCAT	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=6.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.64;ReadPosRankSum=-0.172;SOR=2.815;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr12	117685399	rs9658463	C	T	339.53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=279;ReadPosRankSum=-0.614;SC=GTGTAATGGGCTAAACTGTGT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=117685407;WS=117685389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr12	117691490	rs9658446	G	A	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.904;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=487;ReadPosRankSum=0.596;SC=CTCTGAGGTCGGGCCCATCGC;SOR=1.402;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=25;WE=117691498;WS=117691480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr12	117691727	rs2682822	T	A	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=222;ReadPosRankSum=-0.878;SC=CAACTTACCCTTGTCCACCAC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=11;WE=117691735;WS=117691717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr12	117701714	rs2293054	A	G	4678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.239;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=1.845;SC=TCTTGAAGCCAATGGCTCGCC;SOR=1.654;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=145;TCF=44;TCR=101;TR=142;WE=117701722;WS=117701704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,151:0.98:154
chr12	117705774	rs3741480	C	T	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=194;SC=TCTCTTGATCCTCTGCATCAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=117705782;WS=117705764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	117715724	rs3215291	AC	A	726.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.266;NF=20;NR=3;PP=791;ReadPosRankSum=-0.708;SC=CACTGGGCAAACCCACTCACC;SOR=1.236;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=23;WE=117715732;WS=117715714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr12	117718473	rs11282297	G	GGGTAAAA	4419.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=18;PP=2973;SC=AAAAGTCTGTGGTCTGGGGAC;SOR=2.110;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=73;TCF=54;TCR=19;TR=66;WE=117718481;WS=117718462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr12	117718686	rs2293051	G	C	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-4.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.866;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=20;PP=313;ReadPosRankSum=-2.356;SC=GGTGGAGAGAGGGGAACACCC;SOR=0.511;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=107;TCF=35;TCR=72;TR=31;WE=117718694;WS=117718676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,30:0.29:104
chr12	117768105	rs111326073	G	GCACA,GCA	1017.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=5.229;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.871;NF=18,18;NR=1,1;PP=539,187;ReadPosRankSum=1.447;SC=ACACAAGCATGCACACACACA;SOR=3.352;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=43;TCR=2;TR=19,19;WE=117768113;WS=117768095;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.82:28
chr12	117905636	rs36058871	T	TA	1238.86	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.432;NF=13;NR=33;PP=740;ReadPosRankSum=-0.831;SC=ATAGGCTGAATAAAAAAAAAA;SOR=0.633;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=75;TCF=20;TCR=55;TR=46;WE=117905644;WS=117905626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,51:0.86:59
chr12	117905716	rs111919379	A	AGGGTTTCTG	2560.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.93;QD=45.73;SOR=1.919;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	117905724	rs60346390	G	GT	1714.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=42.87;ReadPosRankSum=1.028;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,38:0.95:40
chr12	117964795	.	C	A	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.742;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.256;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=224;ReadPosRankSum=0.793;SC=AAGCCCTCTGCGTCATCCAAA;SOR=0.129;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=12;WE=117964803;WS=117964785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,13:0.27:48
chr12	117965107	rs112913826	G	C	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.35;MQRankSum=-0.459;QD=18.71;ReadPosRankSum=-3.224;SOR=0.301;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr12	117969378	rs7296195	C	T	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.509;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=-0.708;SC=TCTTAGGCACCCCCACAACAT;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=117969386;WS=117969368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr12	117993064	rs7955803	C	T	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=15;PP=573;ReadPosRankSum=1.482;SC=TGATGTCACACGGAACGGACT;SOR=0.656;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=89;TCF=47;TCR=42;TR=33;WE=117993072;WS=117993054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,35:0.38:93
chr12	118017201	rs4767569	C	T	1856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=55;PP=1591;SC=CAGATAATAACAGTATTGACC;SOR=6.701;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=56;WE=118017209;WS=118017191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	118020115	rs11068551	G	A	4913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=50;PP=2965;ReadPosRankSum=0.940;SC=TGGAGTTGCCGAGATCTCTGC;SOR=0.638;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=148;TCF=98;TCR=50;TR=146;WE=118020123;WS=118020105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,154:0.99:155
chr12	118199286	rs617641	C	G	2380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=40;PP=1984;SC=CCGTCTCTGTCGTGGGCCACT;SOR=0.927;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=34;TCR=40;TR=74;WE=118199294;WS=118199276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	118455759	rs2393374	T	G	5086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=128;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.676;SC=TGGAAATCCTTTACCCATTGA;SOR=0.679;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=329;TCF=119;TCR=210;TR=199;WE=118455767;WS=118455749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,204:0.61:337
chr12	118456825	rs5745811	A	G	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=531;ReadPosRankSum=0.811;SC=TTTTGCACATAAAATATTCTT;SOR=0.160;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=22;WE=118456833;WS=118456815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr12	118467553	rs4767654	A	G	2411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=44;PP=1729;ReadPosRankSum=-1.353;SC=GACCTAACTCATTTGATTTTG;SOR=0.734;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=68;TCR=68;TR=89;WE=118467561;WS=118467543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,98:0.67:146
chr12	118480874	rs7312586	G	A	1258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.508;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=13;PP=1026;ReadPosRankSum=-0.713;SC=GGGGCAGGGAGGCGACATAGT;SOR=0.382;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=66;TCF=47;TCR=19;TR=40;WE=118480882;WS=118480864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,44:0.61:72
chr12	118506327	rs72125532	TTCCTCC	T	2355.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=37;PP=2315;SC=CTGCAGCATCTTCCTCCTCCT;SOR=2.066;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=75;TCF=14;TCR=61;TR=41;WE=118506340;WS=118506317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	118508796	rs7135008	A	G	1526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.516;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=36;PP=1166;ReadPosRankSum=1.199;SC=GGAAGGGAACAAAACAGAAGT;SOR=0.642;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=222;TCF=114;TCR=108;TR=73;WE=118508804;WS=118508786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,75:0.33:225
chr12	118509086	rs7135400	A	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-4.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=294;ReadPosRankSum=2.176;SC=GGTGGGAGCAAGGCAGGGGCC;SOR=1.236;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=16;WE=118509094;WS=118509076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr12	118509148	rs7308222	C	T	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.31;ReadPosRankSum=0.179;SOR=0.661;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,29:0.32:91
chr12	118509157	rs7296643	T	C	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.25;ReadPosRankSum=-0.018;SOR=1.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,32:0.31:104
chr12	118509191	rs7307331	G	A	1283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-8.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.845;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=7;PP=935;ReadPosRankSum=-0.472;SC=GGGCTATAATGCAACAGAAGC;SOR=0.582;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=147;TCF=123;TCR=24;TR=53;WE=118509199;WS=118509181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,54:0.34:157
chr12	118511814	rs192750626	A	G	1733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.252;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=49;PP=1384;ReadPosRankSum=-0.188;SC=ATCAGAAGGTAAACAAAGACA;SOR=1.116;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=93;TCF=25;TCR=68;TR=64;WE=118511822;WS=118511804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,64:0.66:97
chr12	118520170	rs7488309	G	A	1522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=43;PP=1264;SC=CCCTGGCTGCGTAGAGGGTGC;SOR=4.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=48;WE=118520178;WS=118520160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	118520240	rs6490164	G	A	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=9;PP=269;SC=GCCGCCTGGGGATGACAGGGG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=118520248;WS=118520230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	118589069	rs2249624	G	A	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=608;SC=ACACACATAGGCACACACATG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=118589077;WS=118589059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	118589092	rs140297022	GCGCACA	GCA,G	195.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;NF=0,0;NR=12,12;PP=169,76;SC=GTGCGCGCGCGCGCACACACA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12,12;WE=118589105;WS=118589082;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.88:8
chr12	118650917	rs353886	C	T	222.41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.140;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.6715;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=178;ReadPosRankSum=-0.589;SC=TAAAAAAATGCTTTGGAATAT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=118650925;WS=118650907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr12	118673483	rs5801274	G	GA	804.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.6304;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.906;NF=1;NR=41;PP=571;ReadPosRankSum=1.249;SC=ATCCCTATAGGAAAAAAAAAA;SOR=0.892;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=63;TCF=2;TCR=61;TR=42;WE=118673491;WS=118673473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,37:0.74:50
chr12	118681158	rs708862	T	A	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=2;PP=913;SC=AAATAGATAATAGAAAAAAAA;SOR=4.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=34;WE=118681166;WS=118681148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
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chr12	118838694	rs142320477	A	C	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=8.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.205;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=35;PP=734;ReadPosRankSum=1.650;SC=CGTGTGTTAAATGTTTGTCCA;SOR=0.841;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=138;TCF=13;TCR=125;TR=38;WE=118838702;WS=118838684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,40:0.29:140
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chr12	119563064	rs7311828	A	G	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=8;PP=875;ReadPosRankSum=0.699;SC=GAGATGGAGAACTTCGGGAGG;SOR=0.617;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=128;TCF=108;TCR=20;TR=46;WE=119563072;WS=119563054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,48:0.36:135
chr12	119563084	rs7296134	C	G	4555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=27;PP=2965;SC=GGATGGTGACCAGTGCAAAGG;SOR=3.014;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=126;TCR=27;TR=153;WE=119563092;WS=119563074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr12	119563288	rs34186549	A	AC	848.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.482;NF=3;NR=33;PP=1164;ReadPosRankSum=0.304;SC=AGAGCAGGTAACCCCTTGCCC;SOR=0.551;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=123;TCF=13;TCR=110;TR=36;WE=119563296;WS=119563278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,38:0.33:114
chr12	119563372	rs58198276	C	G	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.965;NF=0;NR=7;PP=60;ReadPosRankSum=0.792;SC=CTCCACACTTCCAGCACAGGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=7;WE=119563380;WS=119563362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr12	119568691	rs4298970	A	G	1252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=34;PP=977;ReadPosRankSum=-0.059;SC=ACACTTGGGGAATGTGGAGGC;SOR=0.901;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=12;TCR=50;TR=42;WE=119568699;WS=119568681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,44:0.69:64
chr12	119866533	rs1064319	A	G	4216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=101;PP=2965;SC=GGACAAGGAAATAATAAACCT;SOR=2.320;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=134;TCF=32;TCR=102;TR=133;WE=119866541;WS=119866523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr12	119957861	rs708884	T	C	742.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.782;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=12;PP=560;ReadPosRankSum=-1.689;SC=TCCTCCCACATGTAGTTACTG;SOR=1.124;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=114;TCF=71;TCR=43;TR=39;WE=119957869;WS=119957851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,38:0.32:119
chr12	119960612	rs708887	G	T	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=215;ReadPosRankSum=-0.692;SC=AGAGTTCTGTGACTGGTGCCT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=11;WE=119960620;WS=119960602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr12	119978404	rs708889	A	G	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=333;ReadPosRankSum=-0.197;SC=GATTGCCACTATGTCTGCCTC;SOR=0.671;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=73;TCF=46;TCR=27;TR=23;WE=119978412;WS=119978394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,24:0.30:80
chr12	120031592	.	C	A	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-1.943;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.341;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=0;PP=800;ReadPosRankSum=0.727;SC=AGCCGGCGGCCAGAGCCCCAG;SOR=4.083;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=53;TCR=3;TR=35;WE=120031600;WS=120031582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,41:0.63:65
chr12	120067561	rs2301653	T	C	1055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=4;PP=973;SC=GCTACAACGATGGAGACTACG;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=34;WE=120067569;WS=120067551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	120067727	rs2301654	C	T	5079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=76;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.774;SC=CTTTCTCGAACGCCCGTTGGA;SOR=0.283;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=85;TCR=76;TR=160;WE=120067735;WS=120067717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,163:0.99:164
chr12	120067864	rs2893805	G	A	2380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=57;PP=1850;ReadPosRankSum=-0.747;SC=CTTCTAGTGCGGGAGTGGGTG;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=8;TCR=58;TR=65;WE=120067872;WS=120067854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr12	120078577	rs2301655	T	C	1676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=45;PP=1410;SC=CCAAAGGAGTTTCTAAGGAAT;SOR=4.091;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=50;WE=120078585;WS=120078567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	120106376	rs6490267	G	T	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=144;ReadPosRankSum=-0.047;SC=TCTCTTAGCGGTCCAAGAACC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=8;WE=120106384;WS=120106366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr12	120112099	rs278145	C	T	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=2.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.47;ReadPosRankSum=-0.169;SOR=1.096;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,11:0.17:66
chr12	120114205	rs10849690	C	G	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=401;ReadPosRankSum=-0.273;SC=CTCTTGGAACCAGTGCATCCT;SOR=0.749;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=21;WE=120114213;WS=120114195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr12	120114507	rs278149	G	T	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=25;PP=469;ReadPosRankSum=-0.827;SC=CGGACCATCCGCCGTGGGTCA;SOR=0.512;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=81;TCF=7;TCR=74;TR=27;WE=120114515;WS=120114497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,27:0.33:83
chr12	120126074	rs10669112	A	AAGG	988.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=2.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.04;ReadPosRankSum=-1.279;SOR=0.993;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,31:0.25:123
chr12	120135717	rs278126	G	T	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.501;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=810;ReadPosRankSum=1.179;SC=GAAGGAACATGCGGCCGGCCC;SOR=0.532;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=117;TCF=63;TCR=54;TR=42;WE=120135725;WS=120135707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,43:0.38:114
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chr12	120150196	rs804667	C	T	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.916;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=522;ReadPosRankSum=-0.583;SC=GGATTTCCCCCGTTCCCACTG;SOR=0.199;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=14;WE=120150213;WS=120150186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,15:0.32:47
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chr12	120156141	rs278102	G	A	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=6.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.554;SOR=0.172;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,18:0.24:74
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chr12	120172173	rs11064891	G	A	1289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=43;PP=955;ReadPosRankSum=-0.562;SC=CTGCAAATCAGTAGCACTGAT;SOR=0.728;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=173;TCF=47;TCR=126;TR=59;WE=120172181;WS=120172163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,58:0.34:173
chr12	120195354	rs34851548	TG	T	597.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.959;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.330;NF=4;NR=17;PP=574;ReadPosRankSum=-1.447;SC=GCCTTCCTGGTGGGGGTGGTG;SOR=0.850;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=59;TCF=12;TCR=47;TR=21;WE=120195362;WS=120195344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,26:0.37:70
chr12	120220282	rs440299	A	G	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=109;ReadPosRankSum=-0.045;SC=AGGTCCAAGCAAGCCGAGATG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=6;WE=120220290;WS=120220272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr12	120220589	rs385959	C	T	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=104;ReadPosRankSum=-0.970;SC=TGGTTGCCGACTCCGGTTTCC;SOR=0.634;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=7;WE=120220597;WS=120220579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr12	120270528	rs4767849	T	C	2011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=0;PP=1820;SC=GGACCAAGAATACTTTTTAGT;SOR=8.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=60;TCR=0;TR=60;WE=120270536;WS=120270518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	120313953	rs36054900	C	T	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.505;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=319;ReadPosRankSum=-0.441;SC=ATTCCGCGCTCCATATTTGAA;SOR=0.368;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=63;TCF=16;TCR=47;TR=19;WE=120313961;WS=120313943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,22:0.32:68
chr12	120536806	.	C	A	2627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-7.757;ClippingRankSum=0.000;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.028;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=52;PP=2041;ReadPosRankSum=0.889;SC=CCCACCCAACCCCGACCCGGC;SOR=0.853;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=359;TCF=182;TCR=177;TR=119;WE=120536814;WS=120536796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:240,119:0.33:359
chr12	120567406	rs2240312	C	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=91;ReadPosRankSum=0.880;SC=ACACTGACCCCCCCTGCTCCT;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=7;WE=120567414;WS=120567396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr12	120575549	rs3864938	A	C	7040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=97;PP=2965;SC=TCCAGCAGATACTCGATGATG;SOR=0.918;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=212;TCF=115;TCR=97;TR=212;WE=120575557;WS=120575539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr12	120589160	rs2286046	A	G	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.701;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=356;ReadPosRankSum=2.448;SC=TGGCTGGCACAAGGGGTGGCA;SOR=1.831;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=20;WE=120589168;WS=120589150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr12	120591251	rs10735071	C	T	1616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.539;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=45;PP=1132;ReadPosRankSum=1.760;SC=GTCAACCCTACAGGCTGCATC;SOR=0.735;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=212;TCF=79;TCR=133;TR=71;WE=120591259;WS=120591241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,75:0.35:215
chr12	120606163	rs6490286	T	C	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=6.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.253;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=31;PP=630;ReadPosRankSum=-0.916;SC=AGAGCTGATCTACTCCATCCT;SOR=2.110;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=95;TCF=4;TCR=91;TR=31;WE=120606171;WS=120606153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,34:0.33:102
chr12	120612953	rs199901349	G	A	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=103.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQRankSum=-4.297;QD=6.45;ReadPosRankSum=-6.788;SOR=8.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,64:0.56:114
chr12	120628046	.	G	A	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.846;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=24.316;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQRankSum=-5.101;QD=8.03;ReadPosRankSum=2.442;SOR=4.505;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,28:0.32:87
chr12	120628050	.	G	A	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.070;ClippingRankSum=0.000;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=27.911;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.44;MQRankSum=-6.435;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.142;SOR=4.677;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,25:0.23:111
chr12	120628054	.	G	A	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.971;ClippingRankSum=0.000;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=24.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQRankSum=-7.702;QD=3.38;ReadPosRankSum=-3.150;SOR=4.274;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,22:0.17:132
chr12	120636189	.	CA	C	22	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9999;HP=18;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=56.36;NF=2;NR=0;PP=22;QD=12.5;SC=ACTCTGTCTCCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=2;WE=120636197;WS=120636179;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,2:0.20:10
chr12	120661977	rs4767884	T	C	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.107;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=396;ReadPosRankSum=-0.596;SC=AATCGGGAGCTGCTGGGCTGC;SOR=0.088;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=21;WE=120661985;WS=120661967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr12	120720038	rs7960743	T	C	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.036;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=5;PP=536;ReadPosRankSum=0.972;SC=CACTGCCGCCTGGCCCCTCCA;SOR=0.896;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=110;TCF=89;TCR=21;TR=32;WE=120720046;WS=120720028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,32:0.30:108
chr12	120750239	rs2261612	A	G	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=2;PP=555;SC=CTGTTCAGTCAGCGTCTTCCT;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=120750247;WS=120750229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	120762765	rs5637	C	T	2227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.475;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=53;PP=1681;ReadPosRankSum=-0.162;SC=AGCCAGAGCACGAGTATGAAT;SOR=1.001;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=125;TCF=45;TCR=80;TR=81;WE=120762773;WS=120762755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,86:0.66:131
chr12	120783527	rs1076205	G	A	1639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=38;PP=1294;SC=GAAGTGAGGCGCTGACCTCTC;SOR=2.393;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=12;TCR=39;TR=50;WE=120783535;WS=120783517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	120783561	rs1076206	T	C	1013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=30;PP=865;SC=ATCGCCCCCCTACTGCAGGTC;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=120783569;WS=120783551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	120791042	rs1007469	G	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.291;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=136;ReadPosRankSum=-0.539;SC=ACCCTGAGAAGTCAGACTGCC;SOR=2.062;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=9;WE=120791050;WS=120791032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr12	120794653	rs1179441	T	C	2479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=69;NR=3;PP=2014;SC=CCCCTGCTAGTCCTGGGAGCA;SOR=5.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=69;TCR=3;TR=72;WE=120794661;WS=120794643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	120796703	rs1179445	T	A	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=1;PP=798;SC=ACGCAGATCCTGGGGGATAGG;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=120796711;WS=120796693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	120800696	rs1557769	T	A	160.03	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5564;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=122;ReadPosRankSum=-0.366;SC=GGCTGCAAGGTGGATTGGCCT;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=6;WE=120800704;WS=120800686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr12	120800823	rs757123	A	G	1087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=14;PP=951;SC=CCCCAGCAGCAAGCGCCCCCA;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=26;TCR=14;TR=40;WE=120800831;WS=120800813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr12	120801064	rs34243955	GC	G	78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=0;NR=5;PP=83;SC=CTCTTTAAAGGCCCCCCCCCC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=120801072;WS=120801054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	120806129	rs111293994	C	CT	2748.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.03;QD=37.65;SOR=2.995;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr12	120806706	rs11065094	C	G	2149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.675;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=56;PP=1640;ReadPosRankSum=0.573;SC=ACAAAGGGCCCGCGTGAGCGC;SOR=0.470;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=123;TCF=39;TCR=84;TR=85;WE=120806714;WS=120806696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,85:0.69:123
chr12	120882835	rs3858722	TAC	T	408.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=491;ReadPosRankSum=0.698;SC=AATATGACAGTACAAAAGTAA;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=11;WE=120882844;WS=120882825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr12	120884328	rs2235217	C	T	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.211;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=644;ReadPosRankSum=-0.674;SC=CCCCTCTGGGCGGGCGCCAGG;SOR=1.071;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=139;TCF=65;TCR=74;TR=45;WE=120884336;WS=120884318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,48:0.33:146
chr12	120897652	rs28390349	T	C	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.03;ReadPosRankSum=-0.134;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,4:0.18:22
chr12	120903610	rs75905531	C	A	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=5.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=-1.613;QD=5.64;ReadPosRankSum=-1.544;SOR=0.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,15:0.27:56
chr12	120934407	rs1563333	C	T	1851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.684;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=68;PP=1468;ReadPosRankSum=-0.263;SC=GGGGTTCCTTCCCCCCGATCC;SOR=0.823;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=301;TCF=84;TCR=217;TR=91;WE=120934415;WS=120934397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,91:0.30:307
chr12	120941927	rs7136951	C	T	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=79;ReadPosRankSum=1.234;SC=AGAACATGCCCCTCACTTCTT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=6;WE=120941935;WS=120941917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr12	120942911	rs4766966	G	C	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=486;ReadPosRankSum=-1.539;SC=CCTCTTGTTTGTTCTCACTTG;SOR=0.578;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=21;WE=120942919;WS=120942901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr12	120947788	rs4766968	G	C	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=4.613;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.47;ReadPosRankSum=1.634;SOR=1.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,28:0.26:106
chr12	120947948	rs500003	G	A	6108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=136;PP=2965;SC=AGTGAGTTCCGGGTCTCAGTG;SOR=2.503;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=178;TCF=42;TCR=136;TR=178;WE=120947956;WS=120947938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr12	120959924	rs1167696	C	T	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=676;ReadPosRankSum=0.750;SC=CACCATCTTCCGCCTCGTGTT;SOR=0.829;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=28;WE=120959932;WS=120959914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,29:0.71:41
chr12	120966659	rs55848094	G	A	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=0;PP=872;ReadPosRankSum=1.320;SC=GAACTAATTGGATGTTAAATC;SOR=1.528;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=80;TCF=79;TCR=1;TR=37;WE=120966667;WS=120966649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,37:0.48:77
chr12	120966921	rs3742052	A	G	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.828;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=576;ReadPosRankSum=0.066;SC=AGCTCCATAGAGCACAGCTCC;SOR=0.082;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=61;TCF=3;TCR=58;TR=29;WE=120966929;WS=120966911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr12	120972574	.	C	T	1496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.184;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=23;PP=1210;ReadPosRankSum=0.199;SC=CCCGCCGCGCCCGCTCCGCTC;SOR=0.268;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=86;TCF=55;TCR=31;TR=57;WE=120972582;WS=120972564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,56:0.65:86
chr12	120977381	rs1167723	T	C	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=35;PP=742;ReadPosRankSum=-0.177;SC=GAAATGAAGATGCCAAGTAAT;SOR=0.538;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=8;TCR=48;TR=41;WE=120977389;WS=120977371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,42:0.71:59
chr12	120990582	rs12309824	A	C	128.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5130;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=69;ReadPosRankSum=0.431;SC=GGCTTTTTTTAAGCTATTGTG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=120990590;WS=120990572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr12	120992401	rs3213565	C	T	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=288;ReadPosRankSum=2.002;SC=TGCAGTGCCTCATGAACCAGG;SOR=0.478;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=60;TCR=1;TR=17;WE=120992409;WS=120992391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,17:0.27:63
chr12	120994932	rs7956998	G	A	1110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=3;PP=855;SC=ATGTACCTACGTTGTAAACAA;SOR=4.235;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=120994940;WS=120994922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	120995332	rs2292681	G	A	4603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=68;PP=2965;SC=TGCTACATATGAGTGTCCATG;SOR=0.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=73;TCR=68;TR=140;WE=120995340;WS=120995322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr12	120998443	rs603574	A	G	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=53;ReadPosRankSum=0.345;SC=CCCCAGAGAAAAGGCTGTATT;SOR=0.432;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=5;WE=120998451;WS=120998433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr12	120998481	rs787949	G	A	1150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=8;PP=858;SC=CTACACCATCGTGAGCTTTGA;SOR=2.494;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=35;WE=120998489;WS=120998471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	121004564	rs35194242	CAA	C	559.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQRankSum=1.461;QD=12.72;ReadPosRankSum=0.905;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
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chr12	121017171	rs7174	A	G	2557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=12;PP=2069;SC=TCCTCCTCTAATAAGCAGCTT;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=63;TCR=12;TR=75;WE=121017179;WS=121017161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr12	121017243	rs509445	A	C	1205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=16;PP=899;ReadPosRankSum=1.257;SC=CAGGGATGAAAGATATCTTTG;SOR=0.679;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=153;TCF=102;TCR=51;TR=50;WE=121017251;WS=121017233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,55:0.35:159
chr12	121017264	rs2301456	C	T	3027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.612;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=36;PP=2505;ReadPosRankSum=2.612;SC=GGAGTGATTTCTTCAGCTTAA;SOR=0.809;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=166;TCF=109;TCR=57;TR=107;WE=121017272;WS=121017254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,109:0.63:174
chr12	121017439	rs563920	A	G	3308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=60;PP=2711;SC=CTTGTGAAAGATCTCGACCTT;SOR=1.225;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=36;TCR=60;TR=96;WE=121017447;WS=121017429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr12	121017474	rs3833953	GT	G	887.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.844;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=13;PP=993;ReadPosRankSum=0.684;SC=GTAGGGGGAAGTGTCTTGTTA;SOR=0.541;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=93;TCF=55;TCR=38;TR=29;WE=121017482;WS=121017464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,30:0.31:96
chr12	121018862	rs10774559	C	T	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=3;PP=136;ReadPosRankSum=-0.522;SC=CGGCGCCTGCCCCCTCCACAT;SOR=0.223;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=9;WE=121018870;WS=121018852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr12	121019323	rs591992	T	C	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=16;PP=477;SC=CTGTCAGCTCTCTCAAGCCCC;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=121019331;WS=121019313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	121093621	rs201880849	AGTGC	A	963.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.539;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.248;NF=35;NR=4;PP=1273;ReadPosRankSum=0.008;SC=TGTATGTGCCAGTGCGTGCGT;SOR=1.460;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=75;TCF=64;TCR=11;TR=39;WE=121093642;WS=121093611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr12	121097622	rs529584	G	A	2447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=9;PP=1880;SC=CCCAGGTTAGGTATTTTGTGA;SOR=3.826;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=62;TCR=9;TR=70;WE=121097630;WS=121097612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr12	121131891	rs2393749	C	T	1421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=16;PP=1182;SC=CTTTTGTCCTCAGCCTCAGAC;SOR=1.464;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=46;WE=121131899;WS=121131881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	121132100	rs7964786	C	T	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=13;PP=414;SC=TGCTGCTTGACCAGTAGGACA;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=14;WE=121132108;WS=121132090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	121133037	rs504403	G	C	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=606;SC=TTGAGCTGATGACTATTTTGG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=121133045;WS=121133027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	121134402	rs56217506	T	C	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=29;PP=711;ReadPosRankSum=0.220;SC=AAACCAGCCATATTGGTTTTG;SOR=1.036;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=55;TCF=6;TCR=49;TR=32;WE=121134410;WS=121134392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr12	121151062	rs3833788	CTCTCTTG	C	4843.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=3;PP=2976;SC=GTTGGTTTCTCTCTCTTGTTT;SOR=4.902;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=88;TCR=3;TR=88;WE=121151076;WS=121151052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr12	121157535	rs56179458	GC	AA	1060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=1;PP=596;SC=CAGCTGGGGGGCCTCTGTGGT;SOR=5.058;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=22;WE=121157544;WS=121157525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	121157851	rs3752531	A	G	2098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=55;PP=1608;SC=GCAAGAGTAGATAGGGGAGGT;SOR=3.816;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=8;TCR=55;TR=63;WE=121157859;WS=121157841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	121161048	rs1055070	T	G	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=437;ReadPosRankSum=0.955;SC=CAGGACTGACTCCTCACCCCA;SOR=0.638;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=23;WE=121161056;WS=121161038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr12	121163518	rs2239760	C	A	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=1;PP=272;SC=GCGTCGGTTCCTCGCCTTGGG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=121163526;WS=121163508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	121174899	rs3914	T	C	3207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=57;PP=2377;SC=AGATCAGCCGTGGCTGCGCCT;SOR=0.869;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=49;TCR=57;TR=106;WE=121174907;WS=121174889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr12	121175984	rs555404	T	C	4411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=77;PP=2965;SC=CCTGAGCTTCTGAGGGAGGTG;SOR=0.763;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=152;TCF=74;TCR=78;TR=151;WE=121175992;WS=121175974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr12	121176083	rs1799958	G	A	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.969;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=29;PP=861;ReadPosRankSum=-0.734;SC=CTCCTTTCAGGGCATCAGTGC;SOR=0.527;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=183;TCF=94;TCR=89;TR=55;WE=121176091;WS=121176073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,58:0.31:188
chr12	121176679	rs3915	C	T	3148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=49;PP=2518;SC=TGACCTGGCGCGCTGCCATGC;SOR=0.713;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=51;TCR=49;TR=100;WE=121176687;WS=121176669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr12	121177182	.	C	G	2530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.681;ClippingRankSum=0.000;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=77;PP=1942;ReadPosRankSum=1.264;SC=TCACTGAGATCTACGAGGGCA;SOR=0.773;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=12;TCR=100;TR=86;WE=121177190;WS=121177172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,91:0.77:118
chr12	121177272	rs3916	G	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=87;ReadPosRankSum=1.394;SC=GACTGCCCCAGGACTGCGGGA;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=8;WE=121177280;WS=121177262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr12	121202952	rs6490303	A	T	1709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.751;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.805;NF=13;NR=52;PP=1235;ReadPosRankSum=0.070;SC=AAAAAAAAAAATTTTTTTTCC;SOR=2.062;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=112;TCF=32;TCR=80;TR=65;WE=121202960;WS=121202942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,68:0.60:114
chr12	121204368	rs3213571	G	C	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=184;ReadPosRankSum=-0.579;SC=ACAACTCCAAGGACACATGAC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=12;WE=121204376;WS=121204358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
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chr12	121220376	.	T	C	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.550;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.561;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=1459;ReadPosRankSum=-0.050;SC=GTAGTGATGGTTGTACAGCTC;SOR=0.311;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=28;WE=121220384;WS=121220370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,31:0.74:42
chr12	121221628	rs7137504	C	T	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.239;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=307;ReadPosRankSum=0.226;SC=AACTTCATTCCGCCAAACACT;SOR=1.436;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=20;WE=121221636;WS=121221618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr12	121222411	rs3213570	C	G	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.654;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=578;ReadPosRankSum=-0.624;SC=AAGAGAAAAACAGACAGATTA;SOR=1.000;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=132;TCF=47;TCR=85;TR=37;WE=121222419;WS=121222401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,35:0.26:134
chr12	121222469	rs3213569	T	C	1418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.117;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=40;PP=1124;ReadPosRankSum=1.678;SC=TCATATACATTAACTTGCAAA;SOR=1.769;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=60;TCF=8;TCR=52;TR=45;WE=121222477;WS=121222459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,47:0.76:62
chr12	121222496	rs3213568	C	T	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=33;PP=805;ReadPosRankSum=1.442;SC=GACAGTTCTACGGATTATACG;SOR=0.818;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=36;WE=121222504;WS=121222486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,38:0.84:45
chr12	121222556	rs3213567	T	C	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=41;ReadPosRankSum=-1.395;SC=CCAACGAGATTATGAGCTCCT;SOR=0.138;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=4;WE=121222564;WS=121222546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr12	121248584	rs674021	G	A	4428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=39;PP=2965;SC=CCTCCAACTTGTATCAACCCC;SOR=1.989;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=97;TCR=39;TR=136;WE=121248592;WS=121248574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr12	121341849	rs2686458	A	G	176.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=4;PP=141;SC=CGGGCTCCGAAGCGGCCCCGC;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=121341857;WS=121341839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	121416622	rs1169289	C	G	1258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.929;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=904;ReadPosRankSum=1.056;SC=CGGCCCTGCTCGAGTCAGGGC;SOR=0.621;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=161;TCF=78;TCR=83;TR=51;WE=121416630;WS=121416612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,54:0.32:168
chr12	121416650	rs1169288	A	C	1474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.567;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=28;PP=1046;ReadPosRankSum=-1.552;SC=AGAGGCACTGATCCAGGCACT;SOR=0.787;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=172;TCF=89;TCR=83;TR=60;WE=121416658;WS=121416640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,65:0.35:185
chr12	121416988	rs2244608	A	G	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=104;ReadPosRankSum=2.148;SC=TTGAGTCCCCATGACCTTCAG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=7;WE=121416996;WS=121416978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr12	121426594	rs1169294	G	A	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=0;PP=629;ReadPosRankSum=0.154;SC=TATGGGGAGAGACAGCCCTTG;SOR=0.395;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=74;TCF=74;TCR=0;TR=29;WE=121426602;WS=121426584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,31:0.41:76
chr12	121431272	rs2071190	T	A	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=312;ReadPosRankSum=-0.733;SC=GGAATGGACGTGGGAAGGTGA;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=14;WE=121431280;WS=121431262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr12	121431300	rs1169301	C	T	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.744;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=225;ReadPosRankSum=-0.752;SC=CAGTACCCCACTCACGGCTTT;SOR=0.022;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=15;WE=121431308;WS=121431290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr12	121432117	rs56348580	G	C	2851.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.395;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=78;PP=2962;ReadPosRankSum=0.911;SC=CGTACAGCGGGCCCCCCCCAG;SOR=0.198;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=197;TCF=76;TCR=121;TR=139;WE=121432125;WS=121432107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,123:0.67:184
chr12	121434630	rs55853809	C	CTCATTCAT	2560.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=18;PP=2857;SC=GCCACTGGGACTCATTCATTC;SOR=1.022;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=53;TCF=24;TCR=29;TR=35;WE=121434638;WS=121434620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	121434833	rs2259852	G	A	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=220;ReadPosRankSum=1.056;SC=AGGGTAAGGGGGACTGATGTT;SOR=0.512;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=14;WE=121434841;WS=121434823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr12	121435342	rs2259820	C	T	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.896;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=383;ReadPosRankSum=2.386;SC=CCTGACCACCCTGCAGCCCGT;SOR=1.220;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=81;TCF=62;TCR=19;TR=23;WE=121435350;WS=121435332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,23:0.28:82
chr12	121435427	rs2464196	G	A	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.235;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=15;PP=881;ReadPosRankSum=0.027;SC=GTGACCCAGAGCCCCTTCATG;SOR=0.980;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=154;TCF=101;TCR=53;TR=49;WE=121435435;WS=121435417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,50:0.32:155
chr12	121435475	rs2464195	G	A	1576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.209;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=23;PP=1178;ReadPosRankSum=1.875;SC=CACGGTGAGCGCCCTGTGCCC;SOR=0.582;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=207;TCF=142;TCR=65;TR=70;WE=121435483;WS=121435465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,73:0.34:214
chr12	121435587	rs2259816	G	T	1362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.596;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=40;PP=984;ReadPosRankSum=-0.234;SC=GGACAAGTGTGTTTCCGTGAT;SOR=0.749;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=203;TCF=65;TCR=138;TR=59;WE=121435595;WS=121435577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,62:0.30:208
chr12	121437221	rs1169304	T	C	6157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=119;PP=2965;SC=GGCCCTCCCTTGGCCTGTGAC;SOR=1.043;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=208;TCF=89;TCR=119;TR=208;WE=121437229;WS=121437211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr12	121437382	rs1169305	A	G	1904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=49;PP=1552;SC=GGACCCTGCCAGCATCCAGCA;SOR=2.948;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=11;TCR=49;TR=60;WE=121437390;WS=121437372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	121438844	rs735396	T	C	1264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.298;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=9;PP=999;ReadPosRankSum=-0.359;SC=GGTGGGTGGCTAGCAGCCTTG;SOR=0.368;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=131;TCF=111;TCR=20;TR=51;WE=121438852;WS=121438834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,53:0.39:135
chr12	121439433	rs1169310	G	A	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-6.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.633;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=12;PP=1068;ReadPosRankSum=-1.572;SC=GAGAGGCCCTGGATCAGCGTG;SOR=0.523;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=179;TCF=146;TCR=33;TR=61;WE=121439441;WS=121439423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,59:0.33:177
chr12	121440263	rs41279096	G	A	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.093;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=377;ReadPosRankSum=-0.831;SC=CAGCCGGGGCGAGTGGCACGT;SOR=0.269;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=21;WE=121440271;WS=121440253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr12	121442123	.	C	T	1410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.296;ClippingRankSum=0.000;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.566;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=42;PP=1049;ReadPosRankSum=-0.429;SC=GTGGTGGCAGCGACAGCCGAG;SOR=0.623;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=74;TCR=129;TR=67;WE=121442131;WS=121442113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,68:0.33:207
chr12	121444026	rs2708082	G	A	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.31;QD=28.04;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	121448918	rs112728225	T	A	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.564;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=33;PP=1059;ReadPosRankSum=-0.628;SC=TGAGGCTCGGTTGGGAGGTTG;SOR=0.606;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=164;TCF=85;TCR=79;TR=64;WE=121448926;WS=121448908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,69:0.38:181
chr12	121450165	rs2264750	C	T	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=507;ReadPosRankSum=-1.226;SC=TGACGTGGGCCAATGGGAGGA;SOR=0.678;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=77;TCF=63;TCR=14;TR=28;WE=121450173;WS=121450155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,30:0.37:82
chr12	121450354	rs2264778	C	A	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.349;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=328;ReadPosRankSum=0.561;SC=CAGATAGATGCACTTTTAAGA;SOR=0.456;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=59;TCF=10;TCR=49;TR=20;WE=121450362;WS=121450344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,22:0.35:62
chr12	121450384	rs2254971	G	C	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.791;NF=1;NR=16;PP=259;ReadPosRankSum=-0.321;SC=GGCCGGGCGCGGTGGCTCACG;SOR=0.646;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=17;WE=121450392;WS=121450374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr12	121454257	rs2258227	T	A	7389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=134;NR=95;PP=2965;SC=AATCGCTCACTGTGCCACTGG;SOR=1.079;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=231;TCF=135;TCR=96;TR=229;WE=121454265;WS=121454247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr12	121454313	rs2258287	C	A	1446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.277;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=39;PP=1129;ReadPosRankSum=-1.173;SC=AGAACACCGCCGTTATCAAGC;SOR=0.454;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=215;TCF=80;TCR=135;TR=69;WE=121454321;WS=121454303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,70:0.32:219
chr12	121454342	rs73214155	T	A	2989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=80;PP=2358;ReadPosRankSum=1.337;SC=TGACGTCACGTGAGAGGAGAG;SOR=0.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=36;TCR=114;TR=105;WE=121454350;WS=121454332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,108:0.71:153
chr12	121471337	rs3213545	G	A	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.830;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=474;ReadPosRankSum=-1.084;SC=TGGTGAAGACGAGAGCATCGG;SOR=0.908;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=92;TCF=52;TCR=40;TR=27;WE=121471345;WS=121471327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,28:0.30:93
chr12	121603053	rs208304	T	C	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=152;ReadPosRankSum=0.980;SC=TCTCTTCATGTATCCCAAAGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=7;WE=121603061;WS=121603043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr12	121603118	rs507085	T	C	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.77;ReadPosRankSum=0.823;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,31:0.65:48
chr12	121603122	rs654856	C	A	1306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.13;ReadPosRankSum=0.031;SOR=0.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,35:0.67:52
chr12	121603745	rs208306	T	G	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=372;ReadPosRankSum=-1.535;SC=CAGGAGGCAGTGATCATTTGG;SOR=0.582;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=16;WE=121603753;WS=121603735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr12	121603825	rs36144485	ATGTT	A	2108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.596;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.455;NF=36;NR=1;PP=1562;ReadPosRankSum=-0.535;SC=TTCAATCGAGATGTTTGTTTG;SOR=0.335;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=82;TCF=78;TCR=4;TR=37;WE=121603836;WS=121603815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,54:0.67:81
chr12	121603856	rs208307	C	G	2071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.327;NF=60;NR=10;PP=1696;ReadPosRankSum=0.034;SC=TTTAATTATGCACAGGAGAAA;SOR=0.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=96;TCR=16;TR=70;WE=121603864;WS=121603846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,74:0.64:116
chr12	121605355	rs7958311	G	A	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.921;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=496;ReadPosRankSum=2.920;SC=CATCACTGCCGTCCCAAATAC;SOR=0.135;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=92;TCF=60;TCR=32;TR=31;WE=121605363;WS=121605345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,32:0.32:99
chr12	121605373	rs7958316	G	A	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.342;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=511;ReadPosRankSum=0.675;SC=TACAGTTTCCGTCGCCTTGAC;SOR=0.207;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=99;TCF=61;TCR=38;TR=33;WE=121605381;WS=121605363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,36:0.33:108
chr12	121605599	rs686638	C	T	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=362;ReadPosRankSum=0.425;SC=AAAAGAGATGCACACTCTTTA;SOR=0.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=20;WE=121605607;WS=121605589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr12	121613113	.	C	CAAAAAAAAA	929.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=5.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.47;MQRankSum=-1.357;QD=16.90;ReadPosRankSum=0.433;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,34:0.62:55
chr12	121615103	rs1718119	G	A	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=549;ReadPosRankSum=1.325;SC=TCCCCAGGCCGCTGTGTTCAT;SOR=0.616;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=28;WE=121615111;WS=121615093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,29:0.69:42
chr12	121615283	rs1653598	T	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=101;ReadPosRankSum=-1.668;SC=CACCAAGACATGGAGAGATTC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=121615291;WS=121615273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr12	121618278	rs112146943	CT	C	966.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=2.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=0.645;QD=13.24;ReadPosRankSum=0.999;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,53:0.73:73
chr12	121622023	rs1626329	C	T	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=440;ReadPosRankSum=0.369;SC=TAATATTAAACGTAACTTTAT;SOR=1.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=20;WE=121622031;WS=121622013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr12	121622196	rs2230912	A	G	2241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.021;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=39;PP=1625;ReadPosRankSum=0.160;SC=GAGGAGATACAGCTGCTTAGA;SOR=0.731;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=140;TCF=73;TCR=67;TR=85;WE=121622204;WS=121622186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,92:0.61:150
chr12	121622520	rs1653624	A	T	2328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=49;PP=1827;SC=GACTTTGCCAACCTGCCCAGC;SOR=2.082;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=18;TCR=49;TR=67;WE=121622528;WS=121622510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr12	121622563	rs1621388	G	A	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=25;PP=758;ReadPosRankSum=-0.185;SC=AAGAGTTTCCGAAGAGTGAAG;SOR=0.818;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=33;WE=121622571;WS=121622553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,34:0.63:54
chr12	121660787	rs25643	T	C	1216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.766;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=873;ReadPosRankSum=0.869;SC=TCAACGGGTCTGTCAAGACGT;SOR=0.588;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=84;TCF=42;TCR=42;TR=49;WE=121660795;WS=121660777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,51:0.59:86
chr12	121670726	rs11608486	G	C	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.233;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=471;ReadPosRankSum=1.436;SC=TTCTCAGGAAGGGGCACGCAA;SOR=0.167;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=27;WE=121670734;WS=121670716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr12	121671261	rs7961979	C	A	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=1.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=448;ReadPosRankSum=1.391;SC=CAGGAGCGCACCTCCCTCCCG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=21;WE=121671269;WS=121671251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr12	121678327	.	CT	C	42.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-1.697;QD=1.29;ReadPosRankSum=0.126;SOR=0.511;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr12	121682051	rs2686340	T	C	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=51;ReadPosRankSum=-0.431;SC=CCATGGGCCCTGTGACAGAGC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=121682059;WS=121682041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr12	121682461	rs61953429	C	G	2106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.404;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=45;PP=1600;ReadPosRankSum=-0.355;SC=GAGAAGGGACCCTTGGGATCC;SOR=0.807;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=136;TCF=66;TCR=70;TR=85;WE=121682469;WS=121682451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,86:0.63:137
chr12	121690305	rs112943694	T	TCTGGTGATCCGC	421.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.997;NF=7;NR=0;PP=2716;ReadPosRankSum=0.475;SC=ACTCCTAACCTCTGCCTCAGC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=7;WE=121690313;WS=121690295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr12	121690548	rs2686344	T	C	2179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=2.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.25;ReadPosRankSum=1.788;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,55:0.69:80
chr12	121690555	rs2686345	T	C	2105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=2.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.00;ReadPosRankSum=1.700;SOR=1.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,53:0.68:78
chr12	121706533	rs1718120	T	G	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=471;ReadPosRankSum=-1.605;SC=CCAGGTCCTGTTTAAAGCAGG;SOR=0.711;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=24;WE=121706541;WS=121706523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,24:0.73:33
chr12	121707321	rs1109453	G	A	2538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.910;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=16;PP=1970;ReadPosRankSum=0.418;SC=AGGAGAATGCGGATACTCACA;SOR=1.431;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=131;TCF=105;TCR=26;TR=90;WE=121707329;WS=121707311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,92:0.68:136
chr12	121712077	rs3817190	T	A	2931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=7.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=37;PP=2446;ReadPosRankSum=0.471;SC=GACCCGGAGGTGTCAAGGGGG;SOR=0.707;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=108;TCR=59;TR=105;WE=121712085;WS=121712067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,103:0.63:164
chr12	121764799	rs4980993	A	C	1466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=6;PP=1190;SC=GTCGAGCAGAACTGTCCAACA;SOR=3.306;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=46;WE=121764807;WS=121764789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	121768248	rs2280067	C	T	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=0;PP=889;SC=TAATTAAAGTCATATGAAACT;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=121768256;WS=121768238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr12	121773552	rs3751162	T	C	1091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=30;PP=897;SC=ATCAATGTATTTTAAACGCTG;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=30;WE=121773560;WS=121773542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	121775021	rs143656269	A	C	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=2.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.773;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=250;ReadPosRankSum=-0.058;SC=CTCTGTTTCCAAAAACAAACA;SOR=1.230;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=12;WE=121775029;WS=121775011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr12	121785795	rs1169961	C	A	1999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=52;PP=1678;SC=TCACTCCAAACATGCAAATAA;SOR=4.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=3;TCR=52;TR=55;WE=121785803;WS=121785785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	121789927	rs1799525	C	A	1488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=3;PP=1189;SC=AGCCAGCGGGCGCCTCTCACC;SOR=4.271;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=40;TCR=3;TR=43;WE=121789935;WS=121789917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	121853164	rs11065565	T	C	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.085;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=353;ReadPosRankSum=-0.081;SC=TGGCTCACACTTGTAATCTGA;SOR=0.080;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=16;WE=121853172;WS=121853154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr12	121870922	rs12427382	G	A	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.247;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=497;ReadPosRankSum=-0.488;SC=CCTCTTTGGAGGCTCATTCAT;SOR=0.186;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=22;WE=121870930;WS=121870912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr12	121871006	rs11065575	A	C	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-6.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.069;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=19;PP=530;ReadPosRankSum=0.039;SC=CTTCCAACAAAGAAGCTAGAA;SOR=0.461;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=24;TCR=30;TR=35;WE=121871014;WS=121870996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,38:0.66:58
chr12	121878659	rs1064951	C	T	1424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.873;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=17;PP=1127;ReadPosRankSum=0.326;SC=GATCCCGCATCTGGGCATCCT;SOR=0.822;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=61;TCR=27;TR=56;WE=121878667;WS=121878649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,55:0.61:90
chr12	121879111	rs2288154	G	C	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=631;ReadPosRankSum=0.669;SC=GCTCTTAACTGTCCCCACCTA;SOR=1.129;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=27;WE=121879119;WS=121879101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr12	121880520	rs3751131	G	A	2002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.909;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=39;PP=1490;ReadPosRankSum=-1.062;SC=AGCGGGAGTGGTCGCTCTCCC;SOR=0.830;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=40;TCR=52;TR=69;WE=121880528;WS=121880510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,73:0.77:95
chr12	121881848	rs10849885	G	A	1912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.054;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=18;PP=1482;ReadPosRankSum=-1.098;SC=GGGGCTTCTCGTATTTCCGCT;SOR=1.011;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=90;TCF=62;TCR=28;TR=65;WE=121881856;WS=121881838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,69:0.73:95
chr12	121882098	rs3817551	T	G	4832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.320;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=82;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.070;SC=AAAGAGAGAATGAACAGACCA;SOR=0.708;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=288;TCF=143;TCR=145;TR=174;WE=121882106;WS=121882088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,182:0.62:295
chr12	122017848	rs61355823	CA	C	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.86;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr12	122064773	rs141919534	CCCGCCA	C	5682.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.63;QD=44.05;SOR=2.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr12	122097043	rs63632160	GCACA	G	1058.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;NF=14;NR=0;PP=596;SC=ACACACGCGCGCACACACACA;SOR=4.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=14;WE=122097056;WS=122097033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	122186268	rs28651018	C	T	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.86;ReadPosRankSum=1.036;SOR=0.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,20:0.23:88
chr12	122186317	rs28655666	G	A	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.079;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=11;PP=426;ReadPosRankSum=-0.845;SC=CGTCTTCTTCGACATGGAGGC;SOR=0.999;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=84;TCF=43;TCR=41;TR=25;WE=122186325;WS=122186307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,26:0.30:87
chr12	122208968	rs11608693	G	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=166;ReadPosRankSum=-0.293;SC=AGACAGCGGTGGGGGGTGTGC;SOR=0.350;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=11;WE=122208976;WS=122208958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,10:0.23:44
chr12	122217856	rs59641582	G	GGT	1910.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=11;PP=1796;SC=GGTTCCCCCAGGTGTCTCCCA;SOR=2.110;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=38;WE=122217864;WS=122217846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	122231368	rs2707067	C	A	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=21;PP=1002;SC=AGGGGCGTCCCTCGCCCCCAC;SOR=0.843;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=18;TCR=21;TR=39;WE=122231376;WS=122231358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	122231573	rs2707066	C	T	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=8;PP=195;SC=GGCGGCGCGCCGGGCACTAGC;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=122231581;WS=122231563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	122243594	.	AAT	A	38	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=27;MQ=59.2;NF=4;NR=0;PP=38;QD=13.75;SC=TTCCAAAAAAAATTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=122243603;WS=122243585;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr12	122243905	rs1168666	C	T	5795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=96;NR=81;PP=2965;SC=ACCTGGGCATCGCCAAGGTGG;SOR=0.883;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=179;TCF=97;TCR=82;TR=177;WE=122243913;WS=122243895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr12	122248582	rs895952	C	G	3292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=61;PP=2631;ReadPosRankSum=-0.673;SC=CAACACCCCTCCCAGACTCCG;SOR=0.446;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=39;TCR=62;TR=100;WE=122248590;WS=122248572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,103:0.99:104
chr12	122261456	rs3741593	G	A	3987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=56;PP=2962;ReadPosRankSum=0.423;SC=TGCCACCTGCGGGCTCGCCCG;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=213;TCF=121;TCR=92;TR=130;WE=122261464;WS=122261446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,142:0.63:227
chr12	122284715	rs2247291	T	C	2063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=2;PP=1755;SC=TTTGCAGAGATCGTCCCTGGC;SOR=6.059;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=61;TCR=2;TR=63;WE=122284723;WS=122284705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	122287132	rs3832816	CT	C	340.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=305;SC=AAGAGAGACTCTTTTTTTTGC;SOR=3.912;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=14;WE=122287140;WS=122287122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	122295335	rs1154510	T	C	3833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=84;PP=2927;SC=TAGAATGACGTGGCCTGAATC;SOR=1.574;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=47;TCR=84;TR=131;WE=122295343;WS=122295325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr12	122326812	rs2230681	T	C	1948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=18;PP=1595;SC=CAGGCCGGCGTCGTGACTGTC;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=46;TCR=18;TR=64;WE=122326820;WS=122326802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	122359172	rs6486782	T	C	1800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=8;PP=1481;SC=AGCTGGTTATTATGGTCAAAA;SOR=3.342;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=47;TCR=8;TR=55;WE=122359180;WS=122359162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	122359397	rs142042908	G	GGAGGAGGAGGAGAAA	3898.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.56;QD=55.70;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr12	122361929	rs34885077	CT	C	476.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=551;SC=TCCCCCAGTGCTTTTGAGAGT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=13;WE=122361937;WS=122361919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	122389248	rs1185260	A	G	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=548;SC=ATTTCCCAAGACAGCAAGTTC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=122389256;WS=122389238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	122391963	rs1154513	A	G	1848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=1;PP=1529;SC=AAAATATCGTATTGATAAATG;SOR=6.556;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=49;WE=122391971;WS=122391953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	122394921	rs11043271	A	C	2108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=1;PP=1833;SC=ATTAGGTATTATATAGATGCT;SOR=6.837;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=59;TCF=58;TCR=1;TR=59;WE=122394929;WS=122394911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	122409664	rs658957	T	C	868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=20;PP=643;SC=ATCTTTGTGATATGGTTTGGC;SOR=2.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=122409672;WS=122409654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	122439369	rs1182927	T	C	4569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=88;NR=52;PP=2965;SC=GCCTCAAGAGTTAAACAATCA;SOR=1.350;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=89;TCR=53;TR=140;WE=122439377;WS=122439359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr12	122492598	rs2280573	A	G	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=73;ReadPosRankSum=-0.844;SC=TGTAGCCTTCAAAGACCACTG;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=8;WE=122492606;WS=122492588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr12	122497001	rs28629903	T	C	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.139;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=901;ReadPosRankSum=0.222;SC=CCCCAAGGATTTGGAAGGAGT;SOR=0.968;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=60;TCF=41;TCR=19;TR=41;WE=122497009;WS=122496991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,38:0.67:57
chr12	122516897	rs147186759	G	A	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.678;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=346;ReadPosRankSum=-0.891;SC=CCTCCGGCGCGGCCACCCCGG;SOR=3.258;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=19;WE=122516905;WS=122516887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr12	122611620	rs75503016	A	G	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.145;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=-0.783;SC=CAGTATCCCCACCATGCCCTG;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=5;WE=122611628;WS=122611618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
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chr12	122612325	rs7488393	G	A	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=378;ReadPosRankSum=0.088;SC=GAAGGAAAGGGTACCTGGGAA;SOR=0.303;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=57;TCR=2;TR=21;WE=122612333;WS=122612315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,22:0.37:59
chr12	122612350	rs7486198	G	T	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.960;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=508;ReadPosRankSum=-0.309;SC=GTCTGCCCTAGGGGAGGGGTG;SOR=1.574;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=75;TCF=69;TCR=6;TR=26;WE=122612358;WS=122612340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,30:0.38:80
chr12	122612598	rs7484733	T	C	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=6.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.489;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=455;ReadPosRankSum=-0.391;SC=GCTGGTCCTGTAGGAGAGGCT;SOR=1.050;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=74;TCF=8;TCR=66;TR=24;WE=122612606;WS=122612588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,24:0.32:75
chr12	122612625	rs10847611	C	G	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=2.383;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.57;ReadPosRankSum=1.225;SOR=0.172;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr12	122612635	rs6489238	G	A	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=4.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.96;ReadPosRankSum=0.583;SOR=0.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr12	122613540	rs6489244	T	C	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-2.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=-1.185;SC=TGGGACGTACTTTCTGAGTGA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=6;WE=122613548;WS=122613530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr12	122613599	rs10847853	A	G	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.415;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=194;ReadPosRankSum=2.412;SC=AGGCCTGATTATAGTGCCGGA;SOR=0.396;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=14;WE=122613607;WS=122613589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,15:0.28:53
chr12	122614060	rs7487608	G	T	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.870;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=535;ReadPosRankSum=-0.145;SC=CTCCCTGAGAGTTCTGTATAT;SOR=0.566;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=117;TCF=90;TCR=27;TR=35;WE=122614068;WS=122614050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,35:0.29:119
chr12	122614209	rs5801481	CT	C	1205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.884;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.429;NF=10;NR=31;PP=1259;ReadPosRankSum=0.316;SC=AGGACCCCCACTTTGACATGA;SOR=0.364;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=128;TCF=25;TCR=103;TR=41;WE=122614217;WS=122614199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,47:0.33:141
chr12	122614387	rs7487292	T	G	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=11.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.55;ReadPosRankSum=0.598;SOR=3.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,8:0.22:36
chr12	122615515	rs4758654	C	G	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.978;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=26;PP=663;ReadPosRankSum=-0.115;SC=ACGGTTGCCTCCATCTCCCCC;SOR=2.073;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=49;TCF=4;TCR=45;TR=27;WE=122615523;WS=122615505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,29:0.55:53
chr12	122616759	rs7955571	G	A	2116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.85;ReadPosRankSum=1.348;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,52:0.68:76
chr12	122616766	rs7955575	G	A	2214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=2.223;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.04;ReadPosRankSum=-0.758;SOR=0.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,57:0.72:79
chr12	122618752	rs370257177	G	GT	116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQRankSum=-0.000;QD=8.98;ReadPosRankSum=0.996;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr12	122619486	rs11057291	G	T	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.873;NF=11;NR=0;PP=225;ReadPosRankSum=-1.946;SC=CTCCCAAGGTGCTGGGATTAC;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=11;WE=122619494;WS=122619476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr12	122619528	rs11287019	CT	C	713.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.801;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.780;NF=27;NR=2;PP=529;ReadPosRankSum=1.142;SC=GCCTCTCTATCTTTTTTTTAA;SOR=2.093;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=48;TCF=44;TCR=4;TR=29;WE=122619536;WS=122619518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,33:0.65:51
chr12	122622207	rs11307581	CT	C	2968.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.467;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.06;MQRankSum=0.887;NF=16;NR=67;PP=2968;ReadPosRankSum=0.193;SC=GGATCTGTGTCTTGTCTGGAA;SOR=1.194;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=142;TCF=24;TCR=118;TR=83;WE=122622215;WS=122622197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,94:0.57:166
chr12	122623000	rs4758686	T	C	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.348;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=34;PP=908;ReadPosRankSum=-0.022;SC=TGCAGAAGACTGTGGAGTACA;SOR=0.451;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=54;WE=122623008;WS=122622990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,56:0.76:74
chr12	122625212	rs7488857	A	G	190.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=127;ReadPosRankSum=1.097;SC=TTTTGATCGCATGTTTGTGCT;SOR=0.582;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=9;WE=122625220;WS=122625202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr12	122626842	rs4758685	G	A	3036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.196;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=46;PP=2339;ReadPosRankSum=-0.404;SC=GTTGGAAGGCGTCTTTCTTTC;SOR=1.046;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=191;TCF=109;TCR=82;TR=116;WE=122626850;WS=122626832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,119:0.61:194
chr12	122657271	rs7974857	G	C	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=578;ReadPosRankSum=-0.159;SC=ACACGAGCACGCCCTTCTCTT;SOR=0.771;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=26;WE=122657279;WS=122657261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr12	122658379	rs61955584	T	C	1828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.678;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.99;ReadPosRankSum=-1.480;SOR=0.623;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,68:0.56:122
chr12	122658383	rs6489173	A	G	4862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.59;SOR=1.057;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr12	122668965	rs10847623	T	C	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=2;PP=289;SC=CTAAACTCTATCCCTAATCGT;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=122668973;WS=122668955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr12	122674032	rs10847725	C	T	2395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=29;PP=1748;SC=TTCTCAGAGCCGAGATCAATT;SOR=1.150;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=43;TCR=29;TR=72;WE=122674040;WS=122674022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr12	122674143	rs11060051	G	C	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.630;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=416;ReadPosRankSum=-1.015;SC=CCCCTCCCAGGCCCCTTTCCT;SOR=0.426;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=23;WE=122674151;WS=122674133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr12	122674780	rs11060094	C	A	5679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=81;NR=83;PP=2965;SC=CCTGGTGCTGCAGGGAAACCC;SOR=0.740;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=81;TCR=83;TR=164;WE=122674788;WS=122674770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr12	122675882	rs67032306	C	T	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=2;PP=455;SC=TATCTGCCAACTTCCATTCCA;SOR=3.383;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=17;WE=122675890;WS=122675872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	122684732	rs118113211	C	G	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.729;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=17;PP=930;ReadPosRankSum=-0.118;SC=CCTCCCTCCCCAAGGACTGTC;SOR=0.941;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=103;TCF=71;TCR=32;TR=58;WE=122684740;WS=122684722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,61:0.57:107
chr12	122684966	rs11060679	G	C	1655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=34;PP=1469;SC=CATGGGAGCCGCACTCCCTGG;SOR=1.314;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=52;WE=122684974;WS=122684956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr12	122685140	.	A	AGGGGGAGAAAGACAAGAAAGG	2986.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.765;ClippingRankSum=0.000;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=4.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.31;MQRankSum=5.117;QD=36.87;ReadPosRankSum=0.637;SOR=0.317;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,54:0.67:81
chr12	122689109	.	C	CCCG	2056.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=22;NR=8;PP=1339;SC=TCGCTTCGACCCCGCCGCCGC;SOR=2.511;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=30;WE=122689117;WS=122689099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr12	122691738	rs4758675	C	A	6262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=96;PP=2965;SC=GTGCCTGAGGCGGCTGGGGCT;SOR=0.714;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=189;TCF=93;TCR=96;TR=188;WE=122691746;WS=122691728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr12	122720338	.	C	G	2032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=16;PP=1584;ReadPosRankSum=0.091;SC=CTTACTTGCTCATTAACATCA;SOR=0.616;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=74;TCR=23;TR=67;WE=122720346;WS=122720328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,70:0.69:102
chr12	122723317	.	T	TAC	912.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.863;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQRankSum=-0.681;QD=19.84;ReadPosRankSum=-0.523;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,38:0.83:46
chr12	122724291	rs11057249	C	T	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=581;SC=AGTGAGACTCCGTCTCAAAAA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=19;WE=122724299;WS=122724281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	122760929	.	CCA	C	488.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.000;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=11.742;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=1.690;QD=4.33;ReadPosRankSum=-1.363;SOR=1.946;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,26:0.23:113
chr12	122804034	rs3825097	A	G	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=99;ReadPosRankSum=-1.408;SC=ATCAGTCACAATCCAGTGCTG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=122804042;WS=122804024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr12	122835455	.	G	A	307.89	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.782;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=260;ReadPosRankSum=1.859;SC=TTAAACACATGAATGTGTGGA;SOR=3.418;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=11;WE=122835463;WS=122835445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr12	122862560	rs55834409	C	G	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=38;PP=1046;SC=CAGACAACCTCTAACTTAAAG;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=38;WE=122862568;WS=122862550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	122865029	rs1803290	T	C	3847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=83;PP=2965;SC=TGTTTCTCCTTTGCCTGTTGC;SOR=2.142;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=28;TCR=83;TR=111;WE=122865037;WS=122865019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr12	122964859	.	C	G	1357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.135;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.001;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=28;PP=1078;ReadPosRankSum=1.317;SC=TCAGTGCCATCTATTACAGAC;SOR=0.884;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=68;TCF=28;TCR=40;TR=47;WE=122964867;WS=122964849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,49:0.70:70
chr12	122995480	rs113783639	C	G	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=148;ReadPosRankSum=0.082;SC=CCTGCAGTCCCAGCTACTCGG;SOR=0.430;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=11;WE=122995488;WS=122995470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr12	123031379	rs200482729	AT	A	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.93;ReadPosRankSum=-1.359;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr12	123186880	rs28682471	C	T	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=66.905;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.60;MQRankSum=-8.465;QD=2.27;ReadPosRankSum=-0.828;SOR=5.393;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:177,35:0.17:212
chr12	123186900	rs7314976	G	A	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=27.998;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.96;MQRankSum=-7.387;QD=1.70;ReadPosRankSum=-1.187;SOR=3.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,24:0.14:173
chr12	123200099	rs61955034	T	C	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.896;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.178;NF=29;NR=4;PP=743;ReadPosRankSum=-0.975;SC=TTCCAGGAAATCTTAGGCCGA;SOR=0.382;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=51;TCF=46;TCR=5;TR=33;WE=123200107;WS=123200089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,32:0.65:49
chr12	123200247	rs56308926	G	C	3023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=61;PP=2736;SC=CGGAGTTGGCGATTAACGCCT;SOR=1.305;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=39;TCR=61;TR=100;WE=123200255;WS=123200237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr12	123200334	rs116821988	T	C	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=58.003;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.18;MQRankSum=-5.267;QD=16.55;ReadPosRankSum=1.620;SOR=7.168;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,35:0.57:61
chr12	123200354	rs200905183	G	A	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=37.087;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.49;MQRankSum=5.467;QD=7.05;ReadPosRankSum=-0.550;SOR=0.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
chr12	123200527	rs118091133	T	C	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.53;MQRankSum=-3.727;QD=2.99;ReadPosRankSum=0.786;SOR=1.819;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr12	123200693	rs17884481	A	G	1850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.527;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.194;NF=51;NR=18;PP=1410;ReadPosRankSum=-1.715;SC=AGGGGCAGGAAGAACTCCAGG;SOR=1.354;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=121;TCF=83;TCR=38;TR=69;WE=123200701;WS=123200683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,69:0.58:119
chr12	123200768	rs1798192	T	G	3021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.756;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.739;NF=60;NR=41;PP=2259;ReadPosRankSum=-0.918;SC=ACATTTGCAGTGCCATTCTGG;SOR=0.987;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=163;TCF=87;TCR=76;TR=101;WE=123200776;WS=123200758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,108:0.64:169
chr12	123200937	rs1696352	T	G	3623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=7.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.145;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.989;NF=71;NR=52;PP=2944;ReadPosRankSum=1.178;SC=CCGTGAGGAATATGATGCTGC;SOR=0.303;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=195;TCF=121;TCR=74;TR=123;WE=123200945;WS=123200927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,127:0.63:200
chr12	123201291	rs3825156	A	G	2475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.219;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.623;NF=45;NR=70;PP=2265;ReadPosRankSum=-0.293;SC=TCATGAGTGCAGCTAGTGAGT;SOR=0.594;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=74;TCR=115;TR=115;WE=123201299;WS=123201281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,100:0.58:173
chr12	123265952	rs1798563	A	G	2860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=84;PP=2518;SC=ATTAGATTTGACCGGGCACGG;SOR=5.622;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=4;TCR=84;TR=88;WE=123265960;WS=123265942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr12	123276749	.	GT	G	177.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.206;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQRankSum=0.257;QD=8.46;ReadPosRankSum=0.705;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr12	123281967	rs10744394	G	A	6026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=114;PP=2965;SC=ATCCTTCTCTGTCACATAAGA;SOR=1.361;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=182;TCF=68;TCR=114;TR=182;WE=123281975;WS=123281957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr12	123290951	rs201885799	GTTT	G,GT	1046.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=10.005;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.555;QD=22.27;ReadPosRankSum=0.296;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:7,16,24:0.34,0.51:47
chr12	123297718	rs4759391	T	A	918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=1;PP=759;SC=AGCCTGGGCGTCAGAGCAAGA;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=123297726;WS=123297708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr12	123307754	rs7954285	CA	TG	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=872;SC=GTGATCCGCCCACCCTGGCCT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=15;WE=123307763;WS=123307744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	123333065	rs2135014	C	T	4620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=70;PP=2965;SC=TCTGGTCCTACGCCATTGGGC;SOR=0.734;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=144;TCF=73;TCR=71;TR=143;WE=123333073;WS=123333055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr12	123334929	.	G	T	228	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;FR=0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=28;MQ=57.24;NF=1;NR=11;PP=228;QD=21.8976010456;SC=GCCGCTGGGTGGGGGGGGCCC;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=12;WE=123334937;WS=123334919;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr12	123334946	.	G	A	109	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=28;MQ=55.81;NF=0;NR=6;PP=109;QD=23.9618687579;SC=GCCCTGGTTCGGTGGCCGCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=6;WE=123334954;WS=123334936;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:7,6:0.46:13
chr12	123335240	.	T	TG	179	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=6;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=25;MQ=48.03;NF=5;NR=1;PP=179;QD=34.0;SC=GCCGCTGGGTTGGGGGGCCCT;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=123335248;WS=123335230;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr12	123335287	rs12369846	A	G	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=0;PP=259;SC=GCCCTGGTTCAGTGGCCGCTG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=123335295;WS=123335277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	123335483	rs2271048	A	G	2584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.56;SOR=1.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	123335488	rs2271049	G	A	2618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.39;SOR=1.903;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr12	123335527	rs2271050	C	T	1075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=27;PP=828;SC=CCGCGTCTCACGCCCAGGCGT;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=32;WE=123335535;WS=123335517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr12	123338887	rs202007426	GAA	G	315.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.73;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr12	123339344	rs2292136	A	G	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=0;PP=1219;SC=GCCCGGTCTCAGGTGATCTCT;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=37;WE=123339366;WS=123339334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	123339358	rs2292137	C	G	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=1;PP=749;ReadPosRankSum=0.270;SC=GATCTCTGATCTGTGAGTTTG;SOR=1.659;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=31;WE=123339366;WS=123339334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,32:0.68:47
chr12	123339712	rs2292138	A	G	7063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=147;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.918;SC=CCCTTTGAGGACCCCAGGCAC;SOR=0.728;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=218;TCF=70;TCR=148;TR=217;WE=123339720;WS=123339702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,219:1.00:220
chr12	123340453	rs11418615	G	GC	3681.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=54;PP=2957;SC=AGCTGGAGGTGCGGGGTGGGG;SOR=0.880;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=90;TCF=31;TCR=59;TR=83;WE=123340461;WS=123340443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr12	123341289	rs897386	A	C	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.26;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	123341297	rs897385	A	G	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.52;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	123341833	rs7138398	G	C	4768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=97;PP=2965;SC=CTGTCTCCGTGATCTGCCTGT;SOR=1.814;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=40;TCR=97;TR=137;WE=123341841;WS=123341823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr12	123341863	rs2343109	G	C	3234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=94;PP=2617;SC=TTCATGTAAAGGGGATCATAC;SOR=3.513;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=15;TCR=94;TR=109;WE=123341871;WS=123341853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr12	123342628	rs34131980	CCTCTT	C	2521.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=17;PP=2129;SC=TCTAACCTGTCCTCTTCACCC;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=38;TCF=20;TCR=18;TR=37;WE=123342640;WS=123342618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr12	123343571	rs2343110	T	G	9267.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=71;NR=101;PP=2965;SC=AGCCTGTCGGTGGGGGGGGCT;SOR=1.055;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=197;TCF=84;TCR=113;TR=172;WE=123343580;WS=123343561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr12	123343572	rs5801491	G	GGC	9258.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=94;PP=2983;SC=GCCTGTCGGTGGGGGGGGCTC;SOR=1.070;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=143;TCF=41;TCR=102;TR=134;WE=123343580;WS=123343561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr12	123344910	rs937765	A	C	2755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=11;PP=2215;SC=CTTGAGGGCCACTTTCCACCT;SOR=3.428;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=67;TCR=11;TR=77;WE=123344918;WS=123344900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	123345347	rs7306948	G	A	2832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=44;PP=2256;SC=CTTGCACGCCGACAGCAGCAC;SOR=0.979;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=35;TCR=44;TR=79;WE=123345368;WS=123345337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr12	123345360	rs7298176	T	C	2579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=37;PP=2036;SC=AGCAGCACACTGGGCTCTGGG;SOR=0.717;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=40;TCR=37;TR=77;WE=123345368;WS=123345337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr12	123345736	rs10847910	C	G	7520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=107;PP=2965;SC=AGATGGAGACCCAGGTAGGCG;SOR=1.083;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=77;TCR=107;TR=184;WE=123345744;WS=123345726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr12	123345756	rs3215148	G	GC	6666.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=84;PP=2966;SC=GCCCATGGCTGCCCCGTGACC;SOR=1.142;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=45;TCR=91;TR=125;WE=123345764;WS=123345746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr12	123352179	rs3825143	C	T	2302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=57;PP=1887;SC=AACCTGGTTACAGGGACAGCC;SOR=2.995;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=12;TCR=57;TR=69;WE=123352187;WS=123352169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr12	123425575	rs4148866	C	T	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.620;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=36;PP=900;ReadPosRankSum=0.466;SC=CCTGTCCCACCGATACCCGAC;SOR=0.512;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=154;TCF=36;TCR=118;TR=49;WE=123425583;WS=123425565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,50:0.32:156
chr12	123433137	rs10848106	T	C	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=3;PP=714;SC=GCTGCCAGGGTGCACAGTCCC;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=123433145;WS=123433127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	123460297	rs148367749	TAGAG	T	4251.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.07;MQRankSum=0.707;NF=49;NR=32;PP=2966;ReadPosRankSum=-0.090;SC=AACTGAGGCTTAGAGAGTGAA;SOR=0.682;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=131;TCF=79;TCR=52;TR=81;WE=123460308;WS=123460287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,106:0.68:157
chr12	123460823	rs883563	A	G	1527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=11;PP=1187;SC=CTGCTGCCCCACTCCCTCCTC;SOR=2.564;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=54;WE=123460831;WS=123460813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	123460962	rs884956	T	C	3395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=59;PP=2616;SC=CATCTAGGGGTTCTCATCCCA;SOR=0.862;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=49;TCR=60;TR=108;WE=123460970;WS=123460952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr12	123466111	rs55742290	C	T	3090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=38;PP=2399;SC=CCCTCCTGGCCTTCCAGCCTC;SOR=1.143;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=91;TCF=52;TCR=39;TR=90;WE=123466119;WS=123466101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr12	123471402	rs2049506	T	C	2320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=54;PP=1898;SC=CGTCTCATGGTCACCCCTTCC;SOR=2.472;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=16;TCR=54;TR=70;WE=123471410;WS=123471392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr12	123473254	rs1463877	T	C	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=5;PP=1072;SC=TCCTGGGAGGTCCCAGGCCCC;SOR=3.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=39;WE=123473262;WS=123473244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	123475122	.	C	G	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=0.000;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.723;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=608;ReadPosRankSum=0.408;SC=GTGTAGCTCTCAGCCATGCCT;SOR=0.779;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=121;TCF=65;TCR=56;TR=38;WE=123475130;WS=123475112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,38:0.31:121
chr12	123476586	rs7135296	G	A	1492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=42;PP=1208;SC=GGCAGGGGTCGGGCCAAGCCT;SOR=6.229;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=43;WE=123476594;WS=123476576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	123477311	rs937564	T	C	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=13;PP=294;SC=GGTTGTCTGCTGAAAGTTAGG;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=123477319;WS=123477301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	123485188	rs883263	A	G	2760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=27;PP=2221;SC=GCCTCTCCCCAGACAGTACCC;SOR=2.006;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=71;TCR=27;TR=98;WE=123485196;WS=123485178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr12	123645803	rs1051431	G	A	5928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=91;PP=2965;SC=TACACTGTTCGTAGCTAACTG;SOR=0.746;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=93;TCR=91;TR=183;WE=123645811;WS=123645793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr12	123647725	rs1727296	G	C	4252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=110;PP=2965;SC=CCTTCTATATGTATCAGCATA;SOR=4.926;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=9;TCR=110;TR=119;WE=123647733;WS=123647715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr12	123651162	rs1716167	A	G	1359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=6;PP=1039;SC=CTAAGAAAACATAACATCCCT;SOR=3.398;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=42;TCR=6;TR=48;WE=123651170;WS=123651152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	123651398	.	C	T	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.752;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.141;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=27;PP=644;ReadPosRankSum=-1.767;SC=ACTGCATGTGCATATAAAACA;SOR=1.321;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=54;TCF=9;TCR=45;TR=31;WE=123651406;WS=123651388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,32:0.56:57
chr12	123664514	rs1727301	G	A	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=-0.578;SC=CAAGCAATTTGTTCTCAGTTG;SOR=0.434;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=31;TCF=10;TCR=21;TR=8;WE=123664522;WS=123664504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr12	123665695	rs1727306	A	G	2522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=49;PP=2242;SC=TAGAACATGAACCATTACCCC;SOR=1.223;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=83;TCF=33;TCR=50;TR=82;WE=123665713;WS=123665685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr12	123679171	.	A	ATT	269.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=10;PP=168;SC=GACAAACATAATTTTTTTTTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=10;WE=123679179;WS=123679161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	123682594	rs11610710	G	A	281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=264;SC=CCGCGCCACTGCACTCCAGCC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=123682602;WS=123682592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	123694724	rs2682434	C	T	2141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=48;PP=1704;SC=TGTGCACAAACACACAGAATA;SOR=2.105;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=16;TCR=48;TR=64;WE=123694732;WS=123694714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr12	123699200	rs77954523	GTTT	G	2271.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=2;PP=1699;SC=TAGGCAAGTTGTTTTTTAAAA;SOR=5.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=48;TCR=2;TR=46;WE=123699210;WS=123699190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr12	123699520	rs1727322	A	G	2700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=11.461;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=73;PP=2233;ReadPosRankSum=0.421;SC=GCCAGGCGTGATAGCTCACGC;SOR=5.157;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=79;TCF=6;TCR=73;TR=78;WE=123699528;WS=123699510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr12	123703103	rs2851451	T	C	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=21;PP=462;SC=GACAGAGTCTTGCTGTGTCGC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=123703111;WS=123703093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	123707527	rs34047404	GTA	G	1966.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=10;PP=2531;ReadPosRankSum=-0.206;SC=GTGTGTGTGTGTATATGTACG;SOR=3.912;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=86;TCF=76;TCR=10;TR=83;WE=123707537;WS=123707517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr12	123707552	rs36043549	TA	T	3750.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=18;PP=2979;SC=TATATGTATATAAAAAAAGGA;SOR=3.258;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=139;TCF=116;TCR=23;TR=121;WE=123707560;WS=123707542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr12	123710835	rs1626703	A	C	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=2;PP=481;SC=AAATAATTACACTTAGCAGTT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=123710843;WS=123710825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	123715113	rs941306	C	T	188.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.54;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=80;SC=AAAAAGCCACCAAAGCTAGCA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=123715121;WS=123715103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr12	123738678	rs1568427	A	G	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=363;SC=TCCCTGAGCCATTCCTCCCTA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=123738686;WS=123738668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	123746357	rs4759416	C	G	6232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=109;NR=81;PP=2965;SC=ATGCCTGAAACAGAGGCAGAG;SOR=0.995;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=190;TCF=109;TCR=81;TR=190;WE=123746365;WS=123746347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr12	123746510	rs4759417	C	T	2645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=74;PP=2208;SC=CCCTGAAGGACGCTAACAATC;SOR=7.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=75;TCF=1;TCR=74;TR=75;WE=123746518;WS=123746500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr12	123746542	.	CCCT	C	493.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.263;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=503;ReadPosRankSum=-2.281;SC=TAAAGCCCTTCCCTCCTCACC;SOR=0.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=14;WE=123746552;WS=123746532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,15:0.31:48
chr12	123756210	.	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=105;ReadPosRankSum=-0.967;SC=GCCAGGCCGCGAGGGCGGCGG;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=123756218;WS=123756200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr12	123794022	rs6488867	T	C	5666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=112;PP=2965;SC=CTTCACAACATTTTCTAAACT;SOR=1.667;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=54;TCR=112;TR=165;WE=123794030;WS=123794012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr12	123794450	rs2277343	A	T	715.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.63;SOR=6.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	123799974	rs6488868	A	G	4094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=44;PP=2965;SC=CCCTTCTATCACCATGTGTAA;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=95;TCR=44;TR=139;WE=123799982;WS=123799964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr12	123801672	rs10846515	T	G	3519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=15;PP=2743;SC=GGCGTGAGCCTCTGTGCCCGG;SOR=3.811;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=107;TCR=15;TR=121;WE=123801680;WS=123801662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr12	123810662	rs111400678	A	AC	2641.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.50;QD=32.22;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr12	123810873	rs61388686	G	A	6297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=123;PP=2965;SC=GCTCTCTGGCGATGACCCACT;SOR=1.435;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=65;TCR=123;TR=188;WE=123810881;WS=123810863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr12	123812207	rs7959415	C	T	6585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=161;NR=37;PP=2965;SC=GAATAACACACTTCTTAGATT;SOR=2.868;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=199;TCF=162;TCR=37;TR=198;WE=123812215;WS=123812197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr12	123812611	rs10846517	A	G	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=19;PP=525;SC=TCACATTAGTATTAAGTAAGA;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=123812619;WS=123812601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr12	123812629	rs28419092	G	C	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=562;SC=AGAATCTCCAGTCTTTCAAGA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=123812637;WS=123812619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	123813493	rs7301163	C	A	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=22;PP=660;SC=TTTCTCTCTGCAACATTCATC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=123813501;WS=123813483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	123815146	.	TAA	T	109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=0.736;QD=8.44;ReadPosRankSum=-0.204;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr12	123815668	rs6488869	A	C	1125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=1;PP=962;SC=CACCATGACGACCGGCTGATT;SOR=5.610;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=33;WE=123815676;WS=123815658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr12	123816007	rs11282939	T	TATGTTG	2672.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=52;PP=2972;SC=GGAGTAGGAATATGTTATGTT;SOR=6.770;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=66;TCF=2;TCR=64;TR=53;WE=123816015;WS=123815997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr12	123821234	rs7486223	T	A	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=694;SC=GACAATGAGGTCCTACTCTGT;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=123821242;WS=123821224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	123825389	rs7315453	T	C	286.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=237;SC=TCCAGCGAGGTTTAAGCATAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=123825397;WS=123825379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	123832710	rs11325003	TA	T	5173.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=106;PP=2966;SC=AGACAAAAAATAAAAGGACAG;SOR=1.639;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=143;TCF=31;TCR=112;TR=134;WE=123832718;WS=123832700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr12	123832746	rs10846523	G	A	3883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=98;PP=2965;SC=CAAGGACAAGGTTTGCATTTA;SOR=2.651;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=125;TCF=26;TCR=99;TR=123;WE=123832754;WS=123832736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr12	123875394	rs28660993	C	T	5055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=127;PP=2965;SC=AGCCTCTGTCCTCTGCAAGAA;SOR=3.702;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=21;TCR=127;TR=148;WE=123875402;WS=123875384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr12	123907750	rs72279533	GT	G	123.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.12;ReadPosRankSum=2.144;SOR=0.384;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr12	123960444	.	ATTTTTTTT	A	68.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.16;MQRankSum=0.610;QD=6.87;ReadPosRankSum=1.579;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr12	123960474	rs28971833	A	G	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.449;NF=1;NR=5;PP=131;ReadPosRankSum=-0.346;SC=TTTTTGAGACAGAGTCTCACT;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=123960482;WS=123960464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr12	123969828	rs11522343	A	G	1256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.871;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=37;PP=992;ReadPosRankSum=0.852;SC=AAAGGGCCACATAGACCATTA;SOR=0.532;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=92;TCF=24;TCR=68;TR=51;WE=123969836;WS=123969818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,52:0.54:96
chr12	123983941	rs9697264	G	A	2479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.819;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=25;PP=2024;ReadPosRankSum=-0.953;SC=GAGGGTGGACGCAGGTCAGGG;SOR=0.570;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=136;TCF=102;TCR=34;TR=99;WE=123983949;WS=123983931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,96:0.72:134
chr12	124008073	rs2292500	A	G	4632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=75;PP=2965;SC=CCTCTGAGAAATTGACATCCT;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=147;TCF=72;TCR=75;TR=147;WE=124008081;WS=124008063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr12	124017850	rs28492040	G	C	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=25;PP=1214;ReadPosRankSum=0.384;SC=GGATCTCCAGGACGCGCACGA;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=104;TCF=60;TCR=44;TR=57;WE=124017858;WS=124017840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,61:0.56:108
chr12	124069111	rs71088937	GGGC	G	856.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=11;NR=8;PP=953;SC=GAAGGCAGCGGGGCGGCGGCG;SOR=1.127;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=19;WE=124069121;WS=124069101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr12	124069213	rs786446	T	C	1421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=18;PP=1127;SC=TGCTGGTGCTTCTGGCCGCTC;SOR=1.251;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=46;WE=124069221;WS=124069203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	124072268	rs35178369	G	T	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=343;ReadPosRankSum=-1.495;SC=ACCTCAGTTTGTTGGCATGAG;SOR=0.593;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=17;WE=124072276;WS=124072258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr12	124086620	rs786427	G	C	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=2;PP=311;SC=CTGGAGCTGCGGGAAGCGGAA;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=124086628;WS=124086610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr12	124086998	rs786428	C	G	276.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=227;SC=AGAGGGGCCGCGACCCACCCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=124087006;WS=124086988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr12	124090453	rs786436	A	G	2426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=30;PP=1860;ReadPosRankSum=0.737;SC=TCCTTTAACCAGTGCTTTGCA;SOR=0.597;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=83;TCF=53;TCR=30;TR=81;WE=124090461;WS=124090443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,85:0.99:86
chr12	124090605	rs4047521	ACT	A	7757.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.198;NF=85;NR=65;PP=2969;ReadPosRankSum=0.774;SC=GGAAACCAAAACTCTCTGTTT;SOR=0.507;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=165;TCF=90;TCR=75;TR=150;WE=124090614;WS=124090595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,187:0.99:188
chr12	124102562	.	G	GT	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=12.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQRankSum=-1.066;QD=3.99;ReadPosRankSum=0.499;SOR=0.016;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr12	124207098	rs7301641	T	C	2054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=51;PP=1600;SC=TTCTCAAAACTATGGAAGATG;SOR=3.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=7;TCR=51;TR=58;WE=124207106;WS=124207088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	124209332	rs1139789	T	C	5656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=90;PP=2782;ReadPosRankSum=-1.126;SC=TGAAACGCAATGTTGAGGTAC;SOR=1.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=43;TCR=91;TR=132;WE=124209340;WS=124209322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,141:0.99:143
chr12	124209352	rs11837144	C	T	5238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.240;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=95;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.107;SC=CTGAACAGCTCGTGAGGAAAT;SOR=2.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=121;TCF=25;TCR=96;TR=119;WE=124209360;WS=124209342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,122:0.98:124
chr12	124210782	rs1399961	T	C	1849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=27;PP=1301;SC=CCTTAGAGAGTGATTCTTTGT;SOR=0.854;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=31;TCR=27;TR=58;WE=124210790;WS=124210772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr12	124218359	rs10744159	T	G	1663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=3;PP=1421;SC=AAATAAGGAGTATTGACTGTA;SOR=4.935;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=45;TCR=3;TR=48;WE=124218367;WS=124218349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr12	124220055	rs2271660	T	C	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=20;PP=1132;SC=GATGTGAGACTGTGTTCAACT;SOR=1.220;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=33;TCR=20;TR=53;WE=124220063;WS=124220045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr12	124220354	rs2333838	A	C	186.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=120;SC=ACTTGTTAGGAACCTGAGTAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=124220362;WS=124220344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	124229429	rs7135542	T	C	4386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=83;PP=2965;SC=TTTGTTACAGTGACAGCGTCG;SOR=0.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=65;TCR=83;TR=148;WE=124229437;WS=124229419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr12	124258887	rs7131750	T	C	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=28;PP=888;SC=CACAAATAGGTAGCGGGCAGC;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=124258895;WS=124258877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	124265510	.	G	A	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.186;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.87;MQRankSum=-2.205;QD=5.41;ReadPosRankSum=-1.842;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr12	124265513	.	T	A	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.81;MQRankSum=-2.886;QD=4.04;ReadPosRankSum=-1.108;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr12	124265687	rs11057353	T	C	5576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=69;PP=2965;SC=GGGAGTCACATCTGGAGAAGT;SOR=1.085;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=97;TCR=69;TR=166;WE=124265695;WS=124265677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr12	124267638	rs11057354	A	G	1704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=11;PP=1331;SC=CTGACTGATCACTTTTATTTT;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=48;TCR=11;TR=59;WE=124267646;WS=124267628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	124267703	rs11057355	T	C	2290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=44;PP=1646;SC=GAGAGGTGTCTGACCTGGCAG;SOR=0.968;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=35;TCR=44;TR=78;WE=124267711;WS=124267693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr12	124268458	rs7303002	A	G	2312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=2;PP=1899;SC=CCACCCTAATAATGAGAGTTC;SOR=6.154;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=64;TCF=62;TCR=2;TR=63;WE=124268466;WS=124268448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr12	124274474	rs10846559	A	G	3296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=21;PP=2571;ReadPosRankSum=-0.242;SC=GATTGGACAGATTTTGGAGGA;SOR=1.630;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=77;TCR=22;TR=95;WE=124274482;WS=124274464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,103:0.97:106
chr12	124274758	rs35056478	C	CT	354.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=275;ReadPosRankSum=0.749;SC=GATGCTTAGTCTTTTTTTTTA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=14;WE=124274766;WS=124274748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr12	124281419	rs368845242	AT	A	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQRankSum=-0.611;QD=2.22;ReadPosRankSum=-0.408;SOR=0.202;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr12	124325977	rs4930729	T	G	3786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=70;PP=2843;SC=TCGGAAGATCTTGCGGGCTGA;SOR=0.889;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=58;TCR=70;TR=128;WE=124325985;WS=124325967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr12	124330440	rs4930728	G	A	4090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.946;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=89;PP=2962;ReadPosRankSum=0.505;SC=GGGGTCACTGGCATTTCAAAA;SOR=0.910;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=242;TCF=107;TCR=135;TR=153;WE=124330448;WS=124330430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,151:0.62:244
chr12	124332702	rs10846561	A	G	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=83;ReadPosRankSum=-0.179;SC=AAAGCAGGACATGGCATTTCA;SOR=0.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=7;WE=124332710;WS=124332692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr12	124333519	rs7960854	C	T	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=226;ReadPosRankSum=0.665;SC=GTTTCTGGGCCGTTGACACTC;SOR=0.507;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=12;WE=124333527;WS=124333509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr12	124350360	rs7313897	G	C	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=516;SC=CAGTTAAAAAGCTCATGGAAG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=124350368;WS=124350350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	124350444	rs7314963	C	T	2127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=9;PP=1629;SC=CCTTAAACATCTAGTTTATCT;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=51;TCR=9;TR=60;WE=124350452;WS=124350434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr12	124350704	rs10773043	T	C	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=23;PP=549;SC=TGTTTGTAGTTGAAGGCGATG;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=124350712;WS=124350694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	124352338	rs10846565	T	G	1782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=32;PP=1513;SC=ACCAACATGTTGGGTCTTATG;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=51;WE=124352346;WS=124352328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	124360117	rs10846567	G	T	1863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=55;PP=1630;SC=ACTTATCCATGTAGGCACAGC;SOR=8.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=0;TCR=55;TR=55;WE=124360125;WS=124360107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr12	124362256	rs113178558	T	TG	691.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.62;ReadPosRankSum=0.964;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr12	124363724	rs72053758	GTGTC	G	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=358;SC=TGCGCTCTGTGTGTCTGTCTG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=124363735;WS=124363714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr12	124364131	rs1317312	G	C	2011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=7;PP=1601;SC=CAAGTTTCAGGCCGTGTACTG;SOR=3.647;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=53;TCR=7;TR=60;WE=124364139;WS=124364121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr12	124366150	rs34756279	CT	C	1761.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=4;PP=997;SC=GTTTTGAATTCTTTTTTTTTT;SOR=4.615;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=91;TCF=86;TCR=5;TR=65;WE=124366159;WS=124366140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr12	124383044	rs12306328	T	C	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-4.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=171;ReadPosRankSum=-0.027;SC=TGGCTGATGCTGTCCCAAGTA;SOR=0.317;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=10;WE=124383052;WS=124383034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr12	124387574	rs58411567	G	A	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.719;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=1627;ReadPosRankSum=-0.860;SC=CCGAGGCCGAGACGACCCTGG;SOR=0.825;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=122;TCF=63;TCR=59;TR=40;WE=124387594;WS=124387564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,39:0.31:126
chr12	124387586	rs61587964	A	G	1303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.664;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=1627;ReadPosRankSum=0.583;SC=CGACCCTGGCAGAGGTCATGC;SOR=0.727;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=114;TCF=55;TCR=59;TR=38;WE=124387594;WS=124387564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,37:0.32:116
chr12	124398843	rs113172657	A	ACTG	3968.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=34;PP=2924;SC=CAGAAGGTAAACTCACGGCAG;SOR=0.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=33;TCR=37;TR=65;WE=124398851;WS=124398833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr12	124399155	rs79478560	G	A	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=34;PP=1109;SC=GGGGGTCTACGTGGGTGTCAC;SOR=3.109;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=41;WE=124399163;WS=124399145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr12	124409502	rs7133378	G	A	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=3;PP=699;SC=ATGGATTCTCGTCCCTTTCCA;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=124409510;WS=124409492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	124414098	rs3802999	C	T	1327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=19;PP=1067;SC=GACTTTCCTCCGGGTTCAACC;SOR=0.793;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=19;TCR=20;TR=38;WE=124414106;WS=124414088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	124415916	rs200478023	C	G	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.005;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=13;PP=867;ReadPosRankSum=-2.389;SC=CGCTTGCCAACACGCCAGAAG;SOR=0.950;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=72;TCF=50;TCR=22;TR=45;WE=124415924;WS=124415906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,47:0.64:73
chr12	124417889	rs4930721	C	T	234.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=1;PP=105;SC=TGACCGAGAGCGAGCCCAGCG;SOR=2.833;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=124417897;WS=124417879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	124418472	rs77020228	C	G	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=0;PP=905;ReadPosRankSum=-0.986;SC=GCCAGAACTTCAGGTCCCTTA;SOR=5.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=31;WE=124418480;WS=124418463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chr12	124418674	rs12298484	C	T	5324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=85;PP=2965;SC=TCCGGGCCACCACTCTCTCTG;SOR=0.870;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=76;TCR=85;TR=161;WE=124418682;WS=124418664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr12	124419062	rs11057396	A	C	2161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=38;PP=1563;SC=GCTGGGGAGGAGGCCAGCCAG;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=30;TCR=39;TR=68;WE=124419070;WS=124419052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr12	124420076	rs113646068	C	CAGGA	2109.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=38;PP=2351;SC=CTGGGGTTGTCAGAGTGATCG;SOR=4.849;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=39;WE=124420084;WS=124420066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	124427169	rs35650208	CCA	C	2454.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=1;PP=2160;SC=AGAGCTCAGGCCACACGCATA;SOR=6.701;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=53;TCF=52;TCR=1;TR=47;WE=124427178;WS=124427159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	124427306	rs11057401	T	A	5291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=0.614;SC=TGTTCCGAACTTTTGACTGTC;SOR=0.988;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=172;TCF=75;TCR=97;TR=170;WE=124427314;WS=124427296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,175:0.99:177
chr12	124427524	rs35825716	G	C	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=22;PP=512;SC=TGGGGTCAGAGGGCACCCTCT;SOR=4.977;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=23;WE=124427532;WS=124427514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	124428162	rs4930725	T	A	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=470;SC=AAACCACGGCTCCTGAAGGGC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=124428170;WS=124428152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr12	124496864	rs80197353	T	G	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=5.018;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.54;ReadPosRankSum=-0.881;SOR=0.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,32:0.24:136
chr12	124497113	rs150362388	A	G	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.64;ReadPosRankSum=-0.429;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:174,35:0.17:209
chr12	124798801	rs12318072	C	T	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.962;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=24;PP=1112;ReadPosRankSum=-0.705;SC=TCTATGCGCCCGTACCCACCG;SOR=0.414;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=169;TCF=112;TCR=57;TR=64;WE=124798809;WS=124798791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,63:0.37:171
chr12	124799387	rs904647	G	A	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=394;ReadPosRankSum=0.695;SC=ATGGGTCCATGGAGTGCCCTT;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=16;WE=124799395;WS=124799377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr12	124810174	rs10846657	G	A	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.076;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=173;ReadPosRankSum=-1.428;SC=CTGTGAGCCCGGCAGCCCCTG;SOR=2.147;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=10;WE=124810182;WS=124810164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr12	124810968	rs1006100	C	T	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.206;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=817;ReadPosRankSum=1.067;SC=AAGACAGCACCGACGCTACGG;SOR=0.303;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=41;WE=124810976;WS=124810958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,42:0.67:63
chr12	124824721	rs143952466	C	CGCCGCTGCT	3185.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=0;PP=2979;SC=CCCCCACCCCCGCCGCTGCTG;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=33;TCR=27;TR=20;WE=124824729;WS=124824711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	124824869	rs61755988	G	A	1529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.135;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=31;PP=1163;ReadPosRankSum=-0.909;SC=GTGCTCCACCGTCGTGGTGGA;SOR=0.815;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=200;TCF=108;TCR=92;TR=71;WE=124824877;WS=124824859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,72:0.35:207
chr12	124825447	rs1702334	A	G	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=21;PP=663;SC=TCCCAGCACCAGCCATGGAAC;SOR=3.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=25;WE=124825455;WS=124825437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	124826462	rs2229840	C	T	1303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.657;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=33;PP=1060;ReadPosRankSum=0.236;SC=GCGGTGGCCGCGTTGTGGTGC;SOR=0.582;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=57;TCR=73;TR=59;WE=124826470;WS=124826452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,57:0.43:132
chr12	124826676	rs12314162	C	T	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=72;ReadPosRankSum=1.457;SC=CTGATGGTGTCGCTCCACCTG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=124826684;WS=124826666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr12	124829234	rs1263992	C	T	1815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.918;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=16;PP=1068;ReadPosRankSum=-1.274;SC=CCTCATAGGTCAGGGGGCTCT;SOR=0.902;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=82;TCF=55;TCR=27;TR=51;WE=124829242;WS=124829224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,51:0.62:82
chr12	124829255	rs1244085	A	G	1792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.797;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=978;ReadPosRankSum=0.209;SC=GCCGCGGCTTACCCAGCTCAG;SOR=0.914;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=89;TCF=56;TCR=33;TR=50;WE=124829263;WS=124829245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,49:0.56:87
chr12	124831067	rs2272370	C	A	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=88;ReadPosRankSum=0.880;SC=GCCACCGCCACCCCTCCTAGA;SOR=0.770;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=5;WE=124831075;WS=124831060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr12	124832474	rs1244065	G	A	2195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=50;PP=1808;SC=AGGAGAGGGTGAGGCCATCAT;SOR=1.852;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=20;TCR=50;TR=70;WE=124832482;WS=124832464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr12	124832492	rs1244064	C	G	1853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=41;PP=1510;SC=CATTCCGTGGCTCCCTGAGCC;SOR=1.727;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=59;WE=124832500;WS=124832482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	124832606	rs1244063	A	G	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=12;PP=804;SC=CGCTACCTCCAGATGGAGCCT;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=33;WE=124832614;WS=124832596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	124835352	rs4765551	A	C	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=199;ReadPosRankSum=-1.471;SC=AAATGCAGGCAAAGACGTGCT;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=11;WE=124835360;WS=124835342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr12	124838591	rs4765555	C	G	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-5.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=156;ReadPosRankSum=0.032;SC=ATGGGCTGGCCCCGTGCTGGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=13;WE=124838599;WS=124838581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
chr12	124838772	rs1244082	C	G	5999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.93;SOR=0.974;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr12	124838772	.	CGT	GGA,GGT	2154	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000,0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=22,70;NR=28,90;PP=840,2154;QD=17.8693574972;SC=GGGCTGAGGGCGTGTCTGTGG;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=160;TCF=70;TCR=90;TR=50,160;WE=124838782;WS=124838762;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.31:160
chr12	124838774	rs3817108	T	A	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=2.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.36;ReadPosRankSum=0.879;SOR=0.530;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,53:0.33:163
chr12	124838897	rs1244081	A	G	2868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=50;PP=2183;SC=TGAGGGAGACAGCTGTGAAGA;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=34;TCR=50;TR=84;WE=124838905;WS=124838887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr12	124839150	rs2271142	G	A	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.038;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=613;ReadPosRankSum=0.999;SC=TAAGAGGAGCGAGTCACGTGC;SOR=0.522;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=64;TCF=16;TCR=48;TR=30;WE=124839158;WS=124839140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,32:0.46:69
chr12	124839165	rs2271141	G	A	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.647;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=576;ReadPosRankSum=-0.880;SC=ACGTGCTGCCGGAGCAGGGTC;SOR=0.260;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=61;TCF=16;TCR=45;TR=28;WE=124839173;WS=124839155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,30:0.47:64
chr12	124839540	rs2271139	C	A	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=452;ReadPosRankSum=-1.528;SC=CCCCCACAGTCCAGAGTGCCT;SOR=0.718;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=20;TCR=67;TR=29;WE=124839548;WS=124839530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,27:0.31:86
chr12	124839867	rs870050	A	G	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=5;PP=791;ReadPosRankSum=0.905;SC=CTGAGTGGAGATGACCCAGGC;SOR=1.280;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=33;WE=124839875;WS=124839857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,33:0.85:39
chr12	124839899	rs870051	T	C	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=274;ReadPosRankSum=-0.922;SC=TGGCCCCCACTCAGACTTCAT;SOR=0.859;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=16;WE=124839907;WS=124839889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,16:0.31:52
chr12	124839945	rs870052	T	C	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.880;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=289;ReadPosRankSum=0.473;SC=ATAAGAAGACTAAGCCCCCAA;SOR=1.303;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=54;TCF=23;TCR=31;TR=18;WE=124839953;WS=124839935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,18:0.32:56
chr12	124841421	rs4765144	C	T	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.896;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=227;ReadPosRankSum=-0.661;SC=GGCCTTCCTGCACCCACAGTA;SOR=1.688;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=13;WE=124841429;WS=124841411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr12	124848137	rs1794956	T	C	3087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=78;NR=20;PP=2222;SC=TGCAGGTGCATGCTCCCGCCC;SOR=2.348;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=78;TCR=20;TR=98;WE=124848145;WS=124848127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr12	124856660	rs3741513	T	A	7442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=150;PP=2965;SC=AGCTCTTGGCTGTGGTGGCCC;SOR=1.481;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=235;TCF=83;TCR=152;TR=232;WE=124856668;WS=124856650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr12	124857234	rs1702329	C	G	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=30;PP=877;SC=CCTGACCCTCCGGATGAGGCC;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=124857242;WS=124857224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	124859045	rs2695993	A	G	2213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=35;PP=1670;SC=GAAGTGAGGCAGCACCAAGTA;SOR=0.832;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=41;TCR=35;TR=75;WE=124859053;WS=124859035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr12	124859135	rs11057606	G	A	1441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=45;PP=1167;ReadPosRankSum=1.470;SC=GCTGCTGCTCGCTCTCCTGCC;SOR=4.133;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=47;WE=124859143;WS=124859125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr12	124873079	rs7960906	T	G	1798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.962;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=3;PP=1447;ReadPosRankSum=-0.976;SC=GGAGAGGGCATGGGGGAAAGG;SOR=1.842;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=94;TCF=87;TCR=7;TR=59;WE=124873087;WS=124873069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,61:0.64:96
chr12	124873411	.	TGAGG	T	340	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=22;MQ=59.2;NF=1;NR=6;PP=340;QD=49.7142857143;SC=CGTCCCACGGTGAGGGAGGGA;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=7;WE=124873422;WS=124873401;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:13,7:0.35:20
chr12	124885249	rs2293514	C	T	4065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=40;NR=86;PP=2965;SC=GATAGGATGGCTTCACCCGAG;SOR=1.683;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=40;TCR=86;TR=126;WE=124885257;WS=124885239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr12	124885290	rs2293513	T	C	2931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=73;PP=2200;SC=TGGAGGAGACTGTTTCTTTAG;SOR=1.925;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=29;TCR=73;TR=102;WE=124885298;WS=124885280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr12	124887058	rs35831183	G	GGCT	1344.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.818;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.245;NF=3;NR=29;PP=1513;ReadPosRankSum=-0.189;SC=GCGGGGCATGGGCTGCTGCTG;SOR=1.931;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=73;TCF=9;TCR=64;TR=32;WE=124887066;WS=124887048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,39:0.91:43
chr12	124887093	.	C	CTGT	640	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=28;MQ=61.36;NF=2;NR=29;PP=640;QD=20.8064516129;SC=GCTGCTGCTGCTGTTGTTGCT;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=52;TCF=7;TCR=45;TR=31;WE=124887101;WS=124887083;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr12	124907154	rs115355225	G	A	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.639;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=29;PP=591;ReadPosRankSum=-0.148;SC=GCTTTCCTGCGGGGCAGCCGA;SOR=0.348;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=107;TCF=18;TCR=89;TR=36;WE=124907162;WS=124907144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,37:0.34:109
chr12	124915431	rs59053140	T	C	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.42;ReadPosRankSum=1.121;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,9:0.19:47
chr12	124922325	rs1702322	C	T	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=487;SC=TTCCTCCTTTCCTGGCCGGCC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=124922333;WS=124922322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	124934459	rs1147284	C	G	2801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=58;PP=2195;SC=GCTGGCCACTCGCCACTACAG;SOR=2.112;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=21;TCR=58;TR=79;WE=124934467;WS=124934449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr12	124941816	rs2277341	T	C	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=59;ReadPosRankSum=-1.681;SC=CAGTCCAGCATGCTGATCCTC;SOR=0.917;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=7;WE=124941824;WS=124941806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr12	124957627	rs10846679	C	T	1551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=43;PP=1183;ReadPosRankSum=-0.336;SC=GGTCAGTGTGCGGGGGGCTGG;SOR=0.860;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=19;TCR=68;TR=55;WE=124957635;WS=124957617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,59:0.67:88
chr12	124968349	rs747443	T	C	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.345;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=30;PP=676;ReadPosRankSum=0.524;SC=CAACGTCACATAGGAGATTGC;SOR=0.412;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=100;TCF=15;TCR=85;TR=36;WE=124968357;WS=124968339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,38:0.37:102
chr12	124979789	rs872225	T	G	432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.839;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=298;ReadPosRankSum=-0.628;SC=GCTGTGTGGATCCCGACATGG;SOR=0.160;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=53;TCF=9;TCR=44;TR=19;WE=124979797;WS=124979779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,20:0.36:55
chr12	124979833	rs872224	C	G	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=260;ReadPosRankSum=0.366;SC=CTCCCAGGCCCCAATAAGCTT;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=13;WE=124979841;WS=124979823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr12	125263204	rs701104	A	C	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=118;ReadPosRankSum=-0.319;SC=CCCGCCCACCACAGCCCTGTA;SOR=0.527;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=7;WE=125263212;WS=125263194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr12	125284748	rs5888	A	G	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.888;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=826;ReadPosRankSum=0.150;SC=GAACCGGGTCAGCGTTGAGGA;SOR=0.886;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=76;TCF=41;TCR=35;TR=45;WE=125284756;WS=125284738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,45:0.58:78
chr12	125323593	rs112622075	A	G	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=235;ReadPosRankSum=1.077;SC=TACTGGGATTACAGGCATGAG;SOR=0.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=13;WE=125323601;WS=125323583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr12	125324570	.	C	T	1635	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.54;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MMLQ=24;MQ=43.35;NF=46;NR=18;PP=1635;QD=26.090175196;SC=CCCAACGGCACACATGGGCCC;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=64;WE=125324578;WS=125324560;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,64:0.93:69
chr12	125348263	rs4238001	C	T	2689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.523;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=85;PP=2275;ReadPosRankSum=0.079;SC=GCGGAGCAGCCCATGTCTGCG;SOR=0.201;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=150;TCF=17;TCR=133;TR=99;WE=125348271;WS=125348253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,98:0.66:148
chr12	125398039	rs1071862	G	C	2668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.921;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.969;NF=40;NR=60;PP=2164;ReadPosRankSum=0.210;SC=CACTGGGCTCGACCTCAAGGG;SOR=1.029;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=151;TCF=66;TCR=85;TR=100;WE=125398047;WS=125398029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,101:0.64:157
chr12	125400044	rs74801788	C	T	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.381;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=226;ReadPosRankSum=0.906;SC=TTCCACCTTCCTGTACATTCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=10;WE=125400052;WS=125400034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr12	125400206	rs6488957	A	G	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=13;PP=382;SC=TAGAATCCCAACCTTATTTCA;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=125400214;WS=125400196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	125432444	rs117271296	G	A	1174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=949;ReadPosRankSum=1.872;SC=CTGCAGGGGAGGGAAGGAGGA;SOR=0.671;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=71;TCF=42;TCR=29;TR=47;WE=125432452;WS=125432434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,47:0.66:71
chr12	125434434	rs4562928	C	G	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=280;ReadPosRankSum=-0.772;SC=ATGTTTTAAGCCTCCCTGTGT;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=11;WE=125434442;WS=125434424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
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chr12	125434580	rs4447263	C	T	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.836;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=22;PP=1312;ReadPosRankSum=-0.020;SC=CAGACAGCTCCGGTATGAGGC;SOR=0.570;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=95;TCF=63;TCR=32;TR=63;WE=125434588;WS=125434570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,65:0.66:98
chr12	125435388	rs10773125	C	T	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=39;PP=981;ReadPosRankSum=-1.018;SC=AGGGAAGAACCCATGCCCAGG;SOR=0.465;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=56;TCF=4;TCR=52;TR=41;WE=125435396;WS=125435378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,42:0.78:54
chr12	125436850	rs4375522	G	A	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=505;ReadPosRankSum=-0.931;SC=ACAGCTGAGAGGGAACAAGCC;SOR=0.416;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=22;WE=125436858;WS=125436840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr12	125436897	rs4502074	A	G	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.173;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=9;PP=721;ReadPosRankSum=0.149;SC=CCTGCCCCTCACCAGGTGCCC;SOR=0.307;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=65;TCF=53;TCR=12;TR=44;WE=125436905;WS=125436887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,46:0.70:66
chr12	125437019	rs4429156	T	C	2878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.997;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=58;PP=1998;ReadPosRankSum=0.735;SC=CCCCCAGGCCTGCCGTCACGA;SOR=0.551;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=170;TCF=80;TCR=90;TR=111;WE=125437027;WS=125437009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,117:0.67:174
chr12	125437142	rs6488959	C	T	1927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.186;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=52;PP=1423;ReadPosRankSum=-1.300;SC=AGAGTGAGGTCGGTGGTGGCA;SOR=1.197;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=104;TCF=27;TCR=77;TR=67;WE=125437150;WS=125437132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,71:0.66:107
chr12	125437236	rs6488960	A	G	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.923;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=303;ReadPosRankSum=-1.893;SC=GCTTGTCTCAACCCCTCCCCA;SOR=2.876;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=14;WE=125437244;WS=125437226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr12	125438414	rs12367953	A	G	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.344;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=1;PP=583;ReadPosRankSum=-0.785;SC=GCGTGCCGGCACGGGGCCGTA;SOR=1.540;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=65;TCF=62;TCR=3;TR=37;WE=125438422;WS=125438404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,37:0.55:67
chr12	125438516	rs4516060	T	C	3666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=2.267;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.01;ReadPosRankSum=-0.169;SOR=0.944;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,92:0.65:141
chr12	125438523	rs4258464	C	T	3844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=0.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.97;ReadPosRankSum=-0.020;SOR=0.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,100:0.65:154
chr12	125438549	rs4606565	A	G	2931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=38;PP=2311;ReadPosRankSum=-0.423;SC=GCGCCTGGGGAACGAAGAGGG;SOR=0.648;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=89;TCR=58;TR=97;WE=125438557;WS=125438539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,104:0.68:154
chr12	125438616	rs11831506	A	C	1557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=35;PP=1164;ReadPosRankSum=0.308;SC=CCACCCTCCAACGGGCAGGGC;SOR=0.699;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=89;TCR=98;TR=67;WE=125438624;WS=125438606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,69:0.36:194
chr12	125441359	rs10773127	T	C	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=2.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.41;ReadPosRankSum=1.614;SOR=0.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,22:0.27:83
chr12	125441856	rs11057932	G	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=166;ReadPosRankSum=-0.151;SC=GGAACCCCAAGGCCTCCTTTA;SOR=0.208;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=10;WE=125441864;WS=125441846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr12	125444975	rs4765007	T	C	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=440;ReadPosRankSum=0.454;SC=ACAGCCTGGATGGAGAGAAAC;SOR=0.642;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=109;TCF=58;TCR=51;TR=35;WE=125444983;WS=125444965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,36:0.33:110
chr12	125445124	rs73229559	G	T	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=113;ReadPosRankSum=0.636;SC=GTGCTTTACCGCTTCCTGCCT;SOR=0.142;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=8;WE=125445132;WS=125445114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr12	125448960	rs4076777	C	T	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.160;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=524;ReadPosRankSum=0.487;SC=GGCCGGGCTCCGTCCGTCCTG;SOR=1.622;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=56;TCF=52;TCR=4;TR=25;WE=125448968;WS=125448950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,25:0.42:59
chr12	125449470	rs73229567	G	A	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.34;ReadPosRankSum=0.074;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,28:0.26:108
chr12	125450416	rs73229568	G	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=3.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.63;ReadPosRankSum=1.778;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,9:0.18:49
chr12	125451838	rs78702572	G	A	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.009;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=29;PP=647;ReadPosRankSum=0.806;SC=CACCTGCCAAGCCATGCTCTG;SOR=1.460;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=124;TCF=37;TCR=87;TR=37;WE=125451846;WS=125451828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,37:0.31:120
chr12	125453115	rs11057939	C	T	3202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.035;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=66;PP=2318;ReadPosRankSum=0.409;SC=GCAGACCTTCCGGAAGCACTC;SOR=0.986;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=160;TCF=68;TCR=92;TR=110;WE=125453123;WS=125453105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,118:0.70:168
chr12	125453232	rs10773130	A	G	3091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.37;SOR=1.694;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr12	125453232	.	ACAC	GCAA,GCAC	1079	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;FR=0.5000,0.5000;HP=7;HapScore=1;MGOF=8;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=5,24;NR=17,53;PP=454,1079;QD=23.0667215846;SC=AGTGGGGGGGACACGAGCTTC;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=77;TCF=24;TCR=53;TR=22,77;WE=125453243;WS=125453222;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.29:77
chr12	125453235	rs11057940	C	A	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=2.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.60;ReadPosRankSum=1.363;SOR=1.021;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,25:0.29:87
chr12	125453277	rs10846794	G	A	1450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.866;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=1148;ReadPosRankSum=1.721;SC=CCATTATTCCGAATCAAGGTT;SOR=0.543;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=68;TCF=33;TCR=35;TR=48;WE=125453285;WS=125453267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,50:0.69:72
chr12	125453540	rs10846795	G	A	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=31;PP=722;ReadPosRankSum=-0.488;SC=CTCAGTGACCGTGGCCCCAGG;SOR=0.588;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=57;TCF=10;TCR=47;TR=37;WE=125453548;WS=125453530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,40:0.66:61
chr12	125456004	rs4542508	C	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.950;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=165;ReadPosRankSum=-0.773;SC=CCAGCCTAAGCCCCAAGGGCC;SOR=1.329;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=43;TCF=17;TCR=26;TR=13;WE=125456012;WS=125455994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,13:0.30:44
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chr12	125465023	rs4072887	C	T	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=17;NR=7;PP=463;SC=ATCACAAACACGGGGTGGCGA;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=125465031;WS=125465013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	125467158	rs11558556	C	T	1702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=33;PP=1304;SC=GCTTCTGTAGCATCTCTGCTC;SOR=1.101;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=21;TCR=33;TR=54;WE=125467166;WS=125467148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr12	125467238	rs12424339	G	C	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=19;PP=595;SC=AAGTGAGACTGTAATAAAATT;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=125467246;WS=125467228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr12	125509502	rs7303493	C	T	3951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=59;PP=2956;ReadPosRankSum=-1.052;SC=CTGGCCCCTGCGTAACGAGCC;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=68;TCR=60;TR=126;WE=125509510;WS=125509492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,131:0.98:133
chr12	125562809	rs7303092	G	A	4701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=47;NR=94;PP=2965;SC=CACATCTTCCGGGGCTGGGGC;SOR=1.626;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=47;TCR=94;TR=141;WE=125562817;WS=125562799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr12	125810958	rs551601	T	C	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=262;SC=GTTGAAAAAGTCACTTGCCCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=10;WE=125810966;WS=125810951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	125811056	rs550677	A	G	1511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=2;PP=1217;SC=CAACCTGTATAGTAAACATCG;SOR=5.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=42;WE=125811064;WS=125811046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	125833964	rs7971264	C	T	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.937;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=1;PP=647;ReadPosRankSum=0.532;SC=TCTCAGAACACGGTTTTATTC;SOR=1.900;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=30;WE=125833972;WS=125833954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,31:0.70:44
chr12	125834095	rs1491893	C	A	2919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.745;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=50;PP=2332;ReadPosRankSum=-0.422;SC=CAGAGGAGTCCTTTTTCCTTA;SOR=0.334;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=149;TCF=87;TCR=62;TR=110;WE=125834103;WS=125834085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,109:0.73:150
chr12	125834395	rs3803155	T	C	5994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.337;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=139;PP=2962;ReadPosRankSum=0.330;SC=GGGATGACAGTGACCTTACGG;SOR=0.610;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=358;TCF=142;TCR=216;TR=233;WE=125834403;WS=125834385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,242:0.66:366
chr12	126003934	rs964998	T	C	2294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.62;SOR=4.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr12	126003934	.	TTGCTGA	CTGCTGA,CTGCTGT	1036	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=55,17;NR=5,2;PP=1036,384;QD=17.8461868758;SC=TCTTGACATTTTGCTGAGTCT;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=55;TCR=5;TR=60,19;WE=126003948;WS=126003924;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:60
chr12	126003940	rs4765259	A	T	496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=1.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.64;ReadPosRankSum=-1.535;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,22:0.34:65
chr12	126068417	rs6489006	T	C	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.074;NF=33;NR=0;PP=802;ReadPosRankSum=2.290;SC=TTTTGAACACTGCCATTCTCA;SOR=1.656;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=50;TCR=0;TR=33;WE=126068425;WS=126068407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,34:0.68:50
chr12	126128476	rs11610291	A	G	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=106;ReadPosRankSum=0.370;SC=GTGCCTACAAATTACCTTTTG;SOR=0.141;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=7;WE=126128484;WS=126128469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr12	126128871	rs12305906	T	C	1271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=37;PP=1065;SC=TGTCCTGGAGTCCAGATCTTT;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=37;WE=126128879;WS=126128861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	126135195	rs3803152	A	G	2439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=21;PP=1953;SC=TTAACAATGAAGACTTTGTTC;SOR=1.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=51;TCR=21;TR=72;WE=126135203;WS=126135185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr12	126136863	rs3825381	C	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=68;ReadPosRankSum=1.834;SC=CTTCCCTAACCGATTCCCACA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=126136871;WS=126136853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr12	126137060	rs61021440	C	T	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.727;NF=18;NR=7;PP=572;ReadPosRankSum=-1.385;SC=GTCACCATCGCGGAGCTGGGA;SOR=1.022;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=25;WE=126137068;WS=126137050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr12	126932624	rs758564	G	A	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.244;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=637;ReadPosRankSum=-0.272;SC=AGTGGCTATCGGGGCAGACAA;SOR=0.553;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=52;TCF=26;TCR=26;TR=32;WE=126932632;WS=126932614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr12	126932764	rs758565	C	G	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=202;SC=GCATCAGAAACCCACCCTCTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=126932772;WS=126932754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	126947430	rs1019149	G	T	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=439;ReadPosRankSum=-0.641;SC=GCCTAGAAAGGTACAGGCCCT;SOR=1.022;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=19;WE=126947438;WS=126947420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr12	127229254	rs10847207	A	G	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=148;ReadPosRankSum=0.094;SC=GGTGATGGGCAGCTTACTGTG;SOR=0.056;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=12;WE=127229262;WS=127229244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr12	127229327	rs10773323	T	A	2221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.161;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=12;PP=1675;ReadPosRankSum=-1.549;SC=AAAGGAAGAATCAACACTTTC;SOR=1.421;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=108;TCF=87;TCR=21;TR=73;WE=127229335;WS=127229317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,79:0.69:114
chr12	127229506	rs10847208	T	C	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FS=2.321;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.85;ReadPosRankSum=0.588;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:199,73:0.27:272
chr12	128108780	rs3803151	T	C	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.39;QD=30.72;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	128778575	rs1709696	G	A	2133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.580;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=33;PP=1597;ReadPosRankSum=-0.042;SC=AATCAGAATGGAATAAAATGG;SOR=0.451;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=106;TCF=58;TCR=48;TR=71;WE=128778583;WS=128778565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,79:0.68:117
chr12	128899673	rs11059681	A	G	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.826;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.975;NF=30;NR=15;PP=672;ReadPosRankSum=0.210;SC=TGGGATGACCACGGCGCCGGG;SOR=1.258;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=133;TCF=78;TCR=55;TR=45;WE=128899681;WS=128899663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,47:0.34:139
chr12	128900005	rs1683723	G	A	4132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.486;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=75;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.691;SC=GATCGGCACCGTCGGCCTTTA;SOR=0.644;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=236;TCF=122;TCR=114;TR=153;WE=128900013;WS=128899995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,159:0.65:246
chr12	129028586	rs73426420	C	T	1388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=41;PP=1078;ReadPosRankSum=0.377;SC=AGGTGGGCAGCGGCGGAAAGC;SOR=0.887;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=12;TCR=58;TR=49;WE=129028594;WS=129028576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,51:0.71:72
chr12	129028684	rs200405350	CTG	CG,C	274.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.951;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=359;ReadPosRankSum=-0.205;SC=TGTGTGGTTCCTGGTCCCGGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6;WE=129028696;WS=129028674;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.50:16
chr12	129028687	rs199498284	GT	G	274.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.17;ReadPosRankSum=-0.205;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr12	129028688	.	T	G	374	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=24;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=6;PP=374;QD=68.1285354245;SC=TGGTTCCTGGTCCCGGGCCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=129028696;WS=129028674;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,6:0.43:14
chr12	129028708	rs11610490	G	C	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.277;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.36;ReadPosRankSum=0.936;SOR=0.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr12	129028712	rs12812251	G	C	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.357;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.55;ReadPosRankSum=0.991;SOR=0.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr12	129181625	rs902058	A	G	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=253;SC=ATGGGCCAGCATATAGAGTGA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=129181633;WS=129181615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	129181701	rs902059	A	G	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=3;PP=1011;SC=AAGAAATATTACTGGTAAAGG;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=35;WE=129181709;WS=129181691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	129181810	rs885546	A	G	2037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=36;PP=1597;SC=CAGAGAAGACAATAACCGTGC;SOR=0.990;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=28;TCR=36;TR=64;WE=129181818;WS=129181800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	129181834	rs902060	A	G	2240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=40;PP=1742;SC=ATGACAAAGTATCGGTGACAG;SOR=1.163;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=30;TCR=40;TR=70;WE=129181842;WS=129181824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr12	129189556	rs902061	T	C	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.150;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=158;ReadPosRankSum=-2.019;SC=CCCTGTTTCATTGGGCGTCCT;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=8;WE=129189564;WS=129189546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr12	129189591	rs4533104	A	G	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=439;SC=TCTAAGGGAAAAGGCATCCCC;SOR=3.500;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=129189599;WS=129189581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	129189941	rs12424159	G	A	3410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.562;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=54;PP=2412;ReadPosRankSum=0.326;SC=CAGCCCCGGCGGGGACTATGA;SOR=0.754;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=186;TCF=102;TCR=84;TR=122;WE=129189949;WS=129189931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,130:0.67:193
chr12	129190021	rs11059841	A	G	6650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=106;NR=97;PP=2965;SC=GCACAGGCCAAGATGGGCACC;SOR=0.785;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=203;TCF=106;TCR=97;TR=203;WE=129190029;WS=129190011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr12	129190474	rs3812792	G	A	3822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.061;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=84;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.639;SC=TGGGGGATGCGCCGCCGCCCC;SOR=0.786;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=234;TCF=106;TCR=128;TR=151;WE=129190482;WS=129190464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,154:0.66:235
chr12	129278864	rs1059312	A	G	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=22;PP=654;ReadPosRankSum=0.426;SC=CAGCCAGAAGAAAAAAGTAAT;SOR=0.724;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=124;TCF=53;TCR=71;TR=37;WE=129278872;WS=129278854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,36:0.29:125
chr12	129283711	rs2291350	G	A	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=341;ReadPosRankSum=-0.497;SC=GGCCATCCACGTGAAAACACC;SOR=1.136;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=16;WE=129283719;WS=129283701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr12	129298468	rs10688448	C	CAATA	153.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=175;ReadPosRankSum=-0.525;SC=AATTATTCCTCAATAAAGAGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=5;WE=129298476;WS=129298458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr12	129298735	.	C	G	872	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=23;MQ=49.59;NF=31;NR=18;PP=872;QD=18.5055349499;SC=ACAGACCTGACCGCCGTATGA;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=91;TCF=55;TCR=36;TR=49;WE=129298743;WS=129298725;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:42,49:0.54:91
chr12	129298759	.	C	T	970	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MMLQ=24;MQ=46.53;NF=35;NR=17;PP=970;QD=19.3225233182;SC=ACCTGACCGCCGTATGATGGA;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=148;TCF=86;TCR=62;TR=52;WE=129298767;WS=129298749;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:96,52:0.35:148
chr12	129298779	.	C	CGTATGATGGACCTGACCGCT	211.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=0.000;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=2.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.10;MQRankSum=1.070;QD=2.79;ReadPosRankSum=-2.143;SOR=1.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,2:0.03:76
chr12	129298819	.	C	T	1373	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=24;NF=43;NR=25;PP=1373;QD=20.7025178316;SC=ACCTGACCGCCGTATGATGGA;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=193;TCF=113;TCR=80;TR=68;WE=129298828;WS=129298805;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:125,68:0.35:193
chr12	129299675	rs2306683	C	G	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.973;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=43;PP=1062;ReadPosRankSum=1.832;SC=GGATGAAAACCATATACGGTC;SOR=1.296;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=72;TCF=4;TCR=68;TR=45;WE=129299683;WS=129299665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,45:0.62:73
chr12	129338293	rs10847702	A	T	55.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.96;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=2.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr12	129373073	rs7300146	A	C	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=168;ReadPosRankSum=-1.248;SC=TACAGCAACAAACAGCTCCGG;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=9;WE=129373081;WS=129373063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr12	129373100	rs12309809	G	A	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=511;ReadPosRankSum=0.994;SC=GGGAACTTCAGTGTTTAAGAT;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=21;WE=129373108;WS=129373090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,22:0.81:27
chr12	129410738	rs141839609	CAAT	C	887.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=865;SC=GACTCTGTCTCAATAATAATA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=20;WE=129410748;WS=129410728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	129410789	rs12425716	G	A	2969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=3;PP=2421;SC=ATAAGAGTAGGAGAAGCTGGC;SOR=6.115;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=82;TCR=3;TR=84;WE=129410797;WS=129410779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr12	129432149	rs470655	A	G	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=0.788;SC=TGGAGTTCAAAAGTACTTTTG;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=4;WE=129432157;WS=129432139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr12	129559557	rs10773594	C	T	2295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=36;PP=1836;SC=TATCCAAGGGCGTGACTGAGC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=38;TCR=36;TR=74;WE=129559565;WS=129559547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr12	130015535	rs71082733	G	GA	818.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=2.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.64;MQRankSum=0.869;QD=12.60;ReadPosRankSum=-1.542;SOR=1.190;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,51:0.78:65
chr12	130521184	rs611963	G	A	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.060;NF=8;NR=0;PP=128;ReadPosRankSum=0.215;SC=GCAGTGAGCCGAGGTCATGCC;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=8;WE=130521192;WS=130521174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr12	130521207	rs622000	C	T	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.545;NF=10;NR=0;PP=162;ReadPosRankSum=1.770;SC=TGCACTCCAGCCTGGGCAACA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=10;WE=130521215;WS=130521197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr12	130521234	rs34472041	C	CAAA	665.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.627;HP=10;HapScore=3;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-1.733;NF=18;NR=1;PP=397;ReadPosRankSum=0.000;SC=GACTCTGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=1.310;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=71;TCF=66;TCR=5;TR=19;WE=130521242;WS=130521224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
chr12	130521306	rs600949	G	C	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=16.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.41;ReadPosRankSum=-1.817;SOR=0.176;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,50:0.28:179
chr12	130916685	rs7966010	T	C	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=491;SC=GGGTTTGTAATCTGAGCAGAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=130916693;WS=130916675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr12	130923089	rs2292666	C	G	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=532;SC=GGAACGGAGGCGTTCAGGGAC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=130923097;WS=130923079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	130929546	rs10848102	C	G	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.643;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=350;ReadPosRankSum=-0.165;SC=TCAAAGAGGGCAAACCTGGTA;SOR=3.500;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=16;WE=130929554;WS=130929536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr12	130929599	rs7952756	A	G	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=2;PP=541;ReadPosRankSum=0.913;SC=CTGGGTGGCCAGGAGTATGTT;SOR=0.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=46;TCR=3;TR=30;WE=130929607;WS=130929589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr12	130935710	rs2398519	C	G	4475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=30;PP=2965;SC=GCACAGGCAGCCCCGGCAGCC;SOR=2.670;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=112;TCR=30;TR=142;WE=130935718;WS=130935700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr12	130941150	rs2277361	G	C	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.367;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=17;PP=958;ReadPosRankSum=1.854;SC=GGTCAATCTTGCCAGCGTGCT;SOR=0.463;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=160;TCF=114;TCR=46;TR=52;WE=130941158;WS=130941140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,53:0.32:165
chr12	130941338	rs1356081	G	A	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.741;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=26;PP=466;ReadPosRankSum=-0.498;SC=GTGTGCACATGTGCACTGTGT;SOR=1.115;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=94;TCF=7;TCR=87;TR=27;WE=130941346;WS=130941328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,27:0.28:98
chr12	131276448	rs4759786	G	T	4470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=80;PP=2965;SC=ATGGTTGCTAGGACAATGTTG;SOR=1.228;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=53;TCR=80;TR=133;WE=131276456;WS=131276438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr12	131280752	rs34749116	G	A	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=405;ReadPosRankSum=0.246;SC=AAAATAAAACGACCTGGCCAG;SOR=1.033;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=79;TCF=2;TCR=77;TR=22;WE=131280760;WS=131280742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,25:0.30:84
chr12	131285663	rs1881060	T	C	2109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=16;PP=1618;SC=ACATGACTGATATCTCTCTTG;SOR=2.372;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=51;TCR=16;TR=67;WE=131285671;WS=131285653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr12	131296880	rs7961690	G	T	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=218;ReadPosRankSum=-1.239;SC=TGCCTGGGATGGGCTTCAGAA;SOR=0.563;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=55;TCF=32;TCR=23;TR=17;WE=131296888;WS=131296870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
chr12	131306278	rs7301926	T	C	1484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.079;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=1142;ReadPosRankSum=-0.241;SC=GTGGTTTTTCTTTACTTCTTC;SOR=0.412;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=75;TCF=42;TCR=33;TR=53;WE=131306286;WS=131306268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,56:0.71:79
chr12	131356520	rs141803119	G	A	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=106;ReadPosRankSum=-1.042;SC=ACGTGGGCGGGCGCCGCGCCG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=7;WE=131356528;WS=131356510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr12	131356731	rs116897340	T	C	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=27;PP=838;SC=GGCGGCGGGATAGGGGTCGGA;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=131356739;WS=131356721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr12	131358701	rs59236418	A	AT	314.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.796;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=295;ReadPosRankSum=1.104;SC=GCCTATCTGGATTTTTTAAGA;SOR=1.245;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=11;WE=131358709;WS=131358691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr12	131359298	rs7958223	C	A	1756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=38;PP=1353;SC=ATTAAAACTTCCTGAGTTATT;SOR=1.692;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=56;WE=131359306;WS=131359288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr12	131360352	rs112060445	G	C	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=1.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.696;QD=7.17;ReadPosRankSum=-1.790;SOR=0.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,43:0.32:136
chr12	131360360	rs73461299	G	T	4686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.885;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=76;PP=1844;ReadPosRankSum=0.994;SC=CAGATTGTTCGGTTTGGCTTG;SOR=0.873;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=129;TCF=53;TCR=76;TR=128;WE=131360368;WS=131360342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,136:0.99:137
chr12	131438971	rs56090874	G	T	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=-1.488;QD=4.71;ReadPosRankSum=-1.760;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr12	131439239	rs10848261	T	C	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.537;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=101;ReadPosRankSum=1.407;SC=TGAGCACCGCTCTCCCCCTGC;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6;WE=131439247;WS=131439229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr12	131453378	rs7309920	T	C	1782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=0;PP=1514;ReadPosRankSum=-1.035;SC=GGCTGGGGGATGTGAGGTCCG;SOR=6.770;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=58;TCR=0;TR=57;WE=131453386;WS=131453368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr12	131466562	rs4759534	T	C	1740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=45;PP=1444;SC=TGGAGCTGTATACGCGGGACA;SOR=3.300;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=8;TCR=45;TR=53;WE=131466570;WS=131466552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	131471608	rs1547577	T	C	1947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=14;PP=1565;SC=ATTCCCACAGTACTCAGAATG;SOR=2.080;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=43;TCR=14;TR=57;WE=131471616;WS=131471598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr12	131476665	rs55788836	CAAA	C,CA	1382.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.14;QD=32.92;SOR=7.476;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,25,16:0.60,0.38:42
chr12	131485014	rs4759821	T	C	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=214;ReadPosRankSum=1.408;SC=TGGTCGGTCATGGTGGCTCAT;SOR=0.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=5;WE=131485033;WS=131485004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr12	131485025	rs4759822	A	G	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=214;ReadPosRankSum=0.147;SC=GGTGGCTCATACCTATAATCC;SOR=0.512;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=6;WE=131485033;WS=131485004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr12	131488566	rs10773836	C	T	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.186;NF=16;NR=0;PP=351;ReadPosRankSum=-1.131;SC=CATTGCTTTACCCTTTTTTTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=16;WE=131488574;WS=131488556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr12	131488858	rs12311722	T	C	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.507;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=37;PP=563;ReadPosRankSum=1.478;SC=GTGGCTGCGCTGGACTCCCTT;SOR=1.196;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=128;TCF=19;TCR=109;TR=42;WE=131488866;WS=131488848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,45:0.34:131
chr12	131490413	rs7978321	A	G	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.82;ReadPosRankSum=-0.147;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,7:0.15:46
chr12	131498946	rs1212936	C	T	1973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=51;PP=1578;SC=CTGAGGAATGCTGGGTTGTCT;SOR=3.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=6;TCR=51;TR=57;WE=131498954;WS=131498936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr12	131498995	rs1195923	G	A	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=25;PP=715;SC=CCTTGGTGCCGGCCCGAACTG;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=131499003;WS=131498985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	131555329	rs10744491	C	A	2478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=19;PP=1932;SC=GCTGATTGGACTGTGGAGTAC;SOR=2.133;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=58;TCR=19;TR=77;WE=131555337;WS=131555319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr12	131590404	rs4759544	G	A	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.251;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=18;PP=527;ReadPosRankSum=0.971;SC=GCCTCGAGCCGGGCACGGTGA;SOR=0.261;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=114;TCF=44;TCR=70;TR=33;WE=131590412;WS=131590394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,35:0.30:118
chr12	131593506	rs11061329	G	A	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.914;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=187;ReadPosRankSum=0.127;SC=GACAGGATGAGACAGGTGGAA;SOR=0.050;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=10;WE=131593514;WS=131593496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr12	131602811	rs7961434	C	T	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=625;ReadPosRankSum=-0.843;SC=CATAGTTCCCCCTCTGTATAC;SOR=1.022;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=28;WE=131602819;WS=131602801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr12	131620578	rs884522	C	T	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=4.093;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.41;ReadPosRankSum=-0.420;SOR=1.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,33:0.28:117
chr12	131620588	rs868158	A	G	3995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=47;PP=1773;SC=CCAGGTTGACAGCCAAGGCAG;SOR=1.225;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=72;TCR=48;TR=117;WE=131620596;WS=131620568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr12	131620738	rs2280683	A	G	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=250;ReadPosRankSum=1.359;SC=GCGGGGAGGCAGGGCCGCCAG;SOR=0.197;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=14;WE=131620746;WS=131620728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr12	131622735	rs7302341	T	C	3870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=59;NR=74;PP=2913;SC=CGAGCAGCTCTGCCCGCACCT;SOR=0.905;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=59;TCR=74;TR=133;WE=131622743;WS=131622725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr12	131622833	rs2277337	T	C	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.763;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=265;ReadPosRankSum=0.389;SC=CAGGCTCGGTTGTCAGCAGGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=3;TCR=48;TR=19;WE=131622841;WS=131622823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr12	131687287	rs7486559	G	C	3836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=91;NR=32;PP=2965;SC=CCTCCTCCCCGCGACGTGACG;SOR=2.133;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=91;TCR=32;TR=123;WE=131687295;WS=131687277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr12	131692116	rs11061381	T	C	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.219;NF=38;NR=1;PP=877;ReadPosRankSum=-1.424;SC=CTGGGAGGGGTGGCCCATGGC;SOR=1.140;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=50;TCR=1;TR=39;WE=131692124;WS=131692106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,35:0.76:46
chr12	131692211	rs75681777	G	A	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=74.673;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.39;MQRankSum=-5.464;QD=0.77;ReadPosRankSum=2.714;SOR=5.890;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,18:0.12:147
chr12	131954010	rs201016738	C	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.15;MQRankSum=-1.111;QD=14.80;ReadPosRankSum=0.967;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr12	132209932	rs138640311	ATG	A	3916.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.833;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.416;NF=75;NR=16;PP=2968;ReadPosRankSum=-0.656;SC=TGACGTGAATATGTGTGTTTT;SOR=1.097;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=166;TCF=130;TCR=36;TR=91;WE=132209941;WS=132209922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,109:0.64:169
chr12	132237750	rs1051219	C	T	2212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.680;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=46;PP=1647;ReadPosRankSum=-2.534;SC=CCGGAATCGACGTGACTACTT;SOR=0.788;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=279;TCF=137;TCR=142;TR=99;WE=132237758;WS=132237740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,99:0.35:281
chr12	132237848	rs1982528	T	C	5852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=122;PP=2965;SC=ACCACACCACTACCGCCCCCA;SOR=1.739;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=56;TCR=123;TR=178;WE=132237856;WS=132237838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr12	132240937	rs3217666	C	CAT	354.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.501;NF=13;NR=0;PP=505;ReadPosRankSum=0.877;SC=TCCAGTGAAACATATACCGTA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=13;WE=132240945;WS=132240927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr12	132241229	rs7136191	A	G	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=252;SC=ACATTCCACCATAAGTTGGCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=132241237;WS=132241219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr12	132250712	rs1051233	G	C	757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.821;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=552;ReadPosRankSum=-1.477;SC=GGGAAAAGCTGGCCCAGGCGT;SOR=0.546;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=107;TCF=74;TCR=33;TR=37;WE=132250720;WS=132250702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,37:0.33:112
chr12	132262911	rs75324057	A	T	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=31;PP=585;ReadPosRankSum=-2.449;SC=TGGTACCCTCATGACCCCCAT;SOR=0.746;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=108;TCF=5;TCR=103;TR=32;WE=132262919;WS=132262901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,32:0.29:111
chr12	132269830	rs66665803	G	GA	4599.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=123;PP=2974;SC=AAAGGTCTGGGAAAAAATCAA;SOR=4.174;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=149;TCF=12;TCR=137;TR=131;WE=132269838;WS=132269820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr12	132271113	rs7136643	T	C	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=12;PP=694;SC=CTGGGGCCAGTAGGAAGCGGA;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=15;TCR=12;TR=27;WE=132271121;WS=132271103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	132313098	.	G	GGCTGCCGCT	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9990;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=1;NR=0;PP=187;SC=GGACTCTCGCGGCTGCCGCTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=1;WE=132313106;WS=132313088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	132323082	rs7971187	A	G	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	132323089	rs7965611	C	G	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	132323294	rs4964884	T	C	82.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=54;ReadPosRankSum=-1.282;SC=GAGGTGGGTGTGTGGCCAGGG;SOR=0.105;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=4;WE=132323302;WS=132323284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr12	132325239	rs6598163	G	A	7524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=433;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.908;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=149;NR=143;PP=2962;ReadPosRankSum=0.584;SC=GGCGGGCAGCGCCGCCGACAT;SOR=0.552;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=421;TCF=221;TCR=200;TR=292;WE=132325247;WS=132325229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,298:0.69:431
chr12	132326051	rs4964929	C	T	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.670;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.817;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=100;ReadPosRankSum=1.114;SC=CCCTCTGGCGCAGCCGGCATC;SOR=2.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=6;WE=132326059;WS=132326041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr12	132335592	rs11835665	G	A	1268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.857;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=24;PP=977;ReadPosRankSum=-0.078;SC=CTCACAGGCCGATGGATCTGT;SOR=0.960;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=168;TCF=89;TCR=79;TR=55;WE=132335600;WS=132335582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,57:0.33:173
chr12	132395052	rs7295593	G	C	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=15;PP=890;SC=AGCAGGCTTGGGATGGGGATG;SOR=1.002;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=21;TCR=15;TR=36;WE=132395060;WS=132395042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	132396343	rs11615995	C	T	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=0;PP=1425;SC=GAGCGGAGCACAGGAAGAAAG;SOR=7.864;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=50;WE=132396351;WS=132396333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	132396603	rs11616018	C	T	4338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=101;PP=2965;SC=GTGACACAGACGACTTCGTCA;SOR=2.122;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=36;TCR=101;TR=137;WE=132396611;WS=132396593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr12	132398255	rs68126752	AC	A	52.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=11.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQRankSum=1.111;QD=1.55;ReadPosRankSum=1.879;SOR=3.572;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr12	132398256	rs4964880	C	A	458.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=11.353;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQRankSum=-1.032;QD=13.49;ReadPosRankSum=-1.643;SOR=0.028;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,25:0.74:34
chr12	132399065	rs12303764	T	G	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.868;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=583;ReadPosRankSum=-0.413;SC=GCTGGGGCCTTGTGTGGCAGG;SOR=0.396;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=26;WE=132399073;WS=132399055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,27:0.71:38
chr12	132401566	rs11546871	C	T	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.732;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=583;ReadPosRankSum=-1.071;SC=GCCCCGGACCCGGGCAGCACG;SOR=0.949;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=91;TCF=38;TCR=53;TR=34;WE=132401574;WS=132401556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,38:0.41:93
chr12	132401642	.	TGGGGG	CGGGGC,CGGGGG	890	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000,0.5000;HP=5;HapScore=3;MGOF=28;MMLQ=24;MQ=54.22;NF=0,7;NR=3,38;PP=63,890;QD=38.8226249541;SC=GGCTGTGGGATGGGGGTCGGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=3,45;WE=132401676;WS=132401632;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.06:48
chr12	132401684	.	T	C	113	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;FR=0.5000;HP=5;HapScore=4;MGOF=51;MMLQ=24;MQ=45.67;NF=0;NR=9;PP=113;QD=16.4190236164;SC=GGCTGTGGGATGGGGGTCGGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=9;WE=132401697;WS=132401674;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,9:0.50:18
chr12	132402020	rs4964918	T	C	2042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=35;PP=1614;SC=CCAGCAGCCCTTCCCCGGTGG;SOR=0.754;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=30;TCR=36;TR=65;WE=132402028;WS=132402010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr12	132403161	rs11609348	A	G	2424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=48;PP=1968;SC=CGACCCCATTACTGCGAACCT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=21;TCR=48;TR=69;WE=132403169;WS=132403151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr12	132403305	.	A	ATAGGGTGTGTGGGGTG	230.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=6;PP=699;SC=TGTGTGGGGTATAGGGTGTGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=132403313;WS=132403295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr12	132404212	rs7299195	A	G	1389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=36;PP=1145;SC=GTGACAGGGTAACAGGGAGGC;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=38;WE=132404220;WS=132404202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	132406275	rs7311029	A	C	2107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=0;PP=1808;SC=CTGCTTAGGGAAGGTCAGCAG;SOR=8.318;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=63;TCR=0;TR=63;WE=132406283;WS=132406265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr12	132427909	rs7961398	A	G	988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=1;PP=823;SC=CTTTCCCTGCACAGGTTCCTG;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=35;WE=132427917;WS=132427899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	132514454	rs79985228	C	T	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.494;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=647;ReadPosRankSum=-0.758;SC=CTCAGGTATGCGGCAGTTGGG;SOR=0.867;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=55;TCF=28;TCR=27;TR=31;WE=132514462;WS=132514444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr12	132539468	rs12321543	G	A	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.321;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=735;ReadPosRankSum=-0.991;SC=GAGGATTTATGCAGGGGAGAG;SOR=0.484;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=155;TCF=105;TCR=50;TR=47;WE=132539476;WS=132539458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,50:0.31:160
chr12	132547093	.	A	ACAG	612.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.864;NF=12;NR=8;PP=733;ReadPosRankSum=1.138;SC=AGCAGCAACAACAGCAGCAGC;SOR=0.693;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=67;TCF=44;TCR=23;TR=20;WE=132547101;WS=132547083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr12	132562126	rs73164912	G	A	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.987;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=24;PP=918;ReadPosRankSum=-0.873;SC=CCAGGTGCCCGCCAGCTCCGA;SOR=0.465;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=83;TCF=38;TCR=45;TR=48;WE=132562134;WS=132562116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,49:0.59:83
chr12	132624224	rs202056443	G	A	2604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=45;PP=2167;ReadPosRankSum=1.038;SC=TCGTACCGAGGAACCAGCGGC;SOR=0.481;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=135;TCF=70;TCR=65;TR=91;WE=132624232;WS=132624214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,91:0.67:135
chr12	132626668	rs1133690	T	C	1684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=10;PP=1354;SC=ACATACCTGCTGGGCCAGCTC;SOR=2.628;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=43;TCR=10;TR=53;WE=132626676;WS=132626658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr12	132630822	rs10794454	C	T	2510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.592;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=47;PP=1945;ReadPosRankSum=0.754;SC=TATGTGGCTTCTTCCACTCAT;SOR=0.776;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=161;TCF=82;TCR=79;TR=98;WE=132630830;WS=132630812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,98:0.60:162
chr12	132633458	rs79736234	G	A	1206.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.96;MQRankSum=4.068;QD=38.93;ReadPosRankSum=-0.558;SOR=0.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr12	132633463	rs11246942	C	T	1171.81	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.89;MQRankSum=3.944;QD=40.41;ReadPosRankSum=-0.531;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr12	132635521	rs7397057	T	C	1669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.717;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=21;PP=1322;ReadPosRankSum=0.538;SC=TCTGTCTGTCTGCAGGGGGGG;SOR=0.494;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=106;TCF=75;TCR=31;TR=65;WE=132635529;WS=132635511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,66:0.59:111
chr12	132635779	rs12818246	C	T	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.878;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=9;PP=687;ReadPosRankSum=-0.451;SC=GCTCCATCCGCTGCTCCTTCC;SOR=0.492;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=142;TCF=114;TCR=28;TR=43;WE=132635787;WS=132635769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,42:0.30:140
chr12	132635989	rs11246947	A	G	2520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=47;PP=2027;ReadPosRankSum=1.067;SC=GGTGGGGGCTAGCAGTCCGGG;SOR=0.684;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=120;TCF=48;TCR=72;TR=80;WE=132635997;WS=132635979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,85:0.69:123
chr12	132636400	rs11246948	G	A	1419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=43;PP=1132;ReadPosRankSum=0.997;SC=GGGGCCTCCCGAGCCATCCTT;SOR=0.651;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=70;TCF=4;TCR=66;TR=46;WE=132636408;WS=132636390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,48:0.67:72
chr12	132682481	rs12308155	T	G	3869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=7.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.63;ReadPosRankSum=0.444;SOR=0.322;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,97:0.64:151
chr12	132682484	rs12306514	A	G	3901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=5.290;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.67;ReadPosRankSum=0.730;SOR=0.381;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,97:0.64:152
chr12	132683632	rs4074045	A	C	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=297;ReadPosRankSum=2.690;SC=AGCAGGCTGGACCCGTGCCTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=14;WE=132683640;WS=132683622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr12	132683862	rs6598205	G	A	1763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.970;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=45;PP=1373;ReadPosRankSum=0.026;SC=CCGAGGGTGCGGCCCCAGGGA;SOR=1.070;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=94;TCF=30;TCR=64;TR=65;WE=132683870;WS=132683852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,65:0.69:94
chr12	132683961	rs6598206	T	C	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=138;ReadPosRankSum=0.033;SC=CCGGGTGGGCTGCCTGGGAAG;SOR=2.461;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=10;WE=132683969;WS=132683951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr12	132685837	rs10794457	A	G	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=22.323;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=44;PP=1128;ReadPosRankSum=-1.098;SC=GAGAGGGTACATGGGTGTCAC;SOR=2.945;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=79;TCF=20;TCR=59;TR=52;WE=132685845;WS=132685827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,54:0.67:81
chr12	132688279	rs10902510	A	G	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=27;PP=711;ReadPosRankSum=1.224;SC=TCCCAACGGAAGCGGGCAGCC;SOR=0.602;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=29;WE=132688287;WS=132688269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,31:0.76:41
chr12	132811399	rs74514445	A	G	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=352;ReadPosRankSum=1.151;SC=GCGTGGCCCCAGGGCTCAGCT;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=21;WE=132811407;WS=132811389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr12	132811498	rs368985675	TC	T	2555.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.536;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;PP=2366;ReadPosRankSum=0.353;SC=TCGGACCTGCTCCTCTTCACT;SOR=0.162;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=94;TCF=58;TCR=36;TR=64;WE=132811506;WS=132811488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,78:0.72:108
chr12	132811652	rs73166880	TG	CT	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.225;NF=1;NR=22;PP=1181;ReadPosRankSum=-0.622;SC=TTTACACACATGCCACACACC;SOR=0.616;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=23;WE=132811661;WS=132811642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr12	132811670	rs111837594	A	G	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.369;NF=0;NR=14;PP=296;ReadPosRankSum=1.252;SC=ACCCTTCCCAAGGCCGTCCCT;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=14;WE=132811678;WS=132811660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr12	132824197	.	ATGGCCGCACTCGCCCTCACCCCGTCCCCGGATGCCG	A	1282.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=0.000;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=2.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQRankSum=-3.712;QD=18.07;ReadPosRankSum=0.399;SOR=1.104;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr12	132824450	rs73166888	G	T	3072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.027;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.673;NF=71;NR=46;PP=2474;ReadPosRankSum=-0.467;SC=CTGGACACCGGGGCCGCACTC;SOR=1.159;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=171;TCF=99;TCR=72;TR=117;WE=132824458;WS=132824440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,117:0.68:172
chr12	132862976	rs28503969	G	A	1884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=52;PP=1559;SC=CCTGGCCCAGGCCTCCTGGCC;SOR=4.103;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=6;TCR=52;TR=58;WE=132862984;WS=132862966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr12	132911861	rs28672358	G	C	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.54;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=148;SC=GTGTGTGCCTGTGTGTGTGCC;SOR=2.833;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=132911869;WS=132911851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	132911948	rs28722154	T	C	299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=5;PP=200;SC=TGTACATATATGTGCATGTGT;SOR=0.859;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=10;WE=132911956;WS=132911938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr12	132912031	rs28420217	A	G	135.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=3;PP=77;SC=GCATGCATGCATGTGCATTGT;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=132912039;WS=132912021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr12	132912181	rs71453143	CGTGT	C	72.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=1;PP=83;SC=TGTGTGTGTGCGTGTGTGCCT;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=132912192;WS=132912171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr12	133032047	.	T	TGTGTGCATGTTGAC,TGTGTGTGCATGTTGAC	2873.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.23;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=4,3;NR=33,33;PP=118,1932;SC=TGTGGACATATGTGTGTGCAT;SOR=2.531;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=64;TCF=8;TCR=56;TR=37,36;WE=133032055;WS=133032037;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.30,0.70:64
chr12	133032110	rs9706362	T	C	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=25;PP=596;SC=CTTGTGTGTGTGTGCATGTGT;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=133032118;WS=133032100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	133032132	rs113386371	C	CGT	39.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=3;PP=87;ReadPosRankSum=0.156;SC=TGCATGTGAACGTGTGTGTGA;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=3;WE=133032140;WS=133032122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr12	133067343	.	A	G	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=26.58;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	133067473	rs28435470	G	A	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=28;PP=1175;ReadPosRankSum=0.885;SC=CGGCTTCGCAGGCGTTGAGGC;SOR=0.527;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=47;WE=133067481;WS=133067463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,46:0.98:47
chr12	133102462	rs4883569	G	A	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=497;ReadPosRankSum=0.504;SC=CCGCCTGCCCGCTGCGCCCCG;SOR=0.619;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=23;WE=133102470;WS=133102452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,26:0.76:34
chr12	133104406	rs7135930	G	A	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=5.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.119;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=639;ReadPosRankSum=0.907;SC=GTGGATCTGCGGGGCAGGGCT;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=27;WE=133104414;WS=133104396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,27:0.69:39
chr12	133104461	rs4883566	A	G	2655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=7;PP=2134;SC=TGAGGGCTGCAGGGCAGCTGT;SOR=4.826;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=87;TCR=7;TR=94;WE=133104469;WS=133104451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr12	133104735	rs4883565	T	C	2466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=71;PP=2032;ReadPosRankSum=0.271;SC=CACCATGGGGTTGGTGGGGGG;SOR=0.818;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=9;TCR=93;TR=78;WE=133104743;WS=133104725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,81:0.76:107
chr12	133146416	rs7312710	A	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=141;ReadPosRankSum=-1.419;SC=GCCCAGACATAGCCTGGGCAC;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=8;WE=133146424;WS=133146406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr12	133146457	rs3751316	G	A	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.345;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=316;ReadPosRankSum=1.694;SC=CTGGGCCACAGGAGGGGCAGG;SOR=0.956;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=57;TCF=47;TCR=10;TR=20;WE=133146465;WS=133146447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,20:0.34:59
chr12	133147165	.	T	TG	58	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=2;NR=2;PP=58;QD=21.25;SC=GGGCAGGGGTTGGGGGGTGCG;SbPval=0.05;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=4;WE=133147173;WS=133147155;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,4:0.20:20
chr12	133147182	rs3751312	C	T	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.569;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=2;PP=29;ReadPosRankSum=0.335;SC=TGCGGGGACACGGCCACCGGG;SOR=0.016;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=4;WE=133147190;WS=133147172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr12	133148970	rs34140384	C	T	1603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=6.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=1179;ReadPosRankSum=-0.803;SC=TCGCTGTGCACGCAGGTCCTG;SOR=0.663;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=94;TCR=96;TR=64;WE=133148978;WS=133148960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,68:0.34:198
chr12	133150792	rs11146942	C	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.086;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=141;ReadPosRankSum=-1.767;SC=TGGCCTGCCCCGGCCGGGCCC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=8;WE=133150800;WS=133150782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr12	133153281	rs10870473	A	T	1235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=2;PP=996;SC=TGCTCCCCTTACTGGACTGGC;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=35;WE=133153289;WS=133153271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	133157835	rs140655645	ACCT	A	481.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.247;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=755;ReadPosRankSum=-0.282;SC=TCCAAGTCAAACCTCCTCCGA;SOR=1.773;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=12;WE=133157859;WS=133157825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr12	133157851	rs3751307	G	A	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.504;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=749;ReadPosRankSum=0.309;SC=TCCGAATTGTGGGGTAGATTC;SOR=1.778;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=15;WE=133157859;WS=133157825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,18:0.38:48
chr12	133158280	rs3751306	G	T	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.30;ReadPosRankSum=0.256;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,25:0.27:92
chr12	133158632	rs3751304	C	T	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.706;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=359;ReadPosRankSum=-0.147;SC=TCATGCTCCCCGGCCTCTGCC;SOR=2.428;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=15;WE=133158640;WS=133158622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr12	133159733	rs11550079	C	T	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=223;ReadPosRankSum=1.372;SC=AAGGAGGAGGCCGCCAAGATG;SOR=0.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=12;WE=133159741;WS=133159723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr12	133160468	rs1133733	G	A	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=9.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.85;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=3.596;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr12	133181399	rs11146963	T	C	3524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=71;PP=2512;SC=TCGTGTCTCCTGCATGGCTCC;SOR=1.107;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=48;TCR=72;TR=119;WE=133181407;WS=133181389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr12	133181425	rs11146964	A	G	3360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=69;PP=2565;SC=GCCCTGAAACACCACTCACCA;SOR=1.392;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=38;TCR=70;TR=107;WE=133181433;WS=133181415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr12	133182818	rs12819734	G	A	2100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=43;PP=1571;ReadPosRankSum=-0.171;SC=TAGCAGCAGCGTCCACCCCGG;SOR=0.633;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=24;TCR=44;TR=67;WE=133182826;WS=133182808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr12	133195579	rs200710959	CGCGGGGCGCGGGGT	C	1563.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=19;PP=2976;SC=TCGTGTGGTGCGCGGGGCGCG;SOR=4.351;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=21;WE=133195600;WS=133195569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	133195625	rs11146976	G	A	1600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=112;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=27;PP=597;SC=GCAGGGGAGGGGCTGGGATTG;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=133195633;WS=133195615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	133196596	rs7964634	T	C	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=11;PP=699;SC=GCCTGAGGACTGGGCGCTGTG;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=29;WE=133196604;WS=133196586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr12	133196733	rs7955816	C	T	1326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=17;PP=1053;SC=ATCCTTTTCCCCTGACCAGAG;SOR=0.902;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=20;TCR=17;TR=37;WE=133196741;WS=133196723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr12	133196773	rs7964872	T	G	1632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=14;PP=1289;SC=AGTGACAAGATCTGGGGAGGG;SOR=1.519;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=45;WE=133196781;WS=133196763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr12	133197018	rs6560891	G	A	4840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=72;PP=2965;SC=CTCGCCTCCTGCCGCCTCCTC;SOR=0.798;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=80;TCR=72;TR=151;WE=133197026;WS=133197008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr12	133198021	rs4883632	C	T	5250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.475;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=84;PP=2962;ReadPosRankSum=0.357;SC=CCCCATCAGACGCCGTCAGAC;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=266;TCF=145;TCR=121;TR=184;WE=133198029;WS=133198011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,193:0.69:278
chr12	133201947	rs4883544	T	C	4209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=38;PP=2965;SC=GGCCGAGCTGTGCAACTCCCT;SOR=1.768;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=132;TCF=94;TCR=38;TR=130;WE=133201955;WS=133201937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr12	133202004	rs4883543	C	T	4663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=76;PP=2965;SC=TGCCTCCTTCCGCTAGAACGA;SOR=0.875;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=64;TCR=76;TR=140;WE=133202012;WS=133201994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr12	133202215	rs5745075	G	A	3222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=30;PP=2611;ReadPosRankSum=1.501;SC=ACGGGCAGGCGGCATGCACGA;SOR=0.771;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=67;TCR=30;TR=96;WE=133202223;WS=133202205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,99:0.99:100
chr12	133202428	rs5745073	G	A	1315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=40;PP=1160;SC=AGGATCTCAGGAGAGGAAGGG;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=41;WE=133202436;WS=133202418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	133208886	rs5745023	C	T	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=363;SC=CTCACACGCACGCTGGCACTC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=133208894;WS=133208876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	133208979	rs5745022	T	C	2102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=11;PP=1610;SC=GAAACATCTCTGAGAGCTCAG;SOR=2.799;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=52;TCR=11;TR=63;WE=133208987;WS=133208969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr12	133210985	rs5745005	C	T	1334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=35;PP=977;SC=TGAGACAACGCGGCTGTGTTT;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=36;WE=133210993;WS=133210975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	133212692	rs4883625	T	C	3072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=98;PP=2503;SC=TGTATCTATCTGTACCCTCCA;SOR=4.635;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=9;TCR=98;TR=107;WE=133212700;WS=133212682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr12	133212737	rs4883624	C	T	2250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=64;PP=1929;SC=TTCATTCAGACCACATCATCC;SOR=6.154;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=66;TCF=2;TCR=64;TR=66;WE=133212745;WS=133212727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr12	133214517	rs5744975	G	A	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.62;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	133214522	rs5744974	G	C	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.03;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr12	133214768	rs5744970	A	G	2651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=67;PP=2129;ReadPosRankSum=-0.774;SC=CGCCACAGTCATGGAGAGCCA;SOR=1.587;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=84;TCF=15;TCR=69;TR=82;WE=133214776;WS=133214758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,87:0.99:88
chr12	133218724	rs5744951	C	T	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=497;SC=GCAGAAACACCAGCCAGGTCT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=133218732;WS=133218714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr12	133219831	rs5744944	T	C	5249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=130;NR=42;PP=2965;SC=CAAAGACGGATGCCCTGCGCT;SOR=2.444;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=172;TCF=130;TCR=42;TR=172;WE=133219839;WS=133219821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr12	133220321	rs4883614	T	A	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=20;PP=1006;SC=ACGAGTCCACTGTCGCTGCTG;SOR=0.850;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=16;TCR=20;TR=36;WE=133220329;WS=133220316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr12	133220652	rs5744932	A	AG	1118.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=897;SC=TCGGAGTCCTAGACTTCTGGT;SOR=2.753;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=133220660;WS=133220642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	133220670	rs10870483	G	A	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=18;PP=538;SC=GGTGCCCCTAGCGACGGGGTA;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=133220678;WS=133220660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	133225446	rs4883538	G	T	2276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=20;PP=1804;ReadPosRankSum=0.491;SC=CTGGAGGCCAGGCTAGATCAT;SOR=1.022;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=74;TCF=54;TCR=20;TR=73;WE=133225454;WS=133225436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,75:0.99:76
chr12	133226159	rs4883613	T	C	495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=9;PP=386;SC=ATGCCCGCCATGACTTTCTCA;SOR=1.061;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=16;WE=133226167;WS=133226149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	133226196	rs4883537	G	A	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=5;PP=428;SC=GGGTCAGGACGCATCTCGGGC;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=133226204;WS=133226186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr12	133233705	rs5744889	T	C	1350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=7;PP=1120;SC=AGCCCAGCCTTGGGGCCCCAC;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=41;WE=133233713;WS=133233695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr12	133234027	rs187618435	G	A	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.034;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=452;ReadPosRankSum=-1.021;SC=TGCATGTGCAGGAAACGGGCA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=19;WE=133234035;WS=133234017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr12	133234389	rs5744884	CAT	C	2406.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.286;NF=36;NR=9;PP=2139;ReadPosRankSum=1.673;SC=CCAACTCAGACATATTCTGCT;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=45;WE=133234398;WS=133234379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr12	133234741	rs10649524	C	CGTGT	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=701;SC=GTAACACGTGCGTATGTGTAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=12;WE=133234749;WS=133234731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr12	133238076	rs5744844	T	C	2332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=24;PP=1823;SC=TCTCAATCCATGTCCTTTCTA;SOR=1.550;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=50;TCR=24;TR=74;WE=133238084;WS=133238066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr12	133240782	rs4883592	A	G	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=24;PP=844;SC=TTTCCTTTTCACCCAGTGTGT;SOR=1.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=133240790;WS=133240772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr12	133242140	rs4883586	A	G	1450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=40;PP=1173;SC=TCAAATCTATAGAAAACCTAA;SOR=3.306;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=47;WE=133242148;WS=133242130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr12	133245149	rs5744798	A	G	5729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=91;NR=103;PP=2965;SC=GCTTCCCACCAAGTGGAGAAA;SOR=0.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=195;TCF=92;TCR=103;TR=194;WE=133245157;WS=133245139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr12	133249139	rs5744780	T	A	5169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=140;NR=18;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.818;SC=GGGCTTTATTTCAGCCCCTGC;SOR=2.649;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=159;TCF=141;TCR=18;TR=158;WE=133249147;WS=133249129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,163:0.99:164
chr12	133250118	rs4883555	C	T	3750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=48;PP=2965;SC=CATCTGGATGCGTGCACACGG;SOR=1.131;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=70;TCR=48;TR=118;WE=133250126;WS=133250108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr12	133252556	rs4883545	T	C	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=17;PP=1249;SC=AAGACGGTCATACCCTGAGAA;SOR=1.280;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=44;WE=133252564;WS=133252546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr12	133263743	rs111877885	A	C	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=0;PP=77;SC=GGCTGCGGGAACCGGGCCTCC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=133263751;WS=133263733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr12	133277983	rs7958567	T	C	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=432;ReadPosRankSum=-0.584;SC=CAGCCTCTGCTAACATTACTT;SOR=0.960;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=19;WE=133277991;WS=133277973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr12	133287721	rs7973452	A	G	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=268;ReadPosRankSum=1.070;SC=GTTGGGATCGAGATCGGGACC;SOR=0.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=17;WE=133287729;WS=133287711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr12	133294231	rs11147013	G	T	1933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.749;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=58;PP=1555;ReadPosRankSum=0.750;SC=CCTGGCCACCGGGAGGTCACA;SOR=1.678;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=95;TCF=13;TCR=82;TR=65;WE=133294239;WS=133294221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,68:0.69:99
chr12	133295161	.	G	GT	42	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=26;MQ=45.97;NF=4;NR=0;PP=42;QD=18.25;SC=CTGGGTGGGGGGTCCTGGGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=133295169;WS=133295151;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr12	133295353	rs12423651	C	T	5498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.910;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=121;PP=2962;ReadPosRankSum=0.793;SC=GGCAGCATCCCGCCGCTGTTG;SOR=0.631;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=312;TCF=124;TCR=188;TR=202;WE=133295361;WS=133295343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,208:0.65:319
chr12	133295501	rs11147015	T	C	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.634;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=33;PP=680;ReadPosRankSum=0.900;SC=GTCACGTTGCTGCTCGGGCTG;SOR=0.163;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=57;TCF=3;TCR=54;TR=36;WE=133295509;WS=133295491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,39:0.65:60
chr12	133297103	rs10781631	T	C	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.412;NF=22;NR=1;PP=526;ReadPosRankSum=-0.296;SC=CCGTGTTAGCTGGGATGGTCT;SOR=0.739;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=23;WE=133297111;WS=133297095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,23:0.70:33
chr12	133304146	rs10437912	C	T	1729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=2.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=-1.008;QD=25.82;ReadPosRankSum=1.380;SOR=1.573;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,44:0.66:67
chr12	133304149	rs10437913	G	C	1729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=2.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=-0.972;QD=27.03;ReadPosRankSum=0.223;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,43:0.67:64
chr12	133304604	rs11147024	C	T	1894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.711;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=9;PP=1545;ReadPosRankSum=1.522;SC=ACAGGCTGTCCGGGCCCCACA;SOR=1.650;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=92;TCF=77;TCR=15;TR=64;WE=133304612;WS=133304594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,65:0.71:92
chr12	133304891	rs10870499	T	C	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.736;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.778;NF=0;NR=15;PP=335;ReadPosRankSum=0.584;SC=TCTCGGCTCATCGCAAGCTCC;SOR=2.247;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=15;WE=133304899;WS=133304881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr12	133306946	rs80331242	C	T	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=193;ReadPosRankSum=-0.846;SC=TGCCGTGACCCCAGCAACAGC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=133306954;WS=133306936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr12	133306963	.	T	TGC	191.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.30;ReadPosRankSum=-1.465;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr12	133306965	.	TAC	T	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.09;ReadPosRankSum=-1.465;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr12	133311888	rs10781636	C	G	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=464;ReadPosRankSum=-0.218;SC=CCCAGAAAAGCCTTCTGGAAA;SOR=0.957;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=21;WE=133311896;WS=133311878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr12	133311944	rs10747081	T	C	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.186;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=733;ReadPosRankSum=0.748;SC=TTAATCAAAATGCAACCAACT;SOR=1.911;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=33;WE=133311952;WS=133311934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,34:0.68:50
chr12	133312191	rs10781637	T	C	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=220;ReadPosRankSum=0.117;SC=AGTAGCTGCCTGTCTCCGCAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=13;WE=133312199;WS=133312181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr12	133313337	rs10870504	G	A	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=380;ReadPosRankSum=0.410;SC=AATCACTGGTGGATGGTTTGA;SOR=0.428;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=18;WE=133313345;WS=133313327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr12	133313372	rs7313956	C	A	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=707;ReadPosRankSum=-0.260;SC=TGGGGCTCCACAGGACATGGT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=31;WE=133313380;WS=133313362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,34:0.65:52
chr12	133349620	rs3741483	C	G	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.105;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=300;ReadPosRankSum=0.888;SC=AAACATCGACCACACAATCAA;SOR=0.443;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=23;WE=133349628;WS=133349610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,23:0.32:71
chr12	133349893	rs3741484	A	G	707.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.70;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr12	133353168	.	C	T	77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=28;MQ=50.83;NF=5;NR=0;PP=77;QD=22.3542425094;SC=GCCCCTCCAGCTCCTTCCTCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=133353176;WS=133353165;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr12	133354470	rs900444	T	C	5395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=141;PP=2965;SC=AGGGGGTGAATGCACTCCCGG;SOR=2.081;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=192;TCF=51;TCR=141;TR=192;WE=133354478;WS=133354460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr12	133357412	rs2291260	T	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=5.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.22;ReadPosRankSum=1.382;SOR=0.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr12	133357645	rs35956026	CA	C	176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.206;NF=0;NR=8;PP=198;ReadPosRankSum=-1.711;SC=GAATCTGTGACAAAAACAGAA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=8;WE=133357653;WS=133357635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr12	133360530	rs11147073	T	C	1137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=0;PP=905;SC=TCTGTAACCATTCCACCAAAG;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=133360538;WS=133360520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr12	133360964	rs1009320	G	A	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=554;ReadPosRankSum=-0.714;SC=CTGTGGTGCCGGCAGGCATGA;SOR=2.468;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=22;WE=133360972;WS=133360954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,22:0.79:28
chr12	133363006	rs12823938	G	A	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.079;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=409;ReadPosRankSum=-1.570;SC=CCTTGGCCGCGAGGGCCTCCT;SOR=0.489;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=89;TCF=70;TCR=19;TR=24;WE=133363014;WS=133362996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,25:0.27:92
chr12	133363376	rs7976379	G	T	2251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=43;PP=1760;SC=TGCAACGACTGTGGAAGGGAA;SOR=1.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=29;TCR=43;TR=72;WE=133363384;WS=133363366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr12	133365497	rs968522	A	C	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=0;PP=662;SC=ACAGGCCCCGACCCAGACAGA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=133365515;WS=133365487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr12	133365507	.	A	AACAGG	53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;FR=0.5000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=59.35;NF=7;NR=0;PP=53;QD=11.2857142857;SC=ACCCAGACAGACCCCGCCCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=7;WE=133365515;WS=133365487;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:27,7:0.21:34
chr12	133365920	rs11147076	G	A	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.368;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=210;ReadPosRankSum=1.755;SC=GCGGCGGGGCGTGGGGGGCGT;SOR=4.003;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=10;WE=133365928;WS=133365910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr12	133372395	rs4758905	A	C	5028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.080;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=157;NR=33;PP=2962;ReadPosRankSum=0.772;SC=CATTCCTGCAAGGAGGGTTCT;SOR=0.924;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=268;TCF=219;TCR=49;TR=190;WE=133372403;WS=133372385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,191:0.70:273
chr12	133378244	rs149456851	AC	A	1576.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=3;PP=2009;ReadPosRankSum=0.682;SC=CAGGTTAAAAACAAAAACATG;SOR=0.581;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=84;TCF=80;TCR=4;TR=46;WE=133378252;WS=133378233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,57:0.65:88
chr12	133378440	rs2291258	C	T	2574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.028;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=56;PP=1825;ReadPosRankSum=-0.325;SC=GGACACTCTGCAGGGACGAGA;SOR=0.272;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=126;TCF=41;TCR=85;TR=87;WE=133378448;WS=133378430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,95:0.72:132
chr12	133383923	rs10781653	T	C	907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=23;PP=701;SC=CCTCATTTTCTTTCACACTCC;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=133383931;WS=133383913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr12	133385188	rs3741488	A	T	1202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.468;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=34;PP=940;ReadPosRankSum=0.381;SC=CAAGCAGCATACTTAAAACTG;SOR=0.511;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=58;TCF=9;TCR=49;TR=41;WE=133385196;WS=133385178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,43:0.70:61
chr12	133398395	rs11147096	A	G	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-5.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.656;NF=23;NR=0;PP=321;ReadPosRankSum=-0.563;SC=AGCCGAGATCACGCCACTGCA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=62;TCR=1;TR=23;WE=133398403;WS=133398385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,23:0.37:63
chr12	133398439	rs66472368	CA	C	1460.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=3.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.25;MQRankSum=3.768;QD=17.19;ReadPosRankSum=0.562;SOR=2.176;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,40:0.47:85
chr12	133398451	rs7298097	A	C	1802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=7.966;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.87;MQRankSum=3.263;QD=14.08;ReadPosRankSum=4.963;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,60:0.47:128
chr12	133417982	rs375411000	T	TAA	176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=173;ReadPosRankSum=0.911;SC=ACTCAGAGGGTAAAGCTCCAC;SOR=0.141;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=6;WE=133417990;WS=133417972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr12	133423866	rs10747087	G	A	737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=621;SC=AGGGCTGCACGTTCACGGCCT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=133423874;WS=133423856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr12	133428032	rs2062161	G	A	1355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=1;PP=1093;ReadPosRankSum=-2.071;SC=ACTAGATGGTGGGAAAAGATA;SOR=1.096;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=61;TCR=1;TR=47;WE=133428040;WS=133428022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,48:0.75:64
chr12	133428242	rs2306541	G	A	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=3.377;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.02;ReadPosRankSum=-0.499;SOR=0.365;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,30:0.27:110
chr12	133433173	rs2062163	T	C	1455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=21;PP=1242;SC=TGATTTTATTTCTGGCATCCA;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=23;TCR=21;TR=44;WE=133433181;WS=133433163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr12	133438274	rs2306542	C	G	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.628;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=243;ReadPosRankSum=0.000;SC=CAGGAGAGAACCATGCCTGTA;SOR=0.042;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=12;WE=133438282;WS=133438264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr12	133439115	rs9943858	G	A	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=27;PP=833;SC=ACTTGAGCCCGGGAGTTCGAG;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=133439123;WS=133439105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr12	133447195	rs12821502	G	A	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.143;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.792;NF=34;NR=6;PP=762;ReadPosRankSum=0.726;SC=GCAGTGAGCTGAGATCGCGCC;SOR=0.446;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=102;TCF=89;TCR=13;TR=40;WE=133447203;WS=133447185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,40:0.37:107
chr12	133447242	rs12832244	T	C	1418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.966;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=26;PP=1074;ReadPosRankSum=-1.310;SC=CGAGACTCCATCTCAAAACAC;SOR=0.364;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=171;TCF=111;TCR=60;TR=62;WE=133447250;WS=133447232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,65:0.35:184
chr12	133454420	rs199978810	GC	G	301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.071;NF=0;NR=11;PP=277;ReadPosRankSum=-0.747;SC=ACGGAGTCTCGCTCTGTCGCC;SOR=0.241;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=11;WE=133454428;WS=133454410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr12	133682655	rs710945	A	G	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=6.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.20;MQRankSum=-0.767;QD=6.07;ReadPosRankSum=0.811;SOR=1.259;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,37:0.27:136
chr12	133683261	rs905226	T	C	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-9.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.221;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=61;PP=867;ReadPosRankSum=-0.860;SC=AGAAAAACTATGAATGTATGG;SOR=0.913;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=198;TCF=9;TCR=189;TR=64;WE=133683269;WS=133683251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,65:0.32:202
chr12	133683280	rs905225	A	T	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-7.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=37;PP=632;ReadPosRankSum=0.662;SC=GGAATTTTTTAAAAAGAAGTA;SOR=0.861;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=131;TCF=1;TCR=130;TR=37;WE=133683288;WS=133683270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,36:0.27:132
chr12	133696743	rs144074942	G	GAAC	340.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=1.845;QD=8.11;ReadPosRankSum=-0.621;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,10:0.24:42
chr12	133696754	rs55957232	A	G	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=5.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.705;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.826;NF=11;NR=1;PP=593;ReadPosRankSum=0.080;SC=AAAATGTTATATTAAAAAAAG;SOR=0.095;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=12;WE=133696762;WS=133696733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,12:0.24:50
chr12	133732624	rs3763151	C	T	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=809;ReadPosRankSum=1.085;SC=GAGAGAAACCCTATGAATGTA;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=133732632;WS=133732614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr12	133761207	rs137892024	ATTTG	A	989.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.22;QD=41.24;SOR=2.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr12	133764701	.	C	CT	43	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5010;HP=12;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=21;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=43;QD=12.25;SC=TCTTTATTACCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=133764709;WS=133764691;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr12	133767966	rs11147291	C	T	549.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=464;ReadPosRankSum=-0.686;SC=GTTTTCAATACAATTTTTGTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=19;WE=133767974;WS=133767956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr12	133768273	rs10870589	G	C	1624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=21;PP=1334;SC=AAACTGGAGGGCTTCTATGAA;SOR=0.866;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=25;TCR=21;TR=46;WE=133768281;WS=133768263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr12	133768693	rs200581552	CTT	C	77.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQRankSum=0.792;QD=11.11;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr12	133770306	rs7960924	C	T	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=6;PP=202;SC=AACTTCCATTCGGAAGATTGA;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=133770314;WS=133770296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr12	133778684	rs7963812	G	A	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=1;PP=963;SC=CTAGTATACCGCAATCATGTG;SOR=4.921;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=34;WE=133778692;WS=133778674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr12	133778796	rs7975069	C	T	2708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=42;PP=2041;SC=CTGGGAAGTACGGCAAAAAGC;SOR=0.716;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=40;TCR=42;TR=82;WE=133778804;WS=133778786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr12	133802899	.	A	G	1988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.961;ClippingRankSum=0.000;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.944;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=21;PP=1343;ReadPosRankSum=-0.322;SC=TGGAGATGACAGTACCTGACA;SOR=0.447;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=103;TCF=77;TCR=26;TR=74;WE=133802907;WS=133802889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,84:0.72:116
chr13	19752625	rs605109	A	G	1856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=55;PP=1502;ReadPosRankSum=-0.784;SC=TACAAAGTACATGCTGTTCAA;SOR=6.770;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=0;TCR=56;TR=55;WE=19752633;WS=19752615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr13	19756026	rs783595	C	G	482.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=405;ReadPosRankSum=-0.741;SC=TTGGTCCGGACGTCCTGGGAG;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=18;WE=19756034;WS=19756016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr13	19775652	rs66950030	CA	C	132.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.12;MQRankSum=1.593;QD=14.75;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr13	19775755	rs115152530	A	G	2642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=25;PP=2149;SC=TTTTTTCTGGATAGCCAGGAA;SOR=1.939;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=60;TCR=25;TR=85;WE=19775763;WS=19775745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr13	19775867	rs114445450	G	A	1375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.67;QD=44.38;SOR=6.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr13	19775875	rs138429293	T	C	1452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.79;QD=42.73;SOR=7.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr13	19778601	rs141790008	G	A	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.90;QD=30.88;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	19782646	rs9512066	G	A	4169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=98;PP=2965;SC=TGCTCCACAGGGACCCATATC;SOR=1.001;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=81;TCR=98;TR=178;WE=19782654;WS=19782636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr13	19933372	rs4771142	G	A	2081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.688;NF=51;NR=10;PP=1631;ReadPosRankSum=-0.955;SC=AGTTCTGAGCGAGGGAGAAAT;SOR=1.981;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=62;TCF=52;TCR=10;TR=61;WE=19933380;WS=19933362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr13	19941233	rs3002090	C	A	2743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=44;PP=2213;SC=CCTAGTGATCCTACTGAATTA;SOR=0.761;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=50;TCR=44;TR=94;WE=19941241;WS=19941223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr13	19943643	.	T	A	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=3;PP=513;SC=GGGATGGTTTTGAAAGCTAAT;SOR=2.494;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=19943651;WS=19943633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	19949111	rs71197092	TC	T	110	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.37;QD=27.50;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	19949155	rs34247662	T	G	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.57;QD=32.14;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	19949218	rs35633897	C	T	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.62;QD=45.27;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr13	19949227	rs34936230	C	T	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.36;QD=43.21;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr13	19949262	rs34280326	G	A	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.16;QD=31.94;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	19949287	rs34088473	G	T	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=14;PP=593;SC=GCCCGCTCTCGGCTTTCAAAG;SOR=0.770;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=26;WE=19949295;WS=19949277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr13	19962055	rs9512903	G	A	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=25;PP=706;SC=GTTTGTTCATGAAGATGAAGG;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=19962063;WS=19962045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	20000630	rs2497218	T	C	7039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.344;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=13.096;NF=81;NR=131;PP=2965;ReadPosRankSum=1.840;SC=TTAATTAATATTTTGTCTGTT;SOR=0.150;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=217;TCF=82;TCR=135;TR=212;WE=20000638;WS=20000620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,225:0.99:228
chr13	20000702	rs4408395	G	C	4171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=115;PP=2965;SC=CCTAGATAACGATAACAAAAG;SOR=8.172;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=116;TCF=1;TCR=115;TR=116;WE=20000710;WS=20000692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr13	20004762	rs7139692	T	C	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.536;NF=4;NR=31;PP=792;ReadPosRankSum=-0.724;SC=CTTAACATCATGGATTAAAAA;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=35;WE=20004770;WS=20004752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr13	20004798	rs2497068	C	T	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=22;PP=646;SC=AAGCTAACAACGTATCAATAG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=20004806;WS=20004788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	20038584	rs7339103	A	G	4877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.879;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.121;NF=86;NR=58;PP=2965;ReadPosRankSum=0.173;SC=TTTGTCAGATAAAGACCCTTA;SOR=0.207;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=146;TCF=88;TCR=58;TR=144;WE=20038592;WS=20038574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,154:0.99:156
chr13	20039289	rs2497079	A	T	3514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=106;NR=3;PP=2965;SC=TATATTCTCAAGAATAAAGAA;SOR=6.537;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=106;TCR=3;TR=109;WE=20039297;WS=20039279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr13	20041323	rs2497251	G	T	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.66;QD=32.30;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr13	20041493	.	TAA	T,TA	453.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.47;QD=20.62;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,13,9:0.59,0.41:22
chr13	20041563	rs2492391	C	T	937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=800;SC=CCACAAACTACTGACTCATCC;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=20041571;WS=20041553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	20066994	rs78472618	T	C	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=24.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.26;MQRankSum=-6.923;QD=4.18;ReadPosRankSum=0.605;SOR=3.617;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,22:0.22:102
chr13	20067011	rs76437836	A	C	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=15.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.78;MQRankSum=-7.756;QD=4.77;ReadPosRankSum=0.954;SOR=2.133;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,30:0.27:112
chr13	20067081	rs76668072	A	G	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=1.023;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.93;MQRankSum=-6.857;QD=7.90;ReadPosRankSum=2.517;SOR=0.909;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,33:0.36:91
chr13	20208232	rs2298004	C	T	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=27;PP=756;SC=AATGCAAGCACGCGAAATCGT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=20208240;WS=20208222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	20221516	rs35424555	A	G	7796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.486;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-1.667;NF=109;NR=133;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.784;SC=GTCAAGCTATAAGAAAGTGTT;SOR=0.582;SbPval=0.53;Source=Platypus;TCF=110;TR=242;WE=20221524;WS=20221506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,240:1.00:241
chr13	20236083	rs9551950	C	T	291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=11;PP=275;SC=ATGGTCACATCGCTTTTTTTT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=20236091;WS=20236073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	20247171	rs4769866	A	G	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=0;PP=1223;SC=CTCCAGCCTGAGTGACAGAAT;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=39;WE=20247179;WS=20247161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr13	20247194	.	CA	C	92.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=0.000;QD=1.82;ReadPosRankSum=-1.141;SOR=0.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,13:0.25:51
chr13	20247238	.	G	GT	77.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.076;ClippingRankSum=0.000;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=14.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQRankSum=0.940;QD=0.94;ReadPosRankSum=-1.234;SOR=1.785;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,18:0.22:83
chr13	20251752	rs2290811	T	A	1085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=1;PP=986;SC=GACCATTACATATCTTCATTA;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=33;WE=20251760;WS=20251742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr13	20277413	rs75085951	T	C	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=17.653;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.79;MQRankSum=-4.219;QD=3.56;ReadPosRankSum=1.402;SOR=0.103;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,29:0.25:116
chr13	20601004	rs7981272	T	C	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=8;PP=239;SC=AACAGCTTTTTATTTTATATT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=20601012;WS=20600994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr13	20608354	rs11272380	T	TTTTCTTGAGGTG	1638.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=5.798;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=579;ReadPosRankSum=1.461;SC=TTCTTAAGCTTGTCGTCATAT;SOR=2.159;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=19;WE=20608362;WS=20608344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr13	20633470	rs11432433	T	TA	175.92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.126;NF=10;NR=0;PP=182;ReadPosRankSum=1.282;SC=AACTGGGAATTAAAAAAAAAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=10;WE=20633478;WS=20633460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr13	20656138	rs11344087	CT	C	606.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=21.67;SOR=4.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	20657188	rs9509028	T	G	2791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=76;PP=2340;SC=GTAACAGATTTCTATTTTTAT;SOR=4.565;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=6;TCR=76;TR=82;WE=20657196;WS=20657178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr13	20716533	rs968566	G	T	2753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=54;PP=2288;SC=AGGGCTAGCAGTTTGAAGTCC;SOR=1.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=27;TCR=54;TR=81;WE=20716541;WS=20716523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr13	20978504	rs4638418	C	T	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=454;SC=GCAATAAACCCTCAATGAACA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=20978512;WS=20978494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	20978664	rs3737036	T	C	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=1;PP=473;SC=AGATCAAGGGTAAAGATTCCA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=20978672;WS=20978654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	21006475	rs7983215	T	C	2905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=58;PP=2348;SC=AAGGAGATGATCCTGGGTTTG;SOR=1.688;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=29;TCR=58;TR=87;WE=21006483;WS=21006465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr13	21013670	rs67447039	G	A	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=1.575;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.19;MQRankSum=-2.171;QD=3.35;ReadPosRankSum=2.364;SOR=0.311;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,43:0.44:98
chr13	21148408	rs4326897	G	A	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=2;PP=493;SC=ATAGTGAGCCGTGATTGTGCT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=21148416;WS=21148398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	21156999	rs9509289	G	A	1740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=0;PP=1379;SC=CAATAGATGAGTTATAGAGGC;SOR=7.978;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=50;TCR=0;TR=50;WE=21157007;WS=21156989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr13	21157257	rs35700311	GA	G	1405.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=35;PP=1553;SC=TAGTGTTAAAGATTATAACCA;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=36;WE=21157265;WS=21157247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr13	21170193	rs149283826	G	GTAAAA	238.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.253;NF=2;NR=0;PP=72;ReadPosRankSum=-0.524;SC=GACCTTGTCTGTAAAATAAAA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=2;WE=21170201;WS=21170183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr13	21205124	rs35290473	TG	T	3403.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=54;PP=2951;SC=CATATTACAGTGGTAGTAACC;SOR=1.038;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=83;TCF=25;TCR=58;TR=79;WE=21205132;WS=21205114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr13	21205140	rs1329519	A	T	2970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=61;PP=2360;SC=TAACCTTCAGATATTCCATTT;SOR=1.485;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=30;TCR=61;TR=91;WE=21205148;WS=21205130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr13	21205192	rs9509307	G	A	1944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=46;PP=1641;SC=AAAAAGGACAGTAGAGTGAAA;SOR=2.381;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=12;TCR=46;TR=58;WE=21205200;WS=21205182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr13	21358061	rs17318617	A	G	1289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=32;PP=1040;SC=TATTCAGCCTATTGAAGAGAT;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=38;WE=21358069;WS=21358051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr13	21361513	rs4146442	T	C	1056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=0;PP=911;SC=ATGGTTTCCTTGCCCCCGAAA;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=21361521;WS=21361503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr13	21416945	rs2762995	G	A	1768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=0;PP=1384;SC=TATGTTTTATGAAAGCTGCAG;SOR=8.015;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=49;WE=21416953;WS=21416935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr13	21429776	rs17320607	T	C	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=4;PP=666;SC=CACAGTGGGATTGCCACTACT;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=21429784;WS=21429766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	21442945	rs9509410	G	A	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=1;NR=19;PP=530;SC=CTTTTGGGGGGCAAGAGGAAC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=21442953;WS=21442935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	21476997	rs7326480	A	G	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=25;PP=701;SC=CGCTGTCGACACCGGCGTCGC;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=21477005;WS=21476987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr13	21555544	rs870846	CT	GA	1139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.84;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr13	21555554	rs870848	G	A	1266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.23;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr13	21562832	rs2770928	C	T	3570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=47;PP=2922;SC=GAGGTGCTGCCCAATTCATAC;SOR=1.015;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=63;TCR=47;TR=110;WE=21562840;WS=21562822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr13	21562948	rs558614	G	A	2445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=51;PP=2158;SC=CTGGTGGGCCGCGGGACCGGC;SOR=1.349;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=29;TCR=51;TR=80;WE=21562956;WS=21562938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr13	21620085	rs7317471	T	C	5501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=79;PP=2965;SC=TGGATGGCTGTTTTAACCCCT;SOR=0.740;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=88;TCR=79;TR=167;WE=21620093;WS=21620075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr13	21729064	rs9552370	A	G	1081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=1;PP=986;SC=AACACTAATAATCCTTAAAGA;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=21729072;WS=21729054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr13	21732028	rs10700757	C	CAAA	761.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.93;MQRankSum=0.619;QD=23.81;ReadPosRankSum=1.201;SOR=2.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,29:0.91:32
chr13	21732094	rs4770121	C	T	3334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=36;PP=2675;ReadPosRankSum=-1.490;SC=TAGTTACTTCCGGAGGTGTAG;SOR=0.653;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=103;TCF=67;TCR=36;TR=102;WE=21732102;WS=21732084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,106:0.99:107
chr13	21736133	rs4561294	C	T	682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=516;SC=CTTTATGGTACAGAAGTCCCA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=21736141;WS=21736123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	21746453	rs2026600	T	C	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=9;PP=670;SC=CTAAAACAAATGCTATAAAAT;SOR=1.460;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=28;WE=21746461;WS=21746443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	21751005	rs9550717	G	C	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=6;PP=1003;SC=CTCCAGGTCCGGCCGCGCCAG;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=37;WE=21751013;WS=21750995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr13	21948560	rs149229681	G	C	1449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=29;PP=1136;SC=TTTTAGTGGAGACAGGGTTTT;SOR=1.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=40;WE=21948568;WS=21948550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr13	21951016	rs9509669	A	G	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=302;SC=TTTTAAAAGGAAGAATCTTAC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=21951024;WS=21951006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	21976837	rs9506668	T	C	2217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=22;PP=1635;SC=TGAAGTGTTCTTGTCAAGTGT;SOR=1.675;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=46;TCR=22;TR=68;WE=21976845;WS=21976827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr13	22033463	rs149977193	G	A	292.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=243;SC=GGCGCCGCCGGGACTCCTCCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=22033471;WS=22033453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	22096843	rs1200028	T	C	1106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=26;PP=851;SC=TTAGAATATATAGAGACATTA;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=22096851;WS=22096833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr13	22140911	rs66467009	TA	T	1497.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.13;MQRankSum=0.269;QD=21.40;ReadPosRankSum=-1.004;SOR=0.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,68:0.97:70
chr13	22178308	rs2761924	G	A	329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=11;PP=265;SC=GCGCAGCTAGGCGGCGCTTCT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=22178316;WS=22178298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	22275583	rs9509842	G	A	8445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=179;PP=2965;SC=GACAAAGACAGTTTCTTCACT;SOR=1.866;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=250;TCF=71;TCR=179;TR=250;WE=22275591;WS=22275573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr13	23251016	rs35856253	CT	C	404.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=501;SC=AATCCCAGCACTTTTGGGAGG;SOR=3.912;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=14;WE=23251024;WS=23251006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	23253313	rs9506904	T	C	4086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=94;NR=20;PP=2965;SC=GTGAGAAGACTATGCACGGTA;SOR=2.948;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=94;TCR=20;TR=114;WE=23253321;WS=23253303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr13	23279254	rs314874	G	A	5170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=39;PP=2965;SC=AAGAGAAGTTGTCGACAGATT;SOR=2.362;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=160;TCF=121;TCR=39;TR=160;WE=23279262;WS=23279244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr13	23279279	rs314873	T	C	6535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=142;NR=58;PP=2965;SC=CAGAGGCCATTGAAGATTTTA;SOR=2.016;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=201;TCF=143;TCR=58;TR=200;WE=23279287;WS=23279269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr13	23853468	rs66844808	A	G	3425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=14;PP=2772;SC=TGTAGTGAACAGTTTATAATA;SOR=3.686;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=105;TCR=14;TR=118;WE=23853476;WS=23853458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr13	23894754	rs111358030	G	T	551.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=35.288;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQRankSum=-1.462;QD=20.44;ReadPosRankSum=-2.410;SOR=4.396;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr13	23894755	.	TGC	T	536.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.944;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=28.646;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQRankSum=-1.941;QD=17.89;ReadPosRankSum=-1.643;SOR=4.164;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr13	23894760	.	C	T	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.184;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=25.586;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=-2.207;QD=14.84;ReadPosRankSum=-1.009;SOR=4.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr13	23898454	rs9510700	C	T	1919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=18;PP=1419;SC=GGATTTGCTGCTGACCAGGGT;SOR=1.536;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=58;WE=23898462;WS=23898444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr13	23898509	rs1800353	T	C	2276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=41;PP=1619;SC=CCAACCAGCTTGTGCTTGATG;SOR=0.948;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=33;TCR=42;TR=74;WE=23898517;WS=23898499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr13	23898664	rs1800354	A	G	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=21;PP=692;SC=CAGGAGCACAACCACATCTGC;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=23898672;WS=23898654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	23905711	rs2737699	A	G	2935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=52;PP=2463;SC=GTCATTGCCAATGCTAACAGG;SOR=1.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=34;TCR=52;TR=86;WE=23905719;WS=23905701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr13	23907677	rs2737701	C	T	3799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=40;PP=2965;SC=ATGATGATGACTGTGTCCATT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=80;TCR=40;TR=120;WE=23907685;WS=23907667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr13	23907909	rs17078605	A	G	3446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=49;PP=2840;SC=TGAAGTTTGGACCATATAATG;SOR=0.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=51;TCR=49;TR=100;WE=23907917;WS=23907899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr13	23909162	rs9552929	A	G	3926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=64;PP=2965;SC=TGTCCTTTACAACATGAATAG;SOR=0.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=62;TCR=65;TR=126;WE=23909170;WS=23909152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr13	23911820	rs4143768	A	G	2908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=60;PP=2347;ReadPosRankSum=-0.741;SC=CAATTTCTTGAATATTTGGAA;SOR=0.970;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=83;TCF=22;TCR=61;TR=82;WE=23911828;WS=23911810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,87:0.99:88
chr13	24200794	rs79042385	C	G	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=597;ReadPosRankSum=-0.912;SC=ATGACCACAACTGTAAGCTTA;SOR=2.066;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=23;WE=24200802;WS=24200784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr13	24234369	rs3751366	G	T	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.18;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	24234375	rs3751365	A	T	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.18;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	24234517	rs3751364	A	G	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=8;PP=509;SC=CTCTGCGGTCACAGGACATTC;SOR=1.382;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=24;WE=24234525;WS=24234507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	24242166	rs35041805	C	T	3776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=32;PP=2965;ReadPosRankSum=1.462;SC=GGCCTGCAGCCCCAACCCGGC;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=84;TCR=33;TR=115;WE=24242174;WS=24242156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,117:0.99:118
chr13	24242801	rs7329483	A	G	1632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=10;PP=1352;SC=CCCCATCAAAAACTTTAAGTT;SOR=2.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=46;WE=24242809;WS=24242791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr13	24243200	rs3751363	T	C	1708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=52;PP=1367;SC=AGGAGAGTGGTGCTGTCATCC;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=6;TCR=52;TR=58;WE=24243208;WS=24243190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr13	24384129	rs9510869	C	T	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=22;PP=692;SC=TATGTATAAGCCAGGAAATTT;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=24384137;WS=24384119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr13	24411772	rs7333040	T	C	3770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=39;PP=2870;SC=TCCATCATGCTAGGAGTTAGC;SOR=1.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=73;TCR=40;TR=111;WE=24411780;WS=24411762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr13	24415734	rs9580766	G	A	1782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=50;PP=1502;SC=AGCTAAAGAAGGATTCAAAAC;SOR=7.903;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=50;WE=24415742;WS=24415724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr13	24436230	rs1886972	C	T	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=393;SC=TAAAATATGTCGACTCCTCAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=24436238;WS=24436220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	24449166	rs10595689	AACAC	A	227.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=282;SC=GTTTCTTCAAAACACACACAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=24449177;WS=24449156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	24465743	rs3864971	A	G	5765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=5.635;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.16;MQRankSum=-1.787;QD=31.51;ReadPosRankSum=0.584;SOR=2.006;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,182:0.99:183
chr13	24470913	.	T	G	398	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=49.77;NF=21;NR=0;PP=398;QD=20.6081529784;SC=GAGATGAAAGTAATGAAGAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=66;TCR=4;TR=21;WE=24470921;WS=24470903;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:49,21:0.30:70
chr13	24471210	rs111568876	C	T	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=-6.518;QD=2.44;ReadPosRankSum=-1.420;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,13:0.17:76
chr13	24853011	.	TTTCC	T	116	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=29;MQ=53.88;NF=0;NR=2;PP=116;QD=60.0;SC=GCTGTTTTTCTTTCCTTCCTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=2;WE=24853022;WS=24853001;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,2:0.14:14
chr13	24860240	rs9507300	A	G	177.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=138;SC=TGCCACCAGCATATCCAAGTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=24860248;WS=24860234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	24868752	rs34017703	TA	T	2011.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=5;PP=2011;SC=AAACAGTGGCTAATGACGTAA;SOR=3.990;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=46;TCR=5;TR=50;WE=24868760;WS=24868742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr13	24869025	rs7993660	A	G	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=32;PP=908;SC=AAAGCACCCCACATGATCCCA;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=24869033;WS=24869015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr13	24889997	rs113352291	T	C	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr13	24890001	rs112601619	G	C	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr13	24890050	rs114252282	G	A	1155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=0;PP=981;SC=CCCACTGCACGGAACAGAGGC;SOR=5.728;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=24890058;WS=24890040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr13	24890337	rs9511193	C	G	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.17;MQRankSum=-0.387;QD=34.93;ReadPosRankSum=0.617;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,16:0.89:18
chr13	24890339	rs9511194	A	G	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.24;MQRankSum=-0.405;QD=36.99;ReadPosRankSum=0.835;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,15:0.88:17
chr13	24892841	rs9580939	G	C	3531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=9;PP=2965;SC=CAGAGTGCCCGTCAGGGCGGG;SOR=4.764;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=99;TCR=9;TR=108;WE=24892849;WS=24892831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr13	24893135	rs111305106	A	G	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.793;NF=0;NR=54;PP=1529;ReadPosRankSum=-0.790;SC=CACAGTTCTTACTCTCCAGAC;SOR=6.479;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=0;TCR=55;TR=54;WE=24893143;WS=24893125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr13	24895393	rs3751355	A	G	78.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.46;QD=26.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	24895559	rs3751357	A	G	2664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=11.358;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.38;MQRankSum=-1.365;QD=32.90;ReadPosRankSum=-0.035;SOR=6.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,79:0.98:81
chr13	24895684	rs2862239	A	G	7599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=138;NR=137;PP=2965;SC=TTTTCTCCAGAAATGTTCAGG;SOR=0.789;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=276;TCF=138;TCR=138;TR=275;WE=24895692;WS=24895674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr13	25000617	rs7571	C	G	480.88	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=396;ReadPosRankSum=1.437;SC=GAAATAGAAGCGTCATCCATT;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=17;WE=25000625;WS=25000607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr13	25005720	rs7996670	C	G	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=13;PP=512;SC=AACATATTTTCACTACTTGGG;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=21;WE=25005728;WS=25005710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	25005774	rs61947015	G	A	130.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5254;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=49.23;MQRankSum=-0.180;NF=0;NR=6;PP=101;ReadPosRankSum=-0.366;SC=CACACGGTATGCCCATGTAAT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=25005782;WS=25005764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr13	25008588	rs1372085	A	G	1340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=7;PP=1017;SC=CCAGTGTTGTATGCACACTAT;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=39;WE=25008596;WS=25008578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr13	25008630	rs1822135	A	G	1457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.021;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=12;PP=1175;ReadPosRankSum=-0.668;SC=CAGAAAGCACAGGATACTGTC;SOR=2.274;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=50;WE=25008638;WS=25008620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr13	25008903	rs9318536	G	T	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.59;QD=31.42;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr13	25009099	rs9511259	A	C	1894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=32;PP=1454;SC=CAATAGGGTGAAGAAGGTGGG;SOR=1.123;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=55;WE=25009107;WS=25009089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr13	25009297	rs1050112	G	T	1925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=32;PP=1473;SC=GCAGTCGGGGGAAGATAGGAA;SOR=0.723;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=33;TCR=32;TR=63;WE=25009305;WS=25009287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr13	25009441	rs13428	C	G	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=18;PP=528;SC=TTTTCCACACCTCCACGTTCC;SOR=4.615;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=19;WE=25009449;WS=25009431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	25009485	rs1050110	C	G	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=9;PP=367;SC=TACACCTAAGCCATCCTCTTC;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=25009493;WS=25009475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	25015967	rs61614647	C	T	399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=8;PP=527;SC=TCAACTTATTCGGTAATCAGC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=23;WE=25015975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	25016008	rs59195808	C	T	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.25;QD=31.34;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	25016092	rs55888616	C	T	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.44;QD=29.12;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr13	25016142	rs56259964	T	C	357.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.71;MQRankSum=-1.123;QD=22.36;ReadPosRankSum=-1.003;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr13	25016163	rs56092924	C	T	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.06;QD=32.23;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	25016585	rs3816226	G	A	278.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=58.82;NF=9;NR=0;PP=230;SC=GCTGGGACTCGTGGGGCCTGC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=25016606;WS=25016575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	25016598	rs3816225	A	G	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=10;NR=0;PP=274;SC=GGGCCTGCTGACCTGTCTGCA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=25016606;WS=25016575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	25016620	rs3816224	C	A	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=369;SC=CCCACACTTCCCAGGCCCAGG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=25016640;WS=25016610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	25016632	rs3816223	T	C	390.18	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=332;ReadPosRankSum=0.745;SC=AGGCCCAGGGTGTGGATGTCG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=13;WE=25016640;WS=25016610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr13	25016677	rs3816222	T	C	1582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.91;QD=43.97;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr13	25016687	rs4770683	C	T	1781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.08;QD=41.44;SOR=2.356;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr13	25016870	rs3816221	C	A	1614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=41;PP=1294;SC=ATTTCTATTTCGCTATGTCAG;SOR=4.003;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=4;TCR=41;TR=45;WE=25016878;WS=25016860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr13	25020757	rs9511273	T	C	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=0;PP=568;SC=GAGCATTATATATGGAAATAT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=25020765;WS=25020747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	25020782	rs9318553	C	G	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=3;PP=886;SC=TCATAACTTTCAAACAATGGG;SOR=3.675;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=25020790;WS=25020772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr13	25020863	rs9318554	G	A	2039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=35;PP=1461;SC=ACCATTGTACGAAATTCTTTC;SOR=0.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=31;TCR=35;TR=66;WE=25020871;WS=25020853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr13	25020910	rs9507346	G	A	1838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=42;PP=1503;SC=CTGAAATGGGGAAAAAAATAA;SOR=2.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=55;WE=25020918;WS=25020900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr13	25021144	rs78060735	GTCT	G	3696.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=26;PP=2969;SC=CAAACTCTGCGTCTTCTTACC;SOR=2.476;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=91;TCF=62;TCR=29;TR=76;WE=25021154;WS=25021134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr13	25021200	rs9318558	A	C	3326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.52;QD=30.24;SOR=1.168;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr13	25021211	rs7333856	C	T	2714.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=17.639;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.70;MQRankSum=2.519;QD=25.37;ReadPosRankSum=-2.591;SOR=0.020;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:7,100:0.93:107
chr13	25021245	rs7334587	A	G	2364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.289;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.390;NF=42;NR=56;PP=2026;ReadPosRankSum=1.696;SC=GGCCTCGGGCACATCTGGATT;SOR=0.369;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=130;TCF=53;TCR=77;TR=98;WE=25021253;WS=25021235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,92:0.79:117
chr13	25021263	rs77269056	T	C	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=2.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.84;MQRankSum=-4.055;QD=1.85;ReadPosRankSum=2.993;SOR=1.043;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,22:0.18:119
chr13	25021358	rs7139805	T	C	1086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=2.288;NF=2;NR=36;PP=803;ReadPosRankSum=1.407;SC=TCTCTTTCAATGCTCCATCCA;SOR=3.816;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=38;WE=25021366;WS=25021348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr13	25027744	rs4770684	A	G	6126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.154;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=1.171;SC=CTCTGCTGCCATGGTATTGCT;SOR=0.343;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=211;TCF=109;TCR=102;TR=210;WE=25027752;WS=25027734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,214:1.00:215
chr13	25029083	rs3818938	G	A	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=355;SC=GGTACCCACAGTTGTCAGCTC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=25029091;WS=25029073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	25029218	rs2275660	C	T	2514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=31;PP=1982;SC=GCATGCAAGGCGATTTGCTTG;SOR=1.455;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=57;TCR=31;TR=87;WE=25029226;WS=25029208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr13	25029401	rs7317188	C	G	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=30;PP=1010;SC=ACTTCAACTGCAAAAGGTCTA;SOR=4.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=33;WE=25029409;WS=25029391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr13	25059023	rs4769362	C	T	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=531;SC=TGGTTGTTTCCGGAAACACAA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=25059031;WS=25059013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	25064748	rs61948880	C	T	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=0;PP=1128;ReadPosRankSum=1.000;SC=AGCTCTTTAACGGAGTCTCAA;SOR=6.138;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=41;WE=25064756;WS=25064738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr13	25280753	rs2289905	C	T	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=29;PP=797;ReadPosRankSum=-0.480;SC=TCCAACCTCTCAGGTGGGCTG;SOR=2.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=32;WE=25280761;WS=25280743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,33:0.97:34
chr13	25283657	rs2289910	G	C	1387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=28;PP=1164;SC=CCCATCACACGAGGGCCTGCC;SOR=1.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=25283665;WS=25283647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr13	25283744	rs7318859	G	A	2024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=25;PP=1588;SC=GAGGGAGGGGGAACCGAGAGT;SOR=1.044;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=34;TCR=25;TR=58;WE=25283752;WS=25283734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr13	25338586	rs9578783	A	G	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=15;PP=453;SC=TGGTGTCACCAGAAACTGCGT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=25338594;WS=25338576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	25341365	rs142005435	A	AATC	3004.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=7;PP=2207;SC=CTGTCTCAATAATCATCATCA;SOR=3.849;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=53;TCR=10;TR=45;WE=25341373;WS=25341355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr13	25355965	rs5802305	GT	G	1601.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.29;QD=23.55;SOR=2.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr13	25363776	rs6490979	C	T	952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=11;PP=782;SC=TGATTTTTGTCTAGAGAACAT;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=27;WE=25363784;WS=25363766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	25370255	rs1446294	A	G	1702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=7;PP=1437;SC=TATTAATGTGACTTAAACATT;SOR=3.486;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=51;TCF=43;TCR=8;TR=50;WE=25370263;WS=25370245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr13	25399702	rs9553451	C	A	598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=509;SC=ATTCATTCAACACTTACATTT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=25399710;WS=25399692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	25399752	rs2121253	A	G	2587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=70;NR=1;PP=2220;SC=CCCTTTATTTACTAGATAGAG;SOR=7.223;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=71;TCF=70;TCR=1;TR=71;WE=25399760;WS=25399742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr13	25404743	rs4769382	T	C	1111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=29;PP=869;SC=AGAAGGTAATTTATTTATTAT;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=25404751;WS=25404733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr13	25419176	rs6490984	A	G	1841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=40;PP=1400;SC=ATCTAAAGACAATGGGAAGAC;SOR=2.262;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=53;WE=25419184;WS=25419166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr13	25442921	rs2275938	A	C	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=50;PP=1595;SC=TAAACACTATAAGTGACTCTT;SOR=7.903;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=50;WE=25442929;WS=25442911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr13	25453116	rs9553461	T	C	3302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.24;SOR=7.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr13	25453116	.	TTG	CTC	1800	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=63;NR=0;PP=1800;QD=29.4201249978;SC=TAGGAAGACCTTGTGAGAAGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=69;TCR=0;TR=63;WE=25453126;WS=25453113;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,63:0.91:69
chr13	25453118	rs79933264	G	C	3302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.63;SOR=6.385;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
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chr13	25460428	rs9511502	A	G	4421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=70;PP=2965;SC=AAAGTGTAACAGAGCTGGATG;SOR=0.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=76;TCR=70;TR=146;WE=25460436;WS=25460418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr13	25517938	rs113483335	C	T	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=22;PP=619;SC=GAGATATGAACTTCTCTGTTT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=25517946;WS=25517928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr13	25525370	rs9511519	C	T	1965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.150;NF=59;NR=0;PP=1618;ReadPosRankSum=1.234;SC=ATTTAGTAGACTTATGAAGAA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=61;TCR=0;TR=59;WE=25525378;WS=25525363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,61:0.98:62
chr13	25525481	rs56247049	G	A	12132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FS=4.510;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.80;MQRankSum=-0.863;QD=44.28;ReadPosRankSum=-0.804;SOR=1.286;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,273:1.00:274
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chr13	25525544	rs41288282	T	C	8045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=90;NR=152;PP=2965;SC=CCAAAAAGTATCTCCACGGCA;SOR=1.308;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=243;TCF=90;TCR=153;TR=242;WE=25525552;WS=25525534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr13	25525636	rs41288284	G	C	3244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=88;PP=2659;SC=CCTAAGAATAGAAAAAAAATT;SOR=7.679;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=89;TCF=1;TCR=88;TR=89;WE=25525644;WS=25525626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr13	25670851	rs75475407	A	G	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=2.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQRankSum=-11.862;QD=1.09;ReadPosRankSum=-0.258;SOR=0.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:209,22:0.10:231
chr13	25670868	rs200859889	G	A	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FS=1.652;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQRankSum=-13.415;QD=2.28;ReadPosRankSum=-0.318;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:222,31:0.12:253
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chr13	25670877	rs112107735	G	A	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FS=2.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQRankSum=-14.195;QD=2.38;ReadPosRankSum=0.235;SOR=0.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:240,34:0.12:274
chr13	25670907	rs76264750	C	A	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FS=2.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQRankSum=-16.734;QD=2.92;ReadPosRankSum=0.519;SOR=0.881;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:278,45:0.14:323
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chr13	25670955	rs79397892	C	T	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=348;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQRankSum=-18.331;QD=3.19;ReadPosRankSum=0.066;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:298,48:0.14:346
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chr13	25670981	rs77476965	G	C	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FS=4.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQRankSum=-18.703;QD=2.41;ReadPosRankSum=-0.048;SOR=0.396;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:316,44:0.12:360
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chr13	25670988	rs74564616	T	G	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=381;ExcessHet=3.0103;FS=13.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQRankSum=-19.173;QD=2.46;ReadPosRankSum=-0.382;SOR=0.331;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:333,45:0.12:378
chr13	25671008	rs76447065	C	T	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=425;ExcessHet=3.0103;FS=8.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.36;MQRankSum=-19.882;QD=1.68;ReadPosRankSum=-1.020;SOR=0.380;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:376,46:0.11:422
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chr13	25671272	rs376589131	AG	A	1477.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-6.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=523;ExcessHet=3.0103;FS=15.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.80;MQRankSum=-17.617;QD=2.86;ReadPosRankSum=0.045;SOR=1.189;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:448,68:0.13:516
chr13	25671274	rs76994938	C	T	1489.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=517;ExcessHet=3.0103;FS=14.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQRankSum=-17.529;QD=2.92;ReadPosRankSum=-0.034;SOR=1.118;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:441,69:0.14:510
chr13	25671292	rs80261016	C	T	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=502;ExcessHet=3.0103;FS=6.500;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQRankSum=-17.233;QD=1.35;ReadPosRankSum=1.986;SOR=0.820;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:423,71:0.14:494
chr13	25671310	rs371130768	TTATGA	T	1747.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=510;ExcessHet=3.0103;FS=1.612;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.99;MQRankSum=-15.712;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.702;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:413,73:0.15:486
chr13	25671320	.	A	G	1791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.246;ClippingRankSum=0.000;DP=482;ExcessHet=3.0103;FS=3.704;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQRankSum=-13.968;QD=3.76;ReadPosRankSum=1.236;SOR=1.039;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:404,72:0.15:476
chr13	25671332	rs371570689	CA	C	1246.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=475;ExcessHet=3.0103;FS=11.208;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.61;MQRankSum=-10.090;QD=2.70;ReadPosRankSum=-0.584;SOR=1.779;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:388,73:0.16:461
chr13	25671369	rs76804900	G	T	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=426;ExcessHet=3.0103;FS=37.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.36;MQRankSum=-4.731;QD=1.01;ReadPosRankSum=0.626;SOR=3.624;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:369,55:0.13:424
chr13	25715574	rs9511659	C	T	3540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=103;NR=1;PP=2965;SC=TGAGCAGGCTCAGCATCTGGA;SOR=7.903;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=104;TCF=103;TCR=1;TR=104;WE=25715582;WS=25715564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr13	25802491	rs4770813	A	G	1479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=2;PP=1198;SC=CTTGGTCCCCATCCTCAGGGA;SOR=5.709;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=52;TCF=50;TCR=2;TR=52;WE=25802499;WS=25802481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr13	25825889	rs4312169	T	C	1844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=15;PP=1390;SC=TTCGATCAAATTGATGGTACA;SOR=1.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=50;WE=25825897;WS=25825879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr13	25831888	rs7995033	T	C	12979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=415;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=210;NR=187;PP=2965;SC=GCCAAGAAGATTGCAGCATCC;SOR=0.806;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=397;TCF=210;TCR=187;TR=397;WE=25831896;WS=25831878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,408:1.00:408
chr13	25848404	rs4387458	A	C	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=752;SC=CTTACATGCAACATTCTCAAT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=25848412;WS=25848394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr13	25876011	rs11556093	G	A	11592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=178;NR=186;PP=2965;SC=CGGAACGGGAGCGTCTAGGTA;SOR=0.748;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=366;TCF=179;TCR=187;TR=364;WE=25876019;WS=25876001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,370:1.00:370
chr13	25886932	rs4341628	A	G	3076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=1;PP=2577;SC=TGAACTTTTAAGGATCCTTAT;SOR=7.546;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=84;TCF=83;TCR=1;TR=84;WE=25886940;WS=25886922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr13	25893363	rs59567333	GTTTATA	G	2476.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=0;PP=2556;SC=ATGCTTAACAGTTTATATTTA;SOR=8.121;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=57;TCR=1;TR=48;WE=25893376;WS=25893353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr13	25901781	rs7997070	A	C	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=30;PP=897;SC=GAAAACTACTATAATCCATAA;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=32;WE=25901789;WS=25901771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr13	25911050	rs75002041	AT	A	343.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=2.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.58;ReadPosRankSum=-0.308;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,30:0.31:96
chr13	26273385	rs6491088	G	C	4710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=87;NR=48;PP=2965;SC=ACGTGGCCCTGATCATCGATG;SOR=1.406;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=87;TCR=48;TR=135;WE=26273393;WS=26273375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr13	26273538	rs2296003	C	T	2457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=68;PP=2118;SC=GTATCCCGTGCTTATACAAAA;SOR=5.728;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=71;TCF=3;TCR=68;TR=71;WE=26273546;WS=26273528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr13	26436641	rs2249800	C	T	1058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=28;PP=874;SC=CTTACAGCCACGATGAGCTTC;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=26436649;WS=26436631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr13	26501227	rs1185907	C	T	2482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=32;PP=1805;SC=TTCATTCATTCACCTTCTTCC;SOR=1.096;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=74;WE=26501235;WS=26501217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr13	26535625	rs9511998	G	A	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=4;PP=772;SC=TTGTTTTTGTGTTGTGAAATA;SOR=3.611;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=32;WE=26535633;WS=26535615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr13	26586788	rs9553698	A	C	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=39;PP=881;SC=GGGCTGATGGAGGAGTGGGTG;SOR=5.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=41;WE=26586796;WS=26586778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr13	26959593	rs7327769	T	G	285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=235;SC=AAGAGCAGACTGAGTGTGATG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=26959601;WS=26959583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	26974562	rs998692	G	A	9564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=255;NR=33;PP=2965;SC=AAGCAATACCGTCATGTTTGT;SOR=3.767;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=290;TCF=257;TCR=33;TR=288;WE=26974570;WS=26974552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,298:1.00:298
chr13	27643597	rs9512534	C	T	1286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=27;PP=983;SC=AAAAGACTGACAATACCAAGT;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=42;WE=27643605;WS=27643587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr13	27829310	rs3094293	G	A	5030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=96;NR=50;PP=2965;SC=AGAATACTTTGCAGTTACTTA;SOR=1.579;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=96;TCR=50;TR=146;WE=27829318;WS=27829300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr13	28009031	rs7323	G	C	12356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=400;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=210;NR=175;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.705;SC=AGAAAGGGATGTATGTCGCTG;SOR=0.305;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=389;TCF=213;TCR=176;TR=385;WE=28009039;WS=28009021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,395:1.00:396
chr13	28009920	rs1218825	G	C	4328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=97;PP=2965;SC=CATTTTTGCTGAAAGCACGAA;SOR=2.851;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=22;TCR=97;TR=119;WE=28009928;WS=28009910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr13	28134146	.	C	T	3637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=92;PP=2965;SC=AAATACATTACCATAAGTGAC;SOR=4.077;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=11;TCR=92;TR=103;WE=28134154;WS=28134136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr13	28136989	rs11838661	A	G	4564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=119;PP=2965;SC=TGTTTATGTGACATTTCCACA;SOR=5.120;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=9;TCR=119;TR=128;WE=28136997;WS=28136979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr13	28143229	rs8002697	A	G	8130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=123;NR=119;PP=2965;SC=CTCCATGTGGAAAGAGACGCT;SOR=0.710;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=242;TCF=123;TCR=119;TR=242;WE=28143237;WS=28143219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr13	28155994	rs9512753	G	C	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=19;PP=425;SC=AATCAAGATAGGTTAAAAGTA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=28156002;WS=28155984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr13	28197417	rs8459	C	A	3525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=96;PP=2902;SC=GGAGAACTGTCCTGTAGGATA;SOR=4.466;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=9;TCR=97;TR=105;WE=28197425;WS=28197407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr13	28519354	rs2504220	A	C	4004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.913;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=34;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.055;SC=ACATTGCCAGAGTCTTGGCGA;SOR=0.131;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=162;TCF=128;TCR=34;TR=154;WE=28519362;WS=28519344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:8,155:0.95:163
chr13	28537242	rs1805108	A	C	3230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=8;PP=2660;SC=CCGCTGCAGAACCCGGTGGGT;SOR=4.743;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=95;TCR=8;TR=102;WE=28537250;WS=28537232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr13	28537317	rs1805107	G	A	7759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=169;NR=68;PP=2965;SC=ACAGAGCCAGGCACTGAGGCT;SOR=1.917;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=238;TCF=170;TCR=68;TR=237;WE=28537325;WS=28537307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr13	28537537	rs2504212	T	G	10497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=123;NR=201;PP=2965;SC=AAAAGCACATTGTGGTGAAGA;SOR=1.268;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=324;TCF=123;TCR=201;TR=324;WE=28537545;WS=28537527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,328:1.00:328
chr13	28539185	rs2481953	T	A	5473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=116;PP=2965;SC=GGCTGAGAACTGCAAGGCAGC;SOR=1.754;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=170;TCF=53;TCR=117;TR=169;WE=28539193;WS=28539175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr13	28541583	rs2481967	T	G	5387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=147;PP=2965;SC=AATTGGGGCATCAAGGAGCGA;SOR=5.447;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=9;TCR=147;TR=156;WE=28541591;WS=28541573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr13	28589267	rs4073630	C	T	1323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=0;PP=1186;SC=CTGATTTCAACCAAATTACAG;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=43;WE=28589275;WS=28589257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr13	28589495	rs9579142	C	G	3129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=64;PP=1994;ReadPosRankSum=1.580;SC=GTGCCAGACACTGTTGCAGGC;SOR=2.200;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=11;TCR=65;TR=75;WE=28589517;WS=28589485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,78:0.99:79
chr13	28589509	rs9579143	C	T	2618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=49;PP=1563;SC=TGCAGGCACACGGGCTGCGGC;SOR=3.538;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=8;TCR=49;TR=57;WE=28589517;WS=28589485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr13	28589662	rs4497507	C	G	1192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=30;NR=4;PP=976;SC=AGGGGTGGGGCGGCACCGAGA;SOR=3.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=34;WE=28589670;WS=28589652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr13	28592546	rs17086226	T	C	3432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=13;PP=2809;SC=TTGTTTACCATGATAACGACA;SOR=3.716;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=92;TCR=13;TR=105;WE=28592554;WS=28592536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr13	28602226	rs201497852	AAGAG	A	3458.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=18;PP=2997;SC=AAGAATTAAAAAGAGAGAGAG;SOR=2.484;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=79;TCF=58;TCR=21;TR=64;WE=28602237;WS=28602216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr13	28602256	rs61944200	C	T	3688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.441;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.251;NF=82;NR=34;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.529;SC=GAGCAAACATCCTCTTTGTCA;SOR=1.894;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=117;TCF=82;TCR=35;TR=116;WE=28602264;WS=28602246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,118:0.99:119
chr13	28622356	rs2153000	G	A	6896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=175;NR=30;PP=2965;SC=TCTCAAGGGCGACAAGCAAGG;SOR=3.291;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=175;TCR=30;TR=205;WE=28622364;WS=28622346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr13	28636084	rs7338903	G	A	2609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=56;PP=2132;SC=TCCCTGGGGCGTCGACCAGCA;SOR=1.854;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=23;TCR=56;TR=79;WE=28636092;WS=28636074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr13	28636205	.	A	G	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=504;SC=GGATTCTGATACCTACGTTGC;SOR=4.615;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=28636213;WS=28636195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	28644510	rs2387350	C	A	1106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=2;PP=963;SC=AGATGTGAGGCCATAATATAC;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=33;WE=28644518;WS=28644500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr13	28644830	rs9554239	A	G	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.72;SOR=5.353;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	28647489	rs201203436	GAAAA	G	5675.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.912;HP=17;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;MQRankSum=-0.088;NF=91;NR=15;PP=1282;SC=CTCATCTCTGGAAAAAAAAAA;SOR=3.704;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=193;TCF=157;TCR=36;TR=106;WE=28647502;WS=28647479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,144:0.99:146
chr13	28647573	rs9581971	C	T	12896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=420;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=222;NR=187;PP=2965;SC=GTCCAGCCATCTTTGTAATCT;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=409;TCF=222;TCR=187;TR=409;WE=28647581;WS=28647563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,414:1.00:414
chr13	28647710	rs9581972	C	T	3244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=95;PP=2818;SC=TATAATAAATCGTGCACATTA;SOR=7.743;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=96;TCF=1;TCR=95;TR=96;WE=28647731;WS=28647700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr13	28647723	rs9581973	A	C	2146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=74;PP=1791;SC=GCACATTAAAAGTATACAATT;SOR=7.276;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=75;TCF=1;TCR=74;TR=75;WE=28647731;WS=28647700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr13	28834854	rs139094014	CT	C	1988.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=37;PP=1441;SC=GGAAACCTGTCTTTTAAAAAA;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=37;WE=28834862;WS=28834844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr13	28835527	rs5802469	T	TC	1804.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=9;PP=1653;SC=TATACTTATTTTGTTTCATAG;SOR=2.687;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=38;WE=28835535;WS=28835517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr13	28854692	.	A	ATT	571.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=-0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQRankSum=0.241;QD=43.98;ReadPosRankSum=0.819;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr13	28877629	rs5802470	A	AC	141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.360;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5712;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=94;ReadPosRankSum=2.093;SC=TGGTTTTGGAACCCCCCCCCC;SOR=0.495;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=8;WE=28877637;WS=28877619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr13	28882948	rs9579177	G	A	3549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=47;PP=2806;SC=GGTCTATCGGGGTGCACTAGG;SOR=0.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=56;TCR=48;TR=103;WE=28882956;WS=28882938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr13	28883061	rs7993418	G	A	2860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=53;PP=2141;SC=AAGCATTTACGTATCTAATGA;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=35;TCR=53;TR=88;WE=28883069;WS=28883051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr13	28885672	rs4771238	C	T	566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.34;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	28886113	rs7328692	A	G	2028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=2;PP=1800;SC=TTTTGATGTAAATAAATTTAG;SOR=5.926;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=60;TCF=58;TCR=2;TR=60;WE=28886121;WS=28886103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr13	28893484	rs2296188	T	C	1169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=0;PP=969;SC=AAAGGCTGTCTAACCAAAGGA;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=28893492;WS=28893474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr13	28893642	rs2296189	A	G	4503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=62;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.807;SC=AGATAGATTCAGGAGCCATCC;SOR=0.350;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=85;TCR=62;TR=146;WE=28893650;WS=28893632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,154:0.99:155
chr13	28942840	.	CT	C	361.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.994;ClippingRankSum=0.000;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=10.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.58;MQRankSum=1.736;QD=4.64;ReadPosRankSum=1.823;SOR=2.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,33:0.42:78
chr13	28958955	rs3751395	C	A	3500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=1;PP=2954;SC=GGTGACGGGACTGTTAAGGGA;SOR=7.903;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=102;TCF=101;TCR=1;TR=102;WE=28958963;WS=28958945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr13	28964198	rs17537350	C	T	13839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=435;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=168;NR=255;PP=2965;SC=CCTCTCCTTCCGTCGGCATTT;SOR=1.187;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=424;TCF=168;TCR=256;TR=423;WE=28964206;WS=28964188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,432:1.00:432
chr13	28970917	rs7990486	C	T	3593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=1;PP=2965;SC=GAAATAACTCCTTACGAGATC;SOR=7.884;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=100;TCF=99;TCR=1;TR=100;WE=28970925;WS=28970907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr13	28980150	rs5802481	A	AG	1847.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=44;PP=2020;SC=TTTATGTGTGATCTTCTTTTC;SOR=7.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=44;WE=28980158;WS=28980140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr13	29012584	rs41291688	G	A	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=501;SC=CCACAGTCACGTCATTCTCCC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=29012592;WS=29012574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	29069039	rs55927955	G	A	3865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=106;PP=2965;SC=CAACGACCCGGCCGCCAGAGT;SOR=3.559;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=126;TCF=18;TCR=108;TR=124;WE=29069047;WS=29069029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr13	29275102	rs947027	T	C	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=14;PP=841;SC=CTCTATAAAATAAAGCATTAC;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=33;WE=29275110;WS=29275092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr13	29278063	rs34444192	T	TA	1809.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=8;PP=1904;ReadPosRankSum=-1.506;SC=ATAAAATGATTAAAAATAATG;SOR=2.269;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=64;TCF=55;TCR=9;TR=51;WE=29278071;WS=29278053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr13	29278264	rs34310301	G	GA	712.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.83;MQRankSum=0.665;QD=23.76;ReadPosRankSum=-0.934;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,27:0.90:30
chr13	29674840	rs1536720	T	C	2357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=1;PP=2043;SC=TTCGAATTCATAATCTGTAGA;SOR=7.140;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=72;TCF=71;TCR=1;TR=72;WE=29674848;WS=29674830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr13	29674855	rs1536719	A	G	2285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=3;PP=1915;SC=TGTAGAATTCATTATCTCATT;SOR=5.969;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=82;TCF=79;TCR=3;TR=82;WE=29674863;WS=29674845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr13	29675049	rs140464903	A	T	2910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=82;PP=2397;SC=GCGTCTCCTCAGTCTCCAGCA;SOR=4.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=7;TCR=82;TR=89;WE=29675057;WS=29675039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr13	29855822	rs3751335	C	T	1465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=11;PP=1145;SC=ATAATTAACACGCTGTCTGCC;SOR=2.400;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=46;WE=29855830;WS=29855812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr13	29898881	rs928660	A	G	4295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=102;PP=2965;SC=TCCTTGGGGGAATGACTTGAA;SOR=2.629;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=27;TCR=102;TR=129;WE=29898889;WS=29898871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr13	30014373	rs7337496	C	T	1335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=37;PP=1065;SC=TTCACGTCTCCGTTGTTATAA;SOR=7.428;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=38;WE=30014381;WS=30014363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr13	30071310	rs2258198	G	T	183.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.6;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=87;SC=GATCACAGCTGCCCAGGCTGT;SOR=1.329;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=30071318;WS=30071300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	30075114	rs882953	C	T	3517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=13;PP=2838;SC=TAAAGCATTGCGAACTGATGT;SOR=3.631;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=94;TCR=13;TR=107;WE=30075122;WS=30075104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr13	30077088	rs2482096	C	T	2258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=6;PP=1899;SC=GTTCAGTGTCCACTAGCATGA;SOR=4.047;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=57;TCR=6;TR=63;WE=30077096;WS=30077078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr13	30090230	.	A	G	3510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.316;ClippingRankSum=0.000;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=30;PP=2564;ReadPosRankSum=0.694;SC=GGAGACCCCCAGGGGAAGCCA;SOR=0.664;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=126;TCF=96;TCR=30;TR=124;WE=30090238;WS=30090220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,131:0.98:133
chr13	30090404	rs2989592	T	C	3625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=87;PP=2886;SC=AGGAGGTGGCTTCAATCCATG;SOR=3.570;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=15;TCR=87;TR=102;WE=30090412;WS=30090394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr13	30091516	rs2490267	T	C	3556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=78;PP=2965;SC=GCATCCACTGTTCTCCCCTAA;SOR=2.237;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=27;TCR=78;TR=105;WE=30091524;WS=30091506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr13	30091714	rs2482089	G	A	3041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=22;PP=2488;SC=TCTTACCTATGAGGCTGGTTG;SOR=2.327;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=71;TCR=22;TR=93;WE=30091722;WS=30091704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr13	30091819	rs2482090	G	C	3579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=66;PP=2924;SC=CTGGTAAAAAGCCCAGCTGGG;SOR=1.209;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=43;TCR=66;TR=109;WE=30091827;WS=30091809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr13	30098215	rs2776957	C	T	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=418;SC=CAAGCATTGGCTTGTTTGCCC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=30098234;WS=30098205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	30098226	rs2776958	A	G	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=1;PP=400;SC=TTGTTTGCCCAGGGTGCAGGA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=30098234;WS=30098205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	30346392	rs140223719	CTATAT	C	2340.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.78;NF=0;NR=43;PP=2403;SC=TAAGGTACTACTATATTGTTT;SOR=4.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=43;WE=30346404;WS=30346382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr13	30351248	rs35681461	T	TA	2157.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=6;PP=2312;SC=AGGTAGGGCATAAGAATCAAC;SOR=4.244;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=62;TCF=54;TCR=8;TR=54;WE=30351256;WS=30351238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr13	30805627	rs202087	A	G	2022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=48;PP=1610;SC=TTCAAAAGACAAATTAAATGA;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=12;TCR=48;TR=60;WE=30805635;WS=30805617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr13	31036642	rs3742305	C	G	4554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.165;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=71;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.717;SC=GCGTACTTGTCATCATTTTAC;SOR=0.359;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=67;TCR=71;TR=137;WE=31036650;WS=31036632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,142:0.99:143
chr13	31036681	rs1929606	A	G	3691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=73;PP=2965;SC=TTACCTTTTCATATTTTTCCT;SOR=1.336;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=45;TCR=73;TR=118;WE=31036689;WS=31036671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr13	31037903	rs2249825	G	C	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=15;PP=366;SC=TACTTAGTAAGGGAATGAAAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=31037911;WS=31037893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	31287979	rs147763360	G	GTA	6828.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=127;PP=2990;SC=ATCAGTGCTGGTGTGTGTGTG;SOR=3.655;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=136;TCF=8;TCR=128;TR=134;WE=31287987;WS=31287969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr13	31309830	rs4769055	C	A	2636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=49;PP=1980;SC=AAGCCCTTCACTCAGGGAAGA;SOR=1.030;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=35;TCR=49;TR=84;WE=31309838;WS=31309820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr13	31480827	rs9531945	A	G	1402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=28;PP=1185;SC=CGTGGTGGCCAGGCCCGGGGA;SOR=1.203;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=19;TCR=28;TR=47;WE=31480835;WS=31480817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
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chr13	31725260	rs11556147	A	G	1882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=41;PP=1457;ReadPosRankSum=-0.794;SC=ATTCTGCACAAAAATGTTCCA;SOR=1.418;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=52;WE=31725268;WS=31725250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,57:0.98:58
chr13	31725617	rs2146895	C	T	748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=0;PP=643;SC=CAACCGTTTCCTGTTAACATC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=31725625;WS=31725607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	31725732	rs4941772	A	C	3317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=26;PP=2689;ReadPosRankSum=1.222;SC=CTGAGTTCCAATGTATGACTT;SOR=1.162;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=79;TCR=26;TR=104;WE=31725740;WS=31725722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,105:0.99:106
chr13	31728657	rs4943165	T	C	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.09;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	31728666	rs2274018	G	A	1183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.82;SOR=6.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	31729729	rs1047086	A	G	2609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=52;PP=2044;ReadPosRankSum=0.179;SC=TGAAGGGGTCATTGAATGCTC;SOR=1.105;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=90;TCF=37;TCR=53;TR=88;WE=31729737;WS=31729719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,90:0.98:92
chr13	31789169	rs35344913	CT	C	499.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.66;ReadPosRankSum=0.796;SOR=1.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,27:0.90:30
chr13	31796969	rs2147515	G	C	3113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=64;NR=32;PP=2506;SC=TCCAAGCTCCGTTTTTCAAAT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=64;TCR=32;TR=96;WE=31796977;WS=31796959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr13	31821256	rs9542307	C	G	2458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=58;PP=1966;SC=TTTAACTCACCTGTGAATTAC;SOR=2.055;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=22;TCR=58;TR=80;WE=31821264;WS=31821246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr13	31821992	rs4943266	T	C	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=2;PP=688;SC=TTTTGGTCAGTTTTTCTGTAA;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=31822000;WS=31821982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr13	31835268	rs34409451	AC	A	1599.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=30;PP=1527;SC=GTGTGCATCAACTTTAATTTC;SOR=2.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=36;WE=31835276;WS=31835258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr13	31843598	rs1924817	A	G	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=21;PP=570;SC=AGTTATGTAGATGAAGACAGA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=31843606;WS=31843588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	31848535	rs912600	G	A	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=1;PP=663;SC=ATATGGTTCAGCCTACTCTCT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=31848543;WS=31848525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	31850714	rs1028751	G	C	1075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=7;PP=887;SC=AAAACTTTATGCCGGAAATAT;SOR=2.517;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=34;WE=31850722;WS=31850704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr13	31850989	rs4065552	G	A	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=254;SC=ATTCTTGAGTGTAAATTCAGA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=31850997;WS=31850979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	31891561	rs1041074	T	C	891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=699;SC=TTTATTTATTTTATAAGTCAC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=31891569;WS=31891551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr13	31891746	rs1041073	G	A	3001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=61;PP=2393;SC=TGACTCCGGCGAGCCTGTGTT;SOR=1.533;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=27;TCR=61;TR=88;WE=31891754;WS=31891736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr13	31903834	rs1060709	G	T	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=20;PP=586;SC=CCTAGCCTGCGCAGGGAATGA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=31903842;WS=31903824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	32336040	rs1536635	C	T	1340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=40;PP=1202;SC=TCAGAATTTCCGTTTTAGTTC;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=41;WE=32336048;WS=32336030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr13	32339382	rs12870532	C	T	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=593;SC=TAATAGAAACCCTGTTTAAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=32339390;WS=32339372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	32340193	rs35564049	T	TA	1422.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=27;PP=966;SC=CATATTTATTTAAAAAAAATC;SOR=0.732;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=40;WE=32340201;WS=32340183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr13	32705785	rs17591851	A	G	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=426;SC=AATATTTGATAAACCACTTAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=32705793;WS=32705775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	32708993	rs9590780	T	C	2816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=15;PP=2181;ReadPosRankSum=-0.906;SC=ATTCTATGTGTACATTTCAAC;SOR=1.871;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=72;TCR=15;TR=86;WE=32709001;WS=32708983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,89:0.99:90
chr13	32823882	rs2806630	G	A	1605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=45;PP=1307;SC=TTGAGTCCATGTGGCTGGGTC;SOR=4.977;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=48;WE=32823890;WS=32823872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr13	32834538	rs5802640	C	CTATCT	1219.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=18;PP=954;SC=TCCTTTATTCCTAACAGAAAG;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=21;WE=32834546;WS=32834528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	32866221	rs6561216	A	G	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=2;PP=25;SC=CCAGGTTCAAACGATTCTCCT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=32866229;WS=32866211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr13	32899373	.	A	G	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=138;SC=TTTCCTACATATATTTGTTCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=32899381;WS=32899363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	32905265	rs206073	G	A	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=296;SC=CCGTGATCTCGGTTTACCGCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=32905273;WS=32905255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	32906729	rs144848	A	C	6767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.486;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=136;NR=77;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.186;SC=AAATGTAGCAAATCAGAAGCC;SOR=1.075;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=215;TCF=136;TCR=79;TR=213;WE=32906737;WS=32906719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,215:0.99:217
chr13	32913055	rs206075	A	G	5084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=87;PP=2965;SC=AACCTACTCTATTGGGTTTTC;SOR=0.948;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=65;TCR=87;TR=152;WE=32913063;WS=32913045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr13	32915005	rs206076	G	C	2281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=34;PP=1951;SC=GAACCAAAGTGTCACTTGTTG;SOR=0.722;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=36;TCR=34;TR=70;WE=32915013;WS=32914995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr13	32920844	rs206080	T	C	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=85;SC=ATTGAGCATCTGTTACATTCA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=32920852;WS=32920834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	32929387	rs169547	T	C	2321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=48;PP=1770;SC=AATCAAGCAGTAGCTGTAACT;SOR=1.641;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=22;TCR=48;TR=70;WE=32929395;WS=32929377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr13	32936646	rs9534262	T	C	1717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=7;PP=1407;SC=AATATTCTACTTTTATTTGTT;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=48;WE=32936654;WS=32936636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr13	32953388	rs4942486	T	C	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=0;PP=618;SC=TAAAGCCATCTAGTTACAATA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=32953396;WS=32953378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	32970031	rs1012130	T	C	151.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=1;PP=90;SC=GGAGTTGTATTCATTATTTAG;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=32970039;WS=32970021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	33052294	rs380627	C	T	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=40;PP=1130;SC=TCAATCTCAACGAAGAACTTG;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=40;WE=33052302;WS=33052284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr13	33268573	rs561056	T	C	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=342;SC=GGATTCCTTGTTTAGAAAACT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=33268581;WS=33268563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	33315186	rs2320469	C	T	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.49;SOR=4.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	33315189	rs2320470	G	T	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.38;SOR=4.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr13	33590851	rs2772364	T	C	3167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=60;PP=2487;SC=CCATCTGGGATACGTTCACCC;SOR=1.284;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=98;TCF=38;TCR=60;TR=97;WE=33590859;WS=33590841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr13	33627829	rs570875	T	G	2510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=7;PP=2018;SC=TATAATCTGATTTGGGGATTC;SOR=4.265;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=62;TCR=7;TR=69;WE=33627837;WS=33627819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr13	33634972	.	C	T	6897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.972;ClippingRankSum=0.000;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=113;PP=2965;ReadPosRankSum=1.549;SC=CGCTTTACTCCAGGAAATGCA;SOR=0.660;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=212;TCF=96;TCR=116;TR=207;WE=33634991;WS=33634962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,220:0.98:225
chr13	33634983	rs564481	C	T	6822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=0.346;SC=AGGAAATGCACGTTACACATT;SOR=0.984;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=207;TCF=95;TCR=112;TR=205;WE=33634991;WS=33634962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,216:0.99:218
chr13	33635463	rs648202	T	C	2477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=30;PP=1865;SC=AAGAGGTGGCTGAGAGAGTTT;SOR=1.264;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=46;TCR=30;TR=75;WE=33635471;WS=33635453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr13	33635835	rs649964	T	C	2956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=63;PP=2267;SC=TAATATCCAATGGAATCGATG;SOR=1.390;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=36;TCR=63;TR=99;WE=33635843;WS=33635825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr13	33635939	rs650439	T	A	2114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=52;PP=1757;SC=TAGCTGCGGCTATCTCCTGAA;SOR=2.602;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=14;TCR=52;TR=66;WE=33635947;WS=33635929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr13	33637913	rs34137141	C	CA	546.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=-1.075;NF=21;NR=5;PP=365;ReadPosRankSum=-1.766;SC=GACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=51;TCR=12;TR=26;WE=33637921;WS=33637903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,23:0.92:25
chr13	34013847	rs876133	G	C	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=14;PP=469;SC=CTTTGGGTCTGTTATCAGAGA;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=21;WE=34013855;WS=34013837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	34013959	rs651327	T	C	294.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=245;SC=AAAATTAGAATCAAATGGCCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=34013967;WS=34013949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	34098232	rs1329344	A	C	1967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=2;PP=1548;ReadPosRankSum=1.090;SC=AACACTAGTTAATGCTAATGT;SOR=4.582;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=56;TCR=2;TR=56;WE=34098240;WS=34098222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr13	34398150	rs296898	A	G	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=16;PP=557;SC=GAAATTAAGTATTTTTAAAGA;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=26;WE=34398158;WS=34398140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	34404249	rs2274728	T	C	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=519;ReadPosRankSum=0.875;SC=ATCAGTAATTTAAGAACACCT;SOR=4.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=19;WE=34404257;WS=34404239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr13	34405243	rs3135603	T	C	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=548;SC=CGACAGGAGGTGGAACTCAGG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=34405251;WS=34405233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	34409242	rs3135628	T	C	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.98;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	34409251	rs1805375	C	G	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.98;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	34409603	rs3135629	T	G	2980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=42;PP=2384;SC=AGAAGAGAATTTCAGAGTGTT;SOR=0.780;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=47;TCR=42;TR=89;WE=34409611;WS=34409593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr13	35618991	rs7996448	A	G	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=466;SC=AGAGAGAGATAACAATGATAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=35618999;WS=35618981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	35619385	rs9543121	A	G	2350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=11;PP=1992;SC=AACATGGTATATTAAGTATGA;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=56;TCR=11;TR=67;WE=35619393;WS=35619375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr13	35738430	rs9543506	A	G	895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=829;SC=TTGTTATTCTAATTGTCTAAG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=35738438;WS=35738420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr13	36049080	rs9565317	T	G	1160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=0;PP=1092;SC=ATTATTCCTTTTTAAAGGAAG;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=36049088;WS=36049070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr13	36220379	rs55928043	C	A	2611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=26;PP=2042;ReadPosRankSum=0.324;SC=ATGACAATCACCCTCCTTCCC;SOR=0.745;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=61;TCR=26;TR=86;WE=36220387;WS=36220369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
chr13	36224051	rs200267946	TACTGGG	T	402.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=369;SC=TAAAAAAGTGTACTGGGACTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=36224064;WS=36224041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	36244990	rs3794387	A	G	3450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=12;PP=2582;SC=AATAGCAACCACAGAAATGAT;SOR=3.804;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=100;TCR=12;TR=112;WE=36244998;WS=36244980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr13	36367641	rs1926459	G	C	1349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=32.14;ReadPosRankSum=-0.709;SOR=2.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr13	36382312	rs4421866	C	T	3492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=20;PP=2811;SC=AAAAATAATTCCGTTAAGACA;SOR=2.899;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=84;TCR=20;TR=104;WE=36382320;WS=36382302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr13	36401731	rs2225046	G	A	2314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=4;PP=1855;SC=GGCAAGTGCGGTGCCATCAAT;SOR=5.610;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=60;TCR=4;TR=64;WE=36401739;WS=36401721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr13	36401746	rs9574698	A	G	2729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=8;PP=2140;SC=ATCAATAAAGACTTACTTTCT;SOR=4.255;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=69;TCR=8;TR=76;WE=36401754;WS=36401736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr13	36428595	rs1926466	C	T	1068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=1;PP=919;ReadPosRankSum=1.299;SC=TGCACCAAGGCTGAGACAGGT;SOR=4.351;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=35;WE=36428603;WS=36428585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr13	36521433	rs1936004	T	G	2352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=12;PP=1904;SC=CTTGGCCTGGTGCAGCTCATT;SOR=3.258;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=64;TCR=12;TR=75;WE=36521441;WS=36521423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr13	36521460	rs1936003	A	G	3153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=28;PP=2550;SC=AGCTGCCTCAAATTTCCCCTG;SOR=1.945;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=97;TCF=69;TCR=28;TR=95;WE=36521468;WS=36521450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr13	36745029	rs1328641	C	T	1806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=56;PP=1546;SC=CCTCACATTACAAATCTGTAC;SOR=6.666;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=57;TCF=1;TCR=56;TR=57;WE=36745037;WS=36745019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr13	36747798	rs1410633	C	G	165.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=120;SC=AGGTCCCCCTCTAAGTGGCAC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=36747806;WS=36747788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	36801596	rs45549236	C	A	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=209;SC=ATATTCCAACCAGTTTATTGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=36801604;WS=36801586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr13	36818057	rs55981518	C	T	4428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.918;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=81;PP=2965;ReadPosRankSum=1.214;SC=AAACTGCCCTCGTAGACCTAC;SOR=0.188;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=140;TCF=57;TCR=83;TR=138;WE=36818065;WS=36818047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,147:0.99:149
chr13	36855284	rs67248236	G	A	2086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=23;PP=1580;ReadPosRankSum=-1.062;SC=CTTTAAACACGAGGACAAAAG;SOR=1.545;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=46;TCR=24;TR=68;WE=36855292;WS=36855274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,71:0.97:73
chr13	36939688	rs3736919	C	T	301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=247;SC=CTATAAACCGCCTATTGATAC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=36939696;WS=36939678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	36939758	rs3736920	A	G	1426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=3;PP=1121;SC=TGAAATATTTATCCAACTTTA;SOR=4.664;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=41;WE=36939766;WS=36939748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr13	36940028	rs1041140	G	A	1833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=55;PP=1528;SC=TACAGAGCCAGTCACCAAATC;SOR=4.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=4;TCR=55;TR=59;WE=36940036;WS=36940018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr13	36940123	rs1041139	T	C	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=180;SC=CCTGGATTCCTGCAGTAGCTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=36940131;WS=36940113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	36942533	rs1056850	G	T	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=25;PP=723;SC=AATAAAATACGCTCCAAAATT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=36942541;WS=36942523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr13	37007040	rs4245378	A	G	197.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=3;PP=148;SC=CCCAATAATTACTGGGAAGAT;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=37007048;WS=37007030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	37007501	rs9576049	G	T	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=29;PP=858;SC=AAAGTTGATTGATTTATTTTC;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=37007509;WS=37007491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr13	37014366	rs2282411	G	A	2450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=71;PP=1949;ReadPosRankSum=-1.381;SC=GCCAAGGAGCGTAAAAATCAA;SOR=4.281;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=74;TCF=1;TCR=73;TR=72;WE=37014374;WS=37014356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,77:0.97:79
chr13	37439964	rs3748305	C	A	1574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=39;PP=1243;SC=ATGATTCCACCAGGAAACTTA;SOR=3.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=45;WE=37439972;WS=37439954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr13	37526560	rs6563506	G	A	1504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=12;PP=1229;SC=GGCTTGATGAGGGGAGCAAGG;SOR=1.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=43;WE=37526568;WS=37526550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr13	37546280	rs9576146	G	C	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=409;SC=TAAAAAAGTTGACATTAAAAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=37546288;WS=37546270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	37569200	rs2323165	A	G	1272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=19;PP=885;SC=ATTAAAAATCACTTTTGAAAA;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=23;TCR=19;TR=42;WE=37569208;WS=37569190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr13	37579999	rs59234766	C	CA	54.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.23;MQRankSum=-0.792;QD=7.84;ReadPosRankSum=0.484;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr13	37580139	rs1127446	G	A	3333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=65;PP=2708;SC=TGGCTAGCCAGTTCATTGCAG;SOR=1.458;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=36;TCR=65;TR=101;WE=37580147;WS=37580129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr13	37581051	rs9576154	T	G	1683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=0;PP=1469;SC=AAGTCTAAGCTAATAGCATGT;SOR=8.189;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=61;TCR=0;TR=61;WE=37581059;WS=37581041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr13	37583831	rs9469	G	A	4888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.724;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=69;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.753;SC=AGTGGTTGGCGTGCCTCTCTT;SOR=0.757;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=161;TCF=91;TCR=70;TR=160;WE=37583839;WS=37583821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,164:0.99:165
chr13	37584838	rs7317750	G	A	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=23;PP=855;SC=AAAGTTTGAAGGCTACCAGGG;SOR=1.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=33;WE=37584846;WS=37584828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr13	37598113	rs4943441	A	G	2068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=2;PP=1789;SC=AAGCTGTCTTAAGAAACACTA;SOR=5.960;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=60;TCF=58;TCR=2;TR=60;WE=37598121;WS=37598103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr13	37600199	rs4941856	A	G	114.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=88;SC=TACAACAGAGACCCATAAATA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=37600207;WS=37600189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	37600284	rs9576155	G	A	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=5;PP=729;SC=TATCCTATAAGGGTGAAAAAT;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=27;WE=37600292;WS=37600274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	37621528	rs1199983	A	G	564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=2;PP=470;SC=CAGAGCTCTGAGTCAGCTACA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=37621536;WS=37621518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	37625601	rs1543738	T	C	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=4;PP=613;SC=AACACAAATTTGAACATACTG;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=37625609;WS=37625591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr13	37625770	rs5802853	A	AG	543.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=578;SC=GGCTATTAAGAGAAAAAAAAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=13;WE=37625778;WS=37625760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	37679268	rs9576175	G	T	6610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=103;PP=2965;SC=TCACTGCTACGTCCTCGCCGT;SOR=0.840;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=194;TCF=91;TCR=103;TR=193;WE=37679276;WS=37679258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr13	37804353	rs1408229	A	C	1814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=37;PP=1487;SC=ACCACAAGTAACAGAAGTGGC;SOR=1.781;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=54;WE=37804361;WS=37804343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr13	38154959	rs9576307	G	C	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=28;PP=617;SC=CTGAGGCCACGGGAACAGCTT;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=38154967;WS=38154949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr13	38156706	rs2274082	T	G	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=27;PP=711;SC=ACATTGAAGTTTCTCCCGGTA;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=38156714;WS=38156696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr13	38164445	rs1006416	G	A	1654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=0;PP=1428;SC=AAGTTAATAAGTCAGTTAAAA;SOR=7.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=47;WE=38164453;WS=38164435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr13	38166357	rs9603229	T	G	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.26;NF=0;NR=17;PP=477;SC=GATACATTTTTACATAAATTT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=38166365;WS=38166347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	38211105	rs73184536	T	C	2168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=16;PP=1668;ReadPosRankSum=0.822;SC=TCATAGTCTATACTAGAGTCC;SOR=0.990;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=50;TCR=16;TR=65;WE=38211113;WS=38211095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr13	38237872	rs2985171	A	G	3252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=55;PP=2329;SC=CTGTACTGGAAAAAACAGAGA;SOR=1.261;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=30;TCR=55;TR=85;WE=38237880;WS=38237862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr13	38266000	rs7329237	G	T	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=454;SC=CTTTGGGGGTGAGGTTCTTGG;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=38266008;WS=38265990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr13	38320594	rs35278654	TA	T	681.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=27;PP=487;SC=AGGAGGCACCTAAAAAAAAAA;SOR=5.283;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=28;WE=38320603;WS=38320584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr13	38357471	rs3904512	G	A	2647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=63;PP=2109;SC=ACTGAGCCATGTTTCATGCCA;SOR=2.330;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=19;TCR=63;TR=82;WE=38357479;WS=38357461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr13	38924083	rs2231330	A	T	4527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=40;PP=2965;SC=ACCGACTGCCATAATTCCTGG;SOR=1.841;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=102;TCR=40;TR=142;WE=38924091;WS=38924073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr13	38924263	rs2231332	T	C	5764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=119;PP=2965;SC=TGATCCGAGCTTTTCCAACAA;SOR=1.518;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=180;TCF=61;TCR=119;TR=180;WE=38924271;WS=38924253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr13	38930783	rs2455410	G	A	77.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=56;SC=AATGATTATAGATGCCTAGAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=38930791;WS=38930773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	38930893	rs2481880	C	T	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=12;PP=805;SC=TCAAAAAATACGAGAAACACT;SOR=1.214;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=32;WE=38930901;WS=38930883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr13	38931144	rs9548318	T	C	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=16;PP=722;SC=CCACATTTCATTGATTTAAAA;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=38931152;WS=38931134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr13	38931650	rs34489703	G	GTT	970.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=9;NR=13;PP=528;SC=ATAATACAGGGTTTTTTTTTT;SOR=0.826;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=22;WE=38931658;WS=38931640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr13	38932194	rs2150470	G	A	113.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.78;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	38932207	rs67284300	TA	T	104.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.26;QD=20.97;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	38932545	rs11381230	G	GT	602.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=13;PP=406;SC=TATTTAGCAAGTTTTTTTTTT;SOR=0.859;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=22;WE=38932553;WS=38932535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	38932648	rs2485786	C	T	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=346;SC=AAAATTGTTTCTTGTAGGCTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=38932656;WS=38932638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	38932681	rs2485785	G	T	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=264;SC=ATTTTATTCCGTTTTAGGTAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=38932689;WS=38932671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr13	39263023	rs12874397	C	T	1839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=35;PP=1589;ReadPosRankSum=1.049;SC=AGCTGGCAGCCGGCCAGGTGG;SOR=0.399;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=25;TCR=36;TR=60;WE=39263031;WS=39263013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr13	39263714	rs2496423	T	C	10372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=184;NR=141;PP=2965;SC=AGTGACTCAGTCCCCCACAGA;SOR=0.897;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=325;TCF=184;TCR=141;TR=325;WE=39263722;WS=39263704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,331:1.00:331
chr13	39338612	rs2442370	T	C	942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=24;PP=760;SC=TTATTTCTGTTTTAAAATTTT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=39338620;WS=39338602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	39430314	rs9548509	C	T	4660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.442;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=78;PP=2965;ReadPosRankSum=0.480;SC=ATCGAAGTTACCTTTGACGGG;SOR=0.312;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=147;TCF=69;TCR=78;TR=145;WE=39430322;WS=39430304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,157:0.99:159
chr13	39430443	rs9548510	G	A	1439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=40;PP=1194;ReadPosRankSum=-0.752;SC=TTTGTCAGAGGAAATGCATAA;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=42;WE=39430451;WS=39430433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr13	39433606	rs9532292	A	G	2619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=52;PP=2046;ReadPosRankSum=-0.793;SC=AGATGGTCACACTGGACTCCA;SOR=0.427;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=37;TCR=53;TR=89;WE=39433614;WS=39433596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,89:0.99:90
chr13	39435425	rs11618650	G	A	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=113;SC=TCCTTATCACGTGATGTACAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=39435433;WS=39435416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	39435552	rs36084034	C	CT	1480.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.331;NF=30;NR=13;PP=758;ReadPosRankSum=-0.721;SC=TAAATATGGTCTTTTTTTTTT;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=43;WE=39435560;WS=39435542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,58:0.97:60
chr13	39438383	rs9566369	C	A	2336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=6;PP=1799;ReadPosRankSum=-0.660;SC=ACTTGAAAGACTGTTAACAAT;SOR=2.862;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=61;TCR=6;TR=66;WE=39438391;WS=39438373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
chr13	39446796	rs79240489	G	A	988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=0;PP=852;SC=TCAGTTAAGCGAAAAGAGAAA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=39446804;WS=39446786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr13	39446869	rs9532295	G	A	2185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=22;PP=1620;SC=ATGTAATTTTGTTGTTTTAGG;SOR=1.516;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=47;TCR=22;TR=69;WE=39446877;WS=39446859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr13	39448476	rs4943614	T	C	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=172;SC=CTTCTGCCTCTGTTATTCAGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=39448484;WS=39448466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	39450139	rs1945510	A	C	3373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=12;PP=2800;SC=TCATTATTATAATTACTGGCA;SOR=3.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=87;TCR=12;TR=99;WE=39450147;WS=39450129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr13	39450583	rs67517056	T	TA	213.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5051;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.589;NF=0;NR=13;PP=127;ReadPosRankSum=-0.470;SC=CATTTATTAGTAAAAAAAAAA;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=13;WE=39450591;WS=39450573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr13	39452235	rs1540131	T	C	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=5;PP=1150;ReadPosRankSum=1.063;SC=TACCTTATCATATAACAGAAA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=46;WE=39452243;WS=39452225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr13	39454843	rs41306662	G	A	3283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.609;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=58;PP=2859;ReadPosRankSum=-0.829;SC=GTTTCAGGGGGAAGGATGCCC;SOR=0.687;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=44;TCR=58;TR=101;WE=39454851;WS=39454833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr13	39546530	rs8000175	C	G	1701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=3;PP=1466;SC=CAGGTCTCTGCGGGTACTCAG;SOR=4.935;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=45;TCR=3;TR=48;WE=39546538;WS=39546520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr13	39586133	rs17058947	G	A	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=390;SC=CCAATGTTGGGATATCGCAAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=39586141;WS=39586123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	39586343	rs9576697	G	C	1835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=31;PP=1541;SC=AAACAGAACTGCCTGCAGCTT;SOR=0.884;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=24;TCR=31;TR=55;WE=39586351;WS=39586333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr13	39587166	rs11147745	A	G	3558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=51;PP=2921;ReadPosRankSum=0.338;SC=CCGTTGAGCTAGGATGAGGGA;SOR=0.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=58;TCR=52;TR=108;WE=39587174;WS=39587156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,110:0.98:112
chr13	39587677	rs3751379	A	G	2431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=40;PP=1991;SC=GCTAACTGGCACTGACGTGGA;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=40;TCR=40;TR=80;WE=39587685;WS=39587667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr13	39587865	rs3751378	A	C	9709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=134;NR=81;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.899;SC=CAGAAGAGTCAGAGTTCTGAA;SOR=0.525;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=218;TCF=137;TCR=81;TR=215;WE=39587873;WS=39587855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,227:1.00:228
chr13	39587889	rs3751377	T	C	11267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=150;NR=119;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.755;SC=TAAGAGAAGATAGTGAAGCCA;SOR=0.354;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=270;TCF=151;TCR=119;TR=269;WE=39587897;WS=39587879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,279:1.00:280
chr13	39596403	rs17058990	G	A	1832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=15;PP=1445;SC=ACAACTGTCCGTTCCAAGTGT;SOR=2.342;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=43;TCR=15;TR=58;WE=39596411;WS=39596393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr13	39603380	rs148112555	C	CAATG	986.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=1052;SC=CATTTTTTCCCAAGTAAAAAA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=19;WE=39603388;WS=39603370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	39603407	rs114068495	G	A	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=21.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.97;MQRankSum=-2.935;QD=13.54;ReadPosRankSum=-2.323;SOR=5.084;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr13	39603411	.	T	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.453;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=8.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQRankSum=-3.388;QD=11.47;ReadPosRankSum=-3.647;SOR=2.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr13	39613910	rs113019173	G	T	1880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=49;PP=1482;SC=ACATGTCCTTGTTTGTATTGT;SOR=6.630;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=50;TCF=1;TCR=49;TR=50;WE=39613918;WS=39613900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
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chr13	39618372	rs376116325	GT	G	1645.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.05;ReadPosRankSum=1.036;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,49:0.92:53
chr13	39622075	rs9532318	T	C	1557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=47;PP=1229;SC=GTTTCTTTCCTGGGAATATTT;SOR=3.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=7;TCR=47;TR=54;WE=39622083;WS=39622065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr13	40229724	rs7327779	A	G	2183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=32;PP=1548;SC=CACGCTTCTGAGAGCCCAAGC;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=26;TCR=32;TR=58;WE=40229732;WS=40229714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr13	40229842	rs67765306	A	AG	1233.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=18;PP=1178;SC=AGGTGGCAGCAGGGGGCGGGA;SOR=0.793;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=31;WE=40229850;WS=40229832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr13	40229891	rs3812882	G	A	1173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=23;PP=851;SC=GGAAGTGGTCGCAGTGTCTGC;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=36;WE=40229899;WS=40229881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr13	40229957	rs3812883	T	A	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=14;PP=444;SC=GGCGACGACCTGCAACCCGCT;SOR=2.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=40229965;WS=40229947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	40230043	rs3812884	C	T	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=6;PP=295;SC=GGGCCGGAGTCACAGGTTCCT;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=13;WE=40230051;WS=40230033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	40230122	rs3812885	A	C	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=4;PP=495;SC=TCCCGGCAGCAGAGGGACCGC;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=40230130;WS=40230112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr13	40230216	rs3812886	G	A	2352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=18;PP=1891;SC=CTCCGGAAAAGCGAAGGGGTT;SOR=2.115;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=52;TCR=18;TR=70;WE=40230237;WS=40230206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr13	40230229	rs3812887	C	T	2626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=25;PP=2144;SC=AAGGGGTTTCCTGGGTGTTCT;SOR=1.639;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=53;TCR=25;TR=78;WE=40230237;WS=40230206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr13	40230294	rs3812888	T	C	2605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=44;PP=1983;SC=TGAACGGTGGTGCCTCGAGAA;SOR=0.738;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=43;TCR=44;TR=87;WE=40230302;WS=40230284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr13	40233404	rs7330515	T	C	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=366;SC=TTAATGAAAATAAATCATTTG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=40233412;WS=40233394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	40233691	rs7330016	C	T	199.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=160;SC=CTTACTATTACGCCTGGCTCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=40233699;WS=40233681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	40238162	rs4636783	C	G	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=2;PP=988;SC=TTATTGACAGCATACCTAGAA;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=35;WE=40238183;WS=40238152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr13	40238175	rs67976778	C	T	1830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=2;PP=1103;SC=ACCTAGAAAGCAATAAGACAG;SOR=5.283;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=41;WE=40238183;WS=40238152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr13	40238387	rs4566029	T	C	1203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=32;PP=969;SC=AACAGACTGATTCACCTTCTA;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=34;WE=40238395;WS=40238377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr13	40239139	rs7991151	G	A	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=342;SC=GATCTCATTTGTTTTAAGTCT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=13;WE=40239147;WS=40239129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	40252190	rs4941939	C	T	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	40253901	rs4941940	A	G	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=15;PP=463;SC=GTGAAGTTATACTCTGACAGG;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=40253909;WS=40253891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	40273797	.	C	T	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=20;PP=591;SC=GTGAATGTTTCACATTAAAGA;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=40273805;WS=40273787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr13	40293288	rs5803008	AT	A	869.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=1;PP=586;SC=TAACTTTTACATTTTTTTTTA;SOR=5.670;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=30;WE=40293296;WS=40293278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr13	40297684	rs7985075	C	T	2974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=76;PP=2364;SC=TAGCTGTGTTCTCCTGGGAAA;SOR=4.199;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=9;TCR=76;TR=85;WE=40297692;WS=40297674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr13	40298639	rs78336861	A	T	113.85	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.98;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	40298805	rs9532421	C	T	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=343;SC=TATCTCTTGACATGCTGTATT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=40298813;WS=40298795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	40325310	rs4245396	C	T	1227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=36;PP=1052;SC=AATTTTTACTCTATAATTTGA;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=40325318;WS=40325300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr13	41367510	rs111304627	G	A	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=37;PP=1024;SC=TATTTTTACTGTACCTTTTCT;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=37;WE=41367518;WS=41367500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr13	41373254	rs55943532	G	A	8384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=182;NR=75;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.729;SC=AGATGCAGACGTTCCCTGACC;SOR=0.912;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=258;TCF=183;TCR=75;TR=257;WE=41373262;WS=41373244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,263:1.00:264
chr13	41379272	rs9577152	C	T	3195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=10;PP=2611;SC=AGAATGCAGCCGCCGGTTCCT;SOR=3.755;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=83;TCR=10;TR=93;WE=41379280;WS=41379262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr13	41379550	rs7318125	A	G	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=18;PP=595;SC=ATTTTCTGAAAGGATTGGCTG;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=41379558;WS=41379540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	41486606	rs59845738	T	C	1431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.634;NF=42;NR=1;PP=1178;ReadPosRankSum=-0.822;SC=TAAACATCTATTATTTACAGT;SOR=4.849;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=43;WE=41486614;WS=41486596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
chr13	41486822	rs191419969	G	A	1942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=54;PP=1605;SC=TCAGCAGATCGAGACTAGTCT;SOR=6.701;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=55;WE=41486830;WS=41486812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr13	41495856	rs77750044	A	C	1860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=52;PP=1537;ReadPosRankSum=0.902;SC=TCCGCCACCGACCAAGGGGGA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=52;WE=41495864;WS=41495846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr13	41495889	rs111433219	C	G	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=33;PP=926;ReadPosRankSum=-0.839;SC=AAACATCAACCGAGCTTCCGT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=33;WE=41495897;WS=41495879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr13	41515221	rs151034333	T	A	7198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.858;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=129;NR=89;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.094;SC=AAACTTCTGATGGTTGTGCAA;SOR=0.216;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=220;TCF=131;TCR=89;TR=218;WE=41515229;WS=41515211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,223:0.99:225
chr13	41517023	rs181443903	G	A	1758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=3;PP=1503;SC=CTTAAGCTTAGTATTTTTTTT;SOR=5.097;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=50;TCR=3;TR=53;WE=41517031;WS=41517013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr13	41705495	rs584594	A	G	4790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=65;PP=2965;SC=CAGACAGCTAAAGTGGTGACA;SOR=0.915;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=143;TCF=78;TCR=65;TR=143;WE=41705503;WS=41705485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr13	41706800	rs9566703	A	G	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=409;SC=ACCCCGCAGAACCGCCTCCCG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=41706808;WS=41706790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	41767338	rs2039134	A	G	2772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.74;QD=44.01;SOR=1.573;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr13	41767341	rs2039135	A	G	2772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.64;QD=45.46;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr13	41791440	rs2274903	T	A	1829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=55;PP=1568;SC=ATTTATTTAATTTCTTTGCAG;SOR=6.666;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=56;WE=41791448;WS=41791430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr13	41797601	rs2026469	A	T	1393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=37;PP=1181;SC=TTTCTAAAAGACATATATACA;SOR=5.186;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=39;WE=41797609;WS=41797591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr13	41807950	rs3751344	T	C	2141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=7;PP=1733;SC=CAGACACTCATATAGGACTAT;SOR=4.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=59;TCR=7;TR=66;WE=41807958;WS=41807940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr13	41834578	rs66465270	GT	G	824.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=0;PP=539;SC=TAAGTGTGTGGTTTTTTTTTT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=29;WE=41834586;WS=41834568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr13	41834744	rs2297555	C	T	4077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=49;PP=2965;SC=TTCGGTTTTCCTCATTCACAG;SOR=1.039;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=72;TCR=49;TR=121;WE=41834752;WS=41834734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr13	41835076	rs3215932	T	TA	838.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=581;SC=ACACAGTCTTTAAAAAAAAAT;SOR=5.486;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=26;WE=41835097;WS=41835066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr13	41835089	rs1332940	T	G	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=60.06;NF=0;NR=26;PP=741;SC=AAAAAAATCATCTCTAAAGAT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=41835097;WS=41835066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	41837220	rs3818721	C	T	302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=248;SC=ATTTCAAGCACGTTAGAGAAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=41837228;WS=41837211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	41893105	rs2065498	T	G	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=383;SC=CTAATTCAAATTAAATTTGTA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=41893113;WS=41893095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	41902939	rs3812896	T	C	2063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=40;PP=1658;SC=ATGCAGAAAATTGGTGTTATT;SOR=1.647;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=19;TCR=40;TR=59;WE=41902947;WS=41902929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr13	41948051	rs9525478	G	C	2225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=59;PP=1852;SC=ACAAATTTAAGTTATGTTCAA;SOR=5.486;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=61;TCF=2;TCR=59;TR=61;WE=41948059;WS=41948041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr13	41949804	rs6560982	G	T	1428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=43;PP=1249;ReadPosRankSum=1.521;SC=CTTTTCCAGGGTGCATTTTAA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=43;WE=41949812;WS=41949794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr13	42043086	rs2324791	C	G	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=471;SC=TCATCCTAAGCCTTCTATAGG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=42043094;WS=42043076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	42044508	rs396963	A	G	1827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=16;PP=1293;SC=TGGGAAGCCCAGCATTGAGTT;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=47;TCR=16;TR=62;WE=42044516;WS=42044498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr13	42189232	rs3862741	C	G	1219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=26;PP=861;SC=TAAAAATGAACAATTGAGACA;SOR=1.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=38;WE=42189240;WS=42189222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr13	42266925	rs79145203	A	G	2875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=27;PP=2106;ReadPosRankSum=-1.152;SC=AGGGATGGGCATGCATGCATC;SOR=0.522;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=102;TCF=75;TCR=27;TR=100;WE=42266933;WS=42266915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,106:0.98:108
chr13	42275473	rs7322461	A	G	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=6;PP=767;SC=ATTTTAATCCATCTTTTAAAA;SOR=2.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=42275481;WS=42275463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr13	42303934	.	G	GACACAC	228.19	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.47;MQRankSum=0.431;QD=38.03;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,5:0.83:6
chr13	42361743	rs112297676	T	TAC	271.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.472;NF=0;NR=10;PP=432;ReadPosRankSum=-0.891;SC=GATTCTTAAATACACACACAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=10;WE=42361751;WS=42361733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr13	42390740	rs78527162	G	C	2779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=3;PP=2301;ReadPosRankSum=-0.780;SC=TAAAATACCAGCTTAAAAAAT;SOR=4.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=84;TCF=81;TCR=3;TR=83;WE=42390748;WS=42390730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,86:0.99:87
chr13	42390761	rs75585975	T	C	4418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=12;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.522;SC=AGATTTTAAGTACTGAATTCT;SOR=2.259;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=132;TCF=120;TCR=12;TR=128;WE=42390769;WS=42390751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,135:0.99:137
chr13	42393618	rs2274812	A	G	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=388;SC=GGGCTATCATACTGTTAATAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=42393626;WS=42393608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	42439498	rs76291279	G	A	227.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=162;SC=ATATACAATAGATTATTGTCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=42439506;WS=42439488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr13	42465490	rs7332372	C	T	1653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=1;PP=1437;SC=CCATGTCTTACACAATAAAAT;SOR=6.439;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=50;WE=42465498;WS=42465480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr13	42481712	rs2003064	C	T	3155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=41;PP=2561;SC=TAGAGTGTGACAGAACTTGCC;SOR=1.000;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=58;TCR=41;TR=99;WE=42481720;WS=42481702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr13	42486399	rs2875457	C	T	1480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=42;PP=1206;SC=ATATATATAACGTATATAAAA;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=42;WE=42486407;WS=42486389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr13	42701717	rs605371	A	G	1822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=42;PP=1517;SC=AAGGTAACTCACGAGAATACT;SOR=2.001;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=15;TCR=42;TR=57;WE=42701725;WS=42701707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr13	42701739	rs670676	A	T	1288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=32;PP=1089;SC=GTTTCAAGCAATTGAGGCTAT;SOR=2.476;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=40;WE=42701747;WS=42701729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr13	42701803	rs957255	G	A	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=521;SC=GAAGCGCACTGTAGCATTATG;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=42701811;WS=42701793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	42703682	rs3742261	T	C	2375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.284;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=11;PP=1961;ReadPosRankSum=0.720;SC=TTTTTTTCATTAACAGTCTCT;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=74;TCF=62;TCR=12;TR=72;WE=42703690;WS=42703672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,73:0.97:75
chr13	42734107	rs117428221	G	A	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=0;PP=885;ReadPosRankSum=-0.742;SC=GTTGGTGTCCGCCAGTCTTCA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=32;WE=42734115;WS=42734097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,33:0.97:34
chr13	42734389	rs10492444	C	G	1878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=51;PP=1521;SC=TGGTAGCATACGCATCTCATG;SOR=6.630;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=1;TCR=51;TR=52;WE=42734397;WS=42734379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr13	42764439	rs1170119	T	C	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=0;PP=788;SC=TCTGGAATTTTGTTTGGCATA;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=27;WE=42764447;WS=42764429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	42772717	rs9533031	G	T	4457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=91;PP=2965;SC=TTATTGACCCGGATCTAGATT;SOR=1.527;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=48;TCR=91;TR=139;WE=42772725;WS=42772707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr13	42772774	rs35298264	GT	G	956.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.57;MQRankSum=0.497;QD=19.13;ReadPosRankSum=1.537;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,48:0.96:50
chr13	42783012	rs168329	G	A	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=680;SC=TTAAATATATGTAGATATATA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=42783020;WS=42783004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr13	42793298	rs9315899	G	T	3450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=24;PP=2553;ReadPosRankSum=1.253;SC=AAAGTACAATGATTTATTCTA;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=103;TCF=79;TCR=24;TR=102;WE=42793306;WS=42793288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,110:0.99:111
chr13	42793479	rs180870	G	A	2833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=73;PP=2394;SC=ACCCAAATGAGGATGAGGTAT;SOR=4.047;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=9;TCR=73;TR=82;WE=42793487;WS=42793469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr13	42793766	rs11277175	AGGTTTTTC	A	2218.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=1;PP=2942;SC=TTATCAGAGTAGGTTTTTCTC;SOR=4.534;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=37;WE=42793781;WS=42793756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr13	42794004	rs347382	G	A	4680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=102;PP=2965;SC=CATGGAGGTCGTGAAAATGTT;SOR=1.981;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=39;TCR=102;TR=141;WE=42794012;WS=42793994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr13	42803341	rs545602	T	C	3625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=65;PP=2964;SC=TGGTGCTATTTCTTGGAAGAG;SOR=1.129;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=43;TCR=65;TR=108;WE=42803349;WS=42803331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr13	42869720	rs3835266	A	AG	113	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=1;PP=77;SC=ATCCTTTTCAAGCAGACAGCA;SOR=1.609;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=3;WE=42869728;WS=42869710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	42882762	rs238314	A	G	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=35;PP=986;SC=ACACTTTTGCATATAATTGTG;SOR=3.967;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=39;WE=42882770;WS=42882752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr13	42888230	rs9566957	A	G	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=564;SC=GTCCACTTTTAGATCCTTTGT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=42888238;WS=42888220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	43155168	rs2277438	G	A	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=550;SC=AGACTCTTGCGAGTATGAATT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=43155176;WS=43155158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	43155443	rs2277439	G	A	3763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=67;PP=2859;SC=AGTCCACATCGAGGCTGATAA;SOR=1.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=42;TCR=67;TR=109;WE=43155451;WS=43155433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr13	43463299	rs1323864	T	C	3110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=58;PP=2511;SC=GCCTCACCTATTGTATCAGAG;SOR=1.274;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=36;TCR=58;TR=94;WE=43463307;WS=43463289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr13	43469157	rs1128105	G	A	4224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.280;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=45;PP=2965;ReadPosRankSum=0.399;SC=AGCTGTTACCGCTATTCATAT;SOR=1.304;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=138;TCF=88;TCR=50;TR=132;WE=43469165;WS=43469147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,138:0.98:141
chr13	43469211	rs1359184	G	A	4168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.352;SC=GTTGACTTTTGCCTTGGAGTC;SOR=0.682;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=62;TCR=89;TR=148;WE=43469219;WS=43469201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,147:0.98:150
chr13	43474371	rs4942174	C	T	3461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=10;PP=2828;SC=TATCGTAATGCTTTCCTAAAA;SOR=4.407;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=95;TCR=10;TR=105;WE=43474379;WS=43474361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr13	43491848	rs12863816	C	T	1672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=42;PP=1472;SC=CTACTATAGGCCCGGTGCTAA;SOR=2.437;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=54;WE=43491856;WS=43491838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr13	43491940	rs12864209	C	T	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=15;PP=408;SC=TGTCTGAAAACGTCCCTTGGA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=43491948;WS=43491930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	43537240	rs1054813	A	G	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.24;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	43537246	rs9562444	C	T	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.24;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	43544964	rs9567077	G	T	278.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=201;SC=TCTGTTCTCTGGGACCTCACA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=43544972;WS=43544954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	43788031	rs1044753	C	T	1212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=0;PP=1030;SC=ACAAAGGTTGCGTGCTGGACC;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=37;WE=43788039;WS=43788021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr13	43788158	rs703207	G	A	5874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=117;NR=68;PP=2965;SC=AAGGCACACAGCTTCCATCTT;SOR=1.371;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=118;TCR=68;TR=185;WE=43788166;WS=43788148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr13	43839494	rs4306408	G	A	5799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=103;NR=82;PP=2965;SC=TTCAACCAACGTCAAGCAAGA;SOR=0.861;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=186;TCF=103;TCR=83;TR=185;WE=43839502;WS=43839484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr13	43843812	rs730210	A	G	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=467;SC=GAAGATGTTTACAAGTCTTGA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=43843820;WS=43843802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	43872419	rs4451860	C	T	730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=551;SC=GCTGCCTTTCCATTTTCATTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=20;WE=43872427;WS=43872409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	43872451	rs141332734	C	CAA	621.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.33;MQRankSum=-0.000;QD=31.09;ReadPosRankSum=-2.093;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,17:0.85:20
chr13	43930337	rs2281713	A	G	1298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=26;PP=967;SC=CAATGGCCACAGTTTTGGTCC;SOR=1.230;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=44;WE=43930345;WS=43930327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr13	43935405	rs1535580	C	T	2237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=13;PP=1782;SC=TTCTCATAGGCGTTACTTACT;SOR=3.026;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=60;TCR=13;TR=72;WE=43935413;WS=43935395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr13	43986771	rs2296041	G	A	218.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=179;SC=TTTAAAAACAGGTAGCACAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=43986779;WS=43986761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	44411410	rs66964055	G	A	2486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=17;PP=1812;SC=TTGCCCTATGGCAATGTTACT;SOR=1.966;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=53;TCR=17;TR=70;WE=44411418;WS=44411400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr13	44433700	rs1562216	G	A	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=266;SC=AAGGTAATAGGACAGCTATGG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=44433708;WS=44433690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	44457984	rs9533673	A	G	5597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=85;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.870;SC=CAAATCAGAGAGGAGTCACAA;SOR=0.262;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=168;TCF=82;TCR=86;TR=167;WE=44457992;WS=44457974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,174:0.99:175
chr13	44462808	.	C	A	1402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=0;PP=1114;SC=CAAACTAAATCTGCTCACTTT;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=39;WE=44462816;WS=44462798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr13	44462844	rs9533677	A	T	2676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=5;PP=2181;SC=TTCAGGTGAAATTTTTTATGT;SOR=5.161;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=75;TCR=5;TR=80;WE=44462852;WS=44462834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr13	44464204	.	T	C	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=1;PP=878;SC=CTTTGGCTATTGGGAAAATAA;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=44464212;WS=44464194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr13	44734696	rs4942287	A	G	2704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=27;PP=2040;SC=AAGTGGTTCTATTAAAATAGC;SOR=1.477;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=55;TCR=27;TR=82;WE=44734704;WS=44734686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr13	44948295	rs201663302	T	TG	247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.40;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	44948302	rs199705926	GA	G	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.57;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	44964723	rs2281848	C	T	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=23;PP=684;SC=AGGTGACCTGCAGCCTCCTTT;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=44964731;WS=44964713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr13	44969907	rs1467624	G	A	3816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=34;PP=2815;SC=GATTTGACTCGTAATTCTAAC;SOR=1.688;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=80;TCR=34;TR=114;WE=44969915;WS=44969897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr13	44971503	rs41288337	A	C	1861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=46;PP=1417;SC=AGGACAACGGAAGCGGTCAGC;SOR=3.037;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=10;TCR=46;TR=56;WE=44971511;WS=44971493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr13	45010283	rs1555781	T	G	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=44;PP=1283;SC=TATCTTAAGCTTCCAAGATAA;SOR=5.549;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=2;TCR=44;TR=46;WE=45010291;WS=45010273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr13	45090580	rs1336164	C	T	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=361;SC=GGGACTTCGGCATAAAGGCTT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=45090588;WS=45090570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	45556056	rs148833607	T	TCATGTTTAACATAAAACATAAAA	853.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=1328;SC=TTTGCTATATTCATGTTTAAC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=3;WE=45556064;WS=45556046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	45563464	rs1140993	G	C	3335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=22;PP=2829;SC=AGAACATCCAGCTGTCCCGCG;SOR=2.540;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=82;TCR=22;TR=104;WE=45563472;WS=45563454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr13	45826876	rs7982845	A	G	225.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=186;SC=AAAGTATTAAAGCTAGTGTAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=45826884;WS=45826868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	45912634	rs9595305	T	C	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=3;PP=763;SC=CCCTAAGAATTTTTTACATAT;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=45912642;WS=45912624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr13	45914957	rs2234216	T	C	2770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=77;PP=2316;SC=ACCGTGCGCCTGGCGCCGCCA;SOR=2.810;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=20;TCR=77;TR=97;WE=45914965;WS=45914947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr13	45973231	rs11330086	GA	G	1219.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.674;NF=4;NR=46;PP=614;ReadPosRankSum=0.314;SC=GACACCATTGGAAAAAAAAAA;SOR=0.859;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=79;TCF=5;TCR=74;TR=50;WE=45973240;WS=45973221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,58:0.95:61
chr13	45976349	rs11617888	G	A	2372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=0;PP=1951;ReadPosRankSum=1.080;SC=GATAGAACAAGTAAATTCAAA;SOR=7.140;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=65;TCR=0;TR=64;WE=45976357;WS=45976339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr13	45980223	rs34513916	AT	A	328.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=219;SC=CTCTAAAACAATTTTTTTTTT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=14;WE=45980231;WS=45980213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	45982934	rs6561227	G	A	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=0;PP=707;SC=TGAAAAATCTGTCATGCTATT;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=45982942;WS=45982927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr13	45985583	rs12872200	T	G	1793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=45;PP=1518;SC=TCTTCTTTGATTTATAGAAAC;SOR=2.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=12;TCR=45;TR=57;WE=45985591;WS=45985573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr13	45985608	rs7997155	T	A	1551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=41;PP=1353;ReadPosRankSum=-0.809;SC=CCTCCAGTGCTGTTTTTCCTG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=49;TCF=7;TCR=42;TR=47;WE=45985616;WS=45985598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,46:0.98:47
chr13	46050519	rs2986001	T	C	2240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=53;PP=1863;ReadPosRankSum=-0.910;SC=TGTTTGATTATTTCAGATGTC;SOR=1.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=67;TCF=12;TCR=55;TR=65;WE=46050527;WS=46050509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,68:0.99:69
chr13	46060459	.	AC	A	432	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=24;MQ=53.43;NF=17;NR=0;PP=432;QD=26.0;SC=GAGACGGGAGACGGGAGACGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=17;WE=46060481;WS=46060449;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr13	46060473	.	AC	A	1199	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=29;MQ=56.02;NF=28;NR=0;PP=1199;QD=43.1785714286;SC=GAGACGGGAGACGGGAGAGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=28;WE=46060481;WS=46060449;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,28:0.82:34
chr13	46066163	rs3014948	T	C	1601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=0;PP=1230;SC=CCAACCATTTTCCGTTCTTCA;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=41;WE=46066171;WS=46066153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr13	46067593	rs2985959	G	A	2011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.676;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=46;PP=1581;ReadPosRankSum=-1.175;SC=TTAAAAATGAGGTGCTTGAAG;SOR=2.376;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=64;TCF=17;TCR=47;TR=62;WE=46067601;WS=46067583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,64:0.97:66
chr13	46077301	rs3014959	G	A	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=271;SC=ATATATATATGTACTTTGTAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=46077309;WS=46077291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	46077381	rs3014960	G	A	798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=9;PP=608;SC=TTATACAGCAGATTGCACAGA;SOR=1.302;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=25;WE=46077389;WS=46077371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr13	46085699	rs2985969	G	A	990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=0;PP=850;SC=ATGTTTCCAGGGATGACTGCA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=46085707;WS=46085689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	46085864	rs2985970	A	G	3011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=44;PP=2444;SC=GTTTTGTCAAATGCCACAGGC;SOR=0.870;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=50;TCR=44;TR=94;WE=46085872;WS=46085854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr13	46098994	rs3014966	T	C	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=580;SC=CATTGTGTTTTAATAGGTTTA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=46099002;WS=46098984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	46099243	rs2985984	A	G	2325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=68;PP=1974;SC=GTTTGCATTTATATAGTCCTT;SOR=5.699;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=71;TCF=3;TCR=68;TR=71;WE=46099251;WS=46099233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr13	46103935	rs2274285	A	G	3097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=16;PP=2377;SC=GCAAAGGTCAATGACCTTGCG;SOR=2.882;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=75;TCR=16;TR=91;WE=46103943;WS=46103925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr13	46104130	rs2274286	G	C	2151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=59;PP=1777;SC=TTTTCCTTTTGCTGTAGACAT;SOR=6.027;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=61;TCF=2;TCR=59;TR=61;WE=46104138;WS=46104120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr13	46108643	rs3014901	T	C	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=424;SC=TTTTTTTTTTTCCATTCTAAT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=46108651;WS=46108633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	46108853	rs3014902	TG	CA	2560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=31;PP=2557;SC=CTTCTGCTGTTGGTTTCTAAA;SOR=1.278;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=19;TCR=33;TR=49;WE=46108862;WS=46108843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr13	46115731	rs1536207	C	A	932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=27;PP=803;SC=CCCAGAAGGACCCGGATCTTC;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=46115739;WS=46115721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr13	46124290	rs2860345	T	A	4831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.012;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=70;PP=2965;ReadPosRankSum=0.163;SC=GTCAAACCCCTTACCCCATAA;SOR=0.135;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=83;TCR=70;TR=151;WE=46124298;WS=46124280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,152:0.99:154
chr13	46137837	rs3014917	T	C	3278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=16;PP=2702;SC=CAGCACGTGGTGGAAAATGGT;SOR=3.067;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=102;TCF=86;TCR=16;TR=101;WE=46137845;WS=46137827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr13	46148855	rs747652	A	G	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=517;SC=GGATATATGAAGCAAAAAGAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=46148863;WS=46148845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	46148943	rs140782618	TG	T	95.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.99;ReadPosRankSum=0.282;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr13	46170609	rs3014939	C	T	7647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=133;NR=106;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.054;SC=GCCTTTTCCTCTTCTAGATAT;SOR=1.037;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=241;TCF=134;TCR=107;TR=239;WE=46170617;WS=46170599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,247:0.99:249
chr13	46170719	rs142875900	CCCAGATACTCTTCCTCCT	C	6692.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=1.604;NF=35;NR=89;PP=2973;ReadPosRankSum=-0.998;SC=CCCTTCCTTCCCCAGATACTC;SOR=0.391;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=152;TCF=45;TCR=107;TR=124;WE=46170744;WS=46170709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,164:0.99:166
chr13	46287153	rs9316154	A	C	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=0;PP=717;SC=TGACAAGGATAGGCCACATTT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=23;WE=46287161;WS=46287147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr13	46288145	rs7317245	A	G	2184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=27;PP=1758;ReadPosRankSum=1.905;SC=CGCCCTGCGGAAGATGGTCAG;SOR=0.352;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=38;TCR=27;TR=64;WE=46288153;WS=46288135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,67:0.99:68
chr13	46358320	rs10578981	CAACA	C	940.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=843;SC=ATTTCTTAAACAACAAACAAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=17;WE=46358331;WS=46358310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	46550061	rs11428563	G	GT	601.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=14;PP=653;SC=TTTTATCTGTGATAGGGTCAC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=46550069;WS=46550051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	46562926	rs34502226	C	T	3074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=38;PP=2440;ReadPosRankSum=-0.692;SC=ACACACCTTCCCTCCTTTCAT;SOR=0.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=55;TCR=38;TR=92;WE=46562934;WS=46562916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,96:0.99:97
chr13	46802668	rs625052	C	T	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=3;PP=168;SC=TGCTGATAGACGCCTTCATGA;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=46802676;WS=46802658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	46836201	rs2764598	A	G	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=17;PP=538;SC=AGAGAAAATCAATCCTTTCAT;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=46836209;WS=46836191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr13	46930372	rs9526171	T	C	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=0;PP=834;SC=CTGGTCCTGGTGTCCTCGGTC;SOR=5.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=46930380;WS=46930362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr13	46937097	rs11843301	A	C	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=67.69;MQRankSum=1.877;QD=27.77;ReadPosRankSum=1.760;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr13	47256065	rs45439193	C	G	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=463;SC=TGAAGAGGGTCGATCTTTGTG;SOR=4.047;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=14;WE=47256073;WS=47256055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	47256071	.	T	TTGTGTGTGTGTGTGTG	271.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.05;QD=45.30;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	47260054	rs842381	T	C	3050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=70;NR=17;PP=2471;SC=AGTAGATCTTTCCTTGGTAAA;SOR=2.571;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=70;TCR=17;TR=87;WE=47260062;WS=47260044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr13	47261970	rs842375	T	C	2589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=6;PP=2018;SC=ATATGATTGCTATTAATTTCT;SOR=4.434;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=73;TCF=66;TCR=7;TR=72;WE=47261978;WS=47261960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr13	47273458	rs706621	G	C	3020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=30;PP=2546;SC=AACCCTGTGTGTTTTGTCCAC;SOR=1.661;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=66;TCR=30;TR=96;WE=47273466;WS=47273448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr13	47279375	rs11483731	C	CT	1344.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=25;PP=1026;SC=CACTTTGTATCTTTTTTTTTC;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=28;TCR=32;TR=48;WE=47279383;WS=47279365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr13	47279454	rs842387	A	G	1891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=26;PP=1566;SC=GGCTGCTGGTAGATTCACCAG;SOR=0.762;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=58;TCF=31;TCR=27;TR=57;WE=47279462;WS=47279444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr13	47279680	rs3832915	A	AT	1100.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=36;PP=1054;SC=GATTCTGTAGATTTTTTTACC;SOR=4.461;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=36;WE=47279688;WS=47279670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr13	47297352	rs7319836	G	A	2768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=32;PP=2186;SC=CCTTTGTATTGTAGTGTTTCT;SOR=1.312;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=52;TCR=32;TR=84;WE=47297360;WS=47297342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr13	47302934	rs3742273	T	A	1867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=13;PP=1538;SC=TTACTCACAGTTACCTCAGTG;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=58;WE=47302942;WS=47302924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr13	47308109	rs2298086	A	G	1394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=23;PP=952;SC=TTTTGGAAGCATGCCGAAAAT;SOR=0.733;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=21;TCR=23;TR=44;WE=47308117;WS=47308099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr13	47315984	rs3742274	T	C	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=19;PP=483;SC=GTCCGCATAATGTCTGCACGT;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=47315992;WS=47315974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	47358540	rs8192889	T	C	2954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.782;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=74;PP=2481;ReadPosRankSum=-0.825;SC=ATGTGCACCATTAATACTGGG;SOR=3.255;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=88;TCF=14;TCR=74;TR=87;WE=47358548;WS=47358530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,89:0.99:90
chr13	47470824	rs6312	C	T	4410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=39;PP=2965;SC=TCTTCAGGGTCCACACATGAG;SOR=1.772;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=89;TCR=40;TR=128;WE=47470832;WS=47470814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr13	48563246	rs6561425	A	G	294.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=8;PP=245;SC=GTCCAAAAATAAGGCATTCTC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=48563254;WS=48563236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	48571213	rs8001509	C	T	2103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=46;PP=1646;SC=GTCACTCTTGCTAACTACTTG;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=20;TCR=46;TR=66;WE=48571221;WS=48571203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr13	48575207	rs11316376	GA	G	2331.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=25;PP=2300;SC=AGGGCACCCAGAAAAATGTCA;SOR=1.522;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=67;TCF=42;TCR=25;TR=63;WE=48575215;WS=48575197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr13	48653864	rs5803423	CA	C	33.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=13.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.35;MQRankSum=1.917;QD=1.30;ReadPosRankSum=-1.462;SOR=0.006;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr13	48667697	rs140099695	CAT	C	11708.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=129;PP=2967;SC=TGAGTGAACACATGAGACCTT;SOR=0.771;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=216;TCF=84;TCR=132;TR=211;WE=48667706;WS=48667687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr13	48878271	rs2854351	T	C	214.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=147;SC=TCGGCGGGGATCCGTCCTCGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=48878279;WS=48878261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	48878292	rs2252544	G	A	162.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.14;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	48919358	rs198617	T	G	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=19;PP=609;SC=TTTTATTAGGTTTACACTCTG;SOR=2.925;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=48919366;WS=48919348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	48921884	rs198616	A	G	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=549;SC=AAAAGAAGATAAATAAAGCAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=48921892;WS=48921874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr13	48947469	rs185587	G	T	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=3;PP=476;SC=CTTGGGAGATGGAAAACATTT;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=48947477;WS=48947459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr13	48953655	rs11449461	C	CA	234.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=9;NR=1;PP=158;SC=GACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=10;WE=48953663;WS=48953645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	48955676	rs2804086	T	A	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=329;SC=CTCAAGAACATATAGGGAATT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=48955684;WS=48955666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	49033747	rs198580	G	A	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=0;PP=1256;SC=TAATTAGAGCGATTTCATGAT;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=44;WE=49033755;WS=49033737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr13	49034022	.	A	ATTTCT	4166.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=67.51;QD=34.44;SOR=4.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr13	49051012	rs3020646	C	T	5627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=117;PP=2965;SC=TTCCAGTAGCCGAGATGGTCA;SOR=1.749;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=167;TCF=49;TCR=118;TR=166;WE=49051020;WS=49051002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr13	49107241	rs7997110	T	C	3276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=86;PP=2566;SC=GGCGCCGCGATGAGTTGGCGC;SOR=2.282;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=28;TCR=86;TR=114;WE=49107249;WS=49107231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr13	49684341	rs3834947	C	CT	1511.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=1;PP=1283;SC=GGAACGTTTGCTTTTTTTTCC;SOR=5.747;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=53;TCF=52;TCR=1;TR=49;WE=49684349;WS=49684331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr13	49752915	rs1407826	A	G	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=374;SC=CTGTCACCCAAGCTGCTGCAG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=49752923;WS=49752905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	49840024	rs6561512	A	G	4435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=87;NR=43;PP=2965;SC=GGATTACTGGAAGCAGCTAAG;SOR=1.627;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=87;TCR=43;TR=130;WE=49840032;WS=49840014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr13	49852430	rs2274149	T	G	3638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=4;PP=2793;SC=AAAAATACATTGCAAAGTGTC;SOR=5.078;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=92;TCR=4;TR=96;WE=49852438;WS=49852420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr13	49860194	.	C	T	161	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=7;NR=1;PP=161;QD=24.4714015684;SC=AGGTAATCCACCTACCTTGGC;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=49860202;WS=49860193;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr13	49865748	rs6561514	A	G	1726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=7;PP=1244;SC=CTCTTACAACATGTAAGGCTG;SOR=3.370;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=51;TCR=7;TR=58;WE=49865756;WS=49865738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr13	49866828	rs11616334	G	C	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=3;PP=1021;SC=CCAGATTGCTGTCTGTGATTT;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=35;WE=49866836;WS=49866818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr13	49866869	rs3751418	G	C	1650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=19;PP=1198;SC=GAAACATTCAGAAAATTATTC;SOR=1.262;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=51;WE=49866877;WS=49866859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr13	49885216	rs912547	A	G	2478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=71;PP=2129;SC=CCTCACCCACACTACTCGCGT;SOR=7.195;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=72;TCF=1;TCR=71;TR=72;WE=49885224;WS=49885206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr13	50026246	rs368801861	CT	C	381.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=18;PP=297;SC=TTTTTGTAAACTTTTTTTTTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=18;WE=50026255;WS=50026236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	50070244	rs370049093	GGGGC	G	99.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=3;PP=138;SC=GTGTACCGCGGGGGCGGGCGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=50070255;WS=50070234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	50366657	.	C	CCGGCGGCGGCTACTCCTGCGGCTG	2303.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.02;SOR=4.849;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr13	50366743	rs201124891	A	AG	94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.50;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	50466911	rs34448316	G	A	2272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=11.958;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.68;MQRankSum=0.569;QD=29.52;ReadPosRankSum=0.800;SOR=1.272;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:5,72:0.94:77
chr13	50467124	rs7316930	T	C	3487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=105;PP=2648;SC=TCCAGAACCATGGCAAGAAAC;SOR=4.021;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=13;TCR=105;TR=118;WE=50467132;WS=50467114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr13	50510199	rs9670083	A	C	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.99;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	50510206	rs113482191	C	T	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.41;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr13	50587140	rs1056543	G	C	6962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.810;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=127;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.241;SC=TCAAACTTCAGTTCCTATCTG;SOR=0.830;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=215;TCF=87;TCR=128;TR=212;WE=50587148;WS=50587130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,216:0.99:218
chr13	50590292	rs10675754	T	TCTC	1245.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=953;SC=GCCTGTAACTTCTGGAAAAGA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=19;WE=50590300;WS=50590282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	51484356	rs2274069	C	T	274.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=196;SC=CCGCCCCCCACCCCGGTGGCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=51484364;WS=51484346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	51929375	rs9596506	T	C	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=33;PP=825;SC=GTCAACATTATGTAAAAGAAT;SOR=4.351;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=36;WE=51929383;WS=51929365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr13	52277693	rs9535738	G	T	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=483;SC=TTCACTTAAAGAATTTATTTT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=52277701;WS=52277683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr13	52293532	rs912097	T	C	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=448;SC=TAACTGTTGTTCTCTTTGATT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=52293540;WS=52293522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	52313195	rs1885854	C	T	4091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=61;PP=2965;SC=GTGGGGTGACCGCTCTCTGTT;SOR=0.740;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=65;TCR=61;TR=126;WE=52313203;WS=52313185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr13	52333955	rs147876825	TTTAACCCAAATCA	T	1643.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.335;NF=6;NR=17;PP=2964;ReadPosRankSum=-1.651;SC=AAACGGTTGTTTTAACCCAAA;SOR=0.538;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=23;WE=52333975;WS=52333945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,41:0.98:42
chr13	52342206	rs1058142	G	A	996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=0;PP=785;ReadPosRankSum=-0.546;SC=GCCTCGCTGTGAGGCACAACG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=29;WE=52342214;WS=52342196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr13	52345637	rs2296028	G	C	2813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=60;PP=2295;SC=CCTGTCTGACGTGGAAATGAC;SOR=1.749;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=27;TCR=60;TR=87;WE=52345645;WS=52345627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr13	52351037	rs2296026	C	T	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=3;PP=513;SC=TCTTGGCATGCCTCCACTTCC;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=52351045;WS=52351027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	52373814	rs9535761	G	C	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=37;PP=1618;SC=CTAGAAAGAGGAGACCCACAG;SOR=1.011;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=28;TCR=37;TR=65;WE=52373822;WS=52373804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr13	52391341	rs975504	C	T	3110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=56;PP=2504;SC=GGGGTGTTGGCAGGGAGAGAG;SOR=1.059;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=41;TCR=56;TR=97;WE=52391349;WS=52391331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr13	52425515	rs147056819	AGAG	A	6882.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.85;MQRankSum=9.028;QD=42.75;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,160:0.99:161
chr13	52425587	rs36141261	A	AT	5448.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.963;HP=11;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=-0.268;NF=91;NR=106;PP=2439;ReadPosRankSum=1.297;SC=ATTTGTAGTCATTTTTTTTTT;SOR=0.902;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=243;TCF=103;TCR=140;TR=197;WE=52425595;WS=52425577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:17,222:0.93:239
chr13	52482399	rs35577493	CAG	C	2788.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=20;PP=2574;SC=CATTTGAAGGCAGACTCAACC;SOR=1.609;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=51;WE=52482408;WS=52482389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr13	52511275	rs200831452	GAA	G	666.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=328;ReadPosRankSum=-1.406;SC=CAGGGGACATGAAAAAAAAAA;SOR=4.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=23;WE=52511285;WS=52511265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr13	52511362	rs9535795	C	G	2773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=13;PP=2110;SC=ACCTGGGAGACAGAAGCCTTT;SOR=3.030;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=63;TCR=13;TR=76;WE=52511370;WS=52511352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr13	52511606	rs2282057	G	A	3359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=88;PP=2865;SC=CTGCAGCCACGCTCACTCTGA;SOR=3.154;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=19;TCR=88;TR=107;WE=52511614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr13	52513424	rs9526808	T	C	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.033;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=38;PP=1009;ReadPosRankSum=1.236;SC=TAATATTATGTGCAAAAAACA;SOR=2.608;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=47;WE=52513432;WS=52513414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,48:0.96:50
chr13	52515354	rs1801249	A	G	3865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=72;PP=2965;SC=GGTCTGGGGGACTGCATCTAT;SOR=1.304;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=120;TCF=46;TCR=74;TR=118;WE=52515362;WS=52515344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr13	52520704	rs2296246	C	A	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=13;PP=327;SC=CAGGGGGGCACTGGACACAAC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=52520712;WS=52520694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	52523808	rs732774	C	T	4399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=113;NR=13;PP=2965;SC=AGGAAAGTATCTCTGAACAAC;SOR=4.125;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=113;TCR=13;TR=126;WE=52523816;WS=52523798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr13	52524488	rs1061472	T	C	2905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=76;PP=2322;SC=AGGGACCACCTTGACGATATC;SOR=4.407;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=8;TCR=76;TR=84;WE=52524496;WS=52524478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr13	52524560	rs9526811	C	T	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=15;PP=422;SC=ACTTATCACTCACATGGCCAC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=52524568;WS=52524550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	52542796	rs2147363	T	G	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=439;SC=GGCCTCTAGGTTGACACAGTC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=52542804;WS=52542786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	52544805	rs1801244	C	G	4517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=76;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.833;SC=ACTTCCTGCACAGATGTAGGT;SOR=0.353;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=136;TCF=59;TCR=77;TR=135;WE=52544813;WS=52544795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,143:0.99:144
chr13	52544978	rs3742288	T	G	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=623;SC=GAGGGTTCATTGTCCCGGCTC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=52544986;WS=52544968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	52548140	rs1801243	A	C	3285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.087;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=50;PP=2344;ReadPosRankSum=-1.259;SC=CTAATTACAGAGGGATTATAA;SOR=0.307;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=57;TCR=51;TR=106;WE=52548148;WS=52548130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,113:0.99:114
chr13	52585548	rs2277448	G	T	2156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=47;PP=1624;SC=GAGGAGAGCGGGGTGTTAAAG;SOR=1.852;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=19;TCR=47;TR=66;WE=52585556;WS=52585538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr13	52585591	rs148013251	T	TCGGCG	1469.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=26;PP=1517;SC=TGTGAGGGCATCGGCGCGGCT;SOR=3.675;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=29;WE=52585599;WS=52585581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr13	52602919	rs3825528	A	C	1994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=9;PP=1603;SC=CTTGGTATACATGAGAGAGGC;SOR=3.150;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=59;WE=52602927;WS=52602909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr13	52603194	rs3742289	G	T	6759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=142;PP=2965;SC=GAAAAGCTGGGCCTTGCAGAT;SOR=1.825;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=201;TCF=59;TCR=142;TR=201;WE=52603202;WS=52603184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr13	52603775	rs3742291	C	T	6934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=102;PP=2965;SC=AACTGTGGCACTGGAAGAAAT;SOR=0.785;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=214;TCF=112;TCR=102;TR=214;WE=52603783;WS=52603765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr13	52603896	rs17402034	G	A	4640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.690;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=78;PP=2965;ReadPosRankSum=1.770;SC=CTGGAGGCTCGCCAAGCTATG;SOR=0.735;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=57;TCR=78;TR=134;WE=52603904;WS=52603886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,144:0.99:145
chr13	52657287	rs9563091	A	G	1137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=1;PP=917;ReadPosRankSum=-0.810;SC=TCTCATAGAAAAAAAAAAAAA;SOR=3.442;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=33;WE=52657295;WS=52657277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr13	52657689	rs12585654	T	G	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.9968;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=18;PP=166;SC=TTTTTTTTTTTTGAGATGGAG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=18;WE=52657697;WS=52657679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	52663491	rs9535861	A	G	1482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=27;PP=1011;SC=AAACTTGAACAAATCTTAGGC;SOR=0.994;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=18;TCR=27;TR=45;WE=52663499;WS=52663481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr13	52684801	rs71665641	TAC	T	2108.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=38;PP=1978;SC=ATAGAAATTATACACACACAC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=38;WE=52684810;WS=52684791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr13	52684817	rs9535865	C	T	2148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.20;QD=42.13;SOR=6.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr13	52701490	rs3076657	A	ACTT	3039.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=3;PP=2737;SC=AGAAATTTGAACTTAACTTTA;SOR=5.074;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=63;TCF=58;TCR=5;TR=52;WE=52701498;WS=52701480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr13	52701637	rs1886544	T	G	3621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=79;PP=2839;SC=ATGGGCTGAGTTTCCTGGAAT;SOR=1.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=36;TCR=79;TR=115;WE=52701645;WS=52701627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr13	52701782	rs1886543	T	C	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=399;SC=AATAACTTTCTTTGTGGCCAC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=52701790;WS=52701772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	52707196	.	T	A	3255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=23;PP=2637;ReadPosRankSum=0.751;SC=AAAATATACGTCGCATGAACT;SOR=1.252;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=77;TCR=24;TR=97;WE=52707204;WS=52707186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,102:0.96:106
chr13	52707240	rs3368	C	G	3575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.424;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=49;PP=2872;ReadPosRankSum=-1.206;SC=CTGAGTGAAGCCTCTCCTCAG;SOR=0.877;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=119;TCF=68;TCR=51;TR=116;WE=52707248;WS=52707230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,118:0.98:121
chr13	52707751	rs3831081	T	TCACACA	767.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=489;SC=CTAATTTAAATCACACACACA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=8;WE=52707759;WS=52707741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,18:0.90:20
chr13	52709742	rs2408611	G	A	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=2;PP=557;SC=ACAATGTGACGTACTTAGTGC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=52709750;WS=52709739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	52709938	rs2296351	A	C	4085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=77;PP=2965;SC=ACAAAGTGTCAGGGGTCTCTT;SOR=1.122;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=55;TCR=77;TR=132;WE=52709946;WS=52709928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr13	52710044	rs2296350	T	C	1913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.058;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=47;PP=1722;ReadPosRankSum=-0.701;SC=AAAAAAGATTTTTCAGCATGT;SOR=2.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=61;TCF=12;TCR=49;TR=58;WE=52710066;WS=52710034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,57:0.95:60
chr13	52710058	rs2296349	T	G	1515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.705;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=39;PP=1429;ReadPosRankSum=0.596;SC=AGCATGTACTTTCCAGATCAT;SOR=2.400;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=50;WE=52710066;WS=52710034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,48:0.96:50
chr13	52717950	rs3783242	C	T	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=456;SC=GGAGTATCTCCGATAATCATT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=52717958;WS=52717940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	52718050	rs3837575	C	CT	1204.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=14;PP=1058;SC=AAAATTCTTACTTTTTTTCTT;SOR=1.730;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=35;TCF=19;TCR=16;TR=31;WE=52718058;WS=52718040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr13	52952928	rs113543720	CA	C	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=446;SC=TGGAAAGCTGCAAAAAAAAAC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=24;WE=52952936;WS=52952918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	52971893	rs3803264	G	A	2820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=56;PP=2320;ReadPosRankSum=0.767;SC=CATCCACTACGATGTTGGGCT;SOR=0.532;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=34;TCR=57;TR=90;WE=52971901;WS=52971883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,89:0.99:90
chr13	52989863	rs1056335	C	T	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=0;PP=916;ReadPosRankSum=-0.535;SC=TGTGAAGTTCCAATAAATTCT;SOR=5.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=31;WE=52989871;WS=52989853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chr13	53009048	rs11148252	C	T	1408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=38;PP=1226;SC=CTTTAAATGACTCAGTCAGAT;SOR=3.417;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=44;WE=53009056;WS=53009038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr13	53009106	.	C	T	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.233;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.68;MQRankSum=-2.341;QD=2.67;ReadPosRankSum=0.780;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr13	53010361	.	C	CACACACAT	916.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=63.15;MQRankSum=0.758;QD=43.65;ReadPosRankSum=1.241;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr13	53029770	rs72440971	CGCGGTGGCGGTGGCGGTG	C	1815.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=2;NR=16;PP=2990;SC=AGGTGAAGGCCGCGGTGGCGG;SOR=4.565;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=58;TCF=7;TCR=51;TR=18;WE=53029795;WS=53029760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr13	53030565	rs9536079	G	A	569.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=448;ReadPosRankSum=-0.686;SC=AACCAGCTTTGGAAGTAAACT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=18;WE=53030573;WS=53030555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr13	53035783	rs7337054	T	C	6681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=112;PP=2965;SC=TCAGTAGAACTTCTGCCAATG;SOR=0.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=91;TCR=112;TR=203;WE=53035791;WS=53035773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr13	53035925	rs7335867	A	G	5845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=78;PP=2965;SC=ATCTGAAGTTATAGCCAGGCC;SOR=0.959;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=102;TCR=78;TR=180;WE=53035933;WS=53035915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr13	53036398	rs3803262	A	G	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=325;SC=TATGCCATTAAAGTAAGATTA;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=53036406;WS=53036388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	53233194	rs9536223	A	T	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=167;SC=AGGTTTATTAACATACACTTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=53233202;WS=53233184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	53240884	rs9316580	G	C	369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=318;SC=ATTATTTTGTGTAGGTTTTTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=53240892;WS=53240874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	53254082	rs4539485	T	C	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=3;PP=481;SC=TGTTGATTAATTACTTCTGCC;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=53254090;WS=53254072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	53254296	rs7986540	A	G	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=18;PP=556;SC=CCTTTGTAAGAATATAAACTT;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=53254304;WS=53254286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	53278067	rs3742297	T	C	222.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=184;SC=CTGTAAAGGGTTTGATCTTGT;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=53278075;WS=53278057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	53287023	rs2147692	G	C	1041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=26;PP=802;SC=AAAAACGATTGCATTTGAGCA;SOR=3.477;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=53287031;WS=53287013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr13	53297962	rs61959657	G	A	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=299;SC=TGCTCAGGAAGCTGAGACAGG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=53297970;WS=53297952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	53419139	rs2236363	T	G	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=29;PP=898;SC=GCTTCCATCTTCAGCATGTCA;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=34;WE=53419147;WS=53419129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr13	53421432	rs3742300	C	A	4630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=115;NR=32;PP=2965;SC=CGTCCGCTCCCCCGAGTGCAG;SOR=2.633;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=115;TCR=32;TR=147;WE=53421440;WS=53421422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr13	53422553	rs3742301	A	G	6091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=134;PP=2965;ReadPosRankSum=1.167;SC=GGGCTGCCCCAACGCCTCACA;SOR=0.590;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=197;TCF=58;TCR=139;TR=191;WE=53422561;WS=53422543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,199:0.98:204
chr13	53603077	rs35790097	T	C	3831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=68;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.272;SC=CGGCTTCAGCTCTTTCCCAGG;SOR=0.899;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=59;TCR=69;TR=126;WE=53603085;WS=53603067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,126:0.98:128
chr13	54615315	rs144930433	CA	C	1260.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.333;NF=31;NR=1;PP=1343;ReadPosRankSum=0.422;SC=CATTGCATTACAACATGTACA;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=32;WE=54615323;WS=54615305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr13	54615571	rs144567553	ATAGAT	A	3240.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=65;PP=2957;SC=GCCAGAAGAAATAGATTGGAG;SOR=6.385;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=70;TCF=2;TCR=68;TR=66;WE=54615583;WS=54615561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr13	60385060	rs10665848	A	ATTAC	976.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=789;SC=ATTGCTTGCTAAAAAAATTTT;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=18;WE=60385068;WS=60385050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr13	60407054	rs341514	G	A	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=1;PP=256;SC=ACAGCTTAATGTTGGAAAGGC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=60407062;WS=60407044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	60544126	rs200920639	C	T	1512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=12;PP=1145;ReadPosRankSum=-0.806;SC=AGCAAATCCACGTTTTCATAC;SOR=1.078;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=48;WE=60544134;WS=60544116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr13	60548335	.	C	CA	521.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=488;SC=AAAAAAATGACAAAAAAATAG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=17;WE=60548343;WS=60548326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr13	60582651	rs339540	C	G	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=1;PP=338;SC=CATTTAAAAACAGATTTTATA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=60582659;WS=60582641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	60590299	rs2762134	C	T	3780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.84;QD=42.96;SOR=2.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr13	60590307	rs12429010	C	T	3668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.83;QD=44.20;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr13	60617060	rs2800294	A	G	621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=555;SC=ACTATAATTAACACTATTTGG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=60617068;WS=60617050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr13	61988107	rs4281600	T	G	2471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=57;PP=2137;SC=ATGCTGGAGTTGGGGGAGGGA;SOR=2.155;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=20;TCR=57;TR=77;WE=61988115;WS=61988097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr13	63745832	rs298898	G	A	2249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=26;PP=1798;SC=AAATGGGATAGGATAATGATC;SOR=1.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=41;TCR=26;TR=67;WE=63745840;WS=63745822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr13	67800935	rs9571740	G	A	6040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=73;PP=2965;SC=GGGTCCCATTGTCCCTGGCAG;SOR=1.155;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=111;TCR=73;TR=184;WE=67800943;WS=67800925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr13	67802339	rs8000556	A	T	3534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=71;PP=2873;SC=TGCTGCTGGAAACTTTCACCA;SOR=1.652;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=34;TCR=71;TR=105;WE=67802347;WS=67802329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr13	70314432	rs111307980	A	C	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=365;SC=GTTTTAAAACAATTTTTACCA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=14;WE=70314440;WS=70314422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	70535355	rs9592668	T	A	584.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=590;SC=GAATTTTTTTTAAAAAAGCGT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=70535363;WS=70535345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	70681873	rs3751428	A	G	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=16;PP=597;SC=CTCACGCAGGAGTAGGCTGGT;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=25;WE=70681881;WS=70681863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr13	72014625	.	C	CT	44	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5267;HP=13;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=29;MQ=62.13;NF=4;NR=0;PP=44;QD=12.25;SC=ATGGAGAAAACTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=4;WE=72014633;WS=72014615;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr13	72038653	rs915052	C	A	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr13	72441025	rs45452597	G	A	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=10;PP=352;SC=CAACAACTCCGGGAGAGAACG;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=72441033;WS=72441015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	73301655	rs1465897	A	C	6128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=91;NR=108;PP=2965;SC=GCGCAACGGAAACTCACCGTC;SOR=0.866;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=199;TCF=91;TCR=108;TR=199;WE=73301663;WS=73301645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr13	73301728	rs1465896	T	C	2932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=87;PP=2392;SC=CCAGCACCGCTGCTACTCGCC;SOR=2.992;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=19;TCR=87;TR=106;WE=73301736;WS=73301718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr13	73302157	rs11350390	CT	C	6668.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=95;PP=2965;SC=TAGGTACGCTCTTTGTGGTCC;SOR=0.913;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=164;TCF=62;TCR=102;TR=155;WE=73302165;WS=73302147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr13	73302481	rs4885034	G	A	1208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=34;PP=1031;SC=AGGTCTTGGCGAAAGGAGGAT;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=37;WE=73302489;WS=73302471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
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chr13	73366704	rs11148921	A	T	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.955;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=43;PP=1095;ReadPosRankSum=1.796;SC=AGTTTTTTTTAAAAAAAAAAC;SOR=2.560;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=58;TCF=14;TCR=44;TR=56;WE=73366712;WS=73366693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,47:0.96:49
chr13	73369756	rs145628963	T	C	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=335;SC=ATTTACCATTTATATAGTAGC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=73369764;WS=73369746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	73491108	rs9592872	T	C	217.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=149;SC=CTTTCTAATGTTTTTATCCTC;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=73491116;WS=73491098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	73638121	rs67730943	C	CT	436.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=72.79;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr13	73638125	rs4885061	G	T	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.44;QD=31.58;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	73650108	rs148760123	C	CA	1024.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.58;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	73650112	rs9573097	C	A	1078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.95;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	74289799	rs6562780	A	T	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=28;PP=837;SC=TGCTACCACTATCTTGGGCAG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=74289807;WS=74289789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	74988961	rs61965144	G	A	3195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.051;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=54;PP=2363;ReadPosRankSum=-0.754;SC=CAAGTATCCCGTGACAATCTG;SOR=0.283;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=49;TCR=54;TR=102;WE=74988969;WS=74988951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,106:0.99:107
chr13	75860804	rs534538	C	A	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=295;SC=TGTGACTAGGCGCTCAGCACC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=75860812;WS=75860794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	75873787	rs2297207	G	A	1809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=49;PP=1499;SC=GCAATTCAGTGACCTCCAAGA;SOR=3.037;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=9;TCR=49;TR=58;WE=75873795;WS=75873777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr13	75876389	rs2297208	G	A	3001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=15;PP=2455;ReadPosRankSum=-0.495;SC=CTAAATCCACGAGAATCGCAT;SOR=1.277;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=98;TCF=83;TCR=15;TR=96;WE=75876397;WS=75876379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,97:0.98:99
chr13	75880667	rs2297209	G	A	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=29;PP=834;SC=AACTTTAGACGTTTGATTGTA;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=75880675;WS=75880657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr13	75884216	rs1062087	C	T	2526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=59;PP=1945;SC=GACAGGAATACAACCAGCGGT;SOR=2.513;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=16;TCR=59;TR=75;WE=75884224;WS=75884206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr13	75894015	rs2274758	T	C	1125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.249;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=4;PP=979;ReadPosRankSum=0.326;SC=TTCCCTACTATATAGCCCTCA;SOR=3.912;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=39;WE=75894023;WS=75894005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,38:0.95:40
chr13	75898596	rs2297210	C	A	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=22;PP=658;SC=AATCTTCATTCACTATGAAAA;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=75898604;WS=75898586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr13	75901749	rs2297206	G	T	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=633;SC=AATCTTCTTAGTTAAAATAAT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=75901757;WS=75901739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr13	75936519	rs7983969	C	G	3622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=49;PP=2732;ReadPosRankSum=0.894;SC=CGCGCTGCTCCCCTTGGATCT;SOR=0.365;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=68;TCR=49;TR=116;WE=75936527;WS=75936509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,126:0.99:127
chr13	76055820	rs7327548	G	C	3740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=47;NR=76;PP=2817;SC=TTGGCTTCCCGGGGCCGGGCT;SOR=1.306;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=47;TCR=76;TR=123;WE=76055828;WS=76055810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr13	76100639	rs1050235	A	G	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=1;PP=662;SC=CATTCAATAAATGTTCCATCC;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=76100647;WS=76100629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr13	76102137	rs71127549	GCACACACA	G	689.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.10;MQRankSum=-2.824;QD=38.32;ReadPosRankSum=1.260;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr13	76124151	rs8192738	C	T	6152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=136;PP=2965;SC=CGCTCGGGACCTCGGAGTCTT;SOR=2.192;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=49;TCR=136;TR=185;WE=76124159;WS=76124141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr13	76135028	rs4884008	T	A	1127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=30;PP=958;SC=GTAATTGTTATGTAAAATAGA;SOR=3.026;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=35;WE=76135036;WS=76135018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr13	76140814	rs56945758	CT	C	670.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.371;NF=24;NR=1;PP=380;ReadPosRankSum=-1.619;SC=ACACTGTTGACTTTTTTTTTT;SOR=3.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=25;WE=76140822;WS=76140804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr13	76169234	rs7330411	G	A	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=22;PP=622;SC=AAATTAACTGGTTGCCTATAA;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=76169242;WS=76169224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr13	76210742	rs2224797	A	C	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=26;NR=2;PP=651;SC=CGCGGGGACAACCCCTCCCCT;SOR=4.615;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=28;WE=76210750;WS=76210732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr13	76378459	rs625033	T	C	4423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=37;PP=2965;SC=AATTTACATTTAAGATGCAGG;SOR=1.999;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=92;TCR=37;TR=129;WE=76378467;WS=76378449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr13	76383353	rs9530469	C	T	4165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.042;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=66;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.328;SC=AAAATCTGTGCGTGTTGTTTG;SOR=0.158;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=133;TCF=67;TCR=66;TR=131;WE=76383361;WS=76383343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,136:0.99:138
chr13	76410725	rs2273996	A	G	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=265;SC=TAAAAGGTTAACACGCAGATC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=76410733;WS=76410715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	76412589	rs35202291	TA	T	157.06	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQRankSum=0.368;QD=7.48;ReadPosRankSum=0.544;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
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chr13	76417101	rs920701	C	T	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=27;PP=859;SC=TGGCTTCAGACAATATTCCAG;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=33;WE=76417109;WS=76417091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr13	76419421	rs3832886	AT	A	666.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=708;SC=AAAGGAGGTTATTTAATGAGA;SOR=6.091;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=19;WE=76419429;WS=76419411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	76423248	rs7986131	T	C	2136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=14;PP=1699;SC=ATTGGGAACATGACCTCTTCA;SOR=2.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=54;TCR=14;TR=68;WE=76423256;WS=76423238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr13	76429311	rs9573671	G	A	1770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=11;PP=1426;ReadPosRankSum=0.846;SC=ATTATTATCAGTGTTAATAGC;SOR=1.576;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=47;TCR=11;TR=57;WE=76429319;WS=76429301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,57:0.98:58
chr13	76429619	rs4885354	C	A	285.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=236;SC=TGTATTCGTCCATCTGTGCTG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=9;WE=76429627;WS=76429609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	76445155	rs9544057	G	C	3967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.990;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=51;PP=2965;ReadPosRankSum=0.701;SC=TTAAAAACGGGCAGTTTTTAA;SOR=0.152;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=118;TCF=67;TCR=51;TR=116;WE=76445163;WS=76445145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,122:0.98:124
chr13	76457148	rs7987971	A	G	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=2;PP=939;ReadPosRankSum=0.776;SC=GGTATTCAATAATGCTGGTTC;SOR=3.383;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=32;WE=76457156;WS=76457138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,33:0.97:34
chr13	76457183	rs9530477	T	C	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=10.414;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=3;PP=1187;ReadPosRankSum=0.255;SC=TTCTTTCCCCTAGCTTTGTAT;SOR=4.657;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=44;TCF=40;TCR=4;TR=43;WE=76457191;WS=76457173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr13	77522725	rs67524409	GACTT	G	8897.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.286;NF=68;NR=78;PP=2972;ReadPosRankSum=1.138;SC=CATTTTATGTGACTTACTTAA;SOR=0.920;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=83;TCR=96;TR=146;WE=77522736;WS=77522715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,203:0.99:205
chr13	77522925	rs588702	T	C	1677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=43;PP=1319;SC=GGGAATGAATTATGACAAGTT;SOR=7.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=43;WE=77522933;WS=77522915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr13	77527707	rs9530614	A	G	3333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=31;PP=2541;SC=TATTCACACTATCACTGGTTG;SOR=1.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=68;TCR=31;TR=99;WE=77527715;WS=77527697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr13	77565972	rs654196	A	G	1556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=11;PP=1183;SC=GGACAGGTCAATTCATAAAAG;SOR=2.078;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=45;WE=77565980;WS=77565962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr13	77569901	rs605153	G	A	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=1;PP=1107;SC=GGATATGACAGTAGCAGCATG;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=38;WE=77569909;WS=77569891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr13	77589725	rs599115	A	C	2796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=9;NR=74;PP=2381;SC=ACTGAAAAGCAAAAAAAATAA;SOR=3.860;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=9;TCR=74;TR=83;WE=77589733;WS=77589715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr13	77644862	rs200791802	G	A	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.079;HP=19;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.836;NF=0;NR=16;PP=173;ReadPosRankSum=-0.355;SC=CATAGAAAAAGAAAAAAAAAA;SOR=4.351;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=16;WE=77644870;WS=77644852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr13	77725106	rs9574006	C	A	2761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=69;PP=2237;SC=ATTATAGAAACCAAATACCAT;SOR=3.664;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=11;TCR=70;TR=80;WE=77725114;WS=77725096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr13	77732333	rs3861128	G	A	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=629;SC=TTTCAGATAGGCCTTTACGGA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=77732341;WS=77732323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr13	77739291	rs9318468	A	T	983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.323;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=815;ReadPosRankSum=1.349;SC=CCACTGCACCAGGCCCCAATT;SOR=2.165;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=30;WE=77739299;WS=77739281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,32:0.94:34
chr13	77751892	rs4885445	C	T	5070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=131;NR=22;PP=2965;SC=CATCATCAACCAACACCTCTA;SOR=3.427;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=131;TCR=22;TR=153;WE=77751900;WS=77751882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr13	77756125	rs192262023	T	C	963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=26;PP=793;SC=AGTTTCTGAATACATAAAAGG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=77756133;WS=77756115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	77835520	rs11436373	T	TA	1111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.164;NF=2;NR=46;PP=713;ReadPosRankSum=0.953;SC=TCTTATGTATTAAAAAAAAAA;SOR=1.512;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=81;TCF=6;TCR=75;TR=48;WE=77835528;WS=77835510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,50:0.83:60
chr13	78137932	.	A	AT	369	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=13;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=26;MQ=62.97;NF=23;NR=3;PP=369;QD=14.3846153846;SC=AATTGATTTGATTTTTTTTTT;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=26;WE=78137940;WS=78137922;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:20,26:0.57:46
chr13	78142653	rs11325667	GA	G	99.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=98;SC=GACTTTTGCAGAAAAAAAAGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=5;WE=78142661;WS=78142643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	78146301	rs678047	C	T	3251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=50;PP=2456;SC=ACAATGCCTCCTCGAGCACAG;SOR=0.985;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=40;TCR=50;TR=90;WE=78146309;WS=78146291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr13	78163243	rs41288252	C	G	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=4;PP=972;ReadPosRankSum=-0.917;SC=TACCATGTTTCCATGGTGAAA;SOR=2.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=35;WE=78163251;WS=78163233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr13	78165635	rs147154057	TG	T	1132.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=803;SC=ACTGTAGTAATGATAAAGTAT;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=78165645;WS=78165625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr13	78165637	rs115680772	A	T	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=17;PP=537;SC=TGTAGTAATGATAAAGTATGC;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=20;WE=78165645;WS=78165625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr13	78165725	rs41288254	T	G	274.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=256;SC=CTCCAAAATATTAATAAATGT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=78165733;WS=78165715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	78177082	rs7490669	T	A	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=195;SC=TTTTTATACTTAAAGCCAATT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=78177090;WS=78177072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr13	78178451	rs6563011	C	T	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=0;PP=1037;SC=TAGTGCTATACTTTAACATCA;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=78178459;WS=78178441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr13	78183167	rs912293	G	C	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=332;SC=TTTTATTTATGATGTTTTTTG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=78183175;WS=78183157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	78191824	rs4142585	G	T	2211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=17;PP=1763;SC=TAATGTACTTGGGTCAGAAAG;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=49;TCR=17;TR=66;WE=78191832;WS=78191814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr13	78211386	rs72078326	CAT	C	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=160;SC=CACACACACACATATATATAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=78211395;WS=78211376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	78216873	rs1053985	A	G	1398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=14;PP=1063;SC=TGGAAAATCTACAAGCGGGTG;SOR=1.364;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=39;WE=78216881;WS=78216863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr13	78272267	rs201380414	T	TGG	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=7;PP=328;SC=CGCCCCCCGCTGGCCTGCAGC;SOR=1.270;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=78272284;WS=78272257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	78272276	rs71102772	G	GC	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=294;SC=CTGGCCTGCAGCCTTTGGGTC;SOR=1.270;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=78272284;WS=78272257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	78315707	rs79939430	C	T	2364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=72;PP=2005;SC=AGTTCTTCCACATACTTAAGG;SOR=7.195;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=73;TCF=1;TCR=72;TR=73;WE=78315715;WS=78315697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr13	78475313	rs5351	T	C	1923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=32;PP=1452;SC=AGAAACTGAATAGCCACCAAT;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=29;TCR=32;TR=61;WE=78475321;WS=78475303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr13	78477674	rs5348	A	G	3207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=51;PP=2447;SC=TGATTCCCACAGAGGCTTTCT;SOR=0.786;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=58;TCR=51;TR=109;WE=78477682;WS=78477664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr13	79894736	rs3187338	C	T	1737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=12;PP=1450;SC=CTAGCATATGCAGATCAATGA;SOR=2.564;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=56;WE=79894744;WS=79894726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr13	79894877	rs71696319	CA	C	300.52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.39;MQRankSum=0.500;QD=15.03;ReadPosRankSum=0.549;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,18:0.90:20
chr13	79915389	rs7981067	G	T	1330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=38;PP=1155;SC=AATATTTTAGGTGACAGTAAT;SOR=4.514;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=41;WE=79915397;WS=79915379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr13	79916792	rs374223990	T	TA	1769.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=5;PP=1742;SC=ACAATGAAATTAAATACCTGA;SOR=3.139;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=40;WE=79916800;WS=79916782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr13	79916973	rs3742118	A	T	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=742;SC=ACATCTGCCAAATTTTTAAAA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=26;WE=79916981;WS=79916963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr13	79927157	rs11341470	CA	C	953.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=0;PP=1089;SC=AAATGGAAACCAAAAGGTAGG;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=29;WE=79927165;WS=79927147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr13	79929183	rs9530900	G	A	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=420;SC=AATTATGAGAGAACAGGTTAG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=79929191;WS=79929180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	79929326	rs9530901	G	A	3622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=38;PP=2815;SC=TAAGAAATGCGCGTACTTTTA;SOR=1.493;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=76;TCR=38;TR=114;WE=79929334;WS=79929316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr13	79932617	rs7994560	A	G	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=456;SC=TCCTGACCCTAACCAAATACA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=79932625;WS=79932607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	79940150	rs3831152	CTG	C	1296.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=1166;ReadPosRankSum=-1.627;SC=TCATCTAAAACTGTGTTACAT;SOR=1.236;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=25;WE=79940159;WS=79940140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr13	79940811	rs7327603	T	C	2526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=36;PP=2159;SC=CTGGCGGTGGTACTGGGGGCC;SOR=0.902;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=47;TCR=36;TR=83;WE=79940819;WS=79940801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr13	79943166	rs10710579	TA	T	579.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=25;PP=397;SC=TACACTGTATTAAAAAAAAAA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=25;WE=79943174;WS=79943156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr13	79946071	rs369797909	TA	T	221.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;QD=20.16;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	79946104	rs9545093	A	G	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=565;SC=AAGTTTAGTAATTATTCCACT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=79946112;WS=79946094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	79946163	rs7325232	G	C	286.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=270;SC=TGCCTGTAATGCCAGCACTTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=79946171;WS=79946153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	80095030	rs11549502	C	T	1740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=29;PP=1302;SC=GTGCAGGCTGCGTCTTCAGCA;SOR=0.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=25;TCR=30;TR=54;WE=80095038;WS=80095020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr13	80910786	rs4728	C	A	2090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.67;SOR=1.225;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr13	80910792	rs700397	T	G	2071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.04;SOR=1.203;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr13	87045827	rs9513670	T	C	1788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=34;PP=1320;SC=AATCTAGAGCTAAAGAATTCC;SOR=1.278;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=54;WE=87045835;WS=87045817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr13	92560425	rs1854735	G	T	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=606;SC=CTAAAATATTGTAACACACTT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=92560433;WS=92560415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	92796964	rs12429836	G	A	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=358;SC=ACTTGACTTGGTGTCTACACC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=92796972;WS=92796954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	93142312	rs2149060	T	A	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=278;SC=TTGTGCATTTTAAAAAATTTA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=93142320;WS=93142302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	93142362	rs722178	C	T	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=5;PP=452;SC=CATTGTTTCCCGAAAACTCCA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=17;WE=93142370;WS=93142352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	95090692	rs1540979	T	A	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=431;SC=TAGCAGTCCTTTTGCATGGGG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=16;WE=95090700;WS=95090682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	95096505	rs7339198	G	A	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=404;SC=CAAGTATTCCGAAATCTGAAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=95096513;WS=95096495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	95097956	rs755684	C	T	4208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=80;PP=2965;ReadPosRankSum=0.910;SC=AGTAGAGCCTCCCAGGCTCAT;SOR=0.512;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=48;TCR=81;TR=128;WE=95097964;WS=95097946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,135:0.99:136
chr13	95230877	rs16949940	G	A	1272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=11;PP=1099;SC=AATTTAGTGGGGCATTCAATT;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=38;WE=95230885;WS=95230867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr13	95243270	rs9301979	G	A	6670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=132;PP=2965;ReadPosRankSum=1.383;SC=TTTTACTATAGCATCCCCCTA;SOR=0.554;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=203;TCF=70;TCR=133;TR=202;WE=95243278;WS=95243260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,213:1.00:214
chr13	95254382	rs9556404	A	G	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=16;PP=532;SC=CCGCCGGCTGAGTCCGCCGGC;SOR=1.802;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=95254390;WS=95254372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	95257870	rs146725896	A	T	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=34;PP=985;SC=GAAATATAGTACCATATGTAC;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=95257878;WS=95257860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr13	95275576	rs4296139	C	G	4194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=103;PP=2965;SC=GAAAGAAAATCGTTTATTCTG;SOR=2.816;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=23;TCR=103;TR=126;WE=95275584;WS=95275566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr13	95364046	rs1060474	C	G	3819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=27;PP=2965;SC=CCTTCTTGAGCAGCGTCTTGG;SOR=2.224;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=87;TCR=27;TR=114;WE=95364054;WS=95364036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr13	95364337	rs2253604	T	G	2944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=71;PP=2423;SC=GCCCGCCGCCTCCCGGGCCCT;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=26;TCR=71;TR=97;WE=95364345;WS=95364327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr13	95673939	rs9524765	A	G	2720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=76;PP=2330;SC=AAGTATACCTAGAAAAAAAAA;SOR=4.830;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=6;TCR=78;TR=82;WE=95673947;WS=95673929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr13	95818393	.	TA	T	1273.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=4;PP=1311;SC=GGCCATGTTGTAACAGGAGGT;SOR=3.737;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=32;WE=95818401;WS=95818383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr13	95829843	rs2296653	G	A	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=621;SC=GCAGGGGACAGTGTGGGGAGG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=95829851;WS=95829833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	95829870	rs1751005	T	C	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=0;PP=827;SC=GACACCAGAGTAGGATGAGCT;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=95829878;WS=95829860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr13	95839296	rs1557069	T	C	213.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=143;SC=AAATTGGAAATAACATAATGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=95839304;WS=95839286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	95858686	rs3818493	G	A	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=1;PP=595;SC=TTATGAGAGAGTTAAATGTCA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=95858694;WS=95858676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	95858704	rs3818494	G	C	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=3;PP=616;SC=TCATTACACTGGAACATAGTG;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=95858712;WS=95858694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr13	95858978	rs2274405	T	C	5308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=90;PP=2965;SC=CACTGAAAAATGAAGCCAAAT;SOR=0.714;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=90;TCR=90;TR=180;WE=95858986;WS=95858968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr13	95858996	rs2274406	T	C	5691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=99;PP=2965;SC=AATTCATCCCTCTGAGGCAGG;SOR=0.944;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=177;TCF=78;TCR=99;TR=177;WE=95859004;WS=95858986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr13	95859974	rs2274408	T	C	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=285;SC=TGTGAAAACATAGTAAAACTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=95859982;WS=95859964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	95860214	rs2274409	C	T	1493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=37;PP=1164;SC=TGAGCCTGAGCGATCACAGCC;SOR=2.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=9;TCR=37;TR=46;WE=95860222;WS=95860204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr13	95860288	rs2274410	C	A	762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=24;PP=632;SC=AGCGCTTTTGCTTCCGACAAC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=95860296;WS=95860278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	95861804	rs899494	A	G	2347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=57;PP=1834;SC=CAGTCACTGCAATCGCCTGCA;SOR=3.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=9;TCR=57;TR=66;WE=95861812;WS=95861794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr13	95863008	rs11568658	C	A	2900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.384;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=60;PP=2207;ReadPosRankSum=-0.146;SC=GTTGTCTTCCCCATGGCCATG;SOR=1.355;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=92;TCF=31;TCR=61;TR=89;WE=95863016;WS=95862998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,95:0.97:98
chr13	95921688	rs5805918	AAT	A	129.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.43;QD=25.97;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	96230279	rs1325774	T	G	5370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=112;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.867;SC=AAGAGCTCGCTGGCAAGCTGC;SOR=0.586;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=172;TCF=59;TCR=113;TR=171;WE=96230287;WS=96230269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,179:0.99:180
chr13	96239805	rs11070136	G	A	3217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=28;PP=2510;SC=GCGGGCTTGGGAGAATCATCA;SOR=1.848;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=72;TCR=28;TR=100;WE=96239813;WS=96239795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr13	96258410	rs7319952	A	G	2665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=56;PP=2078;SC=ACTAGTCAAGATACATACAGA;SOR=2.219;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=21;TCR=57;TR=77;WE=96258418;WS=96258400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr13	96270202	rs17268561	A	T	3651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=41;PP=2746;ReadPosRankSum=-0.776;SC=GAGCATCTGGAGGAACGAGGG;SOR=0.542;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=115;TCF=74;TCR=41;TR=114;WE=96270210;WS=96270192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,122:0.99:123
chr13	96293523	rs61975171	A	C	2650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.741;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=16;PP=2116;ReadPosRankSum=-0.709;SC=CTGGATTATGAATCGTGCTCA;SOR=2.676;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=82;TCF=65;TCR=17;TR=80;WE=96293531;WS=96293513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,84:0.99:85
chr13	96506664	rs11070154	A	G	4218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=87;PP=2965;SC=CACAAAATGGAGTATACCCAT;SOR=1.592;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=44;TCR=88;TR=131;WE=96506672;WS=96506654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr13	96529376	rs10601193	TCTGC	T	401.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=61.07;NF=7;NR=1;PP=362;SC=GGCCTTGTGATCTGCCTGCCT;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=8;WE=96529387;WS=96529366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	96539977	rs11842395	T	G	366.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.85;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr13	96539979	rs11842396	T	C	366.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.75;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr13	96540019	rs12871416	C	T	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=1;PP=364;SC=ATAGTCTGACCTTCTGACTTA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=96540027;WS=96540009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	96540141	rs9525075	T	C	1155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.45;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr13	96540141	.	TTT	CTC	1167	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=11;NR=10;PP=1167;QD=58.1175178506;SC=TTCACTCAGATTTACCTTTCT;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=23;TCF=13;TCR=10;TR=21;WE=96540151;WS=96540131;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,21:0.91:23
chr13	96540143	rs9525076	T	C	1155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.45;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr13	96540204	rs12876018	T	G	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=16;PP=572;SC=TTTATCTTCATGTTGATAATC;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=96540212;WS=96540194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	96555149	rs33949518	C	T	1575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=11;PP=1287;SC=GAGTAAATAGCTGTAGCAATT;SOR=2.448;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=49;WE=96555157;WS=96555139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr13	96578189	rs7985727	G	A	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr13	96599271	rs7986005	C	T	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=2;PP=686;SC=AAACAAATCACATTTAGTGCA;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=96599279;WS=96599261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr13	96599433	rs9556512	A	C	1417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=32;PP=1133;SC=AATTCTGGAAAAAGAAGATGA;SOR=2.356;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=42;WE=96599453;WS=96599423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr13	96599445	rs9556513	C	T	1214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=31;PP=977;SC=AGAAGATGAACAAGGACTGTT;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=96599453;WS=96599423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr13	96636170	rs9562008	G	C	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=26;PP=827;SC=GTTTAGAACTGATCTATATAA;SOR=3.912;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=96636178;WS=96636160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr13	96638636	rs816142	A	C	1036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.802;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=816;ReadPosRankSum=1.069;SC=AATTTAATGGAATCATAAACT;SOR=0.876;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=14;TCR=20;TR=33;WE=96638644;WS=96638626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr13	96638651	rs12863903	C	T	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=18;PP=580;SC=TAAACTGGAGCGGACATTATT;SOR=1.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=26;WE=96638659;WS=96638641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr13	96641695	rs555120	T	G	1411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=8;PP=1242;SC=AATTGAAAAGTACTTAAAAGT;SOR=2.935;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=45;WE=96641703;WS=96641685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr13	96643568	.	C	T	168	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=57.6;NF=7;NR=0;PP=168;QD=28.9673160782;SC=TCTTCCACAACGGTTGAACTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=96643576;WS=96643567;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,7:0.88:8
chr13	97079618	rs9556587	A	G	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=395;SC=GTAGATCTCAATGAAGGTTAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=97079626;WS=97079608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	98087096	rs3803251	T	C	2357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=55;PP=1898;SC=GTCCCGGGGCTGGAACTCCCC;SOR=1.638;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=29;TCR=55;TR=84;WE=98087104;WS=98087086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr13	98621940	rs12866550	C	T	3414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=25;PP=2671;SC=AATTAAGTACCATCTAATGGT;SOR=2.465;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=78;TCR=25;TR=103;WE=98621948;WS=98621930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr13	98629334	rs9517155	G	C	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=7;NR=10;PP=296;SC=GGGCGGGCCCGGGGCCCCAAC;SOR=1.061;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=7;TCR=10;TR=17;WE=98629342;WS=98629324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	98631978	rs645882	G	A	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=5;PP=378;SC=TAGAGACAGGGTCTTGCTGTG;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=14;WE=98631986;WS=98631968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	98632349	rs555647	A	G	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=402;SC=GCCACAACTGATAACATTCAC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=98632357;WS=98632339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	98640204	rs34796635	AT	A	213.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=125;SC=GCTCTCATAGATTTTTTTTTT;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=9;WE=98640212;WS=98640194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	98640318	rs592246	C	G	1363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=21;PP=1043;SC=GTTCAAATATCGGGGGACGTT;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=22;TCR=21;TR=43;WE=98640326;WS=98640308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr13	98640386	rs588144	A	G	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=18;PP=505;SC=GGTCTTTGTGACAATATAACC;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=98640394;WS=98640376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	98641223	rs3832890	G	GT	1281.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.335;NF=38;NR=0;PP=1506;ReadPosRankSum=1.527;SC=ACTACTCCAGGTTTGAATGAG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=38;WE=98641231;WS=98641213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr13	98645253	rs626716	A	G	5338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.345;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=83;PP=2965;ReadPosRankSum=1.509;SC=AAGCAACTCTACAGCTAAGTC;SOR=0.487;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=75;TCR=83;TR=157;WE=98645261;WS=98645243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,161:0.99:162
chr13	98649740	rs568379	A	C	1595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=1;PP=1342;SC=GATATGGATAAGATAAAGTCA;SOR=6.399;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=49;WE=98649748;WS=98649730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr13	98650024	rs651241	G	T	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=657;SC=TGTGTCACATGTTATAAGTAG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=98650032;WS=98650014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr13	98654608	rs583478	T	C	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=542;ReadPosRankSum=-0.775;SC=TATACCCTTTTCAAAAAAGTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=18;WE=98654616;WS=98654600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr13	98658358	rs633161	G	A	3416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=2;PP=2898;ReadPosRankSum=0.322;SC=TTTCCTTTGAGGTAATAATTT;SOR=4.883;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=99;TCR=2;TR=99;WE=98658366;WS=98658348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,104:0.98:106
chr13	98658610	.	ATTTTTTTTTTTTTTTTTTTT	A	516.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=2.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.16;MQRankSum=2.053;QD=13.97;ReadPosRankSum=3.678;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr13	98670641	rs528546	G	C	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=0;PP=1695;SC=TTGCCTGTATGAGGAATATCA;SOR=8.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=56;TCR=0;TR=56;WE=98670649;WS=98670635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr13	98829217	rs16955011	C	T	4360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=97;PP=2965;SC=CTGTACACCACGTCGAGGCTC;SOR=1.939;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=39;TCR=97;TR=136;WE=98829225;WS=98829207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr13	98896776	rs7318267	C	T	1873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=10;PP=1595;SC=CTCAAAGCCACCGGCTCCTCC;SOR=3.037;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=49;TCR=10;TR=59;WE=98896784;WS=98896766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr13	99061556	rs5806061	C	CT	3364.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=30;PP=2120;SC=AAAAAAATTACTTTTTTTTTC;SOR=2.303;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=119;TCF=77;TCR=42;TR=97;WE=99061564;WS=99061546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,122:0.98:124
chr13	99090166	rs59023150	TG	T	907.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.74;QD=43.23;SOR=2.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	99090168	rs1969794	G	T	916.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.74;QD=43.66;SOR=2.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	99092052	rs4772080	G	T	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=0;PP=858;SC=TTTCCGATTTGGGTTTTTCCA;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=99092060;WS=99092045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr13	99093094	rs2146998	T	C	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=37;PP=986;SC=AGTGGAGGTATGCAGGGGCAG;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=49;WE=99093102;WS=99093084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr13	99098318	rs2274053	C	T	1892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=17;PP=1563;SC=GGCAGGTGCCCGCTGTGCTTC;SOR=1.903;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=39;TCR=17;TR=56;WE=99098326;WS=99098308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr13	99098470	rs2274054	C	T	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=35;PP=1155;SC=GTAAGTGTCTCGCACAGGGCA;SOR=2.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=46;WE=99098478;WS=99098460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr13	99098882	rs2281766	A	C	5135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=129;NR=32;PP=2965;SC=GCAGAAGCTGACCCCGAAAAG;SOR=2.763;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=161;TCF=129;TCR=32;TR=161;WE=99098890;WS=99098872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr13	99100547	rs12261	T	C	1853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.307;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=24;PP=1515;ReadPosRankSum=-0.873;SC=ACGTGTTGAGTCACAAAGAGT;SOR=1.186;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=64;TCF=39;TCR=25;TR=63;WE=99100555;WS=99100537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,61:0.98:62
chr13	99112468	rs112280830	T	TGCCTGAC	2508.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=0;PP=2281;SC=CGCAAGGTGGTGCTGACAGCC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=32;WE=99112476;WS=99112458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr13	99112680	rs4771305	C	T	2342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=53;PP=1886;SC=AAGGCCTCTTCGGGATGTCTT;SOR=2.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=17;TCR=53;TR=70;WE=99112688;WS=99112670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr13	99112754	rs4772083	TT	GC	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=25;PP=1588;SC=TGGCAATAATTTAATAAACCT;SOR=3.545;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=99112763;WS=99112744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr13	99115838	rs56325686	TA	T	753.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=8.135;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.60;MQRankSum=0.000;QD=19.84;ReadPosRankSum=1.603;SOR=4.921;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,36:0.95:38
chr13	99115927	rs2296149	A	G	4717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=62;PP=2965;SC=TGCTTGGGTCACTCAGGGGCC;SOR=1.242;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=99;TCR=63;TR=161;WE=99115935;WS=99115917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr13	99354931	rs1768042	C	T	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=5;PP=143;SC=CTCTGGAGGCCGGGCACAGTA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=99354939;WS=99354921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	99356612	rs1339067	A	G	2020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.266;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=37;PP=1617;ReadPosRankSum=0.540;SC=CGTCAGTTACAGCAGTGACTG;SOR=0.455;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=32;TCR=37;TR=68;WE=99356620;WS=99356602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,69:0.99:70
chr13	99361959	rs2297319	G	A	5165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.387;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=54;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.933;SC=TCTCAAAGACGACTCTGATCC;SOR=1.211;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=157;TCF=101;TCR=56;TR=154;WE=99361967;WS=99361949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,161:0.99:162
chr13	99363919	rs6145194	GGTTTT	G	727.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=753;SC=AATTGCTTTTGGTTTTGTTTT;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=14;WE=99363931;WS=99363909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	99447005	rs812808	T	C	2044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=41;PP=1586;SC=GGGCAGATCTTGAGGACAGAA;SOR=1.042;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=71;WE=99447013;WS=99446995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr13	99448441	rs9554522	T	A	2496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=17;PP=2025;SC=AGAAAAATAATGTTTAAAAAT;SOR=2.242;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=58;TCR=17;TR=75;WE=99448449;WS=99448431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr13	99448623	rs9554524	A	G	1896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=53;PP=1523;ReadPosRankSum=-0.741;SC=CTGAAGGACGATAATGGAGGG;SOR=3.126;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=4;TCR=54;TR=57;WE=99448631;WS=99448613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
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chr13	99449755	rs1289315	G	A	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=37;PP=1174;SC=TAGACAAAGAGCAAAGATTTT;SOR=2.786;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=45;WE=99449763;WS=99449745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr13	99457431	rs2296984	T	G	4674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=78;PP=2965;SC=CCTGGATGTATGCATACTTAG;SOR=0.820;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=143;TCF=65;TCR=78;TR=143;WE=99457439;WS=99457421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr13	99457552	rs7990741	T	A	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=29;PP=893;SC=ACATTTTATTTGTAAATATAA;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=32;WE=99457560;WS=99457542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr13	99459891	rs9557078	A	C	3963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=18;PP=2965;ReadPosRankSum=0.900;SC=CATTGCTATGAAACTTATCCA;SOR=2.173;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=105;TCR=18;TR=122;WE=99459899;WS=99459881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,123:0.99:124
chr13	99482030	rs9517459	G	C	2347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=54;PP=1873;SC=ACACAAACATGAGCAAATCAA;SOR=2.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=16;TCR=54;TR=70;WE=99482038;WS=99482020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr13	99498902	rs74111314	T	C	2792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=86;PP=2190;SC=CCAGAGCAGATGAAAATGAGA;SOR=4.219;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=9;TCR=86;TR=95;WE=99498910;WS=99498892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr13	99534048	rs6491461	G	A	1948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=18;PP=1552;SC=TTTCTTAAATGTAATGTTCAG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=58;WE=99534056;WS=99534038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr13	99566594	rs16956053	C	T	5175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=86;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.059;SC=TGGCAAGTTCCGGCAGGTAGC;SOR=1.004;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=72;TCR=87;TR=157;WE=99566602;WS=99566584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,167:0.99:169
chr13	99607581	rs9513518	T	A	341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.47;QD=31.07;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	99607911	rs8002389	A	G	1463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=43;PP=1254;SC=CTACAATTAGAGTATGCTAGT;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=43;WE=99607919;WS=99607901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr13	99667961	rs7330438	G	A	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=27;PP=773;SC=TACCATCTTCGTGACAAGCAG;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=99667969;WS=99667951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr13	99667982	rs4772168	T	C	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=23;PP=544;SC=TCACCGGTACTGGAACAGAAG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=99667990;WS=99667972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	99738372	rs61970775	G	T	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=3;PP=268;SC=CAGCAGGGTCGGCCGCTCTGC;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=99738380;WS=99738362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	99853443	rs7338947	T	G	1050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=22;PP=813;SC=CCCCAGGTGCTCTGCCCAGGA;SOR=1.675;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=32;WE=99853451;WS=99853433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr13	99948178	rs2230342	C	A	4640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.348;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=61;PP=2965;ReadPosRankSum=0.406;SC=TATCAGAAATCACCAAATTTG;SOR=0.491;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=75;TCR=62;TR=135;WE=99948186;WS=99948168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,146:0.99:147
chr13	99966516	.	CT	C	231.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.851;QD=8.91;ReadPosRankSum=1.196;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr13	99970429	rs56695114	CT	C	1060.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=40;PP=806;SC=TCTCACCATTCTTTTTTTTTG;SOR=5.235;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=52;TCF=2;TCR=50;TR=41;WE=99970437;WS=99970419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr13	100206623	.	G	A	7705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=143;PP=2965;SC=CGTTCTACACGAAGCCCTTGC;SOR=1.160;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=240;TCF=97;TCR=143;TR=240;WE=100206631;WS=100206613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr13	100515161	rs10648017	A	AGACTT	1807.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=2;PP=1448;SC=CTCAGGTCAAAGACTTAAATA;SOR=4.235;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=25;WE=100515169;WS=100515151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr13	100517409	rs7317032	G	A	2622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=74;PP=2200;SC=ACGAGCAATAGAAAGCCTGTT;SOR=8.688;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=74;TCF=0;TCR=74;TR=74;WE=100517417;WS=100517399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr13	100518400	rs2390354	T	A	267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=0;PP=224;SC=CCAGGGAGGTTTAGATATCTG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=100518408;WS=100518395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	100518580	rs3783185	A	G	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=750;ReadPosRankSum=-0.915;SC=TCTCCAAGCCATAGATCTGGT;SOR=0.446;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=31;WE=100518588;WS=100518570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,33:0.97:34
chr13	100921056	rs4306370	A	G	4116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=101;PP=2965;SC=CCTAAGAAACATTTATAAAGC;SOR=2.647;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=26;TCR=101;TR=127;WE=100921064;WS=100921046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr13	100945533	rs9300598	G	A	8964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=126;NR=157;PP=2965;SC=TTGAAATTCTGTGAAGGCTAT;SOR=0.956;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=283;TCF=126;TCR=157;TR=283;WE=100945541;WS=100945523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr13	100953651	.	T	A	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=4;PP=496;SC=GTGATTTTTCTTGTTTGTTTC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=100953659;WS=100953641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	101020695	rs9518061	A	G	3325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=12;PP=2757;ReadPosRankSum=-0.901;SC=ATATAAAATTATTAACTCTTT;SOR=2.242;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=97;TCF=85;TCR=12;TR=95;WE=101020703;WS=101020685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr13	101144108	rs12428535	A	C	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=22;PP=501;SC=AAAATATTTTAGTGAATATGA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=101144116;WS=101144098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr13	101258586	rs181309872	C	T	2030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=30;PP=1647;SC=AATTTCAACACGATTCAAGTT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=31;TCR=30;TR=61;WE=101258594;WS=101258576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr13	101264633	rs1572641	C	T	1729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=4;PP=1437;SC=CAAGAACTCACAGCCTGCGGT;SOR=4.654;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=48;TCR=4;TR=51;WE=101264641;WS=101264623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr13	101286924	rs1890861	T	C	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=1;PP=249;SC=AAACCATACATAACAAAGAAA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=101286932;WS=101286914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	101287340	rs946837	C	T	3822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=94;PP=2965;SC=CAGTACCCAACGCTGGGGAGG;SOR=3.037;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=20;TCR=94;TR=114;WE=101287348;WS=101287330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr13	101287365	rs946838	T	C	2387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=68;PP=1830;SC=GGACACGCTCTGCGACCACGA;SOR=3.153;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=13;TCR=68;TR=81;WE=101287373;WS=101287355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr13	101288992	rs3803256	C	T	1657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.601;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=35;PP=1223;ReadPosRankSum=1.262;SC=TTACGGCCTGCCAGTCAAAAG;SOR=1.277;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=59;TCF=23;TCR=36;TR=56;WE=101289000;WS=101288982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,59:0.95:62
chr13	101289998	rs7985718	C	A	2874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=53;PP=2361;SC=CTGATTTTCACATAAAAGTGT;SOR=1.166;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=34;TCR=53;TR=87;WE=101290006;WS=101289988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr13	101294428	rs9585476	C	G	1711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=1;PP=1519;SC=AAAGGACACACAGAAAAAGCA;SOR=6.399;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=49;WE=101294436;WS=101294418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr13	101308836	rs11315434	AC	A	604.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=689;SC=TCACTCTGCCACCCAGGCTGG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=101308844;WS=101308826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	101316313	rs1298168	C	T	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=429;SC=GCCACGCTGGCCTTCTCTGCA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=17;WE=101316321;WS=101316303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	101316378	rs1283208	A	G	2207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=8;PP=1882;SC=CACTGACTAGACTCCTGAATG;SOR=3.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=57;TCR=8;TR=65;WE=101316386;WS=101316368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr13	101318136	rs945962	C	T	288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=1;PP=254;SC=ACACTGACCACTCCCCAAGAG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=101318144;WS=101318126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	101321067	rs2791680	T	C	1191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=38;PP=984;SC=AAAACAACACTGTATAAATAT;SOR=3.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=43;WE=101321075;WS=101321057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr13	101322622	rs1283201	G	C	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=34;PP=939;SC=ACCATTCCATGGTGATGCTGT;SOR=2.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=11;TCR=34;TR=45;WE=101322630;WS=101322612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr13	101712426	rs2274085	G	T	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=112;SC=CCTGCATGACGGGTGACCTCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=101712434;WS=101712416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr13	101717980	rs369621391	GAA	G	1117.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=21;PP=452;SC=TTTCTCAAAAGAAAAAAAAAA;SOR=3.126;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=23;WE=101717989;WS=101717970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr13	101720300	rs1289556	T	G	3647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=80;PP=2965;SC=TGTTCCATATTATTTGAAAGT;SOR=2.024;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=30;TCR=80;TR=110;WE=101720308;WS=101720290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr13	101721029	rs11616341	T	C	1672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=3;PP=1416;SC=TAAAAAGTATTCAACTAACAT;SOR=4.977;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=50;WE=101721037;WS=101721019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr13	101727043	rs34229756	C	CAG	657.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.666;NF=1;NR=45;PP=1705;ReadPosRankSum=-1.590;SC=AGCGGGGAGACAGAGAGAGAG;SOR=2.049;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=74;TCF=4;TCR=70;TR=46;WE=101727052;WS=101727033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr13	101727071	rs112963196	CAG	C	1123.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.65;MQRankSum=2.444;QD=28.81;ReadPosRankSum=-1.079;SOR=5.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,36:0.92:39
chr13	101735026	rs12430032	T	A	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=9;PP=1120;SC=ACCGCTTAAGTAGGAAATATC;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=41;WE=101735034;WS=101735016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr13	101736075	rs686141	A	G	2138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=22;PP=1716;SC=GGCGAGGCGGAAGATGAAGAG;SOR=1.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=46;TCR=22;TR=68;WE=101736083;WS=101736065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr13	101753025	rs57703343	GT	G	816.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=1;PP=883;SC=TTGACCTCCAGTTTCAAGTAA;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=23;WE=101753033;WS=101753015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	101755480	rs9300647	G	T	2086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=9;PP=1713;ReadPosRankSum=0.384;SC=TGCATTAGAGGTGGACTACTG;SOR=2.332;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=61;TCR=9;TR=69;WE=101755488;WS=101755470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,69:0.99:70
chr13	101755813	rs7331375	C	A	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=27;PP=787;SC=TTGTACGTGCCATCTGTTAAC;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=101755821;WS=101755803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	101844246	rs5806198	G	GA	2061.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.082;NF=44;NR=15;PP=1274;ReadPosRankSum=0.384;SC=AGATATAATTGAAAAAAAAAT;SOR=0.711;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=88;TCF=64;TCR=24;TR=59;WE=101844254;WS=101844236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,77:0.97:79
chr13	101844479	rs979680	T	C	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=30;PP=990;SC=CATGTGATGTTTGAAGACTTT;SOR=4.174;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=33;WE=101844487;WS=101844469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr13	101890040	rs9518352	A	G	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=340;SC=TGTTAAAATAATGTGACAGGT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=101890048;WS=101890030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	101944752	rs570252	C	T	953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=28;PP=773;SC=TGAGTCACAGCTGACTTTTGA;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=101944760;WS=101944742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr13	102021517	rs145272114	A	ATG	63.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr13	102051635	rs150928881	TA	T	1888.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=42;PP=1793;SC=CCATAGTGTATAATAAACATA;SOR=4.575;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=1;TCR=49;TR=43;WE=102051643;WS=102051625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr13	102235519	rs3918322	A	G	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=4;PP=877;ReadPosRankSum=-0.650;SC=GCTTTCTTTCATGGTTTTTCT;SOR=2.687;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=39;WE=102235527;WS=102235509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr13	102235764	rs370279713	TA	T	231.86	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.80;MQRankSum=0.644;QD=12.88;ReadPosRankSum=-0.211;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,16:0.89:18
chr13	102344867	rs981073	A	G	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=2;PP=496;SC=TAGTGTGCTCACCTCCTTGAA;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=102344875;WS=102344857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr13	102366825	rs2281991	A	G	3204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=24;PP=2540;SC=GTTCTGCTGAAGAGTGGTATA;SOR=2.117;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=68;TCR=24;TR=92;WE=102366833;WS=102366815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr13	102368056	rs1436266	G	T	2104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=58;PP=1691;SC=CATTAGAACAGATAAATGCGA;SOR=3.816;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=8;TCR=59;TR=66;WE=102368064;WS=102368046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr13	103257064	rs35697719	CAT	C	804.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=890;SC=TATACACACACATATATATGT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=19;WE=103257073;WS=103257059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	103271206	rs4576935	G	A	3065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=67;PP=2380;ReadPosRankSum=0.690;SC=GGTAAACTTCGTGTATTTTAT;SOR=0.854;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=29;TCR=68;TR=96;WE=103271214;WS=103271196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
chr13	103275386	rs2230854	T	C	3964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=94;PP=2965;ReadPosRankSum=0.294;SC=TTGTGACCAGTGGAGGTATCC;SOR=0.714;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=144;TCF=47;TCR=97;TR=140;WE=103275394;WS=103275376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,144:0.97:148
chr13	103275495	rs17507043	C	T	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=38;PP=1143;SC=AGCTAGAGATCGTAGCTAAAG;SOR=5.235;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=40;WE=103275503;WS=103275485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr13	103282279	rs660832	A	C	2048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=0;PP=1787;ReadPosRankSum=-0.599;SC=AGTAAAATGTATGGTACATAG;SOR=6.837;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=61;TCR=0;TR=60;WE=103282287;WS=103282269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr13	103282299	rs660811	C	G	2233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=2;PP=1857;ReadPosRankSum=-0.904;SC=GTAGACTTTCCTTGTTTCCTT;SOR=5.186;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=81;TCF=79;TCR=2;TR=80;WE=103282307;WS=103282289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,81:0.99:82
chr13	103289338	rs2274463	C	T	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=486;SC=CCAACCAAACCAAGTCGCTAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=103289346;WS=103289328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	103290535	rs613926	G	C	3733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=32;PP=2964;ReadPosRankSum=1.138;SC=ACCTTCCCCCGCTCTTTTAAA;SOR=0.586;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=124;TCF=92;TCR=32;TR=122;WE=103290543;WS=103290525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,123:0.98:125
chr13	103290574	rs614290	G	A	5059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.636;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=68;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.722;SC=GACACTTACCGATTCTTTTTT;SOR=0.695;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=162;TCF=93;TCR=69;TR=161;WE=103290582;WS=103290564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,163:0.99:164
chr13	103292810	rs634293	G	A	2377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=62;PP=1995;SC=TTTATCTGTAGCATGTATTTC;SOR=3.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=11;TCR=62;TR=73;WE=103292818;WS=103292800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr13	103295485	rs3831118	A	AT	1047.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=0;PP=1273;SC=CATGGGAATTATCCCTAAGTG;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=103295493;WS=103295475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	103295551	rs144831383	CTTCT	C	3860.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=9;PP=2979;SC=TAAAGCTTTGCTTCTTTCTTT;SOR=3.962;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=81;TCF=63;TCR=18;TR=70;WE=103295562;WS=103295541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr13	103296819	rs35462812	C	CAT	706.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=641;SC=AGTTTGAAAACAGAATTGCTC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=14;WE=103296827;WS=103296809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	103297435	rs10713633	CT	C	2327.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.218;NF=5;NR=92;PP=1609;ReadPosRankSum=-0.304;SC=AAAAAAGGGCCTTTTTTTTTT;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=132;TCF=7;TCR=125;TR=97;WE=103297444;WS=103297425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr13	103301130	.	T	G	214	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.9998;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=8;NR=0;PP=214;QD=31.0964015684;SC=GATAGTTAGTTCCTTGCACTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=103301138;WS=103301129;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,8:0.89:9
chr13	103301537	rs664660	G	T	1787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=39;PP=1412;SC=ACTGCCCATCGTATACACTGT;SOR=1.961;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=54;WE=103301545;WS=103301527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr13	103301619	rs3215841	G	GT	1009.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=18;PP=1179;SC=TTTGGCTGAAGTATTTCTTCC;SOR=1.382;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=26;WE=103301627;WS=103301609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr13	103307218	rs673424	C	T	430.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.7427;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=351;ReadPosRankSum=0.802;SC=TCAGATTTTGCGCTTACCTTG;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=15;WE=103307226;WS=103307208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,15:0.88:17
chr13	103307322	rs677248	A	G	1807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.694;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=17;PP=1424;ReadPosRankSum=-0.738;SC=AGCCCAAGCAATAGACCTGTT;SOR=1.447;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=53;TCF=35;TCR=18;TR=52;WE=103307330;WS=103307312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr13	103307360	rs677179	G	A	1643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=25;PP=1224;ReadPosRankSum=-0.544;SC=TGTTTCACGTGAGGCCTTTGT;SOR=0.435;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=56;TCF=30;TCR=26;TR=53;WE=103307368;WS=103307350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,57:0.95:60
chr13	103307483	rs672129	G	A	1961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=47;PP=1519;ReadPosRankSum=0.225;SC=ATGAGTCAGTGTGGAGATAGG;SOR=1.075;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=64;TCF=16;TCR=48;TR=63;WE=103307491;WS=103307473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr13	103315948	rs9585959	G	C	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=363;SC=AAGACAAATAGTCTTTTTAAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=103315956;WS=103315938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	103316113	rs7334625	G	A	1664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=36;PP=1291;SC=TGTTCATTCTGATATATCTTA;SOR=1.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=53;WE=103316121;WS=103316103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr13	103328579	rs665479	G	T	222.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=214;SC=TTAATTTTATGGTTAAAGCTA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=103328587;WS=103328569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	103328619	rs584710	C	A	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=4;PP=726;SC=ATTTTATAAACAAGCTTTATC;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=103328627;WS=103328609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr13	103330718	rs3806	G	A	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=29;PP=833;SC=TAGTGAATGGGTATAAAAACA;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=103330726;WS=103330708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	103339365	rs660207	A	G	8886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=180;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.771;SC=TGGAAATTCAATTCCTCGGCA;SOR=0.737;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=268;TCF=181;TCR=87;TR=267;WE=103339373;WS=103339355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,279:1.00:280
chr13	103346806	rs2390760	C	G	1554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=39;PP=1238;SC=AGTCCTTCCCCCCGGCGCCCA;SOR=2.655;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=45;WE=103346814;WS=103346796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr13	103384824	rs9300756	G	A	1788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=1550;ReadPosRankSum=1.105;SC=TGATCTTTACGTTTGGGAGAA;SOR=0.997;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=35;TCR=26;TR=59;WE=103384832;WS=103384814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,58:0.97:60
chr13	103385015	rs6491707	A	G	5178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=82;NR=65;PP=2965;SC=CTTTAGAGATAGAAGATGCGG;SOR=0.920;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=82;TCR=65;TR=147;WE=103385023;WS=103385005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr13	103385299	rs7335290	A	C	3390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=59;NR=48;PP=2955;SC=ACTTCGGAAGAAATTCCAGAA;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=59;TCR=48;TR=107;WE=103385307;WS=103385289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr13	103385798	rs7983175	T	C	4014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=67;PP=2965;SC=TCCTTTTGAATTTGCAGGGGT;SOR=0.928;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=119;TCF=52;TCR=67;TR=119;WE=103385806;WS=103385788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr13	103386116	rs7982465	C	G	6094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=122;PP=2965;SC=TTCTTCTGACCTGACTCGTGA;SOR=1.295;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=198;TCF=76;TCR=122;TR=197;WE=103386124;WS=103386106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr13	103386283	rs7982670	A	G	4837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=73;PP=2965;SC=TTGAGGGTACATGGAGAGTTC;SOR=0.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=85;TCR=73;TR=158;WE=103386291;WS=103386273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr13	103388220	rs9300758	A	G	3745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=61;PP=2912;SC=AATGAAGCAGATTTCCTCGGA;SOR=0.836;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=53;TCR=61;TR=114;WE=103388228;WS=103388210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr13	103388370	rs9518825	C	T	2546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=41;PP=2066;SC=AGTATTCTACCTTCCCTGCCT;SOR=0.855;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=36;TCR=41;TR=77;WE=103388378;WS=103388360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr13	103395819	rs1375720	C	T	2040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=42;PP=1676;SC=GTAAACTGCCCACTGATTTTA;SOR=1.926;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=60;WE=103395827;WS=103395809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr13	103397937	rs9300759	T	G	8405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=107;NR=142;PP=2965;SC=CATTTGGGATTCACTAAAGTT;SOR=1.001;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=250;TCF=107;TCR=143;TR=249;WE=103397945;WS=103397927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr13	103418728	rs8054	A	G	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=808;SC=CTGTATGTGTACTCAAGATAA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=103418736;WS=103418718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr13	103420671	rs5806323	T	TA	967.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=465;SC=TCTAGAAAAATAAAAAAATCA;SOR=1.931;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=15;WE=103420688;WS=103420661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	103420680	rs1470654	C	A	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=14;PP=419;SC=ATAAAAAAATCATCAGTTCTT;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=19;WE=103420688;WS=103420661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	103445609	rs11441956	G	GT	929.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=1;PP=1087;SC=CCCTGATAGTGTATAATTTGT;SOR=5.136;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=24;WE=103445617;WS=103445599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr13	103449034	rs12865875	A	T	30.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=16;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=30;ReadPosRankSum=0.967;SC=TTCTTTCAGTAAAAAAAAAAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=2;WE=103449042;WS=103449024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr13	103449202	rs1047740	T	C	1455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=10;PP=1190;SC=TGGAATTTAATTTCCACCTTC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=45;WE=103449210;WS=103449192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr13	103473497	rs9557936	T	G	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=13;PP=399;SC=GTATGTCAATTTATCAGTACC;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=103473505;WS=103473487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	103474031	rs2148449	C	T	2829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=83;NR=4;PP=2397;SC=AACATTGAGACAGGCTGTATT;SOR=5.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=87;TCF=83;TCR=4;TR=87;WE=103474039;WS=103474021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr13	103484060	rs2181676	G	A	2293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=61;PP=1970;SC=AAGCATTGACGTGTTTTAGAA;SOR=3.321;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=10;TCR=61;TR=71;WE=103484068;WS=103484050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr13	103484124	rs2146992	A	G	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=24;PP=751;SC=TCACGCCTGTAATCCTAGCAC;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=103484132;WS=103484114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	103491172	rs2281886	G	A	1903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=51;PP=1543;SC=TAGGTTGCAAGTAACAGAAAC;SOR=4.443;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=5;TCR=51;TR=56;WE=103491180;WS=103491162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr13	103491223	rs7337774	C	G	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=21;PP=640;SC=TAAGGACACACGGCTGTCTTT;SOR=4.091;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=103491231;WS=103491213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	103504331	rs41548912	T	C	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=737;ReadPosRankSum=-0.654;SC=CCATGAGAGCTAAATGTTTTT;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=27;WE=103504339;WS=103504321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr13	103506509	rs1535729	A	C	1373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=0;PP=1055;SC=AGCCCCGCCAAGGTTCCTTCC;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=38;WE=103506517;WS=103506499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr13	103511428	rs3918332	G	A	1901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=50;PP=1564;SC=GCTAGCAAATGTGTCTCCTGA;SOR=3.538;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=7;TCR=50;TR=57;WE=103511436;WS=103511418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr13	103514091	rs7982448	T	C	2240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.47;SOR=3.511;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr13	103518769	rs6491716	T	C	1819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=44;PP=1471;SC=TACCACCTTCTTCAGACCCCT;SOR=3.342;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=8;TCR=44;TR=52;WE=103518777;WS=103518759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr13	103527849	rs9514066	G	C	6562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=119;PP=2965;SC=TAAGGCAAAAGGAAAAACCCA;SOR=0.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=219;TCF=100;TCR=119;TR=219;WE=103527857;WS=103527839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr13	103527930	rs9514067	G	C	7232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=134;PP=2965;SC=AGATTCTAAAGGAAAGAATAC;SOR=1.007;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=238;TCF=104;TCR=134;TR=238;WE=103527938;WS=103527920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr13	103528002	rs17655	G	C	6441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=111;PP=2965;SC=TTCAAGTGAAGATGCTGAAAG;SOR=1.087;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=190;TCF=78;TCR=112;TR=188;WE=103528010;WS=103527992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr13	103698363	rs2301157	A	G	1708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=0;PP=1379;SC=ATGAATTCCAATGAAATTCCA;SOR=7.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=45;WE=103698371;WS=103698353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr13	103698630	rs279940	C	T	3678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=103;PP=2965;SC=AATACACAGACAGTTAAGTAA;SOR=5.820;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=4;TCR=103;TR=107;WE=103698638;WS=103698620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr13	103701672	rs71640248	A	G	4714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=86;NR=53;PP=2965;SC=GCGAGCTGGAAAATGCTGTAG;SOR=1.267;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=86;TCR=53;TR=139;WE=103701680;WS=103701662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr13	103703579	rs8000956	T	C	3087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.97;MQRankSum=-0.073;NF=76;NR=20;PP=2603;ReadPosRankSum=0.291;SC=AGATTAAAATTCCCAATGTGA;SOR=0.973;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=98;TCF=78;TCR=20;TR=96;WE=103703587;WS=103703569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,95:0.98:97
chr13	103705044	rs188096	A	C	6617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=85;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.803;SC=ACAACGAGAGAAACCAGAGAT;SOR=0.356;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=201;TCF=116;TCR=85;TR=200;WE=103705052;WS=103705034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,208:1.00:209
chr13	107145463	rs7995379	G	C	6167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=137;NR=54;PP=2965;SC=GCCCGTAGTCGCCGCTGACCT;SOR=1.933;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=137;TCR=54;TR=191;WE=107145471;WS=107145453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr13	107165255	rs9520090	C	G	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=404;SC=TAATCCCAAACTACACATTTT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=107165263;WS=107165245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	108955464	rs1224145	C	G	285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.98;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	108959080	rs11381410	A	AT	748.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.222;NF=30;NR=0;PP=589;ReadPosRankSum=-0.117;SC=CTATGTTAACATTTTTTTTTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=30;WE=108959088;WS=108959070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr13	108959113	rs61972017	A	C	2060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=1;PP=1708;SC=AGTTTTATTTAAGATTCTTTT;SOR=6.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=60;TCF=59;TCR=1;TR=59;WE=108959121;WS=108959103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr13	109282302	rs9284241	T	G	1411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=39;PP=1095;SC=ATTAAGGCAGTTCTCCTGGTA;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=39;WE=109282310;WS=109282292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr13	109311651	rs9587650	A	G	1605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=0;PP=1380;SC=ATCATATTATATACATATATA;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=45;WE=109311659;WS=109311641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr13	109472601	rs2146327	G	C	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=503;SC=CCGGCTGTTAGTTGGACAGCA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=109472609;WS=109472591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	109472849	rs9521065	A	G	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=26;PP=889;SC=CACAGCTACAAAGTGAGAGCT;SOR=2.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=35;WE=109472857;WS=109472839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr13	109472886	rs7994148	A	G	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=19;PP=534;SC=CTGTGTAACAACCAGCCCAGT;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=109472894;WS=109472876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr13	109496601	rs7989143	C	T	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=0;PP=692;SC=ATAAAACCACCGTCATAGTCC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=24;WE=109496609;WS=109496591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	109496813	rs16973313	T	C	3262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.254;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=61;PP=2377;ReadPosRankSum=1.172;SC=GAAAACCCCATGATGAGCGGT;SOR=0.615;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=53;TCR=62;TR=112;WE=109496821;WS=109496803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,116:0.97:119
chr13	109507638	rs200109535	T	TC	215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQRankSum=1.465;QD=30.82;ReadPosRankSum=0.792;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr13	109508011	rs423376	A	C	1197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=43;PP=1014;ReadPosRankSum=1.106;SC=AGCTTCTGGTAGTGGTGATAG;SOR=6.229;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=43;WE=109508019;WS=109508001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr13	109518578	rs9559428	T	C	1367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=24;PP=1062;SC=AGCTTCCAATTTATTCTTCCA;SOR=0.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=41;WE=109518586;WS=109518568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr13	109518676	rs112184150	C	CAGTA	570.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=192;SC=CTAAAAAAAACAGGCAAACTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=109518684;WS=109518666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr13	109535317	rs196141	A	G	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=543;SC=TCACTTCTGTATCTTGGACAG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=109535325;WS=109535314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr13	109538659	rs148087685	TA	T	1596.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=4;PP=1596;SC=TTTTTAAAGTTAATGATTCCC;SOR=4.223;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=40;WE=109538667;WS=109538649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr13	109538698	rs196136	C	T	1950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=20;PP=1441;SC=TGAAAAAATACCTCTTCATTC;SOR=1.539;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=44;TCR=20;TR=64;WE=109538706;WS=109538688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr13	109661359	rs3825491	C	G	4452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=79;PP=2965;SC=AGCATATTCTCCTGGTAACCA;SOR=1.154;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=54;TCR=79;TR=133;WE=109661367;WS=109661349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr13	109680620	rs10574005	GTATAA	G	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.75;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	109793474	rs28705148	T	C	4903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=111;NR=44;PP=2965;SC=CGCCCAAGGTTCACCCAAAGC;SOR=1.959;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=111;TCR=44;TR=155;WE=109793482;WS=109793464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr13	109793720	rs7986595	A	C	4763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=71;PP=2965;SC=TCAGGGAAGCAGAAGGTAAGC;SOR=0.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=84;TCR=71;TR=155;WE=109793728;WS=109793710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr13	110408608	rs1865434	C	T	2061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=29;PP=1653;SC=TTTAATGATACTCTCTGACAT;SOR=1.033;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=36;TCR=29;TR=65;WE=110408616;WS=110408598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr13	110435914	rs12853546	G	A	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.288;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=1183;ReadPosRankSum=1.606;SC=TGCGCCCCACGGGGGAGCTCA;SOR=1.184;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=30;TCR=19;TR=48;WE=110435922;WS=110435904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr13	110807474	rs615742	T	C	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=1;PP=1062;SC=GGCCAGGCTTTGAGGCATGCT;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=38;WE=110807482;WS=110807464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr13	110807496	rs616089	T	C	1983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=7;PP=1542;SC=TGGAAGGGGATGGTTGGAGGA;SOR=3.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=54;TCR=7;TR=61;WE=110807504;WS=110807486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr13	110813523	rs2275842	C	T	985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.81;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	110813532	rs2275843	G	A	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.37;SOR=6.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	110817171	rs1816884	G	C	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=533;ReadPosRankSum=-0.975;SC=GCCCCTCTGGGCTCCCCATAC;SOR=3.528;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=22;WE=110817179;WS=110817161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr13	110818757	rs142048694	TATAG	T	1402.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=27;PP=1385;SC=TACACAAATGTATAGATAAAT;SOR=5.610;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=28;WE=110818768;WS=110818747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr13	110819457	rs652572	A	G	1365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=12.175;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=41.39;ReadPosRankSum=1.315;SOR=5.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chr13	110819460	rs1778817	G	A	1435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=12.430;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=41.02;ReadPosRankSum=1.085;SOR=5.667;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr13	110819586	rs589985	G	A	3667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=39;PP=2899;SC=CCCTAGACACGCAAAGAGGAG;SOR=1.590;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=78;TCR=39;TR=117;WE=110819594;WS=110819576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr13	110821844	rs3832901	A	AAC	488.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.530;NF=20;NR=0;PP=830;ReadPosRankSum=-1.005;SC=GTGGGAGTGTAACACACACAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=20;WE=110821852;WS=110821834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,19:0.86:22
chr13	110839550	rs536174	T	G	2129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=41;PP=1606;SC=GCTCTCCCTGTCATGCCGGGC;SOR=1.542;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=64;TCF=22;TCR=42;TR=63;WE=110839558;WS=110839540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr13	110843985	rs1373744	T	C	1466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=19;PP=1221;SC=ATTTATGGATTTGAAAAAGCA;SOR=0.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=25;TCR=19;TR=44;WE=110843993;WS=110843975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr13	110844721	rs2241967	C	T	2084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=50;PP=1593;SC=GCATAAAAATCTGTATAGGAA;SOR=3.091;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=10;TCR=50;TR=60;WE=110844729;WS=110844711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr13	110845314	rs685884	G	A	1751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=32;PP=1298;SC=AGAAGTCTCCGCAGTGCACTG;SOR=1.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=49;WE=110845322;WS=110845304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr13	110847227	rs505050	G	T	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=504;SC=ATTCTAGGAAGAGATTGTGAA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=110847235;WS=110847218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	110850770	rs683309	T	C	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=0;PP=631;SC=GGCACCCTGGTGTCTGCTTGC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=110850778;WS=110850760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr13	110851014	rs496916	G	C	3360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=61;PP=2442;SC=AGTAACCTCAGGGCCACTTAG;SOR=0.960;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=49;TCR=61;TR=110;WE=110851022;WS=110851004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr13	110856085	rs648263	A	G	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=658;SC=TCTCTCTTTAATATCTCTCAT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=110856093;WS=110856075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr13	110857823	rs482757	C	T	5308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.612;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=89;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.822;SC=CTTGTAAAAACCACAGAGAAA;SOR=0.677;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=161;TCF=72;TCR=89;TR=159;WE=110857831;WS=110857813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,169:0.99:170
chr13	110857895	rs677877	A	G	4086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=99;PP=2965;ReadPosRankSum=0.551;SC=CCTGTAGAATAAAGATGTAAA;SOR=1.641;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=124;TCF=23;TCR=101;TR=122;WE=110857903;WS=110857885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,125:0.99:126
chr13	110859690	rs598819	A	G	2556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=12;PP=1967;SC=TTTTCTCTTTATCTTTTGGAA;SOR=3.316;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=63;TCR=12;TR=74;WE=110859698;WS=110859680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr13	110859743	rs598893	C	T	4326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=42;PP=2965;ReadPosRankSum=1.188;SC=ATGAAGCCCACTCATACCTTT;SOR=0.738;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=129;TCF=87;TCR=42;TR=128;WE=110859751;WS=110859733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,137:0.99:138
chr13	110861785	rs645114	C	G	3352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=44;PP=2535;SC=CTGGGAGAGACAGCATTTTAA;SOR=0.813;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=53;TCR=44;TR=97;WE=110861793;WS=110861775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr13	110864225	rs532625	A	T	3750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=57;NR=52;PP=2828;SC=CGGGATTTCCAGCGAAACCAG;SOR=0.874;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=57;TCR=52;TR=109;WE=110864233;WS=110864215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr13	110864396	rs626444	T	C	1295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=27;PP=883;SC=AAACAGTTTGTCACAAGCTGT;SOR=1.954;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=38;WE=110864404;WS=110864386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr13	110864975	.	C	T	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=28;PP=877;SC=CCTGTGAGGGCGGAAGTAAAA;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=32;WE=110864983;WS=110864965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr13	110895092	rs41275104	A	G	4135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=50;NR=73;PP=2965;SC=CTGGAAGGAAAAGAAAACTTC;SOR=1.125;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=50;TCR=73;TR=123;WE=110895100;WS=110895082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr13	110895150	rs41275106	A	G	3533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=80;PP=2965;SC=GCAAATGGAGATGGTTCTGGC;SOR=1.981;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=112;TCF=31;TCR=81;TR=111;WE=110895171;WS=110895140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr13	110895163	.	C	G	3012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=71;PP=2641;SC=GTTCTGGCATCTTGACTTGTT;SOR=2.044;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=26;TCR=71;TR=97;WE=110895171;WS=110895140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr13	110959464	rs113651836	C	A	201.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=5;PP=158;SC=ACTTCCAGCGCTACGCACCGT;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=110959472;WS=110959454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	111077197	rs4238272	G	A	3789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=60;PP=2965;SC=CCGGAGTAACGGGACCCAAGG;SOR=0.727;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=56;TCR=60;TR=116;WE=111077205;WS=111077187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr13	111077400	rs58151684	AT	A	1132.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=33;PP=1283;SC=TAGGCAATACATTTTGTGACT;SOR=4.351;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=34;WE=111077408;WS=111077390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr13	111077450	rs7326522	G	A	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=454;SC=TTTTGTTTATGACATAAAACA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=111077458;WS=111077440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	111088870	rs4771679	G	T	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=302;SC=CTCCCAGAATGTTTTCAACTC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=111088878;WS=111088860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	111091157	rs9521759	C	A	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.62;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	111098017	rs4771680	T	C	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=508;SC=TAAAAAGACATTTTTGAGACC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=111098025;WS=111098007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	111098338	rs7988186	A	T	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=245;SC=CCTAAAAAGTACAAGATCCCC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=111098346;WS=111098328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	111118580	rs1927352	G	A	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=28;PP=859;SC=TTGCATGAATGACAACCTGGT;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=111118588;WS=111118570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	111130226	rs9559818	G	A	911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=4;PP=690;SC=GTGTTTTCCTGATTCTCTAGA;SOR=3.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=111130234;WS=111130216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	111130519	rs2281974	C	T	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=471;SC=AAGGTAAGACCCCAGCCCTCC;SOR=4.294;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=18;WE=111130527;WS=111130509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	111132820	rs1475438	G	A	1428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=38;PP=1070;ReadPosRankSum=-0.950;SC=TCTGCTGGGCGCCTCTGTGGG;SOR=2.024;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=45;WE=111132828;WS=111132810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr13	111137167	rs1983930	T	C	731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=1;PP=621;SC=CGTGCAGCCCTATGGCTCAGG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=111137175;WS=111137157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	111137891	rs11619327	A	G	122.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.872;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.19;MQRankSum=3.440;QD=9.45;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr13	111143541	rs35120918	G	A	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=384;ReadPosRankSum=-0.188;SC=ACAGGGGCGCGGTGTCTGTTT;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=15;WE=111143549;WS=111143531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr13	111153934	rs378601	G	A	971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=4;PP=775;SC=TCCACCACAGGTGATGGTGTG;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=111153942;WS=111153924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr13	111154058	rs439831	T	A	4098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.04;SOR=0.959;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr13	111154061	rs409858	T	C	4123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.34;SOR=0.852;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr13	111154160	rs2281968	G	A	2113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=45;PP=1691;SC=TCTGTGCTTCGACATCTCTAG;SOR=1.999;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=17;TCR=45;TR=62;WE=111154168;WS=111154150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr13	111155363	rs406174	G	A	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=1;PP=721;SC=CCATGCCACAGACTTGCCAGA;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=111155371;WS=111155353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr13	111155428	rs401316	C	T	1732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=7;PP=1295;SC=GGCCTTGGGGCCCTGTTTAAA;SOR=3.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=53;WE=111155436;WS=111155418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr13	111155711	rs4773198	C	T	3966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=85;PP=2965;SC=GTGTCCCTAACGTCTTGTTTG;SOR=2.000;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=36;TCR=85;TR=121;WE=111155719;WS=111155701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr13	111155773	rs438758	T	C	2596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.22;SOR=3.682;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr13	111155779	rs4773199	G	A	2363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.28;SOR=3.745;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr13	111156021	rs4773200	C	T	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=2;PP=698;SC=AATATTCAAACGGCAGGCGCT;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=111156029;WS=111156013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr13	111156047	rs9284254	C	G	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=1;PP=873;SC=ACGGCTCAGGCCCGTTAGTGT;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=111156055;WS=111156037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr13	111156153	rs9301460	G	A	2666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=40;PP=2097;ReadPosRankSum=-0.665;SC=AGAGTGGAACGACCTTGTGTG;SOR=0.284;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=45;TCR=40;TR=84;WE=111156161;WS=111156143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,86:0.99:87
chr13	111156499	rs4771683	C	T	3721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=58;PP=2965;SC=TTGCAGGTTTCCGTGGGGCTC;SOR=0.745;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=55;TCR=58;TR=112;WE=111156507;WS=111156489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr13	111156773	rs4771684	A	G	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=423;SC=CTACACTCCTATGCCCAGCAG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=111156781;WS=111156763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr13	111158874	rs445348	A	G	3401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=51;PP=2567;SC=CCATGTGCCCAGTGGGCATGA;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=119;TCF=67;TCR=52;TR=117;WE=111158882;WS=111158864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr13	111164614	rs422733	T	C	1374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=22;PP=694;SC=CAAAAATTGGTTTTATTTTTT;SOR=2.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=27;WE=111164637;WS=111164604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr13	111164628	rs3074455	TAA	T	1114.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.78;QD=41.29;SOR=2.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr13	111176393	rs419244	A	G	4643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=89;PP=2965;SC=CCACGATGGCAAAGAGGCAGT;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=61;TCR=89;TR=150;WE=111176401;WS=111176383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr13	111267706	rs371554585	A	AC	1136.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=2;PP=1258;SC=CACAAACCAGACCCTGAACCA;SOR=4.863;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=31;WE=111267714;WS=111267701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr13	111268196	rs330551	G	A	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.21;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr13	111277810	rs330561	C	A	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=29;PP=834;SC=ACAGAGACGGCGGGGTGGAGA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=111277818;WS=111277800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	111290630	rs41275126	T	C	3637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=43;PP=2712;SC=GGTCCTGAGATTGAAACAGGA;SOR=1.285;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=71;TCR=43;TR=114;WE=111290638;WS=111290620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr13	111290880	rs330563	G	A	6481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.017;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=1.681;SC=ACCTGAGCCCGCGCAGACCAG;SOR=0.126;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=206;TCF=108;TCR=98;TR=202;WE=111290888;WS=111290870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,210:0.99:212
chr13	111290967	rs41275128	T	C	5280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=89;PP=2965;ReadPosRankSum=1.786;SC=GCTGAAGGCGTACGGTGCTTG;SOR=0.435;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=66;TCR=91;TR=155;WE=111290975;WS=111290957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,159:0.99:160
chr13	111291044	rs330564	T	C	3858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=81;PP=2965;SC=TATTGCAGCTTTTGGTTAAAC;SOR=1.797;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=36;TCR=81;TR=117;WE=111291052;WS=111291034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr13	111293489	rs144796593	A	ATGC	797.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=10;PP=595;SC=GCTTCAGACTATGCTGCGTGG;SOR=3.500;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=12;WE=111293507;WS=111293479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	111293499	rs61970495	G	A	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=318;SC=ATGCTGCGTGGCCCACCCACC;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=111293507;WS=111293479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr13	111293551	rs330569	A	G	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=59;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=10;PP=507;SC=AACAGGCTGCATTCTGCCGCC;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=19;WE=111293559;WS=111293541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	111293585	rs10709696	TG	T	749.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=4;PP=856;SC=GCTCTTCTGTTGGCTGTGTTG;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=111293593;WS=111293575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	111293640	rs7998306	G	A	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=3;PP=653;SC=GCACAGGCACGTGTGCTGCTG;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=111293648;WS=111293630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr13	111293683	rs2308073	A	AATCG	2055.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=7;PP=1791;SC=TACTTCACTCAATCGACGGTG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=34;WE=111293691;WS=111293673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr13	111293847	rs330570	G	A	2996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=51;PP=2398;SC=GCATGGGTGCGTCTTGTCGTG;SOR=0.947;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=42;TCR=51;TR=93;WE=111293855;WS=111293837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr13	111293915	rs1043886	T	G	2024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=44;PP=1635;SC=TTTTGTCCTTTGATCCAGCAG;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=60;WE=111293923;WS=111293905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr13	111294920	rs11414164	G	GC	5780.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.05;NF=67;NR=83;PP=2969;SC=GATTGTGGATGCCCCCTCCCC;SOR=0.784;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=167;TCF=69;TCR=98;TR=150;WE=111294928;WS=111294910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr13	111295188	rs77749976	G	C	2028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=57;PP=1708;SC=CAGACCTCACGCAATTGTGGC;SOR=5.421;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=60;TCF=3;TCR=57;TR=60;WE=111295196;WS=111295178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr13	111295216	rs79847822	C	T	1493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=41;PP=1214;SC=TCAGGAGCAACCTGAGGATGA;SOR=6.229;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=42;WE=111295224;WS=111295206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr13	111298392	rs436462	A	G	1642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=33;PP=1247;SC=GTGTGTCAAAATCATCTGCCA;SOR=1.480;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=49;WE=111298400;WS=111298382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr13	111315299	rs4622384	T	C	2754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=25;PP=2025;SC=TCCGTGGGTGTGCCTGTTTTC;SOR=1.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=58;TCR=25;TR=83;WE=111315307;WS=111315289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr13	111315405	rs7993933	G	A	2544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=49;PP=1933;SC=AGCCTATTAAGGGCAAACAGC;SOR=1.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=27;TCR=49;TR=76;WE=111315413;WS=111315395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr13	111315489	rs2296659	A	G	1335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=34;PP=1035;SC=CAGCAGATGCACCAAGAGGGA;SOR=4.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=38;WE=111315497;WS=111315479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr13	111315506	rs376834	A	C	1327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=31;PP=1071;SC=GGGAGACAACAATTATAAAAG;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=111315514;WS=111315496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr13	111315595	rs2296657	A	G	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=5;PP=689;SC=GACTGCGGAAACCTGCGGGAG;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=111315603;WS=111315588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr13	111319754	rs4628819	T	C	5806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=82;PP=2965;ReadPosRankSum=1.732;SC=CAATTTCGTTTTCATGATGTG;SOR=0.271;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=93;TCR=83;TR=174;WE=111319762;WS=111319744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,180:0.99:181
chr13	111335319	rs61971611	C	T	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=0;PP=23;SC=GAGGGGTCTGCGCTCCAGATC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=111335327;WS=111335309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr13	111340042	rs78646508	A	C	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.52;QD=25.40;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	111350205	rs34523940	C	T	3128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=14;PP=2529;SC=CAGCCCCATGCGGTGGGAGAC;SOR=3.523;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=84;TCR=14;TR=98;WE=111350213;WS=111350195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr13	111358000	rs9521906	T	G	6607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=106;PP=2965;SC=GATCATATAATTTTTAAAGTA;SOR=0.894;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=193;TCF=87;TCR=106;TR=193;WE=111358008;WS=111357990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr13	111368164	rs7338333	T	G	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=20;PP=1019;SC=GTGTCGCCCCTGCCCCTCTCC;SOR=0.693;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=43;TCF=23;TCR=20;TR=40;WE=111368172;WS=111368154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr13	111566989	rs59070384	A	G	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=203;SC=GGCACGCCCCACGTCCCCCGC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=111566997;WS=111566979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	111567039	rs56924528	G	C	988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=8;PP=663;SC=TGGACAGCCGGGGAAAATGGC;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=111567047;WS=111567029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr13	111893710	rs57317822	G	A	1246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=34;PP=1011;SC=GCTGCGCCCCGAGGTCAGGAA;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=36;WE=111893718;WS=111893700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr13	111933098	rs2296353	C	G	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=462;SC=AGCAAGTGATCAGTTGCTTTA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=111933106;WS=111933088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	111953317	rs145135139	C	T	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=21;PP=618;SC=TTTTTTGAGACGGAGTGTCAC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=111953325;WS=111953307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	111953903	rs3742181	T	C	2731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=73;PP=2337;SC=CATCTTTAAATCTTTTTTTTC;SOR=5.473;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=4;TCR=73;TR=77;WE=111953911;WS=111953893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr13	111955465	rs1555751	T	C	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=35;PP=891;SC=CTATAAGGGATGTCCTCAGTT;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=37;WE=111955473;WS=111955455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr13	111968680	rs7991693	C	T	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=37;PP=1034;SC=GGCATGCACACGCCTCCCGCC;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=40;WE=111968688;WS=111968670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr13	112297403	rs8000950	C	T	906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=5;PP=800;SC=TCGTCCCCTACTGGGGCCAGC;SOR=3.334;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=31;WE=112297411;WS=112297393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr13	113032915	rs7324712	A	G	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=2;PP=547;SC=CAGACTTCACATGTGGTACCT;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=113032923;WS=113032905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr13	113032962	rs9550063	G	C	1485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=12;PP=1173;SC=CGAAGGTCTCGAGGTTCCCAA;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=46;WE=113032970;WS=113032952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr13	113052388	rs2296895	A	G	8168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=172;NR=85;PP=2965;SC=AGGAGATTTTAGATCTGAATA;SOR=1.529;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=257;TCF=172;TCR=85;TR=257;WE=113052396;WS=113052378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr13	113052562	rs2296894	T	C	3142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.71;MQRankSum=-4.435;QD=34.16;ReadPosRankSum=-1.258;SOR=6.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,90:0.98:92
chr13	113053470	rs10816	T	A	1872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=16;PP=1421;SC=GGCATTGAGGTCAAAATTTCC;SOR=2.041;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=42;TCR=16;TR=58;WE=113053478;WS=113053460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr13	113055295	rs3742225	A	G	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=1;PP=474;SC=ATCTCAACTTAGCATGTTTAA;SOR=4.294;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=113055303;WS=113055285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr13	113153114	rs9549532	T	C	1961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=0;PP=1668;ReadPosRankSum=-0.944;SC=GGGCAGGAGATTTGTAATTCT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=62;TCR=0;TR=61;WE=113153122;WS=113153104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,61:0.98:62
chr13	113478654	rs7323586	G	C	3639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=87;NR=23;PP=2965;SC=CTTCCTCTCTGTAGGTGTGGC;SOR=2.573;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=87;TCR=23;TR=110;WE=113478662;WS=113478644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr13	113479813	rs9549564	G	A	2652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.49;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr13	113479820	rs368865	A	G	2593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.03;SOR=1.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr13	113508839	rs9549573	G	C	1379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=40;PP=1281;SC=GAGACAACCTGTCCGGGTAGG;SOR=5.186;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=42;WE=113508847;WS=113508829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr13	113512004	rs7325522	C	G	264.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=221;SC=TCGTAAATTACCTCTAAGTAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=113512012;WS=113511994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr13	113525952	rs1765767	A	G	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=0;PP=680;SC=GTGTTGGCACACAAGAAAAAT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=30;WE=113525960;WS=113525942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr13	113536132	rs1290177	T	C	3689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=54;PP=2558;SC=CTCAGCAGAATGGGTGCGCAC;SOR=0.824;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=68;TCR=54;TR=122;WE=113536140;WS=113536122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr13	113563351	rs2993328	A	G	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=2;PP=638;SC=GCTTATGTTTATCCATGCTGC;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=113563359;WS=113563341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr13	113639869	rs3011543	A	G	2272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.46;SOR=6.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr13	113639872	rs3011542	A	G	2239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.92;SOR=6.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr13	113656216	rs7986677	C	T	1526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=28;PP=1195;SC=CTGACTCGCACTGGGCAGCAT;SOR=1.007;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=48;WE=113656224;WS=113656206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr13	113699488	rs3814266	T	C	6278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=130;NR=71;PP=2965;SC=ATCATGAATATGGGGGATCGC;SOR=1.433;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=130;TCR=71;TR=201;WE=113699496;WS=113699478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr13	113735390	rs494129	T	C	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=3;PP=864;SC=GCGTCCAGCCTGTGGGCTTTG;SOR=4.174;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=113735398;WS=113735380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr13	113738175	rs491455	G	A	1297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=2;PP=1095;SC=GCGTGGCTGCGGCGTCTCCAA;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=38;WE=113738183;WS=113738165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr13	113739518	rs546818	G	A	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=29;PP=907;SC=ACCGTGGCCCGGCCTCCCCAG;SOR=5.486;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=113739526;WS=113739508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr13	113740706	rs1745949	A	G	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=31;PP=921;SC=GTCCCTAGATAAGCCCACTCC;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=33;WE=113740714;WS=113740696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr13	113741851	rs514181	C	A	1855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=29;PP=1554;SC=TCTGAGGTGGCCACGCTGACA;SOR=0.841;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=26;TCR=29;TR=55;WE=113741859;WS=113741841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr13	113742805	rs7986589	C	G	4296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=48;PP=2965;SC=CACAGTCCCCCCATGCGCAAG;SOR=1.547;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=96;TCR=49;TR=144;WE=113742813;WS=113742795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr13	113743768	.	T	C	392	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=56.07;NF=15;NR=0;PP=392;QD=28.4514141698;SC=TCTCATCCAGTCCGTCCGGGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=15;WE=113743776;WS=113743758;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr13	113744139	rs4907483	G	A	4331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=61;PP=2965;SC=TTCCTGCAGTGTGAAGAAGCT;SOR=0.904;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=75;TCR=62;TR=135;WE=113744147;WS=113744129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr13	113745611	rs4907485	T	G	1904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=53;PP=1577;SC=GGGGATGCTCTCGTGGGTCTT;SOR=5.283;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=56;TCF=3;TCR=53;TR=56;WE=113745619;WS=113745601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr13	113748690	rs7327099	C	T	1512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=2;PP=1289;SC=TTTATGAACCCGGGAAGATGA;SOR=5.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=44;WE=113748698;WS=113748680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr13	113749475	rs2146752	G	A	3730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.284;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=100;PP=2965;ReadPosRankSum=1.297;SC=CATTGTTAATGTCAGAAGCAA;SOR=3.912;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=115;TCF=14;TCR=101;TR=113;WE=113749483;WS=113749465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,118:0.98:120
chr13	113750586	rs12855893	G	A	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=3;PP=319;SC=AGCTCCCACCGGGGCAGGGCG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=113750594;WS=113750576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr13	113801737	rs5960	C	T	2396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=20;PP=1921;SC=GTGGTGGAACCATTCTGAGCG;SOR=2.030;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=52;TCR=20;TR=72;WE=113801745;WS=113801727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr13	113801843	rs2031184	A	G	2226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=53;PP=1808;SC=GGCCGTGGTGAGGGGCACCGT;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=17;TCR=53;TR=70;WE=113801851;WS=113801833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr13	113812962	rs2273971	G	A	1571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=39;NR=13;PP=1154;SC=CTGTCCCAGCGCTCCGGGTGG;SOR=2.259;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=52;WE=113812970;WS=113812952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr13	113818708	rs3024731	A	T	1809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=3;PP=1502;SC=ACACACCAGAACTCTTGTGTG;SOR=5.211;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=52;TCR=3;TR=55;WE=113818716;WS=113818698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr13	113818817	rs150762485	T	TC	3850.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.987;HP=11;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.393;NF=38;NR=63;PP=1110;ReadPosRankSum=2.231;SC=TTTTTTTTTTTCCTTTTCAGC;SOR=0.084;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=116;TCF=50;TCR=66;TR=101;WE=113818827;WS=113818795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,122:0.97:126
chr13	113818900	rs564081	A	G	2578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=55;PP=1981;SC=AATCCTACACATGCAGCTGTG;SOR=1.666;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=24;TCR=55;TR=79;WE=113818908;WS=113818890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr13	113833499	rs486407	G	A	614.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=490;ReadPosRankSum=-0.372;SC=GTGTTCTAAAGGAGTAAAAAA;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=18;WE=113833507;WS=113833489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr13	113852425	rs546686	C	T	2931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=14;PP=2330;SC=GCTTCAAGCACAAGATAATGC;SOR=3.185;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=74;TCR=14;TR=88;WE=113852433;WS=113852415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr13	113854600	rs3751412	T	C	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=0;PP=951;SC=TGAAATTACATAAATCATAAA;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=113854608;WS=113854590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr13	113854715	rs3751413	C	T	4861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=45;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.742;SC=TCTGCAGACACCTGTGTGCAC;SOR=0.888;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=148;TCF=103;TCR=45;TR=147;WE=113854723;WS=113854705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,154:0.99:155
chr13	113862801	rs9549692	G	A	1717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=44;NR=8;PP=1390;SC=CCGAACGGAAGAAGGGTGGCG;SOR=3.383;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=52;WE=113862809;WS=113862791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr13	113888201	rs2146408	T	C	4222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=68;PP=2965;SC=TAACTCTGCTTGTTTCTTAGG;SOR=0.722;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=69;TCR=68;TR=136;WE=113888209;WS=113888191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr13	113889474	rs2287250	C	T	5971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.033;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=92;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.154;SC=GTACCGTTTGCTCGCTGAGCG;SOR=0.105;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=92;TCR=95;TR=184;WE=113889482;WS=113889464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,190:0.99:192
chr13	113891075	rs2287253	G	A	1734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=1314;ReadPosRankSum=-0.789;SC=CCCATCTTTTGCAGAGAACCA;SOR=0.250;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=32;TCR=27;TR=58;WE=113891083;WS=113891065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr13	113899004	rs3932499	C	A	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=17;PP=545;SC=AAATACAAAACATTAGCCAGG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=113899012;WS=113898994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	113900197	rs2302756	G	A	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=258;SC=AAAATTACACGGTTTATTTTG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=113900205;WS=113900187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr13	113917767	rs4907602	T	C	2451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=2;PP=2041;SC=TTTAATGCCATTGTAATTAGG;SOR=6.413;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=72;TCF=70;TCR=2;TR=72;WE=113917775;WS=113917757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr13	113965176	rs9577503	C	A	2945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=18;NR=68;PP=2420;SC=CAGCTTCAGCCGGGGAGGTAG;SOR=2.636;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=18;TCR=69;TR=86;WE=113965184;WS=113965166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr13	113978969	rs912010	G	A	3090.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=68;PP=2555;SC=TGGCAGGCAGGCAGACAGGCC;SOR=1.414;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=36;TCR=68;TR=104;WE=113978977;WS=113978959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr13	113999051	rs4406954	C	A	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=20;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=1;PP=502;SC=AAAAAAAAAACGGTTTGTAAC;SOR=5.549;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=19;WE=113999059;WS=113999041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr13	114201576	rs12876871	T	A	2899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=29;PP=2300;SC=TGGGGGAGGCTGTCCTGCGGT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=59;TCR=29;TR=88;WE=114201584;WS=114201566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr13	114240067	rs113638790	CT	C	89.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=0.000;QD=1.95;ReadPosRankSum=-0.401;SOR=0.129;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,12:0.26:46
chr13	114312354	rs9285616	T	G	1500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=6;PP=1181;SC=GTACCCCACCTGGACAGGGTG;SOR=3.952;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=47;TCR=6;TR=53;WE=114312362;WS=114312344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr13	114438097	.	C	T	2302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.163;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=14;PP=1785;ReadPosRankSum=1.278;SC=AAAGGATATTCAGGACGTGGG;SOR=2.681;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=70;TCF=55;TCR=15;TR=68;WE=114438105;WS=114438087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,73:0.97:75
chr13	114453605	.	C	CTGTGTGCACG	2444.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=26;PP=1413;SC=GTGTGCATGCCTGTGTGTGCA;SOR=3.830;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=5;TCR=55;TR=26;WE=114453613;WS=114453594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr13	114549772	rs11841740	G	A	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=5;PP=837;ReadPosRankSum=-0.891;SC=CAACTCAGCGGAGTTGTGCAC;SOR=1.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=30;WE=114549780;WS=114549762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr13	114550829	rs8191973	G	C	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=531;SC=ATAAAATAAAGAGAGAAACTT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=114550837;WS=114550819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	114619747	.	A	ATGGGATGAGTTACACAG	176.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=647;SC=GAGTTACACAATGGGGTGAGT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=114619755;WS=114619737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr13	114620069	rs7984671	C	T	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=15;PP=399;SC=GGGAGCCTCGCGTTGCCAGTG;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=114620077;WS=114620059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr13	114622597	rs9604529	A	G	2530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=60;PP=2038;SC=GCACCTGGAAACTCCAAAGAG;SOR=2.455;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=16;TCR=60;TR=76;WE=114622605;WS=114622587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr13	114623880	rs7399982	G	A	12088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=186;NR=191;PP=2965;SC=CGTGTATTCAGTGCTGCTTCA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=377;TCF=186;TCR=191;TR=377;WE=114623888;WS=114623870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,388:1.00:388
chr13	114758112	rs3737052	G	C	1749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=42;PP=1378;SC=TTATTTAAACGATGCTTTTAA;SOR=2.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=9;TCR=42;TR=51;WE=114758120;WS=114758102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr13	114772933	.	T	TCC	89	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.54;FR=1.0000;HP=5;HapScore=2;MGOF=32;MMLQ=28;MQ=44.47;NF=3;NR=0;PP=89;QD=41.0;SC=CTTACCCTTCTCCCCTCCTGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=3;WE=114772941;WS=114772923;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr13	114773126	rs9562086	C	T	1700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=40;PP=1432;SC=AGCCACACATCTGACGTGCAC;SOR=2.925;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=9;TCR=41;TR=49;WE=114773134;WS=114773116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr13	114774813	rs6560943	C	T	1611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=9;PP=1300;SC=AAGAGAACTCCGTCTCCTGAG;SOR=2.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=41;TCR=9;TR=50;WE=114774821;WS=114774803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr13	114778593	rs7322518	C	T	1356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=4;PP=1076;SC=CTCAGAAAGCCTCGGTCCCTC;SOR=4.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=39;WE=114778601;WS=114778583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr13	114778859	rs146849472	C	CTCTCCCTCTCTCTG	952.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=2350;SC=GTGTCTGTCTCTCTCCCTCTC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=21;WE=114778867;WS=114778849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr13	114780648	rs2274719	A	C	2565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=26;PP=2036;SC=GCGCTATGGCAGTTTCTCAGC;SOR=1.694;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=58;TCR=26;TR=84;WE=114780656;WS=114780638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr13	114780764	rs2274717	A	G	2930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=56;PP=2300;SC=CCCCAGACTCAGTGATGGCGT;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=39;TCR=56;TR=95;WE=114780772;WS=114780754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr13	114781868	rs2274716	G	A	456.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=383;ReadPosRankSum=-0.721;SC=AAAATGCCACGACAGCTCCCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=15;WE=114781876;WS=114781858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr13	114783444	rs7986543	A	G	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=222;SC=GTGAAAGAAAACCTGAATCAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=114783452;WS=114783434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr13	114787031	rs2274713	T	G	1906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=49;PP=1534;SC=GGGCAGCCCGTGTGGAGCAAA;SOR=3.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=6;TCR=49;TR=55;WE=114787039;WS=114787021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr13	114792842	rs3829340	C	T	5820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=137;NR=51;PP=2965;SC=TTCCACTTAACGTTGACCCAT;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=189;TCF=137;TCR=52;TR=188;WE=114792850;WS=114792832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr13	114795094	.	T	C	51	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=23;MQ=43.63;NF=3;NR=0;PP=51;QD=28.5904041824;SC=ACCTCTAAAATGGCGTCATCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=114795115;WS=114795084;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr13	114795107	.	GT	G	454	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=56.75;NF=11;NR=0;PP=454;QD=44.2727272727;SC=CGTCATCCTGGTGGGCCAGGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=114795115;WS=114795084;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr13	114806741	rs9525346	C	A	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=31;PP=944;SC=TTGGGAGGCCCAGGGGGGAGG;SOR=5.728;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=32;WE=114806749;WS=114806731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr13	114839462	rs41291225	T	C	176.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=137;SC=AAAATGTGGATGTGCACCCCA;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=114839470;WS=114839452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr13	115056935	rs41291209	A	C	267.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=246;SC=TTAGGAGTTAAATACAATATT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=115056943;WS=115056925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	20201972	rs4391979	A	C	4303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=88;PP=2965;SC=ATGAGAATCAACAGAATTAGG;SOR=1.882;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=38;TCR=88;TR=126;WE=20201980;WS=20201962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr14	20202040	rs8011997	T	A	3918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=78;NR=35;PP=2965;SC=TACTTGCTTATTCATAATGCA;SOR=1.870;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=78;TCR=35;TR=113;WE=20202048;WS=20202030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr14	20216298	rs12896533	T	C	6282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=79;NR=107;PP=2965;SC=GAACAAGGTCTTCTCTACCTG;SOR=1.010;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=186;TCF=79;TCR=107;TR=186;WE=20216306;WS=20216288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr14	20248828	rs2635535	C	T	2829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=433;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.563;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.99;MQRankSum=0.671;NF=63;NR=63;PP=2062;ReadPosRankSum=0.277;SC=TTCTTGCTCACAGTGATGGCC;SOR=0.635;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=422;TCF=201;TCR=221;TR=126;WE=20248836;WS=20248818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:298,132:0.31:430
chr14	20249176	rs2815960	G	A	2583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.446;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.251;NF=62;NR=53;PP=2101;ReadPosRankSum=0.778;SC=TCAGGCTCAGGTGAGAATACC;SOR=0.745;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=291;TCF=153;TCR=138;TR=115;WE=20249184;WS=20249166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,110:0.39:279
chr14	20249419	.	A	G	2804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=0.000;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.504;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.162;NF=21;NR=81;PP=2272;ReadPosRankSum=-0.896;SC=TGTGAAGAGAAGTGAAAGATA;SOR=1.396;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=165;TCF=41;TCR=124;TR=102;WE=20249427;WS=20249409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,104:0.62:169
chr14	20249456	rs2815959	G	A	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.000;NF=2;NR=48;PP=1134;ReadPosRankSum=-0.840;SC=GTCCTCCTGAGGATCATTGTC;SOR=0.996;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=100;TCF=5;TCR=95;TR=50;WE=20249464;WS=20249446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,51:0.49:104
chr14	20296541	rs56930122	C	CA	969.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=7.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=-1.131;QD=10.77;ReadPosRankSum=-1.774;SOR=0.203;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,47:0.52:90
chr14	20345346	rs12883767	A	T	2049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=57;PP=1776;SC=AGGTTTCTAAATTTTAATAAG;SOR=4.244;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=5;TCR=57;TR=62;WE=20345354;WS=20345336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr14	20403909	rs2792148	T	C	2307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.580;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=41;PP=1711;ReadPosRankSum=0.263;SC=TTTTCTTTTTTGCCATCTTCT;SOR=0.626;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=83;TCR=72;TR=88;WE=20403917;WS=20403899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,94:0.57:164
chr14	20404091	rs12885778	G	A	1179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.805;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=33;PP=887;ReadPosRankSum=0.351;SC=TTTATTGAGCGCAAGACTATC;SOR=1.483;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=129;TCF=47;TCR=82;TR=47;WE=20404099;WS=20404081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,50:0.38:132
chr14	20404614	rs34608158	C	A	1431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.812;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=1093;ReadPosRankSum=-1.311;SC=GGCCTTTTAGCAGACTTCCTG;SOR=0.402;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=163;TCF=93;TCR=70;TR=59;WE=20404622;WS=20404604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,60:0.36:167
chr14	20404735	rs34394400	C	T	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=1.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.92;ReadPosRankSum=-0.226;SOR=0.834;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,50:0.28:177
chr14	20404736	rs2792146	G	A	3393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.644;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=77;PP=2962;ReadPosRankSum=0.742;SC=CTGAGAAACCGTCATGTGAAC;SOR=0.619;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=168;TCF=59;TCR=109;TR=121;WE=20404744;WS=20404725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,124:0.71:175
chr14	20404767	rs2792145	A	G	2957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.575;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=78;PP=2276;ReadPosRankSum=-0.782;SC=ACTAGGGATCATTACGAAGGA;SOR=0.909;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=150;TCF=45;TCR=105;TR=109;WE=20404775;WS=20404757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,112:0.73:154
chr14	20404874	rs2792144	C	T	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=31;PP=796;ReadPosRankSum=1.564;SC=ACAGAATTGGCTTTTTGTTTT;SOR=0.638;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=33;WE=20404882;WS=20404864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,36:0.82:44
chr14	20444490	rs11158071	C	T	6446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=118;NR=88;PP=2965;SC=TCACTGTGGTCACTTTATTCT;SOR=1.036;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=206;TCF=118;TCR=88;TR=206;WE=20444498;WS=20444480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr14	20470399	rs7493807	G	A	7371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.003;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=153;NR=67;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.877;SC=TTGAAGCAGGGCTATTTGTAC;SOR=1.608;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=221;TCF=153;TCR=68;TR=220;WE=20470407;WS=20470389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,230:1.00:231
chr14	20482471	rs12590785	C	T	2839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=28;PP=2323;SC=CTGCTTTCATCTCCTCATTTC;SOR=1.637;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=56;TCR=28;TR=84;WE=20482479;WS=20482461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr14	20501962	rs2775261	G	C	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=2;PP=227;SC=AAACAAGAGAGTGTCTCTTCA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=20501970;WS=20501952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	20502120	rs17277032	C	T	2808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=17;PP=2277;SC=TTTTATCTACCGAGTATCTGC;SOR=2.476;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=65;TCR=17;TR=82;WE=20502128;WS=20502110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr14	20502921	rs2775236	G	A	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.014;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=33;PP=718;ReadPosRankSum=0.229;SC=TTTCCATATCGTCAACTTTAT;SOR=0.884;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=101;TCF=19;TCR=82;TR=39;WE=20502929;WS=20502911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,39:0.38:103
chr14	20528359	rs1959630	G	T	7986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=171;NR=69;PP=2965;SC=TGACATGTAGGTCAACCCTTC;SOR=1.873;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=240;TCF=171;TCR=69;TR=240;WE=20528367;WS=20528349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr14	20586445	rs141368873	G	A	2546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=49;PP=1991;ReadPosRankSum=-0.093;SC=TTGGCCCTTCGGCAACCACTC;SOR=0.719;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=134;TCF=60;TCR=74;TR=88;WE=20586453;WS=20586435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,95:0.66:143
chr14	20665790	rs4981822	T	A	4011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=45;PP=2965;SC=CCCATGTACATCCTGCTCGCC;SOR=1.241;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=79;TCR=45;TR=124;WE=20665798;WS=20665780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr14	20665840	rs4981088	G	A	4813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=65;PP=2965;SC=CACCTCCACAGTCCCCAGCAT;SOR=0.774;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=76;TCR=65;TR=141;WE=20665848;WS=20665830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr14	20665887	rs4981823	G	C	4659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=73;PP=2965;SC=AGATCATCTCGTTCTCTGGCT;SOR=0.764;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=65;TCR=73;TR=137;WE=20665895;WS=20665877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr14	20666175	rs55781225	C	CA	8637.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.507;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.286;NF=62;NR=161;PP=2975;ReadPosRankSum=0.218;SC=CTCTCACTTGCAAAAAAGGCC;SOR=1.104;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=251;TCF=78;TCR=173;TR=223;WE=20666183;WS=20666165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,287:0.99:290
chr14	20666556	rs2318886	C	T	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.575;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=520;ReadPosRankSum=1.180;SC=AAGGTCCTTGCGTAATTAATC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=23;WE=20666564;WS=20666546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr14	20666623	rs2318887	T	C	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.674;NF=1;NR=6;PP=133;ReadPosRankSum=-0.530;SC=CGCGGTGGCTTACGCCTGTAA;SOR=0.175;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=7;WE=20666631;WS=20666613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr14	20692188	rs12891553	T	C	9743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=125;NR=167;PP=2965;SC=CTCTCTGAGATTAAAACCATC;SOR=1.007;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=292;TCF=125;TCR=167;TR=292;WE=20692196;WS=20692178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,304:1.00:304
chr14	20692291	rs34693535	C	T	6204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=108;PP=2965;SC=ATGATCGGTACCTGGCCATCT;SOR=0.947;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=191;TCF=83;TCR=108;TR=191;WE=20692299;WS=20692281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr14	20692453	rs17211285	G	T	4498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=68;PP=2965;ReadPosRankSum=1.345;SC=TTGACCACTTGGTGTGTGACC;SOR=0.247;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=68;TCR=69;TR=136;WE=20692461;WS=20692443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,138:0.99:139
chr14	20692574	rs17277221	T	C	5336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=79;PP=2965;SC=CTTGGGATCTTACACTCTGGT;SOR=0.718;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=159;TCF=80;TCR=79;TR=158;WE=20692582;WS=20692564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr14	20692643	rs17277228	T	C	3913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.043;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=67;PP=2965;ReadPosRankSum=0.137;SC=TTTCTCCACATGTGGGTCCCA;SOR=0.159;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=129;TCF=62;TCR=67;TR=127;WE=20692651;WS=20692633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,132:0.99:134
chr14	20692999	rs11851950	T	G	179.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=146;SC=GCAGTTAAATTCAGCTCATTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=20693007;WS=20692989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr14	20698068	rs4981844	G	T	5082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.993;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=92;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.805;SC=ACCTTTCTGTGGTCCCAACAT;SOR=0.945;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=150;TCF=58;TCR=92;TR=149;WE=20698076;WS=20698058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,157:0.99:158
chr14	20698239	rs1953558	T	C	5982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=76;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.211;SC=AACTGTGCTTTAGGTTCCTTC;SOR=1.034;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=102;TCR=77;TR=177;WE=20698247;WS=20698229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,181:0.99:183
chr14	20698298	rs1953559	T	G	6709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=135;NR=64;PP=2965;SC=CACACTTGGTTGTTGTGTCTC;SOR=1.682;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=199;TCF=135;TCR=64;TR=199;WE=20698306;WS=20698288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr14	20698504	rs1953560	G	A	5098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=129;PP=2965;SC=CAGAGATCATGAATAGGGTTT;SOR=3.841;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=18;TCR=129;TR=147;WE=20698512;WS=20698494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr14	20757728	rs11628038	G	A	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=0.912;SC=TGGCTGGACCGGCTGTCCAGA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=5;WE=20757736;WS=20757718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr14	20760066	rs1953549	T	A	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.862;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=3;PP=686;ReadPosRankSum=-1.555;SC=ATTATTTCTATATCTTTTATA;SOR=1.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=31;WE=20760074;WS=20760056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,31:0.65:48
chr14	20760349	rs11625081	GC	AA	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=475;ReadPosRankSum=1.624;SC=GGAAAGAAGAGCAGAAACAGT;SOR=0.818;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=11;WE=20760358;WS=20760339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr14	20763446	rs1953551	T	C	4082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=86;NR=47;PP=2965;SC=AAGGGTAAAATGGGGGAAATC;SOR=1.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=86;TCR=47;TR=133;WE=20763454;WS=20763436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr14	20764031	rs4981148	C	T	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.131;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=320;ReadPosRankSum=0.248;SC=AGAAGTGTATCCCAATTATAA;SOR=1.842;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=58;TCF=19;TCR=39;TR=20;WE=20764039;WS=20764021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,21:0.35:60
chr14	20764094	rs4981951	G	C	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=109;ReadPosRankSum=-0.106;SC=TAGGAATCTAGAGAAATAAAC;SOR=0.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=6;WE=20764102;WS=20764084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr14	20764585	rs1953552	A	C	2137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-6.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.595;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=66;PP=1598;ReadPosRankSum=-0.810;SC=GATTGCTAGAAGCTTTTCTGT;SOR=0.523;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=145;TCF=39;TCR=106;TR=92;WE=20764593;WS=20764575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,92:0.64:144
chr14	20767618	rs2318864	G	A	2896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=44;PP=2347;ReadPosRankSum=-0.056;SC=CTGCAAATAGGAAGGGCACAT;SOR=0.665;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=161;TCF=92;TCR=69;TR=103;WE=20767626;WS=20767608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,106:0.63:168
chr14	20767706	rs945459	C	T	1650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.616;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=49;PP=1356;ReadPosRankSum=0.250;SC=TTTTACCTTTCTAAGTTTTTT;SOR=1.220;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=98;TCF=19;TCR=79;TR=58;WE=20767714;WS=20767696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,59:0.59:100
chr14	20769870	rs3825766	G	A	329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.337;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=246;ReadPosRankSum=-0.977;SC=CTGAGAAGTAGTATTACGTTG;SOR=2.694;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=12;WE=20769878;WS=20769860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr14	20770036	rs3742945	T	C	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.752;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;PP=720;ReadPosRankSum=-0.147;SC=CATCTCCTTCTGCACATCCTG;SOR=0.773;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=50;TCF=26;TCR=24;TR=37;WE=20770044;WS=20770026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,35:0.73:48
chr14	20784117	rs12889262	A	G	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.219;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=30;PP=838;ReadPosRankSum=-0.559;SC=TTACTTTTATACAGAAGAGAG;SOR=0.952;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=64;TCF=13;TCR=51;TR=36;WE=20784125;WS=20784107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,34:0.55:62
chr14	20784718	rs1132644	G	T	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=267;ReadPosRankSum=0.907;SC=CTGAAGAGAGGCCTAAGAAGG;SOR=0.646;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=15;WE=20784726;WS=20784708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,15:0.31:48
chr14	20788652	rs11292211	TA	T	138.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=150;ReadPosRankSum=-1.314;SC=TTATTGGCTATAAAAAAACAA;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=9;WE=20788660;WS=20788642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr14	20794509	rs884368	A	G	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=128;ReadPosRankSum=-0.861;SC=TCTCAAATTCATAATTTATTA;SOR=0.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=12;WE=20794517;WS=20794499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,11:0.26:42
chr14	20813289	rs2297616	G	A	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.766;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=358;ReadPosRankSum=0.732;SC=GTCTCTGGTAGGAGTGGATCT;SOR=1.215;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=75;TCF=6;TCR=69;TR=21;WE=20813297;WS=20813279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,22:0.29:77
chr14	20813672	rs3093890	A	G	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=357;ReadPosRankSum=-1.293;SC=CTCAGAGAGCATCCTTTGTTA;SOR=0.594;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=80;TCF=28;TCR=52;TR=26;WE=20813680;WS=20813662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,30:0.35:85
chr14	20815013	rs1713430	C	T	1197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;PP=888;ReadPosRankSum=-1.086;SC=TCTCTCTCTCCCTTTCTAGGC;SOR=0.748;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=135;TCF=85;TCR=50;TR=45;WE=20815021;WS=20815003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,50:0.36:138
chr14	20818602	rs3093902	C	G	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=51;ReadPosRankSum=-0.188;SC=TAACTGGCACCTGTGACGAAG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=6;WE=20818610;WS=20818592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr14	20819112	rs3093904	T	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.531;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=201;ReadPosRankSum=-0.933;SC=CTTCTCCCTTTCCTGCCTGTT;SOR=0.105;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=7;WE=20819120;WS=20819102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr14	20820537	rs1760919	A	G	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.715;NF=2;NR=22;PP=445;ReadPosRankSum=-0.662;SC=CGAAAGAAACACATCTTCTTT;SOR=0.492;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=71;TCF=5;TCR=66;TR=24;WE=20820545;WS=20820527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,23:0.32:72
chr14	20824181	rs3093930	T	C	2873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.620;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=88;PP=2013;ReadPosRankSum=-1.206;SC=ATGAAAGTTATGAGTTCAAAG;SOR=0.633;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=194;TCF=47;TCR=147;TR=118;WE=20824189;WS=20824171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,125:0.62:202
chr14	20824415	rs3093933	G	T	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-6.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.331;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=4;PP=574;ReadPosRankSum=-0.373;SC=CTTCAGTTCAGCTCAGTCTCT;SOR=0.409;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=107;TCF=97;TCR=10;TR=33;WE=20824423;WS=20824405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,35:0.31:113
chr14	20825013	rs878157	C	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=136;ReadPosRankSum=-1.160;SC=CTTTAAATTCCTAAAGATACC;SOR=0.446;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=8;WE=20825021;WS=20825003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr14	20825321	rs10625811	T	TTTCAC	1373.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=4.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.38;ReadPosRankSum=-1.020;SOR=1.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,39:0.35:111
chr14	20825323	rs200223594	T	G	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=5.913;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.57;ReadPosRankSum=-0.654;SOR=1.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,38:0.35:110
chr14	20825362	rs3093939	G	A	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.564;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=483;ReadPosRankSum=-0.393;SC=GTTTTTTTCCGATGAGAAAAG;SOR=0.365;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=62;TCF=15;TCR=47;TR=23;WE=20825370;WS=20825352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,23:0.37:63
chr14	20825965	rs2700	A	C	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=335;ReadPosRankSum=-0.024;SC=GAATGTTGATATTAAATAAAC;SOR=0.790;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=51;TCF=5;TCR=46;TR=17;WE=20825973;WS=20825955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,17:0.34:50
chr14	20836923	.	G	GCA	71.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.857;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=191;ReadPosRankSum=-0.719;SC=GCAGGCGCACGCACACACACA;SOR=0.307;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=6;WE=20836931;WS=20836913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr14	20846521	rs2297615	A	T	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.024;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=45;PP=1195;ReadPosRankSum=0.410;SC=CCCCAAGAGCAACACTGGACC;SOR=1.107;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=231;TCF=94;TCR=137;TR=69;WE=20846529;WS=20846511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,71:0.30:237
chr14	20851840	rs2297614	A	G	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.904;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=1043;ReadPosRankSum=-0.587;SC=AGTGGGAGAGAAAAAAAAAGC;SOR=1.034;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=167;TCF=92;TCR=75;TR=52;WE=20851848;WS=20851828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,54:0.32:168
chr14	20852029	rs1760904	A	G	2075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.180;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=28;PP=1616;ReadPosRankSum=0.369;SC=AAGACTAATGATGCCACCTTG;SOR=1.053;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=189;TCF=112;TCR=77;TR=76;WE=20852037;WS=20852019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,80:0.41:196
chr14	20852817	rs1760903	G	A	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=645;ReadPosRankSum=0.387;SC=GAGATCCGACGTGCGGCCTCT;SOR=0.718;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=36;TCR=80;TR=39;WE=20852825;WS=20852807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,44:0.35:126
chr14	20854734	rs945011	A	G	2082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=27;PP=1535;SC=CCCGCTCCCCATGCATGTCTC;SOR=1.002;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=38;TCR=27;TR=65;WE=20854742;WS=20854724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr14	20857306	rs201527652	T	TA	305.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.42;MQRankSum=0.051;QD=10.54;ReadPosRankSum=1.104;SOR=1.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr14	20859013	rs872072	G	A	4209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.311;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=120;PP=2962;ReadPosRankSum=3.042;SC=ACTGTGTATTGTCTGTGCCTT;SOR=1.259;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=228;TCF=54;TCR=174;TR=152;WE=20859021;WS=20859003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,158:0.67:236
chr14	20863677	rs2228036	C	A	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=311;ReadPosRankSum=0.977;SC=TCATTGCCATCCGAAGCTGCT;SOR=0.416;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=14;WE=20863685;WS=20863667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr14	20863811	rs1713417	G	A	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.845;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;ReadPosRankSum=-0.216;SC=GTAAATTTCCGAGTTAGGCAG;SOR=0.591;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=91;TCF=48;TCR=43;TR=28;WE=20863819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,27:0.29:93
chr14	20869819	rs2297612	A	T	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=39;PP=1069;ReadPosRankSum=-0.658;SC=GCAGATTGTAAGACCATCCGA;SOR=0.859;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=68;TCF=11;TCR=57;TR=46;WE=20869827;WS=20869809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,49:0.68:72
chr14	20871645	rs8009925	C	A	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=26;PP=505;ReadPosRankSum=-1.854;SC=AAAAAGGGAACTGGCTGTCCT;SOR=1.027;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=93;TCF=14;TCR=79;TR=30;WE=20871653;WS=20871635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,32:0.34:94
chr14	20872740	rs2275009	G	A	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.373;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=533;ReadPosRankSum=0.394;SC=ATGAAGTGAAGGCCCAAGCTC;SOR=1.234;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=97;TCF=72;TCR=25;TR=30;WE=20872748;WS=20872730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,31:0.31:100
chr14	20872881	rs1760898	G	T	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.161;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=27;PP=634;ReadPosRankSum=0.231;SC=TGGCCAAGATGTTATTGGCCA;SOR=0.372;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=103;TCF=25;TCR=78;TR=37;WE=20872889;WS=20872871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,37:0.34:109
chr14	20876253	rs1760897	A	G	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=24;PP=932;ReadPosRankSum=-0.414;SC=TTTAGACTAGAGAGGGTGGCC;SOR=0.711;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=166;TCF=88;TCR=78;TR=53;WE=20876261;WS=20876243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,58:0.33:177
chr14	20903349	rs1713408	T	C	4921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=107;PP=2965;SC=ACATCTTCCCTGGCATTTCCA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=51;TCR=107;TR=158;WE=20903357;WS=20903339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr14	20916249	rs2275008	T	C	3923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.866;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=73;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.755;SC=TCTGTCCCAGTTTTTTACTGC;SOR=0.537;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=239;TCF=109;TCR=130;TR=138;WE=20916257;WS=20916239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,142:0.58:243
chr14	20916958	rs938883	T	C	2325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=57;PP=1836;ReadPosRankSum=2.013;SC=GCAGCTCAACTAGCTTCTTGC;SOR=0.771;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=34;TCR=87;TR=79;WE=20916966;WS=20916948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,82:0.66:125
chr14	20916987	rs938882	G	A	1814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=49;PP=1375;ReadPosRankSum=-1.238;SC=GGGAATAAGCGTACGAGGCAC;SOR=0.640;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=90;TCF=18;TCR=72;TR=62;WE=20916995;WS=20916977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,65:0.70:93
chr14	20917442	rs938881	A	T	2455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.421;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=58;PP=1859;ReadPosRankSum=0.148;SC=GTGATGAGGAAGTCCATGAAA;SOR=0.477;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=137;TCF=48;TCR=89;TR=91;WE=20917450;WS=20917432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,94:0.66:142
chr14	20919551	rs3120068	C	T	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.430;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=84;ReadPosRankSum=-0.967;SC=CCGCAACTTCCGCCTCCTGGG;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=6;WE=20919559;WS=20919541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr14	20919623	rs3120067	T	C	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.561;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=267;ReadPosRankSum=0.616;SC=TGCCACCACATCAAATTAATT;SOR=0.959;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=11;WE=20919631;WS=20919613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr14	20919667	rs3120066	C	T	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=88;ReadPosRankSum=-0.549;SC=GGTTTTGCCACGTTGGCCAGG;SOR=0.160;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=5;WE=20919675;WS=20919657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr14	20919712	rs3120065	C	T	31.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.16;MQRankSum=0.967;QD=10.61;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr14	20920043	rs1320150	C	T	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=-0.253;SC=CATCTTTGTTCCTGACATTCC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=20920051;WS=20920033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr14	20920250	rs2275007	T	C	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.813;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=530;ReadPosRankSum=-1.050;SC=TATTCCACAGTTGGGCCACAG;SOR=0.801;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=32;TCF=16;TCR=16;TR=27;WE=20920258;WS=20920240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,25:0.81:31
chr14	20920340	rs2275006	A	G	903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.153;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=719;ReadPosRankSum=-1.398;SC=TTATAATCCTAGAGATTGGAA;SOR=0.428;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=30;WE=20920348;WS=20920330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr14	20920360	rs3215948	A	AG	906.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5357;FS=2.079;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=960;ReadPosRankSum=0.656;SC=AAAAAACAATAGTGGGGGACA;SOR=1.382;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=23;WE=20920368;WS=20920350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,28:0.88:32
chr14	20920749	rs1878703	C	G	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=371;ReadPosRankSum=0.990;SC=CACATTTTCACATCTACTCTT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=16;WE=20920757;WS=20920739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr14	20925154	rs1130409	T	G	2717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=70;PP=2202;ReadPosRankSum=1.595;SC=CTATAGGCGATGAGGAGCATG;SOR=0.663;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=35;TCR=109;TR=92;WE=20925162;WS=20925144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,94:0.64:147
chr14	20940515	rs1049562	C	T	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.213;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=699;ReadPosRankSum=-0.299;SC=TTCTGTCTCACACTAAGCACC;SOR=1.501;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=66;TCF=45;TCR=21;TR=36;WE=20940523;WS=20940505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,36:0.52:69
chr14	20940606	rs1049564	G	A	1484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=28;PP=1192;ReadPosRankSum=0.475;SC=CTTTGACTACGGTGAAATCCC;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=93;TCF=46;TCR=47;TR=55;WE=20940614;WS=20940596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,56:0.57:98
chr14	20940626	rs1130650	C	T	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.595;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=30;PP=1246;ReadPosRankSum=0.247;SC=CCAACTTTCCCCGAAGTACAG;SOR=0.549;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=99;TCF=46;TCR=53;TR=58;WE=20940634;WS=20940616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,58:0.57:101
chr14	20940834	rs1713422	A	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.617;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=299;ReadPosRankSum=0.106;SC=AAGAGACAGGACATGTGTGTG;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=13;WE=20940842;WS=20940824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr14	20942744	rs1713420	A	G	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=999;ReadPosRankSum=0.552;SC=GGTAAGTCAGAGGGATAGGTC;SOR=0.596;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=78;TCF=28;TCR=50;TR=44;WE=20942752;WS=20942734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,45:0.55:82
chr14	20978531	rs2319198	G	A	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=3;PP=651;ReadPosRankSum=-0.089;SC=GGAGACCCCAGATACAATGCT;SOR=0.648;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=93;TCF=84;TCR=9;TR=34;WE=20978539;WS=20978521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,32:0.35:92
chr14	21026773	rs891297	C	T	3131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=45;PP=2496;ReadPosRankSum=-0.071;SC=TCGGAACATACTCTCACAAGA;SOR=0.754;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=50;TCR=46;TR=94;WE=21026781;WS=21026763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,99:0.98:101
chr14	21058337	rs4981259	C	T	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=22;ReadPosRankSum=1.180;SC=TCCCCTTCCGCTCAAGGCATT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=21058345;WS=21058328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr14	21058902	rs41317318	G	A	1637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.920;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=51;PP=1294;ReadPosRankSum=0.995;SC=GAGTGACTTCGCATCTTTGGC;SOR=1.270;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=93;TCF=15;TCR=78;TR=59;WE=21058910;WS=21058892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,62:0.65:95
chr14	21074683	rs1243595	C	T	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=253;ReadPosRankSum=1.037;SC=CTGGAGCAGGCGTCATTACTA;SOR=0.483;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=13;WE=21074691;WS=21074673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr14	21108748	rs11621507	G	A	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=-0.000;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.395;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr14	21108748	.	GC	AT	194	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=28;MQ=60.33;NF=4;NR=1;PP=194;QD=49.4935749724;SC=AGCTGAGATCGCGCCACTGCA;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=5;WE=21108757;WS=21108740;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,5:0.38:13
chr14	21108749	rs11621774	C	T	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.722;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=-0.000;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.395;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr14	21108786	rs138453753	T	TTC	183.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.388;NF=6;NR=0;PP=166;ReadPosRankSum=-0.388;SC=GAGTGAGACTTTCTCTCTCTC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=6;WE=21108794;WS=21108776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr14	21109141	rs17277522	C	T	2193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.715;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=29;PP=1611;ReadPosRankSum=-0.342;SC=GGCCTTCTGACGGCCTGAAGC;SOR=0.623;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=115;TCF=70;TCR=45;TR=73;WE=21109149;WS=21109131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,79:0.65:122
chr14	21109170	rs11628297	T	A	4272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=53;PP=2965;SC=TGCTCAGGACTGCCAGCACAA;SOR=1.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=74;TCR=53;TR=127;WE=21109178;WS=21109160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr14	21109278	rs11627438	A	T	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.918;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=909;ReadPosRankSum=0.459;SC=TGTTGGTGCAAGCCAGGCGGA;SOR=0.948;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=164;TCF=78;TCR=86;TR=57;WE=21109286;WS=21109268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,55:0.34:164
chr14	21109671	rs11627574	A	G	1361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.573;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=33;PP=1031;ReadPosRankSum=-1.884;SC=AGAAGTACATAGGGGTCTGTA;SOR=0.626;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=82;TCR=114;TR=58;WE=21109679;WS=21109661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,60:0.30:199
chr14	21109726	rs11622794	G	A	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.194;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=821;ReadPosRankSum=0.431;SC=CACATTGCCTGTCAGATTCAG;SOR=0.424;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=174;TCF=75;TCR=99;TR=51;WE=21109734;WS=21109716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,51:0.29:176
chr14	21109859	rs11156622	T	C	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.014;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=463;ReadPosRankSum=-0.956;SC=ATTGTCTTTTTCACCTGTCCA;SOR=1.609;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=63;TCF=6;TCR=57;TR=24;WE=21109867;WS=21109849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,24:0.38:64
chr14	21215692	rs10136680	C	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.779;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.26;ReadPosRankSum=0.610;SOR=1.138;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,11:0.21:52
chr14	21215728	rs10135976	G	C	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=4.428;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.000;SOR=1.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,17:0.24:71
chr14	21215997	rs11847654	C	T	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.683;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=21;PP=792;ReadPosRankSum=0.294;SC=AGAAGGGGAGCGACCGATATA;SOR=0.735;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=148;TCF=65;TCR=83;TR=48;WE=21216005;WS=21215987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,53:0.34:158
chr14	21238318	rs3827905	G	A	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.572;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=216;ReadPosRankSum=-0.780;SC=AGATGGCATCGTCTCTAAAGA;SOR=1.139;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=68;TCF=48;TCR=20;TR=19;WE=21238326;WS=21238308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,18:0.26:68
chr14	21238798	rs3827907	T	C	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=349;ReadPosRankSum=1.310;SC=ATTCAGTGCTTTCTAAGTAGC;SOR=1.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=14;WE=21238806;WS=21238788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr14	21250366	rs7156801	T	C	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=17;PP=397;SC=ATTGCATCCATGTTTTCTTTT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=21250374;WS=21250356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	21360216	rs2073342	C	G	3711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=8.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.768;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=67;PP=2928;ReadPosRankSum=-1.539;SC=TCAAACTGCACGTATGCAGAC;SOR=0.873;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=176;TCF=80;TCR=96;TR=118;WE=21360224;WS=21360206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,126:0.68:185
chr14	21387994	rs10459477	A	G	4014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.444;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=50;PP=2962;ReadPosRankSum=1.000;SC=TGGAAAAACCAAAATACTTTT;SOR=0.444;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=223;TCF=157;TCR=66;TR=151;WE=21388002;WS=21387984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,160:0.69:233
chr14	21388266	rs3748340	G	C	5499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.395;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.719;NF=117;NR=80;PP=2962;ReadPosRankSum=1.375;SC=AGTTCACCTGGATACCATCAT;SOR=0.733;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=342;TCF=202;TCR=140;TR=197;WE=21388274;WS=21388256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,201:0.57:352
chr14	21388302	rs3748341	G	A	5788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.227;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.697;NF=106;NR=114;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.775;SC=AGCACTCCTCGTCATCACTCA;SOR=0.768;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=368;TCF=179;TCR=189;TR=220;WE=21388310;WS=21388292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,223:0.59:377
chr14	21388331	.	C	T	5309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.271;ClippingRankSum=0.000;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.844;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-8.918;NF=75;NR=123;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.250;SC=GCTCCTCAATCATAGCCAAGA;SOR=0.763;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=337;TCF=129;TCR=208;TR=198;WE=21388339;WS=21388321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,204:0.58:349
chr14	21458131	rs2741733	G	A	927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=0;PP=780;ReadPosRankSum=-0.914;SC=ACAGGCACCTGTATTTCCGTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=30;WE=21458139;WS=21458121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr14	21458181	rs140652112	G	A	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.420;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=343;ReadPosRankSum=0.772;SC=GCACTGAAGTGTCTACTGACA;SOR=2.863;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=62;TCF=50;TCR=12;TR=21;WE=21458189;WS=21458171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,21:0.34:62
chr14	21458649	rs145113570	C	G	2301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.827;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=26;PP=1887;ReadPosRankSum=-0.171;SC=TATGGAGAATCAGGTGCAAAC;SOR=1.214;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=119;TCF=75;TCR=44;TR=76;WE=21458657;WS=21458639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,79:0.64:123
chr14	21460578	rs2297718	T	C	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=5;PP=946;SC=CCCTTTTGTATTGGGGAGTGA;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=21460586;WS=21460568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr14	21463430	rs2741739	G	T	4074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=90;PP=2965;SC=CACCCATATGGCACCAATTAC;SOR=2.056;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=32;TCR=90;TR=122;WE=21463438;WS=21463420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr14	21463474	rs2783801	G	A	2336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=62;PP=1838;SC=AGACTGTCATGTATTGACAAG;SOR=3.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=7;TCR=62;TR=69;WE=21463482;WS=21463464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr14	21467805	rs116849011	C	G	823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=12;PP=613;ReadPosRankSum=0.133;SC=TCTCACCATCCCCAACCTTGG;SOR=0.877;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=27;TCR=18;TR=30;WE=21467813;WS=21467795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,33:0.69:48
chr14	21467913	rs2234632	T	G	1677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=28;PP=1289;SC=CATCACCGGCTAGTCCTCAGA;SOR=0.728;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=55;WE=21467921;WS=21467903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr14	21467928	rs2234633	T	C	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.602;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=634;ReadPosRankSum=-1.572;SC=CTCAGACTCCTGGGCTGTATT;SOR=0.377;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=52;TCF=21;TCR=31;TR=36;WE=21467936;WS=21467918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,38:0.70:54
chr14	21468156	rs2149666	T	G	2529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=13;PP=2077;SC=TGACAGCTCTTGTGTGGGATG;SOR=3.086;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=61;TCR=13;TR=74;WE=21468164;WS=21468146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr14	21484977	rs57283422	G	A	2274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.476;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=30;PP=1751;ReadPosRankSum=0.636;SC=TGTGGGAGACGGGAGGGCACC;SOR=0.562;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=134;TCF=88;TCR=46;TR=83;WE=21484985;WS=21484967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,86:0.63:137
chr14	21486054	rs1243444	T	C	2249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=29;PP=1784;ReadPosRankSum=0.683;SC=ATTGGGCAGATAGCGGTGAGT;SOR=0.679;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=132;TCF=85;TCR=47;TR=79;WE=21486062;WS=21486044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,84:0.61:138
chr14	21486137	rs1243445	G	C	5964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=97;PP=2965;SC=CTCTTGTCCCGATACTCACTG;SOR=0.795;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=181;TCF=84;TCR=97;TR=181;WE=21486145;WS=21486127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr14	21486442	rs1243446	A	G	4628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.461;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=72;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.052;SC=ACACACATAAATGAGCCATGC;SOR=0.658;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=260;TCF=143;TCR=117;TR=159;WE=21486450;WS=21486432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,169:0.63:268
chr14	21488046	rs1243448	G	C	2110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=51;PP=1859;SC=TGCTGCTCCCGTCGACTCTTC;SOR=2.797;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=12;TCR=51;TR=63;WE=21488054;WS=21488036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr14	21489044	rs34056586	G	A	2947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.516;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=54;PP=2318;ReadPosRankSum=-0.113;SC=GGGATCTGCTGTCCAAAACCT;SOR=0.743;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=175;TCF=88;TCR=87;TR=113;WE=21489052;WS=21489034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,115:0.64:180
chr14	21490125	rs1243449	A	C	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=12;PP=728;SC=CTCCCAGAATAACCACTGCCC;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=15;TCR=12;TR=27;WE=21490133;WS=21490115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	21491322	rs1243450	C	G	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=5.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=621;ReadPosRankSum=1.294;SC=AAGATCAGTACGCTTGGGAAG;SOR=0.606;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=37;TCR=63;TR=32;WE=21491330;WS=21491312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,32:0.31:102
chr14	21500395	rs1243462	A	G	1345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=6;PP=1009;ReadPosRankSum=1.150;SC=GAGGCAGCACAGGAGGGTGGG;SOR=2.345;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=44;WE=21500403;WS=21500385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr14	21500411	rs3818613	C	A	1837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=13;PP=1389;ReadPosRankSum=0.029;SC=GTGGGTTCTCCACCACACACC;SOR=1.240;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=55;WE=21500419;WS=21500401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr14	21500426	rs1754340	G	A	2266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=49;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=17;PP=1765;ReadPosRankSum=-0.843;SC=CACACCCTTCGCTCTGCTTAG;SOR=1.061;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=52;TCR=17;TR=68;WE=21500434;WS=21500416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr14	21500455	rs3818615	T	A	2913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=28;PP=2183;ReadPosRankSum=-0.741;SC=CTACCAGCCATCAGTTAGCAT;SOR=0.709;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=63;TCR=28;TR=90;WE=21500463;WS=21500445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,95:0.99:96
chr14	21500597	rs3818616	C	T	2582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=55;PP=2008;SC=TCCACCCCCACCCCTCAAAAG;SOR=1.882;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=77;WE=21500605;WS=21500587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr14	21501049	rs1952525	G	T	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=364;SC=TACAGAGGGGGCTCGTGTGCC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=21501057;WS=21501039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	21503743	rs1243463	G	A	1530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=0;PP=1452;SC=CCTTTGCTGGGCAGCAGAAAA;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=49;WE=21503751;WS=21503733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr14	21503959	rs117360911	T	G	3790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.720;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=100;PP=2900;ReadPosRankSum=-0.077;SC=TCAGTTTCCCTGGTTACCTAT;SOR=0.576;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=241;TCF=77;TCR=164;TR=150;WE=21503967;WS=21503949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,150:0.61:244
chr14	21504447	rs1243464	A	G	6495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=171;PP=2965;SC=AAAAAGTGTGATCCCTTCTTT;SOR=3.956;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=25;TCR=171;TR=196;WE=21504455;WS=21504437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr14	21511458	rs1263872	G	C	11679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.96;NF=159;NR=192;PP=2965;SC=GAGCCACGGGGCCGTGTCCCT;SOR=0.918;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=351;TCF=159;TCR=192;TR=351;WE=21511466;WS=21511448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,361:1.00:361
chr14	21511497	rs1243469	C	T	10151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.019;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=191;PP=2965;ReadPosRankSum=0.518;SC=CTCAGGGAAGCATCCGAACTG;SOR=0.953;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=319;TCF=128;TCR=191;TR=318;WE=21511505;WS=21511487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,327:1.00:328
chr14	21526044	rs12435011	T	C	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.943;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=212;ReadPosRankSum=1.042;SC=CTGTCTCCCTTAAGAGAGATG;SOR=0.015;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=12;WE=21526052;WS=21526034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,12:0.29:41
chr14	21526079	rs12437266	C	T	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=1.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.35;ReadPosRankSum=1.167;SOR=0.326;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,18:0.22:83
chr14	21542037	rs4982405	C	T	2336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=18;PP=1917;SC=ACTGCCCTCTCCTGCTGGTTT;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=56;TCR=18;TR=74;WE=21542045;WS=21542027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr14	21549893	rs7143633	G	C	3525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=66;PP=2860;SC=CCAGCAACACGTGGGAGAGGA;SOR=1.329;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=40;TCR=66;TR=106;WE=21549901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr14	21551069	rs1958396	T	C	3813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=35;PP=2955;SC=CTCAGTCCCTTAAGCAAGGTA;SOR=1.630;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=77;TCR=35;TR=112;WE=21551077;WS=21551059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr14	21555068	rs12891708	A	G	1911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=13.594;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.51;ReadPosRankSum=-0.305;SOR=3.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:10,88:0.90:98
chr14	21558558	rs6571653	G	C	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=18;PP=627;ReadPosRankSum=0.893;SC=CGCCCGCCGCGCCTTCCACCT;SOR=1.044;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=25;WE=21558566;WS=21558548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,24:0.77:31
chr14	21559311	rs34720103	G	A	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.259;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=906;ReadPosRankSum=3.551;SC=TGGGGAGAGTGGGTGCGATAG;SOR=0.483;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=39;WE=21559319;WS=21559301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,39:0.74:53
chr14	21562560	rs7149011	T	C	4112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=73;PP=2965;SC=CGTATAGGATTCATCCCCTTG;SOR=1.089;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=53;TCR=74;TR=126;WE=21562568;WS=21562550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr14	21570273	rs745696	T	C	3777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=66;PP=2965;SC=CACCCCGCCTTTGGAAGGTGA;SOR=0.960;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=49;TCR=66;TR=115;WE=21570281;WS=21570263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr14	21570614	rs4982408	A	C	2892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=33;PP=2322;SC=TGGGTTTCATAGTGGTGGTGG;SOR=1.460;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=57;TCR=33;TR=90;WE=21570622;WS=21570604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr14	21571119	rs12432043	A	G	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=3;PP=656;SC=GGGTAAGAGGAAACTGGGAAT;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=22;WE=21571127;WS=21571109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	21571208	rs12880628	G	T	2079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=16;PP=1761;SC=AAACAGGATAGAAAATTGGGC;SOR=2.338;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=51;TCR=16;TR=67;WE=21571216;WS=21571198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr14	21623010	rs8007993	T	C	3027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=19;PP=2415;SC=TTCACAGGGGTGGGCATGGGA;SOR=2.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=72;TCR=19;TR=91;WE=21623018;WS=21623000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr14	21623290	rs7145814	T	C	1264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.200;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;PP=1037;ReadPosRankSum=1.344;SC=AAGAGGCAGATGGCAGTGAGG;SOR=0.569;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=194;TCF=109;TCR=85;TR=64;WE=21623298;WS=21623280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,62:0.31:200
chr14	21623648	rs7161544	G	A	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.587;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=693;ReadPosRankSum=1.443;SC=AGAGCAGGGGGTTACAAATAG;SOR=1.376;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=120;TCF=57;TCR=63;TR=39;WE=21623656;WS=21623638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,40:0.33:123
chr14	21623836	rs4982419	G	A	1272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.290;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=22;PP=1004;ReadPosRankSum=0.602;SC=AAGAAGGAGAGGCTCTTCAGG;SOR=0.988;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=179;TCF=88;TCR=91;TR=52;WE=21623844;WS=21623826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,54:0.30:181
chr14	21624197	rs10135366	T	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=123;ReadPosRankSum=0.951;SC=AGAGGATCTTTTCTCCTTGGT;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=8;WE=21624205;WS=21624187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr14	21770681	rs17792599	A	G	1639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.540;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=28;PP=1160;ReadPosRankSum=0.765;SC=CAGCCCCTCCATCGTTTAAGG;SOR=0.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=192;TCF=120;TCR=72;TR=74;WE=21770689;WS=21770671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,80:0.39:204
chr14	21770730	rs6571751	A	G	3027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.754;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=61;PP=2162;ReadPosRankSum=1.483;SC=AGTAGCCAGTAAACCCAGTGA;SOR=0.894;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=213;TCF=101;TCR=112;TR=113;WE=21770738;WS=21770720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,120:0.54:221
chr14	21775816	rs8005773	G	C	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=203;ReadPosRankSum=-0.549;SC=ATTCTTACTAGGGCATAGTCA;SOR=0.495;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=12;WE=21775824;WS=21775806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr14	21785790	rs3748357	G	A	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.796;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=306;ReadPosRankSum=-0.177;SC=GCTGAAACTGGATAATAAAGA;SOR=0.346;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=16;WE=21785798;WS=21785780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,18:0.35:51
chr14	21790040	rs10151259	G	T	2173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.765;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=30;PP=1605;ReadPosRankSum=0.505;SC=GATGACAAAAGCTGACAATGA;SOR=0.860;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=116;TCF=71;TCR=45;TR=80;WE=21790048;WS=21790030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,84:0.70:120
chr14	21792811	rs9322965	G	A	2998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.788;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=42;PP=2193;ReadPosRankSum=1.590;SC=GCACCCGACCGTTGTCGTTAT;SOR=1.143;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=162;TCF=93;TCR=69;TR=104;WE=21792819;WS=21792801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,113:0.65:175
chr14	21793236	rs7157052	G	A	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.526;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=970;ReadPosRankSum=0.597;SC=ATTGGTAAGTGCCGTTGGCTT;SOR=0.346;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=85;TCF=27;TCR=58;TR=48;WE=21793244;WS=21793226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,50:0.59:85
chr14	21825924	rs3762156	T	C	221.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=244;SC=TGTGAGCCATTATGCCTGCCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=21825932;WS=21825914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	21826718	rs3762157	T	G	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=29;PP=837;SC=TGGGCAGGATTTGCAGGTTTG;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=21826726;WS=21826708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	21828520	rs927412	T	A	2608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=25;PP=1996;SC=AGAAGCTGAGTGAAATGAAGT;SOR=1.754;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=54;TCR=25;TR=79;WE=21828528;WS=21828510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr14	21829129	rs3762158	C	G	1834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=24;PP=1451;SC=GTTTTACAATCCCCTAAGCAA;SOR=1.009;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=30;TCR=24;TR=54;WE=21829137;WS=21829119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr14	21829404	rs1543494	T	C	6549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=133;PP=2965;SC=TATAGACATTTCTTTTTCAGG;SOR=1.851;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=56;TCR=133;TR=189;WE=21829412;WS=21829394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr14	21830635	rs1983768	C	T	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=464;SC=TTTTTAATAACGAAGTATCCT;SOR=4.294;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=21830643;WS=21830625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	21831052	rs10138699	T	C	4192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=35;PP=2965;SC=CCCGAATATGTGGTTCCTTAG;SOR=2.053;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=129;TCF=94;TCR=35;TR=128;WE=21831060;WS=21831042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr14	21831112	rs10146717	G	A	6854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=126;NR=87;PP=2965;SC=GAGCTCTGGAGTGGGATAAAA;SOR=1.117;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=213;TCF=126;TCR=87;TR=213;WE=21831120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr14	21831692	rs10139379	T	A	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=262;SC=GAAGACACATTATTTAAAAGA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=21831700;WS=21831682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	21833147	rs2295866	G	A	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=22;PP=1193;SC=AATGTGGAGAGGTGTGAGACA;SOR=0.818;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=25;TCR=22;TR=47;WE=21833155;WS=21833137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr14	21836400	rs8008670	T	C	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=1;PP=670;SC=TACACAACTTTCAAACCTCCT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=21836408;WS=21836390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	21838160	rs2181125	A	G	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=798;SC=TTATTTAGCAAACTATCACTG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=21838168;WS=21838150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	21838781	rs4982445	C	T	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=280;SC=CTACTTTTTACTTTTAAAGAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=21838789;WS=21838771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	21840910	rs78373622	C	T	1789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-6.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=52;PP=1377;ReadPosRankSum=2.240;SC=TTGTTTAACTCACTGTTACTT;SOR=0.823;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=15;TCR=79;TR=62;WE=21840918;WS=21840900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,67:0.68:99
chr14	21859079	rs35057134	GA	G	1467.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.767;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.841;NF=29;NR=12;PP=1563;ReadPosRankSum=-0.553;SC=TGTGGGAATAGAGTGGTAATG;SOR=0.499;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=111;TCF=83;TCR=28;TR=41;WE=21859087;WS=21859069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,47:0.38:125
chr14	21859536	rs3762159	T	C	2124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=3;PP=1856;SC=GAAACGATGATACAGTATGTC;SOR=5.074;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=63;TCR=3;TR=66;WE=21859544;WS=21859526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr14	21860360	rs1998332	G	A	5037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=83;NR=72;PP=2965;SC=CCAAGTTAGGGTAAAACTCCC;SOR=0.810;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=84;TCR=73;TR=155;WE=21860368;WS=21860350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr14	21861211	rs7152833	C	A	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=2;PP=336;SC=CCCGGATATACTGTTACACTG;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=21861219;WS=21861201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	21864124	rs10134108	C	A	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=22;PP=618;SC=AGGATGAAGACCTAGCCACAC;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=21864132;WS=21864114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	21869705	rs113076568	C	CT	1770.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=52;PP=1206;SC=GTAAAGCTGACTTTTTTTTTT;SOR=2.869;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=73;TCF=7;TCR=66;TR=57;WE=21869713;WS=21869695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr14	21871653	rs8022395	C	T	5146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=60;PP=2965;SC=CTAGGCAGCGCACCATCTGAG;SOR=1.278;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=98;TCR=60;TR=158;WE=21871661;WS=21871643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr14	21874068	rs7155123	G	C	3213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=88;PP=2703;SC=AAACATGAAGGACTTCTGGGG;SOR=9.087;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=88;TCF=0;TCR=88;TR=88;WE=21874076;WS=21874058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr14	21899631	rs10467770	C	T	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.223;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=467;ReadPosRankSum=0.758;SC=GAATTCCCCACATCACCACCT;SOR=1.619;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=25;WE=21899639;WS=21899621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr14	21928338	rs1045812	C	T	7212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=441;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.165;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=140;NR=124;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.248;SC=AATGAAATTCCGAGGCAGAGG;SOR=0.420;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=429;TCF=240;TCR=189;TR=264;WE=21928346;WS=21928328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,271:0.62:438
chr14	21928383	rs1045811	T	C	6413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=428;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.826;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=152;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.609;SC=ATCTAGGTAATTGCAAGTGTT;SOR=0.839;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=415;TCF=154;TCR=261;TR=239;WE=21928406;WS=21928373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:179,245:0.58:424
chr14	21928397	rs28927672	AT	GC	8376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.614;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=141;PP=2944;ReadPosRankSum=-1.277;SC=AAGTGTTCAAATAGAATGTCT;SOR=1.116;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=350;TCF=97;TCR=253;TR=183;WE=21928406;WS=21928373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,213:0.56:378
chr14	21928485	rs61973205	A	G	1457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.450;NF=1;NR=52;PP=1205;ReadPosRankSum=0.254;SC=GGTGGCTCACACCTGTAATCC;SOR=0.396;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=88;TCF=1;TCR=87;TR=53;WE=21928493;WS=21928475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,53:0.59:90
chr14	21930361	.	TAA	T,TA	913.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.64;MQRankSum=2.070;QD=23.43;ReadPosRankSum=2.063;SOR=2.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:8,14,17:0.36,0.44:39
chr14	21930381	rs56719531	T	G	1509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=-0.602;NF=35;NR=1;PP=813;ReadPosRankSum=1.118;SC=AAAAAAAAAGTGTTGAATTGG;SOR=0.867;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=50;TCR=1;TR=36;WE=21930389;WS=21930371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,47:0.71:66
chr14	21930596	rs10143000	G	A	4608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=113;PP=2965;SC=GACATAAATCGTATCATCAGT;SOR=3.340;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=19;TCR=113;TR=132;WE=21930604;WS=21930586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr14	21931955	rs11848193	T	A	1480.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=61;PP=1598;ReadPosRankSum=-0.630;SC=GGAGAAAATTTAAAAAAAAGA;SOR=0.804;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=94;TCF=6;TCR=88;TR=66;WE=21931963;WS=21931945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,63:0.68:93
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chr14	21936762	rs35440295	G	GAA	1623.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=7.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=-1.068;QD=20.05;ReadPosRankSum=-1.626;SOR=1.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,56:0.69:81
chr14	21945415	rs2282046	A	G	1755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.008;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=33;PP=1336;ReadPosRankSum=1.579;SC=AGGGTCTGAGACGGTGGGAGC;SOR=0.491;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=118;TCF=64;TCR=54;TR=65;WE=21945423;WS=21945405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,67:0.56:120
chr14	21945629	rs12878084	C	T	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.523;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=454;ReadPosRankSum=-0.905;SC=CCTAACTTATCCCCGCGACTT;SOR=0.738;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=22;WE=21945637;WS=21945619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr14	21950836	rs6571850	T	G	3307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=81;PP=2626;SC=AATATTTGCTTCAGTTTTAGT;SOR=3.500;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=11;TCR=82;TR=92;WE=21950844;WS=21950826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr14	21955930	rs1061031	G	A	866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=25;PP=701;SC=TCTATTCCCTGCTACACTTGG;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=21955938;WS=21955920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	21956695	rs3215876	GA	G	1326.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.789;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=1334;ReadPosRankSum=-2.310;SC=ATTTAGGGGGGAAAAGTGGTT;SOR=0.795;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=85;TCF=52;TCR=33;TR=33;WE=21956703;WS=21956685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,53:0.56:95
chr14	21957159	rs12880071	T	C	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=745;ReadPosRankSum=-1.776;SC=ATTTCCAGTTTATAATTCTCC;SOR=0.598;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=28;WE=21957167;WS=21957150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,31:0.70:44
chr14	21960408	rs3737050	A	G	1851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=1;PP=1629;SC=GTCTTTCCTAAGAGTATGGGG;SOR=6.518;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=53;TCF=52;TCR=1;TR=53;WE=21960416;WS=21960398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr14	21960816	rs1060722	T	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.992;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=162;ReadPosRankSum=-0.190;SC=ACTCCACCCTTTCATCCTATG;SOR=1.911;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=8;WE=21960824;WS=21960806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr14	21960969	rs7617	G	A	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.651;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=7;PP=631;ReadPosRankSum=-0.677;SC=TGACCTCCCGGGGGCTCCAAC;SOR=1.284;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=110;TCF=84;TCR=26;TR=41;WE=21960977;WS=21960959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,43:0.38:114
chr14	21967109	rs1061026	T	G	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=8;PP=1318;ReadPosRankSum=0.253;SC=TCTACTAAGTTCTGTCCTTAA;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=73;TCR=12;TR=56;WE=21967117;WS=21967099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,58:0.65:89
chr14	21967916	rs1139130	A	G	4448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.749;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=73;PP=2962;ReadPosRankSum=0.871;SC=ACCCCCAGAGATTTAGACATT;SOR=0.670;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=265;TCF=134;TCR=131;TR=161;WE=21967924;WS=21967906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,168:0.60:278
chr14	21968876	rs3752411	G	A	2622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.834;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=70;PP=2114;ReadPosRankSum=-0.403;SC=TGAGATTCATGGCCCGAGTCC;SOR=0.946;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=129;TCF=27;TCR=102;TR=87;WE=21968884;WS=21968866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,91:0.69:132
chr14	21971246	rs17106830	G	A	1565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.895;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=2;PP=1254;ReadPosRankSum=1.312;SC=CCTTGCCCTAGGGGTAAATCC;SOR=1.536;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=92;TCF=87;TCR=5;TR=52;WE=21971254;WS=21971236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,54:0.58:93
chr14	21971729	rs2242526	C	G	2312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.042;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=44;PP=1760;ReadPosRankSum=-1.510;SC=GGCTAGAGAACGAGGGGAGGT;SOR=0.368;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=114;TCF=47;TCR=67;TR=78;WE=21971737;WS=21971719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,83:0.71:117
chr14	21993498	rs1263811	G	A	4866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=69;PP=2965;SC=AAATGCCCTGGAGACTCCTCT;SOR=0.848;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=78;TCR=69;TR=146;WE=21993506;WS=21993488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr14	22037905	rs8009501	G	A	1413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=10;PP=1145;SC=TCTAATTGTGGCAGCTTCCCT;SOR=2.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=45;WE=22037913;WS=22037895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr14	22038210	rs17792766	G	T	3893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=39;PP=2965;SC=TGGCCTGAATGATCTGTATGT;SOR=1.590;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=81;TCR=39;TR=120;WE=22038218;WS=22038200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr14	22038659	rs17792778	T	C	7077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.571;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.875;SC=GAGGAGATGCTCATATCAATG;SOR=0.643;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=218;TCF=121;TCR=97;TR=217;WE=22038667;WS=22038649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,222:1.00:223
chr14	22038915	rs4982462	A	G	4071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=107;PP=2965;SC=CAAAACAAGAATTAACATAGA;SOR=3.424;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=18;TCR=107;TR=125;WE=22038923;WS=22038905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr14	22070146	rs10134340	C	T	2291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=29.066;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=3.303;NF=49;NR=37;PP=2089;ReadPosRankSum=1.952;SC=AAAACACAGCCGCTGCCCCAT;SOR=0.007;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=100;TCF=63;TCR=37;TR=86;WE=22070154;WS=22070136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,77:0.86:90
chr14	22070165	.	C	T	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.387;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=35.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.78;MQRankSum=-4.562;QD=1.16;ReadPosRankSum=1.026;SOR=5.339;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,15:0.14:108
chr14	22070355	rs199637760	T	C	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=7.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.86;MQRankSum=-9.114;QD=4.44;ReadPosRankSum=0.646;SOR=0.865;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:170,62:0.27:232
chr14	22070509	rs11157069	G	A	5291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.942;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.740;NF=98;NR=88;PP=2962;ReadPosRankSum=1.123;SC=GCATGGAGCCGGCGACCCAAG;SOR=0.629;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=221;TCF=123;TCR=98;TR=186;WE=22070517;WS=22070499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:17,187:0.92:204
chr14	22070595	rs35103338	AC	A	4717.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.451;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.840;NF=53;NR=80;PP=2948;ReadPosRankSum=0.534;SC=ATTGCCAGGTACCTGTCATAG;SOR=0.426;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=188;TCF=61;TCR=127;TR=133;WE=22070603;WS=22070585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,142:0.80:178
chr14	22090208	rs8016939	A	G	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=16;PP=566;SC=TCCTGAATATACATTTTCCTA;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=22090216;WS=22090198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	22090594	rs1063365	C	G	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.723;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=658;ReadPosRankSum=1.489;SC=TCTTACAATGCTCTGGATGGT;SOR=1.030;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=110;TCF=59;TCR=51;TR=35;WE=22090602;WS=22090584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,36:0.31:118
chr14	22101945	rs4982475	G	A	826.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=0;PP=709;ReadPosRankSum=-1.138;SC=GCCAAAGAAAGTGAAAATAAA;SOR=2.242;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=29;WE=22101953;WS=22101935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,28:0.76:37
chr14	22102439	rs35963889	C	G	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=27.690;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.516;NF=29;NR=18;PP=838;ReadPosRankSum=-1.837;SC=CAATACTGCGCGGATGTCACA;SOR=2.342;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=131;TCF=64;TCR=67;TR=47;WE=22102447;WS=22102429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,27:0.24:113
chr14	22102592	rs10138694	T	C	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=60.921;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.291;NF=23;NR=3;PP=481;ReadPosRankSum=0.957;SC=CACTGGGTAGTGCAGGGGCTG;SOR=6.183;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=81;TCF=46;TCR=35;TR=26;WE=22102600;WS=22102582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,21:0.28:76
chr14	22102612	rs10138704	T	C	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=64.955;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.180;NF=35;NR=1;PP=763;ReadPosRankSum=-0.189;SC=GACATATTGCTAGGTACCTGT;SOR=6.851;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=89;TCF=62;TCR=27;TR=36;WE=22102620;WS=22102602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,32:0.37:86
chr14	22102745	rs41314525	C	A	3337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.157;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.045;NF=53;NR=70;PP=2572;ReadPosRankSum=0.322;SC=CAAAATAAGCCGAGGAACGGT;SOR=0.796;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=192;TCF=85;TCR=107;TR=123;WE=22102753;WS=22102735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,127:0.64:197
chr14	22111660	rs3748364	C	T	2361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.132;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.98;MQRankSum=-0.773;NF=46;NR=39;PP=1946;ReadPosRankSum=0.162;SC=GCGAAGCACCCACATTTCTGT;SOR=0.812;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=136;TCF=70;TCR=66;TR=85;WE=22111668;WS=22111650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,87:0.62:141
chr14	22133416	rs12717305	A	G	8267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=130;NR=136;PP=2965;SC=TAACGCTTTCAGGGAACATTC;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=266;TCF=130;TCR=136;TR=266;WE=22133424;WS=22133406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr14	22133648	rs2874103	G	A	7695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=138;PP=2965;SC=GCTGATCATTGTGGCGTATGA;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=241;TCF=102;TCR=139;TR=240;WE=22133656;WS=22133638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr14	22133997	rs970382	A	G	4094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=86;PP=2965;SC=GAAGGGCGCCAGAAAGCCCTG;SOR=1.473;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=44;TCR=86;TR=130;WE=22134005;WS=22133987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr14	22134018	rs61732411	C	T	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.696;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=969;ReadPosRankSum=-1.093;SC=TCTACCTGCTCGGCCCACTTC;SOR=1.190;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=114;TCF=47;TCR=67;TR=45;WE=22134026;WS=22134008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,46:0.39:119
chr14	22134245	rs12435524	T	C	811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.054;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=628;ReadPosRankSum=-0.225;SC=ATAATGGGCATTGGGATTGCA;SOR=2.584;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=25;WE=22134253;WS=22134235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,28:0.61:46
chr14	22167296	rs6572018	G	C	3155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=63;PP=2786;SC=TTGGAGGCACGAACAAGATAT;SOR=1.489;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=33;TCR=63;TR=96;WE=22167304;WS=22167286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr14	22192106	rs926027	A	G	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=292;ReadPosRankSum=-0.291;SC=GACCCCCCCAATCCCGCCCGC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=13;WE=22192114;WS=22192096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr14	22217356	rs2075477	G	A	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.774;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=278;ReadPosRankSum=2.110;SC=TAGGCTGACGGCAGAAGCAGA;SOR=0.235;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=15;WE=22217364;WS=22217346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
chr14	22218051	rs2075478	C	T	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=314;ReadPosRankSum=0.456;SC=TAAAGCCACACTCTATTTCCT;SOR=0.326;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=16;WE=22218059;WS=22218041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr14	22236771	rs11623408	C	T	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.184;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=332;ReadPosRankSum=1.063;SC=GTCTACATTTCAGGCCACATT;SOR=0.385;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=93;TCF=39;TCR=54;TR=25;WE=22236779;WS=22236761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,25:0.26:95
chr14	22237127	rs760008	C	T	4933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=56;PP=2965;SC=CAAACTATTCCCCAGCATACT;SOR=1.349;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=87;TCR=56;TR=143;WE=22237135;WS=22237117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr14	22237187	rs4329837	C	T	1799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=27;PP=1221;ReadPosRankSum=0.898;SC=TCTTGCTACTCATACGTGAAA;SOR=0.729;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=197;TCF=120;TCR=77;TR=69;WE=22237195;WS=22237177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,76:0.36:212
chr14	22265500	rs34668860	G	A	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=204;ReadPosRankSum=-0.411;SC=CCTCACGCTCGCTATTCTCAA;SOR=0.287;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=12;WE=22265508;WS=22265490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr14	22279809	rs2856411	A	C	2343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.363;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=31;PP=2962;ReadPosRankSum=0.566;SC=GGGTACAGCTAAGATCACGTC;SOR=0.149;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=121;TCF=81;TCR=40;TR=75;WE=22279825;WS=22279799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,81:0.61:132
chr14	22279817	rs7156201	G	A	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.509;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=13;PP=2193;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CTAAGATCACGTCTAAGGTAA;SOR=1.117;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=126;TCF=84;TCR=42;TR=48;WE=22279825;WS=22279799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,52:0.39:135
chr14	22293510	rs2178782	T	C	1969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=4;PP=1465;SC=TTTGCATTCGTCCCGCCTGCA;SOR=4.875;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=51;TCR=4;TR=55;WE=22293518;WS=22293500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	22293554	rs35339724	G	GC	3837.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=22;PP=2957;SC=ACATAGCGAAGCTGGTCTCTG;SOR=2.371;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=88;TCF=65;TCR=23;TR=86;WE=22293562;WS=22293544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr14	22315479	rs7151170	G	A	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.049;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.141;NF=2;NR=27;PP=546;ReadPosRankSum=-0.362;SC=TCAAGAACTCGACCTTGAAGT;SOR=1.381;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=86;TCF=12;TCR=74;TR=29;WE=22315487;WS=22315469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,25:0.29:85
chr14	22320728	rs2017224	T	C	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.234;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=386;ReadPosRankSum=0.147;SC=GTTTCCCTTGTTCAGCCATGC;SOR=1.011;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=95;TCF=80;TCR=15;TR=25;WE=22320736;WS=22320718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,26:0.27:96
chr14	22320876	rs2017238	A	G	1268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-5.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.809;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;PP=879;ReadPosRankSum=0.229;SC=CTGATAGTACATTGTTTTTCC;SOR=0.869;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=200;TCF=109;TCR=91;TR=64;WE=22320884;WS=22320866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,69:0.32:214
chr14	22321124	rs2017263	T	C	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.909;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.863;NF=17;NR=10;PP=500;ReadPosRankSum=0.364;SC=CTTCCTTCAATCTGAGGAAAC;SOR=1.045;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=86;TCF=48;TCR=38;TR=27;WE=22321132;WS=22321114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,31:0.33:93
chr14	22321261	rs2017432	C	T	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=2.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.60;ReadPosRankSum=-0.800;SOR=1.385;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,14:0.34:41
chr14	22321269	rs2072609	T	C	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.11;ReadPosRankSum=-0.240;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr14	22321331	rs12892111	G	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=51;ReadPosRankSum=-0.582;SC=GCCGACCCAGGCATTTCTATG;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=22321339;WS=22321321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr14	22322168	rs760003	A	G	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=229;ReadPosRankSum=-0.982;SC=CATGGTAGAGAGTCACTGGAC;SOR=0.208;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=13;WE=22322176;WS=22322158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr14	22322369	rs11626323	T	C	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.509;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=14;PP=270;ReadPosRankSum=-0.193;SC=GTAGGAACCCTCAAATATAGA;SOR=1.442;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=69;TCF=25;TCR=44;TR=19;WE=22322377;WS=22322359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,19:0.26:72
chr14	22322411	rs11629404	G	C	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=251;ReadPosRankSum=-1.779;SC=AATGGTACACGTTAGCCAAAT;SOR=0.524;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=16;WE=22322419;WS=22322401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,17:0.28:61
chr14	22322523	rs11629446	G	A	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.177;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=254;ReadPosRankSum=0.412;SC=GAAGGTAAATGGAACATTATA;SOR=0.298;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=60;TCF=49;TCR=11;TR=16;WE=22322531;WS=22322513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,17:0.28:61
chr14	22322563	rs11620886	C	T	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=3.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.22;ReadPosRankSum=1.630;SOR=1.454;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,31:0.27:115
chr14	22322690	rs12878216	G	A	1415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.870;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=38;PP=986;ReadPosRankSum=-0.781;SC=TGCCCACAGGGACTGTGATGG;SOR=0.554;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=209;TCF=80;TCR=129;TR=63;WE=22322698;WS=22322680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,66:0.31:213
chr14	22322794	rs12879611	C	T	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=5.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.172;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=400;ReadPosRankSum=-1.156;SC=ATATAGAAGTCGAATAGTCCA;SOR=0.021;SbPval=0.04;Source=Platypus;TC=79;TCF=4;TCR=75;TR=25;WE=22322802;WS=22322784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,24:0.29:82
chr14	22322856	rs12884453	T	C	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=121;ReadPosRankSum=2.433;SC=CCTTGCCTCTTCCGTGAATGT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=8;WE=22322864;WS=22322846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr14	22337119	rs909075	G	C	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=36;PP=1198;ReadPosRankSum=-0.938;SC=GGGTAACAGAGTATATTAGTG;SOR=0.492;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=58;TCF=12;TCR=46;TR=46;WE=22337127;WS=22337109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,49:0.80:61
chr14	22337181	rs909076	C	T	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.257;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=708;ReadPosRankSum=0.229;SC=GGTTTCCTCTCGTTACTATGA;SOR=1.402;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=27;WE=22337189;WS=22337171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,31:0.76:41
chr14	22337393	rs876093	G	A	3616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.615;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=39;PP=2891;ReadPosRankSum=-0.995;SC=ACTTGGAAAAGGACCTCAGCT;SOR=0.604;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=116;TCR=57;TR=118;WE=22337401;WS=22337383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,127:0.68:186
chr14	22392845	rs17112255	C	T	3134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=86;PP=2543;SC=ACAGAACTGTCGGAGGGAGGT;SOR=4.407;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=7;TCR=86;TR=93;WE=22392853;WS=22392835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr14	22409517	.	ATCTCTC	A	319	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=1;HapScore=3;MGOF=9;MMLQ=28;MQ=59.62;NF=17;NR=3;PP=319;QD=16.2;SC=GGCTAAACAGATCTCTCTCTC;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=20;WE=22409547;WS=22409507;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:17,20:0.54:37
chr14	22409532	rs3045130	TC	T	506.74	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=7.533;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=4.250;QD=25.34;ReadPosRankSum=0.717;SOR=3.229;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,18:0.90:20
chr14	22409534	rs374912343	TCTCTC	T	304.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQRankSum=1.901;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.331;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,16:0.76:21
chr14	22409571	rs2178779	A	G	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=11;PP=1041;SC=AACCCGTGGAAATTCAGTGAC;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=42;WE=22409579;WS=22409561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr14	22409771	rs4982531	A	G	2428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=60;PP=1945;SC=CATACCGTAAAGAAACCACTT;SOR=2.425;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=19;TCR=60;TR=79;WE=22409779;WS=22409761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr14	22470693	rs5807105	T	TA	6097.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=37;PP=2957;SC=TATGATGTGATAGGACAGAAA;SOR=2.173;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=136;TCF=97;TCR=39;TR=128;WE=22470701;WS=22470683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr14	22470913	rs34215246	CT	C	280.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=3.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.46;ReadPosRankSum=-0.202;SOR=0.245;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,19:0.30:63
chr14	22509188	rs4982545	T	C	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=15;PP=1318;SC=GTAGCAGTCTTAACTGCAGTT;SOR=1.414;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=44;WE=22509196;WS=22509178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr14	22521012	rs2072613	C	G	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.966;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=13;PP=606;ReadPosRankSum=0.467;SC=GTCTATTGCTCTTTTTCTGAA;SOR=1.141;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=100;TCF=59;TCR=41;TR=35;WE=22521020;WS=22521002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,34:0.32:105
chr14	22521051	rs2072614	G	A	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.734;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=487;ReadPosRankSum=1.416;SC=AGGAGGTGACGCAGATTCCTG;SOR=0.489;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=92;TCF=51;TCR=41;TR=31;WE=22521059;WS=22521041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,33:0.33:101
chr14	22533887	rs3811312	C	T	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=391;ReadPosRankSum=0.680;SC=AAGAGGTGTCCTTTCTGACTG;SOR=0.643;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=19;WE=22533895;WS=22533877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr14	22534497	rs3811306	T	G	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.639;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=448;ReadPosRankSum=1.756;SC=GAGGCTGAATTTAAGAAGAAT;SOR=2.267;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=19;WE=22534505;WS=22534487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,20:0.34:59
chr14	22539108	rs2272547	C	T	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=1.333;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.79;ReadPosRankSum=1.218;SOR=0.432;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,11:0.21:53
chr14	22539116	rs2272548	G	A	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.280;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.47;ReadPosRankSum=1.323;SOR=0.389;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,12:0.20:59
chr14	22565073	rs12897143	G	A	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.496;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=38;PP=873;ReadPosRankSum=0.227;SC=GGATCAGATGGTTTAATTCCA;SOR=0.852;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=146;TCF=44;TCR=102;TR=52;WE=22565081;WS=22565063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,53:0.35:150
chr14	22573582	rs2075498	A	C	5646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=112;NR=60;PP=2965;SC=ATTTTGGCTGAAAAACGTTTT;SOR=1.479;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=172;TCF=112;TCR=60;TR=172;WE=22573590;WS=22573572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr14	22573824	rs112427980	T	TA	668.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.950;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.138;NF=8;NR=19;PP=1489;ReadPosRankSum=-0.789;SC=TGACTCTTTTTTAAAAAAACA;SOR=2.019;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=27;WE=22573833;WS=22573814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr14	22573825	rs11408894	T	A	987.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.867;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.108;NF=8;NR=23;PP=1489;ReadPosRankSum=-1.120;SC=GACTCTTTTTTAAAAAAACAG;SOR=1.839;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=31;WE=22573833;WS=22573814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,31:0.63:49
chr14	22580570	rs1040301	C	G	2696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=32;PP=2291;SC=ATGGATAAAGCTTGAGGGAGA;SOR=1.003;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=45;TCR=32;TR=77;WE=22580578;WS=22580560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr14	22580762	rs11628824	G	A	2065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.485;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=40;PP=1692;ReadPosRankSum=-0.305;SC=AAGAAGGAGAGGACTTCACCA;SOR=0.648;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=246;TCF=129;TCR=117;TR=83;WE=22580770;WS=22580752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,84:0.33:254
chr14	22591821	rs8018887	T	C	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=183;ReadPosRankSum=1.079;SC=GTCTTTATAATTAACAGCAAT;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=10;WE=22591829;WS=22591811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr14	22591984	rs200083527	G	GC	1190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=983;ReadPosRankSum=-0.647;SC=AGACCACCCAGCCCCCCTCCA;SOR=0.666;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=130;TCF=61;TCR=69;TR=38;WE=22591992;WS=22591974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,53:0.38:139
chr14	22592235	rs371388716	T	C	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=316;ReadPosRankSum=-2.511;SC=TATTGCATCGTCAGAGTCGCA;SOR=0.639;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=60;TCF=6;TCR=54;TR=21;WE=22592243;WS=22592225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,22:0.35:62
chr14	22600490	rs8014493	C	T	2782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.748;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=22;PP=2161;ReadPosRankSum=-0.683;SC=TAGAATAGAGCTCTCAGCTTC;SOR=0.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=121;TCR=34;TR=102;WE=22600498;WS=22600480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,105:0.66:159
chr14	22600863	rs3811291	G	A	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.109;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=30;PP=839;ReadPosRankSum=0.417;SC=AGACCTAACAGAGGCCACCCA;SOR=1.467;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=112;TCF=50;TCR=62;TR=45;WE=22600871;WS=22600853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,45:0.41:111
chr14	22615918	rs35208818	G	C	181.03	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=203;ReadPosRankSum=0.887;SC=GAGGCTCCTGGCTTTCTATGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=22615926;WS=22615908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr14	22616547	rs2293730	A	G	1467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.525;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=42;PP=2478;ReadPosRankSum=1.224;SC=ACATCACTGCAGCCCAGCCTG;SOR=1.278;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=83;TCF=23;TCR=60;TR=55;WE=22616562;WS=22616537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,55:0.65:85
chr14	22616554	rs34355797	C	A	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.953;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=965;ReadPosRankSum=-0.793;SC=TGCAGCCCAGCCTGGTGATAC;SOR=0.279;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=81;TCF=18;TCR=63;TR=25;WE=22616562;WS=22616537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,27:0.32:84
chr14	22631217	rs2075492	C	T	3791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=70;PP=2965;SC=AGGCAGGAGACAAGACAATCT;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=51;TCR=70;TR=121;WE=22631225;WS=22631207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr14	22631678	rs2075493	C	T	4701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=101;PP=2965;SC=GATTCACTGTCTTCTTAAACA;SOR=1.781;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=42;TCR=101;TR=143;WE=22631686;WS=22631668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr14	22636784	rs11157435	A	C	4876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=73;PP=2965;ReadPosRankSum=0.101;SC=AGGGTCATGAAAAAATATCTG;SOR=0.417;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=79;TCR=74;TR=150;WE=22636792;WS=22636774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,156:0.98:159
chr14	22636874	rs11157436	C	T	2081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=54;PP=1635;ReadPosRankSum=-0.547;SC=CCTACTTCTGCGGCACAGAGA;SOR=0.682;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=113;TCF=30;TCR=83;TR=74;WE=22636882;WS=22636864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,78:0.65:120
chr14	22636954	rs11157437	C	T	1015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=30;PP=833;SC=TCCCCTAGCACAGATGCCCAC;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=22636962;WS=22636944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	22670458	rs2075494	C	T	2055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=16;PP=1635;ReadPosRankSum=-1.161;SC=GGCCTGGAACCTCAATGTGCA;SOR=0.704;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=103;TCF=80;TCR=23;TR=70;WE=22670466;WS=22670448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,73:0.69:106
chr14	22670975	rs2242542	G	A	2168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.723;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=21;PP=1706;ReadPosRankSum=-0.197;SC=CAACCCCATAGGTATTATGGG;SOR=0.925;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=114;TCF=80;TCR=34;TR=75;WE=22670983;WS=22670965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,77:0.67:115
chr14	22690133	rs17198040	T	C	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=3.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.14;ReadPosRankSum=1.009;SOR=0.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,20:0.28:72
chr14	22690191	rs17198047	G	A	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=18.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.70;ReadPosRankSum=0.336;SOR=2.563;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,16:0.21:77
chr14	22690209	rs2272551	A	C	2422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=37;PP=1874;SC=ACAAGCAGGAACCTGGGGAAG;SOR=0.836;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=32;TCR=37;TR=69;WE=22690217;WS=22690199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
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chr14	22772123	rs2009858	C	T	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.779;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=655;ReadPosRankSum=1.202;SC=CAGTGAATGCCTCCTTCTGAA;SOR=0.807;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=111;TCF=68;TCR=43;TR=33;WE=22772131;WS=22772113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,34:0.28:120
chr14	22887459	rs3216790	CG	C	1628.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.23;MQRankSum=2.734;NF=34;NR=23;PP=1600;ReadPosRankSum=-1.922;SC=TTGAGGTTATCGGGGAAATGA;SOR=0.724;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=173;TCF=99;TCR=74;TR=57;WE=22887467;WS=22887449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,65:0.35:184
chr14	22891792	rs11626025	G	T	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.807;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=593;ReadPosRankSum=1.317;SC=GTGTCAATAGGGGTCCCTGCC;SOR=0.105;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=84;TCF=64;TCR=20;TR=29;WE=22891800;WS=22891782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,30:0.34:88
chr14	22891883	rs2072616	G	C	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FS=3.065;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.87;ReadPosRankSum=0.388;SOR=0.521;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:194,78:0.29:272
chr14	22907934	.	T	C	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.813;ClippingRankSum=0.000;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=519;ReadPosRankSum=-1.248;SC=CGGGTGGTGATGGCAAAGTGC;SOR=0.757;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=136;TCF=98;TCR=38;TR=40;WE=22907942;WS=22907924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,41:0.30:135
chr14	22924288	rs10129863	C	T	3115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.599;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=56;PP=2353;ReadPosRankSum=-0.423;SC=GGTACAACAACGTAAGTAACC;SOR=0.691;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=177;TCF=88;TCR=89;TR=117;WE=22924296;WS=22924278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,119:0.65:182
chr14	22924531	rs760020	C	G	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=24;PP=722;SC=CAGAAAGCTACCCTCCTCAAC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=22924539;WS=22924521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	22930022	rs10131866	C	G	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.738;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=37;PP=1166;ReadPosRankSum=-0.950;SC=GCAGAAACTTCCTGACTAGCA;SOR=2.072;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=87;TCF=32;TCR=55;TR=50;WE=22930030;WS=22930012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,53:0.57:93
chr14	22930038	rs1882705	C	T	2586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=52;PP=2040;SC=TAGCAATCGCCCCCTCTCAAC;SOR=1.854;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=23;TCR=52;TR=75;WE=22930046;WS=22930028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr14	22933390	rs36090939	GC	G	581.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=642;ReadPosRankSum=1.878;SC=TTTAGAAATGGCTAAGAAACC;SOR=0.830;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=62;TCF=7;TCR=55;TR=19;WE=22933398;WS=22933380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,20:0.31:64
chr14	22934658	rs11997	C	A	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.206;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=34;PP=1130;ReadPosRankSum=0.786;SC=AGCCAAACCACTTTTTCTTCA;SOR=0.748;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=191;TCF=96;TCR=95;TR=66;WE=22934666;WS=22934648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,63:0.34:188
chr14	22934808	rs59433989	C	T	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.465;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=37;PP=1185;ReadPosRankSum=0.965;SC=TCTTTTTTTACTCCTACAAGT;SOR=1.257;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=79;TCF=24;TCR=55;TR=50;WE=22934816;WS=22934798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,49:0.62:79
chr14	22934918	rs11627907	C	A	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.727;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=282;ReadPosRankSum=-0.399;SC=CCTCATGAGGCAAATAGGCCT;SOR=0.320;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=68;TCF=40;TCR=28;TR=18;WE=22934926;WS=22934908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,21:0.30:69
chr14	22938211	rs17198805	G	A	1381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.995;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=40;PP=1084;ReadPosRankSum=2.530;SC=GGCCTTATCCGGTACCAGAAT;SOR=0.984;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=184;TCF=60;TCR=124;TR=56;WE=22938219;WS=22938201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,59:0.30:195
chr14	22938561	rs11850502	A	T	2284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=1;PP=1921;SC=AACAAATGAAACTACTTACAG;SOR=6.244;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=68;TCF=67;TCR=1;TR=68;WE=22938569;WS=22938551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr14	22942890	rs2254272	G	T	1987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=19;PP=1630;SC=TGTTGCCACCGCTGGAGCAGC;SOR=1.688;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=59;WE=22942898;WS=22942880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	22947818	rs2877437	T	A	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=351;ReadPosRankSum=-1.151;SC=CAGCCCGTGATGGAAGGGTCT;SOR=0.612;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=20;WE=22947826;WS=22947808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,19:0.31:62
chr14	22947903	rs1872159	C	T	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.331;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=14;PP=812;ReadPosRankSum=-1.172;SC=GGAAAGGGAACGAAACTGACA;SOR=1.457;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=155;TCF=94;TCR=61;TR=49;WE=22947911;WS=22947893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,50:0.31:160
chr14	22951893	rs1483968	C	T	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=1;PP=629;ReadPosRankSum=1.369;SC=AAACCTGTAGCTTAATGAAGA;SOR=1.007;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=50;TCF=48;TCR=2;TR=28;WE=22951901;WS=22951883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr14	22952088	rs227861	G	A	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.007;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=40;PP=1016;ReadPosRankSum=-2.161;SC=GGGAAGGGGGGATTCAAACAC;SOR=0.533;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=192;TCF=66;TCR=126;TR=62;WE=22952096;WS=22952078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,61:0.31:197
chr14	22958350	.	ATGCCTGCCTGCCTGCC	A	520.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.654;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.02;ReadPosRankSum=-0.152;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr14	22961854	rs17255862	A	G	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.099;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=15;PP=991;ReadPosRankSum=-1.760;SC=ATGGAAACAAACTGGTCTTTG;SOR=1.432;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=170;TCF=106;TCR=64;TR=53;WE=22961862;WS=22961844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,62:0.34:181
chr14	22963029	rs141311235	A	G	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.531;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=172;ReadPosRankSum=0.114;SC=TCATGGGGACATTTCTAAACC;SOR=0.970;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=12;WE=22963037;WS=22963019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,13:0.30:44
chr14	22963632	rs11372266	G	GC	708.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=0;PP=878;SC=TCTGGCCAGAGCCAGCTGCCC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=18;WE=22963654;WS=22963622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	22963646	rs226985	T	C	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.186;NF=15;NR=0;PP=323;ReadPosRankSum=1.160;SC=GCTGCCCTCATAGGAATTAAT;SOR=1.220;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=15;WE=22963654;WS=22963622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr14	22964840	rs137998884	T	TG	956.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=1;PP=948;SC=CCTGCCATGCTGGAGGTGGCT;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=22964848;WS=22964830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
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chr14	22965118	rs11334443	TC	T	818.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=905;SC=GTTGATGAATTCCTGGCAATC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=23;WE=22965126;WS=22965108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	22965144	rs11334442	AC	A	487.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=536;SC=GATTAGGTCAACGAAGAAGTA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=22965152;WS=22965134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	22972622	rs226990	A	G	3027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=3;PP=2574;SC=CAGCCCGATTAAAAGTTTTCA;SOR=5.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=86;TCR=3;TR=87;WE=22972630;WS=22972612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr14	22972742	rs2170810	G	A	2194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.954;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=60.22;MQRankSum=0.789;NF=54;NR=42;PP=1655;ReadPosRankSum=-0.025;SC=GTGTGGCTCTGGCAACACAGG;SOR=0.606;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=274;TCF=158;TCR=116;TR=96;WE=22972750;WS=22972732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,100:0.35:287
chr14	22972783	rs5807141	AC	A	9873.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=166;PP=2951;SC=GGACAACTTTACCAAGTAAAA;SOR=1.496;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=224;TCF=51;TCR=173;TR=215;WE=22972791;WS=22972773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr14	22972815	rs2170811	C	T	1551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.643;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.023;NF=15;NR=53;PP=1146;ReadPosRankSum=-1.161;SC=TGGATGTTTCCAAGTGAAGTG;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=207;TCF=47;TCR=160;TR=68;WE=22972823;WS=22972805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,70:0.33:213
chr14	22972844	rs5020726	A	G	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.032;NF=5;NR=44;PP=860;ReadPosRankSum=0.769;SC=CACTCTGTTCATTTTTTGTTT;SOR=0.591;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=149;TCF=14;TCR=135;TR=49;WE=22972852;WS=22972834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,50:0.33:153
chr14	22973923	rs4343183	T	C	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.624;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=155;ReadPosRankSum=0.437;SC=GAGGTCAAGGTTACAGTGAGC;SOR=0.061;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=10;WE=22973931;WS=22973920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr14	22973960	rs4343184	T	C	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=202;ReadPosRankSum=0.709;SC=CACTCCAGCCTGGACAACAAA;SOR=0.616;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=12;WE=22973968;WS=22973950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,12:0.30:40
chr14	22974041	rs4343185	T	G	2060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=7.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.752;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=15;PP=1567;ReadPosRankSum=-0.802;SC=AGGAAGGAGATGAAGAAAATT;SOR=0.370;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=227;TCF=194;TCR=33;TR=82;WE=22974049;WS=22974031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,83:0.36:230
chr14	22974150	rs11324184	TC	T	9746.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=174;PP=2966;SC=TCACCGTTATTCCCCTGTAAG;SOR=1.456;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=242;TCF=60;TCR=182;TR=232;WE=22974158;WS=22974140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr14	22974256	rs3811207	A	C	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=6.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=36;PP=808;ReadPosRankSum=-1.295;SC=CATGTGTTAAACTGATAAAAC;SOR=0.457;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=77;TCF=0;TCR=77;TR=36;WE=22974264;WS=22974246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,34:0.43:79
chr14	22975476	rs3751470	A	G	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=0;PP=740;ReadPosRankSum=-0.255;SC=TCAGGAAGGAAGGGCTGACAC;SOR=1.923;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=28;WE=22975484;WS=22975466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,28:0.72:39
chr14	22975700	rs969914	T	G	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.725;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=41;PP=883;ReadPosRankSum=0.806;SC=AAGTATATCTTTTCTCATTTC;SOR=0.609;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=148;TCF=35;TCR=113;TR=55;WE=22975708;WS=22975690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,56:0.38:149
chr14	22975728	rs3794450	G	A	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.271;NF=6;NR=32;PP=651;ReadPosRankSum=-0.719;SC=TGTTATGTCCGTAAATCATAT;SOR=0.546;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=104;TCF=14;TCR=90;TR=38;WE=22975736;WS=22975718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,39:0.38:104
chr14	22975755	rs3794451	T	C	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.329;NF=0;NR=16;PP=847;ReadPosRankSum=0.095;SC=GTTCTTCTTATGCACACACAC;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=0;TCR=51;TR=16;WE=22975764;WS=22975745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr14	22976559	rs1872160	A	T	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.998;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=253;ReadPosRankSum=0.772;SC=ATGTATCCCCAAATCTCCTTT;SOR=0.234;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=15;WE=22976567;WS=22976549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr14	22976790	rs170543	C	T	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=807;SC=AGTTTTGCTCCTTGTTGCGCA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=22976798;WS=22976780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr14	22977669	rs1010116	G	A	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.680;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=728;ReadPosRankSum=-0.556;SC=GTGACTGCACGGGAGAGGAGA;SOR=0.598;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=131;TCF=50;TCR=81;TR=45;WE=22977677;WS=22977659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,48:0.35:139
chr14	22978335	rs226997	C	T	1621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=13;PP=1367;SC=TGAATTATGGCGGTGCTACAA;SOR=2.137;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=40;TCR=13;TR=53;WE=22978343;WS=22978325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr14	22978451	rs11443893	G	GC	2414.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=39;PP=2377;SC=GGAAGCGACAGCACCCTTAGG;SOR=1.681;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=57;TCF=15;TCR=42;TR=52;WE=22978459;WS=22978441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr14	22978516	rs226998	G	A	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=33;PP=997;SC=CTTATCTGCCGTGATATAGCA;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=40;WE=22978524;WS=22978506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	22978577	rs226999	A	G	434.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5216;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=357;ReadPosRankSum=-0.299;SC=TCAGGGGAGGAGAAACATGCT;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=15;WE=22978585;WS=22978567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,15:0.88:17
chr14	22979847	rs5807144	G	GA	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=9.578;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=1.178;QD=17.82;ReadPosRankSum=3.617;SOR=2.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,56:0.84:67
chr14	22982069	rs11444527	A	AG	497.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=11;PP=508;SC=TCTCCCCTCCAGGCTGGAAAA;SOR=4.047;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=12;WE=22982077;WS=22982059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	22984499	rs227027	C	T	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=1;PP=679;SC=GCCTATTGTCCGGTTGTTACA;SOR=4.548;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=23;WE=22984508;WS=22984489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr14	22984500	rs144430862	G	GGTT	1353.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=1;PP=1102;SC=CCTATTGTCCGGTTGTTACAG;SOR=4.680;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=22;WE=22984508;WS=22984489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	22985463	rs227029	G	A	1750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=48;PP=1445;SC=CTTTAAAATGGGATATGAGTG;SOR=7.864;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=48;WE=22985471;WS=22985453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr14	22985487	rs11453171	A	AC	1270.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.98;NF=0;NR=30;PP=1328;SC=GTATGCACACAGCATGCCCAC;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=30;WE=22985495;WS=22985477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr14	22988022	rs227009	C	G	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=19;PP=556;SC=GAGGTGTGGACGGGAAGAAAC;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=22988030;WS=22988012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	22988748	rs227010	G	A	209.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=170;SC=CTTGCCGCCCGGGAGGTGCAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=22988756;WS=22988738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	22990930	rs11380759	A	AT	2582.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=12;PP=2292;SC=GGCCTAATTCAAAAGGAAGCA;SOR=2.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=56;WE=22990938;WS=22990920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr14	22993278	rs5807151	A	AG	1620.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=3;PP=1686;ReadPosRankSum=1.382;SC=AGGTTTGTGTAGGCGACCTCG;SOR=3.056;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=40;WE=22993286;WS=22993268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr14	22993491	rs227015	A	G	2088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=60;PP=1763;SC=TAATTTTTCTACCTCACACGT;SOR=8.287;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=0;TCR=60;TR=60;WE=22993499;WS=22993481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr14	22994806	rs227019	C	T	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=183;SC=CTGGAGGACCCCAGTCCTAGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=22994818;WS=22994796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	22994810	rs33919257	T	TC	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=250;SC=AGGACCCCAGTCCTAGGTAGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=22994818;WS=22994796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	22997524	rs227024	A	G	7783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=173;PP=2965;SC=TTGCAAGGGGAACCATGTTAA;SOR=2.262;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=228;TCF=55;TCR=173;TR=228;WE=22997532;WS=22997514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr14	22998590	rs5807161	AG	A	3484.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=56;PP=2970;SC=CCAACCAGGCAGGGAACTGCT;SOR=1.202;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=19;TCR=57;TR=75;WE=22998598;WS=22998580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr14	22998619	rs5807162	AC	A	2886.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=56;PP=2624;SC=TGGGAAGGGAACCCACCTTAT;SOR=1.788;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=68;TCF=10;TCR=58;TR=65;WE=22998627;WS=22998609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr14	22999179	rs11412657	T	TC	2725.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=13;PP=2163;SC=AAAGGGGGAATCCAGCCAGAG;SOR=3.258;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=56;WE=22999187;WS=22999169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr14	22999202	rs11412658	A	AG	3762.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=16;PP=2965;SC=CCCATGAGGGAGATAGCTGCA;SOR=2.910;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=82;TCF=66;TCR=16;TR=80;WE=22999210;WS=22999192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr14	23000062	rs227003	T	C	6511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=120;NR=74;PP=2965;SC=ACCTTTGGAATTGGAACAAAG;SOR=1.207;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=122;TCR=74;TR=194;WE=23000070;WS=23000052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr14	23000185	rs227004	C	T	4668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=112;PP=2965;SC=GCCTGCTCTTCTCTGGCTGTT;SOR=2.968;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=136;TCF=24;TCR=112;TR=136;WE=23000193;WS=23000175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr14	23001038	.	G	C	1817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.113;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=47;PP=1560;ReadPosRankSum=-0.292;SC=AAATGAGCTGGAGTTTTTTAG;SOR=1.151;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=103;TCF=28;TCR=75;TR=63;WE=23001046;WS=23001028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,65:0.60:108
chr14	23001388	rs227006	T	A	1348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=4;PP=1108;SC=CTTTTCCCTATGTAGATCATG;SOR=4.073;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=40;WE=23001396;WS=23001378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	23002265	rs11289756	GC	G	1026.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=0;PP=1182;SC=GGGTCCAATGGCCCTCTTTGG;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=29;WE=23002273;WS=23002255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr14	23005041	rs5807163	A	AG	7602.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=85;NR=85;PP=2957;SC=TGGCAATCCTAGCTATGGCCC;SOR=1.059;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=91;TCR=92;TR=170;WE=23005049;WS=23005031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr14	23006663	rs11396434	G	GC	1294.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=33;PP=1564;SC=AATGGCCACAGCACCCCCATC;SOR=4.921;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=35;WE=23006671;WS=23006653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	23018665	rs1263653	C	G	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.267;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=269;ReadPosRankSum=1.517;SC=ACAGGATTGCCGAAGTGATGA;SOR=1.041;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=19;WE=23018673;WS=23018655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,19:0.35:54
chr14	23019657	rs1263658	C	G	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=4.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=179;ReadPosRankSum=0.308;SC=CGGGTCTCTGCGTGCATCCTA;SOR=0.245;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=10;WE=23019665;WS=23019647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr14	23020489	rs371247	T	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=158;ReadPosRankSum=-0.379;SC=CACCATCACATCCCTAACAGT;SOR=0.933;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=11;WE=23020497;WS=23020479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,11:0.23:47
chr14	23020688	rs11462449	G	GC	6086.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=68;PP=2957;SC=CCCCGGCAATGCACCAACTGG;SOR=0.934;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=140;TCF=69;TCR=71;TR=133;WE=23020696;WS=23020678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr14	23020820	rs5807168	G	GC	5820.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=62;PP=2957;SC=GGCTGCTGCAGCTCCGCTGGC;SOR=1.241;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=118;TCF=39;TCR=79;TR=98;WE=23020833;WS=23020810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr14	23020825	rs3699	G	C	5796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=60;PP=2922;SC=CTGCAGCTCCGCTGGCTGTGC;SOR=1.135;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=108;TCF=46;TCR=62;TR=103;WE=23020833;WS=23020810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr14	23020919	rs3700	C	T	4663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.01;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr14	23020919	.	CGG	TGC,TGG	1849	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=20,61;NR=16,57;PP=731,1849;QD=21.7907743017;SC=CTCTAGGTCCCGGAGAATGTT;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=118;TCF=61;TCR=57;TR=36,118;WE=23020929;WS=23020909;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.31:118
chr14	23020921	rs3701	G	C	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.04;ReadPosRankSum=0.227;SOR=0.764;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,44:0.34:131
chr14	23020970	rs3702	G	T	4066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=59;PP=2965;SC=CATAAAGAAAGACATAGTATT;SOR=0.740;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=59;TCR=60;TR=118;WE=23020978;WS=23020960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr14	23021039	rs9125	G	A	3128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=70;PP=2398;SC=TATGCTGTGTGTCTGGGCGTG;SOR=1.958;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=29;TCR=70;TR=99;WE=23021047;WS=23021029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr14	23025758	rs10873025	G	A	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.95;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr14	23025932	rs12888861	A	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=59;ReadPosRankSum=0.613;SC=AGGAATCTGCAGGTCTCAGGG;SOR=1.048;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=6;WE=23025940;WS=23025922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr14	23026369	rs33982989	C	CG	701.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=1;PP=740;SC=GGCTGGAGTCCGGATCCACCA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=23026377;WS=23026359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	23027743	rs4982639	G	C	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.174;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=396;ReadPosRankSum=-1.474;SC=GCCAGAACACGCCACGTCACT;SOR=0.242;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=63;TCF=3;TCR=60;TR=22;WE=23027751;WS=23027733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,23:0.35:66
chr14	23044002	rs7621	G	T	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.622;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=582;ReadPosRankSum=-0.727;SC=ATGAGAATGAGTCAGCCAACA;SOR=1.224;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=104;TCF=78;TCR=26;TR=33;WE=23044010;WS=23043992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,37:0.32:114
chr14	23058084	rs1051101	A	G	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=356;ReadPosRankSum=-0.888;SC=AAGGTACTCCAGTCCGCGCCC;SOR=0.399;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=6;TCR=69;TR=22;WE=23058092;WS=23058074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,22:0.29:75
chr14	23074899	rs1242924	C	T	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=430;ReadPosRankSum=0.778;SC=AGAGCGCTGTCGGGAGGTGGT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=19;WE=23074907;WS=23074889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr14	23078969	rs140776429	C	CT	71.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=45;ReadPosRankSum=-1.559;SC=TTTGGAATATCTTTTTTTTTT;SOR=0.160;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=5;WE=23078977;WS=23078959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr14	23079730	rs1242933	A	G	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.528;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=360;ReadPosRankSum=1.486;SC=CAGGAATAAAAGGCCATCCCA;SOR=3.486;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=15;WE=23079738;WS=23079720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr14	23102969	rs1753430	G	A	2132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=38;PP=1835;ReadPosRankSum=-0.775;SC=ATGCCACTAGGAATGATGACT;SOR=0.379;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=65;WE=23102977;WS=23102959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr14	23103544	rs80323992	A	G	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.305;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=686;ReadPosRankSum=1.149;SC=GAAGAAGTACATGGGGGTGTG;SOR=1.000;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=134;TCF=52;TCR=82;TR=46;WE=23103552;WS=23103534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,47:0.34:140
chr14	23235697	rs1957373	C	T	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.683;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=11;PP=903;ReadPosRankSum=0.147;SC=CTTCAACTTCCTTTCAATCTC;SOR=1.152;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=136;TCF=94;TCR=42;TR=47;WE=23235705;WS=23235687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,47:0.33:143
chr14	23235808	rs1957374	G	A	1652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.822;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=31;PP=1170;ReadPosRankSum=-0.507;SC=CGCCTGATCTGCGGCTACAAT;SOR=0.860;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=186;TCF=97;TCR=89;TR=67;WE=23235816;WS=23235798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,73:0.37:195
chr14	23236524	rs8572	C	T	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=15;PP=1072;SC=CTATTCCCAGCAGCCCCGTGC;SOR=1.455;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=43;WE=23236532;WS=23236514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr14	23239512	rs2075846	A	G	2068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.406;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=38;PP=1660;ReadPosRankSum=0.010;SC=TTCCTTCCTTATTTCATCCAG;SOR=0.818;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=263;TCF=128;TCR=135;TR=85;WE=23239520;WS=23239502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,89:0.32:276
chr14	23239880	rs1957502	G	A	1232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=4;PP=1110;SC=GTGAACTGGGGTTGGAGGGTA;SOR=4.351;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=38;WE=23239888;WS=23239870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	23240328	rs8786	T	A	3856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=6.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.245;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=46;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.175;SC=TCCCCCAGCGTGTTGTACATG;SOR=0.847;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=194;TCF=123;TCR=71;TR=132;WE=23240336;WS=23240318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,134:0.68:198
chr14	23240713	rs148216086	T	TAGC	5405.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.986;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.283;NF=22;NR=74;PP=2976;ReadPosRankSum=0.082;SC=CCAATATCCCTAGCAGCAGCA;SOR=0.546;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=201;TCF=49;TCR=152;TR=96;WE=23240721;WS=23240703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,130:0.65:200
chr14	23242828	rs1061040	T	C	1829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.464;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=40;PP=1447;ReadPosRankSum=-1.128;SC=TTTAGTTAGATTTGGGATCCC;SOR=0.100;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=94;TCF=30;TCR=64;TR=66;WE=23242836;WS=23242818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,67:0.71:94
chr14	23244929	rs3751485	A	T	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=359;ReadPosRankSum=-0.021;SC=ACAAGAAGAAAGAGGTTGTGG;SOR=0.997;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=17;WE=23244937;WS=23244919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr14	23245252	rs3829406	A	G	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.33;ReadPosRankSum=1.520;SOR=0.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,30:0.27:113
chr14	23245301	rs3850290	T	C	1334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.891;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=32;PP=1024;ReadPosRankSum=-1.630;SC=CTAAATGAACTCCTTTCAAGG;SOR=1.378;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=67;TCF=17;TCR=50;TR=41;WE=23245309;WS=23245291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,45:0.62:72
chr14	23248112	rs1805061	A	G	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.907;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=542;ReadPosRankSum=-2.057;SC=CAAATGATGAACCCTCAAAGG;SOR=0.334;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=42;TCF=15;TCR=27;TR=27;WE=23248120;WS=23248102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,29:0.67:43
chr14	23282110	rs8018462	A	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.272;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=204;ReadPosRankSum=0.844;SC=CCCACTTACAAATGCAGGCAG;SOR=0.083;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=13;WE=23282118;WS=23282100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr14	23282449	rs1805059	C	T	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.581;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=31;PP=1011;ReadPosRankSum=1.803;SC=CAAAGATGCCCGAGCCGATCA;SOR=0.626;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=194;TCF=82;TCR=112;TR=56;WE=23282457;WS=23282439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,57:0.29:199
chr14	23282699	rs3829407	A	T	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=246;ReadPosRankSum=0.713;SC=GCAATTACATAGAACCTCTAC;SOR=0.213;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=16;WE=23282707;WS=23282689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr14	23282750	rs7157654	A	C	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=143;ReadPosRankSum=-0.279;SC=TCACCAACCAATGCGGAGACC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=8;WE=23282758;WS=23282740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr14	23286343	rs10130537	T	A	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=6.532;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.23;MQRankSum=1.299;QD=28.60;ReadPosRankSum=-1.120;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr14	23286350	rs111507412	T	TATTTTTTA	484.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.82;MQRankSum=1.301;QD=32.32;ReadPosRankSum=-0.941;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr14	23286528	rs150800938	TTTTTA	T	469.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.837;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=537;ReadPosRankSum=0.871;SC=TATTTCGGTATTTTTATTTTA;SOR=1.244;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=11;WE=23286540;WS=23286518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr14	23291924	rs11625306	C	T	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.621;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=44;PP=1092;ReadPosRankSum=0.085;SC=ACAACTGCCTCCGGCCCCGAG;SOR=2.342;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=59;TCF=2;TCR=57;TR=45;WE=23291932;WS=23291914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,46:0.75:61
chr14	23299135	rs1135641	G	T	2756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.326;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=24;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.985;SC=GCTGCTTTAGGGACTGTTCTC;SOR=1.051;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=121;TCF=74;TCR=47;TR=67;WE=23299154;WS=23299125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,69:0.55:126
chr14	23299146	rs146757783	T	C	2894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.172;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=26;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.715;SC=GACTGTTCTCTTCAGTGAGTG;SOR=1.075;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=132;TCF=81;TCR=51;TR=74;WE=23299154;WS=23299125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,76:0.55:138
chr14	23299286	rs4982685	T	C	5388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=70;PP=2965;SC=CACTGCAGCGTAGCCGCTTGG;SOR=0.978;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=93;TCR=70;TR=163;WE=23299294;WS=23299276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr14	23300095	rs9646148	T	G	4088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=90;NR=25;PP=2965;SC=TAGTAGCAAATCCAGGACTAG;SOR=2.500;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=90;TCR=25;TR=115;WE=23300103;WS=23300085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr14	23302585	rs12050397	T	A	2421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=27;PP=1868;SC=GGTGATGCAGTCCATCTCTAA;SOR=1.300;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=74;TCF=46;TCR=28;TR=73;WE=23302593;WS=23302575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr14	23306048	rs1042703	C	T	3328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=24;PP=2661;SC=CCCAAGACCCCCCCGTTGTCT;SOR=2.124;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=72;TCR=24;TR=96;WE=23306056;WS=23306038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr14	23311042	rs17879412	CT	C	1267.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=14;PP=992;SC=CACAGCAAGTCTTACCCAACA;SOR=0.760;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=22;WE=23311052;WS=23311036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	23311044	rs57542488	T	C	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=14;PP=666;SC=CAGCAAGTCTTACCCAACACT;SOR=0.760;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=22;WE=23311052;WS=23311036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	23312554	rs2236302	C	G	2578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.696;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=54;PP=2065;ReadPosRankSum=-0.423;SC=TCATGGCACCCTTTTACCAGT;SOR=0.407;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=167;TCF=89;TCR=78;TR=108;WE=23312562;WS=23312544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,110:0.64:172
chr14	23312718	rs2236303	C	T	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.488;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=338;ReadPosRankSum=1.030;SC=TTGCAGTCTCCGCACCGCCCC;SOR=1.044;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=20;WE=23312726;WS=23312708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr14	23312863	rs2236304	C	G	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=515;ReadPosRankSum=-1.879;SC=ATCTGTCTGTCCTTCCGTCCC;SOR=0.539;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=52;TCR=7;TR=24;WE=23312871;WS=23312855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,25:0.40:62
chr14	23313182	rs2236308	A	G	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=144;ReadPosRankSum=-1.877;SC=AGGCAGGTGGATCACCTGAGG;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=10;WE=23313190;WS=23313172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,10:0.24:42
chr14	23314675	rs911912	C	T	1292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=31;PP=1017;SC=TGGAAAACAACGGCGATGATA;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=36;WE=23314683;WS=23314665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	23352398	.	T	G	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.72;MQRankSum=-2.511;QD=4.94;ReadPosRankSum=2.610;SOR=0.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr14	23355548	rs3751490	G	A	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=507;ReadPosRankSum=0.321;SC=GCACTCACTTGCAATCAGACC;SOR=0.821;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=23;WE=23355556;WS=23355538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr14	23371255	rs61680322	G	GGGC	2367.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FS=0.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.70;MQRankSum=1.665;QD=9.04;ReadPosRankSum=-0.404;SOR=0.628;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:192,70:0.27:262
chr14	23373986	rs1043209	G	A	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=305;ReadPosRankSum=-0.396;SC=GTATGCAGCAGGTTAATCACG;SOR=0.818;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=51;TCF=47;TCR=4;TR=16;WE=23373994;WS=23373976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,18:0.35:52
chr14	23374435	rs2295680	G	A	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.826;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=646;ReadPosRankSum=-1.180;SC=TCCGATCTGAGATGATACGTA;SOR=0.863;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=109;TCF=66;TCR=43;TR=32;WE=23374443;WS=23374425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,30:0.28:108
chr14	23374862	rs2295682	C	T	2056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.961;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=50;PP=1554;ReadPosRankSum=-0.540;SC=TGTGTCCATACCTATAACTAA;SOR=0.479;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=163;TCF=53;TCR=110;TR=77;WE=23374870;WS=23374852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,80:0.48:168
chr14	23391533	rs144411999	C	CACAA	608.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=4.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.51;ReadPosRankSum=0.008;SOR=1.422;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,17:0.27:64
chr14	23391913	rs8007089	T	C	2413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=47;PP=2028;SC=AAGAAGCCCGTACCCCTCTAG;SOR=1.340;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=25;TCR=48;TR=72;WE=23391921;WS=23391903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr14	23394007	rs1956880	T	C	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.413;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;ReadPosRankSum=0.396;SC=GCTTTCTGAGTTTTAGTAAGA;SOR=1.158;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=12;WE=23394015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,12:0.27:45
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chr14	23424186	rs2016392	A	G	1752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=8;PP=1313;SC=CACCCACCTCAGCCTCCCAAA;SOR=3.407;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=49;TCR=8;TR=57;WE=23424194;WS=23424176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr14	23426182	rs2273626	C	A	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.846;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=453;ReadPosRankSum=-2.663;SC=TCGGCTGGGGCGGGCTGGCCA;SOR=0.939;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=107;TCF=34;TCR=73;TR=33;WE=23426190;WS=23426172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,32:0.30:106
chr14	23447662	.	G	A	2252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.202;ClippingRankSum=0.000;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.673;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=38;PP=1796;ReadPosRankSum=-1.384;SC=TGCCTGAGAAGAGAAAAGTGT;SOR=0.603;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=129;TCF=74;TCR=55;TR=85;WE=23447670;WS=23447652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,86:0.64:134
chr14	23451439	.	C	G	4319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.838;ClippingRankSum=0.000;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.519;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=106;PP=2962;ReadPosRankSum=0.383;SC=CCGAACTTCTCCAGCAGGCGA;SOR=0.755;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=237;TCF=77;TCR=160;TR=155;WE=23451447;WS=23451429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,161:0.65:246
chr14	23451481	.	C	G	2956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.980;ClippingRankSum=0.000;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.880;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=86;PP=2339;ReadPosRankSum=-0.405;SC=TCCATGCCCTCGGGCCTGGGG;SOR=1.130;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=157;TCF=32;TCR=125;TR=105;WE=23451489;WS=23451471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,108:0.67:161
chr14	23456315	rs1043675	T	C	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=615;ReadPosRankSum=-2.136;SC=GAGGCAAATTTGCTTTCTCAG;SOR=0.382;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=27;WE=23456323;WS=23456305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr14	23459156	rs11624528	G	A	3466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.644;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=40;PP=2577;ReadPosRankSum=0.149;SC=TCCCTCCACAGCCTAAGAAGG;SOR=0.822;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=156;TCF=95;TCR=61;TR=106;WE=23459164;WS=23459146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,118:0.70:168
chr14	23504238	rs4144360	G	A	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=12;PP=360;SC=CAAAAAGAAGGGCCAGATGCG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=23504246;WS=23504228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	23512430	rs78162644	C	T	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.155;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=620;ReadPosRankSum=0.160;SC=AGCCTCACAGCGTCTGGCTCT;SOR=1.569;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=27;WE=23512438;WS=23512420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,28:0.72:39
chr14	23518791	rs2295689	A	G	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.62;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	23518918	rs11623976	T	C	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=4.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.42;ReadPosRankSum=-2.192;SOR=0.335;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,25:0.22:115
chr14	23523244	rs11625828	C	G	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.873;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=4;PP=990;ReadPosRankSum=0.134;SC=TCTCTAAGCTCCAACAGAGAG;SOR=0.390;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=63;TCF=58;TCR=5;TR=41;WE=23523252;WS=23523234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,41:0.65:63
chr14	23524137	rs11418548	T	TG	1054.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.050;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.798;NF=19;NR=25;PP=897;ReadPosRankSum=0.724;SC=GAACAACCGATGGGGGGGGAT;SOR=0.466;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=92;TCF=35;TCR=57;TR=44;WE=23524145;WS=23524127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,44:0.63:70
chr14	23524234	rs368403267	C	T	2594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.105;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=12;PP=2016;ReadPosRankSum=1.156;SC=CTCCAGAAGACGGGAACTGGG;SOR=0.474;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=129;TCF=113;TCR=16;TR=86;WE=23524242;WS=23524224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,90:0.68:132
chr14	23530908	rs56402910	C	T	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=16;PP=558;SC=GATGGCCGGGCGCGGTGGCTC;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=23530916;WS=23530898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	23532865	rs57315948	A	G	1578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=39;PP=1328;SC=GTTCCCCGGTAAGAGTAGCAG;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=45;WE=23532873;WS=23532855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr14	23549379	rs941719	C	G	4591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=71;PP=2965;SC=ATGAGGACAGCGGGGGCTGGG;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=60;TCR=72;TR=131;WE=23549387;WS=23549369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr14	23559973	rs8020434	T	C	114.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=88;SC=GTTGGAAGGCTTTTTTCTAAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=23559981;WS=23559963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	23571671	rs4444236	A	T	5974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=99;PP=2965;SC=CCTTGTCACTAGTTGCCTTGT;SOR=0.986;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=172;TCF=73;TCR=99;TR=172;WE=23571679;WS=23571661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr14	23572776	rs148655160	T	TAAAAC	2437.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=1;PP=2624;SC=AAAAGCAAAATAAAACAAAAC;SOR=7.903;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=65;TCF=62;TCR=3;TR=47;WE=23572784;WS=23572766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr14	23574095	.	GGCA	G	2758	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MMLQ=24;MQ=60.53;NF=6;NR=51;PP=2758;QD=20;SC=GACTAGTGGCGGCAGCAGCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=89;TCF=25;TCR=64;TR=57;WE=23574105;WS=23574085;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:32,57:0.64:89
chr14	23574112	rs57331962	CA	C	3715.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.86;QD=42.71;SOR=3.083;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr14	23574114	rs55686792	GCA	G	3715.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.85;QD=41.75;SOR=3.134;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr14	23607271	rs1569951	C	T	2227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.235;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=43;PP=1583;ReadPosRankSum=0.085;SC=AAGGAGAGGTCACCACTCCCC;SOR=0.344;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=111;TCF=47;TCR=64;TR=78;WE=23607279;WS=23607261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,85:0.73:117
chr14	23609916	rs10151002	A	T	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=12;PP=326;SC=CCCACCTCTCACCCCTCCCTG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=23609924;WS=23609906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	23612489	rs2273394	C	G	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=442;ReadPosRankSum=0.452;SC=ACAAGCAGAACTGCTCCCTCA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=20;WE=23612497;WS=23612479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
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chr14	23634395	rs139138985	C	G	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=135;ReadPosRankSum=-0.111;SC=CGGCTGCGCTCCAGCCTGAGT;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=7;WE=23634403;WS=23634385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr14	23727902	rs35193725	CTT	C	355.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=5.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=0.000;QD=11.12;ReadPosRankSum=2.798;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
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chr14	23729750	rs2064483	G	A	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=382;ReadPosRankSum=-0.797;SC=CCTACTGGGAGTCTTAGCAAC;SOR=0.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=63;TCF=51;TCR=12;TR=21;WE=23729758;WS=23729740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,21:0.34:61
chr14	23732091	rs11625337	AT	GC	2933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FS=8.779;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.84;ReadPosRankSum=-0.383;SOR=0.379;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:282,92:0.25:374
chr14	23732300	rs34260336	G	GT	297.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=2.567;QD=4.44;ReadPosRankSum=-0.232;SOR=0.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,21:0.31:67
chr14	23734027	rs35272583	GT	G	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQRankSum=-1.054;QD=6.47;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr14	23744800	rs148005528	ACAT	A	252.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=1.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.02;ReadPosRankSum=-0.914;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,9:0.25:36
chr14	23745533	rs10131813	C	T	3420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=76;PP=2898;SC=GGTTTAGAGGCGGCAGTAGCT;SOR=2.036;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=114;TCF=38;TCR=76;TR=109;WE=23745541;WS=23745523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr14	23777374	rs910332	A	G	2163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=64;PP=1920;SC=CTGGAGACGCAGCTGGCTGAC;SOR=5.549;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=4;TCR=64;TR=68;WE=23777382;WS=23777364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr14	23789096	rs10640563	C	CTT	6824.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=116;PP=2930;SC=TAATGAGTCACTTGATTTTTT;SOR=3.378;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=149;TCF=13;TCR=136;TR=126;WE=23789104;WS=23789086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr14	23792019	rs8020117	T	C	1527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=0;PP=1341;SC=TTCAATTTATTGAATATTTAG;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=44;WE=23792027;WS=23792009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr14	23816577	rs73604504	C	T	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=11;PP=465;ReadPosRankSum=0.239;SC=GGCTGTGGGGCCAGGTGGAGG;SOR=0.653;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=20;WE=23816585;WS=23816567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr14	23816998	rs12896494	T	C	1953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.093;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=41;PP=1479;ReadPosRankSum=-1.806;SC=CGCAGCCTTCTACAGTGCTGA;SOR=0.540;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=79;TCF=27;TCR=52;TR=63;WE=23817006;WS=23816988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,68:0.81:84
chr14	23848311	rs723840	C	T	3336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.184;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=50;PP=2666;ReadPosRankSum=0.769;SC=CCTCCCGGGACGGAGCTGCCA;SOR=0.459;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=163;TCF=97;TCR=66;TR=119;WE=23848319;WS=23848301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,120:0.72:166
chr14	23851400	rs453361	C	T	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=543;ReadPosRankSum=2.479;SC=CCCAGGGATCCTGTGGTCCCA;SOR=0.396;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=23;WE=23851408;WS=23851390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr14	23851874	rs178636	A	G	2636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=78;PP=2094;ReadPosRankSum=-1.055;SC=AGGCACCCATACCTCATGCAT;SOR=0.593;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=105;TCF=9;TCR=96;TR=86;WE=23851882;WS=23851864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,88:0.81:108
chr14	23852550	.	G	A	22	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5001;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=22;QD=18.9237375157;SC=GAGGGTGGGAGAAGCTGGTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=3;WE=23852558;WS=23852540;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,3:0.33:9
chr14	23854155	rs8004990	G	A	1494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.559;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=5;PP=1275;ReadPosRankSum=1.206;SC=CCTTCTCCTCGGCGTTTCTGC;SOR=1.201;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=71;TCF=63;TCR=8;TR=52;WE=23854163;WS=23854145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,53:0.73:73
chr14	23854324	rs178638	A	G	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.621;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=35;PP=930;ReadPosRankSum=1.220;SC=TTTCTCCAGAAAGAATTAAAG;SOR=3.003;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=38;WE=23854332;WS=23854314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,37:0.84:44
chr14	23854352	rs178639	A	T	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=648;ReadPosRankSum=-0.683;SC=TTTTTTTTTTAAAACAACAAG;SOR=1.536;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=24;WE=23854360;WS=23854341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr14	23855320	rs382872	G	A	6513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.328;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.584;NF=130;NR=104;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.253;SC=GGACCGCATCGTCCAGCTGGA;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=314;TCF=180;TCR=134;TR=234;WE=23855328;WS=23855310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,241:0.76:319
chr14	23855426	rs45520434	C	T	2977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.610;NF=17;NR=88;PP=2434;ReadPosRankSum=-0.846;SC=TGCAGTAACCCAGGGGCAGGA;SOR=0.655;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=146;TCF=22;TCR=124;TR=105;WE=23855434;WS=23855416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,105:0.72:146
chr14	23855478	rs396024	C	G	1414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.423;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=40;ReadPosRankSum=1.626;SC=CTTCTCCAGGCCACATGGAGG;SOR=1.130;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=71;TCF=17;TCR=54;TR=50;WE=23855486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,51:0.69:74
chr14	23855569	rs178640	A	G	1242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.669;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.583;NF=26;NR=29;PP=1032;ReadPosRankSum=-0.381;SC=GGGCCTCGGCAGCCATGCGGT;SOR=0.704;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=79;TCF=40;TCR=39;TR=55;WE=23855577;WS=23855559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,51:0.66:77
chr14	23856896	rs178642	A	G	4233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.153;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.681;NF=97;NR=53;PP=2962;ReadPosRankSum=1.590;SC=CTCAAAGCCTATGTTCCCCCT;SOR=0.811;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=220;TCF=140;TCR=80;TR=150;WE=23856904;WS=23856886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,149:0.68:220
chr14	23858232	rs451794	C	T	1752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.301;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.304;NF=26;NR=36;PP=1335;ReadPosRankSum=-0.203;SC=CATGCCGGGCCGACTGCAGTG;SOR=0.917;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=80;TCF=36;TCR=44;TR=62;WE=23858240;WS=23858222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,65:0.77:84
chr14	23858271	rs368353621	AGG	A	1499.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.823;HP=14;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.355;NF=6;NR=32;PP=659;ReadPosRankSum=1.791;SC=TCGCCTGGGGAGGGGGGGGGG;SOR=1.609;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=55;TCF=11;TCR=44;TR=38;WE=23858280;WS=23858261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,43:0.83:52
chr14	23861811	rs365990	A	G	3303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.386;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=79;PP=2675;ReadPosRankSum=0.657;SC=AAGGGCCAGCACCTGCTCATC;SOR=1.708;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=167;TCF=64;TCR=103;TR=118;WE=23861819;WS=23861801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,123:0.71:173
chr14	23865885	rs452036	G	A	6857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=358;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.430;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=129;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.554;SC=CAACCACCCAGTGGGGCTCTA;SOR=0.656;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=332;TCF=154;TCR=178;TR=239;WE=23865893;WS=23865875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,254:0.72:353
chr14	23866713	rs412768	A	G	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.510;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=600;ReadPosRankSum=0.190;SC=GGGCTGGGCCATTCCACCAGG;SOR=1.734;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=29;WE=23866721;WS=23866703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,30:0.86:35
chr14	23872666	rs434273	T	C	2143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.277;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=56;PP=1711;ReadPosRankSum=-1.062;SC=CTGAGGTGGGTGGAGGGGAGG;SOR=1.466;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=116;TCF=43;TCR=73;TR=85;WE=23872674;WS=23872656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,87:0.74:117
chr14	23873092	rs388914	G	A	1858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.694;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=49;PP=1394;ReadPosRankSum=-1.294;SC=AAATGTAAACGACCTCTTTGG;SOR=1.307;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=97;TCF=30;TCR=67;TR=68;WE=23873100;WS=23873082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,70:0.71:99
chr14	23874117	rs440466	T	C	6578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.509;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.566;NF=66;NR=191;PP=2962;ReadPosRankSum=1.225;SC=CTTCCCAGCCTGGCCATCAGA;SOR=0.660;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=346;TCF=87;TCR=259;TR=257;WE=23874125;WS=23874107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,272:0.75:361
chr14	23874523	rs2277474	C	T	3767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=38;PP=2899;ReadPosRankSum=0.778;SC=CGGCCACCACCTCGGCATTGT;SOR=0.827;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=185;TCF=129;TCR=56;TR=129;WE=23874531;WS=23874513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,132:0.69:190
chr14	23881920	rs12147570	G	T	338.53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.9989;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=220;ReadPosRankSum=-0.726;SC=GGTCCTCAGGGCAGTGAAGAA;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=10;WE=23881928;WS=23881910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr14	23882144	rs2284651	T	C	1425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.956;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=43;PP=1072;ReadPosRankSum=-0.026;SC=GGACAGGGCATGGGAACAAAG;SOR=1.012;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=92;TCF=27;TCR=65;TR=59;WE=23882152;WS=23882134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,60:0.64:94
chr14	23882186	rs7149517	T	G	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=654;ReadPosRankSum=-0.011;SC=GGGGCCTGCTTTGTGGGCAGG;SOR=0.941;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=29;WE=23882194;WS=23882176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,32:0.63:51
chr14	23883111	.	G	A	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.04;ReadPosRankSum=0.168;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,43:0.22:198
chr14	23883184	rs3729833	C	T	3439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.004;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=71;PP=2684;ReadPosRankSum=0.389;SC=CCTATGCCTCCCCTGGGCCTA;SOR=1.180;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=144;TCF=55;TCR=89;TR=111;WE=23883192;WS=23883174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,119:0.79:151
chr14	23885997	rs3729828	G	A	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=251;ReadPosRankSum=0.545;SC=TGAACAAAACGGACAAAGCGG;SOR=0.616;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=13;WE=23886005;WS=23885992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr14	23886264	rs3729825	C	T	4069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.264;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=77;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.351;SC=TGGAGGGACACGCCTCTTTGC;SOR=0.593;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=192;TCF=86;TCR=106;TR=141;WE=23886272;WS=23886254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,144:0.73:196
chr14	23887645	rs7159367	T	C	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.269;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=739;ReadPosRankSum=-1.444;SC=AGGAGGTGGGTTCAGCTTTCT;SOR=1.085;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=32;WE=23887653;WS=23887635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,32:0.65:49
chr14	23888323	rs34598192	T	TG	5528.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.860;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.279;NF=76;NR=44;PP=2933;ReadPosRankSum=-0.678;SC=AGGGAAGTGATTTGATGCAAG;SOR=0.485;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=169;TCF=108;TCR=61;TR=120;WE=23888331;WS=23888313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,155:0.71:217
chr14	23888665	rs2277475	A	T	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.689;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=753;ReadPosRankSum=0.238;SC=TGTGGTGGGAACCATGGAGCC;SOR=1.183;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=30;TCR=20;TR=35;WE=23888673;WS=23888655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,33:0.69:48
chr14	23892697	.	G	C	275.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-4.560;ClippingRankSum=0.000;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=19.148;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.81;MQRankSum=-6.395;QD=2.24;ReadPosRankSum=-3.964;SOR=3.865;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,19:0.15:123
chr14	23892698	.	AGCTCTGGG	A	242.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.000;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=21.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.34;MQRankSum=-6.974;QD=1.81;ReadPosRankSum=-4.591;SOR=4.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,19:0.14:134
chr14	23892888	rs7157716	A	G	3090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.107;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=86;PP=2359;ReadPosRankSum=0.020;SC=TCAGCTTGGCAATGATCTCAT;SOR=1.598;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=157;TCF=38;TCR=119;TR=108;WE=23892896;WS=23892878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,112:0.69:162
chr14	23899027	rs735711	C	T	884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.523;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=3;PP=734;ReadPosRankSum=1.933;SC=GCTGCTTCAGCTTGAACTTCA;SOR=2.649;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=31;WE=23899035;WS=23899017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,31:0.82:38
chr14	23924704	rs2331984	G	A	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=579;SC=GCGAGATCACGCCACTGCACT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=22;WE=23924712;WS=23924694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	23924767	rs60519724	AT	A	2303.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=24;PP=2710;SC=AAAGCTGAGAATTTTTTTAAA;SOR=1.816;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=105;TCF=76;TCR=29;TR=96;WE=23924775;WS=23924754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr14	23924818	rs8005802	C	A	6498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=62;PP=2965;SC=GAAGATTAGACAAAAATATCA;SOR=0.987;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=92;TCR=63;TR=154;WE=23924838;WS=23924808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr14	23924830	rs10131038	A	G	6554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=81;NR=68;PP=2965;SC=AAAATATCAAAGCAGGATAAA;SOR=0.850;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=150;TCF=81;TCR=69;TR=149;WE=23924838;WS=23924808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr14	23938813	rs8015781	A	G	3385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=14;PP=2782;SC=GGAAGTGAGAAAGCCCTTATT;SOR=3.045;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=86;TCR=14;TR=100;WE=23938821;WS=23938803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
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chr14	23992296	rs223123	T	C	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=166;ReadPosRankSum=0.359;SC=AAGAGCCTGATGCAAAGGAAG;SOR=0.495;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=10;WE=23992304;WS=23992286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr14	23992742	rs223124	T	G	1551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FS=1.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.33;ReadPosRankSum=-0.887;SOR=0.583;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:208,83:0.29:291
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chr14	23999627	rs35092523	TA	T	1974.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FS=0.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQRankSum=1.778;QD=5.89;ReadPosRankSum=1.476;SOR=0.754;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:254,81:0.24:335
chr14	24033027	rs12897422	G	A	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=5.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.60;ReadPosRankSum=1.147;SOR=0.274;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,25:0.18:137
chr14	24429093	rs11158474	A	C	1459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.36;QD=32.44;SOR=4.271;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr14	24429249	rs3742491	G	A	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.550;NF=1;NR=18;PP=228;ReadPosRankSum=1.375;SC=CGGGGGGGGCGCCTTGGAACA;SOR=0.856;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=72;TCF=6;TCR=66;TR=19;WE=24429257;WS=24429239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,19:0.26:72
chr14	24429298	rs3742492	C	G	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.363;NF=0;NR=8;PP=79;ReadPosRankSum=-0.366;SC=GAATGCATTTCTCAAGGGCAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=8;WE=24429306;WS=24429288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,8:0.24:34
chr14	24429334	rs3742493	G	A	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=3.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.08;MQRankSum=1.145;QD=3.28;ReadPosRankSum=-1.390;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr14	24435308	rs138982419	C	A	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.632;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.391;NF=2;NR=5;PP=83;ReadPosRankSum=0.841;SC=CAAGTCCCTGCCCACAAAATA;SOR=0.148;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=7;WE=24435316;WS=24435298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr14	24439065	rs369340165	C	T	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.56;MQRankSum=-1.465;QD=14.68;ReadPosRankSum=1.981;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr14	24458162	rs2273946	G	C	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=-5.946;QD=2.15;ReadPosRankSum=-2.795;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:177,36:0.17:213
chr14	24473498	.	G	A	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.058;ClippingRankSum=0.000;DP=240;ExcessHet=3.0103;FS=127.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.34;MQRankSum=-6.082;QD=0.73;ReadPosRankSum=7.644;SOR=6.130;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,70:0.30:236
chr14	24512897	rs62000819	C	G	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.840;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.595;NF=14;NR=2;PP=338;ReadPosRankSum=-0.264;SC=ACTTGGGAGGCTGAGGCAGGA;SOR=0.223;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=16;WE=24512905;WS=24512887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr14	24512962	rs12894919	C	T	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.133;NF=12;NR=0;PP=116;ReadPosRankSum=-0.300;SC=TGCGCCACTGCACTCCAGCCT;SOR=0.100;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=50;TCR=0;TR=12;WE=24512970;WS=24512952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,12:0.24:51
chr14	24519959	rs6573541	T	C	3757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.552;NF=107;NR=19;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.287;SC=CCTGAAAAGTTATCTGATAAT;SOR=0.763;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=168;TCF=143;TCR=25;TR=126;WE=24519967;WS=24519949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,128:0.76:169
chr14	24522821	rs9972282	C	T	2259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.649;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=24;PP=1702;ReadPosRankSum=-0.866;SC=CTCTCTTATCCCATTTGACCC;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=115;TCF=77;TCR=38;TR=76;WE=24522829;WS=24522811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,82:0.68:120
chr14	24522911	rs35809913	C	G	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.51;ReadPosRankSum=0.900;SOR=0.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,30:0.26:116
chr14	24523594	rs11158525	G	A	6249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.208;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=132;NR=88;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.478;SC=CTGACGCTTCGTCTCCCCCAG;SOR=0.386;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=323;TCF=203;TCR=120;TR=220;WE=24523602;WS=24523584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,232:0.68:341
chr14	24525634	rs4982851	C	A	8234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=124;NR=146;PP=2965;SC=TGTCCCCATCCCAATGCAGAC;SOR=0.858;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=271;TCF=125;TCR=146;TR=270;WE=24525642;WS=24525624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr14	24525782	rs4982852	A	G	4618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=53;PP=2965;SC=TGCCACCTGCACCCACTGCCC;SOR=1.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=100;TCR=53;TR=153;WE=24525790;WS=24525772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr14	24526287	rs7161473	G	C	6156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=96;NR=82;PP=2965;SC=TAAGCTTCAGGAGCTGGGAGG;SOR=0.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=97;TCR=83;TR=178;WE=24526295;WS=24526277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr14	24526593	rs12431698	A	G	1036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=29;PP=839;SC=GTATAAAGCAATGTCCATAGT;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=24526601;WS=24526583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
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chr14	24529890	rs1951635	A	G	5468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=121;NR=45;PP=2965;SC=CCCTGAGACTATGCCCCCTGG;SOR=1.919;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=167;TCF=122;TCR=45;TR=166;WE=24529898;WS=24529880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr14	24533321	rs58091590	G	A	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=1.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.14;MQRankSum=-2.548;QD=20.99;ReadPosRankSum=-2.341;SOR=1.453;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,24:0.75:32
chr14	24533539	rs10146906	C	A	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.930;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.94;ReadPosRankSum=0.401;SOR=0.516;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,22:0.22:98
chr14	24534781	rs12590548	G	A	1475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.073;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=16;PP=1096;ReadPosRankSum=0.823;SC=CACAGCCTGGGGAGCCCCCTT;SOR=1.142;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=82;TCF=54;TCR=28;TR=52;WE=24534789;WS=24534771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,55:0.63:87
chr14	24542458	rs3742497	T	A	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=337;ReadPosRankSum=0.473;SC=CTGGAGATGGTGTCCCAGAGG;SOR=0.859;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=15;WE=24542466;WS=24542448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr14	24543873	rs2025256	G	A	5482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.782;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=75;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.721;SC=AAAGTAAGAAGACACAGACAG;SOR=0.578;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=258;TCF=157;TCR=101;TR=193;WE=24543881;WS=24543863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,199:0.76:263
chr14	24544248	rs2073350	C	T	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.442;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=1;PP=1117;ReadPosRankSum=2.557;SC=TCCGGGCAGGCTGAGGATGTC;SOR=2.226;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=65;TCF=63;TCR=2;TR=47;WE=24544256;WS=24544238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,46:0.74:62
chr14	24545366	rs2070342	T	C	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.066;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=1444;ReadPosRankSum=-0.898;SC=AGGTGGCCATTGACTTCACCG;SOR=0.031;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=29;WE=24545383;WS=24545356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
chr14	24545375	rs2070341	C	T	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.590;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=681;ReadPosRankSum=1.672;SC=TTGACTTCACCGCCTCCAATG;SOR=3.472;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=43;TCR=8;TR=16;WE=24545383;WS=24545356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,17:0.32:53
chr14	24545835	rs45621931	C	T	6188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.880;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=127;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.754;SC=ACAGACTCCACTCCCCAGGGC;SOR=0.904;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=306;TCF=136;TCR=170;TR=223;WE=24545843;WS=24545825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,226:0.74:307
chr14	24545984	rs2070345	G	C	2173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-6.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.689;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=51;PP=1720;ReadPosRankSum=-0.654;SC=AGGAACTCGAGGGGAGGGCAG;SOR=1.098;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=117;TCF=47;TCR=70;TR=81;WE=24545992;WS=24545974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,85:0.69:124
chr14	24563212	rs4982856	T	C	2539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=34;PP=1923;SC=GTTTGCCACCTAGTGTCTCTC;SOR=0.821;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=41;TCR=34;TR=75;WE=24563220;WS=24563202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr14	24563339	rs4982857	A	G	1507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=33;PP=1274;SC=AATGGGAGAGATGGGTTTGGC;SOR=1.659;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=48;WE=24563347;WS=24563329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr14	24567304	rs2759409	C	A	1829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=1;PP=1580;SC=GGTGGGGAAACATAAGGCCAA;SOR=6.593;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=54;TCF=53;TCR=1;TR=54;WE=24567312;WS=24567294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr14	24567498	rs3021119	A	C	10170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=140;NR=184;PP=2965;SC=GACACGGTACAACTCCCGCCT;SOR=1.008;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=326;TCF=141;TCR=185;TR=324;WE=24567506;WS=24567488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,325:1.00:325
chr14	24572709	rs190213824	T	C	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.265;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=4;PP=1111;ReadPosRankSum=0.000;SC=CCATCTTGCTTCCCCCCCAGG;SOR=1.872;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=57;TCF=51;TCR=6;TR=45;WE=24572717;WS=24572699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,46:0.79:58
chr14	24614361	rs7146672	T	G	8605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=181;NR=71;PP=2965;SC=TCCACACTTATGGACTGTGAG;SOR=1.972;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=252;TCF=181;TCR=71;TR=252;WE=24614369;WS=24614351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr14	24624741	rs2295979	C	G	6080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=138;PP=2965;SC=CTGCCCAGGGCAGCTACTGTG;SOR=2.552;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=176;TCF=38;TCR=138;TR=176;WE=24624749;WS=24624731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr14	24625031	rs4982862	C	G	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=10;PP=377;SC=TTACAGACTACTCAGAAAGAC;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=24625039;WS=24625021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	24632481	rs56212235	G	T	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.831;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=638;ReadPosRankSum=-1.523;SC=TGCAACCCAGGTTTCCCTTCC;SOR=1.426;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=27;WE=24632489;WS=24632471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,27:0.79:34
chr14	24635589	rs111232493	C	CT	169.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=0.938;QD=5.48;ReadPosRankSum=0.582;SOR=0.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr14	24644935	.	CTT	C	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.202;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.10;ReadPosRankSum=-0.229;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr14	24646406	rs10690822	G	GGAA	6504.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=26;PP=2969;SC=TGATCGCAGAGGAAGAAGCTA;SOR=2.782;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=157;TCF=125;TCR=32;TR=115;WE=24646414;WS=24646396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr14	24646469	rs17199551	T	C	5843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.031;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.843;NF=132;NR=73;PP=2962;ReadPosRankSum=0.071;SC=TGGAGCTGGATAGTCAGACCC;SOR=0.783;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=288;TCF=184;TCR=104;TR=205;WE=24646477;WS=24646459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,214:0.72:297
chr14	24647522	rs3736840	G	T	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.22;ReadPosRankSum=1.707;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,16:0.19:84
chr14	24647814	rs1885711	T	C	2560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=7;PP=2263;SC=CTACACAGCCTATGGTGCAGC;SOR=4.323;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=67;TCR=7;TR=74;WE=24647822;WS=24647804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr14	24647902	rs34136797	C	T	4756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.140;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=45;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.090;SC=GGGTTGGGCACGAAGTATCCT;SOR=0.996;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=248;TCF=174;TCR=74;TR=168;WE=24647910;WS=24647892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,180:0.69:261
chr14	24647957	rs1885710	C	T	10634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=167;NR=151;PP=2965;SC=CCTCAAACCCCGTGCCTACTA;SOR=0.821;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=318;TCF=167;TCR=151;TR=318;WE=24647965;WS=24647947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,330:1.00:330
chr14	24649669	rs2273912	C	T	1891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.905;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=23;PP=1527;ReadPosRankSum=-0.321;SC=CCAGTACAGCCTGGAGCTCCT;SOR=0.517;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=86;TCF=54;TCR=32;TR=60;WE=24649677;WS=24649659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,65:0.71:91
chr14	24649835	rs2273911	T	C	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.954;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=509;ReadPosRankSum=0.842;SC=TGCCCCAGGCTCTCTGAGCCC;SOR=0.996;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=102;TCF=50;TCR=52;TR=30;WE=24649843;WS=24649825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,32:0.32:99
chr14	24650047	rs7145633	A	G	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=30;PP=857;SC=GAGTGGCAGAATCTCTTATCA;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=24650055;WS=24650037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	24651624	rs149643983	CAG	C	2591.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.827;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.748;NF=2;NR=60;PP=2564;ReadPosRankSum=0.357;SC=GGAGCCAGGTCAGGGGCTGGA;SOR=1.736;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=98;TCF=4;TCR=94;TR=62;WE=24651633;WS=24651614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,67:0.63:106
chr14	24652107	rs34130297	A	AG	4836.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=73;PP=2974;SC=TCATGGGGGTAGGGGGTGGAC;SOR=0.760;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=144;TCF=60;TCR=84;TR=128;WE=24652115;WS=24652097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr14	24653523	rs11550452	G	C	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=10.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.81;ReadPosRankSum=-0.470;SOR=2.682;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,10:0.12:81
chr14	24653954	rs7146310	G	A	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=257;ReadPosRankSum=1.139;SC=CAGCAGCGAGGCCTGGGCAGC;SOR=0.734;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=76;TCF=56;TCR=20;TR=21;WE=24653962;WS=24653944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,22:0.28:80
chr14	24654489	rs2025258	T	C	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.857;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=630;ReadPosRankSum=0.102;SC=GCAGTGGCATTACCTCCCTTG;SOR=0.872;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=105;TCF=34;TCR=71;TR=34;WE=24654497;WS=24654479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,33:0.30:109
chr14	24656251	rs2295978	C	T	1672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FS=5.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.88;ReadPosRankSum=-0.878;SOR=1.010;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:256,87:0.25:343
chr14	24657407	rs6573607	T	G	5790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=110;NR=65;PP=2965;SC=CCGAGAGAAGTGGGTAGGTAC;SOR=1.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=175;TCF=110;TCR=65;TR=175;WE=24657415;WS=24657397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr14	24659408	rs67843857	ACT	A	1410.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=1;PP=1372;SC=TAAGTGAGACACTCTCATATC;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=24659417;WS=24659398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr14	24680606	rs71119065	TC	T	1064.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.690;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=0;PP=1051;ReadPosRankSum=0.722;SC=CCTCCACCCCTCCCCCCGTAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=54;TCR=2;TR=38;WE=24680614;WS=24680596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,39:0.83:47
chr14	24686480	rs149980708	TTTG	T	518.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=1.251;QD=13.30;ReadPosRankSum=1.259;SOR=0.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr14	24702987	rs11158615	A	G	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=2.227;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.93;ReadPosRankSum=-0.718;SOR=0.889;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,61:0.29:212
chr14	24718379	rs41294726	TCTCCGGGAGCCCTGGACTCCCC	T	3045.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=0;PP=2967;SC=ACTGACTCCCTCTCCGGGAGC;SOR=8.526;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=68;TCF=68;TCR=0;TR=43;WE=24718408;WS=24718369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr14	24718515	rs2229463	G	A	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=9.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.91;ReadPosRankSum=-1.536;SOR=1.367;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:177,42:0.19:219
chr14	24724663	rs35312232	C	T	1055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=33;PP=838;ReadPosRankSum=1.469;SC=TTCTCCTCCACATAAACAATC;SOR=0.818;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=8;TCR=43;TR=39;WE=24724671;WS=24724653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,39:0.76:51
chr14	24739055	rs2295313	T	G	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.219;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=176;ReadPosRankSum=1.219;SC=ACCAGCTCAGTGGACCCATCC;SOR=0.178;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=12;WE=24739063;WS=24739053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,12:0.24:50
chr14	24761690	rs1051883	C	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=72;ReadPosRankSum=1.169;SC=GATGCCTACTCTAGCCAACCA;SOR=0.039;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=6;WE=24761698;WS=24761680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr14	24765622	rs2295307	G	A	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=60;ReadPosRankSum=0.348;SC=GGGGGAGGCCGGAGGGAAAAG;SOR=0.798;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=6;WE=24765630;WS=24765612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr14	24765684	rs2295306	G	A	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.153;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=273;ReadPosRankSum=-0.778;SC=AGTGAGTGAGGGAACATGGGT;SOR=0.186;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=58;TCR=6;TR=18;WE=24765692;WS=24765674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,19:0.28:69
chr14	24771137	rs4247000	G	A	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.99;ReadPosRankSum=0.611;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,8:0.19:42
chr14	24771256	rs4247001	T	C	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=10.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.11;ReadPosRankSum=0.520;SOR=0.459;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,34:0.20:174
chr14	24772822	rs4982894	G	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=4.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.50;ReadPosRankSum=0.191;SOR=0.043;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,9:0.17:52
chr14	24772922	rs4982895	C	T	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=4.304;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.16;ReadPosRankSum=-0.174;SOR=1.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,26:0.20:129
chr14	24784911	rs3742511	T	C	14254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=667;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.625;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=252;NR=248;PP=2962;ReadPosRankSum=1.765;SC=AGTTCATCTCTCTGCTGGCTA;SOR=0.685;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=649;TCF=323;TCR=326;TR=500;WE=24784919;WS=24784901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,508:0.77:660
chr14	24788220	rs2295303	G	A	3568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=2;PP=2962;ReadPosRankSum=1.691;SC=GATGAACTGGGAGCAGCTAAC;SOR=1.468;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=144;TCF=142;TCR=2;TR=113;WE=24788228;WS=24788210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,117:0.79:148
chr14	24791136	rs4981504	A	G	1889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=1;PP=1570;SC=TTGTGAAAACAAAGACGCTTG;SOR=8.468;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=69;TCF=68;TCR=1;TR=68;WE=24791144;WS=24791126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr14	24793600	rs1884366	G	A	5330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=116;PP=2965;SC=CTGGGGGCCTGAAGGGAGACA;SOR=2.162;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=158;TCF=42;TCR=116;TR=158;WE=24793608;WS=24793590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr14	24795115	rs11622527	G	T	2102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=30;PP=1685;SC=TGGGAGGGTGGGTGAAAGCAC;SOR=1.011;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=72;TCF=42;TCR=30;TR=71;WE=24795123;WS=24795105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr14	24795231	rs67156008	CCA	C	9532.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=134;NR=39;PP=2967;SC=CATCCCTTCTCCACCATATGA;SOR=2.595;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=185;TCF=142;TCR=43;TR=173;WE=24795245;WS=24795221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr14	24795237	rs55970272	T	C	9930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=161;NR=47;PP=2965;SC=TTCTCCACCATATGACCTCAG;SOR=2.498;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=217;TCF=166;TCR=51;TR=208;WE=24795245;WS=24795221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr14	24795258	rs11622863	C	T	9008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=198;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=0.974;SC=GGCCTGCGGCCCCCCCAGCCC;SOR=0.807;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=287;TCF=200;TCR=87;TR=285;WE=24795266;WS=24795248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,282:1.00:283
chr14	24800879	rs3181256	G	A	1445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=13;PP=1205;SC=ATACAAAAGAGGAAACAGGTC;SOR=2.059;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=46;WE=24800887;WS=24800869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr14	24801635	rs1950502	A	C	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=1;PP=387;SC=TTGCACCTTGACTTGGAGTCA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=24801643;WS=24801625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	24801956	rs2332322	G	C	3376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=47;NR=61;PP=2841;SC=AGGGATCGAAGCCCGGGCCGT;SOR=0.967;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=47;TCR=62;TR=108;WE=24801964;WS=24801946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr14	24802263	rs8003158	A	G	2354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=58;PP=1910;SC=AGGAAAAGCCAGCAGCCCAGC;SOR=2.864;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=13;TCR=58;TR=71;WE=24802271;WS=24802253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr14	24803956	rs1124644	A	C	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=9;PP=395;SC=TCACCCGCTCAAAGCCGCTAC;SOR=1.244;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=15;WE=24803964;WS=24803946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	24806229	rs724165	G	A	8493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.739;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=177;PP=2965;ReadPosRankSum=1.133;SC=CCAAGTTTTCGCTGGCAAGGG;SOR=1.437;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=265;TCF=88;TCR=177;TR=264;WE=24806237;WS=24806219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,270:1.00:271
chr14	24806800	rs1950501	G	C	4261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=67;PP=2965;SC=CAAAGGTCAAGGCATAAAAAG;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=77;TCR=69;TR=143;WE=24806808;WS=24806790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr14	24807295	.	G	A	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.886;ClippingRankSum=0.000;DP=252;ExcessHet=3.0103;FS=4.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.80;ReadPosRankSum=-0.600;SOR=0.404;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:197,52:0.21:249
chr14	24808168	rs3181248	G	A	7372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=152;NR=71;PP=2965;SC=GGGCCTGGCTGGAGCAGCTCT;SOR=1.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=223;TCF=152;TCR=71;TR=223;WE=24808176;WS=24808158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr14	24834971	rs55726184	G	A	2311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.330;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.670;NF=14;NR=64;PP=1782;ReadPosRankSum=-0.014;SC=GGAGGCAGCGGAGCTGAGACC;SOR=1.175;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=95;TCF=18;TCR=77;TR=78;WE=24834979;WS=24834961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,81:0.83:98
chr14	24835017	rs11362560	CG	C	1921.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=57;PP=1631;SC=GAACCAAGGACGGGGGGGCTG;SOR=5.453;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=2;TCR=63;TR=59;WE=24835025;WS=24835007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr14	24839083	rs2229309	G	C	7335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=136;NR=84;PP=2965;SC=GAAGCAGGGGGCCAGGGTGGG;SOR=1.276;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=220;TCF=136;TCR=84;TR=220;WE=24839091;WS=24839073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr14	24843620	rs2295298	T	C	4506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=54;PP=2965;SC=TGGTACTGACTGGCTCCAACT;SOR=1.314;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=92;TCR=54;TR=146;WE=24843628;WS=24843610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr14	24843699	rs12890614	C	T	3726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.014;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=72;PP=2915;ReadPosRankSum=-0.808;SC=GAGGGGAGGGCAGGCAGGGAG;SOR=0.964;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=123;TCF=50;TCR=73;TR=119;WE=24843707;WS=24843689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,125:0.99:126
chr14	24845154	rs12880769	C	A	2340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=15;PP=1951;ReadPosRankSum=-0.844;SC=CCCGAGGGCTCCCTGCCTCAT;SOR=1.414;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=61;TCR=15;TR=75;WE=24845162;WS=24845144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,75:0.99:76
chr14	24845841	rs7149586	T	C	8845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=167;PP=2965;SC=CTCCTCTTTCTCCCTGGGGCT;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=267;TCF=100;TCR=167;TR=266;WE=24845849;WS=24845831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr14	24846757	rs2243891	A	G	6484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.109;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=143;NR=55;PP=2965;ReadPosRankSum=0.767;SC=CTAGATTAAGACCTGCCTGGA;SOR=1.993;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=144;TCR=56;TR=198;WE=24846765;WS=24846747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,202:0.99:204
chr14	24882373	rs3818251	G	A	2804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.082;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=56;PP=2176;ReadPosRankSum=0.822;SC=GGCATGGGAGGGATTAGGGCT;SOR=1.678;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=82;TCF=26;TCR=56;TR=81;WE=24882381;WS=24882363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,86:0.99:87
chr14	24882440	rs4982909	G	C	2349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=16;PP=1955;SC=GGGTCTCAGCGCCATGGAGAA;SOR=2.269;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=50;TCR=16;TR=66;WE=24882448;WS=24882430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr14	24882805	rs10146609	T	C	1463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=41;PP=1255;SC=TTAATACATATATGAAAGCAC;SOR=6.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=42;WE=24882813;WS=24882795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr14	24883887	rs8017377	G	A	2841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=49;PP=2225;SC=GAGTGATGACGCTGACTCTGG;SOR=0.953;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=39;TCR=49;TR=88;WE=24883895;WS=24883877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr14	24887302	rs201911127	CA	C	170.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=211;ReadPosRankSum=0.382;SC=GGAGGATGGCCAGCCACAAGC;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=7;WE=24887310;WS=24887292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr14	24887462	rs3814811	T	C	2980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=40;PP=2300;SC=GGCATCTCTATCTGAAGAGCT;SOR=0.919;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=52;TCR=40;TR=92;WE=24887470;WS=24887452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr14	24898558	rs2273632	C	T	2199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=7;PP=1802;ReadPosRankSum=1.123;SC=AGCTTCAGGGCAGCCCTGCTG;SOR=0.987;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=102;TCF=92;TCR=10;TR=75;WE=24898566;WS=24898548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,80:0.75:107
chr14	24898693	rs2273631	C	T	6837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FS=2.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.80;ReadPosRankSum=1.565;SOR=0.902;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,172:0.80:215
chr14	24898696	rs2273630	T	C	6684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=2.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=33.76;ReadPosRankSum=1.857;SOR=0.930;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,157:0.79:198
chr14	24898751	rs2273629	G	A	2128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.287;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=69;PP=1713;ReadPosRankSum=0.011;SC=GCATCTTTCCGTTTGTTGGAA;SOR=1.779;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=103;TCF=12;TCR=91;TR=76;WE=24898759;WS=24898741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,77:0.73:105
chr14	24898780	rs5025771	C	G	1581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=6.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.589;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=51;PP=1319;ReadPosRankSum=0.521;SC=TACTCCACCACGGGTACCCTC;SOR=2.049;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=77;TCF=6;TCR=71;TR=54;WE=24898788;WS=24898770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,54:0.71:76
chr14	24900209	rs1956905	C	G	1626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=47;PP=1215;ReadPosRankSum=-0.539;SC=AGAGCAGGGCCGAGGAGAGCA;SOR=1.002;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=67;TCF=6;TCR=61;TR=51;WE=24900217;WS=24900199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,70:0.80:87
chr14	24900231	rs3825588	G	C	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-6.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=143;ReadPosRankSum=0.220;SC=GGAAGAGGAGGGGCCTGGGGA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=14;WE=24900239;WS=24900221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,15:0.27:56
chr14	24901249	rs3742520	A	C	2793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.579;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=41;PP=2160;ReadPosRankSum=-1.478;SC=GAGGGAGGGAAACAGGGTGGT;SOR=0.798;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=126;TCF=67;TCR=59;TR=95;WE=24901257;WS=24901239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,101:0.75:135
chr14	24901276	rs7151995	G	T	4542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=66;PP=2965;SC=GAGATGGATTGGGGGTGGAAG;SOR=0.722;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=64;TCR=66;TR=130;WE=24901284;WS=24901266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr14	24901433	rs17795094	C	T	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=2.173;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.03;ReadPosRankSum=1.058;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,44:0.25:174
chr14	24901844	rs2255591	A	G	6532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.519;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=113;PP=2962;ReadPosRankSum=1.070;SC=CTAAGGGCCTAGGAGAGGGAG;SOR=0.627;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=293;TCF=141;TCR=152;TR=223;WE=24901852;WS=24901834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,224:0.78:288
chr14	24905533	rs2277488	G	A	8175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=170;NR=69;PP=2965;SC=TACTGGTCTCGGTTGTCTGGG;SOR=1.943;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=239;TCF=170;TCR=69;TR=239;WE=24905541;WS=24905523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr14	24905548	rs2277489	G	A	8854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=174;NR=100;PP=2965;SC=TCTGGGAGGTGGGCAAGGGCC;SOR=1.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=274;TCF=174;TCR=100;TR=274;WE=24905556;WS=24905538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr14	24909281	rs1043839	C	T	4283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=95;NR=37;PP=2965;SC=GCCCTTGCCACGACCTACTTA;SOR=1.921;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=95;TCR=37;TR=132;WE=24909289;WS=24909271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr14	24909362	rs1043831	T	C	5397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=86;PP=2965;SC=CAGTGTTCGCTGTGGGATCAC;SOR=0.727;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=174;TCF=87;TCR=87;TR=173;WE=24909370;WS=24909352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr14	24909475	rs3211056	C	G	9162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=204;NR=109;PP=2965;SC=GGGCAGCACCCAAGGTCTGGG;SOR=1.594;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=313;TCF=204;TCR=109;TR=313;WE=24909483;WS=24909465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,311:1.00:311
chr14	24909731	rs2273628	C	T	11387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=183;NR=159;PP=2965;SC=TACAGGGGTCCTCTCAGCCTT;SOR=0.792;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=342;TCF=183;TCR=159;TR=342;WE=24909739;WS=24909721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,357:1.00:357
chr14	24910210	rs712487	C	A	6545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=120;PP=2965;SC=TCCCCTTGGCCTCACCTTCTC;SOR=1.068;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=205;TCF=85;TCR=120;TR=205;WE=24910218;WS=24910200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr14	24910317	rs10668100	C	CTT	4005.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=70;PP=2965;SC=TGGAGGAACTCTGGTTGCAGG;SOR=3.334;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=84;TCF=6;TCR=78;TR=74;WE=24910325;WS=24910307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr14	24910846	rs11628143	C	T	935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=0;PP=772;ReadPosRankSum=-0.685;SC=GTTCCCCTGGCGAATATAAGG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=30;WE=24910854;WS=24910836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr14	24910876	rs11158703	G	A	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=3;PP=1238;SC=TTTGGGGGGCGTACCTACACC;SOR=4.977;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=45;TCR=3;TR=48;WE=24910884;WS=24910866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr14	24910973	rs11625819	TT	GA	6805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=33;PP=2947;SC=CGGCTGCCGATTACCTCTTTT;SOR=2.005;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=142;TCF=103;TCR=39;TR=125;WE=24910982;WS=24910963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr14	24911116	rs11158704	C	T	3161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=67;PP=2582;SC=CCCTGAATTTCGGCTTAAGAG;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=24;TCR=67;TR=91;WE=24911124;WS=24911106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr14	24911169	rs11158705	C	T	2489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=39;PP=2202;SC=CATTCATTTCCTGGGCATCCT;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=35;TCR=39;TR=74;WE=24911177;WS=24911159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr14	24911764	rs1956903	G	A	1316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=28;PP=1032;SC=CTGACACCAGGCTTCTCCCCA;SOR=2.419;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=37;WE=24911772;WS=24911754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	24911852	rs12897925	C	G	1934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=13;PP=1551;SC=GCTAGGAGGCCAAGGCCAGGT;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=54;TCR=13;TR=67;WE=24911860;WS=24911842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr14	24970942	rs4600392	A	G	4757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=84;PP=2965;SC=CTCCCAACCAAGTAAAGGGGT;SOR=1.141;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=57;TCR=84;TR=141;WE=24970950;WS=24970932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr14	24971008	rs4519248	C	T	1527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.917;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=50;PP=1238;ReadPosRankSum=-0.107;SC=GCTGCTGGAACAATGGGCCAT;SOR=1.387;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=71;TCF=6;TCR=65;TR=54;WE=24971016;WS=24970998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,55:0.74:74
chr14	24975435	rs5249	G	T	3966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=91;PP=2965;SC=AGTTGAATTGGGATGGGAAGG;SOR=2.152;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=29;TCR=91;TR=120;WE=24975443;WS=24975425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr14	24975509	rs1885108	T	C	1899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=36;PP=1495;SC=AATGAAGGACTGTCAGTCCTC;SOR=1.234;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=22;TCR=36;TR=58;WE=24975517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr14	25043068	rs1885597	T	G	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=27;PP=746;ReadPosRankSum=1.148;SC=TGCTCCTGCTTCCCTGAGCTC;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=28;WE=25043076;WS=25043058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,28:0.80:35
chr14	25044089	rs2070697	C	T	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5027;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=184;ReadPosRankSum=0.461;SC=GCAGACAGCACGGGGAGGGCA;SOR=0.446;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=9;WE=25044097;WS=25044079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr14	25044354	.	C	T	1457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.207;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=0;PP=1142;ReadPosRankSum=0.115;SC=CGCAAAGACTCACTTGGTCTT;SOR=2.070;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=65;TCR=1;TR=46;WE=25044362;WS=25044346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,50:0.72:69
chr14	25044712	rs1957523	C	T	2780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.895;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=82;PP=2057;ReadPosRankSum=0.387;SC=AAGATGGGGACGGCAGGAGAG;SOR=0.363;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=130;TCF=14;TCR=116;TR=94;WE=25044720;WS=25044702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,100:0.74:135
chr14	25045589	rs12878578	A	G	280.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=231;SC=CTGCTCAGGAAGTTTGCCCAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=25045597;WS=25045579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	25078914	rs1957526	A	C	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=380;SC=GGTACAGTAAACTCAGAGACC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=25078922;WS=25078904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	25102160	rs8192917	C	T	5256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.98;NF=111;NR=48;PP=2965;SC=GAAGTCGTCTCGTATCAGGAA;SOR=1.888;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=159;TCF=111;TCR=48;TR=159;WE=25102168;WS=25102150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr14	25281843	rs712491	C	T	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.485;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=348;ReadPosRankSum=-0.190;SC=GCGGAGGTCCCGAATTCTTGT;SOR=1.181;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=77;TCF=58;TCR=19;TR=21;WE=25281851;WS=25281833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,22:0.28:80
chr14	25287095	rs854398	T	C	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=0;PP=615;SC=ATGAATGAGATGACAAGACAG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=23;WE=25287103;WS=25287085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	28102684	rs9672019	C	T	64.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5025;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=41;ReadPosRankSum=0.674;SC=TATAATATAACTGTATATAAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=28102692;WS=28102674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr14	28733843	rs10135219	A	C	1551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.01;MQRankSum=-0.464;QD=43.10;ReadPosRankSum=1.883;SOR=2.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr14	28733847	rs10145670	G	A	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.06;MQRankSum=-0.456;QD=40.10;ReadPosRankSum=1.583;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr14	28733956	rs10145770	G	A	2679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.864;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.983;NF=72;NR=24;PP=2115;ReadPosRankSum=-1.697;SC=CACTGTGACAGCCCACCTCGC;SOR=0.410;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=143;TCF=110;TCR=33;TR=96;WE=28733964;WS=28733946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,98:0.67:146
chr14	29242127	.	T	C	4155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.358;ClippingRankSum=0.000;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.847;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=71;PP=2962;ReadPosRankSum=0.101;SC=ATCCTGGAGATATGGAAAGAA;SOR=0.620;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=245;TCF=123;TCR=122;TR=150;WE=29242135;WS=29242117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,158:0.62:255
chr14	29242271	.	ATT	A,AT	765.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=11.563;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.17;MQRankSum=0.365;QD=17.81;ReadPosRankSum=0.681;SOR=6.618;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:3,12,28:0.28,0.65:43
chr14	29247047	rs11316936	AT	A	98.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.07;MQRankSum=0.385;QD=9.87;ReadPosRankSum=1.569;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr14	29261309	rs56025822	A	AAAC	7760.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.511;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=4.079;NF=79;NR=97;PP=2980;ReadPosRankSum=-1.181;SC=AGCACTAAAAAAAACAAACAA;SOR=0.633;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=248;TCF=118;TCR=130;TR=176;WE=29261317;WS=29261294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,200:0.74:269
chr14	30047580	rs2273815	C	T	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=24;PP=810;SC=AAAAAAATTACCAGTAAAAAT;SOR=2.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=30047588;WS=30047570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	30047690	.	CA	C	43	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=19;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=43;QD=17.3333333333;SC=GCACTAGAACCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=30047698;WS=30047680;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,3:0.60:5
chr14	30063202	rs2273814	A	G	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=3;PP=792;ReadPosRankSum=0.882;SC=GAGACAAATTATAAATGATTT;SOR=0.614;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=53;TCF=49;TCR=4;TR=35;WE=30063210;WS=30063192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,37:0.66:56
chr14	30066929	rs2230505	A	G	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.690;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=28;PP=793;ReadPosRankSum=1.334;SC=ACTTCTCTCCAATGATCCGGG;SOR=0.821;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=142;TCF=54;TCR=88;TR=43;WE=30066937;WS=30066919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,44:0.30:145
chr14	30066976	rs3783299	A	T	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.24;ReadPosRankSum=-1.665;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,32:0.27:117
chr14	30068194	rs2273813	T	G	1636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.209;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=22;PP=1222;ReadPosRankSum=-0.199;SC=TAGCAATGCTTCCAACTGGCT;SOR=0.831;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=196;TCF=125;TCR=71;TR=64;WE=30068202;WS=30068184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,69:0.34:203
chr14	30098349	rs1191601	T	C	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.649;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=374;ReadPosRankSum=-0.571;SC=GTAAGAGATGTAATAGCAAAA;SOR=1.473;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=17;WE=30098357;WS=30098339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr14	30102025	rs1209180	T	C	1628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=12;PP=1302;ReadPosRankSum=0.292;SC=TACATTCCCATGAAAAAGCAA;SOR=0.782;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=91;TCF=72;TCR=19;TR=60;WE=30102033;WS=30102015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,62:0.67:92
chr14	30103441	rs1191599	T	C	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=306;SC=TTTCCTAACTTCGTTGCTTGC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=30103449;WS=30103431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	30125577	rs5007053	A	G	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=128;ReadPosRankSum=-1.074;SC=TGACCTGATTATTCTCATAAA;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=9;WE=30125585;WS=30125567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,9:0.24:38
chr14	30125660	rs6571317	A	G	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.159;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=5;PP=535;ReadPosRankSum=-0.426;SC=AATTTCTAGCACCAGGTAGCA;SOR=1.643;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=114;TCF=88;TCR=26;TR=38;WE=30125668;WS=30125650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,39:0.33:118
chr14	30194899	rs11626603	T	C	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.167;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=292;ReadPosRankSum=0.427;SC=ACAAATACCATGAGAGTGTAA;SOR=0.240;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=78;TCF=10;TCR=68;TR=28;WE=30194907;WS=30194889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,29:0.36:81
chr14	31354374	rs12881068	A	T	5021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.121;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=150;PP=2962;ReadPosRankSum=1.157;SC=TGGAGGGGGAACTAATATGGC;SOR=2.620;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=196;TCF=12;TCR=184;TR=157;WE=31354382;WS=31354364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,163:0.81:200
chr14	31355096	rs1045644	C	G	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=396;ExcessHet=3.0103;FS=2.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.02;ReadPosRankSum=1.930;SOR=0.474;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:334,60:0.15:394
chr14	31364099	.	CT	C	200.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.000;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=5.011;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=2.615;QD=1.30;ReadPosRankSum=-0.098;SOR=0.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,33:0.21:155
chr14	31380191	rs3736742	T	G	2008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=6;PP=1494;SC=TTTGAGGTATTTACTTTTGTC;SOR=3.841;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=47;TCR=6;TR=53;WE=31380199;WS=31380181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	31380895	.	A	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.679;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.46;ReadPosRankSum=1.728;SOR=0.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,8:0.17:47
chr14	31404277	rs9322868	T	C	6656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=178;NR=26;PP=2965;SC=TGCCACCATATATTTATACAC;SOR=3.756;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=204;TCF=178;TCR=26;TR=204;WE=31404285;WS=31404267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr14	31424790	rs56235217	TA	T	721.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.58;QD=22.55;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	31425457	rs17097614	A	T	2972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=73;PP=2360;ReadPosRankSum=1.410;SC=GCCTAAAAATATAAAAGATGC;SOR=0.735;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=33;TCR=84;TR=102;WE=31425465;WS=31425447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,103:0.87:118
chr14	31483761	rs179724	G	T	217.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=178;SC=TTTTACGTCTGTTTATAAAGT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=31483769;WS=31483751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	31495346	rs2281563	C	T	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.223;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=34;PP=1044;ReadPosRankSum=-0.009;SC=CGGGGAGGGGCCGCCATCCCC;SOR=0.484;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=23;TCR=44;TR=52;WE=31495354;WS=31495336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,50:0.78:64
chr14	31535431	rs147135554	A	G	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;QD=1.78;ReadPosRankSum=-0.370;SOR=0.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,20:0.14:142
chr14	31535603	rs6571386	G	C	12898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=402;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=107;NR=286;PP=2965;SC=TTTGTTATTAGTGAGTCTCAG;SOR=2.048;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=393;TCF=107;TCR=286;TR=393;WE=31535611;WS=31535593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,401:1.00:401
chr14	31538984	rs7155228	C	G	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=1.077;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.56;ReadPosRankSum=-1.140;SOR=0.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,19:0.14:134
chr14	31549745	rs11621299	T	G	3989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.403;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=49;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.355;SC=CAGTGTCTTTTTTCTAACCCT;SOR=0.199;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=164;TCF=110;TCR=54;TR=140;WE=31549753;WS=31549735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,140:0.86:162
chr14	31578762	rs17097735	C	T	6502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.317;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=155;PP=2962;ReadPosRankSum=0.287;SC=TTCTCGTTCGCTCCACAGTGG;SOR=0.462;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=258;TCF=69;TCR=189;TR=214;WE=31578770;WS=31578752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,225:0.84:269
chr14	31582380	rs1315794	A	G	4028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=65;PP=2965;SC=AGTAAACTGAAGCTGTTCATC;SOR=0.997;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=50;TCR=66;TR=115;WE=31582388;WS=31582370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr14	31582526	rs2273483	T	C	11865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=374;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=223;NR=136;PP=2965;SC=CAACTATATATAGAATACGCA;SOR=1.255;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=360;TCF=223;TCR=137;TR=359;WE=31582534;WS=31582516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,370:1.00:370
chr14	31592840	.	AGAG	A	539.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.000;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=2.181;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=2.105;QD=4.82;ReadPosRankSum=-1.305;SOR=0.974;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,21:0.19:112
chr14	31597685	rs7157007	C	G	4649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=124;NR=1;PP=2965;SC=TATTCCTGAACTGCTAAATTT;SOR=8.364;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=127;TCF=126;TCR=1;TR=125;WE=31597693;WS=31597675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr14	31598248	rs17097743	A	G	12391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=510;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.521;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=167;NR=249;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.221;SC=TTGCACTGGAAGATGACCCTA;SOR=0.855;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=503;TCF=205;TCR=298;TR=416;WE=31598256;WS=31598238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,415:0.82:504
chr14	31610939	rs12888959	T	C	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.48;ReadPosRankSum=0.882;SOR=0.259;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,5:0.16:31
chr14	31610964	rs72670364	C	A	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=773;ReadPosRankSum=0.509;SC=TTAAGAGTTTCTTTTGTGTGC;SOR=0.473;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=32;WE=31610972;WS=31610954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,34:0.79:43
chr14	31617880	rs11845860	A	C	2079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=6;PP=1688;ReadPosRankSum=-0.016;SC=TGAAAATTTAACAAATCAGTA;SOR=0.772;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=85;TCF=78;TCR=7;TR=67;WE=31617888;WS=31617870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,73:0.80:91
chr14	31619392	rs11620816	T	C	7346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.828;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=173;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.977;SC=GTTTACCTTGTTGCAATTCTT;SOR=0.360;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=285;TCF=79;TCR=206;TR=244;WE=31619400;WS=31619382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,249:0.86:290
chr14	31625994	rs35553721	CA	C	354.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.55;ReadPosRankSum=0.060;SOR=0.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,31:0.40:78
chr14	31647241	rs2274201	G	A	7762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=185;NR=42;PP=2965;ReadPosRankSum=0.517;SC=CACACTGTTCGGCTAAGTCTC;SOR=1.516;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=228;TCF=186;TCR=42;TR=227;WE=31647249;WS=31647231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,246:1.00:247
chr14	31647448	rs34666986	G	A	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FS=2.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.99;ReadPosRankSum=0.084;SOR=0.466;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:232,34:0.13:266
chr14	31793053	rs57656564	GAT	G	2863.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=68;PP=2992;SC=TCAACTGAAAGATATATATAT;SOR=6.466;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=106;TCF=1;TCR=105;TR=69;WE=31793062;WS=31793043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr14	31795361	rs3736917	A	G	4556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=23;PP=2965;SC=ATAATGTCCAATACTTACCAG;SOR=3.082;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=134;TCF=111;TCR=23;TR=134;WE=31795369;WS=31795351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr14	31806943	rs4595710	T	C	2520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=73;PP=2213;SC=GGACACAATTTATAAATACAT;SOR=8.581;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=73;TCF=0;TCR=73;TR=73;WE=31806951;WS=31806933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr14	31809486	rs8012940	C	T	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=2;PP=1380;SC=TTTGCTTATACTGGTATCAAA;SOR=5.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=47;TCR=2;TR=49;WE=31809494;WS=31809476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr14	31809568	rs11408327	G	GA	6780.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=142;NR=29;PP=2972;SC=AGATGCAGAGGAAACAAACAT;SOR=3.096;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=183;TCF=151;TCR=32;TR=171;WE=31809576;WS=31809558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr14	31819047	rs3736918	C	T	8984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=154;NR=134;PP=2965;SC=TCATCTACCACTTGGGCTAAT;SOR=0.895;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=289;TCF=155;TCR=134;TR=288;WE=31819055;WS=31819037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,291:1.00:291
chr14	31819913	rs7158257	A	G	5315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=103;PP=2965;SC=AGCTGTTCCAATATAAGAAGC;SOR=1.361;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=60;TCR=103;TR=163;WE=31819921;WS=31819903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr14	31819966	rs10602248	TTTTG	T	2471.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.09;NF=0;NR=43;PP=2175;SC=GTAGGTAAGTTTTTGTTTGTT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=93;TCF=0;TCR=93;TR=43;WE=31819977;WS=31819956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr14	31828076	rs942907	A	C	7510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=129;PP=2965;SC=ATTGAATCTAATCAAGAGTAA;SOR=1.038;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=218;TCF=89;TCR=129;TR=218;WE=31828084;WS=31828066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr14	31841162	rs5025288	T	C	7262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=210;PP=2965;SC=TAATCAACCATGAAAGGCACA;SOR=3.061;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=254;TCF=44;TCR=210;TR=254;WE=31841170;WS=31841152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr14	31849524	rs4981841	T	A	2164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=0;PP=1797;SC=AAAGGCTTTTTAAGGTGACTA;SOR=8.410;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=63;TCR=0;TR=63;WE=31849532;WS=31849517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr14	31858025	rs3887865	C	T	5142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=123;NR=38;PP=2965;SC=AAGAGTTAGACTGAGATACTG;SOR=2.376;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=123;TCR=38;TR=161;WE=31858033;WS=31858015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr14	31864300	rs7142126	T	C	2619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=0;PP=2099;SC=GAGATAGTCCTAGCTGACTAC;SOR=8.714;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=72;TCR=0;TR=71;WE=31864308;WS=31864290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr14	31864485	rs7141532	G	C	14360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=444;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=186;NR=237;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.141;SC=CTGTGACAAGGTGCAGCGGCA;SOR=0.618;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=424;TCF=187;TCR=237;TR=423;WE=31864493;WS=31864475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,440:1.00:441
chr14	31922408	rs34278949	G	A	8509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=221;NR=34;PP=2965;SC=GCCTCCCAACGTGTTGGGATT;SOR=3.654;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=257;TCF=222;TCR=35;TR=255;WE=31922416;WS=31922398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr14	32032129	rs10143899	C	T	1899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=37;PP=1751;SC=GCTCATTTTTCCCCATTTTTA;SOR=1.217;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=23;TCR=37;TR=60;WE=32032137;WS=32032119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr14	32032214	rs10144137	G	A	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=701;SC=TATTTGTGGTGGATCACTAAT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=32032222;WS=32032204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	32034147	rs3759779	A	T	2511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=2;PP=2141;SC=ATTACATGAAAATATTAAAAG;SOR=6.466;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=76;TCF=74;TCR=2;TR=76;WE=32034155;WS=32034137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr14	32142544	rs35659584	A	AT	698.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.178;NF=26;NR=0;PP=454;ReadPosRankSum=-0.811;SC=AAAAGAGAGGATTTTTTTTTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=26;WE=32142552;WS=32142534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr14	32296018	rs1540425	A	G	3099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=80;PP=2464;SC=TTAGTCCTGTACAGAAGTCTT;SOR=6.229;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=83;TCF=3;TCR=80;TR=83;WE=32296026;WS=32296008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr14	32315901	rs8006872	A	G	4374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=124;PP=2965;SC=GGAGTCTCACACCTGTAATCC;SOR=6.471;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=4;TCR=124;TR=128;WE=32315909;WS=32315891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr14	32328508	rs4981131	G	C	2936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=3.388;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=88;PP=2418;ReadPosRankSum=0.792;SC=TCTAAGGAAAGAATGTCTTCA;SOR=2.322;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=102;TCF=3;TCR=99;TR=90;WE=32328516;WS=32328498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,94:0.89:106
chr14	32414145	rs1278926	C	A	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=3;PP=1046;ReadPosRankSum=1.815;SC=CTGCTGGGACCGACTGCAGCT;SOR=1.032;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=43;WE=32414153;WS=32414135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,45:0.87:52
chr14	32414386	rs1278927	C	A	2172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.910;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=61;PP=1774;ReadPosRankSum=1.569;SC=TTAATAGGGTCAAAGGAGGGT;SOR=0.384;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=93;TCF=16;TCR=77;TR=75;WE=32414394;WS=32414376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,77:0.82:94
chr14	32414463	rs1278928	T	C	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=35;PP=1045;SC=TGGGCAGGCATCCATTATGTG;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=37;WE=32414471;WS=32414453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	32419235	rs1278941	A	G	3328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=3;PP=2707;SC=CAGCCTGCCCAGGTTTATTAA;SOR=6.736;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=117;TCF=114;TCR=3;TR=117;WE=32419243;WS=32419225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr14	32419331	rs1278942	C	T	10015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=320;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=172;NR=143;PP=2965;SC=TAAGAGCATACTCCCTGAAGA;SOR=0.876;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=315;TCF=172;TCR=143;TR=315;WE=32419339;WS=32419321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,319:1.00:319
chr14	32419548	rs1278943	C	T	1027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=29;PP=866;SC=CCCCTTCATACTGATCTAATA;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=32419556;WS=32419538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	32438586	rs1952967	T	G	4800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.414;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=108;PP=2962;ReadPosRankSum=1.319;SC=AGAAAAGCACTGTTGGCTGTA;SOR=0.554;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=215;TCF=80;TCR=135;TR=175;WE=32438594;WS=32438576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,183:0.82:224
chr14	32563640	rs8004384	A	G	4228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=103;PP=2965;SC=GCTTGTTGTTACTTTTTTAAA;SOR=2.887;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=23;TCR=103;TR=126;WE=32563648;WS=32563630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr14	33014327	rs11844955	C	T	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.82;ReadPosRankSum=0.703;SOR=0.041;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,10:0.16:63
chr14	33015014	rs7150894	G	A	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=512;ExcessHet=3.0103;FS=0.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.75;ReadPosRankSum=1.322;SOR=0.553;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:416,93:0.18:509
chr14	33046388	rs1950703	A	G	14121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=439;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.99;NF=272;NR=145;PP=2965;SC=AAACTACAGAAAATTGGACTC;SOR=1.491;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=417;TCF=272;TCR=145;TR=417;WE=33046396;WS=33046378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,432:1.00:432
chr14	33046471	rs768787	T	G	12447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=392;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=288;PP=2965;SC=GTGTTGTTCTTGCTGTCAATA;SOR=2.494;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=373;TCF=84;TCR=289;TR=372;WE=33046479;WS=33046461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,388:1.00:388
chr14	33204812	rs139360332	G	GTT	124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=0.054;QD=3.56;ReadPosRankSum=1.074;SOR=1.034;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,6:0.17:35
chr14	33204825	rs41285498	T	C	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=1.970;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=0.043;QD=3.92;ReadPosRankSum=-0.947;SOR=0.276;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,8:0.19:42
chr14	33242863	rs2273163	T	C	2191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=45;PP=1648;ReadPosRankSum=0.512;SC=ACTCATAGATTGGTTTCTCTC;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=322;TCF=183;TCR=139;TR=103;WE=33242871;WS=33242853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:222,103:0.32:325
chr14	33292743	rs2239647	A	C	9950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=460;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.320;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=181;NR=162;PP=2962;ReadPosRankSum=0.871;SC=GGCAAAAGGGAAAACCGAATG;SOR=0.589;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=444;TCF=236;TCR=208;TR=343;WE=33292751;WS=33292733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,350:0.76:459
chr14	33293122	rs1051695	A	G	8855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.800;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=193;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.349;SC=TTCTATCAGCAACATTTCCTG;SOR=0.875;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=394;TCF=157;TCR=237;TR=316;WE=33293130;WS=33293112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,319:0.80:399
chr14	33293531	rs4647899	T	A	4161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.283;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=82;PP=2962;ReadPosRankSum=0.701;SC=GAGCCTTGTTTCTCTAGTGCT;SOR=0.310;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=185;TCF=81;TCR=104;TR=151;WE=33293539;WS=33293521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,153:0.82:187
chr14	33294042	rs2057121	G	A	1921.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.721;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=56;PP=1438;ReadPosRankSum=1.573;SC=TCCTCATGCCGTATATGTATT;SOR=0.189;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=79;TCF=7;TCR=72;TR=63;WE=33294050;WS=33294032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,68:0.81:84
chr14	33525317	rs35719018	G	GA	536.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.678;NF=1;NR=21;PP=374;ReadPosRankSum=0.506;SC=TAGTGGGGGAGAAAAAAAAAC;SOR=0.892;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=22;WE=33525325;WS=33525307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,24:0.73:33
chr14	33836599	rs1609948	A	G	1056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=29;PP=877;SC=TTTTATCTTGAAATTCCGAAA;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=33836607;WS=33836589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	34047414	rs1958541	T	C	1289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=3.313;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.66;ReadPosRankSum=0.487;SOR=0.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:168,60:0.26:228
chr14	34149916	rs2297118	T	C	2374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.440;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=48;PP=1780;ReadPosRankSum=0.775;SC=CAAGGGGCTCTTGTGGCTTTT;SOR=1.390;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=108;TCF=43;TCR=65;TR=74;WE=34149924;WS=34149906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,81:0.71:114
chr14	34149997	rs2297117	T	C	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=30;PP=671;ReadPosRankSum=1.886;SC=GCAAAATGCATGAGGCAGTAC;SOR=0.871;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=35;WE=34150005;WS=34149987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,38:0.75:51
chr14	34204546	rs112057025	G	A	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=2.059;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.43;ReadPosRankSum=-0.245;SOR=0.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,49:0.24:203
chr14	34243477	rs8019077	T	A	1789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=9;PP=1437;ReadPosRankSum=1.909;SC=GCATTTCTCATAAGAAATGCT;SOR=1.875;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=54;WE=34243485;WS=34243467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr14	34263034	rs36025922	TAAA	T	794.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=2.119;QD=8.28;ReadPosRankSum=-0.443;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,31:0.32:96
chr14	34269167	rs12434716	G	C	2091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=535;ExcessHet=3.0103;FS=0.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.93;ReadPosRankSum=-0.277;SOR=0.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:417,115:0.22:532
chr14	34395148	rs3832940	GA	G	5756.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.650;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.224;NF=41;NR=92;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.460;SC=GGACAGAAAGGAGAATAAAGA;SOR=0.451;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=194;TCF=54;TCR=140;TR=133;WE=34395156;WS=34395138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,161:0.73:220
chr14	34396100	rs10137361	C	T	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.547;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=116;ReadPosRankSum=-0.090;SC=TTTAAAACTACATAAAATTGA;SOR=0.105;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=10;WE=34396108;WS=34396090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr14	34396358	rs145933066	G	GATTT	192.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;QD=48.18;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	34985506	rs7766	G	C	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=2.615;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.19;ReadPosRankSum=-0.756;SOR=0.939;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:175,42:0.19:217
chr14	34985645	rs7797	G	A	6226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.753;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=153;PP=2962;ReadPosRankSum=0.864;SC=CTGCCTTCTCGGCAGCATCTT;SOR=1.060;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=268;TCF=76;TCR=192;TR=211;WE=34985653;WS=34985635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,215:0.78:274
chr14	34993771	rs113569549	G	A	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=91;ReadPosRankSum=0.971;SC=GCAGTGAGGCGAGATTGTGCC;SOR=0.954;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=7;WE=34993779;WS=34993761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr14	34993859	.	A	ATGTGTGTGTG,ATGTGTGTGTGTG	522	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=49.63;NF=25,25;NR=1,1;PP=75,522;QD=3.96153846154;SC=TAAACAAAATATGTATGTGTG;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=66;TCF=63;TCR=3;TR=26,26;WE=34993871;WS=34993849;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.39:66
chr14	34993863	rs61981524	A	G,ATGTGTGTGTGTGTGTG	3385.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=52;NR=3;PP=1650;SC=CAAAATATGTATGTGTGTGTG;SOR=4.804;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=96;TCF=87;TCR=9;TR=55;WE=34993871;WS=34993849;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.84,0.16:67
chr14	34998705	rs12147949	T	C	2463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.379;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=79;PP=1957;ReadPosRankSum=-0.296;SC=TATTAGGATATGGCTAAGAAT;SOR=1.263;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=140;TCF=28;TCR=112;TR=96;WE=34998713;WS=34998695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,102:0.69:148
chr14	35037008	rs11156848	T	C	3378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=56;PP=2685;SC=TTATTTAATTTACATAATAGT;SOR=1.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=38;TCR=56;TR=94;WE=35037016;WS=35036998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr14	35045136	rs34357905	G	GT	348.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;QD=23.25;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	35050586	rs4403967	G	T	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=175;ReadPosRankSum=1.413;SC=TCTTGATCTCGTGACCTCGTG;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=8;WE=35050594;WS=35050576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr14	35062312	rs12432539	C	T	1485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.619;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=33;PP=1170;ReadPosRankSum=-0.064;SC=GGTTATGATACTCCAAAAGAA;SOR=0.248;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=66;TCF=24;TCR=42;TR=55;WE=35062320;WS=35062302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,57:0.81:70
chr14	35075022	rs7151774	G	T	4251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.199;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=107;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.501;SC=AAGCTAAGGGGATCCAGAATG;SOR=1.117;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=206;TCF=70;TCR=136;TR=158;WE=35075030;WS=35075012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,165:0.77:213
chr14	35075063	rs72675225	T	C	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=2.800;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.80;ReadPosRankSum=-1.933;SOR=0.300;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,37:0.27:138
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chr14	35182348	rs35515423	GA	G	199.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.968;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=-0.501;QD=2.06;ReadPosRankSum=-0.951;SOR=0.928;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,21:0.22:97
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chr14	35183888	rs117211470	C	G	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.92;ReadPosRankSum=-2.553;SOR=0.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,5:0.17:29
chr14	35222623	rs3742371	T	C	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.24;ReadPosRankSum=-0.881;SOR=0.042;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,5:0.15:33
chr14	35227831	rs60358922	G	A	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-6.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.888;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=372;ReadPosRankSum=-0.295;SC=AGTAACAGGTGTTTTGACTAC;SOR=0.029;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=95;TCF=94;TCR=1;TR=25;WE=35227839;WS=35227821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,25:0.26:97
chr14	35237939	rs34320241	CT	C	176.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.36;ReadPosRankSum=-0.182;SOR=0.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,24:0.18:130
chr14	35242700	rs3818801	C	T	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.64;ReadPosRankSum=1.523;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,4:0.17:23
chr14	35242709	rs10713079	CA	C	121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.87;ReadPosRankSum=-0.027;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr14	35242828	rs2275145	G	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=3.714;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.19;ReadPosRankSum=-0.979;SOR=1.206;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,17:0.17:102
chr14	35263983	rs17102745	T	C	1298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FS=0.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.29;ReadPosRankSum=-0.191;SOR=0.624;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:233,70:0.23:303
chr14	35343629	rs2145031	A	C	4104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.10;SOR=2.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr14	35468698	.	A	G	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.853;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5034;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=527;ReadPosRankSum=-0.571;SC=GTGATCAACAATTGTTTTTAT;SOR=2.066;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=21;WE=35468706;WS=35468688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,21:0.88:24
chr14	35476673	rs28456062	G	A	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=342;SC=ATATAAAAATGTAAAGCCTGG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=35476681;WS=35476663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	35477785	rs1712351	G	A	603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=480;SC=TATATGTATAGTTTGTTATAT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=17;WE=35477793;WS=35477775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	35515606	rs4007475	TGG	T	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=168;ReadPosRankSum=-0.120;SC=AGGCGGGCGCTGGGCGGGTGA;SOR=1.022;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=5;WE=35515615;WS=35515596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr14	35576458	rs10132769	A	C	1423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.048;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=7;PP=1096;ReadPosRankSum=0.818;SC=ACTACAGTTTACATTTTAGTG;SOR=1.473;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=66;TCF=55;TCR=11;TR=48;WE=35576466;WS=35576448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,51:0.72:71
chr14	35593477	rs71435858	A	AT	138.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=0.776;QD=8.67;ReadPosRankSum=-0.309;SOR=0.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr14	35596092	rs10147080	C	A	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=354;ReadPosRankSum=-1.241;SC=AGGATAATTACAAGTTTGTAA;SOR=1.931;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=15;WE=35596100;WS=35596082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr14	35735967	rs11156878	A	G	2747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.761;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=62;PP=2082;ReadPosRankSum=-0.255;SC=GCCAAACGGAATCTGCGACTG;SOR=1.278;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=148;TCF=62;TCR=86;TR=99;WE=35735975;WS=35735957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,103:0.68:151
chr14	35747817	rs61988272	T	C	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.220;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=545;ReadPosRankSum=-0.541;SC=ATTCCATCCATGCGGCTCTGC;SOR=1.040;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=50;TCF=21;TCR=29;TR=35;WE=35747825;WS=35747807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,38:0.73:52
chr14	35779397	rs33988739	CT	C	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=12.053;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-1.123;QD=1.74;ReadPosRankSum=1.077;SOR=0.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr14	35871093	rs696	C	T	267.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=1;PP=207;SC=CGTTTTGGGCCAGGCAGTGTG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=35871101;WS=35871083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	35871217	rs8904	G	A	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.242;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=18;PP=1008;ReadPosRankSum=0.424;SC=GCCCCTTTGCGCTCATAACGT;SOR=0.269;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=46;WE=35871225;WS=35871207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,46:0.72:64
chr14	35871407	rs1022714	A	G	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=88;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=24;PP=820;SC=ACAGGCTGAGAGAGTTTGCCT;SOR=1.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=14;TCR=24;TR=38;WE=35871415;WS=35871397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	35871441	rs70937092	A	AGTAAGCTATTAAAAAAAGG	1968.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=6;PP=830;SC=TTAAAAAAAGAGGGGGGGCAG;SOR=1.022;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=28;TCF=13;TCR=15;TR=14;WE=35871449;WS=35871431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr14	35871960	rs2233419	G	A	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.993;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=589;ReadPosRankSum=1.005;SC=AGTGCGTCGGGGGCAGGAAGC;SOR=0.392;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=125;TCF=38;TCR=87;TR=34;WE=35871968;WS=35871950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,35:0.28:124
chr14	35872094	rs2233417	C	T	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.765;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=292;ReadPosRankSum=0.046;SC=AAAAGTATAACCACCTGTTTC;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=6;TCR=52;TR=14;WE=35872102;WS=35872084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,14:0.23:62
chr14	35872792	rs2233415	A	G	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=641;ReadPosRankSum=-1.058;SC=AGGTGAGGGTAAATAGTGCTC;SOR=0.606;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=127;TCF=89;TCR=38;TR=39;WE=35872800;WS=35872782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,40:0.31:131
chr14	35872926	rs1050851	G	A	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.70;ReadPosRankSum=0.012;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,27:0.24:112
chr14	35873567	rs2233411	A	T	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=61;ReadPosRankSum=1.753;SC=TCCCACCCCCAGGCCGCGCGC;SOR=0.336;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=7;WE=35873575;WS=35873557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr14	36004075	rs1958260	A	G	2227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=20;PP=1836;SC=GCACCCACGGACTGCGCGTCT;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=48;TCR=20;TR=68;WE=36004083;WS=36004065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr14	36044337	rs61622892	G	GA	909.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.659;NF=7;NR=26;PP=503;ReadPosRankSum=-0.397;SC=CCATCTCAAAGAAAAAAAAAA;SOR=0.713;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=33;WE=36044345;WS=36044327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,41:0.93:44
chr14	36096255	rs34349314	G	GA	2726.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=-1.564;QD=16.63;ReadPosRankSum=-0.394;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,129:0.79:164
chr14	36096271	rs201376057	G	A	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FS=119.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=-3.192;QD=1.41;ReadPosRankSum=-0.453;SOR=7.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:164,82:0.33:246
chr14	36121087	rs35892589	CA	C	1343.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=40;PP=886;SC=GATCTGTAAGCAAAAAAAAAT;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=6;TCR=48;TR=45;WE=36121095;WS=36121077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr14	36231816	rs11847872	G	A	1866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=10;PP=1387;SC=AGACAATTCAGAGATCTTTAG;SOR=3.037;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=46;TCR=10;TR=55;WE=36231824;WS=36231806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr14	36232046	rs17764207	A	G	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.456;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=341;ReadPosRankSum=-0.208;SC=ACACTTTTAAATAAGTCCTTG;SOR=1.911;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=17;WE=36232054;WS=36232036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr14	36239960	rs17103519	G	T	79.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=58;SC=AATTTCCTATGGCATTTTGAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=36239968;WS=36239950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr14	36334030	rs12890607	G	C	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=365;SC=AATTTAGGATGCCAAAGCATT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=36334038;WS=36334020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	36334905	.	C	CT	69.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=5.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=0.000;QD=1.70;ReadPosRankSum=-0.732;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,10:0.24:41
chr14	36768276	rs4900833	T	C	3687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=27;PP=2846;SC=ATGACAAGGATGAGAGGAGTT;SOR=2.362;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=92;TCR=27;TR=119;WE=36768284;WS=36768266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr14	36781037	rs7154340	C	T	2269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=15;PP=1935;SC=CATCTAACCACAAGTATGAAG;SOR=2.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=54;TCR=15;TR=69;WE=36781045;WS=36781027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr14	36789729	rs3168891	T	G	3863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=85;PP=2965;SC=AGAGGTTGGGTCTGCATCTTC;SOR=2.021;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=32;TCR=85;TR=117;WE=36789737;WS=36789719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr14	36789775	rs2899849	A	T	2582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=15;NR=49;PP=1533;SC=CGGGCGATTAAGCTCCGTGGC;SOR=2.267;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=15;TCR=49;TR=64;WE=36789783;WS=36789765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr14	36789795	rs11558802	G	A	2218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=40;PP=1308;SC=CAGCAGCCATGATATCTTCTC;SOR=2.137;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=52;WE=36789803;WS=36789785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr14	36840650	rs3742592	A	T	10127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=168;NR=165;PP=2965;SC=CCAACCTACAACCCAGGGTCT;SOR=0.724;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=335;TCF=169;TCR=166;TR=333;WE=36840658;WS=36840640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr14	36840695	rs3742593	A	G	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FS=4.999;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.56;MQRankSum=-0.784;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.722;SOR=1.024;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:220,74:0.25:294
chr14	36944188	rs1012914	G	A	3020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=79;PP=2459;SC=CTATTTCTGCGTAACAAATTA;SOR=3.306;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=14;TCR=80;TR=93;WE=36944196;WS=36944178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr14	36947081	rs12435251	C	T	3576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=79;PP=2924;SC=TCCCCTCCTCCATCTATAAAA;SOR=1.650;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=37;TCR=79;TR=116;WE=36947089;WS=36947071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr14	36988928	rs149047715	A	AAG	439.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=5.562;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.17;ReadPosRankSum=0.342;SOR=0.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,20:0.24:85
chr14	37051427	rs11624339	C	T	1386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=3;PP=1151;SC=CGCAATCCACCACGCACTTAC;SOR=4.125;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=41;WE=37051435;WS=37051417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr14	37051634	rs35669843	G	C	1634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=33;PP=1237;SC=GGCAGGCTGGGAACGGAGGGG;SOR=2.004;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=47;WE=37051642;WS=37051624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr14	37131993	rs12883298	G	C	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=2;PP=899;ReadPosRankSum=3.236;SC=GTAGTTAGTAGGGGACGGGTG;SOR=0.844;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=49;TCF=47;TCR=2;TR=39;WE=37132001;WS=37131983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,39:0.80:49
chr14	37132048	rs12882923	A	G	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-1.859;NF=43;NR=5;PP=1764;ReadPosRankSum=-2.484;SC=AGTGGCAGGCAGCTGTCCCAA;SOR=0.920;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=70;TCF=62;TCR=8;TR=48;WE=37132069;WS=37132038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,48:0.69:70
chr14	37132061	rs12883049	A	G	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.698;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-2.137;NF=30;NR=9;PP=1764;ReadPosRankSum=-4.640;SC=TGTCCCAAGCAGCGGGTGCGC;SOR=0.233;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=63;TCF=51;TCR=12;TR=39;WE=37132069;WS=37132038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,40:0.62:64
chr14	37132769	rs2236007	G	A	2080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.862;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=68;PP=1584;ReadPosRankSum=-1.020;SC=TGCAGCGTCTGCCCCCGCACT;SOR=0.399;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=102;TCF=15;TCR=87;TR=81;WE=37132777;WS=37132759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,85:0.81:105
chr14	37135752	rs12881240	C	T	1389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.506;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=18;PP=1053;ReadPosRankSum=-0.929;SC=CCGCCCCGCACGCGGTGAACG;SOR=0.345;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=74;TCF=48;TCR=26;TR=49;WE=37135760;WS=37135742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,51:0.67:76
chr14	37140504	rs8004187	C	T	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=281;ReadPosRankSum=-1.567;SC=TAACCTCTAACTGCCAGACAT;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=12;WE=37140512;WS=37140494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr14	37203642	rs5807904	TA	T	2320.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=17;PP=1920;SC=TTTAATGTCTTAAGAGTTTGT;SOR=1.963;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=34;TCR=18;TR=48;WE=37203650;WS=37203632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
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chr14	37344229	rs5807914	A	AG	5678.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=86;PP=2936;SC=GATAAAGAAAATCCAATAAAC;SOR=1.418;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=130;TCF=40;TCR=90;TR=126;WE=37344237;WS=37344210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr14	37344275	rs712384	C	T	3324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=76;PP=2635;SC=TCCTTGATCCCGTCGATTTCT;SOR=2.086;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=104;TCF=27;TCR=77;TR=103;WE=37344283;WS=37344265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr14	37344347	rs2021404	C	T	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=35;PP=906;ReadPosRankSum=0.892;SC=TAGTAATAGGCTAGTGGCAAA;SOR=0.749;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=37;WE=37344355;WS=37344337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,39:0.78:50
chr14	37641880	rs1403	C	A	3292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=84;PP=2577;SC=GGCGCCCACGCCCTTCTCTAT;SOR=2.595;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=23;TCR=84;TR=107;WE=37641888;WS=37641870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr14	37777655	rs34151241	A	G	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=1.634;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.63;ReadPosRankSum=0.336;SOR=0.830;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,33:0.26:128
chr14	37838604	rs35277854	C	CA	623.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=424;ReadPosRankSum=-1.002;SC=ATTCTTGTTGCAAAAAAAAAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=22;WE=37838612;WS=37838594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr14	38014889	rs17106826	A	T	1335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.061;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=4;PP=966;ReadPosRankSum=-0.029;SC=TAGATACAAAATCATCCAATA;SOR=2.505;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=65;TCF=54;TCR=11;TR=43;WE=38014897;WS=38014879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,49:0.70:70
chr14	38016044	rs10151200	C	G	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=1;PP=511;SC=CTTTATCAGCCAGGACATTCT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=38016052;WS=38016034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	38061547	rs112819884	G	C	1964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.272;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=59;PP=1440;ReadPosRankSum=-0.717;SC=CTGCGGCCCAGGTTGGACGGC;SOR=1.203;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=116;TCF=33;TCR=83;TR=80;WE=38061555;WS=38061537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,82:0.70:117
chr14	38061742	rs7144658	C	T	5588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=53;PP=2965;SC=GGCATGCCGGCTACTGCGCCG;SOR=1.846;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=126;TCR=53;TR=179;WE=38061750;WS=38061732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr14	38064009	rs762083	G	C	1838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=1;PP=1514;SC=CCCCCGGCCCGCCTGCCTGCC;SOR=6.630;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=53;TCF=52;TCR=1;TR=52;WE=38064017;WS=38063999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr14	38064215	rs79519281	G	C	5222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=131;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.323;SC=ATCCAGCCCTGTGCGAAGCGA;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=261;TCF=78;TCR=183;TR=186;WE=38064223;WS=38064205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,194:0.72:268
chr14	38165784	rs960787	A	G	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=257;ReadPosRankSum=0.838;SC=GAAACTATCAATTTACTTTTA;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=11;WE=38165792;WS=38165774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr14	38205027	rs1570399	T	C	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.771;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=190;ReadPosRankSum=-0.660;SC=TTCTCTTTGGTTCTTTTGTTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=9;WE=38205035;WS=38205017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr14	38206818	rs4901157	G	A	851.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=653;ReadPosRankSum=1.234;SC=TAGCTTATCAGATAGTATCTG;SOR=3.545;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=25;WE=38206826;WS=38206808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,28:0.88:32
chr14	38207008	rs11439106	A	AT	737.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=823;ReadPosRankSum=-0.077;SC=TAATCACCTTATTTTTTTTTA;SOR=2.226;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=20;WE=38207026;WS=38206998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,23:0.77:30
chr14	38207018	rs17107021	A	T	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=903;ReadPosRankSum=1.245;SC=ATTTTTTTTTAAAAGCATCTA;SOR=2.019;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=24;WE=38207026;WS=38206998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr14	38218343	rs12586727	A	G	5123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.713;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=104;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.266;SC=AGATGCGAGCATACCTGTAAA;SOR=0.630;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=284;TCF=140;TCR=144;TR=194;WE=38218351;WS=38218333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,209:0.69:301
chr14	38218872	rs17768594	T	G	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.147;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=147;ReadPosRankSum=1.424;SC=TAGGATATCCTCCTTTAACAA;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=9;WE=38218880;WS=38218862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr14	38222291	rs4901176	G	C	1368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=9;PP=1198;SC=TGTACCTCCCGCTGTCCCTAT;SOR=2.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=43;WE=38222299;WS=38222281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr14	38259876	rs12590844	G	A	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=236;ReadPosRankSum=0.618;SC=TTTACCTATGGTTATTTTAGA;SOR=0.627;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=13;WE=38259884;WS=38259866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr14	38260034	rs17107106	T	C	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.861;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=493;ReadPosRankSum=-0.778;SC=CTGTCATTTCTCTAGAAAGGT;SOR=0.467;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=104;TCF=31;TCR=73;TR=32;WE=38260042;WS=38260024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,34:0.31:111
chr14	38260089	rs7153624	C	T	1815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=49;PP=1463;SC=TGTAAAAAATCGAAAACCTGA;SOR=5.747;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=2;TCR=49;TR=51;WE=38260097;WS=38260079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr14	38264358	rs969446	C	T	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=178;ReadPosRankSum=-0.797;SC=TTAAGAAAAACATGTATGTTA;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=9;WE=38264366;WS=38264348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr14	38265344	rs1951639	T	A	287.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.98;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	38276433	rs66496750	G	A	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.836;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=44;ReadPosRankSum=0.253;SC=TTTTTGGGAGGCATAGATTTG;SOR=0.027;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=6;WE=38276441;WS=38276431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr14	38277999	rs4901284	C	T	1455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.462;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=18;PP=1055;ReadPosRankSum=-2.672;SC=AATAGTTATACAGCATTTTAT;SOR=1.172;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=75;TCF=47;TCR=28;TR=51;WE=38278007;WS=38277989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,56:0.71:79
chr14	38295646	rs10483494	T	C	1602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=52;PP=1227;SC=CTTTTTAAAGTGACTTATGGA;SOR=8.155;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=0;TCR=52;TR=52;WE=38295654;WS=38295636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr14	38310606	rs10151474	G	A	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=1;PP=359;SC=TTTCTGTATAGTAAGTTGCCA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=38310614;WS=38310596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	38678356	rs12437095	G	A	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=141;ReadPosRankSum=0.210;SC=TCCTCTCCACGGTCGCCTGTG;SOR=1.609;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=7;WE=38678364;WS=38678346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr14	38678492	rs12434340	T	C	591.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=2.634;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=427;ReadPosRankSum=-0.092;SC=TGGGCGGCTGTGGGCTGCAGG;SOR=0.275;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=23;WE=38678500;WS=38678482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,24:0.89:27
chr14	39502539	rs11418467	G	GA	1210.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=60.23;NF=2;NR=30;PP=1058;SC=ACTCCTAGAGGAAAAAAGATA;SOR=3.003;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=32;WE=39502547;WS=39502529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	39502626	rs11283010	A	AAATAGAAC	666.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=774;SC=AAATCATTTGAAATGCCTATG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=11;WE=39502634;WS=39502616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	39512122	rs4902326	T	A	2250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=53;PP=1694;SC=GGAAAAATAATCTACTCAATA;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=13;TCR=53;TR=66;WE=39512130;WS=39512112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr14	39514231	rs1884384	T	A	1448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=0;PP=1273;SC=GCGAATACATTAATAGGTTGA;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=44;WE=39514239;WS=39514221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr14	39517691	rs4902344	T	A	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=381;SC=GGTGGCACACTCCTGTAGTCC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=39517699;WS=39517681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	39517925	rs11556216	T	C	1537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=31;PP=1149;SC=ATTCTCCAAATTTCTGACACT;SOR=2.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=42;WE=39517933;WS=39517915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr14	39524614	rs374256535	A	ATT	214.27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.43;ReadPosRankSum=-0.226;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr14	39532492	rs55993688	T	C	2216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=14;PP=1757;SC=CAAATGTACGTTGTACGTTTT;SOR=2.602;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=50;TCR=14;TR=64;WE=39532500;WS=39532482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr14	39554889	rs202142857	T	TAC	138.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.87;MQRankSum=0.935;QD=10.67;ReadPosRankSum=0.929;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr14	39554891	rs56156769	T	C	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.13;QD=45.68;SOR=5.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	39554891	.	TAT	CAC	679	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=53.85;NF=15;NR=0;PP=679;QD=48.8311916575;SC=TATAATTATATATACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=15;WE=39554901;WS=39554876;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:19,15:0.44:34
chr14	39554893	rs8009506	T	C	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.47;QD=43.21;SOR=5.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	39556185	rs8018720	G	C	3532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=72;PP=2965;SC=GCTTGAGTAAGTGGTACTTTA;SOR=1.524;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=37;TCR=72;TR=109;WE=39556193;WS=39556175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr14	39561840	.	A	G	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.434;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=140;ReadPosRankSum=-0.673;SC=AACTACAAATAGAAAACAAAC;SOR=0.527;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=9;WE=39561848;WS=39561830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr14	39565403	rs3818163	T	A	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=37;PP=1135;SC=GTTCAAAATATGAATGTTCTC;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=38;WE=39565411;WS=39565393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr14	39583481	rs2277458	A	G	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=0;PP=638;SC=GTCTATTAGTACGCCTGCGCT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=39583489;WS=39583471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	39591083	.	AT	A	83.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.53;MQRankSum=0.524;QD=16.75;ReadPosRankSum=0.524;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr14	39591107	rs8008726	G	T	127.18	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQ=62.13;NF=3;NR=2;PP=99;SC=TGTATTTTTAGTAGAGGTGGG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=39591115;WS=39591097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:0,4:1.00:4
chr14	39591565	rs61692397	C	CT	785.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-5.295;NF=32;NR=0;PP=605;ReadPosRankSum=-0.896;SC=GACTTAACTTCTTTTTTTTTA;SOR=5.486;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=32;WE=39591573;WS=39591555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr14	39591613	rs60205535	G	GT	1590.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.99;MQRankSum=0.027;QD=24.10;ReadPosRankSum=0.673;SOR=5.074;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,62:0.94:66
chr14	39591627	rs202076636	C	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=18.625;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=0.274;QD=2.02;ReadPosRankSum=-0.623;SOR=3.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,28:0.33:86
chr14	39605542	rs9322993	T	C	1307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=13;PP=1110;SC=TTTAACCAGTTTCTTATTGAT;SOR=1.788;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=41;WE=39605550;WS=39605532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	39620788	rs8003485	A	T	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=342;SC=AATTACTGAAAATGAATGTAG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=39620796;WS=39620778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	39620936	rs8003807	C	T	1802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=22;PP=1411;SC=GTAAGAAAGGCGAATTCAACT;SOR=1.143;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=59;TCF=37;TCR=22;TR=56;WE=39620944;WS=39620926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr14	39627433	rs35270180	G	A	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=281;SC=ACTAAAATACGATATTTATAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=39627441;WS=39627423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	39627747	rs761804	A	G	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=16;PP=490;SC=TTTGAGACAGATTCTGGCTCT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=39627755;WS=39627737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	39645863	rs2252040	G	A	1734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=47;PP=1387;SC=AAATATAAATGTTTATTAACA;SOR=4.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=5;TCR=47;TR=52;WE=39645871;WS=39645853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr14	39647188	rs68193573	T	A	485.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=18;PP=535;SC=ATGTTTTTTTTAAAAAATCCT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=39647196;WS=39647178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	39650234	rs2180792	A	T	6079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=91;PP=2965;SC=AGAATGTAAAACCCTTTCTCC;SOR=0.714;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=182;TCF=91;TCR=91;TR=182;WE=39650242;WS=39650224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr14	39736680	rs7140561	T	C	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=6;PP=831;SC=GAGCCCGGGGTTACCCCTCAA;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=31;WE=39736688;WS=39736670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	39748480	rs7158558	G	A	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=1;PP=512;SC=GACGTTAAATGAATTGATTTA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=39748488;WS=39748470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	39763006	rs956109	T	C	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=338;SC=TTATGAAATATTAAAGTTATG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=39763014;WS=39762996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	39773639	rs2274398	G	T	1714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=27;PP=1325;SC=TACATCTCTTGGCAGAGAATG;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=26;TCR=27;TR=53;WE=39773647;WS=39773629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr14	39777676	rs1950952	G	C	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=426;SC=TCTTCAGACTGAACAAGCATC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=39777684;WS=39777666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	39784012	.	A	ATGTGTGTGTGTG	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=-0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5436;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.531;NF=3;NR=22;PP=254;ReadPosRankSum=-0.000;SC=AGGTATATATATATGTGTGTG;SOR=0.892;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=49;TCF=4;TCR=45;TR=25;WE=39784022;WS=39784002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,19:0.83:23
chr14	39784014	rs2415539	A	G	1277.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=26;PP=862;SC=GTATATATATATGTGTGTGTG;SOR=3.611;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=46;TCF=5;TCR=41;TR=31;WE=39784022;WS=39784002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr14	39784042	rs2415540	A	G	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=485;SC=GTGTGTGTGTATATATATATA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=19;WE=39784050;WS=39784032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	39784965	rs10150863	G	T	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=32;PP=1060;SC=CAAATTGTATGTTTTTTTCAG;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=38;WE=39784973;WS=39784955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr14	39796048	rs36031495	GT	G	1887.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=17;PP=1166;SC=AGATTTGTATGTTTTTTTTTC;SOR=2.115;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=66;TCF=42;TCR=24;TR=56;WE=39796056;WS=39796038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr14	39816781	rs12882375	C	T	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=166;ReadPosRankSum=1.331;SC=CTTGTGGCCGCAATATAGGAT;SOR=0.725;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=15;WE=39816789;WS=39816771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,18:0.31:58
chr14	39818145	rs1060878	G	A	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.179;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.069;NF=9;NR=10;PP=303;ReadPosRankSum=0.741;SC=TTTTCCACCAGGGGATTTCCC;SOR=0.289;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=46;TCF=27;TCR=19;TR=19;WE=39818153;WS=39818135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr14	39818222	rs7156249	G	T	1206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=22;PP=898;SC=TCAATATGTGGTTTATTAATC;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=36;WE=39818230;WS=39818212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr14	39856043	rs10146207	G	C	2797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=22;PP=2286;SC=TCAGCAACTCGTCTCTCTTCT;SOR=2.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=64;TCR=22;TR=86;WE=39856051;WS=39856033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr14	39871159	rs36065920	AT	A	1623.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=50;PP=1907;SC=AAAGCATGCAATTTTGAGATC;SOR=7.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=0;TCR=54;TR=50;WE=39871167;WS=39871149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr14	42355771	rs721222	C	T	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=132;ReadPosRankSum=0.388;SC=AATTAAATCACTGGATGCTAA;SOR=0.481;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=8;WE=42355779;WS=42355761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr14	42360633	rs6572117	T	C	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.366;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=766;ReadPosRankSum=0.313;SC=TCATGCAGTCTCAGTTTTTGG;SOR=0.761;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=143;TCF=75;TCR=68;TR=47;WE=42360641;WS=42360623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,49:0.34:143
chr14	42373500	rs191949312	T	C	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=185;ReadPosRankSum=-1.235;SC=GAAGAAATTGTCTACAGGAGC;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=8;WE=42373508;WS=42373490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr14	42998026	rs10148466	T	C	1275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=35;PP=954;SC=AACTGCTCATTGTTTTCTTAC;SOR=3.564;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=40;WE=42998034;WS=42998016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr14	44589434	rs11620704	A	G	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.537;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.436;NF=15;NR=22;PP=608;ReadPosRankSum=-0.387;SC=TGGATTTAACAAACAACATTT;SOR=1.096;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=122;TCF=58;TCR=64;TR=37;WE=44589442;WS=44589424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,39:0.30:129
chr14	44973638	rs412408	C	T	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=3;PP=621;SC=AGCTACTTCCCGCTGCCCACC;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=44973646;WS=44973628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	44974922	rs3825632	A	T	876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=7;PP=722;SC=GAGGCTGAACATCAGCAAGGG;SOR=2.066;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=27;WE=44974930;WS=44974912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	44975510	rs3809430	C	T	2739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.832;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=35;PP=2312;ReadPosRankSum=-1.033;SC=CTAAAAGTACCGGGGGACCTT;SOR=0.849;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=86;TCF=50;TCR=36;TR=85;WE=44975518;WS=44975500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,86:0.99:87
chr14	45512771	rs72672914	C	G	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.413;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.52;ReadPosRankSum=-0.076;SOR=1.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr14	45575202	rs72672919	C	A	1853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=49;PP=1336;ReadPosRankSum=0.535;SC=AAATGAAAAGCTAGGTGGAAG;SOR=0.709;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=268;TCF=109;TCR=159;TR=82;WE=45575210;WS=45575192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,87:0.32:276
chr14	45700409	rs61741592	C	T	1814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.719;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=37;PP=1278;ReadPosRankSum=-0.970;SC=TTGGTTTTCTCGTGCATCATT;SOR=0.794;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=54;TCR=61;TR=71;WE=45700417;WS=45700399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,73:0.63:115
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chr14	47315127	rs1388567	G	A	2305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=62;PP=1817;SC=TTGCAGATCAGTTTCTCTTGA;SOR=4.003;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=8;TCR=62;TR=70;WE=47315135;WS=47315117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr14	47324127	rs3007133	G	A	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=115;ReadPosRankSum=-0.846;SC=TGCTTATATCGTGGAATTTCT;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=7;WE=47324135;WS=47324117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr14	47341131	rs2933208	C	G	555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=499;SC=TGGGAAGATTCCTTGAGACCA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=47341139;WS=47341121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	47528470	rs8009302	T	C	3499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=48;PP=2630;SC=TCTCAGACTTTGTAGAGCTTC;SOR=0.922;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=60;TCR=48;TR=108;WE=47528478;WS=47528460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr14	47528551	rs10144183	T	A	3032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=66;PP=2282;SC=TTGGAAGAAGTCAATATATTT;SOR=1.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=27;TCR=66;TR=93;WE=47528559;WS=47528541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr14	47530841	rs7147260	A	C	1674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.94;SOR=7.378;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr14	47530845	rs7147741	G	C	1640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.26;SOR=7.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr14	47582348	rs8006750	T	C	1191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=0;PP=1093;SC=ATCCACTGACTCCACAGAAAT;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=47582356;WS=47582338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	47613364	rs72680210	G	T	1393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.915;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=24;PP=977;ReadPosRankSum=0.187;SC=CAGCTATACCGAACAGGAGGA;SOR=0.658;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=92;TCF=45;TCR=47;TR=52;WE=47613372;WS=47613354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,56:0.59:95
chr14	47687187	rs8011854	A	C	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=684;SC=GAAATCCATAATAGGCTTAAT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=47687195;WS=47687177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	47812071	rs2277472	G	A	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=333;ReadPosRankSum=-0.785;SC=ACACTTAAAGGCTAGGTTCCG;SOR=0.487;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=17;WE=47812079;WS=47812061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr14	47812311	rs7160311	C	G	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.491;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=549;ReadPosRankSum=1.882;SC=CTTGAATAACCAGATGCTCGA;SOR=0.283;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=25;WE=47812319;WS=47812301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr14	50044392	rs2883438	T	C	1608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=16;PP=1063;SC=ACCCTGTTGTTAATACCTCTG;SOR=1.519;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=29;TCR=16;TR=45;WE=50044400;WS=50044382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr14	50044465	rs41317310	G	A	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.350;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=293;ReadPosRankSum=1.528;SC=TGAACTTGGTGCTCTTTTTGA;SOR=1.760;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=65;TCF=38;TCR=27;TR=20;WE=50044473;WS=50044455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,21:0.31:68
chr14	50065143	.	C	T	3905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.970;ClippingRankSum=0.000;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.695;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=63;PP=2893;ReadPosRankSum=1.131;SC=ATTTGTTCAGCAGGAATTGCC;SOR=0.827;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=225;TCF=128;TCR=97;TR=147;WE=50065151;WS=50065133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,153:0.66:232
chr14	50065359	rs2281837	C	G	7790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=141;NR=114;PP=2965;SC=GACGTGCGCCCGCAACGCGTA;SOR=0.895;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=255;TCF=141;TCR=114;TR=255;WE=50065367;WS=50065349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr14	50065444	rs12884574	G	A	3352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.484;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=76;PP=2629;ReadPosRankSum=1.744;SC=GCGCTCGGGGGAAAAGACGTT;SOR=1.176;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=195;TCF=81;TCR=114;TR=123;WE=50065452;WS=50065434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,124:0.64:195
chr14	50065717	rs2281836	G	C	3737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=41;PP=2965;SC=CCAGCTTGACGTGGTTGTGGC;SOR=1.432;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=71;TCR=41;TR=112;WE=50065725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr14	50068299	rs11625804	C	G	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.937;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.802;NF=25;NR=9;PP=582;ReadPosRankSum=-0.778;SC=GATTCCTGCTCTCATGGAGTT;SOR=0.957;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=89;TCF=63;TCR=26;TR=34;WE=50068307;WS=50068289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,34:0.38:90
chr14	50069282	rs2354444	A	T	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-5.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=541;ReadPosRankSum=0.900;SC=TGAAGTACAGAGGCATAGTCA;SOR=1.432;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=1;TCR=52;TR=25;WE=50069290;WS=50069272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr14	50070229	rs200898470	T	TTTC	423.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=1;PP=105;SC=GTAATCATTCTTTCTTCTTCT;SOR=3.767;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=12;WE=50070237;WS=50070219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	50070384	rs7146398	T	C	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=83;ReadPosRankSum=-0.635;SC=TGCCTGGCCCTTACTGTAATC;SOR=0.412;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=5;WE=50070392;WS=50070374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr14	50070426	.	TAA	T	315	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000;HP=20;HapScore=4;MGOF=16;MMLQ=29;MQ=44.84;NF=0;NR=6;PP=315;QD=53.0;SC=TTTTTTTTTTTAATGAGACAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=50070444;WS=50070416;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
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chr14	50074014	rs2354445	G	T	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=231;ReadPosRankSum=-0.282;SC=GTAAATCATTGTATCACATTC;SOR=0.874;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=11;WE=50074022;WS=50074004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr14	50074122	rs17121605	T	A	1883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.830;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=16;PP=1465;ReadPosRankSum=-0.426;SC=ATTCAGGCCATTTCCAGCAGT;SOR=0.861;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=113;TCF=86;TCR=27;TR=68;WE=50074130;WS=50074112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,70:0.60:117
chr14	50074520	rs7148147	C	T	3478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.232;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=62;PP=2610;ReadPosRankSum=0.256;SC=GAAGTCACTTCGGAGTTTGGA;SOR=0.433;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=193;TCF=102;TCR=91;TR=123;WE=50074528;WS=50074510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,129:0.65:199
chr14	50080871	rs6572592	G	A	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=0;PP=576;SC=TATACTAATCGCTTAATAATT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=50080879;WS=50080861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	50087753	rs7519	T	C	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=150;ReadPosRankSum=-0.522;SC=GCGGCGCCGATGCTCGAGCTG;SOR=0.570;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=20;TCR=29;TR=14;WE=50087761;WS=50087743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,14:0.29:49
chr14	50092471	rs9989177	T	C	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.339;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=396;ReadPosRankSum=-0.386;SC=GTTTAAGTTATCTTTTTCCTC;SOR=0.152;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=65;TCF=17;TCR=48;TR=21;WE=50092479;WS=50092461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,22:0.32:69
chr14	50094913	rs2985696	C	A	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=14;PP=386;SC=CTAATAAGTCCCACTTGACAA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=50094921;WS=50094903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	50100386	rs2985687	T	C	3923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=67;PP=2965;SC=ACTCCTCGCGTGTTTCCACAC;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=54;TCR=67;TR=121;WE=50100394;WS=50100376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr14	50100683	rs2985686	C	G	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=13;PP=460;SC=CTCCGTCCTCCGCGCGACTCC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=19;WE=50100691;WS=50100673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	50101370	rs2985685	G	A	3149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=50;PP=2524;SC=CCAGGGCCGTGGCGTCCAGCA;SOR=0.753;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=49;TCR=50;TR=99;WE=50101378;WS=50101360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr14	50101682	rs2985684	C	G	5044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=55;PP=2965;SC=CCACCCCGCGCTCACGCTCTA;SOR=1.344;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=96;TCR=55;TR=151;WE=50101690;WS=50101672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr14	50110319	rs3218801	T	C	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.034;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=753;ReadPosRankSum=-2.091;SC=ACATAAGATATAGAGTTAAGC;SOR=0.489;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=58;TCF=36;TCR=22;TR=37;WE=50110327;WS=50110309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,39:0.63:62
chr14	50110494	rs3218796	C	T	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=113;ReadPosRankSum=0.319;SC=TTTTTAAAAACAGGTCAATAC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=50110502;WS=50110484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr14	50113915	rs7155238	T	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=140;ReadPosRankSum=-0.899;SC=ACTGTAGACATTTTCAAAAAT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=50113923;WS=50113905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr14	50114117	rs3218792	CT	C	288.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.239;NF=0;NR=12;PP=190;ReadPosRankSum=0.416;SC=AATGCTCAGACTTTTTTTTAA;SOR=0.776;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=12;WE=50114125;WS=50114107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr14	50120858	rs3212323	C	T	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=11;PP=517;ReadPosRankSum=-0.404;SC=TTGCAAAAATCTGAACAAAAC;SOR=0.682;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=19;TCR=15;TR=25;WE=50120866;WS=50120848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,26:0.70:37
chr14	50122280	rs10678863	C	CAG	397.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5082;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.126;NF=10;NR=0;PP=389;ReadPosRankSum=-1.282;SC=ATTGCTAACTCTGTTTTTTTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=50122288;WS=50122270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr14	50131728	rs35615446	T	C	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=313;ReadPosRankSum=-1.599;SC=AGAAGTTACATTGAGAACCCA;SOR=1.981;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=14;WE=50131736;WS=50131718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr14	50131846	rs3218791	G	T	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.025;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=1013;ReadPosRankSum=0.938;SC=GGTCTAGTTGGACTGTTCCAG;SOR=0.307;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=63;TCF=35;TCR=28;TR=46;WE=50131854;WS=50131836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,48:0.69:70
chr14	50131932	rs3218795	T	C	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=472;ReadPosRankSum=-1.162;SC=ATGAAAACCGTTGACAAAAAA;SOR=0.719;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=20;WE=50131940;WS=50131922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr14	50133033	rs3218797	T	C	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.363;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=660;ReadPosRankSum=-2.230;SC=AAAAGTTTGATGCTTATTAAG;SOR=1.066;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=76;TCF=35;TCR=41;TR=42;WE=50133041;WS=50133023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,47:0.58:81
chr14	50133218	rs12432319	T	C	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=258;ReadPosRankSum=0.081;SC=ATTTGGGGTATACATTTCAGC;SOR=1.061;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=11;WE=50133226;WS=50133208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr14	50175792	rs11157703	T	C	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=314;SC=TAGTATTTTATTAGCAATTTT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=50175800;WS=50175782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	50192609	rs10147220	A	G	165.03	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5268;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=116;ReadPosRankSum=0.887;SC=TCTGTTGCCCAGGCTGGAGTA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=7;WE=50192617;WS=50192599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr14	50195679	rs4301946	A	G	3144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=42;PP=2092;SC=CCGCGCATACATGTGCAGTTC;SOR=0.995;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=59;TCR=42;TR=101;WE=50195687;WS=50195669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr14	50196373	rs34410594	T	G	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-3.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.645;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=473;ReadPosRankSum=0.934;SC=ATTTTTTTCCTTCAGATCGTA;SOR=0.303;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=20;WE=50196381;WS=50196363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr14	50199337	rs60013005	A	AT	557.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=429;SC=GTGAGGGCAGATTTTTTTTTT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=19;WE=50199345;WS=50199327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	50199375	rs10146753	A	C	1474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=5;PP=1301;SC=AAAACCTTTTATTTTGATTAA;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=41;TCR=5;TR=46;WE=50199383;WS=50199365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr14	50206702	rs4898631	G	A	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=433;SC=AAGTTCAATCGTGTCTCTTTT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=50206710;WS=50206692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	50241205	rs66520673	TAGA	T	675.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.351;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.672;NF=17;NR=1;PP=676;ReadPosRankSum=0.215;SC=AGGATATAAGTAGAAGAAGAA;SOR=1.528;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=18;WE=50241215;WS=50241195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr14	50241258	rs4499141	A	C	2426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=14;PP=1958;SC=ACTTACATACATTTAATTTAT;SOR=2.895;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=58;TCR=14;TR=72;WE=50241266;WS=50241248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr14	50244835	rs4900949	C	T	3304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=34;PP=2552;SC=CTAAGATAAACTGCTTGTATC;SOR=1.306;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=59;TCR=34;TR=93;WE=50244843;WS=50244825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr14	50245374	rs6572613	C	A	119.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=78;SC=TTTCCAAGGACTCTAGAACTC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=50245382;WS=50245364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	50247290	rs4900952	G	T	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=3;PP=346;SC=TAATTGCAGGGGGGGGAAAAA;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=50247298;WS=50247280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	50251369	rs10143621	A	G	1670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=25;PP=1259;SC=TCCTTTTTACATTCAGAAGAT;SOR=0.877;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=55;WE=50251377;WS=50251359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr14	50251888	rs8009346	C	T	3660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=76;NR=30;PP=2965;SC=ACTAAATAGACGTTACAAAAC;SOR=1.928;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=76;TCR=30;TR=106;WE=50251896;WS=50251878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr14	50280577	rs3126194	T	C	366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=2;PP=325;SC=ACACTTCAGCTTCCCAAAGTG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=50280585;WS=50280567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	50280688	rs3126195	T	A	1522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=34;NR=11;PP=1239;SC=GAATTCTGAATAGAAAGAAAT;SOR=2.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=45;WE=50280696;WS=50280678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr14	50298153	rs11365862	AT	A	96.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=14;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.776;NF=1;NR=5;PP=57;ReadPosRankSum=-1.928;SC=ACAGAATTTTATTTTTTTTTT;SOR=0.116;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=6;WE=50298161;WS=50298143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr14	50298962	rs3100906	T	A	3744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=78;PP=2795;SC=GCTTCCAAGCTTGGTTTTATT;SOR=1.708;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=37;TCR=78;TR=115;WE=50298970;WS=50298952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr14	50299051	rs56170989	CT	C	498.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=0;NR=24;PP=359;SC=AGATTTACTTCTTTTTTTTTT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=24;WE=50299060;WS=50299041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	50300310	rs3100904	A	G	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=20;PP=625;SC=AAGTGCTTACAAAATAATGTT;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=50300318;WS=50300300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	50319327	rs3126160	T	C	6126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=144;NR=47;PP=2965;SC=TAAGGAAACATATCAAGCTGG;SOR=2.278;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=192;TCF=145;TCR=47;TR=191;WE=50319335;WS=50319317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr14	50319499	rs3100887	G	T	3548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=91;PP=2845;SC=ACTACCGCAAGTTCCTCTACT;SOR=3.362;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=14;TCR=91;TR=105;WE=50319507;WS=50319489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr14	50477643	rs4900978	G	C	1655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=10;PP=1284;SC=CACATGCCATGTCACTTACTT;SOR=2.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=47;WE=50477651;WS=50477633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr14	50555664	rs2883738	G	T	484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=407;SC=CCCAAATTCCGATGTTGAAAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=50555672;WS=50555654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	50558444	rs201234068	T	C	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.293;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=38;PP=808;ReadPosRankSum=0.458;SC=AGGACACTGGTGGGCTGTGAC;SOR=0.383;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=105;TCF=21;TCR=84;TR=49;WE=50558452;WS=50558434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,48:0.44:108
chr14	50585574	rs10658395	C	CA	1120.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=6;NR=34;PP=835;SC=ATATTTCCCTCAAAAAAAAAA;SOR=3.365;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=40;WE=50585582;WS=50585564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr14	50596862	rs3759597	T	C	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=2;PP=25;SC=AAAAATTAACTCAGAACCTTC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=50596870;WS=50596852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr14	50600698	rs147458500	C	CA	62.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=106;ReadPosRankSum=0.319;SC=TTTCCCCCCCCAGTTTTAGAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=50600706;WS=50600694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr14	50605267	rs35961944	A	AT	325.76	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=-0.635;QD=16.29;ReadPosRankSum=0.520;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr14	50611845	rs2064667	C	T	1991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=12;PP=1506;SC=ATGCTAATTTCATCATCCCCG;SOR=2.340;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=46;TCR=12;TR=58;WE=50611853;WS=50611835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr14	50612401	rs1014879	T	C	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=306;SC=AAAAAGACAATTAACCCAAAA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=50612422;WS=50612391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	50612414	rs726797	C	T	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=306;SC=ACCCAAAAGACAGATGAACAC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=50612422;WS=50612391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	50616878	rs2229869	G	A	6982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=159;PP=2965;SC=GGCTTACTCCGTTTGCCTGAG;SOR=2.024;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=222;TCF=62;TCR=160;TR=221;WE=50616886;WS=50616868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr14	50619927	rs11628935	A	G	1817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=38;PP=1409;SC=TTAGTGAAACATAAGTGTTCA;SOR=1.498;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=59;WE=50619935;WS=50619917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr14	50623657	rs3736759	G	A	2319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=4;PP=2261;ReadPosRankSum=-0.798;SC=CACATAAAATGTGTGTGTGTG;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=87;TCF=83;TCR=4;TR=87;WE=50623665;WS=50623647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,63:0.97:65
chr14	50623679	rs3736760	G	A	2905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.24;ReadPosRankSum=2.250;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:5,88:0.95:93
chr14	50623683	rs3736761	A	G	2905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.91;ReadPosRankSum=2.864;SOR=1.589;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:6,88:0.94:94
chr14	50626836	rs4900992	C	T	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=456;SC=GCTTATTCAACAGCTAGCAAC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=50626844;WS=50626826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	50641347	rs10782418	T	G	3283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=82;PP=2606;SC=AACAGAAACGTCTACTAAAAA;SOR=3.045;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=17;TCR=82;TR=99;WE=50641355;WS=50641337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr14	50655146	rs139780957	CTATT	C	1012.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=3;PP=897;SC=AAAAAAGTGACTATTTATGAT;SOR=3.442;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=19;WE=50655157;WS=50655136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	50666263	rs1955924	C	T	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=223;SC=GGAAATATCACGGTTACTCTG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=50666271;WS=50666253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	50670965	rs1075537	G	C	1269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=5;PP=1056;SC=TCATACAGTGGTTGAGTGACT;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=40;WE=50670973;WS=50670955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	50671133	rs12888783	A	G	1819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=39;PP=1554;SC=TGAACCTTTAAAAAAAAGTTA;SOR=1.692;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=18;TCR=39;TR=57;WE=50671141;WS=50671123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr14	50704331	rs4901000	C	T	5079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=67;PP=2965;ReadPosRankSum=1.981;SC=AAGCTACAAGCGCTACCAGTC;SOR=0.305;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=151;TCF=84;TCR=67;TR=149;WE=50704339;WS=50704321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,167:0.99:168
chr14	50704435	rs80325445	G	A	1709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=53;PP=1357;ReadPosRankSum=1.303;SC=TCCTCTCACAGCCACCTGCCT;SOR=0.675;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=16;TCR=78;TR=64;WE=50704443;WS=50704425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,65:0.67:97
chr14	50732042	rs12432673	G	A	3378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=52;PP=2704;SC=CATAGGTCAGGACTGTATTTA;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=106;TCF=54;TCR=52;TR=106;WE=50732050;WS=50732032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr14	50745123	rs10658363	A	ATTACTT	852.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=2;PP=767;SC=TTCTCTCAGAATTACATTAGA;SOR=3.500;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=13;WE=50745131;WS=50745113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	50750577	rs12433038	A	G	2883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=6;PP=2401;SC=AGAAAAGACAAGGATGGCTTA;SOR=4.855;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=74;TCR=6;TR=80;WE=50750585;WS=50750567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr14	50760030	rs12894758	C	T	2828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=70;PP=2461;SC=CACCTTGACCCCTAACTTATA;SOR=2.915;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=16;TCR=70;TR=86;WE=50760038;WS=50760020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr14	50769717	rs2297995	G	A	4999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=85;PP=2965;SC=CGCCACCAACGATGACTATAT;SOR=1.040;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=67;TCR=85;TR=152;WE=50769725;WS=50769707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr14	50769868	rs1962578	G	A	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=19;PP=539;SC=GCGGCCGGTCGCAGTGGCTCA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=50769876;WS=50769858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	50778816	rs2275591	A	C	2035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=26;PP=1495;SC=ACCGGCGAAAAGCCCGCGGGC;SOR=1.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=42;TCR=26;TR=68;WE=50778824;WS=50778806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr14	50786004	rs12433794	A	G	4980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=106;PP=2965;SC=GGCTGTAGTGAAAAAGGGATG;SOR=1.795;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=47;TCR=107;TR=153;WE=50786012;WS=50785994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr14	50788213	rs2275592	C	T	5772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=104;NR=71;PP=2965;SC=CAAATGATGCCGTTTGGAAAA;SOR=1.141;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=104;TCR=71;TR=175;WE=50788221;WS=50788203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr14	50789078	rs11357954	GT	G	809.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.49;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	50789101	rs10685266	A	AATAC	1367.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=1078;SC=GGATCTCACTAATTTATCTTC;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=50789109;WS=50789091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	50789578	rs8017316	G	C	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=21;PP=655;SC=TCCTGTGTTTGATATTTATTT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=50789586;WS=50789568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	50792273	rs8003113	A	G	1257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=2;PP=1064;SC=AGTAAATTGAATTTATTTTTA;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=37;WE=50792281;WS=50792263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	50798665	.	C	T	325	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=13;NR=0;PP=325;QD=27.6747086575;SC=AATCTGATTTCATTTTCCAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=50798673;WS=50798664;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	50798743	rs4901016	G	A	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=8;PP=1212;SC=CATGCAGGCTGGAAACCCTGG;SOR=2.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=46;WE=50798751;WS=50798733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr14	50799126	rs7161563	G	C	3291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=69;PP=2575;SC=GTCAGCCTTTGAGTAGGGTCC;SOR=1.958;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=28;TCR=69;TR=97;WE=50799134;WS=50799116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr14	50799338	rs7141289	T	C	2306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=16;PP=1800;SC=ATTAAATAAATAGTTTCTAGA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=51;TCR=16;TR=67;WE=50799346;WS=50799328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr14	50801102	rs7141402	G	A	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=1;PP=870;SC=ACTGACCTCAGGTGATCTGCC;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=50801110;WS=50801092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr14	50802727	rs7148089	A	C	4806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=106;NR=37;PP=2965;SC=TCCATAGCTTAAATATTTCTC;SOR=2.131;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=106;TCR=37;TR=143;WE=50802735;WS=50802717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr14	50802840	rs7148292	A	G	4344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=96;PP=2965;SC=GATGAGGCCAACTGGTTGCCT;SOR=2.053;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=36;TCR=96;TR=132;WE=50802848;WS=50802830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr14	50808802	rs7142237	G	T	1037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=3;PP=793;SC=GTTGTATCAAGAACTTTTTCA;SOR=4.680;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=50808810;WS=50808792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	50809895	.	G	C	440	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=54.27;NF=0;NR=15;PP=440;QD=31.6514141698;SC=TTTTTTTTGAGTTGGGTCAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=15;WE=50809903;WS=50809885;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr14	50824839	rs11157737	G	A	2355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=23;PP=1899;SC=TCTTCTTCCAGTGCACACAAA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=71;WE=50824847;WS=50824829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr14	50824954	rs11157738	T	C	1856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=43;PP=1347;SC=TTTTCACCTATGCTTGCTTCA;SOR=1.875;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=61;WE=50824962;WS=50824944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr14	50825033	rs11570816	T	C	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=25;PP=754;SC=CCGGATTGCTTCCAGTGAAAT;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=50825041;WS=50825023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	50828838	rs10137638	A	G	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=3;PP=77;SC=GCCTCCCTGCAGGGCAGGGCT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=50828846;WS=50828828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	50844367	rs59930863	G	GA	1302.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=31;PP=1517;SC=GGGGTGGGAGGAGCCCAGGGA;SOR=3.797;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=33;WE=50844375;WS=50844357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	50844856	rs1890978	A	G	1162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=2;PP=903;SC=TAGGAAAAGCAACTCAGTTCC;SOR=5.186;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=39;WE=50844864;WS=50844846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	50845231	rs7151046	C	A	765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=680;SC=AGGACACCTGCAGACAGTTCT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=50845239;WS=50845221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	50857189	rs2015870	C	A	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.914;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.495;NF=9;NR=21;PP=515;ReadPosRankSum=0.407;SC=TACAATTATTCTATTGTATTA;SOR=0.556;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=97;TCF=26;TCR=71;TR=30;WE=50857197;WS=50857179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,31:0.33:95
chr14	50863716	rs10136595	C	G	278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=1;PP=220;SC=CCCGGCCGCCCTCCCGGCTGC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=50863724;WS=50863707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	50877491	rs1265878	C	A	1056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=30;PP=903;SC=AGATGAGATGCGATCTCTCAT;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=50877499;WS=50877481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	50901768	rs17780143	G	A	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.141;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=150;ReadPosRankSum=-0.286;SC=TTTATGTCCCGTGTAAGGGTT;SOR=1.390;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=12;WE=50901776;WS=50901758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr14	50929508	rs11624731	C	A	4776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=118;PP=2965;SC=TGCTAAAAGACAACAAAATGA;SOR=3.458;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=19;TCR=118;TR=137;WE=50929516;WS=50929498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr14	50942047	rs12717408	C	T	284.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=206;SC=AAAAAATTTACTGGCACTTTA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=50942055;WS=50942037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	50943034	rs76595851	TA	T	58.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=4.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=-0.481;QD=2.26;ReadPosRankSum=1.080;SOR=1.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr14	50949196	rs11364906	TA	T	293.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=259;SC=ACAGTCTACTTAAAAAAAATG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=50949204;WS=50949186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	50971446	rs7146431	C	T	2871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=25;PP=2109;SC=AAGACTTCTTCTGGGAAGAAG;SOR=1.744;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=84;TCF=58;TCR=26;TR=83;WE=50971454;WS=50971436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr14	51057727	rs1060197	G	A	5213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=85;PP=2965;SC=GTGGATCTGAGCGAGAGACCA;SOR=0.964;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=67;TCR=85;TR=152;WE=51057735;WS=51057717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr14	51058234	rs2934684	G	T	4484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=19;PP=2965;SC=TATCAATAATGTACTCTTCTT;SOR=3.344;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=112;TCR=19;TR=130;WE=51058242;WS=51058224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr14	51060452	rs2291672	A	G	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=2;PP=373;SC=AAGCATGTACATAAGAGAGTC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=51060460;WS=51060442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	51062236	rs3834518	TTC	T	2263.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.36;QD=32.34;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr14	51062455	rs10131107	G	A	2364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=67;PP=2094;SC=ATTTCATTGAGAAACCATTTT;SOR=7.054;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=68;TCF=1;TCR=67;TR=68;WE=51062463;WS=51062445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr14	51087263	rs11157759	A	G	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=1;PP=478;SC=ATTCTGTGGCATGGAGGACTG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=51087271;WS=51087253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	51089727	rs3736307	G	T	215.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=176;SC=TGAAACTTTTGTACTACTTTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=51089735;WS=51089717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	51096610	rs3080579	G	GTTCTT	1540.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=2;PP=1824;SC=TATCTGTTCTGAAATGCTCAC;SOR=4.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=31;WE=51096618;WS=51096600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	51097536	rs2934692	G	A	1804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=5;PP=1398;SC=GCAAATTTCAGCTTTGTAAAT;SOR=4.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=44;TCR=5;TR=49;WE=51097544;WS=51097526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr14	51107452	rs871643	T	C	2666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=19;PP=2126;SC=CAAATTTGTGTTGTAAATGTA;SOR=2.274;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=80;TCF=59;TCR=21;TR=78;WE=51107460;WS=51107442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr14	51107737	rs4075253	G	A	875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=748;SC=TACACCACCTGAAAGGTAATG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=51107745;WS=51107727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	51192659	rs1983764	G	A	3749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.617;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=79;PP=2846;ReadPosRankSum=1.638;SC=AGAGATGACCGGGTAGGCTCA;SOR=1.013;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=220;TCF=99;TCR=121;TR=133;WE=51192667;WS=51192649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,141:0.61:231
chr14	51196142	rs2984274	T	C	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=1;PP=549;SC=TGTGTGCCATTAGATTTAGGT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=51196150;WS=51196132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	51202311	rs2295847	G	C	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=7.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.314;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=43;PP=982;ReadPosRankSum=-0.111;SC=TCTAATTCTTGTTCAAGGGAA;SOR=1.031;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=119;TCF=10;TCR=109;TR=46;WE=51202319;WS=51202301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,49:0.39:125
chr14	51204996	rs11376	C	T	3510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=71;PP=2787;ReadPosRankSum=0.496;SC=TGGATTCCAACTGACGGACCT;SOR=0.554;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=202;TCF=81;TCR=121;TR=123;WE=51205004;WS=51204986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,126:0.61:206
chr14	51206021	rs3015485	A	G	3777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=62;PP=2826;SC=AGCTTCTCCAATTACCTTCTC;SOR=0.848;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=119;TCF=57;TCR=62;TR=118;WE=51206029;WS=51206011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr14	51208236	rs76858548	T	TGTA	4079.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=2;PP=2924;SC=ATAACCAAGTTGTCCTAAGAT;SOR=6.759;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=85;TCR=2;TR=81;WE=51208244;WS=51208226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr14	51221341	rs45578537	C	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=3;PP=110;ReadPosRankSum=-0.902;SC=TTACAGTTTCCGTTTTTTGCC;SOR=0.616;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=7;WE=51221349;WS=51221331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr14	51223106	rs2295846	G	T	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.148;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=293;ReadPosRankSum=-1.164;SC=TGCTCTCTTCGTGAAGACTAC;SOR=0.011;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=17;WE=51223114;WS=51223096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr14	51223789	rs2073347	C	T	8831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=162;NR=94;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.855;SC=AACATTCAGCCCCTCATTTTC;SOR=0.507;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=258;TCF=163;TCR=95;TR=256;WE=51223797;WS=51223779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,271:1.00:272
chr14	51224374	rs12882191	T	G	6795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.878;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=131;NR=89;PP=2965;ReadPosRankSum=0.137;SC=CTGTAAAAACTGCTCTGTTTG;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=222;TCF=132;TCR=90;TR=220;WE=51224382;WS=51224364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,231:1.00:232
chr14	51224658	rs2073348	T	A	1346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.545;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=1166;ReadPosRankSum=0.557;SC=TCTGAAGCATTGAGAGAGGAG;SOR=1.031;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=180;TCF=94;TCR=86;TR=59;WE=51224666;WS=51224648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,60:0.32:188
chr14	51225132	rs2073349	G	T	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.583;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;PP=575;ReadPosRankSum=0.525;SC=GCAGCTCCTGGGCTTCCGCAC;SOR=0.733;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=113;TCF=57;TCR=56;TR=37;WE=51225140;WS=51225122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,38:0.33:115
chr14	51226439	rs12892462	C	G	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.290;NF=6;NR=1;PP=133;ReadPosRankSum=-0.667;SC=GATCTCCTGACCTCGTGATCC;SOR=0.156;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=7;WE=51226447;WS=51226432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr14	51227000	rs4901055	A	G	2454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.630;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=67;PP=1956;ReadPosRankSum=0.313;SC=TTTCGTTCTCATGCCTTTGCT;SOR=0.795;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=53;TCR=108;TR=100;WE=51227008;WS=51226990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,99:0.61:163
chr14	51228682	rs6572694	G	A	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=30;PP=889;SC=CAATAACACAGTGTGGCATCT;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=51228690;WS=51228672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	51230428	rs139832186	ATTCT	A	356.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.19;MQRankSum=-0.081;QD=19.82;ReadPosRankSum=-1.075;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr14	51230431	rs150650334	CTT	C	203.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.19;MQRankSum=0.349;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.928;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr14	51230445	rs117261593	T	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.02;MQRankSum=0.427;QD=11.37;ReadPosRankSum=1.743;SOR=1.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr14	51237701	rs17793018	A	G	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.449;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=765;ReadPosRankSum=-0.829;SC=CCACCTGATCAACTCGTTCCC;SOR=0.287;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=141;TCF=47;TCR=94;TR=49;WE=51237709;WS=51237691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,50:0.34:149
chr14	51239067	rs8020503	C	G	4670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=96;PP=2965;SC=GCCAGGTGTCCAGTATTCTCT;SOR=1.625;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=49;TCR=96;TR=145;WE=51239075;WS=51239057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr14	51245666	rs7143959	T	C	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=203;ReadPosRankSum=0.781;SC=AGTGTATCCATCTAGATGAGT;SOR=0.874;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=11;WE=51245674;WS=51245656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr14	51289874	rs1547077	G	T	3338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=34.78;ReadPosRankSum=0.744;SOR=0.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,94:0.98:96
chr14	51289877	rs201641401	T	G	2169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.28;ReadPosRankSum=1.101;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,80:0.75:107
chr14	51290141	rs9672090	A	G	3278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=82;PP=2513;SC=GTGATCGTCCATACGGCAGAT;SOR=2.606;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=22;TCR=82;TR=104;WE=51290149;WS=51290131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr14	51338875	rs11850408	A	C	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=4;NR=0;PP=109;SC=GTGGCGGCGTATCGGGACACG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=51338883;WS=51338865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	51344584	rs10672040	C	CAA,CAAA	1370.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.03;QD=41.54;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,11,22:0.33,0.67:33
chr14	51345599	rs76391304	T	C	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=26;PP=470;ReadPosRankSum=-0.180;SC=GGTTGCTTGATGGGGCAGGTG;SOR=0.612;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=81;TCF=11;TCR=70;TR=30;WE=51345607;WS=51345589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,30:0.36:83
chr14	51347023	rs12889998	T	C	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=564;SC=CTTTTTGTGGTGTTAGATTTT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=51347031;WS=51347013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	51347107	rs2185300	G	A	2314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=16;PP=1841;SC=GGAGACTTTCGGCCTTTGGAA;SOR=2.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=53;TCR=16;TR=69;WE=51347115;WS=51347097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr14	51348281	.	C	CT	345.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=5.832;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.84;MQRankSum=-0.407;QD=11.92;ReadPosRankSum=0.348;SOR=3.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,27:0.93:29
chr14	51353493	rs7158183	T	C	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=487;SC=TTTGAACATATAGACACCAAA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=51353501;WS=51353483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	51355517	rs10144606	C	A	2493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=23;PP=1878;SC=TTACTGATTTCTTTCTTTCTT;SOR=1.759;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=53;TCR=23;TR=76;WE=51355525;WS=51355507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
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chr14	51370852	rs34800262	C	G	3353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.849;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=54;PP=2620;ReadPosRankSum=-0.027;SC=GGTTATCTTTCCTCCTGGCTT;SOR=0.883;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=174;TCF=91;TCR=83;TR=120;WE=51370860;WS=51370842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,127:0.68:186
chr14	51371121	rs4901065	C	T	1231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=3.786;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.894;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,37:0.31:119
chr14	51371130	rs11157780	C	T	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=1.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.26;ReadPosRankSum=-0.973;SOR=0.916;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,35:0.30:118
chr14	51371150	rs11157781	C	T	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.581;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=462;ReadPosRankSum=-0.531;SC=GTATATTGTTCTAATGTAAAA;SOR=1.879;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=102;TCF=27;TCR=75;TR=27;WE=51371158;WS=51371140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,27:0.26:104
chr14	51372098	rs3216001	CA	C	1287.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=1669;ReadPosRankSum=0.419;SC=TTTCTAGAGACAATTCTAGAG;SOR=0.380;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=77;TCF=76;TCR=1;TR=26;WE=51372111;WS=51372088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,34:0.40:84
chr14	51372103	rs1042266	C	G	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=0;PP=1683;ReadPosRankSum=0.560;SC=AGAGACAATTCTAGAGTTCAA;SOR=0.752;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=84;TCF=81;TCR=3;TR=29;WE=51372111;WS=51372088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,36:0.41:88
chr14	51372333	rs1959527	A	G	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.861;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=605;ReadPosRankSum=0.192;SC=GCTTTATAATAAACATCAGCC;SOR=0.131;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=92;TCF=21;TCR=71;TR=32;WE=51372341;WS=51372323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,32:0.34:95
chr14	51375699	rs11414268	T	TA	566.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=548;ReadPosRankSum=-1.126;SC=GGGTGGGTGATAAAAAAAGGC;SOR=0.569;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=69;TCF=11;TCR=58;TR=24;WE=51375707;WS=51375689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,27:0.39:69
chr14	51375797	rs8004768	T	G	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=180;ReadPosRankSum=1.792;SC=ATTCAAAGACTTCATTATAGA;SOR=0.984;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=10;WE=51375805;WS=51375787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr14	51375826	rs8004788	T	C	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=3.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=99;ReadPosRankSum=0.712;SC=TGAGTATATATAACTTTTAAC;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=51375834;WS=51375816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr14	51378590	rs11356035	CT	C	1543.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.175;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=3.652;NF=39;NR=14;PP=1632;ReadPosRankSum=-1.904;SC=CTGGGGCAGCCTTTGGGGAAG;SOR=0.898;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=155;TCF=102;TCR=53;TR=53;WE=51378598;WS=51378580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,60:0.35:170
chr14	51382358	rs1890701	T	C	1631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=50;PP=1262;SC=GTTAGCTCTATGGAGGTGCCA;SOR=4.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=54;WE=51382366;WS=51382348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr14	51383432	rs2075643	G	A	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.383;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=326;ReadPosRankSum=-0.705;SC=CAGGGTGAGTGTCATTCAGCT;SOR=2.197;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=74;TCF=24;TCR=50;TR=19;WE=51383440;WS=51383422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,20:0.27:75
chr14	51446216	rs2275462	T	G	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=22;PP=565;ReadPosRankSum=-1.320;SC=TTTTTCTATTTAAGTCGAGGA;SOR=0.653;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=94;TCF=28;TCR=66;TR=31;WE=51446224;WS=51446206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,31:0.30:103
chr14	51448413	rs10150121	T	C	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=0;PP=894;SC=AGACCACCTGTTTGATTTCCT;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=51448421;WS=51448403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	51475794	rs2297889	A	T	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=13;PP=1180;SC=ATGCAAGGACATACCTTTCAC;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=47;WE=51475802;WS=51475784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr14	51492135	rs11268748	C	CCACACAGGTGTTTT	1567.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=2900;SC=ACCAACAAGGCCAGCGAGACT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=17;WE=51492143;WS=51492125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr14	51710508	rs35110538	T	TA	1850.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.303;NF=42;NR=5;PP=2132;ReadPosRankSum=1.428;SC=TTAAATTTTTTATCCCAAGAT;SOR=2.428;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=44;TCR=5;TR=47;WE=51710516;WS=51710498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr14	51710551	rs10131881	A	T	2247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=89;NR=9;PP=2709;SC=AACTTTTTTTAAAAAAAAATC;SOR=4.247;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=89;TCR=9;TR=98;WE=51710559;WS=51710541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr14	51712092	rs4606635	T	C	2633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=69;NR=12;PP=2239;SC=TATTTGAAGATTCTAAATTAT;SOR=3.401;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=69;TCR=12;TR=81;WE=51712100;WS=51712082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr14	51716161	rs59489282	GT	G	1921.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=34;PP=1160;SC=CAGATTTTTAGTTTTTTTTTT;SOR=0.798;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=80;TCF=40;TCR=40;TR=69;WE=51716169;WS=51716151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr14	51716188	rs7161242	T	G	2463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=37;PP=1914;SC=GATTTTAGACTTGCCATAACT;SOR=0.979;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=47;TCR=37;TR=83;WE=51716196;WS=51716178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr14	51716467	rs7160810	G	A	1431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=30;PP=1066;SC=GACCACAGCCGTACCCATACC;SOR=1.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=43;WE=51716475;WS=51716457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr14	51720906	rs11157811	T	G	150.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=0;PP=120;SC=TGGTTTTTTTTATCTTATCTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=51720914;WS=51720896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	52165083	rs6572784	T	G	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=597;SC=TGATTTTCATTTTTAGTGTAG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=52165091;WS=52165073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	52171690	rs372581825	C	T	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=524;ReadPosRankSum=0.110;SC=AGTGTTTTCTCTCGGGCATTT;SOR=0.428;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=20;WE=52171698;WS=52171680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr14	52179059	rs4901146	T	C	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=138;SC=CTTTTAATTATTGTCTGTATT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=52179067;WS=52179054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr14	52182081	rs731715	T	A	5840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=105;NR=74;PP=2965;SC=GCTTGCCTTCTGCCCGGAAGC;SOR=1.130;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=105;TCR=74;TR=179;WE=52182089;WS=52182071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr14	52186972	rs2277494	A	G	6559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=88;PP=2965;SC=ACACGGGGCCAGAAGACAGCT;SOR=1.143;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=126;TCR=88;TR=214;WE=52186980;WS=52186962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr14	52194407	rs4433726	G	A	4659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=123;NR=9;PP=2965;SC=CTCTTTACAAGGCAAATATTC;SOR=4.900;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=123;TCR=9;TR=132;WE=52194415;WS=52194397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr14	52294397	rs6572795	G	A	1211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=0;PP=996;SC=ATTACACGCAGTGGAAAAGCA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=52294405;WS=52294387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	52418655	rs3825601	G	A	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.294;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=301;ReadPosRankSum=0.837;SC=TCATCTGTGCGTTCCCAACAC;SOR=1.898;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=70;TCF=52;TCR=18;TR=20;WE=52418663;WS=52418645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,20:0.29:70
chr14	52465460	rs1151570	G	A	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=641;ReadPosRankSum=-0.055;SC=ATGTTTTTATGATGTGCTTTC;SOR=1.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=27;WE=52465468;WS=52465450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr14	52471017	rs34688526	G	GAAAT	1989.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.267;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.692;NF=19;NR=14;PP=1754;ReadPosRankSum=-1.096;SC=TACTTGGGAGGAAATAAATGG;SOR=0.432;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=33;WE=52471025;WS=52471007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,46:0.70:66
chr14	52478315	rs1051069	A	G	1101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.718;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=30;PP=887;ReadPosRankSum=0.375;SC=GTTCCAGACCAGCACGGCTGA;SOR=0.886;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=95;TCF=32;TCR=63;TR=45;WE=52478323;WS=52478305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,46:0.47:98
chr14	52495375	rs7144352	C	T	6556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=143;NR=64;PP=2965;SC=AAAACACTGACAGATTAAAGA;SOR=1.736;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=208;TCF=144;TCR=64;TR=207;WE=52495383;WS=52495365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr14	52496387	rs2273430	C	A	1198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=26;PP=959;SC=GCAAGGATTCCCCGGAGTGGG;SOR=2.012;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=52496395;WS=52496377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	52496407	rs2273431	C	T	1345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=29;PP=1128;SC=GGTCTGAATCCTCTGCATGAG;SOR=1.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=41;WE=52496415;WS=52496397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	52505360	rs753051	A	G	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=0;PP=696;SC=TACCTAGCACATAACACAGCA;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=52505368;WS=52505350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	52505375	rs753050	A	G	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=0;PP=961;SC=ACAGCATGGCACTAGGTAACC;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=42;WE=52505383;WS=52505365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr14	52505771	rs2029978	TT	AG	1813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;JOINED;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=37;PP=2094;SC=TTTTCTGCAGTTTTTTTCATC;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=37;WE=52505780;WS=52505761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	52505811	rs2029976	C	T	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=529;SC=CCTTGGGAACCTCCTGAGTTT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=52505819;WS=52505801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	52507429	rs3742536	A	G	1901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=18;PP=1427;SC=AAATTTGCTGAGACGTAAGGC;SOR=1.571;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=55;WE=52507437;WS=52507419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	52509063	rs17831525	G	A	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.747;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=394;ReadPosRankSum=0.058;SC=ACTCGGTGAGGTGCCCCTAAA;SOR=1.371;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=89;TCF=34;TCR=55;TR=23;WE=52509071;WS=52509053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,24:0.25:96
chr14	52509101	rs1982963	G	A	2723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=58;PP=2147;SC=AGGCTTGGACGTCATCCTGGC;SOR=1.967;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=22;TCR=58;TR=80;WE=52509109;WS=52509091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr14	52509483	rs56834750	TG	CA	4201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=28;PP=2947;SC=CAGGAGTTCCTGGCCCCAGTC;SOR=1.686;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=91;TCF=63;TCR=28;TR=87;WE=52509492;WS=52509473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr14	52520368	rs2101919	C	T	4083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=88;PP=2965;SC=TGTAGTGTGACCTGAAGCAGG;SOR=1.915;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=35;TCR=89;TR=123;WE=52520376;WS=52520358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr14	52520853	rs904059	A	G	4571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=79;PP=2965;SC=CATTCACATCATAGTAATCCA;SOR=0.861;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=145;TCF=66;TCR=79;TR=145;WE=52520861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr14	52534985	rs75651404	C	G	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=393;ReadPosRankSum=-0.420;SC=AAGCCTCTCTCTCCTTCCCCA;SOR=1.528;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=17;WE=52535005;WS=52534975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr14	52534997	rs7151874	T	C	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=494;SC=CCTTCCCCACTGGCCAGGGAG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=52535005;WS=52534975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	52535387	rs984051	A	C	2897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=80;NR=6;PP=2425;SC=GGGCTCCAGGAGTGGGGTCTG;SOR=4.953;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=80;TCR=6;TR=86;WE=52535395;WS=52535377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr14	52535415	rs984050	G	A	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.709;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=2;PP=749;ReadPosRankSum=-1.355;SC=CCCTCTGGAGGCAGGGTTTCC;SOR=1.456;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=136;TCF=121;TCR=15;TR=42;WE=52535423;WS=52535405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,45:0.32:140
chr14	52535648	rs3920038	G	T	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=29;PP=653;ReadPosRankSum=0.034;SC=CATTAGCAACGGCAGCAGCAG;SOR=0.690;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=114;TCF=28;TCR=86;TR=38;WE=52535656;WS=52535638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,36:0.32:114
chr14	52536512	rs1497082	T	C	4118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=48;PP=2965;SC=GACCATGAAATACTACTGTGT;SOR=1.266;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=80;TCR=48;TR=128;WE=52536520;WS=52536502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr14	52736310	rs11157908	C	T	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=2.617;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.09;ReadPosRankSum=-0.188;SOR=0.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,44:0.26:168
chr14	52741646	rs17125273	G	A	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.898;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=36;PP=774;ReadPosRankSum=0.253;SC=ACAGGAGCCGGTGCAGCAATT;SOR=0.832;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=131;TCF=22;TCR=109;TR=42;WE=52741654;WS=52741636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,46:0.33:141
chr14	52741746	rs368118998	TA	T	33.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.20;ReadPosRankSum=-0.533;SOR=0.089;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr14	52781195	rs1254598	G	A	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=4;PP=789;SC=GGAACGCTCCGGCTCTCAGAC;SOR=3.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=52781203;WS=52781185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	52793786	rs45622535	A	G	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=339;ReadPosRankSum=-0.412;SC=TAAGGAAGAAAGGTAAGATTC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=14;WE=52793794;WS=52793776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr14	52794234	rs708502	T	C	1245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=36;PP=1074;SC=AAATTGTTCCTTGGAGAAATG;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=52794242;WS=52794224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	53098902	rs762063	G	A	3545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=52;PP=2555;SC=CCAGACTGTCGTCGTGGGCTC;SOR=0.711;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=51;TCR=52;TR=103;WE=53098910;WS=53098892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr14	53100760	rs11157925	A	G	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=34;PP=1001;SC=AAGGTGATTTAGTGGTAATAT;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=53100768;WS=53100750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	53110384	rs4898762	T	C	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=484;SC=GAAACCATCTTAGATAAATTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=53110392;WS=53110374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	53130507	rs17125636	T	C	5011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=115;PP=2965;SC=ACAACGCAAATAAGTAATTTA;SOR=2.287;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=37;TCR=115;TR=152;WE=53130515;WS=53130497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr14	53130547	.	T	C	2186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.426;ClippingRankSum=0.000;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.051;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=68;PP=1915;ReadPosRankSum=-0.488;SC=GATTTAAAGGTCTTTTAATTG;SOR=2.397;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=106;TCF=9;TCR=97;TR=72;WE=53130555;WS=53130537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,73:0.67:109
chr14	53133036	rs12885338	T	C	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=1;PP=987;SC=TGATTTTGTTTATAAAGAGAA;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=35;WE=53133044;WS=53133026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	53176474	rs180721723	A	G	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=312;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTCAGGTTTTAGAATATTTGT;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=13;WE=53176482;WS=53176464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr14	53197042	rs2277493	G	C	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=54;ReadPosRankSum=0.948;SC=CTGGGACCCTGTAGTCTGCGT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=5;WE=53197050;WS=53197035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr14	53235545	rs2274274	A	T	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=7.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-0.548;QD=18.29;ReadPosRankSum=-0.579;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr14	53250293	rs2296494	G	C	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.551;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=227;ReadPosRankSum=1.368;SC=TGGGCTTACAGGCAATTATTT;SOR=1.802;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=15;WE=53250301;WS=53250283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr14	53325090	rs6572868	C	T	4483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=19;PP=2965;SC=AAACAGTATTCCTATTCACAC;SOR=3.528;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=111;TCR=19;TR=130;WE=53325098;WS=53325080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr14	53326454	rs3818453	C	A	3501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=82;PP=2905;ReadPosRankSum=0.907;SC=AAGAAAAGAACGGTTAAAAAC;SOR=1.942;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=18;TCR=83;TR=100;WE=53326462;WS=53326444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,104:0.99:105
chr14	53345266	rs2357946	G	C	4155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=49;PP=2965;SC=ACCCTTTACCGGAATAAGTCC;SOR=1.364;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=82;TCR=49;TR=131;WE=53345274;WS=53345256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr14	53345378	rs2357947	G	A	3494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=82;PP=2688;SC=TGGCCTGCTCGTAAAGCTGAT;SOR=2.345;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=25;TCR=82;TR=107;WE=53345386;WS=53345368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr14	53347721	rs201882097	GA	G	589.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=2.368;QD=5.51;ReadPosRankSum=0.581;SOR=0.517;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,38:0.36:107
chr14	53348540	rs62003529	T	G	2329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.704;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=48;PP=1809;ReadPosRankSum=0.387;SC=GTAAAGAACATCAGTGCCTAT;SOR=1.112;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=124;TCF=53;TCR=71;TR=80;WE=53348548;WS=53348530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,84:0.65:129
chr14	53386172	.	A	ATAAT	83	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.77;NF=0;NR=3;PP=83;QD=38.6666666667;SC=TTTAACAGCAATAATTAACTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=3;WE=53386180;WS=53386162;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr14	53409584	rs7157315	C	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.831;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=45;ReadPosRankSum=-0.279;SC=TAATAGTAAGCTAAGAAGTAA;SOR=0.562;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=5;WE=53409592;WS=53409574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr14	53513478	rs10599915	AAG	A	2603.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.975;NF=55;NR=4;PP=2454;ReadPosRankSum=-0.446;SC=CATGTCCTTCAAGAGAGTTCA;SOR=0.593;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=96;TCF=89;TCR=7;TR=59;WE=53513487;WS=53513468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,68:0.69:99
chr14	53522324	rs5808701	T	TA	1379.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.881;NF=37;NR=1;PP=1550;ReadPosRankSum=-1.650;SC=CCCCCAAACTTATGTCTAGGA;SOR=1.002;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=57;TCF=56;TCR=1;TR=38;WE=53522332;WS=53522314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,42:0.74:57
chr14	53525392	rs915436	C	T	3065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=81;PP=2525;SC=GAAGTGTTATCTTTCAACAAA;SOR=6.184;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=84;TCF=3;TCR=81;TR=84;WE=53525400;WS=53525382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr14	53525427	rs12882412	C	T	1018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-5.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=31;PP=788;ReadPosRankSum=-0.814;SC=TAATATATGGCAAAATACAAA;SOR=1.487;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=31;WE=53525435;WS=53525417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,36:0.65:55
chr14	53529669	rs4898778	A	T	2752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.032;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=12;PP=2189;ReadPosRankSum=2.512;SC=ACCGTCGTTTAGTTATATAGA;SOR=0.208;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=159;TCF=143;TCR=16;TR=97;WE=53529677;WS=53529659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,98:0.61:160
chr14	53539471	rs875663	A	G	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=462;ReadPosRankSum=-0.729;SC=AGTCTCTGTTACAGGAAAGTA;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=20;WE=53539479;WS=53539461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr14	53619463	rs2358188	G	A	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.370;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=59.99;MQRankSum=0.026;NF=7;NR=23;PP=623;ReadPosRankSum=2.367;SC=GCTGCGGCGGGTGCAGCGACA;SOR=1.739;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=30;WE=53619471;WS=53619453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr14	53619480	rs140904345	T	TGCCGCC	1141.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.043;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.038;NF=9;NR=14;PP=1315;ReadPosRankSum=-0.145;SC=GACAAGGAGCTGCCGCCGCCG;SOR=0.118;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=60;TCF=20;TCR=40;TR=23;WE=53619488;WS=53619470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr14	53619544	rs2358189	G	A	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.920;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.986;NF=28;NR=18;PP=867;ReadPosRankSum=0.025;SC=CGGCGGAGCTGAAGTCATAGT;SOR=1.217;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=68;TCF=38;TCR=30;TR=46;WE=53619552;WS=53619534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,48:0.69:70
chr14	54415291	rs12898159	C	T	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=435;SC=TCCCTACACCCGTCATTCCAG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=54415299;WS=54415281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	54418986	rs2761880	T	C	3472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=91;PP=2846;SC=AAAGAATAAATAAACACCAAT;SOR=4.977;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=6;TCR=91;TR=97;WE=54418994;WS=54418976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr14	54863577	rs2235961	G	A	1335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=1;PP=1066;SC=CTAGGAACCAGTCAGCGATTA;SOR=5.186;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=38;WE=54863585;WS=54863567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	54875276	rs4251623	C	A	250.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=237;SC=AGAATCCTTGCTTAGGATGAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=54875284;WS=54875266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	54875514	rs2179896	A	G	915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=20;PP=723;SC=ACAGGTAGGTATAATATCACG;SOR=2.546;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=26;WE=54875522;WS=54875504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	54875591	rs4251625	GT	G	230.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=9;PP=166;SC=GAACAAATCAGTTTTTTTTTA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=54875599;WS=54875581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	54877819	rs2143958	C	G	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=0;PP=397;SC=TCACTTGAACCTGGGAGGCAG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=54877827;WS=54877809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	54879473	rs2268332	G	T	2653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=35;PP=2170;SC=GCAACAGAGAGCCAGCCATGG;SOR=1.192;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=50;TCR=35;TR=85;WE=54879481;WS=54879463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr14	54997792	rs74537102	G	A	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.022;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=399;ReadPosRankSum=0.259;SC=AATTTTGAAAGCATTACCTTT;SOR=0.091;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=62;TCF=10;TCR=52;TR=23;WE=54997800;WS=54997782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,21:0.34:61
chr14	55168673	rs1022754	A	G	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=0;PP=669;SC=AAATATAGCCAGACTATGTAG;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=55168681;WS=55168663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	55218161	rs2295820	A	C	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=393;ReadPosRankSum=-0.663;SC=CTTGTTATTTAATTACAGAAT;SOR=0.437;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=19;WE=55218169;WS=55218151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr14	55218435	rs2295822	A	G	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=190;ReadPosRankSum=-0.210;SC=TGCTTCTTTGAAAGCTGATGC;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=10;WE=55218443;WS=55218425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr14	55221345	rs911612	G	A	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=23;SC=TGACGGCACCGGTGGCAGACT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=55221353;WS=55221341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr14	55221543	rs11627203	T	C	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.174;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=369;ReadPosRankSum=0.899;SC=TGCAGAGCTCTTTTGTTCAGT;SOR=0.414;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=22;WE=55221551;WS=55221533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr14	55241558	.	GA	AC	560	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=59.91;NF=12;NR=1;PP=560;QD=47.1898365279;SC=AAAAAATGAGGAGACCTCCAA;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=53;TCF=49;TCR=4;TR=13;WE=55241567;WS=55241548;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:40,13:0.25:53
chr14	55251357	rs147774600	C	T	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=366;ReadPosRankSum=0.802;SC=GTTCTTCCTGCATGTCCCCAT;SOR=0.631;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=19;WE=55251365;WS=55251347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr14	55255673	rs11431	C	T	1790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.881;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=49;PP=1427;ReadPosRankSum=-0.684;SC=AAGCTGAAGACGAGAGTGACC;SOR=1.258;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=182;TCF=86;TCR=96;TR=77;WE=55255681;WS=55255663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,76:0.42:181
chr14	55313841	.	C	G	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=101;ReadPosRankSum=0.834;SC=CTATAGATTTCTACAATCCTA;SOR=0.963;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=7;WE=55313849;WS=55313831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr14	55424013	rs117649156	T	C	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=147;ReadPosRankSum=-0.834;SC=TCTGTTAAGTTTGTATTGCCA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=55424021;WS=55424003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr14	55454119	rs147777028	C	CAATT	1386.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.707;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=27;PP=1568;ReadPosRankSum=1.453;SC=AAAATTAAAACAAGACAGAAA;SOR=0.127;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=61;TCF=3;TCR=58;TR=29;WE=55454127;WS=55454109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,36:0.55:65
chr14	55454155	rs139807986	C	CATATAT	169.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=13;PP=248;ReadPosRankSum=0.352;SC=ATGATATTTACATATATATAT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=13;WE=55454163;WS=55454145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
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chr14	55509654	rs10138640	T	C	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=156;ReadPosRankSum=-0.436;SC=TAATGACTTTTTTTTGTTTTC;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=8;WE=55509662;WS=55509644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr14	55510110	rs17128136	G	A	1901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=35;PP=1461;ReadPosRankSum=1.386;SC=CAGGGCTTCCGTCTAAAAGGA;SOR=0.673;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=152;TCF=76;TCR=76;TR=71;WE=55510118;WS=55510100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,73:0.46:157
chr14	55529860	rs17851309	A	G	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.456;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.596;NF=17;NR=2;PP=465;ReadPosRankSum=-1.163;SC=CTCCTCCCCAAGCCCCTGGGG;SOR=1.893;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=19;WE=55529868;WS=55529850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr14	55530120	rs3742564	T	C	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=171;ReadPosRankSum=0.075;SC=CAGTTTTGGATGGAAGATTAA;SOR=0.631;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=12;WE=55530128;WS=55530110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr14	55604935	rs4644	C	A	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.319;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=22;PP=1107;ReadPosRankSum=0.650;SC=GGCGCCTACCCTGGAGCACCT;SOR=0.448;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=124;TCF=80;TCR=44;TR=55;WE=55604943;WS=55604925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,56:0.43:129
chr14	55605036	rs4652	A	C	1648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=34;PP=1304;ReadPosRankSum=-1.795;SC=GCCAAGTGCCACCGGAGCCTA;SOR=0.699;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=57;TCR=57;TR=68;WE=55605044;WS=55605026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,65:0.59:111
chr14	55609234	rs2075601	C	T	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=447;ReadPosRankSum=-0.815;SC=TAGAAAATTACATGTTCTTTA;SOR=0.843;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=21;WE=55609242;WS=55609224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr14	55617578	rs35448900	CA	C	190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.971;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=129;ReadPosRankSum=1.217;SC=TGAAAAACAACAAAAAAAAAC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=9;WE=55617586;WS=55617568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr14	55619311	rs15870	A	G	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=197;ReadPosRankSum=0.287;SC=TACTTACATGATTTTCTTCAA;SOR=0.610;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=14;WE=55619319;WS=55619301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr14	55643752	rs8009244	A	G	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=459;ReadPosRankSum=0.117;SC=TCTTAGCAAGAGACTTATTAT;SOR=0.400;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=20;WE=55643760;WS=55643742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr14	55643908	rs10144326	A	G	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=27;PP=853;ReadPosRankSum=-2.199;SC=CCTTAGGTGCAAAGGAATTCT;SOR=0.639;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=79;TCF=26;TCR=53;TR=41;WE=55643916;WS=55643898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,45:0.52:86
chr14	55647575	rs11351178	CA	C	540.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.414;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.576;NF=1;NR=13;PP=407;ReadPosRankSum=0.667;SC=CATGGTAGTGCAATGCCTGTA;SOR=0.034;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=14;WE=55647583;WS=55647565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr14	55647798	rs8012105	A	C	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=164;ReadPosRankSum=2.509;SC=GTGCCACTGCACTCCAACCTG;SOR=0.399;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=55647806;WS=55647788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr14	55648115	rs58737648	C	T	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.661;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=96;ReadPosRankSum=0.433;SC=ATCTGATCATCGTAAATGACC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=6;WE=55648123;WS=55648105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr14	55655692	rs2274271	C	T	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.652;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=360;ReadPosRankSum=-0.297;SC=TGGAACAAGCCCTTGAGATGT;SOR=1.187;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=17;WE=55655700;WS=55655682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr14	55819318	rs114576128	G	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=63;ReadPosRankSum=0.652;SC=TCAAATGAGCGTAGCCCCCTG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=55819326;WS=55819308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr14	55847466	rs946059	A	G	1580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.809;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=44;PP=1317;ReadPosRankSum=-0.048;SC=AACTACTAATAATCCACGAGT;SOR=1.240;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=87;TCF=15;TCR=72;TR=52;WE=55847474;WS=55847456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,54:0.59:91
chr14	55848972	rs3783650	A	C	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=608;ReadPosRankSum=1.246;SC=ATGCAATATAACTGCAAGACA;SOR=0.635;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=13;TCR=39;TR=28;WE=55848980;WS=55848962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
chr14	55902542	rs7149317	G	A	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=299;ReadPosRankSum=-1.199;SC=CTAATTATTGGAAGGAATACT;SOR=0.885;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=15;WE=55902550;WS=55902532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr14	55907025	rs8020152	T	A	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=496;ReadPosRankSum=-0.163;SC=ATGGTCGCTATGAGTTTTAAG;SOR=0.850;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=27;WE=55907033;WS=55907015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr14	55907172	rs8019270	C	G	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.213;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=435;ReadPosRankSum=0.039;SC=CTCCATGGACCGTAATCCCAC;SOR=1.390;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=24;WE=55907180;WS=55907162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr14	56078739	rs1138345	T	G	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.864;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=12;NR=0;PP=190;ReadPosRankSum=0.975;SC=CTATTTAGGTTTTATAGGATC;SOR=2.964;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=12;WE=56078747;WS=56078729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr14	56100160	rs10135907	G	T	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=471;SC=AGACTTTTGTGTTTTTACATT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=56100168;WS=56100150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	56101164	rs139496974	AAACT	A	474.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=467;ReadPosRankSum=0.031;SC=CAGCTCAGCAAAACTAACAAA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=11;WE=56101175;WS=56101154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr14	56101212	rs34111199	C	T	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.981;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=2;PP=775;ReadPosRankSum=0.520;SC=TTTGTAATAACGGAAGGCTCC;SOR=1.349;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=87;TCF=79;TCR=8;TR=38;WE=56101220;WS=56101202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,40:0.44:91
chr14	56104108	rs12433724	T	A	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.89;ReadPosRankSum=1.252;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr14	56106031	rs3831052	TGAC	T	418.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=351;ReadPosRankSum=-2.209;SC=TTTATACCTCTGACGACCTGT;SOR=0.941;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=26;TCF=6;TCR=20;TR=11;WE=56106041;WS=56106021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr14	56108007	rs10483649	G	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=93;ReadPosRankSum=1.295;SC=GAAATACTACGTTTTGTATGA;SOR=0.892;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=7;WE=56108015;WS=56107997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr14	56108033	rs2341890	G	A	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=12;PP=340;SC=CTCTGAAACAGTGTTTCTGTA;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=56108041;WS=56108023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	56108520	rs1951890	A	G	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=218;ReadPosRankSum=-1.293;SC=TACTTGTTATATAACAAGATC;SOR=0.784;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=12;WE=56108528;WS=56108510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr14	56111102	rs10131087	A	C	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=784;ReadPosRankSum=1.254;SC=GCAGAAACCAATAATGGTGCC;SOR=0.675;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=116;TCF=69;TCR=47;TR=39;WE=56111110;WS=56111092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,42:0.34:124
chr14	56113917	rs17684916	A	C	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.437;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=196;ReadPosRankSum=-0.978;SC=AGCATATAAGAATGAATTACT;SOR=0.368;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=8;WE=56113925;WS=56113907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr14	56114866	rs17128657	A	T	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=448;ReadPosRankSum=-1.963;SC=TTTCCTTGTGATTATTCAGTG;SOR=0.597;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=25;WE=56114874;WS=56114856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr14	56116576	rs71448463	AT	A	378.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.656;NF=2;NR=13;PP=223;ReadPosRankSum=-0.096;SC=TCTTTGGTCCATTTTTTTTTT;SOR=1.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=15;WE=56116584;WS=56116566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr14	56119454	rs17684959	C	T	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=85;ReadPosRankSum=-1.025;SC=TAGTTTAGTTCAATCAGCTGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=56119462;WS=56119444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr14	56122689	rs35094494	G	A	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=113;ReadPosRankSum=1.857;SC=TTTTTCTTAGGGGTGATATTG;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=7;WE=56122697;WS=56122679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr14	56126456	rs7160678	C	A	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=24;PP=1045;SC=TTTATAAAGTCGTAACTATTT;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=40;WE=56126464;WS=56126446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr14	56133942	rs7150285	C	T	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.583;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=666;ReadPosRankSum=0.907;SC=TTTGATTTGGCTCATCTTCTG;SOR=0.317;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=36;WE=56133950;WS=56133932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,38:0.42:90
chr14	56139313	rs3215766	GT	G	175.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.386;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=224;ReadPosRankSum=0.205;SC=ATCCTTGGTGGTTTTACTTGG;SOR=0.460;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=37;TCF=20;TCR=17;TR=9;WE=56139321;WS=56139303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,10:0.26:38
chr14	56146228	rs12587735	T	G	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.144;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=363;ReadPosRankSum=-1.791;SC=TTGTTTGGTTTTACATTTCTT;SOR=0.180;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=16;WE=56146236;WS=56146218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr14	56147540	rs10483651	G	T	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=410;ReadPosRankSum=-0.159;SC=TTAAGCCTCAGCTCAAATCTT;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=18;WE=56147548;WS=56147530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr14	56755425	rs34574403	C	CA	245.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=206;SC=TTAATTGGAGCAAAAAAAAAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=10;WE=56755433;WS=56755415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	56958173	rs1889382	C	G	115.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=86;SC=CCCTCAGGCCCATGTCTGTTC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=56958181;WS=56958163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	57046829	rs2275025	C	A	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.957;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=4;PP=152;ReadPosRankSum=0.323;SC=CTGTCCCTCTCCCCTGGTCCC;SOR=0.283;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=8;WE=57046837;WS=57046819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr14	57052511	rs3737171	G	T	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=569;ReadPosRankSum=0.735;SC=CTTTGTTCACGCTGGTGGCTA;SOR=0.591;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=78;TCF=49;TCR=29;TR=29;WE=57052519;WS=57052501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,34:0.39:87
chr14	57070501	rs10782433	A	G	2752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=19;PP=2009;SC=TTTTTGTTGGAAAAGAAGATT;SOR=2.223;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=59;TCR=19;TR=78;WE=57070509;WS=57070491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr14	57072203	rs3818777	T	A	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=0.765;SC=GAATGCTTGGTTTTAATATAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=57072211;WS=57072193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr14	57072338	rs3737170	C	T	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.580;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=213;ReadPosRankSum=-0.671;SC=GTAACCAGCACACAATAATAC;SOR=0.560;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=26;TCF=14;TCR=12;TR=13;WE=57072346;WS=57072328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr14	57082648	rs2275024	A	G	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=228;ReadPosRankSum=-0.456;SC=AATAAGTTAGATTGTTTTTTG;SOR=0.920;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=13;WE=57082656;WS=57082638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr14	57083897	rs2275023	G	A	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.630;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=177;ReadPosRankSum=0.551;SC=ATTATTTTTTGTAGGGACAGA;SOR=2.262;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=11;WE=57083905;WS=57083887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
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chr14	57092038	rs2274706	A	G	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.049;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=5;PP=819;ReadPosRankSum=-1.256;SC=ATTACTTGATAAACTTGATTC;SOR=0.202;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=76;TCF=68;TCR=8;TR=38;WE=57092046;WS=57092028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,41:0.51:80
chr14	57099859	rs1041316	G	A	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=36;PP=1059;SC=CTTACAAAAAGTATCTATAAC;SOR=3.467;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=41;WE=57099867;WS=57099849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr14	57101577	.	T	G	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.193;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=8.389;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.19;MQRankSum=-3.350;QD=1.02;ReadPosRankSum=0.401;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr14	57101682	rs913742	A	G	3057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=51;PP=2429;ReadPosRankSum=-0.309;SC=TGACTATTCTACATTTTTGTG;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=246;TCF=140;TCR=106;TR=118;WE=57101690;WS=57101672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,118:0.47:250
chr14	57113851	rs74244839	G	A	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=311;ReadPosRankSum=0.320;SC=TTTACTGGAGGCTGCTTGAAT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=14;WE=57113859;WS=57113841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr14	57116759	rs7156095	T	G	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.928;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=390;ReadPosRankSum=1.102;SC=CAAGTTGCTTTCTTTTTCTTT;SOR=0.340;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=18;WE=57116767;WS=57116749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr14	57116979	rs1958530	A	G	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=84;SC=TTCGGCCTGAAGAGCCAGTGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=57116987;WS=57116969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr14	57268443	rs171978	C	T	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=133;ReadPosRankSum=0.819;SC=AAAAGAGGTTCTACAGGTCTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=7;WE=57268451;WS=57268433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr14	57271127	rs2277499	G	T	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.270;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=208;ReadPosRankSum=-0.730;SC=GTTTCCGCGGGTTCTCCGACG;SOR=0.018;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=11;WE=57271135;WS=57271117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr14	57746761	rs189696110	T	C	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=416;ReadPosRankSum=-0.816;SC=AAGAACATGATAAAACCATTA;SOR=1.214;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=19;WE=57746769;WS=57746751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr14	57863385	rs12894584	C	T	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=199;ReadPosRankSum=-0.199;SC=AAAATGCTTACCAATGGTTGG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=10;WE=57863393;WS=57863375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr14	57866623	rs2152360	A	G	1446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.78;SOR=2.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr14	57866699	rs45628839	G	A	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.796;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=143;ReadPosRankSum=0.299;SC=TTTCATTGCAGTGTTACTATA;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=9;WE=57866707;WS=57866689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr14	57876265	rs11620639	G	A	3848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=81;PP=2961;SC=ACTATCATCCGCACAGAATCG;SOR=1.482;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=125;TCF=43;TCR=82;TR=124;WE=57876273;WS=57876255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr14	57938124	rs1152531	C	T	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.773;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=485;ReadPosRankSum=0.124;SC=CTGTCCTGGTCCTCACCAGTG;SOR=0.340;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=54;TCF=30;TCR=24;TR=22;WE=57938132;WS=57938114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,22:0.39:56
chr14	57938260	rs1152530	T	C	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=30;PP=1042;SC=CCAGGGACAGTAGTTATTCAC;SOR=2.247;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=40;WE=57938268;WS=57938250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	57945689	rs1152525	G	A	2345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=5;PP=1977;SC=TTTGGCCCACGGCACAGCGAT;SOR=4.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=64;TCR=5;TR=69;WE=57945697;WS=57945679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr14	57948380	rs1152522	T	C	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=192;ReadPosRankSum=0.488;SC=TAGTACCTGCTATGAAAGACA;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=10;WE=57948388;WS=57948370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr14	57957654	rs1203339	T	C	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=4.212;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.16;ReadPosRankSum=1.179;SOR=1.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr14	57957664	rs1203338	T	A	1436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.81;SOR=3.145;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr14	58047219	rs17093357	G	C	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.915;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=18;PP=593;ReadPosRankSum=1.095;SC=TTATATGAATGAGATCTGGCT;SOR=0.518;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=73;TCF=29;TCR=44;TR=31;WE=58047227;WS=58047209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,31:0.42:74
chr14	58056257	rs1190313	G	T	1643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=38;PP=1303;SC=GAATACAAATGTGAGGAAAGC;SOR=2.540;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=48;WE=58056265;WS=58056247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr14	58060862	rs17724076	G	A	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.822;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=11;PP=487;ReadPosRankSum=0.619;SC=CAGAGTTCACGCCAGTTTGAG;SOR=0.341;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=44;TCF=20;TCR=24;TR=25;WE=58060870;WS=58060852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr14	58332380	rs117742957	G	A	1178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.685;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=8;PP=821;ReadPosRankSum=-1.101;SC=CATCCCCGCGGCACCCCTGCG;SOR=0.086;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=64;TCF=55;TCR=9;TR=41;WE=58332388;WS=58332370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,44:0.65:68
chr14	58471355	rs2295139	T	C	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=185;ReadPosRankSum=-0.214;SC=AACGGCCTGATAGCAGCAATG;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=10;WE=58471363;WS=58471345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr14	58471699	rs727203	T	C	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.249;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=13;PP=747;ReadPosRankSum=1.749;SC=GTGTGCTTTATTAAGTAAATT;SOR=0.909;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=47;TCF=25;TCR=22;TR=31;WE=58471707;WS=58471689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
chr14	58478873	rs3837616	GA	G	556.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.589;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.953;NF=1;NR=18;PP=427;ReadPosRankSum=1.153;SC=TTCTCACTAGGAAAAAAATAA;SOR=1.112;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=19;WE=58478881;WS=58478863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,25:0.71:35
chr14	58478979	rs3783688	G	T	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=56;ReadPosRankSum=-0.272;SC=ACAGTAAAAGGATTAACAATA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=58478987;WS=58478969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr14	58478990	rs3783689	T	A	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.40;ReadPosRankSum=-1.368;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr14	58563694	rs2273442	G	C	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=156;ReadPosRankSum=0.258;SC=TCATCTTCTTGTCCCTCTAGG;SOR=0.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=9;WE=58563702;WS=58563684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr14	58600107	rs2180520	T	A	227.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=201;SC=CCTATTTTTTTAAAAAAAAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=58600115;WS=58600097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	58605790	rs3829765	G	A	2238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=30;PP=1766;SC=TCCAGGCTGGGTTTCTTTGTT;SOR=1.073;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=39;TCR=30;TR=69;WE=58605798;WS=58605780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr14	58666882	rs61975916	A	G	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.779;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=2;PP=536;ReadPosRankSum=2.249;SC=GCGAGCGCCGAGACTTGTTGG;SOR=1.523;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=51;TCF=45;TCR=6;TR=26;WE=58666890;WS=58666872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr14	58669660	rs75291796	AT	A	266.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.393;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=443;ReadPosRankSum=-0.735;SC=TTAAAAAAAAATATTAGCAAA;SOR=0.231;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=13;WE=58669668;WS=58669650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr14	58674823	.	CAA	C	47.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.99;ReadPosRankSum=-0.692;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr14	58697795	rs111932447	C	CAG	83.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.67;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=1;PP=34;SC=CTTTTTTTGACAGTGTTGCTC;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=58697803;WS=58697785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr14	58724817	rs35486640	C	CTT	188.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.366;NF=0;NR=6;PP=209;ReadPosRankSum=-1.465;SC=AATAGAAACTCGTCGATAAGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=6;WE=58724825;WS=58724807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr14	58727859	.	C	T	22	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=19;HapScore=4;MGOF=11;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=22;QD=14.1928031368;SC=AGTAATTTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=58727867;WS=58727843;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr14	58730626	rs2348071	A	G	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.194;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=166;ReadPosRankSum=0.491;SC=CACCAACACTAATGATAGCTG;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=58730634;WS=58730616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr14	58737766	rs8005100	A	T	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.536;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=274;ReadPosRankSum=-0.931;SC=TCAGGGAATCACTTAGCCCAG;SOR=0.257;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=15;WE=58737774;WS=58737756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chr14	58758331	rs11461912	G	GT	813.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.772;NF=6;NR=14;PP=856;ReadPosRankSum=1.087;SC=TTACCTAAGAGTAACTAAGTA;SOR=0.544;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=20;WE=58758339;WS=58758321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr14	58766617	rs1957038	A	G	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.890;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=707;ReadPosRankSum=-0.606;SC=TCGCGCCCTGAACACTGCCAA;SOR=0.556;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=65;TCF=24;TCR=41;TR=30;WE=58766625;WS=58766607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,37:0.49:75
chr14	58770389	rs10145481	C	G	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.551;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=268;ReadPosRankSum=-0.066;SC=CTAAAGGGTCCCTCCAGACCA;SOR=0.071;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=15;WE=58770397;WS=58770379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr14	58771632	rs7155580	A	G	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=-1.981;SC=TAAAAGTAATATGCAAATTAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=4;WE=58771640;WS=58771622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr14	58831142	rs1051858	A	G	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=934;ReadPosRankSum=-1.222;SC=AATGGAAAAAACAGAAGAAGT;SOR=0.634;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=41;TCR=39;TR=43;WE=58831150;WS=58831132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,43:0.54:79
chr14	58838668	rs1051860	A	G	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=26;PP=838;ReadPosRankSum=0.638;SC=CCTCATCATCATCTCCCCCAC;SOR=0.670;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=122;TCF=57;TCR=65;TR=48;WE=58838676;WS=58838658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,50:0.39:127
chr14	58838701	rs1051861	C	T	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.010;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=25;PP=846;ReadPosRankSum=-0.954;SC=CTGTAGAATGCAGGTGATAAA;SOR=0.267;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=110;TCF=43;TCR=67;TR=46;WE=58838709;WS=58838691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,48:0.42:114
chr14	58869510	rs7153357	T	C	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=28;PP=723;SC=TTGTGAGTTATGACAGCTTAT;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=58869518;WS=58869500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr14	58907825	rs71107948	AT	A	101.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=98;SC=AATATATACAATTTTTTTTCA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=58907833;WS=58907815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	58917225	rs1748970	C	G	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=0;PP=938;SC=AAAGTATAGGCAAGAGTAATA;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=32;WE=58917233;WS=58917215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	58917454	rs1748971	G	A	3374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=81;PP=2625;SC=TGGAAGTGTCGTGTCACAGAG;SOR=2.531;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=23;TCR=81;TR=104;WE=58917462;WS=58917444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr14	58920240	rs1748975	A	C	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=19;PP=582;SC=GAGTTTTGTTAAGATTTTTCA;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=58920248;WS=58920230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	58923395	rs1743721	G	A	1848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=13;PP=1420;SC=ATCTTCTGTAGCGTTGAAACT;SOR=2.381;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=57;WE=58923403;WS=58923385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	58926527	rs1748980	C	T	170.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=135;SC=TATTTGTAGACATTTTAAGTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=58926535;WS=58926517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr14	58932772	rs1743716	A	G	2586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=72;PP=2166;SC=AATATGTGGGATGGATTTTAT;SOR=4.021;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=9;TCR=72;TR=81;WE=58932780;WS=58932762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr14	58934371	rs1632390	G	A	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=1;PP=996;SC=TGAGAATATAGCCATTAAGAT;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=34;WE=58934379;WS=58934361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	58937416	rs1748986	T	C	4227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=76;PP=2965;SC=GAAGCATCTCTTCCTCCTGTG;SOR=1.416;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=44;TCR=76;TR=120;WE=58937424;WS=58937406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr14	58953617	rs1743702	T	C	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=261;SC=TACTTAACCCTGCCATCAATT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=58953625;WS=58953607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	58953746	rs1617510	C	G	2096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=29;PP=1600;SC=CACCCCACTGCCTACCCCACA;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=37;TCR=29;TR=66;WE=58953754;WS=58953736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr14	58954588	rs5808973	T	TA	1046.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=1;PP=778;SC=TCTGTCCTTTTAAAAAAAAAC;SOR=5.838;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=54;TCF=47;TCR=7;TR=36;WE=58954596;WS=58954578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	59010649	rs28535751	T	C	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=42;PP=938;ReadPosRankSum=-0.274;SC=AAACTCGGGCTGTGGAGGTTT;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=41;TCR=84;TR=63;WE=59010657;WS=59010639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,67:0.52:128
chr14	59014563	rs45568037	G	A	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.168;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=399;ReadPosRankSum=0.692;SC=TGATGCTGCCGTCAGTGAACC;SOR=0.891;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=22;WE=59014571;WS=59014553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,21:0.38:56
chr14	59105188	rs2003021	C	T	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=342;ReadPosRankSum=0.192;SC=TGGGGAGCTACTGGGGGAGGC;SOR=0.836;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=20;WE=59105196;WS=59105178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr14	59112732	rs17832998	C	T	1853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.654;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=40;PP=1509;ReadPosRankSum=1.830;SC=CAAGAACATGCTCGGTGTTCC;SOR=0.591;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=132;TCF=56;TCR=76;TR=72;WE=59112740;WS=59112722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,72:0.55:132
chr14	59730167	.	C	G	1348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.053;ClippingRankSum=0.000;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.898;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=8;PP=1070;ReadPosRankSum=-1.528;SC=AGCGTTTAGTCACATCAAGAA;SOR=0.814;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=111;TCF=90;TCR=21;TR=50;WE=59730175;WS=59730157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,52:0.46:114
chr14	59730422	rs67718668	AAGG	A	1245.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.614;NF=4;NR=26;PP=1280;ReadPosRankSum=-1.160;SC=GGAGCCAGAGAAGGAGAAGAG;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=57;TCF=7;TCR=50;TR=30;WE=59730432;WS=59730412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,33:0.55:60
chr14	59730453	rs1253006	G	A	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.218;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=571;ReadPosRankSum=0.628;SC=GAATGAGTTGGTTTGGTTTGA;SOR=0.148;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=26;WE=59730461;WS=59730443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr14	59789586	rs8021976	A	G	2776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=26;PP=2184;SC=GCACTTAAGCATGGTGCATTT;SOR=2.117;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=70;TCR=26;TR=96;WE=59789594;WS=59789576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr14	59789727	rs8022614	G	A	1598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.430;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=31;PP=1303;ReadPosRankSum=-1.500;SC=GCTGTATAAAGGCGTTAATGA;SOR=0.405;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=119;TCF=52;TCR=67;TR=58;WE=59789735;WS=59789717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,59:0.49:121
chr14	59792842	rs150651346	T	G	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.266;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=36;PP=892;ReadPosRankSum=0.139;SC=TGTTTGGACATTGTCCTAATG;SOR=0.220;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=72;TCF=10;TCR=62;TR=43;WE=59792850;WS=59792832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,43:0.60:72
chr14	59797115	rs941883	A	G	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=264;ReadPosRankSum=0.000;SC=CCTAATAAAGATCCTCATAAT;SOR=0.874;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=12;WE=59797123;WS=59797105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr14	59797235	rs941884	A	G	1325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.776;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=1004;ReadPosRankSum=1.143;SC=ATGAGCTACAACAGAAACTGG;SOR=0.512;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=83;TCF=48;TCR=35;TR=46;WE=59797243;WS=59797225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,47:0.55:85
chr14	59798473	rs2146012	C	G	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=0;PP=807;ReadPosRankSum=0.262;SC=AAATAACCATCCCTGTTCTTT;SOR=1.298;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=30;WE=59798481;WS=59798463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr14	59804999	rs1958180	A	G	2289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-6.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.353;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=32;PP=1684;ReadPosRankSum=0.551;SC=CTTACCCTACATCACTTGTTT;SOR=0.974;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=190;TCF=118;TCR=72;TR=96;WE=59805007;WS=59804989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,101:0.51:197
chr14	59814502	rs941886	C	A	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=305;ReadPosRankSum=-1.037;SC=AACTTAATGACCTTATTCTCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=15;WE=59814510;WS=59814492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr14	59931840	rs3742645	G	T	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=57;ReadPosRankSum=-1.068;SC=CCGTGGCCGCGGAGGAAGTCC;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=59931848;WS=59931830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr14	59939727	rs8660	T	C	2287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.821;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=42;PP=1773;ReadPosRankSum=-0.845;SC=TCATCTTCTATTATAAAGCTT;SOR=0.400;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=150;TCF=84;TCR=66;TR=88;WE=59939735;WS=59939717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,90:0.57:157
chr14	59941143	rs8013894	A	G	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-5.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=2;PP=555;ReadPosRankSum=1.297;SC=TAATAAATGCATCTACTTGCC;SOR=1.061;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=56;TCF=52;TCR=4;TR=32;WE=59941151;WS=59941133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr14	59942953	rs10634233	T	TCAAC	319.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=410;ReadPosRankSum=0.933;SC=CAAAAAAAGATCACATGCAAA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=8;WE=59942961;WS=59942943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr14	59946099	rs1752436	T	C	1435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-6.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.882;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.118;NF=7;NR=58;PP=1029;ReadPosRankSum=1.902;SC=GGAAAGAAGATGTGTTTGTTA;SOR=1.900;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=138;TCF=23;TCR=115;TR=65;WE=59946107;WS=59946089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,68:0.45:151
chr14	59950417	rs1268584	T	G	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.448;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=17;PP=1101;ReadPosRankSum=0.514;SC=AATTGCAAGGTTTCGCGGAGT;SOR=1.541;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=109;TCF=67;TCR=42;TR=56;WE=59950425;WS=59950407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,56:0.52:108
chr14	59950690	rs2296842	A	C	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.907;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=563;ReadPosRankSum=0.087;SC=CGAAGTCCAAAGCGAAGCGGC;SOR=1.352;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=78;TCF=47;TCR=31;TR=33;WE=59950698;WS=59950680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,34:0.43:80
chr14	59951278	rs10140007	T	C	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.875;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=9;PP=767;ReadPosRankSum=-0.632;SC=GCTGATCTAGTGCTTCTCGAA;SOR=0.881;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=94;TCF=69;TCR=25;TR=42;WE=59951286;WS=59951268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,43:0.46:94
chr14	59953379	rs1253109	A	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.210;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=327;ReadPosRankSum=0.715;SC=TATTGCAATTATTTTTTATAA;SOR=0.178;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=15;WE=59953387;WS=59953369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr14	59961971	rs35919683	TG	T	262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.406;NF=0;NR=12;PP=298;ReadPosRankSum=-2.254;SC=TTAAGATCATTGTTTTTTTTT;SOR=0.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=12;WE=59961979;WS=59961961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr14	59965429	rs1271507	T	C	1116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=1;PP=895;ReadPosRankSum=0.949;SC=TACAAATTCTTTATTTTATTT;SOR=0.302;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=67;TCF=66;TCR=1;TR=37;WE=59965437;WS=59965419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,38:0.55:69
chr14	59965705	rs1271508	A	C	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=355;ReadPosRankSum=1.735;SC=AATTTTGGAGATTTTTCCTTA;SOR=1.101;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=18;WE=59965713;WS=59965695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr14	59977606	rs11305995	CA	C	289.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=178;ReadPosRankSum=0.962;SC=GGATCATGTCCAAAAAAAAAT;SOR=0.544;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=14;WE=59977614;WS=59977596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr14	59978366	rs10635523	A	ATG	1968.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=14;PP=1484;SC=TTCCACCCTGATGCGTGCATG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=33;WE=59978374;WS=59978356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr14	59988324	rs12887189	C	T	2166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=41;PP=1529;ReadPosRankSum=-0.730;SC=AGACAAGTCGCTTGAGGTGTG;SOR=0.696;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=66;TCR=72;TR=80;WE=59988332;WS=59988314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,87:0.59:147
chr14	59992258	rs1956366	G	T	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.132;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=244;ReadPosRankSum=-0.529;SC=ATTAATTTCTGAAGTATCCAG;SOR=0.124;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=12;WE=59992266;WS=59992248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr14	59992284	rs1956365	C	T	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=211;ReadPosRankSum=-1.001;SC=GATAGATATTCTTCCTTAGAA;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=9;WE=59992292;WS=59992274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr14	59993663	rs8011271	A	G	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=260;ReadPosRankSum=0.548;SC=TATATGTGTTATAACAAAGAT;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=10;WE=59993671;WS=59993653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr14	59998301	rs2145042	T	C	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.97;ReadPosRankSum=-1.242;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr14	59998310	rs2145041	G	T	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.86;ReadPosRankSum=-0.120;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr14	60004844	rs4261431	C	T	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.479;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=365;ReadPosRankSum=0.343;SC=TGCCACAAATCCACTGATCTC;SOR=1.127;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=45;TCF=25;TCR=20;TR=19;WE=60004852;WS=60004834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr14	60031996	rs1980580	G	A	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=651;ReadPosRankSum=-0.401;SC=GCTTCTCCCTGGGAGGAAAGA;SOR=0.735;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=59;TCF=13;TCR=46;TR=30;WE=60032004;WS=60031986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,31:0.51:61
chr14	60032046	rs1980579	A	G	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=288;ReadPosRankSum=0.612;SC=TAAGAAAGGAATAGTCTGTGT;SOR=0.965;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=15;WE=60032054;WS=60032036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr14	60034840	rs982862	G	C	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=7;PP=1040;SC=TCTCCTACAAGCCATCTTCAC;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=38;WE=60034848;WS=60034830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr14	60039374	rs12886261	G	A	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=4;PP=645;SC=ACTTCATTCTGTTATAAGATC;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=60039382;WS=60039364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr14	60041749	rs35273647	G	GA	302.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.72;NF=1;NR=10;PP=228;SC=TGATTGTTCTGAAAAAAAAAT;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=11;WE=60041757;WS=60041739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	60043323	rs6573272	G	A	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=2;PP=288;SC=TCCAGCGCCCGAGGGGCGTCT;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=60043331;WS=60043313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	60043422	rs4898996	A	G	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=8;PP=253;SC=GGGAGGGGCCAGTGGAGACGG;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=60043430;WS=60043412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	60063472	rs6573275	A	G	2221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=38;PP=1672;SC=TTTACTCAGCATGCCTCTTAG;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=29;TCR=38;TR=67;WE=60063480;WS=60063462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr14	60072023	rs1950786	G	A	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=515;ReadPosRankSum=-2.397;SC=GCAGTTTACAGTATTACACCT;SOR=0.823;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=25;WE=60072031;WS=60072013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr14	60073935	rs1956372	A	G	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=371;SC=TGCATCTGTGAGCTGAAATAC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=60073943;WS=60073925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	60076783	rs1998111	G	C	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.930;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=17;PP=959;ReadPosRankSum=0.048;SC=TTCAGACAAAGAGAAGATAGA;SOR=0.484;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=79;TCF=51;TCR=28;TR=47;WE=60076791;WS=60076773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,51:0.61:83
chr14	60193888	.	C	T	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.926;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.626;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=582;ReadPosRankSum=2.415;SC=CTCCTCGGCCCGGACGCCAGT;SOR=0.349;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=63;TCF=21;TCR=42;TR=30;WE=60193896;WS=60193878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,32:0.49:65
chr14	60394828	rs9323357	G	T	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=125;ReadPosRankSum=1.864;SC=TAGTGACTTTGGGAAGCAGAG;SOR=1.802;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=8;WE=60394836;WS=60394818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr14	60405385	rs34650525	G	A	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=88;ReadPosRankSum=0.251;SC=AGGATTATCAGTTCAGTTCTT;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=60405393;WS=60405375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr14	60411584	rs5809056	TCA	T	148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.52;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr14	60426771	rs150683	T	C	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=125;ReadPosRankSum=-0.497;SC=TGATCTGAAATGGAGAGAATC;SOR=0.188;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=10;WE=60426779;WS=60426761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr14	60444652	rs219328	A	T	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=138;SC=GAGTTTGTTAATTATTAAACT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=60444660;WS=60444642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	60451770	rs219341	G	A	273.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=253;SC=ACTTCAGTTTGATGTAGAATG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=60451778;WS=60451760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	60451816	rs219342	G	A	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=2;PP=347;SC=ATTTTATTTTGCTTCAGAGTC;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=60451824;WS=60451806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	60468661	rs219369	C	T	868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=2;PP=716;SC=CCTTTTTTCACTGTATTTTTT;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=60468669;WS=60468651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	60483598	rs219388	C	T	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=258;SC=ATACAACTTACCTAAATATAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=60483606;WS=60483588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	60484931	rs219391	C	T	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=268;SC=TTCAGCCGATCATTTAACCAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=60484939;WS=60484921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	60485240	rs219392	G	A	225.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=141;SC=GGTTTCCAATGCAAATTATTC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=60485248;WS=60485230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	60498876	rs219409	C	T	354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=297;SC=TAGTTTTATGCTTCTGTATGC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=60498884;WS=60498866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	60519920	rs95425	C	T	2256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=53;PP=1759;SC=CAAAGAAAAACTCGGTAATAA;SOR=2.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=18;TCR=53;TR=71;WE=60519928;WS=60519910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr14	60574539	rs12465	A	G	3321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=45;PP=2830;SC=GAACACTTTTATACCAGTTAG;SOR=0.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=54;TCR=45;TR=99;WE=60574547;WS=60574529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr14	60581673	rs35459418	CT	C	2035.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.06;QD=25.45;SOR=1.923;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr14	60581863	rs219314	G	A	4775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=79;PP=2965;SC=CCAGTGGTCCGGAAAAACATT;SOR=1.048;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=60;TCR=79;TR=139;WE=60581871;WS=60581853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr14	60581935	rs150687	C	T	4502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=67;PP=2965;SC=TAGAAACTAGCTTGCTTCATC;SOR=0.778;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=73;TCR=67;TR=139;WE=60581943;WS=60581925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr14	60582053	rs150688	G	A	3494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=63;PP=2887;SC=AATTCAAAGCGTATATATCAT;SOR=1.127;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=43;TCR=63;TR=106;WE=60582061;WS=60582043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr14	60864583	rs1254293	G	T	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.137;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=27;PP=816;ReadPosRankSum=-1.368;SC=GAAACAGAAGGGTCGCGGCTT;SOR=1.366;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=99;TCF=46;TCR=53;TR=43;WE=60864591;WS=60864573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,48:0.46:104
chr14	60900113	rs1254316	C	T	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.530;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=25;PP=664;ReadPosRankSum=0.398;SC=CCCCTCATTCCGAAAACACTT;SOR=1.197;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=35;WE=60900121;WS=60900103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,36:0.53:68
chr14	60903757	rs1254319	G	A	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=62;ReadPosRankSum=-0.548;SC=GGCTTCTCAAGTAAGTTTCCT;SOR=0.434;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=7;WE=60903765;WS=60903747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr14	60921673	rs1262175	T	C	291.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=211;SC=ACTCAAAGTTTCACAGCAGAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=60921681;WS=60921663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	60923783	rs11625921	C	T	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=16;PP=640;SC=TCATTTTCTACTGACTTCCCA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=60923791;WS=60923773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	60928201	rs1956549	G	A	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=278;ReadPosRankSum=-0.280;SC=AGAGATTAAAGCATTTTCTTA;SOR=0.873;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=43;TCF=22;TCR=21;TR=15;WE=60928209;WS=60928191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,16:0.33:49
chr14	60932569	rs10529202	AACACACACACACACACACACAC	A	245.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=718;ReadPosRankSum=0.157;SC=ATAAATTTATAACACACACAC;SOR=1.270;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=3;WE=60932598;WS=60932559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr14	60935281	rs12878738	C	T	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.54;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=356;ReadPosRankSum=0.860;SC=GAACACAAAACAAAATAATTA;SOR=0.474;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=19;WE=60935289;WS=60935271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,24:0.73:33
chr14	60944959	rs11845369	A	G	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=90;ReadPosRankSum=1.208;SC=ACATTCTTACACACCATGTCC;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=8;WE=60944967;WS=60944949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr14	60945203	rs11158285	G	A	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=90;ReadPosRankSum=-1.199;SC=AAAGAGAAACGAATCTTTCTC;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=6;WE=60945211;WS=60945193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr14	60975956	rs1956558	T	C	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=259;ReadPosRankSum=2.406;SC=GTCGGGGTCGTCCGCTCCCGG;SOR=0.976;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=13;WE=60975964;WS=60975946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr14	60976537	rs33912345	C	A	2727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.064;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=44;PP=2014;ReadPosRankSum=-0.988;SC=GCGCACGCGGCACCTGCTACG;SOR=1.024;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=232;TCF=125;TCR=107;TR=105;WE=60976545;WS=60976527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,113:0.46:244
chr14	60978071	rs1061108	C	G	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=506;ReadPosRankSum=-0.921;SC=TCCAGCGCCACAGAAGCCAGG;SOR=0.655;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=23;WE=60978079;WS=60978061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr14	61118783	rs4899014	C	T	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=379;ReadPosRankSum=-2.225;SC=CCTCGGAGGCCGTGACTGGGC;SOR=0.136;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=17;WE=61118791;WS=61118773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr14	61124940	rs10143202	A	G	1741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.633;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=37;PP=1137;ReadPosRankSum=-0.565;SC=ATTCATGGACATATTTAAAGG;SOR=0.619;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=132;TCF=55;TCR=77;TR=66;WE=61124948;WS=61124930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,75:0.53:141
chr14	61184731	rs370845559	AAAT	A	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=5.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.65;ReadPosRankSum=0.112;SOR=0.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,3:0.14:21
chr14	61285352	rs973063	A	G	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=431;ReadPosRankSum=-0.611;SC=TGAAATGCTTATGGAAAAGAC;SOR=1.143;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=18;WE=61285360;WS=61285342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr14	61445967	rs7142228	A	G	3644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=81;NR=22;PP=2763;SC=TGTTTGAAAGACAGCTGATGA;SOR=2.522;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=81;TCR=22;TR=103;WE=61445975;WS=61445957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr14	61448510	rs2296924	A	G	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=357;ReadPosRankSum=-0.816;SC=GGGAGGGAAAATAATAAACAT;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=17;WE=61448518;WS=61448500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,18:0.69:26
chr14	61449167	rs2296923	T	C	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=3.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=209;ReadPosRankSum=2.419;SC=GGAATTTCTTTACGAAATTTT;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=9;WE=61449175;WS=61449157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr14	61449328	rs976272	T	A	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.927;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=244;ReadPosRankSum=-0.184;SC=AGCTTATGTTTTGGCTAATAC;SOR=0.078;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=19;TCF=4;TCR=15;TR=13;WE=61449336;WS=61449318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr14	61451329	rs2182985	G	A	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=247;ReadPosRankSum=0.888;SC=ACATAATTCTGCTACTCAGAG;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=12;WE=61451337;WS=61451319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr14	61451589	rs2149303	C	T	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.652;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.91;ReadPosRankSum=-1.876;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr14	61453739	rs33922839	C	CT	690.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.287;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.401;NF=18;NR=4;PP=756;ReadPosRankSum=-1.373;SC=ATCTGTTTCTCTTCTTTTTTC;SOR=1.964;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=22;WE=61453747;WS=61453729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,25:0.52:48
chr14	61497147	rs1465146	A	T	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=558;SC=TAGGAACACTATTTATTCTTT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=61497155;WS=61497137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	61497285	rs1465145	T	C	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=11;PP=339;SC=TGTATTAATTTGATAAATATG;SOR=1.127;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=18;WE=61497293;WS=61497275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	61509924	rs2296921	T	C	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.105;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=456;ReadPosRankSum=1.092;SC=TAGAGAAAGGTTTCCAGGTAA;SOR=0.797;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=41;TCF=19;TCR=22;TR=21;WE=61509932;WS=61509914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr14	61643045	rs4902033	C	A	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.726;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=25;PP=775;ReadPosRankSum=-0.648;SC=AATTTCCCCCCTCAATACACA;SOR=0.790;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=107;TCF=48;TCR=59;TR=45;WE=61643053;WS=61643035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,46:0.43:107
chr14	61747644	rs3196765	A	G	1921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=30;PP=1473;SC=CCGAGCAGTTACCGGTGCCCG;SOR=0.871;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=56;TCF=25;TCR=31;TR=54;WE=61747652;WS=61747634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr14	61789318	rs1886466	C	G	280.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=9;PP=233;SC=TCTTCGTCCACGTGGCCGCGG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=61789326;WS=61789308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	61915751	rs2296273	G	A	1659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=4;PP=1353;SC=AAGGATGGGCGCACCAGCTGC;SOR=4.575;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=45;TCR=4;TR=49;WE=61915759;WS=61915741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr14	61952429	rs1536016	T	C	4122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=93;PP=2965;SC=CCTCTCCTGGTATGATCCATC;SOR=2.194;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=32;TCR=93;TR=125;WE=61952437;WS=61952419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr14	61995673	.	C	T	22	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=22;QD=28.3856062736;SC=GAAGCTCATGCGGCCGCATGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=61995681;WS=61995663;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr14	61995691	.	C	CGTGTGTGTGT	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=53.70;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1:1.00:1
chr14	61997226	rs1088680	C	T	1794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=14;PP=1412;SC=AGGCAGAGAACGAAGATGACC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=46;TCR=14;TR=60;WE=61997234;WS=61997216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr14	61997393	rs1088679	T	C	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=31;PP=1092;SC=TTTTCAGTACTTCCCACCAGT;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=61997401;WS=61997383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	62037297	rs798792	C	A	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=3;PP=296;SC=TCCTGAACAGCATCCAGTTTG;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=62037305;WS=62037287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	62204808	rs41508050	C	T	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=4;PP=659;ReadPosRankSum=-0.006;SC=CCCACAGACACAGAAACTGAT;SOR=0.471;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=69;TCF=62;TCR=7;TR=34;WE=62204816;WS=62204798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr14	62205175	rs10138153	T	C	970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=29;PP=893;SC=TTCAAACACTTATTTGAACCA;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=62205183;WS=62205165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr14	62208005	rs4902080	T	C	1318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=37;PP=1197;SC=AACTTTCTGATATATATGCCC;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=38;WE=62208013;WS=62207995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr14	62212675	rs4902082	C	T	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.139;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=138;ReadPosRankSum=0.257;SC=GGCGCGGTGGCTCACACCTGT;SOR=1.445;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=8;WE=62212683;WS=62212665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr14	62213848	rs2057482	T	C	2148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=48;PP=1638;SC=TGGTGGCTCATTACCTAAAGC;SOR=2.869;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=10;TCR=48;TR=58;WE=62213856;WS=62213838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr14	62213929	rs5809121	A	AT	441.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=499;SC=GGTTAGTTCAATTTTGATCCC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=62213937;WS=62213919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	62229113	rs17099207	G	A	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=294;SC=TGGTTTCCTGGGCGACCACCG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=11;WE=62229121;WS=62229103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	62229138	rs138759765	A	AGAGGCGTGCGGGCTTCG,AG	1086.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=44;SC=CTAGTCCGTTAGAGGCGTGCG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=4;WE=62229146;WS=62229128;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:13
chr14	62229434	rs7151978	G	C	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=43;PP=1295;SC=TTGCCTCCATGACTCCTGGAC;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=43;WE=62229442;WS=62229424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr14	62233569	rs73324981	A	T	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.749;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=224;ReadPosRankSum=0.175;SC=AATGAGTCGTAATATATTTTC;SOR=0.096;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=10;WE=62233577;WS=62233559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr14	62234159	rs10145554	A	G	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=19;PP=518;SC=AAAATGGAATAAGTATTGATA;SOR=3.816;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=21;WE=62234167;WS=62234149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	62235250	rs147257744	CTG	C	199.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.180;NF=5;NR=0;PP=177;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TTTGTTTTATCTGTGTTTACT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=62235259;WS=62235240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr14	62462766	rs8019076	T	C	1157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=6;PP=954;SC=TCTCAGGATGTTCAGAACTTC;SOR=3.026;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=36;WE=62462774;WS=62462756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	62463214	rs1889806	C	T	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.407;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=17;PP=835;ReadPosRankSum=1.860;SC=ATGGCTTTGACAGCCAGCTCC;SOR=1.317;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=103;TCF=56;TCR=47;TR=46;WE=62463222;WS=62463204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,47:0.45:105
chr14	62546001	rs1892051	C	G	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=2.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=250;ReadPosRankSum=-0.939;SC=TGCATGCTCACAGGAAAGGAT;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=11;WE=62546009;WS=62545991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr14	62546256	rs2353777	C	T	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=443;ReadPosRankSum=0.058;SC=TAAGGAAATACGAACCCAGAG;SOR=0.593;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=22;WE=62546264;WS=62546246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr14	62547469	rs7148330	G	A	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=0.169;SC=GGATTCTGAAGGAGCACAAAG;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=5;WE=62547477;WS=62547459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr14	62550877	rs2353778	G	A	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.246;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=165;ReadPosRankSum=-2.014;SC=GTAGTGCAGCGTGGGCCAATG;SOR=1.833;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=11;WE=62550885;WS=62550867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr14	63174616	rs7161127	T	C	3642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=62;PP=2853;SC=AATCTGTTTTTCTTAGTGGGT;SOR=0.899;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=49;TCR=62;TR=111;WE=63174624;WS=63174606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr14	63179333	rs12435381	C	T	3465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=36;PP=2565;ReadPosRankSum=1.181;SC=TCCTGGACTCCGTGAAAACTC;SOR=0.497;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=66;TCR=36;TR=101;WE=63179341;WS=63179323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,110:0.99:111
chr14	63269317	rs12588427	T	C	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.110;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=16;PP=436;ReadPosRankSum=-1.257;SC=AGGTGAGAGATGAATAAGTGA;SOR=0.456;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=27;WE=63269325;WS=63269307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr14	63417285	.	TA	T	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=2.793;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.48;MQRankSum=-1.326;QD=2.57;ReadPosRankSum=0.307;SOR=2.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr14	63779846	rs5809192	G	GA	3053.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=71;PP=2972;SC=CCCATAGATAGAAACAGAGAA;SOR=4.502;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=82;TCF=5;TCR=77;TR=75;WE=63779854;WS=63779836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr14	63784407	rs11382440	A	AG	4114.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=29;PP=2936;SC=GGTGATCCGAAGCCCCTGCAG;SOR=2.045;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=67;TCR=32;TR=90;WE=63784415;WS=63784397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr14	63858433	rs113580022	G	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=-1.132;SC=GAGCCACTGCGCCCAGCCCTG;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=4;WE=63858441;WS=63858423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr14	63881729	.	TTA	T	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.908;NF=3;NR=0;PP=88;ReadPosRankSum=-1.004;SC=TAACTTATGTTTATATATATA;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=3;WE=63881738;WS=63881719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr14	64066363	.	G	A	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.010;ClippingRankSum=0.000;DP=243;ExcessHet=3.0103;FS=0.977;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQRankSum=-7.828;QD=0.26;ReadPosRankSum=-0.975;SOR=0.934;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:205,17:0.08:222
chr14	64066367	.	A	T	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=0.000;DP=245;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQRankSum=-8.781;QD=0.62;ReadPosRankSum=-0.729;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:204,19:0.09:223
chr14	64066373	.	G	A	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.208;ClippingRankSum=0.000;DP=246;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.61;MQRankSum=-9.127;QD=0.67;ReadPosRankSum=0.650;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:202,20:0.09:222
chr14	64066379	rs117229690	C	T	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FS=0.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.74;MQRankSum=-9.408;QD=0.68;ReadPosRankSum=2.678;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:215,20:0.09:235
chr14	64066394	.	AC	GT	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=0.000;DP=257;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQRankSum=-9.448;QD=1.08;ReadPosRankSum=3.238;SOR=0.630;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:211,22:0.09:233
chr14	64066398	.	G	C	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=0.000;DP=257;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.67;MQRankSum=-9.448;QD=1.04;ReadPosRankSum=3.081;SOR=0.630;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:211,22:0.09:233
chr14	64066402	.	A	G	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.000;DP=250;ExcessHet=3.0103;FS=0.833;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQRankSum=-9.295;QD=1.18;ReadPosRankSum=2.529;SOR=0.583;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:204,22:0.10:226
chr14	64375985	rs2275018	G	T	1424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.138;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=34;PP=1064;ReadPosRankSum=-0.786;SC=ACAGAAACTGGGGAAACCTTA;SOR=1.091;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=130;TCF=57;TCR=73;TR=57;WE=64375993;WS=64375975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,60:0.44:136
chr14	64421392	rs1255874	G	A	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=2;PP=759;ReadPosRankSum=0.805;SC=GGGGTGTTACGTTCTTTTTAA;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=63;TCF=59;TCR=4;TR=35;WE=64421400;WS=64421382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,37:0.57:65
chr14	64423187	rs2792201	C	A	1364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.787;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=23;PP=974;ReadPosRankSum=-1.365;SC=CAACTCTCTTCAGCTGATGTG;SOR=0.803;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=87;TCF=45;TCR=42;TR=52;WE=64423195;WS=64423177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,55:0.60:91
chr14	64428154	rs1255884	A	G	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=323;ReadPosRankSum=-0.805;SC=CCTGTGAACCAAATGGCAGAG;SOR=0.297;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=19;WE=64428162;WS=64428144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr14	64434652	rs1255891	G	A	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.149;NF=0;NR=16;PP=340;ReadPosRankSum=-0.019;SC=AGACCAAGGCGGGTGGATCAC;SOR=0.382;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=16;WE=64434660;WS=64434642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr14	64444876	rs1255896	G	A	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.096;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=557;ReadPosRankSum=0.546;SC=GTATCTTCACGTTTTATGTAG;SOR=1.734;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=26;WE=64444884;WS=64444866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr14	64449256	rs75944377	G	A	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.66;MQRankSum=-0.520;QD=20.47;ReadPosRankSum=-1.405;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr14	64457638	rs1255908	T	G	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=514;ReadPosRankSum=-1.591;SC=CGTGTTAATTTGAGAATTTTT;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=21;WE=64457646;WS=64457628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr14	64460536	rs60596461	A	AT	116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.78;ReadPosRankSum=2.185;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr14	64462007	rs1255912	A	C	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.370;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=330;ReadPosRankSum=-1.281;SC=TAGGATGAAAACTGTTCTGAA;SOR=0.238;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=15;WE=64462015;WS=64461997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr14	64462071	rs1255913	G	T	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=32;ReadPosRankSum=1.579;SC=CTTCACACTCGCAGCAGAGCC;SOR=0.086;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=3;WE=64462079;WS=64462061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr14	64464236	rs8009321	C	A	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=168;ReadPosRankSum=2.239;SC=TGGAGAATTTCCACTTACACA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=64464244;WS=64464226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr14	64468918	rs12147217	G	A	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=136;ReadPosRankSum=1.221;SC=AGCCATGACAGTTTTTTTTTC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=64468926;WS=64468908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr14	64470159	rs4027385	ACT	A	654.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=571;ReadPosRankSum=-0.985;SC=ATTCCATCCCACTCTATTCAG;SOR=0.811;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=15;WE=64470168;WS=64470147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr14	64491695	rs4902264	T	C	6038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=92;PP=2965;SC=TGGAAAGGAATGGAAGAACCA;SOR=0.868;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=111;TCR=92;TR=203;WE=64491703;WS=64491685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr14	64494278	rs10151127	C	T	1688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=4;PP=1420;SC=GCTCATAGAACTAAAGAAGAA;SOR=4.615;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=48;TCR=4;TR=52;WE=64494286;WS=64494268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr14	64496749	rs4027402	C	T	2006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=45;PP=1670;SC=GATCAAATAGCGGTTGAGGAA;SOR=1.963;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=19;TCR=45;TR=63;WE=64496757;WS=64496739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr14	64496872	rs3866737	G	C	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=301;SC=AGAAATTCCAGTGGTATTCAG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=64496880;WS=64496862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	64497710	rs74413846	T	C	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=27;ReadPosRankSum=-0.779;SC=AATGGAGATATAACAATCTTT;SOR=0.655;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=5;WE=64497718;WS=64497700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr14	64497930	rs4027404	G	A	1957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=26;PP=1631;SC=TGTCTCAACAGCATTCTCAAA;SOR=0.899;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=63;TCF=37;TCR=26;TR=61;WE=64497938;WS=64497920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr14	64498037	rs4027405	G	A	2651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=45;PP=1990;SC=GGAATCAGCTGCAGTGGAAAA;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=40;TCR=45;TR=85;WE=64498045;WS=64498027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr14	64501192	rs9783605	G	A	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=329;SC=TTTTTCTTTAGTAAATGTCAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=64501200;WS=64501182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	64519035	rs1890908	A	G	3768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=85;PP=2965;SC=CTATGAGGGCAGTGATTTAAA;SOR=2.384;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=27;TCR=85;TR=112;WE=64519043;WS=64519025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr14	64519455	rs3829767	A	G	2205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=31;PP=1555;SC=GGAACACAAGATAAAGTTTTG;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=61;WE=64519463;WS=64519445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr14	64520416	rs10138253	G	A	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=23;PP=671;SC=TGGGTGCGGGGGCTCACGCCT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=64520424;WS=64520406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	64522550	rs10676670	T	TAATAA	539.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.37;QD=41.52;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	64522674	rs8010911	G	C	2213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=23;PP=1784;SC=TGTCTTGAATGATGCTTATGA;SOR=1.542;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=41;TCR=24;TR=64;WE=64522682;WS=64522664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr14	64522843	rs8010699	A	G	2977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=47;PP=2298;SC=ACAGTAGCACACATCCAGGAC;SOR=0.733;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=96;TCF=49;TCR=47;TR=96;WE=64522851;WS=64522833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr14	64523094	rs7153376	G	A	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=282;SC=TTTTTTCTCTGTCATTAACAC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=64523102;WS=64523084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	64532107	rs1255972	A	G	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=0;PP=494;SC=CAGGAAAACCATAATAGTATG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=64532115;WS=64532097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	64537295	rs1255965	T	G	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=515;SC=AAAAATTATGTCTACTTCAGG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=64537303;WS=64537285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	64537657	rs1255964	G	A	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=31;PP=845;SC=TATTAAGGACGTGTGCTTGAC;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=64537665;WS=64537647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr14	64542872	rs1255960	G	A	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=270;SC=ATGACTATCAGGAGGAAAATA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=64542880;WS=64542862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	64551688	rs1255953	C	T	1174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=9;PP=963;SC=CTTACAGACACGTGGGCTCCT;SOR=2.073;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=38;WE=64551696;WS=64551678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr14	64564527	rs8007972	C	T	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=425;SC=GGAGCTATACCGTACCAGAGA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=64564535;WS=64564517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	64612845	rs11629287	C	T	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.935;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=1487;ReadPosRankSum=1.431;SC=AAATACAGATCTTGAACAACT;SOR=1.675;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=87;TCF=63;TCR=24;TR=29;WE=64612866;WS=64612835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,29:0.33:87
chr14	64612858	rs10151658	C	A	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.729;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=9;PP=1487;ReadPosRankSum=-0.425;SC=GAACAACTGGCTGGAAGCACA;SOR=1.347;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=99;TCF=66;TCR=33;TR=35;WE=64612866;WS=64612835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,35:0.36:98
chr14	64637147	rs7161192	C	A	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.486;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=963;ReadPosRankSum=0.224;SC=GCTTCAGCCTCTACCAAACCA;SOR=0.469;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=102;TCF=59;TCR=43;TR=50;WE=64637155;WS=64637137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,52:0.47:110
chr14	64640665	rs7148122	C	G	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=209;ReadPosRankSum=-0.751;SC=AAAACAGGACCTTCGCTACTC;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=14;WE=64640673;WS=64640655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr14	64655161	rs1255986	C	T	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=156;ReadPosRankSum=-1.202;SC=AGGTTGAGTGCGGAGAGCTAC;SOR=0.540;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=11;WE=64655169;WS=64655151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr14	64656855	rs2256191	T	C	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.893;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=12;PP=838;ReadPosRankSum=-0.141;SC=GGGTGACCAGTTGATCAAGGC;SOR=1.464;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=102;TCF=63;TCR=39;TR=43;WE=64656863;WS=64656845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,46:0.43:108
chr14	64657684	rs1255988	C	A	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.770;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=628;ReadPosRankSum=0.803;SC=TACAGCGAACCGTCACTTGGC;SOR=0.156;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=76;TCF=18;TCR=58;TR=32;WE=64657692;WS=64657674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,34:0.43:79
chr14	64669514	rs189611387	T	A	1320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.920;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=15;PP=1023;ReadPosRankSum=-0.232;SC=TGCAAATATGTGTAGGGTGAA;SOR=0.494;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=83;TCF=58;TCR=25;TR=48;WE=64669522;WS=64669504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,50:0.59:85
chr14	64674981	rs1152595	T	C	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=243;ReadPosRankSum=1.711;SC=GCTGTGGGCATCCACACTGCT;SOR=0.384;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=12;WE=64674989;WS=64674971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr14	64676098	rs1152592	A	G	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.946;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=11;PP=613;ReadPosRankSum=0.297;SC=GTGCAAAAGCACAGGCTTGGA;SOR=0.951;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=72;TCF=50;TCR=22;TR=38;WE=64676106;WS=64676088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,37:0.50:74
chr14	64680848	rs1152591	A	G	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=390;ReadPosRankSum=-0.881;SC=CAGACTTCTCATGCTCTTCTA;SOR=0.470;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=51;TCR=2;TR=24;WE=64680856;WS=64680838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr14	64681193	rs1152590	C	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=163;ReadPosRankSum=-0.795;SC=TGTCAGGTAACAGCTGGGTTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=10;WE=64681201;WS=64681183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr14	64685822	.	GTT	TTT	80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.9988,0.5011;HP=27;HapScore=4;MGOF=5;MMLQ=7;MQ=52.69;NF=3,4;NR=0,0;PP=37,80;QD=13.3333333333;SC=CAGTTTTTTTGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=3,4;WE=64685831;WS=64685821;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr14	64685822	.	GTT	G	80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.9988,0.5011;HP=27;HapScore=4;MGOF=5;MMLQ=7;MQ=52.69;NF=3,4;NR=0,0;PP=37,80;QD=13.3333333333;SC=CAGTTTTTTTGTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=3,4;WE=64685831;WS=64685821;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr14	64686125	rs35648226	G	T	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.019;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=712;ReadPosRankSum=-0.456;SC=TGAAGAGACTGCAGGTGAGTT;SOR=1.003;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=77;TCF=20;TCR=57;TR=36;WE=64686133;WS=64686115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,41:0.49:84
chr14	64686207	rs915057	A	G	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=239;ReadPosRankSum=-0.782;SC=AGCAGATCCCATGTATTCGTG;SOR=0.458;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=13;WE=64686215;WS=64686197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr14	64687258	rs149978500	A	T	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=29;PP=994;ReadPosRankSum=0.216;SC=ACAGAGCTCCAAAGTAGACTC;SOR=0.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=29;TCR=57;TR=44;WE=64687266;WS=64687248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,45:0.52:87
chr14	64688175	rs1152588	G	C	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=107;ReadPosRankSum=0.500;SC=CTCGTATTCAGTGGGTAAGGC;SOR=0.223;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=7;WE=64688183;WS=64688165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr14	64691644	rs35455974	AT	A	231.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=0.891;QD=10.08;ReadPosRankSum=-0.725;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
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chr14	64699816	rs4986938	C	T	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=140;ReadPosRankSum=-1.162;SC=ACGCTTCAGCCTGTGACCTCT;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=8;WE=64699824;WS=64699806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
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chr14	64882380	rs1950902	A	G	2591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=31;PP=2045;SC=AATGCTGGGAAACTTGCTAGA;SOR=0.920;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=39;TCR=31;TR=70;WE=64882388;WS=64882370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr14	64902493	rs3818240	T	C	2509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=9.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.384;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=78;PP=1974;ReadPosRankSum=-1.252;SC=TCCATGTTGGTATTTTACCAG;SOR=1.306;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=200;TCF=30;TCR=170;TR=88;WE=64902501;WS=64902483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,92:0.46:202
chr14	64905976	rs45618332	C	T	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=326;ReadPosRankSum=0.456;SC=TCTCATACGACTGATACTGCC;SOR=0.713;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=19;WE=64905984;WS=64905966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr14	64908845	rs2236225	G	A	2116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=8.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.230;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=25;PP=1701;ReadPosRankSum=1.905;SC=ATTGCAGACCGGATCGCACTC;SOR=0.577;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=175;TCF=119;TCR=56;TR=74;WE=64908853;WS=64908835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,79:0.43:183
chr14	64909151	rs2236224	G	A	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.044;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=534;ReadPosRankSum=0.943;SC=TCTGATTATCGGCAGTGTGCT;SOR=0.127;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=56;TCF=4;TCR=52;TR=25;WE=64909159;WS=64909141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,27:0.44:61
chr14	64911627	rs1256143	T	C	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=285;SC=AGGGAAGATGTACCTCACAAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=64911635;WS=64911617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	64926433	rs75480958	GTGCT	G	547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=482;SC=AAACATTTCAGTGCTTGCTTA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=9;WE=64926444;WS=64926423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	64935411	rs2230491	C	T	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.633;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.291;NF=21;NR=15;PP=720;ReadPosRankSum=-0.221;SC=CAGCAAAAGCCATTGGAGGGT;SOR=0.913;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=101;TCF=57;TCR=44;TR=36;WE=64935419;WS=64935401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,39:0.37:106
chr14	64935720	rs1256149	C	T	7906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=154;PP=2965;SC=AGCAATAGCACAACTTCTGGA;SOR=1.462;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=240;TCF=86;TCR=154;TR=240;WE=64935728;WS=64935710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr14	64947181	rs8003790	C	T	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.253;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=430;ReadPosRankSum=0.761;SC=AGATTATGGTCGGTAAGAATT;SOR=0.246;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=23;WE=64947189;WS=64947171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr14	64953580	rs10132969	T	A	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=498;ReadPosRankSum=-0.658;SC=ATTTATGAATTAAAAATGCCA;SOR=0.560;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=9;WE=64953599;WS=64953570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr14	64953591	rs10143839	C	T	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=498;ReadPosRankSum=-0.243;SC=AAAAATGCCACGCAAATTTTC;SOR=0.544;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=11;WE=64953599;WS=64953570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr14	64988114	rs10624421	C	CAA	997.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=1118;SC=ATTGTAATAGCAGTCATGCAA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=64988122;WS=64988104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	64988279	rs28626711	A	G	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=1065;ReadPosRankSum=-0.755;SC=ACCAAAGAGAATGGGGTTTTC;SOR=0.738;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=124;TCF=78;TCR=46;TR=53;WE=64988287;WS=64988269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,56:0.43:131
chr14	64988924	rs10133411	T	C	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.329;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=31;PP=967;ReadPosRankSum=-1.175;SC=TAGATGAGCATGTGCTAACCT;SOR=0.408;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=115;TCF=44;TCR=71;TR=56;WE=64988932;WS=64988914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,61:0.48:128
chr14	65008251	rs1063391	C	T	5719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=95;PP=2965;SC=CGGCCGGCGACACCCACCTGG;SOR=0.904;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=177;TCF=82;TCR=95;TR=177;WE=65008259;WS=65008241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr14	65009534	rs35270454	C	CT	1282.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.84;MQRankSum=0.557;QD=26.18;ReadPosRankSum=-1.628;SOR=2.345;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr14	65016702	rs7156953	T	G	2630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=32;PP=1888;SC=CCGTATGGCTTCCAGGGCGAG;SOR=1.233;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=50;TCR=32;TR=82;WE=65016710;WS=65016692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr14	65028728	rs2038271	C	G	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=361;ReadPosRankSum=-0.993;SC=ATATGAATTTCTTTCCTGTTT;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=16;WE=65028736;WS=65028718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr14	65031534	rs6573560	C	T	2188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.164;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=41;PP=1690;ReadPosRankSum=1.037;SC=TTTGCAGAAACTGATGGTCCA;SOR=0.580;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=175;TCF=96;TCR=79;TR=85;WE=65031542;WS=65031524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,87:0.48:180
chr14	65031572	rs4902293	A	G	2204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.092;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=45;PP=1663;ReadPosRankSum=-1.052;SC=TAACTTCCCAATCATGCCAGA;SOR=0.437;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=182;TCF=82;TCR=100;TR=87;WE=65031580;WS=65031562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,91:0.48:189
chr14	65032226	rs8007313	C	T	3393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=59;PP=2627;SC=CATACATACACATATCCATAC;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=43;TCR=59;TR=102;WE=65032234;WS=65032216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr14	65068221	rs11158545	C	A	5598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=123;PP=2965;SC=TTCGAATCCACCATTTCTGCG;SOR=1.623;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=181;TCF=56;TCR=125;TR=179;WE=65068229;WS=65068211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
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chr14	65068333	.	T	C	744.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=4.657;ClippingRankSum=0.000;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=14.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.76;MQRankSum=-1.478;QD=6.83;ReadPosRankSum=-1.082;SOR=2.133;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,25:0.23:109
chr14	65068336	rs369006858	G	A	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=9.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.44;MQRankSum=-2.056;QD=7.01;ReadPosRankSum=-0.620;SOR=1.756;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,23:0.21:108
chr14	65068341	rs377267839	TTCTC	T	648.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=8.039;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.66;MQRankSum=-2.398;QD=5.64;ReadPosRankSum=-0.615;SOR=1.601;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,23:0.20:115
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chr14	65230317	rs94789	C	T	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=145;ReadPosRankSum=1.229;SC=TTTATAAGAGCGCGGAGACTC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=8;WE=65230325;WS=65230307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr14	65230358	rs94788	C	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=392;ReadPosRankSum=-1.221;SC=TCTCAAATCACGCAGGAAGTT;SOR=0.643;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=53;TCF=45;TCR=8;TR=21;WE=65230366;WS=65230348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,21:0.38:55
chr14	65233900	rs60545775	G	A	2003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=17;PP=1497;ReadPosRankSum=1.018;SC=CCTTCCTGACGAGGGTGCCCA;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=157;TCF=121;TCR=36;TR=78;WE=65233908;WS=65233890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,80:0.50:160
chr14	65239877	rs92070	C	T	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.598;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=450;ReadPosRankSum=1.827;SC=TCTTGAGTGACGGCTGGCTGC;SOR=2.576;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=24;WE=65239885;WS=65239867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,24:0.44:54
chr14	65239894	rs747860	C	T	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.658;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=3;PP=581;ReadPosRankSum=0.255;SC=CTGCGTCTACCGCATTAGAGA;SOR=2.252;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=60;TCF=49;TCR=11;TR=30;WE=65239902;WS=65239884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr14	65241228	rs229592	A	G	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=476;ReadPosRankSum=-0.416;SC=TCAGCATCACAATGGCGCCCT;SOR=0.727;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=55;TCR=30;TR=31;WE=65241236;WS=65241218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,33:0.37:89
chr14	65242044	rs184528	C	T	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.878;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=27;PP=970;ReadPosRankSum=1.520;SC=CGATCTCCGCCGCCTCCACCA;SOR=0.821;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=75;TCF=30;TCR=45;TR=44;WE=65242052;WS=65242034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,45:0.58:77
chr14	65245863	rs1741489	C	G	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=4.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=322;ReadPosRankSum=-0.339;SC=GGTGAGGTGACGCAGGACTCA;SOR=0.813;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=15;WE=65245871;WS=65245853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr14	65245956	rs1741488	C	T	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.96;ReadPosRankSum=-0.489;SOR=1.004;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,38:0.52:73
chr14	65245962	rs1741487	A	G	1325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.909;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.21;ReadPosRankSum=-0.032;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,34:0.49:69
chr14	65246006	rs1741486	G	A	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.945;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=630;ReadPosRankSum=-0.717;SC=TGACAATCACGGCCAACCTTT;SOR=1.334;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=59;TCF=18;TCR=41;TR=31;WE=65246014;WS=65245996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr14	65246040	rs2357726	G	A	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.874;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=390;ReadPosRankSum=0.758;SC=CATGGGCGGCGCAGAGCTTTG;SOR=2.004;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=18;WE=65246048;WS=65246030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr14	65246350	rs1741485	A	G	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=266;ReadPosRankSum=1.056;SC=CCAGTCATCTACTGCCAAAAA;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=13;WE=65246358;WS=65246344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr14	65246623	rs1626923	T	C	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.634;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=40;PP=1261;ReadPosRankSum=-0.271;SC=GCTCCTCTTTTCGCACATTCA;SOR=0.809;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=137;TCF=57;TCR=80;TR=66;WE=65246631;WS=65246613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,68:0.48:141
chr14	65250939	rs229634	A	G	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=171;ReadPosRankSum=-0.499;SC=CAGAGCACCCACCCGCCGCCC;SOR=0.352;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=12;WE=65250947;WS=65250929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr14	65253232	rs77806	T	C	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=720;ReadPosRankSum=0.212;SC=CCCAGGGCATTCCAGCCAGTA;SOR=0.680;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=33;WE=65253240;WS=65253222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr14	65259581	rs118108317	G	T	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=415;ReadPosRankSum=-0.722;SC=CTAATGCCAGGACTTTGCAAC;SOR=0.798;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=20;WE=65259589;WS=65259576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr14	65260227	rs229591	T	G	5102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=83;PP=2965;SC=ACACCTCCTTTATGCGGGCCT;SOR=0.857;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=71;TCR=84;TR=154;WE=65260235;WS=65260217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr14	65263300	rs229587	C	T	2586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=25;PP=2151;SC=CTGGTTTTCACTGAGCCAGGT;SOR=1.824;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=57;TCR=25;TR=81;WE=65263308;WS=65263290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr14	65267469	rs230703	T	C	1350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=7;PP=1153;SC=CAAAACAGCTTGTACCTTGCC;SOR=2.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=41;WE=65267477;WS=65267459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr14	65268167	rs230704	C	T	2385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=42;PP=1889;SC=AGCATCCCCACCAGGAGGGCA;SOR=1.121;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=29;TCR=42;TR=71;WE=65268175;WS=65268157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr14	65268605	rs2273475	A	G	1878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=28;PP=1558;ReadPosRankSum=-1.438;SC=TGTAGTCCCAAACAAGTGTAC;SOR=0.758;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=32;TCR=30;TR=57;WE=65268613;WS=65268595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,62:0.94:66
chr14	65269174	rs45607231	G	A	978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=739;SC=TATAAATGGCGCTTGGGTTGG;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=28;WE=65269182;WS=65269164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	65270272	rs17767579	C	A	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=2;PP=509;SC=GATTCTAAGGCCCTGGGCAGC;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=65270280;WS=65270262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	65271634	rs1353857	G	A	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=1;PP=581;SC=CAGCAGCCCCGGGGCCCACAG;SOR=4.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=65271642;WS=65271624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	65271650	rs229581	A	G	953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=2;PP=768;SC=CACAGAAGGGACTTTACCAGC;SOR=3.841;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=65271658;WS=65271640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr14	65289978	rs179338	A	G	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=9;PP=306;SC=GCAGAACGCCATGTCATCTGC;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=12;WE=65289986;WS=65289956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	65406402	rs17881652	G	A	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.741;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=36;PP=1541;ReadPosRankSum=0.691;SC=GTCATCATAAGGGTAGGGGAG;SOR=0.560;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=107;TCF=47;TCR=60;TR=66;WE=65406410;WS=65406392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,67:0.61:110
chr14	65407000	rs2071566	C	T	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.313;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=30;PP=677;ReadPosRankSum=1.754;SC=CCTACCGACCCACCTACCCAT;SOR=1.662;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=92;TCF=36;TCR=56;TR=41;WE=65407008;WS=65406990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,42:0.44:96
chr14	65414976	rs11540871	C	T	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.080;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=206;ReadPosRankSum=-1.397;SC=GGTCATCACACGAGAGGACAG;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=12;WE=65414984;WS=65414973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr14	65419293	rs45454295	A	G	1915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.815;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=34;PP=1404;ReadPosRankSum=-0.205;SC=TCAACACCTGAAGAAAGGAAG;SOR=0.422;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=143;TCF=80;TCR=63;TR=72;WE=65419301;WS=65419283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,77:0.51:152
chr14	65419473	rs59000318	C	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=252;ReadPosRankSum=-0.593;SC=TTGAAAGGGGCTTTCCTCCCT;SOR=0.356;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=15;WE=65419481;WS=65419463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr14	65453493	rs3215788	TG	T	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=177;ReadPosRankSum=0.687;SC=CTCTGCCCAATGGGGGGCGGC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=8;WE=65453501;WS=65453491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr14	65470831	rs12587546	A	G	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=364;ReadPosRankSum=0.825;SC=TGCAGAACCCATCTTACAGTA;SOR=0.670;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=57;TCF=52;TCR=5;TR=24;WE=65470839;WS=65470821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,27:0.44:62
chr14	65472874	.	CTT	C	70.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.141;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.193;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr14	65511243	rs117195243	T	C	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=510;ReadPosRankSum=2.064;SC=CGTGCTTTTTTAGAGGGGTTG;SOR=0.619;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=22;WE=65511251;WS=65511233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr14	65544367	rs762810	C	A	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.767;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=201;ReadPosRankSum=-0.316;SC=AGCACCTGAGCCCCAAGAAGG;SOR=0.039;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=10;WE=65544375;WS=65544357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr14	65550816	rs7159443	T	A	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.817;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=483;ReadPosRankSum=0.384;SC=ATTACCAGGGTAAGGCAGAGC;SOR=2.274;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=23;WE=65550824;WS=65550806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr14	65568215	rs2781373	G	A	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=366;ReadPosRankSum=0.489;SC=CCCCAAAAAGGAATAGAACTG;SOR=0.763;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=22;WE=65568223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr14	65734491	rs1256511	T	A	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.182;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=359;ReadPosRankSum=0.905;SC=CAGAAATGGATATCAGGGCCT;SOR=0.321;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=19;WE=65734499;WS=65734481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr14	66028446	rs2229677	A	G	3888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=61;PP=2965;SC=GCTTAAAACAACAGAATGAAG;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=57;TCR=61;TR=118;WE=66028454;WS=66028436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr14	66028505	rs3825639	T	C	2514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=64;PP=1921;SC=AAATACTGAATGAAGAATGAT;SOR=2.007;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=24;TCR=64;TR=88;WE=66028513;WS=66028495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr14	66209190	rs1054218	C	G	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=702;ReadPosRankSum=1.874;SC=CAAACCATTTCAGCCAAACTG;SOR=2.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=26;WE=66209198;WS=66209180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr14	66424605	rs7141711	C	A	1418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.612;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=30;PP=1180;ReadPosRankSum=0.863;SC=GTGAGCTTTTCAAATGAGAAT;SOR=0.516;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=100;TCF=43;TCR=57;TR=54;WE=66424613;WS=66424595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,55:0.54:102
chr14	66455502	rs17827111	A	G	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=159;ReadPosRankSum=-0.674;SC=TAGAAAAATAATAAAGGCGCT;SOR=0.859;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=8;WE=66455522;WS=66455492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr14	66479652	rs10130914	G	T	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.966;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-7.140;NF=3;NR=25;PP=589;ReadPosRankSum=0.319;SC=TCTGGGCGTCGGCGTCGGTAA;SOR=1.680;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=63;TCF=11;TCR=52;TR=28;WE=66479660;WS=66479642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,28:0.44:63
chr14	66480197	rs3888365	G	A	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.278;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.119;NF=26;NR=21;PP=869;ReadPosRankSum=0.555;SC=AAACTCCACAGTCTCTCCATC;SOR=0.110;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=93;TCF=62;TCR=31;TR=47;WE=66480205;WS=66480187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,37:0.45:83
chr14	66480247	rs1807442	CA	TC	1612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.734;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-8.635;NF=16;NR=27;PP=2382;ReadPosRankSum=-0.992;SC=TATTCTTCTTCATGGCAGTGT;SOR=0.800;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=104;TCF=45;TCR=59;TR=43;WE=66480256;WS=66480237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,43:0.40:107
chr14	67555878	rs12323748	A	G	967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=25;PP=741;SC=TTTTTTTTCAAATTTTTGGCT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=67555886;WS=67555868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	67790332	.	AAT	A	46.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.042;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=115;ReadPosRankSum=-1.010;SC=CCCTTAATCTAATATATATAT;SOR=0.072;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=6;WE=67790341;WS=67790322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
chr14	67814210	rs61988178	A	C	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.41;ReadPosRankSum=0.523;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr14	67814219	rs71129819	C	CT	236.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=4.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.91;ReadPosRankSum=0.258;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr14	67819567	rs10718799	CA	C	388.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.60;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	67878717	rs12888674	A	G	1450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.689;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=24;PP=1148;ReadPosRankSum=-0.799;SC=AATGTCCCGAAGCTCGACGCG;SOR=0.603;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=69;TCR=47;TR=60;WE=67878725;WS=67878707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,59:0.50:119
chr14	68022410	rs3742868	C	T	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.51;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	68022410	.	CGAGC	TGAGC,TGAGT	261	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=23,12;NR=2,1;PP=246,261;QD=11.2308485019;SC=CTGACACTCTCGAGCCACTTG;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25,13;WE=68022422;WS=68022400;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:25
chr14	68022414	rs3742869	C	T	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=2.447;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.58;ReadPosRankSum=0.211;SOR=1.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr14	68024134	rs3825723	A	T	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.118;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=212;ReadPosRankSum=-0.517;SC=CTGGAGAAGCAGGTAAGGGCT;SOR=3.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=11;WE=68024142;WS=68024124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr14	68028538	rs11628043	A	G	197.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=2;PP=149;SC=AGTGAGCCAAAATTGCTCCAC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=7;WE=68028546;WS=68028536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	68029313	rs2236235	G	A	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.920;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=764;ReadPosRankSum=1.156;SC=GGCACCCCGCGGGACAGCATC;SOR=0.423;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=83;TCF=36;TCR=47;TR=36;WE=68029321;WS=68029303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,37:0.44:84
chr14	68035879	rs3825725	A	G	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.277;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=382;ReadPosRankSum=0.173;SC=TGCTGTGGCCACATCGGGCAT;SOR=1.765;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=26;WE=68035887;WS=68035869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr14	68038697	rs2236234	C	G	1430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=23;PP=1234;SC=TGAACATGGGCGTCCCCACTT;SOR=0.836;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=20;TCR=23;TR=43;WE=68038705;WS=68038687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr14	68038729	rs2236233	A	G	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.098;HP=6;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=437;ReadPosRankSum=-0.768;SC=GTGACCCCCCAGCAGCTCCAC;SOR=0.226;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=22;WE=68038737;WS=68038719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr14	68038779	rs2236232	T	G	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.293;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=710;ReadPosRankSum=-1.542;SC=GGTGGTCAAGTCTCAGCAGCT;SOR=0.395;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=65;TCF=55;TCR=10;TR=29;WE=68038787;WS=68038769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,31:0.46:67
chr14	68039027	rs2236231	A	G	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-6.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.452;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=39;PP=856;ReadPosRankSum=0.893;SC=GCAGGGTGGAAGCAGAATGCA;SOR=0.151;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=90;TCF=1;TCR=89;TR=40;WE=68039035;WS=68039017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,42:0.45:93
chr14	68039898	rs117185632	C	G	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.716;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=272;ReadPosRankSum=0.674;SC=AATTGATGACCGAGTAGTGAG;SOR=0.145;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=47;TCF=40;TCR=7;TR=20;WE=68039906;WS=68039888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr14	68040193	rs55856716	G	T	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=93;ReadPosRankSum=-1.718;SC=GGGGAATGTGGCCCAAGGCCA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=5;WE=68040201;WS=68040183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr14	68040681	rs79889192	A	G	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=172;ReadPosRankSum=1.038;SC=TGAGACAAAGATGGGGCCAAA;SOR=0.818;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=9;WE=68040689;WS=68040671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr14	68040838	rs3742872	G	A	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=463;ReadPosRankSum=0.384;SC=AAAGGAGGGAGCACTAGGGCA;SOR=1.281;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=52;TCR=1;TR=22;WE=68040846;WS=68040828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr14	68040925	rs3742873	G	A	1957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.275;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=26;PP=1520;ReadPosRankSum=1.165;SC=TTCTCCCAGCGTGCTGCCCCA;SOR=0.564;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=166;TCF=111;TCR=55;TR=77;WE=68040933;WS=68040915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,80:0.47:171
chr14	68041124	rs1555400	G	C	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=36;PP=1157;SC=GACCAAGGTAGAGGGTGGGGC;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=37;WE=68041132;WS=68041114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr14	68042496	rs4902491	A	G	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=5;PP=938;SC=AGACTCCCTCATCCCCCACTG;SOR=3.556;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=40;WE=68042504;WS=68042486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr14	68042574	rs11158685	A	G	2397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=19;PP=1812;SC=CGGGATGCGCACATAGAGGAA;SOR=2.359;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=60;TCR=19;TR=79;WE=68042582;WS=68042564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr14	68044005	rs4902492	C	T	1814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=26;PP=1542;SC=TCTCTGGTTCCGTGCTTTGGG;SOR=1.140;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=33;TCR=26;TR=59;WE=68044013;WS=68043995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr14	68045840	rs10635755	C	CTTCT	3804.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=37;PP=2918;SC=TCCCCTCTTCCGTCTTTTTAG;SOR=1.013;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=38;TCR=38;TR=73;WE=68045848;WS=68045830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr14	68045935	rs6573781	G	A	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.837;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.058;NF=2;NR=25;PP=544;ReadPosRankSum=-1.031;SC=CCAGGCCATCGCGCATGGAAG;SOR=1.258;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=47;TCF=4;TCR=43;TR=27;WE=68045943;WS=68045925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr14	68048759	rs45451797	C	T	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.13;ReadPosRankSum=-1.398;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr14	68048764	rs3809389	T	C	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.56;ReadPosRankSum=-0.825;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr14	68050339	rs79763265	A	T	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.650;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=10;NR=0;PP=224;ReadPosRankSum=0.908;SC=ATTTTTCACAACCACTCGCAC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=10;WE=68050347;WS=68050329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr14	68050687	rs76327566	A	G	1138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.769;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=30;PP=832;ReadPosRankSum=-0.326;SC=CATTGGCACTATTTCTCTCCA;SOR=1.434;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=107;TCF=42;TCR=65;TR=42;WE=68050695;WS=68050677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,45:0.41:111
chr14	68052983	rs749269	G	A	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.483;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=464;ReadPosRankSum=-1.470;SC=TTGCATCTCCGTATCAATGTT;SOR=1.432;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=24;WE=68052991;WS=68052973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,25:0.40:62
chr14	68053124	rs749270	T	A	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.324;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=31;PP=857;ReadPosRankSum=-1.256;SC=GCTTACGTGCTCTTCTCTTCC;SOR=0.402;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=80;TCF=23;TCR=57;TR=46;WE=68053132;WS=68053114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,47:0.57:83
chr14	68053149	rs749271	A	G	2416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=45;PP=1500;SC=AGCAGTCCTCAAGGCAGGGCA;SOR=2.760;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=58;TCF=13;TCR=45;TR=57;WE=68053157;WS=68053139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr14	68053977	rs6573783	A	C	3321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=55;PP=2514;SC=CGATTCCCCAACACCACTAGT;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=42;TCR=55;TR=97;WE=68053985;WS=68053967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr14	68056914	rs6573785	G	A	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=337;ReadPosRankSum=0.146;SC=GGAGAAATGCGGAGTCAAGGT;SOR=0.527;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=38;TCF=19;TCR=19;TR=19;WE=68056922;WS=68056904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr14	68056966	.	ATT	A	69.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.74;MQRankSum=0.566;QD=8.73;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr14	68057031	rs8010574	G	A	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.755;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.556;NF=0;NR=8;PP=156;ReadPosRankSum=1.225;SC=GTGCAGTGGCGCAATCTCGGC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=68057039;WS=68057021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr14	68060574	rs45474396	G	A	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.260;NF=36;NR=14;PP=1056;ReadPosRankSum=-0.466;SC=GGGAATCAATGATTAACAGAG;SOR=0.743;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=90;TCF=63;TCR=27;TR=50;WE=68060582;WS=68060564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,49:0.53:93
chr14	68066949	rs11547225	G	A	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.620;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=33;PP=885;ReadPosRankSum=-1.191;SC=CCCGCACCGCGCGGCGCTGCA;SOR=0.338;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=83;TCF=19;TCR=64;TR=46;WE=68066957;WS=68066939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,44:0.54:82
chr14	68066979	rs7154825	C	T	2078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=54;PP=1695;SC=CCGGCCCTGGCCGTCTCGCCC;SOR=3.091;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=11;TCR=54;TR=65;WE=68066987;WS=68066969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr14	68108747	rs12896052	G	A	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=156;ReadPosRankSum=0.322;SC=TAATAGGATCGAGATAATCTT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=9;WE=68108755;WS=68108737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr14	68123366	rs3742880	T	C	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=482;ReadPosRankSum=0.307;SC=ATTGCCAGCATATTCCTCATC;SOR=0.445;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=26;WE=68123374;WS=68123356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr14	68126768	rs72723111	T	G	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=248;ReadPosRankSum=0.000;SC=ATATGCTCCATGAGGCAGGGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=11;WE=68126776;WS=68126758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr14	68151984	rs2273160	C	G	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=31;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=58;ReadPosRankSum=0.103;SC=TAGCCCAAAACAGAAAAGGAT;SOR=0.083;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=4;WE=68151992;WS=68151974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr14	68159626	rs3742881	G	A	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.710;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=390;ReadPosRankSum=0.446;SC=AGTAATAGGAGGGAATTGAAA;SOR=1.262;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=16;WE=68159634;WS=68159616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr14	68191109	rs148944474	GTTT	G	1575.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=17;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=22;NR=1;PP=759;SC=GCTGGATAGAGTTTTTTTTTT;SOR=5.838;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=23;WE=68191123;WS=68191099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	68191115	rs201143586	T	G	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.928;HP=16;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.776;NF=16;NR=0;PP=447;ReadPosRankSum=0.873;SC=TAGAGTTTTTTTTTTTTTTTT;SOR=2.338;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=16;WE=68191123;WS=68191099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr14	68192653	rs7156725	G	C	1503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=0;PP=1269;SC=CTATCAAAATGTTACCCCAAC;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=43;WE=68192661;WS=68192643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr14	68193731	rs17852293	G	A	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.767;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=180;ReadPosRankSum=0.290;SC=CTCCTGGAGCGGCTAAAGGTG;SOR=0.033;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=10;WE=68193739;WS=68193721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr14	68220251	rs12880908	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.866;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=137;ReadPosRankSum=0.869;SC=GGCAAAGTGGCCTAGAGTCTT;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=9;WE=68220259;WS=68220241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr14	68220499	rs111891063	A	AATC	1192.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.157;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.491;NF=1;NR=17;PP=728;ReadPosRankSum=-1.464;SC=AAGGAAAGGGAATCATGCTTA;SOR=0.976;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=59;TCF=5;TCR=54;TR=18;WE=68220507;WS=68220489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
chr14	68222582	rs117938831	C	T	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=373;ReadPosRankSum=1.420;SC=CAATGACAGTCTCATTCCCTC;SOR=0.880;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=17;WE=68222590;WS=68222572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr14	68234539	rs3742883	T	C	3791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=86;PP=2965;SC=AGGGCTTTCATTCTTGGAGCT;SOR=2.615;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=23;TCR=86;TR=109;WE=68234547;WS=68234529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr14	68241648	rs141953477	CAAA	C	104.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.46;ReadPosRankSum=-0.623;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr14	68242898	rs12886915	G	A	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=115;ReadPosRankSum=-0.308;SC=TTCTCACTGGGAAGGGGAAGG;SOR=0.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=7;WE=68242906;WS=68242888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr14	68244202	rs767972	C	T	175.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=110;SC=CTCAGGTATGCCTTCCCAACA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=68244210;WS=68244198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr14	68246855	rs2295106	T	A	429.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=366;ReadPosRankSum=0.579;SC=GTTATTTTTTTAAAAAGTGAA;SOR=0.906;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=18;WE=68246863;WS=68246845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr14	68246876	rs2295107	C	T	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-4.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.641;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=7;PP=376;ReadPosRankSum=-0.727;SC=CATTGATATGCAGAAAGGGGC;SOR=0.256;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=23;WE=68246884;WS=68246866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr14	68248281	rs2235962	C	T	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.412;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=277;ReadPosRankSum=-0.561;SC=AGGCAGCAAGCGTGGGACCAG;SOR=0.102;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=18;WE=68248289;WS=68248271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr14	68249499	rs2235967	C	T	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.421;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=24;PP=1164;ReadPosRankSum=-0.065;SC=CTGCTCACCACATGCCACAGC;SOR=0.535;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=118;TCF=74;TCR=44;TR=59;WE=68249507;WS=68249489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,62:0.47:131
chr14	68251012	rs11626860	C	T	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=539;ReadPosRankSum=-0.427;SC=TGAAATCATCCGAAGGCCCAT;SOR=0.843;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=22;WE=68251020;WS=68251002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr14	68264867	rs12891164	A	G	1382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=1071;ReadPosRankSum=0.535;SC=GCTTCTCAGGAGGGCTGCGGC;SOR=0.638;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=66;TCR=41;TR=52;WE=68264875;WS=68264857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,54:0.49:110
chr14	68265484	rs7160083	G	A	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.301;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.866;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr14	68273412	rs145323881	GT	G	362.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.415;NF=4;NR=9;PP=408;ReadPosRankSum=-0.227;SC=AAACAAGACGGTTATCAGGAA;SOR=0.914;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=13;WE=68273420;WS=68273402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr14	68273430	rs181576	A	G	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-1.355;NF=6;NR=18;PP=587;ReadPosRankSum=1.730;SC=GAAACCAAGAACTCTTCTTTT;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=24;WE=68273438;WS=68273420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr14	68274020	rs181572	C	G	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=-0.418;SC=ATTAGATGTCCTGAGCCACAC;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=6;WE=68274028;WS=68274010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr14	68280848	rs181563	A	C	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=383;ReadPosRankSum=-2.158;SC=TTTGTCATCCAAGACAGATTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=17;WE=68280856;WS=68280838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr14	68282750	rs17192296	T	A	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.017;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=115;ReadPosRankSum=0.042;SC=ATGTTCTCATTCGCGGAGTAC;SOR=0.293;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=8;WE=68282758;WS=68282740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr14	68290372	rs17783124	T	G	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.649;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=26;PP=581;ReadPosRankSum=0.489;SC=TTTTTATTGATAAGTTTTATG;SOR=1.099;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=64;TCF=6;TCR=58;TR=28;WE=68290380;WS=68290362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,29:0.45:65
chr14	68290426	rs28604984	T	C	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=286;ReadPosRankSum=-0.585;SC=ACTTGAAATATGAAAATGTAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=18;WE=68290434;WS=68290416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr14	68290464	rs28623567	G	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=137;ReadPosRankSum=-0.733;SC=AAATGATGGTGCTTTTCCATA;SOR=0.350;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=9;WE=68290472;WS=68290454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr14	68301767	rs34564590	G	GA	812.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.482;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=587;ReadPosRankSum=0.142;SC=TATAGAGGTTGAAAAAAAACT;SOR=1.135;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=64;TCF=48;TCR=16;TR=31;WE=68301775;WS=68301757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,37:0.54:68
chr14	68331437	rs961700	G	A	830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=21.664;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=1;PP=688;ReadPosRankSum=1.621;SC=TTCTCAACTAGAAGTTTCTCA;SOR=4.472;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=67;TCF=59;TCR=8;TR=31;WE=68331445;WS=68331427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr14	68331675	rs1474939	A	T	1615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=30;NR=16;PP=1219;SC=TTTATCTAAAAAACTTTTTTT;SOR=1.848;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=38;TCR=20;TR=46;WE=68331683;WS=68331665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr14	68773296	rs3837659	AC	A	2551.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.683;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=32;PP=2948;ReadPosRankSum=1.247;SC=ATATCTTTTGACCAATTTGCA;SOR=0.606;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=96;TCF=28;TCR=68;TR=46;WE=68773306;WS=68773286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,66:0.54:123
chr14	68773298	rs60593979	C	G	2560.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=2962;ReadPosRankSum=1.258;SC=ATCTTTTGACCAATTTGCATT;SOR=0.646;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=107;TCF=40;TCR=67;TR=50;WE=68773306;WS=68773286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,66:0.53:124
chr14	68773353	rs2180770	G	A	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.958;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=29;PP=724;ReadPosRankSum=1.286;SC=TGATCCTCTGGCCTAATAAAC;SOR=0.915;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=81;TCF=20;TCR=61;TR=38;WE=68773361;WS=68773343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,40:0.47:85
chr14	68773469	rs3784104	A	G	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=136;ReadPosRankSum=-1.050;SC=ATGAACTTGCATGGCCGAAGT;SOR=0.368;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=8;WE=68773477;WS=68773459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr14	68878038	rs10146321	A	G	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.53;ReadPosRankSum=-0.015;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr14	68878369	rs10146772	C	A	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=122;ReadPosRankSum=-0.849;SC=CTATTAGGGCCTAAAGAAACC;SOR=0.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=8;WE=68878377;WS=68878359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr14	68934690	rs2074562	A	G	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=31;ReadPosRankSum=-0.819;SC=TGGAATAAGCATACAGCCTTT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=4;WE=68934698;WS=68934686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr14	68935789	rs2525505	T	C	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=14;PP=770;SC=GCTCAGGATATACATCTGTCC;SOR=0.818;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=16;TCR=14;TR=30;WE=68935797;WS=68935779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	68944321	.	AT	A	1121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.48;MQRankSum=1.974;QD=10.68;ReadPosRankSum=0.086;SOR=1.037;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,58:0.55:105
chr14	68944343	rs67962762	CT	C	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=1.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=-1.759;QD=1.54;ReadPosRankSum=-0.787;SOR=1.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,34:0.28:122
chr14	68963746	rs765899	C	T	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=294;ReadPosRankSum=-0.299;SC=CCCATAACTTCAATAAACAAC;SOR=0.906;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=14;WE=68963754;WS=68963736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr14	69012355	rs2525529	C	G	3163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=58;PP=2655;SC=AGAACGGGGACAGGGCATGCC;SOR=1.313;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=37;TCR=58;TR=95;WE=69012363;WS=69012345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
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chr14	69263074	rs6573857	G	A	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=184;ReadPosRankSum=0.904;SC=TGGGCCGCAGGACCCCAGAAG;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=11;WE=69263082;WS=69263064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr14	69328441	rs393673	A	G	1808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=10;PP=1409;SC=AGGGTCTCTCAGTTGTCTGGG;SOR=3.293;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=54;TCR=10;TR=64;WE=69328449;WS=69328431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr14	69328594	rs412638	G	A	4650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=62;PP=2965;SC=TATGCCAACAGTAGCAATTAC;SOR=0.874;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=74;TCR=62;TR=136;WE=69328602;WS=69328584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr14	69328613	rs440689	C	T	4603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=64;PP=2965;SC=ACAAAAATGACGTCATGATCA;SOR=0.794;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=71;TCR=64;TR=135;WE=69328621;WS=69328603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr14	69328645	rs112462879	A	G	2135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.701;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.789;NF=40;NR=35;PP=1563;ReadPosRankSum=0.646;SC=TACGTGCACAAGAGTTTAATG;SOR=0.745;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=159;TCF=79;TCR=80;TR=75;WE=69328653;WS=69328635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,81:0.49:167
chr14	69329149	rs1742501	C	T	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=3;PP=723;SC=CAAAGGATCCCGAAGGCCTTC;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=26;WE=69329157;WS=69329139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	69376658	rs743128	A	C	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=15;NR=11;PP=717;SC=AGCCCCTCAGACCCCAGCACT;SOR=1.071;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=15;TCR=11;TR=26;WE=69376666;WS=69376648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	69392264	rs4899272	T	G	4762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=56;PP=2965;SC=CTGGGCCAGGTTCCGCCTCAC;SOR=1.134;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=85;TCR=56;TR=140;WE=69392272;WS=69392254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr14	69445646	rs4902685	A	G	287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=0;PP=207;SC=TGGGGGCTGCAGCGGGCGGGG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=69445654;WS=69445636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	69521345	rs61741172	G	A	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=23;PP=1058;SC=CTGCCTCCCCGGTCACCAAGG;SOR=1.151;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=40;TCF=17;TCR=23;TR=39;WE=69521353;WS=69521335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	69787749	rs2274442	T	C	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=15;PP=314;SC=CTGGTTTACCTGGCCTACTGA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=69787757;WS=69787739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	69792496	rs34996930	C	T	157.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5436;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=120;ReadPosRankSum=-0.366;SC=ACAGGCACTCCTCAGTCTGGC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=69792504;WS=69792486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr14	69792559	rs35024400	C	G	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=0;PP=917;SC=CATACCTCTTCCCAATCCCCA;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=69792567;WS=69792549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	69798284	rs1147461	G	A	2328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=49;PP=1884;SC=TTCTGCTCCCGGGGGTGGGGC;SOR=2.173;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=17;TCR=49;TR=66;WE=69798292;WS=69798274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr14	69988954	rs10146531	T	G	3389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=41;PP=2740;SC=GATCTCAGGGTTCCTTTGCTG;SOR=1.136;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=61;TCR=41;TR=102;WE=69988962;WS=69988944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr14	69992873	rs8004574	A	G	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=25;PP=737;SC=GACACCATTGACTTTGGGGTC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=69992881;WS=69992863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	69994473	rs1885400	C	G	1979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=65;NR=5;PP=1536;SC=AGTCGGAACCCCACCCTTCCT;SOR=4.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=65;TCR=5;TR=70;WE=69994481;WS=69994463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr14	70235741	rs3104	G	A	2356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=48;PP=1962;SC=ACGTTAGCCAGTTGTTCTTGA;SOR=1.852;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=20;TCR=48;TR=68;WE=70235749;WS=70235731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr14	70346350	rs146095118	G	A	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=99;ReadPosRankSum=-0.674;SC=GCCCCGCGGAGCCCGCGAACC;SOR=0.307;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6;WE=70346358;WS=70346340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr14	70346689	rs56307916	C	T	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=10;PP=331;SC=ACCACTCTCCCTTTCTTGACC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=70346697;WS=70346679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	70418881	rs3742909	G	A	4017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=71;PP=2965;SC=GTGACCCACAGTGCAACCTCC;SOR=0.873;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=60;TCR=72;TR=131;WE=70418889;WS=70418871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr14	70477508	rs3825739	C	T	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.946;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=622;ReadPosRankSum=0.802;SC=GGCAGAGTGCCCTGGAAGAGG;SOR=0.518;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=60;TCF=27;TCR=33;TR=29;WE=70477516;WS=70477498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr14	70477695	rs34311408	C	T	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.513;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=106;ReadPosRankSum=-1.434;SC=CTGGGAAAAACGCACCTGCTG;SOR=0.399;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=7;WE=70477703;WS=70477685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr14	70478173	rs139924326	CA	C	991.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.888;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=11;PP=2375;ReadPosRankSum=2.028;SC=CAGCCCCTCCCAACCCCCCCC;SOR=0.836;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=64;TCF=37;TCR=27;TR=31;WE=70478191;WS=70478163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,37:0.49:76
chr14	70478176	rs116375526	C	T	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=1.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.81;ReadPosRankSum=2.545;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,38:0.47:80
chr14	70478183	rs57609901	C	A	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=3.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.73;ReadPosRankSum=2.566;SOR=1.158;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,41:0.50:82
chr14	70496867	rs227402	C	T	1753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.139;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=19;PP=1272;ReadPosRankSum=-1.812;SC=ATGGACATAGCTGGATTTCTC;SOR=0.994;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=145;TCF=100;TCR=45;TR=68;WE=70496875;WS=70496857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,70:0.46:151
chr14	70496919	rs59217337	CT	C	483.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=12.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=0.742;QD=6.54;ReadPosRankSum=1.836;SOR=2.968;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,41:0.55:74
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chr14	70517985	rs61977412	T	A	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=259;ReadPosRankSum=1.682;SC=ATCCTTCTATTTCCCTTTGTT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=13;WE=70517993;WS=70517975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr14	70522353	rs998919	T	G	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=126;ReadPosRankSum=1.200;SC=TCTCATAATTTCTTCATGTGG;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=7;WE=70522361;WS=70522343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr14	70522684	rs10142899	A	C	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.846;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=116;ReadPosRankSum=-0.415;SC=ACGCAAAAAGAAGCCTTTGGA;SOR=0.027;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=9;WE=70522692;WS=70522674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr14	70530378	rs41285486	G	C	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.52;ReadPosRankSum=-1.102;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr14	70530706	rs150956	C	G	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=362;SC=AGTCAGCCAGCAGACAAAAAC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=70530714;WS=70530696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	70634087	rs2114024	A	G	3667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=59;NR=56;PP=2903;SC=GGTAGAAGGCACGGCTCTTCT;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=59;TCR=56;TR=115;WE=70634095;WS=70634077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr14	70634546	rs7161524	C	T	1244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=9;PP=958;ReadPosRankSum=1.086;SC=CTCGTAGATGCTTGATCTTGC;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=78;TCF=60;TCR=18;TR=43;WE=70634554;WS=70634536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,46:0.55:84
chr14	70634801	rs17765575	T	C	1319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=27;PP=1030;ReadPosRankSum=-1.337;SC=GTTTCTTAATTGTCACCTCCC;SOR=0.729;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=123;TCF=61;TCR=62;TR=53;WE=70634809;WS=70634791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,55:0.43:127
chr14	70697154	rs41350744	G	A	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.311;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-8.351;NF=28;NR=29;PP=1127;ReadPosRankSum=-1.831;SC=TTCCGGGGCCGAAGACACGTG;SOR=0.726;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=110;TCF=49;TCR=61;TR=57;WE=70697162;WS=70697144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,38:0.40:94
chr14	70712880	rs2296918	A	C	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.139;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-7.569;NF=53;NR=23;PP=1676;ReadPosRankSum=-3.501;SC=TAGCAGTAGGAACTGTCACTA;SOR=1.579;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=196;TCF=114;TCR=82;TR=76;WE=70712888;WS=70712870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,51:0.30:171
chr14	70712936	.	GA	G	4220.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.882;ClippingRankSum=0.000;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.960;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=6.436;NF=46;NR=61;PP=2948;ReadPosRankSum=-1.419;SC=ACACTGAAGGGATGTTCCATT;SOR=0.468;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=232;TCF=109;TCR=123;TR=107;WE=70712944;WS=70712926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,126:0.50:254
chr14	70713156	rs11629177	G	A	2944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.724;NF=68;NR=67;PP=2617;ReadPosRankSum=0.256;SC=TTCCCACAGCGCTTTAGCATA;SOR=0.689;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=300;TCF=158;TCR=142;TR=135;WE=70713164;WS=70713146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,120:0.49:245
chr14	70713720	rs34309925	AATC	A	2136.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.852;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.700;NF=31;NR=13;PP=1943;ReadPosRankSum=-1.794;SC=TAAATGAAGAAATCATGGTTC;SOR=1.477;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=112;TCF=58;TCR=54;TR=44;WE=70713730;WS=70713710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,56:0.49:115
chr14	70713961	rs199806705	GT	AC	1579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.358;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.942;NF=11;NR=25;PP=1779;ReadPosRankSum=-1.081;SC=GAGTGAGGCCGTTTATTTTTA;SOR=0.339;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=88;TCF=24;TCR=64;TR=36;WE=70713970;WS=70713951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,42:0.47:89
chr14	70713981	rs12586570	A	G	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.853;HP=3;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.964;NF=9;NR=24;PP=647;ReadPosRankSum=-1.060;SC=AATACTCCTCAAAAGCCCCCA;SOR=0.243;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=73;TCF=17;TCR=56;TR=33;WE=70713989;WS=70713971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,29:0.43:67
chr14	70714162	rs4899340	A	G	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.22;MQRankSum=-4.182;QD=15.69;ReadPosRankSum=1.087;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr14	70714172	rs4899341	T	C	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=4.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.55;MQRankSum=-4.037;QD=15.84;ReadPosRankSum=0.611;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr14	70714259	rs7144638	A	G	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.47;MQRankSum=-4.337;QD=9.83;ReadPosRankSum=-1.028;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr14	70793004	rs4749	A	G	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=6.537;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=-1.001;QD=12.99;ReadPosRankSum=0.306;SOR=0.074;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr14	70793015	rs71744102	TA	T	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=5.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=-1.099;QD=0.85;ReadPosRankSum=-0.647;SOR=0.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,9:0.21:42
chr14	70795756	rs7157430	G	T	252.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=208;SC=CTTTTTATTTGCTTTTCAAAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=70795780;WS=70795746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	70795769	rs56128802	T	A	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=325;SC=TTTCAAATGATTATAGTTTAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=70795780;WS=70795746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	70795772	rs10648369	T	TAC	492.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=631;SC=CAAATGATTATAGTTTATCAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=70795780;WS=70795746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	70809496	rs72733767	A	G	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.099;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=26;PP=731;ReadPosRankSum=-0.355;SC=CCAGAATTCAAATTCAGCCTA;SOR=2.368;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=28;WE=70809504;WS=70809486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,29:0.67:43
chr14	70826458	rs17475333	T	G	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=216;ReadPosRankSum=0.570;SC=TGGTTTCCGCTAGGCAAAAGC;SOR=0.976;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=12;WE=70826466;WS=70826448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr14	70924237	rs3751520	C	A	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.059;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.547;NF=7;NR=2;PP=333;ReadPosRankSum=0.697;SC=ATGGGACCCTCGTGTACATCA;SOR=1.514;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=9;WE=70924257;WS=70924227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,4:0.11:35
chr14	70924249	rs3751521	A	G	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-3.164;NF=8;NR=1;PP=333;ReadPosRankSum=0.429;SC=TGTACATCAGAGTCACTCTTC;SOR=0.631;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=9;WE=70924257;WS=70924227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,4:0.12:33
chr14	70924450	rs58247196	C	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.929;HP=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.668;NF=2;NR=6;PP=137;ReadPosRankSum=-0.479;SC=ATATGAGGGTCAAGAAGCTCT;SOR=3.126;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=8;WS=70924440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr14	70924462	rs3751523	A	G	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=15;SC=AGAAGCTCTTAGTTTCTAGAC;SOR=1.493;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=22;WE=70924470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	70924501	rs8010994	C	G	603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.30;QD=31.78;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	70924602	rs72735759	T	G	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.752;NF=29;NR=9;PP=827;ReadPosRankSum=0.212;SC=AGTGCTTGTTTTGGGGGCTTT;SOR=0.762;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=73;TCF=55;TCR=18;TR=38;WE=70924610;WS=70924592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,39:0.51:76
chr14	70924852	rs3829455	A	C	1883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.32;QD=29.90;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr14	70925257	rs12436346	A	G	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.79;QD=33.77;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	70925501	rs72735760	G	C	3736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=310;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.351;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.257;NF=74;NR=69;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.347;SC=ACAGCAGTGTGAACAAGACGC;SOR=0.780;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=312;TCF=157;TCR=155;TR=143;WE=70925509;WS=70925491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,142:0.46:308
chr14	70925818	rs2022624	T	C	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=3.310;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.82;MQRankSum=-3.224;QD=30.71;ReadPosRankSum=0.521;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,43:0.96:45
chr14	70925863	rs45466397	A	C	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.94;MQRankSum=-1.804;QD=8.57;ReadPosRankSum=0.228;SOR=0.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,23:0.36:64
chr14	70936714	rs2293873	T	C	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.632;NF=17;NR=0;PP=358;ReadPosRankSum=-0.601;SC=GAGCTACGTATGGAAAATTAG;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=17;WE=70936722;WS=70936704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr14	70936840	rs111562158	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=8.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.58;MQRankSum=-8.798;QD=1.38;ReadPosRankSum=0.854;SOR=1.316;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,20:0.16:127
chr14	70937121	rs7152848	T	C	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.887;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=482;ReadPosRankSum=-0.460;SC=CAACGTGGCCTGGCCTGCTAG;SOR=0.824;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=69;TCF=29;TCR=40;TR=29;WE=70937129;WS=70937111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,32:0.44:73
chr14	70937413	rs7153448	T	A	2026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=1.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.34;MQRankSum=-1.076;QD=15.24;ReadPosRankSum=1.613;SOR=0.561;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,56:0.42:133
chr14	70937420	rs7153459	T	C	2122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQRankSum=-2.277;QD=15.49;ReadPosRankSum=0.748;SOR=0.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,58:0.42:137
chr14	70937437	rs45447692	C	T	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.654;HP=4;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.665;NF=23;NR=30;PP=1117;ReadPosRankSum=0.289;SC=CTCTCCTGGTCTTTCTTCTGA;SOR=0.603;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=130;TCF=55;TCR=75;TR=53;WE=70937445;WS=70937427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,56:0.42:134
chr14	70937494	rs8015742	T	G	3786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=77;PP=2965;SC=AGCCTCCAGGTGTTTGATTTC;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=39;TCR=77;TR=116;WE=70937502;WS=70937484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr14	70937725	rs10467821	T	C	729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.323;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-10.096;NF=29;NR=26;PP=874;ReadPosRankSum=-0.895;SC=CACGTGTCTTTGGCCCCGGAA;SOR=0.947;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=136;TCF=74;TCR=62;TR=55;WE=70937733;WS=70937715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,36:0.30:120
chr14	70937988	rs28473545	G	A	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.805;NF=1;NR=5;PP=70;ReadPosRankSum=0.823;SC=GCAGAAAGAGGATTCCTCAGT;SOR=0.340;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=6;WE=70937996;WS=70937978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr14	71048130	rs56405439	C	T	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.791;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=810;ReadPosRankSum=-0.361;SC=CTTTGGCATTCCTTGGCTTGT;SOR=0.440;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=91;TCF=55;TCR=36;TR=40;WE=71048138;WS=71048120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,41:0.44:93
chr14	71050792	rs56322329	T	C	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=-0.090;SC=GTTTTTCCTTTTCTTCATCTT;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=3;WE=71050800;WS=71050782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr14	71050892	rs11158867	A	G	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=217;ReadPosRankSum=-0.094;SC=AACATCCTTTATGTCTTCAAA;SOR=0.555;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=11;WE=71050900;WS=71050882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr14	71052278	rs112233021	T	TTTTTC	465.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.40;MQRankSum=1.041;QD=18.63;ReadPosRankSum=0.845;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr14	71057900	rs55831916	T	C	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=248;ReadPosRankSum=-2.516;SC=TTAGGTCACATCTGAAACAGT;SOR=1.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=12;WE=71057908;WS=71057890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr14	71064314	rs1007402	C	T	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=123;ReadPosRankSum=0.211;SC=GAAAAAGTGCCACCTTCTTAA;SOR=0.096;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=7;WE=71064322;WS=71064304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr14	71064577	rs7154970	T	G	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=85;ReadPosRankSum=-1.413;SC=ACATCAAATGTAGTAGGCACT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=71064585;WS=71064567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr14	71067155	rs111681910	A	AG	384.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.443;NF=17;NR=0;PP=424;ReadPosRankSum=-0.389;SC=CCAAGAACTCAGAAAAAAAAA;SOR=0.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=17;WE=71067164;WS=71067145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr14	71109153	rs4902834	C	G	3047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=60;NR=40;PP=2281;SC=GGACTCGCGCCCGGCCTCCCC;SOR=1.115;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=60;TCR=40;TR=100;WE=71109161;WS=71109143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
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chr14	71208996	rs4899368	A	G	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=1;PP=681;SC=TCAGTCCCGGACTCCCTCAAA;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=71209004;WS=71208989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	71209025	rs4902843	C	A	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=352;ReadPosRankSum=0.768;SC=CACACGAGTTCTTTGCCCTGC;SOR=0.201;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=17;WE=71209033;WS=71209015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr14	71215729	rs10129495	G	A	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.073;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=8;PP=244;ReadPosRankSum=-0.779;SC=AGTCTGAATAGAACATGTGAA;SOR=0.313;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=14;WE=71215737;WS=71215719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr14	71216863	rs10630067	C	CAT	2186.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=38;PP=2239;SC=TGCAATAGCTCGAGTCTTTTC;SOR=2.701;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=43;WE=71216871;WS=71216853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr14	71227913	rs3814872	A	C	3077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=71;PP=2218;SC=GGCAAGGAAAAGAATACAGAA;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=33;TCR=71;TR=104;WE=71227921;WS=71227903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr14	71228000	rs11621281	G	A	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=392;ReadPosRankSum=0.191;SC=TCTCCTGTGGGCTCCAGCATT;SOR=0.793;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=19;WE=71228008;WS=71227990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr14	71267345	rs4902857	C	T	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=118;ReadPosRankSum=0.227;SC=ACAACTGCAACTGCTCTGAGC;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=7;WE=71267353;WS=71267335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr14	71275773	rs3832971	GCCT	G	64.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQ=59.41;MQRankSum=0.349;NF=1;NR=2;PP=98;ReadPosRankSum=-1.184;SC=CGCCGCCGCCGCCTCCTCCTC;SOR=1.179;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=3;WE=71275783;WS=71275763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr14	71374702	rs2526882	G	A	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=20;PP=771;SC=TGCTGGGCCTGCCCTTCACCC;SOR=1.002;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=35;WE=71374710;WS=71374692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	71485692	rs1859914	A	T	924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=1;PP=740;SC=CTTATACTTAAGATATACTTA;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=71485700;WS=71485682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	72040525	rs6574016	G	A	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=306;SC=TGGTATTCCAGTACTTTTTCC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=72040533;WS=72040515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	72055468	rs1859643	A	C	6464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=76;PP=2965;SC=CTGGAGACTCATCTATTTTTC;SOR=1.173;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=112;TCR=76;TR=187;WE=72055476;WS=72055458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr14	72117156	rs8017465	T	C	1622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=29;PP=1268;SC=TTGAAGAATTTCTTCAACTAT;SOR=0.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=29;TCR=30;TR=58;WE=72117164;WS=72117146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr14	72201985	rs2097887	C	A	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-3.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.608;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=746;ReadPosRankSum=-0.220;SC=TTTCTTCTCTCCTTTCCAGTC;SOR=1.538;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=75;TCF=27;TCR=48;TR=39;WE=72201993;WS=72201975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,43:0.52:82
chr14	72457218	rs1476745	C	G	1248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=5;PP=964;ReadPosRankSum=-0.699;SC=CTGCTCACAGCTGCACAGGGA;SOR=0.610;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=95;TCF=86;TCR=9;TR=47;WE=72457226;WS=72457208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,48:0.48:100
chr14	72925171	rs2238186	G	C	440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.125;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=328;ReadPosRankSum=-0.125;SC=AAAACCTAGGGATATCTGAGG;SOR=1.436;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=15;WE=72925179;WS=72925161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr14	72932330	.	G	GTGGA	551	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=26;MQ=60.47;NF=14;NR=0;PP=551;QD=39.7857142857;SC=GGGTGGATGGGTGGATGGATG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=14;WE=72932338;WS=72932320;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:22,14:0.39:36
chr14	72932563	rs75036480	G	A	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.440;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=532;ReadPosRankSum=-1.468;SC=ATACATATAAGAAGAGAGTAA;SOR=0.204;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=59;TCF=3;TCR=56;TR=25;WE=72932571;WS=72932553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,26:0.43:61
chr14	72936954	rs8012037	T	C	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-4.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=171;ReadPosRankSum=-0.553;SC=GGATAAGTTTTGTCTTCATAA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=12;WE=72936962;WS=72936944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr14	72939495	rs10131300	C	A	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.134;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=5;PP=752;ReadPosRankSum=0.919;SC=TAGCCCCTAGCAACAGGAGCA;SOR=0.167;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=60;TCF=54;TCR=6;TR=35;WE=72939503;WS=72939485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,36:0.59:61
chr14	72944943	rs2239277	T	G	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.917;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=877;ReadPosRankSum=-0.031;SC=AATTTTAGTTTGGTCTTAACA;SOR=0.540;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=75;TCF=23;TCR=52;TR=44;WE=72944951;WS=72944933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,46:0.57:81
chr14	73079291	rs10649920	G	GAA	2683.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=44;PP=2457;SC=GGGAAGGGAGGAAACAGTGCA;SOR=2.231;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=54;TCF=7;TCR=47;TR=50;WE=73079299;WS=73079281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr14	73138189	rs1060570	C	A	2567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=30;PP=2142;SC=CGGTGCATCACCTGGTGACGG;SOR=1.310;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=48;TCR=30;TR=78;WE=73138197;WS=73138179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr14	73181428	rs4903049	T	G	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=25;PP=730;SC=TGTTCACAACTCCAAGAGGTG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=73181436;WS=73181418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr14	73190201	.	C	G	706	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=23;NR=2;PP=706;QD=29.6308485019;SC=GATCAGAGCTCTTCTGGAGTT;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=73190209;WS=73190200;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	73198506	rs6574094	T	C	2187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=36;PP=1491;SC=CCAGCAGGTGTGGGAATACCT;SOR=0.746;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=31;TCR=36;TR=67;WE=73198514;WS=73198496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr14	73220153	rs3742835	C	T	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=24;PP=723;SC=TGACTAACCCCGTCATTCACA;SOR=2.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=34;WE=73220161;WS=73220143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr14	73240486	rs8015749	A	G	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=1;PP=274;SC=GTTAACCTATATTATAGCATA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=73240494;WS=73240476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	73358945	rs11158986	A	C	2659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=38;PP=2033;SC=GGGGAAACTGAAAATCAGTTG;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=39;TCR=38;TR=77;WE=73358953;WS=73358935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr14	73360819	rs5809598	T	TTGTC	2899.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=31;PP=2506;SC=TAACAGAATATTGTCTCAGAG;SOR=1.999;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=74;TCF=19;TCR=55;TR=44;WE=73360827;WS=73360809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr14	73360842	rs78898062	G	T	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.227;HP=2;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.984;NF=6;NR=23;PP=630;ReadPosRankSum=-1.336;SC=CTAAAGGTTCGCTCAGGGGAA;SOR=1.048;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=29;WE=73360850;WS=73360832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,30:0.53:57
chr14	73360949	rs2215901	A	G	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=25;PP=732;SC=AGTTATTAGGAGAGCTGTCAA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=73360957;WS=73360939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	73404795	rs2302587	G	A	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=469;ReadPosRankSum=-0.238;SC=GTGCCGCTCTGGGGAGCCACT;SOR=0.561;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=22;WE=73404803;WS=73404785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr14	73408355	rs3742832	G	A	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=824;ReadPosRankSum=-1.023;SC=TTTAGTGCCTGTTTCCTTCAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=25;WE=73408377;WS=73408347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr14	73408369	rs3832967	A	AT	593.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=683;ReadPosRankSum=0.096;SC=CCTTCATTACATCCTATGGAA;SOR=0.927;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=19;WE=73408377;WS=73408347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr14	73409613	rs2333012	G	A	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.264;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=524;ReadPosRankSum=0.279;SC=AGAGATGGGCGTCAGCGGGGC;SOR=0.061;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=45;TCF=42;TCR=3;TR=24;WE=73409621;WS=73409603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr14	73412739	rs2246976	C	T	1390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.121;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=40;PP=1045;ReadPosRankSum=-0.775;SC=CCGGAAGGTACGTTGCCCATC;SOR=1.041;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=138;TCF=48;TCR=90;TR=57;WE=73412747;WS=73412729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,61:0.41:147
chr14	73413965	rs2243443	G	C	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=101;ReadPosRankSum=-0.479;SC=CTGGGTATCTGTGGGCTTCAT;SOR=0.307;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=6;WE=73413973;WS=73413955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr14	73418732	rs3214336	GT	G	204.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=144;SC=AGAAGCATGTGTTTTTTTTAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=73418740;WS=73418722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	73422350	rs2806034	T	G	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.894;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=513;ReadPosRankSum=-0.073;SC=CAGTGACCTCTGTGCGGATCC;SOR=0.575;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=77;TCF=36;TCR=41;TR=37;WE=73422358;WS=73422340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,37:0.49:75
chr14	73423103	.	T	G	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.540;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.494;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=611;ReadPosRankSum=-0.466;SC=GATCAAGCTGTGGGACCTGAG;SOR=1.149;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=47;TCF=29;TCR=18;TR=28;WE=73423111;WS=73423093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr14	73440864	rs12931	C	T	1277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.178;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=982;ReadPosRankSum=0.132;SC=GAGCAATGAGCGTTCCACCTT;SOR=0.524;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=111;TCF=58;TCR=53;TR=51;WE=73440872;WS=73440854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,53:0.46:116
chr14	73445615	.	C	T	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=512;ReadPosRankSum=-0.835;SC=GTATCTGCAGCGGCTCTTGGC;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=47;TCR=24;TR=29;WE=73445623;WS=73445605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,31:0.43:72
chr14	73460109	rs374753534	TA	T	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.67;ReadPosRankSum=1.309;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr14	73465027	.	C	CA	120	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=0.9994;HP=15;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=63.57;NF=0;NR=11;PP=120;QD=11.1818181818;SC=TTGTTACCTGCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=11;WE=73465035;WS=73465017;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,11:0.61:18
chr14	73491270	rs80259615	C	T	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.412;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=26;PP=597;ReadPosRankSum=0.142;SC=GAGCTTGCCCCGGGGGTGAAG;SOR=1.629;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=27;WE=73491278;WS=73491260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr14	73491307	rs3742828	C	A	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=4.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=588;ReadPosRankSum=-0.960;SC=GAAGACTGCACGAAACTTCCA;SOR=0.352;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=47;TCF=1;TCR=46;TR=26;WE=73491315;WS=73491297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr14	73563904	rs67768323	C	T	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.62;MQRankSum=2.455;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr14	73563909	rs202024700	T	C	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.16;MQRankSum=1.710;QD=11.09;ReadPosRankSum=1.309;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr14	73664853	rs165932	G	T	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=383;ReadPosRankSum=-0.213;SC=TATTTGAGAAGGATATTGAAT;SOR=0.852;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=19;WE=73664861;WS=73664843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr14	73716633	rs2293793	T	C	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.815;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=280;ReadPosRankSum=2.771;SC=AAGCCTTGGGTCTTGGGGAGG;SOR=4.310;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=14;WE=73716641;WS=73716623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,14:0.41:34
chr14	73716774	rs177393	G	A	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.558;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=508;ReadPosRankSum=0.572;SC=TTGATGGGACGCCCTGCGAGC;SOR=0.198;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=28;WE=73716782;WS=73716764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr14	73717901	rs12432062	G	A	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.100;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=505;ReadPosRankSum=-1.269;SC=GTGGCCTTTGGTTAGGACTCG;SOR=2.613;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=22;WE=73717909;WS=73717891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr14	73718879	rs2242610	A	G	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=316;ReadPosRankSum=1.096;SC=AGGGGAGGGCATGGGCCCTGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=16;WE=73718887;WS=73718869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
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chr14	73728957	rs177387	G	A	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=94;ReadPosRankSum=1.277;SC=TGCTTTATAAGTGGGGAAGGG;SOR=0.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=7;WE=73728965;WS=73728947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr14	73730290	rs177385	C	A	2192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=17;PP=1716;SC=GAACACACTGCTTAGGGTGGT;SOR=1.946;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=48;TCR=17;TR=65;WE=73730298;WS=73730280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
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chr14	73732302	rs177383	C	G	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=416;ReadPosRankSum=0.387;SC=GAGCTGCTAGCGCATGGTCAT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=19;WE=73732310;WS=73732292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr14	73957682	rs10144461	C	G	170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=128;ReadPosRankSum=-0.977;SC=TTTAGCTTCGCCCCCGGCCGG;SOR=0.124;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=8;WE=73957690;WS=73957672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr14	73957772	rs10144469	A	G	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.256;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=561;ReadPosRankSum=-1.261;SC=GGGCGGCCGAAGCGCCGGCGC;SOR=0.061;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=43;TCF=40;TCR=3;TR=24;WE=73957780;WS=73957762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr14	73957981	rs150704374	G	GC	2701.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=55;PP=2611;SC=GGCGGTGGCGGCGTCCCGGAC;SOR=2.303;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=62;TCF=5;TCR=57;TR=59;WE=73957989;WS=73957971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr14	73958375	rs758109	T	C	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.709;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=637;ReadPosRankSum=-0.308;SC=CAGATCACTTTTACCGGCGCC;SOR=1.270;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=28;WE=73958383;WS=73958365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr14	73958812	rs3813563	T	C	3325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.933;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=63;PP=2791;ReadPosRankSum=-0.865;SC=CGACCCCGAGTCCCAACCGAG;SOR=0.435;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=201;TCF=86;TCR=115;TR=117;WE=73958820;WS=73958802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,119:0.58:206
chr14	73959703	rs10631979	C	CTT	255.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=-2.042;QD=7.52;ReadPosRankSum=-1.314;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr14	73961765	rs11365617	CA	C	395.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.64;ReadPosRankSum=1.280;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr14	73961821	rs4519287	T	C	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=535;ReadPosRankSum=0.883;SC=AGAGTACCCTTTCCTGACTCT;SOR=1.127;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=55;TCF=52;TCR=3;TR=25;WE=73961829;WS=73961811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr14	73961841	rs1019056	T	C	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=530;ReadPosRankSum=0.129;SC=TTTCATCCTCTAAGGCTTGCT;SOR=1.034;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=60;TCF=50;TCR=10;TR=27;WE=73961849;WS=73961831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr14	73961982	rs76429074	C	T	2379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.977;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=41;PP=1827;ReadPosRankSum=0.186;SC=TCCTTGTTCTCCTTTGGGTTT;SOR=0.525;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=157;TCF=87;TCR=70;TR=88;WE=73961990;WS=73961972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,90:0.56:162
chr14	73963383	rs8014577	T	C	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.465;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=312;ReadPosRankSum=-0.877;SC=GGTACATTTCTCTGAAAGATA;SOR=1.863;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=15;WE=73963391;WS=73963373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr14	73989859	rs1074501	C	T	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.189;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=310;ReadPosRankSum=-0.941;SC=CTGGTCATACCGCGTCCCAGC;SOR=1.609;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=16;WE=73989867;WS=73989849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr14	74004595	rs72738342	C	T	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.294;NF=16;NR=21;PP=646;ReadPosRankSum=-1.666;SC=GACTCACCTCCGCTAATTGTT;SOR=0.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=31;TCR=43;TR=37;WE=74004603;WS=74004585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,37:0.51:72
chr14	74036674	rs34765603	G	GC	139.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.282;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=174;ReadPosRankSum=1.544;SC=TTATGTGTATGCCCCCCCGCC;SOR=0.105;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=8;WE=74036682;WS=74036664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr14	74040341	rs34585397	T	C	1698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.857;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.366;NF=6;NR=55;PP=1334;ReadPosRankSum=-0.238;SC=TCAGGTCTCTTCTTAAATGGT;SOR=0.230;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=122;TCF=9;TCR=113;TR=61;WE=74040349;WS=74040331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,62:0.52:119
chr14	74041748	rs149033118	A	G	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=5.516;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.41;MQRankSum=-2.662;QD=5.96;ReadPosRankSum=0.190;SOR=2.517;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr14	74042189	rs7494	A	G	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.57;MQRankSum=-1.273;QD=4.65;ReadPosRankSum=-0.088;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
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chr14	74061968	rs2010070	T	C	1446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.183;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=27;PP=1085;ReadPosRankSum=-0.533;SC=TCGTGGACATTGTGGATATAA;SOR=0.422;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=127;TCF=74;TCR=53;TR=59;WE=74061976;WS=74061958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,61:0.46:132
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chr14	74196686	rs2075025	T	C	1507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=36;PP=987;ReadPosRankSum=-0.485;SC=TCATGTCCTCTGCCTGGAGAA;SOR=0.734;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=49;TCR=65;TR=64;WE=74196694;WS=74196676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,66:0.55:119
chr14	74196792	rs8019058	T	C	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.913;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=653;ReadPosRankSum=1.023;SC=TTAGTCTGCCTACCACACCCA;SOR=0.906;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=73;TCF=26;TCR=47;TR=33;WE=74196800;WS=74196782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,34:0.44:77
chr14	74196844	rs6574140	T	C	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.400;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=389;ReadPosRankSum=0.149;SC=AAAAGCCCTTTTTATCATCTC;SOR=0.951;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=19;WE=74196852;WS=74196834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr14	74196872	rs76529453	G	C	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.406;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=389;ReadPosRankSum=1.339;SC=GCAGAAGTCAGCAAACTTTTT;SOR=1.811;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=18;WE=74196880;WS=74196862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,19:0.44:43
chr14	74203789	rs17782124	G	A	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.364;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=7;PP=669;ReadPosRankSum=1.072;SC=GTTCTGTTCAGGACCCTTCCC;SOR=1.125;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=30;WE=74203797;WS=74203779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,31:0.65:48
chr14	74205198	rs72365435	GCAGCCGCC	G	255.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.279;NF=6;NR=0;PP=1877;ReadPosRankSum=0.189;SC=AGCAAATCCTGCAGCCGCCCA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=6;WE=74205213;WS=74205188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr14	74205878	rs17782128	C	T	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=23;PP=873;ReadPosRankSum=-0.485;SC=AGGGTTGCTGCGGCATGGAAT;SOR=0.705;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=57;TCR=52;TR=48;WE=74205886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,52:0.46:114
chr14	74206481	rs758774	T	C	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.662;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=22;PP=996;ReadPosRankSum=0.123;SC=CAGGCCCATATACCACAGAGT;SOR=0.586;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=122;TCF=64;TCR=58;TR=48;WE=74206489;WS=74206471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,53:0.40:131
chr14	74206658	rs758773	G	A	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.694;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=29;PP=965;ReadPosRankSum=-1.477;SC=CCTGGCCCCCGAAGAGGCAAC;SOR=0.415;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=107;TCF=39;TCR=68;TR=49;WE=74206666;WS=74206648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,50:0.47:106
chr14	74206682	.	C	G	1364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.880;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.681;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=36;PP=1114;ReadPosRankSum=-0.098;SC=TCCGCTTGTTCTGAGCCTTGG;SOR=1.341;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=93;TCF=34;TCR=59;TR=53;WE=74206690;WS=74206672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,52:0.54:96
chr14	74206847	rs758772	A	G	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.250;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=271;ReadPosRankSum=0.940;SC=GACGCTGGACAGTGAGGTCGG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=12;WE=74206855;WS=74206837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr14	74340797	rs11159042	A	T	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.693;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=20;PP=777;ReadPosRankSum=0.188;SC=TCGTTGATGGAGGAGGTATTG;SOR=0.786;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=113;TCF=65;TCR=48;TR=49;WE=74340805;WS=74340787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,51:0.44:117
chr14	74349227	rs8005140	G	A	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=284;ReadPosRankSum=-0.964;SC=TTTTTGAGACGGAGTCTTGCT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=13;WE=74349235;WS=74349217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr14	74371467	rs35370876	TA	T	53.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.021;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=92;ReadPosRankSum=-0.319;SC=GCTATAGTTTTAACAAAGTCT;SOR=2.788;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=74371475;WS=74371465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr14	74375956	rs2302136	A	C	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=429;ReadPosRankSum=1.380;SC=GTAAGTCATTAGACTCTGAAT;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=19;WE=74375964;WS=74375946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr14	74388908	rs1127392	T	C	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.991;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=170;ReadPosRankSum=-1.268;SC=GAGTTGATGATGGTAAGACTT;SOR=2.649;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=11;WE=74388916;WS=74388898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr14	74399212	rs6574155	C	T	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.930;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=32;PP=944;ReadPosRankSum=1.040;SC=ACAGATACTTCTGAATTTTTC;SOR=0.859;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=79;TCF=19;TCR=60;TR=40;WE=74399220;WS=74399202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,45:0.53:85
chr14	74399291	rs2336547	G	A	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=28;PP=923;SC=CTTGCTATCAGTCATCCTGTC;SOR=3.145;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=34;WE=74399299;WS=74399281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr14	74404756	rs28927675	T	C	1779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.076;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=37;PP=1320;ReadPosRankSum=-0.686;SC=AGACTTCTTTTTGTGTATCTC;SOR=1.112;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=106;TCF=48;TCR=58;TR=60;WE=74404764;WS=74404746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,65:0.59:111
chr14	74409032	rs740506	G	A	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=143;ReadPosRankSum=1.036;SC=TGTATTTCAGGCCGCAGCCCT;SOR=0.648;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=7;WE=74409040;WS=74409022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr14	74413129	rs7146634	C	G	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.695;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=626;ReadPosRankSum=0.296;SC=GACACCATCTCCCTTTCTGCT;SOR=0.612;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=49;TCF=23;TCR=26;TR=28;WE=74413137;WS=74413119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,30:0.59:51
chr14	74413420	rs7148485	T	C	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5016;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=245;ReadPosRankSum=0.398;SC=TGGGGAGAATTTGGGGTCTGC;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=9;WE=74413428;WS=74413410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr14	74416782	rs190881382	T	G	3197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=43;PP=2344;ReadPosRankSum=-0.629;SC=GCAGCAGCGGTGGCAGCGAGA;SOR=0.666;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=193;TCF=117;TCR=76;TR=113;WE=74416790;WS=74416772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,119:0.60:199
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chr14	74428286	rs7141392	A	G	1535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=26;PP=1239;SC=AAGGATTCAGATACTATGGGG;SOR=1.132;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=45;WE=74428294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr14	74436699	rs116066050	G	A	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.420;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=542;ReadPosRankSum=-0.635;SC=AGACTCTGGTGTCCTGTCTCT;SOR=0.379;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=63;TCF=37;TCR=26;TR=31;WE=74436707;WS=74436689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr14	74441537	rs2074933	T	C	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=555;ReadPosRankSum=-0.248;SC=ATCTTTTCCTTCATAGAATGG;SOR=0.836;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=56;TCF=37;TCR=19;TR=28;WE=74441545;WS=74441527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr14	74441684	rs2074932	G	A	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.272;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=431;ReadPosRankSum=-1.432;SC=CCAAATCCCAGGTAACTGTAA;SOR=0.950;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=21;WE=74441692;WS=74441674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,21:0.47:45
chr14	74444090	.	GA	G	308.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=-0.345;QD=9.08;ReadPosRankSum=0.782;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr14	74453706	rs199818408	AT	A	2391.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.165;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.900;NF=9;NR=41;PP=2954;ReadPosRankSum=0.703;SC=CCCTGAAGTTATCCCAAATGA;SOR=1.457;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=101;TCF=25;TCR=76;TR=50;WE=74453719;WS=74453696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,62:0.53:116
chr14	74453711	rs111623005	A	C	2429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.350;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.613;NF=16;NR=40;PP=2962;ReadPosRankSum=0.349;SC=AAGTTATCCCAAATGATCCTA;SOR=1.282;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=113;TCF=35;TCR=78;TR=56;WE=74453719;WS=74453696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,63:0.54:116
chr14	74454813	rs2302117	C	A	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.624;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=121;ReadPosRankSum=0.480;SC=CATTCTTTTCCCAAGATGTGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=74454821;WS=74454803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr14	74486079	rs79458742	G	C	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=411;ReadPosRankSum=-0.383;SC=AGCGGCGCGGGTGGGGCATTG;SOR=0.850;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=19;WE=74486087;WS=74486069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr14	74489695	rs79860442	G	T	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=646;ReadPosRankSum=-0.273;SC=CAGGTTGGAAGTCACAGAACT;SOR=0.833;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=29;WE=74489703;WS=74489685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr14	74489735	rs3784039	G	A	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.117;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=445;ReadPosRankSum=1.373;SC=GATACTTCACGGATACTGGCA;SOR=1.047;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=22;WE=74489743;WS=74489725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr14	74512698	rs6574158	T	C	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=0;PP=1219;SC=AAAATAAATATCTTTTGATGA;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=42;WE=74512706;WS=74512688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr14	74514674	rs3784038	A	T	3466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=23;PP=2674;SC=AAAGAGAATGATTATCTTCAG;SOR=2.411;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=82;TCR=23;TR=105;WE=74514682;WS=74514664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr14	74527203	rs8017248	G	A	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=0;PP=823;SC=GAAACTTTGCGGGGGTTAATA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=74527211;WS=74527193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	74537885	rs2072293	T	G	1973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=22;PP=1713;SC=GCCATATGCATAAGGGCAGTT;SOR=1.217;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=60;TCF=38;TCR=22;TR=59;WE=74537893;WS=74537875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr14	74538706	rs4646861	A	G	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.721;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=14;PP=837;ReadPosRankSum=0.351;SC=AATAGAAATTAATGCAAGAAT;SOR=0.845;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=58;TCF=30;TCR=28;TR=34;WE=74538714;WS=74538696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,38:0.58:65
chr14	74539325	rs2302126	C	A	729.89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.930;HP=10;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=42;PP=823;ReadPosRankSum=1.427;SC=CTGAAAAAAACAAACAAACAA;SOR=3.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=11;TCR=46;TR=52;WE=74539333;WS=74539314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,32:0.86:37
chr14	74550908	rs2074939	A	T	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=1;PP=633;SC=TGGGCATGGGACAGGGCCGCA;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=74550916;WS=74550898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	74551526	rs2006732	C	T	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=0;PP=700;ReadPosRankSum=-0.435;SC=CGTGGCTATACTTAGGGGCGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=70;TCR=1;TR=33;WE=74551534;WS=74551516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,36:0.49:73
chr14	74551721	rs115302140	G	T	1991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.146;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=42;PP=1447;ReadPosRankSum=-1.248;SC=AGAGATCTTTGCCTGCAGCCT;SOR=0.575;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=175;TCF=78;TCR=97;TR=78;WE=74551729;WS=74551711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,84:0.45:188
chr14	74567736	rs2300193	T	C	112.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=86;SC=ACGGATCCATTTTCTACTTAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=74567744;WS=74567726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	74568089	rs74431323	A	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.68;ReadPosRankSum=-1.068;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr14	74711883	rs35435463	C	T	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=472;ReadPosRankSum=1.189;SC=TCTTTACCTCCTACCAGCTAG;SOR=0.730;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=71;TCF=46;TCR=25;TR=27;WE=74711891;WS=74711873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,28:0.38:74
chr14	74726515	rs11383441	G	GC	891.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=21;PP=1033;SC=TTGGGGTCCTGCCCTGCGGTG;SOR=2.833;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=25;WE=74726523;WS=74726505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr14	74753278	rs929449	T	C	8603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=138;PP=2965;SC=CCCTGGCCGCTGGCAGAGGAG;SOR=0.785;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=288;TCF=150;TCR=138;TR=288;WE=74753286;WS=74753268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,295:1.00:295
chr14	74759006	rs3742801	C	T	1365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.490;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=10;PP=1067;ReadPosRankSum=-0.055;SC=AAGCCCCACTCGCTCTCGCCC;SOR=1.251;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=104;TCF=81;TCR=23;TR=53;WE=74759014;WS=74758996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,53:0.51:104
chr14	74759301	rs4148078	G	T	1903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-6.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.850;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=32;PP=1264;ReadPosRankSum=-0.023;SC=ACAGGTCGATGAGCTGGGTGA;SOR=0.247;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=127;TCF=76;TCR=51;TR=67;WE=74759309;WS=74759291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,76:0.55:139
chr14	74759477	rs4148077	C	T	2159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.260;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=32;PP=1552;ReadPosRankSum=-0.275;SC=CTAAGCTCTGCGGGACTCAGG;SOR=1.119;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=178;TCF=101;TCR=77;TR=85;WE=74759485;WS=74759467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,89:0.48:184
chr14	74766352	rs2301345	A	G	1116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.043;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=30;PP=933;ReadPosRankSum=-0.098;SC=CTGGGGATCAAGCCAACCTGG;SOR=1.090;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=74;TCF=24;TCR=50;TR=43;WE=74766360;WS=74766342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,41:0.54:76
chr14	74767128	rs7158118	G	A	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=228;ReadPosRankSum=0.778;SC=AACAGACCACGGATACAAAGG;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=10;WE=74767136;WS=74767118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr14	74874540	rs11621669	A	G	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=13;PP=851;SC=CCTGGGCCCCAGGTGCTCTTA;SOR=1.148;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=19;TCR=13;TR=32;WE=74874548;WS=74874530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	74874707	rs2884545	A	G	2394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=41;PP=1809;SC=AAAACAGTGGAGTTTGGTGAC;SOR=1.288;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=27;TCR=42;TR=68;WE=74874715;WS=74874697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr14	74876181	rs12590672	T	G	2519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=45;PP=2088;SC=CTGTGAAGCTTGTCTCACAGC;SOR=1.300;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=27;TCR=45;TR=71;WE=74876189;WS=74876171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr14	74876501	rs4026651	G	C	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=547;SC=GCAGTCCTCAGAGCCTGTCAG;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=74876509;WS=74876491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	74967651	rs143010135	C	T	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.948;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=11;PP=663;ReadPosRankSum=-0.396;SC=GCAGTGGCAGCGGTAGGAGCC;SOR=0.533;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=78;TCF=55;TCR=23;TR=35;WE=74967659;WS=74967641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,34:0.45:76
chr14	74969167	rs2286412	C	T	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=1;PP=453;SC=TAGTTTATGACGGAGTTGTTA;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=74969175;WS=74969157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	74970448	rs5809669	G	GC	399.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=4;PP=495;SC=AGCCTGGAAGGCCCTCCTGGG;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=74970456;WS=74970438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	74973583	rs8020768	C	T	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=32;PP=1017;ReadPosRankSum=0.084;SC=TGTGTGTGTGCGCGCGCGCGT;SOR=0.412;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=36;WE=74973591;WS=74973571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,22:0.79:28
chr14	75016482	rs2196861	T	C	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=1;PP=997;SC=GCCTCTGACATCCTGGAGGGG;SOR=5.838;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=36;WE=75016490;WS=75016472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	75017650	rs934999	G	C	1518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=4;PP=1179;SC=AAATGGGAGAGTCTGCAGACA;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=38;TCR=4;TR=42;WE=75017658;WS=75017640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr14	75078041	.	G	T	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.859;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.06;ReadPosRankSum=-1.239;SOR=0.459;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr14	75078045	.	G	A	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.665;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.06;ReadPosRankSum=-0.874;SOR=0.459;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr14	75078687	.	G	A	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.489;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.60;ReadPosRankSum=-0.921;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr14	75078690	.	G	A	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.60;ReadPosRankSum=-0.921;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr14	75137664	rs2302832	T	C	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=443;ReadPosRankSum=-0.457;SC=ACTCTCCACATTCCCTCTATT;SOR=0.773;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=47;TCF=8;TCR=39;TR=21;WE=75137672;WS=75137654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr14	75139936	rs11844127	C	G	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=0.015;SC=TAAAGAAAAACAAAGAAATTA;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=75139944;WS=75139926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr14	75151047	rs9671386	G	A	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=428;SC=AGTTCCTGGAGGGAGTTGAAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=75151055;WS=75151037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	75159007	rs2270424	G	A	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.893;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=386;ReadPosRankSum=-0.222;SC=GGGTGCAATCGACTGCCAAAG;SOR=1.688;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=2;TCR=47;TR=19;WE=75159015;WS=75158997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr14	75179734	rs2270425	C	G	1171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.666;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=8;PP=939;ReadPosRankSum=-0.132;SC=CTCCCACCAACAGACCCCAGA;SOR=2.041;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=117;TCF=84;TCR=33;TR=49;WE=75179742;WS=75179724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,48:0.42:115
chr14	75182937	rs2287400	G	A	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=242;ReadPosRankSum=-0.032;SC=CACCATAGCAGTGACCATGTT;SOR=0.776;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=12;WE=75182945;WS=75182927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr14	75200653	rs3784021	C	T	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=684;ReadPosRankSum=1.570;SC=ATTGTTATAGCCTGCCCTTCG;SOR=0.651;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=43;TCR=14;TR=33;WE=75200661;WS=75200643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,34:0.59:58
chr14	75200697	rs3825708	G	A	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.739;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=926;ReadPosRankSum=-0.051;SC=TTCTCAGACTGGTCAGTCGTT;SOR=0.454;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=88;TCF=49;TCR=39;TR=49;WE=75200705;WS=75200687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,53:0.57:93
chr14	75276079	rs957345	C	G	1527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=13;PP=1267;SC=ATTCTGTTCTCTAGCCTCCAG;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=46;WE=75276087;WS=75276069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr14	75278302	rs8022046	G	A	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=5;PP=835;SC=TTGCTGAAGCGCTTCCTATTA;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=75278310;WS=75278292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	75279395	rs2302834	T	A	2323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=13;PP=1998;SC=GCCACCAGCCTCCTCCAGCTC;SOR=2.964;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=59;TCR=13;TR=72;WE=75279403;WS=75279385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr14	75282873	rs5809679	AT	A	495.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;QD=19.83;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	75349432	rs8007114	T	C	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.741;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=127;ReadPosRankSum=-0.063;SC=AAAGACAGTTTGGTTCAGAGA;SOR=1.584;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=11;WE=75349440;WS=75349422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr14	75355767	rs57898381	TA	T	309.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=376;ReadPosRankSum=0.124;SC=GTTCGCCTGTTAAAAGGAGTT;SOR=0.299;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=12;WE=75355775;WS=75355757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr14	75359670	rs2230237	G	A	1874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.319;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=34;PP=1366;ReadPosRankSum=1.227;SC=CGCCCTCACAGCCTCCTTCTG;SOR=0.845;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=140;TCF=75;TCR=65;TR=75;WE=75359678;WS=75359660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,78:0.54:144
chr14	75359757	rs58288168	ACT	A	1280.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.341;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=1083;ReadPosRankSum=0.315;SC=CAAAGGGTAAACTCTAGACTG;SOR=0.412;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=60;TCF=6;TCR=54;TR=25;WE=75359766;WS=75359747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr14	75361177	rs2070599	C	G	1793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.652;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=55;PP=1374;ReadPosRankSum=-1.148;SC=ACTTGCCCCACTCCTTATCTA;SOR=0.356;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=167;TCF=41;TCR=126;TR=78;WE=75361185;WS=75361167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,76:0.46:167
chr14	75367740	rs1799900	G	A	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=143;ReadPosRankSum=0.690;SC=GGGTTGGCTTGATATTTCAAT;SOR=0.593;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=9;WE=75367748;WS=75367730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr14	75373210	rs74064442	G	A	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.764;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=437;ReadPosRankSum=0.277;SC=TGCACGAACAGCTTCTGGTGG;SOR=1.142;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=22;WE=75373218;WS=75373200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr14	75373475	rs10134885	T	C	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.948;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=137;ReadPosRankSum=0.430;SC=GATGGGTAGATGGTTCAAGCT;SOR=0.207;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=10;WE=75373483;WS=75373465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr14	75376013	rs60635665	A	C	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.183;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=199;ReadPosRankSum=1.894;SC=CTGGGCAGAAACTCGGCAGGG;SOR=0.105;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=11;WE=75376021;WS=75376003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr14	75376036	rs10131976	C	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=78;ReadPosRankSum=0.998;SC=ACAGCACCCTCCACAGAGGCA;SOR=0.169;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=75376044;WS=75376026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr14	75378296	rs3081755	GTGTGTA	G	1118.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=1;PP=1192;SC=ATGTGTGTTTGTGTGTATGTG;SOR=4.255;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=21;WE=75378309;WS=75378286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	75378331	rs759057	T	C	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=10;PP=1122;SC=TGTGTGTGTGTGCATGCATGT;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=42;WE=75378339;WS=75378321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr14	75386576	rs2286913	G	A	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.809;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=212;ReadPosRankSum=0.275;SC=ACTGCTCAGCGGCCGCTGCAG;SOR=0.126;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=14;WE=75386584;WS=75386566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr14	75388183	rs7156590	C	T	1380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.695;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=40;PP=1045;ReadPosRankSum=-0.694;SC=GGACCGTGCTCGTGAGCAAGG;SOR=0.894;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=109;TCF=31;TCR=78;TR=54;WE=75388191;WS=75388173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,57:0.52:110
chr14	75412908	rs8005277	A	G	1281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=4;PP=1080;SC=GGGACCCCGCACACTCACAGG;SOR=4.317;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=45;WE=75412916;WS=75412898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr14	75415194	rs2159907	G	C	1397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=10;PP=1085;SC=CTACCCACCCGACCCCGGAGA;SOR=2.461;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=42;WE=75415202;WS=75415184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr14	75470446	rs175041	C	A	2070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=46;PP=1696;SC=GTCACAGGCACATAAGGGAAC;SOR=1.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=16;TCR=46;TR=62;WE=75470454;WS=75470436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr14	75483812	rs13712	T	C	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.212;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=616;ReadPosRankSum=-2.066;SC=GAGGCATGGATTGCTGCAGGC;SOR=1.123;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=72;TCF=46;TCR=26;TR=30;WE=75483820;WS=75483802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
chr14	75485406	rs175052	G	A	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=418;SC=GAAACTTCCAGTGCAGATTTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=75485414;WS=75485396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	75485489	rs175053	A	G	1746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=7;PP=1515;SC=AGAAAGAGAAAATAAACTTTG;SOR=3.486;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=51;WE=75485497;WS=75485479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr14	75489632	rs175057	C	T	2239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=23;PP=1771;ReadPosRankSum=-0.426;SC=GAAAAGAAAACGGAACAACGA;SOR=0.704;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=192;TCF=141;TCR=51;TR=86;WE=75489640;WS=75489622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,89:0.45:199
chr14	75497130	rs175070	C	A	896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=0;PP=761;SC=CCTGGCACACCGCAGGTAAAT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=26;WE=75497138;WS=75497120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	75505008	rs3742780	G	C	1522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=3.271;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.60;ReadPosRankSum=-0.093;SOR=0.385;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,60:0.54:112
chr14	75505016	rs175075	A	G	4767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.08;SOR=2.381;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr14	75506549	rs145063005	CATATATATATATATAT	C	1435.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.322;NF=20;NR=0;PP=824;SC=AGAGTTAGGCCATATATATAT;SOR=2.613;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=20;WE=75506574;WS=75506539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,39:0.95:41
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chr14	75513883	rs175081	T	C	5192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=87;NR=61;PP=2965;SC=TTCTCTGAGTTAAGGATGTGG;SOR=1.114;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=87;TCR=61;TR=148;WE=75513891;WS=75513873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr14	75515761	.	G	C	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.217;ClippingRankSum=0.000;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.765;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=15;PP=784;ReadPosRankSum=1.458;SC=TTAGGGAGCTGAAGAACCATG;SOR=0.467;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=94;TCF=59;TCR=35;TR=36;WE=75515769;WS=75515751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,36:0.37:98
chr14	75528580	rs10129657	G	A	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.085;NF=0;NR=5;PP=90;ReadPosRankSum=0.819;SC=CAAGGTGGGCGGATCACCTGA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=75528588;WS=75528570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr14	75535927	rs175499	G	A	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.704;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=236;ReadPosRankSum=-1.039;SC=GGCCCGCCCAGCGCAGCCGAG;SOR=0.239;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=49;TCF=13;TCR=36;TR=17;WE=75535935;WS=75535917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,19:0.38:50
chr14	75537381	rs11546525	C	T	2059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=39;PP=1594;ReadPosRankSum=-0.613;SC=AAGACTCTTACGAACAAGGTG;SOR=0.689;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=77;TCR=74;TR=78;WE=75537389;WS=75537371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,80:0.52:154
chr14	75538217	rs3742778	G	T	2592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.102;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=62;PP=1970;ReadPosRankSum=-0.577;SC=CAAAATTCAGGTCCATTCCAG;SOR=1.097;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=193;TCF=73;TCR=120;TR=94;WE=75538225;WS=75538207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,99:0.50:200
chr14	75544101	rs12589815	C	T	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=200;ReadPosRankSum=0.531;SC=AGTCAGTTACCGCTGTTGCTC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=10;WE=75544109;WS=75544091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr14	75544189	rs12589876	G	A	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=219;ReadPosRankSum=-0.472;SC=ACTCAGGAAGGAGATAGGTGC;SOR=0.560;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=15;WE=75544197;WS=75544179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr14	75551254	rs175487	C	T	2106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=13;PP=1657;SC=GGGGGCTCTACAGGCTCAGGA;SOR=2.483;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=51;TCR=13;TR=64;WE=75551262;WS=75551244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr14	75551442	rs175486	A	C	3364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=72;PP=2616;SC=CTAGTCACAGAAGTAGTTCAG;SOR=1.947;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=26;TCR=72;TR=98;WE=75551450;WS=75551432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr14	75553655	rs175485	T	C	1030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=1;PP=888;SC=TTCAGTACTTTGTGTTTTGTT;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=75553663;WS=75553645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	75572559	rs119077	T	C	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=620;SC=CGGAAATAAATACCTTGATAC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=75572567;WS=75572549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	75574087	rs10146482	C	T	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.657;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=20;PP=654;ReadPosRankSum=-1.213;SC=TGACACCTGACGGATAGCTTT;SOR=0.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=49;TCR=46;TR=41;WE=75574095;WS=75574077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,43:0.45:95
chr14	75580152	rs175464	G	A	1668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=42;PP=1359;SC=GGAAATGGGCGACATCGGATC;SOR=3.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=6;TCR=42;TR=48;WE=75580160;WS=75580142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr14	75587351	rs175454	T	C	900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.64;SOR=6.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	75590822	rs8017642	G	A	1735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.755;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=18;PP=1406;ReadPosRankSum=-0.446;SC=TAATGTTGTCGTGCTGCAGCA;SOR=1.008;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=72;TCR=30;TR=62;WE=75590830;WS=75590812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,64:0.59:108
chr14	75590846	rs175449	A	T	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=14;PP=815;ReadPosRankSum=0.540;SC=CCAGAATAACAATCTCATTCA;SOR=0.680;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=81;TCR=40;TR=42;WE=75590854;WS=75590836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,45:0.36:126
chr14	75601737	rs12435391	A	G	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.235;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=21;PP=663;ReadPosRankSum=-0.119;SC=CATTGTAAACATAATGAAGTG;SOR=0.369;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=81;TCF=34;TCR=47;TR=39;WE=75601745;WS=75601727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,40:0.48:83
chr14	75601782	rs175444	G	C	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.681;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=33;PP=867;ReadPosRankSum=0.281;SC=GGCAGGGGAGGTGGGTAAAGG;SOR=1.184;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=74;TCF=12;TCR=62;TR=38;WE=75601790;WS=75601772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,39:0.51:76
chr14	75601862	rs876402	A	G	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=201;ReadPosRankSum=0.379;SC=TTTTAAGTTCATTATCCTGGC;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=11;WE=75601870;WS=75601852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr14	75605792	rs1047418	A	G	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=10;PP=475;ReadPosRankSum=-0.232;SC=TGGTTCCTCAATTCCCACATT;SOR=0.809;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=61;TCF=38;TCR=23;TR=27;WE=75605800;WS=75605782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,27:0.44:62
chr14	75705656	rs72719908	G	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.032;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=150;ReadPosRankSum=-0.313;SC=TGGGCTTCCCGTCACTGGCAG;SOR=1.938;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=11;WE=75705664;WS=75705646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr14	75705863	rs55641408	C	T	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.937;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=683;ReadPosRankSum=-1.152;SC=GCTGAACAGGCACCTTAGAGA;SOR=0.507;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=79;TCF=22;TCR=57;TR=34;WE=75705871;WS=75705853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,37:0.44:84
chr14	75735859	rs4903300	G	A	2109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.311;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=31;PP=1550;ReadPosRankSum=-0.012;SC=AGTACTAGTAGCAAAGGAACT;SOR=0.546;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=148;TCF=92;TCR=56;TR=80;WE=75735867;WS=75735849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,84:0.54:157
chr14	75745551	rs2239615	T	A	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=424;ReadPosRankSum=1.217;SC=GCAGCGAGCATCTGAGAAGCC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=20;WE=75745559;WS=75745541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr14	75745626	rs7101	C	T	1468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=11;PP=1088;ReadPosRankSum=0.965;SC=CAGCTCTGCTCCACAGCGCCC;SOR=0.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=93;TCR=23;TR=56;WE=75745634;WS=75745616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,58:0.48:120
chr14	75746690	rs1046117	C	T	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=21;PP=820;ReadPosRankSum=1.879;SC=TCGTCTCCTCCGTGGCCCCAT;SOR=0.610;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=36;TCR=38;TR=41;WE=75746698;WS=75746680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,38:0.54:71
chr14	75747407	rs3216792	AG	A	2239.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.425;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.558;NF=33;NR=35;PP=2198;ReadPosRankSum=-0.470;SC=TTAAAACTTAAGGGGAAAGTT;SOR=0.660;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=166;TCF=70;TCR=96;TR=68;WE=75747415;WS=75747397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,82:0.46:180
chr14	75758770	rs3742770	G	A	2212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=18;PP=1641;ReadPosRankSum=0.875;SC=GAACCACTCCGGCTCTGGCCA;SOR=1.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=68;TCF=49;TCR=19;TR=66;WE=75758778;WS=75758760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
chr14	75758885	rs3742769	A	G	2856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=47;SC=AAGTTTGAGCATCCCTTGCTC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=47;TCR=47;TR=94;WE=75758893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr14	75759060	rs3742768	C	T	2885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=52;PP=2256;SC=ATTATCCATACGGGCCTGCTG;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=40;TCR=52;TR=92;WE=75759068;WS=75759050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr14	75760855	rs3742767	G	C	2806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=35;PP=2191;SC=TTGCTCCAGGGCAGGTCGCAG;SOR=1.371;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=60;TCR=35;TR=95;WE=75760863;WS=75760845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr14	75989286	rs175722	G	T	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=15;PP=539;SC=CACCCATTCTGCCAAAGCCCC;SOR=4.294;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=75989294;WS=75989276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	76045193	rs148092740	GTC	G	1510.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.752;NF=36;NR=0;PP=1489;ReadPosRankSum=1.061;SC=GCAGCCTCTAGTCTCTGTTTC;SOR=1.532;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=60;TCR=1;TR=36;WE=76045202;WS=76045183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,39:0.66:59
chr14	76045220	rs11845734	T	C	886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.644;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=4;PP=702;ReadPosRankSum=-2.417;SC=AATAGGCAAGTGTCCTTTCAA;SOR=0.233;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=88;TCF=81;TCR=7;TR=36;WE=76045228;WS=76045210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,35:0.40:87
chr14	76045362	rs2287015	T	C	4246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=410;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=69;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.021;SC=GACACCCCTGTGCCGGAGTCC;SOR=0.727;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=396;TCF=241;TCR=155;TR=178;WE=76045370;WS=76045352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:224,183:0.45:407
chr14	76045691	rs8011292	C	T	1948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.864;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=33;PP=1410;ReadPosRankSum=1.743;SC=CATTGACTGGCTGTCCATGTG;SOR=0.782;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=142;TCF=72;TCR=70;TR=73;WE=76045699;WS=76045681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,77:0.52:148
chr14	76045858	rs2287016	G	A	1879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.062;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=34;PP=1511;ReadPosRankSum=-1.581;SC=CGGTCACCGTGGTGGGCCAGC;SOR=0.531;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=144;TCF=76;TCR=68;TR=68;WE=76045866;WS=76045848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,71:0.48:147
chr14	76045963	rs2287017	C	G	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=42;PP=1200;ReadPosRankSum=1.512;SC=CAGCCTGCTCCGTGGCTGTCT;SOR=0.716;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=134;TCF=44;TCR=90;TR=61;WE=76045971;WS=76045953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,61:0.44:138
chr14	76046104	rs2287018	A	G	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=128;ReadPosRankSum=-0.652;SC=GGGTGACAGTAACTGGGTGTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=7;WE=76046112;WS=76046094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr14	76091197	rs117232115	T	G	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.229;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=81;ReadPosRankSum=1.038;SC=CAAATGTGCATGTAAAGCTGT;SOR=0.039;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=6;WE=76091205;WS=76091187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr14	76129287	rs2302592	C	G	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=578;ReadPosRankSum=0.728;SC=AGGTTGAGCACTGTTTAGGAA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=24;WE=76129295;WS=76129277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
chr14	76149830	rs1477464	T	C	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.066;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=716;ReadPosRankSum=0.248;SC=CTGCCATTGCTTTTCCTGGAG;SOR=0.037;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=29;WE=76149838;WS=76149820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,31:0.67:46
chr14	76156609	rs2303345	C	T	2068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.537;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=42;PP=1550;ReadPosRankSum=-0.313;SC=GGATTCAAGGCTTTTCACATC;SOR=0.773;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=184;TCF=90;TCR=94;TR=81;WE=76156617;WS=76156599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,85:0.45:189
chr14	76173860	rs1005224	T	A	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=136;ReadPosRankSum=-0.052;SC=TCATGTGGAGTGTAGGAATGT;SOR=0.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=7;WE=76173868;WS=76173858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr14	76175565	rs1981898	C	A	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-5.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.987;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=35;PP=830;ReadPosRankSum=-1.428;SC=TAAAAGAAGGCTACCTATTTA;SOR=0.849;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=85;TCF=18;TCR=67;TR=44;WE=76175573;WS=76175555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,45:0.53:85
chr14	76175594	rs1981899	G	A	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=483;ReadPosRankSum=-1.503;SC=TGCTTTGACAGATATTATTGT;SOR=0.616;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=4;TCR=47;TR=24;WE=76175602;WS=76175584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr14	76175666	rs8007792	C	A	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.424;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=126;ReadPosRankSum=0.320;SC=GTTTTTTTCACATGTATCCTA;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=76175674;WS=76175656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr14	76186376	rs2241442	A	G	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=261;ReadPosRankSum=-1.299;SC=GGTCTGAAAGACATAACTTTT;SOR=1.911;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=12;WE=76186384;WS=76186366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr14	76198818	rs5809726	CT	C	581.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=1.446;QD=8.55;ReadPosRankSum=0.945;SOR=1.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
chr14	76201482	rs2288141	G	T	1638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.552;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=15;PP=1283;ReadPosRankSum=0.180;SC=GGTGCAGCCAGACCTGCTAAT;SOR=1.033;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=126;TCF=92;TCR=34;TR=63;WE=76201490;WS=76201472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,64:0.50:128
chr14	76203747	rs967889	A	T	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=0;PP=725;SC=GTGTGAAAGAAAATAAATGTT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=76203755;WS=76203737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr14	76238203	rs45480992	G	C	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.794;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=461;ReadPosRankSum=0.551;SC=AGATGGTAAGGCTTTTCTTAC;SOR=1.300;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=75;TCF=27;TCR=48;TR=27;WE=76238211;WS=76238193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,28:0.36:77
chr14	76238254	rs57636956	AT	A	329.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.70;ReadPosRankSum=0.661;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,19:0.90:21
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chr14	76286253	.	G	A	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.722;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.899;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=306;ReadPosRankSum=0.507;SC=AGAGGGGTCAGCATCTGTTGG;SOR=0.063;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=15;WE=76286261;WS=76286243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,17:0.46:37
chr14	76287061	rs12206	T	C	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.053;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=535;ReadPosRankSum=0.506;SC=ACGTAGCTTCTGGCAATAATG;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=69;TCF=26;TCR=43;TR=33;WE=76287069;WS=76287051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr14	76352929	rs1882827	C	T	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=193;ReadPosRankSum=1.821;SC=AGCTAAATCTCATTTGTCAGT;SOR=0.076;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=10;WE=76352937;WS=76352921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr14	76370358	rs8015239	A	C	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.210;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=157;ReadPosRankSum=-0.129;SC=CGCTATAACTACTGTAACTAC;SOR=0.080;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=9;WE=76370366;WS=76370348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr14	76429868	rs3917200	A	G	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=408;ReadPosRankSum=0.343;SC=TCCTGTCTGAAGAGAGCAGAG;SOR=0.665;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=19;WE=76429876;WS=76429858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr14	76432117	rs3917188	GC	G	1105.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.483;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.913;NF=3;NR=29;PP=1126;ReadPosRankSum=0.271;SC=GCAAGGGTGAGCCAGGGCCTC;SOR=0.217;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=57;TCF=4;TCR=53;TR=32;WE=76432125;WS=76432107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,36:0.56:64
chr14	76432136	rs3917187	T	C	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=364;ReadPosRankSum=0.722;SC=TCTGCTCCTATAGGGACTCAT;SOR=1.214;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=18;WE=76432144;WS=76432126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr14	76488551	rs2058941	A	G	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=443;SC=CTGAGGTCGCACCACTGCACT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=76488559;WS=76488541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	76524970	rs59989662	CT	C	423.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=2.758;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.73;ReadPosRankSum=0.542;SOR=0.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,26:0.41:63
chr14	76525515	rs2302856	A	C	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=100;ReadPosRankSum=0.011;SC=CGGCACACCCAGTGGCCTAAT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=6;WE=76525523;WS=76525505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr14	76525553	rs2302857	A	G	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=348;ReadPosRankSum=0.799;SC=ACAGAGAAAAACAGGTTCAGG;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=16;WE=76525561;WS=76525543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr14	76542856	rs7140892	A	G	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.258;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=299;ReadPosRankSum=1.591;SC=AGTTAGATTTATACTCCAGGT;SOR=0.278;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=16;WE=76542864;WS=76542846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr14	76543004	rs17783366	G	A	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=20;PP=843;ReadPosRankSum=1.227;SC=GCATCACAGAGATTTGGGGCT;SOR=0.662;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=101;TCF=52;TCR=49;TR=43;WE=76543012;WS=76542994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,50:0.45:111
chr14	76549377	rs7161722	G	A	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=2;PP=318;SC=CCCAGCATGTGGGAAGCATAG;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=76549385;WS=76549367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	76618948	.	C	G	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.542;ClippingRankSum=0.000;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.443;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=2;PP=857;ReadPosRankSum=-0.607;SC=GCCGGGTCCTCTCGAGAGTGT;SOR=0.198;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=95;TCF=93;TCR=2;TR=39;WE=76618956;WS=76618938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,41:0.42:98
chr14	76638466	rs3783997	A	G	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=286;ReadPosRankSum=-0.053;SC=CACATTAACTATCTGAATTTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=14;WE=76638474;WS=76638456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr14	76644623	rs2121069	G	A	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.541;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=440;ReadPosRankSum=-0.597;SC=AGAATCCTGCGTTGAGAAGTA;SOR=0.264;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=53;TCF=32;TCR=21;TR=25;WE=76644631;WS=76644613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr14	76662446	rs1900127	C	T	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.850;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=457;ReadPosRankSum=0.807;SC=CATGGGAAAACTGAGACTACA;SOR=0.235;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=20;WE=76662454;WS=76662436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr14	76906157	rs12432875	T	C	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=239;ReadPosRankSum=0.276;SC=CCTGCGGGTCTGGCAGAAGCC;SOR=0.458;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=16;WE=76906165;WS=76906147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr14	76957745	rs2361292	G	C	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=6;PP=410;SC=CCCCTGGTCCGCCCTCCTGAC;SOR=1.244;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=14;WE=76957753;WS=76957735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr14	77239567	rs2075772	A	G	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=31;PP=960;ReadPosRankSum=0.325;SC=ATCCTTCCTCACCTGAAGGGG;SOR=0.749;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=102;TCF=42;TCR=60;TR=52;WE=77239575;WS=77239557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,53:0.52:102
chr14	77279064	rs8008004	A	G	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=1;PP=645;SC=CGCAGAGGCGAGCCCTGGCCG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=77279072;WS=77279054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	77294950	rs2142189	C	T	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=690;ReadPosRankSum=-1.767;SC=GGGAGAGCAGCTGCAGCTTCC;SOR=0.845;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=57;TCF=24;TCR=33;TR=34;WE=77294958;WS=77294940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,35:0.60:58
chr14	77295192	rs2067007	G	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.770;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;ReadPosRankSum=1.787;SC=TGCCCAGCACGTTGGCTGATC;SOR=0.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=11;WE=77295200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr14	77302449	rs3742752	A	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=44;ReadPosRankSum=-0.797;SC=CCTAGCCTGCATCTCCACGCC;SOR=0.088;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=6;WE=77302457;WS=77302439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr14	77305508	rs11628619	T	C	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=80;ReadPosRankSum=-0.967;SC=TGTACATGTATCTTTTAGGCA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=77305516;WS=77305498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr14	77305833	rs12893724	C	T	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=15;PP=453;SC=AATTATATTACCTCAGATGGT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=77305841;WS=77305823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	77311296	rs12896621	A	G	1794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=43;PP=1354;SC=GGGAAGAATCACTTGGCAGAG;SOR=2.604;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=10;TCR=43;TR=53;WE=77311304;WS=77311286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr14	77311445	rs11620630	T	C	294.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=8;PP=247;SC=GGCAGAAGGATTGCTTGAGCC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=77311453;WS=77311435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	77319773	rs372697027	GGTGTGT	G	400.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=380;SC=AGCTGGAAAGGGTGTGTGTGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=10;WE=77319788;WS=77319763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr14	77327254	rs45536531	T	G	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=301;ReadPosRankSum=-1.563;SC=CCAAATCAGTTTCCAGACTTC;SOR=0.730;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=15;WE=77327262;WS=77327244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr14	77332367	rs1882844	C	T	1360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=1097;ReadPosRankSum=-0.817;SC=GCTTGAACCCCACTGGGACAA;SOR=0.446;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=43;WE=77332375;WS=77332357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr14	77332408	rs7160583	T	C	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.727;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=126;ReadPosRankSum=0.710;SC=TTCCAGAAAGTGATGATAGAG;SOR=0.336;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=46;TCF=20;TCR=26;TR=16;WE=77332416;WS=77332398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr14	77336428	rs11625243	G	A	1854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=28;PP=1374;SC=CCATGAGGCTGTACGGGTGCT;SOR=0.831;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=30;TCR=28;TR=58;WE=77336436;WS=77336418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	77492891	rs879027	G	A	3439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.008;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=65;PP=2704;ReadPosRankSum=0.082;SC=GCTTCAATTCGTAGTCCATGC;SOR=0.578;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=261;TCF=125;TCR=136;TR=132;WE=77492899;WS=77492881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,135:0.49:274
chr14	77493647	rs61991619	A	G	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.400;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=68;ReadPosRankSum=1.973;SC=GTTCCACCGCAGCGGCGGCGG;SOR=0.595;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=9;WE=77493655;WS=77493634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr14	77493761	rs200317113	TTGCTGC	T	285.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.757;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.736;NF=2;NR=16;PP=892;ReadPosRankSum=0.891;SC=TGAGCTGTTGTTGCTGCTGCT;SOR=2.093;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=18;WE=77493774;WS=77493751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr14	77493788	rs28692724	C	T	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.866;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.92;MQRankSum=-0.605;QD=5.90;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr14	77493791	rs377151545	CTGT	C	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.06;MQRankSum=-0.605;QD=5.14;ReadPosRankSum=0.524;SOR=0.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr14	77493875	rs71428775	T	C	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=367;ReadPosRankSum=-0.100;SC=CCGCCGCCGCTTCCTTAGCCG;SOR=0.346;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=18;WE=77493883;WS=77493865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr14	77600344	rs7141511	G	T	971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=26;PP=892;SC=CCAGGCCACCGGCATAACTGC;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=77600352;WS=77600334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr14	77686303	rs2287377	A	C	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=7;PP=1073;SC=GCAGCTGAGAACTTTTCTCTC;SOR=3.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=43;WE=77686311;WS=77686293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr14	77691963	.	G	A	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.925;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=113;ReadPosRankSum=-0.183;SC=ATGCTTTCCTGGGGTACAGTT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=7;WE=77691971;WS=77691953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr14	77697967	rs375566	A	G	2803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=59;NR=33;PP=2152;SC=GGGACGACGCACGCATCTACA;SOR=1.378;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=59;TCR=33;TR=92;WE=77697975;WS=77697957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr14	77699933	rs17750404	C	T	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=25;PP=831;SC=ACATGGGCAGCGTTTTGCTGA;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=77699941;WS=77699923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	77703057	rs403291	A	G	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=25;PP=941;SC=TGGGGTTTGCACCCAGGAATA;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=41;WE=77703065;WS=77703047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr14	77704974	rs8010477	G	C	3355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=15;PP=2685;SC=CCAAAAGACTGAGGTGTCTGG;SOR=3.000;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=79;TCR=15;TR=94;WE=77704982;WS=77704964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr14	77705726	rs4899646	C	T	2475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=13;PP=1872;SC=CCCCACAGGCCGACTCAGCAC;SOR=2.925;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=57;TCR=13;TR=70;WE=77705734;WS=77705716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr14	77705764	rs17750422	T	C	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.065;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=904;ReadPosRankSum=0.586;SC=GCGAGGCCTATCCAGGCAGTG;SOR=0.349;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=104;TCF=74;TCR=30;TR=48;WE=77705772;WS=77705754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,53:0.46:114
chr14	77709120	rs2287380	A	G	1297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=0;PP=1059;SC=GTTGCATGCAAGTCTGGGCCC;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=35;WE=77709128;WS=77709110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	77709450	rs409109	T	G	564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=475;SC=GATCAAGGAATAATTCAGGCG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=77709458;WS=77709440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	77733117	rs28909968	CT	C	446.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.189;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.149;NF=1;NR=20;PP=547;ReadPosRankSum=0.849;SC=GCTCCTGGGCCTTTTTTCCTC;SOR=1.802;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=21;WE=77733125;WS=77733107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr14	77743644	rs1055592	G	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=109;ReadPosRankSum=0.339;SC=CCTCATGGCCGGATGGTCCAG;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=7;WE=77743652;WS=77743634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr14	77745193	rs3209079	A	C	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.697;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=966;ReadPosRankSum=0.602;SC=CGCCTCCTCGAAGCAGGACCT;SOR=0.348;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=103;TCF=43;TCR=60;TR=45;WE=77745201;WS=77745183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,49:0.46:107
chr14	77745376	rs61990291	G	A	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=336;ReadPosRankSum=0.129;SC=AGCAGCTGGGGCTCGAGAGCT;SOR=0.765;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=17;WE=77745384;WS=77745366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr14	77746310	rs438931	G	A	1970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.696;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=43;PP=1335;ReadPosRankSum=0.859;SC=GAACGCAGCCGCTCTCCACGG;SOR=0.516;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=154;TCF=61;TCR=93;TR=76;WE=77746318;WS=77746300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,86:0.49:175
chr14	77746847	rs71413457	C	G	846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.297;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=743;ReadPosRankSum=0.563;SC=AGACAGAGATCTAGAGGGCTG;SOR=1.136;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=71;TCF=24;TCR=47;TR=36;WE=77746855;WS=77746837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,35:0.47:75
chr14	77746903	rs150492717	G	A	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=488;ReadPosRankSum=1.497;SC=GCCAAGCGCCGAGCAGAACCT;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=21;WE=77746911;WS=77746893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr14	77751925	rs2270419	C	T	2241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.732;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=30;PP=1754;ReadPosRankSum=1.341;SC=TTCCAAATTTCCTGTTTACGA;SOR=1.115;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=155;TCF=94;TCR=61;TR=85;WE=77751933;WS=77751915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,89:0.55:163
chr14	77766025	rs2287389	G	A	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.27;ReadPosRankSum=-0.643;SOR=0.297;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr14	77766025	.	GGA	AGG	443	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=30;MQ=60.0;NF=0;NR=8;PP=443;QD=62.0584843578;SC=ATGGCCAAGAGGAGAGAGAAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=8;WE=77766035;WS=77766015;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,8:0.35:23
chr14	77766027	rs2287390	A	G	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.76;ReadPosRankSum=-0.715;SOR=0.350;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr14	77767382	rs2287392	A	G	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=461;ReadPosRankSum=-0.378;SC=GCTCCTACTCAGCAACATCAG;SOR=0.368;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=24;WE=77767390;WS=77767372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr14	77787695	rs8177537	G	T	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.186;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=15;PP=481;ReadPosRankSum=0.957;SC=TGCCCGCTGGGGCTCGAAGTT;SOR=0.826;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=45;TCF=22;TCR=23;TR=27;WE=77787703;WS=77787685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,29:0.63:46
chr14	77796641	rs731346	G	A	2904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=46;PP=2204;SC=AACCCACCGGGACCTCTTTCA;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=95;TCF=48;TCR=47;TR=94;WE=77796649;WS=77796631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr14	77843363	rs10141114	A	G	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=9;PP=371;SC=GGGCTCCAGGAGCCCGGCCCC;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=17;WE=77843371;WS=77843353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	77843814	rs11844594	T	C	1946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=19;PP=1563;SC=GATGGAGAGCTGGAGCCTGAG;SOR=1.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=61;WE=77843822;WS=77843804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr14	77843971	rs45540040	C	T	4513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=51;PP=2965;SC=GGGAGCCAGACAGTGCTAAGA;SOR=1.390;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=88;TCR=51;TR=139;WE=77843979;WS=77843961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr14	77844265	rs45527334	G	A	3972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=84;PP=2965;SC=CGGAAACCATGTCTGAGGTTT;SOR=1.647;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=41;TCR=84;TR=125;WE=77844273;WS=77844255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr14	77844592	rs10133824	T	A	3163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=41;PP=2543;SC=AGGAGGCAGGTCTAGAGCCTC;SOR=0.914;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=53;TCR=41;TR=94;WE=77844600;WS=77844582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr14	77844869	rs4903576	A	G	7370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=128;NR=95;PP=2965;SC=GTCAAATGAGAAAAAAAATCC;SOR=1.044;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=223;TCF=128;TCR=95;TR=223;WE=77844877;WS=77844859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr14	77845121	rs2193595	A	G	5325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=117;PP=2965;SC=ACTAAGTGACAAATTTAGAAA;SOR=2.176;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=158;TCF=41;TCR=117;TR=158;WE=77845129;WS=77845111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr14	77872965	rs34176817	CACACACACACACAG	C	513.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.50;QD=36.70;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	77880305	rs10130481	C	T	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=362;SC=GAGTGGAGATCCGCAGGCTTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=77880313;WS=77880295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	77880524	.	CTTT	C	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=-0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=3.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQRankSum=0.084;QD=7.52;ReadPosRankSum=2.256;SOR=2.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
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chr14	77914674	rs10483882	T	C	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=1;PP=1187;SC=GCAACAGTAATGGAGAATCAG;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=40;WE=77914682;WS=77914664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	77916205	rs760252	T	C	1476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=38;PP=1114;SC=TATAGGAACTTAAGGCTTAAA;SOR=4.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=41;WE=77916213;WS=77916195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr14	77917412	rs11159260	A	G	114.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=60;SC=TGCCACCTCCAATGAGAATGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=77917420;WS=77917402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	77919587	rs2364158	T	C	4011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=23;PP=2965;SC=GTAGAGCCTTTATCAGTGATA;SOR=2.632;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=92;TCR=23;TR=115;WE=77919595;WS=77919577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr14	77923783	rs11845345	C	T	1993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=45;PP=1461;SC=GATCAAGATGCGGAGAGGCTG;SOR=1.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=18;TCR=45;TR=63;WE=77923791;WS=77923773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr14	77930752	rs11624314	G	A	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=306;SC=TGAACATACTGTATTCTATAG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=77930760;WS=77930742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	77930855	rs34099277	A	T	1036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=9;PP=703;SC=CTGTGGTAGGATGGCTGTGTT;SOR=1.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=77930863;WS=77930845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr14	77934587	rs3825694	T	C	1634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=32;PP=1196;SC=GTGACATTTCTCTTTTTCTGA;SOR=1.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=47;WE=77934595;WS=77934577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr14	77951124	rs3742728	C	T	3599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=87;PP=2961;SC=GGAGGGGTGGCGTTGCCTGGG;SOR=2.543;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=112;TCF=25;TCR=87;TR=111;WE=77951132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr14	77964500	rs11851856	C	T	910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=4;PP=719;SC=CAGTCTCAGGCTGGCCACCCC;SOR=3.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=77964508;WS=77964490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	77984573	rs926114	C	T	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=39;PP=1313;SC=TACAGAGGACCTGCTGTCCTC;SOR=2.655;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=10;TCR=39;TR=49;WE=77984581;WS=77984563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr14	78018614	rs2178876	C	T	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=18;PP=584;SC=TTGCATTCACCGGCAATGTCA;SOR=2.124;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=24;WE=78018622;WS=78018604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	78023519	rs2272587	C	G	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.954;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=29;PP=661;ReadPosRankSum=-1.387;SC=ACAGTTATACCGCATCTTCCT;SOR=1.270;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=65;TCF=9;TCR=56;TR=32;WE=78023527;WS=78023509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,35:0.51:68
chr14	78028803	rs2364602	A	G	2928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=35;PP=2373;SC=GTGATGCATGATTCAGTTCAT;SOR=1.166;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=49;TCR=35;TR=84;WE=78028811;WS=78028793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr14	78036899	rs11344772	AG	A	1219.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.639;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=39;PP=1564;ReadPosRankSum=1.003;SC=CCTGAATTTAAGAATTACTCA;SOR=1.443;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=79;TCF=4;TCR=75;TR=40;WE=78036907;WS=78036889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,42:0.51:83
chr14	78036935	rs4903606	A	G	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=492;ReadPosRankSum=-0.390;SC=AAATCATAGTATATGTGTTGT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=23;WE=78036943;WS=78036925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr14	78063440	rs12435993	A	C	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.357;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=190;ReadPosRankSum=-0.771;SC=ATGTGTACCCAAATTTCTGAG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=9;WE=78063448;WS=78063430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr14	78063823	rs34670650	AT	A	253.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=299;ReadPosRankSum=-0.142;SC=TACCTTAAGAATTTTCTAAGT;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=10;WE=78063831;WS=78063813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr14	78170896	rs8021036	C	G	1593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=37;PP=1212;SC=AACCTCCAAACACATTTCTTG;SOR=3.657;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=43;WE=78170904;WS=78170886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr14	78174473	rs11159286	A	C	1623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=15;PP=1323;SC=CTCAGCAGCGAGAGGTGCTGC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=50;WE=78174481;WS=78174463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr14	78176851	rs1076496	A	G	1248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=8;PP=1032;ReadPosRankSum=-0.976;SC=ACCGGGAAACACACTGGATTG;SOR=0.615;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=82;TCR=14;TR=56;WE=78176859;WS=78176841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,54:0.59:92
chr14	78183706	rs176959	C	T	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=187;ReadPosRankSum=0.380;SC=GAGGAGAAAACGAAAGAACAA;SOR=0.277;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=12;WE=78183714;WS=78183696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr14	78184566	rs176960	C	A	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.800;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=14;PP=1048;ReadPosRankSum=-0.004;SC=CCTCAAACTGCACTGGTCCTT;SOR=0.956;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=92;TCF=64;TCR=28;TR=50;WE=78184574;WS=78184556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,57:0.59:97
chr14	78187316	rs176965	A	C	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=93;ReadPosRankSum=-0.921;SC=GATGATACATAATCAAGCTGG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=78187324;WS=78187306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr14	78197365	rs114763	C	T	1326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=6.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=1.119;QD=21.75;ReadPosRankSum=-0.121;SOR=2.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr14	78197365	.	CTC	TTG	1719	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=30;MQ=59.92;NF=31;NR=0;PP=1719;QD=57.1763830601;SC=CAGCTCTTCTCTCCCTGGCTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=57;TCR=2;TR=31;WE=78197375;WS=78197355;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
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chr14	78353259	.	AC	A	458.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=1.440;QD=15.82;ReadPosRankSum=-0.219;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr14	78353261	.	ACACACACACAC	A	452.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=1.448;QD=14.15;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr14	78353368	rs17826188	T	C	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=852;ReadPosRankSum=-1.364;SC=CTGGCCCATCTTCCTGGCTCC;SOR=0.633;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=61;TCR=29;TR=43;WE=78353376;WS=78353358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,45:0.49:92
chr14	78365612	rs2287650	C	T	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.978;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=472;ReadPosRankSum=-1.479;SC=GTAGGTGGGACGATGCAATGC;SOR=1.333;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=48;TCF=21;TCR=27;TR=24;WE=78365620;WS=78365602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr14	78366933	rs3837641	G	GAAC	4100.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.742;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.378;NF=46;NR=32;PP=2805;ReadPosRankSum=-0.946;SC=GCGTCTCAAGGAACAACAACA;SOR=0.843;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=218;TCF=136;TCR=82;TR=78;WE=78366941;WS=78366923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,100:0.45:222
chr14	78366967	rs734654	A	G	4409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.767;NF=91;NR=74;PP=2962;ReadPosRankSum=0.577;SC=AATGGGACAGAAAGTTGTAAG;SOR=0.686;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=329;TCF=179;TCR=150;TR=165;WE=78366975;WS=78366957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,166:0.49:337
chr14	78374327	rs6574411	G	A	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=37;PP=949;ReadPosRankSum=-0.235;SC=TGCCCAGGAAGTGCCTGTGTG;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=10;TCR=62;TR=43;WE=78374335;WS=78374317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,43:0.60:72
chr14	78390631	rs150422608	TAAACTC	T	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=45;ReadPosRankSum=0.319;SC=TAAGAAATCTTAAACTCAAAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=2;WE=78390644;WS=78390621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr14	78390880	rs2302944	T	C	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=374;ReadPosRankSum=-0.674;SC=ACCCCGGCAATGTACTGGTGC;SOR=0.627;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=16;TCR=19;TR=21;WE=78390888;WS=78390870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr14	78392008	rs11850022	C	T	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=185;ReadPosRankSum=0.113;SC=AAGGCACAGTCCTCACCGTCG;SOR=0.169;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=10;WE=78392016;WS=78391998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr14	78744823	rs10134857	G	A	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=572;SC=GGGTGAAGGTGGAACTAAGTG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=78744831;WS=78744813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	78748366	rs10147289	C	T	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=504;ReadPosRankSum=-0.941;SC=TTTGAGTTTGCAGGGTTCCAA;SOR=0.693;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=26;WE=78748374;WS=78748356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr14	78748396	rs187150316	G	A	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.098;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=406;ReadPosRankSum=0.347;SC=GAGCTTAAAGGGTATCCTGTC;SOR=1.018;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=21;WE=78748404;WS=78748386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,24:0.42:57
chr14	78764047	rs58752879	C	T	1094.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.804;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=12;PP=920;ReadPosRankSum=1.350;SC=GCGTGCGGCCCCTGTCACTCC;SOR=0.783;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=112;TCF=83;TCR=29;TR=45;WE=78764055;WS=78764037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,44:0.39:114
chr14	78766814	rs4903742	A	G	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=2.402;SC=AAGCTTCCACATTGTATGTTT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=6;WE=78766822;WS=78766804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr14	78993191	.	TG	T	982.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.568;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=20;PP=1034;ReadPosRankSum=-1.269;SC=CTATGCTTCCTGATATCCAAG;SOR=1.148;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=27;WE=78993199;WS=78993181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr14	79181046	rs1465481	A	T	2547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=19;PP=1947;SC=TAGGTTTCTTACATTTGGTTA;SOR=2.215;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=58;TCR=19;TR=77;WE=79181054;WS=79181036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr14	79181226	rs1004212	C	T	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.227;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=29;PP=1296;ReadPosRankSum=-0.124;SC=TTCTCCCCACCGAGCTGTGGA;SOR=0.626;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=123;TCF=62;TCR=61;TR=62;WE=79181234;WS=79181216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,64:0.50:129
chr14	79276733	rs4133797	C	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=0.000;QD=7.57;ReadPosRankSum=-0.301;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr14	79454519	rs154325	G	C	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.966;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=296;ReadPosRankSum=-0.941;SC=GGAACTTTGTGAAGATGTTTG;SOR=0.241;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=16;WE=79454527;WS=79454509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr14	80290425	rs932265	A	G	100.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=4;PP=134;SC=CCCCAGCTTCAGGTGTTGTGT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=80290433;WS=80290415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	80993330	rs34838656	G	GA	512.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.151;NF=3;NR=15;PP=310;ReadPosRankSum=-0.723;SC=AGGAATCCTGGAAAAAAAAAA;SOR=1.255;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=18;WE=80993338;WS=80993320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
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chr14	80993775	.	A	T	81	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;FR=1.0000;HP=16;HapScore=4;MGOF=0;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=81;QD=57.8856062736;SC=GCTCTGTCTAAAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=80993783;WS=80993763;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,2:0.67:3
chr14	81025522	rs1530771	C	A	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.683;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=327;ReadPosRankSum=-2.340;SC=ATGTAGTTTTCGAAATGATTT;SOR=0.132;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=17;WE=81025530;WS=81025512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr14	81046810	rs71456210	A	AACGAGTT	447.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.919;NF=2;NR=5;PP=395;ReadPosRankSum=1.236;SC=ACAATGTAAAAACGAGTTGCC;SOR=1.022;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=7;WE=81046818;WS=81046800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr14	81251255	rs327463	T	C	1529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.387;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=21;PP=1243;ReadPosRankSum=-1.198;SC=AGTCCTGATATGATTCTCAGC;SOR=0.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=141;TCF=94;TCR=47;TR=65;WE=81251263;WS=81251245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,65:0.45:144
chr14	81259078	rs4523859	G	A	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=6.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.519;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=1;PP=638;ReadPosRankSum=-0.155;SC=ATTGAAAACCGTTCCTTAGGA;SOR=1.781;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=58;TCF=54;TCR=4;TR=29;WE=81259086;WS=81259068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr14	81297385	rs7156572	G	A	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=284;ReadPosRankSum=0.585;SC=TGCTCACACTGGAGTTCATAA;SOR=0.278;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=16;WE=81297393;WS=81297375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr14	81307218	rs7142753	T	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=81;ReadPosRankSum=-1.593;SC=TGGATATGAGTTACACAAAAT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=81307226;WS=81307208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr14	81360893	rs34375242	C	CA	33.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.59;ReadPosRankSum=-0.817;SOR=2.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr14	81360958	rs2288347	C	T	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.690;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=211;ReadPosRankSum=0.069;SC=ATTGGAAAGACGTTGTCTACT;SOR=1.445;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=14;WE=81360966;WS=81360948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr14	81362142	.	GA	AA	70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000,0.5010;HP=16;HapScore=4;MGOF=9;MMLQ=18;MQ=59.42;NF=0,2;NR=10,7;PP=70,63;QD=10.4771212547;SC=GACCTAGGAAGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=10,9;WE=81362150;WS=81362132;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr14	81362142	.	GA	GAA	70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000,0.5010;HP=16;HapScore=4;MGOF=9;MMLQ=18;MQ=59.42;NF=0,2;NR=10,7;PP=70,63;QD=10.4771212547;SC=GACCTAGGAAGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=10,9;WE=81362150;WS=81362132;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr14	81371088	rs8016507	A	G	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=2;PP=672;ReadPosRankSum=-1.373;SC=AAGTTCAAGCATTAGTCATTT;SOR=0.823;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=55;TCR=3;TR=37;WE=81371096;WS=81371078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,40:0.63:63
chr14	81422257	rs2239610	G	C	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.819;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=26;PP=591;ReadPosRankSum=-0.681;SC=GAGGTGGCCCGAAGTGCACAA;SOR=2.787;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=61;TCF=8;TCR=53;TR=27;WE=81422265;WS=81422247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,29:0.48:60
chr14	81528412	rs17111401	T	A	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=626;SC=GCTTTTTAATTATGTGTTTTT;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=81528420;WS=81528402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	81558806	rs2075176	C	T	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=3;PP=863;SC=AGTGCATATGCGCAGCAAGAC;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=32;WE=81558814;WS=81558796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	81558965	rs2241119	A	G	2132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=49;PP=1610;SC=GAGTATTACCAGTTCTACTCC;SOR=2.406;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=16;TCR=49;TR=65;WE=81558973;WS=81558955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr14	81562808	rs2075178	A	G	1161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=0;PP=1004;SC=ACTGAGAAATATTATCTTGTT;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=81562816;WS=81562798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr14	81562998	rs2075179	T	C	3717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=70;PP=2695;SC=TGTACAACAATGGCTTTACTT;SOR=1.044;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=124;TCF=54;TCR=70;TR=124;WE=81563006;WS=81562988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr14	81610583	rs1991517	G	C	5076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=66;PP=2965;SC=TTACCCACGAGATGAGGCAGG;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=85;TCR=66;TR=149;WE=81610591;WS=81610573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr14	81662372	.	T	TA	230.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.664;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.883;NF=9;NR=0;PP=332;ReadPosRankSum=-1.109;SC=TTTGTGCATATAAGGAGAGGG;SOR=0.350;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=9;WE=81662380;WS=81662362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr14	81667852	rs8019633	A	T	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=0;PP=861;SC=AACTTCAAGTAGTTAATATAG;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=81667860;WS=81667842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	81670558	rs8006015	A	G	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.671;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=41;ReadPosRankSum=0.401;SC=AAACTGATACAGACACAGAAA;SOR=2.110;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=6;WE=81670566;WS=81670548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr14	81686978	rs113271579	GA	G	135.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=174;ReadPosRankSum=2.235;SC=CAAGATTGGGGAAAAAATTTT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=8;WE=81686986;WS=81686968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr14	81728288	rs371330559	T	A	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.50;MQRankSum=-1.776;QD=4.51;ReadPosRankSum=-0.409;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr14	81743718	rs34323725	C	T	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.025;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=32;PP=1013;ReadPosRankSum=0.998;SC=CCCATGGAAACGGCACTCATG;SOR=1.246;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=101;TCF=39;TCR=62;TR=48;WE=81743726;WS=81743708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,50:0.49:103
chr14	81744736	rs3813535	A	G	1248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.169;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=25;PP=1013;ReadPosRankSum=0.172;SC=CTCCAAGGTGAAGCCTCAGTT;SOR=0.337;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=96;TCF=41;TCR=55;TR=49;WE=81744744;WS=81744726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,49:0.51:97
chr14	85995608	rs12590399	T	G	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.22;ReadPosRankSum=-0.062;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr14	85995614	rs12587861	G	A	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.22;ReadPosRankSum=0.076;SOR=0.293;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr14	86088056	rs10141266	T	C	3657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=44;PP=2670;SC=AGGGCGTAACTGTACTCTACC;SOR=1.304;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=71;TCR=44;TR=114;WE=86088064;WS=86088046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr14	88400367	rs45572135	T	G	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=593;ReadPosRankSum=0.763;SC=CACAGAGAGTTATAGTGGTTA;SOR=0.493;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=16;TCR=51;TR=28;WE=88400375;WS=88400357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,28:0.42:66
chr14	88400449	rs413750	T	C	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=26;PP=602;SC=TATCTATTACTGCAGAAATAG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=26;WE=88400457;WS=88400439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	88400486	rs1042029	A	G	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=13;PP=321;SC=TTAAAGAGGCATTTTTAAAAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=88400494;WS=88400476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	88401213	rs421262	T	C	2874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=70;PP=2193;SC=ATGCCAGAGGTGAAATGACCC;SOR=1.879;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=32;TCR=70;TR=102;WE=88401221;WS=88401203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr14	88406120	rs45626938	C	T	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.77;SOR=4.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	88406127	rs45567441	G	C	1098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.26;SOR=4.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	88406404	rs417276	T	C	262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=208;SC=GTGGGGTTCTTGAGTGGCATC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=88406412;WS=88406394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	88407716	rs34752717	T	TA	1387.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.67;QD=38.55;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	88407734	rs448805	G	C	2352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=56;NR=6;PP=1469;SC=AAAAAAGTCAGTTACCTAAAT;SOR=3.511;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=57;TCR=6;TR=62;WE=88407742;WS=88407724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr14	88407875	rs421466	T	A	3178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=71;PP=2586;SC=TCTCTATGTATACATCACACT;SOR=2.093;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=26;TCR=72;TR=97;WE=88407883;WS=88407865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr14	88407917	rs12432149	G	A	2274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=58;PP=1919;SC=AAAATAAAACGGTTGATTAGT;SOR=3.193;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=11;TCR=59;TR=69;WE=88407925;WS=88407907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr14	88411803	rs444902	T	C	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=1;PP=662;SC=GTTCTTGAAATAGGAGGACCA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=88411811;WS=88411793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	88411947	rs367327	T	C	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=26;PP=1070;SC=CGGCAGCCCATGTAATGGGTC;SOR=1.038;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=45;WE=88411955;WS=88411937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr14	88414283	rs398343	G	A	1409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=31;PP=1193;SC=CATGTGGACAGAATAGCTTTA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=46;WE=88414291;WS=88414273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr14	88416390	rs440426	A	G	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=17;PP=501;SC=CTATTTATCAAGAGAAACACC;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=88416398;WS=88416380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	88416441	rs451073	C	T	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=169;SC=TAGGAAAACACTGTTCAAGCA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=88416449;WS=88416431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	88417095	rs11300320	GA	G	1240.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=21;PP=638;SC=TTATGACTCTGAAAAAAAAAA;SOR=0.813;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=50;TCF=18;TCR=32;TR=37;WE=88417103;WS=88417085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr14	88417161	rs431748	C	T	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=41;PP=1224;SC=AAAAGTTCAACAGTTAATGCC;SOR=2.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=9;TCR=41;TR=50;WE=88417169;WS=88417151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr14	88417244	rs443019	C	T	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=221;SC=GACTTTTTTACAATATAATAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=88417252;WS=88417234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	88431898	rs12888666	C	T	2226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=31;PP=1755;SC=TCCATGGCTCCTGGGCCGTCA;SOR=0.844;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=36;TCR=31;TR=67;WE=88431906;WS=88431888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr14	88453186	rs2165567	A	G	221.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=182;SC=ACAACCTTCTATTACAAGCAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=88453194;WS=88453176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	88453278	rs2119702	T	G	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=3;PP=601;SC=TCTGTAGTTTTCAAATCCCCA;SOR=3.098;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=23;WE=88453286;WS=88453268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	88453424	rs2119703	G	A	643.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=11.648;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=477;ReadPosRankSum=-0.574;SC=GAGTTTTGAGGAAAAAAAAAG;SOR=3.596;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=28;WE=88453432;WS=88453412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,27:0.90:30
chr14	88454691	rs2245387	C	T	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=10;PP=419;SC=AAGTAATGTGCCATTTTTTCA;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=88454699;WS=88454681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	88454910	rs2289511	G	A	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=25;PP=776;SC=AAGAAATCCAGTCATGAATAT;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=88454918;WS=88454900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr14	88477413	rs6574978	C	T	4668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=60;PP=2965;SC=TTGATTATACCTGGAATAAAG;SOR=0.857;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=73;TCR=60;TR=133;WE=88477421;WS=88477403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr14	88651826	rs144490234	A	AAC	487.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=616;ReadPosRankSum=0.354;SC=GAATATTAAAAACACACACAC;SOR=0.724;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=47;TCF=21;TCR=26;TR=16;WE=88651835;WS=88651816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr14	88652389	rs3742692	C	T	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.762;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=563;ReadPosRankSum=1.835;SC=GGATGGTGGCCGCCCGCTGCA;SOR=1.221;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=28;WE=88652397;WS=88652379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,28:0.55:51
chr14	88654235	rs424752	A	G	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=31;ReadPosRankSum=-1.110;SC=TCCAGCCCACAGGACAGAGAC;SOR=0.180;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=4;WE=88654243;WS=88654225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr14	88729931	rs761971	G	T	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=265;SC=GAAGAAGAGAGTTTGTTTATA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=88729939;WS=88729921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	88737193	rs1298237	T	C	3776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=86;PP=2965;SC=ACATGGACCCTTGCTAACAAT;SOR=2.657;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=23;TCR=86;TR=109;WE=88737201;WS=88737183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr14	88792709	rs7142504	C	T	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.387;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=431;ReadPosRankSum=1.616;SC=TGCAATCCCCCTCCATCCCCT;SOR=1.765;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=69;TCF=48;TCR=21;TR=24;WE=88792717;WS=88792699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,26:0.36:72
chr14	88792816	rs3742690	T	G	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=39;PP=1292;SC=AAGATGCCGCTCCAAGCGGTT;SOR=2.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=14;TCR=39;TR=53;WE=88792824;WS=88792806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr14	88792884	rs3742689	T	C	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=20;PP=437;SC=GGGTTAAGTCTGGTGGAAAGA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=20;WE=88792892;WS=88792874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	88852031	rs709886	A	G	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=1;PP=461;SC=ACGGCCTGGCAACGGTTTCCC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=88852039;WS=88852021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	88852279	rs5810413	TG	T	638.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=611;SC=GGCCGCCCCTTGGGGCGCTTC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=17;WE=88852287;WS=88852269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	88895669	rs386579	T	G	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.72;SOR=4.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr14	88934651	rs366476	G	A	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=40;ReadPosRankSum=-0.524;SC=GTGTTCCCCTGGGGAGACAGA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=88934659;WS=88934641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr14	88967336	rs816069	C	A	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=42;PP=1331;SC=AGTAACTATTCAGGAAGACAA;SOR=4.317;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=45;WE=88967344;WS=88967326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr14	88983673	rs4904452	C	A	1162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=34;PP=927;SC=TTCAGTCGCACTAATCCCTGA;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=88983681;WS=88983663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	89063167	rs2297124	A	G	7576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=116;PP=2965;SC=GTAATGTTTCAAGTTGTACTG;SOR=0.815;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=251;TCF=135;TCR=116;TR=251;WE=89063175;WS=89063157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr14	89076189	.	C	T	1362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.092;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=44;PP=1073;ReadPosRankSum=-0.069;SC=GTGACAACATCTCAATTTCCT;SOR=0.324;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=81;TCF=1;TCR=80;TR=45;WE=89076197;WS=89076179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,47:0.56:84
chr14	89077043	rs4899956	G	T	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=254;ReadPosRankSum=2.900;SC=AGCTACTCGGGAGACTGAGGC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=14;WE=89077051;WS=89077036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr14	89082289	rs12885870	A	G	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=229;ReadPosRankSum=0.218;SC=TTCAGGTTACATGTGTAATAT;SOR=0.836;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=13;WE=89082297;WS=89082279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr14	89082396	rs61173654	A	AT	374.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=538;ReadPosRankSum=-1.521;SC=TGACTAGCTGATTTCATAAAC;SOR=1.101;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=42;TCR=1;TR=18;WE=89082404;WS=89082386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr14	89087278	rs201884924	TA	T	109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=0.861;QD=3.54;ReadPosRankSum=1.470;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr14	89087328	rs117347160	A	G	770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=662;ReadPosRankSum=0.636;SC=AAGTACTTCTAAATTATACCA;SOR=0.862;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=46;TCF=16;TCR=30;TR=27;WE=89087336;WS=89087318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr14	89088266	rs4635267	C	T	1147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.861;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=10;PP=973;ReadPosRankSum=-0.464;SC=TACATAAATACGTGATTCTTA;SOR=0.895;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=98;TCF=74;TCR=24;TR=46;WE=89088274;WS=89088256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,47:0.46:102
chr14	89088357	rs56144430	G	A	1574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.163;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=47;PP=1226;ReadPosRankSum=-0.490;SC=CCTTTAACCAGTCCTTCCCTA;SOR=1.315;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=128;TCF=42;TCR=86;TR=64;WE=89088365;WS=89088347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,64:0.49:130
chr14	89088388	rs2983488	G	C	2897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=68;PP=2345;SC=CCTCCCCCTTGTCCGCCTCCA;SOR=2.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=19;TCR=68;TR=87;WE=89088396;WS=89088378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr14	89089149	rs11382327	C	CT	388.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;NF=1;NR=14;PP=302;SC=TAAGCAGAATCTTTTTTTTTT;SOR=4.174;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=15;WE=89089157;WS=89089139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,16:0.89:18
chr14	89091202	rs149369776	G	GGAA	903.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.915;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.457;NF=19;NR=2;PP=945;ReadPosRankSum=-0.585;SC=CATATGAGGAGGAAGGTCGGA;SOR=0.197;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=21;WE=89091210;WS=89091192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr14	89094243	rs1144916	G	C	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=463;SC=ATATTCATCTGTGAAACATGG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=89094251;WS=89094233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	89105287	rs1152383	T	A	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.863;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=160;ReadPosRankSum=-1.050;SC=GTTTGAAAATTTTAAGATGTA;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=9;WE=89105295;WS=89105277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr14	89129304	rs17260373	G	C	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=406;ReadPosRankSum=-0.175;SC=CTAAACGATAGAAAGTAGGTA;SOR=0.735;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=22;WE=89129312;WS=89129294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr14	89148486	rs17260380	C	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.47;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5727;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=94;ReadPosRankSum=0.090;SC=AATAGGATACCGAATAGTGAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=89148494;WS=89148476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr14	89205265	rs17188228	T	C	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=542;ReadPosRankSum=-2.418;SC=ATCACAGTAATTGGTTTAAAA;SOR=0.785;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=54;TCF=27;TCR=27;TR=28;WE=89205273;WS=89205255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr14	89258877	rs61982739	G	A	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=2;PP=25;SC=GCTCCCGCTCGGGCCCGCGGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=89258885;WS=89258867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
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chr14	89591829	rs17777553	G	T	1718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=47;PP=1427;SC=CAAGGAATAAGTATTGAGTAT;SOR=4.575;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=50;WE=89591837;WS=89591819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr14	89647259	rs140257053	G	GGCAGAGAACATGCATGGA	411.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=2.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=0.000;QD=17.16;ReadPosRankSum=-0.289;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr14	89647297	rs34338248	T	TAC	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=46;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=106;ReadPosRankSum=-0.732;SC=CACGTGCACATACACACACAC;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=89647305;WS=89647287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr14	89747473	rs7147341	T	C	1584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=52;PP=1291;SC=TGACACCCTTTGAAAATGCAT;SOR=4.332;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=5;TCR=52;TR=57;WE=89747481;WS=89747463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr14	89867978	rs12147030	T	C	4538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=75;PP=2965;SC=CCCTCTACTATAGCCACGATT;SOR=0.842;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=64;TCR=75;TR=139;WE=89867986;WS=89867968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr14	89878599	rs144767183	C	T	2220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=30;PP=1739;ReadPosRankSum=-0.496;SC=CCCCAAAGCTCTTCAGCAAGT;SOR=0.664;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=101;TCR=61;TR=80;WE=89878607;WS=89878589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,85:0.50:169
chr14	89884022	rs7422	A	C	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.201;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=461;ReadPosRankSum=-0.850;SC=AAGAATTACGATGCGGGCGAG;SOR=1.069;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=25;WE=89884030;WS=89884012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr14	90263500	rs9026	T	A	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-5.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=346;ReadPosRankSum=0.839;SC=ATCACAAGTCTGTAGCATGAC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=18;WE=90263508;WS=90263490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,19:0.40:48
chr14	90263525	rs1555616	C	A	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.088;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=502;ReadPosRankSum=0.389;SC=TTAGTAGAGTCGAGTCTGCTG;SOR=0.018;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=65;TCF=61;TCR=4;TR=28;WE=90263533;WS=90263515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,29:0.43:67
chr14	90303065	rs8021113	T	C	1705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.54;SOR=7.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr14	90303113	rs8019848	A	T	483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=434;SC=CTGTAATCCCAGCACTTTGGG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=90303121;WS=90303103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	90303383	rs8020323	A	G	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=207;SC=TGCACAGGTGAGGGGTGTGCC;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=90303391;WS=90303373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr14	90303435	rs12437204	T	A	602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.18;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	90303445	rs12437206	T	C	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.38;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	90451303	rs1296406	A	G	59.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=38;SC=TCTTGTAGGCATTCCATCATT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=90451311;WS=90451293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr14	90456188	rs2401863	G	T	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=360;ReadPosRankSum=0.208;SC=CTACTATTGCGTAGAAATTTG;SOR=0.504;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=21;WE=90456196;WS=90456178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr14	90528967	rs12878088	C	A	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=105;ReadPosRankSum=1.550;SC=CTCATCCTTTCATTCATCCAT;SOR=0.269;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=6;WE=90528975;WS=90528957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr14	90722824	rs2277516	G	C	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=1;PP=412;SC=AGCACAACTTGGTCAGCGCAG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=90722832;WS=90722814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	90723000	rs2277515	A	G	1767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=37;PP=1319;SC=GGGTCTCAGCAGCCTGAGGCG;SOR=1.421;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=19;TCR=37;TR=56;WE=90723008;WS=90722990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr14	90723059	rs2277514	T	C	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=28;PP=894;SC=TCTTCTCCTTTTGCCGGCCTG;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=90723067;WS=90723049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr14	90723109	rs6575119	T	G	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=333;SC=ACCGCGCTCATGTCCACCGCG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=90723117;WS=90723099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	90723152	rs3825662	A	G	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.56;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=2;PP=23;SC=TTGCCCGGGGATCCTGGGGCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=90723160;WS=90723142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr14	90726676	rs11844225	G	A	2425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=58;PP=1956;SC=CTCTAGCTTTGTGATTCATTT;SOR=2.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=22;TCR=58;TR=80;WE=90726684;WS=90726666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr14	90729931	rs8022531	T	C	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=31;PP=998;SC=GGCTGCTTTGTAAATCTAGCG;SOR=3.383;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=36;WE=90729939;WS=90729921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	90729984	rs8015510	C	T	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=12;PP=527;SC=CTGCTTTTTTCCCTTGGCATT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=19;WE=90729992;WS=90729974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	90730071	rs4811	C	T	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.18;QD=33.51;SOR=3.477;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	90730265	rs2282030	G	A	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=37;PP=1076;SC=TTCCTGTCCCGTGGAAGTAGA;SOR=4.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=41;WE=90730273;WS=90730255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	90752908	rs7160304	G	T	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=336;SC=AGAGATGCCTGAGTGATGATA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=90752916;WS=90752898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	90754538	rs17799226	C	T	1857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=6;PP=1500;SC=GCGGGGCACACGAACAGAACG;SOR=3.804;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=61;TCF=55;TCR=6;TR=59;WE=90754546;WS=90754528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr14	90770210	rs4904670	C	G	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=458;SC=AATTGCTGCACAGTCCATCAG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=90770218;WS=90770200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	90863489	rs12886342	G	A	1931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=6;PP=1584;SC=CAGCAGCAGCGGCATCGGAGG;SOR=3.877;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=50;TCR=6;TR=56;WE=90863497;WS=90863479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr14	90865283	rs2300497	T	C	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=521;SC=CACTTAAGAGTATAAACTTCA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=90865291;WS=90865273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	90865462	rs2300498	C	G	1956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=37;PP=1457;SC=TTACTGCCTCCAACGAAGTGT;SOR=1.249;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=23;TCR=37;TR=60;WE=90865470;WS=90865452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr14	90866346	rs2268433	C	T	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=6;PP=753;SC=AACTGGAAAACCTATGTTGAA;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=31;WE=90866354;WS=90866336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	91007618	rs1294572	T	C	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=0;PP=723;SC=GGCCTCAGTGTGGCAGATTCA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=91007626;WS=91007608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	91060050	.	C	T	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=661;ReadPosRankSum=0.477;SC=CACAGACAAGCGCGGAACACA;SOR=0.682;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=73;TCF=26;TCR=47;TR=35;WE=91060058;WS=91060040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr14	91068663	rs61987022	G	A	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=248;ReadPosRankSum=0.900;SC=ATGGACTGTCGTCCAAATATA;SOR=1.292;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=12;WE=91068671;WS=91068653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr14	91110582	rs3830889	TACATAC	T	886.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=1309;SC=AAAAAGGTTTTACATACACAC;SOR=4.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=15;WE=91110595;WS=91110572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	91113471	rs2277512	G	A	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=10;PP=263;SC=CTAAGGGCCCGTATTTATTTA;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=91113479;WS=91113461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	91113537	rs1286422	A	G	184.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=148;SC=CATGTAAACCATTTCCCTCTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=91113545;WS=91113527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	91121273	rs3742661	G	A	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.139;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=9;PP=744;ReadPosRankSum=-0.911;SC=TGGGAATCCCGCAGGGTAGAC;SOR=1.096;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=87;TCF=63;TCR=24;TR=40;WE=91121281;WS=91121263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,42:0.47:90
chr14	91123575	rs3742660	T	C	2055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=29;PP=1433;ReadPosRankSum=0.200;SC=TGGCATCGTCTGGCTTCAGGC;SOR=0.570;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=148;TCF=96;TCR=52;TR=79;WE=91123583;WS=91123565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,87:0.55:159
chr14	91142779	rs1077697	C	T	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=368;ReadPosRankSum=0.373;SC=TAGAGGGGGGCCCAGGACCAG;SOR=2.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=20;WE=91142787;WS=91142769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr14	91156151	rs942738	G	A	436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-2.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=305;ReadPosRankSum=0.582;SC=ATCACATTGTGCTAAGCACTA;SOR=0.278;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=16;WE=91156159;WS=91156141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,18:0.67:27
chr14	91161862	rs10146731	C	T	1975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.965;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=29;PP=1553;ReadPosRankSum=-0.468;SC=GGTTTTGAGTCGTTCTTGTTT;SOR=1.054;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=141;TCF=83;TCR=58;TR=77;WE=91161870;WS=91161852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,78:0.53:147
chr14	91162063	rs12893100	C	T	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=223;ReadPosRankSum=-0.830;SC=CATGCCTAGCCATCTTTGGTT;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=11;WE=91162071;WS=91162053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr14	91165572	rs1749699	G	A	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=23;PP=1005;ReadPosRankSum=2.517;SC=GTCCCTCTGTGATCAAACCAA;SOR=0.699;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=108;TCF=59;TCR=49;TR=51;WE=91165580;WS=91165562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,55:0.49:112
chr14	91165606	rs1742100	G	A	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.959;NF=16;NR=31;PP=909;ReadPosRankSum=-0.045;SC=ATGGGAAGAAGGCCAGAGCTC;SOR=0.666;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=31;TCR=61;TR=47;WE=91165614;WS=91165596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,50:0.51:98
chr14	91196317	rs10135495	T	C	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.003;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=98;ReadPosRankSum=1.647;SC=GTAGTTCATATTTAAAATTCC;SOR=0.223;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=5;WE=91196325;WS=91196311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr14	91282452	rs2401918	T	G	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.99;ReadPosRankSum=0.932;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr14	91282470	rs943700	G	A	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=411;ReadPosRankSum=0.018;SC=CCGTTCCCGCGGAGGCCGCGG;SOR=1.148;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=21;WE=91282478;WS=91282460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr14	91365646	rs11380703	G	GA	312.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=23.111;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.68;MQRankSum=3.152;QD=5.13;ReadPosRankSum=0.386;SOR=1.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,27:0.44:61
chr14	91409615	rs111743702	A	AT	167.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.867;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.776;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr14	91592748	rs57615276	C	CTTCTT	952.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=1055;SC=ATGTCTGTGCCTTCTTATAAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=17;WE=91592756;WS=91592738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	91642234	rs2295528	A	G	5143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=109;NR=37;PP=2965;SC=TTCTAATTGGATGCTCCCTGC;SOR=2.155;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=109;TCR=37;TR=146;WE=91642242;WS=91642224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr14	91710562	rs143283361	GACACACAC	G,GACAC	250.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;NF=6,6;NR=0,0;PP=230,183;SC=CCAGAACACAGACACACACAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=6,6;WE=91710577;WS=91710552;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.60:10
chr14	91717214	rs11852149	C	T	2041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=44;PP=1582;ReadPosRankSum=2.034;SC=AAGTTGTGGCCGACCCAAGGT;SOR=0.711;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=150;TCF=65;TCR=85;TR=76;WE=91717222;WS=91717204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,79:0.51:155
chr14	91739081	rs941920	A	G	1876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=25;PP=1617;SC=GGCCCGGCCGAGGTGGGGAGC;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=31;TCR=25;TR=56;WE=91739089;WS=91739071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
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chr14	91751788	rs11341843	TC	T	4161.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=60.16;NF=37;NR=66;PP=2969;SC=ATCCTGAGGCTCCCCCTAAAA;SOR=0.912;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=110;TCF=38;TCR=72;TR=103;WE=91751796;WS=91751778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
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chr14	91763971	rs5810533	CT	C	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.47;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
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chr14	91773568	rs1970912	T	C	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=4.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.543;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=440;ReadPosRankSum=-1.195;SC=ACTCCTTCTTTAGCTACAGGT;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=46;TCF=8;TCR=38;TR=21;WE=91773576;WS=91773558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr14	91776434	rs2277507	G	A	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=30;PP=932;SC=CCCGGGCCACGGCTGCCTCCG;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=91776442;WS=91776424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	91883267	rs1285844	A	C	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.282;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;ReadPosRankSum=1.494;SC=CAGAGACTGGACGGGTCAGTG;SOR=0.297;Source=Platypus;TCF=9;TR=16;WE=91883275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr14	91883499	rs1742546	G	A	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=18;PP=875;ReadPosRankSum=-1.254;SC=AAATCAGTGCGCCCACCCCAG;SOR=0.747;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=86;TCF=52;TCR=34;TR=47;WE=91883507;WS=91883489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,49:0.55:89
chr14	91883967	rs3742654	G	T	1669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.578;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=34;PP=1233;ReadPosRankSum=-0.228;SC=GGAGCCAGGCGCACTCACCCA;SOR=0.903;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=103;TCF=48;TCR=55;TR=62;WE=91883975;WS=91883957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,66:0.61:109
chr14	91925027	rs10135595	G	T	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.783;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=449;ReadPosRankSum=-2.840;SC=ACTGCGCTTTGTTGTGGATTT;SOR=1.115;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=53;TCF=29;TCR=24;TR=22;WE=91925035;WS=91925017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,23:0.40:57
chr14	91927717	rs8006817	G	A	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.706;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=18;PP=811;ReadPosRankSum=0.267;SC=TGGGAGTCAAGAATGTACCTT;SOR=0.498;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=81;TCF=45;TCR=36;TR=38;WE=91927725;WS=91927707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,42:0.46:92
chr14	91928933	rs4904784	T	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.949;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=54;ReadPosRankSum=-0.566;SC=AACATTTATGTTGACCCTTAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=4;WE=91928941;WS=91928923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr14	91928992	rs5020186	T	G	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=1.078;SC=CTGTTCCTTGTCAAGCCAAAT;SOR=1.071;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=7;WE=91929000;WS=91928982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr14	91937143	rs10873409	G	A	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.120;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=621;ReadPosRankSum=0.650;SC=ATACCAACATGTCAATATACA;SOR=0.324;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=53;TCF=44;TCR=9;TR=31;WE=91937151;WS=91937133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr14	91942318	rs139615837	C	CA	349.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.685;HP=7;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=423;ReadPosRankSum=1.486;SC=GCCCTGCAGACAAAAAACATT;SOR=1.863;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=15;WE=91942326;WS=91942308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr14	91942342	rs10145724	T	A	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=296;ReadPosRankSum=-2.036;SC=TTTTCCTGTATTTATAAAAAT;SOR=0.892;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=13;WE=91942350;WS=91942332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr14	91942407	rs10145809	T	G	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.72;ReadPosRankSum=1.100;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr14	91948643	rs6575195	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=129;ReadPosRankSum=-0.196;SC=ACCTATAATGGTCATTTTCAA;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=6;WE=91948651;WS=91948633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr14	92040589	rs34650717	TC	T	205.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.757;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=191;ReadPosRankSum=-0.207;SC=CTCGGGCGCCTCCGCCCCGCG;SOR=0.105;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=7;WE=92040597;WS=92040579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr14	92041075	rs1704614	C	G	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=37;ReadPosRankSum=-0.598;SC=GCAGTGCCTACAGAGATCTGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=3;WE=92041083;WS=92041065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr14	92058445	rs1285637	G	A	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=338;ReadPosRankSum=-0.028;SC=TGAAGAAGTGGAATTCCTGAG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=15;WE=92058453;WS=92058435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr14	92084004	rs1620238	C	G	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.989;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=437;ReadPosRankSum=1.071;SC=CATCAAAAGTCACTTCAGCTG;SOR=0.175;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=20;WE=92084012;WS=92083994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr14	92088016	rs1296082	G	A	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.058;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=489;ReadPosRankSum=-0.641;SC=TGTATTTCACGATGTTGAGGG;SOR=1.732;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=23;WE=92088024;WS=92088006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr14	92126443	rs55665101	ATC	A	228.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.691;NF=0;NR=10;PP=265;ReadPosRankSum=0.253;SC=GCCTACATTCATCTCTCTCTC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=10;WE=92126452;WS=92126433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
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chr14	92174343	rs4605095	C	T	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=82;ReadPosRankSum=0.703;SC=ATTGTGAGTGCCTCAAGGGTC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=92174351;WS=92174333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
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chr14	92264081	rs200140556	A	C	721.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=0.927;QD=14.44;ReadPosRankSum=0.303;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr14	92268531	rs10498631	C	T	797.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.191;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=600;ReadPosRankSum=0.968;SC=ATTCCCATATCTTACATTTGA;SOR=0.022;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=49;TCF=43;TCR=6;TR=28;WE=92268539;WS=92268521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,30:0.57:53
chr14	92268615	rs2402073	T	G	2990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=34;PP=2131;SC=ATACAGTCTCTTCACTTCTGA;SOR=1.587;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=64;TCR=34;TR=98;WE=92268623;WS=92268605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr14	92336775	rs929608	T	C	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=5.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.41;ReadPosRankSum=-0.984;SOR=0.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr14	92343764	rs2430341	C	T	1402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=12;PP=1232;SC=GCATACAGCACGTTCCTAGGA;SOR=2.059;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=46;WE=92343772;WS=92343754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr14	92344244	rs2430342	T	C	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.711;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=662;ReadPosRankSum=-0.785;SC=ACCAACCAGATGTTCTGGCTA;SOR=0.470;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=30;TCR=64;TR=41;WE=92344252;WS=92344234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,47:0.46:103
chr14	92344300	rs2498847	A	G	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.249;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=617;ReadPosRankSum=-0.238;SC=AGAACATTAGAACATTCTCCA;SOR=0.014;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=56;TCF=6;TCR=50;TR=28;WE=92344308;WS=92344290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr14	92347680	rs2430347	A	G	2140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=29;PP=1600;SC=GGATGGGGTCAATGCATTTGA;SOR=1.121;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=41;TCR=29;TR=70;WE=92347688;WS=92347670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr14	92403660	rs2474028	T	C	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.47;ReadPosRankSum=0.697;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr14	92454748	rs2273184	A	T	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.771;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=103;ReadPosRankSum=0.367;SC=AAACTTTATTAAAAAAAAGTA;SOR=1.317;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=24;TCF=12;TCR=12;TR=8;WE=92454756;WS=92454738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr14	92477168	rs2277526	A	G	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.266;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=1;PP=703;ReadPosRankSum=0.877;SC=TCTGAACTTTACCCAGGTACT;SOR=0.173;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=68;TCF=67;TCR=1;TR=31;WE=92477176;WS=92477158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr14	92537105	.	C	T	186	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=20;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=18;MQ=61.16;NF=13;NR=0;PP=186;QD=16.9824009652;SC=TTTTTTTTTTCTTTTGGTAAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=13;WE=92537113;WS=92537095;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr14	92537354	.	C	CCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTG	1820.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.59;QD=53.55;SOR=2.899;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr14	92537379	.	T	C	795	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=29;MQ=50.2;NF=7;NR=26;PP=795;QD=25.1445821984;SC=GCTGCTGCTGTTGCTGCTTTT;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=33;WE=92537395;WS=92537369;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:18,33:0.65:51
chr14	92549586	rs16999141	G	A	678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=525;ReadPosRankSum=1.382;SC=CACCCTTAACGACAAATATAG;SOR=0.563;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=56;TCF=16;TCR=40;TR=27;WE=92549594;WS=92549576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr14	92560311	rs2402108	A	G	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=352;SC=TTTTTGTGACAGAGTCTTGCT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=92560319;WS=92560301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	92562986	.	G	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.027;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.10;MQRankSum=-3.801;QD=3.21;ReadPosRankSum=-2.835;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr14	92563254	.	AT	A	83.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=-0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=1.192;QD=5.23;ReadPosRankSum=1.138;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr14	92588155	rs34343740	AT	A	58.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=1.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.17;MQRankSum=1.872;QD=1.37;ReadPosRankSum=-0.912;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,10:0.23:43
chr14	92792255	rs941646	G	A	2282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=50;PP=1854;SC=TGCCAGACACGTGGAGAAATA;SOR=2.173;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=18;TCR=51;TR=68;WE=92792263;WS=92792245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr14	92792432	rs941645	T	C	293.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=244;SC=GTTTATGGACTTGAGTGGGAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=92792440;WS=92792422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	92905817	rs4900122	A	G	2111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=49;PP=1747;SC=ATAAATGCCAAGCCAAGAAGG;SOR=3.091;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=10;TCR=49;TR=59;WE=92905825;WS=92905807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr14	92909073	rs941650	T	C	2788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=45;PP=2188;SC=TCATCACCCATGGGGACGTCG;SOR=0.870;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=98;TCF=52;TCR=46;TR=97;WE=92909081;WS=92909063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr14	92909979	rs72631612	C	T	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=326;ReadPosRankSum=0.294;SC=ACCAGCGCCCCGACCCCCAGC;SOR=1.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=16;WE=92909987;WS=92909969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr14	92911593	rs6575255	C	A	2103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.546;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=25;PP=1595;ReadPosRankSum=-2.237;SC=GCCTGGGTGTCCGTGCTTGTT;SOR=1.177;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=133;TCF=85;TCR=48;TR=80;WE=92911601;WS=92911583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,82:0.62:133
chr14	92915625	.	TACACACACACACACAC	T,TACACACACACAC,TAC	355.73	.	AC=1,0,0;AF=0.500,0.00,0.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-0.539;NF=1,1;NR=9,9;PP=453,1171;ReadPosRankSum=0.170;SC=CTCTTTTGTGTACACACACAC;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=10,10;WE=92915646;WS=92915615;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.69:16
chr14	92920371	rs7144273	C	T	1982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.705;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=43;PP=1588;ReadPosRankSum=-0.775;SC=AGTTTGGACCCAGGACCCGAC;SOR=1.447;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=22;TCR=43;TR=64;WE=92920379;WS=92920361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr14	92922667	rs56007403	C	T	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=308;ReadPosRankSum=-0.417;SC=GAGCAGGGTGCGTGTGAGGGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=6;WE=92922689;WS=92922657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr14	92922681	rs7156906	A	G	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=3;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=308;ReadPosRankSum=-1.140;SC=TGAGGGACCCAGCGTATAGCA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=10;WE=92922689;WS=92922657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr14	92922713	rs7158400	T	C	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.444;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=372;ReadPosRankSum=-0.826;SC=CTTTATCACATGCCTTGGTGT;SOR=0.207;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=18;WE=92922721;WS=92922703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr14	92950061	rs75541565	C	G	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=186;ReadPosRankSum=0.287;SC=TCTTCTCCTCCTCATTCCCAG;SOR=1.022;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=15;WE=92950069;WS=92950051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr14	92958502	rs34605132	TG	T	435.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.170;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=338;ReadPosRankSum=-1.441;SC=TCAGGGCACGTGTGTTTGATT;SOR=0.117;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=10;WE=92958510;WS=92958492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr14	92959216	rs11623883	G	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=276;ReadPosRankSum=0.062;SC=AGCCTTGATCGAGGGACAAGG;SOR=0.527;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=6;WE=92959236;WS=92959206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr14	92959228	rs78254567	G	A	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.417;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=406;ReadPosRankSum=0.966;SC=GGGACAAGGAGGAAGGCAGTG;SOR=1.022;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=9;WE=92959236;WS=92959206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr14	92959282	rs79685763	G	A	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.75;ReadPosRankSum=-2.148;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
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chr14	93081653	rs75641131	C	T	126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=118;ReadPosRankSum=-0.867;SC=AGAATGTGTGCAGCAGACACG;SOR=1.609;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=8;WE=93081661;WS=93081643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr14	93118038	rs3829947	A	G	3918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=55;PP=2965;SC=CCCACAGCCCATGACGCAAAC;SOR=1.138;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=81;TCR=55;TR=136;WE=93118046;WS=93118028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr14	93125415	rs2295991	G	C	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=527;ReadPosRankSum=-0.307;SC=GGGGCCAGGGGATGGGGATGG;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=23;WE=93125423;WS=93125405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr14	93154537	rs71698059	TGGC	T	4374.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=62;PP=2985;SC=TGGACGGTGGTGGCGGCGGCG;SOR=1.473;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=128;TCF=34;TCR=94;TR=86;WE=93154547;WS=93154527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr14	93170741	rs2250672	T	C	836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.502;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=609;ReadPosRankSum=-1.703;SC=TGGTGAACCGTGTCAACTCTG;SOR=1.554;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=90;TCF=37;TCR=53;TR=37;WE=93170749;WS=93170731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,40:0.42:95
chr14	93170901	rs2402189	A	C	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.753;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;ReadPosRankSum=0.871;SC=AGAAGTGAAAATGCCCACTTG;SOR=0.431;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=79;TCF=44;TCR=35;TR=28;WE=93170909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,27:0.35:77
chr14	93170993	rs9791	C	T	1256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.598;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=12;PP=879;ReadPosRankSum=-0.095;SC=ACCTGTGAAGCGGATACGGCT;SOR=0.864;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=132;TCF=98;TCR=34;TR=52;WE=93171001;WS=93170983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,56:0.41:135
chr14	93173113	.	G	A	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.843;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=1.267;SC=TCAGCCTCCCGCAGGTTAGAG;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=93173121;WS=93173103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr14	93178191	rs1951708	A	G	7179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=117;PP=2965;SC=CCACGTCCGAATCTTCCATCC;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=222;TCF=104;TCR=118;TR=221;WE=93178199;WS=93178181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr14	93179093	rs193188128	G	A	1168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.836;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=857;ReadPosRankSum=1.213;SC=CCATGTCAGCGGTGTCTGAGC;SOR=0.234;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=93;TCF=37;TCR=56;TR=40;WE=93179101;WS=93179083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,44:0.45:98
chr14	93180329	.	T	C	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.499;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.74;ReadPosRankSum=-1.081;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr14	93182466	rs1242119	G	A	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.164;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=16;PP=711;ReadPosRankSum=-0.922;SC=TGTAGTATCCGTAAACAGACA;SOR=0.404;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=74;TCF=46;TCR=28;TR=39;WE=93182474;WS=93182456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,39:0.51:76
chr14	93198972	rs12885208	A	T	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=362;ReadPosRankSum=-0.555;SC=CTTAACAAAAAAAAGATTAGT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=17;WE=93198980;WS=93198962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr14	93199203	rs1613441	T	A	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=33;PP=886;ReadPosRankSum=0.811;SC=CAACAAGAACTGATAAACATT;SOR=0.675;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=68;TCF=11;TCR=57;TR=39;WE=93199211;WS=93199193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,38:0.58:65
chr14	93276654	rs1040835	T	C	1876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.419;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=19;PP=1463;ReadPosRankSum=-0.505;SC=TCTGCAGACTTTTCAGGAGAG;SOR=0.838;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=142;TCF=100;TCR=42;TR=67;WE=93276662;WS=93276644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,70:0.48:146
chr14	93276806	rs1040833	C	T	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=27;PP=636;ReadPosRankSum=-1.154;SC=CATTAACTGTCTAATATAATT;SOR=0.726;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=58;TCF=2;TCR=56;TR=28;WE=93276814;WS=93276796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,31:0.51:61
chr14	93282872	rs142530146	T	TCTTCG	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.77;MQRankSum=0.842;QD=7.35;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,2:0.40:5
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chr14	93286291	rs10716250	AC	A	458.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.910;NF=0;NR=16;PP=458;ReadPosRankSum=0.709;SC=GCTTAGGGTTACCCCACAAGT;SOR=0.356;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=16;WE=93286299;WS=93286281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr14	93290723	rs3818256	A	G	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=253;ReadPosRankSum=-0.419;SC=TATTCACTTAATTATATACTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=12;WE=93290731;WS=93290713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr14	93290856	rs2273646	T	C	1642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=5.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.67;ReadPosRankSum=0.186;SOR=1.279;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,42:0.48:88
chr14	93290859	rs2273645	C	T	1611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=5.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.32;ReadPosRankSum=-0.015;SOR=1.265;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,43:0.49:88
chr14	93303604	rs4904994	C	T	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=551;ReadPosRankSum=0.181;SC=AATTGTTCTTCTGTGGTAGCC;SOR=1.236;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=23;WE=93303612;WS=93303594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr14	93303850	rs113573267	T	TG	785.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.458;HP=10;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=1186;ReadPosRankSum=-0.493;SC=CTAGTTTTTTTTTTTGTTTGT;SOR=0.146;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=0;TCR=51;TR=16;WE=93303863;WS=93303840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr14	93303854	rs74598769	T	C	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.13;ReadPosRankSum=0.413;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr14	93303855	rs34061602	G	T	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.742;SOR=0.379;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,18:0.40:45
chr14	93389403	rs7159323	A	C	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=4;PP=516;SC=GGGACTGGACACCTGGGGAGT;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=93389411;WS=93389393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	93407301	rs13316	C	A	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=14;PP=380;SC=CAGCCCAGACCCCAGCGCGGA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=93407309;WS=93407291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	93532665	.	A	ATG	680.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.99;MQRankSum=0.938;QD=25.21;ReadPosRankSum=0.205;SOR=1.839;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,23:0.85:27
chr14	93649501	rs1046099	A	G	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=2;PP=379;SC=TGCTCTACTCATTGCCATATC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=93649509;WS=93649491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	93681742	rs3783901	T	C	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=288;ReadPosRankSum=0.383;SC=TAAAATAGTATATGTTCTGGC;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=14;WE=93681750;WS=93681732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr14	93684814	rs10132640	T	C	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=278;ReadPosRankSum=-2.438;SC=TGGGATTTTATTGTCCGTTAG;SOR=0.634;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=13;WE=93684822;WS=93684804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr14	93686568	.	CTT	C	287.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=3.299;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=0.781;QD=15.14;ReadPosRankSum=0.000;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr14	93693422	rs2905	C	T	1853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.531;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=57;PP=1462;ReadPosRankSum=-0.901;SC=AATGAAAATGCGCTTCCCATT;SOR=1.172;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=147;TCF=40;TCR=107;TR=73;WE=93693430;WS=93693412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,76:0.50:151
chr14	93799284	rs146686071	ACCG	A	887.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=1;NR=16;PP=765;SC=TCCTCCTCCCACCGCCGCCGC;SOR=4.712;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=17;WE=93799294;WS=93799274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	93934004	.	TGC	T	1105.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.130;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=26.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.60;MQRankSum=-4.733;QD=17.28;ReadPosRankSum=2.889;SOR=4.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr14	93934006	.	C	CTTTTTTTTTTTTTTTTTT	1106.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=26.303;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.60;MQRankSum=-4.733;QD=17.29;ReadPosRankSum=3.509;SOR=4.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,33:0.52:64
chr14	93953904	rs61992611	G	A	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=401;SC=CTTTATTGGAGCTATTTTTTT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=15;WE=93953915;WS=93953894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	93953907	rs33942732	A	AT	901.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=13;NR=0;PP=223;SC=TATTGGAGCTATTTTTTTTTT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=13;WE=93953915;WS=93953894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	93962691	rs8006093	G	A	136.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=106;SC=TCTTATATATGTATATCAAAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=93962699;WS=93962681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	93963563	rs79866114	C	G	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.497;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=135;ReadPosRankSum=-0.565;SC=TGTGCAAATGCTTTTCCACTA;SOR=2.584;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=7;WE=93963571;WS=93963553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr14	93994870	rs17094893	A	G	1129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=11;PP=893;SC=ACCCAGGAACAGGAGAGTTCA;SOR=1.923;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=40;WE=93994878;WS=93994860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr14	93994954	rs28420706	G	A	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=28;PP=1060;SC=AACCACCCCCGTTGTATCTCT;SOR=1.455;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=43;WE=93994962;WS=93994944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr14	93998806	rs942068	C	A	1327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=0;PP=1092;SC=ACAGAGTGAGCCACTGTCTCA;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=38;WE=93998814;WS=93998796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr14	94007075	rs1951716	C	T	854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=14;PP=724;SC=GGCAGCTGGGCCTCTCCTCTT;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=11;TCR=14;TR=25;WE=94007083;WS=94007065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	94008753	rs12893237	A	G	1034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=4;PP=783;SC=TAATGCACCTATAATAATTTT;SOR=2.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=27;WE=94008761;WS=94008743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
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chr14	94088587	rs4905081	G	A	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.099;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=591;ReadPosRankSum=-0.883;SC=TTCTCCCTCCGTCCCCAGCCA;SOR=0.489;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=88;TCF=47;TCR=41;TR=34;WE=94088595;WS=94088577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,35:0.40:88
chr14	94097287	rs2148563	G	A	4949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=111;PP=2965;SC=TTTCATCTATGCATTTATTTT;SOR=2.272;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=34;TCR=111;TR=145;WE=94097295;WS=94097277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr14	94103602	rs4905082	G	A	4645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=89;PP=2965;SC=ACGTGCCAACGTGCCTAAACC;SOR=1.371;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=50;TCR=89;TR=139;WE=94103610;WS=94103592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr14	94109829	rs943318	G	A	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=0;PP=369;SC=AAAAACAGCCGTGTGTGTAGT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=94109837;WS=94109819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	94113008	rs17129147	G	T	1396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.730;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=38;PP=1091;ReadPosRankSum=0.099;SC=GTCCTAACGGGAGCCCAGATC;SOR=0.600;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=34;TCR=77;TR=55;WE=94113016;WS=94112998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,57:0.48:118
chr14	94121770	rs11626422	G	A	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.033;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=43;PP=989;ReadPosRankSum=0.380;SC=TGAGCCGAAGGTTTCATTTTC;SOR=0.914;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=102;TCF=16;TCR=86;TR=50;WE=94121778;WS=94121760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,51:0.49:105
chr14	94139906	rs8021237	G	A	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.080;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=499;ReadPosRankSum=0.285;SC=TCTTTGCTTAGAGATGATAAA;SOR=0.130;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=22;WE=94139914;WS=94139896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr14	94152768	rs2296686	C	G	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=565;ReadPosRankSum=-0.722;SC=GCTGGGCAGACAGTCACAGAC;SOR=0.384;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=24;WE=94152776;WS=94152758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr14	94160521	rs943323	C	A	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=0;PP=889;SC=TCTGGTTTGACGTTTCAGAGG;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=94160529;WS=94160511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr14	94160611	rs960888	G	A	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.303;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=17;PP=731;ReadPosRankSum=-1.020;SC=GGTCTTCTGCGGCTGCAAACT;SOR=0.399;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=62;TCF=36;TCR=26;TR=35;WE=94160619;WS=94160601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,37:0.55:67
chr14	94170861	rs111824345	G	A	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.351;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=12;PP=786;ReadPosRankSum=-0.927;SC=GCCCACATCCGTGCGCGACGT;SOR=0.402;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=39;WE=94170869;WS=94170851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,38:0.69:55
chr14	94187832	rs1887197	C	T	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.993;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=257;ReadPosRankSum=0.648;SC=TGTTGCTCTGCGAAGCACTCA;SOR=2.494;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=12;WE=94187840;WS=94187822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr14	94192137	rs10873436	C	T	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=156;ReadPosRankSum=-1.122;SC=CTGGCCCCACCGGCTGGCAGC;SOR=0.245;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=9;WE=94192145;WS=94192127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr14	94245649	rs4905087	A	G	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=0.000;QD=17.86;ReadPosRankSum=-0.564;SOR=0.579;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,39:0.48:82
chr14	94245652	rs4900195	C	T	1464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=0.000;QD=17.44;ReadPosRankSum=-0.145;SOR=0.756;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,39:0.46:84
chr14	94391699	rs10141024	G	A	2706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=55;PP=2095;SC=GGAGAAAAGGGCGAGCACAGC;SOR=1.356;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=31;TCR=55;TR=85;WE=94391707;WS=94391689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr14	94400431	rs11625548	T	C	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.616;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=138;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CACATCTGCCTCGCTCCCGCT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=94400439;WS=94400421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr14	94400906	rs12370	G	A	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=-0.536;SC=CTGCAGCCTCGTCTGTCACCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=94400914;WS=94400899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr14	94403973	rs56003871	C	T	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=130;ReadPosRankSum=-0.131;SC=AACAGTCGCACTCCCTGAGGC;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=8;WE=94403981;WS=94403963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr14	94404217	rs34365480	G	C	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.185;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=562;ReadPosRankSum=-0.954;SC=AACATGCCGGGACCAAGAAGT;SOR=1.170;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=87;TCF=29;TCR=58;TR=29;WE=94404225;WS=94404207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,32:0.34:93
chr14	94405871	rs10873442	G	C	2366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=62;PP=1830;SC=CGCGCTCGGGGGCCAGCGGCG;SOR=2.570;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=18;TCR=62;TR=80;WE=94405879;WS=94405861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr14	94406096	rs7155320	A	C	57.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=36;SC=CCAGCAGGAGAGCTCGGGCGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=94406104;WS=94406086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr14	94410275	rs35894364	CA	C	448.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.690;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.779;NF=10;NR=5;PP=407;ReadPosRankSum=-1.283;SC=TAAAATACAGCAAAAGTGTTA;SOR=1.270;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=15;WE=94410283;WS=94410265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr14	94410447	rs10134105	T	C	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=23;PP=693;SC=CTTAGACACCTTGAAGCCTCA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=94410455;WS=94410437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	94414452	rs12888439	G	A	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=247;ReadPosRankSum=-1.606;SC=CACCTACTACGTGCTGAACAT;SOR=0.906;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=14;WE=94414460;WS=94414442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr14	94417421	rs7147919	G	A	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.175;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=36;PP=1154;ReadPosRankSum=0.559;SC=TGCCGTAGGCGTTCTTGGATT;SOR=1.141;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=129;TCF=58;TCR=71;TR=60;WE=94417429;WS=94417411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,64:0.46:138
chr14	94417541	rs4277287	A	G	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=37;PP=1071;SC=TGGTGTCTGCATTGTGCTGCA;SOR=4.565;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=39;WE=94417549;WS=94417531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
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chr14	94419665	rs68087715	G	T	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.697;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=16;PP=935;ReadPosRankSum=0.384;SC=GGATTCTTCCGCAGGAAAGCT;SOR=1.345;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=83;TCF=49;TCR=34;TR=46;WE=94419673;WS=94419655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,49:0.58:85
chr14	94419888	rs4243701	A	G	274.81	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=200;ReadPosRankSum=0.674;SC=CATGTAGGAGAAAGATACTCA;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=8;WE=94419896;WS=94419878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr14	94421488	rs7161588	C	T	1572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.767;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=46;PP=1249;ReadPosRankSum=-1.155;SC=ACCACGATGTCTATGCCTCTC;SOR=0.596;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=127;TCF=32;TCR=95;TR=62;WE=94421496;WS=94421478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,62:0.50:125
chr14	94464432	rs733166	A	G	1482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=18;PP=1224;ReadPosRankSum=-1.184;SC=ATCCTGCCTGACTCACGGGTC;SOR=0.510;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=48;WE=94464440;WS=94464422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr14	94466081	rs4905137	C	G	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=309;ReadPosRankSum=-0.240;SC=ACTGCGACACCGTGTGTGGCC;SOR=0.634;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=15;WE=94466089;WS=94466071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr14	94469794	rs75333263	C	T	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=558;ReadPosRankSum=2.681;SC=CAGACACATACGCACGCAGAC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=11;WE=94469809;WS=94469784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr14	94469801	rs12890024	A	G	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=324;ReadPosRankSum=-2.124;SC=ATACGCACGCAGACACACACA;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=7;WE=94469809;WS=94469784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr14	94475182	rs78569439	A	G	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=426;ReadPosRankSum=0.622;SC=TGCAGGCCCCATGGCATCACG;SOR=1.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=20;WE=94475190;WS=94475172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr14	94492867	rs60927226	TGGC	T	196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=173;ReadPosRankSum=-1.515;SC=GGACCTGGCCTGGCGGCTCTG;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=94492877;WS=94492857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr14	94503578	rs10138711	G	A	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=0;PP=35;ReadPosRankSum=-0.065;SC=GGGCGTCTAGGATGCTGGTAA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=2;WE=94503586;WS=94503568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr14	94510964	rs2273226	T	C	1357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.995;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=18;PP=986;ReadPosRankSum=-1.678;SC=TAGAGAAGGATGGCTCAGTGT;SOR=1.286;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=127;TCF=79;TCR=48;TR=57;WE=94510972;WS=94510954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,58:0.46:126
chr14	94512415	rs8021300	T	C	255.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=212;SC=ACGAGGCCTATCCACTATGGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=94512423;WS=94512405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	94517533	rs112814907	C	CCACGG	511.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=480;ReadPosRankSum=0.309;SC=ACACACTTGACCAGTTAATTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=9;WE=94517541;WS=94517523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr14	94519199	rs3790045	C	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=191;ReadPosRankSum=1.016;SC=AGTAGGCTCACCTGGGACCAG;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=11;WE=94519207;WS=94519189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr14	94524216	rs1056810	T	C	608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.602;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=429;ReadPosRankSum=1.118;SC=GACCCCGAGCTGCCACATCTG;SOR=0.374;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=50;TCF=16;TCR=34;TR=27;WE=94524224;WS=94524206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr14	94527525	rs11846519	C	T	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.076;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=511;ReadPosRankSum=2.018;SC=AGTGTAATGCCCTAGAGCATT;SOR=0.126;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=22;WE=94527533;WS=94527515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr14	94545377	.	C	T	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=184;ReadPosRankSum=-0.751;SC=TTACCTGTCTCAGCAGCCCCA;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=9;WE=94545385;WS=94545367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr14	94554550	rs998518	T	G	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=168;ReadPosRankSum=-0.174;SC=TGCTTCGGCTTCTTCTACTGC;SOR=0.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=9;WE=94554558;WS=94554540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr14	94563064	rs56294923	T	C	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.674;NF=9;NR=0;PP=135;ReadPosRankSum=-0.079;SC=AAAAAGGCTATGCTTTAAATA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=9;WE=94563072;WS=94563054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr14	94563193	rs7157940	T	C	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.542;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=22;PP=1070;ReadPosRankSum=-0.311;SC=GCAGCTTTATTCAAACCAGAT;SOR=0.446;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=105;TCF=61;TCR=44;TR=47;WE=94563201;WS=94563183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,49:0.46:107
chr14	94564035	rs2896258	A	G	1441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=3.469;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.75;ReadPosRankSum=0.012;SOR=1.274;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,38:0.52:73
chr14	94564039	rs2402407	A	G	1444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=2.086;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.07;ReadPosRankSum=0.873;SOR=1.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,37:0.51:72
chr14	94564058	rs2402408	G	A	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=745;ReadPosRankSum=0.192;SC=TTGCTGTGAAGGAGAGAAACC;SOR=0.668;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=63;TCF=38;TCR=25;TR=36;WE=94564066;WS=94564048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,38:0.55:69
chr14	94567032	rs3818119	C	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=373;ReadPosRankSum=-0.432;SC=GTACCCACTCCCATAGGTTTG;SOR=1.136;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=17;WE=94567040;WS=94567022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr14	94568776	rs2295217	C	T	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=184;ReadPosRankSum=0.605;SC=CTGTTAGGAGCTGCTACCCCT;SOR=1.179;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=10;WE=94568784;WS=94568766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
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chr14	94578188	rs1243080	C	A	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=19;PP=628;SC=GGTCCTGTCCCGGGACCCGTG;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=94578196;WS=94578178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	94582130	rs3833507	T	TGGCCATGGC	1863.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=1;PP=2965;SC=CCTGCAGTTGTGGCTGTGCCC;SOR=4.294;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=22;WE=94582138;WS=94582120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	94594768	rs958187	T	G	1626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=2;PP=1424;SC=TCACGGAACTTCAGGGTGAGA;SOR=5.507;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=47;TCR=2;TR=49;WE=94594776;WS=94594758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr14	94700138	rs4905172	C	G	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=35;PP=1072;SC=TTATTACATTCGTTTAAAATG;SOR=3.033;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=43;WE=94700146;WS=94700128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr14	94772504	rs1042394	G	A	2041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=46;PP=1589;ReadPosRankSum=1.878;SC=GCACATCTCCGAGGTCATAGA;SOR=0.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=67;WE=94772512;WS=94772494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,69:0.99:70
chr14	94776219	rs2228542	C	T	4618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=83;PP=2965;SC=AGGGGAGCTCCGAGTCATGAA;SOR=1.210;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=56;TCR=83;TR=139;WE=94776227;WS=94776209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr14	94776387	rs2281520	A	G	1223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=36;PP=1031;SC=AGAGGAAAACACAGTTCCAGG;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=38;WE=94776409;WS=94776377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr14	94776401	rs11160168	T	C	983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=28;PP=838;SC=TTCCAGGTGATCTCACGGGCC;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=94776409;WS=94776377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	94780608	rs3748320	G	A	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.076;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=741;ReadPosRankSum=-0.334;SC=CATTGCCCATGGTCATTTCTA;SOR=0.408;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=81;TCF=30;TCR=51;TR=35;WE=94780616;WS=94780598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,36:0.44:81
chr14	94830555	rs3819333	C	T	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=152;ReadPosRankSum=0.037;SC=GATGTGAGGTCCACCCTCCCC;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=9;WE=94830563;WS=94830545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr14	94831028	rs34362280	G	C	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=199;ReadPosRankSum=-2.279;SC=ACTTCCCTCTGCTTCAGCTTT;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=9;WE=94831036;WS=94831018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr14	94833033	rs1956172	T	C	4571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=84;PP=2965;SC=CAGAGAATGGTATTGTCCTGC;SOR=1.171;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=55;TCR=84;TR=139;WE=94833041;WS=94833023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr14	94909630	rs3818257	C	T	2251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=58;PP=1773;SC=CTCTGTCTGTCGGCAGCCTGA;SOR=3.105;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=11;TCR=59;TR=69;WE=94909638;WS=94909620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr14	94912799	rs12888805	G	A	2254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=21;PP=1815;SC=TCTGGAGGACGGTGCAAGCCA;SOR=1.678;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=44;TCR=21;TR=65;WE=94912807;WS=94912789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr14	94912896	rs1885137	T	G	2569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=41;PP=2171;SC=AAAGAAACTTTCCTGCTTCTG;SOR=1.003;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=35;TCR=41;TR=76;WE=94912904;WS=94912886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr14	94914455	rs10129672	A	T	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=663;SC=TAATTCTGTCAGAGCAAGCCT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=94914463;WS=94914445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	94929541	rs2224418	G	A	2317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=56;PP=1878;SC=AGTAAGAGGGGCCATCCTTCG;SOR=2.568;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=16;TCR=57;TR=72;WE=94929549;WS=94929531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr14	94930956	rs12891900	T	C	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=20;NR=0;PP=560;SC=CAGGCCTCTGTTTCCTTATCA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=94930964;WS=94930946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	94930980	rs11628686	A	G	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=1;PP=573;SC=AAATAAGAGCATGTGATTAAT;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=94930988;WS=94930970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	94931016	rs8020984	T	G	1332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=7;PP=1072;SC=AGCTTGGACTTTTTTGCAAAT;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=37;WE=94931024;WS=94931006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	94931105	rs11628722	A	G	3291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=33;PP=2515;SC=TTTGTCAAAGACATTTTGGAT;SOR=1.542;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=104;TCF=70;TCR=34;TR=103;WE=94931113;WS=94931095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr14	94933709	rs6575433	C	T	2154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=28;NR=39;PP=1847;SC=GAAAGGGCTTCTCCCACTTGG;SOR=1.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=28;TCR=39;TR=67;WE=94933717;WS=94933699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr14	94935901	rs12879019	G	C	1636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.439;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=31;PP=1217;ReadPosRankSum=1.505;SC=TGGAGAATCTGGGTCTTGGTG;SOR=0.790;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=170;TCF=83;TCR=87;TR=70;WE=94935909;WS=94935891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,71:0.41:174
chr14	94942663	rs11850199	C	A	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.884;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=27;PP=662;ReadPosRankSum=-1.150;SC=GCTAGACATGCAAATGATATA;SOR=0.279;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=68;TCF=5;TCR=63;TR=30;WE=94942671;WS=94942653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,30:0.44:68
chr14	95028020	rs910352	C	T	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.205;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=89;ReadPosRankSum=-1.496;SC=AGAAAGGCCCCGACTTAGGGT;SOR=0.255;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=8;WE=95028028;WS=95028010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr14	95033275	rs1005348	T	G	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.209;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=136;ReadPosRankSum=0.736;SC=GGCCTGCAGATGTCCTGTACC;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=95033283;WS=95033265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr14	95033356	rs5510	C	T	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=414;ReadPosRankSum=0.203;SC=CCAAAGACTTCTATGTTGATG;SOR=0.540;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=20;WE=95033364;WS=95033346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr14	95033595	rs5511	A	T	685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.418;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=493;ReadPosRankSum=-0.382;SC=TCAGTGTGCTATGGGGGCTGA;SOR=1.101;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=48;TCF=22;TCR=26;TR=26;WE=95033603;WS=95033585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr14	95033671	rs3827893	A	T	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.28;ReadPosRankSum=-0.290;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
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chr14	95033708	rs17091071	A	C	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=184;ReadPosRankSum=0.563;SC=TGCTCTGAGAACTTCCATGGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=9;WE=95033716;WS=95033698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr14	95034342	rs2070777	T	A	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.438;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=0;PP=665;ReadPosRankSum=-0.148;SC=GAGCCGAAGCTGTTTGTGGGG;SOR=3.338;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=48;TCR=2;TR=30;WE=95034350;WS=95034332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,32:0.62:52
chr14	95035764	rs145967569	G	A	2634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.847;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=44;PP=2108;ReadPosRankSum=-1.350;SC=ACGTGGATGAGGCTGGCACCG;SOR=0.879;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=175;TCF=93;TCR=82;TR=97;WE=95035772;WS=95035754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,99:0.55:181
chr14	95053890	rs6115	G	A	2049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.809;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=41;PP=1601;ReadPosRankSum=-0.209;SC=CCCAGCCAGAGCATCTTCTTC;SOR=0.805;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=178;TCF=87;TCR=91;TR=78;WE=95053898;WS=95053880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,81:0.44:186
chr14	95054176	rs6112	T	C	2222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.159;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=33;PP=1567;ReadPosRankSum=-0.123;SC=ACACTTTCCCTACCAACTTTA;SOR=0.824;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=180;TCF=106;TCR=74;TR=84;WE=95054184;WS=95054166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,88:0.47:186
chr14	95057270	rs6107	G	A	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=38;PP=1184;SC=GCTTCCCAAGGTCTATTCTGT;SOR=2.259;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=49;WE=95057278;WS=95057260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr14	95057344	.	C	CTCCACTCCACTCCAGTTCACTCTATTCAAT	122.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQRankSum=-0.000;QD=30.68;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr14	95057374	.	TTCCAC	T	124	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=124;QD=47.0;SC=CTCTATTCAATTCCACTCCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=95057386;WS=95057364;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr14	95057401	.	T	C	40	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=40;QD=24.9237375157;SC=CCAGTTCACTTTATTCAATTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=95057409;WS=95057391;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,3:0.60:5
chr14	95058360	rs6109	A	G	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=0;PP=553;SC=ACCTGCCCCTAGTGGCCTGGT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=95058368;WS=95058350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	95058462	rs6116	A	C	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=5.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.201;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=730;ReadPosRankSum=-1.179;SC=CGGGGACAATATTCACTTTCA;SOR=0.278;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=63;TCF=48;TCR=15;TR=33;WE=95058470;WS=95058452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,36:0.55:66
chr14	95058631	rs6108	A	T	1484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=42;PP=1283;SC=AAGGGGGCTAAGCTATGGCCC;SOR=4.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=45;WE=95058639;WS=95058621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr14	95078677	rs1884082	G	T	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.323;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=528;ReadPosRankSum=0.790;SC=TCCCAAGCAGGGGGAGGAGTT;SOR=1.164;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=71;TCF=45;TCR=26;TR=32;WE=95078685;WS=95078667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,33:0.45:73
chr14	95080803	rs4934	G	A	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.229;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=5;PP=1028;ReadPosRankSum=-0.432;SC=ACCTCTCCTGGCTCTGGGGCT;SOR=2.098;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=75;TCF=62;TCR=13;TR=45;WE=95080811;WS=95080793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,45:0.60:75
chr14	95081081	rs17826465	A	G	2185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.888;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=52;PP=1950;ReadPosRankSum=-0.506;SC=AGATTCTCAAAGGCCTCAAGT;SOR=1.183;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=151;TCF=57;TCR=94;TR=78;WE=95081089;WS=95081071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,81:0.50:162
chr14	95085465	rs8004988	C	G	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=125;ReadPosRankSum=-0.860;SC=TCCACTGCTGCGGAAGCAGGG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=7;WE=95085473;WS=95085455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr14	95107973	rs4905226	C	T	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.201;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=951;ReadPosRankSum=-1.086;SC=GGGGTTCACCCTCACCGTGGT;SOR=0.437;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=41;WE=95107981;WS=95107963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,39:0.60:65
chr14	95110017	rs1884084	G	T	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.388;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=319;ReadPosRankSum=0.269;SC=AGATGAGGCAGCTGGAAGATG;SOR=0.044;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=17;WE=95110025;WS=95110007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr14	95566103	rs35300142	AC	A	690.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQRankSum=1.418;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.867;SOR=0.484;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,26:0.39:67
chr14	95566105	rs367764979	ACAC	A	684.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQRankSum=1.338;QD=9.51;ReadPosRankSum=2.078;SOR=0.718;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,26:0.36:72
chr14	95566108	.	C	A	433	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=25;MQ=59.34;NF=18;NR=3;PP=433;QD=22.2748196451;SC=CACACACACACAAACTTACCA;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=64;TCF=55;TCR=9;TR=21;WE=95566116;WS=95566098;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:43,21:0.33:64
chr14	95581899	rs2275182	G	A	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.788;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=2;PP=1008;ReadPosRankSum=-0.448;SC=GCAAGTCTAAGTAAAGACTGG;SOR=0.248;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=66;TCF=64;TCR=2;TR=42;WE=95581907;WS=95581889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,44:0.63:70
chr14	95581961	rs11624081	G	A	1535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.126;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=18;PP=1227;ReadPosRankSum=0.575;SC=CTTAAACTGTGCAACATTCCC;SOR=0.930;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=177;TCF=122;TCR=55;TR=65;WE=95581969;WS=95581951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,66:0.37:178
chr14	95682152	rs377356751	CTGTGTGTGTGTGTG	C	1528.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=16;PP=2997;SC=CTCTCTCTCTCTGTGTGTGTG;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=0;TCR=56;TR=16;WE=95682176;WS=95682142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	95682168	.	G	C	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.485;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=1.098;QD=5.76;ReadPosRankSum=-0.274;SOR=0.139;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,16:0.27:59
chr14	95688959	rs945456	C	G	2489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=21;PP=1989;ReadPosRankSum=1.087;SC=TGGGGAGCCTCTGTGCTGGGA;SOR=0.985;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=74;TCF=53;TCR=21;TR=73;WE=95688967;WS=95688949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,77:0.99:78
chr14	95696275	rs72710126	G	A	2832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=11;PP=2294;SC=CCGGCAGGGGGAGGCACTTAT;SOR=3.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=76;TCR=11;TR=87;WE=95696283;WS=95696265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr14	95875342	rs3742345	C	T	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=169;ReadPosRankSum=1.622;SC=CGGACTTCCCCGCAGGAGTGG;SOR=0.297;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=9;WE=95875350;WS=95875332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr14	95884323	rs12434757	G	A	679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=19;PP=560;SC=CACACAGCACGCCCTCCGGAA;SOR=2.833;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=22;WE=95884331;WS=95884313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	95898486	rs112612004	G	GA	1655.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=1.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.66;ReadPosRankSum=0.798;SOR=0.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,78:0.55:142
chr14	95898487	rs1187747	G	A	5298.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.33;SOR=1.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
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chr14	95905840	rs17092236	C	T	1301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=0;PP=933;ReadPosRankSum=-0.119;SC=CGGCCCCTGGCTCCACACTGG;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=61;TCR=0;TR=43;WE=95905848;WS=95905834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,47:0.71:66
chr14	95906321	rs9671369	G	A	1680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.826;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=44;PP=1332;ReadPosRankSum=-0.833;SC=CAGCTTTTGCGTGGTCACAAC;SOR=0.593;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=103;TCF=29;TCR=74;TR=62;WE=95906329;WS=95906311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,63:0.61:103
chr14	95906441	rs910791	A	G	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=416;ReadPosRankSum=-0.791;SC=AGCCCAGGGCATCCTGAGTGC;SOR=1.214;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=18;WE=95906449;WS=95906431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr14	95906476	rs910790	C	T	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.542;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.55;ReadPosRankSum=-0.757;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr14	95910933	rs9919918	T	C	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=780;ReadPosRankSum=-0.454;SC=GCTCAAAAGCTGCTCCAAAGT;SOR=0.623;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=49;TCR=30;TR=41;WE=95910941;WS=95910923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,45:0.54:84
chr14	95911008	rs9919887	A	G	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.630;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=29;PP=853;ReadPosRankSum=0.311;SC=AGCGTTCCTCATGAGCACCGT;SOR=0.302;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=80;TCF=28;TCR=52;TR=47;WE=95911016;WS=95910998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,54:0.58:93
chr14	95911123	rs8007583	G	T	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=231;ReadPosRankSum=2.040;SC=CCCTGATGGAGTTGGGTGCCT;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=10;WE=95911131;WS=95911113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr14	95916566	rs10148435	G	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=107;ReadPosRankSum=-0.210;SC=GCCTTCTCCTGTTTCAGTTGC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=95916574;WS=95916556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr14	95918466	rs7144636	A	G	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.57;ReadPosRankSum=-0.351;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr14	95918473	rs7144641	A	G	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.81;ReadPosRankSum=-1.009;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr14	95918548	rs11362194	AC	A	1813.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.165;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=15;PP=1884;ReadPosRankSum=-1.765;SC=GTTCCAGCACACCCTGAGTCC;SOR=1.174;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=90;TCF=59;TCR=31;TR=51;WE=95918556;WS=95918538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,60:0.62:96
chr14	95918625	rs4905318	T	C	2590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.295;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=45;PP=1848;ReadPosRankSum=0.454;SC=TATCAGAGAGTGGCTTCAGGT;SOR=0.487;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=142;TCF=80;TCR=62;TR=97;WE=95918633;WS=95918615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,102:0.69:147
chr14	95918741	rs4905319	G	A	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.31;ReadPosRankSum=0.121;SOR=1.378;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr14	95918745	rs4905320	C	T	1158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.65;ReadPosRankSum=1.027;SOR=1.225;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,30:0.61:49
chr14	95918759	rs4905321	C	T	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=1900;ReadPosRankSum=0.410;SC=AGGTGAGGCTCCTCAACAGGA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=21;WE=95918767;WS=95918731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr14	95921741	rs4905324	C	T	1900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=15;PP=1479;ReadPosRankSum=3.321;SC=GTGCCACCAGCTCGTCCTCGG;SOR=0.826;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=93;TCF=72;TCR=21;TR=69;WE=95921749;WS=95921731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,71:0.72:98
chr14	95923421	rs375479710	CAA	C	219.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=5.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.94;MQRankSum=1.118;QD=8.79;ReadPosRankSum=1.427;SOR=2.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr14	95923470	rs146162422	ACTGTC	A	3101.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.360;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.98;MQRankSum=0.857;NF=43;NR=22;PP=2954;ReadPosRankSum=1.201;SC=ACCCTCTGTGACTGTCCCTAG;SOR=0.983;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=120;TCF=76;TCR=44;TR=65;WE=95923482;WS=95923459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,79:0.59:135
chr14	95923670	rs2024863	A	C	2305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=62;PP=1785;ReadPosRankSum=1.173;SC=GCAGATCTACACGCTTCTGTG;SOR=0.740;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=40;TCR=106;TR=85;WE=95923678;WS=95923660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,87:0.59:147
chr14	95923756	rs10610273	GGT	G	80.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=0.744;QD=4.49;ReadPosRankSum=0.699;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr14	95932223	rs12434921	A	G	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=130;ReadPosRankSum=-1.095;SC=GGGTGGATACATGGATGGGTG;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=11;WE=95932231;WS=95932213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr14	95932628	rs4900270	T	C	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.570;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=354;ReadPosRankSum=1.683;SC=ACCTGCCTCCTGGGTCGGGGG;SOR=0.146;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=61;TCF=2;TCR=59;TR=24;WE=95932636;WS=95932618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,26:0.38:68
chr14	95999820	rs3825546	T	C	3829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=70;PP=2965;SC=GTGGCAACAGTGACCAGAAAC;SOR=0.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=58;TCR=70;TR=127;WE=95999828;WS=95999810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr14	96009307	rs716315	C	T	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.689;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=8;PP=610;ReadPosRankSum=0.893;SC=CATTTTGTTACAGTCATCATC;SOR=1.183;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=28;WE=96009315;WS=96009297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr14	96103099	rs4905366	A	G	2166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=23;PP=1714;SC=TCACCTCACCATCTGCTCAGG;SOR=1.734;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=53;TCR=23;TR=75;WE=96103107;WS=96103089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr14	96103269	rs11160283	G	A	1354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=36;PP=1080;SC=TCTACTACACGCCCAGCCCTG;SOR=3.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=44;WE=96103277;WS=96103259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr14	96131432	rs1743491	A	G	2195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=50;PP=1698;SC=TGGAGGTGATATGCTTGAGAT;SOR=1.965;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=19;TCR=50;TR=69;WE=96131440;WS=96131422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr14	96135857	rs1748965	C	T	2260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.627;NF=69;NR=13;PP=1821;ReadPosRankSum=-0.124;SC=TGAGCCACCACGCCCGGTCAC;SOR=0.717;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=116;TCF=98;TCR=18;TR=82;WE=96135865;WS=96135847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,82:0.69:118
chr14	96152728	rs11160284	T	C	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=2;PP=1051;SC=ACGCCGGAGCTGCTCCATTTA;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=39;WE=96152736;WS=96152718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	96157187	rs1064017	G	A	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FS=7.470;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.68;ReadPosRankSum=-1.190;SOR=0.567;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:131,49:0.27:180
chr14	96157331	rs2075770	G	T	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.939;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=32;PP=840;ReadPosRankSum=0.492;SC=TGGCCCCCTTGGGGTTCTTGT;SOR=0.246;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=59;TCF=4;TCR=55;TR=36;WE=96157339;WS=96157321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,36:0.59:61
chr14	96157482	rs1743530	C	T	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.620;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=134;ReadPosRankSum=0.091;SC=GGGAAATCCACAAGCTGGAGT;SOR=0.025;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=9;WE=96157490;WS=96157472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr14	96157698	rs1748958	A	G	1741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=38;PP=1444;SC=TGTGCGTCTCAGTGTAGGGAT;SOR=1.355;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=61;WE=96157706;WS=96157688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	96179118	.	GA	G	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=0.000;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=3.089;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=3.525;QD=0.25;ReadPosRankSum=-0.658;SOR=1.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,23:0.14:164
chr14	96556828	rs2369421	C	T	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=272;ReadPosRankSum=0.255;SC=GGCCAGACGCCGCTGTAGCCA;SOR=0.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=15;WE=96556836;WS=96556818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,15:0.31:48
chr14	96556914	rs2093722	T	C	3740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=43;PP=2804;SC=TCCAAGCCAATGCTGTCCTTC;SOR=1.342;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=75;TCR=43;TR=118;WE=96556922;WS=96556904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr14	96557121	rs10148419	T	C	3801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=43;PP=2944;SC=GCTTGGAGGCTGGCCAGACCA;SOR=1.292;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=76;TCR=43;TR=119;WE=96557129;WS=96557111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr14	96671139	rs1799722	C	T	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.001;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=344;ReadPosRankSum=0.641;SC=GATGACATCACTACCCAGCCC;SOR=1.405;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=57;TCF=38;TCR=19;TR=23;WE=96671147;WS=96671129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,23:0.40:58
chr14	96671222	rs5223	G	T	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.279;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=336;ReadPosRankSum=0.551;SC=GGGACGGTGGGGACGGTGGGG;SOR=1.874;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=20;WE=96671230;WS=96671212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,21:0.37:57
chr14	96703484	rs1046248	C	T	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.866;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=560;ReadPosRankSum=-0.500;SC=TCTGTCTGTTCGTGAGGACTC;SOR=0.478;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=84;TCF=30;TCR=54;TR=32;WE=96703492;WS=96703474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,34:0.40:85
chr14	96707457	rs5224	A	G	1649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.738;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=37;PP=1138;ReadPosRankSum=0.706;SC=AGATCCAGACAGAGAGGAGGG;SOR=0.618;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=224;TCF=120;TCR=104;TR=73;WE=96707465;WS=96707447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,78:0.33:234
chr14	96728916	rs885842	C	A	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.85;ReadPosRankSum=-0.327;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr14	96728961	rs3073017	TTTG	T	116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQRankSum=-0.000;QD=10.61;ReadPosRankSum=-0.096;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr14	96730142	rs2071084	A	G	3082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=50;PP=2522;SC=GAGTGCTGCCAACATTTATCA;SOR=0.772;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=52;TCR=50;TR=102;WE=96730150;WS=96730132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr14	96730740	rs45528332	G	A	1633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=1290;ReadPosRankSum=1.178;SC=GACAAGGTGCGGGGGCCGCAA;SOR=0.614;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=42;TCR=39;TR=52;WE=96730748;WS=96730730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,57:0.66:87
chr14	96734584	rs11160324	T	A	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=308;ReadPosRankSum=0.802;SC=CTCATCTGACTCCAACACCAA;SOR=1.981;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=14;WE=96734592;WS=96734575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr14	96742603	rs12893091	G	A	2238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.591;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=54;PP=1766;ReadPosRankSum=1.976;SC=AGCTGAAATGGAGGCGTGAGG;SOR=0.479;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=126;TCF=39;TCR=87;TR=81;WE=96742611;WS=96742593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,82:0.64:128
chr14	96757361	rs10454690	T	A	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=662;SC=TTAAAACAAATTCTACAAATT;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=96757369;WS=96757351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	96758160	rs2275022	C	T	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=589;ReadPosRankSum=1.488;SC=AAATATATATCTTACAATACA;SOR=1.802;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=21;WE=96758168;WS=96758150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr14	96761514	rs45468796	T	A	1325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.821;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=42;PP=1053;ReadPosRankSum=-2.091;SC=ACTGAAAATGTAATGTGCATG;SOR=0.224;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=167;TCF=34;TCR=133;TR=59;WE=96761522;WS=96761504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,58:0.34:171
chr14	96761557	rs1770547	A	C	3226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=88;PP=2739;ReadPosRankSum=1.895;SC=TTCTTAGCAAACATTTAAATC;SOR=4.429;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=4;TCR=89;TR=92;WE=96761565;WS=96761547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,94:0.99:95
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chr14	96779895	rs1890914	A	G	189.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5731;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=147;ReadPosRankSum=0.887;SC=GAAAATCATAACGGTAAAAGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=96779903;WS=96779885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr14	96781912	rs9323945	T	C	3148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=60;PP=2510;SC=ATCACTCCATTCACTATGCCT;SOR=1.361;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=36;TCR=61;TR=96;WE=96781920;WS=96781902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr14	96783464	rs17094014	C	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=135;ReadPosRankSum=-1.028;SC=AAAAACACTTCGGATTTGTAA;SOR=0.138;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=9;WE=96783472;WS=96783454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,9:0.26:34
chr14	96783727	rs17094017	A	T	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.695;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=243;ReadPosRankSum=-0.290;SC=TCATGAAAATATTTTATATAA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=13;WE=96783735;WS=96783717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr14	96790337	rs34296665	T	TA	585.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=358;ReadPosRankSum=-1.220;SC=GGAACGATCCTAAAAAAAAAG;SOR=0.740;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=87;TCF=15;TCR=72;TR=27;WE=96790345;WS=96790327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,31:0.38:82
chr14	96795997	rs17094019	G	C	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.460;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=278;ReadPosRankSum=0.322;SC=CACCATTTAAGATTATTAGTG;SOR=0.204;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=14;WE=96796005;WS=96795987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr14	96797724	rs1822372	G	A	4877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=119;NR=24;PP=2965;SC=TAAGGTGATCGTGTGAGCAAG;SOR=2.995;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=119;TCR=24;TR=143;WE=96797732;WS=96797714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr14	96813703	rs4905483	A	T	1067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=24;PP=773;SC=CAGGTTCATTATGAATCACAA;SOR=3.545;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=96813711;WS=96813693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	96829290	rs12434329	G	A	1686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.959;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=34;PP=1236;ReadPosRankSum=0.839;SC=TCTTCTTGATGGACTCCGAAA;SOR=0.296;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=88;TCF=33;TCR=55;TR=59;WE=96829298;WS=96829280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,63:0.68:93
chr14	96852071	rs1545280	T	C	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=23;PP=694;ReadPosRankSum=0.437;SC=AATGTTGATATAAAGCTTAAA;SOR=0.732;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=32;WE=96852079;WS=96852061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,35:0.69:51
chr14	96858667	rs3742473	A	G	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=29;PP=624;ReadPosRankSum=-0.157;SC=CGGTCCGCAAACCCAGCGAGG;SOR=0.916;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=80;TCF=4;TCR=76;TR=30;WE=96858675;WS=96858657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,30:0.37:81
chr14	96864309	rs8019939	A	G	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.55;ReadPosRankSum=-1.645;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr14	96909025	rs12431832	A	G	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.345;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=13;PP=883;ReadPosRankSum=-1.412;SC=ATAGCCATCCACATATAACTG;SOR=0.907;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=192;TCF=151;TCR=41;TR=63;WE=96909033;WS=96909015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,64:0.32:197
chr14	96916228	rs10444759	C	T	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=117;ReadPosRankSum=-0.057;SC=TTAGTATATGCGGTGTTTTTT;SOR=0.223;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=8;WE=96916240;WS=96916218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr14	96916232	rs11424079	G	GT	472.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=12;PP=224;SC=TATATGCGGTGTTTTTTTTTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=12;WE=96916240;WS=96916218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	96922752	rs2369679	C	G	3420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.120;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=82;PP=2647;ReadPosRankSum=-1.165;SC=AATTGGCCAACTACTACAAAC;SOR=2.649;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=105;TCF=22;TCR=83;TR=103;WE=96922760;WS=96922742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,109:0.98:111
chr14	96939108	rs60920648	T	C	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.224;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=424;ReadPosRankSum=-0.154;SC=TTTATTTCCCTAAGATCACAT;SOR=1.646;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=19;WE=96939116;WS=96939098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr14	96987437	rs10139164	A	G	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5026;FS=3.468;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=283;ReadPosRankSum=0.431;SC=TATATGAAATAATTTCATATA;SOR=2.303;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=12;WE=96987445;WS=96987427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr14	96993995	rs7146883	A	G	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=200;ReadPosRankSum=-1.139;SC=ACCTTTCTAAACACTTGGCAT;SOR=1.426;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=9;WE=96994003;WS=96993985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr14	96998621	rs10533972	TTG	T	478.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.73;QD=31.92;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	97022123	rs146485027	AT	A	1055.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.945;NF=50;NR=0;PP=704;ReadPosRankSum=0.120;SC=GATTATTGTAATTTTTTTTTT;SOR=1.852;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=75;TCF=75;TCR=0;TR=50;WE=97022131;WS=97022113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,50:0.70:71
chr14	97299853	rs2145635	A	G	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.032;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=14;PP=922;ReadPosRankSum=-0.758;SC=AGAGCTCTGCAAAGAGACATC;SOR=1.473;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=213;TCF=148;TCR=65;TR=66;WE=97299861;WS=97299843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,67:0.30:225
chr14	97312642	rs1951311	G	A	273.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=195;SC=TGGGATTTGTGTGAAAGAATT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=97312650;WS=97312632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	97342500	rs45457797	C	G	3068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.759;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=79;PP=2352;ReadPosRankSum=-0.454;SC=TAGGTAAACACAAATTTCATT;SOR=0.817;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=152;TCF=34;TCR=118;TR=101;WE=97342508;WS=97342490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,105:0.67:156
chr14	98112541	rs12435621	T	G	2179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.006;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=39;PP=1710;ReadPosRankSum=-0.138;SC=TGACTTCTCCTTCTTCATTCT;SOR=0.437;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=144;TCF=85;TCR=59;TR=89;WE=98112549;WS=98112531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,90:0.61:148
chr14	98217929	rs12893126	T	C	551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=469;SC=TGAGGGGGACTGAGAGGAACG;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=98217937;WS=98217919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	98435696	rs2124843	T	C	9088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=135;NR=147;PP=2965;SC=AATATGGCTGTAAAGCTCGGT;SOR=0.785;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=282;TCF=135;TCR=147;TR=282;WE=98435704;WS=98435686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr14	98444253	rs8015127	C	A	1942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=10;PP=1570;SC=CTGTAGGGACCATTTCCCACC;SOR=3.150;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=49;TCR=10;TR=59;WE=98444261;WS=98444243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr14	98444285	rs12890382	G	C	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.18;ReadPosRankSum=-0.098;SOR=0.535;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,13:0.17:75
chr14	98444369	rs8016584	T	C	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=41;PP=1860;SC=ACCAAGCTGGTTTCCTCTCCG;SOR=1.473;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=26;TCR=41;TR=67;WE=98444377;WS=98444359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr14	99392468	rs200318	C	G	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=418;ReadPosRankSum=-1.187;SC=TGCATCACCTCTGTGTTGGCG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=17;WE=99392476;WS=99392458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr14	99640905	rs74649889	G	A	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.617;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=13;PP=730;ReadPosRankSum=1.082;SC=GCAGGTCCCCGGGCGGCGTGG;SOR=0.532;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=127;TCF=91;TCR=36;TR=44;WE=99640913;WS=99640895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,46:0.35:131
chr14	99642360	rs1152783	C	G	989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.020;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=723;ReadPosRankSum=-1.072;SC=CCACGGCCTCCGGCCCGAGCG;SOR=1.051;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=157;TCF=74;TCR=83;TR=50;WE=99642368;WS=99642350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,50:0.31:162
chr14	99642647	rs2487507	T	A	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=26;PP=669;ReadPosRankSum=0.431;SC=GGGATCCCAGTGCCCTGCCTG;SOR=0.808;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=27;WE=99642655;WS=99642637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,29:0.71:41
chr14	99737635	.	G	GCGCCGCTGC	606.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.983;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.313;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=2.313;NF=4;NR=10;PP=1814;ReadPosRankSum=-1.195;SC=AGCCGCCGCCGCGCCGCTGCC;SOR=0.465;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=14;WE=99737643;WS=99737625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr14	99871812	rs1262304	T	G	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.403;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=27;PP=680;ReadPosRankSum=-0.744;SC=ATTTAGACACTAAATAGCTGA;SOR=0.376;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=71;TCF=8;TCR=63;TR=31;WE=99871820;WS=99871802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,34:0.46:74
chr14	99876505	rs1047351	A	G	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.429;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=548;ReadPosRankSum=2.034;SC=TAAGGAATGGAGGGTCTTAGG;SOR=0.465;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=27;WE=99876513;WS=99876495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr14	99924979	rs67963270	TAA	T	636.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=443;ReadPosRankSum=0.272;SC=TTGTAACATTTAAAGTCAGGT;SOR=0.314;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=13;WE=99924988;WS=99924969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr14	99929801	rs2273386	G	A	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=267;ReadPosRankSum=0.301;SC=TTAAAATACAGTTATCATTCT;SOR=0.556;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=15;WE=99929809;WS=99929791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr14	99961830	rs2069492	T	C	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=237;ReadPosRankSum=-0.798;SC=TTGTTTCCCTTTTAGGTGACA;SOR=1.244;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=11;WE=99961838;WS=99961820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr14	99981858	rs11621993	G	A	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=384;ReadPosRankSum=-0.338;SC=GCTAACTATCGGGCCTGAGCA;SOR=0.358;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=18;WE=99981866;WS=99981848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr14	99988724	rs2400681	A	G	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=168;SC=CCGCTTATCCATCCCCCGAGC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=99988732;WS=99988714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	100002473	rs12882209	A	G	1791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=36;PP=1473;SC=AGCAGACTCCATCCCCATTGC;SOR=1.316;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=23;TCR=36;TR=59;WE=100002481;WS=100002463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr14	100046271	rs34139518	T	TC	2234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.045;NF=52;NR=12;PP=2246;ReadPosRankSum=-0.358;SC=TCTGGCTCAGTCCAAGACTTT;SOR=0.620;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=154;TCF=127;TCR=27;TR=64;WE=100046279;WS=100046261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,76:0.48:157
chr14	100069742	rs8007401	G	A	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQRankSum=0.000;QD=4.70;ReadPosRankSum=-1.888;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr14	100125721	rs7145262	C	T	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=2;PP=373;SC=TGAGCCCTGGCTCAGGGCGAC;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=100125729;WS=100125711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	100129327	rs34890784	G	A	1418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.188;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=38;PP=1096;ReadPosRankSum=-1.233;SC=ACTACTACCCGTACATCATCT;SOR=1.125;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=147;TCF=56;TCR=91;TR=57;WE=100129335;WS=100129317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,59:0.40:149
chr14	100135306	rs12436072	G	A	2707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=73;PP=2159;SC=CCCAGGGCCAGGGTGGGGCCC;SOR=5.969;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=3;TCR=74;TR=76;WE=100135314;WS=100135296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr14	100150975	rs61984440	T	C	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.4;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=83;ReadPosRankSum=0.783;SC=CCTCGCCTAGTGCGCGCGGCC;SOR=0.412;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=5;WE=100150983;WS=100150965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr14	100158241	rs4900442	C	T	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.842;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=29;PP=732;ReadPosRankSum=0.518;SC=CCCTGCCTTTCCTTGGGTTGG;SOR=1.531;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=59;TCF=11;TCR=48;TR=34;WE=100158249;WS=100158231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,35:0.59:59
chr14	100166228	rs3742377	G	A	1955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=6.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=10;PP=1596;ReadPosRankSum=-0.068;SC=ACAATGTGGCGCAACCGTCGC;SOR=0.997;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=132;TCF=110;TCR=22;TR=72;WE=100166236;WS=100166218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,74:0.54:138
chr14	100166300	rs943881	T	C	2746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.485;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=56;PP=2194;ReadPosRankSum=1.588;SC=CATCAAGCAGTCGCTCCCCAC;SOR=0.637;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=232;TCF=108;TCR=124;TR=106;WE=100166308;WS=100166290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,110:0.48:228
chr14	100166489	rs943880	G	C	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=228;ReadPosRankSum=-0.670;SC=AGGCAGTAGGGGCTGCCGAAG;SOR=0.638;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=15;WE=100166497;WS=100166479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr14	100172899	rs2273839	A	G	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.241;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=21;ReadPosRankSum=-0.330;SC=TCTGCACAGTATCCTCTCTGT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=3;WE=100172907;WS=100172889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr14	100174092	rs34955990	A	AT	196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.86;MQRankSum=1.111;QD=13.12;ReadPosRankSum=-0.281;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr14	100174178	rs36018216	G	A	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.426;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=-1.020;SC=ATTGCCTAAAGTAAAGGCTTA;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=8;WE=100174186;WS=100174168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr14	100182082	rs3752957	T	C	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.041;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=309;ReadPosRankSum=0.938;SC=TTCGGGGTGGTGGGGGAGAGG;SOR=0.278;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=17;WE=100182090;WS=100182072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr14	100184589	rs7151522	A	G	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=215;ReadPosRankSum=-2.342;SC=GCCTTGGCACATGCTGTTCCC;SOR=0.126;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=12;WE=100184597;WS=100184579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr14	100189423	rs12896665	A	G	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=431;ReadPosRankSum=0.474;SC=CCGATTTTGTATCTGCTGCCA;SOR=0.551;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=22;WE=100189431;WS=100189413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr14	100317376	rs72708401	G	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=283;ReadPosRankSum=0.941;SC=ACCAAAGGTGGGCGTTTGAGT;SOR=2.437;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=13;WE=100317384;WS=100317366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr14	100331876	rs11160553	T	C	2915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=36;PP=2283;SC=AGACCCTGCCTTTAAGAACCA;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=54;TCR=36;TR=90;WE=100331884;WS=100331866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr14	100344698	rs1191118	T	C	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=261;SC=TGATCTCCGTTGCTAGGCCTG;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=100344706;WS=100344688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	100363336	rs17652784	T	C	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=310;SC=GTATTTGTCATGGAATATTTG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=100363344;WS=100363326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	100363671	rs2273707	GA	CG	962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=14;PP=923;SC=CTCAGAAGGCGAAGGTAGGAG;SOR=2.737;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=18;WE=100363680;WS=100363661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	100376715	rs2145859	G	A	1150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=31;PP=862;SC=ATGGTTTTTGGTAATGTTGTA;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=100376723;WS=100376705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	100380948	rs2250718	T	C	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=18;PP=756;SC=TGCCTCAAAATCTCAGTTCTT;SOR=1.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=29;WE=100380956;WS=100380938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	100384032	rs75719251	TTGTG	T	1873.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=4;PP=1703;SC=GTGTGAGCGTTTGTGTGTGCA;SOR=3.767;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=33;WE=100384043;WS=100384022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr14	100387242	rs34263849	A	AT	4380.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=128;PP=2979;SC=TCACTACTTTATTTTTTTAAT;SOR=3.797;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=155;TCF=11;TCR=144;TR=137;WE=100387250;WS=100387232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr14	100404351	rs2295787	T	C	1768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=43;PP=1406;SC=TCTTGTCAGATTGCTCGGCTG;SOR=2.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=11;TCR=43;TR=54;WE=100404359;WS=100404341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr14	100406193	rs4900449	T	A	1361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=3;PP=1073;SC=CAGAGCAGGTTCCCAAGTGAG;SOR=4.664;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=42;WE=100406201;WS=100406183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr14	100563682	rs140837823	TG	T	84.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.908;NF=4;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=-1.017;SC=TACCTGATATTGCTTTTCCCT;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=100563690;WS=100563673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr14	100592959	rs726514	G	A	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.314;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=120;ReadPosRankSum=0.190;SC=CTCTGAAGCCGGGGCCGGCGG;SOR=0.074;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=8;WE=100592967;WS=100592949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr14	100607360	rs1951486	T	C	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=405;ReadPosRankSum=1.084;SC=GGGCGTTAAATCCTTCTCAGG;SOR=0.651;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=20;WE=100607368;WS=100607350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr14	100608274	rs4905933	T	C	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=35;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TTACCATCTCTAGTTGAGGAA;SOR=0.991;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=3;WE=100608282;WS=100608264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr14	100615665	rs4905936	T	C	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.178;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=481;ReadPosRankSum=-0.909;SC=TGCGGGCGGGTGTGCAGAAGA;SOR=1.207;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=98;TCF=42;TCR=56;TR=34;WE=100615673;WS=100615655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,37:0.37:100
chr14	100740904	rs4905942	G	C	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=1;PP=305;SC=CATCCTTTCTGCTTCATGGAA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=100740912;WS=100740894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	100759738	rs3809409	A	C	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.544;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=367;ReadPosRankSum=0.616;SC=GTCCAGTGAGAGGCAGGCAGG;SOR=0.375;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=22;WE=100759746;WS=100759728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr14	100765112	rs199982792	C	T	2268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.352;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=27;PP=1794;ReadPosRankSum=-1.380;SC=GGCTTCCAGCCACCCCAACCC;SOR=1.464;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=158;TCF=97;TCR=61;TR=86;WE=100765120;WS=100765102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,87:0.53:164
chr14	100772672	rs11557209	G	C	69.82	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=41;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TGCCGGGGCTGGGCCTGGCCG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=100772680;WS=100772662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr14	100792093	rs9324019	C	G	1151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=4;PP=930;ReadPosRankSum=1.377;SC=CGGCCCCACTCTCCTCACCGT;SOR=0.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=62;TCR=7;TR=38;WE=100792101;WS=100792083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,40:0.57:70
chr14	100792220	rs7155877	C	T	7545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=60.04;NF=141;NR=86;PP=2965;SC=CACCTGTCCACGGCCAGGAGA;SOR=1.260;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=227;TCF=141;TCR=86;TR=227;WE=100792228;WS=100792210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr14	100792482	rs1951519	C	A	2571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=47;PP=2119;SC=CTGAAGCCCACTTCTCCTGCA;SOR=1.264;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=30;TCR=47;TR=77;WE=100792490;WS=100792472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr14	100795139	rs35007880	G	T	1084.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.267;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=842;ReadPosRankSum=-1.613;SC=CAGCAGCGGCGGCTTTCGGCC;SOR=0.338;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=82;TCF=50;TCR=32;TR=40;WE=100795147;WS=100795129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,41:0.49:84
chr14	100795630	rs4905950	C	T	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.917;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=311;ReadPosRankSum=-0.063;SC=GGGCCGGAAGCGTGAGTCCAG;SOR=0.197;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=15;WE=100795638;WS=100795620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr14	100795663	rs10147903	G	A	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=527;ReadPosRankSum=0.673;SC=TGGGCGCCCCGATCAGGCTCC;SOR=0.620;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=24;WE=100795671;WS=100795653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr14	100801423	rs2234532	T	C	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=23;PP=505;SC=ATGTCCTGAGTGGCTCCTTCC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=100801431;WS=100801413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	100803364	rs2234530	A	G	1855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=9;PP=1501;SC=TGGGTGGCAGAAGGCGGCTGT;SOR=2.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=44;TCR=9;TR=53;WE=100803372;WS=100803354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr14	100803655	rs2234528	C	A	1134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=32;PP=1003;SC=ATTCTGGACCCGGGAAAGGCC;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=100803663;WS=100803645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr14	100808493	rs5810992	G	GA	1412.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=6;PP=958;SC=AGGAAAAAAAGAAAAAAAATT;SOR=2.970;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=37;WE=100808501;WS=100808483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr14	100808510	rs1373	T	A	2149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=15;PP=1565;SC=AATTCAAAATTTTACCTAAAT;SOR=2.336;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=52;TCR=15;TR=67;WE=100808518;WS=100808500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr14	100808845	rs9453	G	A	825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=19;PP=679;SC=GTGGAGTGCAGCAGGGCTGGT;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=100808853;WS=100808835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	100813077	rs941923	T	C	2254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=9;PP=1864;SC=GCAGTGGGCCTCTTACCAATG;SOR=3.849;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=58;TCR=9;TR=67;WE=100813085;WS=100813067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr14	100820980	rs1009812	G	A	1272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=35;PP=1030;SC=TTTGGAAATGGAAAATATAGA;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=100820988;WS=100820970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr14	100826773	rs2234524	C	G	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=6;PP=697;SC=TCAGTCTTACCACAGCTGGCC;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=100826781;WS=100826763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	100831835	rs1998902	C	T	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=242;SC=GAGAATCGCTCGAACTCAGGA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=100831843;WS=100831825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	100832252	rs724392	C	T	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.606;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=310;ReadPosRankSum=0.072;SC=GTTACGGAATCACCCAAAGGT;SOR=3.258;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=15;WE=100832260;WS=100832242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr14	100832282	rs2146105	C	G	1356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=9;PP=1152;SC=AGTGACCTTGCGCACTTACAG;SOR=2.419;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=40;WE=100832290;WS=100832272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	100832391	rs724391	T	C	2057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=36;PP=1407;SC=GCCAAGGGAGTGTCACAGTTT;SOR=0.811;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=31;TCR=36;TR=67;WE=100832399;WS=100832381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr14	100847523	rs2181170	T	C	3476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=45;PP=2654;SC=GAGAAGCGATTGGGGATCTTG;SOR=1.009;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=63;TCR=45;TR=108;WE=100847531;WS=100847513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr14	100847707	rs2273800	A	G	1689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.261;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=39;PP=1280;ReadPosRankSum=0.585;SC=TCATCTTTCCATGCTCAAAGT;SOR=0.839;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=132;TCF=63;TCR=69;TR=67;WE=100847715;WS=100847697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,71:0.51:140
chr14	100847930	rs3742387	A	G	1554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.984;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=37;PP=1191;ReadPosRankSum=0.872;SC=TTATTCAGCCATATTTGAATA;SOR=1.077;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=137;TCF=62;TCR=75;TR=63;WE=100847938;WS=100847920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,67:0.47:143
chr14	101007072	rs6575788	C	G	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=28;PP=795;SC=CCCTCTCTGGCCTCCACACTC;SOR=5.353;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=101007080;WS=101007062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	101138230	rs8011237	A	C	3864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=41;PP=2965;SC=CTCTCCTAGAACTTTCTGTCG;SOR=1.336;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=76;TCR=42;TR=117;WE=101138238;WS=101138220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr14	101194944	rs10151914	T	G	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=3;PP=55;SC=TGGGGCGAGCTGGGGAGATGG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=101194952;WS=101194934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr14	101198417	rs6575799	A	G	2454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=26;PP=1885;SC=TGCCAACAACAGGACCTGCGT;SOR=1.954;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=59;TCR=26;TR=85;WE=101198425;WS=101198407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr14	101301038	rs3194464	C	G	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.187;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=284;ReadPosRankSum=0.368;SC=CAGCACCAGCCTGGCACAGAG;SOR=1.469;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=18;WE=101301046;WS=101301028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr14	101311729	rs56363527	C	T	1174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=588;ReadPosRankSum=0.539;SC=TGTCCTCATCCGCCCTCCTCC;SOR=0.646;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=61;TCF=50;TCR=11;TR=28;WE=101311737;WS=101311719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr14	101311747	rs144425654	C	T	1299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=10;PP=630;ReadPosRankSum=0.600;SC=TCCTCCTCGCCGGCCTGAGTG;SOR=0.665;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=81;TCF=56;TCR=25;TR=34;WE=101311755;WS=101311737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,37:0.43:87
chr14	101349017	rs6575805	A	G	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.201;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=907;ReadPosRankSum=0.528;SC=GGGAGAGCGCAAACGGCTGGT;SOR=0.664;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=82;TCF=41;TCR=41;TR=46;WE=101349025;WS=101349007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,50:0.59:85
chr14	101391354	rs34857222	G	T	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=535;ReadPosRankSum=1.534;SC=ACAAAGAAATGTGTAAGTGAA;SOR=0.462;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=25;WE=101391362;WS=101391344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr14	101403072	rs1956732	T	C	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr14	101403075	rs1956731	C	A	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr14	101406011	rs1951026	G	A	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=9;PP=335;SC=ATGAGTCTAGGACCTTGTTCA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=13;WE=101406030;WS=101406001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	101406022	rs1951025	T	A	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=112;ReadPosRankSum=1.314;SC=ACCTTGTTCATGGGCCTTTTG;SOR=0.160;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=7;WE=101406030;WS=101406001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr14	101409763	rs35829821	A	G	1299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.025;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=24;PP=953;ReadPosRankSum=-0.231;SC=GAAGGTATACATGAATGAAGA;SOR=1.025;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=141;TCF=83;TCR=58;TR=63;WE=101409771;WS=101409753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,62:0.43:144
chr14	101411953	rs12433065	A	G	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.257;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=417;ReadPosRankSum=0.805;SC=ATCAATAAACAAAGGTATAAA;SOR=1.402;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=24;WE=101411961;WS=101411943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr14	101412173	rs11847325	G	C	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=303;SC=TTTTAGTAAAGAAGTATATGG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=101412181;WS=101412163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	101418192	rs10713875	TG	T	915.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=60.37;NF=15;NR=8;PP=965;SC=GGCCCAAGCTTGGGACCAATG;SOR=1.781;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=23;WE=101418200;WS=101418182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	101420572	rs8015089	G	A	201.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=162;SC=TATCAAAGTGGCAGATTATAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=101420580;WS=101420563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	101423634	rs12887775	T	C	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=514;ReadPosRankSum=0.946;SC=TATTTAAGAATATATAAGGAT;SOR=0.563;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=9;TCR=45;TR=24;WE=101423642;WS=101423624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,24:0.42:57
chr14	101429287	rs34448411	G	A	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.782;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=114;ReadPosRankSum=1.633;SC=ATACTGTTCTGTGGAATTTGT;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=7;WE=101429295;WS=101429277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr14	101429459	rs72700530	G	C	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.491;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=337;ReadPosRankSum=-1.675;SC=CTGAGACTCTGAGGTTAGTAC;SOR=1.211;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=18;WE=101429467;WS=101429449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr14	101429568	rs16791	G	A	1119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=27;PP=840;SC=TAGTTCATGAGTTTTGATTGT;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=33;WE=101429576;WS=101429558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	101429659	rs17172	G	A	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=284;SC=ATTATGAAATGTGAGGTGAGG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=101429667;WS=101429649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	101431194	rs4547276	A	G	3780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=89;PP=2965;SC=GTCTGTTAGAAAAGATACATG;SOR=2.854;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=22;TCR=89;TR=111;WE=101431202;WS=101431184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr14	101431216	rs34144313	C	G	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.255;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=43;PP=994;ReadPosRankSum=-0.558;SC=CCCATTCTCTCTGTTTCAAAT;SOR=1.097;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=89;TCF=11;TCR=78;TR=48;WE=101431224;WS=101431206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,50:0.54:93
chr14	101432440	rs111435301	C	CAGA	5672.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=74;PP=2965;SC=AGGTCCATCACAGAAGTAGAG;SOR=1.151;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=123;TCF=38;TCR=85;TR=106;WE=101432448;WS=101432430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr14	101433469	rs67466596	A	T	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.789;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=754;ReadPosRankSum=-2.419;SC=ATCACAAAAGAAATCTGGCCC;SOR=0.450;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=93;TCF=33;TCR=60;TR=39;WE=101433477;WS=101433459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,40:0.41:97
chr14	101433552	rs2145502	C	T	1188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=27;PP=886;SC=GTTCACTTCACTGTATTATTA;SOR=3.026;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=33;WE=101433560;WS=101433542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	101434356	rs4143956	A	T	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=125;ReadPosRankSum=-0.909;SC=TTCAAGAATCATATTCTTTTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=7;WE=101434364;WS=101434346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr14	101435371	rs12432302	A	G	1810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.477;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=40;PP=1370;ReadPosRankSum=1.081;SC=AGAAAAGAAAACCAGTTCTTT;SOR=1.939;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=56;WE=101435379;WS=101435361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,59:0.98:60
chr14	101436159	rs34955121	GT	G	509.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=634;ReadPosRankSum=-1.322;SC=GTATTTCTTTGTTAATACATT;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=18;WE=101436167;WS=101436149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
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chr14	101439870	rs1956727	G	T	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=1;PP=716;SC=GACTGATGTGGATTTCTTATT;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=101439878;WS=101439860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	101439916	rs1956726	T	G	1571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=4;PP=1337;SC=GTATTAGTGTTAAATCAAAGA;SOR=4.317;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=40;TCR=4;TR=44;WE=101439924;WS=101439906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr14	101440072	rs150296823	CTTG	C	657.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.029;NF=1;NR=15;PP=622;ReadPosRankSum=1.041;SC=ATATGAGGACCTTGTTGTTGA;SOR=0.223;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=16;WE=101440082;WS=101440062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr14	101442218	rs12893444	A	G	6024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=96;NR=86;PP=2965;SC=TACATGTCTGAAATTCTGAGG;SOR=0.852;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=96;TCR=86;TR=182;WE=101442226;WS=101442208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr14	101442692	rs28586880	T	G	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.163;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=301;ReadPosRankSum=1.911;SC=TGAGAATGGTTTTAAGTACAT;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=15;WE=101442700;WS=101442682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr14	101442793	rs12895798	T	C	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.240;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=493;ReadPosRankSum=0.409;SC=TAGAAATGAATTGAGGAAAAG;SOR=1.041;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=77;TCF=58;TCR=19;TR=26;WE=101442801;WS=101442783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,29:0.36:80
chr14	101447373	rs34158896	T	C	1798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.264;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.088;NF=38;NR=32;PP=1405;ReadPosRankSum=0.725;SC=GGCGTATGAGTCATCTACAGT;SOR=0.565;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=153;TCF=87;TCR=66;TR=70;WE=101447381;WS=101447363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,71:0.45:157
chr14	101447517	rs10131435	A	G	1568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=41;PP=1177;SC=ATACATTTTCATTCTATTTTT;SOR=4.935;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=44;WE=101447525;WS=101447507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr14	101448425	rs75928883	C	G	1318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.653;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=40;PP=977;ReadPosRankSum=0.701;SC=TTACATGAATCTATAGACTGA;SOR=0.337;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=108;TCF=19;TCR=89;TR=51;WE=101448433;WS=101448415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,53:0.47:112
chr14	101452574	rs4906029	T	C	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.266;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=28;PP=663;ReadPosRankSum=2.090;SC=GTTTTGATTCTATTTTTATAA;SOR=2.291;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=56;TCF=4;TCR=52;TR=29;WE=101452582;WS=101452564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,31:0.52:60
chr14	101453344	rs3742401	G	A,T	1996.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=3.564;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29,22;NR=7,8;PP=808,561;ReadPosRankSum=0.785;SC=TAAATTTAAAGACAACATAGA;SOR=2.303;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=68;TCF=52;TCR=16;TR=36,30;WE=101453352;WS=101453334;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.56,0.42:72
chr14	101454403	rs35097045	G	C	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=522;ReadPosRankSum=-0.008;SC=AAAGCTCTTGGATTTTTAAAA;SOR=0.427;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=60;TCR=0;TR=24;WE=101454411;WS=101454393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,26:0.42:62
chr14	101454578	rs74797707	A	G	3469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.343;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=93;PP=2522;ReadPosRankSum=-0.303;SC=CAGAAAGTCAATTTCCTCTGT;SOR=0.986;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=265;TCF=88;TCR=177;TR=134;WE=101454586;WS=101454568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,140:0.51:274
chr14	101454594	rs78341223	A	G	3137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.909;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.988;NF=21;NR=98;PP=2440;ReadPosRankSum=0.736;SC=TCTGTTTCACATGATTCTATA;SOR=1.574;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=239;TCF=56;TCR=183;TR=119;WE=101454602;WS=101454584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,124:0.50:247
chr14	101459660	rs12880424	C	T	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.550;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=32;PP=789;ReadPosRankSum=-0.745;SC=TAATAGAAATCTAATCTATTC;SOR=0.263;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=68;TCF=7;TCR=61;TR=37;WE=101459668;WS=101459650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,38:0.54:70
chr14	101495787	rs4906031	G	A	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=424;SC=GTGAAGGCTTGAAGAGCTTTT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=101495795;WS=101495785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	101506555	rs76847254	A	G	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.817;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=14;PP=589;ReadPosRankSum=-0.013;SC=TGAGCCCTCCAGGGTAAGTGG;SOR=0.313;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=67;TCF=42;TCR=25;TR=35;WE=101506563;WS=101506545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,36:0.53:68
chr14	101514903	.	GGT	G	97	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=16;MQ=59.24;NF=3;NR=0;PP=97;QD=33.6666666667;SC=GCACCTCTGGGGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=3;WE=101514912;WS=101514902;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,3:0.18:17
chr14	101531854	rs61992671	A	G	1673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=34;PP=1376;SC=CTGGTCCACTAGCCGTCCGTA;SOR=1.358;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=53;WE=101531862;WS=101531844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr14	102018946	rs17100344	A	G	3433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=26;PP=2033;SC=TGGACAACGAAGAGCAGGAAG;SOR=1.409;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=48;TCR=26;TR=74;WE=102018954;WS=102018936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr14	102018963	rs60082567	G	C	3613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=27;PP=2074;SC=GAAGGCCCAGGCTTCTTGGTG;SOR=1.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=54;TCR=27;TR=81;WE=102018971;WS=102018953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr14	102019157	rs12147061	A	C	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=27;PP=760;SC=CACCCTCCATATCCGAAGCTC;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=102019165;WS=102019147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	102019178	rs12147069	C	A	763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=597;SC=CCCATAAACCCATAAGGAGAG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=102019186;WS=102019168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	102263464	rs1746598	A	C	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=195;ReadPosRankSum=-0.554;SC=GATTTTGCCCACAGTAGGAGC;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=10;WE=102263472;WS=102263454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr14	102322900	rs34486272	A	AC	182.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=183;ReadPosRankSum=-0.054;SC=TGTTTACCCCACCCATCTCCT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=6;WE=102322908;WS=102322893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr14	102323093	rs61735777	T	C	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.408;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=33;PP=887;ReadPosRankSum=0.531;SC=TCTTTGACTTTGTTTCTGATC;SOR=0.421;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=120;TCF=43;TCR=77;TR=56;WE=102323101;WS=102323083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,56:0.45:125
chr14	102446161	rs3818188	G	A	2534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.132;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=42;PP=1909;ReadPosRankSum=0.374;SC=TCAGCCTGCCGATTCATCCAA;SOR=0.382;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=182;TCF=104;TCR=78;TR=92;WE=102446169;WS=102446151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,98:0.51:192
chr14	102482399	rs17541158	C	T	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=39;PP=1363;ReadPosRankSum=0.635;SC=CCATGCAGATCGAGCAGCTGG;SOR=0.869;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=147;TCF=63;TCR=84;TR=65;WE=102482407;WS=102482389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,65:0.45:146
chr14	102496394	rs3830916	AGT	A	551.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.281;NF=17;NR=3;PP=671;ReadPosRankSum=0.216;SC=AGGGAGAGAGAGTGTGTGTGT;SOR=0.852;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=62;TCF=49;TCR=13;TR=20;WE=102496405;WS=102496384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr14	102548224	rs2298877	T	C	1884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=34;PP=1372;SC=GGTAATACTCTTGGTTTCTAT;SOR=1.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=21;TCR=34;TR=55;WE=102548232;WS=102548214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	102548384	rs6575895	C	T	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.160;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=392;ReadPosRankSum=-0.344;SC=ACTGAAAGTTCACCATTTTCT;SOR=0.061;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=18;WE=102548392;WS=102548374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr14	102549231	.	C	T	282	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=12;NR=1;PP=282;QD=24.3670163498;SC=GCTGGGATTGCAGGCGTGAGC;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=102549239;WS=102549230;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	102549262	rs10782495	A	G	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=2;PP=498;SC=AGCCACACACAACATAGTTTT;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=102549270;WS=102549252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	102550569	rs3742429	G	A	594.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=505;ReadPosRankSum=0.649;SC=ATTTAGTAGAGATGGGGTTTC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=19;WE=102550577;WS=102550559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr14	102550803	rs4947	G	A	2588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=39;PP=2080;SC=ACAATTTGATGTTGTTCTTTT;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=39;TCR=39;TR=78;WE=102550811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr14	102551795	rs35308930	T	TTAA	2224.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=31;PP=2060;SC=AAAAATTGACTTAATACATTC;SOR=1.436;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=40;WE=102551803;WS=102551785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr14	102552773	rs8004640	A	G	11757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=44.37;ReadPosRankSum=-0.775;SOR=0.897;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,264:1.00:265
chr14	102552773	.	AAT	GAG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=72;NR=173;PP=2947;QD=20;SC=GGCAACACGAAATTCCATCGC;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=256;TCF=73;TCR=183;TR=245;WE=102552783;WS=102552763;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,245:0.96:256
chr14	102552775	rs3736807	T	G	11757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=44.88;ReadPosRankSum=-0.793;SOR=0.900;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,261:1.00:262
chr14	102568296	rs10873531	G	A	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.193;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=9;PP=392;ReadPosRankSum=-0.581;SC=CCAGTGACGCGGTGACAGGGA;SOR=0.094;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=19;WE=102568304;WS=102568286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr14	102568367	rs8005905	T	A	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.642;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=343;ReadPosRankSum=0.293;SC=CCAGACACCATCAGATGCCAG;SOR=2.060;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=20;WE=102568375;WS=102568357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,20:0.45:44
chr14	102659667	rs8003556	T	C	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=178;ReadPosRankSum=-0.520;SC=TGCCTTGCTGTACAGCGGCCG;SOR=0.184;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=9;WE=102659675;WS=102659657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr14	102675350	rs6575900	G	C	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.406;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=35;PP=979;ReadPosRankSum=-0.710;SC=TGACAGGTGGGGAGGACGACT;SOR=1.149;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=124;TCF=53;TCR=71;TR=56;WE=102675358;WS=102675340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,58:0.45:130
chr14	102692657	rs8022651	T	C	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.781;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=257;ReadPosRankSum=-0.729;SC=CCGGGCAGCATGCAGGTGCTC;SOR=2.066;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=16;WE=102692665;WS=102692647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr14	102695693	rs2236493	T	C	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=7;PP=661;ReadPosRankSum=0.432;SC=AAGGTCCTTCTGCGGATCTGT;SOR=0.807;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=34;WE=102695701;WS=102695683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr14	102718052	rs2274815	G	A	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=282;ReadPosRankSum=0.672;SC=TTTCTATTCAGCTTTTATTCT;SOR=0.793;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=49;TCF=20;TCR=29;TR=16;WE=102718060;WS=102718042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,17:0.33:51
chr14	102718419	rs28607975	A	G	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=161;ReadPosRankSum=2.268;SC=TTTATTTAACAATGTGTGAAA;SOR=1.270;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=7;WE=102718427;WS=102718409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr14	102792386	rs7158731	T	C	2113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.716;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=33;PP=1609;ReadPosRankSum=-2.224;SC=AGGCCAATGCTCCTACCGACC;SOR=0.939;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=158;TCF=86;TCR=72;TR=77;WE=102792394;WS=102792376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,81:0.49:167
chr14	102792631	rs7158139	G	A	1429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.462;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=23;PP=1066;ReadPosRankSum=0.302;SC=CAAGGCTCCAGATGAACAGGG;SOR=0.530;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=119;TCF=71;TCR=48;TR=55;WE=102792639;WS=102792621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,57:0.46:123
chr14	102808554	rs34220197	CGTGGA	C	266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=267;SC=CGGTCGTCACCGTGGAGCCAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=102808570;WS=102808544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	102808562	rs56144634	C	G	275.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=119;SC=ACCGTGGAGCCAGAGCCCTCA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=102808570;WS=102808544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr14	102815042	rs7011	C	T	2024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=31;PP=1469;SC=GGCCACCGTGCGCTTCAGGAG;SOR=0.971;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=40;TCR=31;TR=70;WE=102815050;WS=102815032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr14	102843057	rs17100874	C	T	1762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.082;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=14;PP=1315;ReadPosRankSum=1.160;SC=GAAACCTTGGCCATGGCATCG;SOR=1.369;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=162;TCF=118;TCR=44;TR=66;WE=102843065;WS=102843047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,71:0.42:170
chr14	102891646	rs4906197	A	G	2003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=43;PP=1598;SC=AAGGGACGCCACCATATCTTC;SOR=1.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=61;WE=102891654;WS=102891636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr14	102894593	rs1309353	G	A	1685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=18;PP=1395;SC=ACAGGCCACAGTTGCTGGTTT;SOR=1.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=49;WE=102894601;WS=102894583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr14	102900798	rs72700613	T	G	2285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.691;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=44;PP=1725;ReadPosRankSum=1.072;SC=AAACGTTTAATGTCCTGGAGG;SOR=0.512;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=167;TCF=77;TCR=90;TR=88;WE=102900806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,89:0.53:168
chr14	102901201	rs10149146	A	G	3497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=59;PP=2795;SC=AGAGCAGGACATCCTAACCAG;SOR=0.798;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=113;TCF=54;TCR=59;TR=113;WE=102901209;WS=102901191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr14	102904551	rs142320181	CCCCGCTCCCTGCT	C	896.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=15;PP=2973;SC=AGGTTCGCCTCCCCGCTCCCT;SOR=2.636;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=19;WE=102904571;WS=102904541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	102909881	rs114375032	T	C	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.142;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=258;ReadPosRankSum=-0.158;SC=TAAAAGAATATAGCAAAATAC;SOR=0.105;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=13;WE=102909889;WS=102909871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr14	102916165	rs72700618	C	T	1811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.494;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=40;PP=1289;ReadPosRankSum=-1.229;SC=TGGATCTCCTCGGGCAAGAAT;SOR=0.775;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=165;TCF=82;TCR=83;TR=72;WE=102916173;WS=102916155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,77:0.45:170
chr14	102918686	rs1190554	T	C	4557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=53;PP=2965;SC=GCAGGCGGCTTGGTGCAGACA;SOR=1.441;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=100;TCR=53;TR=153;WE=102918694;WS=102918676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr14	102919047	rs2295976	C	T	282.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=7;PP=204;SC=CAAAACTGCCCGGCCTGTGTC;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=8;WE=102919055;WS=102919037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr14	102963128	rs11626608	T	C	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=417;ReadPosRankSum=1.614;SC=CACCTGACATTCTGGAGACAA;SOR=0.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=19;WE=102963136;WS=102963126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr14	102964359	rs146599191	C	CGCCCAAGCTCCCAGCTCCATCTGT,CATCTGT	1400.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=0;PP=36;SC=CCCAGACCTGCGCCCAAGCTC;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=2;WE=102964367;WS=102964349;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:19
chr14	102964654	rs2403058	A	G	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=465;SC=CAGGGGCTTCAGAGTGACTCC;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=102964662;WS=102964644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	103059220	rs1057881	G	A	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=3;PP=168;SC=CCCGGCCCCCGCCGATGCCGG;SOR=1.179;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=103059228;WS=103059210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	103188738	rs61739374	C	T	8163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=112;NR=140;PP=2965;ReadPosRankSum=1.265;SC=TTAAGATGCCCGAAGAGGAAG;SOR=0.334;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=254;TCF=112;TCR=142;TR=252;WE=103188746;WS=103188728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,260:1.00:261
chr14	103341865	rs10668366	G	GT	202.37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.40;ReadPosRankSum=1.271;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr14	103361263	.	C	T	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.706;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=219;ReadPosRankSum=1.069;SC=GTCTTCAATTCCTTGGGCTCA;SOR=0.770;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=13;WE=103361271;WS=103361253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr14	103361376	.	C	T	1877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.244;ClippingRankSum=0.000;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.271;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=23;PP=1480;ReadPosRankSum=-0.016;SC=GAGATTTTTTCAAAAGAGTTG;SOR=1.127;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=141;TCF=92;TCR=49;TR=74;WE=103361384;WS=103361366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,74:0.52:142
chr14	103388999	rs2295828	T	C	1125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.70;SOR=1.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	103389003	rs2295829	G	C	1060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.20;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	103396706	rs148815688	C	G	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=66;ReadPosRankSum=-0.524;SC=GGGGGTTGCTCCGAGGGGCTC;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=4;WE=103396714;WS=103396696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr14	103397055	rs1190233	G	C	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=1;NR=12;PP=350;SC=CTCTCCACCCGCTCTGGCCCC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=103397063;WS=103397045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	103412268	rs2403107	T	C	126.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=74;SC=GGATTGAGTCTGCAAGGATTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=103412276;WS=103412258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr14	103413941	rs8007924	T	C	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=384;SC=AGGCTGGAGGTTGAGACCCTA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=103413949;WS=103413931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	103434530	rs2093414	T	A	2133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.74;QD=33.87;SOR=8.318;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr14	103440282	rs1018550	G	T	4917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=123;NR=25;PP=2965;SC=TTCCATCATCGGCATGAACGT;SOR=3.198;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=148;TCF=123;TCR=25;TR=148;WE=103440290;WS=103440272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr14	103440473	rs8009219	G	C	1453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.157;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=35;PP=1110;ReadPosRankSum=0.224;SC=GCTGTCGCTCGAGCCTGTTTG;SOR=0.267;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=109;TCF=27;TCR=82;TR=51;WE=103440481;WS=103440463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,55:0.49:112
chr14	103449863	rs36061149	C	CA	470.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=10.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.33;MQRankSum=3.883;QD=8.88;ReadPosRankSum=-1.861;SOR=0.043;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr14	103523598	rs34302315	T	C	333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=13;PP=265;SC=GCTCGGCGGCTGCGAGCCCCG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=103523606;WS=103523588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	103576415	rs729184	A	G	1895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=25;PP=1506;SC=CTGGGCCGCCAGCGGAACCAG;SOR=1.196;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=41;TCR=25;TR=66;WE=103576423;WS=103576405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr14	103576803	rs11355422	CG	C	526.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.934;NF=5;NR=18;PP=320;ReadPosRankSum=0.344;SC=GCCTATCGGGCGGGGGGGGGC;SOR=0.487;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=23;WE=103576811;WS=103576793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr14	103593950	rs1132339	C	G	2885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=52;PP=2315;SC=GCTCTGGGTGCAGAACCTCTA;SOR=1.191;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=37;TCR=53;TR=89;WE=103593958;WS=103593940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr14	103595997	rs2234130	G	C	1298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=7;PP=1045;SC=CAGAGACCAAGGCTGAGGGCC;SOR=2.780;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=42;WE=103596005;WS=103595987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr14	103596488	rs2234131	G	A	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=32;PP=1040;SC=CAGGGCACACGTACCGCCCGT;SOR=2.636;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=41;WE=103596496;WS=103596478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr14	103596609	rs2234133	T	A	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=7;PP=464;SC=TGCCCCCTTGTCCAGGCGAGC;SOR=1.519;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=23;WE=103596617;WS=103596599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	103597565	rs749206	G	A	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=30;PP=867;SC=GTGGAGGGAGGAGGAGCTGCT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=103597573;WS=103597555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr14	103599938	rs2234143	C	T	1931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=51;PP=1617;SC=AGATAGGCCGCTGGTGCCTCT;SOR=3.334;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=10;TCR=51;TR=61;WE=103599946;WS=103599928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	103602278	rs710100	A	G	2136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=56;PP=1668;SC=CACCGCCAGCATTAGACGTCA;SOR=2.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=13;TCR=57;TR=69;WE=103602286;WS=103602268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr14	103852607	rs12436956	G	T	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.576;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=350;ReadPosRankSum=-1.561;SC=GTTCGCGGGCGGGTCTGCGAA;SOR=2.409;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=16;WE=103852615;WS=103852597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr14	103918182	rs2273702	G	C	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.100;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=588;ReadPosRankSum=-0.037;SC=TTCATAGTTAGAGTTTATATG;SOR=0.268;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=61;TCF=36;TCR=25;TR=31;WE=103918190;WS=103918172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,31:0.48:64
chr14	103923414	rs2273700	A	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=1.383;SC=GTGAAACATCAATTTATGGGA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=103923422;WS=103923404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr14	103923475	rs2273699	A	G	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.561;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=130;ReadPosRankSum=0.046;SC=TCTCTCACCTATAGGTGAAGT;SOR=1.518;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=7;WE=103923483;WS=103923465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr14	103928657	rs4906326	T	A	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=574;SC=TGAGTATTCATTATGTGTGAA;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=103928665;WS=103928647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	103931879	rs1116095	A	G	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=364;ReadPosRankSum=2.250;SC=TTTTGTCTTGATGTTTTCCCT;SOR=0.852;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=16;WE=103931887;WS=103931869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr14	103932888	rs1951393	C	T	1586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=47;PP=1285;SC=AAGCACAAGTCATATGAACAG;SOR=6.439;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=48;WE=103932896;WS=103932878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr14	103933341	rs11320440	CA	C	248.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=20;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.434;NF=5;NR=1;PP=136;ReadPosRankSum=-1.104;SC=AACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=0.399;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=6;WE=103933356;WS=103933331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr14	103933348	rs201971883	A	G	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.933;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=19;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=1.335;NF=5;NR=1;PP=101;ReadPosRankSum=0.661;SC=TCTCAAAAAAAAAAAAAAAAA;SOR=1.445;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=6;WE=103933356;WS=103933331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr14	103933556	rs8010247	A	G	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.828;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=583;ReadPosRankSum=-0.601;SC=GAGCTGAAATACCCTGTATGT;SOR=1.578;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=50;TCF=11;TCR=39;TR=28;WE=103933564;WS=103933546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr14	103934488	rs10137161	T	C	3004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=54;PP=2385;SC=AGAAGTGTTTTTTCAAGCCAA;SOR=1.119;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=36;TCR=54;TR=90;WE=103934496;WS=103934478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr14	103934654	rs12892292	T	C	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.820;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=4.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=2.362;QD=4.07;ReadPosRankSum=1.795;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr14	103946636	rs8014010	A	G	1196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=0;PP=1054;SC=TAAAAGACTGACATTCCTATT;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=103946644;WS=103946626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	103986255	rs1803283	C	T	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.794;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=289;ReadPosRankSum=-0.758;SC=CCAGCCGCTGCTCCATCTCGA;SOR=0.154;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=19;WE=103986263;WS=103986245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,20:0.47:43
chr14	103987078	rs2071408	G	A	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=242;ReadPosRankSum=-0.564;SC=AACACGGGGCGGGCGGGGGAA;SOR=0.892;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=12;WE=103987086;WS=103987068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr14	103987305	rs8017780	C	A	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.875;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=29;PP=1069;ReadPosRankSum=3.274;SC=CCAGGGCCGTCGGGGAGAGGC;SOR=0.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=82;TCF=39;TCR=43;TR=54;WE=103987313;WS=103987295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,55:0.65:84
chr14	103988180	rs1136165	G	T	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=263;ReadPosRankSum=0.323;SC=TCTCGATGGCGCGGCGCTCCC;SOR=0.317;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=13;WE=103988188;WS=103988170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr14	103995489	rs2765038	C	G	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr14	103996396	rs2765037	G	A	1726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=22;PP=1294;SC=CAATGGTGGCGGTGCGTGTGC;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=31;TCR=22;TR=53;WE=103996404;WS=103996386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr14	103996733	rs2756138	C	G	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=31;PP=927;SC=CCTACAGACACATGTGGCTCC;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=33;WE=103996741;WS=103996723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
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chr14	104001024	.	C	A	2119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.187;ClippingRankSum=0.000;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=41;PP=1627;ReadPosRankSum=1.831;SC=TGTCAGCCTGCCACCGCCCGA;SOR=0.742;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=147;TCF=74;TCR=73;TR=81;WE=104001032;WS=104001014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,82:0.55:150
chr14	104001517	rs2756119	G	A	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.676;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=30;PP=1135;ReadPosRankSum=0.835;SC=AGGAGGGAGGGGGGCATTGAC;SOR=0.993;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=100;TCF=47;TCR=53;TR=53;WE=104001525;WS=104001507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,54:0.53:101
chr14	104001589	.	G	C	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=0.000;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.934;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=17;PP=898;ReadPosRankSum=-0.617;SC=CACGGGGCCTGAGACCATCTC;SOR=1.415;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=100;TCF=52;TCR=48;TR=46;WE=104001597;WS=104001579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,44:0.45:97
chr14	104027557	rs11625397	C	T	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=19;PP=658;SC=TGATAACTTACTACAGCACAA;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=104027565;WS=104027547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	104029246	rs2274269	G	A	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=1;PP=310;SC=CCGCGCCGCCGCGCTTCCTCG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=104029254;WS=104029236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	104029378	rs2274268	C	G	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=10;PP=562;SC=CTTTCTCCCCCCTCTCTGCCG;SOR=1.358;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=26;WE=104029386;WS=104029368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	104029792	rs2296483	G	A	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=318;SC=CTTACCGTGCGTTTTTTTTCG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=104029800;WS=104029782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	104129352	rs7150141	G	A	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=651;SC=TTATGTATCTGTATAAACTAT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=104129360;WS=104129342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	104136469	rs11333716	CT	C	2660.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=12;PP=2695;SC=TAAATGTACTCTTATTTGGTT;SOR=3.136;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=68;TCF=55;TCR=13;TR=65;WE=104136477;WS=104136459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr14	104139570	rs11160757	G	T	2940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=56;PP=2357;SC=GAGTGCTTTCGTCCCAAGTCC;SOR=1.203;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=36;TCR=56;TR=92;WE=104139578;WS=104139560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr14	104143928	rs4906357	A	C	2553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=62;PP=2183;SC=TTTTACATGAATTTTATTGAA;SOR=3.581;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=10;TCR=63;TR=72;WE=104143936;WS=104143918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr14	104165647	rs150986165	C	T	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.850;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=184;ReadPosRankSum=-0.359;SC=GCTCTGCTTCCGCATCCTGGC;SOR=0.321;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=10;WE=104165655;WS=104165637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr14	104165753	rs861539	G	A	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=4;PP=1070;SC=CTCACGCAGCGTGGCCCCCAG;SOR=3.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=36;WE=104165761;WS=104165743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr14	104167075	rs861537	C	T	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=13;PP=404;SC=GTGAGTCCCACGGCCTGCAGC;SOR=2.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=104167083;WS=104167065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	104167545	rs709399	G	A	2413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=55;PP=1862;SC=CAGTGACCCCGACCTGGCCCC;SOR=1.966;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=20;TCR=55;TR=75;WE=104167553;WS=104167535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr14	104167564	rs861536	A	G	2057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=50;PP=1674;SC=CCGCTCCAGGATGGGACTGCC;SOR=2.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=12;TCR=50;TR=62;WE=104167572;WS=104167554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr14	104172807	rs861531	C	A	3608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=86;PP=2660;SC=CATCTCTCCTCCTCACAGCTC;SOR=2.535;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=24;TCR=87;TR=110;WE=104172815;WS=104172797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr14	104177190	.	AAC	A	133	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=9;MMLQ=28;MQ=59.42;NF=12;NR=0;PP=133;QD=11.3333333333;SC=TGTAGTTAAGAACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=12;WE=104177201;WS=104177180;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr14	104194196	rs1535100	C	G	2840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=45;NR=43;PP=2260;SC=AGTGCGCCCTCGTGTCCCTCA;SOR=0.715;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=45;TCR=43;TR=88;WE=104194204;WS=104194186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr14	104194278	rs1535099	C	T	1490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=38;PP=1052;SC=TGCACAGTCCCGCGCGCTCCG;SOR=2.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=47;WE=104194286;WS=104194268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr14	104201075	rs182659124	G	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=349;ReadPosRankSum=1.448;SC=GGTGACGGGGGGCAGGGCGGT;SOR=0.560;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=17;WE=104201083;WS=104201065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr14	104378852	rs8095	G	A	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=6;PP=904;ReadPosRankSum=-0.302;SC=CCAGGTAGCAGTGCATCTCAC;SOR=0.829;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=89;TCF=75;TCR=14;TR=41;WE=104378860;WS=104378842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,43:0.46:93
chr14	104394835	rs9324065	T	C	1449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=16;PP=1136;SC=TGCCGACGCCTGGGCCTTGAG;SOR=1.426;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=48;WE=104394843;WS=104394825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr14	104394850	rs9324066	C	T	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.946;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=16;PP=706;ReadPosRankSum=-0.670;SC=CTTGAGGATGCTGCGGAAGCT;SOR=0.304;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=55;TCF=33;TCR=22;TR=35;WE=104394858;WS=104394840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,34:0.62:55
chr14	104429302	rs140667603	A	AGTGT,AGT	231.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;NF=6,6;NR=0,0;PP=123,135;SC=TTTGTATTTGAGTGTGTGTGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6,6;WE=104429310;WS=104429292;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:5
chr14	104429453	rs6576013	A	G	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=17;PP=742;SC=GCAGTGTGACATGCATCCCAG;SOR=0.793;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=17;TCR=18;TR=34;WE=104429461;WS=104429443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	104436931	rs11851097	C	T	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.072;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=33;PP=859;ReadPosRankSum=-0.211;SC=TCCGCAAACTCTTAAGAACAA;SOR=1.204;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=102;TCF=33;TCR=69;TR=46;WE=104436939;WS=104436921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,46:0.45:102
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chr14	104452640	rs10143389	G	A	1007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=29;PP=831;ReadPosRankSum=1.837;SC=TTGATGACTTGGATATGAAGG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=72;TCF=14;TCR=58;TR=36;WE=104452648;WS=104452630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,36:0.50:72
chr14	104465037	rs10133836	T	C	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=18;PP=945;SC=TGAGTTGGGCTTCTAAAACCA;SOR=0.798;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=17;TCR=18;TR=35;WE=104465045;WS=104465027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr14	104470686	rs28391043	G	A	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=1263;ReadPosRankSum=0.035;SC=ATTCACTTTGGTCATTGTCAA;SOR=0.883;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=24;WE=104470717;WS=104470676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr14	104470698	rs151098927	GTTTATTTATTTA	G,GTTTATTTA	422.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=0,0;NR=8,8;PP=1379,439;SC=CATTGTCAAAGTTTATTTATT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=8,8;WE=104470717;WS=104470676;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.73,0.27:11
chr14	104471857	rs12147828	C	T	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.870;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=347;ReadPosRankSum=2.216;SC=CTCACTTTCCCGCTAACTCTG;SOR=0.052;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=18;WE=104471865;WS=104471847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr14	104473253	rs4900607	A	G	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.009;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=133;ReadPosRankSum=-0.553;SC=TACCACAAACATATGAGGTAG;SOR=0.399;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=6;WE=104473261;WS=104473243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr14	104475034	rs4906401	A	G	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=104;ReadPosRankSum=-0.726;SC=TATTTCCCCTATGTATACTTT;SOR=0.368;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=104475042;WS=104475024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr14	104481016	rs7150795	G	A	1041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=0;PP=882;SC=CTGCTCTGATGACATATGTAC;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=104481024;WS=104481006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	104481083	rs11160779	T	C	1205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=6;PP=969;ReadPosRankSum=0.733;SC=ATATGAAGAATTGAAGACTAG;SOR=0.587;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=105;TCF=93;TCR=12;TR=47;WE=104481091;WS=104481073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,48:0.44:109
chr14	104481200	rs59025288	A	AT	1722.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.708;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.953;NF=8;NR=52;PP=1163;ReadPosRankSum=-1.427;SC=TTTCCTGGATATTTTTTTTCC;SOR=0.795;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=128;TCF=24;TCR=104;TR=60;WE=104481208;WS=104481190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,76:0.53:143
chr14	104484346	rs34317359	G	A	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=78;ReadPosRankSum=-0.967;SC=CTAAAACAGTGTGCAGCAGCT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=104484354;WS=104484336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr14	104484646	rs12589669	T	C	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=292;ReadPosRankSum=-0.299;SC=TATGGGCTGCTGCAATTGGCT;SOR=0.653;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=18;WE=104484654;WS=104484636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr14	104491086	rs72042212	TACACACACACAC	T,TACACACAC	510.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=26;NF=0,0;NR=11,11;PP=772,1016;SC=ACAGGAAGTTTACACACACAC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=11,11;WE=104491105;WS=104491076;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.73,0.27:15
chr14	104497543	rs10135507	C	T	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=699;ReadPosRankSum=-0.366;SC=AGAAATATCTCATCCGGATTT;SOR=0.666;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=90;TCF=32;TCR=58;TR=38;WE=104497551;WS=104497533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,40:0.42:95
chr14	104498472	rs4906405	G	A	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=21;PP=603;SC=CTGCTTTTCTGTTTATAGATC;SOR=4.255;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=104498480;WS=104498462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	104498530	.	ATCTTT	A	91	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=0.9998;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=91;QD=51.0;SC=GGAATGTGTTATCTTTTCTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=2;WE=104498542;WS=104498520;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,2:0.22:9
chr14	104500427	rs10150865	A	G	3663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=65;PP=2747;SC=GATCCTGTTTATTCCTTGTCC;SOR=0.885;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=56;TCR=65;TR=121;WE=104500435;WS=104500417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr14	104500530	rs10151066	C	T	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.19;QD=29.41;SOR=6.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	104501551	rs3830999	AT	A	143.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.434;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=183;ReadPosRankSum=1.349;SC=TTATTGATTTATTTATGCTTG;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=104501559;WS=104501541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr14	104518453	rs7150461	A	G	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.020;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=319;ReadPosRankSum=-1.460;SC=CACACCCCTCAGGAAGCTGTG;SOR=0.061;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=17;WE=104518461;WS=104518443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr14	104559623	rs941952	T	C	2303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=20;PP=1809;SC=CATCCTGACCTACGTCCTTGC;SOR=1.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=49;TCR=20;TR=69;WE=104559631;WS=104559613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr14	104561998	rs1770983	T	C	3810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=75;PP=2965;SC=GCCCAGGTAATCCCAGGGGCC;SOR=1.285;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=122;TCF=45;TCR=77;TR=120;WE=104562006;WS=104561988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr14	104563874	rs7156718	C	T	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=11;PP=621;SC=TCAGCTACTCCGTGGCCTCTC;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=22;WE=104563882;WS=104563864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	104569801	rs8012482	C	G	129.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=3;NR=2;PP=90;SC=GCTCTGAAAACAAGGGAGGAG;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=104569809;WS=104569791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	104570904	rs1744299	T	C	2201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=52;PP=1739;SC=CCACCCCTCATGGGCTGGGGG;SOR=2.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=20;TCR=52;TR=72;WE=104570912;WS=104570894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr14	104571128	.	GC	G	165.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.995;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=98;ReadPosRankSum=0.207;SC=ATGTCAGTTGGCTCCCAGGGG;SOR=0.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=104571136;WS=104571118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr14	104571826	rs1744300	A	G	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=13;PP=350;SC=GCAGCTGGGGACTGTGCACCC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=104571834;WS=104571816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	104573690	rs1744301	A	G	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=28;PP=978;SC=CAGGTAATGGAGCTAGGGCTG;SOR=2.362;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=36;WE=104573698;WS=104573680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr14	104575466	rs1771012	C	T	1106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=0;PP=844;SC=GGCCGGTCCCCGTCCCTGTGC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=104575474;WS=104575456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr14	104633244	rs376180886	G	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.969;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=5;PP=237;ReadPosRankSum=-0.049;SC=AGCCCCACCCGCCACCGCCTC;SOR=0.169;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=15;WE=104633252;WS=104633234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr14	104645559	rs61996620	G	T	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=48;ReadPosRankSum=-2.522;SC=GCCCCCGCCCGCCCTGCCTCC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=104645567;WS=104645549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr14	104646027	rs202007201	G	A	622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=460;ReadPosRankSum=-2.636;SC=CTGGAGCAGTGCGTGAACCTG;SOR=0.665;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=37;TCR=32;TR=32;WE=104646035;WS=104646017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,32:0.45:71
chr14	104710505	rs7142555	T	G	341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=2;PP=275;SC=CATCTCTCAATAGTACTGCTG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=104710513;WS=104710495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	104710651	rs7141507	C	T	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=376;ReadPosRankSum=-1.190;SC=CGGCTGGCTCCTGGCCTCGAC;SOR=0.906;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=39;TCF=27;TCR=12;TR=21;WE=104710659;WS=104710641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr14	104940930	rs28453989	C	T	2626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=42;PP=2060;SC=CCTCACTCTCCCCTTAGAGCG;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=36;TCR=43;TR=78;WE=104940938;WS=104940920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr14	104940967	rs28699424	G	A	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=744;ReadPosRankSum=-0.482;SC=AATTAAGCTGGGGGCAAATGG;SOR=0.655;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=69;TCF=22;TCR=47;TR=34;WE=104940975;WS=104940957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,36:0.51:70
chr14	104941016	rs28715110	G	A	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.971;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.872;NF=7;NR=20;PP=518;ReadPosRankSum=0.543;SC=GAGGATGGGGGACTGCCCGGG;SOR=0.242;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=27;WE=104941024;WS=104941006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,29:0.55:53
chr14	105055118	rs111285011	TGACGGGCAG	T	416.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.623;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.121;NF=6;NR=4;PP=2300;ReadPosRankSum=0.027;SC=CCTGCGGCTCTGACGGGCAGG;SOR=1.247;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=33;TCF=16;TCR=17;TR=10;WE=105055134;WS=105055108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr14	105055291	rs3840008	TG	T	119.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.160;HP=6;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=406;ReadPosRankSum=0.037;SC=AGATCGGACATGGGGGGCACA;SOR=0.027;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=8;WE=105055312;WS=105055281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr14	105055304	rs11160811	A	G	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=5.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.44;ReadPosRankSum=-1.085;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr14	105057948	rs3803317	C	T	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.848;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=316;ReadPosRankSum=2.096;SC=TTGACACCCCCGATGGGCACC;SOR=0.169;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=19;WE=105057956;WS=105057938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr14	105059573	rs28656783	C	T	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=114;ReadPosRankSum=0.418;SC=CCCCCGCCCCCGCCCCACACC;SOR=0.582;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=8;WE=105059581;WS=105059563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr14	105060024	rs12879330	A	G	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=5.975;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.58;ReadPosRankSum=-0.830;SOR=0.089;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr14	105060029	rs12880651	T	C	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=2.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.23;ReadPosRankSum=-0.741;SOR=0.142;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr14	105063253	rs11629201	C	T	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=369;ReadPosRankSum=0.197;SC=GGGAAGATCACCCACAGCAGG;SOR=0.922;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=16;WE=105063261;WS=105063243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr14	105070791	rs3803313	G	T	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=4;PP=957;SC=GTCCCTTGCAGAGGAAGAAGA;SOR=3.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=35;WE=105070799;WS=105070781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	105150273	rs7153053	C	T	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=407;SC=GGTTGGGGTGCGGGTGGGTCT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=105150281;WS=105150263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	105150580	rs34369401	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.429;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=80;ReadPosRankSum=-1.364;SC=GGAGGGACAGCTCGAGGGCTC;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=5;WE=105150588;WS=105150570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr14	105167807	rs4983530	C	T	1738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=15;PP=1313;SC=GCGCGGACCCCGAGCTGTGCA;SOR=1.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=48;WE=105167815;WS=105167797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr14	105170108	rs374945781	GCATGATGTC	GGATGTC,G	151.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.894;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=1366;ReadPosRankSum=0.547;SC=TGTGTGTCCAGCATGATGTCT;SOR=0.412;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=4;WE=105170126;WS=105170098;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.42:12
chr14	105170112	rs199612689	GATGTCT	G	151.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.64;ReadPosRankSum=0.469;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr14	105170118	.	T	G	328	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000;HP=5;HapScore=4;MGOF=13;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=3;NR=1;PP=328;QD=90.6928031368;SC=GCATGATGTCTCCCCTCCAGA;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=4;WE=105170126;WS=105170098;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr14	105170163	rs7145815	G	A	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=505;ReadPosRankSum=-1.331;SC=AGTGCAGCAGGGCAGGGTCAG;SOR=0.976;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=11;WE=105170183;WS=105170153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr14	105170175	rs7146817	T	G	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.741;HP=3;HapScore=4;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=505;ReadPosRankSum=-0.029;SC=CAGGGTCAGGTGCTCTGGGTG;SOR=1.584;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=23;TCF=14;TCR=9;TR=11;WE=105170183;WS=105170153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr14	105170221	rs7145566	C	T	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=986;ReadPosRankSum=1.502;SC=GAGTGGCCTCCGAACCCTCTG;SOR=0.757;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=20;WE=105170230;WS=105170211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr14	105170222	rs7145851	G	A	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=695;ReadPosRankSum=-1.502;SC=AGTGGCCTCCGAACCCTCTGA;SOR=0.633;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=16;WE=105170230;WS=105170211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr14	105172529	rs118017785	C	T	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.569;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=162;ReadPosRankSum=1.883;SC=CTGGGGGCTGCAGGGCGGAGG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=9;WE=105172537;WS=105172519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr14	105173454	rs57402537	G	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=267;ReadPosRankSum=1.476;SC=TAGACCATGGGGGGGGGAGCC;SOR=1.765;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=12;WE=105173462;WS=105173444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr14	105173862	.	ACCCCAC	A	243.37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=9.031;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.319;NF=0;NR=6;PP=308;ReadPosRankSum=0.157;SC=GCAGGCGTCCACCCCACCCCC;SOR=4.163;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=6;WE=105173875;WS=105173852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,7:0.88:8
chr14	105174731	rs149923432	C	CG	174.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.566;NF=5;NR=1;PP=155;ReadPosRankSum=0.015;SC=CGCCAGGCCCCGGGGCTGCGA;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=6;WE=105174739;WS=105174728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr14	105175085	rs11850821	A	G	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.108;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=25;PP=639;ReadPosRankSum=0.937;SC=TGAGGGAGGTAGCCCCCATCC;SOR=0.886;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=16;TCR=69;TR=31;WE=105175093;WS=105175075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,32:0.38:84
chr14	105179043	rs4497619	G	C	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=26;PP=1106;SC=CCTGCTCCTTGTCAGAGACCA;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=37;WE=105179051;WS=105179033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr14	105179194	rs10133301	T	C	2805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=29;PP=2133;SC=GGGCACTGGATGAGCTGTTTG;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=64;TCR=29;TR=93;WE=105179202;WS=105179184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr14	105180484	rs9672043	C	T	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.847;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=398;ReadPosRankSum=-0.244;SC=GAGGCTGCACCTGGGCTGGCT;SOR=0.330;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=40;TCR=4;TR=19;WE=105180492;WS=105180474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr14	105180565	rs4983535	T	C	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.853;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=17;PP=772;ReadPosRankSum=1.580;SC=CTGCAGGAGATCCCGTGGGCA;SOR=0.981;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=79;TCF=41;TCR=38;TR=39;WE=105180573;WS=105180555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,38:0.48:79
chr14	105180706	rs1128840	A	G	4107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=55;PP=2965;SC=AGGGTGGTCCACGGCCCCTGG;SOR=1.147;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=80;TCR=55;TR=135;WE=105180714;WS=105180696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr14	105180785	rs34251364	C	T	2025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.596;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=35;PP=1600;ReadPosRankSum=0.297;SC=GTGCCCCCAGCCCTTGGAGGG;SOR=0.766;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=152;TCF=82;TCR=70;TR=76;WE=105180793;WS=105180775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,78:0.51:153
chr14	105185083	rs138798126	TAC	T	691.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.172;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=656;ReadPosRankSum=-0.536;SC=CCTGATATTGTACCCAGCAAA;SOR=0.922;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=38;TCF=19;TCR=19;TR=16;WE=105185092;WS=105185073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr14	105196235	.	G	A	350	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=28;MQ=57.73;NF=22;NR=3;PP=350;QD=15.3908485019;SC=TCGGCATGGTGGGGAGGAGCT;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=25;WE=105196243;WS=105196220;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr14	105196365	rs33958252	T	C	1597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=28;PP=1354;SC=GAGTCTCCAGTTACTGAGTGG;SOR=0.994;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=24;TCR=28;TR=52;WE=105196373;WS=105196355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr14	105201596	rs7149183	T	C	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=14;PP=369;SC=AGCCTCCACCTGCCCCACCAG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=105201604;WS=105201586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr14	105206172	rs71421880	T	A	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.075;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=627;ReadPosRankSum=0.233;SC=GCCGGGACACTCTCACCCTCG;SOR=0.390;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=82;TCF=30;TCR=52;TR=36;WE=105206180;WS=105206162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,37:0.46:81
chr14	105207040	rs12894569	C	T	3361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.930;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=85;PP=2626;ReadPosRankSum=1.812;SC=ATGAGTTTTCCTCCAGGTACC;SOR=0.631;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=298;TCF=99;TCR=199;TR=129;WE=105207048;WS=105207030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,131:0.43:308
chr14	105207134	rs3803307	A	G	3713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.713;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=77;PP=2965;ReadPosRankSum=0.264;SC=GAGGACCAGCATGGACCATGA;SOR=0.283;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=122;TCF=43;TCR=79;TR=120;WE=105207142;WS=105207124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,123:0.98:125
chr14	105208037	rs4983539	A	C	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=3;PP=535;SC=CGGCCACTCCACCAGGACAGG;SOR=2.925;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=105208045;WS=105208027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	105208057	rs4983384	C	T	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=176;ReadPosRankSum=-0.155;SC=GCCAGGCTGGCGACCCCACGG;SOR=0.214;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=10;WE=105208065;WS=105208047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr14	105208393	rs75268661	G	A	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.338;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=147;ReadPosRankSum=-1.372;SC=CCAGGCAGGGGTGCCGGGGGT;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=8;WE=105208401;WS=105208383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr14	105211426	rs7155192	G	A	96.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=5;PP=94;SC=TCTCCCCACAGCGTTCCCCAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=105211434;WS=105211416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	105212399	.	T	C	118	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=5;NR=0;PP=118;QD=30.5542425094;SC=GTCCCCTGCTTACCACCCAAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=105212407;WS=105212398;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	105213343	rs6644	A	G	1755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=42;PP=1426;SC=TGTTTTAGTCACAGACTGAGC;SOR=2.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=10;TCR=42;TR=52;WE=105213351;WS=105213333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr14	105219467	rs3809453	A	G	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=0;PP=324;SC=ATGGGCGCGCAGCTGTGACGT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=105219475;WS=105219457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	105219976	rs12889167	T	C	2058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=4;PP=1525;SC=CCTGGTGCTTTCTCAGGACTG;SOR=4.875;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=51;TCR=4;TR=54;WE=105219984;WS=105219966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr14	105220210	rs7151424	G	A	1410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=39;PP=1133;ReadPosRankSum=0.667;SC=GCCACAGGTGGTCGGGGCAGG;SOR=1.609;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=44;WE=105220218;WS=105220200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,47:0.96:49
chr14	105222037	rs1132975	C	T	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=333;ReadPosRankSum=-0.397;SC=AAGGCTGTGCCGTCGTTCACC;SOR=0.874;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=21;WE=105222045;WS=105222027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr14	105223194	rs34992074	C	CAT	1166.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=25;PP=1250;SC=AGAACACACACGTGTGGCCCC;SOR=5.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=105223202;WS=105223184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	105223495	rs35550015	G	C	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=125;ReadPosRankSum=-2.283;SC=TTTGGTTGTAGACCCTCTCAG;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=8;WE=105223503;WS=105223485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr14	105223525	rs12590163	T	C	1004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=3;PP=836;SC=GGAGTGTTTGTGTAGTCTCCC;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=105223533;WS=105223515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	105223694	rs143402483	CAT	C	2887.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.773;NF=21;NR=40;PP=2475;ReadPosRankSum=-0.729;SC=CATCCAGACACATGTGGAACT;SOR=0.696;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=141;TCF=50;TCR=91;TR=61;WE=105223703;WS=105223684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,77:0.48:160
chr14	105223853	rs35165446	T	C	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=250;ReadPosRankSum=0.528;SC=CGGAGAGCCCTGGGCAGGGGG;SOR=0.922;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=16;WE=105223861;WS=105223843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr14	105225620	rs10142660	G	T	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.089;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=2;PP=691;ReadPosRankSum=-0.672;SC=CTAGACTGATGATGCCCGCAG;SOR=1.414;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=48;TCF=44;TCR=4;TR=30;WE=105225628;WS=105225610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,31:0.63:49
chr14	105233095	rs2498804	C	A	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=18;PP=482;ReadPosRankSum=-0.656;SC=TCTAAGTGCTCAAGTCACTTT;SOR=0.739;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=66;TCF=19;TCR=47;TR=26;WE=105233103;WS=105233085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,28:0.41:68
chr14	105238591	rs55839843	CCTGAG	C	433.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.442;NF=12;NR=0;PP=958;ReadPosRankSum=-0.089;SC=GCAGCAGGCTCCTGAGGTGAG;SOR=0.507;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=12;WE=105238612;WS=105238581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr14	105238604	rs2498800	C	T	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.205;NF=19;NR=1;PP=978;ReadPosRankSum=-1.346;SC=GAGGTGAGGGCGAGTGTGTGG;SOR=0.846;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=46;TCF=43;TCR=3;TR=20;WE=105238612;WS=105238581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr14	105239192	rs2494732	T	C	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=227;ReadPosRankSum=-1.610;SC=GTGTAGCCTGTAGCTGGGATG;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=11;WE=105239200;WS=105239182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr14	105239894	rs1130233	C	T	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.512;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=298;ReadPosRankSum=-0.390;SC=AGAACACACGCTCCCGGGACA;SOR=0.377;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=18;WE=105239902;WS=105239884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr14	105241378	rs3730346	C	T	1549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.148;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=14;PP=1195;ReadPosRankSum=-0.650;SC=ACCCCGCACCCTCATCTCCAC;SOR=1.059;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=79;TCF=57;TCR=22;TR=54;WE=105241386;WS=105241368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,57:0.69:83
chr14	105241607	rs182149357	G	A	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=226;ReadPosRankSum=0.695;SC=GTCGGCATGCGTGGGGTGGCA;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=12;WE=105241615;WS=105241597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr14	105242228	rs2498797	T	C	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=488;ReadPosRankSum=-0.025;SC=CAAGCGTGGTTCCACAGCTGT;SOR=0.941;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=22;WE=105242236;WS=105242218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr14	105242831	rs3001371	C	T	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=144;ReadPosRankSum=-0.116;SC=CCAAACCCCACAGGCAGGACT;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=8;WE=105242839;WS=105242826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr14	105242966	rs2494735	T	C	1294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.729;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=12;PP=1052;ReadPosRankSum=0.834;SC=GCTGCCCAAGTGCCTGGCCTG;SOR=0.939;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=116;TCF=87;TCR=29;TR=52;WE=105242974;WS=105242956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,52:0.44:117
chr14	105246325	rs2494737	T	A	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=289;ReadPosRankSum=-1.890;SC=AGCCCAGGACTTGGAGGCTCC;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=14;WE=105246333;WS=105246315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr14	105246407	rs3730358	G	A	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.092;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=822;ReadPosRankSum=0.215;SC=AATCCCGAGAGGCCAAGGGGA;SOR=0.290;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=68;TCF=52;TCR=16;TR=39;WE=105246415;WS=105246397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,39:0.57:68
chr14	105258892	rs2494748	C	T	2535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FS=5.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.25;ReadPosRankSum=-1.044;SOR=0.398;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,102:0.49:207
chr14	105258892	.	CA	TG	1606	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=61;NR=28;PP=1606;QD=18.6457064591;SC=CTACTACCCCCATCTCTCCCT;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=199;TCF=139;TCR=60;TR=89;WE=105258901;WS=105258882;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:110,89:0.45:199
chr14	105258893	rs2494749	A	G	7684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=137;NR=55;PP=2054;SC=TACTACCCCCATCTCTCCCTC;SOR=1.886;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=201;TCF=140;TCR=61;TR=192;WE=105258901;WS=105258882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr14	105267579	rs12878684	A	G	3806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=41;PP=2965;SC=GCCGCCTGAGACAGCAGCGCG;SOR=1.227;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=72;TCR=41;TR=113;WE=105267587;WS=105267569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr14	105267934	rs34284721	G	A	2683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=51;PP=2008;ReadPosRankSum=-0.352;SC=TGCCCCTGGGGCAGAACCTGC;SOR=0.725;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=158;TCF=72;TCR=86;TR=93;WE=105267942;WS=105267924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,98:0.60:163
chr14	105268104	rs10141867	G	A	950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.533;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=22;PP=721;ReadPosRankSum=1.437;SC=CCCTGGACCTGTCGTTGAAGT;SOR=0.805;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=81;TCF=40;TCR=41;TR=38;WE=105268112;WS=105268094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,39:0.46:85
chr14	105268228	rs4983387	G	A	3332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=50;PP=2614;SC=CTCACTGTCCGAACAGGAGGA;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=57;TCR=50;TR=107;WE=105268236;WS=105268218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr14	105309252	rs12895703	T	C	2359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.70;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr14	105309256	rs12894371	A	T	2325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.88;SOR=2.628;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr14	105309608	rs12878750	C	T	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=622;SC=TGATGGTCTGCGGGTGTGAGC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=105309616;WS=105309598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	105334799	rs183217990	G	A	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=36;ReadPosRankSum=1.589;SC=TGAGTGCCACGTCCTGGTTCC;SOR=0.105;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=4;WE=105334807;WS=105334789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr14	105335049	rs12431850	C	T	175.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=140;SC=CCGGATGCACCGAGGGCTCTG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=105335057;WS=105335039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr14	105344111	rs78118267	G	A	341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=1;PP=313;SC=TGGTGCCCCCGCGGCCCTGCC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=105344119;WS=105344106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	105344293	rs61995995	C	T	5878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=54;PP=2965;SC=TCATCCGCTTCGGCTACGATA;SOR=1.219;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=80;TCR=54;TR=134;WE=105344301;WS=105344283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr14	105344318	rs2304758	G	A	5268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=59;PP=2581;SC=GCCCCTGAGCGTCCCTCCTCC;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=55;TCR=59;TR=114;WE=105344326;WS=105344308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr14	105344347	rs2304757	C	G	3108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=66;PP=2541;SC=TTCTCAGTCCCCAGGACCACA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=33;TCR=66;TR=99;WE=105344355;WS=105344337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr14	105344419	rs34009344	A	G	2265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=56;PP=1809;SC=ACAGAGCACCAAGGATGACCC;SOR=2.932;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=13;TCR=56;TR=69;WE=105344427;WS=105344409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr14	105344603	rs41310934	C	T	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=523;ReadPosRankSum=-0.707;SC=AGTCCTGGCCCGACCTTGGGA;SOR=1.101;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=20;WE=105344611;WS=105344593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr14	105344761	rs41317300	C	T	3185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=51;PP=2422;SC=GCTCTGTGTTCGCCTTAACAC;SOR=0.732;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=49;TCR=51;TR=100;WE=105344769;WS=105344751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr14	105344872	rs61995998	C	T	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=28;PP=778;SC=GGCTCAGCCACGAGGGCTCAG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=105344880;WS=105344862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr14	105349220	rs2028415	T	G	1193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=31;PP=979;SC=CAGAGGGTGGTGTGTGAAGGG;SOR=3.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=35;WE=105349228;WS=105349210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	105349388	rs2028414	A	C	1298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=13;PP=1057;SC=CCAAGGGACCAGTGCAGCAGG;SOR=1.666;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=39;WE=105349396;WS=105349378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	105349877	rs10145119	C	T	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.42;SOR=3.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	105349886	rs10145122	C	T	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.83;SOR=4.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	105349891	rs10145270	G	A	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.51;SOR=4.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	105349897	rs10145031	A	G	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.34;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	105350235	rs2582555	T	C	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.924;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=459;ReadPosRankSum=2.563;SC=CCTCGGCCGCTGGGGTGCCCT;SOR=0.926;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=71;TCF=49;TCR=22;TR=27;WE=105350243;WS=105350225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,32:0.39:83
chr14	105350355	rs2841236	A	G	3675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=58;NR=60;PP=2666;SC=ACGAGGACACACCCCGAAAGA;SOR=0.810;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=58;TCR=60;TR=118;WE=105350363;WS=105350345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr14	105350799	rs9788593	C	T	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=13;PP=668;SC=AGGAGGAGGACGACAGCCTCA;SOR=0.765;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=27;WE=105350807;WS=105350789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	105350868	rs9788594	C	T	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=21;PP=791;SC=TGGAGGAGGCCCGGAAGATGA;SOR=1.402;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=32;WE=105350876;WS=105350858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr14	105351637	rs2582549	A	G	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=0;PP=496;SC=GGGGGTGGCCAGTGTCAGTGG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=22;WE=105351645;WS=105351627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	105351673	rs894038	C	T	1389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=7;PP=1144;SC=GCTTCTCTGACCCTCGGTGCC;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=37;TCR=7;TR=44;WE=105351681;WS=105351663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr14	105352255	rs2251389	T	A	1541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=11;PP=1229;SC=CGGCAGGCCCTGGGTGGCGCG;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=50;WE=105352263;WS=105352245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr14	105354293	rs2582548	A	G	966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=24;PP=771;SC=GGGCCCGCTCAGGCAGTGCCC;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=105354301;WS=105354283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr14	105356137	rs2919629	G	C	3074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=75;PP=2476;SC=GTGCCAGTGCGTTTTCTTGAG;SOR=4.011;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=7;TCR=77;TR=82;WE=105356145;WS=105356127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr14	105356240	.	CAAATG	C	119.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.97;ReadPosRankSum=-2.369;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr14	105356241	.	A	G	211	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=7;PP=211;QD=35.110173221;SC=ATGGATGGACAAATGGATGGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=105356249;WS=105356231;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,7:0.88:8
chr14	105356247	.	ATGGATGG	A	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.84;ReadPosRankSum=-2.369;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr14	105359306	rs3742939	G	C	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=11;PP=931;SC=TTTCCTGCCGGCTGCAGGCTG;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=38;WE=105359314;WS=105359296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	105359827	rs2247712	T	C	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=3;PP=508;SC=AGCCTCTGCCTGGGGCCCACG;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=105359835;WS=105359817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	105360746	rs2841244	T	C	2514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=69;PP=2106;SC=CCCCTTGGCCTGCCCCCAGCC;SOR=2.226;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=23;TCR=69;TR=92;WE=105360754;WS=105360736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr14	105363157	rs7152667	A	G	555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=498;SC=CCCTGCACATAGGACAGACCA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=105363165;WS=105363147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	105363202	rs10147348	A	G	366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=10;PP=293;SC=TGCCACCAGGAGGCGGCCTGG;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=105363210;WS=105363192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr14	105393556	rs2841280	G	C	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.452;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=482;ReadPosRankSum=-0.572;SC=GTGGGACAGAGAGGCTGGCAC;SOR=1.118;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=42;TCF=23;TCR=19;TR=24;WE=105393564;WS=105393546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr14	105398787	rs2582533	G	C	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=31;ReadPosRankSum=1.068;SC=CACCTCAGGAGGGAGGGGCTG;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=105398795;WS=105398777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr14	105404384	rs1048257	T	C	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.917;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=415;ReadPosRankSum=2.791;SC=TCTCTTGTACTGATGAGCCAT;SOR=1.302;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=66;TCF=39;TCR=27;TR=25;WE=105404392;WS=105404374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,26:0.39:66
chr14	105405599	rs3742935	G	C	854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.033;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=8;PP=723;ReadPosRankSum=-0.269;SC=CTGGGGGCAGGGAAGGAGAAC;SOR=2.093;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=83;TCF=54;TCR=29;TR=36;WE=105405607;WS=105405589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,35:0.41:85
chr14	105405942	rs28454709	G	A	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.423;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=26;PP=1035;ReadPosRankSum=-0.881;SC=CAGCAGTGGAGAGGTGCAGCT;SOR=0.489;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=116;TCF=52;TCR=64;TR=50;WE=105405950;WS=105405932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,51:0.44:117
chr14	105406007	.	C	G	1468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=23;PP=1191;ReadPosRankSum=-2.107;SC=GATTTGCTCTCAGAAGCTGTC;SOR=0.749;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=112;TCF=64;TCR=48;TR=55;WE=105406015;WS=105405997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,55:0.49:113
chr14	105406238	rs2819419	A	C	1778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=6.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.003;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=29;PP=1421;ReadPosRankSum=-0.462;SC=TCCTGCGAGTACTTGGTCATG;SOR=0.525;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=170;TCF=106;TCR=64;TR=69;WE=105406246;WS=105406228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,70:0.41:171
chr14	105407031	rs11623422	A	G	1479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.392;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=42;PP=1184;ReadPosRankSum=1.323;SC=CTGGGCCCTGAGACACACAGG;SOR=1.032;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=132;TCF=43;TCR=89;TR=59;WE=105407039;WS=105407021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,59:0.45:132
chr14	105407208	rs11851053	T	C	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.121;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=22;PP=1105;ReadPosRankSum=-0.793;SC=TAGGAAAAGATACCTGACCAA;SOR=0.900;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=136;TCF=80;TCR=56;TR=58;WE=105407216;WS=105407198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,65:0.45:146
chr14	105407798	rs4465542	T	C	2169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.072;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=61;PP=1626;ReadPosRankSum=0.296;SC=ATGGGAAATGTGGAAGTCTTC;SOR=0.914;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=217;TCF=85;TCR=132;TR=95;WE=105407806;WS=105407788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,99:0.44:225
chr14	105408182	rs9672139	T	G	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.705;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=850;ReadPosRankSum=1.524;SC=ACCTCGGGCATGTGGCCTTCT;SOR=0.808;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=87;TCF=43;TCR=44;TR=41;WE=105408190;WS=105408172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,41:0.47:88
chr14	105408315	rs28600075	T	C	1272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=1016;ReadPosRankSum=0.315;SC=CCTCCATCTTTGGCGCAGACA;SOR=0.754;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=127;TCF=78;TCR=49;TR=53;WE=105408323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,55:0.42:132
chr14	105408811	rs2819421	A	G	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.217;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.319;NF=37;NR=36;PP=1221;ReadPosRankSum=0.957;SC=CTCCACCTTCAGCGCAGACAC;SOR=0.336;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=147;TCF=80;TCR=67;TR=73;WE=105408819;WS=105408801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,74:0.49:152
chr14	105408955	rs2819422	A	G	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.438;NF=22;NR=26;PP=750;ReadPosRankSum=0.035;SC=CTCCAGCCGCACACTGTCCAG;SOR=0.672;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=134;TCF=61;TCR=73;TR=48;WE=105408963;WS=105408945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,49:0.35:139
chr14	105410183	rs10438246	T	C	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=22;PP=695;ReadPosRankSum=-0.136;SC=AGGAGTTTCATGTCCACCTGG;SOR=0.651;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=69;TCF=34;TCR=35;TR=41;WE=105410191;WS=105410173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,41:0.57:72
chr14	105410382	rs201817721	TT	CC	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=6.597;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQRankSum=-11.817;QD=0.29;ReadPosRankSum=1.597;SOR=1.685;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,12:0.08:153
chr14	105410411	rs11160825	C	T	1281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.931;NF=29;NR=23;PP=970;ReadPosRankSum=0.673;SC=ACATCCTTGTCGGCCAGGGAC;SOR=0.740;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=151;TCF=83;TCR=68;TR=52;WE=105410425;WS=105410401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,55:0.36:153
chr14	105410417	rs200284292	G	A	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=0.956;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQRankSum=-10.284;QD=1.67;ReadPosRankSum=-1.340;SOR=0.566;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,17:0.11:156
chr14	105410435	rs201237638	G	A	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=0.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQRankSum=-10.491;QD=1.39;ReadPosRankSum=0.075;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,17:0.10:162
chr14	105410451	rs199536215	T	C	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=2.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=-10.532;QD=1.26;ReadPosRankSum=1.335;SOR=1.035;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,15:0.10:157
chr14	105410775	rs2819424	A	G	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.600;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.954;NF=34;NR=27;PP=1056;ReadPosRankSum=1.684;SC=GGAGACTCACATCGGCTTCCA;SOR=0.610;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=154;TCF=85;TCR=69;TR=61;WE=105410783;WS=105410765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,64:0.40:159
chr14	105410827	rs28380382	C	T	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.690;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.178;NF=28;NR=39;PP=1470;ReadPosRankSum=0.396;SC=CATGGACTTCCCTGGGGCCGA;SOR=0.945;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=160;TCF=76;TCR=84;TR=67;WE=105410835;WS=105410817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,67:0.41:162
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chr14	105412541	rs12433837	CA	TG	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=3.111;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.95;MQRankSum=-6.282;QD=7.00;ReadPosRankSum=-1.676;SOR=1.267;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,15:0.23:64
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chr14	105413142	rs200865013	TG	CA	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=14.342;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.82;MQRankSum=-3.529;QD=1.01;ReadPosRankSum=0.803;SOR=1.451;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,10:0.10:105
chr14	105413204	rs2582514	G	T	2063.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.221;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.941;NF=33;NR=25;PP=1096;ReadPosRankSum=0.076;SC=GGCTGAATGCGGATGTCAGTG;SOR=0.459;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=129;TCF=79;TCR=50;TR=58;WE=105413212;WS=105413194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,58:0.44:132
chr14	105413223	rs55797226	A	G	2140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.750;NF=39;NR=22;PP=1123;ReadPosRankSum=-1.530;SC=TGGTCTTAAGATCCCCTTGCA;SOR=0.651;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=130;TCF=85;TCR=45;TR=61;WE=105413231;WS=105413213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,61:0.45:135
chr14	105414238	rs60754080	C	A	1778.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.533;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.939;NF=22;NR=27;PP=2218;ReadPosRankSum=0.016;SC=GGAGAGGCTCCCGTCGGCCTC;SOR=0.818;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=127;TCF=66;TCR=61;TR=49;WE=105414260;WS=105414228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,50:0.38:130
chr14	105414252	rs60106058	C	T	1958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.100;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.938;NF=29;NR=26;PP=2218;ReadPosRankSum=-1.185;SC=CGGCCTCCACCTTCGGCGCAG;SOR=0.428;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=140;TCF=83;TCR=57;TR=55;WE=105414260;WS=105414228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,56:0.39:144
chr14	105414280	rs2819429	T	G	1275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.943;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.862;NF=38;NR=20;PP=963;ReadPosRankSum=0.763;SC=CACCGAGGCCTCGATGGACTT;SOR=0.984;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=164;TCF=100;TCR=64;TR=58;WE=105414288;WS=105414270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,59:0.36:166
chr14	105414629	rs72702027	G	A	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.754;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.926;NF=24;NR=14;PP=874;ReadPosRankSum=1.217;SC=GGGCCCTCTGGGAGTTTCACA;SOR=0.924;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=86;TCF=52;TCR=34;TR=38;WE=105414637;WS=105414619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,40:0.45:89
chr14	105414790	rs2582513	A	G	1511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.662;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.526;NF=26;NR=29;PP=1141;ReadPosRankSum=1.362;SC=GGACTTGCCAAGGGCAGACAC;SOR=0.783;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=118;TCF=57;TCR=61;TR=55;WE=105414798;WS=105414780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,58:0.46:126
chr14	105414810	rs10145032	C	G	1727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.398;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.789;NF=20;NR=40;PP=1289;ReadPosRankSum=-0.326;SC=CCCCAAACGACAGCATCTTGA;SOR=1.635;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=126;TCF=54;TCR=72;TR=60;WE=105414818;WS=105414800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,65:0.49:134
chr14	105415242	rs200922560	C	T	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=6.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQRankSum=-10.384;QD=0.77;ReadPosRankSum=-1.433;SOR=0.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,12:0.07:164
chr14	105415250	rs201959909	G	C	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=12.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQRankSum=-9.953;QD=0.93;ReadPosRankSum=-1.093;SOR=0.570;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,16:0.09:171
chr14	105415264	rs201041268	GA	AT	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=10.278;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQRankSum=-9.438;QD=1.63;ReadPosRankSum=0.532;SOR=0.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:164,20:0.11:184
chr14	105415352	rs12890949	G	C	2615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-7.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.823;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.178;NF=58;NR=46;PP=2154;ReadPosRankSum=-0.160;SC=TTGGTAGTCAGGTCCTTGTTG;SOR=0.973;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=202;TCF=107;TCR=95;TR=104;WE=105415360;WS=105415342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,106:0.52:205
chr14	105415422	rs79003030	G	A	1920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.566;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.262;NF=33;NR=47;PP=1378;ReadPosRankSum=-0.792;SC=GGGCCTGGACGTCCACCTCCA;SOR=0.626;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=80;TCR=112;TR=80;WE=105415441;WS=105415412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,79:0.44:180
chr14	105415469	rs11846918	T	C	2198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.283;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.117;NF=39;NR=51;PP=2573;ReadPosRankSum=1.476;SC=GGGACTCTCATTTCCACCTTG;SOR=0.356;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=159;TCF=59;TCR=100;TR=90;WE=105415477;WS=105415459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,82:0.53:154
chr14	105415497	rs201263008	T	C	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQRankSum=-5.817;QD=1.47;ReadPosRankSum=1.465;SOR=0.566;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:119,20:0.14:139
chr14	105415608	rs11850848	G	C	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.609;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.782;NF=25;NR=24;PP=902;ReadPosRankSum=-0.107;SC=CCTCGGGCACGTGGCCCTCCG;SOR=0.728;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=99;TCF=48;TCR=51;TR=49;WE=105415616;WS=105415606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,52:0.52:100
chr14	105415659	rs61271499	G	A	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.490;NF=22;NR=21;PP=904;ReadPosRankSum=-0.454;SC=CCTTCAGGTCGGCAGAAGGGG;SOR=0.641;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=42;TCR=39;TR=43;WE=105415667;WS=105415649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,46:0.57:81
chr14	105416010	rs2582511	T	C	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.732;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=524;ReadPosRankSum=0.040;SC=CCTTAACATCTGTCTGGGGGC;SOR=1.312;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=87;TCF=31;TCR=56;TR=34;WE=105416018;WS=105416000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,35:0.39:89
chr14	105416087	rs59117977	C	T	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.164;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=15;PP=630;ReadPosRankSum=-0.562;SC=CCTTTGAGGCCGGCTCCCTCG;SOR=0.392;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=31;WE=105416095;WS=105416077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,33:0.45:74
chr14	105416220	rs2819435	T	A	2307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.897;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.467;NF=56;NR=36;PP=1777;ReadPosRankSum=0.895;SC=GGAGGCTCACTTCGGCCTCCA;SOR=0.884;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=178;TCF=105;TCR=73;TR=92;WE=105416228;WS=105416210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,92:0.53:175
chr14	105417765	rs2894636	AG	CA	1948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=12.236;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQRankSum=-4.522;QD=16.80;ReadPosRankSum=-0.263;SOR=1.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,50:0.43:116
chr14	105417768	rs2396458	C	A	2062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=13.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQRankSum=-5.010;QD=17.33;ReadPosRankSum=-0.399;SOR=1.577;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,52:0.44:119
chr14	105417774	rs2013228	G	A	2133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=11.426;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.74;MQRankSum=-5.664;QD=16.80;ReadPosRankSum=-0.673;SOR=1.565;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,58:0.46:127
chr14	105417837	rs76231332	A	G	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.547;NF=34;NR=29;PP=1028;ReadPosRankSum=0.607;SC=CGTCCTTGTCAGCCAGGGACA;SOR=0.698;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=135;TCF=74;TCR=61;TR=63;WE=105417845;WS=105417827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,63:0.46:137
chr14	105417894	rs2819440	C	G	1418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.499;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=35;PP=1085;ReadPosRankSum=-1.531;SC=CCGGGGCCTGCATGTCCACCT;SOR=0.961;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=115;TCF=39;TCR=76;TR=50;WE=105417902;WS=105417884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,53:0.44:120
chr14	105418166	rs78116894	T	C	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=2.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.54;MQRankSum=-7.533;QD=1.92;ReadPosRankSum=-2.094;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,12:0.12:102
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chr14	105418502	rs201268922	G	T	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=11.095;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQRankSum=-0.071;QD=7.43;ReadPosRankSum=0.692;SOR=1.689;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr14	105418504	rs151013711	G	T	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=1.159;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.92;MQRankSum=-4.415;QD=14.93;ReadPosRankSum=1.285;SOR=0.472;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr14	105418521	rs142241633	G	C	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.502;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.326;NF=14;NR=3;PP=308;ReadPosRankSum=-0.916;SC=TGGGCATCTTGAAACTGGGCA;SOR=1.719;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=47;TCF=28;TCR=19;TR=17;WE=105418529;WS=105418511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr14	105418638	rs78353106	A	G	1550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.629;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.659;NF=42;NR=17;PP=1266;ReadPosRankSum=-2.342;SC=CAGTAGAAGCAGGCTGAATGC;SOR=0.952;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=103;TCF=67;TCR=36;TR=59;WE=105418646;WS=105418628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,65:0.60:109
chr14	105419557	rs78204285	G	A	1202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQRankSum=-3.481;QD=17.69;ReadPosRankSum=-0.170;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
chr14	105419559	rs74525871	A	G	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQRankSum=-3.646;QD=18.32;ReadPosRankSum=0.951;SOR=0.913;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,31:0.46:67
chr14	105419568	rs78110724	A	G	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.872;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQRankSum=-3.462;QD=17.27;ReadPosRankSum=0.513;SOR=0.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,35:0.49:72
chr14	105420215	rs2278607	T	C	2293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=7.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.183;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=53;PP=1870;ReadPosRankSum=-1.491;SC=TTCAGGCCAGTACCCGCTTTT;SOR=0.511;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=148;TCF=46;TCR=102;TR=80;WE=105420223;WS=105420205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,83:0.54:155
chr14	105420534	rs41307096	C	A	1597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.431;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=19;PP=1249;ReadPosRankSum=0.568;SC=TTCCATGGAGCCTGGCTGCCC;SOR=0.333;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=101;TCF=71;TCR=30;TR=56;WE=105420542;WS=105420524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,58:0.57:101
chr14	105452035	rs10150682	A	G	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=12;NR=2;PP=369;SC=GCGGGTCCTGAACGGCGGGGG;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=105452043;WS=105452025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr14	105457771	rs2247140	A	G	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.516;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=3;PP=459;ReadPosRankSum=1.771;SC=GCCGTGCCTCATGATCTCCTC;SOR=1.802;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=53;TCF=45;TCR=8;TR=30;WE=105457779;WS=105457761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,29:0.53:55
chr14	105461067	rs894039	C	T	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.582;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=508;ReadPosRankSum=-0.088;SC=CAAGCTCAAACTGACACTCTT;SOR=1.220;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=27;WE=105461075;WS=105461057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr14	105478102	rs3803294	G	A	1974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.999;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=35;PP=1485;ReadPosRankSum=0.341;SC=AGCGGCACAGGTTGGGCTCCA;SOR=0.530;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=145;TCF=80;TCR=65;TR=75;WE=105478110;WS=105478092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,79:0.50:157
chr14	105518456	rs3803321	A	C	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.636;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=280;ReadPosRankSum=0.982;SC=GACAGAGACAAGAGTGAGGAC;SOR=1.688;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=19;WE=105518464;WS=105518446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr14	105523663	rs7147439	G	A	1163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=32;PP=887;SC=ATCAGATTGAGTCACAAGTTA;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=105523671;WS=105523653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	105609335	rs10149229	A	G	3021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.472;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=69;PP=2400;ReadPosRankSum=-1.309;SC=CCGGCCGCTCAATGGGGTTGC;SOR=0.644;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=224;TCF=99;TCR=125;TR=122;WE=105609343;WS=105609325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,125:0.52:242
chr14	105611282	rs2272591	A	G	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=393;ReadPosRankSum=0.011;SC=CCACCTCCACAGCACTGGCCC;SOR=0.551;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=21;WE=105611290;WS=105611272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr14	105613646	.	G	C	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.917;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.537;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=430;ReadPosRankSum=-0.730;SC=CAGGGCTGGGGCTGTCTGGCC;SOR=1.244;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=22;WE=105613654;WS=105613636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr14	105614032	rs2242636	C	G	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=80;ReadPosRankSum=-0.522;SC=GCAGAAGGGACTGGGGGGCGA;SOR=0.527;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=5;WE=105614040;WS=105614022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr14	105617042	rs1057744	C	T	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=21;PP=807;ReadPosRankSum=0.622;SC=CTGGCACACTCGTCTCGTTCC;SOR=0.635;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=42;TCR=39;TR=43;WE=105617050;WS=105617032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,44:0.53:83
chr14	105617072	.	C	T	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.234;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.923;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=692;ReadPosRankSum=0.659;SC=TGCCGGCCTCCGAAGCCCCGT;SOR=0.572;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=91;TCF=41;TCR=50;TR=38;WE=105617080;WS=105617062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,40:0.43:94
chr14	105617550	rs3830678	C	CGCAGCCCCA	497.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.662;NF=6;NR=7;PP=1302;ReadPosRankSum=0.188;SC=CAGCAGCCCCCGCAGCCCCAG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=28;TCF=12;TCR=16;TR=13;WE=105617558;WS=105617540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr14	105618670	rs2238287	T	C	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.071;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=185;ReadPosRankSum=0.096;SC=TGAGCTGTGGTGCCTGAAAGG;SOR=1.292;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=13;WE=105618678;WS=105618660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr14	105622056	rs2816679	A	G	2583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=52;PP=2141;SC=CCCTCCACGCAGCCCAGCGGC;SOR=1.165;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=33;TCR=52;TR=85;WE=105622064;WS=105622046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr14	105643619	rs10139596	G	A	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.593;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=199;ReadPosRankSum=0.588;SC=AAGGACACACGGGCAGCTGAG;SOR=0.155;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=9;WE=105643627;WS=105643609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr14	105643652	rs10139450	A	C	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.367;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=2.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.84;ReadPosRankSum=-1.137;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr14	105644151	rs1882848	T	C	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=22.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=381;ReadPosRankSum=0.080;SC=CACAGACCCATTGCACCCACT;SOR=5.363;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=16;WE=105644159;WS=105644141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr14	105647562	rs67388067	GGCGGGGGCCGCGAGCTCT	G	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=528;ReadPosRankSum=0.967;SC=CGCCCGGACAGGCGGGGGCCG;SOR=2.225;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=2;WE=105647587;WS=105647552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr14	105676048	rs3087836	G	C	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=157;ReadPosRankSum=0.041;SC=TGTCCACGGGGAACTCCCAGC;SOR=0.090;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=9;WE=105676056;WS=105676038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr14	105686570	rs8005486	T	C	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=30;PP=775;ReadPosRankSum=0.110;SC=GGCTAAGGGCTTTCTAGAACC;SOR=0.800;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=62;TCF=4;TCR=58;TR=32;WE=105686578;WS=105686560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,32:0.52:61
chr14	105692697	rs12883636	G	C	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=25;PP=594;ReadPosRankSum=-1.220;SC=CTGGGGTGCCGCGTGGGCCCC;SOR=0.929;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=27;WE=105692705;WS=105692687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr14	105707747	rs144658695	C	T	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=546;ReadPosRankSum=-1.296;SC=TATACAGGCACGGGTCTGCGG;SOR=0.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=28;WE=105707755;WS=105707737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr14	105715515	rs2816605	C	T	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.053;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=9;PP=339;ReadPosRankSum=-0.247;SC=TGTTCAACAACGAGCTCATGG;SOR=0.510;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=58;TCF=34;TCR=24;TR=20;WE=105715523;WS=105715505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,20:0.33:60
chr14	105716034	rs2816606	C	T	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.810;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.836;NF=10;NR=29;PP=741;ReadPosRankSum=0.373;SC=CCACTCTGTACGCTGCTAAGA;SOR=0.831;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=101;TCF=29;TCR=72;TR=39;WE=105716042;WS=105716024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,42:0.40:105
chr14	105722726	rs1008628	T	C	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=15;PP=471;ReadPosRankSum=-0.103;SC=ACTTCCTGACTGGGCAGGCAG;SOR=0.602;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=41;TCR=35;TR=32;WE=105722734;WS=105722716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,32:0.42:77
chr14	105878224	rs72711585	G	C	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.837;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=37;PP=810;ReadPosRankSum=-0.014;SC=GGGGGCCCACGGTGGGGGCAG;SOR=0.449;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=103;TCF=27;TCR=76;TR=52;WE=105878232;WS=105878214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,52:0.50:104
chr14	105905126	rs4983620	C	T	745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=21;PP=606;SC=GTGGGGGCTACGCCAGCTCCT;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=24;WE=105905134;WS=105905116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr14	105911639	rs6576102	G	A	1715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=1;PP=1480;SC=CCCGAGGGGTGGTGTGGTTAC;SOR=5.856;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=55;TCR=1;TR=56;WE=105911647;WS=105911629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr14	105916420	rs4983409	C	T	7996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=164;NR=87;PP=2965;SC=AAATGGAGAACCCGGAAATGG;SOR=1.393;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=252;TCF=165;TCR=87;TR=251;WE=105916428;WS=105916410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,261:1.00:261
chr14	105924538	rs7492915	G	A	831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=2;PP=652;SC=CCCCGCACCCGGGGAGGAGAG;SOR=4.255;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=105924546;WS=105924528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr14	105924786	rs4074001	G	A	2351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=51;PP=1764;SC=GGTGGGTGTTGGGGACGTGAC;SOR=3.426;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=10;TCR=51;TR=61;WE=105924794;WS=105924776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr14	105929443	rs7143366	C	T	1209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=0;PP=1036;SC=GCCTTCTGGCCGCAGCCCTGC;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=105929451;WS=105929433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr14	105930406	rs4983413	G	A	2684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.018;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=65;PP=1975;ReadPosRankSum=-1.094;SC=CGTCAACAACGTCAAGGCCGG;SOR=0.930;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=222;TCF=91;TCR=131;TR=109;WE=105930414;WS=105930396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,111:0.49:227
chr14	105930923	rs11845995	G	A	1918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=32;NR=36;PP=1564;SC=GGGGACACCCGCCCTGCCTGC;SOR=0.779;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=77;TCF=32;TCR=45;TR=68;WE=105930931;WS=105930913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr14	105931562	rs34681866	C	G	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=171;ReadPosRankSum=-1.031;SC=ATGCTGCCTGCAGGCAGCTTC;SOR=0.459;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=10;WE=105931570;WS=105931552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr14	105931585	rs4983339	A	G	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=18;PP=463;SC=ACCCAAGCTCATGCACTGGTG;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=105931593;WS=105931575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	105935721	rs10150545	A	G	1354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=14;PP=1120;SC=CCATTGTCCCAAGGTGGCTGA;SOR=1.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=48;WE=105935729;WS=105935711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr14	105935824	rs13707	G	A	3628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.158;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=56;PP=2928;ReadPosRankSum=-0.671;SC=CCACGGACAGGCCAGGCACAT;SOR=0.358;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=63;TCR=57;TR=119;WE=105935832;WS=105935814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,119:0.99:120
chr14	105936064	rs10150915	A	G	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=91;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=3;PP=754;SC=GGTCCGTGTAACTCACTGGGG;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=105936072;WS=105936054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	105936100	rs144496498	A	ACCTTGGCTGGTGGCC	2222.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=3;PP=2900;SC=CAGGCACAGCACCTCCCAGCG;SOR=4.021;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=19;WE=105936108;WS=105936090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr14	105945891	rs11849001	C	T	4046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=84;PP=2965;SC=TCCACTGTTCCCCCGACCCAC;SOR=1.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=40;TCR=84;TR=124;WE=105945899;WS=105945881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr14	105953474	rs7160858	G	T	271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=1;PP=182;SC=CGAGGGGCGGGGTCTCCAAGG;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=105953482;WS=105953464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	105953595	rs7140395	T	C	1155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=16;PP=891;SC=CCCGGAGCCGTCATGCCCAAG;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=37;WE=105953603;WS=105953585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
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chr14	105962234	rs7494350	T	C	2436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=19;PP=1838;SC=GAGCGGGAGCTGCCCAAAACC;SOR=2.332;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=57;TCR=19;TR=76;WE=105962242;WS=105962224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr14	105962369	rs7494717	A	G	2133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=58;PP=1697;SC=ACTGGGCAGCACCCTTGGATC;SOR=4.375;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=5;TCR=58;TR=63;WE=105962377;WS=105962359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr14	106054428	rs9972103	C	G	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.42;QD=31.14;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	106054456	rs61984162	A	G	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.74;QD=32.38;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr14	106054748	rs74519992	G	A	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FS=1.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=-6.170;QD=1.98;ReadPosRankSum=2.509;SOR=0.515;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:182,34:0.16:216
chr14	106054791	rs73357622	G	T	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=1.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.13;MQRankSum=-5.150;QD=7.95;ReadPosRankSum=1.648;SOR=0.491;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:112,40:0.26:152
chr14	106054796	rs74091253	A	G	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=3.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=-3.460;QD=8.02;ReadPosRankSum=2.055;SOR=0.398;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,34:0.25:134
chr14	106054812	rs111444508	C	T	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=11.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-1.699;QD=4.83;ReadPosRankSum=-1.091;SOR=0.125;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,27:0.25:110
chr14	106066454	rs4983454	T	C	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.97;QD=28.23;SOR=1.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr14	106066804	.	T	A	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.633;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=174;ReadPosRankSum=-0.500;SC=GACCCCGGCCTGCCCATGGCT;SOR=0.665;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=22;TCF=12;TCR=10;TR=12;WE=106066812;WS=106066794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr14	106067618	rs12884681	G	A	1469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=23;PP=1198;SC=TCTTGCCCCCGCGTCCTGGCC;SOR=1.085;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=20;TCR=23;TR=43;WE=106067626;WS=106067608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr14	106110330	rs8014709	T	C	1823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=16;PP=1504;SC=CCAGCTGGGGTCTGTCCCTGG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=53;WE=106110338;WS=106110320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr14	106173790	rs17349690	A	G	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=20.431;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.53;MQRankSum=6.061;QD=9.00;ReadPosRankSum=1.081;SOR=0.008;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr14	106173808	rs371291470	G	A	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=13.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.49;MQRankSum=-5.787;QD=12.35;ReadPosRankSum=0.602;SOR=4.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr14	106173971	rs10220590	T	C	561.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=12.788;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.28;MQRankSum=0.471;QD=29.57;ReadPosRankSum=0.966;SOR=5.890;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr14	106174261	rs1407	C	G	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.958;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.670;NF=7;NR=28;PP=775;ReadPosRankSum=-1.413;SC=AGAGGTCACGCTCAGGTGGTC;SOR=1.455;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=35;WE=106174269;WS=106174251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,35:0.65:54
chr14	106174518	rs12433324	A	G	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.165;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.000;NF=15;NR=26;PP=766;ReadPosRankSum=0.610;SC=GTCAGCACATACTTCCCCATG;SOR=0.381;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=84;TCF=27;TCR=57;TR=41;WE=106174526;WS=106174508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,40:0.49:82
chr14	106188045	rs11624491	C	T	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=493;SC=TTCCTGGGGTCGTTGCAACAG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=106188053;WS=106188035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	106188230	rs1134590	C	T	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.08;QD=32.19;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	106188309	rs11624581	C	T	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.86;QD=32.14;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	106208082	rs11621259	G	T	264.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.88;QD=44.13;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr14	106208086	rs1045853	A	C	260.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.93;QD=37.26;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	106209340	rs11552998	T	C	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=9;PP=357;SC=AGCCCAGGGCTGCTGTGCCCC;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=20;WE=106209348;WS=106209330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	106236128	rs12890621	T	A	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=9;PP=470;SC=CGTGCTGTTGTACTGCTCCTC;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=17;WE=106236136;WS=106236121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr14	106236451	rs12895160	T	G	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.44;QD=41.62;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr14	106236458	rs11628528	C	T	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.99;QD=43.43;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	106237105	rs2753552	A	G	2757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=64;PP=2223;SC=GAGAGAAGGTATCTGAGCTGA;SOR=2.147;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=22;TCR=64;TR=86;WE=106237113;WS=106237095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr14	106237642	rs2983777	T	G	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=8;PP=508;SC=TCACCGGTTCTGGGAAGTAGT;SOR=1.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=23;WE=106237650;WS=106237632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr14	106237811	rs11621054	C	T	182.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.6699;FS=6.532;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=117;ReadPosRankSum=-1.085;SC=AGAGGCCCCTCGGTTCTTGTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=106237819;WS=106237801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr14	106303325	rs3764172	A	G	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.139;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=492;ReadPosRankSum=-0.253;SC=AGAAGACTGGATTCTGTGGCG;SOR=0.171;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=47;TCF=41;TCR=6;TR=21;WE=106303333;WS=106303315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr14	106303699	rs10139433	G	A	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=318;ReadPosRankSum=-1.511;SC=CCCTGGACCAGCTCTGGCATG;SOR=0.776;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=14;WE=106303707;WS=106303689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr14	106303846	rs1005582	C	T	3423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.732;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=49;PP=2748;ReadPosRankSum=-1.408;SC=GTGGACAGGGCGGTCCACAGG;SOR=0.109;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=118;TCF=69;TCR=49;TR=114;WE=106303854;WS=106303836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,116:0.97:119
chr14	106303948	rs1005581	A	G	2357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=59;PP=1954;SC=GGGGAGGAACAGGGGCTGAGT;SOR=2.995;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=14;TCR=59;TR=73;WE=106303956;WS=106303938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr14	106304899	rs762807	G	T	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.018;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=187;ReadPosRankSum=-0.677;SC=ACAGATAATGGGAGACACGTG;SOR=4.235;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=10;WE=106304907;WS=106304889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr14	106306841	rs709589	C	T	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.814;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=232;ReadPosRankSum=0.646;SC=GTGGTGCTCCCGGGCTGTGGA;SOR=0.307;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=13;WE=106306849;WS=106306831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,17:0.53:32
chr14	106306959	rs149511309	C	T	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.54;ReadPosRankSum=-1.204;SOR=1.492;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr14	106307054	rs2753491	C	G	218.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=1;PP=168;SC=AGGCTGTCAGCCTCTGGCCAC;SOR=2.584;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=6;WE=106307062;WS=106307044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr14	106307418	rs2753492	G	A	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.824;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=16;PP=643;ReadPosRankSum=0.653;SC=GGACCTTCCCGGCCACCTCCC;SOR=0.567;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=83;TCF=45;TCR=38;TR=33;WE=106307426;WS=106307408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,35:0.41:86
chr14	106311030	rs12589570	GT	AC	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=391;ReadPosRankSum=-0.743;SC=GGTCCGTTCAGTGTCCCTCTC;SOR=0.527;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=11;WE=106311039;WS=106311020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr14	106311374	rs2856940	A	G	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr14	106318248	rs1059713	A	T	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.615;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=24;PP=1150;ReadPosRankSum=1.661;SC=ACCCGGAGGCAGCGCCCCTTT;SOR=1.183;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=112;TCF=63;TCR=49;TR=61;WE=106318256;WS=106318238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,62:0.54:115
chr14	106318342	rs2256593	T	C	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.628;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=478;ReadPosRankSum=1.212;SC=ATGCTTTCCCTGTGGTCGGGA;SOR=0.113;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=29;WE=106318350;WS=106318332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,29:0.47:62
chr14	106318440	rs2256589	T	C	1627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.84;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr14	106318450	rs2753504	G	A	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.41;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr14	106321590	rs12365	C	A	1865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=3;PP=1533;SC=CTCACCGGGGCCACACATGGA;SOR=4.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=50;TCR=3;TR=53;WE=106321598;WS=106321580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr14	106329287	rs13379369	G	A	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=53;ReadPosRankSum=1.383;SC=CCCAGTGCCCGTCCCCTCCTG;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=5;WE=106329295;WS=106329277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr14	106329435	rs1950943	T	G	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.387;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=14;PP=735;ReadPosRankSum=-0.406;SC=GTGGTCCCTTTGCCCCAGACG;SOR=0.210;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=36;WE=106329443;WS=106329425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,38:0.51:74
chr14	106329449	.	ATG	A	1508.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.113;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=1.717;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.22;ReadPosRankSum=0.771;SOR=0.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,39:0.42:93
chr14	106329451	.	GTA	ACC	2282	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=14;NR=19;PP=2282;QD=71.0747840867;SC=AGACGTCCATGTAGTAGTAGT;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=94;TCF=51;TCR=43;TR=33;WE=106329461;WS=106329440;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:61,33:0.35:94
chr14	106329453	.	A	ACC	1550.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.646;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=1.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.32;ReadPosRankSum=0.358;SOR=0.476;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,40:0.42:95
chr14	106329919	rs3752943	G	A	2571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=33;PP=2059;SC=CCCTCTCCCCGGCTTTCTTTC;SOR=1.058;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=45;TCR=33;TR=78;WE=106329927;WS=106329909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr14	106330117	rs3752944	G	A	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=1.664;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.34;ReadPosRankSum=1.441;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr14	106330126	rs3752945	C	A	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=1.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.24;ReadPosRankSum=0.382;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr14	106330178	rs61126474	G	A	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.828;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=231;ReadPosRankSum=0.803;SC=GGGTTGTTGGGCATTGGACCC;SOR=0.117;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=13;WE=106330186;WS=106330168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr14	106330197	rs60847425	T	C	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.092;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=286;ReadPosRankSum=0.576;SC=CCCAGAGGCCTAGGGTGGCCC;SOR=0.109;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=15;WE=106330205;WS=106330187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr14	106330320	rs2857385	A	C	5302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=48;PP=2965;ReadPosRankSum=0.319;SC=GCCCCCCAGGATGCTCCGGGG;SOR=0.787;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=112;TCR=48;TR=159;WE=106330328;WS=106330310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,167:0.99:168
chr14	106330355	rs74678017	C	G	1868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.031;HP=2;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=41;PP=1344;ReadPosRankSum=-0.712;SC=GACCCAGCACCCTTATTTCCC;SOR=0.382;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=200;TCF=113;TCR=87;TR=84;WE=106330363;WS=106330345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,85:0.42:203
chr14	106330370	rs2857384	G	A	6937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=101;PP=2965;SC=TTTCCCCCCAGAAATGCAGCA;SOR=0.789;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=213;TCF=112;TCR=101;TR=213;WE=106330378;WS=106330360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr14	106330880	rs2236228	C	T	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.144;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=445;ReadPosRankSum=1.026;SC=TGCCCAGACACAAACCTGTGC;SOR=1.981;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=47;TCF=13;TCR=34;TR=23;WE=106330888;WS=106330870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr14	106346740	rs2244932	A	G	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=0;PP=486;SC=CCCGGCCCCCATCCTCACCAT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=106346748;WS=106346730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr14	106346795	rs2244930	G	T	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.208;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=336;ReadPosRankSum=-0.106;SC=GGTCATGAGGGCTGGGAAGGT;SOR=0.976;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=20;WE=106346803;WS=106346785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr14	106346990	rs2244917	G	C	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=20;PP=470;SC=TGGGCTGCTGGGTGGGGTCTC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=106346998;WS=106346980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr14	106347420	rs72481504	T	C	2153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.392;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=40;PP=1522;ReadPosRankSum=1.917;SC=TACCCGACTGTGACACAGACA;SOR=0.421;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=174;TCF=100;TCR=74;TR=87;WE=106347428;WS=106347410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,91:0.52:175
chr14	106347467	rs2516984	A	C	5976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=80;NR=107;PP=2965;SC=GGGGCCTTCCATTGCTGGGCT;SOR=1.045;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=187;TCF=80;TCR=107;TR=187;WE=106347475;WS=106347457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr14	106349827	rs188955129	G	A	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=28;ReadPosRankSum=0.693;SC=AACTGGAGGCGGGGCTGTCAG;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=106349835;WS=106349817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr14	106350569	rs2516978	C	T	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.268;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=362;ReadPosRankSum=-0.438;SC=GTGCAGGGCACCAGCCCATCG;SOR=0.038;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=52;TCF=50;TCR=2;TR=20;WE=106350577;WS=106350559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr14	106350623	rs2753523	G	C	1365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.718;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=13;PP=1048;ReadPosRankSum=-0.489;SC=GGTCTGGGCAGAAACCCTCGG;SOR=0.984;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=107;TCF=78;TCR=29;TR=50;WE=106350631;WS=106350613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,53:0.47:113
chr14	106350696	rs2857368	A	G	1922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=38;PP=1335;ReadPosRankSum=0.560;SC=CTGCGAGTCCAGTCAGTTTTT;SOR=0.765;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=178;TCF=88;TCR=90;TR=79;WE=106350704;WS=106350686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,85:0.46:186
chr14	106354353	rs2516972	C	T	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.549;NF=17;NR=2;PP=354;ReadPosRankSum=-0.824;SC=AGCCCCTCAGCCCCAGGAGTG;SOR=0.706;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=19;WE=106354361;WS=106354346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr14	106354418	rs12894229	G	A	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.162;NF=34;NR=3;PP=796;ReadPosRankSum=0.574;SC=GGGAATAGCAGTCACCACCAC;SOR=0.653;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=88;TCF=80;TCR=8;TR=37;WE=106354426;WS=106354408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,43:0.44:97
chr14	106354450	rs113647906	A	G	489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=1.210;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=-1.874;QD=4.58;ReadPosRankSum=1.635;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,25:0.23:107
chr14	106354474	rs199550558	TACAGGAG	T	927.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=3.807;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.12;MQRankSum=-7.159;QD=6.77;ReadPosRankSum=-5.236;SOR=0.413;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,33:0.24:137
chr14	106354495	rs200584328	A	AG	1278.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=10.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=-8.375;QD=9.01;ReadPosRankSum=-3.797;SOR=0.860;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,36:0.25:142
chr14	106354498	rs202197703	CT	C	1395.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=14.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQRankSum=-8.065;QD=9.56;ReadPosRankSum=-3.037;SOR=1.077;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,39:0.27:146
chr14	106354503	rs111599611	C	T	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=16.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.09;MQRankSum=-7.304;QD=10.11;ReadPosRankSum=-3.221;SOR=1.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,46:0.31:150
chr14	106354531	rs112554218	T	C	1814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-4.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.398;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.429;NF=27;NR=43;PP=1385;ReadPosRankSum=0.926;SC=GCTCTCCTGCTGAGACTGTGC;SOR=1.516;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=173;TCF=73;TCR=100;TR=70;WE=106354539;WS=106354521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,83:0.44:189
chr14	106354666	rs188457056	C	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=6.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.72;MQRankSum=-1.328;QD=5.69;ReadPosRankSum=-1.734;SOR=0.017;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,7:0.21:33
chr14	106354668	rs190753651	T	C	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=6.320;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.85;MQRankSum=-1.515;QD=6.26;ReadPosRankSum=-2.601;SOR=0.021;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr14	106356974	rs2753529	G	C	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.432;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=15;PP=751;ReadPosRankSum=1.011;SC=TGGGTTCAGGGCGGCTGCTCC;SOR=1.259;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=85;TCF=48;TCR=37;TR=41;WE=106356982;WS=106356964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,42:0.49:86
chr14	106357470	rs113407144	C	T	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.983;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=1;PP=712;ReadPosRankSum=0.080;SC=GTGTCAGGTGCGGCCTCAGAT;SOR=1.217;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=87;TCF=84;TCR=3;TR=36;WE=106357478;WS=106357460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,37:0.43:87
chr14	106357749	rs2254707	C	T	1787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=51;PP=1419;SC=AGAGGCCAGCCACCTCACAAC;SOR=5.820;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=2;TCR=51;TR=53;WE=106357757;WS=106357739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr14	106359259	rs2857366	A	G	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=330;SC=TCCCACTGAGAGAACCCTCCC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=106359267;WS=106359249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	106360453	rs112929337	A	C	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.551;NF=0;NR=18;PP=301;ReadPosRankSum=-0.238;SC=GCCCTGGTCCAGGCGTCTGGG;SOR=0.286;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=18;WE=106360461;WS=106360443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,18:0.36:50
chr14	106361418	rs2753533	T	C	2042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=22;PP=1544;SC=CGATCAAAATTGTAACATGGC;SOR=1.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=64;WE=106361426;WS=106361408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr14	106361561	rs61993631	GC	AT	2221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.12;QD=44.44;SOR=1.390;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr14	106361564	rs61993633	A	T	2221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.03;QD=45.34;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr14	106363915	rs112931456	T	C	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQRankSum=-13.651;QD=0.82;ReadPosRankSum=2.284;SOR=0.677;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:248,24:0.09:272
chr14	106363919	.	T	C	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.485;ClippingRankSum=0.000;DP=272;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQRankSum=-13.625;QD=0.76;ReadPosRankSum=1.392;SOR=0.654;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:247,24:0.09:271
chr14	106363921	.	T	TG	202.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.373;ClippingRankSum=0.000;DP=267;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQRankSum=-13.813;QD=0.76;ReadPosRankSum=1.401;SOR=0.750;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:243,23:0.09:266
chr14	106363923	.	T	C	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.925;ClippingRankSum=0.000;DP=266;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQRankSum=-13.786;QD=0.72;ReadPosRankSum=0.745;SOR=0.708;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:242,23:0.09:265
chr14	106363932	.	T	C	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.196;ClippingRankSum=0.000;DP=264;ExcessHet=3.0103;FS=0.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.80;MQRankSum=-13.732;QD=0.78;ReadPosRankSum=-1.962;SOR=0.524;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:240,23:0.09:263
chr14	106366544	rs112989444	G	A	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=186;ReadPosRankSum=0.237;SC=GGAATCCGACGGGGCGCCCTG;SOR=0.481;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=11;WE=106366552;WS=106366534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr14	106368342	rs56167293	C	A	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.385;NF=3;NR=0;PP=36;ReadPosRankSum=0.189;SC=ATCATCCCTGCCCTGGAGCAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=106368350;WS=106368332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr14	106369534	rs2516960	A	G	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.169;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.976;NF=13;NR=48;PP=1226;ReadPosRankSum=-2.516;SC=GTGGCCAGAGACCTTTCCCAC;SOR=0.375;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=123;TCF=21;TCR=102;TR=61;WE=106369542;WS=106369524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,63:0.50:125
chr14	106370603	rs2857350	G	C	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.067;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=249;ReadPosRankSum=-1.063;SC=AAACCTACCGGCAGGCCTGGG;SOR=1.051;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=15;WE=106370611;WS=106370593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr14	106375638	rs2857347	T	C	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.838;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=1068;ReadPosRankSum=-0.515;SC=GTGGGGACACTGTGGGGCTCC;SOR=1.402;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=53;TCF=40;TCR=13;TR=25;WE=106375657;WS=106375628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr14	106375649	rs12433707	A	G	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.146;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=1068;ReadPosRankSum=0.000;SC=GTGGGGCTCCAGGTGCACGGG;SOR=1.061;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=28;WE=106375657;WS=106375628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,28:0.50:56
chr14	106376144	rs2516956	A	G	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=208;ReadPosRankSum=0.099;SC=GCAGGGTGCCATGGACAGGAG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=14;WE=106376152;WS=106376134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr14	106376354	rs2516955	A	G	1696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.530;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=42;PP=1191;ReadPosRankSum=2.529;SC=TGGGCTCAGCACAACTTGGTC;SOR=1.307;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=150;TCF=68;TCR=82;TR=68;WE=106376362;WS=106376344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,75:0.47:160
chr14	106376385	rs3794477	G	A	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.745;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=35;PP=970;ReadPosRankSum=0.198;SC=TTGACGGGGCGTCCTCATCCC;SOR=0.593;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=104;TCF=32;TCR=72;TR=51;WE=106376393;WS=106376375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,59:0.51:116
chr14	106380073	rs2856850	A	G	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=7.368;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=116;ReadPosRankSum=0.210;SC=TTTGGGTCACAGGCTGCACTG;SOR=2.541;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=7;WE=106380081;WS=106380063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr14	106380144	rs149711953	G	A	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=148;ReadPosRankSum=0.217;SC=CATGGCACGCGGCGGTGCCCC;SOR=0.368;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=10;WE=106380152;WS=106380134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr14	106380174	rs2157630	C	A	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=10;PP=450;SC=GCTGTGGCAGCAGGTTCCCAG;SOR=0.914;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=18;WE=106380182;WS=106380164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr14	106382687	rs2857339	C	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=208;ReadPosRankSum=-0.954;SC=TCACTGTGGGCATAGCAGCTG;SOR=0.914;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=33;TCF=18;TCR=15;TR=16;WE=106382695;WS=106382677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr14	106385233	.	AC	GT	265	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.49;FR=0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=9;MMLQ=24;MQ=55.81;NF=2;NR=0;PP=265;QD=159.233937431;SC=TGGGGACTCCACTGTGCTCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=2;WE=106385253;WS=106385223;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,2:0.13:15
chr14	106385245	.	C	G	284	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.49;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=9;MMLQ=28;MQ=55.96;NF=4;NR=1;PP=284;QD=63.7542425094;SC=TGTGCTCTGGCTGCTGGGGGT;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=5;WE=106385253;WS=106385223;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr14	106385332	rs2250700	G	C	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.769;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=313;ReadPosRankSum=-0.235;SC=GGCCAGGAGAGAGTTTTGGAC;SOR=0.242;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=13;WE=106385340;WS=106385322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr14	106388588	rs2516944	A	T	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=196;ReadPosRankSum=-0.320;SC=GACAACCCCAAATTCAGACCT;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=10;WE=106388596;WS=106388578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr14	106436780	rs67875134	A	G	947.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.078;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.889;NF=9;NR=26;PP=711;ReadPosRankSum=1.074;SC=TCCATCTTGCATATAAACGTT;SOR=1.688;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=61;TCF=19;TCR=42;TR=35;WE=106436788;WS=106436770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,38:0.54:70
chr14	106437036	rs71405043	TCATGGTTTCGTTATACACAGGAGCAAGTGTTTCAAAAA	T	517.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.37;MQRankSum=-5.095;QD=5.51;ReadPosRankSum=-0.884;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,28:0.30:94
chr14	106452628	rs7144717	T	G	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.108;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.710;NF=32;NR=3;PP=819;ReadPosRankSum=-1.304;SC=CCTCCTCCCTTGGGTTTCTGA;SOR=0.252;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=65;TCF=61;TCR=4;TR=35;WE=106452636;WS=106452618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,32:0.53:60
chr14	106452817	rs1065059	A	G	3235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.429;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.092;NF=56;NR=83;PP=2377;ReadPosRankSum=1.425;SC=GGGTTGATCCATCCCATCCAC;SOR=0.788;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=278;TCF=119;TCR=159;TR=139;WE=106452825;WS=106452807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,143:0.51:281
chr14	106471268	rs1143505	A	G	3661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.45;MQRankSum=-7.901;QD=19.79;ReadPosRankSum=0.774;SOR=0.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,94:0.51:185
chr14	106471273	rs77346190	C	T	3625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=1.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.56;MQRankSum=-8.056;QD=18.98;ReadPosRankSum=1.758;SOR=0.864;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,96:0.50:191
chr14	106471353	rs34069216	C	T	3629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.892;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-11.592;NF=80;NR=60;PP=2902;ReadPosRankSum=-0.384;SC=CCCTGGAACTCCTGTGAATAT;SOR=0.772;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=290;TCF=159;TCR=131;TR=140;WE=106471361;WS=106471343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,139:0.47:294
chr14	106471388	rs34874585	C	A	3661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.594;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.458;NF=67;NR=68;PP=2695;ReadPosRankSum=-0.286;SC=GCCAGCGTTGCTCCATCCCAT;SOR=0.544;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=279;TCF=132;TCR=147;TR=135;WE=106471396;WS=106471378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,138:0.49:282
chr14	106471410	rs200773107	T	C	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FS=0.701;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.05;MQRankSum=-9.674;QD=2.33;ReadPosRankSum=-4.317;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:277,33:0.11:310
chr14	106471417	rs201932522	G	A	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FS=1.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.43;MQRankSum=-10.980;QD=2.99;ReadPosRankSum=-2.842;SOR=0.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:263,39:0.13:302
chr14	106471426	rs199743220	G	T	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FS=3.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.92;MQRankSum=-12.348;QD=3.53;ReadPosRankSum=0.404;SOR=1.000;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:249,46:0.16:295
chr14	106471437	rs114502996	G	T	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FS=7.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.92;MQRankSum=-14.350;QD=3.91;ReadPosRankSum=0.815;SOR=1.229;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:219,58:0.21:277
chr14	106471509	rs113475512	C	A	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=37.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.50;MQRankSum=-5.963;QD=2.70;ReadPosRankSum=-1.587;SOR=4.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:148,24:0.14:172
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chr14	106471522	rs111605692	C	T	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=25.336;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.99;MQRankSum=-5.524;QD=1.46;ReadPosRankSum=-3.583;SOR=3.647;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:155,16:0.09:171
chr14	106471528	rs35966079	C	A	2252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=7.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.15;MQRankSum=-7.413;QD=13.91;ReadPosRankSum=0.772;SOR=1.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,63:0.39:162
chr14	106471534	rs36065697	A	G	2226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=8.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.34;MQRankSum=-9.377;QD=14.94;ReadPosRankSum=0.711;SOR=1.342;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,57:0.38:149
chr14	106471547	rs1143496	A	G	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.476;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-10.847;NF=21;NR=36;ReadPosRankSum=1.033;SC=CTGGGAGTGGACACCTGTAGA;SOR=1.197;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=144;TCF=62;TCR=82;TR=57;WE=106471555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,50:0.36:138
chr14	106471580	rs56320742	GC	TT	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;JOINED;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-10.011;NF=16;NR=23;PP=2863;ReadPosRankSum=-0.946;SC=GTGGATGGAAGCCCCCTTGAC;SOR=0.663;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=122;TCF=43;TCR=79;TR=39;WE=106471603;WS=106471570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,35:0.30:118
chr14	106471595	rs34652473	T	C	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.671;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.461;NF=17;NR=18;PP=2882;ReadPosRankSum=-2.606;SC=CTTGACTGGCTTCGATCCCTT;SOR=0.323;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=104;TCF=37;TCR=67;TR=35;WE=106471603;WS=106471570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,28:0.29:98
chr14	106471685	rs34315295	G	A	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.302;NF=12;NR=22;PP=686;ReadPosRankSum=-0.925;SC=AGTCCATGGTGAGGAGTTGTG;SOR=0.650;SbPval=0.58;Source=Platypus;TCF=28;TR=34;WE=106471693;WS=106471675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,32:0.44:73
chr14	106478334	rs78574933	T	C	137.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=27.58;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr14	106478354	rs188216744	T	C	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.82;QD=30.35;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr14	106478401	rs78225485	G	A	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.49;QD=30.87;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr14	106494269	rs12895651	T	C	2179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=34;NR=34;PP=1819;SC=TTATCATCATTCCAATAAATG;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=35;TCR=34;TR=68;WE=106494277;WS=106494259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr14	106518418	rs113047412	A	G	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=5.618;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.88;MQRankSum=-0.473;QD=7.50;ReadPosRankSum=-1.568;SOR=1.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,38:0.36:105
chr14	106518848	rs2073679	T	C	2710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.033;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.595;NF=34;NR=66;PP=2106;ReadPosRankSum=-1.977;SC=TCAGCCCCAATTCCATGGTGA;SOR=0.921;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=223;TCF=81;TCR=142;TR=100;WE=106518856;WS=106518838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,105:0.45:235
chr14	106578952	rs11160922	A	T	2364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.47;NF=63;NR=7;PP=2018;SC=TGATTCATTCAACAATCCCTG;SOR=4.174;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=63;TCR=7;TR=70;WE=106578960;WS=106578942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr14	106586259	rs11625174	T	G	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.706;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=864;ReadPosRankSum=-0.806;SC=GGATAGTATGTGTCACCAGCA;SOR=0.824;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=103;TCF=55;TCR=48;TR=43;WE=106586267;WS=106586249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,50:0.44:113
chr14	106622076	rs12433709	G	A	2917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.468;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.271;NF=35;NR=71;PP=2100;ReadPosRankSum=0.908;SC=GGAGCCTTGCGGGCCCAGTTC;SOR=1.126;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=214;TCF=81;TCR=133;TR=106;WE=106622084;WS=106622066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,115:0.50:232
chr14	106667592	rs3751514	G	A	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.414;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.682;NF=38;NR=8;PP=955;ReadPosRankSum=-0.984;SC=CTCGCACAGTGATACAAGGCC;SOR=0.282;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=83;TCF=71;TCR=12;TR=46;WE=106667600;WS=106667582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,44:0.53:83
chr14	106667902	rs58794564	A	AC	6945.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=89;PP=2936;SC=ACACAGAGACACCTGGTCAGA;SOR=0.724;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=179;TCF=79;TCR=100;TR=162;WE=106667910;WS=106667892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr14	106758201	rs2073677	G	T	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.498;NF=2;NR=12;PP=239;ReadPosRankSum=0.124;SC=TACTCTATGGGGTGCACTCAG;SOR=0.257;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=14;WE=106758209;WS=106758191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr14	106780634	rs34629512	G	A	1423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.349;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.351;NF=33;NR=22;PP=1008;ReadPosRankSum=-0.513;SC=GTTGTAGTAGGTGCTCCCACT;SOR=0.165;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=93;TCF=62;TCR=31;TR=55;WE=106780642;WS=106780624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,57:0.60:95
chr14	106780757	.	G	GTC	1422.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.87;MQRankSum=-3.666;QD=21.23;ReadPosRankSum=0.434;SOR=0.635;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,36:0.54:67
chr14	106780760	.	TCC	T	1419.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.494;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.47;MQRankSum=-3.524;QD=20.58;ReadPosRankSum=-0.111;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,37:0.54:69
chr14	106780817	rs8009554	A	C	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.442;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-6.959;NF=7;NR=25;PP=760;ReadPosRankSum=-1.252;SC=GGACAGGACCACTGTGAACAG;SOR=1.981;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=62;TCF=18;TCR=44;TR=32;WE=106780825;WS=106780807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr14	106791006	rs10148365	C	T	4115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.448;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.656;NF=121;NR=29;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.019;SC=CACTGTGTCTCTCGCACAGTA;SOR=0.865;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=234;TCF=187;TCR=47;TR=150;WE=106791014;WS=106790996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,146:0.65:224
chr14	106791119	rs4502119	A	G	4341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=472;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.527;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.478;NF=103;NR=107;PP=2962;ReadPosRankSum=2.097;SC=CGGAGTCTGCATAGTATTTAT;SOR=0.723;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=494;TCF=246;TCR=248;TR=210;WE=106791139;WS=106791109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:271,201:0.43:472
chr14	106791131	rs10148460	A	G	2005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=480;ExcessHet=3.0103;FS=0.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQRankSum=-2.091;QD=4.19;ReadPosRankSum=-0.919;SOR=0.780;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:369,110:0.23:479
chr14	106791200	rs8017285	GC	AG	4637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.147;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.277;NF=73;NR=82;PP=2944;ReadPosRankSum=0.901;SC=CCCAGTGCATGCCATAGCTAC;SOR=0.933;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=432;TCF=207;TCR=225;TR=155;WE=106791209;WS=106791190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,125:0.38:328
chr14	106805236	rs61740539	C	T	1273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.174;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.083;NF=35;NR=13;PP=1093;ReadPosRankSum=2.352;SC=CGGCCGTGTCCGCGGCAGTCA;SOR=1.393;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=88;TCF=62;TCR=26;TR=48;WE=106805244;WS=106805226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,46:0.52:88
chr14	106805278	rs61739320	A	G	1685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.861;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.628;NF=50;NR=14;PP=1500;ReadPosRankSum=-1.011;SC=ACTGGTTCTTAGACGTGTCTA;SOR=0.580;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=122;TCF=97;TCR=25;TR=64;WE=106805286;WS=106805268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,60:0.50:121
chr14	106805380	rs201158628	G	T	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.954;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FS=6.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQRankSum=-11.847;QD=0.16;ReadPosRankSum=0.250;SOR=1.427;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:231,18:0.07:249
chr14	106805381	rs77489245	T	G	3877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.463;HP=4;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.472;NF=70;NR=66;PP=2962;ReadPosRankSum=0.352;SC=CTTCCCTGGGTGCTGGCGGAT;SOR=0.749;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=248;TCF=128;TCR=120;TR=136;WE=106805416;WS=106805371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,137:0.55:250
chr14	106805386	rs199616126	G	C	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FS=6.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.24;MQRankSum=-11.569;QD=0.23;ReadPosRankSum=-0.104;SOR=1.390;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:243,20:0.08:263
chr14	106805395	rs61995641	G	A	3092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.704;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.920;NF=52;NR=70;PP=2962;ReadPosRankSum=0.489;SC=GGCGGATCCAGCTCCAGTAGT;SOR=1.006;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=265;TCF=126;TCR=139;TR=122;WE=106805416;WS=106805371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,126:0.47:267
chr14	106805408	rs61995642	C	T	3164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.385;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.068;NF=51;NR=72;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.304;SC=CCAGTAGTAACCACCACTGCT;SOR=0.906;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=261;TCF=118;TCR=143;TR=123;WE=106805416;WS=106805371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,128:0.48:264
chr14	106805440	rs6576153	A	G	6896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.9844;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=133;PP=2965;SC=CAGAGACAGTACAGGTGAGGG;SOR=1.646;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=203;TCF=69;TCR=134;TR=201;WE=106805448;WS=106805429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr14	106805481	rs111274188	G	A	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=10.600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.80;MQRankSum=-1.244;QD=0.38;ReadPosRankSum=0.231;SOR=0.109;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,12:0.08:144
chr14	106805508	rs4462488	G	A	3640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=86;PP=2965;SC=TGCACCTGGGGCAGGACCCCT;SOR=2.899;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=23;TCR=86;TR=109;WE=106805516;WS=106805498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr14	106845193	rs10129987	C	G	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.08;QD=33.25;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr14	106845209	rs10129994	C	G	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.26;QD=33.60;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr14	106859351	rs1008525	G	C	876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.85;QD=32.47;SOR=4.332;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr14	106866329	rs182066496	C	A	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.90;MQRankSum=-2.642;QD=2.41;ReadPosRankSum=-1.339;SOR=0.100;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,8:0.17:46
chr14	106866427	rs75206251	G	A	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=18.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQRankSum=-6.957;QD=3.19;ReadPosRankSum=0.718;SOR=0.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,19:0.15:128
chr14	106866434	rs79672195	C	T	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=23.996;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQRankSum=-7.515;QD=2.68;ReadPosRankSum=-1.084;SOR=0.860;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,18:0.13:139
chr14	106866439	rs200309222	A	G	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=33.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQRankSum=-7.977;QD=1.31;ReadPosRankSum=-1.164;SOR=1.596;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,14:0.10:136
chr14	106866449	rs78850219	T	C	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=47.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQRankSum=-6.430;QD=0.29;ReadPosRankSum=-2.349;SOR=3.222;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,10:0.07:139
chr14	106877551	rs8020298	A	C	1686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=33;PP=1232;SC=TGCACCTGCGACCGCCCCCTC;SOR=2.170;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=45;WE=106877559;WS=106877541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr14	106922052	rs10782500	T	G	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=429;ReadPosRankSum=1.054;SC=AATTGCATATTTAGGCTATTT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=18;WE=106922060;WS=106922042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr14	106922368	rs6576168	C	T	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=33;PP=792;ReadPosRankSum=-0.070;SC=AGTAAAAACACAGGACTCATA;SOR=0.689;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=71;TCF=10;TCR=61;TR=39;WE=106922376;WS=106922358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,41:0.54:76
chr14	106926146	rs61999675	G	A	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.086;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.102;NF=27;NR=4;PP=662;ReadPosRankSum=-1.301;SC=TTCCTGCAGCGAGGTTTTTGT;SOR=1.415;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=56;TCF=46;TCR=10;TR=31;WE=106926154;WS=106926136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,32:0.53:60
chr14	106937467	.	G	GC	108	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=175;SC=ACTTTGAGAGGCAAGGTGGGT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=106937475;WS=106937457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr14	107013129	rs2073674	A	C	2706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.640;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.033;NF=44;NR=59;PP=2125;ReadPosRankSum=2.808;SC=GCCTGGCGGAACCAGCTCATA;SOR=0.813;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=213;TCF=93;TCR=120;TR=103;WE=107013137;WS=107013119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,106:0.48:221
chr14	107034659	.	A	G	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.399;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQRankSum=-5.303;QD=2.24;ReadPosRankSum=0.013;SOR=0.852;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,7:0.13:54
chr14	107034665	.	TCA	T	111.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.055;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQRankSum=-5.303;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.052;SOR=0.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,7:0.13:54
chr14	107034668	.	T	TCC	117.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQRankSum=-5.248;QD=2.22;ReadPosRankSum=-0.382;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,7:0.13:53
chr14	107034679	rs370585113	C	T	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQRankSum=-3.913;QD=2.98;ReadPosRankSum=-1.439;SOR=0.803;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,10:0.17:60
chr14	107034681	.	G	C	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=-3.226;QD=3.19;ReadPosRankSum=-1.228;SOR=0.899;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,9:0.16:56
chr14	107034705	rs200210193	G	A	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-2.068;QD=4.76;ReadPosRankSum=-0.612;SOR=1.134;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,11:0.18:60
chr14	107034707	rs201053767	G	T	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=1.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-2.068;QD=4.76;ReadPosRankSum=-0.554;SOR=1.134;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,11:0.18:60
chr14	107034789	rs72686840	G	A	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.960;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=8;PP=649;ReadPosRankSum=1.006;SC=GCAGGTAGGCGGTGCTGATGG;SOR=1.452;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=119;TCF=81;TCR=38;TR=36;WE=107034797;WS=107034779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,36:0.29:123
chr14	107034807	rs72686841	G	A	1103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.400;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=8;PP=665;ReadPosRankSum=1.269;SC=TGGACTTGTCGGCTGAGATGG;SOR=1.862;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=133;TCF=88;TCR=45;TR=39;WE=107034815;WS=107034797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,39:0.28:138
chr14	107034822	rs199503234	C	G	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=12.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.06;ReadPosRankSum=1.234;SOR=1.794;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,38:0.25:153
chr14	107034846	rs199610746	TC	GT	1698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=6.389;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.18;ReadPosRankSum=-1.919;SOR=1.240;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,48:0.26:185
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chr14	107035068	.	C	G	2542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DP=245;ExcessHet=3.0103;FS=4.955;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-1.537;QD=10.42;ReadPosRankSum=0.112;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:172,72:0.30:244
chr14	107035106	rs78810240	G	T	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.460;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.789;NF=33;NR=39;PP=1359;ReadPosRankSum=-0.267;SC=CAAGCCCTCGGCAGGACTGAC;SOR=0.484;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=181;TCF=74;TCR=107;TR=72;WE=107035114;WS=107035096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,72:0.38:191
chr14	107035163	rs201950873	GA	CC	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=7.690;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=-4.997;QD=2.84;ReadPosRankSum=-1.098;SOR=1.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,17:0.14:121
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chr14	107035182	.	T	G	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.933;ClippingRankSum=0.000;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=14.700;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQRankSum=-7.574;QD=1.25;ReadPosRankSum=-1.325;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,12:0.11:105
chr14	107035206	.	C	T	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=9.675;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQRankSum=-8.812;QD=2.74;ReadPosRankSum=-0.479;SOR=2.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,10:0.13:79
chr14	107035207	rs77785266	A	G	1325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=7.898;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQRankSum=-2.829;QD=17.22;ReadPosRankSum=-1.489;SOR=1.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,45:0.58:77
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chr14	107035251	rs74959295	G	A	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.592;HP=3;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-6.985;NF=0;NR=12;PP=182;ReadPosRankSum=2.321;SC=GTTTAAGTGGGGAGGCCCCCA;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=6;TCR=42;TR=12;WE=107035259;WS=107035241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,12:0.24:50
chr14	107035266	rs72686848	C	A	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.57;MQRankSum=2.111;QD=4.23;ReadPosRankSum=-0.216;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,10:0.23:43
chr14	107035280	.	T	C	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.813;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.42;MQRankSum=-4.745;QD=4.70;ReadPosRankSum=-0.036;SOR=0.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr14	107035282	.	A	G	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQRankSum=-4.519;QD=4.99;ReadPosRankSum=0.426;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,4:0.18:22
chr14	107035288	.	C	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.241;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQRankSum=-4.519;QD=5.22;ReadPosRankSum=-0.640;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,4:0.18:22
chr14	107035299	.	G	A	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.264;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.406;NF=0;NR=4;PP=331;ReadPosRankSum=-1.869;SC=CCTGAAGGGAGGAGTCTACAG;SOR=0.631;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=4;WE=107035318;WS=107035256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,4:0.19:21
chr14	107035310	rs372504834	C	G	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.502;NF=0;NR=4;PP=307;ReadPosRankSum=-1.389;SC=GAGTCTACAGCGTTTATAACC;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=4;WE=107035318;WS=107035256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,3:0.14:22
chr14	107048767	rs200617568	G	T	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=5.915;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQRankSum=-4.963;QD=2.41;ReadPosRankSum=0.926;SOR=1.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:151,34:0.18:185
chr14	107048885	rs200064890	C	T	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=2.356;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.17;MQRankSum=0.776;QD=1.38;ReadPosRankSum=-2.187;SOR=1.655;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,7:0.14:49
chr14	107048944	rs35850880	A	T	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=3.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.54;MQRankSum=-0.156;QD=10.31;ReadPosRankSum=1.265;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr14	107078790	rs1858692	C	T	5677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=79;NR=98;PP=2965;SC=AAGAAGAGGACCCTCCAAATC;SOR=0.923;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=178;TCF=79;TCR=99;TR=177;WE=107078798;WS=107078780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr14	107082871	rs144729059	A	ATGC	952.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.57;QD=43.31;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	107082879	rs59681319	C	CG	1087.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.57;QD=49.44;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr14	107082881	rs59072447	T	TA	1079.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.07;QD=51.42;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr14	107082882	rs61261254	G	GA	989.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.07;QD=47.13;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr14	107082897	rs2337902	T	A	966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.46;QD=43.94;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
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chr14	107170077	rs11845244	C	T	2446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.488;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.749;NF=43;NR=54;PP=1675;ReadPosRankSum=-2.099;SC=GGGATGATCCCTCCCATCCAC;SOR=0.649;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=221;TCF=97;TCR=124;TR=97;WE=107170085;WS=107170067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,103:0.45:227
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chr14	107170243	rs74089692	G	C	1653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.193;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.236;NF=33;NR=34;PP=1282;ReadPosRankSum=-1.126;SC=CACCTGTGGAGAGGACACAGG;SOR=0.525;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=124;TCF=64;TCR=60;TR=67;WE=107170251;WS=107170233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,67:0.53:126
chr14	107170398	rs4448834	C	T	1980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=50;PP=1598;SC=GGGGCTTCTTCAGAGGAGGAA;SOR=3.187;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=10;TCR=50;TR=60;WE=107170418;WS=107170388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr14	107170410	rs10220412	G	C	1930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=48;PP=1601;SC=GAGGAGGAATGTGGTTGTTAT;SOR=3.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=6;TCR=48;TR=54;WE=107170418;WS=107170388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr14	107178795	rs10144331	A	G	1781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=55;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=12;PP=1392;SC=TTGTACAGGAAGCGCCCTGGG;SOR=2.461;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=51;WE=107178803;WS=107178785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr14	107178832	rs10144402	A	G	2027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=18;PP=1796;SC=TCCGTGCACAATAATACGTGG;SOR=2.119;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=48;TCR=18;TR=66;WE=107178840;WS=107178822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr14	107178885	rs201513340	G	A	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.071;HP=1;HapScore=4;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.132;NF=28;NR=11;PP=1928;ReadPosRankSum=-2.150;SC=AGGACCACCTGGTTTTTGGAG;SOR=1.114;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=88;TCF=59;TCR=29;TR=39;WE=107178907;WS=107178875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,38:0.44:86
chr14	107178899	rs112655724	T	G	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.054;HP=2;HapScore=4;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.549;NF=28;NR=15;PP=1928;ReadPosRankSum=-1.253;SC=TTTGGAGGTGTCCTTGGAGAT;SOR=1.157;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=90;TCF=54;TCR=36;TR=43;WE=107178907;WS=107178875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,43:0.48:90
chr14	107178938	rs17113976	T	C	1453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.719;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=22;PP=969;ReadPosRankSum=0.859;SC=AGATGTGCTGTAGTATTTATC;SOR=0.831;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=110;TCF=65;TCR=45;TR=57;WE=107178946;WS=107178928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,57:0.51:112
chr14	107178965	rs2073669	A	C	2952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=59;NR=40;PP=2023;SC=CCAATCAATGAGTGCAAGCCA;SOR=1.284;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=59;TCR=40;TR=99;WE=107178973;WS=107178955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr14	107179017	rs61732209	A	G	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.577;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.453;NF=22;NR=31;PP=1063;ReadPosRankSum=-1.444;SC=CAGCTCACACACATTCCACTA;SOR=0.874;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=101;TCF=44;TCR=57;TR=53;WE=107179025;WS=107179007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,55:0.53:103
chr14	107179063	rs61654910	T	C	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.855;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.078;NF=16;NR=20;PP=685;ReadPosRankSum=0.297;SC=TGCAGGTCAGTGTGAGGGTCT;SOR=0.584;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=70;TCF=32;TCR=38;TR=36;WE=107179071;WS=107179053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,40:0.53:76
chr14	107179106	rs10144703	C	T	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.798;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.496;NF=20;NR=17;PP=813;ReadPosRankSum=0.461;SC=ACCAGACTCCCTCAAGGTGAC;SOR=0.551;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=82;TCF=47;TCR=35;TR=37;WE=107179114;WS=107179096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,43:0.48:90
chr14	107179211	rs17113968	A	G	1472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=30;PP=1044;ReadPosRankSum=-0.530;SC=TGACCACAGCACTCACAGGAC;SOR=0.727;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=140;TCF=73;TCR=67;TR=64;WE=107179219;WS=107179201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,68:0.45:151
chr14	107179243	rs61734101	G	A	1347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=33;PP=2244;ReadPosRankSum=-0.829;SC=TAGCAGGAGCGTGGAACAAAG;SOR=0.711;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=43;TCR=67;TR=54;WE=107179276;WS=107179233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,57:0.47:121
chr14	107179254	rs61734098	T	C	1273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=33;PP=2244;ReadPosRankSum=0.287;SC=TGGAACAAAGTATGTCCATGG;SOR=0.715;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=35;TCR=72;TR=49;WE=107179276;WS=107179233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,52:0.44:118
chr14	107179268	rs10144801	A	G	3008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=66;PP=2558;SC=TCCATGGTGGAGAGCAGGATT;SOR=2.808;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=16;TCR=66;TR=82;WE=107179276;WS=107179233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr14	107198866	rs1987970	T	G	1657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.53;QD=40.43;SOR=3.312;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr14	107198866	.	TTGGCCCCA	GTGGCCCCA,GTGGCCCCG	415	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=28;MQ=57.62;NF=35,19;NR=4,3;PP=276,415;QD=7.96849262942;SC=CCGCCCCCTGTTGGCCCCACG;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=39,22;WE=107198882;WS=107198856;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:39
chr14	107198874	rs2301536	A	G	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=4.187;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.47;MQRankSum=-2.912;QD=14.89;ReadPosRankSum=1.601;SOR=0.197;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr14	107198901	rs2301535	C	T	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.360;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.743;NF=26;NR=5;PP=765;ReadPosRankSum=0.252;SC=GGTTTGTGTCCGGGCTCACAC;SOR=0.500;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=31;WE=107198909;WS=107198891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,35:0.64:55
chr14	107211211	rs2073668	G	A	5343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=67;PP=2965;SC=AGCCTCCCCCGGACTCCACCA;SOR=1.096;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=161;TCF=94;TCR=67;TR=161;WE=107211219;WS=107211201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr14	107259830	rs78693499	A	G	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=7.494;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQRankSum=-5.967;QD=0.51;ReadPosRankSum=0.075;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,10:0.13:78
chr14	107282809	rs201928713	T	C	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=24.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQRankSum=-10.922;QD=2.21;ReadPosRankSum=0.170;SOR=3.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,14:0.12:121
chr14	107282813	rs199801132	CA	AG	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=26.993;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.10;MQRankSum=-11.055;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.422;SOR=3.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,15:0.12:124
chr14	107282846	rs200859769	G	A	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=34.826;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQRankSum=-11.749;QD=5.39;ReadPosRankSum=0.473;SOR=3.578;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,26:0.18:141
chr14	107282852	rs201336503	T	C	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=36.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.93;MQRankSum=-11.736;QD=5.64;ReadPosRankSum=0.571;SOR=3.597;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,28:0.20:141
chr14	107282859	rs201095197	G	A	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=30.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.83;MQRankSum=-11.604;QD=6.33;ReadPosRankSum=0.985;SOR=3.349;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,28:0.20:138
chr14	107282872	rs61741319	T	A	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=18.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.90;MQRankSum=-11.471;QD=3.78;ReadPosRankSum=0.806;SOR=2.452;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,28:0.21:135
chr14	107282909	rs202202987	T	C	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-5.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.447;NF=25;NR=22;PP=920;ReadPosRankSum=-0.070;SC=CCTGGGCATATGTTGGGTTCC;SOR=0.649;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=167;TCF=94;TCR=73;TR=47;WE=107282917;WS=107282899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,57:0.31:181
chr14	107282926	rs149038822	A	T	2259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=4.413;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.60;MQRankSum=-10.017;QD=11.41;ReadPosRankSum=2.116;SOR=0.488;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,65:0.33:198
chr14	107282935	rs201762529	A	T	2210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=4.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQRankSum=-10.011;QD=11.11;ReadPosRankSum=2.682;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,64:0.32:199
chr14	107282973	rs200848671	G	C	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=0.609;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.49;MQRankSum=-10.657;QD=4.06;ReadPosRankSum=-1.459;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:158,50:0.24:208
chr14	107282988	.	C	G	985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.615;ClippingRankSum=0.000;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=-10.571;QD=4.98;ReadPosRankSum=-4.949;SOR=0.642;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:158,40:0.20:198
chr14	107282994	.	G	C	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.510;ClippingRankSum=0.000;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=4.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.25;MQRankSum=-11.247;QD=3.55;ReadPosRankSum=-3.852;SOR=1.251;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,24:0.14:177
chr14	107282996	.	G	A	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.276;ClippingRankSum=0.000;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=3.417;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQRankSum=-11.456;QD=3.03;ReadPosRankSum=-3.390;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:150,20:0.12:170
chr14	107283002	.	A	G	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.695;ClippingRankSum=0.000;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=7.452;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQRankSum=-11.475;QD=2.04;ReadPosRankSum=-4.765;SOR=1.661;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,17:0.11:153
chr14	107283003	.	C	G	254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.000;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=2.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQRankSum=-11.165;QD=1.71;ReadPosRankSum=-4.236;SOR=1.240;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,14:0.09:149
chr14	107283150	rs35227799	G	T	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQRankSum=-2.484;QD=17.81;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.580;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr14	107283156	rs10133664	A	G	977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=3.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.37;MQRankSum=-2.751;QD=18.11;ReadPosRankSum=-0.140;SOR=0.444;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr14	107283160	rs10133737	C	T	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=3.860;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.15;MQRankSum=-3.002;QD=17.29;ReadPosRankSum=0.069;SOR=0.444;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr15	20433733	rs3926481	A	C	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.289;NF=19;NR=1;PP=381;ReadPosRankSum=-0.667;SC=CCTTCATAAAAACACATCAAA;SOR=0.112;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=52;TCF=51;TCR=1;TR=20;WE=20433741;WS=20433727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr15	20433755	rs4114043	G	A	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=6.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.198;NF=59;NR=1;PP=1481;ReadPosRankSum=-0.620;SC=GTGAGTTTACGCTATGAGAAA;SOR=0.880;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=81;TCR=1;TR=60;WE=20433763;WS=20433745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,57:0.71:80
chr15	20433958	.	AGGCACAAGGTGCT	A	1445.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=0.000;DP=585;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.69;MQRankSum=1.567;QD=2.57;ReadPosRankSum=0.512;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:491,71:0.13:562
chr15	20444794	rs2722084	C	T	5463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=475;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.967;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-17.090;NF=26;NR=200;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.958;SC=ATAATCTCCTCCCCGGGCTCC;SOR=2.163;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=494;TCF=85;TCR=409;TR=226;WE=20444802;WS=20444784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:269,205:0.43:474
chr15	20445987	rs4931804	C	T	2003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FS=0.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.43;MQRankSum=-6.137;QD=5.40;ReadPosRankSum=-1.175;SOR=0.635;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:270,101:0.27:371
chr15	20446043	rs1823751	T	A	8163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=470;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.424;NF=125;NR=139;PP=2962;ReadPosRankSum=0.388;SC=GGTGAAGCGGTTGCTTCGAGG;SOR=0.651;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=451;TCF=210;TCR=241;TR=264;WE=20446055;WS=20446033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:200,269:0.57:469
chr15	20446047	rs28541280	T	G	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=467;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQRankSum=-0.045;QD=2.89;ReadPosRankSum=-0.350;SOR=0.745;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:371,95:0.20:466
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chr15	20448056	rs8024950	A	G	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.991;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.20;MQRankSum=-7.782;QD=5.17;ReadPosRankSum=-2.214;SOR=0.466;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,35:0.27:130
chr15	20448077	rs3963874	T	A,C	5810.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=47.02;QD=30.11;SOR=2.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,84,109:0.44,0.56:193
chr15	20448306	rs12593272	G	A	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=5.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.01;MQRankSum=-0.275;QD=1.96;ReadPosRankSum=1.381;SOR=0.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,22:0.15:148
chr15	20450242	rs2444187	G	C	2167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.472;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.600;NF=51;NR=64;PP=1483;ReadPosRankSum=0.162;SC=GTTCCTGTGCGGCACACAGCA;SOR=0.559;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=379;TCF=159;TCR=220;TR=115;WE=20450250;WS=20450232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:250,111:0.31:361
chr15	20450376	rs59373601	G	A	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=0.887;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.60;ReadPosRankSum=0.410;SOR=0.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:139,36:0.21:175
chr15	20450433	rs60793038	G	T	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.85;MQRankSum=-1.219;QD=3.20;ReadPosRankSum=-0.631;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,16:0.19:83
chr15	20453825	rs7167849	A	G	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-2.307;NF=7;NR=1;PP=90;ReadPosRankSum=0.774;SC=CCCCTCTCCCAGGCCCTCTTC;SOR=0.307;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=8;WE=20453833;WS=20453815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr15	20453896	rs2601517	G	C	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.208;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.173;NF=32;NR=3;PP=898;ReadPosRankSum=0.597;SC=GGACCCACATGTGGATGCAGA;SOR=3.056;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=35;WE=20453904;WS=20453886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,38:0.79:48
chr15	20453913	rs2601516	C	T	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.849;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.394;NF=26;NR=2;PP=559;ReadPosRankSum=-0.947;SC=CAGAGGGACACACACCCAGCT;SOR=1.925;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=60;TCF=52;TCR=8;TR=28;WE=20453921;WS=20453903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,29:0.48:61
chr15	20453992	rs4931912	T	C	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=41.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.56;MQRankSum=-6.406;QD=3.82;ReadPosRankSum=-0.065;SOR=4.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,26:0.17:149
chr15	20454025	rs4931913	A	G	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=34.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.05;MQRankSum=-6.988;QD=1.06;ReadPosRankSum=0.341;SOR=3.243;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,22:0.15:146
chr15	20454042	rs7168242	A	T	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=15.595;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.68;MQRankSum=-6.857;QD=2.33;ReadPosRankSum=-2.101;SOR=1.007;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,26:0.19:137
chr15	20454162	rs4931914	C	A	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.509;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.250;NF=2;NR=12;PP=257;ReadPosRankSum=0.162;SC=ATTTGGGATCCTCGCTCTCCT;SOR=0.189;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=14;WE=20454170;WS=20454152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr15	20456517	rs12593833	T	C	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.125;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.91;MQRankSum=-0.908;QD=3.71;ReadPosRankSum=-0.406;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr15	20456600	rs2924241	G	T	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.035;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.624;NF=10;NR=2;PP=145;ReadPosRankSum=-0.808;SC=CCACAGCCCTGGCCAAACCCC;SOR=0.255;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=51;TCF=45;TCR=6;TR=12;WE=20456608;WS=20456590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,12:0.24:49
chr15	20456665	rs8026258	T	A	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=2.965;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQRankSum=-9.141;QD=2.61;ReadPosRankSum=-1.886;SOR=1.159;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,12:0.12:97
chr15	20456673	rs8033709	C	G	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=2.660;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQRankSum=-9.557;QD=3.38;ReadPosRankSum=-1.939;SOR=1.134;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,14:0.13:104
chr15	20456677	rs8037872	G	A	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQRankSum=-9.140;QD=3.65;ReadPosRankSum=-2.411;SOR=0.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,18:0.16:116
chr15	20456682	rs58201907	G	C	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.95;MQRankSum=-9.224;QD=3.58;ReadPosRankSum=-1.989;SOR=0.707;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,19:0.15:124
chr15	20456740	rs2954579	A	G	2089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.554;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.891;NF=53;NR=43;PP=1719;ReadPosRankSum=0.793;SC=CTCTTTCACCAGCGCCTGGCT;SOR=0.965;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=172;TCF=89;TCR=83;TR=96;WE=20456748;WS=20456730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,89:0.53:167
chr15	20456787	rs60265308	C	T	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.32;MQRankSum=-1.387;QD=4.16;ReadPosRankSum=1.348;SOR=0.691;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,39:0.23:166
chr15	20457155	rs11856094	A	C	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=5.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.69;MQRankSum=-9.742;QD=6.83;ReadPosRankSum=1.269;SOR=0.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,23:0.23:102
chr15	20457155	.	ACC	CCT	1701	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=29;MQ=52.03;NF=28;NR=12;PP=1701;QD=43.8616968716;SC=GCCAGCATTTACCGCCCACTC;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=114;TCF=91;TCR=23;TR=40;WE=20457165;WS=20457153;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:74,40:0.35:114
chr15	20457157	rs11854770	C	T	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=4.017;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.74;MQRankSum=-9.891;QD=6.90;ReadPosRankSum=0.843;SOR=0.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,23:0.23:101
chr15	20457244	rs2060872	G	C	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=0.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.98;MQRankSum=-1.972;QD=3.26;ReadPosRankSum=-0.641;SOR=0.567;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,39:0.20:193
chr15	20457291	rs6599891	T	C	5930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=7.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.640;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-10.300;NF=144;NR=79;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.145;SC=TGGGCTTGTGTAAGCATCATT;SOR=1.757;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=270;TCF=168;TCR=102;TR=223;WE=20457299;WS=20457281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,197:0.80:245
chr15	20457319	rs8038741	C	A	1842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.458;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.245;NF=50;NR=51;PP=1728;ReadPosRankSum=-0.496;SC=GCACGCTGAGCATGGCAGGGC;SOR=0.726;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=324;TCF=169;TCR=155;TR=101;WE=20457327;WS=20457309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:217,89:0.29:306
chr15	20462450	rs2343219	C	T	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.312;NF=3;NR=1;PP=47;ReadPosRankSum=0.673;SC=TTGCAGGGGACGACCTGTAGA;SOR=0.465;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=4;WE=20462458;WS=20462446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr15	20462480	rs181264388	C	A	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.688;HP=3;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-3.284;NF=8;NR=3;PP=440;ReadPosRankSum=2.606;SC=GTGGGGGGTCCCCTGGTGCCA;SOR=0.307;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=11;WE=20462501;WS=20462470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
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chr15	20462810	rs28679605	T	A	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=5.929;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQRankSum=1.810;QD=4.25;ReadPosRankSum=-0.342;SOR=0.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,12:0.26:47
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chr15	20465103	rs6599901	A	C	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.863;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.881;NF=36;NR=19;PP=1090;ReadPosRankSum=-1.154;SC=GTGATCCACCAACCTCGGCCT;SOR=1.545;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=127;TCF=73;TCR=54;TR=55;WE=20465111;WS=20465093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,42:0.37:115
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chr15	20465181	rs67892369	T	TA	500.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=6.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQRankSum=1.522;QD=4.24;ReadPosRankSum=0.227;SOR=1.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,24:0.20:118
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chr15	20465246	rs8038116	G	A	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.229;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.422;NF=1;NR=15;PP=316;ReadPosRankSum=-0.192;SC=GTGCAGTGGCGCCATCTCAGC;SOR=0.042;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=16;WE=20465254;WS=20465236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,12:0.30:40
chr15	20465278	rs71466665	G	A	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=1.298;NF=0;NR=7;PP=80;ReadPosRankSum=-0.779;SC=TCTGCTTCCCGGGTTCAAGCA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=7;WE=20465286;WS=20465268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr15	20466352	rs4983837	T	C	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.345;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=557;ReadPosRankSum=-1.284;SC=GCATTATAGGTGTGAAAACCA;SOR=0.160;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=52;TCF=51;TCR=1;TR=26;WE=20466360;WS=20466342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
chr15	20466516	rs4983836	C	T	1518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.972;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-9.058;NF=5;NR=72;PP=1850;ReadPosRankSum=-1.567;SC=AAATCTGATCCAAGCTGAGTG;SOR=2.618;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=116;TCF=16;TCR=100;TR=77;WE=20466524;WS=20466506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,55:0.57:97
chr15	20466546	rs4931936	C	A	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=4.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.83;MQRankSum=-3.122;QD=2.94;ReadPosRankSum=0.114;SOR=1.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,11:0.20:56
chr15	20466604	rs4983834	A	G	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.49;QD=37.85;SOR=2.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	20467100	rs4983661	A	G	2204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.305;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.095;NF=72;NR=24;PP=1605;ReadPosRankSum=0.010;SC=CACGTGAAGCACCAGCGCAGA;SOR=1.098;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=222;TCF=157;TCR=65;TR=96;WE=20467108;WS=20467090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,99:0.44:223
chr15	20467242	rs59808209	C	T	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=4.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.976;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.069;NF=9;NR=29;PP=659;ReadPosRankSum=-1.264;SC=GCTGGGCGTCCGACAAGCCTG;SOR=0.836;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=121;TCF=33;TCR=88;TR=38;WE=20467250;WS=20467232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,35:0.32:109
chr15	20467994	rs2601503	C	T	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=-1.871;QD=3.67;ReadPosRankSum=0.022;SOR=0.600;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,12:0.21:56
chr15	20468050	rs4983831	A	G	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQRankSum=-5.022;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.678;SOR=0.392;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,40:0.26:153
chr15	20476942	rs4983659	C	T	4655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=744;ExcessHet=3.0103;FS=0.806;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=-5.985;QD=6.31;ReadPosRankSum=-0.669;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:528,210:0.28:738
chr15	20477005	rs4248783	G	C	8468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=1303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.709;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.957;NF=223;NR=164;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.359;SC=TCCCTATGAGGAACACAACAA;SOR=0.910;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=1274;TCF=697;TCR=577;TR=387;WE=20477013;WS=20476995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:899,396:0.31:1295
chr15	20477090	rs4931940	T	C	5114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-7.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=906;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.363;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=196;PP=2962;ReadPosRankSum=0.412;SC=CTCAGGTGTGTGCCCCCTCCT;SOR=0.607;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=887;TCF=235;TCR=652;TR=271;WE=20477098;WS=20477080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:625,274:0.30:899
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chr15	20481882	rs11248739	G	T	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=-0.795;QD=5.06;ReadPosRankSum=1.365;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,33:0.24:135
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chr15	20874863	rs62000628	T	C	1776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=0.466;QD=5.75;ReadPosRankSum=0.214;SOR=0.652;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:223,86:0.28:309
chr15	20874897	rs7497658	A	G	5589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=372;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.803;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.864;NF=137;NR=92;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.317;SC=CCTATTCTGCATATGGTGGTG;SOR=0.813;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=362;TCF=213;TCR=149;TR=229;WE=20874905;WS=20874887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,235:0.64:368
chr15	20874927	rs62000629	T	A	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=-3.286;QD=0.73;ReadPosRankSum=1.326;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:320,43:0.12:363
chr15	20875094	rs12148785	G	A	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=1.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.16;ReadPosRankSum=-0.130;SOR=0.281;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,29:0.25:114
chr15	20876423	rs10902996	A	G	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=0.553;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.760;SOR=0.617;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:232,69:0.23:301
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chr15	21145503	rs74912473	G	T	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=1;PP=565;SC=TGCAACTCTAGCTCTTAACAT;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=21145511;WS=21145493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	22156928	rs150801989	G	C	3882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.664;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.490;NF=34;NR=97;PP=2958;ReadPosRankSum=-0.153;SC=AGTATATAAGGTATGCTAAGG;SOR=0.612;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=189;TCF=47;TCR=142;TR=131;WE=22156936;WS=22156918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,137:0.70:195
chr15	22318824	rs35131467	AC	A	2161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.961;NF=55;NR=0;PP=2332;ReadPosRankSum=-0.218;SC=TAATAAAGTTACATTTGATAA;SOR=2.995;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=70;TCR=0;TR=55;WE=22318832;WS=22318814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,60:0.82:73
chr15	22318963	rs1429506	A	T	10132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=177;NR=145;PP=2965;SC=TATCACAGAAAAGAACAAGGT;SOR=0.929;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=322;TCF=177;TCR=145;TR=322;WE=22318971;WS=22318953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr15	22319166	rs1429505	G	T	3591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=488;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.862;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.687;NF=90;NR=69;PP=2787;ReadPosRankSum=1.765;SC=AAAGAGAAAGGTGCCAATTAT;SOR=0.845;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=469;TCF=255;TCR=214;TR=159;WE=22319182;WS=22319156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:321,161:0.33:482
chr15	22319174	rs6602966	T	C	2159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=490;ExcessHet=3.0103;FS=6.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-6.880;QD=4.45;ReadPosRankSum=-0.658;SOR=0.621;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:372,113:0.23:485
chr15	22319253	rs6602967	A	G	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FS=4.633;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.02;MQRankSum=-0.505;QD=3.67;ReadPosRankSum=-1.590;SOR=0.989;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:294,77:0.21:371
chr15	22319295	rs4779264	T	C	2318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.521;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=71;PP=1817;ReadPosRankSum=1.520;SC=TGGGCCACAGTAGGATAGCTG;SOR=0.736;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=272;TCF=72;TCR=200;TR=96;WE=22319303;WS=22319285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,98:0.36:275
chr15	22319389	rs8025521	T	A	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=8.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-3.677;QD=4.84;ReadPosRankSum=1.320;SOR=1.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:157,47:0.23:204
chr15	22319410	rs8029027	G	A	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FS=1.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQRankSum=-7.264;QD=4.71;ReadPosRankSum=0.104;SOR=0.876;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:187,56:0.23:243
chr15	22319445	rs6602968	G	A	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FS=8.935;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQRankSum=-15.008;QD=4.08;ReadPosRankSum=0.099;SOR=0.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:263,75:0.22:338
chr15	22319483	rs995427	G	A	4214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=490;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.547;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=5.074;NF=111;NR=67;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.282;SC=ACCCCAAAGAGAAGAAGTAGA;SOR=0.772;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=479;TCF=292;TCR=187;TR=178;WE=22319505;WS=22319473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:304,184:0.38:488
chr15	22319497	rs1366875	G	C	4425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=499;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=5.576;NF=102;NR=80;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.467;SC=AAGTAGAACTGTGCAAAACAA;SOR=0.711;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=485;TCF=269;TCR=216;TR=182;WE=22319505;WS=22319473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:306,189:0.38:495
chr15	22332751	rs930109	T	C	4345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=64;PP=2965;SC=TGAGATGTTTTTGCTGACAGT;SOR=0.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=131;TCF=67;TCR=64;TR=131;WE=22332759;WS=22332741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr15	22332859	rs62004745	G	T	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.184;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.303;NF=33;NR=24;PP=1103;ReadPosRankSum=1.188;SC=TTGCCTGCTGGTGTGGGGGTT;SOR=0.949;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=152;TCF=81;TCR=71;TR=57;WE=22332867;WS=22332849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,55:0.38:143
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chr15	22344879	rs1366870	C	G	6626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=78;NR=122;PP=2620;SC=CTATTCCTCACCCACAGCACC;SOR=1.832;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=78;TCR=123;TR=200;WE=22344887;WS=22344861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
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chr15	22345158	rs1529528	T	C	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=8.091;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.50;MQRankSum=-0.441;QD=5.84;ReadPosRankSum=0.156;SOR=0.253;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,38:0.29:131
chr15	22345306	rs12438744	A	C	1424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=7.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.229;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.821;NF=33;NR=22;PP=1165;ReadPosRankSum=1.731;SC=TTGGCCTCCTACACAGTCATT;SOR=0.522;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=136;TCF=87;TCR=49;TR=55;WE=22345314;WS=22345296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,56:0.39:142
chr15	22368862	rs1835183	G	A	23628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=726;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.056;NF=339;NR=367;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.213;SC=TCTTTTGATGGATGCATTGCA;SOR=0.123;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=710;TCF=339;TCR=371;TR=706;WE=22368870;WS=22368852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,717:1.00:719
chr15	22368905	rs1835182	G	A	21350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=674;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.027;NF=344;NR=301;PP=2965;ReadPosRankSum=1.175;SC=CTGGGGCTTCGGAGATGTTCT;SOR=0.341;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=648;TCF=345;TCR=303;TR=645;WE=22368913;WS=22368895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,663:1.00:665
chr15	22369248	rs491208	T	C	8029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.91;QD=33.32;SOR=1.385;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr15	22369290	rs12593418	A	G	2693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.45;MQRankSum=-0.042;QD=9.80;ReadPosRankSum=0.205;SOR=0.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:157,118:0.43:275
chr15	22369426	rs4087943	G	A	3379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=378;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.304;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.992;NF=56;NR=84;PP=2672;ReadPosRankSum=-0.379;SC=TTCCCTTTACGTAATCCCATT;SOR=0.837;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=363;TCF=150;TCR=213;TR=140;WE=22369434;WS=22369416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:233,142:0.38:375
chr15	22382655	rs535034	A	C	1740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=9.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.326;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.531;NF=9;NR=55;PP=1475;ReadPosRankSum=-0.549;SC=CCCTCTATTTATTTCTGGGCA;SOR=1.496;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=152;TCF=28;TCR=124;TR=64;WE=22382663;WS=22382645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,62:0.42:146
chr15	22382704	rs62006708	G	C	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.21;MQRankSum=1.872;QD=4.36;ReadPosRankSum=1.290;SOR=0.748;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,22:0.22:100
chr15	22382728	rs2808136	C	T	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=7.670;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.61;MQRankSum=-2.885;QD=8.14;ReadPosRankSum=-0.793;SOR=0.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,28:0.33:84
chr15	22382739	rs2671839	A	G	3245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.12;QD=34.53;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr15	22382821	rs12438969	G	C	3285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FS=2.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.66;MQRankSum=0.639;QD=14.35;ReadPosRankSum=-0.732;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,89:0.39:229
chr15	22382828	rs62006709	C	A	3412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=2.254;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.63;MQRankSum=0.825;QD=13.76;ReadPosRankSum=-0.232;SOR=0.865;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,96:0.39:248
chr15	22382897	rs62006710	A	G	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FS=4.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.99;MQRankSum=-1.134;QD=2.11;ReadPosRankSum=-0.391;SOR=1.143;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:180,37:0.17:217
chr15	22383064	rs12441468	C	A	1237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.63;MQRankSum=-1.972;QD=9.10;ReadPosRankSum=-0.323;SOR=0.689;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,52:0.38:136
chr15	22383064	.	CTA	ATG	856	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=28;MQ=53.6;NF=33;NR=15;PP=856;QD=18.947247393;SC=GGTGGAGCTTCTAATGGTCTT;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=134;TCF=91;TCR=43;TR=48;WE=22383074;WS=22383054;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:86,48:0.36:134
chr15	22383066	rs559754	A	G	4113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.079;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.736;NF=76;NR=40;PP=1876;ReadPosRankSum=1.597;SC=TGGAGCTTCTAATGGTCTTCA;SOR=0.184;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=137;TCF=94;TCR=43;TR=116;WE=22383074;WS=22383054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,119:0.86:139
chr15	22383189	rs1820851	G	A	2209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.037;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.153;NF=38;NR=49;PP=1667;ReadPosRankSum=0.042;SC=CCATGTCCACGTGCACCACTC;SOR=0.778;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=222;TCF=99;TCR=123;TR=87;WE=22383197;WS=22383179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,91:0.40:230
chr15	22383482	rs3841636	GA	G	2436.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.082;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.320;NF=10;NR=55;PP=2527;ReadPosRankSum=0.705;SC=GTTTTTCACTGAGTACCTCCC;SOR=1.645;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=133;TCF=23;TCR=110;TR=65;WE=22383490;WS=22383472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,72:0.49:146
chr15	22413700	rs267612	A	G	2054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.18;QD=34.83;SOR=1.773;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	22413825	rs267613	C	T	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.638;NF=43;NR=30;PP=1214;ReadPosRankSum=-0.149;SC=GGCCTTTGACCGCTACATCAC;SOR=0.676;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=247;TCF=144;TCR=103;TR=73;WE=22413833;WS=22413815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:175,72:0.29:247
chr15	22413954	rs1810247	C	T	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=2.925;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.45;MQRankSum=0.118;QD=3.17;ReadPosRankSum=-1.007;SOR=1.097;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,26:0.19:140
chr15	22414005	rs59278647	C	T	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.38;MQRankSum=-0.826;QD=2.93;ReadPosRankSum=-1.537;SOR=0.361;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,25:0.19:132
chr15	22414190	rs28695837	T	C	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=427;ExcessHet=3.0103;FS=4.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.82;MQRankSum=0.529;QD=3.80;ReadPosRankSum=1.562;SOR=1.050;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:332,91:0.22:423
chr15	22414393	.	C	CAA	759.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.346;HP=11;HapScore=3;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-5.946;NF=2;NR=38;PP=441;ReadPosRankSum=-1.316;SC=TGAAAAAGGGCAAAAAAAAAA;SOR=1.802;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=105;TCF=7;TCR=98;TR=40;WE=22414401;WS=22414382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,35:0.47:74
chr15	22440816	rs4505267	A	G	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.70;ReadPosRankSum=-0.598;SOR=0.700;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,28:0.20:143
chr15	22448436	rs62007810	G	A	1540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FS=0.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQRankSum=-10.104;QD=3.86;ReadPosRankSum=-0.168;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:310,89:0.22:399
chr15	22466126	rs1985064	A	C	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=519;ExcessHet=3.0103;FS=1.534;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-2.022;QD=3.44;ReadPosRankSum=0.370;SOR=0.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:412,103:0.20:515
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chr15	22489900	rs113115466	T	C	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.602;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=126;ReadPosRankSum=2.095;SC=CTAAATACTGTTTTCTTCAGG;SOR=1.140;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=10;WE=22489908;WS=22489890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,8:0.18:45
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chr15	22848150	rs372317024	CA	C	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=1.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=1.565;QD=2.34;ReadPosRankSum=1.210;SOR=1.347;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
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chr15	22869804	rs2251602	A	G	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=358;ReadPosRankSum=-0.587;SC=CACAGAAGGCAGTCACTGTGG;SOR=1.308;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=19;WE=22869812;WS=22869794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr15	22869860	rs2289815	G	T	1841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.071;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=9;PP=1444;ReadPosRankSum=0.264;SC=AAAAGTGTTGGTATCAGTGTC;SOR=1.022;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=105;TCF=89;TCR=16;TR=64;WE=22869868;WS=22869850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,68:0.62:110
chr15	22926229	rs2289824	G	A	3954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=28;PP=2965;SC=TTTTCTTAGTGTAAAAACAAT;SOR=2.438;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=94;TCR=28;TR=122;WE=22926237;WS=22926219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr15	22926307	rs7403459	A	G	5501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=87;PP=2965;SC=TCAAGGGTGCACCTGCCCTGT;SOR=0.704;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=90;TCR=87;TR=176;WE=22926315;WS=22926297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr15	22928537	rs79791617	G	C	1540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.131;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=45;PP=1245;ReadPosRankSum=-0.427;SC=TCTGGGGGGGGTGTAACACCG;SOR=2.353;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=78;TCF=14;TCR=64;TR=51;WE=22928545;WS=22928527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,53:0.66:80
chr15	22929905	rs2305094	C	G	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=3.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=0.000;QD=21.81;ReadPosRankSum=0.341;SOR=1.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,47:0.80:59
chr15	22929905	.	CA	GG	951	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=7;NR=33;PP=951;QD=25.1116968716;SC=GGTGAGCACCCACCTCGCGCA;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=57;TCF=12;TCR=45;TR=40;WE=22929914;WS=22929895;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:17,40:0.70:57
chr15	22929906	rs2305093	A	G	2355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.75;QD=40.62;SOR=2.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr15	22933511	rs1867599	A	T	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=20;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.684;NF=7;NR=1;PP=129;ReadPosRankSum=-1.416;SC=TTTTTTTTTTAAATGTGGCAC;SOR=1.244;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=8;WE=22933519;WS=22933501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr15	22933528	rs2084063	G	A	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=2;PP=490;ReadPosRankSum=-1.260;SC=GCACGTTGGTGCATTTTGGGA;SOR=0.976;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=42;TCF=38;TCR=4;TR=26;WE=22933536;WS=22933518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr15	22933691	rs1109036	G	A	3065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.566;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=50;PP=2284;ReadPosRankSum=1.885;SC=AGGTTGATGGGCCAAGCAGCC;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=171;TCF=90;TCR=81;TR=107;WE=22933699;WS=22933681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,116:0.63:183
chr15	22939192	rs11633474	G	A	1925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.981;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=17;PP=1492;ReadPosRankSum=0.364;SC=AGGTGGTTCCGCTATTTGGGG;SOR=0.588;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=90;TCF=66;TCR=24;TR=65;WE=22939200;WS=22939182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,68:0.72:94
chr15	22940670	rs3751566	C	T	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=456;ReadPosRankSum=0.156;SC=TGAGCTGCCCCAGTGCTGTGG;SOR=0.843;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=20;WE=22940678;WS=22940660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr15	22940866	rs45464395	C	T	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.953;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=513;ReadPosRankSum=-0.432;SC=CGACCTGGAGCTGCACAGGCA;SOR=0.865;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=75;TCF=24;TCR=51;TR=26;WE=22940874;WS=22940856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,26:0.32:80
chr15	22945314	rs8029108	C	T	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=143;ReadPosRankSum=1.248;SC=TTAAGTACATCTCATTTATGT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=8;WE=22945322;WS=22945304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr15	22955013	rs2289816	T	G	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=331;ReadPosRankSum=2.180;SC=GCCCCCAGAGTAATTTGTATT;SOR=0.199;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=15;WE=22955021;WS=22955003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr15	22955307	rs3217548	AC	A	179.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=216;ReadPosRankSum=0.226;SC=CCCCGCCTGCACCCTCTCCCT;SOR=0.250;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=8;WE=22955315;WS=22955297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr15	22999940	rs11307802	TG	T	899.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=917;SC=AACAGCCACCTGGCTGCCCGG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=22999948;WS=22999930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	23000272	rs999842	A	G	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.624;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=564;ReadPosRankSum=-0.524;SC=CGCACCATCTATGGACCTTTT;SOR=2.939;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=9;TCR=62;TR=28;WE=23000280;WS=23000262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,30:0.38:78
chr15	23006215	rs78803812	CCTTT	C	250.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=3.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.64;ReadPosRankSum=-1.461;SOR=0.177;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,10:0.19:54
chr15	23019676	.	CAA	C	309.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.416;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=4.559;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.78;MQRankSum=0.312;QD=15.49;ReadPosRankSum=-0.088;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr15	23021113	rs7170784	G	A	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=160;ReadPosRankSum=1.427;SC=CACTCACGAGGAATGAAGATG;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=9;WE=23021121;WS=23021103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr15	23021238	rs7170838	C	T	952.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.098;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;PP=1120;ReadPosRankSum=-0.786;SC=GAAGGAGGCCCTTTTTTTTCA;SOR=1.764;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=65;TCF=37;TCR=28;TR=45;WE=23021246;WS=23021228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,43:0.65:66
chr15	23052632	rs11263683	T	C	2511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=30;PP=2039;SC=CAGCCTGAGTTGTCACACTCT;SOR=1.339;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=52;TCR=30;TR=82;WE=23052640;WS=23052622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr15	23059394	rs1991922	C	T	4993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=79;PP=2965;SC=CTTCAATACACCCATCATGGA;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=80;TCR=79;TR=159;WE=23059402;WS=23059384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr15	23131745	rs7181884	G	A	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=4.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.597;NF=13;NR=1;PP=218;ReadPosRankSum=-1.980;SC=TAGTCCAGACGTATCTTTTCT;SOR=0.505;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=53;TCF=49;TCR=4;TR=14;WE=23131753;WS=23131735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,10:0.20:51
chr15	23132075	rs56264744	G	GA	185.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=17.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=-1.415;QD=4.89;ReadPosRankSum=0.519;SOR=0.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr15	23138992	rs202076313	G	A	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.38;QD=32.06;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	23181835	rs188091559	G	T	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.842;NF=16;NR=0;PP=272;ReadPosRankSum=0.484;SC=TTTGTTAAATGAATATTTATT;SOR=0.163;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=58;TCR=0;TR=16;WE=23181843;WS=23181825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr15	23182267	rs12050782	G	A	4015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=83;PP=2965;SC=AAATGGAAAAGTCATCATATG;SOR=2.030;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=123;TCF=39;TCR=84;TR=122;WE=23182275;WS=23182257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr15	23200698	rs58552405	A	T	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=26.26;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	23685004	rs34879341	G	GCAT	4181.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=59;PP=2957;SC=TCCTTCTCTCGCATCTCCTCC;SOR=2.252;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=80;TCF=13;TCR=67;TR=67;WE=23685012;WS=23684994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr15	23685343	rs74203443	T	C	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.48;QD=19.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	23685475	.	C	T	2428	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MMLQ=28;MQ=48.57;NF=81;NR=25;PP=2428;QD=23.2336906844;SC=TCTCCTGCTCCTGCATCTTCT;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=193;TCF=147;TCR=46;TR=106;WE=23685483;WS=23685465;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:87,106:0.55:193
chr15	23685517	rs372380699	C	T	2190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-5.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.567;HP=2;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.544;NF=86;NR=52;PP=2418;ReadPosRankSum=1.041;SC=TCTGTTCCGGCAGCCTCTGCT;SOR=0.310;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=298;TCF=182;TCR=116;TR=138;WE=23685525;WS=23685507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,97:0.44:218
chr15	23685541	rs375981990	CT	C	10289.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=158;PP=2977;SC=CCCACATCTTCTTCTTCCTGC;SOR=1.581;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=221;TCF=61;TCR=160;TR=219;WE=23685549;WS=23685531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr15	23685583	rs368496365	T	C	2218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=6.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.344;HP=1;HapScore=1;MGOF=53;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.467;NF=16;NR=52;PP=1519;ReadPosRankSum=-2.591;SC=TCCCACATCTTCTCCTCCTGC;SOR=0.323;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=161;TCF=30;TCR=131;TR=68;WE=23685591;WS=23685573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,68:0.40:170
chr15	23685604	.	TC	T	1868.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=0.000;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=3.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.14;MQRankSum=1.845;QD=14.49;ReadPosRankSum=-3.629;SOR=0.272;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,54:0.42:129
chr15	23685605	.	C	T	430	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=42;MMLQ=29;MQ=47.42;NF=2;NR=35;PP=430;QD=12.5613841229;SC=CCTGCATCTTCTCTTCCTGCT;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=115;TCF=6;TCR=109;TR=37;WE=23685655;WS=23685595;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:78,37:0.32:115
chr15	23685606	.	TCTTCCTGCTCCCACATCTTCTCCTCCTGCTCCCGCATCTTC	T	1759.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.000;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.46;MQRankSum=1.383;QD=11.97;ReadPosRankSum=-3.144;SOR=0.761;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,54:0.37:147
chr15	23685639	rs374969803	C	T	1415.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-4.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.66;MQRankSum=-2.439;QD=13.11;ReadPosRankSum=4.846;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,55:0.51:108
chr15	23685639	.	CGCATCTTC	TGCATCTTC,TGCATCTTT	2231	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=42;MMLQ=28;MQ=50.21;NF=7,3;NR=62,18;PP=2231,688;QD=32.83726395;SC=CTCCTGCTCCCGCATCTTCTC;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=76;TCF=8;TCR=68;TR=69,21;WE=23685655;WS=23685595;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.91:76
chr15	23685895	rs111853398	C	T	2141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.559;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.744;NF=55;NR=30;PP=1487;ReadPosRankSum=1.412;SC=ATCCTCTCCTCCTGGTCCCAC;SOR=0.642;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=196;TCF=120;TCR=76;TR=85;WE=23685903;WS=23685885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,89:0.49:181
chr15	23685922	.	C	CCCGCATCTTCTCCTCCTGCTT	4166.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.134;ClippingRankSum=0.000;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQRankSum=-5.613;QD=26.21;ReadPosRankSum=0.667;SOR=0.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,85:0.53:159
chr15	23686598	rs35708006	T	C	1556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=20;PP=1317;SC=TCCCGCAGCTTCTTCTGCTCC;SOR=0.823;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=24;TCR=20;TR=44;WE=23686606;WS=23686588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	23686673	rs59122400	G	A	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=21;PP=1254;SC=TCCTGTCTCCGCATCTTCTCC;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=30;TCR=21;TR=51;WE=23686681;WS=23686663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	23686914	rs57504140	T	A	1083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=38.71;ReadPosRankSum=1.511;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr15	23686924	rs58446506	T	C	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.81;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	23687812	rs2344891	T	G	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.100;NF=0;NR=53;PP=1525;ReadPosRankSum=-1.267;SC=GGTCTCATTTTTTTTTCTTTT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=0;TCR=54;TR=53;WE=23687827;WS=23687802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr15	23687818	rs72495057	CT	C	1590.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.83;MQRankSum=0.000;QD=38.80;ReadPosRankSum=-0.931;SOR=6.043;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr15	23688944	rs4778531	A	G	2582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=37;PP=1887;SC=TTCTTGTGCCATGTGGACACA;SOR=1.006;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=52;TCR=37;TR=89;WE=23688952;WS=23688934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr15	23689510	rs12902150	C	G	1672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=18;PP=1396;SC=GGAATCTTGGCGGTGAGCCTT;SOR=1.157;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=30;TCR=18;TR=48;WE=23689518;WS=23689500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	23932467	rs3743340	G	A	951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.484;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=30;PP=740;ReadPosRankSum=-0.591;SC=TGCTGCGCGCGGCGCCTTCCG;SOR=2.891;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=31;WE=23932475;WS=23932457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,33:0.80:41
chr15	24922208	rs12905237	C	G	1679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-6.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=30;PP=1238;ReadPosRankSum=1.282;SC=CCCAGCCTGCCCCTTCTTTCT;SOR=0.717;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=300;TCF=199;TCR=101;TR=92;WE=24922216;WS=24922198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,92:0.30:304
chr15	24922230	rs3742950	C	G	2494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.340;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=36;PP=1948;ReadPosRankSum=0.111;SC=CCAACCTGTGCAGACCACAGA;SOR=1.086;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=316;TCF=187;TCR=129;TR=106;WE=24922238;WS=24922220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:213,106:0.33:319
chr15	24922687	.	C	A	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=28;PP=951;ReadPosRankSum=-0.838;SC=TCCACTGTCACAACAAACGCA;SOR=0.714;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=154;TCF=72;TCR=82;TR=52;WE=24922695;WS=24922677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,56:0.36:156
chr15	24923390	rs60574723	C	T	1838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.650;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=43;PP=1355;ReadPosRankSum=0.200;SC=CCCATGATTTCCTGAGCCTTC;SOR=0.580;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=245;TCF=105;TCR=140;TR=75;WE=24923398;WS=24923380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,81:0.32:252
chr15	25287279	rs182885322	G	A	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.931;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.926;NF=1;NR=27;PP=549;ReadPosRankSum=-0.201;SC=CTCTGTGAGCGTGCCTTTTCT;SOR=1.508;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=67;TCF=5;TCR=62;TR=28;WE=25287287;WS=25287269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr15	25307562	rs7402542	A	G	7329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=182;NR=68;PP=2965;SC=CGTTCTCATCAGAACTGAGGT;SOR=2.081;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=250;TCF=182;TCR=68;TR=250;WE=25307570;WS=25307552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr15	25310440	rs6576402	A	G	1228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=34;PP=1007;SC=TACACAGGTCAGAGAGTCATA;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=36;WE=25310448;WS=25310430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	25321029	rs4906699	C	T	1479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.877;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=1198;ReadPosRankSum=-0.098;SC=TATTGGTTTTCCAAAGGCACC;SOR=1.074;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=85;TCF=33;TCR=52;TR=50;WE=25321037;WS=25321019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,53:0.59:90
chr15	25324141	rs4344720	C	T	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=463;ReadPosRankSum=1.338;SC=TCCCTTCATACGGTATGTGTT;SOR=0.929;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=22;WE=25324149;WS=25324131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr15	25328715	rs3803326	T	C	1691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.797;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=21;PP=1266;ReadPosRankSum=0.079;SC=TCCTCATTTTTGGGCATGAAT;SOR=0.964;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=93;TCF=58;TCR=35;TR=58;WE=25328723;WS=25328705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,62:0.65:96
chr15	25330550	rs3803328	T	A	2357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.951;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.185;NF=52;NR=29;PP=1870;ReadPosRankSum=0.606;SC=GATGACTTCCTTATATACATT;SOR=0.327;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=131;TCF=89;TCR=42;TR=81;WE=25330558;WS=25330540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,84:0.63:134
chr15	25337657	rs79295766	C	T	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=65;ReadPosRankSum=1.834;SC=CACATTTGCGCGTCTGTTTTG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=25337665;WS=25337647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr15	25415693	rs2739837	T	C	341.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.98;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	25415693	.	TG	CA,CG	96	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=10;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=6,9;NR=0,0;PP=96,7;QD=24.911312477;SC=ATGGTGACCATGGAGGAAGAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6,9;WE=25415702;WS=25415691;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.67:9
chr15	25415694	rs1883008	G	A	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.09;ReadPosRankSum=0.480;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr15	25415759	rs2714734	G	A	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=3;PP=1170;SC=GCCAGCCCCCGGTGCGCTGAA;SOR=4.664;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=42;WE=25415767;WS=25415749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	25415809	rs2739838	C	T	2961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=13;PP=2374;SC=CTGCACTGAGCTGTGGTGAGC;SOR=3.540;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=76;TCR=13;TR=89;WE=25415817;WS=25415799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr15	25438514	.	T	A	1679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.771;ClippingRankSum=0.000;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=16;PP=1324;ReadPosRankSum=1.678;SC=AGGTGATGACTTAAAAATCAT;SOR=0.715;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=235;TCF=179;TCR=56;TR=71;WE=25438522;WS=25438504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,73:0.31:239
chr15	25457129	.	G	A	2119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.992;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.158;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=62;PP=1647;ReadPosRankSum=-0.402;SC=GTATCTGGAGGAGGCCCAACT;SOR=0.559;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=117;TCF=11;TCR=106;TR=70;WE=25457137;WS=25457119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,74:0.62:120
chr15	25483196	rs200783281	T	C	3618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.528;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=41;PP=2850;ReadPosRankSum=1.186;SC=TCATGCTTAATAGTATTATGC;SOR=1.288;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=190;TCF=127;TCR=63;TR=137;WE=25483204;WS=25483186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,138:0.70:197
chr15	25652101	rs8032479	C	G	222.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=183;SC=AATTACATAACAACTAAAAAC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=25652109;WS=25652091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	25924539	rs1047700	T	C	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.990;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=317;ReadPosRankSum=1.137;SC=GGTCTGGCCCTTGAAGTCCTG;SOR=1.270;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=72;TCF=54;TCR=18;TR=20;WE=25924547;WS=25924529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,23:0.30:77
chr15	25925195	rs3736186	T	C	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.036;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=256;ReadPosRankSum=-1.652;SC=GAGACCCACATAGAGCAGAAG;SOR=1.082;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=11;WE=25925203;WS=25925185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr15	25926179	rs2076744	C	T	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.26;ReadPosRankSum=0.534;SOR=0.654;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,27:0.34:80
chr15	25926186	rs2076743	G	A	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.654;SOR=0.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,25:0.32:78
chr15	25926325	rs35849027	T	TAAC	241.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.95;ReadPosRankSum=-1.064;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr15	25932718	.	ACAGGCGAAGGAGGATGGAGCAGGTTGTCCATGGCCTCCCATCTGCTCCATCCTCCTTCGCCTCATT	A	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.151;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.71;ReadPosRankSum=-0.906;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,7:0.13:52
chr15	25937004	rs2066705	C	T	1818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=42;PP=1344;ReadPosRankSum=-1.481;SC=AATCAATGTGCTAGATTTTCT;SOR=0.786;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=29;TCR=64;TR=61;WE=25937012;WS=25936994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,67:0.68:99
chr15	25961964	rs10873607	A	G	4844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=81;PP=2965;SC=CAGACAGCTCAGGCGAGAGGT;SOR=0.756;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=78;TCR=81;TR=159;WE=25961972;WS=25961954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr15	25963599	rs8024374	A	G	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=322;SC=TGGGCGGAGCAGAAAGAAACC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=25963607;WS=25963589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	25967085	rs1564828	T	C	4061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=97;PP=2965;SC=ACAGGATGAATGACCGTGAGG;SOR=1.891;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=43;TCR=97;TR=139;WE=25967093;WS=25967075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr15	26026139	rs8038726	A	G	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=1;PP=674;SC=TAATGCCTGCAAGGCCCTGGA;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=26026147;WS=26026129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	26107366	rs74004319	C	T	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=397;ReadPosRankSum=-2.360;SC=GCAGACTGAGCTTTACTGTCC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=81;TCF=48;TCR=33;TR=25;WE=26107374;WS=26107356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,27:0.33:83
chr15	26260450	rs12440137	C	T	4710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=131;NR=0;PP=2965;SC=GATGCATCTGCCCAACCTTTT;SOR=9.704;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=132;TCF=132;TCR=0;TR=131;WE=26260485;WS=26260440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr15	26260456	rs370137954	CT	C	104.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=1.093;QD=0.93;ReadPosRankSum=1.078;SOR=0.429;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,25:0.22:113
chr15	26260477	rs12437822	T	C	4938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.30;QD=35.03;SOR=3.896;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr15	26828651	rs72702138	G	A	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=125;ReadPosRankSum=0.984;SC=AAGCCCCTGTGGGAACCCTGC;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=7;WE=26828659;WS=26828641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr15	26887814	rs754186	A	G	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=7.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.04;ReadPosRankSum=1.760;SOR=0.279;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,45:0.28:162
chr15	26887879	rs754185	T	C	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=459;ReadPosRankSum=1.157;SC=TGTGAGTTATTTGCGAGAAAG;SOR=0.996;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=70;TCF=6;TCR=64;TR=23;WE=26887887;WS=26887869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,23:0.33:70
chr15	27018187	.	TGCC	T	144	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=4;PP=182;SC=CTCCTGCTGCTGCCGCCGCCG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=27018197;WS=27018177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	27018797	rs20318	G	A	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-2.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.358;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=9;PP=547;ReadPosRankSum=-0.962;SC=CTCACCTGCGGGGCTCAGAGC;SOR=0.116;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=29;WE=27018805;WS=27018787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,29:0.71:41
chr15	27018937	rs20317	G	C	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.074;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=219;ReadPosRankSum=-2.497;SC=GCAGCCAAACGGCGACGCAGG;SOR=0.144;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=13;WE=27018945;WS=27018927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr15	27019040	rs4906901	C	A	47.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=15.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	27061412	rs12910508	T	C	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=110;ReadPosRankSum=-0.097;SC=ACAAAATACATAAAATAAGTT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=7;WE=27061420;WS=27061402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr15	27061564	.	GA	G	38.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.450;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=5.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.76;ReadPosRankSum=-0.400;SOR=0.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,10:0.20:51
chr15	27128174	rs79895435	A	G	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=0;PP=1021;SC=GTAATTGTCAAGTCCTCCAAA;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=27128182;WS=27128164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	27128461	rs140680	C	T	4518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=64;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.787;SC=CCTCTGACTGCCTCGTGCCTT;SOR=0.314;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=143;TCF=78;TCR=65;TR=141;WE=27128469;WS=27128451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,142:0.99:143
chr15	27182212	rs140681	G	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=275;ReadPosRankSum=0.053;SC=TTTAGGTCATGGAACCTTGAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=50;TCR=1;TR=16;WE=27182220;WS=27182202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,17:0.32:53
chr15	27182357	rs140682	T	C	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.325;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=30;PP=962;ReadPosRankSum=-0.630;SC=CTGAAGTCGTTTACGTCTGGA;SOR=0.543;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=72;TCR=96;TR=53;WE=27182365;WS=27182347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,53:0.31:172
chr15	27184435	rs12910925	C	T	4463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.606;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=76;PP=2962;ReadPosRankSum=0.116;SC=GAGGTCTCCTCGTGCCTCCCA;SOR=0.553;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=241;TCF=118;TCR=123;TR=159;WE=27184443;WS=27184425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,168:0.67:249
chr15	27184482	rs34560927	C	T	4176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.194;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=97;PP=2962;ReadPosRankSum=0.467;SC=ACTGGGGCATCGCCAATGAAA;SOR=0.582;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=217;TCF=78;TCR=139;TR=153;WE=27184490;WS=27184472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,160:0.71:225
chr15	27184517	rs17647384	G	A	2640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.745;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=71;PP=2050;ReadPosRankSum=-1.648;SC=AAGAACAGGCGACACCTCTCT;SOR=0.813;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=35;TCR=108;TR=94;WE=27184525;WS=27184507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,99:0.66:149
chr15	27188353	rs140684	C	A	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=301;ReadPosRankSum=0.570;SC=CCCTGCCTGACCCCCGCAGGG;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=15;WE=27188361;WS=27188343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr15	27188459	rs140685	C	T	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.918;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=19;PP=1210;ReadPosRankSum=-0.956;SC=GGTTCATAGCCGTGTGCTATG;SOR=0.925;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=56;WE=27188467;WS=27188449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,55:0.66:83
chr15	27271789	rs35270520	G	T	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=10;PP=1023;ReadPosRankSum=-0.079;SC=CTGCTCATGTGTGTTTCCACC;SOR=0.671;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=107;TCR=28;TR=49;WE=27271797;WS=27271779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,54:0.38:144
chr15	27572289	.	G	A	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.148;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=-0.241;SC=TCTTTCACGTGAGACATACTA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=27572297;WS=27572279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr15	27772676	rs140679	C	T	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.057;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=508;ReadPosRankSum=0.164;SC=TTTTTGTGACCGTGTGCTTCC;SOR=0.963;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=92;TCF=72;TCR=20;TR=27;WE=27772684;WS=27772666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,26:0.29:90
chr15	27772892	rs2303879	G	A	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=209;ReadPosRankSum=-0.110;SC=CAAATACCCAGTTCAACAAGA;SOR=0.634;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=13;WE=27772900;WS=27772882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
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chr15	27890571	rs5811500	GT	G	2493.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=69;PP=1426;SC=GATTGTTGGGGTTTTTTTTTA;SOR=4.255;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=85;TCF=5;TCR=80;TR=72;WE=27890579;WS=27890561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr15	27890589	rs1871018	A	G	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.808;NF=1;NR=21;PP=375;ReadPosRankSum=0.512;SC=TTAAGATATAACTAGACATGG;SOR=0.804;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=77;TCF=5;TCR=72;TR=22;WE=27890597;WS=27890579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,24:0.30:81
chr15	28096453	rs8025804	A	G	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.910;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=80;ReadPosRankSum=1.352;SC=AATCTGATACACACTAACTGT;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=28096461;WS=28096443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr15	28096538	rs1800419	A	G	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.444;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=161;ReadPosRankSum=-0.301;SC=CTCCCAGGCAAGCACCGAAGG;SOR=1.532;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=10;WE=28096546;WS=28096528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,11:0.26:42
chr15	28116173	rs12594397	C	T	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.663;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=156;ReadPosRankSum=0.998;SC=TGCTCACTTTCGTCCTCTACA;SOR=1.539;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=10;WE=28116181;WS=28116163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr15	28116275	rs7175046	G	C	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=6.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.836;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=8;PP=699;ReadPosRankSum=-1.025;SC=AAGTTGAGCCGTCGACATGGA;SOR=1.043;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=150;TCF=119;TCR=31;TR=45;WE=28116283;WS=28116265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,45:0.30:150
chr15	28171147	rs2594928	T	C	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.825;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ATTACAACCTTCATTGTTTTC;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=28171155;WS=28171137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr15	28196821	rs7173419	T	C	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=568;ReadPosRankSum=0.713;SC=TCTCTGGCCTTCCACCAGCCC;SOR=0.336;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=24;WE=28196829;WS=28196811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr15	28196885	rs17566952	C	G	2038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.893;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=16;PP=1662;ReadPosRankSum=-1.171;SC=ACCTTCCCATCCAGAATGTGA;SOR=0.581;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=103;TCF=79;TCR=24;TR=65;WE=28196893;WS=28196875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,71:0.65:109
chr15	28200408	rs7170989	T	C	1694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.113;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=56;PP=1227;ReadPosRankSum=-2.348;SC=TCACGCTGCGTGGTGAGATCG;SOR=1.367;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=104;TCF=20;TCR=84;TR=66;WE=28200416;WS=28200398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,71:0.67:106
chr15	28202663	rs41276934	C	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=138;ReadPosRankSum=1.834;SC=CAGCTAATGTCGCTATTTTGT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=28202671;WS=28202661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr15	28211758	rs4778218	A	G	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=146;ReadPosRankSum=-0.032;SC=GATACTTCCTAATAAGAACTT;SOR=1.085;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=7;WE=28211766;WS=28211748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr15	28230184	rs1800410	T	C	1476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.108;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=11;PP=1127;ReadPosRankSum=0.957;SC=TGGCCGCAACTCCCACGGCAG;SOR=1.086;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=81;TCF=61;TCR=20;TR=49;WE=28230192;WS=28230174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,53:0.62:85
chr15	28230318	rs1800407	C	T	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.964;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=20;PP=931;ReadPosRankSum=-1.688;SC=CACCCGTCCCCGGGAGAGCCG;SOR=1.100;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=173;TCF=102;TCR=71;TR=55;WE=28230326;WS=28230308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,53:0.30:174
chr15	28231793	rs10852218	T	C	2004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.773;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=24;PP=1443;ReadPosRankSum=1.404;SC=AGATCATCTATGGGGAAAAGA;SOR=0.553;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=119;TCF=82;TCR=37;TR=76;WE=28231801;WS=28231783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,79:0.65:122
chr15	28259863	rs4640131	A	G	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=605;ReadPosRankSum=0.408;SC=TGTCTCACGGATCTCAAGCCT;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=23;WE=28259871;WS=28259853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr15	28260053	rs1800401	G	A	2711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.491;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=61;PP=2070;ReadPosRankSum=-0.659;SC=AGGGAGGCCCGGATGCTGATG;SOR=0.534;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=142;TCF=50;TCR=92;TR=96;WE=28260061;WS=28260043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,101:0.70:145
chr15	28260128	rs17652037	C	A	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.600;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=46;PP=1224;ReadPosRankSum=-0.499;SC=GTTAGGGGACCTCCCTCTGTA;SOR=1.755;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=70;TCF=11;TCR=59;TR=53;WE=28260136;WS=28260118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,55:0.76:72
chr15	28356859	rs1129038	C	T	723.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.907;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=519;ReadPosRankSum=0.324;SC=CAGCAGCGAGCGCTCTGCTGC;SOR=1.885;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=23;WE=28356867;WS=28356849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,26:0.70:37
chr15	28357230	rs4778245	T	C	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=27;PP=838;SC=CGGCTGCAGTTTACTTTACTG;SOR=3.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=30;WE=28357238;WS=28357220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	28359744	rs7495441	G	A	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=0;PP=581;SC=CAACAGAGACGGATGACCACC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=28359752;WS=28359734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	28360081	rs7497014	T	C	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=377;SC=TGCAAGTGCATGGCACACACC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=28360089;WS=28360071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	28360888	rs5811542	C	CT	1304.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=36;PP=1640;SC=CTAAAAGCCTCTAACTCTTCA;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=36;WE=28360896;WS=28360878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	28361764	rs4778247	C	T	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=390;SC=AACTCAAGAGCAGGCACAGGC;SOR=3.500;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=28361772;WS=28361756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	28362459	rs7495875	G	A	3437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=81;PP=2689;SC=AGACCCTGCCGTCTGGGGCGC;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=25;TCR=81;TR=106;WE=28362467;WS=28362449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr15	28375872	rs6416603	A	G	1761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=54;PP=1486;SC=TTAGTGCAACATAAAATCATA;SOR=6.630;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=55;WE=28375880;WS=28375862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	28377196	rs10627923	C	CCT	4407.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=23;PP=2976;SC=CCTGGGGGCCCGACTGCGGTG;SOR=2.502;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=66;TCR=25;TR=83;WE=28377204;WS=28377186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr15	28377772	rs8025035	C	T	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=1;PP=1122;SC=ATGCAGCCTCCGGCCTCTGCA;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=38;WE=28377780;WS=28377762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	28378122	rs4778141	T	G	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=531;SC=AACTCAAAAGTTCACCACTTC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=28378130;WS=28378112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	28412872	rs61756152	G	A	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.273;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=21;PP=593;ReadPosRankSum=0.462;SC=TGATGCTTGCGGCTCCCAGGT;SOR=0.489;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=151;TCF=68;TCR=83;TR=42;WE=28412880;WS=28412862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,44:0.28:155
chr15	28414665	rs7494786	T	C	1148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=1;PP=979;SC=TAAGAATATGTGATAAGGCCT;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=28414673;WS=28414655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	28437061	rs72714143	A	G	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=326;ReadPosRankSum=0.221;SC=ACAAGGCAAAACCATCGGTGT;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=16;WE=28437069;WS=28437051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr15	28441817	rs2525936	G	T	416.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5448;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.152;NF=0;NR=14;PP=369;ReadPosRankSum=-1.003;SC=GTAGTTATTTGTTTTTTACAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=14;WE=28441825;WS=28441807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr15	28478799	rs72714147	G	A	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.476;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.740;NF=4;NR=29;PP=581;ReadPosRankSum=-0.713;SC=CACAGATATCGAGCTCCTTAC;SOR=1.414;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=96;TCF=18;TCR=78;TR=33;WE=28478807;WS=28478789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,33:0.34:97
chr15	28502065	rs117504827	G	A	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=4.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.55;ReadPosRankSum=0.060;SOR=0.070;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,11:0.21:52
chr15	28502279	rs11631797	A	G	3148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.440;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.987;NF=43;NR=60;PP=2494;ReadPosRankSum=1.108;SC=AGTCCGCGGAACCATCCATCC;SOR=0.848;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=61;TCR=84;TR=103;WE=28502287;WS=28502269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,108:0.72:151
chr15	28517258	.	C	G	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.83;MQRankSum=-1.150;QD=23.69;ReadPosRankSum=0.674;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr15	28517261	rs374453464	G	A	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.83;MQRankSum=-1.150;QD=23.69;ReadPosRankSum=1.150;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr15	28517282	.	T	G	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.60;MQRankSum=-3.224;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.631;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr15	28517283	.	G	C	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.60;MQRankSum=-3.224;QD=13.40;ReadPosRankSum=0.631;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr15	28517287	.	T	A	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.872;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.92;MQRankSum=-3.440;QD=15.60;ReadPosRankSum=-0.206;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr15	28517291	.	T	C	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.92;MQRankSum=-3.440;QD=18.83;ReadPosRankSum=-0.769;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr15	28517295	.	A	G	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.623;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.67;MQRankSum=-3.623;QD=17.48;ReadPosRankSum=-1.262;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr15	28517303	.	T	G	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.719;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.63;MQRankSum=-3.719;QD=18.72;ReadPosRankSum=-0.516;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr15	28517305	.	T	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.950;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.12;MQRankSum=-3.328;QD=14.92;ReadPosRankSum=-1.584;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr15	28517310	rs199951842	G	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.192;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.55;MQRankSum=-3.328;QD=14.92;ReadPosRankSum=-1.452;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr15	28517436	rs75181529	T	C	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.654;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.273;NF=17;NR=4;PP=524;ReadPosRankSum=-1.051;SC=AGGGCAAAAGTGGGGCGCTGG;SOR=0.177;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=64;TCF=55;TCR=9;TR=21;WE=28517444;WS=28517426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,23:0.37:62
chr15	28517539	rs80340439	G	A	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=2.707;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQRankSum=-7.606;QD=4.33;ReadPosRankSum=-0.173;SOR=1.202;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,15:0.18:85
chr15	28517546	rs79819039	G	C	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=3.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.76;MQRankSum=-7.777;QD=4.56;ReadPosRankSum=-1.110;SOR=1.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,14:0.17:82
chr15	28517555	rs112104080	T	TC	97.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=7.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.78;MQRankSum=-8.094;QD=1.46;ReadPosRankSum=-1.739;SOR=2.655;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,9:0.13:67
chr15	29009050	rs112804410	A	AC	1490.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FS=6.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.91;MQRankSum=-14.233;QD=6.08;ReadPosRankSum=1.424;SOR=1.067;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:189,56:0.23:245
chr15	29052021	rs4036877	A	T	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.646;NF=18;NR=0;PP=333;ReadPosRankSum=0.464;SC=TGAACATTTAATAATTGCATT;SOR=0.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=18;WE=29052029;WS=29052011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr15	29093527	rs58669327	TG	T	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.876;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-4.632;NF=9;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=0.553;SC=CCAGAGGCACTGGGGGGGGCC;SOR=1.659;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=9;WE=29093535;WS=29093517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr15	29385149	rs4779760	A	G	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=0;PP=619;SC=TGCAGATGGCAATGGTTGGGC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=29385157;WS=29385139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	29385204	rs4779761	A	G	1907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=4;PP=1675;SC=TCCTTGTGCTATGGCCAGGCA;SOR=4.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=50;TCR=4;TR=54;WE=29385212;WS=29385194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	29386593	rs8037972	G	A	1360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=35;PP=1117;SC=GTGGGGGCTGGGGGGTTCCCC;SOR=3.716;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=38;WE=29386601;WS=29386583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	29398744	.	G	A	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.758;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=399;ReadPosRankSum=0.064;SC=TCATCCTCCTGTGGGTCCTTG;SOR=0.598;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=20;WE=29398752;WS=29398734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
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chr15	29415698	rs3751563	A	G	4360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=94;PP=2965;SC=AAACCCTGGCATCCGCATAGG;SOR=1.577;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=45;TCR=94;TR=139;WE=29415706;WS=29415688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr15	29417057	rs17749179	A	G	1764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.734;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=44;PP=1354;ReadPosRankSum=0.860;SC=GACATTTTAGATGGCGAGCAA;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=40;TCR=76;TR=68;WE=29417065;WS=29417047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,68:0.58:117
chr15	29417099	rs12438521	G	C	2296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=60;PP=1883;SC=GACACCCACCGAGCGGCAGAT;SOR=3.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=8;TCR=60;TR=68;WE=29417107;WS=29417089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	29418520	rs2256273	C	T	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.643;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=218;ReadPosRankSum=-1.474;SC=GCGGGACACACGCCCGGGACC;SOR=1.112;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=13;WE=29418528;WS=29418510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr15	29418573	rs2672680	AT	GC	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.630;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=396;ReadPosRankSum=1.511;SC=CTGGAGACACATGGCCAGGGG;SOR=1.574;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=10;WE=29418582;WS=29418563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr15	29418745	rs968476	G	T	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.031;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=214;ReadPosRankSum=0.988;SC=GGGGACGCTGGCGTGGGACAG;SOR=1.214;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=11;WE=29418753;WS=29418735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr15	29428556	rs8023368	C	G	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=7;PP=779;SC=TTGTCTGGGGCCCCAGGCCTC;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=29428564;WS=29428546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	29444130	rs59230279	GC	G	1265.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=33;PP=1314;SC=CCCAGAATGAGCCGAGGTCGA;SOR=4.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=33;WE=29444138;WS=29444120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	29544523	rs11071669	A	C	2548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.097;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=9;PP=2085;ReadPosRankSum=-0.307;SC=CTCTTGTACAAAATCAAATCC;SOR=0.996;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=124;TCR=14;TR=89;WE=29544531;WS=29544513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,92:0.65:142
chr15	29544656	rs4583203	T	C	3198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-5.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.001;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=82;PP=2297;ReadPosRankSum=-1.193;SC=TTACACACACTGCAGAAAGCA;SOR=0.349;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=194;TCF=63;TCR=131;TR=128;WE=29544664;WS=29544646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,135:0.67:201
chr15	29862654	rs111717681	C	G	197.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=2;PP=135;SC=AGCGCCTAGCCCCCCCGGCCC;SOR=2.833;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=29862662;WS=29862650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	30008856	rs7166878	C	A	3780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=46;PP=2965;SC=TCTGAGAATGCGCTGGCTTTG;SOR=1.129;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=65;TCR=46;TR=111;WE=30008864;WS=30008846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr15	30008889	rs2229518	G	A	1336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.648;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=29;PP=970;ReadPosRankSum=1.054;SC=GATGGCTGGCGGCAATGTGTG;SOR=0.808;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=130;TCF=58;TCR=72;TR=51;WE=30008897;WS=30008879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,56:0.41:137
chr15	30010328	rs72143374	TA	T	158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=6.588;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.86;MQRankSum=4.007;QD=3.05;ReadPosRankSum=-0.397;SOR=2.196;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,21:0.40:52
chr15	30011427	rs11073215	C	T	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=142;ReadPosRankSum=0.494;SC=TATTAAACTACGATTTAATAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=9;WE=30011435;WS=30011417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr15	30018553	rs4073316	A	T	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.72;ReadPosRankSum=1.657;SOR=0.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,35:0.27:128
chr15	30064495	rs1383315	C	T	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=273;ReadPosRankSum=-0.559;SC=AATTTCTCTTCAGATCAATGA;SOR=0.631;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=14;WE=30064503;WS=30064485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr15	30070198	rs1904812	A	C	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=92;ReadPosRankSum=-0.240;SC=TTTGGTAGTTATTTTATTTTC;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=6;WE=30070206;WS=30070188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr15	30337377	rs10775120	G	C	1807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.651;NF=25;NR=41;PP=1400;ReadPosRankSum=-0.090;SC=GTCGACCCCAGTCCGGACCCC;SOR=0.699;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=36;TCR=58;TR=66;WE=30337385;WS=30337367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,68:0.70:97
chr15	30663397	rs199781709	A	AAAC	127	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.53;QD=31.75;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	30664453	rs149526715	C	T	203.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.26;QD=25.47;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	30700263	rs2564642	T	C	1846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=53;PP=1693;SC=TGCCCTCTCCTTCTCTGCCCC;SOR=5.709;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=57;TCF=4;TCR=53;TR=57;WE=30700271;WS=30700253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	30700278	rs62016505	C	T	1212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.50;QD=33.69;SOR=7.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	31119861	rs3829484	G	A	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=2;PP=481;SC=ACCAGGTGTGGGGCTGTTGGC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=31119869;WS=31119851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	31129037	rs11070624	G	A	2365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=29;PP=1943;SC=GCCTGGTTCCGGAGGTACTGC;SOR=1.194;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=49;TCR=29;TR=77;WE=31129045;WS=31129027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr15	31197564	rs4779794	G	A	5076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=75;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.162;SC=ATGGTAAGAGGAAGTAAAATA;SOR=0.801;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=72;TCR=76;TR=146;WE=31197572;WS=31197554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,154:0.99:156
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chr15	31218164	rs2959037	T	C	2234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=66;PP=1648;SC=GGCTTTCTCTTGTGGCACCCA;SOR=3.556;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=9;TCR=66;TR=75;WE=31218172;WS=31218154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
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chr15	31233220	rs2955792	C	T	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=629;SC=CAATTAGAGACGACAGAAAGT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=31233228;WS=31233210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	31235357	rs2293319	C	T	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=317;SC=CTCATCATTACACAGGTTAAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=31235365;WS=31235347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	31244083	rs2955790	T	G	3513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.147;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=17;PP=2744;ReadPosRankSum=1.244;SC=TAGCTAAAACTGATGTGATTT;SOR=3.446;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=116;TCF=98;TCR=18;TR=115;WE=31244091;WS=31244073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,123:0.99:124
chr15	31244263	rs2955789	C	T	4995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=133;PP=2965;SC=AAAGGAAAAGCAGTGTTAAAA;SOR=3.898;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=17;TCR=133;TR=150;WE=31244271;WS=31244253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr15	31245880	rs1404467	C	T	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=32;PP=916;ReadPosRankSum=-0.875;SC=TTATTTTATACGATCCCTATC;SOR=2.891;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=35;WE=31245888;WS=31245870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr15	31251333	rs11340006	GA	G	1854.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=58;PP=1149;SC=GGCTGGAGGGGAAAAAAAAAA;SOR=3.167;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=68;TCF=3;TCR=65;TR=61;WE=31251341;WS=31251323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr15	31251366	rs2949573	G	A	1565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=40;PP=1215;SC=TGTGCTAAAAGCAGGAATAGT;SOR=3.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=46;WE=31251374;WS=31251356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	31267147	rs1133642	C	T	2018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=41;PP=1540;SC=TGACAATTTGCTCAATACATG;SOR=1.376;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=23;TCR=41;TR=64;WE=31267155;WS=31267137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	31330280	rs2288242	A	G	2529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=35;PP=1889;SC=TGCCATCCTCATTTTCCTTGG;SOR=1.130;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=52;TCR=35;TR=87;WE=31330288;WS=31330270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr15	31330313	rs12913672	A	G	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=310;ReadPosRankSum=-0.805;SC=AGAAATCATCATATGTGCGAA;SOR=0.791;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=81;TCF=37;TCR=44;TR=25;WE=31330321;WS=31330303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,26:0.30:86
chr15	31339151	rs11636121	A	C	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=172;ReadPosRankSum=0.036;SC=GGGGAGCTGGAGAATGCCGTG;SOR=2.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=9;WE=31339159;WS=31339141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr15	31341461	rs10851487	G	A	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=394;ReadPosRankSum=0.961;SC=CTGCCATTAAGTACGGACCTC;SOR=1.220;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=17;WE=31341469;WS=31341451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr15	31341516	rs2288241	C	T	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=9;PP=815;ReadPosRankSum=-1.074;SC=ACAATATGCACCAGTGACAAA;SOR=0.859;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=64;TCF=48;TCR=16;TR=40;WE=31341524;WS=31341506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,42:0.65:65
chr15	31342744	rs1035705	C	T	2698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=73;PP=2138;ReadPosRankSum=0.100;SC=TCTCCTTCTCCGTGGCTTTGC;SOR=0.706;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=162;TCF=40;TCR=122;TR=97;WE=31342752;WS=31342734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,99:0.60:165
chr15	31357138	rs919001	A	G	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.800;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=7;PP=940;ReadPosRankSum=-0.796;SC=GCAAGGATTGATATTTTCAAT;SOR=0.247;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=50;TCF=42;TCR=8;TR=37;WE=31357146;WS=31357128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,38:0.75:51
chr15	31359457	rs3784599	T	G	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.078;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=36;PP=972;ReadPosRankSum=-0.396;SC=TCATGAAATTTAGGGACACTT;SOR=1.366;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=67;TCF=9;TCR=58;TR=41;WE=31359465;WS=31359447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,45:0.62:73
chr15	31362352	rs2241493	C	T	2293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=62;PP=1994;SC=CACCTGTTTGCTTTCCTCTTC;SOR=4.143;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=6;TCR=62;TR=68;WE=31362360;WS=31362342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr15	31362654	rs17815804	G	A	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=95;ReadPosRankSum=0.275;SC=ACATTGGATGGTTGCTCTTTC;SOR=0.392;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=10;WE=31362662;WS=31362644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,10:0.25:40
chr15	31368915	rs2241497	C	G	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=296;ReadPosRankSum=0.109;SC=GTGGTGGACACAAACTCTTTT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=14;WE=31368923;WS=31368905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr15	31369123	rs4779816	A	G	2348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=38;PP=1809;ReadPosRankSum=-1.112;SC=AGAGTCTTTCATGCTAGGAAT;SOR=0.655;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=86;TCR=58;TR=95;WE=31369131;WS=31369113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,97:0.66:147
chr15	31369223	rs4779817	C	T	2656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=60;PP=1916;ReadPosRankSum=-0.602;SC=TGGACCAATACATTCCCAAGC;SOR=0.739;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=159;TCF=61;TCR=98;TR=98;WE=31369231;WS=31369213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,104:0.62:169
chr15	31369258	rs4779818	C	T	2044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.094;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=56;PP=1599;ReadPosRankSum=-2.293;SC=ATTCTTATACCTTTATAAAAC;SOR=0.477;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=107;TCF=19;TCR=88;TR=70;WE=31369266;WS=31369248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,73:0.66:111
chr15	31373727	rs4779504	T	C	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5021;FS=4.973;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=244;ReadPosRankSum=-0.895;SC=TGCCCTCCCTTTGTTCCAGTC;SOR=3.258;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=10;WE=31373735;WS=31373717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr15	31453147	rs75638145	G	A	3080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=74;PP=2316;ReadPosRankSum=1.021;SC=AGCGAGCCCCGCTTGAAGGAG;SOR=0.655;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=60;TCR=98;TR=120;WE=31453155;WS=31453137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,121:0.75:161
chr15	31516008	rs1865873	T	C	2619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=65;PP=2208;SC=GAAAGGAAACTTAGGTCGCCA;SOR=4.323;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=7;TCR=65;TR=72;WE=31516016;WS=31515998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr15	31521505	rs3835087	CGG	C	1857.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=33;PP=912;SC=CTGGTGGGGCCGGGGGGGGGG;SOR=2.608;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=48;TCF=11;TCR=37;TR=40;WE=31521514;WS=31521495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	31619607	rs11537749	G	A	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.08;ReadPosRankSum=0.290;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr15	31776004	.	C	G	24	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=1;NR=2;PP=24;QD=19.5904041824;SC=TGCGGCCAGGCACTGGTCCGC;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=31776012;WS=31775994;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	31776210	rs199744400	TGGC	T	1691.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=39;NR=1;PP=1753;SC=CGCTTGGCCGTGGCGGCGGCG;SOR=5.136;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=70;TCF=68;TCR=2;TR=40;WE=31776220;WS=31776200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	31779595	rs62004065	G	A	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.009;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=12;PP=896;ReadPosRankSum=-0.811;SC=CCCTCCCCAGGATGCCCCAGC;SOR=1.329;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=37;WE=31779603;WS=31779585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,37:0.65:57
chr15	31779838	rs16956777	C	G	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.008;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=34;PP=891;ReadPosRankSum=-0.441;SC=AAGGAAATTCCCAAGCCAGGT;SOR=1.321;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=43;WE=31779846;WS=31779828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,43:0.62:69
chr15	31862448	rs1459198	C	T	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=314;ReadPosRankSum=-0.088;SC=GCATGAATAACGGTCTCATCA;SOR=0.831;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=55;TCF=14;TCR=41;TR=18;WE=31862456;WS=31862438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,18:0.32:56
chr15	32393486	rs201765366	C	CTT	1293.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=6.315;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.40;MQRankSum=0.749;QD=29.40;ReadPosRankSum=-1.898;SOR=1.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,41:0.93:44
chr15	32393663	rs28650375	C	A	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=703;SC=GGAAAAAAAACCAAAAAAACA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=32393671;WS=32393653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	32450704	rs201822909	G	A	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=2.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.66;MQRankSum=-0.359;QD=8.80;ReadPosRankSum=-2.101;SOR=0.392;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr15	32620127	rs3809581	G	A	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=3.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.94;MQRankSum=-3.455;QD=4.14;ReadPosRankSum=0.950;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr15	32925419	.	A	T	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.728;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=650;ReadPosRankSum=-0.417;SC=ATAATTTTTTAAAATCCCTTC;SOR=1.036;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=0;TCR=51;TR=29;WE=32925427;WS=32925409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,30:0.58:52
chr15	32926076	rs11632524	C	T	285.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=236;SC=TTTCGTATTTCAAGTATTTCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=32926084;WS=32926066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	32984196	rs6494593	A	G	392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=10;PP=298;SC=AGTCTGTAGCAATTCTAGCAA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=32984204;WS=32984186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	33010412	rs2293582	G	A	1057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.434;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=17;PP=863;ReadPosRankSum=-1.419;SC=AGGGAAGAGGGCCGCAAACCA;SOR=0.869;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=146;TCF=93;TCR=53;TR=51;WE=33010420;WS=33010402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,50:0.34:147
chr15	33010736	rs2293581	G	A	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.853;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=604;ReadPosRankSum=0.103;SC=GAGCGCAGGAGCATCCGGACC;SOR=0.909;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=98;TCF=29;TCR=69;TR=34;WE=33010744;WS=33010726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,34:0.34:101
chr15	33091281	rs1258806	C	A	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=29;PP=679;ReadPosRankSum=0.356;SC=AAGCTGGGGGCTCATAGTTAC;SOR=0.547;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=30;WE=33091289;WS=33091271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr15	33200798	.	C	A	96	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=8;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=15;MQ=52.28;NF=0;NR=12;PP=96;QD=10.8976010456;SC=AAATAGAAAACAAAACCAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=12;WE=33200806;WS=33200788;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:33,12:0.27:45
chr15	33261185	rs117804335	G	A	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=3.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=124;ReadPosRankSum=2.190;SC=TGGAGGAGGCGGAGGTGGTAG;SOR=0.634;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=8;WE=33261193;WS=33261175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr15	33261232	rs2930131	G	A	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=10;PP=914;SC=TTGGAGGTGCGGGAGACAAAG;SOR=2.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=33261240;WS=33261222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	33300291	rs11630735	A	C	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=464;ReadPosRankSum=0.257;SC=AAAATCAAAAAAGAGGCCAAT;SOR=0.465;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=21;WE=33300299;WS=33300281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr15	33357262	rs2306277	A	G	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.001;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=347;ReadPosRankSum=0.288;SC=CTGCTCAGTCAGGCTGTGGTC;SOR=1.012;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=81;TCF=33;TCR=48;TR=26;WE=33357270;WS=33357252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,26:0.31:83
chr15	33359212	.	C	T	2693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.301;ClippingRankSum=0.000;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.720;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=44;PP=2109;ReadPosRankSum=2.013;SC=ATGGTCTCTCCTCCCTCAGCG;SOR=0.789;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=134;TCF=73;TCR=61;TR=99;WE=33359220;WS=33359202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,100:0.74:136
chr15	33359370	rs11072170	C	T	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.733;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=18;PP=724;ReadPosRankSum=-1.798;SC=GTCTTGGGACCCTTCTTCTCC;SOR=0.738;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=117;TCF=59;TCR=58;TR=40;WE=33359378;WS=33359360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,40:0.32:124
chr15	33359574	rs11858145	C	A	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.588;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=539;ReadPosRankSum=-1.946;SC=AGATAAAACACCACTAGGGGA;SOR=0.538;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=117;TCF=52;TCR=65;TR=34;WE=33359582;WS=33359564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,36:0.30:122
chr15	33380985	rs2291066	A	C	2095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.848;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=21;PP=1130;ReadPosRankSum=0.509;SC=CACAATCACCAAGATTTCTAC;SOR=1.243;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=178;TCF=99;TCR=79;TR=59;WE=33380993;WS=33380975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,62:0.32:194
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chr15	33446311	rs28507600	G	C	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.08;ReadPosRankSum=-0.025;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,35:0.24:146
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chr15	33446947	rs1399078	A	C	2259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.387;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=38;PP=1742;ReadPosRankSum=-1.547;SC=ATGATGTCTGACTCCTCCCTG;SOR=0.272;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=126;TCF=71;TCR=55;TR=78;WE=33446955;WS=33446937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,83:0.62:134
chr15	33757840	rs2596163	G	A	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.232;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=23;ReadPosRankSum=-1.105;SC=GAAATGATGCGATCTCAGGTT;SOR=0.021;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=4;WE=33757848;WS=33757830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr15	33765761	rs2245508	A	G	2325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=58;PP=1779;SC=TGTCCGCCCTACACCTTCTTC;SOR=4.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=5;TCR=59;TR=63;WE=33765769;WS=33765751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	33795710	rs2572204	A	G	1931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=6;PP=1591;SC=ACCTTTTTGCATTCCTATTCA;SOR=4.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=65;TCR=6;TR=70;WE=33795718;WS=33795700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	33840414	rs1435100	A	G	2824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=54;PP=2171;SC=AGGTAATGGAAGGCCTGGGAA;SOR=1.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=33;TCR=54;TR=87;WE=33840422;WS=33840404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr15	33842222	rs1865496	C	G	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=304;SC=AGCAAGCCAGCAGCCTGGTGC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=33842230;WS=33842212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	33842260	rs2304381	G	A	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=225;ReadPosRankSum=0.437;SC=GACACCAGAAGGGTTATAAGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=11;WE=33842268;WS=33842250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr15	33855345	rs2304379	G	A	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=518;SC=ATTTTGTGATGGATTGTACAC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=33855353;WS=33855335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	33872177	rs674155	C	T	3181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=22;PP=2526;SC=TGGTTTTTAGCGGAAACAATC;SOR=2.397;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=101;TCF=79;TCR=22;TR=100;WE=33872185;WS=33872167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr15	33873657	rs668570	C	T	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=1.203;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.31;ReadPosRankSum=-0.559;SOR=0.392;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,23:0.23:99
chr15	33876449	rs10431811	G	A	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.306;NF=35;NR=0;PP=713;ReadPosRankSum=-0.663;SC=AAAAAAGAAAGAATTGTGTCA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=92;TCF=91;TCR=1;TR=35;WE=33876457;WS=33876439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,34:0.36:94
chr15	33876517	rs2643364	A	G	7017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=166;NR=47;PP=2965;SC=AGCAAGTGAAATATTCGACAG;SOR=2.509;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=213;TCF=166;TCR=47;TR=213;WE=33876525;WS=33876507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr15	33876543	rs624954	C	T	7085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=141;NR=79;PP=2965;SC=CAAGTTCTCACGCCCATCATT;SOR=1.378;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=220;TCF=141;TCR=79;TR=220;WE=33876551;WS=33876533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr15	33893769	rs2437135	C	T	2322.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.385;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=44;PP=1746;ReadPosRankSum=0.808;SC=GCCACCACCACCATTCCAAAT;SOR=0.522;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=117;TCF=58;TCR=59;TR=80;WE=33893777;WS=33893759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,87:0.70:125
chr15	33893828	rs3829479	C	G	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.171;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=38;PP=1152;ReadPosRankSum=1.414;SC=AAAGAGGGCTCATCTGAACTC;SOR=1.099;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=51;WE=33893836;WS=33893818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,57:0.68:84
chr15	33905353	rs41279204	C	T	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=317;ReadPosRankSum=-0.679;SC=TCCAGAGTTCCACAGCCTTCT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=15;WE=33905361;WS=33905343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr15	33915964	rs35485665	G	GT	1001.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=12;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.343;NF=35;NR=8;PP=702;ReadPosRankSum=0.000;SC=GGGCTGCATTGTTTTTTTTTT;SOR=0.413;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=80;TCF=66;TCR=14;TR=43;WE=33915972;WS=33915954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,44:0.64:69
chr15	33920616	rs149029359	A	G	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.323;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=9;PP=807;ReadPosRankSum=-0.072;SC=GCTCCTATAGATTTTATGATA;SOR=1.310;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=125;TCF=87;TCR=38;TR=40;WE=33920624;WS=33920606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,42:0.31:136
chr15	33920662	rs35706688	T	C	1473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.282;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=17;PP=1143;ReadPosRankSum=1.406;SC=ACTTGCTCCTTTTCCTTTAGG;SOR=0.853;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=177;TCF=120;TCR=57;TR=60;WE=33920670;WS=33920652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,61:0.33:187
chr15	33923314	rs1495279	A	G	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=213;ReadPosRankSum=-0.907;SC=GGCTAAATGAATGGCTCTTGT;SOR=0.680;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=12;WE=33923322;WS=33923304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr15	33925364	rs2291732	G	A	3181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=83;PP=2631;SC=GATCATCCACGTGCCGTTTTG;SOR=3.126;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=17;TCR=83;TR=100;WE=33925372;WS=33925354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr15	33927764	rs1495280	C	T	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.371;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=341;ReadPosRankSum=0.153;SC=TGAAGGTCTACGTTCTCTCTT;SOR=3.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=16;WE=33927772;WS=33927754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr15	33928460	.	C	T	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.213;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=225;ReadPosRankSum=0.851;SC=CCTTGAGTGTCCCCTAGAAAT;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=10;WE=33928468;WS=33928450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr15	33939646	.	C	G	1931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.944;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.945;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=38;PP=1413;ReadPosRankSum=-1.411;SC=AAGAAATACTCTCTCATACAA;SOR=0.374;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=103;TCF=41;TCR=62;TR=67;WE=33939654;WS=33939636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,72:0.67:107
chr15	33954652	rs4780144	C	T	4399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=74;PP=2965;SC=CAGGAATATCCGCCTCTTCCC;SOR=1.027;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=55;TCR=75;TR=128;WE=33954660;WS=33954642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr15	33955262	rs66533161	GTGAC	G	637.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=888;SC=GCTTGGCATAGTGACTGACCA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=16;WE=33955273;WS=33955252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	33962559	rs11072596	G	C	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=1;PP=436;SC=AATGTTCTTTGTGACACTATG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=33962567;WS=33962549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	33990250	rs1111611	G	A	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=28;PP=839;SC=GCAGGAGCACGAGGTGACTTG;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=33990258;WS=33990240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	33990294	rs1390161	G	A	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=426;SC=CCTTGCCTCAGTTTCTCTTCC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=33990302;WS=33990284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	34014913	rs2293028	C	T	3188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=26;PP=2580;ReadPosRankSum=1.572;SC=CTGTCTTCCTCAGGTGAGAGT;SOR=1.075;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=98;TCF=72;TCR=26;TR=96;WE=34014921;WS=34014903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr15	34021276	rs7498093	T	G	1315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=36;PP=1098;SC=ATTGTGAAATTAGTAATGTTG;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=37;WE=34021284;WS=34021266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	34030865	rs4780171	T	C	1861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=46;PP=1495;SC=ACAGCCGTCATCTGTTTAGCA;SOR=3.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=9;TCR=46;TR=55;WE=34030873;WS=34030855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	34047410	rs76911447	G	T	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=280;SC=TAACCCAAAAGAATTCAATAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=34047418;WS=34047400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	34060740	rs2278317	C	T	2031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=0;PP=1687;SC=TAGTGCATCTCCCTAGAATGC;SOR=8.189;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=57;TCR=0;TR=57;WE=34060748;WS=34060730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	34064043	rs1429754	T	C	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=0;PP=1026;SC=TCTGCCCAGATGACACTGCCA;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=38;WE=34064051;WS=34064033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	34103272	rs4780181	C	G	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.687;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=664;ReadPosRankSum=2.106;SC=GAACTCACACCGGCTTTCCTT;SOR=0.394;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=35;WE=34103280;WS=34103262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,35:0.66:53
chr15	34110759	rs2288612	A	G	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=3.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.545;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=385;ReadPosRankSum=0.451;SC=CCTAAAACCTATCTGTGTTGG;SOR=1.545;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=19;WE=34110767;WS=34110749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr15	34111876	rs10631080	A	AAAAT	1799.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=0.023;QD=27.69;ReadPosRankSum=0.646;SOR=0.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,41:0.63:65
chr15	34112825	rs1036005	C	T	2835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=16;PP=2225;SC=ATGTTCCTGGCTTTACACAAC;SOR=2.935;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=73;TCR=16;TR=89;WE=34112833;WS=34112815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr15	34112865	rs1036006	G	A	4670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=90;NR=52;PP=2965;SC=TGTGAATTACGTCCTGTCCCC;SOR=1.426;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=90;TCR=52;TR=142;WE=34112873;WS=34112855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr15	34112906	rs1036007	C	A	4997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=73;PP=2965;SC=TATTAGATTTCCCTTTAATTT;SOR=0.905;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=83;TCR=75;TR=156;WE=34112914;WS=34112896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr15	34113010	rs2288613	C	T	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=1.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.125;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=672;ReadPosRankSum=-0.905;SC=AAAAAACATTCGAAGTAAGTT;SOR=1.277;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=114;TCF=35;TCR=79;TR=33;WE=34113018;WS=34113000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,37:0.29:128
chr15	34113054	rs3815965	G	A	2957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=62;PP=2328;SC=CACCCTCCAAGGCCAATAGGC;SOR=2.383;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=12;TCR=62;TR=74;WE=34113062;WS=34113044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr15	34113454	rs35254800	AT	A	1236.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.22;NF=25;NR=15;PP=926;SC=TTTCCCTGTGATTTTTTTTCC;SOR=1.659;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=40;WE=34113462;WS=34113444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	34113536	rs2288614	A	G	1768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=26;PP=1470;SC=GTGGTGCTGCAGAGATGGTCC;SOR=1.107;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=34;TCR=26;TR=60;WE=34113544;WS=34113526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	34115088	rs8032198	C	T	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=528;SC=ATTCCATAAGCAGAGCGTCCA;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=34115096;WS=34115078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	34117947	rs200179292	TC	T	759.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=20;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=37;PP=749;SC=TTTTTTTTTTTCCCCATACAG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=37;WE=34117955;WS=34117932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	34118994	rs4041449	C	CAG	3322.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=57;PP=2930;SC=ACACAGCACTCGGGCAAAACT;SOR=2.895;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=71;TCF=10;TCR=61;TR=67;WE=34119002;WS=34118984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr15	34129357	rs7182398	C	T	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=28;PP=838;SC=CCTGGTCTGACGGACGAAGCC;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=34129365;WS=34129347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	34131239	rs143795343	C	T	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=320;ReadPosRankSum=1.045;SC=AGTACTGACACCATTTCCCTA;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=14;WE=34131247;WS=34131229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr15	34132875	rs4780184	G	A	1908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=2;PP=1717;SC=GACATATATAGCAGGACACTT;SOR=5.856;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=59;TCF=57;TCR=2;TR=59;WE=34132883;WS=34132865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	34133130	rs3764232	A	G	2317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=71;PP=2059;SC=ATGGTAGATAATTCTTAGGCC;SOR=8.526;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=0;TCR=71;TR=71;WE=34133138;WS=34133120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
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chr15	34136971	rs7181900	T	C	1318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=0;PP=1063;SC=ACTATTTGTATAGCACATGCT;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=38;WE=34136979;WS=34136961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	34137292	rs12899715	C	G	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=250;ReadPosRankSum=0.086;SC=TGGATCTAATCTCACTCCTTG;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=13;WE=34137300;WS=34137282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr15	34140735	rs2278314	A	G	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.763;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=123;ReadPosRankSum=-0.449;SC=TTTGATTTCTAGGACTTTTCT;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=34140743;WS=34140725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr15	34146783	rs2303308	G	A	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.913;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=600;ReadPosRankSum=-1.001;SC=ACGTGCTGGGGGAACACTTAT;SOR=0.444;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=90;TCF=28;TCR=62;TR=31;WE=34146791;WS=34146773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,33:0.35:93
chr15	34146886	rs713201	T	C	3967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=35;PP=2965;SC=TCAGTGTGTCTCCCAAAATAA;SOR=1.857;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=83;TCR=35;TR=118;WE=34146894;WS=34146876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr15	34146922	rs713203	C	T	5615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=113;NR=58;PP=2965;SC=AATGAGCACACTATGAGGCAA;SOR=1.544;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=171;TCF=113;TCR=58;TR=171;WE=34146930;WS=34146912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr15	34151668	rs7180084	G	C	2116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=4;PP=1724;SC=TTCCCCTCTCGTGGCTTAGGG;SOR=5.010;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=58;TCR=4;TR=62;WE=34151676;WS=34151658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	34152777	rs2303310	T	A	5888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.733;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.97;MQRankSum=-0.052;NF=119;NR=54;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.358;SC=TTGCTTTGTCTTTGTATTTAA;SOR=1.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=175;TCF=120;TCR=55;TR=173;WE=34152785;WS=34152767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,188:0.99:190
chr15	34156284	rs11072759	C	G	1466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=22;PP=1250;SC=TTAATCCATGCGAATGAACTT;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=23;TCR=22;TR=45;WE=34156292;WS=34156274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr15	34156312	rs11072760	T	C	1238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=17;PP=980;SC=GACCAGAGTATCTAATACTAT;SOR=0.743;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=20;TCR=17;TR=37;WE=34156320;WS=34156302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	34330828	.	CCG	C	266	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=69;MMLQ=23;MQ=61.78;NF=6;NR=0;PP=266;QD=48.6666666667;SC=AGGCGCGCCCCCGCGCCACCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=34330837;WS=34330827;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	34354775	.	ACT	A	126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.21;MQRankSum=-4.675;QD=3.34;ReadPosRankSum=-2.465;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr15	34354779	.	T	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.251;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQRankSum=-4.228;QD=3.67;ReadPosRankSum=-3.097;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,5:0.14:37
chr15	34434625	.	TAAAC	T	1881.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.114;NF=27;NR=7;PP=1573;ReadPosRankSum=-0.951;SC=AATACAAACATAAACAATCCA;SOR=0.971;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=34;WE=34434636;WS=34434615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,49:0.72:68
chr15	34435255	rs74482733	T	C	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.235;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=280;ReadPosRankSum=0.290;SC=AATTAATTGATGGTTTAATTT;SOR=0.990;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=19;WE=34435263;WS=34435245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr15	34437854	rs146687820	TA	T	68.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=44;ReadPosRankSum=0.620;SC=GGAGAGAAATTAAAAAAAAAT;SOR=0.197;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=5;WE=34437871;WS=34437844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr15	34437863	rs4780222	A	G	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=450;SC=TTAAAAAAAAATCAAATAACT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=34437871;WS=34437844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	34439170	rs16958836	A	T	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.711;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=24;PP=634;ReadPosRankSum=1.507;SC=CTTTTAAAAAATTGTTACCTT;SOR=0.402;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=133;TCF=42;TCR=91;TR=39;WE=34439178;WS=34439160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,41:0.29:141
chr15	34441102	rs6495551	C	T	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=508;SC=CAGTTGACCACAGTAAACAAA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=34441110;WS=34441092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	34517929	rs17236763	T	C	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=564;ReadPosRankSum=0.500;SC=TAGGTGGAGTTAACGTAGATA;SOR=0.804;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=93;TCF=19;TCR=74;TR=30;WE=34517937;WS=34517919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,33:0.33:100
chr15	34520863	rs17236784	A	G	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=51;ReadPosRankSum=0.719;SC=TGATGGTAGGAAATTGGAGTT;SOR=0.551;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=6;WE=34520871;WS=34520853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr15	34521253	rs7167503	A	T	731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.27;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	34522088	rs140570424	A	C	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=170;ReadPosRankSum=0.325;SC=CTAATCACTTATGTTAAAAAG;SOR=0.421;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=12;WE=34522096;WS=34522078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr15	34522108	rs71702457	ACT	A	360.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=337;ReadPosRankSum=0.062;SC=GAACCAAAAGACTCTTTTCTC;SOR=0.540;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=9;WE=34522117;WS=34522098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr15	34528475	rs17817800	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=124;ReadPosRankSum=-0.432;SC=TTTTGAAGCAGTAATGGGTTA;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=8;WE=34528483;WS=34528465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr15	34528948	rs4577050	G	A	1991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.992;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=27;PP=1549;ReadPosRankSum=-0.601;SC=GCATGTGCCGGAGCATCTGGG;SOR=0.410;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=104;TCF=68;TCR=36;TR=74;WE=34528956;WS=34528938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,75:0.71:105
chr15	34529488	rs35994446	G	GT	292.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=0.764;QD=14.64;ReadPosRankSum=-1.380;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr15	34529776	rs17817806	A	G	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.635;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=28;PP=768;ReadPosRankSum=0.779;SC=TACACATGTGAAAAATTAGAG;SOR=0.426;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=35;TCR=85;TR=40;WE=34529784;WS=34529766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,47:0.36:131
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chr15	34536143	rs79436830	G	T	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=692;ReadPosRankSum=-0.388;SC=CTCTCCAAACGTGAGTAAAAA;SOR=0.735;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=109;TCF=64;TCR=45;TR=37;WE=34536151;WS=34536133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,39:0.35:112
chr15	34537435	rs4371122	C	T	2243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=14;PP=1720;SC=AATAAACATGCATTATTTATC;SOR=2.617;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=54;TCR=14;TR=68;WE=34537443;WS=34537425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr15	34542606	rs17236791	T	C	1455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.714;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=41;PP=1178;ReadPosRankSum=-0.131;SC=TAACATGAGATAGAAAGTAGA;SOR=0.340;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=62;TCF=10;TCR=52;TR=50;WE=34542614;WS=34542596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,51:0.81:63
chr15	34542730	rs61549125	T	C	692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.90;ReadPosRankSum=-0.333;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,21:0.30:70
chr15	34542739	rs56761496	G	C	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=1.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.58;ReadPosRankSum=0.723;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,22:0.30:74
chr15	34542872	rs17236798	C	G	1735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.961;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=35;PP=1259;ReadPosRankSum=0.889;SC=TAGTACCAATCGGAATAGACT;SOR=0.393;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=205;TCF=90;TCR=115;TR=69;WE=34542880;WS=34542862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,76:0.35:218
chr15	34543055	rs10851964	G	A	1640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=16;PP=1298;ReadPosRankSum=-0.303;SC=AAATCACTCCGTGGGTCTGAC;SOR=0.606;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=86;TCF=63;TCR=23;TR=57;WE=34543063;WS=34543045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,58:0.66:88
chr15	34543298	rs11382535	G	GA	2283.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.321;NF=4;NR=73;PP=1013;ReadPosRankSum=-0.660;SC=GCAGCAGTATGAAAAAAAAAA;SOR=1.632;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=103;TCF=7;TCR=96;TR=77;WE=34543306;WS=34543288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,88:0.97:91
chr15	34544351	rs2290941	C	A	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.25;ReadPosRankSum=0.165;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,11:0.23:47
chr15	34544468	rs2290940	C	T	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=24;PP=759;ReadPosRankSum=-0.014;SC=AAAATTGACTCGAGTTACAGA;SOR=0.674;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=147;TCF=71;TCR=76;TR=46;WE=34544476;WS=34544458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,48:0.32:151
chr15	34547757	rs11421665	G	GA	825.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=899;SC=AGTAAAAGGTGAAAGTGTTAT;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=23;WE=34547765;WS=34547747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	34550009	rs149393286	T	TA	378.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=378;ReadPosRankSum=1.493;SC=AAGACATTGATAAAAAATCAC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=2;TCR=61;TR=17;WE=34550017;WS=34549999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,20:0.32:63
chr15	34551082	rs7164902	G	A	1203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.057;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=26;PP=951;ReadPosRankSum=1.720;SC=CCTTGAGTCAGATTAGTGTAA;SOR=0.657;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=103;TCF=53;TCR=50;TR=48;WE=34551090;WS=34551072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,48:0.45:107
chr15	34610964	rs347867	G	C	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr15	34628570	rs347836	C	G	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=451;ReadPosRankSum=-1.300;SC=GGATAAAGAACCCAGTAATGA;SOR=0.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=21;WE=34628578;WS=34628560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,21:0.40:52
chr15	34634324	rs422388	C	G	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.080;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=21;PP=889;ReadPosRankSum=0.368;SC=TCCAGGAACACAGAATGTATG;SOR=0.835;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=151;TCF=74;TCR=77;TR=49;WE=34634332;WS=34634314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,52:0.33:158
chr15	34635029	rs2615357	G	T	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=234;ReadPosRankSum=-0.213;SC=ATTACAGGCGGGAGCCACTGC;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=43;TCR=2;TR=14;WE=34635037;WS=34635019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,14:0.29:48
chr15	34640054	rs150911418	AAAAAAT	A	1403.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=0;PP=796;SC=ACTCCATCTCAAAAAATAAAA;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=17;WE=34640067;WS=34640044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	34640218	rs374230	C	T	9735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=191;NR=100;PP=2965;SC=AGTGCCGCCCCGTCTCCATCC;SOR=1.467;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=293;TCF=193;TCR=100;TR=291;WE=34640226;WS=34640208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr15	34640378	rs430083	T	C	9158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=202;PP=2965;SC=TGACAGGGGATGGGGGCCCTT;SOR=1.499;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=309;TCF=107;TCR=202;TR=309;WE=34640386;WS=34640368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
chr15	34640959	rs371061	G	A	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=22;PP=615;SC=AGTTTAGGCTGTTTAGGACTA;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=34640967;WS=34640949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	34643103	rs347796	A	G	1560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=37;PP=1314;SC=CCGCAGAGAGACTTGTGTGGG;SOR=2.448;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=50;WE=34643111;WS=34643093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	34648647	rs17236868	T	A	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.983;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=469;ReadPosRankSum=0.573;SC=GAGAGCAGTGTGATTCCCTGT;SOR=0.910;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=74;TCF=27;TCR=47;TR=24;WE=34648655;WS=34648637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,24:0.33:73
chr15	34651587	rs4984236	C	T	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=273;ReadPosRankSum=-0.380;SC=AACTAAAACACCTTGTGCCTC;SOR=0.693;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=13;WE=34651595;WS=34651577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr15	34653914	rs35483472	T	C	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=1;NR=27;PP=809;SC=CTTTTCTTTTTTTTTTTGACG;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=34653922;WS=34653904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	34654339	rs10626628	T	TTC,TTCTC	4429.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=2.581;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.34;MQRankSum=-0.202;QD=41.79;ReadPosRankSum=-1.125;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:3,19,84:0.18,0.79:106
chr15	34654718	rs2279686	C	T	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=7;PP=900;SC=CTCCACGCCCCTGTGGTTCCT;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=31;WE=34654726;WS=34654708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	34655092	rs2339434	T	C	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=21;PP=590;SC=GCTCCTTCCCTGGCTCCCACA;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=34655100;WS=34655082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	34657589	rs4984237	A	G	260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=206;SC=ATCAGGGCACATTACTTAGAG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=34657597;WS=34657579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	34659081	.	C	A	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.569;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.988;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=659;ReadPosRankSum=-1.635;SC=GCAAGCCTCTCAGCCATCTCC;SOR=0.073;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=28;WE=34659089;WS=34659071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,30:0.71:42
chr15	34673722	rs76522922	C	T	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.381;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=5.219;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.29;MQRankSum=0.444;QD=11.63;ReadPosRankSum=0.760;SOR=0.470;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr15	34781867	.	T	G	25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=20;MQ=55.68;NF=0;NR=3;PP=25;QD=19.9237375157;SC=GGGGAGGGGGTGGGGGGTGCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=3;WE=34781875;WS=34781857;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,3:0.38:8
chr15	34782792	rs2655313	C	A	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=45;ReadPosRankSum=-0.684;SC=AGTCTTGAGCCGCTTAGGGGC;SOR=0.330;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=4;WE=34782800;WS=34782782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr15	35045312	rs651724	T	A	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.375;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=28;PP=934;ReadPosRankSum=0.033;SC=CTAGGAAGACTGTAGAGTAGC;SOR=1.147;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=155;TCF=75;TCR=80;TR=48;WE=35045320;WS=35045302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,53:0.32:164
chr15	35046816	rs2277558	T	A	899.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.918;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=32;PP=864;ReadPosRankSum=0.155;SC=AGCAATTTTTTAAAAAATCCT;SOR=1.634;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=52;TCF=8;TCR=44;TR=37;WE=35046824;WS=35046806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,37:0.70:53
chr15	35083508	.	TCACACACACACA	T	427.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.940;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=2.455;QD=22.51;ReadPosRankSum=0.217;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr15	35085897	rs7165006	C	G	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=382;ReadPosRankSum=1.883;SC=ACAAGCAATACGATTTTACCC;SOR=0.643;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=18;WE=35085905;WS=35085887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr15	35149008	rs8035240	C	T	3728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.395;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=50;PP=2965;ReadPosRankSum=0.495;SC=TGGTCTCTTCCGGGGCAGATG;SOR=0.530;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=114;TCF=63;TCR=51;TR=113;WE=35149016;WS=35148998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,117:0.99:118
chr15	35168056	rs2290321	C	T	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=101;ReadPosRankSum=-0.991;SC=ATCAGCACACCCAAACTGTAC;SOR=2.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=6;WE=35168064;WS=35168046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr15	35185807	.	T	TGCAC	172.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=0.000;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.127;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr15	35185808	rs71929696	GCA	G	50.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQRankSum=1.119;QD=1.88;ReadPosRankSum=0.476;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr15	35185812	rs6495722	A	G	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQRankSum=0.864;QD=1.94;ReadPosRankSum=0.274;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr15	35196492	rs12898639	C	T	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=109;SC=ATAAAAGTTACTTAAATTATG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=35196500;WS=35196482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	35207397	rs2044920	C	G	1874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=64;PP=1610;SC=AGGAAAAAAACATCCATATTT;SOR=8.410;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=73;TCF=0;TCR=73;TR=64;WE=35207418;WS=35207387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	35207430	rs2044921	C	T	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.166;NF=0;NR=26;PP=617;ReadPosRankSum=1.001;SC=TTTTTTGAGACGGAGTCTCAC;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=26;WE=35207438;WS=35207420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr15	35226918	.	ATAACT	A	422.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.442;NF=2;NR=9;PP=454;ReadPosRankSum=0.709;SC=CAGTTATTTAATAACTTAAAT;SOR=0.536;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=11;WE=35226930;WS=35226908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr15	35230924	rs12594085	A	G	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.594;NF=17;NR=8;PP=347;ReadPosRankSum=0.342;SC=TGCACTGAGTAAAAAAGAAGA;SOR=0.591;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=93;TCF=66;TCR=27;TR=25;WE=35230942;WS=35230914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,27:0.28:98
chr15	35230934	rs10701045	A	ATAGT	4645.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=26;PP=2954;SC=AAAAAAGAAGATACCAGAAAG;SOR=1.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=54;TCR=29;TR=75;WE=35230942;WS=35230914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr15	35252767	rs11636350	G	A	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=0;PP=764;SC=AACCCTATGGGATTTGATACC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=35252775;WS=35252757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	35256624	rs9920529	C	G	1989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=51;PP=1669;SC=TATCTGAAGGCACTACACAGG;SOR=2.985;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=11;TCR=51;TR=62;WE=35256632;WS=35256614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	35261649	rs7164169	A	G	10550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=223;NR=112;PP=2965;SC=CCTCCTCCGGACTCCTAAATC;SOR=1.595;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=336;TCF=224;TCR=112;TR=335;WE=35261657;WS=35261639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,338:1.00:338
chr15	35261952	rs7164070	C	T	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=503;SC=ATATCCTCAGCCTTCAGAGTC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=35261960;WS=35261942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	35664298	rs3759846	C	G	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=439;SC=AAATACTATGCAATTTTTTTG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=35664306;WS=35664288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	35664406	rs141638132	TA	T	1216.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=19;PP=729;SC=TGAGGACACCTAAAAAAAAAA;SOR=0.909;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=23;TCR=22;TR=39;WE=35664414;WS=35664396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	35674184	rs80019930	T	G	1262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=33;PP=1034;SC=TGCTCTCTTATCTGGTACTAA;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=36;WE=35674192;WS=35674174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
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chr15	35834547	rs1020307	T	C	2365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=11;PP=1858;SC=GGTATACCTGTACAATGTAAT;SOR=3.321;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=58;TCR=11;TR=69;WE=35834555;WS=35834537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
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chr15	37026565	rs1037439	A	G	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=11;PP=478;SC=TTCCAGAGGTACTTTATTCCT;SOR=1.371;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=6;TCR=11;TR=17;WE=37026573;WS=37026555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
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chr15	37168502	rs10518914	G	A	1263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=3;PP=1029;ReadPosRankSum=-0.369;SC=ATAGGAGAACGTTGAGATATT;SOR=0.670;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=62;TCR=4;TR=45;WE=37168510;WS=37168492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,45:0.67:67
chr15	37173119	rs67033548	A	AT	1445.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.832;HP=6;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.726;NF=31;NR=15;PP=1322;ReadPosRankSum=-1.717;SC=GTTTGCATTGATTTTTTGTGG;SOR=1.312;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=78;TCF=46;TCR=32;TR=46;WE=37173127;WS=37173109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,57:0.67:85
chr15	37173147	rs12909623	T	G	2086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.754;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=28;PP=1506;ReadPosRankSum=1.431;SC=AAATTTGCGGTGTTTCAGGAA;SOR=0.852;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=107;TCF=63;TCR=44;TR=72;WE=37173155;WS=37173137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,78:0.68:115
chr15	37173267	rs12903788	G	A	1763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.874;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=40;PP=1564;ReadPosRankSum=1.094;SC=ACCCAACTCAGGACTCTAAAG;SOR=0.896;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=93;TCF=37;TCR=56;TR=65;WE=37173275;WS=37173257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,62:0.68:91
chr15	37173379	rs16964235	T	C	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.503;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=184;ReadPosRankSum=0.147;SC=AGTCATAGAGTTCTCACCCCC;SOR=0.017;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=12;WE=37173387;WS=37173369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr15	37173945	rs4451907	A	G	60.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=34;ReadPosRankSum=1.150;SC=TGTTGCCACAATAAAGGGATG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=37173953;WS=37173935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr15	37184736	rs75758362	G	A	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.55;ReadPosRankSum=0.524;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr15	37187197	rs61146116	A	AT	500.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=13;PP=543;SC=TCAAAGAGGAATTTTTTCCCC;SOR=1.863;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=17;WE=37187205;WS=37187187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	37242440	rs11293336	GA	G	451.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=4.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.392;SOR=0.151;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,31:0.50:62
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chr15	38233869	rs2937991	T	C	3517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=23;PP=2841;SC=TTTGATTTCCTAGGTAATGAA;SOR=2.606;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=82;TCR=23;TR=105;WE=38233877;WS=38233859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr15	38258772	rs2959336	A	C	3568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=17;PP=2965;SC=AGGCTACAGCAAGAAACCTCA;SOR=3.196;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=92;TCR=17;TR=109;WE=38258780;WS=38258762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr15	38590722	rs8040553	T	G	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=5;PP=1260;SC=TAAAAAAAATTAACTTCTGGT;SOR=4.317;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=44;WE=38590730;WS=38590712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr15	38590771	rs8036280	A	G	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.130;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=11;PP=980;ReadPosRankSum=0.296;SC=AGACAAAAAGAGTACAAATGG;SOR=1.034;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=72;TCF=52;TCR=20;TR=44;WE=38590779;WS=38590761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,46:0.60:77
chr15	38590854	rs8034630	G	A	1314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.104;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=1029;ReadPosRankSum=0.564;SC=AAGGATTTTTGAAGTGATGAA;SOR=0.433;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=73;TCF=24;TCR=49;TR=45;WE=38590862;WS=38590844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,47:0.61:77
chr15	38614525	rs7182445	G	A	2146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.772;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=40;PP=1482;ReadPosRankSum=0.332;SC=TTGATGACAAGAAGTTTGGTC;SOR=0.556;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=111;TCF=56;TCR=55;TR=79;WE=38614533;WS=38614515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,83:0.72:116
chr15	38616815	rs1879939	G	A	187.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=2;PP=138;SC=AGGGGCAAATGCAAGTGGCCA;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=38616823;WS=38616805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	38617113	rs1879938	C	T	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.51;ReadPosRankSum=0.077;SOR=0.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr15	38617113	.	CTC	TTG	216	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=1;NR=7;PP=216;QD=33.6834843578;SC=TTCTAAGACACTCTATTTGTC;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=8;WE=38617123;WS=38617103;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr15	38617115	rs1879937	C	G	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=16;PP=184;SC=CTAAGACACTCTATTTGTCAG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=38617123;WS=38617103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	38631840	rs7163339	T	C	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.295;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=479;ReadPosRankSum=-1.228;SC=TATATACTTATTGACTTGCTA;SOR=2.526;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=43;TCR=2;TR=24;WE=38631848;WS=38631830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr15	38631920	rs7179118	G	A	2940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=6.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.30;ReadPosRankSum=1.560;SOR=1.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,75:0.62:121
chr15	38631930	rs7180446	C	A	3051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=7.745;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.43;ReadPosRankSum=-0.263;SOR=1.438;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,78:0.65:120
chr15	38632148	rs7181472	A	G	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=46;PP=1453;SC=GTAGAAATTGAATGATGTCAT;SOR=4.935;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=3;TCR=46;TR=49;WE=38632156;WS=38632138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	38641773	rs61670754	G	GTT	1942.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-5.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.23;ReadPosRankSum=-0.837;SOR=0.533;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,49:0.64:77
chr15	38641774	rs34352434	A	AAAT	1942.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.56;ReadPosRankSum=-0.278;SOR=0.471;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,47:0.62:76
chr15	38641777	rs59928364	G	GTA	1641.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.79;ReadPosRankSum=0.379;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,41:0.59:69
chr15	38643574	rs3751526	T	C	5930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.470;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=93;PP=2962;ReadPosRankSum=0.276;SC=AAGAAAATGTTAGGGGAAAAT;SOR=0.503;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=311;TCF=173;TCR=138;TR=200;WE=38643582;WS=38643564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,209:0.64:327
chr15	38794566	rs12324402	A	G	4095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.030;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=73;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.965;SC=CAATCTTTTCAAATTCTTCCT;SOR=0.796;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=253;TCF=132;TCR=121;TR=158;WE=38794574;WS=38794556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,165:0.63:261
chr15	38804020	rs11413668	T	TA	634.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.9816;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=505;ReadPosRankSum=-1.043;SC=GAGTCTCCCTTACGCTGGTTA;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=13;WE=38804028;WS=38804010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr15	38804104	rs6495977	C	A	122.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=88;ReadPosRankSum=-0.674;SC=GTGGATTCCACATCTGGGAGG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=38804112;WS=38804094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr15	38988760	rs7171233	T	A	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=306;ReadPosRankSum=-0.256;SC=TAGGCCGGGGTACCTCAGCCG;SOR=1.136;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=15;WE=38988768;WS=38988750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr15	38988815	rs7165988	C	G	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=6;PP=548;ReadPosRankSum=1.459;SC=TGATATGGAGCTACAAGGGGC;SOR=0.880;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=23;WE=38988823;WS=38988805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr15	38990803	rs12595568	T	G	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=424;SC=GTGTGGTGTGTAAGATGTTGG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=38990811;WS=38990793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	40030440	rs1906163	G	A	2618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.522;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=59.96;MQRankSum=0.011;NF=13;NR=73;PP=2128;ReadPosRankSum=-0.216;SC=ATATACTCAAGGAAATTCACA;SOR=0.108;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=134;TCF=15;TCR=119;TR=86;WE=40030448;WS=40030430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,89:0.66:135
chr15	40030457	rs34646792	GA	G	1187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.610;HP=10;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.017;NF=0;NR=52;PP=700;ReadPosRankSum=0.402;SC=CACAGTTCAGGAAAAAAAAAA;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=103;TCF=2;TCR=101;TR=52;WE=40030465;WS=40030447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,57:0.66:87
chr15	40031715	rs8033687	C	T	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=259;ReadPosRankSum=0.123;SC=AGTACTGGTTCATAAAAGTTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=12;WE=40031723;WS=40031705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr15	40056219	rs34937456	G	A	1839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=1.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.44;ReadPosRankSum=-0.761;SOR=1.018;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,48:0.53:90
chr15	40056223	rs62004778	T	C	1853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=3.224;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.31;ReadPosRankSum=-0.761;SOR=1.131;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,46:0.53:87
chr15	40062825	rs1565560	C	T	1330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=1.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.43;ReadPosRankSum=0.262;SOR=0.343;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,51:0.63:81
chr15	40062838	rs7179838	G	A	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=3;HapScore=3;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=41;PP=2263;ReadPosRankSum=0.850;SC=AAAAAAAACAGTTTCCGAAAA;SOR=0.259;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=68;TCF=2;TCR=66;TR=43;WE=40062846;WS=40062815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,45:0.63:71
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chr15	40062884	rs7180846	T	C	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=416;ReadPosRankSum=1.541;SC=TTCTAGAATATTTTGACACTA;SOR=1.382;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=17;WE=40062892;WS=40062874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
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chr15	40226294	rs508281	A	G	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=289;ReadPosRankSum=2.040;SC=CCAGCGTGGAACACCGCCCAT;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=12;WE=40226302;WS=40226284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr15	40226495	rs566792	T	C	5795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=101;PP=2965;SC=TGGAGGCCATTTACGGCGCGG;SOR=0.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=182;TCF=81;TCR=101;TR=182;WE=40226503;WS=40226485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr15	40231625	rs524240	A	T	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=405;ReadPosRankSum=1.333;SC=AGAACTTTTGATCTAAAATGA;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=19;WE=40231633;WS=40231615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr15	40232001	rs500200	C	A	307.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=250;ReadPosRankSum=-0.646;SC=TCATTTTAAGCCTGTTCATAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=11;WE=40232009;WS=40231991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,11:0.92:12
chr15	40248122	rs8030025	G	A	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.872;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=107;ReadPosRankSum=-0.066;SC=CAATATATTAGGTGTATTTTT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=40248130;WS=40248112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr15	40253886	rs17720964	G	A	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=464;ReadPosRankSum=0.862;SC=AAATGGAGGGGCATTCTTGCC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=20;WE=40253894;WS=40253881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,23:0.68:34
chr15	40254155	rs510949	A	G	3361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=81;PP=2750;SC=AGTTAATCACAAAGGAATGGG;SOR=2.641;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=22;TCR=81;TR=103;WE=40254163;WS=40254145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr15	40259519	rs33911018	C	CT	39.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=1.051;QD=1.81;ReadPosRankSum=-0.185;SOR=0.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr15	40265799	rs2307105	A	G	6006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=129;NR=49;PP=2965;SC=TCAGATTCTGAAGGACAAGAT;SOR=2.033;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=178;TCF=129;TCR=49;TR=178;WE=40265807;WS=40265789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr15	40268998	.	G	GGACGAC	5610.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.000;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=4.219;NF=55;NR=63;PP=2971;ReadPosRankSum=1.691;SC=GCGATGACGAGGACGACGACG;SOR=0.734;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=212;TCF=95;TCR=117;TR=118;WE=40269006;WS=40268988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,135:0.63:213
chr15	40269052	rs34298786	G	A	1955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.498;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-3.825;NF=33;NR=59;PP=1410;ReadPosRankSum=-0.387;SC=TCCTGTAAGCGCACGGCGCGG;SOR=0.624;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=251;TCF=87;TCR=164;TR=92;WE=40269060;WS=40269042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,93:0.37:253
chr15	40269102	rs149792847	A	AT	807.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.369;SOR=1.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,46:0.31:150
chr15	40269126	rs112695691	T	TTTCC	1756.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-0.660;QD=25.83;ReadPosRankSum=-0.748;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,46:0.68:68
chr15	40270214	rs7174071	A	G	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=18;PP=911;SC=GTATTTAAAAATGTCCATGTT;SOR=0.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=21;TCR=18;TR=39;WE=40270222;WS=40270204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	40282625	rs4144472	T	C	1973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=54;PP=1602;SC=GACTCAGATGTCTTGATAATC;SOR=5.926;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=2;TCR=54;TR=56;WE=40282633;WS=40282615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	40284523	rs7178419	C	T	3226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=90;PP=2712;SC=AGGTTTTATTCTACGGCAGAT;SOR=5.849;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=4;TCR=90;TR=94;WE=40284531;WS=40284513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr15	40284802	rs11070241	C	T	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=334;SC=TGTGGCCATACGTGACTTATG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=40284810;WS=40284797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	40285120	rs11633992	A	G	1994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=57;PP=1665;SC=AGCATTTGGGATTTAGTCCCG;SOR=3.947;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=7;TCR=57;TR=64;WE=40285128;WS=40285110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr15	40291140	rs2412457	C	T	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=365;SC=CTTAAAATGTCATTAGACTTG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=40291148;WS=40291130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	40293036	rs72248603	AAAT	A	199.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.163;NF=7;NR=0;PP=181;ReadPosRankSum=-0.958;SC=AAAGCAGAAAAAATAATGACC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=7;WE=40293046;WS=40293026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr15	40300092	rs2279581	T	C	895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=764;SC=CAGGTCAAATTTGTCTTTCAG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=40300100;WS=40300083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	40300214	rs2279580	G	C	3495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.165;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=38;PP=2796;ReadPosRankSum=0.628;SC=AGAAATCTGGGTTTCTCTCTC;SOR=0.350;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=191;TCF=139;TCR=52;TR=123;WE=40300222;WS=40300204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,128:0.65:198
chr15	40300443	rs2279579	T	G	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=231;ReadPosRankSum=-0.903;SC=CTATATTTCTTCACCAAGTGT;SOR=0.141;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=14;WE=40300451;WS=40300433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,13:0.27:48
chr15	40313083	rs12916520	G	T	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=3;PP=431;SC=ACTGTAACCGGTCTGTTTCTG;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=40313091;WS=40313073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	40313141	rs3207297	C	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=92;ReadPosRankSum=0.852;SC=TAAGTGTTGGCCAGATGTCTA;SOR=0.446;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=8;WE=40313149;WS=40313131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,9:0.24:37
chr15	40314967	rs8030856	C	G	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.047;NF=0;NR=8;PP=101;ReadPosRankSum=0.769;SC=GACGGAGTCTCGCTGTCTCCC;SOR=0.169;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=8;WE=40314975;WS=40314957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr15	40322552	rs2250402	G	T	2810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=43;PP=2176;SC=AAACTCTCTTGGTCTCAGGTT;SOR=0.738;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=46;TCR=43;TR=89;WE=40322560;WS=40322542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr15	40324837	rs2291621	C	T	1460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=12;PP=1175;SC=AGCCCTTTTACAGCACAATAG;SOR=2.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=43;WE=40324845;WS=40324827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr15	40328575	rs7535	G	C	6853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.022;NF=79;NR=135;PP=2965;ReadPosRankSum=1.556;SC=GCTGTTGTTGGTGCTGTTGCT;SOR=1.365;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=217;TCF=80;TCR=137;TR=214;WE=40328583;WS=40328565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,220:0.99:222
chr15	40328665	rs8208	G	A	3456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.318;NF=51;NR=57;PP=2781;ReadPosRankSum=1.582;SC=CTCTTCTTCAGCCCATCCATG;SOR=0.287;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=51;TCR=58;TR=108;WE=40328673;WS=40328655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,110:0.99:111
chr15	40328973	rs2291620	A	G	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=267;ReadPosRankSum=1.384;SC=TAGGTAGCATATATCTACAGC;SOR=1.096;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=12;WE=40328981;WS=40328963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr15	40329033	rs2291619	A	G	2693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=5;PP=2061;SC=CGGTATTAGCATTGAAATTCA;SOR=5.114;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=83;TCR=5;TR=88;WE=40329041;WS=40329023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr15	40329480	rs3215044	G	GA,GAA	1570.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=6.112;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.84;MQRankSum=0.697;QD=18.70;ReadPosRankSum=0.080;SOR=0.234;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:13,36,35:0.43,0.42:84
chr15	40330564	rs7321	C	T	2877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=31;PP=2219;SC=CCACAGTACCCTTCTTTGGAA;SOR=1.561;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=62;TCR=31;TR=92;WE=40330572;WS=40330554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr15	40330629	rs8041057	C	T	3735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=61;PP=2840;SC=TGAACACGGCCGCGTACGTGG;SOR=0.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=55;TCR=61;TR=116;WE=40330637;WS=40330619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr15	40330693	rs937215	C	T	2347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=56;PP=1950;SC=GATGACCTAACCCAGCCCCGC;SOR=2.432;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=75;TCF=18;TCR=57;TR=74;WE=40330701;WS=40330683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	40384186	rs190411193	C	T	62.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5032;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=39;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CTCCAAGTCTCACGGCTGGCA;SOR=0.916;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=3;WE=40384194;WS=40384176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr15	40397936	rs539846	G	T	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.927;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=415;ReadPosRankSum=0.859;SC=TTTGGGGAGGGAAAGTCCCCT;SOR=0.193;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=19;WE=40397944;WS=40397926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr15	40453307	rs2277559	A	G	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.338;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=204;ReadPosRankSum=-1.017;SC=GGAGTCGTGTACGTGCCTTGG;SOR=0.404;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=13;WE=40453315;WS=40453297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,15:0.31:49
chr15	40457129	rs3214012	A	C	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=156;ReadPosRankSum=1.428;SC=AATAATAATTATGTGTCAGTC;SOR=0.188;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=9;WE=40457137;WS=40457123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr15	40477831	rs1801376	G	A	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.601;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=277;ReadPosRankSum=1.335;SC=GAGACTGCACGACAGCCAGTT;SOR=1.230;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=64;TCF=35;TCR=29;TR=21;WE=40477839;WS=40477821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,21:0.30:69
chr15	40488851	rs1047130	G	A	1757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.121;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=30;PP=1418;ReadPosRankSum=-0.775;SC=ATCAGCAAGCGTCTGAGGAGA;SOR=0.592;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=233;TCF=150;TCR=83;TR=80;WE=40488859;WS=40488841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,78:0.33:233
chr15	40491952	rs2172742	A	G	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.752;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=532;ReadPosRankSum=0.494;SC=TTTCATACACAAAACTAGAAT;SOR=0.132;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=79;TCF=4;TCR=75;TR=29;WE=40491960;WS=40491942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,30:0.34:87
chr15	40494952	rs2412482	A	T	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=11.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.52;ReadPosRankSum=-1.081;SOR=0.013;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,20:0.27:75
chr15	40494960	rs12898804	A	C	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=11.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.32;ReadPosRankSum=-1.474;SOR=0.013;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,18:0.27:67
chr15	40500986	rs11630664	C	T	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.406;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=28;PP=633;ReadPosRankSum=0.271;SC=GATATACATACCACTATATCC;SOR=1.650;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=65;TCF=7;TCR=58;TR=30;WE=40500994;WS=40500976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,30:0.44:68
chr15	40544493	rs55799438	A	G	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.948;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=76;ReadPosRankSum=1.108;SC=CGCTCAGCTGATTCTCCAGGT;SOR=0.157;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=7;WE=40544501;WS=40544483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr15	40544520	rs55974545	G	C	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=220;ReadPosRankSum=0.697;SC=TCCGCGAGGCGGCCACTGGGC;SOR=0.542;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=13;WE=40544528;WS=40544510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr15	40544617	rs55863440	G	A	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.32;ReadPosRankSum=-1.057;SOR=0.785;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,20:0.21:95
chr15	40545438	rs11636097	A	G	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=370;ReadPosRankSum=0.989;SC=CGCCTAAGAGAGAGGCCCAGT;SOR=0.727;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=83;TCF=19;TCR=64;TR=22;WE=40545446;WS=40545428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,23:0.27:86
chr15	40556685	rs7162809	A	G	5962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=90;PP=2965;SC=ATTTTATAAAAACACACCCCC;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=89;TCR=91;TR=178;WE=40556693;WS=40556675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr15	40556713	rs12902461	T	C	5545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=98;PP=2965;SC=GCCTGCTCCATAGGGGACTTG;SOR=1.219;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=65;TCR=98;TR=163;WE=40556721;WS=40556703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr15	40558744	rs748556	G	A	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=28;PP=594;ReadPosRankSum=0.291;SC=AGTGGGTGTAGGGACACAGGC;SOR=0.723;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=106;TCF=12;TCR=94;TR=32;WE=40558752;WS=40558734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,30:0.28:106
chr15	40565055	rs2253603	G	A	6176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=88;PP=2965;SC=TCAGGCCCCCGCCTGCCCCCA;SOR=0.861;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=199;TCF=110;TCR=89;TR=198;WE=40565063;WS=40565045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr15	40573716	rs4924446	A	G	2121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=11;PP=1810;SC=ACCGAGACAGACAGAGCGTTG;SOR=3.021;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=53;TCR=11;TR=64;WE=40573724;WS=40573706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr15	40582128	.	AAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG	AAGAGAGAG,A	1641.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.16;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;NF=28,28;NR=0,0;PP=850,709;SC=CCTACTTGTGAAGAGAGAGAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=57;TCR=3;TR=28,28;WE=40582155;WS=40582118;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:40
chr15	40582163	rs62021885	A	T	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=8.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.33;MQRankSum=-3.329;QD=4.85;ReadPosRankSum=3.158;SOR=2.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr15	40582165	rs62021886	A	T	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=8.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.41;MQRankSum=-3.259;QD=4.53;ReadPosRankSum=3.243;SOR=2.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr15	40582167	rs62021887	A	T	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.66;MQRankSum=-1.415;QD=31.74;ReadPosRankSum=2.369;SOR=4.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,22:0.92:24
chr15	40582167	.	AGA	TGT	564	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MMLQ=28;MQ=50.67;NF=31;NR=7;PP=564;QD=16.2491546016;SC=AGAGAGAGAGAGAGTGTGTGT;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=104;TCF=89;TCR=15;TR=38;WE=40582177;WS=40582153;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:66,38:0.37:104
chr15	40582169	rs8036867	A	T	3261.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.44;MQRankSum=-1.415;QD=38.37;ReadPosRankSum=2.377;SOR=4.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,83:0.98:85
chr15	40582713	rs34370826	TAG	T	554.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.153;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.033;NF=15;NR=0;PP=586;ReadPosRankSum=-0.376;SC=GATCCATTTGTAGAGAGGCCC;SOR=1.814;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=15;WE=40582722;WS=40582703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr15	40583093	rs2412506	A	G	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=15;PP=383;SC=CAGAGGGAGTACGGGGGGCGG;SOR=2.712;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=40583101;WS=40583083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	40583458	rs936209	A	G	1897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=24;PP=1495;SC=CACCGCCACGAGCCTTACCTC;SOR=0.986;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=32;TCR=24;TR=56;WE=40583466;WS=40583448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	40583876	rs9972418	T	G	4738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=80;PP=2965;SC=GGCTGGGCTGTCAGGTGCTCT;SOR=1.006;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=60;TCR=80;TR=140;WE=40583884;WS=40583866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr15	40589002	rs2229691	A	G	4082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=118;PP=2962;ReadPosRankSum=0.926;SC=CCTCCCCACCAGTATCCTTAC;SOR=0.672;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=243;TCF=56;TCR=187;TR=153;WE=40589010;WS=40588992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,156:0.63:247
chr15	40589830	rs2305649	G	A	4006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=90;PP=2965;SC=AAGCGGGGATGGGGTTCAGCC;SOR=2.100;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=32;TCR=91;TR=122;WE=40589838;WS=40589820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr15	40590134	rs2229690	G	A	4937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=62;PP=2965;SC=TCTTAAAGGCGCTTTCTGCAA;SOR=1.158;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=95;TCR=63;TR=157;WE=40590142;WS=40590124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr15	40590265	rs2305648	C	G	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.601;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=894;ReadPosRankSum=1.354;SC=CATATAACTGCATGGCCGCCA;SOR=1.180;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=135;TCF=55;TCR=80;TR=46;WE=40590273;WS=40590255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,46:0.34:137
chr15	40591255	rs72731486	G	A	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.608;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=11;PP=596;ReadPosRankSum=0.171;SC=CCTGACTCCCGGCATGGCAGG;SOR=0.336;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=91;TCF=66;TCR=25;TR=33;WE=40591263;WS=40591245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,34:0.38:89
chr15	40593939	rs2305647	C	T	1044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.776;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=34;PP=807;ReadPosRankSum=0.070;SC=GTAGGGGATACAGACAAACCT;SOR=3.311;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=58;TCF=6;TCR=52;TR=35;WE=40593947;WS=40593929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,37:0.64:58
chr15	40594845	rs72731487	G	A	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.245;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=241;ReadPosRankSum=0.677;SC=GGATGGAGGTGTGCTCCCTCC;SOR=0.434;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=62;TCF=15;TCR=47;TR=17;WE=40594853;WS=40594835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,18:0.27:66
chr15	40595414	rs1869902	G	C	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=4.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.857;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=589;ReadPosRankSum=-0.972;SC=CTTCCCACCCGCACAGGGACC;SOR=1.302;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=23;WE=40595422;WS=40595404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr15	40595627	rs1869901	G	A	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=710;ReadPosRankSum=-1.181;SC=GGTCAAGAATGAGCAATAGGG;SOR=0.796;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=33;WE=40595635;WS=40595617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,35:0.59:59
chr15	40630073	rs78494549	G	A	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.927;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=462;ReadPosRankSum=0.154;SC=CCCACCGGCCGGCTCCAGGGC;SOR=0.504;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=73;TCF=42;TCR=31;TR=28;WE=40630081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,29:0.40:72
chr15	40632302	rs12440659	G	C	4532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=90;PP=2965;SC=ACCCAAGGAAGAGATCCCAGA;SOR=1.543;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=49;TCR=90;TR=139;WE=40632310;WS=40632292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr15	40645311	rs369426346	GGTGT	G	244.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.586;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.908;NF=6;NR=0;PP=216;ReadPosRankSum=0.723;SC=TCCTTTGAAGGGTGTGTGTGT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=6;WE=40645322;WS=40645301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr15	40645345	rs61508200	T	C	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.18;MQRankSum=1.941;QD=32.87;ReadPosRankSum=0.113;SOR=0.264;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr15	40645345	.	TGT	CGC	80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=10;MMLQ=24;MQ=59.23;NF=7;NR=1;PP=80;QD=16.6834843578;SC=TGTGTGTGTGTGTGCGCGCGC;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=8;WE=40645355;WS=40645335;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,8:0.47:17
chr15	40645347	rs11853293	T	C	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=5.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQRankSum=2.183;QD=26.61;ReadPosRankSum=-0.224;SOR=0.111;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr15	40646520	rs71132169	CT	C	3689.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=80;PP=2536;SC=AAAGCTGCTTCTTTTTTTTCC;SOR=1.138;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=135;TCF=35;TCR=100;TR=111;WE=40646528;WS=40646510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr15	40648372	rs12900982	T	C	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=50.050;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.181;NF=0;NR=33;PP=637;ReadPosRankSum=-0.900;SC=CCCACCATGGTCCAGGGCCCT;SOR=6.084;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=105;TCF=33;TCR=72;TR=33;WE=40648380;WS=40648362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,26:0.27:95
chr15	40650684	.	A	AGACCCTCCCC	1321.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.471;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=3.634;NF=10;NR=12;PP=2737;ReadPosRankSum=-0.468;SC=AGACCCTCCCAGACCCTCCCC;SOR=0.522;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=81;TCF=22;TCR=59;TR=22;WE=40650692;WS=40650674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,35:0.43:81
chr15	40655845	rs1898883	C	G	5418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=60;PP=2965;SC=CAAGGCTGTGCCCCCTGAGGC;SOR=1.270;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=98;TCR=60;TR=157;WE=40655853;WS=40655835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr15	40655873	rs1898882	G	C	5599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=87;NR=79;PP=2965;SC=GAGAGAAGCTGCTCCCTCCAC;SOR=0.787;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=167;TCF=87;TCR=80;TR=166;WE=40655881;WS=40655863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr15	40659476	rs35043215	G	A	1893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.623;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=41;PP=1551;ReadPosRankSum=-1.047;SC=CTGGGACCTGGGCAGAACAAG;SOR=0.901;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=105;TCF=43;TCR=62;TR=66;WE=40659484;WS=40659466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,67:0.63:107
chr15	40660192	rs8040755	C	T	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.250;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=361;ReadPosRankSum=0.155;SC=CACGGCTGTGCTGGTGCACCT;SOR=0.407;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=74;TCF=16;TCR=58;TR=21;WE=40660200;WS=40660182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,21:0.28:74
chr15	40662773	rs3803358	C	T	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.566;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=291;ReadPosRankSum=-0.708;SC=TGTCTGCTCCCACAGCACCAT;SOR=1.179;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=69;TCF=49;TCR=20;TR=17;WE=40662781;WS=40662763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,18:0.26:70
chr15	40675155	rs7164132	C	A	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=104;ReadPosRankSum=-0.736;SC=GAAACCCAGGCGGCCGACTTA;SOR=0.495;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=6;WE=40675163;WS=40675145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr15	40675329	rs7164321	A	G	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=190;ReadPosRankSum=0.891;SC=CTCTTTTCCAACCCCGAGCCG;SOR=0.666;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=46;TCR=3;TR=12;WE=40675337;WS=40675319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,11:0.22:49
chr15	40675443	rs7169404	G	T	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.86;ReadPosRankSum=-0.226;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,32:0.25:128
chr15	40675493	rs7169262	C	T	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.860;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=456;ReadPosRankSum=2.200;SC=CCTGCAGCCCCCCTCTGCGCT;SOR=1.340;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=93;TCF=27;TCR=66;TR=28;WE=40675501;WS=40675483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,28:0.30:94
chr15	40676574	rs143882095	CA	C	101.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=2.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQRankSum=-0.355;QD=4.84;ReadPosRankSum=0.702;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr15	40681854	rs78604110	C	G	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.333;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=214;ReadPosRankSum=0.338;SC=TGCCACTGGGCGATCCACATG;SOR=0.260;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=65;TCF=11;TCR=54;TR=16;WE=40681862;WS=40681844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,18:0.26:68
chr15	40683702	rs11541642	A	G	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.106;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=199;ReadPosRankSum=-0.875;SC=AGCTTTAGGCAGTGAGACCCT;SOR=0.890;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=70;TCF=47;TCR=23;TR=18;WE=40683710;WS=40683692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,18:0.25:72
chr15	40683780	rs2289332	G	A	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.324;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=9;PP=373;ReadPosRankSum=0.210;SC=GTGAAAGGGCGCAAGGGCTGA;SOR=1.460;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=89;TCF=50;TCR=39;TR=28;WE=40683788;WS=40683770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,29:0.31:95
chr15	40684387	rs10681422	G	GTTT	72.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.611;NF=0;NR=4;PP=52;ReadPosRankSum=-0.439;SC=ATAGTAACGTGTTTTTTTTTT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=4;WE=40684395;WS=40684377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr15	40698197	rs373206450	GCCCCAAGGCCTCCTTCCTGCCTGGT	G	149.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=6.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.98;ReadPosRankSum=-1.462;SOR=0.069;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr15	40699940	rs2289331	T	C	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=41;PP=1321;SC=AGTTGGGAGGTCCGGGCAGTC;SOR=3.171;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=8;TCR=41;TR=49;WE=40699948;WS=40699930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	40700006	rs3214685	G	GTT	1101.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=17;PP=1204;SC=AGCTCACACAGTTCTGGTAAA;SOR=1.445;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=27;TCF=8;TCR=19;TR=25;WE=40700014;WS=40699996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	40700022	rs10518693	C	T	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.099;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;ReadPosRankSum=0.846;SC=GTAAATGAAGCCTCTCTAAGA;SOR=1.219;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=18;WE=40700030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr15	40703108	.	G	A	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.84;ReadPosRankSum=1.160;SOR=0.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr15	40703114	rs8033938	A	G	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=2.189;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.96;ReadPosRankSum=-0.150;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr15	40703339	rs8034416	C	T	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=400;SC=ACTTTACCGACACCCTGGTCT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=40703347;WS=40703329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	40703609	rs4924466	A	G	2077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=26;PP=1726;SC=CATTATCAGGATAATGGAGCA;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=37;TCR=26;TR=63;WE=40703617;WS=40703599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	40705105	rs2289330	A	G	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=10;PP=737;SC=TAGGAAGGTGAGTGCCTTCTT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=30;WE=40705113;WS=40705095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	40705159	rs2289329	T	C	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.012;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=656;ReadPosRankSum=0.399;SC=GGCTAATCTGTAACCAGGACC;SOR=1.034;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=40;TCF=22;TCR=18;TR=28;WE=40705167;WS=40705149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,28:0.70:40
chr15	40708422	rs11070270	A	G	2361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=55;PP=1937;SC=GGGGCAGTGGACCAGCTGCTG;SOR=2.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=14;TCR=55;TR=69;WE=40708430;WS=40708412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	40711270	rs2075625	C	G	4104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=10;PP=2965;SC=AGGAGGCGGACGTTGCAGTGA;SOR=4.633;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=110;TCR=10;TR=119;WE=40711278;WS=40711260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr15	40712737	rs11790	T	C	1476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=36;PP=1252;SC=GTCCTATTCCTGTCCTCCAGC;SOR=1.747;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=19;TCR=36;TR=55;WE=40712745;WS=40712727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr15	40716253	rs2304645	G	C	1529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=6;PP=1252;SC=CCACCACCCAGCCACTCTCAG;SOR=3.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=42;TCR=6;TR=48;WE=40716261;WS=40716243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
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chr15	40751555	rs3803357	C	A	8464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=120;NR=133;PP=2965;SC=GCCATCTCATCAGCCCCTGAG;SOR=0.807;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=253;TCF=120;TCR=133;TR=253;WE=40751563;WS=40751545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr15	40758337	rs3743145	A	C	2289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=67;PP=1833;ReadPosRankSum=-0.151;SC=TAGCCTCCTCATGCCCATGCT;SOR=0.665;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=109;TCF=11;TCR=98;TR=75;WE=40758345;WS=40758327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,77:0.69:111
chr15	40820805	rs7164166	A	G	259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=205;SC=AGGGGAAGACACCAGGTCTGG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=40820813;WS=40820800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	40824710	rs8029208	T	C	369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=342;SC=TTCACAGCTGTTCACCATGAG;SOR=4.977;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=40824718;WS=40824700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	40827030	rs12916323	C	G	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=628;ReadPosRankSum=0.195;SC=ATTAGTGTTTCAACATGTATA;SOR=0.580;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=116;TCF=98;TCR=18;TR=34;WE=40827038;WS=40827020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,37:0.32:115
chr15	40849680	rs8029384	C	G	262.31	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=208;ReadPosRankSum=1.789;SC=ATGAGGACATCCACACTCCCT;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=10;WE=40849688;WS=40849670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr15	40855210	rs10152546	T	A	1984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.359;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=65;PP=1667;ReadPosRankSum=0.689;SC=CTCAAACATTTTCATTTGGAA;SOR=1.902;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=122;TCF=27;TCR=95;TR=78;WE=40855218;WS=40855200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,75:0.61:122
chr15	40856989	rs3803354	C	T	8175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=190;PP=2965;ReadPosRankSum=0.139;SC=TGGCCCCTTACCCCAGGGCAG;SOR=0.639;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=255;TCF=63;TCR=192;TR=252;WE=40856997;WS=40856979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,259:0.99:261
chr15	40862064	rs1058734	C	T	2358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=46;PP=1874;ReadPosRankSum=0.221;SC=AGCCCCTGGCCTACTATGAGG;SOR=0.758;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=53;TCR=76;TR=79;WE=40862072;WS=40862054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,83:0.62:134
chr15	40862191	rs141235042	G	GGTTTTGTTTTGTTTTGTTTT	336.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQRankSum=-3.729;QD=5.52;ReadPosRankSum=1.324;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,11:0.18:61
chr15	40898643	rs7177192	G	C	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=15;PP=697;SC=GGGAATGAAAGAGTTCAGGTA;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=13;TCR=15;TR=28;WE=40898651;WS=40898633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	40903684	rs12911738	A	G	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=14;PP=580;SC=AGAAACAGAAACAGGAGAAAA;SOR=0.922;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=11;TCR=14;TR=25;WE=40903692;WS=40903674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	40903814	rs12912058	C	A	112.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=117;SC=TTCAGAAAACCAGTTATTTGC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=40903822;WS=40903804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	40907698	rs11427985	T	TG	224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=192;SC=CCAGGCACGGTGCTCACGCCT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=40907706;WS=40907688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	40913840	rs2412541	G	T	2934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=55;PP=2259;SC=CAGTAATTATGCTAAAATGTA;SOR=1.508;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=29;TCR=55;TR=84;WE=40913848;WS=40913830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr15	40914177	rs11858113	T	C	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.514;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=688;ReadPosRankSum=-0.085;SC=GGTGAAAATATGGATTTGACT;SOR=0.519;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=118;TCF=64;TCR=54;TR=44;WE=40914185;WS=40914167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,45:0.38:120
chr15	40914772	rs11855334	C	T	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.210;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=41;PP=917;ReadPosRankSum=0.503;SC=GCCACACTGTCGTCATTGGAT;SOR=0.789;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=216;TCF=77;TCR=139;TR=62;WE=40914780;WS=40914762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,62:0.28:219
chr15	40915045	rs8041534	T	G	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.519;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=730;ReadPosRankSum=-0.003;SC=TTGATAAGACTATTGTATTTT;SOR=0.714;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=116;TCF=60;TCR=56;TR=44;WE=40915053;WS=40915035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,44:0.38:117
chr15	40915190	rs8040502	A	G	5360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=91;NR=67;PP=2965;SC=ATATACATGTAGGCAGGATGA;SOR=1.066;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=91;TCR=67;TR=158;WE=40915198;WS=40915180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr15	40915894	rs11070285	T	C	2366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.663;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=60;PP=1635;ReadPosRankSum=1.539;SC=TCCTGCCAAATGAAATAGCTA;SOR=0.526;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=339;TCF=178;TCR=161;TR=119;WE=40915902;WS=40915884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:227,120:0.35:347
chr15	40916237	rs17747633	A	G	5638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.448;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=90;PP=2962;ReadPosRankSum=0.644;SC=GGTCATAGGGAAAGTTGTAGA;SOR=0.732;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=285;TCF=149;TCR=136;TR=192;WE=40916245;WS=40916227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,200:0.67:297
chr15	40937727	rs6492959	C	T	2543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=1;PP=2073;SC=TAGACAATTACATGGAATTAA;SOR=7.302;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=74;TCF=73;TCR=1;TR=74;WE=40937735;WS=40937717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr15	40939448	rs8041095	G	A	288.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=7;PP=208;SC=CAAGCCGGGCGGATCACCTGA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=40939456;WS=40939438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	40942715	rs34904135	GT	G	119.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=1.509;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.99;ReadPosRankSum=-1.249;SOR=0.654;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr15	40947023	rs10444817	C	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.658;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=154;ReadPosRankSum=-1.294;SC=GCCAAGACTGCGCCATTGCAC;SOR=0.081;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=12;WE=40947031;WS=40947013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr15	40949526	rs2412544	C	T	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.131;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=241;ReadPosRankSum=-1.193;SC=CATAATTTCACTGGATTTTTT;SOR=0.922;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=49;TCF=26;TCR=23;TR=16;WE=40949534;WS=40949516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,17:0.33:51
chr15	40998305	rs45592734	T	A	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=277;ReadPosRankSum=0.259;SC=TTATATATATTTTTTTGCCAT;SOR=0.631;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=14;WE=40998313;WS=40998295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr15	41030579	rs34355108	C	CA	284.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=194;ReadPosRankSum=0.950;SC=GACTCTGTCTCAAAAAAAAAG;SOR=0.554;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=54;TCF=47;TCR=7;TR=16;WE=41030587;WS=41030569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,17:0.33:51
chr15	41030865	rs2304582	C	G	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.340;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=438;ReadPosRankSum=-0.259;SC=TGCATTGTCCCCTATCCCTGT;SOR=1.926;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=20;WE=41030873;WS=41030855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr15	41036448	rs4923884	G	A	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.712;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=505;ReadPosRankSum=-0.594;SC=TTCCAAGCTAGTATGTTACAG;SOR=1.947;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=78;TCF=9;TCR=69;TR=25;WE=41036456;WS=41036438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,25:0.30:84
chr15	41046883	rs11558807	C	A	1043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.682;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=28;PP=804;ReadPosRankSum=-0.464;SC=GTTTCCATCGCTGGCTGTAAA;SOR=0.456;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=106;TCF=36;TCR=70;TR=45;WE=41046891;WS=41046873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,44:0.42:106
chr15	41047024	rs7169010	G	A	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=124;ReadPosRankSum=0.702;SC=GCAGGCAGGCGGGCGGGCGGG;SOR=1.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=8;WE=41047032;WS=41047014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr15	41062837	.	C	T	1986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.000;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.706;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=33;PP=1485;ReadPosRankSum=0.647;SC=AGTACAGCAACCGAGAAGTCA;SOR=0.775;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=67;TCR=50;TR=76;WE=41062845;WS=41062827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,75:0.63:119
chr15	41063244	rs1866170	C	T	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=152;ReadPosRankSum=0.393;SC=TGGGCAAAGCCGGGGTGACTG;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=9;WE=41063252;WS=41063234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr15	41065873	.	A	C	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.806;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.178;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=500;ReadPosRankSum=2.077;SC=GAGCCCAGGTAGGAAGAGCTC;SOR=0.414;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=25;WE=41065881;WS=41065863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr15	41065890	rs2289219	C	T	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=520;ReadPosRankSum=1.659;SC=GCTCCGAGACCTGAGCGCCCA;SOR=0.776;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=26;WE=41065898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,28:0.42:67
chr15	41099899	rs142730574	T	TGGGGC	366.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=1.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=2.405;QD=8.94;ReadPosRankSum=0.898;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,11:0.27:41
chr15	41101124	rs3743033	C	G	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=92;ReadPosRankSum=-0.586;SC=CTTCATTTGGCTTGAATAAGG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=6;WE=41101132;WS=41101114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr15	41101145	rs3743034	C	T	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=236;ReadPosRankSum=-0.418;SC=TACTGGAAACCGAGGAATTGC;SOR=0.324;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=12;WE=41101153;WS=41101135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr15	41104817	rs35853942	A	G	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=4.672;NF=13;NR=2;PP=454;ReadPosRankSum=-0.263;SC=AGAAAAGAAAAGGTTGAGAAA;SOR=0.383;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=62;TCF=55;TCR=7;TR=15;WE=41104825;WS=41104807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,15:0.25:60
chr15	41104874	rs17657877	G	C	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.249;NF=16;NR=7;PP=355;ReadPosRankSum=0.749;SC=TCTCGGCCTTGCTGATGGCAT;SOR=0.749;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=86;TCF=58;TCR=28;TR=23;WE=41104882;WS=41104864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,26:0.29:90
chr15	41105658	rs3736286	G	A	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.908;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=333;ReadPosRankSum=-1.394;SC=TCCCGTCTCCGCCTCATTGCC;SOR=0.574;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=79;TCF=30;TCR=49;TR=23;WE=41105666;WS=41105648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,25:0.30:84
chr15	41105926	rs690347	T	G	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.583;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=481;ReadPosRankSum=0.490;SC=TGAAGAAGCTTCCCTGGATGA;SOR=1.283;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=94;TCF=72;TCR=22;TR=27;WE=41105934;WS=41105916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,30:0.31:98
chr15	41146581	rs3736287	T	C	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.572;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=268;ReadPosRankSum=-0.680;SC=CTGACCTCCCTTCCACCCGTC;SOR=0.160;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=15;WE=41146589;WS=41146571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,16:0.40:40
chr15	41146880	rs8028552	T	C	1927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.583;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=50;PP=1405;ReadPosRankSum=0.167;SC=ATTTCCCCAGTGACAAAGGTG;SOR=0.481;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=120;TCF=45;TCR=75;TR=82;WE=41146888;WS=41146870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,81:0.68:120
chr15	41148199	rs659232	C	T	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.59;ReadPosRankSum=1.701;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:159,52:0.25:211
chr15	41149161	rs690458	G	C	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=346;ReadPosRankSum=-0.035;SC=ACCACACCACGCGGCCCCTCT;SOR=0.641;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=67;TCF=15;TCR=52;TR=20;WE=41149169;WS=41149151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,22:0.31:70
chr15	41165739	rs1814692	A	C	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.527;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=889;ReadPosRankSum=1.135;SC=TAGCCCCCCGACACATGGAAT;SOR=0.363;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=138;TCF=57;TCR=81;TR=49;WE=41165747;WS=41165729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,48:0.34:141
chr15	41193274	rs9806730	T	C	1607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=42;PP=1275;SC=GCTTTAGATGTGGAAGGGCTT;SOR=2.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=55;WE=41193282;WS=41193264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	41193316	rs9806683	C	T	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=31;PP=925;SC=GCTGGCTTCCCTTGCAGAGAG;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=41193324;WS=41193306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	41224280	rs3212279	G	T	1975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=2;PP=1654;SC=GCCCAGGAGAGCTAGGGGATC;SOR=5.960;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=58;TCF=56;TCR=2;TR=58;WE=41224288;WS=41224270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	41245676	rs11557249	G	A	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-3.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.618;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=426;ReadPosRankSum=0.301;SC=CTCAGCTGGAGCTACCGAGCG;SOR=0.374;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=19;WE=41245684;WS=41245666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr15	41246237	rs3033592	A	ATC	222.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=2;PP=249;SC=GACCACTGACATGTCAGTGTT;SOR=1.329;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=6;WE=41246245;WS=41246227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	41247629	rs147487857	A	G	2438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.266;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=30;PP=1774;ReadPosRankSum=0.702;SC=AAGGCCCTGAAGTACCTGAAT;SOR=0.540;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=290;TCF=208;TCR=82;TR=95;WE=41247637;WS=41247619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,103:0.34:305
chr15	41272675	rs61731592	G	A	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=58;ReadPosRankSum=0.180;SC=GTAAGCACCAGTCCCGCGTAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=4;WE=41272683;WS=41272665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr15	41276158	rs11855248	G	A	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.851;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=157;ReadPosRankSum=0.061;SC=GACCCCCTGTGCTCACCGCCC;SOR=1.445;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=10;WE=41276166;WS=41276148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr15	41297711	.	T	TA	69.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.628;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.42;MQRankSum=1.230;QD=3.49;ReadPosRankSum=1.111;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr15	41313064	rs3214068	C	G	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.462;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=387;ReadPosRankSum=-1.308;SC=CTTGCCAAAGCGAGGAACACA;SOR=0.201;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=18;WE=41313072;WS=41313054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr15	41315591	rs72527311	A	AAT	3163.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=60;PP=2930;SC=TTTAAAAAGTAAGTCTAGACT;SOR=4.863;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=70;TCF=3;TCR=67;TR=61;WE=41315599;WS=41315581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	41339481	rs11070320	C	T	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=1;PP=600;SC=TTATTCTTAACAAAAGAAAAT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=41339489;WS=41339471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	41346092	rs2899010	T	C	1535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=2;PP=1270;SC=TTGGTGCCTATTGAGGCTTAA;SOR=5.464;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=43;TCR=2;TR=45;WE=41346100;WS=41346082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	41347658	rs2306083	G	A	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.28;ReadPosRankSum=0.105;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr15	41350768	rs67053863	CGT	C	116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=8.34;ReadPosRankSum=0.231;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr15	41371789	rs377689884	C	A	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQRankSum=-3.460;QD=5.41;ReadPosRankSum=-0.188;SOR=0.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr15	41373029	rs1983400	T	C	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=41;ReadPosRankSum=0.076;SC=CCAGCCTGGGTGGCTGAGACT;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=4;WE=41373037;WS=41373019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr15	41476101	rs521088	T	C	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=5;PP=1026;SC=AAGCCATCTGTATGGCCTTAA;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=41476109;WS=41476091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	41476209	rs522063	T	C	1932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.762;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=24;PP=1526;ReadPosRankSum=0.803;SC=GAAACCACAGTCTTTCTGATA;SOR=1.096;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=111;TCF=71;TCR=40;TR=71;WE=41476217;WS=41476199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,72:0.64:113
chr15	41476465	rs690733	G	A	1571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.563;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=33;PP=1230;ReadPosRankSum=1.016;SC=AATCCTCACTGGTTTCCCCTT;SOR=0.623;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=181;TCF=88;TCR=93;TR=65;WE=41476473;WS=41476455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,66:0.35:186
chr15	41476875	.	T	C	116	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=49.98;NF=0;NR=9;PP=116;QD=16.7523569497;SC=TTTTTTGAGATGGAGTCTCGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=9;WE=41476883;WS=41476865;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,9:0.50:18
chr15	41483631	rs11371504	T	TA	4556.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=3;PP=2965;SC=GGACATCCTTTACACCCACCT;SOR=6.337;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=98;TCF=93;TCR=5;TR=89;WE=41483644;WS=41483621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr15	41483636	rs2412609	C	T	4700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=95;NR=5;PP=2965;SC=TCCTTTACACCCACCTGAATT;SOR=5.709;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=96;TCR=5;TR=100;WE=41483644;WS=41483621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr15	41487934	rs28382348	G	C	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.777;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=491;ReadPosRankSum=0.478;SC=TACAGGAGCTGTATATACTGG;SOR=0.199;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=77;TCF=71;TCR=6;TR=28;WE=41487942;WS=41487924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,30:0.38:78
chr15	41488037	.	C	T	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.372;ClippingRankSum=0.000;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.278;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=35;PP=962;ReadPosRankSum=-1.923;SC=AGAAAGCCAACGACAATCATG;SOR=0.956;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=201;TCF=101;TCR=100;TR=60;WE=41488045;WS=41488027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,60:0.29:206
chr15	41509288	rs7173086	T	A	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=4;PP=562;ReadPosRankSum=-0.529;SC=AAATTATTCCTTCTTACCTAA;SOR=0.555;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=63;TCR=9;TR=31;WE=41509296;WS=41509278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,31:0.42:74
chr15	41555249	rs7175912	T	C	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=135;ReadPosRankSum=0.940;SC=CCTTTTTTGGTCGTGTGACTT;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=41555257;WS=41555239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr15	41570909	rs11630656	T	G	5566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=63;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.737;SC=TTAATCTTAGTAAAGAGTCCC;SOR=0.512;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=106;TCR=63;TR=168;WE=41570917;WS=41570899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,172:0.99:173
chr15	41605632	rs8032838	G	A	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=13;PP=371;SC=TCTAAAGAAAGTATGTGTCAA;SOR=4.174;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=14;WE=41605640;WS=41605622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	41605653	rs8032846	G	C	289.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=8;PP=240;SC=AAAAAGCCTGGCTTCTTAATG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=41605661;WS=41605643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	41624397	rs28492932	G	C	5427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=59;PP=2965;ReadPosRankSum=1.520;SC=ACACCCTCTCGGGCTAGCCTC;SOR=1.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=179;TCF=118;TCR=61;TR=176;WE=41624405;WS=41624387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,182:0.99:184
chr15	41634587	rs7178634	AC	GA	2471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=22;PP=2215;SC=CTTGCAGGCAACCAAGTTGTT;SOR=1.009;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=50;TCF=27;TCR=23;TR=44;WE=41634596;WS=41634577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	41663896	rs13379756	A	C	2791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.09;SOR=3.083;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr15	41672384	rs7168431	A	G	5165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=115;PP=2965;SC=CTGAAGATTAATAATTTTTTA;SOR=1.768;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=51;TCR=115;TR=166;WE=41672392;WS=41672374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr15	41672441	rs11376196	A	AT	940.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.392;NF=0;NR=43;PP=541;ReadPosRankSum=1.416;SC=CCTTTTGTAAATTTTTTTTTT;SOR=3.958;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=74;TCF=1;TCR=73;TR=43;WE=41672449;WS=41672431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,42:0.89:47
chr15	41689166	rs3204853	C	A	4258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=71;PP=2965;SC=CTCTGCAAAGCGAATACCCAA;SOR=0.801;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=58;TCR=71;TR=129;WE=41689174;WS=41689156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr15	41689232	rs1899	C	T	3319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=74;PP=2794;SC=ATAAGTACCACGCAGCAATTT;SOR=2.004;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=27;TCR=74;TR=101;WE=41689240;WS=41689222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr15	41750096	rs11313160	TC	T	503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=15;PP=286;SC=CTCGTCGTTGTCCCCCCCCCG;SOR=3.500;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=15;WE=41750104;WS=41750086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	41766966	rs167581	G	A	888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=26;PP=706;SC=GGGGGCTGCTGTTCTCTCTGT;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=41766974;WS=41766956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	41772693	rs316607	G	A	1111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=6;PP=921;SC=CAGGGCCACAGTCAGGAGGCT;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=41772701;WS=41772683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	41785690	rs41277684	G	A	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.920;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=26;PP=749;ReadPosRankSum=-0.996;SC=CCCGAGGAACGGGGTAGGGGA;SOR=1.302;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=144;TCF=68;TCR=76;TR=43;WE=41785698;WS=41785680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,46:0.30:151
chr15	41794454	rs1757457	C	T	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=577;ReadPosRankSum=-0.555;SC=CGCTGTCTTTCCCGATCCCCC;SOR=0.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=22;WE=41794462;WS=41794444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr15	41795900	rs316617	T	C	2097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=49;PP=1515;SC=AGATGAAGGATGCTCATAATG;SOR=2.062;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=17;TCR=49;TR=66;WE=41795908;WS=41795890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	41796498	rs316618	T	A	1819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=28;PP=1392;ReadPosRankSum=1.127;SC=CCCTCCCTCCTGACCCACAAG;SOR=0.685;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=62;TCR=44;TR=68;WE=41796506;WS=41796488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,70:0.64:109
chr15	41796901	rs170296	G	T	6320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=106;PP=2965;SC=CACATGAGGTGGCTGGAAAGG;SOR=0.890;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=91;TCR=106;TR=197;WE=41796909;WS=41796891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr15	41798142	rs35932273	C	T	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=4.657;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.508;SOR=0.365;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,39:0.25:155
chr15	41799079	rs316622	C	T	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.015;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=507;ReadPosRankSum=-0.008;SC=TGAGCCACCACGCCCAGCTGA;SOR=0.531;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=26;WE=41799087;WS=41799069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,26:0.43:61
chr15	41803914	rs2254078	A	G	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=67;ReadPosRankSum=-0.058;SC=AGCCCAGCGCAGGGATAGGGG;SOR=0.307;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=6;WE=41803922;WS=41803904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr15	41805115	rs2253936	G	A	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.813;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=592;ReadPosRankSum=0.774;SC=TCGAGCCCCTGGCTGGGCCAG;SOR=0.551;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=99;TCF=66;TCR=33;TR=32;WE=41805123;WS=41805105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,36:0.34:106
chr15	41810439	rs932959	G	C	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=187;ReadPosRankSum=0.829;SC=ACATACATAAGGTGTGTGGAT;SOR=0.293;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=12;WE=41810447;WS=41810429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr15	41813279	rs3743031	C	T	3186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.012;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=48;PP=2413;ReadPosRankSum=1.410;SC=ACCGAGGGACCCTGCTGCTTC;SOR=0.517;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=163;TCF=93;TCR=70;TR=108;WE=41813287;WS=41813269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,116:0.66:175
chr15	41814172	rs2289740	G	C	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.460;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=470;ReadPosRankSum=-0.549;SC=CTGAAGGGCAGAGGTCCAGGG;SOR=0.093;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=67;TCF=24;TCR=43;TR=29;WE=41814180;WS=41814162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,30:0.43:70
chr15	41815516	rs8027526	G	C	3160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=57;PP=2724;SC=GACAGGCGCTGCATGTCCTGG;SOR=1.143;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=39;TCR=57;TR=96;WE=41815524;WS=41815506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr15	41815649	rs2297377	A	G	1819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=8;NR=44;PP=1342;SC=ACAGCCCAAAAGAGCACATTT;SOR=3.037;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=8;TCR=44;TR=52;WE=41815657;WS=41815639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr15	41819322	rs2297380	C	T	4745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=68;PP=2965;SC=AAGACAAGGCCCAGCTAGGCT;SOR=0.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=75;TCR=68;TR=143;WE=41819330;WS=41819312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr15	41819998	rs11070334	G	A	1081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=2;PP=933;SC=CCATGCCCAGGAACAGGAATA;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=31;WE=41820006;WS=41819988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	41827243	rs7181115	A	G	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=19;PP=508;SC=ATAGACCCAAACTTTCCTCAG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=41827251;WS=41827233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	41827655	rs2297381	C	T	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=322;SC=AAAAATGACCCTATGATTGTG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=41827663;WS=41827645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	41829230	rs721772	A	G	5121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=105;PP=2965;SC=TTCTTCACCAACTGCACTGCT;SOR=1.521;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=52;TCR=105;TR=157;WE=41829238;WS=41829220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr15	41856543	rs11070339	A	G	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=467;ReadPosRankSum=-0.813;SC=AGTTAGAATCATTCTGTGTTC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=20;WE=41856551;WS=41856533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr15	41860411	rs7171675	G	A	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.838;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.98;ReadPosRankSum=0.301;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
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chr15	41865488	rs2246444	C	T	4378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=82;NR=51;PP=2965;SC=TGACTCTCTCCCTCAATGCCC;SOR=1.381;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=174;TCF=103;TCR=71;TR=133;WE=41865496;WS=41865478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
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chr15	42059521	rs2605570	A	T	1314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.182;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=36;PP=1018;ReadPosRankSum=-0.537;SC=GAGGGGAAATAGATCTCACCT;SOR=0.944;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=63;TCF=15;TCR=48;TR=47;WE=42059529;WS=42059511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,49:0.73:67
chr15	42109223	rs1197689	T	C	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.161;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=14;PP=348;ReadPosRankSum=-0.422;SC=TCACTGCTGTTAAGTTTGCAG;SOR=0.387;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=78;TCF=29;TCR=49;TR=24;WE=42109231;WS=42109213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,23:0.29:78
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chr15	42128553	rs80228953	C	T	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.607;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=583;ReadPosRankSum=0.921;SC=CTGTGGCATCCCCAGTGCACC;SOR=1.687;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=90;TCF=63;TCR=27;TR=31;WE=42128561;WS=42128543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,33:0.36:91
chr15	42128855	rs7166139	T	C	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.380;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=249;ReadPosRankSum=-1.513;SC=CTGAAAAGTCTCTAAGTCTGA;SOR=1.009;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=14;WE=42128863;WS=42128845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,14:0.29:48
chr15	42129168	rs7165230	A	T	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=1.754;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.73;ReadPosRankSum=0.213;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,35:0.38:92
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chr15	42129373	rs11547012	C	G	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=428;ReadPosRankSum=-0.745;SC=TGGTGAACACCACCAAGCACG;SOR=0.488;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=55;TCF=8;TCR=47;TR=23;WE=42129381;WS=42129363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,26:0.45:58
chr15	42131965	rs57498313	A	G	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.973;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=266;ReadPosRankSum=-0.497;SC=AGGTGGAAGCAGGTCTGTGTG;SOR=0.283;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=18;WE=42131973;WS=42131955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
chr15	42132200	rs2077543	C	G	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=435;ReadPosRankSum=-0.725;SC=ATGGAGATATCATGTCTCCTC;SOR=0.735;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=20;WE=42132208;WS=42132190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr15	42133885	rs1648837	TG	CA	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.628;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=1553;ReadPosRankSum=0.640;SC=CTCGGGGGACTGTGGTGGGGG;SOR=0.146;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=50;TCF=8;TCR=42;TR=30;WE=42133894;WS=42133875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,32:0.59:54
chr15	42134097	rs3816533	C	T	1559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.384;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=38;PP=1160;ReadPosRankSum=-1.518;SC=TGGCACCTTCCGCTTCCACTG;SOR=1.316;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=94;TCF=38;TCR=56;TR=59;WE=42134105;WS=42134087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,61:0.62:98
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chr15	42134371	rs1648834	G	C	3210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=46;PP=2540;ReadPosRankSum=-0.629;SC=TCTTAGGTCTGCATTCTTTGT;SOR=0.740;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=104;TCR=73;TR=112;WE=42134379;WS=42134361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,116:0.64:182
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chr15	42134652	rs1672464	G	A	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.008;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=291;ReadPosRankSum=-1.871;SC=CTGTGGAGACGGTGGCGGGGC;SOR=0.105;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=11;WE=42134660;WS=42134642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr15	42134839	rs1672465	T	C	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=362;ReadPosRankSum=0.943;SC=ACAACCAGGGTGCGGGGCTGG;SOR=0.693;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=23;WE=42134847;WS=42134829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr15	42134930	rs1648832	G	T	242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.998;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=168;ReadPosRankSum=0.103;SC=TTGCGCTCGAGGGGGCACGAA;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=8;WE=42134938;WS=42134920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr15	42135988	rs1672466	C	T	1356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.940;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=35;PP=994;ReadPosRankSum=-2.045;SC=TGCAGCTGGACGGAGACCTGC;SOR=0.914;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=79;TCF=26;TCR=53;TR=51;WE=42135996;WS=42135978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,54:0.66:82
chr15	42137036	rs3214841	CT	C	519.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.712;NF=13;NR=5;PP=595;ReadPosRankSum=0.025;SC=TTGGCTTTGGCTTTTCCCAGG;SOR=0.836;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=18;WE=42137044;WS=42137026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr15	42137282	rs1648829	G	A	2440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.671;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=39;PP=1823;ReadPosRankSum=-1.060;SC=CGGGGGCTGCGGCCTGGGGGC;SOR=0.612;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=78;TCR=58;TR=90;WE=42137290;WS=42137272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,94:0.67:140
chr15	42137576	rs1648828	C	T	1412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.79;ReadPosRankSum=-0.519;SOR=1.453;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,37:0.65:57
chr15	42137581	rs1648827	A	C	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.20;ReadPosRankSum=-0.708;SOR=1.562;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,32:0.67:48
chr15	42138321	rs1197670	A	G	2265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.180;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=16;PP=1729;ReadPosRankSum=0.552;SC=GGGGGTTCACACCTCTTCCCC;SOR=0.142;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=135;TCF=116;TCR=19;TR=90;WE=42138329;WS=42138311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,93:0.68:136
chr15	42139038	rs890508	G	A	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.350;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=33;PP=1000;ReadPosRankSum=0.067;SC=TTCCAGGTTGGGAAGGGTGGG;SOR=1.708;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=64;TCF=17;TCR=47;TR=42;WE=42139046;WS=42139028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,41:0.64:64
chr15	42139390	rs3214531	GT	G	326.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.781;NF=13;NR=1;PP=302;ReadPosRankSum=-0.494;SC=GGTGTGGAGAGTTTTTTTCCA;SOR=0.631;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=14;WE=42139398;WS=42139380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr15	42139642	rs883329	C	T	3340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.820;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=55;PP=2544;ReadPosRankSum=1.821;SC=ACACCTTCTCCGACCCCACCT;SOR=0.791;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=174;TCF=89;TCR=85;TR=119;WE=42139650;WS=42139632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,123:0.69:179
chr15	42140644	.	T	C	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=28;ReadPosRankSum=-0.751;SC=TGCCACATGGTAGGACCCATC;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=42140652;WS=42140634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr15	42142038	rs369906389	G	A	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=2.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.25;ReadPosRankSum=-1.108;SOR=1.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,13:0.21:63
chr15	42143145	rs58422701	C	CCA	7891.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.512;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.289;NF=84;NR=78;PP=2970;ReadPosRankSum=1.202;SC=AGCCTGGCACCCACAGTCACA;SOR=0.512;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=240;TCF=127;TCR=113;TR=162;WE=42143153;WS=42143135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,203:0.75:269
chr15	42143533	rs1197665	T	G	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.994;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=449;ReadPosRankSum=0.129;SC=GCCCTGCAAGTTCCCGCGGCA;SOR=0.209;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=83;TCF=15;TCR=68;TR=29;WE=42143541;WS=42143523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,30:0.33:91
chr15	42143597	rs890507	A	G	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.128;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=308;ReadPosRankSum=-2.545;SC=AGGTCGCATGAGCCACACGCA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=15;WE=42143605;WS=42143587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr15	42144970	rs74659979	G	C	2793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.251;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=78;PP=2962;ReadPosRankSum=2.888;SC=CCCAGCTTGGGGGGGGGGGCC;SOR=0.457;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=150;TCF=49;TCR=101;TR=122;WE=42144987;WS=42144959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:12,117:0.91:129
chr15	42147206	rs1648826	T	C	2340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=54;PP=1822;SC=CAGGGTCACTTGAGATGGTAT;SOR=1.759;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=25;TCR=55;TR=79;WE=42147214;WS=42147196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr15	42147639	rs2305655	A	C	1825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.292;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=27;PP=1374;ReadPosRankSum=-1.055;SC=GTGGGAAGAGAGCGACAGTCT;SOR=0.974;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=126;TCF=75;TCR=51;TR=70;WE=42147647;WS=42147629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,73:0.56:131
chr15	42147663	rs1672467	G	C	4293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=57;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.785;SC=CTGCAGCCCTGCCTTTCCAGG;SOR=0.363;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=74;TCR=58;TR=130;WE=42147671;WS=42147653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,135:0.99:136
chr15	42149472	rs1456235	T	C	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.341;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=7;PP=749;ReadPosRankSum=-1.009;SC=TTCCACATCTTGGGCAAGGCA;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=34;WE=42149480;WS=42149462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,38:0.66:58
chr15	42149506	rs12442525	G	C	1401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=1011;ReadPosRankSum=0.016;SC=ACAAAGGCCTGGGCCTGGCCC;SOR=0.696;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=48;TCR=22;TR=45;WE=42149514;WS=42149496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,51:0.66:77
chr15	42153085	rs2278964	C	T	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=140;ReadPosRankSum=0.297;SC=CAAACACATCCCTCACATCCC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=42153093;WS=42153075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr15	42154738	rs16972193	G	A	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.599;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=486;ReadPosRankSum=-1.241;SC=GGTTCATACCGCTTCTGGGCC;SOR=1.674;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=22;WE=42154746;WS=42154728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
chr15	42156321	rs1197657	T	C	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=19;PP=492;SC=CCCCGGAGCATGAGGAACTGC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=42156329;WS=42156311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	42159110	rs3816534	C	T	1789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.877;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=21;PP=1341;ReadPosRankSum=-0.216;SC=TGAAAACTGTCGAGTGTGGTT;SOR=0.527;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=97;TCF=67;TCR=30;TR=65;WE=42159118;WS=42159100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,67:0.68:99
chr15	42159623	rs8032462	T	C	2298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=3;PP=1933;SC=ACCCCAGCCTTGCAGGCTCAT;SOR=5.105;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=64;TCR=3;TR=66;WE=42159631;WS=42159613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr15	42166333	rs58090119	C	A	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.250;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=252;ReadPosRankSum=2.146;SC=CCAATCATGGCAAGACCCCCA;SOR=0.976;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=44;TCF=24;TCR=20;TR=14;WE=42166341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr15	42166475	rs12593435	G	A	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.257;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=30;PP=1100;ReadPosRankSum=-1.600;SC=CCTGTAGGAAGAAGAGGGCTA;SOR=1.045;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=70;TCF=33;TCR=37;TR=49;WE=42166483;WS=42166465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,50:0.70:71
chr15	42166500	rs12593397	C	T	1213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.643;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=27;PP=959;ReadPosRankSum=0.027;SC=CTTGTGCTTGCGGTGAAGGCT;SOR=0.811;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=72;TCF=35;TCR=37;TR=47;WE=42166508;WS=42166490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,47:0.65:72
chr15	42169129	rs55757140	G	A	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=2;PP=95;ReadPosRankSum=1.217;SC=GCAGGCTCAGGGCCTCCCTCA;SOR=1.075;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=6;WE=42169137;WS=42169119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr15	42170499	rs1201690	T	G	1501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.52;SOR=5.031;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	42170499	.	TCCCAGCC	GCCCAGCC,GCCCAGCT	518	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=33,21;NR=1,1;PP=217,518;QD=7.40503566315;SC=AGAGCCCTGGTCCCAGCCCAA;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=34,22;WE=42170514;WS=42170489;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:34
chr15	42170506	rs747780	C	T	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=2.695;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.33;ReadPosRankSum=0.079;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr15	42170578	rs747779	G	A	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.940;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=8;PP=725;ReadPosRankSum=1.524;SC=GCAGGTCTTGGTGCTCCCTCA;SOR=0.565;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=107;TCF=89;TCR=18;TR=40;WE=42170586;WS=42170568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,42:0.38:111
chr15	42170841	rs1197680	T	C	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=276;ReadPosRankSum=-1.030;SC=GGAGACAGGGTGCGCTGCACA;SOR=0.534;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=72;TCF=12;TCR=60;TR=25;WE=42170849;WS=42170831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,24:0.34:70
chr15	42171483	rs1197682	G	A	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=252;ReadPosRankSum=-0.041;SC=TGGAGGAAGTGGACCCTCCTC;SOR=0.848;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=22;TCR=18;TR=15;WE=42171491;WS=42171473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr15	42171537	rs1197683	A	G	1200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=17;PP=944;SC=AGGGCGTGGCAGGTGTCCTCT;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=42;WE=42171545;WS=42171527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	42171877	rs1197685	A	G	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=6;PP=360;SC=AGTCAGGCCCAGGCTGGGCAC;SOR=1.244;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=16;WE=42171885;WS=42171867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	42172166	rs1197686	T	C	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=463;ReadPosRankSum=-1.194;SC=ACAGGGATGCTCATGCTGCCT;SOR=0.713;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=96;TCF=39;TCR=57;TR=28;WE=42172174;WS=42172156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,30:0.30:101
chr15	42175104	rs1197691	G	C	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=392;SC=GAGAAAACTGGCAGGCCAACA;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=42175112;WS=42175102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	42175507	rs1197692	T	C	5408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=73;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.016;SC=GTCCCCCACCTTGCTGTGTTT;SOR=0.983;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=95;TCR=75;TR=167;WE=42175515;WS=42175497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,170:0.99:172
chr15	42178122	rs2280016	T	C	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.679;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=666;ReadPosRankSum=-1.181;SC=CTGCTCTGCATCCTTAAGGAA;SOR=0.766;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=137;TCF=67;TCR=70;TR=42;WE=42178130;WS=42178112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,42:0.31:137
chr15	42178155	rs1210795	T	C	3890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=75;PP=2857;SC=GGCTGCCTTGTGCTGGAAGCG;SOR=1.102;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=53;TCR=75;TR=128;WE=42178163;WS=42178145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr15	42179711	rs55913027	C	T	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=91;ReadPosRankSum=0.819;SC=TTCTTAAATGCACTCATGCTC;SOR=0.693;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=8;WE=42179719;WS=42179701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr15	42185297	rs55835308	G	GCCCAT	1093.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.778;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=3.216;NF=11;NR=17;PP=1354;ReadPosRankSum=-1.257;SC=GGTCAGCCCAGCCTCACCTGT;SOR=1.081;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=101;TCF=41;TCR=60;TR=28;WE=42185305;WS=42185287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,32:0.29:112
chr15	42185439	rs1672459	C	G	2337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=32;PP=1790;SC=AGCTGGGGGCCTGGTATGGGT;SOR=0.914;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=73;WE=42185447;WS=42185429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	42187492	rs1197701	T	C	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=5.162;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.11;ReadPosRankSum=-1.020;SOR=1.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:170,65:0.28:235
chr15	42187661	rs1704380	T	C	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=42;PP=1280;SC=TCCTTTCCCATTCTCCATCAT;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=42;WE=42187669;WS=42187651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	42235173	rs11631075	G	A	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.278;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=5;PP=795;ReadPosRankSum=-1.011;SC=CCTGGAGGACGGATAGAATAA;SOR=1.381;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=49;TCF=40;TCR=9;TR=33;WE=42235181;WS=42235163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,34:0.69:49
chr15	42276176	rs1704348	T	C	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.441;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=58;ReadPosRankSum=-0.831;SC=TCTACACCTGTGGGCAGCAGG;SOR=0.036;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=9;WE=42276184;WS=42276166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr15	42279598	rs28438985	G	A	1668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=47;PP=1392;SC=GGGATGAAGGGCAGGTCATGA;SOR=6.479;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=48;WE=42279606;WS=42279588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	42287578	rs1668586	G	A	2827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=40;PP=2296;SC=CTGATAGACCGGTGATGTAGC;SOR=0.929;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=53;TCR=40;TR=93;WE=42287586;WS=42287568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr15	42289522	rs1704357	C	T	1174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=27;PP=897;SC=GACACAGCTTCAGGGTCCATT;SOR=2.242;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=35;WE=42289530;WS=42289512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	42292532	rs1668557	T	C	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=16;PP=354;SC=ACTACCCACCTGCAACTTGGT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=42292540;WS=42292522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	42297092	rs2598464	G	A	4469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=67;PP=2965;SC=GAAGCTACTTGATGGCCAGGA;SOR=0.707;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=67;TCR=67;TR=134;WE=42297100;WS=42297082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr15	42298133	rs1704366	A	G	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=1;PP=1113;SC=GGAATCAGCAACAGCTATGAG;SOR=5.084;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=36;WE=42298141;WS=42298123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	42302590	rs1668568	A	G	1076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=29;PP=827;SC=AGATAAAGAAATATTCCTGGC;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=29;WE=42302598;WS=42302580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	42305769	rs75965569	GC	AT	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.96;SOR=4.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	42305773	rs62004282	A	G	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.64;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	42305852	rs10625152	A	AGAG	3468.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=22;PP=2934;SC=TCCGGTAAGCAGAGAAGGAGA;SOR=1.704;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=64;TCF=41;TCR=23;TR=59;WE=42305860;WS=42305842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr15	42305998	rs1668565	T	C	2701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=52;PP=1758;SC=CAAGCATTACTCCAAGGCCAT;SOR=3.293;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=11;TCR=52;TR=63;WE=42306006;WS=42305988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr15	42306015	rs1668564	G	A	2193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=40;PP=1211;SC=CCATTGCCCCGGGGGAGACTT;SOR=3.657;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=47;WE=42306023;WS=42306005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	42311454	rs2724935	T	G	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=2;PP=294;SC=CTCAGCCTCCTCATTGGAGCT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=42311462;WS=42311444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	42342929	rs17690068	G	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=241;ReadPosRankSum=0.810;SC=GACTCAGGACGGGCTGTGTGG;SOR=0.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=12;WE=42342937;WS=42342919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr15	42362821	rs2459692	C	G	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=408;ReadPosRankSum=-2.781;SC=TTCGGGACCCCGGCGGTGTGG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=50;TCR=2;TR=24;WE=42362829;WS=42362811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,25:0.48:52
chr15	42363769	rs1668589	A	G	1666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=51;PP=1240;ReadPosRankSum=-1.178;SC=ACCAAAAGAGATCAGCCTCAG;SOR=0.692;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=27;TCR=106;TR=64;WE=42363777;WS=42363759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,67:0.48:139
chr15	42364329	rs1712401	A	C	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.079;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=348;ReadPosRankSum=1.653;SC=GCACAGAGAGATGCCCTGAGC;SOR=0.697;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=34;TCF=16;TCR=18;TR=17;WE=42364337;WS=42364319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr15	42364637	rs55912424	G	T	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=209;ReadPosRankSum=0.299;SC=GGAGTACCCTGGAGGCAGTGG;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=10;WE=42364645;WS=42364627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr15	42364652	rs1668587	G	A	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=376;SC=CAGTGGCTCCGCCAGGACAGG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=15;WE=42364660;WS=42364642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	42373432	rs600415	C	T	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.441;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=385;ReadPosRankSum=0.337;SC=GGGAAGGGACCGCATAGTTGG;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=17;WE=42373440;WS=42373422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr15	42377744	rs605253	C	G	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.028;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=259;ReadPosRankSum=-0.192;SC=AATCAGAGAGCATGAGCAAGT;SOR=0.866;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=19;WE=42377752;WS=42377734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,19:0.30:64
chr15	42433382	rs694456	A	T	4225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=80;NR=46;PP=2965;SC=TGATGCCCCTACTAGACACAC;SOR=1.358;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=80;TCR=46;TR=126;WE=42433390;WS=42433372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr15	42434254	rs655427	G	A	2196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=21;PP=1665;SC=AGGTCTCCACGTTGTTCAGGA;SOR=1.885;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=50;TCR=21;TR=71;WE=42434262;WS=42434244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	42434505	rs654527	C	A	407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=10;PP=339;SC=GGCTGGCTCCCTGCGGGCCCT;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=42434513;WS=42434495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	42434837	rs1356410	T	C	2958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.305;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=67;PP=2143;ReadPosRankSum=-0.144;SC=GCCTCCTCCATGTCCTCAGGG;SOR=0.504;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=198;TCF=84;TCR=114;TR=122;WE=42434845;WS=42434827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,125:0.62:201
chr15	42436599	rs636535	T	C	35.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.87;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	42437711	rs621560	T	C	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=0;PP=578;SC=ATTCTTCTTGTCTCTGCCAGG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=42437719;WS=42437701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	42439376	rs4923929	G	A	1465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=26;PP=992;SC=TGAGGGACACGCTGTGGCCAC;SOR=1.225;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=17;TCR=26;TR=43;WE=42439384;WS=42439366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	42519136	rs1678988	T	C	1452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=34;PP=1200;SC=GTACAACATTTATACACATTA;SOR=2.636;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=42;WE=42519144;WS=42519126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	42520760	rs1678987	C	T	1670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=0;PP=1345;SC=TTAAAAACCACAGATCCTTCT;SOR=7.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=49;WE=42520768;WS=42520750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr15	42520829	rs1712417	T	C	4593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=120;NR=14;PP=2965;SC=ACTTTCTATGTCCACCCATGG;SOR=4.112;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=120;TCR=14;TR=134;WE=42520837;WS=42520819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr15	42523341	rs56119841	T	TC	5613.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=40;PP=2965;SC=GAAACCCATCTCAAGGGGAGA;SOR=2.021;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=84;TCR=41;TR=122;WE=42523349;WS=42523331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr15	42524065	rs1630294	T	C	4626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=38;PP=2965;SC=CAGGCGTCAATTGCTGAGAGG;SOR=2.056;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=101;TCR=38;TR=139;WE=42524073;WS=42524055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr15	42524165	rs1712420	C	T	4067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=88;PP=2965;SC=GTTAAAGTTGCTAGAAGTCTA;SOR=2.438;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=28;TCR=88;TR=116;WE=42524173;WS=42524155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr15	42528676	rs1679012	C	T	3796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=83;PP=2965;SC=AGGCCAGATGCCAATACTAGA;SOR=2.242;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=28;TCR=83;TR=111;WE=42528684;WS=42528666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr15	42529892	rs66512609	C	CT	127.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.35;MQRankSum=0.282;QD=14.21;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr15	42531768	rs11070363	C	T	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=5;PP=889;SC=CTGAATTGCACAGGAACAATT;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=42531776;WS=42531758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	42553218	rs5812215	AT	A	2365.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.27;QD=33.80;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	42560312	rs2412681	C	T	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=25;PP=836;SC=ATATCCTATTCATTTCGTACC;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=42560320;WS=42560302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	42564369	rs4244587	CA	TG	2660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=34;PP=2817;SC=CTTCAATTACCAAAGCATCAT;SOR=1.255;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=55;WE=42564378;WS=42564359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	42564902	rs7181758	A	C	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=640;SC=CTATTTCTTCAATTTTAACCA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=20;WE=42564910;WS=42564892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	42568547	rs8043515	C	G	1167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=19;PP=835;SC=TTTATTTAGTCTTGAAGATGA;SOR=0.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=16;TCR=19;TR=35;WE=42568555;WS=42568537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	42568630	rs8023678	G	A	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=434;SC=AAATATAGTAGCTAGATCAAA;SOR=4.514;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=42568638;WS=42568620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	42570105	rs12916792	G	C	184.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=2;PP=178;SC=TGGCCATAATGTTCATTTGAA;SOR=1.329;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=42570113;WS=42570095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	42570201	rs12916523	A	G	430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=1;PP=385;SC=GCTTTCTAACATATTCCCTCT;SOR=4.294;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=42570209;WS=42570191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	42570433	rs8024390	C	T	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=8;PP=272;SC=TCAAGAAAGACAAGATGTCAT;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=42570441;WS=42570423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	42570718	rs8024732	A	G	7197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=142;NR=97;PP=2965;SC=TCCACCTATCAGGCATTATTG;SOR=1.174;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=239;TCF=142;TCR=97;TR=239;WE=42570726;WS=42570708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr15	42573067	rs8037020	C	T	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=420;SC=TACTGTAGATCAGTTTCTCTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=42573075;WS=42573057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	42575963	rs2412689	A	G	3916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=66;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.698;SC=CTCAGCAGATAAGGCACAACT;SOR=0.279;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=57;TCR=67;TR=123;WE=42575971;WS=42575953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,124:0.99:125
chr15	42579822	rs11070371	T	C	2715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=76;NR=0;PP=2302;SC=CTAATTATTGTAATTGGTGCA;SOR=8.764;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=76;TCF=76;TCR=0;TR=76;WE=42579830;WS=42579812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr15	42579948	rs8037627	T	C	8859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=176;NR=108;PP=2965;SC=TTAAAATTAATGAAGAGACTC;SOR=1.279;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=284;TCF=176;TCR=108;TR=284;WE=42579956;WS=42579938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr15	42580106	rs8036596	A	C	3728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=102;PP=2965;ReadPosRankSum=0.671;SC=TGCACTTCTTATTTTGGCTGC;SOR=5.728;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=104;TCF=1;TCR=103;TR=103;WE=42580114;WS=42580096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,106:0.99:107
chr15	42584909	rs4923939	C	T	5743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=117;NR=55;PP=2965;SC=CAGCTTGTTTCTCTCTTCCTG;SOR=1.718;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=172;TCF=117;TCR=55;TR=172;WE=42584917;WS=42584899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr15	42589987	rs4924651	T	C	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.60;QD=41.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	42589996	rs4924652	C	T	739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.67;QD=46.24;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	42590034	rs72029141	TATTCATTC	T	88.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=2;PP=257;SC=TTCATTCATTTATTCATTCAT;SOR=1.179;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=3;WE=42590049;WS=42590024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	42603083	rs2412694	C	T	3466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=86;PP=2714;SC=TGTTCTGTTACATATCCAATG;SOR=3.342;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=16;TCR=86;TR=102;WE=42603091;WS=42603073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr15	42606094	rs7173358	A	G	216.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.53;NF=7;NR=0;PP=177;SC=AGGCTGCAGTAAGCACTGTTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=42606102;WS=42606084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	42606153	rs141877658	A	AAACAACAACAAC	1031.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=2976;SC=CTATCTCTAAAAACAACAGCA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=16;WE=42606169;WS=42606143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	42606161	rs11637731	G	A	1243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.69;QD=41.46;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	42619508	rs1659215	C	T	3587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=91;NR=12;PP=2965;SC=ACAATGCATCCTACTGTGAGG;SOR=3.933;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=91;TCR=12;TR=103;WE=42619516;WS=42619498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr15	42694944	rs2241827	T	C	1492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=2;PP=1269;SC=CAGGACAGGATGTTCCTCCCG;SOR=5.507;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=46;TCR=2;TR=48;WE=42694952;WS=42694934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	42701688	rs3115883	T	C	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=11.869;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=56;PP=1347;ReadPosRankSum=2.047;SC=CTTTGGACTTTGGTGGAGCCA;SOR=6.770;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=59;TCF=2;TCR=57;TR=57;WE=42701696;WS=42701678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,59:0.97:61
chr15	42703406	rs3115884	T	C	2130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=5;PP=1791;SC=ACTGGGCACATGGTCCTCTGA;SOR=4.680;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=61;TCR=5;TR=66;WE=42703414;WS=42703396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	42704105	rs3098423	C	T	3906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=85;PP=2965;SC=ATCAGTCATGCTCCTCCTCCA;SOR=1.746;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=35;TCR=85;TR=120;WE=42704113;WS=42704095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr15	42758159	rs2244773	T	A	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=2;PP=366;SC=ACATTTGCTTTTGACGGATTA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=42758167;WS=42758149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	42764519	rs7177521	G	C	3939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=67;PP=2965;SC=CAACGTCACAGCTGCAATGAG;SOR=0.928;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=119;TCF=52;TCR=67;TR=119;WE=42764527;WS=42764509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr15	42805000	rs4573906	G	A	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=1;PP=641;SC=CTCCTGCCTCGGCCTCCCAAA;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=42805008;WS=42804990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	42820451	rs9302112	C	T	2342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=21;PP=1851;SC=ACTCCTGACTCTTATATAGAA;SOR=2.012;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=55;TCR=21;TR=76;WE=42820459;WS=42820441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr15	42851464	rs11070374	C	T	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=393;SC=GCTGGGATTACAGGAGTGAGC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=42851472;WS=42851454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	42930891	rs1197550	A	T	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.167;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=209;ReadPosRankSum=-0.908;SC=TTTCTACTTAACTCTAGTTTT;SOR=0.136;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=16;WE=42930899;WS=42930881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr15	42954888	rs7166373	C	T	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=259;ReadPosRankSum=0.129;SC=TATGTGAGTCCTTTACAGCAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=11;WE=42954896;WS=42954878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr15	42955967	rs938047	A	G	2659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.190;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=37;PP=2101;ReadPosRankSum=-0.841;SC=AGTGATTAAGAGCTGGGATGG;SOR=0.922;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=149;TCF=89;TCR=60;TR=98;WE=42955975;WS=42955957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,99:0.65:152
chr15	42957373	rs8039765	C	A	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.980;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=651;ReadPosRankSum=-1.598;SC=TACCTCTTCCCAGCCAATTGC;SOR=1.584;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=29;WE=42957381;WS=42957363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr15	42957532	rs8024902	T	G	1420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.832;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=1064;ReadPosRankSum=0.680;SC=TGAACTGGTATGCAGACAGTC;SOR=0.341;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=67;TCF=22;TCR=45;TR=48;WE=42957540;WS=42957522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,52:0.72:72
chr15	42958115	.	G	C	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.510;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.785;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=33;PP=717;ReadPosRankSum=-0.030;SC=TCCGGAGCTAGGTAGGGTTGC;SOR=0.296;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=57;TCF=6;TCR=51;TR=39;WE=42958123;WS=42958105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,42:0.70:60
chr15	42966288	rs35738819	G	A	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=40;PP=1189;ReadPosRankSum=-0.060;SC=GTACTTTCTCGGACTAGAGAA;SOR=0.669;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=16;TCR=51;TR=53;WE=42966296;WS=42966278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,53:0.79:67
chr15	42977526	rs6493059	A	C	4216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.382;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=69;PP=2962;ReadPosRankSum=0.830;SC=ACCAAGAGGCAATATGCAGGC;SOR=0.827;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=215;TCF=115;TCR=100;TR=154;WE=42977534;WS=42977516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,153:0.71:217
chr15	42977676	rs6493060	G	A	4099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.878;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=81;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.972;SC=GTGAGCTCCAGCCCCATTGTG;SOR=0.877;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=223;TCF=105;TCR=118;TR=146;WE=42977684;WS=42977666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,176:0.70:252
chr15	42981022	rs28744617	A	G	2786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.657;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=51;PP=2140;ReadPosRankSum=1.952;SC=ATCCATGGCCATGGGATCTCA;SOR=0.610;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=81;TCR=72;TR=107;WE=42981030;WS=42981012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,113:0.72:157
chr15	42981806	rs8030587	G	A	2173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.663;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=42;PP=1724;ReadPosRankSum=0.427;SC=GACAGGAAACGTCGTACTGGA;SOR=0.645;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=129;TCF=64;TCR=65;TR=82;WE=42981814;WS=42981796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,83:0.62:133
chr15	42982340	rs8031218	C	T	2227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=43;PP=1814;ReadPosRankSum=-0.341;SC=AAACAAGATACCATTCTGCCT;SOR=0.741;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=105;TCF=46;TCR=59;TR=76;WE=42982348;WS=42982330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,77:0.71:108
chr15	42983923	rs3742993	A	G	3918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.843;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=63;PP=2962;ReadPosRankSum=1.252;SC=TGAGGACAGCAATCAGAAAGC;SOR=0.423;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=239;TCF=151;TCR=88;TR=157;WE=42983931;WS=42983913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,155:0.65:237
chr15	43009749	rs148176549	G	A	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=294;ReadPosRankSum=0.252;SC=CTTAAGCCCAGGAGGTTAACG;SOR=1.609;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=12;WE=43009757;WS=43009739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr15	43011180	.	T	A	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.640;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=153;ReadPosRankSum=-0.594;SC=GATTTTTCTGTCTCGCTTTTG;SOR=0.264;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=10;WE=43011188;WS=43011170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr15	43011537	rs9919994	G	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=161;ReadPosRankSum=-0.742;SC=GAGCCCAGGGGCCTGTAAACA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=7;WE=43011545;WS=43011527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr15	43017426	rs16957091	T	G	2450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.703;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=65;PP=2002;ReadPosRankSum=-0.813;SC=CCAGCTCCCGTAGCAAGAATA;SOR=0.973;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=130;TCF=37;TCR=93;TR=89;WE=43017434;WS=43017416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,88:0.68:130
chr15	43017919	rs6493062	G	A	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.105;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=408;ReadPosRankSum=0.797;SC=GGCCGGGTGCGGTGACTCACA;SOR=1.463;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=18;WE=43017927;WS=43017909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr15	43018486	rs2305085	G	A	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=26;PP=1108;ReadPosRankSum=0.999;SC=AAAGCCCCCCGGTGGCAGATG;SOR=0.641;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=25;TCR=37;TR=44;WE=43018494;WS=43018476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,44:0.71:62
chr15	43018691	rs2305084	T	G	1045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=29;PP=931;ReadPosRankSum=-0.218;SC=GGGACAGGGATCAGCCAGTGG;SOR=0.616;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=64;TCF=17;TCR=47;TR=40;WE=43018699;WS=43018681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,38:0.60:63
chr15	43020983	rs8023524	G	A	1792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.493;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=32;PP=1426;ReadPosRankSum=1.181;SC=TCTGCCTGGCGCACCAGATCT;SOR=0.874;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=118;TCF=63;TCR=55;TR=70;WE=43020991;WS=43020973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,70:0.59:118
chr15	43021563	rs12905385	G	A	1913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.497;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=39;PP=1546;ReadPosRankSum=-0.964;SC=GAGCTCTCCTGTATCAGTGAA;SOR=0.841;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=116;TCF=57;TCR=59;TR=72;WE=43021571;WS=43021553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,72:0.62:117
chr15	43021628	rs16957104	C	T	1665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.768;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=30;PP=1290;ReadPosRankSum=0.063;SC=ATGGACTTTACTTGTGGAGTC;SOR=0.667;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=100;TCF=50;TCR=50;TR=62;WE=43021636;WS=43021618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,64:0.63:102
chr15	43021986	rs12594483	G	A	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.085;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=678;ReadPosRankSum=-1.611;SC=CGGAACCCCAGCACTCACCAA;SOR=0.484;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=58;TCF=27;TCR=31;TR=39;WE=43021994;WS=43021976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,37:0.66:56
chr15	43022690	rs7174041	C	A	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=5;PP=786;ReadPosRankSum=0.923;SC=TGGCCAGGGCCCCACACGCAC;SOR=0.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=47;TCR=8;TR=34;WE=43022698;WS=43022680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,35:0.62:56
chr15	43023482	rs12917189	T	C	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=42;PP=1022;ReadPosRankSum=0.058;SC=ATTGAGCTCCTGGATCTTCAA;SOR=0.758;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=94;TCF=23;TCR=71;TR=55;WE=43023490;WS=43023472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,58:0.59:98
chr15	43024063	rs12917018	C	T	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.289;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=644;ReadPosRankSum=-0.627;SC=AAAAAATCAGCAAGTGGGAGG;SOR=0.321;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=35;WE=43024071;WS=43024053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,35:0.78:45
chr15	43025174	rs8027427	T	A	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=654;ReadPosRankSum=-0.429;SC=CGGAGGATAGTAGAAAACAGC;SOR=1.312;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=27;WE=43025182;WS=43025164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,27:0.63:43
chr15	43025209	rs11448523	A	AG	1736.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.624;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.271;NF=45;NR=3;PP=1938;ReadPosRankSum=0.006;SC=AGCGGGGAAAACCTTCCCTCC;SOR=0.321;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=72;TCF=69;TCR=3;TR=48;WE=43025217;WS=43025199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,49:0.66:74
chr15	43025476	rs34650750	C	CT	1033.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=4.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQRankSum=-0.444;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.750;SOR=0.212;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,48:0.56:85
chr15	43025524	rs28549876	T	G	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.224;NF=0;NR=56;PP=1330;ReadPosRankSum=-0.887;SC=TCAGGCTGGATTGCAATGACG;SOR=1.581;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=82;TCF=0;TCR=82;TR=56;WE=43025532;WS=43025514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,54:0.67:81
chr15	43028592	rs7167392	G	A	4003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.247;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=112;PP=2962;ReadPosRankSum=0.412;SC=TGGGGCGGCTGGGGCTGCCAG;SOR=1.106;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=208;TCF=45;TCR=163;TR=140;WE=43028600;WS=43028582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,142:0.67:212
chr15	43028749	rs4265781	T	A	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.839;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=11;PP=981;ReadPosRankSum=0.964;SC=AGCGGTGCTCTGGGCCTCGGT;SOR=0.368;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=59;TCF=44;TCR=15;TR=40;WE=43028757;WS=43028739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,42:0.70:60
chr15	43075531	rs9920092	C	T	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=194;SC=TCACCAGATACCAAATCTGCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=43075539;WS=43075521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	43075942	.	T	TA	40	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5634;HP=15;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=27;MQ=61.24;NF=1;NR=3;PP=40;QD=10.75;SC=TTAAGAGAGTTAAAAAAAAAA;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=4;WE=43075950;WS=43075932;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:18,4:0.18:22
chr15	43170690	rs10650948	T	TAC,TACAC	687.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.510;NF=18,18;NR=3,3;PP=296,500;ReadPosRankSum=-0.789;SC=CCGATATGTATACACACACAC;SOR=1.209;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=21,21;WE=43170698;WS=43170680;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.50,0.36:28
chr15	43237805	rs11352938	AT	A	440.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=426;SC=AAAAAGGGATATTTTCCCTTC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=43237830;WS=43237795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	43237813	rs67230215	TTCACCATTGA	T	493.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=2155;SC=ATATTTTCCCTTCACCATTGA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=43237830;WS=43237795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	43244699	rs2277532	A	G	1672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=47;PP=1494;SC=AACAAAACAAATAAGTACCAT;SOR=3.830;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=6;TCR=47;TR=53;WE=43244707;WS=43244689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr15	43256121	rs2054389	T	C	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=4;PP=756;SC=CAATATTTTATCCCCATAGTA;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=43256129;WS=43256111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	43322113	rs3736054	C	A	2265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=61;NR=8;PP=1844;SC=TCTTGAGGTACATAGAGATAA;SOR=3.706;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=62;TCR=8;TR=69;WE=43322121;WS=43322103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr15	43324942	rs6493077	C	T	1153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=28;PP=891;SC=TCATCCAGTCCAGTATTTTTT;SOR=2.133;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=35;WE=43324950;WS=43324932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	43328663	rs3784265	C	T	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=6;PP=678;SC=TATCTTCTCTCCTTAGAAAGA;SOR=1.697;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=43328671;WS=43328653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	43330175	rs7166596	A	T	2814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=82;PP=2421;SC=TTCTCACGTGAAAAATGGAAG;SOR=6.091;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=87;TCF=5;TCR=82;TR=86;WE=43330183;WS=43330165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr15	43352041	rs4924704	G	A	2073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=40;PP=1804;ReadPosRankSum=-0.671;SC=TGAAGGGAACGAACCAAAAAA;SOR=0.606;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=23;TCR=41;TR=63;WE=43352049;WS=43352031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr15	43378118	.	CA	C	154.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.587;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.42;MQRankSum=0.492;QD=4.55;ReadPosRankSum=1.559;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr15	43398108	rs68062403	A	G	3532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=63;PP=2619;ReadPosRankSum=-1.221;SC=GACCGGGGGGAGGACAAAAGA;SOR=1.129;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=153;TCF=89;TCR=64;TR=151;WE=43398116;WS=43398097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,135:0.99:137
chr15	43426626	rs75930246	A	G	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=259;ReadPosRankSum=-0.999;SC=AACTCTAGCCAGGGCTGTGGC;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=12;WE=43426634;WS=43426616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr15	43453056	rs11070392	C	G	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=534;SC=ATACAGTAGTCCTCCCTTATC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=43453064;WS=43453046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	43478113	rs540587	G	C	5302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=106;PP=2965;SC=CCTTGCCTCAGTTCCTCCAGC;SOR=1.624;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=54;TCR=106;TR=160;WE=43478121;WS=43478103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr15	43478511	rs530118	C	T	3161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=67;PP=2479;SC=ACCTTTTGCACGCACGCCAGG;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=30;TCR=67;TR=97;WE=43478519;WS=43478501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr15	43483537	rs495286	T	C	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=1;PP=733;SC=ATAATAGGCCTCGCCTTTTTT;SOR=4.407;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=26;WE=43483545;WS=43483527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	43527236	rs579178	A	G	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=38;PP=1090;SC=CAAGTACCAAATCCCAGGGAA;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=38;WE=43527244;WS=43527226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	43559170	.	C	T	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.765;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=371;ReadPosRankSum=-1.766;SC=GAACCGAAGGCGGGGCTGGAC;SOR=2.925;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=17;WE=43559178;WS=43559160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr15	43568999	rs530683	C	T	903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=4;PP=764;SC=GGTCCTGTGACGCCATGGGGC;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=43569007;WS=43568989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	43739686	.	GA	G	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.454;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=0.068;QD=2.47;ReadPosRankSum=-0.075;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr15	43784000	rs555252	C	T	5005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=75;PP=2965;SC=ACCAACAAACCTTAATACAAA;SOR=0.904;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=61;TCR=76;TR=136;WE=43784008;WS=43783990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr15	43819150	rs2229014	C	G	3382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.690;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=94;PP=2586;ReadPosRankSum=0.093;SC=TAAGCTCATGCCACACATGAA;SOR=0.786;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=182;TCF=39;TCR=143;TR=120;WE=43819158;WS=43819140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,126:0.67:188
chr15	43903198	.	T	TTG	608.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DP=187;ExcessHet=3.0103;FS=3.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.41;MQRankSum=0.203;QD=8.34;ReadPosRankSum=-0.206;SOR=1.306;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,32:0.44:73
chr15	43924420	rs144399798	C	T	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=20.120;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=-10.193;QD=2.07;ReadPosRankSum=-0.808;SOR=4.020;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:104,14:0.12:118
chr15	43924422	rs142408593	T	C	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=20.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.92;MQRankSum=-10.437;QD=2.08;ReadPosRankSum=-1.252;SOR=4.131;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,14:0.12:117
chr15	43924652	.	G	A	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.138;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQRankSum=-5.858;QD=1.19;ReadPosRankSum=0.919;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,5:0.14:36
chr15	43927623	rs375933133	CA	C	191.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FS=4.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=1.207;QD=0.89;ReadPosRankSum=0.509;SOR=0.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:172,43:0.20:215
chr15	43941125	rs2470122	G	C	924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=26;PP=690;SC=CCCGCCCGCCGGACGAAGGCG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=43941133;WS=43941115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	44028569	rs56181031	G	C	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.91;QD=29.85;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	44038899	rs2411284	C	T	3805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=58;PP=2965;SC=AGTTCTTCGCCCCCTGGTGAG;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=60;TCR=58;TR=118;WE=44038907;WS=44038889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr15	44053617	rs8040336	C	T	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=449;ReadPosRankSum=0.193;SC=ATTTTGACTTCTAAGATGGAA;SOR=0.914;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=58;TCF=55;TCR=3;TR=21;WE=44053625;WS=44053607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,22:0.37:60
chr15	44061802	rs1053492	C	T	5389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=124;NR=43;PP=2965;SC=GGTGTGGTCACTGTAAGAACC;SOR=2.261;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=124;TCR=44;TR=167;WE=44061810;WS=44061792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr15	44062419	.	T	C	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=0.000;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.231;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=419;ReadPosRankSum=-0.657;SC=AAACTTGAAATGTAAACATTT;SOR=0.446;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=79;TCF=67;TCR=12;TR=27;WE=44062427;WS=44062409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,27:0.34:80
chr15	44062874	rs7181912	A	T	1183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.45;QD=32.88;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	44068160	rs3844075	C	G	2986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=28;PP=2333;SC=AGGGTGGAGACCTCTTAAGCA;SOR=1.533;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=57;TCR=28;TR=85;WE=44068168;WS=44068150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr15	44084705	rs4644832	G	A	6524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=170;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.757;SC=CGCGCTCTGTGGCCACCCTCA;SOR=2.750;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=192;TCF=21;TCR=171;TR=191;WE=44084713;WS=44084695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,197:0.99:198
chr15	44087973	.	GAT	G	2140.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.597;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=22;PP=2036;ReadPosRankSum=-0.661;SC=GGTCTTAAAAGATGTGAGGGT;SOR=0.780;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=143;TCF=69;TCR=74;TR=50;WE=44087982;WS=44087963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,60:0.36:166
chr15	44090251	rs72290122	CT	C	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQRankSum=1.654;QD=2.32;ReadPosRankSum=1.419;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr15	44090854	rs654276	T	C	1046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=12;NR=20;PP=931;SC=TGAGAGGGGGTTGGGACAGGC;SOR=1.214;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=32;WE=44090862;WS=44090844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	44091351	rs656473	A	T	1261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=42;PP=1189;SC=AGTGTGTGTGAGAGAAATGGC;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=43;WE=44091359;WS=44091341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	44120559	rs678084	T	G	3086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=73;PP=2412;SC=TACCACACCATCCCTGGTAAG;SOR=2.882;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=18;TCR=73;TR=91;WE=44120567;WS=44120549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
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chr15	45028919	rs11388295	C	CT	947.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=1.319;HP=11;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.843;NF=26;NR=13;PP=551;ReadPosRankSum=0.119;SC=GTGAGTGACCCTTTTTTTTTT;SOR=1.148;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=39;WE=45028927;WS=45028909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,46:0.78:59
chr15	45047134	rs2470911	G	A	8038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=127;NR=123;PP=2965;SC=CGATCCAGGCGACTATGTTGA;SOR=0.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=251;TCF=128;TCR=123;TR=250;WE=45047142;WS=45047124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr15	45047573	rs3100139	C	T	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=460;SC=CATTTCTTCACGGTGGGTGAG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=45047581;WS=45047563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	45048757	rs3759881	T	A	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=18;PP=652;SC=ATATATTATCTACACACTAAA;SOR=1.893;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=45048765;WS=45048747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	45059331	rs139690335	A	G	318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=286;ReadPosRankSum=-1.328;SC=GTATGGGGAGATAAAGTACTA;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=12;WE=45059339;WS=45059321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr15	45059390	rs6493127	C	T	1663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=10;PP=1248;SC=GTTTACCCCCCTTTCTCCCAT;SOR=2.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=47;WE=45059398;WS=45059380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	45060014	rs3100143	A	T	4270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=120;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.866;SC=TTAAAGAGGTATTGAAATATT;SOR=5.502;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=124;TCF=3;TCR=121;TR=123;WE=45060022;WS=45060004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,127:0.99:128
chr15	45123909	.	TA	T	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.59;MQRankSum=-2.700;QD=1.55;ReadPosRankSum=-0.474;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr15	45250515	rs11633942	G	T	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.18;MQRankSum=-4.123;QD=24.35;ReadPosRankSum=0.991;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr15	45250518	rs11633824	A	G	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.69;MQRankSum=-3.868;QD=24.69;ReadPosRankSum=0.663;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr15	45250755	rs373082	CA	TG	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=593;SC=CAGCCAAATCCAGCTAATCTC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=11;WE=45250764;WS=45250745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	45258571	rs35986068	C	CA	181.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=183;ReadPosRankSum=-0.030;SC=TCCCATTATACAAAAAAAAGA;SOR=0.430;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=11;WE=45258579;WS=45258561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr15	45353230	rs2854446	C	T	5963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=62;PP=2965;SC=TGCTCCCACCCTCGGACATGG;SOR=1.495;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=117;TCR=62;TR=178;WE=45353238;WS=45353220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr15	45357410	rs2854437	T	G	1834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=11;PP=1599;SC=GCATATATAATACTATTGTTA;SOR=3.180;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=46;TCR=11;TR=57;WE=45357418;WS=45357400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	45361011	rs28662287	C	T	214.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.00;QD=30.69;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	45361180	rs55739437	A	T	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.814;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.788;NF=16;NR=15;PP=681;ReadPosRankSum=-0.943;SC=GTAGAAGGTCAGCTGGGGTGC;SOR=1.402;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=55;TCF=26;TCR=29;TR=31;WE=45361188;WS=45361170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr15	45364647	rs201420581	C	T	43.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=21.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	45387550	rs199138	A	G	1956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=1;PP=1682;SC=TGGAGCCAGGAGCTTTCTCTC;SOR=6.770;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=59;TCF=58;TCR=1;TR=58;WE=45387558;WS=45387540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	45388382	rs2554451	C	T	2017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=52;PP=1600;SC=TCTGAGCAAGCGGGGCTCCTG;SOR=4.548;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=5;TCR=52;TR=57;WE=45388390;WS=45388372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	45391566	rs269869	A	T	1867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=20;PP=1468;SC=AGGAGAAACCATCCCCAGAAC;SOR=1.342;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=34;TCR=20;TR=54;WE=45391574;WS=45391556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	45392075	rs269868	G	A	3733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=81;PP=2965;ReadPosRankSum=2.020;SC=CGAGGGTGGCGAGGCAAAGCC;SOR=1.002;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=31;TCR=82;TR=112;WE=45392083;WS=45392065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,114:0.99:115
chr15	45398965	rs269862	G	T	1600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=17;PP=1304;SC=CAAATAGCCAGCCCCTCAGGC;SOR=1.390;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=32;TCR=17;TR=48;WE=45398973;WS=45398955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	45399467	rs190599	A	G	11726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=362;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.936;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=255;NR=88;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.949;SC=GACAGCACCAAGTGATTCCCC;SOR=2.181;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=346;TCF=257;TCR=89;TR=343;WE=45399475;WS=45399457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,356:1.00:357
chr15	45400164	rs269861	T	C	1527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=2;PP=1216;SC=CAAGGGCTCATAGGGGCTGTC;SOR=4.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=44;WE=45400172;WS=45400157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
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chr15	45404979	rs182090	T	G	3996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=90;PP=2965;SC=CCCAAACCTCTCCCTAAGCCT;SOR=2.056;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=35;TCR=90;TR=125;WE=45404987;WS=45404969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr15	45405463	rs269856	G	T	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.212;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=150;ReadPosRankSum=-0.335;SC=TCAGGGAGCCGCTTGCCGCAC;SOR=3.338;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=9;WE=45405471;WS=45405453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,10:0.28:36
chr15	45408414	rs2576090	C	G	4406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=88;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.745;SC=AGCCCGTGTCCGTCTGCTCGT;SOR=0.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=60;TCR=89;TR=147;WE=45408422;WS=45408404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,148:0.99:149
chr15	45408691	rs2576091	C	G	870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=1.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.24;ReadPosRankSum=-0.153;SOR=1.009;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,26:0.31:85
chr15	45408699	rs2252371	C	T	891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=5.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.661;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,28:0.30:94
chr15	45408710	rs2554459	A	G	3169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=34;PP=2962;SC=GCCTCACCCCACAGGGACCCC;SOR=1.786;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=80;TCR=34;TR=114;WE=45408718;WS=45408681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr15	45408933	rs2576092	T	C	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-5.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=128;ReadPosRankSum=-1.100;SC=CTATGGTAAGTGCTGGAGGGA;SOR=0.846;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=13;WE=45408941;WS=45408923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
chr15	45409271	rs955152	C	T	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.464;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=389;ReadPosRankSum=-0.470;SC=CACAGCGGGTCCCCCCACTCC;SOR=1.184;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=65;TCF=48;TCR=17;TR=24;WE=45409279;WS=45409261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,24:0.36:67
chr15	45414504	rs1863469	T	A	3329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.958;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=78;PP=2467;ReadPosRankSum=-0.595;SC=CCTTCCTGTTTCCAGACTTGG;SOR=0.283;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=185;TCF=62;TCR=123;TR=124;WE=45414512;WS=45414494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,130:0.67:193
chr15	45424286	rs1706810	C	G	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=26;PP=720;SC=TCTGGGCTCCCCCAAGGACAG;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=45424294;WS=45424276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	45433646	rs1648283	T	G	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.766;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=28;PP=998;ReadPosRankSum=-1.362;SC=GTGGTGGGTCTGGAGCCTCGT;SOR=0.395;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=174;TCF=77;TCR=97;TR=58;WE=45433654;WS=45433636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,60:0.34:175
chr15	45434493	rs2292464	C	T	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=57;ReadPosRankSum=1.368;SC=AAGTCAGCTCCAGGGAGAATT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=45434501;WS=45434483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr15	45435217	rs2292465	T	C	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.563;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=621;ReadPosRankSum=0.211;SC=AAGCTCCCCATGGGATGCAGA;SOR=3.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=27;WE=45435225;WS=45435207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,26:0.72:36
chr15	45439910	rs938129	A	G	3647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=83;PP=2834;SC=TCTGTTGGAGATGGGGAAGCC;SOR=2.407;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=26;TCR=83;TR=109;WE=45439918;WS=45439900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr15	45444518	rs1706804	A	G	2034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=37;PP=1614;ReadPosRankSum=-0.063;SC=CGGGCATCACAGACACCACCC;SOR=0.686;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=279;TCF=175;TCR=104;TR=99;WE=45444526;WS=45444508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,98:0.35:281
chr15	45445499	rs1648304	G	C	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=110;ReadPosRankSum=0.120;SC=CTCTGGCCAGGGTCCTCGATC;SOR=0.119;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=9;WE=45445507;WS=45445489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,10:0.25:40
chr15	45445691	.	AATGTGTGTGTGTGT	A	368	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MMLQ=20;MQ=59.89;NF=0;NR=10;PP=368;QD=43.3272935629;SC=AGTAAGTGCGAATGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=10;WE=45445717;WS=45445681;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:34,10:0.23:44
chr15	45445692	.	ATGTGTGTGTGTGTGTGTG	A	288.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;QD=11.11;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr15	45445746	.	A	G	83	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=73;MMLQ=29;MQ=59.46;NF=0;NR=6;PP=83;QD=19.6285354245;SC=GTGTGTGTGTATAATGGGGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=6;WE=45445754;WS=45445736;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr15	45446084	rs11306605	CA	C	725.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;QD=20.16;SOR=3.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	45446156	rs2458236	C	T	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.724;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=583;ReadPosRankSum=-0.827;SC=CAGGTCTGAGCTCCCCCAGAA;SOR=0.811;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=120;TCF=64;TCR=56;TR=37;WE=45446164;WS=45446146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,38:0.30:126
chr15	45454720	rs1706811	G	A	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.99;ReadPosRankSum=0.931;SOR=0.317;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,10:0.22:46
chr15	45457106	rs12438755	G	T	4916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.215;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=88;PP=2772;ReadPosRankSum=-1.245;SC=CTAGGCCCCTGCCCGGGGGTT;SOR=0.434;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=178;TCF=55;TCR=123;TR=131;WE=45457114;WS=45457096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,136:0.73:186
chr15	45457127	rs7169193	C	T	4048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.979;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=73;PP=2178;ReadPosRankSum=-0.302;SC=CTGCCCACTGCCCAGTTGAGC;SOR=0.443;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=132;TCF=29;TCR=103;TR=95;WE=45457135;WS=45457117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,100:0.72:139
chr15	45462439	rs77269169	C	T	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=91;ReadPosRankSum=-0.210;SC=ACTTTATTACCGGGTGGCCTT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=45462447;WS=45462429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr15	45467540	rs1632144	C	G	2005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=21;PP=1506;SC=TCACCTTCCGCGGTGGCCCCA;SOR=1.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=41;TCR=21;TR=62;WE=45467548;WS=45467530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	45544319	rs2899376	T	G	219.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=1;PP=180;SC=CTCCTCTACATTGAGGGCAGG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=45544327;WS=45544309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	45567529	rs12440356	T	C	3605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=32;PP=2848;ReadPosRankSum=0.138;SC=GTATAACTTATTGATATGTTT;SOR=0.906;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=113;TCF=81;TCR=32;TR=111;WE=45567537;WS=45567519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,118:0.99:119
chr15	45654327	rs1145086	A	G	1941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=31;PP=1521;SC=TAGGACTGTAAGGTGCCTCGG;SOR=0.831;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=28;TCR=31;TR=59;WE=45654335;WS=45654317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	45661678	rs1288775	T	A	5558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=124;PP=2965;ReadPosRankSum=1.173;SC=AATGCCCTCCTTGCTTCTGGT;SOR=1.148;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=41;TCR=125;TR=165;WE=45661686;WS=45661668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,175:0.99:176
chr15	45669055	rs12437840	C	A	1202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=28;PP=974;SC=TATTGCATTGCTCTATCAGTA;SOR=2.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=38;WE=45669063;WS=45669045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	45669094	rs12437887	G	A	597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=12;PP=506;SC=TGGAGATGGAGTAAAAATCCA;SOR=1.292;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=19;WE=45669102;WS=45669084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	45670851	rs7164139	G	A	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=11;PP=351;SC=GTAGCGCCCCGAATTAGGAAC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=45670859;WS=45670841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	45694516	rs1346266	G	T	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=477;SC=AACGCAGTCTGCCCTAGCGCA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=45694524;WS=45694506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	45694579	rs1820518	C	T	1941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=9;PP=1505;SC=TTTTGTGGGCCGGGTGGGTTT;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=55;WE=45694587;WS=45694569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr15	45694610	rs1365610	C	T	3169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=22;PP=2490;SC=TTTCGTCTGCCTGGTTCATCT;SOR=2.376;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=70;TCR=22;TR=92;WE=45694618;WS=45694600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr15	45695382	rs7182723	G	A	1349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=16;PP=1214;SC=CAGCTGGTGCGGGCCGTGGCG;SOR=1.206;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=24;TCR=16;TR=40;WE=45695390;WS=45695372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	45695695	rs1153849	G	A	6655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=91;PP=2965;SC=CGCTGCGTAGGCCCGGGAGAT;SOR=0.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=209;TCF=118;TCR=91;TR=209;WE=45695703;WS=45695685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr15	45695763	rs117332547	G	C	6382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=119;PP=2965;SC=AACCTCGGCCGCTTCTGGCGC;SOR=1.202;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=197;TCF=78;TCR=119;TR=197;WE=45695771;WS=45695753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr15	45695830	rs3833012	GT	G	4072.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=97;PP=2973;SC=TGAGGTTGGAGTTGGGGCTCT;SOR=3.533;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=112;TCF=12;TCR=100;TR=109;WE=45695838;WS=45695820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr15	45706739	rs12440038	A	G	1404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=6;PP=1175;SC=ATTATACTAAAACAACTCTTC;SOR=3.365;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=42;WE=45706747;WS=45706729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	45710748	.	G	C	36.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.327;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.45;ReadPosRankSum=0.699;SOR=0.768;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,7:0.09:81
chr15	45710752	.	C	T	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.701;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.38;ReadPosRankSum=1.003;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,7:0.09:80
chr15	45710787	.	A	C	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=0.000;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=-3.014;QD=1.42;ReadPosRankSum=0.158;SOR=0.535;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,12:0.10:123
chr15	45710789	.	C	A	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.268;ClippingRankSum=0.000;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-2.922;QD=1.36;ReadPosRankSum=-0.140;SOR=0.680;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,13:0.10:126
chr15	45710797	rs182022407	A	G	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=1.163;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-4.204;QD=1.26;ReadPosRankSum=-0.170;SOR=0.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,13:0.10:128
chr15	45710811	.	C	T	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.307;ClippingRankSum=0.000;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=1.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-4.708;QD=0.46;ReadPosRankSum=0.703;SOR=0.966;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:122,11:0.08:133
chr15	45710814	.	CT	AC	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.000;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=2.677;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-4.727;QD=0.34;ReadPosRankSum=0.628;SOR=1.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,11:0.08:134
chr15	45710841	.	T	C	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.029;ClippingRankSum=0.000;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-4.918;QD=0.49;ReadPosRankSum=-0.082;SOR=0.652;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,10:0.08:131
chr15	45710847	.	T	C	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.207;ClippingRankSum=0.000;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=-4.766;QD=0.33;ReadPosRankSum=-0.675;SOR=0.633;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,11:0.08:136
chr15	45962041	rs11638918	A	G	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=237;ReadPosRankSum=0.206;SC=CTTAGACCACATGGAACCACA;SOR=0.632;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=16;WE=45962049;WS=45962031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,17:0.29:58
chr15	45968535	rs12914266	A	C	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=382;ReadPosRankSum=-1.593;SC=AGCTGTCAGCATGAAGCGTTG;SOR=0.732;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=57;TCF=14;TCR=43;TR=19;WE=45968543;WS=45968525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,21:0.35:60
chr15	45974593	rs62008309	A	G	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=210;ReadPosRankSum=-1.145;SC=CACAGTGTATAGAGTAAGGAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=12;WE=45974601;WS=45974583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr15	45981317	rs10643	G	A	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.326;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=422;ReadPosRankSum=0.420;SC=AAGCAGAGCCGCTAGAAACCT;SOR=1.091;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=106;TCF=54;TCR=52;TR=31;WE=45981325;WS=45981307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,35:0.30:117
chr15	48053730	rs9920019	A	G	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=6;PP=833;SC=AATTTGTTTTATCTCTAGTGC;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=48053738;WS=48053720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	48058071	rs532598	G	A	2746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=7;PP=2219;SC=AATAGGTGCAGTGCTGAGAAT;SOR=4.539;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=73;TCR=7;TR=79;WE=48058079;WS=48058061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr15	48058484	rs528882	G	T	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=662;SC=CTTTTTTTTTGTTGTTATGGG;SOR=6.091;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=23;WE=48058492;WS=48058474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	48059137	rs11353659	CT	C	326.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=15;NR=1;PP=223;SC=AATTTATAGTCTTTTTTTTTT;SOR=4.047;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=16;WE=48059145;WS=48059127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	48063076	rs568215	T	C	3960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=51;PP=2965;SC=CTGCTCTTCCTACTCCTGAGT;SOR=1.010;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=115;TCF=64;TCR=51;TR=114;WE=48063084;WS=48063066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr15	48443699	rs2470103	T	C	13240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=451;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=232;NR=191;PP=2965;SC=TCCAAAGCCTTGATTTATTCC;SOR=0.901;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=424;TCF=233;TCR=191;TR=423;WE=48443707;WS=48443689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,442:1.00:442
chr15	48450517	rs3736482	T	C	2442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=61;PP=1874;SC=AACTCTCTGATATTTTAATTA;SOR=7.112;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=62;TCF=1;TCR=61;TR=62;WE=48450525;WS=48450507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	48460786	rs11070626	T	C	1655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=1;PP=1383;SC=CCCCTGCCTATATGAAGATTA;SOR=6.439;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=49;WE=48460794;WS=48460776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	48460927	rs8023906	C	T	6289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=98;PP=2965;SC=TTTTCTCCAGCGCCCGAATTC;SOR=0.703;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=198;TCF=100;TCR=98;TR=198;WE=48460935;WS=48460917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr15	48520699	rs1484547	T	C	131.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.97;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	48538979	rs35669481	A	AAAC	1583.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=4;PP=1542;SC=TGTCTCAAACAAACAACAACA;SOR=4.047;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=31;WE=48538987;WS=48538969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	48539026	rs11636073	A	T	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=60.73;MQRankSum=0.052;NF=26;NR=2;PP=514;ReadPosRankSum=-0.101;SC=CAGGGGGAAAAAATGTAGTTG;SOR=0.881;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=86;TCF=78;TCR=8;TR=28;WE=48539034;WS=48539016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,28:0.33:86
chr15	48539043	rs8028035	G	A	3669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=87;NR=17;PP=2753;SC=GTTGAAAGCCGTTTGCTTATG;SOR=3.347;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=87;TCR=17;TR=104;WE=48539051;WS=48539033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr15	48541700	rs2279365	G	A	4154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=99;NR=24;PP=2965;SC=TTCAAGCTTCGAGGCTATAAC;SOR=2.851;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=99;TCR=24;TR=123;WE=48541708;WS=48541690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr15	48561834	rs1484551	A	G	2829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=28;PP=2126;SC=GATTGCCCACATTTTTATGTC;SOR=2.040;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=73;TCR=28;TR=101;WE=48561842;WS=48561824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr15	48580713	rs1552311	T	C	2118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=48;PP=1530;SC=GAAAAAATTGTGTAAGTAGTT;SOR=1.739;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=20;TCR=48;TR=68;WE=48580721;WS=48580703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	48594848	.	T	A	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.979;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=3.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.06;MQRankSum=-5.331;QD=11.73;ReadPosRankSum=-1.795;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr15	48594849	.	T	A	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.608;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=3.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.06;MQRankSum=-5.331;QD=11.73;ReadPosRankSum=-3.839;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr15	48623248	rs66822811	TCGGGCGCGGTGTCTTGCCCACAGCTTGGGGAGCGGCCC	T	911.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=2108;SC=TGAAAGGAAATCGGGCGCGGT;SOR=2.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=48623293;WS=48623238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	48712699	rs3214528	AT	A	599.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=489;SC=CTCAATTATAATTTTTTTTCT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=48712707;WS=48712689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	48713996	rs1820488	G	T	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=11;PP=450;SC=GGCCAACAACGCTTCACATAC;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=48714004;WS=48713986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	48720526	rs363832	G	C	1355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=4;PP=1075;ReadPosRankSum=0.697;SC=GGAAAGTGCGGTGCCAACTGT;SOR=2.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=39;WE=48720534;WS=48720516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr15	48729648	rs2042746	T	C	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=38;PP=1287;SC=TCTCCACAAGTATTTTGAGGT;SOR=4.174;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=42;WE=48729656;WS=48729638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	48736684	rs2303502	A	T	3266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=31;PP=2651;SC=TCATTCTGCTAAGTCCAGTGG;SOR=1.879;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=72;TCR=31;TR=103;WE=48736692;WS=48736674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr15	48749040	rs112092957	C	CGT,CGTGT	924.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.117;NF=0,0;NR=29,29;PP=359,665;ReadPosRankSum=-0.201;SC=AAAGTGCGTGCGTGTGTGTGT;SOR=2.226;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=79;TCF=1;TCR=78;TR=29,29;WE=48749048;WS=48749030;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.31,0.58:26
chr15	48764655	rs67860867	TA	T	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=6.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=1.988;QD=1.73;ReadPosRankSum=0.948;SOR=0.119;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr15	48807637	rs4775765	C	T	4004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=79;PP=2965;SC=CTCACACCGGCAACTCCCAGG;SOR=1.299;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=45;TCR=79;TR=124;WE=48807645;WS=48807627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr15	48903126	rs1018148	A	G	2905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=77;PP=2331;ReadPosRankSum=-0.890;SC=GGTCCCTCACAAACTTTGCTA;SOR=2.517;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=10;TCR=79;TR=87;WE=48903134;WS=48903116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,91:0.99:92
chr15	49009405	rs11334885	AT	A	85.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=9.53;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	49040864	rs34352957	TA	T	156.14	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.26;MQRankSum=0.671;QD=13.01;ReadPosRankSum=-0.580;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr15	49083577	rs58156069	C	T	2383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.441;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=55;PP=1958;ReadPosRankSum=-0.969;SC=TTTTCATCTACGGTATTAAAA;SOR=1.906;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=78;TCF=23;TCR=55;TR=77;WE=49083585;WS=49083567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,76:0.99:77
chr15	49097733	rs34518970	T	TC	360.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQRankSum=-1.103;QD=11.64;ReadPosRankSum=-0.308;SOR=1.839;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr15	49097734	rs72739872	T	C	39.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQRankSum=0.992;QD=1.24;ReadPosRankSum=1.470;SOR=0.343;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr15	49098016	rs1426200	C	A	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=25;PP=725;SC=GGTGATTCACCGAAAATAGCT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=49098024;WS=49098006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	49118087	rs3743292	C	T	1585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=0;PP=1321;ReadPosRankSum=1.617;SC=ATTTTATCTACAAACAAAGTT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=47;WE=49118095;WS=49118077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
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chr15	49168841	rs34224664	G	A	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=32;PP=1143;SC=TCCAATGTTCGAGGGCAGGAA;SOR=1.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=47;WE=49168849;WS=49168831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	49325289	rs11638215	A	C	1446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.264;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=52;PP=1218;ReadPosRankSum=-1.214;SC=GCTGTTGTAAAAGCTGTTGCT;SOR=2.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=140;TCF=4;TCR=136;TR=52;WE=49325297;WS=49325279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,54:0.38:142
chr15	49421868	rs507054	T	G	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=503;ReadPosRankSum=0.125;SC=TGCTTGGCAATGATATAAAGT;SOR=0.856;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=23;WE=49421876;WS=49421858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,24:0.75:32
chr15	49422885	rs2289389	T	G	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.241;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=390;ReadPosRankSum=-1.220;SC=GCAAAGAAAGTAATAGAATCC;SOR=1.022;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=21;WE=49422893;WS=49422875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,22:0.34:65
chr15	49423098	rs2289390	C	T	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.82;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr15	49426048	rs11858814	G	A	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=190;ReadPosRankSum=0.423;SC=TATGTACAAAGAAACAACATT;SOR=0.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=12;WE=49426056;WS=49426038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
chr15	49461248	rs577659	C	T	1623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.661;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=1166;ReadPosRankSum=-0.432;SC=CACTCTTTGGCTATGCTTTAT;SOR=0.101;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=74;TCF=26;TCR=48;TR=55;WE=49461256;WS=49461238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,60:0.76:79
chr15	49493499	.	C	G	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.586;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.538;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=166;ReadPosRankSum=1.535;SC=TTGATAAGATCTAAATTTTTA;SOR=0.105;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=10;WE=49493507;WS=49493489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr15	49527624	rs55979115	T	C	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=169;ReadPosRankSum=-0.711;SC=TGTTTTTTTTTCTTAAATTGT;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=8;WE=49527632;WS=49527614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr15	49663405	rs12903238	G	A	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.652;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=33;ReadPosRankSum=1.204;SC=TAAGAATGTAGTAACCAGCAT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=3;WE=49663413;WS=49663395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr15	49716845	rs16962440	T	C	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=2.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=273;ReadPosRankSum=0.912;SC=TTTCAGGTGATATGTTTTCTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=11;WE=49716853;WS=49716835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr15	49800394	rs58845336	G	A	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-4.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=6;PP=1013;ReadPosRankSum=0.010;SC=GCAGTATACAGAAACTTTACT;SOR=0.856;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=50;TCR=8;TR=43;WE=49800402;WS=49800384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,43:0.74:58
chr15	49834009	rs201443869	A	T	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.418;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=218;ReadPosRankSum=0.551;SC=TATATCTACCAAAATAAAATC;SOR=0.250;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=59;TCF=12;TCR=47;TR=16;WE=49834017;WS=49833999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,15:0.26:57
chr15	49867122	rs12901416	A	G	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=307;SC=ATCCAGAAAAACATTTTTGTA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=49867130;WS=49867112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	49867148	rs12902794	T	C	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=418;SC=CTTATCTCTATTGAAAAATTA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=49867156;WS=49867138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	49867323	rs12902107	G	A	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=25;PP=916;SC=AAAAAAACAAGAGAGAGATGC;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=32;WE=49867331;WS=49867313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	49869141	rs12912703	C	G	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=45;ReadPosRankSum=-0.572;SC=CTATCACTCACTAACATAATT;SOR=0.752;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=5;WE=49869149;WS=49869131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,5:0.22:23
chr15	49869576	rs12148716	T	C	1754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.609;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=48;PP=1242;ReadPosRankSum=-0.628;SC=ATATGTCATATCTAAAATAAA;SOR=0.599;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=183;TCF=53;TCR=130;TR=70;WE=49869584;WS=49869566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,74:0.39:189
chr15	49923026	rs1976551	C	G	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.853;NF=11;NR=0;PP=214;ReadPosRankSum=0.277;SC=TACAGCCGCTCCCCATCACTC;SOR=0.336;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=11;WE=49923034;WS=49923016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,11:0.38:29
chr15	50152583	rs4774549	G	T	3012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=68;PP=2454;SC=CAAAAGCATAGCCAGACCTTC;SOR=3.019;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=17;TCR=68;TR=85;WE=50152591;WS=50152573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr15	50189303	rs2413975	A	G	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=155;ReadPosRankSum=-0.355;SC=TTCCAGCTAGATACATATTCT;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=8;WE=50189311;WS=50189300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr15	50189448	rs2413976	C	A	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=0.783;QD=8.35;ReadPosRankSum=0.988;SOR=0.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,28:0.36:77
chr15	50209258	rs16963067	T	C	3064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=74;PP=2555;ReadPosRankSum=-0.786;SC=TAAAGCCCAATTCAGTTAAAA;SOR=1.651;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=90;TCF=15;TCR=75;TR=89;WE=50209266;WS=50209248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,95:0.99:96
chr15	50212785	rs4426299	G	A	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=762;SC=TAATGTGTGTGTTTTCCGTTT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=50212793;WS=50212775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	50272085	rs8034382	A	G	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=29;PP=825;SC=CTAATTACGCATCTAACTCCA;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=50272093;WS=50272075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	50273488	.	G	C	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.101;ClippingRankSum=-0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=100;ReadPosRankSum=-0.551;SC=TTTAGTGTCAGGACCTGCAAA;SOR=0.148;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=8;WE=50273496;WS=50273478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr15	50288858	rs71469670	T	G	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.884;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=8;PP=595;ReadPosRankSum=0.013;SC=TTTGTTTATCTGTTTAAAATA;SOR=0.808;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=118;TCF=95;TCR=23;TR=43;WE=50288866;WS=50288848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,43:0.36:119
chr15	50289094	rs72734852	C	A	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.247;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=34;PP=719;ReadPosRankSum=-0.679;SC=GTCATTCACACTTCGCTCACT;SOR=1.409;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=66;TCF=3;TCR=63;TR=35;WE=50289102;WS=50289084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,34:0.53:64
chr15	50301649	rs12910217	C	T	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=195;ReadPosRankSum=0.263;SC=CAGCATGGAACGGATTTTTGA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=12;WE=50301657;WS=50301639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr15	50311135	rs12591825	C	A	1477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=36;PP=2799;ReadPosRankSum=0.387;SC=TACCAGAGTACTTCCTGTCAT;SOR=0.701;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=205;TCF=98;TCR=107;TR=66;WE=50311156;WS=50311125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,67:0.32:211
chr15	50311148	rs11070741	A	G	1552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=41;PP=2799;ReadPosRankSum=-0.981;SC=CCTGTCATTAAACCCTCAGCT;SOR=0.671;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=208;TCF=85;TCR=123;TR=67;WE=50311156;WS=50311125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,68:0.32:213
chr15	50366116	rs11412296	T	TA	552.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=705;ReadPosRankSum=-0.140;SC=CCCATGACAATAAGCATACCA;SOR=0.232;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=69;TCR=0;TR=21;WE=50366124;WS=50366106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,23:0.33:69
chr15	50366486	rs77018215	G	T	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=211;ReadPosRankSum=-0.425;SC=AAGGCTGCAAGAATTCTTTTC;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=11;WE=50366494;WS=50366476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr15	50474766	rs1648348	A	C	4118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=65;NR=53;PP=2965;SC=CAGCTACGGGAAGCGGCGGCC;SOR=0.882;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=65;TCR=53;TR=118;WE=50474774;WS=50474756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr15	50489677	rs1863511	A	T	3686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=95;NR=17;PP=2916;SC=TTGTTTTGATATTTTTCTTAT;SOR=3.403;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=95;TCR=17;TR=112;WE=50489685;WS=50489667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr15	50521265	rs5812509	T	TA	5500.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=92;PP=2936;SC=GATCTGTACCTAACCCATAGA;SOR=1.008;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=147;TCF=53;TCR=94;TR=138;WE=50521273;WS=50521255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr15	50546933	rs367785479	TTTTC	T	709.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.090;NF=4;NR=22;PP=254;ReadPosRankSum=0.554;SC=CTTTCTAGTTTTTTCTCTCTC;SOR=1.022;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=26;WE=50546946;WS=50546923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,27:0.71:38
chr15	50555710	rs854160	T	C	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.932;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.293;NF=3;NR=13;PP=270;ReadPosRankSum=2.152;SC=AAGAAGGAGATGGATTTGGCC;SOR=0.090;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=16;WE=50555718;WS=50555700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr15	50557738	rs854163	G	A	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.187;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=12;PP=1020;ReadPosRankSum=-0.456;SC=ACCAGCAGCCGTTCCTGCAGG;SOR=0.934;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=47;TCR=17;TR=46;WE=50557746;WS=50557728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,46:0.73:63
chr15	50570999	rs11372405	G	GT	767.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.429;NF=0;NR=30;PP=601;ReadPosRankSum=1.626;SC=AAAGAAGAGGGTTTTTTTTTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=30;WE=50571007;WS=50570989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr15	50574621	rs11635546	G	A	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=360;ReadPosRankSum=2.077;SC=AAACTTAGCCGGGTATAGCGG;SOR=0.232;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=17;WE=50574629;WS=50574611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr15	50581634	rs34330339	T	TA	2013.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.49;MQRankSum=0.000;QD=22.37;ReadPosRankSum=-0.383;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:5,85:0.94:90
chr15	50596070	rs7164798	T	C	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.48;ReadPosRankSum=-2.151;SOR=0.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,6:0.19:31
chr15	50596370	rs77189483	T	C	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=31;PP=905;ReadPosRankSum=-1.053;SC=ATTTACATTATTGTTACTACA;SOR=0.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=9;TCR=46;TR=37;WE=50596378;WS=50596360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,37:0.69:54
chr15	50601811	rs11636564	T	C	1952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=0;PP=1550;SC=ATAAACACAATACTGACTACA;SOR=8.222;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=56;TCR=0;TR=56;WE=50601819;WS=50601801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	50602067	rs35446819	T	C	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-5.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=297;ReadPosRankSum=0.346;SC=TTTCCCTTCCTGTCTTTATTA;SOR=0.437;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=57;TCF=5;TCR=52;TR=22;WE=50602075;WS=50602057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,21:0.36:59
chr15	50652513	rs139520399	C	CA	644.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=773;ReadPosRankSum=-1.007;SC=TCACCATCCTCAAAGGTGTTA;SOR=0.430;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=22;WE=50652521;WS=50652503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
chr15	50754339	rs3098169	G	A	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=367;ReadPosRankSum=1.072;SC=ATTATTATTCGTCTGCGTTTT;SOR=0.760;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=17;WE=50754347;WS=50754329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr15	50773755	rs3131561	G	A	2247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=40;PP=1771;SC=ACCATGAGCAGCAATCTCCTC;SOR=0.992;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=30;TCR=40;TR=70;WE=50773763;WS=50773745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	50781963	rs3098176	T	A	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=-0.648;QD=17.33;ReadPosRankSum=0.172;SOR=1.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr15	50782335	rs2289108	G	A	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.422;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=202;ReadPosRankSum=1.093;SC=GAAGTTTATCGCCATTTTATT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=7;WE=50782343;WS=50782325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
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chr15	50833113	rs2003359	A	G	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=264;ReadPosRankSum=-0.438;SC=GAGCCACCGCACTCAGTCTAT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=16;WE=50833121;WS=50833111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr15	50836243	rs3109878	T	G	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.059;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=168;ReadPosRankSum=-1.786;SC=AAAAAAAGGATGCCAGGCTCA;SOR=1.402;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=8;WE=50836251;WS=50836233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr15	50854029	rs75278275	TA	T	402.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.859;HP=12;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=163;ReadPosRankSum=0.770;SC=CCACAACAATTAAAAAAAAAA;SOR=1.445;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=15;WE=50854037;WS=50854019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr15	50867082	rs473357	G	A	1741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.416;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=21;PP=1318;ReadPosRankSum=-2.059;SC=TATCTTCTTTGTAAATACTTG;SOR=1.576;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=106;TCF=63;TCR=43;TR=61;WE=50867090;WS=50867072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,68:0.60:113
chr15	50873262	rs2414060	A	G	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=281;ReadPosRankSum=-0.745;SC=TTTATTTATTATAACTGTATT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=13;WE=50873270;WS=50873252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,13:0.68:19
chr15	50878478	rs539383	G	A	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=257;ReadPosRankSum=-0.757;SC=CAGAATTTTCGTCTTCTGACT;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=12;WE=50878486;WS=50878468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr15	50878509	rs1395297	T	C	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=261;ReadPosRankSum=1.965;SC=TCACTGCTCATGTGTTTGACA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=12;WE=50878517;WS=50878499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr15	50878574	rs3109894	G	A	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.311;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=574;ReadPosRankSum=-0.840;SC=CTATTCATATGGTCAAAATAC;SOR=1.098;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=27;WE=50878582;WS=50878564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr15	50882045	rs113973270	T	TTTTTTTG	103.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.765;NF=1;NR=2;PP=105;ReadPosRankSum=-2.260;SC=AGGTTACAGTTTTTTTTGTTT;SOR=0.105;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=3;WE=50882053;WS=50882035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr15	50885976	rs567109	G	T	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.895;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=417;ReadPosRankSum=0.650;SC=AGAAAATCAAGGAAGAGCTAT;SOR=1.469;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=21;WE=50885984;WS=50885966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr15	50888619	rs675011	A	T	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=40;PP=1069;SC=ACAACTTAAAAATAGTAATTC;SOR=4.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=43;WE=50888627;WS=50888609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	50899211	rs12439744	C	T	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=77;ReadPosRankSum=-0.300;SC=ACAAAGTATACAGCATACTCA;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=50899219;WS=50899201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr15	50899309	rs11633404	C	A	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.450;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=686;ReadPosRankSum=-2.123;SC=ACACACACACCCCCCTACGTA;SOR=1.056;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=31;WE=50899317;WS=50899297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr15	50901929	rs35281039	TA	T	1260.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.255;HP=13;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.680;NF=51;NR=11;PP=647;ReadPosRankSum=0.962;SC=TTCCTAAAATTAAAAAAAAAA;SOR=1.053;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=90;TCR=20;TR=62;WE=50901937;WS=50901919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,67:0.70:96
chr15	50903600	rs4775894	C	T	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=416;ReadPosRankSum=0.758;SC=ATTAATACTTCCTACTTTTTA;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=18;WE=50903608;WS=50903590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,20:0.74:27
chr15	50911865	rs34352984	AT	A	264.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.61;ReadPosRankSum=0.299;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr15	50916575	rs137968959	GATTTAC	G	410.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=438;ReadPosRankSum=0.468;SC=AAGTCCTTAGGATTTACATTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=8;WE=50916588;WS=50916565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr15	50920509	.	CT	C	36	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5040;HP=13;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=25;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=36;QD=13.6666666667;SC=AAGGTGAACACTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=50920517;WS=50920499;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,3:0.33:9
chr15	50924995	rs2292175	G	A	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=264;ReadPosRankSum=-0.100;SC=TATTTCACCAGTTTAGAATGT;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=13;WE=50925003;WS=50924985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr15	50926523	rs140773609	AAAAT	A	565.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=317;ReadPosRankSum=0.247;SC=CTCCGTATCAAAAATAAATAA;SOR=1.329;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=8;WE=50926534;WS=50926513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr15	50941108	rs2063011	C	G	1933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=49;PP=1608;SC=GAGATTAAAACACCCTTCAAA;SOR=4.066;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=52;WE=50941116;WS=50941098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
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chr15	50950141	rs17645826	T	C	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.682;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=246;ReadPosRankSum=0.405;SC=TCAGTAGATATTATAGTTCAC;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=6;WE=50950160;WS=50950131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
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chr15	51039891	rs17599340	T	C	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.612;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=189;ReadPosRankSum=-0.183;SC=ATAACAGCAATAGTCCACATT;SOR=1.569;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=13;WE=51039899;WS=51039881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,16:0.33:49
chr15	51040798	rs8035452	T	C	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=154;ReadPosRankSum=0.273;SC=ACTCAGCCTCTAAACCACACA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=7;WE=51040806;WS=51040788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr15	51204364	rs1147129	G	A	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.74;ReadPosRankSum=-0.106;SOR=0.664;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,27:0.23:118
chr15	51204394	rs3214932	C	CT	438.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=2.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.52;ReadPosRankSum=-2.264;SOR=0.395;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,19:0.20:97
chr15	51207818	rs2663553	G	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.690;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=42;ReadPosRankSum=-0.874;SC=CCTTGAAGTTGCATCTATTAT;SOR=0.057;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=5;WE=51207826;WS=51207808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr15	51217361	rs2306331	T	C	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.382;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=40;PP=902;ReadPosRankSum=-0.116;SC=GATTTTCCCCTGCGAAATGAT;SOR=1.149;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=65;TCF=13;TCR=52;TR=49;WE=51217369;WS=51217351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,51:0.76:67
chr15	51217475	rs2306332	G	A	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=406;SC=AGAAGTTTATGCTAGAAAATT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=51217483;WS=51217465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	51276128	rs2306335	A	G	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=457;SC=TATTAGTTCCAGGCTTGAATT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=51276136;WS=51276118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	51293164	rs3840015	G	GT	1182.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=1;PP=1423;SC=TTTGAAATTTGTTGTTTAGAA;SOR=5.728;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=33;WE=51293172;WS=51293154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	51350655	rs76241791	AT	A	515.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=18;PP=843;SC=GGTAAAAAAAATATATATAAA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=51350663;WS=51350645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	51502844	rs4646	A	C	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.474;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=829;ReadPosRankSum=0.166;SC=AGCAGATGACAAATAGCACCT;SOR=0.856;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=79;TCR=47;TR=42;WE=51502852;WS=51502834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,46:0.34:134
chr15	51502986	rs10046	G	A	1928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.495;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=33;PP=1445;ReadPosRankSum=-0.505;SC=GCTCCAGAGTGGGTACTGACC;SOR=0.538;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=201;TCF=122;TCR=79;TR=79;WE=51502994;WS=51502976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,81:0.40:205
chr15	51503881	rs28757202	T	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.59;ReadPosRankSum=0.226;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,15:0.25:61
chr15	51503897	rs28757201	G	A	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=244;ReadPosRankSum=-1.163;SC=TTGAAAAAAGGGCACTTAGGG;SOR=0.827;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=66;TCF=44;TCR=22;TR=18;WE=51503905;WS=51503887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,20:0.29:70
chr15	51504061	rs28757200	C	T	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.794;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=68;ReadPosRankSum=0.669;SC=GCTCATGGGGCCATTTGATGA;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=5;WE=51504069;WS=51504051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr15	51504811	rs1065779	A	C	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=51;ReadPosRankSum=-0.938;SC=TCCATCTGTGATTGGTATTAA;SOR=0.117;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=5;WE=51504819;WS=51504801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr15	51507508	rs2289105	T	C	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=339;ReadPosRankSum=0.759;SC=CACTCAAGGATCAACAACCTC;SOR=0.544;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=1;TCR=56;TR=16;WE=51507516;WS=51507498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,16:0.29:56
chr15	51507782	rs2289106	T	G	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.837;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=10;PP=712;ReadPosRankSum=-0.241;SC=ATTACAGAACTGCTAGAGAAA;SOR=0.114;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=116;TCF=100;TCR=16;TR=46;WE=51507790;WS=51507772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,45:0.39:116
chr15	51510702	rs1143704	T	A	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=0.544;SC=ACCAATCCAATTGTACTCATA;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=7;WE=51510710;WS=51510692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr15	51510868	rs4324076	A	C	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.364;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=17;PP=576;ReadPosRankSum=0.299;SC=GGAAAAAAAAACACACATACA;SOR=0.956;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=139;TCF=82;TCR=57;TR=41;WE=51510876;WS=51510858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,42:0.29:146
chr15	51519945	rs28892005	A	AAAG	1665.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.145;NF=32;NR=3;PP=1518;ReadPosRankSum=-1.969;SC=CATAGACAAAAAAGATTGTAG;SOR=0.909;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=97;TCF=85;TCR=12;TR=35;WE=51519953;WS=51519935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,45:0.44:102
chr15	51529349	rs10550124	GAAACA	G	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.22;ReadPosRankSum=-0.854;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
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chr15	51634255	rs2446421	T	G	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.628;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=625;ReadPosRankSum=-0.158;SC=GTAGGCGGGGTCTCTGTTCCC;SOR=0.943;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=114;TCF=47;TCR=67;TR=37;WE=51634263;WS=51634245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,37:0.32:117
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chr15	51634322	rs72363270	TCTTCTCCCCTGGCCAGG	T	475.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.81;ReadPosRankSum=-0.955;SOR=0.515;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,15:0.28:54
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chr15	51675932	rs11306243	AT	A	234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQRankSum=-0.958;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.764;SOR=0.246;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
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chr15	51839312	rs72283649	TGATGCCAG	T	2753.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=0;PP=2942;SC=TCAGGCAGCTTGATGCCAGAG;SOR=8.287;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=44;WE=51839327;WS=51839302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	51914778	rs6493514	T	G	1888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=44;PP=1516;SC=GCGCGGGAGGTGCGACAAGCT;SOR=2.119;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=60;WE=51914786;WS=51914768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	51981595	.	GGGGTGT	G,GGT	2656.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.15;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=0,0;NR=69,69;PP=144,1240;SC=CATATGCATGGGGGTGTGTGT;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=75;TCF=0;TCR=75;TR=69,69;WE=51981608;WS=51981585;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.19,0.81:36
chr15	51991454	rs2622774	C	T	1290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=12;PP=1007;SC=AAACATTTTTCGTAAAAATTT;SOR=1.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=36;WE=51991462;WS=51991444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	52185961	rs11370809	C	CA	891.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.234;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=1.662;NF=36;NR=7;PP=478;ReadPosRankSum=1.578;SC=GACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=0.432;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=117;TCF=96;TCR=21;TR=43;WE=52185969;WS=52185951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,48:0.57:84
chr15	52252799	rs2258248	C	T	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.613;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=5;PP=953;ReadPosRankSum=1.828;SC=AACTTTATGCCTGGCCTTGAA;SOR=1.217;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=57;TCF=49;TCR=8;TR=40;WE=52252807;WS=52252789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,41:0.69:59
chr15	52264094	rs17612102	T	C	1842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=50;PP=1512;SC=GTGAACCTGTTCTCGCCTGGG;SOR=5.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=53;TCF=2;TCR=51;TR=52;WE=52264102;WS=52264084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	52486335	rs59434591	G	A	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=651;ReadPosRankSum=1.725;SC=GCAAAACACAGCTATCTCTAG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=26;WE=52486343;WS=52486325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr15	52487523	rs3751604	T	A	1249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=4;PP=955;ReadPosRankSum=1.045;SC=ATCAACATCTTATACCATAGT;SOR=2.687;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=37;WE=52487531;WS=52487513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr15	52504142	rs2278295	T	C	1080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=30;PP=926;SC=CCTAAGGAACTTGTGACTAGG;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=52504150;WS=52504132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	52505563	rs3751608	C	T	1941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=53;PP=1667;SC=TCTCCTACCCCATTCTGGCTG;SOR=3.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=10;TCR=53;TR=63;WE=52505571;WS=52505553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr15	52506655	rs6493546	C	T	213.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=1;PP=176;SC=AGGATCCTTTCGTTAGCCCAG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=52506663;WS=52506645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	52515678	rs4405492	G	T	2596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=5;PP=2137;SC=TGAATTTGACGCCACTGACAA;SOR=4.643;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=68;TCR=5;TR=73;WE=52515686;WS=52515668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr15	52531941	rs11635028	A	G	4557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=93;NR=46;PP=2965;SC=TGATCTTCCAACTTTTTCTGC;SOR=1.497;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=93;TCR=46;TR=139;WE=52531949;WS=52531931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr15	52534344	rs3751631	G	A	2644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=31;PP=2089;SC=CAAGATACCCGCGGCAGTGCT;SOR=1.455;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=58;TCR=31;TR=88;WE=52534352;WS=52534334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr15	52539673	rs10163109	C	T	3646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=35;PP=2802;SC=CAACTGTGGTCCGGAAATGCT;SOR=1.843;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=79;TCR=35;TR=114;WE=52539681;WS=52539663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr15	52548784	.	A	ACACGCGCGCG	4455.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.12;QD=37.13;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:5,115:0.96:120
chr15	52553007	rs4497629	C	G	2428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=6;PP=2159;SC=AAAAACCATGCGGCTCTCAAC;SOR=4.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=66;TCR=6;TR=72;WE=52553015;WS=52552997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	52556429	rs4776032	A	G	2081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=36;PP=1465;SC=TGATCTGCACATTGCCCAGAT;SOR=1.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=66;WE=52556437;WS=52556419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	52564191	rs3751629	T	C	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=13;PP=401;SC=AGGCCCTTCCTCTCAGCTGAG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=52564199;WS=52564181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	52587880	rs12907067	C	T	1592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=20;PP=1291;SC=ACGTGCGAGGCTCGGGGGCTG;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=31;TCR=20;TR=51;WE=52587888;WS=52587870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
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chr15	52640990	rs11386962	T	TA	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.682;HP=13;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.734;NF=12;NR=6;PP=236;ReadPosRankSum=-0.245;SC=AAGTATTTACTAAAAAAAAAA;SOR=0.148;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=18;WE=52640998;WS=52640980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,19:0.83:23
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chr15	52684004	rs1669872	C	A	1439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=0;PP=1178;SC=GAAAGCATAACCCCTACTTGT;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=52684012;WS=52683994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	52689526	rs2924130	T	C	4078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=75;PP=2965;SC=CGCGGGCATTTGTGGCCTGCA;SOR=0.870;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=59;TCR=75;TR=134;WE=52689534;WS=52689516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr15	52689631	rs1724577	T	G	3905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=72;PP=2965;SC=CACCCATGAGTTCACAGAAGA;SOR=1.142;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=48;TCR=72;TR=120;WE=52689639;WS=52689621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr15	52725587	rs1917972	A	C	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.169;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=135;ReadPosRankSum=0.355;SC=TGAAAAAAGAAATCTTGGCCA;SOR=0.223;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=52725595;WS=52725577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr15	52820904	rs1693513	C	T	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=41;ReadPosRankSum=-0.094;SC=GCTCCCGCCCCCTCCCCAGCC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=4;WE=52820912;WS=52820894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr15	52897478	rs2414163	T	C	2174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=58;PP=1910;SC=AATTGTAATATTTAAATACCA;SOR=5.994;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=60;TCF=2;TCR=58;TR=60;WE=52897486;WS=52897468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	52901433	rs12915981	C	T	2036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=14;PP=1697;SC=TTATTAGGTACTAAGTTTTTC;SOR=2.457;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=61;WE=52901441;WS=52901423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	52901638	rs3751614	T	C	3748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=64;PP=2965;SC=GCTCCAAGTGTTGAGCAATCC;SOR=1.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=46;TCR=64;TR=110;WE=52901646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr15	52901977	rs2414166	G	A	8787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=105;NR=159;PP=2965;SC=TCAAATGTTGGGCAATTCTTG;SOR=1.200;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=264;TCF=105;TCR=159;TR=264;WE=52901985;WS=52901967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr15	52904046	rs4776063	C	A	1490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=38;PP=1175;SC=AGAAAATTATCATTGTAAAGT;SOR=4.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=41;WE=52904054;WS=52904036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	53230662	rs12050508	C	T	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.609;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=175;ReadPosRankSum=-0.730;SC=TGGACTTGCCCGAACCTATGC;SOR=0.054;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=12;WE=53230670;WS=53230652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr15	53809958	rs17630660	A	C	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=538;ReadPosRankSum=0.228;SC=TCACCTAGGAAAAAAGCAGAT;SOR=0.662;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=88;TCF=33;TCR=55;TR=32;WE=53809966;WS=53809948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,32:0.34:94
chr15	53907948	rs17730281	G	A	4000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.913;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=47;PP=2962;ReadPosRankSum=0.133;SC=AAAATATTGAGGTGCTTAATG;SOR=1.417;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=182;TCF=112;TCR=70;TR=138;WE=53907956;WS=53907938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,143:0.74:192
chr15	53994493	rs6416452	A	G	4776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=88;PP=2965;SC=GACCATGTGGATAGAGTAATG;SOR=1.225;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=58;TCR=88;TR=146;WE=53994501;WS=53994483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr15	53997089	rs578595	C	A	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=149;ReadPosRankSum=0.097;SC=CAAATGCCAGCAAATTATTTA;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=9;WE=53997097;WS=53997079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr15	53998314	rs690235	G	T	2246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=60;PP=1719;SC=ATTCTAACTAGAGAGAGATGG;SOR=5.670;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=62;TCF=2;TCR=60;TR=62;WE=53998322;WS=53998304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	54008795	rs690337	T	C	3243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.159;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=56;PP=2431;ReadPosRankSum=0.603;SC=AGGAAGTGAGTGTACTTACAC;SOR=0.408;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=200;TCF=117;TCR=83;TR=126;WE=54008803;WS=54008785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,128:0.63:203
chr15	54008845	rs690346	T	C	5000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=107;PP=2965;SC=GCCTTCTCCATGCACTGTCCA;SOR=1.280;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=63;TCR=107;TR=170;WE=54008853;WS=54008835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr15	54306925	rs12437941	G	A	5044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=85;PP=2965;SC=TTTGAATGGAGGTGTTCAGGG;SOR=0.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=69;TCR=86;TR=154;WE=54306933;WS=54306915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr15	54435446	rs1897069	G	C	291.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.9784;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=214;SC=GCTTACCTTAGCTATACTTGC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=9;WE=54435454;WS=54435436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
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chr15	54529770	rs16974342	C	T	2838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=6.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=62;PP=2213;ReadPosRankSum=-0.586;SC=AGTATATGCACGTCAACCTCC;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=168;TCF=63;TCR=105;TR=99;WE=54529778;WS=54529760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,105:0.58:180
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chr15	54685448	rs73417774	G	A	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=33;PP=758;ReadPosRankSum=-0.502;SC=TATTTTAAGCGCAACATATAC;SOR=0.457;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=34;WE=54685456;WS=54685438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,35:0.61:57
chr15	54685463	rs489526	G	A	1310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=37;PP=1125;SC=ATATACTGACGACAATAATAA;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=37;WE=54685471;WS=54685453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	54792428	rs8025195	A	G	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=495;ReadPosRankSum=-0.711;SC=CACATTGCTTACTTTTAACCT;SOR=0.540;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=23;WE=54792436;WS=54792418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr15	54842003	rs149201837	G	GTC	844.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.711;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.765;NF=1;NR=19;PP=830;ReadPosRankSum=-1.459;SC=GAAGATGTGTGTGTGATTTCA;SOR=1.179;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=20;WE=54842011;WS=54841993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr15	54847509	rs8039515	G	T	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=344;ReadPosRankSum=1.897;SC=AATGCATTCAGGTGCAGAAGA;SOR=1.220;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=16;WE=54847517;WS=54847499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr15	54847535	rs62022210	G	A	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.675;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=1;PP=714;ReadPosRankSum=-0.041;SC=CAAATAGGAAGTTTGGCATAT;SOR=1.721;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=29;WE=54847543;WS=54847525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,30:0.68:44
chr15	54847677	rs11639005	C	T	1477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.111;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=29;PP=1147;ReadPosRankSum=-0.076;SC=CAAGACAATGCGCTATAATGG;SOR=0.426;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=79;TCF=34;TCR=45;TR=54;WE=54847685;WS=54847667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,55:0.67:82
chr15	54847726	rs62022212	T	C	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.109;HP=3;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=2223;ReadPosRankSum=0.357;SC=ATTATAATGCTCCTATATATA;SOR=0.713;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=76;TCF=38;TCR=38;TR=49;WE=54847748;WS=54847716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,50:0.63:79
chr15	54847740	rs62022213	C	A	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.899;HP=1;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=28;PP=2223;ReadPosRankSum=0.356;SC=ATATATACATCGAGAGAGGCC;SOR=1.021;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=70;TCF=32;TCR=38;TR=48;WE=54847748;WS=54847716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,49:0.67:73
chr15	54914716	rs2681964	C	T	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=462;SC=AAAAACTGCACAATTATTTTA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=54914724;WS=54914706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	54915975	rs2414332	A	T	2597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=9;PP=2112;SC=CTAAAATGTGATATTTCCTTT;SOR=3.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=67;TCR=9;TR=76;WE=54915983;WS=54915965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr15	54918911	rs11856235	T	C	1468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=0;PP=1200;ReadPosRankSum=-0.884;SC=ATATCCTATTTGCCAACATAA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=40;WE=54918919;WS=54918902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr15	54918943	rs11852743	G	A	2419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=0;PP=1924;SC=AATGTATACAGTTTTCAGCAG;SOR=8.526;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=64;TCR=0;TR=64;WE=54918951;WS=54918933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	54919047	rs1520411	A	G	8200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=176;NR=75;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.752;SC=AGGAAAATCGACCAGGGGCTT;SOR=0.812;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=254;TCF=179;TCR=75;TR=251;WE=54919055;WS=54919037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,257:1.00:258
chr15	55621854	rs78117879	A	G	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=136;ReadPosRankSum=0.896;SC=CTTGCTATTTAGAAGATAATA;SOR=0.752;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=8;WE=55621862;WS=55621844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr15	55653031	rs501231	A	G	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.139;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=580;ReadPosRankSum=0.102;SC=TCCTTCTCCAAGGATACTCTT;SOR=0.512;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=45;TCF=23;TCR=22;TR=27;WE=55653039;WS=55653021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,28:0.61:46
chr15	55681780	rs148264230	G	C	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.669;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=522;ReadPosRankSum=0.069;SC=TACAGAACATGACAGGACTGC;SOR=0.243;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=22;WE=55681788;WS=55681770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
chr15	55710365	rs56070549	T	C	2476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=2.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.32;ReadPosRankSum=1.195;SOR=0.957;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,91:0.64:143
chr15	55710369	rs6493785	T	A	5657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.84;SOR=1.203;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr15	55731772	rs375468265	T	C	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.949;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=307;ReadPosRankSum=-0.991;SC=AGCTTGTTTGTGTAGCCACTA;SOR=0.540;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=25;TCR=71;TR=30;WE=55731780;WS=55731762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,29:0.30:97
chr15	55759193	rs600753	T	C	992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.781;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=805;ReadPosRankSum=-0.115;SC=TTTTTTTCTTTCTTCTTTAAT;SOR=0.587;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=94;TCF=43;TCR=51;TR=37;WE=55759201;WS=55759183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,37:0.39:96
chr15	55838506	rs11858599	G	A	1704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.519;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=50;PP=1315;ReadPosRankSum=-0.418;SC=GGTGAAGAGAGGATTTATTGC;SOR=1.280;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=223;TCF=88;TCR=135;TR=71;WE=55838514;WS=55838496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,73:0.32:231
chr15	55838585	rs11858624	G	T	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.676;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=31;PP=763;ReadPosRankSum=-0.699;SC=CCCATTTGCAGGGTTATTGTT;SOR=0.323;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=181;TCF=57;TCR=124;TR=51;WE=55838593;WS=55838575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,53:0.29:185
chr15	55840995	rs2617227	A	G	2255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=1;PP=2038;SC=ATGAATGATTAAAAGTACAAT;SOR=6.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=66;TCF=65;TCR=1;TR=66;WE=55841003;WS=55840985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	55841209	rs76474612	T	A	858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.953;HP=13;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.456;NF=6;NR=38;PP=808;ReadPosRankSum=-0.809;SC=AAAAAAAAAATTCAGGTAATA;SOR=0.875;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=142;TCF=22;TCR=120;TR=44;WE=55841217;WS=55841185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,42:0.32:133
chr15	55881111	rs1992236	A	G	1564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=33;PP=1270;SC=ACCTGTCTGTAGAATGCCTCC;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=47;WE=55881119;WS=55881101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	55974742	.	T	TTTTATTTATTTA	1427.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.39;QD=43.26;SOR=7.054;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	56030543	rs12906885	G	A	1749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=7;PP=1392;SC=TTTTATTTATGAAGTTAGAAA;SOR=3.690;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=48;TCR=7;TR=55;WE=56030551;WS=56030533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	56030756	rs4774222	T	C	2593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=62;PP=2113;SC=CTACAAACTCTAAAAGGTGGG;SOR=3.116;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=13;TCR=63;TR=75;WE=56030764;WS=56030746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr15	56032519	rs10152116	G	A	2373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=1;PP=1993;SC=TATTAATAAAGCAAGAAATCA;SOR=7.083;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=66;TCF=65;TCR=1;TR=66;WE=56032527;WS=56032509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr15	56032975	rs7182733	G	A	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=602;SC=TTCAGGGTATGAGATGACGAA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=56032983;WS=56032965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	56034878	rs11632579	G	A	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=293;SC=TGGCGGTTCCGGACAGGCCGC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=56034886;WS=56034868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	56035010	rs12910180	G	A	1090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=22;PP=835;SC=ACAGCGGTAAGAGAAAGCAGA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=32;WE=56035018;WS=56035000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	56122347	rs2288344	T	G	1044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.051;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=37;PP=876;ReadPosRankSum=1.203;SC=GACGTAGGACTGGGTTCTGGG;SOR=2.400;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=0;TCR=60;TR=37;WE=56122355;WS=56122337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,37:0.61:61
chr15	56122664	rs12910830	T	C	2142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.763;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=31;PP=1752;ReadPosRankSum=1.498;SC=AACAGAGGAATCTCACTCTCT;SOR=0.522;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=112;TCF=73;TCR=39;TR=83;WE=56122672;WS=56122654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,83:0.73:114
chr15	56122741	rs17238461	A	C	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=476;ReadPosRankSum=-0.172;SC=GCTTTTCAGGAGTACCCCACT;SOR=0.629;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=111;TCF=38;TCR=73;TR=37;WE=56122749;WS=56122731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,39:0.34:114
chr15	56125135	rs8024944	C	A	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=5;PP=749;ReadPosRankSum=-0.664;SC=TGGAAGCTTGCGGATTCGTCA;SOR=0.746;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=34;WE=56125143;WS=56125125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,34:0.62:55
chr15	56125182	rs8026172	T	A	1066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=14;PP=794;ReadPosRankSum=1.115;SC=TCCATTTTTTTAATGATCTAT;SOR=0.743;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=40;WE=56125190;WS=56125172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,41:0.64:64
chr15	56130286	rs11071227	A	T	1111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=21;PP=814;SC=AATAAAATACATACTAATAAA;SOR=1.483;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=31;WE=56130294;WS=56130276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	56130633	rs62046644	T	C	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.745;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=251;ReadPosRankSum=0.291;SC=AGGAATGTATTAAGTGTACGT;SOR=1.467;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=13;WE=56130641;WS=56130623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr15	56130692	rs62046645	T	C	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=9;PP=406;ReadPosRankSum=0.769;SC=TTTTAACTGATCAAAATTCAC;SOR=0.696;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=46;TCR=26;TR=25;WE=56130700;WS=56130682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,27:0.36:75
chr15	56139153	rs2288346	T	C	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=2;PP=428;SC=GTATTTATTATAAACATGACT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=56139161;WS=56139143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	56140995	rs12232351	T	A	3171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.241;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=47;PP=2351;ReadPosRankSum=1.250;SC=AGCATTTCTATACACTTACAG;SOR=0.564;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=104;TCR=73;TR=115;WE=56141003;WS=56140985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,120:0.66:183
chr15	56144848	rs62043760	C	T	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.119;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=190;ReadPosRankSum=0.611;SC=CCCAAGCAACCACTCATCTGC;SOR=0.269;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=14;WE=56144856;WS=56144838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,16:0.36:44
chr15	56144888	rs201121993	AATATATATAT	A	367.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.12;QD=36.77;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	56152598	rs4774228	A	G	2732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.99;NF=72;NR=16;PP=1953;SC=ATCTAAGAGCATCTTACTGAG;SOR=2.857;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=72;TCR=16;TR=88;WE=56152606;WS=56152588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr15	56152729	rs2303579	T	C	5055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=67;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.853;SC=GAAGGCCTGGTTGCTATACAT;SOR=0.320;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=155;TCF=88;TCR=67;TR=152;WE=56152737;WS=56152719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,154:0.99:155
chr15	56152872	rs2303580	C	T	7181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.144;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=115;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.784;SC=GGAAGACTCTCGGTTGTCAAC;SOR=0.335;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=110;TCR=116;TR=223;WE=56152880;WS=56152862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,230:1.00:231
chr15	56161919	rs1912402	C	T	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.133;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=466;ReadPosRankSum=0.386;SC=ACTTTAACACCGGGAGAAAAG;SOR=0.321;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=25;WE=56161927;WS=56161909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr15	56162087	rs146081341	A	AAATAAATAAATC	97.37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.13;QD=32.46;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	56207983	rs7174459	C	T	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.674;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=26;PP=928;ReadPosRankSum=0.607;SC=TCTTCTGTAACGAGCCCTTCC;SOR=0.380;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=211;TCF=131;TCR=80;TR=60;WE=56207991;WS=56207973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,60:0.28:214
chr15	56216793	rs2271289	C	T	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=99;ReadPosRankSum=-0.297;SC=CTGGCTGCTCCACTGAAATGT;SOR=0.473;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=8;WE=56216801;WS=56216783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr15	56258809	rs6493829	A	T	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.72;ReadPosRankSum=0.205;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr15	56386577	rs7170589	T	G	4991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=79;PP=2965;SC=CGACCAAAATTAGTGTCATGA;SOR=0.745;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=153;TCF=74;TCR=79;TR=153;WE=56386585;WS=56386567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr15	56387931	rs11071247	C	T	11278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=150;NR=184;PP=2965;SC=CCTGGGTCTCCTGCAATGTAG;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=335;TCF=151;TCR=184;TR=334;WE=56387939;WS=56387921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,340:1.00:340
chr15	56535174	rs2460649	A	G	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=1;PP=760;SC=ACCTCCAGAGATCCTACAAAT;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=56535182;WS=56535164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	56657581	rs2682033	A	C	1544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=47;NR=0;PP=1270;SC=GCGGGAGGCAACCGGGATGTG;SOR=7.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=47;WE=56657589;WS=56657571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	56680944	rs1477589	T	C	188.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=153;SC=GGAAAAAATGTTAGGTGAAAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=56680952;WS=56680934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	56686299	rs72742631	T	C	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=317;ReadPosRankSum=-1.846;SC=TAATGGTCTGTCTTACAATTG;SOR=0.175;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=16;WE=56686307;WS=56686289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr15	56704371	.	CGTGTGT	C	103	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5020;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=103;QD=36.3333333333;SC=TACCCCCAAGCGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=56704384;WS=56704370;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:0,3:1.00:3
chr15	56719797	rs795785	G	T	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=1.366;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.91;ReadPosRankSum=-0.510;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,13:0.23:56
chr15	56720715	rs1554410	T	G	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=98;ReadPosRankSum=0.636;SC=TGGTTTGAATTATTTTTATTC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=6;WE=56720723;WS=56720705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr15	56721264	rs795787	G	A	1471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=8;PP=1193;SC=GTGGTAACATGCAAAAAATCT;SOR=3.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=47;WE=56721272;WS=56721254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	56721406	rs808730	C	T	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=33;PP=958;SC=GAGAAAAATACTTTGTGGGTT;SOR=3.500;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=38;WE=56721414;WS=56721396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	56726205	rs137878743	TTATA	T	1324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.768;NF=26;NR=0;PP=1305;ReadPosRankSum=-0.293;SC=GTCAGAAAATTTATATATATA;SOR=1.480;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=26;WE=56726216;WS=56726195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,34:0.65:52
chr15	56756285	rs1715919	T	G	1833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=21;PP=1465;ReadPosRankSum=0.652;SC=TCTGAGAAATTGCTTGCGCTG;SOR=0.748;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=93;TCF=64;TCR=29;TR=70;WE=56756293;WS=56756275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,69:0.73:95
chr15	56923714	rs8043381	G	A	6598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=111;NR=85;PP=2965;SC=TTTCTTTTTCGTCTTCCAGGT;SOR=1.011;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=197;TCF=111;TCR=86;TR=196;WE=56923722;WS=56923704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr15	56946296	rs8028457	C	A	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=588;SC=AAAACAACAACATACTTTAAT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=56946304;WS=56946286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	56959028	rs28620278	C	T	1982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=20;PP=1472;SC=TTGGATTTGACTGTATTAGGT;SOR=1.292;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=32;TCR=20;TR=52;WE=56959036;WS=56959018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	56981703	rs1871861	T	A	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.16;SOR=6.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	57210562	rs213150	C	A	2062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=10;NR=58;PP=1675;SC=ACGGTACCTGCCACCCCGCTC;SOR=3.193;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=10;TCR=58;TR=68;WE=57210570;WS=57210552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr15	57458784	rs3794617	C	T	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=508;SC=TAATTTGTAACTAAGTGTTGT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=57458792;WS=57458774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	57484572	rs369602117	CT	C	51.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=3.025;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.67;ReadPosRankSum=-0.190;SOR=1.348;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,15:0.19:77
chr15	57523563	rs3838866	AT	A	2094.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=78;PP=1800;SC=TTATTTAGGCATTTTTTTTGG;SOR=8.789;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=95;TCF=0;TCR=95;TR=78;WE=57523571;WS=57523553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr15	57540510	rs72733957	C	G	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=107;ReadPosRankSum=-0.104;SC=AAGGACAGACCCACCTCCCAC;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=7;WE=57540518;WS=57540500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr15	57731335	rs1280395	A	C	9457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=156;NR=115;PP=2965;SC=CAGAATTAATACAGATGACAG;SOR=0.955;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=271;TCF=156;TCR=115;TR=271;WE=57731343;WS=57731325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,281:1.00:281
chr15	57731573	rs7182648	C	T	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.566;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=36;PP=1231;ReadPosRankSum=0.703;SC=TGTGCCCACTCCAGGCCTCCC;SOR=0.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=180;TCF=79;TCR=101;TR=64;WE=57731581;WS=57731563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,65:0.35:186
chr15	57731728	rs1280396	A	G	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.865;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=26;PP=490;ReadPosRankSum=0.158;SC=GAACCGGGCAACAGCAACTTC;SOR=1.688;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=76;TCF=7;TCR=69;TR=27;WE=57731736;WS=57731718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,27:0.35:77
chr15	57732563	.	C	T	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.386;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=271;ReadPosRankSum=0.186;SC=AACAACAGGCCTTATGTTCCA;SOR=0.177;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=13;WE=57732571;WS=57732553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr15	57732743	rs1280398	T	C	1077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.361;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=759;ReadPosRankSum=1.429;SC=TTTCCGAGGCTTTAATGGTTA;SOR=0.843;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=170;TCF=66;TCR=104;TR=48;WE=57732751;WS=57732733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,50:0.29:171
chr15	57743933	rs1280406	A	G	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=35;PP=970;SC=TAATCACTGAATAAATTCCTG;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=57743941;WS=57743923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	57817050	rs10518925	G	A	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=652;ReadPosRankSum=1.156;SC=TCGTGAGACAGCTTTGGTGCT;SOR=1.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=27;WE=57817058;WS=57817040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr15	57836823	rs8029295	G	A	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=31;PP=875;SC=ACTGCAGTGCGGAGGCCCCAG;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=33;WE=57836831;WS=57836813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	57884181	rs1690328	T	C	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=4;PP=398;SC=GCACGCTTATTCTGCCCGGGA;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=57884189;WS=57884171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	57884219	rs2453089	A	G	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=4;PP=397;SC=CCCGCTACCGACCGCCGCTGC;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=57884227;WS=57884209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	57896366	rs2172611	A	T	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=1;PP=424;SC=GTGTTCCCCAATGGAAGTAGG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=57896374;WS=57896356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	57896658	rs2453091	C	A	1435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=38;PP=1222;SC=GGTGTCTGCACCTCTGTTGAG;SOR=2.786;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=47;WE=57896666;WS=57896648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	57910164	rs937254	G	A	1250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=2;PP=1023;SC=CAGTGGGCCCGTTATTACAAC;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=37;WE=57910172;WS=57910154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	57910444	rs935548	A	G	6054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=148;PP=2965;SC=CATGCAAGAGAATGGAGTTGG;SOR=2.833;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=185;TCF=36;TCR=149;TR=184;WE=57910452;WS=57910434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr15	57914094	rs2934439	G	T	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=391;SC=AAGAATAATCGTATTCATATT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=57914102;WS=57914084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	57917821	rs2470360	C	T	1459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=1;PP=1258;SC=GCCCTTCTCTCTGGATCATGC;SOR=6.138;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=42;TCR=1;TR=43;WE=57917829;WS=57917811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	57918069	rs2069133	A	G	2460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=57;PP=1966;SC=CAGCCTTGGCATCAGATTCCA;SOR=2.026;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=22;TCR=57;TR=79;WE=57918077;WS=57918059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr15	57918090	rs2958059	A	G	2112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=51;PP=1720;SC=TTGGCCTGCAAGTACTCATCT;SOR=2.448;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=15;TCR=51;TR=66;WE=57918098;WS=57918080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	57924586	rs2733593	T	A	1387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=7;PP=1103;SC=TGCCAATTCCTCTGGGCCCTG;SOR=2.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=43;WE=57924594;WS=57924576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	57953564	rs986868	C	T	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.51;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	57967219	rs1991252	T	C	8188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=282;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=140;NR=126;PP=2965;SC=AGGCCAAGACTGAAGTGGAAA;SOR=0.790;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=266;TCF=140;TCR=126;TR=266;WE=57967227;WS=57967209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr15	57967285	rs5812908	AT	A	4276.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=136;PP=2616;SC=GAATTTCCTGATTTTTTTTTT;SOR=3.166;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=183;TCF=15;TCR=168;TR=147;WE=57967294;WS=57967275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr15	57976523	rs6493944	A	G	1303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=0;PP=1118;SC=CATTTTCTAGAGTTGTCTTAC;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=39;WE=57976531;WS=57976513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	57976583	rs2554032	A	C	2872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=70;NR=20;PP=2389;SC=CCTGACCTGCATTTTCTCATT;SOR=2.546;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=70;TCR=20;TR=90;WE=57976591;WS=57976573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr15	58000981	rs1062707	C	T	5143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=104;NR=48;PP=2965;SC=TGAAAGCTGCCATTGCAGAAT;SOR=1.798;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=104;TCR=49;TR=152;WE=58000989;WS=58000971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr15	58247563	rs4646640	C	G	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=64;ReadPosRankSum=0.059;SC=TTATCACCTGCGAACAGCAAG;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=58247571;WS=58247553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr15	58253062	rs3784263	C	T	1883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-6.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.294;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=58;PP=1379;ReadPosRankSum=0.653;SC=GAAAACATAGCACTGTGAGTT;SOR=0.849;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=257;TCF=88;TCR=169;TR=86;WE=58253070;WS=58253052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,89:0.33:269
chr15	58253106	rs3784262	T	C	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.563;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=52;PP=863;ReadPosRankSum=-1.114;SC=CTGACTGGCATGGTATTTCTT;SOR=0.953;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=180;TCF=33;TCR=147;TR=62;WE=58253114;WS=58253096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,64:0.34:186
chr15	58253269	rs3784260	T	G	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-5.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.191;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=6;PP=235;ReadPosRankSum=-0.524;SC=AAGGAGATACTTGTTTATTTC;SOR=0.274;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=18;WE=58253277;WS=58253259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr15	58256127	rs4646626	C	T	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=18;PP=631;ReadPosRankSum=-0.363;SC=CTCCCCACTACGCGCCTCTTG;SOR=0.709;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=44;TCR=43;TR=36;WE=58256135;WS=58256117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,37:0.40:92
chr15	58256296	rs4646625	C	T	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.599;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=98;ReadPosRankSum=0.026;SC=ATGTTCTCACCGCTTTGCCTG;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=7;WE=58256304;WS=58256286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
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chr15	58287435	.	C	A	626	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000;HP=22;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=29;MQ=55.78;NF=0;NR=24;PP=626;QD=27.5321338561;SC=AAAAAAAAAACAAACAGAAAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=24;WE=58287443;WS=58287425;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,24:0.71:34
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chr15	58476092	rs3832977	G	GA	1929.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.951;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.604;NF=41;NR=16;PP=1911;ReadPosRankSum=-0.310;SC=ACAAGTGAGTGAAAAACTAGA;SOR=0.242;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=91;TCF=67;TCR=24;TR=57;WE=58476100;WS=58476082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,74:0.75:99
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chr15	58571401	rs72739147	A	T	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.455;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=33;PP=903;ReadPosRankSum=0.085;SC=TCTTCCTTTCATAAAGAAGCT;SOR=0.283;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=145;TCF=43;TCR=102;TR=52;WE=58571409;WS=58571391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,54:0.36:152
chr15	58724371	rs8192701	C	T	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.035;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=42;PP=1018;ReadPosRankSum=-1.286;SC=CTTTTTAAAACGTGTGTCACA;SOR=1.022;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=160;TCF=54;TCR=106;TR=59;WE=58724379;WS=58724361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,59:0.37:158
chr15	58729144	rs17190517	C	T	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.022;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=37;PP=913;ReadPosRankSum=-0.982;SC=TCCCATAGAACGGTGTTGATA;SOR=0.344;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=78;TCF=9;TCR=69;TR=43;WE=58729152;WS=58729134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,42:0.55:77
chr15	58834741	rs690	G	T	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=5;PP=757;SC=AGGAATCTGTGCAACTCTCTC;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=58834749;WS=58834731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	58837910	rs2414592	T	C	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=19;PP=1015;SC=TCCTTGCTCCTGCGTAACCCT;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=24;TCR=19;TR=43;WE=58837918;WS=58837900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	58837933	rs6080	C	A	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.123;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=17;PP=855;ReadPosRankSum=0.188;SC=CCCCTGCTTTCCCATTAGGGC;SOR=0.505;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=57;TCF=34;TCR=23;TR=40;WE=58837941;WS=58837923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,41:0.71:58
chr15	58838010	rs6083	A	G	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=2.324;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.30;ReadPosRankSum=0.487;SOR=0.401;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,18:0.23:79
chr15	58840450	rs1007543	A	C	1364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=6;PP=1158;SC=CTCCTGTGGGATGAGAACCAA;SOR=3.003;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=40;WE=58840458;WS=58840440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	58853079	rs3829462	C	A	2325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=14;PP=1774;SC=ATTACCAGTTCAAGATCCAGT;SOR=2.743;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=58;TCR=14;TR=71;WE=58853087;WS=58853069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr15	58853109	rs3829461	A	G	3244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=32;PP=2480;SC=AAACTGAGACACCAATACAAA;SOR=1.870;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=76;TCR=32;TR=107;WE=58853117;WS=58853099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr15	58853212	rs71964604	GAC	G	4117.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=51;PP=2969;SC=CTAGGGTGATGACACACTTAT;SOR=1.880;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=79;TCF=20;TCR=59;TR=67;WE=58853226;WS=58853202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr15	58853218	rs55913623	C	T	4192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=54;PP=2189;SC=TGATGACACACTTATTTTTCT;SOR=1.956;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=20;TCR=55;TR=74;WE=58853226;WS=58853202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr15	58853307	rs4774305	C	G	1410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=41;PP=1141;SC=AAACCAAAAACTATCTGAGAC;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=41;WE=58853315;WS=58853297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	58853363	rs1869129	C	T	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=320;SC=AAAGACATTACCGTGACACAG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=58853371;WS=58853353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	58857230	rs4775080	G	C	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=1;PP=744;SC=ACCCTCTTCCGTCACCCCCTG;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=58857238;WS=58857220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	58857255	rs4775081	A	G	1197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=2;PP=980;SC=TCACTGCCAGATGCCGGCCTG;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=35;WE=58857263;WS=58857245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	58857378	rs17269397	A	G	2043.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.192;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=32;PP=1634;ReadPosRankSum=0.323;SC=CTGCCAACAGATCTCCCAACA;SOR=1.165;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=113;TCF=62;TCR=51;TR=76;WE=58857386;WS=58857368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,76:0.66:115
chr15	58860963	rs6074	C	A	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=14;PP=386;ReadPosRankSum=1.425;SC=TTCGCCCAACCCAGGAAAAAA;SOR=0.638;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=95;TCF=45;TCR=50;TR=28;WE=58860971;WS=58860953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,33:0.33:101
chr15	58919842	.	C	G	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=482;ReadPosRankSum=0.171;SC=AGAATTCTTTCAAGTTGTCTG;SOR=0.412;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=21;WE=58919850;WS=58919832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr15	59144199	rs16940850	A	G	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=38;PP=1101;SC=AAATGTGATGATCATGGCTGG;SOR=3.564;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=43;WE=59144207;WS=59144189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr15	59185929	rs4238332	T	C	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=457;SC=ACAAAGCTTATATCTGGATTA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=59185937;WS=59185919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	59323048	rs2899642	C	G	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=7;PP=1062;SC=CTGAATATAACGAGCTCTACA;SOR=3.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=41;WE=59323056;WS=59323038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	59376202	rs146786527	ATTTAT	A	485.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.60;MQRankSum=0.641;QD=30.36;ReadPosRankSum=1.958;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr15	59455560	.	G	GT	42.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.748;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.64;ReadPosRankSum=1.434;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
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chr15	59524056	rs7165587	T	C	2152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=57;PP=1716;SC=TACGCCAAACTTTCTCTAAGG;SOR=8.287;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=0;TCR=57;TR=57;WE=59524064;WS=59524046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	59528994	rs11356613	AT	A	447.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=299;SC=GCAGAAAAGAATTTTTTTTTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=18;WE=59529002;WS=59528984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	59548475	rs4508371	C	T	8728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=127;NR=144;PP=2965;SC=TAAGGATCTTCTTCATACCTG;SOR=0.822;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=271;TCF=127;TCR=144;TR=271;WE=59548483;WS=59548465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr15	59750930	rs11071448	G	A	2125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.890;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=53;PP=1669;ReadPosRankSum=-2.059;SC=TTACATTATCGGAGAATGGTT;SOR=0.429;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=118;TCF=30;TCR=88;TR=74;WE=59750938;WS=59750920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,78:0.64:122
chr15	59750960	rs7359171	A	G	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.439;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=44;PP=1216;ReadPosRankSum=-1.183;SC=GGCAAGAGAAACACTATTGTG;SOR=0.281;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=87;TCF=13;TCR=74;TR=54;WE=59750968;WS=59750950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,56:0.64:88
chr15	59752053	rs3803445	G	A	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=509;ReadPosRankSum=0.916;SC=TGTATTTCCAGACTTCTCTGG;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=23;WE=59752061;WS=59752043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,24:0.77:31
chr15	59784334	rs4291860	C	A	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=111;SC=TTAAGTGTGCCTTAGGTGACT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=59784342;WS=59784325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	59784493	rs4296198	C	T	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=10;PP=1187;ReadPosRankSum=0.133;SC=AGATTCGTGCCCGGGACAACA;SOR=0.625;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=60;TCF=48;TCR=12;TR=48;WE=59784501;WS=59784483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,50:0.79:63
chr15	59784648	rs4417505	A	G	1562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.978;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=38;PP=1139;ReadPosRankSum=-1.031;SC=AAACTCCATTATAGTGGGGAA;SOR=1.038;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=82;TCF=24;TCR=58;TR=52;WE=59784656;WS=59784638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,59:0.64:92
chr15	59799278	rs4278683	T	C	251.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.9989;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=230;ReadPosRankSum=-0.253;SC=GGAATTCATTTGAACCTCTGT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=59799286;WS=59799268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr15	59911892	rs3743119	G	T	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=802;SC=TGCTATTAGAGTGTGGGTAAG;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=59911900;WS=59911882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	59931429	rs2306354	G	C	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=10;PP=501;SC=ACTATTTTAAGACTATCAAAA;SOR=0.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=21;WE=59931437;WS=59931419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	59931546	rs148072086	G	C	294.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.85;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	59931556	rs8033208	G	C	294.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.11;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	59944203	rs11637071	A	G	114.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=88;SC=ATATTTAATGATATCATTCAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=59944211;WS=59944196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	59944300	rs4774340	T	C	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=4;PP=786;SC=CTGGGTCAAATAGTCCAAGAT;SOR=3.086;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=59944308;WS=59944290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	59960155	rs6151570	G	C	947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=2;PP=735;SC=AGGAACTCTGGGTTCACCCTG;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=59960163;WS=59960145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	59960941	rs6151566	CCT	C	351.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=1;PP=432;SC=ATGGCTTCTTCCTCTTTTTCT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=59960950;WS=59960931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	59960980	rs6151565	C	T	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=1;PP=593;SC=CACGCGCGCGCGCGCACAGTT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=59960988;WS=59960970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	59961377	rs6151564	T	C	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=102;ReadPosRankSum=-0.862;SC=TATCAAAATATAGCTCTGTAT;SOR=2.247;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=7;WE=59961385;WS=59961367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr15	59961646	rs2307273	T	C	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=13;PP=425;SC=TACAAAATAATAGTTGAAAAA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=59961654;WS=59961636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	59963272	rs56337803	C	CA	169.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=0;PP=207;SC=AACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=14;WE=59963280;WS=59963262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	59964798	rs4774342	C	G	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.96;NF=41;NR=2;PP=1348;SC=AATTAGCTCACAATTCTGTCC;SOR=5.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=43;WE=59964806;WS=59964788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	59972372	rs6151510	A	C	550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=455;ReadPosRankSum=-1.116;SC=TTTTTTGGACAAAGAAACGTG;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=20;WE=59972380;WS=59972362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr15	60643302	rs3743269	T	C	1872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=11;PP=1469;SC=GTCCCCTTCCTCCATCCATGA;SOR=2.683;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=46;TCR=11;TR=57;WE=60643310;WS=60643292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	60644074	rs11633619	C	T	7095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.570;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=150;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.751;SC=AAGCTGTCAACGATCACCCAC;SOR=1.327;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=229;TCF=78;TCR=151;TR=227;WE=60644082;WS=60644064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,231:1.00:232
chr15	60644157	rs11633657	C	T	2336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=68;PP=1921;ReadPosRankSum=-0.881;SC=GAGGTTACCACGGTGACCAGA;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=0;TCR=70;TR=68;WE=60644165;WS=60644147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
chr15	60649579	rs5813020	TC	T	1229.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=25;PP=1115;SC=GAATCTATACTCCTACCCCTT;SOR=2.899;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=28;WE=60649587;WS=60649569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	60674672	rs3759911	C	T	4188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=92;PP=2965;SC=ACTCAAATGACACACATTTAA;SOR=1.811;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=40;TCR=92;TR=132;WE=60674680;WS=60674662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr15	60678298	rs11855679	T	A	1760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=22;PP=1293;ReadPosRankSum=-0.602;SC=GGAAAAAAAGTACAACAAAAA;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=70;TCR=40;TR=62;WE=60678306;WS=60678288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,66:0.57:116
chr15	60678328	rs11858864	C	T	1977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.388;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=32;PP=1479;ReadPosRankSum=0.833;SC=AAGAGGCTCTCCTTTACTCTG;SOR=0.475;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=116;TCF=64;TCR=52;TR=68;WE=60678336;WS=60678318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,72:0.60:121
chr15	60678350	rs7182242	T	C	2067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.223;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=41;PP=1538;ReadPosRankSum=1.529;SC=AGCACAGCGATTCATTATGCT;SOR=0.906;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=125;TCF=57;TCR=68;TR=72;WE=60678358;WS=60678340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,77:0.58:132
chr15	60689877	rs12904258	A	G	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=44;ReadPosRankSum=0.473;SC=AGGGCTTCTTAGAGAAGCCCG;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=4;WE=60689885;WS=60689867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr15	60689927	rs12904756	G	C	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=6;PP=646;SC=CCGGCCCGAGGGCCGGTGGCC;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=60689935;WS=60689917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	60690089	rs12904657	A	G	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.402;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=12;PP=239;ReadPosRankSum=-1.707;SC=CAGCGTCTCCACACCCCGCTA;SOR=1.127;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=18;WE=60690097;WS=60690079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,18:0.28:64
chr15	60724317	rs60675189	T	TA	689.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=803;SC=ATACAAAAAATCTGAAACTTA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=60724325;WS=60724307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	60740915	rs1901993	C	T	1464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=0;PP=1252;SC=ATCAATAGATCGAAAAAATGA;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=42;WE=60740923;WS=60740905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	60748783	rs377300814	TACAC	T	88.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=0;PP=143;SC=TATATATATATACACACACAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=60748794;WS=60748780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	60749073	rs72746688	T	C	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.974;NF=0;NR=15;PP=235;ReadPosRankSum=0.804;SC=CATGTGACTATGTAATTATTC;SOR=0.536;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=15;WE=60749081;WS=60749063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,15:0.45:33
chr15	60771289	rs3743267	A	G	1638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.008;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=46;PP=1309;ReadPosRankSum=0.067;SC=GCGCGCCCAAAAAAGACCATA;SOR=1.075;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=156;TCF=52;TCR=104;TR=65;WE=60771297;WS=60771279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,66:0.42:158
chr15	60771438	rs11389291	G	GC	105.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.869;NF=0;NR=5;PP=133;ReadPosRankSum=-1.600;SC=GCAGCGAAGTGCGAGACTGGG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=5;WE=60771446;WS=60771428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr15	60789798	rs11071539	G	T	6865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=138;NR=72;PP=2965;SC=AGGCTCTTAAGGTAGACACCT;SOR=1.483;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=139;TCR=72;TR=210;WE=60789806;WS=60789788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr15	60792197	.	G	A	2102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=58;PP=1655;ReadPosRankSum=1.059;SC=TTGCAGCCATGAGCGATCTAA;SOR=0.686;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=109;TCF=21;TCR=88;TR=73;WE=60792205;WS=60792187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,75:0.66:114
chr15	60803741	rs61740274	C	T	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=3.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.83;ReadPosRankSum=-0.765;SOR=1.194;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,14:0.21:66
chr15	60807065	rs34783737	A	C	176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=132;ReadPosRankSum=-1.510;SC=TGGAGAATTAAACTTGTAGCA;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=7;WE=60807073;WS=60807055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr15	60824108	rs10851682	T	C	2562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=74;PP=1972;SC=CTTATAAAAGTGTTCCCTGAT;SOR=2.687;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=17;TCR=74;TR=91;WE=60824116;WS=60824098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr15	61521567	rs73436629	A	G	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=67;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=3;PP=84;SC=CGACCGGCGAAAGCAGGAGGG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=61521589;WS=61521557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	61521579	rs77362668	A	G	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.97;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	61521579	.	AAA	GAG	311	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=4;HapScore=4;MGOF=67;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=3;NR=3;PP=311;QD=60.7446458104;SC=GCAGGAGGGAAAAAGCAGGCG;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=6;WE=61521589;WS=61521557;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr15	61521581	rs117108602	A	G	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.97;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	62146969	rs2241491	T	A	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=142;ReadPosRankSum=-0.368;SC=CATAGTTATATTTGGGAGAGC;SOR=0.984;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=9;WE=62146977;WS=62146959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr15	62147207	rs2241492	T	A	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=146;ReadPosRankSum=1.093;SC=AAGAAAAAAATTCCTAACTTT;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=9;WE=62147215;WS=62147197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr15	62148730	rs3833021	TA	T	287.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.483;NF=1;NR=14;PP=174;ReadPosRankSum=-0.377;SC=AAACTGGCACTAAAAAAAAAA;SOR=0.330;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=15;WE=62148738;WS=62148720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr15	62160758	rs7163441	C	A	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=150;ReadPosRankSum=0.075;SC=ATACTTAAAGCAGTTCAAGAA;SOR=0.188;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=8;WE=62160766;WS=62160748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr15	62167017	rs6494299	G	A	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.596;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=363;ReadPosRankSum=-0.036;SC=TCATAACAACGTATTTCATAA;SOR=2.189;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=18;WE=62167025;WS=62167007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr15	62167897	rs12708469	G	A	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=224;ReadPosRankSum=0.750;SC=CCATTTTTCTGTACCTATCCT;SOR=0.495;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=13;WE=62167905;WS=62167887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr15	62169072	rs11071634	A	G	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=-0.883;SC=TCAAAGTGAGATAAATTAGAT;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=6;WE=62169080;WS=62169062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr15	62172985	rs3809517	G	A	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.451;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=323;ReadPosRankSum=0.324;SC=TCGTTCAAAAGAGGCTGATTT;SOR=0.264;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=16;WE=62172993;WS=62172975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,19:0.43:44
chr15	62175019	rs12912348	T	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=151;ReadPosRankSum=0.594;SC=ATTGATCAAATTGAAAAAATC;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=7;WE=62175027;WS=62175009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr15	62199342	rs28413840	T	A	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=81;ReadPosRankSum=-0.031;SC=AAAGCTACTTTTTCTGGAAAT;SOR=0.124;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=6;WE=62199350;WS=62199336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr15	62201333	rs35201581	GA	G	703.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=4.796;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.08;MQRankSum=1.240;QD=6.90;ReadPosRankSum=0.799;SOR=0.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,41:0.40:102
chr15	62202290	rs34965045	C	T	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.425;NF=13;NR=0;PP=210;ReadPosRankSum=-2.127;SC=CAAACCTGCACGTTCTGCACA;SOR=0.209;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=13;WE=62202298;WS=62202280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
chr15	62202482	rs10851704	C	T	2056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.069;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=58;PP=1500;ReadPosRankSum=-2.156;SC=GCCTGACAAACTTTCTGGCCA;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=245;TCF=82;TCR=163;TR=86;WE=62202490;WS=62202472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,90:0.36:253
chr15	62210274	rs11071639	G	T	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.60;ReadPosRankSum=0.719;SOR=0.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,6:0.18:33
chr15	62211450	rs963024	G	A	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=570;ReadPosRankSum=0.518;SC=CCATTTCTTGGTACACTGAAA;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=24;WE=62211458;WS=62211440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr15	62211552	.	G	C	2360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.256;ClippingRankSum=0.000;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=34;PP=1843;ReadPosRankSum=-1.157;SC=TACCAAGACAGAGTCAGAATG;SOR=0.453;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=140;TCF=89;TCR=51;TR=88;WE=62211560;WS=62211542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,90:0.63:143
chr15	62212328	.	G	C	2222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.000;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=47;PP=1770;ReadPosRankSum=-1.058;SC=CCCTTGACTTGAAGGTACCAT;SOR=0.654;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=53;TCR=75;TR=81;WE=62212336;WS=62212318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,81:0.63:129
chr15	62221592	rs28411984	A	C	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=267;ReadPosRankSum=0.952;SC=ATGTTTAAATATAAAAGACTA;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=12;WE=62221600;WS=62221582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr15	62223273	rs9788670	C	T	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.331;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=15;PP=703;ReadPosRankSum=0.323;SC=GTATTGCAAACTCAGAGCTGA;SOR=1.367;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=122;TCF=67;TCR=55;TR=40;WE=62223281;WS=62223263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,42:0.33:127
chr15	62228696	rs11071641	G	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.007;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=123;ReadPosRankSum=2.137;SC=TACTGAATTAGTTCATACCAC;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=7;WE=62228704;WS=62228688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr15	62232796	rs7172838	C	T	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=-1.017;SC=CTATGATCAACGAGAAAAGCC;SOR=0.082;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=6;WE=62232804;WS=62232786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,6:0.21:29
chr15	62239304	rs7166891	A	T	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5032;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=37;ReadPosRankSum=1.645;SC=ACCAAAAGAAAACTCATGAGA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=62239312;WS=62239294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr15	62239697	rs7172145	C	T	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=-0.135;SC=AAAATTAGCACGTTCCCCTTC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=62239705;WS=62239687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr15	62243090	rs10639244	A	AATAT	241.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=124;ReadPosRankSum=-0.525;SC=ATATAAGGGTAATATAACTTC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=62243098;WS=62243080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr15	62244281	rs17238252	C	G	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=315;ReadPosRankSum=1.723;SC=GGAAGAAATTCACACAATGTT;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=14;WE=62244289;WS=62244271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr15	62255172	rs17304010	A	G	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=363;ReadPosRankSum=1.364;SC=TCAACTCCCAATGGATAAATA;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=16;WE=62255180;WS=62255162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr15	62259637	rs3784634	C	T	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=462;ReadPosRankSum=-0.376;SC=AAGGGGCTTCCTTTTGGATCC;SOR=0.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=24;WE=62259645;WS=62259627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,23:0.79:29
chr15	62259772	rs3784633	C	T	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.915;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=1.242;SC=ATTGTCATAGCTATTAAATAC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=62259780;WS=62259762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr15	62265019	rs3833020	A	AT	122.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.175;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.472;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=141;ReadPosRankSum=0.193;SC=AAACTGCATGAAACACTCAAA;SOR=0.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=62265027;WS=62265009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr15	62265507	rs11071645	G	A	287.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=207;SC=AAGAGACTCAGAGTCACACTA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=62265515;WS=62265497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	62270765	rs3784632	G	A	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=619;ReadPosRankSum=1.789;SC=ATATATACACGTATATTACAC;SOR=0.551;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=29;WE=62270773;WS=62270755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,34:0.69:49
chr15	62284101	rs8032433	A	G	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=478;ReadPosRankSum=-0.796;SC=TTTTTTTTTTAACGCTACGTA;SOR=0.279;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=0;TCR=59;TR=22;WE=62284109;WS=62284077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,20:0.36:56
chr15	62304420	.	GACAC	G	92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=58.93;NF=0;NR=7;PP=92;QD=13.5714285714;SC=TTCAGACTCAGACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=7;WE=62304433;WS=62304410;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:22,7:0.24:29
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chr15	62535030	rs1996469	G	A	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.530;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=582;ReadPosRankSum=0.364;SC=AAGCCTGGGCGCTCCTGGGGG;SOR=1.773;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=46;TCF=31;TCR=15;TR=28;WE=62535038;WS=62535020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr15	62539151	rs7402021	T	C	1490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.52;QD=46.59;SOR=6.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	62539153	rs59880159	T	TGG	1650.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.67;QD=48.55;SOR=7.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	62539162	rs2955803	A	C	1793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.79;QD=42.71;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	62539185	rs2945418	T	C	2140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=14;PP=2183;SC=AGCCCTCTGATGCCAGTCCTG;SOR=4.112;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=78;TCR=14;TR=92;WE=62539193;WS=62539175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr15	62539781	rs2611797	A	G	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.692;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=943;ReadPosRankSum=-0.494;SC=GCTGGTTAGCATCAGGGGCTT;SOR=1.697;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=66;TCF=26;TCR=40;TR=50;WE=62539789;WS=62539771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,54:0.75:72
chr15	62932556	rs35757182	G	C	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=324;ReadPosRankSum=0.839;SC=GGTGGAGAGTGAGTGGCTAGA;SOR=0.409;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=17;WE=62932564;WS=62932546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,18:0.41:44
chr15	62936830	rs11852582	C	T	1469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-6.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.785;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=50;PP=1171;ReadPosRankSum=0.931;SC=CTCTCCTGTGCACCTTGCGGA;SOR=1.879;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=66;TCF=3;TCR=63;TR=52;WE=62936838;WS=62936820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,54:0.78:69
chr15	62939440	rs938979	T	C	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=426;ReadPosRankSum=1.486;SC=ATTATTATCGTGAACATCAGG;SOR=0.512;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=19;WE=62939448;WS=62939430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr15	62944448	rs10775179	G	C	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=169;ReadPosRankSum=-1.360;SC=TTAACACGCCGAGTTCTGCCT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=62944456;WS=62944438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr15	62948405	rs78711196	C	G	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=36;PP=912;ReadPosRankSum=0.789;SC=TCGTTTCCAGCAGGCGCTGCT;SOR=0.643;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=37;WE=62948413;WS=62948395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,38:0.67:57
chr15	62967342	rs1878785	A	G	2512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=20;PP=1954;SC=CACCACATACAGTAACTACCT;SOR=2.383;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=67;TCR=20;TR=87;WE=62967350;WS=62967332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr15	62967395	rs1878784	C	T	3942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=50;PP=2965;SC=TAACTGGTCCCGACCACTGTC;SOR=1.089;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=72;TCR=50;TR=121;WE=62967403;WS=62967385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr15	62967554	rs1878783	T	C	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=43;PP=1020;SC=GTGTTCACCTTGGCCCCTTCT;SOR=5.549;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=45;WE=62967562;WS=62967544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	62979016	rs12917611	A	C	215.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=7;PP=166;SC=GCAGAGGGCAAGGAGAGCACT;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=8;WE=62979024;WS=62979006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	62985267	rs2009523	G	A	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.171;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=165;ReadPosRankSum=-0.791;SC=GGTGGCTCACGCCTGTAATCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=11;WE=62985275;WS=62985257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr15	62989775	rs8034474	T	C	1431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=1;PP=1201;SC=GTGCCTCTTTTAGTTGGCCTT;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=40;WE=62989783;WS=62989765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	62990916	rs12906130	G	A	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=182;ReadPosRankSum=-0.083;SC=GGTCCCAGGCGTGTGGGATGA;SOR=0.984;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=10;WE=62990924;WS=62990906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr15	62990971	rs12905981	C	T	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.991;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=324;ReadPosRankSum=1.518;SC=CCAGCAGGCCCTGATGGGGAC;SOR=1.410;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=18;WE=62990979;WS=62990961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,18:0.35:52
chr15	62991210	rs9630428	C	T	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=556;ReadPosRankSum=0.569;SC=TGAGTCTTTGCCTCTCAGTTG;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=24;WE=62991218;WS=62991200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,25:0.74:34
chr15	62994428	rs12594220	G	C	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=256;SC=CAATCACTCAGGTTCTGATGG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=62994436;WS=62994418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	62994784	rs67465793	C	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=0.159;SC=GTTTGTGAGACACTGGATGTT;SOR=0.458;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=6;WE=62994792;WS=62994774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr15	62994928	rs12908653	G	A	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=4.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=0.000;QD=5.11;ReadPosRankSum=-0.386;SOR=1.287;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,25:0.25:99
chr15	63008755	rs78706616	A	G	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=374;ReadPosRankSum=-0.552;SC=CAATATAAAGAAAGCCAAGTC;SOR=0.620;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=61;TCF=4;TCR=57;TR=19;WE=63008763;WS=63008745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,19:0.31:62
chr15	63009733	rs938983	A	G	1626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.418;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=18;PP=1339;ReadPosRankSum=-0.531;SC=ATGCATGTATATTGCATATGC;SOR=0.086;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=77;TCF=57;TCR=20;TR=55;WE=63009741;WS=63009723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,55:0.72:76
chr15	63009804	rs1320191	C	T	2411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.496;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=35;PP=1845;ReadPosRankSum=2.708;SC=CAGCGGCAGCCACACAGACCA;SOR=0.974;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=125;TCF=72;TCR=53;TR=88;WE=63009812;WS=63009794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,90:0.70:129
chr15	63014548	rs10775181	A	G	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=18;PP=798;SC=TCATCTCTCTATAGCCTGGAA;SOR=0.880;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=31;WE=63014556;WS=63014538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	63030398	rs12900862	T	C	3714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=48;PP=2902;SC=TGCTTCTCTCTCTCCACGAAT;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=62;TCR=48;TR=109;WE=63030406;WS=63030388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr15	63044379	rs7171264	A	G	2602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=2;PP=2146;SC=AATCCAAATAAAGGAGAAAAT;SOR=6.413;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=73;TCF=71;TCR=2;TR=73;WE=63044387;WS=63044369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr15	63044637	rs7176359	A	G	4439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=116;PP=2965;SC=GTAAGGGGCTAGTCCCGATGC;SOR=3.291;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=22;TCR=116;TR=138;WE=63044645;WS=63044627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr15	63047778	rs8033767	C	T	5119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=68;PP=2965;SC=CAGCCTTGTGCAATGCCTGCC;SOR=1.112;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=99;TCR=68;TR=167;WE=63047786;WS=63047768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr15	63054439	rs2030040	C	G	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=10;PP=772;ReadPosRankSum=0.678;SC=GTCTTCGACCCTGACTTTGAT;SOR=1.007;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=38;WE=63054447;WS=63054429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr15	63055658	rs10152548	T	A	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=1;PP=416;SC=GAGGTGACTGTGTCAGGGAGG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=63055666;WS=63055648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	63075920	rs202118499	CTGTGTGTG	CTG,C	1213.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.4826,0.5174;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=14,14;NR=5,5;PP=9,928;SC=GCGTTTCTCTCTGTGTGTGTG;SOR=3.014;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=19,19;WE=63075937;WS=63075910;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:29
chr15	63340422	.	G	A	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=0.000;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=590;ReadPosRankSum=0.609;SC=GTGGAAGCCAGAGCCCTAGTG;SOR=0.897;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=81;TCF=47;TCR=34;TR=31;WE=63340430;WS=63340412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,34:0.40:85
chr15	63340647	rs4374117	A	G	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=16;PP=551;SC=GGGCGCCGCCATCGCACAGAG;SOR=1.136;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=25;WE=63340655;WS=63340637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	63349096	rs4775613	G	A	3528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=36;PP=2829;SC=CTTCCTATCTGAAATCAGCAT;SOR=1.802;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=82;TCR=36;TR=118;WE=63349104;WS=63349086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr15	63351687	rs4775614	A	G	2660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=17;PP=2200;SC=AAGCCTCACAAGCCACAGCAG;SOR=2.391;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=81;TCF=64;TCR=17;TR=79;WE=63351695;WS=63351677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr15	63351840	rs1071646	C	A	3788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=75;PP=2866;SC=TGAAAGAGGCCAAGCACATTG;SOR=1.441;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=117;TCF=42;TCR=75;TR=116;WE=63351848;WS=63351830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr15	63353760	rs4774472	C	A	1480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=0;PP=1219;SC=TCCTGGAAAACCTAAACATTT;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=43;WE=63353768;WS=63353750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	63363401	rs201620283	C	CATTTTGTTTT	1595.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=36;PP=1326;SC=CACATTCTTTCGTTTTGTTTT;SOR=5.943;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=37;WE=63363409;WS=63363391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	63413997	rs8182083	C	T	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=3;PP=594;SC=CCGCCCCCTGCCCTTCCCTCC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=63414005;WS=63413987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	63414083	rs34317102	A	C	1788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=23;PP=1397;SC=GTACCGGCTCATGTCAGCAGT;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=34;TCR=23;TR=57;WE=63414091;WS=63414073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr15	63414723	rs189796619	TGG	CTC	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=2;PP=756;SC=GGGGCCCAGGTGGAGGGGGCG;SOR=4.294;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=28;WE=63414733;WS=63414713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	63433766	rs2729835	G	A	7896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.438;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=128;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.804;SC=GTTGTGGAAAGGAAACAAACG;SOR=0.548;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=236;TCF=108;TCR=128;TR=235;WE=63433774;WS=63433756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,244:1.00:245
chr15	63434110	rs8468	C	T	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=24;PP=720;SC=TAGAGTATAACTGAATGCAGA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=63434118;WS=63434100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	63449543	rs7170846	A	C	6279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=149;NR=46;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.690;SC=TCCGTCCCATATGACTCTCGG;SOR=1.226;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=196;TCF=150;TCR=46;TR=195;WE=63449551;WS=63449533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,195:0.99:196
chr15	63449680	rs2292038	C	G	7626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=174;PP=2965;SC=GATCTGCGCTCGGCATCAACT;SOR=2.293;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=233;TCF=59;TCR=174;TR=233;WE=63449688;WS=63449670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr15	63515946	rs11632192	A	G	85.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=59;SC=GTTAAGTGACACATGACTGTA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=63515954;WS=63515936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	63516266	rs17828874	G	C	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=41;PP=1291;SC=TCAAAACAAGGAAATGCTTAT;SOR=6.184;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=42;WE=63516274;WS=63516256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	63554824	rs72363505	GTA	G	937.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.11;QD=34.73;SOR=6.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	63571279	rs35859954	G	GT	169.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQRankSum=-0.641;QD=3.86;ReadPosRankSum=1.004;SOR=0.175;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,13:0.30:44
chr15	63578726	.	C	T	281	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=18;HapScore=3;MGOF=7;MMLQ=15;MQ=59.25;NF=23;NR=0;PP=281;QD=13.7291831542;SC=TTTTTTTTTTCTTCTTAATTA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=23;WE=63578734;WS=63578715;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr15	63639016	rs2270764	A	G	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=18;PP=516;SC=TCTTTTCTGAATCCCCGGAGG;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=63639024;WS=63639006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr15	63866278	rs61751107	C	T	1282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.721;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=28;PP=1011;ReadPosRankSum=-0.189;SC=CGGCTATATTCGGAGGCATTC;SOR=0.631;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=184;TCF=88;TCR=96;TR=60;WE=63866286;WS=63866268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,60:0.31:192
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chr15	63922752	rs10851731	T	A	1499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.934;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=48;PP=1120;ReadPosRankSum=0.552;SC=CCACATCTTCTATGATTACTC;SOR=0.871;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=213;TCF=68;TCR=145;TR=67;WE=63922760;WS=63922742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,69:0.31:221
chr15	63929599	rs71131175	GAT	G	619.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=460;ReadPosRankSum=-1.417;SC=GTGAAAACCTGATATGATTTT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=13;WE=63929608;WS=63929589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr15	63932513	rs2228517	G	C	817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.741;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=18;PP=597;ReadPosRankSum=-1.869;SC=CAGGGTCAGGGAGACAGTTCT;SOR=0.900;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=90;TCF=39;TCR=51;TR=29;WE=63932521;WS=63932503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,33:0.34:96
chr15	63935149	rs10519223	A	G	1630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.529;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.05;MQRankSum=-0.696;NF=54;NR=10;PP=1327;ReadPosRankSum=-0.058;SC=TATAACTACAATATTACCTTT;SOR=0.940;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=193;TCF=158;TCR=35;TR=64;WE=63935157;WS=63935139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,65:0.33:195
chr15	63937209	rs2229749	C	G	2274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.018;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=32;PP=1748;ReadPosRankSum=0.837;SC=TTGATTCCTGCTCCCACCATC;SOR=0.778;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=243;TCF=152;TCR=91;TR=90;WE=63937217;WS=63937199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,96:0.37:257
chr15	63953153	rs2272209	A	G	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.999;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=733;ReadPosRankSum=0.951;SC=AAAATAAAGAAGCTCTCAAAA;SOR=0.998;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=55;TCR=22;TR=35;WE=63953161;WS=63953143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,36:0.45:80
chr15	63954029	rs2228511	C	T	782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.093;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=17;PP=589;ReadPosRankSum=0.240;SC=ACAGGTAGTACGGATTTCCAC;SOR=0.273;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=107;TCF=65;TCR=42;TR=35;WE=63954037;WS=63954019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,36:0.32:112
chr15	63958762	rs1815130	T	C	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=187;ReadPosRankSum=0.625;SC=CCTAGTATTGTCCAAGTTTAA;SOR=0.656;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=12;WE=63958770;WS=63958752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr15	63970456	rs2228510	T	C	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.575;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=595;ReadPosRankSum=-1.089;SC=AGGATACGGATGAGCTGAATA;SOR=1.112;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=122;TCF=46;TCR=76;TR=41;WE=63970464;WS=63970446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,43:0.34:125
chr15	63972689	rs201668548	TA	T	1313.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.851;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=3;PP=1362;ReadPosRankSum=1.456;SC=GAGTTGACTATAAATAGAAAC;SOR=0.411;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=62;TCF=57;TCR=5;TR=38;WE=63972697;WS=63972679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,44:0.66:67
chr15	63984772	rs11630720	T	C	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.599;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=35;PP=787;ReadPosRankSum=1.066;SC=GCAGCTACAGTGAAGAGACAA;SOR=0.633;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=170;TCF=64;TCR=106;TR=57;WE=63984780;WS=63984762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,58:0.33:178
chr15	63988357	rs2255243	C	G	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=192;ReadPosRankSum=0.133;SC=CTCTCCCTTGCCTCCTGTGTG;SOR=0.293;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=12;WE=63988365;WS=63988347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr15	63998914	rs34366173	CTT	C	121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.76;ReadPosRankSum=-0.799;SOR=0.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr15	64017798	rs11632718	A	G	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=204;ReadPosRankSum=0.716;SC=CCGTACTGCAATAAGATACTG;SOR=0.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=12;WE=64017806;WS=64017788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr15	64020073	rs9920746	C	T	1729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=43;PP=1436;SC=GGGACAATTGCTTCAAATGAA;SOR=2.345;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=13;TCR=43;TR=56;WE=64020081;WS=64020063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	64039050	rs8034675	T	C	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=98;ReadPosRankSum=0.340;SC=GTTGAATATATTGTATAGCTA;SOR=0.752;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=7;WE=64039058;WS=64039040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr15	64039879	rs11631436	G	A	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=2;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.546;NF=5;NR=2;PP=105;ReadPosRankSum=1.284;SC=ACACACGCGCGCGCACACACA;SOR=0.169;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=7;WE=64039890;WS=64039869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr15	64048990	rs2271241	T	C	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=148;ReadPosRankSum=0.735;SC=TCTGTGAGTATCAAAGTATAA;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=8;WE=64048998;WS=64048980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr15	64050300	rs12912999	G	A	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=265;ReadPosRankSum=0.825;SC=AAAATACTCAGTATTATTTAA;SOR=0.056;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=12;WE=64050308;WS=64050290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr15	64056437	rs3764186	T	C	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=551;ReadPosRankSum=0.228;SC=GGGAGAGACATATGCATTAAA;SOR=0.787;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=70;TCF=9;TCR=61;TR=27;WE=64056445;WS=64056427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,27:0.38:72
chr15	64215375	rs4776669	G	C	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.569;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=36;PP=855;ReadPosRankSum=-0.696;SC=ATCCCAGGTCGACCCGAGCCA;SOR=1.406;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=134;TCF=41;TCR=93;TR=46;WE=64215383;WS=64215365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,47:0.35:136
chr15	64216965	rs59442217	C	T	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.903;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=545;ReadPosRankSum=-1.097;SC=CCAACCCTGGCGACAGAGCAG;SOR=0.078;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=26;WE=64216973;WS=64216955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr15	64218359	rs117271511	G	A	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.084;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=440;ReadPosRankSum=0.687;SC=TTACGGACTCGGGGAACCCTG;SOR=2.904;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=19;WE=64218367;WS=64218349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr15	64222466	rs57475102	G	A	183.96	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.6699;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=115;ReadPosRankSum=-0.887;SC=CTAACACATCGGGGGAGCAGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=64222474;WS=64222464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr15	64263532	rs6494457	C	A	1919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.140;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=6;PP=1463;ReadPosRankSum=-1.669;SC=AAGGGCTGGTCGGCACTGGGC;SOR=1.038;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=112;TCF=100;TCR=12;TR=69;WE=64263540;WS=64263522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,73:0.63:116
chr15	64263784	rs7180050	G	A	981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=31;PP=828;ReadPosRankSum=-0.345;SC=GCGGGGGGAGGGGAGGCCCAG;SOR=2.147;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=32;WE=64263792;WS=64263774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,33:0.73:45
chr15	64283625	rs7168753	T	C	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=28;PP=635;SC=CCTCGTTTCATGAGCCTGTTT;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=64283633;WS=64283615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	64365340	rs4622459	C	T	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.58;ReadPosRankSum=1.517;SOR=0.301;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,7:0.21:34
chr15	64367745	rs332233	T	C	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.128;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=241;ReadPosRankSum=-1.004;SC=AACTGGAAAGTGGGAAAAAAA;SOR=1.445;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=15;WE=64367753;WS=64367735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr15	64367775	rs332234	T	C	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=11;PP=288;SC=AAAACATTAATGCATTCTAAG;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=64367783;WS=64367765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	64385851	rs332259	T	C	1653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=5;PP=1404;SC=TACCATAAACTTCTAGCGCTT;SOR=4.047;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=43;TCR=5;TR=48;WE=64385859;WS=64385841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	64388052	rs332258	G	C	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.38;ReadPosRankSum=1.383;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr15	64410484	rs2290117	G	T	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.589;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=100;ReadPosRankSum=2.569;SC=TTTAGATATTGAGGACTGTGT;SOR=0.399;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=8;WE=64410492;WS=64410474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,9:0.26:35
chr15	64418221	rs2290119	C	G	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.68;ReadPosRankSum=1.101;SOR=0.074;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,9:0.20:44
chr15	64418397	rs1130603	G	A	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.206;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=27;PP=696;ReadPosRankSum=1.897;SC=TTGTCCCTCCGCCCCCGGAGA;SOR=1.061;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=121;TCF=56;TCR=65;TR=47;WE=64418405;WS=64418387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,55:0.42:131
chr15	64418483	rs2290121	C	T	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=15.164;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.40;ReadPosRankSum=0.295;SOR=3.015;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,19:0.25:77
chr15	64428657	rs2290122	G	A	1229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=35;PP=978;ReadPosRankSum=0.090;SC=TGCTTGTTTTGGGAGTACTCT;SOR=0.699;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=165;TCF=61;TCR=104;TR=55;WE=64428665;WS=64428647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,58:0.32:181
chr15	64445681	rs34975001	GC	G	541.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.859;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=2.138;NF=9;NR=10;PP=592;ReadPosRankSum=1.971;SC=GGGTGGAGGGGCTTTTTTTTG;SOR=0.295;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=62;TCF=37;TCR=25;TR=19;WE=64445689;WS=64445671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,20:0.31:64
chr15	64448365	rs2253557	C	T	1827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=48;PP=1547;SC=AAGGTGGAAGCAGGAGGGCAT;SOR=3.219;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=9;TCR=48;TR=57;WE=64448373;WS=64448355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	64455123	rs4904	G	T	1195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=23;PP=835;ReadPosRankSum=0.151;SC=GGAAGAAGACGGACCCCGCGA;SOR=0.700;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=39;WE=64455131;WS=64455113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,44:0.63:70
chr15	64496611	.	TA	T	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=-0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=9.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.000;QD=5.16;ReadPosRankSum=1.732;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr15	64508763	rs6494466	G	A	1914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.753;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=26;PP=1455;ReadPosRankSum=-0.686;SC=CAACTTACCAGCTGGATGGCT;SOR=0.810;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=106;TCF=65;TCR=41;TR=68;WE=64508771;WS=64508753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,72:0.64:112
chr15	64675313	rs11635527	C	T	146.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=116;SC=ATGAATTGCTCGAACTTAGAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=64675321;WS=64675303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	64679594	rs112815338	A	T	4110.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.42;SOR=5.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr15	64693149	rs11380356	G	GT	1846.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.42;QD=28.41;SOR=8.380;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr15	64706259	rs2046356	G	A	3417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=12;PP=2793;SC=ACCAATTGTTGCATCCTTTTG;SOR=3.830;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=91;TCR=12;TR=103;WE=64706267;WS=64706249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr15	64737103	rs7167394	G	C	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=1;PP=286;SC=ATGGAAAGTAGTATCATCAGA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=64737111;WS=64737096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	64737225	rs7167612	G	A	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=10;PP=578;SC=TCAGTCAAGAGTCTGATTCTC;SOR=1.051;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=24;WE=64737233;WS=64737215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	64742670	rs7172012	T	A	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=2;PP=345;SC=CTCAGAGCTTTGAGTTCCTGC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=64742678;WS=64742660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	64915106	rs525878	C	T	4627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=78;PP=2965;SC=TCTCATCTCCCTGTGAGCAGA;SOR=1.006;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=57;TCR=78;TR=135;WE=64915114;WS=64915096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr15	64968523	rs148512780	G	T	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=432;ReadPosRankSum=-0.438;SC=ACAAATAAGGGCTGTCCTTAT;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=18;WE=64968531;WS=64968513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr15	65033311	rs6494489	C	T	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.565;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=139;ReadPosRankSum=-0.705;SC=GGAGGAACTACGGCCCTTCAG;SOR=0.180;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=11;WE=65033319;WS=65033301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,14:0.28:50
chr15	65040928	rs12911708	C	T	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=42;PP=1233;SC=CACGTTAAATCGGCCTGTCAT;SOR=6.138;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=43;WE=65040936;WS=65040918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	65041622	rs6494493	C	A	3289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=46;PP=2468;SC=TGTTCTCCACCTACTCACGTT;SOR=0.789;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=54;TCR=46;TR=100;WE=65041630;WS=65041612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr15	65054533	rs72744744	C	T	917.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.653;HP=3;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=6;PP=800;ReadPosRankSum=-1.529;SC=GCCTTGTGCCCCACTAGCTAT;SOR=0.343;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=101;TCF=88;TCR=13;TR=38;WE=65054541;WS=65054523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,38:0.37:103
chr15	65054562	rs57945504	T	TG	5394.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=28;PP=2957;SC=TGGGGATGGGTGCTGGAGCAG;SOR=2.786;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=131;TCF=103;TCR=28;TR=128;WE=65054579;WS=65054552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr15	65054571	rs71133474	A	AG	5612.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=103;NR=33;PP=2936;SC=GTGCTGGAGCAGGCCCAGCCA;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=141;TCF=106;TCR=35;TR=136;WE=65054579;WS=65054552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr15	65107804	rs74935506	G	T	1259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=2.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.02;ReadPosRankSum=1.656;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,49:0.66:74
chr15	65108504	rs17802279	A	T	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.368;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=5;PP=735;ReadPosRankSum=-0.313;SC=GGCTCAGAGGATTGGGTCCAT;SOR=1.190;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=32;WE=65108512;WS=65108494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,35:0.62:56
chr15	65108652	rs6494498	T	C	2195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.783;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=54;PP=1828;ReadPosRankSum=2.071;SC=CCCTCACCCCTAAAGGAGCCA;SOR=1.578;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=109;TCF=39;TCR=70;TR=79;WE=65108660;WS=65108642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,78:0.70:111
chr15	65108707	rs7180207	G	C	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.120;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=25;ReadPosRankSum=-0.856;SC=CTGGGCCGGCGCTCCCTCTGT;SOR=1.018;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=40;WE=65108715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,40:0.69:58
chr15	65110034	rs5024311	G	T	2295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=3.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQRankSum=-1.868;QD=28.70;ReadPosRankSum=0.878;SOR=1.312;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,57:0.71:80
chr15	65110039	rs5024312	C	T	2392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=2.156;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.91;MQRankSum=-1.834;QD=29.18;ReadPosRankSum=0.328;SOR=1.054;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,59:0.72:82
chr15	65110391	rs55945924	C	T	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.273;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=7;PP=998;ReadPosRankSum=-1.548;SC=TTTTCTCCCCCCACCATTCCC;SOR=0.318;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=58;TCF=49;TCR=9;TR=40;WE=65110399;WS=65110381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,37:0.65:57
chr15	65113493	rs1872592	G	A	2372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.552;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=43;PP=1811;ReadPosRankSum=1.045;SC=GGAGAGGAGCGTGGGGTGCTT;SOR=0.825;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=252;TCF=140;TCR=112;TR=99;WE=65113501;WS=65113483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,100:0.39:256
chr15	65114833	rs35204896	G	A	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=94;ReadPosRankSum=-1.024;SC=AGCTATCTCAGAGCATCCTCC;SOR=0.163;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=7;WE=65114841;WS=65114823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr15	65116328	rs12899195	A	G	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=6;PP=435;SC=CGCGCAGAGGAAAGCAGCGCG;SOR=1.244;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=16;WE=65116336;WS=65116318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	65116595	rs55675018	G	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.132;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=230;ReadPosRankSum=0.317;SC=GGATTCATGAGACGTAATGGG;SOR=0.124;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=12;WE=65116603;WS=65116585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr15	65140715	rs35048171	C	G	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.767;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=19;PP=767;ReadPosRankSum=0.000;SC=GGACACATCCCTTGTGTGACC;SOR=0.909;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=201;TCF=135;TCR=66;TR=62;WE=65140723;WS=65140693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,63:0.30:212
chr15	65208227	rs1471834	G	A	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=29;PP=838;ReadPosRankSum=-0.664;SC=AGGGAGGCTCGGGCTCTGTCC;SOR=0.582;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=11;TCR=47;TR=36;WE=65208235;WS=65208217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,33:0.60:55
chr15	65209718	rs34503100	G	GTGTC	645.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.916;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=314;ReadPosRankSum=0.930;SC=CTGTGTGTACGTGTCTGTCTG;SOR=0.191;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=6;WE=65209726;WS=65209708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr15	65209818	rs2056496	A	G	309.22	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.9992;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=230;ReadPosRankSum=1.546;SC=GCAGACATTCAGGTGCAGAGT;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=12;WE=65209826;WS=65209808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr15	65209880	rs2056497	A	C	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=3;PP=54;SC=ATTCTGTTTTACTCCTGTACA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=65209888;WS=65209870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	65235500	rs28368318	A	T	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=355;ReadPosRankSum=0.072;SC=GGTAAAAAAAATAAGATGTAA;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=16;WE=65235508;WS=65235490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr15	65235861	rs35136467	TC	T	578.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.54;ReadPosRankSum=0.885;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr15	65236875	rs2414865	T	C	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.188;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=21;PP=741;ReadPosRankSum=-0.084;SC=TGGCAGTGGCTGTCCGCAGCA;SOR=0.495;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=65;TCF=34;TCR=31;TR=41;WE=65236883;WS=65236865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,39:0.62:63
chr15	65237027	rs111581736	C	T	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.501;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=580;ReadPosRankSum=0.331;SC=GAACCCTAGGCCTGACCAATT;SOR=0.180;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=28;WE=65237035;WS=65237017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr15	65239848	rs74019381	C	T	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=216;ReadPosRankSum=-0.796;SC=TAAGCAACCACTGGGCGGAGG;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=10;WE=65239856;WS=65239838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr15	65241910	rs8035622	A	G	639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.564;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=495;ReadPosRankSum=-2.437;SC=GCTGAGCTTGACTGGAGCATG;SOR=1.880;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=20;WE=65241918;WS=65241900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr15	65261501	rs61512879	C	T	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=506;ReadPosRankSum=1.835;SC=TTTGAAGAGGCACATTGAAAG;SOR=1.547;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=24;WE=65261509;WS=65261498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr15	65268979	rs4776255	C	G	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=610;SC=GACTCAAACACTGACATTTCT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=65268987;WS=65268969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr15	65315961	rs4776661	T	C	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=219;ReadPosRankSum=0.878;SC=CAGGCTGACATCAACATTTAA;SOR=0.941;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=49;TCF=45;TCR=4;TR=15;WE=65315969;WS=65315951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,16:0.31:51
chr15	65344035	rs2946676	G	A	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=200;ReadPosRankSum=0.266;SC=TCACTTAGGGGTCATTGCTGT;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=11;WE=65344043;WS=65344025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr15	65347405	rs2232762	G	A	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=6.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.320;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=637;ReadPosRankSum=0.989;SC=CATGCCGCGCGGTGAGCGGGG;SOR=1.352;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=127;TCF=54;TCR=73;TR=35;WE=65347413;WS=65347395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,36:0.28:128
chr15	65357491	rs2232753	G	A	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=197;ReadPosRankSum=-1.274;SC=CCCACGGGGTGGGTCCCAGGA;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=28;TCF=21;TCR=7;TR=13;WE=65357499;WS=65357481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr15	65357558	rs36045000	A	G	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.892;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=27;PP=1229;ReadPosRankSum=1.641;SC=TTCTTACCCAAGTTGGGGTCA;SOR=0.551;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=83;TCF=45;TCR=38;TR=57;WE=65357566;WS=65357548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,58:0.69:84
chr15	65369141	rs147079462	C	T	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=468;ReadPosRankSum=0.692;SC=AGCCTCCGCCCGGCCAGCTCG;SOR=0.722;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=20;WE=65369149;WS=65369131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr15	65369395	rs2919358	C	T	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.366;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=506;ReadPosRankSum=0.851;SC=CTGCTGCAGGCCGTGGAGTGC;SOR=1.220;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=78;TCF=57;TCR=21;TR=30;WE=65369403;WS=65369385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,34:0.41:82
chr15	65369531	rs2946642	G	T	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.153;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=480;ReadPosRankSum=1.183;SC=ACAGTGCCGCGCTCTTCATCT;SOR=0.211;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=27;WE=65369539;WS=65369521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,27:0.36:76
chr15	65369951	rs2919359	A	G	3493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=60;NR=52;PP=2750;SC=TCGGCGGCGAATTCCAGAGGA;SOR=0.804;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=60;TCR=52;TR=112;WE=65369959;WS=65369941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr15	65370353	rs2919360	T	C	4089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=79;PP=2965;SC=TGGTGCGCGGTGACACCGTCT;SOR=1.105;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=136;TCF=57;TCR=79;TR=135;WE=65370361;WS=65370343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr15	65370652	rs12901617	T	C	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=553;ReadPosRankSum=-2.001;SC=ACACCCAGGTTTGGTGCCTTC;SOR=0.984;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=21;WE=65370660;WS=65370642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr15	65449169	rs2946670	C	T	8495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=142;NR=116;PP=2965;SC=GAACAAAATACTCAACTGCTT;SOR=0.907;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=258;TCF=142;TCR=116;TR=258;WE=65449177;WS=65449159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr15	65477373	rs200533693	C	G	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.545;HP=9;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.674;NF=13;NR=18;PP=403;ReadPosRankSum=2.972;SC=CACCCCCCCCCCGACAGGCTG;SOR=0.931;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=91;TCF=47;TCR=44;TR=31;WE=65477381;WS=65477354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,31:0.33:95
chr15	65489128	rs938952	C	T	2717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=38;PP=2171;SC=ACCACTCCACCCTGGCGCTGG;SOR=0.742;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=39;TCR=38;TR=77;WE=65489136;WS=65489118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr15	65489688	rs2679117	T	C	10056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=203;NR=140;PP=2965;SC=CCCCACTGTCTGCCGATGAGT;SOR=1.106;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=343;TCF=203;TCR=140;TR=343;WE=65489696;WS=65489678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,342:1.00:342
chr15	65490901	rs2679118	T	C	5384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=104;NR=59;PP=2965;SC=GTGATGGGCTTTTTCCGACGA;SOR=1.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=104;TCR=60;TR=163;WE=65490909;WS=65490891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr15	65494212	rs2073711	A	G	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=335;SC=AGGCTTACCTATGACAATCAG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=65494220;WS=65494202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	65495820	rs2072048	A	G	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.21;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	65495827	rs2073707	A	G	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.43;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	65496475	rs2585035	T	G	1342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=0;PP=1180;SC=GATAATATAGTGCCATGTGGG;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=41;WE=65496483;WS=65496465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	65496587	rs2585034	C	T	5317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=123;NR=45;PP=2965;SC=ACCAGCCCTACCCCAAAGAAT;SOR=2.137;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=168;TCF=123;TCR=45;TR=168;WE=65496595;WS=65496577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr15	65497849	rs2681038	A	G	1618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=36;PP=1285;SC=CTCTTGAGGGAACTCTGTCAG;SOR=2.004;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=47;WE=65497857;WS=65497839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	65497891	rs68021609	G	T	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=89;ReadPosRankSum=-0.348;SC=TTCTTCTCTGGTAAAGACAAG;SOR=0.223;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=7;WE=65497899;WS=65497881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
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chr15	65624228	rs686739	G	C	5393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=110;NR=51;PP=2965;SC=TCCAGGCCCCGCTTTCCCTGC;SOR=1.768;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=111;TCR=52;TR=161;WE=65624236;WS=65624218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
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chr15	65694613	rs12439363	C	G	147.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=1;PP=112;SC=GGCCTGGACCCCTTGAGGTCC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=65694621;WS=65694603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr15	65771121	rs72739494	T	C	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.188;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=6;PP=676;ReadPosRankSum=0.957;SC=AAGCAAGTATTGATGCTTATA;SOR=0.455;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=56;TCR=11;TR=36;WE=65771129;WS=65771111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,40:0.55:73
chr15	65782451	rs60062953	A	AT	2096.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=3;PP=2269;SC=AAGATTTAGAACTGTGCACTT;SOR=5.097;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=50;TCR=3;TR=50;WE=65782459;WS=65782441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	65792839	rs11071846	G	A	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-6.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=384;ReadPosRankSum=-0.310;SC=CTTTGTTGGTGGGTAAACTGA;SOR=0.194;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=71;TCR=0;TR=22;WE=65792847;WS=65792829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,24:0.31:77
chr15	65804213	rs352478	C	T	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=452;SC=ACATATTTAACATAGGCAGAC;SOR=4.804;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=65804221;WS=65804203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	65804537	rs352477	A	T	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=9;PP=478;SC=GTCACTGATTAATTTATTCAT;SOR=1.061;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=18;WE=65804545;WS=65804527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	65822777	rs452306	C	T	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=41;ReadPosRankSum=0.099;SC=AGGCCCGCTGCTGGCGCCGCC;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=5;WE=65822785;WS=65822768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr15	65822823	rs422390	C	G	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=3;PP=1161;SC=GCGCGGCCCGCGAGCGTGGGG;SOR=4.514;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=40;WE=65822831;WS=65822813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	65856653	rs11539008	G	A	1944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.312;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=53;PP=1563;ReadPosRankSum=-0.793;SC=GAGTCACTACGTCACCGGTGC;SOR=0.349;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=114;TCF=28;TCR=86;TR=72;WE=65856661;WS=65856643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,74:0.62:120
chr15	65902922	rs6494529	G	A	968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.195;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=7;PP=767;ReadPosRankSum=1.568;SC=CTAGACGTTTGTAATTCTTCC;SOR=0.150;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=51;TCF=43;TCR=8;TR=34;WE=65902930;WS=65902912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,35:0.66:53
chr15	65903398	rs4366668	G	A	7597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=452;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.910;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=171;NR=105;PP=2962;ReadPosRankSum=1.337;SC=CCAACAAGCAGCGAAAGGCAG;SOR=0.539;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=437;TCF=278;TCR=159;TR=276;WE=65903406;WS=65903388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,283:0.64:444
chr15	65931908	rs111310111	A	ACTGAGGC	2399.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.990;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=0;PP=2235;ReadPosRankSum=-0.122;SC=ACAGGGGCCCACTGTGCGGCT;SOR=2.040;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=77;TCF=68;TCR=9;TR=35;WE=65931916;WS=65931898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,52:0.61:85
chr15	65935195	rs12101597	C	G	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=-0.484;SC=CCAGGCAGAGCCTTTGATCCA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=3;WE=65935203;WS=65935185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr15	65959645	rs113627784	C	T	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.093;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=155;ReadPosRankSum=-1.113;SC=TCCAGCCTGGCGAAAGAGTGA;SOR=0.593;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=8;WE=65959653;WS=65959637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr15	65960195	rs6494531	A	G	453.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5169;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=346;ReadPosRankSum=-0.701;SC=AGACTACTTAAGACAAGGGGA;SOR=0.818;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=14;WE=65960203;WS=65960185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,15:0.88:17
chr15	65994733	rs17810074	C	T	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.994;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=23;PP=1058;ReadPosRankSum=0.550;SC=GACAGACTTTCACATAAGCTG;SOR=0.455;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=165;TCF=101;TCR=64;TR=55;WE=65994741;WS=65994723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,56:0.33:169
chr15	66023799	rs28556680	G	T	2710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.939;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=74;PP=2095;ReadPosRankSum=-0.241;SC=AACACTATTAGAAAAGTTTCC;SOR=1.141;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=137;TCF=37;TCR=100;TR=100;WE=66023807;WS=66023789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,101:0.72:140
chr15	66025010	rs11071849	G	A	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.771;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=170;ReadPosRankSum=1.270;SC=TCCTCATTCAGAATTGTTATT;SOR=0.593;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=9;WE=66025018;WS=66025000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr15	66025275	rs1435126	C	T	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.071;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=590;ReadPosRankSum=0.217;SC=TTTTGAAATCCCTAATACTAT;SOR=0.218;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=25;WE=66025283;WS=66025265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr15	66044604	rs8033741	A	T	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=0;PP=1006;SC=TCTGTAATTAAACTATGCTGT;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=66044612;WS=66044594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	66161723	rs12909265	G	C	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.554;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=450;ReadPosRankSum=-0.325;SC=CACCGCCCTTGTTGGGCTCAG;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=18;WE=66161731;WS=66161713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr15	66208830	.	C	G	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.441;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.457;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=281;ReadPosRankSum=0.324;SC=GGCCTTGGAACCACAGGTCAG;SOR=1.022;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=14;WE=66208838;WS=66208820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr15	66257236	rs36088570	C	CA	88.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=103;ReadPosRankSum=0.405;SC=CGCCCATTCCCAGCTCATACC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=66257244;WS=66257226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr15	66257408	rs333550	T	C	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=25;PP=1406;SC=GCAGTCACAGTGCTGTGAGCA;SOR=1.131;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=39;TCR=25;TR=64;WE=66257416;WS=66257398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr15	66274690	rs551474	T	C	1153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=19;PP=991;SC=GGGTGCCAGGTGCGCAGAGCT;SOR=0.743;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=40;WE=66274698;WS=66274680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	66386853	rs7168565	G	A	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.087;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=22;PP=904;ReadPosRankSum=-1.268;SC=ATGGGGAGAGGGAGGAAGAAC;SOR=0.452;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=46;WE=66386861;WS=66386843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,49:0.74:66
chr15	66411441	rs16949528	C	T	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.559;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=5;PP=535;ReadPosRankSum=0.134;SC=GAAGTCTCCGCTCTCATAGTA;SOR=1.863;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=116;TCF=86;TCR=30;TR=33;WE=66411449;WS=66411431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,33:0.28:117
chr15	66587581	rs80126717	G	A	3059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=9.638;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=83;PP=2754;ReadPosRankSum=1.211;SC=TATTTTGTCAGAAGGGACTTT;SOR=4.236;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=93;TCF=10;TCR=83;TR=92;WE=66587589;WS=66587571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,91:0.99:92
chr15	66612965	rs17851970	T	C	5794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.194;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=68;PP=2965;ReadPosRankSum=0.479;SC=TGTATCCAAATGGACATTTTG;SOR=1.078;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=191;TCF=121;TCR=70;TR=189;WE=66612973;WS=66612955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,196:0.99:197
chr15	66624282	.	G	A	951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.142;ClippingRankSum=0.000;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=1.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.38;ReadPosRankSum=0.578;SOR=0.962;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,30:0.23:129
chr15	66624284	.	C	A	951.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.000;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=1.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.38;ReadPosRankSum=0.470;SOR=0.962;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,30:0.23:129
chr15	66644263	rs62627278	T	TA	75.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=98;SC=AGGCGTGAGCTACCACGCCCA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=66644271;WS=66644253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	66644521	rs9806123	C	G	2903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=46;PP=2234;SC=TGGAGGTACACGAACAGGTGC;SOR=0.736;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=43;TCR=46;TR=89;WE=66644529;WS=66644511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr15	66679601	rs112542693	G	C	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=0;PP=1160;SC=TTGGTCCTGCGCAGCGGGCGC;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=41;WE=66679609;WS=66679591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	66735551	rs6494573	C	T	2303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=13;PP=1806;SC=CAGCCACAGCCGAAAGTTATC;SOR=2.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=56;TCR=13;TR=69;WE=66735559;WS=66735541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr15	66745890	rs7169326	G	A	2330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=37;PP=1776;SC=CAGTGAGTAGGTGATTCCTGG;SOR=0.836;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=32;TCR=37;TR=69;WE=66745898;WS=66745880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr15	66792087	rs112095287	C	T	951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=25;PP=785;SC=ACCAGCCGGGCACGGTGGCTC;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=66792095;WS=66792077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	66793480	rs11071895	C	T	1656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=15;PP=1337;SC=AGCCTGTATTCCAACAAAAGA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=31;TCR=15;TR=46;WE=66793488;WS=66793470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	66794352	rs74956204	G	A	599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=4;PP=469;SC=ATGGTATTCCGTTTGCCAAGT;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=66794360;WS=66794342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	66795980	rs8043062	A	G	2030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=56;PP=1742;SC=TGGTATGGTGAGGCAAACAAC;SOR=3.442;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=9;TCR=56;TR=65;WE=66795988;WS=66795970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr15	66806308	rs4238406	C	T	1896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=23;PP=1462;SC=TAATGTTGCTCGATACCTGTT;SOR=0.986;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=32;TCR=23;TR=55;WE=66806316;WS=66806298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	66806517	rs4420479	G	A	289.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=8;PP=240;SC=AATCAGCATCGGTGAAAATGA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=66806525;WS=66806507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	66816183	rs6494579	C	G	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=449;SC=CTCAAAACTTCTTCAGATGTT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=66816191;WS=66816173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	66820455	rs8033122	T	A	208.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=8;PP=226;SC=TATTATTATTTTTTTGAGACA;SOR=4.174;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=66820463;WS=66820445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	66821174	rs6494580	G	C	3145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=70;NR=21;PP=2475;SC=TTCTCTGAAGGTTGCTTCTTT;SOR=2.478;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=70;TCR=21;TR=91;WE=66821182;WS=66821164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr15	66821250	rs11071896	A	G	5393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=74;PP=2965;SC=CAAAGTTCGGAGTGATCTTGA;SOR=0.880;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=90;TCR=74;TR=164;WE=66821258;WS=66821240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr15	66874670	rs8041988	C	T	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.159;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=6;PP=127;ReadPosRankSum=1.388;SC=AGAGTGTGAGCTGTGAATGGA;SOR=0.520;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=53;TCF=25;TCR=28;TR=13;WE=66874678;WS=66874660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,14:0.26:54
chr15	66976149	rs2414910	G	T	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=1;PP=423;SC=TCCAAAGGGAGCTCTGTCCCA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=66976157;WS=66976139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	67003944	rs117452956	T	C	2564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.192;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=27;PP=1900;ReadPosRankSum=0.435;SC=ATTAAAAGCATGTAGAACCTG;SOR=0.376;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=124;TCF=92;TCR=32;TR=94;WE=67003952;WS=67003934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,97:0.76:127
chr15	67008737	rs2278604	C	A	4562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.531;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=51;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.438;SC=CAACTAAGTTCTCTTTTTCTT;SOR=1.053;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=240;TCF=165;TCR=75;TR=173;WE=67008745;WS=67008727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,175:0.72:242
chr15	67212062	rs79829875	G	A	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=235;ReadPosRankSum=-0.886;SC=AGGCTAAACCGGCCTCTCTCT;SOR=0.481;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=11;WE=67212070;WS=67212052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr15	67224255	.	G	A	109.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=39;ReadPosRankSum=1.383;SC=CACACCTCCCGGGAGCTGGCT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=67224263;WS=67224245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr15	67224274	rs4776331	A	G	186.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=136;SC=CTGGGGGGAGATAATATGCCT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=67224282;WS=67224264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	67234251	rs266383	A	G	4010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=67;PP=2965;SC=TTCACCCAGAACAGTTTCTCC;SOR=1.142;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=49;TCR=67;TR=116;WE=67234259;WS=67234241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr15	67279456	.	C	T	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.238;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=-0.580;SC=CAAGCAGACACTGGCCAGTCT;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=67279464;WS=67279446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr15	67391394	rs5813427	GT	G	3314.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.45;NF=15;NR=58;PP=2951;SC=CCTTTCTGTGGTTGCCGCCCT;SOR=1.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=16;TCR=62;TR=73;WE=67391402;WS=67391384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr15	67391497	rs1866319	C	A	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=18;PP=511;SC=CTCTTGTTCACAGTCACAGGG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=67391505;WS=67391487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	67430223	rs1866318	T	C	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=5;PP=921;SC=TTGGATTTCTTCTGTCTGGGT;SOR=3.675;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=33;WE=67430231;WS=67430213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	67457335	rs1065080	A	G	1733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=20;PP=1351;SC=ACCACGAGCTACGGGCCATGG;SOR=1.302;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=33;TCR=20;TR=53;WE=67457343;WS=67457325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	67457485	rs2289261	G	C	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=10;PP=578;ReadPosRankSum=0.622;SC=ACCTCTCCCCGGCTCCCCATC;SOR=0.610;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=80;TCR=33;TR=33;WE=67457493;WS=67457475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,34:0.29:119
chr15	67459013	rs7179893	C	T	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.337;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=-0.282;SC=CCTACAGCCACGGATGCTAGC;SOR=0.070;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=6;WE=67459021;WS=67459010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr15	67501782	rs28693872	T	C	3536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.989;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=42;PP=2689;ReadPosRankSum=-1.779;SC=GGAAAAAAGATCCAAGAAAAA;SOR=0.527;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=196;TCF=132;TCR=64;TR=125;WE=67501790;WS=67501772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,131:0.65:201
chr15	67501977	rs28418884	C	T	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.890;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=587;ReadPosRankSum=-0.757;SC=TTATTTGTTACCAAAGTTCTA;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=24;WE=67501985;WS=67501967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr15	67528374	rs7173826	T	G	1493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.588;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=51;PP=1062;ReadPosRankSum=0.222;SC=CCATGTTTGATGCACCATTCT;SOR=1.413;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=227;TCF=75;TCR=152;TR=66;WE=67528382;WS=67528364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,71:0.30:233
chr15	67547288	.	G	A	4281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.292;ClippingRankSum=0.000;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.013;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=101;PP=2962;ReadPosRankSum=0.212;SC=TAATCCAGGTGGGAAACGGGC;SOR=0.799;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=260;TCF=100;TCR=160;TR=160;WE=67547296;WS=67547278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,162:0.63:258
chr15	67596815	rs10438290	T	G	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.061;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=272;ReadPosRankSum=-0.123;SC=GTTGTTTTAATGAGCTCTTAT;SOR=1.755;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=43;TCF=7;TCR=36;TR=15;WE=67596823;WS=67596805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,15:0.34:44
chr15	67692502	rs7495023	T	C	5440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=84;PP=2965;SC=AAATACAGCGTTGGCTCTTTA;SOR=0.741;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=79;TCR=85;TR=163;WE=67692510;WS=67692492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr15	67757539	rs112419712	C	T	1770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.764;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=35;PP=1317;ReadPosRankSum=1.414;SC=ACCTGACAAACGGCCATCTGG;SOR=0.577;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=90;TCF=45;TCR=45;TR=65;WE=67757547;WS=67757529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,67:0.74:90
chr15	67768151	rs3985641	G	C	2302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=31;PP=1892;SC=TGGCTATGATGTTGAGGTATG;SOR=0.811;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=39;TCR=31;TR=70;WE=67768159;WS=67768141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	67782440	rs10574862	AGGAAAT	A	4140.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=48;PP=2945;SC=CAATAAGCTAAGGAAATAGAC;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=21;TCR=49;TR=68;WE=67782453;WS=67782430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr15	67814542	rs62015089	G	A	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.90;ReadPosRankSum=-0.292;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,6:0.19:31
chr15	67842526	rs6494670	G	A	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.473;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=309;ReadPosRankSum=-0.299;SC=GATTATTTATGACCATCATAT;SOR=0.037;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=63;TCF=1;TCR=62;TR=18;WE=67842534;WS=67842516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,19:0.28:67
chr15	67872983	rs7172298	T	C	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.54;ReadPosRankSum=-1.465;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr15	67879418	rs28730805	G	A	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=144;ReadPosRankSum=2.583;SC=TTTAGACTGGGTGCTGAGAAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=67879426;WS=67879408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr15	67885058	rs28637534	T	C	293.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=182;SC=TTATTGCTTTTGATTACTAAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=67885066;WS=67885048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	67892991	rs60932739	AC	A	1786.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FS=1.694;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.45;MQRankSum=5.714;QD=6.43;ReadPosRankSum=-0.199;SOR=0.821;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:201,77:0.28:278
chr15	67938728	rs56254481	C	T	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.505;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=8;PP=214;ReadPosRankSum=0.560;SC=TGTTACAGTGCGATTCATCAT;SOR=0.264;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=43;TCF=18;TCR=25;TR=16;WE=67938736;WS=67938718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr15	67951228	rs5813451	GA	G	3250.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=108;PP=2326;SC=AACTTCTTCTGAAAAAAAAAT;SOR=4.496;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=126;TCF=6;TCR=120;TR=111;WE=67951236;WS=67951218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr15	67962763	rs35395156	A	G	1488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=21;PP=1162;SC=TTTAGCAAACAAAGACCTGTG;SOR=0.994;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=48;WE=67962771;WS=67962753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	67984705	rs4343227	G	A	4921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=138;NR=11;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.843;SC=ATTTCGGATTGAGCAGATGAT;SOR=3.584;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=139;TCR=11;TR=149;WE=67984713;WS=67984695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,152:0.99:153
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chr15	68041070	rs8037011	A	G	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=377;SC=GCTCTGAGCTATGTTACGTGA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=68041078;WS=68041060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	68114499	rs61734073	G	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=72;ReadPosRankSum=-0.472;SC=CGTCGCTGCTGCCACCGCCGG;SOR=0.223;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=9;WE=68114507;WS=68114489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr15	68121483	rs7183168	A	C	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.147;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=11;PP=519;ReadPosRankSum=1.059;SC=GCAGGGCGCCACCCTAATCGC;SOR=1.003;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=61;TCF=35;TCR=26;TR=27;WE=68121491;WS=68121473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,26:0.43:61
chr15	68124665	rs72751453	C	A	1749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.892;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=43;PP=1352;ReadPosRankSum=-0.169;SC=GAAGCTGGAACGGGAATTTCA;SOR=0.446;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=98;TCF=26;TCR=72;TR=60;WE=68124673;WS=68124655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,63:0.62:101
chr15	68124853	rs12901293	G	C	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.714;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=244;ReadPosRankSum=0.015;SC=GTGGGAGTTGGGGGTAGGGGT;SOR=0.009;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=15;WE=68124861;WS=68124843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
chr15	68346549	rs11855475	T	C	973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=0;PP=825;SC=GGGCGGAGGCTAGAGGCGGGC;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=68346557;WS=68346539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	68434212	rs113300929	T	TG	433.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.928;HP=11;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.881;NF=26;NR=0;PP=326;ReadPosRankSum=-0.385;SC=GACATGTGTGTTTTTTTTTTT;SOR=2.338;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=26;WE=68434220;WS=68434195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr15	68445912	rs11633620	T	A	1715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=8;PP=1381;SC=TGTTTTCTACTTCTTTTTTTT;SOR=3.139;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=46;TCR=8;TR=54;WE=68445920;WS=68445902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr15	68468695	rs12438361	T	C	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=405;ReadPosRankSum=-0.355;SC=GGTTTTCTACTCTCTGGCTCC;SOR=0.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=61;TCR=0;TR=21;WE=68468703;WS=68468685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,24:0.37:65
chr15	68492028	rs11071986	G	A	2109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.839;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=44;PP=1483;ReadPosRankSum=2.243;SC=CTCTGCACACGGCCCAGAGGG;SOR=0.880;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=40;TCR=60;TR=73;WE=68492036;WS=68492018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,80:0.73:109
chr15	68510770	rs8025947	A	G	1098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=5.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.812;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=4;PP=913;ReadPosRankSum=1.791;SC=TCAGTTTACTAGGAGATAAAG;SOR=1.814;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=55;TCF=47;TCR=8;TR=37;WE=68510778;WS=68510760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,37:0.67:55
chr15	68522090	.	GGCGGAGCGGA	G	363	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.9998;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=23;MQ=59.86;NF=1;NR=1;PP=363;QD=187.0;SC=CCCGGGGCGGGGCGGAGCGGA;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=2;WE=68522107;WS=68522080;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,2:0.40:5
chr15	68583175	rs6494729	T	C	8972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=126;NR=139;PP=2965;SC=TGGCTGTCAATTCCAATACTC;SOR=0.751;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=269;TCF=129;TCR=140;TR=265;WE=68583183;WS=68583165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr15	68603625	rs898591	C	T	1402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=29;PP=1109;SC=AGGCCATCACCACCTCGTCCG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=43;WE=68603633;WS=68603615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr15	68605067	rs4776394	A	C	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.78;ReadPosRankSum=2.139;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr15	68605169	rs4777035	G	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=266;ReadPosRankSum=-0.830;SC=CGAGCTGTTGGGCTTGACCTC;SOR=0.562;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=62;TCF=50;TCR=12;TR=15;WE=68605177;WS=68605159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,14:0.23:61
chr15	68606045	.	G	GC	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.70;ReadPosRankSum=-0.401;SOR=0.070;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,6:0.19:31
chr15	68609833	rs1516871	T	C	745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=25;PP=593;SC=TATGAAAGCCTGGACCACAGC;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=68609841;WS=68609823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	68612385	rs35808090	C	A	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=1;PP=968;SC=ACCTCAGCCTCCCAAAGTGCT;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=35;WE=68612393;WS=68612375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	68618961	rs2271722	T	C	2384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=16;PP=1698;SC=CTATAGGAGCTTGGGCTCTGC;SOR=1.997;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=62;TCF=45;TCR=17;TR=61;WE=68618969;WS=68618951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	68624175	rs7167822	C	T	2298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=1;PP=2028;SC=TTGCTCCATCCGCTTCCCCAG;SOR=6.154;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=64;TCF=63;TCR=1;TR=64;WE=68624183;WS=68624165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	68624290	rs2292745	G	A	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.221;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=27;PP=900;ReadPosRankSum=1.160;SC=CCACCACCACGTCATTGTAGG;SOR=0.997;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=209;TCF=110;TCR=99;TR=63;WE=68624298;WS=68624280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,67:0.31:215
chr15	68624396	rs7168069	A	C	4020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=104;PP=2965;SC=ATAAACAAACAGGTTCTGCAA;SOR=2.320;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=33;TCR=105;TR=137;WE=68624404;WS=68624386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr15	68624641	rs6494733	A	C	8272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=160;NR=99;PP=2965;ReadPosRankSum=1.602;SC=GGTTGGGGGCACCTGAGAAGC;SOR=0.499;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=261;TCF=161;TCR=100;TR=259;WE=68624649;WS=68624631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,264:1.00:265
chr15	68628143	rs2306023	C	T	4745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=96;PP=2965;SC=CCACGTACACCCGCCCCTGCC;SOR=1.334;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=54;TCR=96;TR=150;WE=68628151;WS=68628133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr15	68631740	rs2125998	A	G	702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=1;PP=596;SC=GAATATACACAGCAGGCCCCT;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=68631748;WS=68631731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	68641362	rs61119953	AG	A	1239.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=40;PP=1099;SC=CTCTCTTTCGAGGGGGGGCTC;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=40;WE=68641370;WS=68641352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	68649587	rs12907890	G	A	4742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=91;PP=2965;SC=ACCTGTAGTCGTTGAGGTGAA;SOR=1.417;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=145;TCF=54;TCR=91;TR=144;WE=68649595;WS=68649577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr15	68656864	rs2306013	A	G	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=2;PP=355;SC=CCGGAATGGCATAAGCAGGGA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=68656872;WS=68656854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr15	68656960	rs2306012	A	G	1271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=17;PP=993;SC=CAGGATGGACATGAGGGTGTG;SOR=1.280;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=28;TCR=17;TR=45;WE=68656968;WS=68656950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	68695220	rs142001507	G	C	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=360;ReadPosRankSum=-0.763;SC=GGTGTGGAATGGTACAGGGCT;SOR=0.616;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=90;TCF=74;TCR=16;TR=26;WE=68695228;WS=68695210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,27:0.29:92
chr15	68695349	rs11629460	G	A	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.215;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=33;PP=1052;ReadPosRankSum=-0.980;SC=TGGTGTCCATGTTGAAGGTGT;SOR=0.591;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=176;TCF=80;TCR=96;TR=63;WE=68695357;WS=68695339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,63:0.35:181
chr15	68695448	rs4777049	T	C	1954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.023;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=51;PP=1547;ReadPosRankSum=-0.178;SC=TCAGGACCCATTGGCAGGTCA;SOR=0.943;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=95;TCF=21;TCR=74;TR=65;WE=68695456;WS=68695438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,67:0.70:96
chr15	68724262	rs2305078	G	C	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.511;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=600;ReadPosRankSum=0.628;SC=CTGGGAGGAGGGTCGCGTCCC;SOR=1.236;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=64;TCF=26;TCR=38;TR=36;WE=68724270;WS=68724252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,37:0.57:65
chr15	68987315	rs11072043	A	C	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=1;PP=590;SC=TGTGGCCCAGACTGACTTGGC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=68987323;WS=68987305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	68987341	rs7359311	A	G	981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=2;PP=814;SC=AGGGCCCAAAAACAAAAATAA;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=68987349;WS=68987331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	69003788	rs71402285	G	A	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=97;ReadPosRankSum=1.672;SC=TGCATGGGGCGCTTCTCCCAG;SOR=0.634;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=7;WE=69003796;WS=69003785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr15	69003871	rs3736272	G	T	1510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=11;PP=1135;ReadPosRankSum=-0.392;SC=CCATGCATCTGCCCTCGCAGG;SOR=0.772;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=55;TCR=15;TR=51;WE=69003879;WS=69003861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,54:0.73:74
chr15	69007656	rs1542746	T	G	4706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=106;PP=2965;SC=CCTAGGTAAGTGGCCCCGAGG;SOR=2.131;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=39;TCR=106;TR=145;WE=69007664;WS=69007646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr15	69011119	rs33913544	C	T	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.990;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=325;ReadPosRankSum=-0.653;SC=AGGGCCTGATCGAGCCCATCT;SOR=1.270;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=67;TCF=18;TCR=49;TR=19;WE=69011127;WS=69011109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,19:0.25:77
chr15	69011389	rs1491640	A	C,G	3236.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=42.59;SOR=4.351;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,53,23:0.70,0.30:76
chr15	69011389	.	AGTGAC	CGTGAT,GGTGAT	1183	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=46,17;NR=5,2;PP=1183,312;QD=24.2444681346;SC=GAGCAGGTAGAGTGACTGGAG;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=65;TCR=7;TR=51,19;WE=69011402;WS=69011379;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.71:72
chr15	69011394	rs1491639	C	T	3548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.28;SOR=4.021;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr15	69011918	rs55921407	C	T	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.924;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=30;PP=575;ReadPosRankSum=-0.680;SC=ATTACCTCCACAGGCCCTGGA;SOR=0.446;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=126;TCF=25;TCR=101;TR=39;WE=69011926;WS=69011908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,42:0.34:125
chr15	69094158	rs10689979	T	TCA	1064.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.753;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=1041;ReadPosRankSum=0.241;SC=ACCAACTGAGTCACACCAGAG;SOR=1.332;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=25;WE=69094166;WS=69094148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr15	69112946	rs4777089	C	A	285.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5052;FS=7.160;HP=8;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=220;ReadPosRankSum=-0.198;SC=CGCCCCCCCCCAAAAAAAGTG;SOR=0.982;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=11;WE=69112954;WS=69112936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,11:0.85:13
chr15	69112971	rs35802209	G	GCA	541.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.194;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.904;NF=14;NR=3;PP=765;ReadPosRankSum=-1.703;SC=CCCCCAGCGCGCACACACACA;SOR=2.795;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=17;WE=69112979;WS=69112961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr15	69238445	rs3743093	G	A	4571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.607;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=75;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.837;SC=ACTGGCATTGGGATCTCTACA;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=242;TCF=128;TCR=114;TR=162;WE=69238453;WS=69238435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,165:0.65:252
chr15	69324085	.	A	G	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.313;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.743;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=34;PP=783;ReadPosRankSum=-1.531;SC=CAACGGGGCCATCACCTTCGA;SOR=1.168;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=72;TCF=11;TCR=61;TR=39;WE=69324093;WS=69324075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,41:0.55:75
chr15	69325581	rs311893	C	T	4241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=55;PP=2965;SC=CCAAGGGCTGCGGCCAGTGCC;SOR=0.895;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=75;TCR=55;TR=129;WE=69325589;WS=69325571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr15	69327825	rs311889	C	T	4832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=104;PP=2965;SC=TCGTGCACACCGTGGCTCACA;SOR=1.833;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=43;TCR=104;TR=147;WE=69327833;WS=69327815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr15	69328226	rs12907196	C	T	1573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=28;PP=1246;ReadPosRankSum=-0.034;SC=GCTGCTCCTCCTCATGTTCAT;SOR=0.737;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=126;TCF=70;TCR=56;TR=62;WE=69328234;WS=69328216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,62:0.48:129
chr15	69329623	rs34924807	G	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.35;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
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chr15	69329624	rs2246273	A	G	308.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.60;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	69339831	.	A	G	920.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=0.000;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.632;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=29;PP=714;ReadPosRankSum=-0.116;SC=CGGGGCAGGCATCGGCATCAC;SOR=0.761;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=167;TCF=69;TCR=98;TR=48;WE=69339839;WS=69339821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,49:0.28:172
chr15	69347593	rs311905	G	A	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=552;SC=AAGCCCCAGGGTAAGGTAGTG;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=69347601;WS=69347583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	69349087	rs311906	T	C	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=23;PP=581;SC=TCTGCTTCATTGCATTAGTAT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=69349095;WS=69349077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	69553728	rs8023271	C	A	3627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.892;SC=CCCTGATAGTCCCTTAAAATT;SOR=4.479;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=5;TCR=113;TR=116;WE=69553736;WS=69553718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,116:0.99:117
chr15	69561518	rs3865014	G	A	5154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=64;PP=2965;SC=TGAGTCCCCAGTCTTCAAAGA;SOR=0.976;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=84;TCR=64;TR=148;WE=69561526;WS=69561508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr15	69676944	.	T	C	930	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MMLQ=24;MQ=50.97;NF=32;NR=2;PP=930;QD=28.3756238984;SC=GCGGGTCCTCTGTGTTCATGG;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=34;WE=69676952;WS=69676934;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	69683945	rs2242464	C	G	3581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=20;PP=2886;SC=AACCTGGACACTCTTGGACCT;SOR=2.921;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=84;TCR=20;TR=104;WE=69683953;WS=69683935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr15	69684376	rs7183388	G	A	2447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=22;PP=1907;SC=AGCCCGGGCAGTGGAGCCAAG;SOR=1.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=51;TCR=22;TR=73;WE=69684397;WS=69684366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	69684389	rs11634798	A	T	2928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=32;PP=2261;SC=GAGCCAAGAAAAAAAAGAAAT;SOR=1.354;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=55;TCR=32;TR=87;WE=69684397;WS=69684366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr15	69684477	rs58280155	T	A	2601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=64;PP=2137;SC=GCTGGTTTTATTTTATTTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=20;TCR=65;TR=84;WE=69684489;WS=69684467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr15	69684481	rs112633523	AT	A	1867.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=52;PP=1206;SC=GTTTTATTTTATTTTTTTTTG;SOR=3.167;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=64;TCF=7;TCR=57;TR=58;WE=69684489;WS=69684467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr15	69684507	rs11634850	A	G	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=42;PP=1304;SC=AGTAGAGACAAGGTTTCGCCA;SOR=4.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=45;WE=69684515;WS=69684497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	69709686	rs3759825	G	A	3349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=24;PP=2506;SC=GCAAAAGGTCGAACTTTCTTC;SOR=2.325;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=78;TCR=24;TR=102;WE=69709694;WS=69709676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr15	69715488	rs7180624	C	T	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.88;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	69728949	rs3825858	A	G	5354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=59;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.054;SC=CACCTTTGCCATCATGCGAAA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=119;TCR=60;TR=177;WE=69728957;WS=69728939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,187:0.99:189
chr15	69732483	rs4776448	G	A	5740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=130;PP=2965;SC=AGTTAGGTTCGATATTTTGAA;SOR=2.702;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=36;TCR=130;TR=166;WE=69732491;WS=69732473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr15	69732736	rs937724	C	T	4791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=82;PP=2965;SC=CTATTGTTACCGAACCTAAAA;SOR=0.948;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=146;TCF=64;TCR=82;TR=145;WE=69732744;WS=69732726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr15	69740350	rs13613	A	G	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=32;PP=920;SC=CTTGTATAGTATATGTTTTGC;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=69740358;WS=69740340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	69746080	.	GTGAT	G	2418.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.142;NF=19;NR=28;PP=2341;ReadPosRankSum=1.560;SC=TGGTGGCAAAGTGATTGTGGT;SOR=0.707;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=33;TCR=48;TR=47;WE=69746091;WS=69746070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,62:0.61:101
chr15	69747675	rs1463911	A	T	1698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=35;PP=1645;SC=GAGATTTTTTAAAAAATAGTA;SOR=1.010;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=62;TCF=27;TCR=35;TR=61;WE=69747683;WS=69747665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr15	69754221	rs8041861	T	C	9558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=148;NR=177;PP=2965;SC=CAATGATGAATGGAACCAGAA;SOR=0.895;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=325;TCF=148;TCR=177;TR=325;WE=69754229;WS=69754211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,335:1.00:335
chr15	69857737	rs16953470	A	G	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-6.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.263;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=6;PP=1026;ReadPosRankSum=1.059;SC=AAAAATATACAATGCCTCCAA;SOR=1.225;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=175;TCF=152;TCR=23;TR=67;WE=69857745;WS=69857727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,68:0.38:180
chr15	70350457	rs2291982	C	G	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=18;PP=1025;SC=CCCCCTCCCCCCAATCAGATT;SOR=1.220;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=30;TCR=18;TR=48;WE=70350465;WS=70350447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	70351788	rs2133977	T	C	7696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=128;NR=101;PP=2965;SC=CACTCTTGTCTCCATCACTGT;SOR=0.912;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=230;TCF=128;TCR=102;TR=229;WE=70351796;WS=70351778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr15	70352968	rs2228176	C	G	4757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=65;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.761;SC=GGAGGCTTTCCGAGGGTGACA;SOR=0.405;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=97;TCR=65;TR=161;WE=70352976;WS=70352958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,167:0.99:168
chr15	70353075	rs3825968	C	A	5258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=1.369;SC=GCAGGTGACACGGAGGTCAGG;SOR=0.432;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=163;TCF=65;TCR=98;TR=162;WE=70353083;WS=70353065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,166:0.99:167
chr15	70368571	rs3830411	A	ATGC	3528.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=59;PP=2924;SC=GCAAGTGGAAATGCAAACTCC;SOR=3.753;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=76;TCF=4;TCR=72;TR=63;WE=70368579;WS=70368561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr15	70371571	rs12901770	A	T	540.81	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=427;ReadPosRankSum=0.918;SC=AATGCCACACAGATGCAGAAC;SOR=2.948;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=15;WE=70371579;WS=70371563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
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chr15	71125093	rs3825970	G	A	1817.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.117;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=48;PP=1474;ReadPosRankSum=-2.361;SC=CCACGATGGCGCACTCCTGGG;SOR=1.168;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=106;TCF=35;TCR=71;TR=68;WE=71125101;WS=71125083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,69:0.65:106
chr15	71125204	rs1549317	A	G	1528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.855;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=32;PP=1161;ReadPosRankSum=0.606;SC=CAAAAGTCCCAAAAAGCTTGA;SOR=0.776;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=86;TCF=42;TCR=44;TR=59;WE=71125212;WS=71125194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,60:0.67:89
chr15	71175296	rs1528828	A	G	1415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=39;PP=1154;SC=ACCTTATAGGATTTTATCTTT;SOR=4.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=42;WE=71175304;WS=71175286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	71186811	rs1881568	C	G	1529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=0;PP=1345;SC=AAGATTATTTCCCCATAATGT;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=46;WE=71186819;WS=71186801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	71193188	rs3830648	A	AAT	226.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.299;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=195;ReadPosRankSum=2.815;SC=AAATTCTCCAAATATAAGATG;SOR=0.223;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=6;WE=71193196;WS=71193178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr15	71276480	rs3834543	GCAA	G	1288.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.248;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.932;NF=15;NR=9;PP=979;ReadPosRankSum=-0.293;SC=AGTGGGACTTGCAACAACAAC;SOR=0.330;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=24;WE=71276490;WS=71276470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,33:0.72:46
chr15	71341050	rs1713569	G	A	1440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=1;PP=1146;ReadPosRankSum=1.992;SC=TGATGAAATTGGGGCACAATA;SOR=1.310;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=78;TCF=76;TCR=2;TR=49;WE=71341058;WS=71341040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,51:0.62:82
chr15	71507764	rs12324441	G	C	1495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.982;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=28;PP=1115;ReadPosRankSum=1.716;SC=TGTCTGTGCCGCTCCCCGTCC;SOR=0.541;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=79;TCF=41;TCR=38;TR=52;WE=71507772;WS=71507754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,56:0.66:85
chr15	71535458	rs12440013	G	C	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.632;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=304;ReadPosRankSum=1.103;SC=AACCCATACCGGGCCTGGAAA;SOR=0.130;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=82;TCF=5;TCR=77;TR=24;WE=71535466;WS=71535448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,24:0.28:85
chr15	71952772	rs62024297	C	A	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.193;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=130;ReadPosRankSum=2.210;SC=TCGTAAATAGCTAGAAAAGAA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=7;WE=71952780;WS=71952762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr15	71953045	rs62024298	G	A	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.122;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=22;PP=710;ReadPosRankSum=-0.890;SC=TCAACATCACGGAGATGTACA;SOR=0.347;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=97;TCF=33;TCR=64;TR=38;WE=71953053;WS=71953035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,38:0.39:98
chr15	72023422	rs2277540	C	T	5109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=107;NR=59;PP=2965;SC=GGTGTGCATACGTGCCAAGTG;SOR=1.499;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=107;TCR=59;TR=166;WE=72023430;WS=72023412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr15	72037610	rs2291994	G	A	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=152;ReadPosRankSum=-0.403;SC=GCCTATTACCGGGTCACTTCA;SOR=0.534;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=36;TCF=23;TCR=13;TR=12;WE=72037618;WS=72037600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
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chr15	72073003	rs2291275	C	T	6425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.884;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=116;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.871;SC=AGCCTGTCCCCGCCCCCAGGG;SOR=0.865;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=197;TCF=81;TCR=116;TR=196;WE=72073011;WS=72072993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,202:1.00:203
chr15	72105928	rs11351249	AC	A	6032.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=37;PP=2969;SC=TTGGCGGTGGACCCCCACGGA;SOR=2.461;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=181;TCF=135;TCR=46;TR=158;WE=72105936;WS=72105918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr15	72172023	.	G	T	2205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=0.000;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=11;PP=1867;ReadPosRankSum=1.144;SC=TTTTTCATATGTTGAACTACT;SOR=0.715;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=122;TCF=105;TCR=17;TR=76;WE=72172031;WS=72172013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,79:0.61:130
chr15	72180440	rs148060237	C	T	872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=5.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.429;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=25;PP=679;ReadPosRankSum=-1.278;SC=CATCAACTGACGAAAATCGCT;SOR=0.439;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=53;TCF=9;TCR=44;TR=31;WE=72180448;WS=72180430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr15	72186286	rs2128112	A	T	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=236;SC=ATAATCCTGAACCTACGCATA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=72186294;WS=72186276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	72191073	rs2415128	T	C	10772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=155;NR=163;PP=2965;SC=CCTCCAAGGATCTGGGTCTCT;SOR=0.730;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=318;TCF=155;TCR=163;TR=318;WE=72191081;WS=72191063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,330:1.00:330
chr15	72191266	rs2415129	C	T	6444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=103;PP=2965;SC=ATCCTCCCATCCTGAAGGGTC;SOR=0.764;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=195;TCF=92;TCR=103;TR=195;WE=72191274;WS=72191256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr15	72244298	.	G	A	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.479;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=110;ReadPosRankSum=0.664;SC=CATTATATAAGCCCAAACCAA;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=8;WE=72244306;WS=72244288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr15	72252189	.	T	TA	313	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;FR=1.0000;HP=15;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=16;MQ=61.02;NF=30;NR=0;PP=313;QD=10.5333333333;SC=AGTAGAAAGGTAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=73;TCF=72;TCR=1;TR=30;WE=72252197;WS=72252179;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:43,30:0.41:73
chr15	72300031	rs3759820	A	C	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=326;SC=TCTTTTGGAAATGCTATTTAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=72300039;WS=72300025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	72302894	rs2957742	G	C	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=886;SC=ATGTATAAATGCAAATTAGAG;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=72302902;WS=72302884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	72431883	rs7175792	G	C	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=486;SC=GCATTTTACAGTCAGGTATTT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=72431891;WS=72431873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	72432583	rs930871	A	G	3091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=74;PP=2463;SC=AGATCTCATTACCACACTTGC;SOR=2.670;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=18;TCR=74;TR=92;WE=72432591;WS=72432573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr15	72454729	rs897731	C	G	4406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=84;PP=2965;SC=CTGAAGAAAGCGGCAATACGG;SOR=1.307;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=51;TCR=84;TR=135;WE=72454737;WS=72454719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr15	72457551	rs2959944	A	G	678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=1;PP=573;SC=GGCAGGTTTAAGAGATGCCCT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=72457559;WS=72457541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	72460339	rs8025939	T	A	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=35;PP=955;SC=AAACAGTCCATTCCCCAGCGT;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=36;WE=72460347;WS=72460329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	72462165	rs11072348	A	C	994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=11;PP=859;SC=GTGTGTATCTATGACTGGGAA;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=30;WE=72462173;WS=72462155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	72462831	rs7182776	T	C	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=24;PP=702;SC=GGAGCCGTCTTATACCAGGAA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=72462839;WS=72462821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	72509647	rs8192395	C	CA	165.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.281;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=259;ReadPosRankSum=-0.828;SC=CTGTGAAACTCAGACTCATCC;SOR=2.484;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=8;WE=72509655;WS=72509637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr15	72543656	rs2959904	T	C	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=2;NR=23;PP=641;SC=AGCTATCCTTTCTGAACAAGC;SOR=4.003;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=25;WE=72543664;WS=72543646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	72545876	rs1426166	T	C	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=23;PP=984;SC=CGTTATCTCCTTGGAGAGGTG;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=32;WE=72545884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	72546765	rs2912227	A	G	3798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=46;NR=68;PP=2956;SC=TGGGCAGGCAAAGGAGAGGGG;SOR=1.150;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=46;TCR=68;TR=114;WE=72546773;WS=72546755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr15	72556799	rs11072352	G	A	1725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=3;PP=1428;SC=TTTTGGAAGGGGGCATTCCAT;SOR=5.058;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=46;TCR=3;TR=49;WE=72556807;WS=72556789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr15	72557955	rs1426170	T	C	1007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=27;PP=865;SC=GTCTTAGCTATAGCCTTACAC;SOR=3.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=72557963;WS=72557945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	72559326	rs62022788	T	G	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=11;PP=322;SC=TTTGTGAGAGTCTCAGTCTCT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=72559334;WS=72559316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	72637795	rs4777502	T	C	2878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=39;PP=2195;ReadPosRankSum=-0.635;SC=ACCTCAGCAATTCACAGCGGA;SOR=0.349;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=92;TCF=53;TCR=39;TR=91;WE=72637803;WS=72637785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,92:0.99:93
chr15	72638892	rs1800431	T	C	1575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=21;PP=1163;ReadPosRankSum=-0.881;SC=GGTTCCACTATGTAGAAATCC;SOR=0.285;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=53;TCF=32;TCR=21;TR=51;WE=72638900;WS=72638882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr15	72859047	rs11403578	A	AT	219.37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=187;ReadPosRankSum=-0.158;SC=CTATTGATAGATTTTTTTTTA;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=72859055;WS=72859037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr15	72879653	rs139334001	A	ATTG	1616.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=14;PP=1563;SC=TCTTAACTATATTGTACTTTT;SOR=0.927;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=33;TCF=17;TCR=16;TR=30;WE=72879661;WS=72879643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	72987588	rs4777527	G	T	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=26;PP=908;SC=GCAGTTTCATGGTATGTGTAT;SOR=2.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=34;WE=72987596;WS=72987578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	73002035	rs8033604	G	A	1569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=15;PP=1189;SC=AAAATATGCTGCCTAGCTCCA;SOR=1.656;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=47;TCF=31;TCR=16;TR=46;WE=73002043;WS=73002025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	73004739	rs33923961	G	A	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=251;ReadPosRankSum=0.183;SC=ACAAGTTCAAGTACAGTCATG;SOR=0.631;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=13;WE=73004747;WS=73004729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr15	73009208	rs80334351	C	T	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=135;ReadPosRankSum=0.421;SC=AGAGAACTTTCAGTTCTTTCT;SOR=0.752;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=10;WE=73009216;WS=73009198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
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chr15	73023937	rs12914333	T	C	5575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=93;PP=2965;SC=TGGCACCCTTTGATTGGAAGA;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=183;TCF=90;TCR=93;TR=183;WE=73023945;WS=73023927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
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chr15	73052840	rs8024644	T	C	3087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=4.022;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.39;ReadPosRankSum=-0.530;SOR=1.356;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,78:0.67:117
chr15	73052845	rs8023358	A	G	2850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=2.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.40;ReadPosRankSum=-0.292;SOR=1.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,72:0.67:108
chr15	73067234	rs11634630	T	C	5508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=88;PP=2965;SC=GGAACTCTGATGCAACCTGGG;SOR=0.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=89;TCR=89;TR=177;WE=73067242;WS=73067224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr15	73409213	rs3840037	A	AT	853.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=9.836;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=31;PP=536;ReadPosRankSum=-0.524;SC=GTTTTAAGTGATTTTTTTTTT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=31;WE=73409221;WS=73409203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,36:0.95:38
chr15	73428224	rs8035499	T	A	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=19;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.743;NF=23;NR=12;PP=808;ReadPosRankSum=0.055;SC=TTTTTTTTTTTAACACAGCTC;SOR=0.693;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=35;WE=73428232;WS=73428214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,40:0.71:56
chr15	73528937	rs747873	T	C	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=90;ReadPosRankSum=0.604;SC=TCTGTACCAATTTTTAGTCCA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=6;WE=73528945;WS=73528927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr15	73541513	rs3736510	A	G	1585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.284;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=42;PP=1191;ReadPosRankSum=1.730;SC=AGAATTATAAATTGTACTACA;SOR=0.569;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=167;TCF=56;TCR=111;TR=66;WE=73541521;WS=73541503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,68:0.39:176
chr15	73545732	rs2623989	T	C	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.259;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.442;NF=17;NR=19;PP=797;ReadPosRankSum=0.482;SC=TTTTTTTTTGTTTCTCTAGTT;SOR=0.491;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=40;TCF=21;TCR=19;TR=36;WE=73545740;WS=73545722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr15	73551250	rs2251205	A	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.065;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=285;ReadPosRankSum=-0.926;SC=CTGGAACACAATAGATACTAG;SOR=1.591;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=75;TCF=21;TCR=54;TR=20;WE=73551258;WS=73551240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,19:0.24:80
chr15	73562532	rs2680348	C	T	3991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.532;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=52;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.837;SC=GATACTACACCGTCCGATGGA;SOR=1.255;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=249;TCF=149;TCR=100;TR=148;WE=73562540;WS=73562522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,148:0.59:250
chr15	73564881	rs1131854	C	T	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.202;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=34;PP=1047;ReadPosRankSum=0.558;SC=AGCCTCCCTCCGAAGCCAATG;SOR=0.587;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=197;TCF=83;TCR=114;TR=61;WE=73564889;WS=73564871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,61:0.31:200
chr15	73566942	rs497539	G	A	4828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.637;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=135;NR=31;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.425;SC=GGGGGTTTTAGTTTTTTTCCT;SOR=2.962;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=137;TCR=32;TR=166;WE=73566950;WS=73566931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,167:0.99:169
chr15	73581444	rs489531	A	G	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=10;PP=693;ReadPosRankSum=-1.618;SC=GCTCAGTGGCATAGGGCACAT;SOR=0.798;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=50;TCR=16;TR=42;WE=73581452;WS=73581434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,42:0.64:66
chr15	73595089	rs3833036	T	TA	1733.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.647;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.654;NF=8;NR=45;PP=1917;ReadPosRankSum=1.148;SC=TCTTGGAACTTACCCTTGAAA;SOR=1.290;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=141;TCF=25;TCR=116;TR=53;WE=73595097;WS=73595079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,61:0.37:166
chr15	73614834	rs529004	T	C	2315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=8;PP=1920;SC=ATAGATTGGATGGCAGTTTGG;SOR=4.265;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=64;TCR=8;TR=72;WE=73614842;WS=73614824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr15	73615878	rs117819825	C	T	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=4.536;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=0.000;QD=4.24;ReadPosRankSum=-0.327;SOR=1.133;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,38:0.24:156
chr15	73616635	rs481579	T	C	1247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=32;PP=923;SC=ATGCACAGCCTGCCCAGGCCA;SOR=2.200;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=42;WE=73616643;WS=73616625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	73766072	rs8023326	A	G	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=-1.000;SC=GCTCGGAGTAAAAAGATCAAT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=73766080;WS=73766062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr15	73848808	rs922687	A	C	1177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=33;PP=978;SC=CCTTTGTTCAATTCTTTGTTT;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=73848816;WS=73848798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	73852298	rs141729178	GA	G	39.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=75;ReadPosRankSum=0.066;SC=TCAAAGTATTGAAAAATGCTT;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=73852306;WS=73852288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
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chr15	73982965	rs6495076	G	A	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.639;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=2;PP=952;ReadPosRankSum=1.123;SC=TTTATCAGGAGCCCACTTTTC;SOR=0.313;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=58;TCF=56;TCR=2;TR=39;WE=73982973;WS=73982955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,41:0.66:62
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chr15	74177071	rs72745335	C	A	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.745;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=6;PP=951;ReadPosRankSum=-0.644;SC=CACCCATAGACCTGCTGGATG;SOR=0.283;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=60;TCF=53;TCR=7;TR=42;WE=74177079;WS=74177061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,43:0.69:62
chr15	74178966	rs62007098	G	A	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=161;ReadPosRankSum=0.236;SC=GAGGTGTCCAGCTAGGGATCA;SOR=0.582;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=10;WE=74178974;WS=74178956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr15	74179024	rs62007099	C	A	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.076;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=129;ReadPosRankSum=-0.322;SC=GCAAGTCTTCCTTGCCTCCCC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=74179039;WS=74179014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr15	74179031	rs72745338	C	T	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.25;ReadPosRankSum=0.967;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr15	74181255	rs7170803	A	G	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=3;PP=670;SC=AGCAGGCTGTACTACTTGAGA;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=74181263;WS=74181245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	74181538	rs13638	A	G	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.176;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=583;ReadPosRankSum=-2.178;SC=CTGCAATATAAACAGTCCTCT;SOR=2.546;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=24;WE=74181546;WS=74181528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,25:0.76:33
chr15	74219546	rs1048661	G	T	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.383;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=21;PP=1387;ReadPosRankSum=1.595;SC=GGCATGGCCCGGGCCCGCACC;SOR=0.368;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=95;TCF=67;TCR=28;TR=63;WE=74219554;WS=74219536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,64:0.65:98
chr15	74220000	rs41429348	C	T	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.978;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=675;ReadPosRankSum=-0.036;SC=CCTACCCTGACCCCGGTCCCG;SOR=0.660;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=64;TCF=33;TCR=31;TR=40;WE=74220008;WS=74219990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,42:0.64:66
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chr15	74238734	rs2304720	T	C	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.156;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=660;ReadPosRankSum=-1.646;SC=CAACCCCCCCTCATCTCCCCC;SOR=0.935;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=32;WE=74238742;WS=74238724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr15	74336633	rs5742915	T	C	5413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=91;NR=74;PP=2965;SC=GCCTGAAGCCTTCTTCAGCAT;SOR=0.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=91;TCR=74;TR=165;WE=74336641;WS=74336623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr15	74356031	rs2636839	C	A	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=1.371;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.88;MQRankSum=-0.466;QD=1.50;ReadPosRankSum=-0.534;SOR=1.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,10:0.14:69
chr15	74467856	rs1052622	G	A	3258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=70;PP=2652;ReadPosRankSum=1.162;SC=TCAAGGGTACGCCGCTGAGCC;SOR=0.427;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=121;TCF=46;TCR=75;TR=116;WE=74467864;WS=74467846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,121:0.99:122
chr15	74472716	rs351242	G	A	1320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.755;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=40;PP=1154;ReadPosRankSum=-0.967;SC=TCCCCTGCAGGCAGCACATGG;SOR=5.235;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=42;WE=74472724;WS=74472706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,42:0.95:44
chr15	74476340	rs2277608	G	C	1933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.583;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=42;PP=1556;ReadPosRankSum=0.954;SC=CCTGGGGTGGGAGCCAGGGAG;SOR=0.481;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=108;TCF=39;TCR=69;TR=68;WE=74476348;WS=74476330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,72:0.64:113
chr15	74477216	rs351238	G	A	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=135;ReadPosRankSum=-0.677;SC=AGCCCGGGCCGGCAGAGCCCT;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=8;WE=74477224;WS=74477206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr15	74477239	rs351237	G	A	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.043;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=254;ReadPosRankSum=0.823;SC=CCTCCCTCCAGGCCCAGGGCC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=13;WE=74477247;WS=74477229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr15	74483415	rs351228	T	C	3632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=47;PP=2768;SC=ACAAGGATTCTGGGGAGCAGG;SOR=1.078;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=66;TCR=47;TR=113;WE=74483423;WS=74483405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr15	74489849	.	G	A	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=380;ReadPosRankSum=-0.830;SC=CAGGCCCCAGGATATCCCCTA;SOR=0.201;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=17;WE=74489857;WS=74489839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr15	74489883	rs351218	A	G	937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=21;PP=770;SC=CACTCATGTGACATCTTGGGG;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=74489891;WS=74489873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	74499956	rs351222	G	C	1077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.445;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=21;PP=654;ReadPosRankSum=-0.444;SC=TCAAACCTCAGGTACACCCCC;SOR=0.522;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=132;TCF=80;TCR=52;TR=48;WE=74499964;WS=74499946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,51:0.38:134
chr15	74528985	rs351175	T	G	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.511;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=5;PP=400;ReadPosRankSum=0.284;SC=CAGGACTGATTCCTGATCACC;SOR=1.112;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=22;WE=74528993;WS=74528975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr15	74529130	rs11633321	T	G	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.001;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=800;ReadPosRankSum=-1.042;SC=CGTCCCTCCTTCAAAGTCCTT;SOR=0.495;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=64;TCF=28;TCR=36;TR=40;WE=74529138;WS=74529120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,42:0.65:65
chr15	74536285	rs67845844	CA	C	254.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.93;MQRankSum=1.866;QD=14.11;ReadPosRankSum=0.341;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,16:0.89:18
chr15	74536400	rs10552820	TAAG	T	2307.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.207;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.390;NF=14;NR=33;PP=2038;ReadPosRankSum=0.587;SC=TGTCTCCCTCTAAGAAGGAGA;SOR=1.101;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=73;TCF=30;TCR=43;TR=47;WE=74536410;WS=74536390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,59:0.69:86
chr15	74558927	rs440793	A	G	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=3;PP=560;SC=CCCTACTCTCAACAATGTCTC;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=74558935;WS=74558917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	74560566	rs1038436	C	T	4146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=99;NR=24;PP=2965;SC=ATTATCAGCTCGGAGCCCCAG;SOR=2.744;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=99;TCR=24;TR=123;WE=74560574;WS=74560556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr15	74572242	rs351165	T	A	1193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=1;PP=1021;SC=CAAATATCTGTGTATGCCTTG;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=35;WE=74572250;WS=74572232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	74572917	rs351164	A	G	1983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=2;PP=1564;SC=GAAAGCAGGCAGCGGGAGACA;SOR=6.273;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=65;TCR=2;TR=67;WE=74572925;WS=74572907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	74588024	rs1484212	T	C	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=44;NR=1;PP=1234;SC=GGGGTGTAGATGGTGTGCTTA;SOR=6.229;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=45;WE=74588032;WS=74588014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	74611182	rs751528	A	G	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=3.590;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.40;ReadPosRankSum=0.826;SOR=0.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr15	74611189	rs751527	T	C	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.78;ReadPosRankSum=2.130;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr15	74622365	rs2277601	C	T	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.924;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=168;ReadPosRankSum=0.140;SC=AGGATCAAGTCATAACCACCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=8;WE=74622373;WS=74622355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr15	74622457	rs2277602	A	C	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.463;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=460;ReadPosRankSum=0.094;SC=ACTGACTTTCAAGTGTAGATG;SOR=0.101;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=19;WE=74622465;WS=74622447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,21:0.78:27
chr15	74622678	rs1564782	G	A	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5005;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=162;ReadPosRankSum=-0.895;SC=GGCAAAGCCAGTGAGGCCCAG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=74622686;WS=74622668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr15	74623272	rs2277605	G	A	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=912;ReadPosRankSum=0.576;SC=GGGCCAAGGTGGACTCCCAGG;SOR=0.631;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=90;TCF=61;TCR=29;TR=45;WE=74623280;WS=74623262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,46:0.51:91
chr15	74623302	rs2277606	T	C	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=1.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.41;ReadPosRankSum=-1.128;SOR=0.935;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,52:0.56:93
chr15	74627222	rs2279356	G	T	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.831;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=295;ReadPosRankSum=0.793;SC=TTTGCTTTCTGCCTGGACAGC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=13;WE=74627230;WS=74627212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr15	74628242	rs900802	C	T	1845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.977;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=17;PP=1360;ReadPosRankSum=0.719;SC=GGGGTACTCACGCACCCCGCT;SOR=0.529;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=101;TCF=79;TCR=22;TR=71;WE=74628250;WS=74628232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,74:0.70:106
chr15	74628891	rs2959003	A	G	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.286;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=42;PP=1106;ReadPosRankSum=0.482;SC=TATCATTGTGAAATACTCCAT;SOR=1.842;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=60;TCF=5;TCR=55;TR=45;WE=74628899;WS=74628881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,45:0.75:60
chr15	74709566	rs2075590	T	G	1053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=1;PP=744;SC=CTTTCCTGCATGGCCCCAGCG;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=74709574;WS=74709564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	74710593	rs28362912	C	T	3913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.216;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=49;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.835;SC=CCCTCCATACCCCCTCCCCCA;SOR=1.100;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=135;TCF=83;TCR=52;TR=132;WE=74710601;WS=74710583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,131:0.99:132
chr15	75041917	rs762551	C	A	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=231;ReadPosRankSum=0.894;SC=CTCTGTGGGCCCAGGACGCAT;SOR=0.446;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=12;WE=75041925;WS=75041911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr15	75044238	rs2472304	G	A	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=725;ReadPosRankSum=-0.641;SC=GAAGCCTTGAGACCCAGGTTG;SOR=0.700;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=33;WE=75044246;WS=75044228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,33:0.66:50
chr15	75047426	rs2470890	C	T	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=116;ReadPosRankSum=0.561;SC=TCTCCATCAACTGAAGAAGAC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=6;WE=75047434;WS=75047416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr15	75080872	rs2168519	T	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.712;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=85;ReadPosRankSum=-0.366;SC=TCAGCTGTAATTCCCGTGTTC;SOR=0.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=5;WE=75080880;WS=75080862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr15	75081078	rs2168518	G	A	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=525;ReadPosRankSum=-0.990;SC=GCCTCCAGCCGTCAGTCTCCC;SOR=0.656;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=39;TCF=21;TCR=18;TR=25;WE=75081086;WS=75081068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr15	75105862	rs183090590	G	A	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=5.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.47;ReadPosRankSum=-0.008;SOR=0.852;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,28:0.25:114
chr15	75114322	rs11636952	T	C	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=33;PP=668;ReadPosRankSum=0.552;SC=CAGAGAGGACTGGGCTGGGCC;SOR=0.541;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=54;TCF=5;TCR=49;TR=37;WE=75114330;WS=75114312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,39:0.70:56
chr15	75115895	rs7162232	G	A	2242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.330;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=54;PP=1805;ReadPosRankSum=-1.330;SC=ACCACCCCCGGTTAGGGATGC;SOR=0.981;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=135;TCF=57;TCR=78;TR=90;WE=75115903;WS=75115885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,89:0.65:136
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chr15	75117912	rs79217743	G	T	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.117;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=17;PP=336;ReadPosRankSum=-2.027;SC=GGGATTCTGAGGAGGCAGCCT;SOR=0.223;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=64;TCF=15;TCR=49;TR=25;WE=75117920;WS=75117902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,25:0.37:68
chr15	75130015	rs11312224	AG	A	3148.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.575;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.866;NF=69;NR=30;PP=2355;ReadPosRankSum=1.363;SC=ATACACCAGCAGGGGGGGACG;SOR=0.481;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=141;TCF=96;TCR=45;TR=99;WE=75130023;WS=75130005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,118:0.73:161
chr15	75131567	rs8039777	C	T	2718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.177;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=62;PP=2148;ReadPosRankSum=0.506;SC=TGACTCCCATCCCTGCTGCAC;SOR=1.198;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=155;TCF=68;TCR=87;TR=97;WE=75131575;WS=75131557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,101:0.64:158
chr15	75131661	rs4886615	A	G	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.804;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=32;PP=949;ReadPosRankSum=-1.181;SC=GTGATAAGGCAGCTGCTGAAT;SOR=0.540;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=100;TCF=31;TCR=69;TR=48;WE=75131669;WS=75131651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,48:0.47:102
chr15	75135447	rs2290574	T	C	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.055;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=625;ReadPosRankSum=-1.508;SC=GCCCCGCCATTCCGGCCGCCT;SOR=1.296;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=29;WE=75135455;WS=75135437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,29:0.69:42
chr15	75140854	rs3765066	G	A	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=234;ReadPosRankSum=1.600;SC=GGGCACTGGCGGGGCTCTGTG;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=11;WE=75140862;WS=75140845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr15	75230502	rs6495131	A	G	184.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5731;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=142;ReadPosRankSum=-0.157;SC=GGGCGGGAGGAGCCACCGCGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=75230510;WS=75230492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr15	75310075	rs12593566	C	A	1615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=9;PP=1250;SC=GAACTAACCCCTTCTGACCTC;SOR=2.701;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=49;TCF=40;TCR=9;TR=47;WE=75310083;WS=75310065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	75311036	rs2289583	C	A	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.204;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=186;ReadPosRankSum=0.818;SC=GGGGAGGGAGCACTGTTTTTT;SOR=1.699;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=11;WE=75311044;WS=75311026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr15	75336729	rs2304899	A	G	6839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=119;PP=2965;SC=TCTGCCAGATATGGAAGAGCC;SOR=1.100;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=206;TCF=87;TCR=119;TR=206;WE=75336737;WS=75336719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr15	75498548	rs1466663	A	G	4703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=77;PP=2965;SC=GCCCCATGGCAGGTACTCCTA;SOR=0.771;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=81;TCR=77;TR=158;WE=75498556;WS=75498538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr15	75499602	rs12591506	C	A	6702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=118;PP=2965;SC=GAACAATGTGCGGGCTGTGCC;SOR=1.092;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=201;TCF=82;TCR=119;TR=200;WE=75499610;WS=75499592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr15	75499619	rs11072531	T	C	5719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=108;PP=2965;SC=TGCCACAGCCTGGTGCCTTCC;SOR=0.919;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=87;TCR=108;TR=195;WE=75499627;WS=75499609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr15	75499861	rs11072532	G	A	7701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=121;PP=2965;SC=CAGAAGGAGGGCGCAAGGCCA;SOR=0.718;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=242;TCF=121;TCR=121;TR=242;WE=75499869;WS=75499851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr15	75499995	rs28509789	T	G	3132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.562;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=77;PP=2487;ReadPosRankSum=-0.452;SC=TGAGCCTGACTCAGCCCCAGC;SOR=1.482;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=180;TCF=73;TCR=107;TR=116;WE=75500003;WS=75499985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,117:0.65:181
chr15	75503147	rs3743211	G	A	2930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=32;PP=2192;SC=GTGGCCAGAGGTGAGCCAGAG;SOR=1.371;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=57;TCR=32;TR=89;WE=75503155;WS=75503137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr15	75518241	rs1994639	G	C	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.00;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	75518246	rs1994640	A	G	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.00;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	75521833	rs6495165	G	C	2601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=21;PP=2166;SC=TCCCCCTGGGGAGGTGAAAAG;SOR=2.103;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=58;TCR=21;TR=79;WE=75521841;WS=75521823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr15	75628414	rs114064595	C	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.569;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=149;ReadPosRankSum=0.903;SC=ATTCCCGGGCCCTGGCTTCTT;SOR=1.022;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=7;WE=75628422;WS=75628404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr15	75643759	rs7182283	G	T	1316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=24;PP=1047;SC=TGGAACCACAGGAGTGCATCA;SOR=1.055;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=41;WE=75643767;WS=75643749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	75650836	rs1128933	G	A	7416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=123;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.804;SC=GGCAGCCAACGTCCAGCACAA;SOR=0.243;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=237;TCF=113;TCR=124;TR=236;WE=75650844;WS=75650826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,244:1.00:245
chr15	75650972	rs3809549	G	A	4182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=70;PP=2965;SC=ATGGGACAGGGGTGGACATAC;SOR=1.051;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=48;TCR=71;TR=118;WE=75650980;WS=75650962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr15	75651022	rs149997575	C	CCCACATGCTGCCCAGCCCATA	4966.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=26;PP=1659;SC=CTCCACCATCCCCACATGCTG;SOR=0.807;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=80;TCF=31;TCR=49;TR=46;WE=75651030;WS=75651012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr15	75653378	rs7174408	T	C	1904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=4;PP=1538;SC=AGCCAAGGCCTGGCCTGACCT;SOR=4.768;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=51;TCR=4;TR=55;WE=75653386;WS=75653368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	75664570	rs4886696	AA	TT	3383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.38;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	75967814	rs1127646	A	G	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=155;ReadPosRankSum=-0.067;SC=AGACAGCACCAGGCATGGAAG;SOR=0.818;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=10;WE=75967822;WS=75967804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
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chr15	75980112	rs4414463	A	G	3162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.014;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=44;PP=2340;ReadPosRankSum=-1.253;SC=AGCCACGGTCAGCCCCTGAGT;SOR=0.893;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=188;TCF=122;TCR=66;TR=125;WE=75980120;WS=75980102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,128:0.68:189
chr15	75981507	rs12900539	A	G	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.409;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.190;NF=7;NR=10;PP=330;ReadPosRankSum=-0.211;SC=CCTGTGCAGGACCACCGCGGT;SOR=0.169;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=17;WE=75981515;WS=75981497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr15	75982053	rs200567906	A	G	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.182;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.89;MQRankSum=-6.509;QD=6.89;ReadPosRankSum=-2.908;SOR=0.926;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,14:0.24:59
chr15	75982058	rs147116973	T	A	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.79;MQRankSum=-6.985;QD=6.30;ReadPosRankSum=-1.310;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,14:0.22:63
chr15	75982428	rs7182906	C	T	1393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.396;NF=31;NR=17;PP=979;ReadPosRankSum=-1.133;SC=CTGCATCCAGCCCCCCGAGAA;SOR=0.636;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=71;TCF=47;TCR=24;TR=48;WE=75982436;WS=75982418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,52:0.70:74
chr15	76030993	rs12904654	A	G	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.066;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=338;ReadPosRankSum=0.000;SC=CGCCCACCCTAAGGCCCCGCC;SOR=0.307;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=18;WE=76031001;WS=76030983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,18:0.78:23
chr15	76031008	rs7181595	C	T	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.039;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=9;PP=247;ReadPosRankSum=1.002;SC=CCCGCCCCAGCCCAGTGCCAG;SOR=0.061;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=14;WE=76031016;WS=76030998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr15	76067911	rs12101948	A	G	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.316;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=287;ReadPosRankSum=0.670;SC=CAGGTGCCTGATACGTGACTG;SOR=2.303;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=14;WE=76067919;WS=76067901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr15	76067987	rs34243492	A	G	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.975;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.870;NF=28;NR=9;PP=672;ReadPosRankSum=-0.734;SC=GAAGAAACTCAACAGAGTAAA;SOR=0.876;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=37;WE=76067995;WS=76067977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,41:0.55:74
chr15	76074518	rs3991352	T	G	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=5.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.041;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-6.330;NF=25;NR=0;PP=603;ReadPosRankSum=1.119;SC=ACACAGGTGATGCTTTGCAGA;SOR=3.690;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=44;TCR=3;TR=25;WE=76074526;WS=76074508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr15	76075943	rs11852472	C	A	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.527;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=365;ReadPosRankSum=-0.038;SC=AGTGGATGGCCACTGATTGCT;SOR=0.105;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=17;WE=76075951;WS=76075933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,19:0.79:24
chr15	76084875	rs12708521	C	T	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.353;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.707;NF=17;NR=10;PP=351;ReadPosRankSum=-0.254;SC=TGGTCTTGGGCGTGAGACCAA;SOR=0.356;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=97;TCF=67;TCR=30;TR=27;WE=76084883;WS=76084865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,26:0.27:98
chr15	76114318	rs35830282	GA	G	202.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.01;MQRankSum=0.712;QD=2.78;ReadPosRankSum=-0.046;SOR=0.927;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,24:0.33:73
chr15	76175828	rs1868020	G	A	1277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=31;PP=1122;SC=TTTTTTATAGGGACGAGATCT;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=39;WE=76175836;WS=76175818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	76182949	rs335713	C	T	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=657;SC=TTTAAAATAGCGTCTACTTTC;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=76182957;WS=76182939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	76183191	rs62028936	T	A	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=11;PP=548;SC=TATATACCATTTTGTTAGGCC;SOR=0.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=21;WE=76183199;WS=76183181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	76189624	rs335692	A	G	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.78;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	76191802	rs335689	G	A	5558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=117;NR=61;PP=2965;SC=ATGGCTAAATGTGTTGACTGT;SOR=1.462;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=178;TCF=117;TCR=61;TR=178;WE=76191810;WS=76191792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr15	76191852	rs335688	T	C	5632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=103;PP=2965;SC=AAAATCTTTCTAACATGCAGA;SOR=1.054;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=74;TCR=103;TR=177;WE=76191860;WS=76191842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr15	76191966	rs335687	T	C	1412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=48;PP=1152;SC=TTACAGCCTTTGCATTTTGCT;SOR=7.864;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=48;WE=76191974;WS=76191956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	76197071	rs3073843	A	ATCT	2107.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=32;PP=1837;SC=TTAAAGGAACATCTCGTTCCG;SOR=4.047;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=4;TCR=46;TR=35;WE=76197079;WS=76197061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	76222140	rs335679	G	T	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=481;SC=TGGAGTGCAAGTCAGTAACAT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=18;WE=76222148;WS=76222134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	76248133	rs11341073	CA	C	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=0.070;QD=4.90;ReadPosRankSum=-0.884;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr15	76248427	rs10711025	GT	G	969.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.361;NF=1;NR=41;PP=634;ReadPosRankSum=-0.039;SC=TAGAAAGAAAGTTTTTTTTTT;SOR=4.758;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=62;TCF=2;TCR=60;TR=42;WE=76248435;WS=76248417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr15	76251344	rs11638364	C	T	820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=1;PP=759;SC=TTTTTAGAGACAGGGTCTTGC;SOR=5.136;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=26;WE=76251352;WS=76251334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	76251452	rs12913434	A	G	2471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=38;PP=1901;SC=CCTCCCAAGCAGCTAGGACTA;SOR=0.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=46;TCR=38;TR=84;WE=76251460;WS=76251442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr15	76496232	rs937732	G	A	7296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=159;PP=2965;SC=AGTGCCTCCCGCAGCTCAGTC;SOR=1.720;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=230;TCF=71;TCR=159;TR=230;WE=76496240;WS=76496222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr15	76496340	rs937733	C	T	2676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=60;PP=2198;SC=CCTTCTCCCCCGCCGCTGCCA;SOR=2.219;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=21;TCR=60;TR=81;WE=76496348;WS=76496330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr15	76510073	rs1533600	G	A	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=312;SC=CTTGTGCAAAGTATCAATTAC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=76510081;WS=76510063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	76518346	rs11281932	C	CCCTTA	1166.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=23;PP=1350;SC=ATTTTAACTTCCAATATATTA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=23;WE=76518354;WS=76518336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	76588127	rs77816643	GT	G	294.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=0.656;QD=11.79;ReadPosRankSum=-0.924;SOR=2.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr15	76603610	rs3215142	CA	C	1893.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=20;PP=1732;SC=CTGAGGGGGCCAGTGATCTTT;SOR=1.067;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=20;TCR=20;TR=40;WE=76603618;WS=76603600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	76603928	rs62027052	C	T	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=6;PP=172;SC=AGGGGCTAGACTGGGAAGTGG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=76603936;WS=76603918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	76630303	rs4636879	T	C	7006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=166;PP=2965;SC=AGCGGGACTATGTCAGGTGAG;SOR=1.490;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=253;TCF=87;TCR=166;TR=252;WE=76630311;WS=76630293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr15	76632907	rs7180257	A	G	2312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=61;PP=1974;SC=GACGGTGAGCAGCCGCTGGGC;SOR=3.026;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=12;TCR=61;TR=73;WE=76632915;WS=76632897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	76673716	rs3765115	T	C	2327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=21;PP=1716;SC=CAATACTTGGTACCTGAAAAG;SOR=2.012;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=51;TCR=21;TR=72;WE=76673724;WS=76673706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr15	76726465	rs1607017	G	T	2434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.595;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=29;PP=2096;ReadPosRankSum=0.163;SC=CCTTGTGAGGGTTTGTTTTTC;SOR=0.336;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=58;TCR=29;TR=85;WE=76726473;WS=76726455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,82:0.98:84
chr15	76763514	rs11072597	C	A	1716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=3;PP=1472;SC=ATTTCTCAAACCTTAACTGCT;SOR=5.018;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=48;TCR=3;TR=51;WE=76763522;WS=76763504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	76957958	rs280021	A	G	189.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=157;SC=ACATCACTAAAAGTTTTTCTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=76957966;WS=76957948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr15	77064389	rs66496622	TGAA	T	997.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=937;SC=CTATTAACTATGAAGAAGAAG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=20;WE=77064399;WS=77064379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	77085740	rs3102707	C	A	252.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=208;SC=TCACTGGAAACAACAAGGCAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=77085748;WS=77085730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	77087785	rs11852395	T	C	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=19;PP=481;SC=TGAACCTCTATGGAGAAAAAT;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=77087793;WS=77087775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	77148253	rs11637494	A	G	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=38;PP=1082;SC=CAGCAATCCCATTACTGGGTA;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=38;WE=77148261;WS=77148243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	77176158	rs3812908	T	C	1547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=1149;ReadPosRankSum=1.972;SC=CTTACCATCATTCTTTAAATT;SOR=0.307;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=47;WE=77176166;WS=77176148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,53:0.98:54
chr15	77176200	rs3812909	A	T	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=30;PP=1135;SC=TATCACATAAACCCATGGAGT;SOR=2.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=41;WE=77176208;WS=77176190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	77197745	rs907594	C	A	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=19;PP=655;SC=GGCTTCCCGGCGCACCACGTG;SOR=2.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=77197753;WS=77197735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	77231158	rs4886841	C	T	2569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=65;PP=2009;SC=TAACTTTGGGCAAGTTATTAA;SOR=2.726;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=18;TCR=65;TR=83;WE=77231166;WS=77231148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr15	77241568	rs1711018	T	C	1728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=58;PP=1474;SC=CTTTAATCTCTGAGCCTGTCT;SOR=3.477;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=9;TCR=59;TR=67;WE=77241576;WS=77241558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	77308387	rs7173067	G	A	3199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=47;PP=2534;SC=ATAAGGACAGGAGAAGGGTTC;SOR=0.839;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=53;TCR=47;TR=100;WE=77308395;WS=77308377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr15	77310345	rs12900395	C	G	1034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=6;PP=930;SC=AAAGCCAGGTCTGGAGTCCCA;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=77310353;WS=77310335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	77310617	rs79438763	C	T	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=590;ReadPosRankSum=-1.108;SC=CCATGGGGAGCGCAGGCAGGA;SOR=0.722;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=53;TCF=31;TCR=22;TR=28;WE=77310625;WS=77310607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr15	77310636	rs3812911	G	C	1727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=24;PP=1422;SC=GAAGCAGGTGGCTTCCGCTCG;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=27;TCR=24;TR=51;WE=77310644;WS=77310626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	77322029	rs3935339	C	T	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=18;PP=495;SC=CAATCATGGGCGCGGCGCTCT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=77322037;WS=77322019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	77323009	rs2469237	T	C	1837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=48;PP=1422;SC=GGGGCCCAAGTGAGGCAGTTG;SOR=2.129;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=17;TCR=48;TR=65;WE=77323017;WS=77322999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr15	77324880	rs4078354	A	G	4447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=54;PP=2965;SC=GGTTGTGGGGAGTTGGGTCCC;SOR=1.027;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=77;TCR=54;TR=131;WE=77324888;WS=77324870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr15	77328108	rs11373069	G	GA	826.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=10;NR=13;PP=921;SC=AGTGTCCCCAGAAGGGGAGGG;SOR=0.859;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=23;WE=77328116;WS=77328098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	77344793	rs11737	T	A	5397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=121;PP=2965;SC=GCTTCTTCACTACTAGAGCCT;SOR=1.827;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=50;TCR=121;TR=171;WE=77344801;WS=77344783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr15	77363451	rs11072641	T	C	259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=229;SC=CCCCAGCAAGTGCCTCGCTCC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=77363459;WS=77363441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr15	77406396	rs3743479	C	T	965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=0;PP=771;SC=TAGAGGTTTGCCTTTCTTCTT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=77406404;WS=77406386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	77407114	rs1867780	C	G	4725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=89;PP=2965;SC=TGAGGTGGGGCTGGGCTCTGC;SOR=1.270;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=148;TCF=58;TCR=90;TR=147;WE=77407122;WS=77407104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr15	77471105	rs11856513	C	A	1744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=0;PP=1383;SC=AAAAAATTCCCATATTCTTCC;SOR=6.556;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=49;WE=77471113;WS=77471095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	77764099	rs150619079	G	A	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.533;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=306;ReadPosRankSum=0.936;SC=TAAATGTAATGTTCTCTTATT;SOR=0.144;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=16;WE=77764107;WS=77764089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr15	77907535	rs2271396	C	G	5704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=92;PP=2965;SC=TGAGTCGGTACAGCCTCTTGA;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=74;TCR=93;TR=165;WE=77907543;WS=77907525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr15	77907775	rs2271397	T	C	9091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.23;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr15	77907784	rs2271398	G	A	9155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.02;SOR=1.263;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr15	78189031	rs62010401	C	T	1482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.906;NF=40;NR=22;PP=1410;ReadPosRankSum=1.346;SC=TGCCTGTGGCCGATGGGCAGC;SOR=0.620;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=92;TCF=57;TCR=35;TR=62;WE=78189039;WS=78189021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,53:0.69:77
chr15	78189075	rs4569232	G	A	1866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=11.167;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.41;MQRankSum=-1.322;QD=19.65;ReadPosRankSum=-0.152;SOR=0.951;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,67:0.71:95
chr15	78189084	rs4243062	T	C	3916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.85;QD=40.80;SOR=0.778;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr15	78189206	rs4886959	C	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=4.830;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.87;MQRankSum=1.629;QD=3.52;ReadPosRankSum=1.479;SOR=0.109;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,9:0.20:44
chr15	78189268	rs11630652	A	T	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.671;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.207;NF=4;NR=4;PP=102;ReadPosRankSum=1.304;SC=AAGACCTCAGAGTCAATGGCC;SOR=0.297;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=8;WE=78189276;WS=78189258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr15	78189370	rs4441238	A	C	2366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=36;PP=2023;SC=ATGCCTATGGACATTATGAAG;SOR=1.040;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=50;TCR=36;TR=86;WE=78189378;WS=78189360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr15	78196212	rs7178928	A	G	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=2;PP=271;SC=CAGGGCCAGGAAGGAAGGGGT;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=78196220;WS=78196202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	78207762	rs57642131	C	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=5.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.52;MQRankSum=-3.923;QD=19.05;ReadPosRankSum=0.215;SOR=2.048;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr15	78207864	rs66955965	C	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.729;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=7;PP=229;ReadPosRankSum=-0.502;SC=CAAGGGGCAACACCAGCTCTT;SOR=0.392;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=13;WE=78207872;WS=78207854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr15	78207914	rs67793790	T	C	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=5;PP=91;ReadPosRankSum=-1.878;SC=GGTGATCAGCTCCCACCCTGG;SOR=0.495;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=43;TCF=25;TCR=18;TR=10;WE=78207922;WS=78207904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,10:0.23:44
chr15	78207974	rs71400903	T	C	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQRankSum=-6.099;QD=1.88;ReadPosRankSum=0.381;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,10:0.17:58
chr15	78208021	rs58158543	T	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=2.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQRankSum=-5.566;QD=3.33;ReadPosRankSum=-0.288;SOR=1.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,12:0.20:60
chr15	78208141	rs58331113	C	T	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.517;NF=10;NR=9;PP=229;ReadPosRankSum=-1.869;SC=TGCAGCTCCCCGTGCCCATGC;SOR=0.616;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=32;TCR=33;TR=19;WE=78208149;WS=78208131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,20:0.29:68
chr15	78211339	rs71400918	T	C	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=2.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.54;MQRankSum=2.083;QD=11.72;ReadPosRankSum=-1.933;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr15	78211344	rs144363575	C	T	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=2.598;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.13;MQRankSum=1.905;QD=10.98;ReadPosRankSum=-1.487;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,19:0.32:60
chr15	78211345	rs12592294	A	G	2072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=13;PP=1791;SC=CTCCTGTAGCATCTTCTGCTG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=58;TCF=43;TCR=15;TR=53;WE=78211353;WS=78211329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr15	78211411	.	GCCTCCTGCTCTCGGAGCATCT	G	584.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.274;ClippingRankSum=0.000;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQRankSum=1.135;QD=6.50;ReadPosRankSum=1.054;SOR=0.633;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,22:0.24:90
chr15	78211471	rs67630434	C	T	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=3.293;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=-2.758;QD=5.28;ReadPosRankSum=-1.506;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,24:0.29:84
chr15	78232240	rs12907147	G	C	4168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=69;PP=2965;SC=GTGGGTCCAGGGTGGCCCTGG;SOR=0.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=69;TCR=69;TR=138;WE=78232248;WS=78232230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr15	78268603	rs28360704	C	T	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.995;NF=3;NR=2;PP=38;ReadPosRankSum=-0.040;SC=CTCACCAGCCCGTGGATGCCA;SOR=0.768;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=5;WE=78268611;WS=78268593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr15	78269731	rs11852862	G	T	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.83;QD=40.97;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	78269737	rs11852790	AC	TT	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.83;QD=40.97;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	78269747	rs11852867	G	A	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.52;QD=39.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	78269760	rs71402931	C	T	62.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.01;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	78269762	rs78023616	C	T	62.74	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.01;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr15	78269763	rs75184028	A	G	62.74	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.01;QD=31.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
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chr15	78269801	rs140951103	G	A	62.74	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=31.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
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chr15	78272330	rs56081051	C	T	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=2.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.25;MQRankSum=-3.420;QD=2.39;ReadPosRankSum=0.744;SOR=0.457;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,19:0.18:105
chr15	78272478	rs58205250	G	A	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.400;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.961;NF=2;NR=9;PP=120;ReadPosRankSum=-1.660;SC=GGGTGGGACCGCTGTGGGGAG;SOR=0.112;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=11;WE=78272486;WS=78272468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,11:0.27:41
chr15	78276594	rs72732526	AC	CA	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=363;ReadPosRankSum=0.447;SC=ACCCACTAAAACTCCACACTC;SOR=1.022;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=9;WE=78276603;WS=78276584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr15	78276660	rs12916320	A	G	2051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=26;PP=1490;SC=AAGGGGGTGTATGAGAACCAG;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=38;TCR=26;TR=64;WE=78276668;WS=78276650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr15	78369815	rs9047	G	A	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=511;ReadPosRankSum=-1.005;SC=GGCGCGCGTCGAACACGAACC;SOR=0.580;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=28;TCR=54;TR=29;WE=78369823;WS=78369805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,28:0.34:82
chr15	78369959	rs113518553	G	C	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.027;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=153;ReadPosRankSum=0.834;SC=CGCCGCCGCCGCCGCCCTCCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=8;WE=78369967;WS=78369949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr15	78390414	rs2289524	T	C	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-8.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.126;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=47;PP=685;ReadPosRankSum=1.024;SC=TTCAAAGAGATGCTGACTGCT;SOR=0.205;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=171;TCF=10;TCR=161;TR=52;WE=78390422;WS=78390404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,53:0.30:178
chr15	78390909	rs12593575	C	T	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.563;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=379;ReadPosRankSum=0.997;SC=TGTGAGTCCCCGGAACCTCTC;SOR=1.201;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=80;TCF=38;TCR=42;TR=24;WE=78390917;WS=78390899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,26:0.31:85
chr15	78401534	rs3214707	T	TC	99.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=0.538;SC=CCCCACATGTTCCCCCACCGC;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=6;WE=78401548;WS=78401526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr15	78401540	rs12592068	A	C	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=2;PP=622;SC=ATGTTCCCCCACCGCATATTC;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=78401548;WS=78401526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	78403004	rs1992469	A	G	3196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=40;PP=2542;SC=TCACCTGGGAACTTGCTCGAA;SOR=1.190;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=62;TCR=40;TR=102;WE=78403012;WS=78402994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr15	78403179	rs2867986	C	G	2544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=56;PP=2077;SC=AGCCAGACAACGGGGAGACAG;SOR=1.996;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=22;TCR=56;TR=78;WE=78403187;WS=78403169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr15	78423479	rs8040395	T	C	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.364;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=20;PP=617;ReadPosRankSum=-1.787;SC=GCGGGGCCTGTGTTGGGGGCC;SOR=0.477;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=137;TCF=85;TCR=52;TR=46;WE=78423487;WS=78423469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,47:0.34:137
chr15	78452296	rs4886560	C	T	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=596;ReadPosRankSum=0.209;SC=AAGATTGTGCCGCTGCACTCT;SOR=1.232;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=53;TCF=50;TCR=3;TR=26;WE=78452304;WS=78452286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr15	78472157	.	T	TCA	208	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=15;MQ=60.18;NF=0;NR=4;PP=208;QD=52.75;SC=ACAGAAGAAATCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=78472165;WS=78472147;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,4:0.50:8
chr15	78474517	rs6495277	T	C	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=32;PP=721;ReadPosRankSum=-1.510;SC=ATCCCAGCAGTGTCCACAAGC;SOR=0.859;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=66;TCF=15;TCR=51;TR=41;WE=78474525;WS=78474507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,42:0.65:65
chr15	78501420	rs139633551	C	CCTGT	409.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=574;ReadPosRankSum=-0.062;SC=TCCAGGGAGCCCTGTCTGTCA;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=6;WE=78501441;WS=78501410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr15	78501433	rs3902931	T	C	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=567;ReadPosRankSum=1.668;SC=GTCTGTCAGTTAGGGTGGGGC;SOR=0.420;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=10;WE=78501441;WS=78501410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr15	78504780	rs10706612	GA	G	1982.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.670;NF=39;NR=33;PP=1666;ReadPosRankSum=-0.263;SC=CCAGCAGAATGAAAAAAACCC;SOR=0.646;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=116;TCF=65;TCR=51;TR=72;WE=78504788;WS=78504770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,86:0.69:124
chr15	78526556	rs10162606	C	T	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=530;SC=ATGACCAGTTCTTCCATCTTA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=78526564;WS=78526546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	78556571	rs62007805	G	A	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=1372;ReadPosRankSum=-0.024;SC=CGGACCCACGGAAGGGCAAGG;SOR=0.534;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=17;WE=78556598;WS=78556561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr15	78556580	rs200375873	GGGGGCGGCCTC	G	341.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.478;NF=6;NR=2;PP=2165;ReadPosRankSum=0.372;SC=GGAAGGGCAAGGGGGCGGCCT;SOR=0.571;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=8;WE=78556598;WS=78556561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr15	78556589	rs12898295	C	G	859.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=64;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.292;NF=20;NR=3;PP=1543;ReadPosRankSum=0.072;SC=AGGGGGCGGCCTCGGGGCGGC;SOR=0.730;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=23;WE=78556598;WS=78556561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr15	78556605	rs150768595	A	T	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=67;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.331;NF=21;NR=4;PP=518;ReadPosRankSum=0.246;SC=GCGGCGGGACAGTTGTCGGAG;SOR=0.963;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=25;WE=78556613;WS=78556595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr15	78557005	rs28484827	A	G	588.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=529;ReadPosRankSum=-0.870;SC=GTGACGCGCGAGCGGGCGGCG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=19;WE=78557013;WS=78556995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr15	78557086	rs66489434	GC	G	2664.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.48;QD=29.94;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
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chr15	78563103	rs3169166	A	C	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.976;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=90;ReadPosRankSum=0.544;SC=ATCATGCTTTAAAAGGATATG;SOR=0.293;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=7;WE=78563111;WS=78563093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr15	78565478	rs7163689	C	T	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=22;PP=1248;SC=TCTTGAAGATCTATATAATGG;SOR=1.009;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=31;TCR=22;TR=52;WE=78565486;WS=78565468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	78565616	rs56229935	A	G	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.672;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=374;ReadPosRankSum=0.736;SC=TTTATAGTTCAGGGAAAATAA;SOR=0.426;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=20;WE=78565624;WS=78565606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr15	78572359	rs9806426	C	G	5682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=137;NR=33;PP=2965;SC=CTGCCTTCCTCCTTCCTAATT;SOR=2.874;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=171;TCF=137;TCR=34;TR=170;WE=78572367;WS=78572349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr15	78581892	rs1879153	C	T	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=1;PP=575;SC=AATGGCATTTCAATGAAAGAA;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=78581900;WS=78581882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	78581938	rs16969675	C	A	1678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=4;PP=1334;SC=CCCAGTTTGTCAAAATAAGAT;SOR=4.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=46;TCR=4;TR=50;WE=78581946;WS=78581928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr15	78585106	rs2280364	C	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=182;ReadPosRankSum=-0.839;SC=CCAGACTCCACTGTAGGTCCA;SOR=0.289;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=10;WE=78585114;WS=78585096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr15	78587111	rs138711577	TTTG	T	1878.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=34;NR=2;PP=1802;SC=TGTTCAGGTTTTTGTTGTTGT;SOR=5.283;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=53;TCF=51;TCR=2;TR=36;WE=78587121;WS=78587101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	78587910	rs1040262	A	G	2471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=29;PP=1842;SC=TTTAGGAGCCAGGCAAGAATG;SOR=1.356;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=50;TCR=29;TR=79;WE=78587918;WS=78587900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr15	78632830	rs1127472	C	G	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=16;PP=610;SC=ACGAGCTGCTCAAGGCACTGG;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=25;WE=78632838;WS=78632820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	78633595	rs2139440	T	G	1877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=52;PP=1631;SC=AGCGTCCCCGTGTCCCCGCTC;SOR=4.066;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=6;TCR=52;TR=58;WE=78633603;WS=78633585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr15	78758677	rs2958720	G	C	1676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=15;PP=1399;SC=GCTCTCTCCAGTTAAAGTGCA;SOR=1.893;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=52;WE=78758685;WS=78758667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr15	78758853	rs2938672	A	C	598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=21;PP=463;SC=TTTTTCTTAAAGTTTATTAAT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=78758861;WS=78758843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	78777312	rs9788758	G	A	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=13;PP=392;SC=AATTATTGTTGGCTTTTCTGT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=78777320;WS=78777302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	78780104	rs2230940	T	C	3127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=46;PP=2514;SC=GGATGTTCAATTTGTGTGGGA;SOR=0.797;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=50;TCR=46;TR=96;WE=78780112;WS=78780094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr15	78780738	.	T	C	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.950;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=599;ReadPosRankSum=0.897;SC=GAAGTCGTTATATTTTTGAAA;SOR=0.582;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=25;WE=78780746;WS=78780728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr15	78786410	rs4887060	A	C	3032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=50;PP=2598;SC=TGAGAATGCAAACAAAGTATT;SOR=0.878;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=42;TCR=50;TR=92;WE=78786418;WS=78786400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr15	78789488	rs13180	C	T	3535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.105;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=29;PP=2692;ReadPosRankSum=1.845;SC=CTGTTTTGGCCGAAAGTTATG;SOR=1.528;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=185;TCF=133;TCR=52;TR=120;WE=78789496;WS=78789478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,126:0.66:192
chr15	78807231	rs148681032	C	CCTCT,CCTCTCT	694.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.9994;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=43;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=209;SC=TATCTAAATACCTCTCTCTCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=16;WE=78807239;WS=78807221;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:16
chr15	78807252	rs59105191	A	C	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.64;QD=42.32;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	78807254	rs146986269	A	C	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.64;QD=42.32;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	78807256	rs141436446	A	C	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=4.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.03;MQRankSum=-0.674;QD=15.93;ReadPosRankSum=0.545;SOR=2.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr15	78819849	rs200988294	A	G	3978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.146;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=95;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.060;SC=ATTGTTGAGCATGTCATTCAT;SOR=0.550;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=260;TCF=100;TCR=160;TR=159;WE=78819857;WS=78819839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,164:0.61:271
chr15	78825917	rs3885951	A	G	3560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.554;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=54;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.243;SC=AACCGGGTGGAAACACTTACA;SOR=0.772;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=190;TCF=107;TCR=83;TR=125;WE=78825925;WS=78825907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,128:0.65:196
chr15	78834689	rs2292117	A	G	1625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=18;SC=AGCAATTATCATCACCAGGTT;SOR=1.329;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=52;TCF=33;TCR=19;TR=51;WE=78834697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	78836631	rs67437837	CTGA	C	1706.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=33;PP=1763;SC=AATAGCATAACTGATGATACA;SOR=3.967;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=35;WE=78836641;WS=78836621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	78839110	rs35886075	CT	C	154.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5007;FS=0.000;HP=23;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.273;NF=0;NR=9;PP=93;ReadPosRankSum=-0.099;SC=AGATTTTTTTCTTTTTTTTTT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=9;WE=78839118;WS=78839100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
chr15	78841220	rs8053	T	C	1984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=44;PP=1353;SC=TCAAAAAACATGAGGAAGAAG;SOR=1.852;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=64;WE=78841228;WS=78841210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
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chr15	78857986	rs55781567	C	G	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.831;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=307;ReadPosRankSum=-2.056;SC=ACTCAGTGCTCCATTCCCCAA;SOR=1.437;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=29;TCF=14;TCR=15;TR=14;WE=78857994;WS=78857976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr15	78873119	rs569207	C	T	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.147;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.81;ReadPosRankSum=0.875;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
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chr15	78882925	rs16969968	G	A	4137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.835;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=100;PP=2962;ReadPosRankSum=1.975;SC=AGCTGCGCTCGATTCTATTCG;SOR=0.370;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=214;TCF=55;TCR=159;TR=139;WE=78882933;WS=78882915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,146:0.65:223
chr15	78894339	rs1051730	G	A	1910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=23;PP=1501;ReadPosRankSum=-0.493;SC=TGTCGTGTTTGTAGCCTGGGG;SOR=0.673;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=77;TCR=38;TR=70;WE=78894347;WS=78894329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,72:0.61:118
chr15	78909452	rs3743075	T	C	1569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=20;PP=1279;SC=AGGGGTTCCATTTCAGCTTGT;SOR=1.094;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=26;TCR=20;TR=46;WE=78909460;WS=78909442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	78909480	rs3743074	G	A	1738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=24;PP=1461;SC=CCAGATCTCGGGGAAGGAAGC;SOR=1.009;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=29;TCR=24;TR=53;WE=78909488;WS=78909470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	78909539	rs3743073	G	T	1315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=25;PP=1064;SC=TTTACTTCCCGTGGCACCACC;SOR=1.075;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=41;WE=78909547;WS=78909529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	78911181	rs8040868	T	C	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=36;PP=1040;ReadPosRankSum=-1.152;SC=ACACGTTGGCTACAGGCCGGA;SOR=0.742;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=72;TCF=17;TCR=55;TR=47;WE=78911189;WS=78911171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,48:0.67:72
chr15	78911261	rs2869547	T	C	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=28;PP=729;SC=CTGGCCACTGTGGGAAGCAGC;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=31;WE=78911269;WS=78911251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	78912943	rs7170068	G	A	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.208;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.15;ReadPosRankSum=-0.325;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr15	78913067	rs66793222	ACAGCAG	ACAG,A	1091.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10,10;NR=13,13;PP=1030,68;SC=GGCAGCAGAGACAGCAGCAGC;SOR=0.765;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=23,23;WE=78913080;WS=78913057;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:27
chr15	78917399	rs1948	A	G	3047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=40;PP=2541;ReadPosRankSum=-0.750;SC=GGGCCTCATCAGCCACAACCC;SOR=0.569;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=110;TCF=70;TCR=40;TR=108;WE=78917407;WS=78917389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,108:0.99:109
chr15	79044330	rs11632672	A	G	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=44;ReadPosRankSum=1.668;SC=CCCATGTTCCAGAACACACAC;SOR=0.368;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=5;WE=79044338;WS=79044320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr15	79045517	rs34816637	G	A	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.90;MQRankSum=-9.270;QD=6.49;ReadPosRankSum=-1.167;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,25:0.22:113
chr15	79045521	rs12917502	T	C	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.89;MQRankSum=-9.005;QD=6.59;ReadPosRankSum=-0.867;SOR=0.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,24:0.21:114
chr15	79054900	rs7495616	C	G	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.596;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.217;NF=3;NR=8;PP=192;ReadPosRankSum=-1.424;SC=ACCACAGGGGCCTGAGCACTG;SOR=1.115;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=26;TCF=10;TCR=16;TR=11;WE=79054908;WS=79054890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr15	79058572	rs1809421	T	G	1003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=21;PP=699;SC=GGGGTGCTCCTCGGCCCTTGG;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=33;WE=79058580;WS=79058562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	79058923	rs1809422	G	A	128.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.97;QD=25.78;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	79059449	rs1810165	G	A	983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=27;PP=750;SC=GCCAGGGGACGCTGGGGCAAG;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=79059457;WS=79059439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	79065562	rs8036224	A	G	1490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.32;QD=30.42;SOR=0.909;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	79069734	rs7161774	G	T	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=11;PP=1140;SC=GCTGCCCCCTGAGCCCTCCTG;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=40;WE=79069742;WS=79069724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	79070000	rs62012628	C	T	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.913;NF=0;NR=27;PP=632;ReadPosRankSum=1.649;SC=TTGGTGGGGCCGGGACAGGAG;SOR=2.432;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=27;WE=79070008;WS=79069990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,28:0.78:36
chr15	79080798	rs3743058	C	T	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.26;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr15	79083120	rs2127898	G	A	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.873;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.677;NF=4;NR=12;PP=259;ReadPosRankSum=-0.314;SC=TGCATGGTGCGTGATCTTTAG;SOR=2.093;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=16;WE=79083128;WS=79083110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr15	79089007	rs3743057	T	C	3309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=77;PP=2552;ReadPosRankSum=-0.766;SC=CATCAGCTACTACCAGGGTCT;SOR=0.696;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=194;TCF=73;TCR=121;TR=123;WE=79089015;WS=79088997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,126:0.64:197
chr15	79092481	rs3971703	G	C	32.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.27;MQRankSum=-0.967;QD=10.93;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
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chr15	79173005	rs17832351	A	G	1510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=33;PP=1232;SC=ATGCTTTTCAATTCTGCAGTT;SOR=2.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=45;WE=79173013;WS=79172995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr15	79214573	.	C	T	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.473;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=223;ReadPosRankSum=0.840;SC=AGCTGAGGCCCGGCCGGCGGT;SOR=1.265;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=26;TCF=15;TCR=11;TR=13;WE=79214581;WS=79214563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr15	79215568	rs34577742	C	T	1802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.412;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=46;PP=1417;ReadPosRankSum=2.514;SC=TTCCCCACAGCGGACCAGGGA;SOR=1.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=12;TCR=49;TR=57;WE=79215576;WS=79215558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,60:0.94:64
chr15	79217690	rs2044226	G	C	4087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=60;PP=2965;SC=AGTAGATGCCGGTTCTATACA;SOR=0.929;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=75;TCR=60;TR=135;WE=79217698;WS=79217680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr15	79223681	rs2289699	G	A	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=1;PP=974;ReadPosRankSum=-0.214;SC=TTTTGCCATCGCCCAGGGCAG;SOR=1.022;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=61;TCF=59;TCR=2;TR=41;WE=79223689;WS=79223671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,43:0.67:64
chr15	79229959	rs60254670	TGGCCAGAATG	T	284.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.584;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=1096;ReadPosRankSum=0.409;SC=CAGGGACCTGTGGCCAGAATG;SOR=0.818;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=4;WE=79229976;WS=79229949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr15	79231478	rs12148472	T	C	2036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.578;NF=53;NR=20;PP=1431;ReadPosRankSum=0.170;SC=AGTTGGGCACTGACCTTAGAC;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=96;TCF=69;TCR=27;TR=73;WE=79231486;WS=79231468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,78:0.76:102
chr15	79231518	rs11638844	A	G	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.365;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.655;NF=32;NR=12;PP=1449;ReadPosRankSum=-0.377;SC=ACTTCTCTGTAAAAAGAAAAA;SOR=1.327;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=138;TCF=91;TCR=47;TR=44;WE=79231531;WS=79231508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,44:0.31:142
chr15	79231523	rs35398112	G	GA	766.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=7.042;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=2.051;QD=5.56;ReadPosRankSum=0.239;SOR=1.287;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,45:0.33:138
chr15	79231616	rs10400902	A	G	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=27;PP=586;ReadPosRankSum=0.402;SC=CGAAAACTGGACTAAATTTAA;SOR=0.703;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=88;TCF=14;TCR=74;TR=31;WE=79231624;WS=79231606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,31:0.35:89
chr15	79237180	rs1036937	C	A	513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.061;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=392;ReadPosRankSum=-1.113;SC=GTTCTCCCAGCGTCCACTCTA;SOR=1.456;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=22;WE=79237188;WS=79237170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,24:0.34:71
chr15	79237247	rs1036938	C	G	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=423;ReadPosRankSum=-0.198;SC=GGAGTTCACGCACAGTTCGGC;SOR=0.530;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=21;WE=79237255;WS=79237237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,21:0.29:72
chr15	79237293	rs2289702	C	T	1338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.554;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=955;ReadPosRankSum=-1.332;SC=AGCCAGGCCCCGGCGCAGAGC;SOR=0.274;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=62;TCF=21;TCR=41;TR=48;WE=79237301;WS=79237283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,49:0.78:63
chr15	79237324	rs1036939	C	A	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.903;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=206;ReadPosRankSum=-0.718;SC=TGGCCCACATCGCAGCGCTGG;SOR=1.545;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=12;WE=79237332;WS=79237314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr15	79237396	.	CG	C	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.27;ReadPosRankSum=-0.700;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr15	79237405	rs28704487	A	C,G	357.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=32.52;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,4,7:0.36,0.64:11
chr15	79254480	rs4778732	T	A	1868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=7;PP=1531;SC=TGGGCTGGGCTCAGCTTCAGG;SOR=3.500;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=51;TCR=7;TR=58;WE=79254488;WS=79254470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr15	79264097	rs4238514	G	A	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=0;PP=846;SC=AGCTGGGCTCGAGAGAATTCT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=79264105;WS=79264090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	79277247	rs4778750	A	C	7271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=127;NR=83;PP=2965;SC=TCAGCCCAGTACTTTGCCCAC;SOR=1.127;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=210;TCF=127;TCR=83;TR=210;WE=79277255;WS=79277237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr15	79277608	rs4778751	G	A	1532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=40;PP=1175;SC=ATGATAAATGGTCACTATTTG;SOR=4.047;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=44;WE=79277616;WS=79277598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr15	79288011	rs6495359	A	C	2206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=19;PP=1722;SC=GATGCCTGTGATGGGTCAGGG;SOR=2.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=49;TCR=19;TR=68;WE=79288019;WS=79288001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	79291262	rs12914556	C	T	3405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=88;PP=2801;SC=TCTGGCTGAGCTGGGGTGAGT;SOR=4.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=9;TCR=88;TR=97;WE=79291270;WS=79291252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
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chr15	79298523	rs894780	G	A	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.991;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=7;PP=505;ReadPosRankSum=0.298;SC=GGGCACCTCAGCCACCTGGCA;SOR=0.473;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=92;TCF=75;TCR=17;TR=31;WE=79298531;WS=79298513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,34:0.34:100
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chr15	79324419	rs2304991	A	G	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=1;PP=640;SC=CATCCCCCACACCTGCCTCCC;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=79324427;WS=79324409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	79327633	rs16970460	T	G	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=418;ReadPosRankSum=-0.175;SC=ACCTCCTGCGTGACTTCAGCA;SOR=0.623;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=89;TCF=20;TCR=69;TR=27;WE=79327641;WS=79327623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,28:0.30:94
chr15	79327686	rs736554	C	T	1492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=37;PP=1141;SC=GAAAACTGCACCGGCAGGATG;SOR=5.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=39;WE=79327694;WS=79327676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	79350624	rs16970524	G	A	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.872;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=221;ReadPosRankSum=0.866;SC=AGGAGCCCAGGGTTTGAGATG;SOR=1.651;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=12;WE=79350632;WS=79350614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr15	79502096	rs12903401	G	C	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.457;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=5;PP=721;ReadPosRankSum=0.316;SC=TTTACATCTTGTCCTGCAAAG;SOR=1.739;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=29;WE=79502104;WS=79502086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,32:0.71:45
chr15	79586361	rs8038778	T	C	5492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=89;PP=2965;SC=CCCGTTTGCCTCAACTGAAGA;SOR=0.829;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=79;TCR=89;TR=168;WE=79586369;WS=79586351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr15	79586532	.	C	G	3296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.802;ClippingRankSum=0.000;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.465;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=48;PP=2748;ReadPosRankSum=0.943;SC=CCAACAGTATCGATAGCAAAG;SOR=1.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=178;TCF=98;TCR=80;TR=113;WE=79586540;WS=79586522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,116:0.63:184
chr15	79606137	rs3825933	G	A	4581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=42;PP=2965;SC=ACTGCTATGTGGAGGACCCCC;SOR=1.761;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=96;TCR=42;TR=138;WE=79606145;WS=79606127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr15	79606408	rs3784544	C	T	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=578;SC=CTTCATTGGCCTCTGTCTAGG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=79606416;WS=79606398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	79614206	rs906440	T	A	1394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=0;PP=1160;SC=GCACAGACTCTTAGTTAGCAT;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=41;WE=79614214;WS=79614196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	79614418	rs906439	A	G	5906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=116;PP=2965;SC=GGGCCCGAGCAGAAGACCTTA;SOR=1.110;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=197;TCF=80;TCR=117;TR=196;WE=79614426;WS=79614408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr15	79703766	.	G	A	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.481;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.037;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=243;ReadPosRankSum=1.248;SC=TTATTGGAAGGAGGTGGACAA;SOR=1.449;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=54;TCF=25;TCR=29;TR=17;WE=79703774;WS=79703756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,18:0.33:54
chr15	79748603	rs7183867	C	T	3642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.604;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=49;PP=2962;ReadPosRankSum=1.000;SC=GTGCCCGGTTCGACCTGTCGC;SOR=1.117;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=189;TCF=107;TCR=82;TR=128;WE=79748611;WS=79748593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,129:0.68:189
chr15	79749447	rs11634652	G	T	3339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.484;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=64;PP=2662;ReadPosRankSum=-0.768;SC=GTATTCCCCGGTTCCTGACAA;SOR=0.517;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=202;TCF=93;TCR=109;TR=122;WE=79749455;WS=79749437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,125:0.61:204
chr15	79750127	rs2902954	A	G	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.172;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=657;ReadPosRankSum=1.544;SC=ACAGCACAGGATCCTTGTCTC;SOR=1.302;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=132;TCF=45;TCR=87;TR=36;WE=79750135;WS=79750117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,41:0.30:137
chr15	79750307	rs1004724	T	C	4734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=55;PP=2965;SC=TTGGCGAAATTGAACGGAAGC;SOR=1.186;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=91;TCR=55;TR=146;WE=79750315;WS=79750297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr15	79755604	rs2297773	A	G	1898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=59;PP=1481;ReadPosRankSum=1.201;SC=TTCTTGGACCATTGAGGAGTA;SOR=0.678;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=24;TCR=99;TR=73;WE=79755612;WS=79755594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,75:0.59:128
chr15	80189058	rs71874818	GCGTGCGCGCGCCGGGAGGGGAAA	G	1130.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.803;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=2966;ReadPosRankSum=-0.551;SC=CGACTAGGGGGCGTGCGCGCG;SOR=1.488;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=10;WE=80189088;WS=80189048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr15	80191343	rs7257	G	A	5221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=107;NR=50;PP=2965;SC=TTCACAATATGGAGTGTCCTT;SOR=1.581;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=107;TCR=50;TR=157;WE=80191351;WS=80191333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr15	80214976	rs78016257	GTGC	G	1268.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=1;PP=1130;SC=CTAAAGGGGAGTGCTGATCCA;SOR=5.353;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=22;WE=80214986;WS=80214967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	80215601	rs17286886	C	T	1487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=39;PP=1200;ReadPosRankSum=-1.150;SC=TCGTCCGCCTCGGGTCCATCC;SOR=0.732;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=29;TCR=65;TR=56;WE=80215609;WS=80215591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,58:0.60:96
chr15	80365745	rs2866367	T	G	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=4.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=506;ReadPosRankSum=-0.423;SC=AATTGTAGTGTATTTCAGTAC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=21;WE=80365753;WS=80365735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr15	80367831	rs2469600	G	C	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=241;ReadPosRankSum=-0.672;SC=AGAGTGGAAAGTAGTTTTCTA;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=10;WE=80367839;WS=80367821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
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chr15	80405098	rs12594035	C	G	4439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.990;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=63;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.305;SC=CCTCATGTCTCTTTATTACCC;SOR=0.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=257;TCF=154;TCR=103;TR=160;WE=80405106;WS=80405088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,166:0.63:264
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chr15	80445292	rs112474268	G	C	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=345;ReadPosRankSum=-0.070;SC=GACAGGCCGTGGGGGCGGGCA;SOR=0.582;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=16;WE=80445300;WS=80445282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr15	80445513	rs376322780	GGGAGT	G	1036.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.070;NF=0;NR=26;PP=1186;ReadPosRankSum=0.415;SC=GGCGCGGGGAGGGAGTGGAGT;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=82;TCF=6;TCR=76;TR=26;WE=80445525;WS=80445503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr15	80450328	rs1370276	T	C	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.299;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=264;ReadPosRankSum=0.052;SC=CTTCAATAGATAGGCTTTCTG;SOR=2.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=14;WE=80450336;WS=80450318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr15	80450389	rs1370275	G	A	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=8;PP=782;ReadPosRankSum=0.747;SC=TGACGGTGTCGTCTTCCTCCT;SOR=0.539;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=36;WE=80450397;WS=80450379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,39:0.76:51
chr15	80452075	rs1370274	T	C	2415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.762;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=38;PP=1813;ReadPosRankSum=0.304;SC=ACGTGATCTTTTTTCTCCCTG;SOR=0.803;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=61;TCR=53;TR=82;WE=80452083;WS=80452065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,85:0.72:118
chr15	80452268	rs1370273	G	A	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=392;ReadPosRankSum=0.037;SC=AGCAGGGGAGGTGAAGGCTGT;SOR=0.906;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=19;WE=80452276;WS=80452258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr15	80452886	rs733679	T	G	1759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.597;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=50;PP=1456;ReadPosRankSum=1.627;SC=TCTGCATCTGTGTGGAGGGTC;SOR=1.547;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=81;TCF=19;TCR=62;TR=63;WE=80452894;WS=80452876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,62:0.77:80
chr15	80454745	rs2114716	T	C	2428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=64;PP=1875;ReadPosRankSum=-1.871;SC=AGCATATTTGTCTCAGGAGCT;SOR=0.905;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=155;TCF=46;TCR=109;TR=88;WE=80454753;WS=80454735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,92:0.59:157
chr15	80460524	rs1545119	A	G	3600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.994;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.198;NF=64;NR=52;PP=2932;ReadPosRankSum=-0.221;SC=CCTTGCTGGTACCCAGCTCTC;SOR=0.150;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=66;TCR=52;TR=116;WE=80460532;WS=80460514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,115:0.98:117
chr15	80464669	rs7180031	A	G	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=24;PP=671;SC=GAAGCTGAAGATCTGGTGCAG;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=80464677;WS=80464659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	80465248	rs58363292	GA	G	2961.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=2;PP=2965;SC=GATCTTTGTGGAGATGGCAGT;SOR=6.413;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=72;TCF=70;TCR=2;TR=69;WE=80465256;WS=80465238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr15	80465300	rs3752693	G	A	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.346;NF=38;NR=11;PP=836;ReadPosRankSum=-0.493;SC=GGAGGGGGTCGTTGGGAGATG;SOR=0.613;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=158;TCF=120;TCR=38;TR=49;WE=80465308;WS=80465290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,53:0.32:164
chr15	80470040	rs2162550	G	A	3057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=86;PP=2633;ReadPosRankSum=-0.687;SC=GGGTCAGCCTGTGGGCCTGGA;SOR=2.480;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=12;TCR=87;TR=98;WE=80470048;WS=80470030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,97:0.99:98
chr15	80472431	rs2043691	C	A	2997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=28;PP=2323;SC=CTAAGCCTGCCGCTGCTCATT;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=63;TCR=28;TR=91;WE=80472439;WS=80472421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr15	80736696	rs72008429	GGTGT	G	316.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.265;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=1.416;NF=0;NR=10;PP=352;ReadPosRankSum=0.168;SC=GTGTGTACGTGGTGTGTGTGT;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=10;WE=80736707;WS=80736686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr15	80762526	rs5814026	TC	T	3193.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.50;QD=31.31;SOR=2.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr15	80806183	rs11072922	T	C	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=4;PP=950;SC=ATCTACTTGATGGCAGCACCA;SOR=4.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=38;WE=80806191;WS=80806173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	80845136	rs3924894	CT	TC	3758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.587;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=61;PP=2944;ReadPosRankSum=1.857;SC=AGTTTTGAGCCTATGGCAATT;SOR=1.125;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=127;TCF=37;TCR=90;TR=80;WE=80845145;WS=80845126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,94:0.66:143
chr15	80889582	.	C	T	1377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.518;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=33;PP=1102;ReadPosRankSum=1.285;SC=TTAGGCAGCCCATAAGCTATG;SOR=0.963;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=101;TCF=41;TCR=60;TR=53;WE=80889590;WS=80889572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,55:0.51:107
chr15	80987812	rs62007944	T	C	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=8;PP=486;SC=TCTCGCTGGGTGAGCTGTGCT;SOR=1.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=24;WE=80987820;WS=80987802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	81176721	rs35343835	C	G	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=28;PP=829;SC=TCGGCTTCCACTGGGCTCTGG;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=81176729;WS=81176711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	81179876	rs11631636	G	A	927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=26;NR=1;PP=779;SC=GCTTCTTCTGGAGAAGAGAAG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=81179884;WS=81179866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	81180981	rs8028511	G	A	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=0;PP=1069;SC=TTGCCTTGGAGTCACAACTTT;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=38;WE=81180989;WS=81180971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
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chr15	81212608	rs1553647	G	A	5990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=136;PP=2965;SC=ACTCCTACCCGGGGTACATCC;SOR=2.303;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=181;TCF=45;TCR=136;TR=181;WE=81212616;WS=81212598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr15	81214611	rs2271162	A	C	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=2.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=88;ReadPosRankSum=1.968;SC=TCTCGAAGAAAATGGAGCAGC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=6;WE=81214619;WS=81214601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr15	81217848	rs2271163	C	T	599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=507;SC=GGTTTCTGTTCAGTCAATGCC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=81217856;WS=81217838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	81221492	rs35092028	C	T	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=3.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.00;ReadPosRankSum=2.040;SOR=1.248;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,20:0.23:88
chr15	81234741	rs1553646	C	G	1036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=30;PP=885;SC=CTGTGTCCTGCGGCTGCTGGC;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=81234749;WS=81234731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr15	81244380	rs117474068	G	A	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=51;ReadPosRankSum=0.580;SC=TCATATGGCTGGCCATGTCCA;SOR=0.169;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=5;WE=81244388;WS=81244370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr15	81271422	rs186972856	G	T	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=385;ReadPosRankSum=1.959;SC=CCACAAACTGGTCATGTGGCA;SOR=1.893;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=18;WE=81271430;WS=81271420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr15	81282144	rs11855057	C	G	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=115;ReadPosRankSum=0.472;SC=TTCGCTGCGCCGCGCAGCGCC;SOR=0.641;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=9;WE=81282152;WS=81282134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr15	81410106	rs1533055	G	A	9254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=300;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.975;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=159;NR=131;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.103;SC=CTTCCTCCTCGCTGACTTCAT;SOR=0.154;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=292;TCF=161;TCR=131;TR=290;WE=81410114;WS=81410096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,296:0.99:298
chr15	81410202	rs2280440	C	T	7792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.574;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=157;PP=2965;ReadPosRankSum=1.222;SC=TCTCCTAGTCCTTCTCATCTT;SOR=0.214;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=240;TCF=79;TCR=161;TR=235;WE=81410210;WS=81410192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,243:0.99:246
chr15	81410488	rs2250029	G	A	1413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=18;PP=1102;SC=TTTTTCTGCAGACATATTCAG;SOR=1.105;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=25;TCR=18;TR=43;WE=81410496;WS=81410478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	81426539	rs2683255	G	C	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=444;SC=CAGGGCGAGGGTGCGCGCTGT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=81426547;WS=81426529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	81430305	rs55908952	C	G	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=684;SC=TGATTATAAACAAAATTGCAT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=81430313;WS=81430295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	81582176	.	CAAAT	C	274.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=2.410;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.50;ReadPosRankSum=1.880;SOR=1.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,11:0.18:61
chr15	81587757	rs17875496	T	A	3868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=46;PP=2965;SC=CTGTTCTAAGTTGTAAAGCTG;SOR=1.255;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=72;TCR=46;TR=118;WE=81587765;WS=81587747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr15	81591639	rs4778636	G	A	4762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=119;NR=27;PP=2965;SC=CCTTCTTGCTGTTCAGCTTGG;SOR=2.849;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=119;TCR=27;TR=146;WE=81591647;WS=81591629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr15	81592802	rs11073001	A	G	2710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=63;PP=2001;SC=CCTTGGACACAGGGTTCTCGC;SOR=2.174;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=21;TCR=63;TR=84;WE=81592810;WS=81592792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr15	81592891	rs11630277	C	T	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=579;SC=TAAAAATAATCCTATATATAA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=81592899;WS=81592881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	81595827	rs57763246	C	T	2355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=18;PP=1833;SC=GATGTCAGTCCGATGTTAAAT;SOR=2.271;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=73;TCF=54;TCR=19;TR=72;WE=81595835;WS=81595817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr15	81598110	rs17875532	C	T	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=517;SC=CCAGCAGCTCCAATCTAGGAC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=81598118;WS=81598104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	81598225	rs17875533	C	A	3091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=11;PP=2378;ReadPosRankSum=0.676;SC=GATTTCTGGTCCTGACTTCCT;SOR=2.522;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=96;TCF=85;TCR=11;TR=94;WE=81598233;WS=81598215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,99:0.99:100
chr15	81598269	rs11556218	T	G	5467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=118;NR=43;PP=2965;SC=TGTTTCCAAATGGGCTGGCCT;SOR=2.060;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=118;TCR=43;TR=161;WE=81598277;WS=81598259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr15	81598416	rs1803275	G	A	5157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.386;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=113;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.882;SC=TTGTCACAAGGAAGCTGACTC;SOR=1.855;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=45;TCR=113;TR=157;WE=81598424;WS=81598406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,158:0.99:159
chr15	81600451	rs4778639	T	G	5555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=121;NR=42;PP=2965;SC=TCCTTTTTTATGTGGACACAG;SOR=2.140;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=121;TCR=42;TR=163;WE=81600459;WS=81600441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr15	81600995	rs4238526	A	G	2740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=50;PP=2091;SC=ATGAAATCTTACAGCTGGGTG;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=34;TCR=50;TR=84;WE=81601003;WS=81600985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr15	81624768	rs4417518	C	T	3490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=38;PP=2577;SC=GCCTAGACATCTGAACAAATC;SOR=1.253;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=65;TCR=38;TR=103;WE=81624776;WS=81624758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr15	81625385	rs11636318	C	T	4174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=74;PP=2965;SC=GTAAGAGTCACATTCATTAAT;SOR=0.921;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=131;TCF=57;TCR=74;TR=131;WE=81625393;WS=81625375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr15	81631681	rs4489964	C	T	1611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=0;PP=1441;SC=TCAATATGATCTAATTCCCTT;SOR=7.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=49;WE=81631689;WS=81631671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr15	81636267	rs7161991	C	T	2421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=38;PP=1895;SC=CAAACTTGCTCTCCAGATCCC;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=39;TCR=38;TR=77;WE=81636275;WS=81636257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr15	81637284	rs4278705	G	A	1989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=32;PP=1603;SC=CTTCTTCAGGGGCTGTCCTGG;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=62;TCF=30;TCR=32;TR=61;WE=81637292;WS=81637274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	81649001	rs7167034	T	C	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=32;PP=787;SC=CTAGCACCCATGGAGCCTTTG;SOR=3.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=36;WE=81649009;WS=81648991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	81651651	rs12903128	G	A	1830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=11;PP=1417;SC=CATTTTATGCGACTGCTGTAA;SOR=2.683;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=56;WE=81651659;WS=81651641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	81666529	rs11634486	G	A	1089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=28;PP=789;SC=TGCTCTGCCCGCTAGTTCTCA;SOR=3.383;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=32;WE=81666537;WS=81666519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr15	82335444	rs11073028	G	A	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.78;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	82387776	rs1532750	T	C	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.466;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=10;PP=778;ReadPosRankSum=0.257;SC=CTCCGTTAGATTGGAAATAAA;SOR=0.346;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=99;TCF=79;TCR=20;TR=43;WE=82387784;WS=82387766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,48:0.45:106
chr15	82387951	rs1969090	G	C	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=196;ReadPosRankSum=-0.575;SC=GTCCAATGAAGCACTGACATT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=12;WE=82387959;WS=82387941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,11:0.27:41
chr15	82387969	rs77062462	A	G	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=131;ReadPosRankSum=-0.834;SC=ATTGTTACACATGCGTGTTGT;SOR=0.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=10;WE=82387977;WS=82387959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,10:0.26:39
chr15	82431219	rs2457497	A	G	1938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=59;PP=1639;SC=TCATGGATCAATCATATGGCT;SOR=8.189;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=0;TCR=59;TR=59;WE=82431227;WS=82431209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr15	82443824	rs78664413	C	T	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.37;ReadPosRankSum=-0.934;SOR=0.758;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,21:0.24:88
chr15	82444437	rs905450	A	G	6056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=113;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.676;SC=GAGTATTTTCACCCTCATTCA;SOR=0.417;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=197;TCF=82;TCR=115;TR=195;WE=82444445;WS=82444427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,198:0.99:199
chr15	82512429	rs2292189	C	G	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.304;NF=8;NR=1;PP=75;ReadPosRankSum=-0.627;SC=CTCTTGGCTCCTCTCCTTTTG;SOR=0.343;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=9;WE=82512437;WS=82512419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,8:0.23:35
chr15	82523358	rs11073036	G	A	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=176;ReadPosRankSum=1.372;SC=AACGATTATTGATTTCTGTGA;SOR=0.346;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=11;WE=82523366;WS=82523348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,12:0.29:41
chr15	82530630	rs1972460	A	G	561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.835;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.44;MQRankSum=1.402;NF=27;NR=0;PP=399;ReadPosRankSum=0.347;SC=AGATTTAATCAGATGCAAACA;SOR=1.591;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=68;TCR=2;TR=27;WE=82530638;WS=82530620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,28:0.38:73
chr15	82544927	rs3902959	C	T	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.912;NF=26;NR=0;PP=460;ReadPosRankSum=-0.061;SC=GAATAAAATACGTGGAATATA;SOR=0.177;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=83;TCF=83;TCR=0;TR=26;WE=82544935;WS=82544917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,25:0.30:83
chr15	82545214	rs4344697	A	T	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.249;NF=1;NR=22;PP=388;ReadPosRankSum=1.819;SC=ACTTATATTTAATTTGTTATT;SOR=0.328;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=76;TCF=3;TCR=73;TR=23;WE=82545222;WS=82545204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,22:0.29:76
chr15	82555146	rs149892112	CCTCTG	C	875.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=1.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=2.162;QD=10.07;ReadPosRankSum=-0.699;SOR=0.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,27:0.31:87
chr15	82558034	rs3858954	G	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.459;NF=5;NR=5;PP=185;ReadPosRankSum=-0.067;SC=GAGTCTTAAAGCCAAGCAAGA;SOR=0.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=24;TCF=11;TCR=13;TR=10;WE=82558042;WS=82558024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr15	82564206	rs79777326	C	G	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-4.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=236;ReadPosRankSum=-0.376;SC=GCTTTAACATCTAATATCAAA;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=13;WE=82564214;WS=82564196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr15	83222444	rs11390316	G	GT	1411.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.433;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=35;PP=1688;ReadPosRankSum=1.071;SC=CTGATCTCCGGTGTAAGCTCC;SOR=1.699;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=40;WE=83222452;WS=83222434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,42:0.89:47
chr15	83224696	rs1145171	C	T	3179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=36;PP=2433;SC=GGTCCCAGGACGGCCACACAG;SOR=1.374;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=65;TCR=37;TR=101;WE=83224704;WS=83224686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr15	83230904	rs66642827	CT	C	158.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=1.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=1.578;QD=2.52;ReadPosRankSum=2.559;SOR=0.864;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,18:0.29:63
chr15	83231080	rs75935532	G	A	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=126;ReadPosRankSum=1.334;SC=CTAGGGCCTTGCCACTACAGG;SOR=0.415;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=10;WE=83231088;WS=83231070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr15	83240293	rs783544	A	C	2844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=73;PP=2217;ReadPosRankSum=1.307;SC=CTGTTTTGGAAAGGAGCACAG;SOR=0.719;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=46;TCR=117;TR=102;WE=83240301;WS=83240283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,105:0.64:164
chr15	83241984	rs11336258	AT	A	397.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=-0.695;QD=6.52;ReadPosRankSum=-0.039;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr15	83328542	rs11635442	C	G	8152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=137;NR=113;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.721;SC=TGGGGCTCCTCCTTCAAACCA;SOR=0.290;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=251;TCF=138;TCR=113;TR=250;WE=83328550;WS=83328532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,253:1.00:254
chr15	83331155	rs2278355	C	T	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=6;PP=200;SC=AGACTGTTCCCGGTTTCCTCC;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=83331163;WS=83331145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	83334128	.	AACACACACACACACACACACACACACAC	A,AAC	925.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=3.188;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.77;MQRankSum=5.103;QD=37.03;ReadPosRankSum=0.972;SOR=0.477;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,6,18:0.24,0.72:25
chr15	83334419	rs7494860	T	C	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=56;PP=1405;SC=TGATTCTGGTTGGGACTTCCC;SOR=4.977;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=4;TCR=56;TR=60;WE=83334427;WS=83334409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr15	83395340	rs11633991	T	C	4473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=44;PP=2965;SC=TCACACTTCATGATGGAGGTC;SOR=1.724;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=100;TCR=45;TR=144;WE=83395348;WS=83395330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr15	83428192	rs1108134	C	T	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=734;ReadPosRankSum=-1.179;SC=TGCACAAATTCGTGAAGCTGA;SOR=0.618;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=66;TCF=30;TCR=36;TR=35;WE=83428200;WS=83428182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr15	83441012	rs1105287	C	A	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=243;ReadPosRankSum=0.113;SC=GAAGAGGAACCTCTAATAGAG;SOR=0.654;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=81;TCF=25;TCR=56;TR=23;WE=83441020;WS=83441002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,23:0.28:82
chr15	83447631	rs4779061	T	G	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.019;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=37;PP=892;ReadPosRankSum=0.552;SC=TTTCAGGAATTTCCCGAGTCT;SOR=0.440;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=175;TCF=56;TCR=119;TR=57;WE=83447639;WS=83447621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,57:0.32:179
chr15	83455137	rs11259947	A	G	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=8.169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.47;ReadPosRankSum=1.090;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,26:0.38:68
chr15	83455423	rs62011702	G	A	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=650;ReadPosRankSum=-0.947;SC=TGTAGAAGGCGTTTTAGATTT;SOR=0.797;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=26;WE=83455431;WS=83455413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,26:0.72:36
chr15	83481880	rs35270670	A	G	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=352;ReadPosRankSum=1.110;SC=GGAAAAGCCAACACCATGGTA;SOR=2.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=13;WE=83481888;WS=83481870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr15	83499665	rs3814282	G	A	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=3.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.82;ReadPosRankSum=1.993;SOR=0.375;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,22:0.25:87
chr15	83499766	rs3814281	G	A	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.898;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=15;PP=636;ReadPosRankSum=-0.234;SC=GACCAGCCACGTCCTCTAGTG;SOR=1.342;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=153;TCF=83;TCR=70;TR=45;WE=83499774;WS=83499756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,47:0.31:153
chr15	83521036	rs1256429	C	T	5533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=106;PP=2965;SC=AAAGCAGGGACGCCAGCTTAA;SOR=1.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=59;TCR=106;TR=165;WE=83521044;WS=83521026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr15	83523368	rs1256426	C	G	2162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=20;PP=1766;SC=CAGCTGGCCTCGGGGCTCACT;SOR=1.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=47;TCR=20;TR=67;WE=83523376;WS=83523358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr15	83528056	rs55861392	G	GT	316.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=13;PP=261;SC=ACAAGTTTTTGTTTTTTTTTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=13;WE=83528064;WS=83528046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	83658832	rs199995569	C	T	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.56;MQRankSum=0.409;QD=16.85;ReadPosRankSum=1.035;SOR=1.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr15	83680114	rs117369065	G	A	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=331;ReadPosRankSum=1.497;SC=GGCGGCGGCTGTCCTGAGCCC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=17;WE=83680122;WS=83680104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr15	83680287	rs4842860	A	G	1554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.940;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=33;PP=1060;ReadPosRankSum=-0.290;SC=ATCTCGGCGCAAAGAAGCCGA;SOR=0.293;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=87;TCF=34;TCR=53;TR=59;WE=83680295;WS=83680277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,63:0.69:91
chr15	83680426	rs12906626	C	G	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=373;SC=AGCGGCCCCACCGCCCGGCGC;SOR=5.549;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=83680434;WS=83680416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	83686759	rs17158127	T	C	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=668;SC=TTGTGGCCATTTATGTTTTTG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=83686767;WS=83686749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	83735926	rs8040457	C	G	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=217;ReadPosRankSum=-0.550;SC=CGGTTGCCCACGTTATGGACA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=11;WE=83735934;WS=83735916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr15	83781631	rs1989	C	T	1560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=1177;ReadPosRankSum=-0.401;SC=AAGAAAACCACCCCGGGACCC;SOR=0.664;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=39;TCR=48;TR=57;WE=83781639;WS=83781621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,59:0.67:88
chr15	83860924	rs150973418	C	T	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQRankSum=-0.674;QD=9.29;ReadPosRankSum=-0.842;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr15	84116490	rs62027509	C	A	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.278;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=420;ReadPosRankSum=0.686;SC=GGGCCGCCTGCTCTCTCCTCG;SOR=2.964;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=20;WE=84116498;WS=84116480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr15	84257295	rs7182322	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=103;ReadPosRankSum=-0.308;SC=TGTAAAAATCGTCCCTTTCAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=7;WE=84257303;WS=84257285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr15	84257351	rs7182482	G	A	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.989;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=339;ReadPosRankSum=0.434;SC=AAGGCAGAGAGGATGTGTGTT;SOR=0.353;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=62;TCF=57;TCR=5;TR=20;WE=84257359;WS=84257341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,21:0.33:64
chr15	84373319	rs3079595	C	CAG	1942.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=39;PP=1985;SC=GGTCAGGAAACTGTCTCTAAA;SOR=5.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=39;WE=84373327;WS=84373309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	84473531	rs7179507	G	A	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=12;PP=359;SC=CTCTAAAACTGATGGTCTCTT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=84473539;WS=84473521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	84488636	rs4483821	A	G	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=16;PP=1402;ReadPosRankSum=-0.780;SC=TATCAGGGGCATTACTATGAA;SOR=1.075;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=67;TCF=50;TCR=17;TR=65;WE=84488644;WS=84488626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr15	84507075	rs12901128	C	T	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=33;PP=802;ReadPosRankSum=-0.040;SC=TTGGAAGTAGCTTTTGTACCA;SOR=1.487;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=0;TCR=51;TR=33;WE=84507083;WS=84507065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,36:0.65:55
chr15	84539619	rs4144691	C	G	4913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=52;PP=2965;SC=CGGCGTCTTTCTCGTAGAAAA;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=88;TCR=52;TR=140;WE=84539627;WS=84539609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
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chr15	84566544	rs11259927	C	T	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=18.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.98;ReadPosRankSum=-1.252;SOR=2.504;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,30:0.25:122
chr15	84568504	rs6603004	A	G	7682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=147;PP=2965;ReadPosRankSum=1.723;SC=GACCTTTTGTAGGAATAATCA;SOR=0.784;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=220;TCF=72;TCR=148;TR=219;WE=84568512;WS=84568494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,243:1.00:244
chr15	84581889	rs12439867	G	A	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=377;ReadPosRankSum=-1.146;SC=CGTGTGGGCCGGGTGTGCAGG;SOR=0.763;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=66;TCF=52;TCR=14;TR=20;WE=84581897;WS=84581879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,21:0.31:67
chr15	84581904	rs4842923	T	C	2870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=23;PP=2004;SC=TGCAGGTCCGTGAGGTGAAGT;SOR=1.900;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=84;TCF=60;TCR=24;TR=83;WE=84581912;WS=84581894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr15	84582124	rs4842838	G	T	3576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=84;PP=2951;SC=AGCAACATGCGTGGGAGGTAT;SOR=2.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=22;TCR=84;TR=106;WE=84582132;WS=84582114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr15	84611630	rs12901723	G	A	2511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.201;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=46;PP=1922;ReadPosRankSum=-1.045;SC=CAAGCCTGCCGCCTCACCCCC;SOR=0.298;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=143;TCF=81;TCR=62;TR=98;WE=84611638;WS=84611620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,100:0.69:145
chr15	84651185	rs8031704	C	A	3253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=56;PP=2687;ReadPosRankSum=0.660;SC=TTAAGTGCCCCGTGCGACGAT;SOR=0.687;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=75;TCR=81;TR=110;WE=84651193;WS=84651175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,112:0.70:159
chr15	84651290	rs7176737	T	C	4574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=77;PP=2965;ReadPosRankSum=0.571;SC=TAAAAATCCATGGTCTTGCTG;SOR=0.250;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=78;TCR=78;TR=155;WE=84651298;WS=84651280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,155:0.99:156
chr15	84657643	rs11629550	T	A	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=0.000;QD=13.23;ReadPosRankSum=2.486;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr15	84706461	rs950169	C	T	2140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.695;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=6;PP=1664;ReadPosRankSum=-0.629;SC=GGAGACTGCACAGACACAACT;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=113;TCF=102;TCR=11;TR=74;WE=84706469;WS=84706451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,78:0.66:118
chr15	84722521	rs1818950	A	G	2983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.343;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.649;NF=64;NR=43;PP=2412;ReadPosRankSum=-0.211;SC=GAGTTGTGAAATCCTCAAAGC;SOR=0.560;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=161;TCF=98;TCR=63;TR=107;WE=84722529;WS=84722511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,108:0.67:162
chr15	84740748	rs35648189	T	C	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=364;ReadPosRankSum=2.315;SC=AAAAACATTTTGTGTTGTAAT;SOR=0.515;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=20;WE=84740756;WS=84740738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr15	84753177	rs12437525	A	G	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=454;ReadPosRankSum=-0.584;SC=AATTGCTGGCAAGAAAAACAG;SOR=1.092;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=19;WE=84753185;WS=84753167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr15	84758840	rs1567086	A	G	1135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=0;PP=959;SC=AGACCCCGTCACTACAAAAAT;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=39;WE=84758848;WS=84758830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr15	84770921	rs28666935	T	C	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=4.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.81;MQRankSum=-3.433;QD=4.91;ReadPosRankSum=-1.200;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,37:0.28:131
chr15	84770946	rs28474939	A	G	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=2.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.32;MQRankSum=-5.794;QD=6.07;ReadPosRankSum=-0.922;SOR=1.325;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,26:0.28:93
chr15	84782417	rs11638297	A	C	3444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.952;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.684;NF=20;NR=100;PP=2804;ReadPosRankSum=-0.859;SC=AGGATCACAAACTTTTGACTC;SOR=1.075;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=164;TCF=30;TCR=134;TR=120;WE=84782425;WS=84782407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,120:0.73:165
chr15	84784964	rs11637158	C	T	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=32.55;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	84950110	rs62029582	G	C	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;BaseQRankSum=-1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.059;NF=4;NR=15;PP=321;ReadPosRankSum=0.305;SC=TGCCGGCACCGGCATGGCAGC;SOR=1.426;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=19;WE=84950118;WS=84950100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr15	84950209	rs10152249	T	C	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.150;NF=4;NR=2;PP=131;ReadPosRankSum=-0.000;SC=ATGGCAAATTTTGACCATTGC;SOR=0.693;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=6;WE=84950217;WS=84950199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr15	85149771	rs2271433	G	T	4225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=92;PP=2965;ReadPosRankSum=1.597;SC=TGTAGCTGTCGTTGCTTCCCT;SOR=0.763;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=135;TCF=42;TCR=93;TR=134;WE=85149779;WS=85149761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,133:0.99:134
chr15	85159397	rs10083683	C	G	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.370;NF=18;NR=0;PP=451;ReadPosRankSum=-0.609;SC=GAACCTGGGACGCAGAGGTTG;SOR=1.143;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=18;WE=85159405;WS=85159387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr15	85163998	rs2044502	G	C	3396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.926;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=72;PP=2708;ReadPosRankSum=-1.691;SC=CAGGGACACAGCCCAGGTGAG;SOR=0.861;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=180;TCF=73;TCR=107;TR=116;WE=85164006;WS=85163988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,122:0.65:187
chr15	85165699	rs11635597	C	T	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=438;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTTGCTGCCACGTTGTTGGGC;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=19;WE=85165707;WS=85165689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,19:0.76:25
chr15	85175102	rs2121452	G	A	4793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=49;PP=2965;SC=TTTAGAGTGCGGTTGCAAAGC;SOR=1.578;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=97;TCR=49;TR=146;WE=85175110;WS=85175092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr15	85186637	rs510875	G	C	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=328;SC=AGTCCTACATGAGCACCCTTG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=85186645;WS=85186628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	85187103	rs11630487	C	T	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=471;ReadPosRankSum=-0.054;SC=CCATCTCAGCCTCCCAAAATG;SOR=1.536;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=20;WE=85187111;WS=85187093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr15	85188994	rs2271432	T	C	8514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=145;PP=2965;SC=CCAGCCGGCCTGAAGCACAGC;SOR=0.811;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=277;TCF=132;TCR=145;TR=277;WE=85189002;WS=85188984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr15	85189464	rs2271431	T	G	3529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.902;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=80;PP=2743;ReadPosRankSum=-0.728;SC=CCTGCAGACTTCGGAGCCTCG;SOR=0.895;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=193;TCF=73;TCR=120;TR=125;WE=85189472;WS=85189454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,128:0.64:199
chr15	85200520	rs1051168	G	T	2590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.860;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=28;PP=1992;ReadPosRankSum=-0.886;SC=GAGGTGTGGGGAGCTGTCCCC;SOR=0.565;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=126;TCF=90;TCR=36;TR=94;WE=85200528;WS=85200510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,98:0.77:128
chr15	85201419	rs12904605	T	C	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=451;ReadPosRankSum=1.146;SC=TCGGGCGCGCTTCCCGGCCGC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=19;WE=85201427;WS=85201409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr15	85235757	rs12900890	C	T	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=20;PP=582;SC=CTCCAACAAACTCTAAAATTC;SOR=3.180;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=85235765;WS=85235747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	85259053	rs6496355	C	A	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=1;PP=1243;SC=GCCCCGCCCCCGGTAGGCCCT;SOR=6.184;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=42;TCR=1;TR=43;WE=85259061;WS=85259043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	85333953	rs2241645	A	G	4106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=50;PP=2965;SC=AGGTATGCCAAATGCTGCTGC;SOR=1.179;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=128;TCF=78;TCR=50;TR=127;WE=85333961;WS=85333943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr15	85341519	rs145372697	C	G	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=1.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.21;ReadPosRankSum=-0.415;SOR=1.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,8:0.17:46
chr15	85360101	rs11857356	T	C	2392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=25;PP=1888;SC=GGCTTGTCTATGTGCTGGGCC;SOR=1.468;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=50;TCR=25;TR=75;WE=85360109;WS=85360091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr15	85360271	rs28431354	A	G	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.13;ReadPosRankSum=-1.946;SOR=0.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,30:0.24:124
chr15	85366622	rs28495917	T	G	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=37;PP=806;ReadPosRankSum=-0.885;SC=TGCACTACATTTCTCTGACTG;SOR=0.714;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=169;TCF=42;TCR=127;TR=48;WE=85366630;WS=85366612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,50:0.28:178
chr15	85370597	rs891286	C	G	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=393;SC=CGGGGTGCTGCAGCTCTGGCC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=85370605;WS=85370587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	85382193	rs1896864	C	A	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.225;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=411;ReadPosRankSum=1.214;SC=GTAACCCAGTCTCCTGCTTCT;SOR=1.733;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=21;WE=85382201;WS=85382183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr15	85383145	rs3803403	C	G	2505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.179;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=53;PP=2040;ReadPosRankSum=-1.305;SC=GAGGTCGACACTCTGCGCAAG;SOR=1.166;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=144;TCF=63;TCR=81;TR=88;WE=85383153;WS=85383135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,90:0.62:146
chr15	85383640	rs3803405	G	A	1874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.451;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=48;PP=1507;ReadPosRankSum=0.022;SC=GCTGCACGGGGGCCTGGGTCC;SOR=1.307;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=114;TCF=37;TCR=77;TR=67;WE=85383648;WS=85383630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,68:0.61:112
chr15	85383839	rs3803406	G	A	2040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.791;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=15;PP=1588;ReadPosRankSum=-1.166;SC=GGGCGCCTGGGGAGAGTCCCA;SOR=0.496;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=85;TCR=25;TR=66;WE=85383847;WS=85383829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,71:0.60:119
chr15	85401259	rs306197	C	T	2708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=36;PP=2201;SC=GAGGTTTCCCCTGAGGGGCCT;SOR=0.954;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=46;TCR=36;TR=82;WE=85401267;WS=85401249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr15	85401419	rs167379	T	C	5492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=95;NR=70;PP=2965;SC=CTCTGACAGGTCTCCCGGCAG;SOR=1.009;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=95;TCR=70;TR=165;WE=85401427;WS=85401409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr15	85407564	rs2289138	A	C	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=1;PP=702;SC=GCTGAGAATTACATTCTTGGA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=85407572;WS=85407554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	85411692	rs3748380	C	T	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.090;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=349;ReadPosRankSum=1.010;SC=CGGTAGCCTCCGCAGAGGCTG;SOR=1.358;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=17;WE=85411700;WS=85411682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr15	85438311	rs151038463	C	CTTG	897.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.217;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.678;NF=1;NR=18;PP=833;ReadPosRankSum=1.211;SC=GAGGAGGTTTCTCAAGCCTCA;SOR=0.284;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=61;TCF=6;TCR=55;TR=19;WE=85438319;WS=85438301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,26:0.43:61
chr15	85438374	rs17222239	C	T	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=135;ReadPosRankSum=1.329;SC=CTCACAGCCCCGAGGCAGGGC;SOR=0.593;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=9;WE=85438382;WS=85438364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,9:0.29:31
chr15	85448906	rs2290269	C	T	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.747;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=349;ReadPosRankSum=-1.737;SC=GGTCTGGCTGCCCAGAGCATC;SOR=0.042;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=51;TCF=10;TCR=41;TR=19;WE=85448914;WS=85448896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,22:0.39:56
chr15	85461898	rs1562885	G	C	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=5.523;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.77;ReadPosRankSum=-1.408;SOR=1.861;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,19:0.23:83
chr15	85467275	rs3803390	C	T	1277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=3.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.11;ReadPosRankSum=-0.269;SOR=0.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:148,61:0.29:209
chr15	85469711	rs2343674	G	A	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=2.963;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.55;ReadPosRankSum=1.000;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr15	85476441	rs2305367	G	A	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.484;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=45;PP=1089;ReadPosRankSum=0.234;SC=CCCTCTCCAAGCTGGTCTACC;SOR=1.096;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=215;TCF=74;TCR=141;TR=64;WE=85476449;WS=85476431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,66:0.29:226
chr15	85478153	rs7163966	G	T	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=32;NR=3;PP=997;SC=AGGATTTCCCGCTCTGAAATG;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=35;WE=85478161;WS=85478143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	85478410	rs2242048	A	G	4140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=53;PP=2965;SC=TGGACATCCAAGGGCTCAGCT;SOR=0.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=68;TCR=53;TR=121;WE=85478418;WS=85478400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr15	85478696	rs2242047	C	T	1579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.098;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=35;PP=1133;ReadPosRankSum=0.329;SC=GTACAAGCAACGCCGCCTGGC;SOR=0.292;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=216;TCF=82;TCR=134;TR=67;WE=85478704;WS=85478686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,73:0.32:225
chr15	85478729	rs2242046	G	A	2722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.702;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=73;PP=2139;ReadPosRankSum=2.364;SC=GTGGGTCGGCGACAGGAAGCA;SOR=0.580;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=156;TCF=39;TCR=117;TR=99;WE=85478737;WS=85478719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,100:0.62:160
chr15	85487960	rs11479919	GC	G	8358.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=100;PP=2966;SC=CGGGGGCCCTGCCCCACCCAC;SOR=0.998;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=218;TCF=113;TCR=105;TR=202;WE=85487968;WS=85487950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr15	85488572	rs8025045	T	G	1539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=45;PP=1240;SC=TTGGGAAGGGTTCATGGAGTG;SOR=7.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=45;WE=85488580;WS=85488562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr15	85607802	rs8031544	T	C	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=136;ReadPosRankSum=-0.105;SC=TCTGTAACAGTATTATAGTTA;SOR=0.465;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=9;WE=85607810;WS=85607792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,9:0.26:35
chr15	85619248	rs11631548	C	T	1801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.124;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=48;PP=1471;ReadPosRankSum=-0.063;SC=GTCAGGCATGCCCCTTTGTAG;SOR=1.354;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=88;TCF=24;TCR=64;TR=63;WE=85619256;WS=85619238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,64:0.72:89
chr15	85619816	.	C	G	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=195;ReadPosRankSum=0.460;SC=AAACAGTTTTCAACTTTATCC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=8;WE=85619824;WS=85619806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr15	85632728	rs61246885	AT	A	298.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=8.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.44;MQRankSum=1.610;QD=7.11;ReadPosRankSum=0.511;SOR=0.075;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,19:0.45:42
chr15	85633824	.	GA	G	136.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.682;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=124;ReadPosRankSum=1.263;SC=ATCCGGATAAGAGTCTCAGAG;SOR=1.501;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=5;WE=85633832;WS=85633814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr15	85633845	rs17540307	A	G	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=462;ReadPosRankSum=1.447;SC=GGATTAAGTGACTTGCTGAGG;SOR=0.941;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=19;WE=85633853;WS=85633835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr15	85656568	rs2304422	A	G	2404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=16;PP=1783;SC=AGGTGCCCAGAGTTGTGCATG;SOR=2.463;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=55;TCR=16;TR=71;WE=85656576;WS=85656558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr15	85666463	rs16974899	G	A	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.272;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=57;PP=1114;ReadPosRankSum=-1.537;SC=TGTGTTTGGGGTCCTTGTACT;SOR=1.305;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=191;TCF=30;TCR=161;TR=64;WE=85666471;WS=85666453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,61:0.31:194
chr15	85666568	.	TACACACACACACACACAC	T	1411	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=57.98;NF=0;NR=5;PP=1411;QD=282.8;SC=ACTAATGGGATACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=5;WE=85666593;WS=85666558;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:18,5:0.22:23
chr15	85669452	rs16974908	C	T	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.602;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=10;PP=613;ReadPosRankSum=-0.054;SC=CTGATAAAAACCAGGAAGTGA;SOR=1.011;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=150;TCF=108;TCR=42;TR=42;WE=85669460;WS=85669442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,40:0.25:157
chr15	85680003	.	C	G	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=54;ReadPosRankSum=-0.623;SC=CCTGGGCTTTCAAGAACAAGA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=85680011;WS=85679993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr15	86029097	rs11856869	C	G	1847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-1.123;NF=1;NR=54;PP=1615;ReadPosRankSum=-0.867;SC=AACCATATGTCCATGAATATA;SOR=6.666;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=55;WE=86029105;WS=86029087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr15	86063681	rs11634589	A	G	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.787;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=112;ReadPosRankSum=-0.441;SC=GTGAGCTGAGATCACGCCACT;SOR=1.609;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=6;WE=86063689;WS=86063671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr15	86064909	rs1483581	T	C	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=230;ReadPosRankSum=0.720;SC=GTGTAGACAGTATAAAAAAAT;SOR=0.315;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=12;WE=86064917;WS=86064899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr15	86087212	rs7162720	C	T	4003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.215;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=76;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.827;SC=GCCTTATTTCCCTCCTCTCAT;SOR=0.595;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=198;TCF=92;TCR=106;TR=144;WE=86087220;WS=86087202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,146:0.72:203
chr15	86087309	rs2291049	T	C	3686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.642;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.405;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=69;PP=2880;ReadPosRankSum=1.435;SC=CAGCTCTGTATCTTGCCTTCT;SOR=0.601;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=204;TCF=97;TCR=107;TR=138;WE=86087317;WS=86087299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,138:0.68:204
chr15	86098507	rs7180143	G	T	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=538;SC=CATTAAGGTTGGACACTATTA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=86098515;WS=86098497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	86098647	rs7164821	T	C	3380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.472;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=45;PP=2589;ReadPosRankSum=-0.652;SC=CTTTCCTCTATTTTTAAAGCT;SOR=0.588;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=103;TCF=57;TCR=46;TR=102;WE=86098655;WS=86098637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,108:0.99:109
chr15	86122654	rs2061821	T	C	2551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=58;PP=2123;SC=GACTTGGTCATGGAGCCAGGC;SOR=1.382;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=32;TCR=58;TR=90;WE=86122662;WS=86122644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr15	86122779	rs2061822	T	C	3359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=35;PP=2565;SC=TGCCACTGTTTGGAAGAATGT;SOR=1.502;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=66;TCR=35;TR=101;WE=86122787;WS=86122769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr15	86122916	rs2061823	T	C	5141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=61;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.707;SC=GTGCCCCTGCTGCCAGTTCCC;SOR=0.483;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=103;TCR=61;TR=163;WE=86122924;WS=86122906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,168:0.99:169
chr15	86122970	rs17557307	T	C	1738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.079;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=35;PP=1311;ReadPosRankSum=-1.198;SC=CATTTAGTAATGAAGAAACCT;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=117;TCR=94;TR=78;WE=86122978;WS=86122960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,82:0.37:223
chr15	86123019	rs2061824	C	T	7951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.169;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=126;PP=2965;ReadPosRankSum=0.755;SC=TTCACGAAGTCGTGAGGAGAG;SOR=0.352;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=237;TCF=111;TCR=126;TR=236;WE=86123027;WS=86123009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,250:1.00:251
chr15	86123170	rs745191	G	T	3340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.472;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=43;PP=2604;ReadPosRankSum=-1.388;SC=GCCCTTCTTGGGCTGGAAGAA;SOR=0.410;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=188;TCF=122;TCR=66;TR=114;WE=86123178;WS=86123160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,120:0.62:194
chr15	86123833	rs4075256	T	C	3525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=56;PP=2965;SC=GACAGGGCAGTAGGCCTGTCC;SOR=0.876;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=48;TCR=56;TR=104;WE=86123841;WS=86123823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr15	86123924	rs4075255	C	T	3417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=49;PP=2965;SC=ATGAGGGTCCCGCCCCTCCAG;SOR=0.772;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=55;TCR=49;TR=104;WE=86123932;WS=86123914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr15	86123988	rs4075254	G	A	3809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=53;PP=2965;SC=CCTGCAAAGTGTGGGTAAGGC;SOR=0.958;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=122;TCF=69;TCR=53;TR=121;WE=86123996;WS=86123978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr15	86124419	rs4843073	C	T	3920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=47;PP=2965;SC=ACAACAGCTCCGCTCTGTTGC;SOR=1.304;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=76;TCR=48;TR=122;WE=86124427;WS=86124409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr15	86124483	rs4843074	C	G	4525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=73;NR=64;PP=2965;SC=CTGCAGTCAGCCTTCTCCTCT;SOR=0.871;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=137;TCF=73;TCR=64;TR=137;WE=86124491;WS=86124473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr15	86124555	rs4843075	G	A	5804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=74;PP=2965;SC=GGTGAGTGGAGATGTGACGGT;SOR=0.861;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=166;TCF=92;TCR=74;TR=166;WE=86124563;WS=86124545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr15	86124946	rs7162168	T	C	3856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=55;NR=79;PP=2965;SC=AGGGAAGTCATGCGAGCCCCG;SOR=1.129;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=55;TCR=79;TR=134;WE=86124954;WS=86124936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr15	86124968	rs11633087	G	A	4282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=66;PP=2965;SC=CTTCAGGCAGGGAAAGGAGCA;SOR=0.806;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=61;TCR=66;TR=127;WE=86124976;WS=86124958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr15	86125031	rs7178065	G	A	3739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=54;PP=2965;SC=TGCCTAAGGGGGCAGACTTGA;SOR=0.763;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=60;TCR=54;TR=113;WE=86125039;WS=86125021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr15	86129201	rs931082	T	A	1428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=36;PP=1124;SC=ATAAATGTGTTTATGTTGCTG;SOR=5.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=38;WE=86129209;WS=86129191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	86181684	rs12593544	A	G	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=2;PP=55;SC=TTCTTATGCTATTATTGGGTG;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=86181692;WS=86181674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	86182512	rs56092539	A	G	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=422;ReadPosRankSum=0.368;SC=AGAAAAAGATAGGAATGTTGG;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=18;WE=86182520;WS=86182502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr15	86182670	rs16942564	G	A	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.775;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=20;PP=482;ReadPosRankSum=-1.252;SC=TGGCTTCCAAGCAGAGCCCAG;SOR=0.793;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=104;TCF=43;TCR=61;TR=33;WE=86182678;WS=86182660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,34:0.32:107
chr15	86182856	rs35727345	C	CT	326.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=359;SC=ATGTAATTACCGAATTTTGTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=86182864;WS=86182846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	86189006	rs71468130	G	GT,GTT	568.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=8.451;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.08;ReadPosRankSum=1.738;SOR=3.698;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,8,12:0.38,0.57:21
chr15	86199049	rs17635450	C	G	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=206;ReadPosRankSum=-1.263;SC=TTTAGTGTCTCAGTGTCTGCT;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=10;WE=86199057;WS=86199039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr15	86212866	rs12904047	A	G	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=0;PP=711;ReadPosRankSum=2.486;SC=TTATTTTACTATGTGGGTCTA;SOR=2.191;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=29;WE=86212874;WS=86212856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,30:0.75:40
chr15	86213172	rs338523	A	G	917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=728;SC=TTTGCTTACTACTTCTTTGAG;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=86213180;WS=86213162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	86227952	rs2306225	A	G	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=2;PP=735;ReadPosRankSum=-0.583;SC=AAAAAAATCAATCTTCTTGTT;SOR=0.760;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=43;TCF=40;TCR=3;TR=30;WE=86227960;WS=86227942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,34:0.69:49
chr15	86253768	rs8037947	T	A	2691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=14;PP=2196;ReadPosRankSum=0.942;SC=TCAGGGCTTGTCAGAGGTGAA;SOR=1.732;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=70;TCR=14;TR=83;WE=86253776;WS=86253758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr15	86253911	rs8038249	T	G	4876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.166;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=109;PP=2965;ReadPosRankSum=0.647;SC=ATTCCCTTTCTGACTTTCTGG;SOR=1.717;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=49;TCR=110;TR=157;WE=86253919;WS=86253901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,160:0.99:161
chr15	86259233	rs71141478	C	CT	363.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=2.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQRankSum=-0.281;QD=13.47;ReadPosRankSum=0.665;SOR=1.938;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,22:0.81:27
chr15	86260700	rs3765096	C	T	3629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=86;PP=2925;SC=TTACCTAGAACATAAGTCTTA;SOR=2.204;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=30;TCR=86;TR=116;WE=86260708;WS=86260690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr15	86261128	rs79813743	C	G	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=143;ReadPosRankSum=0.103;SC=TGAATATCCCCTGTATTCATG;SOR=0.241;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=11;WE=86261136;WS=86261118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr15	86278174	rs2241267	C	T	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=5;PP=822;SC=ACTTGTTTTCCCCTCATTGAA;SOR=3.334;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=86278182;WS=86278164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	86278309	rs2241268	G	A	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=16;PP=571;ReadPosRankSum=0.419;SC=AGATGTGGTCGGTCCCGTTTC;SOR=0.400;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=26;WE=86278317;WS=86278299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr15	86284817	rs13511	T	C	2206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=52;PP=1758;SC=AGCAGAAATATAGAGCCTGTT;SOR=2.939;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=11;TCR=52;TR=63;WE=86284825;WS=86284807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	86286787	rs61734378	C	T	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=1.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.41;ReadPosRankSum=-0.347;SOR=0.939;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,27:0.26:104
chr15	86287724	rs11629690	G	A	952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=1;PP=722;ReadPosRankSum=0.612;SC=CAGAAACCCCGGTGCGCAGAA;SOR=0.356;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=57;TCF=56;TCR=1;TR=32;WE=86287732;WS=86287714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr15	86287910	rs11073517	C	T	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.424;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=348;ReadPosRankSum=0.379;SC=TTCTGCTGACCCTCTTCCTCT;SOR=0.016;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=54;TCF=3;TCR=51;TR=21;WE=86287918;WS=86287900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,21:0.37:57
chr15	86311187	.	GG	CA	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.221;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=427;ReadPosRankSum=1.769;SC=GGAAGAGGTGGGACTGCATTC;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=8;WE=86311196;WS=86311185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr15	86311695	rs1978391	G	A	5930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.978;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=130;PP=2962;ReadPosRankSum=0.890;SC=TGGTTCCTCCGAAAACAAAGA;SOR=0.928;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=314;TCF=118;TCR=196;TR=205;WE=86311703;WS=86311685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,210:0.65:323
chr15	86312681	rs11073537	G	A	2911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.563;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=53;PP=2338;ReadPosRankSum=-0.311;SC=CCTGCCTCCAGCAGTGACTCA;SOR=0.724;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=174;TCF=88;TCR=86;TR=105;WE=86312689;WS=86312671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,107:0.60:178
chr15	86313048	rs2614657	T	C	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.907;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=54;PP=1454;ReadPosRankSum=-0.322;SC=ACATGGTGCGTCAGCTTGTGG;SOR=1.545;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=88;TCF=11;TCR=77;TR=60;WE=86313056;WS=86313038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,61:0.68:90
chr15	86368898	rs4414449	G	A	309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=2;PP=171;SC=AAGTAATTGCGGTCTTTGTCA;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=86368906;WS=86368888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	86368959	rs4577031	A	T	217.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=147;SC=CTAAAGATTAATTTAGGGAGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=86368967;WS=86368949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	86369050	rs72757332	C	T	137.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=78;SC=CTGCCCTGCTCATGGCTGGCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=86369058;WS=86369040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr15	86702241	rs79814209	C	T	1452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.789;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=31;PP=1147;ReadPosRankSum=-0.745;SC=CACCCGAAAGCGCACCCAAGC;SOR=0.568;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=228;TCF=137;TCR=91;TR=69;WE=86702249;WS=86702231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,69:0.30:231
chr15	86768264	rs34786229	C	CT	392.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=1.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.30;MQRankSum=3.717;QD=6.89;ReadPosRankSum=-0.377;SOR=1.151;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr15	86838590	.	C	T	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.296;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.738;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=17;PP=907;ReadPosRankSum=-0.705;SC=CCTTGGTGACCATCACGGCCA;SOR=1.151;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=62;TCF=34;TCR=28;TR=43;WE=86838598;WS=86838580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,47:0.72:65
chr15	86940622	rs4362360	T	C	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.059;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=192;ReadPosRankSum=-1.392;SC=AGGTGATCACTGCTCGAGTTC;SOR=0.478;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=59;TCF=27;TCR=32;TR=20;WE=86940630;WS=86940612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,20:0.34:59
chr15	87097468	rs9788743	T	C	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=591;SC=TTAGGGTTAATAAATGATTTA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=87097476;WS=87097458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	87099537	rs752270	T	C	2699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=41;PP=2018;SC=AGCATTTATCTTGTGAAATTT;SOR=0.987;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=34;TCR=41;TR=75;WE=87099545;WS=87099527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr15	87217488	rs11853730	T	C	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=350;ReadPosRankSum=-2.200;SC=CAGTTAATGCTTTGTTTAACT;SOR=0.594;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=86;TCF=52;TCR=34;TR=23;WE=87217496;WS=87217478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,23:0.25:91
chr15	87217613	rs8028043	A	G	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=33;PP=984;SC=CTCCTGGCTCAAGCTGCAACT;SOR=5.670;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=34;WE=87217621;WS=87217603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	87531281	rs1006030	A	C	2191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=25;PP=1607;SC=TTGCCATTACAAACTTTTTCA;SOR=1.226;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=43;TCR=25;TR=68;WE=87531289;WS=87531271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr15	88423463	rs1560975	C	T	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=3;PP=706;SC=TCTTATGAGCCCTCCCCCAAT;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=88423471;WS=88423453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr15	88428702	rs2117655	C	A	603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=511;SC=TAGAACAATACGGGAGAGTTA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=88428710;WS=88428692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	88576185	rs2229910	G	C	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.771;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=291;ReadPosRankSum=-1.346;SC=TGTCGGGCCCGGCATCCAGTG;SOR=0.953;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=115;TCF=42;TCR=73;TR=31;WE=88576193;WS=88576175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,32:0.28:115
chr15	88669382	rs3825882	G	C	2009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=0;PP=1712;ReadPosRankSum=0.694;SC=ATCAGTACCAGTTAGACCCCA;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=66;TCR=0;TR=63;WE=88669390;WS=88669372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr15	88679785	rs1863480	G	A	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=19;PP=575;SC=TGATAACAGCGTTGTCACCCT;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=88679793;WS=88679775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	88680684	rs1128994	G	A	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.868;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=538;ReadPosRankSum=-0.806;SC=AGCCATCAGCGTTGATGCAGT;SOR=1.356;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=27;WE=88680692;WS=88680674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,28:0.62:45
chr15	88690736	rs202101442	CCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT	C,CCTTCTTCTTCTTCTTCTT	2161.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=5,5;NR=17,17;PP=2995,1450;SC=GCTTTGTTTTCCTTCTTCTTC;SOR=3.651;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=83;TCF=14;TCR=69;TR=22,22;WE=88690764;WS=88690726;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.76,0.24:55
chr15	88726586	rs55725904	G	A	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=0.516;SC=TCAGGTCTCCGGTTTCACTGC;SOR=0.927;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=6;WE=88726594;WS=88726576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
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chr15	89155270	rs12908122	A	G	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.510;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=30;ReadPosRankSum=0.812;SC=TCACCACCCTAAACACCCATC;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=3;WE=89155278;WS=89155260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr15	89169614	rs3743476	A	G	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.32;ReadPosRankSum=-1.603;SOR=0.640;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,23:0.26:89
chr15	89169703	rs8026929	C	G	2098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.726;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=25;PP=1625;ReadPosRankSum=0.699;SC=AGGGCTGGATCTGGCAGTGCC;SOR=0.420;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=119;TCF=81;TCR=38;TR=75;WE=89169711;WS=89169693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,76:0.63:121
chr15	89169858	rs8027765	A	G	6972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=122;PP=2965;SC=CTACCATGGCAATGTCCTCTA;SOR=0.922;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=219;TCF=97;TCR=122;TR=218;WE=89169866;WS=89169848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr15	89172352	rs3826040	C	T	1444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=2;PP=1219;SC=GCTGCCTCCCCCCACAGGGAT;SOR=5.283;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=43;WE=89172360;WS=89172342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	89172370	rs73451733	T	C	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.444;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=2;PP=867;ReadPosRankSum=0.612;SC=GATCCATGCATCTATTGGCCA;SOR=2.049;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=54;TCF=50;TCR=4;TR=37;WE=89172378;WS=89172360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,40:0.71:56
chr15	89172558	rs3743475	G	C	7239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=106;NR=117;PP=2965;SC=CCCGGGATACGACCTATGTCC;SOR=0.756;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=223;TCF=106;TCR=117;TR=223;WE=89172566;WS=89172548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr15	89173657	rs3826038	A	T	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=20;PP=624;SC=CCAGAGGAGTAGGGGTCATCT;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=89173665;WS=89173647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	89182596	rs3200942	A	G	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.809;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=1;PP=599;ReadPosRankSum=-0.801;SC=TCCCCAAGGAACATGGCTGGG;SOR=1.302;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=90;TCF=84;TCR=6;TR=30;WE=89182604;WS=89182586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,30:0.34:89
chr15	89193584	rs8041679	G	C	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=25;PP=791;SC=GGCTGGGGCAGTCACAGCTGG;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=89193592;WS=89193574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	89195264	rs7180509	A	G	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.183;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=1;PP=769;ReadPosRankSum=1.222;SC=TCAAGGAGGGATTGCTCCCTT;SOR=2.247;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=56;TCF=52;TCR=4;TR=33;WE=89195272;WS=89195254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,32:0.57:56
chr15	89195526	rs1137166	A	G	2736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=79;PP=2317;SC=AGCGCCTCCTACACAAGAGCA;SOR=5.969;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=82;TCF=3;TCR=79;TR=82;WE=89195534;WS=89195516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr15	89198560	rs8041687	A	G	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=167;ReadPosRankSum=-0.088;SC=GACTCTGGAAATCGGGATGTG;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=8;WE=89198568;WS=89198550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr15	89385151	rs2293087	T	G	2756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=78;PP=2327;ReadPosRankSum=-0.794;SC=AAGGCCACCTTCCCCTCCCCA;SOR=4.664;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=3;TCR=80;TR=81;WE=89385159;WS=89385141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,84:0.99:85
chr15	89386543	rs11324188	AG	A	3255.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.19;QD=31.31;SOR=3.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr15	89386652	rs34949187	G	A	3210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=72;PP=2651;ReadPosRankSum=0.566;SC=GAGTGCCGGCGGCTGGGTGCC;SOR=0.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=68;TCR=107;TR=118;WE=89386660;WS=89386642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,117:0.66:177
chr15	89390434	rs12911138	G	A	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=3;PP=344;SC=GCTGCACACCGTGGGTCCCTG;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=89390442;WS=89390424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	89391160	rs2272023	C	A	2002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=10;PP=1536;SC=TTGTGAGCCCCCGGACCCCAT;SOR=2.833;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=62;TCF=51;TCR=11;TR=61;WE=89391168;WS=89391150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr15	89392745	rs1568116	T	C	2569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=10;PP=2164;SC=CTCACAATGCTACGCTGGCCA;SOR=3.669;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=66;TCR=10;TR=76;WE=89392753;WS=89392735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr15	89398105	rs2351491	C	T	3564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.061;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=24;PP=2873;ReadPosRankSum=1.531;SC=CTTGGCCTCCCACTGGCGCAG;SOR=2.272;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=79;TCR=25;TR=103;WE=89398113;WS=89398095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,108:0.99:109
chr15	89398330	rs3743399	G	A	7557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=118;NR=114;PP=2965;SC=CATCAGCCTCGGAAGAGCCGT;SOR=0.728;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=233;TCF=119;TCR=114;TR=232;WE=89398338;WS=89398320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr15	89398605	rs938608	G	T	5915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=91;PP=2965;SC=GAGTGGCCCAGCACTCCTACG;SOR=1.340;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=51;TCR=91;TR=142;WE=89398613;WS=89398595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr15	89398631	rs938609	T	A	5403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=77;PP=2965;ReadPosRankSum=0.576;SC=TGAACTGCCCTCTGGAGCTGA;SOR=0.475;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=48;TCR=78;TR=125;WE=89398639;WS=89398621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,126:0.99:127
chr15	89400339	rs2882676	A	C	2485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.424;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=35;PP=1999;ReadPosRankSum=-1.048;SC=GATGTCAGTGAACTTCCTTCA;SOR=0.565;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=78;TCF=41;TCR=37;TR=76;WE=89400347;WS=89400329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,76:0.99:77
chr15	89401109	rs4932439	A	G	5596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=75;PP=2965;SC=ACAACCAGGTATTAGTGGAGA;SOR=1.017;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=170;TCF=94;TCR=76;TR=168;WE=89401117;WS=89401099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr15	89401615	rs3825994	T	G	5188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=99;PP=2965;SC=GTTTCCCCACTGTCTCTCTTG;SOR=1.267;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=160;TCF=61;TCR=99;TR=160;WE=89401623;WS=89401605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr15	89402051	rs1042630	A	G	3165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=36;PP=2463;SC=AGCTGGGGACATTAGTGGAGC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=70;TCR=36;TR=106;WE=89402059;WS=89402041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr15	89402239	rs1042631	T	C	6669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=104;PP=2965;SC=AAGCTAACCTTGAGAGATCCT;SOR=0.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=103;TCR=104;TR=207;WE=89402247;WS=89402229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr15	89402596	rs698621	T	G	7460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=130;PP=2965;ReadPosRankSum=0.806;SC=CAACAGATGCTTCCATCCCAG;SOR=0.253;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=252;TCF=121;TCR=131;TR=251;WE=89402604;WS=89402586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,257:1.00:258
chr15	89422286	rs3809574	C	T	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.450;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=736;ReadPosRankSum=-1.389;SC=GTGCCAGGCCCGGGCCACCGC;SOR=0.462;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=118;TCF=51;TCR=67;TR=42;WE=89422294;WS=89422276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,44:0.36:122
chr15	89423749	rs875024	G	A	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=121;ReadPosRankSum=-0.071;SC=TGTCATAGCTGGGACGGGCTG;SOR=0.465;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=9;WE=89423757;WS=89423739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,9:0.26:35
chr15	89424022	rs55782943	A	T	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=207;ReadPosRankSum=3.150;SC=CATAAAAATCAGGAGATCTCA;SOR=0.823;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=12;WE=89424030;WS=89424012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr15	89424581	rs938605	A	G	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.320;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=293;ReadPosRankSum=1.395;SC=CCCCGTTAGCATCTCACCCCG;SOR=1.368;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=81;TCF=64;TCR=17;TR=23;WE=89424589;WS=89424571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,24:0.30:81
chr15	89430506	rs3743395	C	T	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.686;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=594;ReadPosRankSum=-0.375;SC=GCAGGAGCAACGGGACCAGGA;SOR=0.967;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=121;TCF=39;TCR=82;TR=39;WE=89430514;WS=89430496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,38:0.32:118
chr15	89436244	rs8024779	T	C	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=14;PP=603;ReadPosRankSum=-1.433;SC=TGGAGTCCTGTCTGGGCACTC;SOR=0.652;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=142;TCF=95;TCR=47;TR=41;WE=89436252;WS=89436234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,41:0.28:148
chr15	89436295	rs8039131	G	A	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.584;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=25;PP=700;ReadPosRankSum=2.638;SC=ACTGCATCCTGCTGAGTGACT;SOR=0.641;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=181;TCF=90;TCR=91;TR=51;WE=89436303;WS=89436285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,55:0.29:189
chr15	89444760	rs2015495	T	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.76;ReadPosRankSum=0.796;SOR=0.247;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,8:0.19:42
chr15	89449137	rs3743388	C	G	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=529;ReadPosRankSum=-1.535;SC=AAACTCCTAGCAGGGAAGGGA;SOR=0.610;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=27;TCR=53;TR=32;WE=89449145;WS=89449127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,32:0.38:84
chr15	89450546	rs1878327	C	T	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=668;ReadPosRankSum=-1.059;SC=CACGCACAGACGAGGCGGCGA;SOR=0.657;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=127;TCF=60;TCR=67;TR=38;WE=89450554;WS=89450536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,43:0.32:135
chr15	89450587	rs1878326	G	T	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.88;ReadPosRankSum=-0.579;SOR=0.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,29:0.27:109
chr15	89456306	rs35936125	C	G	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=31;ReadPosRankSum=1.345;SC=AGCAGGGCCGCATCCCCCTGT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=3;WE=89456314;WS=89456296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr15	89456356	rs3743387	G	C	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=74;ReadPosRankSum=0.038;SC=CCTCTGCCCAGCCCGGTCCCC;SOR=0.693;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=4;WE=89456364;WS=89456346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr15	89456544	rs4945	G	T	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.929;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=86;ReadPosRankSum=1.561;SC=AGGCGGGGGCGCGGCATGCTG;SOR=3.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=6;WE=89456552;WS=89456534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr15	89731347	rs2239288	G	C	2210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=55;NR=8;PP=1844;SC=CTGGCTTGCTGTGGCAAGGAA;SOR=3.545;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=55;TCR=8;TR=63;WE=89731355;WS=89731337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr15	89736558	rs6496562	T	C	4034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.983;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=84;PP=2965;ReadPosRankSum=1.173;SC=CAGGTAAGTGTTTCTTCCTGC;SOR=1.922;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=119;TCF=34;TCR=85;TR=116;WE=89736566;WS=89736548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,125:0.98:128
chr15	89754954	rs950541	G	A	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=2;PP=717;SC=GCTGCCGTGCGACAGAACTCT;SOR=3.528;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=89754962;WS=89754944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	89758552	rs4932483	A	G	1460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=41;PP=1160;SC=CAGAGACCTGACCTCCTGCCA;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=41;WE=89758560;WS=89758542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr15	89761664	rs3825991	C	A	1281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=1;PP=1083;SC=ACCTTAGAACCGGCCAGTCTA;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=38;WE=89761672;WS=89761654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	89804043	rs17803620	C	T	5408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=83;PP=2965;SC=AAAGAAATAGCGTCTGAGATC;SOR=0.761;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=172;TCF=89;TCR=83;TR=171;WE=89804051;WS=89804033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr15	89804111	rs16942918	G	A	4567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=99;PP=2965;SC=TTGGGGGTAGGTTTTTGAGGG;SOR=1.742;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=44;TCR=100;TR=143;WE=89804119;WS=89804101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr15	89805189	rs3217022	C	CTG	637.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=692;SC=GAATTTATGTCTGGAGGTTTT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=15;WE=89805197;WS=89805179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	89806710	rs1981623	C	T	2664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=37;NR=44;PP=2036;SC=CATCTTTTCCCTTTTCTTTGT;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=37;TCR=44;TR=81;WE=89806729;WS=89806700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr15	89806721	rs1981624	G	A	2414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=46;PP=1747;SC=TTTTCTTTGTGTATCCTGCTT;SOR=1.096;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=29;TCR=46;TR=75;WE=89806729;WS=89806700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr15	89811482	rs7497351	T	C	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=1;PP=460;SC=TGCCACCACATCGGGCTGATT;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=89811490;WS=89811475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	89811543	rs7496308	G	C	1350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=1;PP=1104;SC=ATCAAGTGATGCGCCCGCCTT;SOR=5.136;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=38;WE=89811551;WS=89811533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	89816541	rs72300014	TA	T	446.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=5.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.69;MQRankSum=-0.140;QD=6.67;ReadPosRankSum=-0.928;SOR=0.118;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,43:0.64:67
chr15	89817689	rs11073853	G	C	218.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=179;SC=ACTGGTAGAGGATACTTTTTC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=89817697;WS=89817679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr15	89826496	rs9806604	C	T	4449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=99;PP=2965;SC=GGATTATTTACGTTAACTTGC;SOR=2.337;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=29;TCR=99;TR=128;WE=89826504;WS=89826486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr15	89836228	rs2283432	G	C	1392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=32;PP=1148;SC=AATAATATCTGTGCTTTTCTT;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=38;WE=89836236;WS=89836218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	89838045	rs2283431	G	A	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=345;SC=AAGCTCTGTTGGGTGCTGCTG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=89838053;WS=89838035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	89838236	rs7183618	G	A	2041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=33;PP=1581;SC=CTCTGCAGAAGGTACAGCAGC;SOR=0.966;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=27;TCR=33;TR=60;WE=89838244;WS=89838226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr15	89844688	rs2159081	A	C	2715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=64;PP=2127;SC=TAGTACCGCTAACTTAATCCC;SOR=2.598;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=16;TCR=64;TR=80;WE=89844696;WS=89844678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr15	89856047	rs11321073	TA	T	136.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQRankSum=0.000;QD=5.94;ReadPosRankSum=-0.217;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr15	89857698	rs16943011	T	G	2454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=1;PP=1965;SC=GCCAAAAATTTTAGATTACTG;SOR=7.112;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=66;TCF=65;TCR=1;TR=64;WE=89857719;WS=89857688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	89857711	rs71464462	A	ATACAAG	3368.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=1;PP=2965;SC=GATTACTGGTATACAACTGCA;SOR=7.083;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=76;TCF=73;TCR=3;TR=56;WE=89857719;WS=89857688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr15	89858602	rs1138465	T	C	2754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=73;PP=1932;SC=GAGAGGATGGTGAAGATGAAA;SOR=2.526;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=18;TCR=73;TR=91;WE=89858610;WS=89858592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr15	89859932	rs3087377	A	AC	1488.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=6;PP=1579;SC=GGGAGCCTGCACCACCCCGAT;SOR=3.109;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=37;WE=89859940;WS=89859922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	89859994	rs3087374	C	A	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.684;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=4;PP=781;ReadPosRankSum=0.726;SC=ATGGTCCAGGCTGGCTTCGTT;SOR=1.981;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=66;TCF=53;TCR=13;TR=36;WE=89860002;WS=89859984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,40:0.56:72
chr15	89860786	rs2307438	A	C	2378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.388;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=53;PP=1964;ReadPosRankSum=1.186;SC=GACCCAATCTACTCTCACAGT;SOR=2.476;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=17;TCR=53;TR=69;WE=89860794;WS=89860776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr15	89862341	rs2302084	A	G	8266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.570;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=143;PP=2965;ReadPosRankSum=1.124;SC=CTAAGGGACCAGAAACAGAGG;SOR=0.640;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=259;TCF=116;TCR=143;TR=258;WE=89862349;WS=89862331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,272:1.00:273
chr15	89862366	rs2246900	T	C	9434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=134;NR=136;PP=2965;ReadPosRankSum=1.047;SC=ACTTTGTCTTTCAGCATCTCA;SOR=0.253;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=272;TCF=134;TCR=138;TR=270;WE=89862374;WS=89862356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,282:1.00:283
chr15	89863928	rs2307449	T	G	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=392;SC=GAACAGATGGTAGTACTAAAG;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=89863936;WS=89863918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	89864316	rs2307433	G	GCTAC	5573.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.09;NF=38;NR=49;PP=2957;SC=CTGTCAATATGCTGAGGGGCT;SOR=0.848;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=98;TCF=44;TCR=54;TR=87;WE=89864324;WS=89864306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr15	89866954	rs2072266	A	G	285.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=3;PP=145;SC=CTTAAGACCTAGGGAACTCTG;SOR=0.892;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=89866962;WS=89866944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	89867154	rs2072267	A	G	3104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=58;PP=2324;SC=CAAGGACCAAAGTAGTGAAGC;SOR=1.284;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=37;TCR=58;TR=95;WE=89867162;WS=89867144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr15	89869768	rs3176183	A	AC	131.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=205;ReadPosRankSum=0.706;SC=CTGTGCCAGAACCCAGACCAG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=7;WE=89869776;WS=89869758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr15	89871499	rs3176174	T	C	2844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=1;PP=2359;ReadPosRankSum=-0.790;SC=GCCCTCCCCTTCAGGGCCTCT;SOR=6.043;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=80;TCF=79;TCR=1;TR=79;WE=89871507;WS=89871489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,82:0.99:83
chr15	89876236	rs2283430	C	A	2533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=0;PP=2132;SC=AGCACCCAGCCCGTAACAGGA;SOR=8.688;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=76;TCF=76;TCR=0;TR=76;WE=89876244;WS=89876226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr15	90022837	rs2289352	C	T	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=224;ReadPosRankSum=0.138;SC=CAGCTGTTTCCACCTCTGCAG;SOR=0.610;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=11;WE=90022845;WS=90022827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
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chr15	90029836	.	T	A	455	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=27;MQ=46.63;NF=1;NR=20;PP=455;QD=23.3224386927;SC=AGAGAGTGTGTGTGTGTGTGT;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=57;TCF=7;TCR=50;TR=21;WE=90029844;WS=90029826;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:36,21:0.37:57
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chr15	90128966	rs11629584	C	T	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.698;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=622;ReadPosRankSum=0.751;SC=TGGTGAAGGCCGGCCCCCCAT;SOR=0.819;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=125;TCF=64;TCR=61;TR=37;WE=90128974;WS=90128956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,41:0.31:134
chr15	90129188	rs1540504	T	C	1503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=43;PP=1296;SC=GCTCCTAAACTAGTAACTAAC;SOR=4.271;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=4;TCR=43;TR=47;WE=90129196;WS=90129178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr15	90129227	rs1540503	A	C	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=27;PP=795;SC=CAGTCTTTTCAAGCATCGGGA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=90129235;WS=90129217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	90135172	rs35892197	C	T	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.030;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=349;ReadPosRankSum=1.590;SC=CTTTGTATGTCCTTTGGAGGG;SOR=0.094;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=16;WE=90135180;WS=90135162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr15	90135196	rs8041127	A	G	1617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=0;PP=1396;SC=CAGTCAGTCCAGGGGAGGAGC;SOR=8.121;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=56;TCR=0;TR=56;WE=90135204;WS=90135186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	90135432	rs34494298	A	G	3659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=92;PP=2965;SC=TATCTCTTGAATATTGATTAT;SOR=3.671;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=13;TCR=93;TR=105;WE=90135440;WS=90135422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr15	90138670	rs8042146	C	T	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=7;PP=751;SC=ATACCATGTGCCGTTCCTTAA;SOR=1.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=27;WE=90138678;WS=90138660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	90138926	rs16974170	A	G	176.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=130;ReadPosRankSum=-0.674;SC=TTTATTGACTATCTGCTACAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=90138934;WS=90138916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr15	90144851	rs4932233	T	C	2410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=44;PP=2023;SC=TCAAAACCTATGTATGGTGTT;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=34;TCR=44;TR=78;WE=90144859;WS=90144841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr15	90144894	rs4932234	T	C	2894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=27;PP=2334;SC=AGGACTACTTTTTAGGCTGGG;SOR=1.554;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=51;TCR=27;TR=78;WE=90144902;WS=90144884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr15	90144944	rs4244876	G	A	4508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=34;PP=2965;SC=TAACTGTTCCGTATTCGATCA;SOR=2.186;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=135;TCF=101;TCR=34;TR=134;WE=90144952;WS=90144934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr15	90159575	rs56036125	T	C	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=20;PP=1401;ReadPosRankSum=-0.355;SC=CCCTTGGCCTTACTGCTGCTT;SOR=0.660;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=68;TCR=31;TR=63;WE=90159583;WS=90159565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,63:0.64:99
chr15	90161355	rs2289486	G	A	6778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=150;NR=52;PP=2965;SC=GTGGTATGGAGTAATCCTTGT;SOR=2.214;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=202;TCF=150;TCR=52;TR=202;WE=90161363;WS=90161345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr15	90168108	rs894157	C	T	2924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=54;PP=2343;SC=GATGCCTTCCCGTGACGTGCA;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=36;TCR=54;TR=90;WE=90168116;WS=90168098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr15	90168693	rs1866928	T	A	3292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.609;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=62;PP=2583;ReadPosRankSum=0.258;SC=ACTGCTTGAGTCAGAGGGCAA;SOR=0.728;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=171;TCF=82;TCR=89;TR=117;WE=90168701;WS=90168683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,120:0.69:173
chr15	90168873	rs117395022	T	C	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.540;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=701;ReadPosRankSum=0.808;SC=GAGAGTCCTGTTGGCCAAGGA;SOR=0.477;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=113;TCF=47;TCR=66;TR=37;WE=90168881;WS=90168863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,40:0.34:117
chr15	90169331	rs55653159	A	G	2080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.493;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=54;PP=1647;ReadPosRankSum=1.282;SC=TTCCTGTGACAGACTGTCTGA;SOR=1.003;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=124;TCF=43;TCR=81;TR=79;WE=90169339;WS=90169321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,81:0.63:128
chr15	90170237	rs3743372	C	T	1427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.379;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=38;PP=1227;ReadPosRankSum=0.090;SC=TCCTTTCAGTCGCGCTTTCTC;SOR=1.206;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=80;TCF=26;TCR=54;TR=54;WE=90170245;WS=90170227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,54:0.66:82
chr15	90172133	rs12914042	C	G	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.899;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=613;ReadPosRankSum=1.360;SC=AATAAAGGCTCGAGGGAGAGT;SOR=0.861;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=81;TCF=54;TCR=27;TR=31;WE=90172141;WS=90172123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,32:0.39:83
chr15	90172419	rs143394914	GGGGTGGGGGCTGTGGGCTGGGT	G	199.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.16;ReadPosRankSum=1.242;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
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chr15	90172834	rs72750748	T	G	3248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.507;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=74;PP=2517;ReadPosRankSum=-0.380;SC=GGCTCAGCCCTCATCATGACC;SOR=0.736;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=216;TCF=93;TCR=123;TR=129;WE=90172842;WS=90172824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,132:0.61:218
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chr15	90177157	rs894156	C	T	2191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.427;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=53;PP=2962;ReadPosRankSum=1.045;SC=ACGGGGCTACCGCGAGCCTGC;SOR=0.342;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=107;TCF=29;TCR=78;TR=77;WE=90177167;WS=90177147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,81:0.72:113
chr15	90177159	rs11633151	C	T	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.995;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=1114;ReadPosRankSum=-0.676;SC=GGGGCTACCGCGAGCCTGCCA;SOR=0.987;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=98;TCF=27;TCR=71;TR=26;WE=90177167;WS=90177147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,28:0.27:104
chr15	90188514	rs894159	A	G	3349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=21;PP=2505;SC=GCTGGCCCAGAACCGTGGAGG;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=75;TCR=21;TR=96;WE=90188522;WS=90188504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr15	90190048	rs1110060	A	G	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.420;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=137;ReadPosRankSum=-0.961;SC=ACCCAGCCTCACCCTCTTCTC;SOR=0.407;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=9;WE=90190056;WS=90190038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr15	90191827	rs8037349	T	C	3623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=19;PP=2965;SC=CCGCTCGCCGTCTCTTCGGGT;SOR=3.139;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=113;TCF=93;TCR=20;TR=112;WE=90191835;WS=90191817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr15	90192905	rs4932240	T	C	2371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=3;PP=1941;SC=AGGTAAGCACTCCACTCCAAA;SOR=5.699;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=68;TCF=65;TCR=3;TR=68;WE=90192913;WS=90192895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr15	90195712	rs11634571	G	A	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=184;ReadPosRankSum=-0.968;SC=CTAGGAAATCGACTCTTCCTC;SOR=0.522;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=12;WE=90195720;WS=90195702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr15	90195765	rs11630003	AA	GG	4143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=15;PP=2947;SC=GCAAGAGGACAAGGCAGAAAT;SOR=2.885;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=69;TCR=16;TR=80;WE=90195774;WS=90195755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr15	90195967	rs8179066	C	G	2308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=48;PP=1735;SC=CCTCCTGCCCCGCATCCTCGG;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=22;TCR=48;TR=70;WE=90195975;WS=90195957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr15	90196008	rs8179065	C	T	986.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.194;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=672;ReadPosRankSum=0.064;SC=AAGTGTCGGTCACGGCCCAGA;SOR=0.417;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=34;WE=90196016;WS=90195998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,38:0.60:63
chr15	90208310	rs1052700	A	T	839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=674;SC=CTGGGAGCCTAGATCATCAGA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=90208318;WS=90208300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	90210257	rs2304796	G	A	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=6.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.45;ReadPosRankSum=0.979;SOR=1.591;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,16:0.29:55
chr15	90210263	rs2304795	A	G	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=3.895;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.09;ReadPosRankSum=0.942;SOR=1.128;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,18:0.29:62
chr15	90211047	rs894162	A	T	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=37;PP=1127;SC=GGCAGCAGATAGCTGGCTCAA;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=38;WE=90211055;WS=90211037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	90213134	rs2304794	T	A	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=8;PP=918;SC=CAGTGGCTGGTTGAGCCACCT;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=90213142;WS=90213124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	90213229	rs6496589	G	C	2653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=30;PP=2287;SC=TCCTTGTCTGGAGGGAGGAGG;SOR=1.468;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=51;TCR=30;TR=81;WE=90213237;WS=90213219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr15	90214948	rs1077903	C	A	1308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=36;PP=1068;SC=TGCCCTCTTTCGCCCTTGTCT;SOR=5.084;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=37;WE=90214956;WS=90214938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr15	90226947	rs7169981	C	A	1882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.670;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=42;PP=1467;ReadPosRankSum=-0.484;SC=GATCCCTGACCAGGCTCAGCA;SOR=0.446;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=109;TCF=34;TCR=75;TR=64;WE=90226955;WS=90226937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,67:0.59:114
chr15	90233969	rs8029037	G	C	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=107;ReadPosRankSum=1.383;SC=CGCTGAGGGGGAGGGGCTGAG;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=7;WE=90233977;WS=90233959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr15	90248819	rs17238056	A	T	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.087;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=16;PP=415;ReadPosRankSum=0.482;SC=ATAAGGAAGGACTTTACCTAG;SOR=0.517;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=63;TCF=18;TCR=45;TR=23;WE=90248827;WS=90248809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,23:0.36:64
chr15	90258144	rs17238390	C	G	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.300;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=82;ReadPosRankSum=0.094;SC=AGAAGACAGGCCATTTCTCAG;SOR=0.017;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=8;WE=90258152;WS=90258134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr15	90273040	rs16943559	C	G	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=7;PP=162;ReadPosRankSum=-1.017;SC=AAGCTCAGGACTTGCAGACAT;SOR=0.801;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=11;WE=90273048;WS=90273030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
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chr15	90274639	rs5814401	T	TG	738.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=662;ReadPosRankSum=-2.002;SC=GTGCAGAGTCTGGGGGAACCG;SOR=0.664;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=70;TCF=45;TCR=25;TR=24;WE=90274647;WS=90274629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,30:0.39:77
chr15	90293776	rs2305441	A	C	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=4.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.01;ReadPosRankSum=0.615;SOR=1.057;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,13:0.21:63
chr15	90293794	rs2305440	G	C	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=7.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.42;ReadPosRankSum=0.549;SOR=1.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,11:0.20:54
chr15	90320120	rs200021459	GAGGGGCAGGGGCAAGGGCAGGGGC	G	955.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.614;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.093;NF=12;NR=4;PP=1598;ReadPosRankSum=-0.175;SC=GACGCAGGCGGAGGGGCAGGG;SOR=0.109;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=16;WE=90320154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,25:0.71:35
chr15	90320134	rs199821487	AGGGCAGGGGCAG	A	228.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=6.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.21;MQRankSum=-1.902;QD=6.18;ReadPosRankSum=-0.475;SOR=2.070;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,10:0.27:37
chr15	90320146	.	G	A	642	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=63.43;NF=8;NR=0;PP=642;QD=84.5964015684;SC=GGCAGGGGCAGGGGCAGGGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=8;WE=90320154;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:28,8:0.22:36
chr15	90328551	rs10584	G	C	4612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=22;PP=2965;SC=CACCTTGCATGGGGGCCGGGT;SOR=3.242;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=119;TCR=22;TR=141;WE=90328559;WS=90328541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr15	90328774	rs71464487	A	AAC	3183.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=58;PP=2930;SC=CTGGGTCCCTAACAGCCTTGA;SOR=2.932;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=9;TCR=63;TR=66;WE=90328782;WS=90328764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr15	90333851	rs17239917	G	A	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.096;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=462;ReadPosRankSum=-0.702;SC=TGGGTAGGGAGCCATGATTAT;SOR=1.328;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=74;TCF=17;TCR=57;TR=24;WE=90333859;WS=90333841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,25:0.34:74
chr15	90340666	rs3214806	C	CT	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=131;ReadPosRankSum=0.038;SC=GGCAATCTTTCTTTTTTTTTG;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=10;WE=90340674;WS=90340656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr15	90340719	rs893615	G	A	2270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.42;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	90340725	rs3934	A	C	2406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.98;SOR=3.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr15	90344352	rs8192297	T	C	822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=678;ReadPosRankSum=1.032;SC=CTCTTACATCTATCAGCCAGT;SOR=0.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=21;TCR=39;TR=28;WE=90344360;WS=90344342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,30:0.48:62
chr15	90347429	.	G	A	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.692;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=666;ReadPosRankSum=0.706;SC=GACTTGCGCCGTCTCCTCTCG;SOR=1.154;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=32;WE=90347437;WS=90347419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr15	90349558	rs25653	C	T	3476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=57;PP=2875;ReadPosRankSum=1.411;SC=CAGCGTCACCCGGTAGGAATC;SOR=0.740;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=175;TCF=90;TCR=85;TR=120;WE=90349566;WS=90349548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,123:0.68:180
chr15	90393949	rs11435035	C	CT	263.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=19;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=1;NR=12;PP=218;SC=TGATTTTTTTCTTTTTTTTTT;SOR=2.833;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=13;WE=90393957;WS=90393939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	90414642	rs3759831	C	G	3175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=25;PP=2569;SC=GAGGTGGCTACAGATGCCCAA;SOR=2.069;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=66;TCR=25;TR=91;WE=90414650;WS=90414632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr15	90420673	rs12440156	G	A	3205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=92;PP=2656;SC=TAAAATACACGTAACATAAAA;SOR=6.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=95;TCF=3;TCR=92;TR=95;WE=90420681;WS=90420663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr15	90437301	rs3784388	C	T	3415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=96;PP=2844;SC=TTGGCCCCGGCGCTCACGAGC;SOR=4.017;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=11;TCR=96;TR=107;WE=90437309;WS=90437291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr15	90446402	rs377353674	C	T	4675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=61;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.319;SC=CAGTATGTACCATGCTCCTGC;SOR=0.658;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=240;TCF=151;TCR=89;TR=166;WE=90446410;WS=90446392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,169:0.69:245
chr15	90454119	rs139739395	CTATTTACCCAGCCCTGAGAAGGCTGGG	C	2160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.087;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.246;NF=6;NR=11;PP=2915;ReadPosRankSum=0.121;SC=CCCGTGTCTCCTATTTACCCA;SOR=0.283;SbPval=0.06;Source=Platypus;TC=54;TCF=9;TCR=45;TR=17;WE=90454153;WS=90454109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,56:0.57:98
chr15	90623052	rs2970357	T	C	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.245;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=109;ReadPosRankSum=0.618;SC=CCTACTACAATGTGCTATAGC;SOR=0.178;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=49;TCF=7;TCR=42;TR=14;WE=90623060;WS=90623042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,14:0.27:51
chr15	90627616	rs60147683	T	C	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.068;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=305;ReadPosRankSum=1.126;SC=ACATCAGGGGTGGCTCCAGGC;SOR=0.906;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=21;WE=90627624;WS=90627606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,21:0.31:68
chr15	90634684	rs11316815	CG	C	1235.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.616;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=3;PP=1005;ReadPosRankSum=-0.633;SC=ACCAGGACAACGGGGGGGTCC;SOR=0.167;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=87;TCF=84;TCR=3;TR=45;WE=90634692;WS=90634674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,48:0.65:74
chr15	90634941	rs10852126	A	G	2756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=78;PP=2279;SC=CTCTCCTCCCAGCCAGGCCCG;SOR=6.618;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=80;TCF=2;TCR=78;TR=80;WE=90634949;WS=90634931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr15	90766754	rs908048	A	G	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=525;SC=ATGGCTCAGCATGTGCCTAAG;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=90766762;WS=90766744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr15	90768959	rs908044	A	C	2257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=24;PP=1790;ReadPosRankSum=-0.712;SC=CAGCCTGTACAGGAGCTGTGG;SOR=0.674;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=52;TCR=24;TR=75;WE=90768967;WS=90768949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,75:0.99:76
chr15	90771750	rs3751655	T	G	5744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=86;NR=98;PP=2965;SC=CCCCCCGGGGTCCCGAGTCTT;SOR=0.783;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=184;TCF=86;TCR=98;TR=184;WE=90771758;WS=90771740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr15	90774670	.	C	G	2128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.187;ClippingRankSum=0.000;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.702;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=52;PP=1674;ReadPosRankSum=1.447;SC=AGGAAGTCCTCAAAGCTAAGG;SOR=0.949;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=113;TCF=36;TCR=77;TR=74;WE=90774678;WS=90774660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,75:0.65:116
chr15	90775643	rs4451921	G	A	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.141;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=33;PP=970;ReadPosRankSum=-0.154;SC=GCTGCTCATTGTCAACCAGGT;SOR=1.436;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=65;TCF=22;TCR=43;TR=48;WE=90775651;WS=90775633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,49:0.73:67
chr15	90776984	rs8025610	G	C	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=1.427;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.90;ReadPosRankSum=1.805;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,29:0.67:43
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chr15	90784207	rs7166441	A	G	3671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=64;PP=2808;SC=GGACTGGGGCAGGCAAACCAT;SOR=0.810;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=120;TCF=56;TCR=64;TR=120;WE=90784215;WS=90784197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr15	90784250	rs7171194	T	C	2297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.399;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=54;PP=1702;ReadPosRankSum=0.057;SC=AAGGATCTCATGGCAGAAGGG;SOR=0.968;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=132;TCF=57;TCR=75;TR=91;WE=90784258;WS=90784240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,94:0.69:136
chr15	90784930	rs10152994	C	A	2982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.009;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=24;PP=2296;ReadPosRankSum=1.201;SC=TGGGCCAGGGCCTGACTTGGA;SOR=1.598;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=142;TCF=101;TCR=41;TR=98;WE=90784938;WS=90784920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,105:0.70:149
chr15	90785060	rs10153004	C	T	3996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.806;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=63;PP=2962;ReadPosRankSum=0.433;SC=TCAGCCCTCACAGGGGTCCGA;SOR=0.565;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=206;TCF=114;TCR=92;TR=138;WE=90785068;WS=90785050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,145:0.68:213
chr15	90794757	rs4357917	T	G	3662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.563;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=73;PP=2861;ReadPosRankSum=1.928;SC=CTCCCACTCTTCCTGATTTAT;SOR=0.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=188;TCF=81;TCR=107;TR=127;WE=90794765;WS=90794747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,134:0.68:198
chr15	90794923	.	C	A	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.094;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=101;ReadPosRankSum=0.524;SC=GGCTTCCAGCCCCTGGGGCCT;SOR=0.191;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=9;WE=90794931;WS=90794913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr15	90801059	rs55674131	A	T	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=233;ReadPosRankSum=-0.580;SC=GCCCAGGGAAACTCAGCCTTT;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=11;WE=90801067;WS=90801049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr15	90802227	rs67188155	G	T	1020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.229;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=38;PP=919;ReadPosRankSum=-0.978;SC=TCCTTTAGATGAAGAATGTGG;SOR=2.016;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=71;TCF=7;TCR=64;TR=40;WE=90802235;WS=90802217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,38:0.54:71
chr15	90805084	rs12592600	A	G	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=508;ReadPosRankSum=-1.162;SC=ATGTGGGGCTAGCCAAAGATG;SOR=1.308;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=21;WE=90805092;WS=90805076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr15	90809586	rs148744537	T	G	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.446;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=709;ReadPosRankSum=2.169;SC=AGGCGCCTGGTGCCCCGCCCA;SOR=0.309;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=129;TCF=91;TCR=38;TR=44;WE=90809594;WS=90809576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,44:0.33:134
chr15	90809633	rs9635390	G	A	5295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=79;PP=2965;SC=CAGATACGGTGAGACTCAGGA;SOR=0.851;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=88;TCR=79;TR=166;WE=90809641;WS=90809623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr15	90818400	rs4533265	A	T	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.478;NF=14;NR=2;PP=303;ReadPosRankSum=1.940;SC=CTGCCGCTGGATCCTGACCCT;SOR=0.770;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=16;WE=90818408;WS=90818390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr15	90902336	rs11630434	C	T	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=38.14;MQRankSum=4.229;QD=17.34;ReadPosRankSum=0.217;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr15	90903311	rs2589957	A	G	2451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.700;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=28;PP=1920;ReadPosRankSum=-1.983;SC=AATCAGGACAATTCTGAAACA;SOR=1.341;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=123;TCF=80;TCR=43;TR=90;WE=90903319;WS=90903301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,91:0.73:125
chr15	90903502	rs11854320	G	A	2024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-5.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=29;PP=1543;ReadPosRankSum=0.157;SC=GGATGGATATGTAGGAGAGAA;SOR=0.607;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=94;TCF=55;TCR=39;TR=68;WE=90903510;WS=90903492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,76:0.74:103
chr15	90905980	rs71461870	TACACACACAC	T	274.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.405;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.967;NF=0;NR=6;PP=988;ReadPosRankSum=0.817;SC=GATCTAAAAATACACACACAC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=90905997;WS=90905970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr15	90931457	rs2589941	C	T	802.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.255;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=0;PP=654;ReadPosRankSum=-0.192;SC=GCTGACGGCACGGGGCGGGGC;SOR=3.816;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=29;WE=90931465;WS=90931447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,29:0.76:38
chr15	90969335	rs2256388	G	T	1698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.769;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=30;PP=1197;ReadPosRankSum=1.370;SC=TCTCTCCTTTGGTGCAGGTGG;SOR=0.788;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=103;TCF=56;TCR=47;TR=67;WE=90969343;WS=90969325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,67:0.66:102
chr15	90982482	rs7177137	A	T	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=6.532;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=145;ReadPosRankSum=0.812;SC=TCTATTTTATACTTCATGCTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=90982490;WS=90982472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr15	90982756	rs6496675	C	T	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.460;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=30;PP=724;ReadPosRankSum=0.009;SC=GAAAAAAATACGAATAACTTG;SOR=2.034;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=52;TCF=8;TCR=44;TR=34;WE=90982764;WS=90982746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,35:0.65:54
chr15	91009484	rs2074585	G	A	3413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.473;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=46;PP=2716;ReadPosRankSum=0.469;SC=TCTGGTAACAGTTCTTTCCCG;SOR=1.281;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=180;TCF=104;TCR=76;TR=123;WE=91009492;WS=91009474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,126:0.68:185
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chr15	91026477	rs8040585	T	C	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.79;ReadPosRankSum=0.326;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
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chr15	91034559	rs6496679	C	G	1501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.276;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=9;PP=1287;ReadPosRankSum=1.104;SC=TTTTTCCCATCCGTAGGAAGC;SOR=1.129;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=70;TCF=56;TCR=14;TR=48;WE=91034567;WS=91034549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,49:0.70:70
chr15	91040725	rs2301832	A	T	863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-5.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.164;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=31;PP=714;ReadPosRankSum=-1.888;SC=TGAGGGTTTCAGCATGTCTGG;SOR=0.148;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=70;TCF=6;TCR=64;TR=35;WE=91040733;WS=91040715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr15	91043192	rs72311245	ATGTTTTGTTT	A,ATGTTTTGTTTTGTTT	1126.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=15,15;NR=0,0;PP=2125,1448;SC=AACTGTCAAAATGTTTTGTTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=15,15;WE=91043209;WS=91043182;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.39,0.61:28
chr15	91083353	rs8033595	G	A	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.262;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=18;PP=686;ReadPosRankSum=-0.778;SC=CTGCGGAGCAGTGCGTCAGAG;SOR=0.648;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=133;TCF=53;TCR=80;TR=41;WE=91083361;WS=91083343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,41:0.29:139
chr15	91141810	rs7180867	A	C	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=593;SC=AGATCCTAACATGAGTGTCTT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=91141818;WS=91141800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	91160996	rs111569950	C	CA	235.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=304;ReadPosRankSum=1.362;SC=CTCCTGGGCTCAAGCGATCCT;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=11;WE=91161004;WS=91160986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr15	91181567	rs6496717	C	T	962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=1;PP=823;SC=CACAGAACACCGCGGTGAGGA;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=91181575;WS=91181557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr15	91294897	rs7183841	T	C	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.628;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=159;ReadPosRankSum=-0.816;SC=AGAGGATCCATACAAAGTGGT;SOR=0.064;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=11;WE=91294905;WS=91294887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr15	91312313	rs17273206	G	A	2636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-5.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.571;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=16;PP=2099;ReadPosRankSum=0.009;SC=ACAGAATCATGAGGTGATGTG;SOR=1.346;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=162;TCF=132;TCR=30;TR=99;WE=91312321;WS=91312303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,101:0.59:171
chr15	91312823	rs3815003	T	C	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.913;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=39;PP=730;ReadPosRankSum=0.081;SC=AGGTGTAAGTTGTTGCACGTC;SOR=1.877;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=56;TCF=2;TCR=54;TR=40;WE=91312831;WS=91312813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,40:0.70:57
chr15	91337479	rs2227933	G	A	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.429;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=20;PP=911;ReadPosRankSum=-1.165;SC=AAAATATAACGGAATGCAGGA;SOR=0.444;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=28;TCR=28;TR=42;WE=91337487;WS=91337469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,42:0.75:56
chr15	91337623	rs3214113	AT	A	128.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.30;ReadPosRankSum=0.282;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr15	91341599	rs17273842	T	G	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=20;PP=479;ReadPosRankSum=-0.869;SC=TTTGAGTTACTTCAATTGAAA;SOR=1.035;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=36;TCF=8;TCR=28;TR=26;WE=91341607;WS=91341589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,27:0.77:35
chr15	91346923	rs2227934	C	A	1085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.955;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=35;PP=891;ReadPosRankSum=1.167;SC=GAAATAAAGCCCAAACTGTAC;SOR=1.443;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=66;TCF=9;TCR=57;TR=40;WE=91346931;WS=91346913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,41:0.59:70
chr15	91354505	rs1063147	C	T	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=1;PP=724;ReadPosRankSum=0.233;SC=CTGAGGAGCTCGACGAGGAAA;SOR=0.756;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=30;WE=91354513;WS=91354495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,34:0.69:49
chr15	91358271	rs10685387	G	GGAA	1697.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.795;NF=36;NR=2;PP=1630;ReadPosRankSum=-2.011;SC=CAGGTTGAGAGGAAGGTCATT;SOR=0.814;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=71;TCF=68;TCR=3;TR=38;WE=91358279;WS=91358261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,38:0.63:60
chr15	91419432	rs11372849	T	TC	2127.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=9;PP=2446;SC=GTCCCCCGCCTCCCGGGGACT;SOR=3.511;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=65;TCF=56;TCR=9;TR=59;WE=91419440;WS=91419422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr15	91420412	rs61752828	G	A	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.458;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=27;PP=904;ReadPosRankSum=1.422;SC=CTGACCCCCAGCCTCGGTACA;SOR=0.171;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=78;TCF=26;TCR=52;TR=46;WE=91420420;WS=91420402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,45:0.59:76
chr15	91420940	rs2071410	C	G	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=15;PP=564;SC=GCCACTTTCCCACTGTGGATC;SOR=1.519;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=23;WE=91420948;WS=91420930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	91420973	rs1573643	T	C	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=10;PP=261;SC=GGCTGTTCCATGGAGGGTTCC;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=91420981;WS=91420963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr15	91421283	rs1573644	T	C	729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=640;SC=GGTGCAGGGCTGGGTGTGCTC;SOR=6.273;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=91421291;WS=91421273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr15	91422543	rs8039305	T	C	1823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=1;PP=1530;SC=AGCTGGGACCTGGGGTTCTTG;SOR=6.593;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=54;TCF=53;TCR=1;TR=53;WE=91422551;WS=91422533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	91423543	rs6224	G	T	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=15;PP=502;SC=CAGCGCCGCCGCCTCTCACAG;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=91423551;WS=91423533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr15	91424574	rs6226	G	C	6369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=129;NR=75;PP=2965;SC=GCCCTCCAGGGTTCGCCCCCC;SOR=1.333;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=204;TCF=129;TCR=75;TR=204;WE=91424582;WS=91424564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr15	91425232	rs6227	C	T	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=8;PP=261;SC=GTGGAGACTGCTTCCCATCCT;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=91425240;WS=91425222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr15	91425280	rs182592330	G	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=52;ReadPosRankSum=0.825;SC=GTGGGCCCAGGACCAGCTGGG;SOR=0.078;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=91425288;WS=91425270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr15	91428521	rs11330240	CT	C	5868.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.565;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.223;NF=48;NR=80;PP=2957;ReadPosRankSum=1.432;SC=TGGGTGCTGGCTGTATCTGCC;SOR=0.646;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=133;TCF=51;TCR=82;TR=128;WE=91428529;WS=91428511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,149:0.99:150
chr15	91428955	rs1894400	C	T	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=21;PP=569;SC=AACCTTGATGCAGCTTCCTCT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=91428963;WS=91428945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr15	91430436	rs2071383	T	C	7051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=85;NR=131;PP=2965;SC=GTGACAAGGCTAAGGACAAGT;SOR=1.220;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=218;TCF=85;TCR=133;TR=216;WE=91430444;WS=91430426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr15	91483531	rs17593423	C	T	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.372;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=348;ReadPosRankSum=-0.280;SC=CTTCCTTTGACGCAGGCTTCT;SOR=0.250;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=20;WE=91483539;WS=91483521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr15	91524841	rs7172758	G	T	5467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=96;PP=2965;SC=GTGGTCTAATGCTTCCATACA;SOR=1.158;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=162;TCF=66;TCR=96;TR=162;WE=91524849;WS=91524831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr15	91557186	rs1972926	C	T	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=4.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=194;ReadPosRankSum=0.262;SC=CAGTGGTTCACGCCTGTAATC;SOR=0.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=11;WE=91557194;WS=91557176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr15	91560367	rs11857433	G	T	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=267;ReadPosRankSum=-0.658;SC=ATTATTGAGGGCTTCCTAATT;SOR=0.502;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=63;TCF=8;TCR=55;TR=18;WE=91560375;WS=91560357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,20:0.31:64
chr15	91561182	rs3743445	C	T	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-5.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=213;ReadPosRankSum=-0.953;SC=AGAAGTGGCCCAGCCACCCAT;SOR=0.794;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=63;TCF=8;TCR=55;TR=16;WE=91561190;WS=91561172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,20:0.28:72
chr15	92397106	.	A	AGCG	821.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.994;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.819;NF=19;NR=1;PP=851;ReadPosRankSum=2.080;SC=GGAAAGCGGCAGCGGCGGCGG;SOR=2.689;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=49;TCF=40;TCR=9;TR=20;WE=92397114;WS=92397096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr15	92432263	rs35188337	CA	C	93.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQRankSum=-0.615;QD=7.21;ReadPosRankSum=1.709;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr15	92459187	rs4077721	T	C	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=1;PP=1306;SC=GGCATCTTCTTGGATTGGCTC;SOR=6.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=44;WE=92459195;WS=92459177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	92647645	rs1517618	G	C	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.500;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=23;PP=734;ReadPosRankSum=1.015;SC=CGCACTCAGAGCCCGCCATGG;SOR=1.012;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=131;TCF=58;TCR=73;TR=38;WE=92647653;WS=92647635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,38:0.29:132
chr15	92647834	rs917355	A	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=78;ReadPosRankSum=-0.140;SC=GGGGTGATGAATGAAGGGGTG;SOR=0.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=7;WE=92647842;WS=92647824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr15	92663630	rs6496893	A	G	1638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=8;PP=1394;ReadPosRankSum=-1.823;SC=AGGAGCAGGGAGCTATAAGAT;SOR=0.565;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=88;TCF=77;TCR=11;TR=60;WE=92663638;WS=92663620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,58:0.67:86
chr15	92669184	rs8033892	G	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.557;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=187;ReadPosRankSum=-0.118;SC=CACCACAGTGGGGTCATAGGG;SOR=0.065;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=12;WE=92669192;WS=92669174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,15:0.38:40
chr15	92714879	rs2240589	C	T	1587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=5;PP=1267;SC=CACTTTATTGCTTTGACTGCC;SOR=4.091;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=43;TCR=5;TR=48;WE=92714887;WS=92714869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	92715131	rs2270061	A	T	1652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=47;PP=1361;SC=AGAACAGCCCACCACCACCCA;SOR=6.439;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=48;WE=92715139;WS=92715121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	92715167	rs2270060	C	T	1085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=31;PP=833;SC=TCACTTAGCGCGCTCCTCCCT;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=92715175;WS=92715157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	92937268	rs3743365	G	T	4579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.46;SOR=6.459;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr15	92937276	rs3743364	C	T	4706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.70;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr15	92977670	rs2242113	T	G	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=28;PP=782;SC=GCAAATTGCTTCTCTTCGTCA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=92977678;WS=92977660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	92987938	rs2305561	C	G	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=2.128;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.176;SOR=0.526;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:135,49:0.27:184
chr15	92988165	rs11637874	C	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.058;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=144;ReadPosRankSum=1.086;SC=CGCGGGTGAGCGGCCTCCCTA;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=9;WE=92988173;WS=92988155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,9:0.24:38
chr15	93007302	rs11399611	C	CT	106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=43.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQRankSum=-1.948;QD=4.27;ReadPosRankSum=2.199;SOR=4.031;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr15	93015427	rs1455773	G	A	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.270;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=370;ReadPosRankSum=-0.411;SC=CTTGCACCCGGCTGACCCCCA;SOR=0.427;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=62;TCF=49;TCR=13;TR=21;WE=93015435;WS=93015417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,22:0.33:66
chr15	93016128	rs13380006	C	T	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.825;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=458;ReadPosRankSum=2.857;SC=CACTGCACTGCTGTTTCTGTG;SOR=1.238;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=72;TCF=66;TCR=6;TR=25;WE=93016136;WS=93016118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,24:0.32:74
chr15	93198671	rs501381	A	G	2035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=41;PP=1544;SC=AGGCGTCGCCACTGCTGTTGG;SOR=1.329;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=26;TCR=42;TR=67;WE=93198691;WS=93198661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr15	93198678	rs68056278	TTGGAGC	T	2497.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=12;NR=30;PP=2303;SC=GCCACTGCTGTTGGAGCTGGA;SOR=1.453;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=42;WE=93198691;WS=93198661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr15	93198784	rs2438194	A	G	932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=26;PP=789;SC=GGTTCGGGCCACGGCGCGGAG;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=93198792;WS=93198774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr15	93306348	rs8032507	C	T	1852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=38;PP=1465;SC=TGCTATGTGCCCACAAAAATT;SOR=1.355;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=59;WE=93306356;WS=93306338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	93306367	rs10636472	G	GA	1388.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=41;PP=1004;SC=TTAGAAATTAGAAAAAAAAAG;SOR=2.970;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=55;TCF=8;TCR=47;TR=46;WE=93306375;WS=93306357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr15	93306403	.	T	TTTTC	845.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.62;QD=35.24;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	93306602	rs11634113	T	C	331.78	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.69;QD=41.47;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	93306603	rs11637549	G	A	331.78	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.69;QD=41.47;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr15	93306644	rs28493166	G	A	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=49;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=344;SC=CTCGTGATCCGCCCACCTTGG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=93306652;WS=93306634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr15	93306681	rs12594947	G	A	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.50;QD=43.73;SOR=3.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr15	93306688	rs12910258	G	A	1380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.26;QD=43.15;SOR=3.545;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr15	93339279	rs77582277	C	G	2191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.839;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=32;PP=1635;ReadPosRankSum=1.068;SC=TGGCATCCCCCGTCCATGAAG;SOR=0.481;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=103;TCF=66;TCR=37;TR=81;WE=93339287;WS=93339269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,88:0.76:116
chr15	93447631	rs1439619	T	G	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=240;ReadPosRankSum=0.532;SC=ACGGCTCCCCTGGGGGGCGGG;SOR=0.582;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=16;WE=93447639;WS=93447621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr15	93487854	rs1320819	G	C	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.099;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=92;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTAGACACGTGCTAGGTTTAT;SOR=0.142;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=8;WE=93487862;WS=93487844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr15	93496874	rs1371390	C	T	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=678;SC=TTAAAGCCTTCAGTAGATCAT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=93496882;WS=93496864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr15	93510603	rs4777755	A	G	2354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=18;PP=1946;SC=AGGGGAGAGAAAATGGCTACC;SOR=1.965;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=52;TCR=18;TR=70;WE=93510611;WS=93510593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr15	93510828	rs144172255	GT	G	58.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.58;MQRankSum=1.191;QD=3.09;ReadPosRankSum=1.714;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr15	93515798	.	G	GA	365.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.64;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	93515801	.	G	GTCTTAATTTTTACTTGCATGCCTTTAGGCTA	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.86;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr15	93521604	rs11074121	A	G	3087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=70;PP=2681;SC=GAATTGGTCAAAAGAAGCAGG;SOR=1.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=30;TCR=70;TR=100;WE=93521612;WS=93521594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr15	93521651	rs11074122	T	G	2175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=58;PP=1797;SC=GCTTTAGGGTTGGGGGCCAGG;SOR=3.578;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=9;TCR=59;TR=67;WE=93521659;WS=93521641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr15	93522312	rs2272461	G	A	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=2;PP=540;SC=CTCTTTTTTTGGGGGGGTTGG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=93522320;WS=93522302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr15	93527794	rs2272459	A	T	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=581;ReadPosRankSum=1.769;SC=AGAAGTGTTGATTATTCAAAG;SOR=1.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=24;WE=93527802;WS=93527784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr15	93536197	rs2272457	C	T	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=613;ReadPosRankSum=1.085;SC=TGCAGGAATACGAAGAGCAGC;SOR=0.968;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=33;WE=93536205;WS=93536187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,33:0.80:41
chr15	93540089	rs11630582	T	C	1972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.787;NF=52;NR=18;PP=1471;ReadPosRankSum=-0.519;SC=GCCAGAGATATATTCAGAGAG;SOR=0.676;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=71;TCR=25;TR=70;WE=93540097;WS=93540079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,75:0.76:99
chr15	93543956	rs12591124	G	A	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=177;ReadPosRankSum=0.619;SC=TCTGAAATGTGTTTGGTTTAC;SOR=0.175;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=11;WE=93543964;WS=93543946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,13:0.30:44
chr15	93552330	rs12915582	C	T	1874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=15;PP=1422;SC=ACAAGACTTACTTTCTGCAGA;SOR=2.226;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=57;WE=93552338;WS=93552320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr15	93555717	rs2119010	A	G	1191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.985;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=25;PP=897;ReadPosRankSum=-0.402;SC=ACAAATACCAATTCCACAGAA;SOR=0.520;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=68;TCF=29;TCR=39;TR=45;WE=93555725;WS=93555707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,45:0.66:68
chr15	93557954	rs56227200	G	C	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=472;ReadPosRankSum=-0.845;SC=GACGTGACTGGGGGTAAGAAA;SOR=0.883;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=68;TCF=67;TCR=1;TR=24;WE=93557962;WS=93557944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,24:0.36:66
chr15	93563164	.	C	CAA	182.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.402;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=2.225;NF=8;NR=1;PP=90;ReadPosRankSum=0.195;SC=ACTCCATCTCCAAAAAAAAAA;SOR=1.259;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=9;WE=93563172;WS=93563154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,8:0.31:26
chr15	93563661	rs964034	G	C	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=451;SC=GTTTTGTTTTGTGGGTCATAG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=93563669;WS=93563651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr15	93609460	rs11074135	A	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.299;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=343;ReadPosRankSum=0.562;SC=CGCTGCGCAGAAACTTCCTGG;SOR=1.029;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=67;TCF=56;TCR=11;TR=21;WE=93609468;WS=93609450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,22:0.31:72
chr15	93609617	rs4778090	A	G	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.450;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=377;ReadPosRankSum=-0.599;SC=GCGTGACTCCAGGTGGGGGAA;SOR=1.056;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=20;WE=93609625;WS=93609607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr15	93616283	rs112633977	A	AAGG	1000.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.870;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.028;NF=4;NR=19;PP=979;ReadPosRankSum=-0.703;SC=TTCAGAAAAAAAGAAGAAAAT;SOR=0.819;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=82;TCF=24;TCR=58;TR=23;WE=93616291;WS=93616273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,30:0.33:90
chr15	93616903	rs2091635	T	C	5918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=132;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.721;SC=CCGAGTTGTCTAGGTCTGGGC;SOR=0.733;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=288;TCF=104;TCR=184;TR=208;WE=93616911;WS=93616893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,208:0.72:289
chr15	93616933	rs55816698	C	G	1501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FS=1.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.08;ReadPosRankSum=-0.211;SOR=0.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:179,68:0.28:247
chr15	93616975	rs4598860	A	G	902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.57;ReadPosRankSum=1.074;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,44:0.27:162
chr15	93749883	rs17540247	G	A	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.943;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=410;ReadPosRankSum=-0.402;SC=TTTGGAAAACGGGACTTTGAA;SOR=0.232;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=90;TCF=13;TCR=77;TR=25;WE=93749891;WS=93749873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,27:0.29:93
chr15	93844616	rs12914371	T	A	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=1.198;SC=GACTTCTTAGTGGTAGCACCT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=5;WE=93844624;WS=93844613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr15	93844762	rs12909691	C	T	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.738;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=541;ReadPosRankSum=0.407;SC=TTCGTCCAACCTTTTGGATTG;SOR=0.255;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=63;TCF=52;TCR=11;TR=26;WE=93844770;WS=93844752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr15	93844836	rs34239935	G	A	1278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=1.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.75;ReadPosRankSum=-0.681;SOR=0.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,38:0.32:119
chr15	93844843	rs12914719	T	A	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.71;ReadPosRankSum=-0.874;SOR=0.848;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,40:0.32:124
chr15	93844947	rs41446745	G	T	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=288;ReadPosRankSum=-0.523;SC=ACAGTTCAAGGTCTCATTAAA;SOR=0.776;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=49;TCF=8;TCR=41;TR=14;WE=93844955;WS=93844937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,14:0.27:52
chr15	94304132	rs12905790	C	T	2430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=1;PP=1987;SC=TAAAATAAAACAGCTGAGATG;SOR=7.223;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=71;TCF=70;TCR=1;TR=71;WE=94304140;WS=94304122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr15	94304189	rs12910750	T	C	4763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=109;NR=32;PP=2965;SC=GGTGATTTAATTGAAGTCACC;SOR=2.398;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=109;TCR=32;TR=141;WE=94304197;WS=94304179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr15	94442477	rs7180479	G	A	1860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=10;PP=1569;ReadPosRankSum=-0.521;SC=CCACCGCGACGGGCCGCCATC;SOR=0.592;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=108;TCF=92;TCR=16;TR=66;WE=94442485;WS=94442467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,67:0.61:109
chr15	94857347	rs294553	T	A	92.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=64;ReadPosRankSum=0.524;SC=GGATGACACCTCTGCATCCAC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=4;WE=94857355;WS=94857337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr15	94857890	rs294552	G	A	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=270;ReadPosRankSum=-0.132;SC=CTTAGCCACAGGATCGATTAA;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=11;WE=94857898;WS=94857880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr15	94858980	rs8024196	G	A	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=579;ReadPosRankSum=-0.890;SC=GATAGACAGTGGCTCAAATCT;SOR=1.284;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=23;WE=94858988;WS=94858970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr15	94883599	rs10152496	T	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.437;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=138;ReadPosRankSum=-0.066;SC=ATGACAAAAATAACATATCTG;SOR=0.068;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=9;WE=94883607;WS=94883589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr15	94884108	rs8025851	G	C	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.217;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=3.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.583;SOR=1.454;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,25:0.25:102
chr15	94927237	rs56166130	T	C	2092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.080;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=12;PP=1581;ReadPosRankSum=-1.082;SC=CCGATGTGTATGTTATCTTTC;SOR=1.464;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=131;TCF=104;TCR=27;TR=75;WE=94927245;WS=94927227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,79:0.59:135
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chr15	94942497	rs2289009	T	C	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.432;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=102;ReadPosRankSum=0.367;SC=ATAGAGTATGTATACTGGTAA;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6;WE=94942505;WS=94942487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
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chr15	94945324	rs6497203	G	A	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=461;ReadPosRankSum=0.032;SC=ATATTACAGCGTAGGTGATTA;SOR=0.439;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=54;TCF=2;TCR=52;TR=24;WE=94945332;WS=94945314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr15	94945698	rs146859566	A	G	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=8.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.58;ReadPosRankSum=-1.146;SOR=1.370;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:147,53:0.26:200
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chr15	94986025	rs75281537	G	A	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.221;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=486;ReadPosRankSum=0.792;SC=TTAAGAGGTTGTAATGCATTT;SOR=2.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=22;WE=94986033;WS=94986015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr15	94986053	rs77840462	G	A	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=0;PP=911;ReadPosRankSum=-1.793;SC=ATAAATGCTTGAAGTCTGTAG;SOR=1.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=58;TCR=0;TR=39;WE=94986061;WS=94986043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,38:0.67:57
chr15	94986274	.	CTCT	C	1041.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.657;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.04;MQRankSum=1.495;QD=15.32;ReadPosRankSum=2.891;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,41:0.60:68
chr15	95013425	.	G	C	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=230;ReadPosRankSum=1.013;SC=CTCTCATCTTGAGGTTTTTAA;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=11;WE=95013433;WS=95013415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr15	96876611	rs7173047	T	A	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=21;PP=626;SC=CCTCGCCGGCTTTCCCCGGCC;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=96876619;WS=96876601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	96880510	rs3833035	ATTC	A	1864.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=3;PP=1607;SC=TGATGACTGAATTCTTCTTCT;SOR=3.767;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=35;WE=96880520;WS=96880500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr15	97940810	rs4076597	T	C	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=0;PP=699;ReadPosRankSum=0.795;SC=ACTTTTCGTTTCAATACCTTG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=28;WE=97940818;WS=97940800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr15	98301845	rs2048115	C	T	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=6.130;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.79;ReadPosRankSum=-1.096;SOR=1.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,8:0.23:35
chr15	98504100	rs4965046	G	C	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=74;ReadPosRankSum=2.039;SC=GGATGGGCGGGGAGGCTGGGT;SOR=0.404;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=9;WE=98504108;WS=98504090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr15	98504326	rs12101554	A	G	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=99;ReadPosRankSum=-1.268;SC=CTCGGCCAGCACCGCGGCCCT;SOR=0.859;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=8;WE=98504334;WS=98504316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr15	98512622	rs5814833	CT	C	435.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.298;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.634;NF=3;NR=21;PP=506;ReadPosRankSum=0.513;SC=AAGCAAAGCTCTTTTTTAAAA;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=11;TCR=79;TR=24;WE=98512630;WS=98512612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,26:0.31:84
chr15	98513845	rs2130882	T	C	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.739;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=471;ReadPosRankSum=0.596;SC=AGATGTGGTATCAGAGGAAGA;SOR=0.333;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=92;TCF=74;TCR=18;TR=32;WE=98513853;WS=98513835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,32:0.34:95
chr15	98514282	rs62023730	A	G	766.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-7.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=3;PP=452;ReadPosRankSum=0.096;SC=GCATATAACCATCATATAATT;SOR=0.719;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=121;TCF=111;TCR=10;TR=37;WE=98514290;WS=98514272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,41:0.33:123
chr15	98514489	rs3803385	A	G	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=29;PP=638;ReadPosRankSum=-0.726;SC=CTTTTTGGGAAAGAGACAGGA;SOR=0.510;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=8;TCR=86;TR=32;WE=98514497;WS=98514479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,33:0.35:94
chr15	98995052	rs56374714	G	GT	2769.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=28;PP=2928;SC=CACAAGGGGGGTTACCTTGGT;SOR=1.445;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=72;TCF=42;TCR=30;TR=70;WE=98995060;WS=98995042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr15	98995081	rs12101356	A	G	3268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=41;PP=2498;SC=GGAGACATCGAGCAGCTAACC;SOR=0.967;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=57;TCR=41;TR=98;WE=98995089;WS=98995071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr15	99192754	.	CTTTTTTTTT	C	1054.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.391;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=19.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=0.428;QD=27.04;ReadPosRankSum=3.157;SOR=2.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,27:0.69:39
chr15	99456253	rs2272037	T	C	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.734;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=866;ReadPosRankSum=-2.009;SC=GAACTTTCTCTGAACTTAATT;SOR=0.329;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=77;TCF=55;TCR=22;TR=48;WE=99456261;WS=99456243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,48:0.58:83
chr15	99456553	rs951715	G	A	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=-2.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=126;ReadPosRankSum=-0.365;SC=ACACTTCTTCGCAAGCTCACT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=7;WE=99456561;WS=99456543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr15	99465274	rs28637929	C	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=544;ReadPosRankSum=0.072;SC=TCAATAGCTCCTTCTATTCCA;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=12;WE=99465293;WS=99465264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr15	99465285	rs2684806	C	T	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=655;ReadPosRankSum=0.541;SC=TTCTATTCCACGGTTAAGATT;SOR=0.770;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=15;WE=99465293;WS=99465264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr15	99467934	rs1464430	A	C	738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.939;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=491;ReadPosRankSum=1.554;SC=TGGAGGGAGAAGAAACGTGGT;SOR=0.177;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=30;WE=99467942;WS=99467924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,32:0.68:47
chr15	99472734	rs4486868	T	C	3357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=20;PP=2691;SC=AGAAATGAAATGAGCAAATTG;SOR=2.876;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=88;TCR=20;TR=108;WE=99472742;WS=99472724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr15	99477911	rs2715449	T	G	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=1;PP=857;SC=AAAGTTGACATCAAGCCATGC;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=99477919;WS=99477901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr15	99478493	rs10400894	T	C	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=1;PP=487;SC=AACACAGGCATCAGCAAGGGC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=99478513;WS=99478483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr15	99478505	rs34389972	A	AC	849.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=1;PP=848;SC=AGCAAGGGCCACCTGACCCTC;SOR=4.977;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=21;WE=99478513;WS=99478483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	99478713	rs2293117	T	C	5739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.857;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=104;PP=2965;ReadPosRankSum=0.833;SC=TTTTCCTTTATAATCTCCCTG;SOR=0.906;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=185;TCF=79;TCR=106;TR=180;WE=99478721;WS=99478703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,191:0.97:196
chr15	99500256	rs2593053	G	A	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.970;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=478;ReadPosRankSum=1.853;SC=GCGCCCTCCCGGTTTGGACCC;SOR=0.490;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=67;TCR=20;TR=33;WE=99500264;WS=99500246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,33:0.37:89
chr15	99511793	rs1521484	C	G	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.306;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=1725;ReadPosRankSum=-0.162;SC=TCCAGCATTTCCTGGATGATG;SOR=1.225;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=108;TCF=42;TCR=66;TR=31;WE=99511812;WS=99511783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,31:0.27:116
chr15	99511804	rs5814919	A	AC	650.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.044;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=1731;ReadPosRankSum=1.177;SC=CTGGATGATGACTCTCAAGGC;SOR=1.038;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=92;TCF=25;TCR=67;TR=25;WE=99511812;WS=99511783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,27:0.25:107
chr15	99511873	rs2715423	G	A	1577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.248;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=39;PP=1240;ReadPosRankSum=2.817;SC=GATGAGTGCCGCGCAGCCCTT;SOR=1.075;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=79;TCF=23;TCR=56;TR=54;WE=99511881;WS=99511863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,56:0.70:80
chr15	99514423	rs199745395	TGGGGGGG	T	626.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=16;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.053;NF=3;NR=11;PP=370;ReadPosRankSum=1.997;SC=CCTCAGTTGATGGGGGGGGGG;SOR=0.560;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=14;WE=99514447;WS=99514413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr15	99544429	rs2593051	G	A	1967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.312;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.615;NF=65;NR=3;PP=1634;ReadPosRankSum=-0.370;SC=GAGAGTCCGCGGCTTCATTCT;SOR=1.847;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=97;TCF=91;TCR=6;TR=68;WE=99544437;WS=99544419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,69:0.69:100
chr15	99646107	rs60530833	A	AG	439.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=8;PP=362;SC=CGCAGGAGGCAAGGCGCTGCG;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=99646115;WS=99646097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr15	99653666	rs2305446	C	T	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=261;ReadPosRankSum=0.508;SC=TGTTTAATAACGCCGGGTGTT;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=13;WE=99653674;WS=99653656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr15	99653800	rs2305445	T	C	1764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.692;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=30;PP=1244;ReadPosRankSum=-2.095;SC=CTTTAGAGAGTGATTGACTGC;SOR=0.794;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=117;TCF=67;TCR=50;TR=71;WE=99653808;WS=99653790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,74:0.60:123
chr15	99667414	rs75546487	T	C	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=148;ReadPosRankSum=2.629;SC=CTCTGGAACCTGCTACCCTAA;SOR=0.990;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=12;WE=99667422;WS=99667404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,13:0.30:44
chr15	99667524	rs260090	G	C	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.069;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=361;ReadPosRankSum=1.740;SC=CTACCTTATTGAGGCCAAGAG;SOR=0.996;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=55;TCF=25;TCR=30;TR=20;WE=99667532;WS=99667514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,20:0.34:58
chr15	99670265	rs3743244	C	T	1837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.108;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=35;PP=1324;ReadPosRankSum=0.229;SC=AAGGACTCACCGAAGGAGAAG;SOR=0.786;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=227;TCF=112;TCR=115;TR=75;WE=99670273;WS=99670255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,80:0.35:230
chr15	99670518	rs1670227	T	C	2140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.084;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=41;PP=1688;ReadPosRankSum=1.020;SC=AGCAGTTCACTCAGTCTCCAG;SOR=0.604;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=271;TCF=129;TCR=142;TR=86;WE=99670526;WS=99670508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,89:0.32:274
chr15	99670989	rs3743248	T	C	7214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=123;NR=95;PP=2965;SC=CCAAGCAGCCTCAGGAGAACA;SOR=0.931;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=218;TCF=123;TCR=95;TR=218;WE=99670997;WS=99670979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr15	99671760	rs260087	T	C	3801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=60;PP=2960;SC=GCATTCGCTTTAGGCGTTGGG;SOR=0.918;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=50;TCR=60;TR=110;WE=99671768;WS=99671750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr15	99671795	rs5030699	C	T	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.785;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=354;ReadPosRankSum=-1.404;SC=TACATCCCTTCAGGCGAGAGC;SOR=0.508;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=46;TCR=55;TR=27;WE=99671803;WS=99671785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,28:0.27:104
chr15	99672599	rs7167599	G	C	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.640;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=31;PP=929;ReadPosRankSum=0.554;SC=ACTGTGCACGGAGAGGGCTCA;SOR=0.767;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=165;TCF=61;TCR=104;TR=47;WE=99672607;WS=99672589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,51:0.30:169
chr15	99672722	rs2292288	A	G	3186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=53;PP=2566;ReadPosRankSum=0.436;SC=GATAGTGCAGAGGACACATCA;SOR=0.683;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=172;TCF=94;TCR=78;TR=114;WE=99672730;WS=99672712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,115:0.66:174
chr15	99678145	rs260089	G	A	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.988;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=263;ReadPosRankSum=-0.848;SC=TTTTCTAGGCGGAGGTGATTT;SOR=0.541;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=72;TCF=44;TCR=28;TR=19;WE=99678153;WS=99678135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,20:0.26:76
chr15	99679489	rs34077294	GAGAT	G	1330.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=1.435;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=1.660;QD=8.75;ReadPosRankSum=-0.349;SOR=0.660;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,41:0.27:152
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chr15	99679830	rs260118	A	G	1405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.324;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=37;PP=1042;ReadPosRankSum=0.032;SC=ACTCTCTGTGACTATCTGTAT;SOR=0.254;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=128;TCF=30;TCR=98;TR=54;WE=99679838;WS=99679820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,56:0.43:131
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chr15	99715352	rs2602016	A	G	3324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=54;PP=2637;SC=TCAGGATGATAAGATGTGCCT;SOR=0.957;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=43;TCR=54;TR=97;WE=99715360;WS=99715342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr15	99798934	rs7162949	G	A	3200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=53;PP=2627;SC=CCTGTGGCTTGTATTCACTTT;SOR=0.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=44;TCR=53;TR=97;WE=99798942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
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chr15	100230908	rs325385	T	C	79.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=4;PP=83;SC=AAGCCAGGCATAGAAAGATAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=100230916;WS=100230898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr15	100243487	rs34131461	GT	G	2185.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.285;NF=68;NR=6;PP=2357;ReadPosRankSum=1.264;SC=GTCCAAATATGTTTTTTCTAA;SOR=2.571;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=89;TCF=83;TCR=6;TR=74;WE=100243495;WS=100243477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,78:0.98:80
chr15	100246834	rs325409	T	G	838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=717;ReadPosRankSum=-0.742;SC=GAAAATGACATTCATATGAAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=24;WE=100246842;WS=100246824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr15	100246936	rs325408	T	C	4648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.58;SOR=2.397;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr15	100246942	rs325407	G	A	4798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.23;SOR=2.079;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr15	100252709	rs3138597	CCAGCAG	C	4809.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=2.730;NF=31;NR=60;PP=2995;SC=CATCGGGCTTCCAGCAGCAGC;SOR=0.387;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=151;TCF=58;TCR=93;TR=91;WE=100252722;WS=100252699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr15	100252805	rs325400	G	T	2399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.645;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=48;PP=1881;ReadPosRankSum=-1.987;SC=AGGAAATGGGGCGCTCCCCTG;SOR=0.807;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=142;TCF=67;TCR=75;TR=90;WE=100252813;WS=100252795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,91:0.64:143
chr15	100256618	rs325380	A	C	3025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-6.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=24;PP=2350;ReadPosRankSum=0.299;SC=CAAATGGTGAAGACAATGCTA;SOR=0.661;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=167;TCF=132;TCR=35;TR=112;WE=100256626;WS=100256608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,115:0.66:173
chr15	100269309	rs6598263	T	G	2759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=5;PP=2175;SC=AAGCTGGGCCTAGTCTTTAAA;SOR=5.136;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=90;TCF=85;TCR=5;TR=90;WE=100269317;WS=100269299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr15	100269680	rs2061007	G	C	4159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.818;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=81;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.362;SC=TGACTGCACTGCACGCTCAAT;SOR=0.963;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=228;TCF=108;TCR=120;TR=147;WE=100269688;WS=100269670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,148:0.63:234
chr15	100269796	rs6598264	A	G	5075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.362;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=88;PP=2965;ReadPosRankSum=0.720;SC=CTGTGGTCTCAGAAGACGGGC;SOR=0.499;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=75;TCR=88;TR=162;WE=100269804;WS=100269786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,166:0.99:167
chr15	100271253	rs12185079	C	T	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.550;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=291;ReadPosRankSum=0.055;SC=AAAGAGATTTCTTAAATTAAG;SOR=0.036;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=16;WE=100271261;WS=100271243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr15	100331253	rs1060457	G	A	1077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=15;PP=794;SC=GGCCCTAGTTGTGCCTCCTCG;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=38;WE=100331261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr15	100331819	rs2958994	A	G	2471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=34;PP=1859;SC=CAAGCAACCCAGAGGACCTGG;SOR=1.127;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=49;TCR=34;TR=83;WE=100331827;WS=100331809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr15	100332799	rs11639102	A	C	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=12.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.31;MQRankSum=-8.515;QD=12.49;ReadPosRankSum=-1.958;SOR=1.640;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,35:0.38:92
chr15	100332807	rs11633999	C	T	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=19.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.03;MQRankSum=-8.646;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.216;SOR=2.462;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,28:0.33:85
chr15	100332919	rs2603217	T	C	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=4.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.48;MQRankSum=-3.830;QD=9.34;ReadPosRankSum=-1.575;SOR=1.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr15	100332989	rs62040187	C	A	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=5.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.85;MQRankSum=0.684;QD=18.49;ReadPosRankSum=-0.085;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr15	100333075	rs11634114	C	T	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.16;MQRankSum=-3.002;QD=6.85;ReadPosRankSum=1.401;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr15	100333090	rs201082411	T	C	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.33;MQRankSum=-3.179;QD=6.52;ReadPosRankSum=1.094;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr15	100339897	rs12910401	T	C	1736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=-0.534;NF=24;NR=31;PP=1068;ReadPosRankSum=-1.409;SC=GTGTTGATGTTGCCGATGATG;SOR=0.326;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=24;TCR=32;TR=55;WE=100339905;WS=100339887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr15	100339938	rs12905599	C	T	1180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.609;NF=11;NR=31;PP=1028;ReadPosRankSum=1.278;SC=GTGGTGCATGCGCAGCATCTC;SOR=0.586;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=42;WE=100339946;WS=100339928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr15	100339960	rs12904401	G	A	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=7.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.11;MQRankSum=-0.742;QD=3.17;ReadPosRankSum=-1.514;SOR=2.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr15	100341157	rs12916271	T	C	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.42;QD=32.65;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	100345136	rs202231117	TA	T	808.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.59;QD=24.51;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr15	100353107	rs8037668	T	C	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.617;NF=5;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=1.077;SC=ATTAAAAAGATATATTCAAGG;SOR=0.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=5;WE=100353115;WS=100353097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr15	100514561	rs2581340	G	C	1135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=0;PP=1025;SC=GGGTGGGTGGGTTTCAGACCT;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=37;WE=100514569;WS=100514551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr15	100514614	rs2573652	T	C	2718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=59.98;NF=74;NR=7;PP=2248;SC=GTGTCACGAGTTCGGCGGTGG;SOR=4.514;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=74;TCR=7;TR=81;WE=100514622;WS=100514604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr15	100516472	rs11634977	G	A	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=733;SC=TGAGGTCAAGGGACTGGGATG;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=100516480;WS=100516462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr15	100533218	rs7175995	C	T	1605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=6;PP=1289;SC=CCCTGCACTGCGGCACGGAGA;SOR=3.830;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=45;TCR=6;TR=51;WE=100533226;WS=100533208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr15	100537494	rs12900132	C	T	1788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.644;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=9;PP=1373;ReadPosRankSum=0.329;SC=GACCTGGGGGCGAGCGAGGGC;SOR=2.426;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=51;TCR=10;TR=57;WE=100537502;WS=100537484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,62:0.95:65
chr15	100589056	rs8028251	T	C	1347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.176;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=6;PP=1074;ReadPosRankSum=0.738;SC=GAACCCAGCTTCTTACCGTGA;SOR=0.987;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=81;TCF=69;TCR=12;TR=47;WE=100589064;WS=100589046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,49:0.59:83
chr15	100591992	rs4965569	A	T	1560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.132;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=39;PP=1168;ReadPosRankSum=0.477;SC=GCCCGTGGGAATGCCGAATCT;SOR=1.113;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=85;TCF=26;TCR=59;TR=54;WE=100592000;WS=100591982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,58:0.63:92
chr15	100592021	rs62041049	C	T	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=31;PP=767;ReadPosRankSum=-1.082;SC=AGGCACACTGCGGCTGTTTCT;SOR=0.681;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=58;TCF=11;TCR=47;TR=38;WE=100592029;WS=100592011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,39:0.65:60
chr15	100594271	rs28529328	G	A	1956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.495;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=54;PP=1474;ReadPosRankSum=1.713;SC=TAGAAAGCAAGTTGAAGACCA;SOR=1.246;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=102;TCF=22;TCR=80;TR=67;WE=100594279;WS=100594261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,72:0.69:105
chr15	100594299	rs28587358	G	C	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.525;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=44;PP=906;ReadPosRankSum=-0.265;SC=AAGGGGCTGGGGGTAGGGGGA;SOR=1.771;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=78;TCF=9;TCR=69;TR=48;WE=100594307;WS=100594289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,49:0.63:78
chr15	100603776	rs6598297	T	A	1302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.877;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=12;PP=920;ReadPosRankSum=2.018;SC=AACACAGGCGTGAAACCAGCC;SOR=0.419;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=138;TCF=110;TCR=28;TR=51;WE=100603784;WS=100603766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,54:0.37:147
chr15	100603987	rs34229918	A	G	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=34;PP=888;ReadPosRankSum=0.573;SC=ACGACACAGAAGTAAACCACA;SOR=0.502;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=64;TCF=6;TCR=58;TR=38;WE=100603995;WS=100603977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,38:0.58:65
chr15	100604020	rs61344232	G	A	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=509;ReadPosRankSum=-1.992;SC=ACCAGAGGCCGTGCAGCATCC;SOR=0.551;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=24;WE=100604028;WS=100604010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,24:0.65:37
chr15	100636586	rs4965583	G	A	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.466;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=799;ReadPosRankSum=-0.893;SC=GGCTGAAGTCGCCCTTCACCA;SOR=0.384;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=73;TCF=51;TCR=22;TR=43;WE=100636594;WS=100636576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,47:0.63:75
chr15	100649465	rs142688382	C	CCAGCTCCTCTAAACACGCGGCA	761.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.39;ReadPosRankSum=-1.826;SOR=0.314;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr15	100649473	rs75158695	C	T	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=544;ReadPosRankSum=1.148;SC=CTCCAGGAAGCGGAAAAAGAC;SOR=0.481;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=8;WE=100649481;WS=100649455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr15	100649512	rs35121839	A	T	265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=181;ReadPosRankSum=-0.663;SC=ACAGTGCAGGACTGAGCTCTG;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=9;WE=100649520;WS=100649502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr15	100672237	rs12907333	T	G	5179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=73;NR=102;PP=2965;SC=TTCCTCTGCCTGAAGCGGGCT;SOR=1.146;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=175;TCF=73;TCR=102;TR=175;WE=100672245;WS=100672227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr15	100692782	rs7162227	C	G	1557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.497;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=5;PP=1239;ReadPosRankSum=-2.813;SC=TGGATCCATGCTCTGTCCCGA;SOR=0.461;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=77;TCF=71;TCR=6;TR=52;WE=100692790;WS=100692772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,55:0.65:84
chr15	100739405	rs12148118	T	C	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=1;PP=1144;ReadPosRankSum=0.617;SC=GGGTCCTTTATTGCAGATGCA;SOR=1.300;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=58;TCR=1;TR=46;WE=100739413;WS=100739395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,49:0.78:63
chr15	100794172	rs7172834	T	A	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=218;ReadPosRankSum=-0.120;SC=TAACTTCAAATCATTTCAGGA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=12;WE=100794180;WS=100794162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr15	100794363	rs4369638	C	T	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.135;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=24;PP=952;ReadPosRankSum=-0.642;SC=ACGGTTCATCCTTGTGTACAC;SOR=0.114;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=120;TCF=41;TCR=79;TR=47;WE=100794371;WS=100794353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,48:0.40:120
chr15	100801698	rs4965613	G	A	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=127;ReadPosRankSum=0.647;SC=TCACAAACACGGCAGCATCCA;SOR=0.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=9;WE=100801706;WS=100801688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,9:0.27:33
chr15	100801965	rs6598316	G	T	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=4.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.36;ReadPosRankSum=-1.657;SOR=0.050;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,5:0.19:27
chr15	100802495	rs4965296	G	A	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=1.545;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.13;ReadPosRankSum=-1.321;SOR=1.095;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,12:0.26:46
chr15	100802499	rs4965297	A	G	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.40;ReadPosRankSum=-0.838;SOR=0.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,13:0.28:47
chr15	100871329	rs11639041	G	A	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=418;ReadPosRankSum=0.486;SC=CCCCCCGGAGGGGCAGGCAAG;SOR=0.693;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=71;TCF=9;TCR=62;TR=22;WE=100871337;WS=100871319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,24:0.32:74
chr15	100889442	rs4965642	A	G	1502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.277;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=22;PP=1014;ReadPosRankSum=-0.084;SC=GCAGTTTGTTACCCTTGAGAT;SOR=0.203;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=52;WE=100889450;WS=100889432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,60:0.65:92
chr15	100889496	rs2289584	T	G	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.760;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=605;ReadPosRankSum=0.330;SC=GACAGCTCGATTCTGATGGGC;SOR=0.484;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=90;TCF=41;TCR=49;TR=32;WE=100889504;WS=100889486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,32:0.33:98
chr15	100942843	rs1023782	G	T	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=-0.832;SC=ATGTGGGGTCGGTGTGGGGCC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=6;WE=100942851;WS=100942839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr15	100942962	rs2439928	T	C	2719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=24;PP=2153;SC=CTCTCAGCCCTGAGGCCGTTC;SOR=1.954;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=61;TCR=24;TR=85;WE=100942970;WS=100942952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr15	100996038	rs12595207	C	T	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=3.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-0.602;QD=5.36;ReadPosRankSum=1.312;SOR=0.469;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,56:0.27:205
chr15	100996076	rs11323964	AT	A	5694.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.514;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=60.12;MQRankSum=1.333;NF=69;NR=67;PP=2966;ReadPosRankSum=0.627;SC=ATTAAGAGCAATAATATTTGG;SOR=0.626;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=202;TCF=102;TCR=100;TR=136;WE=100996084;WS=100996066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,172:0.70:247
chr15	100996321	.	A	G	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.826;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=551;ReadPosRankSum=1.553;SC=TAATAAAACAAATAGTTTTTC;SOR=1.371;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=23;WE=100996329;WS=100996311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr15	101013123	rs1566775	G	A	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.832;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=536;ReadPosRankSum=-0.672;SC=AATGGCAAACGTTTACCTCCA;SOR=0.829;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=89;TCF=53;TCR=36;TR=33;WE=101013131;WS=101013113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,33:0.37:89
chr15	101019529	rs2654574	C	T	1239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=9;PP=933;SC=AGGGATGACACAGTAGTGAAC;SOR=2.419;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=38;WE=101019537;WS=101019519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr15	101019819	rs2587763	G	T	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=194;ReadPosRankSum=-0.295;SC=ATTGACCTTTGCCATATTCTT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=9;WE=101019827;WS=101019809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr15	101031217	rs1503479	C	T	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.164;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=128;ReadPosRankSum=-1.294;SC=GCTGTAACTTCAGGTTTCTAA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=101031225;WS=101031207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr15	101041921	rs60405735	T	C	2789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.362;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=26;PP=2285;ReadPosRankSum=1.338;SC=GAGAAAAGCATATGGAATTGT;SOR=0.869;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=145;TCR=45;TR=109;WE=101041929;WS=101041911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,108:0.55:195
chr15	101044032	rs72759164	G	A	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.730;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=246;ReadPosRankSum=1.150;SC=AGAGCAGTGGGGACCAGAGGG;SOR=0.200;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=15;WE=101044040;WS=101044022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr15	101109358	rs28438569	A	G	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.008;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=-0.758;SC=AAACCCTTTTATGGTGATGAT;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=5;WE=101109366;WS=101109353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr15	101109677	rs8451	C	A	6598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-7.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.067;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=158;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.102;SC=GAACCAGAGGCCTTGATGGAG;SOR=0.399;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=362;TCF=114;TCR=248;TR=241;WE=101109685;WS=101109667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,247:0.67:371
chr15	101109794	rs12157	C	G	2576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.408;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=74;PP=2060;ReadPosRankSum=1.689;SC=CTAAACACTGCTCTGTGGATT;SOR=1.502;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=138;TCF=36;TCR=102;TR=94;WE=101109802;WS=101109784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,95:0.68:140
chr15	101109818	rs12460	G	A	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.386;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=54;PP=1377;ReadPosRankSum=-1.459;SC=CGTCAGAATCGTCAGAGCTGT;SOR=1.172;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=97;TCF=19;TCR=78;TR=65;WE=101109826;WS=101109808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,66:0.68:97
chr15	101109893	rs6598356	C	A	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.467;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=853;ReadPosRankSum=0.248;SC=TGGTGTGAGCCCCCTTGGACA;SOR=0.381;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=63;TCF=26;TCR=37;TR=38;WE=101109901;WS=101109883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,39:0.61:64
chr15	101110265	rs2411836	T	A	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.736;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=710;ReadPosRankSum=1.085;SC=CATTTTCATGTGTGTGATGGT;SOR=0.247;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=32;WE=101110273;WS=101110255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,33:0.72:46
chr15	101110356	rs2411838	T	C	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=192;ReadPosRankSum=-1.437;SC=TGCAGATTAATGACCTTACAA;SOR=1.938;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=13;WE=101110364;WS=101110346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr15	101110372	rs3084804	AAC	A	443.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=376;ReadPosRankSum=-1.058;SC=TACAAAAATAAACAGTTTTAC;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=10;WE=101110381;WS=101110362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr15	101112342	rs1493652	T	C	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=32;PP=962;SC=TATATATAAATTCATAGTGTC;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=101112350;WS=101112332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr15	101113748	rs2062816	C	T	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.430;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=236;ReadPosRankSum=0.213;SC=GGATAACATACAGCTTAAATT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=11;WE=101113756;WS=101113738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr15	101113862	rs12719734	C	T	2552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=21;PP=1983;SC=TTACCTTTCACTTCACTTGCT;SOR=2.026;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=55;TCR=21;TR=76;WE=101113870;WS=101113852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr15	101113950	rs12592868	A	G	2907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.581;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=28;PP=2354;ReadPosRankSum=-0.222;SC=CATGATCTGGACTAGTGATAA;SOR=0.309;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=128;TCF=94;TCR=34;TR=95;WE=101113958;WS=101113940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,99:0.73:135
chr15	101114418	rs8039437	G	A	1911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=53;PP=1520;ReadPosRankSum=-0.128;SC=AAATGGTGTCGAAATGAGTCA;SOR=0.631;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=90;TCF=11;TCR=79;TR=61;WE=101114426;WS=101114408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,64:0.69:93
chr15	101115448	rs4965678	C	A	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=139;SC=ATATGTGGCACACCGAGAAGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=101115456;WS=101115438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr15	101152745	rs4965683	A	C	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=38;PP=1195;SC=TACTCAACATATTATTCTCTC;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=38;WE=101152753;WS=101152735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr15	101188340	.	C	G	563	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=19;NR=0;PP=563;QD=31.4616427656;SC=CACCATCCCACGGTTGTGAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=101188348;WS=101188339;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr15	101441055	rs4646675	T	C	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=120;ReadPosRankSum=1.800;SC=TCCCTCTCCGTGAAAGGAATG;SOR=0.351;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=1;TCR=46;TR=11;WE=101441063;WS=101441045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,11:0.23:48
chr15	101447588	rs4646684	A	G	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=293;ReadPosRankSum=-0.464;SC=TGTATATTATATACCAAGCCC;SOR=0.197;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=0;TCR=62;TR=18;WE=101447596;WS=101447578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,20:0.31:64
chr15	101448783	rs4646687	G	A	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=3.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.78;ReadPosRankSum=-0.244;SOR=1.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,16:0.25:64
chr15	101550858	rs12595297	G	T	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=6.257;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=0.013;QD=3.55;ReadPosRankSum=-0.364;SOR=1.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,29:0.22:129
chr15	101550861	.	CTT	C,CT	2087.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.071;ClippingRankSum=0.000;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=4.906;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.04;MQRankSum=0.291;QD=23.20;ReadPosRankSum=0.436;SOR=1.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:5,43,42:0.48,0.47:90
chr15	101561980	rs146724273	CGTGTGTGTGTGT	C	1007.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.9848;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=17;NR=0;PP=2460;SC=CACGTGTGTGCGTGTGTGTGT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=17;WE=101561999;WS=101561970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	101562793	rs11247253	G	A	1759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=5;NR=47;PP=1445;SC=CGGCTGGCTCGAGAGCCAAGG;SOR=4.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=5;TCR=47;TR=52;WE=101562801;WS=101562783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr15	101566118	rs4427776	C	T	2917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=76;NR=13;PP=2347;SC=TCTGTCCTGTCCCTTGTTCCA;SOR=3.309;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=90;TCF=76;TCR=14;TR=89;WE=101566126;WS=101566108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr15	101567544	rs149998498	C	T	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.225;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=23;PP=537;ReadPosRankSum=-0.219;SC=GCATGAAGGACGTGGGCAGCA;SOR=0.388;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=105;TCF=27;TCR=78;TR=33;WE=101567552;WS=101567534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,33:0.31:106
chr15	101569467	rs11639307	T	C	1409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=39;PP=1096;SC=CGCCAGGCTGTGCAGGTTGCT;SOR=2.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=48;WE=101569475;WS=101569457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr15	101589765	.	T	G	1334	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=44;NR=2;PP=1334;QD=29.7558959249;SC=CGGGGGTTGGTTCCTGTCCCT;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=46;WE=101589773;WS=101589764;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr15	101591857	rs10710683	CG	C	2285.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=8;PP=2180;SC=GAGTGCTGCTCGGGGGGCCCT;SOR=3.551;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=80;TCF=70;TCR=10;TR=66;WE=101591865;WS=101591847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr15	101593641	rs11631875	G	A	2441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.42;SOR=3.638;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr15	101598200	rs11857803	G	A	4454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=68;PP=2965;SC=CTCAGCGACCGCTGGCCCTGT;SOR=0.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=76;TCR=68;TR=144;WE=101598208;WS=101598190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr15	101598314	rs11853661	C	T	2416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=63;PP=2005;SC=AGGAGTACACCGTGGTGTTTT;SOR=3.551;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=9;TCR=64;TR=72;WE=101598322;WS=101598304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr15	101601367	rs148929418	C	CACTT	4902.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=36;PP=2918;SC=CAGTTTCTGCCACTTACAGGA;SOR=1.085;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=94;TCF=48;TCR=46;TR=74;WE=101601375;WS=101601357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr15	101607513	rs2925201	T	C	3302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=79;PP=2649;SC=GTCTACATGGTTGCAGTGATG;SOR=2.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=19;TCR=79;TR=98;WE=101607521;WS=101607503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr15	101718700	rs2005180	G	A	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.963;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=17;PP=366;ReadPosRankSum=-1.211;SC=GGCGGTAGCCGTACTGGATCT;SOR=1.068;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=100;TCF=45;TCR=55;TR=28;WE=101718708;WS=101718690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,28:0.28:99
chr15	101826919	rs28698071	G	A	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.315;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=248;ReadPosRankSum=1.135;SC=CATTACATAAGAGAGCTCCAA;SOR=3.334;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=11;WE=101826927;WS=101826909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr15	101827759	rs35525027	T	C	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.706;NF=12;NR=5;PP=356;ReadPosRankSum=1.212;SC=ATGGTGCATATGTGCCACATT;SOR=0.238;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=17;WE=101827767;WS=101827749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,21:0.78:27
chr15	101827855	rs61752834	C	T	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.263;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=15;PP=1161;ReadPosRankSum=0.346;SC=TATGTAATTCCCATACCTTAG;SOR=0.440;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=69;TCF=50;TCR=19;TR=49;WE=101827863;WS=101827845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,48:0.66:73
chr15	101832387	rs8028930	A	G	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=386;ReadPosRankSum=0.262;SC=AAGCAAAAAGAACCCTTTTCT;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=17;WE=101832395;WS=101832377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr15	101853281	rs117441572	G	A	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.27;ReadPosRankSum=-1.406;SOR=0.590;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,12:0.17:72
chr15	101862690	rs36022203	G	T	1987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=5.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.172;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=7;PP=1548;ReadPosRankSum=0.573;SC=CAGCGCCACCGCCCTGACATT;SOR=0.464;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=110;TCF=99;TCR=11;TR=67;WE=101862698;WS=101862680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,71:0.62:115
chr15	101862970	rs1871975	T	C	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=721;ReadPosRankSum=0.804;SC=CAGAGGCCGCTTGTACCTGGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=29;WE=101862978;WS=101862960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
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chr15	101887767	rs2949	C	T	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=386;SC=TGCACGCACACGCATTCATGC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=101887775;WS=101887757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr15	101887794	rs1030	T	C	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=1;PP=358;SC=TCAACAACTGTTTGTGAGCCA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=101887802;WS=101887784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr15	101888081	rs875293	C	T	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=628;ReadPosRankSum=-0.750;SC=GAGGAAGCGCCCGGGGTTGAC;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=22;WE=101888089;WS=101888071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr15	101905084	rs4965833	G	A	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=0;PP=1068;SC=CCAAGTTGGAGGACTCGCACT;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=37;WE=101905092;WS=101905074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr15	101905327	rs11247286	C	T	2220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=61;PP=1857;ReadPosRankSum=0.306;SC=GGACCCCTACCTCACACCATA;SOR=3.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=5;TCR=62;TR=66;WE=101905335;WS=101905317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,67:0.99:68
chr15	101906205	rs8029952	T	C	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=1;PP=653;SC=GACGTTTACATGACATCGTGG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=101906213;WS=101906195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr15	101906263	rs8034182	T	C	2063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=5;PP=1689;SC=ATTAAAATGGTGAATTTTCTG;SOR=4.548;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=55;TCR=5;TR=60;WE=101906271;WS=101906253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr15	101910511	rs2073591	A	C	4102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=69;NR=55;PP=2965;SC=GTGAGCCCAGACCCCATCCCC;SOR=0.983;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=70;TCR=55;TR=124;WE=101910519;WS=101910501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr15	101910550	rs20543	G	A	4173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=57;PP=2965;SC=CTCTTTGCCAGAAGTTGAGAC;SOR=0.876;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=66;TCR=57;TR=122;WE=101910558;WS=101910540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr15	101929632	rs33912717	AT	A	1824.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.623;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=33;PP=783;ReadPosRankSum=-0.308;SC=CAATCTAAACATTTTTTTTTT;SOR=0.950;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=124;TCF=63;TCR=61;TR=65;WE=101929641;WS=101929622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,95:0.72:132
chr15	101929825	rs6598460	G	C	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=26;PP=662;ReadPosRankSum=-0.194;SC=AACTCACTCTGTGGAGAAGGC;SOR=0.368;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=28;WE=101929833;WS=101929815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,27:0.69:39
chr15	101968084	rs2277585	C	T	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=294;ReadPosRankSum=-0.519;SC=CAGGCTGCCACGCCCGGCCTT;SOR=0.983;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=18;WE=101968092;WS=101968074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr15	101970308	rs2643354	G	A	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=439;ReadPosRankSum=0.638;SC=GAAATGGCATGTGACAGCTCT;SOR=0.715;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=113;TCF=45;TCR=68;TR=34;WE=101970316;WS=101970298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,36:0.32:114
chr15	101970323	rs3825896	G	T	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=23;PP=1107;ReadPosRankSum=-1.014;SC=AGCTCTGTTTGAAATGGATTT;SOR=0.639;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=112;TCF=39;TCR=73;TR=36;WE=101970344;WS=101970313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,37:0.33:113
chr15	101970336	rs3825895	T	C	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.920;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=25;PP=1107;ReadPosRankSum=-0.892;SC=ATGGATTTTATGTTCCGTTGG;SOR=1.372;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=107;TCF=31;TCR=76;TR=32;WE=101970344;WS=101970313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,34:0.31:108
chr15	101971388	rs2643356	T	C	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=176;ReadPosRankSum=0.385;SC=TCCTAATTCTTTCCAGCATAG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=10;WE=101971396;WS=101971379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr15	101972055	rs12902244	T	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=109;ReadPosRankSum=0.765;SC=AGCCTTGCGGTAGTGGTTTTA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=101972063;WS=101972045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr15	101984036	rs11855154	C	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.481;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.20;ReadPosRankSum=-1.081;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr15	102003325	rs150339071	G	A	1258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.352;NF=36;NR=15;PP=972;ReadPosRankSum=-0.080;SC=ACCTGGAGCCGTTGAGCATCA;SOR=0.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=83;TCF=58;TCR=25;TR=51;WE=102003333;WS=102003315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,49:0.60:81
chr15	102029685	rs199543153	G	GGC	871.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=17;PP=832;SC=GCGCGGCGGGGGCGGAGCAGG;SOR=3.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=17;WE=102029693;WS=102029675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr15	102173789	rs601741	G	C	2464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=43;PP=1804;ReadPosRankSum=1.451;SC=CTGTGGTTAGGGACGCTCATC;SOR=0.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=183;TCF=106;TCR=77;TR=104;WE=102173797;WS=102173779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,106:0.57:187
chr15	102177228	.	G	T	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.094;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=228;ReadPosRankSum=-1.031;SC=GGTGTGGTCCGGCTACAGCTT;SOR=0.665;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=16;WE=102177236;WS=102177218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,17:0.27:62
chr15	102191869	rs672314	G	A	1461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-5.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.172;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=11;PP=1204;ReadPosRankSum=-0.374;SC=ATAACTACATGTATTTACTAG;SOR=0.483;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=75;TCF=61;TCR=14;TR=53;WE=102191877;WS=102191859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,54:0.69:78
chr15	102192034	rs507903	A	G	3654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.087;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=83;PP=2860;ReadPosRankSum=-0.908;SC=AGAAAACCTTATTTTGTGTGG;SOR=1.269;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=190;TCF=76;TCR=114;TR=131;WE=102192042;WS=102192024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,136:0.69:196
chr15	102192540	rs675436	T	G	1512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.690;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.73;ReadPosRankSum=2.574;SOR=0.809;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,64:0.50:129
chr15	102192548	rs2939587	A	C	4184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.08;SOR=1.823;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr15	102192626	.	A	G	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.693;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=286;ReadPosRankSum=-1.756;SC=CCGGAGCGTGAACTGGACGCA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=14;WE=102192634;WS=102192616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr15	102196186	rs572705	C	T	3090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.602;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=39;PP=2583;ReadPosRankSum=-1.587;SC=CAGGAATCTACAGCCATGCTT;SOR=0.601;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=177;TCF=118;TCR=59;TR=114;WE=102196194;WS=102196176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,118:0.64:183
chr15	102211654	rs606511	T	C	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.437;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=379;ReadPosRankSum=-1.291;SC=ATTAGAATATTAGTACTATAA;SOR=2.726;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=16;WE=102211662;WS=102211644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr15	102224341	rs12901450	G	A	820.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.773;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=12;PP=538;ReadPosRankSum=-1.185;SC=TGGTCAAGCCGCTGAGAGTCC;SOR=0.799;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=112;TCF=73;TCR=39;TR=37;WE=102224349;WS=102224331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,38:0.34:111
chr15	102251993	rs11247320	G	A	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=143;ReadPosRankSum=-0.134;SC=GTAAGGGCCAGCAGTATACAG;SOR=0.126;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=10;WE=102252001;WS=102251983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,10:0.26:39
chr15	102264304	rs1143138	G	C	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=81;ReadPosRankSum=1.379;SC=CTGTGCGCCGGCCTCCTGCGC;SOR=0.412;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=6;WE=102264312;WS=102264294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr15	102284542	rs71154345	AG	A	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.45;MQRankSum=-0.054;QD=1.14;ReadPosRankSum=-0.530;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,10:0.13:77
chr15	102284597	rs62027633	A	G	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FS=0.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQRankSum=-1.120;QD=1.62;ReadPosRankSum=-0.728;SOR=0.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:209,42:0.17:251
chr15	102284675	rs182931332	A	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=1.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.90;MQRankSum=0.150;QD=1.15;ReadPosRankSum=0.598;SOR=0.867;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:182,29:0.14:211
chr15	102291954	rs28521777	C	T	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=2.666;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.01;MQRankSum=-1.241;QD=3.94;ReadPosRankSum=1.089;SOR=0.328;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,17:0.23:75
chr15	102291955	rs397212	G	A	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=1.192;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQRankSum=-0.830;QD=3.81;ReadPosRankSum=-1.001;SOR=0.468;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,16:0.21:75
chr15	102312009	rs111745531	G	A	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=3.191;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.15;MQRankSum=-2.897;QD=2.00;ReadPosRankSum=1.108;SOR=0.939;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,10:0.21:47
chr15	102312240	rs59860046	GA	G	1116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-8.199;NF=28;NR=17;PP=1096;ReadPosRankSum=-1.580;SC=CAGTGGCCGGGAAATTTGCTG;SOR=0.689;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=86;TCF=53;TCR=33;TR=45;WE=102312248;WS=102312230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
chr15	102312315	rs57638732	GA	G	3618.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=53;PP=2951;SC=GCTTCACCTGGAAGGGAGGGG;SOR=0.820;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=105;TCF=52;TCR=53;TR=102;WE=102312323;WS=102312305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr15	102313716	rs352719	A	G	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=309;ReadPosRankSum=-0.386;SC=TTCCTCCTGGAGCTCTCTCCT;SOR=0.871;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=17;WE=102313724;WS=102313706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr15	102313869	rs72761685	G	A	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.831;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=6;PP=420;ReadPosRankSum=-0.422;SC=AGTTTGCCAGGTTGTCCCCCT;SOR=1.769;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=21;WE=102313877;WS=102313859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr16	81639	rs118023239	C	A	272.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.23;QD=30.31;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	103423	rs2541593	C	A	2705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=12;PP=2203;SC=AGTCGGAGGACGCGGAAGGCC;SOR=3.456;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=69;TCR=12;TR=81;WE=103431;WS=103413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr16	103449	rs11376822	C	CG	4679.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=74;NR=26;PP=2973;SC=GAGTCGCCCGCGCCCAGCGCC;SOR=2.283;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=106;TCF=76;TCR=30;TR=100;WE=103457;WS=103439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr16	103517	rs183360	A	C	5781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.232;NF=100;NR=84;PP=2965;ReadPosRankSum=0.168;SC=GTGTTGCAGGAGAAGCGGTGG;SOR=0.292;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=185;TCF=101;TCR=84;TR=184;WE=103525;WS=103507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,195:0.99:196
chr16	103923	rs2562145	C	G	2900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=75;NR=32;PP=2162;SC=AGACGGAGGCCGCGGGTGGGC;SOR=1.893;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=75;TCR=32;TR=107;WE=103931;WS=103913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr16	105320	rs216596	A	G	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.44;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	105325	rs2858042	G	A	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.20;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	105444	rs2541594	C	T	1444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;PP=1144;ReadPosRankSum=-0.778;SC=CACTTCTGCCCTTGGTCTTTT;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=45;WE=105452;WS=105434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,46:0.98:47
chr16	106777	rs216597	G	C	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=29;PP=893;SC=GCAGAGGGCAGCTGGAGGGGC;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=106785;WS=106767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	106952	rs11435836	G	GC	523.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=615;SC=GATGGCCACTGCACTTCCTGG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=14;WE=106960;WS=106942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	107275	rs1045001	T	G	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=363;SC=TGCCCAACAGTAACTGTCAGC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=107283;WS=107265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	108585	rs216598	T	C	3309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=62;PP=2383;SC=TGATGAACCCTGAGATGTGGG;SOR=1.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=45;TCR=62;TR=107;WE=108593;WS=108575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr16	108796	rs34941405	T	TG	2506.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=51;PP=2578;SC=GCAGTGGGGCTGGCAGGCCCC;SOR=2.368;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=64;TCF=10;TCR=54;TR=61;WE=108804;WS=108786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	109671	rs216599	A	G	5518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=110;PP=2965;SC=GAGAAGGCACACCCTAGGGCG;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=182;TCF=71;TCR=111;TR=181;WE=109679;WS=109661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr16	110165	rs216600	T	C	3065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=22;PP=2563;ReadPosRankSum=1.442;SC=TGGCATTCTCTCCCACATGAC;SOR=1.123;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=94;TCF=72;TCR=22;TR=92;WE=110173;WS=110155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,95:0.99:96
chr16	110925	rs2562146	T	C	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=0;PP=682;SC=AATCAGATGATGGTCTACGGG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=110933;WS=110915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	112151	rs216602	A	G	176.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=3;PP=117;SC=TGGCGAATATACTGCGCAAGT;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=112159;WS=112141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	112513	rs216604	T	C	1642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=3;PP=1503;SC=TCTCTGCCCCTCTTCCCTGCC;SOR=4.935;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=50;WE=112521;WS=112503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	113883	rs10659183	G	GCC	6904.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=62;PP=2967;SC=GGGGCAGCATGCTGCCCCCAG;SOR=0.878;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=124;TCF=47;TCR=77;TR=105;WE=113894;WS=113873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr16	113886	rs11285099	GC	G	6870.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=62;PP=2969;SC=GCAGCATGCTGCCCCCAGGCC;SOR=0.963;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=45;TCR=68;TR=103;WE=113894;WS=113873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr16	113970	rs2157115	T	C	3677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=88;PP=2764;SC=AGCCACCCCCTGAACTGTTAG;SOR=1.821;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=38;TCR=88;TR=126;WE=113978;WS=113960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr16	114535	rs2562147	A	G	1726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=38;PP=1467;SC=GAGAGCGGTCAGTATCCAGAA;SOR=1.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=56;WE=114543;WS=114525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	115041	rs2288490	C	T	2863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=53;PP=2308;SC=GGCAGGCCTGCGGGGCATGGT;SOR=1.029;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=94;TCF=40;TCR=54;TR=93;WE=115049;WS=115031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr16	115072	rs6600227	A	C	2520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=61;PP=2005;SC=ATAATGACAAAGCTGACATCT;SOR=1.718;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=90;TCF=28;TCR=62;TR=89;WE=115080;WS=115062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr16	128179	rs2562162	T	C	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=11;NR=10;PP=468;SC=ACTGCCCCCCTTCTCCCGGCT;SOR=0.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=21;WE=128187;WS=128169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	136888	rs743725	T	C	1160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=37;PP=957;SC=GATGGGTGGGTGTGAGCCCAA;SOR=3.365;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=43;WE=136896;WS=136878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	138772	rs57321480	A	AG	6184.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=49;PP=2957;SC=ATGCTCCGACAGCTGGCCAGC;SOR=1.553;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=84;TCR=51;TR=129;WE=138780;WS=138762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr16	142825	rs2541618	T	C	581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=530;SC=GGCAGGTGGGTCAGGACAGTG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=142833;WS=142815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	148352	rs2541616	G	A	3310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=87;PP=2774;ReadPosRankSum=-0.872;SC=ACCCTGCACCGGGTATGCACC;SOR=2.543;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=101;TCF=13;TCR=88;TR=100;WE=148360;WS=148342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr16	160668	rs808892	T	C	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=43;PP=1255;SC=GCCTCAGCCTTCCAAGTAGCT;SOR=6.273;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=44;WE=160676;WS=160658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	188303	.	AGAGGAGGACGGAGCCGGAGGCGGAGGGGGCCT	A	377.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.97;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	188335	.	T	A	49	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=30;MQ=56.37;NF=0;NR=4;PP=49;QD=20.9428031368;SC=GGAGGGGGCCTGAGGAGGACG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=188343;WS=188325;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,4:0.33:12
chr16	203132	rs2541598	C	G	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.38;ReadPosRankSum=-0.308;SOR=0.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr16	203135	rs2858919	T	A	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=2.808;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=21.53;ReadPosRankSum=0.015;SOR=1.170;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr16	213105	rs2858933	C	T	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	216190	rs11431675	C	CG	3005.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=57;PP=2966;SC=TGCGGATCCCCGGGCTCTGGG;SOR=1.533;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=23;TCR=66;TR=77;WE=216198;WS=216180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr16	223706	rs2541640	A	G	3293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=94;PP=2849;SC=CTGAGTGGGCAGCAGCCTGTG;SOR=7.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=95;TCF=1;TCR=94;TR=95;WE=223714;WS=223696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr16	223735	rs2685121	A	G	1920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=55;PP=1618;SC=GGTTCTCTCTATCCCGGAATG;SOR=6.770;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=56;WE=223743;WS=223725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr16	230481	rs1005364	C	G	210.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=1;PP=171;SC=GGTTCCAGCGCGGGGATGGCG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=230489;WS=230471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	240280	rs1211375	A	C	1418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=30;PP=1185;ReadPosRankSum=-0.752;SC=TCCATCAGTTAATCTCCAATG;SOR=0.800;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=42;WE=240288;WS=240270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr16	277458	rs1203974	G	A	145.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=115;SC=CCCATCAAATGCAATGAAAAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=277466;WS=277448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	284556	rs7191945	G	C	1482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.23;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	284833	rs7202423	T	G	1149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=33;PP=943;SC=AGCGGCGCGGTCGGGTGAGAG;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=34;WE=284841;WS=284823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	322934	rs9940585	C	T	1806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=18;PP=1287;ReadPosRankSum=-0.724;SC=CCCCGGGCTGCGGAGGGGAGA;SOR=0.876;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=41;TCR=18;TR=58;WE=322942;WS=322924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr16	324052	rs2685126	A	G	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=17;PP=1160;SC=CCTTCTCATAATCCACCAGGG;SOR=1.251;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=28;TCR=17;TR=45;WE=324060;WS=324042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	325683	rs200964940	C	CG	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=147;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=2;PP=182;SC=GGGGAGACCCCGGAGACCCCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=325703;WS=325673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	325695	rs201791993	A	AG	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9993;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=147;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=2;PP=114;SC=GAGACCCCCAAGGGCCCCAGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=325703;WS=325673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	325732	rs202190256	A	AG	164.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=124;SC=GGCCTCGCAGACCTCCGCCCC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=325740;WS=325722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	325771	rs111978133	GT	G	230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=61.53;NF=5;NR=1;PP=192;SC=GCGCCCCCGTGTCCCCATGCT;SOR=2.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=325779;WS=325761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	325943	.	A	AG	44.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=2;PP=51;SC=GGGATGACCGACGTCCCGCCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=325951;WS=325933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	330678	rs368146102	G	A	34.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=6;NR=0;PP=108;SC=GCCGCGCGCCGCCATGCTGGG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=330686;WS=330668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	334543	rs45614840	C	G	3895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=51;PP=2907;SC=GAGTACCCTACGCTCAAGTTC;SOR=1.039;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=71;TCR=51;TR=122;WE=334551;WS=334533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr16	336660	rs11647490	G	A	7729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=119;NR=127;PP=2965;SC=TGGATGCCACGGCCAACGAGC;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=247;TCF=119;TCR=128;TR=246;WE=336668;WS=336650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr16	359953	rs2301522	A	G	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=10;PP=1066;SC=TGGGCTGAGGACCGCAAAGCC;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=41;WE=359961;WS=359943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	396264	rs1805105	A	G	7463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=136;PP=2965;SC=CATCGTCCTCATCCATGTCCT;SOR=1.028;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=243;TCF=107;TCR=136;TR=243;WE=396272;WS=396254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr16	417281	rs62032959	G	A	3650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.07;SOR=4.487;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr16	417289	rs62033860	C	T	3799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.68;SOR=3.937;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr16	418429	rs11642334	A	G	4901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.066;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=71;PP=2965;ReadPosRankSum=1.111;SC=GCAGGCAGAGATGGAAAGGGC;SOR=0.285;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=76;TCR=72;TR=147;WE=418437;WS=418419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,155:0.99:156
chr16	418462	rs11640313	C	G	5978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=81;PP=2965;SC=GGCCGGGCCACGAGTCCCCAG;SOR=0.906;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=178;TCF=96;TCR=82;TR=177;WE=418470;WS=418452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr16	419092	rs3830160	A	G	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=13;PP=1321;SC=AGTCGAGCCCATAAGCCTCAT;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=58;WE=419100;WS=419082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr16	419283	rs11434190	A	AG	1386.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=27;PP=1462;SC=AGGGGGGCCCAGGCAACTGCC;SOR=1.981;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=34;WE=419291;WS=419273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	422516	rs62030794	T	G	3862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=43;PP=2965;SC=GGGCATTCACTGGTTGGAGCA;SOR=1.681;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=86;TCR=43;TR=129;WE=422524;WS=422506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr16	424277	rs3743887	G	A	2306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=54;PP=1852;SC=AAGAATCGCCGCACTGAGACG;SOR=1.936;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=76;WE=424285;WS=424267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr16	424420	rs3743888	C	G	280.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=10;PP=293;SC=AAAACCCCGACGCGGAGGCTG;SOR=3.056;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=424428;WS=424410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	425298	rs11648905	G	T	4101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=76;PP=2965;SC=AGGCCGGGGCGGGGGGCTGGC;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=44;TCR=76;TR=120;WE=425306;WS=425288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr16	426432	rs2071915	T	C	3152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=61;PP=2431;SC=AGGGGCTGGATGGTCACGCTC;SOR=1.049;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=45;TCR=61;TR=106;WE=426440;WS=426422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr16	426476	rs2071916	T	C	3433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=54;PP=2719;SC=GACAAGGGGTTTGGCTGGAGG;SOR=0.916;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=48;TCR=54;TR=102;WE=426484;WS=426466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr16	427010	rs62030796	C	T	4201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.70;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr16	427013	rs763140	G	C	4233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.57;SOR=4.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr16	427349	rs763142	C	A	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=598;ReadPosRankSum=-0.571;SC=AGGTTCTCTGCCTCCATCCCG;SOR=0.343;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=25;TCF=13;TCR=12;TR=24;WE=427357;WS=427339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr16	427479	rs11248931	T	C	2356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=31;PP=1787;SC=CTTCTCGGTGTGGTGCTCAGC;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=51;TCR=31;TR=82;WE=427487;WS=427469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr16	427516	rs11649031	T	C	2321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=43;NR=31;PP=1941;SC=AGGAGGGCTGTACCGCGGTGT;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=43;TCR=31;TR=74;WE=427524;WS=427506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	427657	rs11641693	G	A	2153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=41;PP=1808;SC=GCAGGCGGGCGGGCAGCCACC;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=25;TCR=41;TR=66;WE=427665;WS=427647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr16	427784	rs11641742	G	A	2240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=35;PP=1711;SC=TGGCACTGCCGTACCAGCTGT;SOR=0.720;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=36;TCR=35;TR=71;WE=427792;WS=427774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	427820	rs12922073	C	T	2069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=41;PP=1539;SC=GCGGGGCCTGCGAGAAGTGCT;SOR=1.163;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=27;TCR=41;TR=68;WE=427828;WS=427810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr16	427866	rs12933709	T	C	1089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=33;PP=863;SC=GAGAAGGAGGTGTCAGCCAGG;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=37;WE=427874;WS=427856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	427925	rs61261356	T	C	334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=250;SC=GTCCCCCAGATGGAAAGGGCT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=427933;WS=427915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	449162	rs7185254	T	C	1188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=21;PP=1018;SC=CCTGTGGGGATGGGGTTGGGG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=20;TCR=21;TR=41;WE=449170;WS=449152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	449178	rs2363759	T	G	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=16;SC=TGGGGGATCCTTCTCGGCCTT;SOR=0.984;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=36;WE=449186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	449345	rs763151	G	C	5490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=76;PP=2965;SC=CACGTTTACTGTCTGCGGCTC;SOR=0.992;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=174;TCF=98;TCR=76;TR=173;WE=449353;WS=449335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr16	449659	rs14293	G	A	5360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=0.373;SC=TCCGCGCCTCGAGGGCCATGA;SOR=0.711;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=164;TCF=52;TCR=112;TR=163;WE=449667;WS=449649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,168:0.99:169
chr16	449977	rs62030825	G	C	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.76;SOR=2.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	449979	rs62030826	AC	GT	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.77;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	450140	rs35963490	C	CAG	4636.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=44;PP=2930;SC=CAGAGGGCAACGGGAGCAGCA;SOR=0.946;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=86;TCF=39;TCR=47;TR=81;WE=450148;WS=450130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr16	450165	rs448063	T	C	3467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=59;PP=2768;SC=GTCCCTGGGATTCCTCAGGGT;SOR=0.912;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=49;TCR=60;TR=108;WE=450173;WS=450155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr16	450309	rs5841	C	T	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=505;ReadPosRankSum=2.009;SC=GCTGGGCAGACGGGGGCCAGC;SOR=1.893;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=21;WE=450317;WS=450299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr16	455646	rs873477	A	G	2402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=53;PP=1783;ReadPosRankSum=0.257;SC=AGGCAGACAGATCCCGTTTGT;SOR=0.833;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=22;TCR=54;TR=75;WE=455654;WS=455636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,80:0.99:81
chr16	456239	rs11391097	G	GC	1560.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=7;PP=1446;SC=TGGGCCTTCAGCCTGGACTGG;SOR=3.160;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=37;WE=456247;WS=456229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	456291	rs11391098	G	GC	3386.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=42;PP=2975;SC=CTGGGCAGATGCCCCGGGAGT;SOR=1.201;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=43;TCR=43;TR=84;WE=456299;WS=456281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr16	460578	rs11315123	CT	C	205.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=3;PP=194;SC=GGGCCTCCCCCTGACGGCCGC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=5;WE=460586;WS=460574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	461697	rs4984667	C	T	1835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=55;PP=1591;SC=CCTCCCGGCCCCTGCGCCAGC;SOR=6.666;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=56;WE=461705;WS=461687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	570454	rs11863276	T	C	1569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=9;PP=1264;SC=TTGCTGTGCCTTCAGGACAAC;SOR=2.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=42;WE=570462;WS=570444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	570557	rs11537754	T	C	4635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=51;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.776;SC=CAGCCTTCTCTGAGTCCCTGG;SOR=0.571;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=151;TCF=100;TCR=51;TR=148;WE=570565;WS=570547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,155:0.99:156
chr16	570623	rs2071978	G	A	5566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.081;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=86;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.672;SC=TGTCTGCACGGTGTGGCCTGG;SOR=0.293;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=182;TCF=94;TCR=88;TR=180;WE=570631;WS=570613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,184:0.99:185
chr16	601892	rs28422497	T	C	1919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=40;PP=1462;SC=CTTCCTATTATAGGCCTCAGG;SOR=1.647;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=16;TCR=40;TR=56;WE=601900;WS=601882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	601914	rs12449064	G	A	1683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=36;PP=1269;SC=ATGGGCCCCCGGGGGCCGGGC;SOR=2.093;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=46;WE=601922;WS=601904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	602046	rs7196821	T	C	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=9;PP=471;SC=TCCCGCCACCTGCAGGTACTT;SOR=0.990;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=21;WE=602054;WS=602036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	602505	rs377246349	C	T	4765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=111;PP=2965;SC=GGGGGCCGCCCCTGCCGGGCA;SOR=2.560;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=31;TCR=111;TR=142;WE=602513;WS=602495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr16	602799	rs116628166	C	T	1262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=14;PP=1070;SC=GGGAGGGTGGCGTGGGGCAGG;SOR=1.662;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=30;TCR=14;TR=44;WE=602807;WS=602789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	604554	rs7763	T	C	1810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=0;PP=1542;SC=CAATTGTCAGTCCCGTTCCTT;SOR=8.015;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=54;TCR=0;TR=54;WE=604562;WS=604544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	613168	rs12597975	A	G	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=2;PP=352;SC=CCCAGGCTCCAGTCCCTGGAG;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=613176;WS=613158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	615326	rs59985111	T	C	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=23;PP=516;SC=GCCTGAGGTCTGACTGTCTCT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=615334;WS=615316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	622565	rs12917944	A	G	5549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=105;NR=71;PP=2965;SC=CCTCGTCCCTAAGGATGTGGT;SOR=1.146;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=105;TCR=71;TR=176;WE=622576;WS=622555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr16	624114	rs2071979	A	G	5776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=41;PP=2965;SC=CTGCGTCTCGACGGACAGCGG;SOR=2.223;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=126;TCR=41;TR=167;WE=624122;WS=624104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr16	624713	rs4984669	C	T	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=3;PP=559;SC=GACCCATTTGCCTGCTGTTGG;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=624721;WS=624703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	626346	rs2071980	A	C	209.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.97;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	628302	rs3752568	A	G	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=2;PP=378;SC=GTGGGAGCCCATCACGAAAGA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=628310;WS=628292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	628994	rs113780855	TGGGC	T	2721.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=41;PP=2084;SC=AGGCTCCGGCTGGGCGGGCGT;SOR=4.943;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=54;TCF=3;TCR=51;TR=43;WE=629014;WS=628984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	629006	rs59476302	C	T	2762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=39;PP=1168;SC=GGCGGGCGTTCGAGTGGGGCG;SOR=4.370;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=42;WE=629014;WS=628984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	630089	rs7191939	C	T	1502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=0;PP=1262;SC=CGCAAGGTCCCGACTGCAGCT;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=42;WE=630097;WS=630079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	630367	rs7192508	C	T	1179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=32;PP=995;SC=TCTCCTGCTGCAGGCCACGTG;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=37;WE=630375;WS=630357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	630405	rs2071982	T	G	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=23;PP=661;SC=CTCTGGGCAGTGAGTGCTGCG;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=630413;WS=630395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	632051	rs2018789	T	C	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=4;PP=710;SC=CCACCGTGCCTGGCTGCAGGA;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=632059;WS=632041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	632073	rs916414	C	T	1398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=7;PP=1119;SC=GCTTTGATGCCGGCCTGGCAG;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=43;WE=632081;WS=632063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	632115	rs916415	G	A	1987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=16;PP=1597;ReadPosRankSum=0.160;SC=CGGAGGGGGCGGGGAGAGCTT;SOR=1.022;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=64;TCF=48;TCR=16;TR=63;WE=632123;WS=632105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr16	632138	rs4262946	C	T	2180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=56;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=25;PP=1681;ReadPosRankSum=-1.259;SC=TGGGTGGCCACGGCCAGCAGC;SOR=0.564;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=47;TCR=25;TR=71;WE=632146;WS=632128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,72:0.99:73
chr16	632180	rs4984897	G	C	2312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=78;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=36;PP=1864;ReadPosRankSum=0.878;SC=GAAGGTACCTGCAGCCTCTGC;SOR=0.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=37;TCR=36;TR=72;WE=632188;WS=632170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,74:0.99:75
chr16	632198	rs916416	T	A	2529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=82;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=38;PP=2072;SC=TGCTCATGTGTGGGGCCAGCC;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=39;TCR=38;TR=77;WE=632206;WS=632188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	632225	rs4006748	T	C	3025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=30;PP=1953;SC=CGTCCCCTCGTCAGCCGCTTG;SOR=0.784;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=37;TCR=31;TR=64;WE=632241;WS=632215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr16	632230	rs67976359	CG	C	2992.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.136;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=26;PP=2488;ReadPosRankSum=1.684;SC=CCTCGTCAGCCGCTTGCTATC;SOR=0.361;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=56;TCF=26;TCR=30;TR=52;WE=632241;WS=632215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,69:0.99:70
chr16	632233	rs62030874	T	C	2941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.209;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=26;PP=1693;ReadPosRankSum=1.578;SC=CGTCAGCCGCTTGCTATCCTT;SOR=0.416;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=68;TCF=36;TCR=32;TR=57;WE=632241;WS=632215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr16	633125	rs1045277	T	C	3531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=37;PP=2839;SC=GCGCATGTCCTGTGCTTTGTG;SOR=1.490;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=75;TCR=37;TR=111;WE=633133;WS=633115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr16	633353	rs710924	TG	CA	5574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=46;PP=2947;SC=GCCCACCCTGTGTACCCAGGT;SOR=0.958;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=67;TCR=49;TR=108;WE=633362;WS=633343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr16	633764	rs8642	G	A	2980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.307;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=70;PP=2422;ReadPosRankSum=-0.860;SC=CAGGTCCTGCGGCCAAATCTG;SOR=2.421;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=91;TCF=21;TCR=70;TR=90;WE=633772;WS=633754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,93:0.99:94
chr16	633843	rs8675	A	G	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=40.65;ReadPosRankSum=-0.386;SOR=2.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr16	633851	rs8909	T	C	1122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=41.58;ReadPosRankSum=0.000;SOR=2.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr16	646421	rs4984672	A	G	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=42;PP=1347;SC=GTTGCATCACAGCTGAGTCCT;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=7;TCR=43;TR=49;WE=646429;WS=646411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	668443	rs34011309	A	G	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=29;PP=840;SC=AGGCTGGAGTACAGTGGCACA;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=668451;WS=668433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr16	675087	rs3838962	AC	A	3118.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=43;PP=2965;SC=GGCCGAGAGGACACTTAGCTT;SOR=0.914;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=73;TCF=29;TCR=44;TR=69;WE=675095;WS=675077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	675215	rs2269556	G	A	1763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=25;PP=1554;SC=CATGGAAGGCGCCCACCCCCC;SOR=0.800;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=57;TCF=31;TCR=26;TR=56;WE=675223;WS=675205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	677629	rs2269557	T	C	2282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=61;PP=1713;SC=CTAGCGGGGATGGGCGGGGCC;SOR=2.331;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=82;TCF=20;TCR=62;TR=81;WE=677637;WS=677619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr16	679814	rs12447874	T	C	2606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=51;PP=2054;SC=AAGCCCCTCCTTGGCAGCTCC;SOR=1.445;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=29;TCR=51;TR=80;WE=679822;WS=679804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr16	681280	rs4984905	G	T	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=12;PP=774;SC=CACTCCTGCCGCTCCTGCTCC;SOR=0.906;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=15;TCR=12;TR=27;WE=681288;WS=681270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	682566	rs2269561	T	C	2077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=33;PP=1564;ReadPosRankSum=-0.791;SC=CCCACCTAAGTGTCCCCCATC;SOR=0.223;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=71;TCF=37;TCR=34;TR=70;WE=682574;WS=682556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,72:0.99:73
chr16	683692	.	C	T	2243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.072;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=35;PP=1891;ReadPosRankSum=1.494;SC=CAAGCTGGCGCTGAGCCTGTG;SOR=0.313;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=35;TCR=36;TR=70;WE=683700;WS=683682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr16	688557	rs34409359	A	C	566.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=499;ReadPosRankSum=1.614;SC=GAAGGACACGATGCCCGATGC;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=19;WE=688565;WS=688547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr16	699456	rs12934086	A	G	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=15;PP=465;SC=GGTCCCGAGGATCCCGGGTTC;SOR=5.784;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=699464;WS=699446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	700970	rs2076142	C	T	3390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=33;PP=2632;SC=CCTCCCTTGACCTGGAACAAC;SOR=1.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=72;TCR=33;TR=105;WE=700978;WS=700960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr16	701296	rs2076143	G	C	2574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.91;SOR=3.113;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	701303	rs2076144	C	T	2451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.40;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	701656	rs11642546	C	T	2706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=37;PP=1996;SC=CTCCTGGGGCCGGGGCCACAG;SOR=1.046;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=49;TCR=37;TR=86;WE=701664;WS=701646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr16	702677	rs2072879	C	G	1632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=47;PP=1303;SC=CGGTCCCGTCCCCCTGCAGTC;SOR=4.575;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=50;WE=702685;WS=702667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	703721	rs9936879	A	C	5201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=104;PP=2965;SC=CCAGGCGACAATGACCACCTC;SOR=1.595;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=49;TCR=104;TR=153;WE=703729;WS=703711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr16	705360	rs3803697	T	C	3516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=81;PP=2837;ReadPosRankSum=1.427;SC=CGTGGCGGGGTGCTGCGTTCC;SOR=0.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=48;TCR=82;TR=128;WE=705368;WS=705350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,131:0.99:132
chr16	705844	rs8051645	T	C	4024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=76;PP=2965;SC=GGACGGCTTCTTGCGGCTCTG;SOR=1.374;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=45;TCR=76;TR=121;WE=705852;WS=705834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr16	705920	rs9930754	G	C	1920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=41;PP=1579;SC=TCCCAACTCCGGGAGAGCCTC;SOR=1.318;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=66;WE=705928;WS=705910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr16	706010	rs35582942	C	CA	1308.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=32;PP=1534;SC=CACAGGGTGCCACGGGGCCAA;SOR=4.294;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=34;WE=706018;WS=706000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	706067	rs9932866	G	A	289.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=7;PP=210;SC=GGCGGCCCGCGGGGCAGCCTC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=706075;WS=706057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	706534	rs28485323	G	A	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=13;PP=1207;SC=CCACCCTGCAGCAGGTGGGGT;SOR=1.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=34;TCR=13;TR=47;WE=706542;WS=706524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	706668	rs34775748	G	A	3092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=29;PP=2444;SC=GGTTTGGGCCGCCTGGAGAGC;SOR=1.790;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=61;TCR=29;TR=90;WE=706676;WS=706658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr16	707034	rs6600228	A	C	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=11;PP=582;SC=GGTCGAGGGAACCCATGGTAC;SOR=0.770;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=13;TCR=11;TR=24;WE=707042;WS=707024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	707295	rs6600229	T	G	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=18;PP=495;SC=GGCCCACACCTGGACACACAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=707303;WS=707285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	707748	rs36022186	C	T	1316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=2;PP=1115;SC=GACCCCTGCCCCGTGTGGCCA;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=39;WE=707756;WS=707738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	708071	rs2071831	G	C	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=10;PP=1292;SC=CAGGGCAGGTGCTGCCTGGGT;SOR=2.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=45;WE=708079;WS=708061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	708275	rs45613635	C	A	2747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=56;PP=2028;SC=CTCTGGGCCACCTGCTGGTGT;SOR=1.809;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=24;TCR=56;TR=80;WE=708283;WS=708265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr16	708419	rs7188691	T	C	1457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=12;PP=1248;SC=GCCTGCAGCCTCTCCAGCTGG;SOR=2.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=43;WE=708427;WS=708409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	709001	rs4984906	C	A	5420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=126;NR=35;PP=2965;SC=TGTCCTGGCCCCTACTGAGAG;SOR=2.508;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=161;TCF=126;TCR=35;TR=161;WE=709009;WS=708991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr16	709157	rs7194532	T	C	7039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=128;PP=2965;SC=GGGGTGCAGGTGCTGCGCTGA;SOR=0.903;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=234;TCF=106;TCR=128;TR=234;WE=709165;WS=709147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr16	711016	rs76032962	G	C	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=70.00;QD=18.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	711326	rs9932282	G	C	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=7;PP=1022;SC=CTCACGCCTGGCCTCTTGCCT;SOR=2.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=36;WE=711334;WS=711316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	711545	rs11284424	CG	C	4155.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=79;PP=2983;SC=CCCTAGACCCCGGGGGGGGCT;SOR=1.059;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=153;TCF=63;TCR=90;TR=131;WE=711553;WS=711535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr16	711572	rs8062682	C	T	7173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.33;QD=44.56;SOR=0.731;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr16	711582	rs8062685	C	G	7161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.33;QD=44.21;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr16	711712	rs3177415	C	T	6362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=91;PP=2965;SC=GGGACGCCGGCGAGCTCACCT;SOR=0.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=204;TCF=113;TCR=91;TR=203;WE=711720;WS=711702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr16	711905	rs2301426	A	G	5354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=107;PP=2965;SC=GTCGAGAGCCAGTCCCAGAGG;SOR=1.147;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=68;TCR=107;TR=175;WE=711913;WS=711895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr16	712127	rs10903018	A	G	2611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=22;PP=2103;SC=CTGGGGCAGAAGCCTCATCTG;SOR=1.519;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=49;TCR=22;TR=71;WE=712135;WS=712117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr16	712154	rs11248943	G	A	2597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.567;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=28;PP=2168;ReadPosRankSum=-1.044;SC=TGGCGTCCGGGCAGCCTTGTG;SOR=1.347;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=82;TCF=53;TCR=29;TR=81;WE=712162;WS=712144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,82:0.99:83
chr16	712867	rs1057835	A	G	4007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=53;PP=2965;SC=CAGCCTGGGCAGAGGCGGGGC;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=82;TCR=53;TR=135;WE=712875;WS=712857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr16	713204	rs9929652	A	G	1177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.58;QD=45.30;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	715847	rs3752494	A	G	1589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=44;PP=1407;SC=GGGCCTGCTCAGTGGGGGGCC;SOR=3.126;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=7;TCR=44;TR=51;WE=715855;WS=715837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	715990	rs7190775	G	A	2178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=12;PP=1819;SC=TGCTGTGGCCGCCCTGAGCAG;SOR=2.973;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=54;TCR=12;TR=65;WE=715998;WS=715980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr16	716428	rs3743909	G	A	7048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=119;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.961;SC=GAAGGCACCTGTCGGCCCTCA;SOR=0.306;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=220;TCF=100;TCR=120;TR=217;WE=716436;WS=716418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,222:1.00:223
chr16	717057	rs7189028	T	C	2201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=52;PP=1700;SC=TGGTGCCCTGTTCCAAGACAG;SOR=3.545;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=8;TCR=52;TR=60;WE=717065;WS=717047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr16	717085	rs7197072	C	T	1528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=43;PP=1223;SC=ACCTGTGCCCCGGGCTCCTCG;SOR=5.464;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=45;WE=717093;WS=717075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	717523	rs3752493	G	T	3324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=42;PP=2546;ReadPosRankSum=-0.737;SC=GGTTTACACCGTCCGCCAGGC;SOR=0.354;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=60;TCR=43;TR=101;WE=717531;WS=717513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,104:0.99:105
chr16	717828	rs3752490	G	T	2671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=70;PP=2127;SC=GGCATTTATTGCATTATTGCT;SOR=4.228;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=8;TCR=70;TR=78;WE=717836;WS=717818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr16	720041	rs3752489	C	T	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=4;PP=378;SC=CCCTTCTGCTCTCCCCCAGCC;SOR=1.445;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=12;WE=720049;WS=720031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	720986	rs1139897	G	A	4137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=59;PP=2965;SC=CGGGAGGACCGGCTGACCCTG;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=67;TCR=59;TR=126;WE=720994;WS=720976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr16	721798	rs146789763	T	TCCCCTG	2773.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=34;PP=2407;SC=GCATGGCGAGTCCCCTGCCCC;SOR=1.196;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=24;TCR=59;TR=48;WE=721806;WS=721788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr16	722331	rs3177338	C	T	4752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=91;PP=2965;SC=GGTAGGGGCCCGTGGAGTGGG;SOR=1.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=43;TCR=91;TR=134;WE=722339;WS=722321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr16	722548	rs1128550	A	G	3456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=50;PP=2965;SC=AGGTCAATGGACAGGAGAAGT;SOR=0.732;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=52;TCR=50;TR=102;WE=722556;WS=722538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr16	723647	rs1045716	C	G	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=386;SC=CCTGGGTGTGCCTCGCTGCTG;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=723655;WS=723637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	724084	rs1045763	C	T	1639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=42;PP=1335;ReadPosRankSum=-0.778;SC=TAGCAGAGGACCGGAGGTTGG;SOR=2.187;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=7;TCR=43;TR=49;WE=724092;WS=724074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr16	732287	rs3216838	GC	G	6420.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=73;PP=2951;SC=TGCAGGTGAGGCCTGCGGCTG;SOR=0.947;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=163;TCF=87;TCR=76;TR=158;WE=732295;WS=732277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr16	735794	rs11640115	A	G	8722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=146;NR=124;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.806;SC=CTGCCCGACAATGGGGCGGGC;SOR=0.296;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=271;TCF=147;TCR=124;TR=270;WE=735802;WS=735784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,272:1.00:273
chr16	735921	rs763053	T	C	5648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=139;PP=2965;ReadPosRankSum=1.422;SC=TGTCGCTCCGTGCATCTCCTT;SOR=0.904;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=197;TCF=57;TCR=140;TR=196;WE=735929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,200:1.00:201
chr16	737793	rs1018804	G	A	3970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.012;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=88;PP=2965;ReadPosRankSum=1.555;SC=CATGAGGTGCGCCCTCAGAAC;SOR=1.623;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=131;TCF=43;TCR=88;TR=130;WE=737801;WS=737783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,129:0.99:130
chr16	740404	rs4984682	C	G	5912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=59;PP=2965;SC=AAGCCGCTGTCTTTCCCGTCC;SOR=1.546;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=118;TCR=59;TR=177;WE=740412;WS=740394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr16	740466	rs4984913	A	G	5447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=90;PP=2965;SC=AGTGGGCACAAACTCTCGCCC;SOR=0.907;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=168;TCF=76;TCR=92;TR=166;WE=740474;WS=740456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr16	746884	rs4984683	A	C	8545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=161;NR=100;PP=2965;ReadPosRankSum=0.758;SC=CGGAGACGCCAACCAGGCAGA;SOR=1.244;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=263;TCF=162;TCR=101;TR=261;WE=746892;WS=746874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,268:0.99:270
chr16	746914	rs4984915	G	A	9753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=173;NR=127;PP=2965;SC=AGCCTCTGGCGGCAAAACCCT;SOR=1.043;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=300;TCF=173;TCR=127;TR=300;WE=746922;WS=746904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr16	747454	rs12922098	T	C	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=31;PP=920;SC=AGTGAGTCTGTTGCTGAGTCT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=747462;WS=747444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	786279	.	G	C	4536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=41;PP=2965;SC=TTTTTTTAAAGAATGAGGTTA;SOR=1.948;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=99;TCR=41;TR=140;WE=786287;WS=786269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr16	786320	.	G	T	5755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.979;ClippingRankSum=0.000;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.199;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.034;SC=GGATTCAGCTGAAACCGTGCA;SOR=0.378;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=184;TCF=96;TCR=88;TR=183;WE=786328;WS=786310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,187:0.99:188
chr16	812539	rs1076675	C	T	2180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=3;PP=1846;SC=GGCCAGGGTGCGGACACAAGC;SOR=5.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=71;TCR=3;TR=72;WE=812547;WS=812529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	813783	rs113413715	C	A	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5753;FS=4.771;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=17;PP=374;ReadPosRankSum=1.834;SC=CCAGCATCCCCTCCCCCTTCC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=17;WE=813791;WS=813773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr16	813790	rs77068987	T	G	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.13;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr16	813793	rs377332499	CT	C	122.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.46;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr16	813798	.	CTG	C	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.79;ReadPosRankSum=-1.834;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr16	813802	.	T	C	126.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.11;ReadPosRankSum=-0.652;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr16	813803	.	C	CCA	117.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.82;ReadPosRankSum=-0.652;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr16	813808	.	T	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.19;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,1:0.25:4
chr16	815628	rs1737340	A	G	2508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=38;PP=1897;SC=GTGAGACCCCAATCCCCAGCC;SOR=0.788;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=40;TCR=38;TR=78;WE=815636;WS=815618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr16	818687	rs141160926	C	T	4689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=46;PP=2965;SC=GGACCTGGACCTGTTCTCACC;SOR=1.626;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=91;TCR=46;TR=137;WE=818695;WS=818677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr16	825003	rs142136229	G	T	1433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=29;PP=1108;SC=GGTCGGAGGCGCTGAGTCGCA;SOR=1.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=825011;WS=824993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	839262	rs569951	A	G	1715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=24;PP=1430;SC=TGAACTTCAGATCGGAGGAGA;SOR=0.808;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=28;TCR=24;TR=52;WE=839270;WS=839252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	845901	rs2982244	T	C	5682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=99;PP=2965;SC=GAGCACACATTTGTACAGCCT;SOR=1.199;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=68;TCR=100;TR=167;WE=845909;WS=845891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr16	905559	rs4984949	A	C	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=398;SC=AGGCGCCAGGAGGAATTGTCA;SOR=4.174;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=15;WE=905567;WS=905552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	942989	rs11864203	G	C	1722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=1;PP=1404;SC=CTGCCCTCACGCTGCACGGCA;SOR=6.518;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=49;WE=942997;WS=942979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	943107	rs4984705	A	G	5402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=89;PP=2965;SC=AGTCAGTCACAGGGGCTGGGG;SOR=0.715;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=89;TCR=89;TR=178;WE=943115;WS=943097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr16	943130	rs4984706	C	G	5696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=95;PP=2965;SC=GCGGCGGCCCCGACAGAAACA;SOR=0.703;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=94;TCR=95;TR=189;WE=943138;WS=943120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr16	943317	rs11404654	C	CT	2797.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=50;PP=2936;SC=CAGTGGCTTCCTTTGCGCCTT;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=29;TCR=57;TR=75;WE=943325;WS=943307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr16	943361	rs4984707	T	C	2459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=38;PP=2041;SC=CCACGCATCATCACGCTACAG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=37;TCR=38;TR=75;WE=943369;WS=943351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr16	943534	rs4984708	C	A	1050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=29;PP=914;SC=CAAAGGGAGCCGAGGCGCAGG;SOR=3.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=32;WE=943542;WS=943524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	1031303	.	TGAGA	T,TGA	411.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=53.00;QD=27.45;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,9,6:0.60,0.40:15
chr16	1031343	.	AGAGAGTGT	A	418	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=52.45;NF=0;NR=8;PP=418;QD=52.625;SC=AGAGAGAGAGAGAGAGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=8;WE=1031358;WS=1031333;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr16	1031347	.	A	T	159	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=18;MMLQ=28;MQ=51.94;NF=0;NR=6;PP=159;QD=32.2952020912;SC=AGAGAGAGAGAGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=6;WE=1031358;WS=1031333;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr16	1034834	rs237674	T	C	6912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=109;PP=2965;SC=ACTTCAGCAATGTGGACATCT;SOR=0.869;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=241;TCF=132;TCR=109;TR=241;WE=1034842;WS=1034824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr16	1115495	rs213659	T	C	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=12;PP=878;SC=GAGTGCAGGTTGGGGATGGGC;SOR=1.662;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=37;WE=1115503;WS=1115485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	1116213	rs596501	G	A	2594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=43;PP=2098;SC=GGGAGCCCGGGCCGCCCTGGG;SOR=0.766;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=39;TCR=43;TR=81;WE=1116228;WS=1116203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr16	1116220	rs34024516	T	TG	2509.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=33;PP=2366;SC=CGGGCCGCCCTGGGGGACGCT;SOR=0.770;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=78;TCF=38;TCR=40;TR=61;WE=1116228;WS=1116203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr16	1116445	rs530518	A	G	4521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=69;PP=2965;SC=GTTCGGGTCGAGGTCTGCAGC;SOR=0.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=74;TCR=70;TR=143;WE=1116453;WS=1116435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr16	1116567	rs598257	C	A	2281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=62;PP=1789;ReadPosRankSum=-0.809;SC=GATGTGGACACCCCCTGAAAC;SOR=1.584;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=78;TCF=15;TCR=63;TR=77;WE=1116575;WS=1116557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,77:0.99:78
chr16	1129872	rs169068	C	T	5337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=137;PP=2965;SC=GCCACGGAGCCGCGTCCAGAC;SOR=3.545;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=161;TCF=24;TCR=137;TR=161;WE=1129880;WS=1129862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr16	1129912	rs642249	A	G	3228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=86;PP=2689;SC=AGGCCACGCCACCCGCGCACC;SOR=4.047;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=12;TCR=86;TR=98;WE=1129920;WS=1129902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr16	1131181	rs12599155	C	T	7988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.098;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=200;PP=2965;ReadPosRankSum=2.462;SC=GGCACCTTGGCCTTGCTCTGA;SOR=3.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=230;TCF=29;TCR=201;TR=228;WE=1131189;WS=1131171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,242:0.99:244
chr16	1244877	rs9936834	G	A	3263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.52;SOR=4.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr16	1244887	rs3751661	T	A	3344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.34;SOR=3.345;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr16	1245293	rs35250176	G	A	279.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=201;SC=GCAGGGCTCAGTTCCTGGGGC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=1245301;WS=1245283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	1250559	rs8044363	T	C	4748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=106;PP=2965;SC=ACGCCTGGATTGCCATCTTCC;SOR=1.684;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=51;TCR=106;TR=157;WE=1250567;WS=1250549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr16	1252259	rs9934839	A	G	3521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=51;PP=2929;SC=CCAGCCTCAGACTGGCCACAG;SOR=0.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=52;TCR=51;TR=103;WE=1252267;WS=1252249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr16	1252441	rs4984636	T	C	4019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=68;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.998;SC=CCGCATGTGGTCGGGGAGCAT;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=51;TCR=69;TR=119;WE=1252449;WS=1252431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,128:0.99:129
chr16	1255030	.	A	G	303	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=23;MQ=50.08;NF=14;NR=0;PP=303;QD=24.1265151819;SC=GGTGGGAGCCACGGGTGGGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=1255048;WS=1255021;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	1255040	.	GC	G	743	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=28;MQ=55.12;NF=21;NR=0;PP=743;QD=36.8571428571;SC=ACGGGTGGGGGCCCCAGATCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=21;WE=1255048;WS=1255021;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,21:0.84:25
chr16	1255058	.	T	G	1150	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MMLQ=24;MQ=56.97;NF=40;NR=1;PP=1150;QD=28.8968588426;SC=TCAGTGCCGGTGAGGGGTGGG;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=41;WE=1255066;WS=1255048;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	1260021	rs8056494	G	T	1706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=11;PP=1365;SC=AGAAGCCGCCGCCTCATCCCA;SOR=2.540;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=49;WE=1260029;WS=1260011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
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chr16	1260767	rs2738897	G	A	2655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=59;PP=2011;SC=CCTGAGCTCAGTGCCATTGGC;SOR=2.140;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=22;TCR=59;TR=81;WE=1260775;WS=1260757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	1261024	rs2738898	C	T	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=9;PP=424;SC=AGTCCCCTGACGCCACTGCCC;SOR=0.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=17;WE=1261032;WS=1261014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	1261119	rs2738899	G	A	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=3;PP=1327;SC=GCCGGCGCCTGGCAGCTGCTG;SOR=4.977;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=50;WE=1261127;WS=1261109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	1261219	rs2753326	A	G	9483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.73;SOR=1.947;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr16	1261222	rs2753325	A	G	9622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.55;SOR=1.953;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr16	1261282	rs4984637	T	C	8800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.434;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=124;NR=147;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.730;SC=TTTTTGGCATTTTGGGTGTGC;SOR=0.543;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=272;TCF=125;TCR=147;TR=271;WE=1261290;WS=1261272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,279:1.00:280
chr16	1261377	rs2738900	G	A	4402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=95;PP=2965;ReadPosRankSum=1.769;SC=CAGCGCCGCTGCGGGACGGGG;SOR=0.809;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=139;TCF=42;TCR=97;TR=137;WE=1261385;WS=1261367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,137:0.99:138
chr16	1265720	rs3897150	C	T	1500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=43;PP=1256;SC=GCTGAAGCTGCGTCCCTGCTG;SOR=3.958;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=48;WE=1265728;WS=1265710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	1266803	rs11395347	C	CT	1740.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=1;PP=1828;SC=TTCCACTTGGCCGGGCCCGGA;SOR=6.184;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=42;WE=1266811;WS=1266793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	1268494	rs2745136	C	T	2925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.380;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=51;PP=2249;ReadPosRankSum=0.056;SC=GCGCCAGGGACGCCCCAAACC;SOR=0.525;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=92;TCF=41;TCR=51;TR=91;WE=1268502;WS=1268484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,97:0.99:98
chr16	1269029	rs2738893	T	C	2625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=26;PP=2050;SC=CCAGATCCCATTGGCTGTGTC;SOR=1.816;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=56;TCR=26;TR=82;WE=1269037;WS=1269019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr16	1270162	rs1054645	G	A	3439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=51;PP=2731;ReadPosRankSum=-0.700;SC=TTCGGACAGCGCTGCGTCTCC;SOR=0.223;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=111;TCF=58;TCR=53;TR=108;WE=1270170;WS=1270152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr16	1270349	rs4247094	T	C	2617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=59;NR=30;PP=2104;SC=ACAGCGTGGATGCTCAGGGCT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=59;TCR=30;TR=89;WE=1270357;WS=1270339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr16	1271890	rs1004041	G	T	5400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=119;NR=47;PP=2965;SC=CGGGGAGGAAGAAGCCAGCCA;SOR=1.974;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=166;TCF=119;TCR=47;TR=166;WE=1271898;WS=1271880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr16	1272038	rs11248860	G	A	6279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=128;PP=2965;SC=CCAGCTCACAGTGCCAGCCTG;SOR=1.561;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=194;TCF=66;TCR=128;TR=194;WE=1272046;WS=1272028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr16	1272684	rs4984638	C	G	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=21;PP=1058;SC=GCCGGTCACCCAGCACCGGAT;SOR=0.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=22;TCR=21;TR=43;WE=1272692;WS=1272674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	1272865	rs4984639	G	A	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=15;PP=691;SC=TGGGGAGACAGAGTGATCTCC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=27;WE=1272873;WS=1272855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	1273025	rs35047315	C	T	267.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=7;PP=208;SC=CAGCTCTTCCCTCCTAGGCTT;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=1273033;WS=1273015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	1273490	rs760357	C	T	1032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=8;PP=782;SC=CACACGTGCACCCTCCGCAGG;SOR=2.235;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=1273498;WS=1273480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	1273638	rs909920	A	G	2624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=50;PP=2073;SC=ATCCCAAGAAACCCACTGCAC;SOR=1.065;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=37;TCR=50;TR=87;WE=1273646;WS=1273628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr16	1275135	rs9938123	T	C	2971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=34;PP=2362;SC=CAGCCCCCAGTTTCACCCCCA;SOR=1.203;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=58;TCR=34;TR=92;WE=1275143;WS=1275125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr16	1278599	rs4360940	A	G	3002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=22;PP=2537;SC=TGGTGTTTTGAACAGGAGGGG;SOR=2.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=68;TCR=22;TR=90;WE=1278607;WS=1278589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr16	1278744	rs62012862	C	T	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.75;MQRankSum=-0.160;QD=39.52;ReadPosRankSum=-0.747;SOR=6.630;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr16	1278767	rs201725275	C	T	1625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.82;MQRankSum=-0.115;QD=40.64;ReadPosRankSum=1.436;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,39:0.98:40
chr16	1278806	rs199504258	G	A	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.68;QD=33.59;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	1279537	rs188458795	C	G	357.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.68;QD=39.75;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	1279545	rs1800990	T	C	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.68;QD=41.86;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	1279555	rs148897236	C	T	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.68;QD=51.86;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	1279574	rs199887053	C	G	951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.67;QD=45.32;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	1279584	rs111992451	T	C	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.57;QD=40.81;SOR=1.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	1279623	rs72633259	G	A	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=17;PP=763;SC=GGGAGCCCCCGCAGAAGTGCA;SOR=0.892;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=35;WE=1279631;WS=1279613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
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chr16	1279710	rs200630968	G	A	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.65;MQRankSum=0.310;QD=32.91;ReadPosRankSum=0.508;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
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chr16	1306346	rs3865205	CG	GC	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=1.561;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.78;MQRankSum=-2.569;QD=4.09;ReadPosRankSum=-1.452;SOR=1.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,8:0.19:43
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chr16	1306410	rs3993979	A	G	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=14.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.77;MQRankSum=-2.634;QD=12.31;ReadPosRankSum=-0.558;SOR=4.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
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chr16	1306469	rs2401940	T	G	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.166;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.604;NF=0;NR=8;PP=116;ReadPosRankSum=0.632;SC=GAAGGGCTGGTCCCAGGCGTG;SOR=4.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=8;WE=1306477;WS=1306459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr16	1306484	rs2401939	G	T	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=27.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.46;MQRankSum=-5.297;QD=6.56;ReadPosRankSum=0.368;SOR=4.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr16	1306490	rs2401938	T	C	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=25.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.60;MQRankSum=-5.012;QD=7.29;ReadPosRankSum=0.117;SOR=3.896;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr16	1306671	rs1141966	G	A	1721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.91;QD=45.31;SOR=1.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	1306681	rs1141967	G	A	1746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.71;QD=45.97;SOR=1.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	1306802	rs2401930	A	G	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.311;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.820;NF=9;NR=0;PP=122;ReadPosRankSum=0.037;SC=GCCCAGGGACATCAAGGATCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=9;WE=1306810;WS=1306792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr16	1306817	rs3993983	G	A	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.447;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.733;NF=11;NR=0;PP=212;ReadPosRankSum=-0.738;SC=GGATCTGGCCGCCCTCAGGGT;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=11;WE=1306825;WS=1306807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr16	1306918	rs74470113	C	T	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQRankSum=-3.504;QD=21.93;ReadPosRankSum=0.156;SOR=0.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,39:0.56:70
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chr16	1306927	rs79472859	C	T	1588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.78;MQRankSum=-3.511;QD=22.38;ReadPosRankSum=1.086;SOR=0.577;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,41:0.58:71
chr16	1306971	rs72775466	A	G	1580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=10.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQRankSum=-4.214;QD=18.82;ReadPosRankSum=1.900;SOR=0.909;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,42:0.50:84
chr16	1306971	.	ACA	GCG	2025	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=25;MMLQ=23;MQ=57.54;NF=8;NR=21;PP=2025;QD=71.6713060297;SC=ATCTCCAGCCACATCCACACG;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=29;WE=1306994;WS=1306961;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:43,29:0.40:72
chr16	1306973	rs79313952	A	G	1580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=14.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQRankSum=-4.316;QD=18.82;ReadPosRankSum=2.061;SOR=1.192;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,41:0.49:84
chr16	1306986	rs72775467	C	T	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.608;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.565;NF=7;NR=23;PP=2043;ReadPosRankSum=0.986;SC=CACACGGTCACGCTGCCCCCT;SOR=1.722;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=71;TCF=30;TCR=41;TR=30;WE=1306994;WS=1306961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,37:0.46:80
chr16	1311333	rs3765436	A	G	6081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.118;SC=CAGGATCCAGAGCACGTAGAT;SOR=0.231;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=193;TCF=95;TCR=98;TR=192;WE=1311341;WS=1311323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,196:0.99:197
chr16	1311513	rs3085832	G	GGGCA	4635.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.310;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.287;NF=32;NR=47;PP=2974;ReadPosRankSum=1.040;SC=GGTGGGAGCAGGGCAGGCAGG;SOR=0.472;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=107;TCF=45;TCR=62;TR=79;WE=1311521;WS=1311503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,104:0.99:105
chr16	1312546	rs1610293	T	A	5899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.483;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=1.452;SC=CATTAGCGGCTCAGATCATGG;SOR=0.583;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=193;TCF=105;TCR=88;TR=192;WE=1312554;WS=1312536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,193:0.99:194
chr16	1312826	rs7184111	A	G	3961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=63;PP=2965;SC=AGTGGGCAGCAGTCAGCACCC;SOR=0.739;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=67;TCR=63;TR=129;WE=1312834;WS=1312816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr16	1312976	rs8048322	T	G	4421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=87;PP=2965;SC=GGTCATTCTCTGGGACGGGCA;SOR=1.324;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=52;TCR=88;TR=139;WE=1312984;WS=1312966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr16	1323539	rs8060254	T	C	1702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=1;PP=1406;SC=CCATGTGCGATGGAGGAGCAG;SOR=6.556;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=51;TCR=1;TR=52;WE=1323547;WS=1323529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	1323781	rs1610294	T	C	2578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=75;PP=2047;SC=ACCAGGGGGCTGCCTGAGTCA;SOR=3.467;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=13;TCR=75;TR=88;WE=1323789;WS=1323771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr16	1326785	rs35786958	A	T	218.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=215;SC=TCAGGGGTGGAGGGCGTGGGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=1326793;WS=1326775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	1358608	rs148430996	ATGAGGGAGGGAGGGAATTAG	A	2272.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=2;PP=2973;SC=GATCGAATGAATGAGGGAGGG;SOR=4.255;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=26;WE=1358635;WS=1358598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	1358917	rs11644706	A	T	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=10;PP=304;SC=GGGAGGGGGGACCGGAAGCGC;SOR=2.670;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=12;WE=1358925;WS=1358907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	1358976	rs11645809	T	A	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=2;PP=79;SC=GTCCCCCACGTCCCGCCCGCG;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=1358984;WS=1358966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	1364140	rs9941160	T	C	4957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=91;PP=2965;SC=GCGGACAGGCTCCCTCGGCTG;SOR=0.972;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=67;TCR=91;TR=158;WE=1364148;WS=1364130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr16	1364281	rs4984806	T	C	4071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=61;PP=2965;SC=GTGGTTGTTTTCTTTTCTCTC;SOR=0.774;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=125;TCF=64;TCR=61;TR=125;WE=1364289;WS=1364271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr16	1364365	rs4610	A	G	1968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=51;PP=1643;SC=GCGCCATTCCAGGAAAGAAAG;SOR=3.334;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=8;TCR=51;TR=59;WE=1364373;WS=1364355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	1370303	rs909916	T	C	3602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.60;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr16	1370309	rs909917	C	G	3478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.60;SOR=1.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	1370597	rs4017786	G	C	3274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=88;PP=2784;SC=GGGAGTGGAGGACACAGGCTC;SOR=6.273;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=91;TCF=3;TCR=88;TR=91;WE=1370605;WS=1370587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr16	1370614	rs8063770	C	G	2887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=83;PP=2473;SC=GCTCACCCTACGGACAGCCAG;SOR=7.523;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=84;TCF=1;TCR=83;TR=84;WE=1370622;WS=1370604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr16	1370630	rs8043720	A	G	2594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=75;PP=2252;SC=GCCAGGGTCCACGCCTCTGTG;SOR=6.466;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=77;TCF=2;TCR=75;TR=77;WE=1370638;WS=1370620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr16	1388888	rs7197416	C	T	4956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=96;NR=51;PP=2965;SC=TGAGCTGACCCGGCTCTTTCT;SOR=1.406;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=148;TCF=97;TCR=51;TR=147;WE=1388896;WS=1388878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr16	1389153	rs7202563	C	A	2576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=62;PP=2068;SC=TCACCCTGGGCCCCACACACA;SOR=2.391;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=16;TCR=62;TR=78;WE=1389161;WS=1389143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr16	1389394	rs113817326	G	A	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=635;ReadPosRankSum=-0.612;SC=GGCTCCTGGTGCAAAGAGGCA;SOR=1.839;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=26;WE=1389402;WS=1389388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr16	1390789	rs148053271	A	G	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=2;PP=447;SC=GCTGCCTCCCAGGCTTCCCCC;SOR=3.014;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=1390797;WS=1390779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	1393020	rs2235632	G	A	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=22;PP=760;SC=GCCGTGCTGTGAGTGGGTGGA;SOR=1.270;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=35;WE=1393028;WS=1393010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	1394430	rs12597545	C	T	2168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.97;NF=34;NR=28;PP=1738;SC=CTTCCTCTTCCCTGCAATCCA;SOR=0.787;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=34;TCR=28;TR=62;WE=1394438;WS=1394420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	1394507	rs1132356	A	C	3829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=39;PP=2965;SC=ATCCTGAATGACAAGAGTCCC;SOR=1.476;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=78;TCR=39;TR=116;WE=1394515;WS=1394497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr16	1394551	rs11248872	A	G	3627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=45;PP=2897;SC=GACCCTGGCCATGAGGGGTAC;SOR=1.430;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=80;TCR=45;TR=125;WE=1394559;WS=1394541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr16	1396788	rs3215518	TGCAGGTGGGGCCAGCGGG	T	686.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=2;PP=2957;SC=CAGGCCATTCTGCAGGTGGGG;SOR=2.584;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=12;WE=1396813;WS=1396778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	1397518	rs34339539	G	GC	928.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=4;PP=1176;SC=GCACCCAGGGGCCCCTCCTGA;SOR=2.985;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=28;WE=1397526;WS=1397508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	1397815	rs1132358	C	T	6050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=94;PP=2965;SC=TCCCCCTGGACGCCAACGGTG;SOR=0.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=185;TCF=91;TCR=94;TR=185;WE=1397823;WS=1397805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr16	1398077	rs34766513	C	CCT	11379.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=135;PP=2930;SC=GCGAGACTCCCGACTGGCCTC;SOR=0.976;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=234;TCF=92;TCR=142;TR=224;WE=1398085;WS=1398064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr16	1400693	rs2294605	C	T	921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=5;PP=804;SC=CTGAACTGTTCCCCTGTCCGT;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=1400701;WS=1400683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	1407792	rs4984644	T	C	139.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.56;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=1;PP=87;SC=GGGATGACAGTCATGAGCCAC;SOR=1.329;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=1407800;WS=1407782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	1407809	rs4984820	T	C	99.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.76;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	1417408	rs4984823	T	C	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=454;SC=CTGCAGACCCTCTTGCCTGTG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=1417416;WS=1417398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	1419947	rs11248874	A	G	1841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=14;PP=1375;SC=TTGCAGTCCAACCTGGGCGAC;SOR=1.961;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=53;WE=1419955;WS=1419937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	1433766	rs12918814	T	C	4095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=80;PP=2965;SC=CGGGTCCTGATGGTGCTGGGG;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=58;TCR=80;TR=138;WE=1433774;WS=1433756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr16	1442748	rs144573381	T	C	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=7;PP=1262;SC=GTGGCAAGGATTTTTCTAGAC;SOR=3.215;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=49;WE=1442756;WS=1442738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	1447278	.	A	G	84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=24;MQ=52.92;NF=0;NR=4;PP=84;QD=29.6928031368;SC=CGTGCTTCACACTGGGGCAGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=1447286;WS=1447268;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	1451519	rs761068	G	A	973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=7;PP=755;SC=CTGTTCTCGCGCTGTGCCCGC;SOR=2.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=33;WE=1451527;WS=1451509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr16	1455900	rs8044833	C	T	8215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=158;NR=100;PP=2965;SC=CCTCAGGAAGCTCTCACCTGA;SOR=1.266;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=258;TCF=158;TCR=100;TR=258;WE=1455908;WS=1455890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr16	1458561	rs2179534	T	C	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=13;PP=767;SC=TGGGGAGCCATAGGATGAGGA;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=17;TCR=13;TR=30;WE=1458569;WS=1458551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	1464636	rs111437424	A	C	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=8;NR=12;PP=310;SC=TCGGCTTCTCAGTCTGCGGGG;SOR=0.874;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=20;WE=1464644;WS=1464626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	1476465	rs4984834	A	G	280.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=202;SC=AGTTAATCTCAGTCTCAAACA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=1476473;WS=1476455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	1484338	rs7192100	A	G	1163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=10;PP=936;SC=TCAGCCCCACAGGCCCTGGGT;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=38;WE=1484346;WS=1484328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	1484392	rs12598718	G	C	1892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=23;PP=1554;SC=GCTCTAATGAGTACAAAGCCA;SOR=1.217;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=37;TCR=23;TR=60;WE=1484400;WS=1484382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr16	1484473	rs7192331	A	G	2105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=41;PP=1601;ReadPosRankSum=-0.769;SC=GGGCTTCTCCAGGACCCCTCC;SOR=0.307;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=33;TCR=42;TR=74;WE=1484481;WS=1484463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,75:0.99:76
chr16	1492660	rs760993	T	C	1402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=15;PP=1026;SC=AACAGAGGAATGGGAAACACA;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=40;WE=1492668;WS=1492650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	1493030	rs1883480	C	G	2562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=62;PP=2076;SC=GCAGCCTCGGCGGGCTGGGGG;SOR=2.584;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=17;TCR=63;TR=79;WE=1493038;WS=1493020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr16	1493098	rs760994	G	A	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=25;PP=872;SC=TCTGAAGGCCGCCCAGGCACG;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=34;WE=1493106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	1493130	rs760995	C	T	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=16;PP=798;SC=CCTTTTCTAGCTGGACCTGGA;SOR=0.997;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=28;WE=1493138;WS=1493120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	1493175	.	G	C	1075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=5;PP=900;SC=CCCAGCGGGAGATGTGGACCC;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=1493183;WS=1493165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	1493759	rs12596752	C	T	2092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=47;NR=22;PP=1684;SC=GCGGCGGCGACGTGGTCCTCC;SOR=1.678;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=47;TCR=22;TR=69;WE=1493767;WS=1493749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr16	1497137	rs12599176	C	T	1511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=36;PP=1154;SC=CAGAGGCAGGCGGGACCCTCA;SOR=3.611;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=42;WE=1497145;WS=1497127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	1498197	rs2235578	A	G	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=4;PP=495;SC=GCGTCCACACAGCCCTCCATG;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=1498205;WS=1498187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	1498520	rs12597739	A	G	1227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=29;PP=941;SC=TGCCCGTCACACGCCACCAAC;SOR=2.419;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=38;WE=1498528;WS=1498510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	1499377	rs742408	C	T	1754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=31;PP=1402;ReadPosRankSum=-0.822;SC=CAGGCCCAAACCCACCAAGAT;SOR=0.266;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=27;TCR=32;TR=58;WE=1499385;WS=1499367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,59:0.98:60
chr16	1500708	rs61073146	G	GC	2423.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=56;PP=2655;SC=CACGACTCCCGCCTCCGCAGG;SOR=3.193;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=68;TCF=6;TCR=62;TR=61;WE=1500716;WS=1500698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr16	1503879	rs2235579	T	A	7035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=158;PP=2965;SC=CATTGAACACTGCTCCAAGCA;SOR=2.014;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=219;TCF=61;TCR=158;TR=219;WE=1503887;WS=1503869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr16	1504017	rs4786337	A	G	1398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=39;PP=1130;SC=GCAGGGGGCTAGGGGGTCCTG;SOR=5.283;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=41;WE=1504025;WS=1504007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	1504633	rs4265806	C	T	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=528;SC=ACTGGGTGTTCTGAGCAGGCC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=1504641;WS=1504623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	1505599	rs7190701	C	T	2125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=5;PP=1698;SC=TGGGCAGGACCAAGGCCTGAC;SOR=4.615;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=56;TCR=5;TR=60;WE=1505607;WS=1505589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	1507778	rs9922189	T	C	6147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=120;PP=2965;SC=GGGAGACGCATGGCCTCTGAT;SOR=1.028;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=207;TCF=86;TCR=121;TR=206;WE=1507786;WS=1507768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr16	1507842	rs8061743	CG	TC	4726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=75;PP=2947;SC=CACACAGCCCCGATCAGGCAG;SOR=3.133;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=94;TCF=15;TCR=79;TR=90;WE=1507851;WS=1507832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr16	1509273	.	A	AGGAGAGCAGCAGACACGTCGGGGCCTCAGGGAAGG	980.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.79;QD=54.49;SOR=3.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	1509326	rs117037259	C	T	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.38;QD=29.58;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	1510567	rs2072950	T	G	4062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=94;PP=2965;SC=TTCCCCGTCATGACCACCCAG;SOR=2.194;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=33;TCR=94;TR=127;WE=1510575;WS=1510557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr16	1511552	rs2744994	G	T	1831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=12;PP=1479;SC=GGAGTGGGCTGGCAGGGGGCA;SOR=2.604;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=57;WE=1511560;WS=1511542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	1515162	rs2235580	C	T	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=320;SC=GAACCCCGGCCCTGGGGCCCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=1515170;WS=1515152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	1515503	rs2744997	G	A	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=200;SC=GGGCTGGGACGGGCCTCCCTG;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=1515511;WS=1515493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	1524046	rs77259422	T	C	1267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=3;PP=1047;SC=GATCGCGCCATTGCACTCCAG;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=38;WE=1524054;WS=1524036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	1524085	rs55927314	C	CA	1344.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.99;MQRankSum=0.057;QD=28.02;ReadPosRankSum=-1.759;SOR=0.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,44:0.92:48
chr16	1524261	rs28550432	G	T	2193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=58;PP=1861;ReadPosRankSum=1.539;SC=AACTCGGTGCGAAGGGAGACT;SOR=2.103;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=10;TCR=59;TR=68;WE=1524269;WS=1524251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,68:0.99:69
chr16	1524850	rs3751884	A	G	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=2;PP=586;SC=GCGCAGCCCCAGGCCCAGCCC;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=1524858;WS=1524840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	1525109	rs116220083	C	G	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=24;PP=678;SC=CCTGCAACGGCAACCACCGAG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=1525117;WS=1525099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	1547220	rs2235630	C	T	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=7;PP=355;SC=TCCCCTTGCCCGGTCCTGTCC;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=13;WE=1547228;WS=1547210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	1557090	rs11248882	A	G	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=24;PP=854;SC=GGCCTGTGCTAACCATGGATC;SOR=2.694;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=1557098;WS=1557080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	1557794	rs12927760	A	T	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=494;SC=TGTGTGTGTGAGAGATGTGTC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=19;WE=1557802;WS=1557784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	1651721	.	G	GT	5436.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=56;PP=2967;SC=AGGATAGGTGGTAAGAATGCA;SOR=1.251;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=67;TCR=57;TR=121;WE=1651729;WS=1651711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr16	1815946	rs2575371	C	T	6226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=133;NR=59;PP=2965;SC=GCTGACGGGCCGTCCCTCTCC;SOR=1.814;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=192;TCF=133;TCR=59;TR=192;WE=1815954;WS=1815936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr16	1817431	rs2575369	C	T	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=6;PP=439;SC=GACTCAGGCTCGAACAGGCGC;SOR=1.244;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=16;WE=1817439;WS=1817421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	1817754	rs2076427	A	G	2898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=22;PP=2233;SC=GCCACGCCAGATGGGGTGGTG;SOR=2.276;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=63;TCR=22;TR=85;WE=1817776;WS=1817744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr16	1817768	rs2076428	T	G	3157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=25;PP=2494;SC=GGTGGTGGGGTGCTCAAGGCC;SOR=2.184;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=67;TCR=25;TR=92;WE=1817776;WS=1817744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr16	1817935	rs2076429	A	C	4944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=94;PP=2965;SC=TGGCCTGCACACCTGCAGGGG;SOR=1.294;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=56;TCR=94;TR=150;WE=1817943;WS=1817925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr16	1818152	rs2076430	CT	TC	7297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=51;PP=2947;SC=GCCTCTCCCACTCTCCACCTG;SOR=1.744;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=161;TCF=109;TCR=52;TR=156;WE=1818161;WS=1818142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr16	1818503	rs2076431	G	C	2073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=47;PP=1679;SC=CCCTGAATGGGAGTGTGCTGG;SOR=2.303;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=60;TCF=12;TCR=48;TR=59;WE=1818511;WS=1818493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	1818680	rs2072989	G	C	1985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=21;PP=1589;SC=GAGCCTGGCCGTCACTCTGCT;SOR=1.292;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=59;WE=1818688;WS=1818670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr16	1820992	rs11890	T	A	4747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=106;PP=2965;SC=GCCCCTGCCATACCTGTGCGG;SOR=1.997;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=146;TCF=38;TCR=108;TR=144;WE=1821000;WS=1820982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr16	1822797	rs34595082	C	CACCT	727.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=6;PP=547;SC=GGGGTGCACGCACCTGCGCCG;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=10;WE=1822805;WS=1822787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	1822947	rs1076695	C	G	1128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=11;PP=911;SC=TCTCGCGGCGCACGTCGGCCC;SOR=1.418;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=32;WE=1822955;WS=1822937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	1823247	.	G	A	2413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=41;PP=1889;SC=GGTTGGACCCGGGAGGGCGGG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=38;TCR=41;TR=79;WE=1823255;WS=1823237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	1823444	rs761065	C	G	2975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=43;PP=2304;SC=CGGAGCAGGTCCTGAAGCGCC;SOR=0.802;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=47;TCR=43;TR=90;WE=1823452;WS=1823434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr16	1825768	rs2745169	A	C	6463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=129;PP=2965;SC=TGCTCACATGAGGTTCTAAAA;SOR=1.189;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=212;TCF=82;TCR=130;TR=211;WE=1825776;WS=1825758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr16	1826302	rs2437732	G	T	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=31;PP=1020;SC=CCTGGGCGGTGGGGGAGGACC;SOR=2.670;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=39;WE=1826310;WS=1826292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	1826377	rs2235636	A	G	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=15;PP=408;SC=ACCTCAGGGGAAGGGTGGGTG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=1826385;WS=1826367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	1827836	rs1178432	T	C	1640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=13;PP=1316;SC=CGAACCGCGATGAGAAGCTGG;SOR=2.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=49;WE=1827844;WS=1827826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	1836709	rs2575351	G	C	4443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=69;PP=2965;SC=CCCGCATCCCGGTGGAGGCCT;SOR=0.792;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=148;TCF=79;TCR=69;TR=148;WE=1836717;WS=1836699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr16	1836796	rs2235648	C	A	5283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.719;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=0.881;SC=GCCCCAGTATCCCCCGCATGC;SOR=0.111;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=75;TCR=104;TR=176;WE=1836804;WS=1836786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,178:0.98:181
chr16	1837900	rs344358	T	C	2477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=27;PP=2025;SC=GTGTCCCTGCTGGTGCGCCTG;SOR=1.581;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=52;TCR=27;TR=79;WE=1837908;WS=1837890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr16	1838640	rs344359	T	C	2901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=58;NR=41;PP=2031;SC=AGGAGTTCCCTGGGAGCCCCG;SOR=1.059;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=59;TCR=41;TR=99;WE=1838648;WS=1838630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr16	1838836	rs1065656	C	G	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=19;PP=530;SC=CAGCGTCAGCCGGAGAGCTTC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=1838844;WS=1838826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	1842209	rs3751893	A	G	3082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=59;PP=2402;SC=CCGGGACTCCATCAGGCAGGC;SOR=1.072;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=101;TCF=41;TCR=60;TR=100;WE=1842217;WS=1842199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr16	1843672	rs3817902	T	C	1565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=27;PP=1164;SC=CAGGGCAGGCTGCAGGCAGGC;SOR=1.077;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=21;TCR=27;TR=48;WE=1843680;WS=1843662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	1844781	rs2256923	A	G	1104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=7;PP=1029;SC=GGGCACAGCCAGGGCTCGGGG;SOR=3.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=46;WE=1844789;WS=1844771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	1859150	rs1057071	G	A	4827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.12;SOR=5.363;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr16	1859153	rs1057070	T	C	4861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.60;SOR=5.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr16	1859432	rs1628812	G	C	1560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=45;PP=1158;SC=CACGCCCACCGGAGGAGCCAG;SOR=2.998;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=9;TCR=45;TR=54;WE=1859440;WS=1859422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	1859476	rs1629513	G	A	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.88;SOR=4.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	1859482	rs1629534	A	C	1076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.82;SOR=4.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	1859730	rs2745199	G	A	2232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=63;NR=10;PP=1879;SC=AGGGGCCCGCGCCCACCACCT;SOR=3.521;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=63;TCR=10;TR=73;WE=1859738;WS=1859720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	1859850	rs1742442	A	G	4334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=84;PP=2965;ReadPosRankSum=0.686;SC=AGAGAAACGCACCACTTTATC;SOR=0.438;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=58;TCR=85;TR=141;WE=1859858;WS=1859840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,147:0.99:148
chr16	1870037	rs144480059	TGGGCTGCCTGCTGAGCTGAGG	T	1621.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.44;QD=42.68;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	1872160	rs238680	G	A	1791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=0;PP=1439;SC=GTGAGTCCCGGGTCTTTCTCA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=51;WE=1872168;WS=1872150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	1872479	rs238679	A	G	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=16;PP=458;SC=GGCCGCTGACATGGCCCGTCC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=1872487;WS=1872469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	1873087	rs104843	C	A	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=21;PP=671;SC=AGGCCCTCCACGACAGGACGC;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=1873095;WS=1873077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	1902889	rs1617255	T	C	208.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=140;SC=TCAAAGTTCATTGTAAGTTTT;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=1902897;WS=1902884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	1904239	rs10500322	T	A	1960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=49;PP=1598;SC=TTCACCTATATGTAGAAGTTC;SOR=3.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=9;TCR=49;TR=58;WE=1904247;WS=1904229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr16	1907652	rs428123	G	A	1813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=0;PP=1590;SC=CCAGCTGATCGTGACCACTCC;SOR=8.015;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=56;TCR=0;TR=56;WE=1907660;WS=1907642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	1907701	rs408286	AG	CA	3828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=9;PP=2947;SC=CTCCCCTGCCAGATTGCACTT;SOR=3.690;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=82;TCF=71;TCR=11;TR=74;WE=1907710;WS=1907691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr16	1907946	rs411193	C	T	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=605;SC=ATTGCAAAAACACAAGAAAGT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=1907954;WS=1907936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	1910219	rs391288	A	T	182.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=147;SC=AAAGCCATTTATCATGTGACT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=1910227;WS=1910209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	1910373	rs433268	C	G	2619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=26;PP=2053;SC=TGATCATTCTCGCACAATCTC;SOR=1.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=52;TCR=26;TR=78;WE=1910381;WS=1910363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr16	1912139	rs380846	T	C	4827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.99;NF=23;NR=121;PP=2965;SC=CCAATGCTTTTATTTTTCAAA;SOR=3.258;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=23;TCR=121;TR=144;WE=1912147;WS=1912129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr16	1917998	rs1742444	T	C	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=0;PP=833;SC=AATGAGTATCTATATACTTGC;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=1918006;WS=1917988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	1918125	rs1742446	T	G	2793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=51;PP=2112;SC=GCCATATTTGTCTGCAGATCT;SOR=1.240;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=34;TCR=51;TR=85;WE=1918133;WS=1918115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr16	1961674	rs337285	G	C	5008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=44;PP=2965;SC=CGCCGGACCAGGGCCTGGGGC;SOR=1.938;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=114;TCR=44;TR=158;WE=1961682;WS=1961664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr16	1990994	rs13331553	T	C	10949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=172;NR=157;PP=2965;SC=CCCACACGCCTATTTCCCAAG;SOR=0.741;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=329;TCF=172;TCR=157;TR=329;WE=1991002;WS=1990984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,342:1.00:342
chr16	1991513	rs9934331	G	C	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=20;PP=470;SC=CCCGTTCCGAGGGTAGGCTGT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=1991521;WS=1991503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	1992930	rs41286697	C	G	182.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=2;PP=136;SC=CTCCTCGCCCCCAGGCTCCCC;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=1992938;WS=1992920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	1994743	rs2754179	G	A	2832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.69;SOR=6.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	1994749	rs2531332	A	C	2982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.23;SOR=4.438;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr16	1994931	rs61276345	C	CAAGAG	4344.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=71;PP=2965;SC=GCCTTAGTCACTCTGGCCAGA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=90;TCF=9;TCR=81;TR=78;WE=1994939;WS=1994921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr16	1994980	rs11640479	G	T	1663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=48;PP=1353;SC=ATCACTCAGGGCCGGCCCTAC;SOR=5.670;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=50;WE=1994988;WS=1994970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	1996075	rs1003904	G	A	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=55;PP=1432;ReadPosRankSum=-0.703;SC=TGACTATCACGCCGCCCCTAC;SOR=6.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=0;TCR=56;TR=55;WE=1996083;WS=1996065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr16	1996535	rs35725974	C	CA	1569.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=1;PP=1743;SC=ATGCCCCCTACATGTATACCA;SOR=5.283;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=37;WE=1996543;WS=1996525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	2004718	rs2815301	T	C	1146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=24;PP=867;SC=CAGCTGCCAGTTCCCAGATTA;SOR=1.432;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=37;WE=2004726;WS=2004708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	2011126	rs758335	A	G	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=355;SC=CCGATGAGGCATTTGAGTCTG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=2011134;WS=2011116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	2011696	rs145006994	C	T	2822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=4;PP=2344;ReadPosRankSum=-1.134;SC=GGGGCCAGAACCATTGCAAAT;SOR=4.294;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=84;TCR=4;TR=87;WE=2011704;WS=2011686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
chr16	2014031	rs6366	C	G	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=403;SC=TCAGTTCTTTCGAAATGAATT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=2014039;WS=2014021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	2014283	rs2286466	A	G	1198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=3;PP=1021;SC=GTACCTTAATAGGCAGGGAGA;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=36;WE=2014291;WS=2014273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	2015121	rs1133099	C	T	285.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=205;SC=GCGCTCTCCTCTTCACTTAGG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=2015129;WS=2015111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	2015477	rs1054003	C	T	2257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=64;PP=1875;SC=GGCTGTCCCACGTCTTTCAAA;SOR=8.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=0;TCR=64;TR=64;WE=2015485;WS=2015467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr16	2024131	rs3743851	T	C	5252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=46;PP=2965;SC=GGAAGGGCAGTGGGGCGGGCA;SOR=1.953;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=121;TCR=47;TR=167;WE=2024139;WS=2024121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr16	2030971	rs117304081	C	T	3959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=55;PP=2906;SC=CCAACTCCTGCGCACGAAGGT;SOR=0.856;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=65;TCR=55;TR=119;WE=2030979;WS=2030961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr16	2049640	rs2286469	A	G	4469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=78;PP=2965;SC=CGGGCCCTCCATGTGTCCATT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=76;TCR=79;TR=153;WE=2049648;WS=2049630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr16	2050941	rs8046471	A	C	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=3;PP=802;SC=AACAAACAAAAAAAAAGAGCT;SOR=5.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=2050949;WS=2050931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	2059621	rs11366527	GC	G	858.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=17;PP=871;SC=GGTCGCAGCGGCCCCAGCGCC;SOR=1.981;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=23;WE=2059629;WS=2059611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	2059674	rs71384660	T	C	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=52;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=14;PP=406;SC=GCTCCCGCCTTCCCGCTCAGG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=2059682;WS=2059664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	2059698	rs71384661	T	G	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.83;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	2059708	rs71384662	T	G	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.38;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	2059710	rs71384663	T	G	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=51.72;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	2059736	rs71148116	CG	C	113	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.25;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	2059762	.	GC	G	199	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=6;HapScore=2;MGOF=122;MMLQ=23;MQ=59.28;NF=2;NR=6;PP=199;QD=28.0;SC=CCGGGATCCGGCCCCCCTCTC;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=2059770;WS=2059752;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	2059778	.	GT	G	176	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=1.0000;HP=1;HapScore=3;MGOF=69;MMLQ=17;MQ=58.85;NF=2;NR=3;PP=176;QD=45.006179974;SC=CTCTCGGCCGGTCGTGGCGCC;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=2059798;WS=2059768;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	2059939	rs968418	A	C	1867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=0;PP=1218;SC=CCGCTCTACCATGAGCCGACC;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=41;WE=2059947;WS=2059929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	2059955	rs62038790	A	G	2251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=0;PP=1555;SC=CGACCGCTCGAAGGTCCGCGC;SOR=8.015;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=51;WE=2059963;WS=2059945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	2088405	rs149481694	CCCCCCTTCCCCT	C	2824.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=2;NR=42;PP=2986;SC=CCAGAGACCCCCCCCCTTCCC;SOR=2.694;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=72;TCF=6;TCR=66;TR=44;WE=2088424;WS=2088395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
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chr16	2125834	rs13337626	T	C	5949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.644;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=81;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.787;SC=ACAGGAACTTTGCCGCGGAGC;SOR=0.697;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=193;TCF=111;TCR=82;TR=192;WE=2125842;WS=2125824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,198:0.99:199
chr16	2125937	rs1800715	C	G	4615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=97;PP=2965;SC=CCGTGGCCCCCGCTAGGCCTT;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=47;TCR=97;TR=144;WE=2125945;WS=2125927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr16	2133640	rs1800724	C	G	2297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=26;PP=1886;SC=GAGGCCACGTCAGGGCCAGGG;SOR=1.042;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=43;TCR=26;TR=68;WE=2133648;WS=2133630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr16	2133901	rs30259	C	T	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=17;PP=537;SC=GTGCCTGCACCCTGGGAACTG;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=2133909;WS=2133891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	2138218	rs1800718	A	C	5028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=63;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.800;SC=CCCCCTGCCTACGTCCCCAGA;SOR=0.345;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=149;TCF=86;TCR=63;TR=148;WE=2138226;WS=2138208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,151:0.99:152
chr16	2138269	rs1748	T	C	5762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=98;PP=2965;ReadPosRankSum=2.102;SC=ACCCCACCGATATCTACCCCT;SOR=0.834;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=85;TCR=99;TR=181;WE=2138277;WS=2138259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,180:0.99:182
chr16	2138584	rs1051771	G	C	3687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=95;PP=2868;SC=TCATCTCCTCGGTGGAGGACT;SOR=2.593;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=29;TCR=95;TR=124;WE=2138592;WS=2138574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr16	2138670	rs36032671	TAA	T	2913.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=44;PP=2251;SC=GTGAAATAAATAAAGTCCTGA;SOR=2.338;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=56;TCF=8;TCR=48;TR=52;WE=2138679;WS=2138660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr16	2139814	rs114251396	G	A	1515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=10;PP=1156;SC=CGACTGGCCCGGGCAAGGCGG;SOR=2.352;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=44;WE=2139822;WS=2139804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	2140010	rs7203729	A	G	3291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=53;NR=55;PP=2628;SC=GGGAGGGCTCAGGCTCACACC;SOR=0.862;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=53;TCR=55;TR=108;WE=2140018;WS=2140000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr16	2140321	rs79899502	G	A	8129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=158;PP=2965;ReadPosRankSum=0.037;SC=CAGAGGCGCAGCCTGCGCAGG;SOR=1.277;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=262;TCF=101;TCR=161;TR=258;WE=2140329;WS=2140311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,264:0.99:266
chr16	2140454	rs3087632	T	C	3110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=68;PP=2461;ReadPosRankSum=-0.727;SC=ACAGCCGCAGTGCCCAGAGCC;SOR=0.614;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=36;TCR=69;TR=104;WE=2140462;WS=2140444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,106:0.99:107
chr16	2140554	rs3209986	G	A	2366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=38;PP=1894;SC=CAGGGCCTGGGCCACGCTCCA;SOR=0.719;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=39;TCR=38;TR=77;WE=2140562;WS=2140544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr16	2140680	rs10960	T	C	4276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=27;PP=2965;SC=CCTACCAGGATGGCCAGCTGG;SOR=2.782;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=106;TCR=27;TR=133;WE=2140688;WS=2140670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr16	2141396	rs11866494	C	G	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=1;PP=204;SC=CGGTGGGAGGCGCGGGGTCTG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=2141404;WS=2141386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	2142353	rs12918803	G	A	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=10;PP=624;SC=TACAGAGAAGGAAACGGCGGT;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=12;TCR=10;TR=22;WE=2142361;WS=2142343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	2144176	rs34197769	G	A	4740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=97;PP=2965;SC=CCTCTGCAGCGCCAGCGTCTC;SOR=1.421;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=55;TCR=98;TR=152;WE=2144184;WS=2144166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr16	2144299	rs34123233	T	G	1201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=32;PP=984;SC=GGCAGTTTCTTGAGCCTCTTG;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=2144307;WS=2144289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	2152651	rs9928278	T	C	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=13;PP=469;SC=AGGGAAGGGGTAGCGGACGTG;SOR=1.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=18;WE=2152659;WS=2152641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	2159405	rs2575313	C	T	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=11;PP=618;SC=CGCCGACCTGCAGGCGGAAGG;SOR=0.776;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=25;TCF=13;TCR=12;TR=24;WE=2159413;WS=2159395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	2159996	rs9935526	G	A	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=8;PP=565;SC=TCGGGGAGGCGGCCACCATCA;SOR=1.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=24;WE=2160004;WS=2159986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	2160503	rs71385734	T	G	1290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=31;PP=1149;SC=CCGTGCGGCTTGCATTGACGA;SOR=2.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=41;WE=2160511;WS=2160493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	2201489	rs79535819	G	C	566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=3;PP=490;SC=GAGGTCTCAGGGGACAGGAAG;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=2201497;WS=2201479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	2203456	rs26931	T	C	4562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=79;PP=2965;SC=GAGGAAGCCGTCCAGTCCCTA;SOR=1.220;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=130;TCF=51;TCR=79;TR=129;WE=2203464;WS=2203446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr16	2216073	rs8062006	G	C	1729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=47;PP=1528;SC=GCCTCACACCGCAGCCTGTGT;SOR=4.977;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=50;WE=2216081;WS=2216063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	2221157	rs13331284	T	C	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=1;PP=734;SC=GACGTGACCCTGTCCTCAGAG;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=2221165;WS=2221147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	2223864	.	G	C	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=12.411;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQRankSum=0.000;QD=4.99;ReadPosRankSum=0.248;SOR=3.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr16	2223868	.	A	C	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.013;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=7.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=0.000;QD=3.22;ReadPosRankSum=0.388;SOR=2.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chr16	2225823	rs12921326	G	A	3798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=20;PP=2965;SC=ACTGGCCCACGATTACTCATA;SOR=2.978;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=91;TCR=20;TR=111;WE=2225831;WS=2225813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr16	2233565	rs889495	T	C	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=1;PP=617;SC=CGGGTGGGAGTTGTGGCCAGG;SOR=4.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=22;WE=2233573;WS=2233555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	2238931	rs11860560	G	A	1417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=4;PP=1177;SC=GCCTGCTCCCGCCCTATCCCC;SOR=4.174;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=38;TCR=4;TR=42;WE=2238939;WS=2238921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	2255763	rs12922719	A	C	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=0;PP=357;SC=CCTGCGGCAGAGTGGCGCCCG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=2255771;WS=2255753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	2255804	rs3214648	TG	T	364.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.05;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	2256047	rs3217423	AC	A	2196.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=21;PP=2181;SC=CTGACCTTTGACCCCTGCCGT;SOR=1.437;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=60;TCF=36;TCR=24;TR=57;WE=2256055;WS=2256037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	2256326	rs27699	C	T	6898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=111;PP=2965;SC=GGCCTCAGGGCTACCTTCCCG;SOR=0.851;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=209;TCF=98;TCR=111;TR=208;WE=2256334;WS=2256316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr16	2256461	rs26863	C	G	7826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=131;NR=98;PP=2965;SC=GGGTCGACCTCAGCACAGCCA;SOR=1.012;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=229;TCF=131;TCR=98;TR=229;WE=2256469;WS=2256451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr16	2257105	rs26862	C	G	2946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=21;PP=2438;SC=GCCTGCACCCCAACCAGGTGA;SOR=2.678;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=79;TCR=21;TR=100;WE=2257113;WS=2257095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr16	2259766	rs26858	A	G	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=13;PP=368;SC=CTGGCTTGGCAGGGCCGGGTA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=2259774;WS=2259756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	2259865	rs25852	C	G	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=2;PP=564;SC=CCTGAAACCACAGCTCCAGCC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=2259873;WS=2259855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	2260567	rs26857	C	T	2931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=47;PP=2442;SC=CCAGCCACAACCCCCACAGCG;SOR=0.714;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=47;TCR=47;TR=94;WE=2260575;WS=2260557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr16	2260612	rs26856	T	C	3185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=45;PP=2525;SC=AGGAGCAGGCTCACGGCTCTC;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=51;TCR=45;TR=96;WE=2260620;WS=2260602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr16	2260935	rs26855	G	A	1210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=35;PP=1019;SC=CTGACCCTGCGCCTCCCCCTC;SOR=3.312;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=41;WE=2260943;WS=2260925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	2282256	rs26839	G	A	4322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=42;PP=2965;SC=GGCAGCCCCCGCCAGCAGGGG;SOR=1.643;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=129;TCF=87;TCR=42;TR=128;WE=2282264;WS=2282246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr16	2285357	rs26840	C	T	4984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=52;NR=97;PP=2965;SC=CCATCACCATCGCCACCCCCG;SOR=1.565;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=53;TCR=99;TR=149;WE=2285365;WS=2285347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr16	2288224	rs27620	G	A	988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=1;PP=809;SC=CAAAGGGCCAGTGGTGACACC;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=2288232;WS=2288214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	2328570	.	A	C	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=20;PP=636;SC=GCAATTGCAGAACAGCCCTAG;SOR=4.091;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=2328578;WS=2328560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	2328790	rs150928	G	A	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=3;PP=1019;SC=TTCCTACGTGGAGCTACCTGG;SOR=4.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=35;WE=2328798;WS=2328780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	2331430	rs149532	A	G	4659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=76;PP=2965;ReadPosRankSum=0.611;SC=GGGAGTCCGGACTGGGGGCCA;SOR=0.283;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=65;TCR=77;TR=141;WE=2331438;WS=2331420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,148:0.99:149
chr16	2334554	rs1183064	A	T	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=5;NR=7;PP=311;SC=GTGAGGGGGCACCTCCCAGGG;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=12;WE=2334562;WS=2334544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	2337993	rs313909	G	A	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=494;SC=ACTGGCCCCCGATGCCCCCGT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=2338001;WS=2337983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	2338363	rs313908	C	G	2300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=61;PP=1820;SC=GACACCGGCACCGCTTGGGGC;SOR=3.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=8;TCR=61;TR=69;WE=2338371;WS=2338353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	2339327	.	C	T	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=2;PP=300;SC=CTGACTCTCCCGGACCCTGTT;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=2339335;WS=2339317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	2369485	rs5815117	C	CA	389.70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.44;MQRankSum=-1.180;QD=19.49;ReadPosRankSum=1.231;SOR=2.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr16	2373786	rs323060	C	A	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=18;PP=447;SC=GCTGTCACAGCCGAGAACTCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=2373794;WS=2373776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	2375961	rs46725	C	T	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=2;PP=719;SC=CCTGCCCAGCCGCGTGGAGGC;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=25;WE=2375969;WS=2375951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	2479712	rs13337091	A	C	223.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=9;PP=203;SC=AGCCCCTCGGAGCCTTCCCCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=2479720;WS=2479702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	2485620	rs146413013	ACACACACACATATATATG	A	997.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.72;QD=43.38;SOR=6.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	2485629	.	C	T	80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=54;MMLQ=28;MQ=51.64;NF=4;NR=0;PP=80;QD=28.6928031368;SC=CACACACACACATATATATGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=2485637;WS=2485619;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	2485665	rs147350588	CACATATATATATATATAT	C	1489.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.47;QD=42.56;SOR=7.168;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	2485669	.	T	C	599	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=58.1;NF=15;NR=0;PP=599;QD=42.2514141698;SC=CACACACACATATATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=15;WE=2485691;WS=2485655;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:10,15:0.60:25
chr16	2485896	rs12928789	A	G	2386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=60;PP=1865;SC=CCCCACCTGCATGTTGGCGCT;SOR=3.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=7;TCR=60;TR=67;WE=2485904;WS=2485886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	2486998	rs12921396	A	T	1587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=46;NR=0;PP=1360;SC=GGAGGGCTCTACTCTCCTGAA;SOR=7.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=46;WE=2487020;WS=2486988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	2487012	rs34456414	C	CT	1942.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=0;PP=2176;SC=TCCTGAAACACAGCTGCTTTG;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=47;WE=2487020;WS=2486988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	2488211	rs12926008	T	C	1784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=45;PP=1277;SC=CAGAAGGGGGTGTCCAAGGCC;SOR=2.231;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=16;TCR=45;TR=61;WE=2488219;WS=2488201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	2489533	rs28647184	T	G	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=12;PP=801;SC=CTTGGATGCGTTTCTGTCCAC;SOR=0.997;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=28;WE=2489541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	2498828	rs28417759	A	G	2119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=16;PP=1652;SC=AGTGGGCTCCACCCTGAGACC;SOR=2.554;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=61;TCR=16;TR=77;WE=2498836;WS=2498818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	2498849	rs28670436	G	A	3270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=27;PP=2524;SC=CCTTCTCGGCGTTGCAGGTTT;SOR=2.108;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=73;TCR=27;TR=99;WE=2498857;WS=2498839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr16	2499011	rs8060813	T	C	3303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=61;PP=2785;SC=CTTATTAATCTTCGTTGTCGC;SOR=1.051;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=45;TCR=61;TR=105;WE=2499019;WS=2499001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr16	2499786	.	G	GTCCCCTCCA	3081.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=52;NR=10;PP=2375;SC=CATCCCCTCCGTCCCCTCCAT;SOR=3.461;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=93;TCF=79;TCR=14;TR=62;WE=2499794;WS=2499776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	2510179	.	C	T	205	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=5;NR=4;PP=205;QD=26.6412458386;SC=CCGGTGAGGCCTGCGCGGCAG;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=9;WE=2510187;WS=2510169;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	2510603	rs4786284	C	T	1634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=10;PP=1182;SC=GGCCGTGCGACGGCTGCCCGT;SOR=2.480;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=49;WE=2510611;WS=2510593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	2571234	rs78272777	G	C	1192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=30;PP=1044;SC=CCATGGTCCTGAGTCTGGCCT;SOR=3.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=34;WE=2571242;WS=2571224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	2749195	rs3094473	A	G	4136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=86;PP=2965;SC=GTGACTGTCCAGGATGTGGGG;SOR=1.428;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=48;TCR=86;TR=134;WE=2749203;WS=2749185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr16	2802684	rs2240146	T	C	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=7;PP=346;SC=GTGGCGCAGTTGGAGCCCGTT;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=8;TCR=7;TR=15;WE=2802692;WS=2802674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	2808363	rs3094778	C	T	1648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=0;PP=1339;SC=CAGAGCGAGACTCTTATTTTT;SOR=7.903;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=48;WE=2808371;WS=2808353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	2810623	rs2285879	T	G	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=571;SC=TTTTCCTGCATTTCTCTCCTA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=2810631;WS=2810613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	2812890	rs2240141	A	G	5625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=99;PP=2965;SC=CATGCCCTAAACAAAAGTCAC;SOR=1.065;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=170;TCF=71;TCR=99;TR=170;WE=2812898;WS=2812880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr16	2812939	rs2240140	C	A	5895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=87;PP=2965;SC=ATCCTCCCAACCTAAAGCTAA;SOR=0.726;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=185;TCF=97;TCR=88;TR=182;WE=2812947;WS=2812929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr16	2814162	rs3094775	G	A	4273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=73;NR=53;PP=2965;SC=CCCCGCCAAGGGAAAGAAGTG;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=74;TCR=53;TR=126;WE=2814170;WS=2814152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr16	2815237	rs3094773	A	C	5263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=79;PP=2965;SC=AGCCAAGACAAGAACCCCACT;SOR=0.786;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=93;TCR=79;TR=172;WE=2815245;WS=2815227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr16	2818161	rs2301802	T	C	3604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=61;PP=2905;SC=GCTCCTCCTCTTCTTCATCAT;SOR=0.970;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=47;TCR=61;TR=108;WE=2818169;WS=2818151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr16	2818704	rs3094792	T	G	5232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=85;PP=2965;SC=GGAAGGAGACTACCCAGCTTC;SOR=0.773;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=92;TCR=85;TR=177;WE=2818712;WS=2818694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr16	2821573	rs8017	C	T	3064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=77;PP=2399;SC=TGTGTTTCTGCTCTTGGCCAT;SOR=4.271;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=8;TCR=78;TR=85;WE=2821581;WS=2821563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr16	2825594	rs3094774	A	G	1481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.522;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=1109;ReadPosRankSum=-0.811;SC=GAGGCCCTACATGGGGCAAGT;SOR=0.651;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=22;TCR=29;TR=50;WE=2825602;WS=2825584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,53:0.98:54
chr16	2834826	rs12931183	A	G	3179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=60;PP=2367;SC=GAGGAGCCTAAGTCCCAGCCC;SOR=1.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=31;TCR=60;TR=91;WE=2834834;WS=2834816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr16	2835189	rs12599918	G	A	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=31;PP=1233;SC=GAAGAGGAGGGACCTCTGAGA;SOR=1.364;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=17;TCR=32;TR=48;WE=2835197;WS=2835179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	2836027	rs7195287	T	G	4094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=56;PP=2965;SC=CAGGTGTTGGTGGGGAGACAC;SOR=0.899;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=69;TCR=56;TR=125;WE=2836035;WS=2836017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr16	2836271	rs11643898	C	G	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=38;PP=1212;SC=CTTATTTAACCCTCCCCAGAG;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=44;WE=2836279;WS=2836261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	2837592	rs34341809	T	G	2992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=47;PP=1754;SC=GGGCTTAAAGTGCCAGGAGAG;SOR=1.678;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=21;TCR=47;TR=68;WE=2837611;WS=2837582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr16	2837603	rs11076829	C	T	3025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=48;PP=1614;SC=GCCAGGAGAGCGCGAGGCTCA;SOR=1.931;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=20;TCR=48;TR=68;WE=2837611;WS=2837582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr16	2854907	rs2015682	C	T	2317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=9;PP=1812;SC=ACCCATGCTGCTCCCCAGGGT;SOR=3.767;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=59;TCR=9;TR=68;WE=2854915;WS=2854897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	2867531	rs200594570	A	AG	87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.75;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	2903047	rs1054912	G	C	1903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=0;PP=1158;SC=AGATCCAGATGTGGATCTGGC;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=2903055;WS=2903037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	2903068	rs113609771	A	C	2432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=1;PP=1432;SC=CGCCTTTCAGATCCGAGCCCC;SOR=6.593;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=50;TCR=1;TR=51;WE=2903089;WS=2903058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	2903081	rs3743944	G	A	2999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=1;PP=1901;SC=CGAGCCCCGCGTCCCGCTGCG;SOR=7.168;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=69;TCF=68;TCR=1;TR=69;WE=2903089;WS=2903058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	2903850	rs112285893	G	C	1537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=6;PP=1313;SC=GGGGTGGGGGGCTCGAGGGAG;SOR=3.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=42;TCR=6;TR=48;WE=2903858;WS=2903840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr16	2906934	rs732532	G	A	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.51;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=12;PP=505;SC=AGTGAGGAAGGCCCCCAACAC;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=2906942;WS=2906924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	2946816	rs367601895	A	G	1486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=40;PP=1267;SC=GGCACCTCCCAGGGTGGCCCC;SOR=3.306;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=47;WE=2946824;WS=2946806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	2949269	.	C	T	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQRankSum=-0.998;QD=6.48;ReadPosRankSum=0.558;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr16	3016885	rs58462745	A	G	4013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=70;PP=2965;SC=GGTCCTCAGGATGCTGACTGC;SOR=1.125;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=49;TCR=70;TR=119;WE=3016893;WS=3016875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr16	3017272	rs2285827	G	T	114.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=1;PP=88;SC=CGCCCTGCCCGCTGTTCCCAC;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=3017280;WS=3017262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	3021116	rs4786365	T	C	2523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=19;PP=1977;SC=CCCTTGAGGATGTGACTGAAA;SOR=2.191;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=61;TCR=19;TR=80;WE=3021124;WS=3021106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr16	3024188	rs2074528	T	C	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=13;PP=956;SC=AGGATGTGGGTGGGCGGACCC;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=41;WE=3024196;WS=3024178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	3065596	rs2257295	T	C	1922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=34;PP=1419;SC=TCCCGGATGATGGCATGCGCC;SOR=1.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=59;WE=3065604;WS=3065586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr16	3071420	rs2232798	T	A	665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=11;PP=553;SC=TGGGAAATCATTCGGGAGGAG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=22;WE=3071428;WS=3071410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	3073240	rs10508	G	T	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=12;PP=1508;SC=CTACCTGAGTGGGGGCAGGGC;SOR=2.494;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=41;TCR=12;TR=53;WE=3073248;WS=3073230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	3074426	rs56708449	G	C	3469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=86;PP=2678;SC=TGGCTGGGACGGGGCGGGCAG;SOR=2.030;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=36;TCR=86;TR=122;WE=3074434;WS=3074416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr16	3075999	rs2245000	C	G	5762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=113;NR=58;PP=2965;SC=GGTGGGTATACCTGTGGAGTC;SOR=1.405;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=172;TCF=114;TCR=58;TR=171;WE=3076007;WS=3075989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr16	3077710	.	CTT	C	1300.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.809;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=-0.125;QD=27.68;ReadPosRankSum=-1.504;SOR=0.619;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,45:0.96:47
chr16	3078165	rs12448103	A	G	2235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=39;PP=1899;SC=GCCCAGGCGCAGCGAGAAGCG;SOR=0.801;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=36;TCR=39;TR=75;WE=3078173;WS=3078155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr16	3078544	rs2079244	T	G	1397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=5;PP=1198;SC=GGGACTTCTGTACCCGGGCGG;SOR=4.073;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=40;WE=3078552;WS=3078534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	3078616	rs5815143	CATT	C	6319.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=30;PP=2957;SC=GAGTGGGGATCATTATAACCC;SOR=2.617;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=88;TCR=33;TR=112;WE=3078626;WS=3078606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr16	3080997	rs202141775	C	T	4163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=83;PP=2965;SC=GGCCCGTGCCCGTTCTCGCCC;SOR=1.470;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=127;TCF=43;TCR=84;TR=126;WE=3081005;WS=3080987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr16	3096863	rs2250306	G	T	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=1;PP=22;SC=GGTCCCCGGGGCGGCCCCAGC;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=3096871;WS=3096853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	3097074	rs909408	C	T	1007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=15;PP=830;SC=AGAGGGAAGCCGGGCCCGGAC;SOR=0.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=16;TCR=15;TR=31;WE=3097082;WS=3097064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	3097568	rs3743937	C	A	739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=26;PP=612;ReadPosRankSum=0.376;SC=CCCCACCCCTCCCCAGCCCTG;SOR=3.126;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=27;WE=3097576;WS=3097558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr16	3097596	rs3743936	T	A	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=525;SC=ACCCAGCCTGTCCACCGCCCA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=3097604;WS=3097586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	3166587	rs224178	A	G	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=39;PP=1172;SC=GGTGTTAGGGAGAGGTCCTGC;SOR=5.186;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=41;WE=3166595;WS=3166577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	3168836	rs224181	T	G	2497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=24;PP=1978;SC=CCATCAGTTTTGGGGAGATGC;SOR=1.522;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=52;TCR=25;TR=75;WE=3168844;WS=3168826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr16	3170188	rs12032	C	T	5109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=105;PP=2965;SC=GCCCGTTGTGCGGCAAGAGCT;SOR=1.654;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=157;TCF=52;TCR=105;TR=156;WE=3170196;WS=3170178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr16	3293369	rs2234939	C	T	4280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=55;PP=2965;ReadPosRankSum=0.288;SC=GCAGGCGGGTCGGGGGAACGC;SOR=0.425;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=79;TCR=55;TR=133;WE=3293377;WS=3293359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,138:0.99:139
chr16	3293888	rs1231122	C	T	4925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=100;NR=40;PP=2965;SC=CAATCAGCTCCGGAACTACGG;SOR=1.826;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=100;TCR=40;TR=140;WE=3293896;WS=3293878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr16	3293922	rs1231123	A	T	5954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=103;NR=77;PP=2965;SC=AGGGAAAAAAATCCTGAGCAT;SOR=1.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=103;TCR=77;TR=180;WE=3293930;WS=3293912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr16	3294678	rs1231124	G	A	217.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=209;SC=ATTCTCCACAGGGCACACCTA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=3294686;WS=3294668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr16	3405986	rs1218762	G	A	2302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.45;SOR=2.628;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	3405994	rs1228348	A	G	2494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.01;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr16	3406387	rs1218763	C	G	6900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=126;NR=83;PP=2965;SC=TGATTGCCTGCCTGGGTGGCT;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=209;TCF=126;TCR=83;TR=209;WE=3406395;WS=3406377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr16	3406516	rs11643487	A	G	5696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=113;PP=2965;SC=GTGGCGACACAAGTCTCAACC;SOR=1.434;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=62;TCR=113;TR=175;WE=3406524;WS=3406506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr16	3406626	rs11648783	G	A	3579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=60;PP=2965;ReadPosRankSum=0.981;SC=CTGAAAATCCGCTCTGCAGAG;SOR=0.237;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=55;TCR=62;TR=115;WE=3406634;WS=3406616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,116:0.99:117
chr16	3434699	rs27230	A	G	3160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=44;PP=2635;SC=ATTTCCTCATAAAAGATACAA;SOR=0.823;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=49;TCR=44;TR=93;WE=3434707;WS=3434689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr16	3434966	rs27231	T	C	2210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=48;PP=1699;SC=ATAGGTCAATTAGATCTGTCA;SOR=2.139;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=17;TCR=49;TR=65;WE=3434974;WS=3434956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr16	3440394	rs27237	A	G	2543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=50;PP=2004;SC=TGGGTACTCAAGAGACAGAAG;SOR=1.367;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=30;TCR=50;TR=80;WE=3440402;WS=3440384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr16	3441697	rs71133628	A	AC	1320.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.57;MQRankSum=1.636;QD=25.90;ReadPosRankSum=1.738;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,48:0.94:51
chr16	3445239	rs1149492	A	G	1091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=28;PP=881;SC=GAGAAATTATATCAACCTCTA;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=3445247;WS=3445229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	3447282	rs27241	C	G	5010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=80;NR=68;PP=2965;SC=AGGTCTGGATCTCCTCTGGCA;SOR=0.826;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=80;TCR=69;TR=148;WE=3447290;WS=3447272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr16	3452193	rs37811	T	G	4961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=73;PP=2965;SC=CCCAAGAGGCTCTCTCCCAGC;SOR=0.757;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=154;TCF=80;TCR=74;TR=153;WE=3452201;WS=3452183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr16	3455079	rs37813	T	C	1850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=50;PP=1592;SC=GCTTGTACTTTAGATCCTCAA;SOR=6.556;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=51;WE=3455087;WS=3455069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	3458219	rs37819	C	T	200.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=4;PP=136;SC=AAGTTGCCAGCGGAGGGCCAC;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=3458227;WS=3458209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	3487556	rs40534	A	T	2324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=61;PP=1843;SC=TAAAAACAAAAGAAAGCAAAA;SOR=3.551;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=9;TCR=61;TR=70;WE=3487564;WS=3487546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	3487576	rs37825	T	C	1879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=48;PP=1549;SC=ACATAGACAATATCTTCAAGG;SOR=5.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=51;TCF=3;TCR=48;TR=51;WE=3487584;WS=3487566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	3493240	rs3816916	A	C	2586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=68;PP=2117;SC=TAAAGGGACCAATTCCGCTGC;SOR=3.912;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=9;TCR=68;TR=77;WE=3493248;WS=3493230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	3493288	rs34496784	T	C	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=35;PP=1022;SC=CTCGATTCCCTCCGAACCCCC;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=36;WE=3493309;WS=3493278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	3493301	rs7500590	T	C	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=789;SC=GAACCCCCCCTTAAAAACCTA;SOR=5.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=3493309;WS=3493278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	3534892	rs13740	G	A	10798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=204;NR=142;PP=2965;SC=CCCACCCTTCGGCCGCCCGCA;SOR=1.117;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=346;TCF=204;TCR=142;TR=346;WE=3534900;WS=3534882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,346:1.00:346
chr16	3535116	rs4785936	T	C	4102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=74;PP=2965;SC=GCCACAAAAGTGGAAGGCCCT;SOR=0.883;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=63;TCR=74;TR=137;WE=3535124;WS=3535106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr16	3535540	rs2240075	G	A	4423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=82;PP=2965;SC=CGCATGCACCGTCCCCAGGGC;SOR=1.131;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=52;TCR=82;TR=134;WE=3535548;WS=3535530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr16	3599385	.	G	C	904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=16;PP=700;SC=CAGTGCTAGTGAGCCAGTGCT;SOR=1.302;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=25;WE=3599393;WS=3599375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	3602227	rs56070390	AG	A	1743.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=28;PP=1744;SC=TTCTGCTTCAAGGGCATCTGC;SOR=1.157;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=43;WE=3602235;WS=3602217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	3615468	.	AGC	A	163	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=55.01;NF=0;NR=8;PP=163;QD=23.625;SC=TGTGGGAAAAAGCAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=8;WE=3615477;WS=3615458;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:19,8:0.30:27
chr16	3708282	rs35081909	AT	A	2023.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.312;HP=13;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=2.182;NF=8;NR=83;PP=1248;ReadPosRankSum=2.484;SC=GCACCTTTTCATTTTTTTTTT;SOR=2.833;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=129;TCF=16;TCR=113;TR=91;WE=3708291;WS=3708271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,94:0.94:100
chr16	3724465	rs13926	G	C	4143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=97;PP=2965;SC=TGCCACTCACGGACATCCTTG;SOR=1.675;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=45;TCR=97;TR=142;WE=3724473;WS=3724455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr16	3726160	rs8050400	A	G	3737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=65;PP=2788;SC=AGGCAGGCAAAGAAAGGAAAA;SOR=0.968;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=52;TCR=66;TR=117;WE=3726168;WS=3726150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr16	3738887	rs2072379	C	T	1684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=2;PP=1436;SC=GAAACCAAAACAGATTCTGGT;SOR=5.630;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=49;TCR=2;TR=51;WE=3738895;WS=3738877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	3738961	rs2072380	T	G	3630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=25;PP=2965;SC=TTCTCACAGCTAATATATTAT;SOR=2.889;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=99;TCR=25;TR=124;WE=3738969;WS=3738951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr16	3781323	.	AAGG	A	3842.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=37;PP=2971;SC=GGAGCGGCGCAAGGAGGAGAA;SOR=0.786;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=71;TCF=32;TCR=39;TR=64;WE=3781333;WS=3781313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr16	3811556	rs886528	A	G	8923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.659;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=187;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.301;SC=ATTTCCATCAAAGCCCAGGAT;SOR=1.687;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=278;TCF=90;TCR=188;TR=276;WE=3811564;WS=3811546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,283:0.99:285
chr16	3811596	rs11076786	C	T	5771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=152;PP=2965;SC=CCGCAGACACCGCCTCCTCTC;SOR=3.598;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=25;TCR=152;TR=177;WE=3811604;WS=3811586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr16	4016676	rs2230742	A	G	4378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=79;PP=2965;SC=CTCCGCTGTCATGGTTCTTGG;SOR=0.971;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=58;TCR=79;TR=137;WE=4016684;WS=4016666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr16	4027423	rs2072346	C	T	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=1;PP=543;SC=CCAGGCCCTACGCAACCTCGG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=4027431;WS=4027413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	4027605	rs2240735	C	T	2257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=43;PP=1645;SC=CGGCAATCAGCGCGGCCGAGC;SOR=1.079;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=33;TCR=43;TR=76;WE=4027613;WS=4027595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr16	4027688	rs2531990	T	C	1078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=29;PP=907;SC=ACCCCTGCTATACCCGGCCGC;SOR=2.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=36;WE=4027696;WS=4027678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	4027749	rs2601774	A	G	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=352;SC=ACTGAGTCTCACTCTGTCGCC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=4027757;WS=4027739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	4039141	rs2072341	A	G	5703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=127;PP=2965;SC=CCAGCACCATAACTGTGCCAA;SOR=2.316;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=40;TCR=127;TR=166;WE=4039149;WS=4039131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr16	4042449	rs2239307	C	T	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=485;SC=CCCCGACCTCCGCTGCGGGGC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=4042457;WS=4042439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	4042470	rs2239308	T	C	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=9;PP=242;SC=GCTGCTGCACTGGGCGTGGGA;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=4042478;WS=4042460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	4043292	rs2239309	C	G	2122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=10;PP=1792;SC=GTGCGGAGTGCTGTTACCCAA;SOR=3.327;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=57;TCR=10;TR=67;WE=4043300;WS=4043282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr16	4057603	rs3730119	G	A	1326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=36;PP=1085;SC=TGAAAGCACCGTCTGTTGAAA;SOR=4.073;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=39;WE=4057611;WS=4057593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	4163754	rs52791170	T	G	1758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=17;PP=1361;SC=CACATACCTTTCAACTGGTCA;SOR=1.487;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=53;WE=4163762;WS=4163744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	4165432	rs2530898	T	C	274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=2;NR=12;PP=242;SC=GCTGGTGGGGTGGGGAAGCCA;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=4165440;WS=4165422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	4242093	rs8051399	C	T	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=638;SC=AAACCAGGACCTCTCAGACAG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=4242101;WS=4242083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	4245393	rs11076822	T	C	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=626;SC=GAGATGAGGTTTCACTATGTT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=4245401;WS=4245390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	4245426	rs11076823	C	T	1391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=0;PP=1163;SC=CTTGAACCTCCGGCCTCAAGG;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=39;WE=4245434;WS=4245416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	4245693	rs10852643	A	G	4305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=93;PP=2965;SC=GTGAGAAGGAACGGGCGCTGT;SOR=1.775;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=134;TCF=39;TCR=95;TR=132;WE=4245701;WS=4245683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr16	4254479	rs4644864	G	A	3189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=93;NR=4;PP=2531;SC=GAGTCTGCCCGGGCCCTGGTG;SOR=5.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=97;TCF=93;TCR=4;TR=97;WE=4254487;WS=4254469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr16	4254725	rs8054937	A	G	3115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=80;PP=2547;SC=GCTGGGCCTCAAGCAGGGGCT;SOR=4.758;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=7;TCR=80;TR=87;WE=4254733;WS=4254715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr16	4254758	rs62039298	A	T	1658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=45;PP=1319;SC=GCCAAGTTACACTGGACTGAG;SOR=7.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=45;WE=4254766;WS=4254748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr16	4256705	rs13334805	G	A	3411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=13;PP=2636;SC=GGACGGGGTTGCTGTTAGGGA;SOR=3.591;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=89;TCR=13;TR=101;WE=4256713;WS=4256695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr16	4256755	rs58255304	TC	T	5265.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.470;HP=8;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=60.06;MQRankSum=0.165;NF=99;NR=34;PP=2972;ReadPosRankSum=-1.670;SC=GGACTCTCCCTCCCCCTGATG;SOR=2.232;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=152;TCF=109;TCR=43;TR=133;WE=4256763;WS=4256745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,165:0.99:167
chr16	4257060	rs13334970	G	A	3502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=47;PP=2937;SC=GCAGATCCCCGCCTTCCTGGG;SOR=0.970;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=62;TCR=47;TR=109;WE=4257068;WS=4257050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr16	4257281	rs9922726	A	C	9652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.88;SOR=1.577;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr16	4257286	rs9924822	T	C	9321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.82;SOR=1.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr16	4258173	rs889807	T	C	999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=26;PP=793;SC=CAAGAGTCTATAATAACCTAG;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=4258181;WS=4258163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	4386814	rs669561	T	C	6209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=106;PP=2965;SC=GCACCCACTATGTGGACAAGC;SOR=0.703;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=209;TCF=103;TCR=106;TR=209;WE=4386822;WS=4386804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr16	4410867	rs140995663	TCACTGCTGGCCCCACCTCTCCA	T	754.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=0;PP=1437;SC=CCGCCACTCCTCACTGCTGGC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=18;WE=4410896;WS=4410857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	4414727	rs2277852	G	A	1877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=27;PP=1475;ReadPosRankSum=-0.784;SC=TGAGGCCCAGGCCCCCCGACT;SOR=0.326;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=64;TCF=37;TCR=27;TR=61;WE=4414735;WS=4414717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr16	4414987	rs2277851	G	A	3941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=70;PP=2965;SC=GGATGGGGGCGAGGAAGCAAG;SOR=0.920;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=56;TCR=70;TR=126;WE=4414995;WS=4414977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr16	4415410	rs3747575	G	T	2339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=30;PP=1773;SC=GGCCCTGTTCGAGTTCCTCCT;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=42;TCR=30;TR=72;WE=4415418;WS=4415400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr16	4415455	rs3747576	C	G	2656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=45;PP=2148;SC=GGACTCCAGGCTGTGGATGTG;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=41;TCR=45;TR=86;WE=4415463;WS=4415445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr16	4431202	rs758044	A	G	9235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=160;NR=148;PP=2965;SC=TGGACCTGACAGCCAACAGGC;SOR=0.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=310;TCF=160;TCR=150;TR=308;WE=4431210;WS=4431192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
chr16	4432029	rs3810818	A	C	2259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=39;PP=1580;SC=AGCCCCACAGAGCCGGCCACT;SOR=0.948;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=30;TCR=39;TR=69;WE=4432037;WS=4432019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr16	4445327	rs3747579	C	T	2494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=43;PP=1900;SC=GTCAAAGATCCGCAGCTGCTT;SOR=0.934;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=34;TCR=43;TR=77;WE=4445335;WS=4445317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr16	4455675	rs3747580	G	A	2503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=57;PP=2040;SC=CAGCAGCTACGAGGGTCCTTT;SOR=2.103;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=22;TCR=57;TR=79;WE=4455683;WS=4455665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr16	4475868	rs2304631	A	T	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=1;PP=108;SC=GCAGGCGCAGAGTCCCCGGGC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=4475876;WS=4475858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	4476089	rs1139652	T	C	2782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=41;PP=2234;SC=GTGTCAGCCTTACAGGTGAGG;SOR=0.812;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=45;TCR=41;TR=86;WE=4476097;WS=4476079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr16	4484328	rs4785962	A	G	1208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=2;PP=1030;SC=ATGTACTCACAGTTTTCTTTT;SOR=5.283;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=44;WE=4484336;WS=4484318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	4484396	rs1139653	A	T	3440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=22;PP=2822;SC=AACAAAACATAACCCTTTCAT;SOR=2.707;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=84;TCR=23;TR=106;WE=4484404;WS=4484386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr16	4484613	rs4785964	A	G	3121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=87;PP=2796;SC=TGCCCATATGAATAGGTCTCA;SOR=4.525;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=7;TCR=87;TR=94;WE=4484621;WS=4484603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr16	4494549	rs12446640	A	G	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=2;PP=381;SC=GTTGGCCAGGATGGTCTCGAT;SOR=3.383;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=14;WE=4494557;WS=4494539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	4496973	rs2304633	T	A	1678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=28;PP=1307;SC=TTCTTGGGGGTACAGCCAGAG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=55;WE=4496981;WS=4496963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	4500544	rs2304634	C	T	6117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=92;PP=2965;SC=GGCCTCAGAGCCCCCCAGGGT;SOR=0.798;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=197;TCF=105;TCR=92;TR=197;WE=4500552;WS=4500534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr16	4516092	rs3747584	T	C	1491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=5;PP=1256;SC=CCGCGGTCTGTTACACCAACG;SOR=3.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=46;WE=4516100;WS=4516082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	4519548	rs62039231	A	G	4093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=106;PP=2965;SC=GGAGTGCTCCACCACAGCAAG;SOR=3.407;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=18;TCR=106;TR=124;WE=4519556;WS=4519538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr16	4524060	rs3761680	C	A	2180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=13;PP=1774;SC=GGCGCCCTGGCTCTGCAAGGG;SOR=2.867;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=69;TCF=55;TCR=14;TR=67;WE=4524068;WS=4524050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr16	4562351	rs8129	T	C	1761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=9;PP=1376;SC=AAGCTCATTGTCAGCCCCCTG;SOR=2.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=52;WE=4562359;WS=4562341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	4562512	rs7665	A	G	5331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=72;PP=2965;SC=ACCACTGAGCACAGGGAGCAA;SOR=1.110;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=104;TCR=72;TR=176;WE=4562520;WS=4562502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr16	4621725	rs35531180	GA	G	812.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=851;SC=CTGGGGGTTGGAGCAATGAGG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=20;WE=4621733;WS=4621715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	4625126	rs9673241	G	A	2963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=40;PP=2587;SC=ACTGAGAGTGGGAGGCGGGGC;SOR=0.969;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=55;TCR=40;TR=95;WE=4625134;WS=4625116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr16	4641814	rs5815211	AG	A	819.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.424;NF=2;NR=22;PP=843;ReadPosRankSum=-0.578;SC=CCCTCCTGGTAGGGGTCCTGC;SOR=2.303;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=24;WE=4641822;WS=4641804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr16	4649955	rs11076843	T	C	1874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.07;SOR=7.378;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	4649965	rs7403819	T	C	1941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.15;SOR=7.658;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	4660342	rs841184	C	T	1899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=25;PP=1554;SC=GCAGGACCCACGGAGCCGGGA;SOR=1.034;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=32;TCR=25;TR=57;WE=4660350;WS=4660332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr16	4664412	rs138923012	T	TG	193.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=4;NR=5;PP=200;SC=ACAAAAGGGGTGGGGGGGGTC;SOR=1.179;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=9;WE=4664420;WS=4664402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	4664833	rs860889	T	G	1969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=43;PP=1313;SC=GCCTCCCTCCTCCGCCCGCGC;SOR=1.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=17;TCR=43;TR=60;WE=4664841;WS=4664823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr16	4674954	rs3747587	C	G	3462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=45;PP=2709;SC=CCGGCAGCGCCGCGCACCATG;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=73;TCR=45;TR=117;WE=4674962;WS=4674944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr16	4675116	rs1386092	G	T	2439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=72;PP=2046;SC=CGGGCGCGGGGGCGGGGACTC;SOR=6.413;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=74;TCF=2;TCR=72;TR=74;WE=4675124;WS=4675106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr16	4718140	rs201926184	C	T	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.17;MQRankSum=-1.595;QD=1.93;ReadPosRankSum=0.748;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
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chr16	4736080	rs144808025	TTCTGGCTGCGC	T	2112.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=5;PP=2938;SC=CCGCGTTGAATTCTGGCTGCG;SOR=3.657;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=31;WE=4736098;WS=4736070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr16	4736316	rs841225	C	T	3963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=77;PP=2965;SC=TACGTGACCTCCCAGACGCGC;SOR=1.187;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=50;TCR=77;TR=127;WE=4736324;WS=4736306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr16	4747136	rs841215	G	C	2980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=45;PP=2478;SC=GCCTCTCCCGGCCAGGCTCAG;SOR=0.738;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=44;TCR=45;TR=89;WE=4747144;WS=4747126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr16	4748825	rs841214	C	T	2983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=6;PP=2633;ReadPosRankSum=0.636;SC=TGGCGAGCTCCTGCATCTCAG;SOR=3.588;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=83;TCR=6;TR=88;WE=4748833;WS=4748815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
chr16	4751045	rs863980	C	T	3739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=61;PP=2965;SC=TCAGTTGCAGCGCGGGGAGGC;SOR=0.838;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=54;TCR=61;TR=115;WE=4751053;WS=4751035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr16	4751262	rs140099226	C	T	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=517;SC=CAGGGGCTTCCGGTGCGTTCG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=4751270;WS=4751252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	4752134	rs841210	A	G	1156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=10;PP=873;SC=TGCTCTCCACATCCCGCTCAT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=41;WE=4752142;WS=4752124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	4786456	rs859314	A	G	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=1;PP=1126;SC=CACCCTGTGTACCCCACAGAG;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=38;WE=4786464;WS=4786446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	4787987	rs859310	G	A	1928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=40;PP=1462;SC=GTGTGTGTGCGATGTTAGTCT;SOR=1.647;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=60;TCF=19;TCR=41;TR=59;WE=4787995;WS=4787977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	4790273	rs859305	G	A	3844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=52;PP=2965;SC=GCTCTGGTGAGGTCAGCGCTC;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=64;TCR=52;TR=116;WE=4790281;WS=4790263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr16	4794873	rs2075469	C	T	925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=3;PP=809;SC=ATCCTCAGACCGCATGGTGCC;SOR=2.468;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=4794881;WS=4794863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	4796393	rs737700	A	G	4983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=62;PP=2965;ReadPosRankSum=1.456;SC=TCAAGGAAGCAGGGCTCCCAG;SOR=0.548;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=171;TCF=109;TCR=62;TR=170;WE=4796401;WS=4796383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,174:0.99:175
chr16	4796595	rs759988	T	C	1557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=46;PP=1235;SC=TGGTGGATCCTGATGGGGAGG;SOR=3.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=53;WE=4796603;WS=4796585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	4796871	rs2341988	A	G	2112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=16;PP=1721;SC=AGCCCCAACAAGAGTTGGAAC;SOR=2.194;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=62;WE=4796879;WS=4796861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr16	4797226	rs759989	T	C	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=1;PP=911;SC=GCTGCCTGAATTGCATTCTTG;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=33;WE=4797234;WS=4797216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	4797457	rs17853375	C	T	3213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=59;PP=2627;SC=GCTCAGGCCCCTGAAGACACA;SOR=1.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=40;TCR=59;TR=99;WE=4797465;WS=4797447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr16	4801723	rs921863	G	A	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=25;PP=768;SC=TGTATTGGGGGACCCTAAACC;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=4801731;WS=4801713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	4802370	rs3747601	C	A	1232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=6;PP=973;SC=AGTTTCAGGCCTGGTGATCAG;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=38;WE=4802378;WS=4802360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	4802386	rs3747602	G	T	1320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=9;PP=1072;ReadPosRankSum=-0.752;SC=ATCAGGCTTTGGCACCGGGGC;SOR=1.220;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=41;WE=4802394;WS=4802376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr16	4812209	rs12599765	G	A	1981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=32;PP=1590;SC=TAACAAGGAAGTGTGACACAC;SOR=0.822;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=31;TCR=32;TR=63;WE=4812217;WS=4812199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	4815425	rs4786548	T	C	1605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=1;PP=1371;SC=GGCTGAGAAATCTTTTGCAGT;SOR=6.479;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=50;TCR=1;TR=51;WE=4815433;WS=4815415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	4815501	rs12928542	G	C	3830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=42;PP=2965;SC=CAAGGAATCTGCAGCTGCAGA;SOR=1.437;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=75;TCR=42;TR=117;WE=4815509;WS=4815491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr16	4815602	rs12919587	T	C	5319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.97;SOR=1.236;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr16	4815608	rs4786549	A	G	5345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.55;SOR=1.266;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr16	4861709	rs2085329	G	C	2267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=26;PP=1725;SC=GGCCTGTCACGTGGGCCAGGG;SOR=1.371;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=46;TCR=26;TR=72;WE=4861717;WS=4861699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	4873642	rs181701620	C	A	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=0;PP=612;SC=TCACCTCGAGCCTCACAGTGC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=4873650;WS=4873632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	4908049	rs149069168	C	A	6231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=93;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.800;SC=AAAGTAGAGGCCCTTGCCCGA;SOR=0.266;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=202;TCF=109;TCR=93;TR=200;WE=4908057;WS=4908039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,202:1.00:203
chr16	4921330	.	C	T	1552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=40;PP=1259;SC=AGATGGGCATCTGTGCAGTCA;SOR=4.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=43;WE=4921338;WS=4921320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	4933939	rs2037912	G	C	10832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=155;NR=172;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.449;SC=TGCAGGTTTTGCCTCTCCAGC;SOR=0.450;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=331;TCF=156;TCR=175;TR=327;WE=4933947;WS=4933929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,339:0.99:342
chr16	4934549	rs1049208	G	A	12184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=183;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=1.553;SC=CGGCAAAGGCGCTCGCCTCGG;SOR=0.642;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=281;TCF=184;TCR=97;TR=280;WE=4934557;WS=4934539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,282:1.00:283
chr16	4934564	rs1049207	C	G	12785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=202;NR=99;PP=2965;ReadPosRankSum=0.248;SC=CCTCGGCCCGCAGGCCTGGCT;SOR=0.708;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=302;TCF=203;TCR=99;TR=301;WE=4934572;WS=4934554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,301:1.00:302
chr16	4938160	rs2734742	T	G	2442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=27;PP=1859;SC=TCACGTGGCTTCTCCTTCCAT;SOR=1.379;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=74;WE=4938168;WS=4938150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr16	4938280	rs2075637	T	C	1728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=42;PP=1371;SC=GACAGACATGTTCCTGTACCC;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=53;WE=4938288;WS=4938270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	4938321	rs2075636	A	T	1152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=31;PP=880;SC=GCCCTGTGCCATGTGCTGGTT;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=4938329;WS=4938311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	4940387	rs11644917	G	A	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=26;PP=930;ReadPosRankSum=-0.560;SC=ATGCCTCACCGAGCCCTCATT;SOR=0.569;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=16;TCR=27;TR=42;WE=4940395;WS=4940377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr16	4940809	rs2471844	A	G	2767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=60;PP=2284;SC=CCAGGTCCGGACAGTGCTCCT;SOR=1.939;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=23;TCR=60;TR=83;WE=4940817;WS=4940799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	4940989	rs2471843	A	C	923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.99;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	4940994	rs760118	A	G	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.36;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	4942099	rs1049205	C	T	2875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=42;PP=2201;SC=GTCCTCCACCCGGGTCCTCAG;SOR=0.829;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=49;TCR=42;TR=90;WE=4942107;WS=4942089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr16	4944518	rs1876363	C	G	4146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=72;PP=2965;SC=TCACAAAACACACGGCCGGAG;SOR=0.905;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=57;TCR=72;TR=129;WE=4944526;WS=4944508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr16	4945221	rs12709119	A	G	5358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=56;PP=2965;SC=TTACCCCAAAAACTTTGTAGT;SOR=1.473;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=105;TCR=56;TR=161;WE=4945229;WS=4945211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr16	4947534	rs8051246	T	C	35.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.87;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	4947638	rs201173658	C	G	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=5;PP=612;SC=GAGAGTAGCACCCCCGGTGCT;SOR=2.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=4947646;WS=4947628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	4948936	rs12443906	C	T	1468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=40;NR=0;PP=1192;SC=GGGGTCTGCCCGAGCTCCAGG;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=4948944;WS=4948926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	4952598	rs2048098	C	G	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=25;PP=718;SC=GGCCCCCCACCCAGACCCCGG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=4952606;WS=4952588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	4952627	rs79655418	A	G	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=518;SC=TCCTGGAAGGACACAGTGACC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=4952635;WS=4952617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	4961003	rs8057613	A	G	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=26;PP=761;SC=GGTGGGGGCTATGTCCCCACC;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=4961011;WS=4960993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	5037498	.	T	TGGA	694	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=11;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=61.14;NF=59;NR=1;PP=694;QD=11.7166666667;SC=GAGGTCGCGCTGGGGGGGGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=84;TCF=69;TCR=15;TR=60;WE=5037507;WS=5037488;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:24,60:0.71:84
chr16	5037499	.	G	GGA	1352.52	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.691;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=74.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.94;MQRankSum=1.342;QD=24.59;ReadPosRankSum=4.233;SOR=6.356;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,48:0.87:55
chr16	5040717	rs3743845	C	T	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=0;PP=621;SC=TAGGGGAGGGCAGGGTGCCCC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=5040725;WS=5040707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	5055864	.	C	CAAA	1578.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.89;MQRankSum=-2.461;QD=30.36;ReadPosRankSum=-1.269;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,49:0.94:52
chr16	5061085	rs2908669	A	C	1826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=11;PP=1468;SC=GGCAGGGCTGATGTGTTTCAG;SOR=2.794;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=56;WE=5061093;WS=5061075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	5064917	rs2012649	C	T	3487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=70;PP=2604;ReadPosRankSum=-0.891;SC=TCAGCGCCGCCACCTCGTCCT;SOR=0.484;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=42;TCR=71;TR=112;WE=5064925;WS=5064907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,114:0.99:115
chr16	5075633	rs7188856	G	A	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=21;PP=927;SC=GTTTGCTGCAGTGCTGATCAG;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=37;WE=5075641;WS=5075623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	5078841	rs1995278	T	C	4603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=30;PP=2965;SC=GGGGCAGACCTGGACTTCAGC;SOR=2.692;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=109;TCR=30;TR=139;WE=5078849;WS=5078831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr16	5083483	rs2972272	T	C	1458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=36;PP=1226;SC=AGCCGCCGGGTCCACCGGGCT;SOR=2.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=47;WE=5083491;WS=5083473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	5094570	rs8055684	G	A	896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=20;PP=748;SC=TCAGCCAGACGCGGTGGCTCA;SOR=1.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=29;WE=5094578;WS=5094560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	5112642	rs143371301	GA	G	1323.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=38;PP=986;SC=CTTGGAACAAGAAAAAAAAAT;SOR=2.004;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=47;WE=5112650;WS=5112632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	5122072	rs112683515	G	GGTCT	4932.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=46;PP=2918;SC=AGTGGCCAAGGGTCTGGGAGG;SOR=0.896;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=32;TCR=60;TR=71;WE=5122080;WS=5122062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr16	5122191	rs34061670	C	CG	1483.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=35;PP=1520;SC=ATTAGACGAGCGGTTCTGCCC;SOR=4.664;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=36;WE=5122199;WS=5122181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
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chr16	5125365	rs4786590	C	T	4406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=88;NR=44;PP=2965;SC=GGTTTCCTCCCCTTCAAGTCT;SOR=1.493;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=88;TCR=44;TR=132;WE=5125373;WS=5125355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr16	5127335	rs11076869	T	A	2927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.179;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=15;PP=2206;ReadPosRankSum=0.742;SC=CTCAGGGAGCTCAAACTCTCC;SOR=2.920;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=90;TCF=74;TCR=16;TR=89;WE=5127343;WS=5127325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,93:0.99:94
chr16	5517175	rs34212245	T	TTC	325.76	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.737;NF=29;NR=1;PP=503;ReadPosRankSum=0.160;SC=TCAATGTTTCTTCTCTCTCTC;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=30;WE=5517183;WS=5517165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr16	6533549	rs7187508	C	A	1809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=29;PP=1340;SC=CCTTCAGGTACGGCGAGCGAA;SOR=1.061;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=21;TCR=29;TR=50;WE=6533557;WS=6533539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	6704474	rs11640601	A	G	5618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.06;SOR=4.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr16	6704480	rs11645523	C	G	5694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.47;SOR=3.998;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr16	6704749	rs2058527	T	G	4655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=112;PP=2965;SC=ATGATGGTTTTTAGGTGATTC;SOR=2.817;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=137;TCF=25;TCR=112;TR=137;WE=6704757;WS=6704739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr16	7645808	rs12935264	C	G	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=551;SC=ACTGGCCTTACTTTTTTTTTT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=7645816;WS=7645798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	7657373	rs1507010	A	G	2118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=33;PP=1589;ReadPosRankSum=1.137;SC=AAGTCTTCTCAGTCTTTTCTA;SOR=0.284;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=33;TCR=34;TR=66;WE=7657381;WS=7657363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
chr16	7715108	rs8064206	T	C	2601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=75;PP=2042;SC=TGGTTTGTCTTGCAGGACAGA;SOR=3.660;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=12;TCR=75;TR=87;WE=7715116;WS=7715098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr16	7726691	rs2191134	A	G	226.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=0;PP=181;SC=TTTGGGTAACAGCTGCTCTGG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=7726699;WS=7726681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	7726757	rs2302213	A	G	358.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=313;ReadPosRankSum=-0.656;SC=CCTGAGTCACATTTCTCCTTG;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=15;WE=7726765;WS=7726747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr16	7759164	rs7196923	T	C	2357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=60;PP=1891;SC=GTCCTCACTTTCTCCTGCCTC;SOR=3.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=9;TCR=60;TR=69;WE=7759172;WS=7759154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	7759206	rs62011897	G	T	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=36;PP=1185;SC=ACCTCAGTACGGGTTGACGTC;SOR=3.417;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=42;WE=7759214;WS=7759196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	7760846	rs5815427	T	TA	232.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.9994;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=186;ReadPosRankSum=-0.568;SC=TTAGCAACTCTAAAAAAAAAA;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=14;WE=7760854;WS=7760836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr16	8619750	rs7198383	C	T	1820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=11;PP=1465;SC=GCCCCTCCCTCCCCTCCACGA;SOR=2.683;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=47;TCR=11;TR=58;WE=8619758;WS=8619740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr16	8620096	rs9922116	T	C	1468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=40;PP=1224;SC=GCCACGCTGCTCAGCGTCCAG;SOR=4.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=43;WE=8620104;WS=8620086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	8728953	rs1731044	C	T	1019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=16;PP=767;SC=AGGTCTTGTCCGCTTCCTGTG;SOR=0.869;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=19;TCR=16;TR=35;WE=8728961;WS=8728943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	8729124	rs2302607	G	A	1937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=10;PP=1469;SC=CACGGGGCTCGCTAGCATCAT;SOR=2.797;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=47;TCR=10;TR=57;WE=8729132;WS=8729114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	8729254	rs3108687	C	A	1812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=33;PP=1055;SC=GGCAGAGGCACTGGAAATTGG;SOR=2.985;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=40;WE=8729262;WS=8729244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	8729275	rs1641040	T	C	1679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=29;PP=918;SC=ATGTTAGCTGTTGTTGATTTT;SOR=4.351;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=8729283;WS=8729265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	8729323	rs1731043	A	T	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=15;PP=441;SC=CTCTCCATTTATTCTCAGTGA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=8729331;WS=8729313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	8732733	rs1362345	C	G	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=462;SC=CGCACTGTCTCTCCCCATCAG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=8732741;WS=8732723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	8732882	rs5815485	CA	C	3956.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=59;PP=2975;SC=TCTCTCTAGGCAAAAAACATG;SOR=0.895;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=126;TCF=60;TCR=66;TR=109;WE=8732890;WS=8732872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr16	8733071	rs1641048	A	G	1296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=38;PP=1060;SC=TGTTTAGCAGATAGGACAGAC;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=39;WE=8733079;WS=8733061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	8734802	.	G	GAT	359.74	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.59;QD=35.97;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	8734803	.	G	A	772	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=57;MMLQ=28;MQ=60.39;NF=30;NR=3;PP=772;QD=24.4476125014;SC=GGATGGATGGGTGGGTGGATG;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=33;WE=8734811;WS=8734793;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	8734803	.	G	GGA	359.74	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.07;QD=35.97;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	8734830	.	G	GCTGGCTGT	1709.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=6;PP=2170;SC=TGGCTGGCTGGCTGGCTGGCT;SOR=3.258;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=39;WE=8734838;WS=8734820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	8735120	rs8062990	T	C	2546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=51;PP=2147;SC=GCTCTGTGGTTTTGACAGAGC;SOR=1.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=19;TCR=51;TR=70;WE=8735128;WS=8735110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	8735200	rs8045911	G	A	2787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=26;PP=2281;SC=ATGAGCACCAGCTGTCATTCT;SOR=1.501;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=55;TCR=26;TR=81;WE=8735220;WS=8735190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	8735212	rs1629322	T	C	2721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=23;PP=2138;SC=TGTCATTCTCTGAGCGCCTGC;SOR=1.694;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=82;TCF=58;TCR=24;TR=81;WE=8735220;WS=8735190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr16	8735245	rs1641055	C	T	4036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=45;PP=2965;SC=ACCTCACGTTCATTTTCTTCT;SOR=1.335;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=80;TCR=45;TR=125;WE=8735253;WS=8735235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr16	8735355	rs1641056	A	G	1868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=53;PP=1625;SC=GTAGGGGCATAGACCCGAGTT;SOR=4.731;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=57;TCF=4;TCR=53;TR=57;WE=8735363;WS=8735345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	8736028	rs1614616	T	C	6943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=91;PP=2965;SC=AATTTCTGACTTGTACGATCA;SOR=0.878;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=204;TCF=113;TCR=91;TR=203;WE=8736036;WS=8736018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr16	8736150	rs1615559	A	C	3205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=58;PP=2639;SC=CCGGGAGTTCAGTTTTAGAAG;SOR=1.064;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=43;TCR=58;TR=101;WE=8736158;WS=8736140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr16	8736246	rs1731007	G	A	6714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=151;NR=53;PP=2965;SC=CTCTCTGTGCGGATTGCTCTG;SOR=2.093;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=205;TCF=152;TCR=53;TR=204;WE=8736254;WS=8736236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr16	8736499	rs1618219	C	T	1116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=32;PP=920;SC=GTGTCCTTGTCAGTGTCATTA;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=8736507;WS=8736489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	8738350	rs11645418	C	T	2470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=16;PP=1936;SC=GCAAGGTGGGCAGAAACAGCA;SOR=2.698;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=65;TCR=16;TR=81;WE=8738358;WS=8738340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr16	8738398	rs1641065	A	G	4532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=62;PP=2965;SC=TGTGCGTCCGACTGGCTGGTT;SOR=1.007;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=85;TCR=62;TR=146;WE=8738406;WS=8738388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr16	8738427	rs1641066	T	C	4577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=71;PP=2965;SC=CAACTTCACATTGAGACACTT;SOR=0.707;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=75;TCR=71;TR=146;WE=8738435;WS=8738417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr16	8738499	rs1731000	G	A	2921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=65;PP=2399;SC=GGAGCAGCTCGCAGATGGCAA;SOR=1.659;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=33;TCR=65;TR=98;WE=8738507;WS=8738489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr16	8738579	rs1641067	A	G	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=34;PP=1042;SC=GCCTCCAGCAACTGGTAGGTC;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=8738587;WS=8738569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	8738622	rs9933132	C	T	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=586;SC=GGTTGCTTTACTGTGAAGCGG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=8738630;WS=8738612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	8739954	rs1641070	G	A	729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=1;PP=486;SC=TCTTTTCTCTGTTTGCTGCAG;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=8739962;WS=8739944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	8740015	rs1730994	A	C	1623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=10;PP=1287;SC=TCGCCTCCACAAGGCGCGGCG;SOR=2.701;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=47;WE=8740023;WS=8740005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	8740418	rs1641072	T	C	3341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=62;PP=2586;SC=GCCATCATATTGCCGCTCGGC;SOR=1.118;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=43;TCR=62;TR=105;WE=8740426;WS=8740408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr16	8740503	rs1730992	G	A	3545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=59;NR=49;PP=2945;SC=TGAGAAGGAAGAGGCAGGAGC;SOR=0.849;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=59;TCR=49;TR=108;WE=8740511;WS=8740493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr16	8740653	rs1641073	C	T	1792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=46;PP=1449;SC=AGTGATCTTCCTCAGAGGTGT;SOR=3.180;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=53;WE=8740661;WS=8740643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	8832491	rs7205552	T	G	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.90;SOR=5.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	8842128	rs1641011	T	A	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=505;SC=TTTTTCTCATTTCCTTTGTGA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=8842136;WS=8842118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	8844389	rs2229157	C	T	2041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=52;PP=1681;SC=TCTCCTCTGTCCCCATAGGTA;SOR=2.372;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=16;TCR=52;TR=68;WE=8844397;WS=8844379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr16	8851767	rs12930438	C	T	6084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=141;PP=2965;SC=TTCATTCATTCCATAAATATG;SOR=2.523;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=182;TCF=41;TCR=141;TR=182;WE=8851775;WS=8851757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr16	8858580	rs2302608	T	A	2778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=19;PP=2259;SC=CTCACGGCTATTTCCCTCCCC;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=71;TCR=19;TR=90;WE=8858588;WS=8858570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr16	8858700	rs112675542	GCA	G	482.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=2.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=1.691;QD=5.96;ReadPosRankSum=1.139;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,23:0.28:81
chr16	8862212	rs8049072	C	T	83.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=61;SC=ACATATTGTCCCACTGATTGC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=8862220;WS=8862202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	8862506	rs1273406	C	A	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=2;PP=569;SC=ATATACACCTCCTATGCACCC;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=8862514;WS=8862497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	8862592	rs1273407	T	C	1959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=12;PP=1482;SC=CTGACAGCCTTGCGCTGAAAT;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=47;TCR=12;TR=59;WE=8862600;WS=8862582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr16	8868776	rs1641022	C	A	1189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=3;PP=923;SC=TGGACGAGGTCCAGACCGGAG;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=37;WE=8868784;WS=8868766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	8896094	rs2304469	G	A	2795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=39;PP=2466;SC=AGTCAGACCGGTCTTCATATT;SOR=0.947;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=49;TCR=39;TR=87;WE=8896102;WS=8896084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr16	8904877	rs34742119	T	TATG	1291.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=1095;SC=GCTGTTTATCTATGTTGCCCA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=23;WE=8904885;WS=8904867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	8905054	rs11074924	T	C	1805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=42;PP=1424;SC=TTCTGAAATATCTTTGGTGAA;SOR=2.712;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=10;TCR=43;TR=52;WE=8905062;WS=8905044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	8907145	rs9924186	G	T	1736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=56;PP=1569;SC=TCAGACCCCCGACGCCTCTGT;SOR=8.015;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=0;TCR=56;TR=56;WE=8907153;WS=8907135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	8948974	rs6898	T	C	1676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=2;PP=1388;SC=GCCTCCTCCCTGCAAAGTCTC;SOR=5.590;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=47;TCR=2;TR=48;WE=8948982;WS=8948964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	8952113	rs62033507	C	A	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=421;SC=GTCCTCACACCCAGCGCCCAT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=8952121;WS=8952103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	8952248	rs988065	A	G	2015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=27;PP=1597;SC=CATCAGCTGGAGTAATGAAGC;SOR=1.196;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=38;TCR=27;TR=65;WE=8952256;WS=8952238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr16	8953081	rs8097	C	G	3465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=40;PP=2501;SC=CCACGTTGCCCCGCAGAGGGG;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=78;TCR=40;TR=118;WE=8953089;WS=8953071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr16	8988386	rs28362503	CG	C	262.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=1;PP=166;SC=CACCAGCCCCCGGGGGGGGGA;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=9;WE=8988394;WS=8988376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	8989403	rs1677473	A	G	3726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=93;NR=15;PP=2965;SC=TAAAAACACAAATCAAGCTAC;SOR=3.611;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=94;TCR=15;TR=108;WE=8989411;WS=8989393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr16	8992342	rs2304465	G	A	8431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.696;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=151;NR=110;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.760;SC=CCAAAACCCCGAGCCTTCTCT;SOR=0.730;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=262;TCF=151;TCR=111;TR=261;WE=8992350;WS=8992332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,266:1.00:267
chr16	8992868	rs2437724	AC	CA	4829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=91;NR=4;PP=2947;SC=CAAGAAATGGACTGTCAGGTG;SOR=5.058;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=99;TCF=94;TCR=5;TR=95;WE=8992877;WS=8992858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr16	8994563	rs2447919	C	T	1468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=32;PP=1191;ReadPosRankSum=0.152;SC=CTTCCATGTACTTAAGTATTT;SOR=0.826;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=46;WE=8994571;WS=8994553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr16	8995177	rs199579856	GAAA	G	446.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.90;QD=40.61;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	8996377	rs2447918	C	T	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=23;PP=728;SC=AATAAAAACACGCTCATATTT;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=8996385;WS=8996367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	8998571	rs2437727	G	C	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=11;PP=255;SC=AGGCTGAGGCGGGCCGATCAC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=8998579;WS=8998561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	9004564	rs2447916	C	A	11762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=279;NR=60;PP=2965;SC=TAAAGAAGAACGCTACAACAG;SOR=3.017;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=339;TCF=279;TCR=60;TR=339;WE=9004572;WS=9004554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,355:1.00:355
chr16	9010260	rs138207509	ATTTTCTGAATTAGGTC	A	1609.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=3;PP=2966;SC=AAAGATGGGCATTTTCTGAAT;SOR=3.442;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=18;WE=9010283;WS=9010250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	9010446	rs57510291	A	AC	1809.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=31;PP=1752;SC=CTCCATTTAAAGCTCAACTTT;SOR=2.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=9010454;WS=9010436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	9010826	.	TA	T	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=-0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.73;ReadPosRankSum=-0.416;SOR=0.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr16	9014350	rs1677470	T	C	1467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=33;PP=1114;SC=AGAACACACATTTTATTCCCA;SOR=2.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=42;WE=9014358;WS=9014340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	9014434	rs2447912	T	G	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=414;SC=TCCCAACTTTTTTGCTAATTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=9014442;WS=9014424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	9015252	rs30761	A	T	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=18;PP=563;SC=CCCATTTATGATTTCATTGCT;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=9015260;WS=9015242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	9017061	rs139138924	T	TACAACGATGTGGGGGTTTGTAGTTGCATCATTTAA	4026.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=82.18;SOR=7.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	9030444	rs1382390	C	G	2070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=36;PP=1705;SC=ACTCACCTTCCAGCCCAAGCC;SOR=0.957;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=28;TCR=36;TR=64;WE=9030452;WS=9030434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr16	10524957	rs34430103	G	T	5579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.122;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=75;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.154;SC=AGCATGAGGGGGCTTGTAGTC;SOR=0.576;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=178;TCF=101;TCR=77;TR=176;WE=10524965;WS=10524947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,179:0.99:181
chr16	10525230	rs34404959	T	C	1616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=41;PP=1247;SC=TTTTGAAAACTGATGAGTGTA;SOR=2.564;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=53;WE=10525238;WS=10525220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	10527613	rs7205853	C	A	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=24;PP=665;SC=CTTTCACTTGCTGCAGAGCTG;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=10527621;WS=10527603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	10532211	rs1532824	A	C	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=596;SC=AAGCAATCCTACCACCTCAGT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=10532219;WS=10532201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	10566146	rs4453490	G	T	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=294;SC=AAATGAAAAAGTTAAATGTAC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=10566154;WS=10566136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	10567751	.	C	CTTTTT	218	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=15;HapScore=3;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=56.44;NF=12;NR=0;PP=218;QD=18.4166666667;SC=TGAGGCAAAGCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=12;WE=10567759;WS=10567741;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:23,12:0.34:35
chr16	10567984	rs62027485	G	A	912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=803;ReadPosRankSum=-0.915;SC=TTTAGCTCATGTGCAGATTCA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=29;WE=10567992;WS=10567974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr16	10625605	rs111364972	GATGAATGAATGA	G	1418.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=4;PP=2997;SC=GATTTATGTTGATGAATGAAT;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=21;WE=10625624;WS=10625595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	10625997	rs7194566	G	A	3452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=62;PP=2629;SC=CAGGGAGCGCGTTAGAAATGC;SOR=1.042;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=45;TCR=62;TR=107;WE=10626005;WS=10625987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr16	10626070	rs34039732	G	A	1995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=44;PP=1631;ReadPosRankSum=-1.659;SC=GGGGGGGGGCGCTGTAGGTTT;SOR=0.613;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=24;TCR=45;TR=68;WE=10626078;WS=10626060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,69:0.99:70
chr16	10626122	rs12928389	G	C	1476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=37;PP=1179;SC=GGTTAAGGATGACCATTCCTA;SOR=3.516;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=43;WE=10626130;WS=10626112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	10631985	rs1504884	T	C	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=13;PP=340;SC=GCCGGCACTGTGGGGTACACA;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=10631993;WS=10631975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	10769958	rs2719710	T	C	6302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=110;PP=2965;SC=CTCCCGCAGCTGGATGGAGTT;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=212;TCF=102;TCR=110;TR=211;WE=10769966;WS=10769948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr16	10770075	rs2719711	A	G	2854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=76;PP=2405;SC=GCAGTCCTGGAAGACCTCAGA;SOR=5.186;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=5;TCR=77;TR=81;WE=10770083;WS=10770065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	10770091	rs2719712	T	C	2142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=70;PP=1690;SC=TCAGAATCTGTGGTTTCTCCG;SOR=5.367;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=4;TCR=71;TR=74;WE=10770099;WS=10770081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr16	10775855	rs12918646	G	A	3105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=20;PP=2399;SC=CTTACGTGCCGTCAATTTTCT;SOR=2.632;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=73;TCR=20;TR=93;WE=10775863;WS=10775845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr16	10783088	.	TA	T	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.918;ClippingRankSum=0.000;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=0.475;QD=0.59;ReadPosRankSum=1.012;SOR=0.745;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,23:0.16:146
chr16	10788106	rs2251984	A	G	1032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=0;PP=853;SC=CAAGGGAAGCAGAATGAGCGT;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=36;WE=10788114;WS=10788096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	10788129	rs2251985	G	T	1804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=2;PP=1468;SC=AGTATCCCCAGGACACAGCCA;SOR=5.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=54;TCF=52;TCR=2;TR=54;WE=10788137;WS=10788119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	10788406	rs9922129	G	T	4785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.065;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=90;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.843;SC=GCCCACAGCCGGGAGGCCTCG;SOR=0.995;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=60;TCR=90;TR=149;WE=10788414;WS=10788396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,152:0.99:153
chr16	10989374	rs11074937	C	T	1982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=50;PP=1591;ReadPosRankSum=0.993;SC=CTGGTCCCTGCCCTCCCGTCA;SOR=1.802;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=10;TCR=51;TR=60;WE=10989382;WS=10989364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr16	10989770	rs45601738	C	T	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=14;PP=435;SC=GCTGGAGGAACGGAGACTCCA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=10989778;WS=10989760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	10995850	rs6498124	G	T	900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=0;PP=732;SC=TCCCAGGAAGGCCCCTCCAAG;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=25;WE=10995858;WS=10995840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	10995933	rs8046121	A	G	3370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.55;SOR=2.864;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	10995941	.	G	A	3721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.78;SOR=2.679;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr16	10996332	rs6498125	C	G	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=2;PP=283;SC=CATGGAGCCCCTTCTCTGTGC;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=10996340;WS=10996329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	11001743	rs2229320	G	A	4540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=64;PP=2965;SC=GGCTGCAGCCGGGGACACTGC;SOR=0.827;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=77;TCR=64;TR=141;WE=11001751;WS=11001733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr16	11002133	rs4781018	C	G	1318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=34;PP=1028;SC=AGAATGGATTCTCTCCATTTT;SOR=3.109;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=40;WE=11002141;WS=11002123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	11002904	rs2228238	G	A	2461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=16;PP=2112;SC=TGAGCGACACGGTGGCGCTGT;SOR=2.630;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=61;TCR=16;TR=77;WE=11002912;WS=11002894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr16	11002927	rs7197779	A	G	3198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=35;PP=2562;SC=GAGTCCCTGCAGCAGCATGGG;SOR=1.761;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=79;TCR=35;TR=114;WE=11002935;WS=11002917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr16	11008882	.	C	T	4221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=108;PP=2965;SC=AGATGGGAGCCCAACTTACCT;SOR=3.348;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=20;TCR=108;TR=128;WE=11008890;WS=11008872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr16	11015906	rs6498134	A	G	2023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=4;PP=1620;SC=ATAAATATTGATTCCTTCCCC;SOR=4.875;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=52;TCR=4;TR=56;WE=11015914;WS=11015896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	11017058	rs4781024	G	A	3822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=32;PP=2965;ReadPosRankSum=1.398;SC=CCTCTAACCTGGCTCTGAGTC;SOR=1.079;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=91;TCR=32;TR=122;WE=11017066;WS=11017048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,123:0.99:124
chr16	11214668	rs3217121	AAC	A	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.651;NF=0;NR=5;PP=124;ReadPosRankSum=-0.042;SC=GTTGGCTACAAACACACACAC;SOR=0.404;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=5;WE=11214677;WS=11214658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr16	11349403	rs27829	A	C	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=20;PP=585;SC=AGAGACAAAGAGGTGAGCTGG;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=11349411;WS=11349393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	11350059	rs27831	T	C	85.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=2;PP=45;SC=GCTCGCTCTGTTCGGCGCCCG;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=11350067;WS=11350049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	11367143	rs438289	G	A	2228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=11;PP=1219;SC=GTTGCGGGTCGGGAGGGTGTC;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=49;WE=11367162;WS=11367133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	11367154	rs429744	C	T	2275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=12;PP=1416;SC=GGAGGGTGTCCGCTTGGGCTC;SOR=2.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=52;WE=11367162;WS=11367133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	11369851	rs182114260	G	A	6324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.86;SOR=0.996;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr16	11369855	rs2070923	G	T	6388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.37;SOR=0.971;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr16	11444403	rs2032929	T	C	1180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=2;PP=987;SC=GCCGAGATTGTGCCACTGCAC;SOR=4.294;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=35;WE=11444411;WS=11444393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	11444430	rs2032930	T	G	1707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=7;PP=1337;SC=CTGGGCGACATAGCAAGACTC;SOR=3.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=48;WE=11444438;WS=11444420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	11444454	rs57767216	GA	G	2127.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=16;PP=1243;SC=CTCAAAAGAAGAAAAAAAAAA;SOR=2.706;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=91;TCF=64;TCR=27;TR=67;WE=11444477;WS=11444444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr16	11444469	rs2032931	C	T	4524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=73;NR=27;PP=2396;SC=AAAAAAAGAACATTACTATGG;SOR=2.024;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=101;TCF=74;TCR=27;TR=100;WE=11444477;WS=11444444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr16	11444716	rs2032932	A	G	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=21;PP=569;SC=AATGATGTGGATTTCATGGAC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=11444724;WS=11444706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	11537347	.	A	AAGAGAGAG	4415.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;QD=65.91;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr16	11540712	rs4500747	T	C	2057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=43;PP=1512;SC=GCCTATCAGCTGTGAAGGTCT;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=72;TCF=29;TCR=43;TR=71;WE=11540720;WS=11540702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	11540760	rs4502229	C	T	1335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=32;PP=1043;SC=GCAGGTGCAACGGGTGCCTGG;SOR=2.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=43;WE=11540768;WS=11540750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	11541685	rs4296278	A	G	1880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=2;PP=1560;SC=AGGTCAGCAGAGATTCTCCAG;SOR=5.747;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=52;TCR=2;TR=52;WE=11541693;WS=11541675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	11541896	rs4238608	G	A	3397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=96;PP=2860;SC=GCACCAATCCGCACAGCCGTG;SOR=3.513;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=17;TCR=96;TR=113;WE=11541904;WS=11541886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr16	11542894	rs4467099	C	T	3328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=21;PP=2590;SC=TGCACTGCTGCGTTCCAGGCT;SOR=2.663;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=79;TCR=21;TR=100;WE=11542902;WS=11542884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr16	11544741	rs6498192	G	A	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=32;PP=1116;SC=GCAGGCAGCTGGAGGTCCCGA;SOR=2.170;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=45;WE=11544749;WS=11544731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	11544824	rs6498194	G	A	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=19;PP=529;SC=TTTCTAGGACGTTGGTAATGT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=11544832;WS=11544814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	11550619	rs72777209	G	A	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=0;PP=1076;SC=CCAACAAAAGGAAAAGGTGTT;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=37;WE=11550627;WS=11550609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	11553883	rs35839588	C	G	2931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=67;PP=2299;SC=TGCAGGTGGCCCGAGTCCTCC;SOR=3.160;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=15;TCR=67;TR=82;WE=11553891;WS=11553873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr16	11554301	rs72777212	C	G	5716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=74;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.862;SC=CTAGTGCTCTCTCCGGATGTC;SOR=0.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=177;TCF=103;TCR=74;TR=176;WE=11554309;WS=11554291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,187:0.99:188
chr16	11554737	rs8046254	C	T	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=501;SC=CAGCGTATCTCAGCTCACGGA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=11554745;WS=11554727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	11555016	rs6498202	C	G	2172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=46;PP=1640;SC=GGTCAGCCCCCAGGGACCAGC;SOR=1.778;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=23;TCR=46;TR=69;WE=11555024;WS=11555006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	11555861	rs4781101	G	C	1916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=3;PP=1606;SC=CCTTGGATGGGATGTTGATAT;SOR=5.247;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=55;TCR=3;TR=57;WE=11555869;WS=11555851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	11556121	rs4254342	A	G	1595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=40;PP=1286;SC=GGAACCGCTCAGCCTCGCCAC;SOR=2.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=50;WE=11556129;WS=11556111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	11650325	rs3743582	G	A	3066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=65;PP=2555;SC=CCAGGGTGGAGGGCCAAGGAA;SOR=1.469;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=36;TCR=65;TR=101;WE=11650333;WS=11650315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr16	11797365	rs147693005	TACACAC	TAC,T	1011.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=13,13;NR=5,5;PP=819,73;SC=AGGCTTTTGATACACACACAC;SOR=2.200;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=18,18;WE=11797378;WS=11797355;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:26
chr16	11828018	rs4780398	A	G	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=25;PP=738;SC=ATTTAAAAATAGAATGATTCC;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=11828026;WS=11828008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	11836398	rs3743587	C	G	354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=4;PP=288;SC=AGAGCAGCTCCGGCCGCTGGC;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=11836406;WS=11836388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	11836508	rs3743588	G	A	1410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.22;SOR=2.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	11850003	rs7198247	A	G	6160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=144;NR=33;PP=2965;SC=TGGTGACACAACGAGACTCCA;SOR=2.833;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=144;TCR=33;TR=177;WE=11850011;WS=11849993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr16	11852354	rs8743	A	C	3732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=80;PP=2943;SC=AACAGTTTCCAACATATTGAC;SOR=2.033;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=30;TCR=80;TR=110;WE=11852362;WS=11852344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr16	11857566	.	AATATATATATATATATATATATATATATATATATATAT	A,AAT	988.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=41.20;SOR=6.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,6,18:0.25,0.75:24
chr16	11859341	rs7199993	A	G	4163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=24;PP=2965;SC=TTTGGAGAACACACCTCACAA;SOR=2.979;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=114;TCR=24;TR=138;WE=11859349;WS=11859331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr16	11870137	rs34393518	T	TA	492.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=2;PP=426;SC=TCCTTCCCTTTAAAAAAAAAT;SOR=3.500;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=19;WE=11870145;WS=11870127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	11870863	rs78968205	T	C	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=9;PP=271;SC=CCCCATCCTATTACCCTCCCT;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=11870871;WS=11870853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	11873158	rs16958654	T	C	1603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=38;PP=1159;SC=GTTCCAATCATGTTCCCGATA;SOR=1.733;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=56;WE=11873166;WS=11873148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr16	11876203	rs1429077	T	C	7975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=139;PP=2965;ReadPosRankSum=1.146;SC=CTCGGACACATTGGACATGTT;SOR=0.398;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=234;TCF=93;TCR=141;TR=232;WE=11876211;WS=11876193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,245:1.00:246
chr16	11914267	rs113088666	C	CT	317.27	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.24;MQRankSum=0.279;QD=18.66;ReadPosRankSum=-0.225;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,15:0.88:17
chr16	11940390	rs8052900	T	C	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=4;PP=1094;ReadPosRankSum=1.609;SC=TGTTTAAGACTGTTCCACCTA;SOR=2.880;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=41;WE=11940398;WS=11940380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr16	11940764	rs1019814	T	C	1154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=30;PP=918;SC=AAGAAATACTTAGGCAACAAT;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=32;WE=11940772;WS=11940754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	11940829	rs1019813	C	T	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=259;SC=TTAATGAACACTTGAGGGCCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=10;WE=11940837;WS=11940819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	11945231	rs2075158	T	C	1807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=26;PP=1458;SC=ACCGCCACACTGCTTCCAAGC;SOR=1.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=36;TCR=26;TR=62;WE=11945239;WS=11945221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	12009150	rs28653099	C	A	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=6;PP=634;SC=CAGGGCCGCGCGCCCCCGGAC;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=12009158;WS=12009140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	12009279	rs424518	A	G	1515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=40;NR=12;PP=1311;SC=GGCGCCGCCAACTGGGGGTGG;SOR=2.393;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=52;WE=12009287;WS=12009269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	12009304	rs11544193	C	A	2287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=31;PP=1893;SC=GCTGCCGGGCCCCGCAGGAAG;SOR=1.121;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=46;TCR=31;TR=77;WE=12009312;WS=12009294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr16	12009530	.	C	CCCG	1424.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.979;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.123;NF=12;NR=8;PP=1007;ReadPosRankSum=-0.199;SC=CGCTGCTGCTCCCGCCGCCGC;SOR=1.000;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=45;TCF=18;TCR=27;TR=20;WE=12009538;WS=12009520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr16	12009614	rs435108	G	A	3246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=30;PP=2696;SC=ACAGAGAGCGGGAAATGGAGG;SOR=1.755;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=66;TCR=30;TR=96;WE=12009622;WS=12009604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr16	12009781	rs434762	G	A	5493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=63;NR=111;PP=2965;SC=CGGCGGCGGCGGCAGCTCAAC;SOR=1.477;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=63;TCR=111;TR=174;WE=12009789;WS=12009771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr16	12031353	rs62040806	T	C	2550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.49;MQRankSum=-1.244;QD=31.11;ReadPosRankSum=0.848;SOR=1.683;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,81:0.99:82
chr16	12031379	rs62040807	G	A	3405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.871;HP=4;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-1.708;NF=92;NR=38;PP=2965;ReadPosRankSum=1.103;SC=TACCTCTACAGAAAGTTAGTA;SOR=1.889;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=94;TCR=40;TR=130;WE=12031398;WS=12031369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,106:0.97:109
chr16	12031390	rs677507	C	T	5283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=45;PP=2965;SC=AAAGTTAGTACACTCACCCAA;SOR=1.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=98;TCR=45;TR=143;WE=12031398;WS=12031369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr16	12031448	rs636664	T	C	4225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=94;PP=2965;SC=TTCTCGGAAATGCAATAATGA;SOR=1.119;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=66;TCR=94;TR=160;WE=12031456;WS=12031438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr16	12060163	rs373496	A	G	4212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=109;PP=2965;SC=AGGAAGATAAACTCTGAACCA;SOR=3.173;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=129;TCF=19;TCR=110;TR=128;WE=12060171;WS=12060153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr16	12096697	rs116930832	A	G	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=1;PP=888;SC=TCTTGTGCTGATACCCAGGGG;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=12096705;WS=12096687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr16	12136954	rs1703492	A	C	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=19;PP=622;SC=CGGGATGCGAACTGGGATGGG;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=12136962;WS=12136944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	12142130	rs56363861	C	T	1027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=1;PP=943;SC=GATCAACGTGCCTCCTCTTCT;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=35;WE=12142138;WS=12142120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	12142172	rs3826097	T	G	2543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.10;QD=46.25;SOR=6.630;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	12142175	rs3826098	C	G	2543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.48;QD=43.86;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr16	12162969	rs1641843	A	G	4040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=71;PP=2965;SC=ACGTTCTCCCAGATCCTGGAC;SOR=0.799;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=133;TCF=62;TCR=71;TR=133;WE=12162977;WS=12162959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr16	12172873	rs4352067	C	A	221.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=6;PP=182;SC=TGTGGGTTCACGTCAGGTGTG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=12172881;WS=12172863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	12181532	.	C	G	2301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=5;PP=2036;SC=CTGAAGTTATCCTGGGCTTTA;SOR=4.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=66;TCR=5;TR=71;WE=12181540;WS=12181522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr16	12183686	rs350229	C	T	1652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=25;PP=1276;ReadPosRankSum=-0.906;SC=CTCAGCAGTGCGTTCCTTCCG;SOR=0.253;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=53;TCF=28;TCR=25;TR=52;WE=12183694;WS=12183676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr16	12296803	rs1701115	G	T	5304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=42;PP=2965;SC=CTGGTGGCGTGGGAGGTGACA;SOR=2.260;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=122;TCR=42;TR=164;WE=12296811;WS=12296793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr16	12297011	rs9933762	C	G	10573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=148;NR=175;PP=2965;SC=AGTTGTATATCGTGGCCCCAC;SOR=0.862;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=324;TCF=149;TCR=175;TR=323;WE=12297019;WS=12297001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,330:1.00:330
chr16	12297562	rs1701113	G	A	2661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=69;PP=2183;SC=TTTGCTGTAAGACAACCATCC;SOR=5.499;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=3;TCR=69;TR=72;WE=12297570;WS=12297552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr16	12662216	rs17822014	G	A	1600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=0;PP=1350;SC=CATTTCTTCAGGTGGCACCAG;SOR=7.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=47;TCR=0;TR=47;WE=12662224;WS=12662208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr16	12758966	rs1713480	T	C	4579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=96;PP=2965;SC=GAACACGACTTTGACACCTGC;SOR=1.965;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=136;TCF=40;TCR=96;TR=136;WE=12758974;WS=12758956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr16	12759027	rs1713479	A	G	2301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=66;PP=1933;SC=TAGGTAACCTAGGGTCTCCAG;SOR=6.214;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=68;TCF=2;TCR=66;TR=68;WE=12759035;WS=12759017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr16	12897610	rs376927814	A	C	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=360.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.90;ReadPosRankSum=0.503;SOR=8.189;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,59:0.28:212
chr16	13002359	rs9938751	T	C	4927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=74;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.785;SC=CTGCTGTTTATGGAGGCACAG;SOR=0.349;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=96;TCR=74;TR=169;WE=13002367;WS=13002349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,170:0.99:171
chr16	13307302	rs7195991	C	A	2079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=55;PP=1739;SC=CGTCTAAGTTCCAGTGTGTAG;SOR=3.160;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=11;TCR=56;TR=66;WE=13307310;WS=13307292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr16	14026007	rs254942	G	A	1247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=13;PP=955;SC=TTAACTTTTCGTATTAGGTTG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=39;WE=14026015;WS=14025997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	14026925	.	C	A	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.683;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=63.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.62;MQRankSum=-5.056;QD=6.60;ReadPosRankSum=-2.013;SOR=7.168;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,35:0.49:71
chr16	14026927	.	C	A	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.877;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=63.585;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.73;MQRankSum=-5.056;QD=6.60;ReadPosRankSum=-4.198;SOR=7.168;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,35:0.49:71
chr16	14031520	rs31869	G	A	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=302;SC=TCAAATATTTGTTATTTGAGC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=14031528;WS=14031510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	14678349	rs374880534	A	AC	4989.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=114;PP=2979;SC=AGATTCACTGACCCCCCCAAA;SOR=2.046;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=171;TCF=29;TCR=142;TR=135;WE=14678357;WS=14678339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr16	14700254	rs4782156	G	A	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=6;PP=465;SC=GACCCTGAGGGAAAAAAAAAA;SOR=1.179;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=17;WE=14700262;WS=14700244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	14749080	.	AT	A	279.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.65;MQRankSum=0.000;QD=9.65;ReadPosRankSum=-0.461;SOR=1.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr16	14958514	rs117835774	A	G	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=8.045;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.75;MQRankSum=-1.701;QD=32.09;ReadPosRankSum=-0.818;SOR=3.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr16	14968859	rs77578560	C	T	4478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.502;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.278;NF=100;NR=36;PP=2965;ReadPosRankSum=1.401;SC=CACAAGGATACGCAACTATGT;SOR=1.929;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=137;TCF=100;TCR=37;TR=136;WE=14968867;WS=14968849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,141:0.99:142
chr16	15068908	rs28418438	C	G	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=5.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-3.413;NF=1;NR=34;PP=744;ReadPosRankSum=0.038;SC=TTCGGCAGCCCGCGGCGCCGC;SOR=1.022;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=72;TCF=3;TCR=69;TR=35;WE=15068916;WS=15068898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,32:0.46:69
chr16	15068926	.	C	T	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.923;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.286;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.235;NF=4;NR=18;PP=446;ReadPosRankSum=0.075;SC=CGCCTGGCAGCTCCTCCTCTT;SOR=0.104;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=22;WE=15068934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr16	15083131	rs4985166	A	T	2035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.77;QD=33.93;SOR=4.875;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	15083383	rs139221308	G	A	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=16;PP=824;SC=CACGCGCTCCGTGGGGTTGTT;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=16;TCR=16;TR=32;WE=15083391;WS=15083373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	15083561	rs145963881	G	A	328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=10;PP=256;SC=TGCAGGCAACGCACGCGGCGC;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=15083569;WS=15083551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	15083868	rs9928601	A	C	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=6;PP=297;SC=AGGACCAGGGAAGCAGGTGCA;SOR=0.836;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=13;WE=15083876;WS=15083858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	15091589	rs11421981	C	CT	425.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.720;HP=14;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=-3.596;NF=31;NR=6;PP=388;ReadPosRankSum=-0.771;SC=AAATTTCTTTCTTTTTTTTTT;SOR=0.138;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=97;TCF=84;TCR=13;TR=37;WE=15091597;WS=15091579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,27:0.33:83
chr16	15092116	rs6498535	C	T	1606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.04;MQRankSum=1.021;QD=18.68;ReadPosRankSum=1.027;SOR=1.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,41:0.48:86
chr16	15092122	rs139576977	C	T	1718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.31;MQRankSum=0.786;QD=18.09;ReadPosRankSum=-0.142;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,47:0.49:95
chr16	15100202	rs71271216	A	G	1605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.31;MQRankSum=-2.256;QD=13.61;ReadPosRankSum=-1.910;SOR=0.598;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,56:0.47:118
chr16	15110077	rs4262938	C	T	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=4.696;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.91;MQRankSum=-1.565;QD=17.21;ReadPosRankSum=-0.060;SOR=1.349;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,51:0.61:84
chr16	15116400	rs4985161	T	A	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.534;NF=28;NR=0;PP=482;ReadPosRankSum=0.066;SC=ATATTTACAGTTGTTGAAATA;SOR=0.197;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=86;TCF=86;TCR=0;TR=28;WE=15116408;WS=15116390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,27:0.31:86
chr16	15116521	rs4985160	C	T	2392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.225;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-10.709;NF=59;NR=50;PP=2038;ReadPosRankSum=-1.383;SC=TCATGTCCCACGTCCATCTAA;SOR=0.921;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=241;TCF=122;TCR=119;TR=109;WE=15116529;WS=15116511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,102:0.43:238
chr16	15116625	rs1058637	G	T	1896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.794;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.434;NF=10;NR=61;PP=1552;ReadPosRankSum=-0.278;SC=TAGTATATAAGTTCATCTGTT;SOR=0.832;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=147;TCF=25;TCR=122;TR=71;WE=15116633;WS=15116615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,73:0.47:154
chr16	15120411	rs62039476	T	C	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.092;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-7.362;NF=46;NR=1;PP=1032;ReadPosRankSum=-0.338;SC=AATAGAGCATTTCTAAGCGAG;SOR=2.229;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=133;TCF=124;TCR=9;TR=47;WE=15120419;WS=15120401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,23:0.22:105
chr16	15122812	rs112323280	C	G	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=975;ReadPosRankSum=-1.336;SC=GTGTGACGCGCTGAATCGCTG;SOR=0.728;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=93;TCF=37;TCR=56;TR=50;WE=15122820;WS=15122802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,54:0.55:99
chr16	15128068	rs146009528	G	T	274.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=1;PP=225;SC=AATTCCCTCAGTGCTGTGTTA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=15128076;WS=15128058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	15135071	rs7498279	G	A	765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=648;SC=GGAGCTCCTCGATGCAGAAAG;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=15135079;WS=15135061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	15135269	rs9926473	T	G	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=1;PP=260;SC=TCCTTCCTGGTAGACGAGGGG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=15135277;WS=15135263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	15159022	.	CA	C	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.000;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=7.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.64;MQRankSum=-4.467;QD=0.86;ReadPosRankSum=0.777;SOR=2.395;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,19:0.22:86
chr16	15187912	rs11075256	G	C	1600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=8;PP=1073;SC=CACGCCATGAGCTTTGTCCCA;SOR=3.171;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=42;WE=15187920;WS=15187902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	15493046	rs153001	G	A	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	15501658	rs200953251	C	CT	2511.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.393;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.999;NF=64;NR=22;PP=1452;ReadPosRankSum=-0.234;SC=AAAGTTGTTGCTTTTTTTTTT;SOR=0.309;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=115;TCF=79;TCR=36;TR=86;WE=15501666;WS=15501648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:13,106:0.89:119
chr16	15596142	rs12448500	G	C	962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=11;PP=724;SC=TAGCCAGGATGTGAAGCCTGT;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=30;WE=15596150;WS=15596132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	15681426	.	C	T	2606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.083;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.574;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=50;PP=1913;ReadPosRankSum=-0.973;SC=AGCAGGGAACCGGAAGCTCTG;SOR=1.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=79;TCF=29;TCR=50;TR=78;WE=15681434;WS=15681416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,85:0.99:86
chr16	15692836	rs142983571	G	A	2445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=52;PP=1900;SC=GTCGACGGGGGAGTCGTCGGT;SOR=1.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=24;TCR=52;TR=76;WE=15692844;WS=15692826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	15693011	.	T	TA	44	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=20;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=29;MQ=61.98;NF=1;NR=3;PP=44;QD=11.75;SC=TTTAAGGTATTAAAAAAAAAA;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=4;WE=15693019;WS=15693001;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:12,4:0.25:16
chr16	15695059	rs2071331	A	G	2102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=57;PP=1642;SC=ACATGTGCACACCGTCGCCAG;SOR=5.486;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=60;TCF=3;TCR=57;TR=59;WE=15695067;WS=15695049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	15696480	rs71293163	A	AAGGAAAGAAGGAGGGAGGCAGAG	3029.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=56.11;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	15702060	rs72770197	C	T	150.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=152;SC=AGAAACGCTACAGCACACGCA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=15702068;WS=15702050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	15705605	rs7185421	A	G	1267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=32;PP=1033;SC=CAAAGCAAATAGTTTATTTAT;SOR=2.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=38;WE=15705613;WS=15705595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	15727459	rs5815838	AT	A	1015.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.46;QD=23.08;SOR=5.186;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	15771601	rs6498567	T	C	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=7;PP=913;SC=TGTGCTACTGTGTCTAGCCTT;SOR=2.774;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=36;WE=15771609;WS=15771591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	15781054	rs8044738	A	G	1907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=21;PP=1446;SC=CCCATTCTGCAGGTAAAGAGC;SOR=1.644;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=43;TCR=21;TR=64;WE=15781062;WS=15781044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr16	15811023	rs1050163	C	T	6671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.512;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=92;PP=2965;ReadPosRankSum=1.052;SC=CCTGCTCCTCCAGCTGTGCAA;SOR=0.602;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=210;TCF=117;TCR=93;TR=209;WE=15811031;WS=15811013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,210:1.00:211
chr16	15811062	rs1050162	C	T	7386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=130;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.903;SC=CGATGGTGGACTTGAACTTGG;SOR=0.307;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=239;TCF=108;TCR=131;TR=237;WE=15811070;WS=15811052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,240:1.00:241
chr16	15813007	rs72772021	G	A	3727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=22;PP=2965;SC=AAAATAAAATGGGGGTCGAGG;SOR=2.774;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=92;TCR=22;TR=114;WE=15813015;WS=15812997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr16	15813211	rs11646134	G	T	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=44;PP=1335;SC=GAAAGGCCAAGCCCCACCAAG;SOR=3.442;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=7;TCR=45;TR=51;WE=15813219;WS=15813201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	15813633	rs17284411	G	A	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=15;PP=412;SC=CTGCTGCCCAGTTCAGCTTTG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=15813641;WS=15813623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	15813945	rs2075512	C	T	2256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=3;PP=1882;SC=CTGCTGACTTCGGTGGCCTGA;SOR=5.074;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=61;TCR=3;TR=63;WE=15813953;WS=15813935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr16	15818141	rs2075511	A	C	2194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=39;PP=1621;ReadPosRankSum=-0.687;SC=GTTTATCATAAGCGGCCGCCT;SOR=0.263;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=41;TCR=39;TR=79;WE=15818149;WS=15818131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,79:0.99:80
chr16	15818310	rs11130	G	A	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=12;PP=400;SC=GGGACCATGAGTGGCCCCTGT;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=15818318;WS=15818300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	15843899	rs6498570	G	A	3625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=51;PP=2915;SC=TGGGGTCCTCGGGGTAGGTGG;SOR=0.766;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=57;TCR=51;TR=108;WE=15843907;WS=15843889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr16	15869801	rs2072619	T	C	2374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=6;PP=2044;SC=TGAAGAACTGTTCATATGTCA;SOR=4.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=65;TCR=6;TR=71;WE=15869809;WS=15869791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	15892481	rs12102468	C	A	2654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.36;MQRankSum=-0.300;QD=30.17;ReadPosRankSum=0.592;SOR=0.970;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,87:0.99:88
chr16	15892491	.	ACAGAAG	A	329.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.366;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=54.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.94;MQRankSum=-1.816;QD=2.79;ReadPosRankSum=-2.197;SOR=6.191;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,27:0.23:118
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chr16	16110244	rs185005	C	G	1626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.97;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	16110253	rs246215	T	C	1693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.43;SOR=5.084;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	16126764	rs924138	T	C	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=0;PP=478;SC=ACTCCGTTGATTGAAACTGGA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=18;WE=16126772;WS=16126754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	16130514	rs903880	C	A	5275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.21;SOR=2.966;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr16	16130524	rs246232	C	G	4877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.16;SOR=3.872;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr16	16150208	rs17265551	C	T	853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=24;PP=838;SC=ATTTTCTCTGCGTACCTGAAT;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=16150216;WS=16150198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	16161976	rs35604	G	A	4206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=42;PP=2965;ReadPosRankSum=0.623;SC=ACTCTCACTCGGGGCACAGCA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=128;TCF=85;TCR=43;TR=126;WE=16161984;WS=16161966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,133:0.99:135
chr16	16162019	rs35605	T	C	5366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=76;PP=2965;ReadPosRankSum=0.815;SC=GCAGGTGGCCTTGTGCACATT;SOR=0.867;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=166;TCF=89;TCR=77;TR=164;WE=16162027;WS=16162009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,172:0.99:174
chr16	16184222	rs45607032	CAT	C	2093.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=10;PP=1792;SC=CAGTCTCACACATGTGCACTC;SOR=2.352;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=39;WE=16184240;WS=16184212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	16184232	rs2074087	C	G	2208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=11;PP=1311;SC=CATGTGCACTCACGTGGCCGG;SOR=2.348;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=47;WE=16184240;WS=16184212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	16184366	rs28364004	G	T	3413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=58;PP=2722;SC=ACCAGGAGCTGCTGGCTCGAG;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=52;TCR=58;TR=110;WE=16184374;WS=16184356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr16	16200756	rs11075296	C	T	1701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=44;PP=1520;SC=TAAGTGATGACAGTGGCTGGA;SOR=3.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=54;WE=16200764;WS=16200746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	16205449	rs3851716	G	A	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=22;PP=610;SC=GGTTGGTGCCGCTGTCTCCCA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=16205457;WS=16205439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	16219596	rs113369901	G	GAAAAAAAA	2306.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.87;QD=50.15;SOR=2.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	16232201	rs45587033	GT	G	1177.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=7;PP=884;SC=CTATCTCCTGGTTTTTTTCTT;SOR=2.885;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=41;TCF=30;TCR=11;TR=33;WE=16232209;WS=16232191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	16248681	rs2066738	G	A	2238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=37;PP=1852;SC=GGTCAGAGCCGGGTCCCACCA;SOR=0.750;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=71;TCF=34;TCR=37;TR=70;WE=16248689;WS=16248671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr16	16251435	rs3896244	G	A	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=5;PP=682;SC=CTGTGGAGGTGGCTGGTGCCC;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=16251443;WS=16251425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	16253283	rs56822940	GC	G	2326.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=6;PP=1308;SC=GGGACCCATTGCCCCCCCCCA;SOR=3.940;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=72;TCF=64;TCR=8;TR=64;WE=16253291;WS=16253273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr16	16253570	rs2238470	C	T	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=12;PP=377;SC=AGGAATGGGACAGTCTGAGGA;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=16253578;WS=16253560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	16255195	rs3851721	T	G	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.45;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	16255205	rs2376957	C	T	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.25;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	16255240	rs3213470	G	A	1103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=0;PP=896;SC=GCAGGGGTCCGACAGTCTCTG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=16255248;WS=16255230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	16255583	rs187645110	C	T	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=522;SC=AAGATGACACCGTCCTGTCTC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=16255591;WS=16255573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	16263837	rs7201980	T	C	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=226;SC=CAGACCTCACTGGTTCTCCCG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=16263845;WS=16263827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	16267079	rs11866320	A	G	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=588;SC=TTTGGTGGGAAGACTTGGGCC;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=16267087;WS=16267069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	16271357	rs6416668	T	C	5983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=95;PP=2965;SC=AGAAGACACATGAGGGCCCCC;SOR=0.910;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=206;TCF=111;TCR=95;TR=206;WE=16271365;WS=16271347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr16	16272670	rs7500834	T	C	1881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=34;PP=1497;SC=CCTGGAGTAGTCCACCAGGCC;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=23;TCR=34;TR=57;WE=16272678;WS=16272660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr16	16278948	rs41278182	C	T	877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=28;PP=794;SC=GCCTCTGCATCGGAGAGGCCC;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=16278956;WS=16278938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	16280921	rs8056103	T	C	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=2;PP=363;SC=CATTATGGGCTGGGGTGGCCC;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=14;WE=16280929;WS=16280911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	16283973	rs55707615	G	A	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=2;PP=482;SC=CCCCACCCCCGCACTCCTTCC;SOR=3.500;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=18;WE=16283981;WS=16283963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	16284265	rs2239322	T	C	2181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.64;SOR=2.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	16284272	rs7193932	C	T	2075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.17;SOR=3.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	16286614	rs6498618	G	C	1150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=7;PP=832;SC=TCTCCCCTCCGCATCTCCCAC;SOR=2.049;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=32;WE=16286622;WS=16286604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	16291858	rs12929920	G	C	4164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=101;NR=34;PP=2965;SC=TTCAAATCCCGTCTTCCTCCT;SOR=2.200;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=101;TCR=34;TR=135;WE=16291879;WS=16291848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr16	16291871	rs9940089	G	C	4724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=41;PP=2965;SC=TTCCTCCTCTGGCATACCTGC;SOR=2.083;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=111;TCR=41;TR=152;WE=16291879;WS=16291848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr16	16291971	rs9940825	C	T	5358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=93;PP=2965;SC=GCTGCACGTCCACGGACACCA;SOR=0.985;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=169;TCF=75;TCR=94;TR=168;WE=16291991;WS=16291961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr16	16291983	rs9930886	A	G	4880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=99;PP=2965;SC=CGGACACCAGATTGACCACAT;SOR=1.687;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=148;TCF=48;TCR=100;TR=147;WE=16291991;WS=16291961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr16	16350133	.	CT	C	42.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.07;MQRankSum=-3.881;QD=0.99;ReadPosRankSum=0.344;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,9:0.21:43
chr16	17190040	rs3889206	G	T	2674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=73;NR=2;PP=2255;SC=TTGAAAATCCGTCAGAATAAT;SOR=6.466;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=76;TCF=74;TCR=2;TR=75;WE=17190048;WS=17190030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr16	17221423	rs4782034	C	T	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=540;SC=TCCAAGTCCTCTTCTCCTCCA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=17221431;WS=17221413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	17221755	rs3812961	T	G	603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=16;PP=518;SC=GGGCCCAAGGTGTGTAGGATC;SOR=4.514;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=17221763;WS=17221745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	17228368	rs12708815	G	A	5156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=38;PP=2965;SC=GGGACGTCTCGGCCCGTCGAA;SOR=2.079;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=112;TCR=38;TR=150;WE=17228376;WS=17228358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr16	17294295	rs11075341	C	T	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=0;PP=1160;SC=GACGGACAGACCCCGAAGAAA;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=42;WE=17294303;WS=17294285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	17564658	rs117041807	G	C	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=16;PP=331;SC=CACCATCTTCGGAGCGCGGCC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=17564666;WS=17564648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	18823379	rs2606556	T	C	2644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=60;PP=2099;SC=CAAGATTTTTTTGGATCAGCT;SOR=2.613;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=17;TCR=61;TR=77;WE=18823387;WS=18823369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr16	19041491	rs4381586	T	C	273.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=253;SC=ACTACTCTTCTGGTTCCCTGC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=19041499;WS=19041481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	19046960	rs12933286	T	C	2298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=20;PP=1740;SC=TCTTTTGCTGTTGTTTCTATA;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=51;TCR=20;TR=71;WE=19046968;WS=19046950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr16	19056069	rs55792501	A	G	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=1;PP=564;SC=CAGCCTGGGCAACAGAGCAAA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=19056077;WS=19056059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	19079095	rs4531717	T	G	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=28;PP=836;SC=CCTGCGCCGGTCTAGCGAGCT;SOR=4.548;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=19079103;WS=19079085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	19080227	rs75015998	C	CTG	1167.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=13;PP=937;SC=AAAAAACAAACAAATTAAAAA;SOR=1.302;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=17;WE=19080235;WS=19080217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	19083221	rs4782202	A	G	3630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=23;PP=2902;SC=TTACCTGATCATAACGAAGAA;SOR=2.907;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=102;TCR=23;TR=124;WE=19083229;WS=19083211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr16	19183957	.	CT	C	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.000;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.12;MQRankSum=-0.601;QD=0.36;ReadPosRankSum=-0.590;SOR=0.669;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,29:0.20:147
chr16	19183972	rs201359836	G	T	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=227.438;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQRankSum=-3.069;QD=2.26;ReadPosRankSum=-3.096;SOR=8.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,56:0.31:182
chr16	19236181	rs2072076	C	T	1413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=39;PP=1123;ReadPosRankSum=1.213;SC=TTCCAAAACCCGATGAACTCC;SOR=3.352;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=42;WE=19236189;WS=19236171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr16	19309812	rs1548448	T	C	577.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=10.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=385;ReadPosRankSum=-0.986;SC=TCACTTGAGCTGAGAGTTGGA;SOR=4.505;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=15;WE=19309820;WS=19309802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr16	19333111	rs8049175	T	C	2214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.533;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=9;PP=1746;ReadPosRankSum=0.343;SC=GGCCAAATATTATTCAGGGTG;SOR=3.127;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=64;TCF=54;TCR=10;TR=63;WE=19333119;WS=19333101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,67:0.99:68
chr16	19333153	rs8047832	A	C	2779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=34;PP=2094;SC=ACATTTGAATAGGTAGACTGA;SOR=1.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=52;TCR=34;TR=86;WE=19333161;WS=19333143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr16	19333202	rs79117596	C	T	2929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.260;HP=2;HapScore=1;MGOF=49;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=52;PP=2190;ReadPosRankSum=-0.957;SC=TGGCCTCATCCGGTCAGCCGA;SOR=1.138;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=88;TCF=36;TCR=52;TR=87;WE=19333210;WS=19333192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,95:0.99:96
chr16	19333224	rs8048432	G	A	2562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.521;HP=3;HapScore=1;MGOF=53;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=53;PP=1910;ReadPosRankSum=-0.890;SC=TGCCCAACTAGAACTAAAAGG;SOR=1.954;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=76;TCF=23;TCR=53;TR=75;WE=19333232;WS=19333214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,81:0.99:82
chr16	19333241	rs6497343	G	C	2222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=52;PP=1767;SC=AAGGCTGACCGTCCCCTGAAT;SOR=3.327;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=10;TCR=52;TR=62;WE=19333249;WS=19333231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr16	19522394	rs12923369	A	G	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=22;PP=609;SC=TTTTTCGACCATAGCAAAGTC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=19522402;WS=19522384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	19543981	rs12927277	G	C	1948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=51;PP=1692;SC=TTACTGTTACGTTTGAGAAGC;SOR=6.630;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=1;TCR=51;TR=52;WE=19543989;WS=19543971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	19547747	rs226891	C	G	7106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=123;NR=83;PP=2965;SC=GAGGTAGTATCAACAGAATTG;SOR=1.151;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=206;TCF=123;TCR=83;TR=206;WE=19547755;WS=19547737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
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chr16	19548290	rs7191012	G	A	4064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=77;PP=2965;SC=CTGATTTAGCGGGAGTTTGTT;SOR=1.311;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=48;TCR=77;TR=125;WE=19548298;WS=19548280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr16	19556258	rs3841493	CAT	C	2614.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.373;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.320;NF=8;NR=47;PP=2624;ReadPosRankSum=0.869;SC=AAGACATGGACATATTATATT;SOR=3.407;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=61;TCF=8;TCR=53;TR=55;WE=19556267;WS=19556248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,62:0.97:64
chr16	19557844	rs112602419	G	GA	724.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=23;PP=541;SC=GTTTTTTATAGAAAAAAAAAA;SOR=3.180;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=27;WE=19557852;WS=19557834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	19576382	rs35102175	AT	A	297.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.85;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	19580699	rs121235	A	G	4727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=90;NR=49;PP=2965;SC=GTTTCACTGGAGAGAGTTGTG;SOR=1.296;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=90;TCR=49;TR=139;WE=19580707;WS=19580689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr16	19584332	rs371889	A	G	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=549;SC=CCTTGAGACAAATCTCTTTTA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=19584340;WS=19584322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	19586519	rs12925996	G	A	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=682;ReadPosRankSum=1.854;SC=AAGGAAAAAAGTTTTATGTGA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=26;WE=19586527;WS=19586509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr16	19589695	rs35605554	C	CA	304.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=5;NR=3;PP=108;SC=GACCCCATCTCAAAAAAAAAA;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=8;WE=19589703;WS=19589685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	19592990	rs5816059	T	TC	3538.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.200;NF=61;NR=34;PP=2978;ReadPosRankSum=-1.100;SC=GCTCTAGTGATCCCCCACCCC;SOR=0.804;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=113;TCF=67;TCR=46;TR=95;WE=19592998;WS=19592980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,114:0.99:115
chr16	19593163	rs7184710	G	A	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=498;ReadPosRankSum=1.650;SC=TAATCCCAGGGTTACCATGTG;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=18;WE=19593171;WS=19593153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr16	19598717	rs226856	T	C	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=33;PP=834;SC=TTTGGGAGGCTGAGGTGGGCG;SOR=3.855;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=37;WE=19598725;WS=19598707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	19612829	rs16972232	A	T	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=80;SC=AACAAAAAAAATGTGGCTTAA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=19612837;WS=19612819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	19612877	rs3216771	T	TA	355.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=1;PP=452;SC=CATCACAAGTTAAAGCCTGTC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=19612885;WS=19612867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	19619355	rs6497388	G	C	1469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=1;PP=1154;SC=GTTATCATCAGTTACTTCCTA;SOR=6.229;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=42;WE=19619363;WS=19619345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	19619602	rs11291600	CT	C	671.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.15;ReadPosRankSum=0.259;SOR=2.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,35:0.95:37
chr16	19628094	.	C	G	4056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=40;PP=2965;SC=CTGCCATGGACTGGATCTTCC;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=81;TCR=40;TR=121;WE=19628102;WS=19628084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr16	19640099	rs138081043	TTTTA	T	1907.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.18;MQRankSum=0.320;QD=41.47;ReadPosRankSum=-0.113;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
chr16	19653534	rs11647156	A	C	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=2;PP=723;SC=TCTGTCTCAAAAGTTTAAAAA;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=19653542;WS=19653524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	19653700	rs11643482	T	C	6153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=118;NR=74;PP=2965;SC=TTGACTTTTATCTTTAAATGT;SOR=1.325;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=118;TCR=74;TR=192;WE=19653708;WS=19653690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr16	19663269	rs875648	T	C	5613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=50;PP=2965;ReadPosRankSum=0.344;SC=GTTGCACTGCTAGCGTTAATG;SOR=0.502;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=173;TCF=123;TCR=50;TR=171;WE=19663277;WS=19663259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,176:0.99:178
chr16	19680414	rs957675	C	T	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=1;PP=422;SC=CTTCAGGCCACGTGAAGAAGA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=19680422;WS=19680404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	19680546	rs957676	T	C	3509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=31;PP=2695;SC=TTAATATTGATGGGAAGATGC;SOR=1.961;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=81;TCR=31;TR=112;WE=19680554;WS=19680536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr16	19693729	rs3815036	C	T	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=33;PP=1019;SC=GAGCCTCCCCCACCAAACCAT;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=40;WE=19693737;WS=19693719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	19716505	rs739565	A	G	6888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=131;PP=2965;ReadPosRankSum=1.107;SC=CCAACACTGGAGATGATGGAG;SOR=0.483;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=213;TCF=80;TCR=133;TR=211;WE=19716513;WS=19716495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,217:1.00:218
chr16	19726275	rs11640454	C	T	3069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=24;PP=2701;SC=AACTGAGTATCGAGTCTCTGG;SOR=2.277;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=70;TCR=24;TR=94;WE=19726283;WS=19726265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr16	19799962	rs4782283	T	A	344.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=311;SC=CTGTTTTTTTTAAAAAAATCC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=19799970;WS=19799960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	20322425	rs11647569	T	C	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=1;PP=654;SC=CTAACCTAGCTTGGCCTTGAT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=20322447;WS=20322415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	20322439	rs11642182	A	G	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=2;PP=787;SC=CCTTGATTCTATTAATACCAA;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=20322447;WS=20322415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	20334807	rs368914613	AC	A	4099.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=17.444;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.50;MQRankSum=2.152;QD=23.43;ReadPosRankSum=2.589;SOR=0.205;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:10,165:0.94:175
chr16	20334932	rs4393582	G	A	2304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=64;PP=1956;SC=TTTATAAACTGGGAAATTTCA;SOR=6.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=65;TCF=1;TCR=64;TR=65;WE=20334940;WS=20334922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr16	20352313	rs60764202	CA	C	133.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=11.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQRankSum=-1.447;QD=3.18;ReadPosRankSum=1.056;SOR=3.278;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr16	20355651	rs8054296	G	A	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=225;SC=GTGGCCGGGCGCATTAGCTCA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=20355659;WS=20355641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	20360101	rs7193058	G	A	1373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=17;PP=1191;SC=GGTGCGCCTGGCACGGATCCG;SOR=1.005;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=41;WE=20360109;WS=20360091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	20376734	rs8052918	A	G	2123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=11;PP=1781;SC=CCTCTTGGAGATACTTACAGA;SOR=2.939;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=55;TCR=11;TR=66;WE=20376742;WS=20376724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr16	20376755	rs8054266	T	C	2986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=19;PP=2378;ReadPosRankSum=0.096;SC=ACATCACAAATACGTCCTTTT;SOR=1.473;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=75;TCR=19;TR=93;WE=20376763;WS=20376745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,96:0.99:97
chr16	20386115	rs4522429	T	C	8170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=132;NR=119;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.821;SC=ACCAGAGACCTCTCACTAGCA;SOR=0.278;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=252;TCF=133;TCR=119;TR=251;WE=20386123;WS=20386105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,256:1.00:257
chr16	20395908	rs9926996	T	C	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=508;SC=CTTTACCCTATAGCTGTTAAG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=20395916;WS=20395898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	20488803	rs1634306	T	A	1515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.87;QD=31.58;SOR=1.298;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr16	20492000	rs146233716	A	G	359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.29;QD=32.71;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	20498079	rs2072080	T	G	3513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=98;PP=2965;SC=TTCCTATGATTATATGAGATT;SOR=6.439;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=101;TCF=2;TCR=99;TR=100;WE=20498087;WS=20498069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr16	20551855	rs28750179	A	G	580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=1;PP=474;SC=GTCAGCCACCATGTCCGGCCC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=20551863;WS=20551845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	20552075	rs16970280	G	T	3792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=81;PP=2965;SC=GCGAGGCCAGGATCACAAATG;SOR=1.571;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=39;TCR=81;TR=120;WE=20552083;WS=20552065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr16	20570661	rs62035059	T	C	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=4.586;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.15;MQRankSum=-2.195;QD=28.73;ReadPosRankSum=-0.816;SOR=1.447;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr16	20647921	rs62033279	C	T	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=245;SC=GGAGAATGCACGGTGAGCTTC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=20647929;WS=20647911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	20749461	rs9788809	T	C	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=2;PP=470;SC=CGTACTATAATGTATCTAATA;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=20749469;WS=20749451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	20750498	rs34908456	AT	A	112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=1;NR=5;PP=64;SC=CTCAGTATTGATTTTTTTTTT;SOR=2.584;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=6;WE=20750506;WS=20750488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	20753123	rs234271	T	C	5802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=101;NR=74;PP=2965;SC=TCCTCGTCTATCGCCGGCGCG;SOR=1.010;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=101;TCR=74;TR=175;WE=20753131;WS=20753113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr16	20792188	rs5715	T	C	6306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=113;PP=2965;ReadPosRankSum=1.204;SC=AGGTATACTTTCACAAAAGTG;SOR=0.662;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=172;TCF=58;TCR=114;TR=171;WE=20792196;WS=20792178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,186:0.99:187
chr16	20796508	rs8058758	T	C	2602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=70;PP=2184;SC=ACAGTCTCCTTATGATTATTT;SOR=6.385;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=72;TCF=2;TCR=70;TR=72;WE=20796516;WS=20796498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	20810067	rs3213646	T	C	4005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=57;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.776;SC=CTTTTGCATATAGATAGGTGA;SOR=0.223;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=117;TCF=60;TCR=57;TR=116;WE=20810075;WS=20810057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,122:0.99:123
chr16	20811681	rs2301771	C	T	9459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=169;NR=120;PP=2965;ReadPosRankSum=0.626;SC=TTAACAGCTGCTTTCTTTTAC;SOR=0.377;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=290;TCF=170;TCR=120;TR=289;WE=20811689;WS=20811671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,304:1.00:305
chr16	20824666	.	C	T	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.219;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=36.993;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=-3.586;QD=2.23;ReadPosRankSum=-2.675;SOR=5.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,28:0.33:86
chr16	20824697	rs34169933	A	AG	2417.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=66;PP=2936;SC=ACCTCTCCCAAGCTCCATCAT;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=0;TCR=70;TR=66;WE=20824705;WS=20824687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr16	20827647	rs5816137	AT	A	672	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.545;NF=1;NR=33;PP=406;ReadPosRankSum=0.348;SC=CACAAAAACAATTTTTTTTTT;SOR=3.967;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=52;TCF=1;TCR=51;TR=34;WE=20827655;WS=20827637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,35:0.90:39
chr16	20855309	rs9929443	A	G	1819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=41;PP=1400;SC=TGGCCATAGAATCCTTGGATG;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=17;TCR=41;TR=58;WE=20855317;WS=20855299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr16	20860897	rs6654	C	T	1255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=36;PP=1152;SC=CAGCAGACAGCTTTATGGAAA;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=20860905;WS=20860887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	20873767	rs7187522	T	G	6837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=128;PP=2965;SC=CCTGCACCCCTCCTGCTATGT;SOR=1.138;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=218;TCF=90;TCR=128;TR=218;WE=20873775;WS=20873757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr16	20986506	rs3115438	C	T	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=208;SC=GGTATAACCACGCTCATTCGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=20986514;WS=20986496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	20999464	rs4783517	C	A	2155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=59;PP=1802;SC=AGGATGCACACGAGGTGGCTT;SOR=6.027;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=61;TCF=2;TCR=59;TR=61;WE=20999472;WS=20999454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	21008690	rs3115446	T	C	5683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=85;NR=82;PP=2965;SC=TTGTGTCTTTTTTGTCAAACC;SOR=0.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=168;TCF=86;TCR=82;TR=167;WE=21008698;WS=21008680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr16	21030897	rs3095922	T	C	876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=4;PP=655;SC=GTTTAGAACATGTAATTCCAA;SOR=3.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=21030905;WS=21030887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	21035826	rs330135	G	C	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=277;SC=GTTGCCTCCAGGGACTATGAA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=21035834;WS=21035817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	21080949	.	A	C	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.187;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=24.262;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.29;ReadPosRankSum=3.283;SOR=4.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,22:0.40:55
chr16	21116051	rs11074481	T	C	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=362;SC=TGAGTGACAGTGACATTTGTT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=21116059;WS=21116041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	21117655	.	T	G	457	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=16;NR=0;PP=457;QD=30.7357007842;SC=GCAGCTCTTTTATATTTAGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=21117663;WS=21117654;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	21132298	rs13330317	T	C	2133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.525;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=53;PP=1825;ReadPosRankSum=0.740;SC=TTTAATGGAGTACTTAGAACC;SOR=2.904;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=69;TCF=15;TCR=54;TR=66;WE=21132306;WS=21132288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,65:0.97:67
chr16	21132338	rs16970914	T	C	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=39;PP=991;ReadPosRankSum=-0.855;SC=AAGAGAAGAATGCTTGGGCCT;SOR=1.938;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=48;TCF=8;TCR=40;TR=47;WE=21132346;WS=21132328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
chr16	21136477	rs7191215	A	G	2827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=32;PP=2266;SC=AAAGGTCCAAATGCAGGTCCC;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=54;TCR=32;TR=86;WE=21136485;WS=21136467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr16	21145648	rs11074483	C	T	5416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.40;SOR=1.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr16	21145657	rs16970950	G	A	5554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.74;SOR=1.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr16	21147885	rs3743698	T	C	4211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.338;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=94;PP=2965;ReadPosRankSum=0.010;SC=GGATCATGGGTTCAACTGTCC;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=32;TCR=95;TR=125;WE=21147893;WS=21147875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,133:0.99:135
chr16	21147999	rs730260	A	G	2213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=18;PP=1893;SC=TCATGGCAAGAAGATCACTGG;SOR=1.646;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=42;TCR=18;TR=60;WE=21148007;WS=21147989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	21151980	rs8061600	T	C	2477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=50;PP=2007;SC=AAGATGTCTTTACCTCCTTCT;SOR=1.771;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=21;TCR=50;TR=71;WE=21151988;WS=21151970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr16	21152808	rs80032006	G	A	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=15;PP=428;SC=GAGCGGACATGGTACGGTGTG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=21152816;WS=21152798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	21157443	rs79754380	A	T	5737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=119;PP=2965;SC=ACCCTTCAAAAATTAGGGAAG;SOR=1.533;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=180;TCF=61;TCR=119;TR=180;WE=21157451;WS=21157433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr16	21161559	rs57863199	T	TA	1726.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.07;MQRankSum=-0.249;QD=20.80;ReadPosRankSum=1.709;SOR=0.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:7,76:0.92:83
chr16	21182016	rs146876450	G	A	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=27;PP=907;SC=TTTAAGGGGCGGGGTCTTGTT;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=21182024;WS=21182006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	21190853	rs1063087	A	C	4725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=116;PP=2965;SC=AGTCTGCAGAATTCGAGGGGC;SOR=3.308;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=20;TCR=116;TR=136;WE=21190861;WS=21190843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr16	21272768	.	TA	T	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.463;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQRankSum=0.904;QD=3.42;ReadPosRankSum=1.586;SOR=0.340;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr16	21388110	rs2686119	T	C	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.67;QD=26.58;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	21396859	rs368310563	CT	C	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=4.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.81;MQRankSum=-5.162;QD=1.02;ReadPosRankSum=-1.015;SOR=1.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,26:0.22:116
chr16	21531494	rs42138	T	C	2820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=42;PP=2154;SC=ATGCCCGAGCTCATGATGGCG;SOR=0.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=47;TCR=42;TR=89;WE=21531502;WS=21531484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr16	21531609	rs42139	C	T	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.426;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.076;NF=3;NR=15;PP=346;ReadPosRankSum=-2.535;SC=TGGCGGCCATCATCTTCTCCC;SOR=1.501;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=18;WE=21531617;WS=21531599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr16	21531681	rs42140	C	G	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.876;NF=1;NR=3;PP=39;ReadPosRankSum=2.744;SC=GGCCCGCACCCGCCATGCTCT;SOR=0.132;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=4;WE=21531689;WS=21531671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr16	21608472	rs194548	G	A	2004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=1;PP=1681;SC=GCTGTCCCCAGTGGGCAATCT;SOR=6.770;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=58;TCF=57;TCR=1;TR=58;WE=21608480;WS=21608462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr16	21652720	rs1055740	A	G	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=340;SC=TTACATTCTGACATCCTTCTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=21652728;WS=21652710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	21696086	.	ATTT	A	65	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=65.19;NF=1;NR=1;PP=65;QD=34.5;SC=TATTATTATTATTTTTTAGGT;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=21696096;WS=21696076;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	21730449	rs215901	C	T	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=7;PP=749;SC=ATTCTCTTCTCGCAGGCTCTG;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=29;WE=21730457;WS=21730439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	21821976	rs148768203	C	CA	423.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-1.738;NF=16;NR=0;PP=283;ReadPosRankSum=-1.199;SC=CAAGTGGATACAAAAAAAAAA;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=16;WE=21821984;WS=21821966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr16	21970546	rs2967178	T	C	1700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=10;PP=1346;SC=GCATGAGATGTTGTTTTTAGC;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=52;WE=21970554;WS=21970536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	21976762	rs4850	G	A	1607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=22;PP=1211;SC=GCAGCTTACCGGAATGCCTTG;SOR=1.036;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=28;TCR=22;TR=50;WE=21976770;WS=21976752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	21992122	rs2965803	T	C	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=10;PP=299;SC=GTATTATTCTTATGTTTGGTG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=21992130;WS=21992112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	22012146	rs143239876	AATG	A	676.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=570;SC=CTCCTTCTCAAATGATGATGA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=12;WE=22012156;WS=22012136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	22092067	rs72784938	A	C	344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=286;SC=ATTTTACATCAATGAAGTCGG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=22092075;WS=22092057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	22128052	rs11649656	TT	GC	6740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=57;PP=2947;SC=GACCTGGGATTTCCACTTCTC;SOR=1.041;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=87;TCR=60;TR=141;WE=22128061;WS=22128042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr16	22161136	rs1991020	T	C	2512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=16;NR=59;PP=2260;SC=TGCAGAGAGCTTTCAGTCATG;SOR=3.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=16;TCR=59;TR=75;WE=22161144;WS=22161126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr16	22260293	.	AT	A	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=0.967;QD=4.56;ReadPosRankSum=-0.028;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr16	22269867	rs4783453	A	G	4213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=58;PP=2965;SC=GGGAGCCCCCAAGTAAGGACC;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=80;TCR=59;TR=138;WE=22269875;WS=22269857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr16	22328094	rs2290830	G	T	1532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=43;PP=1267;SC=GAGGACTGTGGCCCCTCCTGT;SOR=4.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=3;TCR=43;TR=46;WE=22328102;WS=22328084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr16	22926257	rs62049086	C	T	3680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=2;PP=2965;ReadPosRankSum=1.607;SC=TTCCTTCTGCCCACACAGGAG;SOR=4.425;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=107;TCR=2;TR=106;WE=22926265;WS=22926247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,110:0.97:113
chr16	23079353	rs8047644	T	C	2194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=1;PP=1717;ReadPosRankSum=-0.819;SC=TAAAACACTTTGATTGCAGAA;SOR=5.549;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=60;TCF=59;TCR=1;TR=59;WE=23079361;WS=23079343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr16	23221183	rs5740	A	G	5491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.818;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=119;PP=2965;ReadPosRankSum=0.453;SC=ACAGATTGGCAGGGGCACCCA;SOR=1.493;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=65;TCR=119;TR=183;WE=23221191;WS=23221173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,184:0.99:185
chr16	23221238	rs4281710	A	G	2989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=80;PP=2580;SC=GTTATATCTAAGCTGGGGTGT;SOR=4.688;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=7;TCR=80;TR=87;WE=23221246;WS=23221228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr16	23360199	rs238547	T	C	5930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=125;NR=66;PP=2965;SC=TGGACTTCCCTGCCGTCACCA;SOR=1.561;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=125;TCR=66;TR=191;WE=23360207;WS=23360189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr16	23364081	rs63982	A	C	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=13;PP=1212;SC=TGCTTTACAGATATGCATTCC;SOR=1.848;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=51;WE=23364089;WS=23364071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	23382982	rs3214466	CT	C	1542.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=4;PP=1634;SC=GGCGCCCCCCCTGGCACCTGC;SOR=3.611;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=37;WE=23382990;WS=23382972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	23400494	rs250586	C	A	853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=26;PP=723;SC=CTGAATACGACACAGAGAAGC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=23400502;WS=23400484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	23486197	rs11074559	A	G	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.69;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	23489711	rs1135045	C	G	1075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=3;PP=909;SC=GCTGGCTGTGCTGAGAGGAGG;SOR=4.047;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=32;WE=23489719;WS=23489701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr16	23490125	rs77452128	C	T	2985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=58;PP=2404;SC=CCTCTCTGCTCGCCAGGCAGT;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=27;TCR=58;TR=85;WE=23490133;WS=23490115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr16	23490353	rs4968008	T	G	4290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=88;PP=2965;SC=AGCAACTTACTGAAGGTCATG;SOR=1.345;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=51;TCR=89;TR=138;WE=23490361;WS=23490343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr16	23506940	rs722069	G	A	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=1;PP=897;SC=CCCTAAAACAGTCTTGAGAGA;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=23506948;WS=23506930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	23521643	rs1071685	G	C	1373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=14;PP=1115;SC=GCTACTCACTGAGCCACAGCT;SOR=1.347;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=40;WE=23521651;WS=23521633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	23521750	rs2285522	T	C	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=26;PP=605;SC=GCCCCGACGCTGCGGCCGCGG;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=32;WE=23521758;WS=23521740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr16	23521780	rs2285521	C	T	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=19;PP=526;SC=CCTCTTCAGCCGCTGTAGCGT;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=23521788;WS=23521770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	23533008	rs11074565	G	A	1063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=3;PP=829;SC=TTGTCCTTTTGTGACTGACAT;SOR=4.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=23533016;WS=23532998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	23535680	rs1468138	A	C	2471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=8;PP=2095;SC=CACTGCCCGAAACATCCTCTC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=75;TCF=66;TCR=9;TR=74;WE=23535688;WS=23535670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	23536366	rs6497670	T	C	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=428;SC=TAATTCTATATTGTATTCACT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=23536374;WS=23536356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	23536684	rs6497671	T	C	2154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=43;PP=1693;SC=AAGCTCATACTAGATCTTTCT;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=59;WE=23536692;WS=23536674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	23540798	rs2072062	C	T	3915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=89;NR=28;PP=2965;SC=GTGTGGAACCCTGAGCTCAGC;SOR=2.244;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=90;TCR=28;TR=117;WE=23540806;WS=23540788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr16	23541223	rs2072061	G	A	2130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=54;PP=1682;SC=TGCAGTCTGCGGAAGAAATCA;SOR=5.994;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=2;TCR=54;TR=56;WE=23541231;WS=23541213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr16	23546561	rs2073951	G	C	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=24;PP=861;SC=TCCAGCCATAGACCAGGTCCT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=35;WE=23546569;WS=23546551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	23555726	rs2369009	C	T	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=1;PP=966;ReadPosRankSum=2.736;SC=AGATGCCTGACCCACAGAAAC;SOR=3.611;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=34;WE=23555734;WS=23555716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,36:0.95:38
chr16	23557718	rs7196534	T	C	2851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=59;PP=2202;SC=AGCTCAGAGATCTTGGGCAAG;SOR=2.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=21;TCR=59;TR=80;WE=23557726;WS=23557708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr16	23557790	rs4968019	T	C	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=27;PP=647;SC=AACTTTCTCATGAGGATCATC;SOR=2.964;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=33;WE=23557798;WS=23557780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	23563501	rs7187920	C	T	1474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=14;PP=1161;SC=CAATATTCTCCGCTGCCCCAG;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=47;WE=23563509;WS=23563491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	23606895	rs240744	G	T	4061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=53;PP=2965;SC=ATCCTTATTGGTCAAAGGTCA;SOR=1.005;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=125;TCF=72;TCR=53;TR=124;WE=23606903;WS=23606885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr16	23615042	rs35294437	TA	T	98.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQRankSum=-1.841;QD=2.53;ReadPosRankSum=0.431;SOR=0.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,11:0.28:39
chr16	23619235	rs45516100	A	C	2235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=9;PP=1645;SC=CCACGCTGAGAGTCGTCTTAG;SOR=3.675;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=57;TCR=9;TR=66;WE=23619243;WS=23619225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr16	23625224	rs249935	T	C	3630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.55;SOR=3.145;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	23625230	rs76918977	G	A	3948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.46;SOR=3.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr16	23625463	rs249936	A	T	1228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=35;PP=1116;SC=ACAAACCAGTATTCAGAAAAT;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=23625471;WS=23625453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	23632906	rs200037631	G	GA	1125.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=33;PP=772;SC=CTAATATCAGGAAAAAAAAAT;SOR=3.312;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=35;WE=23632914;WS=23632896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	23634293	rs45551636	C	T	5294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=122;NR=32;PP=2965;SC=TTCTTACCCTCCATCTTCTGC;SOR=2.405;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=122;TCR=32;TR=154;WE=23634301;WS=23634283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr16	23640467	rs249954	G	A	2719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=8;PP=2330;SC=ATTCTTTTCAGTTCATTAAAG;SOR=4.255;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=74;TCR=8;TR=82;WE=23640475;WS=23640457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr16	23640825	rs187008421	A	G	1751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=5;PP=1510;SC=AATGATTACAATGAAATCATA;SOR=3.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=45;TCR=5;TR=50;WE=23640833;WS=23640815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	23641461	rs45532440	C	G	6191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=86;NR=93;PP=2965;SC=AGGTCCTCTTCTAAGTCCTCC;SOR=0.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=179;TCF=86;TCR=93;TR=179;WE=23641469;WS=23641451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr16	23646191	rs152451	T	C	2765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=9;PP=2176;SC=ACCTTTCACTTGAATAAATAA;SOR=4.047;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=71;TCR=9;TR=80;WE=23646199;WS=23646181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr16	23647713	rs80291632	T	G	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=482;SC=AAACAAAAAATACTCATTTTT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=23647721;WS=23647703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	23653020	rs8058061	A	G	5581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=138;PP=2965;ReadPosRankSum=1.042;SC=CCCTTTGGCCATTAGTCCCGG;SOR=1.295;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=181;TCF=41;TCR=140;TR=179;WE=23653028;WS=23653010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,181:0.99:182
chr16	23653112	rs112547094	C	G	2267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=68;PP=1963;SC=GTATTTATTCCTGATTTTCTC;SOR=7.083;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=69;TCF=1;TCR=68;TR=69;WE=23653120;WS=23653102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr16	23654317	rs141294424	A	T	1990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=54;PP=1527;SC=TGTTGTGTGGAAGCCAGAACA;SOR=3.056;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=10;TCR=55;TR=64;WE=23654325;WS=23654307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	23670086	rs78722210	C	G	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=37;PP=1117;SC=ATGAACACAACTCTGCTGGTG;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=39;WE=23670094;WS=23670076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	23672560	rs11545871	A	T	4317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=44;PP=2965;SC=TCAACGCAGCACAGATTGGTT;SOR=1.455;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=84;TCR=44;TR=128;WE=23672568;WS=23672550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr16	23677111	rs35585	G	A	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=19;PP=529;SC=ATTTTCCATCGCAAAAGTAAT;SOR=3.180;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=23677119;WS=23677101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	23690157	rs34210826	T	C	281.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=202;SC=GCGCGCAGGCTTTTGTAACGT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=23690165;WS=23690147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	23690219	rs113553976	G	T	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=4;PP=469;SC=CGGAGGCTCTGCTCGGATCGA;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=23690227;WS=23690209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	23700231	rs112964547	C	CT	285.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.212;NF=2;NR=8;PP=111;ReadPosRankSum=1.472;SC=GACTCCCCAGCTTTTTTTTTT;SOR=1.473;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=10;WE=23700239;WS=23700221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr16	23702761	rs115551684	G	A	2264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=45;PP=1806;ReadPosRankSum=1.417;SC=GGCCCAGAGAGCTCCTGAGCC;SOR=0.516;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=71;TCF=25;TCR=46;TR=70;WE=23702769;WS=23702751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,72:0.99:73
chr16	23702782	rs111527561	G	T	1957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=39;PP=1568;SC=TTGTGACCGGGGCCAGAGGCC;SOR=1.430;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=59;WE=23702790;WS=23702772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	23717833	rs36047689	G	A	2373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=59;PP=1929;SC=TCTTGCAGGAGTGGGGGTTTC;SOR=2.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=14;TCR=59;TR=73;WE=23717841;WS=23717823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	23721601	rs4967959	T	G	2641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=53;PP=2022;SC=ACCAATGGGTTCTTGCCCCCT;SOR=1.347;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=27;TCR=54;TR=80;WE=23721609;WS=23721591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	23722042	rs3899652	T	C	1219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=17;PP=869;SC=CCCCATTTTATAGATGAGGAT;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=31;WE=23722050;WS=23722032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	23723611	rs77276497	A	C	220.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=183;SC=AGTGCTTAAAAATTTTTCAAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=23723619;WS=23723601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	23724753	rs3809682	G	A	1315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=37;PP=1090;SC=TGGAGAACTTGCCACGTGCCG;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=44;WE=23724761;WS=23724743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	23848762	rs3729883	G	A	883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=14;PP=641;SC=CTATTTGTGGGAAGAGAGGGT;SOR=0.760;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=27;WE=23848770;WS=23848752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	24043676	rs1971276	C	G	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=30;PP=876;SC=CCCCTGTCCTCGTTGGGGCTG;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=34;WE=24043684;WS=24043666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	24104328	rs880824	A	G	2548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=69;PP=2096;SC=TGCCACCTGAAATCAGGGAGT;SOR=7.223;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=70;TCF=1;TCR=69;TR=70;WE=24104336;WS=24104318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	24105669	rs7196765	G	A	4497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=113;PP=2965;SC=TCCATCAAACGCGGGGTCAAG;SOR=2.899;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=141;TCF=27;TCR=114;TR=140;WE=24105677;WS=24105659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr16	24135112	rs1013316	T	C	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=2;PP=1096;SC=TACAAGATCGTCCTCAAACCC;SOR=4.514;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=39;WE=24135120;WS=24135102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	24185815	rs72154122	CT	C	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=2.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.81;ReadPosRankSum=0.966;SOR=1.550;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,16:0.21:76
chr16	24202278	.	A	T	964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.042;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=0;PP=756;ReadPosRankSum=0.352;SC=TGGGATAAAAAGCAAAAAACA;SOR=5.486;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=28;WE=24202286;WS=24202268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr16	24357998	rs5816249	T	TG	1411.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=5;PP=1541;SC=GGACCCAGGCTGGCCCCCAGA;SOR=3.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=38;WE=24358006;WS=24357988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	24682396	rs75849092	G	T	2044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=52;PP=1629;SC=AGCAGCTGCCGCACCGACAGC;SOR=3.091;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=11;TCR=52;TR=63;WE=24682404;WS=24682386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	24741005	.	TCGG	T	480.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;NF=7;NR=3;PP=447;SC=GGCGGCGGTGTCGGCGGCGGC;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=10;WE=24741015;WS=24740995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr16	24762182	rs34485608	T	TA	608.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=21;PP=448;SC=AACATAGAATTAAAAAAAAAT;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=21;WE=24762190;WS=24762172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	24769570	rs138667551	TTA	T	763.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=694;SC=TGTATATGTCTTATATTAATA;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=15;WE=24769579;WS=24769560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	24807165	rs1030211	G	A	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=1;PP=745;SC=AGGTCTTCCAGTTCCAAACCC;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=24807173;WS=24807155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	24816492	rs2059134	A	G	5044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=106;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.775;SC=CTTTCCTTACATTCTCCTGTT;SOR=0.520;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=174;TCF=67;TCR=107;TR=172;WE=24816500;WS=24816482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,173:0.99:174
chr16	24828360	rs72770424	C	T	1536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=43;PP=1328;SC=CTACTCTGGGCGACTGAGCCC;SOR=4.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=47;WE=24828368;WS=24828350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	24881192	rs2667751	C	A	1447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=1;PP=1144;SC=GACTTTGTCTCCAAGATCTGA;SOR=5.330;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=41;WE=24881200;WS=24881182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	24883316	rs2667745	T	G	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=1;PP=300;SC=ATTCCCCATGTTAAAAAAGGA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=24883324;WS=24883311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	24883338	rs2667746	C	T	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=548;SC=ATTTGAAGGCCAGCACAGGTG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=24883346;WS=24883328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	24902194	rs274081	T	C	4537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=54;PP=2965;SC=TTCTAGGTTTTGCCGCGGTTG;SOR=1.288;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=90;TCR=54;TR=144;WE=24902202;WS=24902184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr16	24921945	rs17178990	C	A	972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=28;PP=801;SC=GATCTGTCCCCACGCTCCGGC;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=28;WE=24921953;WS=24921935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	24931691	rs55808472	G	A	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=716;SC=GTCAGCCCATGCACACAGGGT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=24931699;WS=24931681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	24947131	rs72770485	T	G	2278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=55;PP=1823;SC=GTTTACTTGGTGCCATATAAA;SOR=3.105;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=70;TCF=13;TCR=57;TR=68;WE=24947139;WS=24947121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr16	24953527	rs72770489	G	A	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=13;PP=377;SC=GGAGCTCTAAGACACCCCTCA;SOR=3.912;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=14;WE=24953535;WS=24953517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	24955183	rs17624477	T	C	4112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=90;PP=2965;SC=CAGCAAGTGTTCTGCAAAGCA;SOR=1.798;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=38;TCR=90;TR=128;WE=24955191;WS=24955173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr16	24958985	rs16974243	G	A	1741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=45;PP=1413;SC=CTTCCTGCCTGGGTGCACAAT;SOR=4.534;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=48;WE=24958993;WS=24958975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	24990136	rs58340349	G	GA	199.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=201;SC=CAACAAAACTGTTTTCTTTCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=24990144;WS=24990126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	24990187	.	TAAAA	T	133.19	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQRankSum=-0.000;QD=19.03;SOR=1.108;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
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chr16	25137289	rs7189229	G	C	116.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=1;PP=152;SC=CTTCAGAACTGCCATCAGCAG;SOR=1.609;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=25137297;WS=25137279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	25137385	rs11861481	G	A	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.460;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.545;NF=26;NR=1;PP=508;ReadPosRankSum=-0.975;SC=GGACAGTGAGGTCCTTCTTCC;SOR=3.841;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=79;TCF=68;TCR=11;TR=27;WE=25137393;WS=25137375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,26:0.35:74
chr16	25151398	rs10681142	A	ACT	943.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=0;PP=977;SC=ATCCTTAAACACTATTGCTCT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=20;WE=25151406;WS=25151388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	25163017	rs139504024	G	GGTGTGTGT	1415.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;QD=45.67;SOR=6.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	25172274	rs277899	G	T	2347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.293;NF=19;NR=57;ReadPosRankSum=0.203;SC=TTGGAAGATAGGATTTTGGTT;SOR=1.132;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=20;TCR=59;TR=76;WE=25172282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,76:0.99:77
chr16	25172307	rs111379361	A	AT	774.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.962;NF=15;NR=20;PP=528;ReadPosRankSum=0.068;SC=CCTCTTACGTATTTTTTTTTT;SOR=0.538;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=71;TCF=33;TCR=38;TR=35;WE=25172315;WS=25172297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,35:0.83:42
chr16	25180610	rs6497812	G	A	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=12;PP=422;SC=CTTTGCAGATGTGATCATGGA;SOR=1.739;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=17;WE=25180618;WS=25180600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	25239588	rs73551053	A	T	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=1;PP=362;SC=TGTCTCAATTAAAAAAAAAAA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=25239596;WS=25239578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	25264196	rs4787702	G	A	246.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5052;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=166;ReadPosRankSum=1.139;SC=CTGAGATTGCGCCACTGTACT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=8;WE=25264204;WS=25264191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr16	25264440	rs11643089	T	C	1284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=42;PP=1068;SC=GAGATGAGTATGTATTGAAAC;SOR=3.865;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=47;WE=25264448;WS=25264430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	25268368	rs4787310	A	G	5079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.649;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.113;NF=78;NR=91;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.547;SC=ATGCCCACTCAGGGTCCTTTT;SOR=0.462;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=173;TCF=81;TCR=92;TR=169;WE=25268376;WS=25268358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,177:0.98:181
chr16	25704145	rs2943336	A	G	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=24;NR=3;PP=544;SC=GGAGGCGCCCAGGACGCCTGG;SOR=3.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=27;WE=25704153;WS=25704135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	25944700	rs4303490	A	G	3240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=48;PP=2388;SC=CATAATCTCAAACAGAGGTGT;SOR=0.818;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=46;TCR=49;TR=94;WE=25944708;WS=25944690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr16	27215267	rs877585	G	A	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=272;SC=GCGCTTTAGCGGTTCTTGGCG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=27215275;WS=27215257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	27215380	rs908382	A	C	1584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=17;PP=1211;SC=GCCGCAAGGCAGGCTGGAAAC;SOR=1.524;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=53;WE=27215388;WS=27215370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	27226437	rs8054431	G	T	4346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=110;PP=2965;SC=GAGGAGCCAGGCTGTAAGTCT;SOR=4.141;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=14;TCR=110;TR=124;WE=27226445;WS=27226427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr16	27227122	rs7405158	T	C	2620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=4;PP=2171;SC=CCAGGGCCTCTAAGGGTTGGA;SOR=5.394;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=71;TCR=4;TR=75;WE=27227130;WS=27227112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr16	27227168	rs11645703	T	G	4686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=28;PP=2965;SC=GGGTGACGGGTGCTGCAGCTG;SOR=2.770;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=112;TCR=28;TR=140;WE=27227176;WS=27227158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr16	27236403	rs2958	G	A	1303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=0;PP=1053;SC=CCTGAAACACGGACGCCTTTC;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=27236411;WS=27236393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	27238034	rs34940876	C	T	2451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=21;PP=1905;SC=CCCTGCCCTGCGGGTACCTGG;SOR=2.133;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=58;TCR=21;TR=79;WE=27238042;WS=27238024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr16	27238110	rs1127228	C	T	3139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=61;PP=2251;SC=GGATGTATTGCTCCATCTCCA;SOR=1.257;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=38;TCR=61;TR=99;WE=27238118;WS=27238100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr16	27244548	rs28456036	A	G	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=30;PP=892;SC=AGTCTGGCAGAGGCACAGTAA;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=27244556;WS=27244538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	27245712	rs34939984	C	T	2358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=67;PP=2018;SC=CCAGGCACTGCGGGCCGCAGG;SOR=5.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=4;TCR=68;TR=71;WE=27245720;WS=27245702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	27253059	rs28363677	G	A	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=1;PP=796;SC=ACTTAGTGACGAACCGTCCTC;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=27253067;WS=27253049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	27269023	rs7201652	T	C	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=31;PP=750;SC=TCATTCTTCATGCTGTTTACT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=27269031;WS=27269013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	27352560	rs140581888	C	T	7464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=102;PP=2965;ReadPosRankSum=1.856;SC=AGGATGACTCCAAGATTTCTG;SOR=0.293;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=223;TCF=120;TCR=103;TR=220;WE=27352568;WS=27352550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,232:1.00:233
chr16	27356203	rs1805010	A	G	2003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=20;PP=1553;SC=CCACACGTGTATCCCTGAGAA;SOR=1.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=43;TCR=20;TR=63;WE=27356211;WS=27356193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	27356359	rs2074572	C	T	1899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=45;SC=GGGCGGAGTGCGGCAGGGGTG;SOR=2.381;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=14;TCR=45;TR=59;WE=27356367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	27356398	rs2072130	C	T	1148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=20;PP=965;SC=GCTGCCTGGGCTGAGGGTGGG;SOR=0.850;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=38;WE=27356406;WS=27356388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	27356667	rs3024560	T	G	2468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=67;PP=2112;SC=ACTGGGAACATTCCTTCCATT;SOR=3.669;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=10;TCR=67;TR=77;WE=27356675;WS=27356657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr16	27367334	rs4787423	C	T	1762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=45;PP=1385;SC=CAATAATACGCATTTACTGAG;SOR=2.644;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=12;TCR=45;TR=57;WE=27367342;WS=27367324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr16	27367413	rs3116572	T	C	331.85	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.74;MQRankSum=-0.196;QD=22.12;ReadPosRankSum=1.394;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr16	27370932	rs138640688	AGTG	A	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=399;SC=TCTGGAATCTAGTGGTGTTGG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=27370942;WS=27370922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	27371158	rs3024660	C	T	1652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=34;PP=1269;SC=GTGTAACAAACGACCCCGAAA;SOR=1.938;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=16;TCR=34;TR=50;WE=27371166;WS=27371148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	27414378	rs6498021	T	G	3031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=14;PP=2441;SC=TTCAAAACAATGGCTGGTGTG;SOR=3.044;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=74;TCR=14;TR=88;WE=27414386;WS=27414368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr16	27441283	rs179760	A	G	2183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=17;PP=1682;SC=TCCAAGAATCAGGGGCAAGTC;SOR=2.242;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=55;TCR=17;TR=72;WE=27441291;WS=27441273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr16	27514102	.	C	T	2321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.172;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=11;PP=1932;ReadPosRankSum=-0.871;SC=CAGTGGTGTCCATGGCTTGTG;SOR=2.924;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=69;TCF=57;TCR=12;TR=68;WE=27514110;WS=27514092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,72:0.99:73
chr16	27561584	rs4787969	G	A	2092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=49;PP=1696;SC=CCTAGGCCATGAACCCCTGGA;SOR=2.566;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=14;TCR=50;TR=63;WE=27561592;WS=27561574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	27629661	rs4787980	G	C	1868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=1;PP=1636;SC=CTCTCAGCCTGCTGCGCCGGT;SOR=6.593;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=55;TCF=54;TCR=1;TR=55;WE=27629669;WS=27629651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	27642249	rs233453	A	G	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=1;PP=707;SC=TGCCACAACCACGCTGTAGTC;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=27642257;WS=27642239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	27666204	rs233470	A	G	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=15;PP=422;SC=TAATCCCAGCACTTTGGGAGG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=27666212;WS=27666194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	27752314	rs5816442	T	TC	137.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=142;SC=GCCAGTTAGCTCCTGGACCTC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=27752322;WS=27752304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	27772901	rs4787984	G	A	4626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=96;PP=2965;SC=CGACTCCCGGGCCCTGGACAA;SOR=1.594;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=47;TCR=96;TR=143;WE=27772909;WS=27772891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr16	27777831	rs8043555	A	G	3659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=84;PP=2856;SC=TCAGTCCAGCATCAGGGAAGC;SOR=1.991;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=34;TCR=84;TR=118;WE=27777839;WS=27777821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr16	27789132	.	A	G	6273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=94;NR=94;PP=2965;SC=CACCAGCCCTAAGGAGGATGG;SOR=0.724;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=189;TCF=94;TCR=95;TR=188;WE=27789140;WS=27789122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr16	27856156	rs772960	T	C	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=111;SC=CCTCCAACTCTCCCCATTTCT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=27856164;WS=27856146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	27861762	rs9923711	C	T	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=307;SC=CATCTGCATGCGAATGATAAA;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=27861770;WS=27861752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	27861785	rs9923715	C	A	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=4;PP=295;SC=ACACAATGTGCCTAGAAGAGG;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=27861793;WS=27861775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	27861969	rs72782161	A	T	544.88	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=456;ReadPosRankSum=-0.800;SC=GAAGAGGAGGAGGGTAAATGA;SOR=1.721;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=20;WE=27861977;WS=27861959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,20:0.91:22
chr16	28123226	rs205384	G	A	5551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=110;PP=2965;SC=TGAGGCTGGCGTGGTTGATGG;SOR=1.347;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=174;TCF=64;TCR=110;TR=174;WE=28123234;WS=28123216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr16	28132951	rs33048	T	C	2637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=18;PP=2157;ReadPosRankSum=0.798;SC=GGGGGCAAGGTCTTTCCTAAA;SOR=1.473;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=83;TCF=65;TCR=18;TR=82;WE=28132959;WS=28132941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,82:0.99:83
chr16	28133152	rs39998	C	A	2618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=74;PP=2175;SC=ACAGACAAGGCTGGTACCAGC;SOR=4.778;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=6;TCR=74;TR=80;WE=28133160;WS=28133142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr16	28137248	rs39631	C	A	2581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=68;PP=2038;SC=GTCCAGCAAGCCACACACAGC;SOR=3.428;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=11;TCR=68;TR=79;WE=28137256;WS=28137238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr16	28143489	rs9930464	C	T	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=1;PP=544;SC=CACAGCTTTTCATCATAAGCC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=28143497;WS=28143479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	28157351	rs28379290	T	C	216.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=177;SC=CATGGCTGTCTCTTAGGCCAC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=28157359;WS=28157341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	28167920	rs34751450	C	CAA	1067.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.267;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=1.244;NF=4;NR=24;PP=883;ReadPosRankSum=1.246;SC=AATTCTCCTTCAAAAAAATAT;SOR=2.765;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=28;WE=28167928;WS=28167910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,32:0.94:34
chr16	28181306	rs28479048	A	G	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=28;PP=955;SC=CATTAAAGCTATGAAGCATCT;SOR=2.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=28181314;WS=28181296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	28181378	rs9927275	C	G	275.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=9;PP=226;SC=TAGAGGCCAGCTCCAATGGCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=28181386;WS=28181368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	28507683	.	G	A	1975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=37;PP=1615;SC=AGAGGCTGCTGAGAGCCAGAC;SOR=1.571;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=19;TCR=37;TR=56;WE=28507691;WS=28507673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	28508716	rs40832	T	C	2819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=45;PP=2143;SC=TTGGAAGGGGTGCTTGGGCAA;SOR=0.757;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=46;TCR=45;TR=91;WE=28508724;WS=28508706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr16	28603393	rs27742	T	C	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=54;SC=GCCATCTTCTTCGCATAGTCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=28603401;WS=28603383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	28617485	rs1801030	C	T	4566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.52;MQRankSum=-2.380;QD=31.94;ReadPosRankSum=-0.296;SOR=1.558;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,141:0.99:143
chr16	28618238	rs7499134	A	G	15016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=470;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=227;NR=222;PP=2965;SC=ACCACCCCTTAGCTCCACACT;SOR=0.741;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=450;TCF=228;TCR=222;TR=449;WE=28618246;WS=28618228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,467:1.00:467
chr16	28618708	rs11648192	C	T	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.482;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=30;PP=689;ReadPosRankSum=0.667;SC=TGAGGACCCACCCTCTAGCTT;SOR=0.184;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=77;TCF=3;TCR=74;TR=32;WE=28618716;WS=28618698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,32:0.41:78
chr16	28620800	rs3760091	C	G	1550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.350;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=43;PP=1215;ReadPosRankSum=0.690;SC=AGCAAAAGCACAGGCCTAGGC;SOR=1.099;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=137;TCF=44;TCR=93;TR=60;WE=28620808;WS=28620790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,61:0.43:142
chr16	28621311	rs2077412	T	C	5559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=85;PP=2965;SC=ATTGTGGGTGTTGTGTGGGGA;SOR=0.705;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=88;TCR=85;TR=173;WE=28621319;WS=28621301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr16	28631314	rs141320733	T	TTGTGTG	437.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=500;ReadPosRankSum=-0.290;SC=GTATTGTATATTGTGTGTGTG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=8;WE=28631322;WS=28631304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr16	28631360	rs28410083	A	T	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=6;PP=521;SC=AGATACTGATAACATTTTCAA;SOR=1.931;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=21;WE=28631368;WS=28631350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	28835900	rs12920514	G	A	2793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=51;PP=2191;ReadPosRankSum=-0.793;SC=AGGTCGAGGGGATGGGGTGTG;SOR=0.427;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=87;TCF=34;TCR=53;TR=85;WE=28835908;WS=28835890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,89:0.99:90
chr16	28838073	rs12448482	A	G	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=29;NR=4;PP=908;SC=CGTACTCTGGACTTCTTAAAC;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=33;WE=28838081;WS=28838063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	28842311	rs4344749	A	G	2566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=41;PP=2274;SC=CAAAGGCACAACGGCCTCTGA;SOR=0.744;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=38;TCR=41;TR=79;WE=28842319;WS=28842301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	28844068	rs7498491	T	A	905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=14;PP=752;SC=CCTCTGTTCTTTTGGCACTGT;SOR=0.760;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=28;TCF=14;TCR=14;TR=27;WE=28844076;WS=28844058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	28845584	rs35725751	C	T	6396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=110;PP=2965;SC=GATTTGGTTGCGCTGGTTGAG;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=90;TCR=110;TR=200;WE=28845592;WS=28845574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr16	28856819	rs8061877	C	T	2168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=33;PP=1679;ReadPosRankSum=0.404;SC=AGGAAAAGAACACACCTCTCA;SOR=0.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=78;TCF=43;TCR=35;TR=75;WE=28856827;WS=28856809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,77:0.97:79
chr16	28883327	rs28433345	T	C	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=20;PP=520;SC=TGAGTGTGCATGTCTCCAGGC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=28883335;WS=28883317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	28903656	rs6565261	C	A	2254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=57;PP=1742;SC=TGACCTCAGGCCAAGAACCCC;SOR=3.458;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=8;TCR=57;TR=65;WE=28903664;WS=28903646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr16	28906084	rs9931989	G	C	2885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=37;PP=2107;SC=GGTGGAAGGAGGGTATGACAG;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=59;TCR=37;TR=96;WE=28906092;WS=28906074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr16	28913787	rs7189927	T	C	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=30;SC=CCCATGCAGGTGCTGAGAGGG;SOR=2.247;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=10;TCR=30;TR=40;WE=28913795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	28914026	rs41292394	G	A	4734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=48;PP=2965;SC=GGAGGGTGTGGGGATGCAGGA;SOR=1.530;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=142;TCF=94;TCR=48;TR=140;WE=28914034;WS=28914016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr16	28915527	rs10499	G	A	4249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=40;PP=2965;SC=AAGGAAGTGAGCATCCTTTTG;SOR=1.681;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=126;TCF=86;TCR=40;TR=125;WE=28915535;WS=28915517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr16	28922149	rs11646653	C	T	6682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=113;PP=2965;SC=CCTTCCACCACGTGCAACTGA;SOR=0.776;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=219;TCF=106;TCR=113;TR=218;WE=28922157;WS=28922139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr16	28925978	rs3924376	T	C	7506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=149;NR=88;PP=2965;SC=CAGCGCCCCCTGGCCGTGCCC;SOR=1.313;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=238;TCF=149;TCR=89;TR=237;WE=28925986;WS=28925968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr16	28944396	rs2904880	C	G	4034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=46;PP=2965;SC=GCCTCCGTGTCTCCCACCGAG;SOR=1.397;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=79;TCR=46;TR=125;WE=28944404;WS=28944386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr16	28993049	rs6565300	A	C	2827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=59;PP=2314;SC=AATTCGGTCGATACTGTCCCC;SOR=1.809;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=24;TCR=59;TR=83;WE=28993057;WS=28993039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr16	28995757	rs7140	C	A	2615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=30;PP=2236;SC=CAGACACTACCTGGGTAGCTC;SOR=1.320;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=53;TCR=30;TR=83;WE=28995765;WS=28995747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr16	28997997	rs1131543	G	A	6082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=102;NR=77;PP=2965;SC=GTGAGGATGCGGATGAGGATG;SOR=1.038;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=102;TCR=77;TR=179;WE=28998005;WS=28997987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr16	29001460	rs9929088	A	C	3603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.107;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=45;PP=2800;ReadPosRankSum=1.078;SC=TACCTGCTGAACCCCGTCAGC;SOR=1.028;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=72;TCR=46;TR=117;WE=29001468;WS=29001450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,120:0.99:121
chr16	29088128	rs67548829	TACAACTATTGCTGTTATACTAAAGACCAATAGAAATAGCAAGATTAATTAAGATACCAGTTGAAA	T	5456.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.65;QD=43.31;SOR=2.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr16	29088221	rs2442141	A	G	1980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.40;QD=32.47;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr16	29102191	.	TTTTTTC	T	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-0.000;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.32;MQRankSum=-1.036;QD=16.55;ReadPosRankSum=1.645;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
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chr16	29113497	rs11366120	AT	A	2058.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.57;QD=25.42;SOR=2.920;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr16	29127350	rs1540389	T	C	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=429;SC=TCTGAATAGATAGAGTTGAGA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=17;WE=29127358;WS=29127342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	29142059	rs1642020	G	C	779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=18;NR=13;PP=725;SC=CTGGCGGGGAGAGCCAGGAGA;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=18;TCR=13;TR=31;WE=29142067;WS=29142049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	29142189	rs1642021	A	T	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.66;QD=31.84;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	29142204	rs1642022	A	G	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.64;QD=31.98;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	29150636	rs34323521	A	AC	177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=213;SC=ACCAAGGGTGACCCCCCACAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=29150644;WS=29150626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	29150785	rs1646119	G	A	1129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=17;PP=833;SC=TTGGCCGCTCGTTCTAGTTTA;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=36;WE=29150793;WS=29150775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	29332380	rs257878	T	C	1735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=38;PP=1313;SC=GAGCTTCTCGTGGAGAATGCC;SOR=1.812;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=56;WE=29332388;WS=29332370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	29375985	.	C	CT	1421.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.054;ClippingRankSum=0.000;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=6.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.03;MQRankSum=-6.671;QD=13.94;ReadPosRankSum=-0.180;SOR=1.617;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,74:0.73:102
chr16	29376400	.	CTG	C	178.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.075;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.86;MQRankSum=-7.020;QD=2.29;ReadPosRankSum=-0.363;SOR=0.311;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,15:0.19:78
chr16	29624247	rs28455095	C	A	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.37;QD=32.07;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	29624668	rs188899883	C	A	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=4;PP=345;SC=AGAGCGCGCCCACGATGGAGA;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=29624676;WS=29624658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	29644794	rs11150561	A	G	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.30;QD=32.42;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	29645078	rs12597368	C	A	2190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=1;PP=1911;SC=TGCACTCCAGCCTGTGTGACA;SOR=6.932;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=65;TCF=64;TCR=1;TR=65;WE=29645086;WS=29645068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	29645104	rs35388990	CA	C	1157.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.745;HP=14;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=-2.454;NF=47;NR=4;PP=613;ReadPosRankSum=0.135;SC=AGTCCTGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=3.086;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=105;TCF=83;TCR=22;TR=51;WE=29645114;WS=29645094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,58:0.94:62
chr16	29647700	rs200123374	C	T	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.51;QD=32.83;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	29675928	rs1050881	C	T	3696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=58;PP=2951;ReadPosRankSum=0.184;SC=TGAGCAGAGGCGGCAAGCGTA;SOR=0.236;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=59;TCR=59;TR=116;WE=29675936;WS=29675918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,122:0.99:123
chr16	29705854	rs9936468	C	T	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=2;PP=248;SC=CCGCAGTCCCCCCCCTGGGAC;SOR=2.303;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=10;WE=29705862;WS=29705851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	29708350	rs9932770	A	G	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=7;PP=811;SC=GGCTGACTTCACTCTGAAGGT;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=36;WE=29708358;WS=29708340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	29790669	rs235634	T	A	2687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.66;SOR=1.685;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr16	29790678	rs183527	T	G	2602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=42;PP=1532;SC=ATTGGGGACTTGGGAAGGCAG;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=58;WE=29790686;WS=29790673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr16	29790767	rs235635	A	G	2094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=28;PP=1721;SC=AACAGGGGTGATGCAGAGAAA;SOR=0.990;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=38;TCR=28;TR=66;WE=29790775;WS=29790757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr16	29790864	rs235636	G	A	2512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=37;PP=1946;SC=AGAGTATGGAGGTGGTGGTGG;SOR=0.876;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=42;TCR=37;TR=79;WE=29790872;WS=29790854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr16	29791561	rs235637	T	G	6800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=144;NR=57;PP=2965;SC=GAAGAAGCTGTTATTTGTGAC;SOR=1.913;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=202;TCF=145;TCR=57;TR=201;WE=29791569;WS=29791551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr16	29791721	rs235638	G	C	4984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=123;PP=2965;SC=GTTTACCCCAGTAGCTGCAGC;SOR=3.337;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=23;TCR=123;TR=146;WE=29791729;WS=29791711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr16	29791818	rs35586094	TA	T	924.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=32;PP=788;SC=AATGGCTCAATAAAAAAAATA;SOR=4.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=34;WE=29791826;WS=29791808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	29809634	rs5816499	TACAC	T	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.57;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	29811319	rs235648	C	T	3180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=85;PP=2533;SC=AAGAGGAGATCGGGAGCCCTG;SOR=4.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=6;TCR=85;TR=91;WE=29811327;WS=29811309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr16	29814234	rs2450399	G	A	4856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=86;PP=2965;SC=TGAAGACAGTGGAAGAGAAGG;SOR=0.998;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=66;TCR=86;TR=152;WE=29814242;WS=29814224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr16	29817998	rs111993640	C	T	970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=1;PP=767;SC=CGCTGAGCCCCGGGGGCCCCG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=29818006;WS=29817988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	29821744	rs2516825	G	A	4903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=79;PP=2965;SC=CTCCTCTTCTGTCAGACCTGA;SOR=0.718;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=160;TCF=81;TCR=79;TR=160;WE=29821752;WS=29821734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr16	29822841	rs11150572	A	C	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=3;PP=672;SC=CCCCAGCCGCATCCCTCCCCA;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=29822849;WS=29822831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	29822957	rs72798131	C	T	3366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=22;PP=2618;SC=GAAAGCTGCACCTGTCCCTCA;SOR=2.390;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=83;TCR=22;TR=105;WE=29822965;WS=29822947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr16	29823202	rs12923293	A	G	1227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=31;PP=994;SC=CTGCTCGTAGAGACGCCTCCA;SOR=3.500;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=35;WE=29823210;WS=29823192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	29825126	rs11150573	T	C	4540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=84;PP=2965;SC=CAGCTCCCAGTTGGCAGGTCC;SOR=1.155;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=142;TCF=58;TCR=84;TR=141;WE=29825134;WS=29825116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr16	29859430	rs11350750	CT	C	98.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.755;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.57;MQRankSum=0.385;QD=9.87;ReadPosRankSum=-0.536;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr16	29908433	rs11649499	C	G	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=22;PP=743;SC=CGTGGGGTCCCGATCAGATCC;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=29;WE=29908441;WS=29908423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	29912802	rs140411458	G	GGGT	9489.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=91;PP=2924;SC=GGGCAGCTCAGGGTGGCCCAG;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=78;TCR=112;TR=156;WE=29912810;WS=29912792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr16	30096468	rs34627357	T	TG	320.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=1;NR=9;PP=241;SC=AGGCTGGGCGTGGGGGGGGCT;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=10;WE=30096476;WS=30096458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	30097630	rs2289292	C	T	895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=16;PP=699;SC=GGAGAAAGTGCGGGGCAAAGG;SOR=0.906;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=12;TCR=16;TR=28;WE=30097638;WS=30097620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	30119525	rs8061772	C	A	598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=2;PP=462;SC=GTGGTGGTCACGGCCTCACCT;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=30119533;WS=30119515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	30194328	rs79512505	G	C	3173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=37;PP=2216;SC=GTAGCCCCTGGCACGAAGTAG;SOR=1.234;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=59;TCR=37;TR=95;WE=30194336;WS=30194318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr16	30198151	rs1132812	A	G	2062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=36;PP=1668;SC=GGGAGATCCCAGATGGGGGCC;SOR=0.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=31;TCR=36;TR=67;WE=30198159;WS=30198141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr16	30380486	rs4238961	T	C	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=0;PP=924;SC=ATCGTTTTCGTTTCGCCCTCC;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=30380494;WS=30380476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	30386262	rs8046445	C	T	2188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=42;PP=1829;SC=GTAGCTGGTTCCCAGTCCAAC;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=26;TCR=42;TR=68;WE=30386270;WS=30386252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr16	30390314	rs12447833	T	C	2179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=66;NR=4;PP=1911;SC=TTGGAGGCTCTGATACTGTCC;SOR=5.105;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=66;TCR=4;TR=70;WE=30390322;WS=30390304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr16	30393660	rs4787643	G	A	7212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=86;NR=141;PP=2965;SC=GGTTGGGGAGGGCAGCAAAAC;SOR=1.266;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=227;TCF=86;TCR=141;TR=227;WE=30393668;WS=30393650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr16	30393771	rs4788409	G	A	2511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=60;PP=2059;SC=GCTAGGAAGAGTCAGTGGGGT;SOR=2.925;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=13;TCR=60;TR=73;WE=30393779;WS=30393761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr16	30407269	rs13333093	C	A	4799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=74;PP=2965;ReadPosRankSum=0.344;SC=TGTGGCCGGCCGAGATCCTGG;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=81;TCR=75;TR=154;WE=30407277;WS=30407259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,153:0.99:155
chr16	30408765	rs12921440	C	T	3592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=54;PP=2877;SC=GTAGGAAATGCCTCTCTCAAA;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=106;TCF=52;TCR=54;TR=106;WE=30408773;WS=30408755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr16	30410445	rs4788413	C	T	1943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=48;PP=1642;SC=CCAGGGAGGGCGGAGGCCCAG;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=13;TCR=48;TR=61;WE=30410453;WS=30410435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr16	30424888	rs11314620	GT	G	226.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=6;PP=146;SC=GAAATTTTGGGTTTTTTTTTC;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=8;WE=30424896;WS=30424878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	30522152	rs3087443	G	A	2653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=12;PP=2075;SC=GGGCCATGAGGCTGCTCCTCA;SOR=3.202;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=63;TCR=12;TR=75;WE=30522160;WS=30522142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr16	30536672	rs3751847	A	G	5127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=100;PP=2965;SC=CGCAGATGCCACAGATGTTAG;SOR=1.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=56;TCR=100;TR=156;WE=30536680;WS=30536662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr16	30536918	rs10871453	C	G	3469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=46;PP=2726;SC=GACTCTTTTCCTCGGGGTTCA;SOR=1.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=78;TCR=46;TR=124;WE=30536926;WS=30536908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr16	30666367	rs3747481	C	T	7475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=106;PP=2965;SC=CGACCACGGCCGCGGCGGCAC;SOR=0.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=225;TCF=118;TCR=107;TR=224;WE=30666375;WS=30666357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr16	30671532	rs35629860	G	A	1442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=6;PP=1207;SC=CCCTAGAGGGGTTGGGAGCTT;SOR=3.467;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=44;WE=30671540;WS=30671522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	30672719	rs885107	T	C	2213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=48;PP=1759;SC=AGCATAAAGGTCTTCTGCGTG;SOR=1.965;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=20;TCR=48;TR=68;WE=30672727;WS=30672709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr16	30724070	rs4889500	G	T	2648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=50;PP=2293;SC=AGTTGAAACGGTGGTGCCCCA;SOR=1.264;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=85;TCF=34;TCR=51;TR=84;WE=30724078;WS=30724060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr16	30724221	rs4889501	C	T	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.54;SOR=3.477;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	30732406	rs1470129	C	G	2252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=22;PP=1755;SC=GCTGGGGACACGGGTCTAGTA;SOR=1.162;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=59;TCF=37;TCR=22;TR=58;WE=30732414;WS=30732396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	30732630	.	C	G	6333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=107;PP=2965;SC=CCAGGCTCCTCTAGCCTGTTG;SOR=0.930;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=193;TCF=85;TCR=108;TR=191;WE=30732638;WS=30732620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr16	30734963	rs4889502	C	A	8372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.154;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=210;NR=50;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.866;SC=TGCCATCCTCCCTCCCTGGGC;SOR=2.890;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=262;TCF=210;TCR=52;TR=260;WE=30734971;WS=30734953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,269:1.00:270
chr16	30760409	.	G	C	44	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.56;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=29;MMLQ=22;MQ=53.09;NF=2;NR=1;PP=44;QD=26.2570708491;SC=GGTGGTGGTGGTGCTGCTGCT;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=3;WE=30760417;WS=30760399;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr16	30762640	rs4889504	C	T	2516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=53;PP=1985;SC=GCAGACGACCCCCCACCTCCT;SOR=1.730;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=79;TCF=25;TCR=54;TR=78;WE=30762648;WS=30762630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr16	30766247	rs9941201	G	A	3114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=23;PP=2263;SC=TGGCAAATCAGTGCAACTTGG;SOR=2.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=66;TCR=23;TR=89;WE=30766255;WS=30766237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr16	30768492	rs71820772	GCTCTGGC	G	1609.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=30;PP=1659;SC=GCTCCTCTGGGCTCTGGCCTC;SOR=3.556;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=32;WE=30768506;WS=30768482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	30770267	rs7188077	C	G	1275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=5;PP=1047;SC=GTCCTGATGTCATCCAAACCC;SOR=3.086;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=35;WE=30770275;WS=30770257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	30772004	rs35446957	GAA	G	2200.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.19;NF=18;NR=26;PP=1724;SC=TATAGTAAAAGAAAAAGAGTA;SOR=0.730;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=44;WE=30772013;WS=30771994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	30772040	rs4889505	A	G	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=26;PP=1051;SC=TATCATGACAAGGCTGTGACA;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=40;WE=30772048;WS=30772030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	30773822	rs1550477	T	C	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=2;PP=1333;SC=CTCCTCCCGTTTGACGCCCCT;SOR=5.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=44;WE=30773830;WS=30773812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	30779716	rs7195142	A	G	4926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=86;PP=2965;SC=CGGGAGCTTCAGGAACGGGAA;SOR=0.962;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=65;TCR=86;TR=151;WE=30779724;WS=30779706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr16	30780828	rs4889506	A	G	3191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=71;PP=2616;SC=TGCAGAAGCTAGAGGAGAAGG;SOR=1.779;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=30;TCR=71;TR=101;WE=30780836;WS=30780818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr16	30832463	rs6565205	A	C	2161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=17;PP=1927;SC=GACACCGTCCAGCAGGTGGGC;SOR=2.105;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=51;TCR=17;TR=68;WE=30832483;WS=30832453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr16	30832475	rs6565206	T	C	2131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=17;PP=1783;SC=CAGGTGGGCATGCCGTGGTGT;SOR=2.206;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=53;TCR=17;TR=70;WE=30832483;WS=30832453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr16	30832701	rs8045550	A	C	6665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=99;NR=99;PP=2965;SC=TGGGCGGGGGAAGAGTGAAGG;SOR=0.751;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=99;TCR=99;TR=198;WE=30832709;WS=30832691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr16	30833272	rs8046609	A	G	6982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=134;NR=94;PP=2965;SC=AACCGACAGCAACATGGGAGC;SOR=1.050;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=228;TCF=134;TCR=94;TR=228;WE=30833280;WS=30833262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr16	30833321	rs8046001	C	T	6606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=124;PP=2965;SC=GATACTCCTCCGGACTCTGGG;SOR=1.206;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=205;TCF=81;TCR=124;TR=205;WE=30833329;WS=30833311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr16	30833425	rs4889510	G	C	1886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=50;PP=1592;SC=CTCCCGTGTTGCAGGGGCTGC;SOR=5.747;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=53;TCF=2;TCR=51;TR=52;WE=30833433;WS=30833415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	30936081	rs35675346	G	A	3005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=25;PP=2221;SC=CGGAAAGGGGGAATCTGGGGT;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=66;TCR=25;TR=91;WE=30936089;WS=30936071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr16	30964940	rs9926903	A	G	7960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=123;NR=110;PP=2965;SC=CACCGTCCCAAGCTGAGCCAG;SOR=0.821;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=233;TCF=123;TCR=110;TR=233;WE=30964948;WS=30964930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr16	31004169	rs17855121	T	C	2986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=34;PP=2304;SC=CCCCAATGGATGACGCCAAGA;SOR=1.519;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=104;TCF=70;TCR=34;TR=103;WE=31004177;WS=31004159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr16	31004812	rs12445568	T	C	5118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=132;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.815;SC=TGATCTAGGGTGACGAGGGAG;SOR=0.923;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=182;TCF=49;TCR=133;TR=181;WE=31004820;WS=31004802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,185:0.99:186
chr16	31004926	rs7194921	C	T	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=32;PP=955;SC=GCACATTATTCACCTGCTCTT;SOR=4.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=34;WE=31004934;WS=31004916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	31012813	rs61239537	G	T	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=267;ReadPosRankSum=1.981;SC=GGGTGCTGGGGCTGGGGCTGG;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=11;WE=31012821;WS=31012803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr16	31044683	rs58726213	A	G	5348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=73;PP=2965;SC=CGTACAAATGACGTATTCCTA;SOR=1.005;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=96;TCR=73;TR=168;WE=31044691;WS=31044673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr16	31044897	rs12445650	G	A	1271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=27;PP=1030;SC=TGCGGGAGCTGGAGCGGGGAA;SOR=2.133;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=37;WE=31044905;WS=31044887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	31049155	rs55979739	A	G	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=1;PP=671;SC=ATAAGAGCTCATGCTATTTGC;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=31049163;WS=31049145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	31050023	rs732173	C	A	679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.99;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	31050033	rs732172	C	T	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.06;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	31075708	rs2032917	C	G	8256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=128;NR=120;PP=2965;SC=GTACAGGACACGCACTTGTAG;SOR=0.750;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=248;TCF=128;TCR=120;TR=248;WE=31075716;WS=31075698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr16	31090407	rs35713203	G	C	2270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=33;PP=1728;SC=GAAGAGGAAGGAGTGGCAGAG;SOR=0.844;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=29;TCR=33;TR=62;WE=31090415;WS=31090397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr16	31091209	rs3751855	T	C	2931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=43;PP=2330;SC=GGCTGGAGACTGCCGAGAAGG;SOR=1.014;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=54;TCR=43;TR=97;WE=31091217;WS=31091199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr16	31092075	rs7196726	G	A	4460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=62;PP=2965;SC=CATAGTGGAGGCTGGGTTCCT;SOR=0.883;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=73;TCR=62;TR=135;WE=31092083;WS=31092065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr16	31095171	rs11865038	C	T	1892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=34;PP=1439;SC=CTCATCCTCACGGCTTTGGTC;SOR=1.071;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=24;TCR=34;TR=58;WE=31095179;WS=31095161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	31095204	rs11864806	G	C	1333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=24;PP=982;SC=CCCATTCCTCGAAGGAACAGG;SOR=1.206;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=39;WE=31095212;WS=31095194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	31095251	rs11864839	G	C	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=25;PP=694;SC=AGAATACTGAGGCTCAAAGCG;SOR=1.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=36;WE=31095259;WS=31095241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	31096164	rs7199949	G	C	1956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=27;PP=1628;SC=TGGTGGTCAGGATAGGGCAGG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=29;TCR=27;TR=56;WE=31096172;WS=31096154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr16	31097574	rs4889535	G	C	371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=6;PP=331;SC=CTGATTGCAGGTCTTTCCCCC;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=13;WE=31097582;WS=31097564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	31103956	.	C	T	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=448;SC=TCCCTTGGTTCCTCTCTCTGT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=31103964;WS=31103946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	31105830	.	C	T	4103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.345;ClippingRankSum=0.000;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=75;PP=2965;ReadPosRankSum=0.385;SC=CATCTGGCATCCTGGCCGCCC;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=53;TCR=76;TR=127;WE=31105838;WS=31105820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,130:0.98:132
chr16	31105922	rs61742233	G	A	2982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.433;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=45;PP=2521;ReadPosRankSum=-0.869;SC=TGCCCACGTCGCAGAGCGCGC;SOR=0.563;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=54;TCR=46;TR=99;WE=31105930;WS=31105912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,96:0.99:97
chr16	31106652	.	C	T	3030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=10;PP=2617;SC=GACTCTGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=4.083;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=95;TCF=84;TCR=11;TR=90;WE=31106673;WS=31106641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr16	31106767	.	C	G	7494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.726;ClippingRankSum=0.000;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=110;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.806;SC=ACCAGCGGATCAGGGGATCCA;SOR=0.256;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=217;TCF=106;TCR=111;TR=216;WE=31106775;WS=31106757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,231:1.00:232
chr16	31122229	rs1549296	C	T	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=441;SC=TTCTTTGTCACAGGGGCTGCC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=31122237;WS=31122219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	31122571	rs889555	C	T	2403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=52;NR=31;PP=1892;SC=GGCTTGGGGGCGGACAGGAAC;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=87;TCF=54;TCR=33;TR=83;WE=31122579;WS=31122561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr16	31131614	rs4527034	A	G	4540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=73;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.905;SC=GCGTGGGTGCAGGGAGTTGGC;SOR=0.273;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=158;TCF=85;TCR=73;TR=157;WE=31131622;WS=31131604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,155:0.99:156
chr16	31141826	rs1549295	A	G	3503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=67;PP=2800;SC=CGGAGAAGCCACTGTCTGACC;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=39;TCR=67;TR=106;WE=31141834;WS=31141816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr16	31141880	rs1549294	A	G	3289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=60;PP=2718;SC=GGGTGCTGCTAGAGATCCTGC;SOR=1.157;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=98;TCF=38;TCR=60;TR=97;WE=31141888;WS=31141870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr16	31142381	rs2855479	A	G	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=8;PP=601;SC=GGGCTTCCCTACCCCTCCCCA;SOR=1.508;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=22;TCF=13;TCR=9;TR=21;WE=31142389;WS=31142371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	31151521	rs8047469	A	G	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.85;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	31152697	rs150305650	T	TAAACAAAC	2143.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=3;PP=1599;SC=TAATTTTTTTTAAACAAACAA;SOR=3.109;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=22;WE=31152705;WS=31152687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	31152717	rs889547	T	C	2765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.15;QD=40.08;SOR=3.226;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr16	31153105	rs1549300	A	G	4171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=59;PP=2965;SC=CAGGGCCCCAATCCCAGGCTA;SOR=0.755;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=124;TCF=65;TCR=59;TR=123;WE=31153113;WS=31153095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr16	31153780	rs889546	G	A	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=2;PP=349;SC=CGCGTTCCGCGGGCCCCGCCC;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=31153788;WS=31153770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	31154358	rs78924645	G	A	3252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=78;PP=2536;SC=TCCCGCACACGTGGCTGGAAA;SOR=2.442;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=23;TCR=78;TR=101;WE=31154366;WS=31154348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr16	31191482	rs929867	A	G	5432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=48;PP=2965;SC=AGGCGTCGGTACTCAGCGGTG;SOR=1.652;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=110;TCR=48;TR=158;WE=31191490;WS=31191472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr16	31193942	rs741810	C	A	1944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=29;PP=1550;SC=ACACTTCAGGCTATGGCCAGA;SOR=0.793;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=32;TCR=29;TR=61;WE=31193950;WS=31193932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr16	31195759	.	C	T	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.840;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.88;MQRankSum=-1.708;QD=0.88;ReadPosRankSum=1.789;SOR=0.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,20:0.28:71
chr16	31196141	rs71771375	GTCTTTTTACTT	G	752.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=2975;SC=TTTCCTAGCTGTCTTTTTACT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=14;WE=31196159;WS=31196131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	31283332	.	C	T	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.566;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.512;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=156;ReadPosRankSum=0.855;SC=CCCCTTTTCCCTTAGGATGGA;SOR=0.132;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=10;WE=31283340;WS=31283322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr16	31342608	rs7188189	T	C	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=22;PP=724;SC=TGCTCCCCGCTGCTCCCCCAC;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=31342616;WS=31342598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	31371193	rs4264407	C	G	5237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=92;PP=2965;SC=GTGGGTGCTTCGATCCTGGTG;SOR=1.215;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=60;TCR=92;TR=152;WE=31371201;WS=31371183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr16	31384422	rs148124533	AAAG	A	244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=0;PP=246;SC=TCTTAAAAAAAAAGAAGAAGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=31384432;WS=31384412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	31384554	rs2070896	T	C	1162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=16;PP=968;SC=TCTCCTTTCCTTCACCTGATA;SOR=1.002;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=36;WE=31384562;WS=31384544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	31392189	rs11150620	G	C	1309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=9;PP=1129;SC=GAGGATGGGAGTGCTCTGACA;SOR=2.780;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=42;WE=31392197;WS=31392179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	31404467	rs8050328	T	G	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=3;PP=572;SC=CCCTGCAGGTTGTGGAGGGGG;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=31404475;WS=31404457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	31404571	rs8050500	T	C	2782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=29;PP=2318;SC=TGTGCCCCTCTTCCTGCTGTG;SOR=1.664;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=59;TCR=29;TR=88;WE=31404579;WS=31404561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr16	31405463	rs112895789	A	G	2578.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.17;MQRankSum=-0.240;QD=29.30;ReadPosRankSum=-1.131;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,85:0.97:88
chr16	31422429	rs12444660	T	C	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=4;PP=582;SC=CCCTCTGCTCTGTGGATGTGG;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=31422437;WS=31422419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	31429267	.	CA	C	166	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=1.0000;HP=9;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=7;NR=2;PP=166;QD=20.0;SC=AAATCCGTCTCAAAAAAAAAC;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=9;WE=31429275;WS=31429266;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr16	31435366	rs116943658	GA	AG	2036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=28;PP=2598;SC=GGGCACCCCCGAAGCTCTGAG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=44;WE=31435375;WS=31435356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	31470540	rs3813002	T	C	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=9;PP=784;SC=TCGGAGGCCCTGGCCCACCTG;SOR=1.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=31470548;WS=31470533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	31471378	rs9926717	A	G	1402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=35;PP=1141;SC=CTTGCTCTCTAGACCCGGGCA;SOR=2.461;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=44;WE=31471386;WS=31471368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	31503751	rs4536493	A	G	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=26;PP=838;SC=TGTCTGCCCCAAGACCTTGGC;SOR=3.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=31503759;WS=31503741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	31519048	rs11861164	A	G	2352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=24;PP=1654;SC=GCAGGGCTGAAAGCAGCAATA;SOR=1.426;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=43;TCR=24;TR=67;WE=31519056;WS=31519038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	31539386	rs8050390	G	A	1260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=7;PP=948;SC=TTAAGGGGAGGAAGTGGGTTG;SOR=2.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=39;WE=31539394;WS=31539376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	31575186	rs7192364	C	T	2346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=16;PP=1828;SC=CCTTTCCTGCCCAAACTCAGT;SOR=2.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=51;TCR=16;TR=67;WE=31575194;WS=31575176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	31580272	rs4889673	C	T	2613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=42;PP=2054;SC=GCCATGGCGCCTTCCATAGTA;SOR=0.876;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=35;TCR=42;TR=77;WE=31580280;WS=31580262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr16	31580530	rs4889548	A	C	1799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.100;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=39;PP=1435;ReadPosRankSum=0.847;SC=CTGACGTTGAACCATTTGACA;SOR=2.001;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=18;TCR=40;TR=56;WE=31580538;WS=31580520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,58:0.97:60
chr16	31613625	rs34368131	GT	G	7686.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.183;NF=92;NR=82;PP=2957;ReadPosRankSum=-0.112;SC=TGAAGAATAAGTAAAACATTT;SOR=0.401;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=181;TCF=96;TCR=85;TR=174;WE=31613633;WS=31613615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,200:1.00:201
chr16	31744807	.	T	C	1675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=5;PP=2058;SC=TTACAAGAGGTTTGTAGATCA;SOR=5.018;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=70;TCR=5;TR=73;WE=31744815;WS=31744797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	31925986	rs117668484	T	C	2442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=39;PP=1950;ReadPosRankSum=1.219;SC=TATGATCAATTTGATGAATCC;SOR=0.955;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=34;TCR=40;TR=72;WE=31925994;WS=31925976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,75:0.97:77
chr16	31926619	rs3850114	G	A	3862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=63;PP=2965;SC=GAGAAACCCTGTAAATGGAAA;SOR=0.742;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=59;TCR=64;TR=122;WE=31926627;WS=31926609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr16	31927308	rs118056264	G	A	7136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.009;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=129;NR=76;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.808;SC=CAAATGTAAAGCATGTAGCAA;SOR=0.950;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=206;TCF=129;TCR=77;TR=205;WE=31927316;WS=31927298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,223:1.00:224
chr16	31987859	rs370699866	C	T	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=0.000;QD=6.88;ReadPosRankSum=2.153;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr16	32486756	rs28495417	A	G	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.371;NF=28;NR=7;PP=823;ReadPosRankSum=-0.432;SC=GGGAGACAGGACACCTACCAC;SOR=0.988;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=40;TCR=11;TR=35;WE=32486764;WS=32486746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,33:0.67:49
chr16	32889182	.	C	T	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.497;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.64;MQRankSum=-1.587;QD=5.43;ReadPosRankSum=-0.388;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,14:0.26:53
chr16	32896606	rs139370574	GC	AT	1327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.91;MQRankSum=-7.728;QD=10.54;ReadPosRankSum=0.061;SOR=0.682;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,39:0.31:126
chr16	32896672	.	G	C	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.065;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=5.473;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.96;MQRankSum=-3.381;QD=1.78;ReadPosRankSum=0.322;SOR=0.111;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,9:0.18:51
chr16	32896688	.	G	A	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.352;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.01;MQRankSum=-2.234;QD=8.26;ReadPosRankSum=-1.060;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr16	32936832	.	A	G	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.624;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=14.443;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.78;MQRankSum=-0.997;QD=17.15;ReadPosRankSum=-2.635;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr16	32936837	.	G	T	339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.355;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=19.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.89;MQRankSum=-0.666;QD=17.88;ReadPosRankSum=-3.014;SOR=4.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr16	32936905	rs139356003	C	T	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.68;MQRankSum=-2.403;QD=8.54;ReadPosRankSum=0.411;SOR=0.839;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr16	32945402	rs57620987	A	C	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.908;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.39;MQRankSum=0.708;QD=7.45;ReadPosRankSum=-0.973;SOR=0.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,26:0.32:82
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chr16	33372694	rs4985323	T	C	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.175;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-14.806;NF=52;NR=39;PP=1522;ReadPosRankSum=-0.454;SC=TTCTCTGAGATTTCTGCCCAG;SOR=0.404;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=312;TCF=200;TCR=112;TR=91;WE=33372702;WS=33372684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:224,65:0.22:289
chr16	33380000	rs4536488	G	A	2157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FS=7.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.12;MQRankSum=-0.295;QD=5.25;ReadPosRankSum=2.375;SOR=0.360;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:300,111:0.27:411
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chr16	33380263	rs57312786	C	G	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.557;NF=2;NR=16;PP=318;ReadPosRankSum=0.326;SC=GAACCATCAGCTTTGGGGTTG;SOR=0.351;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=56;TCF=4;TCR=52;TR=18;WE=33380271;WS=33380253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,16:0.30:54
chr16	33390329	rs12232434	G	C	1827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FS=13.485;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQRankSum=-3.584;QD=6.85;ReadPosRankSum=1.324;SOR=1.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:189,78:0.29:267
chr16	33390399	rs4086208	C	T	2031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.210;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-15.677;NF=66;NR=47;PP=1999;ReadPosRankSum=-0.573;SC=TCTAACCTCACTTTTCTTTAA;SOR=0.892;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=379;TCF=199;TCR=180;TR=113;WE=33390407;WS=33390389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:268,97:0.27:365
chr16	33391213	rs4082382	C	T	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.75;MQRankSum=0.265;QD=10.45;ReadPosRankSum=-0.972;SOR=0.489;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
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chr16	33391348	rs7188099	G	A	761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=4.285;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.81;MQRankSum=-0.536;QD=6.19;ReadPosRankSum=-1.394;SOR=1.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,34:0.28:123
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chr16	33391415	rs357994	A	C	4224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.301;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.011;NF=85;NR=64;PP=2962;ReadPosRankSum=2.654;SC=AGAATCGATTATTCCCACCCA;SOR=0.881;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=215;TCF=114;TCR=101;TR=149;WE=33391423;WS=33391405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,153:0.68:226
chr16	33392008	rs56739713	A	G	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-9.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=2.566;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.71;MQRankSum=-0.167;QD=5.52;ReadPosRankSum=-1.583;SOR=1.463;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,50:0.30:164
chr16	33392165	rs11150710	C	G	2306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.851;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.778;NF=23;NR=78;PP=1744;ReadPosRankSum=0.341;SC=GTGGTATGGCCGTAGACCCAG;SOR=0.969;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=305;TCF=80;TCR=225;TR=101;WE=33392173;WS=33392155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:203,104:0.34:307
chr16	33392215	rs11150709	G	A	1511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=7.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.829;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.119;NF=0;NR=54;PP=1191;ReadPosRankSum=-1.457;SC=AATACTTGGGGGGCTGGGTAC;SOR=1.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=141;TCF=2;TCR=139;TR=54;WE=33392223;WS=33392205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,56:0.39:144
chr16	33392231	rs11150708	C	T	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.758;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.288;NF=0;NR=40;PP=841;ReadPosRankSum=-1.282;SC=GGTACAGTGGCTTTCATGCCT;SOR=1.467;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=110;TCF=2;TCR=108;TR=40;WE=33392239;WS=33392221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,41:0.37:111
chr16	33395795	rs373875949	TA	T	1020.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-0.862;QD=20.83;ReadPosRankSum=0.625;SOR=0.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr16	33395802	rs368088965	AT	A	1203.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-0.916;QD=20.40;ReadPosRankSum=1.026;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr16	33395820	rs113700056	A	ACAG	1929.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=5.051;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.17;MQRankSum=-3.578;QD=18.92;ReadPosRankSum=1.335;SOR=0.123;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,44:0.43:102
chr16	33395882	rs4887691	A	G	1759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=6.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.327;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-12.050;NF=54;NR=20;PP=1438;ReadPosRankSum=-0.389;SC=TGTATTCCCTAAATGCATTTC;SOR=0.278;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=209;TCF=163;TCR=46;TR=74;WE=33395890;WS=33395872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,74:0.35:212
chr16	33395983	rs28650990	T	C	1676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-5.327;NF=7;NR=60;PP=1501;ReadPosRankSum=-0.053;SC=AACACTGGGGTCCTCTACACC;SOR=0.794;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=154;TCF=18;TCR=136;TR=67;WE=33395991;WS=33395973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,64:0.42:153
chr16	33408626	rs8059234	T	C	1636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=506;ExcessHet=3.0103;FS=2.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQRankSum=-19.195;QD=3.25;ReadPosRankSum=-1.224;SOR=0.763;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:397,106:0.21:503
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chr16	33408673	rs28415216	G	A	2685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=486;ExcessHet=3.0103;FS=0.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.27;MQRankSum=-13.212;QD=5.55;ReadPosRankSum=1.846;SOR=0.755;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:386,98:0.20:484
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chr16	33424950	rs2927971	C	T	11038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=651;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.046;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-12.024;NF=243;NR=256;PP=2962;ReadPosRankSum=0.418;SC=GCTGCACGGCCTCAGGTCAAG;SOR=0.426;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=789;TCF=363;TCR=426;TR=499;WE=33424958;WS=33424940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:272,378:0.58:650
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chr16	33534205	rs75274563	T	C	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=19.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQRankSum=-11.580;QD=3.31;ReadPosRankSum=-0.088;SOR=2.565;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,22:0.13:171
chr16	33534209	rs111304289	T	A	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=25.946;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQRankSum=-11.688;QD=3.88;ReadPosRankSum=-0.444;SOR=2.875;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:148,27:0.15:175
chr16	33534212	rs74015084	C	T	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=25.291;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQRankSum=-11.404;QD=3.98;ReadPosRankSum=0.219;SOR=2.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,28:0.16:174
chr16	33534254	rs79370116	C	A	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.20;MQRankSum=-7.081;QD=3.32;ReadPosRankSum=1.561;SOR=0.544;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,26:0.20:133
chr16	33534278	rs10445205	A	G	1170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.331;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.386;NF=4;NR=52;PP=1266;ReadPosRankSum=-0.560;SC=GATGAAATGCATGTAATTAAG;SOR=0.179;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=95;TCF=5;TCR=90;TR=56;WE=33534286;WS=33534268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,44:0.54:81
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chr16	33534344	rs78083012	G	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=6.606;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQRankSum=-5.772;QD=1.16;ReadPosRankSum=0.182;SOR=0.017;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,4:0.11:35
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chr16	33534354	rs74594913	C	T	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=6.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQRankSum=-5.004;QD=1.74;ReadPosRankSum=-0.542;SOR=0.020;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,4:0.12:32
chr16	33534369	rs74800708	C	CAA	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=4.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQRankSum=-5.163;QD=1.11;ReadPosRankSum=0.374;SOR=0.042;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,4:0.12:34
chr16	33539535	rs55950724	T	C	1087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=5.442;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.95;MQRankSum=-7.578;QD=6.63;ReadPosRankSum=0.049;SOR=1.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,48:0.29:164
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chr16	33539747	rs56272308	G	T	2041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-9.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.293;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.433;NF=0;NR=73;PP=1611;ReadPosRankSum=-0.762;SC=CCCTCCAAAAGAAATGGTAAA;SOR=1.838;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=141;TCF=2;TCR=139;TR=73;WE=33539755;WS=33539737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,76:0.53:143
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chr16	33630336	rs492688	A	G	4114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-14.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.593;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.565;NF=149;NR=27;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.233;SC=CTGTACTTACATTTAATGTCT;SOR=0.295;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=346;TCF=304;TCR=42;TR=176;WE=33630344;WS=33630326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,176:0.50:350
chr16	33630533	rs2110374	A	C	4224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-11.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.470;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.619;NF=36;NR=153;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.988;SC=TCAGGGCAGGAGTCTCTGTGG;SOR=0.740;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=383;TCF=75;TCR=308;TR=189;WE=33630541;WS=33630523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,191:0.50:385
chr16	33784956	rs375599241	G	A	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
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chr16	33961483	rs77018326	G	T	635.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=5.149;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQRankSum=-12.616;QD=2.84;ReadPosRankSum=2.276;SOR=1.395;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:198,26:0.12:224
chr16	33961499	rs75192280	CA	TG	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FS=7.056;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.30;MQRankSum=-16.253;QD=4.41;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=1.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:223,45:0.17:268
chr16	33961520	rs75815313	C	T	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FS=1.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.77;MQRankSum=-16.141;QD=2.87;ReadPosRankSum=-2.177;SOR=0.886;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:252,37:0.13:289
chr16	33961529	rs77202604	G	A	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FS=3.567;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQRankSum=-17.343;QD=1.77;ReadPosRankSum=-0.191;SOR=1.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:296,37:0.11:333
chr16	33961539	rs72797452	A	C	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=345;ExcessHet=3.0103;FS=0.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQRankSum=-18.146;QD=2.10;ReadPosRankSum=-0.167;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:306,37:0.11:343
chr16	33961556	rs75931509	A	G	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FS=2.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQRankSum=-18.427;QD=1.57;ReadPosRankSum=1.438;SOR=0.499;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:348,39:0.10:387
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chr16	33961869	.	G	A	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=7.286;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQRankSum=-5.688;QD=2.02;ReadPosRankSum=-0.184;SOR=2.277;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,6:0.13:45
chr16	33962365	.	C	T	391	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=33;MMLQ=17;MQ=51.19;NF=2;NR=5;PP=391;QD=60.8244589353;SC=GGTTCGCCGCCCCACCACCCC;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=7;WE=33962373;WS=33962341;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr16	33965436	.	G	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.318;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.63;MQRankSum=-2.834;QD=5.73;ReadPosRankSum=0.377;SOR=0.624;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,8:0.21:38
chr16	33965443	.	C	T	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQRankSum=-2.885;QD=6.12;ReadPosRankSum=1.150;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,8:0.21:39
chr16	33965445	.	C	T	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.015;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.25;MQRankSum=-2.814;QD=5.19;ReadPosRankSum=1.402;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,9:0.20:46
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chr16	33965456	rs79575365	T	C	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=14.062;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.33;MQRankSum=-3.939;QD=21.42;ReadPosRankSum=0.937;SOR=3.885;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
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chr16	33965735	.	C	T	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.234;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=2.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=0.138;QD=12.40;ReadPosRankSum=0.265;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,22:0.35:62
chr16	33965741	rs111610856	C	T	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=7.117;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=-0.865;QD=14.22;ReadPosRankSum=-0.203;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr16	34318731	rs6563853	T	G	1651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=42;PP=1378;SC=CATGCACATGTAGGAATGGGA;SOR=4.003;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=47;WE=34318739;WS=34318721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr16	34318845	.	G	A	283.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=7;PP=234;SC=CATGGGAGAGGGCAGTCTTGG;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=34318853;WS=34318835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	34681938	rs237988	C	T	2133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=37;PP=1674;SC=ATGAGTTCTTCCATGTTTAGA;SOR=1.437;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=59;WE=34681946;WS=34681928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	34682019	rs237989	G	A	1441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=30;PP=1172;SC=AGTATGAGTGGTTTCATGGTT;SOR=1.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=44;WE=34682027;WS=34682009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	46565019	rs1436436	T	G	3746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=70;PP=2965;SC=GTCGTACCTTTTTACAGGATT;SOR=1.417;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=41;TCR=70;TR=111;WE=46565027;WS=46565009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr16	46637746	rs4967259	T	C	1646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=12;PP=1370;SC=CTACTGCTGATGAAAGGCAGG;SOR=2.215;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=51;WE=46637754;WS=46637736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	46642456	rs8052092	A	G	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=405;SC=CACACAACATAGAGACCTTTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=46642464;WS=46642446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	46651417	rs34949348	TA	T	726.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=659;SC=ACATGGCAATTAGATGTGAAA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=46651425;WS=46651407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	46655210	rs6598679	A	G	4210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=96;NR=52;PP=2965;SC=CGCCCAGCCCATGCGCTCCGG;SOR=1.445;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=96;TCR=52;TR=148;WE=46655218;WS=46655200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr16	46696284	rs168745	G	A	6055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=122;PP=2965;SC=TCAGAGGTTCGTGATTCTCTT;SOR=1.477;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=67;TCR=122;TR=189;WE=46696292;WS=46696274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr16	46705502	rs36310	T	C	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=3;PP=895;SC=TTTAATTCAGTTGCAATTCCT;SOR=4.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=32;WE=46705510;WS=46705492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	46714529	rs700582	A	G	2660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=3;PP=2252;SC=ACACTTTTATACATTCTACAA;SOR=5.838;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=74;TCF=71;TCR=3;TR=74;WE=46714537;WS=46714519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr16	46715191	rs700581	G	A	1397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=5;PP=1086;SC=TTGTTAAGAAGTTACCCTTAA;SOR=3.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=41;WE=46715199;WS=46715181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	46743675	rs4141491	G	A	2857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=69;PP=2255;SC=CTGAGTCAGTGGAACAGATTA;SOR=3.365;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=12;TCR=69;TR=81;WE=46743683;WS=46743665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr16	46755213	rs194055	C	G	1560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=46;PP=1315;SC=ACATGAATGGCTCAGGGCAGC;SOR=6.358;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=47;TCF=1;TCR=46;TR=47;WE=46755221;WS=46755203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr16	46764482	rs36460	A	C	1792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=11;PP=1517;SC=TAAGCCCCCCAACCAAGGCAG;SOR=2.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=56;WE=46764490;WS=46764472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	46773752	rs28185	G	T	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=50;SC=CAACCCCGAGGTGTTCAAGGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=46773760;WS=46773750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	46918908	rs59708508	T	C	124.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=3;PP=94;SC=CTGGGGCCGCTGAGCAAGGGA;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=46918916;WS=46918898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	46950637	rs202005098	CAGAG	C	5344.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=94;PP=2965;SC=TGTCCCCACTCAGAGGGAGTG;SOR=3.575;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=10;TCR=103;TR=103;WE=46950648;WS=46950627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr16	46990859	rs114487971	A	C	3553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=95;NR=4;PP=2944;SC=ATCTGGATTGATAAGACACTC;SOR=5.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=99;TCF=95;TCR=4;TR=99;WE=46990867;WS=46990849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr16	47347780	rs2058769	G	A	3842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=97;PP=2965;SC=ACAAAATAAAGTGTTCTTGTA;SOR=4.066;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=11;TCR=97;TR=108;WE=47347788;WS=47347770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr16	47399670	rs76973321	CT	C	235.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=2.648;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=0.000;QD=3.74;ReadPosRankSum=0.607;SOR=0.342;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,24:0.38:63
chr16	47462851	rs17811434	A	G	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=29;PP=864;SC=GGCAAACATCAAATGAGCATT;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=47462859;WS=47462841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	47486817	rs2111227	C	T	117.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=66;SC=TGATTTATTCCAACTATTATC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=47486825;WS=47486807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	47684686	rs150516784	TATTA	T	3684.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=44;PP=2973;SC=AGTATTAGATTATTAATTTAC;SOR=1.347;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=73;TCF=28;TCR=45;TR=72;WE=47684697;WS=47684676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	47732512	rs35641157	C	CT	138.52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.36;MQRankSum=0.524;QD=27.70;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,3:0.60:5
chr16	48122582	rs7193955	G	A	3543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=54;PP=2965;SC=ATCTCCCCACGGCTGGGCCAG;SOR=0.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=54;TCR=54;TR=108;WE=48122590;WS=48122572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr16	48174559	rs16945869	G	A	3776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=31;PP=2965;SC=ACCACTCAGGGCCCATTTTCC;SOR=2.021;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=84;TCR=31;TR=115;WE=48174567;WS=48174549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr16	48175235	rs16945874	G	T	6876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=106;PP=2965;SC=ACCCACCCTTGCTACCTCTTC;SOR=0.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=216;TCF=110;TCR=106;TR=216;WE=48175243;WS=48175225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr16	48201131	rs41280939	C	G	581.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=462;ReadPosRankSum=-0.554;SC=CGAAGCTGCACCTGTGTGAAC;SOR=3.056;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=17;WE=48201139;WS=48201125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr16	48201432	rs16945916	T	C	5813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.337;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=83;PP=2965;ReadPosRankSum=0.814;SC=AACCAGGATGTGGTCACAGTT;SOR=0.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=196;TCF=111;TCR=85;TR=193;WE=48201440;WS=48201422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,199:0.99:202
chr16	48201707	rs16945917	A	G	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=25;PP=744;SC=TGGGAGAATTATGCCGAGTGC;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=48201715;WS=48201697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	48227748	rs139789251	C	CG	972.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=1051;SC=CCACCTCACTCAAGCCCATAG;SOR=4.174;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=23;WE=48227756;WS=48227738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	48227862	rs11866251	G	A	2794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=32;PP=2210;SC=TCAGCACCACGAAGAAGAAAA;SOR=1.312;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=54;TCR=32;TR=86;WE=48227870;WS=48227852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr16	48247523	rs11866529	T	G	2485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=70;PP=2058;SC=CCATTCCCTGTCACCCGCATC;SOR=6.385;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=72;TCF=2;TCR=70;TR=72;WE=48247531;WS=48247513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	48248918	rs8047091	T	C	3302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=50;PP=2702;SC=TCTCCAATAGTTTCCTTTCCT;SOR=0.733;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=48;TCR=50;TR=98;WE=48248926;WS=48248908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr16	48250011	rs11863233	G	A	1755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=15;PP=1387;SC=ATGGGTGACAGAGAAAGACAT;SOR=2.024;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=39;TCR=15;TR=54;WE=48250019;WS=48250001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	48250026	rs11863236	G	T	2168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.250;HP=4;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=19;PP=1811;ReadPosRankSum=1.351;SC=AGACATTACCGCCAGTGGGAA;SOR=1.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=66;TCF=46;TCR=20;TR=65;WE=48250034;WS=48250016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr16	48250218	rs28654935	T	C	1217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.49;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	48250221	rs28376623	G	A	1217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.10;SOR=4.332;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	48250247	rs28626252	C	A	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=351;SC=CCTGGGTACACAGAAGGGGTG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=48250255;WS=48250237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	48256484	rs16945972	A	G	1504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=1;PP=1220;SC=AGCATGGCCCAGAATAGGCAG;SOR=6.630;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=51;TCR=1;TR=52;WE=48256492;WS=48256474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	48256602	rs16945974	T	C	7563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=172;NR=49;PP=2965;SC=TGGCTGTGCGTTGGTTGATGA;SOR=2.463;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=221;TCF=172;TCR=49;TR=221;WE=48256610;WS=48256592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr16	48258381	rs73546424	T	A	5025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=110;PP=2965;ReadPosRankSum=1.443;SC=TCTCTTTGCATGTGACATCCA;SOR=1.109;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=36;TCR=111;TR=146;WE=48258389;WS=48258371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,152:0.99:153
chr16	48258419	rs9927238	C	A	4413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.91;QD=43.70;SOR=2.788;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr16	48258424	rs9933821	T	C	4450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.91;QD=46.36;SOR=2.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr16	48264617	rs13336759	A	G	817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=23;PP=653;SC=TTCCATACCGAGAATAAGCAG;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=48264625;WS=48264607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	48265777	rs16945988	C	T	3931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=40;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.687;SC=GTCGATGCCACGATTCACGAG;SOR=0.593;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=80;TCR=40;TR=119;WE=48265785;WS=48265767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,124:0.99:125
chr16	48292513	rs16946038	A	G	3437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=23;PP=2793;SC=CTATTGATTGACTCACATTTC;SOR=2.509;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=82;TCR=23;TR=105;WE=48292521;WS=48292503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr16	48329918	rs5816590	TC	T	2028.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=1;PP=2189;SC=TTTTTTGTTCTCCCCTAGGTG;SOR=6.804;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=71;TCR=1;TR=57;WE=48329926;WS=48329908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	48390780	rs150126658	TA	T	569.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=607;SC=CTCTTGAGGCTAAATCCTCAT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=16;WE=48390788;WS=48390770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	48419291	.	GGCC	G	368.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=0;NR=11;PP=515;SC=GCTCCCCCCTGGCCGCCGCCG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=11;WE=48419301;WS=48419281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	49412531	rs27813	A	G	4361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=93;PP=2965;SC=GGCCCCGGCCACCAGAATCCT;SOR=1.340;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=55;TCR=93;TR=148;WE=49412539;WS=49412521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr16	49432926	rs4785287	C	A	2359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=4;PP=1923;SC=CTGGGAGAGACAGCCCCTTGC;SOR=5.166;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=64;TCR=4;TR=67;WE=49432934;WS=49432916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr16	49856691	rs8060387	G	C	1468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=37;PP=1130;SC=AGGCTAGTAAGCATGTGCAAT;SOR=3.865;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=41;WE=49856699;WS=49856681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	50059279	rs9934704	C	A	1189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=25;PP=831;SC=GGCCCGTCCCCCGTCTCCCCT;SOR=1.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=36;WE=50059287;WS=50059269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	50059314	rs9924833	A	G	734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=13;PP=594;SC=GCTCCGGAGGAGCCGGCGTCG;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=21;WE=50059322;WS=50059304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	50059500	rs7194313	C	T	1930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=20;PP=1545;SC=TTTCTTTTCACTGGCAGACAC;SOR=1.721;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=64;TCF=43;TCR=21;TR=63;WE=50059508;WS=50059490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	50060203	rs17213264	A	G	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=4;PP=542;SC=GACCTGAAGCAGTTAAGAGTA;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=50060211;WS=50060193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	50100274	rs6500280	G	C	7658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=134;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.200;SC=GCTCTCATCCGCAGCTCCAGC;SOR=1.028;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=240;TCF=105;TCR=135;TR=238;WE=50100282;WS=50100264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,246:0.99:248
chr16	50102618	rs60730387	G	GAAAT	7719.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=129;NR=0;PP=2918;SC=GCTAAAAATAGAAATGTGAGA;SOR=7.978;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=166;TCF=166;TCR=0;TR=129;WE=50102626;WS=50102608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr16	50112971	rs66756058	GT	G	730.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=501;SC=TAATACAGCTGTTTTTTTTTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=26;WE=50112979;WS=50112961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	50251671	rs10530119	G	GTCTCTCTCTC	629.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=7;PP=2091;SC=GCATGTTGCTGTCTCTCTCTC;SOR=3.258;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=9;WE=50251679;WS=50251661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	50261735	rs4624170	C	T	5843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=123;NR=65;PP=2965;SC=TTATAACTCACGTGACTTGTG;SOR=1.498;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=188;TCF=123;TCR=65;TR=188;WE=50261743;WS=50261725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr16	50323211	rs13332825	T	C	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=8;PP=813;SC=CCTCCCAAAGTGTTGGGATTA;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=33;WE=50323219;WS=50323201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	50326661	rs8051594	A	G	8367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=167;PP=2965;SC=TGCAGGATGCATCCCGGGACC;SOR=1.291;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=273;TCF=106;TCR=167;TR=273;WE=50326669;WS=50326651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr16	50327456	rs2302713	C	T	2049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=56;PP=1694;SC=GGGGACTGGGCCCACCGTTCC;SOR=4.244;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=6;TCR=56;TR=62;WE=50327464;WS=50327446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr16	50328421	rs2302716	T	C	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=2;PP=279;SC=CTATGGAGGCTGAGGAAGGAC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=50328429;WS=50328411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	50328483	rs8061123	G	C	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=2;PP=876;SC=AGACAGTCCTGCGTGCTCCTG;SOR=4.743;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=30;WE=50328491;WS=50328473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	50342847	rs2302681	C	G	1361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=36;PP=1094;SC=CCCCTTTGTACACTCAGGGCT;SOR=3.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=42;WE=50342855;WS=50342837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	50345778	rs2302679	T	C	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=47;PP=1326;SC=TGGGGTGGGGTGGGCTCAGGT;SOR=3.342;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=8;TCR=47;TR=55;WE=50345786;WS=50345768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	50346748	rs3214383	T	TCC	1023.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=2;PP=999;SC=TTGCCACTCTTCCTGTCCCCT;SOR=4.091;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=22;WE=50346756;WS=50346738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	50348409	rs9926131	A	T	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=565;SC=GCCATCTATTATGAAAGGTTT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=50348417;WS=50348399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	50359901	rs8046783	G	A	1206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=36;PP=992;SC=TACTTCATTGGCTGGTTTGCA;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=50359909;WS=50359891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	50367633	rs56370009	T	TA	344.76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.555;NF=7;NR=7;PP=244;ReadPosRankSum=0.622;SC=TAATACTAAGTAAAAAAAAAA;SOR=0.283;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=14;WE=50367641;WS=50367623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr16	50368863	rs143461189	GCATTTTTTTCCCCA	G	922.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.9837;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.417;NF=0;NR=15;PP=2957;ReadPosRankSum=1.302;SC=TTAAAGTAATGCATTTTTTTC;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=15;WE=50368884;WS=50368853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr16	50642201	rs933566	G	C	3896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=72;PP=2965;SC=CTGTCTTCTTGTAGGAGCTCG;SOR=1.107;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=48;TCR=72;TR=120;WE=50642209;WS=50642191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr16	50733859	rs2067085	C	G	2572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=52;PP=1994;SC=TCACACCGTCCCAGAGGGTGA;SOR=1.395;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=27;TCR=52;TR=79;WE=50733867;WS=50733849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr16	50733969	rs2111235	A	G	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=21;PP=580;SC=AACTTGGTCCATGGGATTTCC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=50733977;WS=50733959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	50743919	rs34133110	C	T	3891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=90;PP=2965;SC=CCCAGGTTTTCAAACTCAGGT;SOR=2.303;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=29;TCR=90;TR=119;WE=50743927;WS=50743909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr16	50745583	rs1861759	T	G	3971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=69;PP=2965;SC=TCCTGGTGCGTGCCAAAGGTG;SOR=1.016;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=51;TCR=69;TR=120;WE=50745591;WS=50745573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr16	50757050	rs11423748	G	GA	373.86	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.24;MQRankSum=-0.265;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.048;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,19:0.86:22
chr16	50757276	rs5743291	G	A	2368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=52;PP=1932;SC=GGCAAAGAACGTCATGCTAGA;SOR=1.802;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=23;TCR=52;TR=75;WE=50757284;WS=50757266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr16	50759267	rs138198313	AC	A	997.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=503;SC=CCCACAACGTACTTTATCTGT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=50759277;WS=50759257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	50759269	rs4990643	T	A	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=332;SC=CACAACGTACTTTATCTGTTC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=12;WE=50759277;WS=50759257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	50759547	rs1077861	A	T	1626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=41;PP=1321;SC=GCATTTCTGAATAAGATCTGG;SOR=4.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=44;WE=50759555;WS=50759537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr16	50827601	rs2302759	A	G	4460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=104;PP=2965;SC=CTTAATGGATAAACTTTTGTT;SOR=2.734;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=26;TCR=104;TR=130;WE=50827609;WS=50827591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr16	50841484	rs1054987	G	A	1949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=39;PP=1580;SC=TTCCCCCACTGCAATACCCTG;SOR=1.536;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=20;TCR=40;TR=59;WE=50841492;WS=50841474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	51098427	rs1528601	G	C	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=3;PP=556;SC=GAATGTTTATGTTATGGTGTT;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=51098435;WS=51098417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	51098662	.	AAC	A	22	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.4997;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=1;PP=22;QD=28.0;SC=TAGCAGGTAAAACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=1;WE=51098671;WS=51098652;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,1:0.14:7
chr16	51171175	rs4614723	C	T	6009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=128;PP=2965;SC=AGCCCACTAACAGGTGAGCTG;SOR=1.712;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=59;TCR=128;TR=187;WE=51171183;WS=51171165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr16	51173955	rs144019351	C	T	5746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=96;PP=2965;SC=CAGTGTGTGTCCTGTAGTGCA;SOR=0.899;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=176;TCF=80;TCR=96;TR=175;WE=51173963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr16	51177113	rs4399530	A	C	1283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=2;PP=1070;SC=TGTCCTGAACATTTTATTATA;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=37;WE=51177121;WS=51177103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	51177327	rs34204387	G	GAA,GAAA	5291.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=61.26;QD=41.67;SOR=1.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,101,26:0.80,0.20:127
chr16	51185225	.	A	AGCG	94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=94;QD=35.3333333333;SC=ACGGAAATCGAGCGGCGGCGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=3;WE=51185233;WS=51185215;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,3:0.17:18
chr16	52085593	rs1582317	A	G	5032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=137;NR=10;PP=2965;SC=TATGGGGAGAAAATTAATATC;SOR=5.240;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=137;TCR=10;TR=147;WE=52085601;WS=52085583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr16	52107849	rs33338	C	A	3368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=81;PP=2703;SC=TGAGGCTTGACTGCAAGGATT;SOR=2.746;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=103;TCF=21;TCR=82;TR=102;WE=52107857;WS=52107839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr16	52473263	rs9925256	A	G	4795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=108;PP=2965;SC=GAGAGGCGACAGGGGAGTGCT;SOR=2.240;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=147;TCF=38;TCR=109;TR=146;WE=52473271;WS=52473253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr16	52580500	rs3095602	G	A	1903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=34;PP=1383;SC=GCGCGCCCAGGATGGGGAGGT;SOR=1.057;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=59;WE=52580508;WS=52580490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	52837322	rs4784259	A	C	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=1;PP=825;SC=TTTTTTAATTATAGACCCCTA;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=52837330;WS=52837312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	52837573	rs117379808	G	A	875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.28;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	52992947	rs9933492	T	C	3807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=30;PP=2963;ReadPosRankSum=-0.640;SC=TTCTGATTCCTTTCCGCTTGT;SOR=1.051;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=89;TCR=30;TR=119;WE=52992955;WS=52992937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,121:0.99:122
chr16	52993016	rs9931362	A	C	4584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=83;PP=2965;SC=TTTAGGCTCCATCCCCCTCCT;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=141;TCF=58;TCR=83;TR=140;WE=52993024;WS=52993006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr16	53076055	rs74021638	T	G	7630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=148;NR=119;PP=2965;SC=TTGCAGCACCTTACTGCTTCG;SOR=0.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=267;TCF=148;TCR=119;TR=267;WE=53076063;WS=53076045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr16	53191470	rs12597487	T	C	7454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=157;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.825;SC=AGCTCTTTGCTTTTATTTTGG;SOR=0.956;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=219;TCF=61;TCR=158;TR=218;WE=53191478;WS=53191460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,231:1.00:232
chr16	53256494	rs12597253	T	A	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=1;PP=693;SC=ACAATCTTAATTTAATCAAAT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=53256502;WS=53256484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	53272216	rs8049913	A	C	1450.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=2;PP=1248;ReadPosRankSum=0.197;SC=TAGAAAAAAAACCCAATGTAT;SOR=6.184;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=46;TCR=2;TR=46;WE=53272224;WS=53272206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr16	53279123	rs138968213	TA	T	412.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=455;SC=CACACACACATAACATATATA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=53279131;WS=53279113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	53283966	rs8052283	G	A	3075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=70;PP=2424;SC=GGAATCCTCAGAATGATCTTC;SOR=2.621;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=19;TCR=70;TR=89;WE=53283974;WS=53283956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr16	53288265	rs6499510	G	A	1884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=1;PP=1582;SC=AAGAATTCTTGTATGTGTTTA;SOR=6.736;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=57;TCF=56;TCR=1;TR=57;WE=53288273;WS=53288255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr16	53308315	rs57281432	A	T	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=17;PP=482;SC=GCCTCCTGAGAGGCTCGCACT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=53308323;WS=53308305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	53319390	rs112281896	T	TAATGA	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=416;SC=GATTAAAAAATAATGAAATCC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=8;WE=53319398;WS=53319380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	53320025	rs8056394	G	A	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=0;PP=747;SC=TCATTTTAATGTATTATCCCT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=53320033;WS=53320015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	53325691	rs1894903	G	A	2179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=41;PP=1789;SC=TAAATTGCACGTACTTCTGTA;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=24;TCR=41;TR=65;WE=53325699;WS=53325681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr16	53326860	rs2287078	G	A	10516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=173;NR=159;PP=2965;SC=GACAAATTCAGCAGATACAAC;SOR=0.812;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=333;TCF=173;TCR=160;TR=332;WE=53326868;WS=53326850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,337:1.00:337
chr16	53327041	rs7188463	A	G	2807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=87;PP=2487;SC=GGGTACAATTATCACGCTTTG;SOR=8.909;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=88;TCF=1;TCR=87;TR=88;WE=53327049;WS=53327031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr16	53337817	.	G	A	6022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.000;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.405;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=104;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.454;SC=TGGCCCTCATGATAGGGATTT;SOR=0.854;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=186;TCF=81;TCR=105;TR=183;WE=53337825;WS=53337807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,186:0.98:189
chr16	53340080	rs3760010	G	A	2182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=0;PP=1775;SC=GAATAATTATGTAAAATCCTT;SOR=8.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=64;TCR=0;TR=64;WE=53340088;WS=53340070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr16	53341748	rs6499548	T	G	6248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=59;PP=2965;SC=AATACAGCGATCCCAGTGTAC;SOR=1.597;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=180;TCF=121;TCR=59;TR=180;WE=53341756;WS=53341738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr16	53348207	rs8055218	T	A	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=0;PP=828;SC=ACTAACACTTTCATATATTTA;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=53348215;WS=53348197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
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chr16	53404580	rs192065611	C	T	2948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=36;PP=2341;SC=AAACAGTCCCCTTTTATCTTC;SOR=1.203;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=56;TCR=36;TR=92;WE=53404588;WS=53404570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr16	53404903	rs13333142	T	A	10372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=327;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.356;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=201;NR=114;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.909;SC=ACCACCCATATCTGACACTTC;SOR=1.182;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=317;TCF=201;TCR=116;TR=315;WE=53404911;WS=53404893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,318:1.00:319
chr16	53476804	rs17800577	G	A	3515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=89;PP=2861;ReadPosRankSum=-1.074;SC=AGGAATACACGTTAGTCTGTG;SOR=1.508;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=21;TCR=90;TR=110;WE=53476812;WS=53476794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr16	53487218	rs9941254	C	T	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=423;SC=AAATTCTTAGCGTTGAAATAG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=53487226;WS=53487213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	53496439	rs55875935	GT	G	1049.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.12;QD=24.41;SOR=1.775;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
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chr16	53499599	rs1072910	A	G	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=25;PP=701;SC=GAGGGTGGCAATTAGGTTTAA;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=53499607;WS=53499589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	53503934	rs1131220	G	A	8820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=165;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.111;SC=ATGGAGGGACGCCTGGGCGCA;SOR=1.045;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=288;TCF=121;TCR=167;TR=285;WE=53503942;WS=53503924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,288:0.99:290
chr16	53504721	rs10748	T	C	7243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=148;PP=2965;SC=TTCAGATGAATTGAGGAAAAA;SOR=1.765;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=211;TCF=62;TCR=149;TR=210;WE=53504729;WS=53504711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr16	53513033	rs8043918	C	T	4506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=58;PP=2965;ReadPosRankSum=0.640;SC=TGGTAGTTGCCATGTCTCTCA;SOR=0.388;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=80;TCR=58;TR=137;WE=53513041;WS=53513023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,143:0.99:144
chr16	53513055	rs8049033	T	C	5025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=75;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.699;SC=AGCACTCTTATTGTTTGCCAG;SOR=0.265;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=159;TCF=84;TCR=75;TR=157;WE=53513063;WS=53513045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,162:0.99:163
chr16	53524308	rs3929	G	C	3851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=106;PP=2965;SC=TCCAGCTGATGAGTTACAGCC;SOR=6.148;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=4;TCR=106;TR=110;WE=53524316;WS=53524298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr16	53526551	rs9931702	C	T	3311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=50;PP=2739;SC=CAAATGAAGACATTTTAGAAA;SOR=0.772;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=49;TCR=50;TR=99;WE=53526559;WS=53526541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr16	53534095	rs17193678	T	A	3409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=71;PP=2764;SC=CAGAAGCAAATGGGTTTTCTT;SOR=1.848;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=30;TCR=71;TR=101;WE=53534103;WS=53534085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr16	53699003	rs4133017	G	A	2693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=67;PP=2091;SC=TTTTAGTGGCGCAGAGACCAC;SOR=2.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=17;TCR=67;TR=84;WE=53699011;WS=53698993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr16	53860481	rs3826169	G	A	3023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=84;PP=2478;SC=AGATACACACGCATATACATG;SOR=5.376;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=5;TCR=84;TR=89;WE=53860489;WS=53860471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr16	53913930	rs11076004	G	A	2203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=3.201;NF=1;NR=61;PP=1854;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTTTTGAGATGGAGTCTCGCT;SOR=5.518;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=63;TCF=1;TCR=62;TR=62;WE=53913938;WS=53913920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr16	54273780	rs17253625	C	T	4607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=53;PP=2965;ReadPosRankSum=0.077;SC=CAAGCAAGAGCGGGCGGAATG;SOR=1.390;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=95;TCR=54;TR=147;WE=54273788;WS=54273770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,154:0.99:156
chr16	54274354	rs16953243	A	C	2848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=73;NR=13;PP=2309;SC=CACAGCCTGGAAAAAGCAGAG;SOR=3.391;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=74;TCR=13;TR=86;WE=54274362;WS=54274344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr16	54274562	rs17253832	T	C	5290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=125;PP=2965;ReadPosRankSum=0.852;SC=AAAGTATCACTAAGAGCAAGG;SOR=1.361;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=161;TCF=35;TCR=126;TR=160;WE=54274570;WS=54274552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,161:0.99:162
chr16	54274615	rs55970991	G	T	3018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=87;PP=2469;SC=AGGAAAGAAGGATTCATTTCA;SOR=7.636;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=89;TCF=1;TCR=88;TR=88;WE=54274623;WS=54274605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr16	54279640	rs72811791	G	T	2092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=48;PP=1580;SC=GCACCAGGGCGCTGGGAGTGC;SOR=2.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=11;TCR=48;TR=59;WE=54279648;WS=54279630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr16	54279687	rs16953255	G	C	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.54;SOR=4.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	54279693	rs72811792	A	G	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.24;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	54318102	rs8050831	C	T	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=0;PP=730;SC=TGCTCGGCGTCCTCTCCTTTC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=54318110;WS=54318092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	54318172	rs1126960	C	A	2333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=21;PP=1767;SC=TGGGCACGGGCTGGAAAGCTG;SOR=1.771;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=49;TCR=21;TR=70;WE=54318180;WS=54318162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr16	54318528	rs1450355	A	G	1077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=10;PP=827;SC=GAGCGGGTGCAGGCGGGGGCC;SOR=2.419;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=40;WE=54318536;WS=54318518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	54319571	rs1868692	A	G	2364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=53;PP=1839;SC=AGGGAGCGCGAGTGAGCCCCA;SOR=2.432;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=16;TCR=53;TR=69;WE=54319579;WS=54319561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	54319994	rs1868691	G	C	289.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=9;PP=240;SC=GGAGAGGGGGGCCGACCCCCG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=54320002;WS=54319984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	54691273	rs4784409	C	A	6003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=125;PP=2965;SC=AGAGGGAAACCATTACCAACA;SOR=1.838;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=53;TCR=125;TR=178;WE=54691281;WS=54691263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr16	55513331	rs2287073	G	C	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=2;PP=753;SC=CAGGCGGCGAGGCGGCCACAC;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=55513339;WS=55513321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	55515593	rs1030870	G	A	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=3;PP=1348;SC=GTGTTGTCCAGAGGCAATGCA;SOR=4.849;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=44;WE=55515601;WS=55515583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	55515621	rs1030869	T	C	2069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=4;PP=1617;SC=CTTAAGAAGATAACTCTGGAC;SOR=5.010;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=58;TCR=4;TR=60;WE=55515629;WS=55515611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	55516708	rs857403	T	A	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=1;PP=479;SC=CCTGGCTTATTTCCTGTCTGG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=55516716;WS=55516698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	55516767	rs1030868	G	A	1574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=3;PP=1405;SC=GCTTTGGTCAGTACTGTGCCA;SOR=4.849;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=45;TCR=3;TR=48;WE=55516775;WS=55516757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	55519535	rs1132896	G	C	3631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=52;PP=2772;SC=TGAAGTATGGGAACGCCGATG;SOR=0.800;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=61;TCR=52;TR=112;WE=55519543;WS=55519525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr16	55523520	.	C	G	2700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.000;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.394;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=15;PP=2096;ReadPosRankSum=-0.239;SC=GTGGTAGCCTCAGACTCTTTG;SOR=1.278;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=208;TCF=165;TCR=43;TR=95;WE=55523528;WS=55523510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,100:0.47:215
chr16	55523705	rs243849	T	C	3482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=108;PP=2789;SC=ACTACGATGATGACCGCAAGT;SOR=4.668;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=10;TCR=109;TR=118;WE=55523713;WS=55523695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr16	55525913	rs243846	G	C	1354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=36;PP=1142;SC=GAGGAGGGGGGAGGTCATGTA;SOR=4.565;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=38;WE=55525921;WS=55525903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	55527026	rs11640428	A	T	927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=0;PP=726;SC=AGTGGGGAGAACCTCTGGAGC;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=55527034;WS=55527016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	55527113	rs2287074	G	A	1807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=14;PP=1382;SC=CCACCCCCACGCTGGGCCCTG;SOR=2.187;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=41;TCR=14;TR=55;WE=55527121;WS=55527103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr16	55527298	rs243843	G	A	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=31;PP=824;ReadPosRankSum=0.358;SC=TGAAGACTCCGCCAAATGCTT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=31;WE=55527306;WS=55527288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr16	55530772	rs243838	T	G	971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.71;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	55532458	rs2287076	T	C	973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=33;PP=754;SC=GTTCAGAGGTTGGTGGGCTCT;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=55532466;WS=55532448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	55536727	rs14070	C	T	2663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=40;PP=2063;SC=ATCCTGGCTTCCCCAAGCTCA;SOR=0.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=42;TCR=40;TR=82;WE=55536735;WS=55536717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr16	55543073	rs17302903	G	C	2860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=64;NR=31;PP=2388;SC=GCTTCGGCCGGGTTCTACGCC;SOR=1.536;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=64;TCR=31;TR=95;WE=55543081;WS=55543063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr16	55543322	rs2241147	G	T	1702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=49;PP=1416;SC=GTCAGAGGGGGGTCCAGGTAA;SOR=5.058;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=2;TCR=49;TR=51;WE=55543330;WS=55543312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	55562257	rs837549	G	A	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=0;PP=691;SC=TTAATTAACAGAGCTAATTAC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=55562265;WS=55562252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	55562466	rs837550	G	A	6852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=130;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.869;SC=TACCTTCTATGGTATCTCGAA;SOR=0.452;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=220;TCF=89;TCR=131;TR=219;WE=55562474;WS=55562456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,224:1.00:225
chr16	55579899	rs2397722	G	A	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=660;SC=CAATCTATAAGTATTTTCCCC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=55579907;WS=55579889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	55583149	rs2160277	T	A	2089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=2;PP=1610;ReadPosRankSum=1.139;SC=CTTTTTTTTTTAAAAAAAATG;SOR=4.834;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=63;TCF=61;TCR=2;TR=62;WE=55583157;WS=55583139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,68:0.99:69
chr16	55583448	rs9934904	A	T	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=316;SC=GTCAGAGTTGAGAATTTATCT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=55583456;WS=55583438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	55728081	rs28613651	T	G	1825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=47;PP=1518;SC=TGACTCTTGTTGGGTGGCAGA;SOR=3.422;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=7;TCR=47;TR=54;WE=55728089;WS=55728071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	55731835	rs5569	G	A	2558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=16;PP=2010;SC=CTGTCATCACGGGCCTGGCAG;SOR=2.642;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=64;TCR=16;TR=80;WE=55731843;WS=55731825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr16	55731946	rs998424	G	A	3579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=74;PP=2854;SC=AGGTGAGTAGGGGCTGGGCTC;SOR=1.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=32;TCR=75;TR=106;WE=55731954;WS=55731936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr16	55735912	rs2242447	C	T	6784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=118;PP=2965;SC=CCCTGCTGTGCACTGCCCAAG;SOR=0.856;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=215;TCF=96;TCR=119;TR=214;WE=55735920;WS=55735902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr16	55845122	rs200475030	C	A	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.37;MQRankSum=-0.763;QD=5.11;ReadPosRankSum=3.503;SOR=1.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,44:0.57:77
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chr16	55883627	rs181438833	G	T	4158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=87;PP=2965;SC=CTGGCTTCGTGTCTTCAAAGC;SOR=1.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=38;TCR=87;TR=125;WE=55883635;WS=55883617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr16	55886804	rs147727760	C	G	1689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=2;PP=1380;SC=TCTGTGATATCGAGCTGTGAT;SOR=5.549;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=45;TCR=2;TR=47;WE=55886812;WS=55886794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
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chr16	56226638	rs149880726	G	GCA	281.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.897;NF=1;NR=9;PP=437;ReadPosRankSum=-1.170;SC=TTTAATTCGTGCACACACACA;SOR=1.061;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=10;WE=56226646;WS=56226628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr16	56227965	rs59779556	T	G	4309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=44;PP=2965;SC=AAATCTTGGATGTGTAACAGG;SOR=1.680;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=89;TCR=44;TR=133;WE=56227973;WS=56227955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr16	56228066	rs1190761	A	G	5386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=92;PP=2965;SC=TCTTATTTTTATTCGAGAGCT;SOR=0.882;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=72;TCR=92;TR=164;WE=56228074;WS=56228056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr16	56362725	rs2241952	T	C	3989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=110;PP=2956;SC=AGCGGGCGCATGGCCTGGAGC;SOR=2.544;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=30;TCR=110;TR=140;WE=56362733;WS=56362715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr16	56368689	rs1065375	C	T	5356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=83;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.662;SC=ACCAGCCCACCGAGCAGGACA;SOR=0.253;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=164;TCF=80;TCR=84;TR=163;WE=56368697;WS=56368679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,166:0.99:167
chr16	56377607	.	G	A	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.912;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=232;ReadPosRankSum=-0.620;SC=AGGCCAGGCTGGGGTCGTCCA;SOR=0.507;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=12;WE=56377615;WS=56377597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr16	56377748	rs1799917	A	G	6249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=81;PP=2965;ReadPosRankSum=0.134;SC=CAGCCCACAAAGAGATCTACA;SOR=0.653;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=201;TCF=119;TCR=82;TR=198;WE=56377756;WS=56377738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,198:0.99:201
chr16	56396486	rs4924	C	T	8990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=148;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.795;SC=GTGGGACGTACGCATGAGGCA;SOR=0.314;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=271;TCF=122;TCR=149;TR=270;WE=56396494;WS=56396476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,277:1.00:278
chr16	56401294	rs2241957	T	C	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=684;SC=AAGACCACTGTCGGGACCACA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=56401302;WS=56401284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	56423368	.	C	T	1339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=37;PP=1098;SC=CCCAGAAGTACTCTGGATATA;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=38;WE=56423376;WS=56423358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	56436824	rs2440472	A	G	3963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=13;PP=2965;SC=ACATTCTGACATACTCTGGGA;SOR=4.391;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=125;TCR=13;TR=138;WE=56436832;WS=56436814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr16	56441862	rs2920704	A	G	4677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=62;PP=2965;SC=CAAGTCCTGCATCCAGTATCT;SOR=1.273;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=101;TCR=62;TR=162;WE=56441870;WS=56441852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr16	56442066	rs4238787	C	T	1673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=50;PP=1528;SC=CATTCTTCTTCATGGAAGTGT;SOR=5.630;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=52;TCF=2;TCR=50;TR=52;WE=56442074;WS=56442056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	56468561	rs8056687	C	T	1292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=9;PP=1084;SC=AGTTTTACAACAAACCCAAAA;SOR=2.191;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=39;WE=56468569;WS=56468551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	56501806	rs2288055	C	T	1699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=1317;ReadPosRankSum=-0.751;SC=CATCTGCTGCCTCTTCGTAAG;SOR=0.588;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=48;TCF=33;TCR=15;TR=47;WE=56501814;WS=56501796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr16	56545175	rs11373	T	C	9171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=154;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.733;SC=CCCAGCACAATTGCATTTGCC;SOR=0.375;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=266;TCF=111;TCR=155;TR=264;WE=56545183;WS=56545165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,280:1.00:281
chr16	56548501	rs4784677	C	T	6228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=138;PP=2965;SC=CTGGTTAATGCTGAGAAGAGA;SOR=2.407;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=182;TCF=44;TCR=138;TR=182;WE=56548509;WS=56548491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr16	56601720	rs666636	A	G	4934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.06;SOR=1.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr16	56601720	.	ATT	GTC	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=26;NR=61;PP=2947;QD=20;SC=TGTAAAACATATTGGAAGAGT;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=28;TCR=67;TR=87;WE=56601730;WS=56601710;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,87:0.92:95
chr16	56601722	rs666647	T	C	4934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.00;SOR=1.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr16	56666886	rs1827208	C	T	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=9;PP=280;SC=GGCAGTCCCGCTCCACATCAC;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=56666894;WS=56666876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	56667282	rs1827210	C	A	3569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=74;PP=2965;SC=GGCTCCTGCACGTGCAAAGAG;SOR=2.170;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=28;TCR=74;TR=102;WE=56667290;WS=56667272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr16	56667614	rs2270836	C	T	2118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=31;PP=1756;SC=TGGGGCAGGGCGGTGCCCGGT;SOR=0.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=35;TCR=31;TR=65;WE=56667622;WS=56667604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr16	56667854	rs2270837	A	G	3416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=88;PP=2658;SC=TTCTTTTTATATTAAATATGT;SOR=3.432;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=16;TCR=88;TR=104;WE=56667862;WS=56667844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr16	56673227	rs11640851	C	A	6450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=118;NR=29;PP=2965;SC=TGCAAATGCACCTCCTGCAAG;SOR=2.849;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=118;TCR=29;TR=147;WE=56673235;WS=56673217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr16	56673249	rs11647171	T	C	7737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=140;NR=44;PP=2965;SC=AGAGTGAGTGTGGGGCCATCT;SOR=2.486;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=140;TCR=44;TR=184;WE=56673257;WS=56673239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr16	56673436	rs58069153	A	AAG	3718.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=72;PP=2965;SC=AACTGAGGCCAAGAGTGCACC;SOR=7.523;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=90;TCF=2;TCR=88;TR=73;WE=56673444;WS=56673426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr16	56686002	rs2070838	G	C	4574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.99;SOR=2.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr16	56686005	rs4619400	T	A	4448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.86;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr16	56686030	rs964372	C	G	2372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=49;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=55;PP=1818;SC=TTTCCTCTTGCCCAAGCTCCT;SOR=2.864;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=13;TCR=55;TR=68;WE=56686038;WS=56686020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	56686380	rs2013775	T	C	12345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=411;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.96;MQRankSum=-0.035;NF=282;NR=117;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.898;SC=GGAGCTCTGATGGCTGGCCCT;SOR=0.873;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=400;TCF=283;TCR=117;TR=399;WE=56686388;WS=56686370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,408:1.00:409
chr16	56686471	rs964374	G	T	16213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=522;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=173;NR=334;PP=2965;SC=TGCCTTTTTCGCTTCCTTGCA;SOR=1.532;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=507;TCF=173;TCR=334;TR=507;WE=56686479;WS=56686461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,518:1.00:518
chr16	56693261	rs2291957	G	T	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=488;SC=CAGAGACTGGGGTGGGGGATC;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=56693269;WS=56693251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	56702000	rs904770	T	C	4731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=112;PP=2965;SC=CCAGCGGCTGTTTTTATAGTC;SOR=2.692;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=30;TCR=112;TR=142;WE=56702008;WS=56701990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr16	56704438	rs9934181	G	A	4991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=44;PP=2965;SC=CGCCTGCGCCGGCTCCTGCAA;SOR=1.942;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=107;TCR=44;TR=151;WE=56704446;WS=56704430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr16	56709728	rs8046181	GA	CG	3718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=27;PP=2947;SC=CTGTGCGGGGGAGGGAGAATG;SOR=1.473;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=78;TCF=49;TCR=29;TR=73;WE=56709737;WS=56709718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr16	56718015	rs34700091	AT	A	265.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=18.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=-1.307;QD=3.20;ReadPosRankSum=-0.200;SOR=3.017;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,32:0.39:83
chr16	56855496	rs2118017	C	G	1447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=35;PP=1182;SC=TCGCAGAGCTCGATGATAAGG;SOR=2.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=45;WE=56855504;WS=56855486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	56875476	.	G	A	1019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=1;PP=807;SC=AGCTCCTTTTGGGTGACTGTG;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=56875484;WS=56875466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	56904587	rs1529927	C	G	4041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=68;PP=2965;SC=CGCATCATTGCCGTGGTCTCG;SOR=0.937;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=123;TCF=55;TCR=68;TR=123;WE=56904595;WS=56904577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr16	56913513	rs5801	C	T	7627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=134;PP=2965;SC=TCGGGGCCACCCTCTCCTCTG;SOR=1.037;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=237;TCF=102;TCR=135;TR=236;WE=56913521;WS=56913503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr16	56917953	rs2304483	T	C	2693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=24;PP=2092;SC=CTGGTGCCCTTGGCCCAGGGT;SOR=1.927;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=86;TCF=62;TCR=24;TR=84;WE=56917961;WS=56917943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr16	56919073	rs11076172	G	A	8067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=177;NR=72;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.425;SC=ACGGGTGCCCGGTGCCTAGAG;SOR=0.918;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=250;TCF=178;TCR=72;TR=249;WE=56919081;WS=56919063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,257:1.00:258
chr16	56921829	rs13306676	C	T	1385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=6;PP=1139;SC=ACCCCTATCCCCTGGCAGGCC;SOR=3.365;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=42;WE=56921837;WS=56921819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	56926176	rs12443855	G	A	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=30;PP=919;SC=TTCTTGTGACGGTGGTGCCTG;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=56926184;WS=56926166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	56926828	rs2278489	T	C	2348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=69;NR=3;PP=2017;SC=GATGCGCGGCTGCTGGCTCTG;SOR=6.302;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=69;TCR=3;TR=72;WE=56926836;WS=56926818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr16	56928280	rs13306679	G	C	1918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=1;PP=1596;SC=AGAGCACCGTGTGCGACTTGA;SOR=6.666;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=54;TCF=53;TCR=1;TR=54;WE=56928288;WS=56928276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	56933315	rs9922270	T	C	1933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=2;PP=1691;SC=GCATGAGAATTGCTTGAACCT;SOR=5.820;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=57;TCF=55;TCR=2;TR=57;WE=56933323;WS=56933305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	56936272	rs34772420	T	C	2702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=55;NR=30;PP=2218;SC=TCAACCCACTTTCTCGTCCCC;SOR=1.395;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=55;TCR=30;TR=85;WE=56936280;WS=56936262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr16	56938387	rs2289115	C	T	3600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=87;PP=2871;SC=AAGTAGTGCCCGGCTGGTGGG;SOR=3.005;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=19;TCR=87;TR=106;WE=56938395;WS=56938377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr16	56966011	rs37025	G	A	7161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=158;NR=65;PP=2965;SC=CCGCAGAGCCGGGCGCGGGGC;SOR=1.939;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=223;TCF=158;TCR=65;TR=223;WE=56966019;WS=56966001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr16	56966071	rs37024	T	G	7281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=126;NR=114;PP=2965;SC=AGACGTGAACTGTCGTTGCAG;SOR=0.803;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=242;TCF=128;TCR=114;TR=240;WE=56966079;WS=56966061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr16	56968889	rs1820787	G	A	5405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=134;NR=31;PP=2965;SC=CTCCCACAGTGCTTGGATTAC;SOR=3.104;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=135;TCR=32;TR=165;WE=56968897;WS=56968879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr16	56969148	rs2217332	G	A	9212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.160;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=146;NR=137;PP=2965;ReadPosRankSum=0.193;SC=CATGATCAGCGTCCAGAGGAC;SOR=0.343;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=284;TCF=146;TCR=138;TR=283;WE=56969156;WS=56969138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,295:1.00:296
chr16	56973335	rs2133783	A	G	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=38;PP=1079;SC=AATTTTATCCATGTTACCTGT;SOR=5.186;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=40;WE=56973343;WS=56973325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	57003723	rs891141	G	T	3200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=21;PP=2706;SC=GTTTGCAGGGGTGGGGACCCC;SOR=2.526;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=77;TCR=21;TR=98;WE=57003731;WS=57003713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr16	57003977	rs891142	T	C	8978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.67;SOR=2.868;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr16	57003980	rs891143	T	C	8891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.14;SOR=2.942;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr16	57007451	rs289714	G	A	1740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=46;PP=1461;SC=GCTGCTAGGGGATCCAGATGG;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=5;TCR=46;TR=51;WE=57007459;WS=57007441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	57015463	rs7195984	G	A	3209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=80;NR=14;PP=2564;SC=CTATGAGACAGAAGCACTGGC;SOR=3.352;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=80;TCR=14;TR=94;WE=57015471;WS=57015453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr16	57016092	rs5882	G	A	3020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=50;PP=2279;SC=CTCCGAGTCCGTCCAGAGCTT;SOR=0.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=44;TCR=50;TR=94;WE=57016100;WS=57016082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr16	57017474	rs289741	G	A	3024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=57;PP=2551;SC=AGCCCAGCTCGCCCCTCTCTC;SOR=1.265;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=34;TCR=57;TR=91;WE=57017482;WS=57017464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr16	57017762	rs289742	C	G	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=20;PP=554;SC=CCAAGAGCTGCGGAGTCCTTC;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=57017770;WS=57017752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	57057619	rs1684575	G	T	4813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=83;NR=66;PP=2965;SC=GTGGACTGGAGTTCCCCAAAG;SOR=0.948;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=83;TCR=66;TR=149;WE=57057627;WS=57057609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr16	57057654	rs1672865	A	G	5405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=90;PP=2965;SC=CTCAGCCCAGATCCCCAGACC;SOR=0.799;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=170;TCF=80;TCR=90;TR=170;WE=57057662;WS=57057644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr16	57062177	rs1684576	T	A	3728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.07;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr16	57063760	.	G	A	17158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=0.000;DP=556;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=320;NR=216;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.261;SC=CACGGCTCCGGAAGCTTGAGT;SOR=0.420;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=538;TCF=322;TCR=216;TR=536;WE=57063768;WS=57063750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,553:1.00:554
chr16	57070004	rs11409789	C	CT	2790.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=38;PP=2554;SC=TTGGGCCCCCCGTCTCAGCCT;SOR=1.042;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=57;WE=57070012;WS=57069994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr16	57070165	rs1651668	T	C	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=392;SC=CCCGTGTTCGTAATCAGCAGT;SOR=3.258;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=57070173;WS=57070155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	57071113	rs1684579	TA	CG	5044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=15;PP=2947;SC=ACAGCCTCAGTAACAACGGGC;SOR=2.728;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=105;TCF=84;TCR=21;TR=93;WE=57071122;WS=57071103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr16	57071232	rs1684580	C	G	6851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=112;PP=2965;SC=CCCATCCCCCCCCCCATCATG;SOR=0.753;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=231;TCF=119;TCR=112;TR=231;WE=57071240;WS=57071222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr16	57071335	rs1651670	G	A	3355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=87;PP=2686;SC=CGTTACAGCCGGCACCCCTCT;SOR=5.200;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=92;TCF=5;TCR=87;TR=92;WE=57071343;WS=57071325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr16	57071375	rs1672866	T	C	1418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=50;PP=1164;SC=AGGCTGCTCATGGTTTATACC;SOR=7.903;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=50;WE=57071383;WS=57071365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	57073683	rs864750	G	C	6803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=114;NR=86;PP=2965;SC=CCCCTCTTTTGTCTTCACAGC;SOR=1.011;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=114;TCR=86;TR=200;WE=57073691;WS=57073673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr16	57074451	rs289726	T	C	4175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=41;PP=2965;SC=CAAGGTCTGATTGACTCTAGG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=88;TCR=41;TR=129;WE=57074459;WS=57074441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr16	57075379	rs35622257	G	GT	2574.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=15;PP=2894;SC=GCAGCACTGTGTTTTTGTCCC;SOR=2.861;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=82;TCF=63;TCR=19;TR=75;WE=57075387;WS=57075369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	57075781	rs289727	C	T	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=3;PP=617;SC=GGCCTGGCAGCCCAGGGCTGT;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=57075789;WS=57075771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	57076115	rs158482	T	G	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=22;PP=627;SC=CAATGTAAGTTCTCGGTGAAG;SOR=4.255;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=57076123;WS=57076105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	57080528	rs289723	C	A	4557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=85;PP=2965;SC=AGGGTTCCGTCAGCGCTGCAT;SOR=1.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=61;TCR=85;TR=146;WE=57080536;WS=57080518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr16	57103579	rs289710	G	A	2601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=15;PP=2092;SC=TCCAAGCTCTGTGGTGGCTTA;SOR=2.920;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=64;TCR=15;TR=79;WE=57103587;WS=57103569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr16	57103854	rs289711	T	C	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=413;SC=GTGGAGGGATTGGGGACAAGT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=57103862;WS=57103844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	57111825	rs27392	T	C	6665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=102;PP=2965;SC=GCAGGCCCAGTACTCAATGCT;SOR=0.721;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=209;TCF=107;TCR=102;TR=208;WE=57111833;WS=57111815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr16	57113229	rs42221	A	G	3810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.99;NF=16;NR=93;PP=2965;SC=CTGCCTGCCTAGGGGACCAGT;SOR=3.422;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=16;TCR=94;TR=109;WE=57113237;WS=57113219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr16	57114924	rs154045	A	G	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=2;PP=320;SC=CACGACTGGCACCCTGCTTTC;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=57114932;WS=57114914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	57114982	rs154044	C	T	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=9;PP=782;SC=GCTCTCCTGCCGCTGACTTTG;SOR=1.681;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=30;WE=57114990;WS=57114972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr16	57115274	rs154043	T	C	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=9;PP=685;SC=TCAGCCTTCCTGCTGCACCTG;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=26;WE=57115282;WS=57115264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	57116287	rs27195	A	G	2561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=29;PP=2200;SC=ACAGATGGCAAAGATGGGAGG;SOR=1.358;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=51;TCR=29;TR=79;WE=57116295;WS=57116277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr16	57116514	rs27194	T	A	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=353;SC=ACTGGGATAATTGACTCAGGA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=57116522;WS=57116504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	57144920	rs8053682	TG	AC	4147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=81;PP=2947;SC=GGATCCAGGATGTCTGATGGA;SOR=7.679;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=85;TCF=0;TCR=85;TR=81;WE=57144929;WS=57144910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr16	57155457	rs4783976	T	C	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=500;SC=GTGGACATCCTGGGAGGCTCC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=57155465;WS=57155447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	57171233	rs2305693	C	G	5917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=172;PP=2965;SC=CCAGGAAACACGCACGTCCTC;SOR=7.523;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=175;TCF=3;TCR=172;TR=175;WE=57171241;WS=57171223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr16	57197745	rs62037356	G	T	4598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=115;NR=20;PP=2965;SC=TATAAACTCTGGCCTGGTAAT;SOR=3.562;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=137;TCF=117;TCR=20;TR=135;WE=57197753;WS=57197735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr16	57242093	rs148079684	T	TTTTTG	433.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=336;SC=CACCTTTTGTTTTTTGTTTTG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=6;WE=57242101;WS=57242083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	57249981	rs11391063	A	AT	2496.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=16.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQRankSum=-2.623;QD=15.70;ReadPosRankSum=-0.766;SOR=3.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,97:0.61:159
chr16	57250000	rs199854828	A	T	1387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FS=122.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQRankSum=-5.643;QD=5.71;ReadPosRankSum=-1.082;SOR=7.692;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:166,77:0.32:243
chr16	57250002	rs201071702	C	T	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FS=118.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.08;MQRankSum=-5.841;QD=5.52;ReadPosRankSum=-2.631;SOR=7.620;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:171,74:0.30:245
chr16	57250007	.	G	T	1155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.338;ClippingRankSum=0.000;DP=258;ExcessHet=3.0103;FS=110.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=-5.906;QD=4.60;ReadPosRankSum=-4.263;SOR=7.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:189,62:0.25:251
chr16	57255363	rs7206038	T	C	2540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=65;PP=1883;SC=ATGGGAGCAGTGGCAGTTTGC;SOR=2.276;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=21;TCR=65;TR=86;WE=57255371;WS=57255353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr16	57261146	rs11643790	A	C	1963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=3;PP=1645;SC=CATCATCCAGAAAGCTTAGAA;SOR=5.318;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=56;TCR=3;TR=59;WE=57261154;WS=57261136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr16	57392733	rs4359426	A	C	2052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=43;PP=1633;SC=CAGAGCATGGATCGCCTACAG;SOR=1.263;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=68;WE=57392741;WS=57392723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr16	57481305	rs178602	T	C	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=31;NR=12;PP=1003;SC=CTCCACGCCTTGCGCCTCTCG;SOR=1.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=31;TCR=12;TR=43;WE=57481313;WS=57481295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	57486613	rs686402	C	T	219.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=149;SC=AATGTCTTCCCAGCATGTGCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=57486621;WS=57486603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	57494178	rs223868	T	C	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=45;PP=1423;SC=TCCAAAAACCTCACTTCTTTA;SOR=3.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=6;TCR=45;TR=51;WE=57494186;WS=57494168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	57495026	rs223870	T	C	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=4;PP=617;SC=TGAGATGCTGTTCCTGGGAGC;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=57495034;WS=57495016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	57496494	rs178601	A	G	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=4;PP=430;SC=GACGCTCGGCAGTTCTGGCCT;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=57496502;WS=57496484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	57499841	rs223839	A	G	1479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=20;PP=1136;SC=GCTAAACTCCATGTCTGCTTC;SOR=1.094;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=28;TCR=20;TR=48;WE=57499849;WS=57499831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	57499902	rs4937	T	C	2151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=21;PP=1775;SC=ATTCCTCAGTTCTTCATGATG;SOR=1.539;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=41;TCR=21;TR=62;WE=57499910;WS=57499892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	57503213	rs601194	C	T	7780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=144;NR=100;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.669;SC=CCGGTCAGTGCGGGAGAGCAT;SOR=0.394;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=245;TCF=145;TCR=100;TR=244;WE=57503221;WS=57503203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,256:1.00:257
chr16	57503773	rs223874	G	A	5637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=154;PP=2965;SC=GCTTTAGACCGTTTTTCCAGA;SOR=4.867;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=13;TCR=154;TR=167;WE=57503781;WS=57503763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr16	57507777	rs11458669	T	TC	767.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=13;NR=11;PP=782;SC=CGTTCCCCCCTCCCCCCGTAC;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=24;WE=57507785;WS=57507767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	57508960	rs477025	T	C	4697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.62;SOR=1.318;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr16	57509164	rs223877	A	G	1618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=40;PP=1264;SC=ATGCAGCTCCAGAGCCCGGTA;SOR=3.215;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=49;WE=57509172;WS=57509154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	57509605	.	T	TCTCC	301.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.89;QD=37.72;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	57509956	rs2074545	G	C	1349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=43;PP=1023;SC=GCCTGCCACAGGGGGCGGTGC;SOR=4.450;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=3;TCR=43;TR=46;WE=57509964;WS=57509946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	57562804	rs12935069	G	A	4345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=63;PP=2965;SC=TCCGACCACCGGCGCATGGTC;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=76;TCR=63;TR=139;WE=57562812;WS=57562794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr16	57600688	.	T	C	1452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=34;PP=1084;SC=TGAGTGGGGCTCAGAGCTACA;SOR=2.985;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=42;WE=57600696;WS=57600678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	57625470	rs11646739	C	T	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=1;PP=963;SC=TGATCATTCCCATAGCAACCA;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=34;WE=57625478;WS=57625460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	57687314	rs2305307	T	C	2345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=66;PP=1744;SC=CTGGGCAGGGTGGGACCTGGA;SOR=3.030;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=15;TCR=66;TR=81;WE=57687322;WS=57687304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr16	57689230	rs34289485	GGT	G	821.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=934;SC=GGAACGGATGGGTGTGTGTGT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=19;WE=57689239;WS=57689220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	57689385	rs1801257	C	G	3417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=40;PP=2785;SC=AAGGCCGGAGCGGGGAGGCTG;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=60;TCR=40;TR=100;WE=57689393;WS=57689375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr16	57689805	rs1801255	A	C	3251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.165;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=56;PP=2358;ReadPosRankSum=-0.859;SC=ATTCCAGCCAAGTCCTGGGTG;SOR=0.365;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=53;TCR=56;TR=108;WE=57689813;WS=57689795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,113:0.99:114
chr16	57689883	rs1376041	T	C	2562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=52;PP=2163;SC=TGGTGCTCACTTTCCAGCACC;SOR=1.468;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=28;TCR=52;TR=80;WE=57689891;WS=57689873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr16	57690606	rs11866912	C	A	3875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=102;PP=2965;SC=TTCATATATTCAGTCATTTAT;SOR=5.192;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=6;TCR=102;TR=108;WE=57690614;WS=57690596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr16	57691265	rs2305309	C	A	3278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=43;PP=2503;SC=GGCCAGCTCTCTCCTGTCTCC;SOR=1.098;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=61;TCR=43;TR=104;WE=57691273;WS=57691255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr16	57693247	rs60907901	G	A	2716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=12;PP=2218;SC=AGTCTGGGAAGGCTTCCTGGA;SOR=3.560;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=74;TCR=12;TR=86;WE=57693255;WS=57693237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr16	57713250	rs4238795	C	T	5673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=151;PP=2965;SC=GGCCTGGCAGCCACTGCAGGG;SOR=3.925;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=21;TCR=152;TR=172;WE=57713258;WS=57713240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr16	57713536	rs4784006	G	A	5046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=149;NR=1;PP=2965;SC=ACAGTCGCACGCTTCACACGC;SOR=7.838;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=151;TCF=150;TCR=1;TR=150;WE=57713544;WS=57713526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr16	57722328	rs12444859	C	T	3203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=44;PP=2409;SC=CAGTCTCCTCCTCTACTGCAA;SOR=0.967;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=57;TCR=44;TR=101;WE=57722336;WS=57722318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr16	57722576	rs11648336	T	A	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=16;PP=499;SC=TAAGCAGGTTTGCAAGGCTCT;SOR=5.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=57722584;WS=57722566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	57778488	rs2967152	A	G	4217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=93;PP=2965;SC=CTGCAGTTGTACTGCTTCCTC;SOR=2.416;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=30;TCR=93;TR=123;WE=57778496;WS=57778478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr16	57778550	rs2967153	C	G	1980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=54;PP=1592;SC=AGCACTAACCCGGCAGTGTGG;SOR=4.875;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=3;TCR=54;TR=57;WE=57778558;WS=57778540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	57786517	rs2965797	C	T	5339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=131;PP=2965;SC=CCGTCAGGTACGCAGGCTGTG;SOR=3.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=159;TCF=28;TCR=131;TR=158;WE=57786525;WS=57786507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr16	57786711	rs2965798	C	T	2457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=17;PP=1991;SC=TCAACCCAGACGGCTGCTGCC;SOR=2.455;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=60;TCR=17;TR=77;WE=57786719;WS=57786701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr16	57792993	rs117994346	G	A	5104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=126;NR=24;PP=2965;SC=AACCCACTGCGGGCAGGCAGG;SOR=3.442;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=126;TCR=24;TR=150;WE=57793001;WS=57792983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr16	57794888	rs2965799	A	T	7644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=118;NR=118;PP=2965;SC=GGCACCCACCAGATCAGGCCT;SOR=0.736;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=237;TCF=118;TCR=119;TR=236;WE=57794896;WS=57794878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr16	57795394	rs2967172	G	A	10703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=130;NR=206;PP=2965;SC=GCCCACTGCCGTCTGGGCACA;SOR=1.302;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=336;TCF=130;TCR=206;TR=336;WE=57795402;WS=57795384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,346:1.00:346
chr16	57797913	rs11649013	C	T	6725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=176;NR=23;PP=2965;SC=AGGGCTAACACAGATAACTAC;SOR=3.778;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=200;TCF=177;TCR=23;TR=199;WE=57797921;WS=57797903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr16	57800979	rs141232911	A	C	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=32;PP=883;SC=AGGGGTGCTCACTGCCTCCTG;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=57800987;WS=57800969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr16	57803911	rs3803590	A	G	3355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=77;PP=2583;ReadPosRankSum=-0.881;SC=GGTGCGGGAGAGAGAGGGGCA;SOR=1.232;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=99;TCF=20;TCR=79;TR=97;WE=57803919;WS=57803901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,105:0.99:106
chr16	57805048	rs2967166	A	G	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=4;PP=516;SC=CTTATGGGCTAGCCCTGCCCC;SOR=2.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=19;WE=57805056;WS=57805038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	57805078	rs2965790	C	T	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=6;PP=727;SC=GGGCCTTGGGCTGAGGCACAG;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=28;WE=57805086;WS=57805068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	57805176	rs2967165	A	G	3556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=19;PP=2903;SC=GGCGCCGACTAAGCCGCTCCT;SOR=2.768;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=103;TCF=84;TCR=19;TR=102;WE=57805184;WS=57805166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr16	57806030	rs2965789	A	G	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=1;PP=548;SC=AGGGTGGGATATGCGGGCTCA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=57806038;WS=57806020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	57808992	rs56302643	C	T	1893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=50;PP=1648;SC=GGGATACCCACCAGCCACCTG;SOR=2.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=11;TCR=50;TR=61;WE=57809000;WS=57808982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr16	57822653	rs58082302	G	A	6926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.784;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.078;NF=43;NR=169;PP=2965;ReadPosRankSum=0.030;SC=GAATCCTCACGTGAAGGAGAC;SOR=1.878;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=216;TCF=44;TCR=172;TR=212;WE=57822661;WS=57822643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,220:0.99:223
chr16	57829206	.	C	T	983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=26;PP=776;SC=ACCCAAAAAACGCCTGCCCTG;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=57829214;WS=57829196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	57931205	.	CA	C	127.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.58;MQRankSum=0.126;QD=12.77;ReadPosRankSum=-1.645;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr16	57937788	rs2303785	T	C	2642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=36;PP=2054;SC=CTGCACGGACTTGGGGATCTT;SOR=0.742;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=42;TCR=36;TR=77;WE=57937796;WS=57937778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr16	57937856	rs413562	G	T	2402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=44;PP=1881;SC=AGGTCTGTCCGGCGGTGGCGG;SOR=1.194;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=28;TCR=44;TR=72;WE=57937864;WS=57937846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr16	57937895	rs437920	G	A	1737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=40;PP=1393;SC=TCTGGGGGAAGGGTTATGGGA;SOR=2.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=50;WE=57937903;WS=57937885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	57984483	rs152143	G	A	1601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=43;PP=1285;SC=TGGGATGTGCGGGAGAGTGGG;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=43;WE=57984491;WS=57984473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	57991317	rs503686	C	T	1746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=42;PP=1534;SC=AATCCTGCCACGGCCTCTTCA;SOR=2.437;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=54;WE=57991325;WS=57991307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	57994724	rs2288485	C	T	5411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=99;NR=70;PP=2965;SC=AACTCCCTGCCTCTCCCTTCC;SOR=1.057;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=171;TCF=99;TCR=72;TR=169;WE=57994744;WS=57994714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr16	57996960	rs13336595	C	T	5147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=99;PP=2965;SC=CAGTACCCTGCGGCTGGGACT;SOR=1.075;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=69;TCR=99;TR=168;WE=57996968;WS=57996950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr16	57998345	rs3859043	C	T	1238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=9;PP=990;SC=GGGGAGAATGCGGGCCCCCCT;SOR=2.476;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=41;WE=57998353;WS=57998335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	58001086	rs61997250	C	T	7866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=135;NR=107;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.580;SC=GTTCCACCTCCGCCTCCATCT;SOR=0.928;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=245;TCF=136;TCR=109;TR=242;WE=58001094;WS=58001076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,253:0.99:255
chr16	58296542	rs9923694	T	C	2182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.80;SOR=7.903;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	58296545	rs3815802	G	A	2050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.61;SOR=7.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	58313566	rs6499945	T	G	2192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=7;PP=1353;SC=TTATCATTTTTTTTCTTTTTT;SOR=3.300;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=51;WE=58313587;WS=58313556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	58313578	rs71155257	CT	C	2139.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.18;QD=36.89;SOR=2.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr16	58318604	rs3815803	T	C	3510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=60;PP=2567;SC=CTCAGGACACTCATCGTCATG;SOR=0.960;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=47;TCR=61;TR=107;WE=58318612;WS=58318594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr16	58318721	rs11313996	AT	A	307.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=211;SC=GAGAGTGAGAATTTTTTTTTT;SOR=3.912;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=17;WE=58318730;WS=58318711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	58320211	rs4784916	T	C	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=25;PP=792;SC=AGCTCATATTTCCTGTGTTAA;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=58320219;WS=58320201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	58327646	rs2288012	A	G	4738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=107;NR=36;PP=2965;SC=TGGTGGAAGAATAGAGAAGGC;SOR=2.253;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=144;TCF=107;TCR=37;TR=143;WE=58327654;WS=58327636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr16	58528752	.	G	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.220;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=16.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQRankSum=-5.309;QD=6.12;ReadPosRankSum=-2.041;SOR=3.903;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,18:0.32:57
chr16	58528757	.	G	A	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.771;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=7.295;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.82;MQRankSum=-4.500;QD=3.42;ReadPosRankSum=-2.704;SOR=2.578;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,10:0.16:62
chr16	58533932	rs982697	A	C	1310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=2;PP=1061;SC=AGCAGCCAATATGGGAGCTGG;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=36;WE=58533940;WS=58533922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	58540048	.	GTGTGTGTGTGTGTC	G	2706.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.020;ClippingRankSum=0.000;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.90;MQRankSum=-1.298;QD=30.41;ReadPosRankSum=2.424;SOR=0.898;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:6,83:0.93:89
chr16	58544640	rs12597973	C	G	3248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.49;SOR=4.450;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr16	58545426	rs42945	A	G	3359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=37;PP=2702;SC=GCACCCACTCAGAGAGCAGCG;SOR=1.733;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=82;TCR=37;TR=119;WE=58545434;WS=58545416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr16	58594340	rs71739184	AT	A	445.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.532;NF=2;NR=20;PP=288;ReadPosRankSum=-0.201;SC=AACCGATCTGATTTTTTTTTT;SOR=1.942;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=22;WE=58594348;WS=58594330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,23:0.92:25
chr16	58610257	rs9936144	C	T	1107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=2;PP=1009;SC=CTTGTGGATCCGCCCACCTCA;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=33;WE=58610265;WS=58610247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr16	58614733	rs72790275	C	T	2244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=64;PP=1867;SC=AATGTTTTCACTAGGCTATTG;SOR=8.410;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=0;TCR=64;TR=64;WE=58614741;WS=58614723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr16	58616984	rs17854029	T	C	11238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=181;NR=165;PP=2965;ReadPosRankSum=1.541;SC=CATCTGTTAATCCTGAATGAG;SOR=0.251;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=347;TCF=182;TCR=165;TR=346;WE=58616992;WS=58616974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,358:1.00:359
chr16	58620995	rs12443835	A	G	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=337;SC=ATAAAGAGAAATTAATTTCAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=58621003;WS=58620985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	58622596	rs34716647	TC	T	4373.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=2;PP=2957;SC=CCAGCTACAATCACTTCCGGA;SOR=7.168;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=105;TCF=103;TCR=2;TR=104;WE=58622604;WS=58622586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr16	58743454	rs30842	A	C	4865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=71;PP=2965;SC=GTCAGCCATGACTTTCACTTC;SOR=0.848;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=77;TCR=71;TR=148;WE=58743462;WS=58743444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr16	58750604	rs1058192	G	A	2230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=3;PP=1750;SC=ATTGGCAGAGGCAAACATTAA;SOR=5.549;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=59;TCR=3;TR=61;WE=58750612;WS=58750594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr16	58750869	rs7204324	A	T	2333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=70;PP=2088;SC=GGAAGACTCAACTTATACCCA;SOR=8.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=0;TCR=70;TR=70;WE=58750877;WS=58750859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr16	58752466	rs11076256	C	T	3464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=94;NR=3;PP=2965;SC=AAGTCAAAACCGCAAGTCTTG;SOR=5.933;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=97;TCF=94;TCR=3;TR=97;WE=58752474;WS=58752456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr16	58757668	rs14221	A	C	5010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=105;PP=2965;SC=CGCTAGGCAGAACGTAAGGCT;SOR=1.798;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=45;TCR=105;TR=150;WE=58757676;WS=58757658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr16	58757683	rs257636	A	G	3944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=82;PP=2965;SC=AAGGCTTTCCATTATCATCCC;SOR=1.503;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=43;TCR=82;TR=125;WE=58757691;WS=58757673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr16	58767848	rs12921667	G	A	1255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=0;PP=1080;SC=GGATCCTGAGGATCACTGTGG;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=38;WE=58767856;WS=58767838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	58767916	rs3217426	AGT	A	3794.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.614;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.199;NF=54;NR=25;PP=2987;SC=GTGGCAGAAAAGTGTGTGTGT;SOR=2.005;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=101;TCF=67;TCR=34;TR=79;WE=58767925;WS=58767906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
chr16	61687440	rs72796836	G	T	1813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=2;PP=1493;SC=AGCCACATTGGTTGTATCTAA;SOR=5.211;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=53;TCF=51;TCR=2;TR=52;WE=61687448;WS=61687430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	64982471	rs60503515	AAAGAG	A	2137.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=8;PP=1832;SC=AATGTCTGAGAAAGAGTATTG;SOR=2.400;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=31;WE=64982485;WS=64982461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr16	64982477	rs57831187	T	C	2146.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=9;PP=1036;SC=TGAGAAAGAGTATTGGTCCTA;SOR=2.256;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=37;WE=64982485;WS=64982461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	65005395	rs3785315	T	C	3090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=2;PP=2592;SC=ATTATAAAGATTAGTGAAAAT;SOR=6.869;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=93;TCF=91;TCR=2;TR=93;WE=65005403;WS=65005385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr16	65005462	rs12597529	G	A	6390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=144;NR=51;PP=2965;SC=CTCTGAATGCGTAGGAACCTT;SOR=2.058;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=195;TCF=144;TCR=51;TR=195;WE=65005470;WS=65005452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr16	65016087	rs35213	A	C	3477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=52;PP=2688;SC=TCTTCTACTGAGATCTTGACG;SOR=0.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=55;TCR=52;TR=107;WE=65016095;WS=65016077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr16	65016285	rs35212	C	A	1898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=48;PP=1583;SC=TTTATAGGGACGAGTGAATAT;SOR=3.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=8;TCR=48;TR=56;WE=65016293;WS=65016275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	65022234	rs1130821	C	T	3824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=84;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.809;SC=CTGACACAGACATCTGGTATA;SOR=1.091;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=32;TCR=85;TR=115;WE=65022242;WS=65022224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,120:0.99:121
chr16	65025658	rs35196	T	C	2394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=10;PP=1909;SC=GAAAGCCAAGTCCACCTACTT;SOR=3.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=62;TCR=10;TR=72;WE=65025666;WS=65025648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr16	65025849	rs35194	A	G	3501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=82;PP=2911;SC=CTGGACAGGTAAGCAGGCAAC;SOR=2.663;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=104;TCF=21;TCR=83;TR=103;WE=65025857;WS=65025839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr16	65032846	rs7190608	G	A	1179.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=39;PP=1182;SC=AATCTGCTGCGCACACACACA;SOR=4.351;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=43;WE=65032854;WS=65032836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	65397282	rs3913028	A	G	2149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.87;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	65397291	rs58616603	T	C	2063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.91;SOR=3.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	65839621	rs139083721	CTCT	C	3614.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=64;PP=2978;SC=CTTCCTGCTGCTCTTCTTCTT;SOR=2.252;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=97;TCF=19;TCR=78;TR=79;WE=65839631;WS=65839611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr16	66420885	rs1130844	C	T	5637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=115;PP=2965;SC=AGGACACTGGCGAAAACCTGG;SOR=1.399;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=65;TCR=115;TR=180;WE=66420893;WS=66420875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr16	66424235	rs2304527	T	G	2078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=7;PP=1686;SC=TATGTTAGAATAGCTGAAAGA;SOR=3.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=53;TCR=7;TR=60;WE=66424243;WS=66424225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr16	66432303	rs113303884	GACCACCCC	G	2023.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=1;PP=2983;SC=CTAAACCTCAGACCACCCCAC;SOR=5.421;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=28;WE=66432318;WS=66432293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	66432423	rs1049970	TC	CT	4642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=51;PP=2947;SC=TTCAAATTCATCTTGAATACT;SOR=0.876;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=41;TCR=53;TR=90;WE=66432432;WS=66432413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr16	66434571	rs6499082	G	C	1699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=1;PP=1427;SC=AGCAGCCCAGGGAGCACGCAG;SOR=6.479;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=49;WE=66434579;WS=66434561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	66437131	rs1063438	A	T	1902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=56;PP=1630;SC=GGCCAGTCAGACGCCAGGCAC;SOR=5.318;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=3;TCR=56;TR=59;WE=66437139;WS=66437121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr16	66599791	rs16956732	G	A	1938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=7;PP=1503;ReadPosRankSum=-0.671;SC=CTTTCCAGGTGTTTGCACTTG;SOR=2.617;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=56;TCR=7;TR=62;WE=66599799;WS=66599781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr16	66620897	rs77089801	C	T	1699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=8;PP=1455;SC=TCTCCACCTTCAGGACCTCTT;SOR=3.486;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=52;WE=66620905;WS=66620887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	66646591	rs3743719	C	T	3565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=83;PP=2827;SC=TCCACCCCTGCGCCTCACAGG;SOR=2.221;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=29;TCR=83;TR=112;WE=66646599;WS=66646581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr16	66757487	.	G	GT	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.000;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=10.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.370;QD=1.64;ReadPosRankSum=-0.519;SOR=0.122;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,22:0.22:98
chr16	66757728	rs77481802	GA	G	1506.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=10.546;HP=13;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQ=60.06;MQRankSum=0.227;NF=3;NR=64;PP=750;ReadPosRankSum=0.988;SC=CTTTTGTCCTGAAAAAAAAAA;SOR=3.033;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=102;TCF=5;TCR=97;TR=67;WE=66757738;WS=66757718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:8,77:0.91:85
chr16	66759682	rs2305311	C	A	1957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=9;PP=1583;SC=TCCATCCTTGCAGCACTACTC;SOR=3.334;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=59;WE=66759690;WS=66759672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	66759976	rs2305310	C	T	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=30;PP=849;SC=AACATTCATTCGCTACGATGC;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=30;WE=66759984;WS=66759966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	66762847	rs12599882	T	C	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=0;PP=666;SC=GCAAGCTCTTTGTGACTTCCC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=66762855;WS=66762837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	66776657	rs4407052	G	A	2411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=55;PP=1968;SC=GGAAGATCTTGAAGGTGACAG;SOR=2.432;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=16;TCR=55;TR=71;WE=66776665;WS=66776647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	66789125	rs11075643	A	G	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=318;SC=TGAGATGCAAATAAGTGCTTA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=66789133;WS=66789115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	66792714	rs363156	T	C	3486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=40;PP=2548;SC=ACTGAGTCGTTGTCTTCTACG;SOR=1.198;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=71;TCR=40;TR=110;WE=66792722;WS=66792704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr16	66793226	rs363157	T	C	2826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=80;PP=2155;ReadPosRankSum=1.520;SC=TATGTGTAGATGTCACAAAAT;SOR=1.981;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=14;TCR=81;TR=94;WE=66793234;WS=66793216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr16	66801241	rs201558171	CA	C	153.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQRankSum=1.455;QD=4.05;ReadPosRankSum=-0.953;SOR=0.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr16	66812653	rs363161	T	A	2147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=2;PP=1821;SC=TCCTTCCACCTGTGAGAAACT;SOR=6.123;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=61;TCR=2;TR=63;WE=66812661;WS=66812643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	66812797	rs363162	C	T	10239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=178;NR=121;PP=2965;SC=CCACAGTCTTCGTCACAACCA;SOR=1.126;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=301;TCF=179;TCR=122;TR=299;WE=66812805;WS=66812787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,323:1.00:323
chr16	66842794	rs363169	A	T	1416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=0;PP=1125;SC=CGTTATCTTTAATATCATCAC;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=35;WE=66842802;WS=66842784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	66851224	rs9889170	T	C	1974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=25;PP=1524;SC=ACCATACAACTCCATAAGGAA;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=32;TCR=25;TR=57;WE=66851232;WS=66851214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr16	66861470	rs11372346	C	CA	299.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.9994;FS=5.746;HP=14;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-1.051;NF=9;NR=5;PP=186;ReadPosRankSum=0.924;SC=GACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=0.078;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=14;WE=66861478;WS=66861460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr16	66861966	rs152164	G	A	4820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=82;PP=2965;SC=GCTGTCAAATGTATGGAGGAA;SOR=0.839;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=68;TCR=82;TR=150;WE=66861974;WS=66861956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr16	66885652	rs151460	A	G	4188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=100;PP=2965;SC=CCCCTGACCCAAGCAGCCCGA;SOR=2.548;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=28;TCR=100;TR=128;WE=66885660;WS=66885642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr16	66886450	.	G	GAAGA	991.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.52;QD=41.32;SOR=6.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	66886496	rs375038584	AAAAG	A	1436.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.31;MQRankSum=0.589;QD=25.21;ReadPosRankSum=0.639;SOR=2.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr16	66886505	rs369232559	GAAAAGAA	G	1436.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.31;MQRankSum=0.589;QD=25.21;ReadPosRankSum=0.335;SOR=2.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr16	66886559	rs152168	G	A	4176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=101;NR=29;PP=2965;SC=GAAGTTGCTGGTTTGGTCCCA;SOR=2.470;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=132;TCF=103;TCR=29;TR=130;WE=66886567;WS=66886549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr16	66918097	.	G	A	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.951;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=3.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQRankSum=-2.373;QD=4.11;ReadPosRankSum=0.787;SOR=2.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,22:0.49:45
chr16	66946894	rs150509525	CGT	C	687.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=1.652;QD=5.73;ReadPosRankSum=1.217;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,38:0.32:120
chr16	67179748	.	C	G	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=88;ReadPosRankSum=-0.116;SC=TAGCTCCCCTCTCCCAAGCCT;SOR=0.569;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=7;WE=67179756;WS=67179738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr16	67196674	rs3136635	G	C	1511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=17;PP=1248;SC=TGGAACCCCAGCTAAGGGGTG;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=28;TCR=17;TR=45;WE=67196682;WS=67196664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	67197776	rs5817616	C	CG	910.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=28;PP=808;SC=TGAGAGGGAACGGGGGGGGTG;SOR=2.753;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=33;WE=67197784;WS=67197766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	67221050	rs9924876	A	G	4320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=82;PP=2965;SC=GCCTGGAGATAGGTGGCCTGG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=41;TCR=82;TR=123;WE=67221058;WS=67221040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr16	67233266	rs12923138	A	C	6095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=123;PP=2965;SC=GATTGCCATCAAGATGCGTGA;SOR=1.585;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=187;TCF=64;TCR=123;TR=187;WE=67233274;WS=67233256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr16	67315128	rs78476762	C	T	1839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.98;QD=30.16;SOR=3.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr16	67316600	rs7200919	G	A	9676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=146;NR=152;PP=2965;SC=TGAGCCCCCAGTCCATAGCAG;SOR=0.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=298;TCF=146;TCR=152;TR=298;WE=67316608;WS=67316590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,307:1.00:307
chr16	67324957	rs27860	T	C	2002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=59;PP=1659;SC=AGATGCAGAGTGGGGACTTCT;SOR=3.912;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=9;TCR=59;TR=68;WE=67324965;WS=67324947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr16	67573754	.	C	G	3287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=70;PP=2693;SC=CCCAGCAAGTCAAGTCCATTG;SOR=2.054;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=27;TCR=70;TR=97;WE=67573762;WS=67573744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr16	67670472	.	GTA	G	212.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.371;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=60.98;MQRankSum=1.809;NF=8;NR=0;PP=235;ReadPosRankSum=-2.006;SC=GAAAGAAAGTGTATATATATA;SOR=1.214;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=8;WE=67670481;WS=67670462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr16	67691668	rs6979	A	G	7300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=130;NR=89;PP=2965;SC=CACTCACCTGACAGCTTGGAC;SOR=1.138;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=221;TCF=131;TCR=90;TR=219;WE=67691676;WS=67691658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr16	67861501	rs34693072	T	C	3435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=92;PP=2922;SC=CCCTCATCCATAGGCGAGTCC;SOR=4.680;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=8;TCR=92;TR=100;WE=67861509;WS=67861491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr16	67863451	rs3743733	T	C	2512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=61;PP=2116;SC=TCACAGGGATTCCAGGCCTGA;SOR=2.630;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=16;TCR=61;TR=77;WE=67863459;WS=67863441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr16	67917958	rs34607252	G	A	3210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=38;PP=2476;ReadPosRankSum=-1.354;SC=AGCTTTTTCAGTTCCTGCAGG;SOR=0.685;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=65;TCR=39;TR=101;WE=67917966;WS=67917948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,105:0.97:108
chr16	67991972	rs78818722	C	T	2964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=75;PP=2370;SC=AGGGAGGGGGCGAGTAGAGCA;SOR=3.477;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=91;TCF=16;TCR=75;TR=89;WE=67991980;WS=67991962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr16	68025801	rs255051	G	C	4015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=56;PP=2965;SC=GTAGAAGGTAGGTAAGATGGA;SOR=1.066;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=78;TCR=56;TR=133;WE=68025809;WS=68025791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr16	68057096	rs237831	T	C	2966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=69;PP=2475;SC=ACCGGCCGCGTTAGAGCCATG;SOR=2.610;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=21;TCR=69;TR=90;WE=68057104;WS=68057086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr16	68100461	rs2285912	C	T	3498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=60;PP=2622;SC=TGTGGTCCTCCTCCTCAGCTA;SOR=1.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=38;TCR=60;TR=98;WE=68100469;WS=68100451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr16	68325665	.	GGT	G	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=1.650;QD=3.66;ReadPosRankSum=1.038;SOR=0.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr16	68573945	rs1182968	C	T	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=62;PP=1852;SC=GTGGTGCGATCTTGTGGGAGG;SOR=8.349;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=0;TCR=62;TR=62;WE=68573953;WS=68573935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	68591156	rs1728784	T	A	2119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=7;PP=1672;SC=GGCTCAAGCGTTCTGCCGGCC;SOR=3.442;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=52;TCR=7;TR=59;WE=68591164;WS=68591146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr16	68591230	rs1728785	A	C	4353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=59;PP=2965;SC=GCATTTTATTATTAATACGGC;SOR=0.933;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=74;TCR=59;TR=133;WE=68591238;WS=68591220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr16	68591350	rs1645929	A	G	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=43;PP=1297;SC=GATCTCTAGGATACATAGCTA;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=43;WE=68591358;WS=68591340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	68598007	rs1177648	A	G	15810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=483;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=241;NR=225;PP=2965;SC=CTCTCACTCAAGATGAAAGCA;SOR=0.771;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=466;TCF=241;TCR=225;TR=466;WE=68598015;WS=68597997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,478:1.00:478
chr16	68598744	rs34979386	A	ATTT	461.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=46.17;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	68679770	rs2236393	G	A	280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=206;SC=TCAGTTCCCGGGGAGGCGCAG;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=68679778;WS=68679760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	68710165	rs3118229	T	C	1035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=0;PP=882;SC=AAGCCAAGTCTCCCTTCTGCA;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=68710173;WS=68710155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	68711999	rs1952048	A	G	4853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=112;NR=30;PP=2965;SC=TGTCCCAGCTATTTGCACATC;SOR=2.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=112;TCR=30;TR=142;WE=68712007;WS=68711989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr16	68712217	rs2296410	T	C	2671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=70;PP=2302;SC=CATTGGTGGCTCCAGGGACCC;SOR=4.698;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=6;TCR=70;TR=76;WE=68712225;WS=68712207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	68713730	rs2296409	G	A	4842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=97;NR=52;PP=2965;SC=TGACAGCCACGGATGAGGATG;SOR=1.402;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=98;TCR=52;TR=149;WE=68713738;WS=68713720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr16	68713823	rs2296408	C	A	5259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=111;PP=2965;SC=TCATGTTCACCATTCACCGGA;SOR=1.695;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=50;TCR=112;TR=161;WE=68713831;WS=68713813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr16	68716066	rs1886698	G	A	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=512;SC=TGTATACCCTGAAACCCCGCA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=68716074;WS=68716056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	68716179	rs1886697	T	C	2017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=13;SC=TCTGCTCTGATAGTGCTGTGC;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=47;TCR=13;TR=60;WE=68716187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr16	68718367	rs4783661	T	C	2397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=7;PP=1943;SC=GGCAGCACTGTTGCTAGTGAG;SOR=4.265;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=64;TCR=7;TR=71;WE=68718375;WS=68718357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	68718750	rs2281850	A	G	3208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=73;PP=2710;SC=TGGGCTCAGTAAGCAGCACGT;SOR=3.118;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=14;TCR=73;TR=87;WE=68718758;WS=68718740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr16	68721340	rs2296406	G	A	2432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=4;PP=2099;SC=AGAGCTGGGCGGTAAACAGGA;SOR=5.283;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=69;TCR=4;TR=73;WE=68721348;WS=68721330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	68721470	rs2296405	T	C	6738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=130;NR=97;PP=2965;SC=TTGATGTCAATGACCATGGCC;SOR=0.984;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=227;TCF=130;TCR=97;TR=227;WE=68721478;WS=68721460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr16	68721533	rs1126933	G	C	5366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.94;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=123;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.765;SC=CTGTGCGCCAGGTGCTGAACA;SOR=0.709;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=184;TCF=60;TCR=124;TR=183;WE=68721541;WS=68721523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,189:0.99:190
chr16	68725783	rs2274239	G	A	1876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=48;PP=1584;SC=GACCCTGGAAGGGAGGTTTCA;SOR=3.219;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=9;TCR=48;TR=57;WE=68725791;WS=68725773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	68729112	rs8060790	A	G	3516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=13;PP=2883;SC=GTCTTGGCCCACTGTGTGGTT;SOR=4.209;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=112;TCR=13;TR=125;WE=68729120;WS=68729102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr16	68729785	rs17715450	C	A	8977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=172;NR=113;PP=2965;ReadPosRankSum=0.049;SC=GTACCGTCCTCGGCCAGCCAA;SOR=1.163;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=287;TCF=173;TCR=114;TR=285;WE=68729793;WS=68729775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,296:0.99:298
chr16	68771372	rs3743674	C	T	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=8;NR=7;PP=263;SC=TGCAGGTACCCCGGATCCCCT;SOR=0.804;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=8;TCR=7;TR=15;WE=68771380;WS=68771362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	68771418	rs147838237	C	CGCCCCAGCCCCGT	571.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=5;PP=1849;SC=GCAAGCTCCGCGCCCCAGCCC;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=68771426;WS=68771408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	68771547	rs3743675	G	C	82.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.51;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	68857441	rs1801552	T	C	1851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=31;PP=1433;ReadPosRankSum=0.554;SC=AAGGGGCCGCTGGCGTCTGTA;SOR=0.263;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=61;TCF=29;TCR=32;TR=60;WE=68857449;WS=68857431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr16	68893781	rs17690624	C	T	3822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=95;NR=15;PP=2965;SC=TTTTCTTCTTCAAAAGGCTCG;SOR=3.338;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=95;TCR=15;TR=110;WE=68893789;WS=68893771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr16	68893953	rs4597312	T	C	10123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.782;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=201;NR=125;PP=2965;ReadPosRankSum=1.319;SC=CACAAAACTCTGTGGATGTCA;SOR=0.252;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=328;TCF=203;TCR=125;TR=326;WE=68893961;WS=68893943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,334:0.99:336
chr16	68952939	rs3833052	A	AT	1750.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.312;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.255;NF=41;NR=17;PP=754;ReadPosRankSum=1.339;SC=GAGAATTATGATTTTTTTTTT;SOR=2.139;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=75;TCF=52;TCR=23;TR=58;WE=68952947;WS=68952929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,69:0.97:71
chr16	69007846	rs3743677	C	T	2456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=5;PP=1930;SC=AGCATCTCTGCGTTCATCCCA;SOR=4.977;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=72;TCR=5;TR=74;WE=69007854;WS=69007836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr16	69143481	rs2232227	T	G	7902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=108;NR=139;PP=2965;SC=TTCAGAGCCTTTTTGCCTTCC;SOR=0.987;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=249;TCF=108;TCR=141;TR=247;WE=69143489;WS=69143471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr16	69155309	rs118093016	C	A	4744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=69;PP=2965;SC=TCATTTCAAGCCAAATTTTAA;SOR=0.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=78;TCR=69;TR=146;WE=69155317;WS=69155299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr16	69166366	.	G	GC	242.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=9;NR=0;PP=281;SC=AGCCTCCCGTGCCCCCCGCCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=9;WE=69166374;WS=69166356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	69194501	.	C	CT	156.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQRankSum=-1.224;QD=5.80;ReadPosRankSum=-0.708;SOR=0.287;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr16	69201050	rs61185783	C	T	5614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.679;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=118;PP=2965;ReadPosRankSum=0.740;SC=CATCCGGAGGCGCACAGCTCA;SOR=1.703;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=174;TCF=55;TCR=119;TR=172;WE=69201058;WS=69201040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,182:0.99:184
chr16	69221510	rs10650	C	G	3359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=59;PP=2495;SC=AGATCTTCCCCGGGCTGGCTG;SOR=0.838;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=51;TCR=59;TR=110;WE=69221518;WS=69221500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr16	69303943	rs17624424	G	A	2419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=0;PP=2044;SC=ATCAGGTTGGGAAAACAAAAT;SOR=8.554;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=69;TCR=0;TR=69;WE=69303951;WS=69303933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr16	69317807	rs12325242	G	C	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=1;PP=1126;SC=CTGTATTTCAGAGACTATAAT;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=40;WE=69317815;WS=69317797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	69350035	rs3817030	A	C	3631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=57;PP=2721;SC=GAGTCACACGAGGGGTCCTCA;SOR=0.726;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=114;TCF=57;TCR=57;TR=113;WE=69350043;WS=69350025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr16	69350069	rs12708896	C	G	3849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.395;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=55;PP=2965;ReadPosRankSum=1.102;SC=CAGAGGGGAGCGGAGGAGAGG;SOR=0.530;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=121;TCF=64;TCR=57;TR=119;WE=69350077;WS=69350059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,117:0.99:118
chr16	69354682	rs17702834	C	T	3311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=67;PP=2507;SC=GGTGAGTCTTCCCCAGGAGAA;SOR=1.524;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=37;TCR=67;TR=104;WE=69354690;WS=69354672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr16	69354963	rs1127231	A	G	3883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.634;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=41;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.824;SC=GGTTTGAAAAACGAATTTATA;SOR=1.380;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=80;TCR=42;TR=121;WE=69354971;WS=69354953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,124:0.99:125
chr16	69355229	rs72795270	G	T	901.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=44;PP=1307;SC=GGGATGTTCGGTTTTTTTTTT;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=45;WE=69355237;WS=69355219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	69356695	rs11075714	A	G	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=22;PP=641;SC=TCTCCAGGCCAGGCATGGTAG;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=69356703;WS=69356685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	69362777	rs1055401	T	A	1971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=44.81;ReadPosRankSum=-0.818;SOR=6.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr16	69362777	.	TTC	ATA	2165	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=38;NR=0;PP=2165;QD=58.380733549;SC=TTCTGACATCTTCCTCCAGCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=38;WE=69362787;WS=69362767;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,38:0.93:41
chr16	69362779	rs1055399	C	A	1971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=41.08;ReadPosRankSum=-0.919;SOR=6.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr16	69363734	rs2242414	A	G	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=18;NR=0;PP=507;SC=AGCGGGCTCTACCCCACAGGA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=69363742;WS=69363724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	69364443	rs8057004	A	G	113.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=87;SC=CACAGTGGCCAAAGACTCAGC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=69364451;WS=69364433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	69365123	rs9928658	G	T	1495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=43;PP=1190;SC=GGCCGGGGAGGGGGGGGCGGA;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=43;WE=69365131;WS=69365113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	69372927	rs3759979	T	C	2143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=0;PP=1655;SC=ACAGTACCTATCTCGAAGGCT;SOR=8.380;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=58;TCR=0;TR=58;WE=69372935;WS=69372919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	69373414	rs11542583	T	C	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=27;PP=789;SC=GAGCCGCTGCTGTGGCCGTGG;SOR=1.552;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=39;WE=69373422;WS=69373404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	69373894	rs11643686	T	A	7888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=161;NR=88;PP=2965;SC=TCTCCAGTCCTCTTTTTGCCC;SOR=1.366;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=250;TCF=162;TCR=88;TR=249;WE=69373902;WS=69373884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr16	69375658	rs8053850	G	A	2619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=81;PP=2245;SC=CAACACTCTGGCCTCTTCAGG;SOR=7.452;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=82;TCF=1;TCR=81;TR=82;WE=69375666;WS=69375648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr16	69395434	rs251796	A	G	2028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=54;PP=1651;SC=AAACAAATTCACCCTGGATTG;SOR=5.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=3;TCR=54;TR=57;WE=69395442;WS=69395424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr16	69458779	rs1619397	G	A	5775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.315;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=152;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.194;SC=TGGGAGGTGGGAGGCCTCTGA;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=26;TCR=154;TR=177;WE=69458787;WS=69458769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,180:0.98:183
chr16	69492973	rs34120910	A	AT	204.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQRankSum=1.417;QD=9.31;ReadPosRankSum=-0.547;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr16	69599803	rs8048032	A	G	63.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=1;PP=42;SC=GGGGGCCGCCACGGCTCTTCC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=69599811;WS=69599793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	69602279	rs144294785	GTATATATATA	G	305.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.22;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	69704122	rs72523664	C	CTG	4803.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=69;PP=2969;SC=TAATAAATCACTTTTTATTTC;SOR=1.480;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=33;TCR=73;TR=100;WE=69704130;WS=69704112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr16	69704204	rs3217435	CT	C	1772.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=48;PP=1433;SC=AAAATTTAAGCTTTTTTTATA;SOR=2.730;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=58;TCF=6;TCR=52;TR=54;WE=69704212;WS=69704194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	69711311	rs3743673	A	T	1153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=35;PP=1021;SC=TATGAAGATGACTAGCCAACC;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=69711319;WS=69711301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	69727391	.	C	T	8087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.710;ClippingRankSum=0.000;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.553;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=171;PP=2965;ReadPosRankSum=0.351;SC=AGGCACAACCCCCGCAGCAGG;SOR=1.952;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=239;TCF=68;TCR=171;TR=238;WE=69727399;WS=69727381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,254:1.00:255
chr16	69745145	rs1800566	G	A	1369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=37;PP=1190;SC=GTCAGTTGAGGTTCTAAGACT;SOR=3.467;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=44;WE=69745153;WS=69745135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	69752464	rs689452	C	G	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=581;SC=AAAGCACACACGGAAAACCCA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=69752472;WS=69752454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	69873992	rs2291959	T	G	3557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=31;PP=2735;SC=GGGTGCATTCTCTTTAGCCCA;SOR=2.049;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=121;TCF=90;TCR=31;TR=120;WE=69874000;WS=69873982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr16	69876164	rs9940315	A	G	2389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=63;PP=2009;SC=AGTAGTTAAGAAAGCTAATAG;SOR=3.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=9;TCR=63;TR=72;WE=69876172;WS=69876154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	69905668	rs1000640	G	C	6810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=137;NR=69;PP=2965;SC=CCTTTTCACAGTGACTTATGT;SOR=1.534;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=206;TCF=137;TCR=69;TR=206;WE=69905676;WS=69905658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr16	69942608	rs5817677	AG	A	5443.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=76;PP=2966;SC=CCTTTCTAACAGGGGCCTATG;SOR=0.744;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=133;TCF=53;TCR=80;TR=124;WE=69942616;WS=69942598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr16	69959223	rs2270838	G	A	5927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=124;NR=63;PP=2965;SC=CCTGCAAAGCGCTCAAATGTG;SOR=1.547;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=124;TCR=63;TR=187;WE=69959231;WS=69959213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr16	69963355	rs1566452	G	A	6138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=89;NR=98;PP=2965;SC=TGGCAGAGAAGAGACAGGACA;SOR=0.799;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=89;TCR=98;TR=187;WE=69963363;WS=69963345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr16	69965024	rs2270840	A	T	5332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=75;PP=2965;SC=GAGAAATCGCATGAACCCCTG;SOR=0.805;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=83;TCR=75;TR=158;WE=69965032;WS=69965014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr16	69965281	rs8052727	T	G	2402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=6;PP=1947;SC=TCTAGGAAGCTAGTTTTCATT;SOR=4.855;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=76;TCR=6;TR=82;WE=69965289;WS=69965271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	69965592	rs2291961	A	G	3258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=33;PP=2849;SC=CCAGGGCGTGAGTCTTGGTGA;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=62;TCR=33;TR=95;WE=69965600;WS=69965582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr16	69967093	rs2102066	G	A	745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=17;PP=552;SC=CCTCTGCGTCGACGGACTCCT;SOR=1.893;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=24;WE=69967101;WS=69967083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	69967732	rs8047818	G	A	1125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=2;PP=927;SC=AGGTTAGCCCGGGTGCTTGTC;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=31;WE=69967740;WS=69967722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	69967897	rs2270841	T	C	5352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=70;PP=2965;SC=TCCTGTCTCATGAGGTGCTCA;SOR=1.105;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=182;TCF=112;TCR=70;TR=182;WE=69967905;WS=69967887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr16	69970000	rs2270842	T	G	3254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=84;PP=2751;SC=CTGAGCTCTTTTCCAGCCTCT;SOR=3.398;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=15;TCR=84;TR=99;WE=69970008;WS=69969990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr16	69970329	rs1983016	A	G	4419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=102;PP=2965;SC=TCCGGGTCACAGAGGAGAACA;SOR=1.998;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=37;TCR=103;TR=139;WE=69970337;WS=69970319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr16	69973622	rs10712484	GC	G	3780.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=1;PP=2951;SC=GGCCTGACTGGCAGCCCCTGA;SOR=7.722;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=97;TCF=95;TCR=2;TR=93;WE=69973630;WS=69973612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr16	69973655	rs4985461	C	G	5371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=146;NR=9;PP=2965;SC=GTGGTGCAAGCCCTGTGGCCC;SOR=5.421;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=146;TCR=9;TR=155;WE=69973663;WS=69973645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr16	69973825	rs3748389	G	A	8840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=204;PP=2965;SC=AGGAGACCGAGGGCTTTGGAC;SOR=2.536;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=261;TCF=57;TCR=204;TR=261;WE=69973833;WS=69973815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr16	69988373	rs2549097	T	C	1967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=46;PP=1810;SC=GCGGGCTTGGTGTCCTTTGTC;SOR=0.844;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=42;TCR=46;TR=88;WE=69988381;WS=69988363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr16	69988472	rs75776403	C	T	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=37;PP=1163;SC=ACCCACTACACGCAGGTGAGT;SOR=2.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=47;WE=69988480;WS=69988462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	70099535	rs889378	A	G	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.67;QD=21.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	70099593	rs889377	T	C	141.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.92;QD=28.38;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	70170004	rs8045700	C	A	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=3;PP=293;SC=AAGAGGTTTTCTGAAAGGGGA;SOR=2.147;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=13;WE=70170024;WS=70169994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	70170016	rs8045569	A	G	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.37;QD=40.05;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	70176336	.	G	T	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.700;ClippingRankSum=0.000;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=282.945;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQRankSum=3.073;QD=0.21;ReadPosRankSum=0.223;SOR=7.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:147,45:0.23:192
chr16	70177648	rs2303200	G	A	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=40;PP=1279;SC=GCGCTTCTCCGGGAACCATAA;SOR=4.317;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=43;WE=70177656;WS=70177638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	70180088	rs200566106	A	T	4934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.52;QD=33.12;SOR=1.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr16	70219777	.	A	C	280.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.68;QD=31.20;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	70287177	rs4081753	A	G	7496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=137;NR=92;PP=2965;SC=TGACCTGGGGAACTTGACACA;SOR=1.074;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=229;TCF=137;TCR=92;TR=229;WE=70287185;WS=70287167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,232:1.00:232
chr16	70299692	rs72289034	TGCCCATCAGAAAATCCA	T	190.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=2;PP=791;SC=CGGCCCTGTGTGCCCATCAGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=2;WE=70299716;WS=70299682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	70303337	.	G	A	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=1;PP=268;SC=CTACGTGGGAGGCTGAGGCAG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=70303345;WS=70303330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	70323641	.	A	AC	38	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5559;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=38;QD=17.3333333333;SC=ATCGAGTTAGACCCCCCCCCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=3;WE=70323649;WS=70323631;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:15,3:0.17:18
chr16	70359664	rs139391794	A	C	1377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=36;PP=1097;SC=AACCCACCCAATAGTTGAAAT;SOR=4.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=40;WE=70359672;WS=70359654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	70363147	.	G	A	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.233;ClippingRankSum=0.000;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=98.574;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.45;MQRankSum=-7.881;QD=4.04;ReadPosRankSum=-0.732;SOR=7.476;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,41:0.31:134
chr16	70363151	.	G	A	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.164;ClippingRankSum=0.000;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=92.439;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.24;MQRankSum=-8.047;QD=3.10;ReadPosRankSum=-3.327;SOR=7.313;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,47:0.30:157
chr16	70363155	.	G	A	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.513;ClippingRankSum=0.000;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=89.440;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.63;MQRankSum=-8.683;QD=2.81;ReadPosRankSum=-7.893;SOR=7.130;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,47:0.28:170
chr16	70363401	.	C	G	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=66;PP=2036;SC=GGGGACTCCTCAGATTCCCCA;SOR=5.247;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=3;TCR=66;TR=69;WE=70363409;WS=70363391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	70513384	rs11075764	C	G	3044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=37;PP=2392;SC=TAACCAGGGGCTATATCTGTA;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=53;TCR=37;TR=90;WE=70513392;WS=70513374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr16	70515600	rs6416698	T	G	2881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=71;NR=12;PP=2420;SC=GTCCTGGGGGTGGTGGCATGA;SOR=3.339;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=72;TCR=12;TR=83;WE=70515608;WS=70515590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr16	70530359	rs2303793	A	G	2237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=62;PP=1866;ReadPosRankSum=1.724;SC=TGCATAGAGGAATTGACAGTG;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=0;TCR=63;TR=62;WE=70530367;WS=70530349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr16	70531366	rs2303792	C	T	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=561;SC=GGTACACTGGCCCTAGCTCTG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=70531374;WS=70531356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	70531754	rs2303791	T	G	1478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=4;PP=1250;SC=GCAGGACCAATAAATATGACA;SOR=4.664;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=38;TCR=4;TR=42;WE=70531762;WS=70531744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	70546234	rs3762171	G	A	3002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=38;PP=2368;SC=ACCTGGGGCAGATCACCTTCC;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=52;TCR=38;TR=90;WE=70546242;WS=70546224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr16	70548297	rs3931036	G	A	2222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=46;PP=1616;SC=GTAGCGATGAGTATGTGCTGC;SOR=1.852;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=17;TCR=46;TR=63;WE=70548305;WS=70548287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr16	70553382	rs7204583	G	C	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=365;SC=TCCAAGGACTGTTTGAAAACC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=70553390;WS=70553378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	70560361	rs8051506	G	A	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=3;PP=754;SC=CACCACGCCCGGTCACATATG;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=28;WE=70560369;WS=70560351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	70566260	.	C	CAAAAAAAAAA	1812.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.506;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.38;MQRankSum=-0.647;QD=43.17;ReadPosRankSum=1.740;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr16	70566271	rs116505546	G	A	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=2.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=-2.157;QD=20.37;ReadPosRankSum=1.524;SOR=1.711;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,21:0.40:53
chr16	70569215	rs33910368	A	T	4677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=82;PP=2965;SC=TCACAGTTCCAGGAGGGTCAG;SOR=0.974;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=64;TCR=82;TR=146;WE=70569223;WS=70569205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr16	70575852	rs11645437	A	T	1896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=56;PP=1609;SC=AAGCAGTTAGAGGTAGAAGTT;SOR=5.318;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=3;TCR=56;TR=59;WE=70575860;WS=70575842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr16	70601254	rs7197262	G	A	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=6;PP=885;SC=TGGGCAGAGAGGTGAGGCCTG;SOR=2.899;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=70601262;WS=70601244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	70602221	rs12909	C	T	3024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=41;PP=2480;SC=TCCAGACTATCGGACATAGGG;SOR=0.947;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=54;TCR=41;TR=95;WE=70602229;WS=70602211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr16	70603220	rs4985534	T	C	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=271;SC=GTAGCGAGTTTCTTAGAGAGA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=70603228;WS=70603210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr16	70690989	rs8046424	G	C	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=11;PP=700;SC=GCAGGAGGTGGAGACGCTGCT;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=27;WE=70690997;WS=70690979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr16	70693872	rs3214847	C	CT	2685.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.164;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.780;NF=79;NR=24;PP=1599;ReadPosRankSum=-0.051;SC=CTGCTGCAGTCTTTTTTTTTT;SOR=0.571;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=163;TCF=114;TCR=49;TR=103;WE=70693880;WS=70693862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,121:0.85:142
chr16	70714811	.	C	G	107.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.754;ClippingRankSum=0.000;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=115.449;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=0.000;QD=1.18;ReadPosRankSum=-3.735;SOR=6.089;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,20:0.22:91
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chr16	70796535	rs2305690	C	T	5794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=106;PP=2965;SC=CAGGGGTGCCCGTGAGTGCTC;SOR=3.224;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=129;TCF=22;TCR=107;TR=128;WE=70796543;WS=70796525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr16	70816893	rs1875941	C	T	1336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=2;PP=1160;ReadPosRankSum=-0.866;SC=GCAGTGGCAGCAGCAGTGGCA;SOR=4.712;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=42;WE=70816901;WS=70816883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr16	70818557	rs72792880	A	G	1721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=2;PP=1457;SC=CAGGGAGTACATGTAAATTTA;SOR=5.994;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=60;TCF=58;TCR=2;TR=60;WE=70818565;WS=70818547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr16	70818759	rs2271047	A	G	2509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=70;PP=2137;ReadPosRankSum=-0.802;SC=AGGCACAGACAGGGGAGGGAC;SOR=2.807;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=9;TCR=72;TR=79;WE=70818767;WS=70818749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,78:0.99:79
chr16	70891790	rs138762682	G	A	3074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=3.426;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.04;MQRankSum=-0.094;QD=30.75;ReadPosRankSum=0.644;SOR=2.208;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,98:0.98:100
chr16	70935224	rs75445533	A	T	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.08;QD=30.72;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	70954915	rs1798531	G	T	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.01;QD=33.34;SOR=6.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr16	70972595	rs79004160	T	C	3569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.66;QD=31.59;SOR=3.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr16	70972784	rs1615602	A	G	200.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.00;QD=28.69;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	70972795	.	G	T	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.46;QD=24.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	71163693	rs150028416	A	G	1824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.82;MQRankSum=0.491;QD=31.46;ReadPosRankSum=-0.769;SOR=4.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,57:0.98:58
chr16	71212979	rs2158102	T	C	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=799;SC=ATTATTGTTATAGTCACACAT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=71212987;WS=71212969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	71218926	rs3785347	T	A	3244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=87;PP=2655;SC=CCAAAGATTCTTAAGTGGATG;SOR=4.091;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=10;TCR=87;TR=97;WE=71218934;WS=71218916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr16	71219021	rs3785346	C	T	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=538;SC=CCACTAAGTTCCCTTATAAAA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=71219029;WS=71219011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	71220880	rs12927616	T	C	2964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=84;PP=2594;SC=ATACAGGTCATAATTTTTTTT;SOR=8.909;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=84;TCF=0;TCR=84;TR=84;WE=71220888;WS=71220870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr16	71237587	rs1895528	T	C	1681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=10;PP=1474;SC=CAAATTATTCTATTCTTATGA;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=42;TCR=10;TR=52;WE=71237595;WS=71237577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	71237702	rs764600	C	T	1611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=42;PP=1394;SC=GAACAGATAACAGAAAATAGT;SOR=2.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=53;WE=71237710;WS=71237692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr16	71264399	rs3743954	G	C	6308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=158;NR=38;PP=2965;SC=CGAAAAGAGGGGACGCCCCGG;SOR=2.810;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=196;TCF=158;TCR=38;TR=196;WE=71264407;WS=71264389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr16	71264523	rs12449210	T	A	10252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=120;NR=205;PP=2965;SC=AGACCCCGCGTCCAACTCACA;SOR=1.381;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=326;TCF=120;TCR=206;TR=325;WE=71264531;WS=71264513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,336:1.00:336
chr16	71264561	rs3743953	A	G	7649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=170;PP=2965;SC=GGGGCTCCATACCCAGCTTGA;SOR=2.083;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=235;TCF=65;TCR=170;TR=235;WE=71264569;WS=71264551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr16	71318577	rs3803704	T	C	4718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=76;PP=2965;SC=TAGCCAATTATTTCTGGAAAG;SOR=1.016;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=59;TCR=76;TR=135;WE=71318585;WS=71318567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr16	71319539	rs3826247	C	T	7270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=138;PP=2965;SC=TGATTTTCCCCGCTTTATTAG;SOR=1.288;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=222;TCF=84;TCR=138;TR=222;WE=71319547;WS=71319529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr16	71319646	rs3096380	G	A	6314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=118;NR=66;PP=2965;SC=AATGCATTAAGTTCAGTGTGG;SOR=1.362;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=118;TCR=66;TR=184;WE=71319654;WS=71319636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr16	71319900	rs9928675	T	C	2061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=72;PP=1733;SC=CGAAATCTCATGAGCAGCAAA;SOR=8.581;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=0;TCR=72;TR=72;WE=71319908;WS=71319890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	71406024	rs7203012	C	T	2692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=33;PP=2135;SC=CTATTTAGTGCTGAGATTGAT;SOR=1.192;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=51;TCR=33;TR=84;WE=71406032;WS=71406014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr16	71411446	rs12445308	G	T	2141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.95;SOR=6.123;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	71416431	rs12919213	T	C	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=0;PP=586;SC=ATGAGATCACTGTCGAGATAC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=71416439;WS=71416421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	71417763	rs12597011	A	G	4180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=111;NR=11;PP=2965;SC=ACCTCAGAGGAAGCATGAGCA;SOR=4.531;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=123;TCF=111;TCR=12;TR=122;WE=71417771;WS=71417753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr16	71418586	.	ACATG	A	580	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=58.59;NF=8;NR=0;PP=580;QD=75.75;SC=CACACATCACACATGCACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=8;WE=71418597;WS=71418563;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr16	71419595	rs4327058	A	G	1170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=30;PP=945;SC=CCCAGGGCACAGGAGAGGCTT;SOR=4.294;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=33;WE=71419603;WS=71419585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	71466088	rs4620964	A	G	11876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=390;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=130;NR=244;PP=2965;SC=TGATGTAGCCAGAGCCACACG;SOR=1.508;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=374;TCF=130;TCR=244;TR=374;WE=71466096;WS=71466078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,389:1.00:389
chr16	71483931	rs730470	G	A	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=79;SC=TCTCCATAAGGTGGGATAAGT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=71483939;WS=71483921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	71487206	rs2070832	T	C	1734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=29;PP=1347;SC=CCCAGCTCACTTCCTCCCTCC;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=22;TCR=30;TR=50;WE=71487214;WS=71487196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	71509588	rs2288487	G	A	4240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=53;PP=2965;SC=TGCCGAAGTAGGGGTGAATTA;SOR=0.899;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=65;TCR=53;TR=118;WE=71509596;WS=71509578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr16	71509634	rs2288488	G	C	3871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=55;PP=2946;SC=TACACTCATAGGGTTTCTCCC;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=67;TCR=55;TR=122;WE=71509642;WS=71509624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr16	71509685	rs2288489	C	G	5497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=74;PP=2965;SC=CGGAACTACTCGTGAAACTAT;SOR=0.818;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=83;TCR=74;TR=156;WE=71509693;WS=71509675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr16	71509796	rs8050871	C	G	5707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=78;PP=2965;SC=ACTCCTCACACTGATAGGGTC;SOR=0.776;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=87;TCR=78;TR=164;WE=71509804;WS=71509786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr16	71509976	rs147578256	C	T	5321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.597;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=83;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.107;SC=TGAAAGGTTTCCTTGCACAGG;SOR=0.373;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=156;TCF=73;TCR=83;TR=154;WE=71509984;WS=71509966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,162:0.99:164
chr16	71603912	rs172650	C	A	3295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=94;PP=2740;SC=TTAAAAATAGCCCCCTCATTG;SOR=3.403;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=15;TCR=94;TR=109;WE=71603920;WS=71603902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr16	71604469	rs2303226	A	G	2172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=32;PP=1870;SC=TGCCACACACATGCTGCTTGA;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=38;TCR=32;TR=70;WE=71604477;WS=71604459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr16	71606716	rs72797767	A	C	1770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=48;PP=1527;SC=GTAGTAGGAAATGTACTAAGC;SOR=5.590;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=50;WE=71606724;WS=71606706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	71607384	rs2432520	T	G	1509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=19;PP=1316;SC=CAGAAACAAGTAAAAAGGGAT;SOR=0.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=26;TCR=19;TR=45;WE=71607392;WS=71607374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	71660115	rs4788820	G	C	2566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=45;PP=1673;SC=CTCCCGGGCGGGGACACGGAA;SOR=0.714;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=45;TCR=45;TR=90;WE=71660123;WS=71660105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr16	71668800	rs7206470	G	A	2360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=66;PP=1936;SC=GAAGTTTCCAGTGCTGGAAAA;SOR=4.351;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=6;TCR=66;TR=72;WE=71668808;WS=71668790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr16	71678679	rs7204608	G	C	2351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=26;PP=1794;SC=TGCAGTGTCAGGGAATGTGGT;SOR=1.439;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=49;TCR=26;TR=75;WE=71678687;WS=71678669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr16	71682796	rs61733125	T	C	475.85	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=398;ReadPosRankSum=-0.953;SC=GGGGCAGTCATAGTGCTGTGT;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=16;WE=71682804;WS=71682786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr16	71701248	rs1423983	G	A	2017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=52;PP=1592;SC=TAAGGGGGGAGCATACAAACA;SOR=3.477;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=9;TCR=52;TR=61;WE=71701256;WS=71701238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	71703436	rs2032918	T	G	2288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=64;PP=1835;SC=TAGGTGCTCATTGAATGCTGC;SOR=7.112;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=65;TCF=1;TCR=64;TR=65;WE=71703444;WS=71703426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr16	71710428	rs61733123	G	A	7422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=166;NR=70;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.854;SC=CCACAGTGCAGCTGTTCCAAG;SOR=0.839;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=237;TCF=167;TCR=70;TR=236;WE=71710436;WS=71710418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,245:1.00:246
chr16	71712786	rs61733126	A	G	7705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=118;NR=112;PP=2965;SC=GAATTTGACTAAAGTTGTTGA;SOR=0.755;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=230;TCF=118;TCR=112;TR=230;WE=71712794;WS=71712776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr16	71715915	rs11439127	G	GA	685.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.40;ReadPosRankSum=-0.711;SOR=2.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr16	71718366	rs7195059	C	T	2896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=32;PP=2300;SC=CAGAACATCCCATTACTTTTC;SOR=1.440;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=59;TCR=32;TR=91;WE=71718374;WS=71718356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr16	71736702	rs10626314	G	GTATTTT	887.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.78;QD=46.72;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	71748319	rs145529088	T	C	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=477;SC=TCAACATCAGTTCCGGCAGAA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=71748327;WS=71748309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	71757939	rs7201649	C	G	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=2;PP=23;SC=AAGCAGCTGCCGGCGCCGAGT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=71757947;WS=71757929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	71772795	rs904764	G	A	1660.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.76;ReadPosRankSum=-1.748;SOR=3.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,70:0.88:80
chr16	71773190	rs904763	G	T	3605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=74;PP=2950;ReadPosRankSum=-1.200;SC=CAACAAGAAGGGGGGCTGGGA;SOR=0.376;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=37;TCR=76;TR=110;WE=71773198;WS=71773180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,116:0.98:118
chr16	71784000	rs2270829	A	T	1408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=32;PP=1134;SC=CTAGAGTGTTAGAAATAAAGA;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=40;WE=71784008;WS=71783990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	71790166	rs8053186	G	A	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=22;PP=684;SC=CAGATGTGCTGACGTCCTTGC;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=71790174;WS=71790156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	71792190	rs11866559	G	A	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=2;PP=578;SC=CTCCACTGAGGGAAGAGATTT;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=71792198;WS=71792180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	71792397	.	A	G	3074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=54;PP=2362;SC=CACAAAGCACAGTACCTCCAC;SOR=0.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=46;TCR=54;TR=100;WE=71792405;WS=71792387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr16	71799347	rs12149092	A	G	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=2;PP=1165;SC=ACTTAAAGATATTAAATTCAT;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=39;WE=71799355;WS=71799337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	71801958	rs7192956	T	C	2207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=61;PP=1895;SC=AGATCTAAAGTACAAAGTGAG;SOR=6.059;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=2;TCR=61;TR=63;WE=71801966;WS=71801948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr16	71804956	rs9635524	C	G	5802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=63;PP=2965;SC=ACAGCAGAAACGCGACTCCAC;SOR=1.431;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=113;TCR=63;TR=176;WE=71804964;WS=71804946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr16	71805160	rs4788443	G	A	1620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=44;PP=1420;SC=TGCTGCCTATGAAAAAAAAAA;SOR=3.702;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=6;TCR=45;TR=50;WE=71805168;WS=71805150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	71879868	rs4788563	A	C	1625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=1;PP=1312;SC=GGGCGGGACGAGCTTGACGCC;SOR=6.439;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=47;WE=71879876;WS=71879858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	71917058	rs2288029	G	A	4335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=97;PP=2965;SC=CACAGACTTTGGCAAGAAAAA;SOR=2.007;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=36;TCR=97;TR=133;WE=71917066;WS=71917048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr16	71928850	rs11075908	T	C	1607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=45;PP=1349;SC=TACTGAATTATACCACACAGA;SOR=5.464;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=47;WE=71928858;WS=71928840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	71950450	rs1049794	C	T	1987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=14;PP=1539;SC=GTGTGGAGCACATTATCCGGG;SOR=2.231;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=48;TCR=14;TR=62;WE=71950458;WS=71950440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	71955400	rs4788450	T	G	2338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=45;PP=1790;SC=TTTGTAGGTATGACCTTCTTT;SOR=1.079;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=31;TCR=45;TR=76;WE=71955408;WS=71955390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr16	71955426	rs56089063	C	CAT	2978.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=53;PP=2709;SC=ACAAAAAAAACATTCTTTGCA;SOR=2.636;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=61;TCF=5;TCR=56;TR=57;WE=71955434;WS=71955416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr16	71956511	rs148848854	AATGCCC	A	18411.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=489;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.056;NF=133;NR=207;PP=2985;ReadPosRankSum=0.514;SC=GAACGGTGCCAATGCCCATGC;SOR=0.223;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=406;TCF=160;TCR=246;TR=340;WE=71956524;WS=71956501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,434:1.00:435
chr16	71956588	rs77712195	GTATA	G	15281.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.154;NF=52;NR=235;PP=2974;ReadPosRankSum=-0.187;SC=GGACCAGTAAGTATATATAAG;SOR=0.604;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=296;TCF=52;TCR=244;TR=287;WE=71956599;WS=71956578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,345:0.99:347
chr16	71967886	rs147505098	G	A	8584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=162;NR=100;PP=2965;SC=TCCCAGGCTCGGCTCAGTGTC;SOR=1.275;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=263;TCF=163;TCR=100;TR=262;WE=71967894;WS=71967876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr16	71981414	rs149635567	C	CTTTG	4661.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=24;PP=2965;SC=CCAAGATCCTCTTTGTTGTTC;SOR=1.751;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=91;TCF=58;TCR=33;TR=73;WE=71981422;WS=71981404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr16	71981630	rs9934803	T	G	2316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=52;PP=1504;SC=TAATTTCACATTAATTTTTGC;SOR=4.443;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=5;TCR=52;TR=57;WE=71981638;WS=71981620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr16	71981652	rs9934812	T	G	1679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=36;PP=1075;SC=CAATGATGGGTACCAGGAGAA;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=37;WE=71981660;WS=71981642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	71983664	rs1549292	T	G	285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=2;PP=192;SC=CCAATGGTTCTTCCCATCCCT;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=11;WE=71983672;WS=71983654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	71986764	rs11648353	G	A	423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.60;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	71986946	rs7204708	A	G	4441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=51;PP=2965;ReadPosRankSum=1.753;SC=TGACAGCAGTATGGATGCTGA;SOR=1.246;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=134;TCF=82;TCR=52;TR=132;WE=71986954;WS=71986936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,137:0.99:139
chr16	71986995	rs12708919	G	A	4965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=67;NR=94;PP=2965;SC=TGGACGCACTGAAAGAAAAGC;SOR=1.063;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=162;TCF=67;TCR=95;TR=161;WE=71987003;WS=71986985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr16	71987960	rs9888745	A	C	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=4;PP=516;SC=AAAAAAAAAAAGGATTGCTTA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=71987968;WS=71987950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	71988106	rs9921412	C	T	3716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=52;PP=2924;SC=AGCCGTTGGACCCTTGTAAAC;SOR=0.906;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=65;TCR=52;TR=117;WE=71988114;WS=71988096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr16	72001110	rs9928413	G	A	4099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=66;PP=2965;SC=TCCAAGTGGTGAGAAGGAAGA;SOR=0.769;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=62;TCR=66;TR=128;WE=72001118;WS=72001100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr16	72001629	rs12708922	A	G	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=572;SC=CTCCCAAAGTATTGGGATTAC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=72001637;WS=72001622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	72001971	rs9930930	A	G	937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=26;PP=740;SC=TGCCTCCTCCAGCTGAGGAGC;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=72001979;WS=72001961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	72003732	rs28629271	C	T	2411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=10;PP=1991;SC=TTTAATTACTCAAAACATCAT;SOR=3.551;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=61;TCR=10;TR=71;WE=72003740;WS=72003722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	72003952	rs35259348	G	C	3201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=66;PP=2756;SC=GGCAAAGAAGGTCAGGTGGTT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=31;TCR=66;TR=97;WE=72003960;WS=72003942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr16	72011040	rs3929023	A	G	529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=2;PP=439;SC=TGAGCCTGACAGTTTGAGGCT;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=72011048;WS=72011030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	72011181	rs1559401	G	T	3165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=31;PP=2597;SC=TCAGGTGGAAGTGAGTGCAGT;SOR=1.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=68;TCR=31;TR=98;WE=72011201;WS=72011171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr16	72011193	rs1559400	A	C	3054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=32;PP=2398;SC=GAGTGCAGTTAGGCTGATACT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=62;TCR=32;TR=94;WE=72011201;WS=72011171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr16	72011261	rs1559399	A	G	5371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=64;PP=2965;SC=CTCACTATCAAGGATTTCTCC;SOR=1.112;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=93;TCR=64;TR=157;WE=72011269;WS=72011251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr16	72011450	rs1559398	G	A	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=29;PP=813;SC=GTAAGGAAACGTCCTAGCTCT;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=33;WE=72011464;WS=72011440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	72011456	rs139541803	G	GGTCTTC	1300.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=341;SC=AAACGTCCTAGCTCTTTTTTT;SOR=4.479;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=15;WE=72011464;WS=72011440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	72012072	rs8053841	C	T	1131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=3;PP=911;SC=TAACATAATTCCCTTTAAGTT;SOR=4.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=72012080;WS=72012062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	72012368	rs201075633	G	GTA	166.76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=65.18;QD=41.69;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	72012374	.	A	ATATGTGTGTG	1397	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.9994;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MMLQ=28;MQ=65.84;NF=0;NR=34;PP=1397;QD=41.2647058824;SC=ATATGTATATATGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=34;WE=72012382;WS=72012364;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,34:0.94:36
chr16	72012396	rs2113217	A	G	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.25;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	72012398	rs2878405	A	G	108.18	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.86;QD=36.06;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	72012400	rs62053844	A	G	318.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.04;QD=39.85;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	72012402	rs62053845	A	G	317.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.49;QD=39.72;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	72012413	.	TATATATAC	T	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.31;QD=32.75;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr16	72013797	rs7185272	G	C	10459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=187;NR=129;PP=2965;SC=CAGCGGTAAAGTTGATATGTT;SOR=1.070;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=316;TCF=187;TCR=129;TR=316;WE=72013805;WS=72013787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,327:1.00:327
chr16	72018099	rs12443563	C	T	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=45;PP=1348;SC=CAAAATTACTCATACAAAATT;SOR=4.091;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=4;TCR=45;TR=49;WE=72018107;WS=72018089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	72020294	rs4788590	G	A	2074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=45;PP=1698;SC=GTTCAGATGCGGCTGATGTTA;SOR=1.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=20;TCR=45;TR=65;WE=72020302;WS=72020284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr16	72020323	rs4788591	A	G	1708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=41;PP=1432;SC=GTGATACTTGATAGTACTGAA;SOR=2.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=14;TCR=41;TR=55;WE=72020331;WS=72020313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	72027319	rs141893694	TAATC	T	1019.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=1176;SC=ACGTATGTGATAATCAGGAAA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=24;WE=72027330;WS=72027309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	72032231	rs16973585	T	A	2703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=50;PP=2122;SC=GAGATCCGAATGAAGTTTCTG;SOR=1.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=26;TCR=50;TR=76;WE=72032239;WS=72032221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr16	72042682	rs3213422	A	C	2292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=35;PP=1694;SC=GAGACACCTGAAAGTGAGTCC;SOR=0.719;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=36;TCR=35;TR=71;WE=72042690;WS=72042672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr16	72042825	rs3213423	T	G	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=7;PP=204;SC=GTTTCCGGGGTCTCCTGCAAA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=72042833;WS=72042815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	72046268	rs1465457	C	G	1603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=42;PP=1321;SC=CCCAAGTGAGCAGTGGGGATT;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=42;WE=72046276;WS=72046258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	72048332	rs3764310	T	C	1083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=3;PP=851;SC=AATACCGGGATAGCCTTAGCG;SOR=4.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=72048340;WS=72048322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	72048632	rs8062895	A	G	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=33;PP=906;SC=GCGTTCAGAGATATAAGATCT;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=33;WE=72048640;WS=72048622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	72050885	rs11075914	G	C	2334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=5;PP=2026;SC=CTATGGTGCCGTCTCACTCTG;SOR=4.834;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=68;TCR=5;TR=73;WE=72050893;WS=72050875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr16	72139396	rs150617	T	C	2631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=26;PP=2210;SC=ATTTTTCCCTTCCTGTATGTC;SOR=1.639;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=54;TCR=26;TR=80;WE=72139404;WS=72139386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr16	72139537	rs42544	T	C	3625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=79;PP=2762;SC=AGAGAAGACATGGGAGGCAAG;SOR=1.482;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=123;TCF=43;TCR=80;TR=122;WE=72139545;WS=72139527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr16	72820956	.	G	T	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.756;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.57;MQRankSum=-0.773;QD=12.90;ReadPosRankSum=0.120;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr16	72827758	rs699444	T	C	3103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=31;PP=2635;SC=CAGGCCGATCTCCGCTGTCAC;SOR=1.559;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=57;TCR=31;TR=88;WE=72827766;WS=72827748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr16	72832135	rs740178	T	A	1956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=35;PP=1519;SC=TATGGTCCTCTGCCAGAGTGG;SOR=1.071;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=57;WE=72832143;WS=72832125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	72832618	.	TA	T	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=0.978;QD=1.19;ReadPosRankSum=0.110;SOR=0.165;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,10:0.24:41
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chr16	73521307	.	A	AT	341.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.25;QD=24.41;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr16	74425548	rs2868591	A	G	9489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.094;NF=66;NR=186;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.821;SC=CTGAAGGAGTATCTCCTGGTC;SOR=1.070;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=253;TCF=66;TCR=187;TR=252;WE=74425556;WS=74425538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,258:1.00:259
chr16	74425569	rs11641596	C	T	2847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=0.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-0.836;QD=12.27;ReadPosRankSum=-1.334;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,115:0.50:232
chr16	74447514	rs2650549	T	C	1730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.89;QD=33.28;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	74452071	rs372741573	G	A	784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.05;QD=30.18;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	74490789	rs12446054	G	A	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=485;SC=TACATACTAGGAAACTTGATC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=74490797;WS=74490779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	74493752	rs71158515	C	CT	2334.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=1.370;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.75;MQRankSum=-0.441;QD=20.30;ReadPosRankSum=0.795;SOR=1.190;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:11,104:0.90:115
chr16	74503860	rs2303278	T	A	9722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=183;NR=110;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.060;SC=GAAAGTGGAATGAAACAACTA;SOR=1.311;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=296;TCF=184;TCR=112;TR=293;WE=74503868;WS=74503850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,305:0.99:307
chr16	74504005	rs2303279	T	C	5858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=151;PP=2965;SC=TCAGAAGTTTTGTGGCAACTT;SOR=2.256;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=202;TCF=51;TCR=151;TR=202;WE=74504013;WS=74503995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr16	74504097	rs12716764	G	C	2221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=60;PP=1915;ReadPosRankSum=-0.887;SC=TGACCCACACGTGAGACATCA;SOR=4.112;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=3;TCR=61;TR=63;WE=74504105;WS=74504087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr16	74530611	rs34221253	T	TACAC	909.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=0.000;QD=53.51;ReadPosRankSum=-0.919;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr16	74566092	rs202047611	ATAT	A	2199.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.33;QD=41.50;SOR=4.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	74566097	.	T	A	2307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.15;QD=43.54;SOR=4.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	74660174	rs12933037	G	A	1272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=0;PP=1028;ReadPosRankSum=-0.743;SC=AAAAGTTCATGTTTTCCCTTA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=39;WE=74660182;WS=74660164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr16	74664743	rs7193541	T	C	2804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=33;PP=2205;SC=TATACCAGAATTGAACCATTG;SOR=1.141;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=51;TCR=33;TR=84;WE=74664751;WS=74664733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr16	74664810	rs7188880	A	T	3640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=47;PP=2697;SC=AGCTCCAGACAGGACGTCCAG;SOR=0.881;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=57;TCR=47;TR=104;WE=74664818;WS=74664800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr16	74664969	rs7193959	T	A	877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=26;PP=754;SC=ACACTCATACTCCCAAACTAT;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=74664977;WS=74664959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	74666634	rs4072450	G	C	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=32;PP=988;SC=ATTCAAACTAGTTTTTCAAGT;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=74666642;WS=74666624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	74670458	rs4888262	C	T	1295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=33;PP=1099;SC=TTTGATGTGACGTAAGTTTTT;SOR=2.476;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=42;WE=74670466;WS=74670448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	74695079	rs8058922	G	T	4247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=64;PP=2965;SC=GTTCTCCACAGTGTCTTCTCC;SOR=0.787;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=131;TCF=67;TCR=64;TR=131;WE=74695087;WS=74695069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr16	74706298	rs4888274	A	T	4528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=110;NR=26;PP=2965;SC=CACTCCTTGCACCCATAGATA;SOR=2.919;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=137;TCF=111;TCR=26;TR=136;WE=74706306;WS=74706288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr16	74709737	rs7184423	C	A	5427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=128;PP=2965;SC=ATTGTTGCTACACACAATTGC;SOR=2.862;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=29;TCR=128;TR=157;WE=74709745;WS=74709727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr16	74712905	rs6564158	A	T	1460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=36;PP=1068;ReadPosRankSum=-0.876;SC=CGGGGAGCATAAGTACCTTTG;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=46;WE=74712913;WS=74712895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr16	74725282	rs35430251	C	T	4669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=107;PP=2965;SC=GCAGAATCCACGGGGATCCTG;SOR=2.224;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=35;TCR=107;TR=142;WE=74725290;WS=74725272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr16	74908439	rs2870148	C	T	2593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=75;PP=2209;SC=GTCTTCCTCTCAAGACTCTAG;SOR=5.084;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=5;TCR=75;TR=80;WE=74908447;WS=74908429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr16	74920374	rs4888305	C	T	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=294;SC=TAAGACAGCACGTGGCCAATG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=74920382;WS=74920364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	74922015	.	CAAAA	C	132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.170;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=25.605;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQRankSum=1.600;QD=2.04;ReadPosRankSum=0.853;SOR=4.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,14:0.22:65
chr16	74943867	rs113238843	G	GT	383.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.83;MQRankSum=0.000;QD=31.98;ReadPosRankSum=-0.292;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr16	74943890	rs12325318	A	G	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=328;SC=TTTTGAGACAAAGTCTCTCTT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=74943898;WS=74943880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	75034133	rs6564195	A	G	7289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=152;NR=56;PP=2965;SC=GCCAAGGGATAAATGGGATAC;SOR=2.014;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=209;TCF=152;TCR=57;TR=208;WE=75034141;WS=75034123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
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chr16	75148604	rs755099	G	A	4587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=54;PP=2965;SC=GCGTACAGAAGGCAGCCTCAG;SOR=1.267;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=87;TCR=54;TR=141;WE=75148612;WS=75148594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr16	75186727	rs11859007	G	A	5816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=9.720;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=141;NR=35;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.530;SC=GTCTCTAGGGGTTTCTAAACA;SOR=2.800;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=179;TCF=142;TCR=37;TR=176;WE=75186735;WS=75186717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,178:0.98:181
chr16	75200378	rs9929570	T	C	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=4;PP=620;SC=CCCGCCCACCTAGCCTCCCAA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=75200386;WS=75200368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	75200407	rs11865310	G	C	1561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.93;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
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chr16	75202998	rs12716783	A	C	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=1;PP=1368;SC=GTTTGAAAGGAAACATTTGCA;SOR=6.358;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=47;WE=75203006;WS=75202988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr16	75238103	rs4737	C	T	6111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=88;PP=2965;SC=ATGAGCTTGGCGACACGGGCG;SOR=0.875;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=195;TCF=106;TCR=89;TR=194;WE=75238111;WS=75238093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr16	75239882	rs201071994	G	A	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=29.81;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	75263974	rs6564241	T	C	2881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=74;PP=2455;SC=GAGTTGGAACTACAGGCCGAG;SOR=3.180;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=14;TCR=74;TR=88;WE=75263982;WS=75263964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr16	75267676	rs4888361	A	G	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=7;PP=1039;SC=TCGGCCCTGCAGGGCAAGAGC;SOR=3.033;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=46;WE=75267684;WS=75267666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	75269267	rs3169330	A	G	5506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=94;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.019;SC=CACTCTGGACAGCGGCCACAG;SOR=0.255;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=183;TCF=88;TCR=95;TR=182;WE=75269275;WS=75269257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,187:0.99:188
chr16	75276295	rs7195938	A	G	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=3;PP=687;SC=GGGTGGCTGGACCCTTCTGTG;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=75276303;WS=75276285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	75276775	rs1035539	G	A	1307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=13;PP=1082;SC=GGAGGGCCGGGGCCAGGCCCT;SOR=1.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=41;WE=75276783;WS=75276765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	75277344	rs4888363	A	T	5304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=73;PP=2965;SC=ATCACGACAAAGCTGCCAAGT;SOR=1.051;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=176;TCF=103;TCR=73;TR=175;WE=75277352;WS=75277334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr16	75281964	rs1862737	A	C	5568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=113;PP=2965;SC=CCATCTTACTAGACAGGAAAA;SOR=1.346;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=70;TCR=113;TR=183;WE=75281972;WS=75281954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr16	75285164	rs1862738	A	C	906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=28;NR=4;PP=810;SC=CCGCCAACGCACCCGAGGCGC;SOR=3.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=75285172;WS=75285154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	75300708	rs11149811	C	G	3275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=81;PP=2492;SC=GTCCAGAGCACTGTCCCGGAG;SOR=3.347;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=16;TCR=81;TR=97;WE=75300716;WS=75300698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr16	75301605	rs9319482	A	G	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=7;PP=229;SC=TAGGTGCCCCAGCCAGAATGG;SOR=1.270;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=75301613;WS=75301598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	75327916	rs6624	A	G	10893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=247;PP=2965;SC=CCACTCGGTCAAGGAAGGCTT;SOR=1.978;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=344;TCF=96;TCR=248;TR=343;WE=75327924;WS=75327906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,344:1.00:344
chr16	75338855	rs3743607	C	T	4431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=112;NR=17;PP=2965;SC=GGCAGTTTGTCTCCAATAAAT;SOR=3.494;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=112;TCR=17;TR=129;WE=75338863;WS=75338845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr16	75339131	rs7192981	T	G	1800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=48;PP=1507;SC=CTGATCTCTATATTAACAGTT;SOR=5.670;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=50;WE=75339139;WS=75339121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	75445605	rs1109341	G	A	1161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=4;PP=933;SC=TTGAGTTCAAGTATAACTCTC;SOR=3.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=75445613;WS=75445595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	75445675	rs1109342	G	A	2986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=23;PP=2418;SC=AGAGAGAGACGCTCATTTTTG;SOR=2.229;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=71;TCR=23;TR=94;WE=75445683;WS=75445665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr16	75445906	rs247435	C	T	1433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=42;PP=1162;SC=ATATTGTTTACAGATACTTTT;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=42;WE=75445914;WS=75445896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	75448273	rs8056236	C	T	1065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=0;PP=873;SC=TACCTATTAACATTTTCTTTA;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=31;WE=75448281;WS=75448270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	75448659	rs8051407	A	G	1078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=33;PP=915;SC=AGACATTTTCATTAATACAAG;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=75448667;WS=75448649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	75467076	rs3833048	G	GC	458.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=515;SC=GAGAACAGGAGCCCCCCTGGA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=15;WE=75467084;WS=75467066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	75498252	rs150429885	C	CT	3641.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=31;PP=2599;SC=CGGAGGACAGCGCCCACGCCG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=29;TCR=36;TR=57;WE=75498261;WS=75498242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr16	75498253	rs34904236	G	T	3650.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=30;PP=1569;SC=GGAGGACAGCGCCCACGCCGC;SOR=0.718;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=34;TCR=34;TR=61;WE=75498261;WS=75498242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr16	75652407	.	C	CA	234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.297;ClippingRankSum=0.000;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=14.115;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQRankSum=1.017;QD=2.93;ReadPosRankSum=-1.862;SOR=0.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,25:0.31:80
chr16	75654863	.	C	T	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=553;SC=TTTTCTTCTACTATCTCCCTG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=75654871;WS=75654853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	75674252	rs370077957	TA	T	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=1.837;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.49;ReadPosRankSum=0.041;SOR=0.340;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr16	76311602	rs59314262	G	GT	7156.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=88;PP=2957;SC=CGCTACTTCTGTATCTACTCA;SOR=0.735;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=76;TCR=93;TR=161;WE=76311610;WS=76311592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr16	76343767	rs9927750	C	T	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=541;SC=CTCTTGCAGCCGCCATGATTC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=76343775;WS=76343757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	76343812	rs8053810	GG	AA	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=7;PP=1502;SC=CTGTGAGTCCGGTTAAGTCTC;SOR=2.115;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=32;WE=76343821;WS=76343802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	76350438	rs747980	C	T	5230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=110;PP=2965;ReadPosRankSum=1.160;SC=TGCTTTTCTCCTCTGACTGGC;SOR=0.667;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=165;TCF=54;TCR=111;TR=164;WE=76350446;WS=76350428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,166:0.99:167
chr16	76389441	rs2866712	G	A	4165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=85;PP=2965;SC=TAGTCTCTCGGGGAAAAAGTA;SOR=1.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=43;TCR=85;TR=128;WE=76389449;WS=76389431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr16	76461273	rs7192076	A	C	1600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=0;PP=1313;SC=ACACATTGCTAATAGACATTA;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=43;WE=76461281;WS=76461263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	76461519	rs9927638	C	A	3653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=74;PP=2851;SC=TTATCCAATACACTGACATAG;SOR=2.197;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=27;TCR=74;TR=101;WE=76461527;WS=76461509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr16	76461588	rs9938200	A	G	1485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=43;PP=1184;SC=TTTTAGCTACATAAAGAGGTA;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=43;WE=76461596;WS=76461578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	76482605	.	CT	C	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=3.647;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.51;ReadPosRankSum=1.218;SOR=0.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,12:0.16:74
chr16	76495842	rs35994137	C	A	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=1213;ReadPosRankSum=-0.806;SC=TAACTGATTTCATCTCCCTAG;SOR=0.519;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=31;TCR=19;TR=49;WE=76495850;WS=76495832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr16	76496131	rs34782687	C	T	279.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=230;SC=TCTTTGATCACGGACATTTTG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=76496139;WS=76496121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	76501542	rs1002974	A	G	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=30;PP=884;SC=ACAGGAAATGAATTATATTTA;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=76501550;WS=76501532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	76523792	rs7201030	A	G	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=22;PP=657;SC=TAAGTAAACCATGGTGTCTGT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=76523800;WS=76523782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	76532583	rs12933808	A	G	7190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.99;NF=81;NR=142;PP=2965;SC=CTGCTCTGCCAGGGAGACAGT;SOR=1.387;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=224;TCF=81;TCR=143;TR=223;WE=76532591;WS=76532573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr16	76555015	rs11353699	CT	C	3444.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.06;QD=24.43;SOR=5.042;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr16	76569754	rs6564348	A	T	2256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=53;PP=1880;SC=GTTCTTTTCTATGCAGCTATT;SOR=2.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=16;TCR=53;TR=69;WE=76569762;WS=76569744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr16	76587202	rs7202925	T	G	2003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=20;PP=1659;SC=TGGACCAGGATACTGCACTGG;SOR=1.571;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=40;TCR=20;TR=59;WE=76587210;WS=76587192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	76587331	rs7184958	T	C	1205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=29;PP=951;SC=GACACGTGACTGAGTCCAGCT;SOR=1.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=41;WE=76587339;WS=76587321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	76587647	rs4243123	G	C	2614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=5;PP=2255;SC=ATAATTCTCTGTGGTTTAAAA;SOR=4.977;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=71;TCR=5;TR=76;WE=76587655;WS=76587637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr16	76592313	rs7196722	T	G	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=557;ReadPosRankSum=0.000;SC=TTATGATGACTTATTAAGCAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=26;WE=76592321;WS=76592310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr16	76902722	rs34106659	C	G	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=7;PP=1123;SC=GCAATAATATCTGGTACAGAT;SOR=2.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=40;WE=76902730;WS=76902712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	76902847	rs7500280	T	C	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.18;SOR=6.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	76902850	rs7499278	G	A	983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.77;SOR=6.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	77227180	rs2241416	G	A	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=1;PP=1158;ReadPosRankSum=1.276;SC=AGATCATTGCGGGGTCCTAGG;SOR=3.767;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=40;WE=77227188;WS=77227170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr16	77228629	rs2232503	A	G	6159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=93;PP=2965;SC=CCCAGGAGCGAAATGTGCTGG;SOR=0.792;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=183;TCF=90;TCR=93;TR=183;WE=77228637;WS=77228619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr16	77231935	rs2232509	C	T	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=471;SC=CATGCAGCTGCACTGGGGTAG;SOR=4.294;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=77231943;WS=77231925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	77233261	.	ATGCGTGC	A	1484.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=3;PP=1280;SC=GGTTGCACGCATGCGTGCTGA;SOR=3.258;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=20;WE=77233275;WS=77233251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	77233394	rs4888607	A	G	1438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=28;PP=1159;SC=GCCAGAAGCTACTGAGGAGGC;SOR=1.414;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=44;WE=77233402;WS=77233384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	77240217	rs9928151	G	C	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=455;SC=AAACCTGTCTGTCATTCCATC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=77240225;WS=77240207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	77242013	rs117582181	A	C	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=0;PP=382;SC=TATGCCGGTTAATTGATAGCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=77242021;WS=77242003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	77242035	rs9933799	G	A	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=515;SC=CAGACACAGTGCTTCTCCGTC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=77242043;WS=77242025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	77242083	rs9934426	C	G	1374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=5;PP=1122;SC=CTCTGGCTCACTCTTTCTTCC;SOR=3.664;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=40;WE=77242091;WS=77242073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	77242284	rs1424146	G	A	6972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=136;NR=76;PP=2965;SC=GAAGATGACTGTGCAATGTCA;SOR=1.397;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=212;TCF=136;TCR=76;TR=212;WE=77242292;WS=77242274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr16	77242513	rs2343035	C	T	1173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=35;PP=1033;SC=GCACAGGCTGCTCCCTGGCCT;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=36;WE=77242521;WS=77242503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	77246218	rs13331769	G	A	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=11;PP=387;SC=GTGGAGCGGCGGCTGCACTCG;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=77246226;WS=77246208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	77246517	rs62049594	C	A	888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=17;PP=717;SC=CCGGAGCGCCCCCGAGGTCGG;SOR=1.071;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=13;TCR=17;TR=30;WE=77246525;WS=77246507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	77246795	rs2278049	C	G	1616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=11;PP=1236;SC=AGGAGGATCCCGAGCCGCCGG;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=56;WE=77246803;WS=77246785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr16	77246847	rs2278048	T	G	2170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=40;PP=1608;SC=GACCCGCCCGTTCCCGACCTT;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=30;TCR=40;TR=70;WE=77246855;WS=77246837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	77246953	rs2278047	G	C	1415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=34;PP=1120;SC=GGCGGGGCGTGCTGGGATCTC;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=41;WE=77246961;WS=77246943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	77246988	rs7203616	T	G	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=24;PP=641;SC=GCCGGACCCCTCCCACCAGTC;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=77246996;WS=77246978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	77281779	rs35625788	GTC	G	818.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=862;SC=CTGGCTTGAGGTCTCTCATCA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=19;WE=77281788;WS=77281769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	77325325	rs35478105	G	T	3471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=64;PP=2602;ReadPosRankSum=-0.747;SC=AGCCCTTCTCGCTGCACTTCA;SOR=0.629;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=36;TCR=65;TR=100;WE=77325333;WS=77325315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,110:0.99:111
chr16	77327226	rs4888618	C	A	2799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=73;PP=2322;SC=AAAAAAACAACACACTAAATA;SOR=3.391;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=12;TCR=73;TR=85;WE=77327234;WS=77327216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr16	77334230	rs201338151	T	G	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=180.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.43;ReadPosRankSum=-6.000;SOR=6.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,29:0.34:85
chr16	77334233	.	A	G	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.345;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=32.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.33;ReadPosRankSum=-3.390;SOR=3.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,4:0.06:63
chr16	77389956	rs8059275	A	G	4029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=56;PP=2965;SC=TCCCTTCTCCATCGTGAATCA;SOR=1.154;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=83;TCR=56;TR=139;WE=77389964;WS=77389946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr16	77393207	rs2650907	G	C	1410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=5;PP=1155;SC=GTTCAAAGAGGCACTTACTTG;SOR=3.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=41;WE=77393215;WS=77393197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	77393445	rs72406902	GGAAA	G	1253.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;NF=1;NR=18;PP=249;SC=CAGTGTTTTTGGAAAAAAAAA;SOR=3.611;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=19;WE=77393459;WS=77393435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	77393450	rs114891228	A	C	380.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.694;NF=1;NR=12;PP=409;ReadPosRankSum=-0.174;SC=TTTTTGGAAAAAAAAAAAAAA;SOR=0.446;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=13;WE=77393459;WS=77393435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr16	77393451	.	A	C	50.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.845;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQRankSum=-0.507;QD=1.88;ReadPosRankSum=0.332;SOR=0.954;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,7:0.26:27
chr16	77395948	rs1909802	C	G	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=0;PP=1066;SC=TAGAAAGTTTCCATACTGTGT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=77395956;WS=77395938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	77397899	rs1948718	T	C	1277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=33;PP=1064;SC=TATGTACATATAAATACAATT;SOR=4.351;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=35;WE=77397907;WS=77397889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	77398081	rs1948719	T	C	3384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=32;PP=2571;SC=ACACCCCCGCTTACCATGTTC;SOR=1.835;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=74;TCR=32;TR=106;WE=77398089;WS=77398071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr16	77398386	rs2562119	A	T	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=289;SC=TAACCAACACACCACCAATCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=77398394;WS=77398376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	77401684	rs2434895	T	G	1730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=47;PP=1440;SC=AGGGTTGGTTTTCAACAACTG;SOR=3.300;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=7;TCR=47;TR=54;WE=77401692;WS=77401674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	77756613	rs2914456	G	A	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=0;NR=16;PP=299;SC=TGATTTTGCAGCTCCCGCCAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=77756621;WS=77756603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	77769369	rs308926	C	T	2016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=37;PP=1511;SC=GCCAAGCAGACGCCAGCATCA;SOR=0.844;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=67;WE=77769377;WS=77769359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr16	77769617	.	T	A	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.696;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.926;HP=3;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=142;ReadPosRankSum=0.849;SC=ACCACCTGGGTAAGAATGGTC;SOR=0.031;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=8;WE=77769625;WS=77769607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr16	77769647	rs186305	C	T	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=8;PP=1100;SC=AAATAGAAGTCCAGTAAGTAT;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=31;TCR=8;TR=39;WE=77769655;WS=77769637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	77769679	rs17716789	C	G	2081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=13;PP=1732;SC=ATAAATAGTTCCAAAATTAGA;SOR=2.457;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=47;TCR=13;TR=60;WE=77769687;WS=77769669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	77770531	.	AT	A	89.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.97;ReadPosRankSum=1.122;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr16	77775459	rs11648791	G	A	1850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=3;PP=1521;SC=TAATTTGTCTGTTTTGTTTTC;SOR=5.247;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=52;TCR=3;TR=55;WE=77775467;WS=77775449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	77850966	rs2966053	T	C	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=35;PP=1238;ReadPosRankSum=-0.902;SC=TGGCTCTCAATTGAAGAGTAA;SOR=1.262;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=45;WE=77850974;WS=77850956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr16	77850999	rs2966052	A	G	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=30;PP=937;SC=ATCCATTGAGACAACAAAAGA;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=32;WE=77851007;WS=77850989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	77910418	rs3751765	A	G	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=44;PP=1334;SC=AGGTACCTCTACATATGTGCC;SOR=4.935;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=47;WE=77910426;WS=77910408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	77912966	rs3751767	T	C	2003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=0;PP=1680;SC=TTTCAAGATTTCTCCAGTTCC;SOR=8.189;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=56;TCR=0;TR=55;WE=77912974;WS=77912956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr16	77913219	rs9930395	C	T	4334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=124;PP=2965;SC=GACAGCGTCTCGTTCTGTCAC;SOR=4.506;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=11;TCR=124;TR=135;WE=77913227;WS=77913209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr16	77918801	rs1864228	T	C	1148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=38;PP=891;SC=TTTTCCCAGATGGGTTTGTTT;SOR=6.091;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=39;WE=77918809;WS=77918791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	78062159	rs2075738	C	T	3108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=73;PP=2595;SC=TTCTGGGGGACGTCTTTTTAA;SOR=2.560;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=94;TCF=20;TCR=74;TR=93;WE=78062167;WS=78062149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr16	78062190	rs2735403	T	C	2816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=73;PP=2398;SC=GACAAATCAATAATGTGGCCA;SOR=3.690;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=85;TCF=10;TCR=75;TR=83;WE=78062198;WS=78062180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr16	78062219	rs2204891	C	T	1967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=57;PP=1705;SC=GCCCCAATGCCGGGAGATGAT;SOR=5.353;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=60;TCF=3;TCR=57;TR=60;WE=78062227;WS=78062209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	78063000	rs7197560	T	C	3429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=38;PP=2825;ReadPosRankSum=1.683;SC=ACTTAAGCTATTATGATCCTA;SOR=1.244;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=65;TCR=39;TR=101;WE=78063008;WS=78062990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,106:0.98:108
chr16	78063064	rs7190832	G	T	3900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.177;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=60;PP=2876;ReadPosRankSum=1.199;SC=TTGTTCAAGAGATACACAGCT;SOR=0.369;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=68;TCR=61;TR=128;WE=78063072;WS=78063054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,132:0.99:133
chr16	78063143	rs7192416	C	T	2573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=61;PP=2030;SC=TCCAGTGCTACGGCCTAAAAC;SOR=2.985;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=12;TCR=61;TR=73;WE=78063151;WS=78063133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	78064220	.	T	G	667	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=23;NR=0;PP=667;QD=30.5117918499;SC=ATAGAAAATTTTAACTGTTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=78064228;WS=78064219;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	78085754	rs2344923	C	A	3375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=88;NR=15;PP=2764;SC=GAGCCACCCCCCCTGGCCAAC;SOR=3.486;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=89;TCR=15;TR=103;WE=78085762;WS=78085744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr16	78142209	rs4887937	T	C	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.90;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr16	78143607	rs2287972	C	T	2842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=9;PP=2389;SC=GGGCTCCTTCCCTTCCTGACC;SOR=4.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=74;TCR=9;TR=83;WE=78143615;WS=78143597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	78148794	rs1469117	T	G	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=672;SC=AATGGGGTTTTCCTAAAGTAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=78148802;WS=78148784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	78197911	rs4359451	T	C	762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=0;PP=619;SC=ACCCCACAACTGTGGCCACTG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=78197919;WS=78197909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	78198192	rs2303191	T	C	6120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=115;PP=2965;SC=AATGGGTAAGTGCTTGACTGT;SOR=0.973;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=206;TCF=91;TCR=115;TR=206;WE=78198200;WS=78198182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr16	78312497	rs8050128	C	A	1525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=21;PP=1275;SC=TTGTATCTTACAGAAAACAAA;SOR=1.225;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=50;WE=78312505;WS=78312487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	78420775	rs11545029	G	A	4681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=44;PP=2965;SC=CAAGGTAGAAGCAATGACCCT;SOR=1.578;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=97;TCR=44;TR=141;WE=78420783;WS=78420765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr16	78790765	rs7199110	C	T	2326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=15;PP=1862;SC=GACATCAGAGCATGTGACTTA;SOR=2.804;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=60;TCR=15;TR=75;WE=78790773;WS=78790755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr16	79245465	rs384216	T	C	1761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=2;PP=1535;ReadPosRankSum=1.777;SC=ATCACTCCTTTTCTTAAAATT;SOR=4.294;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=54;TCF=52;TCR=2;TR=53;WE=79245473;WS=79245455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,52:0.98:53
chr16	79245820	rs383362	G	T	5594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.280;NF=97;NR=76;PP=2965;ReadPosRankSum=1.266;SC=AATAAGAGCAGTCACAACAGA;SOR=0.337;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=174;TCF=98;TCR=76;TR=173;WE=79245828;WS=79245810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,177:0.99:178
chr16	79245892	rs144412859	GGGGCT	G	7492.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.73;MQRankSum=0.503;NF=73;NR=72;PP=2973;ReadPosRankSum=2.001;SC=TCACTTTTCTGGGGCTGGGCT;SOR=0.443;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=165;TCF=82;TCR=83;TR=145;WE=79245904;WS=79245882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,174:0.98:177
chr16	79245956	rs2288034	C	G	7992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.11;MQRankSum=0.211;QD=42.51;ReadPosRankSum=-0.487;SOR=1.063;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,185:0.98:188
chr16	79245961	rs2288033	T	C	7907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.12;MQRankSum=0.214;QD=43.45;ReadPosRankSum=0.293;SOR=1.168;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,179:0.98:182
chr16	79246078	rs2288032	G	A	1522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=41;PP=1283;SC=CACTGCAGCCGGGGGCTGGCC;SOR=4.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=44;WE=79246086;WS=79246068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	79619727	rs60080524	GAAA	G	1363.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.26;QD=40.11;SOR=4.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	79619835	rs60533944	G	A	1743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=40;PP=1385;SC=ATTCCCTTGGGTACCTGATTT;SOR=1.823;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=57;WE=79619843;WS=79619825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	79628536	rs66467731	AT	A	725.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=42;PP=605;SC=TCCTCATATGATTTTTTTTTT;SOR=5.486;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=61;TCF=1;TCR=60;TR=43;WE=79628545;WS=79628526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	79998075	rs66539665	T	G	7464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-3.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FS=8.641;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.94;MQRankSum=-0.311;QD=28.38;ReadPosRankSum=6.663;SOR=1.821;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:25,238:0.90:263
chr16	80574886	rs9922406	T	C	5304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=88;NR=77;PP=2965;SC=CCACTTCCTTTTTTGTCTCCT;SOR=0.778;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=166;TCF=88;TCR=78;TR=165;WE=80574894;WS=80574876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr16	80577098	rs8049769	G	T	3101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=11;PP=2487;SC=TAGGTATCTTGCTAAACATTA;SOR=3.865;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=78;TCR=11;TR=89;WE=80577106;WS=80577088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr16	80581547	rs6564762	C	T	3396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=17;PP=2607;SC=CTGAGCATTGCACCCTTAGTA;SOR=3.035;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=84;TCR=17;TR=101;WE=80581555;WS=80581537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr16	80581580	rs6564763	A	C	5699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=125;NR=47;PP=2965;SC=TTAGGATGCAAAATAAAACTG;SOR=2.041;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=126;TCR=47;TR=172;WE=80581588;WS=80581570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr16	80581631	rs6564764	G	A	7782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=150;NR=85;PP=2965;SC=TGCTTGCTACGTTTCCATTTT;SOR=1.348;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=235;TCF=150;TCR=85;TR=235;WE=80581639;WS=80581621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr16	80583276	.	T	A	1358	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=46;NR=1;PP=1358;QD=29.6334300542;SC=AAGCCATCACTTTTTTCTCTT;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=47;WE=80583284;WS=80583275;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	80584604	rs74341389	C	G	2150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=57;PP=1696;SC=CTCATTTAGTCCCTTTTGATT;SOR=6.932;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=58;TCF=1;TCR=57;TR=58;WE=80584612;WS=80584594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	80704886	rs7195952	T	C	2638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=61;PP=1993;SC=CTCAGGATTTTGTCTCCTGGG;SOR=1.511;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=32;TCR=61;TR=93;WE=80704894;WS=80704876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr16	80718879	rs8049284	A	G	4331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=52;PP=2965;SC=GACATGTGCAACCCATTGAAT;SOR=1.222;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=129;TCF=77;TCR=52;TR=129;WE=80718887;WS=80718869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr16	80719086	rs8047798	G	C	2163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=48;PP=1731;SC=AACTCAGTTCGAGGCAACAAG;SOR=2.566;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=13;TCR=48;TR=61;WE=80719094;WS=80719076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	81009949	rs72813721	T	G	1375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=1;PP=1228;SC=CCCAGAGTCTTTAGGTCTTCT;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=37;WE=81009957;WS=81009939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	81014700	rs1477381	T	C	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=426;SC=AAAAAAAAAGTTCAAAAATAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=81014708;WS=81014690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	81015560	rs2549822	C	T	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=29;PP=951;SC=TAAATACTGCCACAGACATGA;SOR=2.073;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=38;WE=81015568;WS=81015550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	81022203	rs34522854	TA	T	2098.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=50;PP=1478;SC=GCACGTTTCCTAAAAAAAACA;SOR=1.580;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=16;TCR=53;TR=65;WE=81022211;WS=81022193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	81022232	rs2549833	T	C	2218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=53;PP=1716;SC=AATTTAAGTCTCCATACGATT;SOR=2.336;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=16;TCR=54;TR=69;WE=81022240;WS=81022222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr16	81025372	rs2244452	A	T	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=0;PP=616;SC=TGTGGTCTTCATCCGAAAACA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=81025380;WS=81025362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	81025490	rs2113196	A	C	5094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.386;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=34;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.874;SC=ATCAAAAACAAAGAAAATGTC;SOR=2.456;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=154;TCF=119;TCR=35;TR=153;WE=81025498;WS=81025480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,160:0.99:161
chr16	81025506	rs2113197	T	A	6066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.163;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=138;NR=43;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.384;SC=ATGTCACAGATAACAGGAGCC;SOR=2.323;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=182;TCF=138;TCR=44;TR=181;WE=81025514;WS=81025496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,185:0.99:186
chr16	81050965	rs935939	A	T	2134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=38;PP=1714;SC=AAGTTTGGGAAGTTTTTCAGA;SOR=1.098;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=26;TCR=38;TR=64;WE=81050973;WS=81050955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr16	81051327	rs935940	C	T	1837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=32;PP=1477;SC=ATTGTAGCTCCCTTGATTTTT;SOR=1.101;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=55;WE=81051335;WS=81051317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	81053682	rs10602593	CT	C	860.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=0;PP=569;ReadPosRankSum=1.407;SC=GAAATTAAGCCTTTTTTTTTT;SOR=5.838;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=55;TCR=2;TR=37;WE=81053702;WS=81053672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,39:0.98:40
chr16	81061827	rs2549887	G	A	5364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=114;NR=42;PP=2965;SC=GGCTGAGAGGGAAGAACCCCT;SOR=1.946;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=115;TCR=42;TR=156;WE=81061835;WS=81061817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr16	81062030	rs2549888	G	T	1452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=24;PP=1185;SC=GCTCTCTCTTGCATCTTCTGC;SOR=1.055;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=41;WE=81062038;WS=81062020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
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chr16	81062157	rs114305409	T	C	9845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=142;NR=39;PP=2965;ReadPosRankSum=0.400;SC=TTCCCTTTTTTTTTTTTTTAA;SOR=1.496;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=220;TCF=174;TCR=46;TR=181;WE=81062179;WS=81062141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,220:1.00:221
chr16	81062171	rs2602428	C	T	11146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=185;NR=74;PP=2965;ReadPosRankSum=1.229;SC=TTTTTAATTTCAGGTATTGCA;SOR=0.960;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=261;TCF=187;TCR=74;TR=259;WE=81062179;WS=81062141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,267:1.00:268
chr16	81077915	rs2257378	T	C	12494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.825;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.723;NF=224;NR=159;PP=2965;ReadPosRankSum=1.501;SC=ATCTGCCTGCTCAGACATTGG;SOR=0.817;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=386;TCF=225;TCR=161;TR=383;WE=81077923;WS=81077905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,385:1.00:386
chr16	81094760	rs804884	A	G	3290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=20;PP=2519;SC=GTTCTACCGCAACCGCTCAGA;SOR=2.978;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=89;TCR=20;TR=109;WE=81094768;WS=81094750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr16	81095363	rs804885	C	T	8488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=197;PP=2965;SC=CTGGGATGGACAGCCCTCTGT;SOR=2.320;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=259;TCF=62;TCR=197;TR=259;WE=81095371;WS=81095353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr16	81118289	rs7187102	C	T	1880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=56;PP=1589;SC=TCCTGTCATACAGCTATGATT;SOR=4.277;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=6;TCR=56;TR=62;WE=81118297;WS=81118279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	81118316	rs35385687	CT	C	301.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=0.265;QD=13.72;ReadPosRankSum=-0.398;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,19:0.86:22
chr16	81121145	rs7200400	T	C	227.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=194;SC=ACAAACAAATTACTATTCAAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=81121153;WS=81121135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	81129822	rs8052579	G	A	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=145;SC=CGCGGCGGGTGACGGGACCGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=81129830;WS=81129812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	81134671	.	G	A	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=0;PP=702;SC=GCTGGTAAGCGTACGCCCGAG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=81134679;WS=81134664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	81145630	rs8053975	C	G	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=0;PP=1065;SC=ACAGCAAAGACACCCTGTACT;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=81145638;WS=81145620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	81145664	rs8054611	A	G	1942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=1;PP=1627;SC=ACCTTCCTTGAGTTCCCAGGG;SOR=6.701;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=55;TCR=1;TR=56;WE=81145683;WS=81145654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	81145675	rs8059153	T	C	2339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=5;PP=1962;SC=GTTCCCAGGGTCTCCCTAACC;SOR=4.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=68;TCR=5;TR=71;WE=81145683;WS=81145654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	81145737	rs8059318	T	G	4216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=46;PP=2965;SC=GCAGAGACCCTCCCCGAACTT;SOR=1.642;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=96;TCR=46;TR=142;WE=81145745;WS=81145727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr16	81145807	rs8054182	C	G	6735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=106;PP=2965;SC=GGATGACAATCATAAAGCCTG;SOR=0.751;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=207;TCF=101;TCR=106;TR=207;WE=81145815;WS=81145797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr16	81151122	rs4889238	A	C	10180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=116;NR=196;PP=2965;SC=ACGTCTCTTTACTCATGCGCT;SOR=1.351;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=312;TCF=116;TCR=196;TR=312;WE=81151130;WS=81151112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr16	81151163	rs8053191	C	T	6471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=150;PP=2965;SC=AAGTTGCGGCCGTGACTGCCC;SOR=2.326;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=200;TCF=50;TCR=150;TR=200;WE=81151171;WS=81151153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr16	81157324	rs4889241	G	A	2266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=21;PP=1710;SC=GTAGACAGTGGACTCCACAAA;SOR=1.897;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=44;TCR=21;TR=65;WE=81157332;WS=81157314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr16	81157521	rs4889242	G	A	1268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=39;PP=1096;SC=GGGCCACCAGGCCAACAGAGC;SOR=4.514;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=42;WE=81157529;WS=81157511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	81164274	rs11150345	C	G	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=22;PP=593;SC=ACAGTCCCTGCTCAGGCAGGA;SOR=4.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=23;WE=81164282;WS=81164264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	81167342	rs11150346	T	G	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=29;PP=843;SC=CCCCTACGTGTGCAGAGGAGG;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=81167350;WS=81167332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	81173030	rs4889243	A	G	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=5;PP=578;SC=ATAAAGGAATAAAAGCCCAGG;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=81173038;WS=81173020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	81173056	rs62053173	A	G	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=10;PP=912;SC=GACTGCTGGCAGTAGGGAAGG;SOR=2.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=38;WE=81173064;WS=81173046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	81173136	rs12918619	T	C	2217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=20;PP=1831;SC=GTGACGAACATGCTCTCCACG;SOR=2.147;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=53;TCR=20;TR=73;WE=81173144;WS=81173126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	81173233	rs141992322	G	C	4342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=67;PP=2965;SC=AGGCCGCCACGCCACTGGTGG;SOR=0.738;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=65;TCR=67;TR=132;WE=81173241;WS=81173223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr16	81174978	rs117006360	A	G	2185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=10;PP=1865;SC=CTGAGGGCCTAGGCATGGCTG;SOR=3.477;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=56;TCR=10;TR=65;WE=81175007;WS=81174968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	81174992	rs117414860	G	T	3335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.08;SOR=3.026;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	81174999	rs76162903	A	G	3574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.07;SOR=2.698;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr16	81182025	rs74030553	C	A	1309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=31;PP=903;SC=GTCCCTTCTGCCCCTTGTGGA;SOR=3.417;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=81182033;WS=81182015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	81183266	rs8044870	A	G	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=681;SC=CCAGCCACTAACCCTGACCTC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=81183274;WS=81183256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	81185326	rs11649028	G	A	2241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=11;PP=1875;SC=CCTGGGTGGCGGAACAAGACC;SOR=3.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=57;TCR=11;TR=68;WE=81185334;WS=81185316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr16	81185416	rs8061038	A	G	5349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=97;PP=2965;SC=GAAACACCTTATCGAGGACGC;SOR=0.902;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=81;TCR=98;TR=178;WE=81185424;WS=81185406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr16	81187685	rs74030562	G	A	4708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=39;PP=2965;SC=CCGGAGTGTCGGGATCAGCCA;SOR=1.989;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=143;TCF=104;TCR=39;TR=143;WE=81187693;WS=81187675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr16	81190294	rs4889251	G	A	1729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=1;PP=1165;SC=CAGGTGATCCGTCCACCTTGG;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=41;WE=81190316;WS=81190284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	81190308	rs4889252	G	T	1691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=39;NR=1;PP=1152;SC=ACCTTGGCCTGCCAAAGTGCT;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=40;WE=81190316;WS=81190284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	81190598	rs9938333	T	C	6142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.19;SOR=1.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr16	81190601	rs1453325	T	C	6073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.33;SOR=1.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr16	81190613	rs1453324	A	G	3979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=81;PP=2965;SC=ATGGCATTGGACATCACCAGG;SOR=1.708;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=36;TCR=81;TR=117;WE=81190621;WS=81190588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr16	81193156	rs10871403	C	G	3948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=101;NR=9;PP=2965;SC=GCCAGAGGCACCAAAAGGGAA;SOR=4.749;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=102;TCR=9;TR=110;WE=81193164;WS=81193146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr16	81194382	rs2317117	T	C	5295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=50;PP=2965;SC=GTGCAATGTCTGGTCTCCAGT;SOR=1.914;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=170;TCF=120;TCR=50;TR=170;WE=81194390;WS=81194372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr16	81197117	rs4889255	A	G	1983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=10;PP=1504;SC=GCTTGAGCCCAGGAGGCAGAA;SOR=3.489;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=58;TCR=10;TR=68;WE=81197125;WS=81197107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr16	81198441	rs7191852	T	C	291.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=236;SC=GAGGGAGCCCTCACACCTCCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=81198449;WS=81198431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	81199429	rs12925622	G	A	5498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=76;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.778;SC=GACCTGTAACGCAGCTGGTTT;SOR=0.327;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=174;TCF=98;TCR=76;TR=173;WE=81199437;WS=81199419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,182:0.99:183
chr16	81199520	rs12931217	T	C	2262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=68;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=61;PP=1744;SC=AGCAGGAGGGTGGTCTGCACA;SOR=2.891;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=12;TCR=61;TR=73;WE=81199528;WS=81199510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr16	81199538	rs12931227	T	C	3400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=43.05;ReadPosRankSum=-0.308;SOR=2.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,78:0.99:79
chr16	81199544	rs12925771	G	A	3628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=45.36;ReadPosRankSum=0.022;SOR=1.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,79:0.99:80
chr16	81199554	rs12926898	CA	TG	3436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-2.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=5.788;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=44.06;ReadPosRankSum=1.692;SOR=3.640;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,76:0.97:78
chr16	81199572	rs12927442	A	G	2133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=109;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=51;PP=1745;SC=TGGCAATCTGAAAAAGGAGGC;SOR=3.258;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=61;TCF=9;TCR=52;TR=60;WE=81199580;WS=81199562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	81199600	rs12599110	G	A	1573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.539;HP=1;HapScore=1;MGOF=92;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=42;PP=1288;ReadPosRankSum=-0.686;SC=TGTTGCTATGGACCTGCTGCC;SOR=3.683;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=50;TCF=7;TCR=43;TR=48;WE=81199608;WS=81199590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr16	81201448	rs11313252	G	A	1675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=66;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=0;PP=756;SC=GATGGGGGGGGAAAGTTCCAC;SOR=5.084;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=81201456;WS=81201446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	81201507	rs34188236	C	A	2849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=76;NR=11;PP=2301;SC=AGGTCTGCATCTGGCCTGGAC;SOR=3.467;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=76;TCR=11;TR=87;WE=81201515;WS=81201497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr16	81204188	rs1901819	A	G	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=402;SC=GCTGGCAGCCAGATGTCAGGC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=81204196;WS=81204178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	81204720	rs35271642	C	A	2666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=67;PP=2134;SC=AAATGTAATTCTGTGGCTCCA;SOR=2.915;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=16;TCR=67;TR=83;WE=81204728;WS=81204710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr16	81208056	rs745209	A	G	1738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=0;PP=1247;SC=AAAGCAGGGGATGATGTGTTC;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=42;WE=81208064;WS=81208049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	81208175	rs11150361	C	T	9684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=212;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=0.944;SC=CCCAAAAGACCAGAGAGGGAG;SOR=0.897;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=301;TCF=214;TCR=87;TR=299;WE=81208183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,305:1.00:306
chr16	81208203	rs11150362	G	T	10071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=201;NR=117;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.708;SC=CAGCCGCTTGGGAGACACCAC;SOR=0.549;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=322;TCF=204;TCR=118;TR=318;WE=81208211;WS=81208193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,326:1.00:327
chr16	81208515	rs12596941	G	A	3527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=70;PP=2743;ReadPosRankSum=-0.776;SC=GTCTCCGAGTGCCACCTGTTA;SOR=0.462;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=45;TCR=71;TR=115;WE=81208523;WS=81208505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,117:0.99:118
chr16	81209207	rs2317114	T	C	2244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=34;PP=1756;SC=TGCCACCACCTACCTTAGCCA;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=37;TCR=34;TR=71;WE=81209215;WS=81209197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr16	81213081	rs4889259	G	A	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=1;PP=1045;SC=CAGGAGGCTGGGACAGGAGGA;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=37;WE=81213089;WS=81213071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	81213142	rs4889260	C	T	3292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=14;PP=2587;SC=AGTGAGATCACATCTCTCTAT;SOR=3.767;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=85;TCR=14;TR=99;WE=81213150;WS=81213132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr16	81213378	rs4889261	A	G	3296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=84;PP=2639;SC=GCAGGCATCCAGGAGGGGCTC;SOR=3.442;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=14;TCR=84;TR=98;WE=81213386;WS=81213368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr16	81213422	rs4889262	C	T	1839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=54;PP=1551;SC=GGGCTGCTGACGCTACAGCCA;SOR=6.630;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=55;WE=81213430;WS=81213412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	81219329	rs9319563	G	T	6340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=117;PP=2965;SC=CAGACACTATGATCCATCAGG;SOR=1.207;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=195;TCF=78;TCR=117;TR=195;WE=81219337;WS=81219319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr16	81219396	rs9674042	T	A	3917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=1.732;SC=TCATGAATAATAACATCAGCT;SOR=4.514;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=5;TCR=112;TR=116;WE=81219404;WS=81219386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,118:0.99:119
chr16	81222447	.	CAAA	C	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=1.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.91;MQRankSum=2.097;QD=0.73;ReadPosRankSum=0.588;SOR=0.957;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,8:0.13:60
chr16	81222672	rs4889271	T	C	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=717;SC=TGGGGTGCTGTTGGCATTCCC;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=81222680;WS=81222662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	81224234	rs12716909	T	C	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=3;PP=1213;SC=CATCTTTTCCTTGTGAGGTTA;SOR=4.450;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=40;TCR=3;TR=43;WE=81224242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	81224423	rs11647179	G	A	4201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=81;PP=2965;SC=CACCAGGGGCGTCAGCCTGTC;SOR=1.290;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=50;TCR=81;TR=131;WE=81224431;WS=81224413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr16	81232275	rs7205673	G	A	1479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=10;PP=1182;SC=ACCTTCAACCGGAACAGCCAG;SOR=2.252;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=42;WE=81232283;WS=81232265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	81232564	rs7194871	T	G	7366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=109;NR=113;PP=2965;SC=CCCATCAGTTTCTGGGTTTCT;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=223;TCF=110;TCR=113;TR=222;WE=81232572;WS=81232554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr16	81240931	rs11150368	T	C	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=204;SC=CCGGACAGCCTACCCCAGCCA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=81240939;WS=81240926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	81241098	rs11150369	C	T	3062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=3.203;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=44.39;ReadPosRankSum=-0.847;SOR=0.410;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,68:0.99:69
chr16	81241098	.	CGG	TGC	1489	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=32;NR=26;PP=1489;QD=26.5942737045;SC=CTTACCTCGGCGGGTTGTAGG;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=62;TCF=33;TCR=29;TR=58;WE=81241108;WS=81241088;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,58:0.94:62
chr16	81241100	rs11150370	G	C	3062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=3.070;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=41.96;ReadPosRankSum=-0.871;SOR=0.311;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,72:0.99:73
chr16	81242102	rs6420424	G	A	4581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.166;NF=80;NR=59;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.684;SC=TCACCTTCCCGGCACTGGTAC;SOR=0.375;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=81;TCR=60;TR=139;WE=81242110;WS=81242092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,146:0.99:147
chr16	81242148	rs55980345	GTT	G	5898.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=59;PP=2950;SC=TCGGACACAGGTTTCCAAAGT;SOR=0.983;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=95;TCF=30;TCR=65;TR=89;WE=81242159;WS=81242138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr16	81242151	rs5818326	T	C	5907.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=59;PP=2851;SC=GACACAGGTTTCCAAAGTAGG;SOR=1.016;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=119;TCF=47;TCR=72;TR=104;WE=81242159;WS=81242138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr16	81242194	rs6564838	T	C	3014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=64;PP=2466;SC=TGACTGTAGCTCCTGGCACTG;SOR=2.059;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=23;TCR=64;TR=87;WE=81242202;WS=81242184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr16	81242366	rs6564839	T	C	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=356;SC=GAAGACCAGGTACTGGGCTAG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=81242374;WS=81242356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	81242386	rs6564840	T	G	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=1;NR=10;PP=267;SC=GGTACTCAGGTGAGGGAGAAG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=81242394;WS=81242376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	81248745	rs8060294	A	G	3974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=81;NR=57;PP=2965;SC=GACCTGCCCCAAGCCACAGTG;SOR=1.089;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=81;TCR=57;TR=138;WE=81248753;WS=81248735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr16	81248935	rs8044334	T	G	1806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=52;PP=1583;SC=GCAGGGGTGATAAATTGAATA;SOR=5.709;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=54;TCF=2;TCR=52;TR=54;WE=81248943;WS=81248925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	81249954	rs7191351	T	A	4311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=55;PP=2965;SC=AGCGGCGGCCTGCCCTCCATG;SOR=0.953;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=78;TCR=55;TR=133;WE=81249962;WS=81249944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr16	81253526	rs141224532	A	ATTATT	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=660;SC=TTAGACATGAATTATTTAATC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=81253534;WS=81253523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	81253637	rs9924275	A	G	4462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=3.571;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=44.63;ReadPosRankSum=-1.099;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,98:0.98:100
chr16	81253642	rs62052455	AG	TC	4458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=3.082;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=42.46;ReadPosRankSum=-0.469;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,103:0.98:105
chr16	81253745	rs9934272	C	G	5636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=82;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.884;SC=GGGAGATGTGCTTCTGCAGAA;SOR=0.276;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=178;TCF=96;TCR=82;TR=177;WE=81253767;WS=81253735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,181:0.99:182
chr16	81253759	rs9924371	A	G	5290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.158;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=88;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.884;SC=TGCAGAAACCACTGGGTGCCT;SOR=0.349;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=172;TCF=84;TCR=88;TR=171;WE=81253767;WS=81253735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,179:0.99:180
chr16	81253917	rs9924530	A	G	2655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=63;PP=2095;SC=CTCTGGCTTAACAGTGGTGGC;SOR=2.359;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=83;TCF=20;TCR=63;TR=82;WE=81253925;WS=81253907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	81254023	rs35807120	T	TA	891.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=20;PP=904;SC=TCTTGGGACTTTCATATGCGG;SOR=4.003;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=22;WE=81254031;WS=81254013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	81314496	rs7501331	C	T	2615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=36;PP=2087;SC=ATCAAAGTGGCATCTACAACA;SOR=1.080;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=51;TCR=36;TR=87;WE=81314504;WS=81314486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr16	81320830	rs8048342	A	G	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=2;PP=637;SC=ATCTTCATGCACTCCTATTTG;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=81320838;WS=81320820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	81398520	rs4889313	G	A	2007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=27;PP=1537;SC=TTTAATATCTGTTCACCTGAC;SOR=0.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=36;TCR=27;TR=63;WE=81398528;WS=81398510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr16	81508244	rs80154255	T	G	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=0;PP=278;SC=ACCGCACTTCTGTGGAAGGGG;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=81508252;WS=81508241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	81529174	rs2925994	A	G	8652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=190;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.782;SC=GCTGCTGGCCACAGGCCAGTG;SOR=0.602;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=291;TCF=100;TCR=191;TR=290;WE=81529182;WS=81529164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,291:1.00:292
chr16	81641452	rs7203914	A	G	236.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=215;SC=GCTGTAAACCAGGTCTGACTG;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=81641460;WS=81641442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	81712245	rs116076438	C	T	1955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=52;PP=1685;SC=TGAGTGCCCCCCCCGCGTGCC;SOR=3.575;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=9;TCR=52;TR=61;WE=81712253;WS=81712235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	81726863	rs2288011	C	G	7695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=156;NR=104;PP=2965;SC=CCTCCGTGGCCCATGCATTCT;SOR=1.187;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=261;TCF=157;TCR=104;TR=260;WE=81726871;WS=81726853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr16	81730381	rs9933631	C	A	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=53;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=14;PP=720;SC=CGGAGTTTCCCGGCTAACACA;SOR=0.922;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=26;WE=81730389;WS=81730371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	81730396	rs151182692	T	TA	1346.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=17;PP=1063;SC=AACACAGTGCTGATCATGAAG;SOR=1.329;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=24;WE=81730405;WS=81730386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	81730397	rs370207043	G	A	1355.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=17;PP=720;SC=ACACAGTGCTGATCATGAAGG;SOR=1.329;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=27;WE=81730405;WS=81730386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	81733268	rs4889369	C	T	6892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=151;NR=66;PP=2965;SC=TGTCCCTTCACCTGGGCCTTC;SOR=1.835;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=217;TCF=151;TCR=66;TR=217;WE=81733276;WS=81733258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr16	81737838	rs190435839	C	T	156.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=121;SC=CTCCTCCCTGCCCCCCTTACT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=81737846;WS=81737828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	81739376	rs3968320	T	A	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=423;SC=CACCATTCCATGTGCCAGGAA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=81739384;WS=81739366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	81816787	rs4476171	T	A	1682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=29;PP=1219;SC=TCCAGTGGACTATGGCCTAGA;SOR=0.931;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=22;TCR=29;TR=51;WE=81816795;WS=81816777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	81891998	rs4341734	G	C	6357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=80;NR=111;PP=2965;SC=CGTAGTTGCTGATTCCTTTAT;SOR=1.052;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=81;TCR=111;TR=191;WE=81892006;WS=81891988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr16	81892041	rs5818357	GGGA	G	6851.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=103;PP=2975;SC=GGCTACAGGGGGGAAAAAAAA;SOR=1.927;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=124;TCF=20;TCR=104;TR=123;WE=81892056;WS=81892031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr16	81892048	rs5016604	A	C	6860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.50;QD=45.44;SOR=2.021;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr16	81892708	rs4888183	T	A	1693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=10;PP=1519;SC=TTTTGTCTCATATTTCTTTCC;SOR=2.790;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=44;TCR=10;TR=54;WE=81892716;WS=81892698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	81914619	rs41305761	A	C	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=53;PP=1297;SC=CCTGGTGCCCAGCCGGCCTCC;SOR=4.768;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=4;TCR=54;TR=57;WE=81914627;WS=81914609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	81917099	rs6564928	G	T	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=305;SC=AACGATTGCAGTCTGCCAGAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=81917107;WS=81917089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	81929379	rs13333348	G	A	1679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=3;PP=1461;SC=GTGAACACACGTGGTATTGAG;SOR=5.058;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=51;TCR=3;TR=54;WE=81929387;WS=81929369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	81929527	rs13333716	C	G	4466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=70;PP=2965;SC=CCTTTGTTACCTCGAGGTCAG;SOR=0.774;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=77;TCR=70;TR=147;WE=81929535;WS=81929517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr16	81929641	rs9928597	G	A	2177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=53;PP=1828;SC=CTCCAAATGCGGGAAGGCCTG;SOR=3.091;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=11;TCR=53;TR=64;WE=81929649;WS=81929631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	81931362	rs8053636	T	C	2120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=0;PP=1731;SC=GTTGGCCAGGTTGGTCTTGAA;SOR=8.287;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=60;TCR=0;TR=59;WE=81931370;WS=81931352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	81939157	rs11859176	G	T	1668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=45;PP=1428;SC=CACGCCCCTTGCAGCTGCTTC;SOR=4.935;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=48;WE=81939165;WS=81939147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	81941160	rs41301803	A	G	694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=2;PP=503;SC=AGAATTCGCCATAAATGTCTA;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=81941168;WS=81941150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	81941934	rs62044874	G	C	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=10;PP=1127;SC=CTGGTACCCTGGGTCAGGGTG;SOR=2.560;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=45;WE=81941942;WS=81941924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	81946368	rs41305765	A	C	2878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=70;PP=2248;SC=GGGCTTGGCAAGGACAGATGC;SOR=1.802;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=31;TCR=70;TR=101;WE=81946376;WS=81946358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr16	81953081	rs12448130	T	C	972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=5;PP=762;SC=GTGTTCTTCCTGCTCCAGGGC;SOR=2.694;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=30;WE=81953089;WS=81953071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	81953368	rs12448152	A	G	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=49;PP=1425;SC=TTCACCATGTATCTGATACTG;SOR=5.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=2;TCR=49;TR=51;WE=81953376;WS=81953358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	81954789	rs12446127	C	G	6188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.94;ReadPosRankSum=0.045;SOR=0.570;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,199:1.00:200
chr16	81956927	rs4485360	C	G	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=457;SC=TTGGGGCCTTCGATCCTTTGC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=81956935;WS=81956917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	81962071	rs4366702	A	C	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=0;PP=1079;SC=TTCCACAGGCAGTATCTCTGC;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=37;WE=81962079;WS=81962061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	81973442	rs11150425	T	C	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=0;PP=1040;SC=GAGATTGTCTTACCAGAAGGG;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=35;WE=81973450;WS=81973432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	81973474	rs4405546	C	A	1938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=2;PP=1510;SC=TGTGGCCTCTCATGAGCTTTG;SOR=5.926;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=54;TCF=52;TCR=2;TR=54;WE=81973482;WS=81973464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr16	82124776	rs2955154	G	T	2277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=61;PP=1826;SC=TCAGTTAAAGGGGTGAAAACA;SOR=3.581;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=9;TCR=61;TR=70;WE=82124784;WS=82124766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	82182832	rs11859599	C	G	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=1;PP=1255;SC=AGCTGCCGTGCACTGTGGGGT;SOR=6.316;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=44;WE=82182840;WS=82182822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	82197883	rs2303266	G	A	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=366;SC=TCTTCTACTTGTTCTCCTTCA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=82197891;WS=82197873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	82203705	rs2303265	A	C	4926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.04;SOR=1.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr16	82203711	rs2303264	G	T	4926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.79;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr16	82203742	rs1134847	T	C	5404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=74;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=51;PP=2861;SC=TCATGCGCAGTAGATTCTTGG;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=114;TCF=62;TCR=52;TR=113;WE=82203750;WS=82203732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr16	82203758	rs2303262	C	T	5330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.18;SOR=0.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr16	82203768	rs2303261	G	T	5056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.39;SOR=1.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr16	82203786	rs2303260	C	G	3910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=71;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=31;NR=51;PP=1765;SC=GCCATGGTAGCTTCCGCCCAG;SOR=1.338;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=31;TCR=51;TR=82;WE=82203794;WS=82203776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr16	82673047	rs4782724	C	T	6163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=106;PP=2965;SC=TGGGCGTGACCCACCTGCAGC;SOR=1.149;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=77;TCR=107;TR=183;WE=82673055;WS=82673037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr16	82882118	rs1585533	A	G	1907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=0;PP=1638;SC=TTTTTAAATTATTACTTTGTC;SOR=8.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=55;TCR=0;TR=55;WE=82882126;WS=82882112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	82882188	rs13336316	G	T	1642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.66;ReadPosRankSum=-0.969;SOR=1.309;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,78:0.84:93
chr16	82882283	rs9935254	C	G	10652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.072;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=164;NR=161;PP=2965;ReadPosRankSum=0.120;SC=GCCCTTTACTCATCTGTCTCC;SOR=0.400;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=328;TCF=165;TCR=163;TR=325;WE=82882291;WS=82882273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,340:0.99:343
chr16	82917768	rs929847	G	C	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=2;PP=1167;SC=TCCTTATGCTGTTTCTTTCCA;SOR=5.186;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=40;WE=82917776;WS=82917758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr16	82917852	rs929848	T	C	3102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=54;PP=2147;SC=TGGGCTCCCATGAGAAGGAAA;SOR=0.730;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=49;TCR=54;TR=103;WE=82917860;WS=82917842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr16	83159350	rs7196370	A	C	1454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=1321;ReadPosRankSum=-0.844;SC=GTTGAAATTAAGCAGGAAGAT;SOR=0.582;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=50;WE=83159358;WS=83159340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr16	83214438	rs28437126	C	A	1528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.936;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=10;PP=1204;ReadPosRankSum=0.700;SC=ATTTTAATCCCCAATTTACAA;SOR=2.225;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=44;WE=83214446;WS=83214428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr16	83214480	rs7188594	C	A	1860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=16;PP=1408;SC=TACAGAGAACCCACAATCCTA;SOR=1.812;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=40;TCR=16;TR=56;WE=83214488;WS=83214470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	83251210	rs4572385	G	A	290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=9;PP=225;SC=ACCCGGGACTGCATGGCTTTA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=83251218;WS=83251200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	83520078	rs2306907	G	A	1877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=9;PP=1530;SC=TCTTGCCCCGGTAGGCACCAC;SOR=3.219;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=55;WE=83520086;WS=83520068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	83658857	rs17760896	C	G	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=39;PP=1166;SC=GTAATTTAAGCCAAAATGACG;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=40;WE=83658865;WS=83658847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	83753815	rs72797298	T	C	3580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=66;PP=2631;SC=CACACACTTGTGCATGTACAC;SOR=0.902;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=54;TCR=66;TR=120;WE=83753823;WS=83753805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr16	83753910	rs142886033	TCATGCACACA	T	1961.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=25;PP=2984;SC=ATACATGCACTCATGCACACA;SOR=1.814;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=33;WE=83753927;WS=83753900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	83775105	rs142704908	A	ATATATG	178.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=6;PP=455;SC=ATATATATATATGTGTGTGTG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=7;WE=83775113;WS=83775095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr16	83816828	rs153654	A	G	2103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=3;PP=1736;SC=AGTCTCATCCACTCTCACCAG;SOR=5.838;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=74;TCR=3;TR=77;WE=83816836;WS=83816818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr16	83817019	rs1048612	A	G	3559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=89;PP=2802;SC=GCAACGCGGCAGGGGCCCTGC;SOR=3.258;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=18;TCR=89;TR=107;WE=83817027;WS=83817009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr16	83842792	rs8053753	G	T	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=2;PP=740;SC=TAACAGTGTCGAAAGAAAATT;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=83842800;WS=83842782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	83873259	rs435383	G	A	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=0;PP=573;SC=AGGAACAGAGGACTCATTTCT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=83873267;WS=83873249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	83873285	rs435367	G	A	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=52;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=1;PP=743;SC=GTGTGTGTGTGTGCTCCTGTG;SOR=5.283;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=30;WE=83873293;WS=83873275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	83873300	rs146203605	T	TTG	351.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.781;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.022;NF=10;NR=2;PP=405;ReadPosRankSum=0.589;SC=CCTGTGTCCTTTGTGTGTGTG;SOR=2.833;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=12;WE=83873320;WS=83873290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr16	83873312	rs367415	C	G	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.12;QD=36.13;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	83886468	rs150603407	GTGCACACA	G	5965.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.464;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.718;NF=93;NR=24;PP=2977;SC=GCACACACACGTGCACACATG;SOR=3.070;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=145;TCF=108;TCR=37;TR=117;WE=83886483;WS=83886458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,144:0.99:145
chr16	83933296	rs446036	T	C	985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=27;PP=811;SC=CCGCCGTCGATCCCCCGGCAG;SOR=3.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=30;WE=83933304;WS=83933286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	83984706	rs147293432	CCT	C	268.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=1.028;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.63;ReadPosRankSum=0.612;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,16:0.16:102
chr16	83999653	rs77204347	A	G	1686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=47;PP=1403;SC=CTGAGAGGACAGAGATGACCA;SOR=4.215;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=5;TCR=47;TR=52;WE=83999661;WS=83999643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr16	84005646	.	A	G	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.162;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.284;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,9:0.20:45
chr16	84027225	.	CTGTGTG	C	237.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.208;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.49;MQRankSum=2.349;QD=18.30;ReadPosRankSum=1.742;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr16	84065710	rs907043	A	G	1725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=49;PP=1467;SC=CTGCCTCACCATCCTCATCTG;SOR=4.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=5;TCR=49;TR=54;WE=84065718;WS=84065700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	84070179	.	T	A	325	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=9;NR=0;PP=325;QD=39.9745791719;SC=GGAACAAGAGTGTGGTTTCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=84070187;WS=84070178;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	84075563	rs1105355	C	A	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=4;PP=1176;SC=ACTCACTTCCCGGGGACTTAC;SOR=3.958;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=42;TCR=4;TR=46;WE=84075571;WS=84075553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr16	84089536	rs11415464	T	TG	323.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=2;PP=377;SC=GCCCGCCTCCTGGGGAGGGAG;SOR=2.494;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=10;WE=84089544;WS=84089531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	84093062	rs2280024	G	A	5049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=48;NR=107;PP=2965;SC=TCAACAAAAAGGAAAATCATC;SOR=1.868;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=48;TCR=107;TR=155;WE=84093070;WS=84093052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr16	84097132	rs3215186	CAAAT	C	5425.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.133;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.225;NF=13;NR=90;PP=2947;ReadPosRankSum=1.904;SC=ATCCACGTGACAAATAAACCA;SOR=3.258;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=115;TCF=13;TCR=102;TR=103;WE=84097143;WS=84097122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,124:0.98:126
chr16	84101240	rs3835163	C	CACATTTT	4057.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=6;PP=2900;SC=CCCCAAAAGTCTTATCCAAAT;SOR=4.307;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=67;TCF=61;TCR=6;TR=63;WE=84101248;WS=84101230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	84102135	rs870584	G	C	1805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=41;PP=1505;SC=CACAGGGCCGGCTCTGCAAGA;SOR=1.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=17;TCR=41;TR=58;WE=84102143;WS=84102125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	84104478	rs1980011	C	T	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=18;PP=615;SC=AAACTGGTTCCGAGAAATACT;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=84104486;WS=84104468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	84158248	rs4378600	G	C	8156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=136;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.752;SC=GGCTGTGCAGGATAAGGCTTC;SOR=0.965;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=249;TCF=112;TCR=137;TR=246;WE=84158256;WS=84158238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,255:0.99:257
chr16	84163126	rs17574602	A	G	4578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=35;PP=2965;ReadPosRankSum=0.513;SC=CATTAATCTAATTATGAGACC;SOR=0.741;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=144;TCF=109;TCR=35;TR=142;WE=84163134;WS=84163116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,143:0.99:145
chr16	84203730	rs9972733	G	C	1821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=25;PP=1370;SC=TTAAAGGAGAGGACGGAGATG;SOR=1.092;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=63;TCF=38;TCR=25;TR=61;WE=84203738;WS=84203720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr16	84217062	rs4782591	C	T	6280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=164;PP=2965;SC=CCGATACCGGCACCCTCCGCG;SOR=2.601;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=210;TCF=44;TCR=166;TR=208;WE=84217070;WS=84217052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr16	84224805	rs8044351	G	C	2019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=17;PP=1562;SC=GCGCGAGATAGGGCCTAGCGC;SOR=2.235;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=53;TCR=17;TR=69;WE=84224813;WS=84224795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr16	84224967	rs8044695	G	A	2591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=45;PP=2114;SC=AGTGCCTGGGGGCCCGCGCCC;SOR=1.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=32;TCR=45;TR=77;WE=84224975;WS=84224957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr16	84225327	rs8049081	C	G	2081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=44;PP=1681;SC=ACGTGGGGAGCAGGGGGTCTG;SOR=1.574;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=21;TCR=44;TR=65;WE=84225335;WS=84225317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr16	84225372	rs111685508	A	G	1563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=38;PP=1232;SC=GCTCAGAGACACCGCCGGAGC;SOR=2.701;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=49;WE=84225380;WS=84225362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	84255809	rs56796255	T	C	3477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=33;PP=2541;ReadPosRankSum=1.191;SC=CATGTAGTCATGGGGGGTGCT;SOR=0.774;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=75;TCR=33;TR=107;WE=84255817;WS=84255799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,115:0.99:116
chr16	84256410	rs7196482	C	T	3891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=61;NR=52;PP=2965;SC=TAGGAGCTCCCGCTCGGCCTC;SOR=0.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=61;TCR=52;TR=113;WE=84256418;WS=84256400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr16	84270381	rs244811	G	A	3536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=26;PP=2959;SC=TGACACACAGGCTGACGGCTG;SOR=2.237;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=81;TCR=26;TR=107;WE=84270389;WS=84270371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr16	84271193	rs11647665	C	T	4257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=102;PP=2965;SC=GGCAAAGAGTCCTGGATGTCA;SOR=3.138;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=17;TCR=102;TR=119;WE=84271201;WS=84271183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr16	84328494	rs400345	C	T	1827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=0;PP=1526;SC=AGACTGTGCACGCTCCTGTCC;SOR=8.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=54;TCR=0;TR=54;WE=84328502;WS=84328484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	84328752	rs369797	G	T	4523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.79;SOR=3.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr16	84328756	rs401782	G	C	4536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.83;SOR=3.103;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr16	84328826	rs429725	A	G	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=32;PP=941;SC=TGCTCCCCCAAAACGTGGCAA;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=84328834;WS=84328816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	84357925	rs244786	G	T	1490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=12;PP=1222;SC=AGTGAGATGGGGAGACTGAAA;SOR=2.208;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=47;WE=84357933;WS=84357915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr16	84358121	rs244787	A	C	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=33;PP=1058;SC=AGGCAGTGAAAGTTTCTTATG;SOR=2.030;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=45;WE=84358129;WS=84358111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr16	84431973	rs12148971	C	T	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=1;PP=457;SC=GATCATGACACTGCACTCCAG;SOR=4.294;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=84431981;WS=84431963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	84438512	rs11149650	G	A	3751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=31;PP=2965;SC=GACCAGAGTCGTCTTTTCTGC;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=85;TCR=32;TR=116;WE=84438520;WS=84438502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr16	84444349	rs247818	A	C	3312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=66;PP=2618;SC=GCTGACCAAGATGGTTCCTCC;SOR=1.565;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=31;TCR=66;TR=97;WE=84444357;WS=84444339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr16	84456642	rs247814	G	A	1436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=0;PP=1138;SC=ATACGCACAGGTCTTCAGTGC;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=38;WE=84456650;WS=84456632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	84456705	rs185063	C	T	3401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=26;PP=2577;SC=ATCACTGAAGCTGTAGGATGG;SOR=2.240;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=105;TCF=79;TCR=26;TR=104;WE=84456713;WS=84456695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr16	84472972	rs247905	G	A	2006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=14;PP=1628;SC=ATCCAGCCTGGGGGTTTCACA;SOR=2.157;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=62;TCF=47;TCR=15;TR=61;WE=84472980;WS=84472962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	84473137	rs247904	G	C	2109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=41;PP=1673;SC=CGAGGTGAGTGCCAAAGGAAT;SOR=1.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=27;TCR=41;TR=68;WE=84473145;WS=84473127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr16	84473195	rs247903	T	A	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=34;PP=1066;SC=CTTTCTAAACTAAGCACACAA;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=37;WE=84473203;WS=84473185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	84481995	rs247891	T	C	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=350;SC=GTCCAGCACCTGTGAACAGCA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=84482003;WS=84481985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr16	84485573	rs247885	C	A	3667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=33;PP=2965;SC=TGACGTTTCTCGGTCTTGTGG;SOR=1.757;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=82;TCR=33;TR=115;WE=84485581;WS=84485563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr16	84486700	rs193704	G	A	2116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=8;PP=1764;SC=GAGGGGTGGGGACGCGGGCCT;SOR=3.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=56;TCR=8;TR=64;WE=84486708;WS=84486690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	84486867	rs2435172	A	G	5971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=93;PP=2965;SC=CTTGGCTGGCAGTGGGGCTGG;SOR=0.818;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=200;TCF=107;TCR=93;TR=199;WE=84486875;WS=84486857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr16	84487056	rs247884	C	T	1883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=55;PP=1565;ReadPosRankSum=-0.907;SC=CTCATGCGTCCGTCGGGTGAC;SOR=5.353;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=58;TCF=2;TCR=56;TR=57;WE=84487064;WS=84487046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr16	84488676	rs113623854	A	AGG	1293.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=1;NR=34;PP=517;SC=GTGGAGATAGAGGGGGGGGTC;SOR=3.180;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=35;WE=84488684;WS=84488666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	84488754	rs247882	T	C	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=453;SC=CAACCCCAAGTACCAACAGCC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=84488762;WS=84488744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	84493032	rs3743654	C	T	4085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=60;PP=2965;SC=TCTCTTTACCCACCTGCGGGG;SOR=0.772;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=65;TCR=61;TR=124;WE=84493040;WS=84493022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr16	84493144	rs410388	C	G	2740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=57;PP=2174;SC=TGTTGCACTGCAGTGAGACTG;SOR=1.872;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=25;TCR=57;TR=82;WE=84493152;WS=84493134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr16	84493927	rs35858301	G	A	1544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=8;PP=1249;SC=GGCGGAGCCTGGAGCCTGTTT;SOR=3.126;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=47;WE=84493935;WS=84493917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	84493954	.	G	GA	2780.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.410;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.177;HP=7;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.254;NF=45;NR=16;PP=1492;ReadPosRankSum=0.154;SC=GCGCAACGTTGGGGGGGGTCC;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=47;TCR=17;TR=61;WE=84493962;WS=84493944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,70:0.97:72
chr16	84494020	rs393515	G	T	4084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=52;PP=2965;SC=TTGGCCTTACGGGGTGGTCTT;SOR=1.027;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=126;TCF=74;TCR=52;TR=124;WE=84494028;WS=84494010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr16	84494275	rs2241640	C	T	8430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=121;NR=134;PP=2965;SC=GGGTAGAGCCCGTTGACAAAG;SOR=0.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=256;TCF=121;TCR=135;TR=255;WE=84494283;WS=84494265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr16	84495761	rs34205686	G	C	1355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=47;PP=1138;SC=GGGAACGACAGGTGACCTCGA;SOR=4.977;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=50;WE=84495769;WS=84495751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	84513463	rs899250	T	G	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=2;PP=706;SC=GCTGCAGGCGTTGCCCTCTAC;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=84513471;WS=84513453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	84520396	rs422145	A	G	4917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=71;PP=2965;SC=AAGAGCAGGCACCAGCGGTGC;SOR=0.961;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=92;TCR=71;TR=163;WE=84520404;WS=84520386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr16	84520537	rs431818	T	C	6040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=114;PP=2965;SC=GAGCACAGGATGAGAAAGCCC;SOR=0.962;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=87;TCR=114;TR=200;WE=84520545;WS=84520527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr16	84520780	rs378384	G	C	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=19;PP=572;SC=ACTGAGCACAGAAAACAGGGC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=84520788;WS=84520770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	84523025	rs111396691	T	C	4591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.829;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=84;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.053;SC=AGATCCTCTGTAAACTGTAAG;SOR=0.230;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=142;TCF=55;TCR=87;TR=139;WE=84523033;WS=84523015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,147:0.99:149
chr16	84523152	rs111274320	G	C	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=32;PP=985;SC=GTGGGGAAAGGTCATGCAATG;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=34;WE=84523160;WS=84523142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	84528235	rs62050761	T	C	2205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=0;PP=1836;SC=TTTCCAGTGTTGTCTTCCCTT;SOR=8.318;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=62;TCR=0;TR=61;WE=84528243;WS=84528225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr16	84528317	rs2435171	G	C	5378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=117;NR=47;PP=2965;SC=TCACAACCTGGTAAAAATGAG;SOR=1.967;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=117;TCR=47;TR=164;WE=84528325;WS=84528307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr16	84529255	.	G	A	2521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.824;ClippingRankSum=0.000;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=8;PP=2050;ReadPosRankSum=1.439;SC=CAAGACTGCTGAGGAGGCTGC;SOR=2.662;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=71;TCR=8;TR=78;WE=84529263;WS=84529245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,81:0.99:82
chr16	84530883	rs12599743	A	C	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=205;SC=CCGAGCACTCAAACCTGCAGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=84530891;WS=84530875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	84531307	rs442288	G	C	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=21;PP=728;SC=GATGCGTTTAGACACTGTCTA;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=84531315;WS=84531297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	84531780	rs501782	T	C	1917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=53;PP=1646;SC=AAAATAAATGTTGAGAATTAT;SOR=5.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=55;TCF=2;TCR=53;TR=55;WE=84531788;WS=84531770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	84693149	rs67118461	G	A	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=0;PP=1323;SC=GACTCAGAGCGTCTCCATCCC;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=45;WE=84693157;WS=84693139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	84695126	rs12924673	G	A	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=2;PP=406;SC=CGGCTCGGAGGGGGTAAGCCT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=84695134;WS=84695116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	84695280	rs17755815	A	G	4550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=31;PP=2965;SC=AGAACCTGCTATGCTACGACC;SOR=2.269;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=102;TCR=31;TR=133;WE=84695288;WS=84695270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr16	84695490	rs12928590	C	T	2982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=43;PP=2496;SC=CGCTGCTGCACGCCAACAGCG;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=46;TCR=43;TR=89;WE=84695498;WS=84695480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr16	84774184	.	T	C	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=215;SC=GTGCCAGCCATGTAAGATTTA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=84774192;WS=84774174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	84792428	rs7202832	C	T	5069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=137;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.405;SC=CCTTCCTGGACGCCGTCCGCA;SOR=1.025;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=164;TCF=24;TCR=140;TR=161;WE=84792436;WS=84792418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,163:0.98:166
chr16	84797637	rs3213810	T	A	5413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=137;NR=36;PP=2965;SC=GTGCCTTTTTTTTTTTTGCTG;SOR=2.647;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=173;TCF=137;TCR=36;TR=173;WE=84797645;WS=84797627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr16	84808824	rs774298	C	G	7184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=153;NR=67;PP=2965;SC=CCTATCGGCTCTTTGCAGGTG;SOR=1.794;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=220;TCF=153;TCR=67;TR=220;WE=84808832;WS=84808814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr16	84879286	rs12931881	G	A	1885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=4;PP=1560;SC=GCAGAGCATTGGCTGTAGGCT;SOR=4.840;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=57;TCF=53;TCR=4;TR=57;WE=84879294;WS=84879276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr16	84879324	rs12051168	T	C	2895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=18;PP=2214;SC=GGGGCGTTGCTGTATTTATGG;SOR=2.783;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=71;TCR=18;TR=89;WE=84879332;WS=84879314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr16	84879464	rs12051468	A	G	3261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=69;PP=2663;SC=CGGGCCCACCAGTCTGCTGGT;SOR=1.480;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=39;TCR=69;TR=108;WE=84879472;WS=84879454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr16	84882911	rs4783086	T	C	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=5;PP=945;SC=CCCTCCCTCCTACCTGCCCGT;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=35;WE=84882919;WS=84882901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr16	84882974	rs4783087	C	A	1699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=21;PP=1414;SC=ACTGAGTGAGCGGTTTCTGCC;SOR=1.136;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=30;TCR=21;TR=51;WE=84882982;WS=84882964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	84883102	rs8061351	C	T	2375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=46;PP=1856;SC=GCTCGGGGCCCATGTGCACGC;SOR=1.150;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=30;TCR=46;TR=76;WE=84883110;WS=84883092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr16	84883195	rs140532417	A	ATTG	1222.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=22;PP=1163;SC=CCCCTGGGGGATTGTCAAATC;SOR=5.283;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=23;WE=84883203;WS=84883185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	84884072	rs4782673	T	G	1558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=9;PP=1175;SC=ACCCTTCACCTCGTACCTCTT;SOR=3.180;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=45;TCR=9;TR=54;WE=84884080;WS=84884062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	84884116	rs4783090	A	G	3133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=27;PP=2447;SC=AGGCCAAATGATATCACCCTT;SOR=1.896;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=66;TCR=27;TR=92;WE=84884124;WS=84884106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr16	84888541	rs2646127	T	C	7320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=199;PP=2965;SC=TCACCCCTCCTGGCCCTATTT;SOR=2.788;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=251;TCF=52;TCR=199;TR=251;WE=84888549;WS=84888531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr16	84888597	rs2646126	C	G	3933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=109;PP=2965;SC=TGAGCTGAGCCTCATCTCCAG;SOR=6.770;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=112;TCF=3;TCR=109;TR=112;WE=84888605;WS=84888587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr16	84907499	rs11298434	GT	G	400.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=1.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=3.257;QD=4.22;ReadPosRankSum=2.534;SOR=1.185;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,43:0.45:95
chr16	84940479	rs1874008	T	C	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=23;PP=580;SC=TGCTGGGGCCTGGGGGTCTCC;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=84940487;WS=84940469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	85009970	rs7195377	A	G	2315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=39;PP=1809;SC=ACTCCGGGCCACCTTTTCTGG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=40;TCR=39;TR=79;WE=85009978;WS=85009960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr16	85011423	rs57465878	CA	C	786.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=791;SC=AAAATAATTGCAATGATTTCC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=20;WE=85011431;WS=85011417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	85011480	rs8045409	T	C	1565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=4;PP=1331;SC=TCCCCTTTCATCCAATAACAG;SOR=4.047;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=44;TCR=4;TR=48;WE=85011488;WS=85011470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	85011622	rs8044638	G	A	3358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=80;PP=2791;SC=CTAGAATGAGGGGGAGATTGG;SOR=2.465;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=24;TCR=80;TR=104;WE=85011630;WS=85011612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr16	85015541	rs16975086	G	A	2986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=37;PP=2215;ReadPosRankSum=-0.786;SC=TGACTTCCCCGGGCTTCAGCT;SOR=0.440;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=91;TCF=54;TCR=37;TR=89;WE=85015549;WS=85015531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,95:0.99:96
chr16	85023855	rs931713	C	T	3591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=26;PP=2912;SC=CAGCCACACCCGAGGACACTA;SOR=2.345;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=81;TCR=27;TR=107;WE=85023863;WS=85023845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr16	85105296	rs12445079	C	T	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=425;SC=GGGAATATTTCGTTAGTTCCT;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=85105304;WS=85105286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	85105554	rs8058770	A	C	3080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=57;PP=2488;SC=AAGCATAACAAATTTGACTTT;SOR=1.313;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=35;TCR=57;TR=92;WE=85105562;WS=85105544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr16	85105643	rs12597135	C	T	1183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=33;PP=1043;SC=TCCAAAAATACTCTGAAAAGG;SOR=4.351;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=35;WE=85105651;WS=85105633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	85106500	rs7184546	C	G	3267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=47;PP=2412;SC=CGCCCTGAACCTCAATGATGT;SOR=0.922;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=60;TCR=47;TR=107;WE=85106508;WS=85106490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr16	85109328	rs16975200	A	G	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=433;SC=TGTTTTGTGCATCTCCAGTGG;SOR=4.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=20;WE=85109336;WS=85109318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	85112002	rs2291967	T	G	6208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=106;PP=2965;SC=GTGTCATCATTGTGCCTTCTC;SOR=1.018;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=81;TCR=106;TR=186;WE=85112010;WS=85111992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr16	85112097	rs12932461	C	G	2705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=69;PP=2150;SC=AGACGCCCAGCCCACAGCCCC;SOR=3.312;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=13;TCR=69;TR=82;WE=85112105;WS=85112087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	85120500	rs7206590	C	T	1679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.20;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	85120609	rs2291962	A	G	3803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=19;PP=2965;SC=TCCCAGAGACAAGGGCCCAGC;SOR=3.434;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=114;TCR=19;TR=133;WE=85120617;WS=85120599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr16	85139173	rs8050910	G	T	1295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=35;PP=1106;SC=CTTGCTAATTGGGTCATCAAA;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=38;WE=85139181;WS=85139163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	85141076	.	G	T	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=6;PP=1119;SC=GGGACTGATGGTATCAATAAT;SOR=3.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=43;WE=85141084;WS=85141066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	85145800	rs60296580	C	G	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=1;PP=289;SC=GGTGGAGGCACCGTGGGAGGG;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=85145808;WS=85145790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	85145977	rs9931038	T	C	3047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=57;PP=2241;SC=GAGCTTTGGCTGTCCCGGTGC;SOR=0.849;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=49;TCR=57;TR=106;WE=85145985;WS=85145967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr16	85690338	rs4843185	G	A	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=361;SC=GCCCTGAATCGCAGCACCTGC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=85690346;WS=85690328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	85690878	rs34805959	C	CA	1958.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=7;PP=2097;SC=TGTTTCCCCCCACAGAGAAGC;SOR=3.422;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=50;WE=85690886;WS=85690868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	85691294	rs7404958	A	G	2927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=71;PP=2185;SC=CTGTTTGCCCAACATCCTGCC;SOR=3.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=11;TCR=71;TR=82;WE=85691302;WS=85691284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr16	85706047	rs9940601	A	C	3383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=47;PP=2555;SC=GGTCTCAGAAAGGGAGCGGCT;SOR=1.140;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=69;TCR=47;TR=116;WE=85706055;WS=85706037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr16	85712105	rs3815795	C	T	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=540;SC=TGAAATTATGCGGCATCAAGG;SOR=3.816;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=85712113;WS=85712095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	85720955	rs3815797	G	A	1917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=1;PP=1634;SC=CGGAACAGAGGGAGCACGGAC;SOR=6.701;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=54;TCF=53;TCR=1;TR=54;WE=85720963;WS=85720945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr16	85721297	rs9930592	T	A	2119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=54;PP=1687;SC=CCAAATGCAATTAATAAAAAC;SOR=3.360;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=9;TCR=54;TR=63;WE=85721305;WS=85721287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr16	85722355	rs2303204	GC	TT	3301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=5;PP=1832;SC=TGAAGGCCACGCGGGAGCCCC;SOR=4.587;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=70;TCF=64;TCR=6;TR=63;WE=85722364;WS=85722345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	85722557	.	T	C	3272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.64;SOR=5.339;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr16	85722560	rs58171120	C	G	3239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.28;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr16	85743732	rs2305357	C	G	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=1;PP=705;SC=CGGGCCCCCACAGCCGACCCG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=85743740;WS=85743722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	85768606	.	A	G	365	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=12;NR=0;PP=365;QD=33.3142677123;SC=CTAGTGAAATAGAAGGCCTGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=85768614;WS=85768605;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	85768717	rs1862733	C	T	3163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=88;NR=4;PP=2637;SC=CAGAGGGCTTCAACTCCCCTC;SOR=5.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=92;TCF=88;TCR=4;TR=92;WE=85768725;WS=85768707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr16	85775064	rs388855	A	G	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=7;PP=871;SC=AGCTCCAGCCAGGATTCAGGT;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=38;WE=85775072;WS=85775054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	85775097	rs72803098	G	C	1910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=11;PP=1551;SC=AGGATGCAGTGAGGGTCAGGC;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=44;TCR=11;TR=55;WE=85775105;WS=85775087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr16	85775175	rs446444	G	A	2963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=40;PP=2138;SC=GAACTCCCACGTGGAGAGTTT;SOR=0.870;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=47;TCR=40;TR=87;WE=85775183;WS=85775165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr16	85813963	rs301165	C	T	3497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=82;NR=31;PP=2695;SC=CCAGCCCGCGCGGCAGCATGG;SOR=2.001;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=83;TCR=31;TR=113;WE=85813971;WS=85813953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr16	85814899	rs3081701	T	TAGTC	9945.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=77;PP=2957;SC=GTCAAAGAAATAGGCTACCAC;SOR=1.265;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=101;TCR=83;TR=169;WE=85814907;WS=85814889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr16	85814995	rs301166	A	G	6030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=155;PP=2965;SC=AAAGACTGGCAGAGCCAACAG;SOR=3.865;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=23;TCR=155;TR=178;WE=85815003;WS=85814985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr16	85815074	rs301167	C	T	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=33;PP=1069;SC=TCTTGCTCTGCTGCCCTAGCT;SOR=4.921;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=36;WE=85815082;WS=85815064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	85838093	rs2599088	G	A	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=53.03;NF=1;NR=1;PP=25;SC=CTTCCGAGTAGCTGGGACTAT;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=85838101;WS=85838088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr16	85838115	rs2733963	G	A	176.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=44.77;NF=4;NR=1;PP=112;SC=GGCACGTGCCGCCACGCCCGG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=5;WE=85838123;WS=85838105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr16	85838166	rs2599089	G	A	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=282;SC=GTTTCACCATGTTAGCCAGGA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=85838174;WS=85838156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr16	85838195	rs2733964	A	C	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=2;PP=350;SC=ATCTCCTGACATCGTGATCCG;SOR=4.047;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=85838203;WS=85838185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	85838503	rs2599090	T	C	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=2;PP=555;SC=GACTCTCAACTTACATGGATT;SOR=3.160;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=85838511;WS=85838493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	85838532	rs2733965	A	G	1345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=4;PP=1098;SC=TTTATTCAATATGTTTTTCAG;SOR=3.611;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=39;WE=85838540;WS=85838522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	85838653	rs2599091	T	C	2278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=22;PP=1780;SC=CCAGAAGGCATTGAAGGAGAA;SOR=1.426;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=46;TCR=22;TR=68;WE=85838661;WS=85838643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	85838804	rs11419687	G	GA	2141.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=47;PP=2181;SC=ACTGTCTAGAGGCAGTCTTGC;SOR=3.611;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=4;TCR=48;TR=51;WE=85838812;WS=85838794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	85839140	rs2599092	T	C	1884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=53;NR=2;PP=1546;SC=CATTTTCTTCTTTCCTTGCCC;SOR=5.820;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=55;TCF=53;TCR=2;TR=55;WE=85839148;WS=85839130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	85839186	rs2733966	C	T	2622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=15;PP=2131;SC=TGTGCACGTACGTGCGTGAAC;SOR=2.975;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=66;TCR=15;TR=81;WE=85839194;WS=85839176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr16	85839543	rs2641797	C	G	2042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=62;PP=1816;SC=GGTGGGCTGTCGGGGACCTCC;SOR=8.222;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=0;TCR=62;TR=62;WE=85839551;WS=85839533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	85840035	rs5818557	CA	C	4636.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.09;NF=70;NR=31;PP=2957;SC=GGGTTAATAACAGACCCGAAT;SOR=2.033;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=107;TCF=75;TCR=32;TR=101;WE=85840043;WS=85840025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr16	86369306	rs3828516	C	A	1089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=5;PP=923;SC=ACGCAGCACCCGCAGTCTCCA;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=86369314;WS=86369296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	86565826	rs3751803	C	G	7419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=139;NR=109;PP=2965;SC=CGGGCGTCCCCGGGGAGGTTC;SOR=1.025;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=248;TCF=139;TCR=109;TR=248;WE=86565834;WS=86565816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr16	86574897	rs34551811	TA	T	83.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.15;ReadPosRankSum=0.119;SOR=0.604;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,16:0.22:73
chr16	86575460	rs3213418	C	G	4799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=120;PP=2965;SC=AAAGGGGCTGCTGGGAATGCC;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=29;TCR=120;TR=149;WE=86575468;WS=86575450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr16	86585905	rs8046613	C	A	3573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=91;PP=2965;SC=CGCCCTGTTTCCAATGCAATC;SOR=3.238;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=110;TCF=18;TCR=92;TR=109;WE=86585913;WS=86585895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr16	86588655	rs2354022	G	C	7002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=139;NR=96;PP=2965;SC=GACCTCCTCGGCCGCTTCCGG;SOR=1.274;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=235;TCF=139;TCR=96;TR=235;WE=86588663;WS=86588645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr16	86588993	rs3751796	T	C	7018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=155;NR=60;PP=2965;SC=CTAGTCATTGTCGAGCGCCGC;SOR=1.892;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=215;TCF=155;TCR=60;TR=215;WE=86589001;WS=86588983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr16	87339278	rs11646030	T	C	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=3;PP=476;SC=CAGGTGGACGTCACCATGCCA;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=87339286;WS=87339268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	87349333	rs6540037	A	G	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=2;PP=1048;SC=CCCCACAGGGATATGTTGGGG;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=35;WE=87349341;WS=87349323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr16	87349489	rs7193801	A	G	2929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=63;PP=2398;SC=GGGATGCTAGAGCACAGGCCT;SOR=1.880;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=27;TCR=63;TR=90;WE=87349497;WS=87349479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr16	87349529	rs7198660	T	C	2864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.76;SOR=3.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr16	87349533	rs2277850	A	G	2758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.98;SOR=4.139;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	87350997	rs4843592	A	G	1371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=41;PP=1204;SC=GAGCCCAACAACGCCCGCGCG;SOR=5.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=43;WE=87351005;WS=87350987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	87376623	rs4843237	C	G	1649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=37;PP=1297;SC=CATCCCCCACCCCAGGCAGGT;SOR=1.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=53;WE=87376631;WS=87376613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	87416903	rs8058715	A	T	205.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=3;PP=137;SC=CCCGCGCCCAACTGGTGGCCC;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=87416911;WS=87416893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	87426028	rs8043569	T	C	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=12;PP=417;SC=CCCAGATCCCTGCACCATGCC;SOR=0.963;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=20;WE=87426036;WS=87426018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	87436382	rs8044820	G	A	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=0;PP=523;SC=ATCAAAGGAAGTGTCCTGTGC;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=87436390;WS=87436372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	87436720	rs1054521	G	T	8341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=194;PP=2965;SC=AAAAAATGCAGCTCTTCTAGA;SOR=1.504;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=297;TCF=102;TCR=195;TR=296;WE=87436728;WS=87436710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr16	87436764	rs1054528	A	G	6282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=175;PP=2965;SC=AAAAAAAGGGATGTTACCAAC;SOR=4.087;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=21;TCR=175;TR=196;WE=87436772;WS=87436754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr16	87451273	rs56283442	G	T	2010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=55;PP=1599;SC=AGGGGGCGGCGGAGCCGGCCG;SOR=3.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=6;TCR=55;TR=61;WE=87451281;WS=87451263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	87451358	rs79319720	A	G	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=16;PP=512;SC=CCTGTGGGACAGGGGCAGGAG;SOR=3.056;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=87451366;WS=87451348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	87452403	rs28607955	A	G	6317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=179;NR=43;PP=2965;SC=CAAAGTAAACATTGTAAAATG;SOR=2.885;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=224;TCF=181;TCR=43;TR=222;WE=87452411;WS=87452393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr16	87454310	rs78839939	A	G	3994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=57;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.743;SC=TCTTCAGGATAGAGCTGACAT;SOR=0.286;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=68;TCR=57;TR=124;WE=87454318;WS=87454300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,127:0.99:128
chr16	87457526	rs56974220	A	G	6964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=126;PP=2965;SC=AGAAACAGACACCACATACTT;SOR=0.876;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=232;TCF=105;TCR=127;TR=231;WE=87457534;WS=87457516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr16	87466695	rs80015854	G	C	4959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=57;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.682;SC=TTTCTTCCTAGCCTTCCAGGA;SOR=0.538;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=158;TCF=101;TCR=57;TR=157;WE=87466703;WS=87466685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,162:0.99:163
chr16	87466803	rs146823917	A	G	3316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=88;PP=2693;SC=TCTTTTCAACACTCACTGTAA;SOR=3.767;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=14;TCR=88;TR=102;WE=87466811;WS=87466793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr16	87638528	.	G	C	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.601;ClippingRankSum=0.000;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.073;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=32;PP=638;ReadPosRankSum=1.325;SC=CCCTGACCCTGGGGCGCTGAG;SOR=1.596;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=92;TCF=28;TCR=64;TR=41;WE=87638536;WS=87638518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,42:0.43:97
chr16	87678441	rs8051448	C	T	7907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=130;PP=2965;SC=GCAACCGGCGCCATGGCTACG;SOR=0.785;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=251;TCF=121;TCR=130;TR=251;WE=87678449;WS=87678431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr16	87723838	rs34767155	T	C	9676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=150;NR=150;PP=2965;SC=TGGAGACGCATCCCCAGAAAA;SOR=0.706;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=301;TCF=151;TCR=150;TR=300;WE=87723846;WS=87723828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr16	87729256	rs72810189	T	C	7032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.554;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.240;NF=100;NR=132;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.400;SC=CCATTCCCTGTGCAGCAGGTA;SOR=0.631;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=233;TCF=101;TCR=132;TR=232;WE=87729264;WS=87729246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,237:1.00:238
chr16	87729334	rs34111279	C	CA	9103.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.313;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.240;NF=97;NR=107;PP=2973;ReadPosRankSum=-0.633;SC=CGCTCCCTCTCCCCCTGCCTG;SOR=0.457;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=208;TCF=97;TCR=111;TR=204;WE=87729342;WS=87729324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,237:1.00:238
chr16	87734747	rs35750555	C	G	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.15;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	87735151	rs113060137	T	A	3289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=1;PP=2810;SC=AGTGTGGGCGTGAGCTCACCC;SOR=7.743;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=97;TCF=95;TCR=2;TR=95;WE=87735159;WS=87735141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr16	87735837	rs78717714	C	T	9823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.649;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=108;NR=198;PP=2965;ReadPosRankSum=0.676;SC=GCCAACTCCTCCTCCACAGTG;SOR=0.316;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=310;TCF=109;TCR=201;TR=306;WE=87735845;WS=87735827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,312:0.99:314
chr16	87742129	rs2290017	G	A	3840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=97;PP=2965;SC=AGGTGGGGGAGGCTGCGGGAC;SOR=4.193;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=12;TCR=97;TR=109;WE=87742137;WS=87742119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr16	87744756	rs60382083	A	C	5220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=152;NR=1;PP=2965;SC=CCCCAATACCAAAAGGTGCTG;SOR=8.675;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=153;TCF=152;TCR=1;TR=153;WE=87744764;WS=87744746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr16	87748198	rs2081981	G	C	3956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=59;PP=2965;SC=GAAAGGAATTGTGTGAGAACC;SOR=0.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=53;TCR=59;TR=112;WE=87748206;WS=87748188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr16	87760337	rs67926154	A	C	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=0;PP=582;SC=TTCCCGGTCCAACGCCTTGCC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=87760345;WS=87760327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	87764403	rs34481270	C	G	1740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=48;PP=1497;SC=TCTGATCTATCAACTACCAAA;SOR=5.590;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=50;WE=87764411;WS=87764393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	87782182	rs56031151	A	T	1455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=6;PP=1170;SC=AGTTCCTCTGAACCCTGGTAT;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=44;WE=87782190;WS=87782172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	87782396	rs34779002	C	A	2353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=56;PP=1869;SC=CTGTCCGCCACCTTGAGGCAC;SOR=2.568;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=16;TCR=56;TR=72;WE=87782404;WS=87782386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	87788756	rs2303770	A	G	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=2;PP=649;SC=CCAGACTCCCACGTGGGAAGA;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=87788764;WS=87788746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	87788836	rs17699859	G	A	2034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=4;PP=1668;ReadPosRankSum=1.280;SC=GACTGGGGATGTCAACTTTGG;SOR=3.643;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=59;TCR=4;TR=62;WE=87788844;WS=87788826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr16	87788864	rs2303771	G	A	3153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=23;PP=2538;SC=GTCCTTTCTGGTATTGTAGAC;SOR=2.448;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=74;TCR=23;TR=97;WE=87788872;WS=87788854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr16	87795580	rs2303772	G	C	3525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=62;PP=2927;SC=GGGCACGGAAGTTCCACAGTC;SOR=0.956;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=47;TCR=62;TR=109;WE=87795588;WS=87795570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr16	87798732	rs4843266	G	C	2518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=14;PP=2097;SC=CATAAAACTGGCCCCGGTTAG;SOR=2.985;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=64;TCR=14;TR=78;WE=87798740;WS=87798722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	87873442	rs33992624	C	G	4871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=89;PP=2965;SC=CTGGAAAGAACAGGGACGACA;SOR=1.225;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=58;TCR=89;TR=147;WE=87873450;WS=87873432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr16	87903082	rs3829509	G	C	267.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=1;NR=8;PP=209;SC=CCAGCGAGCAGTGTGCGCGCC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=87903090;WS=87903072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	87960560	rs12922226	A	T	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=35;PP=995;SC=CACTGCAGGGAGAGAGACGGA;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=87960568;WS=87960550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	87969777	.	TA	T	91.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQRankSum=-0.933;QD=2.87;ReadPosRankSum=0.104;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr16	88008712	rs71156278	C	CT	2209.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=4;PP=2357;SC=GGCCACTCTCCGTGCTCTGGA;SOR=4.731;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=50;TCR=4;TR=52;WE=88008720;WS=88008702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	88012150	rs8052854	T	G	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=429;SC=TTTAAAAGTTTCATTAAGTGA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=88012158;WS=88012140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	88017809	rs3815820	C	T	4516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=92;PP=2965;SC=CCATCCAGGTCCCCATGGTGG;SOR=0.864;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=163;TCF=71;TCR=92;TR=162;WE=88017817;WS=88017799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr16	88052161	rs7499814	C	A	1955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=18;PP=1546;SC=AGATGGCGCTCACGCTGCTGG;SOR=1.888;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=42;TCR=18;TR=60;WE=88052169;WS=88052151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	88061150	rs74740586	C	T	2919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=39;PP=2283;SC=AGCAGAGCATCGACTCCAAGT;SOR=0.878;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=49;TCR=39;TR=88;WE=88061158;WS=88061140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr16	88066655	rs11641367	A	G	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.70;QD=44.70;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	88066659	rs11646301	C	A	972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.68;QD=42.29;SOR=4.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	88110160	rs139782953	T	C	3452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=54;PP=2733;SC=GTGCTGGGTATTTTTCTAGAA;SOR=0.711;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=106;TCF=52;TCR=54;TR=106;WE=88110168;WS=88110150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr16	88123598	rs8063486	C	G	3299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=37;PP=2540;SC=TGTCTTCTCTCTCAGGCGGCA;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=59;TCR=37;TR=96;WE=88123606;WS=88123588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr16	88123697	rs8063654	C	A	3076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=48;PP=2529;SC=GAGGCCCAGACCTGAGACCCC;SOR=0.852;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=43;TCR=48;TR=91;WE=88123705;WS=88123687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr16	88124525	rs28650772	A	G	271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=5;PP=206;SC=CCCACCTGCCACCTCAGAGGG;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=10;WE=88124533;WS=88124515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	88134285	rs11860533	A	G	1017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.71;QD=32.83;SOR=2.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	88494947	rs11648572	T	C	8710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=171;NR=94;PP=2965;SC=TGCCCTCTCTTCCCCTGGAGC;SOR=1.431;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=265;TCF=171;TCR=94;TR=265;WE=88494955;WS=88494937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr16	88494976	rs11640794	A	C	11166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=208;NR=131;PP=2965;SC=CGGCCCCGAGACCCTTCTCTG;SOR=1.296;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=339;TCF=208;TCR=131;TR=339;WE=88494984;WS=88494966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,345:1.00:345
chr16	88495407	rs7199961	G	C	5489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=64;PP=2965;SC=CCCGCGGGGGGCCCCGAGTGG;SOR=1.421;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=115;TCR=65;TR=179;WE=88495415;WS=88495397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr16	88495654	rs12927001	A	G	9380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=163;NR=143;PP=2965;SC=GCGAGTCCCCACTGCCGTCAC;SOR=0.858;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=306;TCF=163;TCR=143;TR=306;WE=88495662;WS=88495644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
chr16	88497031	rs9924504	T	C	3435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=52;PP=2737;SC=AGGAGCTCATTCTGAAGATCG;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=57;TCR=52;TR=109;WE=88497039;WS=88497021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr16	88497400	rs9938800	G	A	4716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=115;NR=26;PP=2965;SC=CCCGTGGCCCGTCTCGAAGCC;SOR=2.865;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=115;TCR=26;TR=141;WE=88497408;WS=88497390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr16	88497446	rs7197071	A	G	6866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=175;NR=58;PP=2965;SC=GGGAGGCCCCAAGTGTGCTGA;SOR=2.215;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=235;TCF=177;TCR=58;TR=233;WE=88497454;WS=88497436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr16	88498221	rs4782300	C	T	15096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=472;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=329;NR=141;PP=2965;SC=GCATCGCCACCGACCTTGGAG;SOR=1.886;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=470;TCF=329;TCR=141;TR=470;WE=88498229;WS=88498211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,469:1.00:469
chr16	88498297	rs12445417	T	G	15932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=558;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=247;NR=296;PP=2965;ReadPosRankSum=0.907;SC=GCAGCCTGTCTGCGAACAGGG;SOR=0.544;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=549;TCF=252;TCR=297;TR=543;WE=88498305;WS=88498287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,547:1.00:548
chr16	88499539	rs9931465	C	G	4967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.662;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=90;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.719;SC=TATCCAACACCCACCCTAGCA;SOR=0.713;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=68;TCR=90;TR=157;WE=88499547;WS=88499529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,164:0.99:165
chr16	88502482	rs3812953	C	T	3767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.667;SC=CAGGCGGTCGCTTGACTAGAA;SOR=1.512;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=21;TCR=88;TR=108;WE=88502490;WS=88502472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,117:0.99:118
chr16	88502505	rs1983014	A	G	2898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=69;PP=2272;SC=AGGAACCCGCATGTCTACGGG;SOR=2.687;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=17;TCR=70;TR=86;WE=88502513;WS=88502495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr16	88504868	rs904783	A	G	7581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.863;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=153;NR=102;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.868;SC=GCCCCGAGGCACCTTCCACAA;SOR=0.847;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=257;TCF=153;TCR=104;TR=255;WE=88504876;WS=88504858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,257:1.00:258
chr16	88505635	rs4782301	A	G	8055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.793;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=160;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.104;SC=CTGCCGAGCCACACACCCACC;SOR=0.797;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=277;TCF=115;TCR=162;TR=274;WE=88505643;WS=88505625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,272:1.00:273
chr16	88505734	rs4782362	C	T	4529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.95;NF=44;NR=95;PP=2965;SC=AAGATGCTTCCGAGTAATTTC;SOR=1.677;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=140;TCF=45;TCR=95;TR=139;WE=88505742;WS=88505724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr16	88593209	rs199766456	CCT	C	95.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.09;ReadPosRankSum=2.334;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr16	88593210	rs35678431	CT	C	440.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=303;ReadPosRankSum=-2.896;SC=TGTTCCTACCCTCCCCCCCCA;SOR=1.839;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=19;WE=88593218;WS=88593199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr16	88599695	rs67712719	GGA	G	4127.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.36;SOR=0.855;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr16	88599697	.	AG	CC	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=29;NR=31;PP=2947;QD=20;SC=GCCAGAGCGGAGCCTCTGGCC;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=60;WE=88599712;WS=88599687;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,60:0.88:68
chr16	88599699	.	CCTCTGG	C	2965	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=23;MQ=60.44;NF=22;NR=34;PP=2965;QD=20;SC=CAGAGCGGAGCCTCTGGCCCA;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=57;TCF=23;TCR=34;TR=56;WE=88599712;WS=88599687;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr16	88599700	rs67322929	CT	C	4217.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.84;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr16	88599702	rs67873604	CTGG	C	4192.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.34;QD=44.60;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr16	88600079	rs13335396	C	G	3179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=53;NR=56;PP=2348;SC=GGCTCTTCCCCGGGGCCCCCA;SOR=0.747;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=53;TCR=57;TR=109;WE=88600087;WS=88600069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr16	88620069	rs2340958	CCC	AAA	311.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;JOINED;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=0;PP=409;SC=ACTCCATCCCCCCAAAAAAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=88620079;WS=88620066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr16	88620195	rs2879897	T	G	2081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=17;PP=1600;SC=TTTATACACTTTCCATTAAAA;SOR=1.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=42;TCR=17;TR=59;WE=88620203;WS=88620185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	88620312	rs2340955	T	C	2049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=42;PP=1543;SC=CCTGCAGGGCTGCCGTCTGCA;SOR=1.276;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=71;TCF=29;TCR=42;TR=70;WE=88620320;WS=88620302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr16	88620345	.	A	C	633	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=24;MQ=59.73;NF=18;NR=14;PP=633;QD=20.8678503921;SC=GGCGGGACGCACGCAGTGCAG;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=84;TCF=38;TCR=46;TR=32;WE=88620353;WS=88620335;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:52,32:0.38:84
chr16	88620345	.	A	ACGCAGTGCAGAGCTGGGACGGACGCC	2032.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.58;QD=78.18;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	88633052	rs56983565	G	C	4956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=48;PP=2965;SC=CAAGAACGCTGGCAGGCTAAG;SOR=1.783;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=103;TCR=48;TR=150;WE=88633060;WS=88633042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr16	88643457	rs936621	A	G	1878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=7;PP=1539;SC=CCAGGAAAGTAGGGACAAGGT;SOR=3.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=51;TCR=7;TR=58;WE=88643465;WS=88643447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr16	88644005	rs899728	A	G	1518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=18;PP=1095;SC=ATGAGGAGAAAGGCGAAGGCA;SOR=0.780;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=23;TCR=18;TR=41;WE=88644013;WS=88643995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	88664506	.	T	C	199	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=8;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=19;MQ=59.58;NF=13;NR=0;PP=199;QD=17.9824009652;SC=CTCTGCCCCCTCCCACCCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=13;WE=88664514;WS=88664496;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:20,13:0.39:33
chr16	88666035	rs6500481	G	A	1250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=0;PP=1042;SC=CTCCCCAGAAGGACAACTGTG;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=88666043;WS=88666025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	88675194	rs9932692	A	G	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=1;PP=524;SC=GTTTGTGAACAGATTTCCTAA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=88675202;WS=88675184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	88675529	rs9930974	C	T	970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=28;PP=824;SC=TTTTTATTTACAGTAAAAAAT;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=88675537;WS=88675519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr16	88688547	rs1111433	T	C	1239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=6;PP=999;SC=CTGTCACACCTGGCATTGCTG;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=39;WE=88688555;WS=88688537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	88688832	rs3751675	A	G	3516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=93;PP=2911;ReadPosRankSum=-0.859;SC=GGGTGTCAGCACCTTGGAGCC;SOR=1.793;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=19;TCR=94;TR=112;WE=88688840;WS=88688822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,113:0.99:114
chr16	88690882	rs3830228	G	GAGC	2150.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=4;PP=1814;SC=GTCCAGGCACGAGCGTGCTCA;SOR=4.223;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=40;WE=88690890;WS=88690872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr16	88695071	rs117451609	G	A	1804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=2;PP=1505;SC=TGGGAGCAGAGCAGGTTGCTG;SOR=5.747;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=52;TCF=50;TCR=2;TR=52;WE=88695079;WS=88695061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	88695332	rs4782306	G	C	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=38;PP=1197;SC=AGCTGGGTCTGAGACCCCATT;SOR=5.136;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=41;WE=88695340;WS=88695322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	88705804	rs2254073	T	C	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=18;PP=390;SC=TGGGCCTTGGTGGTTCTCACC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=88705812;WS=88705794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	88709712	rs7195830	A	G	1608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=13;PP=1148;SC=GCTTCGCTGCATTTATTGCAG;SOR=2.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=54;WE=88709720;WS=88709702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr16	88709737	rs1049255	C	T	1752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=21;PP=1282;SC=GTGCACCTGGCGGGAGGGCAG;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=58;WE=88709745;WS=88709727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr16	88709828	rs1049254	A	G	1382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=32;PP=1135;SC=CCCCGCCGCCACCGCAGCCTC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=47;WE=88709836;WS=88709818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr16	88714559	rs2306422	C	T	3115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=86;PP=2516;SC=GTGGGGCTCCCGTCCCGGGGG;SOR=6.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=89;TCF=3;TCR=86;TR=89;WE=88714567;WS=88714549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr16	88716534	rs3812948	A	G	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=2;PP=237;SC=GAGTGGTGGCAGCGGGCCCCT;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=88716542;WS=88716531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	88717386	rs8053867	T	C	2239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=52;PP=1761;SC=CCAGCGCCTGTTCGTTGGCCC;SOR=2.082;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=18;TCR=52;TR=70;WE=88717394;WS=88717376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr16	88719625	rs11648950	A	T	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=2;PP=750;SC=AGCCGCGCTTAGCCTTTAAGG;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=88719633;WS=88719615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	88723538	.	T	TGG	268.37	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=33.55;ReadPosRankSum=-0.489;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr16	88729650	rs11646758	T	C	2599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=4;NR=70;PP=2229;SC=GCATTACCTCTCAGCCAATGG;SOR=5.367;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=4;TCR=70;TR=74;WE=88729658;WS=88729640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr16	88752693	rs11076698	T	G	5172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.98;NF=124;NR=55;PP=2965;SC=CTCCCGCCCCTCAGGGTCGAG;SOR=1.757;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=125;TCR=55;TR=179;WE=88752701;WS=88752683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr16	88762943	rs1132579	A	T	3512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.425;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=130;NR=39;PP=2766;ReadPosRankSum=0.698;SC=TTTTTTTTTTAAAAAAAAGAC;SOR=1.640;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=172;TCF=132;TCR=40;TR=169;WE=88762951;WS=88762932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,140:0.98:143
chr16	88763151	rs13556	G	A	1734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=55;PP=1439;SC=TGCCGGCCCCGCCTCTGCTGG;SOR=5.353;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=3;TCR=62;TR=58;WE=88763159;WS=88763141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	88766168	rs55780854	C	T	2846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=71;PP=2235;SC=GAGGGCAAGGCGGTCCTGAGA;SOR=3.442;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=12;TCR=71;TR=83;WE=88766176;WS=88766158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr16	88767769	rs2306049	G	C	2402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=52;PP=1891;SC=GCAGGCGGCAGAGTGGGCACA;SOR=1.949;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=73;TCF=20;TCR=53;TR=72;WE=88767777;WS=88767759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr16	88767861	rs2306048	C	G	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=26;PP=754;SC=CCAGCCCGCCCCTCGGGTCTC;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=88767869;WS=88767851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr16	88772491	rs7194105	A	G	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=2;PP=310;SC=CCCAGTCCGGAGCTGCACCGG;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=88772499;WS=88772481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	88776141	rs4598894	G	A	2162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=0;PP=1757;SC=GGGAGGGGCCGGTGAGCCTCG;SOR=8.380;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=62;TCR=0;TR=62;WE=88776149;WS=88776131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr16	88776297	rs4390574	T	C	11545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=203;NR=152;PP=2965;SC=AGGACGCTGCTCACTGTGCGG;SOR=0.950;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=356;TCF=203;TCR=153;TR=355;WE=88776305;WS=88776287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,364:1.00:364
chr16	88778427	rs11361741	GC	G	4375.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=14;PP=2957;SC=CTGATGGTGAGCGGGGGCCCA;SOR=3.797;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=113;TCF=96;TCR=17;TR=109;WE=88778435;WS=88778417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr16	88778510	rs72811472	G	A	6502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=103;PP=2965;SC=GAGGTCAGCCGCAAGAGAGAA;SOR=0.752;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=101;TCR=103;TR=204;WE=88778518;WS=88778500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr16	88779032	rs2290896	G	C	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=9;PP=576;SC=CCCGGAAGGTGTTCAGCCTGC;SOR=1.519;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=25;WE=88779040;WS=88779022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	88779323	rs12148926	C	T	904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=18;PP=489;SC=GGTGAGGCCCCGAGAGCCCCC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=88779336;WS=88779313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	88779328	rs67815044	GC	G	861.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=422;SC=GGCCCCGAGAGCCCCCCTTCC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=14;WE=88779336;WS=88779313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	88779952	rs74757912	C	CCT	2728.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=20;PP=2265;SC=AGTCCTGCGGCCTCGGATGGT;SOR=1.392;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=61;TCF=36;TCR=25;TR=50;WE=88779960;WS=88779942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr16	88780472	rs7205626	T	C	3879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=6;PP=2965;SC=ACGGCACCTGTCCTGGGGACT;SOR=4.995;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=105;TCR=6;TR=111;WE=88780480;WS=88780462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr16	88780518	rs3826076	A	G	4734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=40;PP=2965;SC=GGGCTTTCCCATAGCCTCCAA;SOR=2.217;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=162;TCF=122;TCR=40;TR=162;WE=88780526;WS=88780508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr16	88780634	rs11278302	AGGTGTG	A	7906.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=130;PP=2972;SC=CACTGTGTACAGGTGTGGGTG;SOR=2.329;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=170;TCF=27;TCR=143;TR=156;WE=88780647;WS=88780624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr16	88780685	rs7191439	C	T	3260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=77;PP=2725;SC=GTGTGCTGTGCGCGGGTGTGT;SOR=2.397;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=24;TCR=77;TR=101;WE=88780693;WS=88780675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr16	88780923	rs8050715	C	G	7691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=160;NR=71;PP=2965;SC=TGGGGTGATGCGGGGAGGGAG;SOR=1.812;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=232;TCF=160;TCR=72;TR=231;WE=88780931;WS=88780913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr16	88781125	rs8043637	T	C	7344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=185;PP=2965;SC=CCCAGCGCTGTGGCCAGGGGG;SOR=1.907;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=260;TCF=74;TCR=186;TR=259;WE=88781133;WS=88781115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr16	88781419	rs2306046	A	G	3603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=62;NR=57;PP=2965;SC=GGGTGCTGGCAGGTTTCTTGG;SOR=0.744;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=62;TCR=57;TR=119;WE=88781427;WS=88781409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr16	88781558	rs2306045	G	A	5689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=95;NR=91;PP=2965;SC=AAGGGGCCTCGGGGCTGGTGC;SOR=0.726;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=187;TCF=96;TCR=91;TR=186;WE=88781566;WS=88781548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr16	88782079	rs1061228	G	A	5686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=132;NR=46;PP=2965;SC=TGAGCTTGGCGTACAACTCCT;SOR=2.236;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=132;TCR=46;TR=178;WE=88782087;WS=88782069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr16	88782676	rs2290902	A	G	4035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=43;PP=2965;SC=GGAAGAGATTAGGGATGACCC;SOR=1.236;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=72;TCR=43;TR=115;WE=88782684;WS=88782666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr16	88783374	rs8044367	A	G	4753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=130;NR=41;PP=2965;SC=GTGGTGCACCACCTTGGCCAG;SOR=2.203;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=130;TCR=41;TR=171;WE=88783382;WS=88783364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr16	88783449	rs8057031	C	G	11238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=219;NR=111;PP=2965;SC=CGCCCAGCTTCAGGGTGACGG;SOR=1.581;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=330;TCF=219;TCR=111;TR=330;WE=88783457;WS=88783439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,339:1.00:339
chr16	88783521	rs6500491	T	C	14204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=479;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=241;NR=225;PP=2965;SC=TGAAGAGCAGTGGGAACCAGA;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=466;TCF=241;TCR=225;TR=466;WE=88783529;WS=88783511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,476:1.00:476
chr16	88783738	rs4782432	A	G	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=41;PP=1195;SC=AGTATGGCACAGCGGTAGTAA;SOR=6.138;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=42;WE=88783746;WS=88783728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	88783903	rs7186082	A	G	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=5;PP=563;SC=AGGCAGGAGAATGAAACGCAA;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=88783911;WS=88783893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr16	88785072	rs4620939	G	C	250.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=176;SC=GTTACTAGGGGCCAGGGGAGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=88785080;WS=88785062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr16	88785126	rs4520817	A	G	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=6;NR=2;PP=211;SC=TCTTCTTTTTACTTTTTTAGA;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=88785134;WS=88785116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	88785502	.	C	T	1490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=27;PP=1229;SC=GCAGTACCTCCCTCCTGGGTC;SOR=0.733;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=23;TCR=27;TR=50;WE=88785510;WS=88785492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	88786967	rs4401037	C	T	3848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=83;PP=2965;SC=TCAGCCTGGGCCCAGTACCCG;SOR=1.923;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=34;TCR=83;TR=117;WE=88786975;WS=88786957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr16	88787704	rs8043924	G	C	5385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=134;PP=2965;SC=GTCCGACCCTGGCTTCCACCT;SOR=2.341;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=180;TCF=46;TCR=134;TR=180;WE=88787712;WS=88787694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr16	88788060	rs72811487	G	A	3407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=61;PP=2545;SC=GCTTGTTCTCGTAGCGCCGCA;SOR=0.970;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=45;TCR=61;TR=106;WE=88788068;WS=88788050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr16	88788477	rs9935872	A	G	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=14;PP=551;SC=GCAGGCGCCTACAGGGAGACC;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=88788485;WS=88788467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	88788903	rs4238687	T	G	4378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=84;PP=2965;SC=TCCTTTGGGGTACAAGGGAAT;SOR=1.470;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=44;TCR=84;TR=128;WE=88788911;WS=88788893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr16	88788934	rs4238686	A	G	4759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.33;SOR=1.115;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr16	88788938	rs2242167	G	A	4761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.69;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr16	88791697	rs72811489	T	C	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=17;PP=565;SC=CAGAGGGTGATCATGCGGACA;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=88791705;WS=88791687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	88792047	rs4782430	A	G	5364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=92;PP=2965;SC=TCCTGCGGTGAAAGTCAATGC;SOR=0.961;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=70;TCR=92;TR=162;WE=88792055;WS=88792037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr16	88792097	rs4782429	A	G	3180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=69;PP=2542;SC=AAGCCCCTGTAGGGAGGCGGG;SOR=1.887;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=28;TCR=69;TR=97;WE=88792105;WS=88792087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr16	88793090	rs4516218	A	G	6388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=99;NR=49;PP=2965;SC=GCGGGGCCCCAGGGCGGTGGG;SOR=1.577;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=99;TCR=49;TR=148;WE=88793111;WS=88793080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr16	88793103	rs4424896	C	G	7087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=108;NR=64;PP=2965;SC=GCGGTGGGTGCGGGGGGGCCG;SOR=1.325;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=174;TCF=109;TCR=65;TR=172;WE=88793111;WS=88793080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr16	88793813	rs8057198	T	C	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=5;PP=474;SC=GAGGTCTGCGTGCGTGCGTGC;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=88793821;WS=88793811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr16	88793872	rs113907912	T	C	1368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=2;PP=1061;SC=CCTCCGCCCGTGCACGCCTGT;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=39;WE=88793880;WS=88793862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	88798365	.	G	A	1508	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;FR=1.0000;HP=5;HapScore=1;MGOF=35;MMLQ=28;MQ=59.35;NF=2;NR=55;PP=1508;QD=27.0661616236;SC=GAGTCTGGGGGGAGGGACTTT;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=61;TCF=4;TCR=57;TR=57;WE=88798373;WS=88798355;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,57:0.93:61
chr16	88802832	rs114153706	G	A	817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=21;PP=636;SC=CGGCAGAGAGGGCTGCACAGC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=88802840;WS=88802822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	88803195	rs4782410	T	C	1673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=27;PP=1332;SC=TCTGCAGGCCTCCCCACCCTG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=26;TCR=27;TR=53;WE=88803203;WS=88803185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	88803925	rs66881450	G	GC	736.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=20;NR=1;PP=722;SC=CCTCCGCCCCGCCCCCCGCAC;SOR=5.058;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=21;WE=88803933;WS=88803915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	88803982	rs6500493	C	G	1837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=16;PP=1578;SC=CGCCGCAGGACGGAGCTCTGG;SOR=1.919;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=40;TCR=16;TR=56;WE=88803990;WS=88803972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	88804734	rs7184427	A	G	3994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=57;NR=65;PP=2965;SC=CCCCACCGCGACGCAGAGTCT;SOR=0.848;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=122;TCF=57;TCR=65;TR=122;WE=88804742;WS=88804724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr16	88804924	rs34600315	TC	T	3372.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=46;PP=2951;SC=ATCAGGGAACTCCCAAGACCC;SOR=0.735;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=40;TCR=47;TR=85;WE=88804932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr16	88808111	rs11076707	T	C	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=32;PP=830;SC=CGGGTGGGAGTGTGGATGGGT;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=34;WE=88808119;WS=88808101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr16	88808311	.	T	C	377	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=24;MQ=54.25;NF=10;NR=4;PP=377;QD=29.4122294677;SC=TCTCCAGGTGTGGGTGGGAGC;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=88808319;WS=88808301;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	88808743	rs6500495	A	G	3543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=54;PP=2901;SC=GCGGGGCACAATATGCAGGCA;SOR=0.862;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=60;TCR=54;TR=114;WE=88808751;WS=88808733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr16	88808862	rs7201439	C	T	2009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=53;PP=1663;SC=AGGCTGGTCCCGGGGACGGGG;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=10;TCR=53;TR=63;WE=88808870;WS=88808852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr16	88808918	rs11648555	C	A	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=15;PP=442;SC=GCCCCCAGCCCGGCCAGAGCC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=88808926;WS=88808908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr16	88809368	rs28525359	G	T	8363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=180;NR=67;PP=2965;SC=GTTGCATCCCGATGCATGGCC;SOR=1.953;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=247;TCF=180;TCR=67;TR=247;WE=88809376;WS=88809358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,254:1.00:254
chr16	88809434	rs9925084	A	G	10138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=354;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.136;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=167;NR=177;PP=2965;ReadPosRankSum=0.322;SC=CCTGCTGTGCACCAGGTCAGG;SOR=0.325;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=346;TCF=168;TCR=178;TR=344;WE=88809442;WS=88809424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,349:1.00:350
chr16	88809480	rs9925171	A	G	9014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=175;PP=2965;SC=CTGTGCACCCACACCTGGCAG;SOR=1.279;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=282;TCF=106;TCR=176;TR=281;WE=88809488;WS=88809470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr16	88809686	rs9927855	T	C	9515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=157;NR=135;PP=2965;SC=AGCTCACCCTTCAGCAGGGGT;SOR=0.864;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=292;TCF=157;TCR=135;TR=292;WE=88809694;WS=88809676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,302:1.00:302
chr16	88809773	rs8048714	G	C	6576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=137;PP=2965;SC=ACCCCGGCACGTGCTGGCAGG;SOR=1.916;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=54;TCR=137;TR=191;WE=88809781;WS=88809763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr16	88809893	rs9933845	GG	AC	6420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=41;PP=2947;SC=TGGAGCTCAGGGACAGGTAGC;SOR=1.448;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=139;TCF=91;TCR=48;TR=125;WE=88809902;WS=88809883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr16	88810129	rs8053135	A	G	3029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=77;PP=2398;SC=CTGACCGTGAAGCAGCCCTCA;SOR=3.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=12;TCR=77;TR=89;WE=88810137;WS=88810119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr16	88851310	rs2911442	A	C	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=4;PP=348;SC=CCCACTCACCAGCCAGCAGCG;SOR=1.911;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=88851318;WS=88851300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	88872145	rs507329	T	C	3989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=65;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.751;SC=TTTTGAGGAGTGCAATGTTGG;SOR=0.229;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=127;TCF=60;TCR=67;TR=125;WE=88872153;WS=88872135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,133:0.99:134
chr16	88872511	rs510862	T	C	6631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=96;PP=2965;SC=TGGTGGAGCATGTCAAGGAGC;SOR=0.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=219;TCF=123;TCR=96;TR=219;WE=88872519;WS=88872501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr16	88921493	rs12932588	C	A	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=1;PP=744;SC=ATGCAATTCCCTATTTACCGG;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=88921501;WS=88921483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr16	88922989	.	A	AC	277	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=15;MQ=62.36;NF=0;NR=8;PP=277;QD=37.75;SC=GCACGGGGATACCCCCCGTCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=88922997;WS=88922979;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,8:0.89:9
chr16	88932857	rs139390142	T	C	11181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=31.59;ReadPosRankSum=-0.150;SOR=0.490;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,353:1.00:354
chr16	88946955	rs564705	A	G	1896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=2;PP=1694;SC=GTCCTGCCCTAAGTGTGAACC;SOR=5.747;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=54;TCR=2;TR=56;WE=88946963;WS=88946945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	88948990	.	CTGTGTGTGCATGGCTGTGTGTGCGTGGCTG	C	548.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=4;NR=2;PP=612;SC=GTGGGCGTGGCTGTGTGTGCA;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=6;WE=88949027;WS=88948980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	89119173	.	G	T	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.485;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=129.014;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.51;MQRankSum=-4.051;QD=9.31;ReadPosRankSum=-4.713;SOR=7.053;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,33:0.43:76
chr16	89119175	.	A	T	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.021;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=125.987;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQRankSum=-4.220;QD=8.85;ReadPosRankSum=-5.174;SOR=7.053;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,33:0.41:80
chr16	89160158	rs76688594	G	C	90.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=3;NR=1;PP=47;SC=CCGCCACGACGGGACGGGCGG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=89160166;WS=89160156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr16	89160329	rs145228567	C	G	274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.48;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr16	89160452	rs9938075	A	G	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=11;PP=295;SC=GGCCGGGCGCAGAGCTCTCGG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=89160460;WS=89160442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr16	89167066	rs57558972	C	G	1615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=1;PP=1181;SC=TTGCCTTTCTCCAGCTCGGCC;SOR=6.399;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=65;TCF=59;TCR=6;TR=44;WE=89167083;WS=89167056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	89167075	rs11273288	C	CCCCAGGAGGCTCCCGGGAG	2823.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=2;PP=2967;SC=TCCAGCTCGGCCGCCTGTCAG;SOR=4.493;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=18;WE=89167083;WS=89167056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr16	89167094	rs7188200	T	C	2119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=106;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.16;MQRankSum=0.244;NF=54;NR=9;PP=1494;ReadPosRankSum=-0.485;SC=AGTGCAATGCTGCCCCATGTG;SOR=2.494;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=55;TCR=9;TR=63;WE=89167102;WS=89167084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,67:0.99:68
chr16	89167140	rs7201122	G	C	4606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=60.07;NF=97;NR=42;PP=2965;SC=GCGCCTTGGCGTCCTGCCGGC;SOR=1.761;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=97;TCR=42;TR=139;WE=89167148;WS=89167130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr16	89167395	rs6500526	C	T	10497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.29;SOR=0.808;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr16	89167404	rs7193255	T	C	10527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.23;SOR=0.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr16	89167431	rs6500527	G	C	7040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=112;PP=2965;SC=CCCAGTGGGCGTCATGGATGA;SOR=0.830;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=99;TCR=112;TR=210;WE=89167451;WS=89167421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr16	89167443	rs6500528	T	C	6339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=117;PP=2965;SC=CATGGATGAGTGGCGGTGTGG;SOR=0.916;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=213;TCF=96;TCR=117;TR=213;WE=89167451;WS=89167421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr16	89167458	rs6500529	C	A	6084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=54;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=89;NR=115;PP=2965;SC=GTGTGGCAGTCCCCCTCTACA;SOR=0.997;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=206;TCF=89;TCR=117;TR=204;WE=89167466;WS=89167448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr16	89167792	rs8060043	C	T	1578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=44;PP=1302;SC=TTTCGGTGACCGCACAGCACT;SOR=4.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=47;WE=89167800;WS=89167782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr16	89168981	rs4782457	T	C	952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=29;NR=1;PP=848;SC=AGTCTTGCTCTTGCTCTCAGC;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=89168989;WS=89168971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr16	89169205	rs4782456	C	G	4188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=82;PP=2771;SC=CACCCTCAGACTAGGCGCCTT;SOR=3.045;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=102;TCF=19;TCR=83;TR=101;WE=89169228;WS=89169195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr16	89169219	rs10578141	CCT	C	3726.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=61;PP=2966;SC=GCGCCTTTCCCCTGTCGGGGC;SOR=3.312;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=77;TCF=11;TCR=66;TR=72;WE=89169228;WS=89169195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr16	89169312	rs4782455	T	C	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=28;PP=936;SC=AGACTAGGCATCTTTTCCTGG;SOR=2.242;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=37;WE=89169320;WS=89169302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	89178457	.	G	GTGCCTGCTCATCTTCCCACCGAGTGCTTCCTTTCCTCCGCCGCCGTGGGTCTC	2760.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=125.49;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr16	89178773	rs4782449	A	G	1752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=49;PP=1502;SC=TTTCCTTTCAATGTTCCCTCT;SOR=4.294;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=5;TCR=49;TR=54;WE=89178781;WS=89178763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr16	89180664	rs9940965	C	G	2579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=19;PP=2090;SC=CAAGGGCCGCCTCCTGAGGGG;SOR=2.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=71;TCR=19;TR=90;WE=89180672;WS=89180654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr16	89180883	rs3743979	G	A	3222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=85;PP=2560;SC=GACCACTGCCGTGCGCCTGCC;SOR=3.442;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=14;TCR=85;TR=99;WE=89180891;WS=89180873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr16	89180935	rs3743980	G	T	1409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=41;PP=1169;SC=CTTCCACTGTGCTCTGAGCCC;SOR=6.138;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=42;WE=89180943;WS=89180925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr16	89187378	rs3743983	G	C	1922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=63;PP=1525;SC=AGGCCCCCCAGGGTGGTTACA;SOR=6.184;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=64;TCF=1;TCR=63;TR=64;WE=89187386;WS=89187368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr16	89188672	rs8058601	C	A	1976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=3;PP=1677;SC=GGCCTGGGCCCCCCGCAGTGG;SOR=4.875;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=60;TCF=57;TCR=3;TR=60;WE=89188680;WS=89188662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr16	89254064	rs12929648	A	G	4141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=118;PP=2965;SC=ATGGGGCAGGAGGATGGTGTG;SOR=7.411;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=121;TCF=2;TCR=119;TR=120;WE=89254072;WS=89254054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr16	89267769	rs34679577	GC	G	562.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.10;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr16	89287613	rs10586525	CAG	C	977.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=17;PP=1007;SC=TCCTGATACACAGTGTGTGTA;SOR=2.030;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=22;WE=89287622;WS=89287603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr16	89288418	rs9931258	A	G	2430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=17;PP=2029;SC=TCCTGCTAGGATGGAATGACT;SOR=2.463;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=59;TCR=17;TR=76;WE=89288426;WS=89288408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr16	89291210	rs113560259	G	GGTGA	1952.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=37;PP=2158;SC=AGTTCTCCAAGGTAAGTGTGA;SOR=4.271;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=39;WE=89291218;WS=89291200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr16	89291309	rs28533907	A	T	272.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=224;SC=GTGTCAAGTTAAGCGGCTGTG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=89291317;WS=89291299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	89291945	rs11464538	A	AT	6009.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=23;PP=1648;SC=TTTTTAGGTCATTCTTCTTTC;SOR=2.404;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=99;TCF=72;TCR=27;TR=81;WE=89291959;WS=89291935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr16	89291948	rs12926996	C	T	6292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.27;SOR=2.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr16	89291951	rs12926997	C	T	6348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.03;SOR=1.973;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr16	89293271	rs28417933	A	C	8575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=132;NR=130;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.721;SC=ACCTTGTTCAAAATTGGAGAG;SOR=0.248;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=264;TCF=134;TCR=130;TR=262;WE=89293279;WS=89293261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,270:1.00:271
chr16	89293614	rs4785626	A	G	6108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=124;NR=54;PP=2965;SC=ACCCTGGGGAAAAGCCCTGTG;SOR=1.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=124;TCR=55;TR=178;WE=89293622;WS=89293604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr16	89294381	rs28415940	T	C	6954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.048;NF=98;NR=115;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.132;SC=AAGCCCTTTATATGTACGGTA;SOR=0.890;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=214;TCF=99;TCR=115;TR=213;WE=89294389;WS=89294371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,220:0.99:222
chr16	89294439	rs9921361	G	T	5893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=117;PP=2965;ReadPosRankSum=1.709;SC=AGCACATTCAGATTCACACTG;SOR=1.358;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=186;TCF=69;TCR=117;TR=186;WE=89294447;WS=89294429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,187:0.99:189
chr16	89294511	rs28638280	C	T	4642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=69;PP=2965;SC=CGAGCCTAACCGAGCACATAC;SOR=0.840;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=71;TCR=69;TR=140;WE=89294519;WS=89294501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr16	89294697	rs60437616	C	T	3957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=60;PP=2965;SC=GAAGGACTCACACAGGAGAGA;SOR=0.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=62;TCR=60;TR=122;WE=89294705;WS=89294687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr16	89299054	rs71158785	T	TA	1758.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.90;QD=36.64;SOR=4.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr16	89299200	rs61078268	C	A	13258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=200;NR=96;PP=2965;SC=TGCATATGCACATCAACTCAC;SOR=1.537;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=296;TCF=200;TCR=96;TR=296;WE=89299208;WS=89299190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr16	89299227	rs62068537	C	T	14806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=197;NR=154;PP=2965;SC=TGCAACTCAACTCACACCGTA;SOR=0.924;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=351;TCF=197;TCR=154;TR=351;WE=89299235;WS=89299217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,362:1.00:362
chr16	89299280	rs62068538	T	A	10314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=186;PP=2965;SC=CAACTCGCACTGCGTATGCAA;SOR=1.288;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=304;TCF=117;TCR=187;TR=303;WE=89299288;WS=89299270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,315:1.00:315
chr16	89299876	.	GTGCAACTCAACTCACACTGCGTA	G	2967	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MMLQ=24;MQ=60.11;NF=110;NR=53;PP=2967;QD=20;SC=CGCACTGCGTGTGCAACTCAA;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=191;TCF=126;TCR=65;TR=163;WE=89299906;WS=89299866;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:28,163:0.85:191
chr16	89300015	rs62068548	A	G	8645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=162;NR=125;PP=2965;SC=CTCATACTGCATATGCAACTC;SOR=0.987;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=288;TCF=163;TCR=125;TR=287;WE=89300023;WS=89300005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr16	89300147	rs62068549	A	G	9589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.119;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.461;NF=151;NR=165;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.818;SC=CTCGCACTGCATATGCAACTC;SOR=0.313;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=317;TCF=152;TCR=165;TR=316;WE=89300155;WS=89300137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,323:1.00:324
chr16	89345122	rs3102367	G	A	2191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=25;PP=1648;SC=GGAGACACAGGGGGTGGCTCT;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=35;TCR=25;TR=60;WE=89345130;WS=89345112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr16	89345408	rs3096305	G	A	6674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=135;PP=2965;SC=CGGGCTGGAGGAAGCCGTGAC;SOR=1.498;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=209;TCF=74;TCR=135;TR=209;WE=89345416;WS=89345398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr16	89350038	rs2279348	G	A	11699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=173;NR=228;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.156;SC=CTCCCGGTGCGCCTCCTCGGG;SOR=0.103;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=408;TCF=173;TCR=235;TR=401;WE=89350046;WS=89350028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,404:0.99:407
chr16	89350178	rs2279349	G	A	7344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.954;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=124;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.199;SC=TATGCTTTTCGGTCTGCTCTT;SOR=0.167;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=222;TCF=96;TCR=126;TR=220;WE=89350186;WS=89350168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,226:0.99:228
chr16	89371827	rs3114912	G	A	2608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=65;PP=2014;SC=TGTTTCATATGCCAGGAGAAG;SOR=2.414;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=18;TCR=66;TR=83;WE=89371847;WS=89371817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr16	89371839	rs2277908	G	A	2320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=64;PP=1936;SC=CAGGAGAAGCGCATCTCTTAT;SOR=3.767;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=9;TCR=65;TR=73;WE=89371847;WS=89371817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr16	89379936	rs3102350	T	C	5777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=80;PP=2965;SC=ACTGCAGAGTTGTGGGCTCCA;SOR=0.995;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=187;TCF=106;TCR=81;TR=186;WE=89379944;WS=89379926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr16	89389645	rs3114900	G	C	3896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.98;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr16	89574166	rs3809641	C	G	3743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=82;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.852;SC=AGTCCGAAGGCACAGGACGGA;SOR=1.211;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=109;TCF=25;TCR=84;TR=107;WE=89574174;WS=89574156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr16	89577046	rs3922633	C	T	3313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=89;PP=2866;SC=TGCACACTTACCGCCTCAGCT;SOR=3.464;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=15;TCR=89;TR=104;WE=89577054;WS=89577036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr16	89590060	rs28643511	G	A	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=555;SC=CGCGATCACGGCTCACTGCAG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=89590068;WS=89590050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr16	89590168	rs113476208	T	TATCTC	6051.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=16;PP=2957;ReadPosRankSum=1.069;SC=GGTTTCCTCTTAGGTGGGAAC;SOR=1.893;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=97;TCR=19;TR=100;WE=89590176;WS=89590158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,128:0.98:130
chr16	89590243	rs3803680	G	A	9152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.571;NF=186;NR=99;PP=2965;ReadPosRankSum=0.746;SC=ACAGCACAGCGTTAGTCTTTG;SOR=0.591;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=293;TCF=192;TCR=101;TR=285;WE=89590251;WS=89590233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:7,297:0.98:304
chr16	89590667	rs3803679	T	C	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=20;PP=470;SC=TGAGTGAGGGTGCGGGAGGCC;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=89590675;WS=89590657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr16	89596106	rs3803676	C	T	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=31;PP=939;ReadPosRankSum=1.865;SC=TAGCCTGAAGCCACAATTAGA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=89596114;WS=89596096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,33:0.97:34
chr16	89597057	rs4785690	G	T	1552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=11;PP=1238;SC=TCCTGACTTCGCCCAGCTCCT;SOR=2.256;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=47;WE=89597065;WS=89597047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr16	89597221	rs4785691	A	G	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=31;PP=1122;SC=CTGAAGGTGAAAGCAGCGTGG;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=89597229;WS=89597211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	89598760	rs463701	A	G	2977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=85;NR=1;PP=2601;SC=TAGGGAATGGAGCTGGTAGCT;SOR=7.500;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=86;TCF=85;TCR=1;TR=86;WE=89598768;WS=89598750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr16	89612979	rs35936864	AC	A	356.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=3.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.000;QD=5.85;ReadPosRankSum=3.013;SOR=0.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
chr16	89629218	rs258327	A	G	1628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=9;PP=1269;SC=GAGGTCCTCCAGGTTCTCCTG;SOR=3.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=48;TCR=9;TR=57;WE=89629226;WS=89629208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr16	89653032	rs452176	G	A	2622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=12;PP=2035;SC=CCTGGTAGGTGTTCAGAGCCA;SOR=3.285;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=66;TCR=12;TR=78;WE=89653040;WS=89653022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr16	89653534	.	GCCGCCCCCTCAGTCCGTGGCCCCGCCCCGCC	G	203.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.67;ReadPosRankSum=1.138;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr16	89653999	rs140664874	TTGAG	T	5118.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.449;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.186;NF=12;NR=63;PP=2947;ReadPosRankSum=0.415;SC=GAGTGAGCGTTTGAGTGAACC;SOR=1.260;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=78;TCF=12;TCR=66;TR=75;WE=89654010;WS=89653989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,116:0.99:117
chr16	89654123	rs76691791	AG	GT	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.17;QD=43.24;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr16	89654130	rs71374184	C	G	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.06;QD=42.98;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	89696999	rs395593	C	T	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=366;SC=CTGGGGGAGCCGGGGCTGGGG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=89697007;WS=89696989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr16	89703424	rs445537	A	G	1584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=25;PP=1222;SC=GCATCTCCTCACGTGGGACCT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=27;TCR=25;TR=52;WE=89703432;WS=89703414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr16	89703519	rs461115	C	T	1999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=16;PP=1743;SC=CTTCCAGCCACGAAGGATGAT;SOR=2.119;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=62;WE=89703527;WS=89703509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr16	89712889	rs460879	C	T	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=3;PP=756;SC=TCCCACAGCACCAGAGCGTGG;SOR=3.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=89712897;WS=89712879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr16	89713174	rs460984	C	T	10802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=349;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.256;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=156;NR=177;PP=2965;ReadPosRankSum=1.132;SC=CCCATGGGGCCCCACTCAGCT;SOR=0.412;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=335;TCF=157;TCR=178;TR=333;WE=89713182;WS=89713164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,344:1.00:345
chr16	89717781	rs141950187	AAAAC	A	1014.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=2;PP=978;SC=TCCGTCTCAAAAAACAAACAA;SOR=4.091;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=21;WE=89717792;WS=89717777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr16	89720409	rs258338	T	A	3467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=87;PP=2754;SC=ACTCACTAGGTTCCTTCTAGA;SOR=2.854;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=20;TCR=87;TR=107;WE=89720417;WS=89720399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr16	89724572	rs154664	T	C	854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=4;PP=706;SC=TTATTCTGGATCCACGCAGGC;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=89724580;WS=89724562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	89751895	.	T	C	1192	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=23;MQ=49.76;NF=37;NR=5;PP=1192;QD=29.208838394;SC=CGAGCTGGTCTCGCAGTGGGC;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=48;TCF=43;TCR=5;TR=42;WE=89751903;WS=89751885;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,42:0.88:48
chr16	89753031	rs397891	G	C	2217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=1;PP=1821;SC=GCTAAGGAGAGGAAGCCCGGG;SOR=7.083;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=66;TCF=65;TCR=1;TR=66;WE=89753039;WS=89753021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr16	89753971	rs258325	T	C	3592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=79;PP=2965;SC=GTTGGCCTTTTCTTTTTTGTT;SOR=1.828;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=32;TCR=79;TR=111;WE=89753979;WS=89753961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr16	89754255	rs258324	T	G	2213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=67;PP=1938;SC=GGAAAGGGAGTTTGAGACTAG;SOR=5.166;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=4;TCR=67;TR=71;WE=89754263;WS=89754245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr16	89758973	rs187282	A	G	3900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=74;PP=2941;SC=GCTGAGGCCTAACTCTGCTGC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=36;TCR=74;TR=109;WE=89758981;WS=89758963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr16	89760492	rs465507	C	G	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=1;PP=1173;SC=TTCCAGGCCACCACAGGCTCT;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=37;WE=89760500;WS=89760482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr16	89760552	rs460057	T	C	2278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=20;PP=1755;SC=AGGAGCCGGCTGTATTGAGGT;SOR=2.012;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=54;TCR=20;TR=74;WE=89760560;WS=89760542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr16	89763045	rs460367	C	T	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=370;SC=GCCGCCTGGGCGGGCTGTCCA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=89763053;WS=89763035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr16	89763263	rs462769	T	C	3147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=41;PP=2604;SC=GCAGATTGGCTCCAGCAGAGC;SOR=1.090;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=59;TCR=41;TR=100;WE=89763271;WS=89763253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr16	89774411	rs11860230	T	C	4492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=37;NR=104;PP=2965;SC=AACAGAAGGATACCCCCGGCC;SOR=2.239;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=142;TCF=38;TCR=104;TR=141;WE=89774419;WS=89774401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr16	89775429	.	C	CCCCG	33	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;FR=0.9998;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=23;MQ=66.83;NF=0;NR=2;PP=33;QD=29.5;SC=ACCCCTTATACCCCGCCCACC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=89775437;WS=89775419;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,2:0.50:4
chr16	89778202	rs376041423	G	GC	1260.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=0;PP=821;SC=CTCTGGCTCCGCCCCCCACGG;SOR=5.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=25;WE=89778210;WS=89778192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr16	89778219	rs28588261	A	T	1674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.57;QD=44.07;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr16	89778224	rs7206836	G	C	1708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.55;QD=43.81;SOR=4.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr16	89782989	rs7206570	A	G	3291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=50;PP=2683;SC=CAGGCTGGGGAATGGGAGCAG;SOR=0.713;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=49;TCR=50;TR=99;WE=89782997;WS=89782979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr16	89783187	rs4785706	C	T	1201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=27;PP=982;SC=GCTGTGCTAGCTTCAGCATCT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=40;WE=89783195;WS=89783177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr16	89784521	rs10468304	T	A	11354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=389;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.840;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=254;PP=2965;ReadPosRankSum=0.456;SC=CTGTGATCCTTTGTGCAGCGG;SOR=1.499;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=378;TCF=124;TCR=254;TR=377;WE=89784529;WS=89784511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,383:1.00:384
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chr16	89790167	rs4785590	G	C	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=30;PP=765;ReadPosRankSum=-0.875;SC=GCTCCTCAGTGGGGCAGGGTT;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=33;WE=89790175;WS=89790157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
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chr16	89973777	rs143440936	CTCCCAGT	C	1464.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=34;PP=2143;SC=CACCTCCCTCCTCCCAGTTCC;SOR=4.921;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=34;WE=89973804;WS=89973767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr16	89973796	rs111916961	A	G	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.9978;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.594;NF=0;NR=24;PP=614;ReadPosRankSum=1.468;SC=CCCAGCTCCCAGCTCCCACCT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=24;WE=89973804;WS=89973767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,25:0.96:26
chr16	89973812	.	C	T	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQRankSum=0.000;QD=37.93;ReadPosRankSum=-0.193;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,17:0.94:18
chr16	89973816	rs190789120	A	C	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.38;MQRankSum=-0.352;QD=37.12;ReadPosRankSum=-0.697;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,14:0.93:15
chr16	89973821	.	T	C	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.09;MQRankSum=-0.955;QD=39.16;ReadPosRankSum=-1.433;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr16	90000925	rs4396536	T	C	4775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=96;PP=2965;SC=TTCTCAAGACTCTGTCCAGAG;SOR=1.546;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=50;TCR=96;TR=146;WE=90000933;WS=90000915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr16	90002290	rs1135425	T	C	1649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=54;PP=1354;SC=GGAGCCATCTTGCTGCCGACA;SOR=4.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=4;TCR=54;TR=58;WE=90002298;WS=90002280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr16	90004868	rs56378598	C	T	5415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=149;NR=3;PP=2965;SC=CTCGTGCCCTCGGTCTCTTGC;SOR=6.856;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=153;TCF=150;TCR=3;TR=152;WE=90004876;WS=90004858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr16	90020861	rs7195043	C	T	1900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=45;PP=1481;SC=TTCTTCCTGCCGCGTCCTGCG;SOR=2.265;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=60;TCF=14;TCR=46;TR=59;WE=90020869;WS=90020851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr16	90023901	rs12596872	C	T	2415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=24;PP=1901;SC=TGACTGCCCCCGCCCCCAACC;SOR=1.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=54;TCR=24;TR=78;WE=90023909;WS=90023891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr16	90029660	rs115841388	C	T	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=7;PP=1033;SC=CTCGGCCCTTCGTGGGGAACC;SOR=2.531;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=39;WE=90029668;WS=90029650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr16	90030770	rs56219904	A	G	3118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=51;PP=2434;SC=CTGAGGGGGGATTGGCAGGAG;SOR=0.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=49;TCR=51;TR=100;WE=90030778;WS=90030760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr16	90037828	rs4785755	G	A	5736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=70;PP=2965;SC=CAGCATTTCTGTGTACATGTC;SOR=1.075;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=103;TCR=70;TR=173;WE=90037836;WS=90037818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr16	90050880	rs4785759	A	C	2181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=15;PP=1823;SC=GCCCCTGTTTACTGTTGAATA;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=48;TCR=16;TR=63;WE=90050888;WS=90050870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr16	90075412	rs2241084	T	C	219.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=7;PP=142;SC=GGAGAGAGTGTGCTGTGTCCT;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=90075420;WS=90075402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr16	90093969	rs3743829	T	C	4387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=12;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.225;SC=TGCCAAATGTTCCTGGGAGCA;SOR=2.494;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=128;TCF=116;TCR=12;TR=126;WE=90093977;WS=90093959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,130:0.98:132
chr16	90094195	rs3743827	A	G	2705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=78;PP=2266;SC=CAGGGTGCCTACGCCGAGTGT;SOR=8.789;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=78;TCF=0;TCR=78;TR=78;WE=90094203;WS=90094185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr16	90094214	rs3743826	C	T	1780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=49;PP=1467;SC=GTCCATCTTGCCATGTGGATC;SOR=7.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=49;WE=90094222;WS=90094204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr16	90095277	rs7191175	T	A	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=0;PP=932;SC=TGAAAGAGTCTCATGACCTGA;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=90095285;WS=90095267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr16	90095561	rs3785183	C	T	2977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=68;PP=2962;SC=GGGCAGCCTACGGGGCAGGCT;SOR=2.252;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=104;TCF=31;TCR=73;TR=91;WE=90095605;WS=90095548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr16	90095596	.	AT	GC	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=24;MQ=58.42;NF=25;NR=20;PP=2944;QD=20;SC=GGGGCAGGCTATGGGGCAGCC;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=100;TCF=42;TCR=58;TR=45;WE=90095605;WS=90095548;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:55,45:0.45:100
chr16	90095597	rs71137702	T	TGGGGCAGCCTACGGGGCAGGCTGC	3384.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.58;QD=60.44;SOR=0.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr16	90095620	.	A	G	717	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=41;MMLQ=23;MQ=58.46;NF=8;NR=19;PP=717;QD=27.8433782425;SC=GGGGCAGGCTACGGGGCAGGC;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=95;TCF=46;TCR=49;TR=27;WE=90095628;WS=90095610;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:68,27:0.28:95
chr16	90099061	rs4324129	C	T	3564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=7;PP=2850;SC=ACCAGGTGTGCACAGGTACGG;SOR=5.136;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=98;TCR=7;TR=103;WE=90099069;WS=90099051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
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chr16	90108832	rs2241035	C	T	5289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=88;PP=2965;SC=CCCGTTGCCTCGGCCAAAAGA;SOR=0.872;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=75;TCR=88;TR=163;WE=90108840;WS=90108822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr16	90128224	rs2077426	C	G	2511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=10;PP=2092;SC=CAGAGCTAACCATGTTATCCC;SOR=3.742;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=78;TCR=10;TR=88;WE=90128232;WS=90128214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr16	90133137	rs16966444	G	T	7202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=197;NR=22;PP=2965;SC=AATGATGATGGCAGACACTGC;SOR=4.274;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=219;TCF=197;TCR=22;TR=219;WE=90133145;WS=90133127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr16	90141355	rs12925933	A	C	7750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.992;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.672;NF=136;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.377;SC=CTTCATCGGAATCTTCTGTGT;SOR=0.144;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=249;TCF=138;TCR=111;TR=247;WE=90141363;WS=90141345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,251:0.99:253
chr16	90141477	rs7196459	T	G	3937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.282;NF=27;NR=90;PP=2965;ReadPosRankSum=1.038;SC=AGAGCTGGGATGAGGAACAAA;SOR=1.334;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=119;TCF=27;TCR=92;TR=117;WE=90141485;WS=90141467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,124:0.99:125
chr16	90142087	rs35256427	G	A	9819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=1.474;NF=257;NR=35;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.884;SC=CAGAGCAGTCGCTGATGCTAG;SOR=2.684;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=293;TCF=258;TCR=35;TR=292;WE=90142095;WS=90142077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,300:1.00:301
chr17	69293	rs146351269	G	GTTTCT	403.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=851;SC=CGGCCTAATAGTTTCATTTCT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=16;WE=69306;WS=69283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	69298	rs62057059	A	T	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=554;SC=TAATAGTTTCATTTCTTTTCT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=19;WE=69306;WS=69283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	69368	rs62059560	G	C	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.81;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=1152;ReadPosRankSum=0.217;SC=CCAGGCTGGAGTGCACCGTGC;SOR=0.724;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=45;WE=69376;WS=69358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr17	69631	rs62059561	C	T	1155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=32;PP=898;SC=TACCACGTGGCGTAGCAGCTC;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=34;WE=69639;WS=69621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	131516	rs12942829	C	A	292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=239;SC=GAGGGCATATCCAGCCCACTC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=131524;WS=131506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	169399	rs11654845	T	C	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=560;ReadPosRankSum=0.954;SC=ACAGTTGCACTGAGGCCCGAA;SOR=5.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=26;WE=169407;WS=169389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr17	171373	rs111911315	T	C	363.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=300;SC=GCAACAGAGATGGCCCAGGTG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=14;WE=171381;WS=171363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	177359	rs67434950	G	T	1775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=38;PP=1369;SC=GGCTGGGGGTGGGGAGTCACA;SOR=1.532;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=17;TCR=38;TR=55;WE=177367;WS=177349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	181474	rs12953074	T	C	3291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=42;PP=2508;SC=GAGGGCCTCATCAGCCGACCC;SOR=1.106;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=59;TCR=42;TR=101;WE=181482;WS=181464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr17	182727	rs4074370	T	A	1330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=1;PP=1087;SC=ACCCGAGGGGTACAGGGAACG;SOR=6.043;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=40;WE=182735;WS=182717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	505162	rs4968055	A	G	1370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=30;PP=1084;SC=GAGAAAGAGAAGTGTTTTCTG;SOR=1.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=44;WE=505170;WS=505152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	505250	rs4968092	A	G	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=363;SC=GCTATCTGATAAAGAAGAACT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=505258;WS=505240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	600502	rs2657633	C	T	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=3;PP=805;SC=AGGGACAGCACGTGGCTGCTG;SOR=4.047;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=600510;WS=600492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	602469	rs2543781	G	C	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=0;PP=1048;SC=TGGCAAACTTGAGATTTCAGT;SOR=5.728;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=602477;WS=602459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	636266	rs141977343	A	AGGGCC	1045.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=5;PP=980;SC=GTCAGGCCGAAGGGCCGGGCC;SOR=6.091;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=29;WE=636274;WS=636256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	636320	rs111405529	T	TCTC	2895.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=16;PP=2303;SC=CGCGCGCTGTTCTCTCCGCCC;SOR=2.267;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=41;TCR=17;TR=55;WE=636328;WS=636310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	648157	rs1045481	G	A	1127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=3;PP=957;SC=CTTCAGGGCCGATGCCCTCAG;SOR=3.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=34;WE=648165;WS=648147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	648498	rs2740349	C	T	2619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=34;PP=2047;SC=GGAAGCCAATCACGACAGCTA;SOR=0.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=47;TCR=34;TR=81;WE=648506;WS=648488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	649505	rs4968104	T	A	4109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.212;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=61;PP=2965;ReadPosRankSum=1.179;SC=GGGACCCTGCTCTTCCACAAA;SOR=0.395;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=69;TCR=62;TR=130;WE=649513;WS=649495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,131:0.99:132
chr17	649935	rs2740348	G	C	3623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=54;PP=2946;SC=AAGTCTGGCTGTCGGAAGAGG;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=56;TCR=54;TR=110;WE=649943;WS=649925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr17	673895	rs2644706	C	G	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=309;SC=CTAGTCCACACTTTCCTGTGT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=673903;WS=673885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	680299	rs2273453	T	C	1246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=39;PP=913;SC=AGAGAACTACTGGGCACAGAG;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=39;WE=680307;WS=680289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	685752	rs2249542	G	A	2501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=39;PP=2005;SC=TTTCCTTCCGGAGAGGTGGTG;SOR=0.770;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=35;TCR=39;TR=74;WE=685760;WS=685742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr17	686589	rs35144249	C	CT	526.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=2.558;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=0.544;QD=16.46;ReadPosRankSum=-0.676;SOR=0.317;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,24:0.75:32
chr17	882993	rs374545003	T	C	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=14;PP=374;SC=GGCGGCGGCGTCGGCGGCAGG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=883001;WS=882983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	902841	.	C	G	2455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=31;PP=1987;SC=AAACGGCTCTCGAATGCTTTT;SOR=0.955;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=41;TCR=31;TR=72;WE=902849;WS=902831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	902869	rs12941159	A	G	2113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=40;PP=1654;SC=GGCCTTGGACAACGTGCTGAG;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=27;TCR=40;TR=67;WE=902877;WS=902859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	909451	rs2586306	A	T	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=22;PP=623;SC=TCCCTGTCCTAGGCCTCGTCC;SOR=3.690;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=909459;WS=909441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	910401	rs2586305	G	A	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=1;PP=884;SC=CGGTGCCAGGGTACCTGCGCC;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=910409;WS=910391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	910636	rs2586304	A	G	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=13;PP=440;SC=CGCTGTGGGAACTCCTGAAGG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=910644;WS=910626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	915368	rs333652	A	G	4092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=41;PP=2965;SC=AGGGCAGAGAAAGAGGCCACC;SOR=1.460;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=75;TCR=41;TR=116;WE=915376;WS=915358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr17	926008	.	A	C	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.936;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.36;ReadPosRankSum=-1.446;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr17	934766	.	CCCCCGCAG	C	559	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=559;QD=286.5;SC=GCCCCCGCAGCCCCCGCAGCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=934781;WS=934756;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	934898	rs9903778	G	A	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=5;PP=347;SC=TGTTGGGGGGGCGCTTGCTCC;SOR=1.863;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=934906;WS=934888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	934984	.	C	CGG	434.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=2;NR=8;PP=329;SC=TCGGTCATGCCGGGGGGGACG;SOR=1.981;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=10;WE=934992;WS=934974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	953456	rs2257540	C	T	1760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=47;PP=1467;SC=CCTGAACCTCCGAAGCTGGGA;SOR=3.872;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=5;TCR=47;TR=52;WE=953464;WS=953446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	953737	rs2257222	T	C	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=533;ReadPosRankSum=-1.184;SC=GAGCACGGGGTGGTGGGGTCC;SOR=3.352;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=953745;WS=953727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr17	960221	rs2304959	C	G	3401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=30;PP=2491;SC=TGGGCCACCTCTGGTTCCCGA;SOR=1.841;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=70;TCR=30;TR=100;WE=960229;WS=960211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr17	961149	rs9912632	T	A	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=174;SC=CGCTTAGAAATACAAAAGGCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=961157;WS=961139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	961304	rs2260448	C	A	407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=9;PP=266;SC=AGGAGATAAGCATAAAGTGGG;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=961312;WS=961294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	961900	rs2304961	G	A	621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=0;PP=495;SC=TTTCCGGTTCGTACAGGTCAG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=961908;WS=961890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	970251	rs2258097	TG	CA	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=1;PP=530;SC=TACAACTTCCTGCCTCCACCT;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=11;WE=970260;WS=970241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	970413	rs2262150	C	T	1274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=25;PP=925;SC=TGGCCTCAGACTCCTCGGGGG;SOR=1.259;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=40;WE=970421;WS=970403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	976711	rs2258893	T	C	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=3;PP=304;SC=CCTGGCGGCATGGATACCGCG;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=976719;WS=976701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	1004108	rs12942046	G	A	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=354;SC=CTGTCACCTAGGCTGAAGTAA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=1004116;WS=1004098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	1083083	rs62070499	A	G	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=17;PP=639;SC=AAGGAGGGAGAGCGGGCGGGA;SOR=1.528;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=25;WE=1083091;WS=1083073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	1183354	rs6502774	T	C	4675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=98;NR=46;PP=2965;SC=TCCGCCGCATTCCTGGACCTG;SOR=1.643;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=98;TCR=46;TR=144;WE=1183362;WS=1183344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr17	1183464	rs6502776	A	G	5326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=91;PP=2965;SC=GGAGCAGAACAGCCAGGGCCT;SOR=0.776;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=82;TCR=91;TR=173;WE=1183472;WS=1183454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr17	1264611	rs140254754	TA	T	815.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=2.512;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.98;MQRankSum=0.814;QD=16.99;ReadPosRankSum=0.803;SOR=0.278;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,44:0.92:48
chr17	1371818	rs8080389	C	T	1713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=45;PP=1360;SC=GTGAGGAGAGCGTCATGGTGG;SOR=3.139;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=9;TCR=45;TR=54;WE=1371826;WS=1371808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	1384066	rs4790518	A	G	3386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=57;NR=59;PP=2632;SC=TCTCCTCCTCACCCCCCTCCA;SOR=0.727;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=117;TCF=57;TCR=60;TR=116;WE=1384074;WS=1384056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr17	1412455	rs5818804	GC	G	407.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=443;SC=GGAACGGTCTGCCAGACCCAG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=1412463;WS=1412445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	1437278	rs2270228	C	T	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=2;PP=1018;SC=CTGTAGCAGACACTGACGTGT;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=38;WE=1437286;WS=1437268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	1456507	rs9895971	G	A	1273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=28;PP=995;SC=ACGTAATCCAGCTGCCAGTAA;SOR=1.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=1456515;WS=1456497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	1480088	rs7222193	G	A	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=271;SC=TGGTGACCCCGGGCTGCACCG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=1480096;WS=1480078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	1489088	rs4790208	C	G	1841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=28;PP=1448;SC=GCTCCGGGAGCAGCTGGAGTG;SOR=0.800;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=26;TCR=28;TR=54;WE=1489096;WS=1489078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	1490379	rs143498029	A	ACACTGCGTTTCCCG	1670.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=34;PP=2967;SC=TGCATTTCCCACACTGCGTTT;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=2;TCR=56;TR=34;WE=1490387;WS=1490369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	1490409	rs8078582	T	C	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=177;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=457;SC=CATTTCCCACTAAGCGTGACT;SOR=4.091;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=1490417;WS=1490399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	1493972	rs7210368	T	G	114.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=54;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=84;SC=GGCAGACAGCTCCTGGGATGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=1493980;WS=1493963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	1493999	rs7406591	G	C	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=172;SC=TCCATGGCCCGGCTGGCCCGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=1494007;WS=1493989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	1494027	rs4790668	T	C	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=260;SC=TAACACATTCTGGCCGGTGGC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=1494035;WS=1494017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	1494567	rs12953268	G	A	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=8;PP=801;SC=GGGTACCTGCGGCATCCGGCT;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=33;WE=1494575;WS=1494557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	1516480	rs7219369	T	C	3498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.99;NF=47;NR=70;PP=2583;SC=TTAAAAAATCTGTACTCACTG;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=47;TCR=70;TR=117;WE=1516488;WS=1516470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr17	1530957	.	T	C	31	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=8;HapScore=2;MGOF=33;MMLQ=20;MQ=59.64;NF=6;NR=0;PP=31;QD=10.9618687579;SC=TCCCGCCCCCTCCCAAAGCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=6;WE=1530965;WS=1530947;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,6:0.40:15
chr17	1530979	rs5818816	G	GC	677.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=6;PP=587;SC=AGCTCCAGGAGCCCCCCGCAA;SOR=2.030;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=18;WE=1530987;WS=1530969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	1538546	rs4790250	C	T	3756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=44;NR=78;PP=2965;SC=ACTGTCCGGCCACCAAGTGGG;SOR=1.387;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=122;TCF=44;TCR=78;TR=122;WE=1538554;WS=1538536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr17	1538628	rs3744644	C	G	2594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=35;PP=2181;SC=CTTCTGCTTCCTCTGGGCCTG;SOR=1.204;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=87;TCF=51;TCR=36;TR=86;WE=1538636;WS=1538618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	1550106	rs2293067	C	T	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=8;PP=499;SC=AGCAGGGTGACGGGCAGAGAA;SOR=1.230;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=11;TCR=8;TR=19;WE=1550114;WS=1550096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	1576369	rs11078563	C	T	2904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=20;PP=2426;SC=CATGACGGCCCTGTACCTTGG;SOR=2.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=67;TCR=20;TR=87;WE=1576377;WS=1576359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr17	1576562	rs11078564	C	T	3170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=70;PP=2512;SC=GTGCCCACCACTCAAGTCTTT;SOR=1.935;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=30;TCR=70;TR=100;WE=1576570;WS=1576552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr17	1577690	rs28715427	C	T	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=2;PP=625;SC=AGGCAAAGCACATGCCTCAGT;SOR=5.058;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=1577698;WS=1577680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	1578032	rs8070091	A	G	1801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=46;PP=1482;SC=GATTCTCCAGAGTTAACCTCT;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=13;TCR=46;TR=59;WE=1578040;WS=1578022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	1578122	rs8066413	C	G	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=10;PP=313;SC=TGAGAGTGCACTGGCGCAATC;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=1578130;WS=1578112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	1578835	rs35570313	A	G	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=3;PP=264;SC=TAAACCAATCATGCTACCCAG;SOR=1.911;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=1578843;WS=1578825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	1578939	rs33965342	C	T	1332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=10;PP=1080;SC=AAACAAGCAGCGGAGGTGGTT;SOR=1.662;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=39;WE=1578947;WS=1578929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	1580929	rs11078565	G	C	981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=17;PP=787;SC=GCATGAAAAAGAGCCAGACTC;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=12;TCR=17;TR=29;WE=1580937;WS=1580919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	1582205	rs9902534	G	A	5058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=81;PP=2965;SC=CAGACAGAACGTGAATGAGCA;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=157;TCF=75;TCR=82;TR=156;WE=1582213;WS=1582195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr17	1584324	rs7503397	A	G	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=28;PP=850;SC=TGTTAATATCATTGAATTCAT;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=1584332;WS=1584314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	1585055	rs17761292	G	A	6487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=88;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.738;SC=TGATCTCCCAGGACTCCTTCT;SOR=0.871;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=195;TCF=106;TCR=89;TR=193;WE=1585063;WS=1585045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,205:0.99:207
chr17	1585130	rs11559305	A	G	5402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=99;PP=2965;SC=CTGTCCCTCAACGGCTGGTGG;SOR=1.248;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=161;TCF=62;TCR=99;TR=161;WE=1585138;WS=1585120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr17	1611433	rs4790809	A	G	1693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=31;PP=1376;SC=GCAAGCAGGCAGAGTTCAGTT;SOR=0.922;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=26;TCR=31;TR=57;WE=1611441;WS=1611423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	1611545	rs4790810	A	C	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=23;PP=693;SC=GGTCAGAGGAACCCCATGACC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=1611553;WS=1611535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	1657988	rs189673650	G	A	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=9;PP=249;SC=GTGGGGGGGGGGCGCGGCTGG;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=1657996;WS=1657978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	1674429	rs8074840	T	C	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=27;PP=959;SC=ACACGGTCACTGCCCCCCAGA;SOR=1.132;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=18;TCR=27;TR=45;WE=1674437;WS=1674419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	1675127	rs4274474	C	T	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=319;SC=TGCTTGTCGTCGAGTCTCATA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=1675146;WS=1675122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	1675138	rs4274475	C	T	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=2;PP=371;SC=GAGTCTCATACGCTAACCTCT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=1675146;WS=1675122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	1675451	rs5008943	T	C	252.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=177;SC=TACTCTGTAGTCCTAACTGGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=1675459;WS=1675441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	1678256	rs2269344	G	C	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=483;SC=TCCCTTGAGTGGGGCAATTTT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=1678264;WS=1678246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	1679793	rs2071021	A	G	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=3;PP=768;SC=TGGGCTCTGAAGGACTAACCA;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=28;WE=1679813;WS=1679783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	1679805	rs2071022	A	G	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=4;PP=705;SC=GACTAACCACATGCTTTCTCA;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=1679813;WS=1679783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	1680002	rs6828	T	C	2323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=56;PP=1735;SC=AGCTGAGTTATGAAGGCGAAG;SOR=1.939;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=24;TCR=56;TR=80;WE=1680010;WS=1679992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	1684772	rs7224977	T	C	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=17;PP=527;SC=TTCACTGATTTGTGAGGCAAA;SOR=1.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=27;WE=1684780;WS=1684762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	1686410	rs9902398	T	C	1467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=23;PP=1212;SC=CTCCACCACGTAGAGACTCCT;SOR=0.829;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=21;TCR=23;TR=44;WE=1686418;WS=1686400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	1686563	rs11078639	C	T	609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=16;PP=478;SC=GTTTACAGAGCGGGGGGTAAC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=1686571;WS=1686553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	1687796	rs3815612	A	G	998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=30;PP=845;SC=TGCCAGGGTCAGTTATCAACA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=1687804;WS=1687786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	1690303	rs34115092	AAG	A	257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=309;SC=TATTGAAAGCAAGAGAGAGTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=1690312;WS=1690293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	1690752	rs11549830	G	A	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=371;SC=TTTCTAATCCGCTGTGACGCC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=1690760;WS=1690742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	1748028	rs4790827	A	G	1864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=48;PP=1555;SC=GAATGGGAACAAATTTAGGAA;SOR=3.690;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=7;TCR=48;TR=55;WE=1748036;WS=1748018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	1756351	rs2287321	A	G	1997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=6;PP=1621;SC=TCATTTGAACAGAATTTGTTT;SOR=4.499;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=62;TCR=6;TR=68;WE=1756359;WS=1756341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr17	1761351	.	C	T	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.354;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.80;MQRankSum=-3.310;QD=1.06;ReadPosRankSum=-0.728;SOR=0.013;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,4:0.09:46
chr17	1761353	.	T	C	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.445;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.92;MQRankSum=-3.593;QD=1.06;ReadPosRankSum=-1.145;SOR=0.019;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,5:0.11:47
chr17	1761358	.	G	A	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.900;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.27;MQRankSum=-3.307;QD=0.81;ReadPosRankSum=-0.116;SOR=0.072;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,5:0.10:49
chr17	1761367	.	G	T	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.588;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.24;MQRankSum=-3.435;QD=1.24;ReadPosRankSum=1.687;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,5:0.09:54
chr17	1761373	.	A	G	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.09;MQRankSum=-4.050;QD=1.67;ReadPosRankSum=2.031;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,6:0.10:58
chr17	1761377	.	G	A	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.891;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.35;MQRankSum=-2.861;QD=2.04;ReadPosRankSum=1.896;SOR=0.750;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,7:0.11:65
chr17	1761383	rs375054050	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=2.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.56;MQRankSum=-2.367;QD=2.61;ReadPosRankSum=0.809;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,9:0.13:67
chr17	1761391	.	G	A	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.191;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=2.323;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.57;MQRankSum=-2.353;QD=3.30;ReadPosRankSum=0.897;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,9:0.14:66
chr17	1761401	.	G	T	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.344;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=4.719;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.51;MQRankSum=-2.857;QD=3.18;ReadPosRankSum=-0.062;SOR=1.995;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,10:0.15:67
chr17	1761404	.	G	A	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.147;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=7.082;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.80;MQRankSum=-2.772;QD=2.79;ReadPosRankSum=0.228;SOR=2.182;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,10:0.14:72
chr17	1761423	.	T	C	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.765;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=10.416;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.85;MQRankSum=-3.828;QD=1.24;ReadPosRankSum=0.641;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,11:0.11:99
chr17	1761425	.	C	A	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.005;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=8.268;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.84;MQRankSum=-3.259;QD=1.57;ReadPosRankSum=1.981;SOR=2.271;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,9:0.09:103
chr17	1761428	.	G	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.384;ClippingRankSum=0.000;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=10.379;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.19;MQRankSum=-3.460;QD=0.91;ReadPosRankSum=1.325;SOR=2.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:96,10:0.09:106
chr17	1761431	rs3809874	T	C	3578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=42;PP=2962;SC=TTTCCTAGGTTCCACATCAAG;SOR=1.308;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=65;TCR=42;TR=107;WE=1761465;WS=1761413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr17	1761436	.	A	G	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.275;ClippingRankSum=0.000;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=5.063;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.99;MQRankSum=-3.650;QD=0.44;ReadPosRankSum=1.392;SOR=1.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,10:0.08:118
chr17	1761445	.	C	T	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.689;ClippingRankSum=0.000;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=7.374;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.27;MQRankSum=-3.666;QD=0.51;ReadPosRankSum=0.605;SOR=2.062;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,10:0.08:126
chr17	1761447	.	G	A	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.616;ClippingRankSum=0.000;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=2.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.35;MQRankSum=-3.661;QD=0.45;ReadPosRankSum=0.421;SOR=1.375;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,10:0.08:127
chr17	1778911	rs66498893	GTAGAA	G	2214.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=4;PP=2081;SC=AAAAAGCTAAGTAGAATAGTA;SOR=4.133;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=39;WE=1778923;WS=1778901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	1782957	rs2230930	C	T	3780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=82;PP=2965;SC=TGGACACATCCGGGAAGGTGG;SOR=1.590;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=121;TCF=39;TCR=82;TR=121;WE=1782965;WS=1782947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr17	1792174	rs2270412	G	A	1613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=37;PP=1329;SC=TGAGAACCACGGTTGTGTTCA;SOR=2.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=47;WE=1792182;WS=1792164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	1800217	rs7406062	G	C	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=423;SC=ACATTCAGGAGGAGGCTGTCA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=1800225;WS=1800207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	1839674	rs9902457	G	C	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=263;SC=GCAGCCGAAGGCTCTACCAGC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=1839682;WS=1839664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	1840468	rs9903800	C	T	2819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=41;PP=2133;SC=GGTCGTGGAACGCCTTGTGGT;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=40;TCR=41;TR=81;WE=1840476;WS=1840458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	1933241	rs35350758	AG	A	784.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=0;PP=917;SC=ACTAAGTCGCAGGGCAAGGGC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=23;WE=1933249;WS=1933231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	1933381	rs2273981	G	A	2739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=50;PP=2148;SC=GCCCCCGCTGGCCGATCGGCG;SOR=0.959;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=90;TCF=40;TCR=50;TR=89;WE=1933389;WS=1933371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr17	2091765	rs903160	C	T	4558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=107;NR=42;PP=2965;SC=CCCAGAGCTGCGGCTTGTTCC;SOR=2.046;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=150;TCF=108;TCR=42;TR=149;WE=2091773;WS=2091755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr17	2092006	rs903161	A	T	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=40;PP=1120;SC=GTGTTTGATAAGATGATAAGG;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=40;WE=2092014;WS=2091996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	2186100	rs749240	C	T	2234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=32;PP=1763;SC=CTTTCCGCCACTGGTCAGGGC;SOR=0.898;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=72;TCF=39;TCR=33;TR=71;WE=2186108;WS=2186090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr17	2297571	.	GCA	G	46.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.664;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=2.100;QD=1.87;ReadPosRankSum=-0.612;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr17	2565299	rs8067353	T	A	282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=2;PP=139;SC=GAGCCGAGCTTGCGCCATTGC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=2565307;WS=2565289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	2595215	rs5818873	GC	G	211.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=8;PP=199;SC=AAGGGATCAGGCCCCCCCGTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=2595223;WS=2595205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	2595291	rs62068251	C	T	205.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=140;SC=ACGCCCCCGCCGCGCACCTGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=2595299;WS=2595281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	2597723	rs66960934	GCAGCGGGGACA	G	2683.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=22;PP=2987;SC=CAGCAGGGACGCAGCGGGGAC;SOR=1.057;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=23;TCR=29;TR=38;WE=2597741;WS=2597713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	2598627	rs1003398	T	C	5425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=101;PP=2965;SC=TCCATCCCAGTCCCACAGCTC;SOR=1.206;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=64;TCR=101;TR=165;WE=2598647;WS=2598617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr17	2598639	rs1003399	C	G	4891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=55;NR=100;PP=2965;SC=CCACAGCTCCCGTTCCGCCCC;SOR=1.413;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=55;TCR=100;TR=155;WE=2598647;WS=2598617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr17	2599612	rs2302200	C	G	1479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=29;PP=1310;SC=TGCCGCCTGGCGCTGGCGGGG;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=46;WE=2599620;WS=2599602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	2604375	rs758417	C	T	1191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=3;PP=984;ReadPosRankSum=1.339;SC=GCAGGTGGGCCGGCTCACCCC;SOR=3.003;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=36;WE=2604383;WS=2604365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr17	2606715	rs1065479	G	A	3579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=70;PP=2772;SC=AGAAGCAGGTGCGGTGACACG;SOR=1.266;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=46;TCR=70;TR=116;WE=2606723;WS=2606705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr17	2607560	rs12953041	A	G	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=0;PP=722;SC=CTGCCACAAAATGGGGCCGGT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=2607568;WS=2607550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	2699935	rs123059	T	C	1900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.409;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=42;PP=1515;ReadPosRankSum=-0.659;SC=TTAAGTGCATTGGCGGCCGTG;SOR=1.250;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=24;TCR=42;TR=65;WE=2699943;WS=2699925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,68:0.99:69
chr17	2865789	rs34224666	A	C	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=174;SC=CTGTTGCCTCACCTGAGGCTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=2865797;WS=2865779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	2868935	rs12950923	T	C	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=6;PP=243;SC=GGGTCATCCTTAGGTAGGGCT;SOR=1.445;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=2868943;WS=2868925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	2883588	rs17762452	C	A	1704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=27;PP=1219;SC=CAGGTCCAAACTGAAGACGGT;SOR=0.728;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=26;TCR=27;TR=53;WE=2883596;WS=2883578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	2921210	.	C	CGT,CGTGT	131	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.37;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=7;MMLQ=22;MQ=58.36;NF=3,3;NR=0,0;PP=36,131;QD=13.0;SC=CCTCTGTGACCGTGTGTGTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=3,3;WE=2921218;WS=2921200;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.23:13
chr17	2921251	rs8064800	A	G	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=7;PP=837;SC=GTATGTGTGCACGCATACGTG;SOR=1.697;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=23;WE=2921259;WS=2921233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	2923597	rs2304981	C	A	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=388;SC=CTGTGACTGGCCTGAGTCTCC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=2923605;WS=2923587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	2923767	rs2304982	A	G	3819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=35;PP=2965;SC=AATTTCATCGACAGCCTCCAG;SOR=1.713;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=78;TCR=35;TR=112;WE=2923775;WS=2923757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr17	2924011	rs4790416	T	C	1050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=29;PP=866;SC=AGGAGATGGCTCTGCCTTCAG;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=2924019;WS=2924001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	2929286	rs4072679	A	C	2707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=31;PP=2076;SC=CTCACTCCTCATTTCCATTCC;SOR=1.347;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=50;TCR=31;TR=81;WE=2929294;WS=2929276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	2929674	rs12941934	T	C	3237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=30;PP=2375;SC=AAAACGGCCGTGCCATCTCCC;SOR=1.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=70;TCR=30;TR=100;WE=2929682;WS=2929664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr17	2930438	rs35213780	C	G	1190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=36;PP=1044;SC=TAGCAGGGCCCCAGCCACGCT;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=40;WE=2930446;WS=2930428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	2935591	rs4239039	T	C	763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=4;PP=690;SC=CCTGGGGTCCTGAATCCCTTC;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=2935599;WS=2935581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	2966064	rs200196918	G	C	298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.04;MQRankSum=-1.406;QD=11.95;ReadPosRankSum=1.394;SOR=0.622;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr17	2966154	rs145256155	G	A	2044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.459;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-2.713;NF=62;NR=34;PP=2084;ReadPosRankSum=0.012;SC=CCATAAAAGAGGGAGACCACA;SOR=1.032;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=198;TCF=122;TCR=76;TR=96;WE=2966162;WS=2966144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,77:0.50:153
chr17	2966173	rs61752193	G	C	2047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.876;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.598;NF=59;NR=42;PP=1799;ReadPosRankSum=0.879;SC=CACCCAAATGGGAGGCACAGG;SOR=0.964;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=208;TCF=118;TCR=90;TR=101;WE=2966181;WS=2966163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,84:0.49:172
chr17	2966191	rs61752194	G	A	2215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.366;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.707;NF=61;NR=41;PP=2032;ReadPosRankSum=1.745;SC=AGGTAGAGAAGGTTTTGTATT;SOR=1.072;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=223;TCF=131;TCR=92;TR=102;WE=2966199;WS=2966181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,88:0.45:196
chr17	2966273	rs2676567	G	A	2182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.346;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.547;NF=44;NR=58;PP=1951;ReadPosRankSum=1.715;SC=GAACCCTAAGGGGGTGAGGAA;SOR=0.970;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=234;TCF=120;TCR=114;TR=102;WE=2966281;WS=2966263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,88:0.46:191
chr17	2966308	rs2855605	C	T	2415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.391;NF=51;NR=57;PP=2062;ReadPosRankSum=-0.775;SC=TGGCAATCAACGCTGTGTGAA;SOR=0.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=240;TCF=118;TCR=122;TR=108;WE=2966316;WS=2966298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,98:0.47:208
chr17	3101076	rs2241092	G	C	1439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=21;PP=1173;SC=ATCTCTTGGGGAGCAAGTTCA;SOR=0.829;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=21;TCR=21;TR=42;WE=3101084;WS=3101066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	3119008	rs4325604	T	C	1585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=1247;ReadPosRankSum=-1.092;SC=CATCCTCTTCTTGTTCATTTA;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=24;TCR=29;TR=51;WE=3119016;WS=3118998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,53:0.96:55
chr17	3119397	rs769425	G	T	6315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.054;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=1.108;SC=CCCACACTCTGCTCACAGCTA;SOR=0.271;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=197;TCF=100;TCR=97;TR=194;WE=3119405;WS=3119387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,199:1.00:200
chr17	3119611	rs17762735	G	A	4650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.742;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.764;SC=CACCAAGGGCGTGCTCAAGGC;SOR=1.447;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=46;TCR=96;TR=142;WE=3119619;WS=3119601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,148:0.99:149
chr17	3181555	rs2013809	A	G	3737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.390;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=51;PP=2839;ReadPosRankSum=0.008;SC=GGCTGTAGGCAGTGATGATGA;SOR=0.819;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=129;TCF=76;TCR=53;TR=126;WE=3181563;WS=3181545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,132:0.98:135
chr17	3181662	rs9901356	G	C	2134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=67;PP=1712;SC=AGCTGTGGGAGGTCACAGTAG;SOR=4.091;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=10;TCR=67;TR=77;WE=3181670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr17	3182309	rs2014057	GT	AG	2030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=34;PP=2243;SC=TCAAAGCCCCGTGGCGAGTCC;SOR=2.985;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=39;WE=3182318;WS=3182299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	3213545	rs8071097	G	C	1760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=7;PP=1357;ReadPosRankSum=-0.650;SC=ACCTCATCCTGCTTCTGCCAC;SOR=1.802;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=48;WE=3213553;WS=3213535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,53:0.98:54
chr17	3213728	rs9905684	A	G	3398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=64;PP=2710;ReadPosRankSum=-0.771;SC=CGTCACTACCATTGGAGGCAC;SOR=0.421;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=47;TCR=65;TR=111;WE=3213736;WS=3213718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,113:0.99:114
chr17	3213862	rs9905086	C	G	2894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=42;PP=2374;SC=CCATGCTGAGCCATTTCATAT;SOR=0.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=89;TCF=46;TCR=43;TR=88;WE=3213870;WS=3213852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	3213911	rs9903671	G	C	3151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=40;PP=2609;SC=CTGCCTCTCCGAGCTCTTCTT;SOR=0.947;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=53;TCR=40;TR=93;WE=3213919;WS=3213901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr17	3213962	rs9906179	A	G	2601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=33;PP=1968;SC=CTTGCTGACCATCATGGCCTA;SOR=1.166;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=52;TCR=33;TR=85;WE=3213970;WS=3213952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	3214106	rs9911226	C	A	5368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=60;PP=2965;SC=TGCCCTGTCTCCTCTTAACTT;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=125;TCF=65;TCR=60;TR=125;WE=3214114;WS=3214096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr17	3214128	rs9912090	A	G	5026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=50;PP=2965;SC=TGTGGCCCCAATGTGATCAAT;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=61;TCR=50;TR=111;WE=3214136;WS=3214118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr17	3324004	rs146946227	C	T	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.77;QD=33.63;SOR=6.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	3324086	rs227788	G	A	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=31.15;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	3324255	rs769432	C	T	289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.56;QD=28.98;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	3324720	rs12939997	A	G	2093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=35;PP=1733;SC=TGGGGTTTTCATGACTGTGAT;SOR=0.750;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=70;TCF=35;TCR=35;TR=69;WE=3324728;WS=3324710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	3337057	rs769431	A	G	2536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.92;QD=30.20;SOR=1.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	3343519	rs17822627	T	C	3913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=54;PP=2965;SC=AAGTTTTTTGTTCAGAAACAG;SOR=0.816;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=62;TCR=54;TR=116;WE=3343527;WS=3343509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr17	3349634	.	C	CTT	28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.9998;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=28;QD=48.9550042192;SC=ATTATTAAAACCAGTTCTTTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=3349642;WS=3349624;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	3352257	rs35561131	G	A	6094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=83;PP=2965;ReadPosRankSum=0.728;SC=TGAGTAGCTCGGTTTCTTTGT;SOR=0.758;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=179;TCF=95;TCR=84;TR=177;WE=3352265;WS=3352247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,190:0.99:192
chr17	3352294	rs1488689	A	G	5472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=96;PP=2965;SC=AGGTTCAGGTATTCTTAATTG;SOR=1.159;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=65;TCR=96;TR=161;WE=3352302;WS=3352284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr17	3352331	rs1488690	C	T	4001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=82;PP=2965;SC=CCCGAACTCACTGGACAAGAA;SOR=1.870;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=35;TCR=82;TR=117;WE=3352339;WS=3352321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr17	3352455	rs34414986	C	CAA	1189.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=31;PP=787;SC=TGTAATAGTGCAAAAAAAAAG;SOR=5.486;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=31;WE=3352463;WS=3352445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	3352494	rs35147573	C	CA	452.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=383;SC=TTCTTAATTACAAAAAAAATT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=15;WE=3352502;WS=3352484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	3417123	rs906418	C	T	973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=0;PP=908;SC=CCGGACTCCACCATCCCTCAA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=3417131;WS=3417113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	3418119	rs10579788	AGTT	A	1124.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=1057;SC=GTCACACCAAAGTTGTTGGAG;SOR=5.136;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=23;WE=3418129;WS=3418109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	3419689	rs8081785	CA	TG	1896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=4;PP=1996;SC=ATCCTGTCACCATCCTGCCCC;SOR=3.056;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=33;WE=3419698;WS=3419679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	3424183	rs8079980	A	G	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=4;PP=336;SC=AATTGTTGCCAAGGCCGCCAT;SOR=1.739;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=3424191;WS=3424173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	3424507	rs925101	T	C	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=19;PP=423;SC=CACTGGATCCTGCCTCCTCCA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=3424515;WS=3424497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	3427442	rs62069862	A	G	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=685;SC=CCCCATCTGAAAAATGGCCAT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=3427450;WS=3427432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	3445901	rs11078458	T	G	4338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=65;PP=2965;SC=GGATCCGCACTATCTCCTTGG;SOR=0.764;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=74;TCR=65;TR=138;WE=3445909;WS=3445891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr17	3447914	rs1039519	C	T	1572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=21;PP=1156;SC=TCACATCATCCTGAGGAGACT;SOR=0.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=48;WE=3447922;WS=3447904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	3457954	rs11453205	T	TG	628.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=0;PP=484;SC=AAGGGCTCCCTGGGGGGGTGC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=17;WE=3457962;WS=3457944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	3458072	rs322965	T	C	2088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=32;PP=1606;SC=TCTGGCAGGATGGCAGGGTTC;SOR=0.807;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=39;TCR=32;TR=71;WE=3458080;WS=3458062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	3475018	rs224547	A	G	1493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=42;PP=1307;SC=AGCCCAAGAAACCCACCCATC;SOR=3.865;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=47;WE=3475026;WS=3475008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	3475367	rs224548	T	G	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=5;PP=913;SC=TGTCCACAGGTGAGCCCCAAA;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=3475375;WS=3475357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	3475405	rs224549	C	T	1473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=11;PP=1196;SC=CAGGTGGAGCCTGGGCATTAC;SOR=2.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=45;WE=3475413;WS=3475395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	3475564	rs224550	C	T	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=31;PP=903;SC=ACACCAAGGGCAGAGGAGCTG;SOR=3.912;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=34;WE=3475572;WS=3475554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	3492002	rs161390	A	G	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=658;SC=CGGCTACTTGAGAGGCCGAGA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=3492010;WS=3491999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	3492125	rs199801668	C	A	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=106.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.88;MQRankSum=-1.812;QD=2.02;ReadPosRankSum=-4.108;SOR=6.993;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,32:0.32:101
chr17	3492319	rs7220415	C	A	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=29;PP=786;SC=GTGGCTCATGCCTGTAATCCC;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=3492327;WS=3492309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	3493200	rs222747	C	G	4252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=66;PP=2965;SC=TGGCCCCCAGCATCAGAATCT;SOR=0.754;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=64;TCR=67;TR=130;WE=3493208;WS=3493190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr17	3493533	rs161387	A	G	2140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=35;PP=1579;SC=GGTCTGCCACACTGTCTCCCT;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=37;TCR=35;TR=72;WE=3493541;WS=3493523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	3513719	rs465563	G	A	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=0;PP=482;SC=GTTCTTGGCCGAGATGGGACC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=3513727;WS=3513709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	3514028	rs224496	G	C	2726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=48;PP=2207;SC=CCACGCCCCAGTCCTGGAGCT;SOR=1.101;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=85;TCF=36;TCR=49;TR=84;WE=3514036;WS=3514018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr17	3524695	rs147149189	G	A	2398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=44;PP=1950;SC=AGGAAAACCCGAGCTCCTCAG;SOR=1.012;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=77;WE=3524703;WS=3524685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	3552372	rs161351	G	C	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=383;SC=GTGTCTTTTGGGGATGAGTAT;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=3552380;WS=3552362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	3553526	rs161350	A	G	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=20;PP=780;SC=GAGGCACATCAAGATGGGCTG;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=30;WE=3553534;WS=3553516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	3558417	rs459613	C	G	2115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=39;PP=1684;SC=TCAGGGTGTGCGGGCCTCACG;SOR=1.098;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=66;WE=3558425;WS=3558407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr17	3558698	rs467277	G	A	265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=9;PP=194;SC=TAGGAGCAGGGCGTTCCAGCA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=3558706;WS=3558688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	3561396	rs161400	C	T	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=5;PP=259;SC=GTGGGAGTGACCACGTGGCTG;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=13;WE=3561404;WS=3561386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	3566857	rs11541134	C	T	146.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=1;PP=116;SC=GAGAGAAAGCCGGTCCCAGAG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=3566865;WS=3566852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	3567461	rs2235107	G	A	2532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=27;PP=2050;SC=CCCAAACCTTGTTTCTCCTCC;SOR=1.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=54;TCR=27;TR=81;WE=3567469;WS=3567451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	3568012	rs8278	A	G	2479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=41;PP=1897;SC=TCTGGGAAGGATCCTGGTCGA;SOR=0.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=35;TCR=41;TR=76;WE=3568020;WS=3568002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr17	3571863	rs160589	G	A	1449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=27;PP=1181;SC=CGAGAAGCCGGCAGCAGAGTA;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=18;TCR=27;TR=45;WE=3571871;WS=3571853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	3577273	rs160587	A	G	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=8;NR=10;PP=413;SC=AAGTCTGAAAAGAGCTACAGT;SOR=0.914;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=18;WE=3577281;WS=3577263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	3593074	rs220486	A	G	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=145;SC=GCGCCCCAGCACCACCCACCG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=3593082;WS=3593064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	3618298	rs1367950	C	T	2424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=58;PP=1937;SC=TTCAGAAAACCGGCATTCTGG;SOR=2.155;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=20;TCR=58;TR=78;WE=3618306;WS=3618288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	3620138	rs2293881	A	G	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=1045;ReadPosRankSum=-0.766;SC=TGAAGCAAACAAGGAAAAAAT;SOR=0.634;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=46;WE=3620146;WS=3620128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr17	3627473	rs9907144	C	T	3410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=64;NR=48;PP=2588;SC=GCGGCGGAGGCGTCCCGGCGG;SOR=0.978;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=116;TCF=68;TCR=48;TR=112;WE=3627481;WS=3627463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr17	3627840	rs220462	G	A	5274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=65;PP=2965;SC=GTCCCGAGCGGCCTCCACCTC;SOR=1.114;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=97;TCR=66;TR=162;WE=3627848;WS=3627830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr17	3628212	rs220461	T	C	2425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=34;PP=1881;SC=CCAAGGGGAATAGACAGGCTG;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=39;TCR=34;TR=73;WE=3628220;WS=3628202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr17	3628362	rs3809806	T	C	2781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=44;PP=2263;SC=TTACAGAATGTCTGCTTTTGG;SOR=0.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=40;TCR=44;TR=84;WE=3628370;WS=3628352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	3629698	rs170208	A	G	1257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=39;PP=1028;SC=TTCAACCTCCATCCCCACAGG;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=40;WE=3629706;WS=3629688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	3632836	rs1716	G	A	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=27;PP=1251;SC=GCCAAAGACCGTCTTTCATTG;SOR=0.770;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=25;TCR=27;TR=52;WE=3632844;WS=3632826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	3632952	rs2915554	C	T	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=514;SC=GCAGTGTTGCCGTCTCAGCTC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=3632960;WS=3632942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	3635603	rs56163349	A	G	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=364;SC=TGAGACCAAGATGCAGAAGAC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=3635611;WS=3635593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	3635768	rs3744678	A	C	1968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=33;PP=1485;SC=AGGCTGTTAAAAGAGCAGATG;SOR=1.010;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=26;TCR=33;TR=59;WE=3635776;WS=3635758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	3638037	rs184335	C	T	234.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=190;SC=AGTGAGGGGGCCACCACAGAA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=3638045;WS=3638027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	3638344	rs9674606	G	A	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=37;PP=1359;SC=TGGTGCTGTGGTGCAATGATC;SOR=1.893;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=52;WE=3638352;WS=3638334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	3704558	rs199698373	G	GC	411.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=474;SC=ACACACACCAGCAAGGACCCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=11;WE=3704566;WS=3704548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	3719447	rs61731024	G	A	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=12;PP=745;ReadPosRankSum=-0.672;SC=GTGGACGGGAGTGCTGACGTT;SOR=0.516;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=34;WE=3719455;WS=3719437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr17	3719620	rs16953498	A	G	744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=17;PP=547;SC=GTGAGACAAGACCCAAACAAC;SOR=1.445;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=26;WE=3719628;WS=3719610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	3728975	rs2307753	G	GTAACT	1682.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=3;PP=1780;ReadPosRankSum=0.381;SC=GAGAAAAAACGTAACTAAGTC;SOR=1.981;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=29;WE=3728983;WS=3728965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr17	3732795	rs78830554	T	C	1597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=44;PP=1289;SC=TATAATTATTTCAAAAGAGCA;SOR=7.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=44;WE=3732803;WS=3732785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	3775916	rs7214864	T	C	3022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=65;PP=2206;SC=CGTCGATGAATGGGCACTGTG;SOR=1.522;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=35;TCR=65;TR=100;WE=3775924;WS=3775906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr17	3776555	rs34231122	T	C	1454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=2;PP=1167;SC=CAGAGAAAGATAGAAAAAGCC;SOR=5.464;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=43;TCR=2;TR=45;WE=3776563;WS=3776545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	3783872	rs11651131	T	C	1104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=28;PP=932;SC=TAATAAAAAATTTAAAGCACA;SOR=2.899;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=3783880;WS=3783862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	3786802	rs737360	T	C	1354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=25;PP=1121;SC=GAAATGTCACTACTGTGCAGC;SOR=0.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=44;WE=3786810;WS=3786792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	3786907	rs758642	G	A	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=9;PP=405;SC=GCCCAGGTAAGTGTTAAGCGG;SOR=0.941;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=15;WE=3786915;WS=3786897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	3787593	rs8082046	G	A	2120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=11;PP=1703;SC=TCTGCCTCCCGTTCCCTCCCA;SOR=3.126;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=53;TCR=11;TR=64;WE=3787601;WS=3787583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	3806794	rs2074990	C	G	2900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=28;PP=2214;SC=TGAGAGCTGCCGGAGCGGCCC;SOR=1.935;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=67;TCR=28;TR=95;WE=3806802;WS=3806784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr17	3807044	rs740794	T	C	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=11;PP=644;SC=AGCCCTGGGCTGGTGGAGGGG;SOR=0.941;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=25;WE=3807052;WS=3807034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	3808032	rs2074989	A	G	1023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=1;PP=845;SC=CCAAATTTCCATCACTATGGC;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=36;WE=3808040;WS=3808022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	3808497	rs12449598	AA	GC	2333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=5;PP=2716;SC=GGAAGGTGCAAACCTGAGCCA;SOR=4.174;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=47;TCR=5;TR=49;WE=3808506;WS=3808487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	3808713	rs2074988	T	C	1489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=43;PP=1099;SC=CAGCTGGACCTGTCACACGCT;SOR=3.830;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=4;TCR=43;TR=47;WE=3808721;WS=3808703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	3818620	rs10852862	T	C	3183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=41;PP=2581;SC=ATGTGGGCACTCAGCACCAGG;SOR=0.985;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=54;TCR=41;TR=95;WE=3818628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr17	3818788	rs2875751	G	A	2107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=27;PP=1635;SC=GGACAGGTCCGGAGATGCCCA;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=32;TCR=27;TR=59;WE=3818796;WS=3818778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	3818830	rs2325788	A	G	2310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=31;PP=1810;SC=GACCAGAACCAATCTCTGTCC;SOR=1.040;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=45;TCR=31;TR=76;WE=3818838;WS=3818820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	3819002	rs11078475	T	C	2954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=48;PP=2431;SC=GGGTGTGGGGTATGGCCTCTG;SOR=1.055;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=37;TCR=48;TR=85;WE=3819010;WS=3818992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr17	3912743	rs117464936	C	T	136.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=106;SC=CTGGGAGAGGCGAGAGCCTCA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=3912751;WS=3912733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	3924759	rs141226386	T	C	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=287;SC=GAAACACGAATGTATGTTTAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=3924767;WS=3924749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	3985832	rs2727061	A	G	2466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.205;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=49;PP=2022;ReadPosRankSum=-0.765;SC=TATTCAGAAAATCTAGTCCAT;SOR=1.108;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=80;TCF=31;TCR=49;TR=79;WE=3985840;WS=3985822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,78:0.99:79
chr17	3989669	rs4790166	G	A	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=282;SC=TTCCCACAGCGGCAATCCCTT;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=11;WE=3989677;WS=3989659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	3989968	rs2727060	C	T	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=302;SC=AGACAAAAAACATCAGAGAGC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=3989976;WS=3989958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	3994170	rs2727075	T	C	2011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=54;PP=1659;SC=TTGAAACTTCTCAAGGGTCTA;SOR=4.479;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=5;TCR=54;TR=59;WE=3994178;WS=3994160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	4005770	rs1869493	T	C	3214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=70;PP=2370;SC=GAAACTAGCATGCCTATCTGT;SOR=1.674;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=34;TCR=70;TR=104;WE=4005778;WS=4005760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr17	4007875	rs9907500	C	T	359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=1;PP=256;SC=AATGGTTTTACGATTTGTCCA;SOR=2.670;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=9;WE=4007883;WS=4007865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	4027036	rs11078481	C	G	257.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=0;PP=181;SC=CACCACCGTACTGGGGATGAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=4027044;WS=4027031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	4027392	rs7208760	G	C	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=28;PP=896;SC=TCAAGTAAACGAGGGCAGTTT;SOR=4.047;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=4027400;WS=4027382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	4045809	rs4239043	T	C	1725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=5;PP=1479;SC=CCCTGCCCCATCCCCGCAGTC;SOR=5.136;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=50;TCR=5;TR=55;WE=4045817;WS=4045799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	4046101	rs1454121	A	G	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=28;PP=942;SC=CGTGCCCGAGACCGCGGCCCA;SOR=3.145;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=33;WE=4046109;WS=4046091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	4046270	rs1454122	T	C	243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=8;PP=174;SC=CGACAGCAGCTGGCGGGCGGG;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=4046278;WS=4046260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	4074261	rs897030	A	C	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=15;PP=452;SC=GCTGGCAGGAAATCTGTTCAC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=4074269;WS=4074251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	4077485	rs4790585	G	A	78.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=3;PP=57;SC=TGGGAGCATAGGAGCTTCACA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=4077493;WS=4077475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	4088291	rs2020118	C	T	1985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=49;PP=1628;SC=GGAGCTCTGCCGTGAGGTTGG;SOR=2.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=12;TCR=49;TR=61;WE=4088299;WS=4088281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	4098573	rs5818941	A	AT	1528.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=5;PP=1070;SC=TCAATGACACATTTTTTTTTA;SOR=3.952;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=65;TCF=56;TCR=9;TR=49;WE=4098581;WS=4098563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	4166804	rs2325881	C	T	3145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=38;PP=2452;SC=AGGAGACCCACGCTCTTCCGC;SOR=1.390;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=60;TCR=38;TR=98;WE=4166812;WS=4166794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	4192401	rs148114489	TACACAC	TAC,T	687.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;NF=15,15;NR=0,0;PP=706,37;SC=TGGGAAGAGATACACACACAC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=15,15;WE=4192414;WS=4192391;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:18
chr17	4337283	rs35751906	G	A	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=2;PP=650;SC=GGATGTCAGCGGAGTGCCCTG;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=4337291;WS=4337273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	4337412	rs3809853	C	G	2561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=46;PP=2015;SC=CTGCCGCCGTCCTCTGCTACA;SOR=0.987;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=36;TCR=46;TR=82;WE=4337420;WS=4337402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	4350182	rs2047233	T	C	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=9;PP=1313;SC=CCCTGCCCCTTTGTTGCAGTG;SOR=2.880;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=40;TCR=9;TR=48;WE=4350190;WS=4350172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	4350367	rs2047232	A	G	2397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=46;PP=1504;SC=CATTAGGGGGACGGGGGGTGG;SOR=3.180;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=9;TCR=46;TR=55;WE=4350382;WS=4350357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	4350373	rs3055435	GGT	G	1786.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=38;PP=1956;SC=GGGGACGGGGGGTGGTGGTCA;SOR=3.003;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=43;WE=4350382;WS=4350357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	4350407	rs2047231	G	C	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=25;PP=556;SC=TTGGACATGTGGGGCCTCATA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=4350415;WS=4350397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	4351396	rs6502786	C	T	602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=511;SC=CCCGGGGGTCCCTTGGGCTGT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=4351404;WS=4351386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	4351640	rs884250	G	A	3425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=62;PP=2588;SC=AGAAAAGCCCGTTTGTCTGCC;SOR=1.077;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=41;TCR=62;TR=103;WE=4351648;WS=4351630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr17	4352539	rs7224464	C	T	2255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=35;PP=1877;SC=GCTGGAGTTTCGTGTGGTCGA;SOR=0.779;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=38;TCR=35;TR=73;WE=4352547;WS=4352529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr17	4402803	rs184566	T	C	293.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=213;SC=GCTTTTGGTCTCAGGCCTGCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=4402811;WS=4402793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	4436005	rs9892232	T	C	1354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=38;PP=1045;SC=AGGGGTCTGGTGGGAAGAGAG;SOR=2.400;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=48;WE=4436013;WS=4435995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	4437214	rs4790202	C	T	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=595;SC=ACAGGGGTGCCTGGGGAGGGC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=4437222;WS=4437204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	4439282	rs11078514	G	A	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=4;PP=364;SC=CTGAGGGTGTGGGGGCTTCAG;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=4439290;WS=4439272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	4439313	rs1077200	A	G	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=4;PP=434;SC=GCCCGGGGCCAGGGCCAAGCG;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=4439321;WS=4439303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	4439497	rs12945732	A	G	2195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.81;SOR=2.256;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	4439501	rs1076071	C	G	2375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.00;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	4439727	rs146210718	T	TGG	1012.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=24;PP=824;SC=CAGCAGTGAGTGGGGGGGAGG;SOR=4.255;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=25;WE=4439735;WS=4439717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	4439795	rs12945562	C	G	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=16;PP=462;SC=TGAGCCCTGCCCTGGGGTGGG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=4439803;WS=4439785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	4448853	rs2306267	C	T	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=8;PP=399;SC=TGGTGCAGCTCGCTGCTCAGT;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=14;WE=4448861;WS=4448843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	4455500	rs7206974	T	C	5202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=112;PP=2965;SC=CTTCCTTGAGTGCCAGGCGGA;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=68;TCR=112;TR=180;WE=4455508;WS=4455490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr17	4458598	rs3809849	G	C	2930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=81;PP=2261;SC=GACATCGGCTGGGCGGGATCC;SOR=3.193;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=17;TCR=81;TR=98;WE=4458606;WS=4458588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr17	4461748	rs7215121	G	A	1479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=20;PP=1176;SC=CACTGCTCTCGGGGCTCACAG;SOR=0.829;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=23;TCR=20;TR=43;WE=4461756;WS=4461738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	4463699	rs7216284	G	A	4038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=63;PP=2965;SC=TGGTGCCTCCGGGGGTTTAGA;SOR=0.757;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=59;TCR=63;TR=122;WE=4463707;WS=4463689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr17	4463796	rs7216474	G	A	2220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=53;PP=1767;SC=GATAGACCACGGGCTCTTCTG;SOR=2.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=13;TCR=53;TR=66;WE=4463804;WS=4463786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	4495682	rs4790654	G	A	1798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=19;PP=1344;SC=AGGCCAGTGAGTCGGAGATGA;SOR=1.649;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=57;WE=4495690;WS=4495672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	4497084	rs9908079	G	T	1808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.012;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=27;PP=1613;ReadPosRankSum=-1.332;SC=CTGGGGCCAGGGTTTGTTACT;SOR=0.148;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=68;WE=4497092;WS=4497074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,64:0.97:66
chr17	4498611	rs12103697	G	A	1309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=29;PP=1056;SC=AGCAGGAAACGGCGGCCGGCA;SOR=2.419;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=38;WE=4498619;WS=4498601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	4498682	rs4790655	C	G	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=338;SC=CCAGACGGGGCTTGGGTGGGT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=4498690;WS=4498672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	4540647	rs11078527	G	A	1920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=51;PP=1508;SC=GAGCTAACTCGTCTCCATCAT;SOR=4.139;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=6;TCR=52;TR=57;WE=4540655;WS=4540637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	4541744	rs899452	T	C	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=0;PP=22;SC=CAACCATGCCTCCTTGACTCC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=4541752;WS=4541734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	4544641	rs11568075	G	A	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=290;SC=GTGTGCCACCGACTGCCCTAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=4544649;WS=4544631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	4544729	rs9906597	A	G	1310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=11;PP=1109;SC=GCCAGAGGCCAACGGGGGCGC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=47;WE=4544737;WS=4544719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	4544978	rs369435246	G	GAGA	1042.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=960;SC=CCTTCTGGTGGAGAAGGGTGG;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=19;WE=4544986;WS=4544968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	4574751	rs9436	T	A	1909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=17;PP=1554;SC=TCAGGCTCTGTGGGAGGTGGT;SOR=1.773;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=42;TCR=17;TR=59;WE=4574759;WS=4574741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	4575283	rs3862485	A	G	1202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=16;PP=881;SC=GCCCGGGTTCAGGTTCGGGTT;SOR=0.954;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=39;WE=4575291;WS=4575273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	4576620	rs55677157	C	T	1389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=26;PP=1076;SC=AGCGAGGAGACGGGGCCAGCA;SOR=1.085;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=20;TCR=26;TR=46;WE=4576628;WS=4576610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	4578007	rs4790673	C	G	5329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=55;PP=2965;SC=AGGCAAACAACAAGGCAAGAC;SOR=1.348;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=97;TCR=55;TR=152;WE=4578015;WS=4577997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr17	4579301	rs55884013	G	A	1426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=13;PP=1135;SC=CCTGCTCCACGCCTCCGCTCC;SOR=1.863;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=47;WE=4579309;WS=4579291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	4580137	rs6502806	A	G	1921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=32;PP=1512;SC=GGAAGAGGCCAGTGAGCCAGC;SOR=0.933;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=27;TCR=32;TR=59;WE=4580145;WS=4580127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	4580224	rs11078530	C	T	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=28;PP=801;SC=CCTGTAGACACAAGAAGCAAA;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=4580232;WS=4580214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	4586253	rs34352526	GA	G	1536.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=34;PP=1379;SC=TGGGTCTAAAGAAAAAAATAA;SOR=1.199;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=50;WE=4586261;WS=4586243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	4594847	rs7226084	T	C	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=30;PP=857;SC=TGAAGTCACATCTCCTCTGAG;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=4594855;WS=4594837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	4620497	rs7208257	C	T	2723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=36;PP=2072;SC=AAGTCTTCTCCTTCCTCCGCC;SOR=0.867;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=44;TCR=36;TR=80;WE=4620505;WS=4620487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr17	4620897	rs35741745	A	G	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=2;PP=584;SC=TCCCTGCCCGAGAGGAGGGAA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=4620905;WS=4620887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	4620928	rs28365158	T	C	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=2;PP=756;SC=GAAAGGGCAGTGATGGTGGCG;SOR=3.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=4620936;WS=4620918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	4622551	rs28365160	A	G	2845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=21;PP=2184;ReadPosRankSum=-0.838;SC=GCCCCTAAGCATCTTGTTCTC;SOR=1.430;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=80;TCR=21;TR=100;WE=4622559;WS=4622541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,103:0.99:104
chr17	4623456	rs35383686	G	A	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=581;SC=ACCCCACGGTGGGCCAGGTGA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=4623464;WS=4623449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	4641755	rs1050997	C	T	1515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=27;PP=1107;SC=CCTTGTTGCCCCCACACACGC;SOR=1.225;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=46;WE=4641763;WS=4641745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	4642069	rs2250333	A	G	2336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=6;PP=1989;SC=AGAGGCAGGTAAAATTACCTC;SOR=4.528;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=67;TCR=6;TR=72;WE=4642077;WS=4642059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	4644491	rs9903643	A	G	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=10;PP=286;SC=CTCCCTTCGGAAGCCCTCCCC;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=4644499;WS=4644481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	4684095	rs13520	G	A	2259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=40;PP=1707;SC=TACTGTGTCCGGGGATTGCAG;SOR=1.226;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=65;TCF=25;TCR=40;TR=65;WE=4684103;WS=4684085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	4686340	rs3853643	TT	GG	2966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=30;PP=2947;SC=CAGGTGAAATTTCTTGCGGTG;SOR=1.066;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=61;TCF=27;TCR=34;TR=56;WE=4686349;WS=4686330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	4686414	rs3851	A	C	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=36;PP=1145;SC=CGCAGGACACACCTCACTGAG;SOR=3.664;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=41;WE=4686422;WS=4686404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	4686463	rs3217068	A	ACGCCTACCTGGCT	771.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=2957;SC=TCCTTCCTGGACGCTCACTCC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=8;WE=4686471;WS=4686453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	4689194	rs3215170	AC	A	2582.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=7;PP=2664;SC=TAAGGGACATACCATCACCCC;SOR=4.205;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=70;TCF=61;TCR=9;TR=65;WE=4689202;WS=4689184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr17	4689572	rs4790706	T	C	4143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=74;PP=2965;SC=CGGCCATCTGTCTGTGCACAT;SOR=0.962;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=59;TCR=74;TR=133;WE=4689580;WS=4689562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr17	4693170	rs34850425	T	C	1422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=39;PP=1125;SC=TGGTCGCTGGTGGCCATGGCG;SOR=2.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=8;TCR=39;TR=47;WE=4693178;WS=4693160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	4693342	rs35910358	C	A	275.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=3;PP=195;SC=GAGGCCCGGACGCGGGCGTGC;SOR=0.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=4693350;WS=4693332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	4693508	rs34421346	G	C	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=12;PP=388;SC=GGCCGCGCTGGTCCGGGCCGC;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=4693516;WS=4693498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	4699552	rs3169950	G	A	3036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=73;NR=30;PP=2339;SC=GGCCGGAGGCGTTCACTCCAG;SOR=1.819;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=73;TCR=30;TR=103;WE=4699560;WS=4699542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr17	4699947	rs2241933	T	G	2678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=28;PP=2027;SC=TTTGTATTTTTGGAACTAGGT;SOR=1.423;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=50;TCR=28;TR=78;WE=4699955;WS=4699937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	4710957	rs3867173	G	T	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=2;PP=395;SC=CGGTCAGGAGGCCGTGGGGGA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=4710965;WS=4710948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	4712314	rs3786043	G	A	2629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=20;PP=2001;SC=CTTTTCCTCCGAGCCCCATCT;SOR=2.331;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=82;TCF=62;TCR=20;TR=81;WE=4712322;WS=4712304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	4712757	rs2286671	G	A	3968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=51;PP=2965;SC=AAAGCCAGGTGTCTCCTCCGG;SOR=0.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=66;TCR=51;TR=117;WE=4712765;WS=4712747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr17	4714021	rs3081314	G	GGAAA	2500.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.19;QD=46.31;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	4718776	rs1132448	G	A	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=15;PP=892;SC=ACCAGGAGGAGGGTGTCCGTG;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=21;TCR=15;TR=36;WE=4718784;WS=4718766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	4720469	rs1052748	C	T	3716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=82;PP=2921;SC=AAGACTCCCACATACCCCTAC;SOR=1.837;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=33;TCR=82;TR=115;WE=4720477;WS=4720459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr17	4722299	rs2326097	T	C	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=18;NR=10;PP=809;SC=GTAGGAAGAGTTTCTGGAGTG;SOR=1.460;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=28;WE=4722307;WS=4722292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	4750573	rs9890271	G	A	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=423;SC=ATGGAGTCTCGCTCAGGCTGG;SOR=4.294;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=17;WE=4750581;WS=4750563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	4758174	rs73341669	C	A	2675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=58;PP=2021;SC=GAGTAAGAAGCGCTGAGAAAA;SOR=2.038;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=18;TCR=58;TR=76;WE=4758182;WS=4758164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	4772093	rs28817707	C	T	170.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=105;SC=CAGGTTGGAGCGCAGTGGCAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=4772101;WS=4772083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	4778487	rs8078776	G	A	1958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=39;PP=1508;SC=AACTGAAGACGGATGAGATGA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=59;WE=4778495;WS=4778477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	4795307	rs2586532	C	T	2285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=17;PP=1785;SC=TAACCCTGGACGTATTCACTA;SOR=2.400;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=55;TCR=17;TR=72;WE=4795315;WS=4795297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr17	4795620	rs62073638	G	A	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=3;PP=661;SC=CTACCCGCCTGGGGGTGGGAA;SOR=2.670;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=4795628;WS=4795610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	4835852	rs81663	A	T	964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=1;PP=754;SC=GGATGCTTCCAGGGGATGCAG;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=4835860;WS=4835842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	4837210	rs2586529	A	G	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=2;PP=180;SC=CGACCACCCCAGAGCCCACCT;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=4837218;WS=4837200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	4837952	rs199616811	A	AG	500.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=658;SC=ACAGGGTGATAGGGAGGGGTC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=15;WE=4837960;WS=4837942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	4845768	rs238247	G	A	2535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=44;PP=2038;SC=CAAGGTTGCTGAATGAGGAAG;SOR=0.717;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=42;TCR=45;TR=86;WE=4845776;WS=4845758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	4856376	rs238238	A	G	2338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=35;PP=1854;SC=AACATCAACAATACTCTGGGC;SOR=0.836;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=71;TCF=36;TCR=35;TR=69;WE=4856384;WS=4856366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr17	4856580	rs238239	T	C	4167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=78;PP=2965;SC=CTAAGCGTTGTGGATCAAGAA;SOR=0.886;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=69;TCR=78;TR=147;WE=4856588;WS=4856570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr17	4859112	rs2309347	C	T	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=30;PP=1022;SC=TTGTCTCTGCCCTGTCTCTGC;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=32;WE=4859142;WS=4859102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	4859123	rs111645512	T	C	580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=22;PP=738;SC=CTGTCTCTGCTCTGTCTCTGC;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=24;WE=4859142;WS=4859102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	4859134	rs117488294	C	T	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=13;PP=491;SC=CTGTCTCTGCCCTGTCTCTGC;SOR=3.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=14;WE=4859142;WS=4859102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	4859990	.	C	G	2800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=37;PP=2185;SC=CTTGTAGCTTCTCTCTACTGA;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=47;TCR=37;TR=83;WE=4859998;WS=4859980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr17	4863410	rs238224	A	G	3110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=49;PP=2518;SC=CAAACTCCTGAAGAAGAGCAG;SOR=0.826;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=42;TCR=49;TR=91;WE=4863418;WS=4863400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr17	4875566	rs238230	T	C	3496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=76;PP=2638;SC=CAGCGTCCTCTGGAGCAGCCC;SOR=1.407;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=42;TCR=76;TR=118;WE=4875574;WS=4875556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr17	4877120	rs238229	G	A	3599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=93;PP=2965;SC=CTGGCTTGAGGTGGCCTTGGC;SOR=2.958;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=20;TCR=93;TR=113;WE=4877128;WS=4877110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	4881776	rs376516	C	G	1566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=13;PP=1163;SC=AGTCCCTCCCCCTACGGTTCC;SOR=2.066;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=40;TCR=13;TR=53;WE=4881784;WS=4881766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	4882952	rs1859434	G	A	2106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.41;SOR=4.014;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	4883818	rs238234	C	G	1733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=18;NR=40;PP=1548;SC=GGGGGGTGAGCGTGGGGGATA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=18;TCR=40;TR=58;WE=4883826;WS=4883808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	4885982	rs238233	G	A	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=1;PP=778;SC=AGCCCAGGTCGGGCTAGAGCC;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=4885990;WS=4885972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	4886037	rs238232	A	G	1623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=13;PP=1304;SC=TGAGCTGAATATCTGACTCTC;SOR=2.170;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=50;WE=4886045;WS=4886027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	4890348	.	G	A	1318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.678;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=35;PP=1072;ReadPosRankSum=-0.899;SC=CAGGTGTCCAGGATGGAGATG;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=38;WE=4890356;WS=4890338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr17	4890843	rs8071428	T	C	1793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=7;PP=1465;SC=AGCTGCGCCCTCTGGCGCGGG;SOR=3.611;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=45;TCR=7;TR=52;WE=4890851;WS=4890833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	4891956	rs426475	G	A	1558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NR=20;PP=1158;SC=TCTCACCTACGTTATTTTTGT;SOR=0.818;Source=Platypus;TCR=20;WE=4891964;WS=4891946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	4893357	rs427703	G	C	2061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=25;PP=1658;SC=GAAATTAACCGCAGACTAGGG;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=61;TCF=35;TCR=26;TR=60;WE=4893365;WS=4893347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	4916858	rs72401841	TGGA	T	5504.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=11;PP=2948;SC=GTGCCAGGACTGGAGGGGTGT;SOR=3.740;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=103;TCF=91;TCR=12;TR=98;WE=4916868;WS=4916848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr17	4926882	rs346828	A	G	1632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=25;PP=1294;SC=CCCCCTCGCCACCACTGTCAA;SOR=0.841;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=54;TCF=29;TCR=25;TR=53;WE=4926890;WS=4926872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	4936972	rs346821	G	A	3795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=65;PP=2965;SC=CAGCTGATGGGCCTCAGGGTC;SOR=1.040;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=47;TCR=65;TR=112;WE=4936980;WS=4936962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr17	4937575	rs346822	T	C	2187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=37;PP=1700;SC=CGGGGCCAGCTGCCTCCACAG;SOR=0.807;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=32;TCR=37;TR=69;WE=4937583;WS=4937565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	4937982	rs346824	T	C	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=31;PP=918;SC=GATGCTTTGGTTCTTCTGGAA;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=4937990;WS=4937972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	5036122	.	C	G	546	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=3;HapScore=3;MGOF=37;MMLQ=28;MQ=48.78;NF=10;NR=0;PP=546;QD=58.0771212547;SC=CCCACCAGGGCTCCAGAGCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=10;WE=5036130;WS=5036096;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:18,10:0.36:28
chr17	5036191	rs75631218	G	A	1720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=21.556;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-9.579;NF=44;NR=5;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.609;SC=ACTCCAACATGCCTCATTTGA;SOR=2.873;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=103;TCF=80;TCR=23;TR=49;WE=5036232;WS=5036181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,46:0.45:103
chr17	5036205	rs80328123	A	C	2889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=7.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.40;MQRankSum=-9.395;QD=22.58;ReadPosRankSum=-0.337;SOR=1.381;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,66:0.52:128
chr17	5036210	.	TC	GT	3264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.000;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=6.019;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.57;MQRankSum=-8.648;QD=23.32;ReadPosRankSum=-1.262;SOR=1.298;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,79:0.56:140
chr17	5036214	rs114647990	C	T	3460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=4.281;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.66;MQRankSum=-8.822;QD=22.92;ReadPosRankSum=-0.330;SOR=1.115;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,85:0.56:151
chr17	5036224	rs72830922	C	G	3625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=5.002;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.21;MQRankSum=-8.268;QD=22.11;ReadPosRankSum=0.060;SOR=1.107;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,96:0.59:164
chr17	5036274	rs78465432	C	A	4563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=4.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.41;MQRankSum=-6.611;QD=23.65;ReadPosRankSum=-0.176;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,119:0.62:193
chr17	5036281	rs76236903	G	C	4484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=4.386;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.01;MQRankSum=-6.030;QD=24.11;ReadPosRankSum=-0.585;SOR=1.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,114:0.61:186
chr17	5036329	rs72830923	A	G	1800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.229;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-5.294;NF=7;NR=49;PP=1510;ReadPosRankSum=-1.148;SC=TCTCTGCAGAAACAGGGGACA;SOR=1.022;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=104;TCF=14;TCR=90;TR=56;WE=5036337;WS=5036319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,63:0.56:112
chr17	5036383	rs76207017	C	T	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.321;HP=6;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.933;NF=1;NR=27;PP=564;ReadPosRankSum=0.650;SC=TCTCAGAGGGCGGGTGGCACA;SOR=0.164;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=59;TCF=1;TCR=58;TR=28;WE=5036391;WS=5036373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr17	5048207	rs2304447	A	G	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=44;PP=1380;SC=AAATGTTCTGACCACAAATAC;SOR=3.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=6;TCR=44;TR=50;WE=5048215;WS=5048197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	5058808	rs9899177	G	A	4546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=86;NR=52;PP=2965;SC=GTGCATACCCGGAAGAAAGAC;SOR=1.302;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=86;TCR=52;TR=138;WE=5058816;WS=5058798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr17	5066305	rs2307138	A	T	2549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=63;PP=1927;SC=AAAGGGTAAGAATTTAGGGCC;SOR=2.726;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=17;TCR=63;TR=80;WE=5066313;WS=5066295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	5084763	rs1689965	G	A	5739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=117;PP=2965;SC=GTTTTCTCACGTTCTTCAAGT;SOR=1.596;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=57;TCR=117;TR=174;WE=5084771;WS=5084753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr17	5085893	rs4115657	C	T	6215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=118;PP=2965;SC=CCCTAAGCTCCTCATCCTGGC;SOR=1.440;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=66;TCR=118;TR=184;WE=5085901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr17	5087040	rs9908414	A	G	2162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=42;PP=1757;SC=CTGATGTATAATAAGATTTGA;SOR=1.410;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=23;TCR=42;TR=65;WE=5087048;WS=5087030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	5087602	rs2641232	C	G	526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=446;SC=TTCTATAATTCCTAAAATACA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=5087610;WS=5087592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	5126674	rs2641256	A	G	4418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=33;PP=2598;SC=TGAGGCCCAGACCCACAGAGA;SOR=1.633;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=65;TCR=33;TR=98;WE=5126682;WS=5126664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr17	5126689	rs2585271	G	A	4672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=39;PP=2748;SC=CAGAGACAACGATGATGGCCA;SOR=1.386;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=66;TCR=39;TR=104;WE=5126697;WS=5126679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr17	5126876	rs2641255	C	T	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=355;SC=CTCACTCTGTCGCCCAGGCTG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=5126884;WS=5126866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	5265033	rs117601614	A	C	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=462;SC=AAGCTCTGGGATTTAGCGTTC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=5265041;WS=5265023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	5268356	rs71151866	TA	T	749.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.633;NF=38;NR=0;PP=505;ReadPosRankSum=-1.103;SC=GAGTTAGATTTAAAAAAAAAA;SOR=4.565;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=47;TCR=1;TR=38;WE=5268364;WS=5268346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,38:0.93:41
chr17	5421005	rs56750129	TC	AA	2593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=7;PP=1235;SC=TGTGCCCAGCTCCTTCATTGA;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=46;TCR=8;TR=47;WE=5421014;WS=5420995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	5424129	rs12946467	C	G	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=2;PP=274;SC=AGCCCTGAGACCTGCCCCACA;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=5424137;WS=5424119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	5424376	rs12944976	G	A	3046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=64;PP=2169;SC=CTTCTGCCCCGTGGAATGTGG;SOR=1.586;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=33;TCR=64;TR=97;WE=5424384;WS=5424366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	5425077	rs11651270	T	C	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=14;PP=421;SC=AAGTGGGCCATTTGGAACAGG;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=5425085;WS=5425067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	5436263	rs2301582	C	T	3600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=66;PP=2781;SC=GGAGAAGGCACGCACAAGAGT;SOR=1.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=48;TCR=66;TR=114;WE=5436271;WS=5436253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr17	5485367	rs12150220	A	T	1902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=35;PP=1389;SC=TTGGTAGAGGAGTGAGGCAGA;SOR=1.033;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=61;TCF=26;TCR=35;TR=60;WE=5485375;WS=5485357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	5991344	rs2302836	C	T	1323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=14;PP=926;SC=ACGATGGCCACGAGAGGACTC;SOR=1.259;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=39;WE=5991352;WS=5991334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	6014176	rs2302837	A	G	3031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=74;PP=2590;SC=CCGGGAACACATGGGCACGGC;SOR=2.184;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=24;TCR=74;TR=98;WE=6014184;WS=6014166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr17	6021541	rs2302838	C	T	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=20;PP=676;SC=GGGTGGGAGGCTTGTCAGTAC;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=6021549;WS=6021531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	6330068	rs2292546	T	C	3847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=74;PP=2836;SC=GCACCTCCCATGGCTTCTCCT;SOR=1.011;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=129;TCF=55;TCR=74;TR=128;WE=6330076;WS=6330058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr17	6330109	rs2292545	G	A	3589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=56;PP=2822;SC=ATGACCTCAGGCAGCTGCCCA;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=51;TCR=56;TR=107;WE=6330117;WS=6330099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr17	6330153	rs925616	C	T	2893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=36;PP=2216;SC=ACTGGGCAGGCCCCCCAGAGT;SOR=1.014;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=47;TCR=36;TR=83;WE=6330161;WS=6330143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr17	6331803	rs8075035	T	C	2621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=49;PP=2074;SC=GGCTCCGGGATAGGATGGGGT;SOR=1.320;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=28;TCR=49;TR=77;WE=6331811;WS=6331793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	6331836	rs12453262	T	G	2719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=53;PP=2081;SC=GCTGTGGGGATAAACGGATGG;SOR=1.638;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=23;TCR=53;TR=76;WE=6331844;WS=6331826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	6337247	rs12449580	C	G	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=5;PP=1058;SC=ACGATGGTGTCGCACCAGAAC;SOR=3.500;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=6337255;WS=6337237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	6348823	rs7220100	A	G	990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=28;PP=815;SC=ACTTCATGAAAACAGGGACGT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=28;WE=6348831;WS=6348813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	6352863	rs34107703	C	T	1707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=47;PP=1391;SC=GCCTCAGTCTCCCTCATCTCA;SOR=5.630;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=2;TCR=47;TR=49;WE=6352871;WS=6352853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	6353679	rs7218283	A	C	2433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=37;PP=1941;SC=CTCTGTCTTGAAGGAAACAAG;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=35;TCR=37;TR=72;WE=6353687;WS=6353669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	6364753	rs11654099	A	G	2722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=52;PP=1958;SC=GCACCAGCCCATCGGAGAAGA;SOR=1.053;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=36;TCR=52;TR=88;WE=6364761;WS=6364743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr17	6367470	rs75323938	G	A	1869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=21;PP=1490;SC=ACCACCCTGAGAATGGCCCCT;SOR=1.238;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=34;TCR=21;TR=55;WE=6367478;WS=6367460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	6371557	rs76024428	C	G	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=4;PP=507;SC=TCAGCTTGACCTGAGTCCGCT;SOR=2.670;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=6371565;WS=6371547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	6371738	rs35021251	A	G	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=15;PP=551;SC=AGTGCCCACCAGCTTGTGGCC;SOR=1.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=22;WE=6371746;WS=6371728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	6373737	rs11654175	C	T	2447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=37;PP=1942;SC=GACTGTGGGTCGGAGAGGAAG;SOR=0.824;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=39;TCR=37;TR=76;WE=6373745;WS=6373727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr17	6374779	rs9902425	T	C	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=18;PP=503;SC=CTTGGAGGAGTCAGCCCCGGC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=6374787;WS=6374769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	6377668	rs11078632	C	A	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=437;SC=CTGTCCCCGACTTCACTCTCC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=6377676;WS=6377658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	6381939	rs938288	G	A	3015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=49;PP=2213;SC=GCTCGATGACGGTGGCGACAG;SOR=0.924;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=37;TCR=49;TR=86;WE=6381947;WS=6381929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr17	6387482	rs11656015	G	C	1828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=7;PP=1582;SC=GAGGGCTCTTGCTAAAATCCT;SOR=3.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=48;TCR=7;TR=55;WE=6387490;WS=6387472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	6406883	rs3809835	C	T	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=4;PP=564;SC=GTGCACGGCGCGGTCCCTTCT;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=6406891;WS=6406873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	6441164	rs165106	T	C	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=542;SC=TCTTGGCACATCCACAGGATG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=6441172;WS=6441154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	6441207	rs9907305	C	T	1030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=1;PP=806;SC=GCAGATACCACGTCTGAGTGG;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=6441215;WS=6441197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	6493056	rs367918	T	C	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=361;SC=TCTAAAATTTTGCAATTTGGT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=6493064;WS=6493046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	6538355	rs2301873	G	A	1876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=11;PP=1440;SC=CTTTGGGGTCGCTCCTCCCAT;SOR=2.644;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=55;WE=6538363;WS=6538345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	6545702	rs9909640	C	T	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=482;ReadPosRankSum=0.879;SC=TTTTAACTTGCTGTGGATCCA;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=22;WE=6545710;WS=6545692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr17	6546259	rs2285999	T	C	490.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=389;ReadPosRankSum=-0.412;SC=TTTGACTGTTTTTCTCTTACA;SOR=0.223;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=16;WE=6546267;WS=6546249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr17	6553583	rs2301874	G	A	1065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=15;PP=818;SC=ATTCAACTGAGAATGTGTAAA;SOR=1.214;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=26;WE=6553591;WS=6553573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	6555546	rs56268735	C	CG	3723.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=41;PP=2974;SC=CCCGACCCCGCGGCCAAGCCG;SOR=1.094;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=97;TCF=53;TCR=44;TR=92;WE=6555554;WS=6555536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr17	6659324	rs3785793	A	G	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=3;PP=463;SC=GGGCTGGGCCATCGGAAAACT;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=6659332;WS=6659314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	6661584	rs4796550	T	C	661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=19;PP=547;SC=AGAGTCAAGGTGAGTGTTCAG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=6661592;WS=6661574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	6662320	rs67528158	G	T	1337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=10;PP=991;SC=CATCCTCCCTGCAAGAAAGAA;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=41;WE=6662328;WS=6662310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	6663144	rs71157213	CT	C	1312.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=29;PP=1355;SC=CCTGACCACTCTTTTCACCCC;SOR=1.721;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=36;WE=6663152;WS=6663134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	6663895	rs2271231	C	G	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=7;PP=248;SC=ATGTCTGTCGCAGTGAACAGG;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=11;WE=6663903;WS=6663885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	6683215	rs4796555	C	T	3044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=36;PP=2582;SC=ACTGATCCAGCCCCAAGACCA;SOR=1.227;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=62;TCR=36;TR=98;WE=6683223;WS=6683205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr17	6690161	rs17853331	C	T	2124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=31;PP=1695;SC=ACCTCCTCATCATATCCTGCA;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=61;WE=6690169;WS=6690151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	6690354	rs28407857	T	A	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=10;PP=311;SC=AACGAAGGGCTGAATAAGGCA;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=6690362;WS=6690344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	6690555	rs200110837	GTA	G	1527.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.47;QD=43.65;SOR=5.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	6690564	.	T	TGCGC	616	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=54.38;NF=14;NR=0;PP=616;QD=44.6428571429;SC=TGTATGTGTGTGTGTGTGTGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=14;WE=6690591;WS=6690547;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,14:0.56:25
chr17	6690566	.	T	TGCGCGC	1919.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.41;QD=43.63;SOR=6.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	6690568	rs74442331	T	C	2131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.49;QD=47.37;SOR=5.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	6690570	rs74809992	T	C	2176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.64;QD=46.31;SOR=5.464;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	6690572	rs72836242	T	C	2265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.71;QD=47.20;SOR=5.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	6690583	rs5016848	G	A	2545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=47;NR=9;PP=1445;SC=GCGTGTGTGCGTGCTCATATG;SOR=3.442;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=47;TCR=9;TR=56;WE=6690591;WS=6690547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	6690829	rs4239266	G	A	2224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=51;PP=1521;SC=GGGCACTGCCGGCCCTTTTGC;SOR=4.731;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=4;TCR=51;TR=55;WE=6690837;WS=6690819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	6690853	rs67163717	CT	C	1864.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.48;SOR=6.043;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	6690857	rs111623068	A	G	1810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.94;SOR=5.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	6690865	.	T	TTC	1571.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=28;PP=1033;SC=CCACTTTTTTTTTTTGTCAGC;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=28;WE=6690874;WS=6690843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	6704273	rs2136282	G	A	1775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=37;PP=1443;SC=CTTACAAAAAGGATTAGAGTA;SOR=1.835;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=53;WE=6704281;WS=6704263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	6716242	rs3744395	G	A	1760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=24;PP=1384;SC=CACTGCTTGCGCAGATCATTG;SOR=1.009;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=55;WE=6716250;WS=6716232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	6716385	rs8081510	T	C	1412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=31;PP=1120;SC=GAAACAGACCTCACGCTTTCA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=45;WE=6716393;WS=6716375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	6733790	rs78016069	A	G	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=194;SC=CAAGGATGACATATATACGGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=6733798;WS=6733780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	6899559	rs312467	C	G	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=11;PP=376;SC=AGCTGCGGCCCGCGCGGGGCG;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=6899567;WS=6899549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	6899629	rs3218667	C	T	210.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=171;SC=CAGGCCCGGGCCGAGCTGGGC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=6899637;WS=6899619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	6900362	rs2070589	C	T	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=423;SC=CAGGCGGCGTCGGGGAAGGAG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=6900370;WS=6900352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	6900383	rs312468	T	C	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=372;SC=GCACAAGGTCTCGGGAACTGC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=6900391;WS=6900373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	6902179	rs312470	G	A	2420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=39;PP=2036;SC=CTAGACCTCGGAGTGAAATAA;SOR=0.963;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=72;WE=6902187;WS=6902169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr17	6902743	rs1042356	G	A	2462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=56;PP=1999;SC=TGCTGCCCTCGGGGATGGAAG;SOR=2.043;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=21;TCR=56;TR=77;WE=6902751;WS=6902733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	6902760	rs1126667	A	G	1894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=48;PP=1529;SC=GAAGAGCTTCAGGCTCAACTG;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=13;TCR=48;TR=61;WE=6902768;WS=6902750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	6903537	rs2292353	G	A	181.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=176;SC=TCCCAACAGGGCTCCGGTACT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=6903545;WS=6903527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	6905061	rs1042357	T	G	3584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=68;PP=2762;SC=TGCTGAACACTCACCTGGTGG;SOR=1.133;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=48;TCR=68;TR=116;WE=6905069;WS=6905051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr17	6906085	rs11571338	C	CT	207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=244;SC=ATACAGGGAACTTGGCAGAGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=6906093;WS=6906075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	6909378	rs5819132	C	T	141.03	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.26;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	6909379	rs3934010	C	G	141.03	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.01;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	6915401	rs2271316	C	G	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=9;PP=626;SC=AAACCATGCCCGATCCCCAAA;SOR=1.681;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=30;WE=6915409;WS=6915391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	6919093	rs14309	T	C	2864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=24;PP=2054;SC=CTTCTGACAGTGCGAAGTGGA;SOR=2.069;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=65;TCR=24;TR=89;WE=6919101;WS=6919083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	6927350	rs312461	A	G	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=4;PP=692;SC=GAAGCTGCGCATGTCTCCCTT;SOR=3.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=6927358;WS=6927340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	6928019	rs146207245	C	CCAG	2066.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.9995;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.297;NF=11;NR=20;PP=1598;ReadPosRankSum=-0.607;SC=GACGAGGCCTCCAGCAGCAGC;SOR=0.900;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=61;TCF=20;TCR=41;TR=31;WE=6928027;WS=6928009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,51:0.96:53
chr17	6929924	rs379478	T	C	3646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=49;PP=2816;SC=TTGCCAGTCATCGTACAGTGC;SOR=0.973;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=65;TCR=49;TR=114;WE=6929932;WS=6929914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr17	6933217	rs421264	T	G	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=16;PP=487;SC=GTGTGGAGGCTGCAGGGAGAA;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=6933225;WS=6933207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	6979280	rs181487113	A	G	3912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=57;PP=2965;ReadPosRankSum=0.059;SC=AAGTAGGGCCAGGTACTCCCC;SOR=0.854;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=130;TCF=72;TCR=58;TR=128;WE=6979288;WS=6979270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,132:0.99:134
chr17	7011064	rs199979065	GCACACTACACACACCGCACACGTA	G	2054.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=9;PP=1423;SC=ACGCACACGTGCACACTACAC;SOR=2.701;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=26;WE=7011095;WS=7011054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	7011144	rs62058755	G	A	2865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=35;PP=2310;SC=ACACCCCGGAGGCTCTCTGAC;SOR=1.166;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=86;TCF=51;TCR=35;TR=85;WE=7011152;WS=7011134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	7139238	rs222851	G	A	7740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=135;NR=103;PP=2965;SC=GCCCCAGCCCGAACCTCTCAC;SOR=0.954;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=238;TCF=135;TCR=103;TR=238;WE=7139246;WS=7139228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr17	7140606	rs222852	A	G	1496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=8;PP=1145;SC=ATAATTTCTAAGGGCCTCCTT;SOR=2.985;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=43;WE=7140614;WS=7140596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	7145492	rs58574748	C	CA	2618.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=8;PP=2669;SC=CTGCCTGTCCCGATCCAAGGC;SOR=3.682;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=66;TCF=58;TCR=8;TR=61;WE=7145500;WS=7145482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	7166660	rs77549883	C	T	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=32;PP=948;SC=CACACTCGCCCGTTTCTCTTT;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=34;WE=7166668;WS=7166650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	7185788	rs222848	T	C	2310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=41;NR=32;PP=1646;SC=CCCCCCCTCCTCCAGCTCAGG;SOR=1.012;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=41;TCR=32;TR=73;WE=7185796;WS=7185778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	7192091	rs222842	C	T	2055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=17;PP=1725;SC=TGGGTGTCCTCTGAGTTGAGT;SOR=2.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=48;TCR=17;TR=65;WE=7192099;WS=7192081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	7192198	rs222841	T	G	1798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=40;PP=1452;SC=GTTCTTTTTGTTTTTGAGACA;SOR=2.066;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=54;WE=7192206;WS=7192188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	7193055	rs3833134	GA	G	1956.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=28;PP=1379;SC=CTAAGGCAAGGAACAAGGCTC;SOR=2.200;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=34;WE=7193068;WS=7193045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	7193060	rs55781423	A	G	1965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=29;PP=1002;SC=GCAAGGAACAAGGCTCTGAGG;SOR=2.252;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=41;TCF=11;TCR=30;TR=40;WE=7193068;WS=7193045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	7193255	rs3744405	G	A	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=21;NR=1;PP=645;SC=ACACTGGAAGGGGAAGACCAA;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=7193263;WS=7193245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	7193448	rs222838	A	G	2263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=56;PP=1881;SC=CTGGAGCCAGATTATCCACAG;SOR=2.505;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=17;TCR=56;TR=73;WE=7193456;WS=7193438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	7194010	rs2521992	C	T	423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=264;SC=GTGGAATGTGCTTGCACCCAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=7194018;WS=7194000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	7197794	rs222859	C	A	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=52.21;NF=2;NR=2;PP=49;SC=CGCTGTAGCCCCCGCTGCCGC;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=7197802;WS=7197784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	7213560	rs72840907	C	G	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=36;PP=1193;SC=TTTCAGGTCACCTTGCTGCTT;SOR=2.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=46;WE=7213568;WS=7213550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	7213694	rs4796399	C	A	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=166;SC=AACATTCTTGCTAGCACTTCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=7213702;WS=7213684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	7214824	rs11658072	C	T	4859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=80;PP=2965;SC=CTCCCTGCTTCTGTGCTCAGC;SOR=0.970;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=63;TCR=80;TR=143;WE=7214832;WS=7214814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr17	7217463	rs2292064	T	C	2460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=33;PP=2120;SC=CAGCTGATGTTAGGGTGGTCA;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=39;TCR=33;TR=72;WE=7217471;WS=7217453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr17	7220697	rs62059198	G	T	6234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=113;NR=85;PP=2965;SC=TACCTGGGAGGAGAACTGGGT;SOR=0.990;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=199;TCF=114;TCR=85;TR=198;WE=7220705;WS=7220687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr17	7221385	rs1127440	G	A	3063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=39;PP=2446;SC=GGGACTCACCGGGAAGCAGCA;SOR=1.029;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=52;TCR=39;TR=91;WE=7221393;WS=7221375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr17	7221544	rs7222233	T	C	2715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=47;PP=2008;SC=AGGGTGAGGGTGGGGGAGTAG;SOR=0.982;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=39;TCR=48;TR=86;WE=7221552;WS=7221534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	7221707	rs7216490	G	T	5366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=60;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.687;SC=GACAGAGCTTGGTCAGACCCC;SOR=0.617;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=168;TCF=108;TCR=60;TR=167;WE=7221715;WS=7221697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,166:0.99:167
chr17	7224319	rs3809811	T	C	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=17;PP=547;SC=TTTGCACAGATCCTGAGTGTG;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=7224327;WS=7224309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	7225149	rs3809814	C	G	5148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=66;PP=2965;SC=TCGTGATGGGCCTCGCAGCCC;SOR=1.003;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=157;TCF=91;TCR=66;TR=156;WE=7225157;WS=7225139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr17	7225425	rs2062771	T	C	1460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=43;PP=1046;SC=GAAATGGGGATGCCAACGCCC;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=6;TCR=43;TR=49;WE=7225433;WS=7225415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	7226957	rs35776863	G	A	6756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.324;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=1.415;SC=ACACACAGACGGCCCTCACCA;SOR=0.467;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=205;TCF=107;TCR=98;TR=204;WE=7226965;WS=7226947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,214:1.00:215
chr17	7245371	rs4796407	A	G	2130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=48;PP=1589;SC=TGGGTCCACCAGAGCCCATGA;SOR=2.636;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=13;TCR=48;TR=61;WE=7245379;WS=7245361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	7245674	rs8069505	G	A	2880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=11;PP=2283;ReadPosRankSum=-0.157;SC=AAGGATTGTCGGGGTGGTGGC;SOR=2.348;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=79;TCR=11;TR=89;WE=7245682;WS=7245664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,91:0.99:92
chr17	7246940	rs3809829	T	G	2835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=46;PP=2276;SC=CCTCGAGGCTTGGGGGTCTCC;SOR=0.738;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=43;TCR=46;TR=89;WE=7246948;WS=7246930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	7251605	rs2292066	G	C	2896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=31;PP=2355;SC=GGAAGACTGCGTGCTTCTCCC;SOR=1.364;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=57;TCR=31;TR=88;WE=7251613;WS=7251595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	7253659	rs2292068	T	C	58.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=3;PP=37;SC=CAGAAGCCTGTGCTGTGGGGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=7253667;WS=7253649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	7254602	rs66687178	T	G	4558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=62;PP=2965;SC=CGGCCTTTCCTCCCTCCCCCA;SOR=1.186;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=95;TCR=62;TR=157;WE=7254610;WS=7254592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr17	7259073	rs6503016	C	T	978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=5;PP=740;SC=GACAGGAGGGCTGATCAGGGA;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=29;WE=7259081;WS=7259063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	7286266	rs1554947	C	T	2220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=29;PP=1771;SC=AGGCTGGCTCCCTGTGGCTAC;SOR=1.085;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=42;TCR=29;TR=71;WE=7286274;WS=7286256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	7290787	rs5819155	TG	T	3185.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=45;PP=2974;SC=GTGGGTGTGGTGGACTCCAGA;SOR=0.716;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=29;TCR=46;TR=74;WE=7290795;WS=7290777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	7290821	rs968580	T	C	2627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=54;PP=1995;SC=TCAAGACCAGTCCTTCAATTC;SOR=1.192;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=32;TCR=54;TR=86;WE=7290829;WS=7290811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr17	7292107	rs6503018	G	A	3032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=37;PP=2346;SC=TCTGTCACAGGTGGAGCTGAG;SOR=1.076;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=52;TCR=37;TR=89;WE=7292115;WS=7292097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	7293715	rs3744549	C	T	2264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=17;PP=1983;SC=TAACTGGTGACGGCAGAGGGC;SOR=2.439;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=54;TCR=17;TR=71;WE=7293723;WS=7293705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	7297452	rs4613118	A	G	1323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=15;PP=1022;SC=GGGGTTTTCGAGATGATGGTG;SOR=1.259;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=40;WE=7297460;WS=7297442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	7306727	rs17882626	A	G	2537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=55;PP=2105;SC=AAAAACAGAAACGAAGGGATG;SOR=1.966;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=77;WE=7306735;WS=7306717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	7307074	rs71370494	G	C	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=25;PP=967;SC=AATCCGGGGGGACCCAGGTGG;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=41;WE=7307082;WS=7307064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	7307115	.	G	C	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=3.979;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.55;ReadPosRankSum=1.645;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr17	7307287	rs9900153	T	C	3962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=56;PP=2965;SC=ACGCCCCAAGTACAGTCCCAT;SOR=0.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=69;TCR=56;TR=125;WE=7307295;WS=7307277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr17	7317570	.	C	G	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=3;PP=798;SC=GGCCAGTCCTCAGCAGGCCTG;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=7317578;WS=7317560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	7317647	rs60631713	A	AC	1429.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=14;PP=1657;SC=CCACCTGCCCACCCCTCCCCA;SOR=1.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=41;WE=7317655;WS=7317637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	7318559	rs6503019	G	A	265.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=7;PP=238;SC=TGGCAAGGAGGGATGGGCTTC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=7318567;WS=7318549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	7319325	rs76733190	C	T	7296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.906;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=138;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.772;SC=TTGGCGTGCCCATGGTGGGTG;SOR=0.878;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=235;TCF=96;TCR=139;TR=233;WE=7319333;WS=7319315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,235:1.00:236
chr17	7324788	rs33989543	G	A	3412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=52;PP=2737;SC=TATGATGCCCGGGACATGAGA;SOR=0.731;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=49;TCR=52;TR=101;WE=7324796;WS=7324778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr17	7324852	rs34333422	C	G	2395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=47;PP=1878;SC=GCTGCTACCCCCTAGCCTCTG;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=29;TCR=47;TR=76;WE=7324860;WS=7324842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	7340864	rs34121192	G	A	1098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=24;PP=871;SC=CTCTGTGGGCGAGCGGGACGT;SOR=1.547;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=12;TCR=24;TR=36;WE=7340872;WS=7340854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	7350544	rs2302767	G	A	3158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=72;PP=2518;SC=CTGACTCCCCGGCGACTCCCA;SOR=3.033;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=16;TCR=72;TR=88;WE=7350552;WS=7350534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	7350975	rs2302765	T	C	5280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=104;PP=2965;SC=CATTGGTGAGTAGGCATGGCT;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=60;TCR=104;TR=164;WE=7350983;WS=7350965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr17	7358803	rs7214344	G	A	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=15;PP=525;SC=ACCCACATAAGAGGGAGAGGG;SOR=1.931;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=21;WE=7358811;WS=7358793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	7358861	rs2302762	T	C	289.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=6;PP=240;SC=GCCCATGCTCTCGGAAGACGC;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=7358869;WS=7358851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	7359277	rs2302763	T	C	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=46;PP=1245;SC=CCAACGGGGGTGGAACAAGGC;SOR=3.872;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=5;TCR=46;TR=51;WE=7359285;WS=7359267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	7366651	rs871990	C	G	1849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=38;PP=1487;SC=TGGTGGTGGCCATGGCTGGCC;SOR=1.532;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=58;WE=7366659;WS=7366641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	7385174	rs8065577	G	C	483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=1;PP=377;SC=TTCTAGCTCCGAAGAGTTCCT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=7385182;WS=7385172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	7385454	rs3760422	G	A	1132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=18;PP=901;SC=GGGCCTGCCTGCTGGCTTCGT;SOR=0.869;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=33;WE=7385462;WS=7385444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	7400041	rs9890920	C	T	2524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=11;PP=2068;SC=AGGGAAATGGCCCACCCTCTG;SOR=3.345;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=64;TCR=11;TR=75;WE=7400049;WS=7400031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr17	7400137	rs9898024	T	C	5016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=61;PP=2965;SC=TGGCCTAGAGTTGTATGCGGA;SOR=1.082;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=85;TCR=61;TR=146;WE=7400145;WS=7400127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr17	7402226	rs117311246	C	G	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=499;SC=ACGTGCCCGCCTCAGCCTCCC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=7402234;WS=7402216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	7402556	rs2277638	G	A	5017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=76;PP=2965;SC=TCAAGGTTTCGCTGCAGACAT;SOR=0.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=85;TCR=77;TR=160;WE=7402564;WS=7402546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr17	7402600	rs2228129	T	C	4919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=89;PP=2965;SC=TTAACTGTAGTGTGACAACTC;SOR=0.843;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=168;TCF=78;TCR=90;TR=167;WE=7402608;WS=7402590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr17	7403942	rs12936464	A	C	763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=20;NR=2;PP=606;SC=TGTCTGCCTTACTCTTTGTCT;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=7403950;WS=7403932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	7404107	rs7217707	T	C	4890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=51;PP=2965;SC=GTACCCACAGTACCCATCCCG;SOR=1.279;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=94;TCR=51;TR=144;WE=7404115;WS=7404097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr17	7404209	rs6503030	G	A	5649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=101;PP=2965;SC=GAATTTGGACGTGGGAGCCAG;SOR=1.172;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=168;TCF=67;TCR=101;TR=168;WE=7404217;WS=7404199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr17	7404991	rs2228130	T	C	3474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=60;PP=2615;SC=CTGAATACAATAACTTCAAGT;SOR=1.035;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=47;TCR=61;TR=106;WE=7404999;WS=7404981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr17	7405074	rs8075218	C	T	2148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=38;PP=1781;SC=TTTCCATATACGGGGCCGCTG;SOR=0.990;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=66;WE=7405082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	7405937	rs2071504	C	T	3648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=62;PP=2692;SC=AGCTGCGCTACGGCGAAGACG;SOR=0.950;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=49;TCR=63;TR=111;WE=7405945;WS=7405927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr17	7406343	rs9890028	T	C	287.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=268;SC=ACCACTGTACTTGGTCGGCTG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=7406351;WS=7406339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	7411855	rs4796432	A	G	854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=23;PP=702;SC=TCAACTGGGTATGGTGGCTCA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=28;WE=7411863;WS=7411845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	7412212	rs9889368	A	G	1857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=7;PP=1424;SC=GTTAGAAGAGACGTTTAGAGC;SOR=3.219;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=53;WE=7412220;WS=7412202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	7412965	rs71541942	T	TAGA	3811.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=41;PP=2957;SC=ATGGGGGTCCTAGAAGTCAGC;SOR=0.766;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=29;TCR=51;TR=64;WE=7412973;WS=7412955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	7413038	rs2269459	A	G	2224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=36;PP=1189;SC=TGCAATCAACATTGAGGGGCG;SOR=2.066;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=14;TCR=36;TR=50;WE=7413046;WS=7413028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	7413057	rs7213878	C	T	1912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=28;PP=917;SC=CGGCCAGGCGCGGTGGCTCAC;SOR=3.109;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=35;WE=7413065;WS=7413047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	7413120	rs7218412	A	G	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=380;SC=ACCTGAGCTCAGGAGTTCGAG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=7413128;WS=7413110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	7416683	rs9894023	A	G	12480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=436;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=235;NR=181;PP=2965;SC=CCAGCTACTCACCGACATCTC;SOR=0.994;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=416;TCF=235;TCR=181;TR=416;WE=7416691;WS=7416673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,429:1.00:429
chr17	7417086	rs4344809	G	A	8160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=142;NR=110;PP=2965;SC=CTACAGCCCAGCCTCACCCAA;SOR=0.982;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=254;TCF=142;TCR=112;TR=252;WE=7417094;WS=7417076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr17	7417551	rs9533	T	C	1616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=57;PP=1260;SC=CCCGTGCTGCTGTGCAGTTCT;SOR=8.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=0;TCR=57;TR=57;WE=7417559;WS=7417541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	7452977	rs9899183	C	T	1004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=24;PP=773;SC=TGCATGGGTGCGTGTCTGCAG;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=7452985;WS=7452967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	7460559	rs4968189	T	G	3080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=46;PP=2511;SC=AGGTGTCTGGTCTGTTGGCCC;SOR=0.906;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=87;TCF=41;TCR=46;TR=86;WE=7460567;WS=7460549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr17	7468216	rs4968212	T	C	4380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=53;PP=2965;SC=CTCTCTCCCTTCTCCGACTCC;SOR=1.204;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=82;TCR=54;TR=135;WE=7468224;WS=7468206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr17	7470285	rs58837213	CA	C	2713.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=33;PP=2585;SC=AACTCCGTACCAAAGGGTTAT;SOR=0.798;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=70;TCF=33;TCR=37;TR=64;WE=7470293;WS=7470275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	7474277	rs4968213	C	T	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=25;PP=767;ReadPosRankSum=1.523;SC=GGCCACCTCCCCTAGCTCTGA;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=31;WE=7474285;WS=7474267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr17	7474539	rs28625968	C	T	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=282;SC=AGAACACTAGCTTTAGAGTCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=7474547;WS=7474529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	7477938	rs1057086	G	C	165.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5210;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.792;NF=2;NR=3;PP=100;ReadPosRankSum=-0.366;SC=GCATCTACGCGTATGGTTTTG;SOR=0.223;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=5;WE=7477946;WS=7477928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr17	7478498	rs78553499	G	A	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=312;SC=TTGCCATATCGATTCTGCAGC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=7478506;WS=7478488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	7483915	rs9896688	A	T	8470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=125;NR=144;PP=2965;SC=TATAGCCATGACCTCAGTCTC;SOR=0.814;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=270;TCF=126;TCR=144;TR=269;WE=7483923;WS=7483905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr17	7487108	rs2075230	A	G	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=2;PP=688;SC=CGGGAGGCGGAGTGTCCGCAG;SOR=3.690;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=7487116;WS=7487098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	7492388	rs117372143	G	A	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=1;PP=442;SC=CCGTCCTCCGGCATCCGCCCC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=7492396;WS=7492378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	7557060	rs41283405	G	A	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=2;PP=982;SC=GATATTCACCGCTGTCCCCAC;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=35;WE=7557068;WS=7557050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	7558895	rs117613045	C	T	3069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=55;PP=2358;SC=TCCCCGCCAACGGCAACATCG;SOR=0.985;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=97;TCF=42;TCR=55;TR=96;WE=7558903;WS=7558885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr17	7569698	rs8073498	A	C	2179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=50;PP=1690;SC=AGGGTAGGGAACATGTCTGCC;SOR=2.602;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=14;TCR=50;TR=64;WE=7569706;WS=7569688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	7577099	rs121912660	C	G	1919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=52;PP=1624;SC=GCGCCGGTCTCTCCCAGGACA;SOR=3.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=7;TCR=53;TR=59;WE=7577107;WS=7577089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	7578115	rs1625895	T	C	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=1;PP=938;SC=ACTGCTCACCTGGAGGGCCAC;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=7578123;WS=7578105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	7578645	rs2909430	C	T	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=20;PP=634;SC=AACAAACATGCGTAAGCACCT;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=7578653;WS=7578635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	7578679	rs9895829	A	G	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=10;PP=292;SC=AGCGAGCTAGAGAGAGTTGGC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=7578687;WS=7578669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	7579619	rs17883323	G	T	2886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=55;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=28;PP=1978;SC=AGCAGTCAGAGGACCAGGTCC;SOR=1.635;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=60;TCR=28;TR=87;WE=7579627;WS=7579609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	7579643	rs146534833	CCCCCAGCCCTCCAGGT	C	3025.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=12;PP=2983;SC=GCCCCCCAGCCCCCCAGCCCT;SOR=1.478;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=67;TCF=38;TCR=29;TR=33;WE=7579666;WS=7579633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	7580052	rs8079544	C	T	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=427;ReadPosRankSum=-0.715;SC=TGAGACAGCTCGGCTTCCTGT;SOR=3.056;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=17;WE=7580060;WS=7580042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr17	7592482	rs17885803	C	T	5374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=82;NR=79;PP=2965;SC=ACCCACTTCTCCAGGCCTCTG;SOR=0.741;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=82;TCR=79;TR=161;WE=7592490;WS=7592472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr17	7606722	rs7640	C	G	2859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=54;PP=2336;SC=TGTGGGGGGGCGCCAGACTCC;SOR=1.191;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=36;TCR=55;TR=90;WE=7606730;WS=7606712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr17	7612065	.	C	A	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.064;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.032;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=200;ReadPosRankSum=-1.757;SC=CAGGTAGGAACCAGGGGCTAG;SOR=1.938;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=11;WE=7612073;WS=7612055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr17	7630505	rs11867551	T	C	1901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=18;PP=1563;SC=CACAGGAGCATGATGCCATTC;SOR=1.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=48;TCR=18;TR=66;WE=7630513;WS=7630495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	7641258	.	G	A	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=1;PP=679;SC=TGGGGACAGAGGCTGTGGGGA;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=7641266;WS=7641248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	7646166	rs2642160	A	G	58.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=61;SC=GCATGCGCGCATGTGTAGGTC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=7646174;WS=7646159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	7673928	rs9909288	C	G	1323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.388;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=21;PP=1105;ReadPosRankSum=0.532;SC=ACATAGTACCCTACAAGGATA;SOR=0.563;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=48;TCF=26;TCR=22;TR=47;WE=7673936;WS=7673918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr17	7674850	rs7212989	C	T	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=11;PP=287;SC=GTCATGGTTGCGTGCTTCATT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=7674858;WS=7674840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	7677927	rs4791759	A	G	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=249;SC=CATGTTAGACAGTCTGGGGAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=7677935;WS=7677921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	7681412	rs7359662	C	G	1880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=35;NR=20;PP=1499;SC=ATGACTGTGTCATCCGCCAGA;SOR=1.217;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=55;WE=7681420;WS=7681402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	7682605	rs17806045	C	T	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=7;PP=451;SC=GCATCAACATCGAGGTGCTGT;SOR=1.230;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=12;TCR=7;TR=19;WE=7682613;WS=7682595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	7700712	rs1565817	C	T	5509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=103;PP=2965;ReadPosRankSum=0.422;SC=AGTTCCCTGCCCACAGAGTCT;SOR=1.218;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=173;TCF=69;TCR=104;TR=171;WE=7700720;WS=7700702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,176:0.99:178
chr17	7702357	rs12949280	C	T	1476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=2;PP=1289;SC=CCACCTGACCCGCTGCCCCCG;SOR=4.223;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=45;TCF=42;TCR=3;TR=44;WE=7702365;WS=7702347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	7705089	rs4791834	C	G	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=15;PP=660;SC=CGCCTCTCATCTCTCATCGCA;SOR=1.136;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=26;WE=7705097;WS=7705079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	7708096	rs9889268	G	A	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=2;PP=515;SC=CCCTGGGGGCGGAGGTTGCAG;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=7708104;WS=7708086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	7708163	rs367854692	CA	C	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=5.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=1.945;QD=0.85;ReadPosRankSum=-0.208;SOR=2.044;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,9:0.22:41
chr17	7721231	rs9916791	T	C	4522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=62;PP=2965;SC=ACCTCTCCCGTAGTGTTCCTT;SOR=0.904;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=79;TCR=62;TR=141;WE=7721239;WS=7721221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr17	7726665	rs55758061	C	CAG	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=435;ReadPosRankSum=1.671;SC=GAGAAAAATACAGAGAGAGAG;SOR=1.127;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=11;WE=7726673;WS=7726655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr17	7733555	rs7405476	A	G	835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=0;PP=736;SC=TGTACATGGCAGTGCTAGTGG;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=7733563;WS=7733545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	7733570	.	T	G	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.989;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.86;ReadPosRankSum=3.612;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr17	7750177	rs61462443	T	TACCACC	359.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=4;NR=1;PP=335;SC=CCACCACCATTACCACCACCA;SOR=1.179;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=27;TCF=10;TCR=17;TR=5;WE=7750185;WS=7750167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	7756030	rs34657739	CCA	C	2620.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=41;PP=2282;SC=TGACTCCACCCCATTTTTACC;SOR=2.381;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=48;WE=7756039;WS=7756020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	7761926	rs3744252	C	T	3958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=51;PP=2965;SC=CTTTAAAGATCCGCAAGCACA;SOR=0.879;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=67;TCR=51;TR=118;WE=7761934;WS=7761916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr17	7788409	rs201772788	C	G	130.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=9;PP=224;SC=CAGGTAAGCGCCCGCCCCGAC;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=11;WE=7788417;WS=7788399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	7788427	.	C	A	161	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=7;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=6;PP=161;QD=27.9673160782;SC=GACTCCCCCCCCAAGCCCGAG;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=7788435;WS=7788417;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	7794202	rs12450454	C	G	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=8;PP=757;SC=GGCCTGTGTGCGGCCTGGAAT;SOR=2.019;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=7794210;WS=7794192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	7801509	rs9889962	C	A	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=111;SC=TACAGTAGGGCCTGATTCAAC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=7801517;WS=7801499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	7804405	rs62062524	G	C	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=23;PP=903;SC=CACAGGGGTGGAGCTGGGCTG;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=7804413;WS=7804395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	7806529	rs7222046	A	G	656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=17;PP=550;SC=AGGCAGCTCTATGGGCAGCTT;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=7806537;WS=7806519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	7811998	rs4239111	T	C	2942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=40;PP=2450;SC=TGATGGTTCCTTTTCCTTCAT;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=45;TCR=40;TR=85;WE=7812006;WS=7811988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr17	7812870	rs5819185	CA	C	84.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=100;SC=TGATAGCATTCACATCCGTGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=7812878;WS=7812860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	7948175	rs6503070	C	T	2113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=20;PP=1546;SC=GGCAGGAGGACGCCTTCTTCG;SOR=1.712;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=66;TCF=46;TCR=20;TR=65;WE=7948183;WS=7948165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	7950377	rs11541083	C	T	1073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=26;PP=855;SC=GGATGCAGATCTGGGGTGCAG;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=7950385;WS=7950367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	7950952	rs9898751	C	A	1136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=14;PP=899;SC=TCACCTGCTCCGCCAAGCATG;SOR=1.121;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=20;TCR=14;TR=34;WE=7950960;WS=7950942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	7951819	rs4792147	A	G	2682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=56;PP=2187;SC=GAGCGGAACCAGGGCCTGGTG;SOR=1.270;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=32;TCR=56;TR=88;WE=7951827;WS=7951809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	7960380	rs8072641	T	C	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=429;SC=ACGGTCTCCTTGAACCCAGGT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=7960388;WS=7960370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	7960625	rs9896256	C	T	2856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=25;PP=2234;SC=AGAGCAATATCGTCCTTGGTT;SOR=1.477;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=55;TCR=25;TR=80;WE=7960633;WS=7960615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr17	7961129	rs7214975	G	A	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=15;PP=421;SC=CAGGAACCACGAGCGCATGGT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=7961137;WS=7961119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	7977105	rs12937410	A	G	2344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=63;PP=1940;SC=CCCAGGCGACATCAGTCGTGC;SOR=3.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=13;TCR=63;TR=76;WE=7977113;WS=7977095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	7979463	rs2289586	A	G	3285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=33;PP=2653;SC=TGTCCACCCTAAGAGCCACCC;SOR=1.390;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=65;TCR=33;TR=98;WE=7979471;WS=7979453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	7984157	rs3816263	A	C	2719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=60;NR=29;PP=2204;SC=GCAGGCGCCCAGGGGAAAACC;SOR=1.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=60;TCR=29;TR=89;WE=7984165;WS=7984147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	7990565	.	C	G	189.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.47;MQRankSum=0.949;QD=14.59;ReadPosRankSum=1.100;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr17	7990577	rs7504003	G	C	1247.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.57;QD=31.99;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	7991330	rs9909784	T	G	195.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=6;NR=1;PP=147;SC=CGGGGGAGGGTAGGGGGAGGG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=7991338;WS=7991320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	7991628	rs9903712	C	A	129.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.98;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	7999957	rs3809881	G	A	1932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=15;PP=1541;SC=AGATGGAGACGCTGTTCTCAA;SOR=2.157;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=61;WE=7999965;WS=7999947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	8007650	rs2289587	T	C	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=18;PP=412;SC=CACCGAGCCATGACTGTCTTG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=8007658;WS=8007640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	8007683	rs2289588	C	T	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=271;SC=GGGATGGCCACCACCAAGATT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=8007691;WS=8007673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	8013197	rs76606011	G	C	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=1;PP=698;SC=AAGCGTCTTCGGGGGCGGAGA;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=8013205;WS=8013187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	8018506	rs3027215	C	T	1219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=35;PP=986;SC=AGGAATTGGACATTTCTCCAT;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=38;WE=8018514;WS=8018496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	8021608	rs3027229	G	C	4894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=81;PP=2965;ReadPosRankSum=0.701;SC=TGGATATCAGGAGCCTGGGTT;SOR=0.361;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=59;TCR=82;TR=140;WE=8021616;WS=8021598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,151:0.99:152
chr17	8025180	rs56066045	T	C	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=9;PP=576;SC=GCCGGGGCGGTTTGGGGCGCA;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=14;TCR=9;TR=23;WE=8025188;WS=8025170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	8025712	rs1348325	A	G	1017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=19;PP=882;SC=GCGAACTCCAATATCTCCGCT;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=34;WE=8025720;WS=8025702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	8027318	rs1372869	A	G	1928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=6;PP=1544;SC=CCAGTCCCCTAGCCAAACCAG;SOR=4.407;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=52;TCR=6;TR=57;WE=8027326;WS=8027308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	8046772	rs2585405	C	G	1140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=20;PP=892;SC=GGACTCGGGGCGAGGGCGGGC;SOR=0.743;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=21;TCR=20;TR=41;WE=8046780;WS=8046762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	8048169	rs2253820	T	C	1966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=42;PP=1442;SC=CTTCCTTCTGTGTGTGCAGGG;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=19;TCR=42;TR=61;WE=8048177;WS=8048159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr17	8048283	rs2735611	G	A	374.56	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=310;ReadPosRankSum=1.446;SC=CTGGGGCTAGGCCAGGCAGGT;SOR=2.448;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=13;WE=8048291;WS=8048273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr17	8051639	rs10462024	A	G	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=33;PP=974;ReadPosRankSum=0.156;SC=TCAGCCCTCCACTCTGCCTGG;SOR=5.728;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=33;WE=8051647;WS=8051629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr17	8052415	rs56408410	G	A	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=4;PP=289;SC=GCTGAGGCAGGAGAATCGCTT;SOR=1.270;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=8052423;WS=8052405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	8064083	rs1061032	T	G	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=5;PP=569;SC=TCCAGGGGAGTGGGGGCTGAA;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=8064091;WS=8064073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	8066107	rs2304909	G	A	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=3;NR=1;PP=85;SC=GGGAACGCAGGAGAGACCCCG;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=8066115;WS=8066097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	8076778	rs9894790	C	T	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=1;PP=370;SC=AAGAATCAGACAGGAGCAATC;SOR=4.174;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=16;WE=8076786;WS=8076768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	8076802	rs9901637	T	A	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=1;PP=571;SC=GTGTTGCAAGTCCTGATTACG;SOR=4.712;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=21;WE=8076810;WS=8076792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	8076871	rs77558339	G	A	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=9;PP=939;SC=CTGCCCTCCGGAGGAGGAACA;SOR=2.242;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=35;WE=8076879;WS=8076861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	8076911	rs11655582	A	G	2399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.28;SOR=0.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	8076916	rs11650713	C	T	2434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.27;SOR=0.884;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	8079029	rs8064449	G	C	3314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=51;PP=2690;SC=AGGGAGTCCTGATAGAAGTGG;SOR=0.839;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=45;TCR=51;TR=96;WE=8079037;WS=8079019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr17	8092694	rs8531	T	G	2231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=26;PP=1798;SC=CGGGGTCGATTGGGGGAATGG;SOR=0.990;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=38;TCR=26;TR=64;WE=8092702;WS=8092684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	8108331	rs1059476	A	G	3955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.45;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	8108339	rs2241909	G	A	4144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.73;SOR=1.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr17	8110764	rs2289590	C	A	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=25;PP=849;SC=CTTCCTCATCCCATCCTGTCC;SOR=2.115;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=33;WE=8110772;WS=8110754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	8132763	rs3826543	T	C	1032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=25;PP=805;SC=GGCAGGGGAATGCTAAATAAA;SOR=2.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=35;WE=8132771;WS=8132753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	8135061	rs3027238	T	C	3078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=29;PP=2342;SC=CCAGGAGCTATGAGTCGGTAC;SOR=1.879;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=69;TCR=29;TR=97;WE=8135069;WS=8135051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	8137737	rs4792621	G	A	1698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=15;PP=1302;SC=ATGACAAAAAGGGAAATCACC;SOR=1.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=34;TCR=15;TR=49;WE=8137745;WS=8137727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	8137863	rs78320653	C	T	2695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=31;PP=2080;SC=AGGAGGCCTCCGGGAGGGGCA;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=81;TCF=49;TCR=32;TR=80;WE=8137871;WS=8137853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	8139327	rs4791626	A	G	5149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=75;PP=2965;SC=CCTCTTTGAAAACCCACATTT;SOR=0.832;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=84;TCR=75;TR=159;WE=8139335;WS=8139317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr17	8141707	rs6503093	T	C	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=25;PP=1251;SC=ACCTTCCACTTACCTCACAGC;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=48;WE=8141715;WS=8141697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	8159232	rs7221716	A	G	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=23;PP=712;SC=CCAATAGGTGAGGAGAAATGG;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=8159240;WS=8159222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	8169006	rs11655563	T	C	2481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.006;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=51;PP=2078;ReadPosRankSum=-0.674;SC=GTGATCTTTGTTTGGCTCCTG;SOR=1.634;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=75;TCF=24;TCR=51;TR=74;WE=8169014;WS=8168996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,75:0.99:76
chr17	8170580	rs62063140	C	T	2961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=32;PP=2375;SC=AGAGGCTCCGCGTCCTGGGGG;SOR=1.378;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=58;TCR=32;TR=90;WE=8170588;WS=8170570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	8193473	rs11245	G	A	147.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=117;SC=TGGGTCTCTCGATTCCCTTTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=8193481;WS=8193463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	8194319	rs6503098	T	C	2291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=41;PP=1733;SC=AGGAAGAGCGTTGTCAACCAG;SOR=1.308;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=25;TCR=41;TR=66;WE=8194327;WS=8194309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	8194922	rs143363992	T	TG	398.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.9992;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=485;ReadPosRankSum=0.580;SC=CAGTTCAATGTGGGCTTAGAG;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=13;WE=8194930;WS=8194912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr17	8216468	rs871841	T	C	5999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=97;NR=82;PP=2965;SC=CTCCTGCCACTCCTCAAGCCT;SOR=0.842;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=181;TCF=98;TCR=83;TR=179;WE=8216476;WS=8216458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr17	8219478	rs2270445	A	G	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=12;PP=453;SC=TACCTGTCCCAGCTGCGGCCG;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=8219486;WS=8219468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	8224133	rs3744646	T	C	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=2;PP=345;SC=CCCCACCTCATTGGAGCCTCT;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=8224141;WS=8224123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	8224276	rs3744647	T	C	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=9;PP=1191;SC=GGCTGTTGGATCTTCTTCAGG;SOR=2.935;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=45;WE=8224284;WS=8224266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	8243661	rs12601097	G	A	1651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=31;PP=1321;SC=ACTATTGGTCGTGGCCTTCTC;SOR=0.970;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=23;TCR=31;TR=54;WE=8243669;WS=8243651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	8243785	rs12936935	A	G	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=14;PP=421;SC=CTGCACTTTTACAAATCCAGG;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=8243793;WS=8243775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	8296440	rs12601265	G	A	1552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=18;PP=1285;SC=CTCCAGGCAGGGGAGGAGGCG;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=28;TCR=18;TR=46;WE=8296448;WS=8296430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	8339103	rs8065181	C	T	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=0;PP=110;SC=CCCCCTGTGACACCAGCCCCG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=8339111;WS=8339093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	8339283	rs3744652	C	T	2100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=24;PP=1244;SC=CTGAGCCGAGCGGCTGGGCGG;SOR=0.813;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=28;TCR=24;TR=52;WE=8339291;WS=8339273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	8339307	rs8064417	G	A	2156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=27;PP=1206;SC=TGGCCGGGCCGGCGGAGGGGA;SOR=0.853;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=24;TCR=27;TR=51;WE=8339315;WS=8339297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	8349984	rs369297844	T	TC	328.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=339;SC=TTCCTTGGGTTCCCCCCCACC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=12;WE=8349992;WS=8349974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	8383253	rs4791316	G	C	284.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=204;SC=GTCCTCCCAGGCTCTGAATGC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=8383261;WS=8383248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	8383344	rs3215073	G	GC	1364.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=6;PP=993;SC=GTGGTGGGGAGCCCCCCCGAA;SOR=3.033;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=39;TCF=33;TCR=6;TR=35;WE=8383352;WS=8383334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	8383894	rs6503120	A	G	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=21;PP=672;SC=AGCACAGCACAGGAGCCTCAG;SOR=2.165;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=8383902;WS=8383884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	8384875	rs904417	T	G	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=391;SC=AATTAAACTGTCAAGAAAATC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=8384883;WS=8384865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	8387438	rs113838551	G	GATGA	2019.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=6;PP=1995;SC=TGAACAAATGGATAAGTAACA;SOR=2.885;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=35;WE=8387446;WS=8387428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	8390655	rs7219356	C	T	399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=302;SC=ACGCTGACAGCGGTGCTGTGC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=8390663;WS=8390645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	8393900	rs2270744	G	C	1165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=31;PP=938;SC=GGAAAGAGTTGACCGGGGTGG;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=8393908;WS=8393890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	8393979	rs2270743	C	T	200.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=5;PP=162;SC=CCACTTTGGTCCCCCTGGGCC;SOR=1.609;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=8393987;WS=8393969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	8395894	rs904416	T	C	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=22;PP=576;SC=TCTTCCACCATGTGGCTGATT;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=8395902;WS=8395884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	8395949	.	CT	C	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.17;ReadPosRankSum=0.825;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr17	8396010	rs3744653	A	G	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=6;PP=707;SC=TATCACATTTAAATGCCTTTA;SOR=1.893;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=8396018;WS=8396000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	8397315	rs2277670	C	T	1372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=40;PP=1180;ReadPosRankSum=0.790;SC=TGCATGAGAACGCCCAGTGAC;SOR=6.138;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=40;WE=8397323;WS=8397305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr17	8412133	rs9889907	A	G	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=596;SC=ACTGTACACAATCACATGCTG;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=8412141;WS=8412123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	8416901	rs11374	C	T	2482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=17;PP=2100;SC=CTTCCACCTTCGTCTGCTTCT;SOR=2.463;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=58;TCR=17;TR=75;WE=8416909;WS=8416891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	8417006	rs66631876	GT	G	2586.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=39;NR=54;PP=1408;SC=AAATTAAGCAGTTTTTTTTTT;SOR=0.693;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=130;TCF=51;TCR=79;TR=93;WE=8417027;WS=8416996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr17	8424270	rs8067456	G	A	2429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=29;PP=1852;SC=CCAGGACACCGTTACAGCGAA;SOR=1.165;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=46;TCR=29;TR=75;WE=8424278;WS=8424260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	8449767	rs4791724	A	G	1782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=4;PP=1399;SC=AAGACAGTTTATATTGATTCA;SOR=4.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=46;TCR=4;TR=50;WE=8449775;WS=8449757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	8451744	rs57472344	GA	G	476.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=9;PP=306;SC=TTGATAAAAAGAAAAAAAAAA;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=17;WE=8451752;WS=8451734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	8455532	rs883811	G	A	1193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=35;PP=1030;SC=CTCTTTCAGCGTCTGTAAATT;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=38;WE=8455540;WS=8455522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	8473182	rs422173	G	A	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=15;PP=486;SC=TTAATCTAATGTCTTTACTCA;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=8473190;WS=8473172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	8478586	rs10573578	CAAT	C	1339.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=21;PP=1034;SC=ATGTTAACAACAATGATTTAT;SOR=2.165;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=8478596;WS=8478576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	8478605	rs268460	C	T	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=16;PP=506;SC=ATGTGTTCCACAGGGAATTTG;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=8478613;WS=8478595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	8725214	rs56322041	A	AG	3217.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=58;PP=2936;SC=AGTGGCCCGCAGGAAACGGTG;SOR=1.739;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=81;TCF=21;TCR=60;TR=79;WE=8725222;WS=8725204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	8784149	rs4791764	T	C	5276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=96;NR=61;PP=2965;SC=GCCCCCATCCTTCCAGCTCCT;SOR=1.273;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=96;TCR=61;TR=157;WE=8784157;WS=8784139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr17	8784361	rs4791765	A	G	1629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=44;PP=1313;SC=GGTCAGCCCCAAATCCCTGGC;SOR=4.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=47;WE=8784369;WS=8784351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	8784900	rs376963225	C	CAGTA	2976.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=1;PP=2648;SC=ATGCACGCTCCAGTAAGTCTC;SOR=5.994;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=62;TCF=60;TCR=2;TR=52;WE=8784908;WS=8784890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	8785087	rs9903447	A	C	10051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.69;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,220:1.00:220
chr17	8785092	rs9902600	C	T	10275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.10;SOR=0.868;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr17	8790074	rs11078770	G	A	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=10;PP=328;SC=GGGGAGGGCCGGTGCCCAGCC;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=8790082;WS=8790064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	8792003	rs9915880	C	T	2871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=38;PP=2400;SC=GGGCCGGCCCCGAGGCCTGGG;SOR=1.166;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=53;TCR=38;TR=91;WE=8792011;WS=8791993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	8792029	rs381309	A	G	3544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=39;PP=2861;SC=GCAAGGGACAAGGTGGAGTCA;SOR=1.505;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=70;TCR=39;TR=109;WE=8792037;WS=8792019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr17	8792093	rs16957702	G	A	3249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=53;PP=2497;SC=CACAGTGCCCGTCAGTTTCCA;SOR=0.791;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=47;TCR=53;TR=100;WE=8792101;WS=8792083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr17	8792171	rs11650737	T	C	1908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=43;PP=1521;SC=CTGGCTGGAGTAGCTCCTGTT;SOR=2.428;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=52;WE=8792179;WS=8792161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	8792326	rs11654380	C	T	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=10;PP=368;SC=AGCACTGCCCCCTTGCTCTGC;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=8792334;WS=8792316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	8792371	rs11654094	G	A	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=4;PP=290;SC=CTTTGGGGACGGGGTGGGAGC;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=8792379;WS=8792361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	8792514	rs394811	G	A	1328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=11;PP=1128;SC=TGGGGATGGTGTGGAGCTTCC;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=44;WE=8792522;WS=8792504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	8793905	rs365024	T	C	133.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=1;PP=103;SC=ACACCCTCTATGAGGTCAGCC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=8793913;WS=8793895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	8794002	rs364676	T	C	1262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.54;SOR=2.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	8794009	rs61759652	T	A	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.91;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	8794014	rs381198	A	G	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.40;SOR=2.753;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	8812683	rs181534	T	C	85.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=59;SC=CTCAGCTCACTGCAACCTCTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=8812691;WS=8812673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr17	9066098	rs2286510	C	T	530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=8;PP=422;SC=CGCGCCCCTGCGGCTGACACC;SOR=1.292;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=20;WE=9066106;WS=9066088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	9086338	rs11078789	G	T	1754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.79;SOR=2.998;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	9124464	rs113893303	T	TC	539.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=12;NR=5;PP=398;SC=TTGTCTGTGCTCCCCCCCCAC;SOR=2.200;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=17;WE=9124472;WS=9124454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	9153861	rs8974	G	C	2854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=73;NR=10;PP=2351;SC=TCTGTCATTGGCAGGTGTCAC;SOR=3.560;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=73;TCR=10;TR=83;WE=9153869;WS=9153851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	9154078	rs17743659	G	C	1999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=49;PP=1559;SC=CCTTCAGTTTGTACGAAGTGG;SOR=4.840;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=4;TCR=49;TR=53;WE=9154086;WS=9154068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	9154118	rs17675967	C	T	602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=15;PP=428;SC=TGGGGCGCCGCTGCTGCTACA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=9154126;WS=9154108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	9395033	rs6503214	A	G	81.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.26;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	9395231	rs9893664	G	A	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=14;PP=516;SC=CAAGGCCTGCGTCCTGTTCTG;SOR=1.382;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=21;WE=9395239;WS=9395221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	9408290	.	C	CAAAAAAA	1607.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.81;QD=51.86;SOR=3.477;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	9408594	rs2249929	A	C	292.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=243;SC=CAATTCAAACACAATTTATTG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=9408602;WS=9408584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	9408609	rs2125348	A	G	205.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=183;SC=TTATTGCATCATTAGTTTATG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=9408617;WS=9408599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	9471711	rs1133295	T	G	233.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=1;PP=150;SC=TCACCTTTTCTTTCATATTGA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=9471719;WS=9471701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	9479048	rs7210038	T	C	456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=3;PP=353;SC=TTGCCTGCTCTCCGGAAGCCC;SOR=1.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=9479056;WS=9479038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	9479098	rs7224817	C	A	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=2;PP=366;SC=CCGCCCTCACCCGGGACTCAC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=9479106;WS=9479088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	9479364	rs6503230	T	C	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=347;SC=TTAAAATTGTTAAATAGAAAC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=9479372;WS=9479354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	9515777	rs6503235	G	A	3601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=79;PP=2965;SC=TGATGCTGTCGAGGATATTGT;SOR=1.940;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=32;TCR=79;TR=111;WE=9515785;WS=9515767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr17	9764531	rs2001486	A	G	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=15;PP=584;SC=GTAATTCACCAGGTGTTATTC;SOR=1.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=23;WE=9764539;WS=9764521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	9764547	rs12150176	C	T	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=12;PP=495;SC=TATTCTTTCACGAGCCGGTAA;SOR=1.230;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=19;WE=9764555;WS=9764537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	9765514	rs12150273	G	C	533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=452;SC=CCTTGAGAGAGAGAAGCTGAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=9765522;WS=9765504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	9768941	rs756224	A	G	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=0;PP=1312;SC=TGCACACATAAGCCTCAAGTG;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=44;WE=9768949;WS=9768931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	9774057	rs17810279	T	G	2280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=30;PP=1811;ReadPosRankSum=-0.764;SC=CTGCTCTTTTTTTCAAGGTCA;SOR=0.340;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=72;TCF=42;TCR=30;TR=71;WE=9774065;WS=9774047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr17	9783566	rs4791903	G	C	1001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=4;PP=825;SC=ATGTTGTAGTGAAGGAGACCA;SOR=3.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=9783574;WS=9783556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	9783855	rs2277690	A	G	1374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=37;PP=1103;SC=TCTGAACCAAAATGCCTTGAC;SOR=4.125;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=41;WE=9783863;WS=9783845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	9791375	rs17676067	T	C	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=20;PP=524;SC=GTGGATGGGATGATGCTACGG;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=9791383;WS=9791365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	9792768	rs17681684	G	A	3287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=46;PP=2533;SC=CCTGGGGAAGGACTTCCGGTT;SOR=1.008;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=60;TCR=46;TR=106;WE=9792776;WS=9792758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr17	9792872	rs17681708	T	C	3534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=65;PP=2698;SC=GGCTCCTACATCTAGCCATGC;SOR=1.047;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=49;TCR=65;TR=114;WE=9792880;WS=9792862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr17	9793240	rs17681738	C	T	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=2;PP=789;SC=ATCCTAATAACCCCCACCAGT;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=9793248;WS=9793230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	9793417	rs55789050	A	T	2254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=46;PP=1732;SC=GGGTGCGTGAAAACCTCCTAG;SOR=1.319;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=28;TCR=46;TR=74;WE=9793425;WS=9793407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	9801316	.	T	TGTGTGTGTGC,TGTGTGC	585.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.31;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=19,19;NR=0,0;PP=27,225;SC=TGTGTGTGTGTGCGCGCGCGT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=19,19;WE=9801324;WS=9801306;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.89:18
chr17	9801351	rs17744264	A	G	2671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=2;PP=1308;SC=GTGTGTGTGCACAGGCGCTCA;SOR=5.926;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=58;TCF=56;TCR=2;TR=58;WE=9801359;WS=9801341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	9801370	rs16958933	A	G	3159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=9;PP=1665;SC=CACGGGTGTCATGTGAGTGGT;SOR=3.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=69;TCR=9;TR=78;WE=9801378;WS=9801360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	9801532	rs76286617	G	C	3156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=73;PP=2294;ReadPosRankSum=-0.611;SC=CTGTGCATTGGGAAAAAATAT;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=109;TCF=35;TCR=74;TR=108;WE=9801540;WS=9801522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr17	9801635	rs62064489	A	G	1643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=36;PP=1263;SC=TATCTATTATAAGAATATTGA;SOR=2.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=45;WE=9801643;WS=9801625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	9820695	rs4791910	C	T	2997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=56;PP=2298;SC=CTGTTAGAGACGGCGGCCAAG;SOR=1.156;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=37;TCR=56;TR=93;WE=9820703;WS=9820685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr17	9820739	rs11078821	A	G	1885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=38;PP=1448;SC=TGCTGTCCTCACCTTAGTGTC;SOR=1.467;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=22;TCR=38;TR=60;WE=9820747;WS=9820729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	9821614	rs61532416	G	GA	1252.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=878;SC=TTTACTTCCTGAAATCCTGCT;SOR=5.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=21;WE=9821626;WS=9821604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	9821618	rs55976773	T	G	1261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=567;SC=CTTCCTGAAATCCTGCTCCGC;SOR=5.353;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=22;WE=9821626;WS=9821604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	10205067	rs2008528	C	T	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=35;PP=1168;SC=CCTCTCAGTCCGATTATGAGG;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=46;WE=10205075;WS=10205057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	10206595	rs3744550	T	C	1356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=4;PP=1070;SC=GATATTCTTGTGGTCCTCCTC;SOR=3.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=38;WE=10206603;WS=10206585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	10219366	rs2240577	C	T	1840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=41;PP=1478;SC=AAAGTCAACACGAATGGGAAG;SOR=2.187;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=14;TCR=41;TR=55;WE=10219374;WS=10219356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	10222149	rs2074873	A	G	1983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=26;PP=1542;SC=CCATGTCGTCAATCTCCATCT;SOR=1.146;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=38;TCR=26;TR=64;WE=10222157;WS=10222139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	10223422	rs11658229	G	A	2280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=19;PP=1684;SC=GAGGAGGGGCGCTCTTGCAAA;SOR=2.211;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=53;TCR=19;TR=72;WE=10223430;WS=10223412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	10223573	rs3214259	TA	T	2808.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.265;NF=20;NR=30;PP=965;ReadPosRankSum=0.447;SC=GCAAATAGATTAAAAAAAAAT;SOR=0.291;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=62;TCF=23;TCR=39;TR=50;WE=10223594;WS=10223563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr17	10223586	rs2074875	A	G	3081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.234;NF=31;NR=35;PP=1783;ReadPosRankSum=-0.609;SC=AAAAAAATAAAGAACATGAAA;SOR=0.310;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=31;TCR=36;TR=66;WE=10223594;WS=10223563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr17	10223697	rs2074876	G	T	2122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=36;PP=1694;SC=TTTGCTGCTTGTCATTTTCTA;SOR=1.044;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=24;TCR=36;TR=60;WE=10223705;WS=10223687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	10231417	rs2277644	C	T	1339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=34;PP=1134;SC=GGATGTTGTACTGGATGCAGA;SOR=2.531;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=43;WE=10231425;WS=10231407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	10231498	rs2277645	A	C	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=392;SC=CTGCACCCCCAACCTGTCCCC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=10231506;WS=10231488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	10235360	rs8064714	G	C	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=454;SC=GATCAGCTAAGAAGCAGCCCA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=10235368;WS=10235350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	10236199	rs11654733	A	C	145.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=5;NR=0;PP=115;SC=AGGGTCTGGGATCTGAATTTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=10236207;WS=10236196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	10243589	rs4445936	C	A	3460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=63;PP=2690;ReadPosRankSum=-0.691;SC=CATTTAGCAACTGCCATTTCA;SOR=0.504;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=39;TCR=64;TR=102;WE=10243597;WS=10243579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,108:0.99:109
chr17	10243717	rs3760423	G	A	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=22;PP=701;SC=CTCCGGAGTCGCCTGGAGACA;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=10243725;WS=10243707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	10249087	rs1812043	G	A	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=23;PP=707;SC=CAAGGCGGGCGGATCACGAGG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=10249095;WS=10249077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	10249888	rs34168540	G	GA	809.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=1;PP=1028;SC=CTCTTAATGTGAAAGCTGATT;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=25;WE=10249896;WS=10249878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	10254197	rs2108568	A	G	1552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=45;PP=1327;SC=TGGGTGGGTGAAGACTATGGG;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=45;WE=10254205;WS=10254187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	10258153	rs3214260	GT	G	2642.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=18;PP=2138;SC=ACTCTGGGTTGTTTTTTTTTT;SOR=1.355;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=50;TCF=28;TCR=22;TR=39;WE=10258163;WS=10258143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	10258155	rs5010940	T	C	2651.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=18;PP=1421;SC=TCTGGGTTGTTTTTTTTTTCC;SOR=1.329;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=57;TCF=36;TCR=21;TR=45;WE=10258163;WS=10258143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	10263598	rs2277647	T	C	470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=397;SC=GAACATAGGCTCTAGTTAATG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=10263606;WS=10263588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	10267610	rs4791981	C	T	3269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=73;NR=16;PP=2531;SC=TGAGCATGCCCATATTATCAA;SOR=3.000;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=73;TCR=16;TR=89;WE=10267618;WS=10267600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr17	10314375	rs12601552	G	A	975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=28;PP=826;SC=ATGAGATACAGTTAAAACTAA;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=10314383;WS=10314365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	10314395	rs12601678	C	T	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=19;PP=601;SC=ACGTTGCTCCCTCAAAAAATG;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=10314403;WS=10314385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	10317831	rs4791406	A	G	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=22;SC=TCGAGTTTGAAAAAAGTATCA;SOR=2.546;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WS=10317821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	10317842	rs4791407	A	G	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=20;PP=662;SC=AAAAGTATCAATGCTTCTGAG;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=10317850;WS=10317821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	10317940	rs4791408	A	G	280.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=204;SC=AATTGCAGATAGACAGTGATT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=10317948;WS=10317930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	10318636	rs8068729	A	G	1446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=10;PP=1106;SC=CATTCCTCACAGTTTTGGCAT;SOR=2.540;Source=Platypus;TCR=10;TR=48;WE=10318644;WS=10318626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	10319148	rs7216301	A	G	104.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	10346781	rs3744554	T	C	1411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=10;PP=1170;SC=GCCCGTTCCTTGGCCTCCTCC;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=43;WE=10346789;WS=10346771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	10348354	rs2277649	T	C	2946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=49;PP=2235;SC=CTCAGCCTCATCCAGACGGAG;SOR=0.982;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=38;TCR=49;TR=87;WE=10348362;WS=10348344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	10348705	rs3833153	A	AGAAGC	2024.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=25;PP=2059;SC=GAAAGAGAAGAGAAGCACATT;SOR=1.154;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=34;WE=10348713;WS=10348695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	10352243	.	C	G	2960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.771;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=59;PP=2364;ReadPosRankSum=0.695;SC=CGTTCCACATCAATCATGAGG;SOR=1.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=89;TCF=30;TCR=59;TR=88;WE=10352251;WS=10352233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,92:0.99:93
chr17	10355371	rs11651295	C	T	1512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=31;PP=1098;ReadPosRankSum=-0.532;SC=TCAATCTGCTCCCCAAGCTCA;SOR=0.723;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=45;WE=10355379;WS=10355361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr17	10355763	rs917361	T	C	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=25;PP=1126;SC=TTTGTAGCTGTATTGCAAGGG;SOR=1.347;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=15;TCR=25;TR=40;WE=10355771;WS=10355753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	10356816	rs3744557	C	G	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=10;PP=554;SC=CAAGTAAGTACATTGAGGTGG;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=8;TCR=10;TR=18;WE=10356824;WS=10356806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	10360016	rs2041123	C	G	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=422;SC=CATATCTCTCCTCCCTCAATT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=10360024;WS=10360006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	10362746	rs2058099	A	G	3219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=61;PP=2394;SC=GAACTACAGAACAAGATAAAT;SOR=1.189;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=37;TCR=61;TR=98;WE=10362754;WS=10362736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr17	10363410	rs3744561	A	G	3623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=41;PP=2671;SC=CACCCACTGCATTGTACACCT;SOR=1.411;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=77;TCR=41;TR=118;WE=10363418;WS=10363400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr17	10364191	rs1029665	T	C	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=450;SC=AAGTTCACTATGTCAGCTTTG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=10364199;WS=10364181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	10399897	rs3744563	A	G	4808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=92;PP=2965;SC=ACATTAGTAGAGTAATGGAAG;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=54;TCR=93;TR=145;WE=10399905;WS=10399887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr17	10405061	rs145628279	C	T	3296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=66;PP=2592;SC=CCCCACAAAACTGTTGACCTA;SOR=1.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=31;TCR=66;TR=97;WE=10405069;WS=10405051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	10411335	rs68047947	G	GT	1517.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.72;MQRankSum=0.033;QD=23.35;ReadPosRankSum=2.411;SOR=1.897;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,63:0.97:65
chr17	10411370	rs4791995	T	C	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=38;PP=936;SC=GTTTCACTCTTGGTTGCCCAG;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=38;WE=10411378;WS=10411360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	10411397	rs4791996	G	A	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=33;PP=916;SC=GTGCAGTGGCGTGATCTCGGC;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=10411405;WS=10411387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	10411632	rs35152572	A	G	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=5;PP=895;SC=TCTGGCCTCTAGTTATGTTTT;SOR=3.193;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=32;WE=10411640;WS=10411622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	10414284	rs8082000	C	A	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=3;PP=686;SC=AAAAAAGAAGCAGCTCAAAAT;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=10414292;WS=10414274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	10415840	rs2007027	A	G	4163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=52;PP=2965;SC=CATCTGAAGTAAAGCCCAGAA;SOR=1.095;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=72;TCR=52;TR=124;WE=10415848;WS=10415830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr17	10418275	rs1017068	T	G	1204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=27;PP=976;SC=CTTTCTATAGTGAAACAGGGC;SOR=2.073;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=9;TCR=27;TR=36;WE=10418283;WS=10418265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	10424897	rs5819275	C	CAT	196.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.319;NF=0;NR=6;PP=262;ReadPosRankSum=0.157;SC=TTATTGATGTCATATATATAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=6;WE=10424905;WS=10424887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,7:0.88:8
chr17	10427227	rs117415453	A	T	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=29;PP=838;ReadPosRankSum=1.021;SC=TTGTACATTTAAAAAATTGTG;SOR=1.112;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=35;WE=10427235;WS=10427217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,35:0.95:37
chr17	10431275	rs12952334	A	G	220.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=174;SC=ACTTCTCCCCAAAATAAAAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=10431283;WS=10431265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	10431877	rs11372676	A	AT	513.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=519;SC=AAAAATGCTGATTTTTTGTGC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=16;WE=10431885;WS=10431867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	10432638	rs2277651	T	C	1922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=18;PP=1506;SC=CCATAAGCAATTCTTTCTTAC;SOR=1.812;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=38;TCR=18;TR=56;WE=10432646;WS=10432628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	10434925	rs3744565	T	C	4546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=31;PP=2965;SC=TGGTTAGTGATACCAAGGGTG;SOR=2.456;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=138;TCF=107;TCR=31;TR=137;WE=10434933;WS=10434915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr17	10435325	rs11379780	G	GA	604.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=655;SC=ACATGCAGATGAAAAAATTCT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=20;WE=10435333;WS=10435315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	10442977	rs2277653	T	C	2738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=70;PP=2272;SC=TGCAGTGTTTTAAATATCTCT;SOR=3.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=8;TCR=70;TR=78;WE=10442985;WS=10442967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	10446182	rs719277	C	T	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=3;PP=575;SC=AGAATTATGACATTTCTTACC;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=10446190;WS=10446172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	10446508	rs11078849	T	G	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=452;SC=TTACTACCTTTTTTTTATATA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=10446516;WS=10446498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	10448769	rs11078850	A	T	1748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=15;PP=1310;SC=GCTTATACACAGGCAGCCACT;SOR=1.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=50;WE=10448777;WS=10448759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	10450816	rs12600539	T	C	2640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=21;PP=2028;SC=CTGCATAACGTTCTTTGAGGT;SOR=1.854;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=73;TCF=51;TCR=22;TR=72;WE=10450824;WS=10450806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr17	10532884	rs12940161	G	A	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=255;SC=CAGTCCCTGGGGGGGGGCTCC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=10532892;WS=10532874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	10533595	rs3216886	C	CT	2554.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=40;PP=2723;SC=GGGGTTCCTCCTGCACACACC;SOR=0.910;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=22;TCR=42;TR=61;WE=10533603;WS=10533585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	10535761	.	G	A	687	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=23;NR=1;PP=687;QD=30.0738005228;SC=GTGAGGAGGAGAGAGGTTTTT;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=10535769;WS=10535760;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	10536018	rs2285479	G	A	3888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=68;PP=2965;SC=CCTTCTCGGCGATCTTTCTAT;SOR=1.052;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=50;TCR=68;TR=118;WE=10536026;WS=10536008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr17	10536184	rs2285478	A	G	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=17;PP=542;SC=CAAAACTTCAATGGAATAGTC;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=10536192;WS=10536174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	10541515	rs2285477	C	T	1726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=29;PP=1355;SC=TTCCTCAGCGCGGCCACCATG;SOR=0.884;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=25;TCR=29;TR=54;WE=10541523;WS=10541505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	10542471	rs2285475	T	G	3730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=62;PP=2965;SC=CCAGGTCTACTCGGAGCTTCT;SOR=0.759;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=59;TCR=62;TR=121;WE=10542479;WS=10542461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr17	10542765	rs2285474	A	G	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=11;PP=493;SC=CATCTAACCCAGAGAGTTCCT;SOR=1.402;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=19;WE=10542773;WS=10542755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	10542803	rs2285473	T	C	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=11;PP=612;SC=TAAGAAGAATTCGCAAGCAAT;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=23;WE=10542811;WS=10542793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	10542886	rs2285472	T	C	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=12;PP=521;SC=CCTTGTTCTCTGTGGCATGCT;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=22;WE=10542894;WS=10542876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	10543183	rs2285471	A	G	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=17;PP=656;SC=CCAGTATTTCACTATATATGA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=25;WE=10543191;WS=10543173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	10543218	rs2285470	A	G	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=13;PP=650;SC=CATTTCAACTAAAAAGCAAAA;SOR=0.963;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=23;WE=10543226;WS=10543208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	10543281	rs138188093	TAA	T	572.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=3;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQ=59.53;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=172;ReadPosRankSum=-0.183;SC=CTAGAAGAGTTAAAAAAAAAA;SOR=0.317;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=13;TCR=10;TR=16;WE=10543290;WS=10543271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr17	10543463	rs2285469	T	C	1947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=13;PP=1586;SC=TCTCAGTCTCTGCACTCTTGA;SOR=2.381;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=45;TCR=13;TR=58;WE=10543471;WS=10543453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	10544018	rs876660	T	C	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=26;PP=622;SC=ATTGTAGACATGGAAATCATC;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=10544026;WS=10544008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	10544416	rs876657	G	T	233.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=270;SC=GTTTAAAATCGCCATAGAGAA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=10544424;WS=10544406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	10544696	rs3216884	GA	G	799.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=22;PP=482;SC=TTTCCTAAGAGAAAAAAAAAA;SOR=2.448;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=26;WE=10544704;WS=10544686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	10545432	rs3216883	C	CAGTA	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=391;SC=CACTTCACCTCAGTGACAGTA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=10545440;WS=10545430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	10546130	rs2285468	T	G	5691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=85;PP=2965;SC=ACGGTGGGGATGGAACTGGAT;SOR=0.738;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=84;TCR=85;TR=169;WE=10546138;WS=10546120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr17	10549184	rs2239933	G	A	2654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=24;PP=2089;SC=AGGGCAGCACGTCAGTCAGTT;SOR=1.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=56;TCR=24;TR=80;WE=10549192;WS=10549174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	10550845	rs142213434	TTTTTG	T	898.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=924;SC=CCCCCTAAAATTTTTGTTTTG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=20;WE=10550857;WS=10550835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	10553046	rs1989810	A	G	1316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=29;PP=998;SC=CAAGTCTGTTAGTATAAACAG;SOR=1.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=40;WE=10553054;WS=10553036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	10555021	rs2285467	T	C	3292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.14;QD=42.76;SOR=2.155;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	10555028	rs2285466	G	A	3231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.15;QD=45.52;SOR=1.965;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr17	10555061	rs71360285	A	G	147.98	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.875;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQRankSum=-0.473;QD=13.45;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr17	10555062	rs150760312	TTG	T	138.94	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQRankSum=-0.473;QD=12.63;ReadPosRankSum=-0.023;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr17	10595388	rs2520178	A	G	1779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=41;PP=1423;SC=AGGTGTTTTGAAAGCAGATGG;SOR=2.345;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=52;WE=10595396;WS=10595378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	10633245	rs202312	T	C	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=20;PP=826;SC=CGGTCCGCCTTCCTCCTTGCG;SOR=1.085;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=14;TCR=20;TR=34;WE=10633253;WS=10633235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	10633321	.	C	CG	729.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=16;PP=667;SC=CGTCGCTCCGCCCGGGGGCGG;SOR=2.948;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=10633329;WS=10633311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	11459012	rs1030055	G	C	906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=0;PP=796;SC=ACCTGCCACAGACATGGTCCT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=11459020;WS=11459002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	11502403	rs8079566	G	C	44.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=2;PP=27;SC=AACCAGGAGGGAAGTTCCTGA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=11502411;WS=11502393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	11511412	rs4792156	A	G	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=0;PP=305;SC=GAATTGGAACACCTGCCTTTC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=11511420;WS=11511402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	11513661	rs2191072	C	T	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=2;PP=236;SC=ATTTTCACGCCTCAGGGTTTT;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=11513669;WS=11513651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	11522764	rs10852799	G	A	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=1;PP=377;SC=TATTATCCTCGTGAAAAATAT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=11522772;WS=11522754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	11523082	rs9892256	A	G	1950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=55;PP=1714;SC=TTCCTGGGACAACTGCACGTG;SOR=3.575;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=7;TCR=55;TR=62;WE=11523090;WS=11523072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	11532613	rs9896886	T	C	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=115;SC=CCCCTTCCTGTGTCCATGTGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=11532621;WS=11532603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	11532715	rs28665591	T	C	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=6;PP=711;SC=TTTAACTTTTTTGTGAATTGT;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=11532723;WS=11532705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	11532835	rs9895535	A	G	1289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=28;PP=1073;SC=AAATGCATGAAGAATTTCAAG;SOR=1.666;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=15;TCR=28;TR=43;WE=11532843;WS=11532825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	11536097	rs9899241	T	G	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.49;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	11536102	rs9897667	C	A	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.49;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	11543520	rs11653848	T	C	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=442;SC=TGGTGGGAGGTGTTTGCCGAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=16;WE=11543528;WS=11543510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	11550340	rs11870495	T	C	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=1;PP=613;SC=CAGGCACCGGTGAGCTGGGAG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=11550348;WS=11550330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	11550415	.	G	A	2607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=22;PP=2031;SC=TATGAGGATTGGTGCCGGACA;SOR=2.168;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=58;TCR=22;TR=80;WE=11550423;WS=11550405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr17	11583089	rs8071438	T	C	2867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=14;PP=2087;SC=CCAACCTGGATGCGTTTATAA;SOR=3.185;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=83;TCF=69;TCR=14;TR=82;WE=11583097;WS=11583079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr17	11604598	rs7214186	T	A	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=333;SC=TCCTCCATGGTTGGGGCTGTC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=11604606;WS=11604588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	11622494	rs12945437	A	G	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=465;SC=TTGCCCGCTAAAGAGTCCTCC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=11622502;WS=11622485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	11651139	rs3744582	C	T	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=18;PP=544;SC=GTCCCTGTGGCGGGCTTGGAT;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=11651147;WS=11651129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	11660722	rs11078030	G	T	198.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=1;PP=149;SC=CCATTTACCCGCTCACATCTT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=11660730;WS=11660712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	11666674	rs2277657	T	C	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=255;SC=CCACTGAAACTGAGTGGTTCC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=11666682;WS=11666664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	11684571	rs2277659	G	C	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=20;PP=580;SC=TATTCTGCCTGAACGGCAAAC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=11684579;WS=11684561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	11737899	rs3744584	T	G	335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=2;PP=299;SC=ACTAGTCCAGTGCCCACAGTC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=11737907;WS=11737889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	11737938	rs3744585	G	A	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.32;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	11737941	rs3744586	C	T	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.59;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	11757556	rs12449553	C	G	3831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=66;PP=2965;SC=TGCAAGACCCCGAGTTCAATC;SOR=0.916;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=119;TCF=53;TCR=66;TR=119;WE=11757564;WS=11757546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr17	11772573	rs369897448	G	A	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=16;PP=502;SC=ACCGCCTGGTGAGTGTAAGCC;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=11772581;WS=11772563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	11778577	rs11396360	G	GC	1160.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.160;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.344;NF=0;NR=33;PP=1316;ReadPosRankSum=1.397;SC=CAGATTTTAAGCCCAGTGAAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=33;WE=11778585;WS=11778567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,38:0.95:40
chr17	11786951	rs8070256	T	C	825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=13;PP=674;ReadPosRankSum=-0.597;SC=CCTGAAAACGTTGGAAGACAG;SOR=0.335;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=26;TCF=13;TCR=13;TR=25;WE=11786959;WS=11786941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr17	11787936	rs11868929	A	G	1745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=37;PP=1335;SC=TGGGTAAGACAGATAAACCAG;SOR=1.823;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=16;TCR=37;TR=53;WE=11787944;WS=11787926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	11787975	rs11078042	T	C	1292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=28;PP=1050;SC=TGAGGGACAGTTGAGGTTGGA;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=39;WE=11787983;WS=11787965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	11806266	rs3815269	T	C	142.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.55;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=59;SC=AGCATAGGCATGGGGCAAGGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=11806274;WS=11806256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	11827353	rs2286300	T	C	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=588;ReadPosRankSum=1.681;SC=CTTCTCCCCATCTGTCCTTTC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=21;WE=11827361;WS=11827343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr17	11833287	rs2286303	A	G	2632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=37;PP=1988;SC=GTGCAGAGCCAGCACCCTCCC;SOR=1.105;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=52;TCR=37;TR=89;WE=11833295;WS=11833277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	11833365	rs1859887	G	A	2341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=37;PP=1876;SC=AGCCCCCCACGGGCATGCATG;SOR=0.804;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=71;TCF=33;TCR=38;TR=70;WE=11833373;WS=11833355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	11835331	rs17612861	G	A	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=6;PP=560;SC=CTCATTTCAGGACACTCTGGA;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=11835339;WS=11835321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	11837161	rs12948962	T	C	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=2;PP=579;SC=GTGGAGGTCTTTCTTCCTTCC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=11837169;WS=11837151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	11840528	rs2240521	A	C	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=262;SC=GGAGAGGGTGATGAAGTCAAC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=11840536;WS=11840518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	11886542	rs34660389	C	T	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=448;SC=CCTCCTTCACCACCTCCCCAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=11886550;WS=11886532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	11886864	rs17613212	T	C	256.53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-1.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9988;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=152;ReadPosRankSum=-0.517;SC=CTTAGAACAGTGTGTGGAGCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=9;WE=11886872;WS=11886854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr17	11887518	rs34299203	GA	G	600.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=5.405;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.73;MQRankSum=-0.201;QD=16.69;ReadPosRankSum=0.976;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,33:0.92:36
chr17	11894195	rs35075542	C	T	203.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=164;SC=CTCAGGGATACGCCAATCTGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=11894203;WS=11894185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	12620761	rs12944823	A	G	3132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=65;PP=2430;SC=GAAATCAGACACCAAGAGATG;SOR=1.458;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=37;TCR=65;TR=102;WE=12620769;WS=12620751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr17	12620897	rs12602716	G	A	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=311;SC=TCTAGGCCACGTAGATACCCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=12620905;WS=12620887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	12647406	rs73977966	C	T	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=514;SC=CCAAGAATGGCCATCAGACAA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=12647414;WS=12647396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	12647490	rs12709295	T	C	1993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=11;PP=1727;SC=TTTCCTCATCTTCTTTGCAGT;SOR=2.872;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=49;TCR=11;TR=60;WE=12647498;WS=12647480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	12798303	rs114629559	C	T	1877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=35;PP=1458;SC=TCAGGTAAGGCGGCCATTGAC;SOR=1.392;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=21;TCR=35;TR=56;WE=12798311;WS=12798293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	12799985	rs2302068	G	A	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=23;PP=653;SC=TTTTCTGTGGGGTAATGACCC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=12799993;WS=12799975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	12822892	rs3826375	G	A	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=51.88;NF=11;NR=1;PP=311;SC=TAGTAGAGTCGGAGTTTCGCC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=12822913;WS=12822882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	12822905	rs3826374	A	G	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=47.47;NF=16;NR=1;PP=486;SC=GTTTCGCCATATTGGCCAGGC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=12822913;WS=12822882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	12823271	rs56974323	A	G	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=14.314;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=684;ReadPosRankSum=1.650;SC=CCTAACGTGTACCAGGCACTG;SOR=6.592;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=25;WE=12823279;WS=12823261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr17	12846708	.	G	A	86	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=86;QD=30.1928031368;SC=TGCTTCCCAAGTTTCCACTTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=12846716;WS=12846707;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	12855719	rs2072253	G	A	1316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=5;PP=1052;ReadPosRankSum=-0.778;SC=GTCAGTTACAGTGGTTGGTAT;SOR=2.352;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=38;WE=12855727;WS=12855709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr17	12856005	rs2072252	A	G	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=370;SC=ATAGCATTTTATGATGTCCAA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=12856013;WS=12855995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	12859125	rs3214256	C	CG	1983.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=24;PP=2016;SC=GTCCAGTCCCCGGGGGACATG;SOR=1.249;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=59;TCF=33;TCR=26;TR=52;WE=12859133;WS=12859115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	12859149	rs2190698	C	T	2272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.741;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.255;NF=38;NR=28;PP=1828;ReadPosRankSum=1.196;SC=GGTGTTGAGCCTTGGTTAAAC;SOR=0.793;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=38;TCR=29;TR=66;WE=12859157;WS=12859139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr17	12860183	rs10602009	AACACAC	A	323.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=297;SC=TTCCCCTATAAACACACACAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=4;WE=12860196;WS=12860173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	12862359	rs9904572	G	A	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=718;SC=AACTGTATCTGCTGTGTCTGG;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=12862367;WS=12862349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	12896398	rs73978302	G	C	1637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=41;PP=1395;SC=ACATGTCTCAGAGGGGCAGGG;SOR=2.393;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=53;WE=12896406;WS=12896388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	12898454	rs73981604	C	A	1351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=39;PP=1147;SC=AAGTCTTTGGCTGGAGAACCC;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=40;WE=12898462;WS=12898444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	12898994	rs2286338	C	G	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=1;PP=685;SC=AACAGCCCAGCGGGCCAGGCT;SOR=4.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=12899002;WS=12898984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	12899726	rs4792308	A	G	3393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=36;PP=2582;SC=TTTTGCAAAAAACCATTTCCT;SOR=1.466;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=67;TCR=36;TR=103;WE=12899734;WS=12899716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr17	12899748	rs73981606	A	C	3184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=47;PP=2260;SC=GCCAGAGATGAGTAACAAAAG;SOR=0.931;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=56;TCR=47;TR=103;WE=12899756;WS=12899738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr17	12899963	rs11545302	T	C	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=40;PP=1334;SC=GCTGCCCAAATGTGCCCTCAC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=20;TCR=40;TR=60;WE=12899971;WS=12899953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	12901544	rs11443554	T	TA	578.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=642;SC=ATTCCCAGGGTAAAGTTTGCT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=17;WE=12901552;WS=12901534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	12903599	rs3760316	A	G	935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=14;PP=704;SC=TCCCTGCAGGAAGAGAGAGAA;SOR=0.906;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=27;WE=12903607;WS=12903589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	12905525	rs56341811	TG	T	235.14	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5026;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=271;ReadPosRankSum=-0.140;SC=ATTTACTATGTGGCTATTTAC;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=12905533;WS=12905515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr17	12905574	rs55674356	T	A	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=0;PP=662;SC=ATTCCATTAGTTCAAGATGGC;SOR=5.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=12905582;WS=12905564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	12905743	rs55825263	G	A	3971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=57;PP=2965;SC=ACAAGGGGCCGGTCTGAGACA;SOR=0.892;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=66;TCR=57;TR=123;WE=12905751;WS=12905733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr17	12908204	rs4792309	T	C	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=337;SC=TAAACCCAGATAGTGGTCTTC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=12908212;WS=12908194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	12909046	rs3217019	A	AATC	672.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=2;PP=602;SC=GTAACTGCTGAATCAAGAAAA;SOR=3.126;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=13;WE=12909054;WS=12909036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	12914832	rs73981621	C	T	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.47;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	12914832	.	CCA	TCC	304	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=6;NR=0;PP=304;QD=59.5779791437;SC=TCTCATTCCCCCAACGGGCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=6;WE=12914842;WS=12914822;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr17	12914834	rs73981622	A	C	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.47;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	12914920	rs41494747	A	G	1735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=5;PP=1422;ReadPosRankSum=1.053;SC=CAAGCATTACAAGGCAGAGAA;SOR=2.463;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=59;TCR=5;TR=62;WE=12914928;WS=12914910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,63:0.97:65
chr17	12915009	rs4792311	G	A	3435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.986;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=61;PP=2574;ReadPosRankSum=0.603;SC=ATTTTCATTCGACTCGGAGTC;SOR=0.155;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=113;TCF=50;TCR=63;TR=111;WE=12915017;WS=12914999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,116:0.98:118
chr17	12916463	rs61277685	C	T	1845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=16;PP=1499;SC=CTATTTTCATCCATGTTTTCT;SOR=1.823;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=54;WE=12916471;WS=12916453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	12920260	rs58809197	A	G	4629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=96;NR=36;PP=2965;SC=CTAAGAATGAAAAAACATTTA;SOR=2.105;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=96;TCR=36;TR=132;WE=12920268;WS=12920250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr17	13399486	rs11385090	A	AT	2600.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.53;MQRankSum=0.284;QD=27.67;ReadPosRankSum=0.092;SOR=1.959;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,93:0.99:94
chr17	13400153	rs8080565	G	A	4740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=97;PP=2965;SC=ACGCAAAAAGGCATGTCAGAG;SOR=1.339;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=154;TCF=56;TCR=98;TR=153;WE=13400161;WS=13400143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr17	13446924	rs9913045	G	A	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=5;PP=546;SC=GACAAAAACCGCGATTACTTT;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=13446932;WS=13446914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	13504276	rs111255219	G	T	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=13;PP=979;SC=CGCCGCCGCCGGACAGCCCCA;SOR=1.552;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=38;WE=13504284;WS=13504266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	13504408	rs28663356	C	A	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=29;PP=987;SC=GCGGCTCGGCCGAGGTGGAGA;SOR=2.409;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=8;TCR=29;TR=37;WE=13504416;WS=13504398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	13972811	rs6502330	G	A	288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=1;PP=245;SC=GCCGGAAGTGGCGGCCCGGAA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=13972819;WS=13972801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	13977813	rs143814384	C	CTTTA	2162.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=34;PP=1830;SC=TACTTTCTGCCTTTTTCTCTG;SOR=3.611;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=35;WE=13977821;WS=13977803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	13980350	rs2072279	G	A	2775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=76;PP=2252;SC=ATTTTGGCTCGACTATCCAAA;SOR=4.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=5;TCR=77;TR=81;WE=13980358;WS=13980340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr17	14005373	rs1017076	C	T	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=4;PP=512;SC=TTTTGTCGTTCTGGCCTTTAC;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=14005394;WS=14005363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	14005386	rs2108683	T	C	682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=5;SC=GCCTTTACAGTTGGGACTCCT;SOR=1.931;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=16;TCR=5;TR=21;WE=14005394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	14005439	rs2159132	G	A	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=8;PP=501;SC=TCGCAGCTCTGGTTGTAAGTA;SOR=0.990;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=12;TCR=8;TR=20;WE=14005447;WS=14005429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	14063389	rs7212977	G	T	151.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	14063394	rs78809149	A	C	151.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	14139565	rs4791563	T	C	145.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=5;PP=145;SC=ACGCTTTCAGTTCCAGGGTTA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=14139573;WS=14139555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	14139774	rs4791564	C	A	38.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.42;QD=19.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	14139891	rs62052131	A	C	196.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.35;QD=24.60;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	14140103	rs4792453	A	G	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=53.15;NF=0;NR=2;PP=23;SC=CACTCCCTCCATTCCTGAAGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=14140111;WS=14140093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	15207364	rs13961	T	G	1978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=28;PP=1621;SC=CATACTCGAGTGTGGCTTTGA;SOR=0.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=31;TCR=28;TR=59;WE=15207372;WS=15207354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	15215660	rs2286516	T	C	4604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=69;PP=2965;SC=CTTTGTTGAATTGATTCCACA;SOR=0.707;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=71;TCR=69;TR=140;WE=15215668;WS=15215650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr17	15222535	rs11387328	C	CA	162.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=231;SC=AACAATGTAACAAACATCAAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=15222543;WS=15222525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	15234232	rs2305959	G	A	1290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=0;PP=1080;SC=AACAGATGAAGTAAAACATAA;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=37;WE=15234240;WS=15234222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	15234895	rs7226363	C	T	1634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=33;PP=1260;ReadPosRankSum=1.709;SC=ACAACCTACACGTTCCATGAT;SOR=0.618;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=52;WE=15234903;WS=15234885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr17	15343524	rs71150251	C	CCTT	3732.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.324;NF=30;NR=60;PP=2967;ReadPosRankSum=-0.753;SC=CCCAACCCTACCTTCTTTCTT;SOR=0.973;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=37;TCR=72;TR=90;WE=15343538;WS=15343514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,119:0.98:121
chr17	15406123	rs71974269	CCTCT	C	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.65;QD=35.30;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	15449328	.	T	C	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=30;PP=879;SC=AGTTCAAATATTAATACACAT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=15449336;WS=15449318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	15492409	rs151442	T	C	177.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.49;QD=29.64;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	15492426	rs28445278	C	T	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.93;QD=31.06;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	15499737	rs762697	A	G	43.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.73;QD=21.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	15500031	rs3217025	GA	G	1205.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=46;PP=1821;SC=GGGGGAAAAGGAAAGGTTACA;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=46;WE=15500039;WS=15500021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	15620481	rs2530064	C	T	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.58;QD=32.86;SOR=5.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	15620647	rs61435333	G	A	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.81;QD=24.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	15620679	rs58734516	G	C	151.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.66;QD=30.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	15639050	.	G	GT	55.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=18.42;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	15640815	rs201215351	A	G	30.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=36.67;QD=15.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	15641449	rs113830160	A	G	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=4.520;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.23;MQRankSum=-8.140;QD=0.61;ReadPosRankSum=0.313;SOR=1.936;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,9:0.09:104
chr17	15641457	.	T	C	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.217;ClippingRankSum=0.000;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=4.569;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQRankSum=-7.718;QD=0.90;ReadPosRankSum=1.682;SOR=1.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,9:0.10:94
chr17	15641459	.	G	T	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.124;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=4.596;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=-7.498;QD=1.02;ReadPosRankSum=1.771;SOR=1.928;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,9:0.10:89
chr17	15641462	rs112677849	A	G	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=4.601;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.02;MQRankSum=-7.132;QD=1.34;ReadPosRankSum=1.718;SOR=2.010;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,9:0.11:81
chr17	15641472	rs73978521	G	A	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=7.216;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQRankSum=-6.492;QD=2.22;ReadPosRankSum=2.300;SOR=2.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,9:0.13:68
chr17	15643382	rs11429009	A	AC	3031.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.84;MQRankSum=1.218;QD=22.62;ReadPosRankSum=0.311;SOR=0.603;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:5,129:0.96:134
chr17	15644392	rs7222367	T	C	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=2;PP=352;SC=GTGGCCTCAGTCCTCCTAGGT;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=15644400;WS=15644382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	15668330	rs2955833	G	C	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=29;PP=1414;SC=TGCTTTTGGGGTGGAATTCCT;SOR=1.067;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=24;TCR=29;TR=53;WE=15668338;WS=15668320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	15668720	rs935147	C	G	1255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.72;QD=34.88;SOR=7.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	15668775	rs1814454	A	G	1733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=32;PP=1671;SC=TCTCTCATTCACTAGAACCAC;SOR=1.503;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=43;TCR=32;TR=75;WE=15668783;WS=15668765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	15690210	rs376068178	AC	A	92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.02;QD=23.00;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	15884227	rs2286796	A	G	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=438;SC=CTGAAGACAAAGACAAAAAAC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=15884235;WS=15884217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	15884561	rs10491104	C	T	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=491;SC=CAAATTGCACCGAGAAGAACT;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=15884569;WS=15884551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	15903602	rs758853	C	A	152.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=77;SC=GCGCGGTAGCCTTTGTGAGCG;SOR=1.329;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=15903610;WS=15903592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	15905190	rs3760298	A	G	1242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=3;PP=1002;SC=TGCATCTACTATATGTTTCAT;SOR=4.351;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=36;WE=15905198;WS=15905180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	15909728	rs3760297	A	G	179.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=1;PP=91;SC=CCATCTCAACAGAAGGAAGAA;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=5;WE=15909736;WS=15909718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	15928222	rs11078324	T	C	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=295;SC=GGATGTTAATTCACCTACATT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=15928230;WS=15928212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	15928584	rs2301652	T	G	965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=30;PP=813;SC=CAGCAGATGGTCCTAGATCCT;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=15928592;WS=15928574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	15928600	rs2301651	G	C	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=22;PP=640;SC=ATCCTCCTTGGTCCCCAGTCT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=15928608;WS=15928590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	15930087	rs35168566	G	A	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=398;SC=GATTTGTGAAGTGGTATGTAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=15930095;WS=15930077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	15943910	rs1075901	T	C	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=18;PP=548;SC=TTTTTATTTTTCATGATCTCA;SOR=1.143;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=12;TCR=18;TR=29;WE=15943918;WS=15943900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	15950198	rs1079533	G	A	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=1;PP=949;SC=TTACAGGAGAGGCAACACTGG;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=33;WE=15950206;WS=15950188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	15961951	rs2157991	A	G	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=18;PP=528;SC=AACTAATCCCAGGAAAAGTTT;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=15961959;WS=15961941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	15961993	rs2157990	T	A	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=264;ReadPosRankSum=1.679;SC=CCTGTAGCATTTTTTCAATTC;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=11;WE=15962001;WS=15961983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr17	15968143	rs2285583	T	C	2093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=3;PP=1564;ReadPosRankSum=1.090;SC=AATGTAAACATGATGGTTCTA;SOR=4.143;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=58;TCR=3;TR=60;WE=15968151;WS=15968133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr17	15973748	.	C	G	3606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=46;PP=2670;SC=AGGCATTCCACGGGATAGTTT;SOR=1.009;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=109;TCF=62;TCR=47;TR=108;WE=15973756;WS=15973738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	15973844	rs12942295	A	T	2876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=59;PP=2191;SC=TGTGCCCTAAAGGGAAAGAAA;SOR=1.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=29;TCR=59;TR=88;WE=15973852;WS=15973834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	15974996	.	G	A	1462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=38;PP=1134;SC=AAAGAATTCAGGAAACATTAA;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=38;WE=15975004;WS=15974986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	15977005	rs11078330	A	T	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=133;SC=CTTAACCTACAATAAAATATG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=15977013;WS=15976995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	16005187	rs2285580	T	C	151.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=121;SC=AGAAACCATGTTTGAAAGTAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=16005195;WS=16005177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	16011493	rs35417050	CA	C	112.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=14.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	16022883	rs76010143	T	C	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=27;PP=937;SC=TATATCTCTTTATCTGACATA;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=30;WE=16022891;WS=16022873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	16024701	.	C	CA	235	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=12;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=16;MQ=61.68;NF=0;NR=13;PP=235;QD=18.5384615385;SC=ATCTCTCACTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=13;WE=16024709;WS=16024691;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,13:0.65:20
chr17	16041636	rs2875265	T	C	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=359;SC=TGGTGGCTCATGCCTGTAATC;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=16041644;WS=16041626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	16046845	rs2285579	A	T	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=570;SC=TACATACAAAAAAACCCTTAG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=16046853;WS=16046835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	16049626	rs11078333	A	T	910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.30;SOR=7.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	16052606	rs71299857	C	CATATAT,CATAT,CAT	402.73	.	AC=2,0,0;AF=1.00,0.00,0.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=4,4;NR=1,1;PP=106,76;SC=AGATTTAAGTCATATATATAT;SOR=3.611;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=5,5;WE=16052614;WS=16052596;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.79:14
chr17	16054930	.	A	AGTCTTGATGTTCTCATGGTACACCTTGGTATCTGATGG	108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.519;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.94;ReadPosRankSum=0.657;SOR=1.013;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,7:0.12:56
chr17	16185248	rs3785626	T	G	219.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=149;SC=ATGCAACCTGTAAGACCCATC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=16185256;WS=16185238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	16221271	rs56228407	A	AC	288.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=7;PP=335;SC=CCTGCCCCAGACCCCTGTCTC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=9;WE=16221279;WS=16221261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	16221319	rs9890539	T	C	52.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=37;SC=TAACTGAAGGTTTTTCACAGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=16221327;WS=16221309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	16229232	rs15739	A	G	866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=19;PP=662;ReadPosRankSum=0.806;SC=GGGTTTTCAGATCCAAGGAAC;SOR=1.536;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=28;WE=16229240;WS=16229222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,30:0.94:32
chr17	16248083	rs9907546	T	A	1310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.61;SOR=3.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	16251859	rs2286666	A	G	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=7;PP=849;SC=GCATGCTAACAGTTGGGTGGG;SOR=2.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=40;WE=16251867;WS=16251849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	16256240	rs3095172	C	A	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=314;SC=AGGCTCAGAGCTGAAAGGCGC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=16256248;WS=16256233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	16285927	rs116070441	A	T	341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=5;PP=212;SC=CAGTCATGGCATTCGCAGTGC;SOR=0.859;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=16285935;WS=16285917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	16323589	rs4273076	C	A	2326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=41;PP=1310;SC=GGATCCAAGGCTAGGCATCCT;SOR=2.342;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=11;TCR=41;TR=52;WE=16323597;WS=16323579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	16323608	rs68189233	ATAGT	A	2029.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=31;PP=1649;SC=CTGTGAGCTGATAGTTAGGTG;SOR=2.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=34;WE=16323619;WS=16323598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	16344509	rs141888599	G	T	2449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=35;PP=2158;SC=AGCTGATCTTGTTAAAACTCG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=35;TCR=35;TR=70;WE=16344517;WS=16344499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	16527795	rs8065506	C	A	1449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=36;PP=1106;SC=TTCGTGTAGCCTTCTTGGTTG;SOR=2.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=46;WE=16527803;WS=16527785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	16537207	rs16959888	C	T	2227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=27;PP=1738;ReadPosRankSum=-0.747;SC=TTTCTCTCACCGTCACCCATG;SOR=0.399;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=40;TCR=27;TR=66;WE=16537215;WS=16537197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr17	16593798	rs2349265	C	T	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=11;PP=656;SC=AGACCCCTAGCGTCGGGAGCC;SOR=1.220;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=28;WE=16593806;WS=16593788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	16734869	.	A	G	45	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=54.55;NF=2;NR=3;PP=45;QD=15.9542425094;SC=GGGCCAGCTCATGCTCGTAAC;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=5;WE=16734877;WS=16734845;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
chr17	16836300	rs11650590	C	T	2144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=13;PP=1788;SC=CTCCAATTCTCACTCACTCTG;SOR=2.602;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=53;TCR=13;TR=66;WE=16836308;WS=16836290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	16836425	rs3751987	G	A	2867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=61;PP=2185;SC=CCCTGTGCTCGTCTCAGGTGG;SOR=1.536;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=29;TCR=61;TR=90;WE=16836433;WS=16836415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr17	16842912	rs11078355	A	G	2140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=37;PP=1695;SC=TGCCAAGGCCACTGTCTGGGA;SOR=0.747;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=37;TCR=37;TR=74;WE=16842920;WS=16842902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	16843171	rs11652811	A	G	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=461;SC=GGTAGGGGTGACGGTGTGGGC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=16843179;WS=16843161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	16843992	rs17793572	G	A	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=481;SC=CTGGATCCTGGAGGAAGTTGA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=16844000;WS=16843982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	16844863	rs11654431	C	A	1560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=40;PP=1247;SC=TCGTGCCGGGCACTTCCCCTA;SOR=4.047;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=45;WE=16844884;WS=16844853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	16844876	rs58928848	G	A	1191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=33;PP=944;SC=TTCCCCTACAGCACCCCCTTC;SOR=5.084;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=35;WE=16844884;WS=16844853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	16852027	rs2274892	T	G	359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=303;SC=CGTGACACCATGCAGGTTTGC;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=16852035;WS=16852017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	16960911	rs7223686	A	G	5016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=50;PP=2965;SC=TACGCTGTTCATCACTGTTAC;SOR=1.775;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=170;TCF=120;TCR=50;TR=170;WE=16960919;WS=16960901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr17	16960978	rs6502557	G	A	6676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=142;PP=2965;SC=GAAATGAAACGTGGAGCTCAC;SOR=1.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=210;TCF=68;TCR=142;TR=210;WE=16960986;WS=16960968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr17	16978834	rs4078062	G	A	346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=288;SC=TCTCCACCCCGGATGCTGCAG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=16978842;WS=16978824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	17030331	rs74521076	C	T	269.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=7;PP=191;SC=CTGAGCACAGCAGAAATCAGG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=17030339;WS=17030321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	17035036	rs2271520	A	G	1245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=28;PP=945;SC=GGTTTGCCAGATGGCATCCCC;SOR=1.845;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=11;TCR=28;TR=39;WE=17035044;WS=17035026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	17039561	rs3833098	CCAG	C	1706.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=24;PP=1363;SC=GTGGCTGTTACCAGCAGCAGC;SOR=1.721;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=28;WE=17039571;WS=17039551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	17046145	rs77888743	C	T	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=9;PP=473;SC=GCACCCCATGCGCCAAGTCCC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=20;WE=17046153;WS=17046135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	17046736	rs6502563	T	G	1816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=0;PP=1605;SC=CTTGCTATGGTGGCTAGGCAG;SOR=7.978;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=53;WE=17046744;WS=17046726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	17050573	rs3744134	G	A	2353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=25;PP=1813;SC=CCGCCGTGGCGTGGCAGGCAT;SOR=1.580;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=76;TCF=50;TCR=26;TR=75;WE=17050581;WS=17050563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	17064775	rs5819603	G	GC	1689.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=28;PP=1594;SC=CTGAGCAGGGGTGTCTCCCAG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=35;WE=17064783;WS=17064765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	17067385	rs117993900	C	G	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=3;PP=1017;ReadPosRankSum=0.650;SC=CTGGGAGGCCCGAGTGTTACT;SOR=3.352;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=43;WE=17067393;WS=17067375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr17	17069105	rs3744131	G	A	6547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=142;PP=2965;SC=TCAAAGACGTGACCGTGAGGC;SOR=1.879;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=206;TCF=62;TCR=144;TR=204;WE=17069113;WS=17069095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr17	17079636	rs55784627	C	T	1818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=12;PP=1423;SC=GGCTGCCCTGCTCACTGGTGA;SOR=2.507;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=56;WE=17079644;WS=17079626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	17109476	.	AGCGCCTC	A	1765.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.604;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.130;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.305;NF=9;NR=19;PP=1735;ReadPosRankSum=0.788;SC=CGGGAAGAACAGCGCCTCGCG;SOR=1.086;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=28;WE=17109490;WS=17109466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr17	17118442	rs34235236	T	C	2583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=20;PP=2094;SC=GGGCAGGCGTTAGCGCGGGGC;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=54;TCR=20;TR=74;WE=17118450;WS=17118432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	17120344	rs41424546	C	T	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=3;PP=562;SC=CAGGCCAATACTGCCCTGCGC;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=17120352;WS=17120334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	17122286	rs8065572	C	T	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=451;SC=CAGCCCATGACTGGCTCTCCT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=17122294;WS=17122283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	17124625	rs41400246	C	T	4499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=108;NR=34;PP=2965;SC=CCCCACCTAGCTGGGGAACAG;SOR=2.255;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=108;TCR=34;TR=142;WE=17124633;WS=17124615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr17	17129431	rs41525346	A	G	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=20;PP=1091;SC=GAGCCCACCCAGAGCACCTGG;SOR=1.036;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=30;TCR=20;TR=50;WE=17129439;WS=17129421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	17150952	rs2294155	A	G	570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=484;SC=CACTGTTCACAAGGGTGCTAT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=17150960;WS=17150942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	17152363	rs11336908	GA	G	644	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=20;PP=354;ReadPosRankSum=0.167;SC=TCTGCAGAAAGAAAAAAAAAA;SOR=0.481;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=44;TCF=13;TCR=31;TR=30;WE=17152372;WS=17152353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,34:0.89:38
chr17	17158343	rs117692484	T	A	1041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=27;PP=865;SC=CGGCCAGGCGTGGTGGCTCAT;SOR=2.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=33;WE=17158351;WS=17158333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	17165012	rs139813720	GA	G	659.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=10;PP=387;SC=TGTCTCTAGGGAAAAAAAAAA;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=26;WE=17165021;WS=17165002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	17168053	rs111722797	A	AT	1531.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=8;PP=1711;SC=CCACAAACCTATGGGAGCACT;SOR=2.780;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=37;WE=17168061;WS=17168043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	17168316	rs7219012	A	T	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=13;PP=381;SC=ATTGATATTAAATCATCACTT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=17168324;WS=17168306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	17179209	rs9892352	A	T	273.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=194;SC=TGTGCCAAGAATGTGCCACTG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=17179217;WS=17179205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	17179299	rs4985760	C	G	1486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=4;PP=1176;SC=AGGAAGTGCACAGTGTTCCAT;SOR=3.467;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=41;WE=17179307;WS=17179289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	17183862	rs374649804	AC	A	616.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.45;QD=41.12;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	17183866	rs369078262	AG	A	616.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.84;QD=44.05;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	17184399	rs2012954	A	C	2951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=71;NR=24;PP=2194;SC=GATCCAGGCCAGTTCCCGGTA;SOR=2.278;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=71;TCR=24;TR=95;WE=17184407;WS=17184389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr17	17326363	rs35590625	G	A	3897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=44;PP=2965;SC=AGCTTTGAGTGTTCTTCGAAG;SOR=1.416;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=82;TCR=44;TR=126;WE=17326371;WS=17326353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr17	17326604	rs7225976	CA	TG	3574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=32;PP=2947;SC=CATGATGGGGCAAATGCCAGA;SOR=0.718;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=71;TCF=36;TCR=35;TR=63;WE=17326613;WS=17326594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr17	17409401	rs3816511	G	A	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=10;PP=806;SC=TACCATGGCCGCTCTGACCTG;SOR=1.473;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=31;WE=17409409;WS=17409391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	17409560	rs7946	C	T	2615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=45;PP=2042;SC=AGGAGAGCCACTATGTAGGTG;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=40;TCR=45;TR=85;WE=17409568;WS=17409550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr17	17409709	rs1918249	T	A	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=446;SC=GCCGTGACCCTGGCCCTCCGG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=17409717;WS=17409699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	17412032	rs4646407	G	C	1854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=19;PP=1599;SC=CCTCTGACCCGCCGGGGGAGC;SOR=1.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=59;WE=17412040;WS=17412022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	17415893	rs35277795	C	T	4438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=91;PP=2965;SC=GTCCCAGGAGCGCGAGGCCCA;SOR=1.355;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=145;TCF=54;TCR=91;TR=144;WE=17415901;WS=17415883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr17	17425631	rs897453	C	T	2842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=12;PP=2489;SC=AGGATGGTGACGCTTAGAGAG;SOR=3.586;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=78;TCR=12;TR=90;WE=17425639;WS=17425621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr17	17480195	rs2124344	A	G	2502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=26;PP=2055;SC=CCAAGCAGTGAGATACTCCCG;SOR=1.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=53;TCR=26;TR=79;WE=17480203;WS=17480185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	17682484	rs1006656	G	A	1146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=26;PP=892;SC=AATATTTTCCGTGGTGAGGAA;SOR=2.242;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=17682492;WS=17682474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	17697093	rs371983878	CCAG	C	170.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=5.436;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.84;ReadPosRankSum=0.412;SOR=1.635;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,12:0.13:93
chr17	17698254	rs8067439	G	A	5011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=78;NR=71;PP=2965;SC=CTGGGGAGCCGGAGGCCCTGC;SOR=0.889;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=150;TCF=78;TCR=72;TR=149;WE=17698262;WS=17698244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr17	17705424	rs55658055	A	G	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.025;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;PP=938;ReadPosRankSum=-0.736;SC=TCACTCTTCCAAGGGCCTTCT;SOR=1.009;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=45;WE=17705432;WS=17705414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr17	17707105	rs3818717	T	C	3244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=67;NR=34;PP=2417;SC=GGGCCACCATTGGGTGCTGCC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=67;TCR=34;TR=101;WE=17707113;WS=17707095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr17	17715317	rs2297508	C	G	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=23;PP=1318;SC=GGAAGCCTTTCCCTAGGTGCT;SOR=1.034;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=27;TCR=23;TR=50;WE=17715325;WS=17715307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	17719503	rs7501788	G	T	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	17726965	rs12936927	C	T	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=17;PP=371;SC=AGCGCTGCGGCGCGCCCGCCC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=17726973;WS=17726955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	17740164	rs60282872	GC	G	782.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.03;SOR=4.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	17750907	rs7501812	G	A	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=398;SC=CACGGGGTGCGAGCGGGGACC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=17750915;WS=17750897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	17770355	rs11657074	G	A	137.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=168;SC=GTCCCACCTGGGGGCTAGGGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=17770363;WS=17770345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	17772622	rs34879782	G	GA	462.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=1.114;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.90;MQRankSum=1.919;QD=7.84;ReadPosRankSum=-1.428;SOR=0.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,32:0.54:59
chr17	17774118	rs9907287	C	T	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.782;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=29;PP=855;ReadPosRankSum=0.102;SC=CCTCAAGCCCCGCACTGAGCC;SOR=3.294;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=35;WE=17774126;WS=17774108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr17	17900990	rs8071238	T	C	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=325;SC=TCTCCTGCTGTAGGCCCTCCC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=17900998;WS=17900980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	17948475	rs2955355	G	A	848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=11;PP=662;SC=TGGACACGGGGAACTCTTACC;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=28;WE=17948483;WS=17948465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	17997209	rs2230316	G	A	1833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=28;PP=1462;SC=AATCGGCCTCGTCCAAAGGAG;SOR=0.726;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=29;TCR=28;TR=57;WE=17997217;WS=17997199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	18003671	rs2272570	T	G	1729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=3;PP=1387;SC=GGGGTACTCTTCCTAGGTCTC;SOR=5.018;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=45;TCR=3;TR=48;WE=18003679;WS=18003661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	18003845	rs854813	C	T	5188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=81;PP=2965;SC=TGTGACCCCTCGGTCAGCAGT;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=156;TCF=75;TCR=81;TR=156;WE=18003853;WS=18003835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr17	18041507	rs2280777	C	T	3722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=87;NR=28;PP=2885;SC=CCTCATCTCACTGAAGCCTTA;SOR=2.264;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=87;TCR=28;TR=115;WE=18041515;WS=18041497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr17	18042276	rs2075658	A	C	1214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=27;PP=1000;SC=GTCGGCCTGGACGCTGGTGCT;SOR=1.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=39;WE=18042284;WS=18042266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	18042527	rs854783	A	G	1104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=11;PP=776;SC=TGACATCACTATGGTCACCCT;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=31;WE=18042535;WS=18042517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	18042976	rs854782	C	A	1185.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=47;PP=1185;SC=ATGTCCCCACCCCCACACCCA;SOR=7.523;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=2;TCR=47;TR=49;WE=18042984;WS=18042966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	18043766	rs854780	C	G	4447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=46;PP=2965;SC=CCTGCTCTCTCTTCCTCCTCA;SOR=1.626;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=141;TCF=95;TCR=46;TR=139;WE=18043774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr17	18043817	rs2072652	C	T	4820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=82;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.539;SC=TTCCCTGCCCCGACCCCTGCC;SOR=0.811;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=159;TCF=76;TCR=83;TR=156;WE=18043825;WS=18043807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,159:0.99:161
chr17	18044592	rs2075659	C	T	282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=210;SC=AAGGCTACCACATGCTAACTG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=18044600;WS=18044582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	18045098	rs2072653	G	A	3458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.416;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=60;PP=2778;ReadPosRankSum=-0.729;SC=AGTCCTGCCCGACAGTCAGCC;SOR=0.547;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=109;TCF=49;TCR=60;TR=108;WE=18045106;WS=18045088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,111:0.99:112
chr17	18046058	rs854778	A	C	2335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=15;PP=1868;SC=CCTCCCCACTACCCCAACCCA;SOR=2.439;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=52;TCR=15;TR=67;WE=18046066;WS=18046048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	18046898	rs854777	T	C	300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=200;SC=AGAGTGGAGGTGCCAGGTGGA;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=18046906;WS=18046888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	18047189	rs2272571	G	A	3808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=55;PP=2965;SC=CACAGGCCTCGGGCTGGCCCA;SOR=0.779;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=59;TCR=55;TR=114;WE=18047197;WS=18047179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr17	18047671	rs11421905	G	GC	497.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=2;PP=590;SC=CCCCTCACCAGCCTCAGTTTC;SOR=3.126;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=14;WE=18047679;WS=18047661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	18047772	rs11421904	T	TC	2165.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=21;PP=2142;SC=TGCCTGTCAGTCCAGCTCTGT;SOR=1.532;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=30;TCR=21;TR=51;WE=18047780;WS=18047762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	18051975	rs854774	T	C	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=25;PP=851;SC=ATAGGGTCCATTCTGTTCATG;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=18051983;WS=18051965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	18052466	rs4303606	A	G	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=5;PP=960;SC=GGGTGCAGAAAAAAATTTGGG;SOR=3.258;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=34;WE=18052474;WS=18052456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	18052867	rs2955379	T	C	1708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=52;PP=1269;SC=ATAGCCTCTTTGACCCTGTGC;SOR=3.877;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=4;TCR=52;TR=56;WE=18052875;WS=18052857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	18054692	rs2056841	G	A	5725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=78;PP=2965;ReadPosRankSum=1.481;SC=TGTTCCCACCGCGCCCCTTGC;SOR=0.300;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=94;TCR=79;TR=171;WE=18054700;WS=18054682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,177:0.99:178
chr17	18054868	rs854773	G	T	2402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=64;PP=2048;SC=CCCCCAGCCCGCCAGCCCCCT;SOR=4.205;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=7;TCR=65;TR=71;WE=18054876;WS=18054858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr17	18057272	rs712271	A	G	1667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=36;PP=1331;SC=GGCTGAAGCGAGCAGAGGAGG;SOR=2.348;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=48;WE=18057280;WS=18057262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	18059454	rs2242595	G	A	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=3;PP=566;SC=AGCACAATAGGTGGAAGGAGG;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=18059462;WS=18059444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	18069628	rs72827432	G	T	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=361;SC=GCACACATGTGTGTGCACACA;SOR=3.126;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=13;WE=18069636;WS=18069618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	18077175	rs854800	T	C	2306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=61;PP=1689;SC=GCTACCCCTATGTGGAGATTG;SOR=2.419;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=19;TCR=61;TR=80;WE=18077183;WS=18077165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	18087299	rs1064629	C	T	1927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=19;PP=1528;SC=GAGGCGCTGCCGGCGCCCCTG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=42;TCR=19;TR=61;WE=18087307;WS=18087289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	18133495	rs2290502	G	A	597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=14;PP=413;SC=GGGCTTCTGCGGAGGTTGGCG;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=18133503;WS=18133485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	18135753	rs2290503	T	C	2025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=7;PP=1750;SC=TTGGGTGTCTTCCTCACTGTG;SOR=3.841;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=54;TCR=7;TR=61;WE=18135761;WS=18135743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	18137141	rs2290505	A	G	1820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=26;PP=1397;SC=GGTGGCTGCCAGCGACATAGC;SOR=1.284;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=40;TCR=26;TR=66;WE=18137149;WS=18137131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	18139896	rs2746028	G	T	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=2;PP=456;SC=AACTCGGGTAGCCCTGACATC;SOR=4.615;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=18139904;WS=18139886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	18149854	rs2856289	A	G	4055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=70;PP=2965;SC=GCTGGGTCTGAGCCCCACCAC;SOR=0.998;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=53;TCR=70;TR=123;WE=18149862;WS=18149844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr17	18156541	rs2071241	A	G	1283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=4;PP=1080;SC=ACAGACCACAAGGTGGGCTCT;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=37;WE=18156549;WS=18156531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	18164644	rs72831943	T	A	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=282;SC=CGTCTTATTTTTAGTCTGGGG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=18164652;WS=18164634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	18167397	rs3889402	G	T	877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=12;PP=752;SC=TGCGCAGGACGCAGCTTGAGT;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=14;TCR=12;TR=26;WE=18167405;WS=18167387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	18167505	rs2605143	T	C	1290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=13;PP=1051;SC=CGCTGGCTGCTTCTGTCAACT;SOR=1.552;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=38;WE=18167513;WS=18167495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	18167684	rs12603700	G	A	3998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=56;PP=2965;SC=CCCCTGGAGGGGCTGGCGGGG;SOR=0.828;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=69;TCR=57;TR=124;WE=18167692;WS=18167674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr17	18188884	rs2294914	C	T	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=315;SC=AACAGCTCCACCCGGGTGGCG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=18188892;WS=18188874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	18194362	rs6502645	C	T	1296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=27;PP=1027;SC=AAGAGGAGTACGAAACTCCCC;SOR=1.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=41;WE=18194370;WS=18194352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	18208334	rs7225932	C	A	2059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=11;PP=1567;SC=CTGCAGAGGACCTCATCCGTG;SOR=3.091;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=51;TCR=11;TR=62;WE=18208342;WS=18208324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	18220770	rs1563632	G	A	2559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=38;PP=1966;SC=GGAGCCATCCGCTTCCAGGCA;SOR=0.922;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=49;TCR=38;TR=87;WE=18220778;WS=18220760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr17	18252010	rs3866955	T	C	1136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=29;PP=786;ReadPosRankSum=-0.743;SC=GGGTTTTGGCTGGGAGAGGTG;SOR=1.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=34;WE=18252018;WS=18252000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr17	18256979	rs2273026	C	T	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=629;SC=TGAAGATATTCACATACCTCT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=18256987;WS=18256969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	18259333	rs142013082	CAT	C	1365.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=25;PP=1228;SC=ATGGGAAAAACATGTGTAGCT;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=27;WE=18259342;WS=18259323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	18259415	rs12950117	A	G	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=2;PP=25;SC=TGCCCAGGCTAGAGTGCAGTG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=18259423;WS=18259405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	18284262	rs570145	G	A	2712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=58;PP=2128;SC=ATGCAAGCCAGCGCCGACCAG;SOR=1.636;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=85;TCF=26;TCR=59;TR=84;WE=18284270;WS=18284252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	18286916	rs112094897	A	AG	1568.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=21;PP=1663;SC=GCCCTCGGGCAGCGGCAGGGC;SOR=0.984;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=35;WE=18286946;WS=18286906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	18286922	rs111736884	A	AG	1761.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=27;PP=1338;SC=GGGCAGCGGCAGGGCGGCAGG;SOR=1.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=41;WE=18286946;WS=18286906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	18286930	rs200680358	A	AG	1571.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=23;PP=1192;SC=GCAGGGCGGCAGGGCGGCAGG;SOR=1.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=35;WE=18286946;WS=18286906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	18286938	rs145486982	A	AG	1355.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=21;PP=1223;SC=GCAGGGCGGCAGGGCGGGAGG;SOR=1.688;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=18286946;WS=18286906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	18291432	rs140944304	TCACAGC	T	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.87;QD=40.34;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	18291456	rs578670	C	G	360.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.19;QD=45.10;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	18291470	rs586214	C	G	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.45;QD=37.14;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	18291544	rs586322	A	G	1570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=15;PP=928;SC=TTCTGTGTCCATCTTCCTCTC;SOR=2.649;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=46;TCF=31;TCR=15;TR=45;WE=18291552;WS=18291534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	18291559	rs9890369	T	C	1718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.995;NF=31;NR=20;PP=1219;ReadPosRankSum=1.221;SC=CCTCTCCTCATTGACTCTGCA;SOR=0.800;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=32;TCR=20;TR=51;WE=18291567;WS=18291549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr17	18291618	rs586757	C	T	1261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.979;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.809;NF=16;NR=28;PP=1016;ReadPosRankSum=0.540;SC=AAATGAAGTACCAAGAAACTA;SOR=0.982;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=44;WE=18291626;WS=18291608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr17	18314830	rs62074236	T	C	352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.72;QD=29.40;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	18314913	rs62074237	T	C	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.21;MQRankSum=0.850;QD=16.00;ReadPosRankSum=2.485;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,28:0.49:57
chr17	18314964	rs62074238	T	G	1633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.474;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.217;NF=53;NR=15;PP=1060;ReadPosRankSum=-3.245;SC=CCCAATCGTCTTCTTTCCCAG;SOR=1.358;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=141;TCF=101;TCR=40;TR=68;WE=18314972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,64:0.48:134
chr17	18315107	rs113907775	C	CCT	837.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=39.363;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.97;MQRankSum=-4.992;QD=11.80;ReadPosRankSum=-0.120;SOR=5.674;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,25:0.35:71
chr17	18315147	rs377082374	C	G	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=25.292;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.42;MQRankSum=-6.265;QD=3.28;ReadPosRankSum=0.892;SOR=4.488;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,21:0.20:106
chr17	18380065	rs1682221	C	G	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.209;NF=13;NR=4;PP=370;ReadPosRankSum=-0.930;SC=CATTGAATAACAGCCAAGTTG;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=17;WE=18380073;WS=18380055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr17	18380154	rs1682220	A	G	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.201;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.767;NF=8;NR=15;PP=1133;ReadPosRankSum=-1.121;SC=TGGTGGCCACAGAGGCGGTGG;SOR=0.878;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=54;TCF=28;TCR=26;TR=23;WE=18380172;WS=18380144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr17	18380163	rs376412531	GGA	G	516.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.431;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.727;NF=1;NR=16;PP=1137;ReadPosRankSum=-1.016;SC=CAGAGGCGGTGGAGAGATGGC;SOR=2.561;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=17;WE=18380172;WS=18380144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr17	18380260	.	C	A	23	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=52.37;NF=0;NR=4;PP=23;QD=14.4428031368;SC=GGACACAGTTCTGGGGCTCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=4;WE=18380268;WS=18380250;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,4:0.22:18
chr17	18394431	rs140402450	T	C	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.96;MQRankSum=-1.260;QD=2.36;ReadPosRankSum=0.443;SOR=0.138;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr17	18394552	rs201945348	G	A	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.45;MQRankSum=-3.550;QD=9.42;ReadPosRankSum=0.561;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr17	18395647	.	G	T	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-5.323;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.261;NF=36;NR=0;PP=641;ReadPosRankSum=-0.928;SC=TGGAACCAAGGAAAGATATCG;SOR=0.468;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=105;TCF=103;TCR=2;TR=36;WE=18395655;WS=18395637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,16:0.19:83
chr17	18396131	rs138238232	T	C	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=11.641;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.68;MQRankSum=-0.515;QD=0.89;ReadPosRankSum=0.511;SOR=1.875;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,5:0.13:38
chr17	18397711	rs75054442	G	A	86.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.91;MQRankSum=1.465;QD=10.85;ReadPosRankSum=1.699;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr17	18498059	rs66528329	C	CA	437.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.62;QD=43.77;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	18498497	rs59933375	G	GA	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.162;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.020;NF=4;NR=33;PP=615;ReadPosRankSum=1.007;SC=CTGCAGGCCTGAAAAAAAAAA;SOR=1.765;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=49;TCF=8;TCR=41;TR=37;WE=18498505;WS=18498487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,43:0.86:50
chr17	18528623	rs34925025	A	G	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=24;PP=1053;SC=AGAAGCCCGAAGACCACTGGT;SOR=0.922;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=44;TCF=20;TCR=24;TR=43;WE=18528631;WS=18528613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	18541296	rs2386412	G	A	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.84;QD=28.14;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	18541775	rs9902086	A	G	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=26;PP=911;SC=GACATGGGGCAACCCCGCAGA;SOR=1.923;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=38;WE=18541783;WS=18541765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	18541852	.	ACCCAC	A	2164.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.83;QD=63.67;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	18541857	.	C	CGATGGTG	2164.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.83;QD=63.67;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	18541868	rs55807264	A	G	2614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=11;PP=1726;SC=CCAGGCCAAAACCATGGGCGC;SOR=2.904;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=52;TCR=11;TR=63;WE=18541876;WS=18541842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	18542074	rs9908833	G	A	1913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=54;PP=1700;SC=GTGGCCCGTGGATGCTGGGTC;SOR=3.113;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=10;TCR=54;TR=64;WE=18542082;WS=18542064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	18542519	rs74452761	T	G	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.00;MQRankSum=0.708;QD=12.81;ReadPosRankSum=0.507;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr17	18544520	rs201807927	G	A	662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.36;QD=33.14;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	18565143	rs55636053	T	C	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.318;NF=14;NR=0;PP=204;ReadPosRankSum=-2.375;SC=TAGATGCATATAGAATTGGTC;SOR=0.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=14;WE=18565151;WS=18565133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,8:0.17:48
chr17	18635461	rs113160376	G	A	3341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-1.324;NF=36;NR=80;PP=2959;ReadPosRankSum=-0.225;SC=AGTTGTGAACGGCACCCCCTT;SOR=1.524;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=37;TCR=81;TR=116;WE=18635469;WS=18635451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,108:0.98:110
chr17	18647581	.	C	G	3033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.98;QD=32.98;SOR=1.154;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	18814661	rs55971101	T	TTA	1152.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=28;PP=1470;SC=CGTTTTTTTTTAGTTGGCAAA;SOR=3.477;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=18814669;WS=18814651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	18831915	.	T	G	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.540;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.78;ReadPosRankSum=0.325;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr17	18855611	rs2076562	T	C	2929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=45;PP=2134;SC=TTGCTCTGAATGTGGCCGTGG;SOR=0.815;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=54;TCR=45;TR=99;WE=18855619;WS=18855601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	18882991	rs2472714	T	A	1345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=28;PP=1012;SC=GAGATTCTGTTTTGGGAACCA;SOR=1.508;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=43;WE=18882999;WS=18882981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	18916893	rs11652575	T	C	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=390;SC=GCCCAATGAGTATGGGGACTG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=18916901;WS=18916883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	18918258	rs28526726	C	G	531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=3;PP=394;SC=CTTGGAGGAGCATGCAAATGG;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=18918266;WS=18918248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	18918530	rs9891254	A	G	212.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.9988;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=200;SC=GGTGGGGGCCAGTACGGGGGT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=9;WE=18918538;WS=18918520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	18923818	rs1624825	G	A	182.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=150;SC=GGGATCCCGAGGCCCCAAGAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=18923826;WS=18923808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	19213335	rs2296981	C	G	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=656;SC=CAGGTCTGCACTGCATTGACT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=19213343;WS=19213325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	19216917	rs3826405	T	C	2127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=32;PP=1585;SC=ACACCCAGCGTCCCAGCTGAA;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=30;TCR=32;TR=62;WE=19216925;WS=19216907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	19231898	rs7206963	T	C	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=2;PP=445;SC=AGTACCCTTTTGATGGCTGTC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=19231906;WS=19231888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	19232078	rs6587220	T	C	3022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=53;PP=2258;SC=GGAGCCACCGTACAATCTGTC;SOR=0.992;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=38;TCR=53;TR=91;WE=19232086;WS=19232068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr17	19233096	rs2296979	T	C	1824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=44;PP=1399;SC=GAGCCTGAAGTTTCTAATTCT;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=48;WE=19233104;WS=19233086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	19240972	rs11652712	G	A	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=7;PP=652;SC=GGCTTCCCGCGGAAGTTTCTC;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=27;WE=19240980;WS=19240962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	19247075	rs4924987	G	A	2216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=48;PP=1833;SC=TATGGGGGATGGGGGTAAGAG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=71;WE=19247083;WS=19247065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	19265797	rs10445411	C	T	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.99;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	19314611	rs739830	T	C	2753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=31;PP=2151;SC=CCTCACCTTCTACCTACCGCA;SOR=1.312;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=53;TCR=31;TR=84;WE=19314619;WS=19314601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr17	19314917	rs33912708	CT	C	333.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=6.864;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.35;ReadPosRankSum=0.442;SOR=0.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,22:0.88:25
chr17	19318031	rs1295330	A	G	3730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=52;PP=2965;SC=GGTGGGGAAGACATGGGAGGC;SOR=0.973;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=119;TCF=66;TCR=53;TR=118;WE=19318039;WS=19318021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr17	19319015	rs1295329	C	T	3105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=53;PP=2495;SC=CTCCCTGTCACAGGACGTAGC;SOR=0.936;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=98;TCF=45;TCR=53;TR=98;WE=19319023;WS=19319005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr17	19460790	.	A	G	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.917;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=7;PP=759;ReadPosRankSum=-0.759;SC=ATGTTTCAATATTAACAACTC;SOR=1.292;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=32;WE=19460798;WS=19460780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chr17	19646750	rs59102760	C	T	5528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.785;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=120;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.035;SC=CGTACACCACCTCCTCATAGT;SOR=1.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=53;TCR=121;TR=172;WE=19646758;WS=19646740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,178:0.99:180
chr17	19648219	rs56234923	T	C	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	19699358	rs192511	T	C	2089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=15;PP=1615;SC=AATCTATGTTTTACTATTACA;SOR=1.999;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=43;TCR=15;TR=58;WE=19699366;WS=19699348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	19699605	rs10587010	CAT	C	917.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.462;NF=0;NR=25;PP=1137;ReadPosRankSum=1.611;SC=TCTAAAGAGACATATATATAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=25;WE=19699614;WS=19699595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr17	19713740	rs150122	C	T	5522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=90;NR=86;PP=2965;SC=GCAGTCCCCACTGGCATATCA;SOR=0.773;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=176;TCF=90;TCR=86;TR=176;WE=19713748;WS=19713730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr17	19729495	rs157397	T	C	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=24;PP=794;SC=GGCTAAAAAATGCTTCTGTAA;SOR=0.780;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=21;TCR=24;TR=45;WE=19729503;WS=19729485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	19749952	rs140413803	CA	C	93.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=2.783;QD=3.91;ReadPosRankSum=-0.927;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr17	19999781	rs12942179	G	A	525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=478;SC=CTAGTATAAAGCCTATAAACC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=19999789;WS=19999774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	20000131	rs4925085	G	T	2081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=42;PP=1600;SC=AAAATGCACAGGGCCAGGCAG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=20;TCR=42;TR=62;WE=20000139;WS=20000121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	20059591	rs3833861	A	AC	503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=5;NR=11;PP=459;SC=CCGCAACCCCACCCCCCCTCC;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=16;WE=20059599;WS=20059581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	20297545	rs3874846	T	G	279.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=10.414;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.99;MQRankSum=-1.439;QD=25.43;ReadPosRankSum=-1.120;SOR=4.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr17	20305306	.	CAATAATAAT	C	1112.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.43;QD=39.74;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	20354704	rs56386443	T	C	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.01;QD=19.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	20354747	rs200108749	C	CCT	44.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.01;QD=22.35;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	20435963	.	T	TGA	998.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.55;QD=41.61;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	20768691	rs75640454	C	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=2.302;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQRankSum=-7.568;QD=1.21;ReadPosRankSum=1.381;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,11:0.14:80
chr17	20768692	rs4629022	A	G	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=2.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQRankSum=-8.430;QD=3.55;ReadPosRankSum=1.111;SOR=1.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,13:0.16:80
chr17	20768788	rs78365129	G	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=10.104;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.89;MQRankSum=-7.621;QD=1.12;ReadPosRankSum=-1.443;SOR=2.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,15:0.10:156
chr17	20768803	rs76135364	C	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=5.751;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.45;MQRankSum=-7.208;QD=1.28;ReadPosRankSum=2.369;SOR=1.456;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,15:0.10:147
chr17	20768816	rs73298040	C	T	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=2.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.09;MQRankSum=-6.909;QD=1.68;ReadPosRankSum=4.828;SOR=1.135;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,15:0.11:136
chr17	20768839	rs372665136	GA	G	375.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=1.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.08;MQRankSum=-6.403;QD=3.72;ReadPosRankSum=-0.438;SOR=0.372;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,16:0.16:101
chr17	20768850	rs114103783	G	T	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=1.513;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.95;MQRankSum=-6.443;QD=3.49;ReadPosRankSum=-1.594;SOR=0.333;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,16:0.15:106
chr17	20768867	rs9906896	A	C	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=12.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.55;MQRankSum=-7.387;QD=4.84;ReadPosRankSum=-0.469;SOR=0.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,13:0.17:75
chr17	20768928	.	AAT	A	207	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=29;MQ=51.21;NF=0;NR=5;PP=207;QD=45.6;SC=TCCAGAAAAAAATATGTGAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=5;WE=20768946;WS=20768918;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr17	21117837	rs4985988	T	C	171.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=7;PP=133;SC=CCCAGAGCACTGCGCGGAGGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=21117845;WS=21117827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	21147404	rs897926	A	G	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=0;PP=708;SC=TGGCCCTGCCACCTGCCTGCC;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=21147412;WS=21147394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	21156530	rs201190568	G	GC	247.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=5;PP=244;SC=GGATGGGGCAGCCTGCTCCAG;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=7;WE=21156538;WS=21156520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	21194658	.	T	TACAACACAAC	1255.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5021;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=4;PP=1699;SC=TACAATACAATACAACACAAC;SOR=3.528;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=14;WE=21194666;WS=21194648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	21194769	rs72840055	C	T	1811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.47;ReadPosRankSum=-0.337;SOR=0.800;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,49:0.45:110
chr17	21194769	.	CGA	TGT	1993	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=18;NR=15;PP=1993;QD=62.0141780261;SC=ACTGGCCTGTCGACAGTGCAG;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=55;TCR=45;TR=33;WE=21194793;WS=21194759;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:67,33:0.33:100
chr17	21194771	rs114473529	A	T	1892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.86;ReadPosRankSum=-0.601;SOR=0.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,46:0.43:106
chr17	21194785	rs72840057	T	C	1590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.660;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=1984;ReadPosRankSum=-0.901;SC=TGCAGGTGGCTGGCAATGGCC;SOR=0.950;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=93;TCF=41;TCR=52;TR=35;WE=21194793;WS=21194759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,41:0.41:101
chr17	21194820	rs66503560	G	A	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.410;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=21;PP=469;ReadPosRankSum=-0.975;SC=CCGGGCCCACGTGGGGACCTT;SOR=1.300;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=82;TCF=31;TCR=51;TR=31;WE=21194828;WS=21194810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,34:0.39:87
chr17	21194843	rs75693966	T	C	1299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=5.877;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.549;SOR=1.380;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,35:0.38:92
chr17	21194852	rs72840058	G	A	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=7.855;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.47;ReadPosRankSum=0.572;SOR=1.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,36:0.40:89
chr17	21194859	rs62056394	G	A	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=8.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.03;ReadPosRankSum=-0.463;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,34:0.41:82
chr17	21198972	rs2363221	T	C	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.19;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	21198972	.	TGGTGTC	CGGTGTC,CGGTGTT	366	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=16,11;NR=3,3;PP=76,366;QD=5.83006381827;SC=GATGCAGGCTTGGTGTCCCCA;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19,14;WE=21198986;WS=21198962;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:19
chr17	21198978	rs2363220	C	T	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.90;ReadPosRankSum=0.669;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr17	21199037	rs2885719	G	A	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.351;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=1690;ReadPosRankSum=1.003;SC=TGCGAGGAGCGTGGTCCCCAC;SOR=1.127;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=34;WE=21199059;WS=21199027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,33:0.67:49
chr17	21199051	rs56020453	T	C	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.484;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=634;ReadPosRankSum=-0.982;SC=TCCCCACCCATCCAGCCCATA;SOR=0.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=40;TCR=18;TR=19;WE=21199059;WS=21199027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,21:0.36:59
chr17	21199105	rs71291780	AGG	A	1586.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.204;HP=7;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=1382;ReadPosRankSum=-0.480;SC=GGCTTGGTGAAGGGGGGGCCA;SOR=0.706;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=62;TCF=25;TCR=37;TR=33;WE=21199119;WS=21199095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,44:0.61:72
chr17	21199111	rs55963016	G	A	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.068;HP=6;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=10;PP=1010;ReadPosRankSum=-0.273;SC=GTGAAGGGGGGGCCACATGAT;SOR=1.121;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=75;TCF=38;TCR=37;TR=29;WE=21199119;WS=21199095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,29:0.38:76
chr17	21199236	rs2363219	C	T	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.615;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=247;ReadPosRankSum=-1.865;SC=AAGGGTGGGACTCAAGGGGCT;SOR=1.627;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=15;WE=21199244;WS=21199226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr17	21199275	rs2363218	G	T	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=2.727;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.93;ReadPosRankSum=0.839;SOR=0.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr17	21199275	.	GTG	TTA	674	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=8;NR=7;PP=674;QD=48.4978583241;SC=CAGGGTCTCTGTGCAGAGCTT;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=43;TCF=25;TCR=18;TR=15;WE=21199285;WS=21199265;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr17	21199277	rs2363217	G	A	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=2.626;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.38;ReadPosRankSum=0.576;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,17:0.36:47
chr17	21199376	rs5819736	G	GT	520.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=8.171;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.04;ReadPosRankSum=-0.385;SOR=1.308;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,28:0.38:74
chr17	21199390	rs4997717	C	T	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=4.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.26;ReadPosRankSum=0.476;SOR=0.462;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,31:0.38:81
chr17	21199403	rs4997718	C	T	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=3.161;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.69;ReadPosRankSum=0.838;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,32:0.41:78
chr17	21199499	rs2885718	G	A	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=181;ReadPosRankSum=2.669;SC=ATCTTGCTTCGTCCTGCAGCA;SOR=0.165;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=10;WE=21199507;WS=21199489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr17	21201667	rs144438122	T	C	1256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.658;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=2;PP=1042;ReadPosRankSum=-0.698;SC=CTCATGGGAGTGCAGGGGACA;SOR=1.185;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=101;TCF=96;TCR=5;TR=47;WE=21201675;WS=21201657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,48:0.47:103
chr17	21201719	rs8076154	T	C	2540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=33;PP=2132;ReadPosRankSum=-1.334;SC=CTTCTCTCCATTCTAGGAAAA;SOR=0.679;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=199;TCF=136;TCR=63;TR=102;WE=21201727;WS=21201709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,101:0.50:203
chr17	21201851	rs8072386	A	G	2003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.674;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=64;PP=1584;ReadPosRankSum=0.532;SC=ACAGGGCTCAATGGAAGGAGT;SOR=1.149;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=154;TCF=36;TCR=118;TR=80;WE=21201859;WS=21201841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,80:0.51:158
chr17	21201890	rs8072401	A	G	1909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.91;ReadPosRankSum=0.522;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,50:0.50:101
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chr17	21202056	rs34676150	G	A	1165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=1.369;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.95;ReadPosRankSum=0.022;SOR=0.971;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,32:0.41:78
chr17	21202063	rs77850849	G	C	1275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=5.185;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.83;ReadPosRankSum=0.606;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,34:0.40:86
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chr17	21202078	rs35477472	G	A	1482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.623;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=4;PP=2952;ReadPosRankSum=-0.102;SC=AGGCGCCTCCGGGGCAGGAGG;SOR=1.238;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=94;TCF=81;TCR=13;TR=38;WE=21202086;WS=21202046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,39:0.42:93
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chr17	21202123	rs68151103	A	G	2450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.641;HP=3;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=12;PP=1181;ReadPosRankSum=0.016;SC=ACACTGGCCCATCTACTGCTG;SOR=0.918;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=154;TCF=125;TCR=29;TR=71;WE=21202131;WS=21202113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,74:0.48:155
chr17	21202191	rs33911218	C	A	3558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.513;HP=6;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=56;PP=2417;ReadPosRankSum=-0.934;SC=TCTCCACAGACCCCCCCGGAA;SOR=0.852;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=290;TCF=172;TCR=118;TR=143;WE=21202199;WS=21202181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,154:0.51:302
chr17	21202237	rs36047035	G	C	3534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.598;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=83;PP=2670;ReadPosRankSum=-0.842;SC=ATTGGAGACAGAGTAGGTGCC;SOR=1.090;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=299;TCF=131;TCR=168;TR=136;WE=21202245;WS=21202227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,143:0.46:311
chr17	21202272	rs34880480	C	G	2595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.537;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=70;PP=2036;ReadPosRankSum=0.311;SC=CAGGGCCTCTCACTTCACCTG;SOR=1.299;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=213;TCF=73;TCR=140;TR=98;WE=21202280;WS=21202262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,100:0.45:220
chr17	21202310	rs77343934	GC	AT	2475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=2.039;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.68;ReadPosRankSum=0.454;SOR=0.456;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,65:0.46:140
chr17	21202316	rs78463537	T	C	2574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=2.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.65;ReadPosRankSum=-0.629;SOR=0.408;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,63:0.48:131
chr17	21202318	rs77591777	G	T	2457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.35;ReadPosRankSum=-0.746;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,61:0.48:127
chr17	21202370	rs34794731	G	A	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.701;HP=1;HapScore=3;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=27;PP=1489;ReadPosRankSum=0.819;SC=GAAGAGCCTCGTCCTGCGCTG;SOR=0.123;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=68;TCF=1;TCR=67;TR=28;WE=21202390;WS=21202360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,29:0.43:68
chr17	21202382	rs35763451	TG	T	987.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=1494;ReadPosRankSum=0.796;SC=CCTGCGCTGCTGGCTGTGTGG;SOR=0.467;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=1;TCR=58;TR=23;WE=21202390;WS=21202360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,27:0.44:62
chr17	21203711	rs73311537	C	T	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=150;ReadPosRankSum=1.304;SC=TGCTGAGGGTCACACAGCAGG;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=8;WE=21203719;WS=21203701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr17	21203820	rs78304829	G	C	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=1.937;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.94;ReadPosRankSum=-0.798;SOR=1.025;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,43:0.46:94
chr17	21203825	rs75854955	C	G	1543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=3.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.15;ReadPosRankSum=-0.843;SOR=1.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,41:0.46:90
chr17	21203893	rs34105301	T	C	1753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=38;PP=2739;ReadPosRankSum=1.553;SC=GGTGACCATCTCAGAACTGGG;SOR=0.744;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=132;TCF=60;TCR=72;TR=69;WE=21203915;WS=21203883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,71:0.51:140
chr17	21203907	rs73311539	T	C	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=38;PP=2739;ReadPosRankSum=0.278;SC=AACTGGGCCGTGGAGCCTATG;SOR=0.689;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=52;TCR=72;TR=66;WE=21203915;WS=21203883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,67:0.53:127
chr17	21203934	rs62057672	G	A	1587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.88;MQRankSum=0.000;QD=17.45;ReadPosRankSum=-0.898;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,44:0.48:91
chr17	21203941	rs2305873	G	A	1503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=0.000;QD=18.80;ReadPosRankSum=-0.803;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,36:0.45:80
chr17	21203949	rs62057673	C	T	1341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.85;MQRankSum=0.000;QD=17.89;ReadPosRankSum=-1.743;SOR=0.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,35:0.47:75
chr17	21203964	rs34458870	C	G	476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.610;HP=1;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=390;ReadPosRankSum=-0.792;SC=CCATCATGGCCGTGAAGGTGA;SOR=1.092;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=8;TCR=44;TR=21;WE=21203972;WS=21203954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr17	21203998	rs62057674	G	A	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.566;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=383;ReadPosRankSum=-0.202;SC=GCAGCTGGGAGGGCTCCCTGG;SOR=3.312;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=17;WE=21204006;WS=21203988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr17	21204153	rs66883103	C	T	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=351;ReadPosRankSum=-0.381;SC=GCCTCTGCCACGGCAACCTCT;SOR=0.399;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=68;TCF=65;TCR=3;TR=21;WE=21204161;WS=21204143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,21:0.31:67
chr17	21204187	rs56067280	G	T	1506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.15;ReadPosRankSum=-0.749;SOR=0.631;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,41:0.33:124
chr17	21204192	rs56216806	C	T	1593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.325;SOR=0.618;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,45:0.33:138
chr17	21204210	rs55796947	C	T	1648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.679;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=9;PP=855;ReadPosRankSum=1.274;SC=CGTGAACTCACAGGAGCAGAA;SOR=0.960;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=160;TCF=125;TCR=35;TR=50;WE=21204218;WS=21204200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,50:0.31:160
chr17	21204257	rs56166328	G	A	1868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FS=3.969;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.54;ReadPosRankSum=-0.521;SOR=0.959;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:165,83:0.33:248
chr17	21204266	rs2230435	T	C	9900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=165;NR=100;PP=2962;SC=CGGTCGACTGTTTCTACACTG;SOR=1.312;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=265;TCF=165;TCR=100;TR=265;WE=21204274;WS=21204247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
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chr17	21204308	rs55777930	G	T	3682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FS=5.631;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.24;ReadPosRankSum=0.125;SOR=0.806;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:200,101:0.34:301
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chr17	21205360	rs74998514	G	A	358.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=2.350;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.57;MQRankSum=1.054;QD=18.88;ReadPosRankSum=-0.286;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr17	21205361	rs67557217	GGCT	G	349.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=5.076;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.51;MQRankSum=1.144;QD=16.65;ReadPosRankSum=0.423;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr17	21205396	rs75974715	C	A	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.97;ReadPosRankSum=-0.307;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr17	21205406	rs72831582	A	G	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.77;ReadPosRankSum=-0.285;SOR=0.843;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr17	21205460	rs62057721	C	T	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=13;PP=720;ReadPosRankSum=-1.364;SC=CACAGGGAGACGTGTGGATCT;SOR=0.735;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=92;TCF=66;TCR=26;TR=46;WE=21205468;WS=21205450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,47:0.49:96
chr17	21205592	rs66644302	GGC	G	1091.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.86;MQRankSum=2.784;QD=15.60;ReadPosRankSum=-1.268;SOR=0.813;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,32:0.46:70
chr17	21205604	rs62057722	T	C	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.49;ReadPosRankSum=1.000;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,26:0.43:61
chr17	21205606	rs2305871	G	C	722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.25;ReadPosRankSum=-1.738;SOR=0.557;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,35:0.59:59
chr17	21205642	rs62057723	T	G	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=1357;ReadPosRankSum=-0.206;SC=CCAGCAGGCATGGAGCCTGCC;SOR=0.293;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=21;WE=21205663;WS=21205632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr17	21205654	rs72831585	AT	GA	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;JOINED;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=1338;ReadPosRankSum=-0.732;SC=GAGCCTGCCTATTGATGGTGT;SOR=0.287;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=15;WE=21205663;WS=21205632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr17	21206269	rs73982750	G	A	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.037;HP=3;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=267;ReadPosRankSum=-0.542;SC=AGGTGAGCCCGGGAGGATGAG;SOR=0.093;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=14;WE=21206277;WS=21206259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr17	21206294	rs73311581	C	T	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.441;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=542;ReadPosRankSum=-0.769;SC=GGCAGGAGGCCGAGTGTGTCT;SOR=0.148;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=48;TCF=47;TCR=1;TR=22;WE=21206302;WS=21206284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr17	21206360	rs67280439	A	G	1559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=7.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.029;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=4;PP=2962;ReadPosRankSum=0.287;SC=GGAGGCTGGGATGAGAGGGTG;SOR=0.904;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=127;TCF=111;TCR=16;TR=41;WE=21206393;WS=21206350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,44:0.33:133
chr17	21206372	rs72838545	G	C	1798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=7.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=9;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.021;SC=GAGAGGGTGCGTAGCCTGTGC;SOR=0.758;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=149;TCF=118;TCR=31;TR=47;WE=21206393;WS=21206350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,50:0.32:156
chr17	21206385	rs72838547	C	T	1747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.349;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=12;PP=2962;ReadPosRankSum=0.628;SC=GCCTGTGCAGCGGGAGCGGGA;SOR=0.946;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=166;TCF=119;TCR=47;TR=51;WE=21206393;WS=21206350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,53:0.31:171
chr17	21206444	rs62057728	A	G	1997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.530;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.705;NF=51;NR=35;PP=1634;ReadPosRankSum=0.481;SC=TTTTGACGTGACCAGGAATAA;SOR=0.990;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=249;TCF=137;TCR=112;TR=86;WE=21206452;WS=21206434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,86:0.34:255
chr17	21206556	rs736103	C	T	4054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=105;PP=2965;SC=GGTCAGTGCCCGGCAGCCACC;SOR=3.740;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=15;TCR=105;TR=120;WE=21206564;WS=21206546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr17	21206616	rs57761454	G	A	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=35;PP=763;ReadPosRankSum=-0.483;SC=GCGGGTGGACGTCTCCCTATG;SOR=0.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=0;TCR=71;TR=35;WE=21206624;WS=21206606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,35:0.49:71
chr17	21206635	rs77285979	T	A	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.27;ReadPosRankSum=1.062;SOR=0.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr17	21206642	rs59259996	G	A	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.00;ReadPosRankSum=1.373;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr17	21206654	rs56821097	G	T	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.27;ReadPosRankSum=2.320;SOR=0.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr17	21207602	rs55677712	C	G	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=161;ReadPosRankSum=-1.721;SC=GACCCTGGTGCAACCTGCCCA;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=9;WE=21207610;WS=21207592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr17	21207649	rs56342308	C	T	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=328;ReadPosRankSum=0.553;SC=GGGTCTTGGGCGAGGGAGGGG;SOR=0.833;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=18;WE=21207657;WS=21207639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,19:0.42:45
chr17	21207834	rs58609466	C	T	1557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.691;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=42;PP=1112;ReadPosRankSum=1.503;SC=GTGGCCAAGACGATGGATGCC;SOR=1.152;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=171;TCF=71;TCR=100;TR=64;WE=21207843;WS=21207824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,67:0.38:177
chr17	21207916	rs7209761	A	G	2845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=70;PP=1708;SC=GGCGGGGAGAAATCTGCCCAG;SOR=6.358;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=72;TCF=2;TCR=70;TR=72;WE=21207924;WS=21207899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
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chr17	21207945	rs9896440	A	G	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.56;ReadPosRankSum=-0.040;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
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chr17	21208347	rs4559960	C	A	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.059;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=16;PP=578;ReadPosRankSum=0.029;SC=TCACGCCTCACTCTTCCCTCC;SOR=1.146;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=157;TCF=101;TCR=56;TR=55;WE=21208357;WS=21208337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,60:0.35:170
chr17	21208349	rs7209860	C	G	975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=1.402;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.64;ReadPosRankSum=-0.715;SOR=0.860;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,47:0.27:173
chr17	21208413	rs1657695	C	T	1355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.705;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=36;PP=1087;ReadPosRankSum=-0.708;SC=ATGTCAAGTCCGACGTCTGGA;SOR=0.941;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=194;TCF=85;TCR=109;TR=61;WE=21208421;WS=21208403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,61:0.31:198
chr17	21208449	rs1657694	G	T	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=8.397;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.70;ReadPosRankSum=0.377;SOR=1.393;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,42:0.25:168
chr17	21208456	rs1657693	A	G	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=5.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.77;ReadPosRankSum=0.195;SOR=1.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,40:0.25:163
chr17	21208640	rs7209152	G	A	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=181;ReadPosRankSum=-1.396;SC=GTCACTCATCGTGAAGTCCTG;SOR=0.481;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=10;WE=21208648;WS=21208630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr17	21215434	rs113634008	A	AC	295.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=749;ReadPosRankSum=-0.279;SC=GGGGCCTCTGACCCCCTGTCC;SOR=0.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=46;TCR=3;TR=12;WE=21215454;WS=21215424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,15:0.31:48
chr17	21215446	rs62055363	C	T	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=746;ReadPosRankSum=-1.178;SC=CCCCTGTCCCCGCTGCAGATT;SOR=0.908;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=56;TCF=51;TCR=5;TR=16;WE=21215454;WS=21215424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,18:0.31:58
chr17	21215483	rs55935757	C	T	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.517;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=1;PP=606;ReadPosRankSum=0.841;SC=GGTTCCCTTACGAGTCCTGGG;SOR=1.215;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=86;TCF=79;TCR=7;TR=32;WE=21215491;WS=21215473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,34:0.38:89
chr17	21215537	rs55736474	C	A	1632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.119;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=17;PP=1195;ReadPosRankSum=-0.455;SC=AGGAGCCGTCCCCCCAGCTCC;SOR=1.254;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=171;TCF=117;TCR=54;TR=68;WE=21215545;WS=21215527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,70:0.39:179
chr17	21215552	rs56369732	C	T	2966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FS=5.015;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.33;ReadPosRankSum=-0.587;SOR=1.024;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,78:0.38:207
chr17	21215557	rs35206134	G	A	2964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=7.928;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.60;ReadPosRankSum=-0.851;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,84:0.39:218
chr17	21215637	rs66486636	G	A	2720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FS=0.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.59;ReadPosRankSum=-0.729;SOR=0.618;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,74:0.45:164
chr17	21215643	rs73302034	A	G	2697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=0.699;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.87;ReadPosRankSum=-1.492;SOR=0.782;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,72:0.48:151
chr17	21215682	rs73302038	G	A	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.692;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=32;PP=753;ReadPosRankSum=0.118;SC=TTATTCCTTTGGCAAATAAAC;SOR=1.996;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=77;TCF=8;TCR=69;TR=33;WE=21215690;WS=21215672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,36:0.46:79
chr17	21215700	rs73302043	T	G	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.115;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=442;ReadPosRankSum=-0.906;SC=AACCCCCAGATGACTTGGCAT;SOR=1.478;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=3;TCR=46;TR=21;WE=21215708;WS=21215690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,23:0.46:50
chr17	21216661	rs4994551	C	T	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.99;ReadPosRankSum=0.704;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,15:0.33:46
chr17	21216664	rs4081986	A	G	495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.78;ReadPosRankSum=0.668;SOR=0.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,15:0.33:46
chr17	21216686	rs4994549	C	A	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.889;NF=20;NR=0;PP=382;ReadPosRankSum=-1.076;SC=CCCTTCTTCCCTGGGTGCACG;SOR=0.927;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=50;TCR=2;TR=20;WE=21216694;WS=21216676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr17	21216710	rs4994548	T	C	667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.126;NF=21;NR=1;PP=405;ReadPosRankSum=0.747;SC=CCCCTGCTGCTAGGCCTGGGG;SOR=0.650;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=69;TCF=64;TCR=5;TR=22;WE=21216718;WS=21216700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,22:0.31:70
chr17	21216758	rs5819747	G	GCTTC	1236.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=2.798;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.26;MQRankSum=2.647;QD=10.48;ReadPosRankSum=-1.225;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,36:0.31:118
chr17	21216788	rs1673840	C	T	877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.205;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.161;NF=27;NR=18;PP=637;ReadPosRankSum=0.738;SC=GCCACAGCTGCACTATTCTCT;SOR=1.100;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=149;TCF=82;TCR=67;TR=45;WE=21216796;WS=21216778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,47:0.30:155
chr17	21216846	rs1657688	G	C	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.946;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.321;NF=27;NR=34;PP=1138;ReadPosRankSum=-0.184;SC=ACCTGGAGCTGATGGTGAGTA;SOR=0.433;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=159;TCF=64;TCR=95;TR=61;WE=21216854;WS=21216836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,59:0.37:160
chr17	21216951	rs1673839	C	G	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.651;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=270;ReadPosRankSum=1.382;SC=TGGGTAGCTCCTCTGGCTGGC;SOR=1.893;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=16;WE=21216972;WS=21216941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,18:0.35:52
chr17	21216964	rs1657686	T	C	1526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=42;PP=1214;SC=TGGCTGGCCCTGTGTTCTCTC;SOR=6.229;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=42;WE=21216972;WS=21216941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	21217238	.	GG	CA	553	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=12;NR=1;PP=553;QD=46.6513749894;SC=GGGGGGAAAGGGAGGTTAGTG;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=13;WE=21217247;WS=21217237;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:16,13:0.45:29
chr17	21217239	rs4114291	G	A	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.95;ReadPosRankSum=0.468;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr17	21217258	rs4114290	A	G	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=239;ReadPosRankSum=0.785;SC=GTGGCTGGAGAGTGACCACAA;SOR=0.368;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=13;WE=21217266;WS=21217248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr17	21217290	rs1673837	G	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=254;ReadPosRankSum=-0.823;SC=AGGAGCCACAGATGCCATCTG;SOR=0.983;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=46;TCF=42;TCR=4;TR=14;WE=21217298;WS=21217280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,15:0.32:47
chr17	21217397	rs1657685	A	G	2772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=7.437;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.89;ReadPosRankSum=1.090;SOR=1.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,73:0.47:155
chr17	21217400	rs1622401	G	A	2727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=4.974;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.49;ReadPosRankSum=1.417;SOR=1.113;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,72:0.46:156
chr17	21217411	rs1657684	T	C	1926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.966;HP=4;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=27;PP=2962;ReadPosRankSum=1.565;SC=TGGCCACCTCTCCCTCCCGCT;SOR=1.189;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=148;TCF=88;TCR=60;TR=74;WE=21217419;WS=21217387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,75:0.48:155
chr17	21217513	rs2363198	G	A	1726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=42;PP=1392;ReadPosRankSum=-0.141;SC=TGCTGCCTTCGTGAAGGAGAT;SOR=0.658;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=45;TCR=80;TR=66;WE=21217521;WS=21217503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,66:0.52:128
chr17	21217547	rs2363197	T	C	1586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.88;ReadPosRankSum=-0.856;SOR=0.499;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,45:0.48:94
chr17	21217554	rs2363196	C	T	1459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.962;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.59;ReadPosRankSum=-0.397;SOR=0.503;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,40:0.48:83
chr17	21217566	rs2363375	C	T	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.116;HP=2;HapScore=4;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=2251;ReadPosRankSum=-0.006;SC=GACCCCACTCCGGCCCTCCAG;SOR=0.492;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=65;TCF=15;TCR=50;TR=31;WE=21217574;WS=21217537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
chr17	21217586	rs2363374	G	T	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=4.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.41;ReadPosRankSum=0.261;SOR=0.129;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,28:0.51:55
chr17	21217596	rs2363373	C	G	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=3.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.70;ReadPosRankSum=1.228;SOR=0.194;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr17	21318521	rs76804083	C	T	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=82;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=171;ReadPosRankSum=-1.813;SC=CCTCCAGTCACGTCTGGGGGC;SOR=0.317;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=9;WE=21318529;WS=21318511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr17	21318546	rs112960185	A	G	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.56;ReadPosRankSum=-1.207;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
chr17	21318552	rs112854769	G	A	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.17;ReadPosRankSum=-1.193;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr17	21318555	rs58462457	C	T	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.349;HP=2;HapScore=2;MGOF=49;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=228;ReadPosRankSum=0.560;SC=TAGAGGAGCCCGGAGCCACCA;SOR=0.076;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=17;WE=21318577;WS=21318536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
chr17	21318569	rs74584621	C	T	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.462;HP=2;HapScore=2;MGOF=49;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=1019;ReadPosRankSum=0.545;SC=GCCACCAGCCCAGCCAGACAT;SOR=1.661;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=58;TCR=4;TR=17;WE=21318577;WS=21318536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,18:0.27:67
chr17	21318586	rs59891808	G	C	2419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=1.505;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.47;ReadPosRankSum=-0.932;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,61:0.64:95
chr17	21318586	.	GTC	CTG	426	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=42;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=24;NR=2;PP=426;QD=18.4410721101;SC=ACATGCTGTCGTCTCTGTTGC;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=91;TCF=83;TCR=8;TR=26;WE=21318611;WS=21318576;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:65,26:0.29:91
chr17	21318588	rs77791524	C	G	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.92;ReadPosRankSum=-0.118;SOR=0.709;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,28:0.29:95
chr17	21318595	rs58780973	G	C	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=10.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.06;ReadPosRankSum=-1.008;SOR=0.109;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,34:0.35:98
chr17	21318603	rs79809401	C	T	1065.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=42;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=5;PP=444;ReadPosRankSum=-1.072;SC=TTGCAGGAGCCGCCCTGCCTG;SOR=0.589;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=91;TCR=16;TR=33;WE=21318611;WS=21318576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,34:0.31:111
chr17	21318629	rs58862472	C	A	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=5.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.72;ReadPosRankSum=-0.221;SOR=0.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,46:0.46:99
chr17	21318663	rs72846666	G	A	1479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.755;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=23;PP=1208;ReadPosRankSum=0.321;SC=GGATGACCGCGGCCAGCCGGG;SOR=0.428;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=200;TCF=142;TCR=58;TR=67;WE=21318671;WS=21318653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,67:0.33:204
chr17	21318698	rs1657738	C	T	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FS=5.729;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.74;ReadPosRankSum=-0.943;SOR=1.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:191,74:0.28:265
chr17	21318770	rs3752033	G	A	3840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FS=7.058;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.82;ReadPosRankSum=0.867;SOR=0.434;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:245,110:0.31:355
chr17	21318773	rs3752034	G	A	3803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FS=6.215;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.84;ReadPosRankSum=1.121;SOR=0.449;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:242,109:0.31:351
chr17	21318782	rs78117732	G	A	2835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.707;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=44;PP=1750;ReadPosRankSum=0.399;SC=CGCAGGTGCCGCAACCGCTTC;SOR=0.891;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=342;TCF=212;TCR=130;TR=122;WE=21318790;WS=21318760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:229,126:0.35:355
chr17	21318867	rs73979893	G	A	1399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=425;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.380;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=77;PP=2467;ReadPosRankSum=-0.076;SC=TGGCTGACATGTTCACCACCT;SOR=0.600;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=415;TCF=197;TCR=218;TR=142;WE=21318875;WS=21318857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:290,100:0.26:390
chr17	21318897	rs1657739	G	C	3115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.904;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=66;PP=2396;ReadPosRankSum=-0.419;SC=TCCGCTGGCGGTACATGCTGC;SOR=0.397;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=372;TCF=153;TCR=219;TR=127;WE=21318905;WS=21318887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:247,132:0.35:379
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chr17	21319650	.	CGAG	C	1941.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DP=238;ExcessHet=3.0103;FS=2.671;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.39;MQRankSum=-3.559;QD=8.71;ReadPosRankSum=0.024;SOR=0.504;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:163,60:0.27:223
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chr17	21319728	rs76681424	T	C	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.52;MQRankSum=-10.014;QD=7.07;ReadPosRankSum=-1.883;SOR=0.640;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,29:0.22:130
chr17	21319743	rs76267885	A	G	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQRankSum=-9.395;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.084;SOR=0.559;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:93,21:0.18:114
chr17	21319767	rs1612176	C	T	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=2.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.64;MQRankSum=0.856;QD=13.65;ReadPosRankSum=-0.116;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,28:0.41:69
chr17	21319785	rs1657745	C	T	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=3.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQRankSum=2.234;QD=9.76;ReadPosRankSum=-1.672;SOR=1.253;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,23:0.28:81
chr17	21319786	rs78547883	G	A	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=5.812;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.04;MQRankSum=-4.671;QD=10.11;ReadPosRankSum=1.064;SOR=0.241;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,25:0.31:81
chr17	21319845	rs72846670	C	T	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.323;NF=6;NR=14;PP=345;ReadPosRankSum=-1.432;SC=GAGACCAGGACGGCCGAAGCC;SOR=0.765;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=56;TCF=18;TCR=38;TR=20;WE=21319853;WS=21319835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr17	21319860	rs2917720	C	T	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.13;ReadPosRankSum=-0.957;SOR=0.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,21:0.55:38
chr17	21319860	.	CGGCCTCAG	AGGCCTCAT,TGGCCTCAG	317	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=5,8;NR=5,13;PP=317,214;QD=37.0467874862;SC=GAAGCCGGGACGGCCTCAGCC;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=52;TCF=21;TCR=31;TR=10,21;WE=21319876;WS=21319850;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.19:52
chr17	21319868	rs73979902	G	T	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.08;ReadPosRankSum=-0.331;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,11:0.23:48
chr17	21319908	rs66981137	C	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.24;ReadPosRankSum=-0.927;SOR=0.435;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,7:0.17:40
chr17	21319943	rs5021699	A	G	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=4;HapScore=4;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=2.039;NF=3;NR=9;PP=118;ReadPosRankSum=-1.261;SC=TACAGACGGGAGTCAGAGATC;SOR=0.346;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=12;WE=21319963;WS=21319933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr17	21319955	rs76506689	G	A	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.68;MQRankSum=-2.660;QD=5.08;ReadPosRankSum=0.738;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr17	21319989	rs5021700	C	A	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.45;MQRankSum=-0.593;QD=22.52;ReadPosRankSum=1.249;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr17	21319993	rs5021701	T	C	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.32;MQRankSum=0.000;QD=29.19;ReadPosRankSum=0.437;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr17	21320008	rs78435971	C	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.859;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQRankSum=-0.652;QD=19.76;ReadPosRankSum=0.222;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr17	21320012	rs77515828	C	T	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQRankSum=-1.631;QD=17.76;ReadPosRankSum=0.219;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr17	21320025	rs5021702	C	T	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.051;HP=3;HapScore=4;MGOF=55;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=114;ReadPosRankSum=0.595;SC=TCAGGGGCCCCGGGTTTGAGC;SOR=0.042;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=5;WE=21320033;WS=21319998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr17	21535972	rs10221228	A	G	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.318;NF=14;NR=1;PP=668;ReadPosRankSum=-0.640;SC=GTTTATTGGCATTGATCTCAC;SOR=0.392;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=15;WE=21535988;WS=21535962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,12:0.31:39
chr17	21535979	rs113145914	TCA	T	321.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.213;NF=10;NR=1;PP=667;ReadPosRankSum=-0.379;SC=GGCATTGATCTCACAGTCTGG;SOR=0.298;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=44;TCR=3;TR=11;WE=21535988;WS=21535962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,11:0.28:40
chr17	21536065	rs9325914	A	G	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.71;MQRankSum=-7.469;QD=1.53;ReadPosRankSum=-1.415;SOR=0.577;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,20:0.15:131
chr17	21536106	rs9325915	T	C	656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.563;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-12.054;NF=50;NR=16;PP=1137;ReadPosRankSum=0.028;SC=TCCCAGCACCTGCCACCAGCA;SOR=1.819;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=183;TCF=103;TCR=80;TR=66;WE=21536115;WS=21536096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,38:0.24:158
chr17	21536168	rs9325916	G	A	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-4.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=36.889;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-7.312;NF=12;NR=24;PP=705;ReadPosRankSum=-2.820;SC=GTTTTTCTTTGCTTTTCCTAT;SOR=0.016;SbPval=0.03;Source=Platypus;TC=94;TCF=16;TCR=78;TR=36;WE=21536176;WS=21536158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,29:0.33:87
chr17	21536212	rs73309479	A	G	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=4.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.427;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-6.327;NF=2;NR=28;PP=529;ReadPosRankSum=3.121;SC=CACCAAATTTACCTTTTTTTT;SOR=0.080;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=85;TCF=3;TCR=82;TR=30;WE=21536220;WS=21536202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,24:0.31:77
chr17	21544462	rs9285742	G	A	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=3.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.33;MQRankSum=-1.147;QD=18.32;ReadPosRankSum=-1.827;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr17	21544470	rs9285743	A	G	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=3.174;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.36;MQRankSum=-1.107;QD=15.99;ReadPosRankSum=-0.864;SOR=0.172;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr17	21544587	rs9285744	A	G	1992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.291;NF=48;NR=35;PP=1579;ReadPosRankSum=-1.133;SC=TTAAACTGAAAAAGAAACAAG;SOR=0.731;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=84;TCR=62;TR=83;WE=21544595;WS=21544577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,81:0.54:149
chr17	21544646	rs9285745	T	C	1388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.873;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.692;NF=11;NR=40;PP=1115;ReadPosRankSum=-0.503;SC=TTTCTCCCTATAGAAGATATT;SOR=0.859;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=98;TCF=22;TCR=76;TR=51;WE=21544654;WS=21544636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,52:0.49:106
chr17	21544674	rs9747056	T	A	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.778;NF=2;NR=34;PP=743;ReadPosRankSum=-0.074;SC=TTTCCATATTTTGAAACTGTA;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=69;TCF=4;TCR=65;TR=36;WE=21544682;WS=21544664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,37:0.50:74
chr17	21730703	rs72842072	G	A	1731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=18;PP=1344;SC=GTCAAAATGCGGATCTTCGTG;SOR=1.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=55;WE=21730711;WS=21730693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
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chr17	22066835	rs147079852	C	T	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-5.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.287;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.380;NF=14;NR=18;PP=905;ReadPosRankSum=1.490;SC=ATGCAGATGACAATACTCTTG;SOR=0.346;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=107;TCF=39;TCR=68;TR=32;WE=22066843;WS=22066812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,30:0.28:109
chr17	22066856	rs138169151	CAG	C	449.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=5.603;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.31;MQRankSum=-4.397;QD=5.92;ReadPosRankSum=2.128;SOR=1.840;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,17:0.22:76
chr17	22066870	rs79914182	G	T	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-5.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.957;NF=2;NR=16;PP=1043;ReadPosRankSum=-1.089;SC=GAAAAAAAATGAAGGGAATAT;SOR=0.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=7;TCR=59;TR=18;WE=22066878;WS=22066846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,17:0.25:67
chr17	25753033	rs13341669	T	C	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.181;NF=11;NR=26;PP=660;ReadPosRankSum=-2.079;SC=CTGGCTTCTCTGGGTGCTGAA;SOR=0.679;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=22;TCR=53;TR=37;WE=25753041;WS=25753023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,31:0.45:69
chr17	25887530	rs2945397	G	C	3051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.946;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=80;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.997;SC=TTCTCTTTCCGCTCTCCTCTA;SOR=1.642;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=234;TCF=90;TCR=144;TR=114;WE=25887549;WS=25887520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,118:0.49:243
chr17	25887541	rs2948526	C	T	2622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.742;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=73;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.828;SC=CTCTCCTCTACCCTTGCGTTC;SOR=1.501;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=216;TCF=80;TCR=136;TR=103;WE=25887549;WS=25887520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,107:0.48:224
chr17	25904755	rs189782552	C	T	2272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.817;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=32;PP=1725;ReadPosRankSum=0.373;SC=GCGGGGCAAGCGTGGCCCAGG;SOR=0.948;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=159;TCF=97;TCR=62;TR=87;WE=25904763;WS=25904745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,89:0.54:164
chr17	25909816	rs2293180	C	T	1689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.340;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=25;PP=1274;ReadPosRankSum=2.310;SC=GGCAACAGCGCCCAGGGCCCA;SOR=0.436;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=126;TCF=81;TCR=45;TR=63;WE=25909824;WS=25909806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,64:0.50:127
chr17	25912828	rs2945373	A	G	1255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.366;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=43;PP=972;ReadPosRankSum=0.627;SC=GCTGGTGACCACCTCAGGAAA;SOR=0.399;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=101;TCF=15;TCR=86;TR=52;WE=25912836;WS=25912818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,52:0.51:101
chr17	25915281	rs62057826	C	G	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-5.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=372;ReadPosRankSum=0.698;SC=CCTCAGAGGCCAGGAGCAAGC;SOR=0.788;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=22;WE=25915289;WS=25915271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr17	25917810	rs1403321	A	G	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.555;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=759;ReadPosRankSum=-0.590;SC=GCTGGTGCAAACATGTGCCTG;SOR=0.322;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=88;TCF=63;TCR=25;TR=39;WE=25917818;WS=25917800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,40:0.45:89
chr17	25924596	rs16966333	C	T	1103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=6.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.056;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=40;PP=846;ReadPosRankSum=0.293;SC=ACTTGTCCGGCGCCCCAAGCA;SOR=2.261;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=84;TCF=1;TCR=83;TR=40;WE=25924604;WS=25924586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,42:0.48:87
chr17	25929036	rs4332787	A	G	791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.179;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=575;ReadPosRankSum=-0.817;SC=TACACTTACTATGTACCAACC;SOR=1.027;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=13;TCR=43;TR=28;WE=25929044;WS=25929026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,30:0.49:61
chr17	25930725	rs2241904	G	A	1034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=8.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.99;ReadPosRankSum=1.507;SOR=0.062;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr17	25930730	rs2241905	T	C	1035.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=4.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.14;ReadPosRankSum=2.137;SOR=0.204;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
chr17	25931637	rs2289567	G	T	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=17;PP=897;ReadPosRankSum=-0.249;SC=TCTCTCCCGGGAGTCCCCGCT;SOR=0.616;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=72;TCR=34;TR=53;WE=25931645;WS=25931627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,54:0.50:108
chr17	25932940	rs11433820	A	AT	670.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.520;NF=2;NR=17;PP=661;ReadPosRankSum=-0.403;SC=GGAAGTTCTAATAGAGGCATA;SOR=0.610;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=45;TCF=4;TCR=41;TR=19;WE=25932948;WS=25932930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr17	25935104	rs2289569	G	A	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.742;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=39;PP=895;ReadPosRankSum=-1.825;SC=TGTTCCTCTCGCCCTGTTACT;SOR=0.122;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=82;TCF=6;TCR=76;TR=44;WE=25935112;WS=25935094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,45:0.54:83
chr17	25944235	rs4267373	A	G	1431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=6;PP=1101;SC=TGAGAACATCAAAGGGACCCT;SOR=3.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=43;TCR=6;TR=49;WE=25944243;WS=25944225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	25950175	rs2241906	C	T	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.846;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=130;ReadPosRankSum=-0.195;SC=AGGCCTTGGACGCAGTATGAC;SOR=0.027;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=9;WE=25950183;WS=25950171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr17	25950220	rs1075952	G	A	867.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=0;PP=686;ReadPosRankSum=-0.525;SC=TGGCCAATCAGTCATTTTCAT;SOR=0.562;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=65;TCR=0;TR=31;WE=25950228;WS=25950210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,32:0.46:69
chr17	25958304	rs3751093	G	A	1405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.581;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=42;PP=1132;ReadPosRankSum=0.153;SC=GGCCTTCAGCGGTTCCCAGGC;SOR=1.032;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=119;TCF=34;TCR=85;TR=57;WE=25958312;WS=25958294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,58:0.47:123
chr17	25972311	rs2304886	C	T	2220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=36.735;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.872;NF=77;NR=54;PP=2540;ReadPosRankSum=-0.869;SC=CCGCGATAACCACCATTCTGA;SOR=0.073;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=246;TCF=119;TCR=127;TR=131;WE=25972319;WS=25972301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,89:0.55:163
chr17	25974545	rs4794976	T	G	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=6.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.644;NF=3;NR=29;PP=680;ReadPosRankSum=0.714;SC=CCTTGAACAGTATGGGGGCTG;SOR=0.884;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=70;TCF=7;TCR=63;TR=32;WE=25974553;WS=25974535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,33:0.43:76
chr17	25974600	rs113216780	A	AATTATT	399.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.615;NF=0;NR=9;PP=460;ReadPosRankSum=0.670;SC=GTGGCCAACAAATTATTATTA;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=9;WE=25974608;WS=25974590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr17	25982119	rs4795843	T	C	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=1;PP=643;ReadPosRankSum=0.383;SC=TTTCCCATTATCCCCACTACC;SOR=1.067;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=50;TCF=48;TCR=2;TR=29;WE=25982127;WS=25982109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr17	26073050	rs138929274	T	G	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.80;MQRankSum=-0.000;QD=7.69;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr17	26079737	.	T	G	245	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=30;MQ=43.49;NF=14;NR=1;PP=245;QD=18.6514141698;SC=AGGAAGGCTTTCTTGGGAGCA;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=59;TCR=3;TR=15;WE=26079745;WS=26079727;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:47,15:0.24:62
chr17	26080008	rs4796027	G	A	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=5.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.691;NF=0;NR=37;PP=750;ReadPosRankSum=1.452;SC=CATTGGGAGTGGGGAGGGCAC;SOR=0.768;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=115;TCF=3;TCR=112;TR=37;WE=26080016;WS=26079998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,23:0.25:91
chr17	26087316	rs3729727	C	T	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.473;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=182;ReadPosRankSum=-1.207;SC=AGCATTATCCCCACTTTACAG;SOR=1.445;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=6;WE=26087324;WS=26087306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr17	26088337	rs59685746	GC	G	141.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=156;SC=CCACACCACGGCCCTCCTTGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=5;WE=26088345;WS=26088327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	26089813	.	C	T	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=-0.207;SC=GAGCCTCTGCCCCTGGCTCAC;SOR=0.260;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=5;WE=26089821;WS=26089803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr17	26089867	rs1060826	T	C	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=1;PP=914;SC=GGTGGATCTCTGTGGGCGTGT;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=26089875;WS=26089857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	26092555	rs2297512	G	A	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=6;PP=410;SC=CTAGCCCGGGGCTCACCACTC;SOR=1.292;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=17;WE=26092563;WS=26092545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	26092631	rs1060822	A	G	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=5;PP=1206;SC=GCTCCAGGATACCTTGGACCA;SOR=3.417;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=42;WE=26092639;WS=26092621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	26096597	rs2297518	G	A	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.229;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.012;NF=25;NR=13;PP=701;ReadPosRankSum=-2.108;SC=CATGAAGAGCGATTTCTTCAG;SOR=0.361;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=81;TCF=57;TCR=24;TR=38;WE=26096605;WS=26096587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
chr17	26099171	rs2274894	T	G	967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=0;PP=803;ReadPosRankSum=1.214;SC=GTGTAAGTTTTGGAATCCCTG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=28;WE=26099179;WS=26099161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr17	26100321	rs2248814	A	G	2067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=57;PP=1772;SC=GGCTTGGCTCAGCTCGCGGAT;SOR=4.244;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=6;TCR=57;TR=63;WE=26100329;WS=26100311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	26105932	rs1137933	G	A	3441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.830;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=65;PP=2605;ReadPosRankSum=-0.647;SC=AGCGCTGGACGTCACAGAAGT;SOR=0.759;SbPval=0.65;Source=Platypus;TCF=143;TR=139;WE=26105940;WS=26105922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,143:0.49:293
chr17	26108040	rs2297520	T	C	6530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=85;PP=2965;ReadPosRankSum=0.763;SC=CAATGGCCGGTGGCTGAGGCT;SOR=0.414;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=205;TCF=119;TCR=86;TR=203;WE=26108048;WS=26108030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,212:1.00:213
chr17	26108928	rs28999368	CCTGGTTTCTCCTGGAG	C	544.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=2077;ReadPosRankSum=-1.707;SC=TTTCTTTCTCCCTGGTTTCTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=9;WE=26108951;WS=26108920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr17	26109030	rs3729508	T	C	3281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=29;PP=2274;SC=CCCTGGGAAATGTGCACCGAC;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=73;TCR=29;TR=102;WE=26109038;WS=26109020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr17	26116848	rs8072199	C	T	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=289;ReadPosRankSum=-0.026;SC=TGTTCATGGTCGGTCTGACCA;SOR=0.997;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=15;WE=26116856;WS=26116838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr17	26116896	rs2072324	C	A	171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.62;ReadPosRankSum=0.955;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr17	26125918	rs3730013	G	A	875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.305;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=27;PP=680;ReadPosRankSum=-0.394;SC=GCTGAAGAAGGGAAGCAGAGG;SOR=0.422;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=96;TCF=16;TCR=80;TR=33;WE=26125926;WS=26125908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,35:0.35:99
chr17	26206414	rs3751972	C	A	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=403;SC=AGGCCAATGGCTCTTCCAAAC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=26206422;WS=26206404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	26206478	rs187337413	G	A	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=467;ReadPosRankSum=-0.807;SC=CAGAGGCCAGGAAGGCTCACC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=22;WE=26206486;WS=26206468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr17	26646434	rs5819836	G	GC	3567.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=72;PP=2965;SC=AGGCTCTCCCGGCGCTGCGTC;SOR=3.467;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=84;TCF=9;TCR=75;TR=80;WE=26646442;WS=26646424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	26657261	rs34843464	CA	C	543.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=14.044;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=0.444;QD=15.10;ReadPosRankSum=0.867;SOR=4.325;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,33:0.92:36
chr17	26669245	rs5819838	A	AG	1439.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=2;PP=1488;SC=CCTCACTCCCAGCCGCTTGGC;SOR=5.136;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=32;WE=26669253;WS=26669235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	26671726	.	C	G	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-5.044;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=275;ReadPosRankSum=-1.141;SC=GGTCTCTGCTCTAGCACCCAG;SOR=0.382;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=15;WE=26671734;WS=26671716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr17	26676135	rs13469	C	T	3759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=80;PP=2896;SC=AAGCCTGCAGCGAGACGTGGC;SOR=1.534;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=40;TCR=80;TR=120;WE=26676143;WS=26676125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr17	26678960	rs2073867	G	C	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=8;PP=245;SC=CAAACAAGGTGCTCATACATG;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=26678968;WS=26678950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	26684283	rs11314852	GT	G	749.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=5;PP=739;SC=TCCAGGCCCAGTTCCTCGCGC;SOR=2.200;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=18;WE=26684291;WS=26684273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	26684390	rs11448856	G	GC	1054.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=11;PP=707;SC=GCACAGAGCGGCTTTGCCACC;SOR=1.136;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=14;WE=26684402;WS=26684380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	26684394	rs17856014	T	G	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=11;PP=413;SC=AGAGCGGCTTTGCCACCGGGC;SOR=1.179;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=18;WE=26684402;WS=26684380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	26684449	rs4795429	G	C	450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=13;PP=404;SC=ACGGCCAGGGGCCGCCGGGCT;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=26684457;WS=26684439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	26684529	rs113967755	G	GGC	484.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=8;PP=540;SC=GCGGCCGGGCGGTTCCGCCCC;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=13;WE=26684537;WS=26684519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	26687484	rs11379368	G	GC	2023.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=2;PP=2254;SC=AGAGGGCTGAGCCAGACTGTC;SOR=5.856;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=54;TCR=2;TR=52;WE=26687492;WS=26687474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	26687898	rs11382918	G	GC	1069.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=26;PP=1183;SC=AGGGCAGGGTGCCCTGGTGGG;SOR=3.193;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=29;WE=26687906;WS=26687888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	26691321	rs9910163	A	G	3634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=42;PP=2765;SC=GACAATGGCCAAGGCATAGAT;SOR=1.628;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=83;TCR=42;TR=125;WE=26691329;WS=26691311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr17	26692224	rs11387886	A	AG	7982.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=88;PP=2936;SC=GGGCCATGCCAGGCTGTGCCC;SOR=1.018;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=93;TCR=96;TR=175;WE=26692232;WS=26692214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,224:1.00:224
chr17	26694861	rs704	G	A	8926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=147;NR=128;PP=2965;SC=GGACAGCCACGTGGCGCGGGA;SOR=0.850;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=275;TCF=147;TCR=128;TR=275;WE=26694869;WS=26694851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr17	26695704	rs2227725	A	G	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=21;PP=1069;SC=CCTGAGGAGCAGGGTGGTGGG;SOR=0.741;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=20;TCR=21;TR=41;WE=26695712;WS=26695694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	26695832	rs2071379	A	G	4764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=45;PP=2965;SC=CCCCAGTGAAATGTGAAAGGA;SOR=1.673;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=105;TCR=45;TR=149;WE=26695840;WS=26695822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr17	26699121	rs7212814	G	C	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=7;PP=338;SC=GGCCCACGGCGGGGCGCCGAG;SOR=0.941;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=8;TCR=7;TR=15;WE=26699129;WS=26699111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	26699195	rs11437592	C	CG	943.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=8;PP=729;SC=TGCGGGTGGCCCGGGCCCGCG;SOR=0.990;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=18;WE=26699213;WS=26699185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	26699199	rs112387743	G	GC	978.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.61;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	26699205	rs11340312	GA	G	933.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=8;PP=704;SC=CCGGGCCCGCGAAAGTGTCGC;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=19;TCF=11;TCR=8;TR=18;WE=26699213;WS=26699185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	26699367	rs11437594	G	GC	1649.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=60.69;NF=14;NR=21;PP=1679;SC=CCTGGCTGCTGCGGCCGTGGG;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=14;TCR=21;TR=35;WE=26699375;WS=26699357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	26699483	.	C	T	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.965;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=8;PP=274;ReadPosRankSum=-0.829;SC=GTGTGCAGGCCGCGCGCCTGC;SOR=0.199;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=15;WE=26699491;WS=26699473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr17	26708298	.	A	AGC	15053.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=323;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.34;SOR=1.161;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,318:1.00:318
chr17	26708302	.	GGT	G	15448.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=349;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.78;SOR=1.017;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,345:1.00:345
chr17	26708550	rs11658194	TC	CG	6736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=64;PP=2947;SC=CGAGCTGCTTTCGCTGCACGC;SOR=0.747;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=135;TCF=68;TCR=67;TR=129;WE=26708559;WS=26708540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr17	26708850	.	G	C	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.490;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=26;PP=656;ReadPosRankSum=-0.084;SC=GGTGGGTGCAGATGTGGGGTT;SOR=1.739;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=62;TCF=14;TCR=48;TR=31;WE=26708858;WS=26708840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr17	26716821	rs4795433	C	T	2226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=15;PP=1650;SC=GCAGGGGAATCGCTTGGGCCC;SOR=2.139;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=49;TCR=15;TR=64;WE=26716829;WS=26716811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	26716917	rs4795434	G	T	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=48;PP=1627;SC=ATACAAGTTGGTGTAAATGCT;SOR=2.683;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=12;TCR=48;TR=60;WE=26716925;WS=26716907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	26716991	rs117173644	G	A	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=150;ReadPosRankSum=-1.421;SC=GCATCAAGGTGTCAACGAAAA;SOR=0.465;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=9;WE=26716999;WS=26716981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr17	26727721	rs5819844	GA	G	1221.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=20;PP=1155;SC=GTGAGTTGAAGAATGCCGGAG;SOR=1.418;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=29;WE=26727729;WS=26727711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	26729428	rs4795436	C	T	2205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=61;PP=1870;SC=CCATACCCCACGTGGGGCTTA;SOR=4.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=5;TCR=61;TR=66;WE=26729436;WS=26729418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	26816365	rs11443311	G	GC	1731.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.648;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.015;NF=20;NR=34;PP=1806;ReadPosRankSum=-1.714;SC=TCTGAGGTGAGCCCCATCCAT;SOR=0.582;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=126;TCF=47;TCR=79;TR=54;WE=26816373;WS=26816355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,66:0.50:132
chr17	26818676	rs9890678	T	C	10592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=219;NR=103;PP=2965;SC=GATCTGCACATTCACTGGGAG;SOR=1.677;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=323;TCF=220;TCR=103;TR=322;WE=26818684;WS=26818666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,325:1.00:325
chr17	26823689	.	C	A	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.954;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=25;PP=462;ReadPosRankSum=0.262;SC=CAGCTTAAAGCCACTGAGAGT;SOR=0.554;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=17;TCR=89;TR=30;WE=26823697;WS=26823679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,31:0.28:110
chr17	26824156	rs11567842	A	G	3189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.766;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=59;PP=2403;ReadPosRankSum=-1.976;SC=TGGAGTCCTGATCATCGCACT;SOR=0.484;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=243;TCF=112;TCR=131;TR=121;WE=26824164;WS=26824146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,126:0.49:255
chr17	26850810	rs10527420	TTCTCTCTCTCTCTCTC	T	232.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.542;NF=5;NR=1;PP=321;ReadPosRankSum=-0.236;SC=CGCTCTCTGGTTCTCTCTCTC;SOR=0.141;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=6;WE=26850835;WS=26850801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr17	26850929	rs483434	A	C	2519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=35;PP=1921;SC=GTTGGTCCCCACTGGATGCTG;SOR=1.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=48;TCR=35;TR=83;WE=26850937;WS=26850919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	26851501	rs614434	G	A	11128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=221;NR=130;PP=2965;SC=TCACAGGCTCGCTACTCTCTG;SOR=1.376;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=352;TCF=222;TCR=130;TR=351;WE=26851509;WS=26851491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,357:1.00:357
chr17	26851555	.	C	G	1979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DP=423;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQRankSum=-0.556;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.767;SOR=0.640;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:317,100:0.24:417
chr17	26851602	rs2071587	C	T	4754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=352;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.806;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.069;NF=69;NR=110;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.228;SC=ACACAGCCCCCGCATTGCGTC;SOR=0.817;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=332;TCF=133;TCR=199;TR=179;WE=26851610;WS=26851592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,186:0.54:347
chr17	26851676	.	C	A	2595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-9.273;ClippingRankSum=0.000;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=70;PP=2157;ReadPosRankSum=-0.595;SC=CCTTCAGGCTCTCACCCTCAG;SOR=0.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=211;TCF=68;TCR=143;TR=103;WE=26851684;WS=26851666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,104:0.49:212
chr17	26856261	rs548973	A	G	3554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.976;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=86;PP=2721;ReadPosRankSum=-0.252;SC=CCCACTCTCCAGGGATGGGAG;SOR=0.584;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=286;TCF=116;TCR=170;TR=146;WE=26856269;WS=26856251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,148:0.51:289
chr17	26857737	rs12451259	C	T	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.597;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=2;PP=653;ReadPosRankSum=-1.059;SC=GTCAGAGGTTCGGACTCTCAG;SOR=2.030;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=71;TCF=61;TCR=10;TR=31;WE=26857745;WS=26857727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,31:0.42:73
chr17	26857788	rs12449554	T	C	1474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.535;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=15;PP=1136;ReadPosRankSum=0.144;SC=TCATGGCCCTTAAGAACAGTA;SOR=1.570;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=128;TCF=86;TCR=42;TR=60;WE=26857796;WS=26857778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,59:0.46:129
chr17	26861564	rs2286521	C	T	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=9;PP=572;ReadPosRankSum=0.685;SC=CAGGTGAGGCCGGCCGGGCCA;SOR=0.801;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=24;WE=26861572;WS=26861554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr17	26861618	rs9889455	A	G	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-1.047;QD=9.63;ReadPosRankSum=1.339;SOR=0.885;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr17	26864302	rs532648	G	C	3646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.404;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=63;PP=2924;ReadPosRankSum=1.887;SC=TGACTTGGCAGCCCCGGGCAG;SOR=0.601;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=286;TCF=157;TCR=129;TR=138;WE=26864310;WS=26864292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:150,140:0.48:290
chr17	26879269	.	C	G	150	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;FR=0.5000;HP=10;HapScore=4;MGOF=9;MMLQ=16;MQ=58.8;NF=0;NR=6;PP=150;QD=30.7952020912;SC=GGAAAGGGGGCGGGGGCCAGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=6;WE=26879277;WS=26879253;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr17	26883313	rs631905	A	G	2173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.851;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=59;PP=1656;ReadPosRankSum=1.760;SC=TTGCCACAACATCATACCAGG;SOR=1.031;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=206;TCF=84;TCR=122;TR=93;WE=26883321;WS=26883303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,94:0.44:213
chr17	26887033	rs144845508	T	A	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.737;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=22;PP=891;ReadPosRankSum=0.465;SC=GTATAGACATTGAAAAGGACT;SOR=0.363;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=116;TCF=68;TCR=48;TR=50;WE=26887041;WS=26887023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,51:0.43:119
chr17	26904517	rs652677	C	A	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=336;ReadPosRankSum=1.148;SC=GGCAGGAGGCCCAAGCTGCTT;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=16;WE=26904525;WS=26904514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr17	26916120	.	A	AT	239.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.235;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=-1.193;QD=5.10;ReadPosRankSum=0.629;SOR=0.249;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,16:0.34:47
chr17	26940948	.	C	T	1372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.201;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.878;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=2;PP=1082;ReadPosRankSum=-0.242;SC=ACAGCCTGCACCTCAGTATTG;SOR=1.446;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=89;TCF=84;TCR=5;TR=50;WE=26940956;WS=26940938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,51:0.57:90
chr17	26947652	rs688536	G	A	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.161;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=26;PP=727;ReadPosRankSum=0.513;SC=ACAGCCCCTAGATAATTGTTA;SOR=1.501;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=84;TCF=28;TCR=56;TR=35;WE=26947660;WS=26947642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,36:0.43:84
chr17	27000391	rs9904043	A	G	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=337;ReadPosRankSum=2.638;SC=TTCCCTAGTTATCTTCAGGCA;SOR=0.377;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=39;TCF=22;TCR=17;TR=20;WE=27000399;WS=27000381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr17	27002402	rs9892089	A	G	1831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.548;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=37;PP=1370;ReadPosRankSum=-0.501;SC=GCCCCAACCCATCCTTTTCCT;SOR=0.645;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=182;TCF=100;TCR=82;TR=80;WE=27002410;WS=27002392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,81:0.45:180
chr17	27004703	rs7207976	C	A	2074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.014;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=9;PP=1585;ReadPosRankSum=-0.386;SC=AGATAAAGTCCGTCTCACCCT;SOR=0.168;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=124;TCF=113;TCR=11;TR=74;WE=27004711;WS=27004693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,75:0.61:123
chr17	27009749	rs12051648	C	T	1389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=23.009;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=11;PP=1013;ReadPosRankSum=2.127;SC=CTTTAGATGGCCTGGCCAAAA;SOR=2.307;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=122;TCF=80;TCR=42;TR=52;WE=27009757;WS=27009739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,57:0.44:129
chr17	27014942	.	CT	C	220.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQRankSum=0.161;QD=5.81;ReadPosRankSum=-0.748;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
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chr17	27068371	.	G	C	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.718;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.673;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=12;ReadPosRankSum=-0.631;SC=ATGTGGGAGGGGAGATCCTGC;SOR=1.313;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=72;TCF=43;TCR=29;TR=36;WE=27068379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,36:0.49:73
chr17	27093542	rs9900141	G	A	2181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.618;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=26;PP=1709;ReadPosRankSum=1.769;SC=CTTCAAGGACGGCCCAAATGT;SOR=1.145;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=168;TCF=105;TCR=63;TR=83;WE=27093550;WS=27093532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,84:0.49:173
chr17	27185827	rs2242345	C	T	7124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.164;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=108;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.842;SC=GCCAGGAGGACGTGAAAACAC;SOR=0.350;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=224;TCF=115;TCR=109;TR=223;WE=27185835;WS=27185817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,229:1.00:230
chr17	27187636	rs9279	G	T	6192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=157;PP=2965;SC=GACCAGTTCTGTCCTTGGCTG;SOR=3.407;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=185;TCF=28;TCR=157;TR=185;WE=27187644;WS=27187626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr17	27188296	rs28448745	A	C	211.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=4;PP=151;SC=CCCTACCCCCAATCCCACGCC;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=27188304;WS=27188286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	27207571	rs1060244	C	T	1258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.549;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=4;PP=985;ReadPosRankSum=0.899;SC=AGTGGGCCTGCAGGAGCCTCA;SOR=1.440;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=92;TCF=81;TCR=11;TR=49;WE=27207579;WS=27207561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,49:0.51:96
chr17	27210253	rs6505095	T	C	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.768;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=1053;ReadPosRankSum=-0.955;SC=TCTTCACCTGTCAGTGACGAC;SOR=0.571;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=102;TCF=37;TCR=65;TR=50;WE=27210261;WS=27210243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,51:0.50:101
chr17	27213104	.	AC	A	53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=21;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=53;QD=16.0;SC=CAGTAATCCAACCCCCCAACT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=5;WE=27213112;WS=27213094;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,5:0.31:16
chr17	27225937	rs4795473	C	T	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.677;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=323;ReadPosRankSum=1.144;SC=AGAAAGGAGTCGGGCTAGGCA;SOR=0.030;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=17;WE=27225945;WS=27225927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr17	27246368	rs68042462	CCTCCCCTCCTTGATCCTAACATT	C	2168.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.18;QD=45.18;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	27286154	.	G	A	4019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.481;ClippingRankSum=0.000;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.879;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=63;PP=2962;ReadPosRankSum=0.494;SC=AAGTGGCTACGGGGCCCTGAG;SOR=0.640;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=301;TCF=180;TCR=121;TR=159;WE=27286162;WS=27286144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,159:0.52:308
chr17	27290969	rs11450637	T	TG	675.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=765;ReadPosRankSum=-0.445;SC=CCCTTTCCCCTGGGCACTCAC;SOR=0.796;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=56;TCF=51;TCR=5;TR=23;WE=27290977;WS=27290959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,25:0.45:56
chr17	27306661	rs62068969	G	A	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.736;HP=7;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=16;PP=989;ReadPosRankSum=0.211;SC=GAATACACCCGCCCCAGCTTT;SOR=0.822;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=123;TCF=85;TCR=38;TR=55;WE=27306669;WS=27306651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,56:0.46:123
chr17	27382061	rs68136852	C	A	2515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=3;PP=2152;SC=ACCACTCATGCCACTCTGATT;SOR=5.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=72;TCF=69;TCR=3;TR=72;WE=27382069;WS=27382051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr17	27412805	rs7209661	T	G	1160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=33;PP=950;SC=GACCAGGTAGTGGGATGCGTG;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=34;WE=27412813;WS=27412795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	27413403	rs8080570	T	C	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=3;PP=506;SC=GTTCCAGAGGTGGTCAAGAGG;SOR=3.816;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=27413411;WS=27413393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	27413908	rs4795495	C	G	1719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=5;PP=1545;SC=TCAGCAGCTACTCAAGGGGCT;SOR=4.133;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=45;TCR=5;TR=50;WE=27413916;WS=27413902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	27414230	.	T	C	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-6.497;ClippingRankSum=0.000;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.813;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=31;PP=526;ReadPosRankSum=0.517;SC=TGAGGAGGCCTGGGGTCGAGC;SOR=0.114;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=77;TCF=1;TCR=76;TR=32;WE=27414238;WS=27414220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,32:0.42:77
chr17	27416860	.	T	C	1919	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=68;NR=2;PP=1919;QD=27.9110173221;SC=GGCCTGGCAGTGAGGCACAGG;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=71;TCF=69;TCR=2;TR=70;WE=27416868;WS=27416859;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr17	27419695	rs12602934	G	A	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=7;PP=551;SC=GCTGGGCGGTGAGACAGTAAG;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=22;WE=27419703;WS=27419685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	27420304	rs12603438	G	C	2305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=4;PP=1925;SC=CATGGGCAGGGAGCCGGCCAG;SOR=5.196;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=64;TCR=4;TR=68;WE=27420312;WS=27420294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	27421911	rs2019988	T	G	3772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=61;PP=2892;ReadPosRankSum=-0.929;SC=TGACCCCAGGTTGTGAGGGGG;SOR=0.316;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=47;TCR=62;TR=108;WE=27421919;WS=27421901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,120:0.99:121
chr17	27422053	rs2320786	C	T	2368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=52;PP=1816;SC=CCTCCTCATGCGCCTGCGAGA;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=25;TCR=52;TR=77;WE=27422061;WS=27422043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	27424163	rs748737	A	C	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=6;PP=585;SC=CTGCCCCCAGAGTTCACTGGA;SOR=2.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=27424171;WS=27424153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	27424316	rs8067806	G	A	2770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=39;PP=2368;SC=GCCGTTTCTTGGTGAAGTCCA;SOR=1.090;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=49;TCR=39;TR=88;WE=27424324;WS=27424306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	27425793	rs12450936	A	G	2140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=12;PP=1645;SC=AAGATAAACCAGCAAGGCTTC;SOR=3.116;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=61;TCR=12;TR=73;WE=27425801;WS=27425783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	27437134	rs2279958	A	G	3049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=61;PP=2322;SC=CGAGGGGAAGAGACTGCCCTC;SOR=1.408;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=35;TCR=61;TR=96;WE=27437142;WS=27437124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr17	27437208	rs2279959	A	G	1454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=38;PP=1272;SC=CACTGCTCACAGGGTAGCAGC;SOR=3.467;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=44;WE=27437216;WS=27437198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	27437710	rs1994663	C	G	1990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=52;PP=1624;SC=CGCTCCTCCCCCAAGGCCCCA;SOR=3.056;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=10;TCR=54;TR=61;WE=27437718;WS=27437700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	27438469	rs8076604	G	A	4540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=14;PP=2965;ReadPosRankSum=0.914;SC=GAGCCGGGGGGCATTCTGGGT;SOR=2.833;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=124;TCR=14;TR=137;WE=27438477;WS=27438459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,142:0.99:143
chr17	27441077	rs12601535	C	G	8141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=149;NR=103;PP=2965;SC=AGTCATCCGTCGGGGGTTCCA;SOR=1.170;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=252;TCF=149;TCR=103;TR=252;WE=27441085;WS=27441067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,257:1.00:257
chr17	27443631	rs144361514	G	GCACACACACACACA,GCACACACACACACACA	1336.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=0,0;NR=15,15;PP=402,90;SC=TGGGACAAACGCACACACACA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=15,15;WE=27443639;WS=27443621;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.35,0.65:26
chr17	27449059	rs877492	C	A	2494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=70;PP=2105;SC=TATCCTCCCCCCCACTGCATC;SOR=3.339;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=13;TCR=71;TR=83;WE=27449067;WS=27449049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr17	27455707	rs55939148	AC	A	651.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=707;SC=CCACGAGGCTACCCCAGGAAG;SOR=3.716;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=19;WE=27455715;WS=27455697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	27455736	rs8075284	A	G	1019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.49;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	27456255	rs11080078	G	C	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=380;SC=CAAGCACTGAGGAGCCCAGCA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=27456263;WS=27456245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	27492869	rs6505113	A	G	2569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=15;PP=2003;SC=GGCTCTGATAACAGCTCTTGG;SOR=2.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=59;TCR=15;TR=74;WE=27492877;WS=27492859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	27579011	rs55885610	C	T	1412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=13;PP=1054;ReadPosRankSum=-0.938;SC=TTATCTAAAACGAAAGATGCC;SOR=0.609;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=106;TCF=81;TCR=25;TR=51;WE=27579019;WS=27579001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,56:0.50:112
chr17	27594333	.	C	A	266	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=8;NR=2;PP=266;QD=30.0771212547;SC=TGGCCTCCCACAGTGTTGGGA;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=27594341;WS=27594332;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	27613677	rs12452857	G	A	2911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=41;PP=2337;ReadPosRankSum=-0.250;SC=CAGAAGAGATGGGTGTTAGAG;SOR=0.681;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=228;TCF=142;TCR=86;TR=107;WE=27613685;WS=27613667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,110:0.47:234
chr17	27809104	rs6505138	A	G	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.748;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.472;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=72;ReadPosRankSum=0.771;SC=ATGTCCAGATATATTGGCTAG;SOR=0.061;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=5;WE=27809112;WS=27809096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr17	27835138	rs508706	C	T	2424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.647;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=80;PP=1888;ReadPosRankSum=0.436;SC=ACCAGGCTGCCATGGAGAAAG;SOR=0.906;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=244;TCF=58;TCR=186;TR=102;WE=27835146;WS=27835128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,101:0.42:242
chr17	27861113	rs150300324	TTC	T	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=5.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.14;ReadPosRankSum=-0.779;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,4:0.15:27
chr17	27861329	rs3744624	T	C	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=355;ReadPosRankSum=-0.079;SC=GTATAAGTAATAGAAGGAAAA;SOR=0.579;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=18;WE=27861337;WS=27861319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr17	27889578	rs539307	T	C	4137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=34;PP=2965;SC=GGCCAGGTCTTTCACCTTGTG;SOR=2.038;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=90;TCR=34;TR=124;WE=27889586;WS=27889568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr17	27889986	rs542939	T	C	2529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=7.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=64;PP=2035;ReadPosRankSum=0.565;SC=TCCCAGTAGGTATCCCAGCTG;SOR=0.672;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=204;TCF=65;TCR=139;TR=95;WE=27889994;WS=27889976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,97:0.47:208
chr17	27893015	rs2292973	G	A	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.509;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=3;PP=508;ReadPosRankSum=-0.083;SC=GCCCACGCCTGTTCCAATGCT;SOR=1.179;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=56;TCF=48;TCR=8;TR=26;WE=27893023;WS=27893005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,27:0.48:56
chr17	27895682	rs200199476	GC	G	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.723;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.94;MQRankSum=1.602;QD=6.70;ReadPosRankSum=-0.349;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr17	27898828	rs565977	T	C	2757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.173;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=61;PP=2210;ReadPosRankSum=-0.525;SC=TTTCCTCTTGTTTGTCCCCAC;SOR=0.562;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=254;TCF=100;TCR=154;TR=105;WE=27898836;WS=27898818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,107:0.41:258
chr17	27901975	rs550818	A	G	3254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.404;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=66;PP=2479;ReadPosRankSum=-0.429;SC=ACTTTAAGCCACCAGCTGAGA;SOR=0.661;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=318;TCF=167;TCR=151;TR=142;WE=27901983;WS=27901965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,144:0.44:324
chr17	27904322	rs601364	A	G	6103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=158;PP=2965;SC=CTGACGCAGGACGGCAGGGAC;SOR=3.138;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=190;TCF=31;TCR=159;TR=189;WE=27904330;WS=27904312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr17	27904617	rs2278217	C	A	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=21;PP=1392;ReadPosRankSum=0.363;SC=GGAGGGACCGCGGGGATGAAG;SOR=0.691;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=125;TCF=85;TCR=40;TR=67;WE=27904625;WS=27904607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,68:0.52:130
chr17	27904711	rs11080105	G	A	2273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.742;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=52;PP=1784;ReadPosRankSum=-1.217;SC=GGAAGGGCACGGCACTGCGCT;SOR=0.825;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=196;TCF=88;TCR=108;TR=92;WE=27904719;WS=27904701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,93:0.47:197
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chr17	27910706	rs2303623	C	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=305;ReadPosRankSum=-0.126;SC=TGCTCTGGCCCGTGCCAAGCC;SOR=0.836;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=16;WE=27910714;WS=27910696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
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chr17	27949934	rs77991986	G	GC	817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=14;PP=842;SC=AGAGGGCGGGGCTAGCATAGG;SOR=1.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=19;WE=27949942;WS=27949924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	27958231	.	G	A	1913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.696;ClippingRankSum=0.000;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.811;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=39;PP=1502;ReadPosRankSum=-0.734;SC=CCTCCATCGCGTGCATGCCTG;SOR=0.872;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=151;TCF=73;TCR=78;TR=73;WE=27958239;WS=27958221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,75:0.49:154
chr17	27959903	rs2289629	G	A	2388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=55;PP=1864;ReadPosRankSum=-0.209;SC=TGCATTTTCCGAGTGAGACTG;SOR=0.656;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=197;TCF=76;TCR=121;TR=90;WE=27959911;WS=27959893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,92:0.44:207
chr17	28011502	rs4794860	A	T	1187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=2.206;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=-0.921;QD=12.50;ReadPosRankSum=-0.514;SOR=1.362;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,50:0.53:95
chr17	28029938	rs3102560	T	C	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.450;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=2;PP=737;ReadPosRankSum=0.655;SC=ACAAAAGATATAGTTACCAAG;SOR=2.416;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=72;TCF=63;TCR=9;TR=35;WE=28029946;WS=28029928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,34:0.47:72
chr17	28120851	rs2617882	A	C	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.394;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.736;NF=42;NR=6;PP=1087;ReadPosRankSum=1.070;SC=GAGAAAAAACAATAACTACTA;SOR=0.380;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=86;TCF=77;TCR=9;TR=48;WE=28120859;WS=28120841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,49:0.56:88
chr17	28120887	rs72823964	C	T	1557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.529;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.957;NF=45;NR=15;PP=1163;ReadPosRankSum=-0.556;SC=ACAAAAATGCCGTAGGATATA;SOR=1.010;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=128;TCF=92;TCR=36;TR=60;WE=28120895;WS=28120877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,63:0.47:134
chr17	28268800	rs4567782	A	C	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.810;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=549;ReadPosRankSum=-0.098;SC=TTTGGTGATAACTTTTGGAGT;SOR=0.307;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=67;TCF=45;TCR=22;TR=26;WE=28268808;WS=28268790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,27:0.41:66
chr17	28296327	rs9897794	T	G	3050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.945;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=59;PP=2417;ReadPosRankSum=0.663;SC=TTACCAGAGGTTGATGAAAGA;SOR=0.528;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=222;TCF=104;TCR=118;TR=114;WE=28296335;WS=28296317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,116:0.51:226
chr17	28320248	rs4795524	T	A	10362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=186;NR=128;PP=2965;SC=GACAAAATCATAGTCAAGGTG;SOR=1.096;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=315;TCF=186;TCR=129;TR=314;WE=28320256;WS=28320238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr17	28323499	rs12944395	A	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.563;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=112;ReadPosRankSum=0.052;SC=AGGGGCAATTAGGCTCTTCCA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=5;TCR=14;TR=5;WE=28323507;WS=28323489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr17	28378276	rs11653805	C	T	2231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.537;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=61;PP=1763;ReadPosRankSum=2.736;SC=GCTGGAGTGTCGCAGTGCACT;SOR=0.463;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=145;TCF=34;TCR=111;TR=83;WE=28378284;WS=28378266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,84:0.58:146
chr17	28381141	rs4074170	C	G	2086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-7.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.812;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=69;PP=1614;ReadPosRankSum=-1.754;SC=AAGTTCCAACCTTAAGCAGAA;SOR=1.058;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=163;TCF=27;TCR=136;TR=81;WE=28381149;WS=28381131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,82:0.49:166
chr17	28386526	rs4075623	A	G	746.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.666;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=611;ReadPosRankSum=-1.415;SC=CAATGAACATATATCTTCCGT;SOR=1.165;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=71;TCF=58;TCR=13;TR=30;WE=28386534;WS=28386516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,29:0.40:72
chr17	28407287	rs11080114	C	T	2130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-7.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.938;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=67;PP=1531;ReadPosRankSum=-1.676;SC=AGATTGGTTTCACCCTCCTAA;SOR=0.148;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=177;TCF=21;TCR=156;TR=80;WE=28407295;WS=28407277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,87:0.48:183
chr17	28407876	rs7221743	T	G	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.045;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=411;ReadPosRankSum=-0.248;SC=ATTATAATGGTTCATTCCTGG;SOR=1.413;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=48;TCF=28;TCR=20;TR=21;WE=28407884;WS=28407866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr17	28410124	rs12941382	T	C	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.322;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=345;ReadPosRankSum=0.856;SC=TGTTATTTCTTGCTAATATTT;SOR=0.133;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=51;TCF=10;TCR=41;TR=23;WE=28410132;WS=28410114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr17	28417376	rs8065059	T	C	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=259;ReadPosRankSum=0.093;SC=CAATATGTTTTGGTGGAATGA;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=10;WE=28417384;WS=28417366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr17	28434826	rs5819880	ACTTTT	A	741.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.950;NF=16;NR=0;PP=678;ReadPosRankSum=-1.259;SC=CTCCACTCTTACTTTTCTTTT;SOR=0.927;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=16;WE=28434838;WS=28434816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr17	28444183	rs6505162	A	C	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=443;ReadPosRankSum=-1.278;SC=TTGCTTCCTAACCCGCGCTTG;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=19;WE=28444191;WS=28444173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr17	28444254	rs8067576	T	A	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=130;ReadPosRankSum=-0.221;SC=CCTGGCTTCCTTAGAGGGCCT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=7;WE=28444262;WS=28444244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr17	28505024	rs7221154	G	A	676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.235;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=507;ReadPosRankSum=-0.037;SC=TTCTCAAAAAGCATAGACTTT;SOR=1.015;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=25;WE=28505032;WS=28505014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
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chr17	28549898	rs6354	G	T	4259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=101;PP=2965;SC=TATTCTGCAAGAGAGGGCAAG;SOR=2.682;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=26;TCR=101;TR=127;WE=28549906;WS=28549888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr17	28549978	rs25528	G	T	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=44;PP=1239;SC=GGTGGTTGGTGTCGCCGTCCC;SOR=7.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=44;WE=28549986;WS=28549968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	28576076	rs1050565	T	C	1185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.121;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=8;PP=970;ReadPosRankSum=0.259;SC=GCTGGCAGGATAATGGGTTCC;SOR=1.117;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=113;TCF=91;TCR=22;TR=48;WE=28576084;WS=28576066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,48:0.41:117
chr17	28612448	rs7342921	G	C	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.128;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=25;PP=569;ReadPosRankSum=0.300;SC=TTTCTCCTTTGGTTGCTCCAC;SOR=1.154;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=87;TCF=34;TCR=53;TR=38;WE=28612456;WS=28612438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,38:0.43:88
chr17	28618972	rs34774348	T	TCGG	789.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=1.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=1.974;QD=15.48;ReadPosRankSum=0.607;SOR=0.337;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,23:0.45:51
chr17	28646057	rs6505173	A	G	1632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.289;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=57;PP=1332;ReadPosRankSum=-0.490;SC=AATCTCAAAAAGTAGGTATGA;SOR=3.618;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=109;TCF=4;TCR=105;TR=57;WE=28646065;WS=28646047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,58:0.53:110
chr17	28773092	rs200654089	A	AT	821.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.852;NF=1;NR=28;PP=1048;ReadPosRankSum=1.436;SC=TAAAATCAGCATTAGCCATGT;SOR=0.422;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=29;WE=28773100;WS=28773082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,29:0.60:48
chr17	28778720	rs2253256	G	C	2139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.873;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=32;PP=1665;ReadPosRankSum=-0.203;SC=ATTTCTGTTTGTGCTTCAGTT;SOR=0.842;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=173;TCF=100;TCR=73;TR=80;WE=28778728;WS=28778710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,84:0.48:175
chr17	28811658	rs5819903	G	GT	561.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=388;ReadPosRankSum=-0.383;SC=TATTTTGATTGTTTTTTTTTT;SOR=0.656;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=52;TCF=47;TCR=5;TR=24;WE=28811666;WS=28811648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr17	28890203	rs216455	T	C	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.950;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.275;NF=18;NR=10;PP=480;ReadPosRankSum=0.314;SC=CGGTAGCCTGTTCTCCCCCTC;SOR=0.881;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=28;WE=28890211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,29:0.41:70
chr17	28900708	rs3764416	G	T	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=4;NR=7;PP=215;SC=CCTCAGTGGGGGGAGAGGTGG;SOR=1.445;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=11;WE=28900716;WS=28900698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	28900915	rs58713975	C	G	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.605;NF=5;NR=1;PP=112;ReadPosRankSum=-0.054;SC=CCTCTCCCCTCCCTTGGGGTC;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6;WE=28900923;WS=28900905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr17	29061914	rs112173912	G	C	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.12;MQRankSum=-0.597;QD=2.53;ReadPosRankSum=1.996;SOR=0.962;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
chr17	29161503	rs11080134	A	G	2047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.886;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=49;PP=1788;ReadPosRankSum=-1.600;SC=GCTCCAATTGAAATTAGTAGC;SOR=0.487;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=162;TCF=54;TCR=108;TR=75;WE=29161511;WS=29161493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,76:0.45:168
chr17	29171791	.	G	A	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.687;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=5.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.87;MQRankSum=-5.300;QD=3.26;ReadPosRankSum=-2.376;SOR=2.271;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr17	29195444	rs201420202	CT	C	96.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-2.617;QD=1.36;ReadPosRankSum=-1.063;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,16:0.23:71
chr17	29221227	rs9898911	A	T	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=4.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=390;ReadPosRankSum=0.654;SC=GGGGAAATCAATAGAGTTTTT;SOR=1.697;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=17;WE=29221235;WS=29221217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr17	29283608	.	C	T	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.285;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=143;ReadPosRankSum=-0.475;SC=ATGCTCTTTTCATTGTCTTCT;SOR=0.593;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=9;WE=29283616;WS=29283598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr17	29482878	rs2269855	G	A	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=187;ReadPosRankSum=0.220;SC=TGAGATGCAAGTATAGGTATC;SOR=0.350;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=10;WE=29482886;WS=29482868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr17	29486152	rs2952976	G	A	4058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.388;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=59.96;MQRankSum=-0.944;NF=68;NR=81;PP=2962;ReadPosRankSum=0.110;SC=TTGTGAATTTGATCTTGAGAA;SOR=0.801;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=290;TCF=130;TCR=160;TR=149;WE=29486160;WS=29486142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,156:0.53:297
chr17	29496819	rs2905807	C	T	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.239;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.688;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=3;PP=108;ReadPosRankSum=-0.102;SC=CTGCCTTGGCCTCCTGAAGTG;SOR=0.160;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=7;WE=29496827;WS=29496809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr17	29508775	rs1801052	G	A	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.154;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=380;ReadPosRankSum=0.373;SC=TTACAAAACTGTACCAGATCC;SOR=0.445;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=57;TCF=31;TCR=26;TR=22;WE=29508783;WS=29508765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,25:0.40:62
chr17	29509791	rs2953000	C	T	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.88;ReadPosRankSum=0.685;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr17	29545987	rs67472948	A	AT	1045.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.374;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=5;PP=884;ReadPosRankSum=1.707;SC=CGATTTATTTATTTTTTTAAT;SOR=2.561;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=87;TCF=66;TCR=21;TR=37;WE=29545995;WS=29545977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,44:0.53:83
chr17	29546175	rs2905880	T	C	2480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.618;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=65;PP=2026;ReadPosRankSum=-2.578;SC=GAAGGAAAGATTGTAACTATG;SOR=0.624;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=174;TCF=47;TCR=127;TR=90;WE=29546183;WS=29546165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,91:0.52:176
chr17	29553336	rs141114572	G	GAC	249.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=717;ReadPosRankSum=0.616;SC=TGTATGCGGAGACACACACAC;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=13;WE=29553344;WS=29553326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
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chr17	29559932	rs2066736	C	A	2270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.888;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=29;PP=1955;ReadPosRankSum=0.116;SC=TATAGAAATACAAAACCTAGA;SOR=0.478;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=160;TCF=106;TCR=54;TR=80;WE=29559940;WS=29559922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,81:0.49:167
chr17	29563073	.	T	TTG	2728	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=5;MMLQ=28;MQ=61.67;NF=14;NR=69;SC=CCGCTGTTTTTTGTTTTTTTT;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=152;TCF=18;TCR=134;TR=83;WS=29563063;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:69,83:0.55:152
chr17	29563076	rs59745739	T	TG	3106.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=12.960;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.18;MQRankSum=6.046;QD=19.79;ReadPosRankSum=2.203;SOR=0.191;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,85:0.54:157
chr17	29563085	rs56874702	T	TG	2894.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=9.517;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.45;MQRankSum=4.353;QD=20.98;ReadPosRankSum=1.745;SOR=0.206;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,74:0.54:138
chr17	29646032	rs1129506	G	A	3337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-7.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=90;PP=2662;ReadPosRankSum=1.773;SC=CCGTGGGCATGCTTGGCAATC;SOR=0.867;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=257;TCF=85;TCR=172;TR=130;WE=29646040;WS=29646022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,131:0.51:257
chr17	29647358	rs3837848	A	AT	877.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.224;HP=7;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=5.159;NF=41;NR=3;PP=1016;ReadPosRankSum=0.000;SC=GAGTCCTTTTATTTAAAAAAA;SOR=1.382;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=71;TCR=5;TR=44;WE=29647369;WS=29647348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,38:0.53:72
chr17	29653293	rs9894648	T	C	1716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=8.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.896;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=53;PP=1467;ReadPosRankSum=1.238;SC=CTGTGTTTTGTAAACGATTCA;SOR=1.346;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=130;TCF=21;TCR=109;TR=62;WE=29653301;WS=29653283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,62:0.46:134
chr17	29654876	rs2285894	T	A	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.993;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=190;ReadPosRankSum=-0.194;SC=TTTAAAATTCTCTTCAGTTTG;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=12;WE=29654884;WS=29654866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr17	29663614	.	GTT	G	355	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=12;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=28;MQ=59.51;NF=14;NR=6;PP=355;QD=18.2;SC=TGAGTCCCATGTTTTTTTTTT;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=65;TCF=37;TCR=28;TR=20;WE=29663623;WS=29663604;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:45,20:0.31:65
chr17	29663624	rs7406038	T	A	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-4.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=1.016;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.888;QD=16.50;ReadPosRankSum=-0.907;SOR=0.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr17	29663625	rs7406039	T	A,TA	1621.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=10.221;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-0.098;QD=30.03;ReadPosRankSum=0.665;SOR=1.750;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:2,33,19:0.61,0.35:54
chr17	29670190	rs7405740	C	G	2863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=81;PP=2371;SC=TTATGAAGTACTATTAAGAAA;SOR=6.689;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=82;TCF=1;TCR=81;TR=82;WE=29670198;WS=29670180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr17	29675971	rs2525569	T	A	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.044;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=-1.201;SC=TTAATTATTCTCATTCACATA;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=29675979;WS=29675961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr17	29679246	rs964288	G	A	952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.478;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=7;PP=689;ReadPosRankSum=1.000;SC=CATATTAATTGATTTTTCTCT;SOR=0.068;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=61;TCF=53;TCR=8;TR=35;WE=29679254;WS=29679236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,38:0.59:64
chr17	29684553	rs7350943	C	T	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=510;ReadPosRankSum=0.106;SC=TTTTGACCTACTAGATCTATT;SOR=1.096;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=23;WE=29684561;WS=29684543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,23:0.59:39
chr17	29694434	.	C	T	1339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.175;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.899;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=45;PP=980;ReadPosRankSum=-1.370;SC=GTAAAGCCACCACTTTATAAG;SOR=0.318;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=109;TCF=9;TCR=100;TR=50;WE=29694442;WS=29694424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,53:0.47:112
chr17	29705947	rs2525574	T	C	4114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.775;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=76;PP=2955;ReadPosRankSum=-0.654;SC=GAACAGCCTCTGACAAAGCTG;SOR=0.647;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=372;TCF=212;TCR=160;TR=174;WE=29705955;WS=29705937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:204,178:0.47:382
chr17	29815385	rs57391434	G	T	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.091;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=172;ReadPosRankSum=-1.044;SC=GCGGAGAGCGGACTTGGCCTG;SOR=1.371;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=12;WE=29815393;WS=29815375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr17	29815404	rs8075239	T	G	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.660;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=7;PP=225;ReadPosRankSum=0.106;SC=TGGGAGGTCGTGTTACCTGAG;SOR=0.807;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=46;TCF=22;TCR=24;TR=16;WE=29815412;WS=29815394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr17	29848460	rs8066569	G	C	1340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=33;PP=1097;SC=GGGGGGGTGCGAGTCCTGAGC;SOR=4.021;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=36;WE=29848468;WS=29848450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	29849129	rs75048991	G	A	1649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.191;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=48;PP=1364;ReadPosRankSum=0.957;SC=CCTGGAGGGAGAAGCTACGGG;SOR=1.516;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=115;TCF=28;TCR=87;TR=59;WE=29849137;WS=29849119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,59:0.52:114
chr17	29849479	rs60594701	C	T	3773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.335;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=121;PP=2962;ReadPosRankSum=1.551;SC=GCCGGGGCTCCCTGCCAGCAG;SOR=1.622;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=224;TCF=18;TCR=206;TR=128;WE=29849487;WS=29849469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,131:0.59:223
chr17	29852092	rs2023795	A	G	51.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.398;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=2;PP=27;ReadPosRankSum=0.329;SC=GAGCTTGCCCATTGCGCTGTC;SOR=0.223;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=4;WE=29852100;WS=29852082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr17	29857460	rs61731602	G	A	1489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.644;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=49;PP=1176;ReadPosRankSum=-2.154;SC=CTCTGGCTGCGGAGATAGACA;SOR=0.248;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=130;TCF=14;TCR=116;TR=57;WE=29857468;WS=29857450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,58:0.45:129
chr17	30183663	rs71142094	G	GC	1084.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=2;PP=1192;SC=GAAGCTCCAAGCAAGGCTTCC;SOR=4.548;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=26;WE=30183671;WS=30183653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	30183857	rs8068049	T	C	1771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=31;PP=1424;SC=CTCTCCTGACTGGAGTGGTCA;SOR=0.871;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=58;TCF=27;TCR=31;TR=58;WE=30183865;WS=30183847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	30185565	rs9906443	G	A	1478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=1;PP=1222;SC=TGTAATAACGGTCTGTAACGT;SOR=6.184;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=42;TCR=1;TR=43;WE=30185573;WS=30185555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	30185892	rs11542477	A	G	2967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=81;PP=2459;SC=CTGCTGACCCAGAGCGCCCAC;SOR=3.865;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=11;TCR=81;TR=92;WE=30185900;WS=30185882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	30190467	.	T	C	1336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.262;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.075;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=17;PP=1056;ReadPosRankSum=-0.124;SC=CGCCAGTAGATCTGTCCACAG;SOR=1.144;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=81;TCF=50;TCR=31;TR=50;WE=30190475;WS=30190457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,50:0.60:83
chr17	30222002	rs3760454	T	C	2351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=60;PP=1819;SC=TCTTCTTCTCTGGATCAGCTC;SOR=2.191;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=20;TCR=60;TR=80;WE=30222010;WS=30221992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	30509939	rs6505286	C	G	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=26;PP=782;SC=TTACTAAATTCGGGTTTTAAA;SOR=5.283;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=27;WE=30509947;WS=30509929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	30611885	rs60163475	A	G	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.889;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=28;PP=859;ReadPosRankSum=-0.219;SC=TTTGAGGGTTATGGCTTCCAC;SOR=0.396;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=92;TCF=32;TCR=60;TR=46;WE=30611893;WS=30611875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,47:0.50:94
chr17	30625205	rs4795690	G	A	997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.292;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=31;PP=742;ReadPosRankSum=1.744;SC=GCTTGTCTACGTGGCCGGTGT;SOR=0.430;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=89;TCF=14;TCR=75;TR=39;WE=30625213;WS=30625195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,40:0.43:92
chr17	30643361	rs2344973	A	G	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=413;ReadPosRankSum=-0.901;SC=CCAGGGCCTGAGGTTCAAAGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=20;WE=30643369;WS=30643351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr17	30659006	rs1019152	T	A	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=88;ReadPosRankSum=0.464;SC=GCCTAGAAAATGATTACCCAG;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=5;WE=30659014;WS=30658996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr17	30692548	.	G	C	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;BaseQRankSum=2.277;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.247;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=264;ReadPosRankSum=1.936;SC=TATATTTAAAGATAAAGTACA;SOR=2.033;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=13;WE=30692556;WS=30692538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,16:0.31:52
chr17	30980972	rs2249638	G	A	4349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=94;PP=2965;SC=GCTTCTGAAAGAGAAAGGAAA;SOR=1.828;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=132;TCF=38;TCR=94;TR=132;WE=30980980;WS=30980962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr17	31039255	rs11080184	T	C	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-6.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=33;PP=531;ReadPosRankSum=0.641;SC=GAAAACCATATGGTCATCTCA;SOR=0.495;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=80;TCF=2;TCR=78;TR=34;WE=31039263;WS=31039245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,36:0.44:81
chr17	31072453	rs6505311	A	G	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=264;ReadPosRankSum=-0.703;SC=GTATTAAAGGATACCAAATTT;SOR=0.874;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=12;WE=31072461;WS=31072443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr17	31082747	rs4548927	T	C	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=235;ReadPosRankSum=1.917;SC=ACCCTGATGCTCCCATTTGTA;SOR=0.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=12;WE=31082755;WS=31082737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chr17	31107845	rs10512439	A	G	1672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=58;PP=1385;ReadPosRankSum=-0.459;SC=CTGTGGTTACAGAGAAATGAT;SOR=0.849;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=110;TCF=2;TCR=108;TR=59;WE=31107853;WS=31107835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,59:0.54:110
chr17	31266419	rs2726134	T	C	3441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-7.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.027;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.016;NF=87;NR=11;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.357;SC=AGCGAGACTCTGTCTCAGGAA;SOR=0.491;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=182;TCF=164;TCR=18;TR=98;WE=31266451;WS=31266409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,96:0.55:174
chr17	31266438	rs377006515	A	AAAGG	5693.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FS=5.573;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.47;MQRankSum=-1.018;QD=20.19;ReadPosRankSum=5.108;SOR=1.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,144:0.51:282
chr17	31319024	rs2188953	A	C	2601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.36;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	31319033	rs3922357	G	C	2565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.06;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	31319092	rs2188952	T	G	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=19;NR=31;PP=1271;SC=TAGGGTGGGGTTATCCTGGCC;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=19;TCR=31;TR=50;WE=31319100;WS=31319082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	31319160	rs2346391	T	C	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=363;ReadPosRankSum=0.580;SC=TCTGGAGCTGTTGTGAAATGC;SOR=0.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=20;WE=31319168;WS=31319150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr17	31323728	rs140981292	A	AG	1631.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=0;PP=1682;SC=AGCAGGTGGGAGGCACCTGCC;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=40;WE=31323736;WS=31323718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	31324362	.	T	TGTGTGTAGAG,TGTGTAGAG	87.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.310;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=-2.450;NF=33;NR=1;PP=353;ReadPosRankSum=1.028;SC=TGTGTGTGTGTAGAGAGAGAG;SOR=0.124;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=84;TCF=79;TCR=5;TR=34;WE=31324370;WS=31324352;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.14:63
chr17	31324480	.	C	T	1268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=0.000;DP=242;ExcessHet=3.0103;FS=0.563;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.33;ReadPosRankSum=-0.570;SOR=0.603;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:177,61:0.26:238
chr17	31324657	rs28958	T	C	3395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=61;PP=2659;ReadPosRankSum=-1.060;SC=ACTCTCCTTCTTGTTCTTCTC;SOR=0.676;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=245;TCF=133;TCR=112;TR=131;WE=31324665;WS=31324647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,135:0.53:254
chr17	31324673	rs28957	G	A	3132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=59;PP=2516;ReadPosRankSum=2.338;SC=TTCTCTGGGCGGTGACTGGCA;SOR=0.661;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=234;TCF=119;TCR=115;TR=119;WE=31324681;WS=31324663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,122:0.50:244
chr17	31343175	rs3025251	C	T	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.572;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=136;ReadPosRankSum=1.290;SC=CTGAACATACCGTAGCACAAG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=7;WE=31343183;WS=31343165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr17	31344549	rs2074215	T	C	659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.051;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=458;ReadPosRankSum=0.460;SC=TTCCCTCTACTATGATTCTGA;SOR=0.203;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=22;WE=31344557;WS=31344539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,25:0.47:53
chr17	31350741	rs75112067	C	T	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=1;PP=669;ReadPosRankSum=-0.193;SC=GAGCGCAGAGCGTGACACACA;SOR=0.338;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=58;TCF=57;TCR=1;TR=33;WE=31350749;WS=31350731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr17	31355227	rs58042873	A	AG	1036.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=4;PP=1169;SC=GGCAGATCCCAGGGCCCTGTG;SOR=3.545;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=28;WE=31355235;WS=31355217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	31415854	rs371416854	T	C	181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=133;ReadPosRankSum=-1.663;SC=CTGAGGACCATCAATCCTGGG;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=9;WE=31415862;WS=31415844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr17	32583132	rs2857657	G	C	1921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=54;NR=2;PP=1632;SC=TGAGCTCTTTGTCTTCTCCTG;SOR=5.856;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=54;TCR=2;TR=56;WE=32583140;WS=32583122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	32583269	rs4586	T	C	6778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=105;PP=2965;SC=TCACCTGCTGTTATAACTTCA;SOR=0.702;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=212;TCF=106;TCR=106;TR=211;WE=32583277;WS=32583259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr17	32583911	rs13900	C	T	8791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.900;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=185;PP=2965;ReadPosRankSum=0.766;SC=CCCAGACACCCTGTTTTATTT;SOR=1.851;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=269;TCF=82;TCR=187;TR=266;WE=32583919;WS=32583901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,270:0.99:272
chr17	32612968	.	G	C	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.855;ClippingRankSum=0.000;DP=272;ExcessHet=3.0103;FS=2.541;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.87;ReadPosRankSum=0.184;SOR=0.532;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:211,60:0.22:271
chr17	32614442	rs4795898	T	C	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.801;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=2;PP=731;ReadPosRankSum=-1.383;SC=GCAAAGATGGTTTTACTGGGC;SOR=1.214;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=59;TCF=54;TCR=5;TR=32;WE=32614450;WS=32614432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr17	32647544	rs3138036	A	G	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=256;ReadPosRankSum=-0.883;SC=AACTCAGTCCATGAGAAGGAG;SOR=0.330;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=17;WE=32647552;WS=32647534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr17	32647744	rs3138037	T	C	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.977;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=323;ReadPosRankSum=-1.317;SC=GCTGATCAGTTCTAGGGACCA;SOR=0.257;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=14;WE=32647752;WS=32647734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,15:0.44:34
chr17	32647831	rs1133763	A	C	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=13;PP=1054;ReadPosRankSum=-1.506;SC=CTTCAAGACCAAACGGGGCAA;SOR=0.379;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=107;TCF=83;TCR=24;TR=50;WE=32647839;WS=32647821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,50:0.46:108
chr17	32684389	rs159313	T	C	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.544;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=596;ReadPosRankSum=0.130;SC=GTAAGATCTATTTCTTCCTCT;SOR=0.239;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=61;TCF=50;TCR=11;TR=33;WE=32684397;WS=32684379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,35:0.55:64
chr17	32684991	rs2072069	G	A	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=27;ReadPosRankSum=0.847;SC=GTCATCTCCTGGGTAAACCCT;SOR=0.105;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=32684999;WS=32684981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr17	32688712	rs159271	T	C	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=672;SC=AACCTTATTCTGGTAAAATAC;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=32688720;WS=32688702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	32904480	rs887231	G	A	3272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=17;PP=2650;SC=TAAGATGAGCGAAGTGCATGA;SOR=3.045;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=80;TCR=17;TR=97;WE=32904488;WS=32904470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	32904586	rs887230	C	T	5460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=70;NR=95;PP=2965;SC=TGGTTTTGTCCTGCTCACTGT;SOR=1.075;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=70;TCR=95;TR=165;WE=32904594;WS=32904576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr17	32908064	rs4795938	T	C	4210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=68;PP=2965;SC=CGACTGTTGCTCTCTCGGACC;SOR=0.785;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=69;TCR=68;TR=137;WE=32908072;WS=32908054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr17	32908210	rs7218304	T	C	2119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.75;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	32908210	.	TGGAGGGG	CGGAGGGA,CGGAGGGG	740	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=6,23;NR=16,41;PP=629,740;QD=31.0212670392;SC=CAGGCGCCACTGGAGGGGGTA;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=65;TCF=23;TCR=42;TR=22,64;WE=32908225;WS=32908200;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.34:65
chr17	32908217	rs7212426	G	A	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=1.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.32;ReadPosRankSum=0.254;SOR=0.882;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,29:0.43:68
chr17	32961751	rs2058164	C	A	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.245;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=360;ReadPosRankSum=0.232;SC=GGCAAGGGTGCGGGGTGTGTA;SOR=0.169;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=18;WE=32961759;WS=32961741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr17	32965285	rs11080288	C	CA	494.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=476;ReadPosRankSum=1.398;SC=ACCCCCCCCCCCAACGGGGTC;SOR=0.990;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=12;WE=32965293;WS=32965265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr17	33281716	rs75043272	A	G	99.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=92;ReadPosRankSum=-0.241;SC=AGTTACTCACATTAATGCCAT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=6;WE=33281724;WS=33281706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr17	33286664	rs2230552	A	G	2821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.562;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=58;PP=2101;ReadPosRankSum=1.334;SC=TGCACCAGAAACAAGCCTGTT;SOR=0.808;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=230;TCF=110;TCR=120;TR=108;WE=33286672;WS=33286654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,112:0.47:238
chr17	33288363	rs9635769	C	T	1545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.070;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=17;PP=1158;ReadPosRankSum=0.324;SC=CAAAGCTGCCCGGGCCCGCGC;SOR=0.276;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=106;TCF=79;TCR=27;TR=56;WE=33288371;WS=33288353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,60:0.55:110
chr17	33288882	rs931196	T	G	9042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=135;NR=145;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.291;SC=CAGCGCCTCATTCCGTCAAGA;SOR=0.751;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=282;TCF=136;TCR=146;TR=280;WE=33288890;WS=33288872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,282:0.99:284
chr17	33307700	rs57311484	GC	G	767.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=1;NR=21;PP=829;SC=AAGGCAGCGGGCCCGGGGCGA;SOR=4.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=22;WE=33307708;WS=33307690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	33324678	rs2074517	T	C	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=373;ReadPosRankSum=-0.860;SC=AGTTTTATCATTGTGGCCCTT;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=16;WE=33324686;WS=33324668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
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chr17	33353332	rs3926358	T	C	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=345;SC=GAGGGGTCAGTGGCGCTTGCC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=33353340;WS=33353322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	33445416	rs147268486	T	TA	2630.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.583;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=1.152;NF=59;NR=28;PP=1653;ReadPosRankSum=-0.857;SC=CATTATTGGTTAAAAAAAAAA;SOR=2.108;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=125;TCF=87;TCR=38;TR=87;WE=33445434;WS=33445406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:8,105:0.93:113
chr17	33445549	rs9901455	G	A	6269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=114;PP=2965;SC=GGATGGCAGTGGAGGTCTTCA;SOR=1.000;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=84;TCR=114;TR=198;WE=33445557;WS=33445539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr17	33448818	rs1871892	T	C	16175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=508;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=272;NR=221;PP=2965;SC=AAAACCCTTTTCAAACCCCAA;SOR=0.920;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=493;TCF=272;TCR=221;TR=493;WE=33448826;WS=33448808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,506:1.00:506
chr17	33464864	rs7215209	C	T	2374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=35;PP=1945;SC=GGCCAGCTTCCTGCCATCTGG;SOR=0.832;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=39;TCR=35;TR=74;WE=33464872;WS=33464854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	33466385	rs143252060	T	C	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.952;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=27;PP=889;ReadPosRankSum=-1.868;SC=TTGTGCCACCTATTCAATCAC;SOR=0.287;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=105;TCF=30;TCR=75;TR=43;WE=33466393;WS=33466375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,45:0.42:108
chr17	33469279	rs1471615	G	C	1552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=46;PP=1432;SC=ACACCCACCGGCACTGCTGCC;SOR=5.421;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=48;WE=33469287;WS=33469269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	33478185	rs4796042	C	G	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.87;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	33497050	rs8066133	C	T	2448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.043;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=42;PP=2002;ReadPosRankSum=-0.684;SC=GGACCTCACCCCTGGTTCACC;SOR=0.783;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=224;TCF=126;TCR=98;TR=97;WE=33497058;WS=33497040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,97:0.43:226
chr17	33497331	rs7213921	A	G	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=161;ReadPosRankSum=0.087;SC=TGCTGGGTCCAGACCCACAGG;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=9;WE=33497339;WS=33497321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr17	33501313	.	T	A	2280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.486;ClippingRankSum=0.000;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.623;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=62;PP=1735;ReadPosRankSum=-0.871;SC=AAGGCGGGTGTCATCTCTGCC;SOR=0.603;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=47;TCR=127;TR=85;WE=33501321;WS=33501303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,90:0.50:179
chr17	33501432	rs1384220	C	T	516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.431;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=417;ReadPosRankSum=-0.515;SC=GGCTGGGGGCCGAGGGTCCTG;SOR=1.638;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=19;WE=33501440;WS=33501422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr17	33502937	rs11657816	G	A	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.090;NF=8;NR=2;PP=192;ReadPosRankSum=-0.106;SC=CTGCTGCCTGGGAAGGTGTGC;SOR=0.719;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=10;WE=33502945;WS=33502927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr17	33503922	rs9902956	G	A	645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=495;ReadPosRankSum=0.331;SC=CTGATTATACGGCAGAATTTT;SOR=0.655;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=23;WE=33503930;WS=33503912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr17	33504465	rs12451132	C	T	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=2;PP=753;ReadPosRankSum=0.611;SC=GTGAGGCACTCAGGGAACAAA;SOR=0.573;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=58;TCF=55;TCR=3;TR=31;WE=33504473;WS=33504455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr17	33504809	rs4795065	C	T	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=17;PP=418;ReadPosRankSum=-0.863;SC=AAAAATGCTACAAGGCCCTTC;SOR=0.631;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=20;WE=33504817;WS=33504799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr17	33510323	rs59781678	G	C	310.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=231;ReadPosRankSum=0.772;SC=GGTAGCATGAGTGACCTGCTC;SOR=0.622;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=13;WE=33510331;WS=33510313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr17	33510656	rs8074705	A	G	377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=308;ReadPosRankSum=1.472;SC=GAATCTCCCCACCCACAGACC;SOR=0.340;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=15;WE=33510664;WS=33510646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr17	33513591	rs3744365	A	C	1830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.692;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=58;PP=1308;ReadPosRankSum=-0.301;SC=AGCGACCCTCAGGGATGCTGG;SOR=0.617;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=149;TCF=37;TCR=112;TR=78;WE=33513599;WS=33513581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,81:0.54:151
chr17	33513649	rs3744366	A	G	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.011;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=28;PP=766;ReadPosRankSum=0.820;SC=GGTTCTCCTGAAGAGTCAGGT;SOR=0.099;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=63;TCF=6;TCR=57;TR=33;WE=33513657;WS=33513639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,33:0.52:63
chr17	33520965	rs8079507	G	A	2420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.274;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.360;NF=70;NR=33;PP=1867;ReadPosRankSum=-1.133;SC=CACCTGAACCGCACTGTAGGC;SOR=0.942;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=220;TCF=147;TCR=73;TR=103;WE=33520973;WS=33520955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,101:0.46:219
chr17	33585644	rs145046723	A	G	1013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=6.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.713;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=3;PP=817;ReadPosRankSum=-0.277;SC=GTCCTGTTCTAATGGTTCTAT;SOR=0.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=72;TCF=66;TCR=6;TR=35;WE=33585652;WS=33585634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,36:0.49:73
chr17	33592046	rs36075495	CT	C	3209.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.972;NF=49;NR=52;PP=2967;ReadPosRankSum=0.895;SC=GTAGAATCTGCTTTCTTTGTT;SOR=0.726;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=200;TCF=92;TCR=108;TR=101;WE=33592054;WS=33592036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,109:0.52:210
chr17	33592621	rs2291189	C	T	3460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-6.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.171;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=78;PP=2679;ReadPosRankSum=-0.459;SC=TTCACCAAAGCAAGTGAAGTG;SOR=0.966;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=256;TCF=111;TCR=145;TR=133;WE=33592629;WS=33592611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,139:0.53:264
chr17	33679728	rs142470821	C	A	2944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.716;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=62;PP=2419;ReadPosRankSum=-0.005;SC=ATTTGCTCCACAGTCAAGTAT;SOR=0.565;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=208;TCF=90;TCR=118;TR=110;WE=33679736;WS=33679718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,107:0.52:206
chr17	33680807	rs9897352	G	A	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.82;MQRankSum=-0.921;QD=20.26;ReadPosRankSum=-0.270;SOR=0.773;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,26:0.52:50
chr17	33680811	rs9898983	C	A	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.83;MQRankSum=-0.887;QD=20.17;ReadPosRankSum=-0.701;SOR=0.853;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr17	33680840	rs28571667	T	C	2486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.88;QD=34.07;SOR=8.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr17	33687416	rs938298	C	T	3800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=38.39;ReadPosRankSum=0.572;SOR=5.570;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,98:0.99:99
chr17	33687416	.	CTGAC	TTGAA,TTGAC	1101	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=1,2;NR=47,94;PP=1101,808;QD=24.0514140596;SC=TCATGTTATTCTGACGTGTTA;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=97;TCF=2;TCR=95;TR=48,96;WE=33687428;WS=33687406;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.49:97
chr17	33687420	rs141261472	C	A	1429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.74;ReadPosRankSum=1.105;SOR=0.757;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,50:0.52:97
chr17	33689926	rs4796077	T	C	11519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=189;NR=163;PP=2965;SC=TTTAACACATTCACAATTTTG;SOR=0.859;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=355;TCF=190;TCR=165;TR=352;WE=33689934;WS=33689916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,362:1.00:362
chr17	33690863	rs4796078	G	T	3543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=92;PP=2883;SC=AAGAAATGAAGTGTTACATGC;SOR=4.366;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=9;TCR=92;TR=101;WE=33690871;WS=33690853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr17	33748939	rs2671817	G	A	4316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=38;PP=2965;SC=TCTTGCCCCAGATCCCATAGA;SOR=1.811;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=92;TCR=38;TR=130;WE=33748947;WS=33748929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr17	33749546	rs2586514	A	G	7243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=112;PP=2965;SC=ATATCAACACAGGGCCTCTTT;SOR=0.812;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=239;TCF=127;TCR=112;TR=238;WE=33749554;WS=33749536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr17	33749919	rs1849733	A	C	14732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=462;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=162;NR=292;PP=2965;SC=CTCGTGAGACACTTTCATTCT;SOR=1.463;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=454;TCF=162;TCR=292;TR=454;WE=33749927;WS=33749909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,458:1.00:458
chr17	33769034	rs62078110	G	A	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.17;MQRankSum=-4.043;QD=20.43;ReadPosRankSum=0.692;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr17	33769038	rs62078111	C	A	1010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=1.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.26;MQRankSum=-4.338;QD=19.82;ReadPosRankSum=0.867;SOR=1.168;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr17	33805150	rs2304968	T	C	3412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.972;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=79;PP=2635;ReadPosRankSum=-0.018;SC=ACGAAGAGGATAACTCTGGGA;SOR=0.406;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=259;TCF=87;TCR=172;TR=125;WE=33805158;WS=33805140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,133:0.49:271
chr17	33806863	rs12451746	G	A	2968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-7.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.569;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=39;PP=2526;ReadPosRankSum=-1.810;SC=TCACAAAAATGTGAAAGTAGT;SOR=0.578;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=270;TCF=184;TCR=86;TR=118;WE=33806871;WS=33806853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,118:0.44:271
chr17	33807250	rs9905892	T	A	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.590;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=517;ReadPosRankSum=2.382;SC=GAGTTAAGCCTGAGAGACAGC;SOR=0.175;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=45;TCF=3;TCR=42;TR=22;WE=33807258;WS=33807240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr17	33814735	rs10626701	G	GAA	5654.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.908;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.059;NF=64;NR=47;PP=2970;ReadPosRankSum=-1.798;SC=TAAAGAAAAAGAGAACGAACC;SOR=0.828;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=272;TCF=152;TCR=120;TR=111;WE=33814743;WS=33814725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,148:0.46:320
chr17	33879670	rs71366453	C	CAT	1076.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.06;QD=53.84;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	33879678	.	T	TATAC	1195	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=58.17;NF=28;NR=0;PP=1195;QD=43.5357142857;SC=CACATATATATACACATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=28;WE=33879690;WS=33879668;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,28:0.93:30
chr17	33879682	.	C	T	794	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=58.21;NF=24;NR=0;PP=794;QD=34.5321338561;SC=TATATATACACATATATATAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=24;WE=33879690;WS=33879668;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,24:0.77:31
chr17	33879682	rs71366454	C	CAT	1265.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.62;MQRankSum=-0.256;QD=39.55;ReadPosRankSum=1.300;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr17	33881631	rs321612	T	C	14074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=457;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=283;NR=154;PP=2965;SC=TCCTTAAATTTGTGGACTTTT;SOR=1.471;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=438;TCF=283;TCR=155;TR=437;WE=33881639;WS=33881621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,451:1.00:451
chr17	33881718	rs321613	G	A	12045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=213;PP=2965;SC=ACCAAACTGGGAGGAGCTAGA;SOR=2.168;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=290;TCF=76;TCR=214;TR=289;WE=33881726;WS=33881708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr17	33881734	rs321614	A	G	10709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=46;NR=191;PP=2965;SC=CTAGACAATTACATGGAAAGT;SOR=2.824;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=241;TCF=47;TCR=194;TR=237;WE=33881742;WS=33881724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr17	33881769	.	TAAAA	T,TA	5510.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.83;QD=38.01;SOR=7.068;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,37,108:0.26,0.74:145
chr17	33921160	rs225305	C	T	1107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=30;PP=931;SC=AGGCAGAATGCTGCTGACCTC;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=35;WE=33921168;WS=33921150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	33933006	rs225284	A	C	2432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=66;PP=2064;SC=TCATCCAGGGAAATTCAAACC;SOR=6.273;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=68;TCF=2;TCR=66;TR=68;WE=33933014;WS=33932996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	33963611	rs11345348	AT	A	2273.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=63;PP=2559;SC=AATCGGAAACATTAAAATGGT;SOR=8.318;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=0;TCR=65;TR=63;WE=33963619;WS=33963601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	33968871	rs225270	A	T	2933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=0;PP=2434;SC=ATTCTTTCACACTATCACAAA;SOR=8.885;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=81;TCF=81;TCR=0;TR=80;WE=33968879;WS=33968861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	33998802	rs1049379	G	C	2134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=2;PP=1763;SC=CATCATCGGTGCCTGCAACCT;SOR=6.059;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=62;TCF=60;TCR=2;TR=61;WE=33998810;WS=33998792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	34077232	rs11654604	G	A	4722.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.387;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=73;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.096;SC=TGTGGGCGCCGCAACACCAAA;SOR=0.651;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=359;TCF=222;TCR=137;TR=187;WE=34077240;WS=34077222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:180,188:0.51:368
chr17	34077428	rs11650416	A	C	1752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=7.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.115;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=63;PP=1471;ReadPosRankSum=1.271;SC=GGAGGAAAGCACTGGGGTCAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=125;TCF=3;TCR=122;TR=63;WE=34077436;WS=34077418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,64:0.49:131
chr17	34077459	rs117559122	C	T	1089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.063;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=38;PP=835;ReadPosRankSum=-0.166;SC=GGGCAGCAGACATGGGGAGTG;SOR=0.205;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=80;TCF=1;TCR=79;TR=39;WE=34077467;WS=34077449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,41:0.49:83
chr17	34100350	rs58543174	G	GC	6333.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=99;PP=2965;SC=GCCGGCTCCGGAGATGCTCAG;SOR=1.451;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=35;TCR=101;TR=133;WE=34100358;WS=34100340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr17	34325532	rs2075746	T	C	2045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=53;PP=1707;SC=CCTCCTCGGCTAGCACTTGCT;SOR=3.912;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=61;TCF=7;TCR=54;TR=60;WE=34325540;WS=34325522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	34328461	rs854625	A	G	2000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=37;PP=1519;SC=CTCACCATTTATGAACTGGGC;SOR=1.162;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=25;TCR=37;TR=62;WE=34328469;WS=34328451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	34340161	rs1734953	T	A	5285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=124;NR=33;PP=2965;SC=AATGCTTCTTTAAAAAATAAT;SOR=2.570;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=158;TCF=125;TCR=33;TR=157;WE=34340169;WS=34340151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr17	34340284	rs1003645	C	T	5244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=104;PP=2965;SC=AGCATTCTCACGCAAACCTGA;SOR=1.353;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=59;TCR=104;TR=163;WE=34340292;WS=34340274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr17	34341082	rs1719204	C	G	854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=768;SC=GGGTGGGCCACAGCAGGACCA;SOR=5.058;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=26;WE=34341090;WS=34341072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	34391617	rs2015086	A	G	1172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=0;PP=898;SC=AAGGAGAGACAACAGCTCATA;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=39;WE=34391625;WS=34391607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	34391783	rs2015070	C	T	3444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=59;PP=2660;SC=AGTCTGTCATCCATGTGCTTT;SOR=0.961;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=42;TCR=59;TR=101;WE=34391791;WS=34391773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr17	34416665	rs1719133	A	G	9567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=149;NR=143;PP=2965;SC=GGAAGAGAATAAGCCCGAGTC;SOR=0.755;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=293;TCF=149;TCR=144;TR=292;WE=34416673;WS=34416655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,299:1.00:299
chr17	34431287	rs1049750	G	T	3844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=107;NR=12;PP=2965;SC=AAACCTCTTTGCCACCAATAC;SOR=4.212;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=107;TCR=12;TR=119;WE=34431295;WS=34431277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr17	34431961	rs1719146	T	C	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=31.90;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	34432125	rs1719147	A	G	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=24;PP=1026;SC=GTGATTGAGCATTGGGGAGGC;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=17;TCR=24;TR=41;WE=34432133;WS=34432115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	34842521	rs4796224	A	G	7600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=115;PP=2965;ReadPosRankSum=2.015;SC=GCGGCGCAGTAAACAGTCTCC;SOR=0.426;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=244;TCF=128;TCR=116;TR=242;WE=34842529;WS=34842511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,247:0.99:250
chr17	34862220	rs1109442	T	C	4363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=34;PP=2965;ReadPosRankSum=0.103;SC=GCACCGATCCTGGCAGGTGCT;SOR=1.218;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=140;TCF=106;TCR=34;TR=139;WE=34862228;WS=34862210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,141:0.99:142
chr17	34869150	rs6607296	C	A	2596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.56;SOR=3.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	34869155	rs8882	G	A	2618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.93;SOR=3.150;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	34883679	.	C	G	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.596;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.878;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=445;ReadPosRankSum=0.387;SC=GATACAAGATCTAATTAAGAT;SOR=3.442;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=21;WE=34883687;WS=34883669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr17	35306312	rs2306658	G	C	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.915;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=13;PP=964;ReadPosRankSum=0.644;SC=GGTCTCTGGCGGAGTCGGGGA;SOR=0.526;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=92;TCF=67;TCR=25;TR=48;WE=35306320;WS=35306302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,48:0.53:91
chr17	35346641	rs1045056	T	C	828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.261;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=527;ReadPosRankSum=0.231;SC=CCAAGCGCTCTGTCTATCGAG;SOR=1.148;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=32;WE=35346649;WS=35346631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr17	35470031	rs55811414	T	G	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-7.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=2;PP=653;ReadPosRankSum=-1.123;SC=ACCTGCTTTCTCGGTCAGCAT;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=69;TCF=66;TCR=3;TR=37;WE=35470039;WS=35470021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,37:0.54:69
chr17	35470230	rs3815059	A	T	2627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.255;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=86;PP=2049;ReadPosRankSum=0.096;SC=TTAGAAATCAAGAAATTTCTC;SOR=1.694;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=204;TCF=43;TCR=161;TR=100;WE=35470238;WS=35470220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,104:0.50:210
chr17	35478362	rs1470452	T	C	4727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=51;PP=2965;SC=TGGCCTGATATGTCTTAAACG;SOR=1.551;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=103;TCR=51;TR=154;WE=35478370;WS=35478352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr17	35479382	rs113063499	GATGT	G	377.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.132;NF=10;NR=0;PP=407;ReadPosRankSum=0.031;SC=CAATGTTCCTGATGTATTCAC;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=10;WE=35479393;WS=35479372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr17	35486486	rs9789070	C	T	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=35;PP=1036;SC=ACAATAGTTACAGACAAAGAC;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=37;WE=35486494;WS=35486476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	35549275	rs2305099	T	C	3398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=76;PP=2761;SC=GAAAAAACAGTTCACAAGAGG;SOR=2.326;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=26;TCR=76;TR=102;WE=35549283;WS=35549265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr17	35550158	rs12603097	C	T	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=209;ReadPosRankSum=-0.908;SC=AGAAAGGAATCGGCTTTAGTT;SOR=1.022;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=12;WE=35550166;WS=35550148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr17	35550179	rs12603098	C	T	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.572;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.266;NF=14;NR=1;PP=285;ReadPosRankSum=0.339;SC=CTAAGACACACGTAAGGCAAC;SOR=2.303;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=40;TCF=32;TCR=8;TR=15;WE=35550187;WS=35550169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr17	35550278	rs111919546	AT	A	524.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.923;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.945;NF=11;NR=16;PP=297;ReadPosRankSum=1.108;SC=AGAAAAAGTAATTTTTTTTTT;SOR=0.536;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=66;TCF=29;TCR=37;TR=27;WE=35550286;WS=35550268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr17	35550448	rs2305097	C	A	1161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=33;PP=1024;SC=CATTTAGAAGCCAGTTTTCTA;SOR=3.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=36;WE=35550456;WS=35550438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	35557289	rs11659129	C	T	1824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.155;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=7;PP=1514;ReadPosRankSum=-0.456;SC=TATTAGTAAGCATAAGATTAC;SOR=0.496;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=125;TCF=113;TCR=12;TR=66;WE=35557297;WS=35557279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,68:0.52:130
chr17	35562546	rs2278679	C	T	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=607;ReadPosRankSum=0.384;SC=TATCCCTAAACGCAGAACTAG;SOR=0.853;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=50;TCR=0;TR=27;WE=35562554;WS=35562536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr17	35581887	rs144469510	TTA	T	1204.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.696;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.973;NF=39;NR=9;PP=1543;ReadPosRankSum=0.018;SC=CAGGAAAGGGTTATATATATA;SOR=0.341;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=121;TCF=97;TCR=24;TR=48;WE=35581900;WS=35581877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,63:0.61:103
chr17	35581910	.	TAC	T	515	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=60.11;NF=39;NR=9;PP=515;QD=10.8125;SC=TATATATATATACCTGCAGGT;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=154;TCF=118;TCR=36;TR=48;WE=35581919;WS=35581900;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:106,48:0.31:154
chr17	35600518	rs77260549	A	C	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.032;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=345;ReadPosRankSum=1.012;SC=AGTTAACACAATCCCCCAAAT;SOR=0.307;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=15;WE=35600526;WS=35600508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr17	35608781	rs72010031	CCT	C	1254.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.610;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.818;NF=33;NR=0;PP=1293;ReadPosRankSum=0.959;SC=GTCAACATCCCCTCTCTTTCT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=62;TCR=2;TR=33;WE=35608790;WS=35608771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,35:0.56:62
chr17	35608889	rs1519091	G	A	6223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=92;PP=2965;SC=TGTACTCAGGGCCATTGATTA;SOR=0.850;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=196;TCF=104;TCR=92;TR=196;WE=35608897;WS=35608879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr17	35609746	rs2252757	G	A	3301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=0;PP=2859;SC=TCATGTAGTGGCAGGGATTGA;SOR=9.170;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=94;TCF=94;TCR=0;TR=94;WE=35609754;WS=35609736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr17	35620815	rs111738937	G	GA	1091.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;MQRankSum=1.015;QD=10.60;ReadPosRankSum=0.264;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,52:0.50:103
chr17	35632979	rs2542660	C	A	2818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=51;PP=2138;SC=TGACTGTAACCCCTTGGCCTC;SOR=0.896;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=43;TCR=52;TR=93;WE=35632987;WS=35632969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr17	35696804	rs58654829	G	A	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.734;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=383;ReadPosRankSum=0.429;SC=TCCACTTCCAGAAAGACCTAG;SOR=1.422;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=64;TCF=29;TCR=35;TR=24;WE=35696812;WS=35696794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,26:0.40:65
chr17	35696820	rs147333574	AAAAG	A	871.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=804;ReadPosRankSum=-0.344;SC=CCTAGAGAGAAAAAGAGAGAA;SOR=0.804;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=22;WE=35696831;WS=35696810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,25:0.38:65
chr17	35766475	rs72828246	A	G	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.122;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=34;PP=908;ReadPosRankSum=0.014;SC=GACGTTCCAGAAGCATCTGAT;SOR=1.264;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=67;TCF=3;TCR=64;TR=35;WE=35766483;WS=35766465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,34:0.51:67
chr17	35771468	rs7211875	C	T	4903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=118;PP=2965;SC=CCGTTTGGGTCCCTTTAGCAG;SOR=2.833;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=28;TCR=118;TR=146;WE=35771476;WS=35771458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr17	35783565	rs8067120	C	T	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=470;ReadPosRankSum=0.167;SC=TTAAGATAACCGTAAGGTGGT;SOR=0.160;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=21;WE=35783573;WS=35783555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr17	35783812	rs7501983	A	G	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=380;ReadPosRankSum=-2.136;SC=GGAGATCTATATCTTATTAAA;SOR=0.648;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=18;WE=35783820;WS=35783802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr17	35818592	rs9897879	T	C	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=548;ReadPosRankSum=0.464;SC=ATATATGATATGTATATATAG;SOR=0.384;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=25;WE=35818600;WS=35818582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr17	35896123	rs1045000	T	C	1815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=39;PP=1385;ReadPosRankSum=-0.060;SC=GGTTATTCCATACTTTATCGA;SOR=0.701;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=44;TCR=70;TR=64;WE=35896131;WS=35896113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,69:0.57:120
chr17	35899141	rs1034686	T	A	2842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=3;PP=2280;SC=AGCCTCACCTTAGATGCATGA;SOR=6.091;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=80;TCF=77;TCR=3;TR=80;WE=35899149;WS=35899131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr17	35902225	rs3110623	C	G	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.035;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=813;ReadPosRankSum=-0.776;SC=AACATTCGTTCGGGGTTTCTT;SOR=1.163;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=61;TCF=32;TCR=29;TR=37;WE=35902233;WS=35902215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,37:0.60:62
chr17	35937792	rs377071699	T	C	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.04;ReadPosRankSum=0.799;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr17	35945575	rs112894071	G	A	1045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.144;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=33;PP=766;ReadPosRankSum=0.219;SC=ACCAGCTCCCGGGATTATACA;SOR=0.322;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=71;TCF=3;TCR=68;TR=35;WE=35945583;WS=35945565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,38:0.49:78
chr17	35956263	rs4795207	T	C	3555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=19;PP=2889;SC=ACTAAAGAAGTAAGTACCTGC;SOR=3.258;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=90;TCR=19;TR=109;WE=35956271;WS=35956253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr17	35956391	rs12944821	G	C	1309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.154;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=36;PP=1017;ReadPosRankSum=-0.805;SC=CATCAGGCCTGCTGAAAATAT;SOR=0.357;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=117;TCF=27;TCR=90;TR=49;WE=35956399;WS=35956381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,51:0.42:122
chr17	35984410	rs7216445	T	C	2341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=22;PP=1569;SC=AGTTCTCTCATGGCCAGAAGT;SOR=1.493;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=46;TCR=22;TR=68;WE=35984418;WS=35984400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	35988542	rs112553844	G	A	1423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.079;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=1;PP=1101;ReadPosRankSum=0.235;SC=ATAGCAATTAGGATATTTATA;SOR=1.519;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=101;TCF=97;TCR=4;TR=48;WE=35988550;WS=35988532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,51:0.48:107
chr17	35988672	rs7224513	C	T	2482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.196;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=55;PP=1894;ReadPosRankSum=-0.690;SC=TCATGTGTATCCTGAATCCTG;SOR=0.396;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=197;TCF=73;TCR=124;TR=94;WE=35988680;WS=35988662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,97:0.48:201
chr17	35995638	rs4622555	T	A	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.811;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=631;ReadPosRankSum=-0.569;SC=CATTCACCTGTTGAGGGACAT;SOR=0.618;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=81;TCF=43;TCR=38;TR=33;WE=35995646;WS=35995628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,33:0.40:83
chr17	36003275	rs3813911	T	A	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=0;PP=748;ReadPosRankSum=0.173;SC=CGGGTGTCCATGTGCGCCGGC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=81;TCF=81;TCR=0;TR=35;WE=36003283;WS=36003265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,35:0.43:82
chr17	36003359	rs3813910	A	G	2497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.266;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=19;PP=1890;ReadPosRankSum=-0.402;SC=CTTGGGCACAATACCTGGAAT;SOR=0.828;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=200;TCF=153;TCR=47;TR=90;WE=36003367;WS=36003349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,95:0.46:208
chr17	36047276	rs2229295	G	T	2599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=15;PP=2184;SC=CGCAGGTGCCGGTCAGGTCAC;SOR=2.720;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=64;TCR=15;TR=79;WE=36047284;WS=36047266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr17	36047501	rs8066605	G	A	1640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=4;NR=45;PP=1392;SC=AACCAGCAAAGAGCAGCAGGT;SOR=4.450;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=4;TCR=45;TR=49;WE=36047509;WS=36047491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	36058980	rs2269843	C	T	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=2;PP=455;SC=CTCAGAAGGACCTAATTTCTG;SOR=4.407;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=36058988;WS=36058970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	36059246	rs2269842	A	C	4217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=62;PP=2965;SC=TACACAGGCAAAGACACAGGT;SOR=0.753;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=67;TCR=62;TR=129;WE=36059254;WS=36059236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr17	36059302	rs13339672	T	C	2979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=67;PP=2380;SC=CTCAGGTAGATAAAAGGGCTG;SOR=2.252;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=23;TCR=67;TR=90;WE=36059310;WS=36059292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	36059377	rs2269841	A	G	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=27;PP=798;SC=CAAGTCACATAACCAACTCCC;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=36059385;WS=36059367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	36061282	rs9905004	G	A	362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=9;PP=257;SC=CAGTCACCGGGCTGAGCCTGT;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=36061290;WS=36061272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	36061297	rs2074429	C	T	251.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=161;SC=GCCTGTTACACAGGAGATTCC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=36061305;WS=36061287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	36093863	rs3216929	G	GCAGA	2152.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.270;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.365;NF=2;NR=35;PP=2153;ReadPosRankSum=1.514;SC=CCTTCACTCAGCAGACAGACA;SOR=3.352;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=63;TCF=6;TCR=57;TR=37;WE=36093871;WS=36093853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,48:0.96:50
chr17	36233930	rs2677184	G	A	7020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=122;PP=2965;SC=CATGGGCCCAGCCTAAAAATA;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=223;TCF=100;TCR=123;TR=222;WE=36233938;WS=36233920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr17	36234106	rs2677185	G	A	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=25;PP=723;SC=ACCACTACTAGAAAAAGCATT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=36234114;WS=36234096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	36352408	rs11407739	G	GT	7834.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=364;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-2.281;NF=154;NR=108;PP=2992;ReadPosRankSum=-0.185;SC=AATACTTAAAGTTTTTTTTTT;SOR=0.854;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=329;TCF=187;TCR=142;TR=262;WE=36352416;WS=36352398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:16,306:0.95:322
chr17	36352489	rs4796259	A	C	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=3.910;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.61;MQRankSum=1.501;QD=5.24;ReadPosRankSum=-0.661;SOR=0.205;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,44:0.24:180
chr17	36352537	rs62074773	A	G	1525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.12;QD=32.46;SOR=7.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	36352572	rs62074774	C	T	1089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.97;QD=33.02;SOR=7.054;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	36353560	rs111638343	C	T	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.60;QD=31.38;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	36353761	rs62074778	C	T	2399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-9.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.784;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.452;NF=6;NR=127;PP=2843;ReadPosRankSum=-0.402;SC=ATGAGTCCACCATTCCTAAAA;SOR=1.338;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=253;TCF=17;TCR=236;TR=133;WE=36353769;WS=36353751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,93:0.53:176
chr17	36357295	rs79239780	A	G	2979.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.991;HP=15;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.557;NF=12;NR=117;PP=2667;ReadPosRankSum=3.264;SC=AAAAAAAAAAAAGAAACAAAT;SOR=1.697;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=314;TCF=53;TCR=261;TR=129;WE=36357304;WS=36357285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,129:0.48:268
chr17	36357835	rs1848308	G	A	2015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.220;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.179;NF=20;NR=60;PP=1583;ReadPosRankSum=1.463;SC=ATAAATAGCTGTGAAACTACT;SOR=0.509;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=178;TCF=41;TCR=137;TR=80;WE=36357843;WS=36357825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,80:0.45:178
chr17	36358189	.	GATATATATATATAT	G,GAT	2141.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.969;ClippingRankSum=0.000;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.753;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-2.090;NF=12;NR=31;PP=1483;ReadPosRankSum=0.200;SC=CATTTATTGAGATATATATAT;SOR=2.494;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=141;TCF=28;TCR=113;TR=43;WE=36358210;WS=36358179;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.34,0.59:68
chr17	36358847	rs77355093	T	A	17680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=555;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.582;NF=393;NR=145;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.210;SC=TTTACCTCTATTGCAAATTTT;SOR=0.584;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=540;TCF=395;TCR=145;TR=538;WE=36358855;WS=36358837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,549:1.00:551
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chr17	36384810	rs142086381	A	G	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=567;ReadPosRankSum=2.419;SC=GTGAGACTCTATCTCTATTAG;SOR=0.829;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=46;TCF=42;TCR=4;TR=24;WE=36384818;WS=36384800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr17	36384868	rs71252892	C	G	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.952;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-1.604;NF=29;NR=17;PP=972;ReadPosRankSum=-1.117;SC=ATGACCCCCTCCTTTGGGCTT;SOR=0.430;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=89;TCF=59;TCR=30;TR=46;WE=36384876;WS=36384858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,43:0.51:84
chr17	36398156	rs147730015	ACACACACACC	A	1395.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=27.001;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.07;MQRankSum=-4.929;QD=7.08;ReadPosRankSum=3.155;SOR=2.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,56:0.28:197
chr17	36489302	.	G	A	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=4.441;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=459;ReadPosRankSum=-0.984;SC=GCATAAGAGTGGGAAAAAGAC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=21;WE=36489310;WS=36489292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr17	36584628	.	G	GGGC	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=1;PP=203;SC=ACCCCGGGGGGCCCCCCACAC;SOR=2.833;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=36584636;WS=36584618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	36614524	rs16965349	G	A	1583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.334;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=50;PP=1221;ReadPosRankSum=-0.390;SC=CCGGCTCGCCGCTGCCCTGGT;SOR=1.739;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=182;TCF=65;TCR=117;TR=65;WE=36614532;WS=36614514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,68:0.35:192
chr17	36614563	rs16965350	C	T	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.669;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=42;PP=1050;ReadPosRankSum=0.594;SC=GGGAGGGAGACTCTTTTGTGC;SOR=1.139;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=143;TCF=35;TCR=108;TR=52;WE=36614571;WS=36614553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,57:0.38:151
chr17	36617210	rs9898977	A	G	3216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.445;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=47;PP=2350;ReadPosRankSum=-0.934;SC=GGACCTGCACAGGACTCCTCT;SOR=0.745;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=285;TCF=186;TCR=99;TR=140;WE=36617218;WS=36617200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,147:0.50:292
chr17	36638255	rs7503829	C	T	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.146;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.765;NF=13;NR=1;PP=311;ReadPosRankSum=-0.553;SC=CTGTCTCCCCCACTTCAGATG;SOR=3.126;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=14;WE=36638263;WS=36638245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr17	36646291	rs12937928	A	G	1184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.909;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.079;NF=34;NR=12;PP=826;ReadPosRankSum=-0.919;SC=GGCCGGGAGAACAGGGGAAGG;SOR=1.430;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=105;TCF=68;TCR=37;TR=46;WE=36646299;WS=36646281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,49:0.45:108
chr17	36646386	rs9891156	A	G	2768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=63;PP=2124;SC=TTGAGGACGCACGGGAGCGAA;SOR=1.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=29;TCR=63;TR=92;WE=36646394;WS=36646376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	36666551	rs62074752	T	C	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=421;ReadPosRankSum=2.017;SC=GGGCGGGGGATGAGGCGGACG;SOR=0.651;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=82;TCF=39;TCR=43;TR=32;WE=36666559;WS=36666541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,32:0.40:80
chr17	36718610	rs6503709	T	A	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.576;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=48;PP=1418;ReadPosRankSum=-1.662;SC=GTCACCAAGGTCACCCCTGTC;SOR=0.515;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=114;TCF=35;TCR=79;TR=70;WE=36718618;WS=36718600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,72:0.59:122
chr17	36734700	rs7503695	T	C	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.136;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.215;NF=21;NR=3;PP=1886;ReadPosRankSum=0.566;SC=CCGCTGGCCGTGGCCGCAGCC;SOR=0.242;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=24;WE=36734719;WS=36734690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr17	36734706	rs144253512	CAGCCGG	C	1039.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=3.139;NF=21;NR=4;PP=1893;ReadPosRankSum=-0.196;SC=GCCGTGGCCGCAGCCGGAGCC;SOR=0.619;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=57;TCF=46;TCR=11;TR=25;WE=36734719;WS=36734690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr17	36760753	rs12952883	G	T	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.025;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=309;ReadPosRankSum=-1.648;SC=CGGCCCCCAGGGTCCCTCGGT;SOR=0.842;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=55;TCF=22;TCR=33;TR=19;WE=36760761;WS=36760743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,21:0.36:59
chr17	36830459	rs111565436	G	A	767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.193;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=19;PP=638;ReadPosRankSum=-0.700;SC=AGGAACGCCGGGCCGCCCGGT;SOR=1.639;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=27;WE=36830467;WS=36830449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr17	36830727	rs76756126	G	A	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.795;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=302;ReadPosRankSum=0.434;SC=GCCAGGCGGGGCGCAGGGCAC;SOR=0.372;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=16;WE=36830735;WS=36830717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr17	36861983	rs17855918	T	C	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=29;PP=1281;SC=TGCAGCGTGGTCGTCCACCAA;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=47;WE=36861991;WS=36861973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	36863875	rs2338034	A	G	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.041;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=32;PP=920;ReadPosRankSum=-2.216;SC=GTTGGGGTGGAGGCCGGGTTT;SOR=1.048;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=87;TCF=21;TCR=66;TR=41;WE=36863883;WS=36863865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,43:0.47:91
chr17	36872220	.	C	T	2172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.705;ClippingRankSum=0.000;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.252;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=45;PP=1667;ReadPosRankSum=1.394;SC=GGAATCCCCTCCTCTCCAAAC;SOR=0.590;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=149;TCF=67;TCR=82;TR=84;WE=36872228;WS=36872210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,84:0.54:157
chr17	36873149	rs9892493	C	T	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.382;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=31;PP=1268;ReadPosRankSum=0.768;SC=TGGTCAGCTCCGGCCTGGGAG;SOR=0.470;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=115;TCF=47;TCR=68;TR=57;WE=36873157;WS=36873139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,59:0.49:120
chr17	36881872	rs372049304	AC	A	921.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.069;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-7.576;NF=0;NR=36;PP=762;ReadPosRankSum=0.308;SC=ACCCCTCCTGACCCCCCCAAG;SOR=0.100;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=88;TCF=0;TCR=88;TR=36;WE=36881880;WS=36881862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,38:0.51:75
chr17	36887875	rs12452967	T	G	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=410;ReadPosRankSum=0.098;SC=CCCCTTGCAATGAAGCCAGAG;SOR=0.520;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=19;WE=36887883;WS=36887865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr17	36889466	rs5820264	G	GCCTGC	2304.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=2.009;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.59;ReadPosRankSum=0.199;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,54:0.41:131
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chr17	36895206	rs2075056	A	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=138;ReadPosRankSum=-0.773;SC=AGGTGAGCCCAGCCACCTTCT;SOR=0.693;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=8;WE=36895214;WS=36895196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr17	36896746	rs12601476	T	C	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=43;PP=1313;SC=GGCGCGGTGGTTCACGCCTGT;SOR=6.184;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=44;WE=36896754;WS=36896736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	36906480	rs228271	G	A	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=624;ReadPosRankSum=-0.264;SC=CCAGTGGGAAGGGGGTTGACG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=27;WE=36906488;WS=36906470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,26:0.50:52
chr17	36909061	rs228274	A	G	2810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=36;PP=2115;SC=CGATCGAGGGATCCTAGTACA;SOR=0.959;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=49;TCR=36;TR=85;WE=36909069;WS=36909051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr17	36909182	.	G	A	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.977;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.216;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=234;ReadPosRankSum=2.503;SC=GTCGATGGAAGGAAGCGGTTT;SOR=2.437;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=13;WE=36909190;WS=36909172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr17	36927690	rs25540	C	CTAAG	862.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=10;PP=717;SC=CGCGAGCTCTCTCTAATGGGG;SOR=3.716;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=12;WE=36927698;WS=36927680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	36932200	rs228293	C	G	2897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=78;NR=7;PP=2495;SC=AGCAAAATAACAGAGTCACAA;SOR=5.211;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=78;TCR=7;TR=85;WE=36932208;WS=36932190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr17	36934124	rs2075061	C	T	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=4.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=476;ReadPosRankSum=-0.186;SC=ACTGTTCTGCCGGGAGCAACT;SOR=0.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=24;WE=36934132;WS=36934114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chr17	36934475	rs7207178	C	T	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=382;ReadPosRankSum=0.610;SC=TGTTGACAGACGGCATGTCTG;SOR=1.382;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=19;WE=36934483;WS=36934465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr17	36993655	rs645686	T	C	1388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=47;PP=1107;SC=CCAGACCGGGTGCAGTGGCTC;SOR=5.590;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=49;WE=36993663;WS=36993645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	36997288	rs595306	T	C	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=0;PP=543;SC=GAGCGAGACTTTGTCTCAAAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=18;WE=36997296;WS=36997282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	36997679	rs597234	G	A	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=36;PP=867;ReadPosRankSum=-0.040;SC=TTTCTGGTGGGGGATGAGGAC;SOR=1.449;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=0;TCR=72;TR=36;WE=36997687;WS=36997669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr17	37010150	rs923370	G	A	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=494;ReadPosRankSum=-0.245;SC=TGGGAGTTGAGGTAGAAGCGC;SOR=0.330;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=19;WE=37010158;WS=37010140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr17	37054772	rs1130638	C	T	3605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=60;ReadPosRankSum=-2.300;SC=AGATCAGTAACGTGAGCTCTT;SOR=0.700;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=286;TCF=169;TCR=117;TR=146;WE=37054780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,147:0.51:291
chr17	37054884	rs2286883	A	G	2502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=9.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.248;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=60;PP=2002;ReadPosRankSum=0.882;SC=TGCCTCCACTACCCCTGCCCT;SOR=1.020;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=191;TCF=71;TCR=120;TR=90;WE=37054892;WS=37054874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,91:0.46:196
chr17	37070658	rs525989	A	G	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.707;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=169;ReadPosRankSum=0.106;SC=GTCGGGATTCACAGGACGGCA;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=12;WE=37070666;WS=37070648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr17	37070737	rs525767	A	G	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.702;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.276;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=3;PP=87;ReadPosRankSum=1.016;SC=GGGTGAGTGCAGGTCCTGTTG;SOR=0.223;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=6;WE=37070745;WS=37070727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr17	37071189	rs2241009	C	T	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.508;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=17;PP=1027;ReadPosRankSum=0.878;SC=GGGCTTGAGCCAGGTTGGGGG;SOR=1.325;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=90;TCF=58;TCR=32;TR=54;WE=37071197;WS=37071179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,53:0.60:88
chr17	37075286	rs144614922	A	AGGGCGAGGCCCGTGG	8072.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=423;ExcessHet=3.0103;FS=0.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=2.547;QD=19.93;ReadPosRankSum=-0.433;SOR=0.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:209,196:0.48:405
chr17	37076331	rs646097	G	A	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.227;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=526;ReadPosRankSum=-0.009;SC=ATCTCTGAGTGGAGGAAGCCC;SOR=1.066;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=59;TCF=47;TCR=12;TR=27;WE=37076339;WS=37076321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,27:0.46:59
chr17	37101380	rs9906595	T	C	1615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=54;PP=1187;ReadPosRankSum=-0.589;SC=CTCCAGTTTTTGGGCACTTCC;SOR=0.638;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=30;TCR=117;TR=68;WE=37101388;WS=37101370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,73:0.47:154
chr17	37224288	rs4405583	G	A	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=82;ReadPosRankSum=0.842;SC=GAGCGACAGAGCCAACCAAGA;SOR=0.693;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=5;WE=37224296;WS=37224278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr17	37226399	rs12453656	A	G	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=626;ReadPosRankSum=0.971;SC=TATCCAATACAGGAAGAGGTT;SOR=2.432;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=28;WE=37226407;WS=37226389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,28:0.61:46
chr17	37228765	rs9907595	A	G	2199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=38;PP=1638;SC=CAGAAGGAGCAAGATTAGTGG;SOR=0.955;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=34;TCR=38;TR=72;WE=37228773;WS=37228755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	37234111	rs3744078	G	A	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.850;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=391;ReadPosRankSum=-1.269;SC=CCAGAGGGGTGGGTAGCTCTC;SOR=0.235;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=20;WE=37234119;WS=37234101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr17	37239671	rs9891236	A	G	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=10;PP=893;SC=TCCCCTCCACAGTCGGCCAGT;SOR=2.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=40;WE=37239679;WS=37239661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	37243927	rs12602945	A	G	1989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.017;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=45;PP=1543;ReadPosRankSum=0.196;SC=CTATGCGGTGATATTCAAAGA;SOR=0.543;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=156;TCF=64;TCR=92;TR=79;WE=37243935;WS=37243917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,79:0.51:156
chr17	37244004	rs12600774	G	A	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.352;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=592;ReadPosRankSum=0.917;SC=CAGGCAGAGGGCATCGAGGCC;SOR=2.379;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=66;TCF=14;TCR=52;TR=29;WE=37244012;WS=37243994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,28:0.42:66
chr17	37253064	rs4795348	T	G	1977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.053;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=11;PP=1574;ReadPosRankSum=1.523;SC=AAGAGTTTCTTAAGCAAATGA;SOR=1.284;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=147;TCF=115;TCR=32;TR=67;WE=37253072;WS=37253054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,72:0.47:154
chr17	37253316	rs4795349	G	A	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.881;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=42;PP=980;ReadPosRankSum=0.077;SC=GAGGCTGTGAGGAGTCCTCCC;SOR=2.342;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=91;TCF=6;TCR=85;TR=43;WE=37253324;WS=37253306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,46:0.48:95
chr17	37261981	rs3744351	T	C	683.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=541;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTTTCCTGCCTGGTTTCCCTC;SOR=1.005;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=45;TCF=43;TCR=2;TR=25;WE=37261989;WS=37261971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,25:0.57:44
chr17	37262059	rs3744352	C	T	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.162;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=10;PP=800;ReadPosRankSum=-1.979;SC=TCAGTCTGAGCGGAGTCCTAC;SOR=1.136;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=92;TCF=67;TCR=25;TR=43;WE=37262067;WS=37262049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,43:0.47:91
chr17	37265378	rs16490	C	T	2866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=66;PP=2359;SC=CCCATGGGAACCCCTGGAAGG;SOR=2.625;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=17;TCR=67;TR=83;WE=37265386;WS=37265368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr17	37317672	rs511163	C	G	1670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=47;PP=1481;SC=TGCCCTCTTTCTTTCCCCACT;SOR=3.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=7;TCR=47;TR=54;WE=37317680;WS=37317662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	37319029	rs544198	T	G	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.663;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=437;ReadPosRankSum=-0.670;SC=ATGTCCCACATGAAGAAGTGG;SOR=0.245;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=63;TCF=23;TCR=40;TR=24;WE=37319037;WS=37319019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,23:0.37:62
chr17	37319103	rs657723	T	C	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.840;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=260;ReadPosRankSum=0.255;SC=GACCACCTCATTGGTCAAGCT;SOR=1.329;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=13;WE=37319111;WS=37319093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr17	37321538	rs520054	G	A	283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=190;ReadPosRankSum=-1.647;SC=TTCCCACCCAGCTCCGACACC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=11;WE=37321546;WS=37321528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr17	37322080	rs16527	T	C	2474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.897;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=78;PP=1991;ReadPosRankSum=0.668;SC=GGCCCTGGTATTCGGAGCTCC;SOR=0.302;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=182;TCF=17;TCR=165;TR=88;WE=37322088;WS=37322070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,91:0.48:188
chr17	37331782	rs116613643	C	T	3028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.801;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=62;PP=2343;ReadPosRankSum=2.005;SC=GCGTGCCTGCCCGGCCTGGTG;SOR=0.237;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=262;TCF=101;TCR=161;TR=116;WE=37331790;WS=37331772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,119:0.45:263
chr17	37333804	rs150172956	TA	T	739.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.672;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.826;NF=3;NR=18;PP=727;ReadPosRankSum=-3.077;SC=AAGGCGGGGTTAGGGGGCAGG;SOR=0.373;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=60;TCF=9;TCR=51;TR=21;WE=37333812;WS=37333794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,25:0.38:65
chr17	37341235	rs2301775	A	G	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=513;ReadPosRankSum=0.540;SC=GCCCAGATGTAGGGATCAGGG;SOR=0.662;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=43;TCF=24;TCR=19;TR=23;WE=37341243;WS=37341225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr17	37349655	rs16531	T	C	2441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.253;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=52;PP=1721;ReadPosRankSum=0.792;SC=TCAGCTTTCCTGAGAGGCTGT;SOR=0.657;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=234;TCF=114;TCR=120;TR=109;WE=37349663;WS=37349645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,110:0.46:238
chr17	37349710	rs16532	C	G	6153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=140;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.808;SC=ACCACCACCACGGTCCGGCTG;SOR=1.198;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=187;TCF=46;TCR=141;TR=186;WE=37349718;WS=37349700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,192:0.99:193
chr17	37351041	rs16535	G	A	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=3;PP=384;SC=AAATGGCACAGGGAAGGGTGC;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=37351049;WS=37351036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	37359216	rs72823347	C	T	1705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=7.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=2;PP=1415;ReadPosRankSum=-3.375;SC=GGGTAGTGGCCCGTTCCTAAC;SOR=0.500;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=104;TCF=101;TCR=3;TR=58;WE=37359224;WS=37359206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,59:0.55:107
chr17	37359427	.	ATTT	A	45.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.715;ClippingRankSum=0.000;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.60;MQRankSum=0.272;QD=0.90;ReadPosRankSum=1.045;SOR=0.917;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,6:0.12:51
chr17	37370428	rs11656897	T	C	1940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=6.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.752;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=8;PP=1489;ReadPosRankSum=-0.156;SC=TCACACTGTGTTTCAAGGTCT;SOR=1.384;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=152;TCF=128;TCR=24;TR=67;WE=37370436;WS=37370418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,72:0.46:158
chr17	37371141	rs8070891	G	C	2999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.657;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=31;PP=2348;ReadPosRankSum=-0.228;SC=GAAAGGGTGAGAGGCAGCAGG;SOR=0.990;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=249;TCF=176;TCR=73;TR=120;WE=37371149;WS=37371131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,124:0.49:254
chr17	37371519	rs11078892	T	C	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.061;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=35;PP=819;ReadPosRankSum=1.058;SC=TGGCTCTGCCTCAAAGCCCTG;SOR=1.292;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=88;TCF=8;TCR=80;TR=37;WE=37371527;WS=37371509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,41:0.47:88
chr17	37373043	rs8082152	C	T	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.427;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=485;ReadPosRankSum=1.169;SC=GCAGGGACTGCGGCCAGGGGG;SOR=0.384;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=57;TCF=48;TCR=9;TR=27;WE=37373051;WS=37373033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr17	37381851	rs35137197	G	C	3436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=86;PP=2906;SC=CTCTGAAGCCGTTCTCCAGAG;SOR=3.702;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=13;TCR=86;TR=99;WE=37381859;WS=37381841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr17	37393677	rs56006000	G	A	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=519;ReadPosRankSum=-0.353;SC=GTGGCGTCAGGGGAGGGGCCG;SOR=1.079;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=23;WE=37393685;WS=37393667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,24:0.50:48
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chr17	37399364	rs2338795	T	G	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=204;ReadPosRankSum=1.506;SC=GGCTGACAGGTGGCAGGCGGG;SOR=0.602;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=12;WE=37399372;WS=37399354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr17	37399379	rs2879258	G	T	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=23;NR=7;PP=816;SC=GGCGGGTAACGGGTTTTGGGT;SOR=2.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=37399387;WS=37399369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
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chr17	37400115	rs143578130	G	A	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=49.630;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.08;MQRankSum=-6.257;QD=8.49;ReadPosRankSum=-4.230;SOR=6.034;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,57:0.45:128
chr17	37400120	.	G	A	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.335;ClippingRankSum=0.000;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=27.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.54;MQRankSum=-7.466;QD=8.82;ReadPosRankSum=-5.994;SOR=4.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,23:0.21:112
chr17	37401051	rs11078895	A	G	1549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=12;PP=1205;SC=GTTCCTCACCACCATTCGCTC;SOR=2.259;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=38;TCR=12;TR=50;WE=37401059;WS=37401041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	37410700	rs752314	C	T	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.075;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=300;ReadPosRankSum=-0.035;SC=TATGTCTGGACACCTCTCTTC;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=14;WE=37410708;WS=37410698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr17	37410892	rs2879259	C	G	5308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=69;PP=2965;SC=AAAAGGGGTGCAGTTGATCAG;SOR=0.918;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=83;TCR=69;TR=152;WE=37410900;WS=37410882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr17	37417575	rs3744348	C	G	502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=383;ReadPosRankSum=-2.204;SC=ATGTGTGGCTCTGGGGATCTG;SOR=0.643;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=17;WE=37417583;WS=37417565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr17	37421767	rs2061338	T	C	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=77;ReadPosRankSum=-1.144;SC=GAGTCATACCTGATTCTTTTT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=7;WE=37421775;WS=37421757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr17	37425238	rs1966916	T	G	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=336;ReadPosRankSum=0.837;SC=AATTCTTTGGTGTTTCAGAGC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=14;WE=37425246;WS=37425228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr17	37425262	rs1966915	A	C	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=367;ReadPosRankSum=-1.789;SC=TGTCATGCTAATTTTTTTTTC;SOR=1.609;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=13;WE=37425270;WS=37425252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr17	37427114	rs11307198	TA	T	450.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=1.456;QD=7.91;ReadPosRankSum=0.146;SOR=0.344;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr17	37438931	.	T	TTCAC	1266.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.398;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.367;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.276;NF=25;NR=5;PP=1608;ReadPosRankSum=0.998;SC=AAAGAGCTCATGATTCATTCA;SOR=1.483;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=77;TCF=60;TCR=17;TR=30;WE=37438939;WS=37438921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,35:0.39:90
chr17	37441679	rs679995	A	T	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=3.237;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.49;ReadPosRankSum=1.262;SOR=0.175;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,28:0.47:59
chr17	37441973	rs16968717	G	A	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=220;ReadPosRankSum=-0.228;SC=TATATCCTACGACCCTTCACA;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=10;WE=37441981;WS=37441963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr17	37453294	rs632202	C	A	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=2;PP=713;SC=AAAATTTGCTCAATAGAGTTA;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=37453302;WS=37453284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	37499604	rs9903363	C	G	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.55;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr17	37499614	rs16965088	A	C	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.29;ReadPosRankSum=-0.781;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr17	37580203	rs7405667	T	C	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=218;ReadPosRankSum=-0.092;SC=TGGCGTGATCTTGGCTCACTG;SOR=0.264;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=10;WE=37580211;WS=37580193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr17	37587534	rs35691977	CT	C	410.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=-0.047;QD=7.47;ReadPosRankSum=-0.407;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr17	37596535	rs72825188	T	A	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.304;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=355;ReadPosRankSum=0.612;SC=CAGTGGCTCATGGAAAAACCT;SOR=0.260;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=17;WE=37596543;WS=37596525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr17	37647042	rs72827109	T	A	1045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.312;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=34;PP=822;ReadPosRankSum=0.795;SC=CCTTTTGAACTAAATCTCTCA;SOR=1.049;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=77;TCF=9;TCR=68;TR=38;WE=37647050;WS=37647032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,39:0.48:81
chr17	37671910	rs8070799	G	A	1883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=1;PP=1605;SC=TATCAATAATGTAAAAATTTT;SOR=6.701;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=55;TCR=1;TR=56;WE=37671918;WS=37671900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	37682001	rs59636115	C	T	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=1;PP=736;ReadPosRankSum=0.935;SC=AAAAATGAGACATTTAAAATG;SOR=1.159;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=57;TCF=55;TCR=2;TR=34;WE=37682009;WS=37681991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,34:0.60:57
chr17	37682593	rs113838864	C	G	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=274;ReadPosRankSum=-0.048;SC=TCATGAATCTCATTGAGCTCA;SOR=1.127;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=11;WE=37682601;WS=37682583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr17	37783787	rs3751903	C	G	2799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=73;PP=2234;SC=GCTTCTTCGCCCTCCCAAGGC;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=11;TCR=73;TR=84;WE=37783795;WS=37783777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr17	37786423	rs141350234	C	T	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=32.818;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=40;PP=1105;ReadPosRankSum=0.188;SC=GTCAGCGTGGCGCAACAACCC;SOR=0.006;SbPval=0.06;Source=Platypus;TC=91;TCF=13;TCR=78;TR=53;WE=37786431;WS=37786413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,52:0.58:89
chr17	37814080	rs1877031	G	A	2602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.513;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=44;PP=1975;ReadPosRankSum=1.021;SC=GCCGTGCTGCGGCTCCGGCAC;SOR=0.734;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=190;TCF=97;TCR=93;TR=92;WE=37814088;WS=37814070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,98:0.49:200
chr17	37815899	rs11658786	G	A	2437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.353;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=78;PP=1861;ReadPosRankSum=0.562;SC=AAGATTACATGGGTTGGAGCC;SOR=0.343;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=184;TCF=23;TCR=161;TR=93;WE=37815907;WS=37815889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,95:0.50:191
chr17	37821435	rs931992	G	T	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=199;ReadPosRankSum=1.598;SC=CCTCTGACCGGGGGGCAGCCA;SOR=0.646;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=10;WE=37821443;WS=37821425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr17	37821927	rs45469691	G	C	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.882;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=263;ReadPosRankSum=-1.124;SC=TGCCCAGAGAGCAACAGCTCC;SOR=0.229;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=14;WE=37821935;WS=37821917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr17	37822311	rs1053651	A	C	1932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=45;PP=1600;ReadPosRankSum=-0.311;SC=AGCCCGGTGCACTTCGTCGCT;SOR=0.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=75;TCR=99;TR=79;WE=37822319;WS=37822301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,78:0.42:184
chr17	37829129	rs2247862	A	G	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.004;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=19;PP=598;ReadPosRankSum=0.665;SC=GCTGTGGGCCAAAGGAGTAGC;SOR=0.512;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=68;TCF=22;TCR=46;TR=30;WE=37829137;WS=37829119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,30:0.44:68
chr17	37830447	rs2934956	T	A	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.932;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=30;PP=758;ReadPosRankSum=0.571;SC=CTGAGTCTTGTGTTCACATCA;SOR=0.188;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=54;TCF=2;TCR=52;TR=32;WE=37830455;WS=37830437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr17	37830900	rs2941504	A	G	1585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.792;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=18;PP=1238;ReadPosRankSum=-0.591;SC=TGGTGTGGAAAACTGTGGACC;SOR=1.293;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=141;TCF=90;TCR=51;TR=58;WE=37830908;WS=37830890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,62:0.42:146
chr17	37831035	rs1565922	A	G	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.394;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=33;PP=796;ReadPosRankSum=-1.301;SC=GGGGCTCTGCAGGACAAGAAA;SOR=0.165;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=72;TCF=5;TCR=67;TR=37;WE=37831043;WS=37831025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,40:0.53:75
chr17	37866005	rs1810132	C	T	3395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.739;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=47;PP=2621;ReadPosRankSum=1.049;SC=CTCTCTGTTACTAACCCGTCC;SOR=0.866;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=259;TCF=160;TCR=99;TR=132;WE=37866013;WS=37865995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,137:0.52:266
chr17	37879762	rs903506	G	A	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.186;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=832;ReadPosRankSum=-0.709;SC=ACCGGCCCCCGGCACTGACCC;SOR=1.071;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=70;TCF=25;TCR=45;TR=39;WE=37879770;WS=37879752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,38:0.58:66
chr17	37884037	rs1058808	C	G	2525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.214;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=48;PP=2207;ReadPosRankSum=0.983;SC=TCTGGAAAGGCCCAAGACTCT;SOR=0.546;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=183;TCF=85;TCR=98;TR=95;WE=37884045;WS=37884027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,93:0.51:183
chr17	37898543	rs2952142	T	C	8440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=286;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=160;NR=120;PP=2965;SC=GCCCCTCTCTTGCTCAGACGC;SOR=0.951;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=281;TCF=160;TCR=121;TR=280;WE=37898551;WS=37898533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr17	37902887	rs150443878	GAAAAAGAAAAAGA	G	1607.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=2.922;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=-1.676;QD=14.48;ReadPosRankSum=-0.029;SOR=1.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,46:0.41:111
chr17	37921899	rs2952141	C	T	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=638;SC=ACAGTGTTTCCCTGGCTACCC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=37921907;WS=37921889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	37985801	rs3816470	A	G	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.850;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=568;ReadPosRankSum=1.031;SC=TTATAAATATATATTAAGTAG;SOR=2.746;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=26;WE=37985809;WS=37985791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr17	38020419	rs1453559	T	C	1320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.954;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=42;PP=1042;ReadPosRankSum=0.276;SC=CTGTGGCTACTCGGCCTCTCC;SOR=0.363;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=87;TCF=9;TCR=78;TR=48;WE=38020427;WS=38020409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,49:0.55:89
chr17	38065424	rs9909282	C	G	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=26;PP=672;ReadPosRankSum=1.150;SC=CTGAGGCTCTCAGAGGTCAGC;SOR=0.601;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=12;TCR=53;TR=32;WE=38065432;WS=38065414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr17	38066240	rs2290400	T	C	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=2.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=632;ReadPosRankSum=1.227;SC=ACTGACTCTTTTCCCTCTCTG;SOR=0.620;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=27;WE=38066248;WS=38066230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,25:0.54:46
chr17	38068514	rs1011082	T	C	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=2;PP=811;SC=CTGCCACCCTTGAATCCCTTG;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=38068522;WS=38068504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	38079519	rs146337510	G	A	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.792;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=921;ReadPosRankSum=-1.446;SC=TACATGCCCTGGAGGAAGAAG;SOR=0.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=82;TCF=31;TCR=51;TR=47;WE=38079527;WS=38079509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,52:0.57:91
chr17	38097602	.	TAAA	T	87.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.82;MQRankSum=0.674;QD=10.97;ReadPosRankSum=1.718;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr17	38100134	rs4795406	G	C	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.839;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=12;PP=860;ReadPosRankSum=-0.779;SC=TGGCAGTGGGGCATGCGATTC;SOR=0.801;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=87;TCF=61;TCR=26;TR=42;WE=38100142;WS=38100124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,44:0.48:91
chr17	38100673	rs72832968	C	G	5028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-6.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=414;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=126;PP=2962;ReadPosRankSum=1.609;SC=CCAGGAAGTGCTCCGGCAGGT;SOR=0.472;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=408;TCF=135;TCR=273;TR=198;WE=38100681;WS=38100663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:211,203:0.49:414
chr17	38121993	rs3894194	G	A	4645.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=350;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=82;PP=2962;ReadPosRankSum=0.702;SC=CTAAACCCTCGAGGGGACCTG;SOR=0.680;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=339;TCF=181;TCR=158;TR=176;WE=38122001;WS=38121983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,184:0.53:348
chr17	38122117	rs16965465	G	A	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-6.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.010;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=48;PP=1059;ReadPosRankSum=0.464;SC=CCGACTACACGCTGCTGGATG;SOR=0.327;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=93;TCF=3;TCR=90;TR=50;WE=38122125;WS=38122107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,53:0.56:94
chr17	38122680	rs7212938	G	T	636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=480;ReadPosRankSum=-0.111;SC=CCTGGAGACCGTGCAGGAGAG;SOR=0.737;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=22;WE=38122688;WS=38122670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr17	38122708	rs9914973	T	C	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.921;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=218;ReadPosRankSum=-0.558;SC=TGGGCGGGACTGAGGGTCTCC;SOR=0.101;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=15;WE=38122716;WS=38122698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr17	38126911	rs10531136	AACACACAC	A,AACAC	979.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=1,1;NR=19,19;PP=777,357;SC=GTTTGATTCAAACACACACAC;SOR=4.977;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=20,20;WE=38126926;WS=38126901;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.42,0.58:24
chr17	38127713	rs3916061	A	G	3264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=35;PP=2582;SC=CCCCCAACTCACGCTCCCAAT;SOR=1.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=77;TCR=36;TR=111;WE=38127721;WS=38127703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	38128584	rs5820314	A	AG	819.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=7;PP=1022;SC=CCTCAACTTTAGAAAGACAGA;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=18;TCR=8;TR=23;WE=38128592;WS=38128574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	38128648	rs3859192	C	T	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.01;BaseQRankSum=5.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.201;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=60.21;MQRankSum=-0.887;NF=24;NR=0;PP=533;ReadPosRankSum=1.039;SC=AGACAGAGACCGGAAGGCACA;SOR=2.760;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=49;TCR=3;TR=24;WE=38128656;WS=38128638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr17	38128714	rs3859191	G	A	1772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=11;PP=1506;ReadPosRankSum=-2.241;SC=CATGGGGGTGGATGAGCTAGC;SOR=0.718;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=105;TCR=21;TR=67;WE=38128722;WS=38128704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,67:0.53:127
chr17	38129996	rs60137005	A	T	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.910;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.035;NF=27;NR=14;PP=670;ReadPosRankSum=0.123;SC=TAGTGTCTCAACCCCTGGGTA;SOR=1.080;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=84;TCF=52;TCR=32;TR=41;WE=38130004;WS=38129986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,43:0.49:87
chr17	38130139	rs56326707	C	T	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.193;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=27;PP=679;ReadPosRankSum=-1.968;SC=GCATTAGGGGCAGAGAGAGGA;SOR=1.469;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=82;TCF=21;TCR=61;TR=33;WE=38130147;WS=38130129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,33:0.40:82
chr17	38130746	rs79310476	C	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=111;ReadPosRankSum=-1.121;SC=TTGGTGGGGGCGGGTATTGCA;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=7;WE=38130754;WS=38130736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr17	38131187	rs56030650	C	A	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=528;ReadPosRankSum=-1.005;SC=CATGAAGTGACCCTGGAGGCA;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=23;WE=38131195;WS=38131177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr17	38137364	rs3087852	G	A	1630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.813;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=37;PP=1234;ReadPosRankSum=-1.331;SC=GTGGCGGGTCGACGGGGGAGG;SOR=0.870;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=122;TCF=59;TCR=63;TR=64;WE=38137372;WS=38137354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,65:0.53:123
chr17	38140524	rs3816471	T	C	1080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=14;PP=848;SC=AGTGACATCATTTTCTTCTCT;SOR=1.308;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=35;TCF=21;TCR=14;TR=34;WE=38140532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	38142677	rs3816472	A	C	1224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=1;PP=1031;SC=GAAAGACTGTAATCTTTATTT;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=36;WE=38142685;WS=38142667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	38142978	rs3859188	C	T	3192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-7.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.032;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=99;PP=2442;ReadPosRankSum=0.404;SC=ATCCAGGATGCAGTGAGAGCG;SOR=0.546;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=234;TCF=45;TCR=189;TR=125;WE=38142986;WS=38142968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,128:0.53:241
chr17	38144780	rs7222556	C	T	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=162;ReadPosRankSum=1.264;SC=ATGAATAATGCTTCTGTGAAC;SOR=0.293;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=8;WE=38144788;WS=38144770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr17	38145088	rs9915252	C	G	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=27;PP=818;SC=GGCAGCCAAGCATCTCACTTG;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=38145096;WS=38145078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	38146154	rs9916279	T	C	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.094;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=339;ReadPosRankSum=-0.211;SC=CCAACAACAATGAGTGGGCCA;SOR=0.506;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=56;TCF=14;TCR=42;TR=24;WE=38146162;WS=38146144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,26:0.43:60
chr17	38146482	rs202023639	C	T	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=66.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=-4.768;QD=2.16;ReadPosRankSum=-6.551;SOR=6.697;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,31:0.27:114
chr17	38152304	rs8071037	A	T	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=612;SC=CCCGGGAGGTAAAGGTTGCAG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=38152312;WS=38152294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	38153554	rs2241244	G	C	6722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=164;NR=51;PP=2965;SC=TCCTTCCCTCGCTCATCTCCT;SOR=2.325;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=216;TCF=165;TCR=51;TR=215;WE=38153562;WS=38153544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr17	38153714	rs10671123	T	TGA	10002.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=118;PP=2957;SC=CTGGAAGGGCTGAGCTGCTCT;SOR=0.970;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=212;TCF=82;TCR=130;TR=195;WE=38153722;WS=38153704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr17	38172192	rs2227324	G	A	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.458;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.921;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=151;ReadPosRankSum=-1.027;SC=TGGAAGGGACGTGGGAGAATA;SOR=3.841;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=8;WE=38172200;WS=38172182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr17	38172305	rs2071369	T	C	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.11;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=0.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr17	38172452	rs2071370	T	C	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=6;PP=433;SC=GACCCGGCCATGGCGAGTCTC;SOR=1.721;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=20;WE=38172460;WS=38172442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	38172942	rs2227338	A	G	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.020;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.596;NF=0;NR=34;PP=746;ReadPosRankSum=-2.036;SC=CACCACAGCCAGGCCTGTGTA;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=78;TCF=2;TCR=76;TR=34;WE=38172950;WS=38172932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,35:0.45:78
chr17	38173101	rs9282660	G	T	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.419;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=382;ReadPosRankSum=-2.840;SC=GTGCCATGCCGGCCTTCGCCT;SOR=1.145;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=49;TCF=28;TCR=21;TR=22;WE=38173109;WS=38173091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
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chr17	38179667	rs2302778	A	G	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.972;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=31;PP=704;ReadPosRankSum=-1.043;SC=GGGCCGAGAGAACCTGAGGCT;SOR=1.279;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=80;TCF=10;TCR=70;TR=34;WE=38179675;WS=38179657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,35:0.43:82
chr17	38182844	rs2302775	T	C	1973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=3;PP=1645;ReadPosRankSum=0.887;SC=TAACAAGTCATCACTGGCTGG;SOR=4.014;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=59;TCR=3;TR=61;WE=38182852;WS=38182834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,61:0.98:62
chr17	38186106	rs11555255	C	T	1595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.178;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=50;PP=1204;ReadPosRankSum=-0.240;SC=GCTCTCGGTCCGCTTTGCTGT;SOR=1.483;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=132;TCF=32;TCR=100;TR=61;WE=38186114;WS=38186096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,65:0.46:141
chr17	38188844	rs7502514	A	G	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=202;ReadPosRankSum=-0.337;SC=CCAGGGTGCCACTGGTCTTGC;SOR=0.250;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=14;WE=38188852;WS=38188834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr17	38189055	rs3935280	A	G	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=807;ReadPosRankSum=0.368;SC=GAGGGTGCCCATACCCCGTCA;SOR=0.702;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=36;TCR=66;TR=46;WE=38189063;WS=38189045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,47:0.45:104
chr17	38189793	rs11078934	T	C	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.177;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=12;PP=575;ReadPosRankSum=-0.487;SC=ATTTTGGCACTCCCTCCGGCA;SOR=0.929;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=57;TCF=30;TCR=27;TR=29;WE=38189801;WS=38189783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr17	38191924	rs6503534	A	G	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.731;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=10;PP=578;ReadPosRankSum=-0.921;SC=ACCTCTGCACAAAGACAAGGC;SOR=0.346;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=66;TCF=50;TCR=16;TR=35;WE=38191932;WS=38191914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,37:0.52:71
chr17	38210057	rs8070452	C	G	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.050;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=140;ReadPosRankSum=1.299;SC=CAGACTCTCTCCTCCTGAACC;SOR=0.859;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=8;WE=38210065;WS=38210047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr17	38252667	rs939346	G	A	3038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=32;PP=2345;SC=GGCGGAAGAAGGGGGGAGGAT;SOR=1.514;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=60;TCR=33;TR=91;WE=38252675;WS=38252657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	38253228	rs2102928	T	C	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=10;PP=683;SC=CCAGAATAGGTCCTGGCAAGA;SOR=0.922;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=13;TCR=10;TR=23;WE=38253236;WS=38253218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	38297337	rs41283413	C	G	1712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.981;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=9;PP=1279;ReadPosRankSum=-1.169;SC=AAAGATTTACCTATCTCTGTC;SOR=1.665;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=165;TCF=136;TCR=29;TR=75;WE=38297345;WS=38297327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,78:0.46:168
chr17	38324766	rs11327454	AT	A	639.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=18;PP=650;SC=TTGAGAGAACATTTTCAGTGC;SOR=4.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=18;WE=38324774;WS=38324756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	38333965	rs111460209	G	A	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.104;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=227;ReadPosRankSum=-0.972;SC=GGCCAGCGAGGCTCGGCCCCT;SOR=2.093;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=12;WE=38333973;WS=38333962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr17	38334359	rs66989091	A	AG	1520.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.89;NF=29;NR=8;PP=1759;SC=CCGCCCCCTGAGAGGAAGGAG;SOR=2.531;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=37;WE=38334367;WS=38334349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	38420606	rs113326809	G	A	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.53;MQRankSum=-3.470;QD=18.63;ReadPosRankSum=3.889;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr17	38420612	.	C	A	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.91;MQRankSum=-4.948;QD=12.39;ReadPosRankSum=1.385;SOR=0.650;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
chr17	38451739	.	TA	T	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.830;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.59;MQRankSum=0.859;QD=0.61;ReadPosRankSum=1.788;SOR=0.427;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,9:0.18:50
chr17	38519291	rs502041	C	G	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.651;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=675;ReadPosRankSum=-0.594;SC=GCGGGGCGCACGGCTCGGGGC;SOR=2.075;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=55;TCF=33;TCR=22;TR=31;WE=38519299;WS=38519281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,31:0.57:54
chr17	38556770	rs471692	T	C	2748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.946;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=37;PP=2224;ReadPosRankSum=1.452;SC=AAGAAATCCATAATTATTTAC;SOR=1.226;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=210;TCF=125;TCR=85;TR=105;WE=38556778;WS=38556760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,107:0.50:215
chr17	38563710	rs558068	C	G	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=22;ReadPosRankSum=-1.139;SC=TCCTATTTAACTAATTTATTT;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=3;WE=38563718;WS=38563700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr17	38566396	rs2715548	G	A	1863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=53;PP=1669;SC=GGATAAGCAAGAAGTTTGCTA;SOR=4.029;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=6;TCR=53;TR=59;WE=38566404;WS=38566386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	38572366	rs2586112	G	A	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.073;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=261;ReadPosRankSum=-1.455;SC=AGTGTTTTAAGAAACATTCTG;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=12;WE=38572374;WS=38572356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr17	38609431	rs5820347	G	GAC	2052.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.342;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.492;NF=3;NR=50;PP=2449;ReadPosRankSum=0.486;SC=CATGTGCATAGACACACACAC;SOR=2.269;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=79;TCF=7;TCR=72;TR=53;WE=38609439;WS=38609421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,60:0.94:64
chr17	38634367	rs9895505	G	C	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=91;ReadPosRankSum=-0.514;SC=GGGCTCCCAGGCTCATGTCAC;SOR=0.399;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=7;WE=38634375;WS=38634358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr17	38634383	rs8072052	A	T	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=144;ReadPosRankSum=-0.627;SC=GTCACCCCCAACAGCCCAGAG;SOR=0.582;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=8;WE=38634391;WS=38634373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr17	38634929	rs749906	C	T	3573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.932;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=79;PP=2718;ReadPosRankSum=-0.874;SC=AGAAGGGAAGCGATGACAGCC;SOR=0.756;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=264;TCF=122;TCR=142;TR=143;WE=38634937;WS=38634919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,147:0.55:268
chr17	38635064	rs749907	C	T	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=30;PP=573;ReadPosRankSum=-0.636;SC=GGGGCCCTGGCGCCCCGCTCC;SOR=0.470;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=4;TCR=69;TR=32;WE=38635072;WS=38635054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,32:0.44:73
chr17	38635107	rs749908	C	G	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-6.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=26;PP=541;ReadPosRankSum=0.394;SC=TTGTCTGCCTCTGTCTTACAC;SOR=1.232;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=54;TCF=3;TCR=51;TR=27;WE=38635115;WS=38635097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr17	38635897	rs8076413	G	A	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=9;PP=973;ReadPosRankSum=1.478;SC=CGCCAGCCCCGGAGCCCCAGG;SOR=1.087;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=109;TCF=86;TCR=23;TR=49;WE=38635905;WS=38635887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,51:0.46:110
chr17	38643780	rs3764423	G	A	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=21;PP=547;ReadPosRankSum=-0.027;SC=GTCAGGCTCCGGATCTGGTGA;SOR=0.634;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=23;WE=38643788;WS=38643770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr17	38801695	rs376363717	CT	C	55.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=3.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.91;ReadPosRankSum=0.211;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,13:0.21:61
chr17	38854406	rs2429549	G	A	3703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=110;NR=0;PP=2965;SC=CCAGAAAGATGCCTAGATTGA;SOR=9.455;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=110;TCF=110;TCR=0;TR=110;WE=38854414;WS=38854396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr17	38855772	rs2462961	T	C	5024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=62;PP=2965;SC=AGCAATTGCTTGTACTCTGCG;SOR=1.315;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=103;TCR=62;TR=165;WE=38855780;WS=38855762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr17	38856662	rs887376	T	C	2535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=65;PP=2016;SC=AAGACTATCGTGATGCAAACA;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=22;TCR=65;TR=87;WE=38856670;WS=38856652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	38857446	rs874889	C	A	8604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=155;PP=2965;SC=TCTCAATCTGCATCTCCAGGT;SOR=1.077;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=268;TCF=112;TCR=156;TR=267;WE=38857454;WS=38857436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr17	38857975	.	GTATATATATATATATATATATATATATATATA	G	1072	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MMLQ=25;MQ=61.41;NF=3;NR=3;PP=1072;QD=179.166666667;SC=TGATCCTCTAGTATATATATA;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=25;TCF=9;TCR=16;TR=6;WE=38858014;WS=38857965;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:19,6:0.24:25
chr17	38857996	.	TA	T	2430.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.103;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=2.751;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.66;MQRankSum=0.414;QD=37.98;ReadPosRankSum=1.371;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,62:0.97:64
chr17	38857998	.	TATATATATATATATATATATATATATATATA	T	2433.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.135;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=2.751;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.65;MQRankSum=0.414;QD=38.03;ReadPosRankSum=1.719;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,62:0.97:64
chr17	38858134	rs11309872	CA	C	8799.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=119;NR=66;PP=2957;SC=GCCAATCTGGCATTGTCAATG;SOR=1.765;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=189;TCF=120;TCR=69;TR=185;WE=38858142;WS=38858124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr17	38905477	rs10491127	T	G	3682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=10.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.610;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=7;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.934;SC=AAATAAAAAATTAGCATTGCA;SOR=1.258;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=274;TCF=254;TCR=20;TR=130;WE=38905485;WS=38905467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,132:0.49:272
chr17	38910811	rs34344021	G	T	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-6.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=520;ReadPosRankSum=-0.968;SC=TTCTCTTTAAGAAATCACAAG;SOR=0.854;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=54;TCF=2;TCR=52;TR=25;WE=38910819;WS=38910801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr17	38911212	rs12951078	G	A	2058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.823;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=33;ReadPosRankSum=-0.668;SC=CCAGGTCAGCGTTGGCCTCCT;SOR=0.974;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=149;TCF=76;TCR=73;TR=73;WE=38911220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,78:0.50:156
chr17	38911363	rs12951399	G	A	3041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.060;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=55;PP=2245;ReadPosRankSum=1.404;SC=GTTTCCTCCCGATGAGCTGCC;SOR=0.597;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=209;TCF=107;TCR=102;TR=112;WE=38911371;WS=38911353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,116:0.54:213
chr17	38922718	rs35253595	TTC	T	181.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.860;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.98;ReadPosRankSum=-0.838;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr17	38925099	rs5820360	GT	G	81.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.074;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.81;ReadPosRankSum=2.621;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr17	38934118	rs2286648	C	G	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.456;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=120;ReadPosRankSum=-0.257;SC=GATTCCACTTCTTCAATATTA;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=7;WE=38934126;WS=38934108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr17	38935812	rs981684	A	G	2498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.097;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=36;PP=1934;ReadPosRankSum=1.243;SC=TTTCATCTCGATAAGCTCATT;SOR=1.104;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=184;TCF=106;TCR=78;TR=93;WE=38935820;WS=38935802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,97:0.50:193
chr17	38936659	rs17558560	C	T	1952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.159;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=43;PP=1508;ReadPosRankSum=0.159;SC=CTTCGCAAACCATTGATGTCC;SOR=0.597;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=179;TCF=79;TCR=100;TR=78;WE=38936667;WS=38936649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,81:0.44:183
chr17	38936862	rs2429543	C	T	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.607;NF=0;NR=15;PP=338;ReadPosRankSum=0.945;SC=CCTGTAATCCCAGCACTTTGG;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=15;WE=38936870;WS=38936852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr17	38938216	rs17473777	T	G	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=391;ReadPosRankSum=-0.060;SC=CAAAGCCCTGTTATTGTGATA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=16;WE=38938224;WS=38938206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr17	38938591	rs2469826	C	G	2306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.361;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=46;PP=1598;ReadPosRankSum=0.592;SC=TGCAGATGAGCTGCCCCCAAA;SOR=0.540;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=228;TCF=107;TCR=121;TR=94;WE=38938599;WS=38938581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,97:0.42:231
chr17	38950272	rs2250671	T	C	4748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=67;PP=2965;SC=TCTCGGTCTCTGTCAAGGAGC;SOR=1.017;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=86;TCR=67;TR=153;WE=38950280;WS=38950262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr17	38953540	rs3813038	A	G	9611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=149;NR=152;PP=2965;SC=TCTCCTGGAGAGAAGCAAGAG;SOR=0.719;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=302;TCF=149;TCR=153;TR=301;WE=38953548;WS=38953530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr17	38954687	rs9914044	C	T	1382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=35;PP=1071;SC=TAAGACTACCCCAAGAAACAG;SOR=3.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=42;WE=38954695;WS=38954677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	38955961	rs4624233	G	A	3157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.121;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=69;PP=2517;ReadPosRankSum=-0.472;SC=GGCACCACCAGCATGGCTCCC;SOR=0.832;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=243;TCF=111;TCR=132;TR=121;WE=38955969;WS=38955951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,124:0.50:250
chr17	38975214	.	T	TGCCGCCGTGGCCGCCGCTGGAGCTTCC	913.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.343;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=6.607;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.69;MQRankSum=-1.005;QD=45.69;ReadPosRankSum=-0.236;SOR=3.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr17	38975328	rs17855579	G	A	1486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.58;QD=30.97;SOR=4.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	38976998	rs1799873	G	A	2162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=61;PP=1834;SC=TTAAAAAGCAGCTACATAGTT;SOR=3.881;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=8;TCR=61;TR=69;WE=38977006;WS=38976988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	38978536	rs4261597	A	C	9473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=313;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=142;NR=160;PP=2965;SC=CCCTCCAAAGATGCCTCCATA;SOR=0.809;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=303;TCF=143;TCR=160;TR=302;WE=38978544;WS=38978526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr17	38990834	rs2240078	G	C	3882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=97;NR=17;PP=2965;SC=CCAGCTATGTGCCCTCTGTTG;SOR=3.414;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=97;TCR=17;TR=114;WE=38990842;WS=38990824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr17	38991003	rs10558	T	C	3047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.983;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=64;PP=2549;ReadPosRankSum=-0.925;SC=CTTTCTTCGCTATCTTGGGAC;SOR=0.570;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=284;TCF=132;TCR=152;TR=120;WE=38991011;WS=38990993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,123:0.43:288
chr17	38991032	rs6694	T	A	3285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.094;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=75;PP=2787;ReadPosRankSum=-0.979;SC=GTGCTTGCGGTCATCGGTTGA;SOR=0.457;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=257;TCF=99;TCR=158;TR=127;WE=38991040;WS=38991022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,128:0.49:260
chr17	38991682	.	C	G	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.440;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=119;ReadPosRankSum=-1.394;SC=GTTTAGAAATCTTTTTTAAGG;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=7;WE=38991690;WS=38991672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr17	39023381	rs17566772	G	A	2734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.781;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=76;PP=2137;ReadPosRankSum=-0.259;SC=GAGGAGAGCCGCCGGGACAGT;SOR=0.840;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=210;TCF=68;TCR=142;TR=110;WE=39023389;WS=39023371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,112:0.52:214
chr17	39032479	rs75091657	C	T	1077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.407;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=2;PP=883;ReadPosRankSum=-0.010;SC=ATAGGATTCCCGCCACCCCAC;SOR=0.083;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=82;TCF=80;TCR=2;TR=39;WE=39032487;WS=39032469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,39:0.48:81
chr17	39032768	rs971812	A	T	2244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=8.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=79;PP=1886;ReadPosRankSum=-1.593;SC=CTGATTTATAATATTCAACTT;SOR=0.760;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=150;TCF=0;TCR=150;TR=79;WE=39032776;WS=39032758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,79:0.52:153
chr17	39038698	.	G	A	715	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=32;NR=0;PP=715;QD=23.4303503921;SC=ACCTCCTTTAGGCTTCAGGAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=55;TCR=0;TR=32;WE=39038706;WS=39038697;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:23,32:0.58:55
chr17	39038941	rs149855322	T	TTTTATTTA	3822.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.32;QD=45.51;SOR=8.318;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	39041052	rs7212483	C	T	1534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.037;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=26;PP=1137;ReadPosRankSum=0.096;SC=TCTCACCTGACTTCGCAGCTC;SOR=0.926;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=130;TCF=69;TCR=61;TR=61;WE=39041060;WS=39041042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,64:0.47:136
chr17	39041309	rs17567558	G	A	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.396;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=33;PP=707;ReadPosRankSum=-0.735;SC=AGATGCGGATGCCCCGGCCTC;SOR=1.566;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=118;TCF=43;TCR=75;TR=46;WE=39041317;WS=39041299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,45:0.38:118
chr17	39081546	rs2269860	A	G	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=28;ReadPosRankSum=0.911;SC=AGATGCACACATATACCCACA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=39081554;WS=39081539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr17	39081713	rs8037	A	G	1103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=16;PP=711;ReadPosRankSum=1.563;SC=GCTCCAGTTCATGGCGTAGCT;SOR=0.672;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=75;TCF=48;TCR=27;TR=45;WE=39081721;WS=39081703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,49:0.63:78
chr17	39084504	rs9257	T	C	864.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=1;PP=588;ReadPosRankSum=0.796;SC=CTGTACTGTGTCTGCAGGTCA;SOR=0.663;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=61;TCF=59;TCR=2;TR=28;WE=39084512;WS=39084494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,32:0.49:65
chr17	39114962	rs7213256	C	T	3407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=69;PP=2664;SC=AACCAGTATCCGGGACAGGGG;SOR=1.677;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=33;TCR=69;TR=102;WE=39114970;WS=39114952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr17	39118553	rs4890151	C	T	12748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=416;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=262;NR=132;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.829;SC=AAACACACAGCCAGAGACTGA;SOR=0.664;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=396;TCF=264;TCR=132;TR=394;WE=39118561;WS=39118543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,407:1.00:408
chr17	39119942	rs17843020	G	A	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.837;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=756;ReadPosRankSum=-0.135;SC=GTGCCTCTAGGTCGGCCTTGC;SOR=0.502;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=79;TCF=33;TCR=46;TR=36;WE=39119950;WS=39119932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,37:0.47:79
chr17	39122797	rs10491137	G	A	8498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=138;NR=123;PP=2965;SC=CAAGGCGCTCGTTCAAGATTT;SOR=0.828;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=261;TCF=138;TCR=123;TR=261;WE=39122805;WS=39122787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr17	39123131	rs5820378	G	GT	2859.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=69;PP=2936;SC=GCTTTAGTTTGTTCCAGGTCT;SOR=4.307;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=74;TCF=1;TCR=73;TR=70;WE=39123139;WS=39123121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	39134455	rs2271277	G	A	2193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=6;PP=1841;SC=ACATTCACAAGCAGCAGTTTT;SOR=4.375;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=58;TCR=6;TR=64;WE=39134463;WS=39134445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	39134528	rs16968862	G	A	5077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.648;HP=2;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=118;NR=38;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.139;SC=GCATGTGGTCGAACATGGGCT;SOR=2.347;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=159;TCF=119;TCR=40;TR=156;WE=39134536;WS=39134518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,161:0.99:163
chr17	39134561	rs2271278	C	T	5977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=69;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=69;PP=2965;ReadPosRankSum=0.936;SC=GGGGAAAAATCGATTTTCAAC;SOR=1.358;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=184;TCF=114;TCR=70;TR=182;WE=39134569;WS=39134551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,187:0.99:189
chr17	39134576	rs2271279	A	C	8618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=3.578;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=43.97;ReadPosRankSum=0.819;SOR=0.650;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,195:0.99:196
chr17	39134585	rs2271280	G	A	9160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=3.188;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=45.80;ReadPosRankSum=1.585;SOR=0.369;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,199:1.00:200
chr17	39134590	rs2271281	G	C	9056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.06;SOR=0.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr17	39135084	rs8064733	A	G	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=2;PP=734;SC=AGCAGGCCCCAGTACGTGTTG;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=34;WE=39135092;WS=39135074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	39135205	rs8064910	A	G	5708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=3.044;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=43.58;ReadPosRankSum=-0.698;SOR=0.272;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,130:0.99:131
chr17	39135214	rs8068970	T	C	5728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=3.571;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=43.40;ReadPosRankSum=-0.748;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,131:0.99:132
chr17	39135322	rs8068223	C	T	1152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=32;PP=954;SC=TGCAGTCTCTCGGGCCAGAGT;SOR=3.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=36;WE=39135330;WS=39135312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	39137104	rs9908389	A	G	2050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=6;PP=1638;SC=CAAGATCTCCATCTGGCAGCC;SOR=4.499;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=63;TCR=6;TR=69;WE=39137112;WS=39137094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr17	39137154	rs721958	C	G	3842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=18;PP=2943;SC=GCTGATTCAGCTCTTCTGTCT;SOR=3.184;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=94;TCR=18;TR=112;WE=39137162;WS=39137144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr17	39137297	rs721957	C	T	7271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=120;PP=2965;SC=CACCGTTTCACACTGACAGCG;SOR=0.915;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=220;TCF=100;TCR=120;TR=220;WE=39137305;WS=39137287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr17	39137387	rs2010027	C	T	6749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=99;PP=2965;ReadPosRankSum=1.449;SC=AAGCTGTTCACGAAGCAAGTT;SOR=0.272;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=209;TCF=110;TCR=99;TR=208;WE=39137395;WS=39137377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,212:1.00:213
chr17	39137553	rs8074364	T	G	4757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.011;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=113;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.147;SC=TTTTCACCACTTAGAAGGGCC;SOR=1.929;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=161;TCF=46;TCR=115;TR=158;WE=39137561;WS=39137543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,159:0.99:161
chr17	39138436	rs11078972	A	G	310.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=221;ReadPosRankSum=0.516;SC=GCCCTGCCTCAAGTAGTTTTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=13;WE=39138444;WS=39138426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr17	39138476	rs11078973	CG	TA	1932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=8;PP=1912;ReadPosRankSum=-0.854;SC=TGCCCAAATTCGATTTACAAA;SOR=1.487;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=39;WE=39138485;WS=39138466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
chr17	39138712	rs4243257	G	A	1083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=33;PP=949;SC=GTTCACTCTCGTACCTTTCAC;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=36;WE=39138720;WS=39138702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	39139256	rs9910558	A	T	4668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=97;NR=3;PP=2941;SC=GTGAAACTCCATCTCAAAATA;SOR=6.399;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=100;TCF=97;TCR=3;TR=100;WE=39139264;WS=39139246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr17	39139274	rs34812152	A	T	7610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.85;SOR=4.135;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr17	39139279	rs35072663	A	T	7652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.24;SOR=4.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr17	39139370	rs9908304	G	A	8884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=122;NR=158;PP=2965;SC=CTCTGCTTTCGTGCATAAGAT;SOR=0.999;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=280;TCF=122;TCR=158;TR=280;WE=39139378;WS=39139360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr17	39139413	rs9910145	C	A	9959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=185;PP=2965;SC=ATAAATGATTCTTTGAGAGAA;SOR=3.008;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=226;TCF=41;TCR=185;TR=226;WE=39139421;WS=39139403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr17	39139430	rs9908522	G	A	8761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=167;PP=2965;SC=AGAAACCTAAGTAAACTTCTA;SOR=3.588;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=27;TCR=167;TR=194;WE=39139438;WS=39139420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr17	39139961	rs6503570	C	T	1867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=0;PP=1654;SC=CTATGTATCACTAACTCTTAG;SOR=6.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=59;TCR=0;TR=59;WE=39139969;WS=39139951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	39140221	rs1510068	C	T	7353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=109;PP=2965;ReadPosRankSum=1.745;SC=CTCCAGATAGCTGGCGAGTCT;SOR=0.237;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=220;TCF=111;TCR=109;TR=219;WE=39140229;WS=39140211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,225:1.00:226
chr17	39140417	rs1510069	T	C	6590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=110;PP=2965;SC=GTAGCACAGGTACCGGGGAGA;SOR=1.018;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=194;TCF=84;TCR=110;TR=193;WE=39140425;WS=39140407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr17	39150357	rs1989365	A	G	3060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.486;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=88;PP=2472;ReadPosRankSum=-0.702;SC=CATGGCTATTAGAGTCTGTGG;SOR=0.973;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=231;TCF=56;TCR=175;TR=112;WE=39150365;WS=39150347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,115:0.49:236
chr17	39150443	rs2010209	G	A	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=36;PP=777;ReadPosRankSum=-1.207;SC=GGGCTCTTATGTACCCTCTCC;SOR=0.618;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=75;TCF=0;TCR=75;TR=36;WE=39150451;WS=39150433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,36:0.48:75
chr17	39156224	rs3813051	C	G	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=38;PP=895;ReadPosRankSum=0.626;SC=CAACTGGAAGCCTTCCTGTTT;SOR=1.098;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=0;TCR=65;TR=38;WE=39156232;WS=39156214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,40:0.59:68
chr17	39165174	rs112432710	G	A	2388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.265;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=38;PP=1880;ReadPosRankSum=-0.544;SC=AGGGTGGGGGGCAGGTGTCAC;SOR=0.281;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=216;TCF=143;TCR=73;TR=95;WE=39165182;WS=39165164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,98:0.44:223
chr17	39165358	.	G	GAGA	1889.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.163;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.050;NF=1;NR=42;PP=2007;ReadPosRankSum=0.422;SC=GTTGAGTTGAGAGAAGTCTGT;SOR=0.970;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=108;TCF=3;TCR=105;TR=43;WE=39165366;WS=39165348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,49:0.49:101
chr17	39186031	rs8074117	C	T	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.438;NF=7;NR=8;PP=289;ReadPosRankSum=-0.331;SC=CACAGTAGGACGGGCGGCAGC;SOR=0.593;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=15;WE=39186039;WS=39186021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr17	39186168	rs8074887	A	C	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.561;NF=8;NR=12;PP=473;ReadPosRankSum=-0.556;SC=GTGCTCACAGATCCACCGCTG;SOR=0.704;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=14;TCR=21;TR=20;WE=39186176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr17	39186220	rs8073323	G	A	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=12;PP=1066;SC=TGCCACAGCCGGTTCCGCAGG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=37;WE=39186228;WS=39186210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	39186382	rs8077277	G	A	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.354;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=356;ReadPosRankSum=0.945;SC=CTGAGTTTGGGCTGTACCTTC;SOR=2.517;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=18;WE=39186390;WS=39186372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr17	39190954	.	G	GCAGCAGCTTGGCTGGCAGCAGCTGGTCTCA	3442.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.77;QD=114.76;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	39197590	rs140730427	G	A	3062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.456;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.059;NF=71;NR=44;PP=2214;ReadPosRankSum=0.167;SC=AGCTGGAGCCGCAGGTCCCAC;SOR=0.729;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=254;TCF=152;TCR=102;TR=115;WE=39197598;WS=39197580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,123:0.47:263
chr17	39215901	rs2646023	A	G	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-1.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.425;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=408;ReadPosRankSum=-1.009;SC=GTGCGTTGAGAGGAGAGGTGG;SOR=0.832;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=49;TCF=24;TCR=25;TR=25;WE=39215909;WS=39215891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr17	39240426	rs11658607	G	A	10503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.311;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=1.410;NF=256;NR=158;PP=2965;ReadPosRankSum=1.428;SC=CACTCTCTTGGAAACCCACCC;SOR=1.151;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=415;TCF=256;TCR=159;TR=414;WE=39240434;WS=39240416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,339:1.00:340
chr17	39240504	rs11655310	A	G	9929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.96;QD=43.36;SOR=0.851;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr17	39240511	rs383835	A	T	6795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FS=11.754;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.12;MQRankSum=2.867;QD=30.07;ReadPosRankSum=2.221;SOR=0.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:5,221:0.98:226
chr17	39240661	rs11650484	C	G	4721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=102;PP=2965;SC=TGTCGCCCCACCTGCTGTGAG;SOR=1.710;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=45;TCR=102;TR=147;WE=39240669;WS=39240651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr17	39240790	rs11650261	G	A	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.087;NF=1;NR=11;PP=92;ReadPosRankSum=-1.490;SC=ACCTGCTGCCGCCCCAGCTGC;SOR=0.752;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=12;WE=39240803;WS=39240780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,14:0.40:35
chr17	39240804	.	C	A	600.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=23.096;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.57;MQRankSum=-1.642;QD=33.38;ReadPosRankSum=1.792;SOR=4.031;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr17	39240805	.	G	T	563.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.394;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=50.655;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.95;MQRankSum=-2.625;QD=26.85;ReadPosRankSum=3.086;SOR=5.416;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr17	39240807	rs188505452	C	T	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=59.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.82;MQRankSum=-2.959;QD=23.03;ReadPosRankSum=1.719;SOR=5.416;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr17	39240810	rs143685555	T	A	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=55.474;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.56;MQRankSum=-3.460;QD=23.23;ReadPosRankSum=-1.108;SOR=4.970;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr17	39240818	.	C	T	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.374;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=36.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.75;MQRankSum=-3.922;QD=4.59;ReadPosRankSum=-2.727;SOR=3.219;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr17	39254335	rs201764113	A	AT	10345.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=143;PP=2957;SC=GGAGTTGACCATGGTGTCAGA;SOR=1.150;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=213;TCF=68;TCR=145;TR=207;WE=39254343;WS=39254325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr17	39254444	rs6416913	T	C	3301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=86;PP=2655;SC=AGGCCCGTTGTCACCACGTCA;SOR=7.743;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=87;TCF=1;TCR=86;TR=87;WE=39254452;WS=39254434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	39258027	rs7503699	G	A	971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=10;PP=803;SC=CACAGGTTGGGTGATAGCAAG;SOR=1.981;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=33;WE=39258035;WS=39258017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	39258495	rs168397	G	A	1515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=46;PP=1290;SC=TGATTTAAAGGTGGAATTCAT;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=46;WE=39258503;WS=39258485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	39261560	rs349792	T	A	1907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.62;MQRankSum=-1.822;QD=33.47;ReadPosRankSum=0.754;SOR=6.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr17	39261608	rs349791	G	A	5882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.46;MQRankSum=-2.059;QD=46.32;ReadPosRankSum=-1.023;SOR=5.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,126:0.99:127
chr17	39261611	rs11654665	G	A	6050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.06;MQRankSum=-1.933;QD=43.22;ReadPosRankSum=-0.955;SOR=4.849;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,139:0.99:140
chr17	39261933	rs7207685	C	T	4054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.94;MQRankSum=-2.776;QD=41.80;ReadPosRankSum=-0.736;SOR=0.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,96:0.99:97
chr17	39261949	rs7212474	T	C	3886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-2.066;NF=38;NR=53;PP=2601;ReadPosRankSum=-0.692;SC=GCCAACCCACTTGCTGTCGCC;SOR=0.409;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=38;TCR=54;TR=91;WE=39261957;WS=39261939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,90:0.99:91
chr17	39274069	rs349771	G	C	2363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=6.743;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.14;MQRankSum=1.842;QD=28.83;ReadPosRankSum=1.401;SOR=0.464;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,80:0.98:82
chr17	39274415	rs425487	C	T	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=3.827;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQRankSum=-10.765;QD=0.56;ReadPosRankSum=-4.097;SOR=0.319;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:157,17:0.10:174
chr17	39274518	rs9897031	C	T	8676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=150;NR=113;PP=2965;SC=GCAGAGGTCTCGGCCACAGCC;SOR=1.019;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=264;TCF=150;TCR=114;TR=263;WE=39274526;WS=39274508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,273:1.00:273
chr17	39305956	rs1497383	G	A	2229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.183;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=40;PP=1830;ReadPosRankSum=-0.223;SC=CAGCTGGGGCGGCAGCAGTTC;SOR=0.334;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=153;TCF=88;TCR=65;TR=81;WE=39305964;WS=39305946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,83:0.54:154
chr17	39316870	rs385055	T	C	2508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=9.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.145;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-10.229;NF=78;NR=21;PP=2262;ReadPosRankSum=-0.082;SC=GGTCTGGCAGTAGCTGGGACG;SOR=1.322;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=213;TCF=154;TCR=59;TR=99;WE=39316878;WS=39316860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,93:0.45:208
chr17	39324470	rs75851697	G	T	1543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.155;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=43;PP=1163;ReadPosRankSum=0.485;SC=GGAGAATGAGGTTCTGGAGTT;SOR=0.339;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=130;TCF=30;TCR=100;TR=59;WE=39324478;WS=39324460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,61:0.46:133
chr17	39333956	rs377518	T	C	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=4;PP=514;SC=CACAGGTGGATCATATCAAGA;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=39333964;WS=39333946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	39334133	rs389784	T	C	3462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=58;PP=2759;SC=GGGCTGGCAGTACACAGACTG;SOR=0.786;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=49;TCR=58;TR=107;WE=39334141;WS=39334123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr17	39334456	rs493514	G	A	7240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=166;PP=2965;SC=TTTCCAGGAAGGTGGGTTTGG;SOR=2.190;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=224;TCF=58;TCR=166;TR=224;WE=39334464;WS=39334446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr17	39340597	rs452216	G	A	3801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=90;NR=22;PP=2965;SC=ACATGGACAAGTTGATATAAA;SOR=2.894;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=90;TCR=22;TR=112;WE=39340605;WS=39340587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr17	39340707	rs398825	C	T	5366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=93;PP=2965;SC=CAGCAAGTTGCACGGCAGCAG;SOR=0.947;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=72;TCR=93;TR=165;WE=39340715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr17	39340795	.	ACGGCAGCAGCTGGACATACCACAGCTGGGGTGGCAGGTGGTCTGACAGCAGAGTGGG	A	2584.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.29;QD=44.56;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	39340812	.	T	C	904	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;FR=1.0000;HP=2;MMLQ=27;MQ=51.78;NF=12;NR=21;PP=904;QD=28.4476125014;SC=CAGCTGGACATACCACAGCTG;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=33;WS=39340802;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	39340910	rs2320231	T	C	3249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=40;PP=2225;SC=ACAGACTGGGTGGCAGCAGCT;SOR=1.006;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=90;TCF=50;TCR=40;TR=89;WE=39340918;WS=39340900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	39341158	rs452531	G	A	4376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=103;PP=2965;SC=TGAGTTTTTCGAATGTGGGAA;SOR=2.619;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=29;TCR=103;TR=132;WE=39341166;WS=39341148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr17	39341266	rs449817	A	G	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=29;PP=814;SC=TAGATAGGCAATTATCAAGTT;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=39341274;WS=39341256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	39341294	rs385122	T	A	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=568;SC=TGTGGGAAAATATCTGTATAA;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=39341302;WS=39341284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	39344866	.	G	A	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.263;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=149;ReadPosRankSum=0.399;SC=AAAACACACGGCCGGGCGCGG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=9;WE=39344874;WS=39344856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr17	39346518	rs238824	T	C	8700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=141;PP=2965;SC=TATCAAACTATCTGCTTCAGG;SOR=0.894;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=260;TCF=119;TCR=141;TR=260;WE=39346526;WS=39346508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr17	39346595	rs11283848	T	TGCTGTGGGTCCAGCTGCTGCCAGCCTA	8599.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.86;QD=67.19;SOR=0.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr17	39406409	rs2191379	C	A	2010.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.069;NF=41;NR=38;PP=1534;ReadPosRankSum=0.259;SC=ACCTGTGTGTCCAGCTGCTGT;SOR=0.667;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=160;TCF=82;TCR=78;TR=79;WE=39406417;WS=39406399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,82:0.51:161
chr17	39406444	rs28672975	C	A	1833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.003;HP=2;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.969;NF=25;NR=50;PP=2962;ReadPosRankSum=0.809;SC=CTGATCAAGTCCCAAGAGAAC;SOR=1.026;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=140;TCF=49;TCR=91;TR=75;WE=39406455;WS=39406434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,75:0.51:147
chr17	39406447	rs3967754	A	G	1667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.041;HP=3;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.903;NF=22;NR=41;PP=2940;ReadPosRankSum=0.016;SC=ATCAAGTCCCAAGAGAACCAC;SOR=0.439;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=142;TCF=47;TCR=95;TR=63;WE=39406455;WS=39406434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,70:0.47:149
chr17	39412071	rs9894258	G	A	2900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-8.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.556;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.117;NF=79;NR=38;PP=2228;ReadPosRankSum=0.794;SC=CCCGCCTGCTGTGAGACCACC;SOR=0.347;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=224;TCF=163;TCR=61;TR=117;WE=39412079;WS=39412061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,117:0.52:227
chr17	39427858	rs147314172	T	C	2241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.582;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.675;NF=32;NR=42;PP=1894;ReadPosRankSum=-0.972;SC=TGTGGCCAAATCATCTGTGGG;SOR=0.679;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=75;TCF=33;TCR=42;TR=74;WE=39427866;WS=39427848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,72:0.99:73
chr17	39432306	rs28485549	G	A	2315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.720;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.902;NF=40;NR=46;PP=1954;ReadPosRankSum=0.112;SC=ACCACCCCACGAGTGTCTACC;SOR=0.691;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=156;TCF=78;TCR=78;TR=86;WE=39432314;WS=39432296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,86:0.55:157
chr17	39432562	rs9893993	A	T	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=532;ReadPosRankSum=0.593;SC=AAACCAACAAAGTGAACTTAG;SOR=0.505;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=64;TCF=8;TCR=56;TR=26;WE=39432570;WS=39432552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,28:0.41:69
chr17	39432579	rs78609218	C	T	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.464;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=26;PP=693;ReadPosRankSum=0.042;SC=TTAGGGTGAACTTTGCTCACC;SOR=1.721;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=27;WE=39432587;WS=39432569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,30:0.58:52
chr17	39458765	rs1005197	A	G	3373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.392;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=51;PP=2698;ReadPosRankSum=-1.018;SC=GACAACAAGTAGATTCCGAGC;SOR=0.481;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=238;TCF=144;TCR=94;TR=123;WE=39458773;WS=39458755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,126:0.51:245
chr17	39459050	rs7224236	G	T	1688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=45;PP=1254;ReadPosRankSum=-1.009;SC=ATGTGGTGATGGTGGGCACAG;SOR=0.761;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=123;TCF=37;TCR=86;TR=63;WE=39459058;WS=39459040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,67:0.51:131
chr17	39459167	rs1005196	G	A	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.337;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=523;ReadPosRankSum=-0.098;SC=AAAGACATCCGATACAGAGGG;SOR=2.621;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=21;WE=39459175;WS=39459157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,24:0.63:38
chr17	39464046	rs2074286	G	C	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.227;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=18;PP=924;ReadPosRankSum=-1.555;SC=CTGGCAGGGAGCCTCTTCTGA;SOR=0.351;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=100;TCF=65;TCR=35;TR=46;WE=39464054;WS=39464036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,46:0.46:101
chr17	39464437	rs72828116	G	C	2805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=48;PP=2251;ReadPosRankSum=-0.552;SC=CTGCAGGAAAGAGGTCGGCAG;SOR=0.726;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=203;TCF=110;TCR=93;TR=106;WE=39464445;WS=39464427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,107:0.51:210
chr17	39464487	rs2074285	G	C	3077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.457;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=53;PP=2294;ReadPosRankSum=0.229;SC=GCAGACAGAAGGACAGCGCTT;SOR=0.757;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=252;TCF=146;TCR=106;TR=127;WE=39464495;WS=39464477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,130:0.50:260
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chr17	39464736	rs2074284	C	G	2572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.810;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=44;PP=2066;ReadPosRankSum=2.483;SC=CTCTGAGCAACTTGGCTCACA;SOR=0.554;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=178;TCF=95;TCR=83;TR=88;WE=39464744;WS=39464726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,93:0.50:185
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chr17	39535859	rs2239710	A	G	8040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.045;NF=145;NR=105;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.794;SC=CCTGCGGTTAATTTCCACCAG;SOR=0.342;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=251;TCF=146;TCR=105;TR=250;WE=39535867;WS=39535849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,253:1.00:254
chr17	39538184	rs3744390	G	C	1883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-7.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.073;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.012;NF=28;NR=54;PP=1359;ReadPosRankSum=-0.365;SC=TCTTGAAGTAGGACTGGTAGC;SOR=0.503;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=163;TCF=53;TCR=110;TR=82;WE=39538192;WS=39538174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,84:0.50:168
chr17	39551698	rs58525800	G	A	1617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.761;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.977;NF=50;NR=15;PP=1312;ReadPosRankSum=-1.288;SC=GAGGGGCCACGTGCTTAGATG;SOR=1.144;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=128;TCF=93;TCR=35;TR=65;WE=39551706;WS=39551688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,64:0.49:131
chr17	39553811	rs6503629	G	T	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.832;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=21;PP=671;ReadPosRankSum=-0.458;SC=AGGGAGGGAGGGAGTGCCTGG;SOR=0.468;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=81;TCF=43;TCR=38;TR=42;WE=39553819;WS=39553801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,43:0.53:81
chr17	39578810	rs9893139	G	A	2539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.250;NF=5;NR=84;PP=2090;ReadPosRankSum=1.052;SC=AAATGGGAAAGTCTTGTCCAG;SOR=0.676;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=149;TCF=7;TCR=142;TR=89;WE=39578818;WS=39578800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,91:0.60:152
chr17	39580559	rs9916475	T	A	3034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=2.068;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.97;ReadPosRankSum=0.100;SOR=0.905;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,78:0.51:152
chr17	39580562	rs9916484	T	C	3072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=3.919;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.76;ReadPosRankSum=-0.843;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,78:0.53:148
chr17	39580660	rs9916724	T	C	987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.595;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=30;PP=791;ReadPosRankSum=0.988;SC=GGAGGCAGCATTGGCCTCTGC;SOR=0.263;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=81;TCF=16;TCR=65;TR=40;WE=39580668;WS=39580650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,40:0.49:81
chr17	39580739	rs9910204	C	A	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.069;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=322;ReadPosRankSum=0.470;SC=ATGGTGCAACCCAGAGGGCAT;SOR=0.273;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=17;WE=39580747;WS=39580729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,17:0.63:27
chr17	39593620	rs9894044	T	C	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.677;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=14;PP=507;ReadPosRankSum=1.311;SC=CATCTCTCTTTGGGTATCCCT;SOR=0.655;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=65;TCF=28;TCR=37;TR=32;WE=39593628;WS=39593610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,33:0.49:67
chr17	39593768	rs897416	A	G	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=14;PP=411;SC=CAGGAGGGAGACGTGGAGCAC;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=39593776;WS=39593758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	39594356	rs28550887	G	A	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=15;PP=997;ReadPosRankSum=0.146;SC=TGCAGTCCTCGCTTTCCAGAA;SOR=0.606;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=70;TCR=30;TR=49;WE=39594364;WS=39594346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,51:0.50:102
chr17	39594679	rs7209968	A	G	1367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.742;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=1103;ReadPosRankSum=1.115;SC=AGACCTCCAAAATAAAATGCT;SOR=0.510;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=89;TCF=31;TCR=58;TR=47;WE=39594687;WS=39594669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,48:0.51:94
chr17	39594934	.	A	AC	4114.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.000;DP=501;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.537;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=15;MQRankSum=3.855;NF=46;NR=112;PP=2848;ReadPosRankSum=-0.611;SC=CTGGTTCTATACCCCCCCCAC;SOR=0.615;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=426;TCF=124;TCR=302;TR=158;WE=39594942;WS=39594924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:244,189:0.44:433
chr17	39595116	rs9894668	G	T	5666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-9.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=472;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=113;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.660;SC=ACTTCCTGCAGAAGGGAGGAA;SOR=0.669;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=455;TCF=229;TCR=226;TR=227;WE=39595124;WS=39595106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:236,233:0.50:469
chr17	39596611	rs1350046	T	C	3689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.077;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=54;PP=2956;ReadPosRankSum=0.009;SC=TTCTCTGAGCTTTACATGGAT;SOR=1.019;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=310;TCF=177;TCR=133;TR=139;WE=39596619;WS=39596601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,140:0.46:306
chr17	39616430	rs2604953	G	T	1628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-6.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.778;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=15;PP=1244;ReadPosRankSum=0.008;SC=ACGGTGCGGGGCACGCATGGG;SOR=0.249;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=105;TCF=85;TCR=20;TR=65;WE=39616438;WS=39616420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,65:0.62:105
chr17	39619193	rs11078993	C	T	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.817;NF=45;NR=17;PP=1336;ReadPosRankSum=0.617;SC=CAGGTCAGCCCGGATCTCAGC;SOR=0.722;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=104;TCF=77;TCR=27;TR=62;WE=39619201;WS=39619183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,63:0.59:107
chr17	39620565	rs72830046	C	T	3250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.863;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=39;PP=2675;ReadPosRankSum=0.102;SC=CACGTCCCTGCGGTTGGCCTC;SOR=0.896;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=273;TCF=188;TCR=85;TR=131;WE=39620573;WS=39620555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,130:0.47:277
chr17	39620733	rs2604958	G	C	2319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.524;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=69;PP=1846;ReadPosRankSum=-0.462;SC=ATGTGACAATGATAGGATCCT;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=176;TCF=34;TCR=142;TR=85;WE=39620741;WS=39620723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,86:0.48:179
chr17	39622068	rs2071561	G	T	809.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=3;PP=635;ReadPosRankSum=-0.589;SC=CTCCTTCAGGGACTCAACCTG;SOR=0.765;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=60;TCF=55;TCR=5;TR=31;WE=39622076;WS=39622058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,32:0.52:62
chr17	39623363	rs3744786	T	C	1078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.500;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=29;PP=825;ReadPosRankSum=0.501;SC=ACTGGCTGCCTGGCAGGAACT;SOR=1.027;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=107;TCF=50;TCR=57;TR=49;WE=39623371;WS=39623353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,49:0.45:109
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chr17	39623622	rs1807434	A	C	1682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=41;PP=1301;ReadPosRankSum=0.260;SC=CTGGATGTCTACAGACCCCAT;SOR=0.691;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=118;TCF=36;TCR=82;TR=60;WE=39623630;WS=39623612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,63:0.51:123
chr17	39623708	rs737487	C	T	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.112;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=513;ReadPosRankSum=-0.181;SC=TGTTGATGTTCACACCCAGCC;SOR=2.468;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=23;WE=39623716;WS=39623698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr17	39633317	rs2239711	A	G	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=4;PP=1139;SC=CTCAGAACCGACCCCCTGGGC;SOR=4.317;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=45;WE=39633325;WS=39633307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	39633349	rs2071601	G	C	1797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=13;PP=1373;SC=ATGGGGCGGGGGCTGCAGTTT;SOR=2.419;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=48;TCR=13;TR=61;WE=39633357;WS=39633339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	39634625	rs7216017	A	G	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=3;PP=815;ReadPosRankSum=-0.718;SC=TGCTGTGCTGAGCCTGCAGCT;SOR=2.517;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=29;WE=39634633;WS=39634615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr17	39635303	rs115721956	C	A	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.264;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=28;PP=613;ReadPosRankSum=1.980;SC=CCAAGGTTCACCTCCTCCTCA;SOR=1.341;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=60;TCF=8;TCR=52;TR=31;WE=39635311;WS=39635293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr17	39636044	rs2011243	G	A	2983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=41;PP=2248;SC=CTGGAGATATGAAGAAGTTAT;SOR=0.870;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=49;TCR=41;TR=90;WE=39636052;WS=39636034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	39637244	rs743686	A	G	4534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=82;PP=2965;SC=AGCTTGCAAGAGCTGCTGGAG;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=146;TCF=64;TCR=82;TR=146;WE=39637252;WS=39637234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr17	39643340	rs11657323	T	G	1852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.057;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=31;PP=1430;ReadPosRankSum=1.017;SC=GGCCTCCACGTTGCTGATCAG;SOR=0.913;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=149;TCF=84;TCR=65;TR=74;WE=39643348;WS=39643330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,73:0.48:151
chr17	39643646	rs2301354	G	A	1973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=5;PP=1704;SC=CGCGTTGACCGTACGTCTCAG;SOR=4.875;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=57;TCR=5;TR=61;WE=39643654;WS=39643636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	39644057	rs2301353	G	A	2140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=56;PP=1718;SC=TCAATGACCTGAATTCAAACC;SOR=6.027;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=58;TCF=2;TCR=56;TR=58;WE=39644065;WS=39644047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	39646021	rs1003842	A	G	7224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=133;PP=2965;SC=AGCCCACAGAACGGATGGAGG;SOR=1.159;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=223;TCF=90;TCR=133;TR=223;WE=39646029;WS=39646011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr17	39659183	rs4796698	G	A	3019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.588;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=61;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.442;SC=TGGGAGGGCCGGGTACCTTGG;SOR=0.997;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=215;TCF=99;TCR=116;TR=106;WE=39659202;WS=39659173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,111:0.50:223
chr17	39659194	rs4796697	T	C	2634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.003;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=54;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.278;SC=GGTACCTTGGTGTGGAACCAT;SOR=0.648;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=226;TCF=112;TCR=114;TR=109;WE=39659202;WS=39659173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,113:0.48:233
chr17	39659529	rs7211835	T	C	1044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.794;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=796;ReadPosRankSum=-0.063;SC=AGCCTGCAATTCCCGCTCACC;SOR=0.307;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=77;TCF=46;TCR=31;TR=37;WE=39659537;WS=39659519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,39:0.48:81
chr17	39659913	rs9891361	G	A	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.323;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=33;PP=958;ReadPosRankSum=0.127;SC=GAAGTCGTCCGCAGCCAGCCT;SOR=1.391;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=115;TCF=44;TCR=71;TR=48;WE=39659921;WS=39659903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,51:0.43:120
chr17	39661419	rs149623369	G	A	3284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=47;PP=2601;ReadPosRankSum=-0.647;SC=GGTCAGCGTTGGCCTCCTCCA;SOR=0.700;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=189;TCF=108;TCR=81;TR=113;WE=39661427;WS=39661409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,118:0.62:191
chr17	39661626	rs142246675	A	G	3555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=81;PP=2694;ReadPosRankSum=-0.908;SC=CTCCAAAGCCACTACCAGCCC;SOR=0.672;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=261;TCF=108;TCR=153;TR=139;WE=39661634;WS=39661616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,144:0.54:266
chr17	39661689	rs8182306	G	A	2183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.086;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=51;PP=1729;ReadPosRankSum=-0.054;SC=CTGATCCCCCGGACACAAACC;SOR=0.779;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=210;TCF=91;TCR=119;TR=88;WE=39661697;WS=39661679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,87:0.42:208
chr17	39670912	rs897420	G	C	2862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=26;PP=2330;SC=TTCCCTGATGGCAATGCCAGC;SOR=1.880;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=66;TCR=26;TR=91;WE=39670920;WS=39670902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	39671045	rs897421	T	C	3223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=76;PP=2689;SC=CACCCACACATCTGACTCCTC;SOR=2.424;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=23;TCR=76;TR=99;WE=39671053;WS=39671035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr17	39674540	rs3744784	A	G	2033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=8.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=21;PP=1725;ReadPosRankSum=-0.243;SC=TGTACAGGGTACCAGCCACCT;SOR=0.736;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=112;TCR=44;TR=74;WE=39674548;WS=39674530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,76:0.47:160
chr17	39674641	rs1050784	T	C	2074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.129;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.621;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=43;PP=1790;ReadPosRankSum=-0.112;SC=TCTGGGCTGGTTGGGGTCTGC;SOR=0.747;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=168;TCF=86;TCR=82;TR=80;WE=39674649;WS=39674631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,78:0.48:164
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chr17	39680580	rs1869719	A	C	9984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=172;NR=135;PP=2965;SC=TAGGGAACACAAAGCCCTCCC;SOR=0.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=308;TCF=173;TCR=135;TR=307;WE=39680588;WS=39680570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,316:1.00:316
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chr17	39684321	rs4602	G	C	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=349;ReadPosRankSum=1.491;SC=GCCGCCGTAGGCCCCCGAGGA;SOR=0.601;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=55;TCF=19;TCR=36;TR=21;WE=39684329;WS=39684311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,21:0.37:57
chr17	39684410	rs11550883	G	A	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.048;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=379;ReadPosRankSum=1.277;SC=GCGCGCGAAAGGCGACCCCCG;SOR=1.308;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=21;WE=39684418;WS=39684400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr17	39723451	rs6503636	A	G	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=0;PP=712;ReadPosRankSum=-0.139;SC=TGAGACCTTGACTCTCCACCC;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=63;TCR=0;TR=35;WE=39723459;WS=39723441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,32:0.55:58
chr17	39723990	rs3890472	T	A	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=949;ReadPosRankSum=-0.654;SC=TTTTTCCAGCTCCGGAGGATT;SOR=0.638;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=102;TCF=43;TCR=59;TR=54;WE=39723998;WS=39723980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,56:0.51:109
chr17	39724047	rs1008753	T	C	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=5.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.211;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=30;PP=855;ReadPosRankSum=0.980;SC=GCGGCCCCCATACACATATAT;SOR=1.461;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=73;TCF=19;TCR=54;TR=37;WE=39724055;WS=39724037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,41:0.52:79
chr17	39726276	rs3816510	C	A	1505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=1057;ReadPosRankSum=-1.093;SC=ACCTGCAGACCAGCCAGGGTT;SOR=0.673;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=53;TCR=64;TR=53;WE=39726284;WS=39726266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,60:0.48:125
chr17	39727816	rs8075921	T	G	1869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-6.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.389;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=24;PP=1449;ReadPosRankSum=-1.445;SC=CACCATCACCTCCTCCAGCAC;SOR=0.950;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=211;TCF=148;TCR=63;TR=89;WE=39727824;WS=39727806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,88:0.41:216
chr17	39728050	rs8070680	G	A	5960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=152;PP=2965;ReadPosRankSum=1.354;SC=AACTGCCACCGCCTCCCCTCC;SOR=0.735;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=234;TCF=69;TCR=165;TR=221;WE=39728058;WS=39728040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,220:1.00:221
chr17	39738797	rs2001185	T	C	1398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=2.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.00;MQRankSum=-3.902;QD=10.76;ReadPosRankSum=-1.721;SOR=0.943;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:70,60:0.46:130
chr17	39740323	rs2320456	T	C	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=8.287;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.08;MQRankSum=-1.482;QD=12.68;ReadPosRankSum=0.044;SOR=2.207;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr17	39740325	.	T	C	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.921;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.05;MQRankSum=-0.124;QD=11.64;ReadPosRankSum=1.564;SOR=1.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,13:0.33:39
chr17	39742807	rs3826550	C	T	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.928;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.078;NF=25;NR=33;PP=1107;ReadPosRankSum=0.293;SC=CCCAAGCCAGCACCAAGGCCA;SOR=0.320;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=116;TCF=43;TCR=73;TR=58;WE=39742815;WS=39742797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,59:0.50:118
chr17	39742894	rs3826551	G	A	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.35;MQRankSum=-1.547;QD=16.04;ReadPosRankSum=-1.382;SOR=0.826;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr17	39742898	rs11551758	G	A	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=-1.473;QD=16.94;ReadPosRankSum=-1.925;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr17	39742899	rs6503640	C	T	1421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=30;PP=1017;SC=CCCCAGCCCGCAGGCTCCCCC;SOR=3.442;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=33;WE=39742907;WS=39742884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	39766504	rs7406899	A	G	2850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=49;PP=2209;SC=GGAGAGAAAAAGCAGGGCAGT;SOR=0.959;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=39;TCR=49;TR=87;WE=39766512;WS=39766494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr17	39767744	rs4796681	A	G	780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.239;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.867;NF=4;NR=24;PP=541;ReadPosRankSum=-0.295;SC=GGGCCAGTTCATGCTCATACC;SOR=0.976;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=28;WE=39767752;WS=39767734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,32:0.55:58
chr17	39767836	rs2100509	G	A	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.714;NF=3;NR=9;PP=237;ReadPosRankSum=-1.318;SC=TGGGTGGACCGCCCCACTCTT;SOR=0.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=12;WE=39767844;WS=39767826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr17	39779160	rs9916519	G	C	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=67;ReadPosRankSum=0.470;SC=GAGATCCTCCGCCAGCTGGCC;SOR=0.446;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=6;WE=39779168;WS=39779158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr17	39845229	rs139094815	CCCGCCACCGCCG	C	2717.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=2.014;NF=41;NR=4;PP=2972;ReadPosRankSum=-0.610;SC=CCCGCCTTCTCCCGCCACCGC;SOR=0.709;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=140;TCF=122;TCR=18;TR=45;WE=39845248;WS=39845219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,72:0.50:143
chr17	39846184	rs149009383	G	A	3682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.178;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=62;PP=2787;ReadPosRankSum=-0.752;SC=TAGTGAAGGCGTTTAAGAAAG;SOR=0.516;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=336;TCF=200;TCR=136;TR=145;WE=39846192;WS=39846174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:198,153:0.44:351
chr17	39871696	rs34309618	G	C	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=3.676;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.72;ReadPosRankSum=0.929;SOR=0.334;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,27:0.42:64
chr17	39871700	rs7220169	G	A	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=3.420;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.50;ReadPosRankSum=0.395;SOR=0.379;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,30:0.43:69
chr17	39872026	rs4290525	T	A	1950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.757;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=46;PP=1577;ReadPosRankSum=-0.957;SC=TCTCACCTCCTCAGACCCGTC;SOR=0.605;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=193;TCF=91;TCR=102;TR=87;WE=39872034;WS=39872016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,85:0.43:198
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chr17	39874137	rs7212417	G	A	1351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.648;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=20;PP=949;ReadPosRankSum=0.400;SC=TGAGTGGCTGGTGCAGGCATT;SOR=0.541;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=93;TCF=60;TCR=33;TR=50;WE=39874145;WS=39874127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,54:0.54:100
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chr17	39883595	rs7216154	T	C	3210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=94;PP=2444;SC=CAGTGGACACTGGGGGTTGCT;SOR=3.422;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=14;TCR=95;TR=108;WE=39883603;WS=39883585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	39883721	rs7211623	C	T	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=145;ReadPosRankSum=-0.207;SC=GGGACCCAGGCACACCCAGTC;SOR=0.527;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=8;WE=39883729;WS=39883711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr17	39883972	rs4796600	C	T	4055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=114;NR=6;PP=2965;SC=TCTGGGCCAGCGGCTCTCCAG;SOR=5.687;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=114;TCR=6;TR=120;WE=39883980;WS=39883962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr17	39884091	rs4796601	G	C	14012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=465;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=255;NR=191;PP=2965;SC=GCCCCATACTGGAAGGACCCA;SOR=0.951;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=447;TCF=256;TCR=191;TR=446;WE=39884099;WS=39884081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,459:1.00:459
chr17	39884246	rs4796602	G	A	5001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=121;PP=2965;SC=GGGGAGTCACGCAGCCTGGTT;SOR=2.728;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=29;TCR=121;TR=150;WE=39884254;WS=39884236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr17	39884419	rs4796692	C	T	9930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=198;NR=115;PP=2965;SC=CCCATGGGGCCACGACAAGAG;SOR=1.387;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=314;TCF=198;TCR=116;TR=313;WE=39884427;WS=39884409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,315:1.00:315
chr17	39884583	rs4796693	G	A	4815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=134;PP=2965;SC=GCTGGCCTCCGCTGGGGAGGG;SOR=3.093;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=162;TCF=27;TCR=135;TR=161;WE=39884591;WS=39884573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr17	39884684	rs4796694	C	T	1089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=28;PP=823;SC=TCGGCTGCTGCGCTGTGCCAG;SOR=4.174;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=31;WE=39884692;WS=39884674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	39888455	rs3895103	G	C	7606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=170;NR=59;PP=2965;SC=AGATTGGCCCGCTATCCTCTC;SOR=2.183;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=230;TCF=171;TCR=59;TR=229;WE=39888463;WS=39888445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr17	39890715	rs4796603	A	T	1589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.471;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=40;PP=1205;ReadPosRankSum=1.450;SC=AGGAACTGGGATCCAGAGGTG;SOR=0.863;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=123;TCF=46;TCR=77;TR=61;WE=39890723;WS=39890705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,63:0.50:125
chr17	39890813	rs34106519	C	T	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.952;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=24;PP=666;ReadPosRankSum=-1.900;SC=CGAAGGTGCACAGGTGAGTGC;SOR=0.556;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=73;TCF=22;TCR=51;TR=35;WE=39890821;WS=39890803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,35:0.47:74
chr17	39890876	rs4796604	T	C	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=293;ReadPosRankSum=-2.259;SC=GCCCAACCTCTTCGGGCGCAT;SOR=0.551;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=18;WE=39890884;WS=39890866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,18:0.30:60
chr17	39912145	rs1126821	T	A	4260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=85;PP=2965;SC=GTGGCATCCATGTCTGGGGAC;SOR=1.783;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=123;TCF=37;TCR=86;TR=122;WE=39912153;WS=39912135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr17	39912259	rs141010071	A	AC	1038.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=26;PP=1196;SC=GGTGGGCCTGACCCCTCCCCA;SOR=2.833;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=30;WE=39912267;WS=39912249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	39912581	rs9890858	A	G	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=25;PP=779;SC=GCTGGGTGCCATGGCTCACGC;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=39912589;WS=39912571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	39913645	rs7216034	T	C	6562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=133;NR=77;PP=2965;SC=CCAACTACTGTGGTCCAACCT;SOR=1.354;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=212;TCF=134;TCR=78;TR=210;WE=39913653;WS=39913635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr17	39914070	rs8067890	G	T	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=33;PP=1045;SC=CAGGGGAGAGGTGGAAAGGGG;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=34;WE=39914078;WS=39914060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	39923614	rs12942034	A	G	2376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=8;PP=1979;SC=GCCTCGGGAGAGTTGGGGAGG;SOR=3.973;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=63;TCR=8;TR=71;WE=39923622;WS=39923604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	39923757	.	C	A	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.650;ClippingRankSum=0.000;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.317;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=22;PP=823;ReadPosRankSum=-1.004;SC=GCACGGCCATCTTGGCGCCCT;SOR=0.572;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=123;TCF=59;TCR=64;TR=47;WE=39923765;WS=39923747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,50:0.39:128
chr17	39925713	rs41283425	C	T	2124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.236;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=25;PP=1562;ReadPosRankSum=-1.391;SC=GGGCAGGGCGCGAGTGGCCAG;SOR=0.593;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=192;TCF=139;TCR=53;TR=92;WE=39925721;WS=39925703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,92:0.47:195
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chr17	39928180	rs77327994	G	A	675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.186;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=493;ReadPosRankSum=0.966;SC=GCTTCAGCCCGTCACCAAGCC;SOR=2.770;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=3;TCR=54;TR=26;WE=39928188;WS=39928170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
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chr17	39983808	rs1046404	G	C	1985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.112;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=31;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.809;SC=GAAGTAACCAGAGTTCTCACA;SOR=0.612;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=204;TCF=127;TCR=77;TR=79;WE=39983828;WS=39983798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,83:0.40:210
chr17	39983820	rs1046403	G	A	2040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.938;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=39;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.082;SC=GTTCTCACACGCAGAGCTGTT;SOR=0.474;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=211;TCF=122;TCR=89;TR=85;WE=39983828;WS=39983798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,89:0.41:216
chr17	39983849	rs1128966	G	C	2048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=40;PP=1577;ReadPosRankSum=-0.040;SC=ATGTGTGTATGAGCTGGCCCT;SOR=0.684;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=203;TCF=99;TCR=104;TR=80;WE=39983857;WS=39983839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,83:0.40:206
chr17	39987130	rs4796712	T	C	2321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.674;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=73;PP=1634;ReadPosRankSum=-0.943;SC=GGAGATTGTGTGCTTTGGTCC;SOR=0.566;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=250;TCF=75;TCR=175;TR=106;WE=39987138;WS=39987120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,110:0.43:255
chr17	39988601	rs7208062	C	T	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.087;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=351;ReadPosRankSum=1.136;SC=CAGCCTACTCCATCTCAAGGG;SOR=1.345;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=16;WE=39988609;WS=39988591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr17	39991790	rs1319763	C	T	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=7;PP=406;ReadPosRankSum=1.451;SC=TATCAGGTCCCTCCTAAGAGA;SOR=0.795;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=61;TCF=41;TCR=20;TR=24;WE=39991798;WS=39991780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,23:0.37:62
chr17	39991867	rs3039772	A	ATATC	1954.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.793;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=2015;ReadPosRankSum=0.369;SC=GGGGAGGATAAGGCCCTAGGT;SOR=1.154;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=92;TCF=46;TCR=46;TR=38;WE=39991875;WS=39991857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,49:0.46:107
chr17	39991988	rs1865841	G	A	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.717;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=922;ReadPosRankSum=-0.698;SC=TCAAGCTCCCGGCCATTTCTT;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=48;TCR=54;TR=47;WE=39991996;WS=39991978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,52:0.49:106
chr17	39998141	rs1529933	C	T	1897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.466;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=42;PP=1464;ReadPosRankSum=0.253;SC=GCATTTCTCCCGACATGATGA;SOR=0.882;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=168;TCF=81;TCR=87;TR=75;WE=39998149;WS=39998131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,78:0.44:176
chr17	40003421	rs4796721	C	T	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=409;ReadPosRankSum=0.333;SC=ACTGTACAGACTGGAATTAAG;SOR=0.223;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=19;WE=40003429;WS=40003411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr17	40003756	.	G	T	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.760;ClippingRankSum=0.000;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=6.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=-0.297;QD=0.58;ReadPosRankSum=1.491;SOR=2.013;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,26:0.19:140
chr17	40003788	.	C	T	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=6.483;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.417;NF=0;NR=41;PP=909;ReadPosRankSum=1.184;SC=GATGGAGTCTCGCTCTGTTGC;SOR=0.855;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=79;TCF=0;TCR=79;TR=41;WE=40003796;WS=40003778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,42:0.54:78
chr17	40010070	rs34684777	G	A	1282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=14;PP=1020;ReadPosRankSum=-0.449;SC=GTCTGATGCGGTCCTTCTGCC;SOR=0.746;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=61;TCR=25;TR=48;WE=40010078;WS=40010060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,49:0.56:87
chr17	40010979	rs3744782	G	A	4404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.383;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=96;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.141;SC=CATCAACAAAGTATCCCACAC;SOR=0.717;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=350;TCF=151;TCR=199;TR=168;WE=40010987;WS=40010969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,173:0.48:360
chr17	40024023	rs7217218	A	T	501.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.505;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=363;ReadPosRankSum=0.251;SC=GGGGGAAGAGATCTTGTCTTC;SOR=2.910;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=18;WE=40024031;WS=40024013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr17	40024869	rs12946315	G	A	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.28;MQRankSum=-2.270;QD=20.96;ReadPosRankSum=-1.180;SOR=1.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,38:0.67:57
chr17	40024873	.	G	A	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.006;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.66;MQRankSum=-3.553;QD=8.83;ReadPosRankSum=-1.044;SOR=0.505;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,29:0.45:65
chr17	40024879	.	G	A	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.130;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.61;MQRankSum=-4.263;QD=5.33;ReadPosRankSum=-1.411;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,19:0.26:73
chr17	40024895	rs8079008	A	G	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=0;PP=1149;ReadPosRankSum=-0.811;SC=CAACCCCATGAGTAAGTGGTG;SOR=0.613;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=106;TCF=105;TCR=1;TR=53;WE=40024903;WS=40024885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,46:0.48:96
chr17	40025264	rs9912300	G	T	5358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=10.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=431;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.569;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=140;NR=55;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.082;SC=ATCAACAAACGTAATGAAGAA;SOR=0.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=413;TCF=294;TCR=119;TR=195;WE=40025272;WS=40025254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:224,203:0.48:427
chr17	40025285	rs9914829	A	G	6515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=9.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=532;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.543;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=158;NR=81;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.801;SC=GAAAACAGCTACAATGCTCAC;SOR=0.748;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=511;TCF=336;TCR=175;TR=239;WE=40025293;WS=40025275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:277,249:0.47:526
chr17	40025453	rs3744779	T	C	1831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=10.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.045;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=62;PP=1540;ReadPosRankSum=2.877;SC=CTGTCACTACTATTACTACGA;SOR=1.661;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=121;TCF=1;TCR=120;TR=62;WE=40025461;WS=40025443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,63:0.50:125
chr17	40025670	rs3744780	G	A	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=82;ReadPosRankSum=0.973;SC=CGTGGCTCCTGTTTCCTCCAA;SOR=0.648;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=6;WE=40025678;WS=40025660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
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chr17	40028442	rs147409151	TG	T	2157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.859;HP=7;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.06;MQRankSum=1.012;NF=10;NR=60;PP=2972;ReadPosRankSum=-0.098;SC=CAACCTGGAGTGGGGGGAACA;SOR=1.123;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=157;TCF=29;TCR=128;TR=70;WE=40028458;WS=40028432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,86:0.50:172
chr17	40028450	rs8071627	A	T	2301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.699;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.006;NF=30;NR=55;PP=2962;ReadPosRankSum=0.050;SC=AGTGGGGGGAACAAAGGCCAG;SOR=0.470;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=173;TCF=55;TCR=118;TR=85;WE=40028458;WS=40028432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,92:0.51:181
chr17	40028541	rs8071753	A	G	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.374;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=31;PP=724;ReadPosRankSum=-0.306;SC=GTAACTACCAATCCAAGTCTA;SOR=3.239;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=56;TCF=6;TCR=50;TR=32;WE=40028549;WS=40028531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr17	40028568	rs8071234	C	G	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.284;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=459;ReadPosRankSum=1.178;SC=CCACACAACTCTAAGGCAAAA;SOR=3.654;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=21;WE=40028576;WS=40028558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr17	40048613	rs8065502	A	G	2082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.585;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=27;PP=1581;ReadPosRankSum=-0.328;SC=CTACCTCCGGATGCTTCCTCA;SOR=0.606;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=184;TCF=128;TCR=56;TR=85;WE=40048621;WS=40048603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,87:0.46:190
chr17	40049171	rs4796735	G	A	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=265;ReadPosRankSum=0.290;SC=GGCTCAAGCAGTTCTCCCACC;SOR=0.495;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=13;WE=40049179;WS=40049161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr17	40049473	rs4796736	A	G	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.255;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=33;PP=904;ReadPosRankSum=0.758;SC=ACATACCCCCAGGAGACCTGC;SOR=0.460;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=65;TCF=11;TCR=54;TR=41;WE=40049481;WS=40049463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,40:0.60:67
chr17	40053021	rs11652326	T	C	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=537;ReadPosRankSum=0.847;SC=AAAGCCCTCATCATCCCTCTC;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=24;WE=40053029;WS=40053011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr17	40058204	rs3816121	C	A	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.25;ReadPosRankSum=1.170;SOR=1.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,38:0.63:60
chr17	40058212	rs3816122	G	A	1335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=4.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.72;ReadPosRankSum=1.328;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,33:0.66:50
chr17	40068613	rs2304499	G	A	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=220;ReadPosRankSum=1.957;SC=TGCTGACCTGGAGGTGACCAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=11;WE=40068621;WS=40068603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr17	40104588	.	C	A	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=23.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.53;MQRankSum=-2.848;QD=6.31;ReadPosRankSum=0.684;SOR=5.028;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr17	40104590	.	G	A	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.005;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=22.445;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.79;MQRankSum=-3.086;QD=5.74;ReadPosRankSum=-0.930;SOR=4.649;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr17	40104594	.	G	A	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.499;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=16.705;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQRankSum=-3.696;QD=4.27;ReadPosRankSum=-3.506;SOR=3.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,25:0.37:67
chr17	40105401	rs77012779	T	TATG	3569.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.593;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.995;NF=45;NR=25;PP=2921;ReadPosRankSum=0.788;SC=AAGTCTGACTTATGAACACAA;SOR=0.639;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=162;TCF=102;TCR=60;TR=70;WE=40105409;WS=40105391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,92:0.51:181
chr17	40106868	.	CA	C	68.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.736;ClippingRankSum=-0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.80;MQRankSum=0.539;QD=5.29;ReadPosRankSum=0.371;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr17	40118807	rs4432296	C	T	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=231;ReadPosRankSum=-0.348;SC=GGGCTCGGGTCGTGCCACCGC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=10;WE=40118815;WS=40118797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr17	40123829	rs12602950	G	A	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.412;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=0;PP=742;ReadPosRankSum=-0.787;SC=AGTGTTTTGCGCTGGGCCTCG;SOR=2.948;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=52;TCR=1;TR=31;WE=40123837;WS=40123819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,33:0.57:58
chr17	40125864	rs2070106	G	A	1679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.325;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=43;PP=1244;ReadPosRankSum=0.082;SC=TCTTCACGGGGTACTACGGGA;SOR=1.318;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=158;TCF=64;TCR=94;TR=66;WE=40125872;WS=40125854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,70:0.43:162
chr17	40146970	rs6503679	G	A	2160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.551;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=66;PP=1784;ReadPosRankSum=1.085;SC=GAACTGCACCGGAAAATCAGA;SOR=1.189;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=128;TCF=16;TCR=112;TR=74;WE=40146978;WS=40146960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,75:0.56:133
chr17	40152431	rs374909941	CT	C	561.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=3;PP=539;SC=GCCACCAGGACTTGGCAGCTA;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=14;WE=40152439;WS=40152421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	40169519	rs4796758	G	T	1264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=42;PP=984;ReadPosRankSum=0.057;SC=CCGCGGCGCCGCGCCCAGAAG;SOR=0.287;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=81;TCF=1;TCR=80;TR=43;WE=40169527;WS=40169509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,45:0.54:83
chr17	40173851	rs9894001	A	C	3261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=6.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.620;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=83;PP=2553;ReadPosRankSum=1.040;SC=CTGAACAAATACGGAGGGAGA;SOR=0.927;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=248;TCF=88;TCR=160;TR=124;WE=40173859;WS=40173841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,126:0.50:254
chr17	40174305	rs35557548	T	C	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=268;ReadPosRankSum=-1.090;SC=TTCTCTGGCCTCCTCAGCCCC;SOR=0.399;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=16;WE=40174313;WS=40174295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr17	40186128	rs4277396	C	A	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=2;PP=784;SC=TGGAAAATACCGACCACAGCC;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=40186136;WS=40186118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	40189830	rs60110245	C	T	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.993;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=379;ReadPosRankSum=1.165;SC=TGAAGTCCAGCGGGGGCTGCA;SOR=1.609;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=36;TCF=22;TCR=14;TR=20;WE=40189838;WS=40189820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr17	40215180	rs4796765	A	G	2977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=79;PP=2546;SC=TGTATCCTCTATATCCCTCTG;SOR=3.492;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=13;TCR=79;TR=92;WE=40215188;WS=40215170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
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chr17	40267914	rs144923852	C	T	1140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-7.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=41;PP=872;ReadPosRankSum=-1.987;SC=GGAGAGGTCTCAGAGACCAGA;SOR=0.682;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=12;TCR=99;TR=46;WE=40267922;WS=40267904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,47:0.42:111
chr17	40269280	rs73986522	A	T	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-6.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.043;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=36;PP=933;ReadPosRankSum=-2.245;SC=GTGAGAAGTAAGAATGCTCAA;SOR=0.549;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=98;TCF=14;TCR=84;TR=43;WE=40269288;WS=40269270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,44:0.44:101
chr17	40270040	rs146062629	G	GGA	667.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-1.929;QD=9.68;ReadPosRankSum=2.497;SOR=0.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,24:0.35:69
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chr17	40270062	rs73986523	T	C	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=1.195;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-1.972;QD=9.49;ReadPosRankSum=0.560;SOR=0.908;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,24:0.34:71
chr17	40270084	.	GAGAGAGAGA	G	467.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.898;ClippingRankSum=0.000;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=5.143;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=-2.256;QD=8.21;ReadPosRankSum=-2.589;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,16:0.28:57
chr17	40270103	.	C	CG	613	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=5;HapScore=4;MGOF=22;MMLQ=24;MQ=56.89;NF=10;NR=16;PP=613;QD=24.7692307692;SC=AAGTCAGGGACGGGGGCTGAA;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=59;TCF=19;TCR=40;TR=26;WE=40270130;WS=40270074;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr17	40270107	.	G	GGT	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.300;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=4.030;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=-2.037;QD=4.94;ReadPosRankSum=-2.112;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,7:0.18:38
chr17	40270119	.	GGAGA	G	1720	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=22;MMLQ=24;MQ=57.57;NF=10;NR=14;PP=1720;QD=72.4166666667;SC=CTGAAGCTGAGGAGAGAGAGA;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=55;TCF=24;TCR=31;TR=24;WE=40270130;WS=40270074;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr17	40270238	rs2074164	G	C	1159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=5;PP=877;ReadPosRankSum=1.202;SC=TCCGGCCCAGGTGAGCTCTCT;SOR=0.836;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=86;TCF=75;TCR=11;TR=42;WE=40270246;WS=40270228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,43:0.49:87
chr17	40271757	rs730086	G	A	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=29;PP=741;ReadPosRankSum=0.372;SC=GTGGGTGGGGGATAAAACCAG;SOR=0.636;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=53;TCF=5;TCR=48;TR=33;WE=40271765;WS=40271747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,36:0.62:58
chr17	40271970	rs8072215	A	G	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=47;ReadPosRankSum=0.591;SC=GCTTGAGGAGAATGGAGAACA;SOR=0.765;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=4;WE=40271978;WS=40271960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr17	40272406	rs35184688	G	C	2634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.618;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=64;PP=2110;ReadPosRankSum=-0.694;SC=ACAGATGGCAGAGTTAGGAAA;SOR=1.066;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=217;TCF=84;TCR=133;TR=98;WE=40272414;WS=40272396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,103:0.46:224
chr17	40272594	rs2285657	C	A	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=11;PP=379;ReadPosRankSum=0.580;SC=TGGTGCACACCCCCCCCCAAC;SOR=0.587;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=49;TCF=24;TCR=25;TR=23;WE=40272602;WS=40272584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr17	40274873	rs1122326	A	C	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.540;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=1;PP=597;ReadPosRankSum=2.060;SC=ACTCGGATGCAGAGAGTCGGT;SOR=0.139;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=62;TCF=61;TCR=1;TR=28;WE=40274881;WS=40274863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,27:0.44:61
chr17	40278081	rs2240010	T	A	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=195;ReadPosRankSum=0.755;SC=TGCGGCAAAGTAAGGTTAAAT;SOR=0.616;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=10;WE=40278089;WS=40278071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr17	40280944	rs739637	G	C	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=239;ReadPosRankSum=-0.507;SC=GAACCCTCAAGCCAGGAGCCA;SOR=0.776;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=11;WE=40280952;WS=40280934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr17	40314213	rs60075634	A	C	1396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.332;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=18;PP=1020;ReadPosRankSum=-0.922;SC=AGCCACGTGTAGGGTCTGAAA;SOR=1.180;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=139;TCF=88;TCR=51;TR=57;WE=40314221;WS=40314203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,59:0.40:146
chr17	40314498	rs61160591	A	G	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.552;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.136;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=182;ReadPosRankSum=-1.181;SC=CCTGGTTCTGAGGCCCCTGTG;SOR=0.136;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=9;WE=40314506;WS=40314488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr17	40318296	rs28459794	A	G	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.388;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=6;PP=823;ReadPosRankSum=0.243;SC=TAGGTAGTAGAGGGTGACGGT;SOR=0.283;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=69;TCF=61;TCR=8;TR=39;WE=40318304;WS=40318286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,41:0.59:69
chr17	40321553	rs201523967	C	T	1407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=19;PP=1101;ReadPosRankSum=-0.980;SC=TTCGAGCATGCGCTGCTTGAG;SOR=0.662;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=79;TCR=45;TR=53;WE=40321561;WS=40321543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,56:0.42:132
chr17	40322252	rs939881	T	C	1504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.315;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=31;PP=1017;ReadPosRankSum=-0.282;SC=CGCTGCGCCGTGATGGGCCGC;SOR=0.628;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=139;TCF=68;TCR=71;TR=64;WE=40322260;WS=40322242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,67:0.47:143
chr17	40344878	.	G	A	698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.101;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=12;PP=572;ReadPosRankSum=0.664;SC=GGTCTCTGGTGGGACTGGGCT;SOR=0.518;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=46;TCF=26;TCR=20;TR=26;WE=40344886;WS=40344868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr17	40359505	rs377476267	GCACA	G,GCA	1075.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.26;MQRankSum=-0.331;QD=25.61;ReadPosRankSum=1.142;SOR=2.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:2,10,30:0.24,0.71:42
chr17	40447558	rs2293158	T	C	1851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=13;PP=1513;ReadPosRankSum=0.021;SC=TTGGGGTCTGTAGTATTGGTG;SOR=0.738;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=56;WE=40447566;WS=40447548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,60:0.97:62
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chr17	40459562	rs2272087	A	G	3168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.294;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=34;PP=2652;ReadPosRankSum=0.369;SC=GGGCGCAGAGAGACTGTGGCT;SOR=0.884;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=256;TCF=175;TCR=81;TR=119;WE=40459570;WS=40459552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,118:0.46:255
chr17	40459737	rs1135669	C	T	2386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.821;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=83;PP=2001;ReadPosRankSum=-0.698;SC=GGAAGTTTGACTCCCGTGAGT;SOR=1.407;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=243;TCF=50;TCR=193;TR=98;WE=40459745;WS=40459727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,97:0.39:250
chr17	40460989	rs2293155	A	G	4469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.663;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=96;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.053;SC=GAGGGAGACTACATGGGGCGT;SOR=0.531;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=316;TCF=134;TCR=182;TR=175;WE=40461011;WS=40460979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,174:0.54:320
chr17	40461003	rs2293154	C	T	4377.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.534;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=114;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.185;SC=GGGGCGTGGGCTTCCACCCCA;SOR=0.864;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=316;TCF=111;TCR=205;TR=173;WE=40461011;WS=40460979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,173:0.54:321
chr17	40461674	rs12601982	A	G	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.703;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=167;ReadPosRankSum=0.431;SC=TAGCAGGGTCAAGTCCTCACT;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=8;WE=40461682;WS=40461664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr17	40462531	rs2067694	C	T	1984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.375;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=15;PP=1399;ReadPosRankSum=0.622;SC=CCAGCCCTGACCATGTACTCG;SOR=1.034;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=154;TCF=119;TCR=35;TR=76;WE=40462539;WS=40462521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,81:0.51:160
chr17	40462796	rs143605021	TTGTG	T	565.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.905;NF=1;NR=17;PP=640;ReadPosRankSum=-0.198;SC=ATGCATGTGCTTGTGTGTGTG;SOR=0.368;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=53;TCF=4;TCR=49;TR=18;WE=40462807;WS=40462786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr17	40468489	rs9891867	G	A	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=335;ReadPosRankSum=-1.547;SC=CACCCACCTCGGCCTCCCAAA;SOR=0.582;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=15;WE=40468497;WS=40468479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr17	40475650	rs3830585	G	GA	4464.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=322;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.913;NF=72;NR=57;PP=2970;ReadPosRankSum=0.430;SC=GGTCCTGAAGGAAAGAAAAAG;SOR=0.705;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=282;TCF=160;TCR=122;TR=129;WE=40475658;WS=40475640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,165:0.53:314
chr17	40476667	rs17881940	C	G	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=163;ReadPosRankSum=-0.409;SC=AATGAACAGCCCTATGGGCCG;SOR=1.765;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=11;WE=40476675;WS=40476657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr17	40481529	rs2293152	G	C	1409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.528;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=15;PP=1135;ReadPosRankSum=-0.572;SC=AGCCCTCTCCGGCAGCCAGAG;SOR=1.002;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=124;TCF=86;TCR=38;TR=55;WE=40481537;WS=40481519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,56:0.44:126
chr17	40490539	rs35162488	T	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.46;MQRankSum=1.345;QD=6.72;ReadPosRankSum=-1.930;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr17	40491273	.	CA	C	278.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.000;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=1.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQRankSum=1.272;QD=4.36;ReadPosRankSum=-0.055;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,28:0.44:64
chr17	40497828	rs12601611	C	T	276.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.54;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	40500265	rs2306581	C	A	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=397;SC=AAAGGGTGCCCCTTTATCTCC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=40500273;WS=40500255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	40574557	.	C	T	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=348;ReadPosRankSum=-0.956;SC=GGAGCAGCGCCACGGGCAGGT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=17;WE=40574565;WS=40574547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr17	40619937	rs4796668	A	G	1001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=0;PP=810;SC=ACTTTTTGTAACCAGGTCTTA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=40619945;WS=40619927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	40639422	rs8069972	G	A	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=389;ReadPosRankSum=-0.736;SC=CTCGTGGCCCGGAAGAGAGGT;SOR=0.826;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=16;WE=40639430;WS=40639412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr17	40642452	rs9899168	T	C	6227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=163;NR=23;PP=2965;SC=GTGTAACCACTACCACAATTA;SOR=3.900;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=187;TCF=164;TCR=23;TR=186;WE=40642460;WS=40642442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr17	40689455	rs659497	T	C	5834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=70;PP=2965;SC=AAAGCTACTCTTTCGTGTGGT;SOR=1.005;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=173;TCF=102;TCR=71;TR=171;WE=40689463;WS=40689445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr17	40689476	.	C	T	2160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=0.000;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.297;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=43;PP=1659;ReadPosRankSum=-0.427;SC=GGGACTGGGCCCGCTGGGAGC;SOR=0.816;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=184;TCF=92;TCR=92;TR=82;WE=40689484;WS=40689466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,87:0.46:188
chr17	40689613	rs2071046	G	C	570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.388;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=472;ReadPosRankSum=-0.411;SC=GGGAGCCACCGTAGGTGTTTT;SOR=0.154;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=21;WE=40689621;WS=40689603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,22:0.46:48
chr17	40696233	rs86312	C	G	6994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=128;PP=2965;SC=ATATTACCCCCGCTGGGTGGC;SOR=0.990;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=225;TCF=96;TCR=129;TR=224;WE=40696241;WS=40696223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr17	40699291	rs607740	G	A	4334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=70;PP=2965;SC=CGCAGTGTGTGACACAGGCCT;SOR=0.816;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=134;TCF=64;TCR=70;TR=134;WE=40699299;WS=40699281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr17	40699332	rs607795	T	C	4251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=86;PP=2965;SC=GGGAGGACGCTGTGGCCTCTG;SOR=1.257;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=55;TCR=86;TR=141;WE=40699340;WS=40699322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
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chr17	40700448	rs2854973	C	G	3187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=73;PP=2725;SC=GCGCGCAGCCCGGGCCAGAGC;SOR=2.232;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=24;TCR=73;TR=97;WE=40700456;WS=40700438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
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chr17	40720632	rs646123	G	A	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.875;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=39;PP=933;ReadPosRankSum=-0.823;SC=CATAATTGTAGTACCTTTCCT;SOR=1.274;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=78;TCF=17;TCR=61;TR=48;WE=40720640;WS=40720622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,49:0.62:79
chr17	40721042	rs650558	C	T	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=14;PP=439;ReadPosRankSum=0.722;SC=CCCACTCAGACAGTCCCAGGC;SOR=0.527;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=21;WE=40721050;WS=40721032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr17	40721360	rs632758	C	A	2470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.728;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=47;PP=1979;ReadPosRankSum=1.317;SC=TGGAGCCAAGCGGGGCTGTGA;SOR=0.504;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=165;TCF=86;TCR=79;TR=91;WE=40721368;WS=40721350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,92:0.55:166
chr17	40722029	rs665268	A	G	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=409;ReadPosRankSum=-0.687;SC=AAGGCACACCAGGACAACCCC;SOR=0.895;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=25;WE=40722037;WS=40722019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr17	40723391	rs2010750	C	T	612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=5.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=504;ReadPosRankSum=0.323;SC=GTGATCCACCCGCCTTGGCCT;SOR=2.262;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=21;WE=40723399;WS=40723381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr17	40725656	rs2292752	G	C	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=528;ReadPosRankSum=0.072;SC=AACCACATCCGCCTGGGGTCA;SOR=0.722;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=57;TCF=8;TCR=49;TR=25;WE=40725664;WS=40725646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,27:0.46:59
chr17	40735469	rs1517002	T	G	1656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=21;PP=1172;ReadPosRankSum=0.381;SC=GGTTAAAAGGTAGCTAAAGAA;SOR=0.741;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=93;TCR=49;TR=60;WE=40735477;WS=40735459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,66:0.44:150
chr17	40735641	rs10454087	C	T	962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=32;PP=741;ReadPosRankSum=1.170;SC=CTTCTCCCAGCGTAAAATCCC;SOR=0.579;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=98;TCF=20;TCR=78;TR=41;WE=40735649;WS=40735631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,40:0.41:98
chr17	40737043	rs9889580	G	C	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=6.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.107;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=2;PP=896;ReadPosRankSum=-1.228;SC=AACTACCCCCGACTTCCACTT;SOR=0.047;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=79;TCF=77;TCR=2;TR=41;WE=40737051;WS=40737033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,46:0.55:84
chr17	40737117	rs4792992	G	A	2919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.099;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=35;PP=2264;ReadPosRankSum=0.449;SC=TTGCGTAAGTGGAAAGAATGA;SOR=0.813;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=220;TCF=153;TCR=67;TR=116;WE=40737125;WS=40737107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,120:0.53:228
chr17	40744320	rs4793253	A	G	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=36;PP=859;ReadPosRankSum=-1.281;SC=CTAGTTATACACCTAGGGTAA;SOR=0.746;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=76;TCF=4;TCR=72;TR=38;WE=40744328;WS=40744310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,41:0.51:80
chr17	40766546	rs1045710	C	G	2064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.448;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-11.211;NF=68;NR=9;PP=1781;ReadPosRankSum=-0.081;SC=TCCGGGAACGCAAGTTGGCCA;SOR=1.254;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=171;TCF=149;TCR=22;TR=77;WE=40766554;WS=40766536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,74:0.45:166
chr17	40811781	rs2292750	C	T	4574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=387;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.627;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=58;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.158;SC=TCGTGTCAGCCTCTGAGACTA;SOR=0.924;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=372;TCF=235;TCR=137;TR=171;WE=40811789;WS=40811771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,178:0.46:386
chr17	40811919	rs525911	A	G	2082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.532;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.463;NF=4;NR=80;PP=1693;ReadPosRankSum=0.728;SC=TCGTGGAGGAATTCGCCACCG;SOR=2.624;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=203;TCF=16;TCR=187;TR=84;WE=40811927;WS=40811909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,83:0.41:202
chr17	40812797	rs3835175	C	CT	1138.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.748;NF=2;NR=33;PP=1348;ReadPosRankSum=-2.455;SC=AGGAGGTGGCCTGGATAGGTA;SOR=0.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=4;TCR=74;TR=35;WE=40812805;WS=40812787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,38:0.51:75
chr17	40817448	rs3817331	G	A	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=170;ReadPosRankSum=0.549;SC=TTATTTCTATGCCCATTTTAT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=10;WE=40817456;WS=40817445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr17	40817990	rs7225374	G	A	3012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.96;NF=24;NR=66;PP=2464;SC=CAGAGCGGGCGACTTTCTTGC;SOR=2.059;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=24;TCR=67;TR=90;WE=40817998;WS=40817980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
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chr17	40818584	rs2292749	C	T	5389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=472;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.613;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=133;PP=2962;ReadPosRankSum=0.307;SC=ACTCCTAACCCCCTGGCTCGC;SOR=0.498;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=470;TCF=165;TCR=305;TR=212;WE=40818592;WS=40818574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:258,213:0.45:471
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chr17	40822308	rs8071056	C	A	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=2;PP=355;SC=AGAAGTCCCGCTGCAGGCTCT;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=40822316;WS=40822298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr17	40826525	rs35595844	AAGG	A	1111.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=21;PP=1187;SC=GGGATTGAGGAAGGAGGAGTC;SOR=3.098;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=24;WE=40826535;WS=40826515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	40835819	rs36108420	A	AT	2118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.584;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=14;PP=2159;ReadPosRankSum=0.547;SC=GCTGACTAACAGTCGGTTTCC;SOR=0.428;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=144;TCF=112;TCR=32;TR=56;WE=40835827;WS=40835809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,66:0.41:161
chr17	40835922	rs2271029	A	C	2416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.258;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=43;PP=1781;ReadPosRankSum=-0.185;SC=TACTGCGCCGAGATTCGCCAG;SOR=0.871;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=229;TCF=122;TCR=107;TR=100;WE=40835930;WS=40835912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,103:0.43:240
chr17	40836975	rs9889373	A	G	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.568;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=5;PP=779;ReadPosRankSum=0.816;SC=AGCAGAGGGCAGGACGTGGTT;SOR=1.499;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=117;TCF=98;TCR=19;TR=51;WE=40836983;WS=40836965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,52:0.44:119
chr17	40841397	rs2271028	C	T	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=470;ReadPosRankSum=0.365;SC=CCTGCATCTGCGCTTATACCC;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=23;WE=40841405;WS=40841387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr17	40842084	rs3760386	G	A	1781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.366;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=21;PP=1381;ReadPosRankSum=0.555;SC=AACTGCCTTTGTCTCAACCTA;SOR=1.240;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=151;TCF=99;TCR=52;TR=72;WE=40842092;WS=40842074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,74:0.47:156
chr17	40848342	rs36083265	AT	A	126.92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.45;MQRankSum=-0.385;QD=12.69;ReadPosRankSum=0.126;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr17	40849289	.	C	G	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.273;ClippingRankSum=0.000;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.491;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=8;PP=1313;ReadPosRankSum=-0.212;SC=CTCCCCACCTCAGGTGGACTA;SOR=1.664;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=142;TCF=115;TCR=27;TR=62;WE=40849297;WS=40849279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,61:0.45:137
chr17	40849842	rs1553468	A	G	2709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-8.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.287;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=48;PP=2007;ReadPosRankSum=-0.034;SC=CACAGAGGACAGAAGGGAGGG;SOR=0.621;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=200;TCF=94;TCR=106;TR=102;WE=40849850;WS=40849832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,110:0.53:209
chr17	40854534	rs3841620	G	GT	1449.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=4;PP=1798;ReadPosRankSum=1.132;SC=AAGTGCTGCCGTGGGGCCTGG;SOR=0.512;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=93;TCF=86;TCR=7;TR=45;WE=40854542;WS=40854524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,48:0.51:94
chr17	40912760	rs1078523	A	G	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.256;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=298;ReadPosRankSum=1.096;SC=CCTGAGCTGCATGGCTCAGCT;SOR=3.228;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=34;TCF=8;TCR=26;TR=16;WE=40912768;WS=40912750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr17	40913366	rs9892728	C	T	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.262;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=85;ReadPosRankSum=2.655;SC=GCCTCCTCCTCCTGCTGGGCG;SOR=0.707;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=5;WE=40913374;WS=40913356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr17	40925332	.	G	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=97;ReadPosRankSum=0.097;SC=GGCTTTTTAGGATAACAGCGA;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=8;WE=40925340;WS=40925322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,8:0.22:36
chr17	40940579	rs61755606	G	A	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=561;ReadPosRankSum=-0.345;SC=AGACTTTAGAGGTGGGGTCTA;SOR=0.493;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=46;TCR=8;TR=26;WE=40940587;WS=40940569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr17	40986454	.	GGA	G	417.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.018;ClippingRankSum=0.000;DP=181;ExcessHet=3.0103;FS=2.147;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.03;MQRankSum=2.029;QD=3.32;ReadPosRankSum=-1.026;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,31:0.25:126
chr17	41004637	rs33986943	G	A	1314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=36;PP=1058;ReadPosRankSum=0.495;SC=AAGACAATACGTGATGCCTTT;SOR=0.704;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=113;TCF=35;TCR=78;TR=51;WE=41004645;WS=41004627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,51:0.45:114
chr17	41006760	rs34908272	G	A	1277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=38;PP=998;ReadPosRankSum=0.782;SC=GGTGAGTGGCGGGCAGTCAGA;SOR=0.460;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=88;TCF=18;TCR=70;TR=49;WE=41006768;WS=41006750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,49:0.55:89
chr17	41020995	.	G	A	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.196;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=31;PP=666;ReadPosRankSum=1.219;SC=GCTTATGCCTGTAAGCCCAAC;SOR=1.540;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=71;TCF=9;TCR=62;TR=34;WE=41021003;WS=41020985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,37:0.50:74
chr17	41046440	rs324079	T	G	990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=0;PP=848;SC=CCCTACCTGCTCAGTTCAAGG;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=41046448;WS=41046430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	41059718	rs161627	A	G	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.869;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=155;ReadPosRankSum=0.423;SC=CACACCACGTATTCTTCCTCA;SOR=2.910;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=9;WE=41059726;WS=41059708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr17	41061489	rs161622	T	C	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=3.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.607;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=239;ReadPosRankSum=1.649;SC=TCCGTTTCTCTCCCTAATCAG;SOR=0.061;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=11;WE=41061497;WS=41061479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr17	41063466	rs2229611	T	C	1762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=9.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=58;PP=1434;ReadPosRankSum=1.333;SC=CTTCGGTGTTTAAAGTCAACA;SOR=0.605;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=126;TCF=0;TCR=126;TR=58;WE=41063474;WS=41063456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,61:0.48:128
chr17	41103938	rs534720	T	C	5274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=90;PP=2965;SC=GGAGATAAGCTCTGATACTGA;SOR=0.830;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=73;TCR=90;TR=163;WE=41103946;WS=41103928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr17	41108009	rs151078413	AAC	A	79.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.04;ReadPosRankSum=2.235;SOR=0.497;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,9:0.12:77
chr17	41113131	rs35166621	CA	C	955.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=0;PP=914;SC=CTAGAGAACCCAAACTACGTC;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=23;WE=41113139;WS=41113121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr17	41116234	rs690941	G	A	6357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=132;PP=2965;SC=CGGGACAGCAGGAGACCACGG;SOR=2.135;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=46;TCR=132;TR=178;WE=41116242;WS=41116224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr17	41116291	rs11278824	CAGCCCT	C	3808.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=60;PP=2980;SC=GCCCCGACCCCAGCCCTAGCC;SOR=3.206;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=12;TCR=88;TR=68;WE=41116304;WS=41116281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr17	41116565	rs690971	G	T	3252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.049;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=55;PP=2367;ReadPosRankSum=-0.763;SC=AAGCAGGAGGGTAAGGAATGG;SOR=0.280;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=108;TCF=53;TCR=55;TR=106;WE=41116573;WS=41116555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr17	41116723	rs690979	G	A	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=16;PP=602;SC=CAAGGCACGTGGTTTAGTGAG;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=41116731;WS=41116713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	41121210	rs113173233	GC	G	2517.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.986;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.565;NF=29;NR=70;PP=1676;ReadPosRankSum=0.341;SC=CATCCTGGGGGCGGGGGGGAA;SOR=0.346;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=29;TCR=70;TR=99;WE=41121225;WS=41121199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,94:0.96:98
chr17	41121217	rs7217553	G	A	5067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=73;PP=2657;SC=GGGGCGGGGGGGAAAAAAGAC;SOR=1.258;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=118;TCF=45;TCR=73;TR=112;WE=41121225;WS=41121199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr17	41121263	rs4793187	G	A	2614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=66;PP=2239;SC=AGGAACATTTGTGTTAACAAA;SOR=2.542;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=18;TCR=66;TR=84;WE=41121271;WS=41121253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	41122443	rs2670866	T	C	3115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=69;PP=2264;SC=GAAGAATGGTTGCAGCCAGAA;SOR=1.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=35;TCR=69;TR=103;WE=41122451;WS=41122433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr17	41132578	rs692074	T	C	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=0;PP=200;SC=TGACGTGCGGTGGTGTTTCCG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=41132586;WS=41132568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	41133071	rs1708875	T	C	4264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=88;NR=57;PP=2965;SC=GGACCGGCCATGGTTGCGGGG;SOR=1.202;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=88;TCR=57;TR=145;WE=41133079;WS=41133061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr17	41133242	rs550285	G	A	3485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=79;PP=2838;SC=TGGAGTGCGGGGCCGGCTGAA;SOR=2.237;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=27;TCR=79;TR=106;WE=41133250;WS=41133232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr17	41150949	rs2271539	G	A	3017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=83;PP=2539;SC=TGGGGCAGTAGCCAGTGAGCA;SOR=4.106;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=9;TCR=83;TR=92;WE=41150957;WS=41150939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr17	41150983	rs691954	T	C	2280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=59;PP=1928;SC=CGTGGGAGAGTTTTTGAGAGA;SOR=4.375;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=5;TCR=59;TR=64;WE=41150991;WS=41150973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	41154817	rs11871636	A	C	4315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=70;PP=2965;SC=AGGCTTTGGTAGTGAATGGTG;SOR=0.707;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=75;TCR=70;TR=145;WE=41154825;WS=41154807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr17	41164126	rs692651	A	C	1060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=2;PP=911;SC=AATAGGCCCCACTTCCCCTGG;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=31;WE=41164134;WS=41164116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	41165493	rs588703	A	G	4977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=74;PP=2965;SC=CTCCCCCTAGATGTCCAGCCA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=81;TCR=74;TR=155;WE=41165501;WS=41165483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr17	41165734	rs443759	C	T	5508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=103;PP=2965;SC=TGCAAGATTACGGTGCAGGGA;SOR=1.365;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=62;TCR=104;TR=165;WE=41165742;WS=41165724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr17	41165878	rs13229	C	T	2166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=46;PP=1721;SC=CGTATGTGAACGGGGAGATCC;SOR=1.897;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=20;TCR=46;TR=66;WE=41165886;WS=41165868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	41167957	rs455055	C	A	4665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=20;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.888;SC=ACCACAGAGACCTTCGGGGGA;SOR=2.288;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=144;TCF=124;TCR=20;TR=142;WE=41167965;WS=41167947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,144:0.99:145
chr17	41170898	rs429464	T	C	1653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=41;PP=1365;SC=GGTACAAGGCTACCTTCTTCC;SOR=3.398;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=47;WE=41170906;WS=41170888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	41170943	rs55845054	GTAA	G	863.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=802;SC=AATAGTCATGGTAATAATAAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=17;WE=41170953;WS=41170933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	41246481	rs1799950	T	C	4572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.892;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=418;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.748;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=106;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.593;SC=TGGCAGTTTCTGCTTATTCCA;SOR=0.854;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=399;TCF=185;TCR=214;TR=187;WE=41246489;WS=41246471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:212,203:0.49:415
chr17	41251931	rs799923	G	A	1922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=48;PP=1462;ReadPosRankSum=0.549;SC=TCAAGCAATTGTTGGCCAGTT;SOR=0.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=131;TCF=46;TCR=85;TR=72;WE=41251939;WS=41251921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,75:0.54:140
chr17	41327684	rs10684756	C	CTG	5972.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=105;NR=13;PP=2957;SC=TTGTTCATTGCTGTCTCCCAA;SOR=4.125;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=110;TCR=14;TR=118;WE=41327692;WS=41327674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr17	41332804	rs9904555	T	C	5747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=100;PP=2965;ReadPosRankSum=0.971;SC=TATTTTTTGTTCTTTTAGGAG;SOR=0.356;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=178;TCF=76;TCR=102;TR=176;WE=41332812;WS=41332794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,185:0.99:186
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chr17	41466073	rs4986155	T	C	4011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.711;HP=1;HapScore=1;MGOF=169;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.462;NF=56;NR=66;PP=2962;ReadPosRankSum=0.505;SC=GGGGCTGGAGTTCCTCTGCCA;SOR=0.079;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=148;TCF=60;TCR=88;TR=122;WE=41466081;WS=41466063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,136:0.83:163
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chr17	41466108	rs62080665	G	C	3332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-3.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.168;HP=2;HapScore=1;MGOF=72;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.399;NF=43;NR=67;PP=2962;ReadPosRankSum=0.210;SC=ACCAGACACCGGGCAGAGGGA;SOR=0.110;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=130;TCF=45;TCR=85;TR=110;WE=41466138;WS=41466086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,132:0.87:151
chr17	41466120	rs66825422	GCGGCGCATGGA	G	4724.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.443;HP=1;HapScore=1;MGOF=72;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.829;NF=24;NR=40;PP=2971;ReadPosRankSum=1.528;SC=GCAGAGGGAGGCGGCGCATGG;SOR=0.136;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=106;TCF=35;TCR=71;TR=64;WE=41466138;WS=41466086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,116:0.86:135
chr17	41477710	rs3179287	A	G	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.600;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=-1.055;SC=ACGGTGACCCAAGCCCCCCCT;SOR=2.030;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=5;WE=41477718;WS=41477700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr17	41522213	rs7207008	T	A	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.776;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=961;ReadPosRankSum=-0.404;SC=AACAGCAGGATTGGCTGTAGC;SOR=0.595;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=95;TCF=33;TCR=62;TR=50;WE=41522221;WS=41522203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,53:0.52:101
chr17	41561601	rs140026870	CGGAAGGA	C	10857.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=216;PP=2984;SC=TTGAGGGAAGCGGAAGGAGGA;SOR=5.003;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=281;TCF=17;TCR=264;TR=221;WE=41561615;WS=41561591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr17	41566783	rs141196624	CTCT	C	1164.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.133;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.554;NF=22;NR=4;PP=945;ReadPosRankSum=-0.667;SC=TTGTTCATGTCTCTTCTTTTC;SOR=1.650;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=76;TCF=57;TCR=19;TR=26;WE=41566793;WS=41566773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,34:0.39:87
chr17	41566969	rs1807204	T	G	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.03;ReadPosRankSum=0.607;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr17	41569933	rs11870101	C	T	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.501;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=654;ReadPosRankSum=0.624;SC=AACTCTAATTCAGTTCAAAAC;SOR=0.443;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=59;TCF=52;TCR=7;TR=28;WE=41569941;WS=41569923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr17	41570427	rs2279191	T	C	979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.185;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=751;ReadPosRankSum=0.037;SC=TGGTGCTCTTTTGTTCACACC;SOR=0.453;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=62;TCF=13;TCR=49;TR=35;WE=41570435;WS=41570417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,37:0.58:64
chr17	41573730	rs12602059	T	C	1954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=58;PP=1489;ReadPosRankSum=0.676;SC=CTATTAATCATTTGTTCTTTG;SOR=1.015;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=130;TCF=18;TCR=112;TR=66;WE=41573738;WS=41573720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,71:0.51:138
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chr17	41585657	rs2293014	G	A	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=619;ReadPosRankSum=1.178;SC=CCTTGTATAGGACACACATAC;SOR=0.340;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=26;WE=41585665;WS=41585647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
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chr17	41599383	rs2271958	G	A	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=11;PP=854;ReadPosRankSum=1.724;SC=TGAAAGCTGAGTGGGCTCATA;SOR=0.790;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=62;TCR=22;TR=42;WE=41599391;WS=41599373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,44:0.52:85
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chr17	41610398	rs2242598	C	T	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.219;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=381;ReadPosRankSum=1.227;SC=GAGTGGGCTCCGGAATGGGGG;SOR=0.495;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=38;TCF=16;TCR=22;TR=18;WE=41610406;WS=41610388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr17	41613691	rs56357945	G	T	1703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=20;PP=1270;ReadPosRankSum=-0.449;SC=ACCCCACTGTGTTTTAGGAGA;SOR=0.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=124;TCF=83;TCR=41;TR=62;WE=41613699;WS=41613681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,68:0.53:128
chr17	41622507	rs79868029	A	G	472.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.479;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=8;PP=353;ReadPosRankSum=0.275;SC=AGAATGACCAAAATCCCTTGG;SOR=0.202;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=43;TCF=27;TCR=16;TR=17;WE=41622515;WS=41622497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,18:0.41:44
chr17	41622562	.	C	CGTGTGTGTGTGT	864.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=13.453;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.11;MQRankSum=-1.680;QD=29.82;ReadPosRankSum=0.855;SOR=4.281;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr17	41622740	rs2271959	G	T	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.071;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=39;PP=939;ReadPosRankSum=0.689;SC=CGATTTCTGCGAGAAGCGGGG;SOR=1.460;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=117;TCF=38;TCR=79;TR=52;WE=41622748;WS=41622730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,56:0.46:121
chr17	41846964	rs1230403	T	C	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=0;PP=471;SC=CGAGCAGAGGTGGTGGGGGTG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=41846972;WS=41846954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	41879074	rs17742683	T	C	1540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.420;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=24;PP=1092;ReadPosRankSum=0.440;SC=TAAAGTTACCTGACCCAACTA;SOR=0.402;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=123;TCF=77;TCR=46;TR=59;WE=41879082;WS=41879064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,63:0.50:127
chr17	41955158	rs231521	A	G	8997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=172;NR=99;PP=2965;SC=AGTGAGCCAAAGACCAGGTGA;SOR=1.404;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=272;TCF=173;TCR=99;TR=271;WE=41955166;WS=41955148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,276:1.00:276
chr17	41959808	rs124721	T	C	13233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=421;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=149;NR=256;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.644;SC=GCAGGCCTTGTTGAGCCACCA;SOR=1.210;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=406;TCF=150;TCR=256;TR=405;WE=41959816;WS=41959798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,415:1.00:416
chr17	41960343	rs124719	T	C	2876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=29;PP=2146;SC=GGTTGCTGAATGTAGGGTCCA;SOR=1.683;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=65;TCR=29;TR=94;WE=41960351;WS=41960333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr17	41960633	rs412849	CG	GC	5722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=44;PP=2947;SC=TGCTCAGCCACGTGCGCCAGG;SOR=1.110;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=124;TCF=73;TCR=51;TR=114;WE=41960642;WS=41960623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr17	41961451	rs231518	T	C	4046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=66;PP=2965;SC=AGCCACTTTATCCCAAAGTAT;SOR=0.740;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=59;TCR=66;TR=125;WE=41961459;WS=41961441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr17	41987062	rs3744416	A	G	1321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.579;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=25;PP=1007;ReadPosRankSum=1.345;SC=GTATCTCTCTAATAAAGGCCT;SOR=0.451;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=102;TCF=44;TCR=58;TR=48;WE=41987070;WS=41987052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,50:0.48:104
chr17	41994794	rs231458	C	T	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.715;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=897;ReadPosRankSum=2.016;SC=TCTGAGCCTACGCCGGAAGAC;SOR=1.048;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=96;TCF=37;TCR=59;TR=47;WE=41994802;WS=41994784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,51:0.51:100
chr17	42018471	rs231473	T	C	2208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=45;PP=1602;ReadPosRankSum=-0.261;SC=CCATTTCAGCTCCAGGGAGCT;SOR=0.651;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=159;TCF=73;TCR=86;TR=85;WE=42018479;WS=42018461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,91:0.54:169
chr17	42030531	rs1058046	G	C	3272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=8.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.136;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=80;PP=2655;ReadPosRankSum=0.014;SC=GGAAAGAAGCGTGTCCGGGCC;SOR=0.585;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=220;TCF=66;TCR=154;TR=116;WE=42030539;WS=42030521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,118:0.53:222
chr17	42030743	rs229969	G	C	5673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=136;NR=47;PP=2965;SC=GCGTCTTCGCGGGGAGCCTCG;SOR=2.033;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=136;TCR=47;TR=183;WE=42030751;WS=42030733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr17	42031331	rs2070592	C	T	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.357;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=385;ReadPosRankSum=1.726;SC=CCTTGTGGGGCTTATATCCCC;SOR=1.069;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=52;TCF=21;TCR=31;TR=21;WE=42031339;WS=42031321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr17	42083840	rs228770	T	C	1465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=6;PP=1242;SC=TCCGTGGGGGTAGGGGGGCAG;SOR=3.467;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=45;WE=42083848;WS=42083830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	42084097	rs228771	C	G	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=29;PP=922;SC=GTGGGCGGGCCGGGGACTGGG;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=35;WE=42084105;WS=42084087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	42085150	rs228773	T	C	1717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.94;NF=17;NR=44;PP=1367;SC=TGGTAGGTCCTGCCACTCCCA;SOR=1.942;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=17;TCR=44;TR=61;WE=42085158;WS=42085140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	42085972	rs186636	C	T	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=31;PP=984;SC=GCAGCTGACCCTCACCATGGA;SOR=3.383;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=36;WE=42085980;WS=42085962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	42090587	rs228778	G	C	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=699;SC=TGGCTTCCCAGAGTGTAGAAC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=42090595;WS=42090577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	42156471	rs376816	A	C	4740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=104;NR=34;PP=2965;SC=GGCCCCTCAGACCTCTGGCCT;SOR=2.147;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=138;TCF=104;TCR=34;TR=138;WE=42156479;WS=42156461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr17	42157739	rs850856	C	T	8758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=164;NR=109;PP=2965;SC=GGGGCTCCCACTGACTACCAT;SOR=1.126;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=273;TCF=164;TCR=109;TR=273;WE=42157747;WS=42157729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr17	42158310	rs377963	T	G	1984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=53;PP=1641;SC=ATGGTCAAATTCCACCTGTCA;SOR=6.736;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=54;WE=42158318;WS=42158300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	42162694	rs56379369	CT	C	208.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.9784;FS=0.000;HP=14;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;NF=1;NR=9;PP=112;SC=TCCTCTCCAGCTTTTTTTTTT;SOR=3.056;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=10;WE=42162703;WS=42162684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	42164885	rs228757	G	C	6904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=109;PP=2965;SC=CCTCCCCATCGTCTTCCTCGT;SOR=0.740;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=210;TCF=101;TCR=109;TR=210;WE=42164893;WS=42164875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr17	42170181	rs67111880	TG	T	1175.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=7;NR=31;PP=699;SC=TCCCCTGGGGTGGGGGGGGGG;SOR=1.714;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=38;WE=42170199;WS=42170170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	42170289	rs368328	G	A	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=16;PP=527;SC=GGAAGAGGACGTGGATCTTGG;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=42170297;WS=42170279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	42171206	rs454192	T	C	4270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=68;PP=2965;ReadPosRankSum=1.182;SC=ACCTCCACTGTGGGCAGAAGA;SOR=0.240;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=72;TCR=68;TR=139;WE=42171214;WS=42171196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,147:0.99:148
chr17	42188311	rs228767	C	G	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=10;PP=754;SC=GCAGCCCGCACAGCACAGGTT;SOR=1.136;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=26;WE=42188319;WS=42188301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	42248346	rs7218599	A	T	2688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=43;PP=2156;SC=CTGTCCACCAAGCCCTCTTCT;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=84;TCF=41;TCR=43;TR=84;WE=42248354;WS=42248336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr17	42264962	rs4793082	A	G	4627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=32;PP=2965;SC=CATGGTTAATAACATTAACCT;SOR=2.403;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=104;TCR=32;TR=136;WE=42264970;WS=42264952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr17	42266224	rs8073555	G	C	988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=0;PP=854;SC=AGGTCTTTAGGTTTAGGTTGG;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=42266232;WS=42266214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	42266285	rs370100314	CT	C	39.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.90;ReadPosRankSum=0.493;SOR=0.933;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,9:0.20:44
chr17	42268274	rs757430	C	T	1738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=43;PP=1402;SC=TTCTCCTTTACGGCCTCCCCA;SOR=2.387;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=13;TCR=43;TR=56;WE=42268282;WS=42268264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	42329004	rs13306780	A	C	2739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=71;PP=2251;SC=GAGGCCTGGCACCAGTGGGGG;SOR=5.524;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=5;TCR=72;TR=76;WE=42329012;WS=42328994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	42333191	.	C	T	2116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.071;ClippingRankSum=0.000;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.576;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=45;PP=1629;ReadPosRankSum=-0.571;SC=TATAAGTCTTCTGTAGTGGGT;SOR=0.772;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=70;TCR=94;TR=79;WE=42333199;WS=42333181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,83:0.50:167
chr17	42334652	rs1970774	A	G	1602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-6.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.575;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.528;NF=62;NR=17;PP=1281;ReadPosRankSum=-0.119;SC=GAGCCCTCGCACCCGGCCACT;SOR=1.106;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=156;TCF=118;TCR=38;TR=79;WE=42334660;WS=42334642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,75:0.49:154
chr17	42334950	rs2252501	T	C	2695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.030;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=59;PP=2169;ReadPosRankSum=-0.167;SC=AGTCAAAGGGTCTTGGGGCAA;SOR=0.796;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=229;TCF=104;TCR=125;TR=103;WE=42334958;WS=42334940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,104:0.46:226
chr17	42335387	rs5015	G	A	2567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.236;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=31;PP=2044;ReadPosRankSum=-1.437;SC=GCGGGTGACAGTGCAGCAAAG;SOR=0.562;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=186;TCF=131;TCR=55;TR=99;WE=42335395;WS=42335377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,100:0.52:193
chr17	42336783	rs45488001	G	A	2327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=7.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.100;HP=4;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=9;PP=1821;ReadPosRankSum=-0.837;SC=ATGGGGCTGCGGGGGTCCAGG;SOR=1.092;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=166;TCF=146;TCR=20;TR=84;WE=42336791;WS=42336773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,87:0.51:171
chr17	42336981	rs45473992	C	T	1902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.495;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=50;PP=1568;ReadPosRankSum=-0.187;SC=CGGGAGTCCTCGGGCCAGTCT;SOR=0.535;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=150;TCF=37;TCR=113;TR=69;WE=42336989;WS=42336971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,71:0.47:152
chr17	42337976	rs2074107	G	A	3588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.678;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=57;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.998;SC=CATCTGCAGGGGGTCCAGAAG;SOR=0.392;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=280;TCF=176;TCR=104;TR=138;WE=42337984;WS=42337966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,134:0.49:276
chr17	42338248	rs2854528	A	G	1783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=7.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.200;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=60;PP=1420;ReadPosRankSum=-1.502;SC=GTGCTCAGCCACTCTCGAGAG;SOR=0.228;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=154;TCF=8;TCR=146;TR=65;WE=42338256;WS=42338238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,67:0.44:152
chr17	42339118	rs13306783	G	GC	540.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.466;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.207;NF=0;NR=21;PP=692;ReadPosRankSum=0.083;SC=CCTTCCCAGTGCCCTGGGCTG;SOR=2.007;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=2;TCR=55;TR=21;WE=42339126;WS=42339108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
chr17	42392077	rs68030960	T	C	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=258;ReadPosRankSum=-0.429;SC=GCCTGCTGCATCCTCTGGCCC;SOR=0.793;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=14;WE=42392085;WS=42392067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr17	42392622	rs708386	T	C	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.358;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=37;PP=713;ReadPosRankSum=-0.898;SC=TCGTCACCGATGAGGACAGCT;SOR=1.540;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=116;TCF=37;TCR=79;TR=49;WE=42392630;WS=42392612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,51:0.42:122
chr17	42398052	rs2011951	A	G	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.064;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=551;ReadPosRankSum=0.417;SC=TTCGGCCTGAACCCATTGAGC;SOR=0.914;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=26;WE=42398060;WS=42398042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,28:0.43:65
chr17	42398757	rs2011895	C	A	2819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.942;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=59;PP=2226;ReadPosRankSum=2.053;SC=GGGTTTGGGCCGAGGTGGGGA;SOR=0.471;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=202;TCF=87;TCR=115;TR=108;WE=42398765;WS=42398747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,110:0.52:210
chr17	42400816	rs60776742	C	A	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.932;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=7;PP=244;ReadPosRankSum=-0.259;SC=CATCCCCACCCGCCCCCACCC;SOR=0.175;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=10;WE=42400824;WS=42400806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
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chr17	42430244	rs5848	C	T	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=20;PP=497;ReadPosRankSum=-0.566;SC=CTAGCACCTCCCCCTAACCAA;SOR=0.843;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=24;WE=42430252;WS=42430234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,26:0.48:54
chr17	42431524	rs140882895	C	T	2254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=5;PP=1924;ReadPosRankSum=-1.116;SC=CGCCCGAGTCCAGGCTGGCGT;SOR=0.505;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=137;TCF=130;TCR=7;TR=81;WE=42431532;WS=42431514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,80:0.58:138
chr17	42449789	rs5910	G	A	2031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.969;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=38;PP=1478;ReadPosRankSum=1.538;SC=TGAAGAAGCCGACCTGGGGGT;SOR=0.531;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=158;TCF=87;TCR=71;TR=81;WE=42449797;WS=42449779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,82:0.51:161
chr17	42453065	rs5911	A	C	2253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=45;PP=1797;ReadPosRankSum=-0.365;SC=GGGGCTGGGGATGGGCAGCCC;SOR=0.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=155;TCF=67;TCR=88;TR=78;WE=42453073;WS=42453055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,82:0.51:161
chr17	42453400	rs200370220	C	A	2225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.200;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=41;PP=1790;ReadPosRankSum=0.332;SC=GCGCCTCACCCGGAGTTCTGA;SOR=0.564;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=164;TCF=89;TCR=75;TR=84;WE=42453408;WS=42453390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,85:0.50:170
chr17	42454270	rs850731	T	C	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.935;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=222;ReadPosRankSum=0.218;SC=TGTGAGCCACTGCGCCTGGCC;SOR=0.191;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=11;WE=42454278;WS=42454264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr17	42454463	rs850730	G	C	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=16;PP=931;ReadPosRankSum=-0.020;SC=CTATCTGGGAGATGAGGAGGG;SOR=0.931;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=98;TCF=63;TCR=35;TR=49;WE=42454471;WS=42454453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,50:0.50:101
chr17	42455022	rs34603233	TGAGCCCCTG	T	289.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=1837;ReadPosRankSum=-0.284;SC=TGGTTATTCATGAGCCCCTGG;SOR=0.247;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=5;WE=42455038;WS=42455012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr17	42475983	rs936019	G	C	4549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=0.178;SC=TGGGCTTTCGGGTAGCTGGGA;SOR=0.485;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=156;TCF=57;TCR=99;TR=153;WE=42475991;WS=42475973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,158:0.99:159
chr17	42476409	rs3744427	G	A	2963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.017;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=50;PP=2330;ReadPosRankSum=-0.015;SC=CAGGGCTCTCGTGACCCCATG;SOR=0.601;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=236;TCF=142;TCR=94;TR=121;WE=42476417;WS=42476399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,121:0.51:239
chr17	42483233	rs2045088	T	A	4189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.58;ReadPosRankSum=0.389;SOR=1.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,136:0.99:137
chr17	42483531	rs1377808	T	A	537.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=456;ReadPosRankSum=-0.996;SC=GTATTAGTGTTGAACACATTA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=16;WE=42483539;WS=42483521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr17	42501692	rs1869495	C	A	1865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=4;PP=1443;SC=GTACCTTCTTCTGTTAGCAAG;SOR=4.479;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=51;TCR=4;TR=55;WE=42501700;WS=42501682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	42751607	rs6416902	C	T	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=231;ReadPosRankSum=0.041;SC=GATAAATATACCAAGACATGC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=11;WE=42751615;WS=42751597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr17	42824402	rs4793144	C	A	4225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.952;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=58;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.141;SC=GCTCCTCCCCCCAAGGGCCCC;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=87;TCR=60;TR=142;WE=42824410;WS=42824392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,145:0.97:149
chr17	42824648	rs9893320	T	C	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=20;PP=1249;SC=GCGATCTCTATGCTGCTATGG;SOR=1.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=29;TCR=20;TR=49;WE=42824656;WS=42824638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	42824731	rs9912745	G	A	2677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=11;PP=2197;SC=CTCATCTAATGCCCTGTGCTC;SOR=3.391;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=83;TCF=71;TCR=12;TR=82;WE=42824739;WS=42824721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	42846994	rs8070918	T	C	368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=311;SC=TGGCCACCCCTTCCCCAGGGC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=42847002;WS=42846984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	42847033	rs58726064	C	G	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=2;PP=698;SC=CCCCCCGACTCCCACCTTCAG;SOR=3.767;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=42847041;WS=42847023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	42851634	rs62066014	G	A	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=449;SC=GAGGGCAGGAGGCCATCCTGA;SOR=4.174;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=16;WE=42851642;WS=42851624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	42851729	rs35936481	C	T	1821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=12;PP=1508;SC=CCCTGTCCCACGGCGGGGGTG;SOR=2.507;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=48;TCR=12;TR=60;WE=42851737;WS=42851719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	42852604	rs1558083	G	T	11976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.54;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr17	42852610	rs1558084	T	C	12372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.88;SOR=1.092;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,282:1.00:282
chr17	42853427	rs4792955	A	G	2464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=8;PP=2032;SC=CCAGAGAGCGAGGGGCCTGGG;SOR=4.003;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=64;TCR=8;TR=72;WE=42853435;WS=42853417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr17	42853694	rs4793151	C	T	6653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=148;PP=2965;SC=GCATCGACCTCCACTGATCAG;SOR=2.279;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=51;TCR=149;TR=198;WE=42853702;WS=42853684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr17	42854208	rs1558085	G	A	6840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=126;NR=99;PP=2965;SC=GCAGTCTCTTGTCTCCACTCT;SOR=0.950;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=225;TCF=126;TCR=99;TR=225;WE=42854216;WS=42854198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr17	42854502	rs1558086	G	A	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=3;PP=713;SC=GTCCTGGGGCGCGTGGGGTCA;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=42854510;WS=42854492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	42854610	rs8075210	T	C	2165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=32;PP=1626;SC=GCAAGGGATCTGGCTGGGTCC;SOR=0.832;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=40;TCR=32;TR=72;WE=42854618;WS=42854600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	42855248	rs2070603	T	C	6114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=137;NR=54;PP=2965;SC=GCCTGGAGCCTGGGATGGCGG;SOR=1.884;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=193;TCF=139;TCR=54;TR=191;WE=42855256;WS=42855238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr17	42855472	rs2070604	T	C	7980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=180;PP=2965;SC=CTGTCTGTCCTGCTCTCTATG;SOR=1.635;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=269;TCF=89;TCR=180;TR=269;WE=42855480;WS=42855462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,277:1.00:277
chr17	42855554	rs2070605	T	C	3725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.336;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=100;PP=2924;ReadPosRankSum=-0.131;SC=TTGGCTCCATTGCTGGGGCTG;SOR=2.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=27;TCR=101;TR=126;WE=42855562;WS=42855544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,130:0.98:132
chr17	42857430	rs35504352	G	A	8448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.925;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=119;NR=157;PP=2965;ReadPosRankSum=0.469;SC=ACTCGGGGGCGCCTGGAGGGA;SOR=0.182;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=281;TCF=120;TCR=161;TR=276;WE=42857438;WS=42857420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,279:0.99:281
chr17	42857517	rs16970986	C	T	4945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=129;PP=2965;SC=CAGGGTCTTACCTCTCTGGGA;SOR=4.145;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=16;TCR=129;TR=145;WE=42857525;WS=42857507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr17	42925559	rs12164	C	T	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.034;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=639;ReadPosRankSum=-0.797;SC=CACCTGACGACGAAGACTGTG;SOR=0.474;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=31;WE=42925567;WS=42925549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,33:0.48:69
chr17	42927628	rs2231647	A	G	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=139;ReadPosRankSum=-0.263;SC=GTGAACCCCTAGGACGCCTGA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=8;WE=42927636;WS=42927618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr17	42929092	rs199868353	T	G	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=23.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.78;ReadPosRankSum=-2.417;SOR=4.579;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,26:0.38:69
chr17	42929970	rs2289673	T	C	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=470;ReadPosRankSum=0.129;SC=TAGTCAAACATAGGCCAAAAG;SOR=0.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=23;WE=42929978;WS=42929960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr17	42930859	rs78620114	G	A	3695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.525;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=61;PP=2889;ReadPosRankSum=-0.272;SC=TGAAGCAGATGGTCCCCTACC;SOR=0.941;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=283;TCF=148;TCR=135;TR=138;WE=42930867;WS=42930849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,142:0.48:296
chr17	42932244	rs2289672	C	T	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.581;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=355;ReadPosRankSum=0.130;SC=ACTGTGGCATCCCTGCCTCCT;SOR=0.215;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=16;WE=42932252;WS=42932234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr17	42932474	rs16971033	A	G	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.777;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=36;PP=968;ReadPosRankSum=-1.855;SC=AAGTGACATCAGTGAAAGCCA;SOR=1.157;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=103;TCF=34;TCR=69;TR=50;WE=42932482;WS=42932464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,52:0.47:110
chr17	42934372	rs6503405	A	G	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=417;ReadPosRankSum=-0.303;SC=TGGTGGGGGTAGAGGTGGAAG;SOR=0.850;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=20;WE=42934380;WS=42934362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr17	42934694	rs2277615	T	C	1170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.764;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=36;PP=858;ReadPosRankSum=-0.597;SC=GCTGTCCAAATCATCACCAAA;SOR=0.030;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=85;TCF=4;TCR=81;TR=40;WE=42934702;WS=42934684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,43:0.49:88
chr17	42937963	.	ATT	A	38.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.89;MQRankSum=0.419;QD=2.58;ReadPosRankSum=-0.992;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
chr17	42945296	rs2120276	A	G	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.736;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=19;PP=673;ReadPosRankSum=-0.741;SC=TGAGTGACCCAGGGGAAAAGG;SOR=0.495;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=81;TCF=43;TCR=38;TR=37;WE=42945304;WS=42945286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,38:0.42:90
chr17	42945867	rs3785890	A	G	1460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.138;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=47;PP=1177;ReadPosRankSum=-0.035;SC=GAGGAAAACGAGGACACTGAG;SOR=0.436;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=114;TCF=13;TCR=101;TR=54;WE=42945875;WS=42945857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,55:0.47:118
chr17	42953409	rs2289674	A	G	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.989;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=13;PP=438;ReadPosRankSum=0.713;SC=TGATGCACACAGTGACTGCCA;SOR=0.536;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=58;TCF=28;TCR=30;TR=27;WE=42953417;WS=42953399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr17	42957139	rs2289676	C	T	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=35;PP=810;ReadPosRankSum=0.564;SC=CATAACCCCCCACAGGGTAAA;SOR=0.961;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=76;TCF=9;TCR=67;TR=39;WE=42957147;WS=42957129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,39:0.51:77
chr17	42957855	rs1443463	A	G	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.275;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=21;PP=1070;ReadPosRankSum=0.624;SC=TTCTGCTCCGAAAAGTGAGAG;SOR=0.904;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=124;TCF=75;TCR=49;TR=56;WE=42957863;WS=42957845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,57:0.44:129
chr17	42961009	rs2289677	C	T	2733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.661;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=26;PP=2222;ReadPosRankSum=0.017;SC=CTGAAAGTTCCGTCTTACCTT;SOR=1.244;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=203;TCF=142;TCR=61;TR=100;WE=42961017;WS=42960999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,103:0.50:206
chr17	42979592	rs12451394	G	A	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=5.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.504;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=3;PP=948;ReadPosRankSum=-0.504;SC=AAATGAGGCCGCCAAGGACCA;SOR=1.065;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=89;TCF=82;TCR=7;TR=45;WE=42979600;WS=42979582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,45:0.52:87
chr17	42988959	rs2289671	T	C	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.823;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=189;ReadPosRankSum=1.364;SC=CAGGTCCTCGTCCCTGGCCCT;SOR=0.401;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=23;TCF=16;TCR=7;TR=9;WE=42988967;WS=42988949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr17	43011971	rs140975723	C	G	4194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.404;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=87;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.756;SC=CCAGCAGCTGCTCGGCTGAGG;SOR=0.736;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=313;TCF=148;TCR=165;TR=163;WE=43011979;WS=43011961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,166:0.52:322
chr17	43101698	.	TGTGTGTGTGG	T	1261.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=65.70;QD=35.05;SOR=3.026;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
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chr17	43131480	rs4793172	A	T	4707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-8.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=409;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.750;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=89;PP=2962;ReadPosRankSum=0.289;SC=ACCCAATAAAAAGGATTCCAT;SOR=0.560;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=402;TCF=222;TCR=180;TR=191;WE=43131488;WS=43131470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:210,196:0.48:406
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chr17	43170907	rs2239921	C	T	2696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=85;NR=3;PP=2487;SC=GCTGGAAAGACGGTTTGCAGT;SOR=6.019;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=85;TCR=3;TR=88;WE=43170915;WS=43170897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	43175906	rs2239922	C	T	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=27;PP=660;ReadPosRankSum=0.265;SC=TACCAAAGCCCGTTGGCACCT;SOR=1.132;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=3;TCR=46;TR=29;WE=43175914;WS=43175896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr17	43176804	rs2239923	C	T	3984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=332;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.490;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=68;PP=2962;ReadPosRankSum=1.220;SC=CCCACGGAAGCTGATTGAAGT;SOR=1.011;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=324;TCF=175;TCR=149;TR=162;WE=43176812;WS=43176794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,164:0.50:329
chr17	43181287	rs4793167	A	G	3942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=68;PP=2965;SC=TGCAGGGAAGAGGCAGTGGAG;SOR=1.078;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=47;TCR=68;TR=115;WE=43181295;WS=43181277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr17	43182810	rs2239924	T	G	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=322;ReadPosRankSum=-0.033;SC=GGAGGTCTGATGGACGTGTGA;SOR=0.641;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=17;WE=43182818;WS=43182800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr17	43183028	rs1053733	G	A	2150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=56;PP=1841;SC=GTGCGATTCTGGATAAAGCCA;SOR=3.091;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=11;TCR=56;TR=67;WE=43183036;WS=43183018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	43183108	rs1053739	G	A	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=245;ReadPosRankSum=0.187;SC=GAGAATCCCTGGCAAAGGGAG;SOR=0.387;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=12;WE=43183116;WS=43183098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr17	43191006	rs2285427	T	C	1176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.262;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=37;PP=872;ReadPosRankSum=0.087;SC=GCAGGGGCTCTTAGCGGCCCT;SOR=2.626;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=95;TCF=15;TCR=80;TR=40;WE=43191014;WS=43190996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,44:0.44:101
chr17	43192549	rs35911033	T	TC	4221.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=32;PP=2973;SC=GGGTGCAGGGTCGCAGGCGGG;SOR=1.919;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=72;TCR=35;TR=98;WE=43192557;WS=43192539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	43197593	rs2129732	G	A	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=302;ReadPosRankSum=-0.805;SC=AAAGCTGCAGGTGGAGAGGGC;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=15;WE=43197601;WS=43197583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr17	43197675	rs7226273	T	C	1489.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=13;PP=1218;ReadPosRankSum=0.739;SC=GGGCTGGGGTTCAGGGCGGAA;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=100;TCR=27;TR=61;WE=43197683;WS=43197665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,61:0.47:131
chr17	43198166	rs11382448	A	AG	1762.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=6;PP=2018;SC=CCCTCAGGACAGGGCCCTGCC;SOR=3.830;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=48;WE=43198174;WS=43198156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	43213772	rs2306828	A	C	1891.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.207;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=32;PP=1519;ReadPosRankSum=2.312;SC=GGGACCCATCACCACCTCTGC;SOR=0.792;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=128;TCF=65;TCR=63;TR=68;WE=43213780;WS=43213762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,69:0.53:131
chr17	43216472	rs16939879	A	G	1479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-8.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=12;PP=1128;ReadPosRankSum=0.359;SC=GAGAGCATGCAGGAGGTGCAG;SOR=0.636;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=153;TCF=128;TCR=25;TR=70;WE=43216480;WS=43216462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,69:0.45:154
chr17	43227766	rs78243847	T	TTTGG	1564.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=1340;SC=TCCCCCTGGCTTTGGTTTCGT;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=24;WE=43227774;WS=43227756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	43308183	rs58744688	A	C	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.954;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=421;ReadPosRankSum=0.176;SC=TCAGTGGCCAATGTAGCACCT;SOR=1.143;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=19;WE=43308191;WS=43308173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr17	43309942	rs9913962	G	A	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.025;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=45;PP=1032;ReadPosRankSum=0.835;SC=TTCTATGTGCGTGTGTGGGTG;SOR=0.109;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=118;TCF=13;TCR=105;TR=54;WE=43309950;WS=43309932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,56:0.46:122
chr17	43310143	rs79181461	G	A	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=482;ReadPosRankSum=-0.412;SC=TGTATACTATGTGTGTACTTT;SOR=1.022;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=24;WE=43310151;WS=43310133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr17	43310182	rs75239108	T	C	869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.124;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=1;PP=707;ReadPosRankSum=1.477;SC=GTGTGTACCATTGAGTCCATA;SOR=1.267;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=64;TCF=61;TCR=3;TR=33;WE=43310190;WS=43310172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,33:0.51:65
chr17	43311620	rs9898221	A	G	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.497;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=33;PP=1089;ReadPosRankSum=-0.723;SC=CAGCCCCCACACTGCTGCATC;SOR=0.415;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=111;TCF=41;TCR=70;TR=56;WE=43311628;WS=43311610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,58:0.49:118
chr17	43314544	rs77766814	A	G	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-5.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.966;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=2;PP=513;ReadPosRankSum=0.849;SC=GGTTGGATACAAAGAACTTCC;SOR=0.173;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=53;TCF=51;TCR=2;TR=31;WE=43314552;WS=43314534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr17	43316520	rs1023995	T	C	1758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=49;PP=1520;SC=TGGGGTCAGGTAGACCTGGGT;SOR=7.903;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=49;WE=43316528;WS=43316510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	43318778	rs7218169	GC	CG	3205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=35;PP=2368;SC=CCGCCATGGGGCCCTCCAGGC;SOR=1.073;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=61;WE=43318787;WS=43318768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
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chr17	43319770	rs1801353	C	T	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.626;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=37;PP=1250;ReadPosRankSum=-0.025;SC=CTGGGTGGCACTGAAACCCAG;SOR=0.594;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=139;TCF=56;TCR=83;TR=64;WE=43319778;WS=43319760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,67:0.46:146
chr17	43333125	rs11651968	C	T	3943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.535;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=38;PP=2962;ReadPosRankSum=0.200;SC=CAGGCAGACACGTGGTTCTCC;SOR=0.801;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=289;TCF=208;TCR=81;TR=144;WE=43333133;WS=43333115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,149:0.51:294
chr17	43333785	rs76453679	AAGAC	A	1453.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.206;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.545;NF=7;NR=24;PP=1515;ReadPosRankSum=-0.515;SC=AGTCATCTCTAAGACAGAAGA;SOR=1.367;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=70;TCF=21;TCR=49;TR=31;WE=43333796;WS=43333775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,39:0.46:84
chr17	43334649	rs60163605	C	A	842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.959;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.71;ReadPosRankSum=-0.725;SOR=0.541;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,26:0.36:72
chr17	43334653	rs58314091	T	C	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.037;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.33;ReadPosRankSum=-1.273;SOR=0.605;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,24:0.37:65
chr17	43342141	rs1047833	G	C	3797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=67;PP=2965;SC=CGTCTTTGGTGACCAAGCTGA;SOR=1.188;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=42;TCR=67;TR=109;WE=43342149;WS=43342131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr17	43342306	rs2285674	C	A	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=322;ReadPosRankSum=-1.181;SC=CTCAGAGAATCCCACCCGGCT;SOR=0.693;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=16;WE=43342314;WS=43342296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr17	43344073	rs2074293	G	A	1146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.044;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=38;PP=980;ReadPosRankSum=0.479;SC=TTGGGTACGGGCTCAGGGCCC;SOR=1.116;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=100;TCF=26;TCR=74;TR=48;WE=43344081;WS=43344063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,47:0.46:103
chr17	43351127	rs2072090	G	C	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.431;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=31;PP=828;ReadPosRankSum=-0.697;SC=TAATCGTGGAGGAAGGGAGGA;SOR=1.200;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=65;TCF=20;TCR=45;TR=44;WE=43351135;WS=43351117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,44:0.67:66
chr17	43352049	rs17685379	C	T	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.976;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=68;ReadPosRankSum=-1.518;SC=GTGCTCCACACACAGAGGCTG;SOR=0.765;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=5;WE=43352057;WS=43352039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr17	43364293	rs56405343	C	CG	10596.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=143;NR=94;PP=2969;SC=GAGGCAGAGCCGCCGTAGGCC;SOR=1.550;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=260;TCF=158;TCR=102;TR=237;WE=43364301;WS=43364283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr17	43679196	.	T	C	259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.30;QD=25.98;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	43910455	rs17689966	G	A	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.39;QD=30.40;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	43923180	rs242944	G	A	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.41;QD=27.78;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	43923898	rs171443	A	G	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.70;QD=28.87;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	43924136	rs201078809	T	C	4888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=106;PP=2965;SC=CCCTGGGGCCTCGGAGGAGCT;SOR=1.304;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=54;TCR=106;TR=160;WE=43924144;WS=43924126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr17	43924412	rs242943	T	C	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.19;QD=32.89;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	44060859	rs63750072	A	G	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.80;QD=27.55;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	44074018	rs11568305	G	A	1540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.31;QD=30.82;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	44554051	.	A	AAAT	41.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=35.00;QD=41.70;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1:1.00:1
chr17	44788253	rs78850923	G	A	286.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=268;SC=AGCATGTACGGATTATAACTC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=44788261;WS=44788243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	44788310	rs183211	G	A	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=5;PP=425;SC=AAATGCTTTAGACTCCTTTTT;SOR=2.093;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=19;WE=44788318;WS=44788300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	44828931	rs199533	G	A	3494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.766;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=53;PP=2742;ReadPosRankSum=-0.656;SC=AAGGGAAGAAGGTCTGGATAG;SOR=0.497;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=224;TCF=136;TCR=88;TR=127;WE=44828939;WS=44828921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,132:0.57:232
chr17	44950122	rs4968281	T	C	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=10;PP=488;SC=GAGGGCAGGATGGGCCTGCTC;SOR=1.051;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=24;WE=44950130;WS=44950112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	45000529	rs189899	G	C	2528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=66;NR=18;PP=2001;SC=GGAAGCCAGAGCCGGAGCCGT;SOR=2.476;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=66;TCR=18;TR=84;WE=45000537;WS=45000519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	45000547	rs183199	G	C	2850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=69;NR=24;PP=2103;SC=CGTGGCCTGCGGGGCCGGCGA;SOR=2.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=69;TCR=24;TR=93;WE=45000555;WS=45000537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	45012248	rs169126	T	G	1736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=2;PP=1496;SC=GCCTTTGCTTTGCTTTTTCTT;SOR=5.630;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=47;TCR=2;TR=49;WE=45012256;WS=45012241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	45015936	.	G	GT	839.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.102;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.707;HP=12;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;PP=555;ReadPosRankSum=2.174;SC=CTTGATGTTTGTTTTTTTTTC;SOR=1.049;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=101;TCF=53;TCR=48;TR=37;WE=45015944;WS=45015926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,43:0.41:105
chr17	45214631	rs11570544	G	A	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.548;NF=17;NR=20;PP=849;ReadPosRankSum=1.185;SC=AGGCATAAGCGTAATTTGGAT;SOR=0.811;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=67;TCF=33;TCR=34;TR=37;WE=45214639;WS=45214621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,34:0.53:64
chr17	45219658	.	C	T	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.507;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.659;NF=11;NR=19;PP=633;ReadPosRankSum=0.249;SC=ATTTTCCCTTCTGAAATGATG;SOR=0.704;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=54;TCF=19;TCR=35;TR=30;WE=45219666;WS=45219648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
chr17	45234760	.	CA	C	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.507;QD=0.91;ReadPosRankSum=1.021;SOR=0.659;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,12:0.20:59
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chr17	45291103	rs11327482	TG	T	3458.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.200;NF=63;NR=26;PP=2906;ReadPosRankSum=0.512;SC=TACTTCCCTTTGGGGGGCCTT;SOR=1.313;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=76;TCR=33;TR=89;WE=45291111;WS=45291093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,114:0.99:115
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chr17	45331427	rs11871251	G	A	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.793;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=285;ReadPosRankSum=-0.223;SC=CTGGGAATGCGCGTGTCCTGG;SOR=1.329;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=17;WE=45331435;WS=45331417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr17	45363546	rs35265764	G	T	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.153;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=359;ReadPosRankSum=0.178;SC=ATCTATATTTGTCCCCTCTCT;SOR=0.083;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=16;WE=45363554;WS=45363536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr17	45364722	rs2292865	C	T	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=129;ReadPosRankSum=0.472;SC=GGGCTCGGTTCCAGCTTGCCC;SOR=0.495;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=8;WE=45364730;WS=45364712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr17	45367681	rs2292864	C	T	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.073;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=160;ReadPosRankSum=-1.941;SC=GGAGAGTCCACCTCATTTGGC;SOR=0.036;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=9;WE=45367689;WS=45367671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr17	45368337	rs15908	A	C	1484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.729;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=23;PP=1143;ReadPosRankSum=1.485;SC=GTTCTAAAGTAGAGCTGGAAG;SOR=1.197;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=117;TCF=64;TCR=53;TR=61;WE=45368345;WS=45368327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,61:0.51:119
chr17	45369777	rs4642	A	G	2122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=22.187;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=24;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.831;SC=AGCAGGACGAATGCAGCCCCC;SOR=1.811;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=156;TCF=91;TCR=65;TR=77;WE=45369797;WS=45369767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,77:0.49:158
chr17	45369789	rs4634	G	A	2334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=21.612;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=24;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.625;SC=GCAGCCCCCGGGAGGGTCAGC;SOR=1.946;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=167;TCF=103;TCR=64;TR=85;WE=45369797;WS=45369767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,85:0.50:170
chr17	45380002	rs3760372	T	C	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=8;PP=1261;SC=CATACTTCCCTGGAAGTCCTG;SOR=3.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=48;WE=45380010;WS=45379992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	45385012	rs3809863	C	T	1467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=37;PP=1095;ReadPosRankSum=-1.509;SC=CAGTAAGAGACGGGGCTGGGC;SOR=0.955;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=131;TCF=52;TCR=79;TR=58;WE=45385020;WS=45385002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,61:0.45:135
chr17	45422628	rs7214410	A	G	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.351;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=122;ReadPosRankSum=-1.097;SC=GCAAAAGTAGATAGTTTAATC;SOR=0.037;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=7;WE=45422636;WS=45422618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr17	45425115	rs7206971	G	A	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=351;ReadPosRankSum=-1.567;SC=AGAGTGGGGGGAATAAGGATA;SOR=0.997;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=16;WE=45425123;WS=45425105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr17	45425144	rs3851808	C	T	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.079;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=520;ReadPosRankSum=0.888;SC=TTTTGATTAACTAACTAAATG;SOR=1.341;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=27;WE=45425152;WS=45425134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr17	45425287	rs71377306	C	T	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.244;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.058;NF=5;NR=34;PP=880;ReadPosRankSum=-0.864;SC=TTTAGAAATGCGACAGGCACT;SOR=1.863;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=61;TCF=11;TCR=50;TR=39;WE=45425295;WS=45425277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,40:0.63:63
chr17	45438886	rs10538163	CAGTG	C	2906.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.163;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.000;NF=1;NR=62;PP=2954;ReadPosRankSum=-1.025;SC=CCTATATTGACAGTGAGTTAT;SOR=0.446;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=141;TCF=6;TCR=135;TR=63;WE=45438897;WS=45438876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,76:0.51:150
chr17	45438952	rs6504872	C	T	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=5.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=519;ReadPosRankSum=1.140;SC=CATTTTTTTCCGGATATCAAT;SOR=1.075;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=25;WE=45438960;WS=45438942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr17	45451894	rs4968318	G	A	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.300;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=7;PP=497;ReadPosRankSum=1.452;SC=GTTATCAAGTGTAGCAGGATG;SOR=1.098;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=62;TCF=42;TCR=20;TR=25;WE=45451902;WS=45451884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,27:0.42:65
chr17	45479446	rs12452315	A	C	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=5;PP=549;ReadPosRankSum=-1.136;SC=GCTTTATTGGATCTGACTTTT;SOR=0.673;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=25;WE=45479454;WS=45479436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,29:0.54:54
chr17	45479706	rs11079774	C	G	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=474;ReadPosRankSum=-0.831;SC=GCAGATGAAACTTGGTTTTGA;SOR=1.850;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=21;WE=45479714;WS=45479696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr17	45479733	rs12452796	A	C	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=341;ReadPosRankSum=0.644;SC=ATTGGCTGGCATATAGGAACT;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=14;WE=45479741;WS=45479723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
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chr17	45569815	rs2610367	A	G	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.409;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.318;NF=15;NR=38;PP=1172;ReadPosRankSum=-0.524;SC=TTGAGGTATGAGGGCTGCCAT;SOR=1.681;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=119;TCF=41;TCR=78;TR=53;WE=45569823;WS=45569805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,38:0.37:103
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chr17	45669524	rs3865314	A	C	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-6.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.820;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.685;NF=0;NR=25;PP=351;ReadPosRankSum=0.143;SC=GTTCCCAAATAGTTTCTGGCT;SOR=1.566;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=1;TCR=68;TR=25;WE=45669532;WS=45669514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,23:0.38:61
chr17	45677192	rs34538095	CT	C	517.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.048;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-0.022;QD=7.97;ReadPosRankSum=0.020;SOR=0.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,31:0.48:65
chr17	45695832	rs3760370	C	T	4756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=7.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=412;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.006;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=91;PP=2962;ReadPosRankSum=1.375;SC=CAGTAAGTTACGGTGAAAACT;SOR=0.477;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=399;TCF=186;TCR=213;TR=186;WE=45695840;WS=45695822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:219,190:0.46:409
chr17	45695914	rs3760371	T	C	2982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=88;PP=2280;ReadPosRankSum=2.689;SC=TTGAGCTGCCTTAACCCTAAC;SOR=0.515;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=207;TCF=33;TCR=174;TR=106;WE=45695922;WS=45695904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,111:0.53:209
chr17	45700384	rs3065062	C	CCTA	393.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.316;NF=0;NR=11;PP=392;ReadPosRankSum=-0.024;SC=AACAGTATATCCTAATAAGCC;SOR=1.096;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=11;WE=45700392;WS=45700374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr17	45734209	rs68149542	CTTT	C	2701.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.283;NF=34;NR=21;PP=1108;ReadPosRankSum=0.583;SC=TATCTTTTGTCTTTTTTTTTG;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=72;TCR=44;TR=55;WE=45734219;WS=45734199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,71:0.51:139
chr17	45742233	rs56226803	T	A	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=227;ReadPosRankSum=0.274;SC=TGGACCTATATTATATGGCCT;SOR=0.481;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=11;WE=45742241;WS=45742223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr17	45750596	rs3809868	G	A	1685.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.584;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=57;PP=1366;ReadPosRankSum=1.905;SC=ACCTAGGTCTGTTTTCCAGAC;SOR=1.081;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=108;TCF=6;TCR=102;TR=60;WE=45750604;WS=45750586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,62:0.58:107
chr17	45754569	rs11301979	AC	A	1873.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=41;PP=1925;SC=TTAAATATCGACCAGGCTGGG;SOR=4.534;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=44;WE=45754577;WS=45754559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	45755810	rs4239162	G	A	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.485;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.821;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=322;ReadPosRankSum=-0.343;SC=CCCTTCGTCCGCTCGCCAATG;SOR=0.350;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=19;WE=45755818;WS=45755800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr17	45757598	rs7210738	G	A	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.290;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=33;PP=908;ReadPosRankSum=-0.127;SC=GATGGCAACAGTTCACTTTTT;SOR=1.127;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=60;TCF=11;TCR=49;TR=40;WE=45757606;WS=45757588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,46:0.68:68
chr17	45759767	rs7223246	C	T	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.390;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=318;ReadPosRankSum=-1.146;SC=CATCTGTTTTCAGATCTGTTA;SOR=0.230;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=16;WE=45759775;WS=45759757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr17	45774072	rs8078309	T	C	2390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.661;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=58;PP=1685;ReadPosRankSum=-0.160;SC=CCACCCCACCTGCAGTACCCA;SOR=0.717;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=205;TCF=102;TCR=103;TR=108;WE=45774080;WS=45774062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,108:0.51:211
chr17	45786452	rs4794057	C	T	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=175;ReadPosRankSum=-0.276;SC=CCAGCCACCACGTGAAGGCCG;SOR=0.409;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=12;WE=45786460;WS=45786442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,11:0.50:22
chr17	45811210	rs2074190	A	G	7870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=193;NR=44;PP=2965;SC=TACCCGCGGGACTGGAGGTGT;SOR=2.985;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=238;TCF=194;TCR=44;TR=237;WE=45811218;WS=45811200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr17	45822092	rs11650354	C	T	1341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.367;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=5;PP=1036;ReadPosRankSum=-1.569;SC=GACCCGTTTTCTTGCCTTCTA;SOR=2.163;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=84;TCF=68;TCR=16;TR=44;WE=45822100;WS=45822082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,47:0.53:88
chr17	45822579	rs12721470	G	A	2831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.147;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=60;PP=2289;ReadPosRankSum=-0.190;SC=CCATCCGGCCGGAATCCAGTG;SOR=0.912;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=198;TCF=91;TCR=107;TR=106;WE=45822587;WS=45822569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,107:0.53:203
chr17	45885687	rs9907142	A	G	2009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=13;PP=1575;SC=CCATGTTCCCATAGCCTGGCT;SOR=2.995;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=59;TCR=13;TR=72;WE=45885695;WS=45885677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr17	45885756	rs9911983	C	T	2055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.181;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=27;PP=1575;ReadPosRankSum=0.569;SC=CGCTGCTATCCGTCTGCCGCC;SOR=0.935;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=142;TCF=89;TCR=53;TR=76;WE=45885764;WS=45885746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,77:0.53:144
chr17	45887951	rs2074189	G	T	2296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=7;PP=1871;SC=GAGAGTCTAAGAATCCCACCT;SOR=4.235;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=63;TCR=7;TR=70;WE=45887959;WS=45887941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	45890707	rs2301690	C	T	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.250;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=664;ReadPosRankSum=-0.020;SC=GGTTGAAGGGCTTGCAGCCGG;SOR=1.539;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=92;TCF=43;TCR=49;TR=37;WE=45890715;WS=45890697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,40:0.42:96
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chr17	45894735	rs9914156	A	G	5034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=102;PP=2965;SC=TCTGCGGGGAAAAAGAACAAG;SOR=1.343;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=161;TCF=58;TCR=103;TR=160;WE=45894743;WS=45894725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr17	45896478	rs878171	T	C	2316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=52;PP=1717;SC=GGGGGTGAAGTGTTGGTAGAG;SOR=1.525;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=28;TCR=52;TR=80;WE=45896486;WS=45896468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	45896637	rs8077844	A	G	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=48;ReadPosRankSum=0.431;SC=CATGTGCAGAACGCTCCCCTA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=45896645;WS=45896627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr17	45897531	rs1985407	C	A	6674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=118;NR=87;PP=2965;SC=TGTCTGGTTCCAGCTTGGCCC;SOR=0.994;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=118;TCR=87;TR=205;WE=45897539;WS=45897521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr17	45904420	rs11538868	C	T	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.149;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=9;PP=1135;ReadPosRankSum=0.753;SC=TTGGGGAAGACCTTCATCAGG;SOR=1.090;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=97;TCF=78;TCR=19;TR=54;WE=45904428;WS=45904410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,54:0.55:99
chr17	45905779	rs17774166	G	A	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=373;ReadPosRankSum=0.525;SC=GACAATGGCTGAGTGTCCTAC;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=18;WE=45905787;WS=45905769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr17	45905850	rs4793671	C	T	2280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=15;PP=1767;SC=GTGACATGTACCCAAATTCCT;SOR=2.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=59;TCR=15;TR=74;WE=45905858;WS=45905840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	45912696	rs17701113	C	T	1153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.991;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=26;PP=908;ReadPosRankSum=-0.715;SC=GCTTGGTTTCCCCACTTCGGT;SOR=1.180;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=95;TCF=41;TCR=54;TR=42;WE=45912704;WS=45912686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,44:0.44:99
chr17	45915468	rs878295	T	G	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=804;ReadPosRankSum=-0.087;SC=AGAAAGGAGATACCCCCCGAC;SOR=0.760;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=60;TCF=26;TCR=34;TR=36;WE=45915476;WS=45915458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,40:0.62:65
chr17	45915788	rs7350974	T	C	6899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=104;PP=2965;SC=GCCACCCCCATCCCGAAGATG;SOR=0.883;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=226;TCF=122;TCR=104;TR=226;WE=45915796;WS=45915778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chr17	45917147	rs1004770	C	G	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=259;ReadPosRankSum=-0.936;SC=TGGCACTGATCGTATCAAATG;SOR=0.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=13;WE=45917155;WS=45917137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr17	45917703	rs11652952	C	T	3072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.891;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=70;PP=2406;ReadPosRankSum=-0.736;SC=TCACAGCGTGCGTCTTCGACA;SOR=0.755;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=287;TCF=132;TCR=155;TR=127;WE=45917711;WS=45917693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,129:0.44:294
chr17	45959620	rs17616603	T	C	5296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=103;PP=2965;SC=TGGATGGTATTTGAACTTTCC;SOR=1.768;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=46;TCR=103;TR=149;WE=45959628;WS=45959610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr17	45973685	rs117197317	G	T	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.152;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=492;ReadPosRankSum=0.650;SC=TGCCGGCGGGGTCTTCCCGGC;SOR=1.609;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=23;WE=45973693;WS=45973675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,22:0.48:46
chr17	45992622	rs11871969	G	A	2354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.879;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.99;MQRankSum=0.912;NF=72;NR=28;PP=2017;ReadPosRankSum=0.140;SC=GAGGCAAGTGGGCTTGCGTTC;SOR=0.561;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=221;TCF=163;TCR=58;TR=100;WE=45992630;WS=45992612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,97:0.45:216
chr17	46020698	rs11079804	C	T	793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.581;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=657;ReadPosRankSum=0.679;SC=ATCTGACCTCCCTTGACCCAG;SOR=1.291;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=60;TCF=45;TCR=15;TR=30;WE=46020706;WS=46020688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr17	46030644	rs3833856	T	TG	3668.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=97;PP=2969;SC=TGGAGCAGGGTGGGGGAGACA;SOR=3.481;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=117;TCF=10;TCR=107;TR=105;WE=46030652;WS=46030634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr17	46048157	rs2525084	A	G	427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.16;ReadPosRankSum=-0.458;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr17	46048165	rs2597168	T	C	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.13;ReadPosRankSum=-1.085;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr17	46048168	rs2255697	C	T	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.13;ReadPosRankSum=-1.085;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr17	46048592	rs2905846	A	G	1148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.883;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=29;PP=899;ReadPosRankSum=0.773;SC=CTCCCTCCGGAAGCGGCTCAA;SOR=1.157;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=100;TCF=37;TCR=63;TR=42;WE=46048600;WS=46048582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,44:0.43:102
chr17	46048858	rs2525085	C	G	1427.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.713;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=42;PP=1180;ReadPosRankSum=-1.322;SC=GAGCTCTGACCCCTGAAAGCC;SOR=1.053;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=118;TCF=33;TCR=85;TR=57;WE=46048866;WS=46048848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,56:0.47:120
chr17	46052793	rs2597172	A	G	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.685;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=29;PP=713;ReadPosRankSum=-1.180;SC=GCCTGGTTGCACCCCCTTTGG;SOR=1.584;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=60;TCF=13;TCR=47;TR=35;WE=46052801;WS=46052783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,36:0.60:60
chr17	46054264	rs2525087	C	A	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.766;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=35;PP=975;ReadPosRankSum=-1.174;SC=GTGTCTGTAACGGCATCACTT;SOR=0.613;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=32;TCR=68;TR=52;WE=46054272;WS=46054254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,54:0.51:105
chr17	46055036	rs7503584	G	A	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=415;ReadPosRankSum=1.035;SC=GAGCAGGGATGATGGGCCATA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=20;WE=46055044;WS=46055026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr17	46055106	rs2597173	C	T	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.944;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=557;ReadPosRankSum=-0.628;SC=GAATGTGCAGCCATTGACCTC;SOR=0.532;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=71;TCF=46;TCR=25;TR=33;WE=46055114;WS=46055096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,32:0.45:71
chr17	46055347	rs2875746	A	G	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=30;PP=711;ReadPosRankSum=1.011;SC=CTAGAAACAAAAAATGCAGCG;SOR=0.547;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=64;TCF=6;TCR=58;TR=34;WE=46055355;WS=46055337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,35:0.52:67
chr17	46059071	rs2737	T	C	1945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.180;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.265;NF=36;NR=39;PP=1422;ReadPosRankSum=1.095;SC=CTGTGGTCTATCAGGCGAAAA;SOR=0.821;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=166;TCF=82;TCR=84;TR=75;WE=46059079;WS=46059061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,81:0.46:175
chr17	46114620	rs12940701	C	T	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.647;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=19;PP=639;ReadPosRankSum=1.497;SC=GACAGCGGGCCGAGCCTCCTT;SOR=0.618;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=95;TCF=46;TCR=49;TR=40;WE=46114628;WS=46114610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,41:0.42:97
chr17	46115072	rs199699704	C	CG	712.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.93;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	46115084	rs201261614	T	TGG	717.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.64;QD=44.86;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	46115122	.	A	AG	419.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=60;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=0;NR=13;PP=163;SC=GGACGTGGCCAGCCTCGGGCC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=46115131;WS=46115112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	46132212	rs373501023	T	TG	1232.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=29;PP=1324;SC=GGAAGGGGGCTGGCTGGGCCG;SOR=3.321;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=30;WE=46132220;WS=46132202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	46152559	.	CT	C	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.000;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=1.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.85;MQRankSum=2.697;QD=0.42;ReadPosRankSum=0.267;SOR=1.043;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,16:0.19:83
chr17	46153296	rs2240123	C	T	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.952;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=0;PP=675;ReadPosRankSum=0.066;SC=AGGGAAGAAGCAGAACAAAAC;SOR=1.826;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=82;TCF=80;TCR=2;TR=34;WE=46153304;WS=46153286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,34:0.42:81
chr17	46190819	rs8080662	G	A	3224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=63;PP=2579;SC=GGGTGCTTATGTAGGAACTGG;SOR=1.477;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=37;TCR=63;TR=100;WE=46190827;WS=46190809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr17	46190928	rs12601675	TG	CA	317.10	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=18.451;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=1102;ReadPosRankSum=-1.157;SC=TTTTTTTTGATGTAGGGTCTT;SOR=5.890;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=20;WE=46190937;WS=46190918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,18:0.86:21
chr17	46195926	rs8071267	C	T	1133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=0;PP=1140;SC=GGCGACAGAGCGAGACTCCAT;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=42;WE=46195947;WS=46195916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	46198876	rs3744346	G	C	765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=23;PP=570;SC=AGTGAGCTCTGGGTTCTGCTC;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=46198884;WS=46198866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	46214476	rs12600464	A	G	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=8.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.763;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=0;PP=647;ReadPosRankSum=2.350;SC=TAGCATTAGTATGAGAAATGA;SOR=1.390;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=88;TCF=84;TCR=4;TR=31;WE=46214484;WS=46214466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,33:0.35:94
chr17	46239985	rs208005	A	G	2170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=52;PP=1816;SC=TTTCCGAGGTACCCATGTTTT;SOR=2.483;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=14;TCR=52;TR=66;WE=46239993;WS=46239975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	46262171	rs2278868	C	T	2528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=61;PP=1996;SC=ATCCGTACACCGTAGCCCTTA;SOR=2.690;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=14;TCR=61;TR=75;WE=46262179;WS=46262161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	46265433	rs2305433	G	C	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=34;PP=811;SC=CACTCCCACAGGTTATCCCAT;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=46265441;WS=46265423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	46607021	rs7226137	T	C	7352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=92;PP=2965;SC=GACCCGACCTTCCTCTCGCTC;SOR=1.140;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=229;TCF=137;TCR=92;TR=227;WE=46607029;WS=46607011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr17	46607113	rs35115415	C	T	3244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.459;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=64;PP=2523;ReadPosRankSum=0.173;SC=CGGCAATCTCCACCCTCCGGG;SOR=0.738;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=249;TCF=124;TCR=125;TR=127;WE=46607121;WS=46607103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,130:0.52:251
chr17	46607817	rs7207109	C	T	2049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.849;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=40;PP=1558;ReadPosRankSum=1.346;SC=GTGCAAAGCTCGCGGTCTGCT;SOR=0.560;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=172;TCF=90;TCR=82;TR=79;WE=46607825;WS=46607807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,83:0.47:177
chr17	46607958	rs12939811	T	A	1739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=36;PP=1379;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTCCTTCTGATTGACCCAGAG;SOR=0.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=142;TCF=65;TCR=77;TR=64;WE=46607966;WS=46607948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,67:0.45:148
chr17	46608030	rs12946855	G	A	2119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.968;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=30;PP=1702;ReadPosRankSum=-0.976;SC=CCGAGGGCGCGGAGCTGGGGA;SOR=0.409;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=144;TCF=92;TCR=52;TR=75;WE=46608038;WS=46608020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,77:0.51:152
chr17	46608184	rs145570960	G	GGGGCGCTGT	3018.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.266;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=5.581;NF=13;NR=36;PP=2976;ReadPosRankSum=0.418;SC=AAAGGAGGTTGGGGCGCTGTG;SOR=0.586;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=167;TCF=46;TCR=121;TR=49;WE=46608192;WS=46608174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,75:0.47:158
chr17	46620288	rs1042815	G	A	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=398;ReadPosRankSum=1.101;SC=AGAAGAAAGGGAGTGGATTAA;SOR=0.646;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=18;WE=46620296;WS=46620278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr17	46620402	rs2229302	G	A	1915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.869;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=33;PP=1512;ReadPosRankSum=0.589;SC=GAGCGCGGGGGTCGAAAGGAC;SOR=0.439;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=155;TCF=99;TCR=56;TR=83;WE=46620410;WS=46620392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,83:0.53:157
chr17	46621828	rs56128659	T	A	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.644;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=96;ReadPosRankSum=-0.293;SC=CTTCCACTGCTTTTTCTCCCC;SOR=0.446;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=6;WE=46621836;WS=46621826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr17	46622335	rs111979968	A	AC	894.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=0;NR=29;PP=981;SC=ATCGGAAGGGACCCCCCTCCT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=29;WE=46622356;WS=46622325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	46622348	rs138169880	A	AC	154.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.86;MQRankSum=-1.096;QD=6.73;ReadPosRankSum=-1.576;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr17	46629593	rs2229304	G	T	2261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.950;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=52;PP=1720;ReadPosRankSum=-0.386;SC=GCCGACAGGGGCTCGGGGGCC;SOR=1.255;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=162;TCF=71;TCR=91;TR=85;WE=46629601;WS=46629583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,90:0.53:169
chr17	46651061	rs2288277	T	C	2594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=7;PP=2010;SC=GCAAACCTGCTGAAGCATCCA;SOR=4.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=69;TCR=7;TR=76;WE=46651069;WS=46651051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	46655149	.	C	A	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.522;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=206;ReadPosRankSum=-0.999;SC=TCAACCCCCCCCCAACCCATG;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=12;WE=46655157;WS=46655139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr17	46670520	rs7406798	T	C	1442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=2;PP=1229;SC=AGGGGAATATTTGCGGAGTCT;SOR=5.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=40;WE=46670528;WS=46670510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	46673723	rs12949148	TC	GT	8249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-7.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.322;HP=4;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=57;PP=2944;ReadPosRankSum=1.219;SC=TCTGACGCCCTCGGCTCCCCA;SOR=1.031;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=397;TCF=261;TCR=136;TR=182;WE=46673732;WS=46673713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:202,210:0.51:412
chr17	46688256	rs7406910	T	C	4547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=7.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=366;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.788;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=90;PP=2962;ReadPosRankSum=1.657;SC=GAAAATAAAGTATTCGCATAA;SOR=0.646;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=342;TCF=161;TCR=181;TR=170;WE=46688264;WS=46688246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,176:0.48:363
chr17	46691587	rs112987208	A	AGGCCCCCTGCCC	2348.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=2;PP=1602;SC=CCGGCCTGCCAGGCCTTGGGC;SOR=4.047;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=25;WE=46691595;WS=46691577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	46702999	rs112409771	C	G	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.166;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=217;ReadPosRankSum=-0.031;SC=CCTCCCGGCCCGCTCTCCGGC;SOR=2.359;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=14;WE=46703007;WS=46702989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr17	46709835	rs718079	A	G	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.755;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=5;PP=231;ReadPosRankSum=0.845;SC=CCAGCTAAGCAAGGAGCAGTA;SOR=0.023;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=13;WE=46709843;WS=46709825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr17	46799812	rs1054072	A	G	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.878;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=549;ReadPosRankSum=1.124;SC=CTTGCAAGCAAGCATCGGCCT;SOR=1.930;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=55;TCF=8;TCR=47;TR=25;WE=46799820;WS=46799802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr17	46840178	rs12936178	T	C	2351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.796;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=13;PP=1956;ReadPosRankSum=-1.725;SC=GTTGGCCCCATTGCTGCTACT;SOR=0.812;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=147;TCF=123;TCR=24;TR=85;WE=46840186;WS=46840168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,87:0.58:151
chr17	46862675	rs507973	TC	AT	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=509;ReadPosRankSum=0.353;SC=AGGAAAGCAGTCGATAGTAAA;SOR=0.776;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=11;WE=46862684;WS=46862665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr17	46874362	.	A	AT	414.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=1.225;QD=6.38;ReadPosRankSum=-1.063;SOR=0.749;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,26:0.40:65
chr17	46878625	rs17634167	A	G	1040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.341;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=677;ReadPosRankSum=1.312;SC=ACTCAGCAGGAAGACACCAGG;SOR=0.210;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=91;TCF=65;TCR=26;TR=41;WE=46878633;WS=46878615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,45:0.47:95
chr17	46879079	rs12947660	G	T	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=344;ReadPosRankSum=0.585;SC=CCATTACTAGGTGCTCCCAGA;SOR=0.223;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=16;WE=46879087;WS=46879069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr17	46881748	rs489005	T	C	4388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=76;PP=2965;SC=AAACAAGAACTGGAATGCACA;SOR=0.848;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=140;TCF=64;TCR=76;TR=140;WE=46881756;WS=46881738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr17	46894597	rs114722761	A	T	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=388;ReadPosRankSum=-0.409;SC=GCGCTAGGGGAGGGGCGCGCC;SOR=1.708;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=16;WE=46894605;WS=46894587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr17	46926772	rs551605	A	G	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=367;SC=ACCTTGGAGCATGGAGATCAG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=46926780;WS=46926762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	46934001	rs72437948	GCATT	G	2397.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=41;PP=2168;SC=TAAATGCTGTGCATTCATTCA;SOR=6.630;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=84;TCF=1;TCR=83;TR=42;WE=46934012;WS=46933991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	46970836	rs684682	A	G	1411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=30;PP=1142;SC=GCCGCGCCGCAGTGCTCTGTA;SOR=1.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=44;WE=46970844;WS=46970826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	46972479	rs3080082	ATCTC	A	5471.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.465;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.354;NF=51;NR=68;PP=2974;ReadPosRankSum=-0.239;SC=ATGCCATACTATCTCTCTGCT;SOR=0.503;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=262;TCF=119;TCR=143;TR=119;WE=46972490;WS=46972469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,144:0.48:301
chr17	46973139	rs35074390	TG	T	1986.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=45;PP=1603;SC=TGAGGCTCCATGGGGGGGTCA;SOR=2.566;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=72;TCF=13;TCR=59;TR=58;WE=46973147;WS=46973129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr17	46985756	rs71144541	AG	A	418.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=1;PP=413;SC=GTGGAAGCGGAGGGGGTGGGG;SOR=3.912;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=12;WE=46985764;WS=46985746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
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chr17	47011897	rs57901004	C	T	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.085;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.967;NF=17;NR=10;PP=488;ReadPosRankSum=1.213;SC=ACCCAGGAGGCGGAGGTTGCA;SOR=0.512;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=57;TCF=38;TCR=19;TR=27;WE=47011905;WS=47011887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr17	47013382	rs140139274	G	GTTTGT	1683.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.30;MQRankSum=-2.689;QD=21.31;ReadPosRankSum=1.149;SOR=0.400;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,41:0.52:79
chr17	47013393	rs59383380	G	GT	635.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=1.817;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.37;MQRankSum=2.977;QD=7.31;ReadPosRankSum=-0.818;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,37:0.43:87
chr17	47013717	rs3215074	AT	A	507.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=307;ReadPosRankSum=1.323;SC=CTAGTTCCTAATTTTTTTTTA;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=75;TCF=2;TCR=73;TR=26;WE=47013725;WS=47013707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,29:0.41:71
chr17	47014675	rs2132201	C	T	7498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=182;PP=2965;SC=GGTCAGACGGCTCCAGAGGGC;SOR=2.863;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=227;TCF=45;TCR=182;TR=227;WE=47014683;WS=47014665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,236:1.00:236
chr17	47014754	rs2132200	T	C	2858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=78;PP=2521;SC=CTTTGGGACATCGAGCTAGGT;SOR=6.019;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=81;TCF=3;TCR=78;TR=81;WE=47014762;WS=47014744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr17	47035869	rs4793605	T	C	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.073;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=183;ReadPosRankSum=0.412;SC=TTCCTTTTCATTGGGTGGTGC;SOR=0.036;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=11;WE=47035877;WS=47035859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr17	47036043	rs72833611	C	G	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=562;ReadPosRankSum=-0.391;SC=GGGCAGAATCCAGTCCTGAGC;SOR=0.799;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=73;TCF=29;TCR=44;TR=31;WE=47036051;WS=47036033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,34:0.44:78
chr17	47038391	rs6504587	T	C	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=29;PP=868;SC=TAGCCTGAGCTTCGCCCAGAG;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=47038399;WS=47038381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	47038471	rs4794004	A	G	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=124;ReadPosRankSum=1.476;SC=CGACACAGCTATCTCTCCGTT;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=9;WE=47038479;WS=47038461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr17	47039132	rs2291725	T	C	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.772;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=20;PP=907;ReadPosRankSum=0.190;SC=TTAGCTTGACTGGCCAGCTCC;SOR=1.095;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=98;TCF=58;TCR=40;TR=53;WE=47039140;WS=47039122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,54:0.54:100
chr17	47039254	rs2291726	T	C	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.860;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=33;PP=997;ReadPosRankSum=0.159;SC=TCTTTTAATATCTGAACCCCA;SOR=1.022;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=87;TCF=29;TCR=58;TR=47;WE=47039262;WS=47039244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,48:0.53:90
chr17	47044463	rs62078384	C	T	3161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.215;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=56;PP=2478;ReadPosRankSum=1.299;SC=ACCTGTCATCCCCTAACCCCT;SOR=0.485;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=204;TCF=112;TCR=92;TR=118;WE=47044471;WS=47044453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,120:0.59:205
chr17	47044721	rs369779985	CTTTTT	C	487.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=16.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQRankSum=-0.198;QD=30.48;ReadPosRankSum=2.025;SOR=5.280;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr17	47076551	rs2411760	G	T	1190.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=37.21;ReadPosRankSum=2.482;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,30:0.94:32
chr17	47076551	.	GGGGGGG	TGGGGGC,TGGGGGG	481	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000,0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=1,1;NR=27,35;PP=481,244;QD=19.0881383879;SC=AGCTCTTTTCGGGGGGGGTGG;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=28,36;WE=47076565;WS=47076541;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.70:40
chr17	47076557	rs1948513	G	C	1220.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=35.91;ReadPosRankSum=2.449;SOR=1.556;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,30:0.88:34
chr17	47210429	rs7207842	A	G	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.846;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=16;PP=796;ReadPosRankSum=-0.626;SC=TCCACGTGGAAGTGGCCTCTC;SOR=0.998;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=99;TCF=53;TCR=46;TR=40;WE=47210437;WS=47210419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,38:0.38:100
chr17	47219542	rs12453819	G	A	3092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=48;PP=2445;SC=GAGGTAATGCGGGTCATGAAG;SOR=0.969;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=41;TCR=48;TR=89;WE=47219550;WS=47219532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	47237802	rs1523137	A	G	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=0;PP=1085;SC=TCTCATCCCAACCAGGACTCT;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=35;WE=47237810;WS=47237792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	47238028	rs8071836	C	T	5046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=94;PP=2965;SC=CTTGGGGCTCCGTGGTGGCAA;SOR=1.223;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=60;TCR=94;TR=154;WE=47238036;WS=47238018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
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chr17	47243620	.	A	G	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.693;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=5.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.10;ReadPosRankSum=-0.682;SOR=0.189;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
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chr17	47293848	rs2233368	C	T	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=109;ReadPosRankSum=0.525;SC=GCCAAGGACCCAGTGGAAGAT;SOR=0.069;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=7;WE=47293856;WS=47293838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr17	47297297	rs616338	T	C	2709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=45;PP=2070;SC=TCCTCTGCGTTTTCCCTGGCC;SOR=0.961;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=33;TCR=45;TR=78;WE=47297305;WS=47297287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	47300081	rs2233374	C	G	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.250;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=593;ReadPosRankSum=0.566;SC=CTGCTGACAGCCCAGGGCTCT;SOR=1.609;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=25;WE=47300089;WS=47300071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr17	47329705	rs596783	T	C	3453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.965;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=47;PP=2735;ReadPosRankSum=-1.563;SC=CAGGAGGCGATACCAGGCCAG;SOR=0.779;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=266;TCF=171;TCR=95;TR=136;WE=47329713;WS=47329695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,134:0.50:269
chr17	47376346	.	CT	C	69.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.980;ClippingRankSum=0.000;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=15.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=1.871;QD=0.94;ReadPosRankSum=-1.515;SOR=0.004;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,13:0.18:74
chr17	47484228	rs2233667	G	C	1009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.735;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=17;PP=701;ReadPosRankSum=-0.488;SC=TAAGGGGAGAGAGTGAGCACA;SOR=0.587;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=56;TCR=46;TR=37;WE=47484236;WS=47484218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,42:0.39:109
chr17	47486905	rs3033735	G	GT	296.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=13.600;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.82;MQRankSum=-0.908;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.623;SOR=0.017;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr17	47583581	rs55759007	A	G	2147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=8.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.765;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=5;PP=1748;ReadPosRankSum=0.051;SC=GGCAGGCAATAGGGGAGGGAG;SOR=1.256;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=146;TCF=132;TCR=14;TR=75;WE=47583589;WS=47583571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,76:0.51:148
chr17	47588000	rs11466155	C	T	9298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=214;PP=2965;SC=TGGTTGTGGGCCTTGTGGCCT;SOR=1.937;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=299;TCF=85;TCR=214;TR=298;WE=47588008;WS=47587990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
chr17	47688881	rs140209761	T	TAGAG	906.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.477;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=1149;ReadPosRankSum=0.660;SC=TGCCAGCAGATAGACGACTTT;SOR=0.190;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=0;TCR=61;TR=21;WE=47688889;WS=47688871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,25:0.42:60
chr17	47780707	rs375908491	TGC	T	202.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.592;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.684;NF=3;NR=35;PP=466;ReadPosRankSum=0.637;SC=ACACAAAATGTGCGCACACAC;SOR=1.387;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=38;WE=47780719;WS=47780697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,12:0.27:44
chr17	47780710	rs10595474	GCA	G	245.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.875;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-2.792;NF=2;NR=35;PP=562;ReadPosRankSum=1.389;SC=CAAAATGTGCGCACACACACA;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=37;WE=47780719;WS=47780697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr17	47785064	rs9908959	C	A	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=13;PP=539;SC=TGGGGAGAGACTGTCGGCCCG;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=20;WE=47785072;WS=47785054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	47801651	rs11079874	A	G	178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.928;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.233;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=120;ReadPosRankSum=0.777;SC=CACCCCCCACACAAACCTGTT;SOR=0.105;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=9;WE=47801659;WS=47801641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr17	47888852	rs4462645	A	G	8277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=151;NR=101;PP=2965;SC=CAACGGAGAGACAGCTTCGAT;SOR=1.196;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=253;TCF=152;TCR=101;TR=252;WE=47888860;WS=47888842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr17	47899280	rs373603649	TA	T	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-1.485;QD=2.23;ReadPosRankSum=1.559;SOR=0.177;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,10:0.29:34
chr17	48046963	rs61749026	A	G	5631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=482;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.098;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=104;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.515;SC=GCCTCCCCCAATTTGTCCTAC;SOR=0.798;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=475;TCF=246;TCR=229;TR=219;WE=48046971;WS=48046953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:253,226:0.47:479
chr17	48068720	rs8081044	T	A	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=1;PP=595;SC=GTCCATGCAATTGTCATCTGG;SOR=4.615;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=20;WE=48068728;WS=48068710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	48070741	rs2303467	G	A	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=0;PP=890;ReadPosRankSum=0.420;SC=CGCCCCCGCGGCCCTGGACAG;SOR=0.649;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=86;TCF=86;TCR=0;TR=42;WE=48070749;WS=48070731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,42:0.49:86
chr17	48070878	rs2303466	C	T	5304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=485;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.998;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=130;NR=83;PP=2962;ReadPosRankSum=0.578;SC=TGGAGTAGATCGTACGCGGCT;SOR=1.068;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=480;TCF=268;TCR=212;TR=213;WE=48070886;WS=48070868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:266,217:0.45:483
chr17	48072426	rs2278163	G	A	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=113;ReadPosRankSum=0.262;SC=ACCGGAGTGCGAGAGAGGCGG;SOR=0.693;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=14;TCF=6;TCR=8;TR=8;WE=48072434;WS=48072416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr17	48148413	rs2301628	G	A	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=21;PP=789;SC=TAGCACACACGGATTGGCCGG;SOR=2.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=26;WE=48148421;WS=48148403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	48151908	rs4793639	T	C	8373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=104;NR=146;PP=2965;SC=GGTGAGATTGTTCTGCCCACC;SOR=1.144;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=251;TCF=105;TCR=146;TR=250;WE=48151916;WS=48151898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr17	48155771	rs16948648	C	T	1503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=44;PP=1301;SC=CAGGCCTCCACTTTCCCTGGA;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=44;WE=48155779;WS=48155761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	48157827	rs371281488	GGTGTGT	G	453.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=0;NR=9;PP=498;SC=TCATAGCATGGGTGTGTGTGT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=9;WE=48157840;WS=48157817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	48165064	rs12951197	T	C	1990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=31;PP=1599;SC=AGGATGGGCCTAAGCAGGCTG;SOR=0.758;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=29;TCR=31;TR=60;WE=48165072;WS=48165054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	48172779	rs7221362	A	C	2398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=8;PP=1951;SC=GACCACAACCAAAGTCGCGGC;SOR=3.826;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=64;TCR=8;TR=72;WE=48172787;WS=48172769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	48184288	rs847694	G	A	5074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=90;PP=2965;SC=GAGAAGCCCCGGGGACCCCTC;SOR=1.225;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=56;TCR=90;TR=146;WE=48184296;WS=48184278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr17	48184377	rs847693	A	G	6031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=63;PP=2965;ReadPosRankSum=0.371;SC=CCCAGTATCAATGTCAGGAGG;SOR=0.620;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=187;TCF=124;TCR=63;TR=186;WE=48184385;WS=48184367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,192:0.99:193
chr17	48186131	rs3059824	T	TCTC	3282.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=57;PP=2969;SC=GGGAGGCTTCTCTCCTCACTC;SOR=4.587;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=84;TCF=5;TCR=79;TR=60;WE=48186145;WS=48186121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	48202135	.	G	GCGCGCACA,GCGCACACA	187.74	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.210;NF=6,6;NR=2,2;PP=71,94;ReadPosRankSum=1.383;SC=ACGCGCGCGCGCACACACACA;SOR=0.941;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=8,8;WE=48202143;WS=48202125;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.70:10
chr17	48212647	rs11317638	GA	G	1791.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.29;NF=34;NR=9;PP=1697;SC=GGGGAGGGAGGAACAATGGGA;SOR=2.925;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=43;WE=48212655;WS=48212637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	48212876	rs3744536	C	T	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.056;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=9;PP=916;ReadPosRankSum=-0.278;SC=TTCAATGCTGCTCCCTCCACT;SOR=0.916;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=75;TCF=58;TCR=17;TR=41;WE=48212884;WS=48212866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,42:0.57:74
chr17	48226445	rs112058541	G	GC	468.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=2;PP=514;SC=TGGCTGGCGAGCGGGGGCGGC;SOR=2.985;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=12;WE=48226453;WS=48226435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	48227384	.	G	GGC	2683.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=51;PP=2765;SC=GCCGCGCCGCGCTCCTTGTCG;SOR=5.994;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=58;TCF=1;TCR=57;TR=52;WE=48227392;WS=48227374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	48227403	.	G	GGC	2212.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=39;PP=2105;SC=CGCCGCCTGCGCGCTGGGGCG;SOR=4.271;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=43;WE=48227411;WS=48227393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	48243504	rs9911548	C	T	2463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=51;PP=2025;SC=GGTGGTAAGACGGAGGTGTGG;SOR=1.522;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=29;TCR=51;TR=80;WE=48243512;WS=48243494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr17	48245180	rs2696297	C	T	4464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=113;NR=26;PP=2965;SC=GGATTGGGTGCTCATTCACAG;SOR=2.919;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=113;TCR=26;TR=139;WE=48245188;WS=48245170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr17	48248998	rs36107109	C	T	2667.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.461;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=36;PP=2131;ReadPosRankSum=0.401;SC=CCTCTGCTGTCGTTGCCTCTT;SOR=0.875;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=207;TCF=133;TCR=74;TR=101;WE=48249006;WS=48248988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,101:0.48:210
chr17	48249450	rs2696293	C	G	5626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=123;PP=2965;SC=GAAGTCTCCACTGGGCTGCCC;SOR=1.868;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=51;TCR=123;TR=174;WE=48249458;WS=48249440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr17	48252804	rs2696288	T	C	2285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=42;PP=1892;SC=ACTGACAGCCTAGCCAGGTAG;SOR=1.042;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=72;WE=48252812;WS=48252794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr17	48258140	rs2586484	T	C	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=5;PP=652;SC=CTCGCATTCTTTCCCACGCGG;SOR=2.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=48258148;WS=48258130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	48258321	rs2586485	C	T	3593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=56;PP=2965;SC=TACTGTATTCCGGTGATAGAA;SOR=0.820;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=63;TCR=56;TR=119;WE=48258329;WS=48258311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr17	48263021	rs2249492	C	T	6753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=135;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.269;SC=TGGGGTGGGGCGGAGACAACG;SOR=0.381;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=241;TCF=139;TCR=102;TR=236;WE=48263029;WS=48263011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,239:1.00:240
chr17	48264717	rs2696245	C	T	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=11;NR=4;PP=387;SC=GATTCTTCCTCTCTTTGCCCA;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=48264725;WS=48264707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	48265426	rs2586488	A	G	8774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=190;PP=2965;SC=GTAGAGTTCTAAAGGCATGGG;SOR=2.017;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=262;TCF=72;TCR=190;TR=262;WE=48265434;WS=48265416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,268:1.00:268
chr17	48265495	rs1800215	T	C	2510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=83;PP=1983;SC=ACAGGACCGGTGGGACCAGCA;SOR=7.569;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=84;TCF=1;TCR=83;TR=84;WE=48265503;WS=48265485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr17	48266669	rs2586489	G	C	9667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=158;NR=128;PP=2965;SC=AGGTGCCAGAGAGCAGCACAG;SOR=0.902;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=286;TCF=158;TCR=128;TR=286;WE=48266677;WS=48266659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr17	48267291	rs2075559	G	C	3185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-7.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.510;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=64;PP=2386;ReadPosRankSum=0.109;SC=AGAGCACAGAGGCATCAAGCC;SOR=0.726;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=255;TCF=130;TCR=125;TR=134;WE=48267299;WS=48267281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,133:0.52:254
chr17	48268223	rs2734272	A	G	6958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=161;NR=80;PP=2965;SC=CAATGGGGCCAGTCAGACCAC;SOR=1.590;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=241;TCF=161;TCR=80;TR=241;WE=48268231;WS=48268213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr17	48268626	rs2696246	A	G	5232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=113;NR=42;PP=2965;SC=AAGGGGAAGAAGGGAGGATTA;SOR=1.996;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=113;TCR=42;TR=155;WE=48268634;WS=48268616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr17	48269302	rs2857396	G	A	8958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=144;NR=139;PP=2965;SC=GGCCAAGTACGACGCACCTTG;SOR=0.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=283;TCF=144;TCR=139;TR=283;WE=48269310;WS=48269292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr17	48269426	rs2586490	C	T	4276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=123;PP=2965;SC=GAGCAAAACCCACCTGGGGCC;SOR=3.865;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=17;TCR=124;TR=140;WE=48269434;WS=48269416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr17	48270098	rs1800695	G	A	3641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.319;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=95;PP=2879;ReadPosRankSum=0.306;SC=CCGAGGAGACGAGGGGCTGAG;SOR=0.534;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=263;TCF=77;TCR=186;TR=136;WE=48270106;WS=48270088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,137:0.52:263
chr17	48271433	rs1007086	A	G	1314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.686;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=33;PP=1061;ReadPosRankSum=0.256;SC=AGCAGCAGTGAGGACAGCAGG;SOR=0.888;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=97;TCF=35;TCR=62;TR=50;WE=48271441;WS=48271423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,50:0.52:97
chr17	48272055	rs2253369	C	T	3260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.119;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=87;PP=2399;ReadPosRankSum=-0.148;SC=GAGGGTGGAGCGGGAGGGGGC;SOR=0.909;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=233;TCF=73;TCR=160;TR=123;WE=48272063;WS=48272045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,129:0.55:236
chr17	48273439	rs2734281	T	C	4298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=70;NR=55;PP=2965;SC=CATAACCTGCTCCCATTGTCA;SOR=0.929;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=70;TCR=55;TR=125;WE=48273447;WS=48273429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr17	48273464	rs2141279	T	C	5069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=49;PP=2965;SC=CAAGAGCAGATACTGAGACCC;SOR=1.533;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=146;TCF=97;TCR=49;TR=146;WE=48273472;WS=48273454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr17	48274291	rs2075555	T	G	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=2;PP=536;SC=TGCAACTCAGTATCTTTTGGG;SOR=2.948;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=48274299;WS=48274281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	48274309	rs2075554	T	C	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=2;PP=582;SC=GGGGAAGAGGTTGGGACTGGA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=48274317;WS=48274299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	48276004	rs5820805	G	GC	2833.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=67;PP=2957;SC=AGACATTCCTGCAAAGATGCA;SOR=5.004;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=3;TCR=68;TR=70;WE=48276012;WS=48275994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	48276971	rs2256835	G	C	1703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.517;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=47;PP=1354;ReadPosRankSum=-0.463;SC=GAAGAGACGCGCGTTAGAGCC;SOR=0.410;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=141;TCF=37;TCR=104;TR=67;WE=48276979;WS=48276961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,68:0.48:143
chr17	48277059	rs150854949	AGCCCCAGGCCCCAGGCCCCAG	A,AGCCCCAGGCCCCAG	808.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=23;NF=6,6;NR=5,5;PP=1136,708;SC=CCCCAGCCCCAGCCCCAGGCC;SOR=0.693;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=36;TCF=17;TCR=19;TR=11,11;WE=48277087;WS=48277049;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.64,0.36:22
chr17	48277079	.	AG	A	198	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=26;MMLQ=29;MQ=60.36;NF=7;NR=5;PP=198;QD=17.3333333333;SC=CCCAGGCCCCAGGCCCCAGGC;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=12;WE=48277087;WS=48277069;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:14,12:0.46:26
chr17	48354937	rs12602216	G	C	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=1;PP=768;ReadPosRankSum=-0.949;SC=GAGTGAGGTGGGGGGTGGCTT;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=71;TCF=69;TCR=2;TR=35;WE=48354945;WS=48354927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr17	48356260	rs6504642	G	C	7143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=127;PP=2965;SC=GAGCCAGACAGCCCAGTGGAT;SOR=0.987;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=226;TCF=99;TCR=127;TR=225;WE=48356268;WS=48356250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr17	48423415	.	AG	A	91.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.578;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=64;ReadPosRankSum=-0.589;SC=GGCGTGGAGGAGGGGGGGCGG;SOR=0.223;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=4;WE=48423423;WS=48423405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr17	48431032	rs739990	G	A	2087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.604;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=41;PP=1726;ReadPosRankSum=-0.083;SC=ACCCTGGCGAGGGTTCCAAGG;SOR=0.717;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=149;TCF=75;TCR=74;TR=81;WE=48431040;WS=48431022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,80:0.54:149
chr17	48431197	rs739989	C	T	1431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.316;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=14;PP=1222;ReadPosRankSum=0.764;SC=CTGCCCCACCCCCGGAAGCCC;SOR=1.234;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=91;TCF=62;TCR=29;TR=52;WE=48431205;WS=48431187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,53:0.58:92
chr17	48432042	rs11430429	G	GA	1732.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=27;PP=1889;SC=AGGTAGCCTAGGAGGGAAACT;SOR=1.230;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=43;WE=48432050;WS=48432032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	48432324	rs12451299	G	C	1714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.429;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=42;PP=1247;ReadPosRankSum=-0.524;SC=AGCCTCCTGAGGATGTACCTG;SOR=0.764;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=186;TCF=94;TCR=92;TR=80;WE=48432332;WS=48432314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,78:0.43:182
chr17	48432681	rs2526538	G	A	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=354;ReadPosRankSum=0.389;SC=GCAAGGGGCAGAGGAAGGATG;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=15;WE=48432689;WS=48432677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr17	48433081	rs886568	G	A	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.155;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=10;PP=600;ReadPosRankSum=1.363;SC=TGCCAGGCGGGTGAAAGAGCT;SOR=1.068;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=62;TCF=38;TCR=24;TR=30;WE=48433089;WS=48433071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr17	48433958	rs4794136	T	C	5013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=431;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.778;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=131;PP=2962;ReadPosRankSum=0.481;SC=TCCACCTGTATGGCAGCTACC;SOR=0.576;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=419;TCF=165;TCR=254;TR=219;WE=48433966;WS=48433948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,221:0.52:428
chr17	48437456	rs6504649	C	G	2494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.867;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=34;PP=1949;ReadPosRankSum=0.856;SC=CAGCGGCACACACAGCTCACA;SOR=1.118;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=202;TCF=120;TCR=82;TR=93;WE=48437464;WS=48437446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,96:0.46:209
chr17	48440522	rs10656180	T	TCCA	7890.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=108;PP=2967;SC=CCTGTCCTTCTCCACCATATT;SOR=1.429;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=158;TCF=40;TCR=118;TR=148;WE=48440533;WS=48440512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr17	48445674	rs111380254	CCTGGTCAG	C	1742.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=1.190;QD=15.29;ReadPosRankSum=-0.510;SOR=0.770;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,48:0.42:114
chr17	48445699	rs2586438	C	T	1644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.014;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.09;MQRankSum=-1.063;NF=8;NR=54;PP=1563;ReadPosRankSum=-0.610;SC=AGCTGGTCAGCGAGGTGGTCC;SOR=0.884;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=104;TCF=11;TCR=93;TR=62;WE=48445707;WS=48445689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,63:0.54:117
chr17	48452776	rs3760413	A	C	6745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=98;NR=111;PP=2965;SC=CTGTCCCAGAAATAGCTGAAA;SOR=0.834;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=209;TCF=98;TCR=111;TR=209;WE=48452784;WS=48452766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr17	48452978	rs3060668	A	AAGC	4529.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.062;NF=45;NR=48;PP=2966;ReadPosRankSum=0.773;SC=TGACTGGAAAAAGCCCTTTCC;SOR=0.664;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=225;TCF=109;TCR=116;TR=93;WE=48452986;WS=48452968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,117:0.47:251
chr17	48455985	rs2189712	A	T	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=259;ReadPosRankSum=-0.226;SC=AGGAGCCAACAGTACTGGTGT;SOR=0.804;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=18;WE=48455993;WS=48455975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,19:0.39:49
chr17	48456193	rs12450550	T	C	1771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.891;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=40;PP=1283;ReadPosRankSum=0.022;SC=GTAACTGACATCACAGCAAAG;SOR=1.057;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=145;TCF=59;TCR=86;TR=65;WE=48456201;WS=48456183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,69:0.45:153
chr17	48457567	rs917029	G	A	1030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=1;PP=874;SC=GTAACATGGCGCCCACCTCTT;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=48457575;WS=48457557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	48460745	rs3744525	C	G	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.13;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	48460745	.	CAGACC	GAGACC,GAGACT	175	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=2,2;NR=11,7;PP=6,175;QD=3.13624711902;SC=AATGTCTCCACAGACCGAAAC;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13,9;WE=48460758;WS=48460735;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:13
chr17	48460750	rs3744524	C	T	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.37;ReadPosRankSum=1.079;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr17	48465636	rs3760412	A	G	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.161;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=482;ReadPosRankSum=0.695;SC=GTGGTGGCTCACGCCTGTAAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=23;WE=48465644;WS=48465626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr17	48469724	rs757509	T	C	1309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=5;PP=1037;SC=CCAGGGAGTGTATAAGGAGCC;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=38;WE=48469732;WS=48469714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	48472270	rs3760407	C	T	2852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=9;PP=2305;SC=GAAGGAGTCACGGCTGCATGC;SOR=3.841;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=79;TCR=9;TR=88;WE=48472278;WS=48472260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr17	48474501	rs72832501	G	A	2863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.739;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.014;NF=70;NR=33;PP=2195;ReadPosRankSum=0.980;SC=TAGAGAAGAGGAAAGTAAGTG;SOR=0.836;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=208;TCF=137;TCR=71;TR=103;WE=48474509;WS=48474491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,109:0.50:217
chr17	48503473	rs371898261	GCGCCC	G	69.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.53;MQRankSum=0.674;QD=11.62;ReadPosRankSum=-0.253;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr17	48504132	rs9901133	A	G	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.580;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=4;PP=328;ReadPosRankSum=0.931;SC=TCATGGGCAAACTTGGGGATC;SOR=0.258;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=19;WE=48504140;WS=48504122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
chr17	48539763	rs2277631	C	A	3233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.859;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.004;NF=43;NR=70;PP=2521;ReadPosRankSum=1.832;SC=TGTCTCTCACCATCGTCCCCA;SOR=0.899;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=235;TCF=98;TCR=137;TR=113;WE=48539771;WS=48539753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,120:0.49:243
chr17	48539997	rs8082089	T	C	2260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.108;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=70;PP=1856;ReadPosRankSum=1.647;SC=ATGCCCCCTGTCCCTGTGACA;SOR=0.262;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=181;TCF=25;TCR=156;TR=84;WE=48540005;WS=48539987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,84:0.46:181
chr17	48540960	rs3744522	C	G	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.878;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=540;ReadPosRankSum=0.081;SC=AAACCCTCTTCTTCCTCACTC;SOR=0.105;SbPval=0.18;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=27;WE=48540968;WS=48540950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,28:0.52:54
chr17	48541443	rs2277630	G	C	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.929;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=5;PP=506;ReadPosRankSum=0.702;SC=CCAGCCCAGGGCCAGCTGCCA;SOR=1.250;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=27;WE=48541451;WS=48541433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr17	48541491	rs2277629	A	G	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.920;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=11;PP=801;ReadPosRankSum=0.303;SC=AGAAAAGGGAATGTTCCTCCC;SOR=0.536;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=87;TCF=65;TCR=22;TR=41;WE=48541499;WS=48541481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,42:0.49:86
chr17	48541707	rs898455	G	A	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.995;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=621;ReadPosRankSum=1.285;SC=TGGGATGACAGCAGATGGACA;SOR=0.560;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=29;TCR=28;TR=30;WE=48541715;WS=48541697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,30:0.54:56
chr17	48542572	rs898454	C	G	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.165;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=9;PP=802;ReadPosRankSum=1.556;SC=CCCTCCAGGGCCAGGGGGTAT;SOR=0.426;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=87;TCF=70;TCR=17;TR=42;WE=48542580;WS=48542562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,45:0.51:88
chr17	48543391	rs2231506	A	C	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=219;ReadPosRankSum=-0.411;SC=ATCTCAGATAATCCAATCTAC;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=10;WE=48543399;WS=48543381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr17	48545596	rs34864120	G	A	2855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.566;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=49;PP=2240;ReadPosRankSum=0.142;SC=GGTTCTCCACGTCGTCCAGGG;SOR=0.572;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=182;TCF=86;TCR=96;TR=104;WE=48545604;WS=48545586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,107:0.55:193
chr17	48549791	rs2305998	C	G	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.887;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=20;PP=543;ReadPosRankSum=-0.531;SC=TGTCCCAGGCCCGGATCATGA;SOR=0.540;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=73;TCF=30;TCR=43;TR=36;WE=48549799;WS=48549781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,36:0.47:76
chr17	48556350	.	T	C	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.699;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.227;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=7;PP=289;ReadPosRankSum=-0.061;SC=GTCCTGAGCCTGCGGGCCGGC;SOR=0.507;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=40;TCF=26;TCR=14;TR=18;WE=48556358;WS=48556340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr17	48557326	rs2290862	G	A	1614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.385;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=28;PP=1268;ReadPosRankSum=0.504;SC=TGTGGCACAGGCAGCCCACCT;SOR=0.545;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=69;TCR=58;TR=61;WE=48557334;WS=48557316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,62:0.47:132
chr17	48557348	rs2290861	T	C	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=32;PP=1180;ReadPosRankSum=-1.672;SC=CCTGCAGACTTGGAAGTCACA;SOR=0.495;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=135;TCF=73;TCR=62;TR=66;WE=48557356;WS=48557338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,67:0.48:139
chr17	48560550	.	A	AAAAG	371.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=65.96;QD=37.17;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr17	48599195	rs9893172	T	C	1014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=0;PP=896;SC=GGAAGCTGCGTGGGAGTGGAG;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=48599203;WS=48599185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr17	48606537	rs1133818	C	G	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.319;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=179;ReadPosRankSum=-1.098;SC=ACACCCAGAGCCTGCACAGTG;SOR=0.257;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=11;WE=48606545;WS=48606527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr17	48606606	rs4793659	G	A	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.508;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=45;ReadPosRankSum=-0.241;SC=TATTCATTCCGTTCAGTCTGC;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=48606614;WS=48606596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr17	48607280	rs6504671	G	C	2184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FS=1.260;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.70;ReadPosRankSum=-2.096;SOR=0.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,86:0.50:172
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chr17	48608717	rs1064055	T	C	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=13;PP=456;ReadPosRankSum=0.127;SC=CCCTGGTGACTGACCTGATGG;SOR=0.779;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=65;TCF=36;TCR=29;TR=30;WE=48608725;WS=48608707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,31:0.45:69
chr17	48610272	rs755046	G	C	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.347;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=10;PP=471;ReadPosRankSum=-0.260;SC=GTGCCGTCCCGCTGCTGCACA;SOR=1.125;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=53;TCF=29;TCR=24;TR=25;WE=48610280;WS=48610262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,26:0.49:53
chr17	48613837	rs3785915	A	G	1753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.988;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=14;PP=1371;ReadPosRankSum=-1.419;SC=CCCATCCTTCAAGACTGTGAC;SOR=0.184;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=158;TCF=138;TCR=20;TR=78;WE=48613845;WS=48613827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,77:0.48:159
chr17	48616114	rs4794158	C	G	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.592;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=2;PP=604;ReadPosRankSum=-0.687;SC=GCTGACTGAGCGGCAAATGGC;SOR=2.235;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=27;WE=48616122;WS=48616104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
chr17	48618106	rs7215760	A	G	1758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.588;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=14;PP=1421;ReadPosRankSum=0.329;SC=GCCCTGGGCGAGGGATAAGGG;SOR=0.307;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=125;TCF=103;TCR=22;TR=67;WE=48618114;WS=48618096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,66:0.52:126
chr17	48619249	rs4794159	C	A	2877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.626;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.904;NF=32;NR=84;PP=2322;ReadPosRankSum=-1.411;SC=CGCGGGCGAGCCGGGCAGGCC;SOR=0.926;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=215;TCF=63;TCR=152;TR=116;WE=48619257;WS=48619239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,115:0.55:211
chr17	48625543	rs12943759	G	A	2188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.833;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=39;PP=1785;ReadPosRankSum=0.693;SC=CTGGGAGCAGGGGTCCTACTG;SOR=0.546;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=174;TCF=92;TCR=82;TR=81;WE=48625551;WS=48625533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,84:0.46:182
chr17	48629458	rs8065903	A	G	2899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.860;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=45;PP=2238;ReadPosRankSum=1.061;SC=ACACAGGACAAGCTCTTTTGG;SOR=1.199;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=256;TCF=141;TCR=115;TR=116;WE=48629466;WS=48629448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,117:0.45:260
chr17	48646346	.	A	AGT	365.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.000;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.806;NF=0;NR=27;PP=806;ReadPosRankSum=0.727;SC=CCTGCAGGTGAGTGTGTGTGT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=91;TCF=4;TCR=87;TR=27;WE=48646354;WS=48646336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr17	48646376	.	T	TGTGTGTGTGTGTTG	281.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.364;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQRankSum=-2.855;QD=5.63;ReadPosRankSum=2.017;SOR=0.297;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,12:0.24:50
chr17	48647011	rs12946808	T	G	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.609;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=24;PP=1511;ReadPosRankSum=0.782;SC=TTGACCTCTTTTGACCCCACT;SOR=0.776;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=167;TCF=113;TCR=54;TR=77;WE=48647019;WS=48647001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,78:0.46:170
chr17	48652875	rs198550	A	G	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=173;ReadPosRankSum=1.077;SC=TCTTCAGGACATTTCCTCTTC;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=13;WE=48652883;WS=48652865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr17	48653354	rs12449998	C	A	3291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.582;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=48;PP=2455;ReadPosRankSum=-0.764;SC=TGGGTCCCGCCGGCTCATGCT;SOR=0.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=237;TCF=145;TCR=92;TR=125;WE=48653362;WS=48653344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,131:0.53:245
chr17	48668013	rs8064333	G	C	2439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.860;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=50;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.549;SC=CTGACTCTCAGTTGAGGAATG;SOR=0.899;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=113;TCF=25;TCR=88;TR=63;WE=48668029;WS=48668003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,64:0.56:115
chr17	48668021	rs34926473	AT	A	2376.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=50;PP=2948;ReadPosRankSum=0.540;SC=CAGTTGAGGAATGGTAGCAGG;SOR=0.818;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=103;TCF=12;TCR=91;TR=56;WE=48668029;WS=48668003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,61:0.55:111
chr17	48668091	rs8066026	A	C	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=267;ReadPosRankSum=-0.707;SC=GTCTGGAGTCAGGCCCCACTG;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=18;WE=48668099;WS=48668081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
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chr17	48678325	rs198530	A	T	7290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=122;NR=91;PP=2965;SC=CTGGGAGGGCACTGGAGGGGC;SOR=1.039;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=213;TCF=122;TCR=91;TR=213;WE=48678333;WS=48678315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr17	48683200	rs3744521	G	C	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.966;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=5;PP=942;ReadPosRankSum=1.648;SC=GGGCTCAGGAGTCCTGGGCTT;SOR=1.643;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=75;TCF=64;TCR=11;TR=45;WE=48683208;WS=48683190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,46:0.61:75
chr17	48693760	rs4794171	G	C	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.980;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=655;ReadPosRankSum=-1.685;SC=CGGAGAAAAGGGGGGTCTTGG;SOR=1.051;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=77;TCF=30;TCR=47;TR=42;WE=48693768;WS=48693750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,45:0.55:82
chr17	48698906	rs4794172	C	A	689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.525;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=4;PP=513;ReadPosRankSum=0.464;SC=TTCCCGCCCCCCTGTGCTTCG;SOR=0.034;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=50;TCF=46;TCR=4;TR=26;WE=48698914;WS=48698896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,27:0.52:52
chr17	48703752	rs739925	T	C	3292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.304;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=83;PP=2665;ReadPosRankSum=0.304;SC=AGCGCCGGCCTACGTCCTGGC;SOR=0.898;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=289;TCF=107;TCR=182;TR=125;WE=48703760;WS=48703742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,126:0.43:296
chr17	48712705	rs12604031	G	A	4759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.90;SOR=0.731;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr17	48712711	rs9890046	C	G	4793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.39;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr17	48735774	rs739923	G	A	3973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=74;PP=2962;ReadPosRankSum=1.379;SC=TGATTCCCCCGTCCTATTCTC;SOR=0.703;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=351;TCF=191;TCR=160;TR=161;WE=48735782;WS=48735764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,162:0.46:354
chr17	48746135	rs879459	C	T	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.192;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=512;ReadPosRankSum=0.702;SC=GTCCTCCTTTCCCCTGCCCCC;SOR=1.044;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=23;WE=48746143;WS=48746125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr17	48746923	rs4794176	G	C	1531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.227;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=61;PP=1145;ReadPosRankSum=0.360;SC=AAGAGGCTAGGGCATAGAGCT;SOR=1.066;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=129;TCF=15;TCR=114;TR=67;WE=48746931;WS=48746913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,70:0.51:136
chr17	48746986	rs143477851	G	A	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.082;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=546;ReadPosRankSum=-1.207;SC=TTCACACATTGGTGTAACGTT;SOR=0.113;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=49;TCF=2;TCR=47;TR=25;WE=48746994;WS=48746976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,27:0.53:51
chr17	48750231	.	GA	G	88.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.336;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=1.294;QD=4.03;ReadPosRankSum=-0.495;SOR=0.392;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr17	48752600	rs4148415	C	T	544.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.707;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=379;ReadPosRankSum=-0.723;SC=CCTTTCAATCCCCCTCATTTT;SOR=1.385;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=18;WE=48752608;WS=48752590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr17	48752866	rs2072365	C	T	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.609;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=544;ReadPosRankSum=-0.436;SC=CCAGCCCTCCCGGAGGCTGTA;SOR=1.222;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=61;TCF=13;TCR=48;TR=27;WE=48752874;WS=48752856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,30:0.45:66
chr17	48752890	rs2072366	G	A	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=311;ReadPosRankSum=-0.237;SC=GGCCTCCCCAGGCCCTGCCAG;SOR=0.836;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=17;WE=48752898;WS=48752880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,18:0.42:43
chr17	48777819	.	AAAG	A	438.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.254;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=3.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQRankSum=-2.065;QD=10.20;ReadPosRankSum=-1.162;SOR=2.070;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr17	48797210	rs11398903	T	TG	4121.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=85;PP=2973;SC=CCGCGGGCCTTGGCCTGAGCC;SOR=2.282;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=115;TCF=19;TCR=96;TR=104;WE=48797218;WS=48797200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr17	48801239	rs117687704	G	A	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=471;ReadPosRankSum=-0.085;SC=CAAGTGATCGGTCCGCCTCAG;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=21;WE=48801247;WS=48801229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr17	48821201	rs9894501	T	C	6803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.92;QD=42.79;SOR=2.440;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr17	48821207	rs9894508	T	C	6383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.91;QD=45.60;SOR=2.867;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr17	48823815	rs2302288	C	T	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=306;ReadPosRankSum=0.278;SC=TAAGTTTTGCCTAGTCTTGTT;SOR=0.631;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=13;WE=48823823;WS=48823805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr17	48834023	rs3760403	A	G	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.12;QD=43.43;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	48834032	rs3760402	G	A	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.31;QD=42.94;SOR=4.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	48834080	rs9303561	A	G	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=20;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=4;PP=430;SC=AAAAAAAAAAAGAAACCTAAA;SOR=1.473;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=16;WE=48834088;WS=48834070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	48917333	rs9675120	C	T	5149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=403;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.750;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=99;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.287;SC=AGACAGTGAGCTTCCTCTGTG;SOR=0.663;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=390;TCF=199;TCR=191;TR=200;WE=48917341;WS=48917323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:194,205:0.51:399
chr17	48940422	rs4626	T	C	1924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.608;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=27;PP=1643;ReadPosRankSum=1.261;SC=CTACAAAAGATTTCTCATTGA;SOR=0.756;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=153;TCF=95;TCR=58;TR=73;WE=48940430;WS=48940412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,72:0.47:154
chr17	49076857	.	T	TA	98.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.054;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=1.622;QD=3.66;ReadPosRankSum=2.021;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
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chr17	49197654	rs5820842	A	AC	1136.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.58;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	49231623	rs34431255	C	G	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.67;ReadPosRankSum=-0.161;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr17	49231627	rs11556835	G	A	720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.48;ReadPosRankSum=-1.356;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr17	49247503	.	C	CT	33.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=16.107;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQRankSum=2.624;QD=1.87;ReadPosRankSum=0.142;SOR=0.006;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr17	49271018	rs12453388	G	A	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=31;ReadPosRankSum=0.674;SC=TTGCTCTGTCGCCCAGGCTGG;SOR=1.179;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=3;WE=49271026;WS=49271008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr17	49281133	rs17574235	G	A	2583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=16;PP=1961;ReadPosRankSum=-0.098;SC=ATTACGGTAAGGGTAAATAAA;SOR=0.482;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=223;TCF=189;TCR=34;TR=95;WE=49281141;WS=49281123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,101:0.44:232
chr17	49350546	rs35339641	AT	A	285.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.9931;FS=0.000;HP=16;HapScore=3;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;NF=15;NR=0;PP=163;SC=CTCCTTTAAAATTTTTTTTTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=15;WE=49350555;WS=49350536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	49350802	rs2318789	A	C	2490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.966;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=52;PP=1929;ReadPosRankSum=1.394;SC=TTCCAAGAGGAATCTTGAAGG;SOR=0.973;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=202;TCF=92;TCR=110;TR=90;WE=49350810;WS=49350792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,95:0.46:207
chr17	49350959	rs36097713	G	GT	215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.485;HP=14;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.050;NF=1;NR=11;PP=127;ReadPosRankSum=1.129;SC=TTATGTTATTGTTTTTTTTTT;SOR=0.136;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=12;WE=49350967;WS=49350949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr17	49371230	rs12940196	G	C	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.850;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.079;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=234;ReadPosRankSum=1.611;SC=GCTCCCAGTTGTTACACTTTA;SOR=4.351;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=12;WE=49371238;WS=49371220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr17	49371505	rs917654	C	G	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=-2.308;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=170;ReadPosRankSum=-1.352;SC=TTAATAAATTCTAGTCTGTTT;SOR=0.250;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=8;WE=49371513;WS=49371495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr17	49710713	rs3815371	G	A	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=496;ReadPosRankSum=-0.887;SC=GGAGTGTGATGGCTATTGTCA;SOR=0.850;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=20;WE=49710721;WS=49710703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr17	49711045	rs2286634	A	G	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=194;ReadPosRankSum=0.292;SC=AGATCCAACCATCCTCTTAAA;SOR=1.096;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=11;WE=49711053;WS=49711035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr17	49713205	rs10514986	G	T	1446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.702;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=16;PP=1110;ReadPosRankSum=0.746;SC=AATGACCAGAGAGAAACTCAC;SOR=0.801;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=130;TCF=91;TCR=39;TR=58;WE=49713213;WS=49713195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,60:0.46:131
chr17	49713300	rs11870209	G	A	2002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.229;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=42;PP=1452;ReadPosRankSum=0.276;SC=TCGACCCATCGTAAGTGATGA;SOR=0.572;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=158;TCF=72;TCR=86;TR=80;WE=49713308;WS=49713290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,84:0.52:163
chr17	49713428	rs139939914	GACAT	G	563.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.147;NF=0;NR=17;PP=564;ReadPosRankSum=1.444;SC=TGGTATTGCTGACATACATAC;SOR=0.544;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=17;WE=49713439;WS=49713418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr17	50149899	rs5820905	C	CT	1751.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.25;MQRankSum=0.269;QD=26.54;ReadPosRankSum=0.108;SOR=5.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr17	51063941	rs2271474	C	G	3730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=339;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.512;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=70;PP=2962;ReadPosRankSum=0.715;SC=TTTTAATTTCCACACCACTGT;SOR=0.874;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=330;TCF=173;TCR=157;TR=156;WE=51063949;WS=51063931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:178,157:0.47:335
chr17	51901084	rs3803825	A	G	7324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=89;NR=112;PP=2965;SC=AGACAACCTTAAAGGACCTGG;SOR=0.957;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=201;TCF=89;TCR=112;TR=201;WE=51901092;WS=51901074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr17	51901385	rs3803826	C	T	8302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=147;NR=108;PP=2965;SC=CATTTATGCTCTGGTGGCACA;SOR=1.004;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=257;TCF=147;TCR=110;TR=255;WE=51901393;WS=51901375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr17	51901643	rs4561518	C	T	2724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=57;PP=2174;SC=CAGGCAAACACCTGTCAACGC;SOR=1.845;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=23;TCR=57;TR=80;WE=51901651;WS=51901633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr17	51901703	rs4561519	C	G	2027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=36;PP=1749;SC=GAAGTCAGGACGGATAATGCA;SOR=1.092;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=27;TCR=36;TR=63;WE=51901711;WS=51901693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	51902252	rs3826355	C	T	5433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=76;PP=2965;SC=TAGCCAATGGCTGGAAAACAT;SOR=0.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=158;TCF=82;TCR=76;TR=158;WE=51902260;WS=51902242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr17	51902492	rs10693171	A	AAAT	2153.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=38;PP=2130;SC=AAAACTGTCCAAATTATCTAA;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=38;WE=51902500;WS=51902482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	52991026	rs58570485	CAAAAAA	C	770.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=20;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQ=58.31;MQRankSum=2.357;NF=21;NR=0;PP=231;ReadPosRankSum=-0.760;SC=GACTCTGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=56;TCR=7;TR=21;WE=52991054;WS=52991016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr17	52992128	rs3834969	TA	T	3570.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.194;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.722;NF=21;NR=85;PP=2948;ReadPosRankSum=0.075;SC=TCATTGCATTTAATTGATGTC;SOR=0.593;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=212;TCF=35;TCR=177;TR=106;WE=52992136;WS=52992118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,119:0.51:235
chr17	52993346	rs2934935	G	A	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=37;PP=1030;SC=CCTGATTTCAGTTGATTTCTA;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=37;WE=52993354;WS=52993336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	53007655	rs12939352	T	G	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=536;ReadPosRankSum=0.150;SC=TGCCTACAAGTGACCCCTCTT;SOR=0.446;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=24;WE=53007663;WS=53007645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr17	53013980	rs17745189	A	G	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.302;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=442;ReadPosRankSum=0.695;SC=TATTTTTTTAAAAACACATGC;SOR=0.164;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=20;WE=53013988;WS=53013970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr17	53014232	rs5821077	A	ATTAAG	481.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=5;PP=428;ReadPosRankSum=1.357;SC=ACTTAATGTTATTAACGTTAA;SOR=0.804;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=17;TCF=7;TCR=10;TR=8;WE=53014240;WS=53014222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr17	53014442	rs5821078	C	CT	696.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=11.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.74;MQRankSum=3.300;QD=6.83;ReadPosRankSum=2.070;SOR=0.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,46:0.45:102
chr17	53016495	rs117454625	G	A	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=35;PP=831;ReadPosRankSum=0.052;SC=AGCACTTTGGGAGGCCAAGGC;SOR=0.774;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=68;TCF=0;TCR=68;TR=35;WE=53016503;WS=53016485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,39:0.52:75
chr17	53026823	rs71159274	TAAAAG	T	2683.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.499;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.506;NF=52;NR=1;PP=2235;ReadPosRankSum=-1.029;SC=GTCTCAGTAATAAAAGAAAAG;SOR=1.501;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=152;TCF=143;TCR=9;TR=53;WE=53026835;WS=53026813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,71:0.47:150
chr17	53038430	rs4793784	A	G	814.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.424;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=673;ReadPosRankSum=0.269;SC=AACTATCAAAACTTATTTATT;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=27;WE=53038438;WS=53038420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr17	53038654	rs1802212	A	C	2041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.458;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=46;PP=1660;ReadPosRankSum=1.472;SC=TAAAACGTAGACTCTGTGCAG;SOR=0.994;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=178;TCF=80;TCR=98;TR=78;WE=53038662;WS=53038644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,79:0.44:180
chr17	53038745	rs17817901	A	G	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.872;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.149;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.075;NF=8;NR=31;PP=736;ReadPosRankSum=-1.356;SC=ATTAAATAGAATAACAGTTCC;SOR=0.410;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=90;TCF=17;TCR=73;TR=39;WE=53038753;WS=53038735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,45:0.45:99
chr17	53041965	rs12951542	T	C	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=442;ReadPosRankSum=0.793;SC=ATTAGAATCATAGTGTTAAAA;SOR=1.214;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=19;WE=53041973;WS=53041955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr17	53063743	rs958556	C	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=71;ReadPosRankSum=-1.383;SC=AGGATAGCAGCAATGAGTAGT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=53063751;WS=53063733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr17	53076799	rs1156287	G	A	1523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.679;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=40;PP=1201;ReadPosRankSum=-0.308;SC=CATAATTACCGGAGCCAAGTT;SOR=0.818;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=130;TCF=43;TCR=87;TR=59;WE=53076807;WS=53076789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,61:0.46:134
chr17	53076986	rs11658717	G	A	2353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.410;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=19;PP=1774;ReadPosRankSum=0.360;SC=TTTCTTTTTAGTACTAGGTTA;SOR=0.400;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=187;TCF=152;TCR=35;TR=86;WE=53076994;WS=53076976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,91:0.47:195
chr17	53084697	rs141409093	CT	C	396.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=433;ReadPosRankSum=2.014;SC=TCTGTCCCCCCTCCAAAAAAA;SOR=0.368;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=9;WE=53084709;WS=53084687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr17	53084701	rs373088836	A	C	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=423;ReadPosRankSum=1.706;SC=TCCCCCCTCCAAAAAAAAAAA;SOR=0.420;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=9;WE=53084709;WS=53084687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr17	53084790	rs12051573	C	T	1688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.975;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=7;PP=1247;ReadPosRankSum=0.107;SC=ACAGCAGGAACTCAGAACATA;SOR=0.909;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=111;TCF=96;TCR=15;TR=60;WE=53084798;WS=53084780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,64:0.54:118
chr17	53121020	rs17818142	A	G	3604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=68;PP=2962;ReadPosRankSum=0.425;SC=AGTCGTGGCAATTTTGGATCC;SOR=0.698;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=283;TCF=139;TCR=144;TR=135;WE=53121028;WS=53121010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,137:0.47:290
chr17	53124546	rs149633875	CGTGTGT	C	468.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.174;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=1.112;NF=1;NR=9;PP=391;ReadPosRankSum=0.360;SC=TATATGTGCTCGTGTGTGTGT;SOR=0.172;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=10;WE=53124559;WS=53124536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,13:0.48:27
chr17	53158361	rs2628302	G	A	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=3;PP=601;ReadPosRankSum=0.483;SC=AGTAAAGATAGATGTTGTTTA;SOR=0.711;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=52;TCF=46;TCR=6;TR=29;WE=53158369;WS=53158351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr17	53158492	rs8069999	G	A	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=852;ReadPosRankSum=-1.014;SC=CAACGCTGGCGCTTGAATCTA;SOR=0.691;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=116;TCF=47;TCR=69;TR=50;WE=53158500;WS=53158482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,58:0.47:123
chr17	53478675	rs3744308	A	G	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.758;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.187;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=66;ReadPosRankSum=-0.058;SC=CCACCATGCCAAGCTAAACAC;SOR=1.371;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=6;WE=53478683;WS=53478665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr17	53485186	rs2286806	C	T	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=527;ReadPosRankSum=-0.856;SC=ACTGTCCTAGCGAGGGGGAAA;SOR=2.152;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=73;TCF=16;TCR=57;TR=28;WE=53485194;WS=53485176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,28:0.38:73
chr17	53491455	rs11659004	C	A	967.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.877;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=773;ReadPosRankSum=1.000;SC=ATAACTACCCCTTCCTCCCAC;SOR=0.862;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=79;TCF=50;TCR=29;TR=37;WE=53491463;WS=53491445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,38:0.47:80
chr17	53828493	rs12941739	A	C	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.155;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=397;ReadPosRankSum=-0.251;SC=AGCTTCTCGGAGGAGCAGTTC;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=44;TCR=3;TR=21;WE=53828501;WS=53828483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr17	53828706	rs890488	C	G	2048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=26;PP=1730;SC=GACAGGGGCGCGTCTTCTCCG;SOR=0.986;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=33;TCR=26;TR=59;WE=53828714;WS=53828696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	53844833	rs57156382	CT	C	3045.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.133;HP=14;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=95;PP=2083;ReadPosRankSum=-0.947;SC=GCTTGCTTTTCTTTTTTTTTT;SOR=3.258;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=129;TCF=11;TCR=118;TR=103;WE=53844855;WS=53844823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,124:0.98:126
chr17	53844847	rs35430620	C	T	1588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.993;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=44;PP=1025;ReadPosRankSum=1.644;SC=TTTTTTTAGACGTACTTTCAC;SOR=0.503;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=119;TCF=16;TCR=103;TR=52;WE=53844855;WS=53844823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,61:0.48:127
chr17	53844903	rs35052837	G	A	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.104;NF=0;NR=26;PP=606;ReadPosRankSum=-1.223;SC=TCAGCTCACCGCAATCTCCGC;SOR=0.818;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=26;WE=53844911;WS=53844893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr17	53851071	rs2960063	A	G	1393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.56;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	53851078	rs2912558	T	C	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.09;SOR=1.681;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	53851228	rs2960062	C	T	3582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=53;PP=2765;SC=GCCTGGCGATCGAGAGTGACG;SOR=0.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=56;TCR=53;TR=109;WE=53851236;WS=53851218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	53852111	rs2960061	T	C	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=5.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=501;ReadPosRankSum=0.187;SC=ATTTTTCTGGTATTTTTCCTT;SOR=0.770;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=31;TCR=30;TR=24;WE=53852119;WS=53852101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,25:0.38:65
chr17	54428067	rs2215756	C	T	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=474;ReadPosRankSum=-0.332;SC=ATGATAAAATCATATGTCAAC;SOR=0.850;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=20;WE=54428075;WS=54428057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr17	54428436	rs17759670	A	G	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.102;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=467;ReadPosRankSum=-1.492;SC=GATGCTTGCAATTTTATAAAT;SOR=2.468;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=21;WE=54428444;WS=54428426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr17	54450038	rs957724	C	A	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.099;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=315;ReadPosRankSum=0.982;SC=CAATGCACCTCAACACACTGG;SOR=2.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=16;WE=54450046;WS=54450028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr17	54450134	rs8069322	G	A	1217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.753;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=869;ReadPosRankSum=0.149;SC=AGAAAGAGAAGCAGCTGAAAG;SOR=0.604;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=63;TCR=33;TR=44;WE=54450142;WS=54450124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,48:0.44:108
chr17	54517855	rs7224536	T	C	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=326;ReadPosRankSum=0.670;SC=GTAGCAAATGTCTATTCTGAA;SOR=1.519;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=14;WE=54517863;WS=54517845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr17	54526301	rs2024316	C	T	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=399;ReadPosRankSum=0.843;SC=TTGGCATCGCCTGCTTGCTCT;SOR=1.061;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=58;TCF=53;TCR=5;TR=21;WE=54526309;WS=54526291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,22:0.39:56
chr17	54534634	rs10852985	G	A	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.180;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=255;ReadPosRankSum=-0.236;SC=CTACATAGCCGTTATATTTTA;SOR=0.293;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=16;WE=54534642;WS=54534624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr17	54554821	rs373804237	CT	C	400.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.30;MQRankSum=-0.255;QD=8.01;ReadPosRankSum=-0.602;SOR=0.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr17	54558282	rs68128704	GTA	G	78.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.878;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=153;ReadPosRankSum=-1.262;SC=GTGTGTGTGTGTAAATTTTCC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=4;WE=54558292;WS=54558272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr17	54558284	rs11079234	A	G	199.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=9;PP=298;ReadPosRankSum=1.029;SC=GTGTGTGTGTAAATTTTCCTT;SOR=0.446;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=10;WE=54558292;WS=54558272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr17	54872391	rs55815590	A	G	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.233;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=620;ReadPosRankSum=0.089;SC=TCCGGGAGAGAGAAGGAGACG;SOR=0.475;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=59;TCF=48;TCR=11;TR=30;WE=54872399;WS=54872381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,32:0.52:61
chr17	54872439	rs72837329	T	C	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.842;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=16;PP=986;ReadPosRankSum=-0.030;SC=ACAGGATGAATCCTGTTCCTG;SOR=0.435;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=101;TCF=72;TCR=29;TR=50;WE=54872447;WS=54872429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,53:0.51:104
chr17	54872555	rs72837330	C	A	1823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.583;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=38;PP=1447;ReadPosRankSum=-0.303;SC=TCAAAACAAACCACACTGAAG;SOR=0.625;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=153;TCF=79;TCR=74;TR=76;WE=54872563;WS=54872545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,76:0.48:159
chr17	54872595	rs72837331	A	G	1918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.854;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.73;ReadPosRankSum=-1.275;SOR=0.644;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,53:0.43:122
chr17	54872604	rs72837332	C	T	1845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=0.761;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.33;ReadPosRankSum=-0.894;SOR=0.580;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,48:0.42:113
chr17	54872614	rs72837333	C	T	1539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=1.866;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.55;ReadPosRankSum=0.761;SOR=0.488;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,40:0.40:99
chr17	54892126	rs4794668	A	G	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=1;PP=800;SC=AACTCTAACCAAACCCCTAAC;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=35;WE=54892134;WS=54892116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	54892348	rs72837358	G	C	1457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=37;PP=1245;ReadPosRankSum=0.184;SC=AGTCGGGAAGGTGCCTTAAGG;SOR=0.667;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=32;TCR=67;TR=55;WE=54892356;WS=54892338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,54:0.57:94
chr17	54912339	rs1048159	G	A	1267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.520;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=968;ReadPosRankSum=0.912;SC=GCAAGCACGGGTGGCGCGACA;SOR=0.545;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=110;TCF=63;TCR=47;TR=50;WE=54912347;WS=54912329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,50:0.45:112
chr17	54912737	rs7225724	A	G	1745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=50;PP=1442;SC=TTTTGAGGAAACAAGCTAATA;SOR=5.097;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=3;TCR=50;TR=53;WE=54912745;WS=54912727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	54921322	rs3760157	G	A	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.513;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=437;ReadPosRankSum=-0.614;SC=TTGTTTTGTGGGTTATCATTG;SOR=1.508;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=19;WE=54921330;WS=54921312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr17	54921494	rs3760158	A	C	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=357;ReadPosRankSum=-0.184;SC=GTTATTTAACATCCATTAATC;SOR=0.922;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=19;WE=54921502;WS=54921484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr17	54925262	rs6503775	G	T	1412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=4;PP=1072;SC=AAAATAATTTGTCTTTTTCTT;SOR=4.223;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=41;WE=54925270;WS=54925252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
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chr17	54936131	rs72837387	T	C	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=247;ReadPosRankSum=-0.065;SC=TTTGCCAGCATACATAGAGTA;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=12;WE=54936139;WS=54936121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr17	54939715	rs9911560	T	C	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-6.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=423;ReadPosRankSum=1.560;SC=CAGTGGTTTATGGCTCATGCA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=26;WE=54939723;WS=54939705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr17	54939737	rs3826295	T	A	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=406;ReadPosRankSum=-0.470;SC=CTGGTCACTGTACACTAGCGG;SOR=1.071;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=17;WE=54939745;WS=54939727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr17	54978794	rs205498	G	A	2149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=1;PP=1831;SC=ACTGGGGGTGGGCTCCTGGAG;SOR=5.580;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=64;TCF=63;TCR=1;TR=64;WE=54978802;WS=54978784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	54981571	.	CA	C	485.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=0.000;DP=218;ExcessHet=3.0103;FS=20.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=1.613;QD=3.20;ReadPosRankSum=0.403;SOR=2.552;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,50:0.33:152
chr17	55027850	rs8071691	T	C	2301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-10.672;NF=35;NR=53;PP=1770;ReadPosRankSum=0.222;SC=CATCACAAGATTCAGACTCCG;SOR=0.662;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=207;TCF=81;TCR=126;TR=88;WE=55027858;WS=55027840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,89:0.43:209
chr17	55038062	rs9899845	T	C	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.269;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=2;PP=172;ReadPosRankSum=0.343;SC=GTCTAGCGGCTTCAGGCCCGG;SOR=0.223;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=9;WE=55038070;WS=55038052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,8:0.53:15
chr17	55055741	rs71139945	CT	C	273.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=1.647;QD=11.90;ReadPosRankSum=0.281;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr17	55058689	rs3095499	G	C	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=198;ReadPosRankSum=-0.333;SC=AGTGAAGGGCGGATTTGGTCC;SOR=0.646;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=12;WE=55058697;WS=55058679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr17	55065530	rs12453004	A	G	1072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.281;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.125;NF=29;NR=5;PP=764;ReadPosRankSum=0.477;SC=GTGTGACTCAAAAAGCAATCA;SOR=0.950;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=53;TCR=9;TR=34;WE=55065538;WS=55065520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,38:0.55:69
chr17	55065558	rs11437466	T	TA	3010.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=26;PP=2970;SC=TAATTCTGTGTAATTCCTTTT;SOR=1.809;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=69;WE=55065566;WS=55065548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr17	55074482	.	T	TA	110.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=0.000;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=2.360;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.07;MQRankSum=1.933;QD=1.12;ReadPosRankSum=-1.808;SOR=1.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,19:0.19:99
chr17	55075582	rs1811258	A	G	1786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=1;PP=1633;SC=TGAGGCAGGAAAATCGCTTGA;SOR=6.518;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=54;TCF=53;TCR=1;TR=54;WE=55075590;WS=55075574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	55075670	rs367630962	CA	C	108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=15.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQRankSum=2.500;QD=0.82;ReadPosRankSum=-1.655;SOR=2.771;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,25:0.19:133
chr17	55075928	rs12941709	C	T	3985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=113;PP=2965;SC=AATTCAGAGACCTGAATTTGT;SOR=5.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=5;TCR=113;TR=118;WE=55075936;WS=55075918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr17	55078526	rs67794111	C	T	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=205;ReadPosRankSum=2.580;SC=TGGGGAGCTGCACGTGGCTGT;SOR=0.507;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=12;WE=55078534;WS=55078516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr17	55079471	rs12940187	T	C	3850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.845;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=61;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.445;SC=CCCTAAATCTTTGGAAACATC;SOR=0.632;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=323;TCF=192;TCR=131;TR=148;WE=55079479;WS=55079461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,149:0.45:333
chr17	55163827	rs72843416	C	T	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.740;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=8;PP=637;ReadPosRankSum=-0.660;SC=GGATCTTCCTCTCCTGGGGGA;SOR=1.256;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=78;TCF=54;TCR=24;TR=31;WE=55163835;WS=55163817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,33:0.42:79
chr17	55182878	rs17761023	C	T	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=7;PP=1034;ReadPosRankSum=-1.294;SC=GGGATGCTGGCGCTCCTCGGC;SOR=0.794;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=100;TCF=87;TCR=13;TR=50;WE=55182886;WS=55182868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,51:0.49:104
chr17	55183716	rs1050515	T	C	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=6.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=22.320;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=39;PP=1077;ReadPosRankSum=-1.275;SC=AAGCCCAGGATAGAGGTGTCG;SOR=2.345;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=114;TCF=40;TCR=74;TR=50;WE=55183724;WS=55183706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,53:0.46:116
chr17	55183792	.	G	A	946	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=29;MQ=57.11;NF=32;NR=15;PP=946;QD=20.8674726074;SC=AAATGAGGAGGGCTTGGATAG;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=125;TCF=79;TCR=46;TR=47;WE=55183800;WS=55183782;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:78,47:0.38:125
chr17	55183813	.	A	G	1230	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MMLQ=29;MQ=57.55;NF=43;NR=16;PP=1230;QD=21.4368002127;SC=AAATGAGGAGAGCTTGGATAG;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=145;TCF=92;TCR=53;TR=59;WE=55183821;WS=55183803;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:86,59:0.41:145
chr17	55187558	rs72828911	C	G	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.519;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=402;ReadPosRankSum=0.314;SC=TGTGGTAAGCCCAAAGCTCCC;SOR=3.890;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=16;WE=55187566;WS=55187548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr17	55189723	rs3094444	T	G	1862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=2;PP=1615;SC=AAGTGTTTTGTTACCTCAAAG;SOR=5.820;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=57;TCF=55;TCR=2;TR=56;WE=55189731;WS=55189713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	55334793	rs148540229	T	TC	487.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.281;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=3.227;NF=23;NR=3;PP=360;ReadPosRankSum=-0.926;SC=ACACCTTCTCTCCCCCCCCCA;SOR=0.970;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=90;TCF=77;TCR=13;TR=26;WE=55334801;WS=55334783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,27:0.43:63
chr17	55363421	rs11079286	G	C	3557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=87;PP=2829;SC=GCCTCTTTCTGTCTTTCCCTC;SOR=3.300;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=104;TCF=16;TCR=88;TR=103;WE=55363429;WS=55363411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr17	55674423	rs6503820	G	A	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=4.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=313;ReadPosRankSum=0.048;SC=GGGGTGGGGAGGGGGCTAGAT;SOR=1.085;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=14;WE=55674431;WS=55674413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr17	55704465	rs1861474	A	G	1676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=10;PP=1392;ReadPosRankSum=0.380;SC=AACCCTCATGAGAGACAAATT;SOR=0.712;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=121;TCF=101;TCR=20;TR=63;WE=55704473;WS=55704455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,62:0.50:123
chr17	55917353	rs2099914	C	G	2996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=78;PP=2545;SC=TCAATTAATTCGCTAAAGATA;SOR=3.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=11;TCR=78;TR=89;WE=55917361;WS=55917343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	56056706	rs12939279	C	T	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.618;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=382;ReadPosRankSum=-0.587;SC=AACACTGTATCTACCTGTAAA;SOR=1.164;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=19;WE=56056714;WS=56056696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr17	56060028	rs143850195	G	GAAGCA	3511.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.202;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.888;NF=42;NR=19;PP=2983;ReadPosRankSum=-0.725;SC=ATACCATAATGAAGCAAAGCA;SOR=0.471;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=207;TCF=164;TCR=43;TR=61;WE=56060036;WS=56060018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,89:0.46:193
chr17	56060215	rs2228270	T	C	4121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.318;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.794;NF=69;NR=88;PP=2962;ReadPosRankSum=0.712;SC=AGAGCTTGTGTCGATTGAGAT;SOR=0.795;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=321;TCF=146;TCR=175;TR=157;WE=56060223;WS=56060205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:168,157:0.48:325
chr17	56060793	rs35869410	C	T	1973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.808;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=59;PP=1556;ReadPosRankSum=2.222;SC=CTCAGCCTCTCACAATGGCCT;SOR=0.545;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=130;TCF=28;TCR=102;TR=76;WE=56060801;WS=56060783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,76:0.57:133
chr17	56083934	rs2233911	G	A	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=484;ReadPosRankSum=0.168;SC=ACCAGGAGGAGAAGCTCGCTC;SOR=0.784;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=55;TCF=3;TCR=52;TR=23;WE=56083942;WS=56083924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chr17	56235104	rs3863503	C	A	3558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=40;PP=2837;SC=CCTGTGCTTCCCATCCCGCCC;SOR=1.508;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=116;TCF=76;TCR=40;TR=116;WE=56235112;WS=56235094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr17	56235322	rs1987665	G	A	975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=28;PP=942;SC=CACAGCTGAAGTTTGTTCTTT;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=56235330;WS=56235312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	56247101	rs60994383	C	A	2825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.902;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=22;PP=2061;ReadPosRankSum=1.209;SC=TTTCCTGTTTCTAATGTTCCT;SOR=1.211;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=210;TCF=159;TCR=51;TR=104;WE=56247109;WS=56247091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,111:0.51:219
chr17	56270121	rs12602891	T	C	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=1;PP=945;SC=CGGCTGGGGGTCCTCAAAGTG;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=33;WE=56270129;WS=56270111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	56270442	rs11079339	A	G	1389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.451;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=35;PP=1168;ReadPosRankSum=-2.098;SC=GAGACTGCATAGCAGAGGCCA;SOR=0.490;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=121;TCF=44;TCR=77;TR=56;WE=56270450;WS=56270432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,55:0.46:119
chr17	56271060	rs11079340	T	C	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=739;ReadPosRankSum=2.007;SC=GGTCTGCCCATTTGCCTTCCC;SOR=0.328;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=16;TCR=14;TR=28;WE=56271068;WS=56271050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr17	56271094	rs11652709	G	C	1022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=7;PP=835;SC=CAGAACCACAGCTGCGGCTGC;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=56271102;WS=56271084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	56271497	rs10853004	A	G	2062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=51;PP=1598;SC=GATCTCTTAAATGCGGGGAGT;SOR=2.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=11;TCR=51;TR=62;WE=56271505;WS=56271487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	56272390	rs2240815	A	G	8100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=151;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.750;SC=ACCGTGGCCGAGCCCTCATGT;SOR=0.495;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=252;TCF=100;TCR=152;TR=251;WE=56272398;WS=56272380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,258:1.00:259
chr17	56274781	rs34415223	T	TG	1302.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=31;PP=1423;SC=ATCAGAACGTTGAGTCCCTTT;SOR=5.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=32;WE=56274789;WS=56274771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	56283088	rs35298266	AC	A	980.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.957;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=957;ReadPosRankSum=-2.049;SC=AGGGTGGAGAACAGCAGATCC;SOR=0.287;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=25;WE=56283096;WS=56283078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr17	56289545	rs3213698	T	C	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=17;NR=1;PP=522;SC=ACCTTTTTCTTAGCATTAACA;SOR=3.716;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=18;WE=56289553;WS=56289535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	56290334	rs3826300	T	C	3047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=39;PP=2325;SC=GGAATGAACTTGCGCTTACAT;SOR=1.167;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=57;TCR=39;TR=96;WE=56290342;WS=56290324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr17	56290556	rs3744105	A	G	925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=22;PP=738;SC=ACACCTCACTAAAGTATATGA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=56290564;WS=56290546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	56293960	rs7225148	T	C	3678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.791;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=18;PP=2882;ReadPosRankSum=1.736;SC=TTTGGCAATATGTATCACCAG;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=97;TCR=19;TR=114;WE=56293968;WS=56293950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,119:0.98:121
chr17	56320158	rs8178290	C	A	992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=0;PP=770;SC=TTCCATCTCTCCCAGTACCTA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=56320166;WS=56320148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	56321271	rs7219860	G	A	8476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=192;NR=63;PP=2965;ReadPosRankSum=0.895;SC=GGTAATGGCCGAGAAAGAGGG;SOR=1.186;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=257;TCF=194;TCR=63;TR=255;WE=56321279;WS=56321261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,263:1.00:264
chr17	56321451	rs369027249	GAC	G	244.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=6.138;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQRankSum=-1.199;QD=4.99;ReadPosRankSum=-0.091;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
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chr17	56344656	rs8178407	A	G	2264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=7;PP=1798;SC=GCCCCAAAGGAGGCTGTGAAC;SOR=4.174;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=60;TCR=7;TR=67;WE=56344664;WS=56344646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
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chr17	56351708	rs72051182	AGT	A	85.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=192;SC=AGAATCTAGGAGTGTGTGTGT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=4;WE=56351717;WS=56351698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr17	56357818	rs7208693	C	A	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=24;PP=1189;ReadPosRankSum=-0.244;SC=TCCCCCAGGACAGCTGCCCAG;SOR=0.935;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=116;TCF=66;TCR=50;TR=59;WE=56357826;WS=56357808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,61:0.51:119
chr17	56383744	rs11079346	T	C	1609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.598;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=24;PP=1121;ReadPosRankSum=-0.451;SC=CCCAGTTGTGTGGGCTGTGGA;SOR=0.332;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=156;TCF=112;TCR=44;TR=71;WE=56383752;WS=56383734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,73:0.45:163
chr17	56384374	rs11652816	A	G	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=50;PP=1303;ReadPosRankSum=0.500;SC=CTCACTCCCTATGCCCCTAGG;SOR=0.778;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=108;TCF=22;TCR=86;TR=62;WE=56384382;WS=56384364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,61:0.56:109
chr17	56384928	rs36057095	C	T	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=660;ReadPosRankSum=-0.251;SC=AGGGAAGACCCAGCTGGTGTT;SOR=0.495;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=52;TCF=46;TCR=6;TR=29;WE=56384936;WS=56384918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr17	56386118	rs2680689	A	G	1832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.700;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.97;MQRankSum=-1.000;NF=44;NR=37;PP=1354;ReadPosRankSum=0.336;SC=CCTCCTGCTCATCCTCCGAAT;SOR=0.761;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=163;TCF=84;TCR=79;TR=81;WE=56386126;WS=56386108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,81:0.49:164
chr17	56386358	rs2526360	T	A	2069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.155;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=26;PP=1683;ReadPosRankSum=-1.152;SC=TGCAGTGTTCTCGGGGATCTG;SOR=0.800;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=207;TCF=141;TCR=66;TR=84;WE=56386366;WS=56386348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,86:0.42:206
chr17	56386386	.	G	T	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.765;ClippingRankSum=0.000;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=236.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.44;ReadPosRankSum=-7.081;SOR=7.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,44:0.25:176
chr17	56388238	rs2680704	C	G	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.787;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=29;PP=925;ReadPosRankSum=1.016;SC=GACCCTTTTGCCATCTCTCTG;SOR=1.209;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=110;TCF=45;TCR=65;TR=44;WE=56388246;WS=56388228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,48:0.42:114
chr17	56388303	rs3744099	T	A	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.930;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=643;ReadPosRankSum=0.475;SC=GGGAGCAGGGTGCTGGAGAGG;SOR=0.493;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=84;TCF=26;TCR=58;TR=33;WE=56388311;WS=56388293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,33:0.40:82
chr17	56388927	rs2072144	T	C	1905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.266;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=35;PP=1521;ReadPosRankSum=0.390;SC=TGGGCAGGGCTATACCTTCTG;SOR=0.501;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=130;TCF=73;TCR=57;TR=75;WE=56388935;WS=56388917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,73:0.57:129
chr17	56389631	rs9905604	A	G	2350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.621;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=51;PP=1769;ReadPosRankSum=-1.279;SC=GGCCCGGCCCACAGGTCCAGG;SOR=0.739;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=175;TCF=87;TCR=88;TR=96;WE=56389639;WS=56389621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,98:0.55:178
chr17	56389732	rs9913145	T	C	2060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.571;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=39;PP=1528;ReadPosRankSum=0.285;SC=TAGCTCCACTTGCTCAGGAGG;SOR=0.555;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=160;TCF=78;TCR=82;TR=82;WE=56389740;WS=56389722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,86:0.51:167
chr17	56390249	rs62084580	G	T	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.655;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=0.712;SC=GAGCAGTAAAGATCTGGATTA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=56390257;WS=56390239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr17	56393251	rs199737483	GGGAT	G	338.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.006;NF=6;NR=0;PP=305;ReadPosRankSum=-1.249;SC=CTGGGCAGAGGGGATGGATGG;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=6;WE=56393262;WS=56393241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr17	56393548	rs2072143	T	C	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.492;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=336;ReadPosRankSum=0.270;SC=TCCACTTCCATGTCCTGTCTT;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=19;WE=56393556;WS=56393538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr17	56393714	rs2074630	G	A	721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.849;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=538;ReadPosRankSum=-1.548;SC=GAGGTCTCCAGCTCCACCCGG;SOR=2.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=60;TCR=2;TR=26;WE=56393722;WS=56393704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,27:0.42:65
chr17	56396587	rs2072146	T	C	1726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.401;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=43;PP=1358;ReadPosRankSum=-0.734;SC=AAGCCTGGAGTTCCTGTGCCA;SOR=1.397;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=126;TCF=48;TCR=78;TR=64;WE=56396595;WS=56396577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,65:0.52:126
chr17	56397324	rs2285992	G	A	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.301;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=154;ReadPosRankSum=0.299;SC=TGTCCTGTGGGAACTCCACCC;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=9;WE=56397332;WS=56397314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr17	56398006	rs2526380	C	G	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=13;PP=494;ReadPosRankSum=-0.117;SC=GTAGAGAGGGCTGCGAGGGAG;SOR=0.629;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=63;TCF=30;TCR=33;TR=26;WE=56398014;WS=56397996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,27:0.39:69
chr17	56399592	rs2269919	C	T	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=330;ReadPosRankSum=-1.559;SC=GCCGGGCACACAGTAAATGCT;SOR=0.756;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=16;WE=56399600;WS=56399582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr17	56400617	rs11655709	T	C	1518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.183;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=6;PP=1197;ReadPosRankSum=1.737;SC=CTGGCCGGGGTGAAGGGAGGA;SOR=1.797;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=126;TCF=106;TCR=20;TR=57;WE=56400625;WS=56400607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,58:0.46:126
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chr17	56424710	rs757485	T	C	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.643;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=20;PP=920;ReadPosRankSum=0.591;SC=GAAGAGCTATTCCCTCTTTTG;SOR=0.265;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=76;TCF=30;TCR=46;TR=39;WE=56424718;WS=56424700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,39:0.49:79
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chr17	56432362	rs2158460	C	G	511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.991;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=371;ReadPosRankSum=-0.158;SC=ATTTAGAGAGCGGGGAGGAAA;SOR=1.358;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=19;WE=56432370;WS=56432352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,20:0.44:45
chr17	56435885	rs2526374	G	T	2916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=65;PP=2153;ReadPosRankSum=0.754;SC=AGGTGGCTCAGTCCCCAGCCT;SOR=0.710;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=194;TCF=72;TCR=122;TR=104;WE=56435893;WS=56435875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,109:0.55:199
chr17	56440542	rs2680700	G	T	1684.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=9.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=1;PP=1385;ReadPosRankSum=0.713;SC=AGGATCTCTCGCAGCTCCAGG;SOR=0.198;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=118;TCF=117;TCR=1;TR=58;WE=56440550;WS=56440532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,59:0.49:121
chr17	56492800	rs3744093	T	C	2895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.065;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=64;PP=2205;ReadPosRankSum=-0.688;SC=ACTCTGATAATAGCTTTCTGT;SOR=0.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=207;TCF=87;TCR=120;TR=107;WE=56492808;WS=56492790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,112:0.52:215
chr17	56540110	rs3803753	G	A	2768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.630;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=15;PP=2006;ReadPosRankSum=-0.642;SC=GGTACTTTGAGCTTTATAAGC;SOR=1.169;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=183;TCF=149;TCR=34;TR=95;WE=56540118;WS=56540100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,101:0.53:192
chr17	56540267	rs3803752	C	T	3747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.067;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=85;PP=2962;ReadPosRankSum=0.593;SC=CTGTATTGTGCTATTTTCAAC;SOR=1.070;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=290;TCF=129;TCR=161;TR=142;WE=56540275;WS=56540257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,144:0.49:295
chr17	56544280	rs1017089	T	G	8102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=141;NR=109;PP=2965;SC=GGAAGAGGCATTGGGAGTGAC;SOR=0.945;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=251;TCF=141;TCR=110;TR=250;WE=56544288;WS=56544270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,255:1.00:255
chr17	56569842	rs75741842	T	TGA	4596.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=16;PP=2975;SC=CCCTGTTTTTTGTCATACTAA;SOR=3.023;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=89;TCF=72;TCR=17;TR=87;WE=56569850;WS=56569832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr17	56580997	rs1860262	T	C	1825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=7;PP=1519;SC=GGCGACAAAGTGAGATTCCGT;SOR=3.690;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=49;TCR=7;TR=56;WE=56581005;WS=56580987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	56581375	.	C	G	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.360;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.291;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=169;ReadPosRankSum=-0.701;SC=CTATAGGTTTCTAAATAGCAC;SOR=0.483;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=43;TCF=26;TCR=17;TR=11;WE=56581383;WS=56581365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,12:0.27:45
chr17	56581651	rs4277402	C	G	5150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=92;PP=2965;SC=TTGTCACAGGCCTTAGGACTT;SOR=1.172;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=61;TCR=92;TR=153;WE=56581659;WS=56581641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr17	56584205	rs2302189	A	C	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.908;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=17;PP=691;ReadPosRankSum=0.819;SC=TGTGCTCTCCACTCCAGAGCA;SOR=0.551;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=69;TCF=33;TCR=36;TR=35;WE=56584213;WS=56584195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,32:0.46:69
chr17	56585872	rs3744108	G	C	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.773;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=23;PP=1119;ReadPosRankSum=0.305;SC=ACGTTCTGCAGGTCAAAGCCC;SOR=0.579;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=96;TCF=58;TCR=38;TR=56;WE=56585880;WS=56585862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,57:0.57:100
chr17	56589813	.	C	A	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.326;ClippingRankSum=0.000;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=30;PP=1118;ReadPosRankSum=1.159;SC=ATGAGGGCATCGGCTGCCCGG;SOR=0.671;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=100;TCF=45;TCR=55;TR=56;WE=56589821;WS=56589803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,58:0.57:101
chr17	56598213	rs10719315	GA	G	835.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.147;NF=2;NR=29;PP=1001;ReadPosRankSum=-0.282;SC=GCTAAAGGGAGAAAAGGGTTG;SOR=1.044;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=66;TCF=6;TCR=60;TR=31;WE=56598221;WS=56598203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr17	56598439	rs1057068	T	C	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.504;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=21;PP=1103;ReadPosRankSum=0.145;SC=GTGTCTCCCGTGTCACATCCT;SOR=0.561;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=119;TCF=79;TCR=40;TR=59;WE=56598447;WS=56598429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,60:0.49:123
chr17	56603978	rs2079703	G	A	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.243;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.860;NF=18;NR=4;PP=382;ReadPosRankSum=0.915;SC=CACACACTCTGCTCCCTGCCC;SOR=0.976;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=22;WE=56603986;WS=56603968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,22:0.44:50
chr17	56620167	rs17822735	C	T	1848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.829;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=28;PP=1486;ReadPosRankSum=2.109;SC=ATTTTAAAACCGGACAATAAA;SOR=0.926;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=151;TCF=88;TCR=63;TR=70;WE=56620175;WS=56620157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,72:0.46:158
chr17	56620501	rs17222523	A	G	2161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.262;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=58;PP=1649;ReadPosRankSum=0.508;SC=GAACTGTCACATGGTGAGTTG;SOR=0.825;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=159;TCF=60;TCR=99;TR=90;WE=56620509;WS=56620491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,91:0.55:165
chr17	56621286	rs8071623	G	T	8528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.847;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=167;NR=107;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.201;SC=CCAGTCTCGGGTCCCCGAGGA;SOR=0.221;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=276;TCF=169;TCR=107;TR=274;WE=56621294;WS=56621276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,277:0.99:279
chr17	56621359	rs6503867	T	C	10195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=177;NR=152;PP=2965;SC=AGTCTGATGCTGAATGGGGAG;SOR=0.853;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=330;TCF=178;TCR=152;TR=329;WE=56621367;WS=56621349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,335:1.00:335
chr17	56636854	rs7225128	T	C	5485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=76;NR=88;PP=2965;SC=ATTTCCTTCTTTCTGGTGTAA;SOR=0.843;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=164;TCF=76;TCR=88;TR=164;WE=56636862;WS=56636844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
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chr17	56649614	rs144725723	AAAACAAAC	A	351.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=1169;ReadPosRankSum=-2.949;SC=TTACATTATTAAAACAAACAA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=8;WE=56649629;WS=56649604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
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chr17	56769979	rs12946397	C	T	871.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=1;PP=671;ReadPosRankSum=-0.374;SC=AGTTTGGCTGCTCCGGGGTTA;SOR=0.387;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=56;TCF=55;TCR=1;TR=32;WE=56769987;WS=56769969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr17	56833457	rs201186780	G	GGAACCC	2699.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=5.781;NF=23;NR=31;PP=2984;ReadPosRankSum=0.552;SC=AGCCGGAGCCGGAACCCGAAC;SOR=0.685;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=184;TCF=80;TCR=104;TR=54;WE=56833465;WS=56833447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,70:0.44:159
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chr17	57076893	rs4598970	T	A	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.203;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=505;ReadPosRankSum=-0.595;SC=CCTTCCCAAGTCTTTAAATAA;SOR=1.819;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=24;WE=57076901;WS=57076883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr17	57089576	.	C	CCAGCAGCAGCAGCAG	59.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.180;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=7.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=-0.368;QD=2.84;ReadPosRankSum=-0.135;SOR=0.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,4:0.19:21
chr17	57089588	rs72443487	G	GCAGCAGCAGCAGCAGCAC	1406.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.550;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.664;NF=22;NR=10;PP=474;ReadPosRankSum=-1.839;SC=AGCAGCAGCAGCACCACCACC;SOR=2.303;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=32;WE=57089596;WS=57089566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,42:0.88:48
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chr17	57094847	rs4932692	T	C	1805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.469;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=58;PP=1562;ReadPosRankSum=1.036;SC=CACTATTTAGTCTGTCAGAAA;SOR=1.203;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=146;TCF=18;TCR=128;TR=65;WE=57094855;WS=57094837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,65:0.44:149
chr17	57126842	rs62084384	G	A	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=171;ReadPosRankSum=1.050;SC=GCATCCAGATGTTTCTAAAAC;SOR=0.346;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=9;WE=57126850;WS=57126832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr17	57152920	rs6416933	A	G	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.960;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.27;MQRankSum=0.189;QD=6.63;ReadPosRankSum=1.282;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr17	57165890	rs192990687	T	C	832.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=685;ReadPosRankSum=0.884;SC=TTTTTTTTTTTAAGAGATGAG;SOR=2.899;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=26;WE=57165898;WS=57165868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,28:0.67:42
chr17	57247249	rs9914425	T	A	4211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.963;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=113;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.358;SC=AAGGTAAGGCTTAATGTGGAA;SOR=0.770;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=291;TCF=88;TCR=203;TR=160;WE=57247257;WS=57247239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,164:0.56:295
chr17	57272079	rs2291193	G	A	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=2;PP=853;SC=CAGTTGTGCTGGTTCCAATTT;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=33;WE=57272087;WS=57272069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	57278908	.	CT	C	3193.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.159;ClippingRankSum=0.000;DP=398;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.459;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.772;NF=107;NR=41;PP=1563;ReadPosRankSum=1.810;SC=ATAATTGGGACTTTTTTTTTT;SOR=0.742;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=361;TCF=257;TCR=104;TR=148;WE=57278917;WS=57278898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,173:0.50:345
chr17	57287454	rs6503905	A	G	4119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=40;PP=2965;SC=TAATGGGAGCATCAGCCTGGA;SOR=1.965;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=102;TCR=40;TR=142;WE=57287462;WS=57287444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr17	57290383	rs3744383	G	A	8257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.040;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=133;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.834;SC=CTGAGAAGAGGCCAAACTTCG;SOR=0.272;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=255;TCF=118;TCR=137;TR=249;WE=57290391;WS=57290373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,265:0.99:269
chr17	57311748	rs6503908	C	A	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=1;PP=417;SC=TGTCTACCCCCAAAAAAAAAA;SOR=4.047;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=16;WE=57311756;WS=57311738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	57334668	rs12450435	C	G	3617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=95;PP=2958;SC=AGGTTAGAGTCAGTGACTGCA;SOR=3.892;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=13;TCR=96;TR=108;WE=57334676;WS=57334658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr17	57466917	rs2290266	A	G	1653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.130;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=52;PP=1220;ReadPosRankSum=-0.011;SC=CTCGCTTTCCATGGCCTTGTG;SOR=0.547;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=114;TCF=12;TCR=102;TR=59;WE=57466925;WS=57466907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,64:0.54:119
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chr17	57663596	rs58298344	TA	T	304.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=6.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.12;MQRankSum=-3.497;QD=5.86;ReadPosRankSum=0.584;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
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chr17	57743691	rs9893154	G	A	3042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=61;PP=2581;SC=AGCTACTGAGGGGCCTACTCC;SOR=1.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=28;TCR=61;TR=89;WE=57743699;WS=57743681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	57750982	rs8065248	T	C	2857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=27;PP=2313;SC=AAATTTAAAGTTTCCTTTTGT;SOR=1.890;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=60;TCR=27;TR=86;WE=57750990;WS=57750972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	57752271	rs139848148	A	G	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.927;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=156;ReadPosRankSum=-0.262;SC=AAATATAGGTAGTCATTTGTT;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=9;WE=57752279;WS=57752261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,12:0.39:31
chr17	57889192	rs2063353	T	G	3844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=91;PP=2965;SC=ATGAACCCATTACAAGACAAT;SOR=2.737;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=24;TCR=92;TR=115;WE=57889200;WS=57889182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr17	57918516	.	G	C	1178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.720;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=2;PP=1005;ReadPosRankSum=0.425;SC=TAACAGGCCAGAAATGCCTGG;SOR=0.768;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=85;TCF=82;TCR=3;TR=46;WE=57918524;WS=57918506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,44:0.52:85
chr17	57937792	.	G	GA	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.33;ReadPosRankSum=-1.791;SOR=0.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,20:0.15:136
chr17	58030551	rs34068842	CT	C	197.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=30.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.46;MQRankSum=-1.083;QD=4.21;ReadPosRankSum=-0.425;SOR=5.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,17:0.36:47
chr17	58040730	rs4968401	T	C	1774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=46;PP=1439;SC=CTTTATTCACTAAAGGAGTAG;SOR=4.575;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=4;TCR=46;TR=50;WE=58040738;WS=58040720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	58128104	.	C	T	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.859;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=3;PP=717;ReadPosRankSum=2.183;SC=GCCTTTTCATCAGAGATGATG;SOR=1.729;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=32;WE=58128112;WS=58128094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,33:0.61:54
chr17	58149745	rs3744375	G	A	4916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=126;PP=2965;SC=AATGAGGCTTGCAAAAGACTA;SOR=2.974;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=154;TCF=27;TCR=127;TR=153;WE=58149753;WS=58149735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr17	58156228	rs116476597	C	T	2562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=62;PP=1918;ReadPosRankSum=0.343;SC=GCGGTGCCTCCCGCGGCTGCA;SOR=0.661;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=48;TCR=102;TR=91;WE=58156236;WS=58156218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,95:0.61:157
chr17	58156301	.	T	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.902;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=38.463;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-1.316;QD=1.68;ReadPosRankSum=-0.568;SOR=3.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr17	58180062	rs8075626	T	C	7609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=83;NR=190;PP=2965;SC=GCTTGGCCGGTGGCGGCGGAG;SOR=1.634;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=273;TCF=83;TCR=190;TR=273;WE=58180070;WS=58180052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr17	58180079	rs8074512	C	G	10833.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=181;PP=2965;SC=GGAGCTTGGCCGGCGGCGGCG;SOR=1.891;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=238;TCF=57;TCR=181;TR=238;WE=58180087;WS=58180069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr17	58180172	rs8075789	T	C	3208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=81;PP=2657;SC=CATTTCTATTTCTCATTCCAT;SOR=4.129;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=10;TCR=82;TR=91;WE=58180180;WS=58180162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr17	58332659	rs111586105	C	T	365.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=5.177;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.82;MQRankSum=-4.055;QD=2.97;ReadPosRankSum=-4.001;SOR=3.142;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,45:0.37:123
chr17	58506794	.	C	G	1889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=0.000;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=23;PP=1541;ReadPosRankSum=0.059;SC=TGCCCAAGCTCTGCCATGCAT;SOR=0.728;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=101;TCR=50;TR=69;WE=58506802;WS=58506784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,69:0.47:148
chr17	58786625	rs2643103	A	G	5740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=113;NR=59;PP=2965;SC=AGTACTGGGAATGAACCGCCT;SOR=1.506;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=113;TCR=60;TR=172;WE=58786633;WS=58786615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr17	58824567	rs7501675	T	C	2210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=37;PP=1741;SC=AGATCAGTGGTGAAGCACAAG;SOR=0.719;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=73;TCF=36;TCR=37;TR=72;WE=58824575;WS=58824557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	59477723	.	C	T	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=3.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.15;ReadPosRankSum=0.399;SOR=1.037;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
chr17	59480289	rs200207014	GAT	G	6136.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.56;QD=44.47;SOR=3.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr17	59480291	.	T	G	2379	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=68;MMLQ=24;MQ=59.46;NF=92;NR=6;PP=2379;QD=24.6303184954;SC=GAAGAACCGATAGAGAGAGAG;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=99;TCF=92;TCR=7;TR=98;WE=59480299;WS=59480281;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:1,98:0.99:99
chr17	59480311	rs202026270	GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA	G	217.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=7.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=-1.379;QD=1.94;ReadPosRankSum=-0.941;SOR=1.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,17:0.15:112
chr17	59480313	rs140392356	GAGAGAGAGAGAGAGAGAGA	G	2854.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=7.300;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.79;MQRankSum=1.414;QD=25.49;ReadPosRankSum=0.954;SOR=0.149;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,95:0.85:112
chr17	59482165	rs66504335	GC	G	6502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQ=59.92;NF=68;NR=45;PP=2971;SC=CAGGGAGGTGGCGGCGGGGGG;SOR=1.373;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=121;TCF=71;TCR=50;TR=113;WE=59482181;WS=59482155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr17	59482169	rs35619711	C	G	6831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.92;QD=46.47;SOR=1.282;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr17	59482173	rs9891115	G	A	6766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.92;QD=45.11;SOR=1.248;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr17	59485393	rs2240736	C	T	7796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=152;NR=91;PP=2965;SC=GTCTAACCCTCGTCTTGTTCT;SOR=1.342;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=245;TCF=153;TCR=92;TR=243;WE=59485401;WS=59485383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
chr17	59485555	rs1057987	C	T	7941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=139;NR=120;PP=2965;SC=TCTCCCGGAGCCCCTTCCTGG;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=263;TCF=143;TCR=120;TR=259;WE=59485563;WS=59485545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr17	59489893	rs9907379	T	C	5803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=121;PP=2965;SC=CGGCAACTCCTCACAGGTCCA;SOR=2.030;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=44;TCR=121;TR=165;WE=59489901;WS=59489883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr17	59557600	rs3744438	C	T	2284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.374;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=60;PP=1713;ReadPosRankSum=-0.273;SC=TCACAGCTCGCGGAGCCGCAG;SOR=0.450;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=192;TCF=62;TCR=130;TR=94;WE=59557608;WS=59557590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,96:0.48:199
chr17	59560463	rs7218485	C	T	3272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.498;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=46;PP=2416;ReadPosRankSum=-0.284;SC=CTGGGGTGGACGACCTGCCCC;SOR=0.939;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=252;TCF=152;TCR=100;TR=122;WE=59560471;WS=59560453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,130:0.50:260
chr17	59560974	.	A	AGTGT	72.37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.34;QD=72.37;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1:1.00:1
chr17	59667953	rs17610181	G	A	3333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.675;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.621;NF=77;NR=55;PP=2512;ReadPosRankSum=-0.343;SC=TTCAGAGCTCGGACTGCCTTT;SOR=0.899;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=307;TCF=170;TCR=137;TR=132;WE=59667961;WS=59667943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,139:0.43:322
chr17	59668021	rs61739273	G	C	2889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.442;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.091;NF=46;NR=60;PP=2227;ReadPosRankSum=-0.954;SC=TTCTACACCTGTTTCATCGAC;SOR=0.479;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=238;TCF=94;TCR=144;TR=106;WE=59668029;WS=59668011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,110:0.45:243
chr17	59668352	rs17531723	C	T	2494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.611;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.107;NF=52;NR=44;PP=2015;ReadPosRankSum=0.732;SC=GCTTTACCGACTGGTTCTTCA;SOR=0.789;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=215;TCF=109;TCR=106;TR=96;WE=59668360;WS=59668342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,98:0.45:220
chr17	59763465	rs4986765	T	C	3853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=51;PP=2962;ReadPosRankSum=0.794;SC=CAGCCAAGGATTCCAGTGCAC;SOR=0.704;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=267;TCF=169;TCR=98;TR=140;WE=59763473;WS=59763455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,146:0.53:275
chr17	59857809	rs4988351	C	G	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=17;PP=485;SC=TTAGAAGAGGCTGGGCAAAGT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=59857817;WS=59857799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	59955426	rs606072	T	G	6768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=159;PP=2965;SC=ACTTGTGTGTTATTTACTGGG;SOR=3.247;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=191;TCF=32;TCR=159;TR=191;WE=59955434;WS=59955416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr17	59971067	rs8077835	A	T	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=1.809;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.92;ReadPosRankSum=-1.922;SOR=0.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,35:0.47:75
chr17	59982085	rs72843757	G	A	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.648;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=129;ReadPosRankSum=0.903;SC=ATCTCAAGTTGCCAAATGCAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=59982093;WS=59982075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr17	60042569	rs140673828	T	C	4786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.261;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=75;PP=2962;ReadPosRankSum=0.708;SC=GATACTCCACTATTCAAGTTG;SOR=0.767;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=355;TCF=202;TCR=153;TR=178;WE=60042577;WS=60042559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,175:0.50:352
chr17	60043884	rs671347	G	A	10014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=178;NR=126;PP=2965;SC=CATTGTTACCGTCAGCTGCCT;SOR=1.078;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=305;TCF=179;TCR=126;TR=304;WE=60043892;WS=60043874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,321:1.00:321
chr17	60070111	rs11375626	G	GT	560.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=678;SC=GATTCTTACAGTAACAAGTAA;SOR=4.174;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=15;WE=60070119;WS=60070101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	60070140	rs11375627	C	CT	337.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=49;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=233;SC=CTTATTATTACTTTTTTTTGA;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=60070148;WS=60070130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	60142710	.	G	GC	380	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=23;MQ=60.98;NF=0;NR=9;PP=380;QD=45.1111111111;SC=AGGCCGCCGGGCGCCCGCCCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=9;WE=60142718;WS=60142700;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr17	60215386	rs3803868	T	C	1047.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.703;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.875;NF=27;NR=16;PP=799;ReadPosRankSum=0.021;SC=TTTCGGCCCGTCAAGGGTTGG;SOR=0.900;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=94;TCF=57;TCR=37;TR=43;WE=60215394;WS=60215376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,43:0.46:93
chr17	60215748	rs11079465	T	C	114.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=108;SC=CAGCTCCCGGTGCAGCTCGGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=60215756;WS=60215738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	60217236	rs56068498	A	G	967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=17;PP=811;SC=GGCGTTGTACATGTCCAGCGT;SOR=1.112;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=13;TCR=17;TR=30;WE=60217244;WS=60217226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	60360238	rs10163525	A	G	3171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.140;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-13.313;NF=50;NR=80;PP=2592;ReadPosRankSum=-1.047;SC=GGTAGTAAGGATGAACATTCC;SOR=0.409;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=259;TCF=95;TCR=164;TR=130;WE=60360246;WS=60360228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,92:0.41:223
chr17	60360261	rs62069132	T	C	3057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.733;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-11.806;NF=30;NR=95;PP=2015;ReadPosRankSum=1.150;SC=TTGTAGATGGTGAAGAGGAGC;SOR=0.391;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=231;TCF=55;TCR=176;TR=125;WE=60360269;WS=60360251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,88:0.45:195
chr17	60363906	rs202158824	G	T	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.75;MQRankSum=1.843;QD=9.60;ReadPosRankSum=-1.180;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr17	60363941	rs148555715	G	C	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.82;MQRankSum=0.838;QD=11.55;ReadPosRankSum=-0.485;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
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chr17	60366741	rs2668983	C	G	2064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.474;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.734;NF=23;NR=51;PP=1625;ReadPosRankSum=-1.298;SC=AGGACAGATACGAATGTGTTA;SOR=0.896;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=131;TCF=44;TCR=87;TR=74;WE=60366749;WS=60366731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,75:0.56:133
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chr17	60758273	rs2245463	G	C	2424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.022;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=51;PP=1777;ReadPosRankSum=0.713;SC=AGCTGACCTCGGTGCACAGCC;SOR=0.514;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=219;TCF=118;TCR=101;TR=105;WE=60758281;WS=60758263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,105:0.48:220
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chr17	60759347	rs2460300	A	G	3338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=6.645;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.53;ReadPosRankSum=-0.085;SOR=0.969;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,91:0.42:215
chr17	60759796	rs111736142	A	G	1206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.797;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=38;PP=990;ReadPosRankSum=-1.870;SC=GAACAGGGAAAGGCTGAGCCT;SOR=0.962;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=108;TCF=27;TCR=81;TR=49;WE=60759804;WS=60759786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,49:0.44:111
chr17	60766224	rs2465430	A	G	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.820;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=265;ReadPosRankSum=1.612;SC=CCAGCTGTGCAGTGGTCCTGC;SOR=2.348;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=43;TCR=2;TR=18;WE=60766232;WS=60766214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,19:0.40:47
chr17	60766483	rs2465429	A	G	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.388;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=349;ReadPosRankSum=-0.099;SC=TGGAAAAGCAATAGCACCCAC;SOR=0.077;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=18;WE=60766491;WS=60766473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,18:0.49:37
chr17	60767015	rs2429387	G	A	2397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.558;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=51;PP=1876;ReadPosRankSum=-0.040;SC=TGTGAGAGCCGCAATGCCAGC;SOR=0.722;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=181;TCF=90;TCR=91;TR=97;WE=60767023;WS=60767005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,97:0.53:183
chr17	60767135	rs56288724	A	G	1908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.557;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=39;PP=1498;ReadPosRankSum=0.364;SC=GGCTCCCGACACTTTTGCCCT;SOR=0.532;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=183;TCF=101;TCR=82;TR=84;WE=60767143;WS=60767125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,84:0.46:184
chr17	60767461	rs2465426	C	G	1761.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.751;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=20;PP=1364;ReadPosRankSum=0.364;SC=CATGGGCAAGCTGTCGGTGGC;SOR=0.818;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=108;TCF=71;TCR=37;TR=61;WE=60767469;WS=60767451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,64:0.57:112
chr17	60767953	rs11357719	GC	G	2226.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.163;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=12;PP=1388;ReadPosRankSum=0.040;SC=GGGGGACTCTGCCCCCCCCGG;SOR=0.390;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=150;TCF=125;TCR=25;TR=75;WE=60767961;WS=60767943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,90:0.60:151
chr17	60768243	rs2465425	A	G	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.403;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=902;ReadPosRankSum=0.764;SC=TCTAGAACACACCTGCTCTCC;SOR=0.484;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=65;TCR=45;TR=53;WE=60768251;WS=60768233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,54:0.47:116
chr17	60769406	rs35688424	T	C	769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.295;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=1;PP=577;ReadPosRankSum=1.525;SC=GTGCTTTGTATGTTTACTTAA;SOR=1.467;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=51;TCF=48;TCR=3;TR=28;WE=60769414;WS=60769396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr17	60769803	rs3826537	A	G	1026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=27;PP=790;ReadPosRankSum=-0.974;SC=TGAATGAGCAACAAGAATAGA;SOR=0.693;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=80;TCF=27;TCR=53;TR=42;WE=60769811;WS=60769793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,43:0.50:86
chr17	60779025	rs2251391	A	G	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.602;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=20;PP=904;ReadPosRankSum=-0.885;SC=AAGGGCTGGCAGGAGAGGTCT;SOR=1.175;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=118;TCF=69;TCR=49;TR=56;WE=60779033;WS=60779015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,56:0.46:121
chr17	60813550	rs147046907	G	A	3332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=61;PP=2609;ReadPosRankSum=0.319;SC=TAAGAGATCTGTATATAGTGG;SOR=0.714;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=285;TCF=145;TCR=140;TR=125;WE=60813558;WS=60813540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:164,131:0.44:295
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chr17	61087073	rs16946713	A	G	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.411;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=549;ReadPosRankSum=-0.134;SC=GTAACACTTTATTAATGCTTA;SOR=0.174;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=49;TCF=4;TCR=45;TR=27;WE=61087081;WS=61087063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,27:0.55:49
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chr17	61432774	rs4968765	A	G	937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=31;PP=761;ReadPosRankSum=-0.456;SC=TCTGTGATAAACAATTCTGAG;SOR=0.278;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=61;TCF=1;TCR=60;TR=32;WE=61432782;WS=61432764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,34:0.54:63
chr17	61457217	rs8065950	G	C	4304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.684;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=117;PP=2962;ReadPosRankSum=1.542;SC=CCATTTTTCCGCCATCTCTAG;SOR=0.498;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=312;TCF=72;TCR=240;TR=156;WE=61457225;WS=61457207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,164:0.51:321
chr17	61473325	rs2270133	C	A	1837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-3.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.366;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=52;PP=1293;ReadPosRankSum=-0.058;SC=TTTTCAAGCTCTGTATTGAAG;SOR=0.968;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=134;TCF=34;TCR=100;TR=66;WE=61473333;WS=61473315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,74:0.50:149
chr17	61548918	rs4277405	C	T	3792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.716;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=57;PP=2962;ReadPosRankSum=0.167;SC=GGGAGCCCTGCCATGCCATGT;SOR=0.533;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=270;TCF=169;TCR=101;TR=146;WE=61548926;WS=61548908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,148:0.53:277
chr17	61548948	rs4459609	C	A	4046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-8.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.543;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=64;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.039;SC=TATAGTATATCTATGCCCAGC;SOR=0.564;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=294;TCF=179;TCR=115;TR=160;WE=61548956;WS=61548938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,160:0.53:300
chr17	61556298	rs4295	C	G	1326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.885;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=6;PP=1150;ReadPosRankSum=0.070;SC=GCTCCTCCTTCTAGCAGCGAG;SOR=1.326;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=122;TCF=103;TCR=19;TR=53;WE=61556306;WS=61556288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,50:0.41:121
chr17	61556527	rs4296	A	G	2025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=59;PP=1765;SC=GCTGCACTCCAGACCATGCAG;SOR=6.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=60;TCF=1;TCR=59;TR=60;WE=61556535;WS=61556517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	61559923	rs4309	C	T	2413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.902;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=23;PP=1785;ReadPosRankSum=1.829;SC=AGGATCTGCCCGTCTCCCTGC;SOR=0.260;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=160;TCF=125;TCR=35;TR=85;WE=61559931;WS=61559913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,88:0.55:161
chr17	61560763	rs4311	T	C	3403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=33;PP=2631;SC=TCTACAAAAGTTAAATCCATC;SOR=1.524;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=65;TCR=33;TR=98;WE=61560771;WS=61560753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr17	61562309	rs4316	C	T	4025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=64;PP=2965;SC=TGCTGGTCCCCAGCCAGGAGG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=125;TCF=61;TCR=64;TR=125;WE=61562317;WS=61562299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr17	61562553	rs4320	G	A	3655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=97;NR=11;PP=2965;SC=AACCTGGAGAGGGGAGGCAGA;SOR=4.215;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=97;TCR=11;TR=108;WE=61562561;WS=61562543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr17	61562774	rs4321	T	C	13408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=429;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=133;NR=280;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.818;SC=AGCATGTGCATACACACAGAG;SOR=1.561;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=414;TCF=134;TCR=280;TR=413;WE=61562782;WS=61562764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,423:1.00:424
chr17	61564052	rs4331	A	G	9096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.110;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=185;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.872;SC=AACGGGCAGCACTGCCTGCCC;SOR=1.016;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=300;TCF=115;TCR=185;TR=299;WE=61564060;WS=61564042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,303:1.00:304
chr17	61564281	rs4332	T	C	3390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=22;PP=2791;SC=GGCCTGGGGGTAGTGCAGGCC;SOR=2.419;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=80;TCR=22;TR=102;WE=61564289;WS=61564271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr17	61564522	rs4333	T	C	2096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=55;PP=1722;SC=CAGAGTTGGGTTCCCCTCGCT;SOR=4.943;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=4;TCR=55;TR=59;WE=61564530;WS=61564512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	61565990	rs4341	G	C	7847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.89;SOR=2.944;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr17	61565998	rs4342	A	C	7945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.18;SOR=2.662;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr17	61566031	rs4343	G	A	6813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.456;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=139;NR=74;PP=2965;ReadPosRankSum=0.222;SC=TGATGGCCACGTCCCGGAAAT;SOR=1.252;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=214;TCF=139;TCR=75;TR=213;WE=61566039;WS=61566021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,225:1.00:226
chr17	61573761	rs4362	T	C	5050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=73;PP=2965;SC=CCAGGTACTTTGTCAGCTTCA;SOR=0.925;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=166;TCF=93;TCR=73;TR=166;WE=61573769;WS=61573751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr17	61574492	rs4363	G	A	1230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=15;PP=956;SC=CTTGCTTCCCGCTCAGCTCGC;SOR=1.151;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=38;WE=61574500;WS=61574482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	61660889	rs66502552	CG	C	4452.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=69;PP=2972;SC=TTAGCCGGGCCGGGGGGTGGC;SOR=0.721;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=139;TCF=64;TCR=75;TR=122;WE=61660897;WS=61660879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr17	61776479	rs1877317	T	C	2089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=27;PP=1778;SC=AGGCCCTGGATCAGGGCTGCA;SOR=1.044;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=37;TCR=27;TR=64;WE=61776487;WS=61776469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	61781331	rs3830487	T	TAGAACC	20727.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=518;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=149;NR=190;PP=2981;SC=GAACCAGAACTAGAACCAGAA;SOR=0.948;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=467;TCF=196;TCR=271;TR=339;WE=61781349;WS=61781321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,454:1.00:454
chr17	61781980	.	T	G	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.412;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=3.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.04;ReadPosRankSum=-0.543;SOR=2.115;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr17	61782325	rs9897229	T	C	1911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=41;PP=1493;SC=TCTGCCATGCTCAGGTGGATC;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=16;TCR=41;TR=57;WE=61782333;WS=61782315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	61783908	rs3817182	A	G	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=440;SC=TAGTATTCCTAGTCTGTGTCC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=61783916;WS=61783903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	61790917	rs16947051	G	C	4543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=115;PP=2965;SC=CCATACGCAAGGACAAGAACA;SOR=2.273;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=156;TCF=40;TCR=116;TR=155;WE=61790925;WS=61790907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr17	61805607	rs2137144	G	A	5897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=86;PP=2965;SC=CGACCCTCACGTAGAAAACCA;SOR=0.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=97;TCR=86;TR=183;WE=61805615;WS=61805597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr17	61805747	rs4968597	G	A	2294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=53;PP=1846;SC=TACTGTGTAGGCCTACTTCAG;SOR=2.737;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=69;TCF=14;TCR=55;TR=67;WE=61805755;WS=61805737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	61829157	rs11283431	A	ATAGTGTT	5221.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=79;NR=0;PP=2974;SC=ATTCTTCTTTATAGTGTTATC;SOR=9.308;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=115;TCF=112;TCR=3;TR=79;WE=61829165;WS=61829147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr17	61829989	rs3785572	C	T	3203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=86;NR=4;PP=2541;SC=TAAGCAAGCACAGGCTTATAG;SOR=5.158;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=90;TCF=86;TCR=4;TR=90;WE=61829997;WS=61829979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr17	61838196	rs374704881	CA	C	223.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQRankSum=0.990;QD=4.66;ReadPosRankSum=0.813;SOR=1.143;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr17	61838259	rs11654841	G	A	7083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=145;NR=71;PP=2965;SC=GAAAACCAGCGGGAAGAATAC;SOR=1.599;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=216;TCF=145;TCR=71;TR=216;WE=61838267;WS=61838249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr17	61842167	.	A	G	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=121;ReadPosRankSum=0.731;SC=ATAACCTTCAAATTCTTCATC;SOR=0.794;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=35;TCF=18;TCR=17;TR=11;WE=61842175;WS=61842157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr17	61882627	.	C	G	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.686;ClippingRankSum=0.000;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=37;PP=774;ReadPosRankSum=-0.593;SC=CCTTGAATTTCTTTTCTAATG;SOR=1.170;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=88;TCF=1;TCR=87;TR=37;WE=61882635;WS=61882617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,37:0.42:88
chr17	61884120	rs2251164	G	A	1691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=51;PP=1439;SC=GTAGAACCTTGTTGATAAGGA;SOR=7.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=0;TCR=51;TR=51;WE=61884128;WS=61884110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	61888693	rs2584629	T	A	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=25;PP=754;SC=GGGATAGACGTAACAAGACTG;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=61888701;WS=61888683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	61889213	rs3217509	G	GA	7446.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.09;NF=101;NR=85;PP=2936;SC=GATGCAGGTAGAAATATAATG;SOR=1.144;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=195;TCF=109;TCR=86;TR=186;WE=61889221;WS=61889203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr17	61892862	rs2247435	G	A	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=6;PP=667;SC=CTTTGTCCTCGTTCTCTTCTT;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=61892870;WS=61892852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	61898063	rs3833114	C	CGCTTGAACCTGGAAGACGG	986.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=2957;SC=CAAGGAGAATCAGGCTGCAGT;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=61898071;WS=61898053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	61898135	rs2665836	C	A	1927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=18;PP=1691;SC=ATCTCAAAAACAAAAAATTAC;SOR=1.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=61;WE=61898143;WS=61898125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	61901197	rs2727288	T	A	6918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=164;NR=58;PP=2965;ReadPosRankSum=0.487;SC=CGGATGGTGCTCAAGGAGAAC;SOR=1.085;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=223;TCF=165;TCR=58;TR=222;WE=61901205;WS=61901187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,226:1.00:227
chr17	61901439	rs2584627	T	C	6475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.995;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=131;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.747;SC=CCCAGCTCCTTTCACCTCTTC;SOR=1.605;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=63;TCR=131;TR=193;WE=61901447;WS=61901429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,198:0.99:199
chr17	61901641	rs894407	T	C	7949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.316;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=65;PP=2965;ReadPosRankSum=1.003;SC=TTCCCAGACTTTTCCCCTGGA;SOR=1.162;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=114;TCR=66;TR=179;WE=61901649;WS=61901631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,180:0.99:181
chr17	61901657	rs894406	A	G	8601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=128;NR=75;PP=2965;SC=CTGGACACCCAGTCCACACCT;SOR=1.318;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=128;TCR=75;TR=203;WE=61901665;WS=61901647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr17	61902822	rs716880	C	G	12823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=253;NR=123;PP=2965;SC=AATTAGTTGACGCACTCTGCA;SOR=1.667;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=379;TCF=255;TCR=124;TR=376;WE=61902830;WS=61902812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,379:1.00:379
chr17	61903445	rs2584625	G	C	2525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=10;PP=1987;SC=GTGATGTCCTGCTGGAGAGTC;SOR=3.116;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=60;TCR=10;TR=70;WE=61903453;WS=61903435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	61904337	rs141581810	TCCACTTCCAGTTTC	T	1884.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=17;PP=2973;SC=AGCACCAGATTCCACTTCCAG;SOR=2.147;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=52;TCF=4;TCR=48;TR=18;WE=61904358;WS=61904327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	61904465	rs28362566	C	CG	608.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=766;SC=ATGCAGCTAACTACTTCCGCT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=61904473;WS=61904455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	61904724	rs2665834	T	C	5164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.52;SOR=2.262;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr17	61904728	rs2727287	G	A	5313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.03;SOR=2.073;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr17	61906679	rs2584623	G	A	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=229;SC=AGGTCCAGAGGGACTCTTGAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=9;WE=61906687;WS=61906669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	61906846	rs2665833	T	C	3673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=45;PP=2580;SC=GTCTCTTGTCTGCCACAGCTG;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=124;TCF=78;TCR=46;TR=123;WE=61906854;WS=61906836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr17	61908055	rs55833669	CT	C	1322.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=46;NR=6;PP=846;SC=CTTGATGTTCCTTTTTTTTTT;SOR=3.570;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=74;TCF=63;TCR=11;TR=52;WE=61908075;WS=61908045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	61908271	rs968719	C	T	5380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.362;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.126;SC=TGGCTCTGAACTGGTACAGAA;SOR=0.499;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=163;TCF=76;TCR=87;TR=161;WE=61908279;WS=61908261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,166:0.99:167
chr17	61908556	rs13030	C	T	7078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=103;PP=2965;SC=TCAACCAGCTCGACGGCTTTG;SOR=0.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=107;TCR=104;TR=210;WE=61908564;WS=61908546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr17	61912261	rs2665832	C	T	603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=16;PP=490;SC=CCTGGAGCTCCGGATACTGAA;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=61912269;WS=61912251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	61919723	rs2665799	A	G	49.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	62020572	.	CAG	C	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.406;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=3.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.62;ReadPosRankSum=-0.768;SOR=0.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,4:0.18:22
chr17	62022659	rs58028318	A	AG	2548.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=12;PP=2963;SC=GTACAACGAGAGGACCGGGGT;SOR=2.932;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=75;TCF=60;TCR=15;TR=67;WE=62022667;WS=62022649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr17	62041068	rs6504191	T	C	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=5;PP=825;SC=TCTCCGCTGCTGCTCTGCCTC;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=35;WE=62041076;WS=62041058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	62041317	rs2331408	G	T	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=14;PP=437;SC=CAAACTTAGTGCAGGTGGGGG;SOR=2.531;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=62041325;WS=62041307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	62042078	rs2877373	T	C	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=10;PP=298;SC=TCCCATGACGTCCACCTCCTT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=62042086;WS=62042068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	62045298	.	A	AC	2192.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.423;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.531;NF=64;NR=14;PP=1473;ReadPosRankSum=-0.759;SC=CATCTCAAAAAAAAAAAAAAA;SOR=0.981;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=86;TCF=72;TCR=14;TR=78;WE=62045306;WS=62045288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,76:0.97:78
chr17	62048467	rs2302236	A	G	2559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=41;PP=1881;SC=CCAGGCCTGCACATGGTACGG;SOR=0.715;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=45;TCR=41;TR=86;WE=62048475;WS=62048457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	62049235	rs9892013	A	G	3060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=58;PP=2432;SC=GCCGGCCGGGACAGGCATGTC;SOR=1.313;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=36;TCR=58;TR=94;WE=62049243;WS=62049225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	62075847	.	T	G	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=4.064;ClippingRankSum=0.000;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.774;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=25;PP=991;ReadPosRankSum=0.246;SC=TGGGGAGCTGTCCCTGGAGGG;SOR=0.571;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=99;TCF=50;TCR=49;TR=47;WE=62075855;WS=62075837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,46:0.47:97
chr17	62075994	rs76735942	G	GA	636.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.455;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=556;ReadPosRankSum=0.450;SC=CACTGGCCGGGGGGGTTGGGG;SOR=1.230;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=50;TCF=22;TCR=28;TR=19;WE=62076002;WS=62075984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,21:0.41:51
chr17	62076077	rs62070903	C	G	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.191;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=13;PP=542;ReadPosRankSum=0.365;SC=CCCTGGGTCACCTTCCTGCAG;SOR=0.721;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=47;TCF=26;TCR=21;TR=30;WE=62076085;WS=62076067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,32:0.68:47
chr17	62079286	rs12939821	G	A	1456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.662;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=41;PP=1058;ReadPosRankSum=-0.685;SC=ATCAGTCCCTGCCCCACGCCA;SOR=0.578;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=139;TCF=46;TCR=93;TR=63;WE=62079294;WS=62079276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,67:0.47:143
chr17	62079334	rs11079520	A	G	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.078;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=34;PP=886;ReadPosRankSum=0.128;SC=GCTGTTGTGTAAGAGCTCCCT;SOR=1.402;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=80;TCF=21;TCR=59;TR=43;WE=62079342;WS=62079324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,43:0.54:80
chr17	62080969	rs4141180	A	C	4179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=39;PP=2965;SC=AAAGTGACTTATCACTCCCAA;SOR=1.900;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=93;TCR=39;TR=132;WE=62080977;WS=62080959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr17	62083929	rs6504194	A	G	7596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=156;NR=107;PP=2965;SC=CACAGGGAACAGGGCACCCCC;SOR=1.115;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=263;TCF=156;TCR=107;TR=263;WE=62083937;WS=62083919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,263:1.00:263
chr17	62121480	rs196912	T	C	5822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=96;PP=2965;SC=GGAAGCGAGATGTGAAGTAGC;SOR=0.754;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=107;TCR=96;TR=203;WE=62121488;WS=62121470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr17	62122145	rs196915	A	G	1889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=6;PP=1506;SC=AAGATTTATAAAGAATGGATG;SOR=3.690;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=48;TCR=6;TR=54;WE=62122153;WS=62122135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	62122237	.	G	A	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.161;ClippingRankSum=0.000;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=3.097;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.96;ReadPosRankSum=-0.566;SOR=0.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,25:0.25:101
chr17	62122677	rs196917	G	A	3159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=3;PP=2643;SC=AGGCGGCAGCGACTTTTGCAA;SOR=6.316;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=95;TCF=92;TCR=3;TR=95;WE=62122685;WS=62122667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	62123022	rs196918	C	T	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=17;PP=475;SC=CTGTTCCTCACGAAGCACAGG;SOR=4.294;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=62123030;WS=62123012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	62125272	rs196923	A	G	5469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=116;NR=70;PP=2965;SC=GTTTGAGCACATGCTTCGCTG;SOR=1.305;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=186;TCF=116;TCR=70;TR=186;WE=62125280;WS=62125262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr17	62130389	rs10689374	G	GCCT	1672.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=31;PP=1699;SC=GCAACCCCAGGCCTCCTCCAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=31;WE=62130397;WS=62130379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	62130937	rs196929	T	C	798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=654;SC=CTCAAGTTCATTGCCTCATAT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=62130945;WS=62130927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	62132309	rs196931	C	T	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=11;PP=351;SC=AGGCACTGCACCCCAGACTGC;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=14;WE=62132317;WS=62132299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	62141455	rs187826	A	G	3228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=69;PP=2561;SC=CCTTGTCCCCAATGGTGACGC;SOR=1.655;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=35;TCR=69;TR=104;WE=62141463;WS=62141445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr17	62145672	rs196939	A	G	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=29;PP=1201;SC=CAGACCAGCCAGCCCATTACC;SOR=1.203;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=46;WE=62145680;WS=62145662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	62145728	rs196940	A	G	1214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=27;PP=949;SC=TTATCTAATTATAACAAACAA;SOR=2.133;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=37;WE=62145736;WS=62145718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	62152611	rs5821420	T	TA	830.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FS=12.071;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.948;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.730;SOR=2.910;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,59:0.81:73
chr17	62156933	rs196947	T	C	1019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=1;PP=842;SC=AAGCTCCAGGTGGGAGACACA;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=62156941;WS=62156923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	62158012	rs196950	T	C	3243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=13;PP=2717;SC=AGACTTTATATGTCACTCACT;SOR=3.589;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=101;TCF=88;TCR=13;TR=100;WE=62158020;WS=62158002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr17	62158278	rs196951	T	C	3076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=105;PP=2625;SC=TTCTCCCTCCTGTTAACCTAC;SOR=6.556;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=108;TCF=3;TCR=105;TR=108;WE=62158286;WS=62158268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr17	62158300	rs196952	C	T	2290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=68;PP=1942;SC=TGGGCTAGTGCACGTGAAGGT;SOR=7.112;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=69;TCF=1;TCR=68;TR=69;WE=62158308;WS=62158290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	62158319	rs196953	T	C	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=49;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=43;PP=1332;SC=GTTATATGCATTTTTGTATCA;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=43;WE=62158327;WS=62158309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	62254983	rs1967130	G	A	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=511;SC=GTCCCACATTGTATTGGTGAC;SOR=4.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=62254991;WS=62254973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	62463825	rs199721035	T	TG	1449.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=33;PP=1663;SC=CTGAGGCAGGTGATTACTTGA;SOR=3.556;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=36;WE=62463833;WS=62463815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	62512913	.	C	A	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-5.294;ClippingRankSum=0.000;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.735;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=642;ReadPosRankSum=-0.687;SC=ACTAAAGAATCTAAATCATCA;SOR=0.292;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=123;TCF=35;TCR=88;TR=39;WE=62512921;WS=62512903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,40:0.31:129
chr17	62754586	rs9908143	T	C	7932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=140;PP=2965;SC=TAAGTTTTCATCCCTTTCCAA;SOR=1.125;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=240;TCF=97;TCR=143;TR=237;WE=62754594;WS=62754576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr17	62757972	rs184401952	T	C	1748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=9;PP=1270;ReadPosRankSum=-2.516;SC=TCATGATTAATAGGCTAGTAT;SOR=0.659;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=121;TCF=105;TCR=16;TR=64;WE=62757980;WS=62757962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,67:0.52:129
chr17	62758984	rs11374577	G	GC	1093.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=1179;SC=TAAGTTAAAAGTAAAGCTAAT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=26;WE=62758992;WS=62758974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	62782689	rs6504255	T	C	3306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=26;PP=2683;SC=GCATACCTGATTGTGGTGTCA;SOR=2.147;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=101;TCF=75;TCR=26;TR=100;WE=62782697;WS=62782679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr17	62924044	rs6504263	G	A	1729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.37;QD=32.03;SOR=5.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	62950679	.	C	A	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.177;ClippingRankSum=0.000;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=16.923;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.89;ReadPosRankSum=0.476;SOR=3.585;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,29:0.25:118
chr17	62952689	rs3960389	C	G	2575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.70;QD=32.60;SOR=0.881;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr17	63049698	rs41300618	T	C	3720.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.875;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=80;PP=2962;ReadPosRankSum=0.823;SC=CAGGAAGATATTGTAAGAAAA;SOR=0.763;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=292;TCF=130;TCR=162;TR=142;WE=63049706;WS=63049688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,143:0.47:302
chr17	63052344	rs12945514	G	T	206.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=158;SC=GCGACACAGCGGACCAGGGCG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=63052352;WS=63052334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	63052361	rs7216195	C	G	288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=218;SC=GGCGGTGCCCCGCCCCGCACC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=63052369;WS=63052351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	63133804	rs2585858	A	G	3184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=53;PP=2412;SC=AGGAGTGGAGAGCACCCCTTT;SOR=0.791;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=48;TCR=53;TR=101;WE=63133812;WS=63133794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr17	63149361	rs16960673	A	C	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=252;ReadPosRankSum=-2.362;SC=GTGTCTGTGGAGCACACCTTA;SOR=0.307;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=13;WE=63149369;WS=63149351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr17	63532767	rs28684769	C	G	1563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.727;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=50;PP=1238;ReadPosRankSum=1.738;SC=CTATTCTGCTCAGAGAGAGAG;SOR=1.479;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=111;TCF=14;TCR=97;TR=54;WE=63532787;WS=63532757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,57:0.50:113
chr17	63532914	rs28760438	A	G	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=141;ReadPosRankSum=2.007;SC=CTGCAAAAACAGCCATTCCCA;SOR=0.892;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=9;WE=63532922;WS=63532904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr17	63533423	rs7219582	C	A	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=6;PP=884;ReadPosRankSum=0.585;SC=CGGGACACTGCGGTCCGCCCG;SOR=0.593;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=69;TCF=59;TCR=10;TR=38;WE=63533431;WS=63533413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,39:0.57:69
chr17	63533768	rs1133683	G	A	1543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.409;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=28;PP=1205;ReadPosRankSum=1.527;SC=AGCGGGAGCGGGGGCTATAGC;SOR=0.559;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=113;TCF=55;TCR=58;TR=59;WE=63533776;WS=63533758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,60:0.52:115
chr17	63533789	rs9915936	T	C	3910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=57;PP=2587;SC=GGCCTACGCCTGGAGACTGGC;SOR=0.912;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=49;TCR=58;TR=106;WE=63533797;WS=63533779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr17	63534036	rs76682777	AC	A	1697.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.389;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.809;NF=7;NR=37;PP=1722;ReadPosRankSum=-0.606;SC=TCGGCTCCCTACGCAGGAGCA;SOR=0.161;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=71;TCF=10;TCR=61;TR=44;WE=63534044;WS=63534026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,49:0.62:79
chr17	63534250	rs8078753	T	C	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=4;PP=1068;SC=ACGCACCCCATGCACATGCGC;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=39;WE=63534258;WS=63534240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	63534478	rs35399989	G	A	1249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.873;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=36;PP=1090;ReadPosRankSum=0.247;SC=GACGTGGAAAGGAAAGGGAGG;SOR=0.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=93;TCF=26;TCR=67;TR=49;WE=63534486;WS=63534468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,47:0.51:93
chr17	63534538	rs4541111	C	A	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=314;ReadPosRankSum=-0.212;SC=GAGCTTCCCGCACCAGGCGCT;SOR=0.458;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=16;WE=63534546;WS=63534528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr17	63537783	.	G	T	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=0.000;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.380;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=31;PP=626;ReadPosRankSum=-0.873;SC=AGGGCCACATGCTTCCATAGG;SOR=0.381;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=112;TCF=10;TCR=102;TR=35;WE=63537791;WS=63537773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,38:0.33:115
chr17	63554591	rs2240308	G	A	4459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.812;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.569;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=108;PP=2962;ReadPosRankSum=0.947;SC=GAAGAGACAGGCATGGGTTTG;SOR=0.558;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=310;TCF=106;TCR=204;TR=167;WE=63554599;WS=63554581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,171:0.54:314
chr17	64001925	rs1015098	G	A	704.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.428;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=20;PP=545;ReadPosRankSum=-1.858;SC=ATTGGAAGACGAGTAAAGTTT;SOR=1.781;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=28;WE=64001933;WS=64001915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr17	64002046	.	A	AATACT	72	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=1;NR=1;PP=72;QD=50.5;SC=GAATGATTTCAATACTATACT;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=2;WE=64002054;WS=64002036;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,2:0.25:8
chr17	64023483	rs11079627	A	G	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=363;ReadPosRankSum=0.699;SC=TGACAGAGCAAGACTCTGTCT;SOR=0.446;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=9;WE=64023501;WS=64023473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,9:0.26:35
chr17	64023493	rs35334393	T	TA	167.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.129;HP=9;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=384;ReadPosRankSum=0.502;SC=AGACTCTGTCTAAAAAAAAAG;SOR=1.402;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=11;WE=64023501;WS=64023473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,12:0.27:44
chr17	64023624	rs17704679	T	C	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.060;HP=6;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=764;ReadPosRankSum=-1.725;SC=ATTACCTTTTTTTCATAGATG;SOR=0.922;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=54;TCF=21;TCR=33;TR=34;WE=64023632;WS=64023614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,35:0.60:58
chr17	64023642	rs11079628	A	G	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=11;PP=297;ReadPosRankSum=-0.277;SC=ATGTGTTTTAAATGACTTTTC;SOR=0.612;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=17;WE=64023650;WS=64023632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,20:0.42:48
chr17	64023781	rs11079629	C	T	137.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=110;SC=TGTCAAACTTCAGTTCAGAGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=64023789;WS=64023771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	64024254	.	A	AT	694	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=15;NR=1;PP=694;QD=47.3653600294;SC=TCTACATCTCAAAGCATCAAT;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=16;WE=64024263;WS=64024253;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr17	64024255	rs56239919	A	T	952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=1;PP=442;SC=CTACATCTCAAAGCATCAATC;SOR=3.816;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=16;WE=64024263;WS=64024253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	64024303	rs4277386	G	A	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.280;HP=1;HapScore=2;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=534;ReadPosRankSum=-0.797;SC=TATACAATGCGATAAAAGAAT;SOR=1.445;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=43;TCF=40;TCR=3;TR=24;WE=64024311;WS=64024293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr17	64024340	rs9901053	T	C	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.334;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=2;PP=934;ReadPosRankSum=1.459;SC=CATTTCTGAGTTTTATTTTTT;SOR=2.108;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=70;TCF=63;TCR=7;TR=40;WE=64024348;WS=64024330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,40:0.55:73
chr17	64024375	rs9899985	G	A	1399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.854;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=13;PP=974;ReadPosRankSum=0.174;SC=TGATACATCTGAATCAAGAAA;SOR=0.880;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=96;TCF=70;TCR=26;TR=53;WE=64024383;WS=64024365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,55:0.55:100
chr17	64025093	rs11651820	G	A	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=65;ReadPosRankSum=0.524;SC=TTAAATACCAGTAAAAATTCC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=4;WE=64025101;WS=64025083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr17	64025331	rs11652766	A	G	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.094;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=494;ReadPosRankSum=1.503;SC=GCTCATAATCATTTACAAGAT;SOR=1.115;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=75;TCF=31;TCR=44;TR=32;WE=64025339;WS=64025321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,33:0.42:79
chr17	64025435	rs60700240	T	TTAATCA	236.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.531;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=119;ReadPosRankSum=0.241;SC=ATGAAATTTTTTAATCAGCTA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=3;WE=64025443;WS=64025425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr17	64025926	rs9908964	G	T	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=0;PP=845;SC=GCAGATAACTGATACAGTTAA;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=64025934;WS=64025919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	64049733	rs1401049	A	G	1863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=8.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.133;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=4;PP=1498;ReadPosRankSum=0.168;SC=GTAGGAAGGTAAAGTTTTTCT;SOR=0.892;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=137;TCF=126;TCR=11;TR=63;WE=64049741;WS=64049723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,67:0.47:143
chr17	64050007	rs11079637	G	A	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=393;ReadPosRankSum=-0.198;SC=GCTACATCAGGAAATCAAGAG;SOR=0.646;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=18;WE=64050015;WS=64049997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr17	64050062	rs1401048	G	A	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.029;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=142;ReadPosRankSum=-0.431;SC=GTAATTCAGCGGAAAAAATGG;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=64050070;WS=64050052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr17	64062830	rs908713	T	A	2148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=13;PP=1675;SC=ATCAAATTTTTTTCTCCACAT;SOR=2.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=53;TCR=13;TR=66;WE=64062838;WS=64062820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	64173170	rs2159557	A	G	1774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.65;ReadPosRankSum=1.605;SOR=0.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,69:0.53:130
chr17	64179231	rs11658189	T	G	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=3.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=321;ReadPosRankSum=0.828;SC=TTTTCTTCCATGTTGATAGTT;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=14;WE=64179239;WS=64179221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr17	64208229	rs190137879	T	A	2275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.613;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=30;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.573;SC=TGTGACATTTTGTGTGGAATC;SOR=0.612;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=154;TCF=99;TCR=55;TR=83;WE=64208238;WS=64208219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,87:0.55:159
chr17	64208230	rs6933	G	A	1770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.615;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=25;PP=2962;ReadPosRankSum=0.473;SC=GTGACATTTTGTGTGGAATCT;SOR=0.801;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=153;TCF=98;TCR=55;TR=71;WE=64208238;WS=64208219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,72:0.46:158
chr17	64208285	rs1801690	C	G	1574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.861;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=36;PP=1226;ReadPosRankSum=-0.283;SC=ATCAGTTTTCCAAAAAGCCAG;SOR=0.502;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=150;TCF=65;TCR=85;TR=66;WE=64208293;WS=64208275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,67:0.43:155
chr17	64208396	rs1558359	G	A	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.112;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=421;ReadPosRankSum=0.991;SC=TACATTTTACGAGTATATAGA;SOR=0.189;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=19;WE=64208404;WS=64208386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,21:0.49:43
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chr17	64216815	rs8178847	C	T	1850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.449;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=49;PP=1337;ReadPosRankSum=-1.267;SC=CTTATAAACACGAAGTGTTGC;SOR=0.551;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=39;TCR=106;TR=67;WE=64216823;WS=64216805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,73:0.48:151
chr17	64216854	rs52797880	A	G	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.709;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.102;NF=6;NR=33;PP=771;ReadPosRankSum=2.876;SC=TGGAGGGCAGATGATGGCTGG;SOR=0.307;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=86;TCF=11;TCR=75;TR=39;WE=64216862;WS=64216844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,42:0.46:91
chr17	64216870	rs79228460	T	G	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.656;HP=7;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=1.026;NF=4;NR=32;PP=775;ReadPosRankSum=0.115;SC=GCTGGGAAAATAAAGAACTAT;SOR=0.192;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=74;TCF=6;TCR=68;TR=36;WE=64216878;WS=64216860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,39:0.50:78
chr17	64216929	rs78195703	GA	G	208.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.046;NF=0;NR=13;PP=136;ReadPosRankSum=0.286;SC=TTTCCAGAAAGAAAAAAAAAA;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=13;WE=64216937;WS=64216919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr17	64219690	rs8178837	T	A	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=607;ReadPosRankSum=-0.805;SC=AGGATGAATATCCCCCACAAG;SOR=0.558;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=28;WE=64219698;WS=64219680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,28:0.56:50
chr17	64221994	rs35151038	C	CA	192.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=-0.683;QD=6.02;ReadPosRankSum=0.429;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr17	64222282	rs8178832	TA	T	546.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=27;PP=323;ReadPosRankSum=0.929;SC=TTCTTTGGGCTAAAAAAAAAC;SOR=0.873;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=89;TCF=5;TCR=84;TR=28;WE=64222290;WS=64222272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,31:0.39:79
chr17	64225529	rs8178822	G	T	3529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.413;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=86;PP=2683;ReadPosRankSum=0.738;SC=CTACCAAAGTGGTTTTCGTCT;SOR=0.597;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=293;TCF=107;TCR=186;TR=138;WE=64225537;WS=64225519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,144:0.47:309
chr17	64735035	rs5821506	C	CT	6383.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=127;PP=2975;SC=TGGAAACTTCCTTTTTTCCCC;SOR=1.216;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=216;TCF=62;TCR=154;TR=182;WE=64735043;WS=64735025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr17	64735143	rs4324167	G	A	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.987;NF=1;NR=37;PP=1900;ReadPosRankSum=0.522;SC=TGGGACTACAGGCACACACCA;SOR=0.668;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=77;TCF=2;TCR=75;TR=38;WE=64735165;WS=64735133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,39:0.49:79
chr17	64735157	rs9892696	T	C	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-6.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.074;HP=1;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.029;NF=2;NR=32;PP=1670;ReadPosRankSum=0.303;SC=CACACCACCATGCCTGGCTAA;SOR=0.094;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=68;TCF=2;TCR=66;TR=34;WE=64735165;WS=64735133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr17	64737717	rs3803821	T	A	2542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.145;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=31;PP=1903;ReadPosRankSum=-0.215;SC=TTTGAGAATGTAAAGTATACA;SOR=0.812;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=196;TCF=128;TCR=68;TR=95;WE=64737725;WS=64737707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,100:0.50:201
chr17	64738635	rs61761552	G	A	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.734;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=2;PP=674;ReadPosRankSum=-0.134;SC=AGTTAATATTGCCATTGAGCT;SOR=0.269;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=30;WE=64738643;WS=64738625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,31:0.65:48
chr17	64783081	rs6504459	G	A	9347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=309;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=182;NR=121;PP=2965;SC=GGCTGTTTCTGTCTGCAAAGG;SOR=1.142;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=303;TCF=182;TCR=121;TR=303;WE=64783089;WS=64783071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr17	64785191	rs11420909	T	TG	2792.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=59;PP=2957;SC=AGGAGGCCGGTGCCCCTGGCT;SOR=3.316;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=70;TCF=7;TCR=63;TR=66;WE=64785199;WS=64785181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	65104743	rs11653020	G	A	4256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=52;PP=2965;SC=TGGGTATGGAGCGCTGCCCTG;SOR=1.284;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=83;TCR=53;TR=135;WE=65104751;WS=65104733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr17	65116109	rs368328112	C	T	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.80;MQRankSum=-4.407;QD=9.70;ReadPosRankSum=-1.370;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr17	65119931	.	CTG	C	209.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.270;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.21;MQRankSum=-2.398;QD=9.12;ReadPosRankSum=-1.711;SOR=1.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr17	65119961	.	GTC	G	136	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=27;MQ=58.59;NF=8;NR=0;PP=136;QD=17.375;SC=GTGTGTGTGTGTCAGAGAGAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=8;WE=65119970;WS=65119951;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:24,8:0.25:32
chr17	65146219	.	G	C	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.575;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=42;PP=983;ReadPosRankSum=0.224;SC=TAAGAGTATTGAGTACTTTTA;SOR=1.807;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=85;TCF=4;TCR=81;TR=43;WE=65146227;WS=65146209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,44:0.52:85
chr17	65342066	rs17647947	T	C	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.705;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=518;ReadPosRankSum=-0.480;SC=ATATATCCATTTCAAATTTTA;SOR=1.785;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=20;WE=65342074;WS=65342056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,22:0.45:49
chr17	65528801	rs2304278	C	T	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=3;PP=601;SC=ATGTGGCTGCCTTCTCTTCTC;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=65528809;WS=65528791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	65548540	rs2916133	G	T	4052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=106;PP=2965;SC=GATTTACAGTGGATTATCCAA;SOR=3.611;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=122;TCF=16;TCR=106;TR=121;WE=65548548;WS=65548530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr17	65549847	rs2570046	A	G	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=24;PP=752;SC=GAATAATTCCAAGTCAGAAAT;SOR=2.910;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=65549855;WS=65549837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	65574283	rs2570035	A	G	4673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.813;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=59;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.533;SC=GCTAATGAAAATTTGCTTTTC;SOR=0.753;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=375;TCF=243;TCR=132;TR=174;WE=65574291;WS=65574273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:201,177:0.47:378
chr17	65574437	rs8082003	A	G	2376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.410;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=71;PP=1863;ReadPosRankSum=-1.449;SC=AGCACTTCTCACAGCCCCTCT;SOR=0.345;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=158;TCF=21;TCR=137;TR=84;WE=65574445;WS=65574427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,89:0.53:167
chr17	65665608	rs36013607	AT	A	466.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=2;PP=313;SC=AATTTCTTTGATTTTTTTTTT;SOR=3.816;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=19;WE=65665616;WS=65665598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	65714359	rs3760226	G	A	2557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=67;PP=2082;ReadPosRankSum=-0.795;SC=AGTGAGGTCTGGAATCTGGCT;SOR=5.004;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=69;TCF=1;TCR=68;TR=68;WE=65714367;WS=65714349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,74:0.99:75
chr17	65718798	rs5821454	TA	T	91.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=62.36;NF=0;NR=5;PP=75;SC=GAAATTTCTTTAAAAAAAAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=65718806;WS=65718788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	65718839	rs999043	C	T	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=80;SC=GTTGCCCTGTCACCCAGGCTT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=65718847;WS=65718829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	65720346	rs11654692	A	G	1128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=851;ReadPosRankSum=0.648;SC=GAGATTATAAATAGAGGATTG;SOR=0.622;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=37;TCF=12;TCR=25;TR=36;WE=65720354;WS=65720336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr17	65722849	rs3744268	G	A	1478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=45;PP=1312;SC=TTTTCATTTCGTTATTACCCA;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=45;WE=65722857;WS=65722839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	65730404	rs4790943	G	A	2181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=20;PP=1666;SC=ATATTTAACTGTAACTCCCCC;SOR=1.675;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=47;TCR=20;TR=67;WE=65730412;WS=65730394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	65732959	rs7223990	A	G	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=22;PP=757;SC=TATCCTTACAACTCTTAGAGC;SOR=1.839;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=65732967;WS=65732949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	65733119	rs3752647	T	C	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=4;PP=628;SC=GAGTGTTTCATATCCCTCTAA;SOR=3.352;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=65733127;WS=65733109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	65734514	rs1542610	A	G	6894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=172;PP=2965;SC=TCTTTATAGGATATAGTTATA;SOR=3.312;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=204;TCF=32;TCR=172;TR=204;WE=65734522;WS=65734504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr17	65735563	rs2286916	G	A	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=3;PP=380;SC=TTCAATCTTCGTGATGGGTTT;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=65735571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	65736725	rs11439892	C	CA	307.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.95;MQRankSum=-0.162;QD=14.66;ReadPosRankSum=1.801;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,19:0.90:21
chr17	65737016	rs34886243	CT	C	794.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.338;NF=1;NR=33;PP=567;ReadPosRankSum=-0.193;SC=AAAATAACTTCTTTTTTTTTT;SOR=4.351;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=59;TCF=1;TCR=58;TR=34;WE=65737024;WS=65737006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr17	65739627	rs10127	A	G	373.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=278;ReadPosRankSum=0.812;SC=TTCTGGATGCAAATTTTACTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=14;WE=65739635;WS=65739617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr17	65739789	rs2286917	A	G	2971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.70;SOR=1.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr17	65739797	rs2286918	A	T	2920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=3.701;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=42.95;ReadPosRankSum=1.590;SOR=0.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,67:0.99:68
chr17	65821481	rs12945266	C	T	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.050;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=157;ReadPosRankSum=-0.191;SC=AGCCCAGGCGCCCAGGGCTCC;SOR=0.495;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=8;WE=65821489;WS=65821471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr17	65822233	.	CGAGGAGGAG	C	669.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.852;NF=12;NR=3;PP=2979;ReadPosRankSum=-0.091;SC=ACCACGAGAGCGAGGAGGAGG;SOR=0.616;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=15;WE=65822249;WS=65822223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr17	65849927	rs2046323	T	G	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=5.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=0;PP=638;ReadPosRankSum=-1.143;SC=TGCTTCTTCGTATTATTTTAA;SOR=0.808;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=28;WE=65849935;WS=65849922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
chr17	65871559	rs9890629	G	A	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=335;ReadPosRankSum=0.760;SC=TAAAATGGCCGTTCAATGGAA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=17;WE=65871567;WS=65871549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr17	65871598	rs12451707	G	A	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=501;ReadPosRankSum=-1.010;SC=TTTAGTAGTTGACTGAATGTG;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=60;TCR=0;TR=25;WE=65871606;WS=65871588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,26:0.43:61
chr17	65882172	rs4318247	A	G	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=455;ReadPosRankSum=0.044;SC=TCCTAAAACAATTGTCTTTTC;SOR=0.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=54;TCR=0;TR=21;WE=65882180;WS=65882162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,21:0.37:57
chr17	65882457	rs8072824	T	A	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.061;NF=0;NR=41;PP=886;ReadPosRankSum=-1.877;SC=CATCCATTCCTTTAAAGGGAA;SOR=0.625;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=85;TCF=0;TCR=85;TR=41;WE=65882465;WS=65882447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,40:0.48:83
chr17	65887896	rs8079754	A	G	885.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.353;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=5;PP=693;ReadPosRankSum=-2.410;SC=GTTTTGGTGAAATAAGGTGGT;SOR=0.471;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=59;TCF=51;TCR=8;TR=30;WE=65887904;WS=65887886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr17	65906926	rs368956376	AT	A	1167.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=3.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.90;MQRankSum=-1.123;QD=16.00;ReadPosRankSum=-1.229;SOR=0.166;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,34:0.47:73
chr17	65906928	rs202228218	AT	A	170.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=5.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=5.549;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQRankSum=-0.469;QD=2.80;ReadPosRankSum=0.846;SOR=0.035;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,17:0.28:61
chr17	65918807	rs12600941	A	G	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=92;ReadPosRankSum=0.735;SC=GGCTGCTTTCATGATACAAAG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=7;WE=65918815;WS=65918805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr17	65944515	rs11870068	A	C	1265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-6.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=49;PP=963;ReadPosRankSum=-0.396;SC=TTAAAATTTCAGTATGTTTTC;SOR=1.139;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=101;TCF=13;TCR=88;TR=55;WE=65944523;WS=65944505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,56:0.55:102
chr17	65955651	rs8068790	T	C	5466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=61;PP=2965;SC=CTTTAATTGATAACAGGAAGA;SOR=1.479;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=174;TCF=113;TCR=61;TR=173;WE=65955659;WS=65955641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr17	65955758	.	T	TCCTCCAGCCCCTCCAGCC	1688.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=0.000;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=3.200;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.66;MQRankSum=3.636;QD=19.64;ReadPosRankSum=-0.026;SOR=0.376;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,37:0.43:86
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chr17	66036934	rs75756883	A	AT	1431.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.495;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.073;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=65;PP=1649;ReadPosRankSum=-0.155;SC=GTGTTTTTAGATTTTTTTTTG;SOR=0.507;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=154;TCF=54;TCR=100;TR=110;WE=66036951;WS=66036924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,73:0.49:148
chr17	66036943	rs141699894	T	TG	1719.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FS=8.261;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.25;MQRankSum=0.000;QD=9.72;ReadPosRankSum=0.788;SOR=0.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,80:0.45:177
chr17	66038181	rs62084696	C	G	1288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.743;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=13;PP=954;ReadPosRankSum=-1.055;SC=ACTTTTATTTCTCTTTTTGTT;SOR=1.241;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=131;TCF=89;TCR=42;TR=52;WE=66038189;WS=66038171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,54:0.40:135
chr17	66038556	rs62084697	G	A	1691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.621;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=49;PP=1202;ReadPosRankSum=0.930;SC=TAGTGACTTTGTCAAGTTTTG;SOR=0.227;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=116;TCF=18;TCR=98;TR=62;WE=66038564;WS=66038546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,66:0.55:120
chr17	66039350	rs4638	A	G	2557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=38;PP=1949;ReadPosRankSum=2.303;SC=ATCCAGAAGTATTAGCAGATA;SOR=0.722;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=199;TCF=114;TCR=85;TR=92;WE=66039358;WS=66039340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,97:0.48:204
chr17	66039618	rs35594666	G	A	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.934;NF=0;NR=14;PP=291;ReadPosRankSum=-1.348;SC=TCAGGAGTTCGAGACCAGCCT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=14;WE=66039626;WS=66039608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,14:0.45:31
chr17	66040400	rs138710933	C	G	2728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.514;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.98;MQRankSum=1.266;NF=79;NR=19;PP=2191;ReadPosRankSum=-0.820;SC=ATTTGTGCAACTGTTCTGAAA;SOR=1.037;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=159;TCF=124;TCR=35;TR=98;WE=66040408;WS=66040390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,99:0.61:162
chr17	66042639	rs138669765	T	A	1659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.696;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.840;NF=46;NR=12;PP=1265;ReadPosRankSum=1.440;SC=GATCAAAACGTTGTACCAGAA;SOR=1.437;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=138;TCF=96;TCR=42;TR=58;WE=66042647;WS=66042629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,63:0.43:145
chr17	66121807	rs1964244	C	T	2700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.648;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=38;PP=2053;ReadPosRankSum=1.974;SC=CAGCCTTAAACGACTGAAGAA;SOR=1.061;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=211;TCF=124;TCR=87;TR=104;WE=66121815;WS=66121797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,107:0.49:220
chr17	66122038	rs7210681	A	G	737.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQRankSum=2.262;QD=16.77;ReadPosRankSum=2.799;SOR=0.208;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr17	66124489	rs2240606	G	A	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.286;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=44;PP=1036;ReadPosRankSum=-1.637;SC=GTCCACAGCTGTATGCCCCAG;SOR=0.427;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=95;TCF=15;TCR=80;TR=53;WE=66124497;WS=66124479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,56:0.55:102
chr17	66195838	rs78733882	A	T	3440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.953;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=67;PP=2603;ReadPosRankSum=-0.472;SC=GAAGACTTGGAATGAGCTCCC;SOR=0.676;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=251;TCF=126;TCR=125;TR=133;WE=66195846;WS=66195828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,136:0.53:257
chr17	66265042	.	CA	C	33.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=4.172;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.79;MQRankSum=-2.789;QD=0.38;ReadPosRankSum=1.508;SOR=0.577;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,15:0.17:89
chr17	66364691	rs1558876	C	G	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=704;SC=TGTTTCAGCACCAGCGGGAGG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=66364699;WS=66364681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	66364749	rs1558877	T	C	2745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=1;PP=2312;SC=TGCCCTTACCTGTGACTCAGC;SOR=7.403;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=81;TCF=80;TCR=1;TR=80;WE=66364757;WS=66364739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr17	66364804	rs1558878	T	C	6190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=36;PP=2965;SC=TGCAGGGCTCTGGGAGATGGA;SOR=2.798;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=186;TCF=150;TCR=36;TR=186;WE=66364812;WS=66364794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,195:1.00:195
chr17	66416357	rs62000424	C	T	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=3;PP=755;ReadPosRankSum=0.112;SC=GATGGGAGCACGGGGCCTGAG;SOR=0.857;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=72;TCF=64;TCR=8;TR=35;WE=66416365;WS=66416347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,36:0.49:74
chr17	66420766	rs3785605	T	C	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.840;NF=0;NR=17;PP=338;ReadPosRankSum=-0.355;SC=CCTGTAATCCTAGCACTTTGG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=17;WE=66420774;WS=66420756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr17	66422158	rs12946747	A	G	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=252;ReadPosRankSum=0.232;SC=GTATGAGGCGAAGGTTTCCTT;SOR=0.542;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=29;TCF=18;TCR=11;TR=12;WE=66422166;WS=66422148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr17	66424923	rs1002446	C	T	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=7;PP=488;ReadPosRankSum=1.858;SC=GACAACTCTACACGACCAGCT;SOR=0.700;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=26;WE=66424931;WS=66424913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr17	66425995	rs3785610	T	G	2086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.40;SOR=6.316;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	66425995	.	TCC	GCT	2326	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=59.7;NF=38;NR=1;PP=2326;QD=61.0119967913;SC=CTCCCAAGGTTCCGGGATTAC;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=39;WE=66426005;WS=66425985;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,39:0.95:41
chr17	66425997	rs3785611	C	T	2086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.40;SOR=6.316;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	66429511	rs17672144	G	T	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=294;ReadPosRankSum=0.465;SC=AGCCAAGATTGGGTGTTCAGA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=13;WE=66429519;WS=66429501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr17	66430923	rs10445211	A	G	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=30;PP=657;ReadPosRankSum=-0.450;SC=TATGTGCCATATCAACAATTC;SOR=2.038;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=1;TCR=52;TR=30;WE=66430931;WS=66430913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,30:0.56:54
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chr17	66440791	rs11868531	C	A	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=23;PP=524;ReadPosRankSum=0.247;SC=CTGACCAAATCCAAATCATTC;SOR=1.127;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=25;WE=66440799;WS=66440781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr17	66446803	rs2302782	T	C	1032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.265;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=5;PP=789;ReadPosRankSum=-1.242;SC=TCTTGAAAGATGTCCATCTTT;SOR=1.382;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=83;TCF=70;TCR=13;TR=43;WE=66446811;WS=66446793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,42:0.51:82
chr17	66447073	rs2302783	T	C	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.649;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=98;ReadPosRankSum=-0.769;SC=TTACATGGATTGATCACTTCC;SOR=0.143;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=9;WE=66447081;WS=66447063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chr17	66449122	rs883541	G	A	1701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=27;PP=1366;SC=TTTAGTTCCAGTTGCTAGGGA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=24;TCR=27;TR=51;WE=66449130;WS=66449112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	66453305	rs71378928	C	G	1365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=29;NR=0;PP=780;SC=GTGGGGGGTGCGGCAAACCCC;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=66453313;WS=66453295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	66453320	rs67556103	A	C	1676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=0;PP=1149;SC=AACCCCACTGAAGGGGTACGG;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=66453328;WS=66453310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	66453410	rs71378929	C	T	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=16;PP=1057;ReadPosRankSum=-0.448;SC=CCACAAGCTGCTCTCAGGACG;SOR=0.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=90;TCR=33;TR=59;WE=66453418;WS=66453400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,59:0.49:121
chr17	66453572	rs146213184	GGCCCGGGAA	G	2344.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=35;PP=2941;SC=TCGGGGGCTCGGCCCGGGAAG;SOR=4.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=35;WE=66453588;WS=66453562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	66524987	rs2302230	G	A	1757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.944;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=23;PP=1349;ReadPosRankSum=-0.834;SC=ATACAGAGCAGTTATTTTGAT;SOR=0.946;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=146;TCF=92;TCR=54;TR=69;WE=66524995;WS=66524977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,71:0.46:155
chr17	66526027	rs2302231	G	T	940.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.071;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=26;PP=814;ReadPosRankSum=-1.018;SC=TTGAGAGTGTGTGTTTGTTTA;SOR=0.762;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=124;TCF=67;TCR=57;TR=49;WE=66526035;WS=66526017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,44:0.36:122
chr17	66526741	rs11540571	A	G	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=428;ReadPosRankSum=1.382;SC=TTATTGCACCATTTTCAATTT;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=18;WE=66526749;WS=66526731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,20:0.43:46
chr17	66533655	rs2907373	A	G	1415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.386;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=17;PP=1085;ReadPosRankSum=-0.776;SC=GTCTGGGGCCAACTGTTCCAC;SOR=1.121;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=142;TCF=100;TCR=42;TR=64;WE=66533663;WS=66533645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,65:0.45:144
chr17	66533979	rs2286556	C	G	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.101;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=170;ReadPosRankSum=-1.705;SC=AGCTGATACTCTTGGCGCCTC;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=8;WE=66533987;WS=66533969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr17	66536219	rs2286558	G	C	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=271;ReadPosRankSum=-0.084;SC=AGACAGGGGTGTGAACGAAGC;SOR=0.420;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=13;WE=66536227;WS=66536209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr17	66538239	rs2302234	G	T	2542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.001;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=37;PP=1987;ReadPosRankSum=1.185;SC=GCAGGTGTGGGTTGCCACAGA;SOR=0.784;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=254;TCF=161;TCR=93;TR=108;WE=66538247;WS=66538229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,108:0.42:257
chr17	66547829	rs200576196	AATT	A,AATTATT	424.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.555;NF=12,12;NR=0,0;PP=498,352;ReadPosRankSum=-0.745;SC=TAGTATTTTCAATTATTATTA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=12,12;WE=66547839;WS=66547819;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.43,0.50:14
chr17	66864420	rs187610484	C	T	1989.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.616;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=38;PP=1333;ReadPosRankSum=-2.952;SC=ATGGATGATACGAATCCCTAA;SOR=0.638;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=61;TCR=71;TR=71;WE=66864428;WS=66864410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,80:0.56:143
chr17	66872802	rs1481	G	C	2004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.530;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.976;NF=33;NR=46;PP=1432;ReadPosRankSum=0.026;SC=AGGTCTTCACGGGAGACTTCA;SOR=1.070;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=161;TCF=73;TCR=88;TR=79;WE=66872810;WS=66872792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,85:0.51:168
chr17	66877235	rs200431859	A	T	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=196;ReadPosRankSum=-1.862;SC=CCATTAGATAACATATTTTCC;SOR=0.914;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=10;WE=66877243;WS=66877225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr17	66880081	rs8080098	A	G	949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=22;PP=702;SC=TTCAATATCAAAGATATACTA;SOR=4.407;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=66880089;WS=66880071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	66880371	rs1470293	G	A	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=455;SC=ATAGATACCTGTATCTCTAAC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=66880379;WS=66880361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	66880405	rs3744492	T	C	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=191;ReadPosRankSum=-1.303;SC=TTTCACAGTGTGTACAGAACT;SOR=0.481;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=10;WE=66880413;WS=66880395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr17	66881456	rs143548476	C	T	1252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.075;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=39;PP=939;ReadPosRankSum=-0.317;SC=AATACAGTGACCTAAAAGAAG;SOR=0.970;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=97;TCF=12;TCR=85;TR=43;WE=66881464;WS=66881446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,48:0.46:104
chr17	66883367	rs113231105	G	C	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=547;ReadPosRankSum=1.006;SC=GGATTTTATAGTTCTTTAATT;SOR=0.638;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=24;WE=66883375;WS=66883357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr17	66883719	rs6501839	A	G	3284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=86;PP=2798;SC=AACTATTCAAACAAAACCTTT;SOR=4.025;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=9;TCR=87;TR=95;WE=66883727;WS=66883709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
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chr17	66899710	rs3744494	C	G	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=600;ReadPosRankSum=-0.935;SC=CTCTGCTAAGCATCTCATGAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=25;WE=66899718;WS=66899700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr17	66899725	rs3744495	C	G	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.55;ReadPosRankSum=0.913;SOR=0.655;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr17	66899733	rs3744496	C	T	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.04;ReadPosRankSum=1.548;SOR=0.606;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr17	66904031	rs140303260	GA	G	152.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.702;HP=14;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=85;ReadPosRankSum=0.309;SC=CTGGCATTCAGAAAAAAAAAA;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=5;WE=66904047;WS=66904021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr17	66904039	.	A	G	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.847;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=54;ReadPosRankSum=0.946;SC=CAGAAAAAAAAAAAAAGACAT;SOR=0.283;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=4;WE=66904047;WS=66904021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr17	66925116	rs4147980	G	A	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=2;PP=881;ReadPosRankSum=0.906;SC=GTTTGTAAATGATTACAGCCT;SOR=3.442;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=33;WE=66925124;WS=66925106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr17	66925910	rs4147977	T	C	4917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=107;PP=2965;SC=CTGAAATGGATTCTAAGATAA;SOR=5.247;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=7;TCR=107;TR=114;WE=66925931;WS=66925900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr17	66925923	rs4147976	C	T	4345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=94;PP=2792;SC=TAAGATAACTCTTCATTCACT;SOR=6.932;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=96;TCF=2;TCR=94;TR=96;WE=66925931;WS=66925900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr17	66936840	rs75002525	C	T	883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.012;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=0;PP=730;ReadPosRankSum=0.407;SC=TATAAATCTGCGGTCAAATAA;SOR=2.538;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=73;TCF=71;TCR=2;TR=34;WE=66936848;WS=66936830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,34:0.44:77
chr17	66938112	.	T	A	1267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.833;ClippingRankSum=0.000;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.159;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=35;PP=966;ReadPosRankSum=-0.767;SC=CTCCATTTTTTAAGAAAGTTC;SOR=1.754;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=125;TCF=56;TCR=69;TR=51;WE=66938120;WS=66938102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,53:0.40:132
chr17	66938141	rs35643726	G	C	1274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=25.537;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=37;PP=981;ReadPosRankSum=-0.785;SC=TAAGGCCCAAGTTTGTTGACA;SOR=2.448;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=122;TCF=47;TCR=75;TR=47;WE=66938149;WS=66938131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,51:0.40:129
chr17	66938232	rs4147958	A	G	1169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=33;PP=972;ReadPosRankSum=-0.938;SC=TTCTTAAGAAAAAGAAATATC;SOR=5.838;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=33;WE=66938240;WS=66938222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr17	66938260	rs4147957	A	G	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.509;HP=6;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=168;ReadPosRankSum=-1.230;SC=CAACAAAAAAACGTAGCCTAA;SOR=0.035;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=9;WE=66938268;WS=66938250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr17	66972364	rs72301477	A	ATT	700.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.390;HP=11;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=380;ReadPosRankSum=-0.644;SC=TAGGAATTCTATTTTTTTTTT;SOR=1.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=80;TCF=3;TCR=77;TR=24;WE=66972372;WS=66972354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,26:0.43:61
chr17	66982447	rs9916254	C	T	2465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.722;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=61;PP=1919;ReadPosRankSum=0.776;SC=TCCCCTCCACCGCTCCCTTTC;SOR=0.937;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=232;TCF=92;TCR=140;TR=98;WE=66982455;WS=66982437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,101:0.42:239
chr17	66985399	.	ACA	TCT	159	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5025;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=3;PP=159;QD=70.8226249541;SC=TCTCTCTCTCACACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=3;WE=66985409;WS=66985389;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr17	66986162	rs9902444	A	C	2689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=67;PP=2242;SC=TTTCCTTATAAAAAATCATGA;SOR=4.434;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=7;TCR=67;TR=74;WE=66986170;WS=66986152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr17	66987202	rs2302293	A	T	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=434;ReadPosRankSum=-0.018;SC=AGATTCATTCAGAGCACAACA;SOR=1.308;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=20;WE=66987210;WS=66987192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr17	67004072	rs7222838	T	C	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.368;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=743;ReadPosRankSum=-0.632;SC=AGTACTCATATTTACTCTTCA;SOR=0.395;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=61;TCF=17;TCR=44;TR=32;WE=67004080;WS=67004062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,34:0.54:63
chr17	67004483	rs72452413	ATAT	A	694.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.340;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=711;ReadPosRankSum=-0.981;SC=CCTTTTAGAAATATTATCCTG;SOR=0.158;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=16;WE=67004493;WS=67004473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr17	67012314	rs147704935	TATAAC	T	316.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=342;ReadPosRankSum=0.568;SC=CAAAAAGTAATATAACATTAT;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=8;WE=67012326;WS=67012304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr17	67017819	rs67786995	GTCCT	G	544.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=17.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.23;MQRankSum=1.251;QD=13.97;ReadPosRankSum=1.101;SOR=0.029;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr17	67020526	rs7221250	A	G	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.095;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.291;NF=10;NR=29;PP=783;ReadPosRankSum=0.163;SC=AGTTATTTTTATCCAACTGTG;SOR=1.174;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=82;TCF=25;TCR=57;TR=39;WE=67020534;WS=67020516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,43:0.50:86
chr17	67023295	rs9899818	G	A	2206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.622;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=56;PP=1719;ReadPosRankSum=-2.125;SC=CCACCCTTTCGGATAAGATCC;SOR=0.618;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=154;TCF=44;TCR=110;TR=80;WE=67023303;WS=67023285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,84:0.52:163
chr17	67023755	rs6501947	A	G	1488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=7;PP=1247;SC=TTTTATGGCTATGTGACATCT;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=42;WE=67023763;WS=67023745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	67024585	rs12940103	T	C	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=7;PP=1632;SC=GGATTACAGGTGTGAGCCACC;SOR=3.578;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=61;TCF=54;TCR=7;TR=60;WE=67024593;WS=67024575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	67024799	rs8066758	T	A	2440.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=76;PP=2530;SC=GGCATGATTTTAAAAAAAATT;SOR=4.021;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=11;TCR=76;TR=87;WE=67024807;WS=67024789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
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chr17	67031457	rs1860447	C	T	4396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=69;PP=2965;SC=TGCAGGAAGACGTGTATACAA;SOR=0.844;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=62;TCR=69;TR=131;WE=67031465;WS=67031447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr17	67040609	rs16973539	T	G	1549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.030;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=6;PP=1130;ReadPosRankSum=-1.833;SC=AAATGCAATGTGGTTAGATTC;SOR=0.129;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=86;TCF=79;TCR=7;TR=52;WE=67040617;WS=67040599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,55:0.62:88
chr17	67045452	rs61741903	G	T	2752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=59;PP=2070;ReadPosRankSum=0.992;SC=AAGCCACTTTGTTCATTATCT;SOR=0.673;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=217;TCF=91;TCR=126;TR=104;WE=67045460;WS=67045442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,110:0.48:231
chr17	67075072	rs2302290	G	A	212.28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5565;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=141;ReadPosRankSum=0.967;SC=CATAAAACATGAGTTTATAGG;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=67075080;WS=67075067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr17	67075294	rs2302289	C	T	5137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=64;PP=2965;SC=CAGGAAAATGCATGTTGCTTT;SOR=1.199;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=97;TCR=64;TR=161;WE=67075302;WS=67075284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr17	67080770	rs11657954	A	G	2572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=71;PP=2164;SC=CCTAACTCATAATTTTAAAAA;SOR=5.394;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=74;TCF=3;TCR=71;TR=74;WE=67080778;WS=67080760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	67080811	rs71144653	CT	C	576.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.9995;FS=0.000;HP=14;HapScore=3;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.471;NF=0;NR=28;PP=309;ReadPosRankSum=0.093;SC=ACATGAAAGACTTTTTTTTTT;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=28;WE=67080821;WS=67080801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr17	67081732	rs2302133	C	T	1870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=9;PP=1618;ReadPosRankSum=0.568;SC=TCATGAAATTCCTGTTTTGGA;SOR=1.981;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=60;TCF=51;TCR=9;TR=58;WE=67081740;WS=67081722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr17	67081830	rs2302134	T	C	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.636;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=27;PP=999;ReadPosRankSum=0.392;SC=TCCAGCACCATTGGGTCCTAG;SOR=0.711;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=94;TCF=46;TCR=48;TR=48;WE=67081838;WS=67081820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,51:0.52:98
chr17	67099129	rs2364315	A	G	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=510;SC=AGTTAATAAGAGAAGGCCATA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=67099137;WS=67099119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	67101718	rs7212506	C	T	276.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=5;PP=198;SC=ACATAGCATACATTATATTTT;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=67101726;WS=67101708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	67109662	rs11659091	G	A	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=4;PP=695;SC=CTCTCTTGATGCATTACAATG;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=67109681;WS=67109655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	67109673	rs7504026	A	G	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.444;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=410;ReadPosRankSum=0.188;SC=CATTACAATGAAAGCTCTACC;SOR=0.119;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=17;WE=67109681;WS=67109655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr17	67109894	rs9282552	C	T	1769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=44;PP=1297;SC=TGAGAAAATACGCAACTTTTA;SOR=4.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=5;TCR=44;TR=49;WE=67109902;WS=67109884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	67119593	rs4603621	G	C	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=25;PP=729;SC=AATAGTAAAAGAATGCGCAAA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=67119601;WS=67119583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	67125840	rs4968839	C	T	2838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=45;PP=2164;SC=ATAATTGTAACGAATATGGAA;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=40;TCR=45;TR=85;WE=67125848;WS=67125830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	67132022	rs7219200	T	C	2375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=5;PP=2021;SC=TGCATCTGCATGCTCAACACA;SOR=4.921;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=71;TCR=5;TR=74;WE=67132030;WS=67132012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	67150176	rs2886232	T	C	3474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=86;PP=2903;SC=AATGTCAGATTCACCTTTGGT;SOR=2.606;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=109;TCF=22;TCR=87;TR=108;WE=67150184;WS=67150166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr17	67151025	rs139743225	T	A	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.863;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=266;ReadPosRankSum=2.069;SC=TGCTGACATGTGAAGAAGTTT;SOR=0.031;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=10;WE=67151033;WS=67151015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr17	67152893	rs10605889	CAAAT	C	337.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=63.17;NF=5;NR=3;PP=344;SC=AAAACAAAAACAAATAAATAA;SOR=1.402;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=8;WE=67152904;WS=67152883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	67160186	rs7208382	T	C	3364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=45;PP=2649;SC=TTATGCAATATATATATTTAG;SOR=0.961;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=105;TCF=59;TCR=46;TR=104;WE=67160194;WS=67160176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr17	67170736	rs740520	A	G	1700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=24;SC=TGTGGAAAAAATGATCACTTA;SOR=0.813;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=24;TCR=24;TR=48;WE=67170744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	67171748	rs12940557	A	G	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=524;SC=GAAAAACTCTAGAAGCATTCA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=67171756;WS=67171738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	67178316	rs4968849	A	G	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=6;PP=964;SC=AGTGCTCTCCATTTGAATAAG;SOR=3.109;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=42;WE=67178324;WS=67178306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	67178954	rs4968851	C	T	1232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=27;NR=20;PP=895;SC=TTGATCCTAACATAGTGGAAG;SOR=0.919;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=48;TCF=27;TCR=21;TR=47;WE=67178962;WS=67178944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	67178976	rs60708995	GA	G	554.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.93;MQRankSum=0.000;QD=17.89;ReadPosRankSum=1.157;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr17	67181508	rs145177816	G	GGAGCAA	380.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=293;ReadPosRankSum=1.188;SC=ATTTGAAAATGGAGCAAGCTG;SOR=0.425;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=6;WE=67181516;WS=67181498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr17	67181540	rs11658738	C	A	1272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.40;QD=47.14;SOR=5.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	67181548	rs11655199	T	G	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.32;QD=39.96;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	67188576	rs8070232	A	G	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=474;SC=AGACATTTTGAGCTGTTTATT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=67188584;WS=67188566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	67188668	rs8074259	T	C	2198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.97;NF=56;NR=15;PP=1678;SC=CATATTAATATGCTCATTTAA;SOR=2.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=56;TCR=15;TR=71;WE=67188676;WS=67188658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	67193150	.	A	AGGGAGG	236.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5052;FS=4.228;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.420;NF=6;NR=1;PP=424;ReadPosRankSum=0.623;SC=CCGTGGACAGAGGGAGGGGGA;SOR=2.833;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=7;WE=67193158;WS=67193140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr17	67193168	rs12946689	A	G	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.58;MQRankSum=-1.393;QD=2.90;ReadPosRankSum=-0.097;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr17	67210992	rs11657804	T	C	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=254;ReadPosRankSum=-1.419;SC=AGGTGTGTAATCTGAGATTTA;SOR=0.223;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=14;WE=67211000;WS=67210982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr17	67211058	rs9909045	T	A	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=460;SC=CAATTTTTTTTAAAAAATAGT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=67211066;WS=67211048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	67212031	rs11077414	A	G	9758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=166;NR=124;PP=2965;SC=GAAGTTGTCTATATAACACAG;SOR=1.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=290;TCF=166;TCR=124;TR=290;WE=67212039;WS=67212021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,306:1.00:306
chr17	67212423	rs9909216	G	A	2886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=23;PP=2273;SC=AATACAATTGGGATTGATGTT;SOR=2.059;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=66;TCR=23;TR=89;WE=67212431;WS=67212413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	67212574	rs9912127	A	C	1654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=47;PP=1221;SC=GAAATGGTTAAGAGTAAAAGC;SOR=2.872;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=10;TCR=48;TR=57;WE=67212582;WS=67212564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	67215712	rs12941264	C	T	1895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=15;PP=1485;SC=GGAGACCCATCACTGTCATCA;SOR=2.041;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=42;TCR=15;TR=57;WE=67215720;WS=67215702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	67219703	rs11655507	G	A	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-6.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=539;ReadPosRankSum=0.694;SC=TATTAACTTTGTATCTCACTC;SOR=0.597;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=56;TCR=0;TR=26;WE=67219711;WS=67219693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr17	67220060	rs1468513	T	G	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=385;SC=GCTTACACTGTGCATACAGGA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=67220068;WS=67220050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	67245941	rs1420904	G	A	1482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=6;PP=1087;SC=TACAACATAAGTGCTTTTCAA;SOR=3.033;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=43;WE=67245949;WS=67245937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	67252245	rs116635853	C	T	2175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.905;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=9;PP=1853;ReadPosRankSum=0.804;SC=TTCTATATACCGGGAATTGAT;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=154;TCF=136;TCR=18;TR=77;WE=67252253;WS=67252235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,78:0.49:158
chr17	67260926	rs12449649	A	G	2367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=10;PP=1867;SC=TGAAATGCCAATAAGCTTCCT;SOR=3.040;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=54;TCR=10;TR=64;WE=67260934;WS=67260916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	67273882	rs536009	C	A	2280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=33;PP=1850;SC=CTCACTAGAGCAGCCTTGGTT;SOR=0.840;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=36;TCR=33;TR=69;WE=67273890;WS=67273872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr17	67274054	rs12452340	C	A	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=272;SC=GAAGCAGGAACATTTAAAGAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=67274062;WS=67274044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	67279959	rs56193366	C	CAGTA	289.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=330;SC=CTATCACTATCAGTATCTCAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=67279967;WS=67279949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	67280310	rs564426	A	C	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=270;SC=ACAGCCTGTGAAACATATCAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=67280318;WS=67280300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	67282332	rs1550828	T	C	5561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=126;NR=43;PP=2965;SC=GAGTATAATATAGAATAATGT;SOR=2.171;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=170;TCF=127;TCR=43;TR=169;WE=67282340;WS=67282322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr17	67283676	rs116888803	C	T	2104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.657;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=8;PP=1611;ReadPosRankSum=0.911;SC=CTATTTATACCTCAGGAATTA;SOR=0.327;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=167;TCF=152;TCR=15;TR=74;WE=67283684;WS=67283666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,78:0.45:174
chr17	67287327	rs34164530	G	GT	2652.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=11;PP=1790;SC=ATATAATGAAGTTTTTTTTTC;SOR=3.865;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=94;TCF=82;TCR=12;TR=82;WE=67287335;WS=67287317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	67293535	rs487382	A	G	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=27;PP=922;SC=GAGTTACCATAATTAGTTTTT;SOR=3.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=67293543;WS=67293525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	67297176	rs12938097	T	C	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=579;SC=GAATATGACTTAGGGTACCCT;SOR=4.003;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=21;WE=67297184;WS=67297166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	67502138	rs2074027	G	A	1104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=37;PP=830;ReadPosRankSum=-1.218;SC=ACCTGAAATAGTCATCTTATC;SOR=1.098;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=0;TCR=64;TR=37;WE=67502146;WS=67502128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,40:0.59:68
chr17	67516340	.	G	GT	510.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.534;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=-1.777;QD=7.30;ReadPosRankSum=0.803;SOR=0.992;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,27:0.39:70
chr17	69334553	rs4401085	G	C	1802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=16;PP=1348;SC=GTGTCTAGGTGTGGTTACTTT;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=54;WE=69334561;WS=69334543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	69334971	.	TATTTC	T	2920.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.16;MQRankSum=-0.591;QD=41.72;ReadPosRankSum=0.768;SOR=5.699;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,69:0.99:70
chr17	69334972	.	A	C	1619	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;FR=1.0000;HP=7;HapScore=1;MGOF=40;MMLQ=29;MQ=56.0;NF=1;NR=53;PP=1619;QD=30.6253928249;SC=TGTTTCTTTTATTTCCTTTCT;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=54;WE=69334980;WS=69334962;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr17	69334981	.	CTTTCTTTCTTCCTTCCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTT	C,CCTTTCTTTCTTTCTTTCTTT	2756.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.547;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=56.22;MQRankSum=-1.067;QD=86.15;ReadPosRankSum=1.411;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,16,15:0.50,0.47:32
chr17	70118935	rs2229989	C	T	2093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.697;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=21;PP=1725;ReadPosRankSum=-0.733;SC=AGAAGGACCACCCGGATTACA;SOR=0.989;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=220;TCF=164;TCR=56;TR=90;WE=70118943;WS=70118925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,88:0.40:219
chr17	70845688	rs12449747	C	A	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=0;PP=486;SC=ACAATTGCCCCTTCCCCTTTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=70845696;WS=70845678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	70846027	rs4998297	G	A	2719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=71;PP=2289;SC=AGCTACAGCAGGAAGAAGCTT;SOR=4.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=7;TCR=71;TR=78;WE=70846035;WS=70846017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	70846116	rs4436821	C	T	565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=450;SC=CACTGCAGCCCCAACTTCCCG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=70846124;WS=70846106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	70943990	rs2466517	T	C	3569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=49;PP=2641;SC=AGTGCCAGGGTCGTCTGGGGG;SOR=0.881;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=58;TCR=49;TR=106;WE=70943998;WS=70943980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr17	71027543	rs9912666	G	A	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=374;SC=AGAAATCACCGATCAGTTCCT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=71027551;WS=71027533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	71081078	rs9891809	G	A	6501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=136;PP=2965;SC=AAAGAGCCACGCAAATAAAGA;SOR=1.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=200;TCF=64;TCR=136;TR=200;WE=71081086;WS=71081068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr17	71166701	rs7220818	A	G	2282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.575;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=33;PP=1812;ReadPosRankSum=0.890;SC=CATGAGTCCAATTCAGAGAAC;SOR=0.455;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=181;TCF=117;TCR=64;TR=87;WE=71166709;WS=71166691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,87:0.48:182
chr17	71189155	.	A	AGG	668	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=7;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=23;MQ=59.58;NF=13;NR=4;PP=668;QD=40.8235294118;SC=AAGATGGCGGAGGGGGCGGGA;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=39;TCF=32;TCR=7;TR=17;WE=71189163;WS=71189145;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr17	71189182	.	A	G	543	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=24;MQ=60.19;NF=21;NR=5;PP=543;QD=22.2219697134;SC=GGGCGTAGGTAGATCGCCGGG;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=26;WE=71189190;WS=71189172;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr17	71189266	.	G	C	616	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=12;NR=21;PP=616;QD=19.7203397742;SC=CGACCCTGCGGCTCTTTTCGA;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=80;TCF=43;TCR=37;TR=33;WE=71189274;WS=71189256;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:47,33:0.41:80
chr17	71192468	rs1052705	C	T	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=1;PP=27;ReadPosRankSum=-0.084;SC=GATCTTACAACACTCCTGACT;SOR=0.124;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=4;WE=71192476;WS=71192464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr17	71192663	rs1052706	G	A	1264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.792;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=12;PP=1052;ReadPosRankSum=0.852;SC=AGCCATCCCAGGAGAAGTTCT;SOR=0.817;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=118;TCF=86;TCR=32;TR=48;WE=71192671;WS=71192653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,49:0.41:119
chr17	71192873	rs11544800	A	G	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.351;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=41;PP=1049;ReadPosRankSum=0.591;SC=GGCAGGTGGCAGCCGCCAGCC;SOR=1.712;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=107;TCF=31;TCR=76;TR=52;WE=71192881;WS=71192863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,53:0.48:110
chr17	71192955	rs1010442	C	T	1169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.111;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=26;PP=957;ReadPosRankSum=0.383;SC=GGGTTTATGGCGTTTGTCTTC;SOR=0.280;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=84;TCF=26;TCR=58;TR=42;WE=71192963;WS=71192945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,44:0.51:86
chr17	71193590	rs78661663	C	T	1267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-5.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=35;PP=2090;ReadPosRankSum=-0.343;SC=ATAATTTGCTCAGCGTCTACC;SOR=0.771;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=103;TCF=29;TCR=74;TR=49;WE=71193602;WS=71193580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,52:0.48:108
chr17	71193594	rs7221701	G	A	1428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.813;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=38;PP=2516;ReadPosRankSum=-0.177;SC=TTTGCTCAGCGTCTACCGTGT;SOR=0.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=28;TCR=72;TR=53;WE=71193602;WS=71193580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,56:0.53:106
chr17	71195949	rs1009110	C	T	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.217;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=323;ReadPosRankSum=0.079;SC=CTCCCTGTTTCAATATGCACT;SOR=1.878;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=18;WE=71195957;WS=71195939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,20:0.50:40
chr17	71196809	rs1026128	A	G	1721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.136;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=26;PP=1356;ReadPosRankSum=0.243;SC=TTACTTACCAATGAGTCCACC;SOR=0.929;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=141;TCF=82;TCR=59;TR=66;WE=71196817;WS=71196799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,67:0.47:144
chr17	71196995	rs1026129	G	A	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=283;ReadPosRankSum=0.356;SC=GATTTCTGTCGCTTCCCAAGT;SOR=0.826;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=15;WE=71197003;WS=71196985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr17	71197200	rs1026130	T	C	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=1;PP=710;SC=TGTTTTGAAATGTCCTTAAAG;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=71197208;WS=71197194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	71197439	rs1551036	C	T	2617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.040;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=29;PP=1923;ReadPosRankSum=1.910;SC=CCTGGGTCAGCGTGGCAAACC;SOR=1.540;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=186;TCF=111;TCR=75;TR=93;WE=71197447;WS=71197429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,101:0.50:202
chr17	71197748	rs1037256	G	A	3040.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.450;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=71;PP=2494;ReadPosRankSum=1.685;SC=GCATTGAAGAGGGTGTGCAAG;SOR=0.655;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=261;TCF=107;TCR=154;TR=121;WE=71197756;WS=71197738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,121:0.45:269
chr17	71201675	rs3829571	T	C	2136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=42;PP=1604;SC=GGGTGGGGACTGGGAATTCAT;SOR=0.920;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=74;TCF=32;TCR=42;TR=73;WE=71201683;WS=71201665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
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chr17	71203231	rs57965299	CAAAAA	C	324.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.09;MQRankSum=2.173;QD=24.98;ReadPosRankSum=0.595;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
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chr17	71232687	rs745143	T	C	2870.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.949;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=62;PP=2232;ReadPosRankSum=-1.289;SC=TTTAAGTTTGTTCATTCCGAG;SOR=1.179;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=240;TCF=114;TCR=126;TR=102;WE=71232695;WS=71232677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,108:0.43:249
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chr17	71232804	.	CATT	AATC,AATT	2962	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=74,150;NR=53,135;PP=2391,2962;QD=19.2477785422;SC=CCAGAATCATCATTGTGTCCC;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=289;TCF=152;TCR=137;TR=127,285;WE=71232815;WS=71232794;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.44:289
chr17	71232807	rs904383	T	C	3404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=311;ExcessHet=3.0103;FS=9.656;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.05;ReadPosRankSum=-0.019;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:168,140:0.45:308
chr17	71232881	rs745142	G	C	3485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.080;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=65;PP=2762;ReadPosRankSum=-0.149;SC=CTGATAGTCAGTTCCAAGCAT;SOR=0.535;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=303;TCF=164;TCR=139;TR=136;WE=71232889;WS=71232871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,139:0.45:310
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chr17	71238433	rs1566286	G	A	1823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.399;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=39;PP=1432;ReadPosRankSum=-0.034;SC=GGAACCCCCTGCCGGACTTAC;SOR=0.489;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=185;TCF=99;TCR=86;TR=79;WE=71238441;WS=71238423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,77:0.42:185
chr17	71238525	rs1566287	A	G	1409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=44;PP=1073;ReadPosRankSum=0.198;SC=CTTCTGTTGCAGGTTCTGGGC;SOR=0.679;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=30;TCR=100;TR=57;WE=71238533;WS=71238515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,58:0.43:134
chr17	71238649	rs5821951	T	TC	198.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=259;ReadPosRankSum=-0.611;SC=ATTTTGGAGTTGGACATAATT;SOR=0.155;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=8;WE=71238657;WS=71238639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr17	71238693	rs1566288	T	C	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=119;ReadPosRankSum=1.581;SC=CTACCATTTATTCAACAGCTT;SOR=0.922;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=7;WE=71238701;WS=71238683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
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chr17	71239016	rs2270727	C	T	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=297;ReadPosRankSum=0.355;SC=AACAACAAGCCGTGTTTCCTT;SOR=2.613;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=13;WE=71239024;WS=71239006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr17	71239190	rs2270728	A	T	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.975;NF=4;NR=15;PP=461;ReadPosRankSum=1.078;SC=CCATTCCGTTATGTGGACCTC;SOR=0.608;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=19;WE=71239198;WS=71239180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr17	71239214	rs138600770	GAA	G	784.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=3.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.35;MQRankSum=0.915;QD=25.31;ReadPosRankSum=0.642;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr17	71239227	.	T	TG	562.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.685;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=4.465;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.63;MQRankSum=1.871;QD=22.51;ReadPosRankSum=0.973;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr17	71239234	.	T	TTTTG	613.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.176;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=2.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.63;MQRankSum=1.821;QD=24.55;ReadPosRankSum=-0.028;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,16:0.64:25
chr17	71241279	rs74822881	C	T	1115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=1;PP=839;ReadPosRankSum=-0.862;SC=CCTCTCGGATCCTTACATTTG;SOR=0.804;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=73;TCF=71;TCR=2;TR=39;WE=71241287;WS=71241269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,40:0.53:76
chr17	71244630	rs8915	C	T	1522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.141;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=27;PP=1127;ReadPosRankSum=-1.092;SC=TAAGAAGCAACGCTTAGATCT;SOR=0.881;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=132;TCF=70;TCR=62;TR=59;WE=71244638;WS=71244620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,62:0.45:137
chr17	71246230	rs112790822	C	G	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.539;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=573;ReadPosRankSum=1.319;SC=CGTTCACTTACAGGATCAAAA;SOR=1.449;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=25;WE=71246238;WS=71246220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,28:0.57:49
chr17	71334473	rs3195414	G	A	2753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.513;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=34;PP=1992;ReadPosRankSum=1.093;SC=CCCCAGCTCCGTGTAATTCCC;SOR=0.633;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=223;TCF=151;TCR=72;TR=105;WE=71334481;WS=71334463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,112:0.48:232
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chr17	71344668	rs75637704	C	T	3819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=68;PP=2881;ReadPosRankSum=1.201;SC=AGCCCATCTACGTTCACTGCC;SOR=0.702;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=344;TCF=191;TCR=153;TR=157;WE=71344676;WS=71344658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,160:0.45:355
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chr17	71346353	rs28397959	A	C,ACCCGGGCACTGCTGGGCCTGGCCCCCC	2923.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=69;NR=11;PP=2076;SC=CCTGGCCCCCAACCCACGCAG;SOR=6.399;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=69;TCR=11;TR=80;WE=71346361;WS=71346343;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.59,0.41:49
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chr17	71346943	rs4969107	A	G	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=42;PP=1227;SC=GAGCACAGATAGTCAGGTATA;SOR=5.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=44;WE=71346951;WS=71346933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	71353985	rs2279730	T	C	2020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=3;PP=1578;SC=TGGTCCTCAGTTAGCACTAAC;SOR=4.909;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=54;TCR=3;TR=57;WE=71353993;WS=71353975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	71357718	rs35151121	ACT	A	1092.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.136;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=999;ReadPosRankSum=2.560;SC=TCTGTCCTCCACTCTGTTTCC;SOR=1.725;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=56;TCF=51;TCR=5;TR=25;WE=71357727;WS=71357708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,29:0.50:58
chr17	71357810	rs2279732	G	A	2913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.424;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=45;PP=2238;ReadPosRankSum=0.095;SC=TGCCTGGTCCGTTGCTCTCCT;SOR=0.518;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=206;TCF=130;TCR=76;TR=114;WE=71357818;WS=71357800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,118:0.54:217
chr17	71358045	rs11657033	T	C	905.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-5.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.031;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=39;PP=702;ReadPosRankSum=0.577;SC=CTGGAGGCCATGGGGAAGGGG;SOR=0.136;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=74;TCF=2;TCR=72;TR=41;WE=71358053;WS=71358035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,41:0.55:75
chr17	71361576	rs11655063	G	C	550.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.948;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.906;NF=6;NR=15;PP=374;ReadPosRankSum=-1.719;SC=TTCTTCTGTGGAAGTTCAAAG;SOR=1.670;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=21;WE=71361584;WS=71361566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr17	71365314	rs867998	A	G	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.160;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=31;PP=820;ReadPosRankSum=1.781;SC=GCGCTGGCACATCAGCACTTA;SOR=1.068;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=88;TCF=22;TCR=66;TR=40;WE=71365322;WS=71365304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,43:0.46:94
chr17	71375794	rs62072075	C	T	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=806;ReadPosRankSum=0.248;SC=GAGGCACCCCCGCCATTCTAG;SOR=0.527;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=21;WE=71375802;WS=71375779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr17	71376869	rs12941386	C	T	865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.226;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=2;PP=660;ReadPosRankSum=-0.915;SC=CCTACTTTTCCGTGTGTTTAG;SOR=0.088;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=64;TCF=62;TCR=2;TR=31;WE=71376877;WS=71376859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,32:0.49:65
chr17	71382747	rs7212508	T	C	1866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=44;PP=1477;SC=CGCCCCATGCTCCCACCAAGG;SOR=3.037;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=54;WE=71382755;WS=71382737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	71390366	rs904381	C	A	1673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.666;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=41;PP=1290;ReadPosRankSum=0.090;SC=CCAGCACGAGCCCGTTGCGAT;SOR=0.592;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=129;TCF=49;TCR=80;TR=68;WE=71390374;WS=71390356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,69:0.52:132
chr17	71394066	rs7224026	C	G	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.361;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=-2.232;SC=CATCAGAAAACAGAAAGAGAG;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=71394074;WS=71394062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr17	71397366	rs11653524	G	A	1593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.179;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=35;PP=2537;ReadPosRankSum=-1.516;SC=GAGAGCCGCCGTGTTGGCATG;SOR=0.521;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=131;TCF=54;TCR=77;TR=62;WE=71397383;WS=71397356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,67:0.49:137
chr17	71397375	rs7226251	T	G	1799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.434;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=41;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.040;SC=CGTGTTGGCATGAGCTTGGCT;SOR=0.855;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=126;TCF=50;TCR=76;TR=66;WE=71397383;WS=71397356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,67:0.52:128
chr17	71398046	.	C	CG	427.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.777;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.847;HP=12;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=347;ReadPosRankSum=-1.313;SC=TGGCCTTGGGCGGGGGGGGGC;SOR=0.330;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=61;TCF=54;TCR=7;TR=22;WE=71398054;WS=71398036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr17	71398170	rs9302962	G	C	2576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.134;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=47;PP=1882;ReadPosRankSum=-1.213;SC=TGAAGTACTCGGTGAACTTCT;SOR=0.834;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=244;TCF=133;TCR=111;TR=109;WE=71398178;WS=71398160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,112:0.45:250
chr17	71410891	rs12386051	C	T	1736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.231;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=44;PP=1356;ReadPosRankSum=0.283;SC=CCGGAGGGACCGTGGGAACTA;SOR=0.996;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=129;TCF=46;TCR=83;TR=64;WE=71410899;WS=71410881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,65:0.49:132
chr17	71415224	.	A	G	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.080;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.04;ReadPosRankSum=0.466;SOR=0.064;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,9:0.19:47
chr17	71415245	rs8071352	G	A	2170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=1;PP=1757;SC=GTCCACTCCCGATCTTCCCCC;SOR=6.869;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=59;TCF=58;TCR=1;TR=59;WE=71415253;WS=71415235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	71418605	rs9894213	T	C	3499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=79;PP=2861;SC=CAGAAGTGGGTATCTTGGGTG;SOR=2.465;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=23;TCR=79;TR=102;WE=71418613;WS=71418595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr17	71419999	.	T	C	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.667;NF=22;NR=1;PP=490;ReadPosRankSum=-0.018;SC=GCTCTGAGCATGCCAGTTGCT;SOR=0.874;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=23;WE=71420007;WS=71419989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,26:0.72:36
chr17	71420035	rs6501636	T	C	1779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=6;PP=1358;SC=TCTGCCGGGGTCTGGGAGGGC;SOR=3.952;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=45;TCR=6;TR=51;WE=71420043;WS=71420025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	71426656	rs1105353	G	T	2116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=13;PP=1720;SC=GTACCTGATGGTTACTCGGGG;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=54;TCR=13;TR=67;WE=71426678;WS=71426646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr17	71426670	rs1105354	G	A	2494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=17;PP=1979;SC=CTCGGGGGTCGTGGGTCACTC;SOR=2.542;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=62;TCR=17;TR=79;WE=71426678;WS=71426646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	71429674	rs11652365	C	T	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=1;PP=579;SC=GTGATCTGCCCACCTCAACCT;SOR=4.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=71429682;WS=71429666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	71429776	rs8071524	G	A	3175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=13;PP=2518;SC=ACAAGTGTACGTGGGGAACCC;SOR=3.500;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=81;TCR=13;TR=93;WE=71429784;WS=71429766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
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chr17	71503636	rs9895895	T	C	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.694;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=570;ReadPosRankSum=0.524;SC=TGAACTCCAGTGGCCAGCTGC;SOR=1.659;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=28;WE=71503644;WS=71503626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr17	71640085	rs62063643	G	A	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.332;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=72;ReadPosRankSum=0.319;SC=GTCACCGTGAGGCCGGCCAGC;SOR=1.901;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=5;WE=71640093;WS=71640075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr17	71746361	rs17782705	G	A	315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.362;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=187;ReadPosRankSum=-0.866;SC=GGCCTGGCCTGAGCAGGTATG;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=9;WE=71746369;WS=71746351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr17	71746386	rs17191848	A	G	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=209;ReadPosRankSum=0.428;SC=CGACAACTGCAGAGAGTGCCA;SOR=0.307;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=13;WE=71746394;WS=71746376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr17	71746427	rs35481671	G	A	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.02;ReadPosRankSum=0.481;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr17	71746435	rs34026863	C	T	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=4.550;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.16;ReadPosRankSum=0.493;SOR=0.119;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,27:0.50:54
chr17	71746479	rs2683163	C	G	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.486;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=8;PP=1089;ReadPosRankSum=-0.747;SC=GCTGCGAGCACAGCCAAAAAG;SOR=0.229;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=94;TCF=83;TCR=11;TR=48;WE=71746487;WS=71746469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,49:0.50:98
chr17	71746508	rs2683162	T	C	1319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.314;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=15;PP=1060;ReadPosRankSum=-0.536;SC=CTCCTGTCCCTGCGGTGGGCT;SOR=0.118;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=111;TCF=91;TCR=20;TR=54;WE=71746516;WS=71746498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,54:0.48:113
chr17	71746796	rs2620035	A	G	2291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.917;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=53;PP=1655;ReadPosRankSum=-1.852;SC=TGTCTGGAATATCTCCCCTTG;SOR=0.496;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=161;TCF=52;TCR=109;TR=82;WE=71746804;WS=71746786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,89:0.53:169
chr17	72206137	rs114042367	C	T	41.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=135.651;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.23;MQRankSum=1.282;QD=0.44;ReadPosRankSum=-4.954;SOR=5.130;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,12:0.13:94
chr17	72209858	rs7206926	A	G	4541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=78;PP=2965;SC=ACCAGGAGGTAAGTTTACGCC;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=58;TCR=79;TR=136;WE=72209866;WS=72209848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr17	72226945	rs877583	A	G	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=6;PP=482;ReadPosRankSum=-0.948;SC=CACCGCACCCAACCCTAAGCT;SOR=0.567;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=27;WE=72226953;WS=72226935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr17	72233559	rs62621376	G	A	2632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=55;PP=1948;ReadPosRankSum=-0.750;SC=GGCGGGCAGCGTTGTTGTTCA;SOR=0.711;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=205;TCF=99;TCR=106;TR=103;WE=72233567;WS=72233549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,106:0.50:211
chr17	72240177	rs35999669	T	G	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=482;ReadPosRankSum=-0.117;SC=CGCTGATGGCTCTGCGGCAGT;SOR=0.770;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=66;TCF=43;TCR=23;TR=31;WE=72240185;WS=72240167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,34:0.49:69
chr17	72240336	rs73356650	G	A	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.306;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=27;PP=653;ReadPosRankSum=1.463;SC=CATCTGAACCGGCCCCTCTCG;SOR=0.963;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=57;TCF=10;TCR=47;TR=32;WE=72240344;WS=72240326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,32:0.55:58
chr17	72245613	rs1870991	A	G	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.163;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=27;PP=594;ReadPosRankSum=-0.686;SC=CCACTGACCAAGATGGCGGAG;SOR=0.186;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=58;TCF=1;TCR=57;TR=28;WE=72245621;WS=72245603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,28:0.48:58
chr17	72245629	rs1870993	A	G	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=457;ReadPosRankSum=-0.684;SC=CGGAGGTGGCAGGGCCTTGCT;SOR=0.242;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=22;WE=72245637;WS=72245619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,22:0.52:42
chr17	72245953	rs1112216	G	A	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.099;NF=14;NR=0;PP=317;ReadPosRankSum=0.389;SC=GCCAGGTGGGGGGGTGGGAGG;SOR=0.631;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=14;WE=72245961;WS=72245951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr17	72245986	rs36208397	CCACTGTGGGGCTCCTGGGAGACGGAGCCT	C	2062.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=10.481;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.14;MQRankSum=0.226;QD=31.25;ReadPosRankSum=-0.320;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,64:0.97:66
chr17	72246101	rs3897753	T	C	3542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.968;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.848;NF=77;NR=51;PP=2682;ReadPosRankSum=-1.557;SC=AGCGCGCACTTACCACCATGC;SOR=0.286;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=218;TCF=143;TCR=75;TR=128;WE=72246109;WS=72246091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,132:0.59:225
chr17	72246382	rs139483749	TCTCG	T	2530.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.984;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.341;NF=25;NR=27;PP=2392;ReadPosRankSum=-2.145;SC=CCTCGGCCTCTCTCGCTCTCT;SOR=0.949;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=122;TCF=54;TCR=68;TR=52;WE=72246393;WS=72246372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,68:0.49:140
chr17	72246466	rs7224615	C	T	1470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.283;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.168;NF=14;NR=43;PP=1105;ReadPosRankSum=-1.439;SC=ACCAGCTGACCGCCATGGTGG;SOR=1.482;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=109;TCF=36;TCR=73;TR=57;WE=72246474;WS=72246456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,60:0.53:114
chr17	72248363	rs4789639	C	T	1648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.003;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=26;PP=1266;ReadPosRankSum=1.306;SC=TGTCCCTCCTCTTCCTCCAGG;SOR=0.220;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=114;TCF=77;TCR=37;TR=65;WE=72248371;WS=72248353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,66:0.57:116
chr17	72248483	rs4789640	A	G	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.158;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=875;ReadPosRankSum=1.291;SC=TGATCTGTGCAGGGCCAAGGG;SOR=0.259;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=85;TCF=26;TCR=59;TR=47;WE=72248491;WS=72248473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,48:0.56:86
chr17	72248524	rs4789641	C	T	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.889;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=593;ReadPosRankSum=-1.044;SC=AGGTGGGCTGCCTAGTAAGGA;SOR=1.911;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=27;WE=72248532;WS=72248514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr17	72248593	rs4789642	C	T	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.621;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=280;ReadPosRankSum=-1.521;SC=CTCTGCTCTACGATTTAGCTG;SOR=0.853;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=15;WE=72248601;WS=72248583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr17	72249229	rs9899862	C	A	2804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.540;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=49;PP=2233;ReadPosRankSum=0.395;SC=GAAACAGAGACTACGATGACA;SOR=0.817;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=244;TCF=131;TCR=113;TR=110;WE=72249237;WS=72249219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,112:0.45:249
chr17	72250110	rs8069056	G	C	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.310;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=32;PP=798;ReadPosRankSum=0.764;SC=CCAGACCGTCGTGGGTATCCC;SOR=1.396;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=80;TCF=12;TCR=68;TR=36;WE=72250118;WS=72250100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,37:0.44:84
chr17	72250149	rs8074722	T	C	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=268;ReadPosRankSum=-1.463;SC=ATTGCAAAGATGCAAGAAATC;SOR=1.071;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=17;WE=72250157;WS=72250139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr17	72256155	rs7225498	G	A	929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=7.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=0;PP=726;ReadPosRankSum=0.175;SC=AGGCACGGCCGGGTTTCCCTC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=75;TCF=74;TCR=1;TR=34;WE=72256163;WS=72256145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,35:0.47:75
chr17	72256196	rs34344898	TC	T	1904.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=1;PP=2059;ReadPosRankSum=-2.045;SC=CTCTGAGAAGTCCCCGGCACC;SOR=0.828;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=140;TCF=134;TCR=6;TR=63;WE=72256204;WS=72256186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,68:0.53:128
chr17	72281305	.	G	A	5366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-6.778;ClippingRankSum=0.000;DP=443;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=91;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.497;SC=GGAGAAAGATGAGAACTACGT;SOR=0.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=419;TCF=232;TCR=187;TR=204;WE=72281313;WS=72281295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:220,218:0.50:438
chr17	72281367	rs6501706	A	G	8754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=188;PP=2965;SC=CCCCAGCTGCAAGAGCCCCAT;SOR=1.755;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=273;TCF=83;TCR=190;TR=271;WE=72281375;WS=72281357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr17	72285659	rs35604335	CA	C	762.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=9.547;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.99;MQRankSum=1.684;QD=12.50;ReadPosRankSum=0.024;SOR=2.511;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,46:0.75:61
chr17	72297104	rs34880269	C	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.520;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=125;ReadPosRankSum=1.629;SC=GACCCCAGGACGGTGGGGTGA;SOR=0.914;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=9;WE=72297112;WS=72297094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr17	72297119	rs73995218	G	A	279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=190;ReadPosRankSum=-1.750;SC=GGGTGAGGGCGGAGAAGGCAA;SOR=0.551;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=11;WE=72297127;WS=72297109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,12:0.46:26
chr17	72297180	rs8076337	A	G	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.429;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=504;ReadPosRankSum=-0.111;SC=CCCTCCTCCCACCAGGTCATG;SOR=0.404;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=72;TCF=57;TCR=15;TR=32;WE=72297188;WS=72297170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,34:0.46:74
chr17	72301432	rs8073660	A	G	6289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=484;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.440;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=163;NR=69;PP=2962;ReadPosRankSum=1.652;SC=CGTCAGCTGAAAAGATTGTGT;SOR=0.955;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=466;TCF=317;TCR=149;TR=232;WE=72301440;WS=72301422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:244,236:0.49:480
chr17	72303449	rs11867486	G	A	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.537;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=18;PP=535;ReadPosRankSum=0.411;SC=GACCTGTGTCGTAGAACCTGG;SOR=0.965;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=66;TCF=34;TCR=32;TR=32;WE=72303457;WS=72303439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,36:0.49:73
chr17	72305534	rs2290955	C	T	2624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.624;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=55;PP=2048;ReadPosRankSum=1.970;SC=GAAGGTCACGCGCATGTCCCT;SOR=0.431;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=215;TCF=94;TCR=121;TR=105;WE=72305542;WS=72305524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,106:0.49:215
chr17	72305688	rs2290956	T	C	1006.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=31;PP=769;ReadPosRankSum=-1.177;SC=CGATTGCTTTTGAGCGTGTGC;SOR=0.800;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=79;TCF=25;TCR=54;TR=43;WE=72305696;WS=72305678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,43:0.52:83
chr17	72305753	rs2290957	C	T	1773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=44;PP=1374;SC=CACAACAGAACCACCTGGGGG;SOR=2.794;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=54;WE=72305761;WS=72305743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	72305793	rs12051676	C	T	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.077;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=323;ReadPosRankSum=1.596;SC=AGCAGGTACCCGGCATCTCCT;SOR=0.197;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=17;WE=72305801;WS=72305783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr17	72306116	rs66769719	CCT	C	5520.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=39;PP=2974;SC=TAACTTTGCTCCTCTCTCCTC;SOR=1.758;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=124;TCF=80;TCR=44;TR=107;WE=72306125;WS=72306106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr17	72308319	rs1979370	G	A	2944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=59;PP=2353;SC=CATCATCTTCGCAGAGCTGAA;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=40;TCR=59;TR=99;WE=72308327;WS=72308309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr17	72308403	rs4239008	G	A	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.70;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	72308410	rs4239009	C	T	1529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.71;SOR=3.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	72308447	rs1979371	G	A	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=19;PP=616;SC=TCTGCTTGCCGACTTCCTGGG;SOR=2.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=23;WE=72308455;WS=72308437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	72310476	rs2054400	G	A	4968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=134;PP=2965;SC=GTGGTGGGCTGGGAGCATCGG;SOR=4.572;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=12;TCR=135;TR=146;WE=72310484;WS=72310466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr17	72321928	rs7207519	T	C	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=4;PP=501;SC=GTGCAGACACTCACAGCACAG;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=72321936;WS=72321918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr17	72322997	rs141207337	CGGAGTGCCTGGTTCTT	C	1796.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=21;PP=2932;SC=GGATGGGGCCCGGAGTGCCTG;SOR=6.043;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=22;WE=72323020;WS=72322987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
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chr17	72339542	rs72852209	C	T	776.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.041;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=2;PP=588;ReadPosRankSum=2.099;SC=CCCTGTGCCACGCTCACCACC;SOR=2.527;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=56;TCF=47;TCR=9;TR=29;WE=72339550;WS=72339532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,29:0.51:57
chr17	72340553	rs11870297	C	T	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=247;ReadPosRankSum=1.869;SC=GCAGGAGGGGCGGGGACAGAA;SOR=0.343;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=14;WE=72340561;WS=72340543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,16:0.39:41
chr17	72344723	rs75219617	TGTAA	T	2771.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.779;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.564;NF=32;NR=22;PP=2362;ReadPosRankSum=-0.599;SC=CCCTGAGGGCTGTAAGTTTTA;SOR=1.007;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=136;TCF=75;TCR=61;TR=54;WE=72344734;WS=72344713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,74:0.45:163
chr17	72346736	rs12451539	C	T	5378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=92;PP=2965;SC=TCCCAGGACCCTCCAGGCCCC;SOR=0.964;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=71;TCR=92;TR=163;WE=72346744;WS=72346726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr17	72346855	rs11077744	T	C	6613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=139;NR=71;PP=2965;SC=GCTGGAAGCATGAGAAGTCCC;SOR=1.566;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=210;TCF=139;TCR=71;TR=210;WE=72346863;WS=72346845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr17	72348741	rs11655890	T	C	1584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=34;PP=1362;SC=CACAAATGGCTCCAGCTGCCC;SOR=2.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=48;WE=72348749;WS=72348731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	72348810	rs1814832	A	C	2370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=18;PP=1967;SC=CCACAGCTTAACCCCGAGGAC;SOR=2.115;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=51;TCR=18;TR=69;WE=72348818;WS=72348800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	72349067	rs2280108	C	T	1995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.391;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=55;PP=1486;ReadPosRankSum=-1.057;SC=TGCAGAACAGCGCCCTCCCTC;SOR=0.531;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=159;TCF=45;TCR=114;TR=78;WE=72349075;WS=72349057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,81:0.50:162
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chr17	72350362	rs72852235	G	A	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.019;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=24;PP=1239;ReadPosRankSum=-0.801;SC=GGCGGCGCTCGCGGGCCCTGG;SOR=1.251;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=104;TCF=60;TCR=44;TR=64;WE=72350370;WS=72350352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,67:0.62:108
chr17	72350412	rs2271535	G	A	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.013;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=18;PP=966;ReadPosRankSum=-0.231;SC=GCGACAGAGCGCAGCAGCCTG;SOR=1.254;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=107;TCF=60;TCR=47;TR=49;WE=72350420;WS=72350402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,49:0.44:111
chr17	72351406	rs2271536	C	T	774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.864;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=626;ReadPosRankSum=1.072;SC=GCCTGCCCCACGGCACAAGCA;SOR=0.479;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=81;TCF=48;TCR=33;TR=34;WE=72351414;WS=72351396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,33:0.39:85
chr17	72352686	rs55690660	G	A	866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.985;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=2;PP=750;ReadPosRankSum=-0.571;SC=TAGGGTGGCCGGCGCCTGGCC;SOR=1.714;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=62;TCF=56;TCR=6;TR=34;WE=72352694;WS=72352676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr17	72356484	rs11870955	T	A	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.195;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=51;ReadPosRankSum=0.305;SC=TGCATGGGTGTGAGCAGAGGG;SOR=0.027;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=5;WE=72356492;WS=72356474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr17	72357585	rs6501712	A	G	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=172;ReadPosRankSum=0.455;SC=GTTTCCCAGCACGGCCTTCCC;SOR=0.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=12;WE=72357593;WS=72357575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,13:0.43:30
chr17	72357805	rs12939498	C	T	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.861;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=19;PP=914;ReadPosRankSum=0.387;SC=CCTGGCCGGCCGCGTGCAGCC;SOR=0.542;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=80;TCF=47;TCR=33;TR=44;WE=72357813;WS=72357795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,44:0.55:80
chr17	72366695	rs2382647	C	A	7352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.297;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=123;PP=2965;ReadPosRankSum=0.156;SC=GCCCACGCCCCACGTCAGCGG;SOR=0.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=228;TCF=105;TCR=123;TR=227;WE=72366703;WS=72366685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,234:1.00:235
chr17	72367843	rs11652774	C	T	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.053;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=3;PP=748;ReadPosRankSum=0.236;SC=ATGCCTCTCCCCTCCCTCACC;SOR=0.127;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=59;TCF=56;TCR=3;TR=31;WE=72367851;WS=72367833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
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chr17	72369704	rs12451435	G	A	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.214;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=145;ReadPosRankSum=-0.342;SC=CCAGCCACAGGAGACACAGCC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=8;WE=72369712;WS=72369694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
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chr17	72541052	rs2292107	C	T	5288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.534;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.526;NF=101;NR=104;PP=2962;ReadPosRankSum=3.192;SC=CCACGGGGCCCGCCACGGTCA;SOR=0.441;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=400;TCF=201;TCR=199;TR=205;WE=72541060;WS=72541039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,202:0.54:375
chr17	72541838	rs809740	A	G	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.269;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=9;PP=886;ReadPosRankSum=-0.349;SC=AGAGCTCCCCAAGTCCAGGGT;SOR=0.406;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=90;TCF=74;TCR=16;TR=44;WE=72541846;WS=72541828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,46:0.51:90
chr17	72541980	rs783230	A	G	1364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=43;PP=993;ReadPosRankSum=-0.456;SC=ACAAAATGTAATCTCCTCCCA;SOR=0.671;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=144;TCF=34;TCR=110;TR=56;WE=72541988;WS=72541970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,59:0.40:148
chr17	72542028	.	C	T	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.067;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=513;ReadPosRankSum=0.292;SC=CTTCTGCTCTCTGCTTCCTTG;SOR=0.776;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=2;TCR=58;TR=24;WE=72542036;WS=72542018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,26:0.41:63
chr17	72588326	rs493430	A	C	3545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.113;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=65;PP=2959;ReadPosRankSum=-1.105;SC=AGCAGCAGAGATGGGGACAGC;SOR=0.429;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=250;TCF=135;TCR=115;TR=125;WE=72588334;WS=72588316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,127:0.50:253
chr17	72608834	rs579238	G	A	1629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.097;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=27;PP=1271;ReadPosRankSum=-0.603;SC=TCACCCAGAAGACAGCACCCA;SOR=0.521;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=153;TCF=93;TCR=60;TR=65;WE=72608842;WS=72608824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,66:0.43:154
chr17	72608926	rs509574	G	A	2074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.170;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=37;PP=1662;ReadPosRankSum=-0.484;SC=TGGTGGACACGGTGAAAATGA;SOR=0.624;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=179;TCF=87;TCR=92;TR=79;WE=72608934;WS=72608916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,82:0.44:185
chr17	72610089	rs1878061	C	T	1002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=5.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=33.758;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=0;PP=842;ReadPosRankSum=-0.296;SC=AACACCTCCCCGGTGCTGAGG;SOR=5.299;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=81;TCF=70;TCR=11;TR=37;WE=72610097;WS=72610079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,37:0.45:83
chr17	72613589	rs581157	T	G	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.035;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=30;PP=668;ReadPosRankSum=-0.663;SC=GCCGGGGCCCTTCAGAGACAA;SOR=0.880;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=74;TCF=16;TCR=58;TR=37;WE=72613597;WS=72613579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,38:0.51:75
chr17	72615293	rs12950039	C	T	2476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.605;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=41;PP=1798;ReadPosRankSum=1.004;SC=CCAGCAGCACCTCCTTCTAGG;SOR=0.470;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=225;TCF=142;TCR=83;TR=102;WE=72615301;WS=72615283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,105:0.45:234
chr17	72691928	rs2034310	T	C	1763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=29;PP=1236;ReadPosRankSum=-0.901;SC=GGTAGCCTTTTGCGGGGAGGT;SOR=0.723;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=125;TCF=69;TCR=56;TR=67;WE=72691936;WS=72691918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,72:0.55:130
chr17	72699384	rs749780	C	A	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.148;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=53;ReadPosRankSum=1.200;SC=GGGGTCTGGACTGCTACTATG;SOR=0.105;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=4;WE=72699392;WS=72699374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr17	72700943	rs35489971	A	G	3417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=96;PP=2669;ReadPosRankSum=-0.935;SC=GATTTGAGTGACAATGGAGTA;SOR=0.670;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=272;TCF=74;TCR=198;TR=133;WE=72700951;WS=72700933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,134:0.49:274
chr17	72709027	rs200814939	G	A	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.071;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;PP=743;ReadPosRankSum=1.198;SC=ACAGGTCCCCGTTCCCCTCAG;SOR=0.551;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=84;TCF=41;TCR=43;TR=37;WE=72709035;WS=72709017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,40:0.45:88
chr17	72709195	rs67406906	T	C	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.341;NF=0;NR=15;PP=230;ReadPosRankSum=-0.838;SC=CCTGTAATCCTGGCACTTTGG;SOR=0.760;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=15;WE=72709203;WS=72709185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr17	72709210	rs71380839	C	T	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.445;NF=0;NR=12;PP=243;ReadPosRankSum=-0.395;SC=CTTTGGGAGGCCAAGGCGGGC;SOR=0.622;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=12;WE=72709218;WS=72709200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr17	72736755	rs11651291	A	G	2209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=1;PP=1956;SC=CAGGGTGAAGATGGCGGCTGG;SOR=6.932;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=63;TCF=62;TCR=1;TR=63;WE=72736763;WS=72736745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
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chr17	72744798	rs745666	G	C	1440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.874;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=16;PP=1250;ReadPosRankSum=-0.012;SC=TTGGTCTGTGGTCCTCTCTCG;SOR=0.499;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=98;TCF=72;TCR=26;TR=56;WE=72744806;WS=72744788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,56:0.57:98
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chr17	72762901	rs4788849	A	T	1412.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=3.033;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.58;ReadPosRankSum=0.614;SOR=2.123;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,64:0.52:122
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chr17	72771637	rs750018	C	T	365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.670;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=371;ReadPosRankSum=0.388;SC=CTTTTTTCCCCCCTCATATAT;SOR=1.154;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=15;WE=72771645;WS=72771627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr17	72773387	rs8074137	G	A	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=356;ReadPosRankSum=0.418;SC=GGTGAAGCCTGCTCTTTTGTT;SOR=1.071;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=17;WE=72773395;WS=72773377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr17	72773794	rs9910691	C	A	1740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.068;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.900;NF=10;NR=55;PP=1375;ReadPosRankSum=-0.050;SC=CACGGTGGCTCACGCCTGTAA;SOR=1.611;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=122;TCF=25;TCR=97;TR=65;WE=72773802;WS=72773784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,66:0.53:125
chr17	72781812	rs2166703	G	A	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.690;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=248;ReadPosRankSum=2.048;SC=CAGGAAGCCCGAACATGAGGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=11;WE=72781820;WS=72781802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr17	72784932	rs2016126	G	A	5334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.383;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=118;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.529;SC=CCTCAGCTTCGTGACCACCAC;SOR=0.665;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=362;TCF=152;TCR=210;TR=206;WE=72784940;WS=72784922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:160,212:0.57:372
chr17	72786912	rs4494584	A	T	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=19;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.604;NF=6;NR=1;PP=146;ReadPosRankSum=0.215;SC=GAATTCCCTTAAAAAAAAAAA;SOR=0.113;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=7;WE=72786920;WS=72786902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr17	72791088	rs3830567	A	AG	3589.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=2.810;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.81;MQRankSum=0.490;QD=26.01;ReadPosRankSum=-0.752;SOR=1.895;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,135:0.98:138
chr17	72791266	rs9910463	G	A	2257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=61;PP=1889;SC=TACCCTCCTGGCCCCCAGGTT;SOR=3.737;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=72;TCF=9;TCR=63;TR=70;WE=72791274;WS=72791256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	72791618	rs7221435	A	G	2203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=68;NR=9;PP=1827;SC=CAGCCCAGCCAGGCGGCCTCG;SOR=3.940;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=68;TCR=9;TR=77;WE=72791626;WS=72791608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr17	72838481	rs939536	C	T	2077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=1;PP=1856;SC=GATTTCATGGCAGAAGCCAGA;SOR=8.318;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=62;TCF=61;TCR=1;TR=62;WE=72838489;WS=72838471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr17	72839130	rs139495021	A	AGCTCCGGGG	1061.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=7;PP=2957;SC=CAGGTCCTCCAGCTCCGGGAA;SOR=0.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=7;TCR=9;TR=13;WE=72839138;WS=72839120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	72848758	rs75018418	C	CG	3448.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=70;PP=2974;ReadPosRankSum=0.651;SC=CTCCTGGGGGCGGGCGGGGCC;SOR=3.365;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=89;TCF=4;TCR=85;TR=72;WE=72848786;WS=72848748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,79:0.99:80
chr17	72848772	rs199662980	G	GC	3482.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=75;PP=1262;ReadPosRankSum=1.712;SC=CGGGGCCTGAGCGGGGCGGGA;SOR=3.940;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=78;TCF=2;TCR=76;TR=77;WE=72848786;WS=72848748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,74:0.99:75
chr17	72848778	rs201209302	C	CG	3329.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=2;NR=72;PP=1262;SC=CTGAGCGGGGCGGGAGGGCCG;SOR=6.358;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=76;TCF=2;TCR=74;TR=74;WE=72848786;WS=72848748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr17	72851133	rs689730	A	G	2587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=60;PP=2072;SC=TAAACACCACAGCCACCGTCA;SOR=1.967;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=24;TCR=60;TR=84;WE=72851141;WS=72851123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr17	72861145	rs1996710	A	G	2887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=84;PP=2466;SC=GGCCTGGAGAAGGCTGGCGGC;SOR=5.259;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=87;TCF=3;TCR=84;TR=87;WE=72861153;WS=72861135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	72862705	rs2070918	G	A	5300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=69;NR=89;PP=2965;SC=CAGGTCCCCCGGGAATGGGAG;SOR=1.048;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=158;TCF=69;TCR=89;TR=158;WE=72862713;WS=72862695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr17	72888836	rs489152	G	A	6806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=116;PP=2965;SC=GAGGAGGAAGGAGACGGGTCT;SOR=0.918;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=207;TCF=91;TCR=116;TR=207;WE=72888844;WS=72888826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr17	72889676	.	G	C	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.51;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=51.4;NF=40;NR=54;PP=2962;QD=20;SC=TAGGTTCCATGGGCTCCGTGG;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=203;TCF=91;TCR=112;TR=94;WE=72889693;WS=72889666;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:109,94:0.46:203
chr17	72889676	.	G	GGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATGGGCTCCGTAGGTTCCATC	7467.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.83;QD=67.28;SOR=0.907;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr17	72889685	.	G	A	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.51;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=51.06;NF=39;NR=51;PP=2962;QD=20;SC=TGGGCTCCGTGGGTTCCATGG;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=197;TCF=85;TCR=112;TR=90;WE=72889693;WS=72889666;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:107,90:0.46:197
chr17	72927123	rs6501741	G	T	8441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=177;PP=2965;SC=ACCCAACCCCGGGCTGGTTAG;SOR=1.692;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=262;TCF=84;TCR=178;TR=261;WE=72927131;WS=72927113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,265:1.00:265
chr17	72929380	rs2035835	G	C	1576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=0;PP=1236;SC=AGGATGGGCCGCCATCTAGCC;SOR=6.316;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=42;WE=72929399;WS=72929370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	72929391	rs2035834	A	G	1563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=0;PP=1191;ReadPosRankSum=-0.858;SC=CCATCTAGCCACGGCCCAGCA;SOR=5.353;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=52;WE=72929399;WS=72929370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr17	72945212	rs139084906	TAGA	T	1572.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=0;PP=1444;SC=GCCCAAGGGTTAGAAGAAGAC;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=31;WE=72945222;WS=72945202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	72945334	rs8068514	T	C	3561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=47;PP=2776;ReadPosRankSum=-0.903;SC=CACATCCTCTTCCCCAGCTGT;SOR=0.343;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=60;TCR=47;TR=106;WE=72945342;WS=72945324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr17	72948369	rs17853024	A	G	2609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=32;PP=2054;SC=CTCACTTGTCAATGCAGATCT;SOR=1.489;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=60;TCR=32;TR=92;WE=72948377;WS=72948359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr17	72949146	rs2307010	C	T	1320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=20;PP=993;SC=ATGAGGTGGACGGTCGCCGCT;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=23;TCR=20;TR=43;WE=72949154;WS=72949136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	72951823	rs9899490	C	T	2673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=2;PP=1860;SC=GGCTGTGCCCCCCTTATGTAG;SOR=5.994;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=59;TCF=57;TCR=2;TR=59;WE=72951831;WS=72951813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	72951845	rs9903414	G	A	3305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=9;PP=2072;SC=AAGTAGGCCCGCTGGCCACCC;SOR=3.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=66;TCR=9;TR=75;WE=72951853;WS=72951835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr17	72952017	rs9906160	A	G	2248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=55;PP=1729;SC=ACTTGTTGGCAGTCACCATGG;SOR=3.458;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=10;TCR=56;TR=65;WE=72952025;WS=72952007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	72955227	rs902727	C	G	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=26;PP=781;SC=CCCAACAAATCCCCCCCTCCA;SOR=3.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=72955235;WS=72955217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	72957962	rs10719287	CT	C	3162.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=25;PP=2951;SC=GCCAAGGGCCCTTCACCTGTT;SOR=1.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=81;TCF=54;TCR=27;TR=76;WE=72957970;WS=72957952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr17	72959000	rs7503218	G	C	2260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=3;PP=1918;SC=CAACTGGCCCGGCCCCAACCC;SOR=5.640;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=66;TCR=3;TR=69;WE=72959008;WS=72958990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	72983888	rs7222918	A	C	161.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=2;PP=116;SC=CGTCCCTGCCACTCCACCCTT;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=72983896;WS=72983878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	72995412	rs4789125	G	C	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.53;QD=28.88;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	73017140	rs186190090	G	A	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.775;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=46;PP=1137;ReadPosRankSum=1.099;SC=CTGGGCGTCCGGGCAGCTGCA;SOR=0.355;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=102;TCF=5;TCR=97;TR=49;WE=73017148;WS=73017130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,49:0.47:104
chr17	73058249	rs61750318	A	G	2813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.477;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=59;PP=2214;ReadPosRankSum=-1.113;SC=AACTACGGCAATGAGGATCAG;SOR=0.649;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=231;TCF=109;TCR=122;TR=113;WE=73058257;WS=73058239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,114:0.49:233
chr17	73096951	rs4238978	A	G	1660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=48;PP=1480;SC=TAGTGTGGTAAAAGGGGAACA;SOR=5.507;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=50;WE=73096959;WS=73096941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	73126746	rs10715821	GT	G	11451.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=115;NR=128;PP=2974;SC=GCCTAGGACAGTGAAAGACAG;SOR=0.826;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=245;TCF=116;TCR=129;TR=243;WE=73126754;WS=73126736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr17	73127024	rs9910084	C	G	3190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=66;PP=2656;SC=GGGATAGGGACTTGGCTCTAA;SOR=2.069;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=25;TCR=66;TR=91;WE=73127032;WS=73127014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	73127217	rs3736075	G	C	1861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=35;PP=1458;SC=AGAAGGACGCGGTTACCGCCG;SOR=1.033;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=63;WE=73127225;WS=73127207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	73138751	rs111454348	G	A	815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.21;SOR=6.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	73143574	rs1382508	T	A	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=0;PP=697;SC=TTCCAGTGGGTGAACTGAAAC;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=73143582;WS=73143564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	73177444	rs1471453	C	A	649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=1;NR=17;PP=523;SC=AATGTGAAAGCGGAAAAATCC;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=73177452;WS=73177434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	73205976	rs34126097	T	C	4001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=42;PP=2898;SC=AGGATGTAGATGTTTACTCTC;SOR=1.645;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=92;TCR=42;TR=134;WE=73205984;WS=73205966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr17	73208176	.	T	TGC	1872.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.000;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=1.992;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.42;MQRankSum=0.518;QD=19.92;ReadPosRankSum=0.625;SOR=1.573;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,79:0.84:94
chr17	73208184	rs202030397	T	C	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=2.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=64.95;MQRankSum=-0.583;QD=0.61;ReadPosRankSum=0.426;SOR=0.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,15:0.14:105
chr17	73208205	rs8075486	G	T	3277.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=100;PP=2250;SC=GTGTGTGTGTGGGTATTTTGA;SOR=4.712;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=106;TCF=6;TCR=100;TR=105;WE=73208213;WS=73208195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr17	73221439	rs2291029	C	T	4856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=69;PP=2965;SC=TCCCTTAGCCCGGGAACACCC;SOR=0.834;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=148;TCF=79;TCR=69;TR=148;WE=73221447;WS=73221429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr17	73222847	rs1551967	C	T	6095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=107;NR=84;PP=2965;SC=CAGGGATGTTCATTTAAAATA;SOR=0.933;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=191;TCF=107;TCR=84;TR=191;WE=73222855;WS=73222837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr17	73228101	rs899318	T	C	1801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=61;PP=1426;SC=CCCAGCCTACTGTCTGTGGGA;SOR=6.932;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=62;TCF=1;TCR=61;TR=62;WE=73228109;WS=73228091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	73228144	rs2291030	T	C	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=31;PP=946;SC=GGTCACACTTTATGCCTACCC;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=73228152;WS=73228134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	73240836	rs4789156	T	C	2052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=65;PP=1656;SC=AGTGAGGGCGTGCTCGGGGCT;SOR=4.033;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=9;TCR=65;TR=74;WE=73240844;WS=73240826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	73258086	rs201957984	GC	CG	2779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.537;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=74;PP=1662;ReadPosRankSum=-0.553;SC=GCGAGCAGCGGCGGGGGGGCG;SOR=2.906;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=107;TCF=26;TCR=81;TR=94;WE=73258095;WS=73258074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,96:0.98:98
chr17	73269530	rs1809352	A	G	1757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=15;PP=1316;SC=TCCTTCCTGCACTCAGCGCTG;SOR=2.303;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=62;TCF=47;TCR=15;TR=61;WE=73269538;WS=73269520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	73274181	rs2306217	T	C	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=583;SC=TGGAAGGGGGTGTTCTGGTGG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=73274189;WS=73274171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	73274500	rs3214917	T	TA	1404.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=38;PP=1491;SC=TCCCCTCGCCTAAAATACCAG;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=39;WE=73274508;WS=73274490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	73274558	rs77860123	G	A	1036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=32;PP=849;SC=CAAGGGAAACGCTGGACAGAG;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=73274566;WS=73274548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	73279624	rs7213318	A	G	3067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=27;PP=2285;SC=CCCGGGCGTCATACACGCTGC;SOR=2.281;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=81;TCR=27;TR=108;WE=73279632;WS=73279614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr17	73279700	rs4788882	C	T	4318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=71;PP=2965;SC=AAGAAGTCACCGACAGCCCAA;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=61;TCR=71;TR=132;WE=73279708;WS=73279690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr17	73328773	rs1529844	T	C	2579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=36;PP=2052;SC=TAATGGAGCTTAACTTACGGA;SOR=0.824;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=43;TCR=36;TR=79;WE=73328781;WS=73328763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr17	73328989	rs16967789	G	A	272.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=225;SC=TTCACTCGAAGTATTATCAGT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=73328997;WS=73328979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	73389446	rs4788890	A	G	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=0;PP=581;SC=ACCACACATCACACCAACTCA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=73389454;WS=73389436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	73402246	rs7220246	C	A	2662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=24;PP=1987;SC=CCGGATTCTCCAATATAGGCC;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=58;TCR=24;TR=82;WE=73402254;WS=73402236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr17	73482110	rs11331365	TC	T	1077.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.34;NF=4;NR=23;PP=1089;SC=CCCCAACCTCTCCAGCTGTGC;SOR=3.407;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=27;WE=73482118;WS=73482100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	73482664	rs9899149	T	C	1672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=41;PP=1253;SC=CCACTCTCTTTTGAGCAGGGC;SOR=6.316;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=41;WE=73482672;WS=73482654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	73484753	rs11652993	C	G	3093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=30;PP=2313;SC=CTAACCCCAGCGAATGTCTGT;SOR=1.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=62;TCR=30;TR=92;WE=73484761;WS=73484743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr17	73485033	rs11867527	T	C	2473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=72;PP=1922;SC=TGGTGTCTTCTGTGAAGAGGG;SOR=2.758;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=18;TCR=72;TR=90;WE=73485041;WS=73485023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	73488794	rs4078259	C	T	10208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=118;NR=188;PP=2965;SC=TGTGCAACATCGCCCTGCAAG;SOR=1.288;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=306;TCF=118;TCR=188;TR=306;WE=73488802;WS=73488784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,315:1.00:315
chr17	73489220	rs7215753	T	C	4695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=113;PP=2965;SC=CCAGGCGAGATCTTCCAGAGC;SOR=2.521;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=33;TCR=113;TR=146;WE=73489228;WS=73489210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr17	73489567	rs4078474	C	G	7409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=186;NR=75;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.666;SC=AACTCTCTCCCCCAGGCACAG;SOR=0.928;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=263;TCF=188;TCR=75;TR=261;WE=73489575;WS=73489557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,262:1.00:263
chr17	73490611	rs8078131	A	G	1129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=4;PP=866;SC=CCTGGGGCCCATATGCTCATT;SOR=4.021;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=38;WE=73490619;WS=73490601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	73491484	rs8082606	C	T	9544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=141;NR=164;PP=2965;ReadPosRankSum=0.367;SC=CAACCGGGTACGATGGCAGGA;SOR=0.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=307;TCF=141;TCR=166;TR=305;WE=73491492;WS=73491474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,309:1.00:310
chr17	73491894	rs11077792	G	A	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=5;PP=887;SC=CAGAAGTGCCGATGTTCACAT;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=73491902;WS=73491884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	73494200	rs72851930	G	C	2674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=2;PP=2400;ReadPosRankSum=1.249;SC=GGAAGAGCTAGGAGCAGCCGG;SOR=5.235;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=85;TCF=83;TCR=2;TR=84;WE=73494208;WS=73494190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr17	73494963	rs9894026	G	A	2386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=17;PP=2041;SC=AAGCAGTGTCGGGTTCACACG;SOR=2.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=56;TCR=17;TR=73;WE=73494971;WS=73494953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	73497415	rs8081353	T	C	3434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.19;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr17	73497415	.	TTT	CTC	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=55;NR=15;PP=2947;QD=20;SC=ATCTAGGTGATTTCAACACCT;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=72;TCF=57;TCR=15;TR=70;WE=73497425;WS=73497405;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,70:0.97:72
chr17	73497417	rs8081354	T	C	3434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.04;SOR=2.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	73497439	rs8075850	G	A	2742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=11;PP=2348;SC=CTCTTATCCCGTTAGTGCCTG;SOR=3.611;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=71;TCR=11;TR=82;WE=73497447;WS=73497429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	73497794	rs9892311	T	C	4816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=71;PP=2965;SC=AAAGGTTGGCTTGGGACTTGG;SOR=0.719;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=77;TCR=72;TR=147;WE=73497802;WS=73497784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr17	73498483	rs7503373	T	C	2324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=31;PP=1937;SC=CCCTGGGCTCTCATCTAGTGG;SOR=0.874;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=37;TCR=31;TR=68;WE=73498491;WS=73498473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	73498623	rs7502835	A	G	7114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=151;NR=101;PP=2965;SC=TTGGGGTCACACTAGGACTGG;SOR=1.170;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=252;TCF=151;TCR=101;TR=252;WE=73498631;WS=73498613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr17	73499697	rs7207376	T	C	4248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=56;PP=2965;SC=CAGCTGAGGGTGACAGCACGT;SOR=1.063;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=80;TCR=56;TR=136;WE=73499705;WS=73499687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr17	73500073	rs72851933	G	T	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=30;PP=909;SC=GGCAGAATTAGCAGGAGCTGG;SOR=5.610;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=31;WE=73500081;WS=73500063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	73500241	.	G	A	407	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=33;MMLQ=28;MQ=57.2;NF=18;NR=0;PP=407;QD=24.5428451415;SC=GGTGCACCCCGTGGAGGTCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=18;WE=73500249;WS=73500231;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,18:0.75:24
chr17	73500263	.	C	T	752	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=6;HapScore=1;MGOF=30;MMLQ=29;MQ=58.4;NF=30;NR=2;PP=752;QD=24.5866003921;SC=CCTTCCCCCCCGAGGCCCACG;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=32;WE=73500271;WS=73500253;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,32:0.86:37
chr17	73500288	.	G	T	1460	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MMLQ=24;MQ=59.28;NF=54;NR=4;PP=1460;QD=25.7719174577;SC=ACCCCGTGGAGGTCACACCTT;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=61;TCF=57;TCR=4;TR=58;WE=73500296;WS=73500278;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,58:0.95:61
chr17	73502219	rs11868796	G	T	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=13;PP=548;SC=GTCTGCCCCCGATCCATCTGC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=19;WE=73502227;WS=73502209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	73502645	rs72851936	G	A	3553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=83;NR=20;PP=2773;SC=ATGAGGAAGCGAGGGGACCCC;SOR=2.573;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=104;TCF=83;TCR=21;TR=103;WE=73502653;WS=73502635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr17	73504416	rs6501815	T	C	4220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=104;PP=2965;SC=CTGCCCTCACTCAGCATCCCT;SOR=2.512;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=134;TCF=29;TCR=105;TR=133;WE=73504424;WS=73504406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr17	73512884	rs8079373	T	G	2975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=37;PP=2411;SC=AGCGCTCGCATGGCCCCAAGG;SOR=1.227;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=58;TCR=37;TR=95;WE=73512892;WS=73512874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr17	73513156	rs8074291	G	A	4999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=68;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=84;NR=71;PP=2965;SC=CTCCCGCGGTGAGCGGCGGGC;SOR=0.807;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=155;TCF=84;TCR=71;TR=155;WE=73513164;WS=73513146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr17	73513182	rs113075319	CGCCCTCCCT	C	5869.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5010;FS=3.437;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.395;NF=28;NR=58;PP=2983;ReadPosRankSum=0.424;SC=GACCGGGGACCGCCCTCCCTG;SOR=0.556;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=127;TCF=40;TCR=87;TR=86;WE=73513198;WS=73513172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,138:0.99:139
chr17	73513289	rs6501818	C	G	1784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=52;PP=1538;ReadPosRankSum=-0.804;SC=GCCGGCAGCGCCTTCACCCGG;SOR=2.658;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=6;TCR=53;TR=58;WE=73513297;WS=73513279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr17	73513415	rs11316466	CT	C	569.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=9;PP=689;SC=ACAACCCGGTCTTTAGAGAAC;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=18;WE=73513423;WS=73513405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	73513619	rs56895494	C	A	5843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=123;NR=63;PP=2965;SC=ATAAGCTGAGCTGTTGGCCCC;SOR=1.635;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=186;TCF=123;TCR=63;TR=186;WE=73513627;WS=73513609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr17	73513867	rs58787501	G	A	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=392;SC=ATGCTGTCACGAGGCTTACAT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=73513875;WS=73513857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	73514944	rs62088466	A	G	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=0;PP=813;SC=TCCAACCTTAATCACAGGGTT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=73514952;WS=73514934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr17	73515237	rs55786842	A	G	2447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=64;PP=1937;SC=GCTGGAGTGCAGTTCCTTGGG;SOR=3.145;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=13;TCR=65;TR=77;WE=73515245;WS=73515227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	73518284	rs6501820	G	C	4164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=84;PP=2965;SC=AGGTGCAGCGGTGCTCCAGCT;SOR=1.485;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=45;TCR=84;TR=129;WE=73518292;WS=73518274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr17	73518328	rs77247739	A	C	2079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=60;PP=1652;SC=CAGCGGCGGCAGGTGCAGAGG;SOR=2.630;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=77;TCF=16;TCR=61;TR=76;WE=73518336;WS=73518318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr17	73519137	rs62088468	A	C	893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=670;SC=GTGCACACTTATAATCCCAGC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=73519145;WS=73519134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	73519589	rs62088469	T	C	1504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=7;PP=1271;SC=AGAGGGAGAATAACCAGTGGG;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=40;TCR=7;TR=47;WE=73519597;WS=73519579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	73519668	rs72851947	G	A	3585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=26;PP=2965;SC=TGGAACTGGTGGAGGGAAAGG;SOR=2.604;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=92;TCR=26;TR=118;WE=73519676;WS=73519658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr17	73539631	rs6501822	A	G	3382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=71;PP=2618;SC=TCGGCCAAGCAGCTCAGGCTG;SOR=1.588;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=38;TCR=71;TR=109;WE=73539639;WS=73539621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr17	73552062	rs2305528	G	C	1854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=3;PP=1579;SC=TGCTGCAGCTGCAGCAGCCAT;SOR=5.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=52;TCR=3;TR=55;WE=73552070;WS=73552052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	73552185	rs1671036	G	A	6005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=113;NR=79;PP=2965;SC=CCGTCCCTGCGCATCCTGGCC;SOR=1.029;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=193;TCF=114;TCR=79;TR=192;WE=73552193;WS=73552175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr17	73559119	.	C	T	1893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.200;ClippingRankSum=0.000;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.628;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=19;PP=1526;ReadPosRankSum=-2.679;SC=GGCCCGCCACCGGCGTGTGTT;SOR=0.399;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=139;TCF=104;TCR=35;TR=67;WE=73559127;WS=73559109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,70:0.49:144
chr17	73565262	rs2305526	T	A	8204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=142;PP=2965;SC=AGCTGGGTCCTGTCCCCGTGG;SOR=1.120;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=242;TCF=100;TCR=142;TR=239;WE=73565270;WS=73565252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr17	73587268	rs2290455	C	T	8562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=139;NR=138;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.557;SC=TCTTTGCCATCGTGGCATCAG;SOR=0.223;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=278;TCF=140;TCR=138;TR=277;WE=73587276;WS=73587258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,280:1.00:281
chr17	73587347	rs11656113	G	A	4473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=109;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.806;SC=GGCCTTCCTGGGTGGCTGAAC;SOR=2.155;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=131;TCF=20;TCR=111;TR=129;WE=73587355;WS=73587337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,135:0.99:136
chr17	73587640	rs707709	T	C	3016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=16;PP=2479;SC=GGTGGTCCTATGTGCCCCTCC;SOR=3.166;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=79;TCR=16;TR=95;WE=73587648;WS=73587630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	73588027	rs746840	C	T	1307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=13;PP=1015;ReadPosRankSum=0.913;SC=TACTGCTGCCCAGGGATGCTT;SOR=0.660;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=39;WE=73588035;WS=73588017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr17	73588058	rs736522	G	T	2947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=4.346;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=43.35;ReadPosRankSum=-0.180;SOR=1.208;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,67:0.99:68
chr17	73588067	rs736523	A	G	2969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=4.137;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=42.43;ReadPosRankSum=-0.796;SOR=1.067;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,69:0.99:70
chr17	73590436	rs820254	A	G	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=377;SC=AGATCTCCTCATGTGACATAT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=73590444;WS=73590426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	73590522	rs820255	G	A	2201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=25;PP=1698;SC=CATTCCTGAAGCAGAGATCTC;SOR=1.394;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=44;TCR=25;TR=69;WE=73590530;WS=73590512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	73590817	rs2305524	C	T	3775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=55;PP=2965;SC=GATCCCTGCCCGTGGAAAGTG;SOR=0.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=61;TCR=55;TR=116;WE=73590838;WS=73590807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr17	73590830	rs820256	T	G	3366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=54;PP=2660;SC=GGAAAGTGCCTTTGATGCCAG;SOR=0.800;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=58;TCR=54;TR=112;WE=73590838;WS=73590807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr17	73597544	rs11871553	A	G	6555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=90;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.564;SC=TTCCTCCAGAAGAGCCACTAT;SOR=0.570;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=209;TCF=117;TCR=92;TR=205;WE=73597552;WS=73597534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,211:0.99:214
chr17	73598904	rs62089251	C	G	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=3;PP=338;SC=GCCCTTCACCCCCACAGCTGG;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=73598912;WS=73598894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	73601755	rs936054	G	A	1361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=26;PP=1018;SC=GAAAGGAGAGGTGCATTCTGG;SOR=1.508;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=15;TCR=26;TR=41;WE=73601763;WS=73601745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	73602081	rs8068464	G	A	1854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=34;PP=1442;SC=ATGCAGGCTCGCATGCGTGGG;SOR=1.057;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=59;WE=73602089;WS=73602071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	73607468	rs11077795	A	G	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=2;PP=554;SC=CGCTTGAGCTAGAGCCTCAGA;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=73607476;WS=73607458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	73608203	rs820140	T	C	4591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=116;PP=2965;ReadPosRankSum=0.961;SC=TTGCCCTCCTTCCTCCCCAGC;SOR=2.133;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=20;TCR=117;TR=136;WE=73608211;WS=73608193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,140:0.99:141
chr17	73608744	rs11336364	CA	C	399.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.104;NF=24;NR=0;PP=252;ReadPosRankSum=-0.579;SC=GACTCTGCCTCAAAAAAAAAA;SOR=4.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=24;WE=73608766;WS=73608734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,24:0.92:26
chr17	73609112	rs820142	G	A	4790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=83;PP=2965;SC=GATCATGGGCGCATACCTGGT;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=147;TCF=64;TCR=83;TR=147;WE=73609120;WS=73609102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr17	73612642	rs11439064	A	AT	11480.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=112;NR=145;PP=2974;SC=TGAAGAAGCCATGAAGCAAGG;SOR=0.739;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=275;TCF=117;TCR=158;TR=257;WE=73612650;WS=73612632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,309:1.00:309
chr17	73619952	.	GCTTCT	G	9949.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=226;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.43;SOR=0.992;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr17	73619953	.	CT	GG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=59.93;NF=85;NR=70;PP=2947;QD=20;SC=GGACCGGTGGCTTCTGGGGGT;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=190;TCF=103;TCR=87;TR=155;WE=73619965;WS=73619942;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:35,155:0.82:190
chr17	73619955	.	TCTG	T	2948	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=59.97;NF=63;NR=70;PP=2948;QD=20;SC=ACCGGTGGCTTCTGGGGGTGG;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=139;TCF=67;TCR=72;TR=133;WE=73619965;WS=73619942;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,133:0.96:139
chr17	73619958	.	G	GGT	9949.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.02;SOR=0.989;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr17	73620804	rs820187	C	A	5298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=91;PP=2965;SC=GTGGCAGGGCCGGGTGTGTGT;SOR=1.040;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=160;TCF=69;TCR=91;TR=159;WE=73620812;WS=73620794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr17	73621432	rs820188	A	G	3455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=71;PP=2846;SC=GGGGCCTGTGAACATCTGTCC;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=27;TCR=71;TR=98;WE=73621440;WS=73621422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr17	73625430	rs4788902	G	A	5150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=86;PP=2965;SC=TCGGGGGCTCGTGCTCGCCTC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=171;TCF=84;TCR=87;TR=170;WE=73625438;WS=73625420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr17	73625478	rs820191	T	C	4893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=84;NR=81;PP=2965;SC=TGATCCGAGTTGTCTCCATCA;SOR=0.717;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=84;TCR=81;TR=165;WE=73625486;WS=73625468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr17	73625629	rs820192	A	C	2337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=41;PP=1908;SC=CTGGAGCAGTAACTCACATTG;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=27;TCR=41;TR=68;WE=73625637;WS=73625619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	73626208	rs820193	G	C	1467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=6;PP=1184;SC=CAGCTTCTGCGTCAGAGTATG;SOR=3.467;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=42;WE=73626216;WS=73626198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	73626829	rs820195	C	G	3431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=64;NR=43;PP=2760;SC=AGGGCCCCGGCGGGTGGCTGA;SOR=1.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=64;TCR=43;TR=107;WE=73626837;WS=73626819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr17	73626922	.	G	GTGT	2577.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.981;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.6656;FS=3.815;HP=11;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.677;NF=27;NR=24;PP=700;ReadPosRankSum=0.053;SC=TCTCATCTGTGGGGGGGGGGG;SOR=0.849;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=68;TCF=28;TCR=40;TR=51;WE=73626931;WS=73626908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr17	73626983	rs9896073	G	C	2637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=35;PP=2166;SC=GTCCCCCACAGCCCGGATGAG;SOR=0.850;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=42;TCR=35;TR=77;WE=73626991;WS=73626973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	73627565	rs820197	A	G	5006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=97;PP=2965;SC=GGCCTCCCTCATACAGCTCGG;SOR=0.947;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=172;TCF=75;TCR=97;TR=172;WE=73627573;WS=73627555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr17	73658489	rs820159	T	C	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=442;SC=GGTCTTAGACTAATCTCCATC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=73658497;WS=73658484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	73698557	rs820232	C	T	2315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=14;PP=1860;SC=CTCCTCTTCACAGGACAAGAT;SOR=2.804;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=61;TCR=14;TR=75;WE=73698565;WS=73698547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	73700130	rs78580953	AG	A	1328.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=29;PP=1319;SC=ACAGCAAAGAAGATGGAACGT;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=73700138;WS=73700120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	73702253	rs2305529	G	A	4388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=92;PP=2965;SC=CAGACAGCACGTGGATCTGGG;SOR=1.954;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=36;TCR=92;TR=128;WE=73702261;WS=73702243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr17	73702317	rs820230	A	G	2894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=29;PP=2330;SC=GGGGTGGGCCACTTCGGGGTC;SOR=1.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=66;TCR=29;TR=95;WE=73702325;WS=73702307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr17	73702402	rs820229	T	C	6931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=148;NR=58;PP=2965;SC=GTGATCCTGATTTCTGCTTTA;SOR=1.889;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=208;TCF=148;TCR=60;TR=206;WE=73702410;WS=73702392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr17	73720638	rs820166	C	T	2498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=8;PP=2010;SC=CAGGGCCCTGCCTCTGGCGGC;SOR=4.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=69;TCR=8;TR=77;WE=73720646;WS=73720628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	73720900	rs820167	A	G	2972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=80;PP=2376;SC=TCCTGGCAGGATCATCCCTTG;SOR=4.294;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=10;TCR=81;TR=90;WE=73720908;WS=73720890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	73723239	rs2584100	G	A	5857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=135;NR=54;PP=2965;SC=TTTGCTGAGCGCCTCCCCATT;SOR=1.963;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=135;TCR=55;TR=189;WE=73723247;WS=73723229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr17	73723453	rs34275940	GC	G	6343.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=109;PP=2974;SC=AATGGGTGCTGCCCCCCAGTG;SOR=1.128;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=183;TCF=54;TCR=129;TR=158;WE=73723461;WS=73723443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr17	73725239	rs56375128	C	CA	129.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQRankSum=-1.901;QD=3.93;ReadPosRankSum=0.768;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr17	73732025	rs820174	C	T	2265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=4;PP=1919;SC=GCTAGCGGCACCCTGGCTCCC;SOR=5.166;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=64;TCR=4;TR=68;WE=73732033;WS=73732015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	73732045	rs820175	T	C	2712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=68;NR=10;PP=2224;SC=CACAGCTCTGTTCCCACAGGC;SOR=3.753;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=79;TCF=69;TCR=10;TR=78;WE=73732053;WS=73732035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	73732522	rs820176	T	G	2489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=49;PP=1994;SC=CACAGGGCAGTGTGGGCAGGA;SOR=1.463;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=24;TCR=49;TR=73;WE=73732530;WS=73732512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	73732810	rs820177	A	C	3702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=97;PP=2682;SC=GGTTGCTGAGAGCCTAGGCAG;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=33;TCR=97;TR=130;WE=73732818;WS=73732800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr17	73733315	rs820179	G	C	2062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=0;PP=1740;SC=GAGGCAGATCGCAGAGTAGGG;SOR=8.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=60;TCR=0;TR=60;WE=73733323;WS=73733305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	73746146	rs820387	T	C	6014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=145;NR=48;PP=2965;SC=CCCCTGGTGGTGAAGGGGGAT;SOR=2.290;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=195;TCF=146;TCR=49;TR=193;WE=73746154;WS=73746136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr17	73751042	rs3988219	C	CACAT	4710.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=75;PP=2976;SC=CACGTGCACACGCATGCACAC;SOR=2.371;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=22;TCR=78;TR=96;WE=73751050;WS=73751027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr17	73753503	rs871443	T	C	1980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.181;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=31;PP=1609;ReadPosRankSum=1.338;SC=ACAGATGGGCTGACCCTGGGG;SOR=0.820;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=187;TCF=115;TCR=72;TR=81;WE=73753511;WS=73753493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,81:0.44:186
chr17	73753661	rs9367	C	T	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.112;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=41;PP=957;ReadPosRankSum=0.367;SC=ACCCCCGCCACGTCCCACTAG;SOR=0.278;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=111;TCF=14;TCR=97;TR=49;WE=73753669;WS=73753651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,47:0.44:107
chr17	73754248	rs743554	G	A	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=41;PP=1443;ReadPosRankSum=0.432;SC=AGGGCCCCGGGAAGCTGCCGC;SOR=0.761;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=127;TCF=56;TCR=71;TR=72;WE=73754256;WS=73754238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,71:0.57:124
chr17	73759038	rs35008831	TC	T	4912.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=50;PP=2970;SC=GTGGGCACACTCCCACCCAGG;SOR=1.280;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=131;TCF=77;TCR=54;TR=126;WE=73759046;WS=73759028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr17	73759304	rs820386	G	T	2859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=50;PP=2348;SC=TCCAGGGAGAGTCCCTGCCAC;SOR=1.090;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=36;TCR=50;TR=86;WE=73759312;WS=73759294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	73759552	rs7209235	G	A	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.109;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=7;PP=193;ReadPosRankSum=-0.823;SC=ATGGTAAGAGGGGCTGCCTGG;SOR=0.014;SbPval=0.04;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=12;WE=73759560;WS=73759542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr17	73760626	rs56038529	T	C	1612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.081;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=26;PP=1278;ReadPosRankSum=-0.562;SC=ACTGGGCCTCTCTAGGCCTCA;SOR=0.480;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=143;TCF=89;TCR=54;TR=63;WE=73760634;WS=73760616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,63:0.44:142
chr17	73760820	rs55715426	G	A	1724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.667;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=40;PP=1352;ReadPosRankSum=0.121;SC=CAGAGGGCGGGCTTGAGCCAA;SOR=0.778;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=129;TCF=51;TCR=78;TR=65;WE=73760828;WS=73760810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,68:0.52:130
chr17	73780506	rs11655389	G	A	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-4.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=321;ReadPosRankSum=-1.254;SC=GAACCTAGCTGTACTAAGTAT;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=16;WE=73780514;WS=73780496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr17	73781075	.	GC	G	27	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;FR=0.9998;HP=13;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=15;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=27;QD=16.0;SC=CGTACGTAGAGCCCCCCCCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=2;WE=73781083;WS=73781065;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,2:0.15:13
chr17	73812909	rs9908146	A	G	1518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=13;PP=1132;SC=CCACCCAGCCAGGTCCTGTCC;SOR=2.345;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=49;WE=73812917;WS=73812899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
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chr17	73816026	rs11868471	A	G	7118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=120;PP=2965;SC=AGAGCTCTGCACCCGTGAACA;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=238;TCF=117;TCR=121;TR=237;WE=73816034;WS=73816016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr17	73819525	rs8078208	C	T	2003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=30;PP=1632;ReadPosRankSum=0.666;SC=CCGCCTTCTCCGACCTGGAGG;SOR=0.666;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=193;TCF=119;TCR=74;TR=82;WE=73819533;WS=73819515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,82:0.42:193
chr17	73824121	rs7210574	T	C	1166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=16;PP=866;ReadPosRankSum=0.720;SC=AGACCTGGGCTTCTCGGTCAC;SOR=0.770;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=71;TCF=43;TCR=28;TR=43;WE=73824129;WS=73824111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,44:0.60:73
chr17	73826406	rs2290769	G	C	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.455;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=2;PP=65;ReadPosRankSum=0.908;SC=GGCCAGGACGGGACCATGGAG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=5;WE=73826414;WS=73826396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr17	73827205	rs1135688	T	C	2113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.624;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=20;PP=1564;ReadPosRankSum=-1.071;SC=TGCAGGGCCTTGGGTGGCAGG;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=125;TCR=41;TR=81;WE=73827213;WS=73827195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,84:0.48:175
chr17	73828903	rs112267124	G	A	3338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.266;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.073;NR=82;PP=2457;ReadPosRankSum=-1.917;SC=AAGAGGGGCCGTGGGAGGAGA;SOR=0.543;Source=Platypus;TCR=165;WE=73828911;WS=73828893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,135:0.53:254
chr17	73830996	rs17581728	C	T	1399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=23;PP=1112;ReadPosRankSum=-0.840;SC=TGGAAGATGCCGCACCTCCAC;SOR=0.665;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=110;TCF=65;TCR=45;TR=57;WE=73831004;WS=73830986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,56:0.50:113
chr17	73832384	rs74410877	C	T	1784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.978;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=32;PP=1321;ReadPosRankSum=0.453;SC=CAGGCCCAGGCGCTGGTCTCC;SOR=0.544;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=154;TCF=87;TCR=67;TR=70;WE=73832392;WS=73832374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,74:0.46:160
chr17	73833087	rs142821095	C	CCCTCCTCCAGGGCCCCTGGTGGAGAA	107.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.39;ReadPosRankSum=-1.465;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,2:0.29:7
chr17	73836162	rs7223416	C	G	1282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=21;PP=996;ReadPosRankSum=1.585;SC=CGGTGTAGCTCGGCTGCGAGC;SOR=0.801;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=78;TCF=39;TCR=39;TR=41;WE=73836170;WS=73836152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,45:0.57:79
chr17	73837142	rs8067076	A	C	1311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-7.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=50;PP=1072;ReadPosRankSum=-0.073;SC=CAGACGAAGCAGTAAGTGACC;SOR=0.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=11;TCR=92;TR=56;WE=73837150;WS=73837132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,58:0.55:105
chr17	73837209	rs11868308	C	T	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.736;HP=1;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=257;ReadPosRankSum=0.078;SC=TCCTCCCAGCCGCATCCCTTT;SOR=2.247;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=13;WE=73837224;WS=73837199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr17	73838798	.	G	A	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.244;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=6;PP=735;ReadPosRankSum=-0.867;SC=GGGGGAGAGGGAAGGGGACCA;SOR=0.656;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=60;TCF=49;TCR=11;TR=33;WE=73838806;WS=73838788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,36:0.58:62
chr17	73838816	rs3744006	G	A	1066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.320;HP=5;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=5;PP=906;ReadPosRankSum=-0.587;SC=CCAGCAGCATGGGGGGCCAGC;SOR=1.121;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=82;TCF=71;TCR=11;TR=42;WE=73838824;WS=73838806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,41:0.49:83
chr17	73838857	rs11870883	C	T	1916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=10;PP=1576;ReadPosRankSum=-0.063;SC=TGGGTGCTCCCGCCAAGAGTC;SOR=0.639;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=127;TCF=108;TCR=19;TR=69;WE=73838865;WS=73838847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,69:0.53:129
chr17	73839214	rs3744008	G	C	963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.022;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=14;PP=792;ReadPosRankSum=0.141;SC=CTGCAGGAAGGGGGGTGGGGT;SOR=0.419;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=75;TCF=50;TCR=25;TR=39;WE=73839222;WS=73839204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,39:0.52:75
chr17	73839366	rs3744009	C	T	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=33;PP=911;ReadPosRankSum=0.970;SC=CACGGGGTCACCTTGGGGACC;SOR=0.590;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=88;TCF=21;TCR=67;TR=44;WE=73839374;WS=73839356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,45:0.50:90
chr17	73839498	rs9903200	G	A	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.719;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=8;PP=263;ReadPosRankSum=2.459;SC=TGCCATCAGCGTCGGCCGGCA;SOR=1.179;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=13;WE=73839506;WS=73839488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr17	73840243	rs3744010	G	A	1156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=9;PP=897;ReadPosRankSum=0.870;SC=CAGGGCACCCGTACCCGAGAC;SOR=0.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=82;TCF=63;TCR=19;TR=42;WE=73840251;WS=73840233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,44:0.52:85
chr17	73844748	rs2290771	A	G	1016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=29;PP=856;ReadPosRankSum=-0.231;SC=AGCCACCTGAAAGGGGAAGGA;SOR=0.776;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=83;TCF=20;TCR=63;TR=38;WE=73844756;WS=73844738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,38:0.45:85
chr17	73847613	rs936393	A	G	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.591;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=311;ReadPosRankSum=0.128;SC=CAACAGCAACAAGCCTCTCAA;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=20;WE=73847621;WS=73847603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,21:0.52:40
chr17	73847799	rs936391	G	A	1850.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.693;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=56;PP=1448;ReadPosRankSum=-1.096;SC=AGACAGTATGGAGACGCGACG;SOR=0.953;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=127;TCF=31;TCR=96;TR=72;WE=73847807;WS=73847789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,70:0.56:125
chr17	73871467	rs3744017	G	A	2236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=6.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.940;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=18;PP=1749;ReadPosRankSum=-0.629;SC=GAGGGGGCACGGGCGTCCACT;SOR=0.371;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=145;TCF=119;TCR=26;TR=81;WE=73871475;WS=73871457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,85:0.57:149
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chr17	73872948	rs1055129	A	G	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=412;ReadPosRankSum=1.098;SC=ACAGCCCTACACTCGGGTCCC;SOR=1.532;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=19;WE=73872956;WS=73872938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
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chr17	73874012	rs3903010	T	G	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.707;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=49;ReadPosRankSum=-0.931;SC=GGTGCTCCTGTGCGGCGCAGG;SOR=1.675;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=12;TCF=5;TCR=7;TR=4;WE=73874020;WS=73874002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr17	73874071	rs4600514	G	A	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=213;ReadPosRankSum=0.495;SC=TCGAGCGGCCGTAGGTGGCGC;SOR=1.022;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=22;TCF=12;TCR=10;TR=12;WE=73874079;WS=73874061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr17	73874138	rs4072479	G	C	146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.169;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=4;PP=79;ReadPosRankSum=-1.105;SC=GTCCGCGGAGGGCGGGGCTGC;SOR=0.527;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=8;WE=73874146;WS=73874128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr17	73874684	rs116044941	G	C	145.22	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.9968;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=106;ReadPosRankSum=0.157;SC=GGAGGGACCCGGGCCGTTCGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=73874692;WS=73874674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr17	73886888	rs3760128	A	G	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.003;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=11;PP=409;ReadPosRankSum=0.350;SC=CTGGGGCCCCAGAGGGAACAC;SOR=0.963;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=62;TCF=39;TCR=23;TR=30;WE=73886896;WS=73886878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,30:0.48:63
chr17	73887807	rs11270925	TGCACACACACACGTGCTCACA	T	1167.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.282;NF=13;NR=0;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.967;SC=CATACGAACATGCACACACAC;SOR=0.325;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=46;TCR=3;TR=13;WE=73887835;WS=73887797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,31:0.56:55
chr17	73888354	rs34974290	G	A	2846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=57;PP=2238;ReadPosRankSum=0.087;SC=GCACCTGCAGGAAGGTCTGCT;SOR=0.694;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=225;TCF=111;TCR=114;TR=114;WE=73888362;WS=73888344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,115:0.50:232
chr17	73888423	rs7222755	A	G	3265.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=7.507;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.75;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=1.226;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,86:0.47:184
chr17	73888427	rs7222757	A	C	3361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FS=8.543;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.98;ReadPosRankSum=-1.031;SOR=1.232;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,89:0.48:187
chr17	73888672	rs3744028	T	C	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=425;ReadPosRankSum=0.937;SC=GGGCTGAGGGTCAGGGATGTG;SOR=0.495;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=20;WE=73888680;WS=73888662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,21:0.51:41
chr17	73888743	rs3744027	G	A	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=4;PP=210;ReadPosRankSum=-1.802;SC=GCTCAGCCCCGCTCCCTGCTG;SOR=0.569;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=10;WE=73888751;WS=73888733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,11:0.48:23
chr17	73894804	rs7370	G	A	413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.160;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=331;ReadPosRankSum=0.606;SC=TGGGCCTGACGGGAGGGGGCC;SOR=1.514;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=16;WE=73894812;WS=73894794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr17	73897033	rs111405920	A	AC	4870.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.459;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=56;PP=2971;ReadPosRankSum=0.098;SC=CCTGGGCAGCACCCCCTACCC;SOR=0.592;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=239;TCF=107;TCR=132;TR=100;WE=73897054;WS=73897023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,129:0.47:273
chr17	73897046	rs9902371	A	G	5015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.433;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=73;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.321;SC=CCCTACCCCCAGTACTCCAGT;SOR=0.810;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=277;TCF=136;TCR=141;TR=135;WE=73897054;WS=73897023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:149,136:0.48:285
chr17	73900688	rs3744015	T	C	1576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.378;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=25;PP=1191;ReadPosRankSum=0.817;SC=CCTGCTCTGCTCGGCGCCGGT;SOR=0.877;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=144;TCF=89;TCR=55;TR=70;WE=73900696;WS=73900678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,66:0.47:140
chr17	73906934	rs9302994	G	A	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.553;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=29;PP=942;ReadPosRankSum=-1.621;SC=GAGCTGAGAGGGAGGTGGAGC;SOR=0.166;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=80;TCF=14;TCR=66;TR=39;WE=73906942;WS=73906924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,46:0.52:88
chr17	73908566	rs9895947	A	C	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=26;ReadPosRankSum=-1.180;SC=TCCTACCTGGAAAGACCATTT;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=73908574;WS=73908556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr17	73909948	rs55793071	C	T	3098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.566;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.557;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=84;PP=2485;ReadPosRankSum=0.821;SC=AGGTGGGAGGCTGGGGGTGCC;SOR=0.962;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=205;TCF=60;TCR=145;TR=114;WE=73909956;WS=73909938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,116:0.56:207
chr17	73910165	rs144888266	G	C	1124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.200;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=11;PP=870;ReadPosRankSum=0.978;SC=GGGCTGCCTGGGCTCAGATGC;SOR=1.129;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=88;TCF=64;TCR=24;TR=43;WE=73910173;WS=73910155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,44:0.49:90
chr17	73913729	rs4788912	C	G	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=242;SC=AGTGAGGTCACGGGAGTGCCG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=73913737;WS=73913727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	73913965	rs11288315	TC	T	1910.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=18;PP=1997;SC=CAGCAGCTGCTCCCCCTTCCC;SOR=1.688;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=55;WE=73913973;WS=73913955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	73922941	rs2305913	T	C	1396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.590;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=961;ReadPosRankSum=0.523;SC=AGAAGTCCTCTCAATGGGTCT;SOR=0.738;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=93;TCF=45;TCR=48;TR=51;WE=73922949;WS=73922931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,56:0.55:101
chr17	73926121	rs1135889	C	A	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.856;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=51;ReadPosRankSum=-1.242;SC=CTCTGAGATACCTGAAACCTA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=4;WE=73926129;WS=73926111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr17	73931787	rs59867239	G	A	1441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=32;PP=1055;ReadPosRankSum=-1.702;SC=ATGACTTCAGGAGGAAAGAAG;SOR=0.654;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=124;TCF=50;TCR=74;TR=55;WE=73931795;WS=73931777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,57:0.45:128
chr17	73931847	rs7218498	C	G	963.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.261;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=30;PP=710;ReadPosRankSum=0.671;SC=AGGCGTCAGACCTTTCAGATG;SOR=0.912;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=76;TCF=10;TCR=66;TR=34;WE=73931855;WS=73931837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,37:0.46:81
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chr17	73953404	rs11077798	T	C	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=267;ReadPosRankSum=-1.147;SC=TCAAGTGATCTGCCCACCTCA;SOR=0.197;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=13;WE=73953412;WS=73953394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr17	73953737	rs79158403	C	G	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.569;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=509;ReadPosRankSum=0.258;SC=TTTAAACTCTCATATCTCAGA;SOR=0.044;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=52;TCF=4;TCR=48;TR=26;WE=73953745;WS=73953727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr17	73969953	rs3744033	A	G	1754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=59;PP=1478;ReadPosRankSum=0.301;SC=TTGGCCTTCAAGGAGAAGGTC;SOR=0.801;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=139;TCF=21;TCR=118;TR=68;WE=73969961;WS=73969943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,68:0.48:143
chr17	74017554	rs74955334	G	T	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FS=7.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQRankSum=-8.953;QD=3.23;ReadPosRankSum=2.058;SOR=1.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,17:0.15:111
chr17	74017573	rs78569674	C	G	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=1.155;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQRankSum=-9.001;QD=3.06;ReadPosRankSum=-2.590;SOR=0.953;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,14:0.13:108
chr17	74035543	rs7409	T	C	3051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=73;PP=2597;SC=CAGCGGCCCCTTTCCCAGGAG;SOR=2.687;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=17;TCR=73;TR=90;WE=74035551;WS=74035533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	74036573	rs2260516	A	T	3836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.514;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=89;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.703;SC=TTTCACAGGGATTCAGTAAGA;SOR=2.536;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=115;TCF=26;TCR=89;TR=113;WE=74036581;WS=74036563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,120:0.99:121
chr17	74036912	rs2598444	A	G	1159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=3;PP=1069;SC=AAACAGTAGTATGGGGTGTGA;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=36;WE=74036920;WS=74036902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	74037208	rs2598445	G	A	4030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=109;PP=2965;SC=ACAAAACAAAGCAAAACACTA;SOR=3.477;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=18;TCR=109;TR=127;WE=74037216;WS=74037198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr17	74039867	rs1530834	T	C	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=1;PP=1290;SC=GCTGACTCCATAACCTGCCAG;SOR=5.630;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=48;TCF=47;TCR=1;TR=47;WE=74039875;WS=74039857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	74046672	rs2665972	A	G	3175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=78;PP=2788;SC=CTAATGGGAGAGGAGCAAAAT;SOR=2.906;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=17;TCR=78;TR=95;WE=74046680;WS=74046662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	74056413	rs2665998	C	T	4163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=44;PP=2965;SC=CCAAGAGACCCTCAGTGCCCC;SOR=1.485;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=75;TCR=44;TR=119;WE=74056421;WS=74056403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr17	74063523	rs4789241	G	A	4807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=134;PP=2965;SC=TATACTTATGGTTACTAGAAT;SOR=5.079;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=10;TCR=134;TR=144;WE=74063531;WS=74063513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr17	74066320	.	ACAAAGCAAACAAACAAAC	A	81.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.259;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.81;MQRankSum=-8.836;QD=0.86;ReadPosRankSum=-1.408;SOR=0.016;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,10:0.11:95
chr17	74066447	rs2443168	T	A	11055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=369;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=207;NR=122;PP=2965;SC=ACATCTTGTATGTGATACTAA;SOR=1.196;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=330;TCF=208;TCR=122;TR=329;WE=74066455;WS=74066437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,338:1.00:338
chr17	74077071	rs187179298	G	A	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.405;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=49;PP=1027;ReadPosRankSum=1.809;SC=AGACTGACGAGCCTGTGACCA;SOR=2.050;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=101;TCF=5;TCR=96;TR=50;WE=74077079;WS=74077061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,51:0.50:103
chr17	74158736	rs62090128	G	A	2581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=53;PP=1976;ReadPosRankSum=-0.814;SC=TCAAGGACAGGCTGTCTCTAC;SOR=0.682;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=88;TCR=103;TR=99;WE=74158744;WS=74158726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,103:0.52:198
chr17	74169682	rs11655525	C	G	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=116;ReadPosRankSum=1.180;SC=TCTGGGGCTGCCGGAAACTGC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=6;WE=74169690;WS=74169672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr17	74261967	.	C	T	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.458;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=1.421;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.75;ReadPosRankSum=0.844;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,10:0.21:48
chr17	74283214	rs346786	C	A	1612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.668;NF=37;NR=3;PP=910;ReadPosRankSum=-0.145;SC=GAGGGCAGGGCCAAGCCAGCT;SOR=0.622;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=77;TCR=6;TR=40;WE=74283222;WS=74283204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
chr17	74283253	rs8072620	A	G	2169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=6.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.767;NF=56;NR=8;PP=1424;ReadPosRankSum=0.466;SC=CCCTGGAGCTAAAGAGTGGGG;SOR=0.676;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=113;TCR=16;TR=64;WE=74283261;WS=74283243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,66:0.50:133
chr17	74283769	rs346785	T	C	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=403;ReadPosRankSum=-1.377;SC=ACAATCCAGGTCAAAGACAGT;SOR=0.563;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=18;WE=74283777;WS=74283759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr17	74286082	rs4789273	C	T	4105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.620;HP=4;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=55;PP=2154;ReadPosRankSum=-0.445;SC=CTTTTGCTTTCTCCTGCCAAA;SOR=0.784;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=216;TCF=111;TCR=105;TR=110;WE=74286090;WS=74286072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,109:0.50:219
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chr17	74287204	rs2279052	C	G	1942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.051;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=45;PP=1598;ReadPosRankSum=1.261;SC=CTACTGAGCTCTCCCATCAGA;SOR=0.897;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=149;TCF=65;TCR=84;TR=74;WE=74287212;WS=74287194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,75:0.50:151
chr17	74287389	rs2279053	T	C	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.642;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=1042;ReadPosRankSum=-2.356;SC=AGGAATTCCATGTCGGTCCGA;SOR=0.519;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=99;TCF=60;TCR=39;TR=53;WE=74287397;WS=74287379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,55:0.54:101
chr17	74287594	rs2279054	G	A	1386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=29;PP=1129;ReadPosRankSum=-1.108;SC=TGATCTGGGTGTGTAGATCCC;SOR=0.719;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=45;TCR=52;TR=54;WE=74287602;WS=74287584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,53:0.54:99
chr17	74288564	rs35035566	CTGA	C	3939.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.352;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.337;NF=53;NR=28;PP=2966;ReadPosRankSum=-0.567;SC=CCAAACCACGCTGATGATCTG;SOR=0.481;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=200;TCF=130;TCR=70;TR=81;WE=74288574;WS=74288554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,106:0.51:208
chr17	74289242	rs3803736	T	C	2123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.435;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=34;PP=1730;ReadPosRankSum=-0.251;SC=CCAGGCCATGTTGATCGACGA;SOR=0.784;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=167;TCF=85;TCR=82;TR=76;WE=74289250;WS=74289232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,80:0.45:176
chr17	74289500	rs3803737	G	A	1834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.684;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=22;PP=1385;ReadPosRankSum=1.107;SC=GCTCATCCACGACAAATGGTA;SOR=1.377;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=106;TCF=63;TCR=43;TR=64;WE=74289508;WS=74289490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,68:0.61:111
chr17	74289705	rs6501880	A	G	3305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=373;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.893;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=77;PP=2518;ReadPosRankSum=-1.259;SC=GTCTCTGGCCAAGGGTAAGTC;SOR=0.722;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=363;TCF=185;TCR=178;TR=144;WE=74289713;WS=74289695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:224,148:0.40:372
chr17	74289839	rs6501881	G	A	2760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.233;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=69;PP=2119;ReadPosRankSum=0.543;SC=GTCGTGGCACGCCAGCTTCAT;SOR=0.561;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=248;TCF=90;TCR=158;TR=111;WE=74289847;WS=74289829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,114:0.45:251
chr17	74289875	rs6501882	C	T	2664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.053;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=49;PP=2153;ReadPosRankSum=-0.731;SC=GCTGCTGTCTCCCAGTACCAG;SOR=0.614;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=209;TCF=101;TCR=108;TR=97;WE=74289883;WS=74289865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,100:0.47:213
chr17	74289908	rs6501883	A	G	2800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=8.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.508;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=36;PP=2229;ReadPosRankSum=-2.115;SC=TTTGTTCCCTACTGGAAACCC;SOR=0.768;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=214;TCF=132;TCR=82;TR=98;WE=74289916;WS=74289898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,103:0.46:222
chr17	74290097	rs7225131	T	A	1680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.438;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=48;PP=1236;ReadPosRankSum=-0.817;SC=TAAGTGTTTCTGAGCCCTGGT;SOR=1.659;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=121;TCF=29;TCR=92;TR=57;WE=74290105;WS=74290087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,64:0.48:132
chr17	74300497	rs73996306	G	A	983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=4;PP=758;ReadPosRankSum=-0.537;SC=CTGGTTCACCGCTTGTGAGGC;SOR=0.892;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=78;TCF=68;TCR=10;TR=39;WE=74300505;WS=74300487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,40:0.50:80
chr17	74300916	rs8068457	G	C	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=309;ReadPosRankSum=-0.193;SC=ACTGAGAGACGGCCAGCCCCC;SOR=0.588;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=37;TCF=30;TCR=7;TR=16;WE=74300924;WS=74300906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,20:0.48:42
chr17	74301070	rs8068763	G	A	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.001;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=28;PP=638;ReadPosRankSum=1.870;SC=CCCTACACACGCACACTCACA;SOR=1.064;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=78;TCF=20;TCR=58;TR=35;WE=74301078;WS=74301060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,39:0.44:89
chr17	74303379	rs73996309	G	A	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=141;ReadPosRankSum=-0.662;SC=GGTAGAGCATGGGCCACTCTA;SOR=0.984;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=9;WE=74303387;WS=74303373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr17	74307737	rs10459	T	C	1875.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.683;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=40;PP=1450;ReadPosRankSum=0.529;SC=TCTTGGGACATTGCAGCTTCT;SOR=0.947;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=166;TCF=76;TCR=90;TR=71;WE=74307745;WS=74307727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,75:0.43:174
chr17	74308891	rs61440609	T	G	1335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.946;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=10;PP=1106;ReadPosRankSum=-1.078;SC=ACTGAATCATTTTATTATTCC;SOR=1.431;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=115;TCF=85;TCR=30;TR=54;WE=74308899;WS=74308881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,52:0.44:117
chr17	74310084	rs56194157	A	C	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=4.122;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.90;ReadPosRankSum=0.984;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr17	74324729	rs346791	C	A	1932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.32;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	74326198	.	T	C	784.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=6.983;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=26;PP=598;ReadPosRankSum=0.107;SC=GAAGGAAAAATAGAAAATACT;SOR=0.831;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=68;TCF=5;TCR=63;TR=27;WE=74326206;WS=74326188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,29:0.40:73
chr17	74326553	rs449114	G	A	2615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.10;SOR=4.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	74326556	rs399029	A	T	2649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.16;SOR=3.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	74349515	rs114276513	G	A	192.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=142;SC=CCCGCCCCAGGTGCAGGAGGT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=74349523;WS=74349505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr17	74349834	rs372518573	T	G	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=20;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=33;ReadPosRankSum=0.189;SC=GGCTGCACTCTGAGTGCTTCC;SOR=0.693;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=4;WE=74349842;WS=74349824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
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chr17	74398514	rs11652985	G	C	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=10.242;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.90;ReadPosRankSum=1.741;SOR=0.048;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr17	74401405	rs11290311	AG	A	6801.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=139;PP=2974;SC=GTCCTGGGGGAGGGGAGGAGA;SOR=2.054;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=192;TCF=40;TCR=152;TR=176;WE=74401413;WS=74401395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr17	74466085	rs72466449	C	T	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=38;ReadPosRankSum=-0.524;SC=CAACATGATCCCCGTCTCTGC;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=3;WE=74466093;WS=74466075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr17	74468552	rs12942767	A	G	5665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=51;PP=2965;SC=AAGATAAATGAGGCGGTGGAG;SOR=1.664;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=168;TCF=117;TCR=51;TR=168;WE=74468560;WS=74468542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr17	74471298	rs12951122	G	A	1192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.380;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=38;PP=1069;ReadPosRankSum=0.322;SC=GGGCCACCCTGGCCTGGTCAC;SOR=0.151;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=92;TCF=11;TCR=81;TR=45;WE=74471306;WS=74471288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,44:0.47:93
chr17	74473593	rs3833088	A	AG	1191.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=5;PP=1515;ReadPosRankSum=1.558;SC=ATGGGGGCCCAGCAGCTCCAC;SOR=0.412;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=75;TCF=66;TCR=9;TR=37;WE=74473601;WS=74473583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,38:0.51:74
chr17	74475024	rs3744045	G	A	5037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=74;PP=2965;SC=CGGTGGGTGCGGGGCGTGGGG;SOR=0.758;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=82;TCR=74;TR=155;WE=74475032;WS=74475014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr17	74475975	rs3809694	C	A	1264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.499;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=923;ReadPosRankSum=0.747;SC=GTGGTGTGTGCAGCCCAGGTC;SOR=0.540;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=113;TCF=64;TCR=49;TR=46;WE=74475983;WS=74475965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,50:0.43:117
chr17	74476045	rs3826287	G	C	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.196;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=34;PP=856;ReadPosRankSum=-1.561;SC=CTTCAACCCTGATTTATGCCC;SOR=1.160;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=108;TCF=27;TCR=81;TR=42;WE=74476053;WS=74476035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,45:0.40:113
chr17	74476089	rs138608987	ATGTGTGTGTG	A	572.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.784;NF=0;NR=14;PP=1846;ReadPosRankSum=-0.457;SC=TATATATATAATGTGTGTGTG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=1;TCR=52;TR=14;WE=74476106;WS=74476079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr17	74477340	rs3826288	A	G	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=2;PP=815;SC=GGCTGCACAGACAGCAGCTGT;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=74477348;WS=74477330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	74477691	rs11870168	C	T	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=20;PP=687;SC=AGGACCCTGACGCCAGGGCAC;SOR=1.697;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=27;WE=74477699;WS=74477681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	74524651	rs4238995	TT	GG	1301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.067;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=17;PP=1481;ReadPosRankSum=0.798;SC=GGGGGTGGAGTTAGGGGTCCT;SOR=1.085;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=64;TCF=30;TCR=34;TR=30;WE=74524660;WS=74524641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,34:0.52:66
chr17	74534650	rs9914222	G	T	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.840;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=576;ReadPosRankSum=1.702;SC=GTCCAGAGAGGCACCGGATAG;SOR=0.960;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=86;TCF=34;TCR=52;TR=35;WE=74534658;WS=74534640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,35:0.40:87
chr17	74536333	.	CG	GG	834	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000,1.0000;HP=12;HapScore=3;MGOF=4;MMLQ=13;MQ=61.94;NF=5,8;NR=15,18;PP=52,834;QD=2.9;SC=GGCGGTTGGTCGGGGGGGGGG;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=20,26;WE=74536343;WS=74536323;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:7,26:0.79:33
chr17	74536333	.	CG	CGG	834	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000,1.0000;HP=12;HapScore=3;MGOF=4;MMLQ=13;MQ=61.94;NF=5,8;NR=15,18;PP=52,834;QD=2.9;SC=GGCGGTTGGTCGGGGGGGGGG;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=20,26;WE=74536343;WS=74536323;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr17	74536762	rs2289607	G	T	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=3.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=340;ReadPosRankSum=0.000;SC=TGCGTGCACCGTATCCTGGCC;SOR=1.101;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=15;WE=74536770;WS=74536752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr17	74539092	rs4318240	C	T	6591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=119;NR=90;PP=2965;SC=TGCTGATCTGCTCTGGTTTTC;SOR=1.001;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=209;TCF=119;TCR=90;TR=209;WE=74539100;WS=74539082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr17	74540492	rs2278639	C	T	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.653;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=5;PP=293;ReadPosRankSum=0.173;SC=GCTGGGGAGGCGCTCAGGGTG;SOR=0.071;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=16;WE=74540500;WS=74540482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr17	74540917	rs895157	A	C	2426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.707;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=78;PP=1779;ReadPosRankSum=0.192;SC=AGGAATTGTCAGGCCAAGGTC;SOR=0.927;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=196;TCF=64;TCR=132;TR=110;WE=74540925;WS=74540907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,106:0.55:192
chr17	74541129	rs4232870	A	G	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.893;HP=2;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=13;PP=723;ReadPosRankSum=0.420;SC=CTGGGGTGCCATGTGGGCCGG;SOR=0.274;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=20;WE=74541145;WS=74541119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,23:0.50:46
chr17	74541137	rs4648339	C	T	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.050;HP=3;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=1036;ReadPosRankSum=-0.884;SC=CCATGTGGGCCGGGTGGGGGG;SOR=1.936;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=23;WE=74541145;WS=74541119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr17	74541171	rs5742903	T	C	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.724;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=15;PP=560;ReadPosRankSum=0.864;SC=GGGAGCAGGCTGGCTTTGGTG;SOR=0.323;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=55;TCF=32;TCR=23;TR=29;WE=74541179;WS=74541161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,29:0.51:57
chr17	74554739	rs4648343	C	G	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.095;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=6;PP=1289;ReadPosRankSum=0.555;SC=AAATGAGTAGCGTCTTTGCCC;SOR=0.223;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=109;TCF=100;TCR=9;TR=53;WE=74554747;WS=74554729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,54:0.48:112
chr17	74555106	rs4647885	T	C	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.609;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.290;NF=27;NR=11;PP=707;ReadPosRankSum=0.172;SC=AGGATCTTCATGATGAAATTT;SOR=0.325;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=88;TCF=68;TCR=20;TR=38;WE=74555114;WS=74555096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,39:0.43:91
chr17	74557681	rs4510053	A	C	5759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=149;NR=21;PP=2965;SC=TGTTTGTAAGATTTGTTTACA;SOR=4.003;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=150;TCR=21;TR=170;WE=74557689;WS=74557671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr17	74557803	rs60161580	GT	G	4844.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.206;NF=17;NR=151;PP=2988;ReadPosRankSum=1.799;SC=TGGCTCCATGGTTTTTTTTTT;SOR=1.072;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=201;TCF=20;TCR=181;TR=168;WE=74557811;WS=74557793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,194:0.99:196
chr17	74559287	rs4451979	T	C	223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.511;NF=0;NR=12;PP=158;ReadPosRankSum=0.340;SC=ATGCGTTCTTTGGGCTTCATC;SOR=0.299;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=12;WE=74559295;WS=74559277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr17	74563653	rs2241918	A	G	9047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=166;NR=130;PP=2965;SC=AAAAAGAGACATTTCAGCTCA;SOR=0.966;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=297;TCF=166;TCR=131;TR=296;WE=74563661;WS=74563643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,312:1.00:312
chr17	74570408	rs7207173	A	G	4910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=60;PP=2965;SC=GCAGGAAGCTAAGGCAGAAGG;SOR=1.017;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=84;TCR=60;TR=144;WE=74570416;WS=74570398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr17	74570559	rs17513606	C	T	2185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.455;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=67;PP=1718;ReadPosRankSum=-2.184;SC=AGAGATTGAACAGGCCACGGA;SOR=0.966;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=208;TCF=65;TCR=143;TR=94;WE=74570567;WS=74570549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,93:0.45:207
chr17	74574826	rs2304921	C	T	1828.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.928;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=38;PP=1543;ReadPosRankSum=1.594;SC=ACAGGGTAGTCGACCACTCTA;SOR=0.466;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=147;TCF=66;TCR=81;TR=74;WE=74574834;WS=74574816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,73:0.49:148
chr17	74581914	rs3135934	C	G	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.105;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=11;PP=280;ReadPosRankSum=0.073;SC=GCGAGCGCCCCGTCCGCTGAC;SOR=0.929;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=54;TCF=22;TCR=32;TR=18;WE=74581922;WS=74581904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,19:0.35:54
chr17	74581945	rs12449329	AA	GC	1660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=23;PP=1381;SC=GAAGGGAGAGAACCGGGTGGG;SOR=2.891;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=27;WE=74581954;WS=74581935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	74582025	rs1867561	G	C	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=12;PP=352;SC=TGCGGCGCCTGCCCGCCCGGC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=74582033;WS=74582015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	74621635	rs2286595	C	T	1159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=27;PP=897;SC=AGGAGAAACACGGCCTGTAGT;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=32;WE=74621643;WS=74621625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	74625865	.	GT	G	86.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=11.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.55;MQRankSum=2.572;QD=2.99;ReadPosRankSum=3.453;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr17	74639530	rs719430	T	C	3143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=23;PP=2609;SC=CCCTGGGCTATCATTTTTCTG;SOR=2.232;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=98;TCF=75;TCR=23;TR=97;WE=74639538;WS=74639520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr17	74681435	rs2286593	A	G	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.010;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=322;ReadPosRankSum=-1.686;SC=CTACAACGAGACAGCCAGAGA;SOR=1.981;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=13;WE=74681443;WS=74681425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr17	74684159	rs117149310	G	A	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=264;ReadPosRankSum=-1.627;SC=CCCCGACACTGTCAGGCCCCC;SOR=0.352;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=13;WE=74684167;WS=74684149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr17	74684598	rs4788942	C	T	2454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=48;PP=1926;ReadPosRankSum=-1.478;SC=CTGCGGCCAGCAGACAAAGGG;SOR=0.674;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=198;TCF=101;TCR=97;TR=97;WE=74684606;WS=74684588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,99:0.50:199
chr17	74684858	rs7219390	T	C	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=295;ReadPosRankSum=-0.024;SC=CTTGCAGGAATGTCAGAGGAT;SOR=0.997;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=17;WE=74684866;WS=74684848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr17	74712886	rs1014390	G	A	2976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=81;PP=2434;SC=GTTAAAAGCAGGACCCCCGGG;SOR=4.688;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=6;TCR=82;TR=87;WE=74712894;WS=74712876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	74716759	rs12943725	A	G	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=423;ReadPosRankSum=0.309;SC=GAGAAACCCAATACGGTGCCC;SOR=0.246;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=19;WE=74716767;WS=74716749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr17	74718155	rs2240769	C	T	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.523;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=215;ReadPosRankSum=1.646;SC=CCTTCTGATCCAGGGATTGCA;SOR=0.066;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=12;WE=74718163;WS=74718145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,12:0.35:34
chr17	74728938	rs4789351	C	T	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=0;PP=567;SC=TTTATACAAACCCAGAAAGAC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=74728946;WS=74728928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	74732507	rs237058	A	G	15854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=502;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=128;NR=368;PP=2965;SC=ACCTGGAACGACTCCGACTCC;SOR=2.185;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=496;TCF=128;TCR=368;TR=496;WE=74732515;WS=74732497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,497:1.00:497
chr17	74733099	rs237057	G	A	1610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.569;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=34;PP=1311;ReadPosRankSum=0.946;SC=TGGTGTAGCGGTCCCGCGGGA;SOR=0.332;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=144;TCF=57;TCR=87;TR=64;WE=74733107;WS=74733089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,65:0.45:146
chr17	74733403	rs3744061	G	A	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=160;ReadPosRankSum=0.643;SC=TAGCGCACCTGAGTAACAACT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=9;WE=74733411;WS=74733393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr17	74734323	rs237054	G	A	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=0;PP=972;SC=CCTGGCTCCTGCATCTGCCTT;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=74734331;WS=74734313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
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chr17	74750215	rs11399997	C	CT	8436.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=104;PP=2967;SC=TCAGGAACAACTCGGCATTTG;SOR=0.738;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=180;TCF=73;TCR=107;TR=172;WE=74750223;WS=74750205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,227:1.00:227
chr17	74750331	rs116719	C	T	2331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=61;PP=1822;SC=CAACATCTCTCTAACATGGGG;SOR=5.728;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=2;TCR=61;TR=63;WE=74750339;WS=74750321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	74857515	rs499828	A	C	58.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.70;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr17	74857676	rs13342029	A	G	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=6;PP=172;ReadPosRankSum=-0.068;SC=GAGGTGCTACATACTTTTAAA;SOR=0.741;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=17;TCF=9;TCR=8;TR=14;WE=74857684;WS=74857666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr17	74899234	rs568277	T	A	1349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.351;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=11;PP=1022;ReadPosRankSum=-1.803;SC=TAGGCCCGGGTTGACCTTGTG;SOR=0.361;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=97;TCF=78;TCR=19;TR=50;WE=74899242;WS=74899224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,53:0.53:100
chr17	74899320	rs567361	G	C	2840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.807;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=36;PP=2140;ReadPosRankSum=0.190;SC=CCTCCCGCACGCAGGCCTCCC;SOR=1.038;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=215;TCF=134;TCR=81;TR=107;WE=74899328;WS=74899310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,112:0.51:219
chr17	74902358	rs3803742	C	T	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.148;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=50;ReadPosRankSum=-0.712;SC=GCTGTGGGAGCACCTGCTCTG;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=74902366;WS=74902348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr17	74920957	rs3889146	G	T	3195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=9;PP=2663;SC=CTCTGCACTTGTACAGTTCAT;SOR=4.152;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=84;TCR=9;TR=93;WE=74920965;WS=74920947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	74921257	rs8067585	G	A	1620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=46;PP=1274;SC=CTGCCCCCACGTCCCCACTCA;SOR=4.215;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=5;TCR=46;TR=51;WE=74921265;WS=74921247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	74922636	rs12450749	G	A	1594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=0;PP=1394;SC=AGGGACACACGGGGAGGTTGC;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=48;TCR=0;TR=48;WE=74922644;WS=74922626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	74922652	rs11653088	C	T	1978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=2;PP=1737;SC=GTTGCTGACCCTGGTTCCTGG;SOR=5.856;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=54;TCR=2;TR=56;WE=74922660;WS=74922642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	74922706	rs33966966	C	T	3739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=13;PP=2965;SC=TCGACACCTTCGGGACGGAAC;SOR=3.729;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=100;TCR=13;TR=113;WE=74922714;WS=74922696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr17	74928758	rs79286496	C	T	8697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=142;NR=128;PP=2965;ReadPosRankSum=1.903;SC=TCATGGGCTTCGTGTCCGAGG;SOR=0.284;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=271;TCF=143;TCR=128;TR=270;WE=74928766;WS=74928748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,279:1.00:280
chr17	74928921	rs77352627	C	T	2338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.76;SOR=5.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	74928931	rs8078608	C	T	1899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.23;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	74929442	rs12600695	A	G	4228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.590;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=117;PP=2965;ReadPosRankSum=0.321;SC=TCCAGCAGCCACTCCAGGGGT;SOR=4.615;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=129;TCF=11;TCR=118;TR=127;WE=74929450;WS=74929432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,130:0.98:132
chr17	74936576	rs8081793	G	A	13034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=446;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=192;NR=236;PP=2965;ReadPosRankSum=0.407;SC=GCTTCAGCCCGCCCCACAGCT;SOR=0.947;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=432;TCF=194;TCR=238;TR=428;WE=74936584;WS=74936566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,438:1.00:440
chr17	74937066	rs9900337	C	G	1464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=42;PP=1190;SC=CATCCCTCCCCTGGTCAGACA;SOR=7.658;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=43;WE=74937074;WS=74937056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	74942478	rs8067984	C	T	4836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=58;PP=2965;SC=ACCTACCCTACGAGTACACCT;SOR=1.453;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=101;TCR=58;TR=159;WE=74942486;WS=74942468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr17	74944709	rs9894270	T	C	6682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=137;NR=87;PP=2965;ReadPosRankSum=0.819;SC=CGGTGCTGTGTGGTCCCTGCC;SOR=0.462;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=225;TCF=138;TCR=87;TR=224;WE=74944717;WS=74944699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,226:1.00:227
chr17	75085226	rs3214724	TC	T	1528.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=1;PP=1686;SC=TGTTACTTTTTCCCCCAAGGT;SOR=6.439;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=52;TCF=51;TCR=1;TR=47;WE=75085234;WS=75085216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	75085260	rs2247814	C	G	2499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=3;PP=1976;SC=GAGAAATATCCCCCGACGATT;SOR=6.161;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=83;TCF=80;TCR=3;TR=83;WE=75085268;WS=75085250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr17	75085434	rs2678770	G	A	6800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=121;PP=2965;ReadPosRankSum=0.452;SC=GCCAAGTTGTGGGTGCAGCAT;SOR=0.443;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=199;TCF=77;TCR=122;TR=198;WE=75085442;WS=75085424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,210:1.00:211
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chr17	75190846	rs673918	A	C	5305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=69;PP=2965;SC=TTCCATCACGACCTCTTCAGA;SOR=0.915;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=86;TCR=69;TR=155;WE=75190854;WS=75190836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
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chr17	75397802	rs139887327	C	CA	233.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.269;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.446;NF=11;NR=2;PP=147;ReadPosRankSum=-0.463;SC=GACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SOR=1.751;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=13;WE=75397810;WS=75397792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
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chr17	75494705	rs2627223	A	G	1437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=29;PP=1147;SC=GGCCAACGGCATGGAGGAGAA;SOR=1.426;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=48;WE=75494713;WS=75494695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr17	75494746	rs1059485	A	G	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=1.120;NF=5;NR=11;PP=265;ReadPosRankSum=2.107;SC=TGTAGACGCCACCCTGCCCAC;SOR=0.807;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=16;WE=75494754;WS=75494736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr17	75494780	rs11537705	A	T	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.861;NF=3;NR=11;PP=303;ReadPosRankSum=-0.956;SC=CCCCCAAGTCATTTCCGTCCC;SOR=0.910;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=14;WE=75494795;WS=75494770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr17	75494787	rs5822173	T	TC	540.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=14;PP=714;SC=GTCATTTCCGTCCCCCCCCAG;SOR=1.981;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=19;WE=75494795;WS=75494770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	75834770	rs9910282	A	G	1046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=22;PP=854;ReadPosRankSum=0.131;SC=CTGCTCAAGAAGAAATCTTGG;SOR=0.656;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=87;TCF=43;TCR=44;TR=42;WE=75834778;WS=75834760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,42:0.45:93
chr17	76047561	.	TAA	T	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.51;MQRankSum=-1.197;QD=1.42;ReadPosRankSum=0.387;SOR=0.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,6:0.17:35
chr17	76087407	.	CA	C	33.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQRankSum=-0.174;QD=0.53;ReadPosRankSum=-1.643;SOR=0.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,13:0.20:64
chr17	76113872	rs143140501	G	A	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.997;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=12;PP=635;ReadPosRankSum=0.988;SC=CCCTCCACCCGCCCCACTCAC;SOR=0.506;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=44;TCR=23;TR=35;WE=76113880;WS=76113862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,37:0.55:67
chr17	76113954	rs2613516	G	A	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.956;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=25;PP=725;ReadPosRankSum=0.766;SC=TGAGGAAGACGGTGCTCATGT;SOR=1.078;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=95;TCF=47;TCR=48;TR=41;WE=76113962;WS=76113944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,41:0.44:94
chr17	76114963	rs2748430	C	G	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=513;ReadPosRankSum=-0.547;SC=GGGGAGGGTTCTAGTGTCCCA;SOR=0.317;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=11;WE=76114983;WS=76114953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr17	76114975	rs2748429	G	T	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=513;ReadPosRankSum=0.397;SC=AGTGTCCCAGGCTCTGCCCAG;SOR=0.793;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=10;WE=76114983;WS=76114953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr17	76115181	rs2252496	A	T	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.022;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=601;ReadPosRankSum=-0.818;SC=CCTCCCCGAGATCAGGCTGGT;SOR=1.133;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=80;TCF=34;TCR=46;TR=35;WE=76115189;WS=76115171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,36:0.44:82
chr17	76115353	rs2748428	T	C	1643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.275;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=25;PP=1174;ReadPosRankSum=-0.231;SC=GGCCAGACAGTAGGAGGCAAG;SOR=0.486;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=126;TCF=77;TCR=49;TR=58;WE=76115361;WS=76115343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,65:0.49:132
chr17	76116017	rs743047	C	A	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.765;NF=34;NR=1;PP=864;ReadPosRankSum=-0.626;SC=GCGTGAGCCACCACACCGGGC;SOR=0.446;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=58;TCF=57;TCR=1;TR=35;WE=76116025;WS=76116007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,36:0.61:59
chr17	76116153	rs2926778	T	C	2699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.131;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=63;PP=2084;ReadPosRankSum=0.584;SC=GAACATTTTTTAAATGTTCCT;SOR=0.378;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=163;TCF=53;TCR=110;TR=99;WE=76116161;WS=76116143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,101:0.60:168
chr17	76117361	rs2073285	T	C	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=280;SC=CTCCAAGATCTGGCCCTCCCC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=76117369;WS=76117351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	76117878	.	CAT	C	5332.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.956;ClippingRankSum=0.000;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.808;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.132;NF=37;NR=75;PP=2978;ReadPosRankSum=0.282;SC=ACACAACACACATGAGACACA;SOR=1.025;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=212;TCF=70;TCR=142;TR=112;WE=76117887;WS=76117868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,139:0.53:263
chr17	76117971	rs1997978	G	A	3006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=85;PP=2412;SC=CCCTCCAGGCGCAGAGAGGAC;SOR=6.229;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=3;TCR=85;TR=88;WE=76117979;WS=76117961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	76119930	rs55677349	T	C	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=0;PP=1072;SC=AAGTGGATAGTTGGATAGGTG;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=37;WE=76119938;WS=76119920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	76121760	rs7502920	C	T	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.938;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=0;PP=662;ReadPosRankSum=1.471;SC=TTGCACCCCACCCCAGGCCGG;SOR=2.331;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=30;WE=76121768;WS=76121750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,31:0.60:52
chr17	76128386	rs1354985	G	C	3509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=26;PP=2893;SC=GACTCTCAGCGCGGCCCCAGC;SOR=2.325;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=80;TCR=26;TR=106;WE=76128394;WS=76128376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr17	76128662	rs1396149	G	C	1296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=24;PP=992;SC=CCAGGGCCCAGAGCGTGGCGA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=37;WE=76128670;WS=76128652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	76130575	rs7208422	A	T	8909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=184;NR=92;PP=2965;SC=AACGTACTCAACGGGCTCCTG;SOR=1.545;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=276;TCF=184;TCR=92;TR=276;WE=76130583;WS=76130565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr17	76131070	rs12452890	G	A	7850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=135;PP=2965;SC=CCAACACGGAGGTCAACCTCA;SOR=1.004;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=238;TCF=102;TCR=136;TR=237;WE=76131078;WS=76131060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr17	76134828	rs7221365	C	A	3546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=68;PP=2965;SC=TCAGGGCAGCCGGGGCCATGG;SOR=1.477;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=37;TCR=68;TR=105;WE=76134836;WS=76134818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr17	76137198	rs369764	T	G	1135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=27;PP=893;SC=CTGTAACCCCTACCCCTGCCT;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=8;TCR=27;TR=35;WE=76137206;WS=76137188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	76142402	rs2310998	G	A	978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=8;PP=780;SC=CACCCACCCAGGGAGCATCCC;SOR=2.019;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=29;WE=76142410;WS=76142392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	76142811	rs147459634	GT	G	1933.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=10;PP=1980;SC=AAGAGCTTTTGTGAGTGATGG;SOR=2.655;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=44;WE=76142819;WS=76142801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	76143009	rs7217374	G	A	2877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=69;PP=2240;SC=GGCATAGCCTGCTGCAGGGAG;SOR=2.511;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=20;TCR=69;TR=89;WE=76143017;WS=76142999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr17	76156983	rs62079086	T	C	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.995;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=2;PP=571;ReadPosRankSum=-0.040;SC=CTTCTTAAGGTGCTTGATCAA;SOR=1.280;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=72;TCF=63;TCR=9;TR=31;WE=76156991;WS=76156973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,31:0.42:73
chr17	76157266	rs4071641	T	C	5082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=126;PP=2965;SC=CTACTTCTGCTGGGCGTCCTC;SOR=2.028;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=178;TCF=51;TCR=127;TR=176;WE=76157274;WS=76157256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr17	76157348	rs12951279	G	A	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.142;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=589;ReadPosRankSum=-0.231;SC=GAGTGCGGTGGGGGGCACAGG;SOR=2.712;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=26;WE=76157356;WS=76157338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
chr17	76162134	rs3644	C	T	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.117;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=83;ReadPosRankSum=0.605;SC=GTAGAATGAACCGTCCAGAGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=76162142;WS=76162124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr17	76164925	rs112700371	G	A	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.856;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.808;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=69;ReadPosRankSum=1.200;SC=GGCGAGCGGGGCCGGCGTCCA;SOR=1.981;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=5;WE=76164933;WS=76164915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr17	76167047	rs1062668	C	T	5862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=445;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.117;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.217;NF=130;NR=87;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.581;SC=TGGCCTCGGCCTTCTTCTTGG;SOR=0.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=430;TCF=257;TCR=173;TR=217;WE=76167055;WS=76167037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:223,219:0.50:442
chr17	76171139	.	C	G	2474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.757;ClippingRankSum=0.000;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.126;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.016;NF=50;NR=43;PP=1890;ReadPosRankSum=0.341;SC=ACCTCCTTCTCTGTGCCGAGC;SOR=0.786;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=187;TCF=92;TCR=95;TR=93;WE=76171147;WS=76171129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,96:0.50:191
chr17	76171277	rs8072887	C	T	2020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=55;PP=1518;ReadPosRankSum=1.082;SC=AGACAGAGGGCGCTCAGCCAC;SOR=0.661;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=55;TCR=114;TR=82;WE=76171285;WS=76171267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,85:0.49:175
chr17	76178748	rs1143697	T	C	860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.174;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=28;PP=633;ReadPosRankSum=-0.964;SC=AGGCGGGCAGTGCCTCCATGG;SOR=1.222;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=100;TCF=39;TCR=61;TR=41;WE=76178756;WS=76178738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,42:0.41:102
chr17	76182771	rs150794517	G	A	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=65.76;MQRankSum=3.105;QD=35.14;ReadPosRankSum=0.122;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr17	76182776	rs139163612	G	A	2312.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=65.05;MQRankSum=6.192;QD=25.99;ReadPosRankSum=0.501;SOR=1.000;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,58:0.65:89
chr17	76182781	rs149930991	G	A	1226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=66.50;MQRankSum=4.161;QD=33.16;ReadPosRankSum=1.292;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,29:0.78:37
chr17	76182805	.	G	GGAGGGGAGGC	2823.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.659;ClippingRankSum=0.000;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=7.322;NF=66;NR=5;PP=2976;ReadPosRankSum=6.722;SC=GGAGGGGAGGGACGGGACAAG;SOR=0.456;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=126;TCF=119;TCR=7;TR=71;WE=76182813;WS=76182795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,77:0.61:127
chr17	76183043	rs1071664	A	G	2762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.946;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=70;PP=2241;ReadPosRankSum=1.188;SC=TGGGGGAGCCAGGCAGCACAG;SOR=1.282;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=223;TCF=97;TCR=126;TR=114;WE=76183051;WS=76183033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,113:0.51:223
chr17	76183348	rs118063987	T	G	565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=8;PP=436;ReadPosRankSum=-0.338;SC=TGGGGCCTGGTCTGAGCCCCG;SOR=0.269;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=20;WE=76183356;WS=76183338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr17	76198458	rs11649894	C	T	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.992;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.712;NF=23;NR=3;PP=623;ReadPosRankSum=-0.978;SC=TGCAGTGAGCCGAGATCGCGC;SOR=0.360;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=26;WE=76198466;WS=76198448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr17	76198754	rs35822441	T	C	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.540;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=18;PP=659;ReadPosRankSum=1.648;SC=GGGCGGGCCTTGCTCACACGC;SOR=0.317;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=33;WE=76198762;WS=76198744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,35:0.56:63
chr17	76210367	rs9904341	G	C	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.420;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=8;PP=920;ReadPosRankSum=-1.548;SC=TTTGAATCGCGGGACCCGTTG;SOR=1.260;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=99;TCF=79;TCR=20;TR=48;WE=76210375;WS=76210357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,51:0.50:102
chr17	76218857	rs4789559	G	A	2351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.281;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=12;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.987;SC=AAAAAATATGGTAGGGAAGGG;SOR=1.782;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=178;TCF=141;TCR=37;TR=85;WE=76218877;WS=76218847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,87:0.48:183
chr17	76218869	rs17882271	G	A	2773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.565;HP=4;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=25;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.572;SC=AGGGAAGGGGGTCCCTGGATT;SOR=1.176;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=212;TCF=155;TCR=57;TR=108;WE=76218877;WS=76218847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,111:0.51:219
chr17	76219123	.	TAGACTAGCTGGGGTGCCC	T	625	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=63.51;NF=0;NR=8;PP=625;QD=83.5;SC=CTGGGGTGCCTAGACTAGCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=8;WE=76219148;WS=76219113;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
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chr17	76230693	rs79885699	T	G	2370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.063;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=41;PP=1854;ReadPosRankSum=0.476;SC=GTGCAGTCATTGTGGTCCTGC;SOR=0.595;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=210;TCF=117;TCR=93;TR=90;WE=76230701;WS=76230683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,93:0.43:216
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chr17	76235015	rs880190	G	A	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.862;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=6;PP=396;ReadPosRankSum=-0.446;SC=TAGCGGGGCCGGGGATGCTGA;SOR=0.307;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=65;TCF=53;TCR=12;TR=25;WE=76235023;WS=76235005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,26:0.39:66
chr17	76267843	rs872359	G	A	3614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.938;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=67;PP=2690;ReadPosRankSum=0.990;SC=GGTATCTCCCGACATGAGCAC;SOR=0.705;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=254;TCF=125;TCR=129;TR=133;WE=76267851;WS=76267833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,143:0.54:265
chr17	76394042	rs16971107	G	A	1455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=0;PP=1209;SC=ACCTGGTGTCGTAGCGTTTCC;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=43;WE=76394050;WS=76394032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	76394449	rs2292644	C	T	2064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=56;PP=1672;SC=GGCATGCAAGCCTGGCCCCTC;SOR=5.387;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=59;TCF=2;TCR=57;TR=58;WE=76394457;WS=76394439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	76395421	rs2292643	G	A	3852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.29;SOR=5.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
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chr17	76395750	rs12450500	C	T	3125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.41;SOR=8.581;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	76396963	rs3817294	A	G	2133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=52;PP=1638;SC=ACACCCTTCTATGGCTGTGGG;SOR=3.160;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=11;TCR=52;TR=63;WE=76396971;WS=76396953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	76400236	rs3744219	G	A	2416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=54;PP=1766;SC=AGGGGGTGGGGAGCCCTGGCG;SOR=4.479;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=6;TCR=54;TR=60;WE=76400244;WS=76400226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	76400258	rs3744217	G	A	1717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.20;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	76400268	rs3826323	C	G	1568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.82;SOR=3.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr17	76410871	rs3744216	G	A	3776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=39;PP=2844;SC=AGGGCAGGCCGCCTTTCTCTT;SOR=1.590;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=78;TCR=39;TR=116;WE=76410879;WS=76410861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr17	76411154	rs3833108	T	TG	273.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=313;SC=AGGGTGTGGCTGGGGGCCCAG;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=76411162;WS=76411144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	76422473	rs4969188	T	C	2175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=8;PP=1702;SC=GGGTGTGGGGTGTGCCGAGCT;SOR=3.816;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=57;TCR=8;TR=65;WE=76422481;WS=76422463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	76423097	rs2271613	G	A	6019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=110;PP=2965;SC=CGACTACCACGTAGGGGGTCT;SOR=1.161;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=185;TCF=75;TCR=110;TR=185;WE=76423105;WS=76423087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr17	76424482	rs651806	A	G	1967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=2;PP=1614;SC=ACCCAAGCCCAAGGCTGGGGC;SOR=5.670;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=68;TCR=2;TR=70;WE=76424490;WS=76424472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	76433685	rs2289757	A	G	1161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=2;PP=925;SC=AGGCCGTGGCATGGGATGGGG;SOR=5.186;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=40;WE=76433693;WS=76433678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	76433898	rs12941494	T	C	4094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=94;PP=2965;SC=CGTGCTGTAGTGCTCCAGCTT;SOR=1.643;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=44;TCR=94;TR=138;WE=76433906;WS=76433888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr17	76435448	rs12150123	C	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=57;ReadPosRankSum=0.842;SC=GTTTTAAAACCCATCTTAAAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=76435456;WS=76435438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr17	76449505	rs2289751	G	C	5645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.946;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=148;PP=2965;ReadPosRankSum=0.753;SC=CAATGAGCAAGGTGTCCCCTT;SOR=1.134;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=197;TCF=48;TCR=149;TR=196;WE=76449513;WS=76449495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,201:1.00:202
chr17	76451921	rs8069561	A	G	2385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=50;PP=1932;SC=CGACCAGCCTAAAGTGGGATG;SOR=1.457;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=26;TCR=50;TR=76;WE=76451929;WS=76451911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	76456352	rs623336	T	C	4197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=99;PP=2834;SC=GGAAGGAAGATGGACAGGAGA;SOR=1.504;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=52;TCR=99;TR=151;WE=76456360;WS=76456342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr17	76456403	.	C	CGTGCATGTGTGTGCATGTGT	2107.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.99;QD=52.69;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	76457559	rs692529	T	G	1224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=1;PP=1041;SC=TGACCACACGTGGAAGCCCAG;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=37;WE=76457567;WS=76457549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	76457910	rs640292	G	C	743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=601;SC=CGTGTCTTACGACTCCCAGTG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=76457918;WS=76457900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	76462770	rs691225	G	A	7030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=95;PP=2965;ReadPosRankSum=1.852;SC=GGAAGCGGGCGCTGACGGACA;SOR=0.322;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=219;TCF=123;TCR=96;TR=218;WE=76462778;WS=76462760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,228:1.00:229
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chr17	76475067	rs56372780	A	G	2899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.671;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=17;PP=2240;ReadPosRankSum=0.890;SC=CAGGCACTGGACCGTAAGGCA;SOR=0.624;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=206;TCF=172;TCR=34;TR=105;WE=76475075;WS=76475057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,109:0.51:213
chr17	76475809	rs28454411	T	C	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=59;ReadPosRankSum=-0.617;SC=CCTGTCCTCATGTTCTAAGGT;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=6;WE=76475817;WS=76475799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr17	76480848	rs12952246	T	C	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.78;ReadPosRankSum=-2.289;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr17	76481608	rs11077370	A	G	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=46;NR=7;PP=1184;SC=CCGGGTAGGCAGGGCGTGGCC;SOR=3.611;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=53;WE=76481616;WS=76481598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	76481693	rs11872051	C	G	1853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=25;PP=1417;ReadPosRankSum=-0.161;SC=GGTAGTTGTCCGTGTTCAGGC;SOR=0.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=199;TCF=141;TCR=58;TR=87;WE=76481701;WS=76481683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,87:0.43:202
chr17	76481997	rs12944880	T	C	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.263;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=6;PP=378;ReadPosRankSum=-0.232;SC=CACCGATTCCTGCCTCTAAAT;SOR=0.418;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=19;WE=76482005;WS=76481987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
chr17	76482256	rs691142	A	G	8299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=171;NR=97;PP=2965;SC=CCAGCTAAGCAGGATGCTGAG;SOR=1.445;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=269;TCF=172;TCR=97;TR=268;WE=76482264;WS=76482246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,278:1.00:278
chr17	76482432	rs691151	A	G	11759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=144;NR=209;PP=2965;SC=GCAGGTACAGAATCGTTTGGA;SOR=1.157;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=354;TCF=144;TCR=210;TR=353;WE=76482440;WS=76482422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,362:1.00:362
chr17	76486622	rs113420656	G	GGTCT	996.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.547;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.428;NF=21;NR=4;PP=1175;ReadPosRankSum=0.018;SC=TTTATTCCCAGGTCTCTCACC;SOR=0.031;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=54;TCF=50;TCR=4;TR=25;WE=76486630;WS=76486612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr17	76488973	rs1983306	A	G	597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=444;SC=CACTCTTGTCACCGAGGCTGG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=76488981;WS=76488963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	76490083	rs691912	G	A	650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.371;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=2;PP=463;ReadPosRankSum=-0.460;SC=CCACCATGCCGGATCCCTGCA;SOR=0.955;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=67;TCF=59;TCR=8;TR=27;WE=76490091;WS=76490073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,28:0.41:69
chr17	76490978	rs73387129	C	G	1574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-7.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.098;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=19;PP=1140;ReadPosRankSum=2.009;SC=GAAGCCAACCCTGGCTGCTGC;SOR=0.289;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=94;TCF=68;TCR=26;TR=60;WE=76490986;WS=76490968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,63:0.66:96
chr17	76491127	rs691652	TG	CC	1894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.757;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=34;PP=2222;ReadPosRankSum=0.063;SC=CCCTCGGCCATGAGCATGATC;SOR=0.944;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=97;TCF=27;TCR=70;TR=45;WE=76491136;WS=76491117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,50:0.48:105
chr17	76495050	rs691291	C	T	1662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.718;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=23;PP=1269;ReadPosRankSum=1.883;SC=ACGAGCCAGTCACCCGACGTG;SOR=0.526;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=101;TCF=66;TCR=35;TR=63;WE=76495058;WS=76495040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,65:0.62:104
chr17	76496294	rs73387148	G	A	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-5.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.831;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=374;ReadPosRankSum=3.407;SC=CCAGAGATCTGGAGTTTACTG;SOR=0.124;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=59;TCF=54;TCR=5;TR=22;WE=76496302;WS=76496284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,26:0.40:65
chr17	76496330	rs73380861	G	A	1439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.873;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=15;PP=1070;ReadPosRankSum=-1.032;SC=CAGGGTGCTAGGATCTGCTTC;SOR=0.407;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=109;TCF=82;TCR=27;TR=53;WE=76496338;WS=76496320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,56:0.48:116
chr17	76496492	rs2028734	A	G	1759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.634;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=44;PP=1364;ReadPosRankSum=0.908;SC=CGGGGCCGGCAGGGGCTCCAC;SOR=0.446;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=173;TCF=65;TCR=108;TR=77;WE=76496500;WS=76496482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,79:0.45:177
chr17	76496577	rs2028735	C	T	1404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.878;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=39;PP=996;ReadPosRankSum=1.379;SC=TGTGTGCCAGCGACCCCATGG;SOR=0.468;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=98;TCF=26;TCR=72;TR=55;WE=76496585;WS=76496567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,58:0.56:103
chr17	76498346	rs141632101	CCTT	C	3317.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.118;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.549;NF=42;NR=40;PP=2964;ReadPosRankSum=0.263;SC=GGTAAATTCTCCTTCTTTTCA;SOR=0.794;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=180;TCF=85;TCR=95;TR=82;WE=76498356;WS=76498336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,88:0.46:192
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chr17	76498406	rs930572	A	G	3086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.479;HP=2;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=55;PP=2962;ReadPosRankSum=0.446;SC=TTTTTTTTAAAGACTCTCAGT;SOR=0.642;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=224;TCF=115;TCR=109;TR=114;WE=76498414;WS=76498382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,117:0.51:231
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chr17	76503966	rs9902653	T	C	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=29;PP=761;ReadPosRankSum=0.315;SC=TTCCAGGACATAGACTGAAGC;SOR=0.510;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=31;WE=76503974;WS=76503956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,33:0.63:52
chr17	76506607	rs867654	G	A	3023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=49;PP=2327;ReadPosRankSum=-0.124;SC=AAAAAATCCAGGCAGGATTCA;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=44;TCR=50;TR=92;WE=76506615;WS=76506597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,97:0.98:99
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chr17	76525475	rs884714	T	G	2696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=1;PP=2308;SC=ATGGTTGCGTTTGATGGGCTG;SOR=7.328;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=77;TCF=76;TCR=1;TR=77;WE=76525483;WS=76525465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	76525565	rs4273108	A	G	8005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=174;NR=61;PP=2965;SC=TGCAGCTTCAAGTGGATCTCC;SOR=2.150;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=235;TCF=174;TCR=61;TR=235;WE=76525573;WS=76525555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr17	76525759	rs61741523	G	C	3735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.754;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=105;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.260;SC=TTTCATGAAGGCTTCCAGGTC;SOR=1.100;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=265;TCF=64;TCR=201;TR=134;WE=76525767;WS=76525749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,137:0.51:270
chr17	76525805	rs4969212	C	G	4689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=134;PP=2965;SC=ATTTGTGTGGCCCCAGCCCCC;SOR=4.558;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=12;TCR=134;TR=146;WE=76525813;WS=76525795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr17	76525864	rs4597380	G	A	798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=604;ReadPosRankSum=0.209;SC=GGGGACGACCGCGGTGAGGTC;SOR=0.796;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=0;TCR=56;TR=28;WE=76525872;WS=76525854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,31:0.53:59
chr17	76526724	rs111543966	G	A	1230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=41;PP=1018;ReadPosRankSum=-0.962;SC=CTGGGGCCAGGGTCAGCAAAG;SOR=0.718;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=85;TCF=4;TCR=81;TR=43;WE=76526732;WS=76526714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,43:0.51:85
chr17	76533269	rs111781371	A	AAAAG	1906.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=-2.537;QD=16.02;ReadPosRankSum=2.613;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,52:0.44:119
chr17	76535759	rs7220871	T	C	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=430;ReadPosRankSum=-0.213;SC=CTAGAAACTATAGATTCTAAC;SOR=1.773;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=20;WE=76535767;WS=76535749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr17	76535948	rs7221209	T	C	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.122;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=47;PP=1212;ReadPosRankSum=-1.869;SC=CTGCCCTGAATAGTTCTGCGT;SOR=1.110;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=107;TCF=19;TCR=88;TR=56;WE=76535956;WS=76535938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,53:0.50:106
chr17	76536048	rs7220203	C	A	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.235;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=189;ReadPosRankSum=-1.022;SC=TCTGGACCGCCCGTCCATGTT;SOR=0.195;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=12;WE=76536056;WS=76536038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr17	76554114	rs62075923	A	G	3444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.956;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=22;PP=2666;ReadPosRankSum=-0.235;SC=ACATCTCTGAAACACACAAAC;SOR=0.549;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=283;TCF=238;TCR=45;TR=125;WE=76554122;WS=76554104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,131:0.45:293
chr17	76554147	rs4969171	A	G	4041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=413;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.204;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=116;NR=59;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.506;SC=AAACCAAAACAATACAAAGCT;SOR=0.570;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=395;TCF=270;TCR=125;TR=175;WE=76554155;WS=76554137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:229,182:0.44:411
chr17	76557862	rs894966	T	C	1794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=30;PP=1374;ReadPosRankSum=-0.239;SC=CCAGGCTCCATTTGAGCTGCC;SOR=0.689;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=143;TCF=82;TCR=61;TR=68;WE=76557870;WS=76557852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,70:0.48:145
chr17	76558083	.	G	A	1449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.472;ClippingRankSum=0.000;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.301;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=45;PP=1110;ReadPosRankSum=1.082;SC=AGGAGAAGGGGGCCTCTTCAC;SOR=1.141;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=99;TCF=9;TCR=90;TR=49;WE=76558091;WS=76558073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,52:0.50:104
chr17	76558159	rs2376587	T	C	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=30;PP=737;SC=TCTTCAGGAGTGAGAGAATGT;SOR=4.174;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=33;WE=76558167;WS=76558149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	76567707	rs894968	T	C	4618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=52;PP=2965;SC=AGCAGCCGAGTGTCCCAGAAC;SOR=1.504;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=96;TCR=52;TR=148;WE=76567715;WS=76567697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr17	76569003	rs116365379	G	A	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.360;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=29;PP=587;ReadPosRankSum=2.166;SC=CTGTGGTTCCGCCCCCTGTGC;SOR=0.693;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=64;TCF=2;TCR=62;TR=30;WE=76569011;WS=76568993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,33:0.50:66
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chr17	76672002	rs1126607	T	C	661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.008;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=489;ReadPosRankSum=-0.583;SC=CAGTGATAACTGCCCACCCTT;SOR=1.938;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=69;TCF=54;TCR=15;TR=28;WE=76672010;WS=76671992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,30:0.41:73
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chr17	76794774	rs3744799	T	C	2028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=56;PP=1736;SC=ATGACCCCTGTGCACGGCGAC;SOR=2.704;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=14;TCR=56;TR=70;WE=76794782;WS=76794764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
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chr17	76798548	rs71964596	TTTTTTC	T	1292.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.41;QD=41.70;SOR=1.839;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
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chr17	76799860	rs3088040	T	C	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=16;PP=1039;SC=AGAGGGGCTCTGGGGGGGCTC;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=31;TCR=16;TR=47;WE=76799868;WS=76799850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	76799898	rs9302885	A	G	2265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=31;PP=1680;SC=GGTGTGGAAGAGACACAAGGT;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=41;TCR=31;TR=72;WE=76799906;WS=76799888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	76814782	rs35273233	G	A	1229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.701;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=13;PP=1003;ReadPosRankSum=-0.857;SC=AGTTGGCAAAGCGCTTGAGGG;SOR=1.005;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=109;TCF=76;TCR=33;TR=48;WE=76814790;WS=76814772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,48:0.43:111
chr17	76816199	rs7222131	G	A	1487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.277;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=47;PP=1164;ReadPosRankSum=-1.397;SC=GCAAATCACAGAACTTAGACT;SOR=1.946;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=103;TCF=21;TCR=82;TR=54;WE=76816207;WS=76816189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,55:0.50:109
chr17	76817090	rs3744793	C	T	1964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.280;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=46;PP=1554;ReadPosRankSum=1.426;SC=TCCAGCGCGACGTCCAAGTAG;SOR=0.559;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=160;TCF=63;TCR=97;TR=79;WE=76817098;WS=76817080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,78:0.49:158
chr17	76832133	rs900349	T	C	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=55;SC=AATATTTAAGTCCATCCACTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=76832141;WS=76832129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr17	76867185	rs55743137	G	T	1296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=32;PP=1017;SC=ACAACCTGTAGCTGGGGTACA;SOR=3.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=76867193;WS=76867175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	76897733	rs12941365	G	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=4.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=204;ReadPosRankSum=1.153;SC=TAGGCCAAGCGACTTCACTCT;SOR=1.730;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=10;WE=76897741;WS=76897723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr17	76897974	rs4789936	C	T	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=436;ReadPosRankSum=2.209;SC=CTTGAAATCACTGGGCTGACT;SOR=0.910;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=21;WE=76897982;WS=76897964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr17	76970879	rs3744166	A	G	3835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=61;PP=2965;ReadPosRankSum=0.624;SC=ACTGGACCTCATCCAGCATGA;SOR=0.905;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=135;TCF=72;TCR=63;TR=132;WE=76970887;WS=76970869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,133:0.99:135
chr17	76973339	rs1113032	T	C	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-4.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.118;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=318;ReadPosRankSum=0.074;SC=GGGAGCCAGATGGCCCGAGGC;SOR=0.188;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=20;WE=76973347;WS=76973329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr17	76993546	rs8077024	A	G	1892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.621;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=33;PP=1344;ReadPosRankSum=-0.818;SC=AGAGGATGGCAGCACCCACAA;SOR=0.527;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=177;TCF=107;TCR=70;TR=79;WE=76993554;WS=76993536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,85:0.47:180
chr17	77039835	rs4789924	G	A	3285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.089;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=27;PP=1693;ReadPosRankSum=-1.426;SC=ACGTGAGTGCGTCGTGAGTGC;SOR=0.381;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=174;TCF=127;TCR=47;TR=87;WE=77039843;WS=77039825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,90:0.51:176
chr17	77039852	rs4789854	G	A	3669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.220;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=33;PP=2040;ReadPosRankSum=1.080;SC=GTGCGTGTATGCATGCATGGG;SOR=0.417;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=217;TCF=154;TCR=63;TR=102;WE=77039860;WS=77039842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,105:0.48:219
chr17	77040128	rs4789922	T	C	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.892;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=41;PP=938;ReadPosRankSum=-1.390;SC=TCCTGAGTCGTGTGCCCCATG;SOR=1.003;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=99;TCF=22;TCR=77;TR=52;WE=77040136;WS=77040118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,51:0.50:103
chr17	77040185	rs4789853	G	C	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.450;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.796;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=512;ReadPosRankSum=1.859;SC=AGCTGCCGTCGCCTCCGGACC;SOR=0.154;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=51;TCF=4;TCR=47;TR=25;WE=77040193;WS=77040175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr17	77042718	rs11077409	C	T	1330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=1115;ReadPosRankSum=-1.421;SC=GCTGTGACCCCGGTACCTCCA;SOR=0.644;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=42;TCR=53;TR=49;WE=77042726;WS=77042708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,50:0.52:97
chr17	77043574	rs11077410	T	C	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=474;ReadPosRankSum=0.258;SC=CTCAGGACACTACCGGATTGC;SOR=1.061;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=21;WE=77043582;WS=77043564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr17	77044218	rs3833103	T	TGCTGACCCCAGGGCTCAGCACCAG	779.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=8.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.44;ReadPosRankSum=1.876;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr17	77071002	rs8076010	C	G	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=4;PP=253;ReadPosRankSum=-0.447;SC=CCTGCGATTGCCTCTCGGCGT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=12;WE=77071010;WS=77070992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
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chr17	77073566	rs3744181	G	A	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.040;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=440;ReadPosRankSum=0.375;SC=GTTTTTCCCCGGACCCCCTGC;SOR=1.349;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=21;WE=77073574;WS=77073556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,22:0.48:46
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chr17	77081222	rs4789984	C	T	1354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.655;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=3;PP=1117;ReadPosRankSum=0.620;SC=AATCAGGCAGCCTTCTCTGGA;SOR=0.170;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=112;TCF=108;TCR=4;TR=53;WE=77081230;WS=77081212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,52:0.47:110
chr17	77081788	rs4789879	G	A	1942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=40;PP=1363;ReadPosRankSum=-1.288;SC=GAGGAGGAGAGCTTCACCTGT;SOR=0.674;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=154;TCF=73;TCR=81;TR=75;WE=77081796;WS=77081778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,81:0.49:165
chr17	77082320	rs35037969	C	T	3210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.015;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=60;PP=2546;ReadPosRankSum=0.517;SC=CCGCCGGGCCCGGCCAGGATC;SOR=0.708;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=229;TCF=117;TCR=112;TR=125;WE=77082328;WS=77082310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,123:0.54:229
chr17	77083180	rs57241083	C	G	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-3.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=748;ReadPosRankSum=0.019;SC=GGAAGTGGCTCTGAGGCAGTC;SOR=0.663;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=79;TCF=25;TCR=54;TR=42;WE=77083188;WS=77083170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,44:0.51:86
chr17	77086806	rs62063826	A	G	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=177;ReadPosRankSum=0.397;SC=GCGTGTGGCCAGGACGCGGGA;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=13;WE=77086814;WS=77086796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,13:0.45:29
chr17	77086821	rs117691352	G	A	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.129;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=428;ReadPosRankSum=0.409;SC=GCGGGACTTGGACTTGGTTGG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=20;WE=77086829;WS=77086811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr17	77086851	rs148863918	G	GT	619.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=3.892;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.65;ReadPosRankSum=-0.733;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,29:0.59:49
chr17	77087005	rs112100897	C	CA	2497.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.228;NF=21;NR=42;PP=2538;ReadPosRankSum=1.089;SC=TGCAGCTTCTCGGGGGAGGCA;SOR=0.707;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=119;TCF=35;TCR=84;TR=63;WE=77087013;WS=77086995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,77:0.51:151
chr17	77088634	rs10676066	G	GTAAT	629.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.176;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=546;ReadPosRankSum=-2.020;SC=GGTTTGGTGTGTAATAGGCAG;SOR=0.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=11;WE=77088642;WS=77088624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr17	77088790	rs11286198	GA	G	658.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=2.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.62;ReadPosRankSum=-0.267;SOR=1.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,36:0.58:62
chr17	77089515	rs4789891	G	T	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.759;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=207;ReadPosRankSum=-0.088;SC=CTGCACGGAGGGCCCAAGAGC;SOR=0.030;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=12;WE=77089523;WS=77089506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr17	77089629	rs12602626	T	A	763.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=1.032;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.58;ReadPosRankSum=-0.979;SOR=0.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,41:0.46:89
chr17	77089630	rs371204042	GA	G	1254.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=3.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.49;ReadPosRankSum=-0.957;SOR=1.366;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,49:0.60:81
chr17	77089873	.	CCA	C	255	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=6;MMLQ=20;MQ=59.54;NF=0;NR=10;PP=255;QD=25.8;SC=CAACAGCTGGCCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=10;WE=77089886;WS=77089863;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr17	77090473	rs61042144	A	G	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.270;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=515;ReadPosRankSum=1.423;SC=CAAGGGCCTCACCACCCATGC;SOR=1.417;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=63;TCF=43;TCR=20;TR=32;WE=77090481;WS=77090463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,32:0.48:66
chr17	77090637	rs200668420	TGGGAGGAGGGTGG	T	784.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.18;ReadPosRankSum=2.498;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr17	77093026	rs8072150	T	C	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=4.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=471;ReadPosRankSum=1.217;SC=CCCACCCCTTTAGTGATGGAG;SOR=1.162;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=21;WE=77093034;WS=77093016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,19:0.41:46
chr17	77093255	rs147472360	TC	T	187.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.035;HP=12;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=4;PP=86;ReadPosRankSum=1.026;SC=CCCACGATCCTCCCCCCCCCC;SOR=0.116;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=8;WE=77093263;WS=77093245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr17	77093734	rs59021665	A	G	1298.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.138;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=6;PP=1101;ReadPosRankSum=-0.480;SC=GGGGCCAAGTAGCTGGTCTCA;SOR=0.948;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=102;TCF=89;TCR=13;TR=53;WE=77093742;WS=77093724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,49:0.52:95
chr17	77093768	rs58352742	T	C	2528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.638;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=25;PP=2081;ReadPosRankSum=-0.793;SC=CCGCCCCAGCTTTTACCTGCA;SOR=0.592;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=193;TCF=148;TCR=45;TR=100;WE=77093776;WS=77093758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,99:0.52:189
chr17	77102966	rs36122090	T	TC	873.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=16;PP=909;SC=GGCCAGATTCTCCCCACCCTT;SOR=1.382;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=23;WE=77102974;WS=77102956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	77704912	rs8074547	T	C	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.925;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.831;NF=9;NR=4;PP=255;ReadPosRankSum=-0.682;SC=ATGAGAGGCCTGGCCGTCCTC;SOR=0.223;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=13;WE=77704920;WS=77704902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
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chr17	77707492	rs11150740	G	C	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=202;ReadPosRankSum=0.442;SC=CAGAGCACGGGGGCACCTAGG;SOR=0.551;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=12;WE=77707500;WS=77707482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr17	77709339	rs11657217	C	G	3223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.035;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=78;PP=2479;ReadPosRankSum=-0.197;SC=TGTACGATGCCCTCAAGGACG;SOR=0.789;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=225;TCF=85;TCR=140;TR=123;WE=77709347;WS=77709329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,128:0.54:236
chr17	77709405	rs78553282	C	T	2037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=52;PP=1662;ReadPosRankSum=1.089;SC=CCTTCCACTACGCCAACAACC;SOR=1.064;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=159;TCF=62;TCR=97;TR=81;WE=77709413;WS=77709395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,81:0.49:166
chr17	77709527	.	CT	C	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.361;ClippingRankSum=0.000;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=12.553;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.89;MQRankSum=1.663;QD=1.35;ReadPosRankSum=-1.468;SOR=0.008;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr17	77751983	rs71368052	C	G	170.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=6;NR=0;PP=91;SC=GCGCGGCGGTCCGGGCGGGTG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=77751991;WS=77751975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	77753296	rs8064780	C	T	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.684;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=18;PP=462;ReadPosRankSum=-1.808;SC=GTGCTGGGCGCTGCTCGCCTG;SOR=0.404;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=22;WE=77753304;WS=77753286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr17	77758484	rs3751956	G	A	2205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.651;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=45;PP=1709;ReadPosRankSum=0.351;SC=GTGAGAAGCTGGCTTCCAGAG;SOR=0.916;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=160;TCF=76;TCR=84;TR=81;WE=77758492;WS=77758474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,84:0.52:162
chr17	77768395	.	C	G	1994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.874;ClippingRankSum=0.000;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.687;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=32;PP=1529;ReadPosRankSum=-0.368;SC=CACGCTCACTCTCTCCCCTGC;SOR=0.459;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=168;TCF=105;TCR=63;TR=78;WE=77768403;WS=77768385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,79:0.46:170
chr17	77808240	.	C	CGTG	167.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.503;ClippingRankSum=-0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.43;MQRankSum=0.792;QD=11.98;ReadPosRankSum=-2.027;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr17	77809591	.	GC	G	66.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=10.733;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.09;ReadPosRankSum=1.852;SOR=2.282;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,10:0.16:61
chr17	77811733	rs371298714	TA	T	122.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=4.561;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.14;ReadPosRankSum=-0.820;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
chr17	77984141	rs35922784	C	T	3083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=56;PP=2480;SC=GCGGCTCCCGCCCCTCCTCGG;SOR=1.167;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=36;TCR=56;TR=92;WE=77984149;WS=77984131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr17	78013724	rs2289527	G	C	1503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=23;PP=1110;SC=AGGGGGAGGTGGAGACAGAAG;SOR=0.813;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=26;TCR=23;TR=49;WE=78013732;WS=78013714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	78039178	rs80207190	A	G	2465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=22;PP=2045;SC=TACCGGTGATAGAAGGAAAAG;SOR=1.966;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=55;TCR=22;TR=77;WE=78039186;WS=78039168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	78061317	rs11150839	A	C	992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=4;PP=846;SC=GAGAGACAAAACCTGGCTCAC;SOR=3.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=78061325;WS=78061307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	78061353	rs11150840	G	A	1091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=2;PP=944;SC=GCCTGCGGGCGAGGACCCGTA;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=33;WE=78061361;WS=78061343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	78061979	rs12942049	A	C	2739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=80;PP=2086;ReadPosRankSum=1.470;SC=AAGACCATGTAGGAGGCCAGG;SOR=2.345;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=11;TCR=81;TR=91;WE=78061987;WS=78061969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,98:0.99:99
chr17	78064015	rs4889953	G	C	915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=16;PP=771;SC=CGTGCACGAAGAACACGGGAC;SOR=1.071;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=31;WE=78064023;WS=78064005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	78064145	.	A	ACAC	380	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.63;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=23;MQ=42.32;NF=3;NR=5;PP=380;QD=56.9967820507;SC=TGCACGAACAAGGGACGCGCG;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=8;WE=78064153;WS=78064135;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,8:0.80:10
chr17	78064216	.	CAGCACGTGCATGAACAACACAGGACACACACA	C	284.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.90;QD=35.59;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	78064247	.	CA	C	160	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=48.42;NF=1;NR=5;PP=160;QD=31.0;SC=AGGACACACACAAGCACGTGC;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=6;WE=78064255;WS=78064237;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr17	78071052	rs12952612	T	C	3053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=20;PP=2294;SC=AGGCCACCGATGAGTGCACCA;SOR=2.502;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=74;TCR=20;TR=94;WE=78071060;WS=78071042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr17	78073562	rs2304854	A	G	1961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.119;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=45;PP=1610;ReadPosRankSum=0.963;SC=TCGAGTCACCAGGGCCCTCCT;SOR=1.712;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=65;TCF=20;TCR=45;TR=64;WE=78073570;WS=78073552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr17	78078709	rs1800300	T	C	4213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=62;NR=65;PP=2965;SC=CCCGCGGCTGTTGCTACATCC;SOR=0.724;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=127;TCF=62;TCR=65;TR=127;WE=78078717;WS=78078699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr17	78079481	rs8069491	C	G	875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=1;PP=686;SC=CTGTCCTTGGCGTGCGGGTTG;SOR=5.136;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=25;WE=78079489;WS=78079471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	78079509	rs12452721	T	G	952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=6;PP=723;SC=GAGAGTAAGGTGGCTGTGGGG;SOR=2.621;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=30;WE=78079517;WS=78079499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	78079544	rs3816256	C	G	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=21;PP=993;SC=CCCATCTCTTCTAGATCAAAG;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=24;TCR=21;TR=44;WE=78079552;WS=78079534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	78079597	rs1042393	A	G	1267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=29;PP=942;SC=GAGACCCCGCATGTCCACAGC;SOR=1.775;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=42;WE=78079605;WS=78079587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	78079643	rs1800301	C	T	843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=24;PP=690;ReadPosRankSum=-1.389;SC=TGGAGTTCTCCGAGGAGCCCT;SOR=1.675;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=29;WE=78079651;WS=78079633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr17	78079669	rs1042395	G	A	470.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=408;ReadPosRankSum=-0.553;SC=GTGATCGTGCGCCGGCAGCTG;SOR=3.056;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=18;WE=78079677;WS=78079659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr17	78081526	rs3071247	A	AGCAGCGG	2953.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=43;PP=2980;SC=CCCACGGTACAGCGGCGGGCG;SOR=1.576;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=59;TCF=12;TCR=47;TR=55;WE=78081534;WS=78081516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	78081551	rs2304845	T	C	2448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=39;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=40;PP=1129;SC=GCGGGGGCACTGAGCTGGGGA;SOR=2.041;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=55;TCF=14;TCR=41;TR=54;WE=78081559;WS=78081541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	78081707	rs2252455	G	A	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=13;PP=383;SC=TAAGCTGCCCGCCGCCCAGCG;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=21;TCF=7;TCR=14;TR=20;WE=78081715;WS=78081697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	78081982	rs2241888	G	A	1717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=1;PP=1045;SC=TGAGCTCCTCGTGGGGAGAGA;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=38;WE=78081990;WS=78081972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	78082005	rs2241887	C	T	2366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=9;PP=1577;SC=CTCAACTCTCCGCCTGTGATT;SOR=3.334;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=59;WE=78082013;WS=78081995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	78082504	rs1800304	G	A	2905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=41;PP=2154;SC=AGGACGTCCAGTGGAACGACC;SOR=0.782;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=84;TCF=43;TCR=41;TR=84;WE=78082512;WS=78082494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr17	78083726	rs2278619	A	G	3004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=59;PP=2447;SC=TCACCTTGACAGGTTTCCCTC;SOR=1.145;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=40;TCR=59;TR=99;WE=78083734;WS=78083716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr17	78084507	rs2304844	G	C	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=550;SC=TCTCCCCACTGCAGCCTCTCG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=78084515;WS=78084497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	78084688	rs2304843	C	A	4193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=59;PP=2965;SC=GGGGACTACCCCACCCTCCTC;SOR=0.867;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=134;TCF=73;TCR=61;TR=132;WE=78084696;WS=78084678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr17	78084940	rs199788201	GC	G	467.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.98;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	78084942	rs4889817	G	T	476.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=281;SC=GGAAAGGGGCGGGGGGGGGAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=78084950;WS=78084930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	78086043	rs2304838	C	T	1369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=37;PP=1123;SC=TCTCCCCACCCGCTGCCTGCA;SOR=4.615;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=40;WE=78086051;WS=78086033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	78086846	rs2304836	A	G	1747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=40;PP=1446;SC=GGGTGGCGGCATGGCAGGTGG;SOR=1.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=18;TCR=40;TR=58;WE=78086854;WS=78086836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	78086953	rs2304833	G	A	1091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=7;PP=837;SC=CTCCCGAGGCGGGGACTCCAG;SOR=2.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=78086961;WS=78086943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	78087109	rs1800310	A	G	2322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=40;PP=1642;SC=ACCTCTACACACTGTTCCACC;SOR=0.941;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=32;TCR=40;TR=72;WE=78087117;WS=78087099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr17	78090928	rs2304832	G	A	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=26;PP=741;SC=GGGACCCTAAGCCCTGGGGAG;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=78090936;WS=78090918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	78091405	rs1126690	G	A	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.625;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=27;PP=1282;ReadPosRankSum=-0.850;SC=CCAGGTGCCAGTAGAGGCCCT;SOR=0.726;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=48;TCF=21;TCR=27;TR=47;WE=78091413;WS=78091395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,52:0.98:53
chr17	78092063	rs1042397	G	A	1230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=19;PP=932;SC=CCAAGGGTGGGGAGGCCCGAG;SOR=0.743;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=17;TCR=19;TR=36;WE=78092071;WS=78092053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	78114033	rs74003638	G	A	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=209;SC=GATGATCACCGATTATTATTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=78114041;WS=78114023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	78155182	rs9906472	A	C	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=20;NR=0;PP=581;SC=GGTCCTGCTTACCTGACAACT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=78155190;WS=78155172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	78157592	rs11656949	C	T	483.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=17;NR=3;PP=599;ReadPosRankSum=1.383;SC=CATGCTCACCCGCCCACATGC;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=20;WE=78157600;WS=78157582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr17	78158063	rs4889991	G	A	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=13;PP=371;SC=GCACCCCGGCGCGACCCTGCT;SOR=3.126;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=15;WE=78158071;WS=78158053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	78162170	rs28674001	G	A	1750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.085;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=27;PP=1312;ReadPosRankSum=-0.858;SC=CCTCCCCACCGCACAGCTGTA;SOR=0.331;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=54;WE=78162178;WS=78162160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr17	78172292	rs34367357	G	A	4424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.373;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=62;PP=2965;ReadPosRankSum=0.807;SC=GCAGATCAGCGTCATCGGCGG;SOR=0.792;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=147;TCF=83;TCR=64;TR=144;WE=78172300;WS=78172282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,147:0.98:150
chr17	78177805	rs2289540	C	G	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=11;PP=374;SC=GTAACCCCACCTGTCTCTCCT;SOR=1.473;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=78177813;WS=78177795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	78178916	rs61757652	C	T	1890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=11;PP=1567;SC=CCGCCCGGCCCCGGCCTGTGC;SOR=2.604;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=56;WE=78178924;WS=78178906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr17	78180618	rs4889998	A	C	2031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=57;NR=3;PP=1799;SC=GGCAAGCTCTATTCCCTCATC;SOR=5.318;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=60;TCF=57;TCR=3;TR=60;WE=78180626;WS=78180610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	78188963	rs4889839	G	A	2250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=30;NR=47;PP=1685;SC=CATGAGGTCCGGGGCCCCCGG;SOR=1.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=30;TCR=47;TR=77;WE=78188971;WS=78188953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	78189009	rs4889840	C	T	1462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=40;PP=1203;SC=TGTTCTCCCACGGCCCTCCCA;SOR=3.564;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=46;WE=78189017;WS=78188999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	78210944	rs8070283	G	A	745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=603;SC=CTGAGGCTGCGGTGGCCCCTG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=78210952;WS=78210934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	78219065	rs7406843	C	A	4070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=83;PP=2965;SC=GGTGAGTGACCTGTCCGCCTC;SOR=1.341;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=48;TCR=83;TR=130;WE=78219073;WS=78219055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr17	78219100	rs7406844	C	T	3102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=69;PP=2530;SC=GTTGGACGCCCTAACGTTGTT;SOR=2.160;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=26;TCR=69;TR=95;WE=78219108;WS=78219090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr17	78221850	rs12941437	A	G	213.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=176;SC=GGGGGCAGAAAGCTGTCCCGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=78221858;WS=78221844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	78222280	rs7209848	A	G	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=4;PP=358;SC=CCTGCAGCACACTAGGTTGGG;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=78222288;WS=78222270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	78222565	rs7214131	A	G	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=32;PP=1154;SC=CCCTGTCCCCAACGCTCTCCA;SOR=1.519;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=48;WE=78222573;WS=78222555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	78222638	rs34911974	GC	G	1123.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=25;PP=1081;SC=TCAGCCAGTGGCTGCTGCAGC;SOR=4.479;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=78222646;WS=78222628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	78222661	rs9904116	C	T	588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=469;SC=GGGTGGTGGCCCCCCACATAT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=78222669;WS=78222651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	78223103	rs8064518	C	A	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=12;PP=432;SC=GTGCACTGGGCTGCCTTAGGG;SOR=1.127;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=20;WE=78223111;WS=78223093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	78281088	rs61087724	G	T	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=466;SC=TGACCCACATGTGCTGTTGTA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=78281096;WS=78281078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	78298938	rs6565674	A	G	1154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=27;PP=898;SC=GGACAACTTCAATGACATTTT;SOR=3.026;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=33;WE=78298946;WS=78298928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	78617439	rs6565469	T	C	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=4;PP=421;SC=CTTTGAAGTGTGTTATATAAG;SOR=2.093;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=78617447;WS=78617429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	78681590	rs2306690	A	G	761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=5;PP=651;SC=ATGAGTTCCAAGCATTCCCTG;SOR=2.400;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=78681598;WS=78681580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	78765219	rs4969429	A	G	1770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=9;PP=1322;SC=TGTTCCATTCATGCCGTTCAC;SOR=3.407;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=59;WE=78765227;WS=78765209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	78795868	rs9911574	A	G	1527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=0;PP=1270;SC=GCCGTGCGCCAAGCTTCTGCT;SOR=7.978;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=52;TCR=0;TR=52;WE=78795876;WS=78795858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr17	78820212	rs3829572	G	A	1754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=13;PP=1493;ReadPosRankSum=0.582;SC=GGCAGGGGTGGGCAAGACCAG;SOR=1.244;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=59;TCF=46;TCR=13;TR=58;WE=78820220;WS=78820202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr17	78820329	rs3751945	C	T	3324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=57;PP=2625;SC=TCACCATGGGCGTGGAGAACC;SOR=0.729;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=55;TCR=57;TR=112;WE=78820337;WS=78820319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr17	78829375	rs12943041	G	A	988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=26;PP=800;SC=TAACCTGGGGGCTGAGGGAGG;SOR=3.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=78829383;WS=78829365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	78865546	rs2289764	T	C	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=6;PP=315;SC=TGAGTCATCTTGTGGTTCAGT;SOR=1.493;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=15;WE=78865554;WS=78865536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	78865630	rs2289765	A	G	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=11;PP=477;SC=CTTCTCCAGCAACCACAGGTA;SOR=0.846;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=13;TCR=11;TR=24;WE=78865638;WS=78865620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	78867733	rs3751943	A	G	2617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=70;PP=2159;SC=AGAGCAGCACAGACCTGTGTC;SOR=4.725;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=5;TCR=70;TR=75;WE=78867741;WS=78867723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr17	78896529	rs2271603	C	T	7647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=146;PP=2965;SC=CCTAGGCCACCGTGAACGCCC;SOR=1.365;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=232;TCF=86;TCR=146;TR=232;WE=78896537;WS=78896519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr17	78897547	rs7217786	C	T	911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=26;PP=786;ReadPosRankSum=0.241;SC=ATGGCCTCAGCCTCAGGCTGC;SOR=3.912;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=27;WE=78897569;WS=78897537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr17	78897561	rs6565491	C	T	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=608;ReadPosRankSum=1.419;SC=AGGCTGCTCACATCACCATGG;SOR=3.528;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=23;WE=78897569;WS=78897537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr17	78921117	rs4969231	C	T	992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=22;PP=785;SC=AGTATCTGAACGGCCAGGACT;SOR=1.542;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=32;WE=78921125;WS=78921107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	78972326	rs10871491	A	G	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=19;PP=621;SC=GGCCGTGGGCAAGCCCTGCTG;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=78972334;WS=78972316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	79006850	rs11870986	T	C	4225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=69;PP=2965;SC=GCAGGCCAGCTCAGGAAGTAA;SOR=0.769;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=64;TCR=69;TR=133;WE=79006858;WS=79006840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr17	79007075	rs11150764	C	A	910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=764;ReadPosRankSum=-0.941;SC=TTCCTCCAGGCGAGCAGAGCT;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=28;WE=79007083;WS=79007065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr17	79009153	rs8073224	T	C	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=17;PP=402;SC=CGTGTGCGCCTGGGTCGCGCG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=79009161;WS=79009143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr17	79010533	rs4969350	G	A	1622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=44;NR=4;PP=1371;SC=GGGGTTGTTAGGTTTGGTTTC;SOR=4.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=44;TCR=4;TR=48;WE=79010541;WS=79010523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	79010839	rs6565527	A	C	289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=10;PP=206;SC=ACCGGGCAGTAGGCCTTCACC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=79010847;WS=79010829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	79031825	rs9898347	G	A	480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=14;PP=395;SC=GGCAGCTCTGGGGCCCTGTCC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=79031833;WS=79031815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	79059230	rs8080815	C	T	3730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=46;PP=2826;SC=TGTTTGGAGGCGAGATTGTCC;SOR=1.277;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=80;TCR=46;TR=125;WE=79059238;WS=79059220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr17	79060474	rs41292398	C	G	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.45;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=3;PP=78;SC=GACAGCAGCCCCCCAGGTGCG;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=79060482;WS=79060464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	79072011	rs72634327	A	G	2553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=47;PP=2048;SC=TCATACAACAAGCCCTGCACC;SOR=1.193;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=31;TCR=47;TR=78;WE=79072019;WS=79072001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr17	79077957	rs34057293	T	C	2156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=54;PP=1757;SC=ACGTGCCTCCTCAGACCCTAC;SOR=3.327;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=10;TCR=54;TR=64;WE=79077965;WS=79077947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	79077980	rs57792378	A	C	1760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=48;PP=1516;SC=TCATGCCACAACCCTCAATAG;SOR=5.670;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=50;WE=79077988;WS=79077970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	79082862	rs11664	G	A	2698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=29;PP=2033;SC=GGTCTCGTCCGTTTTCCTCCT;SOR=1.508;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=58;TCR=29;TR=87;WE=79082870;WS=79082852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	79089428	rs12450670	A	C	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=2;PP=484;SC=AAAGCAGCGTATATTGTCTGT;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=79089436;WS=79089418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	79090198	rs62073016	C	T	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=19;PP=574;SC=TGGGGCTCTCCTGGGCCCCTC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=79090206;WS=79090188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	79093142	rs144250320	C	CCGCGTGCCCTACCTCT	751.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=1;PP=239;SC=GCCCTGCCTCCCGCGTGCCCT;SOR=3.912;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=7;WE=79093150;WS=79093132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	79093427	rs62073018	C	T	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=1;NR=13;PP=339;SC=CCTGGGACCCCGGCCCGGCCC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=79093435;WS=79093417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	79093822	rs36000545	A	G	1712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=17;PP=1337;SC=CCCCCTAAGGAACGTAGGGGG;SOR=1.480;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=50;WE=79093830;WS=79093812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	79095144	rs8073904	G	A	1649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=1279;ReadPosRankSum=-0.919;SC=AGGTGGCCTCGGCCGTGTCCT;SOR=0.238;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=51;TCF=28;TCR=23;TR=50;WE=79095152;WS=79095134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,53:0.98:54
chr17	79095629	rs7503604	C	A	1875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=22;PP=1491;SC=TCAGCGTGGCCGCCCGCAGAG;SOR=1.421;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=38;TCR=22;TR=60;WE=79095637;WS=79095619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	79098838	rs141491493	GGCAGGGTGA	G	583.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=13;PP=1641;SC=CAGGGGCAGGGGCAGGGTGAG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=13;WE=79098854;WS=79098828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	79102193	rs66762502	TAGG	T	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.85;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	79105850	rs4969253	T	C	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=20;PP=646;SC=ATGTAGAGGCTGCACCTGTAT;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=79105858;WS=79105840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	79108141	rs4969397	A	G	3104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=28;PP=2402;SC=GGATCCCACGACAGCTCCCGC;SOR=1.683;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=65;TCR=28;TR=93;WE=79108149;WS=79108131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr17	79108344	rs55660414	C	T	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=34;PP=956;SC=GGCTGAGGGCCGGCCAGGCCC;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=79108352;WS=79108334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	79139473	rs2659034	C	G	2850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.845;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=57;PP=2159;ReadPosRankSum=-1.200;SC=CCCTCCGTGCCCCAGTTACCT;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=97;TCF=38;TCR=59;TR=95;WE=79139481;WS=79139463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,98:0.98:100
chr17	79140505	rs12946891	C	G	502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=3;PP=388;SC=GCCGCCCCCCCACCCCATGCC;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=79140513;WS=79140495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	79155116	rs906180	A	G	4200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=83;PP=2965;SC=TGCTGCCCACAGACATGAGAC;SOR=1.154;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=55;TCR=83;TR=138;WE=79155124;WS=79155106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr17	79165171	rs869370	G	A	4149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.866;SC=GTTGCCACCCGGAGCCGGCCC;SOR=2.472;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=15;TCR=112;TR=126;WE=79165179;WS=79165161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,127:0.99:128
chr17	79171805	rs7225364	C	A	1348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=30;PP=1041;SC=TGACTAAAGCCAGGAGGAGCC;SOR=2.247;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=39;WE=79171813;WS=79171795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	79171967	rs2659016	A	G	779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=10;PP=538;SC=GCGGGGCAGCACGTCCGGCTC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=25;WE=79171975;WS=79171957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	79173184	rs2659015	T	C	1002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=11;PP=769;SC=CTCTCACCAGTATTGTTGGCC;SOR=1.542;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=34;WE=79173192;WS=79173174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	79173224	rs2725419	T	C	1111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=15;PP=792;SC=TGCCGCCTGGTGTGGGGGACA;SOR=1.040;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=22;TCR=15;TR=37;WE=79173232;WS=79173214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	79173398	rs906176	A	G	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=3;PP=247;SC=GGACGACCCCAGGCTCCACAG;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=79173406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	79173462	rs906175	C	T	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=5;PP=720;SC=CAGCAGCAGCCCCGCACGGTC;SOR=2.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=79173470;WS=79173452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	79174221	rs2466773	T	C	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=16;PP=474;SC=ATGGTGACAGTGGCCTGGTTC;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=79174229;WS=79174211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	79180775	rs2256881	A	G	2260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=6;PP=2003;SC=TCCCATACAGACAGGTGGATG;SOR=4.343;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=62;TCR=6;TR=68;WE=79180783;WS=79180765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	79182667	rs9896314	A	G	199.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=2;PP=143;SC=GGAGCAGGCCAGGGTGGGGCA;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=79182675;WS=79182657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	79182778	rs62075318	T	C	1163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=10;PP=924;SC=TGTTGGATCTTCTAAGGTTGT;SOR=2.012;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=79182786;WS=79182768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	79193701	.	G	A	3703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.766;ClippingRankSum=0.000;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=72;PP=2965;ReadPosRankSum=0.706;SC=TCTTCTGCTCGCTGCCTGTGA;SOR=0.456;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=47;TCR=73;TR=119;WE=79193709;WS=79193691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,119:0.99:120
chr17	79202956	rs2048057	T	C	2148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.505;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=47;PP=1481;ReadPosRankSum=-0.711;SC=CCGTGCCCCCTGGGATCCGTT;SOR=1.308;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=75;TCF=28;TCR=47;TR=74;WE=79202964;WS=79202946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,78:0.99:79
chr17	79213305	rs2659009	G	A	131.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=5;NR=0;PP=101;SC=CGGGGAGGTGGCTGGGAGGGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=79213313;WS=79213295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	79213562	rs2255166	T	C	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=20;PP=605;SC=TGCTTTCCCGTTGGTTCAAGG;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=79213570;WS=79213552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	79219500	rs10569617	AATG	A	3381.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.14;NF=22;NR=30;PP=2783;SC=GGTTAAGGCCAATGATGACCC;SOR=0.772;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=54;TCF=23;TCR=31;TR=52;WE=79219510;WS=79219490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	79220224	rs2725405	G	C	1444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=25;PP=1182;SC=TCTCAGCTTGGCCTGGGCTGC;SOR=0.874;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=22;TCR=25;TR=47;WE=79220232;WS=79220214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	79372928	.	A	AGTGT	391.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;NF=6;NR=1;PP=398;SC=TGTGCGTGTGAGTGTGTGTGT;SOR=2.093;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=7;WE=79372936;WS=79372918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	79385318	rs4998275	T	G	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.455;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=2.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.06;MQRankSum=2.489;QD=5.11;ReadPosRankSum=-1.010;SOR=0.991;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr17	79385322	rs4969434	T	G	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.059;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=1.957;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.35;MQRankSum=2.320;QD=4.69;ReadPosRankSum=-1.539;SOR=1.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr17	79389251	rs9897258	C	T	2209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=21;PP=1670;SC=GTAACGCGAGCGCGAGGCCCC;SOR=1.483;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=69;TCF=47;TCR=22;TR=68;WE=79389259;WS=79389241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	79389486	rs11870740	G	A	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=10;PP=297;SC=CCCCTCGGTGGGAGGTGGAGC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=79389494;WS=79389476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	79390260	rs151241907	G	GGTGT	600.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=11;PP=582;ReadPosRankSum=-0.656;SC=GTCCATTGAGGGTGTGTGTGT;SOR=0.412;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=16;WE=79390268;WS=79390250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr17	79390277	.	G	A	1156	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=38;MMLQ=27;MQ=55.3;NF=15;NR=4;PP=1156;QD=62.6721690814;SC=GTGTGTGTGTGTGTCCATGAG;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=53;TCF=31;TCR=22;TR=19;WE=79390315;WS=79390267;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:34,19:0.36:53
chr17	79390298	.	T	TGCGTGTGCGCGTGTGTGTCCATGAAAATGGGTGTGTGCATGTGTATGTCCATGAGGATGGGTGTGTGC,TGC	2296.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.13;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=19;PP=2474;SC=GATGGGTGTGTGCATGTGTGC;SOR=0.859;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=49;TCF=26;TCR=23;TR=43;WE=79390315;WS=79390267;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:24
chr17	79390370	rs36169187	CGT	C	2281.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=28;PP=2415;SC=GGTGTATGTGCGTGTGTGTGT;SOR=0.871;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=57;TCF=26;TCR=31;TR=53;WE=79390379;WS=79390360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	79395814	rs34098647	A	AT	1447.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.531;NF=8;NR=48;PP=958;ReadPosRankSum=-1.377;SC=TCCTCTCGTGATTTTTTTTTT;SOR=0.632;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=12;TCR=74;TR=56;WE=79395822;WS=79395804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:7,58:0.89:65
chr17	79402514	rs12600846	C	T	1720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=1345;ReadPosRankSum=1.903;SC=TCTGGCGGTTCGCTTAGCCCA;SOR=0.269;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=54;TCF=25;TCR=29;TR=53;WE=79402522;WS=79402504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr17	79409309	rs12938890	A	G	1426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=24;PP=1097;SC=GCGGCCTGGCACGGGGGTGGT;SOR=0.733;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=24;TCR=24;TR=48;WE=79409317;WS=79409299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	79414307	rs7213444	A	G	2533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=54;PP=2052;SC=CCCCTACCCTACCGAGCGGGG;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=23;TCR=54;TR=77;WE=79414315;WS=79414297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr17	79414914	rs10871497	A	G	1297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=38;PP=1085;SC=GAGTCCCAGCAGTGGGACCCA;SOR=4.565;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=41;WE=79414922;WS=79414904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr17	79418260	rs6565571	A	G	1789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=44;PP=1394;SC=GCTTCCGTGCACGAGGCCTCA;SOR=2.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=54;WE=79418268;WS=79418250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr17	79418770	rs61746096	C	T	1201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=22;PP=939;SC=TGGTGGAGGCCGCTGGCCTGG;SOR=1.432;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=35;WE=79418778;WS=79418760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr17	79418983	rs34593866	G	GC	806.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=25;PP=688;ReadPosRankSum=1.511;SC=AGGCCCCTGTGCCCCCCCCAC;SOR=2.115;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=28;WE=79418991;WS=79418973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr17	79424516	rs12601317	A	G	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=34;PP=1139;SC=GCTGCTGCACACCGGGGCCAG;SOR=2.636;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=42;WE=79424524;WS=79424506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	79425141	rs78579961	C	T	999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=4;PP=848;SC=CCCAACCAGCCGGGTCTCTAG;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=79425149;WS=79425131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	79426481	rs4969273	A	G	1404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=21;PP=1066;SC=GCCCTGGGCCAGGCCCCACCT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=21;TCR=21;TR=42;WE=79426489;WS=79426471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr17	79427794	rs3744147	C	G	1920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=34;PP=1608;SC=GCTGGGGGAACCAGGAGGCCC;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=21;TCR=34;TR=55;WE=79427802;WS=79427784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	79427822	rs3744148	C	T	1430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=25;PP=1217;SC=AGGCAGGGTCCGGGGAGGGGC;SOR=1.105;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=42;WE=79427830;WS=79427812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	79429711	rs3736072	C	T	1450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=3;PP=1143;SC=CTGGCCGCCACCTGTCCCCAC;SOR=5.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=43;WE=79429719;WS=79429701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr17	79429852	rs8746	C	T	3101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=56;PP=2414;SC=GGGACTGTGCCGTCTTCCTGT;SOR=1.202;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=38;TCR=56;TR=94;WE=79429860;WS=79429842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr17	79502316	rs138055235	A	C	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=198;SC=CACCATCCGCATCCCCATCTC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=79502324;WS=79502306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	79508263	rs62076028	A	G	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=396;SC=CCGAGTGACTAGAGGGGGGCC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=79508271;WS=79508253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	79508400	rs14422	T	C	1412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=22;PP=1043;SC=GAGCCCTGGGTGGCCTGCTCT;SOR=0.818;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=25;TCR=22;TR=47;WE=79508408;WS=79508390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	79508484	rs58483803	G	A	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=24;PP=766;SC=ACACCCCTTGGAGCAGGGTGA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=79508492;WS=79508474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr17	79508506	rs2228698	G	T	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=22;PP=685;SC=CCTCTCCCTCGAGCTGCCTGG;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=28;WE=79508514;WS=79508496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr17	79510899	rs7406506	A	G	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=526;SC=GCGGCAGAGCAGACTTGGATC;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=79510907;WS=79510889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	79511135	rs8077430	A	G	1943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=38;PP=1444;SC=GGCACAGGTCAGTCATGGCCA;SOR=1.196;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=23;TCR=39;TR=61;WE=79511143;WS=79511125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr17	79513881	rs369579337	TA	T	131.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.000;QD=6.59;ReadPosRankSum=-0.825;SOR=0.385;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr17	79514129	rs11552304	G	A	3503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=41;PP=2965;SC=TGTGTGTGGCGGGGCCAGGCC;SOR=1.127;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=64;TCR=41;TR=105;WE=79514137;WS=79514119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr17	79514832	rs7224579	G	A	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=27;PP=1082;SC=GTGGAGCCACGCCAGAGAGTG;SOR=0.853;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=22;TCR=28;TR=49;WE=79514840;WS=79514822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr17	79515075	rs6565593	A	G	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=15;PP=454;SC=TTGGCTCCCCAGAATGTTCCT;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=79515083;WS=79515065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	79519382	rs4076968	G	A	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=27;PP=802;SC=GTCAGAGTGAGAAGCCCCGGC;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=79519390;WS=79519372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	79526402	rs4073997	G	C	1135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=16;PP=774;SC=CCCCGACGGCGCCGTACTCAT;SOR=0.927;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=16;TCR=16;TR=32;WE=79526410;WS=79526392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	79526569	rs4076819	C	G	366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=9;PP=234;SC=CAGTGCTGGTCCTGCCCACAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=79526577;WS=79526559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	79530993	rs8070929	G	T	866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=20;PP=653;SC=TGTAATCCCAGCTACTCGGGA;SOR=2.753;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=79531001;WS=79530983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr17	79567610	rs7213849	C	T	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=282;SC=ATGCGACACGCCTCCCGGCTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=79567618;WS=79567600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	79573860	rs10695650	C	CTTAA	944.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=837;SC=AGAGAAGCAACTTAAACATCA;SOR=1.828;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=15;WE=79573868;WS=79573850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	79577127	rs8077038	T	G	895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=0;PP=739;SC=GTAAGTTCTTTGAACCACTCA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=79577135;WS=79577117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr17	79612541	rs34896443	G	A	3254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=53;PP=2681;SC=CACACCCTGCGTGTGGCCATC;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=52;TCR=53;TR=105;WE=79612549;WS=79612531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr17	79615225	rs7406494	G	T	336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=8;PP=277;SC=CTGCCCGCAGGGGGGCGGCGT;SOR=2.494;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=79615233;WS=79615215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	79637349	rs10438817	T	C	2615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=40;PP=1819;SC=AGGGGGAGTCTGACGGGGCCT;SOR=1.006;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=90;TCF=49;TCR=41;TR=89;WE=79637357;WS=79637339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr17	79660681	.	C	A	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=11;PP=596;SC=CGCTTGTCCTCAGCTGCCCCC;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=12;TCR=11;TR=23;WE=79660689;WS=79660671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	79766825	rs7406228	C	A	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=4;PP=543;SC=GCGTACACACCCACCAGGACT;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=79766833;WS=79766815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	79767019	rs200551811	TCTGTCTGC	T	903.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=18;PP=2012;SC=CTGATGGCTCTCTGTCTGCCT;SOR=3.258;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=20;WE=79767034;WS=79767009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	79767530	rs370243345	CCTGT	C	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=309;SC=TGCCTGTCTGCCTGTCTGTCT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=79767541;WS=79767520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr17	79767602	.	T	TCTGTCTGCCTGC	1096.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=3;PP=1511;SC=TGTCTGCCTGTCTGTCTGCCT;SOR=4.977;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=26;WE=79767610;WS=79767592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	79768848	rs2272030	A	G	1658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=38;NR=22;PP=1296;SC=GGGCGGGCCCAGGGTGGGGCT;SOR=1.493;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=62;TCF=38;TCR=24;TR=60;WE=79768856;WS=79768838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr17	79769466	rs28454947	T	C	1502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=42;PP=1077;SC=CCCAGGCAGGTGGGTGGGTGG;SOR=2.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=10;TCR=42;TR=52;WE=79769474;WS=79769456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr17	79770740	rs5384	C	T	1823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=27;PP=1342;SC=AAGTGGTCTTCGCCTTCGTGA;SOR=0.906;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=30;TCR=27;TR=57;WE=79770748;WS=79770730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr17	79784101	rs374374934	GCA	G	165.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=5.555;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.10;ReadPosRankSum=0.442;SOR=1.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,12:0.15:79
chr17	79784105	rs144826913	A	G	1677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.525;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=16;PP=1901;ReadPosRankSum=-0.229;SC=TTGTGTGCACACACACACACA;SOR=0.175;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=85;TCF=67;TCR=18;TR=72;WE=79784115;WS=79784091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,71:0.85:84
chr17	79784107	.	A	G	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=7.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.80;ReadPosRankSum=0.633;SOR=2.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,13:0.15:89
chr17	79791597	rs35031019	A	G	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=5;PP=326;SC=CGGGCGGGCAAAGCTGGCTCA;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=16;WE=79791605;WS=79791587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	79791792	rs34856581	G	A	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=298;SC=GCCCCAACCCGGGTCAGAGGG;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=79791800;WS=79791782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	79803101	rs1130674	A	G	2989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=45;PP=2326;SC=CGTTGTAATCAATGACCTGTG;SOR=0.797;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=51;TCR=45;TR=96;WE=79803109;WS=79803091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr17	79803433	rs35649520	G	A	2537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=65;NR=14;PP=1990;SC=GAGGGAAGGCGCACCGTCCTG;SOR=3.098;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=65;TCR=14;TR=79;WE=79803441;WS=79803423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr17	79805003	rs111301737	A	G	2490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=54;PP=2007;SC=AATGCAGAAGATTCTCCCAAT;SOR=1.639;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=25;TCR=54;TR=79;WE=79805011;WS=79804993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr17	79805134	rs2070871	G	A	1611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=19;PP=1272;SC=CGGTGAACTCGATGACAAGGG;SOR=1.314;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=31;TCR=19;TR=50;WE=79805142;WS=79805124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	79817005	rs1010954	G	A	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=4;PP=868;SC=CTTCCAAGTCGGCAGGCCAGT;SOR=3.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=79817013;WS=79816995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr17	79818159	rs35766162	T	C	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=1;PP=425;SC=AGAGCCTGGCTCAGCGGCCCC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=79818167;WS=79818149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	79818260	rs11558886	G	T	1068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=16;PP=875;SC=TTGCTTTTCCGCAGCACCAGG;SOR=0.752;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=16;TCR=16;TR=32;WE=79818268;WS=79818250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	79818360	rs1130664	T	G	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=17;PP=606;SC=CGGACACGGATCAGGCGGGGC;SOR=1.460;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=9;TCR=17;TR=26;WE=79818368;WS=79818350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	79827163	rs113301975	C	T	7859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=130;NR=108;PP=2965;SC=ACCCCAGCCCCAGCCCCGCCT;SOR=0.895;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=238;TCF=130;TCR=108;TR=238;WE=79827171;WS=79827153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr17	79862882	rs146889521	C	G	4242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=72;PP=2965;SC=GGGGAGGGCACGGTAAGTCTA;SOR=1.144;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=51;TCR=72;TR=123;WE=79862890;WS=79862872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr17	79872129	rs1879568	A	G	4483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=80;PP=2965;SC=ACCCTCGGGCAGGCAGGGGCT;SOR=0.945;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=65;TCR=80;TR=145;WE=79872137;WS=79872119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr17	79872241	rs1879569	A	G	5591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=75;PP=2965;SC=TCCCAGTTCAAAGGCTGCCCC;SOR=0.867;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=167;TCF=92;TCR=75;TR=167;WE=79872249;WS=79872231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr17	79891147	rs61747618	T	C	2674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=31;PP=2026;SC=GGCCAGAAGGTGACAGAGCGG;SOR=1.434;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=55;TCR=31;TR=86;WE=79891155;WS=79891137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	79893962	rs34419046	G	A	4409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=33;PP=2965;SC=AGCCCCACAGGGACTCAGTCT;SOR=2.251;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=102;TCR=33;TR=134;WE=79893970;WS=79893952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr17	79894106	.	A	AT	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.19;MQRankSum=-1.180;QD=16.96;ReadPosRankSum=-0.717;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,48:0.84:57
chr17	79977698	.	C	A	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.976;ClippingRankSum=0.000;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=28;PP=1306;ReadPosRankSum=0.518;SC=AGGACAGACACGGGGACCCAC;SOR=0.330;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=51;TCF=22;TCR=29;TR=50;WE=79977706;WS=79977688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,52:0.98:53
chr17	79990972	rs10708637	CG	C	815.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=20;PP=842;SC=AATTGCGATACGGGTTCTGCC;SOR=4.091;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=22;WE=79990980;WS=79990962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	79991271	rs62078707	G	A	712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=546;SC=GTGGGGCTGGGGTAGCCGACT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=79991279;WS=79991268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	80000798	rs140905889	GAC	G	116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.10;MQRankSum=2.663;QD=1.34;ReadPosRankSum=1.414;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,11:0.13:87
chr17	80006504	rs1128009	T	C	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=1;PP=567;SC=CTCACTGGTGTGGCCGTGGCA;SOR=3.912;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=80006512;WS=80006494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	80006957	rs12948507	A	C	1802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=17;PP=1440;SC=TCACCACGTTATGTGGGTTCT;SOR=1.567;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=50;WE=80006965;WS=80006947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr17	80007018	rs12939972	T	C	2712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=21;PP=2064;SC=GTGGGCAGAGTGTGTGGCCTG;SOR=2.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=59;TCR=21;TR=80;WE=80007026;WS=80007008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr17	80007055	rs62078730	T	C	3521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=47;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=25;PP=2678;SC=CGCCTGCCCCTGGCCAGGAGC;SOR=2.324;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=79;TCR=25;TR=104;WE=80007063;WS=80007045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr17	80007080	rs28404464	T	C	5853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.01;SOR=1.893;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr17	80007088	rs28696285	C	G	6147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.60;SOR=1.695;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr17	80007324	rs56148859	C	T	12444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.017;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=181;NR=197;PP=2965;ReadPosRankSum=0.572;SC=CTCACTGGCCCGAGAACTGTG;SOR=0.117;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=380;TCF=181;TCR=199;TR=378;WE=80007332;WS=80007314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,387:0.99:389
chr17	80007887	rs9915228	A	G	6230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.57;SOR=1.219;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr17	80007897	rs9915742	G	T	6109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.60;SOR=1.381;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr17	80008018	rs9893491	A	G	3919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=51;PP=2965;SC=CTTGGAGCAAAAAGAGCCGGG;SOR=0.973;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=67;TCR=51;TR=118;WE=80008026;WS=80008008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr17	80008392	rs9916764	G	T	3991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=55;PP=2965;SC=GGAGGCTCCTGGCGTTCACAT;SOR=0.812;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=61;TCR=55;TR=116;WE=80008400;WS=80008382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr17	80008676	rs4464142	A	C	3053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=72;PP=2495;SC=CACGTAGAGGATGGCACTGGG;SOR=3.044;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=17;TCR=72;TR=89;WE=80008684;WS=80008666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr17	80009156	rs28552909	T	C	1766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=21;PP=1279;SC=CGCCGGGGAGTGGGGGACACT;SOR=1.292;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=58;WE=80009164;WS=80009146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr17	80009320	.	T	C	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=19;PP=461;SC=GCCTAGACCCTGGGAGGCGGG;SOR=4.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=80009328;WS=80009310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr17	80009668	.	C	G	85	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=3;NR=1;PP=85;QD=29.9428031368;SC=CCCGGCGCTGCGAGCGGAGAA;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=80009676;WS=80009658;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr17	80011975	rs34809889	G	A	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=37;PP=1147;SC=AAGGGAGCGCGGGTGTCTGGG;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=39;WE=80011983;WS=80011965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	80012449	rs11077966	G	A	2318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=15;PP=1876;SC=CCCTGGACACGGCCTGGGTGG;SOR=2.432;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=55;TCR=15;TR=70;WE=80012457;WS=80012439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr17	80012769	rs11655185	G	A	7303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.099;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=141;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.958;SC=GCGCCCCCCCGCCAGGTCAGC;SOR=1.011;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=233;TCF=91;TCR=142;TR=231;WE=80012777;WS=80012759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,238:1.00:239
chr17	80012997	rs35085155	A	G	4487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=94;PP=2965;SC=GCTCTAGGAAATGTGGAGCAT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=44;TCR=94;TR=138;WE=80013005;WS=80012987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr17	80013235	rs4969464	A	G	1565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=21;PP=1253;SC=GGGCACATGTACAGGTGTAGG;SOR=1.007;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=26;TCR=21;TR=47;WE=80013243;WS=80013225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	80014272	rs34689427	G	GCC	6308.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=59;PP=2966;SC=ATGAAGGTGGGCCCCGCCTGG;SOR=1.149;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=144;TCF=77;TCR=67;TR=128;WE=80014280;WS=80014262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr17	80014861	rs4969484	T	G	3241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.096;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=40;PP=2495;ReadPosRankSum=-0.725;SC=GTGGGCTGGCTTGAGGGGGGG;SOR=1.023;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=106;TCF=65;TCR=41;TR=105;WE=80014869;WS=80014851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr17	80019207	rs11542331	G	C	1782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.658;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=35;PP=1260;ReadPosRankSum=-0.886;SC=CCTCGAACAGGGCGGGGTTGT;SOR=0.738;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=28;TCR=35;TR=62;WE=80019215;WS=80019197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr17	80022656	rs34249409	C	CG	330.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=396;SC=ATTCCAGGACCGGGAACCCAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=80022664;WS=80022646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	80037191	rs4075080	A	G	3908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=57;PP=2965;SC=GTCCCACCCCACTCCTGTCCC;SOR=0.902;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=70;TCR=57;TR=127;WE=80037199;WS=80037181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr17	80038952	rs4246444	T	G	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=6;PP=483;SC=CGAAGGGCGGTATGCCTGCCG;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=17;WE=80038960;WS=80038945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	80039028	rs4246445	A	G	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=12;PP=806;SC=CCGCCTGGCCACCCACACGCA;SOR=1.739;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=36;WE=80039036;WS=80039018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	80040607	rs4969465	T	C	486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=7;PP=464;SC=GTCTCTTCCCTACACGCCGGG;SOR=1.112;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=17;WE=80040615;WS=80040597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	80043044	rs45573640	C	G	2365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=38;PP=1976;SC=TACAGCGGGTCGGGGAGGGTC;SOR=0.869;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=33;TCR=38;TR=70;WE=80043052;WS=80043034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr17	80045086	rs4485435	G	C	1514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=19;PP=1133;SC=GGACGCCTCCGGCCACTGTGA;SOR=1.314;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=51;WE=80045094;WS=80045076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	80048985	.	G	C	1117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=23;PP=867;SC=GCCCCATCCCGTGCCACTGTG;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=29;WE=80048993;WS=80048975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	80050554	rs10591316	CGG	C	746.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=31.11;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	80091941	rs4789754	G	A	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=7;PP=602;SC=TAGATGAAGGGGTGTTACCTG;SOR=1.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=22;WE=80091949;WS=80091931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr17	80092131	rs4789753	T	C	2110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=43;PP=1574;SC=TCCTCTTGTGTTGAATGCAAA;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=24;TCR=43;TR=67;WE=80092139;WS=80092121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr17	80092171	rs4789752	A	G	1203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=27;PP=937;SC=GTTCCTTTTCAAAACCAAAGT;SOR=2.073;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=37;WE=80092179;WS=80092161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr17	80103737	rs6502066	T	C	2754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=30;PP=1938;SC=CTGCTGGAGTTGGCTCCACAG;SOR=1.434;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=84;WE=80103745;WS=80103727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr17	80104593	rs12600852	G	A	1262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=21;PP=867;SC=CTATGGATGTGTGCATGCATG;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=21;TCR=21;TR=42;WE=80104601;WS=80104583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	80104631	rs12603050	A	G	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=23;PP=743;SC=ATACAAATGCATGTGTGCACA;SOR=2.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=80104639;WS=80104621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	80104762	rs12602320	C	T	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.43;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr17	80104762	.	CGT	TGC	334	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=3;NR=3;PP=334;QD=64.5779791437;SC=CGCAAACAAACGTGTGTGCAC;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=6;WE=80104772;WS=80104752;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr17	80104764	rs12603584	T	C	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=49.42;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr17	80109349	.	A	C	304	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5273;HP=1;HapScore=2;MGOF=79;MMLQ=27;MQ=56.38;NF=17;NR=5;PP=304;QD=15.3986914794;SC=TCTGACCCACATCCAGAACCT;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=22;WE=80109357;WS=80109347;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:0,22:1.00:22
chr17	80121275	rs34448080	A	G	2956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=65;PP=2286;SC=ACCTGAGAACAAAGGAAGACC;SOR=1.586;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=33;TCR=65;TR=98;WE=80121283;WS=80121265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr17	80121358	rs34867501	T	C	1001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=36;PP=849;SC=CTGACCCCAATGCGAAGCTGT;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=37;WE=80121366;WS=80121348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	80136418	rs7209474	C	T	3135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=48;PP=2421;SC=TCCAGGGTCACGGCCTTCAGC;SOR=0.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=54;TCR=48;TR=101;WE=80136426;WS=80136408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr17	80137173	rs3935816	C	T	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=20;PP=550;SC=CTCCTGCTCTCGCATGGCCTG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=80137181;WS=80137163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	80141907	.	G	GCACACA	424.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.176;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.04;MQRankSum=-0.985;QD=28.32;ReadPosRankSum=-0.171;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chr17	80145983	rs4789730	T	A	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr17	80146089	rs4789729	G	A	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=3;PP=564;SC=CCAAGCACACGCTCACTGGTC;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=80146097;WS=80146079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	80151501	rs56193110	A	G	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=4;PP=680;SC=GAAATCCAAAACAGCGGGCTC;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=80151509;WS=80151491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	80151805	rs4789670	T	C	2927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=64;PP=2171;SC=ACTCCAGTCCTGGCCTGCGAG;SOR=1.431;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=36;TCR=64;TR=99;WE=80151813;WS=80151795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr17	80151881	rs4789722	G	A	2343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=30;PP=1935;SC=TGGCCTCCAGGTCCTGGAGCT;SOR=0.904;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=39;TCR=30;TR=69;WE=80151889;WS=80151871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr17	80159566	rs8072670	T	C	3333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=45;PP=2696;SC=GCCTGGCCTCTTCCCACTCCC;SOR=0.884;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=54;TCR=45;TR=99;WE=80159574;WS=80159556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr17	80195582	rs9303026	T	C	6988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=128;PP=2965;SC=ACCTGGCGGGTTCTACGGCGG;SOR=1.168;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=214;TCF=86;TCR=128;TR=214;WE=80195590;WS=80195572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,222:1.00:222
chr17	80198007	rs9901910	G	C	3718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=78;PP=2784;SC=CTGGCCTTGCGCCAGCTGGGC;SOR=2.033;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=31;TCR=78;TR=109;WE=80198015;WS=80197997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr17	80211139	rs111560395	C	T	4534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.890;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.106;SC=AGAGCAAGGGCGCGAGATGGC;SOR=1.543;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=142;TCF=45;TCR=97;TR=141;WE=80211147;WS=80211129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,147:0.99:148
chr17	80218800	rs35693344	G	A	1224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=4;PP=1117;SC=CCAGGCTGGAGGGCAGTGGCA;SOR=4.294;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=38;WE=80218808;WS=80218790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	80275253	rs3176829	T	C	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=554;SC=GGGAGAGCTCTGGAGCTGTGG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=80275261;WS=80275243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	80280865	rs11077986	G	A	3438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=73;PP=2694;SC=ACCCAGTGTCGGGGGCGGACT;SOR=1.835;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=32;TCR=73;TR=105;WE=80280873;WS=80280855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr17	80332251	rs11654140	T	C	2565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=33;PP=1942;SC=TGGCCGCCACTGGCAGCTCTG;SOR=1.039;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=48;TCR=33;TR=81;WE=80332259;WS=80332241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr17	80352138	rs6502106	T	C	1255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=0;PP=1102;SC=AGTGCTGGGATTACAGGCGTG;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=39;WE=80352146;WS=80352128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr17	80352234	rs62079522	G	A	3706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=49;PP=2883;ReadPosRankSum=-0.590;SC=GACTCAGCACGGCAACCAAGG;SOR=0.377;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=66;TCR=49;TR=114;WE=80352242;WS=80352224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,118:0.99:119
chr17	80352303	rs62079523	G	A	3468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=57;PP=2799;SC=CCCCTCTCGGGCGGGTGGTGA;SOR=0.987;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=46;TCR=57;TR=103;WE=80352311;WS=80352293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr17	80355975	rs62079527	C	T	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=3;PP=511;SC=GCAGATGCTCCGTGAACTCAG;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=80355983;WS=80355965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr17	80356019	rs9905077	C	G	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=5;PP=641;SC=CCACACCCACCGTGCTTGCCT;SOR=2.910;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=80356027;WS=80356009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	80356315	rs6502107	A	G	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=401;SC=TTGCTCCATCACCCAGGCTGG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=80356323;WS=80356305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	80361753	rs11655676	G	A	222.78	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=1;PP=218;ReadPosRankSum=-1.282;SC=CACTCACCGTGCCCACGGGCA;SOR=1.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=10;WE=80361761;WS=80361743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr17	80367206	rs62080965	G	A	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=409;SC=CAAAGTTAACGGGTAAAAAAA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=80367214;WS=80367196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	80438165	rs367877086	GCA	G	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.37;ReadPosRankSum=-0.249;SOR=0.072;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
chr17	80439606	rs61126963	CA	C	182.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.95;MQRankSum=2.050;QD=4.57;ReadPosRankSum=1.179;SOR=1.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr17	80544855	rs1387545	T	C	735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=626;SC=GTGTGATAGCTATCTGGTTAT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=22;WE=80544863;WS=80544845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	80545156	rs6502124	A	G	1136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=31;PP=851;SC=ATGGTAAGACATGCTGGTCGG;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=33;WE=80545164;WS=80545146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr17	80574082	rs753569	T	G	1368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.77;SOR=6.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	80574532	rs12950772	A	G	4816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=70;PP=2965;SC=CTGTGAAGACAAGAAAAGAAA;SOR=0.964;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=164;TCF=94;TCR=70;TR=164;WE=80574540;WS=80574522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr17	80577126	rs59969975	ATCT	A	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=479;SC=CACCCACATCATCTACTACTT;SOR=1.981;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=80577136;WS=80577116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr17	80583230	rs3826309	A	G	3665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=55;PP=2695;SC=ATGTGGACCCATTTCCCATCG;SOR=0.843;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=62;TCR=55;TR=117;WE=80583238;WS=80583220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr17	80585094	rs2291393	C	T	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=454;SC=CTCGCCGCAGCTTGACTGCCT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=80585102;WS=80585084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	80601769	rs59318270	TA	T	2992.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=35;PP=2681;SC=AGGTTAAATTTAAGACTCCGA;SOR=0.815;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=66;TCF=29;TCR=37;TR=64;WE=80601777;WS=80601759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr17	80602050	rs11649788	C	G	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=12;PP=367;SC=TGTCCTTGTACAAATGTTACT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=80602058;WS=80602040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	80619080	rs4789706	T	C	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=283;SC=CCAATGTCCCTGAAGGGATCC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=80619088;WS=80619070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr17	80626104	rs12952159	T	C	2796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=25;PP=2296;ReadPosRankSum=-0.634;SC=GGGGTTTTTGTGGTCTTCAGG;SOR=1.009;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=89;TCF=64;TCR=25;TR=88;WE=80626112;WS=80626094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,89:0.99:90
chr17	80626210	rs7221877	T	C	3007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=72;PP=2187;SC=CCTTCCAGTCTGCAGGACTGG;SOR=1.588;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=33;TCR=72;TR=105;WE=80626218;WS=80626200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr17	80656616	rs2243606	T	G	150.81	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=0;NR=7;PP=133;SC=ACAGCGCGCATCCCCGCCCGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=80656624;WS=80656606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	80674643	rs2250000	C	G	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=0;PP=783;SC=TGGAGGAGCTCCTGAGGCGCG;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=80674651;WS=80674633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr17	80674839	rs10714010	CG	C	909.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.38;MQRankSum=0.490;QD=30.32;ReadPosRankSum=-1.389;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr17	80676946	rs111661651	A	ACCACCCC	589.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=6;PP=485;SC=GCATCTTCACACCACCCCCCA;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=7;WE=80676954;WS=80676936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr17	80684638	rs2246103	T	C	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=14;PP=1193;SC=CTGGGGGCGGTGGGGACCTGG;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=33;TCR=14;TR=47;WE=80684646;WS=80684628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr17	80684784	rs142718764	G	A	2336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=40;PP=1727;SC=GGGTGGAAACGTAGCAGAGGA;SOR=1.012;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=30;TCR=40;TR=70;WE=80684792;WS=80684774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr17	80685126	rs2243446	T	C	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=25;PP=592;SC=CTTCACATGCTGGACTAGCTT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=80685134;WS=80685116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr17	80693705	rs2256322	A	G	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=13;PP=386;SC=GGGGCCTGGGAAGGCGGAGGG;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=80693713;WS=80693695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	80696410	rs2253149	A	C	603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=2;PP=541;SC=GGAGGCCCTCAGGAGCACGGG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=80696418;WS=80696400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	80696542	rs2253132	G	A	1412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=20;PP=1117;SC=ACCCATATGCGCACATGTGTA;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=22;TCR=20;TR=42;WE=80696550;WS=80696532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	80698776	.	C	G	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=535;SC=GCCACATTGTCTACCCTAGAT;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=80698784;WS=80698766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	80699163	.	C	G	2052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=0.000;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=1.152;NF=50;NR=9;PP=1627;ReadPosRankSum=-0.747;SC=ACAGCTCCTTCAGGCCAAGGA;SOR=1.917;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=60;TCF=51;TCR=9;TR=59;WE=80699171;WS=80699153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr17	80700592	rs1994554	T	C	2819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=31;PP=2250;SC=CCTGTGCTTCTCTTGAAGAAG;SOR=1.382;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=56;TCR=31;TR=87;WE=80700600;WS=80700582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr17	80700712	rs1994553	T	C	2156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=53;PP=1585;SC=TCTGTCTCCTTGTCGACGCCC;SOR=2.211;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=19;TCR=53;TR=72;WE=80700720;WS=80700702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr17	80708607	rs149413139	C	T	3638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=103;PP=2965;SC=CTTCCTTGGGCACCATGCGAA;SOR=3.767;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=15;TCR=103;TR=118;WE=80708615;WS=80708597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr17	80730527	rs615630	T	C	478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=18;PP=376;SC=TCTGAGGGAGTGTGCAGCAGT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=80730535;WS=80730517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr17	80763983	rs582192	C	T	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=527;SC=TTGCTGGTGCCGGCACTGTCT;SOR=4.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=19;WE=80763991;WS=80763973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr17	80765322	rs668990	C	A	1422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=1;PP=1174;SC=GATTTGAGAACGGAGGGAAGG;SOR=6.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=39;WE=80765330;WS=80765312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr17	80786008	rs6502134	G	A	7329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=114;PP=2965;SC=CACCCACACAGTTGAATGTGC;SOR=0.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=226;TCF=112;TCR=114;TR=225;WE=80786016;WS=80785998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr17	80786427	rs11364632	GC	G	4926.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=85;PP=2983;SC=AATGGAATGTGCCCCCCCCGA;SOR=1.044;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=171;TCF=53;TCR=118;TR=132;WE=80786435;WS=80786417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr17	80786627	rs34655768	GCA	G	1804.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=34;PP=1647;SC=ACCCAGAGATGCACACACACA;SOR=4.362;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=35;WE=80786636;WS=80786617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr17	80788465	rs12938126	T	C	5027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=85;PP=2965;SC=CAGCAGGTTCTGCAGCTCGTG;SOR=0.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=73;TCR=86;TR=158;WE=80788473;WS=80788455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr17	80788492	rs12948179	A	G	4773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=74;PP=2965;SC=CGGGGAAGGCAGGCCTCGGAG;SOR=0.705;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=78;TCR=74;TR=152;WE=80788500;WS=80788482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr17	80790442	rs3744165	T	G	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=263;SC=TCTTTCCCGATCACTTCTATC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=80790450;WS=80790432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	80827955	rs7222931	A	G	1361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=0;PP=1055;SC=GGAGCCCCGAACCTCTGGGTG;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=80827963;WS=80827945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr17	80863857	rs2292971	T	C	1420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=19;PP=984;SC=GATCTTCACATGAGGCATGGG;SOR=0.952;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=26;TCR=19;TR=45;WE=80863865;WS=80863847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr17	80865526	rs2085616	G	A	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=1;PP=1083;SC=ATGCTCCTCCGAGTGTACTTG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=40;WE=80865534;WS=80865516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr17	80865866	rs879715	T	C	256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=10;PP=203;SC=ACAGGCTCTCTGCTGGCGTCA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=80865874;WS=80865856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr17	80866427	rs8073910	G	T	250.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=237;SC=TTAAGATTCAGCTCGGATTCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=80866435;WS=80866417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	80867281	rs2271916	C	A	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=11;PP=320;SC=CCCTCTCTGCCTATGTGTGTT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=80867289;WS=80867271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	80867333	rs2271915	C	T	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=111;SC=CTGTGGGAGGCGCATGAGGGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=80867341;WS=80867323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr17	80878389	rs1471197	A	G	155.81	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=3;NR=5;PP=143;SC=AGGCGCTTTTAGAAAAGTAAC;SOR=0.941;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=8;WE=80878397;WS=80878379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr17	80878412	rs5822547	C	CT	65.92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.319;NF=1;NR=5;PP=78;ReadPosRankSum=0.319;SC=TGCGTCTATCCTTTTTTTTTT;SOR=0.446;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=6;WE=80878420;WS=80878402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr17	80887244	rs1127986	T	C	4855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=99;PP=2965;SC=GCAGGTCCGATGTGGCCTCCG;SOR=1.357;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=57;TCR=99;TR=156;WE=80887252;WS=80887234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr17	80887451	rs2034962	A	G	1769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=35;PP=1403;SC=TCTTGGGAGCATGTATGGAGC;SOR=1.123;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=24;TCR=35;TR=59;WE=80887459;WS=80887441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr17	80890638	rs898095	T	C	1041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=18;PP=844;SC=CATGACTTCCTTTCCGATTAA;SOR=0.880;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=15;TCR=18;TR=33;WE=80890646;WS=80890628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	80895745	rs3785520	T	C	2012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=27;PP=1384;SC=GCGACACTCGTGTGTGTAGGC;SOR=0.917;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=32;TCR=27;TR=59;WE=80895753;WS=80895735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr17	80895769	rs3785521	A	G	2121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=30;PP=1709;SC=GTGCAGATGTACGCACACACA;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=28;TCR=31;TR=58;WE=80895777;WS=80895759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr17	80895933	rs3785522	A	G	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=28;PP=877;SC=AGGTTCTGCGAGATGGTGCAG;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=80895941;WS=80895923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr17	80897215	rs3744156	C	T	1930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=12;PP=1502;SC=CGCTTCCCTCCGGCAAATGCA;SOR=2.797;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=49;TCR=12;TR=61;WE=80897223;WS=80897205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr17	80899281	rs9390	G	A	3061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=36;PP=2405;SC=ACAGGGACGCGGAGCTTGCAG;SOR=1.337;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=58;TCR=36;TR=94;WE=80899289;WS=80899271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr17	80904844	rs7225887	C	T	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=28;PP=887;SC=TCCTCAAAGGCGCCCCCTGTG;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=80904852;WS=80904834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr17	80914988	rs1001865	G	T	1678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=6;PP=1375;SC=GGGAAGGCTCGGAGCAGCTGT;SOR=3.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=43;TCR=6;TR=49;WE=80914996;WS=80914978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr17	80923432	rs7217917	T	C	238.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=165;SC=CCCGGAGGCATGGCAAGGCGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=80923440;WS=80923430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr17	80963331	rs9901757	C	T	1352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=14;PP=1116;SC=ACGCGCATCTCGGCGGTGAAC;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=42;WE=80963339;WS=80963321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr17	80992932	rs16940609	A	C	1990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=25;PP=1543;SC=AGCAAAGGTAAGACCCTGAGC;SOR=1.296;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=69;TCF=44;TCR=25;TR=68;WE=80992940;WS=80992922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr17	80993058	rs10717152	CT	C	649.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=13;PP=176;SC=ATATGATATTCTTTTTTTTTT;SOR=4.047;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=14;WE=80993066;WS=80993048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	80993076	rs7405848	A	G	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=14;PP=410;SC=TTTTTTCGAGATGGAGTTTCC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=80993084;WS=80993066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr17	81006629	rs7406119	C	T	2514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.697;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=41;PP=1845;ReadPosRankSum=-0.815;SC=CGTCCAGCCACGGTTCAGCGT;SOR=0.757;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=72;TCF=31;TCR=41;TR=71;WE=81006637;WS=81006619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,81:0.99:82
chr17	81009595	rs11868631	C	T	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=5;PP=380;SC=GCGGGGCACCCTCCCCGCTGG;SOR=1.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=11;TCR=5;TR=16;WE=81009603;WS=81009585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr17	81009813	rs112877732	C	A	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=15;PP=386;SC=CTGCTCGGCGCGGGGCGGGGC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=81009821;WS=81009803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr17	81050833	rs74775917	A	AG	4338.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=47;PP=2957;SC=GCTGAGTGTGAGATCCTTTGA;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=49;TCR=49;TR=95;WE=81050841;WS=81050823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr17	81050982	rs7501742	G	C	2961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.379;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=46;PP=1839;ReadPosRankSum=-0.862;SC=GTGAGTGTCTGCTCGGCAGCT;SOR=1.227;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=27;TCR=46;TR=72;WE=81050990;WS=81050972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr17	81051007	rs7502442	G	T	2542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.206;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=44;PP=1543;ReadPosRankSum=-0.839;SC=CCTCCTGTGCGCCTGGTTTCT;SOR=1.768;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=19;TCR=44;TR=62;WE=81051015;WS=81050997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr17	81051887	rs7223467	T	G	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=0;PP=660;SC=TGGCAGAGTCTGGGGTCAGCT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=81051895;WS=81051877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	81052423	rs8269	G	A	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=31;PP=833;SC=TGGGAGCCGCGTGCCCTGGGC;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=81052431;WS=81052413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr17	81083660	rs141356578	T	C	985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=25;PP=826;SC=CAGACATGTGTTGGGCATGGA;SOR=2.376;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=33;WE=81083668;WS=81083650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	180211	rs79829832	CT	C	99.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=1.528;QD=2.08;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.659;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,15:0.31:48
chr18	196829	rs655781	G	A	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.006;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=16;PP=307;ReadPosRankSum=-0.392;SC=TACATTTACCGTACTTACTGG;SOR=0.212;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=58;TCF=6;TCR=52;TR=19;WE=196837;WS=196819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,20:0.34:59
chr18	197741	rs35489764	AT	A	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.83;ReadPosRankSum=-0.650;SOR=0.551;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr18	203081	rs471274	A	C	1470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.591;HP=3;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=23;PP=1096;ReadPosRankSum=0.356;SC=GGATTTCTTTACATTTTGTCT;SOR=0.788;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=177;TCF=101;TCR=76;TR=57;WE=203089;WS=203071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,59:0.32:182
chr18	204815	rs56806027	T	A	247.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=360;ReadPosRankSum=0.586;SC=TATAGTATTATTTGGATCAAT;SOR=0.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=5;WE=204824;WS=204805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr18	204816	rs4039610	T	TAAAAA	238.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=364;ReadPosRankSum=0.534;SC=ATAGTATTATTTGGATCAATC;SOR=0.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=5;WE=204824;WS=204805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr18	214991	rs7343029	C	T	275.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=204;ReadPosRankSum=0.199;SC=GCTATGGGGCCAATAAGTTTT;SOR=0.597;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=13;WE=214999;WS=214981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,13:0.30:44
chr18	219029	.	G	A	46	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=54.52;NF=0;NR=4;PP=46;QD=20.1928031368;SC=AAATACTCATGAAGTGGTGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=219037;WS=219019;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,4:0.33:12
chr18	224184	rs631343	C	G	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.386;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=37;PP=843;ReadPosRankSum=0.139;SC=GATGTTCTGTCGTGAACAAAA;SOR=1.508;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=142;TCF=34;TCR=108;TR=44;WE=224192;WS=224174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,44:0.30:148
chr18	225051	rs7227515	C	T	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.925;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=427;ReadPosRankSum=-1.311;SC=AGTTCTATTTCGTGCTAAGAA;SOR=0.846;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=70;TCF=34;TCR=36;TR=26;WE=225059;WS=225041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,26:0.37:70
chr18	247834	rs16976866	T	G	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.154;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.979;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=494;ReadPosRankSum=0.826;SC=TGATAGTCTGTCAATGGCAAC;SOR=0.571;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=79;TCF=45;TCR=34;TR=28;WE=247842;WS=247824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,29:0.36:81
chr18	252559	rs657138	G	A	7091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=100;NR=126;PP=2965;SC=GAGCTTCCTCGTCTCCCATTT;SOR=0.808;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=226;TCF=100;TCR=126;TR=226;WE=252567;WS=252549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,237:1.00:237
chr18	260108	rs11309829	TA	T	96.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.194;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=3.358;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.44;ReadPosRankSum=-0.156;SOR=0.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr18	334758	rs2305026	T	C	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=6;PP=312;SC=CCTCCGGTGCTGGGGTTGGCT;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=17;WE=334766;WS=334748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr18	334994	rs2305025	A	G	1810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=13;PP=1436;SC=TCCCCACTGGAGCCCTGAGGG;SOR=2.303;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=55;WE=335002;WS=334984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr18	335244	rs5822558	G	GA	1853.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=35;PP=1962;SC=AAGCATAAAAGAAAAAGGTGT;SOR=1.107;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=50;WE=335252;WS=335234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr18	348265	rs8085115	T	C	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=282;SC=AGGAAACAGATTGAACGAAAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=348273;WS=348255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr18	357570	rs685658	T	C	365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=10;PP=308;SC=GATGTCATTTTAAAATTTATC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=357578;WS=357560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr18	607024	rs62090070	A	T	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.81;ReadPosRankSum=-0.673;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr18	607068	rs62090071	T	C	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=3.546;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.27;ReadPosRankSum=0.580;SOR=1.055;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,8:0.20:40
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chr18	618124	rs518471	T	C	2549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=71;PP=2227;SC=TGGTTTCTTATCTGTGCTGTG;SOR=4.615;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=6;TCR=71;TR=77;WE=618132;WS=618114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr18	619050	rs546696	G	T	896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=0;PP=700;ReadPosRankSum=1.631;SC=GTGGCAGCTGGGTCCATGTGG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=28;WE=619058;WS=619047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr18	624783	rs495688	A	G	1799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=0;PP=1535;SC=TTTAGAATGTATACATTTCAA;SOR=8.015;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=53;WE=624791;WS=624773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr18	624824	rs495799	T	C	2950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=11;PP=2289;SC=GCACATAGATTATGAAATGGA;SOR=3.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=75;TCR=11;TR=86;WE=624832;WS=624814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr18	625070	rs498466	G	A	2350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=68;PP=1996;SC=CACAGTTCTTGAGGCACCTAT;SOR=5.196;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=72;TCF=4;TCR=68;TR=72;WE=625078;WS=625060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr18	645176	rs565034	C	A	2150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=57;PP=1739;SC=AACTTGTTTCCAAATACCTGG;SOR=4.343;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=6;TCR=57;TR=63;WE=645184;WS=645166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr18	657685	.	G	C	241	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=9;NR=0;PP=241;QD=30.6412458386;SC=CGCGCCACTTGGCCTGCCTCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=657693;WS=657675;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr18	657685	.	G	GGCCTGCCTCCGTCCCGCCGCGCCACTTC	233.76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=116.88;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	662103	rs1001761	G	A	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.793;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=337;ReadPosRankSum=-1.958;SC=AGATGGCTTAGGATTTACCTG;SOR=0.175;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=19;WE=662111;WS=662093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr18	662370	rs2612095	T	C	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.425;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=376;ReadPosRankSum=-0.100;SC=CTTCCTAGCATGTGTTTGCTC;SOR=1.148;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=22;WE=662378;WS=662360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr18	669292	rs147919381	GTTGA	G	1702.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.748;NF=0;NR=36;PP=1702;ReadPosRankSum=0.111;SC=CAGCCACATGGTTGATTGTGT;SOR=1.539;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=0;TCR=61;TR=36;WE=669303;WS=669282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,43:0.66:65
chr18	670541	rs2847609	A	G	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=294;ReadPosRankSum=0.925;SC=ATCGCTGCAGAGGCTGTTATG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=13;WE=670549;WS=670531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr18	671520	rs2853536	C	T	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.830;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=38;PP=1253;ReadPosRankSum=0.163;SC=GTGGAACAGGCATCTGCTCAA;SOR=0.460;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=97;TCF=33;TCR=64;TR=60;WE=671528;WS=671510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,62:0.62:100
chr18	671648	rs2853537	A	T	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.021;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=350;ReadPosRankSum=0.089;SC=GGCACTTAACATGTCAGGTGC;SOR=3.737;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=15;WE=671656;WS=671638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr18	672792	rs1059394	C	T	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=0;PP=718;ReadPosRankSum=-0.834;SC=ACTTGTTTCACGGACATGAGG;SOR=1.287;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=32;WE=672800;WS=672782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,33:0.62:53
chr18	673016	rs699517	C	T	3854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.025;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=97;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.653;SC=CAAAGGAGCTCGAAGGATATT;SOR=0.530;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=204;TCF=60;TCR=144;TR=139;WE=673024;WS=673006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,142:0.68:209
chr18	674320	rs3744962	A	G	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.073;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=5;PP=371;ReadPosRankSum=0.055;SC=TTTCTTGAGCAGGAAGGAGTT;SOR=1.043;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=106;TCF=82;TCR=24;TR=30;WE=674328;WS=674310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,33:0.30:110
chr18	674440	rs11081251	A	C	4436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=77;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.516;SC=TCCTGTTAACAACCACCTGGA;SOR=0.695;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=222;TCF=112;TCR=110;TR=155;WE=674448;WS=674430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,163:0.71:229
chr18	674535	rs2847172	T	C	1889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.365;HP=12;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.667;NF=7;NR=56;PP=1554;ReadPosRankSum=0.912;SC=TTTTTTTTTTTTGACATGGAG;SOR=0.051;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=95;TCF=8;TCR=87;TR=63;WE=674543;WS=674525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,63:0.68:93
chr18	677214	rs7229142	G	A	1282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=4;PP=1005;ReadPosRankSum=0.427;SC=AACCAACTCCGCCTGAGAGTT;SOR=0.532;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=69;TCF=63;TCR=6;TR=47;WE=677222;WS=677204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,47:0.69:68
chr18	677240	rs3819101	G	A	2082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.170;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=15;PP=1707;ReadPosRankSum=0.083;SC=ACATGCCAGCGGACAAGGTCT;SOR=1.106;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=112;TCF=89;TCR=23;TR=77;WE=677248;WS=677230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,77:0.69:111
chr18	677302	rs2298583	G	A	3596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.525;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=66;PP=2829;ReadPosRankSum=0.390;SC=CCTGGATTGAGGGACCCTACT;SOR=0.698;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=208;TCF=105;TCR=103;TR=134;WE=677310;WS=677292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,136:0.64:211
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chr18	685797	rs2847329	C	T	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.150;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=591;ReadPosRankSum=0.875;SC=ACTGCAAGACCACAGAAGTGT;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=24;WE=685805;WS=685787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
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chr18	691266	rs2612086	A	G	1803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.216;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=59;PP=1444;ReadPosRankSum=0.352;SC=GGATACCAGCATCCTGGGATC;SOR=1.872;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=96;TCF=13;TCR=83;TR=65;WE=691274;WS=691256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,66:0.68:97
chr18	693269	rs2612083	A	C	4311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.724;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=97;PP=2149;ReadPosRankSum=-0.623;SC=TGTACAGTAGAGGCTACAATG;SOR=1.113;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=181;TCF=32;TCR=149;TR=115;WE=693277;WS=693259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,119:0.64:185
chr18	693285	rs2606248	A	T	3791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.433;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=81;PP=2204;ReadPosRankSum=-1.907;SC=CAATGGCCTGATCTTATTCTT;SOR=1.437;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=144;TCF=21;TCR=123;TR=92;WE=693293;WS=693275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,96:0.64:149
chr18	693767	rs2612082	C	T	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.990;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=502;ReadPosRankSum=1.048;SC=GCTTTATCATCGCTATAGTGA;SOR=4.271;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=20;WE=693775;WS=693757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr18	693828	rs2305996	A	C	1186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.517;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.205;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=8;PP=837;ReadPosRankSum=-1.329;SC=GCATGTCATCAATGATATCCA;SOR=0.307;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=53;TCF=43;TCR=10;TR=35;WE=693836;WS=693818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,42:0.70:60
chr18	693986	rs3217714	GCT	G	3545.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.997;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.839;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.622;NF=11;NR=57;PP=2957;ReadPosRankSum=-0.991;SC=CGCGTTGGCAGCTCTAATGCT;SOR=0.935;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=98;TCF=14;TCR=84;TR=68;WE=693995;WS=693976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,88:0.73:120
chr18	694206	rs2847602	A	G	1806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.314;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=13;PP=1529;ReadPosRankSum=-1.065;SC=TCAGTGTCGTACAGCTCCCAG;SOR=0.410;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=101;TCF=84;TCR=17;TR=63;WE=694214;WS=694196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,65:0.62:104
chr18	697160	.	T	C	1072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.320;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=1;PP=900;ReadPosRankSum=0.128;SC=ATCTCTATTTTCACATTCGTT;SOR=0.512;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=57;TCF=56;TCR=1;TR=35;WE=697168;WS=697150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,36:0.63:57
chr18	697377	rs34911737	CTT	C	2321.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-5.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.925;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.564;NF=13;NR=40;PP=2093;ReadPosRankSum=0.181;SC=GGATTGAACTCTTGTTTATGC;SOR=0.545;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=90;TCF=19;TCR=71;TR=53;WE=697386;WS=697367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,60:0.63:95
chr18	706322	rs3831414	C	CACTG	1011.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=994;ReadPosRankSum=-0.403;SC=AACCATGAAACTTTTTACTCA;SOR=1.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=18;WE=706330;WS=706319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
chr18	706558	rs58085394	C	T	2978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.773;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=87;PP=2298;ReadPosRankSum=0.437;SC=CATAGGCAGCCGAGTAGTCAG;SOR=0.513;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=159;TCF=29;TCR=130;TR=108;WE=706566;WS=706548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,111:0.69:161
chr18	706589	rs2612102	A	G	2030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=63;PP=1599;ReadPosRankSum=0.742;SC=CTGCAGGAGAAGAGTTCCCCG;SOR=0.636;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=7;TCR=93;TR=68;WE=706597;WS=706579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,71:0.70:102
chr18	712319	.	TCGG	T	651	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=19;MQ=59.48;NF=8;NR=8;PP=651;QD=42.75;SC=AGAGCTGCAGTCGGCGGGGCG;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=16;WE=712329;WS=712309;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr18	712356	.	G	T	336	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=23;MQ=51.41;NF=9;NR=11;PP=336;QD=18.5385606274;SC=CAAGCCGCGCGTACCATGGCG;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=20;WE=712364;WS=712346;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr18	712568	rs3786349	G	A	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.649;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.708;NF=7;NR=27;PP=690;ReadPosRankSum=0.530;SC=CGAGAGCCGGGAGATCCTGCC;SOR=1.721;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=54;TCF=14;TCR=40;TR=34;WE=712576;WS=712558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,36:0.64:56
chr18	724612	rs537141	A	G	3862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=75;PP=2965;SC=ACTTGTTCTAATACTTCACGG;SOR=1.342;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=45;TCR=75;TR=120;WE=724620;WS=724602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr18	737036	rs28722141	A	G	347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.657;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=9;PP=298;ReadPosRankSum=0.550;SC=TATGGTTAATATCAAATTGTG;SOR=0.339;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=15;WE=737044;WS=737026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr18	742858	rs9961743	C	T	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.564;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=443;ReadPosRankSum=-0.308;SC=TATATGCATACAAATCAAGAC;SOR=1.880;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=20;WE=742866;WS=742848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,22:0.59:37
chr18	743226	rs3786347	A	G	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.272;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=9.700;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=111;ReadPosRankSum=-0.619;SC=CCACAGCTAAACAATGACAGA;SOR=2.209;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=8;TCF=3;TCR=5;TR=6;WE=743234;WS=743216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr18	743436	rs3786348	T	C	352.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5041;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=260;ReadPosRankSum=-1.137;SC=GAATAAACTATACTGTAATAT;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=14;WE=743444;WS=743426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr18	745884	rs3214047	A	C	595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.590;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=488;ReadPosRankSum=-0.394;SC=TACTTTCACTATATCTTTCTC;SOR=1.928;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=20;WE=745892;WS=745874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr18	904766	rs2231181	G	C	2218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=12;PP=1840;SC=GCTCCTCCGCGCTTCACCTCA;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=54;TCR=12;TR=66;WE=904774;WS=904756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr18	905537	rs2231183	T	C	2797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=66;PP=2185;SC=AGCTGGGGCTTCCCAGGCACA;SOR=3.312;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=13;TCR=66;TR=79;WE=905545;WS=905527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
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chr18	907564	rs12967282	C	A	2414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.69;ReadPosRankSum=-1.640;SOR=0.617;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,60:0.64:94
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chr18	907566	rs8192596	T	C	2414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.69;ReadPosRankSum=-1.964;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,61:0.65:94
chr18	907675	rs8192597	G	A	747.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.786;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=26;PP=586;ReadPosRankSum=0.356;SC=AGGAAGAGGCGTACGGCGAGG;SOR=1.027;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=117;TCF=39;TCR=78;TR=36;WE=907683;WS=907665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,36:0.30:119
chr18	907820	.	C	A	455.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.442;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=389;ReadPosRankSum=1.488;SC=CGCGCACACCCGCGGCTGGGA;SOR=0.399;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=15;WE=907828;WS=907810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr18	908128	rs8192599	G	C	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.695;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=582;ReadPosRankSum=-0.017;SC=GGGAGTTATTGGCGAGTTCTG;SOR=0.283;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=24;WE=908136;WS=908118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr18	908229	rs2231185	A	T	1649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.764;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=27;PP=1192;ReadPosRankSum=-0.453;SC=GGGGACAGAAACAGTGACCCT;SOR=0.561;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=103;TCF=61;TCR=42;TR=61;WE=908237;WS=908219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,64:0.62:104
chr18	909561	rs2231187	A	G	2034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.960;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=19;PP=1601;ReadPosRankSum=-0.677;SC=CTGTCAAGAAATACTTGGCGG;SOR=1.360;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=93;TCF=63;TCR=30;TR=67;WE=909569;WS=909551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,71:0.74:96
chr18	1278665	rs1595005	C	T	1902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.915;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=51;PP=1403;ReadPosRankSum=0.272;SC=AATCTGAGTGCTCCCCTGTCT;SOR=1.592;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=99;TCF=32;TCR=67;TR=71;WE=1278673;WS=1278655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,73:0.72:101
chr18	2539016	rs8084295	C	G	7538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=163;NR=52;PP=2965;SC=CCAGACTCCACAGCAATAAAA;SOR=2.400;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=216;TCF=164;TCR=52;TR=215;WE=2539024;WS=2539006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr18	2544356	rs2176451	T	C	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=26;PP=863;SC=CACAGCTGCATTGATTTTTGT;SOR=3.841;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=2544364;WS=2544346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr18	2547500	rs2677879	G	T	3692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=81;PP=2965;SC=GGTATTTGCTGTATTTGCAGG;SOR=2.142;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=30;TCR=81;TR=111;WE=2547508;WS=2547490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr18	2656248	rs2430853	G	C	336.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=318;ReadPosRankSum=0.957;SC=GATTTCGCGCGTGTGTGTGTC;SOR=0.760;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=72;TCF=19;TCR=53;TR=18;WE=2656256;WS=2656238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,17:0.23:73
chr18	2666046	rs9947882	A	C	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.029;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.85;ReadPosRankSum=0.619;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr18	2688798	rs637651	G	A	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=334;SC=GATAGACGGTGGGACAGAACT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=2688806;WS=2688788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	2698125	rs626994	T	C	603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=483;SC=ATCGGTTGGGTTATTCAGGTT;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=2698133;WS=2698115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr18	2705633	rs8090967	T	A	30.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.838;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.56;ReadPosRankSum=1.562;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr18	2705675	rs8090988	T	A	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQRankSum=-1.636;QD=3.66;ReadPosRankSum=-0.367;SOR=0.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr18	2705700	rs635132	A	G	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=1;PP=640;ReadPosRankSum=-0.532;SC=AGGTCAAGACAATCAAGACAC;SOR=0.859;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=36;WE=2705708;WS=2705690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,35:0.71:49
chr18	2707619	rs2276092	G	A	2415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.505;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=60;PP=1787;ReadPosRankSum=-1.368;SC=GCCTAATGAGGTTAGGCCTGC;SOR=1.104;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=132;TCF=44;TCR=88;TR=87;WE=2707627;WS=2707609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,93:0.67:139
chr18	2724930	rs633422	A	T	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.952;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=18;PP=681;ReadPosRankSum=-1.279;SC=AAATAACCAAAGGACCAAATT;SOR=0.275;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=46;TCF=20;TCR=26;TR=34;WE=2724938;WS=2724920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,32:0.71:45
chr18	2726365	rs16943716	C	G	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=6.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.06;ReadPosRankSum=-0.682;SOR=0.072;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,7:0.23:30
chr18	2740625	rs521992	G	A	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=102;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TTCTAAGCATGTTTTTATAGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=2740633;WS=2740615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr18	2750238	rs2304860	A	G	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.865;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=425;ReadPosRankSum=1.541;SC=GTTGGGACTGAATAGAAGTTG;SOR=0.327;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=67;TCF=5;TCR=62;TR=21;WE=2750246;WS=2750228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,22:0.32:69
chr18	2751475	rs300293	A	G	1332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=35;PP=1090;SC=GTAAATATATAATGTTATATA;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=2751483;WS=2751465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr18	2763697	rs483547	C	T	2157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=30;PP=1613;ReadPosRankSum=-0.920;SC=CCATTAAAGGCTCTAATGAGG;SOR=0.724;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=134;TCF=83;TCR=51;TR=81;WE=2763705;WS=2763687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,84:0.60:140
chr18	2769910	.	C	G	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.860;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=508;ReadPosRankSum=-1.280;SC=TGTTTATTAGCTATCTAACCA;SOR=0.503;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=22;WE=2769918;WS=2769900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr18	2771516	rs300291	G	T	2416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=21;PP=1873;SC=GCAAATTTTTGGTTTTTTATT;SOR=2.103;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=56;TCR=21;TR=77;WE=2771524;WS=2771506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr18	2784404	rs35853884	TGAAA	T	202.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=268;ReadPosRankSum=-0.445;SC=TTGGAGCAGTTGAAATAAGTT;SOR=1.096;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=7;WE=2784415;WS=2784394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr18	2847361	rs112881773	C	G	133.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=2;NR=4;PP=73;SC=CCGCCTACCCCTCCCCGGCCC;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=2847369;WS=2847351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	2847730	rs2289687	C	G	516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=4;PP=429;SC=GGTCTGGTGCCGCAGTCCCCT;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=2847738;WS=2847720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	2885118	rs592120	C	T	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-5.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.435;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=322;ReadPosRankSum=-0.479;SC=GGCCTCGAAACAGCTTGAAGA;SOR=0.048;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=17;WE=2885126;WS=2885108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr18	2909831	rs607411	C	G	2890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=62;PP=2403;SC=AGTGTTTGAACGGAACTGGTA;SOR=1.916;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=27;TCR=62;TR=89;WE=2909839;WS=2909821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr18	2946291	rs643507	C	T	5228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=92;PP=2965;SC=AGTTCCTTCTCCTCAGTAGTC;SOR=1.150;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=57;TCR=92;TR=149;WE=2946299;WS=2946281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr18	2951447	rs138599261	TAA	T	298.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=8;PP=121;SC=TTCACCATGGTAAAAAAAAAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=8;WE=2951456;WS=2951437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	2960969	rs17881253	TTATTAA	T	580.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.72;NF=0;NR=11;PP=658;SC=ATCATTAGCCTTATTAATTTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=2960982;WS=2960959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	2982817	rs1539792	C	A	1169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=33;PP=1033;SC=GTATATAATCCAAACAGAAAG;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=2982825;WS=2982807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	3067278	rs2230164	A	G	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=60;ReadPosRankSum=-0.180;SC=CCTTCTTGCCACCTTTCAGGG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=3;WE=3067286;WS=3067268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr18	3072052	rs202209077	A	AT	530.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=14;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.818;NF=0;NR=30;PP=299;ReadPosRankSum=0.861;SC=GGGATTCAGGATTTTTTTTTT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=1;TCR=71;TR=30;WE=3072060;WS=3072042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,31:0.58:53
chr18	3075503	rs10667835	C	CAAA	4695.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=37;PP=2967;SC=AACAAACAGACGAAGAATTTT;SOR=1.522;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=95;TCF=57;TCR=38;TR=90;WE=3075511;WS=3075493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr18	3075712	rs2298539	C	A	1375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=33;PP=1040;ReadPosRankSum=0.472;SC=TTGCTAGGACCAGGGACTTAC;SOR=0.639;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=25;TCR=52;TR=49;WE=3075720;WS=3075702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,52:0.63:83
chr18	3075746	rs1143657	G	A	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.304;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=36;PP=1008;ReadPosRankSum=0.455;SC=ATTCAGCATAGGCCTCATCGT;SOR=1.170;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=64;TCF=13;TCR=51;TR=44;WE=3075754;WS=3075736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,45:0.68:66
chr18	3075778	rs2298537	A	C	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=29;PP=751;ReadPosRankSum=0.332;SC=GAAAAAAGAAAAGTTAGAATT;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=32;WE=3075786;WS=3075768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,32:0.70:46
chr18	3075872	rs2298536	C	G	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=-1.309;SC=ATGACTAAACCGACTTTGATT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=3075880;WS=3075862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr18	3085191	rs148266515	AT	A	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=6.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.69;ReadPosRankSum=-0.974;SOR=0.020;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,9:0.22:40
chr18	3089522	rs948298	G	T	1217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=3;PP=974;SC=CTTTATCCACGGCCTATTTTT;SOR=3.855;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=34;WE=3089530;WS=3089512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr18	3094377	rs36091956	GA	G	433.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.69;MQRankSum=0.856;QD=14.46;ReadPosRankSum=0.251;SOR=1.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,25:0.83:30
chr18	3100429	rs7232329	G	A	1170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.623;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=31;PP=928;ReadPosRankSum=1.206;SC=TTCGTCCTTCGGAACAAAATA;SOR=0.663;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=153;TCF=59;TCR=94;TR=50;WE=3100437;WS=3100419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,50:0.32:154
chr18	3112231	rs8096379	G	C	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=104;ReadPosRankSum=-1.400;SC=AGCACAGAAAGGCCGAACCTT;SOR=0.610;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=42;TCF=38;TCR=4;TR=10;WE=3112239;WS=3112221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,11:0.25:44
chr18	3112568	rs8097874	C	A	617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=17;PP=553;SC=TCAAACACTACGCAGGTGACT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=3112576;WS=3112558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr18	3120060	rs6506068	G	A	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=83;ReadPosRankSum=-0.106;SC=TACTTGTTGAGCATTTTATTT;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=6;WE=3120068;WS=3120050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr18	3129131	rs8089599	T	C	141.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=140;SC=AGAATGGACATTGATGAAAGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=3129139;WS=3129121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	3131593	rs34489383	CT	C	620.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.513;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=28;PP=416;ReadPosRankSum=-0.197;SC=GAAAACAATTCTTTTTTTTTT;SOR=3.489;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=29;WE=3131601;WS=3131583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,31:0.70:44
chr18	3134953	rs200029902	A	ATT	117.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=4.973;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=-2.048;QD=5.35;ReadPosRankSum=-1.059;SOR=0.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr18	3164385	rs11659820	C	T	2100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=39;PP=1649;ReadPosRankSum=-0.134;SC=TCAGCGTTGCCCGCTCTCCAC;SOR=0.644;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=128;TCF=62;TCR=66;TR=78;WE=3164393;WS=3164375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,80:0.61:132
chr18	3168816	rs2230167	G	A	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=6.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.062;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=6;PP=580;ReadPosRankSum=0.275;SC=AAGACTCACCGTTTCTGTACC;SOR=0.929;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=73;TCF=57;TCR=16;TR=28;WE=3168824;WS=3168806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,29:0.38:76
chr18	3173873	rs10153407	G	A	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=229;ReadPosRankSum=-0.492;SC=AGCATTATGGGCTAACTTATT;SOR=0.315;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=11;WE=3173881;WS=3173863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
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chr18	3188613	rs113174034	T	C	1163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=56;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.495;NF=28;NR=1;PP=680;ReadPosRankSum=-0.017;SC=GGGGACAGAGTGAGACTCCAT;SOR=1.132;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=29;WE=3188621;WS=3188603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,29:0.76:38
chr18	3188630	rs140742792	AG	A	1287.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.499;HP=3;HapScore=4;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.400;NF=24;NR=4;PP=1720;ReadPosRankSum=1.720;SC=CCATCTCAAAAGGAAAAAAAA;SOR=0.127;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=48;TCF=44;TCR=4;TR=28;WE=3188650;WS=3188620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr18	3188642	rs111506648	A	G	1392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.409;HP=10;HapScore=4;MGOF=36;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.233;NF=32;NR=5;PP=1719;ReadPosRankSum=2.517;SC=GAAAAAAAAAAAGAAACAAAT;SOR=0.041;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=64;TCF=59;TCR=5;TR=37;WE=3188650;WS=3188620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,36:0.59:61
chr18	3188664	rs36223371	TACACAC	T	1533.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.485;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=7;PP=1868;ReadPosRankSum=0.320;SC=AATCTATATCTACACACACAC;SOR=0.177;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=81;TCF=66;TCR=15;TR=40;WE=3188679;WS=3188654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,44:0.59:74
chr18	3188715	rs73375192	T	C	2395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.308;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=34;PP=1952;ReadPosRankSum=0.368;SC=ATTTCCACCTTTGTAAGTTAC;SOR=0.239;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=145;TCF=99;TCR=46;TR=91;WE=3188723;WS=3188705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,89:0.64:140
chr18	3188857	rs2230166	A	G	6453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.763;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=68;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.951;SC=TGGAAACCACAGACTGCCTGG;SOR=1.130;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=244;TCF=139;TCR=105;TR=165;WE=3188865;WS=3188847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,167:0.68:244
chr18	3188873	rs2230165	G	A	6854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.920;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.475;NF=105;NR=76;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.639;SC=CCTGGATGCCGTGGACTGCCT;SOR=0.886;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=268;TCF=153;TCR=115;TR=181;WE=3188881;WS=3188863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,183:0.68:268
chr18	3188976	rs1962519	A	G	1801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.728;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=55;PP=1374;ReadPosRankSum=-0.027;SC=GACTGTTTAGATGTTGTGATT;SOR=0.564;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=251;TCF=80;TCR=171;TR=83;WE=3188984;WS=3188966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,85:0.33:258
chr18	3253543	rs1791105	G	A	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=352;ReadPosRankSum=-0.708;SC=TAAGGTTTGAGTAAAGTGTGG;SOR=0.951;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=2;TCR=68;TR=21;WE=3253551;WS=3253533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,20:0.28:71
chr18	3253569	rs6417016	C	T	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=5.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.311;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=234;ReadPosRankSum=0.819;SC=TGTTTCCCACCGGATCACCAG;SOR=0.019;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=14;WE=3253577;WS=3253559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,15:0.31:48
chr18	3272744	rs7242012	A	G	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=1;PP=465;SC=GTTTAGGTGCATACTTATTCC;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=3272752;WS=3272734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	3272798	rs6506097	AG	TA	1759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=0;PP=2137;SC=TTTTACCTACAGACTTTAGGT;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=35;WE=3272807;WS=3272788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr18	3272855	rs6506099	C	T	2669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=17;PP=2100;SC=TTTTGTTTTACGTTTTTGTGT;SOR=2.726;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=63;TCR=17;TR=80;WE=3272863;WS=3272845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr18	3272874	rs7407072	T	A	3029.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=27;PP=2438;SC=GTTTTTTTTTTAATCCAGAAT;SOR=2.168;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=96;TCF=69;TCR=27;TR=95;WE=3272882;WS=3272864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr18	3273153	rs7407045	C	T	1625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=45;PP=1328;SC=TTTTTTTGTGCGATGTACAAA;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=45;WE=3273161;WS=3273143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr18	3277466	rs6506100	TG	CA	9815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=132;PP=2947;SC=AAAGTACTTCTGTGAAATAGA;SOR=1.824;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=201;TCF=58;TCR=143;TR=190;WE=3277475;WS=3277456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr18	3277691	rs6506102	A	T	1950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=11;PP=1577;SC=TACGATTGACAAGCTTTAGGA;SOR=2.683;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=47;TCR=11;TR=58;WE=3277699;WS=3277681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr18	3447871	rs151472	T	C	1933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=47;PP=1489;ReadPosRankSum=1.860;SC=TCCCCCCTTCTCCTGGAAAGT;SOR=0.782;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=114;TCF=39;TCR=75;TR=70;WE=3447879;WS=3447861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,71:0.62:115
chr18	3534692	rs72469391	CT	C	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.30;ReadPosRankSum=0.380;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr18	3580485	rs2240900	G	T	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=33.20;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr18	5196992	rs292286	T	C	1787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=24;PP=1482;SC=TCCTCTACCCTGCTCCCCTCC;SOR=1.107;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=60;TCF=36;TCR=24;TR=59;WE=5197000;WS=5196971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
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chr18	5292030	rs620652	A	G	6013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=82;PP=2965;SC=TTTTAAAGTAAGTGCTGCAGG;SOR=0.932;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=180;TCF=98;TCR=82;TR=180;WE=5292038;WS=5292020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr18	5394966	rs78651692	C	T	2663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.585;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=22;PP=2101;ReadPosRankSum=0.473;SC=GAATTTTCTTCGGAATACATG;SOR=0.926;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=140;TCF=103;TCR=37;TR=88;WE=5394974;WS=5394956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,92:0.63:146
chr18	5395190	.	GA	G	517.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=591;ReadPosRankSum=1.607;SC=CTCACTGGGAGAAACCATCAT;SOR=0.512;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=19;WE=5395198;WS=5395180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr18	5396936	rs59176398	T	C	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=439;ReadPosRankSum=-0.763;SC=AGAGGAGAAATACACTATACA;SOR=0.749;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=20;WE=5396944;WS=5396927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr18	5407839	rs2874686	C	T	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.028;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=376;ReadPosRankSum=-1.161;SC=GGCACGTGTACGCTCTTGCAT;SOR=0.283;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=22;WE=5407847;WS=5407829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,23:0.43:54
chr18	5407911	rs2322093	A	G	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=23;PP=672;SC=TAGGAAGCTTAATAAGAATAT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=5407919;WS=5407901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr18	5410574	rs3817466	A	G	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.754;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=35;PP=889;ReadPosRankSum=-0.872;SC=CCTCAGTGGCAGTGGTCTCCC;SOR=1.426;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=105;TCF=32;TCR=73;TR=46;WE=5410582;WS=5410564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,45:0.41:109
chr18	5410749	rs16948127	C	T	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.041;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=107;ReadPosRankSum=1.316;SC=TGTCACACTACCTTCTCACAA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=5410757;WS=5410739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr18	5415935	.	A	G	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.098;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.325;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=670;ReadPosRankSum=0.903;SC=AGCGTATGGCACTGAGAAGGA;SOR=1.106;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=61;TCF=43;TCR=18;TR=37;WE=5415943;WS=5415925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,39:0.61:64
chr18	5419723	rs117538203	C	T	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=1;PP=768;ReadPosRankSum=-0.183;SC=TCCCTCGTGCCGGATGGCCGA;SOR=1.559;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=47;TCF=45;TCR=2;TR=31;WE=5419731;WS=5419713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
chr18	5420021	rs3752061	A	G	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=19;PP=542;SC=ACTGAAAAAAAAAATACCAAC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=5420029;WS=5420011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr18	5423631	rs12607210	A	T	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=22;PP=577;SC=TTACTCTGAGAGGTCATGTGT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=5423639;WS=5423621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr18	5433570	rs2272130	A	C	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.710;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=666;ReadPosRankSum=-0.875;SC=TGAGAAGAAAAATATGTTACA;SOR=0.667;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=128;TCF=62;TCR=66;TR=37;WE=5433578;WS=5433560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,39:0.29:133
chr18	5433722	rs3931700	C	T	1882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=32;PP=1517;SC=GCACTACAAACGAACACCTGG;SOR=1.238;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=22;TCR=32;TR=54;WE=5433730;WS=5433712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr18	5437961	rs5822861	T	TC	1697.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=25.102;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=9;PP=1741;ReadPosRankSum=0.602;SC=GTAAGCACGCTCTTTCCGGAG;SOR=2.406;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=71;TCF=42;TCR=29;TR=41;WE=5437969;WS=5437951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,53:0.60:89
chr18	5577258	rs11876037	T	C	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.952;NF=15;NR=0;PP=313;ReadPosRankSum=-0.894;SC=GTATCCAATGTAGAGTTATAA;SOR=0.252;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=15;WE=5577266;WS=5577248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,14:0.34:41
chr18	5630531	rs4083186	G	A	1315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=25;PP=1007;SC=GAATTCTCCGGGGTCCAGTCT;SOR=1.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=16;TCR=25;TR=41;WE=5630539;WS=5630521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr18	5630689	rs9952048	G	C	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.493;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=121;ReadPosRankSum=0.623;SC=CAGCCCTCGCGGGCCCGCCCT;SOR=1.179;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=8;WE=5630697;WS=5630679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr18	5840617	rs9965310	G	T	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-3.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=58;ReadPosRankSum=0.231;SC=CTCCCATCAGGTATCTCCACT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=5;WE=5840625;WS=5840607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr18	5840674	rs9966028	C	A	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=2.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.23;ReadPosRankSum=1.089;SOR=0.143;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,9:0.20:46
chr18	5840810	rs72855836	G	A	898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=5.373;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.69;ReadPosRankSum=-1.148;SOR=0.958;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,45:0.28:158
chr18	5890584	rs369822552	C	T	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=245;ReadPosRankSum=1.709;SC=AGTCCGGGTCCGCACTCCCCG;SOR=0.120;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=14;WE=5890592;WS=5890574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr18	5891637	rs28656885	C	A	5598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.174;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=92;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.105;SC=AGGAGGAGGACGGGGAGGCGG;SOR=0.681;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=307;TCF=155;TCR=152;TR=196;WE=5891645;WS=5891627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,206:0.65:318
chr18	5956145	.	T	C	53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=53;QD=43.8856062736;SC=GACATTCACATCAAATTAATG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=2;WE=5956153;WS=5956144;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,2:0.40:5
chr18	5956238	rs3737353	C	T	567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=478;ReadPosRankSum=0.519;SC=GACTTCTTGGCCTGAGGCAAT;SOR=1.688;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=22;WE=5956246;WS=5956228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr18	5956425	rs3737354	C	T	1511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.921;NF=22;NR=35;PP=1156;ReadPosRankSum=-1.476;SC=AAATGTTTTGCCACGGAAGCC;SOR=0.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=39;TCR=63;TR=57;WE=5956433;WS=5956415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,59:0.55:107
chr18	5956470	rs3737355	T	C	673.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.840;NF=8;NR=22;PP=1125;ReadPosRankSum=-0.433;SC=GTTCTGAGTGTGATGTGGAAC;SOR=0.787;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=73;TCF=20;TCR=53;TR=30;WE=5956491;WS=5956460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,33:0.43:77
chr18	5956483	rs3737357	G	C	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.621;HP=3;HapScore=3;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.15;MQRankSum=0.831;NF=8;NR=32;PP=1941;ReadPosRankSum=-0.197;SC=TGTGGAACCCGTCATAGCCTC;SOR=0.407;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=64;TCF=11;TCR=53;TR=40;WE=5956491;WS=5956460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,42:0.61:69
chr18	5956502	rs34472471	GCT	G	1150.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.507;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.797;NF=0;NR=24;PP=1031;ReadPosRankSum=-0.233;SC=TCCGTGTTGAGCTCACCAGTG;SOR=0.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=24;WE=5956511;WS=5956492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr18	5960010	.	CAT	C	483	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=81;MMLQ=28;MQ=54.39;NF=23;NR=0;PP=483;QD=21.5652173913;SC=GAAATACATACATATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=23;WE=5960019;WS=5960000;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,23:0.82:28
chr18	5960012	.	T	TATATATATAC	296.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQRankSum=-1.076;QD=17.45;ReadPosRankSum=0.245;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr18	5960026	.	T	TAC	505.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.141;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.61;MQRankSum=-3.049;QD=18.73;ReadPosRankSum=-1.516;SOR=1.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr18	5960036	.	TACACAC	T	1157	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MMLQ=28;MQ=54.98;NF=41;NR=0;PP=1157;QD=28.5365853659;SC=TATATATATATACACACACAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=41;WE=5960069;WS=5960024;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,41:0.91:45
chr18	5960038	.	C	CATATATAT	967.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.927;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.51;MQRankSum=-2.352;QD=29.33;ReadPosRankSum=-2.646;SOR=2.004;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr18	5960040	rs199658556	C	T	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=4.037;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.09;MQRankSum=-1.849;QD=29.02;ReadPosRankSum=-2.406;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr18	5960042	.	C	T	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.469;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=4.367;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.37;MQRankSum=-1.617;QD=25.87;ReadPosRankSum=-2.587;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,26:0.63:41
chr18	5960044	rs199756387	CAT	C	325.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.807;NF=45;NR=1;PP=1769;ReadPosRankSum=2.468;SC=TATACACACACATATATATAT;SOR=0.186;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=53;TCF=51;TCR=2;TR=46;WE=5960069;WS=5960024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr18	5960048	rs368307522	T	C	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.574;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.483;NF=32;NR=0;PP=2651;ReadPosRankSum=-1.621;SC=CACACACATATATATATATAT;SOR=2.770;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=32;WE=5960069;WS=5960024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,28:0.65:43
chr18	5960060	rs10658145	C	CGT	942.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQRankSum=-1.004;QD=18.85;ReadPosRankSum=0.984;SOR=0.361;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,29:0.58:50
chr18	5960165	rs505559	G	A	5450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=77;PP=2965;SC=CCTACAGTGCGAGATGAAAAG;SOR=0.739;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=81;TCR=77;TR=158;WE=5960173;WS=5960155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr18	6032122	rs370740355	A	G	45.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.45;ReadPosRankSum=-0.319;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr18	6032282	.	TAA	T	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.63;ReadPosRankSum=0.015;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr18	6046717	rs7234770	T	C	1157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.628;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=24;PP=829;ReadPosRankSum=0.602;SC=AAAACAGAGATACAACTTACC;SOR=1.080;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=182;TCF=96;TCR=86;TR=54;WE=6046725;WS=6046707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,58:0.30:193
chr18	6171674	rs17408183	T	C	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=169;ReadPosRankSum=0.617;SC=TGAGGCTTAATTGTAAATAAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=11;WE=6171682;WS=6171664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr18	6511473	rs4798453	C	T	679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=563;SC=CTGTAATAATCGTGGACATCA;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=6511481;WS=6511463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	6511669	rs4798454	T	G	2153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=43;PP=1511;SC=GAGCTCTTTGTTGGTGACATT;SOR=1.745;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=19;TCR=43;TR=62;WE=6511677;WS=6511659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr18	6730016	rs57509765	G	C	216.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=147;SC=GCTGCGCCTTGTGCCTGAGCG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=6730024;WS=6730006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	6851267	rs8087719	G	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=87;ReadPosRankSum=-1.400;SC=TACCTTAGGTGATTTTTAAGG;SOR=0.197;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=6;WE=6851275;WS=6851257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr18	6870524	rs62082833	T	C	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=485;ReadPosRankSum=0.433;SC=ATTTGTTTTATAGCAAATAGT;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=21;WE=6870532;WS=6870514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr18	6873354	rs2282522	G	A	1265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=0;PP=1137;SC=TTGAGTGAACGCATAATAATT;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=37;WE=6873362;WS=6873344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr18	6889973	rs4239328	A	G	6430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.714;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=149;NR=74;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.844;SC=TGATGGCACCAAACCTTTTCT;SOR=1.422;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=224;TCF=149;TCR=75;TR=223;WE=6889981;WS=6889963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,224:1.00:225
chr18	6890434	rs1116757	A	G	3489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=71;PP=2835;SC=TCCAGGTTCCATCTTTCTTAA;SOR=1.377;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=43;TCR=71;TR=113;WE=6890442;WS=6890424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr18	6890591	rs1116756	C	T	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=25;PP=714;SC=TAGATTTGTACTCCTCAAAGG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=6890599;WS=6890581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr18	6912143	rs1056408	A	C	2424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=66;PP=1997;ReadPosRankSum=-0.840;SC=AAACCCCAACAAAGTTCTTAA;SOR=4.921;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=68;TCF=1;TCR=67;TR=67;WE=6912151;WS=6912133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
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chr18	6947013	rs489023	C	T	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=200;ReadPosRankSum=-0.818;SC=AAAAGGTTTTCTTGTAGCAAT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=9;WE=6947021;WS=6947003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr18	6949241	.	A	C	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=0.000;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.242;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=28;PP=997;ReadPosRankSum=-0.128;SC=CTTTTCTTTTAACATAGTCTG;SOR=0.272;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=66;TCF=15;TCR=51;TR=39;WE=6949249;WS=6949231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,43:0.63:68
chr18	6956504	rs11270496	ACAGCTCCAGCTC	A	7019.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=53;PP=2989;SC=GATTTTTAGCACAGCTCCAGC;SOR=0.798;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=126;TCF=62;TCR=64;TR=95;WE=6956523;WS=6956494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr18	6980457	rs693360	T	C	1002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=9;PP=732;SC=CTTCCTTATGTTCCTGAGTGA;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=28;WE=6980465;WS=6980447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	6980523	rs607230	T	C	935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=16;PP=773;SC=CACTTACCTTTAGGAATTGCT;SOR=0.826;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=14;TCR=16;TR=30;WE=6980531;WS=6980513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	6982443	rs538815	C	T	1400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=8;PP=1171;ReadPosRankSum=2.185;SC=GGCTGCTCAGCGAGACGCTCA;SOR=0.782;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=91;TCF=78;TCR=13;TR=57;WE=6982451;WS=6982433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,56:0.62:90
chr18	6983194	rs11661974	G	T	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.83;ReadPosRankSum=0.304;SOR=0.579;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,23:0.26:89
chr18	6985270	rs11664063	C	T	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.922;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=25;PP=752;ReadPosRankSum=-0.117;SC=TGGAACTCAGCGGCATGGTCC;SOR=1.574;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=54;TCF=21;TCR=33;TR=36;WE=6985278;WS=6985260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,37:0.66:56
chr18	6985468	rs11660907	A	C	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=15;PP=1103;ReadPosRankSum=-1.240;SC=TGCATATAGAAAAGATGTGTG;SOR=0.359;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=75;TCF=54;TCR=21;TR=47;WE=6985476;WS=6985458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,50:0.63:79
chr18	6985499	rs11664115	C	T	1595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-0.748;QD=16.98;ReadPosRankSum=1.344;SOR=0.772;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,59:0.63:94
chr18	6985506	rs616722	T	C	3543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.83;QD=38.94;SOR=1.130;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr18	6985655	rs617573	C	T	1235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=34;PP=1013;SC=GCAGCAGAAACGGCATTTTAA;SOR=3.967;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=38;WE=6985663;WS=6985645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr18	6986259	rs62081531	G	A	3144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=50;PP=2591;SC=TTGAAAGGACGTGGCTTGCTG;SOR=0.712;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=102;TCF=52;TCR=50;TR=102;WE=6986267;WS=6986249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr18	6993673	rs62081533	T	C	2383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.174;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=32;PP=1705;ReadPosRankSum=-0.751;SC=TCAATGGCTATGGCCAGGTCT;SOR=0.382;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=74;TCF=40;TCR=34;TR=72;WE=6993681;WS=6993663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,80:0.99:81
chr18	6997818	rs12961939	A	C	2341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.884;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.457;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=34;PP=1893;ReadPosRankSum=0.694;SC=AGGTTCAGAGAAAGAACGGCA;SOR=0.637;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=344;TCF=236;TCR=108;TR=105;WE=6997826;WS=6997808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:240,108:0.31:348
chr18	6999315	rs525394	A	G	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=187;ReadPosRankSum=-2.363;SC=CTATGCTTAGAAAATAAGAAA;SOR=0.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=10;WE=6999323;WS=6999305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr18	6999368	rs525231	C	T	1067.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.24;ReadPosRankSum=0.853;SOR=0.655;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,29:0.39:75
chr18	6999377	rs525206	A	G	1123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=1.100;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.77;ReadPosRankSum=1.049;SOR=0.979;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,33:0.38:88
chr18	6999628	rs625106	T	C	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.280;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=150;ReadPosRankSum=1.479;SC=CATAATAGCTTGAGGAGCACC;SOR=1.087;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=15;WE=6999636;WS=6999618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr18	6999694	rs693754	T	C	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.478;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=2;PP=29;ReadPosRankSum=1.336;SC=GCTTCTAACTTGCGACAGTAA;SOR=0.651;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=24;TCF=7;TCR=17;TR=5;WE=6999702;WS=6999684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr18	7008591	rs662471	T	C	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.589;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=29;PP=661;ReadPosRankSum=-0.093;SC=CCAACCTCCATTGAAATGTCT;SOR=1.781;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=135;TCF=48;TCR=87;TR=37;WE=7008599;WS=7008581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,38:0.28:138
chr18	7010428	rs74825364	C	G	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=111;ReadPosRankSum=-0.068;SC=ACAAAGCTTTCATTCAAAAAC;SOR=0.223;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=8;WE=7010436;WS=7010418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
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chr18	7016794	rs35419086	TC	T	547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=637;SC=CATGACACCATCCCCATCCCT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=17;WE=7016802;WS=7016784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
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chr18	7042402	rs648161	A	G	218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.444;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=158;ReadPosRankSum=0.834;SC=GGAAGATAAGATGATCCCAAG;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=9;WE=7042410;WS=7042392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr18	7117623	rs334406	G	C	1716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=13;PP=1318;SC=GCCCGCCTGCGGGGGACAGGG;SOR=2.262;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=54;WE=7117631;WS=7117613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr18	7117782	rs334407	A	G	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=26;PP=754;SC=GGAACGCTCCACGGGACGCGA;SOR=3.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=7117790;WS=7117772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	7117880	rs36201812	CCCCGCCCCGT	C	233.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=4;PP=1321;SC=CTGCGCCCCGCCCCGCCCCGT;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=5;WE=7117897;WS=7117870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	7947184	rs11661715	A	G	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5003;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=112;ReadPosRankSum=0.566;SC=TGAATTCATCACTCAGGTGTT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=6;WE=7947192;WS=7947174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
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chr18	8088969	rs488952	G	C	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=534;ReadPosRankSum=1.828;SC=AAATCCATATGTTTATTAGCT;SOR=0.578;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=22;WE=8088977;WS=8088959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr18	8089027	rs658110	G	A	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=183;ReadPosRankSum=-1.303;SC=TTGATGTAAGGTGATCAAGTA;SOR=0.481;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=10;WE=8089035;WS=8089017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr18	8244282	rs60751184	C	CA,CAA	1056.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.27;MQRankSum=-0.487;QD=26.42;ReadPosRankSum=0.466;SOR=1.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:2,19,19:0.47,0.47:40
chr18	8244335	rs12962826	G	A	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=100;ReadPosRankSum=-0.249;SC=GGTTTCTTCAGTCATTTTCAG;SOR=0.478;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=8;WE=8244343;WS=8244325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr18	8248041	rs12964764	G	T	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.252;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=9;PP=322;ReadPosRankSum=0.221;SC=AACCCAATGCGTTTCTACAGC;SOR=0.547;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=60;TCF=37;TCR=23;TR=17;WE=8248049;WS=8248031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,18:0.29:62
chr18	8343333	rs2246146	G	A	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.876;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=211;ReadPosRankSum=-0.681;SC=CTGCATGTGGGTATTAATAGA;SOR=0.404;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=11;WE=8343341;WS=8343323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,11:0.41:27
chr18	8343530	rs2279074	G	A	1481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.850;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=29;PP=1188;ReadPosRankSum=-0.457;SC=TGAGTGGACCGTCTGCTGCAA;SOR=0.653;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=89;TCF=44;TCR=45;TR=59;WE=8343538;WS=8343520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,58:0.66:88
chr18	8379046	rs3826631	A	G	383.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.165;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=300;ReadPosRankSum=1.616;SC=TTGGGGAGGGAGGGGGAAGGG;SOR=3.500;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=17;WE=8379054;WS=8379035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,16:0.89:18
chr18	8379089	rs8082894	T	A	1907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.42;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr18	8379095	rs3819095	G	C	1922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.73;SOR=3.865;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr18	8379281	rs201312634	C	T	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=4.266;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.66;ReadPosRankSum=-0.927;SOR=0.768;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,27:0.25:106
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chr18	8384827	rs7240621	C	G	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=91;ReadPosRankSum=0.049;SC=AGATTCCTGACCTTATGGAGC;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=6;WE=8384835;WS=8384817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr18	8384848	rs586931	A	C	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.067;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=119;ReadPosRankSum=-1.519;SC=TTACATTCTAATAGGAGCAGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=8384856;WS=8384838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr18	8387058	rs664201	T	G	5836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.90;SOR=0.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr18	8387065	rs594742	C	T	5737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.80;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
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chr18	8387219	rs593950	G	C	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.900;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=181;ReadPosRankSum=-0.890;SC=AAGGCCGCACGGTTGTGCACT;SOR=0.123;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=12;WE=8387227;WS=8387209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
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chr18	8705583	.	A	ACGCCGCCGCCGC	505.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.550;ClippingRankSum=0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=6.368;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.77;MQRankSum=0.730;QD=38.90;ReadPosRankSum=-0.085;SOR=4.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
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chr18	8706143	rs11661625	C	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.515;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=336;ReadPosRankSum=0.025;SC=GGCCGCAAAGCCAAGCGCGGC;SOR=1.751;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=16;WE=8706151;WS=8706133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
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chr18	8783835	rs35739383	T	C	2528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.446;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=35;PP=2061;ReadPosRankSum=0.217;SC=ATGGAGGACATGCGGGGCCAG;SOR=0.568;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=148;TCF=96;TCR=52;TR=97;WE=8783843;WS=8783825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,96:0.66:146
chr18	8784370	rs918272	A	G	8017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=155;NR=86;PP=2965;SC=ACTCGGAGGAAATGTTTGAGA;SOR=1.378;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=241;TCF=155;TCR=86;TR=241;WE=8784378;WS=8784360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr18	8784612	rs1965665	A	G	1578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.059;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=37;PP=1198;ReadPosRankSum=-1.496;SC=GAAGAGGAGCAGGGTGAGGGG;SOR=0.316;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=184;TCF=72;TCR=112;TR=68;WE=8784620;WS=8784602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,71:0.37:190
chr18	8786117	rs112600899	C	A	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=4.530;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=68.21;MQRankSum=4.538;QD=22.80;ReadPosRankSum=-0.234;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr18	8786409	rs149413249	G	A	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=451;ReadPosRankSum=0.028;SC=TTGTCCAGTCGCAGAGAAAGA;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=20;WE=8786417;WS=8786399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
chr18	8793236	rs556991	T	C	2421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=72;PP=1835;SC=GCTAGACTCCTGGGCACGTAT;SOR=3.109;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=87;TCF=14;TCR=73;TR=86;WE=8793244;WS=8793226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr18	8796503	rs2287501	C	T	1562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=40;PP=1241;SC=TCTGTTTTGTCCTTGACCCCA;SOR=3.958;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=45;WE=8796511;WS=8796493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr18	8798185	rs12386117	G	A	4033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=78;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.847;SC=CAGTGACCGAGGCTGTGGCTT;SOR=0.563;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=124;TCF=45;TCR=79;TR=123;WE=8798193;WS=8798175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,124:0.99:125
chr18	8821301	rs656602	T	C	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=510;ReadPosRankSum=-0.728;SC=GATTGTACTTTAAAGGCCTCA;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=21;WE=8821309;WS=8821291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr18	8821556	rs629142	G	T	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=483;ReadPosRankSum=-0.291;SC=GTCTTAAAATGTTGTTTTGTC;SOR=1.402;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=22;WE=8821564;WS=8821546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,22:0.73:30
chr18	8825192	rs581894	A	G	5567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=104;PP=2965;SC=ACACCAAGGGAGGCCCTCCAG;SOR=1.159;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=67;TCR=104;TR=171;WE=8825200;WS=8825182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr18	8826083	rs3744977	G	C	2590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=44;PP=1955;SC=CTGGCTACACGCTCACTGAGA;SOR=1.193;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=30;TCR=44;TR=74;WE=8826091;WS=8826073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr18	9104283	rs78247459	G	A	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.230;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=453;ReadPosRankSum=0.219;SC=GGAGCTCCTGGCGTGCCATAC;SOR=2.789;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=72;TCF=10;TCR=62;TR=25;WE=9104291;WS=9104273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,27:0.36:74
chr18	9105108	rs1396740	C	T	231.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=5;PP=165;SC=ATTACTTATACAACCAGGCCC;SOR=1.863;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=2;TCR=5;TR=7;WE=9105116;WS=9105098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	9117867	rs906807	T	C	2150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=22;PP=1818;SC=CATAAGACAGTTATGCAAAAT;SOR=1.508;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=68;TCF=45;TCR=23;TR=67;WE=9117875;WS=9117857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
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chr18	9182331	.	A	AACTTCAGGTAGGT	2213	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=2213;QD=771.0;SC=GTGGTGCGTAACCTATTGTAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=9182340;WS=9182321;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
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chr18	9522606	rs329007	G	A	4645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=116;PP=2965;SC=TGAACTTGAGGAGATAGGTAA;SOR=4.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=11;TCR=116;TR=127;WE=9522614;WS=9522596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr18	9522666	rs2241943	A	G	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.393;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=448;ReadPosRankSum=1.506;SC=GGACAGTGTCAATGTATAAGA;SOR=0.075;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=61;TCF=1;TCR=60;TR=23;WE=9522674;WS=9522656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,24:0.36:66
chr18	9553179	rs403093	A	G	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=447;SC=AGTAAGACACATATTACAGGA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=9553187;WS=9553169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	9557488	rs78552925	A	G	462.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=375;ReadPosRankSum=-0.440;SC=TAACCTCAAAAAATTAAATCA;SOR=1.220;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=16;WE=9557496;WS=9557478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr18	9562042	rs2306134	C	T	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=11;PP=256;ReadPosRankSum=-0.239;SC=GTCTGAATCGCTGTGAATATA;SOR=0.831;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=54;TCF=16;TCR=38;TR=15;WE=9562050;WS=9562032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,14:0.25:56
chr18	9577352	rs329000	C	T	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=15;PP=451;SC=TTAGCTAGGACTGAAAAATTC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=9577360;WS=9577342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	9588016	rs11081485	C	T	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=5;PP=1009;ReadPosRankSum=-0.409;SC=TGCCTAACCCCGGCCTGACTT;SOR=0.869;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=54;TCR=7;TR=43;WE=9588024;WS=9588006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,44:0.71:62
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chr18	9775411	rs6506698	A	G	1294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=36;PP=1067;SC=CATCAGAATGACCACTCTGTC;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=38;WE=9775419;WS=9775401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr18	9859134	rs10695443	A	AAATATT	426.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=1.951;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.76;ReadPosRankSum=1.604;SOR=0.281;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,14:0.25:55
chr18	9887497	rs11081510	G	A	13878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=449;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.340;NF=208;NR=217;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.808;SC=CCAGCCTAAGGAGGGTGACAT;SOR=0.259;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=431;TCF=212;TCR=219;TR=425;WE=9887505;WS=9887487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,443:1.00:444
chr18	9887582	rs141130127	C	A	3244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-6.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=459;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.841;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.752;NF=74;NR=68;PP=2455;ReadPosRankSum=1.643;SC=GCCATCCAGCCCAAGGAGGGT;SOR=0.725;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=434;TCF=213;TCR=221;TR=142;WE=9887590;WS=9887572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:299,151:0.34:450
chr18	9887857	rs17732496	G	A	7243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.548;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=145;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.798;SC=GGACTTTGAGGCATCACTGAA;SOR=1.313;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=221;TCF=76;TCR=145;TR=220;WE=9887865;WS=9887847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,227:1.00:228
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chr18	10455077	rs28379930	A	G	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.880;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=170;ReadPosRankSum=0.000;SC=CAGCCGGCGGAGGCAGCCCGG;SOR=1.336;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=12;WE=10455085;WS=10455067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,11:0.28:39
chr18	10455133	rs28484275	C	T	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=36;ReadPosRankSum=0.660;SC=CGCGGCACGGCCTACACTGTC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=4;WE=10455141;WS=10455123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr18	10468453	rs539412	C	T	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.763;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=3;PP=108;ReadPosRankSum=-0.470;SC=AACTTTCCACCTTTATTTTTC;SOR=0.307;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=34;TCF=25;TCR=9;TR=8;WE=10468461;WS=10468443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,8:0.24:34
chr18	10677880	rs5823112	GA	G	426.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=320;SC=TTTCTGTGAAGAAAAAAAAAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=18;WE=10677888;WS=10677869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr18	10680104	rs1944383	C	T	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=62;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=1;PP=754;SC=ATCTAAAGTTCCCATTCTTCC;SOR=5.136;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=26;WE=10680112;WS=10680100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr18	10680132	rs688237	C	T	2032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.25;SOR=7.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr18	10680142	rs688222	T	A	2316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.12;SOR=8.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr18	10680163	rs487037	G	A	2443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=0;PP=2074;SC=ACTGGGGAAAGGGATAAATTA;SOR=8.581;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=72;TCR=0;TR=72;WE=10680171;WS=10680153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr18	10744273	rs150286626	T	C	1408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.659;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=41;PP=1115;ReadPosRankSum=0.899;SC=ATTCTTGCCATTGTTGTTCCC;SOR=3.348;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=60;TCF=6;TCR=54;TR=43;WE=10744281;WS=10744263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,45:0.73:62
chr18	10759840	rs35033671	C	A	4666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=54;PP=2965;SC=GATCAGCCAGCAGGCGTGGAT;SOR=1.308;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=90;TCR=54;TR=144;WE=10759848;WS=10759830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr18	10763218	rs2865131	T	C	952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=31;PP=713;SC=ATTCCTAGCATGCGCAAGGAA;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=10763226;WS=10763208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	10784733	rs3830641	GA	G	844.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=1;PP=940;SC=TAGGGTTGAAGAGCTGCCTTC;SOR=4.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=22;WE=10784741;WS=10784723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr18	10785070	rs12604151	A	C	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=23;PP=701;SC=TCGTTTATTGAATCCCTCTCT;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=10785078;WS=10785060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	10787047	rs6505592	G	A	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=13;PP=635;SC=TCTTTTTTCAGTCCAGTCATA;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=15;TCR=13;TR=28;WE=10787055;WS=10787037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr18	10789014	rs2870106	G	A	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=158;ReadPosRankSum=0.265;SC=AATCTCTGCAGAGGTAGCTCA;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=10;WE=10789022;WS=10789004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,9:0.27:33
chr18	10795041	rs6505594	A	G	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.375;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=299;ReadPosRankSum=2.425;SC=TGGTCAATACAATGCTCAGTC;SOR=1.075;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=18;WE=10795049;WS=10795031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,17:0.33:52
chr18	10797308	rs36081769	G	A	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=-3.374;QD=1.42;ReadPosRankSum=-3.215;SOR=0.037;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,7:0.15:47
chr18	10797338	rs145681764	T	TATC	753.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.92;MQRankSum=-1.732;QD=8.76;ReadPosRankSum=-2.313;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,21:0.24:86
chr18	10797540	rs185322783	A	T	1599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.777;HP=6;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=53;PP=1247;ReadPosRankSum=1.721;SC=CGAATACTTTATTTAACTATT;SOR=0.422;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=181;TCF=27;TCR=154;TR=65;WE=10797548;WS=10797530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,67:0.35:190
chr18	10797567	rs56112279	A	G	1347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=49;PP=991;ReadPosRankSum=-1.011;SC=AACATGTGACATTTGTATAAA;SOR=0.832;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=129;TCF=5;TCR=124;TR=51;WE=10797575;WS=10797557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,55:0.40:137
chr18	11066010	rs7236754	T	C	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=0;PP=656;SC=CCATGCCATATTAGCCCTGCT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=11066018;WS=11066008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	11609863	rs112705545	G	A	1175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.133;NF=46;NR=14;PP=1022;ReadPosRankSum=0.952;SC=CTTAAACTGCGTGGCGACCCC;SOR=0.595;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=118;TCR=36;TR=60;WE=11609871;WS=11609853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,51:0.37:138
chr18	11609903	rs8087561	CA	GG	8084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=79;PP=2947;SC=TCCGAGGCCGCACCTGCTTCT;SOR=1.105;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=192;TCF=106;TCR=86;TR=182;WE=11609912;WS=11609893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr18	11610052	rs74410464	T	C	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.176;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=1.498;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.44;MQRankSum=-3.633;QD=4.49;ReadPosRankSum=-0.702;SOR=0.372;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,19:0.23:83
chr18	11610073	rs75301503	G	A	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.341;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.080;NF=2;NR=12;PP=146;ReadPosRankSum=-1.000;SC=TACGACTGGTGTGGACTGTTG;SOR=0.151;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=56;TCF=5;TCR=51;TR=14;WE=11610081;WS=11610063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,14:0.24:59
chr18	11619799	rs112261054	ATGT	A	1756.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=9.243;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.96;MQRankSum=0.796;QD=41.83;ReadPosRankSum=0.702;SOR=4.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr18	11824829	rs1647555	A	G	2471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=0;PP=2055;SC=CTTGCAAAAAACAGTTTTTGC;SOR=8.526;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=67;TCF=67;TCR=0;TR=66;WE=11824837;WS=11824819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr18	11824880	rs1647556	T	A	5381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.00;SOR=6.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr18	11824886	rs1647557	T	G	5490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.93;SOR=5.404;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr18	11864707	rs4315401	A	G	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=344;SC=TGTGCATGGCAGCCCTTTCAG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=11864715;WS=11864697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	11867297	rs2855646	C	T	1795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.193;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=57;PP=1460;ReadPosRankSum=0.348;SC=CTTAACTATTCTTGAATTAGA;SOR=2.007;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=97;TCF=11;TCR=86;TR=61;WE=11867305;WS=11867287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,63:0.63:100
chr18	11876613	rs3892113	T	G	1823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=21;PP=1384;ReadPosRankSum=-2.115;SC=ATTTGTCATTTCTACAGCAAC;SOR=0.665;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=234;TCF=166;TCR=68;TR=76;WE=11876621;WS=11876603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,80:0.33:242
chr18	11884670	rs643652	C	G	1140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=27;PP=863;SC=ACCAGGCACACGTTGAACACC;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=11884678;WS=11884660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr18	11886563	rs662515	C	G	732.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=525;ReadPosRankSum=1.598;SC=CTTTCCTCTGCAGGAGCAGCG;SOR=0.613;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=47;TCR=53;TR=31;WE=11886571;WS=11886553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,33:0.32:102
chr18	11893764	rs2277729	T	C	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=199;ReadPosRankSum=0.163;SC=GGGAATTAAGTATCAGAGAAG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=10;WE=11893772;WS=11893754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr18	11998922	.	CCG	C	699.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.37;QD=38.87;SOR=3.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr18	12008391	rs17593321	C	T	2527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=41;PP=2146;ReadPosRankSum=-0.440;SC=GAAAACCTCTCGGCAAGGCCA;SOR=0.731;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=131;TCF=73;TCR=58;TR=90;WE=12008399;WS=12008381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,92:0.68:135
chr18	12012457	rs635370	A	C	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=392;SC=CCTCGTGTCAACCGTGGTCTA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=12012465;WS=12012447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	12014411	rs643107	T	G	2165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=40;PP=1569;SC=ACTTCTGAAATAAAAGTGTGA;SOR=1.296;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=24;TCR=41;TR=64;WE=12014419;WS=12014401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr18	12027941	rs45446291	AT	A	1184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.885;NF=29;NR=1;PP=1161;ReadPosRankSum=0.438;SC=TCGAAAGATGATCCTTACTCT;SOR=1.473;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=30;WE=12027949;WS=12027931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,34:0.74:46
chr18	12057195	rs9959517	A	G	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=10;PP=678;ReadPosRankSum=3.219;SC=GTCCTCCTCTATGAGCCGCGA;SOR=0.656;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=75;TCR=27;TR=37;WE=12057203;WS=12057185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,39:0.37:106
chr18	12057389	rs9959781	C	G	3847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.474;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.232;NF=51;NR=52;PP=2962;ReadPosRankSum=0.803;SC=GGTCCTGCAGCGCCTGCAGCT;SOR=0.602;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=261;TCF=126;TCR=135;TR=103;WE=12057411;WS=12057379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,108:0.39:274
chr18	12057403	rs9959774	A	G	3614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.984;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.781;NF=38;NR=56;PP=2962;ReadPosRankSum=1.683;SC=TGCAGCTCCCAGTCCTTGCTG;SOR=0.775;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=245;TCF=104;TCR=141;TR=94;WE=12057411;WS=12057379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,100:0.39:259
chr18	12067762	rs7506731	C	T	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.946;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=11;PP=410;ReadPosRankSum=0.642;SC=TGCCCCTGGGCTCGTGGGGAG;SOR=0.569;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=36;TCR=29;TR=24;WE=12067770;WS=12067752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,24:0.36:67
chr18	12067777	rs6505712	T	C	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.069;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=13;PP=498;ReadPosRankSum=0.651;SC=GGGGAGGGCTTCATGGCGCCA;SOR=0.714;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=65;TCF=36;TCR=29;TR=25;WE=12067785;WS=12067767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,25:0.37:67
chr18	12067919	rs12966234	G	A	1003.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.039;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=770;ReadPosRankSum=0.586;SC=GGGCATTGGGGTTGTGGGGGG;SOR=1.516;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=124;TCF=72;TCR=52;TR=45;WE=12067927;WS=12067909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,45:0.36:124
chr18	12068078	rs34203217	G	T	1447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.582;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=21;PP=1126;ReadPosRankSum=-0.093;SC=CGGAGTGCTCGCAGGCCTCTC;SOR=0.742;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=187;TCF=114;TCR=73;TR=59;WE=12068086;WS=12068068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,61:0.32:189
chr18	12076504	rs12966109	A	C	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=64;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=18;PP=568;SC=CCCCTCGGGGACGCCCATCGT;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=12076512;WS=12076494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr18	12076541	.	G	GCGCCGCCGCCGC	1061	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5065;HP=1;HapScore=1;MGOF=40;MMLQ=16;MQ=55.73;NF=1;NR=7;PP=1061;QD=134.0;SC=CAGTGCCGCGGCGCCGCCGCC;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=8;WE=12076549;WS=12076531;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr18	12094006	rs9964971	C	T	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=200;ReadPosRankSum=-0.765;SC=GAGAAGATCTCTGGCTTCAGG;SOR=0.430;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=10;WE=12094014;WS=12093996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr18	12094031	rs11664969	G	T	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=417;ReadPosRankSum=-1.257;SC=AGGTCAGGGGGTCGTTCCTGG;SOR=1.308;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=19;WE=12094039;WS=12094021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr18	12096249	rs1986751	G	T	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=8.278;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.65;ReadPosRankSum=0.129;SOR=0.558;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,22:0.22:98
chr18	12097547	rs4796945	A	G	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=-1.081;SC=TTCTACATGGACAGGCATATT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=12097555;WS=12097540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr18	12099654	rs6505715	T	C	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.074;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=7;PP=425;ReadPosRankSum=-0.642;SC=AAACAAGAGATGTAAAAGTCT;SOR=1.061;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=85;TCF=60;TCR=25;TR=27;WE=12099662;WS=12099644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,28:0.31:89
chr18	12107493	rs77270132	G	A	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.736;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=594;ReadPosRankSum=-0.106;SC=AGTTAACAGCGGATCACTGTT;SOR=0.247;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=46;TCF=13;TCR=33;TR=26;WE=12107501;WS=12107483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,26:0.57:46
chr18	12115002	rs9959641	A	G	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=145;ReadPosRankSum=0.389;SC=AAACACAGAGATTTTATATAA;SOR=0.387;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=9;WE=12115010;WS=12114992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr18	12115310	rs8091585	C	T	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.581;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=15;PP=427;ReadPosRankSum=2.665;SC=TGTAAAAAGACGGATAATTCC;SOR=1.210;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=21;WE=12115318;WS=12115300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,22:0.43:51
chr18	12115339	rs8091463	A	G	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.216;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=302;ReadPosRankSum=-1.033;SC=TATATTTAGTATATGCTATAA;SOR=1.072;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=16;WE=12115347;WS=12115329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
chr18	12124152	rs11873244	C	G	297.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=4.611;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.72;MQRankSum=-2.261;QD=5.13;ReadPosRankSum=1.265;SOR=1.057;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,15:0.26:58
chr18	12125657	rs7243248	G	A	1612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.857;NF=45;NR=31;PP=1154;ReadPosRankSum=-0.057;SC=GAATGAGGAAGCATTAACAAA;SOR=0.669;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=259;TCF=152;TCR=107;TR=76;WE=12125665;WS=12125647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,77:0.29:262
chr18	12126407	rs9303759	T	A	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.160;NF=0;NR=16;PP=305;ReadPosRankSum=-0.057;SC=AGATAAGTATTTTTCAAACTT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=16;WE=12126415;WS=12126397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,16:0.33:49
chr18	12254562	rs71369912	C	CCCGCGCACACACCCAT	7769.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=8;NR=46;PP=2045;SC=GCTCCGCGACCCCGCGCACAC;SOR=2.273;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=165;TCF=23;TCR=142;TR=54;WE=12254570;WS=12254551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr18	12274104	rs11545881	G	T	1484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.121;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=8;PP=1139;ReadPosRankSum=-0.361;SC=CAGCCAGCACGTCCCCACTTG;SOR=0.342;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=77;TCF=67;TCR=10;TR=52;WE=12274112;WS=12274094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,53:0.68:78
chr18	12308243	rs8087840	T	A	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	12308243	.	TGC	AGT	110	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=110;QD=54.4892916207;SC=GGCCCGCAGTTGCCGCTGTCG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=12308253;WS=12308233;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr18	12308245	rs8086821	C	T	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	12308377	rs8086993	C	A	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=18.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	12348285	rs11553521	T	C	2531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=20;PP=2073;SC=CAATCACTCGTTCAATTGCCT;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=52;TCR=20;TR=72;WE=12348293;WS=12348275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr18	12348415	.	G	A	1570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.447;ClippingRankSum=0.000;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.018;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=33;PP=1301;ReadPosRankSum=0.778;SC=CTTACCCACCGAAATACGCCC;SOR=1.103;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=214;TCF=112;TCR=102;TR=75;WE=12348423;WS=12348405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,73:0.34:217
chr18	12351342	rs11080572	C	T	2051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=39;PP=1668;SC=CCGGCCTAAGCAGCGCGGGGT;SOR=1.341;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=64;WE=12351350;WS=12351332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr18	12358661	rs8091858	C	T	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=476;ReadPosRankSum=2.389;SC=TCTTAAATTTCATTTTACCTT;SOR=0.377;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=52;TCR=0;TR=22;WE=12358669;WS=12358651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,22:0.40:55
chr18	12358997	rs7407640	A	G	2717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=71;PP=2127;ReadPosRankSum=-0.998;SC=TCCAGCTTTCACATGTGGTGC;SOR=2.232;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=10;TCR=72;TR=81;WE=12359005;WS=12358987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,86:0.99:87
chr18	12359920	rs8097342	G	A	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=1;PP=386;SC=TTATATTTGAGATTACCCATC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=12359928;WS=12359911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	12363950	rs2298542	C	T	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=252;SC=GTTTCAGCCACACAAGGAAAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=12363958;WS=12363940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	12421442	rs3906620	T	A	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=1;PP=685;SC=TATCATTTCTTGAATAGTGAA;SOR=5.058;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=25;WE=12421450;WS=12421437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	12449589	rs186290036	C	T	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=28;ReadPosRankSum=-0.606;SC=AGTGTCCTCGCGCACGGACGC;SOR=0.096;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=5;WE=12449597;WS=12449579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr18	12449984	rs35442495	GT	G	1084.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=30;PP=1311;SC=AAGTAAATTTGTTGTCAAAAC;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=30;WE=12449992;WS=12449974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	12453005	rs499013	A	G	1730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.21;SOR=5.186;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr18	12453005	.	ATAAT	GTAAC,GTAAT	576	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=22,35;NR=1,2;PP=576,266;QD=27.3681684723;SC=AATAAGGAAGATAATTGGTAT;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=23,37;WE=12453017;WS=12452995;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.61:38
chr18	12453009	rs77457080	T	C	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.42;ReadPosRankSum=-0.409;SOR=1.455;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr18	12512385	rs5823223	CA	C	946.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.94;MQRankSum=2.577;QD=7.51;ReadPosRankSum=1.356;SOR=0.573;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,63:0.50:126
chr18	12512559	rs550613	C	A	6415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=170;PP=2965;SC=CAGGCATAAACATTTCATTAA;SOR=5.549;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=10;TCR=171;TR=180;WE=12512567;WS=12512549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr18	12512574	rs567709	T	C	5207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=146;PP=2965;SC=CATTAAGTTATCTTCTCAAAT;SOR=7.236;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=150;TCF=3;TCR=147;TR=149;WE=12512582;WS=12512564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr18	12634934	rs35302137	CA	C	225.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.84;MQRankSum=0.597;QD=11.29;ReadPosRankSum=1.876;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr18	12700092	rs2542173	A	G	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	12819041	rs7245206	C	T	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=57.88;NF=8;NR=0;PP=200;SC=TGTGGTGAGCCGAGATCGTGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=12819049;WS=12819031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	12951738	rs1474043	G	A	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=9;PP=954;SC=TGCTGATTGTGTTCTTTTGTT;SOR=2.356;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=40;WE=12951746;WS=12951728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr18	12955439	rs11286163	CT	C	573.70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=6.105;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.66;MQRankSum=-2.272;QD=16.87;ReadPosRankSum=-0.207;SOR=3.841;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,30:0.88:34
chr18	12978733	rs8182426	C	G	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=424;ReadPosRankSum=0.148;SC=ATGTTAATGTCAATTGTTTTT;SOR=1.284;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=18;WE=12978741;WS=12978723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr18	12979028	.	T	C	138	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=138;QD=43.1928031368;SC=ATGTAAACTTTGAAATGTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=4;WE=12979049;WS=12979018;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:13,4:0.24:17
chr18	12979041	rs61610540	A	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.334;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=342;ReadPosRankSum=2.537;SC=AATGTTTTTTAAAAATGGTCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=8;WE=12979049;WS=12979018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr18	12982760	rs12955780	G	A	3324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=89;PP=2716;SC=AATATTTTTTGAAAATGGTCT;SOR=6.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=91;TCF=2;TCR=89;TR=91;WE=12982768;WS=12982750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr18	12982791	rs61123859	CAT	C	1761.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.927;NF=0;NR=43;PP=1821;ReadPosRankSum=-1.524;SC=CTTTTAATGTCATATTAATTT;SOR=1.926;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=0;TCR=62;TR=43;WE=12982800;WS=12982781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,45:0.71:63
chr18	12984144	rs6505776	C	A	6154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.694;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.202;SC=CTAGGTTCAACTATTCCAAGT;SOR=0.733;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=190;TCF=79;TCR=111;TR=189;WE=12984152;WS=12984134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,198:0.99:199
chr18	12986802	rs11480632	G	GTT	716.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;QD=34.13;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	13001704	rs7240309	T	C	788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=20;PP=621;SC=CTTGAAGAGTTTTCTTTTATT;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=13001712;WS=13001694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr18	13008369	rs6505777	A	G	189.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=0;PP=158;SC=TTTAAGAGGTAAAATACATAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=13008377;WS=13008359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	13030383	rs9964466	G	A	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=52;SC=GTAGTCATCTGAATTTAAAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=13030391;WS=13030373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	13049948	rs11441028	G	GA	1577.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=42;PP=1269;SC=TAGGAACTGGGAAAAAAATGT;SOR=4.215;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=1;TCR=52;TR=43;WE=13049956;WS=13049938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
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chr18	13087815	rs527839	G	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.893;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=189;ReadPosRankSum=0.243;SC=ATGTGAGGAAGAAATACCCGT;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=9;WE=13087823;WS=13087805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr18	13088673	rs498685	T	C	548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=424;ReadPosRankSum=0.780;SC=ATACGCCTGTTTCCTTCTGAC;SOR=1.460;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=17;WE=13088681;WS=13088663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
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chr18	13095609	rs474337	T	C	2419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=49;PP=1913;SC=CGCCCGCCTCTGGATCAGCTG;SOR=1.367;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=81;TCF=32;TCR=49;TR=80;WE=13095617;WS=13095599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr18	13096436	rs556371	T	C	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=34;PP=860;SC=GCACAAAGCATGTGCATGGTT;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=13096444;WS=13096426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr18	13103814	rs116475654	A	T	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.24;ReadPosRankSum=-1.148;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,6:0.18:33
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chr18	13460037	rs59728040	G	A	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=383;ReadPosRankSum=-1.514;SC=ACGTCGTCACGCCATGGTCAT;SOR=0.622;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=21;TCR=32;TR=22;WE=13460045;WS=13460027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,23:0.42:55
chr18	13460078	rs59719495	T	C	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=264;ReadPosRankSum=1.386;SC=TCCAGCTTCCTTTTGAAGAGG;SOR=0.793;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=14;WE=13460086;WS=13460068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr18	13643179	rs11080665	C	A	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.795;NF=15;NR=0;PP=275;ReadPosRankSum=-0.979;SC=GTGATCCATCCGCCTCTGCCT;SOR=0.877;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=15;WE=13643187;WS=13643170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,15:0.36:42
chr18	13666768	rs1149356	A	G	1282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=40;PP=1019;ReadPosRankSum=0.254;SC=TGTCATCTTAAGCAAAAACAA;SOR=0.664;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=25;TCR=90;TR=51;WE=13666776;WS=13666758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,52:0.44:118
chr18	13731407	rs61281036	C	CA	273.14	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=0.577;QD=14.38;ReadPosRankSum=-2.187;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
chr18	13742365	rs4239313	A	C	251.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=200;SC=TAGCCCAGATATAATTAAAAG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=13742373;WS=13742362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr18	13759820	rs4797813	G	T	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.61;SOR=6.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	13762011	rs4461147	C	A	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=8;PP=1185;SC=CACACCTTGTCGTCTAAATGT;SOR=2.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=44;WE=13762019;WS=13762001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr18	13884901	.	T	G	3071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.898;ClippingRankSum=0.000;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.169;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=47;PP=2249;ReadPosRankSum=-2.017;SC=GGTGGAGATCTTCCTGGTGTG;SOR=1.043;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=202;TCF=124;TCR=78;TR=129;WE=13884909;WS=13884891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,131:0.64:206
chr18	14105923	rs2159940	T	C	2597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=30;PP=2061;SC=TAAGGCTTTTTTTGAATATGG;SOR=1.079;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=46;TCR=30;TR=76;WE=14105931;WS=14105913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr18	14106039	rs62086326	T	C	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.373;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.533;NF=10;NR=28;PP=1007;ReadPosRankSum=2.069;SC=TTTACTAATATTTGAGTCATG;SOR=1.051;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=38;WE=14106047;WS=14106029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,39:0.75:52
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chr18	14156143	rs149108958	A	G	119.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.59;QD=23.98;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	14156241	rs115684852	A	T	2299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.84;QD=31.94;SOR=3.521;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr18	14157291	rs9959262	A	T	5644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=123;PP=2965;SC=TCAGCTGCCTACTTCCTCCGT;SOR=2.103;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=48;TCR=123;TR=171;WE=14157299;WS=14157281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr18	14157373	rs7505684	T	A	1920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=56;PP=1645;SC=ATAAGATAATTTATGAAGTTT;SOR=5.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=58;TCF=2;TCR=56;TR=58;WE=14157381;WS=14157363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr18	14179603	rs4797872	A	G	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.86;QD=27.51;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr18	14378621	rs55811695	C	T	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.659;NF=1;NR=5;PP=82;ReadPosRankSum=0.980;SC=ACCAGGCCCGCGTCCTCCTCC;SOR=0.693;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=6;WE=14378629;WS=14378611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr18	14542931	rs45554841	C	T	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=29.991;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.472;NF=28;NR=10;PP=612;ReadPosRankSum=-1.576;SC=GCTCCCCCTGCAGCAGGGGAA;SOR=2.182;SbPval=0.02;Source=Platypus;TC=133;TCF=65;TCR=68;TR=38;WE=14542939;WS=14542921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,33:0.27:122
chr18	14542949	rs9807555	T	C	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=72.459;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.83;MQRankSum=-6.548;QD=7.77;ReadPosRankSum=-1.308;SOR=3.113;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,38:0.26:145
chr18	14542979	rs200806970	A	G	1408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=175.672;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=46.55;MQRankSum=-2.675;QD=10.14;ReadPosRankSum=2.087;SOR=4.087;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,59:0.42:139
chr18	14543057	rs9807633	T	G	2572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.477;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.842;NF=38;NR=59;PP=2148;ReadPosRankSum=1.670;SC=GGGGAAGCGGTGGTGAAACCA;SOR=0.887;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=143;TCF=58;TCR=85;TR=97;WE=14543065;WS=14543047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,95:0.69:138
chr18	14543098	rs11873462	C	T	3037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.805;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.151;NF=22;NR=52;PP=1653;ReadPosRankSum=-1.094;SC=GATCGAATGGCTTCTTCACAG;SOR=0.887;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=115;TCF=35;TCR=80;TR=74;WE=14543106;WS=14543088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,74:0.65:113
chr18	14543139	rs28535987	T	C	1384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.013;NF=5;NR=36;PP=992;ReadPosRankSum=-0.154;SC=CAAACCTCAGTCACCATCTGC;SOR=0.941;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=63;TCF=7;TCR=56;TR=41;WE=14543147;WS=14543129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,37:0.63:59
chr18	14752768	rs45620343	G	A	2849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=57;PP=2374;SC=CAACTAGTTTGTGAAACCTGT;SOR=1.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=26;TCR=57;TR=83;WE=14752776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr18	14752957	rs12457503	G	A	3497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=64;PP=2832;SC=GTGAGAATTTGTTAATGGTGG;SOR=1.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=46;TCR=64;TR=110;WE=14752965;WS=14752947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr18	14757766	rs45550134	A	G	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.288;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=150;ReadPosRankSum=0.072;SC=TGATAGGCACATATTAAATTG;SOR=0.033;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=13;WE=14757774;WS=14757756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr18	14763651	.	G	A	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.150;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=248;ReadPosRankSum=1.167;SC=TATTTAAGCAGAAAGAAAATT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=13;WE=14763659;WS=14763646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chr18	14779890	.	T	C	415	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.45;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=29;MQ=53.25;NF=6;NR=0;PP=415;QD=74.9618687579;SC=TGAAAATAGATTTGTATATGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=6;WE=14779933;WS=14779880;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:19,6:0.24:25
chr18	14779969	rs9675365	C	G	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=1.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.15;MQRankSum=1.115;QD=3.41;ReadPosRankSum=-1.522;SOR=0.455;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,14:0.22:63
chr18	14779986	rs76927023	G	A	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.680;NF=8;NR=9;PP=247;ReadPosRankSum=-1.268;SC=GAATCCAAACGAGAGGAAGAT;SOR=0.560;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=30;TCR=34;TR=17;WE=14779994;WS=14779976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,10:0.16:64
chr18	14780019	rs72873710	G	T	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.26;MQRankSum=-5.261;QD=8.86;ReadPosRankSum=0.657;SOR=0.561;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,16:0.27:59
chr18	14780024	rs79199021	T	C	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.214;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.97;MQRankSum=-5.366;QD=8.91;ReadPosRankSum=0.561;SOR=0.417;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,17:0.29:59
chr18	14780037	rs72873711	C	A	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-3.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.317;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.858;NF=5;NR=17;PP=1486;ReadPosRankSum=0.883;SC=TGTATTATTGCTGTTATTATT;SOR=0.412;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=13;TCR=43;TR=22;WE=14780045;WS=14780009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,16:0.31:52
chr18	14780064	rs78339886	A	G	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.543;HP=3;HapScore=2;MGOF=54;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.217;NF=2;NR=11;PP=187;ReadPosRankSum=0.797;SC=AAATATTAATATTGAGTGATG;SOR=0.124;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=13;WE=14780072;WS=14780046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr18	14780082	rs11080793	G	A	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQRankSum=-1.167;QD=26.79;ReadPosRankSum=-0.272;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,20:0.80:25
chr18	14780082	.	GC	AC,AT	420	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.37;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=54;MMLQ=28;MQ=54.39;NF=0,0;NR=21,8;PP=420,118;QD=21.6557720261;SC=ATGTGAAAATGCAAAATCAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=21,8;WE=14780091;WS=14780072;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.81:26
chr18	14780083	.	C	T	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.769;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.21;MQRankSum=-3.855;QD=7.47;ReadPosRankSum=-0.515;SOR=0.163;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr18	14780108	.	C	T	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.389;ClippingRankSum=0.000;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.76;MQRankSum=-3.618;QD=4.12;ReadPosRankSum=-0.650;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,3:0.20:15
chr18	14796214	rs9303863	G	T	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.518;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.276;NF=12;NR=2;PP=221;ReadPosRankSum=1.456;SC=GTCCCTTTACGTTTAGAGTCT;SOR=1.465;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=14;WE=14796222;WS=14796204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr18	14830262	.	C	T	156	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=46.62;NF=0;NR=10;PP=156;QD=19.0771212547;SC=TTAGAGAAATCCAACTATCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=10;WE=14830270;WS=14830252;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
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chr18	14837168	rs56391489	GT	G	484.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=3;PP=285;ReadPosRankSum=1.938;SC=TTTTTCTGAAGTTTTTTTTTT;SOR=0.748;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=86;TCF=73;TCR=13;TR=29;WE=14837176;WS=14837158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,31:0.34:92
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chr18	18559675	rs7237677	G	C	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=90;ReadPosRankSum=0.712;SC=TCTGCAATTGGTACAGTGTTG;SOR=0.636;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=5;WE=18559683;WS=18559670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,5:0.71:7
chr18	18983766	rs2117317	C	T	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.317;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=373;ReadPosRankSum=-0.093;SC=TTATGGATTGCGTCCCCATCA;SOR=0.185;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=78;TCF=74;TCR=4;TR=24;WE=18983774;WS=18983756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,24:0.32:76
chr18	19030946	.	C	G	965.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.071;ClippingRankSum=0.000;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.681;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=21;PP=727;ReadPosRankSum=0.754;SC=AACATTTGTTCTGTTGATGAG;SOR=0.619;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=124;TCF=70;TCR=54;TR=46;WE=19030954;WS=19030936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,46:0.35:130
chr18	19065494	rs7234335	C	G	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=1;PP=366;SC=CCTCTTACAGCGGTCATTTCT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=19065502;WS=19065484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	19079537	rs8087553	A	G	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=400;SC=ACACGGAGCAATGTGGAGAGC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=19079545;WS=19079527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	19079853	rs4800747	A	G	5915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=68;PP=2965;SC=TGAAGCAGGAATGTGACTCCC;SOR=1.333;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=112;TCR=68;TR=180;WE=19079861;WS=19079843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr18	19100517	rs1395251	T	C	1579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=0;PP=1172;SC=TTTAAGTTAATATTGGAAAAA;SOR=7.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=43;WE=19100525;WS=19100507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr18	19100758	rs34960489	A	ATCT	3697.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=62;PP=2957;SC=GTAGGTGCTGATCTTAAGAAA;SOR=2.570;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=12;TCR=76;TR=72;WE=19100766;WS=19100748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
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chr18	19110466	rs35451929	TG	T	218.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.15;ReadPosRankSum=0.953;SOR=0.970;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,11:0.61:18
chr18	19115896	rs4800780	A	T	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=259;SC=ATTAAAACTGATCTTTACATG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=19115904;WS=19115890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	19119801	rs1818274	C	T	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.919;NF=37;NR=1;PP=1028;ReadPosRankSum=-1.022;SC=AGAGCAAGACCCTGTCTCAGG;SOR=0.772;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=56;TCF=55;TCR=1;TR=38;WE=19119821;WS=19119791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,41:0.69:59
chr18	19119813	.	TA	T	33.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.052;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=2.393;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.64;MQRankSum=-2.132;QD=0.54;ReadPosRankSum=0.573;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,11:0.17:63
chr18	19119974	rs35031202	GAT	G	1484.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.038;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.841;NF=4;NR=49;PP=2001;ReadPosRankSum=0.528;SC=TCCAGCCCTAGATATATATAT;SOR=1.576;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=83;TCF=12;TCR=71;TR=53;WE=19119985;WS=19119964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,53:0.79:67
chr18	19153494	rs973730	C	T	2366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.280;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=19;PP=1828;ReadPosRankSum=0.154;SC=TCCCTAAAAACGTACTTTGAG;SOR=1.450;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=129;TCF=95;TCR=34;TR=84;WE=19153502;WS=19153484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,88:0.66:133
chr18	19154143	rs13381941	G	A	1639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.131;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=43;PP=1221;ReadPosRankSum=1.072;SC=AGATCCTTGCGTGCATTGAGA;SOR=1.123;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=211;TCF=89;TCR=122;TR=68;WE=19154151;WS=19154133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,72:0.33:218
chr18	19192255	rs2850556	C	T	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=7;PP=971;ReadPosRankSum=0.210;SC=CCGCCATGCGCCTGCAGTGCT;SOR=0.695;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=148;TCF=130;TCR=18;TR=53;WE=19192263;WS=19192245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,59:0.38:156
chr18	19208851	rs2847117	A	G	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=201;ReadPosRankSum=-0.198;SC=TGGGGGGTGGAGGGAATCTGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=13;WE=19208859;WS=19208841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
chr18	19237131	.	C	T	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.331;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=229;ReadPosRankSum=1.341;SC=AAAAGAATTTCGGAAGTAAAA;SOR=0.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=11;WE=19237139;WS=19237121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr18	19243976	rs11665314	T	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.013;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=241;ReadPosRankSum=-0.196;SC=AATCAGACATTTATTTAAAAA;SOR=1.206;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=12;WE=19243984;WS=19243966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
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chr18	19408950	rs9989532	C	T	2240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=48;PP=1822;SC=TTTAATTCTCCCTTGGTGGTT;SOR=1.852;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=21;TCR=48;TR=69;WE=19408958;WS=19408940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr18	19423963	rs3216119	GT	G	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=356;SC=TCTTCAGTAGGTCCAGGGTGT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=19423971;WS=19423953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr18	19756856	rs3764504	C	T	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.856;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=133;ReadPosRankSum=0.238;SC=CCCGGGGTGACGCGGGGAGGG;SOR=1.609;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=8;WE=19756864;WS=19756846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr18	19780527	rs11352746	AC	A	3182.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=22;PP=2902;SC=GGCTGCACAGACCCCGTTCAT;SOR=2.303;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=88;TCF=61;TCR=27;TR=77;WE=19780535;WS=19780517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr18	19996011	rs7227477	G	A	1135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.557;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.322;NF=34;NR=6;PP=906;ReadPosRankSum=0.287;SC=TTTGTGGAGGGAGAGCTGAAT;SOR=1.961;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=61;TCF=49;TCR=12;TR=40;WE=19996019;WS=19996001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,40:0.65:62
chr18	20555219	rs2336916	T	C	1721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=36;PP=1368;SC=TTTTATTTTATTTAGCTATAC;SOR=1.835;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=53;WE=20555227;WS=20555209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr18	20564800	rs3052770	TTCA	T	1177.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=1;PP=1147;SC=GATAATGCTTTTCATCATCAT;SOR=4.332;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=20564810;WS=20564790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	20577871	.	G	A	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.235;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=177;ReadPosRankSum=-1.426;SC=CAGAAAAAAAGTCTTTAACCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=20577879;WS=20577861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr18	20816942	rs1966657	A	G	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.306;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.38;ReadPosRankSum=-1.780;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr18	20817276	rs12185467	G	C	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=167;ReadPosRankSum=-0.094;SC=TTGGTGGCCGGCTGGGGGCTT;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=10;WE=20817284;WS=20817266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,9:0.27:33
chr18	20932384	rs8084251	A	G	527.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=348;ReadPosRankSum=0.371;SC=TGTTTTCTAGATCTGTGATCT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=16;WE=20932392;WS=20932374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr18	20950158	rs148939309	GA	G	364.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=2.151;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=0.037;QD=8.90;ReadPosRankSum=-0.073;SOR=0.246;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr18	20953485	rs9944662	C	A	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.441;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=298;ReadPosRankSum=2.599;SC=TGCAGCCCTGCGGAGAAGGCA;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=14;WE=20953493;WS=20953475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr18	20953720	rs8099409	G	A	2144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.810;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=54;PP=1721;ReadPosRankSum=-1.486;SC=GCCAGGAGGAGGAGGGCACTG;SOR=0.328;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=99;TCF=24;TCR=75;TR=74;WE=20953728;WS=20953710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,74:0.76:98
chr18	20964769	rs8094375	A	G	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=1;PP=811;SC=ATATTCCCACATATGTCTGGT;SOR=5.610;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=32;WE=20964777;WS=20964759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr18	20965034	rs62095860	G	A	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=42;PP=972;ReadPosRankSum=0.958;SC=GGAATGGCCTGAAAGAAAACA;SOR=0.728;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=154;TCF=32;TCR=122;TR=52;WE=20965042;WS=20965024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,55:0.34:164
chr18	21017836	rs7226498	T	C	3332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=59;PP=2597;SC=CGTCCCCTTCTCGGGGATCCA;SOR=1.234;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=36;TCR=59;TR=95;WE=21017844;WS=21017826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr18	21017878	rs145064186	C	T	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.25;ReadPosRankSum=1.975;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,10:0.19:54
chr18	21033582	rs8086258	G	C	2637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=83;PP=2183;SC=GGGACCCCGCGGACCTCGGCA;SOR=3.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=12;TCR=83;TR=95;WE=21033590;WS=21033572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr18	21043106	rs72884533	T	C	490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=421;ReadPosRankSum=1.043;SC=ATTTGATGAGTAATTGTCATG;SOR=0.487;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=18;WE=21043114;WS=21043096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr18	21044376	.	C	G	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.108;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.424;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=10;PP=335;ReadPosRankSum=0.877;SC=CTTTGAATCTCATTTGGTAAT;SOR=1.061;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=50;TCF=23;TCR=27;TR=17;WE=21044384;WS=21044366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,17:0.32:53
chr18	21044607	rs2291993	G	A	1168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.358;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=36;PP=920;ReadPosRankSum=0.309;SC=GTTACAGAAAGTATCTATCTC;SOR=1.047;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=62;TCF=11;TCR=51;TR=43;WE=21044615;WS=21044597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,43:0.68:63
chr18	21055092	rs7235571	A	C	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=24;PP=746;SC=CTTTTAAAAGAATTCACACAC;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=21055100;WS=21055082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr18	21083738	rs303760	C	T	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.625;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=22;PP=339;ReadPosRankSum=0.972;SC=GTCGTGGGCGCGCCAAGGCCG;SOR=0.322;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=84;TCF=8;TCR=76;TR=25;WE=21083746;WS=21083728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,25:0.29:85
chr18	21084265	rs117624142	T	A	2949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.424;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=37;PP=2243;ReadPosRankSum=-1.613;SC=AATAATCGCTTGCGGGTTGGC;SOR=0.899;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=152;TCF=97;TCR=55;TR=106;WE=21084273;WS=21084255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,110:0.69:159
chr18	21088081	rs1652381	T	C	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=255;SC=AGCGGGGCATTGGGGTCGCAG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=21088089;WS=21088071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
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chr18	21103909	rs891387	T	C	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=1;PP=273;SC=CCTGGATTGTTAGCTCCTTCC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=21103917;WS=21103899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	21103971	rs891386	T	G	441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.305;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=265;ReadPosRankSum=2.073;SC=CATTTCTTCCTTGACTACAAT;SOR=0.133;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=17;WE=21103979;WS=21103961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr18	21107628	rs111369676	G	GTATTGTATTTCT	1635.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.321;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=2954;ReadPosRankSum=-0.583;SC=GGTCTTTAAAGTAGAGTGTCC;SOR=1.656;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=25;WE=21107636;WS=21107618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,34:0.68:50
chr18	21109250	rs1788825	T	C	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.853;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=18;PP=548;ReadPosRankSum=-2.255;SC=TGTCAGCCTTTGTGGAAAAGA;SOR=0.304;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=28;WE=21109258;WS=21109240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,30:0.61:49
chr18	21109269	rs1652375	T	C	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.290;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.062;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=370;ReadPosRankSum=-1.992;SC=GAAGGTGGGCTGCAGCTTTCC;SOR=0.303;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=21;WE=21109277;WS=21109259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr18	21109466	rs1652376	G	T	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.658;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=2;PP=1066;ReadPosRankSum=-0.042;SC=CTGGAGCGATGTGTGCAAAAC;SOR=0.305;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=67;TCF=65;TCR=2;TR=44;WE=21109474;WS=21109456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,44:0.66:67
chr18	21110411	.	G	A	1735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.521;ClippingRankSum=0.000;DP=288;ExcessHet=3.0103;FS=2.891;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.05;ReadPosRankSum=-1.498;SOR=0.772;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:206,81:0.28:287
chr18	21113285	rs2510344	T	C	3044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.367;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=30;PP=2432;ReadPosRankSum=0.136;SC=AATGTCCTTCTATTGTGCCAC;SOR=0.841;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=165;TCF=115;TCR=50;TR=107;WE=21113293;WS=21113275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,114:0.66:174
chr18	21119291	rs6507720	A	G	3026.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.356;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=29;PP=2220;ReadPosRankSum=-0.652;SC=TCAGCAAAACAGGAAAGATTT;SOR=1.547;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=183;TCF=132;TCR=51;TR=122;WE=21119299;WS=21119281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,127:0.66:192
chr18	21119777	rs1140458	G	A	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.395;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=8;PP=584;ReadPosRankSum=1.125;SC=GTACTGACTAGTTGTCCAGCT;SOR=0.385;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=30;WE=21119785;WS=21119767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,32:0.67:48
chr18	21120035	rs7239575	T	C	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.643;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=246;ReadPosRankSum=0.045;SC=GCGAGGATCATGGAGAATAAG;SOR=3.500;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=15;WE=21120043;WS=21120025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr18	21120381	.	TA	T	42.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.080;ClippingRankSum=0.000;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=1.973;QD=1.02;ReadPosRankSum=0.288;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,9:0.21:42
chr18	21120444	rs1805082	T	C	3709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.456;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=56;PP=2847;ReadPosRankSum=0.399;SC=TCCAATCCAATATCTACTTTG;SOR=0.961;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=193;TCF=109;TCR=84;TR=132;WE=21120452;WS=21120434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,139:0.68:204
chr18	21123296	.	G	GA	89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=15;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=16;MQ=54.97;NF=8;NR=0;PP=89;QD=11.625;SC=CCGTCTCAGAGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=8;WE=21123304;WS=21123286;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:23,8:0.26:31
chr18	21123536	rs11299077	TA	T	560.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=1.035;QD=10.99;ReadPosRankSum=2.803;SOR=0.643;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,39:0.76:51
chr18	21124945	.	C	G	943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.803;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.783;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=20;PP=773;ReadPosRankSum=-1.257;SC=GACAGCTTTTCATGTGCCCCA;SOR=0.636;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=35;WE=21124953;WS=21124935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,35:0.49:71
chr18	21127910	rs2435307	C	T	2447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.298;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=41;PP=1669;ReadPosRankSum=-0.169;SC=AAGTGCTTGCCGCAAGTGTCT;SOR=0.815;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=144;TCF=75;TCR=69;TR=88;WE=21127918;WS=21127900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,93:0.61:152
chr18	21134569	rs201731344	CAA	C	66.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQRankSum=0.744;QD=3.71;ReadPosRankSum=-1.530;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr18	21140432	rs1805081	T	C	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.577;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=469;ReadPosRankSum=-0.362;SC=CTCCATCCCATGGACTGGAAA;SOR=1.306;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=26;WE=21140440;WS=21140422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,27:0.71:38
chr18	21192261	rs1652366	G	T	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=27;PP=815;SC=CCTCATACCCGTAACCTTCCT;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=21192269;WS=21192251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr18	21209988	rs11660305	G	A	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=63;ReadPosRankSum=0.213;SC=TAGGGCGGGTGCAGTGGCTCA;SOR=1.688;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=5;WE=21209996;WS=21209978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr18	21294117	rs34200895	TA	T	90.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=5.269;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.59;ReadPosRankSum=1.739;SOR=2.133;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,9:0.26:35
chr18	21338276	rs6507894	C	T	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.497;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=260;ReadPosRankSum=-0.999;SC=CGTGATGACTCGTGTGTCAGG;SOR=1.817;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=14;WE=21338284;WS=21338266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,14:0.32:44
chr18	21338515	rs11308832	TC	T	600.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=18;PP=614;SC=CGTGGCCTTCTCCCCCCTCTC;SOR=3.716;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=20;WE=21338523;WS=21338505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr18	21393229	rs11420756	A	AT	151.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=120;ReadPosRankSum=-0.903;SC=TGATTTTGTGATTTTTTTTTT;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=9;WE=21393237;WS=21393219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr18	21395358	rs2155841	G	C	534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.139;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=400;ReadPosRankSum=-0.962;SC=ATACAGTGAGGCAGTTTTCAA;SOR=1.096;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=90;TCF=43;TCR=47;TR=25;WE=21395366;WS=21395348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,25:0.28:90
chr18	21400005	rs7244406	A	C	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=395;ReadPosRankSum=0.832;SC=AGTAGCTCAGATACTTCCCCA;SOR=0.298;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=0;TCR=54;TR=20;WE=21400013;WS=21399995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,22:0.37:60
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chr18	21437931	rs867449	G	C	1011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.668;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=29;PP=735;ReadPosRankSum=0.671;SC=GTGACCCAGGGACCGGGGCTT;SOR=0.486;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=126;TCF=36;TCR=90;TR=42;WE=21437939;WS=21437921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,45:0.35:128
chr18	21441717	rs12965685	C	T	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.893;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=21;PP=404;ReadPosRankSum=1.539;SC=AGGAGCTGCCCGCAACCATCC;SOR=0.226;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=86;TCF=17;TCR=69;TR=29;WE=21441725;WS=21441707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,28:0.32:88
chr18	21474827	rs1268716	G	A	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.359;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=8;PP=759;ReadPosRankSum=1.245;SC=GCAGTCCCACGGCTCCCCCCA;SOR=0.202;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=54;TCF=44;TCR=10;TR=34;WE=21474835;WS=21474817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,34:0.63:54
chr18	21475153	rs1262340	G	A	177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=154;ReadPosRankSum=-0.578;SC=TGATCCAAATGAAGATAAGAC;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=8;WE=21475161;WS=21475143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr18	21481233	rs1154226	C	G	1180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.310;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=32;PP=881;ReadPosRankSum=0.109;SC=CTGCCCAAGCCAAGCAGGCAA;SOR=0.504;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=57;TCF=13;TCR=44;TR=42;WE=21481241;WS=21481223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,44:0.73:60
chr18	21481340	rs1154227	A	G	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=190;ReadPosRankSum=0.750;SC=TGAGAGAAGCAGGGATCTTTA;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=9;WE=21481348;WS=21481330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr18	21483206	rs729814	G	A	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=246;ReadPosRankSum=0.044;SC=CTCTTAGATGGAAGAGAATAT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=11;WE=21483214;WS=21483196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr18	21495483	rs1541836	T	C	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=22;PP=540;SC=GAGATGCTATTGATGTTGCTA;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=21495491;WS=21495473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr18	21511034	rs1154232	C	A	4140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.292;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=67;PP=2962;ReadPosRankSum=1.298;SC=AGACAAGGAACCTGCAGGTCA;SOR=0.976;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=242;TCF=130;TCR=112;TR=155;WE=21511042;WS=21511024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,159:0.64:248
chr18	21511089	rs1154233	A	G	7003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=131;PP=2965;SC=CGATAGCGGCAGCCCAATTTT;SOR=1.111;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=224;TCF=92;TCR=132;TR=223;WE=21511097;WS=21511079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr18	21511172	rs1258107	G	C	2888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=87;PP=2282;SC=CTGGGTGAGTGGAATAATACT;SOR=3.745;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=13;TCR=87;TR=100;WE=21511180;WS=21511162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr18	21513768	rs1131521	C	T	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.303;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=11;PP=720;ReadPosRankSum=1.269;SC=TCCTGAAGTCCTAGATTTGAC;SOR=1.170;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=32;WE=21513776;WS=21513758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,33:0.70:47
chr18	21526087	rs2288592	C	T	164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=93;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=128;ReadPosRankSum=-0.338;SC=ATACAACTCACGTATCTTTCT;SOR=0.875;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=52;TCF=41;TCR=11;TR=12;WE=21526095;WS=21526077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,11:0.22:51
chr18	21529722	rs2241643	G	A	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.695;HP=2;HapScore=2;MGOF=63;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=206;ReadPosRankSum=-1.246;SC=TTTCTGCTTGGTTGCAGAGCC;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=12;WE=21529730;WS=21529712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr18	21531906	rs11873358	C	T	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=230;ReadPosRankSum=-1.454;SC=GCTTCCGTCACTCATGGTTGC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=12;WE=21531914;WS=21531896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr18	21534701	rs1051149	C	A	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.32;ReadPosRankSum=-0.913;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr18	21534701	.	CTC	ATT	462	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=0;NR=9;PP=462;QD=57.274208318;SC=TCATTCTTCACTCAGGACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=9;WE=21534711;WS=21534691;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,9:0.47:19
chr18	21534703	rs1051150	C	T	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.99;ReadPosRankSum=-1.928;SOR=0.874;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr18	21644091	rs56229252	G	T	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=529;ReadPosRankSum=-1.575;SC=GTGTGTGTGTGTTTTTTTAAC;SOR=0.676;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=28;WE=21644099;WS=21644081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,29:0.39:74
chr18	21662816	rs2305024	A	C	4036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=13;PP=2965;SC=TGGAGTTTTGAAAAATGGAAA;SOR=3.985;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=101;TCR=13;TR=114;WE=21662824;WS=21662806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
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chr18	21694618	rs4800176	G	A	5979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=127;PP=2965;SC=ATTGGTAAATGTGAAATGTCT;SOR=1.660;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=185;TCF=58;TCR=127;TR=185;WE=21694626;WS=21694608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
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chr18	21739725	rs1049684	T	C	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.401;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=596;ReadPosRankSum=1.296;SC=AACCTCTTCCTGGACATGCTG;SOR=0.240;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=148;TCF=97;TCR=51;TR=42;WE=21739733;WS=21739715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,43:0.28:156
chr18	21759593	rs12604451	T	C	1053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.536;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=0;PP=910;ReadPosRankSum=1.031;SC=ACATCAAAATTGTTAACTTGC;SOR=2.732;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=51;TCR=1;TR=35;WE=21759601;WS=21759583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,35:0.65:54
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chr18	21938396	rs7226922	T	C	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.536;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=11;PP=1521;ReadPosRankSum=2.120;SC=TTCCCCACCCTCGTGCACAGG;SOR=0.375;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=37;WE=21938404;WS=21938374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,37:0.77:48
chr18	21938658	rs7227401	T	G	1031.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=30;PP=803;ReadPosRankSum=-1.480;SC=TTAGGTGAGATAGAGAGAATT;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=31;WE=21938666;WS=21938648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,34:0.79:43
chr18	21946572	rs656487	T	A	1215.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.36;ReadPosRankSum=1.587;SOR=0.689;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,57:0.63:91
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chr18	22017752	rs1941814	C	A	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.98;ReadPosRankSum=1.011;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,3:0.23:13
chr18	22017800	rs620931	T	A	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=10.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=16.03;ReadPosRankSum=-0.231;SOR=2.392;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr18	22018129	rs1791254	A	C	150.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=120;SC=ATTATAAAATACAAGTTTCTC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=22018137;WS=22018119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr18	22020543	rs677688	C	G	3080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=40;PP=2376;SC=GGAAAGTTCGCTTAAAGCATT;SOR=1.044;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=52;TCR=40;TR=92;WE=22020551;WS=22020533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr18	22804244	rs4129657	T	C	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.825;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=1;PP=192;ReadPosRankSum=-0.364;SC=GTGGAGAGTGTAAACATAAAG;SOR=0.346;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=10;WE=22804252;WS=22804234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr18	22931849	rs185260009	C	T	418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=359;ReadPosRankSum=1.997;SC=GCAGCGGCGGCGGCAGCAGCG;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=19;WE=22931857;WS=22931839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,19:0.70:27
chr18	23598160	rs607404	A	T	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=6;PP=698;SC=TTATAACTAAACCACAAAGGC;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=23598168;WS=23598150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr18	23865851	rs12456749	C	T	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.461;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=594;ReadPosRankSum=0.449;SC=TCCAGAAAAGCGTGGTTGCCT;SOR=1.147;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=139;TCF=81;TCR=58;TR=44;WE=23865859;WS=23865841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,46:0.32:145
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chr18	23872235	rs12963653	A	G	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.859;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=9;PP=690;ReadPosRankSum=-0.788;SC=TCAGGAGGCAATGAAAAACAA;SOR=0.992;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=104;TCF=74;TCR=30;TR=36;WE=23872243;WS=23872225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,37:0.35:106
chr18	23873463	rs1677016	T	C	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.216;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=11;PP=488;ReadPosRankSum=1.528;SC=CTCAGAAAAATAGAATAAAAG;SOR=0.611;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=38;TCF=21;TCR=17;TR=22;WE=23873471;WS=23873453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr18	23875336	rs1382260	T	A	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.18;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr18	23875336	.	TTG	ATC,ATG	174	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=2,3;NR=8,11;PP=174,37;QD=22.7467874862;SC=GACTGATTTCTTGGAAGGCAA;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=14;TCF=3;TCR=11;TR=10,14;WE=23875346;WS=23875326;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.71:14
chr18	23875338	rs140468533	G	C	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.55;ReadPosRankSum=-0.837;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr18	23901198	rs2276407	G	A	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.266;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=358;ReadPosRankSum=-1.864;SC=ATAAACTCTCGAGTGTTATAG;SOR=1.030;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=73;TCF=13;TCR=60;TR=21;WE=23901206;WS=23901188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,21:0.27:78
chr18	24039964	rs3835044	AT	A	955.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=29;PP=847;SC=CTAAGAGGTGATTTTTTTCCA;SOR=3.383;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=31;WE=24039972;WS=24039954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr18	24436519	rs68006382	A	G	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.404;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5468;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=747;ReadPosRankSum=0.286;SC=GCAGCTCATGAATGTAGAATC;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=29;WE=24436527;WS=24436509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,31:0.86:36
chr18	24524561	rs16943019	A	T	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.11;ReadPosRankSum=-0.484;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr18	24603853	rs71353424	T	A	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=-0.408;SC=TTTAGTTTCCTTTGTAAATCC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=5;WE=24603861;WS=24603843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr18	24628305	rs12458504	C	T	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=269;SC=AAATTAATATCGATCAGTTCA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=24628313;WS=24628295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	24628679	rs12456126	A	T	978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=27;PP=778;SC=TATGCATTAAATGTGCTGTTG;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=24628687;WS=24628669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr18	25562831	rs8092870	C	T	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.111;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.98;ReadPosRankSum=-0.187;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr18	25565082	rs1220144	A	G	5278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=105;PP=2965;SC=AAACCTTCACACGCAGGATGG;SOR=1.329;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=163;TCF=58;TCR=105;TR=163;WE=25565090;WS=25565072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr18	25570228	rs1628684	G	C	5161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=98;PP=2965;SC=TTGACTGAGGGGGGTGCTGAA;SOR=0.976;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=75;TCR=98;TR=172;WE=25570236;WS=25570218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr18	25572837	rs1662733	G	A	2488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=53;PP=2042;SC=TCAGAGGAGGGGCATGGACCA;SOR=2.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=19;TCR=53;TR=72;WE=25572845;WS=25572827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr18	25573308	rs1662734	C	T	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=0;PP=878;SC=GGATGCCTCACGTAAGGCCCT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=25573316;WS=25573298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr18	25573622	rs2957286	G	C	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=40;PP=1316;SC=ATAAAGATAAGAACTTAAATG;SOR=4.271;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=43;WE=25573630;WS=25573612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr18	25585687	rs874314	G	A	519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=399;ReadPosRankSum=-1.699;SC=TTTCCCAAAAGCATTATGAAT;SOR=1.893;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=17;WE=25585695;WS=25585677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr18	25593931	rs1443453	A	C	500.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=532;ReadPosRankSum=-0.735;SC=GCAAAAAAAAACCCCTAATAC;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=20;WE=25593939;WS=25593921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr18	25616451	rs1944294	A	T	1145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.673;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=7;PP=873;ReadPosRankSum=0.715;SC=GAAAACATACAATTCTGCTTG;SOR=1.190;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=63;TCF=49;TCR=14;TR=41;WE=25616459;WS=25616441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,42:0.65:65
chr18	27879067	rs78549380	A	G	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=43;ReadPosRankSum=-1.309;SC=TTCCACAAATATTTAGCAAAA;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=27879075;WS=27879057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr18	28577113	.	C	G	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.089;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=194;ReadPosRankSum=0.250;SC=ACCTTTTATTCATTCATTCAT;SOR=0.180;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=11;WE=28577121;WS=28577103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,11:0.30:37
chr18	28586964	rs1313586	A	G	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.887;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=29;PP=851;ReadPosRankSum=-0.454;SC=CAGGTTCATCAGGATCAACAG;SOR=0.976;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=160;TCF=79;TCR=81;TR=50;WE=28586972;WS=28586954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,54:0.31:172
chr18	28588537	rs1313587	C	T	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.118;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=441;ReadPosRankSum=0.609;SC=TAAAATACATCTGGCATTTCA;SOR=0.145;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=96;TCF=2;TCR=94;TR=26;WE=28588545;WS=28588527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,28:0.28:99
chr18	28598866	rs5823777	CTG	C	51.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.036;NF=0;NR=3;PP=69;ReadPosRankSum=-1.470;SC=ACACACACATCTGTGTGTTTC;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=3;WE=28598875;WS=28598856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr18	28605715	rs202439	A	T	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.236;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=215;ReadPosRankSum=1.243;SC=GCATATCAATAAAAGTCCTAC;SOR=1.033;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=14;WE=28605723;WS=28605705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,18:0.31:58
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chr18	28611061	rs276937	A	T	800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=5.724;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.27;ReadPosRankSum=-1.063;SOR=0.429;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,41:0.27:152
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chr18	28622524	rs276924	C	T	2722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=47;PP=2129;SC=ACCCCCGTCCCCACCCCAGCC;SOR=0.809;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=40;TCR=47;TR=87;WE=28622532;WS=28622514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
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chr18	28659724	rs1658128	T	C	1106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=0;PP=939;SC=AGTGCATGTATCCAGCTTTAA;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=28659732;WS=28659714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	28662776	rs1790702	G	A	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.328;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.68;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr18	28666526	rs35717505	T	TTAA	2675.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=21;PP=2760;SC=TCAGGTTTTATTGTTTATGTT;SOR=1.609;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=55;TCF=33;TCR=22;TR=51;WE=28666534;WS=28666516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr18	28666826	rs17799745	T	C	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=186;ReadPosRankSum=0.148;SC=GGCAAAGTCATGGCTTTTATA;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=11;WE=28666834;WS=28666816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr18	28671212	rs1790683	T	G	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=346;ReadPosRankSum=0.700;SC=ATTAGCTGGGTAGGGGTGAGA;SOR=0.869;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=14;WE=28671220;WS=28671202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr18	28673565	rs12954874	T	C	4235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=5.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.972;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=94;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.016;SC=AGGGAACATGTAATGTCACAT;SOR=1.073;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=218;TCF=83;TCR=135;TR=146;WE=28673573;WS=28673555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,155:0.67:230
chr18	28711519	rs1789072	C	T	3062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=15;PP=2274;SC=TAGCATTTAACTTCCATGTAA;SOR=2.608;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=74;TCR=15;TR=89;WE=28711527;WS=28711509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr18	28712737	rs36112658	CA	C	197.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=231;SC=GCATATGTCTCAAAAAATTCA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=28712745;WS=28712727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	28719674	rs1789043	A	G	1281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=7;PP=858;SC=AAAACATGTCATATATTTATA;SOR=2.560;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=43;WE=28719682;WS=28719664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr18	28720366	.	T	C	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.387;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=300;ReadPosRankSum=0.367;SC=ACATTTAAAATGTAACCTAAA;SOR=1.101;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=16;WE=28720374;WS=28720356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr18	28728497	.	C	T	3002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.338;ClippingRankSum=0.000;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.618;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=37;PP=2326;ReadPosRankSum=-0.932;SC=AAGATAGTCACTCTGTGTTCA;SOR=1.022;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=134;TCF=82;TCR=52;TR=100;WE=28728505;WS=28728487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,110:0.76:144
chr18	28898201	rs1834582	A	G	3073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.255;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=21;PP=2340;ReadPosRankSum=0.886;SC=TGGGAGAAAGAAAAAGAACAG;SOR=1.393;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=175;TCF=134;TCR=41;TR=104;WE=28898209;WS=28898191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,112:0.60:188
chr18	28898294	rs1426310	A	G	4198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.149;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=84;PP=2962;ReadPosRankSum=0.501;SC=AGTAGTTGCAATGCTGTTCAT;SOR=0.470;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=212;TCF=81;TCR=131;TR=140;WE=28898302;WS=28898284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,156:0.68:228
chr18	28906460	rs57200666	TG	CA	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.941;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=600;ReadPosRankSum=-0.329;SC=TATGGTTTCATGTTGTTTTTA;SOR=1.501;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=13;WE=28906469;WS=28906450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr18	28907096	rs765054	C	T	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=599;ReadPosRankSum=-0.329;SC=ACTATAGTCACCTAGATGATG;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=24;WE=28907104;WS=28907086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr18	28908090	rs2303465	G	A	1456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=7.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=0;PP=1177;ReadPosRankSum=0.245;SC=GAAAGCTGTCGTATATCAAAT;SOR=1.409;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=76;TCF=76;TCR=0;TR=48;WE=28908098;WS=28908080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,50:0.64:78
chr18	28913599	rs12967407	C	T	2210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=32;PP=1677;ReadPosRankSum=1.275;SC=ACCGAGATGGCGGGGCAGATG;SOR=0.713;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=127;TCF=74;TCR=53;TR=77;WE=28913607;WS=28913589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,84:0.63:133
chr18	28913929	rs5823800	TTC	T	592.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=588;ReadPosRankSum=-0.493;SC=CCTACTGTAGTTCTCTCTCTT;SOR=0.387;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=14;WE=28913938;WS=28913919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr18	28916230	rs74277377	G	GAT	208.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.045;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=268;ReadPosRankSum=1.803;SC=AAGATAATAAGTTTTTTTTGC;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=28916238;WS=28916220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr18	28916290	rs6506917	G	A	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=213;ReadPosRankSum=-0.287;SC=TTCTTATAATGAAACTATTTT;SOR=0.223;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=11;WE=28916298;WS=28916280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr18	28923983	rs11660224	AT	CA	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=4.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.563;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=1285;ReadPosRankSum=-0.801;SC=TTTGTTTAACATCTCAAATGC;SOR=3.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=22;WE=28923992;WS=28923973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,26:0.72:36
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chr18	28935375	rs8099566	C	T	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=722;SC=ACTAAAAAACCAACAATGTGA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=28935383;WS=28935365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr18	28993589	rs7234333	C	T	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.229;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=23;PP=560;ReadPosRankSum=-0.756;SC=TATGTGGAGACCTTGCACCTT;SOR=0.476;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=10;TCR=63;TR=27;WE=28993597;WS=28993579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,28:0.37:75
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chr18	29125854	rs1042769	A	G	2752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.895;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=52;PP=2169;ReadPosRankSum=1.201;SC=AATTCAAGACACTAGCTGAAG;SOR=0.483;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=162;TCF=86;TCR=76;TR=106;WE=29125862;WS=29125844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,108:0.65:165
chr18	29126670	rs1791235	T	C	2928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.824;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=55;PP=2357;ReadPosRankSum=0.526;SC=CCACCAGAGTTACCAAGCATA;SOR=0.636;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=183;TCF=93;TCR=90;TR=109;WE=29126678;WS=29126660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,110:0.59:186
chr18	29206121	rs3764474	A	G	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=446;ReadPosRankSum=1.327;SC=TCAGCAAAAAATACTTCCCTT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=19;WE=29206129;WS=29206111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr18	29207155	rs1026123	C	T	2477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=81;PP=2050;ReadPosRankSum=1.893;SC=AAGGTTTCAGCCTTTTATGTG;SOR=0.648;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=121;TCF=1;TCR=120;TR=82;WE=29207163;WS=29207145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,84:0.66:127
chr18	29237860	rs1449087	C	T	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=447;ReadPosRankSum=-0.468;SC=CCTGCTCCTGCTGCACTCAAA;SOR=0.829;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=68;TCR=1;TR=24;WE=29237868;WS=29237850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,24:0.35:68
chr18	29264182	rs1449081	G	A	167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=94;ReadPosRankSum=-0.434;SC=GCCCCTGTTTGAACAGCTTCC;SOR=0.247;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=7;WE=29264190;WS=29264172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr18	29426552	rs34846731	A	C	1103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.46;SOR=7.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
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chr18	29435778	rs34167680	T	TA	262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=4.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.59;MQRankSum=1.943;QD=7.10;ReadPosRankSum=-3.233;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
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chr18	29451174	rs8084584	T	A	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.10;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
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chr18	29708981	rs684359	G	A	1597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=10;PP=1295;SC=TGTAATGTGTGTCAAGATGTG;SOR=2.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=40;TCR=10;TR=50;WE=29708989;WS=29708971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr18	29793526	rs335518	C	T	7607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.700;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=154;PP=2965;ReadPosRankSum=0.646;SC=ACCACCGGTTCGTAACTCATT;SOR=1.448;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=238;TCF=82;TCR=156;TR=234;WE=29793534;WS=29793516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,246:0.99:249
chr18	29795076	rs173032	T	C	3124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=29;PP=2473;SC=ACAGGCCTTCTAAAGTGGGAA;SOR=1.784;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=66;TCR=29;TR=95;WE=29795084;WS=29795066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr18	29795101	rs233223	T	C	3749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=76;NR=40;PP=2965;SC=GGCTTTGTTCTCTAATGGAAC;SOR=1.512;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=77;TCR=40;TR=116;WE=29795109;WS=29795091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr18	29796885	rs146727791	G	T	1037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.093;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=8;PP=850;ReadPosRankSum=-0.637;SC=AAAAGAAAATGAAAATTAAAG;SOR=0.429;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=144;TCF=123;TCR=21;TR=47;WE=29796893;WS=29796875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,47:0.33:144
chr18	30352057	rs200605696	GCGCCGGCC	G	1221.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=6.052;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.80;MQRankSum=4.461;QD=11.75;ReadPosRankSum=-1.759;SOR=1.456;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,37:0.36:104
chr18	30352114	rs71366355	C	G	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.050;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=2.460;NF=44;NR=16;PP=958;ReadPosRankSum=0.709;SC=CGCCGCCGCCCGGCTCGGAGG;SOR=1.048;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=177;TCF=121;TCR=56;TR=60;WE=30352122;WS=30352104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,59:0.34:176
chr18	30672631	rs1995096	G	A	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=4;PP=458;SC=GGATATCATCGTCAGATCAGA;SOR=2.419;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=30672639;WS=30672621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	30804756	rs466113	C	T	1640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=5;PP=1332;SC=TGTTCTTTGTCGAGACTTCTG;SOR=4.003;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=41;TCR=5;TR=46;WE=30804764;WS=30804746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr18	30846895	rs9965081	A	T	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=2;PP=829;SC=ATTGGTTTTTACTGTTATTTT;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=30846903;WS=30846885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
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chr18	30950168	rs9965655	T	C	3810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=80;PP=2965;SC=AGAGAACAAATAGAAGTTCAT;SOR=2.224;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=28;TCR=80;TR=108;WE=30950176;WS=30950158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr18	30976968	rs4447495	C	G	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=366;SC=TTTAAAGAAGCGTTACGATTA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=30976976;WS=30976958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	30977255	rs6507018	G	A	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=14;PP=422;SC=GTAAGGATACGGGAAGAAAAT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=30977263;WS=30977245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr18	31241497	rs9304126	C	G	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.958;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.150;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=272;ReadPosRankSum=1.935;SC=TTTTCAATTGCAGAAAAGCTC;SOR=0.086;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=14;WE=31241505;WS=31241487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr18	31263320	rs8086318	G	A	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=6.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.854;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.399;NF=36;NR=3;PP=689;ReadPosRankSum=-0.957;SC=GTACGTACACGTTTCCCTCTA;SOR=1.532;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=124;TCF=107;TCR=17;TR=39;WE=31263328;WS=31263310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,45:0.33:135
chr18	31263603	rs62092392	A	G	851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=682;ReadPosRankSum=-0.299;SC=GTCTATTATCAAAGATGACTT;SOR=0.726;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=0;TCR=55;TR=29;WE=31263611;WS=31263593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr18	32373873	rs9989533	T	C	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=85;ReadPosRankSum=1.107;SC=CATTTACTTATGTTGACCCCC;SOR=0.204;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=7;WE=32373881;WS=32373863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr18	32386081	rs11664422	A	G	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=136;ReadPosRankSum=-0.233;SC=TGTGATTTCTACAGAATAGAA;SOR=2.147;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=10;WE=32386089;WS=32386079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr18	32386101	rs11664472	C	A	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=204;ReadPosRankSum=-0.282;SC=AAATGTCAAACCTTGTTGCTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=10;WE=32386109;WS=32386091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr18	32386340	rs9952711	T	C	1752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.455;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=44;PP=1299;ReadPosRankSum=0.990;SC=CCCTCATTCCTCTATGTCCCC;SOR=0.361;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=94;TCF=21;TCR=73;TR=59;WE=32386348;WS=32386330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,63:0.64:98
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chr18	32418186	rs17557695	T	A	1520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.024;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=32;PP=1132;ReadPosRankSum=0.488;SC=AAACTAAAAATGGAGATTTCT;SOR=0.310;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=74;TCF=24;TCR=50;TR=51;WE=32418194;WS=32418176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,56:0.70:80
chr18	32418265	rs1954861	G	A	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=401;ReadPosRankSum=-0.879;SC=CTTTAACCCAGTTAACAGCAC;SOR=0.756;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=17;WE=32418273;WS=32418255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr18	32418634	rs1941753	T	A	3769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.957;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=60;PP=2884;ReadPosRankSum=0.108;SC=TACCAAAAACTCACTCCTACC;SOR=0.550;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=197;TCF=118;TCR=79;TR=137;WE=32418642;WS=32418624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,143:0.71:201
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chr18	32444166	rs16966095	A	G	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=278;ReadPosRankSum=-0.964;SC=ATGTAAAACAATTTGTTAGAC;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=32444174;WS=32444156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,12:0.92:13
chr18	32455379	rs541157	T	C	3559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.685;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=59;PP=2734;ReadPosRankSum=-0.562;SC=GGCTTTATTTTTTGTTGTGGT;SOR=0.642;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=186;TCF=94;TCR=92;TR=124;WE=32455387;WS=32455369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,129:0.67:192
chr18	32558525	rs34534618	C	A	3913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.761;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=51;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.648;SC=AGAATGGCAACATTTCCCCTG;SOR=1.136;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=221;TCF=130;TCR=91;TR=138;WE=32558533;WS=32558515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,142:0.62:228
chr18	32650341	rs3744923	A	G	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=492;ReadPosRankSum=-1.784;SC=GTCATGTGGAATGTGATTTTA;SOR=0.610;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=21;WE=32650349;WS=32650331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,22:0.67:33
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chr18	32822382	rs4799374	G	T	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=0;PP=918;SC=ACACTCCTTCGCAAGCACAGA;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=32822390;WS=32822372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	32823369	rs138222337	T	C	3028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.038;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=82;PP=2538;ReadPosRankSum=-1.759;SC=ACCTTTATTATTCTAAACCAG;SOR=1.290;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=165;TCF=47;TCR=118;TR=110;WE=32823377;WS=32823359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,107:0.67:159
chr18	32823905	rs1054890	T	C	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.971;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=13;PP=610;ReadPosRankSum=-2.038;SC=GTATGTCATGTTAATTTGTTT;SOR=0.106;SbPval=0.07;Source=Platypus;TC=99;TCF=75;TCR=24;TR=33;WE=32823913;WS=32823895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,35:0.34:104
chr18	32824740	.	C	G	139	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=28;MQ=59.2;NF=0;NR=9;PP=139;QD=19.3079125052;SC=CGGTGGGGGGCGGGGGAGGAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=7;TCR=12;TR=9;WE=32824748;WS=32824730;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr18	32834095	rs2289037	T	C	2660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.268;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=63;PP=2012;ReadPosRankSum=0.270;SC=CACTGTGTTCTGTGGGGATTC;SOR=1.227;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=161;TCF=68;TCR=93;TR=99;WE=32834103;WS=32834085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,106:0.63:169
chr18	32834186	rs2249769	T	G	3008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.316;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=50;PP=2319;ReadPosRankSum=-0.740;SC=ATTTCCCTTTTGCTTCTTAGA;SOR=0.560;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=157;TCF=78;TCR=79;TR=102;WE=32834194;WS=32834176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,106:0.66:160
chr18	32836089	rs4799376	T	C	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=30;ReadPosRankSum=-0.090;SC=ATTATGAGACTAGAGAAAAAT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=3;WE=32836097;WS=32836079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr18	32838807	rs7229055	T	C	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=430;SC=GCACTCTAGCTTGGGCGACAG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=16;WE=32838815;WS=32838797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr18	32886528	rs147217916	T	TAGTC	2695.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=9;PP=2339;SC=ACAAACATTTTAGAGTTCTGA;SOR=2.876;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=52;TCF=39;TCR=13;TR=43;WE=32886536;WS=32886518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr18	32887914	rs1131709	A	G	1208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.553;NF=8;NR=36;PP=927;ReadPosRankSum=0.503;SC=CATTAAAACCACACTGGATCC;SOR=0.779;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=11;TCR=49;TR=44;WE=32887922;WS=32887904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,46:0.74:62
chr18	32887933	rs9963614	A	G	1579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=45;PP=1303;SC=CCGGATACGTATGGTGGCTCA;SOR=4.935;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=48;WE=32887941;WS=32887923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
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chr18	32917780	rs5823970	G	GA	1278.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=38;PP=1542;SC=TCTATTAAGGGAAAAGAAACC;SOR=6.043;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=38;WE=32917788;WS=32917770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr18	32948446	.	T	TTTTATTTA,TTTTATTTATTTA	1686.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.37;QD=54.41;SOR=6.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,22,9:0.71,0.29:31
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chr18	33048554	rs3088182	C	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.817;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.275;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=275;ReadPosRankSum=-1.386;SC=CAGCTTTCCACTTCATCTCCC;SOR=0.468;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=71;TCF=58;TCR=13;TR=20;WE=33048562;WS=33048544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,20:0.28:72
chr18	33058318	.	G	GA	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.172;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.36;MQRankSum=1.418;QD=2.83;ReadPosRankSum=0.470;SOR=0.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr18	33234532	rs17561903	C	T	477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=390;ReadPosRankSum=-0.754;SC=AGGGTATGAACGTGATTTCTG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=17;WE=33234540;WS=33234522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,17:0.77:22
chr18	33243536	rs3744989	A	G	473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=350;ReadPosRankSum=-1.302;SC=AAATAGAATCATGAATCAATC;SOR=1.022;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=20;WE=33243544;WS=33243526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,21:0.68:31
chr18	33269274	rs3737383	T	A	1827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.434;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=61;PP=1536;ReadPosRankSum=1.627;SC=CTTAAAAAAATTTAATCTTTT;SOR=2.624;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=99;TCF=13;TCR=86;TR=66;WE=33269282;WS=33269264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,66:0.67:99
chr18	33272291	rs201969184	AAT	A	113.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.99;ReadPosRankSum=0.302;SOR=0.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,7:0.18:38
chr18	33282985	rs9989616	A	C	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.226;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=515;ReadPosRankSum=0.364;SC=AACTCTTAAAAGGGATAATTT;SOR=0.286;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=57;TCF=16;TCR=41;TR=33;WE=33282993;WS=33282975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,33:0.58:57
chr18	33283016	rs34294638	C	CT	499.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.742;NF=2;NR=18;PP=393;ReadPosRankSum=0.142;SC=TTTACTTTGCCTTTTTTTTAT;SOR=0.456;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=20;WE=33283024;WS=33283006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,22:0.69:32
chr18	33514043	rs72889069	C	T	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;BaseQRankSum=3.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=22;ReadPosRankSum=0.507;SC=CTTGAACTCCCGGGCTCAAGT;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=4;WE=33514051;WS=33514033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
chr18	33514223	rs72889071	A	G	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=7;PP=88;ReadPosRankSum=0.924;SC=TCGTGGATCTACACTGTAGAT;SOR=0.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=8;WE=33514231;WS=33514213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr18	33554775	.	A	G	61	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=5;NR=0;PP=61;QD=19.1542425094;SC=TTAAATTTCAATATACTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=33554783;WS=33554774;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr18	33557466	rs2276314	A	G	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.637;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=10;PP=889;ReadPosRankSum=0.523;SC=TGCCACTCCTACAAGTAAACT;SOR=1.592;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=120;TCF=80;TCR=40;TR=43;WE=33557474;WS=33557456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,43:0.35:123
chr18	33573400	rs16967317	A	G	319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=218;ReadPosRankSum=1.533;SC=GTGAGTTTTCACATCAAAAGA;SOR=0.315;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=12;WE=33573408;WS=33573390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr18	33605753	rs1047866	T	G	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=205;ReadPosRankSum=0.568;SC=ATTAACACTATGTTTAAAATT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=12;WE=33605761;WS=33605743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,11:0.26:42
chr18	33613595	rs3737474	T	C	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=231;ReadPosRankSum=-1.212;SC=ATTTTAATAGTTTAAGGCAAA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=13;WE=33613603;WS=33613585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,15:0.39:38
chr18	33647254	rs1789517	A	C	6779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=155;NR=53;PP=2965;SC=TGACGATGGGACGCGAGTGTT;SOR=2.112;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=208;TCF=155;TCR=53;TR=208;WE=33647262;WS=33647244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr18	33691313	rs1540043	T	G	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=103;ReadPosRankSum=0.851;SC=TCCAGTGTTTTTGAGAGGGGG;SOR=0.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=8;WE=33691321;WS=33691303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr18	33694120	rs1050631	G	A	1945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.581;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=22;PP=1617;ReadPosRankSum=0.151;SC=ATCCAGGCCAGAGTGGCGACG;SOR=0.867;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=114;TCF=76;TCR=38;TR=69;WE=33694128;WS=33694110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,69:0.60:115
chr18	33696772	rs1789504	A	C	1174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.800;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=39;PP=1013;ReadPosRankSum=0.017;SC=CAATACTTTAAAACAGTAATT;SOR=2.349;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=59;TCF=3;TCR=56;TR=40;WE=33696780;WS=33696762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,39:0.66:59
chr18	33706614	rs1789528	C	G	8852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=137;NR=136;PP=2965;SC=GATGCTCGTGCTCTGAGTGAT;SOR=0.714;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=275;TCF=137;TCR=138;TR=273;WE=33706622;WS=33706604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,283:1.00:283
chr18	33709762	rs1632169	G	C	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=6.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=1;PP=955;ReadPosRankSum=-0.283;SC=TCAGGGGGGCGGGGCTGCCTC;SOR=0.619;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=82;TCF=79;TCR=3;TR=45;WE=33709770;WS=33709752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,51:0.59:87
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chr18	33713287	rs1785905	T	A	1488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.988;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=37;PP=1081;ReadPosRankSum=-0.612;SC=GCTGTAAGTATTAACCAGATT;SOR=0.957;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=79;TCF=30;TCR=49;TR=58;WE=33713295;WS=33713277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,59:0.73:81
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chr18	33725931	rs1785928	G	A	1541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.812;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=19;PP=1219;ReadPosRankSum=0.150;SC=ACAGCAGCCAGTGAGATTATT;SOR=0.984;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=95;TCF=63;TCR=32;TR=59;WE=33725939;WS=33725921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,58:0.60:96
chr18	33726447	rs1785927	C	G	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=392;ReadPosRankSum=1.975;SC=AGTAGAGGCACTTGAAGTTCA;SOR=1.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=18;WE=33726455;WS=33726437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr18	33744380	rs12959905	G	A	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.588;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=2;PP=1002;ReadPosRankSum=-0.385;SC=TTTTTAAAATGTTTTCTCTTC;SOR=1.949;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=71;TCF=66;TCR=5;TR=43;WE=33744388;WS=33744370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,47:0.64:74
chr18	33744677	rs684890	T	C	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=226;ReadPosRankSum=1.134;SC=ACAGTTATGTTCATTTTATCT;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=11;WE=33744685;WS=33744667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr18	33750046	rs8299	C	T	2254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.076;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=33;PP=1704;ReadPosRankSum=0.149;SC=GGGGTGAGTGCGACTCCACTG;SOR=0.876;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=138;TCF=77;TCR=61;TR=80;WE=33750054;WS=33750036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,87:0.58:149
chr18	33750222	rs12953927	A	G	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=518;ReadPosRankSum=1.612;SC=TGTAGCCCTCATGTCATTTCA;SOR=1.085;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=27;WE=33750230;WS=33750212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,28:0.53:53
chr18	33750314	rs637786	G	A	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.230;NF=0;NR=6;PP=100;ReadPosRankSum=-1.169;SC=TCACTCTGTCGCCCAGGCTGG;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=33750322;WS=33750304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr18	33767479	rs11665282	G	A	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=3;PP=278;SC=GGGCCCGGCCGGCCTGGATGG;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=33767487;WS=33767469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	33767749	rs4267398	G	A	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.550;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=549;ReadPosRankSum=0.268;SC=GGCGCATTTTGAATCGAAACT;SOR=1.272;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=28;WE=33767757;WS=33767739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,29:0.64:45
chr18	33775371	rs2298601	G	A	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=6.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.65;ReadPosRankSum=0.712;SOR=0.072;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,10:0.23:44
chr18	33775379	rs2298602	C	T	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=4.188;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.36;ReadPosRankSum=1.356;SOR=0.069;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,8:0.21:38
chr18	33778468	rs73430959	C	A	488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=385;ReadPosRankSum=0.557;SC=ACGAACATTCCCATGCAAGTC;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=19;WE=33778476;WS=33778458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,20:0.36:55
chr18	33778606	rs59942447	G	A	1567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FS=4.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.29;ReadPosRankSum=-0.931;SOR=0.462;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:148,67:0.31:215
chr18	33778606	.	GC	AA	1162	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=30;NR=31;PP=1162;QD=19.9257028666;SC=CACAAAAGAAGCGACCCTAAG;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=206;TCF=113;TCR=93;TR=61;WE=33778615;WS=33778596;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:145,61:0.30:206
chr18	33778607	rs596644	C	A	7793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=94;PP=2962;SC=ACAAAAGAAGCGACCCTAAGT;SOR=0.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=205;TCF=110;TCR=95;TR=204;WE=33778615;WS=33778596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr18	33779705	rs3744900	G	A	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.139;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=223;ReadPosRankSum=-1.227;SC=ACTGCCGGGAGCACGGCTGCT;SOR=1.230;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=53;TCF=43;TCR=10;TR=15;WE=33779713;WS=33779695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,15:0.26:57
chr18	33779821	rs646424	C	A	5545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=116;NR=46;PP=2965;SC=AGTGGGTATGCGGAACGTGAC;SOR=2.024;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=162;TCF=116;TCR=46;TR=162;WE=33779829;WS=33779811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr18	33779855	rs623053	C	T	3652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.323;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=32;PP=2864;ReadPosRankSum=-0.170;SC=GTCATATCCACCCCGGTCAGG;SOR=1.300;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=193;TCF=136;TCR=57;TR=126;WE=33779863;WS=33779845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,132:0.65:202
chr18	33779896	rs540967	A	G	7825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=157;NR=68;PP=2965;ReadPosRankSum=1.915;SC=AGAGGAACGTAGTGCTTCAGC;SOR=0.803;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=229;TCF=160;TCR=69;TR=225;WE=33779904;WS=33779886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,233:1.00:234
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chr18	33783030	rs579596	T	C	3133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.125;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=33;PP=2187;ReadPosRankSum=-0.555;SC=GCACATGGATTGTTTTGACCA;SOR=0.351;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=143;TCF=103;TCR=40;TR=109;WE=33783038;WS=33783020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,119:0.78:153
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chr18	33829077	rs568388	T	C	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=18;PP=814;SC=CCAGTTGCTGTCCATTTCTCC;SOR=1.536;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=10;TCR=18;TR=28;WE=33829085;WS=33829067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	33831044	rs518413	C	T	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=0;PP=685;SC=TATTTTGTAACCAAACTTTTT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=33831052;WS=33831034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr18	33848663	rs111317566	A	ATACAT	1814.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.089;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.442;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.867;NF=0;NR=36;PP=2143;ReadPosRankSum=-0.105;SC=AATTTTTAGCATAAAGTTTCT;SOR=2.226;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=1;TCR=57;TR=36;WE=33848671;WS=33848653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,46:0.74:62
chr18	33877687	rs188660514	T	C	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=2;PP=1169;SC=AGCCTGCGAGTCCGCGAGCCA;SOR=5.283;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=42;WE=33877695;WS=33877677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
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chr18	34205385	rs2644253	A	G	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=1;PP=457;SC=AAAAATCCCTATTAGGGCAAT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=34205393;WS=34205378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr18	34205551	rs60414347	C	T	1681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.924;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=11;PP=1313;ReadPosRankSum=-2.077;SC=GGAGGGCCAGCGTGTGTTCCA;SOR=0.333;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=93;TCF=78;TCR=15;TR=61;WE=34205559;WS=34205541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,63:0.66:95
chr18	34232610	rs2848901	C	T	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=172;ReadPosRankSum=-0.977;SC=CCTGCTGTCTCGAATGCCAGC;SOR=0.646;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=11;WE=34232618;WS=34232600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr18	34232952	rs1893433	T	C	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.509;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=233;ReadPosRankSum=-0.637;SC=ACACAGTGTGTTAACTGCACC;SOR=0.189;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=13;WE=34232960;WS=34232942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr18	34233231	rs1893434	C	T	1612.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=15;PP=1090;ReadPosRankSum=-1.759;SC=GTCTTTTTGACGCTGAAGAAT;SOR=0.695;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=201;TCF=154;TCR=47;TR=66;WE=34233239;WS=34233221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,73:0.35:209
chr18	34261475	rs141148037	C	T	1658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.836;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=40;PP=1351;ReadPosRankSum=1.144;SC=AGAGAGGCGGCGGCAGGAGAG;SOR=0.570;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=98;TCF=35;TCR=63;TR=63;WE=34261483;WS=34261465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,65:0.66:98
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chr18	34273279	rs61735993	C	G	2258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.994;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=34;PP=1875;ReadPosRankSum=0.581;SC=ACCTCGCCAGCAGCCCCAGCC;SOR=0.860;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=159;TCF=94;TCR=65;TR=85;WE=34273287;WS=34273269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,85:0.54:158
chr18	34289364	rs11661275	G	A	657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=514;ReadPosRankSum=2.024;SC=GGTAAATGAAGCCCCTTGTTT;SOR=2.910;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=23;WE=34289372;WS=34289354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,24:0.83:29
chr18	34297753	rs3809994	C	T	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.706;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=359;ReadPosRankSum=0.176;SC=GAAGTGAGGCCCCCTTGCCCC;SOR=1.409;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=47;TCR=2;TR=18;WE=34297761;WS=34297743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
chr18	34298732	rs7240383	G	C	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.643;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=372;ReadPosRankSum=-0.204;SC=GGGCTGAAGAGATTCGTTCTG;SOR=1.652;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=3;TCR=55;TR=19;WE=34298740;WS=34298722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,18:0.32:57
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chr18	34323855	rs11878091	T	C	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.14;ReadPosRankSum=-0.290;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
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chr18	34376735	rs34680547	CTG	C	697.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-0.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=605;ReadPosRankSum=0.061;SC=AACCACCACTCTGGAGCTGGT;SOR=0.818;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=15;WE=34376744;WS=34376725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr18	34380148	rs72883565	A	G	2866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=18;PP=2169;ReadPosRankSum=-0.784;SC=CCACGCTTGTAAACAATTCTT;SOR=0.716;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=149;TCF=121;TCR=28;TR=99;WE=34380156;WS=34380138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,103:0.66:155
chr18	34380417	rs11664088	C	A	897.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=28;PP=717;ReadPosRankSum=-0.442;SC=CAAATAAATTCTGTATTTGAA;SOR=1.378;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=29;WE=34380425;WS=34380407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,31:0.79:39
chr18	34398833	rs147892182	T	TAA	3997.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.543;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.118;NF=48;NR=28;PP=2962;ReadPosRankSum=1.292;SC=TGATGGGAGGTAGAGTTCATG;SOR=1.028;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=113;TCF=69;TCR=44;TR=76;WE=34398841;WS=34398823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,99:0.71:139
chr18	34398914	rs1045781	C	T	895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.245;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=659;ReadPosRankSum=-0.194;SC=TGATGGTCACCTCAGTCACAC;SOR=0.502;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=154;TCF=65;TCR=89;TR=43;WE=34398922;WS=34398904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,45:0.28:161
chr18	34408969	rs9958080	C	G	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=305;SC=CCTTCGCCCCCACCCTCTCGC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=34408977;WS=34408963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	34465512	rs137989513	T	TA	167.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.473;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.32;ReadPosRankSum=-0.564;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr18	34475737	rs72887036	A	G	1695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=17;PP=1303;ReadPosRankSum=-1.054;SC=TTAGGAGGCAATTAAGGTTAA;SOR=0.733;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=117;TCF=84;TCR=33;TR=63;WE=34475745;WS=34475727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,62:0.52:119
chr18	34539578	rs3744904	A	G	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=13;PP=384;SC=CTGTTCCTGGACCCAAAGGTA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=34539586;WS=34539568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	34647323	rs3747896	T	G	3624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=77;PP=2790;ReadPosRankSum=0.788;SC=TGCATGGTGGTGGGGCACTGC;SOR=0.707;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=163;TCF=58;TCR=105;TR=118;WE=34647331;WS=34647313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,126:0.73:173
chr18	34664093	rs323295	A	G	1705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.638;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=16;PP=1274;ReadPosRankSum=0.091;SC=TACAGGTTAAAAGCTCAGGCT;SOR=0.343;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=87;TCF=66;TCR=21;TR=59;WE=34664101;WS=34664083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,64:0.69:93
chr18	35065374	.	CG	C	52	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=6;HapScore=2;MGOF=29;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=52;QD=39.0;SC=CGAGCTCAGGCGGGGCGGCGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=35065382;WS=35065364;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr18	35065396	rs4799451	T	C	209.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=170;SC=CGCCCTGCCGTCCTCTCCCCG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=35065404;WS=35065386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	35145660	rs138975334	T	TCTCG	1090.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=19;PP=1247;SC=CGCTCCTCTCTCTCGCTCGCT;SOR=3.098;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=21;WE=35145668;WS=35145650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr18	37201910	rs2852341	G	A	1264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=4;PP=1012;SC=AGCTTTCTTTGCTCCTACAGT;SOR=4.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=40;WE=37201918;WS=37201900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr18	39535169	rs3833864	T	TC	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=149;ReadPosRankSum=0.440;SC=AACCGGAAGTTCCGTGTTGTG;SOR=0.096;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=6;WE=39535177;WS=39535159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr18	39537513	rs73454598	A	G	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=5;PP=464;ReadPosRankSum=-0.836;SC=TGTCTGAAACATTGTTGGTCT;SOR=0.788;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=117;TCF=97;TCR=20;TR=35;WE=39537521;WS=39537503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,37:0.30:123
chr18	39542407	rs33946724	GAT	G	376.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=282;ReadPosRankSum=-2.183;SC=TTAAAAGAAAGATATATATAT;SOR=0.678;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=36;TCF=30;TCR=6;TR=8;WE=39542416;WS=39542397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr18	39584264	rs3819162	C	T	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=89;ReadPosRankSum=-0.273;SC=GCCTAGTCAACTTCTCTATCC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=8;WE=39584272;WS=39584254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr18	39600755	rs8095411	A	G	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=78;ReadPosRankSum=0.366;SC=ATGATTTAAAATAAGATATGA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=4;WE=39600763;WS=39600745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr18	39623942	rs534507	A	G	1032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=30;PP=843;SC=ATGCTTTGACATAATAGTATT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=39623950;WS=39623932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr18	40323497	rs1804730	G	T	977.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.475;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=14;PP=762;ReadPosRankSum=0.158;SC=AAGAACCTTTGAGCTTCTTCC;SOR=1.027;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=117;TCF=71;TCR=46;TR=43;WE=40323505;WS=40323487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,44:0.35:126
chr18	40503735	rs199883812	GA	G,GAAA	801.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.83;MQRankSum=0.056;QD=16.36;ReadPosRankSum=1.155;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:2,35,12:0.71,0.24:49
chr18	41559268	rs7230555	T	G	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=568;ReadPosRankSum=-0.555;SC=GAAATGATGGTTAGTAACAAA;SOR=0.358;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=23;WE=41559276;WS=41559258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,23:0.77:30
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chr18	43206985	rs1484873	A	G	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=9;PP=515;SC=GGTGATGTTCATCAACAATCC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=14;TCR=9;TR=23;WE=43206993;WS=43206975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr18	43221341	rs7233416	T	C	3727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=81;PP=2924;SC=AACCAGGTTATTCTGGCTATT;SOR=2.053;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=32;TCR=81;TR=113;WE=43221349;WS=43221331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr18	43243679	rs8092227	A	G	82.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=0;PP=56;SC=GATTTTTCCCAGCTCTCTGCT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=43243687;WS=43243669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	43245986	rs7234198	T	G	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=2;PP=687;SC=GCTTCCTCAGTAGGAACAGGA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=43245994;WS=43245976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr18	43246779	rs2170973	C	T	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=406;SC=GGAGGTTAAACAGCAATTTAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=43246787;WS=43246769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
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chr18	43247784	rs9964193	C	T	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.130;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=750;ReadPosRankSum=0.466;SC=CTTCCTGCCCCGGTTCCATTT;SOR=0.139;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=33;WE=43247792;WS=43247774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,35:0.71:49
chr18	43248504	rs6507631	T	C	4034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.86;SOR=1.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
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chr18	43248578	rs9304319	C	A	1282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=38;PP=1119;SC=GTCCACTGGACTAATAACTAA;SOR=5.943;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=38;WE=43248586;WS=43248568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr18	43252786	rs1531926	A	G	1788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=13;PP=1409;SC=GGAAGGGTTCAGTGCCAAGTC;SOR=2.694;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=51;TCR=13;TR=64;WE=43252794;WS=43252776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr18	43258919	rs72437878	C	CT	386.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=4.088;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=-1.299;QD=10.18;ReadPosRankSum=1.190;SOR=1.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,27:0.71:38
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chr18	43307455	rs3861806	C	T	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=21;PP=570;SC=GTATCTTTTCCGGGCAGAGCC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=43307463;WS=43307445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr18	43310851	rs12963324	G	A	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=728;ReadPosRankSum=0.513;SC=GGTTGAGAGAGAAATATTAAA;SOR=1.708;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=16;WE=43310859;WS=43310835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr18	43314100	rs28994298	C	T	1223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.578;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=0;PP=981;ReadPosRankSum=-0.082;SC=ACGATGCTTACGTAGACTTTG;SOR=2.750;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=61;TCR=0;TR=42;WE=43314108;WS=43314090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,43:0.65:66
chr18	43314401	rs35812340	G	GA	255.06	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=223;ReadPosRankSum=1.555;SC=ATGCCTTTTTGAAAAAAAAAA;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=11;WE=43314409;WS=43314391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr18	43316538	rs2298718	A	G	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.513;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=32;PP=1093;ReadPosRankSum=0.948;SC=ATTACAATCCATTCTTTCCAG;SOR=0.474;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=181;TCF=101;TCR=80;TR=67;WE=43316546;WS=43316528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,68:0.36:188
chr18	43319060	rs473429	T	C	3171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=26;PP=2627;ReadPosRankSum=-1.054;SC=TGTAGGAGTTTGTGGGTGTCC;SOR=0.706;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=167;TCF=127;TCR=40;TR=113;WE=43319068;WS=43319050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,113:0.66:172
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chr18	43319519	rs1058396	G	A	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=612;ReadPosRankSum=-0.248;SC=CCCATTTGAGGACATCTACTT;SOR=0.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=43;TCR=78;TR=39;WE=43319527;WS=43319509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,41:0.33:126
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chr18	43446734	rs3826633	T	C	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.589;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=4;PP=678;ReadPosRankSum=-0.824;SC=AGGAACAGTCTCTGCCTTTTA;SOR=1.452;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=95;TCF=79;TCR=16;TR=35;WE=43446742;WS=43446724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,34:0.36:94
chr18	43450753	rs11334955	TA	T	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.35;ReadPosRankSum=2.504;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
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chr18	43490602	rs3744996	G	A	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.581;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=567;ReadPosRankSum=-0.662;SC=TTGCAGCATGGTGGAAGTCAG;SOR=0.322;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=59;TCF=45;TCR=14;TR=27;WE=43490610;WS=43490592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr18	43505558	rs4476262	C	G	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=266;ReadPosRankSum=0.326;SC=GAGAATTAAACAGAAAATCCT;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=14;WE=43505566;WS=43505555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,13:0.28:47
chr18	43508800	rs9965433	G	A	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=4;PP=606;ReadPosRankSum=-0.555;SC=TCCAAGATTTGAAAAAACAAA;SOR=0.533;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=85;TCR=11;TR=33;WE=43508808;WS=43508790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,35:0.34:102
chr18	43509045	rs73953914	A	G	390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=232;ReadPosRankSum=0.197;SC=CACTTATATCATTTTTTCAAG;SOR=0.425;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=13;WE=43509053;WS=43509035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr18	43523312	rs3745000	G	A	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.689;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=32;PP=663;ReadPosRankSum=-0.013;SC=AAAAATCATAGTTACTATGAA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=75;TCF=0;TCR=75;TR=32;WE=43523320;WS=43523302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,32:0.43:75
chr18	43547127	rs11301517	TG	T	4016.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=81;NR=34;PP=2974;SC=CTCGGGAGGGTGGGGGAGATC;SOR=1.915;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=129;TCF=88;TCR=41;TR=115;WE=43547135;WS=43547117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr18	43573408	.	A	C	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.016;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=176;ReadPosRankSum=-0.884;SC=GCCAGGAGTCAGGTTACATGT;SOR=0.627;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=12;WE=43573416;WS=43573404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr18	43652203	rs8085444	G	A	681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=12;PP=488;ReadPosRankSum=-0.048;SC=AGGTAGCACAGAGCGGGGAGG;SOR=0.591;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=15;TCR=18;TR=23;WE=43652211;WS=43652193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,25:0.74:34
chr18	43652345	rs3745002	A	G	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=189;ReadPosRankSum=-0.895;SC=TCCCTGCGCGAGACCTGGGCG;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=9;WE=43652353;WS=43652335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr18	43666280	rs146099416	TAGTTAATATATTAATACCTTAAGA	T	2069.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.044;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.106;NF=21;NR=4;PP=2971;ReadPosRankSum=0.934;SC=TATACAAATATAGTTAATATA;SOR=1.302;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=56;TCF=46;TCR=10;TR=25;WE=43666311;WS=43666270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,53:0.63:84
chr18	43666861	rs8095031	T	C	934.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=2;PP=801;ReadPosRankSum=0.726;SC=AAATTTTCCATAATAAAAAGT;SOR=1.659;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=34;WE=43666869;WS=43666851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,33:0.67:49
chr18	43666952	rs8097521	C	A	2456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.694;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=35;PP=1811;ReadPosRankSum=-0.364;SC=TTTAACATTTCTTTTAATCAT;SOR=0.630;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=81;TCR=51;TR=89;WE=43666960;WS=43666942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,95:0.69:137
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chr18	43702733	rs9965812	C	T	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-2.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=168;ReadPosRankSum=0.490;SC=ACTCAGGCATCCAGGCTCTGA;SOR=0.481;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=9;WE=43702741;WS=43702723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
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chr18	43833701	rs34068795	T	TCTG	3264.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=20;PP=2957;SC=TGACAAAACATCTGGCAATGC;SOR=1.641;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=46;TCR=24;TR=58;WE=43833709;WS=43833691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr18	43914438	rs8084936	A	C	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=321;ReadPosRankSum=0.143;SC=CCCCCACCCCATTTTAGGGGG;SOR=1.402;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=14;WE=43914446;WS=43914428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr18	44063718	rs143514947	AC	A	528.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.679;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=61.64;MQRankSum=1.340;NF=1;NR=16;PP=599;ReadPosRankSum=-0.435;SC=CCTGCAGGAAACAAAAGTGTG;SOR=0.249;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=17;WE=44063726;WS=44063708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr18	44114473	rs436433	T	C	2461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=59;PP=1818;SC=AGTATGGCCTTGGCAACATCC;SOR=2.038;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=22;TCR=59;TR=81;WE=44114481;WS=44114463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr18	44122010	rs10775482	T	C	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.806;NF=2;NR=35;PP=893;ReadPosRankSum=-0.960;SC=CTGGCTGATATCATTAACATG;SOR=0.616;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=3;TCR=60;TR=37;WE=44122018;WS=44122000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,37:0.59:63
chr18	44126909	rs1893566	T	C	2803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.659;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=52;PP=2284;ReadPosRankSum=1.789;SC=CCGCCTCCCCTACCCTCCTCG;SOR=0.692;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=151;TCF=74;TCR=77;TR=104;WE=44126917;WS=44126899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,102:0.69:147
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chr18	44135050	rs732109	G	A	2361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=27;PP=1749;SC=TGTTGGGCTAGCCGAGAAATG;SOR=1.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=74;WE=44135058;WS=44135040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr18	44135143	rs11665444	T	C	1602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=33;PP=1317;SC=CCCAGCCTCATGGTTCTGTGG;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=20;TCR=33;TR=53;WE=44135151;WS=44135133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
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chr18	44138902	rs4243280	C	T	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=1;PP=915;SC=GGCTTAGCACCGACCACAGCT;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=44138910;WS=44138892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr18	44143153	rs36086089	C	T	1414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.983;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=23;PP=1045;ReadPosRankSum=-0.578;SC=GCGCCACCCACATCTCCTGTC;SOR=0.775;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=69;TCF=36;TCR=33;TR=49;WE=44143161;WS=44143143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,54:0.72:75
chr18	44157489	rs328167	G	T	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=221;ReadPosRankSum=-1.098;SC=GTGGTAGGGGGTGAGAAGGGA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=12;WE=44157497;WS=44157486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr18	44157506	rs328166	G	T	338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=270;ReadPosRankSum=-0.033;SC=GGGAATGTGAGGCTCAGGTCT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=13;WE=44157514;WS=44157496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr18	44171827	rs12606558	G	A	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=385;ReadPosRankSum=0.912;SC=CAGCTCATAGGTCAGGCCCAT;SOR=0.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=19;WE=44171835;WS=44171817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,18:0.41:44
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chr18	44595809	rs2289036	A	T	3051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=43;PP=2511;SC=AAGCAGGGGGATGGAGTTGAA;SOR=0.941;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=97;TCF=54;TCR=43;TR=95;WE=44595817;WS=44595799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr18	44601611	rs3816125	A	G	5219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=71;PP=2965;SC=CTTTAAGTCTATAAGCTTGAA;SOR=0.944;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=90;TCR=72;TR=161;WE=44601619;WS=44601601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr18	44610718	rs16954999	T	C	3018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=69;NR=24;PP=2473;SC=ACATGCATTTTTGGGCTCCAG;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=69;TCR=24;TR=93;WE=44610726;WS=44610708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
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chr18	44771481	rs17723754	C	T	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=43;PP=1038;ReadPosRankSum=1.325;SC=CTATTAACTCCAAGGAGAAAC;SOR=1.646;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=0;TCR=65;TR=43;WE=44771489;WS=44771471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,44:0.68:65
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chr18	46190721	rs3816755	G	A	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=8.282;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=1;PP=886;ReadPosRankSum=0.642;SC=TCCTTTCTGCGGATCTGCTCT;SOR=0.495;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=89;TCF=87;TCR=2;TR=40;WE=46190729;WS=46190711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,40:0.44:90
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chr18	46889624	rs3840892	A	AT	751.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=3.239;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.12;MQRankSum=2.121;QD=5.45;ReadPosRankSum=1.999;SOR=0.391;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,43:0.31:138
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chr18	47088655	rs34474737	T	G	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.140;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=206;ReadPosRankSum=0.718;SC=TTCTGTTTCTTGGGAGGGGGT;SOR=0.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=8;WE=47088663;WS=47088645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr18	47088826	rs35978968	C	T	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=2.284;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.14;ReadPosRankSum=-0.260;SOR=0.995;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,31:0.55:56
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chr18	47102043	rs45451293	G	A	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=300;ReadPosRankSum=0.000;SC=AGCACTGCAGGCACTATTTAT;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=14;WE=47102051;WS=47102033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr18	47113008	rs6507931	C	T	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.998;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=2;PP=607;ReadPosRankSum=0.188;SC=CGGGGCATGGCATGAAAATTT;SOR=1.312;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=48;TCF=44;TCR=4;TR=28;WE=47113016;WS=47112998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,29:0.62:47
chr18	47313643	rs2259175	A	C	62.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
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chr18	47369863	rs112905294	A	G	1701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.859;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=52;PP=1300;ReadPosRankSum=0.473;SC=ATATTTCCCCATAGCTCATCT;SOR=0.532;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=123;TCF=24;TCR=99;TR=66;WE=47369871;WS=47369853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,69:0.54:127
chr18	47373466	rs3017176	G	A	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=3;PP=157;ReadPosRankSum=1.379;SC=AGATGGGAGCGGGGGCTGAAG;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=11;WE=47373474;WS=47373456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,11:0.27:41
chr18	47375928	rs113660613	C	A	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=192;ReadPosRankSum=1.806;SC=CTCACTCACACCCCCCTACCT;SOR=0.269;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=10;WE=47375936;WS=47375918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr18	47375932	rs488890	C	G	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.87;ReadPosRankSum=-1.807;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
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chr18	47376128	rs490697	A	G	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=17;PP=533;SC=AGTGCGGCCCATGGGCAGCCG;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=47376136;WS=47376118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr18	47401935	rs2276172	C	T	1439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=6.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=0;PP=1260;ReadPosRankSum=1.012;SC=AAGTAGGAGCCCTCTGAGACT;SOR=1.207;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=76;TCF=76;TCR=0;TR=47;WE=47401943;WS=47401925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,48:0.61:79
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chr18	47402280	rs657424	A	C	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=556;SC=GCCTCCCTCTATATCAGCCAT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=47402288;WS=47402270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr18	47404399	rs2276175	A	G	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=31;PP=756;ReadPosRankSum=-0.499;SC=TGGCTAAATAAAGCTAGCCCT;SOR=0.723;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=3;TCR=51;TR=33;WE=47404407;WS=47404389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,35:0.61:57
chr18	47405304	rs2276176	A	G	966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.842;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=5;PP=713;ReadPosRankSum=0.083;SC=CAGCAGAAGCACCCCCCTTGC;SOR=0.324;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=62;TCF=56;TCR=6;TR=42;WE=47405312;WS=47405294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,43:0.67:64
chr18	47405425	rs3841750	T	TGAG	3916.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=42;PP=2962;ReadPosRankSum=0.374;SC=TCTTTCTTCATGAGATTTTCC;SOR=0.703;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=128;TCF=56;TCR=72;TR=78;WE=47405433;WS=47405415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,93:0.62:149
chr18	47405525	rs4939602	T	C	2609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=0.903;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.34;ReadPosRankSum=-0.604;SOR=0.847;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,68:0.66:103
chr18	47405530	rs4939603	C	T	2499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.31;ReadPosRankSum=0.284;SOR=0.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,62:0.65:95
chr18	47406913	rs1217632	A	G	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.230;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=367;ReadPosRankSum=2.522;SC=AACTGGATACATGTAAATGCT;SOR=0.850;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=92;TCF=15;TCR=77;TR=24;WE=47406921;WS=47406903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,24:0.26:91
chr18	47406938	rs1217633	T	C	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-5.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.128;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=201;ReadPosRankSum=0.466;SC=TTAAGAAAATTGATTTGGTTA;SOR=0.142;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=64;TCF=2;TCR=62;TR=18;WE=47406946;WS=47406928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,18:0.28:64
chr18	47455923	rs2298628	C	T	65.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=49;ReadPosRankSum=2.484;SC=TCGTCTCCAACACCCCGCAGG;SOR=0.527;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=27;TCF=22;TCR=5;TR=6;WE=47455931;WS=47455913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr18	47455980	rs56278513	GA	G	69.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.278;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.39;MQRankSum=0.396;QD=5.36;ReadPosRankSum=0.429;SOR=0.525;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr18	47462657	rs1627232	G	A	1250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.382;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.383;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=881;ReadPosRankSum=-0.400;SC=GCTTGATGCAGCGGACATAGT;SOR=0.160;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=68;TCF=46;TCR=22;TR=41;WE=47462665;WS=47462647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,46:0.64:72
chr18	47462775	rs3744846	A	G	1039.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.883;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=31;PP=734;ReadPosRankSum=0.065;SC=GATGTGTGATAAAGAAAAACT;SOR=1.386;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=72;TCF=16;TCR=56;TR=37;WE=47462783;WS=47462765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,40:0.53:76
chr18	47462804	rs1787596	G	A	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.481;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.866;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=444;ReadPosRankSum=-0.011;SC=GGTGGCGGTAGTTATTGTTAC;SOR=1.315;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=45;TCF=4;TCR=41;TR=22;WE=47462812;WS=47462794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,27:0.54:50
chr18	47463587	rs1790797	A	G	1727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=8;PP=1397;SC=CATGCACCTCAGCCCATAGCT;SOR=3.647;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=55;TCR=8;TR=62;WE=47463595;WS=47463577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr18	47463872	rs1787519	A	G	2310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=65;PP=1895;SC=GAAAACACACATCCACGCCAA;SOR=5.255;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=4;TCR=65;TR=69;WE=47463880;WS=47463862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr18	47480660	rs1787299	G	A	4211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=51;PP=2965;SC=GGGAATACCCGAGCCAACAGA;SOR=1.273;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=79;TCR=51;TR=130;WE=47480668;WS=47480650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr18	47480898	rs1557359	T	C	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=175;ReadPosRankSum=0.580;SC=AGGCTGGCTCTGTGAAGGTTG;SOR=1.230;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=13;WE=47480906;WS=47480888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,13:0.42:31
chr18	47488625	rs17715416	A	G	547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=346;ReadPosRankSum=-1.206;SC=AATTTGCATCATCAGTTTTAC;SOR=0.786;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=81;TCR=20;TR=31;WE=47488633;WS=47488615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,32:0.30:107
chr18	47518652	rs16951370	A	G	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.046;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=17;PP=761;ReadPosRankSum=0.721;SC=AAATCCTCCCACTCACCTGGA;SOR=0.473;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=53;TCF=30;TCR=23;TR=38;WE=47518660;WS=47518642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,40:0.66:61
chr18	47563299	rs1815930	T	C	4002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=36;PP=2965;SC=CCACTGTAGGTATAGATGACA;SOR=1.934;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=92;TCR=36;TR=128;WE=47563307;WS=47563289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr18	47581748	rs16951438	A	C	1193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.972;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=19;PP=884;ReadPosRankSum=0.284;SC=ACCCTTGTGCACTGAAAGATT;SOR=0.538;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=68;TCF=40;TCR=28;TR=44;WE=47581756;WS=47581738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,45:0.65:69
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chr18	47765121	rs35839946	G	C	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.497;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=266;ReadPosRankSum=0.063;SC=TTTCAGACAAGAATTGCCAAC;SOR=1.965;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=14;WE=47765129;WS=47765111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
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chr18	47801800	rs140690	G	A	787.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=657;ReadPosRankSum=0.588;SC=GGCGACGCAGGCGGTGAGCAA;SOR=0.723;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=84;TCF=27;TCR=57;TR=32;WE=47801808;WS=47801790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,33:0.39:84
chr18	47802971	rs10775495	A	G	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.256;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=22;PP=683;ReadPosRankSum=-0.277;SC=CCAGCCTAGCATGACACTGGA;SOR=0.441;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=138;TCF=76;TCR=62;TR=45;WE=47802979;WS=47802961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,47:0.33:141
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chr18	47810351	rs7228084	A	G	1515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.577;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=38;PP=1076;ReadPosRankSum=-1.765;SC=CCTGAAGGCGAGTGCGGGCAC;SOR=0.634;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=178;TCF=65;TCR=113;TR=60;WE=47810359;WS=47810341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,66:0.35:189
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chr18	47902337	rs1970679	A	G	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=2.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.71;ReadPosRankSum=-1.697;SOR=1.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,8:0.19:42
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chr18	47908556	rs6507992	G	A	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.797;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=24;PP=791;ReadPosRankSum=0.120;SC=TAAAGAAAACGTTCCTTCCCA;SOR=1.387;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=37;WE=47908564;WS=47908546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,39:0.74:53
chr18	48190271	rs3752085	T	G	1097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-6.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=2;PP=856;ReadPosRankSum=-0.885;SC=TAGCCGAGACTTGGCCTTTCC;SOR=0.897;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=74;TCF=70;TCR=4;TR=47;WE=48190279;WS=48190261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,47:0.62:76
chr18	48190440	rs3752087	G	A	4128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.085;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=71;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.291;SC=GCTGTCGGCCGTGGACAGCCG;SOR=0.781;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=229;TCF=121;TCR=108;TR=156;WE=48190448;WS=48190430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,157:0.68:231
chr18	48241327	rs188879895	G	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=4.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.99;ReadPosRankSum=0.960;SOR=0.057;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,7:0.19:36
chr18	48255396	.	C	T	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.468;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=0;PP=1034;ReadPosRankSum=-0.432;SC=ACCTGTCCATCACCCTCCCAC;SOR=1.647;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=61;TCR=0;TR=42;WE=48255404;WS=48255386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,42:0.68:62
chr18	48331524	rs2586776	G	A	915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.214;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=680;ReadPosRankSum=1.928;SC=ATTTACTTACGTCATCTAATA;SOR=0.990;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=52;TCF=37;TCR=15;TR=33;WE=48331532;WS=48331514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,34:0.64:53
chr18	48331553	rs2849233	T	C	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.519;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=12;PP=855;ReadPosRankSum=-0.523;SC=GTCTGAAGGGTGATATCTATG;SOR=1.148;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=60;TCF=41;TCR=19;TR=41;WE=48331561;WS=48331543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,42:0.69:61
chr18	48333203	rs4940019	C	G	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.651;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=42;PP=1447;ReadPosRankSum=0.939;SC=GCTTCTGGAACCTCAGTTTCC;SOR=1.345;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=96;TCF=35;TCR=61;TR=62;WE=48333211;WS=48333193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,67:0.67:100
chr18	48335773	rs79313911	A	G	1736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.743;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=28;PP=1329;ReadPosRankSum=0.746;SC=TGGTCCATGGAACTAAAAACA;SOR=0.713;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=101;TCF=53;TCR=48;TR=62;WE=48335781;WS=48335763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,64:0.61:105
chr18	48446953	rs674210	C	T	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.035;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=336;ReadPosRankSum=1.031;SC=AAAAAAACTTCAGGGTTTTGA;SOR=0.521;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=65;TCF=25;TCR=40;TR=21;WE=48446961;WS=48446943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,21:0.31:68
chr18	48577782	rs7229678	G	C	700.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=619;ReadPosRankSum=1.700;SC=TGATACAAGAGCAGGTAACTA;SOR=0.859;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=39;TCF=8;TCR=31;TR=26;WE=48577790;WS=48577772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
chr18	48592020	rs28539779	T	C	558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.258;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=466;ReadPosRankSum=-1.841;SC=AAATTGAGCATAGTACATTGT;SOR=1.414;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=18;WE=48592028;WS=48592010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr18	48593649	rs148310488	TTTATATA	T	392.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=61.53;MQRankSum=0.787;NF=1;NR=10;PP=523;ReadPosRankSum=-0.296;SC=GGAAAAATGTTTTATATATTA;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=11;WE=48593663;WS=48593639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr18	48723137	.	C	CCCG	1209.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.151;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.971;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=1.273;NF=12;NR=16;PP=2980;ReadPosRankSum=0.819;SC=GTACAGCACCCCCGCCGCCGC;SOR=0.636;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=29;TCR=41;TR=28;WE=48723161;WS=48723127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
chr18	48723145	rs147438518	CGCCGCCGCG	C	724.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=11.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.78;MQRankSum=-1.382;QD=10.98;ReadPosRankSum=0.413;SOR=1.524;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,22:0.33:66
chr18	48723217	rs35675106	C	T	2599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=38;PP=2108;SC=GGGACCCGCCCGGGATCTGCT;SOR=0.742;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=41;TCR=38;TR=79;WE=48723225;WS=48723207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr18	48723439	rs4396619	C	T	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=36;ReadPosRankSum=0.928;SC=ACAGCTCCGCCGCCCGCCGGG;SOR=0.770;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=6;WE=48723447;WS=48723429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr18	48991891	rs7241264	G	A	1736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=24.178;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=30;PP=1480;ReadPosRankSum=-0.288;SC=GGAGGAGCCAGGCTGCAGAAA;SOR=0.514;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=108;TCF=46;TCR=62;TR=65;WE=48991899;WS=48991881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,65:0.58:113
chr18	49867224	rs9951523	T	C	3044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=47;PP=2344;SC=AGCTTCCTTGTTCAGCGCGCA;SOR=0.713;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=47;TCR=48;TR=94;WE=49867232;WS=49867214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr18	50278686	rs13381333	G	A	5698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=111;PP=2965;SC=ACCAATGTGAGGCATCTTTAG;SOR=1.142;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=183;TCF=72;TCR=111;TR=183;WE=50278694;WS=50278676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr18	50432602	rs2229080	C	G	1998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=27;PP=1581;SC=GCAGATCAGCCGACTCCAACC;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=39;TCR=27;TR=66;WE=50432610;WS=50432592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr18	50731829	rs4497763	A	G	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=29;PP=867;SC=AGACTCGCAAACTCTTGAAAC;SOR=4.863;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=50731837;WS=50731819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr18	50923932	rs7231978	G	T	1228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=36;PP=1058;SC=ATATAAAATAGTTCATCCTCT;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=50923940;WS=50923922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr18	50929098	rs10612041	CAAT	C	5386.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=29;PP=2967;SC=AAATTTCCAACAATGTTTATT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=95;TCF=65;TCR=30;TR=94;WE=50929108;WS=50929088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr18	50994505	rs79528572	G	C	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=283;SC=ATGGAAATGAGGAATGACTAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=50994513;WS=50994495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	51053218	rs113173464	T	TCACCCCAGGC	1040.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=13;PP=2983;SC=TACTGTCCATTCACCCCAGGC;SOR=2.833;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=15;WE=51053226;WS=51053208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr18	51750584	.	T	TGCC	572.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.829;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=2.422;NF=0;NR=16;PP=912;ReadPosRankSum=-0.390;SC=CCGCCACCGCTGCCGCCGCCG;SOR=2.613;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=16;WE=51750592;WS=51750574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr18	51795957	rs10584411	GCGA	G	404.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=1.833;QD=6.86;ReadPosRankSum=2.078;SOR=0.573;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,14:0.24:59
chr18	51796119	rs582474	G	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.091;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=135;ReadPosRankSum=0.444;SC=CGGCCACTGGGGCGCGACCGT;SOR=1.371;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=8;WE=51796127;WS=51796109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr18	51797620	rs3730685	C	CTA	1191.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.613;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=3;PP=1166;ReadPosRankSum=-0.328;SC=CAGGAGAAAACACGTCACTCT;SOR=1.146;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=105;TCF=88;TCR=17;TR=30;WE=51797628;WS=51797610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,34:0.29:116
chr18	51804259	rs610281	C	T	1118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.525;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=41;PP=845;ReadPosRankSum=-1.024;SC=ACCTACTAACCAAAAGTACAT;SOR=2.387;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=107;TCF=12;TCR=95;TR=43;WE=51804267;WS=51804249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,45:0.41:111
chr18	51804317	rs3730727	A	G	311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=236;ReadPosRankSum=-0.171;SC=TGAAAGATTCATGACTTTTGT;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=14;WE=51804325;WS=51804307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,14:0.34:41
chr18	51809122	rs2956141	A	T	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-2.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=108;ReadPosRankSum=1.128;SC=CTTAAAGATAAGATTGATATA;SOR=0.321;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=7;WE=51809130;WS=51809119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr18	51818417	rs3730809	ACT	A	231.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.192;NF=0;NR=8;PP=260;ReadPosRankSum=-0.000;SC=TTGTAAGTACACTCTTTTTTG;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=8;WE=51818426;WS=51818407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr18	51818448	rs34362008	CTT	C	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=76;ReadPosRankSum=-0.328;SC=TAAGTATACTCTTATGGGATT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=51818457;WS=51818438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
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chr18	51820805	rs8305	G	A	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=37;PP=705;ReadPosRankSum=0.290;SC=GTGGAAGAGAGCAGGATCAGA;SOR=0.600;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=139;TCF=15;TCR=124;TR=41;WE=51820813;WS=51820795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,43:0.31:139
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chr18	51887123	rs1657904	C	T	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=208;ReadPosRankSum=0.038;SC=TGATTTTGATCTAGGCCAAAT;SOR=0.446;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=14;WE=51887131;WS=51887113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
chr18	51888169	rs1657907	G	C	1783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FS=10.036;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.64;ReadPosRankSum=-0.167;SOR=0.959;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,51:0.28:185
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chr18	51904461	rs35286005	C	CTTTA	1255.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.117;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.093;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=0;PP=1133;ReadPosRankSum=0.653;SC=TAATAGTCAACTTTATTTATT;SOR=3.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=28;WE=51904469;WS=51904451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,29:0.69:42
chr18	51904498	rs3753057	G	A	1552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.616;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.747;NF=46;NR=1;PP=1199;ReadPosRankSum=1.241;SC=TGGCTATTCAGTTCTTAATAA;SOR=2.606;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=71;TCF=66;TCR=5;TR=47;WE=51904506;WS=51904488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,52:0.66:79
chr18	52265308	rs9947055	A	C	3447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.178;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=55;PP=2646;ReadPosRankSum=0.393;SC=TGAATCTACAACTTCAACAGC;SOR=0.571;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=187;TCF=105;TCR=82;TR=121;WE=52265316;WS=52265298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,126:0.65:194
chr18	52551716	rs3737477	C	T	593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.908;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=507;ReadPosRankSum=0.268;SC=ACTCAACTGCCTTAGGTGCTT;SOR=2.535;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=6;TCR=64;TR=23;WE=52551724;WS=52551706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,24:0.33:72
chr18	52555398	rs4343367	G	A	3721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=85;PP=2876;SC=CTGCTGTTCAGCAAATGGAGC;SOR=2.794;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=21;TCR=85;TR=106;WE=52555406;WS=52555388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr18	52571434	rs4801109	T	C	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=0;PP=761;SC=TTTGTTTGATTTTCTGAAATG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=52571442;WS=52571424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr18	52571741	rs4801110	C	T	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=30;PP=816;SC=ATACTATTCACATCAAATCTG;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=52571749;WS=52571731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr18	52575002	rs1944382	G	A	4756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=69;NR=72;PP=2965;SC=GGGTGGAAGAGGACAGAGACC;SOR=0.706;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=141;TCF=69;TCR=72;TR=141;WE=52575010;WS=52574992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr18	52585071	rs138785518	GACACACAC	G	980.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=4;PP=1552;SC=CACGTGCACAGACACACACAC;SOR=2.124;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=18;WE=52585086;WS=52585061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr18	52605188	rs1344011	C	T	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=1;PP=977;ReadPosRankSum=-0.019;SC=AAAGTCATACCTTGATTTTCA;SOR=1.649;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=60;TCF=58;TCR=2;TR=39;WE=52605196;WS=52605178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,41:0.67:61
chr18	52608329	rs8087479	C	A	2305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=48;PP=1897;SC=AGAAGGAAAACAAAACCATTT;SOR=1.426;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=26;TCR=49;TR=74;WE=52608337;WS=52608319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr18	52895418	rs6567210	G	A	3079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=45;PP=2487;ReadPosRankSum=0.195;SC=AGTTTTGAATGATCGATCTCA;SOR=0.686;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=121;TCR=73;TR=119;WE=52895426;WS=52895408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,119:0.60:198
chr18	52895531	rs8766	T	C	2166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-6.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.724;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=64;PP=1649;ReadPosRankSum=-1.908;SC=GGGGAGGCTCTGAGGACACCT;SOR=0.198;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=129;TCF=30;TCR=99;TR=88;WE=52895539;WS=52895521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,90:0.68:133
chr18	52896000	rs8087569	A	G	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.902;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.464;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr18	52896003	rs8087570	A	G	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.114;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.48;ReadPosRankSum=-0.576;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr18	52901607	rs41483647	A	G	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=247;ReadPosRankSum=0.699;SC=GGAGAAACACAATTAGCGGGC;SOR=0.752;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=16;WE=52901615;WS=52901597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,17:0.52:33
chr18	52922000	rs62092442	T	C	123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=93;ReadPosRankSum=0.090;SC=ACAAGTAAAATTTTAGTCGAC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=52922008;WS=52921990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr18	52924695	rs74849864	C	T	1347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=39;PP=995;ReadPosRankSum=-0.441;SC=TTTAAACAGTCCTTTTGGAAA;SOR=0.461;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=63;TCF=3;TCR=60;TR=42;WE=52924703;WS=52924685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,47:0.67:70
chr18	52942827	rs1788027	G	A	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=8;PP=841;SC=TGACATTCCCGTTACCGTGTA;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=32;WE=52942835;WS=52942817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	53018307	.	A	G	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.923;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.358;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=611;ReadPosRankSum=-0.074;SC=ACTGATTGTTAGTACTTAAAC;SOR=1.871;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=28;WE=53018315;WS=53018297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,27:0.75:36
chr18	53070914	rs17522826	G	A	1279.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=38;PP=1012;ReadPosRankSum=0.486;SC=CCTCACTCTGGCTATGATAAA;SOR=0.685;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=17;TCR=60;TR=49;WE=53070922;WS=53070904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,49:0.65:75
chr18	53131179	.	CTGTG	C	848	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MMLQ=27;MQ=60.17;NF=17;NR=4;PP=848;QD=40.5238095238;SC=GCCCATGCCTCTGTGTGTGTG;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=21;WE=53131190;WS=53131169;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,21:0.81:26
chr18	53131202	rs143184224	TGTGTGTGA	T	162.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.849;HP=2;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.754;NF=19;NR=6;PP=357;ReadPosRankSum=1.419;SC=TGTGTGTGTGTGTGTGTGAGA;SOR=0.061;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=25;WE=53131219;WS=53131190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr18	53131204	rs200413459	TGTGTGA	T	34.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.715;HP=2;HapScore=3;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.434;NF=19;NR=6;PP=305;ReadPosRankSum=1.769;SC=TGTGTGTGTGTGTGTGAGAGA;SOR=1.721;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=28;TCF=22;TCR=6;TR=25;WE=53131219;WS=53131190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr18	53131488	rs3760600	C	A	218.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=148;SC=AACCAGGCACCGGGCTACCAT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=53131496;WS=53131478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr18	53252388	rs599550	G	A	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=0;PP=556;SC=TGCAATAACCGTATGATTACA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=53252396;WS=53252378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	53302845	rs610362	C	T	1516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=2;PP=1207;SC=TAGAAACTACCGTTATGTTTG;SOR=5.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=41;WE=53302853;WS=53302835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr18	53303101	rs611326	C	G	2729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=71;PP=2242;SC=GGCACCTGTGCTATTTTCTCC;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=17;TCR=71;TR=88;WE=53303109;WS=53303091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr18	53332089	rs796742	C	T	417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=349;SC=GAGGCGGGAGCCGGCTCCCTC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=53332097;WS=53332079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	53696010	rs1477440	A	G	3099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=17;PP=2468;SC=GATCAGACTCACTTTGCAAAA;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=109;TCF=91;TCR=18;TR=108;WE=53696018;WS=53696000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr18	53696180	rs2551452	C	A	3085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=80;PP=2533;ReadPosRankSum=-1.429;SC=TTCTAAGAAACATGAGTAGAA;SOR=2.158;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=14;TCR=81;TR=94;WE=53696188;WS=53696170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,96:0.99:97
chr18	53696212	rs34257372	ATGAG	A	2569.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=45;PP=2449;SC=CTAAAACAATATGAGTATTTC;SOR=4.407;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=46;WE=53696223;WS=53696202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr18	53727502	rs2535724	T	C	3833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=118;PP=2965;SC=AATAAGTGTTTGTAGGTGCCC;SOR=3.695;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=17;TCR=118;TR=135;WE=53727510;WS=53727492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr18	54285411	rs676951	G	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.119;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=120;ReadPosRankSum=0.344;SC=GTATAAAAATGTTTAAAAAAT;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=7;WE=54285419;WS=54285401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr18	54293843	rs11664091	C	T	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.48;BaseQRankSum=-1.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=105;ReadPosRankSum=-0.088;SC=GACAGAGTCTCACTCTGTCGG;SOR=0.892;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=7;WE=54293851;WS=54293833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr18	54305564	rs657489	C	T	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=8.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.45;ReadPosRankSum=0.208;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,41:0.24:171
chr18	54305757	rs681176	G	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-4.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=221;ReadPosRankSum=1.453;SC=AAGGAGAGATGCTCAGGAAGG;SOR=0.804;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=16;WE=54305765;WS=54305747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,15:0.34:44
chr18	54339818	rs568078	C	G	3759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=54;PP=2630;SC=GCATCTCAGCCGTACTTTTAA;SOR=0.740;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=62;TCR=54;TR=116;WE=54339826;WS=54339808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr18	54339977	rs566956	A	G	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=28;PP=829;SC=TATAGTCCCCAAATGATGCTT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=54339985;WS=54339967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	54346482	rs683248	T	G	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=1;PP=1011;SC=GTCTTCTATTTTACTATGGCT;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=33;WE=54346490;WS=54346472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr18	54346510	rs597585	G	A	1622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=2;PP=1407;SC=CACTCAAATAGAAGGTTAATT;SOR=5.549;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=47;TCR=2;TR=49;WE=54346518;WS=54346500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr18	54346745	rs11452823	A	AT	1020.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.380;NF=3;NR=33;PP=736;ReadPosRankSum=-1.300;SC=GTAGCGAGGTATTTTTTTTTT;SOR=2.252;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=54;TCF=3;TCR=51;TR=36;WE=54346753;WS=54346735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,39:0.98:40
chr18	54346804	rs525682	T	G	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=731;SC=TAAATCTAAATGTAGATATTT;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=54346812;WS=54346794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr18	54348514	rs605067	C	T	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=11;PP=919;SC=AAAAGTCACACTCAAAGCTGA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=35;WE=54348522;WS=54348504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	54348650	rs474607	T	C	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=24;PP=824;SC=TGACTCTAAGTACAAACTATT;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=54348658;WS=54348640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	54353028	.	C	T	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.944;ClippingRankSum=0.000;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=182;ReadPosRankSum=2.221;SC=ACTTGTGTTTCAAAACCTGGT;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=9;WE=54353036;WS=54353022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr18	54353382	rs609195	A	T	1788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=52;PP=1510;SC=TTATTTTTTGATAATTTTCTT;SOR=7.978;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=0;TCR=52;TR=52;WE=54353390;WS=54353372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr18	54354074	rs1943016	C	T	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.579;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.717;NF=23;NR=11;PP=677;ReadPosRankSum=0.091;SC=TTTTACAAATCTTTCTTTTCA;SOR=0.432;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=45;TCF=30;TCR=15;TR=34;WE=54354084;WS=54354064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,36:0.82:44
chr18	54354076	rs5825199	T	TTC	1930.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=13;PP=1437;SC=TTACAAATCTTTCTTTTCAGG;SOR=1.508;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=32;WE=54354084;WS=54354064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr18	54354239	rs576095	T	C	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=15;PP=466;SC=AGCTGTATTTTTATCCTTCAA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=54354247;WS=54354229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr18	54606734	rs8093847	T	C	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=312;ReadPosRankSum=-0.039;SC=TCCAGTTATTTATTAATGTCT;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=13;WE=54606742;WS=54606724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr18	54694561	rs3833199	A	ACGGC	540.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=493;ReadPosRankSum=-1.037;SC=ATCCAGTGGCACGGCCGGGTC;SOR=0.252;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=11;WE=54694569;WS=54694551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr18	54815025	rs11151997	G	T	1268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.564;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=31;PP=930;ReadPosRankSum=-0.396;SC=GAGCCAGAAGGCCAGGACCCT;SOR=0.256;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=72;TCF=16;TCR=56;TR=42;WE=54815033;WS=54815015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,46:0.60:77
chr18	55019963	.	T	TCACA	1442.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=1;PP=758;SC=GCGCGCGCGCTCACACACACA;SOR=5.353;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=26;WE=55019971;WS=55019953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	55027212	rs1942964	T	G	1999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=12;PP=1539;SC=CCAAATGTACTTATTGTTCCA;SOR=2.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=53;TCR=12;TR=65;WE=55027220;WS=55027202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr18	55111632	rs4060160	C	A	879.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.350;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=25;PP=602;ReadPosRankSum=-0.469;SC=CAGGCAGCAGCAGCTCCTTGA;SOR=0.212;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=72;TCF=11;TCR=61;TR=31;WE=55111640;WS=55111622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,34:0.45:75
chr18	55143589	rs618953	A	G	1757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=1;PP=1497;SC=ATCTCTTTGTACAACTTTGTC;SOR=6.479;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=50;TCR=1;TR=51;WE=55143597;WS=55143579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr18	55143766	rs3745074	C	T	3642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.322;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=59;PP=2962;ReadPosRankSum=0.139;SC=GAACACTCTTCGCCATCTTCA;SOR=0.682;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=195;TCF=101;TCR=94;TR=130;WE=55143774;WS=55143756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,131:0.66:198
chr18	55218656	rs57800921	CT	C	224.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.49;ReadPosRankSum=-0.469;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr18	55221648	rs536560	T	C	2368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=76;PP=1910;SC=ACCAGGGCATTGGACCAACCT;SOR=5.549;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=79;TCF=3;TCR=76;TR=79;WE=55221656;WS=55221638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
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chr18	55226254	rs1736440	T	C	1892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=1;PP=1706;SC=AGTCTGAGATTTGAGAATTCA;SOR=6.630;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=52;TCF=51;TCR=1;TR=52;WE=55226262;WS=55226244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr18	55226383	rs536765	G	C	7382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=137;NR=95;PP=2965;SC=TTACAGACATGGGCAGTGAGT;SOR=1.136;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=232;TCF=137;TCR=95;TR=232;WE=55226391;WS=55226373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr18	55240455	rs577152	T	C	4390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=105;NR=31;PP=2965;SC=AGGTTATAATTGAGGTGTTTA;SOR=2.426;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=105;TCR=31;TR=136;WE=55240463;WS=55240445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
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chr18	55253710	rs317815	G	A	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=232;ReadPosRankSum=0.167;SC=GCGAGGGCCCGGGCGCCAGCT;SOR=0.941;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=12;WE=55253718;WS=55253700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr18	55268866	rs2070109	C	T	837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.946;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=8;PP=692;ReadPosRankSum=0.961;SC=CTTTCCTCCACGCTTCTGGAG;SOR=1.085;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=113;TCF=81;TCR=32;TR=36;WE=55268874;WS=55268856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,36:0.33:109
chr18	55272968	rs4940931	C	T	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.859;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=5;PP=741;ReadPosRankSum=-2.039;SC=AGAAGCAGGTCCTGCTGTTAC;SOR=1.863;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=31;WE=55272976;WS=55272958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,32:0.71:45
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chr18	55283236	rs9319918	T	C	1830.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=55;PP=1444;ReadPosRankSum=-1.124;SC=AAAAGACAGTTCTTGAACATT;SOR=0.919;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=9;TCR=82;TR=61;WE=55283244;WS=55283226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,63:0.68:92
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chr18	55287739	rs388644	A	C	762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=597;SC=GCAAGTCACAAGAAAATTGAC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=55287747;WS=55287729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr18	55288007	rs389031	G	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.776;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=101;ReadPosRankSum=1.132;SC=AGGTCCATAAGTAATTAATAT;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=55288015;WS=55287997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr18	55288879	rs368935	A	G	2894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=13;PP=2282;SC=CCGAAACCCGACTGGAGCAGA;SOR=3.417;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=70;TCR=13;TR=83;WE=55288887;WS=55288869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr18	55289076	rs2032938	C	T	1676.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.006;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=50;PP=1357;ReadPosRankSum=0.155;SC=TCTGAGGGCGCCTGCGAGAAT;SOR=0.499;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=99;TCF=20;TCR=79;TR=64;WE=55289084;WS=55289066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,63:0.65:97
chr18	55289180	rs2032937	A	G	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=291;ReadPosRankSum=0.694;SC=TTCCGGATCCAGAGACGCCCC;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=15;WE=55289188;WS=55289170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,15:0.79:19
chr18	55315959	rs12958967	G	A	154.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.81;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	55317591	rs34027711	C	A	2272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.081;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=33;PP=1731;ReadPosRankSum=0.376;SC=GGACTATATTCTTTATACCTT;SOR=0.292;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=140;TCF=92;TCR=48;TR=84;WE=55317599;WS=55317581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,87:0.60:145
chr18	55317676	rs222581	C	T	5531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=93;PP=2965;SC=ACAGCAACAGCCAGGATGATA;SOR=0.914;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=168;TCF=75;TCR=93;TR=168;WE=55317684;WS=55317666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr18	55317837	rs11152025	G	A	1144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=32;PP=959;SC=CACTTTGAGAGGCCAAGGTGG;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=34;WE=55317845;WS=55317827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	55322367	rs17753176	A	T	2556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=0;PP=2300;SC=TCAGAACTAGATTTTTATTCA;SOR=8.714;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=79;TCF=79;TCR=0;TR=79;WE=55322375;WS=55322357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr18	55335412	rs317845	A	G	1196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.057;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=904;ReadPosRankSum=0.684;SC=AGATAAGACCAATTATAATCA;SOR=1.038;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=41;WE=55335420;WS=55335402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,45:0.63:71
chr18	55335495	rs317844	A	G	2949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=28;PP=2428;SC=GATGCAGAAGAATGTGCTGGA;SOR=1.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=59;TCR=28;TR=87;WE=55335503;WS=55335485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr18	55335803	.	G	A	90.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.384;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=39.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.04;ReadPosRankSum=-2.586;SOR=3.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr18	55335804	rs202206427	G	A	90.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-3.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=39.329;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.04;ReadPosRankSum=-3.169;SOR=3.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr18	55338627	.	C	T	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-2.756;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=207;ReadPosRankSum=0.550;SC=ATACAGCTTTCATGCAAACTT;SOR=0.097;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=57;TCR=0;TR=15;WE=55338635;WS=55338617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,14:0.23:60
chr18	55338656	rs317838	G	A	3405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=90;NR=4;PP=2699;SC=GCATCAGAGAGTAAGTTCAGA;SOR=5.570;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=90;TCR=4;TR=94;WE=55338664;WS=55338646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr18	55352389	rs11659313	T	C	984.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=37;PP=640;ReadPosRankSum=-1.897;SC=TCTACACCTATGTCCAGAGGC;SOR=0.660;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=174;TCF=51;TCR=123;TR=53;WE=55352397;WS=55352379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,55:0.31:180
chr18	55352436	rs319459	G	A	3330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=88;PP=2649;SC=AGTGATGGTGGTAAGACCATA;SOR=3.767;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=13;TCR=88;TR=101;WE=55352444;WS=55352426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr18	55352470	rs143958246	TTTA	T	1267.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.471;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.780;NF=1;NR=26;PP=1108;ReadPosRankSum=2.387;SC=GGCTAAAATATTTATTATCTG;SOR=0.095;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=50;TCF=1;TCR=49;TR=27;WE=55352480;WS=55352460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,33:0.65:51
chr18	55359314	rs11873034	A	G	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=103;ReadPosRankSum=2.411;SC=ACCTTACTCAATACTTCATAT;SOR=0.092;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=8;WE=55359322;WS=55359304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,8:0.22:36
chr18	55362532	rs319443	T	G	2876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=61;PP=2476;SC=TTATCTAGTCTGTTATTGGGT;SOR=1.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=26;TCR=61;TR=87;WE=55362540;WS=55362522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr18	55362816	rs319442	G	A	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=22;PP=602;SC=TGAGTTCAAAGTGGAAGTTAA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=55362824;WS=55362806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr18	55364830	rs319439	G	A	715.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.920;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=538;ReadPosRankSum=0.348;SC=TTTAAATCAGGCCCATCGAGA;SOR=0.194;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=25;WE=55364838;WS=55364820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr18	55364852	rs319438	A	G	1472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=6;PP=1094;SC=ACACTTACCCATCCAGTTCTG;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=46;TCR=6;TR=52;WE=55364860;WS=55364842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr18	55397512	rs319432	T	G	1587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=0;PP=1332;SC=TAGAAAGCCTTCAAGGGCAGA;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=43;WE=55397520;WS=55397502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr18	55397624	rs33964473	GATA	G	7054.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=57;PP=2973;SC=AGAACACTATGATAATGATTT;SOR=1.334;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=138;TCF=78;TCR=60;TR=133;WE=55397634;WS=55397614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr18	55397674	rs319433	G	C	5389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=79;PP=2965;SC=TAGAATTTTAGGGAACACCAT;SOR=0.909;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=96;TCR=79;TR=175;WE=55397682;WS=55397664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr18	55397871	rs319434	T	C	7978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=251;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=105;NR=139;PP=2965;SC=TTCTACTGCCTTCAGTGATGT;SOR=1.001;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=245;TCF=106;TCR=139;TR=244;WE=55397879;WS=55397861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,250:1.00:250
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chr18	56037849	rs2075405	A	G	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=194;ReadPosRankSum=-0.048;SC=TGAAAAGTTCATTGATCTAAT;SOR=0.200;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=13;WE=56037857;WS=56037839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,15:0.31:48
chr18	56040649	rs1943994	T	C	2975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=82;PP=2563;SC=GCAGCACCTTTTTGTCATGCC;SOR=7.500;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=83;TCF=1;TCR=82;TR=83;WE=56040657;WS=56040639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr18	56054616	rs5825274	AT	A	681.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=1.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.73;MQRankSum=1.498;QD=12.86;ReadPosRankSum=0.686;SOR=0.452;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,35:0.66:53
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chr18	56057899	.	G	A	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.715;ClippingRankSum=0.000;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.954;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=465;ReadPosRankSum=-0.394;SC=CATGGACGCCGAAAAGCGTAT;SOR=0.523;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=67;TCF=43;TCR=24;TR=28;WE=56057907;WS=56057889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,31:0.45:69
chr18	56118493	rs17669	C	T	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=-2.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.690;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=201;ReadPosRankSum=-2.003;SC=TAAAGTCTGGCTCTTTTGCAC;SOR=0.041;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=10;WE=56118501;WS=56118483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,11:0.52:21
chr18	56149048	rs3744867	A	G	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=160;ReadPosRankSum=0.281;SC=TAGGTTACCCAGGGACGTTAG;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=53;TCR=2;TR=15;WE=56149056;WS=56149038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,15:0.26:58
chr18	56149099	rs7240666	T	C	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=13;PP=937;ReadPosRankSum=-1.569;SC=GCCTTCTTTATTGTCATAGAG;SOR=0.671;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=143;TCF=105;TCR=38;TR=49;WE=56149107;WS=56149089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,49:0.33:147
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chr18	56182174	rs7505023	T	C	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=0;PP=978;SC=TCGTCCCTCCTAGTCCCCAAC;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=56182182;WS=56182164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	56182507	rs4940399	C	G	891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=25;PP=727;SC=TCTGAGACGTCAAGGAACTGT;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=56182515;WS=56182497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr18	56191351	rs7228617	C	T	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=300;SC=TGCATTTTTTCCTAATATACT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=56191359;WS=56191341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	56196451	rs7236563	C	T	1161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=870;ReadPosRankSum=0.272;SC=CAGCTTGGATCTTTTTCAGTA;SOR=0.660;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=63;TCF=20;TCR=43;TR=39;WE=56196459;WS=56196441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,42:0.63:67
chr18	56196492	rs10451415	G	A	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.477;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=15;PP=304;ReadPosRankSum=1.262;SC=ATATTTGAAGGTCAGTGTAAC;SOR=0.380;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=53;TCF=9;TCR=44;TR=19;WE=56196500;WS=56196482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr18	56201945	rs13381117	G	A	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=151;ReadPosRankSum=-1.397;SC=CACAACCATAGCATCAATGCC;SOR=0.746;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=9;WE=56201953;WS=56201943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr18	56202059	rs10469211	A	G	4982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=106;NR=39;PP=2965;SC=CAGCAACAGAACCTCACCTCT;SOR=2.140;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=145;TCF=106;TCR=39;TR=145;WE=56202067;WS=56202049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr18	56202418	rs10469212	T	C	5944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=76;PP=2965;SC=CCTGCAGTAATTTAGGGGCTT;SOR=0.982;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=102;TCR=76;TR=177;WE=56202426;WS=56202408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr18	56202768	rs3809983	C	A	3793.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.603;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=46;PP=2962;ReadPosRankSum=0.757;SC=CCAAGAGAAGCGTGAGTCATT;SOR=0.611;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=188;TCF=123;TCR=65;TR=129;WE=56202776;WS=56202758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,132:0.69:192
chr18	56202982	rs3826594	A	T	2763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.504;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=59;PP=2251;ReadPosRankSum=0.618;SC=GAATTTGTTCAGCCTCCTGCT;SOR=0.897;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=134;TCF=50;TCR=84;TR=91;WE=56202990;WS=56202972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,96:0.69:139
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chr18	56203120	rs3809981	C	T	1698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.387;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=28;PP=1233;ReadPosRankSum=0.252;SC=TTGATTGACCCCCTTCTCTGG;SOR=0.392;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=88;TCF=50;TCR=38;TR=55;WE=56203128;WS=56203110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,61:0.63:97
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chr18	56203447	rs3809979	A	G	2350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.321;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=45;PP=1776;ReadPosRankSum=-0.762;SC=GACTTCTCCAATGTACACTGA;SOR=0.826;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=142;TCF=67;TCR=75;TR=84;WE=56203455;WS=56203437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,88:0.60:147
chr18	56203891	rs3809978	G	T	3380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.83;ReadPosRankSum=-0.969;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,84:0.67:126
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chr18	56204250	rs3809976	A	C	4904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.476;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=79;PP=2962;ReadPosRankSum=0.143;SC=ATATGATCCAACTGCACTTGG;SOR=0.633;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=259;TCF=145;TCR=114;TR=172;WE=56204258;WS=56204240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,183:0.68:271
chr18	56204387	rs67925233	ACAGTTGATGTGTCCT	A	4972.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.745;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.848;NF=28;NR=43;PP=2930;ReadPosRankSum=-0.440;SC=GGCAATGGTAACAGTTGATGT;SOR=1.038;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=176;TCF=79;TCR=97;TR=71;WE=56204418;WS=56204377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,124:0.54:228
chr18	56204410	rs55910046	C	T	5259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.119;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.697;NF=48;NR=61;PP=2962;ReadPosRankSum=0.647;SC=CCTCAGTCTCCCTGGTCGCTT;SOR=0.887;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=201;TCF=100;TCR=101;TR=109;WE=56204418;WS=56204377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,133:0.59:227
chr18	56204671	rs4940404	A	T	1837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.710;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=29;PP=1491;ReadPosRankSum=0.881;SC=GGTAGGTGGAATTCTCCACCT;SOR=0.949;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=96;TCF=52;TCR=44;TR=66;WE=56204679;WS=56204661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,68:0.67:102
chr18	56204747	rs3826593	G	A	2396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.383;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=38;PP=1731;ReadPosRankSum=-0.502;SC=GAAAGTACTGGTAAAAAGAGG;SOR=0.565;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=129;TCF=75;TCR=54;TR=84;WE=56204755;WS=56204737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,91:0.64:143
chr18	56204932	rs3809973	T	G	4195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.558;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=57;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.900;SC=GAGGCGAATATTTATCAACTG;SOR=0.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=254;TCF=157;TCR=97;TR=151;WE=56204953;WS=56204922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,157:0.60:263
chr18	56204945	rs3809972	C	G	4443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.452;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=68;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.820;SC=ATCAACTGGTCTCCCAACAAG;SOR=0.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=267;TCF=153;TCR=114;TR=161;WE=56204953;WS=56204922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,166:0.60:276
chr18	56204977	rs3809971	C	T	4729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=88;PP=2962;ReadPosRankSum=2.069;SC=TATCAAAACACGTTCCTTGGT;SOR=0.685;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=303;TCF=154;TCR=149;TR=176;WE=56204999;WS=56204967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,180:0.58:310
chr18	56204991	rs3809970	C	T	5208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.431;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=95;PP=2962;ReadPosRankSum=0.916;SC=CCTTGGTCACCAGCCTCAAAA;SOR=0.626;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=315;TCF=157;TCR=158;TR=191;WE=56204999;WS=56204967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,195:0.60:324
chr18	56205262	rs12103986	A	C	4940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=6.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.853;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=104;PP=2962;ReadPosRankSum=0.884;SC=GTTTTTCTTCATGCTGTGGAC;SOR=1.213;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=237;TCF=89;TCR=148;TR=159;WE=56205270;WS=56205252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,171:0.67:256
chr18	56205481	rs9962203	G	A	1498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.431;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=47;PP=1255;ReadPosRankSum=-1.212;SC=AGTGATATTAGTAGAATTGTT;SOR=0.396;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=74;TCF=12;TCR=62;TR=57;WE=56205489;WS=56205471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,55:0.74:74
chr18	56205551	rs9962964	C	T	641.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=553;ReadPosRankSum=0.000;SC=CCTCAATGACCGTAATAATGG;SOR=2.753;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=23;WE=56205559;WS=56205541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,22:0.81:27
chr18	56245965	.	G	GACACACACACAC	448.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQRankSum=-1.068;QD=64.10;ReadPosRankSum=-1.204;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr18	56246442	rs12606191	T	C	1966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.344;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=35;PP=1546;ReadPosRankSum=0.596;SC=ATAAGTCCTTTCCCCCCACTC;SOR=0.865;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=232;TCF=125;TCR=107;TR=81;WE=56246450;WS=56246432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,82:0.36:230
chr18	56247180	rs9958735	T	C	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.080;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=26;PP=870;ReadPosRankSum=-0.297;SC=TTGCCTCAGATAGCGGGAGGC;SOR=0.667;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=175;TCF=77;TCR=98;TR=54;WE=56247188;WS=56247170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,54:0.30:180
chr18	56247567	rs9956630	A	G	1165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.30;ReadPosRankSum=0.172;SOR=0.654;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,53:0.29:185
chr18	56247600	rs9944810	C	A	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.480;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=30;PP=914;ReadPosRankSum=0.553;SC=TCTGATTTGCCCTTTCTTCTT;SOR=0.597;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=201;TCF=108;TCR=93;TR=60;WE=56247608;WS=56247590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,62:0.30:208
chr18	56274514	rs6566986	A	G	6355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=146;NR=35;PP=2965;SC=ACAGAATATAAGGATATTAGT;SOR=2.797;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=182;TCF=147;TCR=35;TR=181;WE=56274522;WS=56274504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr18	56279025	rs6566987	T	G	1780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=49;PP=1573;SC=TTCGGAGTCTTTCATCCTTTC;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=10;TCR=49;TR=59;WE=56279033;WS=56279015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr18	56412784	rs58993112	C	T	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=0;PP=775;SC=CCAAAATTCACGAGAGGCCAG;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=27;WE=56412792;WS=56412774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr18	56587437	rs146289063	G	A	3702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.495;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.109;NF=65;NR=73;PP=2828;ReadPosRankSum=0.441;SC=CAGACGGAGCGTGCGCATCGA;SOR=0.745;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=225;TCF=106;TCR=119;TR=138;WE=56587445;WS=56587427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,142:0.62:230
chr18	56646583	rs35743757	A	AAAAT	660.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=832;SC=GAAAATAAAAAAAAAAGGAGC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=16;WE=56646591;WS=56646573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	56648756	rs61733373	C	T	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.210;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=277;ReadPosRankSum=1.322;SC=TGGAGAAGCACGTCCAGCTGA;SOR=0.693;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=15;WE=56648764;WS=56648746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
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chr18	56711284	rs11152116	C	T	2255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=4;PP=1811;SC=GTAATTCCTGCGACAATTCTT;SOR=5.166;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=62;TCR=4;TR=65;WE=56711292;WS=56711274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
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chr18	56807339	rs3744891	T	G	572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.727;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.433;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=16;PP=399;ReadPosRankSum=-0.813;SC=GGCTTCCCAGTCAGGGCTCCG;SOR=0.086;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=21;WE=56807347;WS=56807329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr18	56819930	rs3760555	T	C	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.773;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=37;PP=1015;ReadPosRankSum=-0.439;SC=AAAGAGGCTTTATTTCCTTTT;SOR=0.271;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=62;TCF=7;TCR=55;TR=43;WE=56819938;WS=56819920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,46:0.69:67
chr18	56887507	rs1062557	C	A	749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=1;PP=631;SC=CATGCGCGGCCGTGAGCTCCC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=56887515;WS=56887497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr18	56936395	rs7226481	T	C	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=521;ReadPosRankSum=-0.537;SC=GCGCGAGAGGTTGCAGGCCGG;SOR=0.743;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=23;WE=56936403;WS=56936385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,25:0.69:36
chr18	56940307	rs2271733	G	T	2801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.794;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.669;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=39;PP=2149;ReadPosRankSum=0.313;SC=GGATCCCGTCGTCCTTGGTAA;SOR=0.606;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=146;TCF=91;TCR=55;TR=102;WE=56940315;WS=56940297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,106:0.69:153
chr18	56963767	rs17769193	C	G	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=39;ReadPosRankSum=-0.850;SC=GCTAAATGCTCTGCCAGGAAT;SOR=0.078;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=5;WE=56963775;WS=56963757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr18	56963852	rs17696504	T	G	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.484;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=4;PP=519;ReadPosRankSum=1.238;SC=CATTAAAACATGTACTGCTTG;SOR=1.169;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=84;TCF=70;TCR=14;TR=27;WE=56963860;WS=56963842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,28:0.32:87
chr18	56979805	rs372826450	AAT	A	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.48;ReadPosRankSum=-0.709;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chr18	56985729	rs12955045	G	A	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=270;ReadPosRankSum=0.617;SC=CCAAAATTCAGACAAAAGCTG;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=15;WE=56985737;WS=56985719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr18	56998901	rs12959578	C	T	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=392;ReadPosRankSum=0.113;SC=CCCAGAAAACCTTCTATCCCC;SOR=0.557;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=18;WE=56998909;WS=56998891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,18:0.46:39
chr18	57000274	rs7238054	T	C	184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-4.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.563;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=124;ReadPosRankSum=-1.246;SC=GTATGAGTTCTTCCTTTCCTA;SOR=0.034;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=10;WE=57000282;WS=57000264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,10:0.28:36
chr18	57000303	rs2298712	G	A	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=2;PP=893;ReadPosRankSum=0.109;SC=AATTATAAAAGGAAAAGGAAA;SOR=1.096;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=54;TCF=51;TCR=3;TR=37;WE=57000311;WS=57000293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,37:0.69:54
chr18	57000518	rs10714229	GT	G	240.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.47;ReadPosRankSum=-0.507;SOR=1.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr18	57005739	rs35746038	T	A	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=191;ReadPosRankSum=0.445;SC=GTCACAAATTTAGGATAAAAA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=11;WE=57005747;WS=57005729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,11:0.35:31
chr18	57014704	rs10632432	A	AAACC	142.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.46;ReadPosRankSum=-0.024;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,6:0.19:32
chr18	57014812	.	T	TA	168.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.494;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=1.461;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.12;ReadPosRankSum=-1.587;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
chr18	57022754	rs1127220	T	C	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.117;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=1076;ReadPosRankSum=0.316;SC=CAGCTCCAATTCGACCTCTTC;SOR=0.518;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=154;TCF=65;TCR=89;TR=53;WE=57022762;WS=57022744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,54:0.34:160
chr18	57026573	rs140141851	A	AC	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.33;MQRankSum=2.147;QD=1.61;ReadPosRankSum=-0.326;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,5:0.19:26
chr18	57115133	rs3809990	T	C	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.767;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=166;ReadPosRankSum=-0.088;SC=CTGGAGAACATTGTCCAGGCC;SOR=2.891;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=9;WE=57115141;WS=57115131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr18	57115203	rs1893788	T	C	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.784;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=3;PP=669;ReadPosRankSum=0.722;SC=CTGTGCCCTCTTCCACACTCA;SOR=2.584;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=29;WE=57115211;WS=57115193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,30:0.65:46
chr18	57115532	rs75346177	G	A	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.060;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=114;ReadPosRankSum=-1.180;SC=TAACTTGTATGACATTACTCA;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=57115540;WS=57115522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr18	57133862	rs8083041	T	A	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.85;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr18	57134152	rs4940876	A	G	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=11;PP=337;SC=AGAGAATACTAAGTTTCTGAG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=57134160;WS=57134142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	57136825	.	C	G	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.912;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=10;PP=246;ReadPosRankSum=-0.339;SC=GGAGCCTCGGCACAAACGTCG;SOR=0.328;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=16;WE=57136833;WS=57136815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,17:0.38:45
chr18	57136869	rs632899	A	G	902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=736;SC=GCTCACATCAACTACAGGAGG;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=57136877;WS=57136859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	57136902	rs663452	C	A	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=408;SC=CTGGCCCTGGCCTGGAAAGGA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=57136910;WS=57136892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	57136943	rs650033	G	A	167.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=132;SC=TCAAGGGCACGTGTGAAGTGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=57136951;WS=57136933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr18	57364089	rs3114280	G	C	55.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=3;PP=34;SC=GCGTACGCGGGGCAGACTCCG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=57364097;WS=57364079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr18	57567436	.	C	T	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.294;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.042;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=328;ReadPosRankSum=-0.680;SC=CGCGCAAGAACGCTCAACCGA;SOR=0.951;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=58;TCF=26;TCR=32;TR=22;WE=57567444;WS=57567426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr18	57567699	rs78800940	G	A	1545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.766;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=38;PP=1355;ReadPosRankSum=0.784;SC=GACCAAGCCGGATTTGCGATT;SOR=0.925;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=33;TCR=62;TR=58;WE=57567707;WS=57567689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,55:0.59:93
chr18	57638330	rs10871774	G	A	3372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=37;PP=2822;SC=TTTCTGCGCAGAACTGTCGTA;SOR=1.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=57;TCR=37;TR=94;WE=57638338;WS=57638320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr18	59157764	rs680530	T	C	5017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=114;NR=39;PP=2965;SC=TTCTCCTTCATTTTCTGAAAA;SOR=2.303;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=114;TCR=39;TR=153;WE=59157772;WS=59157754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr18	59158065	rs681902	T	G	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=26;PP=719;SC=GACCCGGGTATTGGATATTGA;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=59158073;WS=59158055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	59166541	rs12964819	C	T	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=4.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.04;ReadPosRankSum=0.162;SOR=0.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:60,15:0.20:75
chr18	59166762	.	T	TAC	67	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=67;QD=38.5;SC=CCTATATATATACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=2;WE=59166770;WS=59166752;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,2:0.20:10
chr18	59170304	rs595093	C	G	2063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=33;PP=1649;SC=CCACAACAGTCAACATCACCC;SOR=0.822;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=62;WE=59170312;WS=59170294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr18	59174817	rs1547956	C	A	1316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=38;PP=1050;SC=TTTTTCTAAACCACTTTCATG;SOR=4.615;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=41;WE=59174825;WS=59174807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr18	59203707	rs62097360	G	A	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.989;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=10;PP=514;ReadPosRankSum=-0.133;SC=AATGATGTACGTAATCCATGT;SOR=0.289;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=98;TCF=75;TCR=23;TR=32;WE=59203715;WS=59203697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,34:0.34:101
chr18	59206197	rs5825446	C	CT	2320.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=3;PP=1833;SC=AACCATTACTCTTTTTTTTCT;SOR=5.969;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=82;TCF=73;TCR=9;TR=73;WE=59206205;WS=59206187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr18	59206480	rs11875000	C	T	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=6.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=36;PP=961;ReadPosRankSum=-1.751;SC=ACTCCAGAAACGAACAGTTCA;SOR=1.044;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=61;TCF=5;TCR=56;TR=39;WE=59206488;WS=59206470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,40:0.65:62
chr18	59483514	rs9319985	A	G	3796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.693;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.546;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=73;PP=2931;ReadPosRankSum=-0.736;SC=AGAAGCCGGGAGGCAGCTTGG;SOR=0.614;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=204;TCF=88;TCR=116;TR=133;WE=59483522;WS=59483504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,138:0.67:207
chr18	59739962	rs112622481	T	TA	154.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=3.398;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.777;QD=3.44;ReadPosRankSum=0.508;SOR=0.243;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr18	59751715	rs1560502	T	C	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.144;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=3;PP=315;ReadPosRankSum=-1.288;SC=GACTTTATAATCTTAATCAAT;SOR=0.036;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=17;WE=59751723;WS=59751705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr18	59777011	rs2163518	T	C	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=3;PP=387;ReadPosRankSum=0.948;SC=GCATTTTAAATACAGATTTAA;SOR=0.442;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=91;TCF=82;TCR=9;TR=26;WE=59777019;WS=59777001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,28:0.30:94
chr18	59805532	rs9959632	T	C	1904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=50;PP=1685;SC=TCATTTTCACTTGGGAACCAA;SOR=3.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=8;TCR=50;TR=58;WE=59805540;WS=59805522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr18	59806190	rs2298779	C	T	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.402;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=95;ReadPosRankSum=-0.536;SC=CATTTTTGTGCGTGCCTTTTT;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=6;WE=59806198;WS=59806180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,6:0.46:13
chr18	59807635	rs12608212	T	C	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=206;ReadPosRankSum=0.422;SC=GAGTTGATAATAAAATTTTAT;SOR=0.495;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=12;WE=59807643;WS=59807625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr18	59814268	rs9320000	G	A	444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=2.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.94;ReadPosRankSum=-1.567;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,22:0.24:90
chr18	59821949	rs11659731	G	A	91.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=116;ReadPosRankSum=-0.399;SC=TAAAATATGAGCTAGTCATTC;SOR=0.193;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=5;WE=59821957;WS=59821939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,5:0.29:17
chr18	59824209	rs1021952	A	T	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=262;ReadPosRankSum=-0.512;SC=GGAAAAAAAAATACTGTAATT;SOR=0.266;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=15;WE=59824217;WS=59824199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,15:0.35:43
chr18	59824490	rs1021953	A	T	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.297;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=31;PP=622;ReadPosRankSum=-1.198;SC=AGTAATAGTTATATACACATG;SOR=0.271;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=106;TCF=8;TCR=98;TR=35;WE=59824498;WS=59824480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,36:0.32:111
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chr18	59947118	rs2980981	G	A	1432.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=32;PP=1094;ReadPosRankSum=1.043;SC=TTTTATATTCGGCATCCCTTT;SOR=0.710;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=180;TCF=84;TCR=96;TR=59;WE=59947126;WS=59947108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,61:0.33:186
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chr18	60225865	rs72941651	G	C	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=141;ReadPosRankSum=-0.156;SC=TATTATATTTGTTTTCTTTAT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=60225873;WS=60225855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr18	60227939	rs146609669	TAATTA	T	436.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=537;ReadPosRankSum=1.024;SC=ATGTAACATTTAATTAAATTT;SOR=0.260;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=12;WE=60227951;WS=60227929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr18	60230191	rs17668713	G	T	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.24;ReadPosRankSum=1.479;SOR=0.238;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,6:0.18:33
chr18	60231851	rs12956093	A	G	642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=473;ReadPosRankSum=-0.112;SC=AGAAGAAAGGAAAGCCACAAA;SOR=0.646;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=29;TCR=36;TR=26;WE=60231859;WS=60231841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,28:0.40:70
chr18	60232383	rs57164502	ATACT	A	563.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.456;NF=0;NR=13;PP=525;ReadPosRankSum=0.677;SC=ATTCAGCATGATACTTACTGT;SOR=0.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=4;TCR=46;TR=13;WE=60232394;WS=60232373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,17:0.33:51
chr18	60232405	rs4940561	C	T	1493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=40;PP=1232;SC=TTAATAGATACTGAGCTGTTG;SOR=3.564;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=46;WE=60232413;WS=60232395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
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chr18	60491364	rs34639796	CA	C	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=2.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.65;MQRankSum=1.525;QD=2.16;ReadPosRankSum=0.750;SOR=1.688;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
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chr18	60630531	rs547690	T	C	447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=3;PP=335;ReadPosRankSum=-1.431;SC=TTTTATTTCTTGGATAAAGGT;SOR=0.455;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=19;WE=60630539;WS=60630521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,19:0.38:50
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chr18	61034420	rs402348	T	G	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=216;ReadPosRankSum=-0.855;SC=AGGGCTGGGCTGCGGCGAGGC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=13;WE=61034428;WS=61034410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,13:0.32:40
chr18	61060873	rs898890	G	A	876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=25;PP=686;SC=ATGTATAATAGTTTTGTATGT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=61060881;WS=61060863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr18	61066337	.	C	A	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=351;ReadPosRankSum=-1.108;SC=CCACTCAAGGCAGGGGAGCAA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=13;WE=61066345;WS=61066331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,14:0.74:19
chr18	61066463	rs2276317	A	G	3202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=69;NR=22;PP=2654;SC=GATATTTACTATATTATCCTA;SOR=2.535;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=69;TCR=22;TR=91;WE=61066471;WS=61066453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr18	61067959	rs952245	T	C	2295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=68;PP=1816;SC=TTTAGAAAAATGTCATGAGAA;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=13;TCR=68;TR=81;WE=61067967;WS=61067949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr18	61078888	rs11383277	G	GT	798.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.18;QD=23.49;SOR=5.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	61154043	rs34587228	T	C	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=2;PP=730;ReadPosRankSum=0.552;SC=GTGCTGAGGTTGAGGAGCCTT;SOR=0.723;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=80;TCF=75;TCR=5;TR=35;WE=61154051;WS=61154033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,35:0.43:81
chr18	61156606	rs12454742	G	C	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=7.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.798;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=8;PP=773;ReadPosRankSum=0.306;SC=CGAAGAGACCGTATGCAAAGG;SOR=0.904;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=135;TCF=104;TCR=31;TR=42;WE=61156614;WS=61156596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,44:0.31:143
chr18	61160287	rs2289519	T	C	1922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.953;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=58;PP=1482;ReadPosRankSum=0.626;SC=GAAGAAATTTTCTGAATCAGA;SOR=1.076;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=233;TCF=77;TCR=156;TR=81;WE=61160295;WS=61160277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:155,84:0.35:239
chr18	61160385	rs2289521	T	C	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=423;ReadPosRankSum=-0.933;SC=TGAAAAATGATAGGGACAGAG;SOR=0.380;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=115;TCF=32;TCR=83;TR=32;WE=61160393;WS=61160375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,33:0.29:115
chr18	61166248	rs200081849	G	GTA	150.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=8.081;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.93;MQRankSum=5.493;QD=3.35;ReadPosRankSum=-0.094;SOR=0.008;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,7:0.16:45
chr18	61166256	rs71366963	G	A	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.537;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.505;NF=24;NR=1;PP=2362;ReadPosRankSum=1.524;SC=GGGTATATATGTGTGTGTGTG;SOR=0.360;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=59;TCR=2;TR=25;WE=61166291;WS=61166246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,8:0.16:50
chr18	61166267	rs373058086	TGCGC	T	209.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=12.954;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=2.198;QD=3.75;ReadPosRankSum=-0.869;SOR=0.008;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,13:0.23:56
chr18	61166269	rs56208842	C	T	132.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-3.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.34;MQRankSum=-0.511;QD=2.41;ReadPosRankSum=2.015;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,9:0.16:55
chr18	61166273	rs12458191	C	T	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQRankSum=-0.468;QD=1.73;ReadPosRankSum=2.654;SOR=0.465;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,9:0.14:63
chr18	61166280	.	GTATA	G,GTA	327.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.505;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.904;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.435;NF=32;NR=3;PP=1142;ReadPosRankSum=1.977;SC=GCGCGTGTGTGTATATATATA;SOR=2.003;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=93;TCF=85;TCR=8;TR=35;WE=61166291;WS=61166246;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.21:77
chr18	61166282	.	A	G	203.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.958;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=2.222;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.42;MQRankSum=2.660;QD=2.55;ReadPosRankSum=2.547;SOR=0.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,14:0.17:80
chr18	61170467	rs1840557	G	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=9;NR=0;PP=182;ReadPosRankSum=-0.746;SC=CTGCTTTGAAGCTGGGCTTAT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=9;WE=61170475;WS=61170459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr18	61170500	rs1455557	T	C	260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=174;ReadPosRankSum=1.548;SC=TGTTTTCAATTGAGCCAGGTC;SOR=0.241;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=10;WE=61170508;WS=61170490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,11:0.33:33
chr18	61170721	rs1455556	T	C	1241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.45;ReadPosRankSum=-0.479;SOR=0.733;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:163,65:0.29:228
chr18	61170925	rs8093128	T	C	6366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=137;PP=2965;SC=CTCGAAACATTATTTTCTTTG;SOR=2.328;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=183;TCF=45;TCR=138;TR=182;WE=61170933;WS=61170915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr18	61225801	rs7244584	C	T	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.631;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=47;PP=1157;ReadPosRankSum=-0.871;SC=GTGATAGTTGCTTATCCCCAA;SOR=1.030;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=142;TCF=30;TCR=112;TR=57;WE=61225809;WS=61225791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,59:0.39:150
chr18	61226694	rs11152391	G	A	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.522;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=76;ReadPosRankSum=-0.664;SC=AACAGAGACAGCTGACATCTT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=5;WE=61226702;WS=61226686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,5:0.38:13
chr18	61226740	rs12103954	G	A	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.289;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=48;ReadPosRankSum=1.432;SC=TACAAAACACGCATCTTTTAG;SOR=0.124;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=7;WE=61226748;WS=61226730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr18	61231143	rs33927218	AAAAAT	A	311.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.13;MQRankSum=4.215;QD=5.77;ReadPosRankSum=2.296;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,14:0.26:54
chr18	61231417	rs9957786	A	G	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.810;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=522;ReadPosRankSum=0.230;SC=GGAATGATTTACAATATGTAT;SOR=1.179;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=79;TCF=6;TCR=73;TR=26;WE=61231425;WS=61231407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,26:0.32:82
chr18	61233739	rs2077549	T	C	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=180;ReadPosRankSum=0.617;SC=TCTTGAAGGTTGTCACTGCCC;SOR=0.512;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=9;WE=61233747;WS=61233729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr18	61254525	rs3216123	A	AT	801.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.686;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=2.053;QD=5.94;ReadPosRankSum=-0.688;SOR=0.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,44:0.33:135
chr18	61256117	rs77936810	GC	G	145.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=212;ReadPosRankSum=-2.136;SC=AATTCATTTGGCGGGGGGGTT;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=6;WE=61256125;WS=61256107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr18	61261515	rs11152394	T	C	1194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.441;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=528;ReadPosRankSum=2.580;SC=CAAGTCCATCTGCATCATATT;SOR=1.004;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=129;TCF=55;TCR=74;TR=41;WE=61261523;WS=61261505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,41:0.31:132
chr18	61261540	rs11152395	T	C	1276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.796;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=634;ReadPosRankSum=-0.692;SC=ATACATATTATTTGTCATTTG;SOR=1.138;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=109;TCF=49;TCR=60;TR=35;WE=61261548;WS=61261530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,36:0.32:112
chr18	61261565	rs11152396	C	G	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.850;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.94;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=19;PP=422;ReadPosRankSum=-0.999;SC=ATGGGTCAACCTTTTTCTGTT;SOR=0.820;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=109;TCF=54;TCR=55;TR=31;WE=61261573;WS=61261555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,34:0.30:113
chr18	61264298	rs1020694	G	A	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.499;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=11;PP=782;ReadPosRankSum=2.457;SC=GGTGGAGGACGGTTACGATCT;SOR=1.405;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=150;TCF=103;TCR=47;TR=50;WE=61264306;WS=61264288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,50:0.33:151
chr18	61264468	rs1020693	C	T	2529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=344;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.379;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=37;PP=1864;ReadPosRankSum=-2.108;SC=CAGCTGCCACCGGCATAGGCT;SOR=0.973;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=335;TCF=203;TCR=132;TR=105;WE=61264476;WS=61264458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:234,109:0.32:343
chr18	61271065	rs7229459	G	A	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=3.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=164;ReadPosRankSum=0.890;SC=CAGATTCAACGGATAGTTACA;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=9;WE=61271073;WS=61271055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,9:0.45:20
chr18	61308895	rs2518061	A	G	4122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=21;PP=2965;SC=TCTCCACCTGAGTCGGCCAGG;SOR=2.985;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=126;TCF=104;TCR=22;TR=125;WE=61308903;WS=61308885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr18	61309139	rs2518060	G	A	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=3.506;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.96;MQRankSum=-1.027;QD=2.13;ReadPosRankSum=-0.674;SOR=0.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,5:0.17:29
chr18	61310374	rs2687472	C	T	2688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.690;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.412;NF=70;NR=25;PP=2039;ReadPosRankSum=1.207;SC=TAAAGCTGAACCATAGTGCTC;SOR=1.277;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=152;TCF=106;TCR=46;TR=95;WE=61310382;WS=61310364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,102:0.64:160
chr18	61322849	rs61703421	G	C	1822.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=1;PP=1453;ReadPosRankSum=-0.213;SC=CAGAACATCTGCAGGTGAACA;SOR=0.676;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=75;TCR=1;TR=56;WE=61322857;WS=61322839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,60:0.76:79
chr18	61323012	rs3180227	C	G	5516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.377;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=93;PP=2962;ReadPosRankSum=1.228;SC=TGATCCGAATCCTACTACAGC;SOR=0.483;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=277;TCF=148;TCR=129;TR=190;WE=61323020;WS=61323002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,192:0.69:278
chr18	61325905	rs7228687	T	G	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.399;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=235;ReadPosRankSum=0.924;SC=TAAGAGTAATTTATGTAACTA;SOR=2.012;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=65;TCF=23;TCR=42;TR=16;WE=61325913;WS=61325895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,18:0.26:70
chr18	61326505	rs8089032	T	A	3270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=82;NR=12;PP=2554;SC=AACGGAGCTATTGCACTCTGA;SOR=3.545;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=82;TCR=12;TR=94;WE=61326513;WS=61326495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr18	61326597	rs8085479	A	C	9560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.30;QD=45.31;SOR=1.004;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr18	61326602	rs8085482	A	G	9755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.33;QD=45.38;SOR=0.906;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr18	61326609	rs8089201	T	G	9460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.36;QD=44.63;SOR=0.876;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr18	61326628	rs11370831	A	AT	7337.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=53;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=103;PP=2936;SC=GCCAGGTGAAATTACCTGTAA;SOR=0.702;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=196;TCF=86;TCR=110;TR=182;WE=61326636;WS=61326618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr18	61377579	rs1395268	A	C	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=42;PP=1300;SC=GGAGAGACTGAAGAGCAATTG;SOR=3.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=6;TCR=42;TR=48;WE=61377587;WS=61377569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr18	61377644	rs1395269	T	G	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=358;ReadPosRankSum=-1.886;SC=TCTTTCATGCTCCCGCTCTGG;SOR=0.957;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=17;WE=61377652;WS=61377634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr18	61378743	rs1506424	G	T	1468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.124;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=43;PP=1206;ReadPosRankSum=-0.179;SC=AACCAGCTATGTGTCCCCCTT;SOR=1.702;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=76;TCF=17;TCR=59;TR=53;WE=61378751;WS=61378733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,53:0.69:77
chr18	61379838	rs4940595	T	G	2952.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.917;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=38;PP=2357;ReadPosRankSum=0.600;SC=GTTTGGTGTCTAATTCTCTCA;SOR=0.503;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=178;TCF=124;TCR=54;TR=118;WE=61379846;WS=61379828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,121:0.65:185
chr18	61383160	rs8085655	G	A	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=96;ReadPosRankSum=0.566;SC=ACTTGTTTATGGGAACTGCTT;SOR=1.863;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=6;WE=61383168;WS=61383152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr18	61383181	rs8087185	A	C	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=93;ReadPosRankSum=-1.199;SC=TTTTCTCTGCATTAGAATTTT;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=6;WE=61383189;WS=61383171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr18	61383354	rs17071550	C	T	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.652;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.692;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=20;PP=897;ReadPosRankSum=-1.451;SC=ACGAGGAAAACGATTAATGCT;SOR=0.236;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=78;TCF=48;TCR=30;TR=44;WE=61383362;WS=61383344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,48:0.59:82
chr18	61387312	rs1506418	G	A	1112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=23;PP=782;ReadPosRankSum=-1.543;SC=CCTGGTGAATGCCATATATTT;SOR=0.559;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=41;WE=61387320;WS=61387302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,44:0.72:61
chr18	61387333	rs1506419	T	A	955.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=670;ReadPosRankSum=0.091;SC=CAAAGGACAATGGCAAAATAA;SOR=0.616;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=32;WE=61387341;WS=61387323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,35:0.65:54
chr18	61387389	rs1506420	G	A	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.599;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=525;ReadPosRankSum=-1.550;SC=AGCTAAGTGAGGTAAGTATTT;SOR=0.293;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=21;WE=61387397;WS=61387379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,23:0.74:31
chr18	61387984	rs7239198	T	C	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=301;ReadPosRankSum=-0.060;SC=CATGCAGATATCCGTGTTATG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=61388001;WS=61387974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr18	61387993	rs12607732	T	C	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=106;ReadPosRankSum=0.431;SC=ATCCGTGTTATGCAAGGTAAT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=3;WE=61388001;WS=61387974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
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chr18	61390316	rs1395265	C	A	5326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=90;NR=70;PP=2965;SC=ACACCTCCCCCGATTCAAACT;SOR=0.938;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=160;TCF=90;TCR=70;TR=160;WE=61390324;WS=61390306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr18	61390332	rs1395266	C	T	5593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=95;NR=74;PP=2965;SC=AAACTTGAAACTAAGTATGAG;SOR=0.922;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=169;TCF=95;TCR=74;TR=169;WE=61390340;WS=61390322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr18	61390361	rs1395267	T	C	5603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=87;PP=2965;SC=CCTGTTAAAATCTCTAGGGGT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=92;TCR=87;TR=178;WE=61390369;WS=61390351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr18	61390570	rs953695	T	G	5330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=93;PP=2965;SC=ACCCCTTCCTTTTCTTTATAA;SOR=0.897;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=170;TCF=77;TCR=93;TR=170;WE=61390578;WS=61390560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr18	61390649	rs953696	C	T	2873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=68;PP=2176;SC=TGGGGTTGAGCAAGGCTCAGA;SOR=2.405;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=22;TCR=68;TR=90;WE=61390657;WS=61390639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr18	61391228	rs2089318	T	C	4189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=47;PP=2839;SC=AATTTTTGGCTAATTGCTTGA;SOR=1.104;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=113;TCF=66;TCR=47;TR=112;WE=61391236;WS=61391218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr18	61391247	.	G	A	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.360;ClippingRankSum=0.000;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.721;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.121;NF=17;NR=19;PP=475;ReadPosRankSum=-0.962;SC=GAATTGAATTGAATTATACTA;SOR=0.661;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=119;TCF=60;TCR=59;TR=36;WE=61391255;WS=61391237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,39:0.31:125
chr18	61391323	rs147160513	CTCT	C	2333.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.70;QD=40.94;SOR=2.262;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr18	61391449	rs144614464	C	CTCT,CTCTTCT	692.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.70;QD=40.75;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,12,5:0.71,0.29:17
chr18	61391505	rs144622175	CTCT	C	1339.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.65;QD=40.60;SOR=2.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr18	61391697	rs12326861	A	G	1369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=39;PP=1182;SC=TATACTCAGGATAACATGGAG;SOR=4.664;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=41;WE=61391705;WS=61391687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr18	61391738	rs17071630	T	C	635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=612;ReadPosRankSum=-0.230;SC=CTATTAAACATTTACTGCCTT;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=21;WE=61391746;WS=61391728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,21:0.72:29
chr18	61393442	rs9965604	T	C	443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=312;SC=CCAACCCAAATCCACAGAAGG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=61393450;WS=61393432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	61393644	rs1893563	T	A	1718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=33;PP=1390;SC=CTGCTATTTCTGACTCCTAAG;SOR=1.009;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=23;TCR=33;TR=56;WE=61393652;WS=61393634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr18	61394300	rs8097334	C	T	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=1;PP=492;SC=GTTCCCTCCACTCTCAGTTCT;SOR=3.716;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=61394308;WS=61394290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr18	61394403	rs8098025	A	G	1482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=29;PP=1108;SC=ACCAGAGGCAACCACACCCTC;SOR=1.426;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=45;WE=61394411;WS=61394393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr18	61394522	rs6567386	A	G	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=8;PP=267;SC=TAGTCCTTGGACAGGTCATTC;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=61394530;WS=61394512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	61463784	rs1701648	G	T	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=116;ReadPosRankSum=-1.124;SC=AATGTGGTTTGGAATAATCTT;SOR=0.922;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=7;WE=61463792;WS=61463774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr18	61465746	rs34405525	GA	G	415.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=390;ReadPosRankSum=1.457;SC=TATGTGTTAAGAAAAAAACTT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=21;WE=61465754;WS=61465736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr18	61465810	rs1720858	A	G	1823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.121;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.014;NF=60;NR=12;PP=2589;ReadPosRankSum=-0.062;SC=TAAAATAAACATTTTTCCCTC;SOR=1.385;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=107;TCF=86;TCR=21;TR=72;WE=61465830;WS=61465800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,75:0.69:109
chr18	61465822	rs113041735	A	AT	2056.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.764;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.012;NF=53;NR=20;PP=2831;ReadPosRankSum=0.662;SC=TTTTCCCTCAATTTTTTTTTC;SOR=0.974;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=118;TCF=79;TCR=39;TR=73;WE=61465830;WS=61465800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,86:0.69:124
chr18	61468306	rs2689399	G	C	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.597;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.153;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=367;ReadPosRankSum=-0.651;SC=ACTGTTGATTGAGTTTTCACT;SOR=1.814;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=17;WE=61468314;WS=61468296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr18	61575120	rs1916661	G	T	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.903;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=173;ReadPosRankSum=0.210;SC=ATACATGCTTGTGAAACTGAA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=7;WE=61575128;WS=61575110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr18	61627300	rs12959740	T	C	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=209;ReadPosRankSum=1.107;SC=AATCATAAAATTATTGATTTT;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=10;WE=61627308;WS=61627290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr18	61650865	rs11537989	G	A	3486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.723;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=67;PP=2742;ReadPosRankSum=0.764;SC=TGACAAAGCTGGTCCTTGTGA;SOR=0.620;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=182;TCF=92;TCR=90;TR=129;WE=61650873;WS=61650855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,130:0.70:186
chr18	61654463	rs3826616	A	G	1848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.344;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=47;PP=1443;ReadPosRankSum=0.455;SC=TTCATCAGGCACCACAAAACC;SOR=0.930;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=128;TCF=47;TCR=81;TR=73;WE=61654471;WS=61654453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,73:0.57:127
chr18	63477317	rs11332924	GA	G	953.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.375;NF=0;NR=43;PP=608;ReadPosRankSum=1.227;SC=ATTAAGTACTGAAAAAAAAAA;SOR=6.043;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=1;TCR=63;TR=43;WE=63477326;WS=63477307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr18	63489378	rs8097752	C	T	4594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=47;PP=2965;SC=ATTTGCTTGTCATTCAGGCAA;SOR=1.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=92;TCR=47;TR=139;WE=63489386;WS=63489368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
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chr18	64218308	.	G	A	1531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.164;ClippingRankSum=0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=0;PP=1226;ReadPosRankSum=-0.403;SC=ATGTAATGAAGATGTAGAATC;SOR=1.493;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=74;TCF=74;TCR=0;TR=47;WE=64218316;WS=64218298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,51:0.65:78
chr18	64748928	rs11423865	C	CT	520.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.156;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=12;PP=422;ReadPosRankSum=-0.583;SC=TTCAGCAGGACTTTTTTTTGG;SOR=0.392;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=82;TCF=45;TCR=37;TR=25;WE=64748936;WS=64748918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,29:0.32:90
chr18	65178103	rs112210097	G	GCA	40.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=0.984;SC=ATACACGCGTGCACACACACA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=4;WE=65178111;WS=65178093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr18	66358403	rs309228	G	T	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.875;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=85;ReadPosRankSum=-0.743;SC=AAAACATCAGGCATTCAAGTC;SOR=1.022;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=7;WE=66358411;WS=66358393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr18	66364396	rs412679	G	A	84.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.132;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=26;ReadPosRankSum=0.241;SC=TCACAATTTAGTTTATTAAAT;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=3;WE=66364404;WS=66364386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr18	66365129	rs433550	T	G	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=72;ReadPosRankSum=0.066;SC=TAAATTAAATTACAATACATC;SOR=1.085;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=5;WE=66365137;WS=66365119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
chr18	66367607	rs72955911	A	G	1315.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=6;PP=1055;ReadPosRankSum=0.010;SC=TCAAATATTAATAACATACAG;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=48;TCR=8;TR=42;WE=66367615;WS=66367597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,44:0.76:58
chr18	66368825	rs3745058	A	C	383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.183;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=247;ReadPosRankSum=-0.361;SC=AAGCATAAAGAAGCAGTCCCT;SOR=2.219;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=14;WE=66368833;WS=66368815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr18	66504093	rs485613	A	C	4688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=62;PP=2965;SC=ACATGGTGGCACCTGCCTCAC;SOR=0.904;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=79;TCR=62;TR=141;WE=66504101;WS=66504083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr18	66504351	rs637051	G	A	5548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=76;PP=2965;SC=ACAGTGCCAGGGAGGAAGGAA;SOR=0.867;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=168;TCF=92;TCR=76;TR=168;WE=66504359;WS=66504341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr18	66504459	rs572020	A	T	4536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=78;PP=2965;SC=TAGAAGCTAAAGTTACCCAGG;SOR=0.956;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=61;TCR=78;TR=139;WE=66504467;WS=66504449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr18	66511027	rs9962597	C	T	307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=2;PP=270;SC=AATATACATCCCAATTATAAA;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=66511035;WS=66511017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr18	66511207	rs33926572	TA	T	339.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=206;SC=ATCTAAATACTAAAAAAAAAT;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=9;WE=66511215;WS=66511197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr18	66513235	rs12959654	G	A	738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=4;PP=543;SC=ATCCTCCTATGTAAGAGAATA;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=66513243;WS=66513225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	66513256	rs8088575	A	G	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=6;PP=778;SC=TTATGAGTGAAAGGAATTGAG;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=29;WE=66513264;WS=66513246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	66513471	rs1954878	C	G	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=9;PP=1094;SC=TAGGAAAATGCCTATAAAATT;SOR=2.362;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=36;WE=66513479;WS=66513461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr18	66513662	rs1977942	T	C	4960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=90;PP=2965;SC=GAAAGAGGTATGGGGGAATAT;SOR=0.992;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=161;TCF=70;TCR=91;TR=160;WE=66513670;WS=66513652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr18	66513749	rs1970675	T	C	3889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=81;PP=2965;SC=GCACAACAGATAAGAGGAAGG;SOR=1.857;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=35;TCR=81;TR=116;WE=66513757;WS=66513739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr18	66513840	rs1970674	C	A	1320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=38;PP=1184;SC=AATTCAGACTCTATGACATCT;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=38;WE=66513848;WS=66513830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr18	66678131	rs7234663	A	G	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=596;SC=TTTTATCAGAATAGACTATAA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=66678139;WS=66678121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr18	66678453	rs930164	A	G	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=23;PP=639;SC=ATAAATATTCATATCTTAATG;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=66678461;WS=66678443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	67068605	rs33984456	TG	T	1464.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.885;NF=0;NR=58;PP=862;ReadPosRankSum=0.124;SC=GCTGGCTGCCTGGGGGGGGGG;SOR=2.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=100;TCF=2;TCR=98;TR=58;WE=67068613;WS=67068595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,62:0.73:85
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chr18	67531642	rs763361	T	C	1123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.461;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=21;PP=817;ReadPosRankSum=0.507;SC=GTAGGTTGACTGGTAGAGATG;SOR=1.256;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=197;TCF=100;TCR=97;TR=56;WE=67531650;WS=67531632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,57:0.28:203
chr18	67531797	rs763362	A	G	1034.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.25;ReadPosRankSum=1.959;SOR=1.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,37:0.62:60
chr18	67563309	rs1630425	A	C	1500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=36;PP=1186;SC=ATGATTAGATACAGGTTGTCA;SOR=2.208;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=12;TCR=36;TR=48;WE=67563317;WS=67563299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr18	67563348	rs1788115	T	C	1202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=34;PP=1025;SC=TGGAAGATACTTAATCATAAA;SOR=5.728;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=35;WE=67563356;WS=67563338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr18	67613926	rs10782036	A	G	1762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=1;PP=1452;SC=AAATGTTGTAAGTGGATAAAA;SOR=6.439;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=49;WE=67613934;WS=67613916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr18	67614674	rs3214811	T	TA	1103.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.312;NF=8;NR=27;PP=644;ReadPosRankSum=0.330;SC=CTGGTTCTATTAAAAAAAAAA;SOR=0.538;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=55;TCF=14;TCR=41;TR=35;WE=67614682;WS=67614664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr18	67697137	rs139326191	G	A	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.920;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=190;ReadPosRankSum=0.382;SC=TTATCCATCTGTACCTTTCTT;SOR=0.223;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=15;WE=67697145;WS=67697127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
chr18	67718688	rs4891392	A	G	3268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=64;PP=2643;SC=CACGGTAACAAACGGGAGTGT;SOR=1.449;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=34;TCR=64;TR=98;WE=67718696;WS=67718678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr18	67724802	rs12968602	A	G	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=530;SC=TCTCTTTTCTAACATCCAGAC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=67724810;WS=67724797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr18	67726975	rs11876398	A	G	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=393;SC=GAGCCTAAAAAAGAATAAAGC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=67726983;WS=67726965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr18	67727003	rs1435086	A	T	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.975;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=712;ReadPosRankSum=1.576;SC=CCAGGTCACAAGAAATCTTGT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=67727011;WS=67726993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr18	67733234	rs11151561	T	A	1152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=29;PP=881;SC=ACACACAAGATATCCTTAAAC;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=67733242;WS=67733224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	67741117	rs1369292	G	A	3513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=27;PP=2816;SC=TCAAAATAAAGGACTTATGCA;SOR=2.093;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=77;TCR=27;TR=104;WE=67741125;WS=67741107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr18	67741309	rs1369293	G	A	1615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=44;PP=1327;SC=CGCATTACAGGAAACCAATTC;SOR=4.450;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=48;WE=67741317;WS=67741299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr18	67742801	rs285228	G	A	2292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=13;NR=54;PP=1863;SC=GGGAAAGAAGGAGGAGACACT;SOR=2.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=13;TCR=54;TR=67;WE=67742809;WS=67742791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr18	67759549	rs4891394	C	A	1067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=31;PP=913;SC=ATGAAAACAACGTGAAAATGT;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=67759557;WS=67759539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	67809647	rs11665653	A	C	962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.44;QD=32.09;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr18	67812773	rs11662011	G	A	1236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=0;PP=1010;SC=ACAAACTGAAGAATGTCACAT;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=35;WE=67812781;WS=67812763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr18	67817744	rs12606964	T	C	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=393;SC=GGTTTCTTTTTAGTTTCTCAC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=67817752;WS=67817734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr18	67818046	rs12604751	C	T	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=337;SC=CTTCTGTTTACAATCCCATTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=67818054;WS=67818036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr18	67860719	rs283250	T	C	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=28;PP=927;SC=ATAAAATTATTCTTTAGTAGA;SOR=4.047;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=67860727;WS=67860709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr18	67863850	rs74941514	T	TCTC	3675.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=35;PP=2965;SC=ATGCTTTCCATCTCCAAAGGC;SOR=0.846;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=75;TCF=35;TCR=40;TR=62;WE=67863858;WS=67863840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr18	67871343	rs3911730	A	C	7543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=168;NR=64;PP=2965;SC=GTTTGGTATGAGGCAGAAGAT;SOR=2.041;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=232;TCF=168;TCR=64;TR=232;WE=67871351;WS=67871333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,242:1.00:242
chr18	70209321	rs7237888	C	A	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=20;PP=564;SC=CGCAGCCGCCCGGCTCGCGCA;SOR=3.528;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=70209329;WS=70209311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	70416119	rs11872857	T	C	1181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=0;PP=979;SC=TATTTCTAATTGTGAAATGTC;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=34;WE=70416127;WS=70416109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr18	70416367	rs35742923	C	CA	1974.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=61;PP=1959;SC=ACTATTTGCACAAAAAAATAT;SOR=5.518;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=77;TCF=3;TCR=74;TR=62;WE=70416375;WS=70416357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr18	70417396	rs922999	C	T	1441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=8;PP=1131;SC=TTGCGAGTAGCTGTGTTTCAT;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=46;WE=70417404;WS=70417386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
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chr18	70532840	rs10164255	T	G	445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.312;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=321;ReadPosRankSum=1.289;SC=CATCTCTGAATGAAGAGAGGG;SOR=1.191;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=50;TCF=23;TCR=27;TR=20;WE=70532848;WS=70532830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,20:0.41:49
chr18	70532977	rs10163845	A	G	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.923;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=146;ReadPosRankSum=-0.500;SC=CAGACTGTGGAGGAGGAGAAT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=7;WE=70532985;WS=70532967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
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chr18	71442075	.	TGG	CGT	1112	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=33;NR=15;PP=1112;QD=24.2805807263;SC=AAAAAGAAGTTGGAAGATGCA;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=48;WE=71442085;WS=71442065;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,48:0.96:50
chr18	71442077	rs11875403	G	T	2435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.29;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr18	71749154	rs3831448	G	GT	733.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.579;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=824;ReadPosRankSum=1.908;SC=AAACGGTTCTGTTTTTACCTT;SOR=0.432;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=42;TCF=33;TCR=9;TR=24;WE=71749162;WS=71749144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr18	71749359	rs12962744	G	A	889.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.182;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=31;PP=670;ReadPosRankSum=1.058;SC=TTCAGTCGGCGACTTTATAAG;SOR=1.329;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=143;TCF=50;TCR=93;TR=41;WE=71749367;WS=71749349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,43:0.29:150
chr18	71796889	.	GA	G	25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5011;HP=12;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=1;NR=2;PP=25;QD=10.3333333333;SC=TTGCCTCATTGAAAAAAAAAA;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=3;WE=71796897;WS=71796879;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr18	71807614	rs17088833	T	C	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.117;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=29;PP=797;ReadPosRankSum=2.241;SC=TATTCCCTTCTACAAAATTCC;SOR=0.321;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=59;TCF=8;TCR=51;TR=35;WE=71807622;WS=71807604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr18	71815063	rs3813115	G	A	1423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.240;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=28;PP=1043;ReadPosRankSum=-2.017;SC=GGGCTGAAACGAAGAGTGCAC;SOR=0.431;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=69;TCF=28;TCR=41;TR=49;WE=71815071;WS=71815053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,55:0.74:74
chr18	71815122	rs3813114	G	A	643.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=468;ReadPosRankSum=1.935;SC=GCGCATGCGCGCGTGAGCAAA;SOR=1.410;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=23;WE=71815130;WS=71815112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,25:0.83:30
chr18	71822321	rs3737513	A	G	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.865;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=2;PP=588;ReadPosRankSum=-0.992;SC=CAAAAGCAGCAGACAAGCTTG;SOR=1.599;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=64;TCF=58;TCR=6;TR=35;WE=71822329;WS=71822311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,32:0.52:61
chr18	71825718	.	T	TAATCA	412.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.614;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.52;ReadPosRankSum=1.047;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr18	71825719	.	A	AATCAAGCAAGC	2166	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=2166;QD=566.5;SC=TGATTAAAATAGGGTTTCTGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=4;WE=71825728;WS=71825709;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,4:0.27:15
chr18	71825720	.	G	A	400	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=400;QD=108.692803137;SC=GATTAAAATAGGGTTTCTGAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=71825728;WS=71825709;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:6,4:0.40:10
chr18	71825720	.	G	GCAAGCA	454.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.32;ReadPosRankSum=0.850;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr18	71920966	rs1790871	T	C	2350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=45;PP=1820;SC=AAATCTTTGCTCCTTCTAACA;SOR=1.308;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=27;TCR=45;TR=72;WE=71920974;WS=71920956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr18	71930734	rs2032262	T	C	2976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=55;PP=2405;SC=AGAGGTAGAATAAAAATTTTT;SOR=1.414;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=32;TCR=55;TR=87;WE=71930742;WS=71930724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr18	71930758	rs2032263	G	A	2105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=45;PP=1652;SC=TCAGGCAAATGAATTAAGAGA;SOR=2.658;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=13;TCR=45;TR=58;WE=71930766;WS=71930748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr18	71930834	rs144732931	C	CTG	1437.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=30;PP=1510;SC=CAACAGGAGACTAACTTGTCC;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=30;WE=71930852;WS=71930824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr18	71930844	rs2032264	C	G	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=28;PP=843;SC=CTAACTTGTCCATAAATGTGG;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=71930852;WS=71930824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr18	71989909	rs10164170	T	C	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=4;PP=642;SC=AAGTCCTTTTTATAAATGTGG;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=71989917;WS=71989899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr18	71990033	rs10163785	G	T	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=18;PP=795;SC=TTGTTTATAGGGATTATACGT;SOR=1.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=13;TCR=18;TR=31;WE=71990041;WS=71990023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr18	71995106	rs75354463	A	G	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=149;ReadPosRankSum=2.368;SC=CTAAATGGGCAGTCATTTCCT;SOR=0.239;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=12;WE=71995114;WS=71995096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr18	71996377	rs1541292	G	A	1211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=30;PP=1037;SC=TAATCCCAACGGTTTGGGAGG;SOR=4.235;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=3;TCR=30;TR=33;WE=71996385;WS=71996367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr18	72020475	rs8093010	T	C	4668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=43;PP=2965;SC=TCTCTATCCTTTTCAGGAACA;SOR=1.869;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=102;TCR=43;TR=145;WE=72020483;WS=72020465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr18	72021548	rs12608084	C	T	2100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=54;PP=1727;SC=ATGCTAGACCCTTAAAACCCC;SOR=5.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=3;TCR=54;TR=57;WE=72021556;WS=72021538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr18	72021717	rs12606060	T	C	3006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=21;PP=2416;SC=AAATCAAAACTTAAGAAATCT;SOR=2.486;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=68;TCR=21;TR=89;WE=72021725;WS=72021707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr18	72109174	rs1559805	C	A	1514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=3;PP=1284;SC=CCAGCCCTGGCGGACTCTCAT;SOR=4.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=44;WE=72109182;WS=72109164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr18	72113730	rs3861310	A	G	1944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=8;PP=1650;SC=CTGCAGAAGCAACAGTAGTTT;SOR=4.112;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=65;TCR=8;TR=72;WE=72113738;WS=72113720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr18	72114455	rs8087020	C	T	5526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=61;NR=118;PP=2965;SC=AACAGCAGCTCTCCCGCCACA;SOR=1.460;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=61;TCR=118;TR=179;WE=72114463;WS=72114445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr18	72167124	rs3764509	C	G	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=160;ReadPosRankSum=0.000;SC=CAGGTCGCCCCTCAGTCTCCA;SOR=0.941;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=14;WE=72167132;WS=72167114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,15:0.37:41
chr18	72168608	rs2303463	G	A	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.010;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=291;ReadPosRankSum=-0.736;SC=CTGCGTGGCCGGAGAAGAGAG;SOR=0.485;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=15;WE=72168616;WS=72168598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,16:0.31:52
chr18	72173270	rs35061137	GC	G	271.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.346;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=500;ReadPosRankSum=0.777;SC=GCCTATGCGTGCCCAGAGGAA;SOR=0.563;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=9;WE=72173286;WS=72173260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,9:0.28:32
chr18	72173278	rs34780792	G	A	286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=514;ReadPosRankSum=0.747;SC=GTGCCCAGAGGAAAGGCACTG;SOR=0.646;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=9;WE=72173286;WS=72173260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr18	72176083	rs2278161	T	C	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.469;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=10;PP=370;ReadPosRankSum=-1.170;SC=AGGCAAGCTGTATGGGAGAGG;SOR=0.810;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=71;TCF=35;TCR=36;TR=23;WE=72176091;WS=72176073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,23:0.32:73
chr18	72178161	rs2278159	T	C	324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.703;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=10;PP=238;ReadPosRankSum=-0.407;SC=ATGTGGACTATGTCTGCATTT;SOR=0.905;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=71;TCF=37;TCR=34;TR=19;WE=72178169;WS=72178151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,19:0.26:72
chr18	72178300	rs2278158	G	T	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=32;ReadPosRankSum=0.431;SC=GAATCTCCCGGTTCTCCCAAA;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=4;WE=72178308;WS=72178290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr18	72179579	rs734559	G	A	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.75;ReadPosRankSum=1.853;SOR=0.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,29:0.25:118
chr18	72180739	rs2241510	G	A	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=181;ReadPosRankSum=0.756;SC=GGAAAGAGCAGCTCGCCTTGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=11;WE=72180747;WS=72180729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr18	72183695	rs2241509	T	A	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=35;PP=981;ReadPosRankSum=-0.823;SC=TTGGGTAATATAGGCTGTTAC;SOR=3.664;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=36;WE=72183703;WS=72183685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr18	72186059	rs733062	G	A	2085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=6;PP=1781;SC=GACCTTGAACGCGGGCTTGCT;SOR=4.277;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=65;TCF=59;TCR=6;TR=65;WE=72186067;WS=72186049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr18	72186175	rs5826329	T	TC	649.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=8.312;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=1.633;QD=5.46;ReadPosRankSum=0.808;SOR=0.591;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,33:0.28:119
chr18	72186404	rs2241508	G	A	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.195;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=44;ReadPosRankSum=0.013;SC=CCTTCCCCCCGTGTGCAGCTG;SOR=0.027;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=5;WE=72186412;WS=72186394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr18	72226455	rs12605490	A	T	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=1;PP=640;SC=CTTGATCAACAGAAAAGTACC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=72226463;WS=72226445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr18	72226504	rs12605520	C	T	1160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=10;PP=906;SC=TCGCTCCCCCCGCAGAGCAGA;SOR=2.012;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=37;WE=72226512;WS=72226494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr18	72226539	rs12607796	T	C	1585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=17;PP=1266;SC=GCTAATGGCCTGCTTGCTCTT;SOR=1.524;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=50;WE=72226547;WS=72226529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr18	72228124	rs4263028	A	G	5095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=97;PP=2965;SC=AATACCTCCCATCATCCTGGC;SOR=1.078;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=72;TCR=97;TR=169;WE=72228132;WS=72228114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr18	72234337	rs4891562	A	C	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=0;PP=486;SC=CCATGATTCAATTACCTCCCC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=72234345;WS=72234327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr18	72234635	rs12960862	C	T	1987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=51;PP=1611;SC=CAATCACTTACGGAACCCGGG;SOR=2.985;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=9;TCR=51;TR=60;WE=72234643;WS=72234625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr18	72238283	rs4892244	A	G	883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=0;PP=678;SC=TGAGAAACACAGAAAGTGAAG;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=72238291;WS=72238273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr18	72245660	rs141377822	A	AG	337.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=382;ReadPosRankSum=-0.889;SC=CTACCATTGGAGTATCATTTT;SOR=0.590;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=12;WE=72245668;WS=72245650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,13:0.30:44
chr18	72247278	rs4892247	C	T	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=1;PP=805;SC=ATTAACTGTACTAATCAGTTT;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=72247286;WS=72247268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr18	72250762	rs11659237	T	C	4107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=29;PP=2965;SC=GTTCTTGTCCTTACCCTATTC;SOR=2.416;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=94;TCR=29;TR=123;WE=72250770;WS=72250752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr18	72251035	rs67670142	G	A	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=0.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=242;ReadPosRankSum=-1.359;SC=TTCAATTTATGTGAGAATGGA;SOR=0.446;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=11;WE=72251043;WS=72251025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr18	72264397	rs7505285	A	C	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.07;ReadPosRankSum=-0.491;SOR=0.348;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr18	72264406	rs7505289	A	G	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=2.526;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.79;ReadPosRankSum=-0.851;SOR=0.171;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,23:0.40:57
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chr18	72344509	rs7227263	G	A	3013.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.592;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=36;PP=2508;ReadPosRankSum=0.860;SC=TCCGGACTCCGGGCTGCATTC;SOR=0.756;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=184;TCF=125;TCR=59;TR=111;WE=72344517;WS=72344499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,109:0.60:181
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chr18	72347482	rs12327359	T	C	1553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.509;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=33;PP=1336;ReadPosRankSum=0.699;SC=GAATTTATTTTTACATATTAA;SOR=0.322;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=86;TCF=31;TCR=55;TR=55;WE=72347490;WS=72347472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,56:0.64:87
chr18	72493314	rs7228438	G	T	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=0;PP=568;SC=TTATTCTTAAGTTCTCTTTGT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=72493322;WS=72493304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr18	72593097	rs75375525	G	A	640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.878;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.520;HP=4;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=476;ReadPosRankSum=1.155;SC=TGCTGCACTGGCCCCTTCTCT;SOR=0.148;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=25;WE=72593105;WS=72593087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,26:0.53:49
chr18	72593118	rs2628126	C	T	1225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=33;PP=972;SC=GCAGAGAGGACGGCAAGACAC;SOR=3.967;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=37;WE=72593126;WS=72593108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr18	72776121	rs3744913	G	A	4629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=70;PP=2965;SC=TCATCGTGACGGAGGAGCTGG;SOR=0.775;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=77;TCR=70;TR=147;WE=72776129;WS=72776111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr18	72914280	rs7230037	G	A	1333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=947;ReadPosRankSum=0.304;SC=TGTCAGATGCGTTAACACCAA;SOR=0.777;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=44;WE=72914288;WS=72914270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,50:0.65:77
chr18	72997677	rs3826609	C	T	2807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=45;PP=2204;ReadPosRankSum=0.414;SC=GTCCCGACAGCGTCTCGTACC;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=42;TCR=46;TR=86;WE=72997685;WS=72997667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,91:0.98:93
chr18	72998004	rs3744908	T	C	3640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=77;NR=42;PP=2657;SC=CGTCCTCGTATGGGCTGCTTC;SOR=1.553;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=120;TCF=77;TCR=43;TR=119;WE=72998012;WS=72997994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr18	72998268	rs3744909	T	C	4859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=79;PP=2965;SC=GGAAGGAGGATGCCCAGAAGG;SOR=0.755;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=82;TCR=79;TR=161;WE=72998276;WS=72998258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr18	72998886	rs3809997	T	C	5905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=71;PP=2965;SC=AGAAGCCGCCTGTGGCTGGCG;SOR=1.345;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=115;TCR=71;TR=186;WE=72998894;WS=72998876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr18	72999359	rs55679337	T	C	3104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=36;PP=2524;SC=AAGAGCTCCCTGGCCAAGGCT;SOR=1.384;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=62;TCR=36;TR=98;WE=72999367;WS=72999349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr18	73130653	rs3214645	G	GT,GTT	655.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.22;ReadPosRankSum=1.535;SOR=3.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,19,6:0.73,0.23:26
chr18	73130705	rs33995140	AT	A	947.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.337;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=6;PP=617;ReadPosRankSum=0.318;SC=AATATGTAGTATTTTTTTTTA;SOR=0.732;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=64;TCF=54;TCR=10;TR=43;WE=73130713;WS=73130695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,45:0.65:69
chr18	73139335	rs7235563	C	G	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=11.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.77;ReadPosRankSum=-1.198;SOR=1.944;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,30:0.24:125
chr18	74082584	rs9676093	G	A	2560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=70;PP=2087;SC=ACAGATCAGCGTGTGAGCTTC;SOR=5.031;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=5;TCR=70;TR=75;WE=74082592;WS=74082574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr18	74082655	rs690035	G	C	824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=23;PP=670;SC=AAAGACACCAGCGCCTAGCCT;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=74082663;WS=74082645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr18	74090957	rs56087742	CG	C	1774.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=39;PP=1491;SC=GAGTGTAGGACGGGGGGGCGC;SOR=1.863;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=71;TCF=25;TCR=46;TR=53;WE=74090965;WS=74090947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr18	74092366	rs12970367	G	A	359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=10;PP=271;SC=TGTCTTCAGCGGGAGAAGCCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=74092374;WS=74092356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr18	74207575	rs3813102	C	T	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=300;ReadPosRankSum=-1.857;SC=AGTGGTCGCCCCTCGTCAAGG;SOR=1.127;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=14;WE=74207583;WS=74207565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,13:0.59:22
chr18	74208485	rs3841258	CG	C	977.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=28;PP=606;SC=GGCGATCAGACGGGGGGGGGC;SOR=2.899;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=31;WE=74208493;WS=74208475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr18	74208573	rs4891164	G	A	146.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=176;SC=TCAGGCAGAAGGACAGGGACA;SOR=1.981;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=74208581;WS=74208563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr18	74591992	rs5826483	G	GT	932.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=-0.632;QD=17.60;ReadPosRankSum=-1.097;SOR=2.885;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,45:0.85:53
chr18	74611127	rs608433	A	G	3408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=74;PP=2588;SC=CAAGACGAATATTCCAGTCCC;SOR=1.856;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=32;TCR=74;TR=106;WE=74611135;WS=74611117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
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chr18	74680369	rs470774	C	T	1793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=49;PP=1489;SC=TTGGAATCTCCGTTTTAAAGC;SOR=4.654;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=4;TCR=49;TR=53;WE=74680377;WS=74680359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr18	74691940	.	G	A	330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.299;ClippingRankSum=0.000;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.923;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=6;PP=229;ReadPosRankSum=0.113;SC=AGGAAGCTTGGATGTCAACAG;SOR=0.973;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=15;WE=74691948;WS=74691930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,16:0.28:58
chr18	74692336	rs9199	A	G	1072.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.124;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=809;ReadPosRankSum=-0.273;SC=GTTTTAAGGCAGTTATATTAA;SOR=1.001;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=67;TCF=38;TCR=29;TR=43;WE=74692344;WS=74692326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,44:0.66:67
chr18	74697040	rs62105660	A	G	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.732;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=276;ReadPosRankSum=0.646;SC=CCCCAGGTCTACCAGGGTGTT;SOR=0.083;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=29;TCF=24;TCR=5;TR=14;WE=74697048;WS=74697030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr18	74701984	rs470797	G	A	130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.506;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=83;ReadPosRankSum=-1.123;SC=GCAGGGAGCCGTAGTGAGCAG;SOR=1.863;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=21;TCF=15;TCR=6;TR=7;WE=74701992;WS=74701974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr18	74702089	.	G	C	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.359;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=6;PP=198;ReadPosRankSum=0.630;SC=AGGGAAGCTGGATCTCTCCTC;SOR=0.132;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=12;WE=74702097;WS=74702079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr18	74702864	rs9676113	G	A	1202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.962;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=13;PP=979;ReadPosRankSum=0.078;SC=CTCAGTGTGCGGCTCTCCTGA;SOR=0.311;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=67;TCF=49;TCR=18;TR=42;WE=74702872;WS=74702854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,43:0.62:69
chr18	74702999	rs9676140	C	G	896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=726;ReadPosRankSum=0.976;SC=GGGCTGAATACAGGAAAATGC;SOR=0.809;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=46;TCF=9;TCR=37;TR=28;WE=74703007;WS=74702989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,30:0.61:49
chr18	74721697	rs3752070	G	A	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.152;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=165;ReadPosRankSum=-0.638;SC=GAGGCTGGGGGTGGGCCCCTG;SOR=1.718;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=34;TCF=27;TCR=7;TR=11;WE=74721705;WS=74721687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,11:0.32:34
chr18	74779614	rs4890887	C	A	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=481;ReadPosRankSum=1.257;SC=CCTGGTGCTACCCACCAGCAG;SOR=1.112;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=20;WE=74779622;WS=74779604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,20:0.77:26
chr18	74779866	rs4890888	G	A	356.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.576;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=291;ReadPosRankSum=1.338;SC=ATGTACTGCAGGCTGTTTGTT;SOR=2.746;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=13;WE=74779874;WS=74779856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr18	74962447	rs13306375	A	G	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.458;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=48;ReadPosRankSum=0.174;SC=CCCGGCGCCTACTATCCCGCC;SOR=0.446;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=4;WE=74962455;WS=74962437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr18	74962645	rs5374	T	C	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.793;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=430;ReadPosRankSum=-1.072;SC=TCGCGCTGGGTGTGCTGGGCA;SOR=0.575;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=106;TCF=61;TCR=45;TR=31;WE=74962653;WS=74962635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,31:0.27:114
chr18	74980498	.	G	GCCT	221.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.179;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=2.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQRankSum=1.687;QD=10.56;ReadPosRankSum=-0.468;SOR=0.233;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
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chr18	74980809	rs5376	G	A	5089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=94;PP=2965;SC=ACTAAAGAAAGTAAAAGTCGA;SOR=1.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=155;TCF=61;TCR=94;TR=154;WE=74980817;WS=74980799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr18	76753588	rs7240860	A	G	3335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=69;PP=2701;SC=ACTGCCGCCCACTGTCCCTGG;SOR=1.440;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=38;TCR=69;TR=107;WE=76753596;WS=76753578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr18	76753768	rs2447437	C	G	2863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=66;PP=2177;SC=CGGGCCGCCCCTCACTAAAGC;SOR=2.229;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=24;TCR=66;TR=90;WE=76753776;WS=76753758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr18	76754466	rs2472644	C	T	4656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=88;PP=2965;SC=TCCTGTCCTACGCGGGGTCCT;SOR=0.988;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=67;TCR=88;TR=155;WE=76754474;WS=76754456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
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chr18	77156174	rs139536097	G	A	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=342;ReadPosRankSum=1.075;SC=CGGGGCGGCCGCTTCTCCTGT;SOR=0.223;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=9;WE=77156182;WS=77156161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr18	77156197	rs62096862	C	T	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=163;ReadPosRankSum=1.328;SC=CTCCGCCCGCCGCTCCACTCC;SOR=0.904;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=11;WE=77156205;WS=77156187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
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chr18	77209015	rs2278801	A	G	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=32;PP=984;SC=GGCCTCTGGCAGGGGGCGGTA;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=37;WE=77209023;WS=77209005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
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chr18	77402305	rs56014953	C	G	439.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.83;MQRankSum=0.640;QD=33.83;ReadPosRankSum=0.483;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,11:0.85:13
chr18	77420703	rs868678	C	G	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.001;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=698;ReadPosRankSum=1.522;SC=AGCTCCCTCCCGGGGTCTTTC;SOR=0.884;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=40;WE=77420711;WS=77420693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,42:0.60:70
chr18	77439532	rs3826573	T	C	1064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.539;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=31;PP=836;ReadPosRankSum=1.163;SC=CCCGCCATGCTCTGTCCGCGG;SOR=2.111;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=59;TCF=13;TCR=46;TR=37;WE=77439540;WS=77439522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,38:0.66:58
chr18	77440128	rs17855830	T	G	74.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=2;PP=60;SC=CGCGCAGTCCTCCGGGGCCTC;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=77440136;WS=77440118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr18	77455871	rs558700	C	T	1340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.300;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=13;PP=950;ReadPosRankSum=0.957;SC=AAGATAGCAGCGTGTGTCCGT;SOR=0.208;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=72;TCF=55;TCR=17;TR=47;WE=77455879;WS=77455861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,49:0.67:73
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chr18	77474921	rs2126082	G	A	2492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.507;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=63;PP=2035;ReadPosRankSum=-0.586;SC=GGCAGAAGCCGAAGGCTGCCC;SOR=0.877;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=142;TCF=43;TCR=99;TR=89;WE=77474929;WS=77474911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,89:0.63:141
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chr18	77694128	rs3837882	TA	T	2648.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.516;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.431;HP=13;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.294;NF=3;NR=110;PP=1553;ReadPosRankSum=-0.389;SC=TGCATTTCTTTAAAAAAAAAA;SOR=2.929;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=148;TCF=6;TCR=142;TR=113;WE=77694137;WS=77694118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,120:0.96:125
chr18	77694168	rs2277725	T	G	1943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.635;NF=1;NR=68;PP=1652;ReadPosRankSum=0.250;SC=GATCACAAGATTTTGGTTTTT;SOR=0.865;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=98;TCF=1;TCR=97;TR=69;WE=77694176;WS=77694158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,68:0.71:96
chr18	77728045	rs2298644	C	T	1787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=7;PP=1494;SC=TGTGCCTCGGCGGCTCTGGAC;SOR=3.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=47;TCR=7;TR=54;WE=77728053;WS=77728035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr18	77728135	rs2298645	G	T	4118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=61;PP=2965;SC=AGAATGTCAAGGACTTAATGG;SOR=0.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=124;TCF=62;TCR=62;TR=123;WE=77728143;WS=77728125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr18	77728221	rs35659527	T	C	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.997;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=460;ReadPosRankSum=-0.907;SC=CGTTTTCGTATGTTTTGACTG;SOR=0.291;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=77;TCF=16;TCR=61;TR=31;WE=77728229;WS=77728211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,30:0.37:82
chr18	77736735	rs4799116	T	C	5189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=80;PP=2965;SC=GAGGCTCCACTTTTGGAGAAT;SOR=0.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=75;TCR=80;TR=155;WE=77736743;WS=77736725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr18	77737810	rs147014161	TTTTTG	T	145.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.828;NF=0;NR=5;PP=137;ReadPosRankSum=-0.834;SC=ATCAGGGCAATTTTTGTTTTG;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=5;WE=77737822;WS=77737800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr18	77797321	rs748337	C	T	965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=10;PP=764;SC=GCTCTTCTTCCTGATGGAGAC;SOR=1.382;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=26;WE=77797329;WS=77797311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr18	77805949	rs3744873	A	C	3939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=54;PP=2965;SC=AACGCAGATGAAAAAGGGAAG;SOR=0.868;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=116;TCF=62;TCR=54;TR=116;WE=77805957;WS=77805939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr18	77894844	rs3744877	G	A	6753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=102;PP=2965;SC=AGGTGGTCCCGTCTGGGCTTC;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=214;TCF=112;TCR=102;TR=213;WE=77894852;WS=77894834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr18	77896699	.	C	CA	55	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5852;HP=14;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=15;MQ=61.53;NF=0;NR=4;PP=55;QD=14.75;SC=ATAAAACTTGCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=77896707;WS=77896689;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,4:0.33:12
chr18	77920282	rs138211063	A	G	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=85;ReadPosRankSum=-0.957;SC=AAAAAATAAAATGACACTTGT;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=6;WE=77920290;WS=77920279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr18	77926862	rs72978384	G	A	4392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=75;PP=2965;SC=ACTCTCTGGCGAGGAAGGGTG;SOR=0.985;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=60;TCR=75;TR=135;WE=77926870;WS=77926852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr18	77927028	rs1879105	A	G	1203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=33;PP=969;SC=GAGAGCTTGCACCGGGGTGGA;SOR=3.500;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=38;WE=77927036;WS=77927018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	281360	rs7815	C	T	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=2;PP=224;SC=GGACTCACAGCAGCTCCCTGC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=281368;WS=281350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	290947	rs8111051	C	A	222.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=4;PP=167;SC=GCCCGCGTGACTCACCTCCCA;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=290955;WS=290937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	312143	rs10416918	T	C	1224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=3;PP=1054;SC=CGGTCAGCAGTGCCCAGGGCG;SOR=3.556;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=38;WE=312151;WS=312133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	367251	rs117935266	T	G	2592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=57;PP=2136;SC=AGAGAAGGGTTACGTGAAACA;SOR=1.893;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=21;TCR=57;TR=78;WE=367259;WS=367241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	367313	rs585487	G	A	946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=735;ReadPosRankSum=-0.718;SC=GAGCAACACTGAAAGACACAA;SOR=2.517;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=27;WE=367321;WS=367303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr19	371396	rs644644	G	C	1501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.27;QD=34.92;SOR=7.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	372551	rs652081	A	G	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=6;PP=604;SC=CCTTTCCCACACAGCATCCTG;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=30;WE=372559;WS=372541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	373673	rs2303814	G	A	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=17;PP=621;SC=AAGGACAGTGGGGGGGCCGGC;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=373681;WS=373663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	373690	rs74176336	C	T	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=9;PP=355;SC=CGGCGGGACGCGTGGATTATT;SOR=1.061;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=15;WE=373698;WS=373680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	374016	rs2303815	G	A	3223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=69;PP=2525;SC=CCCTTCCTGCGAGGAGACAGG;SOR=2.078;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=98;TCF=27;TCR=71;TR=96;WE=374024;WS=374006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr19	374492	rs10410345	G	C	1187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=32;PP=932;SC=CCAGAGAAGCGTGGGTCTTGC;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=374500;WS=374482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	374547	rs648770	T	C	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=12;PP=393;SC=CCGCCTCTCCTTTCCCTCGAG;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=374555;WS=374537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	407809	.	G	A	2226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=33;PP=1797;SC=GCAGCTGCCCGGCGGCGCCCG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=34;TCR=33;TR=67;WE=407817;WS=407799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	407900	rs10411998	A	G	2119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=32;PP=1634;SC=GGGGGCTCTCAGCCAGCATGG;SOR=0.807;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=38;TCR=32;TR=70;WE=407908;WS=407890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	418769	rs12981152	G	A	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=1;PP=112;SC=TCTGGAATTCGACAGAGATGG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=418777;WS=418759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	422534	rs12984753	G	A	1290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.03;SOR=6.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	422543	rs2287958	G	A	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.88;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	422555	rs2287957	G	A	771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=22;PP=622;SC=GGAGTCCCTCGTGCACCCGTC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=422563;WS=422524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	425182	rs61735134	G	A	1203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=31;PP=921;SC=GCTCCTCGTGGTCCGGGGGGC;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=425190;WS=425172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	439055	rs112380345	G	A	1371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=38;PP=1172;SC=AGGGGGCTTAGAGAGTGTGGT;SOR=4.565;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=41;WE=439063;WS=439045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	460475	rs12980271	G	C	69.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.09;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	460668	rs189741717	C	G	110.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=22.18;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	463810	rs60512152	GC	G	153.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=0;PP=167;SC=AGGCCCGCCAGCCCCCCGTTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=6;WE=463818;WS=463800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	464310	rs34551779	A	G	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=23;PP=958;SC=CCGATGGCGCACAGGGGGCAC;SOR=0.883;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=18;TCR=23;TR=41;WE=464318;WS=464300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	498212	rs12461640	A	C	1198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=26;PP=935;SC=GATTGCAGGCAGGGTCCCAGC;SOR=1.501;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=39;WE=498220;WS=498202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	519018	rs145134429	C	T	2447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=43;PP=2010;SC=ACGGCCAAGCCCCCGAGGAGG;SOR=0.948;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=34;TCR=43;TR=77;WE=519026;WS=519008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	536068	.	G	A	534	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=33;MMLQ=28;MQ=56.85;NF=15;NR=12;PP=534;QD=21.0656004647;SC=GGAGCCTCACGTCCTCGTCCT;SbPval=0.03;Source=Platypus;TC=59;TCF=19;TCR=40;TR=27;WE=536076;WS=536058;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:32,27:0.46:59
chr19	536088	.	C	T	1872	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=28;MMLQ=27;MQ=57.07;NF=25;NR=12;PP=1872;QD=51.5343570959;SC=TTCCGGGACCCGAGGCGCTGG;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=56;TCF=28;TCR=28;TR=37;WE=536098;WS=536078;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:19,37:0.66:56
chr19	536088	.	C	CGGGGCGCTGGGAGCCTCACATCCTCGTCCTTCCGGGACCT	2213.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.32;QD=67.08;SOR=1.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	536090	.	A	G	713	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MMLQ=23;MQ=57.23;NF=4;NR=13;PP=713;QD=43.9865419145;SC=CCGGGACCCGAGGCGCTGGGA;SbPval=0.04;Source=Platypus;TC=54;TCF=28;TCR=26;TR=17;WE=536098;WS=536078;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:37,17:0.31:54
chr19	541685	rs7150	C	T	546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=18;PP=464;SC=CTTTTTCTCCCTCCCCATGTC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=541693;WS=541675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	544315	rs3760874	A	G	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=13;PP=408;SC=ACATCCCGGGACCGTGGGAGA;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=544323;WS=544305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	547224	rs4919846	A	G	2474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=18;PP=1796;SC=GGACAGTCGCAGCAGGCAGCA;SOR=2.468;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=62;TCR=18;TR=80;WE=547232;WS=547214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr19	547491	rs2070795	C	T	621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=19;PP=524;SC=CCGACGGCGCCCATTCTCTGC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=547499;WS=547481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	548865	rs12972174	C	T	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=0;PP=115;SC=TGCCGCCCCCCGCCCCCGCAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=548873;WS=548855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	549595	rs1599883	T	C	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=3;PP=543;SC=CCTCAGCAGGTGCAGAGGCTG;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=549603;WS=549585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	549678	rs1599882	A	G	2222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=33;PP=1654;SC=GGTGTTGGCCAGAGTCCTGTC;SOR=0.948;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=74;TCF=41;TCR=33;TR=74;WE=549686;WS=549668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	605171	rs12981860	T	C	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=469;SC=TCCTGGTGCCTATGCTGCAGG;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=605179;WS=605161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	613898	rs1054786	T	C	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=12;NR=13;PP=456;SC=GCGTGCGGGCTGACACCTACT;SOR=0.770;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=25;WE=613906;WS=613888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	616057	rs201222040	G	C	146.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=5;PP=116;SC=GGCCGCTGGCGCTCGGCTCGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=616065;WS=616047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	641215	rs7246140	T	C	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=23;PP=783;SC=CCCACCCTCCTGGGGCTCCCA;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=13;TCR=23;TR=36;WE=641223;WS=641205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	643104	.	G	GGAGGGGACTCGTGGTCTGGGGCAGGGGGGGCTCCTCGTGTCTGTCGTGGTCAT	534.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=178.24;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	646891	rs10403235	G	A	2461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=32;PP=1781;SC=CAGACACGTCGCGGGACACAG;SOR=0.908;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=41;TCR=32;TR=73;WE=646899;WS=646881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	647039	rs2074460	T	C	1402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=27;PP=1052;SC=CTCCGTTAGCTGTCTCCATCG;SOR=0.963;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=20;TCR=27;TR=47;WE=647047;WS=647029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	649110	rs2040736	G	C	78.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=3;PP=68;SC=GAGCCCGCCCGGGGTCGGAGA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=649118;WS=649100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	652206	rs8102953	G	A	1621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=23;PP=1276;SC=TGACACGATCGGGAAGCACGA;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=27;TCR=23;TR=50;WE=652214;WS=652196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	652948	rs10153505	T	G	2949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=73;PP=2404;SC=CCCCCCCAAGTGTGAGGACAG;SOR=3.767;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=11;TCR=73;TR=84;WE=652956;WS=652938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr19	676559	rs62134281	G	A	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=2;PP=50;SC=CGGGCGGGGCGGGCCACCCAC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=676567;WS=676549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	680378	rs7246311	C	T	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=10;PP=305;SC=CCCGGCGCGGCTGCAGGTCTG;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=680386;WS=680368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	685985	rs62131270	G	C	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=16;PP=466;SC=ATCTCACCACGGCCCTCCCTG;SOR=1.828;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=685993;WS=685975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	687142	rs8102982	G	A	2152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=48;PP=1719;SC=TCTCCCTGGCGGCCTCAGCAG;SOR=2.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=13;TCR=48;TR=61;WE=687150;WS=687132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	691909	rs4375794	T	C	1778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=32;PP=1351;SC=AGTCGGGGTGTGTGGTGAGAG;SOR=1.071;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=55;WE=691917;WS=691899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	725939	rs3787017	C	T	379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=316;SC=GGCAGAGCCTCGTCCCCTCCT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=725947;WS=725929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	726910	rs28452452	G	A	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=4;NR=0;PP=83;SC=TCCCCGGACAGAGGAAGCAGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=726918;WS=726900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	727209	.	G	GCCCTGACCCTGACCCCAA	456.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.13;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	727261	.	CAACCT	C	296	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=70;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=1;NR=3;PP=296;QD=79.75;SC=ACCCTGACCCCAACCTGACCC;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=4;WE=727273;WS=727251;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr19	727544	rs3746168	C	G	4063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=68;PP=2965;SC=ACGACTCTGACCTGGATCCCT;SOR=0.822;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=58;TCR=68;TR=126;WE=727552;WS=727534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr19	740272	rs7245884	C	T	1888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=51;NR=2;PP=1563;SC=CTGGCTCCCCCCTCCCTGGCT;SOR=5.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=51;TCR=2;TR=53;WE=740280;WS=740262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	740560	rs10419493	T	C	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=23;PP=550;SC=CGTGTGGGTCTGGCGTCTGCC;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=740568;WS=740550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	746206	rs2384776	C	T	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=0;PP=695;SC=GCCAAGGTTTCCCTCCTGCCT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=746214;WS=746196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	815086	rs351988	A	G	2750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=42;PP=2012;ReadPosRankSum=1.559;SC=GGACACCTGCAGGGCGGAAGG;SOR=0.223;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=46;TCR=43;TR=87;WE=815094;WS=815076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,94:0.99:95
chr19	840984	rs2074639	C	T	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=17;PP=829;SC=AGGAGCTTGACCGTGGGTGCA;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=23;TCR=17;TR=40;WE=840992;WS=840974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	844020	rs351111	G	A	1957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=41;PP=1461;SC=ACTGAACGACGTTCTCCTCAT;SOR=1.376;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=23;TCR=41;TR=64;WE=844028;WS=844010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	844077	rs351112	A	C	942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=29;PP=739;SC=GCACGGCCAGAGGGCTCCGGG;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=844085;WS=844067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	844147	rs150219073	G	C	302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=10;PP=246;SC=CCACGACCGAGGCCGCTGCAG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=844155;WS=844137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	853122	rs34535016	CG	C	246.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=4;NR=5;PP=185;SC=GGGCTGCTGGCGGGGGGGGGT;SOR=1.085;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=9;WE=853139;WS=853112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	868115	rs13090	C	T	1350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=9;PP=1052;SC=GGACGGTCCTCTGGATGCAGA;SOR=2.461;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=35;TCR=9;TR=44;WE=868123;WS=868105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	868524	.	G	A	1077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=29;PP=875;SC=GCACTGAGCGGGTTCCCACTT;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=34;WE=868532;WS=868514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	868551	rs1631848	T	C	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=23;PP=707;SC=GGGCCTCCCTTACGCCTGCCC;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=868559;WS=868541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	869037	rs1683591	A	G	79.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	871135	rs1683569	A	G	1255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=14;PP=905;SC=GCAGGCGGCTAACCAGGCCGT;SOR=1.236;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=37;WE=871143;WS=871125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	871447	rs1683570	A	G	1030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=2;PP=849;SC=GTGACCCCAGAGTTCTCTCCC;SOR=3.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=871455;WS=871437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	871724	rs73492568	G	A	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=28;PP=793;SC=ATGTTCTGGCGGGGGGCTCAG;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=31;WE=871732;WS=871714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	873743	rs1651888	G	A	290.89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.9992;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=237;ReadPosRankSum=1.648;SC=GTTGCCGGACGGAGAGGAACT;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=10;WE=873751;WS=873733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr19	884782	rs2965294	C	G	2591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=7;PP=2057;SC=CGAGGCGAGACGATCGCTTAG;SOR=3.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=67;TCR=7;TR=74;WE=884790;WS=884772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr19	897571	rs3746149	G	C	1116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=24;PP=967;SC=GCAAGAACGGGAGGAATTTGG;SOR=1.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=34;WE=897579;WS=897561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	899567	rs2930885	C	G	2366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=58;PP=2042;SC=GCCGCAGCCTCGGAGGGTCCG;SOR=2.617;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=15;TCR=58;TR=73;WE=899575;WS=899557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	913044	rs199619192	G	GC	132	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQ=62.65;NF=1;NR=1;PP=41;SC=AGGGAGCCCAGCCCGCCCCCG;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=2;WE=913052;WS=913034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	913048	rs1683587	G	C	170.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.13;QD=34.18;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	917526	rs10407968	A	G	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=6;PP=596;SC=CTACGTCCGGACCCAACGCGT;SOR=1.402;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=20;WE=917534;WS=917516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	920642	rs350132	T	A	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=14;PP=758;SC=GCGGAGCTGCTCCGCCTGGGG;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=14;TCR=14;TR=28;WE=920650;WS=920632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	929678	rs3826948	G	A	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=9;PP=702;SC=GAGAGCCCGAGAGTGCCCGGA;SOR=1.220;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=26;WE=929686;WS=929668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	929753	rs1799595	A	G	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=10;PP=757;SC=TGGGACACCCAGCCAGCCCCG;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=34;WE=929761;WS=929743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	960187	rs1637993	G	C	2038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=16;NR=49;PP=1685;SC=CCCCCACCCCGCTGGAGGGAG;SOR=2.531;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=16;TCR=49;TR=65;WE=960195;WS=960177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	960266	rs1683584	C	T	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=521;SC=GTGAGCACCCCGTGGCTGGAG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=960274;WS=960256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	964434	rs2240615	G	A	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=26;PP=765;SC=CGGACCCAGTGAGTGGCGGAC;SOR=2.517;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=32;WE=964442;WS=964424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	965043	rs12608658	T	C	1278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=31;PP=1000;SC=CAAGCACCAATGGCAGCTCCA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=46;WE=965051;WS=965033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	966458	rs71335324	CA	C	121.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.41;QD=15.22;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	966693	rs6510986	C	T	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=37;PP=1596;SC=CAGCTGTGGCCGCACAGGCAG;SOR=1.214;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=61;TCF=23;TCR=38;TR=60;WE=966701;WS=966683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	968318	rs8105235	C	T	602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=1;PP=480;SC=GAGATCGCGCCACTGCACTCC;SOR=5.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=19;WE=968326;WS=968308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	968345	rs7251219	CA	TG	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=3;PP=1284;SC=GGCAACAGAGCAAGACTCTGT;SOR=3.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=24;WE=968354;WS=968335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	971933	rs1051504	A	G	1119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=23;PP=1128;SC=CCAACAAAGGAGGCGGCGGCG;SOR=0.846;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=19;TCR=23;TR=42;WE=971941;WS=971923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	971949	rs1051505	G	A	1475.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=25;PP=1244;SC=CGGCGGCGGCGGCAGCAGCAG;SOR=0.846;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=45;TCF=19;TCR=26;TR=44;WE=971957;WS=971939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	990281	rs2158367	G	A	2730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=49;PP=2101;SC=GTCTCACCACGCGCTCCCCAT;SOR=0.878;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=42;TCR=49;TR=91;WE=990289;WS=990271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr19	991196	rs60416441	CGTCCCAG	CCCCAG,C	3828.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=31;PP=2957;SC=CTGTCTGGCACGTCCCAGGTG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=51;WE=991212;WS=991186;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:88
chr19	991199	rs201372013	CCCAGG	C	3829.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.52;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr19	991204	.	G	C	1681	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=28;NR=31;PP=1681;QD=29.0808680093;SC=CACGTCCCAGGTGACCCCTGT;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=78;TCF=39;TCR=39;TR=59;WE=991212;WS=991186;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:19,59:0.76:78
chr19	991361	rs190264646	C	G	1179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=3;NR=34;PP=944;SC=GGTGGGCGCGCCTCTGCTCGG;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=37;WE=991369;WS=991351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	991892	rs71335285	T	C	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=261;SC=GGGGCGGAACTTGGCTTGCTG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=991900;WS=991882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	991968	rs1127043	T	C	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=9;PP=664;SC=CAGTCACCAATGCCGCCATCC;SOR=1.885;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=991976;WS=991958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	1004718	.	G	A	4071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=66;PP=2965;SC=CACGGCCCCCGCCCCCACAGG;SOR=0.820;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=131;TCF=62;TCR=69;TR=127;WE=1004726;WS=1004708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr19	1031340	rs12978059	C	G	266.56	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=269;ReadPosRankSum=1.207;SC=AGGGTGGTGGCGGGGGGCGGT;SOR=1.981;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=12;WE=1031348;WS=1031330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr19	1037715	rs200177867	T	C	295.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.395;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQRankSum=-1.471;QD=24.65;ReadPosRankSum=-0.928;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr19	1037716	rs201532581	G	A	295.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.050;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.42;MQRankSum=-1.471;QD=24.65;ReadPosRankSum=-0.928;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr19	1037718	rs199741851	G	T	295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.744;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.18;MQRankSum=-1.616;QD=26.89;ReadPosRankSum=-0.095;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr19	1037731	rs75808449	C	T	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.394;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.233;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.90;MQRankSum=-1.383;QD=25.08;ReadPosRankSum=0.115;SOR=0.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr19	1037749	rs77454210	G	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.091;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=4.832;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQRankSum=-2.015;QD=15.92;ReadPosRankSum=2.030;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr19	1037756	rs77830704	G	A	280.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.498;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=4.752;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.35;MQRankSum=-2.610;QD=16.52;ReadPosRankSum=0.188;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr19	1037766	rs78386506	G	A	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=5.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.14;MQRankSum=-2.232;QD=16.12;ReadPosRankSum=-2.127;SOR=0.557;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
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chr19	1037869	rs75014171	C	T	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.16;MQRankSum=-2.515;QD=8.53;ReadPosRankSum=0.751;SOR=0.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr19	1037869	.	CCC	TCA	441	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=4;HapScore=4;MGOF=26;MMLQ=28;MQ=54.16;NF=0;NR=3;PP=441;QD=164.822624954;SC=CTGAATATCCCCCTTACTACC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=1037879;WS=1037818;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr19	1037871	rs78251590	C	A	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.39;MQRankSum=-2.369;QD=9.97;ReadPosRankSum=0.732;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr19	1074064	rs12610818	C	G	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=18;PP=1030;SC=GGCCATTGCGCGGGTCGGGCC;SOR=0.874;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=24;TCR=18;TR=42;WE=1074072;WS=1074054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	1074315	rs12974537	C	T	2229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=40;PP=1733;SC=CTTGTCCCAGCACCTCACACC;SOR=1.061;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=31;TCR=40;TR=71;WE=1074323;WS=1074305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	1079959	rs36084354	G	A	4325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.853;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=73;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.804;SC=TGATGCATATGCAGACGGCGC;SOR=0.287;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=136;TCF=62;TCR=74;TR=135;WE=1079967;WS=1079949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,138:0.99:139
chr19	1090020	rs61585798	TG	T	1051.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=21;NR=10;PP=696;SC=GGGGTGTGTGTGGGGGGGGAA;SOR=1.949;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=31;WE=1090028;WS=1090010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	1094004	rs12459404	G	A	2784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=33;PP=2130;SC=CTTGTCCCCAGATTGGGCTTT;SOR=1.265;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=59;TCR=33;TR=92;WE=1094012;WS=1093994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr19	1108090	rs80050348	G	C	299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=206;SC=GTCGGGCGCTGAAGGCACTGC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=1108098;WS=1108080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	1108399	.	G	A	154.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=2;PP=139;SC=TGATGTCGCAGCCCTGGTGCG;SOR=1.329;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=1108407;WS=1108389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	1268178	rs12975875	G	A	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=2;PP=319;SC=GGGGCAGAGAGGCAGGGGTCC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=1268186;WS=1268168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	1270231	rs56378951	GC	G	860.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=29;PP=541;SC=CTGACAGCCAGCCCCCCCCCC;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=29;WE=1270239;WS=1270221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	1271274	rs12609287	C	T	4217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=48;PP=2965;SC=AGCAGGAGTCCCGTCTCGAGG;SOR=1.270;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=77;TCR=48;TR=125;WE=1271282;WS=1271264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr19	1271529	rs4807050	C	T	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=27;PP=941;SC=AGCTGGTACTCACTTTTTCCT;SOR=2.247;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=37;TCF=10;TCR=27;TR=37;WE=1271537;WS=1271519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	1272040	rs12488	T	C	1508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=19;PP=1197;SC=GAGACAGTTATGACAGTTACG;SOR=1.201;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=30;TCR=19;TR=49;WE=1272048;WS=1272030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	1274539	rs8108009	T	C	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=25;PP=593;SC=TATGGCCCCATGGCGGGCGCC;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=26;WE=1274547;WS=1274529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	1277275	rs757292	G	C	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=34;PP=1190;SC=AGGAGACGGTGTTTGAGTCCC;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=49;WE=1277283;WS=1277265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	1356516	rs149297811	CAGG	C	3563.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=46;PP=2826;SC=AAATCTTGATCAGGAGATACC;SOR=2.026;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=62;TCF=15;TCR=47;TR=59;WE=1356526;WS=1356506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	1357082	rs713042	T	C	2423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=58;PP=2035;SC=AAATCCTCTCTCTAGAGGAAA;SOR=3.026;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=11;TCR=59;TR=69;WE=1357090;WS=1357072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	1358726	rs2285972	C	T	2280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=52;PP=1754;SC=TCTCGTACCCCCGTGGCCTCC;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=14;TCR=52;TR=66;WE=1358734;WS=1358716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	1360575	rs3826942	G	A	4972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=56;PP=2965;SC=TAAGAGGGGAGGAAACTCAGC;SOR=1.304;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=92;TCR=56;TR=148;WE=1360583;WS=1360565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr19	1366179	rs72377165	CGCTGGGGTCACCCCCAGA	C	1223.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=2;PP=2957;SC=CGGGAGACTTCGCTGGGGTCA;SOR=4.407;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=9;WE=1366204;WS=1366169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	1366422	rs2668418	C	G	1614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=47;PP=1454;SC=GCCTGAGGGGCCAGGCCGGCC;SOR=4.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=4;TCR=47;TR=51;WE=1366430;WS=1366412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	1367412	rs72983524	A	G	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=23;PP=665;SC=GAATTCTCACAACTGTCCTGG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=1367420;WS=1367402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	1389252	rs116889903	G	A	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=8;PP=687;SC=ACACTCATGCGCACATATACA;SOR=1.697;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=25;WE=1389260;WS=1389242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	1422297	rs117240167	C	T	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=4;PP=578;SC=CGGAAGACCACCTGTGGTGCT;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=1422305;WS=1422287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	1453705	rs12985827	T	C	472.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=366;ReadPosRankSum=-0.836;SC=CATATGTCTCTGCCCACACCT;SOR=3.160;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=19;WE=1453713;WS=1453695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr19	1455933	rs146334923	C	CAGAGTCAGAGCCCAGGGCGAAGTCATCCCAGGA	1062.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=70.85;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	1456544	rs2656869	A	G	137.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=4;PP=107;SC=TCTGGCGTGCAGCTCATGCAG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=1456552;WS=1456534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	1456730	rs3896893	G	T	75.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=54;SC=CCCCTCATCTGTCCCCCAGGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=1456738;WS=1456720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	1457875	rs12005	G	A	43.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	1467684	rs265273	A	C	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=16;PP=621;SC=GGGCAAGAACAGAGCAGGGCT;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=27;WE=1467692;WS=1467674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	1487083	rs4807119	C	T	2561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=35;PP=2007;ReadPosRankSum=0.201;SC=CCAGGAGGGGCGGGGAGGGGG;SOR=0.360;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=47;TCR=35;TR=81;WE=1487091;WS=1487073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,86:0.99:87
chr19	1488147	rs4807120	C	T	2063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=43;PP=1816;SC=AGGGCGCCAGCGGCCCCGTCC;SOR=1.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=21;TCR=43;TR=64;WE=1488155;WS=1488137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	1510661	rs265291	A	G	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=2;PP=353;SC=GGCTGCGCACAGAGACGCCAC;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=1510669;WS=1510651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	1533868	.	TGTGGGGGCGAGGG	T	827	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=827;QD=287.333333333;SC=GGGTGCTGGGTGTGGGGGCGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=3;WE=1533891;WS=1533858;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,3:0.50:6
chr19	1533869	rs61257352	GT	G	143	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.75;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	1533871	rs201797915	GGGGGCGAGGGGT	G	143	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.75;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	1533883	.	T	G	88	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;FR=1.0000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=3;NR=0;PP=88;QD=40.9237375157;SC=GGGCGAGGGGTGGGGACGCCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=3;WE=1533891;WS=1533858;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,3:0.75:4
chr19	1533972	rs11084897	C	G	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=4;PP=412;SC=TGGACCCGGCCTCTGCCTCCT;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=1533980;WS=1533962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	1534042	rs10853954	T	C	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=9;PP=855;SC=ATGGTGCAGGTGAGCCCGGGG;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=1534050;WS=1534032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	1534155	rs11084898	A	G	265.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.07;MQRankSum=0.632;QD=24.16;ReadPosRankSum=1.207;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr19	1534191	rs10775585	C	T	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.57;QD=45.30;SOR=4.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	1534198	rs12608783	A	G	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.54;QD=43.04;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	1534215	rs11084899	T	C	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=301;SC=GGAAAATGCATGACGTTTTTG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=1534223;WS=1534205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	1535084	rs12984316	G	A	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=13;PP=830;SC=GTGGAGTCCCGGCCCAACTGG;SOR=1.209;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=20;TCR=13;TR=33;WE=1535092;WS=1535074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	1535193	rs58035688	GCCC	G	3043.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=24;PP=2254;SC=CCACGGCTGCGCCCCCACCAC;SOR=1.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=31;TCR=25;TR=53;WE=1535213;WS=1535183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	1535205	rs265282	G	C	3169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=27;PP=1507;SC=CCCCACCACCGGACAGCACCT;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=40;TCR=27;TR=67;WE=1535213;WS=1535183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	1535291	rs12462146	G	A	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=29;PP=993;SC=GGTAGTGCCAGGGACCCAGGC;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=35;WE=1535299;WS=1535281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	1535349	rs265281	G	A	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=583;SC=CCTGGGGGAGGGCTGGGGGGC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=1535357;WS=1535339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	1555434	.	A	AC	207	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;FR=1.0000;HP=9;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=23;MQ=61.19;NF=0;NR=7;PP=207;QD=33.4285714286;SC=GCCGCCGCCCACCCCCCTGCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=1555442;WS=1555424;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,7:0.88:8
chr19	1622116	rs2240590	G	A	1211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=15;NR=22;PP=938;SC=CCACCGGGCCGCTACCGGGCG;SOR=1.096;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=15;TCR=22;TR=37;WE=1622124;WS=1622106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	1646221	rs2302419	C	T	1689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.411;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.491;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=4;PP=1451;ReadPosRankSum=-0.051;SC=TCGCTGCCCCCGACCCGGCCT;SOR=4.575;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=54;TCF=49;TCR=5;TR=52;WE=1646229;WS=1646211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,52:0.96:54
chr19	1650134	rs1860661	A	G	1803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=23;SC=TGAACTGTGGAGGCAAAGGGG;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=32;TCR=23;TR=55;WE=1650142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	1783261	rs2385387	C	T	2416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.21;ReadPosRankSum=-0.596;SOR=0.263;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,79:0.99:80
chr19	1784890	rs3764605	A	G	1652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=29;PP=1267;ReadPosRankSum=1.264;SC=TTATGGACACACTCAGCAGGA;SOR=0.338;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=24;TCR=30;TR=53;WE=1784898;WS=1784880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,57:0.98:58
chr19	1784944	rs3764606	A	G	1034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=24;PP=751;SC=TGAGGTCGGCATCTGGGGACA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=7;TCR=24;TR=31;WE=1784952;WS=1784934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	1785772	rs8110462	T	C	1478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=39;PP=1160;SC=GAGATCAGGATCTCCTCGGGC;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=44;WE=1785780;WS=1785762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	1789385	rs200289706	A	C	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=7;PP=1068;SC=TGTCGTTGGCACCGTCCCCGA;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=40;WE=1789393;WS=1789375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	1799763	.	CA	C	61.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.588;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.81;ReadPosRankSum=-0.636;SOR=0.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr19	1806210	rs7252063	A	C	834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=21;PP=686;SC=CTCCCTCTGCAAACCCTCCCC;SOR=2.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=26;WE=1806218;WS=1806200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	1809836	rs8107742	T	C	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=22;PP=496;SC=ACCCAGGCACTGGGGAGGCCC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=1809844;WS=1809826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	1810605	rs716993	T	C	1775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=23;PP=1332;SC=CCGCCCCCTCTGCCCAGGATC;SOR=0.986;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=32;TCR=23;TR=55;WE=1810613;WS=1810595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	1811462	rs45535339	C	T	1396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=9;PP=1177;SC=CCCTGTGTTCCGGCCACCCGA;SOR=2.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=41;WE=1811470;WS=1811452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	1811547	rs12609187	A	G	2954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.647;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=34;PP=2138;ReadPosRankSum=-1.026;SC=GCCTCCTCTCAGGTGCCCCTC;SOR=0.314;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=101;TCF=67;TCR=34;TR=99;WE=1811555;WS=1811537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,108:0.98:110
chr19	1817134	.	C	CCCAGATGGGG	805.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=2343;SC=GTGAGCCAGGCCCAGATGGGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=8;WE=1817142;WS=1817124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	1818459	rs1610106	A	G	555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=3;PP=456;SC=TGGGAAGGGGAAGGACCCGGG;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=1818467;WS=1818449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	1818952	rs893538	C	G	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=6;PP=804;SC=CCGTGTGGCACAGCAGGGGCT;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=1818960;WS=1818942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	1819234	rs113598561	ACT	A	952.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=17;PP=910;SC=CTCTGCCTCAACTCCCCCTTT;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=1819243;WS=1819224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	1821637	rs4807145	A	G	2217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=47;PP=1687;ReadPosRankSum=-0.732;SC=CCGTTGGAGGACTGGCTGCCG;SOR=0.735;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=69;TCF=21;TCR=48;TR=68;WE=1821645;WS=1821627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,72:0.99:73
chr19	1825786	rs59277540	T	TA	131.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=8.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.76;MQRankSum=1.213;QD=8.78;ReadPosRankSum=-0.067;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr19	1848243	rs12984809	A	G	427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.55;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	1880950	rs4807160	T	C	1296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=28;PP=988;SC=CCCCAGCTCTTGCCCAGCAGG;SOR=1.203;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=45;WE=1880958;WS=1880940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	1908694	rs4806818	C	T	647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=16;PP=539;SC=AACAGGGTCTCTCTATCTTGC;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=1908702;WS=1908684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	1914795	rs11666645	C	T	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=3;PP=334;SC=GCACTGGAGCCGAGGGGAGGG;SOR=2.147;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=1914803;WS=1914785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	1914940	rs11084918	A	G	2034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=22;PP=1557;SC=TGCCCAGGGCAGCTCAGGGTT;SOR=1.739;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=72;TCF=49;TCR=23;TR=71;WE=1914948;WS=1914930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	1915118	rs10853957	A	C	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=18;PP=599;SC=GCCGTTGGCAAACAGTGTCCT;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=22;WE=1915126;WS=1915108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	1918023	rs10415845	T	C	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=0;PP=970;SC=ATGGGGTCACTGGGCTGGGGA;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=1918031;WS=1918013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	1918760	rs376128461	CA	C	316.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=14;NR=0;PP=171;SC=GACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=14;WE=1918768;WS=1918750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	1924076	rs7255232	TC	CT	2888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=8;PP=2947;SC=TCATTTTCTGTCTTCTGCCTC;SOR=3.750;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=54;TCR=8;TR=61;WE=1924085;WS=1924066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	1952841	rs2396366	T	C	3275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=47;PP=2459;ReadPosRankSum=-0.106;SC=GGCCGAACCCTGCTGTGCCCT;SOR=1.009;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=65;TCR=48;TR=111;WE=1952849;WS=1952831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,114:0.98:116
chr19	1953637	rs35628322	C	T	523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=10;PP=470;SC=CAGCTCTGCCCGTGGCCCTCA;SOR=1.244;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=7;TCR=10;TR=17;WE=1953645;WS=1953627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	1954126	rs34622118	C	CA	5259.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=72;PP=2957;SC=GCACCTGATGCGTTAAACCCA;SOR=2.053;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=100;TCF=21;TCR=79;TR=90;WE=1954136;WS=1954116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr19	1954128	rs34797288	T	C	5268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=72;PP=2755;SC=ACCTGATGCGTTAAACCCATT;SOR=2.183;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=101;TCF=24;TCR=77;TR=96;WE=1954136;WS=1954116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr19	1970013	rs35089119	C	G	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=485;SC=AGGGCCGCCCCGAGTCACCGG;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=1970021;WS=1970003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	2041032	rs2287003	T	C	2549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=12;PP=2168;SC=GTGCGGCTGGTACTCACCCCC;SOR=3.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=70;TCR=12;TR=82;WE=2041040;WS=2041022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	2042886	rs7253052	A	G	921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=23;PP=811;SC=AGGGCAGGGCAGGGCAGGACA;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=2042894;WS=2042876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	2129067	rs142361260	A	G	1180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=6;PP=907;SC=GCCCGCCCCCACCGCGCATGG;SOR=2.531;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=38;WE=2129075;WS=2129057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	2214057	rs2074552	C	T	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=21;PP=637;SC=GTCCTCTGTGCGGGTGGGAGG;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=2214065;WS=2214047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	2217023	rs141523228	C	T	2783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=53;PP=2080;SC=TGAAGCTGAGCCCTCAGGACC;SOR=1.414;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=32;TCR=53;TR=85;WE=2217031;WS=2217013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr19	2244903	rs6510652	T	G	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=356;SC=CCTGGGCGCTTGAGTACGGTT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=2244911;WS=2244893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	2246652	rs2074861	G	A	1063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=2;PP=854;SC=GGCCTCCCCCGGGGTCCCGCT;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=32;WE=2246660;WS=2246642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	2249477	rs10407022	G	T	2097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=32;PP=1676;SC=CCTCCAGGCAGCCCACAAGAG;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=33;TCR=33;TR=65;WE=2249485;WS=2249467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	2251512	rs7252789	T	A	282.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=4;PP=262;SC=TCTGCCCAGGTGGCCCCGGCG;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=2251520;WS=2251502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	2251817	rs10417628	T	C	2162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=59;PP=1735;SC=AAGATGCAGGTCCGTGGGGCC;SOR=5.486;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=62;TCF=3;TCR=59;TR=62;WE=2251825;WS=2251807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	2255080	.	A	C	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.980;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=533;ReadPosRankSum=-0.790;SC=GGGGTTGAACATGGGGAGCAC;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=21;WE=2255088;WS=2255070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr19	2324060	rs2302057	G	A	229.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=1;PP=185;SC=CCCTCGTCCCGCTGCCCCCCT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=2324068;WS=2324050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	2324113	rs140121434	A	AC	2013.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=53;NR=2;PP=2251;SC=CTCGGCCGCCACCCCACTCAC;SOR=6.027;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=59;TCR=2;TR=55;WE=2324121;WS=2324103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr19	2324384	rs10404826	A	G	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=21;PP=621;SC=GCAGCAGACCACGTCTGCGGG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=2324392;WS=2324374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	2328281	rs11666344	G	A	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.54;SOR=5.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	2337377	rs3752204	C	G	1693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=10;PP=1417;SC=GGTGGGAGAACGGGCAGCTGG;SOR=2.790;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=51;WE=2337385;WS=2337367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	2337408	rs55710409	C	T	2390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=21;PP=1913;SC=TGACTCACATCACGTGAGACA;SOR=1.949;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=50;TCR=21;TR=71;WE=2337416;WS=2337398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	2339773	rs60107832	G	A	2414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=9;PP=1908;SC=CCCGAGCCCCGTGTCGGCCAG;SOR=3.884;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=66;TCR=9;TR=75;WE=2339781;WS=2339763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	2339949	rs3746285	T	C	5781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.99;QD=43.47;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr19	2339958	rs1609752	T	C	5564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=59.99;NF=31;NR=91;PP=2965;SC=ATTTCTACGATCTCCTCGGTG;SOR=2.157;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=123;TCF=31;TCR=92;TR=122;WE=2339966;WS=2339952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr19	2340154	rs5826760	G	GC	1547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=32;PP=1521;SC=TGCGGCGGCTGCCTTCGGCAA;SOR=2.409;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=37;WE=2340162;WS=2340144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	2341047	rs55818311	C	T	3423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.196;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=67;PP=2662;ReadPosRankSum=0.920;SC=CGGCGGGCAGCGGAGTCCTCG;SOR=1.091;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=42;TCR=67;TR=108;WE=2341068;WS=2341037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr19	2341060	rs7245824	T	C	2596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=54;PP=1850;SC=AGTCCTCGGGTGCACCAGGGC;SOR=1.203;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=35;TCR=54;TR=89;WE=2341068;WS=2341037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr19	2341192	rs55856585	TG	T	3679.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=29;PP=2628;SC=GCGTTTCACCTGGGGTTTGTC;SOR=1.473;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=75;TCF=42;TCR=33;TR=69;WE=2341200;WS=2341182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	2341209	rs7246088	T	C	3971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=35;PP=2243;SC=TGTCCGGGTGTCATGGGAACC;SOR=1.354;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=58;TCR=36;TR=93;WE=2341217;WS=2341199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr19	2341488	rs76434007	T	A	1811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=36;PP=1435;SC=ACCTCCCACGTGGCCTGGACT;SOR=1.316;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=23;TCR=36;TR=59;WE=2341496;WS=2341478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	2341674	rs3210	G	C	1665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=28;PP=1278;SC=GTGTGTATTGGAGCCACGGCA;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=22;TCR=28;TR=50;WE=2341682;WS=2341664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	2344034	rs17852546	C	A	43.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=3;PP=55;SC=CCTTCCTGACCAAGGTAGGCG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=2344042;WS=2344024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	2344484	rs55704748	A	G	4406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.845;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=55;PP=2965;ReadPosRankSum=0.262;SC=CGGAGCGGATAGGGCTCGAGG;SOR=0.844;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=82;TCR=56;TR=137;WE=2344492;WS=2344474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,142:0.99:143
chr19	2353148	rs10402284	T	C	2895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=73;PP=2393;SC=CCCAGCTGAATCCGAGGGCCG;SOR=2.935;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=16;TCR=73;TR=89;WE=2353156;WS=2353138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr19	2363785	rs143993232	TGA	T	133	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=160;SC=ACTCTGTGTGTGAGTGTGTGT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=2363794;WS=2363775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	2363803	rs78434388	C	T	207.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=155;SC=TGTGTGTGTGCGTGCGCGCGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=2363811;WS=2363793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	2389872	rs891174	G	C	2617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=45;PP=2149;SC=CGAGCGGCCAGCATTGGCGTG;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=40;TCR=45;TR=85;WE=2389880;WS=2389862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	2389954	rs891175	G	A	2528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.86;SOR=2.342;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	2389958	rs891176	T	A	2553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.80;SOR=2.794;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	2424961	rs148871041	G	A	707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=1;PP=555;SC=CCGGGGGCGTGGGGGCTCGGG;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=2424969;WS=2424951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	2520716	rs1133692	T	C	1753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=34;PP=1293;SC=GCCCCGTTGTTCAGAGAGCTG;SOR=1.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=16;TCR=34;TR=50;WE=2520724;WS=2520706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	2520791	rs3764585	C	A	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=21;PP=701;SC=CAGGGGCGCCCGGCCTTGGCT;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=2520799;WS=2520781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	2524477	rs4807289	T	C	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=9;PP=271;SC=CATGTATGTGTGTATGTGTAT;SOR=1.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=15;WE=2524485;WS=2524467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	2538074	rs71337145	C	CAAACA	411.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=236;SC=GACTCTCTCTCAAACAAAACA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=2538082;WS=2538064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	2538760	rs7250546	A	T	2815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=77;PP=2390;SC=AGATATATATATTTTTCTTTT;SOR=4.615;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=7;TCR=78;TR=84;WE=2538768;WS=2538750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	2538808	rs142216309	C	T	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=22;PP=626;SC=ACTCTGTCTCCCAGGCTGGAG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=2538816;WS=2538798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	2557323	rs71929279	GCA	G	1734.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=5;PP=1703;SC=ACACACATGTGCACACAGACA;SOR=3.664;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=36;WE=2557332;WS=2557313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	2557392	rs10421267	C	G	2699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=36;PP=2182;SC=CACGCAGGAGCGAGCGCCTCC;SOR=1.080;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=51;TCR=37;TR=86;WE=2557400;WS=2557382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	2576272	rs1029753	T	C	1457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=47;PP=1182;SC=CCCAGGGGACTGCAGCAAAAA;SOR=4.575;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=4;TCR=47;TR=51;WE=2576280;WS=2576262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	2717880	rs7343093	A	G	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=23;PP=618;SC=GAGCCTGTGCAGAGAGGAGGG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=24;WE=2717888;WS=2717870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	2732986	rs759073	T	C	2483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=33;PP=2087;SC=TCATGGCGCTTACGGTGACCG;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=40;TCR=33;TR=73;WE=2732994;WS=2732976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	2759456	rs147913895	G	GC	1180.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=38;PP=1119;SC=CTACATTTTCGCCCCCCCACC;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=38;WE=2759464;WS=2759446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	2834373	rs17605476	C	T	2254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=21;PP=1753;SC=AGAAGCCCTACGGGTGCGGTG;SOR=1.678;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=43;TCR=21;TR=64;WE=2834381;WS=2834363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	2841656	.	G	C	95.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=6;PP=90;SC=GGGGAGCTGAGGGACGCGGGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=2841664;WS=2841646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	2852744	rs35627030	C	T	3742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.595;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=65;PP=2844;ReadPosRankSum=0.235;SC=CTGAGAAAACCTACGAATGTA;SOR=0.673;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=46;TCR=65;TR=110;WE=2852752;WS=2852734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,118:0.99:119
chr19	2853566	rs10412087	A	G	3896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=79;PP=2965;SC=ATATGAGAAGACATACCGCAG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=41;TCR=80;TR=119;WE=2853574;WS=2853556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr19	2867583	rs8104536	C	A	147.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=121;SC=CCTCCCCTGCCCCAGTCTTCA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=2867591;WS=2867573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	2896818	rs8100809	C	T	1767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=25;PP=1393;SC=CAAATGTCCTCGAAAAGATGA;SOR=0.841;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=29;TCR=25;TR=54;WE=2896826;WS=2896808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	2896948	rs8104326	T	C	1886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.88;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	2896953	rs8101379	A	G	1861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.41;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	2897133	rs8103080	G	A	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=7;PP=249;SC=TTTTTCTCCCGTGTGCATTCT;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=2897141;WS=2897123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	2900865	rs10420989	G	A	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=55;SC=GGGGCTTAGAGATTGTCCAAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=2900873;WS=2900861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	2900930	rs12981209	C	T	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=449;ReadPosRankSum=-0.417;SC=TTCGTCCTCCCTGCCGCGCGT;SOR=1.358;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=18;WE=2900938;WS=2900920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr19	2901114	rs11279103	CGCCGAAGTCT	C	1043.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=2967;SC=AACCAGAGTCCGCCGAAGTCT;SOR=4.091;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=17;WE=2901131;WS=2901104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	2915738	rs2043336	T	A	1989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=50;PP=1619;SC=GGGAAAGGACTAAGACAGACA;SOR=4.103;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=6;TCR=50;TR=56;WE=2915746;WS=2915728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	2916048	rs2043335	T	A	2116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=6;PP=1805;SC=CTTATTCCTTTTGAGATTTGT;SOR=4.310;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=58;TCR=6;TR=63;WE=2916056;WS=2916038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	2917186	rs2288959	T	C	3094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=49;PP=2345;SC=ACGGAAGAACTGACACTGAGG;SOR=0.896;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=55;TCR=49;TR=104;WE=2917194;WS=2917176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr19	2917612	rs10410539	T	C	2669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=48;PP=2158;SC=GGATCCACACTGGGGACAAAC;SOR=0.784;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=42;TCR=48;TR=90;WE=2917620;WS=2917602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	2933480	rs3786948	C	T	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=399;SC=CCACTGTATTCGTAGATTCAC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=2933488;WS=2933478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	2934282	rs3746073	T	C	1621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=24;PP=1299;SC=CTCGAAAGTATGAGGGACAGC;SOR=0.970;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=55;WE=2934290;WS=2934272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	2936443	rs7251272	A	G	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=3;PP=450;SC=CCCTGTGCCCAGCCGATACTT;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=2936451;WS=2936433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	2936623	rs4807371	C	T	1503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=25;PP=1210;SC=ACTTTACAATCTCTTCATCAT;SOR=0.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=20;TCR=25;TR=45;WE=2936631;WS=2936613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	2939268	rs10410034	A	G	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=1;PP=1054;SC=AGGGAATGACACCACCCTTAC;SOR=6.229;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=46;WE=2939276;WS=2939258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	2978135	rs445657	G	C	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=5;PP=819;SC=CGGGTGCCTTGCTTCCCTGGC;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=2978143;WS=2978125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	2989810	rs504199	G	T	1103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=28;PP=912;SC=GGAAGGGGAAGCATCCTGTGC;SOR=2.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=2989818;WS=2989800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	2991814	rs428113	T	C	2137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=28;PP=1640;SC=CTTGACCTGATTGCCTCCCGA;SOR=0.990;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=35;TCR=28;TR=63;WE=2991822;WS=2991804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	2994814	rs439808	T	C	825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=11;PP=550;SC=TTTGAAGAGATGATGCTTCAT;SOR=1.071;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=17;TCR=11;TR=28;WE=2994822;WS=2994804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	3053802	rs425485	T	C	1090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=20;PP=812;SC=CCAACCTCCCTGTCCCGGCCC;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=19;TCR=20;TR=39;WE=3053810;WS=3053792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	3054089	rs2302301	C	T	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=3;PP=51;SC=ACCTGTCCCCCGCCCACCCGC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=3054097;WS=3054079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	3056285	rs58280427	G	C	396.41	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.02;ReadPosRankSum=0.559;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,16:0.89:18
chr19	3061344	rs62125457	G	A	280.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=8;PP=217;SC=GCGCAGCTGCGGCGCCCCCCC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=3061352;WS=3061334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	3150238	rs310680	A	G	2285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=53;PP=1907;SC=ATCCGGGCCTACTATGAGCGT;SOR=2.030;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=20;TCR=53;TR=73;WE=3150246;WS=3150228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	3186085	rs11551095	G	T	1314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=14;PP=1063;SC=CTTGTCTGCCGCTCGGCTTCA;SOR=1.347;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=41;WE=3186093;WS=3186075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	3193180	rs538197	C	G	290.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=210;SC=GGGACAGTCACTGGGCCCCCT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=3193188;WS=3193170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	3193484	rs499877	A	G	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=13;PP=349;SC=AGGCGTCCCCATCCCAAGGGC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=3193492;WS=3193474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	3196122	rs311615	T	C	1510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=5;PP=1246;SC=GTGCTGGGGATGCCCCCTGGC;SOR=4.047;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=44;TCR=5;TR=48;WE=3196130;WS=3196112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	3198695	rs311620	C	G	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=551;SC=AGTGCTGAGGCCGATGCTGGC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=3198703;WS=3198689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	3198755	rs2304247	C	T	1856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=0;PP=1574;SC=TCTCCAAGCCCCACACACGGG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=54;TCR=0;TR=54;WE=3198763;WS=3198745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	3198777	rs311621	A	G	1971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=4;PP=1563;SC=CACCTGCCCCAGGAACAGCCA;SOR=4.834;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=66;TCR=4;TR=70;WE=3198785;WS=3198767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	3201695	rs311625	A	G	171.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=6;PP=165;SC=CCCACCAGGCACCTCTGCAGA;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=3201703;WS=3201685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	3204172	rs8106438	A	G	940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=20;PP=730;SC=ATGGGTCCGGAGCTCTGCGGA;SOR=1.536;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=29;WE=3204180;WS=3204162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	3206235	rs482758	A	G	167.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.97;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	3207338	rs312068	T	C	5175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.62;SOR=0.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr19	3207348	rs312069	G	C	5454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.62;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr19	3284819	rs3746064	T	C	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=1122;ReadPosRankSum=1.527;SC=TTTGTTGCTGTCCTTGCGGCT;SOR=0.242;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=44;TCF=25;TCR=19;TR=43;WE=3284827;WS=3284809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr19	3285012	rs59656659	T	C	141.03	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5267;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=98;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CGCCCCCGCCTAGGGCCCCGC;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=6;WE=3285020;WS=3285002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr19	3285042	rs113646375	C	T	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=2;PP=24;SC=CCGCCCCGGACGTGTCGTTCT;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=3285050;WS=3285032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	3293593	rs313784	A	G	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=506;SC=GTGATGCTTCAAGAGGCTACA;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=3293601;WS=3293583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	3448842	.	T	C	510	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=18;NR=0;PP=510;QD=30.2650673637;SC=CTCTGAGCCTTCGTTTACTCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=3448850;WS=3448841;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	3448869	rs4807473	A	G	924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=0;PP=801;SC=TAATGGGCTCACAGCCTCTCC;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=3448877;WS=3448859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	3452683	rs8105687	A	G	2773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=77;PP=2353;ReadPosRankSum=1.052;SC=GGCGGGGCGCATTCGGGCCTC;SOR=1.915;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=93;TCF=15;TCR=78;TR=92;WE=3452691;WS=3452673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,91:0.99:92
chr19	3478646	rs10413312	C	G	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=18;PP=549;SC=CTTGGGGAGACGGGCGGGTGC;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=3478654;WS=3478636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	3480232	rs2240666	A	G	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=0;PP=380;SC=GCCCAGCGAGAGGGAGGCCGG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=3480240;WS=3480222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	3480358	rs2074961	T	C	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=22;PP=895;SC=CCAACTCCCCTATCCCGCGAC;SOR=1.483;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=35;WE=3480366;WS=3480348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	3526452	rs2286543	A	G	279.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=230;SC=CCCACCTCCCAGGCACCAGCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=3526460;WS=3526442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	3526786	rs2286546	G	A	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=1;PP=109;SC=TGGGTCCCTCGAGAGAGGGCG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=3526794;WS=3526776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	3533274	rs740681	G	A	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=5;PP=659;SC=CGACCGCAGCGCCCCCTCCGC;SOR=2.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=25;WE=3533282;WS=3533264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	3534842	rs10155	G	A	5391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=79;NR=93;PP=2965;SC=TAAACCTGCCGGGCAGGACCG;SOR=0.894;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=79;TCR=93;TR=172;WE=3534850;WS=3534832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr19	3538638	rs8644	G	A	781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.43;QD=43.43;SOR=5.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
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chr19	3538647	rs113259909	C	CGTGGGTGCGTG	1115.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=2900;SC=CGTTCCAGCACGGTGGCGGCG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=3538662;WS=3538628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	3538654	rs1128872	G	C	1159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=1;PP=595;SC=GCACGGTGGCGGCGCCGTGCT;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=3538662;WS=3538628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	3539444	rs7258234	T	G	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=372;SC=CACTGTGGGGTCTACAGACCT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=3539452;WS=3539434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	3543397	rs12608919	C	T	971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=22;PP=690;SC=CCACGGGCCCCGGCCAGCCCC;SOR=1.819;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=3543405;WS=3543387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	3543980	rs190228213	C	T	3181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=38;PP=2480;ReadPosRankSum=-0.664;SC=CAGCGGTCCCCGCCTTCCCTC;SOR=0.527;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=64;TCR=38;TR=101;WE=3543988;WS=3543970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,102:0.99:103
chr19	3544971	rs12976454	C	T	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=22;PP=614;SC=GTAGGCACCGCGGGTACCACC;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=3544979;WS=3544961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	3546502	rs78952285	C	T	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=263;SC=ACCCCTACCCCCAACCCCAGC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=3546510;WS=3546492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	3548057	rs6510759	T	C	3421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=61;NR=62;PP=2621;SC=CAGTCAGTGGTGGCGGGCCCA;SOR=0.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=61;TCR=62;TR=123;WE=3548065;WS=3548047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr19	3548313	rs2240752	T	C	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=272;SC=GGAACCTGGGTCACTTCCTCC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=3548321;WS=3548303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	3576314	rs35766767	CCTT	C	4304.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=46;PP=2969;SC=AGGTAAGCGACCTTCTTCCTC;SOR=0.734;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=83;TCF=31;TCR=52;TR=77;WE=3576324;WS=3576304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr19	3579000	rs1443	C	T	1387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=29;PP=1082;SC=CTCCTCCAGCCGAGGGACCCT;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=39;WE=3579008;WS=3578990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	3595794	rs4523	A	G	4340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=73;PP=2965;SC=GGAACAGGATATACACCCAGG;SOR=0.949;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=134;TCF=61;TCR=73;TR=134;WE=3595802;WS=3595784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr19	3610502	rs740349	G	A	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=367;SC=AGGGACCACCGGGCCCCAGTT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=3610510;WS=3610492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	3611146	rs2074786	A	G	1556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=18;PP=1256;SC=CCCTGTGCTCAGAGGTGGGGG;SOR=1.287;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=33;TCR=18;TR=51;WE=3611154;WS=3611136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	3611186	rs758016	C	T	2572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.36;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	3611190	rs758017	C	A	2547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.93;SOR=0.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	3611765	rs2369188	A	G	3353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=40;PP=2607;SC=TTTATATAGGAGGAAACTGAG;SOR=1.158;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=65;TCR=40;TR=105;WE=3611773;WS=3611755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr19	3611972	rs2158935	G	A	6788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=107;NR=110;PP=2965;SC=GGAAGATGCCGTTGGCAAACT;SOR=0.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=218;TCF=107;TCR=111;TR=217;WE=3611980;WS=3611962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr19	3612914	rs6510763	T	C	1713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=54;PP=1330;SC=GGTGACGGAATGCACGCTCAG;SOR=5.994;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=2;TCR=54;TR=56;WE=3612922;WS=3612904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	3613346	rs2074789	G	A	1834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=30;PP=1514;SC=GGTGGGCGCCGCGTCCTCAGG;SOR=0.726;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=59;TCF=29;TCR=30;TR=59;WE=3613354;WS=3613336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	3613400	rs2240504	C	G	2335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=16;PP=1151;SC=GGAGGCTGCCCACGGCCCCTC;SOR=1.567;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=35;TCR=16;TR=51;WE=3613408;WS=3613390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	3613422	rs2074790	G	A	2513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=20;PP=1420;SC=ATCCTGCTCCGCGTCTGCATC;SOR=1.498;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=39;TCR=20;TR=59;WE=3613430;WS=3613412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	3613596	rs57918402	A	G	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=26;PP=786;SC=TGGGACGCAGAGCCGGGGTCA;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=3613604;WS=3613586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	3614403	rs7255692	T	C	1778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=52;NR=1;PP=1495;SC=ACCGGGCCCGTGCCATGTGGG;SOR=6.556;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=54;TCF=53;TCR=1;TR=53;WE=3614411;WS=3614393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	3623229	rs7252821	A	T	175.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=5;PP=140;SC=CGAGACCCTGAGTCAAAAAAG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=3623237;WS=3623219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	3623505	rs7252742	C	T	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=4;PP=724;SC=CCAGCCTGGGCGACAGAGCGA;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=3623513;WS=3623495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	3623534	rs7253265	A	G	2055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=13;PP=1726;SC=GTCAAAAAAGAAAGCTGATAG;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=47;TCR=13;TR=60;WE=3623542;WS=3623524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	3626476	rs4806945	T	C	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=1;PP=401;SC=TCCCCTTCTCTAGGAAGCCCT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=3626484;WS=3626466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	3633273	rs542690	G	C	1747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=43;PP=1550;SC=GAGACACTTAGCCCACGGCCA;SOR=2.790;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=10;TCR=43;TR=53;WE=3633281;WS=3633263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	3637395	rs10408855	T	C	10942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=225;NR=126;PP=2965;ReadPosRankSum=0.276;SC=CTGACCTCAATTGCAGCCGTG;SOR=0.593;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=353;TCF=226;TCR=127;TR=351;WE=3637403;WS=3637385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,359:1.00:360
chr19	3638041	rs1879038	G	C	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=8;PP=268;SC=ATGAAGCAGCGAGGAGGTGCC;SOR=1.445;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=4;TCR=8;TR=12;WE=3638049;WS=3638031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	3641672	rs3815338	C	T	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=3;PP=405;SC=AGCAGGTGGGCGCCCCGACCT;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=3641680;WS=3641662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	3645947	rs12460780	G	A	3387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=31;PP=2549;SC=GGTCCCTCCCGCCTTGCGGGG;SOR=2.024;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=79;TCR=31;TR=110;WE=3645955;WS=3645937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr19	3646071	rs45455692	G	T	2731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.549;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=70;PP=2361;ReadPosRankSum=-1.139;SC=AAGAGAGTTGGGGGGGGTGCC;SOR=2.915;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=89;TCF=18;TCR=71;TR=87;WE=3646079;WS=3646061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,86:0.98:88
chr19	3647440	rs4806948	A	G	1192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=26;PP=930;SC=ATGCCAGGCCACCTCACTCAG;SOR=1.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=37;WE=3647448;WS=3647430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	3648528	.	G	A	119	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=24;MQ=57.28;NF=6;NR=1;PP=119;QD=21.9673160782;SC=CTGCAGACCCGGGCGCCCACC;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=7;WE=3648536;WS=3648518;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,7:0.39:18
chr19	3648545	.	G	A	95	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=29;MQ=56.45;NF=4;NR=0;PP=95;QD=32.4428031368;SC=CACCTGTGGGGCTGCAGACCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=4;WE=3648553;WS=3648535;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:10,4:0.29:14
chr19	3653525	rs2074957	C	T	1713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=38;PP=1345;SC=TCTTGCCCCCCGACTGCACGC;SOR=2.093;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=51;WE=3653533;WS=3653515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	3656652	rs10432303	G	A	354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=296;SC=AACTGATGACGGGTCGCTGCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=3656660;WS=3656642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	3660944	rs3826944	G	A	3674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=42;PP=2876;SC=CTGGAAGCCCGTAACAGCAAA;SOR=1.437;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=72;TCR=42;TR=114;WE=3660952;WS=3660934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr19	3667461	rs7257360	T	C	1249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=39;PP=921;SC=TGTGTAACTCTGCGTGGGGCT;SOR=5.376;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=41;WE=3667469;WS=3667451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	3730169	rs45580639	C	T	2673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=55;PP=2153;SC=TCTCTGACCCCAGCCTGGGTC;SOR=1.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=23;TCR=55;TR=78;WE=3730177;WS=3730159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr19	3762698	rs13960	C	T	1207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=5;PP=979;SC=CGCAATACGTCATGGCGACCA;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=3762706;WS=3762688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	3762926	rs7245624	G	A	1784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=43;PP=1448;SC=CAAGCGCAGAGAGGCGGATGC;SOR=3.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=9;TCR=43;TR=52;WE=3762934;WS=3762916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	3811457	rs10413220	G	C	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=3;NR=19;PP=536;SC=GCCCCTCGACGCTTTTTTTTT;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=22;WE=3811465;WS=3811447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	3831709	rs2240234	C	T	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=31;PP=1106;SC=TAGGAGGTCACGATGGAAGCT;SOR=2.247;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=41;WE=3831717;WS=3831699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	3833572	rs56713158	TA	T	569.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.56;MQRankSum=-0.361;QD=20.35;ReadPosRankSum=0.620;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr19	3902722	rs2060247	C	G	1214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=36;PP=1013;SC=TGATGGCGCTCTCATGAAGCC;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=3902730;WS=3902712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	3908039	rs3810374	C	T	1188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=29;PP=960;ReadPosRankSum=-0.936;SC=TTCGGGTGGACGGACTGTGGG;SOR=1.378;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=37;WE=3908047;WS=3908029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chr19	3908201	rs3810373	T	C	853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=9;PP=714;SC=TGGTGGGTGGTGCGCGGGAGG;SOR=1.382;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=28;WE=3908209;WS=3908191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	3920616	rs8108660	T	C	187.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=140;SC=GCTGGGATTATAGGCATGAGC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=3920624;WS=3920606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	3924517	rs61551618	A	G	2637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=25;PP=1963;ReadPosRankSum=0.483;SC=ACATACATGTAGAAGCGCATT;SOR=0.368;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=80;TCF=55;TCR=25;TR=78;WE=3924525;WS=3924507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,85:0.98:87
chr19	3938829	.	T	G	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.989;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.07;MQRankSum=3.237;QD=6.99;ReadPosRankSum=0.223;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr19	3940129	.	G	A	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=266;SC=TGGATCACCTGAGGTCAGGAG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=3940137;WS=3940119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	3977486	rs36527	A	G	2144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=40;PP=1546;SC=GCACACTGGCATAGAGGCAGC;SOR=1.276;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=26;TCR=40;TR=66;WE=3977494;WS=3977476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	3979408	rs36526	A	G	5096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=65;PP=2965;SC=CCGCGATGATATGCTCTCCCG;SOR=1.053;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=91;TCR=65;TR=156;WE=3979416;WS=3979398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr19	3980824	rs36525	A	G	1714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=32;PP=1320;SC=GGGCCCGGCCACCGGGACCAC;SOR=1.199;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=22;TCR=32;TR=54;WE=3980832;WS=3980814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	4024020	rs2028827	G	A	3141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=31;PP=2476;SC=CCCTGACCCCGTGTTTGTCTT;SOR=1.540;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=66;TCR=31;TR=97;WE=4024028;WS=4024010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr19	4028067	rs4520954	C	T	3038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=23;PP=2396;SC=CGGTCTCCACCTTGTCGGGTG;SOR=1.994;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=65;TCR=23;TR=88;WE=4028075;WS=4028057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr19	4032949	rs895333	A	G	1867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=1;PP=1475;SC=CCAATCCCTCACGGCCCCGAG;SOR=6.994;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=65;TCF=64;TCR=1;TR=64;WE=4032957;WS=4032939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	4033244	rs749449	G	C	1568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=53;PP=1328;SC=CCCTGGGCCCGGGGCGGCTTG;SOR=5.820;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=55;TCF=2;TCR=53;TR=55;WE=4033252;WS=4033234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	4033462	rs7255988	T	C	2234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=26;PP=1712;SC=CAGAGACCTGTGCCCACCTGC;SOR=1.340;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=44;TCR=26;TR=70;WE=4033470;WS=4033452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	4033614	rs12460140	G	A	1480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=39;PP=1154;ReadPosRankSum=-0.759;SC=GGCCGGAGCCGGACATCCGTG;SOR=3.398;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=42;WE=4033622;WS=4033604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
chr19	4042077	rs4410205	C	A	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=4;PP=567;SC=CTCTGAAGCACAGAGGTTAGG;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=4042085;WS=4042067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	4153659	rs350879	G	A	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=4;PP=896;SC=GAGCTTGCCCGGCCCCAGGTA;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=4153667;WS=4153649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	4156841	rs350872	G	A	1699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=0;PP=1487;SC=TTGAGCCTCAGCAGCCCCGGG;SOR=7.864;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=50;TCR=0;TR=50;WE=4156849;WS=4156835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	4168437	rs74612303	C	A	1815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=20;PP=1544;SC=AGGAATATATCGATGGCCTGG;SOR=1.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=36;TCR=20;TR=56;WE=4168445;WS=4168427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	4169998	rs350852	G	A	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=533;SC=CTGACCTGCCGAGTAACCTTG;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=4170006;WS=4169991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	4170378	rs350851	G	A	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=24;PP=692;SC=AGGCCGAGGCGGGTGGATCAC;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=4170386;WS=4170368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	4174570	rs76366923	T	A	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=679;ReadPosRankSum=-0.769;SC=AGAAAAAGAATCCACAGTTTC;SOR=0.399;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=31;WE=4174578;WS=4174560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr19	4174950	rs350845	A	G	2146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=24;PP=1688;SC=GGTCCTGCCGAGGGGCGGGAC;SOR=1.542;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=45;TCR=24;TR=69;WE=4174958;WS=4174940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	4175785	rs7246235	T	G	1040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=13;PP=805;SC=AGGAGAGTCCTCAGGGGCCTC;SOR=1.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=34;WE=4175793;WS=4175775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	4177051	rs350844	A	G	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=2;PP=739;SC=CAGAGCCCCCACCCCTGCACC;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=32;WE=4177059;WS=4177041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	4177331	rs350843	A	C	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=476;SC=GGGCAAGTGGACCAACCTCTC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=4177339;WS=4177321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	4180690	rs7260071	T	G	1594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=7;PP=1301;SC=CAGATGGATGTGTTCTCATTC;SOR=3.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=46;WE=4180698;WS=4180680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	4180836	rs352493	C	T	2795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=54;PP=2284;SC=GAACACCACACTGGAAGACTG;SOR=1.356;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=33;TCR=54;TR=87;WE=4180844;WS=4180826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr19	4186395	rs2159983	T	G	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=10;PP=972;SC=AGGTGGCCTGTGGAGAGGAGA;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=4186403;WS=4186385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	4198169	rs28615978	C	T	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=7;PP=424;SC=GTGAGGGAGCCGGGCCCCCGG;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=17;WE=4198177;WS=4198159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	4199839	rs6510793	A	C	1915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=17;PP=1569;SC=AGCAGCCAACACTGCCCCACG;SOR=1.649;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=57;TCF=40;TCR=17;TR=56;WE=4199847;WS=4199829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	4202683	rs352513	T	C	274.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=2;PP=235;SC=CCTCAAATTCTCAGCTGCTTC;SOR=3.056;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=4202691;WS=4202673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	4207161	rs34976536	A	T	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=333;SC=ACTCAAGCGAACCTCCTGCCT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=4207169;WS=4207151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	4208082	rs2240670	T	C	2432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=68;PP=2140;SC=TAGGAGGTCCTAGAGCTTACC;SOR=6.273;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=2;TCR=68;TR=70;WE=4208090;WS=4208072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	4210401	rs60239405	C	CA	1981.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.96;NF=14;NR=31;PP=2119;SC=GGGCGTGGGCCAGCCTGGGTG;SOR=1.220;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=45;WE=4210409;WS=4210391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	4210465	rs12710072	A	G	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.49;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	4212808	rs58559746	C	A	235.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=191;SC=CACGTGCAAACACACGCACCA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=4212816;WS=4212798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	4216910	rs10413818	G	A	1382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=20;PP=1085;SC=CACGGGAGCCGAGGCCACGGG;SOR=0.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=22;TCR=20;TR=42;WE=4216918;WS=4216900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	4217207	rs353693	T	G	2370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=44;PP=1785;SC=AGGGATGGAATCCACAGGAGT;SOR=1.150;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=30;TCR=44;TR=74;WE=4217215;WS=4217197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	4222559	rs11085066	A	G	1109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=1;PP=885;SC=CAGGGACGGGACCTTCCCTTG;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=4222567;WS=4222549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	4231165	rs78593442	T	C	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=4;PP=470;SC=AACCAGAAGCTCACTCTTTCT;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=4231173;WS=4231155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	4234554	rs143251761	C	T	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=3;PP=664;SC=AGTGAGACTCCGTTTCAAAAC;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=4234562;WS=4234544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	4236996	rs4740	G	A	1465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=33;PP=1036;SC=CAGGTACTACGTCCAAGTGGC;SOR=2.208;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=44;WE=4237004;WS=4236986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	4237067	rs4905	A	G	397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=10;PP=320;SC=CCACTGCCACAATGAGCCTGG;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=4237075;WS=4237057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	4250917	rs3803907	G	A	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=0;PP=495;SC=GGAGCTCCCCGTTGCTGGAGG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=4250925;WS=4250907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	4250991	rs3803908	A	G	1222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=3;PP=988;SC=CAGCGTCCCAAGACAGCTCAC;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=34;WE=4250999;WS=4250981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	4251069	rs1045750	T	C	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=33;PP=1412;SC=AGAAATTCAATGCTCGGAAGG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=32;TCR=33;TR=65;WE=4251077;WS=4251059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	4254211	rs10853970	T	C	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=3;PP=434;SC=ATCTCACCAGTCAAAGCAATA;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=4254219;WS=4254201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	4254308	rs11085067	T	C	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=15;PP=774;SC=AAGATTCTAGTGCCTGGGGAT;SOR=1.148;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=19;TCR=15;TR=34;WE=4254316;WS=4254298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	4254375	rs11085068	C	T	1215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=20;PP=876;SC=ACACAGACTACACCATGGAGC;SOR=0.843;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=17;TCR=20;TR=37;WE=4254383;WS=4254365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	4267927	rs13343335	G	A	1619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=49;PP=1447;SC=GAAGGCAGGCGGCTTCTTTTT;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=49;WE=4267935;WS=4267917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	4268543	rs4807565	G	C	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=6;PP=604;SC=CCTGTCTGCTGTGGAGCTGAG;SOR=1.893;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=4268551;WS=4268533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	4284922	rs10404794	T	C	1620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=36;PP=1215;SC=AAGCTGAAGGTGGAAGAGCCC;SOR=1.342;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=57;WE=4284930;WS=4284912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	4292597	rs888932	C	T	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=2;PP=656;SC=TGGGATCTCTCACTCCTCTCC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=4292605;WS=4292587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	4297855	rs112590213	TA	T	225.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.222;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.87;MQRankSum=-0.682;QD=11.29;ReadPosRankSum=2.144;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr19	4298064	rs61753885	C	T	3633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=61;PP=2955;SC=CACACGTACGCCCCGCTGTGG;SOR=0.922;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=50;TCR=61;TR=111;WE=4298072;WS=4298054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr19	4302299	rs74664646	G	C	2490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=25;PP=2024;SC=ATGACAGCAAGAGTGGGGTTC;SOR=1.824;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=56;TCR=25;TR=81;WE=4302307;WS=4302289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	4304774	rs17523436	G	A	606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=13;PP=453;SC=ACGGGGTGGGGCAGGGCGGGC;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=19;WE=4304782;WS=4304764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	4304855	rs62129299	A	G	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=8;PP=223;SC=CCCCGCCTCCACCCCAGCTGC;SOR=3.442;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=4304863;WS=4304845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	4306311	rs4807578	T	C	885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=24;PP=724;SC=GTGCCAGCCGTACCTACGAGC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=4306319;WS=4306301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	4308098	rs11669091	T	C	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=26;PP=945;SC=TTGGCAAAAGTACATACTGAT;SOR=2.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=35;WE=4308106;WS=4308088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	4308128	rs73919830	C	T	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=15;PP=473;SC=GTGTCCAGGCCGGGCACAGTG;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=4308136;WS=4308118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	4310327	rs11879976	C	T	1682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=33;PP=1265;SC=ACCCCACTACCCTGCCCCTGG;SOR=1.524;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=17;TCR=33;TR=50;WE=4310335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	4324390	rs112594246	G	C	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=2;PP=300;SC=GTGGGGACTTGTGTGACTGTA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=4324398;WS=4324380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	4324564	rs57455784	C	T	285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=6;PP=256;SC=TGTGGTGGCTCACGCCGGTAA;SOR=0.859;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=11;WE=4324572;WS=4324554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	4328860	rs11882358	T	C	1744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=35;PP=1304;SC=TCCGCTCTTCTGCACGTAAAC;SOR=1.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=22;TCR=35;TR=57;WE=4328868;WS=4328850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	4333625	rs73534895	G	A	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=1;PP=25;SC=GCACAATGGAGGGTAGGAGCA;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=4333633;WS=4333615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	4333711	rs7247504	C	T	301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=2;PP=299;SC=ATCTCCTGATCCCGGAGAATC;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=4333719;WS=4333701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	4352763	rs11668153	C	T	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=9;NR=1;PP=273;SC=TGCTCCCTCCCTCCCTCTAGT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=4352771;WS=4352753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	4352837	rs111765325	G	GA	736.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=6;PP=249;SC=TTAGCAGGGAGCGGGGGGGCA;SOR=0.914;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=13;WE=4352846;WS=4352827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	4352838	rs11668187	C	G	745.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=6;PP=365;SC=TAGCAGGGAGCGGGGGGGCAC;SOR=0.914;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=11;TCR=8;TR=14;WE=4352846;WS=4352827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	4352959	rs11882587	A	G	1092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=16;PP=866;SC=ACGTTCTGGCAGGGGTCTCAG;SOR=1.040;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=37;WE=4352967;WS=4352949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	4353841	rs7246177	T	C	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=1;PP=112;SC=ATTTCTTCTTTGTAAATAAGA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=4353849;WS=4353831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	4354810	.	A	G	214	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=11;NR=0;PP=214;QD=22.615564777;SC=GCGGTGAGCCAAGATCGTGCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=4354818;WS=4354809;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	4355035	rs2041772	A	G	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.136;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=17;PP=787;ReadPosRankSum=-0.895;SC=ATCCAGGGCCAGGTGGGCGGG;SOR=0.405;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=33;TCF=16;TCR=17;TR=32;WE=4355043;WS=4355025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr19	4355054	rs2041773	A	G	919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=15;PP=700;ReadPosRankSum=2.299;SC=GGGGCGTTGGAGGACCGGGGT;SOR=0.818;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=16;TCR=16;TR=30;WE=4355062;WS=4355044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,32:0.94:34
chr19	4355203	rs2041774	G	A	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=144;SC=GCATTCTGGGGAGGGTTGGGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=4355211;WS=4355193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	4357555	rs4807583	A	G	2167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=50;PP=1690;SC=CCAAGATCTCACCTTTCTGGG;SOR=2.049;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=67;TCF=17;TCR=50;TR=66;WE=4357563;WS=4357545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	4362691	rs243261	G	C	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=17;PP=853;SC=CCCGGGGCTTGGGCTTATACT;SOR=0.798;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=19;TCR=17;TR=36;WE=4362699;WS=4362681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	4363564	rs139561776	TGA	T	1083.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=21;PP=1187;SC=GCAAGGGGGCTGAGAGGGGAC;SOR=2.303;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=26;WE=4363573;WS=4363554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	4406160	rs243342	G	A	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=4;PP=83;SC=ACTTATGCACGATTGGTGTTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=4406168;WS=4406150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	4408751	rs243347	A	G	591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=1;PP=414;SC=GATTACAGGCATGAGCCACCA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=4408759;WS=4408741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	4431896	rs243371	C	T	1150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=4;PP=946;SC=AAAGAGTGCCCGGGCATAGGG;SOR=3.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=35;WE=4431904;WS=4431886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	4442336	rs9352	C	T	1677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=29;PP=1352;SC=CCGGATGCTGCGGGTGAGAAG;SOR=0.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=29;TCR=29;TR=58;WE=4442344;WS=4442326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	4442529	rs243382	T	C	186.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=120;SC=ATGCCAGGCATCGTTCTGGCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=4442537;WS=4442519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	4442999	rs243383	T	G	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=7;PP=821;SC=CACCCTGACCTCGAGCCCACT;SOR=3.202;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=39;WE=4443007;WS=4442989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	4443046	rs2992	T	C	1554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=17;PP=1150;SC=GTATGTAGAATGCTTAGGGTG;SOR=1.697;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=55;TCF=37;TCR=18;TR=54;WE=4443054;WS=4443036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	4446995	rs243389	C	T	1975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=58;PP=1690;SC=GTCCAGGGGCCCGGCTCTCGC;SOR=5.960;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=60;TCF=2;TCR=58;TR=60;WE=4447003;WS=4446985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	4452497	rs243395	G	A	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=2;PP=113;SC=TACCTGGGGCGGTGAAAGCGT;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=4452505;WS=4452487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	4453324	rs376965	TG	CC	2304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=12;PP=2495;SC=CCACAACCTGTGTCCACCTTG;SOR=2.004;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=47;WE=4453333;WS=4453314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	4453856	rs144275315	TCCAGGGCCAGGCA	T	1188.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=2;PP=2973;SC=GACTTCTGCATCCAGGGCCAG;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=19;WE=4453876;WS=4453846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	4457496	rs10425328	CG	GC	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=0;PP=654;SC=CTGACCCTCGCGTGCCGCTCC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=11;WE=4457505;WS=4457486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	4457650	rs1044510	C	T	1547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=33;PP=1049;SC=GTCCCGCGCTCTTGAACTTGA;SOR=1.567;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=51;WE=4457658;WS=4457640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	4457792	rs12977256	T	A	58.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=19.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	4493979	rs150536528	C	T	1949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=37;NR=26;PP=1524;SC=CTTCCTGTAGCGGAGAAGCCT;SOR=1.033;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=64;TCF=37;TCR=27;TR=63;WE=4493987;WS=4493969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	4498440	rs2288924	T	C	1152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=27;PP=844;SC=CTCCCTTAGATGTCTCGGGAA;SOR=1.845;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=39;WE=4498448;WS=4498430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	4498700	rs10406139	A	T	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=168;SC=TTCTGCAGATACAGCTCCCCT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=4498708;WS=4498696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	4499023	rs67274054	C	T	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=11;PP=320;SC=CCTGGGTCAGCGAGGAGGCCG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=4499031;WS=4499013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	4499632	rs72100503	AAGCTGGCCGGGGAGG	A	1831.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=22;PP=2933;SC=GGCCGAGGAGAAGCTGGCCGG;SOR=3.716;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=66;TCF=3;TCR=63;TR=23;WE=4499654;WS=4499622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	4502287	rs7254167	G	T	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=12;PP=330;SC=TGGGGCGCAGGCGGCAGTGTC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=4502295;WS=4502277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	4508945	rs8105775	A	G	2779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=50;PP=2045;SC=CCTTTGGCCCAGGCTGGGAGG;SOR=0.820;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=45;TCR=50;TR=95;WE=4508953;WS=4508935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr19	4510560	rs7251858	C	T	3449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.960;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=64;PP=2844;ReadPosRankSum=0.784;SC=TGTGTGGTGGCCAAAAGCCCC;SOR=0.930;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=43;TCR=64;TR=106;WE=4510568;WS=4510550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,111:0.99:112
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chr19	4511578	rs62115186	A	G	1706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=6.335;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=-3.949;QD=9.75;ReadPosRankSum=-4.987;SOR=0.921;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,47:0.27:175
chr19	4511580	rs78884463	CA	TG	1547.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=6.343;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.53;MQRankSum=-4.014;QD=8.84;ReadPosRankSum=-5.470;SOR=0.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,46:0.26:175
chr19	4511647	rs7256387	C	G	2675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.48;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=39;PP=2555;SC=CTTTGGCCAACTTCACAGCCC;SOR=1.292;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=65;WE=4511655;WS=4511637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr19	4511725	rs73920825	T	C	4776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.58;QD=46.83;SOR=0.815;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr19	4511730	rs62115190	T	C	5435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.39;QD=47.27;SOR=0.782;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr19	4511737	rs57610751	T	C	3537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=31.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.00;MQRankSum=5.901;QD=25.45;ReadPosRankSum=-0.734;SOR=0.786;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,121:0.87:139
chr19	4511830	rs7257142	A	G	3477.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-5.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=336;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.586;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.164;NF=29;NR=61;PP=2962;ReadPosRankSum=2.799;SC=TGGTCTGGACAGTCCCTTTGG;SOR=0.893;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=265;TCF=116;TCR=149;TR=90;WE=4511838;WS=4511820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:187,146:0.44:333
chr19	4511908	rs10423606	C	T	7435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=49.900;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=6.131;NF=113;NR=71;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.722;SC=CGGTCTTGGCCGTGTCTACAC;SOR=0.910;SbPval=0.91;Source=Platypus;TCF=117;TR=184;WE=4511943;WS=4511898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,188:0.78:242
chr19	4511920	rs28460600	T	C	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FS=61.912;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.96;MQRankSum=-5.981;QD=4.02;ReadPosRankSum=-0.894;SOR=2.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:195,41:0.17:236
chr19	4511927	rs10422025	G	A	10069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.53;MQRankSum=-1.248;QD=45.36;ReadPosRankSum=1.372;SOR=0.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,219:0.99:222
chr19	4511927	.	GCA	ACG	2944	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MMLQ=24;NF=105;NR=99;PP=2944;QD=20;SC=ACCTGTCTGGGCAGCCCCTTT;SbPval=0.58;Source=Platypus;TCF=110;TR=204;WE=4511943;WS=4511898;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:13,204:0.94:217
chr19	4511929	rs10424401	A	G	10055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.65;MQRankSum=-1.226;QD=45.30;ReadPosRankSum=1.268;SOR=0.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,219:0.99:222
chr19	4511935	rs113821070	T	C	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=223;ExcessHet=3.0103;FS=63.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.34;MQRankSum=-7.490;QD=1.99;ReadPosRankSum=-3.167;SOR=4.889;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:200,23:0.10:223
chr19	4511955	rs7260518	T	C	9062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.479;NF=118;NR=104;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.112;SC=TTCACAGCACTGGTCACCCCA;SOR=0.877;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=223;TCF=118;TCR=105;TR=222;WE=4511963;WS=4511945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,223:0.99:225
chr19	4512409	rs10410197	T	C	4320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=62;PP=2965;SC=TGGTGGTGTCTACGCCGGTCT;SOR=0.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=63;TCR=63;TR=125;WE=4512417;WS=4512399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr19	4512669	rs55901236	T	C	3904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=56;PP=2965;SC=CTGCAGACGGTGTCCTTTGTA;SOR=0.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=64;TCR=56;TR=119;WE=4512677;WS=4512659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr19	4513559	rs4807597	A	G	1556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=23;PP=1134;SC=GCTGGACACCACCTCCTTGGT;SOR=0.859;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=21;TCR=23;TR=44;WE=4513567;WS=4513549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	4525046	rs1610090	A	G	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=4;PP=248;SC=TTCCCAGGGCAGGCCGGGGCG;SOR=1.329;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=4525054;WS=4525036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	4529622	.	T	TACACAC	132	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=132;QD=67.5;SC=CATATATGTATACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=2;WE=4529630;WS=4529612;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,2:0.29:7
chr19	4550698	rs2043328	C	T	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=255;SC=AACTGTATAACGGGTACAGCT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=4550706;WS=4550688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	4555310	rs10853973	T	C	275.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=2;PP=254;SC=AAGCCCCAAATCCCGCTGAGC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=4555318;WS=4555300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	4557056	rs10422881	A	C	2390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=50;PP=2047;SC=TGAGGGGGTAACGGGTCCCAG;SOR=1.673;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=24;TCR=50;TR=74;WE=4557064;WS=4557046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr19	4558431	rs2304213	C	G	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=10;PP=349;SC=GCAGAAGCAGCAGGGCCGGGC;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=4558439;WS=4558421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	4657957	rs11148	A	C	2503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=21;PP=1984;SC=CCTTTCAGGGACACAGGCCCC;SOR=1.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=50;TCR=21;TR=71;WE=4657965;WS=4657947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr19	4659924	rs72620522	C	T	3571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=10;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.923;SC=ACCTCTACCCCATCCCCATCT;SOR=2.683;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=103;TCF=93;TCR=10;TR=102;WE=4659932;WS=4659914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,107:0.99:108
chr19	4660799	rs2286366	C	T	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=36;PP=1107;SC=TCAGGCCAGGCCTGCTGGGTC;SOR=2.608;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=10;TCR=36;TR=46;WE=4660807;WS=4660789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	4665115	rs11880911	G	C	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=397;SC=GGGGTTTGCTGTCATCTGTGA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=4665123;WS=4665105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	4670236	rs10401515	C	G	2349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=49;PP=1813;SC=CAAACGCCACCGTCGTGGGCT;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=27;TCR=49;TR=76;WE=4670244;WS=4670226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr19	4670313	rs2270090	C	G	1135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=33;PP=961;SC=AAGCTCGCGCCGACGCCGTTC;SOR=4.921;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=2;TCR=33;TR=35;WE=4670321;WS=4670303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	4679754	rs10415374	G	A	187.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=7;NR=0;PP=151;SC=GGAGCCCCTGGTCACAGTGGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=4679762;WS=4679750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	4684642	rs8105807	A	G	2647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=35;PP=2061;SC=CCCGAGACCCAAAGGACCCAG;SOR=1.191;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=54;TCR=35;TR=89;WE=4684650;WS=4684632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr19	4685276	rs10421782	A	C	4666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=89;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.348;SC=AGATGGTCCAACTGCCAATCT;SOR=0.726;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=60;TCR=93;TR=148;WE=4685284;WS=4685266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,151:0.98:154
chr19	4690817	rs13346537	G	A	214.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=151;SC=ATGCGCGTGCGTGTGTGTGTG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=4690825;WS=4690807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	4697757	rs7254243	C	G	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=37;PP=1132;SC=CATGTCCCCCCCAAATTCATA;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=39;WE=4697765;WS=4697747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	4700187	rs2277735	A	G	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=11;PP=664;SC=CCTTCCCCGCATCATCTAGTA;SOR=1.308;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=33;WE=4700195;WS=4700177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	4714044	rs2277733	T	C	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=3;PP=668;SC=CAGGGAACTGTGGTCCCAGAT;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=4714052;WS=4714034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	4714468	rs7251000	C	T	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=418;SC=CTGCCGCTTTCCCCACTCCCT;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=4714476;WS=4714458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	4720031	rs3833278	C	CCCT	785.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=547;SC=CCCCTTCGCCCCCTCCTCATT;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=10;WE=4720060;WS=4720021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	4720042	rs11672100	G	T	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=233;SC=CCTCCTCATTGCTCCAGGCAG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=4720060;WS=4720021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	4720052	rs3833277	G	GC	533.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=10;PP=281;SC=GCTCCAGGCAGCCCCCCAAGC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=10;WE=4720060;WS=4720021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	4769740	rs11878617	C	A	2461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=57;PP=1878;SC=GGCTCCGTTTCGTCTCCAGAA;SOR=3.026;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=12;TCR=57;TR=69;WE=4769748;WS=4769730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	4772449	rs2885717	C	T	1332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=28;PP=812;SC=CTGCTGTGTCCCCAGCGCCTG;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=4772471;WS=4772439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	4772463	rs3760951	C	T	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=23;PP=639;SC=GCGCCTGGTCCGGGGCCCGGC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=4772471;WS=4772439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	4859937	rs8289	T	C	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=10;PP=667;SC=ACAGTCTTGATGTGCGGGTAG;SOR=1.402;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=19;TCR=10;TR=29;WE=4859945;WS=4859927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	4890914	rs2656938	A	G	142.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=84;SC=GGGGAGACACAGATACCTAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=4890922;WS=4890908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	4896948	rs35308440	C	CT	571.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.01;MQRankSum=2.023;QD=21.18;ReadPosRankSum=0.371;SOR=1.542;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,25:0.93:27
chr19	4902754	rs2779168	G	A	2131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=48;PP=1751;ReadPosRankSum=-0.837;SC=TCAGGGTTAAGATCACCTGCC;SOR=0.672;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=22;TCR=49;TR=69;WE=4902762;WS=4902744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,69:0.99:70
chr19	4929124	rs5826865	GC	G	596.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=406;SC=GATGCAGATTGCCCCCCCCCC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=21;WE=4929132;WS=4929114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	4929413	rs2251520	T	C	1790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=51;PP=1385;SC=CCACCCACGGTGAGGCGGCCG;SOR=2.730;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=13;TCR=51;TR=64;WE=4929421;WS=4929403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	4929473	rs2123731	A	G	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=31;PP=1039;SC=ATGAGACGGAATTGGGGCTGT;SOR=2.093;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=9;TCR=31;TR=40;WE=4929481;WS=4929463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	4944555	rs2602730	G	A	2621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=68;PP=2120;SC=CCAGGGGTCAGGGTGGTTACC;SOR=3.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=9;TCR=68;TR=77;WE=4944563;WS=4944545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	4945914	rs2250982	A	C	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=1;PP=294;SC=TGGCTGGCATACACGGCCGGA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=4945922;WS=4945904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	4945974	rs2250978	T	C	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=11;PP=450;SC=ATGAGGATGATGTGGTGAGTG;SOR=1.101;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=16;TCR=11;TR=27;WE=4945982;WS=4945964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	4954455	rs17883331	G	A	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=8;PP=785;SC=GGGGGGCTTCGCGTCCCCCAG;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=4954463;WS=4954445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	4954679	rs55946225	G	GC	2707.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=10;PP=2936;SC=CCCGAGCAGGGCGGGTCCCCG;SOR=3.581;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=71;TCR=11;TR=75;WE=4954687;WS=4954669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	5041178	rs2240678	T	C	3756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=57;PP=2580;SC=AGGACTTTGATGACCTTGAAC;SOR=0.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=127;TCF=69;TCR=58;TR=126;WE=5041186;WS=5041168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr19	5047442	rs141865002	T	TG	1661.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=44;NR=4;PP=1833;SC=TCGCAGGTTCTGGGGGTGGCC;SOR=5.097;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=48;WE=5047450;WS=5047432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	5047691	rs2620818	G	A	2034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=58;PP=1604;SC=GTGAGTGTCTGCACTGGCCCT;SOR=4.277;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=6;TCR=58;TR=64;WE=5047699;WS=5047681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	5111994	rs2613736	A	G	1336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=40;PP=1150;SC=GCCAGGCACGATCGCTCACAC;SOR=5.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=42;WE=5112002;WS=5111984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	5132051	rs2620839	G	A	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=35;PP=1000;SC=GGCTCTCATCGGCCCTGCTCC;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=5132059;WS=5132041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	5135392	rs2620836	A	G	3961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=40;PP=2965;SC=CTCCCTCGGAAAGGGCTGCCC;SOR=1.667;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=82;TCR=40;TR=121;WE=5135400;WS=5135382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr19	5137192	rs2613790	C	T	1436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=4;PP=1235;SC=CCAAGTTACCCGGCCCCTCCC;SOR=4.174;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=40;TCR=4;TR=44;WE=5137200;WS=5137182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	5137846	rs2613786	G	A	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=5;PP=455;SC=AGGAGCATACGCCTGCACCGA;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=5137854;WS=5137836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	5174030	rs2620822	A	G	1579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=5;PP=1219;SC=GCGTGAATCCAGGAGGCGGAG;SOR=4.332;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=49;TCR=5;TR=54;WE=5174038;WS=5174020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	5174180	rs2620821	C	T	1889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=48;PP=1476;SC=AGCAAAGTCTCGTCACCACGG;SOR=2.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=9;TCR=48;TR=57;WE=5174188;WS=5174170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	5206775	rs1143700	A	G	2401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=58;NR=19;PP=2038;SC=GCCTGGGGGGAACCATGGCTT;SOR=2.242;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=58;TCR=19;TR=77;WE=5206783;WS=5206765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr19	5208216	rs60630722	G	A	1575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=9;PP=1302;SC=TCCCCAGCAGGGCCAAAAGCT;SOR=2.786;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=47;TCF=37;TCR=10;TR=46;WE=5208224;WS=5208206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	5208236	rs55727125	G	A	1910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=13;PP=1542;SC=TGGGACACTCGAGGGAGCTCA;SOR=2.226;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=58;TCF=44;TCR=14;TR=57;WE=5208244;WS=5208226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	5208514	rs139873720	TG	T	1706.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=40;PP=1698;SC=GTTTTTGAGATGGAGTTTCAC;SOR=3.611;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=46;TCF=3;TCR=43;TR=43;WE=5208522;WS=5208504;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	5210622	rs2302224	G	A	5484.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=47;PP=2965;SC=AGGAGATGGCGGCCGTGGTCA;SOR=1.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=115;TCR=47;TR=162;WE=5210630;WS=5210612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr19	5210782	rs1143698	G	A	8613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=172;PP=2965;SC=GTCTCCGCCAGCGGCCCCTGT;SOR=1.321;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=277;TCF=104;TCR=173;TR=276;WE=5210790;WS=5210772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,285:1.00:285
chr19	5212380	rs1064300	C	T	3074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=48;PP=2392;SC=CGGCATCTGGCGGGTTGCAGG;SOR=0.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=50;TCR=49;TR=96;WE=5212388;WS=5212370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr19	5212482	rs2230611	G	A	1793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=34;PP=1400;SC=GGCGGACCTCGCGTTTCTCAC;SOR=1.412;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=53;WE=5212490;WS=5212472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	5212586	rs4807696	G	T	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=18;PP=532;SC=CGGGTGTGGTGGCTCATGCCT;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=5212594;WS=5212576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	5214533	rs9304921	A	G	4010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.997;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=43;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.799;SC=GGACAGGCTGACTGGCAGGGG;SOR=0.953;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=114;TCF=70;TCR=44;TR=113;WE=5214541;WS=5214523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,122:0.99:123
chr19	5214697	rs4807697	A	G	3428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=70;PP=2615;SC=GCGTTCTGACACCGGTAGCCG;SOR=1.342;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=41;TCR=70;TR=111;WE=5214705;WS=5214687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr19	5215474	rs73919781	G	A	1577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=28;PP=1347;SC=CTGTGAGGCCGAGGTGATGAG;SOR=1.132;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=46;WE=5215482;WS=5215464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	5220900	rs10412973	T	C	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=547;SC=TGATAGGGTCTGTGTTTCATA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=5220908;WS=5220890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	5222071	rs3746132	G	C	2471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=2;PP=1427;SC=TGAGCCTTAAGCCCTGCTGAA;SOR=5.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=49;TCR=2;TR=51;WE=5222079;WS=5222061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	5222088	rs3746131	C	G	2923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=5;PP=1914;SC=TGAACTACAACCCCTGACCCT;SOR=4.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=61;TCR=5;TR=66;WE=5222096;WS=5222078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	5239175	.	G	GGAGA	142	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.50;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	5255992	rs34548642	A	AT	336.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=338;ReadPosRankSum=1.247;SC=TCATTTTTCTATTTTTTTTCC;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=15;WE=5256000;WS=5255982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr19	5256251	rs59925916	G	GT	558.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.40;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	5260878	rs36016542	T	C	2894.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=36;PP=1210;SC=ACAAGGCGGTTGTTGGGGGGC;SOR=1.230;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=62;TCF=23;TCR=39;TR=59;WE=5260887;WS=5260868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	5260879	rs10708972	GT	G	2885.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=34;PP=1890;SC=CAAGGCGGTTGTTGGGGGGCC;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=45;WE=5260887;WS=5260868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	5260933	rs7246162	A	T	1419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=36;PP=1096;SC=GCCAGGCCTCAGCACTCTGCC;SOR=2.786;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=43;WE=5260941;WS=5260923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	5263061	rs55840918	G	T	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=17;PP=459;SC=TATGTCCTCAGCGAGGAGGGG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=5263069;WS=5263051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	5264967	rs4807017	A	G	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=4;PP=606;SC=GATGCTCCCCACCCCCTGCTG;SOR=3.056;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=5264975;WS=5264957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	5265222	rs4807703	G	A	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=16;PP=467;SC=GGGCAGAGACGTGAGAGAAAT;SOR=3.500;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=18;WE=5265230;WS=5265212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	5274384	rs1034917	C	T	1513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=40;PP=1301;SC=GAAGGGGGGGCGCTGATGGGT;SOR=2.170;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=53;WE=5274392;WS=5274374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	5286276	rs115657473	G	A	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=21;PP=668;SC=TGTGAGAGGCGAGTGGGGAAA;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=5286284;WS=5286266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	5455422	rs4375786	T	C	419.10	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=320;ReadPosRankSum=1.077;SC=AGAACCCTGGTGACTCCTGGT;SOR=2.584;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=13;WE=5455430;WS=5455414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr19	5455611	rs2240743	C	T	2424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=23;PP=1906;SC=GCCCTCGCGTCCTGGCCACAG;SOR=1.641;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=47;TCR=23;TR=70;WE=5455619;WS=5455601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	5455796	rs420325	A	G	3526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=57;PP=2741;SC=CCGCGCAGGCAGTGGTACGGG;SOR=0.743;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=61;TCR=57;TR=118;WE=5455804;WS=5455786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr19	5455971	rs8103406	G	T	3239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.63;SOR=1.042;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	5455978	rs8107825	T	C	3415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.80;SOR=1.163;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	5455989	rs8104246	C	T	3037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=26;PP=1858;SC=GCTGATCCGCCGCTACGACTG;SOR=1.195;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=41;TCR=26;TR=67;WE=5455997;WS=5455961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	5456450	rs8111108	T	C	6095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.212;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=129;NR=73;PP=2965;ReadPosRankSum=0.778;SC=TGGATGAGTATGAGGAGGGCG;SOR=1.089;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=203;TCF=129;TCR=74;TR=202;WE=5456458;WS=5456440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,210:1.00:211
chr19	5595354	rs10413286	T	C	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=1;PP=351;SC=GCCCACAGCCTCACCCAGCTC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=5595362;WS=5595344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	5667215	.	G	C	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.782;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=56.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.51;ReadPosRankSum=-3.196;SOR=5.279;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,13:0.25:51
chr19	5696611	rs142021468	C	T	1786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=14;PP=1389;SC=TCCTAGGACCCGGAAGGCTCG;SOR=2.024;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=38;TCR=14;TR=52;WE=5696619;WS=5696601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	5759231	rs11879365	T	G	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=25;PP=804;SC=GAGAAGCAGGTCTGAGATCAG;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=5759239;WS=5759221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	5766090	rs2446200	T	C	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=15;PP=765;ReadPosRankSum=0.644;SC=CCTGGGTCCATATTTCTGTCT;SOR=1.121;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=34;WE=5766098;WS=5766080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,37:0.95:39
chr19	5768331	rs10680062	T	TTTTA	728.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=766;SC=AAATTAGGAATTTTATTTATT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=16;WE=5768339;WS=5768321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	5787214	.	TG	CA	1486	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.39;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=25;MQ=50.28;NF=21;NR=2;PP=1486;QD=66.9333858636;SC=TGGTGGGAGATGGTGGGAGGT;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=23;WE=5787253;WS=5787204;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:25,23:0.48:48
chr19	5788228	rs113274115	GCA	G	191.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FS=1.263;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.24;MQRankSum=3.255;QD=2.40;ReadPosRankSum=0.248;SOR=0.401;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,13:0.16:80
chr19	5824420	rs71934499	GGT	G	937.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=26;PP=1390;SC=AGTGGGAGGTGGTGGGGGGGT;SOR=1.681;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=5824429;WS=5824410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	5844537	rs778986	A	G	4278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=70;PP=2965;SC=CACGATGACCATGTCTGCCTG;SOR=0.807;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=65;TCR=70;TR=135;WE=5844545;WS=5844527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr19	5844649	rs812936	G	A	3024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=48;PP=2408;SC=GGCCATGTCCGTAGCAGGATC;SOR=0.780;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=44;TCR=48;TR=92;WE=5844657;WS=5844639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr19	5866585	rs778982	C	T	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=16;PP=1001;SC=AGTGAGGTCCCGGCAGCCCAG;SOR=1.206;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=25;TCR=16;TR=41;WE=5866593;WS=5866575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	5866654	rs778983	A	G	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=21;PP=852;SC=TCTGGTACCTAGATTCCTGCT;SOR=1.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=33;WE=5866662;WS=5866644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	5866724	rs4807054	G	A	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=470;SC=AGGCCGCAGCGTCTCCCGCCA;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=5866744;WS=5866714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	5866736	rs57100281	T	C	500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.34;QD=45.52;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	5867177	rs778970	G	A	1211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.41;QD=32.75;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	5867748	rs778971	G	T	2865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=72;PP=2335;SC=GGTCAGAGTAGCTGGGAAGAG;SOR=3.284;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=14;TCR=72;TR=86;WE=5867756;WS=5867738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	5892317	rs1626918	C	T	407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=2;PP=352;SC=CCTCAGCGCGCGCATCCGTGG;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=5892325;WS=5892307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	5892382	rs1678867	C	T	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=1;PP=783;SC=CCTGGAGGGCCGGGGAAGGGC;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=5892390;WS=5892372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	5892433	rs1627779	C	T	1116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=6;PP=838;SC=GTCCCAGAAGCGGCCATGGTG;SOR=2.554;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=5892441;WS=5892423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	5892486	rs1628564	C	T	1787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=22;PP=1309;SC=ACTAGTCTTTCCTCCTGTCCA;SOR=0.871;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=27;TCR=22;TR=49;WE=5892494;WS=5892476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	5892568	rs1629368	G	T	2739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=33;PP=2150;SC=TCCCGGCTGCGGTGGGCAGGA;SOR=1.192;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=50;TCR=33;TR=83;WE=5892576;WS=5892558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	5892743	rs10432306	C	T	1501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=32;PP=1255;SC=CCCTGCCGGCCGCAGTAGAGA;SOR=1.765;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=46;WE=5892751;WS=5892733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	5892770	rs1631032	C	T	1648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=30;PP=1385;SC=CCGGTGCCCTCGAGTGGATGC;SOR=1.157;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=20;TCR=31;TR=50;WE=5892778;WS=5892760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	5892954	rs1678868	T	C	2408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=38;PP=1775;SC=GAACCCAGAGTGTTTAACAAT;SOR=0.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=34;TCR=38;TR=72;WE=5892962;WS=5892944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	5903807	rs8108064	G	T	2467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=61;PP=1999;SC=GACTTCTCGGGCTGCGCGCGC;SOR=2.955;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=14;TCR=61;TR=75;WE=5903815;WS=5903797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	5905141	rs10406399	G	A	508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=9;PP=418;SC=GGTAGGCGGAGGCAGAGCCGA;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=18;WE=5905149;WS=5905131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	5923448	.	C	A	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=26;PP=751;SC=CCTGCCCCGGCAACCCAAGTG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=5923456;WS=5923438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	5928185	rs274793	T	C	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=352;SC=CACCAGATCATGTACTCCACA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=5928193;WS=5928175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	6042059	rs2288846	C	T	1543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=16;PP=1296;SC=ACGCACATGGCTCCATTGGTG;SOR=1.747;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=53;WE=6042067;WS=6042049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	6230771	rs2233185	T	G	1103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=29;PP=890;SC=GTGGCCGTGGTGCAGGGACAC;SOR=4.112;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=32;WE=6230779;WS=6230761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	6262355	rs2227261	C	T	5640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.695;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=100;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.718;SC=ACCCATCAGCCTCCTGCCTGT;SOR=0.735;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=172;TCF=72;TCR=100;TR=171;WE=6262363;WS=6262345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,184:0.99:185
chr19	6306857	rs76925618	C	T	1945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=36;PP=1600;SC=CCATGGTGACCATGCCATAAG;SOR=1.010;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=26;TCR=36;TR=62;WE=6306865;WS=6306847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	6306971	rs4807863	G	A	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=19;PP=522;SC=ACTTCTCATGGCTCTTGACCA;SOR=2.833;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=22;WE=6306979;WS=6306961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	6333290	rs2335192	T	C	1209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=0;PP=999;SC=ACCACAGAGCTTGGCATCAAG;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=6333298;WS=6333280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	6361845	rs57445020	G	GC	2552.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=39;PP=2776;SC=TCGGCTGGCTGCCCCGGCCCC;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=32;TCR=42;TR=69;WE=6361853;WS=6361835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	6415443	rs1616305	T	C	3364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=71;PP=2451;SC=GCTGTGGGGGTGCTCCGGGCT;SOR=1.278;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=44;TCR=72;TR=115;WE=6415451;WS=6415433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr19	6415795	rs8103311	T	C	1848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=20;PP=1297;SC=GGGCCTGCCCTCCGCCAGGTG;SOR=0.914;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=31;TCR=20;TR=51;WE=6415803;WS=6415785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	6417855	rs2258496	G	A	3423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=45;PP=2788;ReadPosRankSum=0.772;SC=ACTGGCACCTGGGGAGGGAGG;SOR=1.077;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=63;TCR=46;TR=107;WE=6417863;WS=6417845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,108:0.98:110
chr19	6419275	rs2305059	A	G	2632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=24;PP=2097;SC=CCGCTGTCTGAAAAGAGGAGA;SOR=1.765;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=49;TCR=24;TR=73;WE=6419283;WS=6419265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr19	6426271	rs66673060	CCAGCCT	C	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=1;PP=405;SC=ACCCCCACCCCCAGCCTGCTT;SOR=2.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=6426284;WS=6426261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	6436304	rs2860182	TC	CT	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=842;SC=TCCAGTTGTTTCGGTGGAGGG;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=6436313;WS=6436294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	6469042	rs150679157	CT	C	54.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=5.492;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.35;MQRankSum=0.649;QD=1.16;ReadPosRankSum=-1.144;SOR=1.928;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,11:0.23:47
chr19	6495064	rs446199	C	G	363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=274;SC=TTAGGGTCAGCGGGGAGTCAG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=6495072;WS=6495054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	6585921	rs453462	G	C	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=2;PP=235;SC=CCACCACTACGCCCCACCACA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=6585929;WS=6585911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	6589960	rs11361927	CT	C	805.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=5;PP=810;SC=CTGTCTCCCCCTCTCCGTTTC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=21;WE=6589968;WS=6589950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	6665020	rs344560	T	C	7584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=122;PP=2965;ReadPosRankSum=1.697;SC=ACGACCACCTTCTCCCCAGCC;SOR=0.284;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=226;TCF=103;TCR=123;TR=225;WE=6665028;WS=6665010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,234:1.00:235
chr19	6677989	rs17030	G	A	2646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=35;PP=2140;SC=CGTCCTCCTCGGGCCAGTGCT;SOR=1.127;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=51;TCR=35;TR=86;WE=6677997;WS=6677979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	6679360	rs344555	T	C	1751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=13;PP=1503;SC=ATGGGATAGATGACCTGGGTA;SOR=2.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=44;TCR=13;TR=57;WE=6679368;WS=6679350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	6679511	rs2277984	C	T	5304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=90;PP=2965;SC=CTTTCCTCTGCGGGCAGATGT;SOR=0.853;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=168;TCF=77;TCR=91;TR=167;WE=6679519;WS=6679501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr19	6679563	rs2277983	T	C	3347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=83;PP=2489;SC=CCAAAGACCATGCCTGGGAGG;SOR=2.021;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=32;TCR=83;TR=115;WE=6679571;WS=6679553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr19	6689331	.	T	TAC,TCTAC	514	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=11;MMLQ=24;MQ=56.38;NF=0,0;NR=13,13;PP=110,514;QD=8.76923076923;SC=TCTCTCTCTCTCTACCTACCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=1;TCR=51;TR=13,13;WE=6689354;WS=6689321;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.25:52
chr19	6689341	.	T	TA	105.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.260;ClippingRankSum=-0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.22;MQRankSum=-0.000;QD=11.75;ReadPosRankSum=2.655;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr19	6689342	.	C	A	437	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=2;HapScore=3;MGOF=11;MMLQ=25;MQ=55.52;NF=1;NR=30;PP=437;QD=15.2184262112;SC=CTACCTACCTCCCTCCCTCCC;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=31;WE=6689354;WS=6689321;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,31:0.77:40
chr19	6689342	.	C	CCTA	168.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;QD=16.87;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr19	6690461	rs6417195	G	A	203.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=164;SC=ATTAGAGGGCGGGTCTGTATT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=6690469;WS=6690451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	6693571	rs11085194	C	T	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=476;SC=AGGGCAGGGGCGGGGTGCAGA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=6693579;WS=6693561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	6696342	rs2287848	A	G	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=2;PP=367;SC=ATTTGGCTCCATCCATGCCCT;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=6696350;WS=6696333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	6696496	rs2287847	T	C	4822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=93;NR=63;PP=2965;SC=GAGTGAGAGATACCGATGGCT;SOR=1.068;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=93;TCR=64;TR=156;WE=6696504;WS=6696486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr19	6696557	rs2287846	C	G	4351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=52;NR=92;PP=2965;SC=TCATTTACCCCCCTTACCCTG;SOR=1.451;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=52;TCR=92;TR=144;WE=6696565;WS=6696547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr19	6696597	rs2287845	G	A	3336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=76;PP=2637;SC=CCCTGCAGCCGACTCACCACG;SOR=2.014;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=107;TCF=31;TCR=76;TR=107;WE=6696605;WS=6696587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	6696691	rs2355315	G	T	1733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.29;SOR=2.247;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	6696699	rs2253756	G	A	1658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.79;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	6696789	rs2355316	G	A	344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=58.84;NF=0;NR=11;PP=286;SC=GCGGTGGCTCGTGCCTGTGAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=6696797;WS=6696779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	6697214	rs5826946	AT	A	287.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=396;SC=TGCTTCTGAAATTCTGGGACT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=6697222;WS=6697204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	6697406	rs423490	A	G	4093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.749;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.371;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=49;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.700;SC=GATGGTAGACAGCAGCCTTGA;SOR=1.203;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=144;TCF=93;TCR=51;TR=141;WE=6697414;WS=6697396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,144:0.99:145
chr19	6697829	rs366510	G	T	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=542;SC=GACAGAACACGGAGTGTCAAG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=6697837;WS=6697819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	6702042	rs433594	A	G	223.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=184;SC=TAAAGTGCCAAGAAACATAGG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=6702050;WS=6702032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	6702157	rs428453	C	G	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=10;PP=703;SC=CCGACATGCTCACAGCCAGAA;SOR=1.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=27;WE=6702165;WS=6702147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	6702246	rs432823	T	C	1034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=17;PP=832;SC=GAGGTTGGGGTATTAGGAGAT;SOR=0.811;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=16;TCR=17;TR=33;WE=6702254;WS=6702236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	6702598	rs406514	G	A	3643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.590;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=86;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.884;SC=TACCTGCAGGGGGTTTAGATC;SOR=2.581;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=111;TCF=25;TCR=86;TR=110;WE=6702606;WS=6702588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,113:0.99:114
chr19	6708107	rs10659507	T	TTCTC	952.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.31;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	6710572	rs189367	G	A	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.77;QD=32.99;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	6718534	rs2250656	T	C	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=26;PP=874;SC=TTCTTGGTCTTCCGAGGTGGC;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=6718542;WS=6718524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	6731057	rs2279624	T	C	1727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=20;PP=1350;SC=ACGGGTTGTTTCCTGTGGGCT;SOR=1.382;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=36;TCR=20;TR=56;WE=6731065;WS=6731047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	6731304	rs2279626	G	A	1126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=28;PP=907;SC=CTGCAGGGGCGCGAGCAGGCG;SOR=1.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=6731312;WS=6731294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	6731766	rs1702375	C	A	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=5;PP=307;SC=GAAAGAGAGGCCAGACTGGGG;SOR=1.473;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=13;WE=6731774;WS=6731756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	6732018	rs2291666	C	T	6335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=136;NR=54;PP=2965;SC=AGCCTCAGCCCGGGGGCAGGG;SOR=1.938;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=191;TCF=137;TCR=54;TR=190;WE=6732026;WS=6732008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr19	6732615	rs2047139	T	C	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=25;PP=582;SC=GGGAGGCTGATGGTGGTGGTG;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=6732623;WS=6732605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	6732982	rs2012357	G	A	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=319;SC=GCTGCTCCCCGGTCCAAGGCT;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=6732990;WS=6732972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	6733517	rs339395	A	G	1206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=3;PP=975;ReadPosRankSum=0.466;SC=GGGGTGAGGCACTCTGGGCCC;SOR=2.880;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=43;WE=6733525;WS=6733507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr19	6734131	rs339397	C	G	2818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=46;PP=2428;SC=GGGAAAACGGCATGGGGAGTG;SOR=0.812;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=42;TCR=46;TR=88;WE=6734139;WS=6734121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr19	6737481	rs340138	T	C	2010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=18;PP=1429;SC=CAGCGCCAGCTGGTGGATGCG;SOR=2.035;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=64;TCF=46;TCR=18;TR=63;WE=6737489;WS=6737471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	6737509	rs339401	G	A	2621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=38;PP=1976;SC=CAGCCACCCAGCAGCAGCACC;SOR=1.005;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=46;TCR=38;TR=84;WE=6737517;WS=6737499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	6739710	rs2303109	G	T	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.63;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	6743399	rs381897	A	T	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.86;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	6743405	rs2277986	A	G	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.86;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	6744762	rs339405	A	C	4600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=47;PP=2965;SC=AGAGGGAGGTACCCATAGGCT;SOR=1.528;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=138;TCF=91;TCR=47;TR=138;WE=6744770;WS=6744752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr19	6754774	rs168129	C	A	3599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=59;PP=2908;SC=TCAGGTGAAGCGTGATTATGT;SOR=0.903;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=111;TCF=52;TCR=59;TR=111;WE=6754782;WS=6754764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr19	6820951	rs164016	C	T	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=16;PP=467;SC=ATATACAAGACGCAAATAGCA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=6820959;WS=6820941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	6833072	rs308200	C	T	152.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=2;PP=109;SC=GACCCAAAAGCCAATCAATGA;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=6833080;WS=6833062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	6833162	rs78698684	CT	C	120.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=4.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.40;MQRankSum=1.003;QD=5.03;ReadPosRankSum=-0.331;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr19	6833777	rs186295	A	G	1593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=31;PP=1249;SC=CCTGTGTACCACAAATAATGG;SOR=1.118;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=21;TCR=31;TR=52;WE=6833785;WS=6833767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	6833989	rs308199	G	T	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=24;PP=995;SC=GTTGCTGTGTGGGGGCAGGAG;SOR=1.105;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=39;WE=6833997;WS=6833979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	6836271	rs308196	A	C	183.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=148;SC=AAATAGTTTTACAAAGAGTAT;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=6836279;WS=6836261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	6836836	rs308194	G	A	1131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.9545;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.392;NF=12;NR=2;PP=1413;ReadPosRankSum=-1.285;SC=CCATTGAGCAGAGAGATGGAC;SOR=1.839;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=14;WE=6836873;WS=6836826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,26:0.96:27
chr19	6836844	rs6146454	GACACACACACACACACACACAC	G	1132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.144;NF=4;NR=0;PP=1110;ReadPosRankSum=-1.602;SC=CAGAGAGATGGACACACACAC;SOR=2.226;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=4;WE=6836873;WS=6836826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,33:0.97:34
chr19	6908675	rs34044572	C	CT	1444.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.32;MQRankSum=0.318;QD=18.52;ReadPosRankSum=0.980;SOR=0.915;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,66:0.85:78
chr19	6913811	rs457857	A	G	3089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=75;PP=2440;SC=CTCAGCAAATATCACTCCGGC;SOR=3.166;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=92;TCF=16;TCR=76;TR=91;WE=6913819;WS=6913801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	6913878	rs462913	G	T	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=32;PP=892;SC=TACACCTAGGGGATGATTTTG;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=6913886;WS=6913868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	6919529	rs171674	T	C	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=498;SC=AAACGATTCCTTCCTTTTTTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=6919537;WS=6919519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	6919624	rs373533	A	C	1468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=15;PP=1075;SC=GCGCTTCTTCAAAGACCACCA;SOR=1.203;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=41;WE=6919632;WS=6919614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	6919753	rs461645	A	G	1388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=33;PP=1100;SC=TCTGGAGAACATTCAGGTTTG;SOR=1.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=48;TCF=14;TCR=34;TR=47;WE=6919761;WS=6919743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	6919879	rs252566	C	T	105.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.26;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	6935113	rs252551	C	T	3349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=54;PP=2506;SC=TCACCTCCCCCCCTCTTTTAA;SOR=0.730;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=106;TCF=52;TCR=54;TR=106;WE=6935129;WS=6935103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	6935121	rs1160969	T	TAA	4355.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=52;PP=2966;SC=CCCCCTCTTTTAATTTCCTCT;SOR=0.979;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=82;TCF=28;TCR=54;TR=78;WE=6935129;WS=6935103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	6937683	rs388711	A	G	3076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=68;PP=2366;SC=TGCTCCCTGCAGGTGCTGGTC;SOR=1.728;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=31;TCR=68;TR=99;WE=6937691;WS=6937673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr19	6939910	rs463891	G	A	1050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=0;PP=906;SC=TAACATTTTAGTGTTTATCCT;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=6939918;WS=6939900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	6940189	rs464849	G	C	435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=14;PP=360;SC=TGTTGGGGGCGGTCTTCCTGT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=6940197;WS=6940179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	6955612	.	G	C	2963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=44;PP=2359;SC=TTATTATAAAGATGATAATGG;SOR=0.804;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=43;TCR=46;TR=86;WE=6955620;WS=6955602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr19	6960834	rs459883	A	C	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=0;PP=843;SC=GAATCCAAGGAAAGAAAAGTG;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=6960842;WS=6960824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	6961182	rs460698	G	A	898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=27;PP=772;SC=ATTTTAGATGGAGTCAGATGT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=6961190;WS=6961172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	6972357	rs252579	C	T	2960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=51;PP=2302;SC=CGTGGACCAGCGGCCTCCCTC;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=41;TCR=51;TR=92;WE=6972365;WS=6972347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr19	6980939	rs2035972	T	C	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=0;PP=366;SC=TTTTTGAAAATGGAGTCCTTC;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=6980947;WS=6980929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	6981849	rs1874003	T	C	1601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=42;PP=1297;SC=TCCCTTCTTCTAGTCACCCTC;SOR=5.421;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=44;WE=6981857;WS=6981839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	6988955	rs68152415	A	C	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=474;SC=TTGCCCAGTCACACGTGCAAG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=6988963;WS=6988945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	6991010	rs8108538	C	T	342.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=8;PP=225;SC=ATCGCATCACCGCACTCCAGC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=6991018;WS=6991000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	7005905	rs62126094	T	A	130.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=26.18;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	7011766	rs6510942	T	C	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=5;PP=519;SC=TCTTGCTTCTTGTTGGCAAAG;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=7011774;WS=7011756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	7074872	rs2967648	G	A	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=5;PP=418;SC=CGGGCAGGAGGGGGGGTGACC;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=7074880;WS=7074862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	7083818	rs17637922	C	T	1155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=27;PP=876;SC=TGAGCAAACTCTAACAAGATG;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=31;WE=7083826;WS=7083808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	7116963	rs1051690	T	C	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=1;PP=551;SC=CTGAACTCCATTGGACATGGT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=7116971;WS=7116954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	7122511	rs34073323	AT	A	603.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=0;PP=662;SC=AAAAAGAAGTATCTTGCCCCT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=7122519;WS=7122501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	7150418	rs2252673	C	G	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=365;SC=CAAAAAGCCACAGAAACCCCT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=7150426;WS=7150408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	7166109	rs2059807	A	G	2734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=19;PP=1981;SC=GCATCAGCCTATTAAAAGCAA;SOR=2.331;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=54;TCR=19;TR=73;WE=7166117;WS=7166099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	7166138	rs3815902	G	A	3715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.97;NF=72;NR=38;PP=2736;SC=ATTCACATACGAATTCACATT;SOR=1.669;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=72;TCR=38;TR=110;WE=7166146;WS=7166128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr19	7166376	rs2059806	C	T	2257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=45;PP=1674;SC=TGGAACCACACGCATCCTGCC;SOR=1.885;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=19;TCR=45;TR=64;WE=7166384;WS=7166366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	7167951	rs2860177	T	G	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=4;PP=641;SC=CCTCGCCTCCTCAGCGTCTCT;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=7167959;WS=7167941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	7168213	rs2245143	C	G	1738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=40;PP=1257;ReadPosRankSum=-0.769;SC=GCAGAGGTGACGCTGCTATTC;SOR=1.276;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=54;TCF=13;TCR=41;TR=53;WE=7168221;WS=7168203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,57:0.98:58
chr19	7170517	rs2860178	A	G	201.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=133;SC=CCGGTCCCTCATGCCAAAAAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=7170525;WS=7170511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	7184238	rs6510959	G	A	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	7184243	rs41315074	C	G	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	7184651	rs3835070	GGA	G	142.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=235;SC=CGGGCAAACTGGAGAGAGAGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=5;WE=7184660;WS=7184641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	7293898	rs7508518	G	C	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=146;SC=GCCCCCGGTGGCCATGGCTGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=7293906;WS=7293888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	7427607	rs11260007	T	C	1754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=4;PP=1363;SC=AGAATCCAGGTCCTGGCTTCC;SOR=4.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=47;TCR=4;TR=51;WE=7427615;WS=7427597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	7504767	rs10401415	G	T	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=242;SC=GCCTGGAGGGGTTGTTTTTTT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=7504775;WS=7504757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	7504982	rs10422503	C	T	1773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=44;NR=14;PP=1391;SC=GAGCCCCGGGCGCGAACATGG;SOR=2.265;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=60;TCF=46;TCR=14;TR=58;WE=7504990;WS=7504972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	7506668	rs2287909	T	G	2245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.915;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=56;PP=1816;ReadPosRankSum=-1.245;SC=TCATCTCCGCTCTCTCGCGGC;SOR=3.136;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=68;TCF=11;TCR=57;TR=66;WE=7506676;WS=7506658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,72:0.97:74
chr19	7506755	rs2287910	A	G	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=15;PP=812;SC=TTGGGGTGGCATGGCTCTGGG;SOR=0.811;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=18;TCR=15;TR=33;WE=7506763;WS=7506745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	7506982	rs10424311	C	G	556.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.166;NF=3;NR=16;PP=483;ReadPosRankSum=0.348;SC=GCCCTCCACTCTCTTCTCTGC;SOR=1.270;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=19;WE=7506990;WS=7506972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr19	7507010	rs200202576	CCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTTCCTT	C	534.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.36;QD=41.13;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	7518268	rs11463454	T	TC	205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=2;PP=217;SC=ACCTCATAGATCCACATGTCC;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=8;WE=7518276;WS=7518258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	7524743	rs11259996	G	C	2837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=42;PP=2286;SC=GCCGAGGCTGGCCTGCCTGGG;SOR=0.738;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=45;TCR=42;TR=87;WE=7524751;WS=7524733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	7528734	rs2287918	A	G	1190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=4;PP=976;SC=ATCTGCAGGCAGCTGGGCAGC;SOR=4.125;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=38;TCR=4;TR=42;WE=7528742;WS=7528724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	7533767	rs10405143	T	G	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=14;PP=840;SC=AGGGCCCTCGTGTGAGCATGC;SOR=0.811;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=18;TCR=14;TR=32;WE=7533775;WS=7533757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	7533850	rs9329368	A	G	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=20;PP=1097;SC=CCCACCGAGAACCGGCTGGCC;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=23;TCR=20;TR=43;WE=7533858;WS=7533840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	7534075	rs2241396	C	T	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=259;SC=CAGGCTCTAGCGGCTCGCTGG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=7534083;WS=7534065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	7538039	rs11880122	A	G	2897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=31;PP=2193;SC=GGCCATGAGTATGAAATCATC;SOR=1.460;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=89;TCF=58;TCR=31;TR=88;WE=7538047;WS=7538029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr19	7538117	rs11880140	A	G	2826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.815;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=32;PP=2179;ReadPosRankSum=-0.749;SC=AGGGTTTCCCATCACAAGGGG;SOR=1.503;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=97;TCF=64;TCR=33;TR=95;WE=7538125;WS=7538107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,99:0.99:100
chr19	7568966	rs113706007	A	ATCTCTCTCTCTC	726.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=1973;SC=GGGAATCTCAATCTCTCTCTC;SOR=3.912;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=6;WE=7568974;WS=7568956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	7569282	rs484870	A	G	1372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=33;PP=1134;ReadPosRankSum=0.664;SC=AGGCCCCAGGATCTGCCTGAA;SOR=0.634;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=16;TCR=34;TR=49;WE=7569290;WS=7569272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr19	7570729	rs683729	G	A	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=4;PP=669;SC=AGTGCTACCAGGTGGGGCCCA;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=7570737;WS=7570719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	7570978	rs685034	T	C	2082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=40;PP=1481;SC=ACTACTGCCCTTCAGAGTGGA;SOR=2.925;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=49;WE=7570998;WS=7570968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	7570990	rs685048	A	G	1974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=38;PP=1312;SC=CAGAGTGGAGACAGGTGCAGA;SOR=3.767;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=43;WE=7570998;WS=7570968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	7571030	rs3826736	T	A	1004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=29;PP=800;SC=GCAGCAAAGCTACCTGCCGCG;SOR=4.047;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=32;WE=7571038;WS=7571020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	7571067	rs200631755	A	AAGCCCCGCCCCATGG	231.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=2;PP=449;SC=CGCTCCCGGGAAGCCCCGCCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=2;WE=7571075;WS=7571057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	7572169	rs505570	G	C	1911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=52;PP=1630;SC=CCTTCAGCCTGAAGATCATCC;SOR=4.731;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=4;TCR=52;TR=56;WE=7572177;WS=7572159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	7573098	rs475923	T	A	1055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=8;PP=847;SC=ACAGTGCAAGTACAGCCACAT;SOR=2.235;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=32;WE=7573106;WS=7573088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	7573287	rs1133378	C	T	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.13;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	7573297	rs608144	T	C	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.51;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	7573301	rs1133380	C	T	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.93;SOR=3.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	7593169	rs2305889	A	G	1061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=27;PP=843;SC=CCAGACCAGCACTGACCAGGG;SOR=4.047;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=30;WE=7593177;WS=7593159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	7605566	rs591040	C	T	6218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=118;NR=76;PP=2965;SC=ACAGCGTCAACAGCCTTCTCA;SOR=1.231;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=118;TCR=76;TR=194;WE=7605574;WS=7605556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr19	7606737	rs492092	G	C	1129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=10;PP=926;SC=CGAGGAAGCTGTGGCCTCGTC;SOR=1.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=33;WE=7606745;WS=7606727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	7607023	rs577866	T	C	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=277;SC=ACCGCCTGCCTGTCTTGATTG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=7607031;WS=7607013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	7607564	rs620744	T	C	2167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=33;PP=1825;SC=CGGGTAAGGCTTGGGACCCTG;SOR=0.754;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=32;TCR=33;TR=65;WE=7607572;WS=7607554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	7615585	rs577219	T	G	197.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=4;PP=158;SC=CCTCGACAACTCACACACATC;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=7615593;WS=7615575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	7615682	rs66529260	GA	G	348.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=2;PP=432;SC=CATTTCGTTGGAAAAAGGGGA;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=13;WE=7615690;WS=7615673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	7616347	rs473899	G	A	2255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=51;PP=1738;SC=GGCCCAGAGCGTGCTGGGAGA;SOR=2.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=16;TCR=51;TR=67;WE=7616355;WS=7616337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	7616474	rs661825	C	G	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=328;SC=AAGTAGGACCCAGGTGCAGAG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=7616482;WS=7616464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	7625864	rs35902090	G	GC	1724.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.328;NF=39;NR=14;PP=1522;ReadPosRankSum=0.020;SC=GACTCTGTGGGCCCCCCCTAA;SOR=0.631;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=72;TCF=51;TCR=21;TR=53;WE=7625872;WS=7625854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,59:0.97:61
chr19	7626013	rs11307097	AC	A	2429.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.375;NF=17;NR=55;PP=2225;ReadPosRankSum=-0.121;SC=GGCCCAGGGGACCCCCCAAGA;SOR=1.143;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=86;TCF=18;TCR=68;TR=72;WE=7626021;WS=7626003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,81:0.96:84
chr19	7626669	rs2303178	G	A	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=26;PP=927;ReadPosRankSum=1.266;SC=TGTCGTTTTCGGACTGGGGAC;SOR=0.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=39;WE=7626677;WS=7626659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,39:0.98:40
chr19	7670063	.	T	TGTGTGTGTGTG	806.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.261;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=7.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQRankSum=-3.168;QD=16.81;ReadPosRankSum=-2.217;SOR=2.468;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr19	7675917	rs747569	C	G	2678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=16;PP=2215;SC=GCTGTTGTCTCCCCCCGGGGA;SOR=2.391;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=61;TCR=16;TR=77;WE=7675925;WS=7675907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	7684450	rs143149642	GGGGGGAT	G	2310.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=28;NR=17;PP=2295;SC=GGGGTGGGGAGGGGGGATGGG;SOR=1.445;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=45;WE=7684464;WS=7684440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	7692058	rs794084	G	A	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=3;PP=549;SC=GACATCCTACGCGGAGCTAGT;SOR=2.636;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=7692066;WS=7692048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	7692151	.	C	T	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=25;PP=1062;SC=CCGATAGCCTCGCACAGCTGT;SOR=0.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=20;TCR=25;TR=45;WE=7692159;WS=7692141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	7694393	rs4134809	G	A	5454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=60;PP=2965;SC=CGGGCCGCGAGAGTCGCGCCA;SOR=1.356;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=107;TCR=60;TR=166;WE=7694401;WS=7694383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr19	7695620	rs11260004	T	C	3124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=63;PP=2537;SC=TGCTGGGGACTAATGTCTGCC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=30;TCR=63;TR=93;WE=7695628;WS=7695610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr19	7696292	.	GGGT	G	75.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=64.19;QD=25.08;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	7696294	.	GT	G	28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;FR=0.5208;HP=8;HapScore=3;MGOF=7;MMLQ=21;MQ=64.19;NF=4;NR=0;PP=28;QD=10.5;SC=GCGGGGGGGGGTGGTCCCGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=4;WE=7696302;WS=7696282;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,4:0.80:5
chr19	7697168	rs2279042	C	T	1888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=4;PP=1610;ReadPosRankSum=1.167;SC=GTCAGGGCAGCGGATGGACAG;SOR=3.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=57;TCR=4;TR=60;WE=7697176;WS=7697158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
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chr19	7703605	rs8104339	C	T	2279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.526;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=27;PP=1703;ReadPosRankSum=0.200;SC=CCCTCCCTTCCCTGCAGAAAT;SOR=1.079;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=75;TCF=46;TCR=29;TR=72;WE=7703613;WS=7703595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,78:0.96:81
chr19	7704815	rs138165596	TATGTGTGTGC	T	274.76	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=6;PP=756;SC=TGTCCATGTGTATGTGTGTGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=7704832;WS=7704805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	7708214	rs2303115	G	A	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=304;SC=AGAGATGGGGGGTTCTGGGGG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=7708222;WS=7708204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	7710040	rs929807	T	C	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=10;PP=722;SC=ACCTGGGAGCTCACCTGGCCG;SOR=1.688;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=30;WE=7710048;WS=7710030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	7710210	rs889187	A	G	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=16;PP=456;SC=AGGAGCGGGCATGGGGGGACC;SOR=2.200;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=7710218;WS=7710200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	7710269	rs710951	A	G	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=7;PP=189;SC=GCAGAGGGCCATTGGTGCACA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=7710277;WS=7710259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	7711221	rs10001	T	C	1535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=16;PP=1095;SC=TCATCAAGGATGTAATGGAGG;SOR=1.654;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=36;TCR=16;TR=52;WE=7711229;WS=7711211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	7712277	rs6791	A	G	1916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=37;PP=1450;SC=CAAGGCTGGCATAGAAGCCCG;SOR=1.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=27;TCR=37;TR=64;WE=7712285;WS=7712267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	7712425	rs34976997	G	C	979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=24;PP=830;SC=GGACCCTGGGGTCTGGGGCTT;SOR=2.910;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=7712433;WS=7712415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	7712474	rs794074	G	A	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=8;PP=572;SC=CTAGGTGTCTGGACTCCAGAG;SOR=1.085;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=21;WE=7712482;WS=7712464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	7712585	rs794073	T	G	1260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=8;PP=1026;SC=CCCCAACATCTTCCCCAAACC;SOR=2.985;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=38;TCR=8;TR=45;WE=7712593;WS=7712575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	7735089	rs10402265	G	C	796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=0;PP=609;SC=CCACGCTCCTGTGTTCCGGGC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=7735097;WS=7735079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	7735318	rs112669651	AGATGATGAT	A	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=2;PP=598;SC=ATAAACCTGGAGATGATGATG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=7735334;WS=7735308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	7742345	rs8107661	G	A	216.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.532;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=163;ReadPosRankSum=1.593;SC=ATGTGTGTGTGGTGTGATCAC;SOR=2.788;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=7742353;WS=7742335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,8:0.89:9
chr19	7743869	rs113286748	C	T	888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=8;PP=658;SC=GAAAATGCCACGTAAGTTGGC;SOR=1.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=7743877;WS=7743859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	7744075	.	ACCC	A	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=1;NR=5;PP=127;SC=ACGGGAAATGACCCCCCCCCC;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=6;WE=7744085;WS=7744065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	7754912	rs4996980	G	A	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.77;SOR=4.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	7754917	rs4996979	T	C	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.67;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	7754942	rs4996978	A	C	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=82;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=5;PP=873;SC=AGAGACCCTTATCTCTGAGCC;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=33;WE=7754950;WS=7754932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	7754964	rs4996977	T	C	2041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.61;SOR=3.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
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chr19	7754971	rs4996975	C	T	2270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.42;SOR=3.745;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	7755056	rs2228138	G	A	2634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=48;PP=2004;ReadPosRankSum=0.094;SC=TGTAGTCCACGTGGCTCCCAT;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=37;TCR=49;TR=84;WE=7755064;WS=7755046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,88:0.98:90
chr19	7755159	rs4996973	A	G	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=23;PP=1317;SC=GTCCTGGGGGACAGGACAGGG;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=23;TCR=23;TR=46;WE=7755167;WS=7755149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	7755213	rs4996972	C	T	1809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=22;PP=1488;SC=CAGCCCACTTCGAGAGGTTGG;SOR=1.101;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=31;TCR=22;TR=53;WE=7755221;WS=7755203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	7755285	rs28364072	A	G	1992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=27;PP=1548;SC=GCAGAGCCCCAGCCCACCTGC;SOR=1.163;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=40;TCR=27;TR=66;WE=7755293;WS=7755275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	7755469	rs2277995	T	C	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.48;SOR=4.235;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	7755472	rs74927160	G	T	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.22;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
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chr19	7755482	rs77121754	A	G	1501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.17;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	7755485	rs76013233	GC	AT	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.49;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
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chr19	7762380	rs113716290	TCCCCTGCAA	T	2024.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.23;NF=28;NR=8;PP=2969;SC=CCTCGCTTTTTCCCCTGCAAC;SOR=2.303;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=38;TCF=30;TCR=8;TR=36;WE=7762396;WS=7762370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	7762440	rs72558007	C	T	2228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=73;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=29;PP=1873;SC=ATCTGGTCACCGTGGTGGCTT;SOR=1.209;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=44;TCR=29;TR=73;WE=7762448;WS=7762430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	7764363	rs61499635	GTTTTT	G	1955.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.270;HP=15;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.688;NF=5;NR=40;PP=995;ReadPosRankSum=0.939;SC=AGCTGAAGCCGTTTTTTTTTT;SOR=2.996;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=57;TCF=6;TCR=51;TR=45;WE=7764376;WS=7764353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr19	7764436	rs12980031	G	T	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=16;PP=655;SC=CCCTCAATTTGCCACTCCTTC;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=7764444;WS=7764426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	7764545	rs3214456	G	GC	805.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=5;PP=925;SC=GGACTGGGGAGCCCCGCTTCT;SOR=2.670;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=23;WE=7764553;WS=7764535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	7764741	rs2287867	G	A	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=19;PP=655;SC=GCTGATTTGGGATTTAATGAT;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=7764749;WS=7764731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	7764772	rs2287868	T	C	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=15;PP=513;SC=AGCCATCAAATCCTAGTTACC;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=7764780;WS=7764762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	7794127	.	A	C	3136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.000;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.052;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=51;PP=2542;ReadPosRankSum=0.581;SC=AGTGTTTCTGAGACTCAGCAG;SOR=0.284;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=106;TCF=54;TCR=52;TR=104;WE=7794135;WS=7794117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,104:0.99:105
chr19	7794605	rs2277997	T	C	2423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=15;PP=2037;SC=CATCCCTAAGTATGGAGCCCC;SOR=2.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=59;TCR=15;TR=74;WE=7794613;WS=7794595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr19	7795813	rs6603117	G	A	83.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	7796235	rs12978097	C	T	1390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=28;PP=1123;SC=CAGGCGAGGCCGGGAACTCGG;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=17;TCR=28;TR=45;WE=7796243;WS=7796225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	7796366	rs12978401	C	T	996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=12;PP=832;SC=CGCGGGGACTCGCGCACATAC;SOR=1.044;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=31;WE=7796374;WS=7796356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	7796497	rs11260026	C	G	2547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=23;PP=2083;SC=TGGGGGTTTTCTGTCCCCAGG;SOR=1.824;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=55;TCR=23;TR=78;WE=7796505;WS=7796487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	7831166	rs868875	A	G	937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=23;PP=722;SC=TTGAGTTACCAACCCTGCCTG;SOR=3.841;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=25;WE=7831174;WS=7831156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	7831226	rs868876	A	T	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=356;SC=AACTGCGATCATTGCACTTGG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=7831234;WS=7831216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	7831429	rs475896	C	G	982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=0;PP=791;SC=AGCGGTCCACCCAACATGGAC;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=7831437;WS=7831427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	7831628	rs2277998	G	A	4924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=103;PP=2965;SC=GAACTGGCACGACTCCGTCAC;SOR=1.552;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=153;TCF=50;TCR=103;TR=153;WE=7831636;WS=7831618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr19	7831700	rs562607	G	C	2165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=52;PP=1781;SC=GCAGGTACACGTGGTGGGGGT;SOR=3.647;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=8;TCR=52;TR=60;WE=7831708;WS=7831690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr19	7912816	rs2307003	C	T	336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=169;SC=AGGTGGGGGGCGGCCAGGCAG;SOR=2.494;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=7912824;WS=7912806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	7913752	rs3826742	C	T	1513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=2;PP=1271;SC=TGGGTGGCCACGGGGAGGCTG;SOR=5.464;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=43;TCR=2;TR=45;WE=7913760;WS=7913742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	7913974	rs555609	T	C	5416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=74;PP=2965;SC=ACCCGGAACATGAGTTCTTCA;SOR=0.906;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=170;TCF=96;TCR=74;TR=170;WE=7913982;WS=7913964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr19	7916475	rs2452012	T	C	3491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=83;PP=2634;SC=TGAGGACCGATGGTGCCTGGG;SOR=2.061;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=30;TCR=83;TR=113;WE=7916483;WS=7916465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr19	7916620	rs580790	A	G	1244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=27;PP=1010;SC=TGAACCAGGCAGAGCTGATGC;SOR=1.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=41;WE=7916628;WS=7916610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	7917919	rs12975442	C	T	1871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=3;PP=1531;SC=GGGCGGCCCCCGGTGGTCAGG;SOR=5.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=50;TCR=3;TR=53;WE=7917927;WS=7917909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	7918103	rs526464	A	G	3327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=68;PP=2580;SC=GGTACTGGTAAGAAGGGGGGA;SOR=1.702;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=30;TCR=68;TR=98;WE=7918111;WS=7918093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr19	7927465	rs57122454	G	C	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=12;PP=326;SC=ACCGCCCCCGGACGCGCCCCT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=7927473;WS=7927455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	7928462	rs10410459	T	C	2885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=49;PP=2304;SC=ACGCATTGTATCCTCTGTCCC;SOR=1.046;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=37;TCR=49;TR=86;WE=7928470;WS=7928452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	7935716	rs12984133	G	A	1957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=29;PP=1666;SC=GGAAGAGGGCGTCTCCGGAGG;SOR=0.899;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=35;TCR=29;TR=64;WE=7935724;WS=7935706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr19	7936208	rs525420	A	G	4772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=62;PP=2965;SC=AGAAGGTGAGATCAAAGAAGC;SOR=1.041;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=88;TCR=62;TR=150;WE=7936216;WS=7936198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr19	7938306	rs58971992	A	AG	1884.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=24;PP=1857;SC=CTGGGGTACCAGGTTTCGGGA;SOR=0.767;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=48;TCF=20;TCR=28;TR=44;WE=7938314;WS=7938296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	7944348	rs56796931	TC	T	3752.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=36;PP=2965;SC=CAGCAACTTCTCCAAGAAATT;SOR=1.270;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=47;TCR=38;TR=79;WE=7944356;WS=7944338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr19	7944849	rs11260038	A	C	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=26;PP=932;SC=GACAGATGGAATTGACGTGAG;SOR=1.775;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=38;WE=7944857;WS=7944839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	7963914	rs524029	A	C	4780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=89;PP=2965;SC=TATCCGAGGTATCCGGGGAGA;SOR=1.324;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=144;TCF=55;TCR=89;TR=144;WE=7963922;WS=7963904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr19	7976116	rs10412007	T	C	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=11;PP=646;SC=AGATACGTCTTCTCCTCCCCC;SOR=0.941;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=13;TCR=11;TR=24;WE=7976124;WS=7976106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	7986638	rs475002	C	G	2181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=54;PP=1724;SC=GGAAGAAGCCCTGGCAGTGGC;SOR=2.472;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=16;TCR=54;TR=70;WE=7986646;WS=7986628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	7990134	rs112578370	T	G	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=3;PP=574;SC=GCCGGCCCTCTGAGACCCCGG;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=28;WE=7990142;WS=7990124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	8117869	rs11575008	C	T	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=240;SC=TTACCACTTCCCTCCACGACC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=8117877;WS=8117859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	8120930	.	T	G	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=215;SC=CCTGGAAGGGTTGTGGTATGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=8120938;WS=8120921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	8122737	rs2303164	G	A	2754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=41;PP=2069;SC=AGTTATCATCGTCCAAGTTTA;SOR=0.809;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=84;TCF=43;TCR=41;TR=84;WE=8122745;WS=8122727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	8122767	rs2303165	T	C	2663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=31;NR=44;PP=2085;SC=TCAGCAGCAGTAAGAGGAATG;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=31;TCR=44;TR=75;WE=8122775;WS=8122757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr19	8127075	rs34145389	C	G	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=8;PP=288;SC=GTCAATTTTACTTCGGCCTCT;SOR=0.976;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=13;WE=8127083;WS=8127065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	8136839	rs73005512	G	C	842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=2;PP=717;SC=GCTCCTTCTTGGGGGGGCTGA;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=8136847;WS=8136829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	8137102	rs7256904	G	T	2499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=77;PP=2254;SC=GATGGGCAGGGTGGAGGGGTT;SOR=6.413;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=79;TCF=2;TCR=77;TR=79;WE=8137110;WS=8137092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr19	8137850	.	C	CGT	152.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5008;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.728;NF=8;NR=0;PP=332;ReadPosRankSum=-1.164;SC=CACAAAGCCCCGTGTGTGTGT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=8;WE=8137858;WS=8137840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr19	8151132	rs144887983	C	G	2321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=23;PP=1895;SC=TCATCACAGTCGCACCGGAAG;SOR=1.547;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=49;TCR=23;TR=72;WE=8151140;WS=8151122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	8151261	rs11665747	C	T	1997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=52;PP=1552;SC=GGCAGCCAGCCTCTCCCACAG;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=9;TCR=52;TR=61;WE=8151269;WS=8151251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	8159362	rs7245429	G	T	1652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=35;PP=1356;SC=CTGGAAGCCAGGGGGACAGAT;SOR=1.747;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=51;WE=8159370;WS=8159352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	8159409	rs7245552	G	T	1255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=29;PP=972;SC=GGCAAGTGCCGGGTAGGCAGG;SOR=1.900;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=42;WE=8159417;WS=8159399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	8160334	rs12608849	G	A	2800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.039;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=41;PP=2178;ReadPosRankSum=-1.235;SC=GCTGTGTTGAGGCAATGGCCA;SOR=0.124;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=47;TCR=41;TR=86;WE=8160342;WS=8160324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,90:0.98:92
chr19	8160517	rs10413994	A	G	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=24;PP=754;SC=TGTATAGACTATGTATATTAG;SOR=3.180;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=8160525;WS=8160507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	8160812	rs10404258	C	T	1666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=23;PP=1154;SC=TCTGAGAACCCACTTTGTGGC;SOR=0.800;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=28;TCR=23;TR=51;WE=8160820;WS=8160802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	8165868	rs56182050	G	A	1117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=23;PP=877;SC=TGCGCAAAGGGGAACAAAGCT;SOR=1.483;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=11;TCR=23;TR=34;WE=8165876;WS=8165858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	8167830	rs12986396	A	G	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=19;PP=712;SC=CCAAAGAGATAGGAACTCCTT;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=8167838;WS=8167820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	8167873	rs56921504	A	G	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=419;SC=TGGCTTGTCCAGGCACAGTGG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=8167881;WS=8167863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	8168326	rs3865463	G	A	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=165;SC=ACTGCCACATGTCAGCACTTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=8168334;WS=8168316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	8171252	rs2126971	A	G	718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=583;SC=ATAGACATTTAAAGGGTCTAT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=8171260;WS=8171242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	8174650	rs3813779	A	G	2592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=60;PP=2003;SC=GTAGGGAGGAAGCGCGGTCCT;SOR=2.777;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=15;TCR=60;TR=75;WE=8174658;WS=8174640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	8174724	rs11672038	C	T	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=31;PP=905;SC=CTACAGCCCTCGCTCAAGGTC;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=8174732;WS=8174714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	8176458	rs12609936	A	G	3726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.90;SOR=1.725;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	8176463	rs11260057	A	G	3759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.23;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	8190674	.	C	CA	60.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.63;MQRankSum=-0.751;QD=6.75;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr19	8191238	rs10906993	C	T	2684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.75;SOR=1.942;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	8191248	rs10906994	A	G	2887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.10;SOR=1.716;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	8191323	rs7260558	T	C	2129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=37;PP=1684;SC=TTCCCATGGGTGCCTGGGAGG;SOR=0.840;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=70;TCF=33;TCR=37;TR=69;WE=8191331;WS=8191313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	8191401	rs3813778	G	A	1909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=32;PP=1521;SC=CGAGGGTGGCGCAGCACTCAG;SOR=0.865;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=26;TCR=32;TR=58;WE=8191409;WS=8191391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	8196444	rs4804271	C	T	2592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=20;PP=2128;SC=TCACCGGAGTCTTTGGCAGGA;SOR=2.275;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=65;TCR=20;TR=85;WE=8196452;WS=8196434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	8196508	rs12974280	G	C	3333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=59;PP=2357;SC=AGCAGCACTCGGACTTGGTGA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=58;TCR=59;TR=117;WE=8196516;WS=8196498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr19	8197865	rs11666450	C	T	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=4;PP=457;SC=GCTCCAGGCTCACCCATGCAG;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=8197873;WS=8197855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	8200759	rs6603148	G	T	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=2;PP=52;SC=AGGTGGGTTTGGGGGCACAGT;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=8200767;WS=8200750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	8201051	rs8112525	T	C	8367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=127;NR=133;PP=2965;SC=ACATCACCCCTACTCTTGGAT;SOR=0.723;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=263;TCF=127;TCR=136;TR=260;WE=8201059;WS=8201041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,272:1.00:272
chr19	8201249	rs9749144	C	A	2052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=40;PP=1583;SC=AACCGCCCCCCCTTCCACCTG;SOR=1.196;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=26;TCR=40;TR=66;WE=8201257;WS=8201239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	8202944	rs1531547	G	C	264.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=215;SC=CCTGGACACCGTCCCCTGTTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=8202952;WS=8202934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	8203328	rs7246376	G	A	2360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=42;PP=1887;SC=CTCAGGGACCGGGCCAGCTGC;SOR=1.134;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=31;TCR=42;TR=73;WE=8203336;WS=8203318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	8212107	rs11669201	C	A	1476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=15;PP=1111;SC=TGAGCCCCTGCCCGTGTGGAC;SOR=1.378;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=44;WE=8212115;WS=8212097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	8315847	rs379983	A	G	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=0;PP=617;SC=CTGGTTGTCAACTGCGCTGAT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=8315855;WS=8315837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	8320656	rs144397154	TGGGGCGGGGC	T	2959.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.30;QD=42.89;SOR=1.785;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	8320890	rs2306199	T	G	1223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=20;PP=1022;SC=GAGCGAGCTTTGCAAGATGGT;SOR=0.927;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=35;WE=8320898;WS=8320880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	8326904	rs36259	G	A	2424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=41;PP=1936;SC=AAAGAACGGGGCAGCTGGAGG;SOR=1.003;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=74;TCF=32;TCR=42;TR=73;WE=8326912;WS=8326894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	8367033	rs250510	T	C	621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=1;PP=525;SC=CAACTTTAATTGCCACCCTCA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=8367041;WS=8367023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	8376431	rs561	G	A	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=9;PP=470;SC=ACCTCTTTATGGGAGGAGCTG;SOR=0.963;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=21;WE=8376439;WS=8376421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	8386480	rs189801319	C	A	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=4;PP=492;SC=AATTTGGGGGCAGGGGGAGGG;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=8386488;WS=8386470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	8386998	rs4147644	T	C	3212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.076;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=23;PP=2519;ReadPosRankSum=0.971;SC=AGGACACCCCTTTGATAGACC;SOR=1.234;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=72;TCR=23;TR=94;WE=8387006;WS=8386988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
chr19	8387207	rs1057232	G	A	1119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=38;PP=1007;SC=GTCTGTCACAGTCTGCTCCTT;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=38;WE=8387215;WS=8387197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	8388410	rs7253567	G	A	180.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=134;SC=AGATTGTGCCGCTGCACTCCA;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=6;WE=8388418;WS=8388400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	8389768	rs111756439	GTCACAGGTTGAC	G	4733.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.39;NF=33;NR=36;PP=2937;SC=GGGAAGGGAGGTCACAGGTTG;SOR=1.056;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=78;TCF=36;TCR=42;TR=69;WE=8389787;WS=8389758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr19	8397700	rs145917648	AAAAAT	A	132	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=3;NR=0;PP=124;SC=ACTCCGTCTCAAAAATAAAAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=3;WE=8397712;WS=8397690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	8398714	rs2009733	A	G	1257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=11;PP=1039;SC=GCCAGGAGAGACTCAGGATGG;SOR=1.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=37;WE=8398722;WS=8398704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	8398949	rs111751275	CTCGCTGTCGCCA	C	1077.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=5;PP=2557;SC=CGCCACCGTTCTCGCTGTCGC;SOR=0.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=10;WE=8398968;WS=8398939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	8399628	rs710949	A	G	413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.38;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	8399635	rs890853	C	T	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.16;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	8399819	rs201921116	G	A	279.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=7;PP=258;SC=CGGGTCTGGGGCGTCCCATCG;SOR=1.402;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=8399827;WS=8399809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	8429680	rs12609364	G	A	219.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=149;SC=AGCCGAGGAGGGAGGTTCGCT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=8429688;WS=8429670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	8454236	rs72996752	A	G	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=237;SC=ACTACCTGACAATACAGCAGT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=8454244;WS=8454226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	8464653	rs2913970	G	A	682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=547;SC=GTTGGCAGCCGCGTTGGTGCA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=8464661;WS=8464643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	8467538	rs148680686	C	CTTGTTTTTTTCTTT	489.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=576;SC=TGTTCGTTTGCTTGTTTTTTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=4;WE=8467546;WS=8467528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	8486884	rs1133893	G	A	2804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=47;PP=1992;SC=CGTCATCCGTGCCTTGGACAC;SOR=0.924;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=40;TCR=48;TR=87;WE=8486892;WS=8486874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr19	8495765	rs2303180	G	A	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=12;PP=359;SC=AGTGGCTGTGGTTGTGCAGCA;SOR=1.230;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=8;TCR=12;TR=20;WE=8495773;WS=8495755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	8495887	rs2303179	T	A	102.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=76;SC=GGAAGAGAGCTTCTGAGGTCA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=8495895;WS=8495877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	8503574	rs11259981	A	G	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=337;SC=GACACCATGCAGAGCCTAGTC;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=8503582;WS=8503564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	8528310	rs8102587	A	G	1116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=4;PP=904;SC=ACTGTCATTGATATTTACTAT;SOR=3.321;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=33;WE=8528318;WS=8528300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	8533504	rs7258281	T	C	1116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=50.76;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	8533509	rs59319088	C	T	1116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.67;SOR=6.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	8536373	rs12973706	A	G	1411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=28;PP=1154;SC=AATTATTGGGACAACTGGACT;SOR=1.414;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=44;WE=8536381;WS=8536363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	8548175	rs1599871	A	C	1540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=48;PP=1195;SC=AGTGGTGAGAAGTGCGGGTTC;SOR=3.422;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=8;TCR=48;TR=56;WE=8548183;WS=8548165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	8551094	rs2230647	T	C	3834.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=58;PP=2965;SC=GCATGGGCCCTGCCATGGGCC;SOR=0.810;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=123;TCF=64;TCR=59;TR=122;WE=8551102;WS=8551084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr19	8551852	rs11669139	A	G	2382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=26;PP=1687;SC=GCTGCAAGGCATGCCTTAGGA;SOR=1.320;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=77;TCF=51;TCR=26;TR=76;WE=8551860;WS=8551842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	8553630	rs6992	C	T	1563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=23;PP=1145;SC=AGGGGTGTGGCGTGGTTAAGT;SOR=0.841;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=29;TCR=23;TR=51;WE=8553638;WS=8553620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	8555886	rs2303110	G	C	4039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=38;NR=77;PP=2868;SC=CTTCCTGATAGCCCCCACCAA;SOR=1.539;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=38;TCR=77;TR=115;WE=8555894;WS=8555876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr19	8555905	rs117300065	G	A	3418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=71;PP=2519;SC=AAGGAATTGTGTGCTCGTGAG;SOR=2.036;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=26;TCR=71;TR=97;WE=8555913;WS=8555895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr19	8563456	rs2910435	C	G	1492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=19;PP=1242;SC=GTGTCCCAGCCGCTCCAAACC;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=30;TCR=19;TR=49;WE=8563464;WS=8563446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	8564523	.	T	G	2965	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=29;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=80;NR=57;PP=2965;QD=20;SC=GGGGCCTTCTTGGGGTGCTCG;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=80;TCR=57;TR=137;WE=8564531;WS=8564513;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr19	8567475	rs968502	T	C	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=11;PP=519;SC=TGATGGGCCATGGGATGAGTG;SOR=0.941;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=13;TCR=11;TR=24;WE=8567483;WS=8567465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	8567500	rs968501	G	A	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=13;PP=628;SC=CCGAGCTGGGGCCGCTGCCTT;SOR=0.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=25;WE=8567508;WS=8567490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	8567548	rs968500	A	G	366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=7;PP=272;SC=CGGTCAGCACACAGGGTGGGG;SOR=1.445;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=11;WE=8567556;WS=8567538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	8575765	rs3111564	C	G	747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.16;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	8576307	rs2910443	A	G	422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=6;PP=282;SC=GGTATCCACCAGACCCCGCAG;SOR=1.371;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=17;WE=8576315;WS=8576297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	8576468	rs2967575	A	C	2084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=31;PP=1612;SC=GAGCCCAGCCAGCCCTCCTGG;SOR=1.002;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=42;TCR=31;TR=73;WE=8576476;WS=8576458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	8576670	rs7175	C	T	1340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=31;PP=999;SC=GCAGCGGGAACGGCAGGCCCG;SOR=2.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=43;WE=8576678;WS=8576660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	8576862	rs2287865	G	C	240.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=6;PP=163;SC=TGGGCAGAGGGCTGGGCTGGG;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=8576870;WS=8576852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	8576888	rs2042302	C	G	233.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=150;SC=CCTCCAGGGGCACCAGGGAGA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=8576896;WS=8576878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	8577868	rs2967578	T	C	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=8;PP=696;SC=TCGCTTCTATTGTTTCAGGGA;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=8577876;WS=8577858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	8578000	rs1064010	G	A	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=17;PP=1129;SC=CCGGGGCCAGGCTGGCAGCTG;SOR=0.741;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=21;TCR=17;TR=38;WE=8578008;WS=8577990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	8578118	rs1064009	A	G	1769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=22;PP=1461;SC=TGGAGGAGGAAGGGGCTGCAG;SOR=1.118;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=32;TCR=22;TR=54;WE=8578126;WS=8578108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	8578199	rs1141019	T	C	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=35;PP=1018;SC=CCAGCATGTCTGGGATGGGCC;SOR=1.565;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=14;TCR=35;TR=49;WE=8578207;WS=8578189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	8578860	rs2287864	C	T	224.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=126;SC=AGGCTGTAGGCGCGACAGGGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=8578868;WS=8578850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	8579011	rs2287863	T	C	912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=15;PP=616;SC=GCAGTGCGAGTTCGCGCTCAC;SOR=0.756;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=30;WE=8579019;WS=8579001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	8591233	rs35536931	G	GTC	301.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=380;SC=AAACTCAAAAGTCTCTCTCTC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=8591241;WS=8591223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	8591572	rs2303687	C	G	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.99;SOR=2.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	8592207	rs2967774	A	G	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=12;PP=980;SC=GCGGCAGGTAAGGACCTGGCT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=26;TCR=12;TR=38;WE=8592215;WS=8592197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	8601051	rs57614495	G	GTC	412.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.803;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=500;ReadPosRankSum=1.261;SC=GTCTCCCTCTGTCTCTCTCTC;SOR=3.126;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=11;WE=8601059;WS=8601041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr19	8615589	rs4804311	A	G	2135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=50;PP=1659;SC=CTGTGGTACAACGGGGGCAGA;SOR=2.235;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=16;TCR=51;TR=66;WE=8615597;WS=8615579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	8619302	rs34667346	G	GTGA	502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=3;PP=533;SC=CCTGGGGGTGGTGATGTTTCA;SOR=1.445;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=10;WE=8619310;WS=8619292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	8619461	rs2913925	A	G	1200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=10;PP=963;SC=TGGGCCTGGCAGGGGAGGTCA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=41;WE=8619469;WS=8619451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	8642160	rs4542783	T	C	2290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=14;PP=1833;SC=CTCCTCTTTCTTCTTCCAGAT;SOR=2.617;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=55;TCR=14;TR=69;WE=8642168;WS=8642150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	8645786	rs7252299	A	C	1389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=12;PP=1096;SC=CCTAGTGGCCATGGCAGGTTT;SOR=2.252;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=44;WE=8645794;WS=8645776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	8657092	rs71179860	C	CGGGATGGGGCTGGAAG	635.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=2230;SC=TCAGCCTCTCCGGGATGGGCA;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=5;WE=8657100;WS=8657082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	8662350	rs7248483	C	T	41.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.87;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	8669873	rs7260282	T	C	1977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=8;PP=1583;SC=CATTTCCCCCTGCGTTCCAGA;SOR=3.113;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=48;TCR=8;TR=56;WE=8669881;WS=8669863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	8669931	rs7255721	G	C	2181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=18;PP=1598;SC=CACATGGGAGGTGCTGGCCTG;SOR=1.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=48;TCR=18;TR=66;WE=8669939;WS=8669921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	8841558	rs28324	T	C	2902.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=41;PP=2409;SC=CCCGGCTCCATACACCCATGT;SOR=0.832;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=90;TCF=49;TCR=41;TR=89;WE=8841566;WS=8841548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	8923117	rs250315	A	G	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=235;SC=CCAGGAACACAGCATTCTCAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=8923125;WS=8923107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	8932092	rs2910347	G	A	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=534;SC=AGCACGAGATGTTGGGGGGGG;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=8932100;WS=8932082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	8953801	rs2969292	T	C	3106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=28;PP=2505;SC=AATTTCTGGTTACTGAGGAAG;SOR=1.790;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=63;TCR=28;TR=91;WE=8953809;WS=8953791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr19	8953922	rs2972588	C	T	3729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=76;PP=2965;SC=CCAAGAAGGCCGTCCTGAAAA;SOR=1.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=44;TCR=76;TR=120;WE=8953930;WS=8953912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr19	8961772	rs2972591	A	G	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=424;SC=ATTATTTGTCAATTAATTAAA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=8961780;WS=8961762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	8961981	rs1035442	C	G	4295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=70;NR=69;PP=2965;SC=CATGTGATGACTCCCAGGAGT;SOR=0.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=70;TCR=69;TR=139;WE=8961989;WS=8961971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr19	8962461	rs1964289	G	C	291.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=9;PP=243;SC=TCTGGAGATGGAGTCTTGCTC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=8962469;WS=8962451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	8979112	rs73493609	G	C	1411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=1;PP=1171;SC=CACCACCTCAGGGGACCAGCC;SOR=6.138;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=42;WE=8979120;WS=8979102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	8982084	rs3752139	C	G	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=0;PP=491;SC=AGAGAACCGGCAAACAGACAC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=8982092;WS=8982074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	8982146	rs3752140	T	G	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=7;PP=820;SC=ATGGGGCTGATAGCTGCTCAC;SOR=2.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=31;WE=8982154;WS=8982136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	8986920	rs111523062	CA	C	200.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=1;PP=147;SC=AACTTCATCTCAAAAAAAAAA;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=10;WE=8986928;WS=8986910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	8987133	rs3764555	T	C	1586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=29;PP=1296;SC=AGAAGGGAGCTTGGGTTGGTC;SOR=1.136;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=21;TCR=29;TR=50;WE=8987141;WS=8987123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	8987218	rs3764556	G	T	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=574;SC=ACCAGGTGCTGCATGACGTTG;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=8987226;WS=8987208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	8992980	.	C	G	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.727;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQRankSum=-2.924;QD=3.49;ReadPosRankSum=0.000;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,3:0.19:16
chr19	8992981	.	T	G	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.433;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.55;MQRankSum=-2.924;QD=3.49;ReadPosRankSum=0.067;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,3:0.19:16
chr19	8992988	rs371102230	G	A	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=3.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.63;MQRankSum=-3.037;QD=2.93;ReadPosRankSum=1.009;SOR=0.113;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,3:0.18:17
chr19	8992993	rs114497462	G	A	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=4.129;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.88;MQRankSum=-3.451;QD=2.08;ReadPosRankSum=1.410;SOR=0.068;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,3:0.14:21
chr19	8992996	.	T	A	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.031;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=3.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQRankSum=-3.352;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.849;SOR=0.076;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,3:0.15:20
chr19	8992997	.	G	A	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=3.941;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQRankSum=-3.352;QD=2.34;ReadPosRankSum=0.795;SOR=0.076;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,3:0.15:20
chr19	8994113	rs2009979	T	C	1475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=3;PP=1193;SC=ACACTTGGGGTAGCCAGACTG;SOR=4.712;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=41;WE=8994121;WS=8994103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	8994373	rs873869	A	G	1286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=18;PP=1050;SC=TAGGTGGAACAAGACAAGGTG;SOR=0.990;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=24;TCR=18;TR=42;WE=8994381;WS=8994363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	8995853	rs11672574	T	C	117.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=3;PP=89;SC=CTCTCAGATCTTTCCCTCATG;SOR=3.258;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=8995861;WS=8995843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	8996019	rs73493652	A	T	1618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=38;NR=15;PP=1283;SC=GGAGAGTGGGAAAGGGTTAAG;SOR=2.024;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=38;TCR=15;TR=53;WE=8996027;WS=8996009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	8996182	rs56136170	C	T	2220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=25;PP=1778;SC=GAAGAAGAAACGGTGAAGTTC;SOR=0.990;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=39;TCR=25;TR=63;WE=8996190;WS=8996172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	8997189	rs111427194	T	TGGGAGA	2008.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=19;PP=2014;SC=ACCTGAGCTGTGGGAGAGGGA;SOR=1.414;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=55;TCF=24;TCR=31;TR=29;WE=8997197;WS=8997179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	8997343	rs55785038	C	T	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=14;PP=1007;SC=CTTCCATGCCCTGTCATGAGT;SOR=1.387;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=38;WE=8997351;WS=8997333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	8997454	rs76629162	G	A	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=2.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.86;MQRankSum=-8.969;QD=1.42;ReadPosRankSum=2.639;SOR=0.326;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,11:0.11:102
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chr19	8997481	.	CC	AT	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.10;MQRankSum=-10.210;QD=0.49;ReadPosRankSum=2.055;SOR=0.662;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:120,11:0.08:131
chr19	8997680	rs56233329	C	T	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=26;PP=736;SC=ACTATAACAACAGAAGTTTCT;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=8997688;WS=8997670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	8998532	rs57902801	T	C	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=485;SC=GTGTCCCCTTTCTTATCCCTA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=8998540;WS=8998522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	8999381	.	C	A	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.103;ClippingRankSum=0.000;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=29.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.73;MQRankSum=-7.500;QD=0.91;ReadPosRankSum=-2.792;SOR=2.617;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,12:0.10:123
chr19	8999383	rs79909361	A	G	825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=5.730;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQRankSum=-11.347;QD=6.26;ReadPosRankSum=-1.769;SOR=0.299;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,27:0.20:132
chr19	8999386	rs77049866	A	G	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=2.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.69;MQRankSum=-11.349;QD=7.05;ReadPosRankSum=-2.404;SOR=0.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,31:0.22:138
chr19	8999395	rs200813849	T	C	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=14.125;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.47;MQRankSum=-8.451;QD=1.74;ReadPosRankSum=-1.677;SOR=1.196;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,17:0.12:142
chr19	8999438	rs77891947	A	T	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=15.841;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.67;MQRankSum=-4.125;QD=2.06;ReadPosRankSum=2.193;SOR=2.394;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,19:0.12:162
chr19	8999446	rs201254514	T	C	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=8.927;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.79;MQRankSum=-10.366;QD=1.18;ReadPosRankSum=2.028;SOR=1.178;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,24:0.15:161
chr19	8999449	rs76798407	G	T	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=16.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.66;MQRankSum=-3.609;QD=1.90;ReadPosRankSum=1.017;SOR=2.289;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,18:0.12:155
chr19	8999474	rs199946350	T	C	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=11.024;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.34;MQRankSum=-11.300;QD=2.51;ReadPosRankSum=-0.657;SOR=1.756;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,24:0.14:166
chr19	8999488	rs200071553	C	T	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FS=14.535;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.19;MQRankSum=-11.019;QD=1.54;ReadPosRankSum=0.140;SOR=2.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,16:0.11:150
chr19	8999503	.	TG	GA	75.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.161;ClippingRankSum=0.000;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=16.100;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.46;MQRankSum=-11.074;QD=0.61;ReadPosRankSum=0.800;SOR=3.073;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,11:0.09:124
chr19	8999507	.	A	G	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.052;ClippingRankSum=0.000;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=13.511;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.59;MQRankSum=-10.315;QD=0.60;ReadPosRankSum=0.940;SOR=2.840;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,10:0.08:127
chr19	8999518	rs77650227	A	G	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=21.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQRankSum=-10.422;QD=0.65;ReadPosRankSum=0.380;SOR=4.232;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,11:0.09:122
chr19	9000169	.	CA	TG	192.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0.000;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=6.967;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQRankSum=-7.328;QD=2.17;ReadPosRankSum=-2.794;SOR=1.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,11:0.12:89
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chr19	9002519	rs150783178	G	C	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.421;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FS=0.708;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.94;MQRankSum=-9.535;QD=7.04;ReadPosRankSum=-0.359;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,43:0.36:120
chr19	9002576	rs80214581	T	C	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.349;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=44.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.03;MQRankSum=-10.289;QD=2.67;ReadPosRankSum=1.752;SOR=4.401;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,18:0.17:108
chr19	9002587	rs201053591	C	T	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=59.709;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.27;MQRankSum=-10.151;QD=3.22;ReadPosRankSum=1.200;SOR=5.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,16:0.15:105
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chr19	9009627	.	G	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.234;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=4.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.57;MQRankSum=-7.468;QD=2.78;ReadPosRankSum=-1.149;SOR=1.534;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,12:0.14:86
chr19	9009630	.	G	T	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=3.099;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.56;MQRankSum=-7.828;QD=2.41;ReadPosRankSum=-1.410;SOR=1.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,11:0.13:85
chr19	9009637	.	T	C	111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.807;ClippingRankSum=0.000;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=1.483;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.70;MQRankSum=-7.465;QD=1.36;ReadPosRankSum=-1.643;SOR=1.099;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,9:0.11:82
chr19	9009640	rs118154006	C	T	102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=1.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQRankSum=-7.654;QD=1.19;ReadPosRankSum=-1.760;SOR=1.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,9:0.10:86
chr19	9009663	.	A	G	153.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=18.884;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.00;MQRankSum=-9.199;QD=1.52;ReadPosRankSum=-3.168;SOR=2.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,10:0.10:101
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chr19	9009690	.	C	T	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.526;ClippingRankSum=0.000;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=22.528;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.29;MQRankSum=-11.059;QD=3.88;ReadPosRankSum=-0.305;SOR=2.946;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,19:0.15:124
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chr19	9012995	rs372792987	G	A	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.45;MQRankSum=-7.267;QD=6.29;ReadPosRankSum=-1.468;SOR=0.084;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,12:0.22:55
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chr19	9013000	.	A	AAAT	336.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.683;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.51;MQRankSum=-6.991;QD=6.60;ReadPosRankSum=-2.739;SOR=0.082;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,11:0.22:51
chr19	9013012	.	A	G	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQRankSum=-6.273;QD=1.73;ReadPosRankSum=-2.725;SOR=0.026;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,5:0.12:41
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chr19	9015374	.	C	A	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.269;ClippingRankSum=0.000;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=3.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.83;MQRankSum=-10.260;QD=1.33;ReadPosRankSum=3.153;SOR=0.372;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:152,17:0.10:169
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chr19	9018476	rs112059772	G	A	33.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=2.220;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQRankSum=-7.286;QD=0.49;ReadPosRankSum=0.683;SOR=0.194;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,5:0.07:69
chr19	9019348	.	A	G	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.556;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=1.515;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.73;MQRankSum=-7.218;QD=0.76;ReadPosRankSum=1.627;SOR=0.395;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,8:0.09:88
chr19	9019352	.	T	C	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.974;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=1.496;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQRankSum=-7.174;QD=0.73;ReadPosRankSum=1.507;SOR=0.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,8:0.09:87
chr19	9019353	.	G	T	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.239;ClippingRankSum=0.000;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=1.554;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.71;MQRankSum=-7.174;QD=0.73;ReadPosRankSum=1.404;SOR=0.370;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,8:0.09:87
chr19	9019605	rs12981679	C	G	1455.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.94;NF=29;NR=10;PP=1105;SC=CTCACTGCTGCTGGTGGGCAC;SOR=2.362;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=39;WE=9019613;WS=9019595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	9021107	.	C	G	1461	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MMLQ=16;MQ=45.51;NF=30;NR=20;PP=1461;QD=29.9154242509;SC=CCAGGGTGACCCATGTCCTCC;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=131;TCF=85;TCR=46;TR=50;WE=9021126;WS=9021086;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:81,50:0.38:131
chr19	9021159	.	T	C	596	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.42;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MMLQ=28;MQ=48.73;NF=7;NR=32;PP=596;QD=16.1736208345;SC=GGGTGAATGGTACCAGGAGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=133;TCF=56;TCR=77;TR=39;WE=9021167;WS=9021149;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:94,39:0.29:133
chr19	9024758	rs1862463	T	C	1196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=30;NR=7;PP=961;SC=GGGAGTGTGATCTCTAGTTAG;SOR=3.145;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=37;WE=9024766;WS=9024748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
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chr19	9025604	rs200791776	A	G	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=2.889;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.67;MQRankSum=-8.668;QD=0.48;ReadPosRankSum=0.386;SOR=0.333;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,14:0.13:111
chr19	9025826	rs7256118	T	A	682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=581;SC=TGGAGTAAAGTGGCATGATCT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=9025834;WS=9025816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	9028373	rs56396897	G	A	5123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=90;PP=2965;SC=ATCCACTGCCGTGGCTGAGCT;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=66;TCR=90;TR=156;WE=9028381;WS=9028363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr19	9028432	rs10411029	C	T	3544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=73;PP=2735;SC=GTCCATCCACCTCTCCATCCT;SOR=1.835;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=30;TCR=73;TR=103;WE=9028440;WS=9028422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr19	9048342	rs10854118	C	T	2420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=35;PP=1882;SC=GGGGTCACCACTCCTGATACC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=36;TCR=35;TR=71;WE=9048350;WS=9048332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr19	9049726	rs11670328	G	A	4136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=80;NR=43;PP=2965;SC=CTGAGCTGACGTCTGCCCCAT;SOR=1.366;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=81;TCR=43;TR=123;WE=9049734;WS=9049716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr19	9056982	rs11670318	G	A	4607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=75;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.753;SC=CTCAAATCCTGTGGTCTCAAA;SOR=0.239;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=74;TCR=76;TR=149;WE=9056990;WS=9056972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,151:0.99:152
chr19	9057408	rs1423051	A	G	3525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=50;PP=2882;SC=TTCCACAAAGAGAGAGCTCTT;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=107;TCF=57;TCR=50;TR=107;WE=9057416;WS=9057398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	9057687	rs1895364	A	G	2747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=41;PP=2226;SC=AGGGATGTGTATTCTATTAGA;SOR=0.788;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=39;TCR=41;TR=80;WE=9057695;WS=9057677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	9057721	rs2216662	C	T	2668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=43;SC=GTCATGGAGACTTCAGTAGTA;SOR=0.815;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=39;TCR=43;TR=82;WE=9057729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	9058907	rs1833777	G	C	2281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=24;PP=1742;ReadPosRankSum=-0.727;SC=TTTCAAAAACGTGAATTGCCT;SOR=0.438;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=43;TCR=24;TR=66;WE=9058915;WS=9058897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr19	9058942	rs1833778	C	T	2615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=29;PP=2136;SC=GCTTTAGAAGCGGCCAGACTC;SOR=1.395;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=53;TCR=29;TR=82;WE=9058950;WS=9058932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	9059808	rs7508222	A	G	2696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=39;PP=2225;SC=GACTTCAGTGATGGCCAGTAT;SOR=0.717;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=41;TCR=39;TR=80;WE=9059816;WS=9059798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	9060605	rs2194168	G	A	2451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=42;PP=1896;SC=CTTGTCTAGCGCTGATGGTGC;SOR=1.121;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=30;TCR=43;TR=72;WE=9060613;WS=9060595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr19	9060656	rs2216663	C	T	2376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=34;PP=1896;SC=GCTGAATTGCCTCTGTCTCCA;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=35;TCR=34;TR=69;WE=9060664;WS=9060646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	9060812	rs1820099	T	C	3718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=40;PP=2959;SC=GGAGAGGAGATGAGTGGCTAC;SOR=1.708;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=80;TCR=40;TR=120;WE=9060820;WS=9060802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr19	9062544	rs2547063	T	G	2757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=33;PP=2376;SC=CAGGCCAGGGTTGAGAAGAGA;SOR=1.139;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=50;TCR=33;TR=83;WE=9062552;WS=9062534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr19	9063678	rs2547064	T	G	4850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=70;PP=2965;SC=GCTTGACGTGTCCAAAGTACT;SOR=0.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=145;TCF=75;TCR=70;TR=145;WE=9063686;WS=9063668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr19	9063935	rs2252675	G	A	3576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=44;PP=2961;SC=CTTCAGAGCCGCTGGACTCCC;SOR=1.049;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=63;TCR=44;TR=107;WE=9063943;WS=9063925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr19	9065632	rs1867691	T	C	2596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=43;PP=2020;SC=GTAGCACCAATGGACACTTCA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=43;TCR=43;TR=86;WE=9065640;WS=9065622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr19	9070194	rs1344572	A	G	6173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=92;PP=2965;SC=GGCGAAGGTGATACCCATTGG;SOR=0.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=99;TCR=93;TR=191;WE=9070202;WS=9070184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr19	9070225	rs1559172	G	C	5359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=93;PP=2965;SC=TTGGATGTGTGTGAATCAGCT;SOR=1.053;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=158;TCF=65;TCR=93;TR=158;WE=9070233;WS=9070215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr19	9070837	rs2547067	G	A	3199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=56;PP=2428;SC=GCTATTGTGGGCCGATCAAGG;SOR=1.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=36;TCR=57;TR=91;WE=9070845;WS=9070827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr19	9071763	rs10422567	T	A	2655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=37;PP=2114;SC=GCTAGAAGAGTTGACCCCTGT;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=42;TCR=37;TR=78;WE=9071771;WS=9071753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	9072313	rs2121133	A	G	2214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=29;PP=1872;SC=GCAGGTGAGGACAGAAAGGAA;SOR=1.054;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=40;TCR=29;TR=69;WE=9072321;WS=9072303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	9072742	rs2591590	T	C	2633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=57;PP=1812;SC=TCCTGGGAGATGCTGGTCTCC;SOR=1.227;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=92;TCF=35;TCR=57;TR=91;WE=9072750;WS=9072732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr19	9074950	rs2591591	G	T	2670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=37;PP=2188;SC=GTTGTAGCATGGATAGGTACC;SOR=0.821;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=41;TCR=37;TR=78;WE=9074958;WS=9074940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	9075217	rs2547068	T	A	1754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=19;PP=1410;SC=GACAGCCTGGTGATGGCTTCT;SOR=1.302;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=54;WE=9075225;WS=9075207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	9075346	rs2591592	T	A	2865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=31;PP=2246;SC=GAAGAGATAATACTTGTTTGT;SOR=1.005;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=52;TCR=31;TR=83;WE=9075354;WS=9075336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	9075584	rs2547069	T	A	1536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=32;PP=1308;SC=TGACCCAGCCTGTGGTCTCTA;SOR=1.514;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=48;WE=9075592;WS=9075574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	9075635	rs2547070	G	A	1373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=27;PP=1131;SC=TGTCTGTGGTGGACTCAGAAG;SOR=1.347;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=13;TCR=27;TR=40;WE=9075643;WS=9075625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	9075737	rs2547071	T	C	1393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=18;PP=1110;SC=GGGTCCTTAATACACTGGAGG;SOR=1.038;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=25;TCR=18;TR=43;WE=9075745;WS=9075727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	9075969	rs2591593	C	T	1335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.310;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=24;PP=1052;ReadPosRankSum=-0.707;SC=GGGCACCTGCCCTGGATGTGC;SOR=0.511;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=44;TCF=20;TCR=24;TR=43;WE=9075977;WS=9075959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chr19	9076083	rs2547072	G	A	1499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=15;PP=1110;ReadPosRankSum=-1.200;SC=TGCAGCTGGTGTGACTGCACT;SOR=0.351;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=46;WE=9076091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,51:0.96:53
chr19	9076163	rs2547073	C	T	3010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.014;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=25;PP=2474;ReadPosRankSum=-0.687;SC=AAGTGAGTTCCTGGGGAGTTG;SOR=1.633;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=88;TCF=62;TCR=26;TR=87;WE=9076171;WS=9076153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,91:0.99:92
chr19	9076278	rs953551	G	A	5605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.188;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=66;PP=2965;ReadPosRankSum=0.510;SC=GGACAGGGGCGTATTTGGGTC;SOR=1.076;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=177;TCF=110;TCR=67;TR=176;WE=9076286;WS=9076268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,180:0.99:181
chr19	9076728	rs2591594	C	T	6371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=122;PP=2965;SC=AGAAGTTGTGCGCCTCTCTGT;SOR=1.337;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=72;TCR=122;TR=194;WE=9076736;WS=9076718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr19	9076858	rs2547074	C	T	2462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=45;PP=1919;ReadPosRankSum=0.000;SC=GCTGTGGTTACGTCCAGGATG;SOR=1.281;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=31;TCR=47;TR=75;WE=9076866;WS=9076848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,79:0.98:81
chr19	9076929	rs2547075	T	G	1626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=33;PP=1239;SC=AATGTCACTTTTCACTGCACT;SOR=1.480;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=51;WE=9076937;WS=9076919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	9076950	rs2547076	C	A	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=26;PP=1079;SC=TACATTGGCCCTCAGAGTCTC;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=17;TCR=26;TR=43;WE=9076958;WS=9076940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	9076991	rs2591595	C	T	1326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=21;PP=1081;SC=TGACAGATGACGCAGAGCTTG;SOR=0.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=20;TCR=21;TR=41;WE=9076999;WS=9076981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	9077060	rs2591596	C	T	1473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=21;PP=1171;SC=AGGGCAGAGACACTAGTGAGG;SOR=0.919;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=25;TCR=21;TR=46;WE=9077068;WS=9077050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	9077264	rs1862461	T	G	2393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=39;PP=1952;SC=CTGTGGTGCTTACCCATGTCT;SOR=0.836;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=31;TCR=39;TR=70;WE=9077272;WS=9077254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	9077436	rs1862462	G	A	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=22;PP=1581;SC=AGTTGTCTTTGAAACCAGTTC;SOR=1.197;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=57;WE=9077444;WS=9077426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	9077803	rs2591597	T	C	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=16;PP=707;SC=GGGCTGATGCTGGGTTCCTTG;SOR=0.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=31;WE=9077811;WS=9077793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	9077902	rs2547077	A	G	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=428;SC=GTATATGCAAATGGTACAGAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=9077910;WS=9077892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	9077984	rs2547078	T	C	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=86;SC=TTCCTCCTTCTCTGGGAAAGA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=9077992;WS=9077974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	9080283	.	G	GAAAGAAAGAGAAAGAAAGAAAGAAAGAA	337.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.55;QD=30.70;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	9080462	rs2547065	C	G	3917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=67;PP=2965;SC=TGCTGGACTGCTCCCCGTCTC;SOR=1.004;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=119;TCF=52;TCR=67;TR=119;WE=9080470;WS=9080452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr19	9083124	rs12608495	G	A	2311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=36;PP=1851;ReadPosRankSum=-1.106;SC=CCAAACTTGGGACCTCAGAAA;SOR=0.401;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=35;TCR=37;TR=70;WE=9083132;WS=9083114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,74:0.96:77
chr19	9087615	rs1596798	T	A	4883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=71;PP=2965;SC=TTTCTGCCAATTTTGTGTAAT;SOR=0.773;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=77;TCR=71;TR=148;WE=9087623;WS=9087605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr19	9212864	rs4804399	A	C	347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=1;PP=289;SC=GGAGACAGAGAAAGACTCCAT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=9212872;WS=9212862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	9225387	.	G	GA	158	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=60.74;NF=7;NR=9;PP=158;QD=10.0625;SC=ATTCTGCCTCGAAAAAAAAAA;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=56;TCF=29;TCR=27;TR=16;WE=9225395;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:40,16:0.29:56
chr19	9226017	rs2217657	C	G	3369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=56;PP=2807;SC=TCAGCAAGCCCCAGAAATGGA;SOR=0.711;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=113;TCF=55;TCR=58;TR=110;WE=9226025;WS=9226007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr19	9237746	rs369468829	TTTTC	T	722.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.54;QD=40.15;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	9346427	rs1968136	T	C	5680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=113;PP=2965;SC=TATGTGGCCATGGCACTGCTG;SOR=1.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=197;TCF=84;TCR=113;TR=197;WE=9346435;WS=9346417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr19	9346599	rs1985937	C	G	2540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.94;QD=34.81;SOR=1.103;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	9434714	rs115157305	C	G	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=472;SC=GTGACACTTGCGCTCTTCGGG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=9434722;WS=9434704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	9434930	rs10411624	T	C	3603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=47;NR=71;PP=2867;SC=TGGGCGGCGTTCGGTGGTGTC;SOR=1.188;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=47;TCR=71;TR=118;WE=9434938;WS=9434920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr19	9435320	rs368039177	GA	G	318.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.49;QD=19.92;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	9448917	rs8113427	T	G	100.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=3;PP=74;SC=GATCAGTTTCTTTTTTGGCAA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=9448925;WS=9448907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	9449149	rs8110197	A	G	967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=1;PP=797;SC=GGATTCTCAGATTTTATTTCT;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=9449157;WS=9449139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	9449337	rs8110584	G	A	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=20;PP=837;SC=AGTGGAACAGGGCCCCTGCAA;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=12;TCR=20;TR=32;WE=9449345;WS=9449327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	9450029	rs16979618	T	C	2970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=66;PP=2451;ReadPosRankSum=-0.802;SC=ATTTAGTTTTTTTCTGGAACA;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=22;TCR=67;TR=88;WE=9450037;WS=9450019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,90:0.99:91
chr19	9452186	rs117107816	G	A	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=311;SC=ACTTCCTGCAGTCACTTTGTT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=9452194;WS=9452176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	9452308	rs16979655	G	C	1086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=2;PP=938;ReadPosRankSum=-0.727;SC=AGAGTAAAAGGGAGAATCTCA;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=33;WE=9452316;WS=9452298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr19	9452868	rs16979666	G	A	2273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=49;PP=1890;SC=AAGCATGTGGGAAACCCTTCA;SOR=1.745;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=21;TCR=49;TR=70;WE=9452887;WS=9452858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	9452879	rs16979670	C	A	2178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.229;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=49;PP=1764;ReadPosRankSum=1.140;SC=AAACCCTTCACTGAGTCGTCA;SOR=1.778;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=69;TCF=20;TCR=49;TR=68;WE=9452887;WS=9452858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,69:0.99:70
chr19	9488947	rs80257388	A	G	1247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=2;PP=959;SC=CTGCCTGCTTAGGACTCTGCC;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=34;TCR=2;TR=36;WE=9488955;WS=9488937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	9490760	rs2230750	A	G	2409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=25;PP=1879;ReadPosRankSum=1.107;SC=AAACCAAAAGATACAATTGCT;SOR=0.751;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=79;TCF=54;TCR=25;TR=78;WE=9490768;WS=9490750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,79:0.99:80
chr19	9490814	rs2217652	C	T	3041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=46;PP=2332;SC=GGCATAAACACGGTAAGACTT;SOR=0.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=53;TCR=46;TR=99;WE=9490822;WS=9490804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr19	9491014	.	C	CAGAGAATAACCACAAGT	294.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.489;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=1319;ReadPosRankSum=-0.887;SC=TGCTGGCTCACAGAGAATAAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=3;WE=9491022;WS=9491004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr19	9491210	rs1347165	C	G	866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=0;PP=688;SC=TCATACGCACCTACTGAAAAT;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=9491218;WS=9491200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	9524185	rs2241356	A	G	2270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=33;PP=1732;SC=GAAACTTAAAAGCTTTGCCAC;SOR=0.779;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=32;TCR=34;TR=65;WE=9524193;WS=9524175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	9524272	rs75717316	T	C	2853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=36;PP=2199;SC=GCGTAAATGCTTTACCACATT;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=46;TCR=36;TR=82;WE=9524280;WS=9524262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	9524715	rs78504948	A	G	2991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.635;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=37;ReadPosRankSum=1.607;SC=TTGCATTCATAAGGCTTCTCA;SOR=0.707;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=91;TCF=53;TCR=38;TR=90;WE=9524723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,96:0.99:97
chr19	9526269	rs75901532	A	C	2697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=7;PP=2231;SC=CTGATTTTCTATAATGGAATC;SOR=3.556;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=68;TCR=7;TR=75;WE=9526277;WS=9526259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	9582091	.	T	TA	258.75	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.65;QD=32.34;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	9582092	rs28393052	T	A	267.78	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.65;QD=33.47;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	9582164	rs5827059	G	GA	84.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=3;PP=42;SC=ATAAACATAAGAAAAAAGAAA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=9582172;WS=9582154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	9582180	rs5827061	A	AT	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=66;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=2;PP=24;SC=AGAAAGCTAAATTGAACATTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=9582188;WS=9582170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	9583742	rs10401559	A	T	812.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=1;PP=663;SC=CTATTTTCTTAATAAATCACC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=9583750;WS=9583732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	9583804	rs10408343	T	C	1706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=2;PP=1395;SC=ACACAGCTTCTAAACATACTG;SOR=5.058;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=47;TCR=2;TR=49;WE=9583812;WS=9583794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	9646137	rs888870	A	G	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=21;PP=620;SC=GTTGAGGTGGAAGGATTACTT;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=9646145;WS=9646127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	9646739	rs888872	C	G	324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=1;PP=270;SC=ACAGGCAGAGCCTGACTCACA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=9646747;WS=9646729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	9646862	rs2042199	T	G	1634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=12;PP=1315;SC=CAGGATATCCTAAAAAGAGCA;SOR=2.604;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=44;TCR=12;TR=56;WE=9646870;WS=9646852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	9646898	rs2042200	G	A	2803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=21;PP=2221;ReadPosRankSum=1.093;SC=GGACAAATCAGCAGCTGCCAT;SOR=1.159;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=65;TCR=21;TR=85;WE=9646906;WS=9646888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,89:0.99:90
chr19	9678535	rs1559200	G	A	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=212;SC=TAATACAAGCGATGGGGAATG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=9678543;WS=9678525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	9678732	rs35536068	CT	C	870.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=12;PP=567;SC=GAATCCCAATCTTTTTTTGAG;SOR=0.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=21;WE=9678740;WS=9678722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	9678748	rs12462832	T	G	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=12;PP=639;SC=TTGAGTGTGGTAAATAAGAAA;SOR=0.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=25;TCF=13;TCR=12;TR=24;WE=9678756;WS=9678738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	9869348	rs192422051	A	G	1133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=19;PP=930;ReadPosRankSum=1.601;SC=CTCCAATGTGAGTTATCATGT;SOR=0.245;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=39;TCF=20;TCR=19;TR=38;WE=9869356;WS=9869338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr19	9964823	rs8111802	A	G	1537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=4;PP=1236;SC=CCCAGCCCCCAGAGGCCCCCC;SOR=4.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=50;TCR=4;TR=53;WE=9964831;WS=9964813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	9964946	rs11556088	G	A	5588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=76;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.020;SC=TATAGAGGGCGCGCTCCCGGG;SOR=1.038;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=102;TCR=76;TR=175;WE=9964954;WS=9964936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,179:0.99:181
chr19	10071063	rs10406152	T	C	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=0;PP=829;SC=GGCTCCCTCATGGTCCCTCCC;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=30;WE=10071071;WS=10071053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	10090649	rs11879687	A	G	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=10;PP=432;SC=CCCAACCCCCAATGAGGGTGA;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=9;TCR=10;TR=19;WE=10090657;WS=10090639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	10106671	rs3745592	C	G	3005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=20;PP=2299;SC=TTTCCCCATCCAGCACTGTAT;SOR=2.790;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=80;TCR=20;TR=100;WE=10106679;WS=10106661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr19	10106936	rs1559186	G	C	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=10;PP=359;SC=CTTTCATAGAGAGCTGGAAAG;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=10106944;WS=10106926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	10107455	rs139398421	A	AAG	306.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=7;PP=417;SC=ATGAGTCAGAAAGAGAGAGAG;SOR=3.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=8;WE=10107463;WS=10107445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	10108714	rs7254800	G	A	2510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=28;PP=1930;SC=GAAGGGAGAAGTGAGTGTCGG;SOR=1.292;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=49;TCR=28;TR=77;WE=10108722;WS=10108704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr19	10108929	rs3745596	C	T	353.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.196;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.191;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=331;ReadPosRankSum=1.560;SC=CACACACACACACACGGAGTC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=10108937;WS=10108919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:8,13:0.62:21
chr19	10112346	rs2287803	T	C	5237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=76;PP=2965;SC=TCCAAGCTCCTCTGAGAACGT;SOR=0.784;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=72;TCR=76;TR=148;WE=10112354;WS=10112336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr19	10116076	rs11085529	G	C	710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=2;PP=625;SC=CACAATCACAGGCTGCAACGG;SOR=4.091;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=10116084;WS=10116066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	10129262	rs1644733	T	C	292.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=242;SC=GTTTAAAGGTTACCAAGGTTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=10129270;WS=10129252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	10129552	rs1122206	C	G	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=28;PP=1004;SC=GGCAGGGCCACATCGTGGTGA;SOR=1.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=10129560;WS=10129542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	10131852	rs2255079	A	T	996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=4;PP=662;SC=CCTGTATCTTAAAAAAAAAAA;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=23;WE=10131874;WS=10131842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	10131866	rs2016307	A	T	1125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=6;PP=729;SC=AAAAAAAAAAATGGACAAAAT;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=30;WE=10131874;WS=10131842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	10131999	rs1644731	T	C	2843.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=39;PP=2125;SC=CAGGTTTCTATGGCTGAGTTC;SOR=1.076;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=53;TCR=39;TR=92;WE=10132007;WS=10131989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	10169208	rs17211059	G	A	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=3;PP=870;SC=TCTCCAAGACGCTGAGGGAAT;SOR=4.047;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=32;WE=10169216;WS=10169198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	10169477	rs11667515	G	A	2239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.594;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=21;PP=1694;ReadPosRankSum=1.808;SC=CCTCCCTCTGGCCCTCTAGAA;SOR=1.370;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=67;WE=10169485;WS=10169467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,71:0.99:72
chr19	10192425	rs112439574	G	GGAA	347.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.36;QD=38.64;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	10197488	rs139505689	G	GC	1401.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.69;QD=37.88;SOR=5.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	10218030	rs1551570	C	T	436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=335;SC=CTGCGTCCGACTGACTCTAAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=10218038;WS=10218020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	10218434	rs55752217	C	T	2842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=54;PP=2341;SC=CTCCGGGCACCTCTGCTAGAC;SOR=1.402;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=30;TCR=54;TR=84;WE=10218442;WS=10218424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	10218524	rs2305791	C	G	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=25;PP=870;SC=CCTTCCAGGTCAAGAAGGTGA;SOR=1.819;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=35;WE=10218532;WS=10218514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	10221151	rs2305792	C	G	2327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=53;PP=1895;SC=ACCCGCGTCTCTTGGCTCAGT;SOR=2.505;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=16;TCR=53;TR=69;WE=10221159;WS=10221141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	10222558	rs2010353	G	T	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=8;PP=225;SC=GAGGTCGAGGGGGGTGGAACA;SOR=4.407;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=10222566;WS=10222548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	10224526	rs3745600	C	T	4725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=68;PP=2965;SC=TGCTCTGCGCCCTGACGCTGC;SOR=0.889;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=73;TCR=68;TR=141;WE=10224534;WS=10224516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr19	10225777	rs7401	A	G	2481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=50;PP=1986;SC=CCGAGTACACAGTGGCAGCTG;SOR=1.292;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=30;TCR=50;TR=80;WE=10225785;WS=10225767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr19	10226052	rs2305795	G	A	779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=3;PP=627;SC=AAAACCAGCCGGGGGACTGTT;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=10226060;WS=10226042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	10226256	rs7710	A	G	2745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=64;NR=26;PP=2064;SC=TGATGAAGGCAAAGCCCTGTG;SOR=1.872;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=64;TCR=26;TR=90;WE=10226264;WS=10226246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr19	10226340	rs71188883	GTGCC	G	5440.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=54;PP=2982;SC=CAGCCCCACCGTGCCTGCCTG;SOR=0.759;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=109;TCF=43;TCR=66;TR=93;WE=10226351;WS=10226330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr19	10229240	.	CAA	C	232.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=15.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=0.000;QD=13.69;ReadPosRankSum=-1.092;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr19	10229297	rs11667630	C	A	2317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=33;PP=1901;SC=TCCGGGAGCACGGTTTTCCAA;SOR=0.898;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=39;TCR=33;TR=72;WE=10229305;WS=10229287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	10229521	rs2290687	C	T	1883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=26;PP=1674;SC=AGGGTCCCCACTCCCTGCACC;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=35;TCR=26;TR=61;WE=10229529;WS=10229511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	10229726	rs149991692	TGGCAGTCCTCACTCACCTCCC	T	1869.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=2926;SC=GGACACCGAGTGGCAGTCCTC;SOR=2.780;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=39;TCF=6;TCR=33;TR=12;WE=10229754;WS=10229716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	10251747	rs2290684	A	G	2097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=19;PP=1692;SC=GTTACAGAAGAATAACTTGAA;SOR=1.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=43;TCR=19;TR=62;WE=10251755;WS=10251737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	10265312	rs721186	T	C	1920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=31;PP=1471;SC=GCATGCAGGGTGTCAGGAAGA;SOR=0.787;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=61;WE=10265320;WS=10265302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	10270746	rs3079962	GA	G	2133.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=57;PP=1336;ReadPosRankSum=-1.410;SC=CGTTCTGGGGGAAAAAAAAAA;SOR=0.896;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=103;TCF=27;TCR=76;TR=74;WE=10270754;WS=10270736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,90:0.99:91
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chr19	10334663	rs2116942	T	G	921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=26;NR=7;PP=752;SC=ACCCCCGGCCTCCAGCACTGC;SOR=2.517;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=33;WE=10334671;WS=10334653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	10340912	rs2288937	A	G	184.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=2;PP=169;SC=CGCGGTATCCACGCTCGCTCG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=8;WE=10340920;WS=10340902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	10363251	rs113197610	A	C	2616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=40;NR=39;PP=1985;SC=GTGCTGCGCAAAGTCGAGCTC;SOR=0.717;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=40;TCR=39;TR=79;WE=10363259;WS=10363241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	10370490	rs1059840	T	A	4138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=76;PP=2965;SC=CCACTGTTGATGTGAAGCACC;SOR=1.033;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=130;TCF=54;TCR=76;TR=130;WE=10370498;WS=10370480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr19	10370542	rs11115	C	T	2318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.864;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=63;PP=1932;ReadPosRankSum=-0.901;SC=TTGGGAGCCTCAGGCCCACGC;SOR=2.247;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=9;TCR=64;TR=72;WE=10370550;WS=10370532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr19	10395683	rs5498	A	G	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=18;PP=683;SC=GGTCACCCGCAAGGTGACCGT;SOR=1.893;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=10395691;WS=10395673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	10402131	rs901886	T	C	2630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=53;PP=2184;SC=CAAGTCCCGGTGTTCAAAGAG;SOR=1.141;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=36;TCR=53;TR=89;WE=10402139;WS=10402121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	10402938	rs1056538	G	A	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=38;PP=1050;SC=CAGGCAGCTGGTCTGCAACGT;SOR=3.816;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=42;WE=10402946;WS=10402928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	10403368	rs2228615	G	A	3646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.385;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=19;PP=2883;ReadPosRankSum=-0.828;SC=CGCAGCTGGGGCCCAAGCTCT;SOR=3.031;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=112;TCF=92;TCR=20;TR=111;WE=10403376;WS=10403358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,114:0.99:115
chr19	10403947	rs2569702	T	C	1561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=33;PP=1177;SC=GCAGGGTGCATTTCTATCTGG;SOR=1.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=16;TCR=33;TR=49;WE=10403955;WS=10403937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	10404227	rs2569703	C	G	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=0;PP=756;SC=AGAGTGCATGCCTCGACTAGC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=10404235;WS=10404219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	10405906	rs34124276	C	CT	673.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=2;PP=766;SC=AGGCAGGATCCTCTTCTGCCC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=10405914;WS=10405896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	10407169	rs710845	G	C	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=14;PP=767;SC=CCGTGTGTCTGAACGGAGCGG;SOR=0.869;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=20;TCR=14;TR=34;WE=10407177;WS=10407159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	10416777	rs35251981	A	ATAT	264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=5;PP=268;SC=CTCATTAGTAATATTATTATT;SOR=2.584;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=6;WE=10416785;WS=10416767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	10418838	rs35063123	G	A	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=4;PP=622;SC=AGAAAGGGCGGCCTGGCCCCA;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=10418846;WS=10418828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	10419468	rs55905227	C	T	286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=210;SC=CCTTACGGCACCCGTAGATCA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=10419476;WS=10419458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	10426024	rs1124765	T	G	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=4;PP=328;SC=TGGACAAATGTATAAGGACCT;SOR=1.911;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=10426032;WS=10426014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	10426422	rs378395	A	C	1773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=46;NR=7;PP=1337;SC=CCTCCTCTCCAGCCGGGCGCG;SOR=3.611;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=54;TCF=46;TCR=8;TR=53;WE=10426430;WS=10426412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	10426628	rs395782	T	C	3616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=71;PP=2946;SC=CAGCCTGCAGTAGAACCCTGG;SOR=1.487;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=110;TCF=39;TCR=71;TR=110;WE=10426636;WS=10426618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr19	10428790	rs12459144	C	T	252.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=208;SC=AAGACCAACCCCTGCCACCAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=10428798;WS=10428780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	10429120	rs281427	T	C	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=39;PP=997;SC=ATCTTCCCTCTGCCTCCCAGG;SOR=3.564;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=45;WE=10429128;WS=10429110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	10429740	rs111808396	A	G	2370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=26;PP=1830;SC=CACAAAGAACACACAAAATAC;SOR=1.581;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=53;TCR=26;TR=79;WE=10429748;WS=10429730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	10431300	rs34942709	A	AG	1164.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=8;PP=1094;SC=ATTTGGCCTTAGGGGACAGAG;SOR=2.432;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=27;WE=10431308;WS=10431290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	10432334	rs12983649	T	G	3498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=58;PP=2594;SC=GGGGGCAGGGTGGCCCAGGGA;SOR=0.956;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=46;TCR=58;TR=104;WE=10432342;WS=10432324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr19	10439405	.	G	C	1894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.631;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=19;PP=1542;ReadPosRankSum=-0.623;SC=GGTCCACACAGAGGCAGCGGG;SOR=1.402;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=62;TCF=42;TCR=20;TR=61;WE=10439413;WS=10439395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr19	10444826	rs2278442	G	A	5284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=92;PP=2965;SC=GCAGCCCCGTGTTAGCTCACC;SOR=0.880;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=168;TCF=76;TCR=92;TR=168;WE=10444834;WS=10444816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr19	10624713	rs142151258	G	T	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=11;PP=1084;SC=CGCAGGAGTGGCGTCCGCAGC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=33;TCR=11;TR=44;WE=10624721;WS=10624703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	10625067	rs6511701	A	C	3226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=47;PP=2564;SC=GTGCACAGATAGCGGCCAGGA;SOR=0.916;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=59;TCR=47;TR=106;WE=10625075;WS=10625057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr19	10659737	rs12979378	C	T	2287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=48;PP=1731;SC=TCTAGGACACCTCCACCTGGG;SOR=1.641;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=71;WE=10659745;WS=10659727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	10659806	rs187370055	T	C	980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=31;PP=706;SC=CCTCATCACTTTTTTTTTTTT;SOR=5.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=32;WE=10659814;WS=10659796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	10665691	rs10419405	T	C	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=322;SC=CAACAAGAGGTTGACGGAGCC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=10665699;WS=10665681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	10665912	rs6146467	C	CCCGCCCTGCCCGCAGCGCACCTGGCT	2079.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.27;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	10668383	rs3745256	T	C	7178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=149;PP=2965;SC=GCCAGGCTGCTGGGCTATGCC;SOR=1.301;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=243;TCF=93;TCR=150;TR=242;WE=10668391;WS=10668373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,251:1.00:251
chr19	10668452	rs3745255	A	G	5122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=120;PP=2965;SC=CACCGGGTTCAAACACGGGCT;SOR=2.554;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=155;TCF=35;TCR=120;TR=155;WE=10668460;WS=10668442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr19	10668953	rs875569	G	A	1509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=39;PP=1177;SC=GAGCCCACTCGAGACATAGGA;SOR=3.306;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=45;WE=10668961;WS=10668943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	10669032	rs892084	T	C	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=302;SC=TAGGGCTCCCTACAGCCCTCC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=10669040;WS=10669022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	10670992	rs3745249	C	T	2646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=43;PP=1959;SC=GCTCACCCCTCCTCTTCCTCC;SOR=0.715;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=87;TCF=44;TCR=43;TR=87;WE=10671000;WS=10670982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	10672493	rs12984043	C	T	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=35;PP=1185;SC=GAAGTCTCCCCGTCTGAGTTC;SOR=3.109;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=43;WE=10672501;WS=10672483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	10676343	rs3745246	A	T	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=21;NR=4;PP=563;SC=CGGGGTGCAGAGGGGGGCTTG;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=10676351;WS=10676333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	10676423	rs3745245	G	A	1267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=19;PP=993;SC=CCGACTCGGAGCTGGAGTCGC;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=41;WE=10676431;WS=10676413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	10676487	rs34864064	G	GC,GCC	993.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5033;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=22;NF=17;NR=10;PP=271;SC=CAGACGGGATGCCCCCCCCCA;SOR=1.071;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=45;TCF=25;TCR=20;TR=27;WE=10676495;WS=10676477;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.28,0.72:29
chr19	10676681	rs3218222	T	C	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=12;PP=396;SC=GGCATGGCGGTTCTGTGGCCC;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=10676689;WS=10676671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	10679067	rs33926515	GAGA	G	1660.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=7;PP=1593;SC=TGAAAGCCTAGAGAAGAAGGA;SOR=2.891;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=35;WE=10679077;WS=10679057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	10679240	rs1968445	C	G	1692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=36;PP=1395;SC=GCACCAGCTCCCGGTGCAGAA;SOR=1.453;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=56;WE=10679248;WS=10679230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	10685859	rs1560712	G	C	1733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=45;PP=1404;SC=GAGATACCATGTCTACAAAAA;SOR=6.399;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=46;WE=10685867;WS=10685849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	10687757	rs7252007	T	C	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=1;PP=684;SC=TCATGAGCCATCACACCTGAC;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=10687765;WS=10687747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	10690321	rs73018660	C	T	236.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=192;SC=TGAGCCACTGCGCTGGGCCCA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=10690329;WS=10690311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	10690557	rs10426276	G	C	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=23;PP=836;SC=GTGGAGAGTGGAGAGTGACCC;SOR=1.681;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=33;WE=10690565;WS=10690547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	10697773	rs75323740	A	G	2227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=13;PP=1729;SC=GTGTTCCCAGACCTCTTCCTG;SOR=2.770;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=69;TCF=56;TCR=13;TR=66;WE=10697781;WS=10697763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	10697801	rs75192074	G	T	3035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=32;PP=2237;SC=CGGAGGGGTCGCCCCTGAATC;SOR=1.449;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=93;TCF=61;TCR=32;TR=92;WE=10697809;WS=10697791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr19	10738639	rs3087969	C	T	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=30;PP=1125;SC=ACCCCACTGACAGCCGGGGCG;SOR=1.225;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=18;TCR=30;TR=48;WE=10738647;WS=10738629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	10741622	rs12710257	A	G	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=2;PP=619;SC=CGGAGGTTGCAGTGAGCCGAG;SOR=4.479;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=27;WE=10741630;WS=10741612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	10741681	rs60016481	C	CA	480.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=1.976;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQRankSum=-1.940;QD=11.18;ReadPosRankSum=-0.345;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr19	10741907	rs12972963	A	G	5233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=108;PP=2965;SC=AGTCCTGAGCAGTCTGCCCCA;SOR=1.128;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=68;TCR=108;TR=176;WE=10741915;WS=10741897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr19	10742170	rs2288904	A	G	2016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=32;PP=1694;SC=GAGGTGCTTCAAGATGGTGAC;SOR=0.784;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=36;TCR=32;TR=67;WE=10742178;WS=10742160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	10742287	rs1560711	C	T	1980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=27;PP=1581;SC=TGGTGCCATCCTCTGCTCCAT;SOR=0.871;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=27;TCR=27;TR=54;WE=10742295;WS=10742277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	10742443	rs1560710	C	T	3023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=44;PP=2324;SC=TATTGGCGCACCGCGCCAGGG;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=41;TCR=44;TR=85;WE=10742451;WS=10742433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr19	10742463	rs1560709	G	T	3069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=43;PP=2322;SC=GTCTCACTTTGCTGGGTGGGA;SOR=0.757;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=43;TCR=43;TR=86;WE=10742471;WS=10742453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr19	10748657	.	C	G	2610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.000;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=41;PP=2160;ReadPosRankSum=-0.793;SC=CCCCTAGTCCCTGAAGCCAGC;SOR=0.293;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=50;TCR=41;TR=90;WE=10748665;WS=10748647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,89:0.99:90
chr19	10748735	.	C	A	2677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.669;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.267;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=46;PP=2263;ReadPosRankSum=1.917;SC=ACTTCCTCTTCCTGTTGGGCA;SOR=0.447;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=86;TCF=40;TCR=46;TR=85;WE=10748743;WS=10748725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,86:0.99:87
chr19	10793197	rs200416871	C	T	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=2;PP=400;SC=CCTTGGGGGTCTTGCCACCTC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=10793205;WS=10793187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	10907286	rs34516961	A	G	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=11;PP=754;SC=GCATTCTCAGACTTCCCTGGA;SOR=1.329;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=31;TCF=19;TCR=12;TR=30;WE=10907294;WS=10907276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	10968929	.	C	A	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.129;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.62;MQRankSum=-3.521;QD=10.16;ReadPosRankSum=-0.783;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr19	10968931	rs201606964	G	A	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.90;MQRankSum=-3.640;QD=9.74;ReadPosRankSum=-1.452;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr19	10970558	rs8100581	A	G	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=3;PP=891;SC=GGCAACCCTGATCCCTGTCAC;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=34;WE=10970566;WS=10970548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	11019994	rs4804546	T	C	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=34;PP=1145;SC=TTTATCTCAGTTACTGCAGAG;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=36;WE=11020002;WS=11019984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	11027513	rs111698028	C	T	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=10;PP=399;SC=TGCAGCTGTGCAGCCCTCAGG;SOR=1.244;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=6;TCR=10;TR=16;WE=11027521;WS=11027503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	11038843	rs892010	G	C	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=13;PP=859;SC=TAGGGTTGACGCTGGGATGGG;SOR=1.044;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=18;TCR=13;TR=31;WE=11038851;WS=11038833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	11170677	rs117490455	A	G	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=24;PP=1184;SC=GGGGTGCTGCATTCCCAGAGC;SOR=0.853;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=28;TCR=24;TR=51;WE=11170685;WS=11170667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	11221454	rs2738442	T	C	7155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.00;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr19	11221457	rs12710260	G	C	7179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.16;SOR=0.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr19	11221487	rs192390193	G	A	4891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=75;PP=2965;ReadPosRankSum=2.060;SC=CCCCCTCTGCGCTTCCTGACA;SOR=0.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=74;TCR=76;TR=149;WE=11221495;WS=11221477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,160:0.99:161
chr19	11224181	rs1003723	C	T	1863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=26;PP=1482;SC=GGGCTCCTGGCGCTGATGCCC;SOR=0.871;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=30;TCR=26;TR=56;WE=11224189;WS=11224171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	11224265	rs5930	A	G	2346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=24;PP=2051;SC=TCATCAGCAGAGACATCCAGG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=48;TCR=24;TR=72;WE=11224273;WS=11224255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	11224491	rs1569372	A	G	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=37;PP=1152;SC=AGCAGGAAGGAGCTTCAGGAA;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=39;WE=11224499;WS=11224481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	11227480	rs2738447	A	C	124.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=95;SC=GGCCCTCAGGACCCTCTGGGA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=11227488;WS=11227470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	11227602	rs688	C	T	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.269;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=8;PP=892;ReadPosRankSum=0.244;SC=TCGATGTCAACGGGGGCAACC;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=33;WE=11227610;WS=11227592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr19	11230645	rs2569549	T	C	656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=467;SC=AGTGAAACTCTGTCTGAAACA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=16;WE=11230661;WS=11230635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	11230650	rs145643854	GAAAC	G	810.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=774;SC=AACTCTGTCTGAAACAAACAA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=15;WE=11230661;WS=11230635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	11230690	rs116959285	C	G	1659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=4;PP=1352;SC=AACAAAAAAACTAGTTGTGGA;SOR=4.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=45;WE=11230698;WS=11230680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	11230881	rs5925	T	C	4393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=52;PP=2965;SC=AGGATATGGTTCTCTTCCACA;SOR=1.082;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=77;TCR=52;TR=128;WE=11230889;WS=11230871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr19	11233941	rs5927	A	G	2443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=49;PP=1925;SC=CAACCACCCGACCTGTTCCCG;SOR=1.329;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=79;TCF=29;TCR=50;TR=78;WE=11233949;WS=11233931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr19	11238492	rs12459476	A	G	865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=2;PP=747;SC=ACCTTCTTAAACCGGAATTGA;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=11238500;WS=11238482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	11238548	rs2569538	A	G	1954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=11;PP=1548;SC=GTGGCCTCTCACAGACTTGGG;SOR=3.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=57;TCR=11;TR=68;WE=11238556;WS=11238538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	11241915	rs6413504	A	G	1959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=13;PP=1383;SC=TGTTTCCTGAATGCTGGACTG;SOR=2.265;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=56;TCF=43;TCR=13;TR=55;WE=11241923;WS=11241905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	11242307	rs2738464	G	C	255.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=1;NR=6;PP=181;SC=GATGAAAGGGGAGGGGATGTC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=11242315;WS=11242297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	11258607	rs73010473	G	A	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=246.599;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.01;MQRankSum=-0.389;QD=1.82;ReadPosRankSum=-9.477;SOR=7.111;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,70:0.41:172
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chr19	11303469	rs7254270	C	G	3725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=54;NR=29;PP=1883;SC=GCCCCCCCCCCCCAAGCCATT;SOR=1.770;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=55;TCR=30;TR=83;WE=11303477;WS=11303447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr19	11303943	rs3745681	A	G	2524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=34;PP=1938;SC=CCCGTTCTCGAACCCAGGTGC;SOR=1.058;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=43;TCR=34;TR=77;WE=11303951;WS=11303933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	11310920	rs8101345	C	T	276.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=196;SC=CCATCCTGTACCTGTCCTGGT;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=11310928;WS=11310910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	11313256	rs3745682	G	A	4986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=59;PP=2965;ReadPosRankSum=1.034;SC=CCACAAGGACGTGCCTCCAGC;SOR=0.489;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=154;TCF=95;TCR=59;TR=153;WE=11313264;WS=11313246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,161:0.99:162
chr19	11326629	rs10403991	C	A	1372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=33;PP=1063;SC=ACTGGGGTTCCAGGCTGACTC;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=42;WE=11326637;WS=11326619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	11348098	rs34301174	G	A	966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=11;PP=696;SC=TCTGGGGACAGTGCATTGGCA;SOR=1.112;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=19;TCR=11;TR=30;WE=11348106;WS=11348088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	11358799	rs12978266	G	A	1837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=38;PP=1417;SC=GGGTGGCTCTGGGCGGCTACA;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=20;TCR=38;TR=58;WE=11358807;WS=11358789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	11363146	rs8113582	A	T	1438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=14;PP=1113;SC=GCTGCCCCTAAGTCAGACTCA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=31;TCR=14;TR=45;WE=11363154;WS=11363136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	11436302	rs56363898	A	AG	836.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=2;NR=24;PP=1054;SC=AAGACCCCTGAGGGCAGAGTC;SOR=3.611;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=11436310;WS=11436292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	11459665	rs78738753	G	GA	3620.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=53;PP=2936;SC=CAAGGCTCTGGAGCGTACAGC;SOR=0.992;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=89;TCF=31;TCR=58;TR=82;WE=11459673;WS=11459655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr19	11461834	rs118019382	C	T	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=426;SC=GGAATGAGGCCGGGTGTGGTG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=11461842;WS=11461824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	11526765	rs167479	G	T	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=17;PP=478;SC=ATGGGCAGGGGGGTCTCGGAA;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=11526773;WS=11526755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	11529958	rs1549168	C	T	933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=24;PP=719;SC=GCTCCATGGCCGGCGCCCGTC;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=5;TCR=24;TR=29;WE=11529966;WS=11529948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	11534503	rs57892201	TG	T	892.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=22;NR=6;PP=535;SC=CCGTCTGGGGTGGGGGGGGGG;SOR=2.432;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=28;WE=11534512;WS=11534493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	11541685	rs34095	G	A	3739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=65;PP=2915;SC=ATCCACCGCCGCGGGAACCCT;SOR=1.131;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=45;TCR=65;TR=110;WE=11541693;WS=11541675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr19	11541712	rs34094	T	C	3493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=54;PP=2796;SC=ACCCCTTTGCTCCTTACCTTG;SOR=0.849;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=48;TCR=54;TR=102;WE=11541720;WS=11541702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	11558240	rs186375	T	C	1170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=17;PP=845;SC=CCGACCGCACTGCTCACCCGC;SOR=1.075;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=23;TCR=17;TR=40;WE=11558248;WS=11558230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	11558340	.	AGAGGAG	A	1484.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=14;PP=1135;SC=CGTCGCCCACAGAGGAGGAGG;SOR=1.085;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=20;WE=11558353;WS=11558330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	11624491	rs4804168	C	G	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=2;PP=702;SC=AAGAGGGATTCGGAGAGGGAG;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=11624499;WS=11624481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	11660012	rs8100751	T	A	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.37;QD=32.35;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	11891003	rs799193	G	A	4271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.676;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=43;PP=2965;ReadPosRankSum=1.289;SC=TAATTGCTACGTTAGAGTTGA;SOR=1.406;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=133;TCF=89;TCR=44;TR=132;WE=11891011;WS=11890993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,134:0.99:135
chr19	11943697	rs400106	G	A	3886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=69;PP=2965;SC=ATGGAGAGAAGCCCTATGCAT;SOR=0.998;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=118;TCF=47;TCR=71;TR=116;WE=11943705;WS=11943687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr19	12058536	rs4804175	C	T	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=11;PP=333;SC=TATATTTAAACGTGACTGAGG;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=12058544;WS=12058526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	12157334	rs4804176	T	G	1275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=5;PP=1095;SC=CATTGCACCTTTGTCTCATTT;SOR=3.442;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=37;WE=12157342;WS=12157324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	12222381	rs1866382	C	G	2252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=14;PP=1912;SC=AAGGATTCTGCGAAGACATTT;SOR=2.602;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=65;TCF=50;TCR=15;TR=64;WE=12222389;WS=12222371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	12256358	rs12972621	T	G	3805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.315;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=59;PP=2957;ReadPosRankSum=-0.715;SC=TTTCATGATATCGAACGGAAT;SOR=0.473;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=111;TCF=52;TCR=59;TR=110;WE=12256366;WS=12256348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,117:0.99:118
chr19	12541532	rs10422063	C	A	6699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.330;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.094;NF=79;NR=68;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.835;SC=GAAATCAATACAGGCTTTCCC;SOR=0.477;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=148;TCF=79;TCR=69;TR=147;WE=12541540;WS=12541522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,154:0.99:155
chr19	12541547	rs10402252	T	G	6865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.091;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.355;NF=80;NR=79;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.866;SC=TTTCCCAAGTTTGCATTTATA;SOR=0.302;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=161;TCF=80;TCR=81;TR=159;WE=12541555;WS=12541537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,162:0.99:163
chr19	12542772	rs1134389	C	T	2003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.02;QD=32.85;SOR=6.837;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
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chr19	12542851	rs4804693	AT	GC	927.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.96;MQRankSum=0.000;QD=40.34;ReadPosRankSum=0.604;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr19	12542891	rs140908232	G	A	176.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.34;QD=29.47;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr19	12543333	rs3979432	C	T	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.76;QD=32.78;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	12551616	rs35084134	C	G	886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=0;PP=827;SC=GGACCCGGGTCCGTAGATCCC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=12551624;WS=12551608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	12551715	rs11881297	A	C	3053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=66;NR=29;PP=2314;SC=ACGCCGGCCCAGCACACGCAC;SOR=1.832;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=96;TCF=67;TCR=29;TR=95;WE=12551723;WS=12551705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr19	12551842	.	C	T	2757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=69;PP=2247;SC=CTACAGAACCCAGAGCCGAGC;SOR=3.339;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=13;TCR=69;TR=82;WE=12551850;WS=12551832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	12576049	rs7259240	G	A	2451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=34;PP=1906;SC=ACGTTTTCCCGCATTCTTTAC;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=44;TCR=35;TR=78;WE=12576057;WS=12576039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	12576573	rs10404972	G	A	276.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=7;PP=198;SC=AAAACAAAACGCACAATTAGT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=12576581;WS=12576563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	12662318	rs79749579	G	GC	2045.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=41;PP=2012;SC=GTTGAACATTGCCCCTGTCCC;SOR=2.231;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=57;TCF=8;TCR=49;TR=48;WE=12662326;WS=12662308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	12738397	.	A	G	309	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=15;NR=1;PP=309;QD=21.4857007842;SC=CTGAGATCGCACCATTGCACT;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=12738405;WS=12738396;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	12766756	.	G	A	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=414;SC=CATGCATGGAGACAAAAAACT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=12766764;WS=12766746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	12780204	rs117131055	T	C	1803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=40;PP=1444;SC=GTCCGACATATTGTTAGTGGA;SOR=1.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=15;TCR=40;TR=55;WE=12780212;WS=12780194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	12781493	rs201176698	C	T	2112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=38;PP=1626;SC=ACCTCACCATCATGCTGGCCT;SOR=1.131;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=28;TCR=38;TR=66;WE=12781501;WS=12781483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	12805424	rs117566511	C	T	3111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.896;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=41;PP=2377;ReadPosRankSum=-0.915;SC=GGTACTATTTCGCTTAGTGCC;SOR=0.888;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=60;TCR=42;TR=101;WE=12805432;WS=12805414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,102:0.99:103
chr19	12876278	rs1205169	C	A	3421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=88;PP=2794;SC=GAAAAGAAAGCAGGCCAGGCG;SOR=4.262;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=10;TCR=88;TR=98;WE=12876286;WS=12876268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	12936881	rs4804736	G	A	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=30;PP=827;SC=GGGAGTCTATGTGCGGAACGT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=12936889;WS=12936871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	12939792	rs1466306	T	C	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=33;PP=1038;SC=CCCTGTGAGCTAGGGTCTTGG;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=37;WE=12939800;WS=12939782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	12978655	rs56114354	C	T	2010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=39;PP=1549;SC=TCAGCGCCCCCCAAGAGGACG;SOR=1.437;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=21;TCR=39;TR=60;WE=12978663;WS=12978645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	13002400	rs1799918	G	C	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=24;PP=600;SC=TGCCGCAGGTGGACTCTGTCC;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=13002408;WS=13002390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	13002563	rs2242517	T	G	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=12;NR=3;PP=408;SC=ACATGGGTGTTGGGGGGTAGG;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=13002571;WS=13002557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	13006685	rs2238641	T	C	2073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.08;SOR=3.516;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	13006685	.	TGG	CGA	2398	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=36;NR=3;PP=2398;QD=62.8581506375;SC=CCACCTGCCTTGGCCTCCTAA;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=39;WE=13006695;WS=13006675;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,39:0.93:42
chr19	13006687	rs12151303	G	A	2073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.12;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	13008607	rs1060218	G	T	2341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=34;NR=49;PP=1974;SC=TGCTGGGGGGGAATGGGATTT;SOR=1.259;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=86;TCF=37;TCR=49;TR=83;WE=13008615;WS=13008597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	13010520	rs8012	A	G	1630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=14;PP=1236;SC=GAAGTCGTTCAGATGTGTTCC;SOR=1.961;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=55;TCF=40;TCR=15;TR=54;WE=13010528;WS=13010510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	13010643	rs9384	G	T	2541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=58;PP=1796;SC=AGAGTGACATGGAAGCAACTC;SOR=1.775;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=26;TCR=58;TR=84;WE=13010651;WS=13010633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr19	13015530	rs17706531	A	G	258.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=8;PP=203;SC=AGAGTACAGGAAGCGGCCAGG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=13015538;WS=13015520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	13050788	.	C	G	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=1;PP=747;SC=AGAACCAGGTCTTCCTTTTAT;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=13050796;WS=13050778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	13199029	.	G	C	1442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=39;PP=1212;SC=AAAAAGAAAAGCCTTCCCCCT;SOR=5.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=41;WE=13199037;WS=13199019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	13226900	rs74437885	C	A	4372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=21.761;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=35;PP=2965;ReadPosRankSum=0.701;SC=TCATACCCCGCCCCCGCCATC;SOR=2.108;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=151;TCF=111;TCR=40;TR=145;WE=13226908;WS=13226890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,152:0.96:158
chr19	13227354	rs2302159	G	A	146.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=89;SC=CTGCGGCCTCGGTAAGCTGAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=13227362;WS=13227344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	13318672	.	C	CCTG	128	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.00;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	13319693	rs16051	A	G	680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.9990;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=16;NR=9;PP=694;SC=GGGGCGGGGGATGGTGGTGGT;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=25;WE=13319701;WS=13319681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	13319989	rs10413221	T	C	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=13;PP=561;SC=TTCCTGCAGCTGCTGCCTGGC;SOR=0.859;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=11;TCR=13;TR=24;WE=13320010;WS=13319979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	13320002	rs2304093	C	G	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=10;PP=505;SC=TGCCTGGCCCCCTCTGTCCCC;SOR=0.963;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=12;TCR=10;TR=22;WE=13320010;WS=13319979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	13322822	rs3217380	AG	A	635.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=2;PP=656;SC=TGAGTCCGGCAGGGAGGGGAT;SOR=3.611;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=17;WE=13322830;WS=13322812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	13323124	rs16048	T	G	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=21;PP=1303;SC=TGTGTGTGTGTGGGGGGCCCA;SOR=0.818;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=24;TCR=21;TR=45;WE=13323132;WS=13323114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	13335432	rs3816027	G	A	2402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=36;PP=1791;SC=GGAGATCCCCGGTTCCACCCT;SOR=0.824;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=39;TCR=36;TR=75;WE=13335440;WS=13335422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	13338180	rs143245670	AAAG	A	962.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=18;NR=5;PP=970;SC=CACTAAAAAAAAAGAAGAAGA;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=23;WE=13338190;WS=13338170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	13339417	rs36088930	GAGAT	G	194.25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=11;NR=1;PP=528;ReadPosRankSum=0.489;SC=GAGAGAGAGAGAGATATATAT;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=13339428;WS=13339407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr19	13355900	rs16039	T	G	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=4;PP=764;SC=AGCTATGGCTTCCGGGACACA;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=13355908;WS=13355890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	13356150	rs16035	T	G	2823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=68;PP=2147;SC=GCTGGCCGGGTGCATGTTAGA;SOR=2.461;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=19;TCR=68;TR=87;WE=13356158;WS=13356140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr19	13364012	rs8103699	C	T	323.53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.419;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=265;ReadPosRankSum=0.827;SC=GGCAACACTCCAGCCCCAGGC;SOR=1.473;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=13;WE=13364020;WS=13364002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr19	13373477	rs16031	A	G	259.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=215;SC=TGAGCAGTGTACAACCTGCTC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=13373485;WS=13373467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	13387904	rs16030	A	G	3768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=43;PP=2937;SC=TCTCAAAGGTAAAGACGCCTG;SOR=1.479;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=81;TCR=43;TR=123;WE=13387912;WS=13387894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr19	13409390	rs16025	C	T	2808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=42;PP=2048;SC=CCTTGTCCTCCCTCCGCGCGT;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=41;TCR=42;TR=83;WE=13409398;WS=13409380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	13409472	rs16023	T	A	1574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=43;PP=1354;SC=GCCCTCGCCCTCGCCCTCGCC;SOR=3.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=8;TCR=43;TR=51;WE=13409480;WS=13409462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	13409696	rs16022	C	G	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=8;PP=614;SC=CGGCCTCGCCCTCCCAGAACC;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=30;WE=13409704;WS=13409686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	13410235	rs12985136	G	T	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=24;PP=675;SC=TGACCCAGGCGAACCAACCCA;SOR=5.211;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=13410243;WS=13410225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	13411482	rs16018	G	A	1486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=33;PP=1154;SC=TAAAAGGCACGTGGAATCTTT;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=45;WE=13411490;WS=13411472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	13423688	rs10407951	A	T	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=17;PP=480;SC=TATCATTTTTAAACTTTTTAT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=13423696;WS=13423678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	13441135	.	G	A	2017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=17;PP=1646;SC=CTTTATGGTGGTTCTCCGCAG;SOR=2.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=47;TCR=17;TR=64;WE=13441143;WS=13441125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	13875987	.	G	A	942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=21;PP=739;SC=TTTAAGTACAGTGACCCACTA;SOR=1.839;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=13875995;WS=13875977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	13883032	.	C	G	2831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=29;PP=2271;SC=CTGAGGAGCTCCGGACAGCCC;SOR=1.531;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=58;TCR=29;TR=87;WE=13883040;WS=13883022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr19	13899980	rs4926171	A	T	1056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=22;PP=887;ReadPosRankSum=0.917;SC=GCCAGCCCTGAGGTCCTGTTT;SOR=0.495;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=36;WE=13899988;WS=13899970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr19	13936385	rs62620757	C	T	4339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=70;PP=2965;SC=TGGCTGCACACGGTACTGGGC;SOR=0.721;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=71;TCR=71;TR=141;WE=13936393;WS=13936375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr19	13940959	rs10403445	G	C	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=1;PP=737;SC=ATGTACGTGTGTCTGCCCCCG;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=13940967;WS=13940949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	13947292	rs895819	T	C	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.192;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=15;PP=891;ReadPosRankSum=-0.489;SC=CACGACTTGGTGTGGACCCTG;SOR=0.416;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=37;WE=13947300;WS=13947282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr19	13988416	rs2016163	A	G	3798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=54;PP=2965;ReadPosRankSum=0.829;SC=GCGGCGCCACACGTGAGCGCG;SOR=0.373;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=77;TCR=54;TR=130;WE=13988424;WS=13988406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,127:0.99:128
chr19	13988558	rs148122339	C	CGAG	3568.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=65;PP=2986;SC=AGGCCACCGCCGAGGAGGAGG;SOR=3.726;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=90;TCF=4;TCR=86;TR=68;WE=13988566;WS=13988548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	13993457	rs2242130	C	T	249.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=2;PP=205;SC=CAGGTGAGGCCAGGACCTCAC;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=13993465;WS=13993447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	13996587	rs3803894	G	A	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=1;PP=227;SC=GGTCACTGTCGCCCATTCTCT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=13996595;WS=13996577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
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chr19	14000400	rs3803891	A	G	4061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=89;PP=2965;ReadPosRankSum=1.496;SC=CTCCGCTCCCAGGTGCCAGAG;SOR=0.827;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=128;TCF=38;TCR=90;TR=127;WE=14000408;WS=14000390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,132:0.99:133
chr19	14000870	rs2305775	C	T	4255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=85;NR=39;PP=2965;SC=TGGGGCCCTCCAGGCAGGCCA;SOR=1.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=85;TCR=39;TR=124;WE=14000878;WS=14000860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr19	14001165	rs112207239	G	T	3034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=38;PP=2480;SC=GGCGGGCACTGTCTGCCTGCG;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=93;TCF=55;TCR=38;TR=93;WE=14001173;WS=14001155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr19	14003896	rs11085875	C	T	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=16;PP=620;SC=GACACAGAGCCGGAACTTTAA;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=24;WE=14003904;WS=14003886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	14006300	rs58722011	C	A	1032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=9;PP=748;SC=CTCTGGGGGTCCCCATAGAAG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=14006308;WS=14006290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	14015711	rs6511898	C	A	3314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=69;PP=2580;SC=GTCATTTTATCTTCCCCTTGA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=34;TCR=69;TR=103;WE=14015719;WS=14015701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr19	14015815	rs6511899	T	C	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=25;PP=759;ReadPosRankSum=-0.748;SC=AGGTTACCCCTACCTCCACCT;SOR=2.115;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=29;WE=14015823;WS=14015805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr19	14020573	rs12971500	T	C	2631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=27;PP=2132;SC=TCTCTGGCCATCATGGCTGCC;SOR=1.781;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=58;TCR=27;TR=85;WE=14020581;WS=14020563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	14023191	rs7250180	G	A	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=10;PP=790;ReadPosRankSum=-0.601;SC=TGAGAGACCCGGATGAGGATG;SOR=0.481;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=32;TCF=22;TCR=10;TR=31;WE=14023199;WS=14023181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr19	14029269	rs2305776	A	C	4901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=41;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.718;SC=CACAGGGTCCAAGCCCCCAAC;SOR=0.914;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=148;TCF=107;TCR=41;TR=146;WE=14029277;WS=14029259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,153:0.99:154
chr19	14030689	rs10410239	T	C	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=4;PP=263;SC=GTCTGGTGGGTGTCCTGGAGA;SOR=1.473;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=14030697;WS=14030679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	14037745	rs750581	A	C	4434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.072;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=67;PP=2965;ReadPosRankSum=1.785;SC=GACATAAGACAATGGCCTGAC;SOR=0.291;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=132;TCF=65;TCR=67;TR=131;WE=14037753;WS=14037735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,141:0.99:142
chr19	14040525	.	TG	T	313.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=259;SC=AGGATAGGCATGGGGGGGGAG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=12;WE=14040533;WS=14040515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	14044067	rs10423549	G	A	1555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.458;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=1245;ReadPosRankSum=1.239;SC=GCAGAGCCCCGGCGGGCAGCC;SOR=0.610;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=50;TCF=23;TCR=27;TR=49;WE=14044075;WS=14044057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr19	14045311	.	A	AGTGT	52.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.42;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=2;PP=124;SC=GGTCGCCTTCAGTGTGTGTGT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=2;WE=14045319;WS=14045301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	14048479	rs151108544	C	T	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=539;SC=CTCTGCACCGCCCTCCTGCAA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=14048487;WS=14048469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	14048587	rs55873182	G	C	2652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=29;PP=1983;SC=ACTCCCCTCCGTGGGCCCCAC;SOR=1.721;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=54;TCR=29;TR=83;WE=14048595;WS=14048577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	14048728	rs138002759	A	G	2713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=67;PP=2241;SC=CAGGGGCTGCAAGCTCTCCCC;SOR=3.003;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=83;TCF=15;TCR=68;TR=82;WE=14048736;WS=14048718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr19	14048943	rs180763870	G	T	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=4;PP=1249;SC=GAGCAGGGGTGGGGGGGCAGG;SOR=4.317;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=49;TCF=44;TCR=5;TR=47;WE=14048951;WS=14048933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	14065534	rs1056142	A	C	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=24;PP=765;SC=GGTCACAGCAACCTCTGAGCC;SOR=3.841;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=14065542;WS=14065524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	14070447	.	C	T	2473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=29;NR=43;PP=2077;SC=TCTTCGTGGCCGCAACCTGCG;SOR=1.164;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=29;TCR=43;TR=72;WE=14070455;WS=14070437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr19	14083761	rs2305780	T	C	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=9;PP=262;SC=CCAGTGCTGGTGGAGCTGGCG;SOR=1.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=15;WE=14083769;WS=14083751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	14139004	rs1982632	A	G	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=1;PP=399;SC=CGTTCAAAGCATCTCCGTCCA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=14139012;WS=14138994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	14161547	rs10424865	A	G	1814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=24;PP=1473;SC=CACCTCCCCAACTTCTTTGGT;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=54;TCF=29;TCR=25;TR=53;WE=14161555;WS=14161537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	14161745	rs10404803	T	G	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=10;PP=293;SC=TACTCCACAGTGGGGAGAGGT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=14161753;WS=14161735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	14162347	rs10404921	C	G	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=1;PP=790;SC=GGGCAAGACTCTGTCTCAAAA;SOR=4.680;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=29;WE=14162355;WS=14162337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	14162676	rs2306190	A	C	1483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=17;PP=1093;SC=TGCCCTGACTACTCCTGTCTT;SOR=0.919;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=42;WE=14162684;WS=14162666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	14165598	rs56361194	C	T	4962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=83;PP=2965;SC=CTGCCACCCACCCCCTCCCAG;SOR=0.705;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=81;TCR=84;TR=163;WE=14165606;WS=14165588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr19	14166065	rs148192106	A	AGGACAAAAGGGAAGACAGGGTTAAGATG	7024.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=70.96;ReadPosRankSum=0.858;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,97:0.98:99
chr19	14168326	rs7250611	C	T	264.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=217;SC=CCTCCCTCCTCCGCGGGGCTC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=14168334;WS=14168316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	14184227	rs8104055	G	C	1014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=29;PP=877;SC=TGAACTCGTCGAGCTGCGCGT;SOR=3.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=32;WE=14184235;WS=14184217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	14184442	rs58659592	G	A	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=1;PP=110;SC=AGGCCGCGGCGGGGAGCGGCT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=14184450;WS=14184432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	14184713	rs35666756	C	CG	2625.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=52;PP=2780;SC=GTAGCAACGCCGGGACCCCCA;SOR=1.522;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=77;TCF=20;TCR=57;TR=68;WE=14184721;WS=14184703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	14185226	rs7258963	T	C	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=18;PP=520;SC=GGAAAGTTGGTGGTGATCTGG;SOR=1.893;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=14185234;WS=14185216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	14185448	rs7255516	C	A	1829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=8;PP=1487;SC=AGGCCCAAACCGCCACCCCGA;SOR=3.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=49;TCR=8;TR=57;WE=14185456;WS=14185438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	14194458	rs35357458	C	A	3171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.188;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=52;PP=2603;ReadPosRankSum=1.052;SC=AGCTGGCCTGCGAGGAGTGGG;SOR=0.385;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=100;TCF=48;TCR=52;TR=99;WE=14194466;WS=14194448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,99:0.99:100
chr19	14294288	rs61051191	GC	G	1609.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=13;PP=1016;SC=CATTTTATCTGCCCCCCCCAG;SOR=2.303;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=46;WE=14294296;WS=14294278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	14499357	rs2302094	T	A	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.93;QD=32.18;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	14499410	rs2302092	G	C	639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=9;PP=507;SC=GAAAGAGAGGGCTCGCGCACG;SOR=0.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=20;WE=14499418;WS=14499400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	14561722	rs8107892	A	G	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=2;PP=272;SC=AGGAGAAATTAACAGAATCCA;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=14561730;WS=14561712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	14562977	rs12973696	T	C	207.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=9;PP=169;SC=GAAGCCAAGGTGGACGGATCA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=14562985;WS=14562967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	14578354	rs34422078	C	G	1571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=17;PP=1202;SC=TCCCCTTACTCTGGCCTCCTC;SOR=1.524;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=52;WE=14578362;WS=14578344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	14580869	rs34241778	GC	G	1937.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=22;NR=36;PP=1927;SC=TATTCGGGGTGCCCCCCACCC;SOR=1.234;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=65;TCF=26;TCR=39;TR=58;WE=14580877;WS=14580859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr19	14582539	rs8598	C	T	2401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=48;PP=1760;SC=CGCGGCCCCTCACAGCCGCGG;SOR=1.339;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=29;TCR=48;TR=77;WE=14582547;WS=14582529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	14583264	rs2241363	G	C	312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=200;SC=CGGGACACACGGTCCTGCCTG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=14583272;WS=14583254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	14583582	rs11668633	C	T	2197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=23;NR=48;PP=1595;SC=CGGCCAGGAACAGTGGCCGCT;SOR=1.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=71;WE=14583590;WS=14583572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	14589378	rs1127307	C	T	3764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=47;PP=2914;ReadPosRankSum=0.854;SC=CCATGGTGGCCGCTATTGGGG;SOR=1.115;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=120;TCF=71;TCR=49;TR=117;WE=14589386;WS=14589368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,122:0.98:124
chr19	14590142	.	TGACAAGAGTGA	T	346	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=0.9998;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=29;MQ=45.73;NF=2;NR=0;PP=346;QD=194.5;SC=CCAGCCTGGGTGACAAGAGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=2;WE=14590160;WS=14590132;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,2:0.67:3
chr19	14627050	rs4926222	G	A	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=36;PP=975;SC=CCCAGAGGCCGTCTGCCATAG;SOR=3.967;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=39;TCF=3;TCR=36;TR=39;WE=14627058;WS=14627040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	14629150	rs3962158	G	A	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=321;SC=TCTGGTAGTAGTCTTTACCCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=14629158;WS=14629140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	14655865	rs7252966	T	C	1759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=19;PP=1371;ReadPosRankSum=-0.620;SC=GAGTTGTTTCTAAGCCTCTCA;SOR=0.668;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=59;TCF=40;TCR=19;TR=58;WE=14655873;WS=14655855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,57:0.98:58
chr19	14674235	rs891089	C	T	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=548;SC=CGTGGCACTCCGCAGGAACGC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=14674243;WS=14674225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	14682804	rs9543	G	C	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=17;PP=675;SC=GGACCAGGTGGGCCCCCATGG;SOR=0.880;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=14;TCR=17;TR=31;WE=14682812;WS=14682794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	14693777	rs140035650	ATG	A	101.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.080;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=1;PP=154;ReadPosRankSum=-1.312;SC=CTCTGTGTGTATGTGTGTGTG;SOR=0.093;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=4;WE=14693786;WS=14693767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr19	14736288	rs34381727	C	G	2246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=6;PP=1872;SC=TAGAACAATTCAGATGTTTCA;SOR=4.343;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=58;TCR=6;TR=63;WE=14736296;WS=14736278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	14740824	rs77548886	A	AG	1481.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=10;PP=1439;SC=TTAAGTTTAAATAACAAAGAA;SOR=1.949;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=33;WE=14740832;WS=14740814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	14741065	rs62124014	G	A	423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=384;SC=AACTAATAATGAGCATGAACA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=14741073;WS=14741055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	14744032	rs732722	G	A	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=4;PP=450;SC=TGGGAACATCGAAGGCACATA;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=14744040;WS=14744022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	14744181	rs899217	T	A	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=23;PP=695;SC=ACATAAAGTGTCTCTTTTCCT;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=14744189;WS=14744171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	14744311	rs62124017	G	A	170.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=135;SC=GAAGTCAGGAGCTTGAGACCA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=14744319;WS=14744301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	14752325	rs8102646	C	T	3448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=21;PP=2864;SC=GCTGGTGTTCCGGATGGCTTT;SOR=2.549;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=76;TCR=21;TR=97;WE=14752333;WS=14752315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr19	14754831	rs61276204	GTT	G	30.71	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=15.35;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	14769339	rs4606855	C	G	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=15;PP=414;SC=TTCCTGCCCTCGGTTGTCTTT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=14769347;WS=14769329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	14779550	rs4239642	C	A	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=325;SC=CCACTGGAGACCATGAGTGGC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=14779558;WS=14779540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	14804183	rs10407394	A	G	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=12;PP=654;SC=TTTGATTGTGACCACTCTGCT;SOR=0.906;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=28;WE=14804191;WS=14804173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	14805719	rs3850141	T	C	1463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=7;PP=1115;SC=GGATTTTCCATGCCTGCTGTG;SOR=3.080;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=38;TCR=7;TR=45;WE=14805727;WS=14805709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	14806017	rs3813144	G	C	179.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=146;SC=GCCATGTGAAGAAGACAGACG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=14806025;WS=14806007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	14817062	rs4808319	G	A	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=24;PP=850;SC=TTTCCTGAGCGAGCAGCTGCC;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=9;TCR=24;TR=33;WE=14817070;WS=14817052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	14817145	rs4809215	G	T	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=9;PP=353;SC=TGCCTGCTCCGCATTCACGCA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=14817153;WS=14817135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	14817548	rs6511961	T	A	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=26;PP=685;SC=CAGTGCCTACTCTGGGCCACC;SOR=2.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=31;WE=14817556;WS=14817538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	14819310	rs34925577	C	CAG	2261.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=31;PP=1984;SC=TCTCAGGGGACGGGAGAGTTC;SOR=1.201;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=41;WE=14819318;WS=14819300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	14826849	rs4078586	T	C	2048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=11;PP=1663;SC=TTCCCCAGGCTTGCCAGCCTC;SOR=2.904;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=51;TCR=11;TR=62;WE=14826857;WS=14826839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	14829749	rs3764626	C	T	4104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=62;PP=2965;SC=TATGAGTGCGCGACTTGCGGT;SOR=0.724;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=64;TCR=62;TR=125;WE=14829757;WS=14829739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr19	14846897	rs1859257	T	A	4027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=97;NR=21;PP=2965;SC=ATTGAATGCCTAGCACGCCTT;SOR=2.871;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=119;TCF=98;TCR=21;TR=118;WE=14846905;WS=14846887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr19	14857179	rs1029476	T	C	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=18;PP=415;SC=TTTTGAAACCTGTTATCTCTT;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=20;WE=14857195;WS=14857169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	14857187	.	C	CT	513.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=0;NR=4;PP=60;SC=CCTGTTATCTCTTTTTTTTTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=4;WE=14857195;WS=14857169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	14857891	rs10403842	A	G	78.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=57;SC=CAACAATATTAAGTGTTTCTT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=14857899;WS=14857881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	14862430	rs2524383	C	G	5733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=87;PP=2965;SC=GCATCCAGGTCAAGGTGGCCA;SOR=0.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=173;TCF=86;TCR=87;TR=173;WE=14862438;WS=14862420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr19	14862517	rs3752189	A	G	4962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=101;PP=2965;SC=CAGAGCGGCGATCAGATTTGA;SOR=1.465;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=55;TCR=101;TR=156;WE=14862525;WS=14862507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr19	14866698	rs28420691	C	T	797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=22;PP=673;SC=GCCTGCAGGGCGAGGCCAAGG;SOR=3.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=25;WE=14866706;WS=14866688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	14866974	rs2253472	T	C	2656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=15;PP=2138;SC=ATCTTTAAATTTCTTATTTTT;SOR=2.720;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=59;TCR=15;TR=74;WE=14866982;WS=14866964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	14867186	rs2524386	G	A	1514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=41;PP=1265;SC=ACATAAGGGGGGTTAGGTTAG;SOR=4.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=44;WE=14867194;WS=14867176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	14875201	rs7253782	G	T	1320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=4;PP=996;SC=GAAGGAGACAGAAAACATGCA;SOR=3.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=40;TCF=36;TCR=4;TR=40;WE=14875209;WS=14875191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	14910438	rs10415312	C	T	4443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=79;PP=2965;SC=ATTTCCATTTCGGTGCAGAAG;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=47;TCR=79;TR=126;WE=14910446;WS=14910428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr19	14910573	rs10415562	C	T	2905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=53;PP=2286;SC=GGGTGACAGACGGCCACGAAG;SOR=1.109;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=40;TCR=53;TR=93;WE=14910581;WS=14910563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr19	14938616	rs2190686	T	C	6098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.241;NF=86;NR=94;PP=2965;ReadPosRankSum=0.661;SC=TCCAGGATGCTAGAACCAGCA;SOR=0.280;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=181;TCF=86;TCR=95;TR=180;WE=14938624;WS=14938606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,184:0.99:185
chr19	14974930	rs10407452	G	A	4962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=106;NR=45;PP=2965;SC=GCTGCAAAATGCATCACCATG;SOR=1.783;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=106;TCR=45;TR=151;WE=14974938;WS=14974920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr19	14975368	rs10415965	A	G	2796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=54;PP=2332;SC=GTGTGGAGGCAGGAGTCTGAG;SOR=1.408;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=31;TCR=54;TR=85;WE=14975376;WS=14975358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	14975471	rs11085912	C	T	2623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=42;PP=2126;SC=ATTCTTGTTTCTCTGAAAATC;SOR=0.743;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=39;TCR=42;TR=81;WE=14975479;WS=14975461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	14991963	rs10404119	C	A	3938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=68;PP=2965;SC=CAGATGTCTGCAAAGGACAGG;SOR=0.986;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=51;TCR=68;TR=119;WE=14991971;WS=14991953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr19	14992031	rs10405129	A	G	3467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=40;PP=2860;SC=TGTGGCCAGGATGATGAGCAG;SOR=1.125;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=59;TCR=40;TR=99;WE=14992053;WS=14992021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr19	14992042	rs10405136	A	G	4876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.26;QD=44.33;SOR=1.069;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr19	14992045	rs10404335	C	T	4876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.78;QD=46.45;SOR=1.168;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr19	14992178	rs149867911	CTATTTATTTATT	C	1560.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=2997;SC=CTTTTTTTTTCTATTTATTTA;SOR=3.675;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=8;TCR=57;TR=16;WE=14992197;WS=14992168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	14992226	rs10410793	A	G	1666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=76;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=31;PP=838;SC=ATTAACATAGACAGGGTCTCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=14992234;WS=14992216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	15052983	rs3044711	T	TATC	5667.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=72;PP=2957;SC=GTCCTAAGAGTATCTGCCAGA;SOR=1.572;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=34;TCR=87;TR=100;WE=15052991;WS=15052973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr19	15132545	rs736737	T	C	3039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=45;PP=2409;SC=GGTGAGAGCCTTCGGGGGTGG;SOR=0.736;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=45;TCR=45;TR=90;WE=15132553;WS=15132535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr19	15132574	rs757463	C	G	3033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=52;NR=38;PP=2355;SC=GTGCCGGTGGCTGGAGGCTGG;SOR=1.132;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=52;TCR=38;TR=90;WE=15132582;WS=15132564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	15133762	rs8111625	G	C	5551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=68;PP=2965;SC=AAGAACCTCAGCTGGGGCCTC;SOR=1.103;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=169;TCF=101;TCR=68;TR=169;WE=15133770;WS=15133752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr19	15165818	rs3181162	A	C	284.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=2;PP=175;SC=TGGTGCAATCATGGCTCACTG;SOR=2.093;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=15165826;WS=15165816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	15166997	rs11574685	C	T	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=42;PP=1347;SC=CTTCTGTTCCCAAGGCCAAAT;SOR=4.091;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=5;TCR=42;TR=47;WE=15167005;WS=15166987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	15198263	rs8105277	A	G	6239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=86;PP=2965;SC=TTGTCCACCCACAGCGTTACT;SOR=1.141;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=208;TCF=122;TCR=86;TR=207;WE=15198271;WS=15198253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr19	15198624	rs117343407	C	T	2692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=42;PP=2138;SC=TGTGGTGTCACTGTCCTATGG;SOR=0.843;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=38;TCR=42;TR=80;WE=15198632;WS=15198614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr19	15233581	rs2074265	C	A	2298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=31;PP=1751;SC=AGTAGGGGTACAGCACGTCAA;SOR=0.934;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=37;TCR=31;TR=68;WE=15233589;WS=15233571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	15233631	rs2074266	G	A	3366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=39;PP=2668;SC=GGGACAGGGAGGACGCTGAGT;SOR=1.168;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=60;TCR=39;TR=99;WE=15233639;WS=15233621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr19	15235932	rs4141356	G	A	708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=17;PP=503;SC=GAACCTCTCCGGAAGAAATCG;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=15235940;WS=15235922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	15273221	rs757472	T	C	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.97;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	15273231	rs4809028	A	G	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.88;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	15273248	rs4809029	A	C	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=235;SC=CACTGCTGACACCCAGTGGAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=15273256;WS=15273238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	15273381	rs4809030	A	G	1289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=13;PP=949;SC=TCCCTGGAGGATGAAGGGGAG;SOR=1.501;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=37;WE=15273389;WS=15273371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	15276055	rs2074617	C	G	1250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=3;PP=926;SC=CTTCATGAAGCCTGGTTATGT;SOR=4.294;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=15276063;WS=15276045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	15276143	rs2074618	C	T	2519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=38;PP=1876;SC=CAGGTGACACCAACCCAGCTT;SOR=0.766;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=43;TCR=38;TR=81;WE=15276151;WS=15276133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	15276919	rs2074619	G	A	2513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.89;SOR=3.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	15276923	rs10416777	C	T	2478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.49;SOR=4.029;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	15277006	rs45591935	T	C	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.36;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	15277009	rs62113791	CA	TG	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.34;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	15277938	rs1548554	C	T	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=0;PP=677;SC=TTGCTGAATACACACACCCTT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=15277946;WS=15277928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	15278057	rs1548555	A	G	2073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=39;PP=1582;SC=CACTGTCACTAACCTGGGCCA;SOR=1.473;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=21;TCR=39;TR=60;WE=15278065;WS=15278047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	15285052	rs1044006	T	C	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=15;PP=771;SC=GTAGCTCCTCTGGCGGCAGCA;SOR=0.752;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=17;TCR=15;TR=32;WE=15285060;WS=15285042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	15285272	rs10422818	T	C	2679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=51;PP=2099;SC=ACAATCCCCTTCCATGCATTC;SOR=1.275;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=32;TCR=51;TR=83;WE=15285280;WS=15285262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr19	15285382	rs71168591	ATTTT	A	418.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=18;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=198;SC=TCACTGGATAATTTTTTTTTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=10;WE=15285393;WS=15285372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	15291096	rs137943075	G	A	894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=21;PP=725;SC=CACAGGAACAGAGGTAACCCC;SOR=2.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=15291104;WS=15291086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	15292088	rs7257550	G	C	246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=179;SC=CCCTTATCTCGGCAAGAAGCT;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=15292096;WS=15292078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	15292366	rs11669982	C	T	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=1;PP=635;SC=TCCCTGCTCTCCAAGCAGAGG;SOR=4.091;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=23;WE=15292374;WS=15292356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	15292437	rs1043997	T	C	2149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=48;NR=27;PP=1563;SC=CTCCGTAGCCTGGCGGGCAGG;SOR=1.547;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=49;TCR=27;TR=75;WE=15292445;WS=15292427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	15294991	rs2074616	C	T	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=1;PP=593;SC=ATAAATAAAACGGGAAAAGTA;SOR=4.977;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=23;WE=15294999;WS=15294981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	15300069	rs10423702	T	C	3880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=40;PP=2965;SC=TCACAGACGATGGAGCTCCCC;SOR=1.646;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=129;TCF=89;TCR=40;TR=128;WE=15300077;WS=15300059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr19	15302844	rs1043994	T	C	3778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=63;PP=2965;SC=ATGGTGAGGGTGCACAGGGCA;SOR=0.709;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=64;TCR=63;TR=127;WE=15302852;WS=15302834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr19	15303225	rs3815188	G	A	3480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=65;PP=2528;ReadPosRankSum=-0.852;SC=AGAATCGGGCGGTGCCAGCCA;SOR=0.520;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=38;TCR=66;TR=103;WE=15303233;WS=15303215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr19	15469602	.	C	T	853	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=30;NR=1;PP=853;QD=28.6377810499;SC=CAGGCAAGCACTGACTCATTA;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=15469610;WS=15469601;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	15471569	rs375638784	A	G	195.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=1;PP=174;SC=AAGAACCCCTAAAGATGTTGT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=15471577;WS=15471567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	15471856	rs4809184	T	C	1896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=44;PP=1407;ReadPosRankSum=-0.638;SC=ACTCCCCATCTGGGCCCACGT;SOR=0.651;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=68;TCF=23;TCR=45;TR=67;WE=15471864;WS=15471846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,68:0.99:69
chr19	15485350	rs4809185	C	T	1994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=11;PP=1594;SC=CGGGCTGACCCGCCTGGCCTT;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=51;TCR=11;TR=62;WE=15485358;WS=15485340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	15508130	rs7247749	G	A	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=11;PP=404;SC=GGGCCCAGGTGCCTAAGATAG;SOR=1.022;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=19;WE=15508138;WS=15508120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	15508362	rs2058322	G	C	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=7;PP=520;SC=TGTAGATTTGGTGGATGAGGC;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=13;TCR=7;TR=20;WE=15508370;WS=15508352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	15511205	.	CT	C	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=4.218;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.15;ReadPosRankSum=0.393;SOR=1.755;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chr19	15539439	rs887898	A	G	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=431;SC=TCCAAGACTCAGGCCGCAGAT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=15539447;WS=15539429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	15540564	.	C	T	1674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=20;PP=1176;SC=GGGCGGGTGGCCCAGGCCCTT;SOR=1.179;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=32;TCR=20;TR=52;WE=15540572;WS=15540554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	15550869	rs117240920	C	T	8201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=137;PP=2965;SC=GGAACACGGCCGGCTCCTCGT;SOR=0.876;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=254;TCF=117;TCR=137;TR=254;WE=15550877;WS=15550859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,260:1.00:260
chr19	15565046	rs9646651	G	A	1867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=21;PP=1566;SC=CTCGCAGGATGGTGGGCAGTG;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=46;TCR=21;TR=66;WE=15565054;WS=15565036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	15569592	rs4809193	C	G	33.31	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.5051;FS=4.771;HP=7;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=63;ReadPosRankSum=0.431;SC=CCCGTGCCCCCCCCACCCCCC;SOR=2.225;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=4;WE=15569604;WS=15569582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr19	15569596	.	A	AC	145	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=0.9997;HP=14;HapScore=4;MGOF=3;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=145;QD=85.0;SC=TGCCCCCCCCACCCCCCGCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=2;WE=15569604;WS=15569582;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,2:0.33:6
chr19	15570931	rs3764566	G	A	1082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=0;PP=916;SC=GGTGTTTGGTGTAGATTGGAA;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=15570939;WS=15570921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	15640669	rs73512652	G	A	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=20;PP=625;SC=CCTCAGGTACGTGGGCTGGGC;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=15640677;WS=15640659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	15648715	rs11666601	G	A	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=3;PP=642;SC=AGGGCTCAGCGGTCTCCCTTG;SOR=3.528;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=25;WE=15648723;WS=15648705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	15658779	.	TGA	T	99	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=99;QD=25.5;SC=CAGCTGCCCCTGAGAGAGAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=4;WE=15658788;WS=15658769;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr19	15726487	rs4646523	G	T	2487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=13;PP=2045;SC=CCCCGTGGCTGCTCCTGCTGG;SOR=2.985;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=64;TCR=13;TR=77;WE=15726495;WS=15726477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr19	15730498	rs55848814	G	GC	2817.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=37;PP=2965;SC=ACCGTCGCTTGTGACGCCTGC;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=30;TCR=37;TR=67;WE=15730506;WS=15730488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	15739084	rs4239613	T	C	2485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=0;PP=2167;SC=GTGTATGCTCTCTGGATAATT;SOR=8.635;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=75;TCF=75;TCR=0;TR=75;WE=15739092;WS=15739074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	15739274	rs2056820	C	T	6112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=82;PP=2965;SC=GAGGAGGGTCCTGGGCAGGGC;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=184;TCF=101;TCR=83;TR=183;WE=15739282;WS=15739264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr19	15739315	rs2056821	T	C	6779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.031;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=107;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.455;SC=CGGACCTTGTTCTTACTGTCC;SOR=0.253;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=210;TCF=103;TCR=107;TR=208;WE=15739323;WS=15739305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,214:1.00:215
chr19	15739597	rs2056822	A	C	4028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=83;PP=2965;SC=GCTTCGACCCAGAAAACGCCC;SOR=1.237;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=52;TCR=83;TR=135;WE=15739605;WS=15739587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr19	15739992	rs2239366	T	C	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=471;SC=ACCTTCCACCTTGGCCCCCAG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=15740000;WS=15739986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	15740220	rs4239614	C	T	1826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=50;PP=1484;SC=TTTGCACCAACTACCTTTTCA;SOR=3.219;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=9;TCR=50;TR=59;WE=15740228;WS=15740210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	15740268	rs2239367	C	G	972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.53;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	15740275	rs2283605	G	A	870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.54;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	15769992	rs2460817	A	T	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=9;NR=1;PP=209;SC=AGGATGGGGCACCTGGGTGCA;SOR=2.494;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=15770000;WS=15769982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	15770018	rs68106141	T	C	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.61;QD=42.57;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	15770018	.	TCC	CCT	668	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;FR=1.0000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=27;MQ=57.72;NF=10;NR=5;PP=668;QD=48.0978583241;SC=AGTTTCCACCTCCCTCCCCAA;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=15;WE=15770028;WS=15770008;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	15770020	rs2460819	C	T	723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.61;QD=42.57;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	15784061	rs7254013	C	A	3088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=38;PP=2284;SC=TTCCTGGTAACTGGACTCCTA;SOR=1.112;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=59;TCR=38;TR=97;WE=15784069;WS=15784051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr19	15784116	rs7253210	G	A	2697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=53;PP=2135;SC=GACTCTAATCGGCCCATCTCT;SOR=1.423;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=30;TCR=53;TR=83;WE=15784124;WS=15784106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr19	15784167	rs7254627	A	G	1885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=53;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=47;PP=1608;SC=GAGGCCACTTAGTTGTTGGTT;SOR=2.794;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=11;TCR=47;TR=58;WE=15784175;WS=15784157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	15784195	rs10414690	G	C	1730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.27;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	15784200	rs55794585	C	T	1660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.89;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	15784214	rs56398124	C	T	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=28;PP=957;SC=TCTCAGCCCTCGTTTACTCAC;SOR=2.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=15784222;WS=15784185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	15784285	rs56205003	C	T	991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=16;PP=819;SC=ACACTGTCCCCGGAGCTCTTC;SOR=0.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=31;TCF=15;TCR=16;TR=31;WE=15784293;WS=15784275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	15784319	rs56124328	G	T	968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=10;PP=821;SC=TCCTCACCCTGCATCCCCTCT;SOR=1.536;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=21;TCR=10;TR=30;WE=15784327;WS=15784309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	15784377	rs16995376	C	T	2838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.54;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	15784386	rs16995378	C	T	2973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.73;SOR=2.517;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	15784617	.	A	G	1492	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=4;NR=50;PP=1492;QD=28.2735409731;SC=TCAGTGAGCTAGGTATTGATG;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=4;TCR=50;TR=54;WE=15784625;WS=15784607;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	15784660	.	A	G	1096	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=53;MMLQ=29;MQ=58.25;NF=0;NR=37;PP=1096;QD=30.5613841229;SC=GAGAAGCAAGAGAGATGGCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=37;WE=15784668;WS=15784650;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,37:0.97:38
chr19	15789034	rs28416595	C	A	3259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=27;PP=2451;SC=CTAAAATTAACCATCACAGGA;SOR=1.925;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=71;TCR=27;TR=98;WE=15789042;WS=15789024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr19	15789098	rs609636	A	G	3927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=65;PP=2933;SC=GGGCTTGAAGAACTCGACCCA;SOR=0.882;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=54;TCR=65;TR=118;WE=15789106;WS=15789088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr19	15789140	rs609290	A	G	2940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=62;PP=2381;SC=GGGCTTTACGATATGGCTGGG;SOR=1.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=31;TCR=62;TR=93;WE=15789148;WS=15789130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr19	15791180	rs8100667	C	T	4405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=88;PP=2965;SC=CTCTTGCCCACTGTCCTTGGC;SOR=2.063;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=36;TCR=88;TR=124;WE=15791188;WS=15791170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr19	15793069	rs10415700	G	A	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=322;SC=TCTGGTCCTCGCTGGCAATGG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=15793077;WS=15793059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	15793235	rs2285888	T	C	3081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=52;PP=2212;SC=GGGCAGCAGTTGTCTGGACAT;SOR=0.731;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=53;TCR=52;TR=105;WE=15793243;WS=15793225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr19	15795842	rs2018030	C	T	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=13;PP=783;SC=GTCCACCCTCCGGTGCTGAAG;SOR=1.022;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=20;TCR=13;TR=33;WE=15795850;WS=15795832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	15806703	rs695149	A	C	2369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=8;PP=1961;SC=AGAGTTGTGTATTTGTTCCCT;SOR=3.943;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=60;TCR=8;TR=67;WE=15806711;WS=15806693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	15807062	rs687774	C	T	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=22;PP=815;SC=TCACCACCACCACCCCCATCC;SOR=1.819;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=33;TCF=11;TCR=22;TR=32;WE=15807070;WS=15807052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	15807157	rs688231	A	G	2435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=21;PP=1193;SC=ACATCACCTCACCCCAAAACA;SOR=1.238;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=32;TCR=21;TR=53;WE=15807165;WS=15807147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	15807175	rs688256	G	C	2707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=25;PP=1594;SC=ACACACACAAGTGTCTCTCCA;SOR=1.196;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=38;TCR=25;TR=63;WE=15807183;WS=15807165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	15807212	rs596252	T	G	1945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=31;PP=1425;SC=GAAATCCCACTGGCAAACCTT;SOR=0.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=33;TCR=31;TR=64;WE=15807220;WS=15807202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	15807305	rs688755	T	C	1083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=23;PP=855;SC=CTTTTATTCCTTTCTCCGCAG;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=15807313;WS=15807295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	15807830	rs593421	T	C	3393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=32;PP=2644;SC=GAAGCTGGAATTGATCATGCG;SOR=1.765;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=72;TCR=32;TR=104;WE=15807838;WS=15807820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr19	15807884	rs593818	A	G	4797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=82;PP=2965;SC=CCTGAATGTAAGCTTGCAGTG;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=66;TCR=82;TR=148;WE=15807892;WS=15807874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr19	15807984	rs594255	G	A	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=34;PP=1038;SC=ACAGCCTGCAGGGGGCTCTTG;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=15807992;WS=15807974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	15838972	rs4569397	T	A	3462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=64;PP=2965;SC=TTCACGCTGCTGGGCAACCTG;SOR=1.234;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=107;TCF=43;TCR=64;TR=106;WE=15838980;WS=15838962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr19	15839081	rs2067083	C	T	3456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=-0.953;NF=48;NR=65;PP=2674;ReadPosRankSum=1.841;SC=ACACCGTGGCCATCATCCCGC;SOR=0.365;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=48;TCR=66;TR=113;WE=15839089;WS=15839071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr19	15839910	rs10426009	G	A	370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=307;SC=AAAGATTTCTGTATATGACAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=15839918;WS=15839900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	15852223	rs1966357	A	C	1766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=7;PP=1491;SC=AGAACTACAGAACCATATCTG;SOR=3.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=48;TCR=7;TR=55;WE=15852231;WS=15852213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	15852363	rs11670007	G	A	5466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=86;PP=2965;SC=TGGATTGAACGCAGACTCCAC;SOR=0.740;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=169;TCF=83;TCR=86;TR=169;WE=15852371;WS=15852353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr19	15852544	rs11670326	C	T	3306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=49;PP=2591;SC=CTCACTCCTTCCTTCTCATGG;SOR=0.815;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=96;TCF=47;TCR=49;TR=96;WE=15852552;WS=15852534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr19	15853150	rs16980824	C	T	2185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=28;PP=1639;SC=CTCTAAGCTCCTAATGGCCAG;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=36;TCR=28;TR=64;WE=15853158;WS=15853140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	15881751	rs8112713	A	C	5103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=117;NR=25;PP=2965;SC=CATTTGACATAAAGCTCCATT;SOR=3.071;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=143;TCF=118;TCR=25;TR=142;WE=15881759;WS=15881741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr19	15881953	rs4807986	A	G	5541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=63;NR=111;PP=2965;SC=CGGAAGCGCCACCCGTCATGG;SOR=1.338;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=63;TCR=111;TR=174;WE=15881961;WS=15881943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr19	15882796	.	T	A	647	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=53;MMLQ=28;MQ=55.92;NF=24;NR=1;PP=647;QD=27.2708485019;SC=TCCCCAACTTTCTCCCTTTGG;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=15882804;WS=15882795;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	15884810	rs10421246	A	T	1634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=8;PP=1274;SC=ATTCCAGACCAGATCTGTCCA;SOR=2.655;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=47;TCF=38;TCR=9;TR=46;WE=15884818;WS=15884800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	15890388	rs7259595	A	G	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=575;SC=GAGTGAGTGAATGAGCCGCCT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=15890396;WS=15890382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	15890517	rs11669449	A	C	2372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=23;PP=1934;SC=CTGCTGCCACACTCACGAGGT;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=47;TCR=23;TR=70;WE=15890525;WS=15890507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	15890625	rs11673423	C	G	2765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=54;PP=2099;SC=GCCAGGAAGCCGGCCAGGAGC;SOR=1.280;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=34;TCR=54;TR=88;WE=15890633;WS=15890615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr19	15890771	rs56317414	T	G	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.31;SOR=2.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	15890777	rs55926517	G	T	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.51;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	15890800	rs56180406	A	G	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=2;NR=15;PP=460;SC=CAGTGGAGAGAAGCAGGGAAG;SOR=3.383;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=17;WE=15890808;WS=15890790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	15905941	rs56117700	T	C	214.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.69;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	15918455	rs61739573	G	A	2418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=55;PP=2301;SC=GCACGTTGTAGCGCAGGGGGT;SOR=1.966;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=34;TCR=55;TR=89;WE=15918463;WS=15918445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr19	15932941	rs3761012	A	G	1449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=18;NR=26;PP=1143;SC=GTTTGCGTCCAAGGCGATCTC;SOR=1.251;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=18;TCR=26;TR=44;WE=15932949;WS=15932931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	15933059	rs3761013	A	G	1067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=17;PP=797;SC=ATGACCTGGAATCTGGCTGAA;SOR=0.869;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=32;TCF=15;TCR=17;TR=32;WE=15933067;WS=15933049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	15933155	rs367984219	A	AT	392.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.05;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	15934599	rs2285881	C	G	1889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=31;PP=1358;SC=AAGCCACATCCTCAAAGGCTG;SOR=0.754;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=32;TCR=32;TR=63;WE=15934607;WS=15934589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	15934656	rs10411865	A	G	2444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=50;PP=1913;ReadPosRankSum=-0.715;SC=TGAGACTGACAGCCCTGGGTA;SOR=0.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=32;TCR=51;TR=82;WE=15934664;WS=15934646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr19	15989405	rs1126433	C	T	44.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=22.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	15990048	rs3093198	A	G	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=6;PP=860;SC=GGTGAGGGAAAGAGAGCTGGA;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=31;WE=15990056;WS=15990038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	16034519	rs3746152	T	A	2183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=3;PP=1828;ReadPosRankSum=-0.721;SC=TCAAGCATGTTCCATGGCTCC;SOR=4.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=69;TCF=66;TCR=3;TR=68;WE=16034527;WS=16034509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,68:0.99:69
chr19	16034714	rs8104361	A	G	6693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=137;PP=2965;SC=GGGAGGGTGCAGCGCCGCTCC;SOR=1.380;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=216;TCF=79;TCR=137;TR=216;WE=16034722;WS=16034704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
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chr19	16059846	rs117192411	C	G	2554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=11;PP=2203;ReadPosRankSum=-0.912;SC=AGCATCATATCTGAATTTAAC;SOR=2.200;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=70;TCR=11;TR=80;WE=16059854;WS=16059836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,78:0.99:79
chr19	16060827	rs1594685	T	G	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=24;PP=838;SC=CTGTTGTAAGTGTTCAGGTAT;SOR=1.819;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=10;TCR=24;TR=34;WE=16060835;WS=16060817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	16130594	rs11669662	G	C	2443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.64;SOR=1.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	16130604	rs7250074	T	C	2536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.00;SOR=1.316;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	16131679	rs757545	T	C	4590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=104;PP=2965;SC=ATGTTGGGACTCCACCAACGC;SOR=2.143;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=34;TCR=105;TR=138;WE=16131687;WS=16131669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr19	16136405	rs4808423	C	T	1660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=11;PP=1083;SC=GCCCTGAAACCCGGCCCTGCC;SOR=1.938;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=45;WE=16136413;WS=16136395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	16136528	rs140634016	G	GCAGCACCTGGC	3007.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=17;PP=2068;SC=GGCAGCCGGGGCAGCACCTGG;SOR=0.871;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=72;TCF=34;TCR=38;TR=32;WE=16136536;WS=16136518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	16136923	rs757546	T	C	2810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=60;PP=2131;SC=AGCACTCATCTGGGGTTGGCA;SOR=1.361;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=37;TCR=61;TR=97;WE=16136931;WS=16136913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr19	16137025	rs757547	C	A	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=26;PP=765;SC=AAACCCAGCCCAGCAAGCAGC;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=16137033;WS=16137015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	16137052	rs757548	A	C	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=22;PP=666;SC=CCGGGCCCCCAAGCCCGCCAG;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=16137060;WS=16137042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	16146400	rs17683335	A	G	3942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=57;PP=2965;SC=GTGCATGGAGATGGAGTCCCT;SOR=0.879;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=127;TCF=69;TCR=58;TR=126;WE=16146408;WS=16146390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr19	16178587	rs4808031	A	C	2051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=41;PP=1549;ReadPosRankSum=1.858;SC=GGCTGCTGGGAGTCCTCTCTG;SOR=0.481;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=70;TCF=28;TCR=42;TR=69;WE=16178595;WS=16178577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr19	16186813	rs139298941	A	AC	127.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5567;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=106;ReadPosRankSum=-1.732;SC=CGGGGACGTGACCCCCCCCCC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=3;WE=16186821;WS=16186803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr19	16197320	rs2228367	T	C	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=5;PP=1029;SC=CCAAGCACATTGCGGAAGAGG;SOR=3.716;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=42;WE=16197328;WS=16197310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	16197421	rs2303149	A	G	2021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.586;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=45;PP=1616;ReadPosRankSum=1.021;SC=TAGGGAGGACACCGGGGCCAA;SOR=1.367;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=69;TCF=24;TCR=45;TR=68;WE=16197429;WS=16197411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,68:0.99:69
chr19	16232380	rs112005697	AG	A	224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=245;SC=TGACCCCTCCAGGCCACAGTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=16232388;WS=16232370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	16232508	rs55692650	A	G	1589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=13;PP=1187;SC=TCTCCTACTGAGGACAGTTAT;SOR=2.004;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=50;TCF=36;TCR=14;TR=49;WE=16232516;WS=16232498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	16238279	rs1043308	C	T	1925.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=27;PP=1395;SC=AGATGATACTCGGGAACAAGT;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=28;TCR=27;TR=54;WE=16238287;WS=16238269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	16242887	rs200560717	T	TTTGG	676.86	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.86;MQRankSum=0.514;QD=35.62;ReadPosRankSum=0.368;SOR=2.200;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr19	16254694	rs2446366	A	G	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.95;SOR=2.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	16254700	rs56125298	A	G	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.09;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	16263202	rs285286	G	T	269.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=1;PP=209;SC=CACTCCAGCCGGGGGGACAGA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=16263210;WS=16263197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	16265494	rs111524	G	A	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=7;PP=187;SC=CTTTCTGCCTGTCACCTACCC;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=16265502;WS=16265484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	16268207	rs5827321	TA	T	5376.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=88;NR=67;PP=2975;SC=CGGCAGCAGCTAAAAAAGCCA;SOR=1.228;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=177;TCF=105;TCR=72;TR=155;WE=16268215;WS=16268197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr19	16275515	rs6512086	A	G	3295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=21;PP=2637;SC=GTGGGCGGTGACGGAGAGCAT;SOR=2.746;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=81;TCR=21;TR=102;WE=16275523;WS=16275505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr19	16275655	rs6512087	C	T	5170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.942;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.987;SC=GGCACTCAGCCCCCCCCGCGT;SOR=0.175;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=173;TCF=75;TCR=98;TR=171;WE=16275663;WS=16275645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,176:0.99:178
chr19	16275772	rs4808461	A	G	2294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=65;PP=1952;SC=CAGGAGGGCTAGGCCGGCTGT;SOR=4.468;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=6;TCR=65;TR=71;WE=16275780;WS=16275762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	16280634	rs2003419	A	G	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=28;PP=806;SC=TTTTTGAGACAGAGTCTCGGT;SOR=3.611;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=32;WE=16280642;WS=16280624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	16301312	rs206231	A	G	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=14;PP=670;SC=ACTCACCTCCATGTCTCTTCT;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=33;WE=16301320;WS=16301302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	16301544	rs2242143	G	C	1855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=7;PP=1485;SC=GGGAGCCCAGGGTTCAGGAGT;SOR=3.370;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=51;TCR=7;TR=58;WE=16301552;WS=16301534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	16320075	rs2290802	C	G	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=30;PP=860;SC=GGCAAAGCCCCGAGAGCCGTT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=16320083;WS=16320065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	16321047	rs7258138	T	C	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=380;SC=TTTATATTTATTTTCTGTTCT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=15;WE=16321055;WS=16321044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	16337423	rs2305939	T	C	1523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=41;PP=1307;SC=CATTACAGCCTAGGGCAGGGT;SOR=3.865;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=5;TCR=41;TR=46;WE=16337431;WS=16337413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	16338532	rs2124904	G	A	2142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=56;PP=1843;SC=CTGGGCTGTCGGCAGACTCCT;SOR=4.548;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=5;TCR=56;TR=61;WE=16338540;WS=16338522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr19	16339069	rs2305937	G	A	3210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=87;PP=2670;SC=TCTCTGGCCCGTCCCAGGAGC;SOR=3.890;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=11;TCR=87;TR=98;WE=16339077;WS=16339059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	16339715	rs3752797	C	T	5619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=120;PP=2965;SC=ACAGCGAGATCGTGTGGTCCA;SOR=1.649;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=57;TCR=120;TR=177;WE=16339723;WS=16339705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr19	16344528	rs2279060	C	G	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=43;PP=1345;ReadPosRankSum=-0.676;SC=CAGTCAGCTGCAATCAGGACC;SOR=3.486;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=46;WE=16344536;WS=16344518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr19	16345099	rs897774	T	C	2472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=31;PP=1867;SC=AGTGAGGCCCTACCCGTGGGG;SOR=1.136;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=43;TCR=31;TR=74;WE=16345107;WS=16345089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	16435717	rs8106384	T	C	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=19;PP=913;SC=CCGCGTCCTTTCTCCCCGGGT;SOR=0.843;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=24;TCR=19;TR=42;WE=16435725;WS=16435707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	16436262	rs3745318	T	C	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=246;SC=GATGCGCCGCTGGGGCCCGCA;SOR=2.448;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=16436270;WS=16436252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	16528539	rs2124915	T	C	341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=7;PP=243;SC=AGGGATAAAATTGTCCCTTTA;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=16528547;WS=16528529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	16539347	rs71178694	G	GAAGA	2241.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.56;QD=46.70;SOR=7.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	16547929	rs62118102	G	A	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.815;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=532;ReadPosRankSum=0.453;SC=ACTTCACAAAGTTAAACACAG;SOR=2.494;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=25;WE=16547937;WS=16547919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,24:0.92:26
chr19	16582785	rs7252649	G	T	156.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=2;PP=142;SC=TCCGAGCGCCGGGGGAACGGG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=16582793;WS=16582775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	16591464	rs9305079	G	A	2740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=50;PP=2156;SC=AATTATCTGCGTACTCTTCAT;SOR=0.959;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=40;TCR=50;TR=90;WE=16591472;WS=16591454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr19	16593189	rs138347151	CAACAA	C	740.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=0;PP=805;SC=GACCCTGTCTCAACAAAACAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=14;WE=16593211;WS=16593179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	16593203	rs75847259	A	G	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.08;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	16593415	rs8100755	G	A	1896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=30;SC=AACCATATGGGGTGGTCTCAA;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=26;TCR=30;TR=56;WE=16593423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	16594967	rs10413787	A	G	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=20;PP=556;SC=TTAAATCCTCAATTTCTTTTT;SOR=4.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=21;WE=16594987;WS=16594957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	16594979	rs7252242	C	T	614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.29;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	16601154	rs3810196	T	C	2163.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=1;PP=1662;SC=CTAGAAGTGGTTGTGTTGCAC;SOR=6.963;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=58;TCF=57;TCR=1;TR=58;WE=16601162;WS=16601144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	16601194	rs3810198	C	T	3647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=22;PP=2607;SC=TAATATAGTACTGCGATTTTC;SOR=2.624;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=86;TCR=22;TR=108;WE=16601202;WS=16601184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr19	16606742	rs3810199	G	C	1659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=29;PP=1329;SC=GGGGACCCTCGAGGATTCGAG;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=47;WE=16606750;WS=16606732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	16606766	rs3810200	G	C	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=21;PP=772;SC=TCGCTGCCGTGGACCCCGTGG;SOR=1.542;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=11;TCR=21;TR=32;WE=16606774;WS=16606756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	16633950	rs1043481	T	C	1664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=44;PP=1359;SC=TGATGTGGGGTGGGCCCTGTC;SOR=2.644;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=12;TCR=44;TR=56;WE=16633958;WS=16633940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	16666101	rs2287869	G	C	1598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=36;PP=1127;SC=AGTAGCTCAGGGGGCTAACGA;SOR=1.569;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=18;TCR=36;TR=54;WE=16666109;WS=16666091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	16797240	rs2249827	A	G	1152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=22;PP=877;SC=TTCTTGCAGCATTCTTGCCTT;SOR=0.902;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=16;TCR=22;TR=38;WE=16797248;WS=16797230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	16798927	rs2547112	T	C	3565.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=43;PP=2550;SC=CTGTCTCTCTTGCTGTCTCCC;SOR=1.349;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=71;TCR=43;TR=114;WE=16798935;WS=16798917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr19	16842052	rs8107776	G	T	2334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=43;PP=1770;SC=ACCCTGAAGTGCCAGACCTTC;SOR=1.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=28;TCR=43;TR=71;WE=16842060;WS=16842042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	16855265	rs812847	A	G	3007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=40;PP=2218;SC=CCCCTGTCTGATTCCCTCGCG;SOR=1.014;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=55;TCR=40;TR=95;WE=16855273;WS=16855255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr19	16860105	rs706764	G	A	2923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=69;PP=2468;SC=CTGCCTGGACGCTGATGCCCA;SOR=2.967;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=15;TCR=69;TR=84;WE=16860113;WS=16860095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr19	16860833	.	G	A	3020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=67;PP=2580;SC=ACTGCCCCCCGAGGGTGCACC;SOR=2.128;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=25;TCR=67;TR=92;WE=16860841;WS=16860823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr19	16860882	rs61746179	G	A	2474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.615;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.791;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=46;PP=2108;ReadPosRankSum=1.489;SC=GGGGGTTTTGGACACCTTGCA;SOR=0.824;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=79;TCF=33;TCR=46;TR=78;WE=16860890;WS=16860872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,78:0.99:79
chr19	16872940	rs773852	G	A	3250.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=81;PP=2729;SC=CACTGAACTTGGACCGAAAGG;SOR=2.857;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=18;TCR=81;TR=99;WE=16872948;WS=16872930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr19	16876099	rs4808526	T	C	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=21;PP=676;SC=TTTTCATCAATTCTCATACCT;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=16876107;WS=16876089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	16899838	rs2608737	A	T	151.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=156;SC=ACCCTCGCCAACTCTGCTTCA;SOR=2.303;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=16899846;WS=16899828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	16905474	rs2431802	G	T	103.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=4;PP=77;SC=GGTTAGCAACGTTTTCTGCCA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=16905482;WS=16905464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	16923494	rs773894	C	G	1687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.44;SOR=4.450;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	16957638	rs2241377	A	C	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=2;PP=356;SC=AAGATCCACAAGTGTGCAGAC;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=16957646;WS=16957628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	16976117	rs10625481	A	AC	128.50	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.534;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=9.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.51;MQRankSum=0.489;QD=16.06;ReadPosRankSum=0.157;SOR=4.163;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr19	16976286	rs773911	A	G	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=18;PP=818;SC=AGAAGAAGCTATCTCGGATGG;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=16;TCR=18;TR=34;WE=16976294;WS=16976276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	16988456	rs2303090	A	G	1628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=35;PP=1183;SC=CAGAGGTAAGAGGCCCTGAGA;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=51;WE=16988464;WS=16988446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	16988476	rs2258663	T	C	1135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=32;PP=789;SC=ATGCATGCTCTGTTCCTTCCT;SOR=2.780;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=8;TCR=32;TR=40;WE=16988484;WS=16988466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	17011950	rs77345177	A	AC	3273.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=30;PP=2928;SC=AGCCAGCCTGACCTGGGTGCC;SOR=1.371;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=39;TCR=30;TR=69;WE=17011958;WS=17011940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr19	17032550	rs3745331	A	G	1432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.42;SOR=5.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	17032559	rs3745332	T	C	1550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.08;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	17088299	rs1824152	T	C	1892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=27;PP=1378;SC=CACGGCCAGATGAAGAGAGGT;SOR=1.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=38;TCR=27;TR=65;WE=17088307;WS=17088289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	17088458	rs12975235	G	A	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=417;SC=TCCTGTCTACGCATTGAGACA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=17088466;WS=17088448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	17091368	rs8103646	T	G	1351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=6;PP=1126;SC=CCCGCTTGCTTCGCTGCTGGG;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=40;WE=17091376;WS=17091358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	17091533	rs8100517	C	T	2160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=42;PP=1682;ReadPosRankSum=0.534;SC=CTCTGCCTCGCACCAATGTTG;SOR=0.992;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=30;TCR=43;TR=71;WE=17091541;WS=17091523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,74:0.97:76
chr19	17100552	rs1973093	A	G	4008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=47;PP=2965;SC=GAGCCCCCACAGGCTTCCCGT;SOR=1.559;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=91;TCR=47;TR=137;WE=17100560;WS=17100542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr19	17108053	rs12974937	C	T	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=32.47;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	17108283	rs12982311	A	G	151.98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5436;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=115;ReadPosRankSum=-0.792;SC=GGCATACCCAATCTATGCCAC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=17108291;WS=17108273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr19	17111297	rs4808551	A	G	1394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=12;PP=925;SC=CATGTTGATCATTAAGGCACC;SOR=2.393;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=48;WE=17111305;WS=17111287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	17111411	rs4808064	A	G	2318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=49;PP=1752;SC=GGCCAGGTTGACATAGTGTGG;SOR=2.239;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=16;TCR=49;TR=65;WE=17111419;WS=17111401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	17112874	rs3745342	C	T	542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.75;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	17112881	rs3745343	T	A	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.22;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	17112921	rs3745344	C	T	563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=6;PP=458;SC=AGGGGAGGGGCACACCCCAGG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=19;WE=17112929;WS=17112911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	17113001	rs12972329	C	A	1272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=16;PP=996;SC=AGGGGAACGACCTTGAGGGAG;SOR=1.151;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=38;WE=17113009;WS=17112991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	17113147	rs3745345	A	G	2670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.625;NF=38;NR=47;PP=2027;ReadPosRankSum=-0.985;SC=TCAGAAGCTCAAACTTGGGCA;SOR=0.959;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=39;TCR=49;TR=85;WE=17113155;WS=17113137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,91:0.98:93
chr19	17119560	rs897768	T	C	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=25;PP=690;SC=CAGAAGGGGATGGGCTGGGCC;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=17119568;WS=17119550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	17122463	rs56266450	G	A	1445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=1.810;NF=5;NR=39;PP=1127;ReadPosRankSum=0.312;SC=CGCCCCGGCCGTCCACGGTCA;SOR=2.628;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=44;WE=17122471;WS=17122453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr19	17122630	rs35560062	G	A	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=29;PP=1104;SC=AGATACTGGGGAAGGAGTTTG;SOR=1.508;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=45;WE=17122638;WS=17122620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	17137290	rs11878608	A	C	1510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=15;PP=1186;SC=TCGCTGCAACACTCTGAGCCA;SOR=1.426;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=31;TCR=15;TR=46;WE=17137298;WS=17137280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	17166981	rs2278997	G	A	586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=436;SC=TCCCAAGAGAGCCAAGTGGAT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=17166989;WS=17166971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	17169758	rs2305757	G	C	1918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=45;PP=1464;SC=CCAGCAGGGGGAGAACTCTGG;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=13;TCR=45;TR=58;WE=17169766;WS=17169748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr19	17170540	rs1551552	GG	AT	1537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=1643;SC=TTCTAATGATGGGTTTATTGG;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=28;WE=17170549;WS=17170530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	17170885	rs1130222	C	T	3213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=28;PP=2584;SC=TCACCCTTTCCGACCCCACTG;SOR=1.808;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=67;TCR=28;TR=95;WE=17170893;WS=17170875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr19	17173487	rs3816550	A	G	2215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=33;PP=1792;SC=TCACTGCCCGAGGACCATGGC;SOR=0.874;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=71;TCF=37;TCR=34;TR=70;WE=17173495;WS=17173477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	17179789	rs2305754	G	A	1100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=8;PP=850;SC=AATTCCAGTTGCTCAGAACCT;SOR=2.432;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=36;WE=17179797;WS=17179779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	17186127	rs2305752	A	C	6999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.30;SOR=2.019;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr19	17186136	rs2305751	C	A	7267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.52;SOR=1.849;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr19	17273893	rs7256689	G	T	1447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=15;PP=1130;SC=ATGAGCAGCTGCAGTATTACT;SOR=1.364;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=41;WE=17273901;WS=17273883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	17283383	rs11463235	A	AG	924.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=14;PP=1080;SC=GCGAGGTTCCAGGTGCTCAGA;SOR=0.765;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=26;WE=17283391;WS=17283373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	17298679	rs7249926	G	C	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=8;NR=3;PP=199;SC=GCCTGAGCCAGCAACAGACTT;SOR=1.802;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=17298687;WS=17298669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	17298724	rs9305088	G	C	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=6;PP=406;SC=CCTGCCTGATGTCTCGCATTC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=19;WE=17298732;WS=17298714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	17298893	rs3826689	G	T	1866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=30;PP=1446;SC=CACCTGTTCCGTGGCAAAGGC;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=27;TCR=30;TR=57;WE=17298901;WS=17298883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	17298946	rs3826690	T	C	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=30;PP=1032;SC=GAGTGTAAACTCAGCAGGTTG;SOR=2.147;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=39;WE=17298954;WS=17298936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	17299009	rs3826691	A	G	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=432;SC=AGGCTGAGGCAGGCGGATCAC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=17299017;WS=17298999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	17301706	rs62126162	G	A	568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.03;QD=40.63;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	17301733	rs34092109	T	C	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.158;NF=19;NR=1;PP=556;ReadPosRankSum=-0.316;SC=GGAGTACAGGTGTGAGCCACC;SOR=3.352;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=20;WE=17301741;WS=17301723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr19	17301863	rs962919	G	A	3251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.136;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=46;PP=2472;ReadPosRankSum=-0.682;SC=TCGCTGGCCAGAACACTCACC;SOR=0.346;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=99;TCF=52;TCR=47;TR=98;WE=17301871;WS=17301853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,104:0.99:105
chr19	17301880	rs4808072	T	C	3550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=51;PP=2835;SC=CACCTAGATTTTCCTTTCTCC;SOR=0.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=52;TCR=51;TR=103;WE=17301888;WS=17301870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	17302056	rs962918	A	G	598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=476;SC=TCGGGGCACTACAAACCCACA;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=17302064;WS=17302046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	17302112	rs10541498	ACT	A	397.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=401;SC=CCCCAGGGCCACTCTCTGAAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=17302121;WS=17302102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	17303460	rs4808594	A	G	283.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=233;SC=ACACCAGCCTAGGTCTCACTC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=17303468;WS=17303450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	17303774	rs1545620	T	G	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=9;PP=817;SC=CCTCCAGGCCTCATGGAGGGG;SOR=1.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=17303782;WS=17303764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	17305440	rs1064305	T	C	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=13;PP=1025;SC=CAAGAGCAGGTGCTGAGGAGG;SOR=1.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=29;TCR=13;TR=42;WE=17305448;WS=17305430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	17306031	rs2279003	T	C	4015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=64;PP=2965;SC=CACCGGCCCCTGGCAGCGCCC;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=65;TCR=64;TR=129;WE=17306039;WS=17306021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr19	17306265	rs142693688	C	T	2027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=42;PP=1552;ReadPosRankSum=-0.832;SC=CCACAGGGGCCGCCCTCACGC;SOR=0.650;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=63;TCF=20;TCR=43;TR=62;WE=17306273;WS=17306255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr19	17312679	rs138701398	G	A	1833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=2;PP=1346;SC=GCACCTCCTCGGGTACGCAGG;SOR=4.029;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=50;TCF=48;TCR=2;TR=50;WE=17312687;WS=17312669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	17313094	rs16981678	C	T	2127.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=50;PP=1603;SC=ACACCAAGAACGACTTCGAGC;SOR=2.206;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=17;TCR=50;TR=67;WE=17313102;WS=17313084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	17313613	rs149650225	G	A	2019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=5;PP=1766;SC=CTCTTCCCAGGGGGGCCCCCG;SOR=4.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=58;TCR=5;TR=63;WE=17313621;WS=17313603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr19	17315973	.	A	AAG	280.06	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.090;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=63.18;MQRankSum=2.032;QD=23.34;ReadPosRankSum=1.401;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr19	17316253	rs2305763	T	C	1557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=5;NR=39;PP=1251;SC=GAGCAGCCAGTAGGGGGCGGC;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=44;WE=17316261;WS=17316243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	17316782	rs7248508	T	C	2022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=22;PP=1605;SC=GAGCCAGGCGTTGAGCCTGGC;SOR=1.437;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=42;TCR=22;TR=64;WE=17316790;WS=17316772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	17317955	rs8110964	A	G	1431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=9;PP=1126;SC=ACCGCATGTCACCTGGGGCGC;SOR=2.746;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=41;TCR=9;TR=50;WE=17317963;WS=17317945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	17321487	rs12982797	A	G	254.53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=222;ReadPosRankSum=-0.775;SC=TCGCCCACTCAGAGATGTCAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=17321495;WS=17321477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr19	17321669	rs12463169	A	G	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=18;PP=720;SC=CAAGTGGCTCAGTCCCCTCCC;SOR=0.957;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=33;TCF=15;TCR=18;TR=32;WE=17321677;WS=17321659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	17322742	rs190936398	A	G	966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=25;PP=808;SC=CGGCGCGCCCACCCCGAGCCC;SOR=2.765;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=31;WE=17322750;WS=17322732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	17330060	rs414528	T	C	2587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=62;PP=2094;SC=GAGAAGCAGTTGGCAGCTGAG;SOR=1.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=30;TCR=62;TR=92;WE=17330068;WS=17330050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr19	17330212	rs59959709	G	A	691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=18;PP=524;SC=GGGACTGGGGGAGCTCTCCAG;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=17330220;WS=17330202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	17339193	rs144117913	C	CT	455.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=345;SC=TGCCCAGTTTCTTTTTTTTTT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=16;WE=17339201;WS=17339183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	17361064	rs10415471	C	T	1147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=8;PP=951;SC=GCTGGGGAGGCGGGAGGGGAG;SOR=2.726;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=41;WE=17361072;WS=17361054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	17362526	rs10469471	A	G	1152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=30;PP=971;SC=GTTGCGAAGGAGAAGAGAGGG;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=17362534;WS=17362516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	17362941	rs7247493	A	C	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=241;SC=TCAGAGACCCACATCTGGTTC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=17362949;WS=17362931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	17366110	rs35026554	CA	C	1223.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.61;QD=23.99;SOR=3.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	17366278	rs4430871	T	C	2647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=57;PP=1929;SC=CCTGGAGCTCTGCCCGTTCCC;SOR=1.305;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=34;TCR=57;TR=91;WE=17366286;WS=17366268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr19	17367585	rs4464206	G	C	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=345;SC=GGTGGGTTAAGTTCATGCCAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=17367593;WS=17367575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	17379558	rs10424178	C	T	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=1;PP=431;SC=GTTTTTAAAACTCCAAGGGGA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=17379566;WS=17379548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	17382505	rs10420922	A	T	1658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=44;PP=1282;SC=CAGCCATGGCAGGGAGGGTCC;SOR=3.342;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=9;TCR=44;TR=53;WE=17382513;WS=17382495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	17384651	rs113272353	C	T	1694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=6;PP=1481;SC=GAATTACAGGCGTGAGCCACT;SOR=3.872;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=49;TCR=6;TR=54;WE=17384659;WS=17384641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	17387176	rs34084277	A	G	2410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=21;PP=1932;SC=CCTCACAGGCAGCAGTGAACT;SOR=2.112;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=61;TCR=21;TR=82;WE=17387184;WS=17387166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	17387254	rs61634114	G	A	4035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=42;PP=2965;SC=TGATAAGAGGGGCAGACCCCC;SOR=1.628;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=84;TCR=42;TR=126;WE=17387262;WS=17387244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr19	17389648	rs10406920	C	T	1009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.771;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=699;ReadPosRankSum=0.625;SC=CCCGCCTCCCCGGCAGGATAT;SOR=1.524;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=32;WE=17389656;WS=17389638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr19	17389704	rs8170	G	A	1272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=15;PP=1004;SC=CCAGCTACAAGTATGAGGTGG;SOR=1.151;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=24;TCR=15;TR=39;WE=17389712;WS=17389694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	17392483	rs7246262	C	G	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=3;PP=318;SC=TCCTCCCACCCGGGCTCTTAT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=17392491;WS=17392473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	17393015	rs1864116	C	T	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=61.53;NF=0;NR=14;PP=371;SC=GACCCCAACGCTCGGTAAGAT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=17393023;WS=17393005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	17393449	rs73509996	T	G	524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=412;SC=TGACCCCTCTTGCGCTGCCGC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=17393457;WS=17393439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	17393504	rs1864113	G	C	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=3;PP=526;SC=TGGCCGCCGCGTGGGGCTGCC;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=17393512;WS=17393494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	17393925	rs56069439	C	A	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=15;PP=656;ReadPosRankSum=-0.634;SC=CTATTTGTGGCCAGCTCTTTC;SOR=0.356;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=26;WE=17393933;WS=17393915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,28:0.97:29
chr19	17394504	rs891017	A	C	5438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=72;NR=92;PP=2965;SC=ACGGACACCAACCCCTGGAGC;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=73;TCR=92;TR=164;WE=17394512;WS=17394494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr19	17394839	rs66753001	A	G	5717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.354;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=88;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.920;SC=CCCAGCTCTCAGCCCCACTTT;SOR=0.490;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=197;TCF=107;TCR=90;TR=195;WE=17394847;WS=17394829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,196:0.99:197
chr19	17395003	rs11086065	A	G	2455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=63;PP=2048;SC=CAGTTTGAGCAGCCAGATCCT;SOR=2.985;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=14;TCR=63;TR=77;WE=17395011;WS=17394993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr19	17395055	rs11882562	C	G	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=36;PP=1139;ReadPosRankSum=0.911;SC=CTAGCTTCACCTATCTGCTGC;SOR=2.124;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=43;WE=17395063;WS=17395045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr19	17395182	rs4808614	G	T	238.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=8;PP=274;SC=ATCATCAGCTGCTTCTTCTTC;SOR=1.863;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=17395200;WS=17395172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	17395192	rs60208686	CT	C	68	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=4;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=3;PP=66;SC=GCTTCTTCTTCTTTTTTTTTA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=4;WE=17395200;WS=17395172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	17395213	rs146612163	A	G	109.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=50;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=3;PP=83;SC=TTTTTTTAAGACGGAGTTTCA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=17395221;WS=17395203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	17396549	rs751599	T	C	2453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=53;PP=1766;SC=GTGGTTGCGGTGTTGTGTCCC;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=23;TCR=53;TR=76;WE=17396557;WS=17396539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	17396761	rs891018	T	C	197.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=153;SC=AACCTGCACATGCATGTATTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=17396769;WS=17396751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	17397244	rs10425939	C	T	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=10;PP=806;SC=TGGTGGCAGGCTGGCCACCTG;SOR=1.542;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=33;WE=17397252;WS=17397234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	17397483	rs367668712	G	T	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.78;MQRankSum=0.732;QD=5.35;ReadPosRankSum=-0.703;SOR=2.783;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr19	17397487	.	GTGTGTGTGTGTGTT	G	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.611;ClippingRankSum=-0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=8.451;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.83;MQRankSum=0.732;QD=4.34;ReadPosRankSum=-0.135;SOR=2.783;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr19	17397700	rs10401700	A	C	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=416;SC=GGGCAACTCCACCTGGAATAG;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=17397708;WS=17397690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	17411871	rs138354638	G	A	5750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=85;PP=2965;SC=CCAGGGAACCGCCGACACCAT;SOR=0.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=182;TCF=97;TCR=85;TR=181;WE=17411879;WS=17411861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr19	17412507	rs141225960	G	A	226.28	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.8387;FS=9.542;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=208;ReadPosRankSum=0.765;SC=GGCACTCCCTGAGCCTTGGGA;SOR=4.398;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=8;WE=17412515;WS=17412497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr19	17416590	rs3217329	CT	C	2054.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=26;PP=2014;SC=CCAACGGCCTCTTTTTTGCAC;SOR=1.340;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=70;TCF=42;TCR=28;TR=63;WE=17416598;WS=17416580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	17424932	rs2288463	A	G	1083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=21;PP=828;SC=TGTTCCTGGGACTGGGAGGAA;SOR=1.040;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=37;WE=17424940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	17424947	rs12327712	T	G	1139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=18;PP=893;SC=GAGGAATTGGTCACTTCCAGG;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=17;TCR=18;TR=35;WE=17424955;WS=17424937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	17430549	rs147250555	C	T	1668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=48;PP=1355;SC=GCACCCCGCCCGCCCGCCTCC;SOR=4.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=5;TCR=48;TR=53;WE=17430557;WS=17430539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	17435884	rs755123	T	C	3615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=63;PP=2865;SC=ATGTGGCCCCTGACGAGAGGA;SOR=0.853;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=57;TCR=63;TR=119;WE=17435892;WS=17435874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr19	17438642	rs8102944	A	G	3606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=66;PP=2908;SC=AGAAGAGCACAACGTAGCCGA;SOR=1.140;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=45;TCR=66;TR=111;WE=17438650;WS=17438632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr19	17440542	rs8110408	C	G	2244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=17;PP=1798;SC=GCAGGGGGGACTGCCGCTGGG;SOR=2.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=53;TCR=17;TR=70;WE=17440550;WS=17440532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	17441488	rs1529482	C	T	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=3;PP=502;SC=ACCTCTCCCCCTGGGGAGCAC;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=17441496;WS=17441484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	17445212	.	C	T	227.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=1;PP=164;SC=AAGCACCGTCCCAGCCCCGCC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=17445220;WS=17445202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	17448961	rs1864112	A	C	4933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=101;NR=62;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.776;SC=GAATTCTCACAGCACCCCGAG;SOR=0.499;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=164;TCF=102;TCR=62;TR=163;WE=17448969;WS=17448951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,165:0.99:166
chr19	17450016	rs3810206	T	C	1614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=39;PP=1290;SC=CGCTCAGGGGTGCACGTAGTG;SOR=1.692;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=17;TCR=39;TR=56;WE=17450024;WS=17450006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	17450446	rs4808623	G	A	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=399;ReadPosRankSum=-0.910;SC=GGAACGCGGGGCCCTTTCTCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=16;WE=17450454;WS=17450436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr19	17488141	rs10417806	A	C	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=40;PP=1061;SC=GCTCACCACCAGGCCTGCTCT;SOR=3.209;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=47;WE=17488149;WS=17488131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	17502409	.	C	G	1863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=4;PP=1530;SC=TGCATGGCCTCTGCATGTTGT;SOR=4.654;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=52;TCF=48;TCR=4;TR=52;WE=17502417;WS=17502399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	17514440	rs919265	G	C	400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=292;SC=TCCCCGCCCCGCTTCCCCAGC;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=17514448;WS=17514430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	17514646	rs113321277	T	TGGG	4439.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=60;PP=2924;SC=GCGGTACAGATGGCAAATCAG;SOR=1.469;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=84;TCF=20;TCR=64;TR=78;WE=17514654;WS=17514636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr19	17516400	rs111617488	A	AGCTGAAAG	2981.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=32;PP=2753;SC=TCTCCCCTTTAGAGTCTGGCC;SOR=2.939;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=58;TCF=6;TCR=52;TR=34;WE=17516408;WS=17516390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	17531450	rs2303680	G	A	1580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=38;PP=1236;SC=TCCAGTAAGGGCTGCTTCGGA;SOR=1.938;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=52;WE=17531458;WS=17531440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	17531990	rs10679842	C	CT	221.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.03;MQRankSum=-0.895;QD=15.80;ReadPosRankSum=-1.509;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,12:0.86:14
chr19	17534693	rs2288408	T	C	1957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=24;PP=1620;SC=ATCTTCCTACTTCCCTCTCCC;SOR=1.034;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=35;TCR=24;TR=59;WE=17534701;WS=17534683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	17534898	rs13345062	C	T	1664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=44;PP=1466;SC=TCTCAGGGAGCCTGGGTCTGC;SOR=3.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=8;TCR=44;TR=52;WE=17534906;WS=17534888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	17535546	rs4808636	C	T	1104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=12;PP=970;SC=CCTGAGGGGCCGGCACCCGCC;SOR=1.542;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=23;TCR=12;TR=34;WE=17535554;WS=17535536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	17535658	rs4808637	A	C	2692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=52;NR=31;PP=2111;SC=CTAAGTACCCACTCTGCCATT;SOR=1.375;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=52;TCR=31;TR=83;WE=17535666;WS=17535648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	17535867	rs201974585	CCTCACTGCATCCTGGGGCCACCCCCA	C	921.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=846;SC=GGCCACCCCCCCTCACTGCAT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=13;WE=17535900;WS=17535857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	17544165	rs10415889	C	T	1156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=11;PP=833;SC=AGATCACCTCCGTTTGTAAAG;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=34;WE=17544173;WS=17544155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	17547292	rs4808641	A	G	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=9;PP=315;SC=GTCCTTCCCCATGCTCCCTGG;SOR=1.061;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=15;WE=17547300;WS=17547282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	17566860	.	C	T	4156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=90;PP=2965;SC=TTAGGCAGCGCCTTCTGTGTG;SOR=1.893;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=127;TCF=37;TCR=90;TR=126;WE=17566868;WS=17566850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr19	17622614	rs11086075	C	T	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=15;PP=576;SC=CGCGCTCGGCCTGTCGGGCGG;SOR=1.828;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=21;WE=17622622;WS=17622604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	17628587	rs6743	A	G	4516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=58;PP=2965;SC=TGACCCTCACACTACCTGTCC;SOR=1.207;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=92;TCR=58;TR=150;WE=17628595;WS=17628577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr19	17628737	rs8104468	T	C	1492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=42;PP=1272;SC=CCAGACATTATTGTGCTGAAG;SOR=6.138;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=43;WE=17628745;WS=17628727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	17631720	rs181859054	G	A	2139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=23;PP=1598;SC=CTGGGCCGCAGGCAGGGCCTT;SOR=1.263;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=61;TCF=38;TCR=23;TR=60;WE=17631728;WS=17631710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	17641391	rs59324033	G	A	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=375;SC=CAGCCACATGGATGGAAACAG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=17641399;WS=17641387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	17641667	rs74336438	G	A	1842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=39;PP=1467;ReadPosRankSum=1.455;SC=CTCAGGAGCCGACCGGAAGCC;SOR=0.602;Source=Platypus;TCF=21;TR=60;WE=17641675;WS=17641657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr19	17643065	rs12984143	T	C	2012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=12;PP=1482;SC=GCTCCCTCTTTCTGCAGAAGC;SOR=2.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=42;TCR=12;TR=54;WE=17643073;WS=17643055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	17648350	rs8107859	T	C	251.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=7;PP=208;SC=CTTCAGGGCATAGGTGGGTCT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=17648358;WS=17648340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	17650229	rs114207587	C	A	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=24;PP=868;SC=CTGCGGGGGGCAGGCCGCGCC;SOR=2.235;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=17650237;WS=17650219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	17651370	rs11878663	A	G	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=17;PP=925;SC=AGAGCCCCTCAGGCACGCGGC;SOR=1.378;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=27;TCR=17;TR=44;WE=17651378;WS=17651360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	17654182	rs76814516	G	A	1380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=14;PP=1097;SC=GTCTGACGACGGCCCTCAACT;SOR=1.402;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=39;WE=17654190;WS=17654172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	17662616	rs76629753	G	A	1599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=23;PP=1243;SC=GAGGCTGAGCGGGAAGGAGGG;SOR=0.818;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=25;TCR=23;TR=48;WE=17662624;WS=17662606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	17664418	rs34631213	G	A	2144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=51;PP=1833;SC=CCCACCTTCCGAAATACATTT;SOR=2.694;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=12;TCR=51;TR=63;WE=17664426;WS=17664408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	17671382	rs73525772	G	A	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=24;PP=756;SC=TTTGCAGAAGGGTAAACTGAG;SOR=2.765;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=30;WE=17671390;WS=17671372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	17679597	rs3848645	A	G	1209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=34;PP=976;SC=CCAGTTCAGAACACACTGAAG;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=36;WE=17679605;WS=17679587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	17691938	rs73524018	G	C	1594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=5;PP=1439;SC=CAGCTGTCCCGTCCCCTGAAG;SOR=4.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=45;TCR=5;TR=50;WE=17691946;WS=17691928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	17692324	rs8100092	T	G	1891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=50;PP=1590;ReadPosRankSum=-1.057;SC=GGACATCAGGTCCACCTCTGG;SOR=2.049;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=60;TCF=9;TCR=51;TR=59;WE=17692332;WS=17692314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr19	17728502	rs2287851	T	C	2226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=14;PP=1954;SC=GCGGTCTGGGTACCCTTACCC;SOR=2.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=57;TCR=14;TR=71;WE=17728510;WS=17728492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	17728726	rs8113826	C	A	1318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=39;PP=1083;ReadPosRankSum=-0.832;SC=GGCTGGGTAGCCCTGCTGTCC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=41;WE=17728734;WS=17728716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr19	17731716	rs10421645	G	C	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=703;SC=CAGGGGTTTAGAGGTCAGACT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=17731724;WS=17731706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	17734488	rs10419420	A	G	284.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=173;SC=CCAGCCCAGAAGAGGTGGAAG;SOR=1.402;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=17734496;WS=17734478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	17738850	rs56388321	C	T	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=9;PP=257;SC=GGGTCTGGGTCTGGAGGAAGC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=17738858;WS=17738840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	17739976	rs11667290	T	C	208.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=1;PP=169;SC=GTCAGGGCCCTGGGGAGAAGG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=17739984;WS=17739966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	17741047	rs10413821	A	G	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=23;PP=1111;SC=GTTGGGAGAAAACATCCACCA;SOR=0.919;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=20;TCR=23;TR=43;WE=17741055;WS=17741037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	17744075	rs71162163	G	GC	1140.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=28;PP=1196;SC=GTCCTTCCCTGCCCCACAGAG;SOR=3.026;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=30;WE=17744083;WS=17744065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	17746947	rs4239634	A	G	1929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=46;PP=1654;SC=TTCCTCTGGGAGAACTTCCCC;SOR=2.381;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=15;TCR=46;TR=61;WE=17746955;WS=17746937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	17756432	rs77282111	C	T	3992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=107;NR=19;PP=2965;SC=CATGCTCTGGCTGGATCCCTG;SOR=3.120;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=107;TCR=19;TR=126;WE=17756440;WS=17756422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr19	17758390	rs142411173	C	G	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=459;SC=ACTCATCAACCGGGGGGACTC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=17758398;WS=17758380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	17759289	rs73922174	G	C	1077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=2;PP=908;SC=CGTGGCACTTGACACCGCACT;SOR=4.680;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=32;WE=17759297;WS=17759279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	17760561	rs11665951	C	T	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=204;SC=GGTGACCTTACTTGGAAACGG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=17760569;WS=17760551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	17763230	rs112542073	C	T	391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=1;PP=328;SC=CATGAGCCACCGCACCCCGCC;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=17763238;WS=17763220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	17763392	rs1159365	A	G	2001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=27;PP=1484;SC=CCAGCCTTGGACTTGGGGTTC;SOR=1.000;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=35;TCR=28;TR=62;WE=17763400;WS=17763382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	17769166	rs7258943	C	T	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=21;PP=564;SC=CTTACGGTGCCGCTACCGAAG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=17769174;WS=17769156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	17774512	rs12151017	C	T	188.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=160;SC=GAGTACCTTCCCTGAGTATCA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=17774520;WS=17774502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	17777431	rs10424761	A	G	1530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=27;PP=1186;SC=TTCAGCTGATACCCAAGGAAG;SOR=1.067;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=19;TCR=27;TR=46;WE=17777439;WS=17777421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	17777508	rs9305092	C	G	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=23;PP=822;SC=CATCTTGGAACGAATACTGAA;SOR=1.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=33;WE=17777516;WS=17777498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	17778832	rs7248783	A	G	3848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=29;PP=2895;SC=AGGGAAAGACAAGCTTAGAGA;SOR=2.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=132;TCF=103;TCR=29;TR=132;WE=17778840;WS=17778822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr19	17786766	rs112409090	GAGAC	G	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=1;PP=473;SC=GTCTCTCCAAGAGACAGACAG;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=8;WE=17786777;WS=17786756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	17799246	rs140985715	T	TG	748.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=20;NR=3;PP=668;SC=CGCTGCGGGCTGGGGGGGCGT;SOR=4.892;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=23;WE=17799254;WS=17799236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	17830507	.	GGGCGGCGGC	G	458.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.67;QD=41.70;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	17835709	rs8111340	C	T	2454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=73;NR=3;PP=2184;SC=GACCTGGAGACTGCCTTCGTA;SOR=5.811;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=76;TCF=73;TCR=3;TR=76;WE=17835717;WS=17835699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr19	17835831	rs3761055	T	G	5188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=91;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.798;SC=ACAGAACGGGTCCTTTAGTGT;SOR=0.339;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=161;TCF=70;TCR=91;TR=161;WE=17835839;WS=17835821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,166:0.99:167
chr19	17837806	rs7252905	C	A	5817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=91;PP=2965;SC=CGGACCCAGCCGCGGGAGGTG;SOR=0.749;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=179;TCF=88;TCR=91;TR=179;WE=17837814;WS=17837796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr19	17837981	rs7253548	A	G	2632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=56;PP=2110;SC=CCCCCAGTGCAGCCTGCGGCT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=28;TCR=56;TR=84;WE=17837989;WS=17837971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	17844325	rs2287860	T	C	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=484;ReadPosRankSum=1.400;SC=TAAGCTGTGTTCCCCAGGCCA;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=20;WE=17844333;WS=17844315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr19	17881552	rs3746197	C	T	999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=8;PP=763;SC=CTGGGGGAGGCCCCCTGAGTA;SOR=2.165;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=30;WE=17881560;WS=17881542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	17885270	rs2287859	A	G	978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=23;PP=811;SC=AGCGGGAGCCAGAGCCACCTG;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=17885278;WS=17885260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	17885308	rs2287858	G	A	844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=505;SC=ACCCCTGCCCGGTCTGGCCCA;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=17885316;WS=17885298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	17885325	rs2287857	A	C	759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=385;SC=CCCAGGCTAGACCGAGATCCC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=17885344;WS=17885315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	17885336	rs2287856	C	T	365.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=225;SC=CCGAGATCCCCTCCCCTGCCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=17885344;WS=17885315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	17886940	rs2287854	G	A	2269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=36;PP=1940;SC=GGGCCACCGCGGGCAGCCTCA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=34;TCR=36;TR=70;WE=17886948;WS=17886930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	17887024	rs2287853	T	C	2355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=38;PP=1872;SC=GCTGGATGCATTCGTGTGTGA;SOR=0.719;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=37;TCR=38;TR=75;WE=17887032;WS=17887014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	17888787	rs4808690	G	A	110.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=88;SC=AGCGGAGGTTGCAGCAAGCTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=17888795;WS=17888777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	17892193	rs2287852	G	C	2258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=20;PP=1968;SC=TGGGGGTCGCGTCTGGGGTCC;SOR=1.852;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=70;WE=17892201;WS=17892183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	17892478	rs2042299	A	G	763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=11;PP=598;SC=CTATATTCACACTGTCTATCC;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=15;TCR=11;TR=26;WE=17892486;WS=17892468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	17892591	rs2042298	A	G	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=18;PP=850;SC=CAGCCTTCACAGAGTATGTCC;SOR=0.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=19;TCR=18;TR=37;WE=17892599;WS=17892581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	17892796	.	CTTTTTTTTTTTTTTTT	C	769	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=1.0000;HP=20;HapScore=1;MGOF=6;MMLQ=20;MQ=58.31;NF=0;NR=3;PP=769;QD=257.333333333;SC=ATAGGAGGGCCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=17892819;WS=17892786;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,3:0.38:8
chr19	17922795	rs36686	G	A	4261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.929;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=103;PP=2965;ReadPosRankSum=0.852;SC=CCATCGCAACGCCTGTCCTCC;SOR=2.188;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=35;TCR=104;TR=137;WE=17922803;WS=17922785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,140:0.99:141
chr19	17922972	rs45514998	T	G	483.22	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=404;ReadPosRankSum=-1.039;SC=CCTGTTTCCATAGGAAGGGGC;SOR=2.093;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=15;WE=17922980;WS=17922962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,16:0.89:18
chr19	17937429	rs3008	A	G	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=0;PP=562;SC=ATGCAATGTCATGGGGGTGTT;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=25;WE=17937437;WS=17937419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	17937758	rs3212798	C	T	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=596;SC=CGTGCCTGAGCAGTCCAAAGG;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=17937766;WS=17937748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	18047521	rs12151269	C	T	1296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=38;PP=1145;SC=CAGGCGCTGTCGCTCACGCCT;SOR=4.514;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=41;WE=18047529;WS=18047511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	18053340	rs4808105	T	C	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=55;SC=TTGTTCCTGGTATGTCCCCTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=18053348;WS=18053330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	18054643	rs1052564	C	T	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=468;SC=CGCCGGGCCCCGGGGCCATGC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=18054651;WS=18054633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	18104317	.	C	T	2504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=29;PP=1977;SC=GTGTGAAGATCGAGCAAGGGA;SOR=1.252;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=47;TCR=29;TR=76;WE=18104325;WS=18104307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr19	18170265	rs3833286	T	TC	216.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=263;SC=CATCTAGGGTTCCCCCGCAGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=8;WE=18170273;WS=18170255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	18171886	rs383483	A	G	4973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=53;PP=2965;SC=CTTGTCCAGCATGTGCACCCA;SOR=1.583;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=167;TCF=114;TCR=53;TR=167;WE=18171894;WS=18171876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr19	18172043	.	GT	G	445.92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.290;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=0.283;NF=1;NR=22;PP=252;ReadPosRankSum=-1.274;SC=AGGAGCTGAGGTTTTTTTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=54;TCF=3;TCR=51;TR=23;WE=18172051;WS=18172033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,24:0.89:27
chr19	18179115	rs845379	C	T	201.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=162;SC=GGATTACATGCGTGAGTCACT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=18179123;WS=18179105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	18192880	rs17886718	C	T	831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=5;PP=633;SC=ATCACGCATCCGAGAGTAGGG;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=18192888;WS=18192870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	18192938	rs17887070	G	A	1809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=8;PP=1389;SC=TGAGGGTTTGGGAATGGTAGA;SOR=3.139;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=42;TCR=8;TR=50;WE=18192946;WS=18192928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	18232778	rs273483	A	G	1404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=34;PP=1097;SC=ACCACGGGCAAGGGTTGGGCA;SOR=2.409;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=43;WE=18232786;WS=18232768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	18278023	rs10413655	C	T	2485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=31;PP=1951;ReadPosRankSum=-1.136;SC=CAGCTGCGGGCCCAGGCCTCG;SOR=0.342;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=78;TCF=47;TCR=31;TR=77;WE=18278031;WS=18278013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,80:0.99:81
chr19	18284651	rs2241089	G	T	1562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=2;PP=1348;SC=CCCCTGCTGCGATGACCCTGT;SOR=5.376;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=44;WE=18284659;WS=18284641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	18285751	rs2241090	G	C	695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=559;SC=GATGAATTGCGTATCACAGCC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=18285759;WS=18285741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	18286546	rs200373	T	A	705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=13;PP=491;SC=GAGGGGGACATGGGTGGTAAC;SOR=1.051;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=22;WE=18286554;WS=18286536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	18288069	rs7125	A	G	2927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=48;PP=2111;SC=TCCAGCCACCACACGAGTATG;SOR=0.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=45;TCR=48;TR=93;WE=18288077;WS=18288059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr19	18305578	rs16982263	G	C	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=3;PP=393;SC=TTCTTGGTTTGCTTCCCAGGC;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=18305586;WS=18305568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	18305824	rs2271881	C	T	3602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=47;PP=2784;SC=TCGTGCCCCCCCAATTTCGAG;SOR=1.040;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=114;TCF=67;TCR=47;TR=114;WE=18305832;WS=18305814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr19	18307224	rs11552160	A	C	2413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=66;PP=1857;SC=ACCAATCCAGAGCTCCCTCAG;SOR=3.312;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=13;TCR=66;TR=79;WE=18307232;WS=18307214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr19	18309365	rs2271882	A	G	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=235;SC=TCTGCATGGCAAACTCCTACA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=18309373;WS=18309355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	18344273	rs35421958	AC	A	1420.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=16;NR=28;PP=663;SC=GGCTGAAGAGACCCCCCCCCA;SOR=0.853;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=19;TCR=34;TR=44;WE=18344281;WS=18344262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	18358783	rs4808122	A	G	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=2;PP=362;SC=ACACCTGTCCAGGTTCAGCAG;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=18358791;WS=18358773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	18359037	rs57884093	G	A	1726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.58;SOR=1.938;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	18368796	rs148731495	C	T	2835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=38;PP=2259;SC=ATTGGCTCCCCGGACCGCCTG;SOR=1.130;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=53;TCR=38;TR=91;WE=18368804;WS=18368786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr19	18375608	rs8102923	G	A	4888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=80;NR=60;PP=2965;SC=CCTTGGACAGGGCCTGGTTCA;SOR=1.017;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=141;TCF=81;TCR=60;TR=140;WE=18375616;WS=18375598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr19	18375815	rs8103177	G	A	4896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=99;PP=2965;SC=AGGACTCAACGTTGCATGTGG;SOR=1.640;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=49;TCR=99;TR=148;WE=18375823;WS=18375805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr19	18375846	rs2277921	G	A	4372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=88;PP=2965;SC=GGGTGCCATCGGCGGCACCAG;SOR=1.508;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=47;TCR=88;TR=135;WE=18375854;WS=18375836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr19	18375882	rs12608777	G	C	3034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=57;PP=2390;SC=ACAGGCTGCCGGGCATGGTCC;SOR=0.994;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=45;TCR=58;TR=102;WE=18375890;WS=18375872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr19	18376407	rs8110972	T	A	2564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=43;NR=35;PP=2106;SC=TACAGGCACATACACGTGAGG;SOR=0.876;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=43;TCR=35;TR=78;WE=18376415;WS=18376397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	18376517	rs61740752	C	T	3553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.42;SOR=0.908;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	18376522	rs2277922	T	G	3595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.95;SOR=0.850;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	18377274	rs3746186	A	G	2805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=48;PP=2221;ReadPosRankSum=0.725;SC=GGTGGTGGTCATCGTGGACGC;SOR=0.756;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=95;TCF=46;TCR=49;TR=93;WE=18377282;WS=18377264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,97:0.98:99
chr19	18377496	rs8104533	C	G	7562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=123;PP=2965;SC=GGTCCGGGCACTTACACGTTT;SOR=0.864;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=233;TCF=109;TCR=124;TR=231;WE=18377504;WS=18377486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr19	18377647	rs8103906	G	C	2855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=35;NR=52;PP=2350;SC=AGGAAGGCCAGCCCCCGGACT;SOR=1.230;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=36;TCR=53;TR=87;WE=18377655;WS=18377637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	18377761	rs12609001	A	G	2589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.171;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=34;PP=2072;ReadPosRankSum=-1.064;SC=AGATTGTCACAGGAAGGGAAC;SOR=0.996;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=92;TCF=56;TCR=36;TR=90;WE=18377769;WS=18377751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,92:0.98:94
chr19	18378219	rs1469023	A	G	3412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=59;PP=2648;SC=CATTTTGTCCAGGAGACTGGG;SOR=0.862;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=50;TCR=59;TR=109;WE=18378227;WS=18378209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr19	18391171	rs7249	C	T	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=176;SC=GCACCCTCTCCAAGTCCGGGG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=18391179;WS=18391161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	18391207	.	C	G	252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=1;PP=160;SC=CCCGCGAGCCCGCCCCTTGGG;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=18391215;WS=18391197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	18391260	rs371094475	G	C	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=6;PP=590;SC=CTCAGTACGCGGGCACCTGGT;SOR=2.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=18391268;WS=18391250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	18392873	rs7247222	C	A	972.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=4;PP=840;SC=TCCCGCATGGCTAAATAACTC;SOR=3.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=31;WE=18392881;WS=18392863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	18418286	rs2232974	C	G	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=1;PP=454;SC=ACTGTTTGCCCGCCTGTCTGC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=18418294;WS=18418276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	18423402	rs2232968	T	C	2593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=24;PP=1957;SC=CGTTGGTGGGTGCAGCACCCA;SOR=2.049;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=86;TCF=62;TCR=24;TR=85;WE=18423410;WS=18423392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr19	18426950	rs2232965	T	C	940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=24;PP=624;ReadPosRankSum=-1.173;SC=GTCCCACCCATGACTCATAGA;SOR=1.230;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=32;WE=18426958;WS=18426940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr19	18451381	rs7251555	A	T	215.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=2;PP=214;SC=ACCGGGGGCGAGGCCGGGGGC;SOR=2.093;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=18451389;WS=18451371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	18453629	rs66732430	G	A	1130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=9;PP=911;SC=ACTGGGAAGGGCCACTCTTGG;SOR=2.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=36;WE=18453637;WS=18453619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	18497024	rs1059519	G	C	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=2;PP=678;SC=ACTCAGGACGGTGAATGGCTC;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=18497032;WS=18497014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	18499780	rs1227733	A	G	1202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=26;PP=894;SC=ACCTGCGCGGAGGACGCGACC;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=35;WE=18499788;WS=18499770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	18502728	rs6512264	C	A	241.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=168;SC=GCCATGGAGGCGTTAGGACGC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=18502736;WS=18502718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	18502835	rs6512265	G	A	1327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=11;PP=1145;SC=TCATCCATTGGGGCCTGGCCC;SOR=1.775;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=40;WE=18502843;WS=18502825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	18502971	rs112850161	G	C	1931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=41;PP=1416;ReadPosRankSum=-0.734;SC=AAGTGTGGGAGGGGGAGGACT;SOR=0.463;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=66;WE=18502979;WS=18502961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,69:0.99:70
chr19	18503019	rs7254789	T	C	1237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=34;PP=928;ReadPosRankSum=0.452;SC=AAGTCCAGAGTGGGCCAGGTG;SOR=1.487;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=43;TCF=8;TCR=35;TR=42;WE=18503027;WS=18503009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
chr19	18503093	rs6512266	T	G	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=589;SC=CCTGAGATCATGAGTTCAAGA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=18503101;WS=18503083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	18538742	rs10405636	A	C	3474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=62;PP=2356;SC=GGCGCCTGACAGAAGAGAGGC;SOR=0.882;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=55;TCR=62;TR=117;WE=18538750;WS=18538732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr19	18541579	rs11395316	G	GA	1633.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=13;PP=1194;SC=CTGCAGAGAGGGGGGGCACAC;SOR=1.666;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=36;WE=18541587;WS=18541569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	18541785	rs35742476	C	T	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=35;PP=1065;SC=TCTGGCTGAACATGCGTTTGA;SOR=3.109;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=42;WE=18541793;WS=18541775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	18542000	rs146733624	GGTCCTGGTGACCACTGGTGCCTGA	G	818.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=3;PP=1792;SC=TAGCCACAGTGGTCCTGGTGA;SOR=1.292;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=5;WE=18542031;WS=18541990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	18542701	rs10408290	C	T	5694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=74;PP=2965;ReadPosRankSum=1.887;SC=GCCCCTATCCCGCCATCAATC;SOR=1.142;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=180;TCF=104;TCR=76;TR=177;WE=18542709;WS=18542691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,185:0.99:187
chr19	18543054	rs10409003	C	T	1677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=34;PP=1260;SC=TAGGAGTGTGCAGTTCGCAGG;SOR=1.453;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=21;TCR=34;TR=55;WE=18543062;WS=18543044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	18544284	rs151008041	GGGCGGGGGCGCGTC	G	1039.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=3;PP=2974;SC=GGGCTGTGCGGGGCGGGGGCG;SOR=1.802;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=13;WE=18544305;WS=18544274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	18544467	rs2288428	T	C	63.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=2;PP=42;SC=CCGGGGGGGGTGGCGGGGAGG;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=3;WE=18544475;WS=18544457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	18544498	rs2544723	A	C	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.38;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	18544501	rs62122438	C	T	264.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=52.96;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	18544505	rs2544724	G	C	264.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.83;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	18544677	rs78783575	G	GC	967.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=14;PP=981;SC=GGCCGGAGGGGCTGGCGGGCA;SOR=1.101;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=22;WE=18544685;WS=18544667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	18545786	rs1045631	G	T	2165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=19;PP=1751;SC=TGCAGCCATTGGTGGCAGCGG;SOR=1.716;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=46;TCR=19;TR=65;WE=18545794;WS=18545776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	18546029	rs35926638	AG	A	918.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=10;NR=18;PP=935;SC=TAGCTTAGCCAGGGGGGTATC;SOR=1.536;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=28;WE=18546037;WS=18546019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	18546678	rs2303697	T	C	6714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.201;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.921;SC=ATGGCGCCGATAGGTTCTCCC;SOR=0.378;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=202;TCF=105;TCR=97;TR=201;WE=18546686;WS=18546668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,208:1.00:209
chr19	18547305	rs4595905	T	A	4152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=62;PP=2965;SC=GGTTGGATGGTGAGGGTGTGG;SOR=0.708;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=131;TCF=68;TCR=63;TR=130;WE=18547313;WS=18547295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr19	18548884	rs2303696	T	C	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=18;PP=388;SC=AGGCCGTCCCTGCCCCGAACC;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=18548892;WS=18548874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	18557657	rs2303692	C	T	3877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=81;PP=2965;SC=CCTGAGTCTGCGCCCATGGCA;SOR=1.769;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=35;TCR=81;TR=116;WE=18557665;WS=18557647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr19	18576484	rs2278238	T	C	1916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=29;PP=1402;SC=GCCTGGAAAATGGACTCTGTC;SOR=0.854;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=62;TCF=32;TCR=30;TR=61;WE=18576492;WS=18576474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	18650278	rs7247733	T	C	1623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=23;PP=1252;SC=GCCTGGGGTGTGTGGGGATAG;SOR=0.931;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=28;TCR=23;TR=51;WE=18650286;WS=18650268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	18650331	rs116035960	G	A	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=31;NR=17;PP=1055;SC=CACGCCCCTCGCCCCTGCCCT;SOR=1.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=48;WE=18650339;WS=18650321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	18652521	rs11574806	G	A	3685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=53;PP=2856;SC=TGGGGCCGGGGCTGGGGCGGG;SOR=0.856;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=115;TCF=62;TCR=53;TR=115;WE=18652529;WS=18652511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr19	18675854	rs10692700	G	GGGC	3502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;MQRankSum=0.260;NF=5;NR=60;PP=2972;ReadPosRankSum=-1.269;SC=TGCCACCCCAGCCCAGCTGAC;SOR=2.110;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=71;TCF=5;TCR=66;TR=65;WE=18675862;WS=18675843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,81:0.99:82
chr19	18679351	rs11086117	C	T	3210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=73;PP=2603;SC=CCCTGAGCCCCGGCTTCGAGG;SOR=2.063;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=27;TCR=73;TR=100;WE=18679359;WS=18679341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr19	18685964	rs6554	G	T	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=30;PP=929;SC=CAAATAAGGTGGTTCTTTCCT;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=18685972;WS=18685954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	18699489	rs10415257	T	C	44.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=2;PP=27;SC=GCGGTCTTGGTTCCCCTTTCT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=18699497;WS=18699479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	18699990	rs2074174	T	C	3030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=82;NR=17;PP=2448;SC=GGTCCTTGTGTGGCTGCAGAG;SOR=2.857;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=83;TCR=17;TR=99;WE=18699998;WS=18699980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr19	18700047	rs2074175	A	G	5958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=132;NR=52;PP=2965;SC=ACCTTCACGAAAAAGGCCCCA;SOR=1.868;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=132;TCR=52;TR=184;WE=18700055;WS=18700037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr19	18703077	rs3170474	T	C	493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=15;PP=338;SC=TGGCTGGGGTTGCGCCCCACT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=18703085;WS=18703067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	18704528	rs7256319	C	T	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=30;PP=832;SC=TGCCCCTCTCCGGGCCTTGGC;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=18704536;WS=18704518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	18707878	rs7247346	A	C	1706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=49;PP=1504;SC=CAGAGGAGGGACCCTCTCAGC;SOR=5.097;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=52;WE=18707886;WS=18707868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	18709662	rs114059820	C	T	1964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=43;PP=1623;SC=AGGTCAAGTCCTTCATGTTCT;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=61;WE=18709670;WS=18709652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	18709761	rs28579583	G	A	1050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.03;SOR=5.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	18709768	rs8108207	G	A	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.89;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	18728254	rs34863656	G	A	5398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=99;PP=2965;SC=TCCGTGTTCCGCCTCCCAGCG;SOR=0.962;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=78;TCR=101;TR=177;WE=18728262;WS=18728244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr19	18775077	rs1076235	C	T	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=11;PP=1415;SC=GCAGCACGGCCGACAAGAACG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=39;TCR=11;TR=50;WE=18775085;WS=18775067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	18778445	rs10421503	C	G	1289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.270;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=9;PP=1064;ReadPosRankSum=-0.982;SC=CAGCCACTGCCAGCCACACGT;SOR=2.996;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=47;WE=18778453;WS=18778435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr19	18857950	rs201266874	G	C	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=49.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=-1.336;QD=3.99;ReadPosRankSum=-3.613;SOR=4.605;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr19	18879472	.	C	T	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=4;PP=567;SC=CCCTGGTGGCCCCCTGTTGCC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=18879480;WS=18879462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	18895218	rs12327738	G	A	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=21;PP=715;SC=GTGGGCCACCGGAGCCCCCCT;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=27;WE=18895226;WS=18895208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	18897526	rs5827423	A	AG	1404.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=30;PP=1521;SC=CATTAGGATGAGCCAGCCTGA;SOR=2.891;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=34;WE=18897534;WS=18897516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	18942888	rs4808161	C	G	737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=20;NR=6;PP=695;SC=CGCCGGGGCGCGCGGTTTGGT;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=18942896;WS=18942878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	18956699	rs59045002	G	A	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=0;PP=884;SC=ATGAGGCCAGGGTGTCACACC;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=31;WE=18956707;WS=18956689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	18957048	rs140841383	G	A	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=53;PP=1586;SC=TCTGGGTGGCGGTGTCCTCGG;SOR=8.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=0;TCR=53;TR=53;WE=18957056;WS=18957038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	18971322	rs757115	T	C	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=453;SC=ATTCTACTTATTTTTAACATG;SOR=4.615;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=18971330;WS=18971312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	18979324	rs11673194	A	C	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=304;SC=CCTCCCCACCACCCAGGCAAG;SOR=4.977;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=18979332;WS=18979314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	18980172	rs4808863	G	A	132.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=4;PP=102;SC=CGCGGCCGAGGCAGGCTCCGA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=18980180;WS=18980162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	18980213	rs4808864	A	G	78.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	18989885	rs199624421	G	T	2715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=72;PP=2165;SC=TGAGAAGAAAGCCCCCACGCC;SOR=2.597;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=20;TCR=72;TR=92;WE=18989893;WS=18989875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr19	19006648	rs113536478	A	G	63.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;NF=3;NR=2;PP=71;SC=AGAGGCGCGCAGTGGCCGCGG;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=19006656;WS=19006638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	19011244	rs1127821	T	C	1151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=34;PP=949;SC=CCAGCGTCTCTGGGTAGCCAC;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=41;WE=19011252;WS=19011234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	19014248	rs55988241	C	T	2445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=47;PP=2037;SC=GGGAGGGTCCCGCATCATTGC;SOR=1.108;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=32;TCR=47;TR=79;WE=19014256;WS=19014238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr19	19016785	rs73003085	G	A	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=15;NR=29;PP=973;SC=CTAGAGGAGGGCCACGCACCC;SOR=1.559;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=19016793;WS=19016775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	19017862	rs10330	G	A	1633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=20;PP=1266;SC=CAGGAAGGTGGTGTTGGTCAC;SOR=0.900;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=26;TCR=20;TR=46;WE=19017870;WS=19017852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	19021970	rs1468461	T	C	3098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=75;PP=2474;SC=AGACAGGAAGTCCCTGCCCCA;SOR=3.540;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=12;TCR=75;TR=87;WE=19021978;WS=19021960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr19	19030689	rs2231993	C	G	2047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=43;PP=1599;SC=AGGGCCTTCCCCAAGAGGCCT;SOR=1.574;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=20;TCR=43;TR=63;WE=19030697;WS=19030679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	19032637	rs2231997	T	C	2228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=51;PP=1662;SC=CTGCCTCTCATGCTCTGTCCC;SOR=1.522;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=28;TCR=52;TR=79;WE=19032645;WS=19032627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	19033089	rs2158004	G	A	593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=4;PP=466;SC=GCCAAGACCCGGGGCCATGGA;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=20;WE=19033097;WS=19033079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	19033387	rs2106660	G	A	3557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=60;NR=49;PP=2954;SC=ACACTGAGGCGTGGCGGTCTA;SOR=0.907;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=60;TCR=49;TR=109;WE=19033395;WS=19033377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr19	19035159	rs5827425	CT	C	1329.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=3;NR=31;PP=1397;SC=CCTGGGATACCTTCCCCGCCT;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=34;WE=19035167;WS=19035149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	19035370	rs1476505	G	C	2083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=13;PP=1672;SC=ACCCTGTCCCGAGGCCTCACA;SOR=2.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=50;TCR=13;TR=63;WE=19035378;WS=19035360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	19035428	rs61750860	G	T	3141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=39;PP=2243;SC=CCAACCCTGTGCAGAAAGAAC;SOR=1.167;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=56;TCR=39;TR=95;WE=19035436;WS=19035418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr19	19040312	rs1059240	G	C	980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=23;PP=730;SC=GCTCAAACAGGCTGACGTCCA;SOR=1.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=32;WE=19040320;WS=19040302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	19245511	rs3826994	T	G	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=276;SC=AATCAAGGCTTTGCAATTTGT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=19245519;WS=19245501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	19348947	rs12981871	T	C	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=325;SC=GAGGGGTGATTTCGCCCCGCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=19348955;WS=19348937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	19379017	.	CT	C	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.958;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQRankSum=0.475;QD=1.87;ReadPosRankSum=0.859;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr19	19431423	rs3934667	T	G	1195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.669;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=35;PP=902;ReadPosRankSum=-0.936;SC=CGACTGGGTTTTTTTTTTTTT;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=40;WE=19431431;WS=19431413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr19	19431963	rs12460764	G	T	3049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=65;PP=2308;SC=GGGCCGGGCCGCGAGGGAGGA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=30;TCR=65;TR=95;WE=19431971;WS=19431953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr19	19446936	rs769267	G	A	2062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=14;PP=1644;SC=ACTAGATCCCGCAGTTCGAAG;SOR=2.231;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=47;TCR=14;TR=61;WE=19446944;WS=19446926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	19447933	rs34414052	G	GT	2397.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.518;HP=14;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=15;MQRankSum=0.812;NF=31;NR=58;PP=905;ReadPosRankSum=-1.151;SC=TTGCCGCCTTGTTTTTTTTTT;SOR=0.288;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=124;TCF=41;TCR=83;TR=89;WE=19447941;WS=19447923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:11,104:0.90:115
chr19	19449603	rs2074089	G	A	3047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=36;PP=2345;SC=GGCAGGTACCGTAAAACTGAT;SOR=1.361;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=96;TCF=59;TCR=37;TR=95;WE=19449611;WS=19449593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr19	19449686	rs2074090	G	T	2975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=59;PP=2264;SC=ACCTGGTGTCGGCCTGTGACC;SOR=1.313;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=34;TCR=59;TR=93;WE=19449694;WS=19449676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	19451591	rs2965190	A	G	951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=15;PP=714;SC=CCTTGGGGTAATCACAGTCAT;SOR=0.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=14;TCR=15;TR=29;WE=19451599;WS=19451581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	19453521	rs2965191	T	G	1504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=23;PP=1193;SC=GGGCCAGGGCTGGGGGCGGGG;SOR=0.853;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=27;TCR=23;TR=50;WE=19453529;WS=19453511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	19453560	rs2301669	C	A	2012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=27;PP=1536;SC=CCCTGGTAACCCCTGCTGTCT;SOR=0.957;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=35;TCR=27;TR=62;WE=19453568;WS=19453550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	19453742	rs2965192	A	G	798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=24;PP=678;SC=GCCAGACGCTAGCTGTACCAG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=19453750;WS=19453732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	19454828	rs2965193	G	A	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=20;PP=569;SC=GACTGAATTCGCCAAGTGCAT;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=19454836;WS=19454818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	19466293	rs62135557	C	G	1017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=23;PP=890;SC=CTCTTTTGTCCAACAAACCCT;SOR=1.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=35;WE=19466301;WS=19466283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	19547086	rs2916077	T	C	1374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=44;PP=1097;ReadPosRankSum=0.259;SC=CAGCAGGCTTTGGTCAGCTTC;SOR=4.174;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=45;WE=19547094;WS=19547076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr19	19637930	rs7251447	A	G	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=3;PP=398;SC=CTCTGCCCACAGCCCTTGCCC;SOR=2.584;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=19637938;WS=19637920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	19637955	rs62137771	G	A	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=4;PP=501;SC=CGCGACCCTCGCCCTGCCCCC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=19637963;WS=19637945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	19735257	rs1266503	G	T	6292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=76;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.214;SC=CATTGACCAGGGAGTTGGCCT;SOR=0.435;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=200;TCF=124;TCR=76;TR=198;WE=19735265;WS=19735247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,206:1.00:207
chr19	19740729	rs880090	C	G	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=4;PP=413;SC=ATGGGTCCGTCTTCACAATCT;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=19740737;WS=19740719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	19750822	rs45458192	C	T	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=5;PP=475;SC=TGCTGGGAAACGAGGGGATCA;SOR=2.200;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=22;TCF=17;TCR=5;TR=19;WE=19750832;WS=19750812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	19750824	rs11298700	AG	A	934.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=5;PP=581;SC=CTGGGAAACGAGGGGATCAGG;SOR=2.030;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=19;TCF=14;TCR=5;TR=16;WE=19750832;WS=19750812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	19751456	rs2043293	C	A	277.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=8;PP=228;SC=CCCAGACCAGCCCAGTGGCAC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=19751464;WS=19751446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	19753292	rs7248885	G	A	1607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=12;PP=1287;SC=TAAATGGTTAGGGGCTTGGGG;SOR=2.256;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=48;WE=19753300;WS=19753282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	19758190	rs892035	T	C	2493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.71;SOR=0.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	19822049	rs7246866	T	C	325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=271;SC=CTGGAACAATTAAGGGCTTTA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=19822057;WS=19822039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	19824850	rs11085270	T	G	2430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=22;PP=2153;ReadPosRankSum=1.621;SC=TTGCTTGCTTTCTTTTGAAAT;SOR=1.227;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=84;TCF=62;TCR=22;TR=82;WE=19824858;WS=19824840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,76:0.99:77
chr19	19910183	rs34277739	A	G	2015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=16;PP=1563;SC=TAATGAAGGTATAGAGAACAC;SOR=2.129;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=45;TCR=16;TR=61;WE=19910191;WS=19910173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	19916736	rs12973032	T	C	2973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=1;PP=2521;SC=AACTATTTCCTTGGGAACACA;SOR=7.546;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=85;TCF=84;TCR=1;TR=85;WE=19916744;WS=19916728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr19	20150380	rs2335896	T	C	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=331;SC=GTTCCCACTCTAGCGCCCATG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=20150388;WS=20150370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	20242379	rs112605508	CT	C	211.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.82;ReadPosRankSum=0.198;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr19	20307777	rs112723967	G	A	3305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=28;PP=2562;SC=TTTCAGTTGTGTGTTCTCATT;SOR=2.137;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=78;TCR=28;TR=106;WE=20307785;WS=20307767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr19	20308301	rs113493829	G	C	4178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.482;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=55;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.796;SC=AAAATTCATAGTGGAGAGAAA;SOR=0.589;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=125;TCF=69;TCR=56;TR=124;WE=20308309;WS=20308291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,135:0.99:136
chr19	20308954	rs112134607	C	T	1140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=25;PP=953;SC=AGAGGTAATTCTGCTGTTGTT;SOR=1.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=10;TCR=25;TR=35;WE=20308962;WS=20308944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	20735138	rs58829785	GA	G	132.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=0.000;QD=2.50;ReadPosRankSum=1.348;SOR=0.182;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,16:0.30:53
chr19	20748522	rs12979592	C	A	3652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=73;PP=2965;SC=GCCACAGAGGCTGGGCCTCTA;SOR=1.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=113;TCF=40;TCR=73;TR=113;WE=20748530;WS=20748512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr19	20806770	rs34554673	T	TCA	930.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=13;PP=932;SC=ATATCAATTCTTAGTTAGAAA;SOR=1.721;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=20;WE=20806778;WS=20806761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	20806824	rs10409289	T	C	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=6;PP=454;SC=CACATTCACATGGTTTCTCTC;SOR=1.292;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=17;WE=20806832;WS=20806814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	20808149	rs1991528	A	G	2337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=43;PP=1906;SC=AAGCTTTGCCACATTCTATAT;SOR=1.164;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=29;TCR=43;TR=72;WE=20808157;WS=20808139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr19	20808515	rs1968385	T	A	1919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=48;PP=1488;SC=AATATAAATATATATATGCAG;SOR=3.296;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=57;TCF=8;TCR=49;TR=56;WE=20808523;WS=20808505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	20844340	rs3217340	G	GAAGT	3034.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=34;PP=2950;SC=GCCTTTAGGAGAAGAACCAGA;SOR=1.054;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=56;TCF=17;TCR=39;TR=51;WE=20844348;WS=20844330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	21116811	rs201690956	A	G	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=23.083;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.73;MQRankSum=-4.399;QD=0.59;ReadPosRankSum=-3.184;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,16:0.16:101
chr19	21203552	rs2081054	C	T	3140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=38;PP=2469;SC=CCCTGTGACCCGCAGGTATTG;SOR=1.190;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=93;TCF=54;TCR=39;TR=92;WE=21203560;WS=21203542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	21205531	rs7252588	C	T	1180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=3;PP=942;SC=CCAAGATATCCGCCATGGTTA;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=35;WE=21205539;WS=21205521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	21216536	rs3760839	G	A	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=25;PP=747;SC=TTCCATATAGGAAAGAATTTT;SOR=5.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=21216544;WS=21216526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	21217211	rs1470020	A	G	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=27;PP=738;SC=CAAGTTTGCTATCAGAACCAA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=21217219;WS=21217201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	21299774	rs36125838	T	TATA	6541.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=69;PP=2924;SC=CAAAAAAGGTTATGAACTAAA;SOR=0.952;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=132;TCF=54;TCR=78;TR=115;WE=21299782;WS=21299764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr19	21300462	rs2884554	A	G	3162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=40;PP=2562;SC=ACAAAACATAAAAGAATTCAT;SOR=0.947;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=48;TCR=40;TR=88;WE=21300470;WS=21300452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr19	21349311	rs7256576	C	T	3494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=88;PP=2861;SC=CTAAATGTTTCATGTCTCTTT;SOR=3.026;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=110;TCF=22;TCR=88;TR=110;WE=21349319;WS=21349301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr19	21350520	rs113788883	TA	T	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FS=5.731;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.05;MQRankSum=2.598;QD=0.22;ReadPosRankSum=0.103;SOR=0.311;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:160,28:0.15:188
chr19	21477431	rs1781873	T	C	1888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=42;PP=1477;SC=TCCACACTTTTACAGCCTTTC;SOR=2.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=16;TCR=42;TR=58;WE=21477439;WS=21477421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	21492062	rs547516	G	A	8078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.713;NF=108;NR=150;PP=2965;ReadPosRankSum=0.615;SC=GGGTTTGGCTGCCATCTCGTG;SOR=0.381;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=262;TCF=109;TCR=153;TR=258;WE=21492070;WS=21492052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,265:1.00:266
chr19	21493258	rs669560	T	A	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.13;QD=31.55;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	21493278	rs34067558	TA	T	474.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.46;MQRankSum=0.417;QD=19.78;ReadPosRankSum=-0.290;SOR=3.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr19	21541806	rs2012013	T	C	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=1;PP=558;SC=TTCTTTGTCTTTGGCTGCCGC;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=21541814;WS=21541796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	21544503	rs12981775	C	T	1360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=5;PP=1025;SC=ACCGAGATATCTGCCATGGTT;SOR=3.365;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=38;WE=21544522;WS=21544493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	21544514	rs12981564	A	G	1454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=6;PP=1101;SC=TGCCATGGTTATGTCAGCTAG;SOR=3.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=41;WE=21544522;WS=21544493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	21544571	rs1142653	G	A	1828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=19;PP=1411;SC=CCCATAGGACGACCTGAGGTA;SOR=1.342;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=54;WE=21544579;WS=21544561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	21544714	rs12982282	C	G	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=25;PP=659;SC=AAAACATGCTCTACTAAAAAT;SOR=3.841;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=26;WE=21544722;WS=21544704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	21558266	rs116953711	C	T	1593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=47;PP=1387;SC=TGCATAAATGCGTTTCTGATC;SOR=7.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=47;WE=21558274;WS=21558256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	21558311	rs2914645	C	T	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=441;SC=ATTATCCATGCAGAAAAAAAT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=21558319;WS=21558301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	21560141	.	G	A	75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=26;MQ=52.02;NF=4;NR=0;PP=75;QD=27.4428031368;SC=ACTGCCTTCAGTTCCTCTCTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=21560149;WS=21560134;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	21587918	rs7254059	G	T	3147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.70;ReadPosRankSum=-0.718;SOR=1.384;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,105:0.99:106
chr19	21588165	rs2650847	G	A	2463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=69;PP=2017;SC=TGAGTTTCTGGTGCCTGTTTT;SOR=7.223;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=70;TCF=1;TCR=69;TR=70;WE=21588173;WS=21588155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	21588692	rs1055753	T	C	1643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=27;PP=1030;SC=TTGACATAGATGAAAGGTTGA;SOR=0.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=53;TCF=25;TCR=28;TR=52;WE=21588700;WS=21588682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	21588709	rs368881488	T	TAAA	730.19	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.76;MQRankSum=0.089;QD=45.64;ReadPosRankSum=-1.456;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,13:0.81:16
chr19	21606230	rs148183266	AG	GT	2175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=20;PP=2460;ReadPosRankSum=-0.778;SC=TACACATAAGAGAATTCATAC;SOR=0.239;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=51;TCF=27;TCR=24;TR=44;WE=21606239;WS=21606220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr19	21606429	rs4621113	G	T	3222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=23;PP=2742;SC=CCCTATAAATGTGAAGAATGT;SOR=2.160;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=71;TCR=23;TR=94;WE=21606437;WS=21606419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	21688495	rs73017722	C	T	2584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=12;PP=2193;SC=TTCTTAGAGGCCCAGCCTGTG;SOR=3.401;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=69;TCR=12;TR=81;WE=21688503;WS=21688485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	21688602	rs10420016	C	G	4664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=78;PP=2965;SC=CTGACATCCCCAGAGAGGGGG;SOR=0.706;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=154;TCF=76;TCR=78;TR=154;WE=21688610;WS=21688592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr19	21719401	rs35782355	T	C	2111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=27;PP=1808;SC=GCAAATCATTTTGCATGCTTT;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=35;TCR=27;TR=62;WE=21719409;WS=21719391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr19	21736788	rs2562502	T	C	1432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=33;PP=1106;SC=TTGGTTTTTTTACATACTCCC;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=40;WE=21736796;WS=21736778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	21950337	rs10412066	G	C	3647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=65;PP=2760;SC=ACACAGAGAAGTGAGAGCAAA;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=42;TCR=65;TR=107;WE=21950345;WS=21950327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr19	22171646	rs202153431	A	T	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FS=44.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.97;MQRankSum=-9.351;QD=2.65;ReadPosRankSum=4.286;SOR=3.543;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:215,32:0.13:247
chr19	22171651	rs199911466	C	T	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FS=43.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.49;MQRankSum=-9.668;QD=2.73;ReadPosRankSum=4.586;SOR=3.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:211,32:0.13:243
chr19	22171667	rs200945511	C	T	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=35.661;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.12;MQRankSum=-11.180;QD=0.99;ReadPosRankSum=1.871;SOR=3.272;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:199,30:0.13:229
chr19	22171884	rs200362574	TTTC	T	1080.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.92;QD=41.57;SOR=6.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	22193451	rs2040654	C	G	1986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=8;PP=1527;SC=ATGGCTGAACCGGACTGAGGT;SOR=3.943;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=61;TCR=8;TR=69;WE=22193459;WS=22193441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	22255799	rs200402014	T	TA	5857.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.29;MQRankSum=0.558;QD=42.76;ReadPosRankSum=1.126;SOR=2.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,136:0.99:137
chr19	22255803	rs368701052	T	A	5649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.409;NF=9;NR=108;PP=2965;ReadPosRankSum=1.300;SC=TTTATTTTTTTTTTTGTAGAA;SOR=3.528;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=9;TCR=110;TR=117;WE=22255811;WS=22255789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,123:0.99:124
chr19	22256396	rs3752163	G	A	6474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=89;NR=109;PP=2965;SC=AGTACAACAGGTGAAACAGAT;SOR=0.930;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=200;TCF=89;TCR=111;TR=198;WE=22256404;WS=22256386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr19	22270897	.	G	A	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.585;ClippingRankSum=0.000;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.92;MQRankSum=-7.949;QD=1.15;ReadPosRankSum=0.769;SOR=0.741;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,11:0.10:105
chr19	22270899	.	G	T	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=0.000;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.05;MQRankSum=-7.798;QD=1.13;ReadPosRankSum=1.242;SOR=0.603;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,10:0.09:107
chr19	22363826	rs7252593	G	C	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FS=24.845;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.85;MQRankSum=-4.459;QD=2.20;ReadPosRankSum=-0.995;SOR=2.369;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,23:0.15:157
chr19	22363844	rs7252604	G	A	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=20.924;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.46;MQRankSum=-4.159;QD=0.97;ReadPosRankSum=-2.189;SOR=3.247;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,10:0.08:126
chr19	22364492	rs10419666	A	T	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=334;SC=AAGCAAGACGACATTGCAATA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=22364500;WS=22364482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	22375868	rs8104929	C	T	6627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=129;PP=2965;ReadPosRankSum=1.032;SC=GGGCTCTTTTCCTTGCTCCAG;SOR=0.658;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=192;TCF=62;TCR=130;TR=191;WE=22375876;WS=22375858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,206:1.00:207
chr19	22379587	rs2360001	G	T	2725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=65;PP=2168;SC=AACTTTTAATGTGACTCAAGG;SOR=3.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=9;TCR=65;TR=74;WE=22379595;WS=22379577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	22486535	rs9304996	A	G	5169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=62;PP=2965;SC=GGAAATGTATATGTGTCTTTC;SOR=1.186;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=159;TCF=96;TCR=63;TR=158;WE=22486543;WS=22486525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr19	23328940	rs7247102	G	A	3459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=62;PP=2879;SC=CATACTGGAGGGAAACCCTAC;SOR=1.279;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=38;TCR=62;TR=100;WE=23328948;WS=23328930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr19	23406165	rs2885604	T	C	1092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=26;PP=900;SC=TAAGGGTTGATGATTGGTTAA;SOR=2.073;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=37;WE=23406173;WS=23406155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	23406801	rs8110795	G	C	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=19;PP=475;SC=GAAGGTCTTGGGCAAAATAAC;SOR=2.925;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=22;WE=23406809;WS=23406791;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	23413937	rs7256859	A	G	2491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=1;PP=2060;ReadPosRankSum=-0.725;SC=TGCCCGCCTTAGCCTCTCCAA;SOR=5.811;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=72;TCF=71;TCR=1;TR=70;WE=23413945;WS=23413927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr19	23414167	rs4932841	T	G	3831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=99;PP=2965;SC=GCAATACCTGTTTTATTAAAA;SOR=3.804;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=15;TCR=99;TR=114;WE=23414175;WS=23414157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr19	23433107	rs10405424	G	C	3203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=61;PP=2642;SC=TTGCAGGTCAGAGGGCCACAG;SOR=1.378;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=33;TCR=62;TR=94;WE=23433115;WS=23433097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	23542697	rs1821845	G	C	3363.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=48;PP=2703;SC=TAAAAGCTTTGCCACATTCTT;SOR=0.733;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=48;TCR=48;TR=96;WE=23542705;WS=23542687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr19	23545250	rs1044095	A	G	2094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=37;PP=1809;SC=ATTTCTTTCCAGTATGTCTTA;SOR=0.880;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=32;TCR=38;TR=69;WE=23545258;WS=23545240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	23837145	rs11671053	A	G	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=17;PP=619;SC=GCAGAAATTCACCTTGGTATA;SOR=1.302;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=23837153;WS=23837135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	23837365	rs4380159	A	C	2983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=53;PP=2384;SC=CCCTTGTGCAACTTACATTCA;SOR=0.936;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=43;TCR=53;TR=96;WE=23837373;WS=23837355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr19	23845038	rs10418600	T	G	2281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.94;QD=44.74;SOR=3.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	23845042	rs10418602	T	C	2247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.94;QD=44.96;SOR=3.745;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	23869684	rs4020520	G	A	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=3;PP=1325;SC=TCTTATGGCTGCAGGGGACTG;SOR=4.977;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=46;TCR=3;TR=49;WE=23869692;WS=23869674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	23869823	rs2364624	T	G	4076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=68;PP=2965;SC=GTCGCACCCGTAACTCTCACC;SOR=1.089;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=51;TCR=69;TR=119;WE=23869831;WS=23869813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr19	23869941	rs2364625	A	G	3155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=63;PP=2479;SC=ACACAGAGCAATGAAAGCGAG;SOR=1.306;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=38;TCR=63;TR=101;WE=23869949;WS=23869931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	23926332	rs10405811	G	A	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=373;SC=CTTCACACTTGTAGGTTTTTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=23926340;WS=23926322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	23927252	rs1818990	C	T	4258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=60;PP=2965;SC=TTCTTCACATCTGTAGGGCTT;SOR=0.892;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=130;TCF=70;TCR=60;TR=130;WE=23927260;WS=23927242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr19	23927468	rs1818989	A	G	1618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=32;PP=1327;SC=AGTAAGGGTTAAGGACTGATT;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=51;WE=23927476;WS=23927458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	23928102	rs7248674	C	G	1851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=43;PP=1495;SC=GGTGAAAAGTCTTGGGCAAAA;SOR=2.604;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=11;TCR=43;TR=54;WE=23928110;WS=23928092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	23941459	rs6417220	G	A	2381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=14;PP=1978;SC=GGAGAACTCAGGGCGCAAATT;SOR=2.770;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=57;TCR=14;TR=71;WE=23941467;WS=23941449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	24115369	rs56014490	T	C	4536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=94;PP=2965;SC=TGGTAAATATTTGAAAGTCTT;SOR=1.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=139;TCF=44;TCR=95;TR=137;WE=24115377;WS=24115359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr19	29567134	rs1549944	T	C	1510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=26;PP=1143;ReadPosRankSum=-0.449;SC=GAAATGGCTTTTGGATCAGTG;SOR=0.767;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=36;TCR=38;TR=51;WE=29567142;WS=29567124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,54:0.68:80
chr19	29704002	rs11666764	T	C	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.76;QD=42.54;SOR=1.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	29704010	rs8100724	A	C	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.36;QD=39.42;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	30017759	rs77232410	C	G	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.305;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=132;ReadPosRankSum=-0.365;SC=CAGCGCCGCGCCCGAGTCGTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=8;WE=30017767;WS=30017749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr19	30018052	rs4804888	G	T	1902.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=5;PP=1513;ReadPosRankSum=-0.499;SC=CGACTGCCTCGCTTTAGGTTG;SOR=0.524;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=94;TCF=87;TCR=7;TR=62;WE=30018060;WS=30018042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,65:0.67:97
chr19	30020678	rs35700860	T	C	576.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=391;ReadPosRankSum=1.206;SC=GCCAGAAGAGTAGGTTTGGGA;SOR=0.651;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=81;TCF=68;TCR=13;TR=24;WE=30020686;WS=30020668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,26:0.32:82
chr19	30021023	rs62104163	G	C	334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.407;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=4;PP=322;ReadPosRankSum=-1.331;SC=CGGCCGCGGCGACAAGAGCCC;SOR=2.251;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=40;TCF=20;TCR=20;TR=14;WE=30021031;WS=30021013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,14:0.34:41
chr19	30099457	rs1465585	A	G	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=3.677;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.75;MQRankSum=-1.696;QD=4.84;ReadPosRankSum=0.069;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,16:0.25:64
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chr19	30164618	rs1864223	C	G	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=3.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.691;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=286;ReadPosRankSum=1.829;SC=GGTTACTGTGCGTAGTCAGTG;SOR=1.795;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=14;WE=30164626;WS=30164608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,13:0.32:40
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chr19	30314459	rs4805483	A	G	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.038;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.599;NF=38;NR=1;PP=973;ReadPosRankSum=-0.363;SC=CCATCTTGAGAAAAAAAAAAA;SOR=1.961;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=60;TCF=57;TCR=3;TR=39;WE=30314467;WS=30314449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,42:0.71:59
chr19	30314666	rs7257694	C	T	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.497;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=461;ReadPosRankSum=0.987;SC=AGCAGAGCAGCGGGCCGGAAA;SOR=0.376;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=69;TCF=8;TCR=61;TR=28;WE=30314674;WS=30314656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,28:0.41:68
chr19	30433668	rs1990903	C	T	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=342;SC=CCCAGCTGCCCGGGCCCCCGG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=30433676;WS=30433658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	30500118	rs3840928	GTGA	G	11112.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=88;PP=2993;SC=TCTTACCACAGTGATGATGAT;SOR=1.431;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=298;TCF=156;TCR=142;TR=192;WE=30500131;WS=30500108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr19	31769763	rs12461253	G	A	2620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.585;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=53;PP=2308;ReadPosRankSum=-0.003;SC=TTTTGGCGGCGACAGGAGTGA;SOR=0.202;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=144;TCF=62;TCR=82;TR=100;WE=31769771;WS=31769753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,93:0.69:134
chr19	31840190	rs71173962	AG	A	1105.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=28;PP=1074;SC=ACAGGGAGGGAGGGGGCGGCG;SOR=3.321;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=29;WE=31840198;WS=31840180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	31930388	rs8103449	A	T	367.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.419;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=256;ReadPosRankSum=0.769;SC=GGTCTGGATAACTTGCACAGA;SOR=0.227;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=81;TCF=70;TCR=11;TR=21;WE=31930396;WS=31930378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,21:0.25:84
chr19	32083696	rs7245697	T	C	5734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=76;NR=113;PP=2965;SC=ATGGCTCTACTGCCGTCCACC;SOR=1.122;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=190;TCF=77;TCR=113;TR=189;WE=32083704;WS=32083686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr19	32102242	.	G	A	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=9;PP=250;ReadPosRankSum=-0.586;SC=GGAGAGAGAGGAACCAGGGAG;SOR=0.804;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=56;TCF=26;TCR=30;TR=18;WE=32102250;WS=32102232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,17:0.31:55
chr19	32873698	rs2270399	A	G	5599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=80;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.897;SC=CTGGAAGTTCAGAAAATGCAG;SOR=0.323;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=181;TCF=101;TCR=80;TR=179;WE=32873706;WS=32873688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,188:0.99:189
chr19	32899293	rs2012353	G	A	1534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=27;PP=1225;SC=CAGCAATTTGGGTTGCTTTTA;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=18;TCR=27;TR=45;WE=32899301;WS=32899283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	32902404	rs10410770	A	G	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=338;SC=AGGTTGGACTATAGAGTGAAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=32902412;WS=32902394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	32927311	rs2302773	G	A	274.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=2;PP=196;SC=GAATAATTATGAGTGTAATTA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=32927319;WS=32927301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	32946043	rs2903738	A	T	211.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=146;SC=TAATAAACTAATTGTTTTAGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=32946051;WS=32946033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	32955406	rs7252536	A	T	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=81;SC=ATTTCTGGTAATTTTTTAAGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=32955414;WS=32955399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	32971223	rs16967141	C	T	1616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=8;PP=1383;SC=TAGACTCAGCCCTGTGGAAGG;SOR=3.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=40;TCR=8;TR=48;WE=32971231;WS=32971213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	32973077	rs7253039	C	T	2846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=51;PP=2309;ReadPosRankSum=1.140;SC=TGCCTCCCTACGTGGCCTACT;SOR=0.409;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=36;TCR=52;TR=87;WE=32973085;WS=32973067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,90:0.99:91
chr19	33072266	rs10411464	T	C	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=6;PP=146;SC=GGCTTGGCCCTCGCGGGGCGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=33072274;WS=33072256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	33076973	rs10500262	T	A	1961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=52;PP=1564;SC=GAGAATAAATTGCCTTTCCTA;SOR=8.121;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=0;TCR=52;TR=52;WE=33076981;WS=33076963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	33098632	rs2302970	G	C	1001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=5;PP=831;SC=CAGCAGGAGGGGGATGAGGTC;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=31;WE=33098640;WS=33098622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	33098870	rs2903755	C	T	2098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.83;SOR=7.824;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	33098875	rs2868150	T	C	2033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.22;SOR=7.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	33106390	rs614370	T	G	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=279;SC=GTCAGGACACTGAGGTGAGAG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=33106398;WS=33106388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	33106621	rs405858	C	T	2177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.537;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=36;PP=1659;ReadPosRankSum=-0.714;SC=ATTCGGGGTCCGCTGCACTGA;SOR=0.650;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=66;TCF=30;TCR=36;TR=65;WE=33106629;WS=33106611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,69:0.99:70
chr19	33110149	rs28615461	T	C	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=18;NR=2;PP=516;SC=CCCCAGCCCTTCCTCTGGAAG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=33110157;WS=33110139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	33110204	rs2287669	T	C	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=7;PP=1140;SC=TGCCTTGAGCTGGCTGACATG;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=43;WE=33110212;WS=33110194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	33117666	rs6510271	T	C	1995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=18;PP=1592;SC=GCGGAGTGGCTCCATGGTAGT;SOR=2.019;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=42;TCR=18;TR=60;WE=33117674;WS=33117656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr19	33117842	rs6510272	C	A	1167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=28;PP=892;SC=GGCATGAAACCCACGGTAGAT;SOR=3.442;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=5;TCR=28;TR=33;WE=33117850;WS=33117832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	33117884	rs6510273	T	C	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=578;SC=CTACAGCTAATATAAAGTAAG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=33117892;WS=33117874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	33119883	rs6510274	A	G	310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=314;SC=CTGGAGTGCAATGGTGTGATC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=33119891;WS=33119873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	33130496	rs11084666	T	C	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=24;PP=544;SC=TCTAGTCAGTTGGTTCGCTCA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=33130504;WS=33130486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	33131112	rs3760943	G	A	1557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=1;PP=1269;SC=CTCGTGATCCGCCCGCCTTGG;SOR=6.316;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=45;WE=33131120;WS=33131102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	33131336	rs10416829	T	C	4501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=123;PP=2965;SC=GAGATTCAAATGGACTGACAA;SOR=2.651;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=33;TCR=123;TR=156;WE=33131344;WS=33131326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr19	33133936	rs3841621	CG	C	812.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=0;PP=910;SC=ATCAAACCAGCGTGTCACCTC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=20;WE=33133944;WS=33133926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	33134425	rs259229	G	A	2337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=44;PP=1797;SC=AAAGGGCTTGGATTTGCATGG;SOR=1.209;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=28;TCR=44;TR=72;WE=33134433;WS=33134415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	33134635	rs259228	A	G	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=84;SC=AAGTGCTAACACAAGCTTTAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=33134643;WS=33134625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	33135458	rs259225	C	T	471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=14;PP=384;SC=TCCTACAGGGCCTAGGCCCTC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=33135466;WS=33135448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	33137337	rs74776662	G	T	2416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=5;PP=2100;SC=TCTAAAACAGGAGAAAAAGGT;SOR=4.949;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=71;TCR=5;TR=75;WE=33137345;WS=33137327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr19	33137629	rs259220	T	A	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=34;PP=962;SC=CTTCACCCCATTGTGGGTTTG;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=33137637;WS=33137619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	33149768	rs259251	G	A	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=1;PP=731;SC=AGTCTACCACGTCTCTGGAAC;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=33149776;WS=33149758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	33150045	rs11486502	C	T	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.70;QD=28.72;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	33167455	rs259290	G	T	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=11;PP=597;SC=CATGCGACGCGCGCTGGAGCT;SOR=1.101;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=25;WE=33167463;WS=33167445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	33167879	rs259291	G	A	854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=5;NR=20;PP=682;SC=CTGAGCTGACGGACACCCGAC;SOR=2.670;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=33167887;WS=33167869;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	33182802	rs8108837	C	T	122.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=2;PP=95;SC=GGGGTCCCTGCAGGGCCGGGC;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=33182810;WS=33182792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	33183352	rs61732600	G	C	2178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=61;PP=1711;SC=AGCCACCGCCGGGCCTGGCCT;SOR=3.086;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=12;TCR=61;TR=73;WE=33183360;WS=33183342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr19	33211069	.	C	T	130	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=6;PP=130;QD=27.4618687579;SC=CAGCCGCGCACAGCCTCCCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=33211077;WS=33211059;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	33239450	rs4805805	C	G	2019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=48;PP=1545;SC=AAGCCAGTGCCTGATCACTGC;SOR=2.448;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=63;TCF=14;TCR=49;TR=62;WE=33239458;WS=33239440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	33240570	rs9783983	G	A	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=4;PP=441;SC=GGTCCTGCCCGAGGAAGACAT;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=33240578;WS=33240560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	33264348	rs12608647	G	T	2147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=20;PP=1633;SC=CTGAAGAAAAGTTTTCTTTTA;SOR=1.678;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=46;TCR=20;TR=66;WE=33264356;WS=33264338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	33281924	rs11881633	A	G	2689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=33;PP=2168;SC=GAACAAGATCAAGCCCTGCTT;SOR=1.321;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=55;TCR=33;TR=88;WE=33281932;WS=33281914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr19	33282109	rs11878874	C	T	603.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=479;ReadPosRankSum=-1.096;SC=TTTGAGATTACAGGCATGAGC;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=19;WE=33282117;WS=33282099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr19	33289463	rs4805811	T	C	258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=252;SC=AAAAATTTTATGCTTTAACTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=33289471;WS=33289453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	33292568	rs12976876	A	T	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=6;PP=801;SC=TCACAGATAAATTAAAGTGCT;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=33292576;WS=33292558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	33293948	rs35110475	G	A	2110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=31;PP=1747;ReadPosRankSum=-0.801;SC=CAAGGTCCCCGCAGAGCTGTA;SOR=0.275;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=36;TCR=31;TR=66;WE=33293956;WS=33293938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
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chr19	33304690	rs8107900	C	T	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=13;PP=611;SC=ATGGTAAGTACGCATTTTTTC;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=25;WE=33304698;WS=33304680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	33304713	rs8111278	T	C	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=12;PP=534;SC=AGAAATAAATTTGTTTGAATG;SOR=0.776;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=22;WE=33304721;WS=33304703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
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chr19	33321717	rs10645053	A	AGG	1265.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.67;NF=2;NR=21;PP=1019;SC=CCCTGTGCTCAGGATGGCCAG;SOR=3.407;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=23;WE=33321725;WS=33321707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	33349351	rs61730903	C	T	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.796;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=10;PP=1206;ReadPosRankSum=0.732;SC=CCTACCTGCCCGCTGTGAAGC;SOR=2.461;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=45;WE=33349359;WS=33349341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,45:0.96:47
chr19	33349488	rs2287879	T	C	1542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=47;PP=1161;SC=GGGTCTTTCTTGGCCTCCAAG;SOR=3.422;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=7;TCR=47;TR=54;WE=33349496;WS=33349478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	33351376	rs5827823	C	CA	248.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.46;MQRankSum=-0.260;QD=11.84;ReadPosRankSum=0.234;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr19	33390796	rs10418340	G	A	5062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=59;PP=2965;SC=CCTGGGTTATGTTTTCTGCCA;SOR=1.301;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=159;TCF=99;TCR=60;TR=157;WE=33390804;WS=33390786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr19	33406442	rs7246178	A	G	2510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=50;PP=2038;SC=CAAAAGAGGAAGATAAAAACT;SOR=1.409;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=27;TCR=50;TR=77;WE=33406450;WS=33406432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr19	33406484	rs7260149	G	T	2740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.82;SOR=2.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	33406493	rs35219657	G	C	2523.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.89;SOR=3.139;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	33406549	rs7246326	A	G	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=21;PP=573;SC=CTTTTGAGCCAGACGTGGTGG;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=33406557;WS=33406539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	33409048	rs59487918	GC	G	457.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=327;SC=TTCAACTGGGGCCCCCGGCAG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=10;WE=33409069;WS=33409041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	33409054	rs2278402	G	A	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.78;QD=42.65;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	33409061	rs2278403	G	C	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.53;QD=41.34;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	33409413	rs2278404	G	T	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.821;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=28;PP=803;ReadPosRankSum=-0.823;SC=TTTGCAGTCAGGCGAGGAAGG;SOR=4.112;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=29;WE=33409421;WS=33409403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr19	33414420	rs4805825	A	G	3425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=67;PP=2744;SC=CACTTCTTGGACTCGCATCCT;SOR=1.774;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=29;TCR=67;TR=96;WE=33414429;WS=33414410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr19	33418037	rs141452719	CCCAT	C	233.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=3;PP=198;SC=TACCCACCTACCCATCCATCC;SOR=1.329;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=4;WE=33418048;WS=33418027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	33428423	rs2304100	G	T	151.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=137;ReadPosRankSum=0.792;SC=AAGGGTGAAAGTTCAACAACT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=33428431;WS=33428413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr19	33430816	rs12461782	T	G	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=23;PP=1025;SC=GAGAGAGAGATAAACTTTTAA;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=19;TCR=23;TR=42;WE=33430824;WS=33430806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	33439158	rs12710001	T	C	160.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=2;PP=119;SC=AAAATTGTGGTTTTTTTTTTC;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=33439166;WS=33439148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	33444453	rs75223967	T	G	15531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=501;ExcessHet=3.0103;FS=2.949;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=32.22;ReadPosRankSum=-1.291;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:88,394:0.82:482
chr19	33444453	.	TGCA	GGCA,GGCG	2944	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=289,216;NR=82,61;PP=814,2944;QD=2.28779302573;SC=TCCTTAGCAATGCACTAATTT;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=469;TCF=367;TCR=102;TR=371,277;WE=33444464;WS=33444443;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.79:469
chr19	33444456	rs2944021	A	G	9598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=532;ExcessHet=3.0103;FS=3.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.78;ReadPosRankSum=-0.922;SOR=0.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:184,327:0.64:511
chr19	33444479	rs79480383	C	T	2956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=614;ExcessHet=3.0103;FS=3.852;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.01;ReadPosRankSum=1.279;SOR=0.468;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:433,157:0.27:590
chr19	33444511	rs80283382	T	C	15441.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=695;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.559;HP=2;HapScore=1;MGOF=52;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.475;NF=213;NR=302;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.009;SC=ACTGGGAACATAGAAAACACC;SOR=0.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=634;TCF=277;TCR=357;TR=515;WE=33444519;WS=33444501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,533:0.81:655
chr19	33444519	rs146108457	A	G	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=695;ExcessHet=3.0103;FS=0.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.99;MQRankSum=-2.774;QD=0.35;ReadPosRankSum=-1.673;SOR=0.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:579,75:0.11:654
chr19	33444556	.	T	C	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=54;MMLQ=24;MQ=59.82;NF=59;NR=330;PP=2962;QD=20;SC=AGGTCATCACTGTGGCCTCCT;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=507;TCF=94;TCR=413;TR=389;WE=33444564;WS=33444546;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:118,389:0.77:507
chr19	33444576	.	C	T	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=39;MMLQ=28;MQ=59.43;NF=30;NR=297;PP=2962;QD=20;SC=TCTGTCCTCCCGGGCACTGAC;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=415;TCF=54;TCR=361;TR=327;WE=33444598;WS=33444566;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:88,327:0.79:415
chr19	33444588	.	T	G	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;FR=0.5000;HP=5;HapScore=1;MGOF=39;MMLQ=28;MQ=59.27;NF=11;NR=251;PP=2962;QD=20;SC=GGCACTGACATCCCCCAATTC;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=342;TCF=33;TCR=309;TR=262;WE=33444598;WS=33444566;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:80,262:0.77:342
chr19	33444707	rs10411735	C	T	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=23;PP=678;SC=GCCAATTTGGCCTGTATTAGA;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=33444715;WS=33444697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	33462564	rs34358164	TA	T	411.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=2.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.42;MQRankSum=0.058;QD=12.87;ReadPosRankSum=-1.136;SOR=0.242;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,26:0.81:32
chr19	33462938	rs751732	C	T	247.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=7;PP=173;SC=CTCAGCTCGGCCCTCGACCAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=33462946;WS=33462928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	33467357	rs2304102	G	A	1926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=25;PP=1525;SC=AAACCAAAGAGCCCAGTAAGA;SOR=1.107;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=35;TCR=25;TR=60;WE=33467365;WS=33467347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	33467620	rs7247715	T	C	916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=28;PP=740;SC=CATCTTCTCCTGAGACCACAA;SOR=4.047;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=31;WE=33467628;WS=33467610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	33470874	rs8099835	A	G	3073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=24;PP=2326;SC=GGAAATGTTCAGGGCCTGAAC;SOR=2.281;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=106;TCF=82;TCR=24;TR=105;WE=33470882;WS=33470864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr19	33471279	rs12971408	C	T	923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=725;SC=TTTGGGAGGCCGAGGAAGGCG;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=33471287;WS=33471269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	33481388	rs7250684	C	T	2557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=8;PP=1940;SC=TCCACGCCACCACTGACTGCC;SOR=4.062;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=63;TCR=8;TR=71;WE=33481396;WS=33481378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr19	33486810	rs4805026	A	G	636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.13;QD=45.48;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	33486822	rs8110267	T	C	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.64;QD=41.99;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	33487071	rs12610600	G	C	1842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=48;PP=1429;SC=TGCAGAGGCTGGCCTCCCGCA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=23;TCR=48;TR=71;WE=33487079;WS=33487061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	33487182	rs11084689	A	G	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=12;PP=376;SC=CAGAGCATAAAGGCCCAAGGG;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=33487190;WS=33487172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	33487251	rs8110730	T	C	227.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=25.31;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	33490462	.	G	A	138.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-2.355;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.673;NF=7;NR=0;PP=100;ReadPosRankSum=-1.178;SC=ACCAAGTGGGGCCCACATCTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=7;WE=33490470;WS=33490452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr19	33490480	rs74603434	G	A	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=2.869;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.68;MQRankSum=-5.565;QD=11.35;ReadPosRankSum=0.094;SOR=1.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr19	33490487	.	C	T	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=2.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.96;MQRankSum=-5.033;QD=3.55;ReadPosRankSum=-0.221;SOR=1.286;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,10:0.21:47
chr19	33490585	rs78615454	G	A	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.835;NF=15;NR=25;PP=432;ReadPosRankSum=-2.033;SC=CACTTCTCCTGGTGGTCCAGA;SOR=0.695;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=132;TCF=50;TCR=82;TR=40;WE=33490593;WS=33490575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,27:0.26:104
chr19	33490667	rs200498530	G	A	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.085;NF=0;NR=8;PP=97;ReadPosRankSum=-2.953;SC=ACAGACCCACGTAGAGATTTC;SOR=0.422;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=8;WE=33490675;WS=33490657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,6:0.17:36
chr19	33490685	rs8109247	T	C	645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=20;PP=454;SC=TTCTCTACCATGTCTCCAGCT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=33490693;WS=33490675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	33498978	rs2163807	A	G	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=3;PP=544;SC=TCTGCCGATCACACCGGGTCC;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=33498986;WS=33498968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	33512632	rs34594918	CA	C	6973.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.256;NF=25;NR=133;PP=2951;ReadPosRankSum=-0.395;SC=CTCAGCAGCCCAAGCTCAGGT;SOR=0.621;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=168;TCF=28;TCR=140;TR=158;WE=33512640;WS=33512622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,191:0.99:193
chr19	33579128	rs7259333	T	C	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=34;PP=1671;SC=GGGCCTTTAGTGGAGGTTTCT;SOR=0.927;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=41;TCR=34;TR=75;WE=33579136;WS=33579118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	33584176	rs35647730	C	CT	289.70	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=188;ReadPosRankSum=1.274;SC=GTAGTTTTAACTTTTTTTTTT;SOR=1.863;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=12;WE=33584184;WS=33584166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr19	33584479	rs12460195	G	A	1660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.746;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=40;PP=1471;ReadPosRankSum=-0.147;SC=TTGCATATGTGTGATTCTCTT;SOR=0.914;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=12;TCR=42;TR=51;WE=33584499;WS=33584469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,54:0.96:56
chr19	33584491	rs12460349	C	T	1525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=40;PP=1358;ReadPosRankSum=-1.258;SC=GATTCTCTTGCTGAGGGATAG;SOR=1.473;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=7;TCR=42;TR=47;WE=33584499;WS=33584469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,50:0.96:52
chr19	33585219	rs58636263	CT	C	235.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.519;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.53;MQRankSum=0.000;QD=15.72;ReadPosRankSum=1.739;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr19	33586739	rs13345542	G	C	3054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=58;PP=2379;ReadPosRankSum=-0.876;SC=ATTGCATGGTGTGACTGACCT;SOR=0.541;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=33;TCR=59;TR=91;WE=33586747;WS=33586729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,95:0.99:96
chr19	33592301	rs10410778	C	A	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=324;SC=ATGACACGTACTATTTATGTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=33592309;WS=33592291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	33597816	rs10408093	T	C	2253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=40;PP=1556;ReadPosRankSum=0.016;SC=GTATGTGCCATGGAGAAGACG;SOR=0.934;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=77;TCF=36;TCR=41;TR=75;WE=33597824;WS=33597806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,81:0.98:83
chr19	33597930	rs3760893	C	A	646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=545;ReadPosRankSum=-0.708;SC=TGTGGAAATACCACTATTTAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=21;WE=33597938;WS=33597920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr19	33600764	rs2287679	T	C	2893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.393;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=61;PP=2360;ReadPosRankSum=0.936;SC=AGAGCCCAGCTCTCCCCTGCA;SOR=1.872;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=87;TCF=25;TCR=62;TR=85;WE=33600772;WS=33600754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,89:0.99:90
chr19	33602856	rs3786934	A	G	1229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=33;PP=1032;SC=ATATTAAAGCACTGCCTAGCC;SOR=3.500;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=5;TCR=33;TR=38;WE=33602864;WS=33602846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	33602881	rs3786933	C	T	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=27;PP=870;SC=TAGTTTTTTCCTTTTTTTTGA;SOR=3.912;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=30;WE=33602889;WS=33602871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	33604531	rs8103733	C	T	224.56	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5958;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=151;ReadPosRankSum=-0.431;SC=CCCAGATTCTCGAACTGCTTT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=7;WE=33604539;WS=33604526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr19	33605300	rs10416265	A	G	5699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=127;PP=2965;ReadPosRankSum=1.071;SC=GAGGAAGAGCATGCACCAGAA;SOR=0.826;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=190;TCF=58;TCR=132;TR=184;WE=33605320;WS=33605290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,194:0.98:198
chr19	33605312	rs10421769	T	C	5846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=134;PP=2965;SC=GCACCAGAATTATCCGCAAAT;SOR=2.481;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=175;TCF=40;TCR=135;TR=174;WE=33605320;WS=33605290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr19	33610060	rs8113398	A	G	1401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=34;PP=1158;SC=CATTTTTATCAGTGTGTGATT;SOR=2.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=43;WE=33610068;WS=33610050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	33617583	rs6510356	C	T	2298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.669;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=39;PP=1910;ReadPosRankSum=-1.128;SC=CCGACAGCAGCGACAGCCAGA;SOR=0.439;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=74;TCF=35;TCR=39;TR=72;WE=33617591;WS=33617573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,75:0.97:77
chr19	33620855	rs59303077	G	GA	85.14	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.16;MQRankSum=0.366;QD=12.16;ReadPosRankSum=-0.366;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr19	33620993	rs35506888	T	TCC	2004.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=16;PP=1885;SC=GTTTTTCACTTTAGCTAACTT;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=37;WE=33621001;WS=33620983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	33628438	rs10402746	C	T	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=108;SC=GGATTACAGACGTGAACCACC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=33628446;WS=33628428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	33635761	rs3848596	C	T	2175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=28;PP=1664;SC=ATCCGGTGGACGGTTCTGTGG;SOR=1.042;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=41;TCR=28;TR=69;WE=33635769;WS=33635751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	33635853	rs3848597	G	A	1823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=36;PP=1152;SC=CCTTTCCCTCGTCTTACACTG;SOR=2.885;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=44;WE=33635861;WS=33635843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	33635877	rs3848598	T	C	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.94;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	33635887	rs3848599	T	G	1561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.38;SOR=4.921;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	33635991	rs10410058	G	A	137.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=3;PP=79;SC=GGTCTCAAGCGATTCTCCTCC;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=33635999;WS=33635981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	33636010	rs10411610	C	T	143.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=3;PP=85;SC=CCTGCATTGGCCTCCCAAAGT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=33636018;WS=33636000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	33642273	rs12327849	A	C	321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=239;SC=CCCATTCATGACTTCCTGAAT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=33642281;WS=33642263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	33663189	rs10422125	T	G	259.53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.036;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.8374;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=179;ReadPosRankSum=-0.674;SC=GATTGTTGAATGACATTCCTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=33663197;WS=33663179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr19	33698448	rs3745973	G	A	1504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=22;PP=1191;SC=CAATGCTGGAGGCCAGCGATG;SOR=0.823;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=24;TCR=22;TR=46;WE=33698456;WS=33698438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	33792631	rs34529039	C	A	1122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=33;PP=1045;SC=TGGGCACGGGCGTGGGCGGCG;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=34;WE=33792639;WS=33792621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	33953743	rs6510386	A	G	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=1;PP=410;SC=GGGCGCAGTCAGAAGAAAAAT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=33953751;WS=33953733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	33968814	rs35273650	GA	G	1148.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=2;PP=1285;SC=AAGCAAAACAGAAAAGGCTAT;SOR=4.977;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=34;WE=33968822;WS=33968804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	33984050	rs10411395	T	C	1785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=8;PP=1410;SC=TCAAGGCACTTGGATAACAGG;SOR=3.139;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=45;TCR=8;TR=53;WE=33984058;WS=33984040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	34302673	.	C	CT	99.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.483;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=3.608;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=1.912;QD=1.28;ReadPosRankSum=0.630;SOR=1.539;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,16:0.21:78
chr19	34303985	rs117133644	C	A	3354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=43;PP=2793;ReadPosRankSum=1.825;SC=GCCCAGCGAGCACCAGGGTCC;SOR=0.344;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=59;TCR=43;TR=101;WE=34303993;WS=34303975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,103:0.99:104
chr19	34687746	rs3119815	C	A	551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=16;PP=453;SC=AACTCAACACCAACTATTAGA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=34687754;WS=34687736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	34706440	rs57270694	A	G	1252.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=16;PP=1079;SC=ATTTCTAACTATGGAAGTTTT;SOR=0.914;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=21;TCR=17;TR=37;WE=34706448;WS=34706430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	34710532	rs2297521	A	G	1063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=15;PP=792;SC=TGTGAATTACAGATGTTTCTC;SOR=0.984;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=19;TCR=15;TR=34;WE=34710540;WS=34710522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	34710807	rs2599557	A	C	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=24;PP=802;SC=CTGTTCTTTTATCTTATGATA;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=34710815;WS=34710797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	34712654	rs536367	C	T	2632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.526;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=50;PP=2046;ReadPosRankSum=-0.214;SC=GTAAGTGTTACTGTTAATAAA;SOR=1.088;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=85;TCF=34;TCR=51;TR=82;WE=34712662;WS=34712644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,86:0.97:89
chr19	34712736	rs537252	T	C	1019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=28;PP=852;SC=GTGAATTGTTTTGAGGACATT;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=34712744;WS=34712726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	34717269	rs67394960	CAT	C	221.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=218;SC=CTCCTGTCCCCATCTCTTTCT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=6;WE=34717278;WS=34717259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
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chr19	34838998	rs328406	C	T	210.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=5;PP=143;SC=AGGTGTCCCCCGAGGGGCCTG;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=34839006;WS=34838988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chr19	34843761	rs397414	C	A	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=8;NR=23;PP=821;SC=AGACCCCACCCCAGCCCCCAC;SOR=2.235;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=34843769;WS=34843751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	34843874	rs72121022	AGCCTGCCT	A	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;MQ=61.07;NF=0;NR=7;PP=1337;SC=CAGGCCAGCCAGCCTGCCTGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=7;WE=34843889;WS=34843864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	34859457	rs2099099	G	A	1257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=3;PP=1124;ReadPosRankSum=-0.971;SC=GTTGGGGGGGGCAGTCTTTAT;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=41;WE=34859465;WS=34859447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr19	34885006	rs8108038	A	G	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=35;PP=1076;SC=GGAGTCAGCAAGATTTGTGGG;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=40;WE=34885014;WS=34884996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	34890322	rs2301263	G	A	1409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=21;PP=1127;SC=GGCTTGGGGCGTGCCTGGCTT;SOR=0.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=22;TCR=21;TR=43;WE=34890330;WS=34890312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	34904539	rs9653103	C	G	53.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	34922865	rs3217243	T	TGTATAAA	828.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=11;PP=746;SC=ATTGCAAAGTTGTATAAGGGT;SOR=2.531;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=12;WE=34922873;WS=34922855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	34942872	rs2161472	A	T	1153.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=32.05;ReadPosRankSum=-1.520;SOR=4.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr19	34954873	rs10412944	C	G	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=362;SC=TTTAAAAAATCAACCTGACTG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=34954881;WS=34954863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	34959812	rs7258977	A	G	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=0;PP=942;SC=CGTAATGTGTAAAGTGAAAAT;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=34959820;WS=34959802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	34959979	rs7259160	A	G	2180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=33;PP=1762;SC=TAGTTGATTCAGATGAAGAAG;SOR=0.779;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=36;TCR=33;TR=69;WE=34959987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	34971763	rs7257588	T	C	1194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=8;PP=995;SC=CCCTGACAGATAACGGTTTGG;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=29;TCR=8;TR=37;WE=34971771;WS=34971753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	34971846	rs4344866	C	T	1330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=27;PP=1117;SC=CCCTAGTCACCTCTCGATTCC;SOR=1.501;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=41;WE=34971854;WS=34971836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	34971998	rs7248705	G	A	1050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=9;PP=917;SC=GGGGAGGCTCGCCGCCCACCG;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=34972006;WS=34971988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	34972146	rs7248847	G	C	1508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=21;PP=1142;SC=TTCAGAGGCCGGTGCGCGGCC;SOR=1.136;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=30;TCR=21;TR=51;WE=34972154;WS=34972136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	34972892	rs12609305	A	C	68.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=1;PP=47;SC=GCAGCGCTCCAGGGCGGGCGC;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=34972900;WS=34972882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	34973413	rs1465433	T	C	92.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=2;PP=56;SC=CGGGGCCGGCTCCCTTCCCGC;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=34973421;WS=34973403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	34973476	.	G	A	130	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=3;NR=4;PP=130;QD=23.5387446496;SC=GCGCGGCCGAGCGGCGGCTGG;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=34973484;WS=34973466;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	34981191	rs2902629	A	G	779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=1;PP=607;SC=CCCCAGGTCAAGCGGGTGGGC;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=34981199;WS=34981181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	34985369	rs28550036	A	T	1013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=3;PP=845;SC=CGAGGTGTGCACACAGGGAGA;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=28;TCR=3;TR=31;WE=34985377;WS=34985359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	35036089	rs7259820	G	A	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.99;QD=32.56;SOR=3.816;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	35175208	rs2290652	A	G	2895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=25;PP=2189;SC=AAGGATATTTATGATGAAGAT;SOR=1.994;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=68;TCR=25;TR=93;WE=35175216;WS=35175198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr19	35175775	rs11543232	C	T	3827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=76;NR=44;PP=2946;SC=CATCAGAGCACTCACACGGGA;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=76;TCR=44;TR=120;WE=35175783;WS=35175765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr19	35231472	rs11426796	T	TA	602.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=2;PP=492;SC=TTCAAATAGTTAAAAAAAAAC;SOR=4.003;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=22;WE=35231480;WS=35231462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	35270362	rs11673342	G	C	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=3;PP=613;SC=TGAACTCTCTGATGTTTACTG;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=35270370;WS=35270352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	35491326	rs3072398	A	AGCCCT	266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=3;PP=328;SC=CGCGCAGCCCAGCCCTGCCCT;SOR=0.941;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=6;WE=35491334;WS=35491316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	35513896	rs4806072	C	T	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=14;PP=801;SC=CCCCATGCCCCCCAGCTCCCC;SOR=0.760;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=16;TCR=14;TR=29;WE=35513904;WS=35513886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	35533550	rs11399986	A	AC	390.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=11;PP=386;SC=ATGCATCCCCACCCCTGTTAG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=11;WE=35533558;WS=35533540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	35541330	rs57035236	TA	T	353.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=4;PP=336;SC=CTGTCCCTGGTAATTAGCTCC;SOR=1.270;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=10;WE=35541338;WS=35541320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	35551225	rs3830343	G	GC	3179.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=45;PP=2969;SC=CCCTGTCGCCGCCCCCTGCTG;SOR=0.909;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=106;TCF=46;TCR=60;TR=82;WE=35551233;WS=35551215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr19	35556300	rs2305746	A	G	1738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=28;PP=1366;SC=ACTCTGAACTAGGCTGGGGAT;SOR=0.804;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=54;TCF=25;TCR=29;TR=53;WE=35556308;WS=35556290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	35556640	rs1688031	T	C	1267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=39;PP=1054;SC=GGGATGGAGATGCAGGGGAGT;SOR=4.223;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=43;WE=35556648;WS=35556630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	35556659	rs1672991	A	G	966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=24;PP=787;SC=GTGGGTGGTCAGGCTCCCCAT;SOR=3.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=28;WE=35556667;WS=35556649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	35556744	rs1688030	T	C	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=15;PP=782;SC=ACTTTGGCCTTCAGCCAGACC;SOR=0.997;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=26;WE=35556752;WS=35556734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	35557260	rs1042328	T	G	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=47;PP=1416;SC=ACGCTGGGCCTAGGATGGGAC;SOR=6.358;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=48;WE=35557268;WS=35557250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	35590180	rs1687994	T	A	1571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=30;PP=1250;SC=CCTGTGGGTGTGACATGCATA;SOR=1.562;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=16;TCR=30;TR=46;WE=35590188;WS=35590170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	35597215	rs10422803	C	A	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=249;SC=TTGTGCCGAGCCTGCCCTGCC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=35597223;WS=35597205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	35597352	rs2445826	T	C	1550.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=9;PP=1197;SC=ACCACCCGGCTGGGGAGGCCT;SOR=2.655;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=45;WE=35597360;WS=35597342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	35597462	rs10424084	A	G	4948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.258;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=43;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.851;SC=CAGAGATGTGAGACCCTCAGG;SOR=1.776;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=104;TCR=44;TR=147;WE=35597470;WS=35597452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,150:0.99:151
chr19	35597620	rs10423723	C	T	3301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=67;PP=2569;SC=CAGCTCATTGCGCCTTTTCAA;SOR=1.480;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=36;TCR=68;TR=103;WE=35597628;WS=35597610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr19	35597729	rs7258700	C	T	2073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.111;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=39;PP=1604;ReadPosRankSum=-0.779;SC=GAGAGAGCCCCGACCTGATGA;SOR=1.051;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=64;TCF=25;TCR=39;TR=63;WE=35597737;WS=35597719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr19	35602014	rs4806085	T	C	2801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=44;PP=2182;SC=GTGTCAACCATGCCCCGAGGC;SOR=0.919;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=54;TCR=44;TR=98;WE=35602022;WS=35602004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	35602338	rs11665663	T	C	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=15;PP=473;SC=TTTAAATGTTTGCAATTATTA;SOR=1.220;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=9;TCR=15;TR=24;WE=35602346;WS=35602328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	35602445	rs199877070	TGGG	T	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=4;PP=79;SC=TGAGTCAGGCTGGGGGGGGGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=35602455;WS=35602435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	35612159	rs2290649	C	G	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=16;PP=824;SC=GGTGAGAGCCCGTGCCCCCTT;SOR=1.096;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=22;TCR=16;TR=38;WE=35612167;WS=35612149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	35614253	rs112343981	G	GGT	1257.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=6;PP=1242;SC=ACACGGAAGTGGTGTGTGTGT;SOR=2.012;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=25;WE=35614261;WS=35614243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	35614336	rs1672974	T	C	1709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=34;PP=1402;SC=ACCCCATCACTTCCCGCAGGC;SOR=1.436;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=52;WE=35614344;WS=35614326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	35616087	rs3826989	G	A	3268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=29;PP=2592;SC=CCAGAGTCCCGTTGGTGGTCT;SOR=1.902;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=72;TCR=29;TR=101;WE=35616095;WS=35616077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr19	35622695	rs1673007	A	G	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=5;PP=675;SC=AGCCTCACACATGAGTAAGGG;SOR=2.621;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=35622703;WS=35622685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	35624890	rs11666576	C	T	1469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=8;PP=1136;SC=TGTGCATAAACGCACACTCCC;SOR=2.786;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=43;WE=35624898;WS=35624880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	35642651	rs36072726	G	T	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=35;PP=1070;SC=AAGGGAAGTCGCGGGGATGGA;SOR=3.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=41;WE=35642659;WS=35642641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	35649324	rs1633915	C	G	1584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=38;PP=1332;SC=CAGGGGCAGGCGGCGGGGACA;SOR=3.352;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=45;WE=35649332;WS=35649314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	35651531	rs1617607	A	G	1133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=1;PP=971;SC=ATACAGACATAAGCCACCGCG;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=33;WE=35651539;WS=35651521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	35655151	rs1672994	T	C	1953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=54;PP=1626;SC=GCCATCTGGTTAGTAACTGCC;SOR=5.856;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=56;TCF=2;TCR=54;TR=56;WE=35655159;WS=35655141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	35657351	rs8106303	A	C	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=16;PP=674;SC=AGCTGCATATACATACAAACC;SOR=0.976;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=12;TCR=16;TR=28;WE=35657359;WS=35657341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	35660450	rs2285515	T	C	1840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=31;PP=1327;SC=CGTGACTGAATCATTTCCTTC;SOR=1.071;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=23;TCR=31;TR=54;WE=35660458;WS=35660440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	35660508	rs12110	G	A	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=29;PP=1088;SC=TGCCGGAATCGTTGCAGGTGA;SOR=1.659;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=35660516;WS=35660498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	35660546	rs1046294	T	C	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=24;PP=632;SC=GCTGACAACCTGCTGGGCACC;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=8;TCR=24;TR=32;WE=35660554;WS=35660536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	35715641	rs2291532	G	A	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=347;SC=CCTGGGCTACGGGGCACCGGG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=35715649;WS=35715631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	35718819	rs542977	C	A	1118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=0;PP=997;ReadPosRankSum=-1.096;SC=GATCCCCTGACCGGAAGAATC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=36;WE=35718827;WS=35718809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,35:0.95:37
chr19	35719020	rs541169	C	T	5760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=111;NR=67;PP=2965;SC=AGCGGCTAGACCACACCAGCA;SOR=1.342;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=179;TCF=112;TCR=67;TR=178;WE=35719028;WS=35719010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr19	35719106	rs565791	A	G	5912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=109;PP=2965;SC=AGGCGTTTACACTCGCCCGGC;SOR=1.003;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=194;TCF=85;TCR=109;TR=194;WE=35719114;WS=35719096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr19	35739702	rs16970163	G	A	1181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=10;PP=931;SC=GGAGGACCGCGGCGGGTCAAG;SOR=2.133;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=26;TCR=10;TR=36;WE=35739710;WS=35739692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	35757427	rs34259399	G	A	1334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=32;PP=1134;SC=GTTGACAGGAGTAGCTCAGGT;SOR=2.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=41;WE=35757435;WS=35757417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	35758275	rs142507475	G	GGGA	3674.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=14;PP=2900;SC=GAGTAATGGTGGGAGAAGCCG;SOR=2.804;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=73;TCF=54;TCR=19;TR=62;WE=35758283;WS=35758265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	35760930	rs150053370	TG	T	112.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=86;SC=CACCCCTGGGTGGGGGGGGGA;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=5;WE=35760938;WS=35760920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	35786868	rs2301600	C	T	2691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=54;PP=2099;SC=CAGAGCACAGCGTCCTGGATA;SOR=1.230;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=34;TCR=54;TR=88;WE=35786876;WS=35786858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	35793589	rs1126770	C	T	3353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=76;PP=2768;ReadPosRankSum=-0.281;SC=AGAGGGCCACCGCCTTCAACC;SOR=0.582;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=106;TCF=28;TCR=78;TR=104;WE=35793597;WS=35793579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,108:0.98:110
chr19	35800720	rs10411883	G	C	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=0;PP=114;SC=AGGAGTCTCCGGGGCCGGGCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=35800728;WS=35800716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	35832910	.	GTCCTTCCTTCCTTCCT	G	2998	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=59.5;NF=4;NR=14;PP=2998;QD=20;SC=GTGGTGGTCAGTCCTTCCTTC;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=18;WE=35832933;WS=35832900;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:18,18:0.50:36
chr19	35836751	rs4805119	A	G	912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=27;PP=775;SC=CCTCATTCCCACTCGGCAACA;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=35836759;WS=35836741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	35836859	rs4805120	A	G	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=1;PP=447;SC=TCAAGACCTCATGATACACAC;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=35836867;WS=35836849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	35843086	rs2301151	G	A	3248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=74;PP=2509;SC=GCACTGGCCCGCTCCGGCCTG;SOR=1.915;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=28;TCR=74;TR=102;WE=35843094;WS=35843076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr19	35850416	rs146211359	G	A	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.97;QD=29.98;SOR=4.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	35863180	rs201159994	A	G	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=3.565;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.49;MQRankSum=-1.572;QD=8.71;ReadPosRankSum=-0.846;SOR=0.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr19	35979464	rs10407971	G	A	2396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=48;PP=2036;SC=CTCTGGAGAAGGTGAAGGAAC;SOR=1.778;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=21;TCR=48;TR=69;WE=35979472;WS=35979454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	35979745	rs10408664	G	A	1842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=49;PP=1514;SC=CTTTCTTCCTGGAAAAGGAGA;SOR=3.690;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=7;TCR=50;TR=56;WE=35979753;WS=35979735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	35991442	rs909072	T	G	1678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=40;PP=1417;SC=CACCTGATCGTCTCTGCCTGC;SOR=2.215;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=53;WE=35991450;WS=35991432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	35993661	rs11084816	C	T	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=5;PP=532;SC=AGGGTGGCTGCCTTGAGGGAG;SOR=1.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=15;TCR=5;TR=20;WE=35993669;WS=35993651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	35994376	rs149163465	GTT	G	401.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.61;QD=44.64;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	35994384	rs3829678	T	G	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.75;QD=41.08;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	35994390	rs3829677	T	G	376.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.61;QD=41.86;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	35997363	rs6510492	C	T	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=6;PP=795;SC=ACACCTCAAGCAAATGAGATT;SOR=2.964;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=35997371;WS=35997353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	35997644	rs6510494	C	G	597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=534;SC=GGCTGGGCATCGTGGGTCACG;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=35997652;WS=35997634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	35998213	rs4358061	A	C	2281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=17;PP=1812;SC=GGATCCCAGAACCCTGTTTTG;SOR=2.400;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=55;TCR=17;TR=72;WE=35998221;WS=35998203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	35998362	rs4254439	T	G	2788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=62;PP=2253;SC=AGGCTCACCCTATAATTGTCT;SOR=1.744;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=89;TCF=27;TCR=62;TR=88;WE=35998370;WS=35998352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	35999251	rs11084818	C	G	1797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=41;PP=1396;SC=TAATGGCACTCTCTTTTGGAA;SOR=2.262;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=13;TCR=41;TR=54;WE=35999259;WS=35999241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	36002361	.	ACTGCTGCCACCACTGCTGCCGCCACTGCTGCCGCCACTGCTGCTGCCACTG	A	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=18.43;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr19	36002710	rs4806162	C	A	2878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=35;PP=2265;SC=GTGGGGGATTCGTGCACTGTC;SOR=1.055;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=53;TCR=35;TR=87;WE=36002718;WS=36002700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr19	36003430	rs7254784	C	T	3760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=52;PP=2965;SC=CAGGGAGGCACGCGGAGCATG;SOR=0.936;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=118;TCF=65;TCR=53;TR=117;WE=36003438;WS=36003420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr19	36003721	rs7254211	G	A	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=13;PP=453;SC=TGCACTTAGTGGGACCATCTC;SOR=2.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=36003729;WS=36003711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	36004106	rs4806163	A	G	5645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=101;PP=2965;SC=AGCATCTGCTACGCCAAAGCC;SOR=1.121;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=171;TCF=70;TCR=101;TR=171;WE=36004114;WS=36004096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr19	36004171	rs12460932	C	A	3596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.586;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=77;PP=2965;ReadPosRankSum=1.752;SC=GGCCAAGGGCCTCACTGACTT;SOR=1.351;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=117;TCF=39;TCR=78;TR=115;WE=36004179;WS=36004161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,114:0.99:115
chr19	36015727	rs73030916	G	T	5452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=114;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.858;SC=ACTCCCAGGGGCCTCCTCTCC;SOR=0.719;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=172;TCF=57;TCR=115;TR=171;WE=36015735;WS=36015717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,175:0.99:176
chr19	36015865	rs2285511	A	C	1074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.81;SOR=6.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	36017615	rs116935689	G	A	2668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=19;PP=2117;SC=GCTCCTTCCCGGCCTGGCCAG;SOR=2.476;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=63;TCR=19;TR=82;WE=36017623;WS=36017605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr19	36017928	rs10775583	G	C	5826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=92;NR=85;PP=2965;SC=AAACTGCCCCGCCTCCCTTCC;SOR=0.738;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=92;TCR=85;TR=177;WE=36017936;WS=36017918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr19	36018272	rs12461911	C	T	4128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=78;NR=51;PP=2965;SC=CGGCCTGCCCCGCAGCATGGT;SOR=1.135;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=79;TCR=52;TR=129;WE=36018280;WS=36018262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr19	36024296	rs74409639	G	A	1874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=3;PP=1521;SC=CCTCGGCGACGTCACTGGGTA;SOR=4.768;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=52;TCR=3;TR=55;WE=36024304;WS=36024286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	36033460	rs2239945	C	T	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=15;PP=1007;SC=CAATGTTCGTCATGGGTGTCA;SOR=1.455;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=26;TCR=15;TR=41;WE=36033468;WS=36033450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	36038221	rs759996	T	C	3357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=65;PP=2456;SC=GACATTTTCCTGCAGGACCTT;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=49;TCR=65;TR=114;WE=36038229;WS=36038211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr19	36038390	rs7599	A	G	1659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=41;PP=1258;SC=TCCCTGCCTCACTCCAGGTTT;SOR=2.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=11;TCR=41;TR=52;WE=36038398;WS=36038380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	36042187	.	G	T	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=1;PP=685;SC=TGTGGAGGGGGCCGTGGGGGG;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=36042195;WS=36042177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	36042207	rs2301617	C	T	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=1;PP=660;SC=GAGTTATTGGCCAGTTAGAAA;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=36042215;WS=36042197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	36044524	rs2251124	G	A	598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=4;PP=436;SC=AGAACCAGCCGGAGCCCAAGG;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=36044532;WS=36044514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	36045772	rs2733739	A	G	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=1;PP=528;SC=TCCATCTGCAAGCAAGTGTCT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=36045780;WS=36045762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	36050969	rs2733743	A	G	3808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=94;PP=2965;SC=CAGGCCCTGCACGGTGCCTGC;SOR=3.184;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=20;TCR=94;TR=114;WE=36050977;WS=36050959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr19	36054018	rs7247310	C	T	491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.98;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	36054032	rs57302216	C	T	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.90;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	36054605	rs73597298	T	G	623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=18;PP=475;SC=GGGAGGGCGGTGGGGTGGAGC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=36054613;WS=36054595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	36207510	rs1052491	G	A	2881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=33;PP=2274;SC=GTCCCAGCCTGGCCTCCATGC;SOR=1.240;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=55;TCR=33;TR=87;WE=36207518;WS=36207500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr19	36214632	rs11373774	A	AG	1181.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=11;PP=1090;SC=CTGTTCCCGCAGCCGGACGAT;SOR=1.044;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=25;WE=36214640;WS=36214622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	36223111	rs61351824	C	G	3595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=47;PP=2746;SC=ACCCTCCCCCCACAGGAAGTC;SOR=1.197;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=73;TCR=47;TR=120;WE=36223119;WS=36223101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr19	36228954	rs2242522	G	T	3525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=59;PP=2835;SC=TGTTCATCCTGCCCTGCAGAT;SOR=0.849;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=48;TCR=59;TR=107;WE=36228962;WS=36228944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	36230423	rs147295574	C	A	2539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.171;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=31;PP=2193;ReadPosRankSum=0.386;SC=TGGGCCATACCCCCACCTGGC;SOR=1.084;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=86;TCF=54;TCR=32;TR=84;WE=36230431;WS=36230413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,80:0.99:81
chr19	36236120	rs231597	A	G	4239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=57;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.724;SC=AACCCTGGAAAAGGTGCAAAG;SOR=0.300;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=68;TCR=57;TR=124;WE=36236128;WS=36236110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,129:0.99:130
chr19	36243089	rs170758	T	C	2761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=36;PP=2181;ReadPosRankSum=-0.898;SC=CTGGAGATGGTCAAAGCCCGG;SOR=0.380;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=52;TCR=36;TR=87;WE=36243097;WS=36243079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,90:0.99:91
chr19	36243813	rs231243	G	A	1460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=13;PP=1166;SC=CTCCCTACGCGGGCCATCTGC;SOR=1.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=41;WE=36243821;WS=36243803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	36258937	rs5827939	AG	A	2373.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=35;PP=2484;SC=CTGCTTGCCCAGGGCCGCCCT;SOR=0.880;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=65;TCF=27;TCR=38;TR=62;WE=36258945;WS=36258927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	36279862	rs59882609	AG	A	614.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=554;SC=ATCTGCAGAGAGGGGAACCAT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=36279870;WS=36279852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	36302921	rs12462360	T	C	2552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=39;PP=1994;SC=AGGAGGCTCCTGGCCTTCTGA;SOR=0.867;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=44;TCR=39;TR=83;WE=36302929;WS=36302911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	36317556	rs77309273	C	A	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=11;PP=423;SC=CCCTGACAGGCAAAAAGTGGA;SOR=0.914;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=19;WE=36317564;WS=36317546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	36321910	rs731934	G	A	2066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=34;PP=1612;SC=TCCAGGCGTCGGGGGTACCTC;SOR=0.849;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=29;TCR=34;TR=63;WE=36321918;WS=36321900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	36322270	rs2071327	C	T	4332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=60;PP=2965;SC=GGTCCTCTTCCGACCTTCCAG;SOR=0.883;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=133;TCF=72;TCR=61;TR=132;WE=36322278;WS=36322260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr19	36336437	rs201239200	T	C	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=40.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.14;ReadPosRankSum=-3.292;SOR=4.797;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,10:0.30:33
chr19	36342212	rs3814995	C	T	4354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.429;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=69;PP=2965;ReadPosRankSum=0.053;SC=GGCCCCATCTCAGAGCGGCCG;SOR=0.311;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=135;TCF=66;TCR=69;TR=133;WE=36342220;WS=36342202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,140:0.99:142
chr19	36353421	.	G	C	1454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.357;ClippingRankSum=0.000;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.263;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=45;PP=1134;ReadPosRankSum=-0.888;SC=GCGGATAGTGGCCGGAGTGGC;SOR=1.306;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=131;TCF=34;TCR=97;TR=57;WE=36353429;WS=36353411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,59:0.44:135
chr19	36355595	rs382789	A	G	1249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=14;PP=954;SC=TCTGGAGGAGAAAGGGACTCT;SOR=1.236;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=38;WE=36355603;WS=36355585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	36435936	rs144984680	CT	C	78.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=3;PP=118;SC=GCGCCCCCCCCTCTAAGGGTC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=36435944;WS=36435926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	36486445	rs7249826	G	C	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=16;NR=6;PP=565;SC=GGCGTGGGTTGCCAGCCTGAC;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=22;WE=36486453;WS=36486435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	36497358	rs2285422	C	G	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=3;PP=547;SC=GGGGCCCCCTCTGGCCACACA;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=36497366;WS=36497348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	36549690	rs11538454	C	T	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=2;PP=1020;SC=AGGTGTCACTCGAGAAGGTGC;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=37;WE=36549698;WS=36549680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	36564653	rs11669890	C	T	1262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=34;PP=976;SC=GTGAATAACACGCCAAGCAGC;SOR=4.021;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=38;WE=36564661;WS=36564643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	36575645	rs2301734	G	A	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=16;PP=675;SC=AGCCAGAGACGGGTGAGCCCG;SOR=1.071;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=11;TCR=16;TR=27;WE=36575653;WS=36575635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	36584904	rs2301737	C	T	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=3;PP=359;SC=CCTGTATTCTCTCCTTACCAT;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=36584912;WS=36584894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	36595436	rs1008328	A	C	3289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=41;PP=2664;SC=TTGGTCTGTTACAGGGCAGCC;SOR=1.190;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=58;TCR=41;TR=99;WE=36595444;WS=36595426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	36602097	rs2075472	C	T	621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=18;NR=1;PP=545;SC=GAGAGCCTTCCGGAGGGCATG;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=36602105;WS=36602087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	36640642	rs17879464	G	A	2438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.294;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=34;PP=1891;ReadPosRankSum=-0.802;SC=TTTGCCAGCCGTCCCTGGGTG;SOR=0.470;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=76;TCF=41;TCR=35;TR=75;WE=36640650;WS=36640632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,78:0.99:79
chr19	36640769	rs14100	T	C	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=32;PP=718;SC=GCCCCCTCACTGCCTTGCTAT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=36640777;WS=36640759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	36642310	rs2008683	T	C	1283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=1;PP=1125;SC=CAGCCACCTCTTACTCTGGGT;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=38;WE=36642318;WS=36642300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	36642561	.	G	GC	1754.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.02;QD=41.78;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	36642562	rs2285599	A	C	1763.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=29;PP=1036;SC=ACCCCCCCCGACCCCCCACCT;SOR=2.247;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=36;WE=36642570;WS=36642550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	36674305	rs4805162	A	G	1594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=17;PP=1322;SC=ACCAGTGTGAATTTTCTGATG;SOR=1.378;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=47;TCF=30;TCR=17;TR=46;WE=36674313;WS=36674295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	36685310	rs2287897	C	T	1173.53	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=3.531;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=36.67;ReadPosRankSum=0.788;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,30:0.94:32
chr19	36685316	rs2287898	T	C	1141.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=4.102;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=40.78;ReadPosRankSum=0.625;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,26:0.93:28
chr19	36858944	rs11084857	A	G	1903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=50;PP=1424;ReadPosRankSum=-0.021;SC=CATCATAAATATGAAAACTTT;SOR=1.863;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=7;TCR=52;TR=57;WE=36858952;WS=36858934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,62:0.97:64
chr19	36885067	rs17206365	A	T	965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=20;PP=705;SC=AAAAGAAGCAACATTTCTAAT;SOR=1.681;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=36885075;WS=36885057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	36981218	rs2967473	G	A	2703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=62;PP=2078;SC=AATGAGTGGGGCAGGAAGTAA;SOR=1.890;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=26;TCR=62;TR=88;WE=36981226;WS=36981208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
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chr19	37039069	rs2912444	A	C	4226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=68;PP=2965;SC=GGTCCTTGTAAGTCAATCTTG;SOR=0.734;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=74;TCR=68;TR=142;WE=37039077;WS=37039059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
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chr19	37134864	rs62112477	C	T	207.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=6;PP=168;SC=GACAGAGTTTCGCTCTTGTTG;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=37134872;WS=37134854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	37147330	rs12981751	T	G	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=880;ReadPosRankSum=-1.047;SC=TGCAAGAGCTTCCTGTGCTTG;SOR=0.507;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=36;WE=37147338;WS=37147320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr19	37203249	rs1830031	T	C	1019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=2;PP=833;SC=TGTACCTGGCTAAGTCCACCT;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=37203257;WS=37203239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	37210529	rs3108200	A	G	2473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=33;PP=1995;ReadPosRankSum=-0.738;SC=ATCATCAGAGAACTCACACAG;SOR=0.269;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=39;TCR=33;TR=71;WE=37210537;WS=37210519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,74:0.99:75
chr19	37210805	rs3108201	C	T	4705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=70;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.909;SC=AGAAACCCTACATTTGTAAAG;SOR=0.245;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=74;TCR=70;TR=143;WE=37210813;WS=37210795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,150:0.99:151
chr19	37241141	rs1673082	A	G	5018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=75;PP=2965;SC=GTTGAATAAGATGTGCAGACG;SOR=0.744;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=154;TCF=79;TCR=75;TR=154;WE=37241149;WS=37241131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr19	37241781	rs2462576	G	A	256.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=1;NR=6;PP=183;SC=GGTAGAAAGGGGAGACAAACT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=37241789;WS=37241771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	37690375	rs73023557	C	T	1480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=6;PP=1200;ReadPosRankSum=-0.791;SC=TACAGTGAGCCGTGATTGCAC;SOR=2.215;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=43;WE=37690383;WS=37690365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
chr19	37690420	rs1234250	C	T	2058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=25;PP=1471;SC=AGTGAGACCCCGTTTCAAAAA;SOR=1.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=34;TCR=25;TR=59;WE=37690428;WS=37690410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	37721404	rs56895666	T	TA	748.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.938;HP=14;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.018;NF=2;NR=38;PP=400;ReadPosRankSum=-0.642;SC=ACATTTAGTTTAAAAAAAAAA;SOR=0.307;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=80;TCF=7;TCR=73;TR=40;WE=37721412;WS=37721394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,42:0.66:64
chr19	37726433	rs320880	G	A	3272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=14;PP=2635;SC=CAAGTAATACGTATGTTTATT;SOR=3.486;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=103;TCF=88;TCR=15;TR=101;WE=37726441;WS=37726423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr19	37864925	rs61161652	A	AC	1631.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=4;PP=1778;SC=CCACCCCGCCACCCTGGCCAG;SOR=3.702;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=46;TCF=42;TCR=4;TR=43;WE=37864933;WS=37864915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	37879852	rs376931538	C	CTGTG	5204.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=44;PP=2918;SC=TGGAGAAAAACCATATGCATG;SOR=1.308;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=93;TCF=26;TCR=67;TR=66;WE=37879862;WS=37879842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr19	37879854	rs200420244	AT	A	5204.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=44;PP=2965;SC=GAGAAAAACCATATGCATGCA;SOR=1.115;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=21;TCR=45;TR=65;WE=37879862;WS=37879842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr19	37880650	rs200623828	T	C	3729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=56;PP=2860;SC=TCATCAGATCTTGTCCCTAAG;SOR=0.710;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=55;TCR=56;TR=111;WE=37880658;WS=37880640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr19	37918609	rs7254009	C	T	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=375;SC=AATCATGATGCTTGCAATAAA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=37918617;WS=37918599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	37958973	rs35295578	GT	G	605.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=25;PP=359;SC=TGCCTTTCGTGTTTTTTTTTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=25;WE=37958981;WS=37958963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	37966661	rs1236810	A	G	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=209;SC=CCCTGAGTACAAATATGATAA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=37966669;WS=37966651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	38027957	rs45593644	A	G	4875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=68;PP=2965;ReadPosRankSum=0.964;SC=TTTTTCTTCAATCCAGAGCCC;SOR=0.269;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=146;TCF=78;TCR=68;TR=145;WE=38027965;WS=38027947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,150:0.99:151
chr19	38033251	rs9797618	C	T	67.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.64;QD=22.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	38040076	rs1564206	C	T	1904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=49;PP=1422;SC=TGCCTGTGTTCCCCGGGGCGC;SOR=6.701;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=50;TCF=1;TCR=49;TR=50;WE=38040084;WS=38040066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	38046967	rs10420552	G	A	1111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=16;PP=793;SC=TCCACATCCAGTTTGGCTCCT;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=19;TCR=16;TR=35;WE=38046975;WS=38046957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	38047075	rs10420268	A	G	745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=16;PP=559;SC=TGGGAACAGTACACATAAATC;SOR=2.400;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=38047083;WS=38047065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
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chr19	38091932	rs1975937	A	T	1791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=1;PP=1503;SC=TCAAAGCCAGATGTGATTACC;SOR=6.630;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=55;TCF=54;TCR=1;TR=54;WE=38091940;WS=38091922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
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chr19	38314767	rs2305105	A	G	3168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=40;PP=2261;ReadPosRankSum=1.052;SC=GAAGTGACAAAAGAACAAATG;SOR=0.337;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=51;TCR=40;TR=90;WE=38314775;WS=38314757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr19	38376485	rs10408510	T	A	3419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=58;PP=2806;SC=AATGGCTTCATGTTTGGCCAG;SOR=1.094;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=102;TCF=44;TCR=58;TR=102;WE=38376493;WS=38376475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr19	38377409	rs7252765	A	T	975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.49;QD=29.57;SOR=1.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	38377564	rs7253969	T	C	7969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=151;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.135;SC=AAAACTTTTCTTTTGGTTTGT;SOR=1.225;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=250;TCF=152;TCR=98;TR=248;WE=38377572;WS=38377554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,253:0.99:255
chr19	38377773	rs34785154	G	A	5498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.557;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=75;PP=2965;ReadPosRankSum=0.141;SC=CTCTGCTTCCGAGCCAGTTTC;SOR=0.067;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=178;TCF=103;TCR=75;TR=174;WE=38377781;WS=38377763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,174:0.98:178
chr19	38378107	rs60704260	G	A	5665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.987;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.280;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=91;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.794;SC=TGGCAATTTCGCTTTCCTCCA;SOR=0.437;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=174;TCF=83;TCR=91;TR=173;WE=38378115;WS=38378097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,182:0.99:183
chr19	38378539	rs10422056	G	C	6295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=133;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.802;SC=CCAGTATCTTGTTGAACATTC;SOR=0.991;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=51;TCR=135;TR=183;WE=38378547;WS=38378529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,189:0.99:190
chr19	38379446	rs6508750	C	T	5049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.583;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=86;PP=2965;ReadPosRankSum=1.210;SC=TTTTTCAGCTCGGGCTCGTTT;SOR=0.657;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=156;TCF=69;TCR=87;TR=154;WE=38379454;WS=38379436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,161:0.99:162
chr19	38382328	rs953370	C	T	4934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=85;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.196;SC=AAGAAAAAGCCGGCTTTTCAT;SOR=1.026;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=154;TCF=67;TCR=87;TR=151;WE=38382336;WS=38382318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,157:0.99:159
chr19	38384421	rs3894129	C	G	3142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=49;PP=2529;SC=GTCCAGAATGCCTATGAGTCT;SOR=0.848;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=41;TCR=50;TR=90;WE=38384429;WS=38384411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr19	38621473	rs861304	G	A	1091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=31;PP=869;SC=CTGGCATGAGGCCTCCCTGGC;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=38621481;WS=38621463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	38633159	rs2304132	C	T	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=499;SC=CCTCCCAGGGCAGGGGTACCC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=38633167;WS=38633149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	38643511	.	C	G	5063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.766;ClippingRankSum=0.000;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=77;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.645;SC=CCTGCTATCTCTTGATCCCCA;SOR=0.223;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=159;TCF=81;TCR=78;TR=158;WE=38643519;WS=38643501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,166:0.99:167
chr19	38643557	.	C	T	3854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=79;PP=2965;SC=GGCGACTCCTCTTCCGGCGGC;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=120;TCF=41;TCR=79;TR=119;WE=38643565;WS=38643547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr19	38673126	rs3833273	GT	G	874.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=7;PP=650;SC=AATGGATTTGGTTTTTTTTAT;SOR=2.517;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=29;WE=38673134;WS=38673116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	38697054	rs3745946	G	A	401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=274;SC=GGGTCAGCGCGCACAGCCCTC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=38697062;WS=38697044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	38704192	rs28493214	A	G	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=2;PP=554;SC=TCACCAGGGAAGGCTCAGGCA;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=38704200;WS=38704182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	38704561	rs4803871	G	A	181.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=3;PP=87;SC=CCACGTGGCCGGCAGCAGTCC;SOR=2.303;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=38704569;WS=38704551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	38708329	rs2304174	A	C	795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=9;PP=604;SC=TCAGCCAGAGACCTGAGCAGC;SOR=1.136;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=14;TCR=9;TR=23;WE=38708337;WS=38708319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	38708398	rs2304175	A	C	942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=9;PP=712;SC=GTCTCTGGGCACCCCTCTCTC;SOR=1.536;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=20;TCR=9;TR=29;WE=38708406;WS=38708388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	38709532	rs2288907	C	G	4512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=110;NR=21;PP=2965;SC=AGGGGTGAGACGAAGCCATGC;SOR=3.291;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=110;TCR=21;TR=131;WE=38709540;WS=38709522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr19	38709552	rs2288909	C	T	5246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=119;NR=47;PP=2965;SC=CAGCGGGGGTCCCCCAGAGGT;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=166;TCF=119;TCR=47;TR=166;WE=38709560;WS=38709542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr19	38709568	rs2255456	C	T	5575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=67;PP=2965;SC=GAGGTGGGCCCACCTGACAGT;SOR=1.300;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=176;TCF=108;TCR=68;TR=175;WE=38709576;WS=38709558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr19	38778617	rs8104823	A	G	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=25;PP=1100;SC=AGGCCACCGGATGGGTCATTG;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=20;TCR=26;TR=45;WE=38778625;WS=38778607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	38794786	rs76682100	T	G	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=1;PP=267;SC=GGACAGAGGTTGGGTGGGGCG;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=38794794;WS=38794784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	38794895	rs2304176	T	C	1178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=9;PP=945;SC=CAACTTCTCTTACCGCCATGG;SOR=2.179;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=36;WE=38794903;WS=38794885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	38795159	rs2304177	G	A	3325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=51;PP=2965;SC=GGCTGCGGAGGGGCGGGAAGG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=61;TCR=51;TR=112;WE=38795167;WS=38795149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr19	38795250	rs45437199	G	A	4899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=86;NR=77;PP=2965;SC=CCTCACTGCCGCACCTCCATC;SOR=0.743;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=163;TCF=86;TCR=77;TR=163;WE=38795258;WS=38795240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr19	38795546	rs139805446	TGAA	T	2607.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=19;PP=2118;SC=AAGCCCAAAGTGAAGAAGAAG;SOR=1.316;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=55;TCF=29;TCR=26;TR=45;WE=38795556;WS=38795536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	38798086	rs3178327	T	C	2876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=41;PP=2310;SC=CAAAGATGGCTACGCAGCACC;SOR=0.874;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=47;TCR=41;TR=88;WE=38798094;WS=38798076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr19	38800165	rs3900981	C	T	1333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=21;PP=1112;SC=CAGGATAACTCAGGCCACCAG;SOR=0.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=20;TCR=21;TR=41;WE=38800173;WS=38800155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	38817110	rs7250755	A	G	1098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=0;PP=875;SC=AGGATCACTTAGGTCCAGGAG;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=38817118;WS=38817100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	38817486	rs3745951	T	C	6277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=103;PP=2965;SC=CTGTGATCTTTGCCCACCTCG;SOR=0.712;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=206;TCF=103;TCR=103;TR=206;WE=38817494;WS=38817476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr19	38817876	rs34989303	G	A	2967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=63;PP=2321;SC=CTTCCGCCACGTGTCCGACCT;SOR=1.906;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=27;TCR=63;TR=90;WE=38817884;WS=38817866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr19	38826656	rs59898212	G	C	265.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=2;PP=240;SC=TGGGAGCTGGGAGAGGAGGGA;SOR=2.093;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=38826664;WS=38826646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	38826947	rs56849284	T	C	1731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=46;PP=1472;SC=AAGAGACAGTTTTCATCGAGA;SOR=3.342;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=9;TCR=46;TR=55;WE=38826955;WS=38826937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	38827960	rs2302182	T	C	2543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=25;PP=2130;SC=CTGGCAGTGCTCCTGGCGTCG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=52;TCR=25;TR=77;WE=38827968;WS=38827950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	38847431	rs2286475	T	C	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=27;PP=1492;ReadPosRankSum=1.800;SC=GTGAGTATACTCTACTGCTGC;SOR=0.793;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=31;TCR=28;TR=57;WE=38847439;WS=38847421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,61:0.97:63
chr19	38848861	rs8106895	C	G	1304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=4;PP=1099;SC=TGCTCCAGCTCCAGGTTTTGA;SOR=4.021;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=37;TCR=4;TR=41;WE=38848869;WS=38848851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	38850246	rs60071299	G	A	303.41	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=10.792;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.28;ReadPosRankSum=-0.646;SOR=4.972;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,11:0.92:12
chr19	38853297	rs2302183	G	A	2865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=45;PP=2442;ReadPosRankSum=-0.890;SC=GGACACCATCGGAGGGGCGGG;SOR=0.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=90;TCF=44;TCR=46;TR=89;WE=38853305;WS=38853287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,91:0.99:92
chr19	38853511	.	G	GTT	109.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,0:0:0
chr19	38905683	rs10412098	A	G	803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=17;PP=608;SC=GCAGCCGGAAACCCGCGCAGC;SOR=2.215;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=24;TCF=6;TCR=18;TR=23;WE=38905691;WS=38905673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	38910987	rs80159218	G	A	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=19;PP=541;SC=GAATTTCTAGGTGCTGAGCTA;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=38910995;WS=38910977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	38912597	rs4310986	G	A	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=6;PP=516;SC=CTGCTGGGGAGAGGACACTTA;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=38912605;WS=38912587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	38912764	rs892055	A	G	2297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=17;PP=1829;SC=TCGCCCTCCTATTTTTCCGGT;SOR=2.082;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=51;TCR=17;TR=68;WE=38912772;WS=38912754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	38935366	rs57132842	C	T	2600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=49;PP=1977;SC=CAAAACAGACCCTTAATGTTG;SOR=1.055;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=35;TCR=49;TR=84;WE=38935374;WS=38935356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr19	38939408	rs10406027	T	C	1829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=50;PP=1401;SC=TCACCTATGCTGCTCCAGACC;SOR=2.730;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=13;TCR=50;TR=63;WE=38939416;WS=38939398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	38939505	rs4476278	T	C	673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=18;PP=543;SC=ATCGCTTGAGTCCAGGAGGTC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=38939513;WS=38939495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	38942714	rs4802469	G	A	863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=473;SC=GGATCGCTTGGGCCCAGGAGC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=38942722;WS=38942704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	38943728	rs12460768	G	A	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=15;PP=529;SC=GGGCCACGGCGCTGGGCGGGG;SOR=2.200;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=38943736;WS=38943718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	38945851	rs7254832	T	C	1185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=9;PP=1011;SC=CCTATTGTGATGCCTCTTATT;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=38;WE=38945859;WS=38945841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	38946182	rs2288888	G	A	2906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=77;PP=2493;SC=TGGAGGCCTCGTCTGGTAGGA;SOR=3.309;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=93;TCF=16;TCR=77;TR=92;WE=38946190;WS=38946172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	38946215	rs2288889	G	C	2371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=62;PP=1892;SC=GTGGGACAGAGGCTTGTGGGA;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=83;TCF=20;TCR=63;TR=81;WE=38946223;WS=38946205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	38948356	rs2071085	T	C	3346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=69;PP=2644;SC=ATGGATGTCCTTTCCTTAATC;SOR=1.879;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=27;TCR=69;TR=96;WE=38948364;WS=38948346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr19	38949904	rs3745847	C	T	2034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=26;PP=1577;SC=ACGGCTGCCCCGTGCAGGGTG;SOR=1.033;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=39;TCR=26;TR=64;WE=38949912;WS=38949894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	38950947	rs2304147	C	T	1311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=8;PP=1138;SC=GCTTCCATGTCCCCCACTGAC;SOR=2.948;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=34;TCR=8;TR=42;WE=38950955;WS=38950937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	38953996	rs2304148	A	G	1936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=15;PP=1584;SC=GTGTTCTTGGAAAGAGGGGTC;SOR=2.187;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=44;TCR=15;TR=59;WE=38954004;WS=38953986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	38956839	rs2228070	C	T	3232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=59;PP=2353;ReadPosRankSum=0.852;SC=ATGGGCACAACGTGTGGGCCC;SOR=0.385;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=101;TCF=41;TCR=60;TR=100;WE=38956847;WS=38956829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,107:0.99:108
chr19	38959680	rs11083462	C	T	3507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=33;PP=2675;SC=GCTGTATGATCGACCTCACAG;SOR=1.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=73;TCR=33;TR=106;WE=38959688;WS=38959670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr19	38968225	rs77702866	G	T	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=594;ReadPosRankSum=-1.055;SC=GGGGGACTCAGATCCAACAAC;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=25;WE=38968233;WS=38968215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,26:0.96:27
chr19	38983000	.	CA	C	250.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.94;QD=17.91;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	38985308	rs75563090	G	A	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=26;PP=982;SC=ATCCCCTTGGGTAATGAATAC;SOR=2.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=35;WE=38985316;WS=38985298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	38990336	rs2228071	C	T	1338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.19;SOR=1.839;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	38990345	rs2229147	C	T	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.09;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	38990676	rs2234709	C	A	1243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=30;PP=1029;SC=TGAGCCAGGGCAGGATGGGAA;SOR=1.501;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=44;WE=38990684;WS=38990666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	38991640	rs2960323	C	G	927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=28;PP=826;SC=GGTGAGCAACCCTGCCCAGCC;SOR=3.477;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=32;WE=38991648;WS=38991630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	38993372	rs1469695	A	G	1254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=34;PP=948;ReadPosRankSum=-1.046;SC=CTGCAGGTGGAGCGGGGCAGG;SOR=3.767;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=36;WE=38993380;WS=38993362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr19	38993448	.	GGGAGGA	G	532	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=70.0;NF=10;NR=0;PP=532;QD=54.2;SC=CAGGGGCAGGGGGAGGAGCAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=38993461;WS=38993438;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	38993547	rs2229142	C	T	3353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=22;PP=2487;SC=TGCTGCAGCACCTGTTGCGCC;SOR=2.691;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=82;TCR=22;TR=104;WE=38993555;WS=38993537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr19	38993638	rs1469699	A	G	3272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=65;PP=2509;SC=TTAGCATCTCATTTCCAGGCC;SOR=1.343;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=38;TCR=65;TR=103;WE=38993646;WS=38993628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	38994910	rs2229144	G	A	2312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=24;PP=1851;SC=GCCTACCCACGGGCTGGGCCA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=49;TCR=24;TR=73;WE=38994918;WS=38994900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	38995152	rs2915949	G	A	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=267;SC=TTGAGGCTTCGATTTGGAGGT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=38995160;WS=38995142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	38995355	rs10532729	ACCT	A	727.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=783;SC=GCTTATAGCGACCTCCTACCC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=17;WE=38995365;WS=38995345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	38995438	rs2960340	T	C	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=6;PP=1191;SC=TGTGCGCCATTGCCGGGGCTC;SOR=3.467;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=42;WE=38995446;WS=38995428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	38995510	rs2915951	T	C	2987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=36;PP=2291;SC=CCACAGTGGATGCTGAAGGCA;SOR=1.390;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=63;TCR=36;TR=99;WE=38995518;WS=38995500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr19	38995975	rs2915952	G	A	809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=10;PP=651;SC=CCTATGGAGAGAACATAGACG;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=24;WE=38995983;WS=38995965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	38996066	rs2915953	A	G	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=9;NR=18;PP=672;SC=CCCAGCATTGAGGGTCAAAAT;SOR=1.697;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=9;TCR=18;TR=27;WE=38996074;WS=38996056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	38996620	rs2960342	C	T	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.65;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	38996623	rs2960343	T	G	548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.73;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	38996640	rs2915954	A	G	503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=46;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=6;PP=267;SC=AGGGTCTAGAACAAGGGGCAT;SOR=1.270;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=38996648;WS=38996630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	38996990	rs2229146	T	C	1500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.376;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=26;PP=1189;ReadPosRankSum=-0.229;SC=CCGACCTTAGTGCTGTTACCC;SOR=0.368;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=52;WE=38996998;WS=38996980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,54:0.95:57
chr19	38997076	rs2960344	C	T	3087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=34;PP=2454;SC=CTGGCATCCTCTGAATCTAGC;SOR=1.449;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=59;TCR=34;TR=93;WE=38997084;WS=38997066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr19	38997214	rs2960345	T	G	1511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=38;PP=1205;SC=GCCCCCACGCTACCCCCGTGG;SOR=2.655;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=9;TCR=38;TR=47;WE=38997222;WS=38997204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	38997323	rs2915957	T	C	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=10;PP=871;SC=CATGGGGTAATGAGATGAGCA;SOR=1.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=25;TCR=10;TR=35;WE=38997331;WS=38997313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	38997364	rs35973146	T	TTCA	1977.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=9;PP=1906;SC=TATTCGTATCTTCTTTATCAC;SOR=2.461;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=36;WE=38997372;WS=38997354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	38997459	rs2915958	G	C	1776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=36;PP=1481;SC=TCTGGTCTTTGCCTCCCCAGG;SOR=1.835;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=16;TCR=36;TR=52;WE=38997467;WS=38997449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	38997609	rs2915959	T	A	168.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=5;PP=134;SC=GGGTTGGGGCTCCCGCGGAAG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=38997617;WS=38997599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	38997679	rs2960347	G	T	43.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=2;PP=26;SC=GAGGGGTGGAGCCGAGAGGAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=38997687;WS=38997669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	38998497	rs5828009	G	GC	774.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=23;PP=947;SC=GCTTATGCCCGCCCCACCTGC;SOR=5.058;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=23;WE=38998505;WS=38998487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	39002725	rs2071089	A	G	2736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=48;PP=2218;SC=CAGACGCCCCAGCTGTGGTCA;SOR=0.807;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=90;TCF=42;TCR=48;TR=90;WE=39002733;WS=39002715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr19	39010023	rs2229145	C	T	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=27;PP=952;SC=TGGTGCGGGACGAGTTCTCTG;SOR=2.899;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=33;WE=39010031;WS=39010013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	39014642	rs73544616	C	T	943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=30;PP=830;SC=TGCACGCCCCCGCCTCGAGAA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=39014650;WS=39014632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	39018161	rs112541479	A	G	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=11.614;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=760;ReadPosRankSum=0.660;SC=AAACAAAAAGATGAAGAAGAA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=26;WE=39018169;WS=39018151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,27:0.93:29
chr19	39018280	rs2960354	C	T	2443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=31;PP=1900;ReadPosRankSum=-0.693;SC=CTTCTTCCTCCCTTCAGGTCG;SOR=0.377;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=45;TCR=31;TR=75;WE=39018288;WS=39018270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,78:0.99:79
chr19	39034322	rs45555835	G	A	2630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.329;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=52;PP=2076;ReadPosRankSum=-0.749;SC=CCCCTGGGGCGGGAGTGGGAA;SOR=1.189;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=80;TCF=28;TCR=52;TR=79;WE=39034330;WS=39034312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr19	39051655	rs113916872	T	C	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=61.34;NF=7;NR=1;PP=197;SC=CACTCCAGCCTGGGCGACACA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=39051663;WS=39051645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	39056291	rs113579185	C	T	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=8;PP=376;SC=GGGCGGTGGCCGTGACCGATG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=10;TCR=8;TR=18;WE=39056299;WS=39056281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	39061169	rs111512034	C	A	1366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=11;PP=996;SC=ACTTTGATTGCAGGTAAATGA;SOR=1.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=32;TCR=11;TR=43;WE=39061177;WS=39061159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	39061258	rs35959206	C	G	1112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=23;PP=892;SC=ACTACCTGTCCCGGAACTTTT;SOR=1.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=35;WE=39061266;WS=39061248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	39068641	rs1468571	A	C	1910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=31;PP=1440;SC=TAGAGATCACAGCCCACAATG;SOR=0.724;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=29;TCR=31;TR=60;WE=39068649;WS=39068631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	39068882	rs139464203	G	A	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=26;PP=736;SC=GGACTCTGCAGGGGTGGGGCG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=39068890;WS=39068872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	39071257	rs7254175	C	T	276.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=197;SC=CCCAGTGCGTCGGGAGGCCGA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=39071265;WS=39071247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	39108560	rs199711666	C	T	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=28;PP=808;ReadPosRankSum=-0.671;SC=GCTGGGCCTGCGCCCAGGGGC;SOR=2.242;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=32;WE=39108568;WS=39108550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chr19	39224413	rs4801861	A	G	2670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=41;PP=1997;SC=CGAACTTGTTAAATATGGCCT;SOR=0.843;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=38;TCR=41;TR=79;WE=39224421;WS=39224403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr19	39226648	rs368493626	AGGTCTCGGGGGTCTCGGG	A	144	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.00;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	39232984	.	G	A	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.416;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=19.659;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.66;MQRankSum=-4.231;QD=1.08;ReadPosRankSum=-0.827;SOR=4.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,13:0.27:49
chr19	39297007	rs74176466	C	CA	604.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5067;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.463;NF=11;NR=9;PP=294;ReadPosRankSum=-1.158;SC=GACTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=0.646;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=43;TCF=26;TCR=17;TR=20;WE=39297015;WS=39296997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,24:0.77:31
chr19	39299280	.	A	AAAAG	218.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.362;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.92;MQRankSum=0.207;QD=19.88;ReadPosRankSum=-2.362;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr19	39299362	rs1035525	A	G	1930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=15;PP=1459;SC=AGCTTGGGAAACAAGAGAGAA;SOR=1.942;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=56;WE=39299370;WS=39299352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	39322087	rs9419	T	G	2657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=62;PP=2135;SC=TCCGGAAGCCTCCTCTTGTGC;SOR=1.927;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=25;TCR=63;TR=87;WE=39322095;WS=39322077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr19	39328145	rs2278010	A	C	2733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=29;PP=2040;ReadPosRankSum=0.593;SC=GGGGAAAAGTAAAGGTTTTAG;SOR=0.569;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=82;TCF=53;TCR=29;TR=81;WE=39328153;WS=39328135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,86:0.99:87
chr19	39330714	rs62119016	A	C	2191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=29;PP=1676;SC=CGAGGAACCCAGGGGGCCCGG;SOR=1.103;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=43;TCR=29;TR=72;WE=39330722;WS=39330704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	39330868	.	T	G	65	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=20;MQ=59.13;NF=0;NR=6;PP=65;QD=16.6285354245;SC=GGGGAGGGGGTGGGGGGTGCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=6;WE=39330876;WS=39330858;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,6:0.43:14
chr19	39334811	rs2278011	T	A	2023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=48;PP=1629;SC=TACCCCAGAGTGTGATAAGGA;SOR=3.150;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=10;TCR=48;TR=58;WE=39334819;WS=39334801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	39334830	rs2278012	C	T	1558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=43;PP=1145;SC=GACAAGGTAGCACCCCAAGAC;SOR=3.912;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=6;TCR=44;TR=49;WE=39334838;WS=39334820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	39338125	rs862454	G	A	1769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=30;PP=1331;SC=ACAAGATGACGCCCCACTGGC;SOR=0.793;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=63;TCF=32;TCR=31;TR=62;WE=39338133;WS=39338115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	39338142	rs862455	A	G	1683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=34;PP=1323;SC=TGGCCTCTGTACTGTTGTAGA;SOR=1.159;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=22;TCR=34;TR=56;WE=39338150;WS=39338132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	39381338	.	GA	G	51.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.18;MQRankSum=1.230;QD=0.75;ReadPosRankSum=-0.302;SOR=0.562;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,15:0.22:69
chr19	39398416	rs3136642	A	G	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=17;PP=527;SC=GAACTCAGGCAGCAGCGCCAG;SOR=4.804;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=18;WE=39398424;WS=39398406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	39400054	rs11404115	T	TA	1681.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=38;PP=1837;SC=TCGGTTCTCATAGTGGCATCC;SOR=4.317;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=39;WE=39400062;WS=39400044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	39408360	rs7508411	A	G	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=5;PP=546;SC=GCCCCTCTCCACACCGGAAGT;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=39408368;WS=39408350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	39408688	rs4803034	C	G	2992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=46;PP=2491;SC=GGAGGGAAGACTGATTGTCAC;SOR=0.878;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=88;TCF=42;TCR=46;TR=88;WE=39408696;WS=39408678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr19	39409236	rs11083489	C	A	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=27;PP=832;SC=TTTTACAGTCCCAACCCCAGC;SOR=2.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=33;WE=39409244;WS=39409226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	39410986	rs12460327	C	G	485.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=10;PP=342;ReadPosRankSum=-0.488;SC=GAGATAAAAACAGAGACAGGG;SOR=0.551;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=15;WE=39410994;WS=39410976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr19	39412756	rs59946162	A	AT	3638.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.067;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=1.131;NF=45;NR=64;PP=2139;ReadPosRankSum=1.966;SC=AATAGAGCCTATTTTTTTTTT;SOR=0.505;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=157;TCF=60;TCR=97;TR=109;WE=39412764;WS=39412746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:14,143:0.91:157
chr19	39412881	rs61736057	C	T	3085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=67;PP=2552;ReadPosRankSum=0.427;SC=ACAGTACCTGCTGCACTTCAC;SOR=1.034;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=94;TCF=26;TCR=68;TR=93;WE=39412889;WS=39412871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,94:0.99:95
chr19	39421388	rs730078	A	G	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=22;PP=757;SC=TTGGACCGGGAACAAGGCGGC;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=4;TCR=22;TR=26;WE=39421396;WS=39421378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	39433299	rs8113389	A	G	2780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=39;PP=2082;SC=CAAGGGCGCCATAGTGCCCCA;SOR=1.044;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=52;TCR=39;TR=91;WE=39433307;WS=39433289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr19	39433497	rs11313800	GT	G	451.74	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=481;ReadPosRankSum=1.101;SC=TCCTGCGCTAGTTTGCTGGGG;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=9;WE=39433507;WS=39433487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,12:0.92:13
chr19	39433499	rs57290038	T	G	460.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5004;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=353;ReadPosRankSum=1.455;SC=CTGCGCTAGTTTGCTGGGGAC;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=9;WE=39433507;WS=39433487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,12:0.92:13
chr19	39435485	rs10416055	G	A	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=0;PP=513;SC=AGAAGGGCTCGATACTTCTTA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=39435493;WS=39435475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	39435933	rs11672849	C	G	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=9;PP=266;SC=CAGAGCCTGGCGGAGGAGCCT;SOR=1.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=15;WE=39435941;WS=39435923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	39437258	rs10568003	TCA	T	2610.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=31;PP=2168;SC=GGCATTCAAGTCACAGTCAGA;SOR=1.140;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=52;TCF=18;TCR=34;TR=47;WE=39437278;WS=39437248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	39437270	rs2278412	G	A	2630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=37;PP=1491;SC=ACAGTCAGAAGCCACCTCCTC;SOR=1.255;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=21;TCR=37;TR=58;WE=39437278;WS=39437248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	39440918	rs2304117	T	C	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=22;PP=672;SC=GGGCCAGGGATGGGTCCGCCG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=9;TCR=22;TR=31;WE=39440926;WS=39440908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	39440966	rs2304118	T	C	517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=13;PP=396;SC=CCATCTCCAGTAGCCAGAGTC;SOR=2.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=39440974;WS=39440956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	39443577	rs12608890	A	T	874.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=766;ReadPosRankSum=-0.914;SC=TCCCTTTCATATTTTACTCCC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=27;WE=39443585;WS=39443567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr19	39589334	rs560364	G	A	2047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=52;PP=1635;SC=TTGAGGAGGAGTGGGAAGAGG;SOR=2.694;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=12;TCR=52;TR=64;WE=39589342;WS=39589324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	39589869	rs11326424	CG	C	319.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=9;PP=332;SC=GCGCGCGGGTCGGGGGCGGTG;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=10;WE=39589877;WS=39589859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	39590955	rs8110736	G	A	5377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=88;PP=2965;SC=CCAGCCTGCCGTACATGACAT;SOR=0.727;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=172;TCF=84;TCR=88;TR=171;WE=39590963;WS=39590945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr19	39760069	rs30481	G	C	1714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=40;PP=1565;SC=TCTCTATCCTGCTCCCCAACC;SOR=2.925;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=49;WE=39760077;WS=39760059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	39948871	.	CCCA	C	94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=17;MQ=60.0;NF=2;NR=0;PP=94;QD=49.0;SC=TCTGCCCTCGCCCACCACCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=2;WE=39948881;WS=39948861;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,2:0.18:11
chr19	40093111	rs3764843	C	A	2111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=8;PP=1591;SC=GAATGAAGCCCGAGGGCAAGG;SOR=3.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=48;TCR=8;TR=56;WE=40093119;WS=40093101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	40096127	rs2233709	C	T	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=313;SC=CAGGGTCCATCTCCCATAACT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=40096135;WS=40096117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	40149297	rs1860134	T	A	1956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=49;PP=1555;SC=TACGTGTGTCTCAATGAGTAT;SOR=3.334;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=8;TCR=50;TR=57;WE=40149305;WS=40149287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	40170053	rs8103033	G	A	1247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=19;PP=910;SC=CACAGAGGGAGACAACAATGT;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=21;TCR=19;TR=40;WE=40170061;WS=40170043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	40174119	rs1126159	C	T	3037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=76;NR=13;PP=2439;SC=TTTTCTTATGCCTTTCAGCCG;SOR=3.407;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=76;TCR=13;TR=89;WE=40174127;WS=40174109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr19	40174236	rs7258833	G	A	4725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=88;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.769;SC=GCAACTCCAAGGAGAAACTGG;SOR=0.683;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=44;TCR=89;TR=132;WE=40174244;WS=40174226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,144:0.99:145
chr19	40197924	rs4830	T	C	2407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=27;PP=1939;SC=CATGAACAGTTGTGTGTTTGG;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=50;TCR=27;TR=77;WE=40197932;WS=40197914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr19	40199914	rs10755	C	G	2549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=55;PP=1974;SC=TGCAAGTCTTCAGAGATATCT;SOR=1.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=23;TCR=55;TR=78;WE=40199922;WS=40199904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	40224833	rs375867	A	T	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=48;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=489;SC=CCGGGGACAGAGGGAGTTATC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=40224841;WS=40224823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	40224869	rs391646	T	A	1110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=64;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=1;PP=610;SC=AAGAGCTGCCTCCTGCTCTGA;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=40224877;WS=40224859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	40224887	rs391660	T	C	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.82;SOR=3.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	40224894	rs2074927	C	T	1648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.11;SOR=3.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	40224901	rs453827	G	A	1763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.99;SOR=3.365;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	40224986	rs384138	A	G	3407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=35;PP=2537;SC=GAAAGGGCATATTCTTGGATT;SOR=1.343;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=63;TCR=35;TR=98;WE=40224994;WS=40224976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	40225168	rs399641	T	A	1253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=36;PP=1005;SC=AGCAGGTCCCTTTCTTGTGGG;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=40225176;WS=40225158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	40225646	rs17608	G	A	3022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=57;PP=2213;ReadPosRankSum=-1.372;SC=CAAGAAACAGGCAAGTGGTCG;SOR=0.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=39;TCR=60;TR=95;WE=40225654;WS=40225636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,103:0.97:106
chr19	40225790	rs76370710	C	T	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=449;SC=TCCCATGGTGCAGCCAGTTAG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=40225798;WS=40225780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	40319227	rs56077108	C	T	1646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=32;PP=1183;SC=AGGTGTACTGCGGGGGAGGGG;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=51;WE=40319235;WS=40319217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	40368268	rs141933551	G	A	79.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=2.644;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.77;MQRankSum=-4.310;QD=3.32;ReadPosRankSum=-0.675;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,4:0.17:24
chr19	40368274	.	C	A	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.134;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=5.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.02;MQRankSum=-4.679;QD=8.95;ReadPosRankSum=-2.274;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr19	40368280	rs62106924	A	G	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=8.501;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.74;MQRankSum=-4.700;QD=7.74;ReadPosRankSum=-1.278;SOR=2.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr19	40368376	rs75204711	A	C	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=36.533;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.521;NF=9;NR=29;PP=470;ReadPosRankSum=-0.422;SC=AGGAAGCCAGAGCCTTGCAAA;SOR=1.819;SbPval=0.01;Source=Platypus;TC=99;TCF=52;TCR=47;TR=38;WE=40368384;WS=40368366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,29:0.31:93
chr19	40368395	rs28472548	C	T	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.865;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.296;NF=6;NR=21;PP=345;ReadPosRankSum=0.164;SC=AAGAATGTCACGGTCCCCACC;SOR=1.919;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=95;TCF=45;TCR=50;TR=27;WE=40368403;WS=40368385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,19:0.22:87
chr19	40368498	rs12610683	AA	CC	2661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=44;PP=2848;SC=GTGCCAGATGAAAGGGGTCCG;SOR=2.419;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=54;TCF=9;TCR=45;TR=51;WE=40368507;WS=40368488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	40374034	rs138587194	A	G	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=2.345;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.34;MQRankSum=1.459;QD=4.38;ReadPosRankSum=-1.810;SOR=0.211;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr19	40376675	rs77872255	G	A	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=5.067;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.25;MQRankSum=-0.879;QD=2.93;ReadPosRankSum=0.846;SOR=1.567;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,12:0.20:59
chr19	40382178	rs76154158	A	G	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=2.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.275;NF=11;NR=1;PP=248;ReadPosRankSum=0.714;SC=CGGGAAGGAAAGTGGCCCCTG;SOR=0.976;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=12;WE=40382186;WS=40382168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr19	40392482	rs62108883	A	G	80.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.46;QD=26.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	40392631	rs80068592	G	A	382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.63;QD=27.34;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	40392719	rs200664901	G	A	203.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=29.11;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	40405847	rs2011817	C	T	196.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=1;PP=116;SC=CCAGTTACACCACCCTCAGCC;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=40405855;WS=40405837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	40406019	rs2355719	G	A	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=20;PP=824;SC=CATGGCACGTGCACTGCTGCC;SOR=1.121;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=14;TCR=20;TR=34;WE=40406027;WS=40406009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	40408146	rs56186636	G	A	1606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=30;PP=1392;SC=CTGCAAGGAGGGGGTGCCGAT;SOR=1.314;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=23;TCR=30;TR=53;WE=40408154;WS=40408136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	40408268	rs34938990	G	T	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.37;QD=31.38;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	40408821	rs11083543	C	G	2527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=24;PP=2079;SC=GCCAGCACCACGGGCAGCTTC;SOR=1.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=52;TCR=24;TR=76;WE=40408829;WS=40408811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	40408857	rs4802064	T	C	2572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=39;PP=1855;SC=ACCTGGGAGGTGAGAGAGGCA;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=46;TCR=39;TR=85;WE=40408865;WS=40408847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	40408910	rs11083544	T	C	2424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=51;PP=1836;SC=GGTAGGACCCTAGTTCAAGCC;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=18;TCR=51;TR=69;WE=40408918;WS=40408900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr19	40698365	rs199866647	T	C	3312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=68;PP=2438;SC=GGAGCAGGTGTGCCAGGAAGC;SOR=1.140;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=47;TCR=68;TR=115;WE=40698373;WS=40698355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr19	40711333	rs892117	A	G	205.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=212;SC=CCTTTTTTGCATATTAAGAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=40711341;WS=40711323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	40719076	rs1129156	T	C	3977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=90;PP=2895;SC=CCCCTGGCTTTGCCAGCCTCA;SOR=1.406;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=50;TCR=91;TR=140;WE=40719084;WS=40719066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr19	40720079	rs3746005	C	T	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=13;PP=369;SC=CGCCATCGGACGGGGCGCTGG;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=17;WE=40720087;WS=40720069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	40721076	.	CAGGCCAGACACTCCGGA	C	1493.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.464;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.723;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.523;NF=6;NR=11;PP=2964;ReadPosRankSum=-1.522;SC=CGCCTCCCAGCAGGCCAGACA;SOR=1.211;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=60;TCF=18;TCR=42;TR=17;WE=40721100;WS=40721066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,41:0.47:87
chr19	40721877	rs8106744	G	C	313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=260;SC=CATTCCCCCCGACCCCACACA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=40721885;WS=40721867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	40723844	rs79666308	C	T	193.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=163;SC=CCCATCCCCCCACCCCCCGAC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=40723852;WS=40723834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	40739513	rs33933140	A	G	3281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=59;PP=2456;ReadPosRankSum=-1.175;SC=TAAAACCTGAATCTCCAACCG;SOR=0.553;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=37;TCR=60;TR=95;WE=40739521;WS=40739503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,104:0.99:105
chr19	40739721	rs2304186	G	T	3203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=49;NR=55;PP=2443;SC=AAGTTAGGGGGAAAAAACCAC;SOR=0.711;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=104;TCF=49;TCR=55;TR=104;WE=40739729;WS=40739711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr19	40742320	rs2304189	T	C	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=26;PP=974;SC=GGATCTCAGGTGCATGCTCCC;SOR=1.225;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=17;TCR=27;TR=43;WE=40742328;WS=40742310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	40761140	rs200272953	T	C	4461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.100;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=92;PP=2965;ReadPosRankSum=1.209;SC=GACAAAGGTGTTGGGTCGCGG;SOR=1.990;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=133;TCF=38;TCR=95;TR=129;WE=40761148;WS=40761130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,135:0.99:137
chr19	40770982	rs3730050	T	C	166.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=131;SC=GTCCACGAAATGGGGGCATAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=40770990;WS=40770972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	40788641	rs11880261	T	C	439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=14;PP=305;SC=TCTGATAAGATGCGGTGGAAG;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=40788649;WS=40788631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	40839664	rs8103796	A	C	575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=1;PP=477;SC=TCTACCTTTGAAAATTACAGG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=40839672;WS=40839654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	40875800	rs3745198	C	G	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.29;ReadPosRankSum=1.501;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr19	40875810	rs3745199	C	G	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.140;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=24.20;ReadPosRankSum=-0.035;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr19	40883844	rs45469694	A	C	4065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=55;PP=2965;ReadPosRankSum=1.215;SC=TTCAGACACCAGGGGCGGCCC;SOR=0.417;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=138;TCF=83;TCR=55;TR=136;WE=40883852;WS=40883834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,137:0.99:138
chr19	40884160	rs4635	G	A	1969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=55;PP=1596;ReadPosRankSum=0.421;SC=CTGTCCCCGCGCCCCCGCTTC;SOR=1.354;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=72;TCF=15;TCR=57;TR=70;WE=40884168;WS=40884150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,77:0.99:78
chr19	40886223	rs56237517	G	A	2604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=32;PP=2072;ReadPosRankSum=0.827;SC=GAACGCACCCGGCTCACCTCA;SOR=0.483;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=52;TCR=32;TR=83;WE=40886231;WS=40886213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr19	40900865	rs268674	C	T	2093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=21;PP=1686;SC=ACCACCTGCCCGGCTGTGGAC;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=38;TCR=21;TR=59;WE=40900873;WS=40900855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr19	40901011	rs3745202	G	C	3081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=60;PP=2362;SC=CTTTTCCCCCGGGCTGGCACG;SOR=1.085;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=44;TCR=60;TR=104;WE=40901019;WS=40901001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr19	40901496	rs268673	T	C	2655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=54;PP=2143;ReadPosRankSum=1.434;SC=CTTTTGTCTCTATCATCTCCA;SOR=1.051;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=77;TCF=21;TCR=56;TR=75;WE=40901504;WS=40901486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,80:0.99:81
chr19	40901604	rs268672	A	G	2052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.77;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	40901614	rs268671	A	G	2003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.53;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	40904602	rs744389	G	A	3381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=50;PP=2729;SC=CCAGGTCCCCGGTGGGCACAG;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=50;TCR=50;TR=100;WE=40904610;WS=40904592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr19	40929363	rs268687	T	C	2270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=37;PP=1751;ReadPosRankSum=-0.722;SC=GCCACCGCTGTGTGGCCAGGA;SOR=0.255;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=42;TCR=38;TR=78;WE=40929371;WS=40929353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,79:0.99:80
chr19	40929553	rs268686	G	C	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=17;PP=575;SC=GGATCTTGGGGAAGTCACTTA;SOR=2.030;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=23;WE=40929561;WS=40929543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	40947373	rs10560834	GGATC	G	2644.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=14;PP=2638;SC=ACATGAGGAAGGATCGATCCC;SOR=2.265;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=50;WE=40947384;WS=40947363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
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chr19	40947751	rs35314597	G	A	1618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.854;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=20;PP=1251;ReadPosRankSum=-0.619;SC=AGAGGGGCTCGGGGGGCAGGG;SOR=0.888;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=28;TCR=21;TR=48;WE=40947759;WS=40947741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
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chr19	41075662	rs1165837	G	C	779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=21;PP=533;SC=GGTGGGGATAGGAGGACCCCT;SOR=2.226;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=7;TCR=21;TR=28;WE=41075670;WS=41075652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	41078220	rs1165841	G	C	1067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=10;PP=864;SC=CCAGATCTCTGAAGTCCTGTG;SOR=1.473;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=30;WE=41078228;WS=41078210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	41081295	rs62107872	T	A	1478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=1187;ReadPosRankSum=0.869;SC=ATACGGCCTCTGTGCCCTGTT;SOR=0.555;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=45;WE=41081303;WS=41081285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr19	41082868	rs16974365	T	C	1731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=1457;ReadPosRankSum=0.173;SC=GGGAAGTCATTCATCTGAATG;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=28;TCR=30;TR=56;WE=41082876;WS=41082858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,55:0.96:57
chr19	41083444	rs2290682	C	T	7200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=123;NR=92;PP=2965;SC=CATCCATCCTCTGCCCCCCTT;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=217;TCF=124;TCR=93;TR=215;WE=41083452;WS=41083434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr19	41083854	rs67613859	TAC	T	265.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=24.16;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	41084471	rs3217684	A	AG	908.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=880;ReadPosRankSum=1.680;SC=AATGGAATGGAGGGGCGCGGA;SOR=1.739;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=21;WE=41084479;WS=41084461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr19	41095086	.	TGAGGACAGTCCTGTCCAACAGGGAGG	T	2919.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=8;PP=2607;SC=TGGGCAGCGGTGAGGACAGTC;SOR=1.196;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=9;WE=41095119;WS=41095076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	41096189	rs396118	A	G	2082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=34;PP=1591;SC=CACCCACGACAGCCTTCACAG;SOR=0.776;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=37;TCR=34;TR=71;WE=41096197;WS=41096179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	41104977	rs55815263	C	T	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=10;PP=801;SC=GGAGAAGAACCTCGTTAGTCA;SOR=1.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=33;WE=41104985;WS=41104967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	41107433	.	A	G	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=11;PP=379;SC=CGCTGCGTCCATGGGCCGACC;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=41107441;WS=41107423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	41111069	rs2303729	G	A	3022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=41;PP=2317;ReadPosRankSum=0.924;SC=GGCCCCGGCTGTACCAGGCCT;SOR=0.330;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=53;TCR=41;TR=93;WE=41111077;WS=41111059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,97:0.99:98
chr19	41114065	rs2303728	G	T	1907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=12;PP=1476;ReadPosRankSum=0.315;SC=CAGAGTCTGGGCTGGCCATCG;SOR=1.640;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=63;TCF=51;TCR=12;TR=62;WE=41114073;WS=41114055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr19	41116397	rs1318544	G	A	1174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=9;PP=941;SC=TTCTCCCGGGGCTGTCTGCCC;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=40;WE=41116405;WS=41116387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	41117624	rs2278246	T	C	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=0;PP=559;SC=ACGAGGAAGGTGTCTGTCTTC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=41117632;WS=41117614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	41117869	rs1131620	A	G	2062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=42;PP=1654;SC=CCAACCCAACACTGCTGGCTC;SOR=1.410;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=24;TCR=42;TR=65;WE=41117877;WS=41117859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	41118056	rs1051303	A	G	1913.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=37;PP=1388;SC=CCAGTGCAGGACCTGTCCTTC;SOR=1.647;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=18;TCR=37;TR=55;WE=41118064;WS=41118046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr19	41119273	rs12611045	G	C	4088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=28;PP=2965;SC=TGGGAGGCCGGGTCCCGTGAC;SOR=2.531;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=100;TCR=28;TR=128;WE=41119281;WS=41119263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr19	41120083	rs2369006	A	T	1241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=4;PP=994;SC=AGCCTCCCCAACTCTCCTCTA;SOR=4.021;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=38;WE=41120091;WS=41120073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	41122671	rs10403963	C	T	1023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=2;PP=831;SC=TGTTGATCTTCAGAAGCTCAG;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=41122679;WS=41122661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	41123093	rs59030801	A	AG	2911.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=69;PP=2936;SC=CTCTGTGACCAGGTTACGAGG;SOR=3.285;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=81;TCF=9;TCR=72;TR=77;WE=41123101;WS=41123083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	41125159	rs7259237	A	G	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=2;PP=552;SC=TTAAATATACACATTATATTT;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=41125167;WS=41125149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	41125177	rs7259554	G	C	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=8;PP=1006;SC=TTTGAAAGCTGAGACTTTCGG;SOR=2.494;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=36;WE=41125185;WS=41125167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	41128309	rs10880	C	T	1723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=37;PP=1401;SC=TCCCCAGGCACGTTCCCAGGC;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=52;WE=41128317;WS=41128299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	41129842	rs7367	C	T	2134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=29;PP=1538;SC=TCTCCCTAGACAATGACGAGT;SOR=0.844;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=61;TCF=32;TCR=29;TR=60;WE=41129850;WS=41129832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	41131675	rs2278242	C	G	853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=2;PP=662;SC=GCAGAGGGTGCCTGGGCTGCT;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=25;WE=41131683;WS=41131665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	41132022	rs2278243	C	G	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=201;SC=CAAACTCTGTCCCCTAGACCA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=41132030;WS=41132012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	41133844	rs41512448	T	C	341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=12;PP=283;SC=TAGGGGGTGCTGGTCAGGGAC;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=41133852;WS=41133834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	41135475	rs1051481	G	A	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=14;PP=398;SC=CCCGCTGGCCGCCCACCCGCG;SOR=2.179;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=18;WE=41135483;WS=41135465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	41173880	rs2604901	C	T	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=11;PP=621;SC=GCTGTTGCTGCTGCTGCTGCT;SOR=0.846;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=25;WE=41173905;WS=41173870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	41173892	rs141662737	CTGCTGT	C	935.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=8;PP=733;SC=GCTGCTGCTGCTGCTGTTGCT;SOR=0.859;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=18;TCF=7;TCR=11;TR=14;WE=41173905;WS=41173870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	41175996	rs149436869	C	T	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=17;PP=525;SC=CTCTACCCCCCGCCCTCGGTG;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=41176004;WS=41175986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	41192610	rs112258640	T	TTGAG	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=741;SC=ATGTGAGTGTTTGTGACTCTG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=41192618;WS=41192600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	41206208	rs2246095	A	G	2255.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=50;PP=1758;SC=GCCACCAGACAGCATACCTGG;SOR=1.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=22;TCR=50;TR=72;WE=41206216;WS=41206198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	41209477	rs11538385	C	T	1619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=9;PP=1322;SC=TCTTGAGTACCGCCAGCAGGT;SOR=2.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=39;TCR=9;TR=48;WE=41209485;WS=41209467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	41250733	rs138724383	G	T	354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=8;PP=252;SC=CCCTTCAGGGGAGAGCCCAGG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=3;TCR=8;TR=11;WE=41250741;WS=41250723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	41283365	rs2233159	C	G	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=10;PP=316;SC=CCCTCCTTGGCTTTATGCAAA;SOR=2.147;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=41283373;WS=41283355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	41350664	rs1809810	A	T	1522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=40;PP=1143;SC=CAGCATAGGGAACACTTCGGT;SOR=2.746;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=49;WE=41350672;WS=41350654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	41354417	.	G	C	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.476;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.076;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.111;NF=10;NR=0;PP=147;ReadPosRankSum=0.467;SC=AAGTGCGGGCGCCTTTCCCCA;SOR=2.679;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=10;WE=41354425;WS=41354407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,6:0.18:33
chr19	41354442	.	C	G	66	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=24;MQ=48.54;NF=9;NR=0;PP=66;QD=11.1968013941;SC=GTCCCCATCCCCAGGCAGAAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=31;TCR=7;TR=9;WE=41354450;WS=41354432;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:29,9:0.24:38
chr19	41354606	rs4986892	G	T	195.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.11;MQRankSum=-7.944;QD=1.78;ReadPosRankSum=0.523;SOR=0.722;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,18:0.16:110
chr19	41381647	rs12460590	A	C	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.96;QD=33.73;SOR=6.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	41382607	rs2316206	AG	CA	1116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.46;QD=42.95;SOR=6.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	41382612	rs2316208	CG	TA	1132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.26;QD=49.25;SOR=6.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	41382645	rs3865455	G	A	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.66;QD=39.34;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	41382653	rs2388869	A	G	366.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.61;QD=45.85;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	41382655	rs2316210	T	G	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.61;QD=41.47;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	41382665	rs3852869	G	A	241.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.75;QD=40.31;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	41383153	rs2261144	A	G	2949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=49;PP=2185;SC=GGCCAAACTCATGGGGATCAC;SOR=0.713;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=96;TCF=47;TCR=49;TR=96;WE=41383161;WS=41383143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	41383344	rs2302988	T	C	1723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.408;NF=22;NR=39;PP=1328;ReadPosRankSum=1.130;SC=AATGATAGTCTGAATAGGTAA;SOR=0.569;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=63;TCF=22;TCR=41;TR=61;WE=41383352;WS=41383334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr19	41383378	rs16958956	C	A	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=32;PP=1049;SC=ATACGGCTCCCCCTATGAGAC;SOR=2.247;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=43;WE=41383386;WS=41383368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	41383799	rs3869579	G	A	1840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=28;PP=1529;SC=AAGCCATAGCGCAGGGTGGTG;SOR=0.762;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=30;TCR=28;TR=58;WE=41383807;WS=41383789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	41384637	rs4079367	C	T	1977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=16;PP=1615;SC=TGGCTTTGCACCTCCCCGCAC;SOR=2.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=46;TCR=16;TR=62;WE=41384645;WS=41384627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	41384675	rs4079366	T	C	2755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=42;PP=1886;SC=CTCCTGCATGTGGATGAGAAA;SOR=0.756;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=94;TCF=51;TCR=43;TR=93;WE=41384683;WS=41384665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr19	41386136	rs4142867	A	C	1535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=38;PP=1383;SC=AGAAGGTGGGATCGATATTGG;SOR=2.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=13;TCR=38;TR=51;WE=41386144;WS=41386126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	41386282	rs3815705	G	C	1390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=6;PP=1224;SC=AAGTGCGGGCGCCTTTCCCCA;SOR=3.312;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=42;WE=41386290;WS=41386272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	41386420	rs56081734	A	C	4889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=62;NR=85;PP=2965;SC=AGGAAGCCCGACTCCTCCTGG;SOR=0.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=62;TCR=85;TR=147;WE=41386428;WS=41386410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr19	41386486	rs3815708	CA	AG	1763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.03;QD=45.22;SOR=4.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
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chr19	41386544	rs71337574	C	G	851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.04;QD=42.59;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	41386547	rs74219554	G	C	817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.63;QD=43.04;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr19	41387656	rs10425176	A	T	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.37;QD=39.46;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	41387669	rs10425185	A	G	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=9;PP=316;SC=GATGGAGGCGAGTGGGAGTGG;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=41387677;WS=41387637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	41397370	rs3852870	A	C	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=23;PP=670;SC=TCACATAGAAACTTATGACTT;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=25;WE=41397378;WS=41397360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	41397806	rs8106551	C	A	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=255;SC=TGTTTATATCCCTCTAAAATC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=11;WE=41397814;WS=41397796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	41400906	rs10626476	C	CAGAG	1121.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=9;PP=1255;SC=AGAGAAAAGACAGGCTGAAAA;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=24;TCF=14;TCR=10;TR=23;WE=41400924;WS=41400896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	41400913	rs140473451	AAAAC	A	834.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=9;PP=704;SC=AGACAGGCTGAAAACAAACAA;SOR=2.531;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=28;TCF=18;TCR=10;TR=23;WE=41400924;WS=41400896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	41401950	rs4803398	G	C	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-2.318;NF=33;NR=4;PP=945;ReadPosRankSum=0.236;SC=CTGCCTTTTCGGGGTGTTAAA;SOR=2.147;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=37;WE=41401958;WS=41401940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,35:0.95:37
chr19	41402162	rs3956342	T	C	805.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.038;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.714;NF=13;NR=14;PP=647;ReadPosRankSum=0.968;SC=TGGGTTCAAGTGATTCTCCTG;SOR=0.152;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=29;TCF=13;TCR=16;TR=27;WE=41402170;WS=41402152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,29:0.94:31
chr19	41402579	rs6508953	A	G	3336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=54;PP=2763;ReadPosRankSum=-1.096;SC=TCTTTGATGGACATTATCGAG;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=56;TCR=56;TR=109;WE=41402587;WS=41402569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,106:0.98:108
chr19	41403150	.	G	A	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.524;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=6.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.52;MQRankSum=-5.537;QD=7.31;ReadPosRankSum=3.103;SOR=2.921;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr19	41403155	.	G	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.177;ClippingRankSum=0.000;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=8.418;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.93;MQRankSum=-6.335;QD=5.64;ReadPosRankSum=-1.109;SOR=3.078;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
chr19	41403325	rs7252852	T	C	3987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=90;PP=2791;ReadPosRankSum=-1.109;SC=ATCCCTAAAGTGCAGAGGAGT;SOR=1.451;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=49;TCR=91;TR=138;WE=41403333;WS=41403315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,144:0.99:146
chr19	41403982	rs11083583	G	GT	2242.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=7;PP=2569;SC=AAAAACACCTGTTTTATTTTG;SOR=4.205;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=69;TCF=61;TCR=8;TR=64;WE=41403990;WS=41403972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	41404196	rs10419393	A	G	1760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=36;PP=1492;SC=AACATCATCCAGGACACTCAG;SOR=1.412;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=57;WE=41404204;WS=41404186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	41405962	rs4803400	T	G	4051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=58;PP=2965;SC=CTTCTCTCTATGCTCGCTGGT;SOR=0.876;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=70;TCR=58;TR=128;WE=41405970;WS=41405952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr19	41414363	rs8100418	A	T	3597.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=22;PP=2965;ReadPosRankSum=1.084;SC=CGCCGGCACCAGCACAGCCCT;SOR=1.592;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=112;TCF=90;TCR=22;TR=110;WE=41414371;WS=41414353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr19	41414481	rs72480748	G	A	5950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.389;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=0.294;SC=GATTTGAAGCGGAAGTTCTGC;SOR=0.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=191;TCF=80;TCR=111;TR=189;WE=41414489;WS=41414471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,194:0.99:196
chr19	41415112	rs3844442	T	A	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=2;PP=588;SC=AGTAGTAGCCTGGCAGCAAAC;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=41415120;WS=41415102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	41416750	rs10419589	T	C	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=9;NR=13;PP=590;SC=ATCTTCCTTTTCCAGCCCCCT;SOR=0.963;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=22;WE=41416758;WS=41416740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	41416831	rs146260021	A	AT	78.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=15.77;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	41442597	rs73038469	G	A	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=18;PP=531;SC=GACAGAGAGTGAGAGAGACAG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=41442605;WS=41442587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	41447479	rs34151237	T	G	219.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.94;QD=36.64;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	41447486	rs34013487	C	G	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.34;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	41447492	rs73038475	T	C	185.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.41;QD=37.18;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	41447928	rs3865460	G	A	4081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=49;PP=2965;SC=CAAGGCTACAGCCTCTCCTGA;SOR=1.241;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=79;TCR=49;TR=128;WE=41447936;WS=41447918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr19	41515350	.	G	A	98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=47.02;NF=1;NR=7;PP=98;QD=16.5964015684;SC=AGGGCAAGATGGAGAGGTGAG;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=8;WE=41515358;WS=41515340;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:30,8:0.21:38
chr19	41558800	rs11083604	T	C	836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=6;PP=644;SC=CCACCGCACCTGGCCTGTTTG;SOR=2.387;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=41558808;WS=41558790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	41558878	rs56156262	G	A	1137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=28;PP=1029;SC=TCGGGAGACAGGCAGCTTGGA;SOR=2.115;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=42;WE=41558886;WS=41558868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	41564417	rs12978001	C	A	1093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=6;NR=26;PP=859;SC=CCAGGCAAGGCGCCTTGGATG;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=32;WE=41564425;WS=41564407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	41595958	rs75703079	C	T	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQRankSum=-4.706;QD=2.57;ReadPosRankSum=1.882;SOR=0.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
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chr19	41622189	rs305968	G	A	4872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=77;PP=2965;SC=AGCTGCCTCCGGGACCCAGAC;SOR=0.718;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=151;TCF=74;TCR=77;TR=151;WE=41622197;WS=41622179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr19	41622615	rs12975986	C	T	406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=11;PP=300;SC=CTTGTTGACACTCAGGGCTGC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=41622623;WS=41622605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	41626438	rs34650210	CT	C	584.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=330;ReadPosRankSum=-0.248;SC=ATGGCACGATCTTTTTTTTTT;SOR=0.804;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=30;TCF=6;TCR=24;TR=23;WE=41626446;WS=41626428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr19	41627868	rs80319612	G	A	148.96	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.99;MQRankSum=-1.534;QD=18.62;ReadPosRankSum=-0.489;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,7:0.88:8
chr19	41628677	rs305975	T	G	2738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=31;PP=2263;SC=TGGTCTAGAGTGAAGGGGCCT;SOR=1.402;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=86;TCF=55;TCR=31;TR=85;WE=41628685;WS=41628667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	41631415	rs137939255	C	A	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.51;QD=31.75;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	41700343	rs338600	C	T	2041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=50;NR=10;PP=1560;SC=TGGTAGAGGGCGTAGAAGCTA;SOR=2.765;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=51;TCR=10;TR=60;WE=41700351;WS=41700333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	41700493	rs338599	G	C	3100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=64;PP=2576;SC=ACCTGGGACCGTGGCGGCCTG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=30;TCR=64;TR=94;WE=41700501;WS=41700483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr19	41703660	rs338594	T	C	1599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=17;PP=1293;SC=GCCGGTCCCTTTTTGAGTCTA;SOR=1.747;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=53;WE=41703668;WS=41703650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	41703793	rs57266494	G	A	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=33;PP=1185;SC=TGATCCAGGCGGAGGCCCGGT;SOR=1.708;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=15;TCR=33;TR=48;WE=41703801;WS=41703783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	41704304	rs338593	T	C	746.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=2;PP=567;SC=TGGGTTCAGCTCCAACCTGCT;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=41704312;WS=41704294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	41704832	rs338592	A	G	1804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=44;PP=1385;SC=CTGAATGGGCATGGTGACCTG;SOR=2.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=54;WE=41704840;WS=41704822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	41707094	rs1628289	A	G	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=432;SC=TTTACTTCCCAAAGGCTGTGT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=41707102;WS=41707084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	41709222	rs57934551	T	A	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=8;NR=0;PP=209;SC=TTGGGCTCAGTGAGGGCTGGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=41709230;WS=41709212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	41711755	rs338586	G	T	369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=1;PP=307;SC=GATGCCATTAGGTTTTGTGAA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=41711763;WS=41711745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	41711815	rs338585	G	A	1249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=2;PP=973;ReadPosRankSum=-0.758;SC=AGGACCAAATGGACTGGGGTG;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=38;WE=41711823;WS=41711805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr19	41712159	rs71835001	CCT	C	725.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=13;NR=5;PP=809;SC=CTGACTCAGCCCTCTCTCTCT;SOR=2.093;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=18;WE=41712170;WS=41712149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	41725271	rs10411012	A	G	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=12;PP=911;SC=TGGGAGCCCAACAACTTCTGA;SOR=1.552;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=25;TCR=12;TR=37;WE=41725279;WS=41725261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	41743861	rs7249222	A	G	4292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=57;PP=2965;SC=TGTGCTGTCAAACGATGGGAT;SOR=0.978;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=131;TCF=74;TCR=57;TR=131;WE=41743869;WS=41743851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr19	41748753	rs2304234	T	C	6443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=127;NR=72;PP=2965;SC=GATCCAAGGCTTCATCCATGA;SOR=1.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=199;TCF=127;TCR=72;TR=199;WE=41748761;WS=41748743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr19	41759631	rs3835078	ACCC	A	2014.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=31;PP=1669;SC=CCTTTCAGGGACCCCCCCCCC;SOR=2.786;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=33;WE=41759645;WS=41759621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	41759637	rs116056574	C	T	2023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=32;PP=1041;SC=AGGGACCCCCCCCCCCCAACT;SOR=2.833;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=37;WE=41759645;WS=41759621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	41762525	rs2304232	A	G	1994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=51;PP=1607;SC=TGGTAGGTGCACTCCCGCCAA;SOR=3.223;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=8;TCR=51;TR=59;WE=41762533;WS=41762515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	41765407	rs4591267	A	C	2697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=15;PP=2192;ReadPosRankSum=-0.803;SC=TCCAGAATGCACCCCTTCTGA;SOR=1.542;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=80;TCF=65;TCR=15;TR=79;WE=41765415;WS=41765397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,85:0.99:86
chr19	41774064	rs2304230	T	C	1515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=8;PP=1228;ReadPosRankSum=-1.123;SC=GCCTTCTGGATGCTTTGGTCC;SOR=1.296;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=50;WE=41774072;WS=41774054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,51:0.96:53
chr19	41797899	rs11083614	C	A	176.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.55;QD=25.26;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	41798111	rs3752705	A	G	2264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=10;PP=1774;SC=TGCCTATGGCAAGAGTTGGCA;SOR=3.373;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=68;TCR=10;TR=78;WE=41798119;WS=41798101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	41807700	rs7248164	G	A	891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=24;PP=707;SC=TGGCTCCCCAGTGATTTCTTT;SOR=3.767;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=41807708;WS=41807690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	41808432	rs11881940	A	T	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=5;PP=1085;SC=CCTTCTGTCTATGTCTTTCTT;SOR=3.321;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=36;WE=41808440;WS=41808422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
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chr19	41811730	rs12745	T	C	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=18;PP=414;SC=CACCCCCCACTGCACAGACCT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=41811738;WS=41811720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	41825776	rs3826714	A	G	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=19;PP=671;SC=CAGTAGCAGGAAGACCCCAGA;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=41825784;WS=41825766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	41889423	rs11880674	A	T	915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.79;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	41889429	rs7259900	A	T	977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=7.160;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=37.61;ReadPosRankSum=1.227;SOR=2.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,25:0.96:26
chr19	41889748	rs12602	T	C	1749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=27;PP=1298;SC=TGACCCTGGCTGCCTACCTTG;SOR=0.728;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=26;TCR=27;TR=53;WE=41889756;WS=41889738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	41897674	rs878082	G	A	496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=360;SC=CTAGCAGTGAGGGTATATGTA;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=41897696;WS=41897664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	41897688	rs878083	G	A	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=377;SC=ATATGTATCCGCCAGGAGGGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=41897696;WS=41897664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	41903220	rs10853751	G	A	4984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=113;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.746;SC=GTCAGTATGCGTCTCCTCCTC;SOR=1.081;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=151;TCF=38;TCR=113;TR=151;WE=41903228;WS=41903210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,161:0.99:162
chr19	41903671	rs892044	A	G	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.60;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	41903675	rs892043	A	G	674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.69;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	41919944	rs3213861	A	C	1277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=11;PP=939;SC=GGTCCCCTCTACACCCCCAGG;SOR=2.038;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=28;TCR=11;TR=39;WE=41919952;WS=41919934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	41920211	rs3213860	T	C	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=241;SC=AAGCCAGGGTTAGGACTCTGG;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=41920219;WS=41920201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	41928336	rs284651	T	C	564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=16;PP=468;SC=TCCCCAATCCTGCCACCTTCC;SOR=3.056;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=19;WE=41928344;WS=41928326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	41928652	rs284652	C	T	2611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.98;NF=40;NR=36;SC=ACCAGCCCTTCCTCATCGAGG;SOR=0.824;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=40;TCR=36;TR=76;WE=41928660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	41928701	rs284653	C	T	3483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=21;PP=2082;SC=CCCGTCAGCACCCCCACAGCA;SOR=1.893;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=54;TCR=21;TR=75;WE=41928709;WS=41928691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	41928724	rs284654	G	A	4480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=34;PP=2965;SC=GACAGCCACCGTAGCATCTTC;SOR=1.739;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=75;TCR=34;TR=109;WE=41928732;WS=41928714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr19	41928765	rs284655	C	T	5177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=75;PP=2965;SC=CAAAACATGGCCTTATCACCT;SOR=0.867;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=91;TCR=75;TR=165;WE=41928773;WS=41928755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr19	41928867	rs3217385	G	GC	3267.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=70;PP=2936;SC=ACTCCAGGGAGCCCACACTGA;SOR=2.184;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=18;TCR=78;TR=86;WE=41928875;WS=41928857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr19	41930396	rs4674	A	G	6807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.486;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=92;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.781;SC=ACCCCAACCTACTCTTCTCAG;SOR=0.584;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=213;TCF=118;TCR=95;TR=209;WE=41930404;WS=41930386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,211:1.00:212
chr19	41931454	rs113478859	A	AGGCCAGGGCCGG	988.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=2857;SC=CCAGAGGCCCAGGCCAGGTCA;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=10;WE=41931462;WS=41931444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	41932084	rs284660	G	T	5764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.081;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=84;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.751;SC=GGCTCTCCCAGGCCACTAGTG;SOR=0.292;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=177;TCF=92;TCR=85;TR=176;WE=41932092;WS=41932074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,186:0.99:187
chr19	41932120	rs284661	C	T	7561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.99;MQRankSum=0.000;QD=43.21;ReadPosRankSum=1.488;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,174:0.99:175
chr19	41932129	.	C	T	7692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.99;QD=44.21;SOR=0.764;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr19	41932275	rs284662	T	C	2934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.565;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=54;PP=2328;ReadPosRankSum=-0.692;SC=GAGACTTGGCTGCCACCACCT;SOR=0.657;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=45;TCR=55;TR=98;WE=41932283;WS=41932265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,99:0.99:100
chr19	41932612	rs284663	C	T	2395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=45;PP=1909;SC=CGGATGTCCACTCGATGTACA;SOR=1.194;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=30;TCR=45;TR=75;WE=41932620;WS=41932602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr19	41949870	rs3745286	T	C	137.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=2;PP=137;SC=CCCCTTGCTCTCTGGGGTGGC;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=41949878;WS=41949860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	42027500	rs4803475	A	G	5681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=76;PP=2965;SC=CCAAATCTCCATTAAGTGTAT;SOR=1.072;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=52;TCR=76;TR=128;WE=42027522;WS=42027490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr19	42027514	rs4803476	T	A	5425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=76;PP=2965;SC=AGTGTATTTTTTGAACAGTGA;SOR=1.188;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=46;TCR=76;TR=122;WE=42027522;WS=42027490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr19	42083849	rs714106	C	A	3424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=70;PP=2538;SC=GGATACTACACCCTACAAGTC;SOR=1.449;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=38;TCR=71;TR=108;WE=42083857;WS=42083839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr19	42085873	rs2302188	A	G	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=21;PP=800;SC=GTTTAACCATATGCTCACCAT;SOR=1.244;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=13;TCR=21;TR=34;WE=42085881;WS=42085863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	42092815	rs3745936	T	A	4360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=94;PP=2965;SC=CTGTTTTTACTGGAATTGCTA;SOR=1.954;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=39;TCR=94;TR=133;WE=42092823;WS=42092805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr19	42219306	rs62117363	C	A	2511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=57;PP=1944;SC=GACTTTCTGCCCCAGAAAAAC;SOR=1.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=23;TCR=57;TR=80;WE=42219314;WS=42219296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	42265866	rs28547939	C	G	2935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=22;PP=1634;SC=GCTTTATTCTCTTTCCTCCAG;SOR=1.576;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=45;TCR=22;TR=67;WE=42265874;WS=42265856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	42265889	rs11548735	G	T	3243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=31;PP=1804;SC=GGCCCAGATGGCCCCACCATT;SOR=1.068;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=75;TCF=43;TCR=32;TR=73;WE=42265897;WS=42265879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	42311060	rs5828129	A	AAAG	1691.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=2;PP=1682;SC=GGAGTTGGCCAAATAGGAGAT;SOR=4.977;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=34;WE=42311068;WS=42311053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	42313803	rs3795022	T	C	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=0;PP=498;SC=GGGTCCTTCCTCTCTGCTCAG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=42313811;WS=42313793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	42313921	rs734107	G	T	3095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=20;PP=2440;ReadPosRankSum=0.465;SC=TGAAAATGGGGTTCCCTTCTT;SOR=0.874;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=95;TCF=75;TCR=20;TR=93;WE=42313929;WS=42313911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,98:0.98:100
chr19	42315281	rs899662	G	T	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=19;PP=592;SC=CTTAGCTTCCGCCAGGAGCTG;SOR=2.494;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=42315289;WS=42315271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	42315300	rs2008808	G	T	737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=20;PP=565;SC=TGCTCCTGTGGGTTGATGGAG;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=42315308;WS=42315290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	42342319	rs2290695	A	G	1413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=32;PP=1105;SC=TAAAGCCCACAACTCCCCTTG;SOR=2.252;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=43;WE=42342327;WS=42342309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	42342822	rs7252877	T	A	458.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.77;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	42342923	rs10414356	T	A	1285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.819;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=10;PP=1046;ReadPosRankSum=1.690;SC=AGAGCAAGCATAACGAAATTG;SOR=2.165;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=39;WE=42342931;WS=42342913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr19	42343155	rs4130852	G	T	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=21;PP=967;SC=CTGAGCCCGTGAACTGCCAAC;SOR=0.984;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=37;WE=42343163;WS=42343145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	42343526	rs3922888	G	T	1426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=42;PP=1202;SC=ATAGGCTCCCGCAGACCTTCT;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=0;TCR=42;TR=42;WE=42343534;WS=42343516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	42354629	rs2305809	T	C	4472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=76;PP=2965;SC=GGACATCTGGTCCCTCAGAGT;SOR=1.076;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=131;TCF=55;TCR=76;TR=131;WE=42354637;WS=42354619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr19	42373298	rs1366610	G	A	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=13;PP=511;SC=AGCAGGGTAGGGGGGGCTGCA;SOR=1.508;Source=Platypus;TCF=7;TR=20;WE=42373306;WS=42373288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	42373679	rs2075750	C	T	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=1;PP=530;SC=CAGGTGGCTTCTTGAGAAGCC;SOR=4.294;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=42373687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	42373893	rs2075751	C	T	1403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=32;PP=1117;SC=GCCCATACTTCGTCAGGTAGA;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=43;WE=42373901;WS=42373883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	42375244	rs2075754	C	T	872.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=3;PP=670;SC=CCCTTGAGACCCAGTTTCCAC;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=42375252;WS=42375234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	42462788	rs1075728	G	A	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=1;PP=639;SC=CCTGGGCGGTGAGAGGAGGGA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=42462796;WS=42462778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	42463447	rs735571	C	T	4039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=85;PP=2965;SC=GCTGCCATGTCTGCGTCGTGA;SOR=1.761;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=38;TCR=85;TR=123;WE=42463455;WS=42463437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr19	42471050	rs919390	G	C	1000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=7;PP=844;SC=CCTGGGCCTGGGGGACGGGGA;SOR=2.448;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=42471058;WS=42471040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	42489516	rs2217342	A	C	3090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=45;PP=2308;SC=GGTTGTCGTGAGTGCAGTCGG;SOR=0.856;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=55;TCR=45;TR=99;WE=42489524;WS=42489506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr19	42596244	rs367613289	C	A	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=129.948;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=35;PP=641;ReadPosRankSum=-3.468;SC=TCAGGCCTGACAAGCCGATAG;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=74;TCF=33;TCR=41;TR=35;WE=42596252;WS=42596234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,31:0.44:71
chr19	42736267	rs851609	A	G	1623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=12;PP=1280;SC=GAGGAGGGATAAGAATGGCGT;SOR=2.004;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=36;TCR=12;TR=48;WE=42736275;WS=42736257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	42793590	rs3826706	G	A	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=12;PP=601;SC=ATCTTGCCCAGGACCCAGCAG;SOR=0.963;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=24;TCF=11;TCR=13;TR=23;WE=42793598;WS=42793580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	42799049	rs1052023	C	T	3857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=85;PP=2957;ReadPosRankSum=-0.811;SC=AGTTGAAGATCCGTGAGGTGC;SOR=1.065;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=118;TCF=31;TCR=87;TR=116;WE=42799057;WS=42799039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,122:0.99:123
chr19	42848764	rs874002	A	G	1133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=22;PP=987;SC=GTGGGCCGGCAGGAGGGGGCC;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=20;TCR=22;TR=42;WE=42848772;WS=42848754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	42865283	rs73033437	G	A	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=550;SC=GTGAATCACCGCAGGCAGGGT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=20;WE=42865291;WS=42865273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr19	43519442	rs10414166	T	C	6493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=103;PP=2965;SC=GGGTTAGAGTTTGCGAAGCAG;SOR=0.898;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=196;TCF=92;TCR=104;TR=194;WE=43519450;WS=43519432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
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chr19	43690506	rs8107936	G	C	2463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=24;PP=1867;SC=GTGAGCAGGAGCCCCTTCCAG;SOR=1.670;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=76;TCF=52;TCR=24;TR=74;WE=43690514;WS=43690496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr19	43690567	rs140503003	G	A	3393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=48;PP=2516;SC=TGGTCTCTGCGCCTGCGTGTT;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=56;TCR=48;TR=104;WE=43690575;WS=43690557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr19	43708926	rs11673307	G	T	3798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=99;NR=18;PP=2965;SC=TGGAACAGGCGGCAGACTCCT;SOR=3.376;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=118;TCF=100;TCR=18;TR=117;WE=43708934;WS=43708916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr19	43708968	rs11669435	T	C	4808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=49;PP=2965;SC=GTCTCCACCCTCTGGATGTTT;SOR=1.506;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=149;TCF=100;TCR=49;TR=149;WE=43708986;WS=43708958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr19	43708978	rs67183694	TC	T	4994.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=62;PP=2951;SC=TCTGGATGTTTCTTTTTCCCC;SOR=0.869;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=114;TCF=51;TCR=63;TR=112;WE=43708986;WS=43708958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr19	43709072	rs56700032	G	A	1932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=57;PP=1628;SC=TATAGTTATTGTTATCATTTT;SOR=6.770;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=58;TCF=1;TCR=57;TR=58;WE=43709080;WS=43709062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	43857873	rs45441892	G	C	1840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=10;PP=1455;ReadPosRankSum=1.458;SC=GGTCATGAGCGCGGTATTACT;SOR=1.785;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=49;TCR=10;TR=58;WE=43857881;WS=43857863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr19	43858317	rs4803613	G	A	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=4;PP=534;SC=GGACCCTGGAGGCCTGACCTC;SOR=2.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=19;WE=43858325;WS=43858307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	43859549	rs1962260	T	C	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=3;PP=388;SC=CAGGTGTGAGTCACCACACCC;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=43859557;WS=43859539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	43860048	rs117850879	G	T	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=6;PP=364;SC=ACCCAGAGGAGGGTGGGCCTG;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=14;WE=43860056;WS=43860038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr19	43865499	rs71339512	T	C	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=6.160;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.64;MQRankSum=0.384;QD=9.39;ReadPosRankSum=1.943;SOR=2.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
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chr19	43876942	rs72623900	C	T	4900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=42;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=55;PP=2965;SC=GGGCCAGTGCCAGCCCCACCC;SOR=0.767;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=107;TCF=52;TCR=55;TR=106;WE=43876950;WS=43876921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr19	43876979	rs71774559	GC	G	5531.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.73;NF=50;NR=40;PP=2973;SC=CAGGCCCCCAGCCCCACCTCC;SOR=0.973;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=56;TCR=45;TR=90;WE=43877009;WS=43876969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr19	43876983	rs114301694	C	T	5810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.74;QD=46.49;SOR=0.958;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr19	43876991	rs10404818	T	G	6406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.89;QD=46.76;SOR=0.969;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr19	43876994	rs10404822	T	G	6602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.89;QD=46.50;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr19	43877001	rs10403027	A	G	6761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.90;QD=44.49;SOR=0.923;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr19	43877081	rs61525615	G	T	4570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=92;PP=2965;SC=GGAGCTGGAAGGTTGGGCCAC;SOR=1.500;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=142;TCF=49;TCR=93;TR=141;WE=43877089;WS=43877071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr19	43877540	rs369424159	C	G	177.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.84;QD=29.64;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	43883124	rs4803622	C	T	1166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=10;PP=1288;SC=AGTTCAGTCCCCGCAGGGACC;SOR=2.242;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=48;WE=43883132;WS=43883114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	43883313	rs4803623	C	G	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.99;QD=34.23;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	43920443	rs3810375	C	G	3007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=46;PP=2570;SC=GGTTGATTATCTCCATGCCAA;SOR=0.760;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=90;TCF=44;TCR=46;TR=90;WE=43920451;WS=43920433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr19	43969757	rs2259013	A	G	1032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=31;PP=839;SC=TCCCCCCTGGATGTGCCGCCT;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=43969765;WS=43969747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	43979589	rs1055099	G	T	4206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=37;PP=2965;SC=CGTCAGCGGCGGTCACGATGA;SOR=1.839;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=89;TCR=37;TR=126;WE=43979597;WS=43979579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr19	43982467	rs2682543	A	G	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=344;SC=GAGACTGGGCACAGAAACTGG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=43982475;WS=43982457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	43983740	rs1133929	T	C	224.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=7;PP=217;SC=GTGGGGTGGGTGGGGCCTGGG;SOR=2.093;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=43983748;WS=43983730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	43999256	.	A	G	86	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=61;MMLQ=28;MQ=49.67;NF=6;NR=0;PP=86;QD=20.1285354245;SC=TGGACTCCTGAGTCTGAGGGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=6;WE=43999264;WS=43999249;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr19	43999271	.	G	GA	1869	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MMLQ=29;MQ=49.11;NF=11;NR=0;PP=1869;QD=172.363636364;SC=GAGGGAGGAGGGGCTGGGGCC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=31;TCR=4;TR=11;WE=43999300;WS=43999261;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:24,11:0.31:35
chr19	43999292	.	G	GGTCTGAGGGAGGAGGAGACTCGGGGCAGGACCCCTGA	2183.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.44;QD=99.26;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	43999634	rs1125030	A	C	5012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=62;PP=2965;SC=AGGGCAGGTGACAGGTAGCTC;SOR=1.114;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=91;TCR=62;TR=153;WE=43999642;WS=43999624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr19	44001345	rs7257767	C	T	1191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=11;PP=922;SC=TGTCCCGATCCTCCTCCTCCT;SOR=1.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=38;WE=44001353;WS=44001335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	44001891	rs2682549	T	C	1878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=2;PP=1610;SC=AAGAACCAGATGCCATTACCT;SOR=5.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=59;TCF=57;TCR=2;TR=59;WE=44001899;WS=44001881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	44012005	.	G	A	235	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.6194;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MMLQ=28;MQ=53.48;NF=8;NR=2;PP=235;QD=26.9771212547;SC=CAGGAGTCCAGGCCCCCAGCC;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=10;WE=44012013;WS=44011995;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:4,10:0.71:14
chr19	44012005	.	G	GGCCCCCAGCCCCTCCTCCCTCAGACCCAGGAGTCCAA	395.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=197.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	44012880	rs2682578	A	G	620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=8;PP=490;SC=TTTACACTCCACTTTCAAAGT;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=23;WE=44012888;WS=44012870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	44047493	.	CGTGTGT	C,CGT	754.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.11;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=18,18;NR=0,0;PP=160,668;SC=TTAAATGCATCGTGTGTGTGT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=18,18;WE=44047506;WS=44047483;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.35,0.65:20
chr19	44047826	rs2682557	T	A	4376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=89;PP=2965;SC=TCACTCATATTGTCCTCGAGC;SOR=1.576;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=45;TCR=89;TR=134;WE=44047834;WS=44047816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr19	44050195	rs25479	C	T	3865.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=68;PP=2934;ReadPosRankSum=-1.251;SC=CCCCCAGCCCCAGCCCTACCT;SOR=0.237;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=59;TCR=69;TR=127;WE=44050203;WS=44050185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,128:0.99:129
chr19	44055565	.	G	A	413	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=15;NR=2;PP=413;QD=26.339483091;SC=CCCTCATCTGGAGTACCCCAG;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=17;WE=44055573;WS=44055564;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	44055582	rs2139720	C	T	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=3;PP=568;SC=CCAGCCCCTGCCCCGCTCCTC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=44055590;WS=44055572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	44055726	rs25487	T	C	3118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=60;NR=42;PP=2377;SC=GCCTTACCTCTGGGAGGGCAG;SOR=1.085;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=103;TCF=60;TCR=43;TR=102;WE=44055734;WS=44055716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr19	44055898	rs25486	C	T	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=22;PP=658;SC=CAAAGGGGAACGAGACAGGGG;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=44055906;WS=44055888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	44057227	rs915927	T	C	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=377;SC=TAGGTCCTGCTGGGTCGCTGG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=44057235;WS=44057217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	44079687	rs3213245	G	A	1425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=34;PP=1136;SC=AGTGGGAGGGGGCGGGGTGCG;SOR=2.687;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=44;TCF=10;TCR=34;TR=43;WE=44079695;WS=44079677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	44081288	rs2682585	A	G	1830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=20;PP=1386;SC=GTCCAGACCCACCCCTCCTCA;SOR=1.646;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=63;TCF=42;TCR=21;TR=62;WE=44081296;WS=44081278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	44081499	rs2682586	A	G	1219.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5089;FS=3.444;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.91;MQRankSum=-0.178;NF=8;NR=38;PP=1464;ReadPosRankSum=0.524;SC=TAGAGAGAGAAAGAGCCTTCA;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=49;TCF=9;TCR=40;TR=46;WE=44081507;WS=44081487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,42:0.93:45
chr19	44082945	rs304731	T	C	2989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=39;PP=2158;SC=GGGATCATCATGGTTCTCAAG;SOR=1.000;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=55;TCR=39;TR=94;WE=44082953;WS=44082935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr19	44098903	rs304726	T	A	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=390;SC=ACCTCCATGGTCGCACCTAGG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=44098911;WS=44098893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	44117582	rs10410000	T	C	3818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=56;PP=2965;SC=GGCGAGAGATTGCAGCCGATC;SOR=1.217;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=137;TCF=81;TCR=56;TR=137;WE=44117590;WS=44117577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr19	44118188	rs3815422	A	C	10638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=166;NR=183;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.907;SC=TAGCAAGGAGAGCGACCCCAG;SOR=0.461;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=353;TCF=168;TCR=185;TR=349;WE=44118196;WS=44118178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,361:0.99:364
chr19	44118353	rs2302421	G	A	10246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=338;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=197;PP=2965;ReadPosRankSum=1.908;SC=CAGTCAAGCCGACGCCACCAC;SOR=0.665;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=326;TCF=125;TCR=201;TR=319;WE=44118361;WS=44118343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,328:0.98:334
chr19	44118680	rs1860149	A	G	274.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=225;SC=CACTGCTGGCATGGGGCACAG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=44118688;WS=44118670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	44130453	rs3746003	G	A	4774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=122;PP=2965;ReadPosRankSum=1.085;SC=GCCACACCCCGGTCAGACACT;SOR=1.795;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=149;TCF=26;TCR=123;TR=148;WE=44130461;WS=44130443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,146:0.99:147
chr19	44131297	rs407049	T	C	6036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=126;NR=61;PP=2965;SC=AGGATGCGTCTGACAAGGGGG;SOR=1.682;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=187;TCF=126;TCR=61;TR=187;WE=44131305;WS=44131287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
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chr19	44223125	rs346049	C	T	6084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=100;NR=87;PP=2965;SC=CTTCTTCCTGCTGGTCTCCCC;SOR=0.947;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=187;TCF=100;TCR=87;TR=187;WE=44223133;WS=44223115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr19	44223145	rs34439296	C	T	6507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=99;PP=2965;ReadPosRankSum=1.294;SC=CCCGCCGCTGCGGGGCCGTCG;SOR=0.283;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=204;TCF=105;TCR=99;TR=203;WE=44223153;WS=44223135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,208:1.00:209
chr19	44223412	rs34471331	C	T	2038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=41;PP=1637;ReadPosRankSum=-0.864;SC=CCTGGGAGCACGACCTGCCCT;SOR=0.628;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=64;TCF=21;TCR=43;TR=62;WE=44223420;WS=44223402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr19	44224161	rs346048	T	A	1202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=31;PP=961;SC=AAATCCAAATTACCAACAAAA;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=38;WE=44224169;WS=44224151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	44244423	rs430066	A	G	2391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=68;PP=2043;SC=TCAGCCTTGGATGCATCCGAA;SOR=4.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=5;TCR=68;TR=73;WE=44244431;WS=44244413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	44248878	rs346532	A	G	811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=1;PP=668;SC=CCCTGCTCCCAGTGGGTGCCC;SOR=5.353;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=29;WE=44248886;WS=44248868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	44254972	rs164070	C	T	2377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=59;PP=1924;ReadPosRankSum=-0.855;SC=CTAGACTATACGAAGTCCCTT;SOR=1.440;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=76;TCF=16;TCR=60;TR=75;WE=44254980;WS=44254962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,76:0.99:77
chr19	44280837	rs514328	G	A	2102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=27;NR=38;PP=1520;SC=GTCTCCCTCCGCCTGGCCCTC;SOR=0.934;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=71;TCF=27;TCR=44;TR=65;WE=44280845;WS=44280827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	44280980	rs35773079	T	G	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=326;SC=CCCAGTGCGGTGGCTCACACC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=44280988;WS=44280970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	44302624	rs349053	T	C	4060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=52;PP=2965;SC=CATTCTGCCATTGCCCTGGAA;SOR=1.133;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=70;TCR=52;TR=122;WE=44302632;WS=44302614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr19	44303066	rs11547806	C	G	1785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=34;PP=1400;SC=AGCGCGTCCGCGTTCGATTGC;SOR=1.371;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=20;TCR=34;TR=54;WE=44303074;WS=44303056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	44306389	rs72214885	GCCCCCA	G	4792.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=22;PP=2973;SC=AGGAGTCCAGGCCCCCAGTCT;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=62;TCR=24;TR=81;WE=44306402;WS=44306379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	44351694	rs2195980	C	T	4928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=86;PP=2965;SC=AAAATTCATACTGGTGTGAAA;SOR=1.112;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=149;TCF=63;TCR=86;TR=149;WE=44351702;WS=44351684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr19	44377357	rs239942	C	T	3567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=39;PP=2898;SC=GAGCCCTTACCAAAAGCCTTT;SOR=1.365;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=67;TCR=39;TR=106;WE=44377365;WS=44377347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr19	44419030	rs420242	A	G	8450.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=149;NR=126;PP=2965;SC=TCTCTCCTGCATGAGCCCTTT;SOR=0.849;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=275;TCF=149;TCR=126;TR=275;WE=44419038;WS=44419020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,287:1.00:287
chr19	44466754	rs413061	G	C	3297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=7;PP=2622;ReadPosRankSum=-0.730;SC=TTGCAGTTTGGGGTTATGAGT;SOR=3.321;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=92;TCR=7;TR=97;WE=44466762;WS=44466744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr19	44469577	rs451601	T	G	2268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=68;PP=1984;SC=TTGCCAAACTTCTTTCATAAC;SOR=8.497;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=68;TCF=0;TCR=68;TR=68;WE=44469585;WS=44469567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	44470189	rs454301	T	A	6632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=81;NR=115;PP=2965;SC=TAAACAGTCCTTCAGTGATGT;SOR=1.146;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=197;TCF=82;TCR=115;TR=196;WE=44470197;WS=44470179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr19	44470420	rs439676	T	C	8775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=178;NR=95;PP=2965;SC=ACCATTCAAATGTGGGCAATG;SOR=1.451;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=273;TCF=178;TCR=95;TR=273;WE=44470428;WS=44470410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr19	44470548	rs453640	A	G	10443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=315;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=153;NR=151;PP=2965;SC=CACAGCTTCAAGAACATCAGA;SOR=0.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=304;TCF=153;TCR=151;TR=304;WE=44470556;WS=44470538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,308:1.00:308
chr19	44470663	rs435590	G	C	13031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=411;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=208;NR=187;PP=2965;SC=AGGAGAAAAAGCATTCAGATG;SOR=0.791;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=395;TCF=208;TCR=187;TR=395;WE=44470671;WS=44470653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,405:1.00:405
chr19	44471209	rs365745	T	A	5905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=132;NR=52;PP=2965;SC=TACTCAGAGTTCACAACTTCA;SOR=1.876;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=132;TCR=52;TR=184;WE=44471217;WS=44471199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr19	44471323	rs366111	G	A	8670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=115;NR=139;PP=2965;SC=GAGGGTCCACGGGGGAGAGCG;SOR=0.886;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=256;TCF=116;TCR=140;TR=254;WE=44471331;WS=44471313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,270:1.00:270
chr19	44471632	rs56887248	CT	C	531.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.88;QD=19.69;SOR=6.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	44500478	rs398235	A	T	5569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=111;PP=2965;SC=TAAACAGTCCATCAGTGATGT;SOR=1.489;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=168;TCF=56;TCR=112;TR=167;WE=44500486;WS=44500468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr19	44500761	rs448921	G	A	11558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=183;NR=181;PP=2965;SC=AATGTTCATCGTAAATTACAC;SOR=0.709;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=365;TCF=184;TCR=181;TR=364;WE=44500769;WS=44500751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,371:1.00:371
chr19	44501116	rs388812	A	G	11014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=153;NR=155;PP=2965;SC=ACACAGGAGAAAAACCATATA;SOR=0.706;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=308;TCF=153;TCR=155;TR=308;WE=44501124;WS=44501106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,322:1.00:322
chr19	44501227	rs388471	A	G	10350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=326;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=127;NR=169;PP=2965;SC=AAGAATGTGGAAAGGGATTTT;SOR=1.015;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=296;TCF=127;TCR=169;TR=296;WE=44501235;WS=44501217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,319:1.00:319
chr19	44501627	rs35292176	T	C	2109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=56;PP=1701;SC=TGACACATAATTGTTCATATT;SOR=8.222;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=0;TCR=56;TR=56;WE=44501635;WS=44501617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	44503379	rs452554	C	T	1432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=18;PP=1173;SC=TACATTTCATCCAGTCCTGTA;SOR=1.038;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=27;TCR=18;TR=45;WE=44503387;WS=44503369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	44503541	rs11314755	TA	T	1118.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=22;PP=1157;SC=AGACAGACCTTAAGAGTTCAT;SOR=1.839;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=29;WE=44503549;WS=44503531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	44503569	rs7252394	G	A	798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=20;PP=640;SC=TTTACAAAACGAATCATGAAC;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=44503577;WS=44503559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	44503607	rs7253205	T	C	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=537;SC=CACTAGAATGTCAGTGACATG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=44503615;WS=44503597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	44511202	rs2356549	A	T	4965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=100;NR=56;PP=2965;SC=TACTCAAGACACTGAAGACTC;SOR=1.383;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=100;TCR=56;TR=156;WE=44511210;WS=44511192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr19	44511223	rs424147	T	G	5366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=73;PP=2965;SC=CAAAAAGTAGTAGGAAAAATG;SOR=0.967;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=166;TCF=93;TCR=73;TR=166;WE=44511231;WS=44511213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr19	44511389	rs2191566	G	T	2491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=55;PP=1866;SC=TGTCTCTTTTGTGTTGACTTT;SOR=2.955;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=11;TCR=55;TR=66;WE=44511397;WS=44511379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	44530390	rs8101750	T	C	2934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=74;PP=2404;SC=TACATGATCTTCACAGTGGCA;SOR=3.962;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=10;TCR=74;TR=84;WE=44530398;WS=44530380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr19	44530444	rs3830527	GAC	G	1463.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=28;PP=1295;SC=ATGGGCGTGAGACACAGGTGG;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=28;WE=44530453;WS=44530434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	44535999	rs7258517	G	T	5905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=139;NR=37;PP=2965;SC=GATGGAGACTGTTCCAGAAGC;SOR=2.745;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=176;TCF=139;TCR=37;TR=176;WE=44536007;WS=44535989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr19	44564401	rs12610472	T	C	1604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=33;PP=1179;SC=AAGACTTCTTTGTCGTTGGAC;SOR=1.238;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=58;TCF=25;TCR=33;TR=57;WE=44564409;WS=44564391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	44564981	rs3826941	G	A	9539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=137;NR=148;PP=2965;SC=CAACCCAAAGGGAAGGGAATT;SOR=0.785;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=286;TCF=137;TCR=149;TR=285;WE=44564989;WS=44564971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,295:1.00:295
chr19	44565125	rs4502339	A	G	2840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=78;PP=2278;SC=CCTTCCAGCTAGTGGCCCTGC;SOR=5.622;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=82;TCF=4;TCR=78;TR=82;WE=44565133;WS=44565115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	44570393	rs6509138	C	A	3990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=76;PP=2965;SC=TGAGGAAGGACTATCTATAAT;SOR=1.392;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=120;TCF=44;TCR=76;TR=119;WE=44570401;WS=44570383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr19	44570551	rs4375771	G	A	3246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=41;PP=2641;SC=ACATCTCAGCGCTTCATATTC;SOR=1.157;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=59;TCR=41;TR=100;WE=44570559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr19	44571154	rs4433920	T	C	8676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=123;NR=135;PP=2965;SC=ACTTGCACCATAGAGCCCACA;SOR=0.810;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=258;TCF=123;TCR=135;TR=258;WE=44571162;WS=44571144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr19	44580758	rs57895932	T	C	922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=33;PP=760;SC=ATTTATGTTATGAGTAGAAAT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=33;WE=44580766;WS=44580748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	44585159	rs4803674	T	A	3567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=28;PP=2897;SC=CATACGTTTGTTGTTGTAGGA;SOR=2.261;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=81;TCR=28;TR=109;WE=44585167;WS=44585149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr19	44586076	rs4553729	T	C	2791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=39;PP=2066;SC=ACCATATCAGTGTTCAAGTTC;SOR=0.901;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=49;TCR=39;TR=88;WE=44586084;WS=44586066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr19	44589999	rs139900131	TCTC	T	7293.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=72;PP=2965;SC=AGCTCTCAGTTCTCCACACAA;SOR=0.905;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=143;TCF=65;TCR=78;TR=137;WE=44590009;WS=44589989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr19	44590558	rs7255701	C	T	4864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=54;PP=2965;SC=CCATGGTCCACATGCAAGAGA;SOR=1.257;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=89;TCR=55;TR=143;WE=44590566;WS=44590548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr19	44591360	rs8113249	G	A	2820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=76;PP=2385;SC=GAAGCGCTACGAGAGGCGCTT;SOR=4.099;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=9;TCR=76;TR=85;WE=44591368;WS=44591350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	44604914	rs62115526	T	C	3745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=29;PP=2933;SC=CCAGGAATCATTGGTCATGAG;SOR=2.342;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=90;TCR=29;TR=119;WE=44604922;WS=44604904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr19	44610665	rs2068061	A	G	6650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=115;NR=88;PP=2965;SC=TCAAGACTTGATGATAAATAG;SOR=0.925;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=115;TCR=88;TR=203;WE=44610673;WS=44610655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr19	44610798	rs4239529	A	T	7046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=93;NR=120;PP=2965;SC=GATGTCTCCCACTTTGATTTT;SOR=0.969;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=213;TCF=93;TCR=120;TR=213;WE=44610806;WS=44610788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr19	44611066	rs7508149	T	C	12639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=401;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=209;NR=180;PP=2965;SC=ATGTTCATCATAAATTACACA;SOR=0.873;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=389;TCF=209;TCR=180;TR=389;WE=44611074;WS=44611056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,397:1.00:397
chr19	44611420	rs4508518	A	G	12117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=371;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.98;NF=169;NR=190;PP=2965;SC=ACACGGGAGAAAAGCCATATA;SOR=0.796;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=361;TCF=170;TCR=191;TR=359;WE=44611428;WS=44611410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,366:1.00:366
chr19	44611957	rs3746322	T	C	9482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.547;NF=118;NR=169;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.801;SC=GTGGGAAGAGTTTTGGCTGGG;SOR=0.409;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=290;TCF=120;TCR=170;TR=287;WE=44611965;WS=44611947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,291:1.00:292
chr19	44612005	rs3746321	A	G	9651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.91;QD=44.27;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
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chr19	44612231	rs3746319	A	G	6148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=91;PP=2965;SC=TTCATTCTCTAAAGTGCAAGA;SOR=0.704;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=185;TCF=93;TCR=92;TR=183;WE=44612239;WS=44612221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr19	44634903	rs10413195	A	G	1385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=0;PP=1152;SC=AACATTCCCTATATTTATTAA;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=38;WE=44634911;WS=44634893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	44662274	rs35483237	T	TA	914.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.79;MQRankSum=0.666;QD=20.33;ReadPosRankSum=-0.559;SOR=1.206;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,41:0.91:45
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chr19	44677233	rs12459795	A	G	3279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=93;PP=2871;SC=CACCCTTTGTACTGCTTGCCC;SOR=4.914;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=99;TCF=6;TCR=93;TR=99;WE=44677241;WS=44677223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr19	44721699	rs9304640	C	T	5698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=81;NR=91;PP=2965;SC=CATTGCCTCTCGTTTCCTGCT;SOR=0.822;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=81;TCR=91;TR=172;WE=44721707;WS=44721689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr19	44739303	rs2279073	T	C	6541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=115;NR=85;PP=2965;SC=ATGGCTCCAATCAGAAATTAC;SOR=1.029;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=200;TCF=115;TCR=85;TR=200;WE=44739311;WS=44739293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr19	44739399	rs2279072	T	C	7114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=114;NR=100;PP=2965;SC=CGAATGTTCATACAGGAGAAA;SOR=0.900;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=216;TCF=114;TCR=102;TR=214;WE=44739407;WS=44739389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr19	44764064	rs1233444	A	G	4246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=52;PP=2965;SC=AGGAGGGCGAAGCAGCCGTCA;SOR=1.153;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=78;TCR=52;TR=130;WE=44764072;WS=44764054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr19	44769974	rs12462723	C	T	1254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=9;PP=1009;SC=GTACAAACACCTTTTTCAGCG;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=28;TCR=9;TR=37;WE=44769982;WS=44769964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	44778405	rs1233428	A	C	3975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=58;PP=2965;SC=AGAGTTCACAAAGGAGAGAAG;SOR=0.759;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=63;TCR=59;TR=120;WE=44778413;WS=44778395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr19	44792701	rs2125579	T	G	4787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=96;PP=2965;SC=GTCCTTCTCATGTGTACTACA;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=48;TCR=96;TR=144;WE=44792709;WS=44792691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr19	44792969	rs2609908	G	A	2725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=31;PP=2099;SC=AATATACATAGTTTGTTTTTC;SOR=1.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=50;TCR=31;TR=81;WE=44792977;WS=44792959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	44807359	rs67283809	GAT	G	317.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=273;SC=GAAATTAACAGATATATATAT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=6;WE=44807368;WS=44807349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	44832684	rs2609880	T	G	5412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=93;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.795;SC=GTTTCTCTCCTGTGTGGACTC;SOR=0.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=176;TCF=82;TCR=94;TR=175;WE=44832692;WS=44832674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,184:0.99:185
chr19	44832875	rs2722722	A	G	4373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.745;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=46;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.842;SC=CCTTGAAGATATAAATTATGG;SOR=0.775;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=74;TCR=47;TR=120;WE=44832883;WS=44832865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,134:0.99:135
chr19	44832992	rs2722723	C	G	4959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=88;PP=2965;SC=CCACACTCCTCAGAATTATAT;SOR=1.194;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=58;TCR=88;TR=146;WE=44833000;WS=44832982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr19	44833506	rs4325673	C	T	4778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=50;PP=2965;ReadPosRankSum=0.431;SC=GCTGATGAACCTCAGAGCTGG;SOR=0.654;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=97;TCR=50;TR=146;WE=44833514;WS=44833496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,147:0.99:148
chr19	44833851	rs4280359	G	C	3826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=39;PP=2965;SC=CTATATGAGTGAATATATAGT;SOR=1.322;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=69;TCR=39;TR=108;WE=44833859;WS=44833841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr19	44840789	rs2571104	T	C	2129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=16;PP=1673;SC=AACATCCATCTCTTGGGGTTT;SOR=2.200;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=65;WE=44840797;WS=44840779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	44845385	rs74260472	C	T	1034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=27;PP=840;SC=TCTTCTATCCCATTTCTGGGC;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=6;TCR=27;TR=33;WE=44845393;WS=44845375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	44847480	rs5828194	GA	G	7964.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=134;PP=2951;SC=AGGGTAATACGAAAGAAGCCA;SOR=1.288;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=203;TCF=63;TCR=140;TR=191;WE=44847488;WS=44847470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr19	44890685	rs73039936	T	G	4991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=103;NR=48;PP=2965;SC=GAAGGTCCTTTCCACGCTCAC;SOR=1.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=103;TCR=48;TR=151;WE=44890693;WS=44890675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr19	44898674	rs112139093	G	A	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=7;PP=469;SC=ATTTACCCACGTAACAAACCT;SOR=1.839;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=25;WE=44898682;WS=44898664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	44901557	rs2722651	A	G	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=13;PP=426;SC=TGAACAGACTAAACTCCCACC;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=44901565;WS=44901547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	44932972	rs1434579	C	T	3996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=49;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.826;SC=AAGCCCTTTCCGCACTCTTGG;SOR=0.346;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=67;TCR=49;TR=115;WE=44932980;WS=44932962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,126:0.99:127
chr19	44933947	rs12151338	G	A	4549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=94;PP=2965;SC=GGGTGGTTACGTATGTGCGTG;SOR=1.394;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=146;TCF=52;TCR=94;TR=146;WE=44933955;WS=44933937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr19	44934489	rs2571174	G	A	3492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=66;PP=2801;SC=ACTGTCCAGGGAATTCTCAAT;SOR=1.522;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=34;TCR=66;TR=100;WE=44934497;WS=44934479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr19	44936245	.	A	G	334	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=12;NR=0;PP=334;QD=30.7309343789;SC=CCAGAAATAAACTTCTGTTGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=44936253;WS=44936244;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	44947184	rs204547	T	C	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=155;SC=GTCCAGAGCGTGACTGCTTCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=44947192;WS=44947174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	45015014	rs77673324	C	G	4204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=22;PP=2965;ReadPosRankSum=1.402;SC=CCTACAGACTCTTTAGTAGGG;SOR=1.625;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=120;TCF=98;TCR=22;TR=119;WE=45015022;WS=45015004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,129:0.99:130
chr19	45016990	rs5828200	CT	C	3795.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=41;PP=2951;SC=GACTGGGGTCCTTCTGTTGTT;SOR=0.994;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=42;TCR=42;TR=83;WE=45016998;WS=45016980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr19	45017477	rs10706694	TA	T	1599.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=43;PP=1787;SC=CGTTGGGAGGTAATCAGATTG;SOR=5.330;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=44;WE=45017485;WS=45017467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	45021210	rs10414398	G	A	4388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=58;PP=2965;SC=GGTCAGGCTGGAGTTGAGCTC;SOR=0.854;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=70;TCR=58;TR=128;WE=45021218;WS=45021200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr19	45024875	rs12975863	T	C	2082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=48;PP=1221;SC=TCCAGGAGTGTGTGCGTGTGT;SOR=5.784;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=51;TCF=2;TCR=49;TR=50;WE=45024888;WS=45024865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	45024879	rs57244256	CGT	C	1983.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=28;PP=1298;SC=GGAGTGTGTGCGTGTGTGTGT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=1;TCR=47;TR=28;WE=45024888;WS=45024865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	45029208	rs10408247	G	A	3646.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.278;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=53;PP=2740;ReadPosRankSum=-0.671;SC=ACTTTGGGTGGCATCAAGTGG;SOR=0.446;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=57;TCR=54;TR=110;WE=45029216;WS=45029198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,116:0.99:117
chr19	45033379	.	GCACA	G,GCA	779.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.09;MQRankSum=2.672;QD=25.99;SOR=3.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:1,8,21:0.27,0.70:30
chr19	45116776	rs846898	G	A	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=0;PP=1267;SC=CTGACTCTGGGGCAGGCACTA;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=43;WE=45116784;WS=45116766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	45117163	rs111463774	C	T	2622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=36;PP=2010;ReadPosRankSum=0.914;SC=GCTGCAGACGCGACTGTACAG;SOR=0.263;Source=Platypus;TCF=42;TR=77;WE=45117171;WS=45117153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,84:0.99:85
chr19	45121424	rs10412507	G	A	2210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=30;PP=1697;SC=CTGCCTTCTCGGAGCTGCCCT;SOR=0.752;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=35;TCR=30;TR=64;WE=45121432;WS=45121414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	45126900	rs846856	T	C	2202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=1;PP=1804;SC=AATGAATGAATGAACACATGA;SOR=7.024;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=65;TCF=64;TCR=1;TR=65;WE=45126908;WS=45126890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	45126994	rs846857	A	G	6821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=135;NR=67;PP=2965;SC=TTCCCTGTTTACACAGACAGC;SOR=1.632;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=202;TCF=135;TCR=67;TR=202;WE=45127002;WS=45126984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,210:1.00:210
chr19	45147518	rs5828211	C	CA	3223.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=60.14;NF=15;NR=51;PP=2973;SC=GTCTGGCTCCCGCTCCGCATC;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=15;TCR=51;TR=66;WE=45147526;WS=45147508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr19	45147542	rs439446	T	C	2419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=45;PP=1235;SC=GCCGGGTACTTGCCCCCTTGG;SOR=2.958;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=55;WE=45147550;WS=45147532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	45147576	rs5828212	CG	C	1270.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=27;PP=1229;SC=ACGGCCCCGCCGCGGCGCCAC;SOR=3.611;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=29;WE=45147584;WS=45147566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	45157113	rs71171278	A	AG	8059.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=110;NR=75;PP=2974;SC=AATCCCGCGTACCCCAGGCCC;SOR=1.234;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=188;TCF=112;TCR=76;TR=185;WE=45157121;WS=45157103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr19	45162038	rs203710	A	G	3470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=47;PP=2764;SC=ACTCAGGCATATCCCGTAACG;SOR=0.956;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=59;TCR=47;TR=106;WE=45162046;WS=45162028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr19	45213755	rs143934888	A	G	5289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=65;PP=2965;SC=CCCTCGCCCCATATGCCCCAC;SOR=1.450;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=116;TCR=65;TR=180;WE=45213763;WS=45213745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr19	45322744	rs1135062	A	G	6256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=117;PP=2965;SC=CCACTTCGGCACCGGTGAGTG;SOR=1.047;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=85;TCR=117;TR=202;WE=45322752;WS=45322734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr19	45385759	rs3745150	G	C	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=16;PP=484;SC=GGTCTAAATGGAGTAGGGAGG;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=45385767;WS=45385749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	45389224	rs283814	A	G	5887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.99;NF=113;NR=89;PP=2965;SC=ACAAGCCACCAACCCCAAAAG;SOR=0.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=202;TCF=113;TCR=89;TR=202;WE=45389232;WS=45389214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr19	45404431	rs741780	T	C	1578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.851;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=36;PP=1282;ReadPosRankSum=1.291;SC=TGGGGCCACTTGCTAATTCTC;SOR=1.549;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=53;TCF=17;TCR=36;TR=52;WE=45404439;WS=45404421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr19	45404691	rs405697	A	G	1336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=35;PP=1093;SC=CCACATTACCAGGGAACACTT;SOR=3.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=40;WE=45404699;WS=45404681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	45409167	rs440446	C	G	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=17;PP=568;SC=ACCCTGGGAACCCCTGGCCTC;SOR=2.636;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=45409175;WS=45409157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	45419394	.	C	CAAAAAAA	797.84	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.626;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.52;MQRankSum=0.530;QD=49.86;ReadPosRankSum=1.086;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,15:0.94:16
chr19	45419414	rs369972573	C	A	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.35;MQRankSum=-3.818;QD=21.59;ReadPosRankSum=0.532;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr19	45430280	rs5112	C	G	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.95;QD=33.30;SOR=0.780;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	45448036	rs1132899	T	C	1219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=13;PP=978;SC=GAAGGAACCCTGAGCCCCCCA;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=39;WE=45448044;WS=45448026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	45448465	rs5167	T	G	9995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=150;NR=171;PP=2965;SC=CTGGGTCCGCTCACCAAGGCC;SOR=0.877;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=322;TCF=151;TCR=171;TR=321;WE=45448473;WS=45448455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,341:1.00:341
chr19	45451620	rs5120	T	A	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=2;PP=867;SC=GACACCGAGCTCACACAGAGC;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=32;WE=45451628;WS=45451610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	45452335	rs4803776	T	C	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=4;PP=767;SC=GGAGTCCAGGTCCCCAGACCC;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=45452343;WS=45452325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	45458146	rs3760629	A	C	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=0;PP=540;SC=AGGGGTCAGAAGACAAGGGTG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=45458154;WS=45458137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	45458593	rs2238682	C	T	507.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=12;PP=459;SC=CGCGCGATTGCGCTGCGAAGT;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=18;WE=45458601;WS=45458583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	45458925	rs7252480	C	T	318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=264;SC=GGGTCGGTTCCCCTGCACGCT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=45458933;WS=45458915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	45465363	rs35566032	GA	G	4271.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=68;PP=2966;SC=TTTGTTCACCGAAAACATTCA;SOR=0.978;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=109;TCF=36;TCR=73;TR=100;WE=45465371;WS=45465353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr19	45476422	rs204481	T	C	5602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=59.97;NF=40;NR=133;PP=2965;SC=CCGGAGGAGCTCCACGCGTCG;SOR=2.462;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=40;TCR=133;TR=173;WE=45476430;WS=45476412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr19	45477910	rs11318909	CT	C	2175.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=67;PP=2552;SC=ACTGAAGGACCTTTTCCTCCA;SOR=7.083;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=81;TCF=0;TCR=81;TR=67;WE=45477918;WS=45477900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	45488434	rs204472	A	G	1520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=6;PP=1171;SC=TGCAGGTGCCAGCAGGTCTCA;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=44;TCR=6;TR=50;WE=45488442;WS=45488424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	45488567	rs204471	T	C	4063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=74;PP=2704;SC=TCAAGGTAAATGGGCAGGGTT;SOR=0.854;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=64;TCR=74;TR=138;WE=45488575;WS=45488557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr19	45489548	rs58800134	A	AG	1902.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=2;PP=2057;SC=GCTTGAGCCCAGAATTCGAGA;SOR=5.670;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=48;TCF=44;TCR=4;TR=46;WE=45489556;WS=45489538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	45490570	rs3786505	A	G	8339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=167;PP=2965;ReadPosRankSum=0.976;SC=CCTTCTGCCCACTCTCGCTTT;SOR=0.590;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=261;TCF=92;TCR=169;TR=259;WE=45490578;WS=45490560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,269:1.00:270
chr19	45494247	rs11405080	A	AC	3968.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=77;PP=2936;SC=GTCTCCAGGTACCACGTATCC;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=108;TCF=14;TCR=94;TR=88;WE=45494255;WS=45494237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr19	45494349	rs11333249	TC	T	773.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=16;PP=801;SC=CATAACTGCTTCCCTGGGCGA;SOR=2.400;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=45494357;WS=45494339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	45495668	rs2075618	G	C	2962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=78;PP=2417;SC=GGTGAGGCCCGGTGGGCAGGT;SOR=2.723;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=101;TCF=22;TCR=79;TR=100;WE=45495690;WS=45495658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr19	45495682	rs2075619	A	G	3271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=73;PP=2734;SC=GGCAGGTGGGAGCTCCCACCG;SOR=2.584;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=96;TCF=22;TCR=74;TR=95;WE=45495690;WS=45495658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr19	45496303	rs9193	T	C	2860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=46;PP=2276;SC=CAGCGTGTGATGTAGGGGCCG;SOR=0.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=48;TCR=46;TR=93;WE=45496311;WS=45496293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	45506772	rs7251460	T	A	3635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=49;PP=2965;SC=GACAGGTAAATCTTACCACCT;SOR=0.806;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=59;TCR=50;TR=108;WE=45506780;WS=45506762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr19	45515053	.	TGT	AGA	54	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=40.5;NF=1;NR=1;PP=54;QD=53.7339374311;SC=TGTGTGTGTGTGTGAGAGAGA;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=2;WE=45515063;WS=45515043;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,2:0.40:5
chr19	45536036	rs10424046	C	G	727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=19;PP=610;SC=GGTGACCCACCACCTCGGAGA;SOR=2.124;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=45536044;WS=45536026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	45537417	rs143167603	AAAAT	A	1034.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=3;PP=975;SC=ACTGTCTCTAAAAATAAATAA;SOR=2.494;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=20;WE=45537428;WS=45537407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	45540541	.	GA	G	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.67;ReadPosRankSum=-0.497;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr19	45561063	rs4803794	A	G	2759.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=49;PP=2142;SC=CACGGTGGCCAAGGTAGAGAA;SOR=0.852;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=43;TCR=49;TR=92;WE=45561071;WS=45561053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr19	45571781	rs10445571	T	C	3427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=57;NR=50;PP=2679;SC=AGCTCTTCTTTCCCTTGGCAG;SOR=0.787;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=108;TCF=57;TCR=51;TR=107;WE=45571789;WS=45571771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr19	45571900	rs34337168	G	GCC	1852.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=34;PP=1543;SC=CAGCTCCGCTGCCGCTATGCT;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=34;WE=45571911;WS=45571890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	45571903	rs36097205	G	C	1861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=34;PP=1012;SC=CTCCGCTGCCGCTATGCTGGG;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=34;WE=45571911;WS=45571890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	45572247	rs376538298	CA	C	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.94;MQRankSum=0.054;QD=0.99;ReadPosRankSum=-0.495;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,13:0.27:49
chr19	45649371	rs118054030	C	A	4483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=62;PP=2965;SC=CCAGGCAAGCCCCTGCCTGTT;SOR=0.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=81;TCR=63;TR=142;WE=45649379;WS=45649361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr19	45681560	rs7254936	T	C	2640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=85;PP=2042;SC=TCTTGCGTCATGGCGCGAGCC;SOR=5.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=6;TCR=86;TR=91;WE=45681568;WS=45681550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	45716678	rs346740	G	C	3138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=65;PP=2485;SC=ACCCAACCCAGCCGTGGACCC;SOR=1.921;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=96;TCF=30;TCR=66;TR=95;WE=45716686;WS=45716668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
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chr19	45868006	rs238405	A	T	2168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=2;PP=1758;SC=GACTCACAGCAAGCAACAGAC;SOR=6.059;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=59;TCF=57;TCR=2;TR=59;WE=45868014;WS=45867996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
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chr19	45868478	rs238407	T	A	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=31;PP=1015;SC=CTTCAAACCCTGGTCTCCACA;SOR=2.409;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=41;WE=45868486;WS=45868468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	45872036	rs1799783	C	T	2132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=32;PP=1809;SC=GGAGCTTGTGCTCATTGGAGG;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=33;TCR=32;TR=65;WE=45872044;WS=45872026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
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chr19	45911320	.	A	AAAAAAAAAATCAAAAAACCT	3508.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.514;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=10.170;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.57;MQRankSum=-0.100;QD=67.48;ReadPosRankSum=1.035;SOR=4.526;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
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chr19	46057081	rs3826860	A	G	5126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=75;PP=2965;SC=CGCCCAGCTCAGCTGCCGCCT;SOR=1.051;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=102;TCR=75;TR=176;WE=46057089;WS=46057071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr19	46094597	rs3745820	G	A	8105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.725;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=147;NR=104;PP=2965;ReadPosRankSum=1.243;SC=AGGCCACCCAGCCTTCCATGG;SOR=0.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=252;TCF=147;TCR=105;TR=251;WE=46094605;WS=46094587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,256:1.00:257
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chr19	46121020	rs12985660	T	C	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=30;PP=955;SC=GGACATTCTCTTGCCTCAGGG;SOR=5.549;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=31;WE=46121028;WS=46121010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
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chr19	46136487	rs16979952	T	C	1949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=55;PP=1645;SC=AATTGGCTGGTTGAGTTTAGT;SOR=6.666;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=56;WE=46136495;WS=46136477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
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chr19	46144814	rs28602630	G	A	5698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=126;NR=48;PP=2965;SC=TCTAGGTTACGACCTCGTGGC;SOR=2.028;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=175;TCF=127;TCR=48;TR=174;WE=46144822;WS=46144804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr19	46145700	.	G	C	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.182;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=71.043;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.93;ReadPosRankSum=-3.164;SOR=5.781;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,17:0.23:75
chr19	46180150	rs4803846	A	G	2215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=14;PP=1782;SC=GCTGGGGGAGACTGGGAGACA;SOR=2.517;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=52;TCR=14;TR=66;WE=46180158;WS=46180140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	46185217	rs12709891	C	A	3714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=60;PP=2874;SC=CGTGTCTGTTCAGTTAGCATG;SOR=0.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=117;TCF=57;TCR=60;TR=116;WE=46185225;WS=46185207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr19	46195051	rs61466254	G	GC	3532.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=67;NR=34;PP=2455;SC=ATCTGCCCCTGCCCCCCCCGC;SOR=1.915;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=130;TCF=81;TCR=49;TR=101;WE=46195067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr19	46199106	rs34362798	CT	C	114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=6;PP=70;SC=CCACAGGGATCTTTTTTTTTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=6;WE=46199114;WS=46199096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	46204938	rs4803847	C	T	1699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=3;PP=1399;SC=CTGGCATTCACTCTTGTTGGG;SOR=4.575;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=50;WE=46204946;WS=46204928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	46204986	.	C	A	2766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=21;PP=2144;SC=CTGCCTTCCTCTGATTTGTGG;SOR=2.276;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=67;TCR=21;TR=87;WE=46204994;WS=46204976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	46205036	.	C	G	6483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=55;PP=2965;SC=CCCTTCCTCTCTAATCGCCCC;SOR=1.282;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=92;TCR=55;TR=147;WE=46205058;WS=46205026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr19	46205050	rs4803848	T	C	6917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=92;NR=70;PP=2965;SC=TCGCCCCCACTTCCAGAGAAG;SOR=0.955;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=162;TCF=92;TCR=70;TR=162;WE=46205058;WS=46205026;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr19	46206175	.	C	T	8340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=148;NR=104;PP=2965;SC=TACCCGTGCTCCATCTCATCT;SOR=1.024;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=252;TCF=148;TCR=104;TR=252;WE=46206183;WS=46206165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr19	46214700	rs138545162	TA	T	2003.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.384;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=2.338;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.09;MQRankSum=0.143;QD=20.87;ReadPosRankSum=0.209;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,93:0.97:96
chr19	46262286	rs725660	C	A	6878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=139;PP=2965;SC=GAGTACCTGACCCAAGGTGAG;SOR=1.457;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=219;TCF=79;TCR=140;TR=218;WE=46262294;WS=46262276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr19	46268902	rs2341097	C	T	3400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=44;PP=2564;SC=AGCCTCAGCACGGTGTGGGGG;SOR=1.168;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=107;TCF=63;TCR=44;TR=107;WE=46268910;WS=46268892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr19	46269313	rs2014377	G	C	2730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=60;PP=1965;SC=CCCTGCTGCAGGGCCACACCC;SOR=1.585;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=32;TCR=60;TR=92;WE=46269321;WS=46269303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	46282890	rs2070737	A	T	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=12;PP=344;SC=CCCACCTGCCACACCACGCCC;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=46282898;WS=46282880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	46285362	.	G	GC	129	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=7;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=63.51;NF=5;NR=0;PP=129;QD=30.0;SC=CTGCCATCCTGCCCCCCCAAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=46285370;WS=46285352;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,5:0.56:9
chr19	46288706	rs3760843	A	T	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=145;SC=GAGGTCTTGTACTGAGACACT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=46288714;WS=46288696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	46289392	rs8110017	G	C	2642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=10.611;HP=7;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=23;PP=2300;ReadPosRankSum=1.271;SC=GGGCCAGGGGGGGGTGCGGGT;SOR=1.834;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=89;TCF=64;TCR=25;TR=87;WE=46289400;WS=46289382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,85:0.98:87
chr19	46289503	rs8109951	C	T	5084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=100;PP=2965;ReadPosRankSum=0.553;SC=GTGGAGAGAGCGGGGCGCCCC;SOR=0.344;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=179;TCF=76;TCR=103;TR=176;WE=46289511;WS=46289493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,176:0.99:177
chr19	46294136	rs72626215	G	A	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=3;PP=551;SC=AGGCAGAGAAGTTGGGGGCTC;SOR=2.925;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=46294144;WS=46294126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	46313825	rs10407137	A	T	3340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=23;PP=2731;SC=GCCCCCACTGACCCTGATGCC;SOR=2.562;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=83;TCR=23;TR=106;WE=46313833;WS=46313815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr19	46318963	rs3810331	C	A	2244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=48;PP=1877;SC=CTCCTGGTGACCGGGGAAGGA;SOR=1.516;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=24;TCR=48;TR=72;WE=46318971;WS=46318953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	46319415	rs1132645	G	C	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.231;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=30;PP=890;ReadPosRankSum=1.059;SC=CTGGGGCCGGGGCCAAGGTCA;SOR=2.989;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=36;WE=46319423;WS=46319405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr19	46320041	rs74821481	G	T	1469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=17;PP=1252;SC=GGTACCTGGTGGGGGGAAGGG;SOR=1.280;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=46;WE=46320049;WS=46320031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	46326200	rs12976060	A	G	1277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=33;PP=1006;SC=TGGGGAGCTGAGGGCAAGCTC;SOR=3.967;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=36;WE=46326208;WS=46326190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	46327166	rs11671524	G	A	2357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=49;PP=1555;SC=CCAGACCCAGGGTGAGAGCTT;SOR=4.103;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=54;TCF=5;TCR=49;TR=54;WE=46327174;WS=46327156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	46327185	rs7252416	G	C	1876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=39;PP=1233;SC=TTAGGGGAGGGTCAGGTGTTG;SOR=5.235;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=41;WE=46327193;WS=46327175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	46327209	rs11284049	CT	C	1305.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=53;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=32;PP=1367;SC=GGCAGGGTGGCTTGCGGGGCA;SOR=4.921;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=33;WE=46327217;WS=46327199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	46329438	rs7246155	G	A	1003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=0;PP=849;SC=GGCCCAGAGCGCGGACACAGC;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=46329446;WS=46329428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	46329781	rs28362500	GT	G	984.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=60.42;NF=2;NR=22;PP=1022;SC=CTGGTCCCCAGTGCAGGAGGC;SOR=4.255;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=46329789;WS=46329771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	46331302	rs4239535	C	G	1103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=30;PP=848;SC=CAAGCCCCTGCTTATAAAGCT;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=46331310;WS=46331292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	46332194	rs3745929	C	T	1700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=6;PP=1482;SC=GGAAGCCTCTCGGGGACAGGA;SOR=3.830;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=46;TCR=6;TR=52;WE=46332202;WS=46332184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	46333632	rs4516331	G	A	1060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=26;PP=778;SC=GTGGGTAAGAGGAAGGAAGAG;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=46333640;WS=46333622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	46334955	rs4803866	C	T	1013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=29;PP=854;SC=CACAAAACCTCGTTTAAATCC;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=46334963;WS=46334945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	46338492	rs7256192	G	A	2421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=40;PP=1932;ReadPosRankSum=-0.950;SC=AGGACCTGTGGGATGCCCAGG;SOR=0.293;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=76;TCF=35;TCR=41;TR=74;WE=46338500;WS=46338482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,76:0.99:77
chr19	46367901	rs1363538	T	C	1979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=47;PP=1518;SC=CTTGGGCAGCTGAGGAACTGG;SOR=1.751;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=18;TCR=47;TR=65;WE=46367909;WS=46367891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
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chr19	46498353	rs892217	C	G	1527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=22;PP=1166;SC=GCATGCACACCCGGCTCTCCC;SOR=0.853;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=49;TCF=27;TCR=22;TR=49;WE=46498361;WS=46498343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
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chr19	46498835	rs55951953	C	T	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.27;SOR=6.184;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	46511548	rs2287305	T	C	2026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=39;PP=1661;SC=AGATCTGGCATCTGCGGGAGC;SOR=1.366;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=23;TCR=39;TR=62;WE=46511556;WS=46511538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	46520026	rs2287306	A	G	1522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=35;PP=1133;SC=CGCCAGACCCAGCCCCCTGCT;SOR=1.747;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=51;WE=46520034;WS=46520016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	46520728	rs11669048	G	C	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=22;PP=671;SC=GGCAATTGTAGCTCACGGCAG;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=46520736;WS=46520718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	46543249	rs756401	T	C	1275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=36;PP=1050;SC=GTAGCAGCAGTGGCGGGGAAG;SOR=3.209;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=44;WE=46543257;WS=46543239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	46627592	rs2287307	G	A	5396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.655;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.055;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=132;PP=2965;ReadPosRankSum=0.695;SC=AGGGAGAAAGGAAAAAGGTTG;SOR=2.054;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=32;TCR=134;TR=163;WE=46627600;WS=46627582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,165:0.98:168
chr19	46640551	rs1990765	C	A	9525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=294;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=153;NR=129;PP=2965;ReadPosRankSum=1.382;SC=ACACCACATGCAATATTATCT;SOR=0.309;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=283;TCF=154;TCR=129;TR=282;WE=46640559;WS=46640541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,289:1.00:290
chr19	46652396	rs138711585	TCTCTCTCTCTCC	T	782.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5565;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=451;SC=TGGGCAACCATCTCTCTCTCT;SOR=4.514;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=19;WE=46652416;WS=46652386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	46664400	rs10408162	A	G	3032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=57;NR=28;PP=2497;SC=ACATAGGCTAAGGTAATATGT;SOR=1.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=57;TCR=28;TR=85;WE=46664408;WS=46664390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	46815969	.	GGT	G	76.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.349;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=3.815;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=1.917;QD=2.95;ReadPosRankSum=-0.365;SOR=0.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr19	46857286	rs2075144	G	A	495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=14;PP=403;SC=CCTGAGCCAGGCAGATACTGA;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=16;WE=46857294;WS=46857276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	46886768	rs2072492	G	A	1867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=45;PP=1498;ReadPosRankSum=-0.984;SC=GAGGGCCAGCGGGGGTGGGCT;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=57;TCF=11;TCR=46;TR=56;WE=46886776;WS=46886758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr19	46887007	rs1024781	G	C	2677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=24;PP=2229;SC=CTCTCGGCCCGTCCCTCTCCG;SOR=1.809;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=58;TCR=24;TR=82;WE=46887015;WS=46886997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	46892111	rs759290	C	T	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=30;PP=853;SC=AAGAACATGACGAACACCCCC;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=46892119;WS=46892101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	46892168	rs8106745	T	C	262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=178;SC=AGCCTGTGAGTGCTGACCAGC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=46892176;WS=46892158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	46893238	rs759291	A	C	3041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=21;PP=2591;SC=TTGCCCAGCCATTCCTTCTCT;SOR=2.535;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=73;TCR=21;TR=94;WE=46893246;WS=46893228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr19	46893465	rs2311213	A	G	2978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=33;PP=2453;SC=GGTAAGGGGCAGGGGTAGGTT;SOR=1.496;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=65;TCR=33;TR=98;WE=46893473;WS=46893455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	46972967	rs2288916	G	C	1015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=1;PP=832;SC=CACGAGCCCAGTCACTTCTGC;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=30;WE=46972975;WS=46972957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	46974307	rs3826852	C	T	3896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=88;PP=2965;SC=CGGCTCTGAACCTACTATGTG;SOR=2.264;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=30;TCR=88;TR=118;WE=46974315;WS=46974297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr19	47030432	rs3745795	T	C	2629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=77;PP=2083;ReadPosRankSum=-0.869;SC=GAAGTCAGGCTGCCCGGGCAC;SOR=1.569;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=98;TCF=19;TCR=79;TR=96;WE=47030440;WS=47030422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,96:0.99:97
chr19	47104310	rs17551870	TGG	T	1953.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=37;PP=1615;SC=GAAAGTGAAGTGGGCCCGGGA;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=37;WE=47104319;WS=47104300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	47109011	rs3729510	T	C	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=3;PP=786;SC=GGGCCGAGGGTCTGGGCTGAG;SOR=4.047;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=47109019;WS=47109001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	47111663	rs3729760	T	C	4881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=81;NR=68;PP=2965;SC=AGGGAGCCTCTCTCAGGGTGA;SOR=0.864;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=149;TCF=81;TCR=68;TR=149;WE=47111671;WS=47111653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr19	47112123	rs146819515	C	T	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=6;PP=761;SC=GCTACATCAGCGCCGCAGAGC;SOR=2.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=31;WE=47112131;WS=47112113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	47124714	rs2229129	T	G	2038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=29;PP=1633;SC=CCCTCCTCCCTGAGGCGAGCT;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=67;WE=47124722;WS=47124704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	47126614	rs12459883	C	G	1952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=12;PP=1611;SC=CACGATGTCTCACCTCTTTTG;SOR=2.683;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=47;TCR=12;TR=59;WE=47126622;WS=47126604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	47127324	rs2229128	C	G	2532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=66;PP=2201;SC=CCAGTCCGGTCACCAGCACCG;SOR=3.442;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=12;TCR=66;TR=78;WE=47127332;WS=47127314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr19	47137162	rs1005774	C	A	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=538;SC=TCCACGTCCACCCCTACCCCC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=47137170;WS=47137152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	47137459	rs12974613	C	T	2273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=63;PP=1815;SC=CTGCCTGCGACACCTGCGAGC;SOR=3.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=10;TCR=63;TR=73;WE=47137467;WS=47137449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr19	47177913	rs314665	A	G	8306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=155;NR=116;PP=2965;SC=CTCCCAGCGCACGTCGTCACT;SOR=1.014;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=273;TCF=157;TCR=116;TR=271;WE=47177921;WS=47177903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,284:1.00:284
chr19	47228985	rs313844	G	C	780.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=22;PP=667;SC=GGGCTTGAGGGCCCCTGTCTT;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=47228993;WS=47228975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	47291174	rs3027956	G	C	3472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=81;NR=26;PP=2682;SC=TTGGCGGTGGGCTCCGCCGCT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=109;TCF=82;TCR=27;TR=107;WE=47291182;WS=47291164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr19	47342867	rs312185	A	C	2685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=43;PP=2016;SC=AGCAACGGAGATTGCCAGGAC;SOR=0.972;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=33;TCR=43;TR=76;WE=47342875;WS=47342857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr19	47542425	rs71353947	C	T	1275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=36;PP=1060;SC=TGTGAGCAGTCAGGCTCCTGT;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=38;WE=47542433;WS=47542415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	47543774	rs3745615	G	A	1445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=32;PP=1227;SC=TCCACGGACAGGACGCCACGA;SOR=2.409;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=10;TCR=33;TR=42;WE=47543782;WS=47543764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	47548327	rs10423289	A	C	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.88;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	47549962	rs73566538	G	A	3269.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=77;PP=2659;SC=AGGGGGACATGGGGGGATTAA;SOR=2.063;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=27;TCR=77;TR=104;WE=47549970;WS=47549952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr19	47584699	rs3745619	C	T	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=14;NR=0;PP=322;SC=AGGCAGGCCACAGCACTGAGG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=47584707;WS=47584689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	47585517	rs7250850	G	C	6107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=106;NR=78;PP=2965;SC=GCTTCTTTGGGAGTTCGATGT;SOR=1.041;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=185;TCF=107;TCR=78;TR=184;WE=47585525;WS=47585507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr19	47585698	rs7251104	G	C	2337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=63;PP=1924;SC=GAAGACAGGTGTAGGAAGGGC;SOR=8.410;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=0;TCR=63;TR=63;WE=47585706;WS=47585688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	47587772	rs2303107	G	A	2769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=62;PP=2273;SC=AGATGGGATCGGGGTTAATAA;SOR=2.275;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=82;TCF=20;TCR=62;TR=81;WE=47587780;WS=47587762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	47588202	rs7248181	G	T	2640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=1;PP=2100;SC=CAGCCCTTTGGGGGGTGGCTG;SOR=6.568;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=75;TCF=74;TCR=1;TR=75;WE=47588210;WS=47588192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	47588325	rs2287842	G	A	9924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=331;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=180;NR=133;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.785;SC=CCATGTCCTCGTCATAGAAGT;SOR=0.367;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=314;TCF=181;TCR=133;TR=313;WE=47588333;WS=47588315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,329:1.00:330
chr19	47597102	rs10408163	T	C	222.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=170;SC=GGGGATTAAATTAATACCTGA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=47597110;WS=47597098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	47634313	rs177918	T	G	1129.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=32;PP=1034;SC=TTGAGGCCGCTAGGGTCTGGA;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=36;WE=47634321;WS=47634303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	47658320	rs11666272	T	C	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=480;SC=TTGATTCCAATAACATGATTC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=47658328;WS=47658310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	47658482	rs11670191	G	A	2694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=55;PP=2077;SC=TATGTGTAACGTGGGGGCAGA;SOR=1.321;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=35;TCR=55;TR=90;WE=47658490;WS=47658472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr19	47700438	rs372707074	CA	C	50.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.91;MQRankSum=0.000;QD=2.82;ReadPosRankSum=-1.227;SOR=0.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr19	47735818	rs139316960	C	T	6405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=139;NR=56;PP=2965;SC=CCCTGGGCACCTGGCATGGAC;SOR=1.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=195;TCF=139;TCR=56;TR=195;WE=47735826;WS=47735808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr19	47761646	rs12985905	G	C	2997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=34;PP=2263;SC=TTGGCTCCACGCAGCCAGCGA;SOR=1.109;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=55;TCR=34;TR=89;WE=47761654;WS=47761636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr19	47823038	rs4467185	G	A	4261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=96;NR=32;PP=2965;SC=TTCCCCTTAGGACTCCTTCAA;SOR=2.251;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=96;TCR=32;TR=128;WE=47823046;WS=47823028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr19	47823484	rs4804049	T	C	5472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=95;PP=2965;SC=TCCGAGGGGCTGGCTTGGCCT;SOR=0.794;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=181;TCF=86;TCR=95;TR=181;WE=47823492;WS=47823474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr19	47823871	rs11880097	G	T	3749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=54;PP=2965;SC=TGCTGCTGAAGAAGCTGGACT;SOR=0.853;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=63;TCR=54;TR=117;WE=47823879;WS=47823861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr19	47876081	rs117334188	C	T	4156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=64;PP=2965;SC=TCACCCGCAGCGCCCAGAGCA;SOR=0.722;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=131;TCF=67;TCR=64;TR=131;WE=47876089;WS=47876071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr19	47879727	rs149884083	G	A	2668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.462;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=62;PP=2073;ReadPosRankSum=-0.672;SC=CAAGCAGGGCGCCGTGCTGCA;SOR=1.274;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=95;TCF=33;TCR=62;TR=94;WE=47879735;WS=47879717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,94:0.99:95
chr19	47885180	rs889167	A	G	2753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=16;PP=2267;SC=ATTTGGGTGCAGGTAGACCTG;SOR=3.352;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=83;TCR=16;TR=99;WE=47885188;WS=47885170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr19	47916654	.	CA	C	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.214;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=4.775;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.40;MQRankSum=0.000;QD=1.58;ReadPosRankSum=0.706;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,6:0.27:22
chr19	47933190	rs142312177	A	AG	1471.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=11;PP=1673;SC=GACACAGAACAGGGCAATCAA;SOR=1.828;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=40;WE=47933198;WS=47933180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	47933728	rs8104926	A	G	1368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=32;PP=1077;SC=CGTGTCTGCGAGGCAGAGACA;SOR=2.200;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=42;WE=47933736;WS=47933718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	47935352	rs4801722	T	C	3210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=15;PP=2540;SC=CACCTCATTTTGGCAGGATCC;SOR=3.148;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=82;TCR=15;TR=97;WE=47935360;WS=47935342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	47944710	rs2254560	T	C	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=24;PP=1038;SC=GTGCAGGGGGTAAGGGGGAGG;SOR=1.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=37;WE=47944718;WS=47944700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	47980153	rs2293424	G	A	1360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=28;PP=1078;SC=GGTCACTGCCGGGCAGGAGAA;SOR=1.364;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=16;TCR=28;TR=44;WE=47980161;WS=47980143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	48219929	rs61746407	G	A	3394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=31;PP=2784;SC=CCATCCGCACGGTGACCTCGG;SOR=1.970;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=75;TCR=31;TR=106;WE=48219937;WS=48219919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr19	48239557	rs11669035	T	G	1504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=3;PP=1187;SC=GAGTGGGGCCTGCAGCCTGTG;SOR=5.097;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=50;WE=48239565;WS=48239547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	48244045	rs34197064	C	CT	1012.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=3;PP=1097;SC=CAGCTACCCCCGAGCTTCTCC;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=23;WE=48244053;WS=48244035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	48244194	rs7255434	A	G	2891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=32;PP=2307;SC=CGAAGCTGCTAGAGGCACTGG;SOR=1.434;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=57;TCR=32;TR=89;WE=48244202;WS=48244184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	48244569	rs3745758	G	A	6104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=124;PP=2965;ReadPosRankSum=1.194;SC=TGGATGATGAGGAGTTCGCGC;SOR=0.795;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=179;TCF=54;TCR=125;TR=178;WE=48244577;WS=48244559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,187:0.99:188
chr19	48244692	rs3833256	C	CG	1352.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=35;PP=1522;SC=CCGAGTGAGCCGGCCCCCCTC;SOR=5.136;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=37;WE=48244700;WS=48244682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	48245287	.	G	C	1072.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=29;PP=919;SC=GGGGGGCTCAGAGGGGAGACA;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=48245295;WS=48245277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	48249117	.	CGTCGGGG	C	50	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=63.02;NF=0;NR=2;PP=50;QD=30.5;SC=TGCGTGGACTCGTCGGGGGTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=2;WE=48249131;WS=48249107;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,2:0.29:7
chr19	48250320	rs2334293	G	C	1495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=37;PP=1071;ReadPosRankSum=1.126;SC=GTGGAATGGCGGTTATTCATT;SOR=0.941;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=14;TCR=38;TR=51;WE=48250328;WS=48250310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr19	48250414	rs3745756	A	G	327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=273;SC=GGTCAACCTTAATATAAACAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=48250422;WS=48250404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	48253579	rs3745754	A	G	5360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.580;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=112;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.786;SC=CTTCTTTCCCACCAGACTCTG;SOR=1.338;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=172;TCF=60;TCR=112;TR=171;WE=48253587;WS=48253569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,177:0.99:178
chr19	48253667	rs3786780	C	G	1839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=54;PP=1508;ReadPosRankSum=-0.769;SC=GTTTGGGCTTCGGAGTGCAGA;SOR=5.318;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=55;WE=48253675;WS=48253657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,57:0.98:58
chr19	48254392	rs10402957	T	C	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=29;PP=858;SC=CACCTATGAATGGGGACAGGA;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=40;WE=48254400;WS=48254382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	48255804	rs1042558	A	G	2679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=86;NR=12;PP=2095;SC=CGTCCCAGGCACCCGCCGTGG;SOR=3.657;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=86;TCR=12;TR=98;WE=48255812;WS=48255794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr19	48258551	rs10406879	T	C	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=12;PP=806;SC=AGAGAGAAGGTCTCCCTGTGT;SOR=1.352;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=20;TCR=12;TR=32;WE=48258559;WS=48258541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	48258578	rs10405135	A	G	1106.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=14;PP=780;SC=CACCGGCCTGAGCCCTGACCC;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=21;TCR=14;TR=35;WE=48258586;WS=48258568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	48258717	rs1804994	A	G	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=12;PP=398;SC=GCGCGGCGGCAGAGGCGGCGG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=48258725;WS=48258707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	48258772	rs11083895	G	A	169.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=134;SC=GAAGGCTGGGGCGGCTCAAGT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=48258780;WS=48258762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	48258826	rs10411523	G	A	143.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=114;SC=GGAGGGGGCCGGGTCCCAGGT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=48258834;WS=48258816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	48260079	rs889142	T	C	2443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=50;PP=2105;ReadPosRankSum=-0.803;SC=CAGGGCCCCTTCCAGAGTGTG;SOR=0.823;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=72;TCF=21;TCR=51;TR=71;WE=48260087;WS=48260069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr19	48282077	rs111841672	C	CGCAGCGG	2751.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=34;PP=2029;SC=TATTGGTAAGCCCAGCGGCCA;SOR=1.162;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=51;WE=48282085;WS=48282064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	48282172	rs1862485	T	C	742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=16;PP=544;SC=ATGGGAGCCCTTGTATGGGAA;SOR=2.400;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=48282180;WS=48282162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	48284025	rs34362700	C	CG	3780.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.230;NF=68;NR=31;PP=2975;ReadPosRankSum=1.591;SC=AGTGGATGCCCGGGGGGCATT;SOR=1.106;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=123;TCF=83;TCR=40;TR=99;WE=48284033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,121:0.99:122
chr19	48321645	.	C	CTCCATCCATCCATCCA	1311.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=1;PP=929;SC=CCATCCATCCCTCCATCCATC;SOR=6.273;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=25;WE=48321653;WS=48321638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	48337897	rs62128767	G	A	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.110;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=37;PP=948;ReadPosRankSum=-0.672;SC=AATCACAGGGGCGACTTCAGG;SOR=4.351;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=38;WE=48337905;WS=48337887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr19	48374950	rs62129966	C	A	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=25;PP=683;SC=GGGCCTTTATCCTGCCTGGTC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=48374958;WS=48374940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	48389363	rs296361	G	A	5353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=64;PP=2965;SC=CTCAGTTCACGATTCTGCCTC;SOR=1.219;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=99;TCR=64;TR=163;WE=48389371;WS=48389353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr19	48389425	rs11083907	A	G	4602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=65;PP=2965;SC=CCCTTATCACAAACTCATCAC;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=146;TCF=81;TCR=65;TR=146;WE=48389433;WS=48389415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr19	48523128	rs35362679	G	A	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=31;PP=1231;SC=TTTCTGTGCCGACACCAGTAA;SOR=1.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=14;TCR=31;TR=45;WE=48523136;WS=48523118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	48523197	rs2303691	C	A	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=15;PP=462;SC=GCTCAACAAACACCTCCTGAA;SOR=2.948;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=48523205;WS=48523187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	48525507	rs2303690	G	A	5422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=75;PP=2965;SC=CTGCACTAACGAAGGATCAAA;SOR=0.900;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=165;TCF=90;TCR=75;TR=165;WE=48525515;WS=48525497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr19	48525694	rs114249913	G	A	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=35;PP=966;SC=TTTTTCAAGCGTGTCTGATTA;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=48525702;WS=48525684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	48543774	rs8102084	C	G	407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=3;PP=321;SC=TCTCCACCCCCAACTCTACTC;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=48543782;WS=48543769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	48543862	rs8105198	G	A	1153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=4;PP=900;SC=CTGGACTCACGGTTCATGCGG;SOR=3.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=34;WE=48543870;WS=48543852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	48544753	rs3745745	G	A	2048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=15;PP=1653;SC=GAATTTATACGGAAATGCACA;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=46;TCR=15;TR=61;WE=48544761;WS=48544743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	48551546	rs9226	A	T	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=569;SC=CCAGGTGGACATCAGGGCCCT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=48551554;WS=48551536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	48558003	rs744399	A	C	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=3;PP=461;SC=GAGGCCTCTCAATCCATGCTG;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=48558011;WS=48557993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	48558342	rs3217328	TCTCCAGAAGACCC	T	549.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=0;NR=7;PP=1981;SC=TTGCAAGACCTCTCCAGAAGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=48558362;WS=48558332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	48565468	rs4802425	G	T	2555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=60;PP=2031;SC=GCAAGACTTGGAAATGGAAGG;SOR=2.219;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=20;TCR=60;TR=80;WE=48565476;WS=48565458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	48581253	rs1019785	C	G	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=2;PP=53;SC=TCTGTGCTCGCTGACCTCATG;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=1;TCR=2;TR=3;WE=48581261;WS=48581243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	48592092	rs11564553	A	C	1038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=27;PP=888;SC=ATGGGCTCCAATGGCAGCCAA;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=48592100;WS=48592082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	48598823	rs156631	A	G	2984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=38;PP=2300;SC=CCCAGTGCAGAGAAGCCAGCG;SOR=0.901;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=90;TCF=51;TCR=39;TR=89;WE=48598831;WS=48598813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr19	48598916	rs156632	A	G	2201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=42;PP=1741;SC=GGAATGTAGCAGGTATGCAGG;SOR=1.134;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=72;TCF=30;TCR=42;TR=71;WE=48598924;WS=48598906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	48601350	rs251685	T	C	1339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=3;PP=1004;SC=CACTCCGTGCTGTTCCATCCC;SOR=4.565;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=37;WE=48601358;WS=48601340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	48601454	rs251684	T	C	3220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=45;PP=2585;SC=CTGCAAATATTGGGTAGGGTA;SOR=0.916;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=56;TCR=45;TR=101;WE=48601462;WS=48601444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr19	48601528	rs251683	G	T	2675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=54;PP=2162;SC=TTTGGGAGAAGGTGCCAAGAC;SOR=1.477;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=29;TCR=54;TR=83;WE=48601536;WS=48601518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	48601593	rs11432234	A	AT	803.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.371;NF=1;NR=28;PP=649;ReadPosRankSum=-0.926;SC=CGTAGGCCACATTTTTTTTTA;SOR=3.981;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=29;WE=48601601;WS=48601583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chr19	48602948	rs2303744	T	C	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=4;PP=746;SC=TGCTTAGAGATAACCATGTAG;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=26;WE=48602956;WS=48602938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	48608548	rs11564523	C	T	1479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=7;PP=1187;ReadPosRankSum=-0.892;SC=ACAGAGGGGGCGATTCTGGGA;SOR=2.265;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=50;WE=48608556;WS=48608538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,53:0.98:54
chr19	48609601	rs11564519	C	T	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=502;SC=CTTCTTGCCTCGGCCACCAAA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=48609609;WS=48609591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	48613544	rs251696	C	A	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=2;PP=169;SC=CGGAGCTTGCCGTGAGCCGAG;SOR=1.863;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=48613552;WS=48613534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	48613612	rs146764560	T	A	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.16;QD=40.47;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	48613624	rs199676177	TA	T	839.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.72;QD=39.99;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	48613788	.	T	G	250	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=5;NR=10;PP=250;QD=18.9847475031;SC=GTGGAGCTTGTGCTCCGGAAT;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=57;TCF=15;TCR=42;TR=15;WE=48613796;WS=48613778;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:42,15:0.26:57
chr19	48613788	rs138501838	T	TGCTCCGGAATCCGGTGCGGAGGCTTGG	1812.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=62.51;SOR=2.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	48622375	rs3729512	C	T	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=19;NR=5;PP=531;SC=GAGGCTGAGGCGCAGCCGCCA;SOR=2.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=24;WE=48622383;WS=48622365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	48622427	rs20581	A	G	1220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=14;PP=990;SC=CCAGCTCCTCATCACTGAAGC;SOR=1.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=27;TCR=14;TR=41;WE=48622435;WS=48622417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	48622545	rs274883	A	G	2053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=38;PP=1600;SC=CCCCCACCCCACTCTGGTCTA;SOR=0.811;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=31;TCR=38;TR=69;WE=48622553;WS=48622535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	48630700	rs61230848	GCC	G	2093.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=40;PP=1664;SC=TCTCCCTCTCGCCCCACCTAA;SOR=7.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=40;WE=48630709;WS=48630690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	48634298	rs3730994	C	T	1449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=5;PP=1167;SC=TGACCACAGACCCTGGCAGAG;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=45;WE=48634306;WS=48634288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	48646883	rs2288878	T	C	5399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=62;PP=2965;SC=GACGCAAGAGTGACAGTGGTG;SOR=1.544;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=116;TCR=62;TR=177;WE=48646891;WS=48646873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr19	48646993	rs415465	C	T	4448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=99;PP=2965;SC=CCCAGGGCTGCCTCTCTGTCC;SOR=2.203;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=34;TCR=99;TR=133;WE=48647001;WS=48646983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr19	48647241	rs3730931	T	C	3191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=61;PP=2465;SC=AAAACGGAGATTGAATTGCAT;SOR=1.563;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=31;TCR=61;TR=92;WE=48647249;WS=48647231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	48654553	rs20580	G	T	3672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=51;PP=2965;SC=CCTTCTCTGTGGCCACTTCAG;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=114;TCF=63;TCR=51;TR=114;WE=48654561;WS=48654543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr19	48657077	.	T	TCACACACA	462	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=40.15;NF=8;NR=0;PP=462;QD=58.125;SC=CCTCTTGGCTTCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=8;WE=48657085;WS=48657067;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,8:0.53:15
chr19	48660238	rs3730868	C	T	1398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=8;PP=669;SC=GAAAGGCAGGCGACTGAAGGG;SOR=1.609;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=23;WE=48660258;WS=48660228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	48660243	rs3730867	GAAGGGGCA	G	1434.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=6;PP=1735;SC=GCAGGCGACTGAAGGGGCAGG;SOR=1.681;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=22;WE=48660258;WS=48660228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	48668709	rs3730850	A	G	1778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=3;PP=1518;SC=CTAACGTAAGAGTTTTTGTTT;SOR=5.058;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=52;TCF=49;TCR=3;TR=52;WE=48668717;WS=48668699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	48668830	rs20579	G	A	4935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=103;NR=52;PP=2965;SC=GCATGTTGGCGTCAGAATTCT;SOR=1.625;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=103;TCR=52;TR=155;WE=48668838;WS=48668820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr19	48668966	rs143468290	G	GAA	2252.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.98;QD=33.62;SOR=2.958;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr19	48673304	rs73574169	T	G	944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=0;PP=764;SC=CCCCCCTCCCTCTGGGAGACA;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=48673312;WS=48673294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	48685877	rs16981771	G	A	6853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=87;PP=2965;SC=CCTGCCTGCCGGTGCGCACCA;SOR=0.966;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=212;TCF=125;TCR=87;TR=212;WE=48685885;WS=48685867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr19	48686072	rs2007182	G	A	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=40;PP=1114;ReadPosRankSum=0.075;SC=GGGGAAAGCCGCGCTGAAGAC;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=42;WE=48686080;WS=48686062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,46:0.98:47
chr19	48686098	rs2007183	G	T	990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=26;PP=773;SC=GGTCATTCATGCCTTCATCCG;SOR=4.548;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=48686106;WS=48686088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	48690906	rs10416739	G	A	136.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=0;PP=106;SC=ATGTAATATTGATAATATAAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=48690914;WS=48690896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr19	48695381	rs409135	A	G	2018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=59;PP=1694;SC=TTTTATATTTATTTATCCTTG;SOR=6.837;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=60;TCF=1;TCR=59;TR=60;WE=48695389;WS=48695371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	48700477	rs146323828	C	T	861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=9;PP=676;SC=GGGAGTGCAGCGGGGAGAGGG;SOR=1.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=21;TCR=9;TR=30;WE=48700485;WS=48700467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	48707581	rs1965759	G	A	2576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.43;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	48707581	.	GTG	ATA	2677	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=13;NR=40;PP=2677;QD=20;SC=GATGGAGGGTGTGCCGGAGGA;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=53;WE=48707591;WS=48707571;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,53:0.96:55
chr19	48707583	rs1965758	G	A	2576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.43;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	48709635	rs8110489	G	A	8374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.749;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=184;NR=92;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.473;SC=TTCAGGAAGCGCCTACCGTAT;SOR=1.526;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=282;TCF=187;TCR=95;TR=276;WE=48709643;WS=48709625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,279:0.98:285
chr19	48709674	rs73057772	A	G	9134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=138;NR=153;PP=2965;ReadPosRankSum=1.405;SC=AGCAGTCCCAATGAGTCTGGA;SOR=0.545;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=296;TCF=140;TCR=156;TR=291;WE=48709682;WS=48709664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,299:0.98:304
chr19	48715153	rs3745718	T	C	3015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=58;PP=2469;SC=CCTCATTGTCTTGGAGATCAT;SOR=1.662;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=87;TCF=28;TCR=59;TR=86;WE=48715161;WS=48715143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	48715269	rs2008521	T	C	1083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=27;PP=852;SC=TTGAGAATCGTTCACTTACAG;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=32;WE=48715277;WS=48715259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	48788904	rs140236127	GGAAAGAAA	G	1577.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.34;QD=42.64;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	48800338	rs7252988	A	G	2955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=69;NR=36;PP=2237;SC=CGCTCGAATCAGACGCTGTGC;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=69;TCR=36;TR=105;WE=48800346;WS=48800328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr19	48800751	rs61747754	C	A	2023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=20;PP=1708;SC=TGGCGCTGCGCCTCCGCCTGC;SOR=1.758;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=44;TCR=20;TR=64;WE=48800759;WS=48800741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	48800791	rs2292113	A	G	2616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=21;PP=2088;SC=GGGAAGGTGAACTGGGCCCCG;SOR=2.026;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=57;TCR=21;TR=78;WE=48800799;WS=48800781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	48801047	rs73047511	T	C	1104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=31;PP=979;SC=GCCCTTCCCTTCTGGGGCACC;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=48801055;WS=48801037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	48801426	rs8111947	T	C	4982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.358;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=83;NR=69;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.886;SC=CTCCCTGCCGTCTCCCACCTG;SOR=0.497;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=153;TCF=83;TCR=70;TR=152;WE=48801434;WS=48801416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,155:0.99:156
chr19	48821896	rs73047547	C	A	4394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=70;PP=2965;SC=TCACTAAAGGCAGGACCCAGG;SOR=0.886;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=60;TCR=70;TR=129;WE=48821904;WS=48821886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr19	48823545	rs8107712	G	A	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=11;PP=1314;SC=TATAAAGAATGAATGAATTAC;SOR=2.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=48;WE=48823553;WS=48823535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	48830286	rs10415654	T	A	1412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.39;SOR=2.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	48832554	rs8102349	A	G	3055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=13;PP=2532;SC=CAAGCAGGTGAAGCTGGAACT;SOR=3.334;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=77;TCR=13;TR=90;WE=48832562;WS=48832544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr19	48836673	rs3826828	G	T	1807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=48;PP=1505;SC=ACCTCCGACCGGAGCCACCTG;SOR=3.219;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=10;TCR=48;TR=58;WE=48836681;WS=48836663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	48848708	rs112116754	T	TTTAC	2074.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=47;PP=2137;SC=CTTTCATTTATTTATTTATTT;SOR=5.630;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=53;TCF=4;TCR=49;TR=48;WE=48848716;WS=48848698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	48866457	rs73049222	G	C	1123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=2;PP=977;SC=GGAGGCGCCAGGGCAGCTCTC;SOR=4.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=35;WE=48866465;WS=48866447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	48866482	rs3826824	C	T	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=2;PP=1375;SC=GCAACTAGGGCCCTGCCGCCG;SOR=5.549;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=50;TCF=48;TCR=2;TR=49;WE=48866490;WS=48866472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	48876661	rs2569713	A	G	1792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=2;PP=1461;SC=AAAGAGGGAGAGGTCCAGACG;SOR=5.747;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=49;TCR=2;TR=51;WE=48876669;WS=48876651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	48908631	rs34833452	AG	A	1012.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=22;PP=953;SC=CTGGAATGGGAGGGGTGTGGG;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=25;WE=48908639;WS=48908621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	48922772	rs11302654	CT	C	1223.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.136;HP=16;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.525;NF=29;NR=28;PP=786;ReadPosRankSum=0.250;SC=GTAGTTCTTTCTTTTTTTTTT;SOR=0.469;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=88;TCF=35;TCR=53;TR=57;WE=48922781;WS=48922761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,62:0.95:65
chr19	48923101	rs276709	C	A	888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=26;PP=767;SC=TGGGCTGGAGCTGGGGCTGGG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=48923109;WS=48923091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	48924963	rs1654671	G	A	1320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=7;PP=1099;ReadPosRankSum=-0.756;SC=GCCAGATAGCGGGTGTGTCTC;SOR=1.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=39;WE=48924971;WS=48924953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr19	48945880	rs62130268	T	C	149.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=6;PP=116;SC=GCTGCAGCGCTGAGGCCGCCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=48945888;WS=48945870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	48946325	rs111420822	T	C	53.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=17.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	48949286	rs1643487	G	T	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=5;PP=789;SC=AGGGTCGGCGGCGCACGTGTG;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=35;WE=48949294;WS=48949276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	48949766	rs929743	C	G	5111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=96;PP=2965;SC=ACAGGTAAGACCCGAGGCTTT;SOR=1.267;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=58;TCR=96;TR=154;WE=48949774;WS=48949756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr19	48954571	rs1799274	A	T	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=432;SC=TCCTCCTTGAATAGTTTTACA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=48954579;WS=48954561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	48968015	rs73050908	C	T	2464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.015;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.197;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=45;PP=1838;ReadPosRankSum=1.671;SC=CCAACCCTGGCGCTGACCCTG;SOR=1.012;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=77;TCF=32;TCR=45;TR=75;WE=48968023;WS=48968005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,82:0.98:84
chr19	48977019	rs1799258	C	T	2466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=3;PP=2108;SC=ATTGGTGAGACTGGATCATGT;SOR=5.838;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=70;TCR=3;TR=73;WE=48977027;WS=48977009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr19	49095871	rs2302949	G	A	1590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=1;PP=1334;SC=AGCTCTGGGGGCTGGACCTGG;SOR=5.507;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=46;WE=49095879;WS=49095861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	49099955	rs3815691	C	T	410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=333;SC=CTTCCTTGGCCGAGTGCCCTC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=49099963;WS=49099945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	49102513	rs1052131	C	T	3394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=38;PP=2577;SC=CGGAGGAGGACGGCAGCCCAG;SOR=1.287;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=65;TCR=38;TR=103;WE=49102521;WS=49102503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	49102782	rs10410524	G	A	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=31;PP=915;SC=TCAGAGTCCCGCCCAGAGGCA;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=49102790;WS=49102772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	49114236	rs454715	T	G	936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=27;PP=768;SC=AAAGTTCAGGTGGGCTAAAGG;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=49114244;WS=49114226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	49116076	rs2617801	C	G	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=3;PP=445;SC=TAGGGGTGTGCGCTTGCAAGT;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=49116084;WS=49116066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	49116134	rs2617800	T	G	1267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=5;PP=975;SC=CCCAGTCTGGTGAATGGACAC;SOR=3.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=31;TCR=5;TR=36;WE=49116142;WS=49116124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	49116359	rs447802	T	C	2289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=46;PP=1734;SC=TCCACATCGGTGGTGGTGGCT;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=77;TCF=31;TCR=46;TR=77;WE=49116367;WS=49116349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr19	49116438	rs376524	A	G	2474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=40;PP=1963;SC=CCAAGCCCTGAACCTCATCCG;SOR=0.955;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=32;TCR=40;TR=72;WE=49116446;WS=49116428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr19	49116555	rs368654	A	G	1774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=40;PP=1402;SC=CGGAATATAGAAAGCCGGGGC;SOR=2.066;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=55;WE=49116563;WS=49116545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	49120252	rs11382518	T	TA	895.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.398;HP=12;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=571;ReadPosRankSum=-1.372;SC=AAGCTCCAGATAAAAAAAAAA;SOR=2.274;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=54;TCF=41;TCR=13;TR=33;WE=49120260;WS=49120242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,36:0.92:39
chr19	49122248	rs3094287	T	C	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=5;PP=1030;SC=CATCCCTGCTTTCCTGGCCCC;SOR=3.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=38;WE=49122256;WS=49122238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	49123875	.	TA	T	90.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=5.932;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.20;MQRankSum=-0.394;QD=3.02;ReadPosRankSum=-0.340;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,12:0.40:30
chr19	49131764	rs34630951	A	AAG	4565.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=31;PP=2930;SC=GAGCAAATGAAAGATGACCAG;SOR=1.247;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=101;TCF=61;TCR=40;TR=87;WE=49131772;WS=49131754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	49141532	rs3848543	T	C	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=657;SC=CAGAATGTACTAGGTCGAGAA;SOR=4.804;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=21;WE=49141540;WS=49141522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	49143025	rs2303147	T	C	1642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=17;PP=1363;SC=TCCCTCCCTCTGAATCTCGCC;SOR=1.480;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=34;TCR=17;TR=50;WE=49143033;WS=49143015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	49183705	rs3826846	G	A	4424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=72;PP=2965;SC=CGCTGTGTCCGCCTCACGGGC;SOR=0.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=73;TCR=72;TR=145;WE=49183713;WS=49183695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr19	49206603	rs281377	C	T	3343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=51;PP=2883;SC=ACCACCTGAACGACTGGATGG;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=67;TCR=51;TR=117;WE=49206611;WS=49206593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr19	49216926	rs281384	A	G	2302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=11;PP=1806;SC=GCAGGAGTCCAGAACCTCAGC;SOR=3.401;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=67;TCR=11;TR=78;WE=49216934;WS=49216916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	49217261	rs281385	A	G	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=29;PP=959;SC=TATCCGCGGCACGTGGAAGAG;SOR=3.258;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=5;TCR=29;TR=34;WE=49217269;WS=49217251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	49217305	rs281386	A	G	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=23;PP=671;SC=GGCTTGACCTAGAGCAGCCAA;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=49217313;WS=49217295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	49217520	rs281387	T	C	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=2;PP=362;SC=TTCCTACCGCTGGTCCTCGCC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=15;WE=49217528;WS=49217510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	49217605	rs281388	T	G	1150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=14;PP=831;SC=GTCCGCAAGCTCATAGCCCCG;SOR=1.206;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=24;TCR=14;TR=38;WE=49217613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	49244219	rs2307018	CG	AA	2115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=22;PP=2140;SC=TTTGCTCGGCCGCTCCACTGC;SOR=0.866;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=44;TCF=20;TCR=24;TR=42;WE=49244228;WS=49244209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	49246866	rs838147	A	G	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=27;PP=755;SC=CTGGGGCCAGATCATCTATGA;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=49246874;WS=49246856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	49247601	rs11672046	C	T	1472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=25;PP=1224;SC=AAGGAGGAGGCAGTTGGGGAA;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=48;WE=49247609;WS=49247591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	49247693	rs8108136	C	T	2241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=24;PP=1800;SC=GGGACACCGACTCCCATCTTC;SOR=1.516;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=49;TCR=24;TR=73;WE=49247701;WS=49247683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	49247786	rs8108468	G	A	3281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=53;PP=2597;SC=GCTCCTTCACGAAGAGATCGC;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=53;TCR=53;TR=106;WE=49247794;WS=49247776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr19	49247900	rs8111288	G	A	1306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=40;PP=1137;SC=AGGAAAGGGCGCTACAACTGA;SOR=5.186;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=42;WE=49247908;WS=49247890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	49248640	rs12982115	A	G	1699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=34;PP=1419;SC=CACTGGGCAAAGATAGGCCTG;SOR=1.402;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=54;WE=49248648;WS=49248630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	49248730	rs838145	G	A	2397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=16;PP=1961;SC=TAGGGAAAACGGTATTTACTA;SOR=2.206;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=52;TCR=16;TR=68;WE=49248738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	49254504	rs2071699	G	A	3622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=83;PP=2958;SC=TAGCAGGAAGGCCAGGCAGAG;SOR=2.001;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=33;TCR=83;TR=116;WE=49254512;WS=49254494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr19	49254573	rs838137	T	A	1853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=48;PP=1461;ReadPosRankSum=-0.799;SC=TAGCAAATGCTCTGAGGCTGA;SOR=2.235;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=8;TCR=50;TR=56;WE=49254581;WS=49254563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,59:0.98:60
chr19	49259529	rs838133	A	G	3162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=40;PP=2571;SC=AGCACTCAGGACTGTGGGTTT;SOR=1.134;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=61;TCR=41;TR=101;WE=49259537;WS=49259519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	49260101	rs490942	C	T	1339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=8;PP=1143;SC=GGGACAGAGCCGGATGGTGGG;SOR=2.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=41;WE=49260109;WS=49260091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	49261368	rs739320	T	C	2051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=35;PP=1668;SC=CCCCCCGCACTCCCGGAGCCA;SOR=0.854;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=30;TCR=35;TR=65;WE=49261376;WS=49261358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	49299533	rs557106	A	G	3487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=43;PP=2687;SC=AGAGCAGCACAGAAAGCCCAC;SOR=1.247;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=72;TCR=43;TR=115;WE=49299541;WS=49299523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr19	49300605	rs526744	T	C	1395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=32;PP=1071;SC=TGGAGGGCAGTCTGGTTGGGT;SOR=2.252;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=42;WE=49300613;WS=49300595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	49339098	rs8110220	T	C	4960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=63;NR=85;PP=2965;SC=GCCCCGCTGTTCACTGAGAAT;SOR=1.008;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=63;TCR=85;TR=148;WE=49339106;WS=49339088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr19	49340858	rs10407029	C	T	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=23;PP=686;SC=GCGCTAGGACCCCGGATTCCC;SOR=2.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=49340866;WS=49340848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	49342269	rs3745705	T	C	831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=0;PP=625;SC=CCAAGGGAATTTGAGGAACTA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=49342277;WS=49342267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	49364625	rs518822	C	T	250.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=2;PP=175;SC=CAGTTCCCATCGCCTGGTGCA;SOR=1.179;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=7;TCF=5;TCR=2;TR=7;WE=49364633;WS=49364615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	49368843	rs506425	T	C	6282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=128;PP=2965;SC=AAGGCGTGGATCTTGTTTACT;SOR=1.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=191;TCF=63;TCR=128;TR=191;WE=49368851;WS=49368833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr19	49375676	rs638050	T	C	7241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=136;NR=85;PP=2965;SC=ATTGTGTTCGTTGCTCTTATC;SOR=1.316;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=223;TCF=137;TCR=86;TR=221;WE=49375684;WS=49375666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr19	49376582	rs564196	G	A	2372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=23;PP=1845;SC=CTCCTCAGCCGCGCCTGGAGC;SOR=1.488;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=71;WE=49376590;WS=49376572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr19	49377086	rs611251	T	C	2876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=39;PP=2477;SC=GAAGAAGCTGTAAAGAAAGAA;SOR=0.839;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=46;TCR=39;TR=85;WE=49377094;WS=49377076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	49377242	rs557806	G	C	3623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=51;PP=2965;SC=GTGTCCCCCCGATCTTCAGGC;SOR=0.903;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=61;TCR=51;TR=112;WE=49377250;WS=49377232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr19	49377319	rs610308	A	G	2690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=46;PP=2089;SC=AAAGGCACACAAAGAAACTGG;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=41;TCR=46;TR=87;WE=49377327;WS=49377309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	49377436	rs556052	G	C	2777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=43;PP=2313;SC=TGAGGTCAAGGCTTTGGGGGC;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=84;TCF=41;TCR=43;TR=84;WE=49377444;WS=49377426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	49378180	.	AT	A	109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.010;ClippingRankSum=0.000;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.76;MQRankSum=0.943;QD=2.61;ReadPosRankSum=-0.046;SOR=0.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,12:0.29:42
chr19	49378994	rs500079	A	G	3855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=31;PP=2965;SC=ACGCCGCATCACCCAGGCCCA;SOR=2.285;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=133;TCF=102;TCR=31;TR=132;WE=49379002;WS=49378984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr19	49379167	rs524	C	T	5279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=134;PP=2965;SC=AAGCTGTGGCCACACCTTCCC;SOR=2.861;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=166;TCF=32;TCR=134;TR=166;WE=49379175;WS=49379157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr19	49379182	rs527	G	C	4887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=124;PP=2965;SC=CTTCCCGCTCGTCTGCTGCTG;SOR=3.367;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=22;TCR=124;TR=146;WE=49379190;WS=49379172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr19	49379326	rs688644	T	C	374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=314;SC=GCGAGCAGCGTCTGTATGTGT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=49379334;WS=49379316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	49384452	.	TTTTTTTTTTTTTTTTC	T	233.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.319;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.16;MQRankSum=1.572;QD=13.75;ReadPosRankSum=0.157;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr19	49384468	rs28666080	C	T	132.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.89;MQRankSum=-1.467;QD=7.81;ReadPosRankSum=-3.557;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr19	49391404	rs8112811	C	T	4171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=64;PP=2965;SC=CTCATATGGTCGCTGTCCGTG;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=66;TCR=64;TR=130;WE=49391412;WS=49391394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr19	49399628	rs3830422	CCA	C	536.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=60.83;NF=10;NR=1;PP=535;SC=TAGGCCCCGCCCACAGACTCC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=49399637;WS=49399618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	49399821	rs12461075	G	A	1729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=25;PP=1348;SC=CCGCTGGGGAGATGGGAGAGG;SOR=0.960;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=55;WE=49399829;WS=49399811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	49400634	rs7260579	C	T	3599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=62;PP=2648;SC=CTCATAGCAGCGAGCTCATGC;SOR=0.936;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=110;TCF=48;TCR=62;TR=110;WE=49400642;WS=49400624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr19	49400775	rs6509407	G	A	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=24;PP=720;SC=GAGGTCACAGGAGGTGCAGAA;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=49400783;WS=49400765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	49400991	rs6650758	C	G	1844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=1;PP=1555;SC=CCTGCAAGGCCGATGGTGCTG;SOR=6.963;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=65;TCF=64;TCR=1;TR=65;WE=49400999;WS=49400981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	49401205	rs145391367	CTTAT	C	1335.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=29;PP=1448;SC=AATCTTTAGCCTTATTTATTT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=84;TCF=3;TCR=81;TR=29;WE=49401216;WS=49401195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	49404393	rs10416967	C	T	1800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=54;PP=1505;SC=GGAAAATCTGCATCACGCCCC;SOR=6.630;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=55;WE=49404401;WS=49404383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	49409197	rs71903082	TCACTC	T	1714.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=128;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=34;PP=2317;SC=AAGGGTGGCCTCACTCCCGGC;SOR=4.514;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=37;WE=49409209;WS=49409187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	49409221	rs113033245	TGTGCTAGGCAG	T	1358.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=20;PP=2969;SC=CAGGTGGTTGTGTGCTAGGCA;SOR=4.615;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=49409239;WS=49409211;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	49416456	rs2387579	G	A	6229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.076;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.783;SC=ACGTGCCTGTGAGGACCCCAT;SOR=0.288;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=196;TCF=99;TCR=97;TR=195;WE=49416464;WS=49416446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,198:0.99:199
chr19	49416554	rs5828369	CA	C	2980.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=81;PP=2779;SC=GCCCTTGAGGCAAAAAAACTC;SOR=2.707;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=112;TCF=21;TCR=91;TR=97;WE=49416562;WS=49416544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr19	49421829	rs2287834	A	G	2789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=6;PP=2234;SC=CTAGTGGGGTACTAAAGCCTG;SOR=4.539;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=73;TCR=6;TR=79;WE=49421837;WS=49421819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	49421966	rs2287836	T	C	5362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=60.06;MQRankSum=0.163;NF=75;NR=93;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.812;SC=GATACCTTGCTATCCTCTTCC;SOR=0.941;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=171;TCF=76;TCR=95;TR=168;WE=49421974;WS=49421956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,169:0.99:171
chr19	49424354	rs12979307	C	T	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=0;PP=829;ReadPosRankSum=1.194;SC=CCCTCTCCAACATGGGTGGGC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=29;WE=49424362;WS=49424344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,33:0.97:34
chr19	49424381	rs12979328	C	A	1867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=9;PP=1299;SC=TGGACCTGTGCCCCTGATGGC;SOR=3.037;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=52;WE=49424389;WS=49424371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	49424925	rs11671777	C	T	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=1;PP=539;SC=TTATTAAGCCCGACTGTCAAT;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=49424933;WS=49424915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	49425772	rs1532704	T	C	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=39;PP=1035;SC=CCCTGGGGGCTGGTGTCATGT;SOR=2.958;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=48;WE=49425780;WS=49425762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	49438363	rs2270941	G	A	1939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=41;PP=1474;SC=AAGGACCCGAGCGTGGGTGAG;SOR=1.284;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=25;TCR=41;TR=66;WE=49438371;WS=49438353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	49438433	rs4987162	C	G	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=20;PP=534;SC=TGGCTGCCCCCTGGGAGATGC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=49438441;WS=49438423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	49442849	rs3830420	T	TG	2576.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=23;PP=2231;SC=GGGCCCAGGCTGGGGGGGCCC;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=59;TCR=27;TR=74;WE=49442857;WS=49442839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	49442933	rs2270939	T	C	4859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=78;PP=2965;SC=AGAAGATTTCTGTCGTGGGAA;SOR=0.781;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=81;TCR=78;TR=158;WE=49442941;WS=49442923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr19	49445679	rs11669022	C	T	1388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=15;PP=997;SC=CCTGCCCTGACCCAGGACTTC;SOR=1.378;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=27;TCR=15;TR=42;WE=49445687;WS=49445669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	49445817	rs11666105	T	C	3352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=45;PP=2682;SC=AAGGGCATGGTACAGGTGAGG;SOR=0.987;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=59;TCR=45;TR=104;WE=49445825;WS=49445807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr19	49458262	rs4645881	C	T	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=12;PP=592;SC=CGAGCCCCCTCGCCGGCCCGT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=15;TCR=12;TR=27;WE=49458270;WS=49458252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	49464971	rs704243	G	A	1336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=34;PP=1022;SC=ATTGGGGGACGTGGGCATTTT;SOR=3.365;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=38;WE=49464979;WS=49464961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	49469087	rs2230267	T	C	2317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=9;PP=1928;SC=CTTCCGCGAATTGGCCGAGGA;SOR=3.321;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=62;TCR=9;TR=71;WE=49469095;WS=49469077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	49485758	rs2270937	C	T	1388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=37;PP=1129;SC=AGAGGCATCACGGGGCCTCCT;SOR=4.615;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=40;WE=49485766;WS=49485748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	49513349	rs2287760	C	G	5701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=133;PP=2965;SC=CCGGGATCCCCTCGCCCCCAG;SOR=2.119;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=50;TCR=134;TR=183;WE=49513357;WS=49513339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr19	49529379	rs7255292	T	C	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=17;PP=401;SC=TCAGAGCACATGGAGACAGGG;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=49529387;WS=49529369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	49604813	.	A	C	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.459;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=10.732;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.57;ReadPosRankSum=2.478;SOR=3.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,20:0.33:61
chr19	49605530	rs10419811	A	G	1069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=26;PP=787;SC=CCCTCCTCCCACCCCAGTCGC;SOR=2.432;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=32;WE=49605538;WS=49605520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	49632597	rs117665044	T	C	683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=12;PP=555;SC=CTAAACTGGATCTTGTCTCCA;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=10;TCR=12;TR=22;WE=49632605;WS=49632587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	49685708	rs201110201	CCCAT	C	1607.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.155;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.468;NF=32;NR=5;PP=1767;ReadPosRankSum=-0.404;SC=CATCCATCCACCCATCCATCC;SOR=3.334;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=73;TCF=62;TCR=11;TR=37;WE=49685719;WS=49685698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,55:0.93:59
chr19	49794028	rs45549132	G	T	1751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=50;PP=1391;ReadPosRankSum=1.475;SC=AAGGAACCTGGAGAAGGGCCA;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=2;TCR=52;TR=52;WE=49794036;WS=49794018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chr19	49812403	rs2278405	G	T	1388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=31;PP=1182;SC=GCATAAGGGGGTTGTAAAAGA;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=42;WE=49812411;WS=49812393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	49812952	rs77689038	G	C	6029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=127;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.184;SC=GCACCAACAAGACACCAGCAA;SOR=0.403;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=189;TCF=60;TCR=129;TR=187;WE=49812960;WS=49812942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,191:0.99:193
chr19	49835001	.	C	T	2654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=47;PP=2078;SC=GGCTGTGTCCCTTCTGCACCC;SOR=1.151;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=33;TCR=47;TR=80;WE=49835009;WS=49834991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr19	49838891	rs354020	C	A	7362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.752;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=141;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.793;SC=GGCTACCCAGCCGGGGCCCAG;SOR=0.771;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=239;TCF=141;TCR=98;TR=238;WE=49838899;WS=49838881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,241:1.00:242
chr19	49839015	rs354021	T	C	6286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=138;PP=2965;SC=GGATCCTCATTGACAAGACCA;SOR=1.451;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=213;TCF=74;TCR=139;TR=212;WE=49839023;WS=49839005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chr19	49841054	rs354026	G	T	4352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=68;PP=2965;SC=AGTACACAGAGCTAGCCATTC;SOR=0.988;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=56;TCR=68;TR=124;WE=49841062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr19	49845895	rs8108669	C	T	376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=314;SC=GAGAGACCCACGGGTCACCCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=49845903;WS=49845885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	49869051	rs2303759	T	G	5070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=56;PP=2965;SC=TCCTCACAGATGACCGACAAC;SOR=1.279;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=92;TCR=57;TR=148;WE=49869059;WS=49869041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr19	49878115	rs1054770	G	A	4035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=37;PP=2965;SC=CCTGGAGGGCGGCCACTGGCT;SOR=1.788;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=82;TCR=37;TR=119;WE=49878123;WS=49878105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr19	49878196	rs2288481	G	A	6715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=118;NR=88;PP=2965;SC=GGACGTCCTAGAAGAGGGGAC;SOR=0.957;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=206;TCF=118;TCR=88;TR=206;WE=49878204;WS=49878186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr19	49894027	rs61018355	T	TC	2334.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=8;PP=1774;SC=AGGACACCATTTCCTGCTTCT;SOR=3.014;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=43;WE=49894036;WS=49894017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	49894028	rs57104627	T	C	2343.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=8;PP=1269;SC=GGACACCATTTCCTGCTTCTC;SOR=3.056;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=50;TCF=42;TCR=8;TR=46;WE=49894036;WS=49894017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	49894152	rs7256629	C	T	3188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=41;PP=2674;SC=TGGACCTGCCCGAGGGCCCGG;SOR=1.081;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=60;TCR=41;TR=101;WE=49894160;WS=49894142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	49894217	rs7256984	G	T	2713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=67;PP=2252;SC=CCCCGGGGAGGGTGAGGAGGG;SOR=2.383;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=88;TCF=21;TCR=67;TR=87;WE=49894225;WS=49894207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	49899076	rs10405154	G	A	1023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=10;PP=800;SC=CTGACCTCCCGGCAACTGCCA;SOR=1.819;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=33;WE=49899084;WS=49899066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	49900877	rs9304688	A	G	2427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=49;PP=1954;SC=GTTCCAGGGAAGCCAACATTC;SOR=1.578;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=22;TCR=49;TR=71;WE=49900885;WS=49900867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr19	49901125	rs12977735	C	T	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=2;PP=531;SC=GAGTCTCTCTCCTGTTTATCT;SOR=3.816;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=19;WE=49901133;WS=49901115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	49901318	rs10421748	T	C	3050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=55;PP=2366;SC=GAATGCCAAATTGCAGCGGAG;SOR=1.167;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=37;TCR=56;TR=92;WE=49901326;WS=49901308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr19	49901484	rs12980364	T	C	354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=286;SC=CCCATGCTCGTGTCTGCATCC;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=49901492;WS=49901474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	49902990	rs9807898	A	C	217.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=210;SC=GAGGCCACCTACATAAGAGTG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=49902998;WS=49902980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	49903008	rs8110789	G	C	250.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=7;PP=175;SC=GTGGACCAGTGCCTCCCTTCT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=49903016;WS=49902998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	49925667	rs12974629	T	G	2736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=13;PP=2229;SC=GCGCAGGAACTAGGCGCAGTC;SOR=3.657;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=85;TCR=13;TR=97;WE=49925675;WS=49925657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr19	49930295	rs73053944	C	G	12187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=384;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=188;NR=180;PP=2965;SC=ACCTCAAACACTAACCCTACC;SOR=0.736;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=368;TCF=188;TCR=180;TR=368;WE=49930303;WS=49930285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,376:1.00:376
chr19	49930721	rs4802605	T	C	5864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=67;NR=110;PP=2965;SC=GAGTCCAACGTCCCTCCTCCC;SOR=1.355;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=178;TCF=67;TCR=111;TR=177;WE=49930729;WS=49930711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr19	49932053	rs145602134	C	T	2840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=80;PP=2354;SC=TCCCCCGCCACGCTCCCCAAC;SOR=4.664;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=6;TCR=80;TR=86;WE=49932061;WS=49932043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr19	49935927	rs5828394	A	AG	1268.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=29;PP=1427;SC=ACAGGTGTACAGGGACACTAG;SOR=2.613;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=34;WE=49935935;WS=49935917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	49940131	rs3826718	G	C	1200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=38;PP=929;SC=CCAGGATCCAGGGCAAAACCT;SOR=4.174;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=42;WE=49940139;WS=49940121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	49944730	rs58045148	CA	C	1701.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=41;PP=1796;SC=TCCCGGGGTCCAGCCCCGGCC;SOR=6.138;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=41;WE=49944738;WS=49944720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	49949589	rs1043263	A	T	1893.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=9;PP=1486;SC=ACTTTTAGGGAAGCCAGCAGC;SOR=3.091;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=52;TCR=9;TR=61;WE=49949597;WS=49949579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	49950298	rs13394	C	T	5703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=127;PP=2965;SC=GGGAGGTCAACTTCGGCCAAG;SOR=2.343;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=170;TCF=43;TCR=127;TR=170;WE=49950306;WS=49950288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr19	49950356	rs12443	C	G	3143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=77;PP=2585;SC=GCTTTTCAGGCCTGAGGAGGA;SOR=2.786;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=19;TCR=77;TR=96;WE=49950364;WS=49950346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	49954356	rs6509432	G	A	112.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=3;PP=86;SC=CCGAGGTCTCGGCTCATTGCA;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=49954364;WS=49954346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	49954803	rs2293013	C	T	7781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.47;SOR=0.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr19	49954807	rs2293012	T	G	7763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.94;SOR=0.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr19	49955016	rs2293011	G	T	1686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=49;PP=1368;SC=TCAAATCCGTGGGGAATATGT;SOR=7.903;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=49;WE=49955024;WS=49955006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	49956460	rs11267495	GTAGCCCCACCCCATTCCCAT	G	1219.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=0;PP=2957;SC=TCTGTATCTTGTAGCCCCACC;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=14;WE=49956487;WS=49956450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	49956690	rs3760670	C	T	1867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.619;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=45;PP=1464;ReadPosRankSum=0.535;SC=TGAGAGTCTGCCCGGCCGGCG;SOR=2.024;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=61;TCF=16;TCR=45;TR=60;WE=49956698;WS=49956680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,61:0.98:62
chr19	49964977	rs1320303	C	G	2706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=33;PP=2126;SC=CCTGAATGTCCTCAGTGGCCC;SOR=1.489;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=61;TCR=33;TR=94;WE=49964985;WS=49964967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr19	49965131	rs76844851	GG	AC	5362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;JOINED;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=69;PP=2947;SC=GAACTGGGGGGGGTCCCTAGG;SOR=1.160;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=116;TCF=46;TCR=70;TR=108;WE=49965140;WS=49965121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr19	49965173	rs7259560	A	T	2586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=52;PP=2167;SC=GCCTGGCGGGAGAGTGTGCGG;SOR=1.286;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=33;TCR=52;TR=85;WE=49965181;WS=49965163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr19	49967680	rs2293009	G	A	5815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=88;PP=2965;SC=ACAGGCTCCAGGTGGGCACTG;SOR=0.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=173;TCF=85;TCR=88;TR=173;WE=49967688;WS=49967670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr19	49969310	rs2914668	A	G	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=8;PP=459;SC=CCAGGATGCCAACCCCCACTG;SOR=1.127;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=20;WE=49969318;WS=49969300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	49971596	rs11879863	C	T	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=417;SC=TTACTGCGGGCGGGGCTCCCC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=49971604;WS=49971586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	49973784	rs1055637	A	G	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=293;SC=TGCACCCCACAGACACCTGGG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=49973792;WS=49973774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	49982451	.	ATT	A	222.87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.98;MQRankSum=1.172;QD=13.93;ReadPosRankSum=0.711;SOR=1.765;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr19	50028306	rs71724821	CCTGCTG	C	4806.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=79;PP=2993;SC=CATCTTCCATCCTGCTGCTGC;SOR=3.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=157;TCF=13;TCR=144;TR=86;WE=50028319;WS=50028296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr19	50059982	rs4594362	C	G	3306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=42;PP=2627;SC=TGGGGCAGGTCACCGTGCGGG;SOR=0.884;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=52;TCR=42;TR=94;WE=50059990;WS=50059972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	50086626	rs3745473	T	C	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=16;PP=848;SC=TCAGGAATGTTTCTAGTCCTT;SOR=0.836;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=12;TCR=16;TR=28;WE=50086634;WS=50086616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	50086806	rs3745474	C	T	4588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=37;PP=2965;SC=CAGAAGTCTTCCTGGGTCCCC;SOR=2.039;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=103;TCR=37;TR=140;WE=50086814;WS=50086796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr19	50091798	rs2288920	G	T	888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=12;PP=649;SC=GGGGCTGACAGGTGGCATCCT;SOR=0.976;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=17;TCR=12;TR=29;WE=50091806;WS=50091788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	50092002	rs2288921	T	G	296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=203;SC=ATGAAAGACCTAAGGACACAG;SOR=2.303;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=50092010;WS=50091992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	50093454	rs4429389	A	T	2074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=2;PP=1808;SC=CCCCATGCAAAGGTCTAGGGG;SOR=6.123;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=66;TCF=64;TCR=2;TR=66;WE=50093462;WS=50093444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	50095047	rs146415405	AGCCGG	A	1519.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQ=60.35;NF=1;NR=26;PP=1319;SC=GTGGGAGCCCAGCCGGGCCGG;SOR=3.383;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=27;WE=50095059;WS=50095037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	50096421	rs10404887	C	G	573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=0;PP=445;SC=TTGAGCACCCCGATTCCCTTG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=20;WE=50096429;WS=50096414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	50097547	rs7251877	A	G	670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=575;SC=CCCCTCATTCATGTCTCATTA;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=50097555;WS=50097537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	50097607	rs57940349	C	T	2579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.94;SOR=3.086;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr19	50097784	rs10414643	T	C	4889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=41;PP=2965;SC=TCATGAACCTTATCTCGGCCC;SOR=1.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=141;TCF=100;TCR=41;TR=141;WE=50097792;WS=50097774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr19	50097932	rs16981329	G	C	7148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=121;NR=99;PP=2965;SC=TCTCTCTGACGCGCGGTCTTC;SOR=0.837;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=221;TCF=122;TCR=99;TR=220;WE=50097940;WS=50097922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,221:1.00:221
chr19	50098423	rs12462756	G	A	3675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=107;PP=2965;SC=GCCCACCGCCGCCTGAGCGGG;SOR=3.348;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=132;TCF=20;TCR=112;TR=127;WE=50098431;WS=50098413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr19	50099422	rs73058052	C	T	2530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=44;PP=1968;SC=GCTATGCAGCCGGAGCAGGTG;SOR=0.968;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=35;TCR=44;TR=79;WE=50099430;WS=50099412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	50100295	rs3745475	A	G	2542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=27;PP=2078;SC=GCGTAGGCCCACCAAACTCGG;SOR=1.749;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=60;TCR=27;TR=87;WE=50100303;WS=50100285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr19	50103252	rs2116922	G	A	3864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=87;PP=2927;SC=TGATCACTAGGTAACAGTTGT;SOR=2.400;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=28;TCR=87;TR=115;WE=50103260;WS=50103242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr19	50105239	rs6509439	C	T	416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=378;SC=GTTGAGTGCCCGCTGGATGAC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=50105247;WS=50105229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	50124663	rs73058085	G	A	3089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=13;PP=2462;ReadPosRankSum=0.911;SC=GGGGGCTGGGGCCTGTACTTT;SOR=2.137;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=76;TCR=13;TR=88;WE=50124671;WS=50124653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,95:0.99:96
chr19	50128543	rs7256146	A	G	2308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=58;PP=1829;SC=GCCCAGCCCCATCCTGCCTCA;SOR=3.026;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=13;TCR=58;TR=71;WE=50128551;WS=50128533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	50140068	rs1368464	C	T	5742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=114;PP=2965;SC=CCGCCACCAGCAACCCCTGTC;SOR=1.216;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=186;TCF=72;TCR=114;TR=186;WE=50140076;WS=50140058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr19	50140092	rs1865077	G	A	5601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=110;PP=2965;SC=TCTGCCGGTCGTTAATGGCGA;SOR=1.217;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=182;TCF=70;TCR=112;TR=180;WE=50140100;WS=50140082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr19	50140209	rs1368463	C	T	4797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=58;PP=2965;SC=GAGGGGCCATCGTGGGGACCA;SOR=1.119;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=83;TCR=58;TR=141;WE=50140217;WS=50140199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr19	50140246	rs1865076	C	A	5589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=104;NR=63;PP=2965;SC=CCCCAAGAGCCCTCAGCCCCC;SOR=1.230;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=168;TCF=104;TCR=64;TR=167;WE=50140254;WS=50140236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr19	50154904	rs7251334	A	C	1016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=20;PP=840;SC=CGCCCGGCCTACACCGGCCGC;SOR=1.284;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=11;TCR=20;TR=31;WE=50154912;WS=50154894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	50156896	rs10401743	T	C	1919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=44;PP=1580;SC=GCTGCCCACGTTGCCCCCGCC;SOR=2.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=15;TCR=44;TR=59;WE=50156904;WS=50156886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	50161807	rs7047	T	C	956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=9;PP=802;SC=CTGCCCCGTGTCCACCTCCCT;SOR=1.981;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=36;TCF=27;TCR=9;TR=34;WE=50161815;WS=50161797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	50162909	rs7251	C	G	1721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=24;PP=1481;SC=GAGGGCTCAGCTCTCCCCAGG;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=31;TCR=24;TR=55;WE=50162917;WS=50162899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	50167726	rs2304207	C	G	9240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=111;NR=177;PP=2965;SC=ATTCCCGTAACCCTGCAGCTC;SOR=1.271;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=288;TCF=111;TCR=177;TR=288;WE=50167734;WS=50167716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr19	50168927	rs2304205	A	C	209.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=0;PP=140;SC=GCTGGAACCCACCCCTGTCTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=50168935;WS=50168917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	50169020	rs2304204	T	C	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=1;PP=387;SC=GCTTTCTTTTTGATCGACTTC;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=50169028;WS=50169010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	50177171	rs3745469	G	A	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=26;PP=736;SC=ACGTTACAAAGTATTCAATTG;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=50177179;WS=50177161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	50182697	rs8109314	T	C	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=2;PP=455;SC=TGTGGGCATATCCTGCCAGCC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=50182705;WS=50182687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	50183980	rs1433102	TT	CC	1217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=2;NR=23;PP=1493;SC=TGCTGCGCACTTCCTAGGGTC;SOR=4.407;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=25;WE=50183989;WS=50183970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	50193163	rs201107314	A	G	3349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=69;PP=2574;SC=TGGACACTGCAGCCAGGTGAG;SOR=1.149;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=45;TCR=69;TR=114;WE=50193171;WS=50193153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr19	50195770	rs10423579	TT	CG	1951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=37;PP=2126;SC=CCCCTTTTTCTTAGAATTTTG;SOR=3.816;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=41;WE=50195779;WS=50195760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	50209095	rs7249356	T	G	1631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=8;PP=1316;SC=CTAAGAAGTATATAATAAATG;SOR=2.925;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=47;WE=50209103;WS=50209085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	50216118	rs56405217	T	TG	4557.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=59;NR=51;PP=2974;SC=TGAGTGGAGCTGGGCGCGCTG;SOR=1.129;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=117;TCF=60;TCR=57;TR=110;WE=50216126;WS=50216108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr19	50250872	rs8109529	G	A	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=28;PP=876;SC=CCTTGGCTAAGGGGATGGCTT;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=50250880;WS=50250862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	50265230	rs1273634	C	T	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=1;PP=566;SC=GACCTCGGTCCTCCCCAGCGG;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=50265238;WS=50265220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	50302713	rs201278183	C	T	8044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.496;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.044;NF=135;NR=108;PP=2965;ReadPosRankSum=1.138;SC=CCCATGAAGCCGTCAAGACGC;SOR=0.589;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=246;TCF=137;TCR=109;TR=243;WE=50302721;WS=50302703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,254:1.00:255
chr19	50304336	rs1003424	A	G	3585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=80;PP=2794;ReadPosRankSum=0.377;SC=CTCAGCCTGCAGGGGAGAACA;SOR=1.132;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=108;TCF=27;TCR=81;TR=107;WE=50304344;WS=50304326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,115:0.99:116
chr19	50304392	rs10421561	T	C	2039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=52;PP=1605;ReadPosRankSum=0.055;SC=CCCAGGGGTCTCAGGGCAGGC;SOR=2.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=5;TCR=53;TR=57;WE=50304400;WS=50304382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chr19	50304439	rs10421754	T	C	889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=22;PP=786;SC=TCCACCCCAATCCACCTAGCA;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=5;TCR=22;TR=27;WE=50304447;WS=50304429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	50305688	rs2159984	G	C	5234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.97;ReadPosRankSum=1.420;SOR=0.684;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,168:0.99:169
chr19	50308893	rs8101959	T	C	3558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=87;NR=28;PP=2729;SC=CGGGGCCTAATGGAGCCTCCC;SOR=2.061;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=87;TCR=29;TR=115;WE=50308901;WS=50308883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr19	50310775	rs62129186	C	T	1263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=36;PP=1050;SC=GGCCTCGGGGCTCTAGCTGGC;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=50310783;WS=50310765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr19	50314458	rs55810357	GA	G	1232.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.03;QD=22.01;SOR=6.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	50315423	rs8104825	G	A	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=417;SC=AAGTGTTGGTGGTCTGCACTC;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=16;WE=50315431;WS=50315413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	50315698	rs2305919	A	C	2472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.020;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=39;PP=1919;ReadPosRankSum=0.506;SC=CCTCTCTCAGACCAACCTGCC;SOR=0.141;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=73;TCF=32;TCR=41;TR=71;WE=50315706;WS=50315688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,76:0.97:78
chr19	50315773	rs2305918	T	A	3518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=37;PP=2717;SC=CATAGCCAAATTAACAGCTGC;SOR=1.423;Source=Platypus;TCR=37;TR=103;WE=50315781;WS=50315763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr19	50316083	rs35816883	C	T	3566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=30;PP=2965;ReadPosRankSum=0.300;SC=GCCCCATCCTCTTTCCATATG;SOR=0.829;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=107;TCF=77;TCR=30;TR=106;WE=50316091;WS=50316073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,106:0.99:107
chr19	50338453	rs752522	C	T	6177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=154;PP=2965;SC=TGACAGTCCCCAAACCAGCAC;SOR=2.514;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=197;TCF=43;TCR=154;TR=197;WE=50338461;WS=50338443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr19	50342111	rs10403127	G	A	4400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=130;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.918;SC=ATTAACAGAAGTGGCGCGGCA;SOR=3.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=9;TCR=131;TR=139;WE=50342119;WS=50342101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,136:0.99:137
chr19	50354211	rs7260222	C	T	6330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=119;PP=2965;SC=CCACCCCATTCGGTAGGGGCT;SOR=1.168;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=202;TCF=81;TCR=121;TR=200;WE=50354219;WS=50354201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr19	50358170	rs1290657	T	C	1994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=33;NR=32;PP=1727;SC=TCCCACCCCATCCACTCTGAG;SOR=0.822;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=33;TCR=32;TR=65;WE=50358178;WS=50358160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	50363175	rs1290646	A	G	2216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=2;PP=1917;SC=CCACGGCATGATGCCGTGGTT;SOR=6.091;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=62;TCR=2;TR=64;WE=50363183;WS=50363165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	50369762	rs183127015	C	T	3535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=61;PP=2733;SC=TCCCTCATTTCTGGGGAGTGT;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=103;TCF=41;TCR=62;TR=102;WE=50369770;WS=50369752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr19	50383591	rs8109661	A	G	6580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=108;PP=2965;SC=TTTGACCCCGACTATGAACCT;SOR=0.780;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=205;TCF=96;TCR=109;TR=204;WE=50383599;WS=50383581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr19	50394203	.	CCT	C	216	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=23;MQ=67.16;NF=7;NR=0;PP=216;QD=32.1428571429;SC=GCCCCCCCCCCCTGCCCGCCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=50394212;WS=50394193;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,7:0.78:9
chr19	50394205	.	T	C	170.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=70.00;QD=28.47;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	50411742	rs892028	A	G	7570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=134;NR=113;PP=2965;SC=TGAGCTGTGCATCGATGTTCT;SOR=0.841;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=249;TCF=136;TCR=113;TR=247;WE=50411750;WS=50411732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr19	50412217	rs1062798	C	G	1389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=22;PP=1088;SC=GCTGCTGCTGCTGGTGGTGGT;SOR=0.836;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=19;TCR=22;TR=41;WE=50412225;WS=50412207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	50412417	rs999583	G	A	2073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=17;PP=1701;SC=TGGGCCCAGTGCTGGTGATGG;SOR=1.999;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=46;TCR=17;TR=63;WE=50412425;WS=50412407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	50435747	rs283525	T	C	2712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=12;NR=74;PP=2351;SC=GGAGCCTCCCTTACCCCCCGG;SOR=4.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=12;TCR=74;TR=86;WE=50435755;WS=50435737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr19	50435862	rs283526	C	T	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=11;PP=319;SC=GATGCCCCGCCCCTCCCACCA;SOR=1.739;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=16;WE=50435870;WS=50435852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	50436115	rs61742136	C	T	5568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=79;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.330;SC=ATCCTGCCACCACCCGAGGGG;SOR=0.959;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=178;TCF=98;TCR=80;TR=176;WE=50436123;WS=50436105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,184:0.99:186
chr19	50453317	rs9304690	C	T	5247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.869;SC=TCTTGATCTCCGAGTACTCGG;SOR=0.409;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=171;TCF=68;TCR=103;TR=169;WE=50453325;WS=50453307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,170:0.99:171
chr19	50462244	rs1811375	G	A	5174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=112;PP=2965;SC=TGGGCCCCCAGTTTGGCACTG;SOR=1.698;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=169;TCF=57;TCR=112;TR=169;WE=50462252;WS=50462234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr19	50462298	rs62113133	G	C	3147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=5.045;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.34;MQRankSum=-0.798;QD=33.49;ReadPosRankSum=1.700;SOR=3.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,92:0.98:94
chr19	50462396	rs140838254	ACTATC	A	1033.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=21;PP=1173;SC=GGTAAAGGGAACTATCCTGGA;SOR=4.977;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=22;WE=50462408;WS=50462386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	50474673	rs112792790	T	C	95.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.84;MQRankSum=1.282;QD=15.96;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr19	50496183	rs56089748	C	T	1422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=32;PP=1130;SC=CATACTCATTCTCATGGAGGA;SOR=1.714;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=45;WE=50496191;WS=50496173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	50496281	rs113770287	G	GAC	705.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.26;NF=0;NR=14;PP=692;SC=TGCAGACCAGGAGGGAGCCCC;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=50496289;WS=50496271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	50657786	rs66651303	AG	A	7053.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=172;NR=13;PP=2966;SC=TGACCCATCCAGGGGAGTCGC;SOR=5.263;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=210;TCF=187;TCR=23;TR=185;WE=50657794;WS=50657776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr19	50713713	rs590722	C	A	2742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=61;PP=2350;SC=CCTGTTCACGCCCCGCGGGCC;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=25;TCR=61;TR=86;WE=50713721;WS=50713703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	50726459	rs654877	T	C	8318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=280;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.859;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=160;NR=103;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.085;SC=GGAGCTTGCCTGAGGTCATTG;SOR=0.215;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=266;TCF=163;TCR=103;TR=263;WE=50726467;WS=50726449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,277:0.99:279
chr19	50735024	rs34062561	C	T	1719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=2;PP=1477;SC=AGGTGCTAAACGCCCACTCCA;SOR=5.709;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=51;TCR=2;TR=53;WE=50735032;WS=50735014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	50750419	rs607227	C	T	6324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=127;PP=2965;SC=GAAAGAGCCGCGCACCCCGGC;SOR=1.283;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=208;TCF=81;TCR=127;TR=207;WE=50750427;WS=50750409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr19	50762418	rs1651553	A	G	2993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=62;PP=2468;SC=AGCTGGAGCCACGGCTGGTGC;SOR=1.686;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=29;TCR=62;TR=91;WE=50762426;WS=50762408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr19	50763889	rs12981413	C	T	8741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=174;NR=92;PP=2965;SC=CCCACCCCTCCCTGCTCATTG;SOR=1.506;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=267;TCF=175;TCR=92;TR=266;WE=50763897;WS=50763879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr19	50764017	rs146099002	T	TGC	5751.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=12.142;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=122;PP=2987;ReadPosRankSum=1.495;SC=TGTGTGTGTGTGCGTGCATGA;SOR=5.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=145;TCF=2;TCR=143;TR=122;WE=50764025;WS=50764007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,136:0.96:142
chr19	50764079	rs140241247	A	AGT	1987.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=56;PP=2027;ReadPosRankSum=0.329;SC=TGTGTGTGCAAGTGTGTGTGC;SOR=4.849;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=61;TCF=1;TCR=60;TR=57;WE=50764087;WS=50764069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
chr19	50766707	rs1529492	T	C	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=28;PP=984;SC=GTGGCCCCAGTAGGGAGAGGA;SOR=1.954;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=10;TCR=28;TR=38;WE=50766715;WS=50766697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	50771609	rs3745504	G	A	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=20;PP=1077;SC=AGAAGAGGCTGCAGCAGCACA;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=22;TCR=20;TR=42;WE=50771617;WS=50771599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	50771635	rs930086	T	C	1603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=25;PP=1282;SC=GTCTGGCCCCTTGCATGCCCA;SOR=0.773;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=23;TCR=25;TR=48;WE=50771643;WS=50771625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	50775742	rs1651543	A	G	459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=7;PP=386;SC=GTGACTGGGGACCTGTGGTCT;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=7;TCR=7;TR=14;WE=50775750;WS=50775732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	50805138	rs3826772	C	T	3069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=80;PP=2446;SC=TAGGTGAGAGCGGAGGCCACA;SOR=3.235;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=15;TCR=80;TR=95;WE=50805146;WS=50805128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr19	50832152	rs375912738	T	C	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	50862768	rs11670727	C	T	1996.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=16;PP=1574;SC=ACCTCCCCAGCCAGCAAGGGG;SOR=2.267;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=65;WE=50862776;WS=50862758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	50880741	rs2695121	T	C	2499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=3;PP=2048;SC=AGTAGGGTCTTTGGAGAGATG;SOR=5.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=67;TCR=3;TR=70;WE=50880749;WS=50880731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	50881820	rs55652650	A	AAAC	7027.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=81;PP=2924;SC=GAAGATTCGGAAACAGCAGCA;SOR=0.841;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=137;TCF=43;TCR=94;TR=121;WE=50881828;WS=50881810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr19	50882169	rs2248949	A	G	2098.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=63;PP=1909;ReadPosRankSum=-0.932;SC=TGGGAAGAGGATCCCCCAGGG;SOR=2.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=9;TCR=64;TR=72;WE=50882177;WS=50882159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr19	50936378	rs3765069	C	T	808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=20;PP=566;SC=TGGGGGTTCCCGCATCAGTTT;SOR=3.098;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=50936386;WS=50936368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	50938385	rs11669020	C	A	5416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=63;PP=2965;SC=GTGCAGACCGCATGCTCAACT;SOR=1.294;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=104;TCR=63;TR=167;WE=50938393;WS=50938375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr19	50939867	rs2004423	G	A	1846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=3;PP=1522;SC=CCCGGCCCTGGACCCAGGTGT;SOR=5.247;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=54;TCR=3;TR=57;WE=50939875;WS=50939857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	50940594	rs2293455	G	C	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=57;NR=3;PP=1784;SC=GCCCAGGCCTGAGCAAGGTTG;SOR=5.453;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=60;TCF=57;TCR=3;TR=60;WE=50940602;WS=50940584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	50954584	rs8105250	C	T	3039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=66;PP=2258;SC=CCACGGGCTGCGCTGGGAGCG;SOR=1.705;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=28;TCR=66;TR=94;WE=50954592;WS=50954574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	50957397	rs25665	G	A	8353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.223;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=142;NR=126;PP=2965;ReadPosRankSum=0.036;SC=CACCAACCCCGTCGGCGAGGA;SOR=0.579;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=272;TCF=143;TCR=129;TR=268;WE=50957405;WS=50957387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,272:0.99:275
chr19	50965272	rs25668	T	C	2358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=66;PP=1856;SC=CCCTCAACTGTGCTGTCAGAG;SOR=2.503;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=19;TCR=66;TR=85;WE=50965280;WS=50965262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	50967640	rs25667	G	A	5039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=82;NR=70;PP=2965;SC=ATGGAAATCCGTGAAGATCCC;SOR=0.823;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=82;TCR=70;TR=152;WE=50967648;WS=50967630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr19	50969325	rs1274604	A	G	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=551;SC=ACAGTGGCCTAGGATGGGGCG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=50969333;WS=50969315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	50982086	rs921938	C	A	600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=462;SC=AATGGGGGCCCAGATGGGGAG;SOR=4.514;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=50982094;WS=50982076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	50983930	rs10409679	C	T	4712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=80;NR=73;PP=2965;SC=TGACGCACCCCGGGGGCTGCC;SOR=0.773;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=154;TCF=80;TCR=74;TR=153;WE=50983938;WS=50983920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr19	50985038	rs12609351	C	T	629.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=508;SC=GCTGCCCACTCGAGCGCCCTC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=50985046;WS=50985028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	50986074	rs14031	G	A	1593.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=44;PP=1306;SC=CTGGATGGCCGGGGGCTTCTG;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=44;WE=50986082;WS=50986064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	51015404	rs12977172	T	C	1749.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=47;NR=6;PP=1368;SC=CAGGAGGCTCTGCCAGAAGGC;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=47;TCR=6;TR=53;WE=51015412;WS=51015394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	51017835	rs889131	G	A	5651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=147;PP=2965;SC=CCCAGCTCGCGTCAGCCCAGG;SOR=3.050;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=177;TCF=30;TCR=147;TR=177;WE=51017843;WS=51017825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,179:1.00:179
chr19	51020903	rs61751956	A	G	1280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=21;PP=923;ReadPosRankSum=1.033;SC=AGTTGAGGCCAGGCGGGCCTT;SOR=0.390;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=50;TCF=29;TCR=21;TR=49;WE=51020911;WS=51020893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr19	51021057	rs61751957	A	G	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=11;PP=740;SC=CCCACTGGCCACGGCGGCCGC;SOR=1.542;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=22;TCR=11;TR=33;WE=51021065;WS=51021047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	51052189	rs11880112	T	C	55.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=3;PP=34;SC=CCATGTGGCCTGGGTGCTTGC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=51052197;WS=51052179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	51159571	rs4801844	T	G	4131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=74;PP=2965;SC=ACCACCAGCTTCCCAGCCCCT;SOR=1.517;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=40;TCR=74;TR=113;WE=51159579;WS=51159561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr19	51161088	rs10404821	C	A	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=433;SC=CTCCTTTGACCATAGCGACAG;SOR=4.514;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=51161096;WS=51161078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	51161197	rs116088642	A	C	1573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=21;PP=1240;SC=TCTGAACCCAAAATGAACCAG;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=47;TCF=26;TCR=21;TR=46;WE=51161205;WS=51161187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	51170706	rs3745521	A	G	2268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=50;PP=1851;SC=TCCGCTCGTCACAGGGGCCCG;SOR=1.349;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=77;TCF=27;TCR=50;TR=77;WE=51170714;WS=51170696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr19	51191172	rs12975345	A	G	4187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=26;PP=2965;SC=GAGTGGCCGCAGGAGCACCTT;SOR=3.126;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=124;TCR=26;TR=150;WE=51191180;WS=51191162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr19	51200290	rs34959666	G	GC	4904.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=86;PP=2975;ReadPosRankSum=1.366;SC=ACGTTCACACGCCCCCCAGGC;SOR=0.356;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=150;TCF=44;TCR=106;TR=127;WE=51200298;WS=51200280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,160:0.99:161
chr19	51217550	rs3745530	G	A	3810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=59;PP=2965;SC=AACCCCGTCTGAGCCATGGGC;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=63;TCR=60;TR=122;WE=51217558;WS=51217540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr19	51228634	rs11084024	G	A	6948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=119;NR=93;PP=2965;SC=GCACGCTCGAGAACTGCGTGG;SOR=0.959;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=212;TCF=119;TCR=93;TR=212;WE=51228642;WS=51228624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr19	51228802	rs1053020	T	G	2769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=75;PP=2373;SC=CTCCGGAATCTCCCTTCCCTT;SOR=3.912;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=11;TCR=75;TR=86;WE=51228810;WS=51228792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	51262620	rs10424138	A	C	2013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=44;PP=1542;SC=CCAGTCTTTGACTTCTGCCCT;SOR=2.621;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=13;TCR=44;TR=57;WE=51262628;WS=51262610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr19	51262668	rs12983009	C	T	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.97;QD=31.27;SOR=7.054;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	51331199	rs142271509	G	GT	986.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.60;QD=41.11;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	51331204	.	T	TTG	645	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=58.02;NF=1;NR=18;PP=645;QD=35.3157894737;SC=GCCCTGTTTTTGTTTGTTGTT;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=19;WE=51331213;WS=51331189;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,19:0.79:24
chr19	51331205	.	G	T	551	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=57.79;NF=1;NR=17;PP=551;QD=32.5428451415;SC=CCCTGTTTTTGTTTGTTGTTG;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=18;WE=51331213;WS=51331189;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,18:0.86:21
chr19	51331205	rs372866981	G	GT	1009.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.53;QD=43.90;SOR=3.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	51359497	rs11573	T	C	973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.37;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	51359503	rs1135766	A	G	1070.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.66;SOR=2.066;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	51361315	rs12946	C	T	5157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=122;NR=46;PP=2965;SC=GTCGGCACAGCCTGTTTCATC;SOR=2.060;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=168;TCF=122;TCR=46;TR=168;WE=51361323;WS=51361305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr19	51361472	rs2003783	C	A	3246.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=79;SC=GCCTGCCGAGCTCACGGATGC;SOR=2.595;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=21;TCR=80;TR=100;WE=51361480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr19	51361644	rs1810020	A	G	3838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=29;PP=2965;SC=CAGGACTCCTAGGTCTGAGGG;SOR=2.121;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=111;TCF=82;TCR=29;TR=110;WE=51361652;WS=51361634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr19	51362716	rs66592214	T	C	895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=1;PP=703;SC=CCTGGGCCCTTACCCAGCCTC;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=51362724;WS=51362706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	51362803	rs35192866	C	T	2176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=26;PP=1681;ReadPosRankSum=0.641;SC=TTCTGATCACCGAACTGACCA;SOR=0.481;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=70;TCF=43;TCR=27;TR=68;WE=51362811;WS=51362793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr19	51362955	rs45588133	G	A	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=20;PP=590;SC=TTGTCCCACCGACCTGTCTAC;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=51362963;WS=51362945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	51363398	rs1058205	C	T	5184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=92;PP=2965;SC=CCCTATCAACCCCCTATTGTA;SOR=0.928;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=166;TCF=74;TCR=92;TR=166;WE=51363406;WS=51363388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr19	51391476	.	T	A	2138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=48;PP=1699;SC=TGCTTGTGGGTTTATGAGCTT;SOR=2.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=19;TCR=48;TR=67;WE=51391484;WS=51391466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	51411636	rs2569527	G	T	927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=5;PP=767;SC=CCTTCTGGTCGTGCCCTCCGC;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=51411644;WS=51411626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	51412666	rs1654552	C	A	2557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=61;PP=2138;SC=CAGAGACGAGCGATCCTGAGG;SOR=2.985;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=14;TCR=61;TR=75;WE=51412674;WS=51412656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr19	51413802	rs198969	G	C	1755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=3;PP=1536;SC=ACAGCCATGGGGGACGGATAA;SOR=5.136;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=52;TCR=3;TR=55;WE=51413810;WS=51413792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	51430868	rs59881416	G	A	1970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=57;PP=1681;ReadPosRankSum=-0.716;SC=TGTCTGCAAAGCCTATTTTAA;SOR=2.899;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=6;TCR=58;TR=63;WE=51430876;WS=51430858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr19	51447065	rs1701949	T	C	726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=21;PP=540;SC=AAGGGGGGCATGAGAGAGGCA;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=51447073;WS=51447055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	51452250	rs183854	T	C	2720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=66;PP=2059;SC=AGCATGAGGTTGTTAGAGTGG;SOR=1.945;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=28;TCR=67;TR=94;WE=51452258;WS=51452240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr19	51455814	rs2739412	A	C	3566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=35;PP=2762;SC=CAATCCCACAACCCTCCCACC;SOR=1.672;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=112;TCF=77;TCR=35;TR=111;WE=51455822;WS=51455804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr19	51456005	rs2659093	T	G	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.87;SOR=6.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	51456015	rs11553092	G	A	1132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.57;SOR=6.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	51465200	rs112376245	A	AC	904.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=3;NR=23;PP=857;SC=CTCCCCAGTCACCCCCCAACC;SOR=3.056;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=26;WE=51465208;WS=51465190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	51466516	rs1654537	A	G	1153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=5;PP=956;SC=CACTTCCCCAAGTAGCCAGTA;SOR=3.383;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=37;WE=51466524;WS=51466506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	51485194	rs1654523	C	T	2473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=53;PP=1956;SC=TGGAGGAGCACGTGGGTAGCT;SOR=1.795;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=22;TCR=53;TR=75;WE=51485202;WS=51485184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	51485622	rs2659067	A	G	2613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=48;PP=2061;SC=GATAGCAGTAAGATCTGCAGG;SOR=1.075;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=32;TCR=48;TR=80;WE=51485630;WS=51485612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr19	51487175	rs1624358	T	G	1373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=35;PP=1112;SC=AAAATCTTCATCCCTCTGCTG;SOR=2.356;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=45;TCF=9;TCR=36;TR=44;WE=51487183;WS=51487165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	51506537	.	G	A	1910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=29;PP=1359;SC=GAGAAGGGCAGAGGAACTGTT;SOR=0.724;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=31;TCR=29;TR=60;WE=51506545;WS=51506527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	51530693	rs1474520	G	A	2566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=12;PP=2074;SC=CAGGCAGCCCGAGTCCAGCTG;SOR=3.373;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=68;TCR=12;TR=80;WE=51530701;WS=51530683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	51535130	rs3745540	A	G	7160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.937;SC=TGGGCCCCTTACTCCGTGGGT;SOR=0.311;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=211;TCF=98;TCR=113;TR=209;WE=51535138;WS=51535120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,221:1.00:222
chr19	51535460	rs10635364	T	TCC	907.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=18;PP=945;SC=CCACGGACACTCAGGCGCTCC;SOR=4.712;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=19;WE=51535468;WS=51535450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	51563965	rs2569474	G	A	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=13;PP=379;SC=GGTAAGGGTCGGATTATTGCC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=51563973;WS=51563955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	51566873	rs10426620	G	A	1949.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=53;NR=6;PP=1542;SC=TCCACAAGGCGTAGCGTGTGG;SOR=3.877;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=53;TCR=6;TR=59;WE=51566881;WS=51566863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	51647519	.	C	G	2027	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=46;NR=35;PP=2027;QD=25.453965587;SC=GCAGCGAAAGCCTGGGATGGG;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=46;TCR=35;TR=81;WE=51647527;WS=51647518;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	51656218	rs273661	G	C	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=477;SC=CTATACAGAGGAATATATCCG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=51656226;WS=51656208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	51656454	rs273662	A	T	1802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=33;PP=1427;SC=ACCTATCAGGACAAGAAGCCA;SOR=1.238;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=23;TCR=33;TR=56;WE=51656462;WS=51656444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	51815243	rs4802779	G	C	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=5;PP=231;SC=GGGTAATCGGGGGATCAGGGG;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=12;WE=51815251;WS=51815233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	51831777	.	G	A	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.721;ClippingRankSum=0.000;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=44.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.39;MQRankSum=-5.106;QD=2.03;ReadPosRankSum=-1.938;SOR=6.019;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,26:0.39:66
chr19	51835892	rs11402251	T	TG	4738.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=60.16;NF=32;NR=77;PP=2965;SC=CTGGGGTCTGTGCCTGGAAGA;SOR=1.317;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=115;TCF=33;TCR=82;TR=109;WE=51835900;WS=51835882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr19	51837332	rs10418551	A	G	1139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=5;PP=870;SC=GTAGGAGGGCAGGATGGATGA;SOR=2.891;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=35;WE=51837340;WS=51837322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	51841417	rs34380065	C	T	3623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=87;PP=2948;SC=CTCCCCCAACCGTGTCTCTGC;SOR=3.196;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=18;TCR=87;TR=105;WE=51841425;WS=51841407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr19	51843589	rs6509528	G	T	2414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=22;PP=2070;SC=CGAGTGTCAGGGTCACCTGGG;SOR=1.936;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=78;TCF=56;TCR=22;TR=78;WE=51843597;WS=51843579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	51843808	rs7259266	C	T	2882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=67;PP=2244;SC=CCTCTGAGCGCATCCGGGGCG;SOR=2.229;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=24;TCR=67;TR=91;WE=51843816;WS=51843798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr19	51844978	rs8105710	G	T	4073.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.339;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=79;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.469;SC=CAGAGAAGGGGGAAACCGGGC;SOR=1.038;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=129;TCF=50;TCR=79;TR=126;WE=51844986;WS=51844968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,133:0.99:135
chr19	51845371	rs10414211	T	G	2407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=48;PP=1810;SC=AGCCTGTGGGTTGTCCATGGT;SOR=1.207;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=32;TCR=48;TR=80;WE=51845379;WS=51845361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	51853468	rs4802789	C	T	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=379;SC=TGAGGCAATCCGAGGGAACAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=51853476;WS=51853466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	51856619	rs2004309	T	C	2035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=39;PP=1169;SC=AGCCCCTCCTTCCTCAGACCC;SOR=3.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=6;TCR=39;TR=45;WE=51856649;WS=51856609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	51856631	rs3889312	G	A	1741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.27;QD=45.84;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	51856641	rs3889313	G	C	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.88;QD=52.87;SOR=5.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	51883727	rs2547318	G	A	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=15;PP=1217;SC=TCTGCCCCAGGCACTGACCTT;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=47;WE=51883735;WS=51883717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	51919434	rs375392809	GA	G	82.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.81;MQRankSum=1.816;QD=0.93;ReadPosRankSum=1.357;SOR=0.814;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,18:0.20:89
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chr19	51957493	rs140402033	TG	CA	3020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.37;QD=45.09;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
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chr19	51957503	rs141020441	A	G	2581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.23;QD=49.65;SOR=6.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	51957506	rs149859818	T	C	2311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.00;QD=45.33;SOR=6.479;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	51984725	rs8106673	T	A	3616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=26;PP=2918;SC=GCTGACTGCCTCACAAATGTC;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=83;TCR=26;TR=109;WE=51984733;WS=51984715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr19	52000192	rs144032115	A	G	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.56;MQRankSum=-4.965;QD=8.66;ReadPosRankSum=2.755;SOR=0.705;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,21:0.37:57
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chr19	52000672	rs3829658	G	A	4628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=109;NR=33;PP=2965;SC=TGCCCCTAGCGTCACTCCTGA;SOR=2.452;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=109;TCR=33;TR=142;WE=52000680;WS=52000662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr19	52001485	rs11668530	G	A	4901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=59.93;NF=98;NR=62;PP=2965;SC=CAGACAAGGTGCAGGGACTGG;SOR=1.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=160;TCF=98;TCR=62;TR=160;WE=52001493;WS=52001475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr19	52002317	rs4801871	G	C	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=8;PP=709;SC=GGAGGGGGGGGCCGGGGCTCA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=23;TCR=8;TR=31;WE=52002325;WS=52002307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	52002488	rs968491	C	A	1815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=30;PP=1463;SC=CAGAAAGACACGGAGTTCCCA;SOR=1.118;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=21;TCR=30;TR=51;WE=52002496;WS=52002478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	52002729	rs2009362	G	A	2206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=41;PP=1636;SC=TCATGGTCACGCCGGCCCCAG;SOR=1.134;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=26;TCR=42;TR=67;WE=52002737;WS=52002719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	52003058	rs10420446	C	T	3011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=61;PP=2468;SC=CTTACTCCTCCCCTGAGCCAG;SOR=1.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=90;TCF=28;TCR=62;TR=88;WE=52003066;WS=52003048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	52003089	rs10420457	C	T	2517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=47;PP=2017;SC=CCTCCAACTCCCTCCCAGGAT;SOR=1.739;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=70;TCF=22;TCR=48;TR=69;WE=52003097;WS=52003079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	52003331	rs6509544	G	C	4336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=66;PP=2965;SC=GGAATCGACCGTGGGTATCCT;SOR=0.755;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=130;TCF=64;TCR=66;TR=128;WE=52003339;WS=52003321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr19	52004469	rs3810108	C	T	3876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=87;NR=31;PP=2965;SC=CCATCACCCCCGGCCCCCTCC;SOR=2.142;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=118;TCF=87;TCR=31;TR=118;WE=52004477;WS=52004459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr19	52004551	rs3810109	C	T	6357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=108;NR=97;PP=2965;SC=TCTTGGAGCCCGTGCCTTACC;SOR=0.852;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=207;TCF=109;TCR=98;TR=205;WE=52004559;WS=52004541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr19	52004743	rs3810110	G	A	7360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=100;PP=2965;SC=CACTGCTCGAGCTGGGTTGTT;SOR=0.934;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=224;TCF=124;TCR=100;TR=223;WE=52004751;WS=52004733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr19	52004791	rs66949844	G	GC	10170.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=104;NR=68;PP=2936;SC=ATGGTCCCCTGCCCGGAACCA;SOR=1.340;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=210;TCF=123;TCR=87;TR=172;WE=52004803;WS=52004781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr19	52004795	rs61742108	G	T	10430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=128;NR=77;PP=2965;SC=TCCCCTGCCCGGAACCAGTAG;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=215;TCF=133;TCR=82;TR=205;WE=52004803;WS=52004781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,238:1.00:238
chr19	52031162	rs897783	A	G	1832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=42;PP=1438;SC=CCCACTCCCTATGGAGAGTAC;SOR=2.468;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=53;WE=52031170;WS=52031152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	52031648	rs10419617	A	G	1969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=50;PP=1564;SC=TGAACCCGGAACCAGCCTCTT;SOR=2.797;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=12;TCR=50;TR=62;WE=52031656;WS=52031638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr19	52032964	rs3976745	C	G	6411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=129;NR=73;PP=2965;SC=TCGCGCACCTCCCCCCACACT;SOR=1.379;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=204;TCF=131;TCR=73;TR=202;WE=52032972;WS=52032954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr19	52033742	rs2305772	G	A	3817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=78;PP=2965;SC=GGAGCATCTGGGGTGGAAAGA;SOR=1.672;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=117;TCF=39;TCR=78;TR=116;WE=52033750;WS=52033732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr19	52034940	rs1551559	C	T	840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=22;PP=717;SC=GGAAGGACTGCGGGGAGGAAC;SOR=1.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=52034948;WS=52034930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	52097177	rs7253296	T	C	2342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=0;PP=2016;SC=TCCTTGGTTTTGGGATCTTGC;SOR=8.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=65;TCR=0;TR=65;WE=52097185;WS=52097167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	52101918	rs1868947	T	C	2074.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=40;PP=1597;SC=GTGCAGCACATGGTGCTTGTG;SOR=1.163;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=27;TCR=41;TR=66;WE=52101926;WS=52101908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	52102232	rs58593232	TGA	T	2420.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=46;PP=2417;SC=ATCATCTTAGTGAGAGATGAA;SOR=3.729;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=53;TCF=5;TCR=48;TR=50;WE=52102241;WS=52102222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	52104489	rs8113451	C	G	2009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.538;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.087;NF=49;NR=18;PP=1660;ReadPosRankSum=0.907;SC=ACATGGTGGACACCGTGCTCA;SOR=1.971;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=68;TCF=49;TCR=19;TR=67;WE=52104497;WS=52104479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,67:0.99:68
chr19	52104560	rs3752127	T	C	2001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=28;PP=1491;SC=GCTAGGGGGGTGCCCTTCCGC;SOR=0.949;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=36;TCR=28;TR=64;WE=52104568;WS=52104550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	52104713	rs3752126	G	C	1516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=40;PP=1218;SC=TGCTGGACCTGGTGCACTCGG;SOR=2.437;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=53;WE=52104721;WS=52104703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	52130637	rs1106476	TC	AA	2986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=10;PP=2947;SC=CAGTCCAGCCTCTCTCTCCCA;SOR=3.160;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=55;TCR=11;TR=62;WE=52130646;WS=52130627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	52132524	.	TAC	T	244.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.83;QD=27.19;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	52132986	rs200975295	A	G	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.109;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.77;MQRankSum=1.698;QD=17.52;ReadPosRankSum=-2.583;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr19	52133292	rs149216253	A	G	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.791;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=0.000;QD=17.99;ReadPosRankSum=-1.065;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr19	52148952	.	T	TAC	371	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=23;MQ=53.46;NF=7;NR=4;PP=371;QD=34.0;SC=CTCTCTCTTCTACACACACAC;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=11;WE=52148960;WS=52148942;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:18,11:0.38:29
chr19	52148980	rs11424909	C	CA	653.75	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.38;MQRankSum=-0.975;QD=32.69;ReadPosRankSum=0.000;SOR=1.501;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,17:0.85:20
chr19	52148981	.	C	A	517	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;FR=1.0000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MMLQ=28;MQ=43.21;NF=18;NR=6;PP=517;QD=22.9904671895;SC=ACACACACACCCCCCTCACTC;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=24;WE=52148989;WS=52148971;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,24:0.89:27
chr19	52148981	rs2100297	C	CA	653.74	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.31;MQRankSum=-1.159;QD=29.72;ReadPosRankSum=-0.287;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,19:0.86:22
chr19	52208277	rs11382950	G	GC	2752.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=19;PP=2683;SC=TGGTGTCCAGGCTCCGGGACC;SOR=1.949;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=61;TCF=41;TCR=20;TR=58;WE=52208285;WS=52208267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	52220351	rs11084111	G	A	6835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.127;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=114;PP=2965;ReadPosRankSum=0.713;SC=GGATCCGCACGTCCCCACCAA;SOR=0.323;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=223;TCF=109;TCR=114;TR=221;WE=52220359;WS=52220341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,225:1.00:226
chr19	52223121	rs7248778	A	G	1974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=41;NR=25;PP=1539;SC=GAGCAGCGGCAGGCTGCAGGA;SOR=1.263;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=41;TCR=25;TR=66;WE=52223129;WS=52223111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	52223180	rs56166910	A	G	2411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=50;PP=1881;SC=AGGAAGGGGCATGAGTCCCGG;SOR=1.339;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=29;TCR=50;TR=79;WE=52223188;WS=52223170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	52223251	rs59168688	T	G	1643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.15;SOR=2.133;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	52223266	rs57088533	T	C	1452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.73;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	52227137	.	T	TACACACACAC,TACACAC	761.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.1;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;NF=2;NR=0;PP=84;SC=CATGGCTGTATACACACACAC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=2;WE=52227145;WS=52227127;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:10
chr19	52249071	rs5828493	CT	C	209.19	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.07;ReadPosRankSum=0.717;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,14:0.88:16
chr19	52249211	rs867228	T	G	3734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=36;PP=2965;SC=TGCCTGTAACTCCACCTCTGC;SOR=1.882;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=125;TCF=89;TCR=36;TR=125;WE=52249219;WS=52249201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr19	52249672	rs1042229	A	C	3715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=61;PP=2965;SC=CAACGGCCACATTTATCCTCT;SOR=0.877;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=51;TCR=61;TR=112;WE=52249680;WS=52249662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr19	52250216	rs5030878	A	G	1706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=42;PP=1392;SC=CCCTCCAGAGATGTTCGTGGG;SOR=2.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=13;TCR=42;TR=55;WE=52250224;WS=52250206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	52520714	rs12976476	G	T	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=425;SC=CCCAGCACTTGGGGAGGCTGA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=52520722;WS=52520704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	52659991	rs1821278	A	G	3964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=39;PP=2965;SC=TTGCAAGGTTATAACTTTGAC;SOR=1.382;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=109;TCF=70;TCR=39;TR=109;WE=52659999;WS=52659981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr19	52660279	rs1366245	C	T	2917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.617;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=49;PP=2408;ReadPosRankSum=-0.874;SC=ACCCTTTACACATATAAGGTT;SOR=0.696;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=91;TCF=42;TCR=49;TR=89;WE=52660287;WS=52660269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,91:0.99:92
chr19	52660783	rs17696575	A	G	1342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=31;PP=1046;SC=TCATACATTTAGGAAGGATAC;SOR=2.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=42;WE=52660791;WS=52660773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	52660826	rs61641512	G	A	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=661;SC=GAGTTTTTTCGTTGGTTTTTT;SOR=5.058;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=25;WE=52660834;WS=52660816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	52664019	rs3794976	A	G	1002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=28;PP=861;SC=AATTCAATAGAAGATTATGAT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=52664027;WS=52664009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	52714917	rs41275800	G	A	1623.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=45;PP=1333;SC=CTCTGGACACGGCCACGTGTC;SOR=7.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=45;WE=52714925;WS=52714907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	52716143	rs74536039	G	A	9316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=125;NR=153;PP=2965;SC=TCCTGCCCATGAAAGAGAATC;SOR=0.904;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=278;TCF=125;TCR=153;TR=278;WE=52716151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr19	52803669	rs3217319	CTG	C	4619.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=44;PP=2969;SC=AAGAGTCATGCTGTGTGATGA;SOR=0.849;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=49;TCR=51;TR=88;WE=52803678;WS=52803659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	52825235	rs8102373	A	G	2373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=49;PP=1857;SC=GTCGCAATTCACACCTTGCAG;SOR=1.842;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=19;TCR=49;TR=68;WE=52825243;WS=52825225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	52852523	rs321953	T	C	2679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=52;PP=2107;SC=GTTCTCTCTGTTTCTTTCTGA;SOR=1.554;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=25;TCR=52;TR=77;WE=52852531;WS=52852513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	52869022	rs2241586	G	T	1426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=16;PP=1169;SC=AACCCTTGAGGCACATCTGTC;SOR=1.280;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=44;WE=52869030;WS=52869012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	52869278	rs321937	G	C	3373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=61;PP=2779;SC=TTTAGAGTCCGTGCAAGCCTT;SOR=1.201;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=39;TCR=61;TR=100;WE=52869286;WS=52869268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr19	52869312	rs162120	T	C	3068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=63;PP=2391;SC=TAATCCATACTGCAGAGAAAC;SOR=1.314;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=101;TCF=38;TCR=63;TR=100;WE=52869320;WS=52869302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr19	52869534	rs162119	G	A	4883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=68;PP=2965;SC=GAGAGTGTTCGGGACTTACTA;SOR=0.789;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=75;TCR=68;TR=143;WE=52869542;WS=52869524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr19	52870052	rs1054612	C	G	5060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=132;PP=2965;SC=GAATTCACACCTAGCACAACA;SOR=3.042;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=161;TCF=29;TCR=132;TR=161;WE=52870060;WS=52870042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr19	52873023	rs707312	A	G	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=0;PP=697;SC=CTCTGCCGGGACACAATCTAT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=52873031;WS=52873020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	52882733	rs10445583	T	C	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=11;PP=790;SC=ACTGCAACCTTCGCTTCCTGG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=24;TCR=11;TR=35;WE=52882741;WS=52882723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	52882805	rs10445584	C	T	1844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=29;PP=978;SC=TGAGCCTCCGCGCCTGGCCTC;SOR=1.714;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=14;TCR=29;TR=43;WE=52882813;WS=52882795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	52882824	rs10445585	T	A	1548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=25;PP=800;SC=TCATTTTTAATTTTTTTAGAG;SOR=2.115;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=34;WE=52882832;WS=52882814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	52887145	rs34470614	TA	T	1916.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=29;PP=2027;SC=ACAAGTCTCTTAAAAATCAAC;SOR=0.854;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=58;TCF=26;TCR=32;TR=54;WE=52887153;WS=52887135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	52887246	rs34678014	T	TCAA	2221.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=19;PP=2289;SC=GAAAAACCTATCAACAATTCC;SOR=0.859;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=30;TCR=25;TR=41;WE=52887254;WS=52887236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	52887427	rs8104808	A	C	8898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.05;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr19	52887437	rs8104812	A	C	8816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=3.121;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=44.31;ReadPosRankSum=1.899;SOR=0.320;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,198:0.99:199
chr19	52887904	rs2042913	T	C	4037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=68;PP=2965;SC=GTAATAAATGTGGCAAGGTCT;SOR=0.870;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=64;TCR=68;TR=131;WE=52887912;WS=52887894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr19	52888070	.	T	TTTGGGAGGCCGAGGCGG	2061.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.633;ClippingRankSum=0.000;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=91.124;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.32;MQRankSum=2.094;QD=18.91;ReadPosRankSum=2.636;SOR=6.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,56:0.51:109
chr19	52888073	.	G	GGATCATGAGGTCAGGAGATC	1057.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.351;ClippingRankSum=0.000;DP=143;ExcessHet=3.0103;FS=57.330;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.21;MQRankSum=1.315;QD=11.02;ReadPosRankSum=-3.671;SOR=6.393;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,28:0.29:96
chr19	52888210	rs56151179	T	C	3312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.050;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=42;PP=2632;ReadPosRankSum=-0.876;SC=GATTTCATACTGGAGAGAAAC;SOR=0.282;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=92;TCF=49;TCR=43;TR=91;WE=52888218;WS=52888200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,108:0.99:109
chr19	52888245	rs55748277	A	G	3499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=39;PP=2744;ReadPosRankSum=1.838;SC=GAATGTGGCAAGGACTTCACT;SOR=0.916;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=56;TCR=40;TR=93;WE=52888253;WS=52888235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,107:0.98:109
chr19	52888620	rs3170100	T	G	1466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=43;PP=1304;SC=CAGCATGAGATAATTCATTCA;SOR=5.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=45;WE=52888628;WS=52888610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	52893473	rs7253837	A	G	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=1;PP=509;SC=TGTCCCCTGCACTGGCCCGCA;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=52893481;WS=52893463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	52893552	.	G	T	2018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.653;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=5;PP=1818;ReadPosRankSum=-0.837;SC=CCGCTCCCTCGTCAGCTCCTG;SOR=3.126;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=59;TCR=5;TR=63;WE=52893560;WS=52893542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr19	52905067	rs324091	A	C	1942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=31;PP=1616;SC=CTCAGTTAGGATAAATCAGAC;SOR=0.725;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=31;TCR=31;TR=62;WE=52905075;WS=52905057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	52920006	rs10664588	C	CTG	4472.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=70;PP=2957;SC=TCCCTACAAACTGTATGGCAA;SOR=2.212;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=93;TCF=14;TCR=79;TR=84;WE=52920014;WS=52919996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr19	52940931	rs1428179	A	T	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=312;SC=TTTCTGTCAGACTTTAAACAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=52940939;WS=52940921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	52941171	rs1428180	T	C	3142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=36;PP=2510;SC=ATAAGTTTTTTCAGTGTCAAA;SOR=1.053;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=88;TCF=52;TCR=36;TR=88;WE=52941179;WS=52941161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr19	52941540	rs1366257	G	A	5124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=73;PP=2965;SC=AAAGAATGTGGGAAAGTCTTT;SOR=0.719;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=148;TCF=75;TCR=73;TR=148;WE=52941548;WS=52941530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr19	52941618	rs1366258	A	C	5062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=63;PP=2965;SC=AAATGTAGTGAATGTGGCAAA;SOR=0.963;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=140;TCF=76;TCR=64;TR=139;WE=52941626;WS=52941608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr19	52941847	rs1366259	A	T	3710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=57;PP=2965;SC=TTCATACTGGAGAGAAACCTT;SOR=0.763;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=55;TCR=57;TR=112;WE=52941855;WS=52941837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr19	52942159	rs2608497	A	G	5936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=81;PP=2965;SC=CAAACCTTCAACGACATAGGA;SOR=0.787;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=170;TCF=87;TCR=83;TR=168;WE=52942167;WS=52942149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr19	52942445	rs2608498	C	T	10031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=123;NR=135;PP=2965;SC=AGAGAAGCCTCACAGTTGTAA;SOR=0.772;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=258;TCF=123;TCR=135;TR=258;WE=52942453;WS=52942435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr19	52942495	rs2561001	G	A	9406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=129;PP=2965;SC=CACACCTTGCGCGACATAGGA;SOR=0.862;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=237;TCF=108;TCR=129;TR=236;WE=52942503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr19	52942734	rs2446079	C	T	2328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=65;PP=1936;SC=CAGTGGCTCACGTCTGTAATC;SOR=7.083;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=66;TCF=1;TCR=65;TR=66;WE=52942742;WS=52942724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	52954507	rs324104	T	C	2211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=24;PP=1454;SC=CCGGAGGTGCTGAGGAGCCAA;SOR=1.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=46;TCR=24;TR=70;WE=52954515;WS=52954497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr19	53075758	rs77054172	G	A	1039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=30;PP=853;SC=TGTGAAAGAGGCTTCTCTAAT;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=53075766;WS=53075748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr19	53270384	rs1820128	A	G	5931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=113;PP=2965;SC=TGACATCTACAATGGCATGTA;SOR=1.248;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=200;TCF=86;TCR=114;TR=199;WE=53270392;WS=53270374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr19	53303527	rs8107444	A	G	4060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=61;PP=2965;SC=TTCATTACACATGTATGGTTT;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=65;TCR=61;TR=126;WE=53303535;WS=53303517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr19	53303705	rs10417163	T	G	4189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=68;PP=2965;SC=TTGTATGGTTTCTCTGCAGTA;SOR=1.082;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=47;TCR=68;TR=115;WE=53303713;WS=53303695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr19	53311395	rs7257656	G	A	6029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=122;PP=2965;SC=CCCTGAAATGGAAACACATTT;SOR=1.676;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=181;TCF=59;TCR=122;TR=181;WE=53311403;WS=53311385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr19	53384185	rs6509701	C	T	3637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=54;PP=2867;SC=ATGCGAGGTACGCTTTTGTAC;SOR=0.838;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=57;TCR=54;TR=111;WE=53384193;WS=53384175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr19	53384571	.	C	G	5910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=88;NR=101;PP=2965;SC=TAAGGTTTCTCTCCAGTATGC;SOR=0.852;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=190;TCF=88;TCR=102;TR=189;WE=53384579;WS=53384561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr19	53518178	rs140876268	C	G	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FS=5.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.97;MQRankSum=-6.169;QD=5.25;ReadPosRankSum=-0.660;SOR=0.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:142,70:0.33:212
chr19	53572494	rs11665677	G	T	6335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=83;PP=2965;SC=TAAAGACTTTGCCACATTCAT;SOR=0.828;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=93;TCR=83;TR=176;WE=53572502;WS=53572484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr19	53572917	rs10407463	G	A	5598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.131;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=82;PP=2965;ReadPosRankSum=0.760;SC=AGGTTTTGCCGCACTCACTGC;SOR=0.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=176;TCF=93;TCR=83;TR=175;WE=53572925;WS=53572907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,182:0.99:183
chr19	53589677	rs329718	C	T	4140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=85;PP=2965;SC=CACAGTCACACGCACAGATCT;SOR=1.627;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=43;TCR=85;TR=128;WE=53589685;WS=53589667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr19	53612055	rs10410030	T	C	3816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=66;PP=2965;SC=CCACATTCATTGCATTTGTAA;SOR=0.998;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=52;TCR=66;TR=118;WE=53612063;WS=53612045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr19	53618536	rs150409873	C	G	1175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=9;PP=924;SC=TGCAGTGAGCCGAGATTGCAC;SOR=2.531;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=34;TCR=9;TR=43;WE=53618544;WS=53618526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	53619866	rs66667460	C	T	101.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.68;QD=25.26;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	53645291	rs2195310	T	C	5401.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=78;NR=85;PP=2965;SC=CCACATCCATTAGATTTGTAA;SOR=0.768;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=78;TCR=85;TR=163;WE=53645299;WS=53645281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr19	53651845	rs10694633	T	TTC	2252.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=0;PP=2282;SC=GAATTCAAACTTGTTTTCCCA;SOR=7.864;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=48;WE=53651853;WS=53651835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	53667637	rs4803054	C	T	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=454;SC=GTGATCCCCCCGCCTCGGCCT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=53667645;WS=53667627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	53667804	rs4801958	C	T	5204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=58;PP=2965;SC=CCAGTATGGACTGCCATATGG;SOR=1.357;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=103;TCR=58;TR=161;WE=53667812;WS=53667794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr19	53667913	rs12459469	A	G	4170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.829;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=69;PP=2965;ReadPosRankSum=0.969;SC=CAAGATGTGAATTTTGAGTGA;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=119;TCF=49;TCR=70;TR=117;WE=53667921;WS=53667903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,127:0.99:128
chr19	53667940	rs12459471	A	G	3973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.457;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=68;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.896;SC=TGCCACATTCATTACATTTGT;SOR=0.572;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=57;TCR=69;TR=124;WE=53667948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,132:0.99:133
chr19	53669273	rs4801959	T	C	4556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=47;PP=2965;SC=TTTCCCTTCATGTTGAAATTG;SOR=1.578;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=142;TCF=95;TCR=47;TR=142;WE=53669281;WS=53669263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr19	53669492	rs12460170	A	G	4779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=83;PP=2965;SC=GGACAAGCCTACAGTGTCACA;SOR=0.988;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=66;TCR=83;TR=148;WE=53669500;WS=53669482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr19	53669653	rs12460233	C	T	1110.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=31;PP=920;SC=AGGTAAATAACTATTTCCCAT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=53669661;WS=53669643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	53678924	rs4289099	C	A	1998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=51;PP=1690;SC=GTTCAATTCACGTAAGCAGAC;SOR=5.247;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=3;TCR=52;TR=54;WE=53678932;WS=53678914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
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chr19	53784647	rs11084232	G	A	621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=526;SC=TACAGTGGGCGTGACTCAGTG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=53784655;WS=53784637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr19	53793574	rs2865248	A	G	4408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=72;PP=2965;SC=GCTCTTTGTTAACGGAGTACA;SOR=1.095;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=56;TCR=72;TR=128;WE=53793582;WS=53793564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
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chr19	53849700	rs4803090	G	A	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	53888388	rs2708713	T	A	732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=621;SC=CTTGAATATCTACATTTTTTT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=53888396;WS=53888378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	53905578	rs2617638	C	T	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=34;PP=968;SC=GGCATGATCTCGGCTCACGGC;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=53905586;WS=53905568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
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chr19	53958263	rs1984432	G	A	8344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=141;NR=115;PP=2965;SC=TGTGAAGTCTGTCCACGATGC;SOR=0.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=256;TCF=141;TCR=115;TR=256;WE=53958271;WS=53958253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,269:1.00:269
chr19	53991335	rs2617675	G	A	177.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=115;SC=CTGGAGTGCAGTGGCACAATC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=53991343;WS=53991329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	53994802	rs10422163	A	T	7573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.918;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=115;NR=109;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.738;SC=GAGAAACCCTACAAGTGTACT;SOR=0.244;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=226;TCF=117;TCR=109;TR=224;WE=53994810;WS=53994792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,234:1.00:235
chr19	53995004	rs2708845	G	A	3944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=69;PP=2965;SC=GTTTTAATCGGAAAACACACC;SOR=1.150;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=43;TCR=70;TR=112;WE=53995012;WS=53994994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr19	54006848	rs11880610	G	C	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.065;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.132;NF=18;NR=25;PP=761;ReadPosRankSum=-0.182;SC=GACAATGGCAGCTTTTGGGTT;SOR=0.983;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=78;TCF=37;TCR=41;TR=43;WE=54006856;WS=54006838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,43:0.58:74
chr19	54072757	rs3746304	C	T	3447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=93;PP=2819;SC=TGTTTCCCAGCTCTTTCTATT;SOR=7.844;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=94;TCF=1;TCR=93;TR=94;WE=54072765;WS=54072747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr19	54075076	rs6509792	A	C	3013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=70;PP=2479;SC=AAACTAGTTGAATTTCTTCTT;SOR=2.461;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=21;TCR=70;TR=91;WE=54075084;WS=54075066;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr19	54075126	rs6509793	C	T	1584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=46;PP=1342;SC=TTGATGTGGCCGTGAGCACCA;SOR=5.507;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=48;WE=54075146;WS=54075116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	54075138	rs11372224	A	AC	1530.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=35;PP=1506;SC=TGAGCACCACAACCTTCCCCT;SOR=5.084;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=36;WE=54075146;WS=54075116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	54080144	rs8109631	A	G	3779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=65;PP=2965;SC=ATGTCAAAAGACCTGCTACTA;SOR=0.955;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=49;TCR=65;TR=114;WE=54080152;WS=54080134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr19	54080279	rs1351	T	C	2920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=31;PP=2284;SC=TCCATACTGGTGAGAAACCTT;SOR=1.389;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=56;TCR=31;TR=87;WE=54080287;WS=54080269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr19	54080780	rs16985052	C	T	4476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=64;PP=2965;SC=AGATCCACACCGGTGAGAAGC;SOR=0.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=137;TCF=73;TCR=64;TR=137;WE=54080788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr19	54080999	rs1056393	A	G	3717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.766;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=68;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.917;SC=TCATTTATGGATCGAGCCTCG;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=50;TCR=68;TR=117;WE=54081007;WS=54080989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,118:0.99:119
chr19	54105521	.	G	GGT	31.25	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=-0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.9985;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=137;ReadPosRankSum=1.150;SC=TATGGGTATGGGTGTGTGTGT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=6;WE=54105529;WS=54105511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr19	54211903	rs7256241	T	G	1888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.607;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=9.930;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=2;PP=1612;ReadPosRankSum=-0.181;SC=CAGAAAACGGTCAAACAGCGA;SOR=5.820;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=57;TCF=54;TCR=3;TR=55;WE=54211911;WS=54211893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,56:0.97:58
chr19	54215465	rs4803166	C	G	760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=4;PP=643;SC=AGCCGAGATCCCACCACCGCA;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=54215473;WS=54215455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	54216777	rs5828551	T	TTTTG	3407.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=72;PP=2982;SC=GAGTCTGTTTTTTTGTTTGTT;SOR=6.543;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=94;TCF=5;TCR=89;TR=73;WE=54216785;WS=54216767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	54216813	rs2865855	A	T	1818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.07;SOR=6.630;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	54230337	rs73600866	T	A	4140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=6.422;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.45;ReadPosRankSum=1.325;SOR=2.480;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,135:0.99:136
chr19	54234353	rs4470257	A	G	2895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=76;PP=2431;SC=GAAAAACAACACTGAAGCTGA;SOR=3.467;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=13;TCR=76;TR=89;WE=54234361;WS=54234343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	54238265	rs3931061	G	C	1230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=35;PP=1029;SC=ATTTGTAGAGGATGCTTATCA;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=39;WE=54238273;WS=54238255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	54242693	rs140276616	G	GCTGACCGTGGTAATA	5282.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=35;PP=2957;SC=TGAAGTTGATGCATTTGCAGA;SOR=2.564;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=83;TCF=9;TCR=74;TR=37;WE=54242701;WS=54242683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr19	54242761	rs60519699	A	G	918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=31;PP=836;SC=TTGCTTTTTCATTCTAAGACA;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=54242769;WS=54242751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	54244423	rs4802001	A	G	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=669;SC=CAGCAGGAGAATCTCTTGAAC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=54244431;WS=54244415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	54245706	rs61217982	G	C	3469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=25;PP=2767;SC=TATTTTGTGTGTATTTTAACC;SOR=2.215;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=78;TCR=25;TR=103;WE=54245714;WS=54245696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr19	54245788	rs56013413	G	A	3979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=79;PP=2965;SC=ACCCTCTAGAGGAAGCACTTT;SOR=1.710;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=36;TCR=79;TR=115;WE=54245796;WS=54245778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr19	54245897	rs73602947	A	T	1571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=39;PP=1222;SC=ATATATTTGCATGCTTATCAT;SOR=4.003;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=44;WE=54245905;WS=54245887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	54245935	rs146905912	GT	G	495.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.16;QD=24.79;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	54255878	rs56196717	GTTT	G	941.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.28;QD=39.24;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	54257185	rs611356	C	G	2962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.28;QD=47.79;SOR=6.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr19	54257190	rs62144158	AC	GA	3099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.55;QD=45.58;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	54261644	rs3901466	C	T	965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=26;PP=727;SC=TGGACGGTGGCGGGGTTCTGT;SOR=5.421;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=28;WE=54261652;WS=54261634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	54307322	rs12460528	G	A	5469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=94;PP=2965;SC=GGTTGGTGCCGAGCACAGAAG;SOR=0.813;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=81;TCR=95;TR=175;WE=54307330;WS=54307312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr19	54308554	rs4806773	C	T	2216.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=21;PP=1729;SC=GCAGCCTGCACTGGGGATGCC;SOR=1.778;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=48;TCR=21;TR=69;WE=54308562;WS=54308544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	54308775	rs34166148	C	CT	123.19	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.67;MQRankSum=0.157;QD=15.40;ReadPosRankSum=-1.534;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,7:0.88:8
chr19	54310961	rs2866112	G	C	2956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=74;PP=2448;SC=TGTTACTGGTGCTTGACAACT;SOR=3.044;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=16;TCR=74;TR=90;WE=54310969;WS=54310951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr19	54311090	rs11084300	C	T	275.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=226;SC=CCACAACCTCCGCCTCCTGGG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=54311098;WS=54311080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	54312796	rs58572468	C	G	280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=21;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=10;NR=1;PP=244;SC=AAAAAAAAAACACACGAACCT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=54312804;WS=54312786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	54314585	rs6509827	G	A	1997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=52;PP=1576;SC=CTCATCAGCAGCCTCTAATGA;SOR=3.091;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=10;TCR=52;TR=62;WE=54314593;WS=54314575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	54327440	rs4539722	G	A	1554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=35;PP=1306;SC=GGGGTGCCGTGAGCCCCAAAG;SOR=2.160;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=47;WE=54327448;WS=54327430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	54385437	rs307942	A	C	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=9;PP=1364;SC=CGCCTCCCCCAACCCGGGGCT;SOR=2.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=40;TCR=9;TR=49;WE=54385445;WS=54385427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	54385820	rs2547362	C	T	3727.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=98;PP=2965;SC=GAAAGGGGGCCCTGAGGCAGA;SOR=5.136;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=7;TCR=98;TR=105;WE=54385828;WS=54385810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr19	54387313	rs307956	A	T	757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=6;PP=635;SC=TGGTTTTCTCAGTGTCCGAGT;SOR=2.124;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=18;TCR=6;TR=24;WE=54387321;WS=54387303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	54394965	rs3745406	T	C	4723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=73;PP=2965;SC=TGGACCCCAATGGTCTCTCTG;SOR=0.782;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=158;TCF=85;TCR=73;TR=157;WE=54394973;WS=54394955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr19	54395098	rs3745405	G	T	1796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=44;PP=1491;SC=AGTCTGGGGTGCAGGGAAGGC;SOR=2.712;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=54;WE=54395106;WS=54395088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	54396003	.	T	TGC	48.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.384;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=0.572;QD=1.80;ReadPosRankSum=-1.562;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,5:0.19:27
chr19	54396006	.	GCACA	G	706.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.701;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.417;NF=2;NR=9;PP=1000;ReadPosRankSum=1.321;SC=CCCAGCATGCGCACACACACA;SOR=0.598;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=11;WE=54396020;WS=54395996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,24:0.77:31
chr19	54396012	.	A	G	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.305;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.60;MQRankSum=-0.463;QD=23.06;ReadPosRankSum=0.095;SOR=0.471;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,24:0.77:31
chr19	54396026	.	A	ACG	46.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.633;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQRankSum=0.583;QD=1.56;ReadPosRankSum=0.934;SOR=0.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr19	54396040	rs66707238	ACACACG	A	53.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=0.624;QD=1.99;ReadPosRankSum=1.547;SOR=0.752;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,6:0.22:27
chr19	54396046	rs146099614	G	GCACA	481.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.016;HP=2;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.550;NF=13;NR=12;PP=576;ReadPosRankSum=-0.541;SC=GCACACACACGCACACACCCC;SOR=0.324;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=49;TCF=28;TCR=21;TR=25;WE=54396054;WS=54396036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr19	54445594	rs11324363	AG	A	4031.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=110;PP=2975;SC=TCCTCGTCTTAGGGGGGTCTC;SOR=4.407;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=121;TCF=6;TCR=115;TR=114;WE=54445608;WS=54445584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr19	54483311	rs71949256	CGT	C	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQRankSum=0.510;QD=2.77;ReadPosRankSum=-1.532;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,7:0.23:31
chr19	54483339	rs12979538	T	C	837.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=41;PP=930;ReadPosRankSum=0.254;SC=TGTGTGTGTGTGCGCGCGCGC;SOR=3.841;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=45;TCF=1;TCR=44;TR=42;WE=54483347;WS=54483329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,33:0.97:34
chr19	54515415	rs12980121	G	C	5182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=47;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.790;SC=GGGTCCCTCTGTCCCAAGCGG;SOR=0.712;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=151;TCF=104;TCR=47;TR=150;WE=54515423;WS=54515405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,156:0.99:157
chr19	54554942	rs4442924	C	A	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	54561385	rs11673528	T	C	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=0;PP=664;SC=TCCCAGCTACTCGGGAGGCTG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=24;WE=54561393;WS=54561381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	54561506	.	G	A	1514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.951;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=43.357;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.57;MQRankSum=-5.737;QD=19.17;ReadPosRankSum=2.643;SOR=6.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,44:0.56:79
chr19	54561507	.	C	A	1502.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=40.462;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.94;MQRankSum=-6.831;QD=19.52;ReadPosRankSum=1.860;SOR=5.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,41:0.53:77
chr19	54561511	.	G	A	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.104;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=42.762;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.17;MQRankSum=-7.911;QD=15.58;ReadPosRankSum=-4.538;SOR=5.778;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,37:0.42:88
chr19	54561512	.	C	A	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.260;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=39.394;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.29;MQRankSum=-7.929;QD=16.13;ReadPosRankSum=-6.201;SOR=5.614;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,34:0.40:85
chr19	54561513	.	C	A	1338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.992;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=35.478;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.59;MQRankSum=-7.770;QD=16.33;ReadPosRankSum=-7.262;SOR=5.435;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,31:0.38:82
chr19	54561792	rs11669427	G	A	4380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=81;NR=47;PP=2965;SC=CATTGCTCTCGGCTTCAACCA;SOR=1.239;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=81;TCR=47;TR=128;WE=54561800;WS=54561782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr19	54579363	rs4806706	C	A	5151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=106;NR=44;PP=2965;SC=CCTTTCCCAGCGATTCTCCTT;SOR=1.920;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=150;TCF=106;TCR=44;TR=150;WE=54579371;WS=54579353;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr19	54600232	rs1657535	A	C	3473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=19;PP=2807;SC=GCAGCGGTAAATTCCCCCTTG;SOR=3.098;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=89;TCR=19;TR=108;WE=54600240;WS=54600222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr19	54604194	rs3760698	G	C	4689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=96;PP=2965;ReadPosRankSum=1.050;SC=TTACGGAAGAGAGTATCGAGG;SOR=0.826;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=141;TCF=44;TCR=97;TR=140;WE=54604202;WS=54604184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,145:0.99:146
chr19	54606209	rs254260	T	G	2206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=23;PP=1632;SC=AAGTGCAGGTTCCGGTGGCGC;SOR=1.340;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=45;TCR=23;TR=68;WE=54606217;WS=54606199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	54606405	rs254259	T	C	4557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=33;PP=2965;SC=GGGTGACGCTTCTTGCCACCC;SOR=2.268;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=134;TCF=101;TCR=33;TR=134;WE=54606413;WS=54606395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr19	54609027	rs254257	A	G	4151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=107;PP=2965;SC=GTTAGGCTCCAACCCCTACCT;SOR=2.730;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=135;TCF=27;TCR=108;TR=134;WE=54609035;WS=54609017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr19	54609170	rs254256	A	G	7208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.92;SOR=3.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chr19	54609178	rs254255	C	G	7491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.56;SOR=2.958;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr19	54609449	.	A	C	1648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=41;PP=1412;SC=CCCCCGTTCCATTTTTTAAGA;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=44;WE=54609457;WS=54609439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	54609692	rs254266	T	G	235.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=181;SC=TAGCCAGGATTGTCTCGATCT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=54609700;WS=54609682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	54609746	rs8100254	G	C	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=3;PP=355;SC=AAAGTGCTGGGATTACAGGTG;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=54609754;WS=54609736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	54611287	rs621147	G	A	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=6;PP=796;SC=CACTGGCGCCGGCTCTGGAGC;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=25;TCR=6;TR=31;WE=54611295;WS=54611277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	54611560	rs254263	C	G	2145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=31;PP=1798;SC=TCCTGGCAGGCAGGAGGGGGA;SOR=0.724;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=32;TCR=31;TR=63;WE=54611568;WS=54611550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	54627039	rs35291886	GCACA	G	1527.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=13;PP=1434;SC=ATACACACATGCACACACACA;SOR=0.749;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=35;TCF=20;TCR=15;TR=29;WE=54627050;WS=54627029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr19	54627097	rs2303557	T	C	1944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=9;PP=1603;SC=AGGCGGGAGATCCAGGAGGCT;SOR=3.150;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=59;WE=54627105;WS=54627087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	54632352	rs608608	C	G	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=3;PP=509;SC=GCTGGGCTTCCGGCTGGTGGA;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=23;WE=54632360;WS=54632342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	54632423	rs655240	T	C	2356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=10;PP=2038;SC=CGCCTCCTCTTCCCCCTAGAT;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=59;TCR=10;TR=69;WE=54632431;WS=54632413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr19	54647078	rs34281370	T	TGG	273.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=6;NR=2;PP=199;SC=GGGTAGGGGTTGGGGGGGGTC;SOR=1.179;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=8;WE=54647086;WS=54647068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr19	54649671	rs36665	T	C	4200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=37;NR=94;PP=2965;SC=CCACCTCCCCTCCCAGCCACA;SOR=2.009;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=132;TCF=37;TCR=95;TR=131;WE=54649679;WS=54649661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr19	54651774	rs35247489	C	T	619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=6;PP=527;SC=GTGGGGGCAGCGAGGCCAGAG;SOR=1.721;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=21;TCF=14;TCR=7;TR=20;WE=54651782;WS=54651764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	54652203	rs43211	T	C	2566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=46;PP=1832;SC=GCAGCGGAGGTGGAGGGAGCA;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=43;TCR=46;TR=89;WE=54652211;WS=54652193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	54657877	rs4806718	T	C	2854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=76;PP=2409;SC=GCACACTCGCTTGGGGTGTGG;SOR=5.524;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=80;TCF=4;TCR=76;TR=80;WE=54657885;WS=54657867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr19	54665970	rs36655	C	T	2464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=13;NR=67;PP=2115;SC=CCTGGAACTCCTGGGTCCCCG;SOR=3.116;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=13;TCR=67;TR=80;WE=54665978;WS=54665960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	54667748	rs36654	G	A	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=31;PP=871;SC=TCGCTCTGTTGCCCAGCCTAG;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=54667756;WS=54667738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	54676763	rs641738	C	T	6644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=131;PP=2965;SC=GGCCAGCCACCCCCTAGAGGA;SOR=1.527;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=194;TCF=63;TCR=131;TR=194;WE=54676771;WS=54676753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr19	54676814	.	G	GC	3437.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.203;ClippingRankSum=0.000;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.209;NF=5;NR=84;PP=2936;ReadPosRankSum=-0.363;SC=TTCTTCCATGGCCCAGGCTGG;SOR=2.468;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=98;TCF=6;TCR=92;TR=89;WE=54676822;WS=54676804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,104:0.99:105
chr19	54677759	rs4806721	T	C	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=1;PP=437;SC=GGAGCTTCTCTGGGGCAAGGC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=54677767;WS=54677749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	54687334	rs254283	C	G	2498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=15;PP=2056;SC=CGGGAACACACAACAGGCACT;SOR=2.774;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=78;TCF=63;TCR=15;TR=77;WE=54687342;WS=54687324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr19	54691225	rs1865961	T	C	2022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=49;PP=1701;SC=GCCTTGGCCATTCACTCCACG;SOR=2.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=12;TCR=49;TR=61;WE=54691233;WS=54691215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	54694334	rs16985457	G	C	1132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=26;PP=881;SC=TGGACGGCGGGTGTCCAGGGG;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=54694342;WS=54694324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	54695163	rs593073	T	C	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	54697079	rs7595	C	T	1418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=12;PP=1106;SC=GCTGGGCCCCCGAGGACACCA;SOR=2.059;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=29;TCR=12;TR=41;WE=54697087;WS=54697069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	54697602	rs36622	G	A	2615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=12;NR=65;PP=2078;SC=GGCCTGGAGGGGGGGGACTGA;SOR=3.202;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=12;TCR=65;TR=77;WE=54697610;WS=54697592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	54705317	rs158366	C	G	2554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=58;PP=2138;SC=TGTGCCAGTACGTGGGACTAC;SOR=2.494;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=17;TCR=58;TR=75;WE=54705325;WS=54705307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr19	54705340	rs2304524	C	G	2056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=44;PP=1777;SC=TTGTCCACCCCCTTCTCCCCA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=64;WE=54705348;WS=54705330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	54705588	rs17305304	A	G	3090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=72;PP=2465;SC=GATAAATGGAACCAGCCTTCT;SOR=2.882;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=18;TCR=72;TR=90;WE=54705596;WS=54705578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr19	54705619	rs36614	A	G	1755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=46;PP=1455;SC=GGCACTTGTGAAGTAGGAAAA;SOR=4.215;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=5;TCR=46;TR=51;WE=54705627;WS=54705609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr19	54705641	rs17305311	T	C	1551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=45;PP=1351;SC=TGTATCTGGATCAGTCTTTGC;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=45;WE=54705649;WS=54705631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	54711258	rs2304523	T	G	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=17;PP=1027;SC=CCTTGTCGCTTCTTCCAGGGT;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=24;TCR=17;TR=41;WE=54711266;WS=54711248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	54723355	rs255774	A	G	4790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.98;NF=8;NR=132;PP=2965;SC=CGGGAGTCTGACCTGCAGCCC;SOR=5.450;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=8;TCR=132;TR=140;WE=54723363;WS=54723345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr19	54723738	rs255772	G	C	3722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.51;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=32;PP=2965;SC=CCTCACTCACGATTCTGAGGG;SOR=1.991;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=32;TCR=32;TR=64;WE=54723746;WS=54723728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr19	54723813	rs8101337	G	C	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.68;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=49;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=7;PP=616;SC=GGAGGTGAAGGCTGGGGCTGT;SOR=1.508;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=54723821;WS=54723803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	54723822	rs2885369	GT	AC	282.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.83;QD=70.70;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	54723829	rs4023903	C	T	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=35.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	54723995	rs378867	G	C	178.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=7;SC=TGGGGGAGGCGGCGCTCCCCA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WS=54723985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	54724006	rs4806726	C	A	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=27.51;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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chr19	54726816	rs80332440	A	T	1588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.11;QD=31.15;SOR=1.201;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
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chr19	54726839	rs141453251	C	T	2173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.07;QD=44.36;SOR=2.256;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
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chr19	54726861	rs114813697	C	T	1579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=71;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=51;PP=2189;SC=CGTCTCCTCCCGGTGACCCCG;SOR=2.540;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=82;TCF=31;TCR=51;TR=82;WE=54726880;WS=54726851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	54726872	rs140228691	C	G	1214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.95;QD=31.15;SOR=2.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
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chr19	54743758	rs7246746	C	A	2538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=70;PP=2201;SC=GCGCTCCCCACGAGGCCTCAG;SOR=7.195;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=5;TCR=70;TR=75;WE=54743766;WS=54743748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	54743865	.	C	T	517.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.701;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;MQRankSum=0.000;QD=28.77;ReadPosRankSum=-0.742;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr19	54744356	.	AAATAACCCCGTG	A	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.99;MQRankSum=-1.383;QD=10.43;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr19	54744373	.	A	C	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.99;MQRankSum=-1.383;QD=12.44;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr19	54745550	rs71257443	G	T	37.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=18.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr19	54745978	rs1052964	T	C	194.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.08;QD=27.83;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	54745989	rs1052963	G	C	113.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.90;QD=28.26;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	54746081	rs28445220	T	C	1747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=4.011;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.84;MQRankSum=-1.770;QD=25.70;ReadPosRankSum=-0.422;SOR=0.982;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,67:0.99:68
chr19	54754752	rs433291	T	C	1428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=32;PP=1159;SC=TCAAGCTGTGTAGCTGGGCGT;SOR=2.356;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=10;TCR=32;TR=42;WE=54754760;WS=54754742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	54754820	rs429425	T	G	692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=16;PP=534;SC=GAGTGAGAGGTAAGGAACGTG;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=54754828;WS=54754810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	54755911	rs12977057	C	T	1389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=47;NR=9;PP=1283;SC=AGGGGCGGGGCCTCACCCGAG;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=47;TCR=9;TR=56;WE=54755931;WS=54755901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	54755922	rs12977062	CA	TG	2905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=13;PP=1409;SC=CTCACCCGAGCATCCATCTCC;SOR=2.483;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=54;TCR=16;TR=58;WE=54755931;WS=54755901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	54755994	rs417523	G	A	3576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=53;PP=2634;SC=CAAGGGGTTCGTCTCCTGGGA;SOR=0.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=56;TCR=53;TR=109;WE=54756002;WS=54755984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr19	54756024	rs405443	A	C	3268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=55;PP=2407;SC=GAGACTTCTCAGTCCTGCCAG;SOR=0.931;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=46;TCR=55;TR=101;WE=54756032;WS=54756014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr19	54756302	rs415860	A	G	1881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=27;PP=1406;SC=GGGCAGTGAGAGGGCTGTGCG;SOR=0.725;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=29;TCR=27;TR=56;WE=54756310;WS=54756292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	54756657	rs434755	C	T	5124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=114;NR=42;PP=2965;SC=TGACTTTCCTCTGTGTTTGGT;SOR=1.959;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=156;TCF=114;TCR=42;TR=156;WE=54756665;WS=54756647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr19	54759361	rs12975366	T	C	8322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=138;PP=2965;SC=ATAGCCGACATCAGAGCGACA;SOR=0.839;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=263;TCF=125;TCR=138;TR=263;WE=54759369;WS=54759351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,262:1.00:262
chr19	54802340	.	T	TC	729.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=902;SC=TCTCTGAGTCTCCCCTCCCCG;SOR=4.977;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=23;WE=54802348;WS=54802330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	54876324	rs3745441	T	C	3090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=29;PP=2423;SC=GAGCAGGGAATTTTCCAGACC;SOR=1.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=65;TCR=29;TR=93;WE=54876332;WS=54876314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr19	54940303	rs3745428	T	A	888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=0;PP=768;SC=CCAGATGTCCTGCTGGACATC;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=54940311;WS=54940297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	54962374	rs1035450	A	G	1513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=10;PP=1248;SC=TTTTCTGCCCAGCTTCTCTTG;SOR=2.876;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=43;TCR=10;TR=53;WE=54962382;WS=54962364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	54962467	rs1035451	G	A	3466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=44;PP=2773;SC=TTTCTCATAGGCAGTGAAAAA;SOR=1.138;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=109;TCF=64;TCR=45;TR=108;WE=54962475;WS=54962457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr19	54962579	rs1035452	C	T	2222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=55;PP=1757;SC=GCGAGAGGGACGGAGGCCAGT;SOR=2.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=15;TCR=55;TR=70;WE=54962587;WS=54962569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr19	54963813	rs3841263	CCT	C	5007.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=14;PP=2969;SC=GGCACATGTGCCTCTCTGCTT;SOR=3.481;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=85;TCR=15;TR=95;WE=54963822;WS=54963803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr19	54964019	rs963352	C	T	2243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=65;PP=1886;SC=GGGATGGGGCCGGGTGGTGGA;SOR=7.024;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=66;TCF=1;TCR=65;TR=66;WE=54964027;WS=54964009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	54965527	rs7247170	C	T	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=363;SC=CTGTGACCACCGCGTCCTCAC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=54965535;WS=54965521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	54965860	rs3813148	G	A	6518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=119;PP=2965;SC=ACCGCATGAAGCGTAAGTTGG;SOR=0.951;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=214;TCF=95;TCR=119;TR=214;WE=54965868;WS=54965850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr19	54965889	rs3813147	G	C	4130.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=113;PP=2965;SC=CGTGGAGGTCGGAGCGGTTGG;SOR=2.521;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=34;TCR=113;TR=147;WE=54965897;WS=54965879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr19	54965907	rs3813146	C	T	3652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=91;PP=2965;SC=TGGGCCCTCACAAGAGCTCCT;SOR=2.854;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=23;TCR=91;TR=114;WE=54965915;WS=54965897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr19	54966579	rs889147	C	G	2886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=58;PP=2259;SC=CTGGGAAGCCCGATGACTGGC;SOR=1.609;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=90;TCF=31;TCR=59;TR=89;WE=54966587;WS=54966569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr19	54967803	rs76543489	A	G	2133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=29;PP=1658;SC=ACTGCCCCTCATCCCTTCCTA;SOR=1.209;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=74;TCF=45;TCR=29;TR=73;WE=54967811;WS=54967793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	54971229	rs3745437	T	C	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=4;PP=1330;SC=CACCTTCCCCTCAAGGAGGCT;SOR=4.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=47;WE=54971237;WS=54971219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	54973280	rs10423424	C	G	4100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=78;PP=2965;SC=TCACTCCAGGCGGATCTCAGC;SOR=1.144;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=54;TCR=78;TR=132;WE=54973288;WS=54973270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr19	54973988	rs140013148	GCCT	G	4844.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=68;PP=2974;SC=TGGCTTCAGTGCCTCCTCAGT;SOR=1.743;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=103;TCF=30;TCR=73;TR=95;WE=54973998;WS=54973978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr19	54974318	rs10406453	T	C	4898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=91;NR=62;PP=2965;SC=AAGGCGGCCATGGAAGCGGAA;SOR=1.130;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=91;TCR=62;TR=153;WE=54974326;WS=54974308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr19	54974774	rs1981829	A	T	424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=3;NR=10;PP=343;SC=GCGGCTCCCCATGGATGCACC;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=3;TCR=10;TR=13;WE=54974782;WS=54974764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	55009497	rs3865495	A	C	1739.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.63;QD=30.52;SOR=2.604;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	55044228	rs10553990	TTC	T	4967.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=45;PP=2974;SC=CAAGCTATTTTTCTCTCTCCT;SOR=1.027;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=117;TCF=59;TCR=58;TR=102;WE=55044249;WS=55044212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr19	55044241	rs74177858	C	CT	1389.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=10.018;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.84;MQRankSum=-1.092;QD=17.59;ReadPosRankSum=-3.462;SOR=0.787;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:11,68:0.86:79
chr19	55048270	rs17606836	C	T	3407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=71;PP=2712;ReadPosRankSum=-0.776;SC=TCCAGGCCAACTTTTCTGTGG;SOR=0.655;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=109;TCF=37;TCR=72;TR=108;WE=55048278;WS=55048260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,112:0.99:113
chr19	55049066	.	G	A	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.86;QD=29.17;SOR=6.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	55049088	rs143540272	A	AAAAGAAAGAAAG	3597.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.79;QD=58.98;SOR=4.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	55049332	rs62131630	G	C	1561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=52;PP=1244;ReadPosRankSum=1.803;SC=CCATGACCCTGGGCTAGGCAG;SOR=4.479;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=55;TCF=2;TCR=53;TR=54;WE=55049340;WS=55049322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,57:0.98:58
chr19	55086106	rs45497601	C	G	2459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=33;PP=2012;SC=AGGGGGTCGGCTCTCAGGGGC;SOR=0.836;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=71;TCF=38;TCR=33;TR=70;WE=55086114;WS=55086096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	55175009	rs11540761	G	T	1351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=21;PP=941;SC=TGGGCCCCAGGACCCACATGC;SOR=0.735;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=23;TCR=21;TR=44;WE=55175017;WS=55174999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	55175596	rs3050015	T	TGTGGGAG	5449.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=55;NR=19;PP=2343;SC=CTGGGGATGATGTGGGAGCCC;SOR=1.751;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=123;TCF=87;TCR=36;TR=74;WE=55175606;WS=55175586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr19	55175740	rs3745871	C	T	7723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=139;PP=2965;SC=TGGACACTTTCCTTCTGATCA;SOR=1.087;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=236;TCF=97;TCR=139;TR=234;WE=55175748;WS=55175730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr19	55176262	rs731170	A	G	4594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=53;PP=2965;SC=TCCTTGGAGGATCCCAGGCCC;SOR=1.314;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=147;TCF=94;TCR=53;TR=146;WE=55176270;WS=55176252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr19	55176535	rs1925241	C	T	1605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=33;PP=1385;SC=CGAGCTGATGCGGGGAGCAGG;SOR=1.519;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=51;WE=55176543;WS=55176525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	55281355	.	T	C	2577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.872;ClippingRankSum=0.000;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.207;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.511;NF=52;NR=46;PP=1984;ReadPosRankSum=-0.110;SC=TGGAAAGCAATAGAGGGAGGG;SOR=0.551;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=143;TCF=71;TCR=72;TR=98;WE=55281363;WS=55281345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,98:0.69:143
chr19	55327891	rs150752618	A	G	603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.31;QD=28.75;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	55328023	rs149862889	C	A	2303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.26;QD=31.56;SOR=1.103;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	55328959	rs149236621	G	T	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.41;QD=31.67;SOR=0.836;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	55331419	rs143886704	C	T	2779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15;NR=90;PP=2701;SC=TACTCACACCCCCTATCAGTT;SOR=3.792;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=15;TCR=90;TR=105;WE=55331427;WS=55331409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	55333246	rs146719656	C	T	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=25.43;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr19	55340933	rs62124154	G	C	2139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=60;PP=1730;SC=AAGTCTCACGGGGCACAGGCC;SOR=3.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=13;TCR=60;TR=73;WE=55340941;WS=55340923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr19	55341753	rs12985492	A	G	8179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=214;PP=2965;SC=GGCCTTGAGGACGTCTTCTAG;SOR=3.484;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=252;TCF=38;TCR=214;TR=252;WE=55341761;WS=55341743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,243:1.00:243
chr19	55344340	.	A	ATGGGCCTGGAGTGGAGATC	1004.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=17;PP=1361;SC=AGGTGGAGTTATGGGCCTGGA;SOR=4.294;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=47;TCF=3;TCR=44;TR=18;WE=55344348;WS=55344330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr19	55344382	rs12151085	A	G	488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=58;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=56.52;NF=1;NR=14;PP=411;SC=TGGAGTGATGAGCCTAGAAGT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=55344390;WS=55344372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	55346409	rs4806584	T	A	1908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=7;PP=1661;SC=GCAGGTAGGCTCTGATGGTGA;SOR=3.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=52;TCR=7;TR=59;WE=55346417;WS=55346399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	55349031	rs58731871	G	A	1316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=3;PP=1153;SC=CTCTTCCTAGGAGTCCACAGA;SOR=4.461;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=35;TCR=3;TR=38;WE=55349039;WS=55349021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	55349273	rs1130492	C	A	3798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=35;NR=82;PP=2965;SC=CGGTTCTGTTCCTCACTCCCC;SOR=1.817;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=35;TCR=82;TR=117;WE=55349281;WS=55349263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr19	55396613	rs10402324	G	A	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=1;PP=853;SC=TCCCCATGGCGAGCCACCTCA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=55396621;WS=55396603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	55396900	rs1865096	A	G	2888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=70;PP=2349;SC=GGCACTACAGATTCCGGTACA;SOR=3.019;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=16;TCR=70;TR=86;WE=55396908;WS=55396890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	55399572	.	T	C	4194.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.344;ClippingRankSum=0.000;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.791;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=62;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.720;SC=GACCTCAATGTCTCAGGGATC;SOR=0.679;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=74;TCR=64;TR=135;WE=55399580;WS=55399562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,138:0.97:143
chr19	55401170	rs16986050	A	G	1498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=33;PP=1211;SC=ACCGAGCTGGAGCCAACAGAT;SOR=1.659;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=47;WE=55401178;WS=55401160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr19	55438940	.	AAAAC	A	4279.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.33;QD=43.23;SOR=3.375;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr19	55439166	rs269933	T	C	1687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=44;PP=1394;SC=AACATGGAAATCCACGCATTC;SOR=4.935;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=47;WE=55439174;WS=55439156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	55439197	rs269934	A	C	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=26;PP=644;SC=TAGTGGCTCAAGCGTGTAATC;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=55439205;WS=55439187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	55441769	rs269949	G	A	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=2;PP=345;SC=GACCGAAGCCGCAGTGAGCCG;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=15;TCF=13;TCR=2;TR=14;WE=55441777;WS=55441759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	55441902	rs269950	T	C	2774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=30;PP=1964;SC=GATTCTCTAATGCCTGACAGA;SOR=1.585;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=61;TCR=30;TR=91;WE=55441910;WS=55441892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	55441995	rs269951	A	G	2453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=52;PP=1953;SC=CCTCTGAGAGATATCTACAGC;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=23;TCR=52;TR=75;WE=55442003;WS=55441985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	55445174	rs269957	T	C	2665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=77;PP=2104;SC=TGCTCAGTGATGTCCACATGC;SOR=3.118;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=16;TCR=77;TR=93;WE=55445182;WS=55445164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr19	55587648	rs372742476	TG	T	1578.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=9;PP=1187;SC=GAGGAGGGGCTGGGGGCCTGG;SOR=2.179;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=33;WE=55587676;WS=55587638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	55587658	rs62124197	G	A	1892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.45;QD=47.32;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr19	55587668	rs61448344	C	T	1923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.66;QD=41.82;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	55587822	rs12609976	G	A	4313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=54;NR=90;PP=2965;SC=CATGAGCACCGCCACAGGGTA;SOR=1.410;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=54;TCR=91;TR=144;WE=55587830;WS=55587812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr19	55589591	rs10412296	T	C	1147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.123;NF=1;NR=37;PP=1049;ReadPosRankSum=-0.050;SC=GGGCTGGGGGTCTGGACTCCT;SOR=4.294;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=38;WE=55589599;WS=55589581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,34:0.97:35
chr19	55589627	rs374973895	GT	G	451.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=4.803;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.18;MQRankSum=0.235;QD=26.57;ReadPosRankSum=-1.437;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,14:0.82:17
chr19	55589629	.	CTGGACTCCTGGGTCAGAGGGAAGAGGGGCTGGGGGG	C	442.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.064;ClippingRankSum=0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=6.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.39;MQRankSum=0.153;QD=22.14;ReadPosRankSum=-1.433;SOR=2.925;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr19	55591392	rs56378581	C	T	2196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=13;PP=1712;SC=TCCCTAACCCCCTAACCGCCT;SOR=2.704;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=55;TCR=13;TR=68;WE=55591400;WS=55591382;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	55593417	rs17700138	C	T	5305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=90;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.766;SC=CTGCCTGGTGCTGGCCCCGCG;SOR=0.286;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=74;TCR=91;TR=164;WE=55593425;WS=55593407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,168:0.99:169
chr19	55594996	rs1628576	C	G	3705.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=59;PP=2965;SC=AAGCGCCCCCCAGGTCGCTGT;SOR=0.759;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=61;TCR=59;TR=120;WE=55595004;WS=55594986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr19	55598724	rs1054940	A	G	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=6;PP=939;SC=TCGCTGCAGAAGGAGGAGCTG;SOR=2.584;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=55598732;WS=55598714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr19	55603388	rs10410929	T	C	2361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=68;PP=2047;SC=CCACAAGCCCTTCCCCCACGG;SOR=5.699;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=71;TCF=3;TCR=68;TR=71;WE=55603396;WS=55603378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr19	55605704	rs3803899	AC	CT	4421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=11;PP=2947;SC=ACCCCAGCCCACCCCACACCT;SOR=3.375;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=96;TCF=82;TCR=14;TR=88;WE=55605713;WS=55605694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr19	55610066	rs55805974	CG	C	1944.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=7;PP=1547;SC=TGTCAGAAGTCGGGGGGGTTC;SOR=3.511;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=68;TCF=58;TCR=10;TR=56;WE=55610074;WS=55610056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr19	55623806	rs604216	C	T	590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=4;PP=459;SC=AGGTGTCCCCCACCCCACACA;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=55623814;WS=55623796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	55624223	rs56367991	G	A	1443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=35;PP=1237;SC=CCAGCAAGTCGGGACTCCAGA;SOR=3.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=42;WE=55624231;WS=55624213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	55644325	rs890868	A	C	4019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=77;PP=2965;SC=CTGCCCCCTTACGGCTGTAGA;SOR=1.342;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=42;TCR=77;TR=119;WE=55644333;WS=55644315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr19	55649219	.	C	G	2153	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=68;NR=9;PP=2153;QD=28.41261315;SC=CCTCCTCCCTCAGACCCAGGA;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=68;TCR=9;TR=77;WE=55649227;WS=55649218;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	55652475	rs148264676	C	T	4722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=123;NR=25;PP=2965;SC=AGGAGGAAAACTATTATCTGC;SOR=3.010;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=149;TCF=124;TCR=25;TR=148;WE=55652483;WS=55652465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr19	55658088	rs11669534	G	A	945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=10;PP=683;SC=GGAGATGGGGGCACAGAAGAG;SOR=1.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=34;WE=55658096;WS=55658078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	55660537	rs9636153	T	C	6223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=129;PP=2965;SC=ACCTAGGCTGTGTCTGAGATG;SOR=1.272;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=206;TCF=77;TCR=129;TR=206;WE=55660545;WS=55660527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,214:1.00:214
chr19	55665584	rs7252610	A	C	1561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=29;PP=1251;SC=TCTGGGGGCAAACGAGGGGGT;SOR=1.345;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=16;TCR=29;TR=45;WE=55665592;WS=55665574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	55667647	rs3729711	C	A	2515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=68;PP=2089;SC=TCTCTCCGCGCCGCTCCTCCG;SOR=3.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=10;TCR=68;TR=78;WE=55667655;WS=55667637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	55671337	rs890872	C	T	1775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=30;PP=1500;SC=TGAGCAGAATCGAGCGGCAGG;SOR=0.922;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=24;TCR=30;TR=54;WE=55671345;WS=55671327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	55699454	rs890870	T	C	3328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=22;PP=2399;SC=ACCTGGTACTTGTCTGCAAAA;SOR=2.465;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=78;TCR=22;TR=100;WE=55699462;WS=55699444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr19	55708557	rs2288521	A	G	6950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=88;PP=2965;SC=AAATTGTACAACGTCCCGGGT;SOR=1.063;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=123;TCR=88;TR=211;WE=55708565;WS=55708547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr19	55708573	rs2288520	G	A	6917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.512;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=102;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.110;SC=CGGGTTCCAGGGCCTCCACTT;SOR=0.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=222;TCF=118;TCR=104;TR=219;WE=55708581;WS=55708563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,226:0.99:228
chr19	55709928	rs2288519	C	T	784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=3;PP=568;SC=TACTCTTCATCTCCCAAGGAG;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=21;WE=55709936;WS=55709918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	55711543	rs17700265	G	A	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=0;PP=577;SC=GAGGTGCCACGCCGCTCCTGC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=55711551;WS=55711533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	55713385	rs73066689	A	G	4447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.94;NF=93;NR=47;PP=2965;SC=CTGTCCCTTAAACAAATAAGA;SOR=1.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=140;TCF=93;TCR=47;TR=140;WE=55713393;WS=55713375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr19	55713535	rs2288515	G	A	4711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=66;PP=2965;SC=ATGTTGGTGTGTGCTGTGCTT;SOR=0.927;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=145;TCF=79;TCR=66;TR=145;WE=55713543;WS=55713525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr19	55715309	rs45535035	C	T	7082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.39;ReadPosRankSum=-0.092;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,237:0.98:241
chr19	55715319	rs9304763	C	G	10123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=43.64;ReadPosRankSum=-0.906;SOR=0.272;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,231:1.00:232
chr19	55738425	rs3745919	G	A	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.42;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	55738634	rs4644955	T	C	1495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=18;PP=1118;SC=GATCACCAGGTGGGCATGGGG;SOR=1.270;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=49;WE=55738642;WS=55738624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	55738746	rs4374298	G	A	2819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=29;PP=2325;SC=CCGCGCCACAGCATGGCCATC;SOR=1.504;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=56;TCR=29;TR=85;WE=55738754;WS=55738736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr19	55739515	rs4255895	T	C	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=81;SC=CTGGGGCCTCTCTCACACGGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=55739523;WS=55739505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	55739605	rs4606850	C	T	1583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=6;PP=1302;SC=CCCCCACAGCCGAGCACACAA;SOR=3.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=43;TCR=6;TR=49;WE=55739613;WS=55739595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr19	55739813	rs10419308	G	A	3598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=81;PP=2748;SC=GCGCTTTGGGGAGTGGGGAGC;SOR=1.911;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=32;TCR=81;TR=113;WE=55739821;WS=55739803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr19	55741961	rs28678477	G	C	2023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.771;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=43;PP=1625;ReadPosRankSum=-0.679;SC=TACCCAGCCCGAGGCTGCAGC;SOR=1.489;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=64;TCF=21;TCR=43;TR=63;WE=55741969;WS=55741951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,65:0.98:66
chr19	55751123	rs8104509	G	A	1802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=21;PP=1429;SC=TATCGGTGGCGGTGGGAGGCT;SOR=1.238;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=58;TCF=36;TCR=22;TR=57;WE=55751131;WS=55751113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	55756980	rs3745920	A	G	1468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=39;PP=1128;SC=GGGACTCATCAGCACCCAGGG;SOR=4.758;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=42;WE=55756988;WS=55756970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	55758628	rs7258327	C	T	1938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=50;PP=1536;SC=GGCCCCGCCCCGGGACTGCCC;SOR=3.841;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=7;TCR=50;TR=57;WE=55758636;WS=55758618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	55776823	rs67351527	G	A	3866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=53;NR=104;PP=2965;SC=CAACCCTATCGCCCGCCCCGT;SOR=1.506;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=169;TCF=53;TCR=116;TR=157;WE=55776831;WS=55776813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr19	55777143	rs62126349	T	C	2735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=19;PP=2255;SC=CCTTCCTCTCTACGGGAAGGT;SOR=2.387;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=65;TCR=19;TR=84;WE=55777151;WS=55777133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	55800789	rs62126358	C	G	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=3;PP=1218;SC=AGTGGGAGACCAGGCCCTTTG;SOR=5.136;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=50;TCR=3;TR=53;WE=55800797;WS=55800779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	55854313	rs2384685	G	A	1726.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=44;PP=1405;SC=GCCAACCGGGGAAAAGCGAGG;SOR=4.575;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=48;WE=55854321;WS=55854303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	55857777	rs45480394	G	T	5624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=59;NR=106;PP=2965;SC=GCCCAGAAACGCACCCTCGGG;SOR=1.447;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=166;TCF=60;TCR=106;TR=165;WE=55857785;WS=55857767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr19	55869892	rs28420516	C	T	7365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=85;NR=82;PP=2965;SC=TCCTTCATCTCGCCCCATGGC;SOR=0.717;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=167;TCF=85;TCR=82;TR=167;WE=55869911;WS=55869882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr19	55869903	rs28712579	T	C	7184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=81;PP=2965;SC=GCCCCATGGCTGCTCCTTCAT;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=83;TCR=81;TR=164;WE=55869911;WS=55869882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr19	55870104	rs12974819	G	C	8461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=168;NR=113;PP=2965;SC=GGATTTCGAGGGCTGCTCTTT;SOR=1.163;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=282;TCF=169;TCR=113;TR=281;WE=55870112;WS=55870094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,286:1.00:286
chr19	55870600	rs12460416	C	G	6773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=148;PP=2965;SC=ATCTGGTATTCGGTAGGTGAG;SOR=1.833;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=212;TCF=64;TCR=148;TR=212;WE=55870608;WS=55870590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr19	55871019	rs12609732	A	G	3808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=55;PP=2965;SC=AGATGTGACAAGGCCAGATGG;SOR=0.781;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=63;TCR=55;TR=117;WE=55871027;WS=55871009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr19	55872397	rs2124918	A	G	4137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=86;PP=2965;SC=TCCTGACGTCAGCATGCTCCA;SOR=1.476;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=50;TCR=86;TR=135;WE=55872405;WS=55872387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr19	55872566	rs2124919	A	G	1861.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=36;PP=1524;SC=GTCTCTGAGCAGCCACCGTCT;SOR=1.430;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=58;TCF=21;TCR=37;TR=57;WE=55872574;WS=55872556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr19	55872955	rs11673554	G	C	654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=17;PP=577;SC=CCGCTCCTCCGTCAGACCCAG;SOR=2.584;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=55872963;WS=55872945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	55873674	.	G	A	3448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=0.000;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=41;PP=2727;ReadPosRankSum=1.695;SC=GGCCGTGCGCGTGGTCCTGGG;SOR=0.557;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=117;TCF=76;TCR=41;TR=116;WE=55873682;WS=55873664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,118:0.99:119
chr19	55888503	rs146943389	C	CG	807.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=27;PP=787;SC=TGAGGGAGGACGGGGGGGTCT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=27;WE=55888511;WS=55888493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	55895588	rs1870074	G	A	314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=229;SC=GCACCCGGCGGGCTCCCCTGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=55895596;WS=55895578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	55899602	rs56312243	C	T	1288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=34;PP=1059;SC=TCTGCTCCCCCGCCCCCAGGC;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=41;WE=55899610;WS=55899592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	55902941	rs45448592	G	A	1488.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=5;PP=1214;SC=GCATCTACTGGGTCAGGGCTC;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=45;WE=55902949;WS=55902931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	55903158	rs10653185	C	CAG	1222.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=1309;SC=CAGATGGACTCATGATCACAG;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=55903166;WS=55903148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	55912946	rs61748180	T	G	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.37;QD=33.06;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	55913038	rs7608	C	T	1825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.98;QD=33.20;SOR=3.952;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	55913286	rs11393810	T	TC	781.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=816;SC=TCATCTTTGCTCCTGTCTCCC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=20;WE=55913294;WS=55913276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	55966346	rs2277959	C	T	3974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=77;NR=57;PP=2965;SC=GGCGGCCAGGCGGGCATTACC;SOR=1.078;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=78;TCR=57;TR=134;WE=55966354;WS=55966336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr19	55993260	rs34864744	A	G	1089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.692;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=59.95;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=30;PP=822;ReadPosRankSum=-0.896;SC=CGCCCCGGGTACCGCCTCCGC;SOR=3.780;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=34;WE=55993268;WS=55993250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chr19	55993790	rs7254184	A	G	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=13;PP=382;SC=GCCACGTGGAAGAGGCCGCGG;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=19;WE=55993798;WS=55993780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	55993876	rs10423355	T	C	369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=3;PP=310;SC=GCCGCCCCCGTCCCGCCGCCA;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=55993884;WS=55993866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	55996939	rs3745450	G	A	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=2;PP=775;SC=GTCCTGATCTGGGAAGTGCCG;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=28;WE=55996947;WS=55996929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr19	55998262	rs77664073	C	T	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=16;NR=13;PP=579;SC=GGCTACCAGGCCGAGGGGGGC;SOR=0.997;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=16;TCR=13;TR=29;WE=55998270;WS=55998252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	55999993	rs4405662	A	G	2711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=58;PP=2092;SC=TGAGTGATCCATTCTCCTTGG;SOR=1.240;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=37;TCR=59;TR=95;WE=56000001;WS=55999983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr19	56000429	.	GC	G	144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQ=60.83;NF=0;NR=7;PP=103;SC=CCATCTGCCCGCCCCCCCCCC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=7;WE=56000437;WS=56000419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	56000896	rs62130160	G	T	1825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=29;PP=1569;SC=CCTTCTTCGGGGAGGGGGCAG;SOR=0.728;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=29;TCR=29;TR=58;WE=56000904;WS=56000886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	56001419	rs10716127	CG	C	317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=6.990;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=9;PP=429;ReadPosRankSum=0.524;SC=CTGCCCCCCCCGAGGGGAGAG;SOR=3.020;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=56001427;WS=56001409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,9:0.90:10
chr19	56001871	rs4274529	C	T	790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=20;PP=609;SC=TCTCCTTAGCCGGGGCCCTGG;SOR=3.528;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=56001879;WS=56001861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	56024519	rs671542	T	C	1308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=34;PP=986;SC=CCTCCAACTCTGAGAGTCCAT;SOR=2.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=42;WE=56024527;WS=56024509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	56024563	rs514574	G	C	858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=22;PP=703;SC=CTGGGGTGAGGAGACTGGGAC;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=56024571;WS=56024553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	56024599	rs671152	A	G	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=480;SC=GTAAAGAGACAGATTCCAGAC;SOR=3.056;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=56024607;WS=56024589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr19	56028918	rs77278103	C	T	9288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=114;NR=163;PP=2965;SC=ACGCCCTTACCCACCTTGCCC;SOR=1.139;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=279;TCF=114;TCR=165;TR=277;WE=56028926;WS=56028908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr19	56029465	rs4801331	G	A	1832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=30;PP=1436;SC=CCACCACGATGCCTCATCCCA;SOR=0.849;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=70;TCF=37;TCR=33;TR=67;WE=56029473;WS=56029455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	56029616	rs150781976	C	CCCA	10945.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=131;NR=53;PP=2973;SC=GACCCCTCACCCCACAACTCC;SOR=2.521;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=207;TCF=149;TCR=58;TR=184;WE=56029624;WS=56029606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,239:1.00:239
chr19	56040962	rs71830799	CAGAGAGG	C	2422.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=2;PP=2339;SC=ATGCAGCCTGCAGAGAGGAGA;SOR=3.990;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=58;TCF=51;TCR=7;TR=41;WE=56040976;WS=56040952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr19	56041046	rs59876483	GC	AA	6075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.23;MQRankSum=0.198;NF=70;NR=55;PP=2947;ReadPosRankSum=1.122;SC=AAAGCCGTTGGCCTTGGGGGC;SOR=0.333;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=133;TCF=73;TCR=60;TR=125;WE=56041055;WS=56041036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,138:0.99:139
chr19	56041255	rs620251	C	G	2082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=38;PP=1569;SC=TCGGCCGCGGCGGCCAGGCCG;SOR=1.230;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=25;TCR=38;TR=63;WE=56041263;WS=56041245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr19	56047448	rs310453	A	G	2896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=39;PP=2182;SC=CGGCCATAGCAACCCTGGCCC;SOR=1.157;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=59;TCR=39;TR=98;WE=56047456;WS=56047438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr19	56052337	rs55643341	A	AC	9763.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=181;PP=2966;SC=GCTCCCCAAAACCCAGGTCCC;SOR=1.569;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=267;TCF=69;TCR=198;TR=247;WE=56052345;WS=56052327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,293:1.00:293
chr19	56052665	rs55997334	A	G	2918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=38;PP=2351;SC=GTAGCAGGAGACAGAGCTCAG;SOR=0.809;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=45;TCR=38;TR=83;WE=56052673;WS=56052655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	56056184	rs491639	A	G	626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=7;PP=521;SC=GAGGCTGGGCAAGGAGCACGC;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=22;WE=56056192;WS=56056174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	56089219	rs1053817	C	T	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=3;PP=490;SC=GTGAAGGGGACGGGTGGGTAG;SOR=2.948;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=56089227;WS=56089210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	56089353	rs2292812	C	T	2995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=25;PP=2374;SC=GCAGGTGAGCCTTGCTGTCTA;SOR=2.160;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=69;TCR=25;TR=94;WE=56089361;WS=56089343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr19	56089908	rs113850871	C	CCCG	1249.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=7;PP=1193;SC=CTCCGTTCTGCCCTTCTCCCC;SOR=1.460;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=23;WE=56089916;WS=56089898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	56090493	rs12974617	A	C	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=18;PP=611;SC=GCCACGTCTCAGGCCACGCTG;SOR=1.382;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=8;TCR=18;TR=26;WE=56090501;WS=56090483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	56104136	rs7247236	T	C	2634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=48;PP=2095;SC=CGGGCGGCGGTCGCCGCCTCC;SOR=1.220;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=32;TCR=48;TR=80;WE=56104144;WS=56104126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr19	56104524	rs10403432	C	T	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=11;PP=535;SC=CGGCCCAGGCCTGCGCTGGGG;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=22;WE=56104532;WS=56104514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	56104560	rs10403462	C	G	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=13;PP=641;SC=GCAGGTCGTGCGTCAGCTTGT;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=26;TCF=13;TCR=13;TR=25;WE=56104568;WS=56104550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr19	56109344	rs79090458	C	T	390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=327;SC=GTTCCCAGACCCACCACCTGT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=56109352;WS=56109334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	56114237	rs310459	G	A	1732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=44;PP=1489;SC=GGGCCGAGGAGGAGGAGGAGA;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=8;TCR=44;TR=52;WE=56114245;WS=56114227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr19	56135983	rs117034576	T	C	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=23;PP=797;SC=GGGGTGGGGCTCGAACTGGCG;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=56135991;WS=56135973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	56156447	rs11084406	A	G	5821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=127;PP=2965;ReadPosRankSum=1.255;SC=ACTCTGGGGAACGCCCGTTTC;SOR=1.108;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=173;TCF=45;TCR=128;TR=172;WE=56156455;WS=56156437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,175:0.99:176
chr19	56160399	rs7246799	T	C	973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=1;PP=828;SC=CTGGGGTCCGTAGGAAGCCGC;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=28;WE=56160407;WS=56160389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	56162776	rs2287791	C	T	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=21;PP=1129;SC=AAGAAGGCAGCGCCAGTGAGA;SOR=0.693;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=20;TCR=21;TR=41;WE=56162784;WS=56162766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	56163704	rs73062531	C	T	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=7;PP=1164;SC=TCGCCGAGATCCTTTCTTCCC;SOR=3.003;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=34;TCR=7;TR=41;WE=56163712;WS=56163694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr19	56170771	rs537728	G	A	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=20;PP=704;SC=GTGTTGGCCGGCCTGTGGGTG;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=56170779;WS=56170761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr19	56171778	rs507498	A	C	1948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=10;PP=1764;SC=TGGAGCTTACATGGTTGCGGG;SOR=2.998;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=48;TCR=10;TR=58;WE=56171786;WS=56171768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	56175149	rs310444	G	A	1855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=46;PP=1483;SC=TTCTCCCCCAGTCCTGTTCCC;SOR=3.037;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=57;TCF=10;TCR=47;TR=56;WE=56175157;WS=56175139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr19	56180732	rs681804	T	C	2148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=44;NR=29;PP=1701;SC=TGGGGGGGCATGTGAGGGGCC;SOR=1.103;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=44;TCR=29;TR=73;WE=56180740;WS=56180722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
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chr19	56220504	rs73062405	T	C	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=34.44;SOR=6.091;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
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chr19	56223486	rs59900917	G	T	971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=25;PP=704;SC=GCTCCTGGGGGACGTATGTCT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=56223494;WS=56223476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	56228403	.	T	TC	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.525;ClippingRankSum=-0.000;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=0.275;QD=4.07;ReadPosRankSum=0.624;SOR=0.120;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
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chr19	56249445	rs755804	A	G	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=1;PP=593;SC=TCCTCGCCCCATCATCCAGCA;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=27;WE=56249453;WS=56249435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr19	56274162	.	T	A	63.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=4.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.80;MQRankSum=0.931;QD=2.66;ReadPosRankSum=0.674;SOR=1.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr19	56274424	rs150161449	C	A	1596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=106.702;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.20;MQRankSum=-5.936;QD=9.02;ReadPosRankSum=1.162;SOR=3.659;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:107,70:0.40:177
chr19	56274453	rs75239380	G	A	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=79.073;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.00;MQRankSum=-5.841;QD=7.28;ReadPosRankSum=1.000;SOR=5.879;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,47:0.30:155
chr19	56274460	rs200071964	A	G	2892.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FS=81.901;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.16;MQRankSum=5.635;QD=19.16;ReadPosRankSum=0.586;SOR=0.001;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,109:0.72:151
chr19	56274583	.	T	C	210.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.81;QD=30.11;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	56284428	rs150473927	C	A	504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.58;QD=31.55;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	56284457	rs78244980	G	A	1543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.80;QD=32.16;SOR=2.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	56284507	rs115250131	T	G	4426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.21;QD=44.71;SOR=0.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
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chr19	56284529	rs199519773	C	A	3208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.873;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=5.643;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.82;MQRankSum=-2.009;QD=41.67;ReadPosRankSum=1.216;SOR=2.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,76:0.99:77
chr19	56284535	rs144990325	A	G	2986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=3.899;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.77;MQRankSum=-2.755;QD=42.67;ReadPosRankSum=1.641;SOR=2.517;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,68:0.97:70
chr19	56284582	rs201888659	A	T	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=9.777;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.40;MQRankSum=-2.343;QD=29.20;ReadPosRankSum=-2.205;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,17:0.89:19
chr19	56284587	rs200252021	C	G	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.05;MQRankSum=-2.100;QD=49.72;ReadPosRankSum=-2.100;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
chr19	56307583	rs2616940	A	G	1704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=36;PP=1311;SC=CGATTTCTTCACATTCGCTGG;SOR=1.453;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=56;WE=56307591;WS=56307573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr19	56320304	.	CA	C	7983.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.865;ClippingRankSum=0.000;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.331;NF=107;NR=83;PP=2974;ReadPosRankSum=-0.450;SC=ATCGTCTTCACAAATTCTTCT;SOR=1.149;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=201;TCF=115;TCR=86;TR=190;WE=56320312;WS=56320293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,230:0.99:232
chr19	56329186	rs71182913	GA	G	77.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.99;MQRankSum=-1.776;QD=3.70;ReadPosRankSum=0.509;SOR=1.071;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr19	56372705	rs4801635	C	T	1579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=1;PP=1292;SC=ACAAGTGGCTCGTGTTGACCG;SOR=6.273;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=44;WE=56372713;WS=56372695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr19	56388262	rs16986758	C	T	602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=549;SC=CGGTGCCTATCCACATGAATG;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=56388270;WS=56388252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	56393051	rs302457	T	C	2667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=67;PP=2198;SC=AAATCATTGATACTCTGAGTT;SOR=3.401;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=12;TCR=67;TR=79;WE=56393059;WS=56393041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr19	56410340	rs302828	T	G	3137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=87;PP=2548;SC=GGGAAAGTAATTGCGTCCCGA;SOR=4.407;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=8;TCR=87;TR=95;WE=56410348;WS=56410330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr19	56413532	rs7258847	G	A	3614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=88;PP=2849;SC=CATCTGACAAGTGCTTGCAAG;SOR=2.854;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=20;TCR=88;TR=108;WE=56413540;WS=56413522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr19	56413583	rs302835	A	G	1673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=47;PP=1408;SC=TGCAGGGTGAAAGCCACAGAG;SOR=7.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=47;WE=56413591;WS=56413573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr19	56443864	rs145915426	T	TTTTTTG	451.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=589;SC=AGTACACTTTTTTGTTGTTGT;SOR=3.442;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=9;WE=56443872;WS=56443854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	56459342	rs306507	C	T	2522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=27;PP=2046;SC=TCTCATATTCCGCCCTGGACA;SOR=1.639;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=53;TCR=27;TR=80;WE=56459350;WS=56459332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr19	56459614	rs306506	G	C	5200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=83;PP=2965;SC=AATGTGTGTTGTAGTCCGCAG;SOR=0.934;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=69;TCR=83;TR=152;WE=56459622;WS=56459604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr19	56464058	rs306501	C	G	2157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=47;PP=1664;SC=CTAAGGCAAGCCAGATTTTAA;SOR=1.897;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=19;TCR=48;TR=66;WE=56464066;WS=56464048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	56473645	rs11671531	A	G	306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=275;SC=CTTTATGGAGATGGTCTGTTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=56473653;WS=56473635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	56477687	rs306497	A	G	3001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=63;PP=2402;SC=TGGAGTCCAAAGCTGTGAAGC;SOR=1.686;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=29;TCR=63;TR=92;WE=56477695;WS=56477677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr19	56477710	rs306496	T	C	2055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=58;PP=1555;SC=CTATGCAGGGTGCTGAGATCC;SOR=2.864;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=11;TCR=58;TR=69;WE=56477718;WS=56477700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr19	56487430	rs306483	G	A	1637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.61;QD=43.10;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	56487450	rs306482	T	G	1745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.62;QD=44.76;SOR=5.084;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr19	56487603	rs306481	A	G	4299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=69;PP=2965;SC=AATAGCCTGAAGGATGATGGG;SOR=0.723;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=135;TCF=66;TCR=69;TR=134;WE=56487611;WS=56487593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr19	56490778	rs306475	C	T	753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=5;PP=626;SC=ACTGCCTGTTCACCTCCATCT;SOR=2.400;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=23;WE=56490786;WS=56490768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	56499279	rs306457	G	C	3360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=7.417;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=92;PP=2485;ReadPosRankSum=-0.572;SC=TTAATCCTTAGGCCGTCCAGT;SOR=2.070;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=129;TCF=36;TCR=93;TR=126;WE=56499287;WS=56499269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,125:0.98:128
chr19	56499345	rs306455	A	G	1328.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=38;PP=1116;ReadPosRankSum=-0.917;SC=GGCAAATACCAGGCGTTATCA;SOR=3.816;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=41;WE=56499353;WS=56499335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr19	56511082	rs35427984	C	G	1955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=33;PP=1529;SC=CTTTCCATGGCGATGTTATCA;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=29;TCR=33;TR=62;WE=56511090;WS=56511072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr19	56511217	rs12462690	G	A	713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=18;PP=607;SC=CATGACACACGGATCGAATCC;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=56511225;WS=56511207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr19	56511233	rs12462663	C	T	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=502;SC=AATCCCCTGCCCTCGCTGCTG;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=56511241;WS=56511223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr19	56520091	rs12460573	C	T	1970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=9;PP=1580;SC=ACATTCTTATCCTTGGCTTGG;SOR=3.370;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=50;TCR=9;TR=59;WE=56520099;WS=56520081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	56520129	rs12460633	G	A	2444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=20;PP=1928;SC=ATTGAGGCCAGTCTCCCTTTT;SOR=2.012;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=53;TCR=20;TR=73;WE=56520137;WS=56520119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr19	56520150	rs12460592	C	G	2873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=31;PP=2262;SC=TCTTTGTCTTCCAGGACATTC;SOR=1.364;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=56;TCR=31;TR=87;WE=56520158;WS=56520140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	56530664	rs306428	A	G	4385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-1.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-1.570;NF=133;NR=24;PP=2965;ReadPosRankSum=0.106;SC=TCTCTGACTCAAATAATAAAC;SOR=2.263;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=158;TCF=134;TCR=24;TR=157;WE=56530672;WS=56530654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,156:0.99:157
chr19	56538203	rs3103612	C	A	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=391;SC=TGACCTCCCACAGTGCTGGGA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=56538211;WS=56538193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr19	56552230	rs2569425	A	G	1225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=1;PP=1043;SC=AAAGGAGGGAAAGATGGAACT;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=35;WE=56552238;WS=56552222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr19	56561749	rs2574762	A	G	174.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=1;PP=135;SC=GGGAATGAGCATCACGATCTT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=56561757;WS=56561739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr19	56564916	rs35553570	G	C	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=2;PP=588;SC=AGGAATAAAGGAAACTCCAGT;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=22;WE=56564924;WS=56564906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	56565164	rs3103057	G	A	1330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=29;PP=979;SC=CAGTGTTCTGGCGAGACTCGG;SOR=2.007;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=11;TCR=29;TR=40;WE=56565172;WS=56565154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr19	56569917	rs386875	G	A	403.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=306;SC=TGCCCACTACGTTCTGAGTAC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=56569925;WS=56569907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	56599405	rs4077285	C	G	87.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.76;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr19	56599437	rs5828672	CTCG	C	400.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=0;PP=372;SC=CGCCCGCGGCCTCGTCGTCGT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=56599447;WS=56599427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	56663256	rs502722	A	G	5178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.668;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.293;NF=55;NR=106;PP=2965;ReadPosRankSum=1.947;SC=TGGGGGCGCTACTGTGGATTG;SOR=1.397;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=163;TCF=57;TCR=106;TR=161;WE=56663264;WS=56663246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,166:0.99:167
chr19	56669758	rs679557	T	C	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=16;NR=7;PP=503;SC=TGTGGCTTCCTCCCAGCAGGG;SOR=1.802;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=24;TCF=16;TCR=8;TR=23;WE=56669766;WS=56669748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr19	56688570	rs16987029	G	A	3946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=76;NR=48;PP=2845;SC=ACCGGGTAACGCCTCCCTAAG;SOR=1.196;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=126;TCF=76;TCR=50;TR=124;WE=56688578;WS=56688560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr19	56688706	rs16987031	C	G	1787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=46;PP=1551;ReadPosRankSum=1.375;SC=AGAAATATTGCGTGTCTCTAC;SOR=2.056;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=8;TCR=47;TR=54;WE=56688714;WS=56688696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr19	56691912	rs274171	G	C	3094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=20;PP=2505;SC=CGCCTGCCCCGCTTTCTGTCT;SOR=2.478;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=71;TCR=20;TR=91;WE=56691920;WS=56691902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr19	56693643	rs274174	T	C	2212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=56;PP=1658;SC=GGGAGTTAGATGTCTTCTCCT;SOR=2.395;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=75;TCF=18;TCR=57;TR=74;WE=56693651;WS=56693633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	56696474	rs141760700	A	G	577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=3;PP=460;SC=GTTCAAGACCAGCCTGGCCAA;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=56696482;WS=56696464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
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chr19	56704399	rs61745809	G	A	3737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=89;PP=2965;SC=CTGACCCCATGAGAGTGTCCA;SOR=2.917;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=22;TCR=89;TR=111;WE=56704407;WS=56704389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr19	56901293	rs6509995	C	T	1327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=13;PP=1006;SC=CAGGGAAGATCTTCTAAGACA;SOR=1.455;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=27;TCR=13;TR=40;WE=56901301;WS=56901283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	56904509	rs11439847	T	TA	732.37	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=2.310;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.74;MQRankSum=0.839;QD=18.78;ReadPosRankSum=-0.168;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:5,34:0.87:39
chr19	56918560	rs4801159	T	A	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=14;PP=374;SC=GAACATTTTGTTTTTCTTCCA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=56918582;WS=56918550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	56918574	rs2288862	T	C	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=3;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=12;PP=343;SC=TCTTCCAAAATTCTGCAACCT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=56918582;WS=56918550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	56918598	rs2288863	T	C	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=61;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=269;SC=AAGGTTCCATTCATCCAGTGA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=56918606;WS=56918588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr19	56935527	rs3810340	A	G	5300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=137;NR=40;PP=2965;SC=GTGGGAAAGCATTTAGCTATA;SOR=2.494;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=177;TCF=137;TCR=40;TR=177;WE=56935535;WS=56935517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr19	56953585	rs3760849	T	C	5588.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=68;PP=2965;SC=ATTGAAGGCTTTTCCGCACTT;SOR=1.000;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=93;TCR=68;TR=161;WE=56953593;WS=56953575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr19	56953863	rs8107758	T	C	3592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=34;PP=2965;SC=GCTTCTCTCCTGTATGAATGT;SOR=1.674;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=70;TCR=34;TR=104;WE=56953871;WS=56953853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr19	57062073	rs379214	T	C	2771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=38;PP=2145;SC=TAGGAAACTTTACCCAGGGTC;SOR=0.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=45;TCR=38;TR=83;WE=57062081;WS=57062063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr19	57065189	rs145011	T	C	6052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=82;NR=111;PP=2965;SC=ACTATGTGTTTGGAAGGAAGC;SOR=1.059;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=193;TCF=82;TCR=111;TR=193;WE=57065197;WS=57065179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr19	57175578	rs12610410	C	T	4405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.97;NF=72;NR=67;PP=2965;SC=GGGCTTCTCGCCTGTGTGGAT;SOR=0.794;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=72;TCR=67;TR=139;WE=57175586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr19	57184136	rs10409943	C	G	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.22;QD=35.06;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	57184361	rs201168421	C	CT	1226.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=47.91;MQRankSum=-0.360;QD=26.10;ReadPosRankSum=0.812;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,46:0.98:47
chr19	57293394	rs2286751	A	G	2796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=44;PP=2220;SC=CACTAAGGGAACTAAGTTCCT;SOR=0.715;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=42;TCR=44;TR=86;WE=57293402;WS=57293384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	57335022	rs1860565	G	A	3914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=48;PP=2877;SC=TGTCGTCGTCGCTGGTCACGT;SOR=1.270;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=75;TCR=48;TR=123;WE=57335030;WS=57335012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr19	57335179	rs1860566	T	C	1718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=41;PP=1368;SC=CATTTCTGAGTTCAAAACCCT;SOR=3.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=47;WE=57335187;WS=57335169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	57641146	rs1027392	A	G	4813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=80;NR=58;PP=2965;SC=TTTTCTGGCAACATGCAGAAT;SOR=1.032;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=138;TCF=80;TCR=58;TR=138;WE=57641154;WS=57641136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr19	57642098	rs3764574	G	A	4218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=57;PP=2965;ReadPosRankSum=1.736;SC=TTCAAGAGGTGCCTCAACATC;SOR=0.302;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=129;TCF=72;TCR=57;TR=128;WE=57642106;WS=57642088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,138:0.99:139
chr19	57642782	rs9973206	C	A	1487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=41;PP=1267;SC=AGGGGGAATACGAAGGTGACT;SOR=5.283;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=43;WE=57642790;WS=57642772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	57646570	rs4801433	T	C	2680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=56;PP=2153;SC=TTATGTTGAATGAGGTTTTTC;SOR=1.508;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=29;TCR=56;TR=85;WE=57646578;WS=57646560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	57647015	rs7251328	A	G	6118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=86;PP=2965;ReadPosRankSum=2.082;SC=GCTTGTAGGCATTTCCACAGT;SOR=1.054;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=210;TCF=123;TCR=87;TR=207;WE=57647023;WS=57647005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,211:0.99:213
chr19	57647236	rs7252632	T	C	4634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=89;PP=2965;SC=GATGGATTATTGCCAACTAAT;SOR=1.065;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=61;TCR=89;TR=150;WE=57647244;WS=57647226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr19	57648277	rs4801200	A	T	2729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=18;PP=2170;SC=TCTTCCTCCAACCATGGCTCC;SOR=2.503;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=63;TCR=18;TR=81;WE=57648285;WS=57648267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr19	57648433	rs2370135	T	C	2310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=66;PP=1760;SC=CGTATGCTTGTGTGAATATTT;SOR=2.805;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=16;TCR=66;TR=82;WE=57648441;WS=57648423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr19	57649900	rs2370134	C	T	3012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=22;PP=2300;ReadPosRankSum=-0.712;SC=TTTCTCTGTTCGGGATTCAGC;SOR=0.997;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=86;TCF=63;TCR=23;TR=84;WE=57649908;WS=57649890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,92:0.99:93
chr19	57653864	rs11084488	T	C	737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=3;PP=692;SC=GTAGAGTGTGTGTTACCTTTT;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=26;WE=57653872;WS=57653854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr19	57654065	rs58537382	T	C	4443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=82;PP=2965;SC=TGAGGGAAAATGGAAAAGAAC;SOR=0.937;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=65;TCR=82;TR=147;WE=57654073;WS=57654055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr19	57654104	rs59976893	T	C	4680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=84;PP=2965;SC=GCTTTGGAAGTTGGGGATCAT;SOR=1.235;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=52;TCR=84;TR=136;WE=57654112;WS=57654094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr19	57654217	rs10426157	T	G	1472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.73;SOR=6.229;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	57665750	rs8108591	T	C	2139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=10;PP=1735;SC=GTCCAGTTGATATTATCAAGT;SOR=3.393;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=58;TCR=10;TR=67;WE=57665758;WS=57665740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr19	57666840	rs12459119	G	A	162.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=3;PP=54;SC=TTGAGACAGCGGTCTCTCTCA;SOR=2.303;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=57666848;WS=57666830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	57723007	rs2074858	G	C	6847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.76;SOR=0.706;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr19	57723013	rs917340	G	A	6876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.37;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr19	57742472	rs11084490	G	C	3422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=196;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=18;PP=2233;SC=CTGTGTAGCAGTGAGACATCA;SOR=2.942;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=98;TCF=80;TCR=18;TR=98;WE=57742480;WS=57742462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr19	57742489	rs58264281	C	T	5455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=18;PP=2100;SC=ATCAGTGAGGCTGCAGGACGA;SOR=2.093;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=94;TCF=73;TCR=21;TR=87;WE=57742522;WS=57742479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr19	57742493	rs142269286	AGGACGAGCAGGATT	A	5511.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=20;PP=2974;SC=GTGAGGCTGCAGGACGAGCAG;SOR=1.746;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=61;TCF=41;TCR=20;TR=56;WE=57742522;WS=57742479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr19	57742514	rs150998448	G	GC	4001.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=20;PP=2326;SC=GATTGGAAGCGCCCCGGCCAG;SOR=1.572;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=64;TCF=39;TCR=25;TR=55;WE=57742522;WS=57742479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr19	57743039	rs758098	T	C	1034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.38;SOR=6.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	57752326	rs8111661	C	G	1529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=38;PP=1211;SC=TGCTTTTCTGCTAGTTCGGGG;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=11;TCR=38;TR=49;WE=57752334;WS=57752316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	57760018	rs2014572	G	A	2175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=1;PP=1793;SC=CTAGAGCATGGGCAGGAGCCA;SOR=6.932;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=62;TCF=61;TCR=1;TR=62;WE=57760026;WS=57760008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr19	57760057	rs3746231	G	A	3856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=24;PP=2965;SC=CTCTCCCAAGGCACCTGTCCA;SOR=2.757;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=93;TCR=24;TR=117;WE=57760065;WS=57760047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr19	57760216	rs1019071	G	A	2208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=63;PP=1823;SC=TGGTTTCTCCGTCCTCCCAGC;SOR=5.166;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=4;TCR=63;TR=67;WE=57760224;WS=57760206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr19	57764770	rs10421632	G	A	4333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=67;PP=2965;SC=TAAAAATCCAGTTATTCAGGA;SOR=0.886;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=126;TCF=59;TCR=67;TR=126;WE=57764778;WS=57764760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr19	57765432	rs8100154	A	G	4258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=63;PP=2965;SC=CCTACCTCAAAAGGCACCAGC;SOR=0.740;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=128;TCF=65;TCR=63;TR=128;WE=57765440;WS=57765422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr19	57865082	rs862703	T	C	6931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=123;NR=77;PP=2965;SC=CAGCTGTACTTATCATGGCAG;SOR=1.289;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=201;TCF=124;TCR=77;TR=200;WE=57865090;WS=57865072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr19	57868336	rs862709	A	G	5792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=89;PP=2965;SC=TAAGTGCAACAAATGTGGGAA;SOR=0.747;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=176;TCF=87;TCR=89;TR=176;WE=57868344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr19	57890000	rs2361119	C	T	2762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=37;PP=2235;SC=GCCAAAATGACGAACAACACC;SOR=1.030;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=49;TCR=37;TR=86;WE=57890008;WS=57889990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr19	57909872	rs4801478	G	A	3694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=28;PP=2957;SC=AGAGGTTACAGCTTCAAAGCC;SOR=2.086;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=82;TCR=28;TR=110;WE=57909880;WS=57909862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr19	57922664	rs4801480	T	C	1243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=1;PP=1051;SC=TGAGGCTCGGTTGAATCGGTT;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=38;WE=57922672;WS=57922654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	57929213	rs377038890	CA	C	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.62;MQRankSum=0.830;QD=2.64;ReadPosRankSum=0.952;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr19	57954628	rs7249430	G	A	2587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=11;PP=2206;SC=CGGAGTTCACGTGCACTTCAC;SOR=3.528;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=68;TCR=11;TR=79;WE=57954636;WS=57954618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr19	57956828	rs7246856	T	G	3133.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=65;PP=2585;SC=AAACATCAGATAATTCATACT;SOR=2.154;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=24;TCR=65;TR=89;WE=57956836;WS=57956818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr19	57983457	rs10153521	A	G	2973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=15;PP=2512;SC=ACAGGTATGGAAATATTTCTG;SOR=2.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=68;TCR=15;TR=83;WE=57983465;WS=57983447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr19	57985460	rs2074059	T	A	2944.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=51;PP=2301;SC=GACATCTCCATTGATTGCACA;SOR=0.874;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=92;TCF=41;TCR=51;TR=91;WE=57985468;WS=57985450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr19	57985566	rs2074060	G	C	2069.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=31;PP=1672;SC=TTGCACTGAAGCAGAACTGTT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=32;TCR=31;TR=63;WE=57985574;WS=57985556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	57985851	rs35902786	C	T	2531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=41;PP=2047;SC=GGAAGCCTCACTACAAATATG;SOR=0.828;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=74;TCF=33;TCR=41;TR=73;WE=57985859;WS=57985841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	57985889	rs7257644	T	C	2185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=18;PP=1733;SC=ACCAAGGTCATAGGACTGTTG;SOR=2.035;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=45;TCR=18;TR=63;WE=57985897;WS=57985879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	57986184	rs2285607	G	A	4544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=59;PP=2965;SC=GAAACACTAAGTACAGGCCAA;SOR=0.980;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=76;TCR=59;TR=135;WE=57986192;WS=57986174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr19	57987895	rs2074065	C	T	1524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=5;PP=1123;SC=GTCCTCAGACCCAAGAGATCG;SOR=4.317;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=38;TCR=5;TR=43;WE=57987903;WS=57987885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
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chr19	58002964	rs8108040	G	C	2981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=55;PP=2773;SC=TGGCCTCTCTGGGTAAGGTTC;SOR=0.757;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=50;TCR=55;TR=105;WE=58002972;WS=58002954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
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chr19	58003580	rs2074071	A	G	6190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=122;NR=83;PP=2965;SC=ATACCGAGAGATAGTTGGTGG;SOR=1.306;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=205;TCF=122;TCR=83;TR=205;WE=58003588;WS=58003570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr19	58003613	rs2074072	C	T	6794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=112;PP=2965;SC=GAGGTGTGAACTCAGGGATGG;SOR=0.788;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=212;TCF=100;TCR=112;TR=212;WE=58003621;WS=58003603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,218:1.00:218
chr19	58003728	rs2074073	G	A	5917.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=99;NR=85;PP=2965;SC=CTATTCTGATGTTTGACCTAG;SOR=0.876;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=184;TCF=99;TCR=85;TR=184;WE=58003736;WS=58003718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr19	58003873	rs2074074	C	T	2490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=61;PP=1934;SC=TATTTGGTTGCAGTTGGTTTT;SOR=3.500;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=9;TCR=61;TR=70;WE=58003881;WS=58003863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr19	58004158	rs2074075	C	T	1887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=19;PP=1498;SC=TTAGACACATCTGTGAGAGTG;SOR=1.460;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=58;WE=58004166;WS=58004148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr19	58004346	rs2074076	G	C	1971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=24;PP=1510;SC=AAAAAGACAAGAGGGCAGGGT;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=33;TCR=24;TR=57;WE=58004354;WS=58004336;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	58004931	rs2074077	A	G	6030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=131;NR=50;PP=2965;SC=ACATCAGAGAATTCACACTGG;SOR=2.358;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=181;TCF=131;TCR=50;TR=181;WE=58004939;WS=58004921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr19	58038964	rs12461014	T	A	2104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=28;PP=1627;SC=GCGCTAGTGATTACGCCGCAG;SOR=0.886;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=63;TCF=35;TCR=28;TR=62;WE=58038972;WS=58038954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr19	58058739	rs10410631	T	C	2191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.257;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=33;PP=1767;ReadPosRankSum=-0.708;SC=CCTTTCGACATTGACTACACT;SOR=0.319;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=29;TCR=34;TR=62;WE=58058747;WS=58058729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,67:0.99:68
chr19	58071195	rs75946741	C	T	153.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=4;PP=105;SC=CAACACGCCCCACCACAAACG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=58071203;WS=58071185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr19	58084930	rs3746222	G	A	2881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=36;PP=2081;SC=GCAAAATGTCGGTCAGGAATG;SOR=0.829;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=43;TCR=36;TR=79;WE=58084938;WS=58084920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr19	58117223	rs2360543	T	A	2613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=34;PP=2113;SC=TTGAGCTCCATGCCTCACCCT;SOR=1.022;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=46;TCR=34;TR=80;WE=58117231;WS=58117213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr19	58118715	rs10715037	CT	C	1001.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=2.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.99;MQRankSum=2.344;QD=14.11;ReadPosRankSum=1.013;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,61:0.86:71
chr19	58125549	rs9676859	C	T	3545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=24;PP=2748;ReadPosRankSum=0.303;SC=GGCGGCGGCACTCTTAGGGGC;SOR=0.853;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=115;TCF=91;TCR=24;TR=113;WE=58125557;WS=58125539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,119:0.98:121
chr19	58455381	rs257652	C	T	6927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=119;NR=91;PP=2965;SC=GAAGACCCCACTCCTTCCAGG;SOR=0.938;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=210;TCF=119;TCR=91;TR=210;WE=58455389;WS=58455371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,216:1.00:216
chr19	58500271	rs11880378	T	G	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=8;PP=212;SC=CTCATATTTGTTATATACTCT;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=58500279;WS=58500261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr19	58514715	rs4801540	C	G	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=18;PP=530;SC=GTGAGTTTTCCTCTATCGATA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=58514723;WS=58514705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr19	58549366	rs159870	C	G	2742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=64;PP=2203;SC=GGCCGCACCTCGCGCTGGGCC;SOR=2.147;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=23;TCR=64;TR=87;WE=58549374;WS=58549356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr19	58549593	rs2241406	C	G	1182.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=7;PP=900;SC=CGCAGGCTTCCTGCCCCGGGC;SOR=3.109;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=42;WE=58549601;WS=58549583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr19	58570697	rs7256947	G	T	762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=8;NR=21;PP=629;SC=GGCCGGCGAGGAGGGGGAGGG;SOR=1.942;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=29;WE=58570705;WS=58570687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr19	58570714	rs146738840	A	AGGCCG	600.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.90;QD=46.21;SOR=2.147;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr19	58570794	rs8110363	C	T	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=62.89;NF=3;NR=7;PP=226;SC=CAGCAGCGCGCGTCTGTGTGG;SOR=1.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=58570802;WS=58570784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr19	58571615	rs151015554	GGTGCCCGGCCTCTACTC	G	592.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=14;PP=2382;SC=GGCCTCTACTGGTGCCCGGCC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=14;WE=58571639;WS=58571605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr19	58572979	rs1469087	G	A	4174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=55;PP=2965;SC=GTGGTAGTGGGCTTCAGCCAG;SOR=1.266;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=139;TCF=82;TCR=57;TR=136;WE=58572987;WS=58572969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr19	58573083	rs1469086	A	G	2958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.999;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=63;PP=2391;ReadPosRankSum=0.251;SC=GGGTAAGGCCACACCCATGTC;SOR=1.622;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=96;TCF=33;TCR=63;TR=94;WE=58573091;WS=58573073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,97:0.99:98
chr19	58578578	rs2229375	C	T	9355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=181;PP=2965;ReadPosRankSum=0.900;SC=AGAGACCTTACGAATGTCACG;SOR=0.477;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=292;TCF=110;TCR=182;TR=291;WE=58578586;WS=58578568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,303:1.00:304
chr19	58579923	rs2229379	A	G	980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=28;PP=802;SC=AGAAACGTACATTCATACACA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=58579931;WS=58579913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr19	58629830	rs8108978	A	T	1616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=8;NR=46;PP=1278;SC=GCCTAGTGCGACGAGGGCGGG;SOR=3.342;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=8;TCR=46;TR=54;WE=58629838;WS=58629820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr19	58629878	rs8109275	G	T	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=680;SC=GGCCGCAGCTGCCTGGCAGCC;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=58629886;WS=58629868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	58718360	rs59557917	A	AG	2891.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=56;PP=2957;SC=GGTCCCCGGGAGCCCTGGACC;SOR=1.863;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=77;TCF=20;TCR=57;TR=74;WE=58718368;WS=58718350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr19	58791254	rs77570482	A	T	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.61;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr19	58858231	rs3214663	GC	G	1847.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=8;PP=2001;SC=TTTAAACAGAGCCTCTCTTCA;SOR=2.970;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=42;TCR=8;TR=48;WE=58858239;WS=58858221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr19	58858614	rs11345647	AG	A	1264.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=6;PP=1136;SC=AGCGCTAACCAGGGGTGCCCA;SOR=2.554;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=37;TCF=27;TCR=10;TR=29;WE=58858622;WS=58858604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr19	58858676	rs1265957	A	G	2151.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=22;PP=1550;SC=CCAGGCAAACATCAGCAGACG;SOR=1.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=49;TCR=22;TR=71;WE=58858684;WS=58858666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	58859052	.	A	G	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=17;PP=437;SC=GCCCCAGGCCACGCCCCAGGC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=17;WE=58859074;WS=58859042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	58859054	rs113490434	GC	G	504.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=17;PP=628;SC=CCCAGGCCACGCCCCAGGCCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=58859074;WS=58859042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	58859066	rs1265959	A	G	512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=15;PP=384;SC=CCCAGGCCACACCCCAGGCCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=58859074;WS=58859042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr19	58864479	rs893184	T	C	5552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=98;PP=2965;SC=AGTCTCCAGGTGGGCCTGGCA;SOR=0.953;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=178;TCF=80;TCR=98;TR=178;WE=58864487;WS=58864469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,188:1.00:188
chr19	58864867	rs2375470	A	G	2259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=51;PP=1844;SC=ATGAGGCCCCAAGGGAGGGCG;SOR=1.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=21;TCR=51;TR=72;WE=58864887;WS=58864857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr19	58864879	rs3833872	T	TG	1916.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=44;PP=2012;SC=GGGAGGGCGGTGGGGTGGCTC;SOR=2.872;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=55;TCF=6;TCR=49;TR=49;WE=58864887;WS=58864857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr19	58870003	rs10692126	T	TGAG	2346.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=8;PP=2527;SC=CTAGCAGATCTGAGAAAACAA;SOR=3.171;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=57;TCF=47;TCR=10;TR=53;WE=58870011;WS=58869993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr19	58870087	rs11332731	TG	T	7874.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=121;NR=53;PP=2967;SC=CACACAGGTGTGGACTGGAGA;SOR=2.097;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=175;TCF=122;TCR=53;TR=174;WE=58870095;WS=58870077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr19	58871130	rs6510138	C	G	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=578;SC=ACGAGGTCAGCAATTCCAAGA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=58871138;WS=58871120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr19	58879965	rs7255489	A	G	2865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=59;PP=2256;SC=ACACTGGGGGACTCTTGCCCG;SOR=1.828;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=25;TCR=59;TR=84;WE=58879984;WS=58879955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr19	58879976	rs7255596	C	T	2416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=53;PP=1875;SC=CTCTTGCCCGCCTGCTGCTGC;SOR=2.043;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=20;TCR=53;TR=73;WE=58879984;WS=58879955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	58898193	rs975947	C	T	1350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=9;PP=1025;SC=CACTGGGCCTCACTCCGCTAA;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=29;TCR=9;TR=38;WE=58898201;WS=58898183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr19	58904715	rs2289143	C	T	1491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.777;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=39;ReadPosRankSum=0.000;SC=TCATATCCCCCTTCTCTCTAG;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=45;WE=58904723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,46:0.98:47
chr19	58908150	rs13343526	C	G	1508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=25;PP=1030;SC=CTCCGGCCCCCCGCGGCCCCA;SOR=0.729;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=28;TCR=25;TR=53;WE=58908158;WS=58908140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr19	58920104	rs145105239	ACGGGAGTTC	A	1978.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=4;PP=2982;SC=GGCGCGGGCCACGGGAGTTCC;SOR=4.271;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=37;TCF=33;TCR=4;TR=32;WE=58920120;WS=58920094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr19	58928302	rs10423138	T	C	3204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=37;PP=2488;SC=ATGGGGCAGCTTTCCCACCTG;SOR=1.284;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=57;TCR=37;TR=94;WE=58928310;WS=58928292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr19	58928786	rs7257872	A	G	2801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=43;PP=2284;SC=CTATGAGTGTACAGAATGTGG;SOR=0.818;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=37;TCR=44;TR=80;WE=58928794;WS=58928776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr19	58929052	rs3764535	G	A	3058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=34;NR=50;PP=2287;SC=AGTGTGGGAAGGCCTTCAAAC;SOR=1.095;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=85;TCF=35;TCR=50;TR=84;WE=58929060;WS=58929042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr19	58929136	rs3764534	G	A	1986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=47;PP=1545;SC=CACATGGGAAGGTCGTTAGCT;SOR=2.760;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=11;TCR=47;TR=58;WE=58929144;WS=58929126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr19	58929194	rs3764533	A	G	1046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=27;PP=822;SC=AAAGGAGGTTAAGGAGAGTGG;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=58929202;WS=58929184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr19	58945962	rs9941466	C	T	3821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=63;PP=2965;SC=CAGTGTGAAACTTTTTATTAC;SOR=1.003;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=112;TCF=49;TCR=63;TR=111;WE=58945970;WS=58945952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr19	58946056	rs1465789	G	A	3164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=41;PP=2475;SC=CAGATGGTTGGGGAGAGTGGA;SOR=0.936;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=54;TCR=41;TR=94;WE=58946064;WS=58946046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr19	58951123	rs7259841	T	C	3870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=28;NR=89;PP=2965;SC=ACACTCCACTTACCTGCGCCG;SOR=2.448;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=28;TCR=89;TR=117;WE=58951131;WS=58951113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr19	58962958	rs893188	C	T	6134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=111;PP=2965;SC=GCAATGTGAGCTCTGGGGGCT;SOR=0.933;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=200;TCF=89;TCR=111;TR=200;WE=58962966;WS=58962948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr19	58963018	rs893187	C	G	3960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=91;PP=2965;SC=CAGGCCACACCGGTGGTCTGG;SOR=1.990;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=35;TCR=91;TR=126;WE=58963026;WS=58963008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr19	58963047	rs116959667	G	T	2890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=79;PP=2336;SC=GCGCGGGTCGGGGCCCGAGGC;SOR=3.540;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=13;TCR=79;TR=92;WE=58963055;WS=58963037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr19	58966644	rs60037165	A	T	3747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=78;NR=34;PP=2965;SC=GCGTCTTCCCAGTTGCCGATG;SOR=1.919;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=78;TCR=34;TR=112;WE=58966652;WS=58966634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr19	58982384	rs10418774	A	G	6436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=87;NR=92;PP=2965;SC=TCCGGCTTAGAGAAAAGACAC;SOR=0.777;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=87;TCR=93;TR=179;WE=58982392;WS=58982374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr19	58989495	rs893185	A	C	2417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=32;PP=1910;SC=CCCTGAGGGGAACCATGGACA;SOR=0.948;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=43;TCR=32;TR=75;WE=58989503;WS=58989485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr19	58991900	rs882610	G	A	5245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=101;PP=2965;SC=CACCCCCGACGCTCACTCACA;SOR=1.391;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=59;TCR=101;TR=160;WE=58991908;WS=58991890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr19	59010593	rs4801274	A	G	6729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=172;PP=2965;SC=TCCATCTGCAAGGAGGGAGCC;SOR=3.067;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=209;TCF=37;TCR=172;TR=209;WE=59010601;WS=59010583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,208:1.00:208
chr19	59025685	rs4801602	A	C	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=23;PP=520;SC=CCCCTGCGGAAGACAGGGCGG;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=59025693;WS=59025675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr19	59082605	rs3752109	C	T	5669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=122;NR=50;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.828;SC=CTCCTCATAGCGGAAGCACCG;SOR=0.798;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=173;TCF=123;TCR=50;TR=172;WE=59082613;WS=59082595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,181:0.99:182
chr20	76962	rs6111385	T	C	13595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=459;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=251;NR=201;PP=2965;SC=TGCCACCATCTGAGGCCACTA;SOR=0.942;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=455;TCF=252;TCR=203;TR=452;WE=76970;WS=76952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,455:1.00:455
chr20	126310	rs11467417	ACC	A	3600.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FS=1.557;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.18;ReadPosRankSum=1.002;SOR=0.822;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:218,104:0.32:322
chr20	138004	rs6055356	G	C	113.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=87;SC=TGGGTGGCCTGAAATTTCCTG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=138012;WS=137994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr20	138125	rs2298108	G	T	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.530;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=256;ReadPosRankSum=-0.488;SC=GAGGAAGGTAGCATAGTGTGC;SOR=3.154;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=12;WE=138133;WS=138115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,12:0.27:44
chr20	138148	rs2298109	C	T	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.248;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=333;ReadPosRankSum=0.454;SC=TTCACTGGACCAAAAGCTTTG;SOR=2.526;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=14;WE=138156;WS=138138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,14:0.26:53
chr20	138178	rs3216039	GC	G	1245.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.415;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=15;PP=985;ReadPosRankSum=1.114;SC=CTTCTGGAAAGCCTGGCCATG;SOR=0.132;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=46;TCF=25;TCR=21;TR=28;WE=138186;WS=138168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,39:0.66:59
chr20	139362	rs6055460	G	A	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=585;ReadPosRankSum=-0.268;SC=CAAAACCAACGTGCCTTCAGT;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=26;WE=139370;WS=139352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr20	139409	rs12624951	G	A	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=502;ReadPosRankSum=-0.591;SC=TCCTTTCTGTGTATAGTAACC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=65;TCR=1;TR=26;WE=139417;WS=139399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,27:0.39:69
chr20	139456	rs12624954	G	A	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.772;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=12;PP=887;ReadPosRankSum=-0.937;SC=CTATGTACAAGGACATTGCAG;SOR=0.438;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=148;TCF=117;TCR=31;TR=49;WE=139464;WS=139446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,50:0.32:154
chr20	139576	rs16995685	C	A	1595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=233;ExcessHet=3.0103;FS=3.265;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.85;ReadPosRankSum=1.301;SOR=0.938;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:163,70:0.30:233
chr20	139741	rs76169392	C	T	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.35;ReadPosRankSum=-0.966;SOR=0.395;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr20	139745	rs4142304	T	C	1268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=32;PP=522;SC=CTTCTTCCTTTTGGTTTCTTG;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=139753;WS=139731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr20	168625	rs11396059	G	GT	1484.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.314;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.435;NF=24;NR=27;PP=1432;ReadPosRankSum=0.766;SC=AATGACACATGTTTTTTCTCT;SOR=0.317;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=105;TCF=36;TCR=69;TR=51;WE=168633;WS=168615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,59:0.60:98
chr20	168728	rs4813043	T	A	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.422;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=37;PP=1001;ReadPosRankSum=-0.267;SC=AGCCTGTTACTTTATTGAAGC;SOR=1.553;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=77;TCF=22;TCR=55;TR=48;WE=168736;WS=168718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,50:0.64:78
chr20	207889	rs2298149	G	A	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=192;ReadPosRankSum=-0.690;SC=GAGCTCAGGAGCATCAACCCA;SOR=0.533;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=42;TCR=1;TR=12;WE=207897;WS=207879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,12:0.28:43
chr20	208168	rs6110460	T	C	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=141;ReadPosRankSum=-1.054;SC=AACTGCCAGATTGTGTCCAGT;SOR=0.752;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=8;WE=208176;WS=208158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,8:0.32:25
chr20	210061	rs13045643	G	A	1595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-7.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=27;PP=1181;ReadPosRankSum=1.566;SC=AAAACTACCTGCAATATGGAA;SOR=0.681;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=80;TCR=60;TR=62;WE=210069;WS=210051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,66:0.44:149
chr20	238435	rs66489228	CTGGTCT	C	3080.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.930;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.576;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.156;NF=9;NR=46;PP=2804;ReadPosRankSum=0.531;SC=GTTCCTGCTCCTGGTCTTGGC;SOR=1.022;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=109;TCF=27;TCR=82;TR=55;WE=238448;WS=238425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,79:0.65:122
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chr20	278687	rs5839847	CCGG	C	2080.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=28;NR=11;PP=1873;SC=CCAGGATGAGCCGGCGGCGGC;SOR=2.400;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=33;TCR=13;TR=39;WE=278697;WS=278677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr20	334317	rs5839855	TC	T	7363.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=133;PP=2973;SC=CCTGGATCCTTCCCCCCTTCT;SOR=1.164;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=205;TCF=59;TCR=146;TR=190;WE=334325;WS=334307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,234:1.00:234
chr20	371972	rs6051637	T	C	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=322;ReadPosRankSum=-1.337;SC=TGGAGCCCTATGCGCGGCTGC;SOR=0.478;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=72;TCF=60;TCR=12;TR=22;WE=371980;WS=371962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,23:0.30:76
chr20	377226	rs6115830	C	T	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.800;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=27;PP=899;ReadPosRankSum=-1.652;SC=TGCCCTTAGCCCCAACCCGAT;SOR=0.451;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=164;TCF=92;TCR=72;TR=55;WE=377234;WS=377216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,59:0.36:166
chr20	389456	rs3746792	C	T	1439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.082;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=37;PP=1075;ReadPosRankSum=-0.319;SC=TGGGGAACTTCCGGTGGGAAG;SOR=1.430;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=93;TCF=34;TCR=59;TR=54;WE=389464;WS=389446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,57:0.59:96
chr20	391170	rs7059	C	T	1479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.791;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=29;PP=1084;ReadPosRankSum=-0.507;SC=AAAAATTGTACACACTTCTTC;SOR=0.546;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=93;TCF=44;TCR=49;TR=57;WE=391178;WS=391160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,59:0.61:96
chr20	397928	rs6115906	C	T	2229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=40;PP=1562;SC=TGGAGGCCCTCGTGTGCTGCC;SOR=1.164;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=28;TCR=40;TR=68;WE=397936;WS=397918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr20	398278	rs11698154	G	T	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=6.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=6;PP=730;ReadPosRankSum=-0.058;SC=GTGAGGAGGCGGAGGGCGACA;SOR=0.643;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=111;TCR=20;TR=38;WE=398286;WS=398268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,37:0.29:128
chr20	400504	rs67470622	AGTGACCCTGCACCTGGCT	A	620.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.219;NF=0;NR=11;PP=2345;ReadPosRankSum=-0.236;SC=TGCTGCTGGCAGTGACCCTGC;SOR=0.756;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=11;WE=400529;WS=400494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr20	402710	rs2057251	A	G	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=5;PP=960;ReadPosRankSum=-1.013;SC=CATGTGAGGGATGGAGTCCCC;SOR=0.823;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=67;TCF=59;TCR=8;TR=43;WE=402718;WS=402700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,43:0.63:68
chr20	402921	rs6051905	C	G	1949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.262;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.726;NF=11;NR=62;PP=1531;ReadPosRankSum=0.170;SC=CAAGTCCCAACTCCTAAGGAA;SOR=1.063;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=107;TCF=17;TCR=90;TR=73;WE=402929;WS=402911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,74:0.67:111
chr20	442937	rs708978	C	G	230.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=5;PP=171;SC=CCCCCCGGGCCGCCCTCGCAG;SOR=0.892;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=4;TCR=5;TR=9;WE=442945;WS=442927;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr20	488930	rs74119	C	T	3501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=97;NR=3;PP=2965;SC=ACTCTGCTTCCTCACTGCAAA;SOR=6.419;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=100;TCF=97;TCR=3;TR=100;WE=488938;WS=488920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr20	590456	rs282164	A	G	1724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=59.95;NF=36;NR=22;PP=1425;SC=TGCCCGCGGCACGGAAGCACG;SOR=1.316;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=36;TCR=22;TR=58;WE=590464;WS=590446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr20	590542	rs2754502	CG	GC	4795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=53;PP=1913;SC=GCCAGGCGCACGGTCTCGATC;SOR=1.106;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=104;TCF=41;TCR=63;TR=92;WE=590551;WS=590532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr20	590900	rs183989	T	C	158.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=5;PP=114;SC=GCCGCGTCCCTCCGTGCGCCG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=590908;WS=590890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr20	628768	rs6053664	T	C	1882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.748;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=20;PP=1491;ReadPosRankSum=-0.268;SC=GCCCTTCCTCTTCCTCCACCC;SOR=0.993;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=197;TCF=140;TCR=57;TR=78;WE=628776;WS=628758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,77:0.39:199
chr20	628890	rs6053666	T	C	11298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=1.600;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=183;NR=156;PP=2965;ReadPosRankSum=2.421;SC=ACCCCTACCTTCGTGGAGTTG;SOR=0.404;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=345;TCF=187;TCR=158;TR=339;WE=628898;WS=628880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:6,357:0.98:363
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chr20	633815	rs11905119	T	C	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.449;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.830;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=45;ReadPosRankSum=-0.991;SC=GCGTTCCTCCTGCACGCAGCC;SOR=0.034;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=6;WE=633823;WS=633805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
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chr20	744050	rs8122335	A	G	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.237;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=650;ReadPosRankSum=-1.589;SC=CTTAACCACTACATGTACAGC;SOR=1.675;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=27;WE=744058;WS=744040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr20	744450	rs3746805	G	A	1767.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=1374;ReadPosRankSum=-1.220;SC=GGTCATTGAGGAGGTCTTCCA;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=46;TCR=46;TR=64;WE=744458;WS=744440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,65:0.70:93
chr20	744662	rs3833341	A	ACAGGTCAAT	831.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.247;NF=0;NR=9;PP=2288;ReadPosRankSum=0.036;SC=AAAGGACAAGACAGATCCCTG;SOR=0.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=9;WE=744670;WS=744652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,19:0.79:24
chr20	825678	rs538094	T	C	4991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=106;NR=41;PP=2965;SC=AGCCGCTCTTTAGCCCTGAGA;SOR=2.046;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=106;TCR=41;TR=147;WE=825686;WS=825668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr20	853502	rs11907018	G	A	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=128;ReadPosRankSum=0.488;SC=CAGGGTGTCAGGGAAGGCGGT;SOR=0.641;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=8;WE=853510;WS=853499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr20	854807	rs2297122	C	T	374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=282;ReadPosRankSum=0.557;SC=GTGGGCAAGGCCCAGACCTGC;SOR=0.760;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=41;TCF=35;TCR=6;TR=17;WE=854815;WS=854797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr20	854940	rs944110	T	C	3871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=71;PP=2965;SC=CAGACATCACTTGGGCACACT;SOR=1.071;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=49;TCR=71;TR=120;WE=854948;WS=854930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chr20	855113	rs73078132	G	C	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.650;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=46;ReadPosRankSum=-0.916;SC=GGTTGGGGCTGTGTCGAGCAA;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=855121;WS=855103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr20	858769	rs873147	C	T	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=55;ReadPosRankSum=0.420;SC=AGCTGAAGACCCCAGCCCCCA;SOR=0.465;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=5;WE=858777;WS=858759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr20	860426	rs61737018	G	A	848.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.729;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=22;PP=667;ReadPosRankSum=1.405;SC=GAAAATTCACGGTGCCATTCT;SOR=0.588;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=50;TCR=64;TR=40;WE=860434;WS=860416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,40:0.34:118
chr20	865664	rs55955946	TC	T	555.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=4;PP=666;ReadPosRankSum=-0.370;SC=GAGCAGGGTCTCCCCTCCCCT;SOR=1.047;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=20;WE=865672;WS=865654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,20:0.62:32
chr20	982892	rs6056520	G	A	711.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=556;ReadPosRankSum=-0.711;SC=CGGCGGGCGCGGGGGCTGCTG;SOR=0.360;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=24;WE=982900;WS=982882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,25:0.58:43
chr20	1099329	rs2072962	A	G	549.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-4.145;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=404;ReadPosRankSum=-0.586;SC=AGAGGGAAGCAGAGTTATAGC;SOR=0.610;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=23;WE=1099337;WS=1099327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,23:0.77:30
chr20	1099523	rs1803415	T	G	9201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=125;NR=158;PP=2965;SC=CACGGTTACTTCGGCTTGGGT;SOR=0.935;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=283;TCF=125;TCR=158;TR=283;WE=1099531;WS=1099513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,292:1.00:292
chr20	1099666	rs2072961	G	C	1525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=40;PP=1266;SC=GTCTGGGGCAGATGGCAGCGT;SOR=6.184;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=41;WE=1099674;WS=1099656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr20	1108262	rs6040024	C	G	2004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=58;PP=1628;SC=ATGGAAGAACCTTTTATTTCT;SOR=6.901;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=59;TCF=1;TCR=58;TR=59;WE=1108270;WS=1108252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
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chr20	1115689	rs185213918	T	C	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=16;PP=551;ReadPosRankSum=-0.102;SC=GCCGCCGCCGTCGTTGCAGCC;SOR=0.604;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=45;TCR=49;TR=32;WE=1115697;WS=1115679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,31:0.33:94
chr20	1184045	rs71191998	T	TA	99.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQRankSum=0.595;QD=9.07;ReadPosRankSum=-0.277;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr20	1187752	rs80125338	C	G	1212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.798;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=25;PP=915;ReadPosRankSum=-0.669;SC=CTTAACTGGACGGAGATGACA;SOR=0.564;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=85;TCF=33;TCR=52;TR=42;WE=1187760;WS=1187742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,47:0.51:93
chr20	1187878	rs79521191	C	T	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.463;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=9;PP=201;ReadPosRankSum=-1.693;SC=CCCTCATCTGCTGTGCATCCC;SOR=0.184;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=10;WE=1187886;WS=1187868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
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chr20	1292964	rs4814110	T	C	4562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=117;NR=25;PP=2965;SC=CCCTCCCTGGTGCGGCCACCA;SOR=3.105;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=142;TCF=117;TCR=25;TR=142;WE=1292972;WS=1292954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr20	1293008	rs2273958	C	T	4675.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.804;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=56;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.513;SC=TCTGCCCGTCCACCTCACACA;SOR=0.551;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=244;TCF=165;TCR=79;TR=167;WE=1293016;WS=1292998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,170:0.69:247
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chr20	1520883	rs2256520	T	C	2748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=34;PP=2130;ReadPosRankSum=1.303;SC=AGGGAATATGTTCTCTCCTAG;SOR=0.414;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=85;TCF=51;TCR=34;TR=84;WE=1520891;WS=1520873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
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chr20	1552457	rs16995332	G	A	4469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.806;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=75;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.231;SC=GAGAGTGAACGTCCCCACGGG;SOR=0.507;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=244;TCF=122;TCR=122;TR=164;WE=1552465;WS=1552447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,168:0.66:253
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chr20	1592150	.	TGA	T	654.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.343;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=26.307;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.08;MQRankSum=-7.549;QD=7.36;ReadPosRankSum=-0.139;SOR=4.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,20:0.22:89
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chr20	1592193	rs371465078	C	T	672.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=1.074;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.32;MQRankSum=-11.151;QD=5.26;ReadPosRankSum=-1.133;SOR=0.897;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:99,29:0.23:128
chr20	1592215	rs41289057	C	G	1579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.432;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-9.564;NF=42;NR=19;PP=1126;ReadPosRankSum=-2.318;SC=TAATTCCCGGCCTGGTCCAGC;SOR=0.378;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=183;TCF=137;TCR=46;TR=61;WE=1592223;WS=1592205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,63:0.35:182
chr20	1592265	rs45471597	A	G	3058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.436;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-10.162;NF=66;NR=63;PP=2474;ReadPosRankSum=1.999;SC=GGATCAGGGAAGTCACAGTGC;SOR=0.643;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=280;TCF=151;TCR=129;TR=129;WE=1592273;WS=1592255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,129:0.46:282
chr20	1592284	rs1135196	G	A	2808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.609;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-9.486;NF=58;NR=59;PP=2200;ReadPosRankSum=1.579;SC=GCAGTGCAGAGTGGCCGACTC;SOR=0.716;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=263;TCF=133;TCR=130;TR=117;WE=1592292;WS=1592274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,119:0.45:267
chr20	1592312	rs72484087	T	C	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.393;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.146;NF=36;NR=46;PP=1183;ReadPosRankSum=-4.686;SC=GCAACTGATATGGACTTGTCA;SOR=0.374;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=229;TCF=93;TCR=136;TR=82;WE=1592320;WS=1592302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:171,55:0.24:226
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chr20	1592352	rs139138248	A	C	456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=1.202;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.96;MQRankSum=-11.329;QD=3.51;ReadPosRankSum=-4.801;SOR=0.967;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,15:0.12:130
chr20	1592355	rs145146965	T	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.35;MQRankSum=-10.194;QD=0.64;ReadPosRankSum=-3.466;SOR=0.750;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,10:0.08:127
chr20	1592383	rs139926854	A	ATT	285.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=2.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.16;MQRankSum=-9.761;QD=2.95;ReadPosRankSum=-3.131;SOR=1.480;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,13:0.13:97
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chr20	1592399	rs200926806	G	A	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=2.334;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.41;MQRankSum=-9.277;QD=4.08;ReadPosRankSum=2.276;SOR=1.312;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,15:0.17:88
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chr20	1617163	rs41275438	G	T	2101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.893;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=31;PP=1751;ReadPosRankSum=0.594;SC=TACAAAAGGGGCATCGATAAA;SOR=1.504;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=145;TCF=87;TCR=58;TR=90;WE=1617171;WS=1617153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,87:0.61:143
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chr20	1895835	rs17855612	C	T	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.84;MQRankSum=-7.543;QD=6.17;ReadPosRankSum=-4.128;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,12:0.20:59
chr20	1895842	rs17853847	T	C	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.75;MQRankSum=-7.599;QD=6.11;ReadPosRankSum=-3.098;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,13:0.22:60
chr20	1895889	rs72620874	G	C	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=2.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.310;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.185;NF=9;NR=18;PP=608;ReadPosRankSum=1.116;SC=GCTGGACCAGGCCGGGAATTA;SOR=0.293;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=27;WE=1895897;WS=1895879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,25:0.46:54
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chr20	1895950	.	CCT	GTC	2796	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=27;MMLQ=28;MQ=52.77;NF=6;NR=13;PP=2796;QD=20;SC=CTGTTTCAGACCTCACAAAGA;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=19;WE=1895973;WS=1895946;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:18,19:0.51:37
chr20	1895950	.	CCT	C	686.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.51;MQRankSum=-3.330;QD=18.07;ReadPosRankSum=3.204;SOR=0.507;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr20	1895963	rs17855613	A	G	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.23;MQRankSum=-3.042;QD=21.58;ReadPosRankSum=0.370;SOR=0.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr20	1895963	.	AAC	GAA	2806	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=27;MMLQ=29;MQ=49.3;NF=10;NR=13;PP=2806;QD=20;SC=CACAAAGAGAAACAACATGGA;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=41;TCF=19;TCR=22;TR=23;WE=1895973;WS=1895946;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:18,23:0.56:41
chr20	1895965	rs17855614	C	A	841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.243;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.44;MQRankSum=-3.173;QD=21.04;ReadPosRankSum=0.600;SOR=0.726;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr20	1895984	rs17855615	C	A	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.71;MQRankSum=-4.692;QD=18.20;ReadPosRankSum=1.038;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr20	1895990	rs17855616	G	A	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.22;MQRankSum=-5.248;QD=16.47;ReadPosRankSum=1.170;SOR=0.460;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr20	1896051	rs139878822	CCGA	C	1285.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.711;HP=3;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-6.088;NF=23;NR=4;PP=2711;ReadPosRankSum=-0.571;SC=AAAGGGAGCCCCGATGACGTG;SOR=1.172;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=27;WE=1896068;WS=1896041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,32:0.51:63
chr20	1896059	rs115287948	G	A	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=4.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.83;MQRankSum=-6.014;QD=18.42;ReadPosRankSum=0.432;SOR=1.398;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,35:0.49:71
chr20	1896059	.	GT	AC	2692	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;FR=0.5000;HP=1;HapScore=4;MGOF=16;MMLQ=24;MQ=52.92;NF=28;NR=4;PP=2692;QD=20;SC=CCCCGATGACGTGGAGTTTAA;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=78;TCF=60;TCR=18;TR=32;WE=1896068;WS=1896041;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:46,32:0.41:78
chr20	1896060	rs114499682	T	C	1307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=4.048;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.73;MQRankSum=-5.944;QD=18.68;ReadPosRankSum=0.294;SOR=1.456;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr20	1896100	rs6136375	C	T	1630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.711;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.607;NF=43;NR=27;PP=1300;ReadPosRankSum=0.708;SC=TGTCTGTGCGCGGTGAGTACA;SOR=1.172;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=118;TCF=69;TCR=49;TR=70;WE=1896108;WS=1896090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,67:0.59:114
chr20	1896244	rs6136376	A	G	395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=349;ReadPosRankSum=0.192;SC=CAAATAAGGGAAGTTGAGGCC;SOR=1.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=14;WE=1896252;WS=1896234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr20	1915226	rs2076554	G	A	312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=215;ReadPosRankSum=1.082;SC=ATATGCAGTTGTATTTCTGTT;SOR=0.237;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=13;WE=1915234;WS=1915216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
chr20	2082732	rs6112857	C	G	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.269;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=356;ReadPosRankSum=0.603;SC=TGCTCGGTCCCGGAGGCAGCC;SOR=1.795;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=18;WE=2082740;WS=2082722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr20	2290333	rs214803	C	A	566.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.722;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=445;ReadPosRankSum=0.736;SC=AACTGGCAGACGGCCTTCAAC;SOR=0.146;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=21;WE=2290341;WS=2290323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,21:0.66:32
chr20	2290532	rs214804	T	G	1426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=40;PP=1073;ReadPosRankSum=2.325;SC=TAGCCCTTGTTCATTCAAGGA;SOR=0.648;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=18;TCR=61;TR=52;WE=2290540;WS=2290522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,54:0.67:81
chr20	2290547	rs214805	C	T	1240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=37;PP=970;ReadPosRankSum=1.102;SC=CAAGGACTGACGGGGACCACA;SOR=0.853;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=66;TCF=10;TCR=56;TR=43;WE=2290555;WS=2290537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,45:0.65:69
chr20	2361684	rs2422753	C	T	1653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=21;PP=1207;SC=TCAAGAAACACGGGTCTGTGG;SOR=1.159;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=31;TCR=21;TR=52;WE=2361692;WS=2361674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr20	2375262	rs2076405	A	G	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=6;PP=378;SC=CATCTTCACGATGGAGACAGG;SOR=1.112;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=15;WE=2375270;WS=2375252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr20	2380396	rs2076404	G	A	2198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=51;PP=1737;ReadPosRankSum=2.147;SC=TACCCTGGGAGAGAAGGGCCC;SOR=0.874;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=72;TCF=20;TCR=52;TR=71;WE=2380404;WS=2380386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,72:0.99:73
chr20	2413126	rs6036467	C	T	1398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=4;PP=1163;SC=CTCCCCTCCCCTTCCTCCAGC;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=40;TCR=4;TR=43;WE=2413134;WS=2413116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr20	2442273	rs6049216	C	A	416.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=352;ReadPosRankSum=0.690;SC=AAATAAAGATCCATAGGTGCA;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=15;WE=2442281;WS=2442263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr20	2451503	rs4815262	G	A	1176.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.171;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=899;ReadPosRankSum=0.969;SC=TGGAGTTCCGGCCCCGGAGCG;SOR=0.297;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=66;TCF=19;TCR=47;TR=44;WE=2451511;WS=2451493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,46:0.70:66
chr20	2473587	rs41308639	A	T	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.590;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=420;ReadPosRankSum=-0.402;SC=ATTCGTCAGAATATATGGTTC;SOR=0.399;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=21;WE=2473595;WS=2473577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,21:0.41:51
chr20	2474081	rs4815270	T	C	1542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=3;PP=1368;SC=CGCCTTTTCCTTTCCCAAGAA;SOR=4.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=43;TCR=3;TR=46;WE=2474089;WS=2474071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
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chr20	2517432	rs6036861	T	C	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=27;PP=517;ReadPosRankSum=1.667;SC=CTGTCCCCTGTGCGCTGAGCG;SOR=0.813;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=4;TCR=36;TR=30;WE=2517440;WS=2517422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,31:0.76:41
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chr20	2539387	rs6050063	G	A	2896.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.215;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=68;PP=2261;ReadPosRankSum=0.387;SC=ATTCCGAGGAGGGAGGAGAAG;SOR=1.175;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=156;TCF=58;TCR=98;TR=104;WE=2539395;WS=2539377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,107:0.67:160
chr20	2542669	rs7270277	C	T	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.431;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=13;PP=216;ReadPosRankSum=-0.158;SC=GAGCAGGCTGCGGGTCAGCCA;SOR=0.358;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=19;WE=2542677;WS=2542659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,22:0.33:66
chr20	2542747	rs4815323	G	T	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=250;ReadPosRankSum=0.438;SC=TCCCCAAAGGGGCTTGATGTG;SOR=0.299;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=11;WE=2542755;WS=2542737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr20	2552805	rs1883981	T	A	1613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=25;PP=1137;ReadPosRankSum=0.745;SC=AATCCTGCTTTTTTTTTTTTT;SOR=0.639;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=100;TCF=62;TCR=38;TR=63;WE=2552813;WS=2552792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,65:0.68:95
chr20	2552926	rs1883980	T	C	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.948;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=31;PP=623;ReadPosRankSum=-0.710;SC=GTGTGTGGGGTGGGGGCAGTG;SOR=0.066;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=63;TCF=11;TCR=52;TR=41;WE=2552934;WS=2552916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,42:0.65:65
chr20	2559778	rs6083735	G	C	1689.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=6.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.724;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=21;PP=1333;ReadPosRankSum=0.088;SC=AGAGTTTTACGTCTTTTATTT;SOR=0.318;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=91;TCF=61;TCR=30;TR=57;WE=2559786;WS=2559768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,59:0.63:94
chr20	2560030	.	T	TTTTA	270.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.65;MQRankSum=2.167;QD=12.89;ReadPosRankSum=-0.855;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
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chr20	2591005	rs1883978	A	G	1144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.082;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=7;PP=778;ReadPosRankSum=-0.377;SC=GGGAGTGCAGAGATGGCAGCC;SOR=0.534;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=66;TCF=53;TCR=13;TR=37;WE=2591013;WS=2590995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,42:0.58:72
chr20	2591232	rs6050576	C	T	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.011;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=482;ReadPosRankSum=-0.049;SC=TGATGGATGACGTCCACCTCA;SOR=2.383;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=22;WE=2591240;WS=2591222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,25:0.62:40
chr20	2593006	rs1015159	A	G	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.867;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=12;PP=324;ReadPosRankSum=1.648;SC=TACACTCTCTAAAAAGGTGAC;SOR=1.368;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=40;TCF=14;TCR=26;TR=17;WE=2593014;WS=2592996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr20	2593863	rs6515646	T	C	1212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=9;PP=934;ReadPosRankSum=-2.406;SC=TGACGGTGTCTGACATGCTGG;SOR=0.772;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=58;TCR=15;TR=44;WE=2593871;WS=2593853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,45:0.61:74
chr20	2594190	rs10485601	C	T	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=24;PP=610;ReadPosRankSum=-0.301;SC=ATGTGACCTTCTATTCTAGGA;SOR=0.657;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=25;WE=2594198;WS=2594180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr20	2596747	rs374364073	TTC	T	97.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=2.472;QD=1.58;ReadPosRankSum=0.327;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,9:0.15:62
chr20	2596969	rs4621228	T	A	2159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=42;PP=1742;SC=CTCTCTGAACTCCCCTCTTTC;SOR=1.195;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=72;TCF=26;TCR=46;TR=68;WE=2596977;WS=2596959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr20	2596998	rs4481063	G	A	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=2.743;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.04;ReadPosRankSum=2.687;SOR=0.323;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,15:0.23:66
chr20	2597073	rs4544508	T	G	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=34;PP=1054;SC=GGGAGAGGGGTTGGTGGAGGA;SOR=2.636;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=42;WE=2597081;WS=2597063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr20	2597978	rs4815428	G	A	4124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=63;PP=2965;SC=TCAGTTGCCCGGGAGCACCTC;SOR=0.774;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=60;TCR=63;TR=123;WE=2597986;WS=2597968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr20	2598019	rs6083866	C	T	4420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=79;NR=51;PP=2965;SC=CAGAGGGCCTCGGCCCAGAAT;SOR=1.220;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=130;TCF=79;TCR=51;TR=130;WE=2598027;WS=2598009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr20	2616556	rs910271	T	C	1599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=11;PP=1205;SC=ATAGGAGGCATGCTTTTCTCT;SOR=2.628;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=49;TCF=38;TCR=11;TR=48;WE=2616564;WS=2616546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr20	2616679	rs2422808	C	G	2521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=49;PP=1976;SC=TCATCCTGGACGGTAAAAAGA;SOR=1.220;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=32;TCR=49;TR=81;WE=2616687;WS=2616669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr20	2617993	rs6083914	C	T	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=1;PP=639;SC=GAGTTCACGCCGCTGCACTCC;SOR=4.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=22;WE=2618001;WS=2617983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr20	2618094	rs6037181	G	A	3943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=81;NR=40;PP=2965;SC=CCTGGGCCAGGACCAACAGTT;SOR=1.532;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=121;TCF=81;TCR=40;TR=121;WE=2618102;WS=2618084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr20	2618140	rs6083915	T	C	6153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=117;NR=72;PP=2965;SC=TTGAGAAGAGTCACAAATCTG;SOR=1.301;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=189;TCF=117;TCR=72;TR=189;WE=2618148;WS=2618130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr20	2618308	rs6050771	C	T	2941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=81;PP=2388;SC=TATGAAACAGCGTGAAATCAG;SOR=6.138;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=84;TCF=3;TCR=81;TR=84;WE=2618316;WS=2618298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr20	2621998	rs6050798	T	C	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=42;PP=1100;SC=TCCCCACTGATGGCTAGGACT;SOR=2.876;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=9;TCR=42;TR=51;WE=2622006;WS=2621988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
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chr20	2633325	rs150527448	GGGGCGC	G	568.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=7;NR=2;PP=464;SC=GAGTGGTTGCGGGGCGCGGGC;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=9;WE=2633338;WS=2633315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr20	2633378	rs149713688	A	AGAGCCTGGGCCT	1051.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=4;PP=1103;SC=GGCCGCAGACAGGGCCTGGGC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=15;WE=2633388;WS=2633368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr20	2633404	rs6115307	C	G	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.25;QD=39.91;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr20	2633404	.	CGCCTGC	GGCCTGC,GGCCTGG	357	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.22;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MMLQ=29;MQ=59.71;NF=20,3;NR=12,3;PP=357,55;QD=12.2428503921;SC=CCTGGGCCTGCGCCTGCGCCT;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=33;TCF=20;TCR=13;TR=32,6;WE=2633418;WS=2633394;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.97:33
chr20	2633936	rs2073194	T	C	2413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=15;PP=1863;SC=TGGAGGAGTCTGTGCTCAACC;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=60;TCR=15;TR=75;WE=2633944;WS=2633926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr20	2637071	rs8958	T	C	2664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=24;PP=2133;SC=GGGGTAACACTCCAAAATATG;SOR=1.781;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=57;TCR=24;TR=81;WE=2637079;WS=2637061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr20	2637619	.	G	A	1744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.931;ClippingRankSum=0.000;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.522;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=38;PP=1302;ReadPosRankSum=-1.023;SC=TGACCTTGTAGAATGGAGGCA;SOR=0.619;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=210;TCF=95;TCR=115;TR=73;WE=2637627;WS=2637609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,76:0.35:219
chr20	2637737	.	C	T	2962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.211;ClippingRankSum=0.000;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.271;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=68;PP=2269;ReadPosRankSum=2.175;SC=GCAGAGGAAGCGGCTGCTGAG;SOR=0.427;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=156;TCF=49;TCR=107;TR=104;WE=2637745;WS=2637727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,112:0.69:163
chr20	2644407	rs2073193	C	G	2725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=58;PP=2281;SC=TCCTCGGCCTCAATTGGGGGA;SOR=2.484;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=18;TCR=58;TR=76;WE=2644415;WS=2644397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr20	2690383	rs13042775	G	A	939.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.574;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=29;PP=738;ReadPosRankSum=0.249;SC=AGGGAGGAGCGGAGCAGCCCC;SOR=0.346;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=56;TCF=8;TCR=48;TR=35;WE=2690391;WS=2690373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,35:0.62:56
chr20	2732902	rs2235813	C	G	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=80;ReadPosRankSum=-0.510;SC=CCCCGGGGCCCGAGCCGGGTG;SOR=0.892;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=6;WE=2732910;WS=2732892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr20	2732951	rs149223102	C	T	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=44;ReadPosRankSum=0.847;SC=GGCGCCGCCACCGCCCCTCCC;SOR=0.446;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=5;WE=2732959;WS=2732941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr20	2739583	rs2073125	T	C	1358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=32;PP=1099;ReadPosRankSum=-2.171;SC=CTGACAAGTTTCACTCTCCAG;SOR=0.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=33;TCR=53;TR=52;WE=2739591;WS=2739573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,52:0.58:90
chr20	2775332	rs127078	T	C	779.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.663;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=31;PP=629;ReadPosRankSum=0.280;SC=GGCAGGATAATGTGCTGTTTA;SOR=0.393;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=165;TCF=46;TCR=119;TR=46;WE=2775340;WS=2775322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,45:0.26:172
chr20	2775425	rs11480464	G	GA	200.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.54;MQRankSum=1.910;QD=5.74;ReadPosRankSum=-1.591;SOR=0.315;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr20	2777459	rs1985525	T	C	1099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=4;PP=835;SC=GAGGAAGGGGTAGGACTGGGG;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=26;TCR=4;TR=30;WE=2777467;WS=2777449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr20	2777828	rs742707	G	T	1383.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.873;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=34;PP=1098;ReadPosRankSum=0.937;SC=ACCCTGGCCTGACTGCCCACC;SOR=0.833;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=82;TCF=30;TCR=52;TR=52;WE=2777836;WS=2777818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,52:0.62:84
chr20	2778075	rs127076	T	C	1343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=35;PP=1117;SC=CCTCCAAGCTTACTGTCTCCC;SOR=3.312;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=42;TCF=6;TCR=36;TR=41;WE=2778083;WS=2778065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr20	2779257	rs215541	G	C	2134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=53;PP=1829;SC=TGAGCCTAAGGTTGCTCCTGC;SOR=3.407;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=9;TCR=53;TR=62;WE=2779265;WS=2779247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr20	2796133	rs2073127	G	A	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.932;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.017;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=30;PP=927;ReadPosRankSum=1.429;SC=GTAGGCGGGCGGGCCAGTGGA;SOR=0.126;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=111;TCF=38;TCR=73;TR=55;WE=2796141;WS=2796123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,57:0.50:113
chr20	2797015	rs215561	G	A	2033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.865;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=38;PP=1552;ReadPosRankSum=-1.120;SC=CTGCCAGGCCGTCCTGGGCGC;SOR=0.465;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=102;TCF=49;TCR=53;TR=75;WE=2797023;WS=2797005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,77:0.75:103
chr20	2797137	rs11469869	GCC	G,GC	575.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=26.17;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,8,14:0.36,0.64:22
chr20	2846289	rs677344	G	A	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.086;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=3;PP=60;ReadPosRankSum=-1.749;SC=ACACATTTGTGGGCAGGCATC;SOR=0.016;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=5;WE=2846297;WS=2846279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr20	2904143	rs633284	A	T	35.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=16.250;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.56;ReadPosRankSum=0.482;SOR=0.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,4:0.17:23
chr20	2945759	rs1178027	C	T	2068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.157;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=54;PP=1630;ReadPosRankSum=0.434;SC=ACGTGGCTTCCAGATAACCAG;SOR=0.558;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=290;TCF=117;TCR=173;TR=95;WE=2945767;WS=2945749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,94:0.33:286
chr20	2996423	rs1178015	T	A	97.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=1.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.14;ReadPosRankSum=1.412;SOR=1.125;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,11:0.13:86
chr20	2996497	rs1178016	C	T	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=2.952;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.88;ReadPosRankSum=0.564;SOR=1.011;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,24:0.15:158
chr20	2996589	rs1178017	G	T	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=7.170;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.32;ReadPosRankSum=0.891;SOR=0.169;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,22:0.28:80
chr20	3002889	rs544090	A	C	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.902;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.248;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=35;PP=766;ReadPosRankSum=-0.297;SC=TGACCCTTGTACCCCCACCCC;SOR=0.394;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=118;TCF=12;TCR=106;TR=40;WE=3002897;WS=3002879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,41:0.35:118
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chr20	3007228	rs571058	G	A	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.508;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=3;PP=439;ReadPosRankSum=0.274;SC=GAGAAGAGCAGTATGGAGCCA;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=58;TCF=50;TCR=8;TR=23;WE=3007236;WS=3007218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,24:0.39:61
chr20	3007492	rs599538	T	C	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=98;ReadPosRankSum=-0.188;SC=ACCCCTTCCATTTCTCAGGTA;SOR=0.120;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=8;WE=3007500;WS=3007482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,9:0.25:36
chr20	3007694	rs10668644	A	AGGT	600.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.587;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=549;ReadPosRankSum=0.462;SC=CCAGGGCCTGAGGTGGGAGCA;SOR=0.340;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=44;TCF=36;TCR=8;TR=13;WE=3007702;WS=3007684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,17:0.40:42
chr20	3027415	rs3216762	GC	G	743.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.911;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.781;NF=5;NR=14;PP=556;ReadPosRankSum=-1.154;SC=TGGGACTCCAGCCGGGGACGC;SOR=0.767;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=59;TCF=25;TCR=34;TR=19;WE=3027423;WS=3027405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,28:0.38:74
chr20	3090942	rs34205880	A	G	1752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=32;PP=1338;SC=TTCGGGGCCCAGGATGCTCCC;SOR=0.871;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=26;TCR=32;TR=58;WE=3090950;WS=3090932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr20	3090969	rs45482595	T	C	1742.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=38;PP=1415;SC=CTCTGGTAAATCAGGAAGGAA;SOR=1.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=53;WE=3090977;WS=3090959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr20	3091110	rs45592236	G	A	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.18;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr20	3104100	rs11908519	C	T	171.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=136;SC=AAATTCAATTCTAAACTTTCA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=3104108;WS=3104090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr20	3128578	rs41304800	A	C	5732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.059;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=86;PP=2965;ReadPosRankSum=0.914;SC=CTGAGGAGCTATCTCTCCAAT;SOR=0.277;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=171;TCF=85;TCR=86;TR=168;WE=3128586;WS=3128568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,177:0.99:178
chr20	3147024	rs7260750	G	A	3916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=91;PP=2965;SC=AAACGCAGGAGGGGGCTGGGG;SOR=2.187;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=123;TCF=31;TCR=92;TR=122;WE=3147032;WS=3147014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr20	3147762	rs6051612	A	G	1539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=36;PP=1221;SC=CCAGGAGAGGATCCCGCCCTG;SOR=2.400;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=47;WE=3147770;WS=3147752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr20	3171628	rs2295546	G	A	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.157;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=154;ReadPosRankSum=-1.219;SC=GTCGAATCAGGCTGCCCTGCC;SOR=0.141;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=8;WE=3171636;WS=3171618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,8:0.62:13
chr20	3172246	rs2295547	A	C	1304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.488;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=4;PP=1010;ReadPosRankSum=0.061;SC=TCGTCCATTAAAAATGCAGGA;SOR=1.553;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=70;TCF=62;TCR=8;TR=47;WE=3172254;WS=3172236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,48:0.69:70
chr20	3175556	rs2295549	C	G	1143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=34;PP=900;ReadPosRankSum=-1.601;SC=CCCTAGCAAGCCCACAGGGTT;SOR=0.787;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=13;TCR=48;TR=43;WE=3175564;WS=3175546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,43:0.69:62
chr20	3175742	rs2295551	A	G	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.605;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=5;PP=455;ReadPosRankSum=-0.472;SC=TGGCCACTAAAGCCTGCTGGT;SOR=0.293;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=23;TCF=18;TCR=5;TR=19;WE=3175750;WS=3175732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,18:0.86:21
chr20	3176009	rs2295552	T	C	2870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=63;PP=2182;SC=CCTGTGGACATAGGAGGCAAA;SOR=2.468;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=19;TCR=63;TR=82;WE=3176017;WS=3175999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr20	3180597	rs6515776	G	T	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.592;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=10;PP=705;ReadPosRankSum=0.360;SC=AAGAAGCAAGGCTGCCTTGCC;SOR=0.971;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=155;TCF=114;TCR=41;TR=44;WE=3180605;WS=3180587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,44:0.28:157
chr20	3180616	rs6515777	G	A	1347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=3.207;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.97;ReadPosRankSum=1.840;SOR=1.033;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,44:0.26:169
chr20	3181262	rs73573863	C	T	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.474;NF=1;NR=10;PP=185;ReadPosRankSum=-0.738;SC=GCCATGAGTGCGTGTGTGTGT;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=11;WE=3181270;WS=3181252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr20	3184134	rs2295553	C	T	887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=20;PP=757;SC=AGCGGCAGCCCGGAAGCCTCA;SOR=1.460;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=30;WE=3184142;WS=3184124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr20	3185313	rs11699145	G	A	1060.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=39;PP=887;ReadPosRankSum=-1.650;SC=TCCACCCTGAGGCCGGGATCT;SOR=0.656;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=144;TCF=26;TCR=118;TR=48;WE=3185321;WS=3185303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,47:0.32:146
chr20	3190039	rs45620433	C	G	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=543;ReadPosRankSum=0.175;SC=GCCGCCACCGCGAGCCCACTC;SOR=1.079;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=24;WE=3190047;WS=3190032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,24:0.69:35
chr20	3193674	rs75402132	G	A	185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.387;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=368;ReadPosRankSum=1.438;SC=CCTGAAAGCCGGGGTGAGGCC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=26;TCR=1;TR=8;WE=3193695;WS=3193664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr20	3193687	rs78089909	C	T	230.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=368;ReadPosRankSum=0.836;SC=GTGAGGCCCACAGGCCTGAGT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=10;WE=3193695;WS=3193664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr20	3193732	rs11087570	G	A	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.069;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=0;PP=789;ReadPosRankSum=1.002;SC=CAGAGTTATCGATGAGAAAGG;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=52;TCF=49;TCR=3;TR=34;WE=3193740;WS=3193722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,33:0.65:51
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chr20	3193978	rs8362	G	A	1209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=29;PP=860;ReadPosRankSum=-0.218;SC=CGGAGTACCAGGGGGAGCCGG;SOR=0.775;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=15;TCR=48;TR=38;WE=3193986;WS=3193968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,43:0.63:68
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chr20	3209083	rs41281858	G	A	2103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.666;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=44;PP=1786;ReadPosRankSum=-1.568;SC=GTCTGTGGGCGGCAGGGACCG;SOR=0.508;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=109;TCF=43;TCR=66;TR=76;WE=3209091;WS=3209073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,77:0.68:113
chr20	3209357	rs10048856	C	T	2841.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.907;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=45;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.551;SC=CACAATCCTGCGGTGGCCCGA;SOR=0.649;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=150;TCF=77;TCR=73;TR=95;WE=3209379;WS=3209347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,107:0.65:164
chr20	3209371	rs2281575	G	A	2744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.639;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.940;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=40;PP=2962;ReadPosRankSum=0.605;SC=GGCCCGAGCCGCGAGTGTCAC;SOR=0.656;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=155;TCF=77;TCR=78;TR=92;WE=3209379;WS=3209347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,102:0.61:167
chr20	3210692	rs6139039	A	G	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=14;NR=3;PP=511;SC=TGCCAGCCCAAGGCTCCCAGA;SOR=2.419;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=3210700;WS=3210682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr20	3211064	rs3810561	A	C	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.77;ReadPosRankSum=-0.567;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr20	3211723	rs3803954	A	G	4300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.536;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=83;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.909;SC=GGGGGATGGGAGAGAGGGTTT;SOR=0.829;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=237;TCF=112;TCR=125;TR=151;WE=3211731;WS=3211713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,159:0.64:247
chr20	3212222	rs147477986	T	TG	3732.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=48;PP=2279;SC=GAGTCACCCCTAGAAACAGAG;SOR=2.777;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=67;TCF=10;TCR=57;TR=54;WE=3212233;WS=3212212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr20	3212223	.	A	T	3741.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.19;SOR=3.070;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr20	3212223	.	AGA	TGG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=6;NR=47;PP=2947;QD=20;SC=AGTCACCCCTAGAAACAGAGG;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=7;TCR=55;TR=53;WE=3212233;WS=3212212;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,53:0.85:62
chr20	3212225	.	A	G	3681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.60;SOR=3.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr20	3214020	rs2144771	G	T	1848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=3;PP=1556;SC=ACATGTTTCTGACACACCCAC;SOR=5.136;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=50;TCR=3;TR=52;WE=3214028;WS=3214010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr20	3214581	rs3803956	C	T	268.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=2;PP=186;ReadPosRankSum=0.719;SC=TGCAGAGCCACGACTGCTGGT;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=19;TCF=15;TCR=4;TR=10;WE=3214589;WS=3214571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr20	3214819	rs3827075	T	G	3908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.255;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=83;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.621;SC=TCAGGGTCCCTGGCGAAGCGG;SOR=0.537;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=246;TCF=107;TCR=139;TR=153;WE=3214827;WS=3214809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,155:0.63:247
chr20	3215046	rs6139040	C	G	214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.706;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=5;PP=174;ReadPosRankSum=-0.813;SC=CCAGCCGCAGCAGTCCAGCCC;SOR=0.658;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=22;TCF=12;TCR=10;TR=9;WE=3215054;WS=3215036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr20	3218355	rs3827076	C	G	1223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.969;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=34;PP=1066;ReadPosRankSum=-0.891;SC=ATGCAACCCACGCCACCCTAG;SOR=1.302;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=66;TCF=18;TCR=48;TR=44;WE=3218363;WS=3218345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,43:0.64:67
chr20	3218634	rs3810562	G	C	1751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=44;PP=1387;SC=CTCTCTCCTCGGATGCCAAGG;SOR=2.080;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=60;WE=3218642;WS=3218624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr20	3219561	rs113139885	G	A	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=127;ReadPosRankSum=-0.070;SC=GCGAAGCCGCGCCCGGGCCTC;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=8;WE=3219569;WS=3219551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr20	3219692	rs6084314	C	T	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.089;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=17;PP=975;ReadPosRankSum=0.896;SC=GAGACGGTGGCGGAGACCCGG;SOR=0.459;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=63;TCF=40;TCR=23;TR=44;WE=3219700;WS=3219682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,46:0.71:65
chr20	3219894	rs6107260	A	G	684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=21;PP=608;SC=ACACACCCCCACGCCGCGCCT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=3219902;WS=3219884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr20	3233142	rs6037516	C	G	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=71;ReadPosRankSum=-1.160;SC=AGGCCTCCAGCAGAGCTGAGG;SOR=0.141;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=6;WE=3233150;WS=3233132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr20	3235916	rs2281496	T	C	1412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.045;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=16;PP=1163;ReadPosRankSum=-1.797;SC=TCTTCAGGGCTTTCCTCTGAG;SOR=1.122;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=88;TCF=58;TCR=30;TR=54;WE=3235924;WS=3235906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,54:0.61:89
chr20	3236015	rs1569942	A	G	2446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=61;PP=2030;SC=TCTATTACACAACTAAGATCT;SOR=2.925;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=14;TCR=61;TR=75;WE=3236023;WS=3236005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr20	3240723	rs6051685	C	T	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=6.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.355;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.885;NF=0;NR=25;PP=482;ReadPosRankSum=1.369;SC=CGGTGGCTCACGCCTGTAATC;SOR=2.263;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=3;TCR=69;TR=25;WE=3240731;WS=3240713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,26:0.35:75
chr20	3245006	rs6515783	T	C	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.86;ReadPosRankSum=2.141;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,4:0.25:16
chr20	3275239	rs2281504	G	A	909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=9;PP=707;ReadPosRankSum=-0.062;SC=CAGCAGGCTGGCTCAGGGCAC;SOR=0.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=32;TCR=13;TR=31;WE=3275247;WS=3275229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,32:0.70:46
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chr20	3296279	rs2236115	G	A	222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=175;ReadPosRankSum=-0.408;SC=CATAGTGCAAGTCTTTTAGAT;SOR=0.289;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=10;WE=3296287;WS=3296269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr20	3298881	.	CAAA	C,CA	933.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.12;QD=30.12;SOR=6.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,12,19:0.39,0.61:31
chr20	3299054	rs6139071	T	C	1636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=42;PP=1259;ReadPosRankSum=0.908;SC=AAGCCTGCATTGAATGAGAAA;SOR=0.704;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=218;TCF=100;TCR=118;TR=77;WE=3299062;WS=3299044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,76:0.36:214
chr20	3324487	rs10582105	CGTGT	C	116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=180;ReadPosRankSum=0.921;SC=GAGTGCACAGCGTGTGTGTGT;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=3;WE=3324498;WS=3324477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr20	3329062	rs6139087	TG	CA	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=667;ReadPosRankSum=0.974;SC=CTTAAAGAAATGACAAATTAG;SOR=0.723;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=15;WE=3329071;WS=3329052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,16:0.33:49
chr20	3355567	rs2208030	T	C	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=1;PP=897;ReadPosRankSum=0.573;SC=TTGGTAAAAATAGACGAAGGG;SOR=0.681;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=63;TCF=62;TCR=1;TR=39;WE=3355575;WS=3355557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,41:0.60:68
chr20	3362009	rs2008730	T	C	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=643;ReadPosRankSum=-0.656;SC=ACACAGAGTTTACCAATATAT;SOR=0.693;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=25;WE=3362017;WS=3361999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,25:0.78:32
chr20	3362033	rs6051818	T	C	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=3.682;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.573;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=274;ReadPosRankSum=-0.428;SC=TACCATCTAGTACTTCTTCAG;SOR=0.382;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=16;WE=3362041;WS=3362023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,17:0.31:54
chr20	3515924	rs151518	G	A	486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.003;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=4;PP=401;ReadPosRankSum=0.900;SC=CTGGGTTTGTGACAGATGGAC;SOR=1.582;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=58;TCF=42;TCR=16;TR=21;WE=3515932;WS=3515914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,22:0.34:64
chr20	3515951	rs151519	C	T	396.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.149;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=320;ReadPosRankSum=1.133;SC=ATTATAAATACAAAACGAAGT;SOR=1.874;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=76;TCF=46;TCR=30;TR=20;WE=3515959;WS=3515941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,21:0.25:83
chr20	3527884	.	G	A	822	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=28;NR=1;PP=822;QD=29.5438349154;SC=CTAAGTTAATGGAAGCGTTGC;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=3527892;WS=3527883;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr20	3539928	rs117689603	C	T	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=72;ReadPosRankSum=0.291;SC=TGCCCCCCTACATCCATGGTG;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=4;WE=3539936;WS=3539918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr20	3541382	rs17782078	T	C	1068.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.794;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=8;PP=776;ReadPosRankSum=-1.021;SC=GTTTTTCACATTCATAATGAG;SOR=1.051;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=116;TCF=87;TCR=29;TR=41;WE=3541390;WS=3541372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,44:0.36:122
chr20	3541633	rs235577	A	G	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=49;PP=1382;SC=TGTTTAGAAAAGTTCAACCTA;SOR=7.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=49;WE=3541641;WS=3541623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr20	3546143	rs113123213	G	A	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=453;ReadPosRankSum=0.988;SC=GGCCGGGCACGGTGGCTCACG;SOR=0.291;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=0;TCR=62;TR=22;WE=3546151;WS=3546133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,24:0.36:66
chr20	3557342	.	G	A	283	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=29;MQ=55.55;NF=5;NR=0;PP=283;QD=63.5542425094;SC=CTGTCTGTCTGTCTATCTATC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=5;WE=3557362;WS=3557336;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,5:0.29:17
chr20	3557342	.	G	GTCTGTCTGTCTGTCTATCTA	421.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.83;QD=70.29;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr20	3564672	rs235540	C	T	1688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.910;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=47;PP=1273;ReadPosRankSum=0.383;SC=CCAATGCCTACGTGGCCTCCT;SOR=1.578;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=94;TCF=27;TCR=67;TR=61;WE=3564680;WS=3564662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,65:0.66:98
chr20	3564772	rs170976	T	A	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=250;ReadPosRankSum=0.040;SC=GCATGCCCTCTGTATAGGCAA;SOR=0.990;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=12;WE=3564780;WS=3564762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr20	3565546	rs235538	C	G	3325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.650;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=103;PP=2695;ReadPosRankSum=0.657;SC=CCTTGCATATCCAAATTCAAG;SOR=1.550;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=185;TCF=32;TCR=153;TR=120;WE=3565554;WS=3565536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,120:0.65:186
chr20	3571782	rs17782628	T	C	209.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=143;ReadPosRankSum=1.521;SC=AGTTCTTCCATGGTACAGACC;SOR=0.330;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=10;WE=3571790;WS=3571772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr20	3575248	rs235532	G	C	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.015;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=42;PP=906;ReadPosRankSum=-0.577;SC=GGACCACCAGGGAGGACCAAG;SOR=1.437;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=63;TCF=5;TCR=58;TR=45;WE=3575256;WS=3575238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,45:0.70:64
chr20	3576880	rs17710146	C	G	190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=121;ReadPosRankSum=0.210;SC=TCTTCCTAGACTGCCTGAGCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=3576888;WS=3576870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr20	3577062	rs3886999	G	A	452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.206;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=366;ReadPosRankSum=-1.733;SC=AACCCTCTCAGAGGAACATGT;SOR=2.001;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=81;TCF=38;TCR=43;TR=22;WE=3577070;WS=3577052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,23:0.26:87
chr20	3585602	rs616641	A	C	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.271;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=5;PP=180;ReadPosRankSum=-0.993;SC=TACTCATGTCACCTGGGGCCT;SOR=0.941;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=14;WE=3585610;WS=3585592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
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chr20	3619384	rs6051991	G	T	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.604;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=340;ReadPosRankSum=2.512;SC=GTTTGAATCAGGGAGGATGAG;SOR=1.510;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=73;TCF=70;TCR=3;TR=22;WE=3619392;WS=3619374;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,22:0.30:73
chr20	3624704	rs2246799	G	A	504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=393;ReadPosRankSum=0.539;SC=TTATATACCTGAAATTGATGG;SOR=0.415;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=68;TCF=65;TCR=3;TR=21;WE=3624712;WS=3624694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,22:0.32:69
chr20	3624830	rs2246808	G	A	1518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=36;PP=1004;ReadPosRankSum=-0.452;SC=CACTGGAGCCGTGTTTTGGCA;SOR=0.731;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=79;TCR=101;TR=65;WE=3624838;WS=3624820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,70:0.38:184
chr20	3640467	rs635674	C	T	1268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=39;NR=3;PP=1095;SC=GGTAAGCCAGCCCCTTCTCAA;SOR=4.565;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=42;WE=3640475;WS=3640457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr20	3640823	rs2853208	C	T	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.974;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=8;PP=485;ReadPosRankSum=0.079;SC=GGCTGTGCTCCGGGTCTCCCT;SOR=0.344;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=38;TCF=27;TCR=11;TR=23;WE=3640831;WS=3640813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr20	3649713	rs628965	A	G	1088.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.745;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.32;ReadPosRankSum=-0.399;SOR=0.524;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,29:0.67:43
chr20	3649721	rs628977	T	C	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=625;ReadPosRankSum=0.063;SC=AGAGAGCCCATCCTCACTCAG;SOR=0.772;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=24;TCR=20;TR=28;WE=3649729;WS=3649717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,29:0.66:44
chr20	3649803	rs678881	G	C	94.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.93;ReadPosRankSum=-1.019;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,9:0.18:49
chr20	3650066	rs630712	C	A	1932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=40;PP=1484;SC=TCAGCAGGAGCCCCTGGGGCT;SOR=1.503;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=22;TCR=40;TR=62;WE=3650074;WS=3650056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr20	3654993	rs2485700	T	C	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=100;ReadPosRankSum=-1.184;SC=TGACCACCAATCCCAGCTCCC;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=7;WE=3655001;WS=3654983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr20	3655085	rs511898	C	T	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.500;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=99;ReadPosRankSum=1.133;SC=TGTGAATTCCCGTCTCTTCTG;SOR=2.219;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=7;WE=3655093;WS=3655075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr20	3657803	rs568251	AT	GA	2037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.050;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.441;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=38;PP=2446;ReadPosRankSum=-0.598;SC=GGGCAAGAAAATGTGTGGAGC;SOR=1.807;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=62;TCF=11;TCR=51;TR=43;WE=3657812;WS=3657793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,51:0.75:68
chr20	3670512	rs17701662	A	T	274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.906;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=187;ReadPosRankSum=-1.421;SC=CAGGCAAATCATGCTGCAGCA;SOR=0.321;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=13;WE=3670520;WS=3670502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
chr20	3670945	rs609203	C	A	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.40;ReadPosRankSum=0.041;SOR=0.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,18:0.27:67
chr20	3673815	rs2474436	A	G	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=165;ReadPosRankSum=0.070;SC=AGTCACAGGCAGCAGCCTGCA;SOR=0.478;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=11;WE=3673823;WS=3673805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,11:0.28:40
chr20	3674064	rs3827110	G	C	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.628;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=6;PP=336;ReadPosRankSum=1.344;SC=TCATTCCTGTGAGTCCCACCC;SOR=0.141;SbPval=0.12;Source=Platypus;TC=66;TCF=55;TCR=11;TR=20;WE=3674072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,20:0.29:70
chr20	3674821	.	G	GACACACACAC	413.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.128;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=6.021;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.38;MQRankSum=-2.166;QD=25.86;ReadPosRankSum=0.244;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr20	3675498	rs709012	T	G	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=23;PP=657;ReadPosRankSum=-0.856;SC=GACTCCTGTGTGTACCTGGCA;SOR=0.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=44;TCR=74;TR=37;WE=3675506;WS=3675488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,39:0.31:124
chr20	3677095	rs11471725	T	TGCTG	109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=172;ReadPosRankSum=0.546;SC=GGAGGCCTTCTGCTGGCTGGA;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=4;WE=3677103;WS=3677093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr20	3677357	rs501538	T	C	4034.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=63;PP=2965;SC=TGGCCTCAGCTTTAGCCTGGA;SOR=0.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=123;TCF=60;TCR=63;TR=122;WE=3677365;WS=3677347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr20	3677736	rs673114	T	G	970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.615;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=4;PP=850;ReadPosRankSum=1.226;SC=ACCCACAGAGTACACTCAGGA;SOR=2.419;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=35;WE=3677744;WS=3677726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,34:0.74:46
chr20	3678792	rs41297628	A	C	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.476;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=238;ReadPosRankSum=0.469;SC=TGCAGGGAGGAAGAACATGGG;SOR=0.387;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=34;TCF=9;TCR=25;TR=13;WE=3678800;WS=3678782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,15:0.43:35
chr20	3678841	rs76500013	G	T	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.876;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=9.622;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=6.62;ReadPosRankSum=-0.349;SOR=0.016;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr20	3679928	rs74423567	G	A	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.717;NF=26;NR=6;PP=558;ReadPosRankSum=-0.596;SC=ATGAGCCGGCGTCAGTGCTGG;SOR=0.693;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=101;TCF=79;TCR=22;TR=32;WE=3679936;WS=3679918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,34:0.33:104
chr20	3680259	rs12624921	A	G	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.107;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=95;ReadPosRankSum=0.167;SC=TTTAATGCCAAATCAGATCTA;SOR=0.074;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=6;WE=3680267;WS=3680249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr20	3682242	rs45472900	C	T	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.141;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.466;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=374;ReadPosRankSum=1.411;SC=CCACAAGTCCCGCCTGGGTCT;SOR=0.390;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=72;TCF=15;TCR=57;TR=25;WE=3682250;WS=3682232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,27:0.37:73
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chr20	3723091	rs611073	A	G	1188.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=29;PP=941;ReadPosRankSum=-0.087;SC=GAGGTGGGGAAGGTGGGGAGT;SOR=0.656;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=72;TCF=25;TCR=47;TR=43;WE=3723099;WS=3723081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,45:0.59:76
chr20	3730524	rs62206555	G	A	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=772;ReadPosRankSum=0.418;SC=GCGGCGCCCCGGTACCCAGCG;SOR=0.712;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=65;TCF=37;TCR=28;TR=42;WE=3730532;WS=3730514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,41:0.63:65
chr20	3740620	rs11470482	GCA	G	632.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.701;NF=6;NR=11;PP=627;ReadPosRankSum=-0.145;SC=ACTCACACATGCACACACACA;SOR=0.597;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=17;WE=3740629;WS=3740610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,24:0.31:77
chr20	3759200	rs2281477	G	A	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=263;ReadPosRankSum=-1.202;SC=AGCTGGGGTGGGAAGCAGCTT;SOR=0.483;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=53;TCF=12;TCR=41;TR=16;WE=3759208;WS=3759190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,16:0.28:57
chr20	3759528	rs2281478	C	T	1692.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=36;PP=1246;ReadPosRankSum=1.046;SC=CTTCCACTCTCACAAGTGACA;SOR=0.728;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=176;TCF=87;TCR=89;TR=71;WE=3759536;WS=3759518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,74:0.41:181
chr20	3778433	rs3746644	T	C	393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.476;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=292;ReadPosRankSum=0.205;SC=TCTGCCTGTGTCAGGAGAGTT;SOR=0.156;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=58;TCF=6;TCR=52;TR=18;WE=3778441;WS=3778423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,18:0.31:59
chr20	3780857	rs140901750	T	TGGACTGGAGACCTGGTGCTAG	380.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=4.771;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.93;MQRankSum=2.125;QD=18.13;ReadPosRankSum=-0.486;SOR=0.053;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr20	3781670	.	A	G	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.713;ClippingRankSum=0.000;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.956;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=613;ReadPosRankSum=-1.041;SC=AGCTCCACCCATGCTCTGGCA;SOR=1.175;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=113;TCF=47;TCR=66;TR=39;WE=3781678;WS=3781660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,38:0.35:110
chr20	3783649	rs592687	G	C	7946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=153;NR=92;PP=2965;SC=TTTCTAGGCAGATTTGGGACT;SOR=1.296;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=245;TCF=153;TCR=92;TR=245;WE=3783657;WS=3783639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr20	3784110	rs1056720	C	T	2726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=314;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.909;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=60;PP=2143;ReadPosRankSum=1.708;SC=AGAGCCCCATCGCGCCCTGTA;SOR=0.591;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=301;TCF=158;TCR=143;TR=121;WE=3784118;WS=3784100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,121:0.39:313
chr20	3838441	rs17857295	C	G	1728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.574;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=30;PP=1242;ReadPosRankSum=-1.343;SC=CTCTGTCTACCAGAGCTACCA;SOR=1.004;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=264;TCF=165;TCR=99;TR=87;WE=3838449;WS=3838431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,89:0.34:265
chr20	3843027	rs7262903	C	A	716.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.088;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=23;PP=610;ReadPosRankSum=0.069;SC=GCATCAGGAGCAGGACACAGA;SOR=1.388;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=79;TCF=24;TCR=55;TR=29;WE=3843035;WS=3843017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,28:0.35:81
chr20	3846397	rs7269320	C	T	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-3.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.281;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=7;PP=324;ReadPosRankSum=-2.198;SC=GACAGCAGCTCTGAGAATAGG;SOR=0.422;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=39;TCR=19;TR=21;WE=3846405;WS=3846387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,23:0.36:64
chr20	3846843	rs3746660	C	T	1935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.687;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=53;PP=1499;ReadPosRankSum=-1.045;SC=TCCTGCAGTACACCTGGCCCC;SOR=0.918;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=113;TCF=33;TCR=80;TR=73;WE=3846851;WS=3846833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,75:0.65:115
chr20	3870124	rs3737084	G	C	2199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=55;PP=1755;SC=CGGATGGGAGGGGGCCGGCTC;SOR=1.700;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=26;TCR=55;TR=81;WE=3870132;WS=3870114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr20	3897559	rs10679953	T	TTTCCCC	2099.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.644;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.839;NF=19;NR=21;PP=2102;ReadPosRankSum=-0.905;SC=TGGGATTTTTTTTCCCCCATC;SOR=0.774;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=138;TCF=73;TCR=65;TR=40;WE=3897567;WS=3897549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,55:0.38:144
chr20	3915885	rs241606	A	C	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=345;ReadPosRankSum=-0.493;SC=GAAACAGGCCAAAATAGATGA;SOR=0.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=5;TCR=50;TR=19;WE=3915893;WS=3915875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,19:0.33:57
chr20	3954789	rs2143236	T	A	602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=1;PP=508;SC=TTAACTGATTTAAAAAAAACA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=3954797;WS=3954779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr20	4053254	rs6139288	A	G	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.289;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=23;PP=963;ReadPosRankSum=0.318;SC=GAAGAAGGGAAACCAGGCAGG;SOR=1.075;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=52;TCF=23;TCR=29;TR=40;WE=4053262;WS=4053244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,41:0.77:53
chr20	4123965	rs138690069	GCA	G	67.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=2;PP=63;ReadPosRankSum=-0.524;SC=ATATATATACGCACACACACA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=2;WE=4123974;WS=4123955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr20	4155935	rs2295484	G	T	3165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.146;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=72;PP=2408;ReadPosRankSum=1.160;SC=GTCCAGCCCAGCCACCTCCCC;SOR=0.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=159;TCF=58;TCR=101;TR=113;WE=4155943;WS=4155925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,117:0.69:169
chr20	4157853	rs1535225	G	A	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=256;ReadPosRankSum=0.913;SC=GAGGACCTTCGTTGGTTGCCA;SOR=0.368;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=12;WE=4157861;WS=4157845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr20	4158164	rs11552911	C	A	1812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.023;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=52;PP=1517;ReadPosRankSum=-0.021;SC=GCTACCTTACCAACCACGGCC;SOR=1.420;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=115;TCF=33;TCR=82;TR=68;WE=4158172;WS=4158154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,68:0.59:116
chr20	4202802	rs835873	A	G	1980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=51;PP=1607;SC=GACCGATACTATTTAGCTGCT;SOR=3.021;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=11;TCR=51;TR=62;WE=4202810;WS=4202792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr20	4229514	rs184418609	T	C	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=17.20;ReadPosRankSum=-0.282;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr20	4680844	.	G	A	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.775;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=14;PP=384;ReadPosRankSum=0.224;SC=ATCATGAGCCGTTGCTAATGC;SOR=0.191;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=20;WE=4680852;WS=4680834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr20	4705718	rs2245220	C	T	2638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=65;PP=2148;SC=ATCTGGCTCACGGTGAAATAA;SOR=3.098;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=13;TCR=65;TR=78;WE=4705726;WS=4705708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr20	4705756	rs2756263	T	C	1364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=44;PP=1048;SC=CAGTACAGAGTGCAGCAGCGA;SOR=4.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=4;TCR=44;TR=48;WE=4705764;WS=4705746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr20	4713176	rs2735677	A	G	1021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.318;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=780;ReadPosRankSum=-0.320;SC=GCCATGCAGTATGGGGAAGTG;SOR=0.887;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=137;TCF=65;TCR=72;TR=45;WE=4713184;WS=4713166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,45:0.32:139
chr20	4768136	rs55900827	T	C	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=543;ReadPosRankSum=0.279;SC=CTGCAAAAGCTGGCTTCGAGA;SOR=1.426;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=25;WE=4768144;WS=4768126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,25:0.74:34
chr20	4768475	rs111533115	A	AAGGGACT	441.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.83;ReadPosRankSum=-0.011;SOR=0.152;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,14:0.28:50
chr20	4770440	rs2422992	G	A	281.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=261;SC=ACGATACTCAGAATGTACTCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=4770448;WS=4770430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr20	4771336	rs8122874	G	T	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=354;ReadPosRankSum=-0.546;SC=TGGCCAGTGCGACAGCACCCA;SOR=1.022;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=17;WE=4771344;WS=4771326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr20	4781496	rs3818277	T	C	104.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=68;ReadPosRankSum=0.079;SC=CCTTCCCCCATGCAGGAGCCC;SOR=0.090;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=7;WE=4781504;WS=4781486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr20	4880132	rs71993570	AGCTCAATGCCTTCTGC	A	1249.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=2;PP=2957;SC=CAAACGGCGCAGCTCAATGCC;SOR=4.479;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=12;WE=4880155;WS=4880122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr20	5149064	rs6116671	A	C	41.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr20	5149065	rs6116672	A	C	41.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.92;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr20	5159344	rs2295508	C	T	224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=175;ReadPosRankSum=1.355;SC=TGAGCTGTCCCGGGGGACTCA;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=9;WE=5159352;WS=5159335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr20	5169877	rs6038087	A	G	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=35;PP=853;ReadPosRankSum=1.087;SC=TCCCTCACCCATCTTCTGCCT;SOR=0.551;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=52;TCF=7;TCR=45;TR=41;WE=5169885;WS=5169867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,41:0.77:53
chr20	5282559	.	A	G	120	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=10;NR=0;PP=120;QD=15.4771212547;SC=TGCAGCATTCAGCTTCTTGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=10;WE=5282567;WS=5282558;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:16,10:0.38:26
chr20	5283256	rs3746682	C	G	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=4.141;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.54;ReadPosRankSum=1.691;SOR=1.064;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,49:0.27:179
chr20	5296488	rs910971	G	C	1966.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=274;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.470;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=39;PP=1485;ReadPosRankSum=-2.046;SC=GACCAAGAATGGGGAGTCCTA;SOR=0.746;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=265;TCF=144;TCR=121;TR=90;WE=5296496;WS=5296478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,91:0.33:272
chr20	5296549	rs910972	C	T	2180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.220;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=55;PP=1642;ReadPosRankSum=2.220;SC=GGCGCGCGCCCGGGCTGGGAC;SOR=0.856;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=244;TCF=104;TCR=140;TR=93;WE=5296557;WS=5296539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,96:0.39:249
chr20	5296651	rs910973	T	G	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=33;PP=1135;ReadPosRankSum=-0.651;SC=GCGGCCGCACTGTCGGCGTCT;SOR=0.722;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=211;TCF=109;TCR=102;TR=67;WE=5296659;WS=5296641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,69:0.32:213
chr20	5297172	rs4544519	T	G	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.735;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=27;PP=563;ReadPosRankSum=1.150;SC=TGCGCTCTGCTGCTCCGGAAG;SOR=1.213;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=86;TCF=17;TCR=69;TR=31;WE=5297180;WS=5297162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,33:0.37:89
chr20	5454400	rs606389	A	T	1386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.20;QD=30.82;SOR=1.714;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr20	5454686	rs1060236	A	G	43.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.50;QD=21.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr20	5528518	rs3747910	A	G	750.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.394;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=30;PP=600;ReadPosRankSum=-1.399;SC=CAAATACAAAACACATAAAAT;SOR=2.464;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=89;TCF=11;TCR=78;TR=31;WE=5528526;WS=5528508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,31:0.34:92
chr20	5528534	rs3747911	A	G	545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.628;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=478;ReadPosRankSum=1.080;SC=AAAATACTGTAATTTTATGGT;SOR=2.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=68;TCF=5;TCR=63;TR=23;WE=5528542;WS=5528524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,22:0.31:70
chr20	5542052	rs2273371	A	G	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.689;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=11;PP=348;ReadPosRankSum=-0.009;SC=GACAGGAATGAAAGAATTTTT;SOR=0.783;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=52;TCF=31;TCR=21;TR=19;WE=5542060;WS=5542042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr20	5542092	rs2273372	T	C	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.345;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=15;PP=346;ReadPosRankSum=0.482;SC=TAGAATGTGCTGCATAGAGAA;SOR=1.538;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=58;TCF=27;TCR=31;TR=22;WE=5542100;WS=5542082;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,25:0.41:61
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chr20	5551034	rs1056244	G	C	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=6.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=468;ReadPosRankSum=-0.423;SC=AAAACAATGGGTTTTCTCTTT;SOR=0.242;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=0;TCR=65;TR=23;WE=5551042;WS=5551024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,22:0.34:65
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chr20	5844121	rs1699232	CA	TG	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-4.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.869;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=716;ReadPosRankSum=1.573;SC=TGGTGCCGGGCAGTGTGCAGG;SOR=1.310;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=54;TCF=6;TCR=48;TR=15;WE=5844130;WS=5844111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,17:0.33:52
chr20	5903067	rs6085324	T	A	2447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.779;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=34;PP=1828;ReadPosRankSum=1.407;SC=AGCTGATGCCTCGGAAGCCCA;SOR=0.617;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=117;TCF=74;TCR=43;TR=89;WE=5903075;WS=5903057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,90:0.74:121
chr20	5903323	rs910122	G	A	2970.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.408;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=40;PP=2298;ReadPosRankSum=1.078;SC=AAAGGGGAGCGAGGGGAAGAT;SOR=1.000;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=148;TCF=92;TCR=56;TR=105;WE=5903331;WS=5903313;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,107:0.72:149
chr20	5903517	rs236151	A	G	6361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=96;NR=98;PP=2965;SC=TGGAGAGGAGACAGGGAGCCA;SOR=0.724;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=195;TCF=97;TCR=98;TR=194;WE=5903525;WS=5903507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr20	5903848	rs236152	C	G	2650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.252;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=38;PP=2143;ReadPosRankSum=-1.962;SC=GGCGTCCAGGCCCCTGAGGAC;SOR=1.013;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=141;TCF=81;TCR=60;TR=95;WE=5903856;WS=5903838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,98:0.68:144
chr20	5903894	rs236153	A	G	2603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.872;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=46;PP=2071;ReadPosRankSum=0.448;SC=GAGGAAGTGAAGAATACAGGG;SOR=0.498;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=132;TCF=68;TCR=64;TR=89;WE=5903902;WS=5903884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,92:0.67:137
chr20	5904040	rs742711	G	A	2736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=57;PP=1934;ReadPosRankSum=1.118;SC=GGAAAGGGACGCCATCACAGA;SOR=0.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=162;TCF=73;TCR=89;TR=104;WE=5904048;WS=5904030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,108:0.64:168
chr20	5905550	rs236155	G	A	827.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=1;PP=672;ReadPosRankSum=-1.073;SC=TTGCACTCATGCTCCATCAAA;SOR=0.846;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=28;WE=5905558;WS=5905540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,30:0.71:42
chr20	5905779	rs2821	C	A	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.118;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=26;PP=718;ReadPosRankSum=-1.222;SC=CACCATTTATCTACCCAAGGG;SOR=0.263;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=96;TCF=24;TCR=72;TR=37;WE=5905787;WS=5905769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,40:0.39:103
chr20	5935385	rs236114	T	C	1774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=33;PP=1297;SC=ATCTTACCAATGTATTCGAGG;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=24;TCR=33;TR=57;WE=5935393;WS=5935375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr20	5937719	rs41282142	A	G	2124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.431;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=8;PP=1714;ReadPosRankSum=-1.659;SC=AGAGTTCTGTATAAAGAGGAT;SOR=0.420;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=101;TCF=91;TCR=10;TR=71;WE=5937727;WS=5937709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,72:0.70:103
chr20	5939214	rs3761873	A	C	940.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=709;ReadPosRankSum=-0.747;SC=CAAGAATGTCAGAGCAAATTA;SOR=0.525;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=38;TCR=10;TR=33;WE=5939222;WS=5939204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,35:0.70:50
chr20	5948706	rs236100	A	G	2032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.25;SOR=2.560;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr20	5948712	rs236101	C	T	1839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.80;SOR=2.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr20	5953833	rs16991617	A	G	2344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.335;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=46;PP=1660;ReadPosRankSum=1.297;SC=GAAAAAGTCAAATGCTACAGG;SOR=0.389;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=133;TCF=51;TCR=82;TR=80;WE=5953841;WS=5953823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,87:0.62:141
chr20	5963586	rs55949141	T	G	1589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=8;PP=1324;ReadPosRankSum=-0.154;SC=GAAAAAATGTTTTTTCTGCTT;SOR=0.946;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=64;TCR=11;TR=55;WE=5963594;WS=5963576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,55:0.74:74
chr20	5975124	rs11472210	G	GAC	66.14	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=157;ReadPosRankSum=-0.210;SC=CAGACAGACAGACACACACAC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=5;WE=5975132;WS=5975114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr20	5987212	rs149662716	AGGC	A	131.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.210;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.782;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.431;NF=0;NR=4;PP=110;ReadPosRankSum=-0.674;SC=CGTACCGATGAGGCGGCGGCG;SOR=3.590;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=4;WE=5987222;WS=5987202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr20	5987267	rs2294971	A	T	90.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=62.13;MQRankSum=0.253;NF=0;NR=4;PP=63;ReadPosRankSum=0.524;SC=TCAGGTAACAAGCTCTGGGTG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=5987275;WS=5987257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr20	5988095	rs4813786	A	G	2452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=65;PP=1837;ReadPosRankSum=0.061;SC=CTCTCCTAACATTAACTTTGA;SOR=0.662;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=143;TCF=42;TCR=101;TR=92;WE=5988103;WS=5988085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,97:0.65:149
chr20	5990726	rs59996436	T	TG	502.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.69;MQRankSum=3.282;QD=13.23;ReadPosRankSum=0.509;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr20	6011882	rs2423132	G	T	472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=1;PP=353;SC=TAATGCATATGAGTACTCTTC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=6011890;WS=6011872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr20	6033004	rs6117050	G	A	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.09;ReadPosRankSum=0.621;SOR=0.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr20	6033025	rs1884643	T	C	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=1.971;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.23;ReadPosRankSum=0.662;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr20	6033628	rs751681	T	G	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=2.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=174;ReadPosRankSum=0.732;SC=CTCCCCTGTCTGCTTTTGCCC;SOR=0.193;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=11;WE=6033636;WS=6033618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,11:0.31:36
chr20	6064554	rs753929	A	G	1497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=1;PP=1213;SC=AAGTGTCAGGACTATTTATAA;SOR=6.184;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=42;WE=6064562;WS=6064544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr20	6064635	rs753928	G	A	3134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=29;PP=2315;SC=CTCCCCAAAAGCCACTTAAAA;SOR=1.911;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=66;TCR=29;TR=95;WE=6064643;WS=6064625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr20	6064710	rs753927	A	G	4116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=82;PP=2965;SC=AGGTGAGGCCAAACTCAGGCA;SOR=1.179;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=136;TCF=53;TCR=83;TR=135;WE=6064718;WS=6064700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr20	6064839	rs2232077	T	C	994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=29;PP=851;SC=TCAACCTCTCTTCACATGCAC;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=6064847;WS=6064829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr20	6065729	rs2232074	C	T	4097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=43.59;ReadPosRankSum=-0.692;SOR=0.776;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,93:0.99:94
chr20	6065729	.	CTT	TTC	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=58;NR=25;PP=2947;QD=20;SC=GGATTTGTGTCTTTTTGCACA;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=90;TCF=61;TCR=29;TR=83;WE=6065739;WS=6065719;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,83:0.92:90
chr20	6065731	rs2232073	T	C	4097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=43.13;ReadPosRankSum=-0.657;SOR=0.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,94:0.99:95
chr20	6069562	rs6117076	C	T	2121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=21;PP=1670;SC=TGAGCCACCGCGTCTGCCCTG;SOR=1.678;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=47;TCR=21;TR=68;WE=6069570;WS=6069552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr20	6077726	rs6076938	T	C	2280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=59;PP=1848;ReadPosRankSum=1.453;SC=ACAGAAATGTTATAAATATAA;SOR=4.205;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=62;TCF=3;TCR=59;TR=62;WE=6077734;WS=6077716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,67:0.99:68
chr20	6096695	rs2295435	C	T	1970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=39;PP=1637;SC=GATATATCTGCAAAAATGAAA;SOR=1.092;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=66;WE=6096703;WS=6096685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr20	6100002	rs6038363	C	A	1304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=0;PP=1148;SC=TGGTGATGCACCAGACAGGGT;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=38;WE=6100010;WS=6099992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr20	6100088	rs10373	A	G	2355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=36;PP=1866;SC=CTCCTCCAACATGAAGGTCTC;SOR=0.934;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=43;TCR=36;TR=79;WE=6100096;WS=6100078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr20	6100230	rs2273423	A	C	1675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=37;PP=1281;SC=CTGCTGAACAAAAAGGCAGAC;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=52;WE=6100238;WS=6100220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr20	6751034	rs1049007	A	G	1320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.616;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=37;PP=972;ReadPosRankSum=0.957;SC=GCAGGCACTCAGGTCAGCCGG;SOR=0.602;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=172;TCF=57;TCR=115;TR=56;WE=6751042;WS=6751024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,61:0.34:181
chr20	6759115	rs235768	A	T	2843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.428;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=67;PP=2087;ReadPosRankSum=-0.792;SC=CCGTGACCAGACTTTTGGACA;SOR=0.732;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=289;TCF=122;TCR=167;TR=115;WE=6759123;WS=6759105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,121:0.40:303
chr20	7980390	rs1012891	C	T	973.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=8.085;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.28;ReadPosRankSum=0.555;SOR=1.361;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,45:0.29:155
chr20	7999537	rs2294247	C	A	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.818;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=1;PP=492;ReadPosRankSum=0.829;SC=ATGACATCTCCAGGTCTTCAA;SOR=1.038;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=80;TCF=76;TCR=4;TR=27;WE=7999545;WS=7999527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,27:0.34:80
chr20	7999642	rs2294248	G	A	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.583;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.949;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=29;PP=849;ReadPosRankSum=-0.073;SC=CATACTGCACGTGGATGTCAC;SOR=0.525;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=188;TCF=88;TCR=100;TR=58;WE=7999650;WS=7999632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,60:0.32:188
chr20	8626903	rs1018443	C	T	1227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=8.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FS=6.838;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.11;ReadPosRankSum=-1.016;SOR=1.394;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:146,55:0.27:201
chr20	8628696	rs2235947	G	A	1536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.321;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=40;PP=1174;ReadPosRankSum=0.466;SC=CAGCCTAAGTGGGAGTGTGGA;SOR=1.166;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=85;TCF=28;TCR=57;TR=57;WE=8628704;WS=8628686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,57:0.68:84
chr20	8637727	rs6140670	G	A	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=8.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.28;ReadPosRankSum=1.301;SOR=0.062;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
chr20	8639443	rs2076640	T	C	2397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=67;PP=2075;SC=GATCGTTAGGTTAGTTTCCTC;SOR=6.244;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=69;TCF=2;TCR=67;TR=69;WE=8639451;WS=8639433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr20	8639474	rs2076639	C	A	1848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=52;PP=1589;SC=GCATTCCTTTCGGTCTGAAAT;SOR=6.556;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=53;TCF=1;TCR=52;TR=53;WE=8639482;WS=8639464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr20	8678446	rs2295179	G	A	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=25;PP=834;SC=GTATATGAATGTTACTAAGAG;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=8678454;WS=8678436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr20	8698565	rs6039243	T	C	1154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=43;PP=1018;SC=GGGCTGTGCGTGGTGGCTCAT;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=43;WE=8698573;WS=8698555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr20	8703145	rs6086563	C	G	2085.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-6.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.191;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=73;PP=1739;ReadPosRankSum=-0.108;SC=TGGTCACTTTCTGCCATCTAG;SOR=1.322;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=123;TCF=8;TCR=115;TR=77;WE=8703153;WS=8703135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,76:0.62:123
chr20	8703252	rs6086564	C	T	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=260;ReadPosRankSum=-0.091;SC=GAAGATATGGCGTTTAGAAAA;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=12;WE=8703260;WS=8703242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr20	8705496	rs6056043	A	C	1551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=49;PP=1235;SC=CTTAATAGAGAGATTTATGCT;SOR=4.654;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=4;TCR=49;TR=53;WE=8705504;WS=8705486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
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chr20	8741247	rs3886935	C	T	252.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.21;ReadPosRankSum=0.740;SOR=0.097;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,14:0.23:60
chr20	8745768	rs186797959	C	T	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=275;ReadPosRankSum=-1.220;SC=CCTTAGCTTTCATATTCATTT;SOR=0.368;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=14;WE=8745776;WS=8745758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,15:0.52:29
chr20	8755243	rs2235613	T	C	944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.349;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=730;ReadPosRankSum=1.322;SC=ACCTCGCTGCTCTGGATGCTG;SOR=0.336;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=141;TCF=107;TCR=34;TR=40;WE=8755251;WS=8755233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,42:0.30:141
chr20	8769180	rs2327089	C	T	1277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.328;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=898;ReadPosRankSum=-0.895;SC=GAAGTAAGCCCTCATTCCCAT;SOR=0.548;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=159;TCF=59;TCR=100;TR=54;WE=8769188;WS=8769170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,57:0.34:166
chr20	8770108	rs4633993	A	C	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=190;ReadPosRankSum=-0.229;SC=GTCTGAGATTACCATTTGTCA;SOR=0.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=53;TCR=2;TR=13;WE=8770116;WS=8770098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,14:0.25:57
chr20	8770130	rs2327090	A	G	278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=2.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.57;ReadPosRankSum=0.760;SOR=1.683;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,14:0.23:61
chr20	8770282	rs6039269	G	A	1107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.405;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=30;PP=670;ReadPosRankSum=-0.513;SC=TGGTGAGCTCGCTGTGAGCTT;SOR=0.450;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=130;TCF=42;TCR=88;TR=48;WE=8770290;WS=8770272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,53:0.40:134
chr20	8773155	rs6056118	C	T	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=307;ReadPosRankSum=-1.270;SC=TTCTTCCTTTCTGGCCCCTTG;SOR=0.631;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=14;WE=8773163;WS=8773145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
chr20	8773295	rs6056119	T	C	1027.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.140;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.689;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=24;PP=678;ReadPosRankSum=-0.578;SC=CATCTTTTTGTGTCTGGATTT;SOR=0.818;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=120;TCF=59;TCR=61;TR=45;WE=8773303;WS=8773285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,49:0.40:121
chr20	8782901	rs6056128	G	C	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=3.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=56;ReadPosRankSum=2.189;SC=GGACTTGCTCGTTTGTCCTTC;SOR=0.606;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=6;WE=8782909;WS=8782891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,6:0.20:30
chr20	8862157	rs141768696	A	AAGTT	612.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=635;ReadPosRankSum=-0.216;SC=ATGATATTTTAAGTTAATGTA;SOR=0.275;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=15;WE=8862165;WS=8862147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr20	8862593	rs41275590	A	G	187.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=145;ReadPosRankSum=0.903;SC=TCTTCCCGAGAAGCATCCCTT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=8862601;WS=8862583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr20	9288522	rs6077510	G	A	611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.493;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=15;PP=549;ReadPosRankSum=1.140;SC=GCAAGAAGGAGCAGTTTTTGA;SOR=0.343;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=24;WE=9288530;WS=9288512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,24:0.67:36
chr20	9386049	rs55990277	A	T	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.611;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.21;ReadPosRankSum=0.882;SOR=0.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,9:0.20:46
chr20	9388457	rs77137692	T	C	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.980;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=340;ReadPosRankSum=-0.069;SC=AGCCTTTACCTTTCAATTTGT;SOR=0.892;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=47;TCF=44;TCR=3;TR=18;WE=9388465;WS=9388447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,18:0.36:50
chr20	9389232	rs11470510	GGGTTTGAT	G	390.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.492;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.543;NF=9;NR=2;PP=1218;ReadPosRankSum=0.384;SC=TTTTCGGTGAGGGTTTGATGG;SOR=1.002;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=48;TCF=34;TCR=14;TR=11;WE=9389247;WS=9389222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,14:0.25:55
chr20	9401928	rs6056608	G	A	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=728;ReadPosRankSum=0.161;SC=CTTTGCTCTCGTTCGTGCTGC;SOR=0.399;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=16;WE=9401948;WS=9401918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr20	9401940	rs6056609	A	G	405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=3.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=728;ReadPosRankSum=0.413;SC=TCGTGCTGCTACAGGTTATAT;SOR=0.668;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=15;WE=9401948;WS=9401918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,15:0.58:26
chr20	9424609	.	AT	A	118.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.811;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=91;ReadPosRankSum=0.904;SC=TAGTGACTTAATTTTTTTTGT;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=6;WE=9424617;WS=9424599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr20	9453567	rs2206389	T	C	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=25;PP=755;SC=AGCCACCAGATCTCTAGCTAA;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=9453575;WS=9453557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr20	9510263	rs2232268	T	A	852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.392;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.975;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=7;PP=572;ReadPosRankSum=-0.050;SC=ACCAGAGCTCTCTGCTTTTCT;SOR=1.402;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=42;TCF=30;TCR=12;TR=28;WE=9510271;WS=9510253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,33:0.69:48
chr20	9543622	rs2297345	C	T	3310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=58;PP=2743;SC=AAGGTAGCTGCTGTACATGTC;SOR=1.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=38;TCR=58;TR=96;WE=9543630;WS=9543612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr20	9543681	rs2297346	C	T	2092.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=15.213;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.33;ReadPosRankSum=0.281;SOR=2.236;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,55:0.64:86
chr20	9543688	rs2297347	T	G	2021.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=9.075;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.59;ReadPosRankSum=-0.443;SOR=1.877;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,51:0.65:79
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chr20	9560712	rs3746545	A	G	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=0;PP=424;SC=TTTACAATCCAATCGTATAAA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=9560720;WS=9560702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr20	9625003	rs4816157	G	A	1394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.080;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=48;PP=1126;ReadPosRankSum=-0.420;SC=AAATATAAATGGAAAAGAGGC;SOR=0.458;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=143;TCF=16;TCR=127;TR=55;WE=9625011;WS=9624993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,55:0.37:149
chr20	10019093	rs575534	A	G	2123.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.652;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=50;PP=1601;ReadPosRankSum=0.872;SC=CCATTAATGGACTTAGTGCTT;SOR=0.501;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=252;TCF=105;TCR=147;TR=91;WE=10019101;WS=10019083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,93:0.36:256
chr20	10023689	rs4813909	G	A	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=332;ReadPosRankSum=0.135;SC=AGCTAAATATGGATTTTTAAT;SOR=1.426;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=16;WE=10023697;WS=10023679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr20	10026357	rs685723	T	C	663.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=574;ReadPosRankSum=-1.068;SC=TAAAATTGTCTAGCAATTTTG;SOR=0.677;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=106;TCF=24;TCR=82;TR=29;WE=10026365;WS=10026347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,30:0.28:109
chr20	10030188	rs652633	T	A	1418.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.897;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=30;PP=1073;ReadPosRankSum=0.777;SC=CCAAATCCACTGTGGGCCCTT;SOR=0.712;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=185;TCF=92;TCR=93;TR=61;WE=10030196;WS=10030178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,63:0.32:195
chr20	10030452	rs524625	G	A	1243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.496;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=28;PP=901;ReadPosRankSum=-0.282;SC=GGATCGTATGGACCTAAGAAA;SOR=0.669;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=150;TCF=81;TCR=69;TR=50;WE=10030460;WS=10030442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,55:0.35:155
chr20	10030931	rs656111	C	A	816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=6.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.109;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=29;PP=613;ReadPosRankSum=0.013;SC=AAAAGATGACCGAATTTTAGT;SOR=2.126;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=87;TCF=9;TCR=78;TR=30;WE=10030939;WS=10030921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,32:0.35:92
chr20	10032413	rs683145	T	G	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.738;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.289;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=21;PP=394;ReadPosRankSum=0.817;SC=AATCTGGAGCTTTAATAGATG;SOR=1.213;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=89;TCF=27;TCR=62;TR=27;WE=10032421;WS=10032403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,29:0.31:93
chr20	10277452	.	A	C	179	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=6;NR=0;PP=179;QD=35.6285354245;SC=TATCGGTATTATCTAATGCCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=10277460;WS=10277451;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr20	10280083	rs363006	G	A	719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=21;PP=532;ReadPosRankSum=0.079;SC=CAGTCAGCAAGTCCCTACTGC;SOR=0.586;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=24;WE=10280091;WS=10280073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,27:0.82:33
chr20	10438780	rs6104617	A	G	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.950;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=2.562;SC=CCAAATAAAAAGAAATTTTAA;SOR=0.160;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=5;WE=10438788;WS=10438770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,4:0.27:15
chr20	10439002	rs6039947	T	A	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.227;HP=10;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.772;NF=5;NR=15;PP=274;ReadPosRankSum=0.644;SC=CTCTGCAAAATTTTTTTTTTT;SOR=0.495;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=57;TCF=13;TCR=44;TR=20;WE=10439010;WS=10438992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr20	10439037	rs6039948	A	G	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=58;ReadPosRankSum=-0.769;SC=GTTCTGGGGCATGTGTGCAGG;SOR=0.105;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=7;WE=10439045;WS=10439027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,7:0.25:28
chr20	10541542	rs139067448	T	C	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-8.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=48;PP=729;ReadPosRankSum=1.649;SC=CAATTATGTTTGACTCTGACT;SOR=0.802;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=148;TCF=10;TCR=138;TR=51;WE=10541550;WS=10541532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,53:0.35:151
chr20	10579488	rs79265163	G	C	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.380;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=396;ReadPosRankSum=0.949;SC=GGAGTGGAGAGTCCCACTTGC;SOR=1.469;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=74;TCF=16;TCR=58;TR=22;WE=10579496;WS=10579478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,22:0.29:76
chr20	10620386	rs1051419	A	G	790.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.390;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=4.579;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.97;ReadPosRankSum=-1.097;SOR=0.367;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:117,42:0.26:159
chr20	10622080	rs3215563	CA	C	116.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.34;ReadPosRankSum=-1.591;SOR=0.563;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr20	10624396	rs2273059	T	C	1378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.478;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=34;PP=1081;ReadPosRankSum=-0.663;SC=GGTAAAGCCATTGGGAAAACC;SOR=0.461;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=196;TCF=83;TCR=113;TR=64;WE=10624404;WS=10624386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,66:0.33:200
chr20	10624924	.	TCACACACACACACACA	T	225.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.547;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.55;MQRankSum=0.863;QD=6.84;ReadPosRankSum=0.617;SOR=0.602;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr20	10625804	rs1801140	T	G	1073.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=15;PP=801;ReadPosRankSum=-1.248;SC=TGTTACAGGTTGTTCCTTCCC;SOR=0.689;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=88;TCF=52;TCR=36;TR=38;WE=10625812;WS=10625794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,40:0.44:90
chr20	10627488	.	AACTTTCAAC	A	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.517;ClippingRankSum=0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.74;MQRankSum=-1.066;QD=4.51;ReadPosRankSum=0.962;SOR=1.302;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr20	10629525	rs35308216	T	C	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.085;HP=1;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;ReadPosRankSum=-0.502;SC=GGAATTTCTATGTGCATGCCT;SOR=1.767;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=26;TCF=11;TCR=15;TR=11;WE=10629533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr20	10632861	rs45575136	G	A	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.236;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.862;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=28;PP=773;ReadPosRankSum=-0.744;SC=AAGTTCCCCCGTTGAGACACG;SOR=0.536;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=91;TCF=29;TCR=62;TR=42;WE=10632869;WS=10632851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,40:0.43:92
chr20	10633313	rs6040055	T	C	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.334;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=308;ReadPosRankSum=-0.765;SC=ACAATTCAAATGGAAGACTGC;SOR=1.648;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=47;TCF=14;TCR=33;TR=22;WE=10633321;WS=10633303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,23:0.47:49
chr20	10637057	rs10485741	T	C	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.478;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=491;ReadPosRankSum=-0.379;SC=TGCAGTCACCTGGGAGTTTGC;SOR=0.311;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=105;TCF=66;TCR=39;TR=34;WE=10637065;WS=10637047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,35:0.33:105
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chr20	10653469	rs1051415	C	T	2546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.681;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=40;PP=1761;ReadPosRankSum=-0.636;SC=TGCAGGGCCCCCCGGCCGTGA;SOR=0.871;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=277;TCF=162;TCR=115;TR=102;WE=10653477;WS=10653459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,109:0.37:292
chr20	11008754	rs75044160	C	A	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=291;ReadPosRankSum=-0.879;SC=CCATTTTATACACACTGCTCA;SOR=1.371;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=12;WE=11008762;WS=11008744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr20	11790885	rs3036550	C	CTT	226.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.637;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=152;ReadPosRankSum=1.056;SC=TTTCCTCATACTTCACCTGCC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=6;WE=11790893;WS=11790875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr20	11791008	rs803665	C	T	2661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=28;PP=1938;SC=CCACTAGCTTCGCCTCTGTCC;SOR=1.275;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=48;TCR=28;TR=76;WE=11791016;WS=11790998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr20	11830180	rs33956420	CT	C	70.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=1.838;QD=2.14;ReadPosRankSum=-0.153;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr20	11871253	rs11908312	G	C	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.278;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.802;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=113;ReadPosRankSum=0.494;SC=CAGTTCGTGGGACAAGGACGA;SOR=2.419;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=7;WE=11871261;WS=11871247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr20	11903654	rs35364034	G	A	3980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.515;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=71;PP=2962;ReadPosRankSum=0.498;SC=AAGATCTGGCGTTGAGCATTG;SOR=0.428;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=232;TCF=124;TCR=108;TR=143;WE=11903662;WS=11903644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,148:0.63:236
chr20	12989901	rs3761896	T	C	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=213;ReadPosRankSum=-2.244;SC=TCCCGGGCTCTGTCACTTCAC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=12;WE=12989909;WS=12989891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr20	12990044	rs3761895	T	C	4428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=64;NR=79;PP=2962;SC=TAAGAGGCACTCTCCCCTACT;SOR=0.886;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=144;TCF=65;TCR=79;TR=143;WE=12990065;WS=12990034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr20	12990057	rs3761894	T	A	1108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.167;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=32;PP=811;ReadPosRankSum=-0.630;SC=CCCCTACTCTTCTCTGAATTA;SOR=0.467;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=140;TCF=54;TCR=86;TR=54;WE=12990065;WS=12990034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,54:0.38:142
chr20	13029764	rs1431433	A	C	9056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=123;NR=176;PP=2965;SC=AGCTGTGGAAAGAAAAGAACA;SOR=1.103;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=300;TCF=123;TCR=177;TR=299;WE=13029772;WS=13029754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
chr20	13029790	rs6078899	C	T	1993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=293;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.547;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=56;PP=1561;ReadPosRankSum=-1.051;SC=TACGTATGCGCACCTCCCTGG;SOR=0.814;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=277;TCF=113;TCR=164;TR=91;WE=13029798;WS=13029780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:195,92:0.32:287
chr20	13029862	rs919604	C	T	6075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=111;PP=2965;SC=AGGTGCAGATCCTAGAAAGCA;SOR=1.342;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=177;TCF=66;TCR=111;TR=177;WE=13029870;WS=13029852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr20	13029920	rs934335	C	G	5481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=87;PP=2965;SC=ATCTCCACCTCCTAAACCCCA;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=74;TCR=88;TR=161;WE=13029928;WS=13029910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr20	13053018	rs243887	T	G	2011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.888;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;PP=1572;ReadPosRankSum=1.254;SC=TCTGTTTGATTTGATGGAGAG;SOR=0.890;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=89;TCF=49;TCR=40;TR=64;WE=13053026;WS=13053008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,69:0.73:94
chr20	13053035	rs243888	A	G	2029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.966;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=37;PP=1503;ReadPosRankSum=-0.569;SC=AGAGGGTATCAGACGACTATA;SOR=0.437;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=102;TCF=53;TCR=49;TR=74;WE=13053043;WS=13053025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,81:0.75:108
chr20	13055258	rs6131426	C	A	844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=1226;ReadPosRankSum=1.260;SC=GTGTTATAAACTGCAGAAAGA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=29;WE=13055275;WS=13055248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr20	13055267	rs150837910	G	GA	565.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=1244;ReadPosRankSum=0.629;SC=ACTGCAGAAAGAAAAAAAAGA;SOR=1.206;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=22;WE=13055275;WS=13055248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,25:0.61:41
chr20	13060220	rs8119959	G	A	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.324;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=4;PP=721;ReadPosRankSum=-0.171;SC=TGAGTAAAATGAAACTACTGA;SOR=1.859;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=34;WE=13060228;WS=13060210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,35:0.73:48
chr20	13060331	rs8120012	G	A	2117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.721;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=33;PP=1599;ReadPosRankSum=-0.830;SC=CTTCTTTTCTGGTTTGTTGCT;SOR=0.624;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=114;TCF=65;TCR=49;TR=74;WE=13060339;WS=13060321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,78:0.66:119
chr20	13073963	rs1030561	T	C	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-0.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=206;ReadPosRankSum=-0.439;SC=CTAACTGCTATACATGATTTT;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=10;WE=13073971;WS=13073956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr20	13074235	rs708937	G	A	2262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.71;SOR=2.546;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr20	13074235	.	GTGTATTTT	ATGTATTTA,ATGTATTTT	709	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=5,11;NR=20,46;PP=413,709;QD=18.6587149945;SC=GTGAGTATCAGTGTATTTTCT;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=11;TCR=46;TR=25,57;WE=13074251;WS=13074225;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.44:57
chr20	13074243	rs1011290	T	A	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.757;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=1.255;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.44;ReadPosRankSum=-0.060;SOR=0.446;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,26:0.44:59
chr20	13074330	rs41392045	A	C	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=3.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=253;ReadPosRankSum=-2.024;SC=ACGTAGCCTCATGAAACACAA;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=10;WE=13074338;WS=13074320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
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chr20	13610464	rs35023928	A	G	1305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=0;PP=1069;ReadPosRankSum=-1.687;SC=TTTGCTTCCAATTCCTCTCTG;SOR=1.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=66;TCR=0;TR=42;WE=13610472;WS=13610454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,43:0.63:68
chr20	13698006	rs4239710	T	C	1976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=21;PP=1561;SC=GCCTGGTGTCTATGGTTACCT;SOR=1.430;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=58;WE=13698014;WS=13697996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr20	13740566	rs35664838	T	C	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.160;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=195;ReadPosRankSum=0.181;SC=TCAGATCTTATGGTCACTCTC;SOR=0.074;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=12;WE=13740574;WS=13740556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr20	13750448	rs35589194	C	CA	442.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.72;QD=29.52;SOR=2.448;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr20	13755728	rs67609153	CA	C	32.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=4.472;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=2.34;ReadPosRankSum=-0.714;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr20	13765942	rs3831170	CCCGCGGGG	C	831.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=11.101;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.39;MQRankSum=6.255;QD=8.08;ReadPosRankSum=-1.626;SOR=0.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,30:0.29:103
chr20	13769127	rs6042362	A	G	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.197;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=798;ReadPosRankSum=0.121;SC=AGATGATGTAACCTTCTGGAA;SOR=0.446;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=49;TCF=32;TCR=17;TR=36;WE=13769135;WS=13769117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,38:0.70:54
chr20	13782400	rs45510491	G	A	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.81;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=1.493;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,25:0.66:38
chr20	13782409	rs1015517	A	G	1404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.32;SOR=7.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr20	13830102	rs2073289	C	T	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.494;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=20;PP=727;ReadPosRankSum=-0.006;SC=AACTGATTCCCGTGAGCAGGT;SOR=0.421;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=125;TCF=72;TCR=53;TR=43;WE=13830110;WS=13830092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,42:0.33:128
chr20	13830137	rs2073290	A	C	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.445;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=21;PP=732;ReadPosRankSum=0.727;SC=CATCCTACCCATGGTGATTTC;SOR=0.818;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=119;TCF=59;TCR=60;TR=40;WE=13830145;WS=13830127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,42:0.34:124
chr20	13845726	rs2073292	T	C	113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=80;ReadPosRankSum=0.566;SC=TTGCTGCCTATGTGCACAAAC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=13845734;WS=13845717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr20	13845987	rs761811	C	T	3995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=88;NR=31;PP=2965;SC=AATTTTAACTCATCTTACTAG;SOR=2.191;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=119;TCF=88;TCR=31;TR=119;WE=13845995;WS=13845977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr20	13847420	rs660710	A	G	4857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.98;NF=70;NR=88;PP=2965;SC=AATAAATGGCAAGGGGCTGCC;SOR=0.879;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=70;TCR=88;TR=158;WE=13847428;WS=13847410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr20	13867165	rs11905248	C	A	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=33;PP=900;ReadPosRankSum=-0.994;SC=GAGAAAACACCGTTAGCTTAT;SOR=0.928;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=37;WE=13867173;WS=13867155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,37:0.77:48
chr20	13868745	rs243910	T	C	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=35;PP=1078;SC=CCTAGCTCCATAATGACCCAT;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=36;WE=13868753;WS=13868735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr20	13869215	rs34529022	A	G	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.325;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=210;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CTAATTATCTATATGGATAAG;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=9;WE=13869223;WS=13869205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr20	14306896	rs6042672	G	A	1415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.571;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=32;PP=1047;ReadPosRankSum=0.735;SC=TGGTATCAGAGGTGACAGACT;SOR=0.628;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=182;TCF=78;TCR=104;TR=57;WE=14306904;WS=14306886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:131,62:0.32:193
chr20	14306953	rs6079391	G	T	2171.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.514;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.462;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=53;PP=1749;ReadPosRankSum=-0.898;SC=CTGTGGTTTGGTGATCCTTAG;SOR=1.594;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=124;TCF=50;TCR=74;TR=79;WE=14306961;WS=14306943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,80:0.64:125
chr20	14307019	rs36034779	T	G	1665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.257;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=32;PP=1293;ReadPosRankSum=0.278;SC=GCCACTGTCCTTGGGCAGGAT;SOR=0.270;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=93;TCF=41;TCR=52;TR=62;WE=14307027;WS=14307009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,64:0.68:94
chr20	15480226	rs2180526	T	C	2101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=0;PP=1680;SC=TCTGTACTGGTGTAGGACCAG;SOR=8.287;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=60;TCR=0;TR=60;WE=15480234;WS=15480224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr20	15480308	rs2145014	G	T	4048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=35;PP=2965;SC=TGTACTTATTGGTTGAACTGA;SOR=1.863;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=88;TCR=35;TR=123;WE=15480316;WS=15480298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr20	15480548	rs2145015	T	A	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=37;PP=1057;SC=TGATGCTCAGTTCCCCCCAAA;SOR=4.615;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=3;TCR=37;TR=40;WE=15480556;WS=15480538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
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chr20	15948439	rs6043641	A	G	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=113;ReadPosRankSum=1.481;SC=CCATCTTTAGATGACACTTTT;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=7;WE=15948447;WS=15948429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr20	15967390	rs41275442	C	T	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.666;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=352;ReadPosRankSum=-1.353;SC=AATGATTCAACGAAGAATGAA;SOR=1.214;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=18;WE=15967398;WS=15967380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr20	15967533	rs6043660	G	A	583.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.899;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=12.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.45;ReadPosRankSum=0.974;SOR=3.141;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,21:0.81:26
chr20	16021720	rs6135652	C	T	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=414;ReadPosRankSum=1.767;SC=ACCTTTTCTGCAAAAGAAGTT;SOR=0.407;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=17;WE=16021728;WS=16021710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr20	16223865	rs2144897	T	C	928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=19;PP=716;ReadPosRankSum=-1.502;SC=GAGGTGGATCTGGTTTTGGAA;SOR=0.641;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=148;TCF=88;TCR=60;TR=45;WE=16223873;WS=16223855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,46:0.30:153
chr20	16223922	rs1541065	T	C	833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.718;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=21;PP=627;ReadPosRankSum=0.099;SC=ATATTTCTACTAGCAAGACAT;SOR=0.786;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=121;TCF=51;TCR=70;TR=35;WE=16223930;WS=16223912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,38:0.29:130
chr20	16224066	rs2144898	C	T	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=217;ReadPosRankSum=-1.351;SC=ATTGAGGTGGCGGGAGAGGAT;SOR=0.324;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=12;WE=16224074;WS=16224056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr20	16351329	rs2144893	C	T	726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.909;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=593;ReadPosRankSum=-0.195;SC=AGCAAGTTCACGGGGCGGGGG;SOR=2.546;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=26;WE=16351337;WS=16351319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,26:0.74:35
chr20	16359567	rs6034464	A	G	3155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.556;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=41;PP=2394;ReadPosRankSum=-2.491;SC=TTCAATCTCCATGCCCAGGGT;SOR=1.299;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=210;TCF=132;TCR=78;TR=125;WE=16359575;WS=16359557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,130:0.60:217
chr20	16362173	rs11306679	CA	C	196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=6.698;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=1.396;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.687;SOR=2.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr20	16475112	rs6044027	G	A	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.891;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.256;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=124;ReadPosRankSum=-0.636;SC=AAATGAGATCGCGACTTTTAC;SOR=0.105;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=8;WE=16475120;WS=16475102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr20	16486698	rs2295115	G	A	1497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.210;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=11;PP=1218;ReadPosRankSum=-0.083;SC=CCAGAGTCACGAGGGACTTGT;SOR=0.460;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=85;TCF=68;TCR=17;TR=53;WE=16486706;WS=16486688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,55:0.60:91
chr20	16492242	rs6135772	C	T	664.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.315;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=541;ReadPosRankSum=-0.769;SC=CAACACATAACAGCAGCAACC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=24;WE=16492250;WS=16492232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr20	16493533	rs6135775	T	C	3058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.667;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=40;PP=2363;ReadPosRankSum=0.086;SC=GACTGAAGAGTCCTTCACAGA;SOR=0.596;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=158;TCF=101;TCR=57;TR=109;WE=16493541;WS=16493523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,113:0.70:162
chr20	16493580	rs6135776	A	G	3837.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.207;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=70;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.577;SC=TGCATGGGAAAGACCAATGTC;SOR=0.522;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=204;TCF=104;TCR=100;TR=136;WE=16493588;WS=16493570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,141:0.67:210
chr20	16496362	rs6044046	T	A	2622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.901;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=70;PP=1940;ReadPosRankSum=-1.532;SC=ATTTTAATAATAGCCCCTTCA;SOR=1.552;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=114;TCF=16;TCR=98;TR=79;WE=16496370;WS=16496352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,91:0.73:125
chr20	16496415	rs6131837	T	C	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=723;ReadPosRankSum=-0.033;SC=CTCTTAAGGATTAGACCATAT;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=28;WE=16496423;WS=16496405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr20	16506939	rs6034517	C	T	699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.857;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=578;ReadPosRankSum=-1.348;SC=GACTAAAAACCATTTCATTCC;SOR=1.302;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=26;WE=16506947;WS=16506929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,28:0.54:52
chr20	16506971	rs6044072	A	T	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.03;ReadPosRankSum=0.120;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr20	16554067	rs4814510	A	G	628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=523;ReadPosRankSum=1.470;SC=GTTCCGCGGCAGCCCCACCTG;SOR=2.494;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=21;WE=16554075;WS=16554057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr20	16729654	rs10627353	A	AAGATG	2046.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.067;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.734;NF=7;NR=31;PP=2187;ReadPosRankSum=-1.247;SC=CTGGCAGTGTAAGATAATTTA;SOR=0.952;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=75;TCF=10;TCR=65;TR=38;WE=16729662;WS=16729644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,52:0.67:78
chr20	16730464	rs6075100	T	C	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.900;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=97;ReadPosRankSum=1.241;SC=TGATTCTCACTATCAGCAAAG;SOR=0.163;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=8;WE=16730472;WS=16730454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr20	16730479	rs6075101	C	T	194.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=133;ReadPosRankSum=-0.988;SC=GCAAAGAGGACGCCTGCGAGT;SOR=0.204;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=10;WE=16730487;WS=16730469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,10:0.32:31
chr20	16732004	rs12479958	T	C	48.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=25;ReadPosRankSum=0.728;SC=CTCAAATGGGTAAATTGAGAC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=3;WE=16732012;WS=16731994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,3:0.30:10
chr20	17389830	rs2217182	T	C	1689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=3;PP=1275;SC=GGACTAGAAATGTTTAAAGTC;SOR=5.058;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=44;TCR=3;TR=47;WE=17389838;WS=17389820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr20	17436895	rs2021789	G	A	4747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.52;SOR=4.377;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
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chr20	17474968	rs6080718	T	C	5827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=107;PP=2965;SC=CAGGTATAGATGGTTCCTCTG;SOR=0.890;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=198;TCF=91;TCR=107;TR=197;WE=17474976;WS=17474958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr20	17475217	rs6136118	C	T	3610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.234;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=68;PP=2965;ReadPosRankSum=0.711;SC=CAGAGTCTTCCGCAACAGAAA;SOR=1.116;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=108;TCF=40;TCR=68;TR=108;WE=17475225;WS=17475207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,113:0.99:114
chr20	17477592	rs6080719	C	T	995.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=8;PP=817;SC=CCTTTCCCACCGGATCCAGTG;SOR=2.093;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=31;WE=17477600;WS=17477582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr20	17477751	rs6044850	A	G	1734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=40;PP=1351;SC=AAAAATGAAAAAAAAGCTTTC;SOR=2.480;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=12;TCR=40;TR=52;WE=17477759;WS=17477741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr20	17539168	rs6044883	A	G	1337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=2;PP=1072;SC=TCAGACTACTACTGAGCCAAT;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=35;TCR=2;TR=37;WE=17539176;WS=17539158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr20	17594714	rs35586556	GC	G	384.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=61.94;NF=10;NR=1;PP=407;SC=TTCTCTCGGAGCTACCGGAAG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=17594722;WS=17594704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr20	17595329	rs7261001	G	A	1621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=9;PP=1372;SC=CTGCCTCCCCGGGGCTCCCGG;SOR=2.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=40;TCR=9;TR=49;WE=17595337;WS=17595319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr20	17596289	.	A	G	810.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.126;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.958;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=27;PP=649;ReadPosRankSum=-0.794;SC=ATGGAGCAACAGCTCCATCCT;SOR=1.347;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=29;WE=17596297;WS=17596279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,29:0.69:42
chr20	17596731	rs2236250	C	T	6610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=137;PP=2965;SC=GCACAGGCACCGCTCTCTAGC;SOR=1.655;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=67;TCR=137;TR=204;WE=17596739;WS=17596721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr20	17597331	rs911347	C	T	2437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=11;PP=2086;SC=GGCCTGCACTCTTCTGGGATT;SOR=3.581;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=63;TCR=11;TR=74;WE=17597339;WS=17597321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr20	17597361	rs911348	A	G	2820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=20;PP=2212;SC=TCTGGGGACCAGCTCACCGCC;SOR=2.903;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=80;TCR=20;TR=100;WE=17597369;WS=17597351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr20	17599214	rs2328181	T	C	2416.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=15;PP=1782;SC=GTCACACTCCTGGCATGGGGA;SOR=2.425;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=57;TCR=15;TR=72;WE=17599222;WS=17599204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr20	17600357	rs11960	G	A	5270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=80;PP=2965;SC=CTCCAAATGCGACGTGTGCTC;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=160;TCF=80;TCR=80;TR=159;WE=17600365;WS=17600347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr20	17602028	rs2236253	T	C	1961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=12;PP=1381;SC=GGCCACCTCCTGCCCCATAGG;SOR=2.658;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=48;TCR=12;TR=60;WE=17602036;WS=17602018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr20	17605016	rs2236254	T	C	904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=4;PP=769;SC=TCCTAGTGCCTCTGTGTGTCC;SOR=3.180;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=23;TCR=4;TR=27;WE=17605024;WS=17605006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr20	17605240	rs6034867	A	T	1568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=33;PP=1136;SC=GGTCAGGGAGAGCAGCTTCTC;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=45;WE=17605248;WS=17605230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr20	17606372	rs2295672	T	C	2367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=54;PP=2051;SC=GGACGGTCCCTTCTGGCTGCC;SOR=2.472;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=16;TCR=54;TR=70;WE=17606380;WS=17606362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr20	17610729	rs6044917	T	C	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=22;PP=617;SC=CTGGTCCATGTGGGAAGGAAA;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=8;TCR=22;TR=30;WE=17610737;WS=17610719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr20	17617531	rs6044923	T	C	201.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=157;SC=CCAGCTGCAGTGGGAACGACG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=17617539;WS=17617521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr20	17622676	rs41276398	C	T	127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=-0.109;SC=GCAGGGGCTTCGAGTCAAGGG;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=6;WE=17622684;WS=17622666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr20	17639857	rs77553739	G	T	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=23.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.73;MQRankSum=4.333;QD=22.12;ReadPosRankSum=-0.645;SOR=3.058;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,37:0.77:48
chr20	17640009	rs13040917	A	C	3811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=64;PP=2965;SC=GCCCCCTCGGACTTTTTGCCC;SOR=0.709;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=131;TCF=67;TCR=64;TR=131;WE=17640017;WS=17639999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr20	17674451	rs6080781	G	C	515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=18;PP=424;SC=TGTGTCCAGTGGGAGGAGGTG;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=17674459;WS=17674441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr20	17705677	rs4814640	A	G	700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=3;PP=537;SC=GGAGATGGACAACATGTCTCC;SOR=3.098;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=25;WE=17705685;WS=17705667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr20	17705849	rs2296907	C	T	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=12;PP=254;ReadPosRankSum=-0.583;SC=TTTCTTCCCCCAGTCCTGCCA;SOR=0.616;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=26;TCR=38;TR=20;WE=17705857;WS=17705839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,19:0.31:61
chr20	18005600	rs2281543	A	C	713.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.075;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=21;PP=590;ReadPosRankSum=0.682;SC=CGAATGCCTGAAAGGATGAGG;SOR=1.893;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=64;TCF=24;TCR=40;TR=28;WE=18005608;WS=18005590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,28:0.42:67
chr20	18022171	rs1571431	C	T	4381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.645;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=72;PP=2962;ReadPosRankSum=0.761;SC=ACGCACTCCCCGCTCACCTGT;SOR=0.571;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=232;TCF=123;TCR=109;TR=151;WE=18022179;WS=18022161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,163:0.67:245
chr20	18118740	rs1205190	T	G	5282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=76;NR=93;PP=2965;SC=GCGCGCGGCGTCGACCTGGGG;SOR=0.910;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=76;TCR=93;TR=169;WE=18118748;WS=18118730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
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chr20	18123084	rs78016265	CT	C	566.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=360;ReadPosRankSum=-0.794;SC=GTATCTTCATCTTTTTTTTTG;SOR=1.364;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=25;WE=18123092;WS=18123074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,28:0.64:44
chr20	18142564	rs3828013	A	G	3530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.042;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=50;PP=2748;ReadPosRankSum=0.173;SC=TAAAAGAGAAAAGGTCTCGAA;SOR=0.519;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=97;TCR=72;TR=116;WE=18142572;WS=18142554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,122:0.69:178
chr20	18142924	rs3748511	G	A	2283.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.397;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=59;PP=1736;ReadPosRankSum=0.020;SC=TTGGGTATGGGCCATGGTATA;SOR=1.050;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=305;TCF=137;TCR=168;TR=100;WE=18142932;WS=18142914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:214,104:0.33:318
chr20	18143117	rs1205193	T	G	3622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=43;PP=2835;SC=GTGGTTGGGGTCAGAAAGAAG;SOR=1.127;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=61;TCR=43;TR=104;WE=18143125;WS=18143107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr20	18165136	rs373697126	T	G	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.28;MQRankSum=1.952;QD=24.05;ReadPosRankSum=1.774;SOR=2.554;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,30:0.79:38
chr20	18167977	rs2747404	T	C	2762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=37;PP=2018;SC=CAAGCAACCCTGCTATGCTAC;SOR=0.982;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=83;TCF=45;TCR=38;TR=82;WE=18167985;WS=18167967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr20	18286888	rs2328286	G	A	1439.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=8;PP=1215;SC=TTGAATTCTTGAATGGGCTCT;SOR=2.885;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=44;WE=18286896;WS=18286878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr20	18291064	rs2424155	C	T	1496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=45;PP=1255;SC=TTAATTTTCTCGGCTGTTTCA;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=45;WE=18291072;WS=18291054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr20	18296072	rs1033545	T	A	4566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.99;NF=74;NR=67;PP=2965;SC=CCCAGCTCAGTCAGGGAACCC;SOR=0.807;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=74;TCR=67;TR=141;WE=18296080;WS=18296062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr20	18361603	rs1883938	T	C	5058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=88;NR=79;PP=2965;SC=AGGACAAGTCTGCAAAGCAGA;SOR=0.789;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=168;TCF=89;TCR=79;TR=167;WE=18361611;WS=18361593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr20	18393275	rs59695827	C	T	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.540;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=74;ReadPosRankSum=1.602;SC=GAAGAAAGGGCATCCTCCCCC;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=6;WE=18393283;WS=18393265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr20	18393312	rs6075337	C	G	817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=2;PP=697;SC=TGATGGCTGTCAGGAGGGGTT;SOR=4.091;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=18393320;WS=18393302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr20	18393499	rs6075338	C	T	1232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=25;PP=967;SC=ACATCGGGGCCATGCGTGAGG;SOR=1.552;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=13;TCR=25;TR=38;WE=18393507;WS=18393489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr20	18395988	rs6035037	C	T	1266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.600;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.744;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=23;PP=875;ReadPosRankSum=-0.185;SC=CCACACCAGCCGCAGAAGGAC;SOR=0.879;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=82;TCF=43;TCR=39;TR=42;WE=18395996;WS=18395978;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,48:0.55:87
chr20	18414309	rs79400176	C	T	697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=467;ReadPosRankSum=-1.258;SC=CAAGTGGAGGCTTGCCTGTGG;SOR=0.723;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=75;TCF=42;TCR=33;TR=28;WE=18414317;WS=18414299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,31:0.39:80
chr20	18414356	rs6035042	A	G	2397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=44;PP=1824;SC=CACACACCACACAGATGGGAG;SOR=1.096;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=30;TCR=44;TR=74;WE=18414364;WS=18414346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr20	18429497	rs6081147	T	C	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.88;QD=34.06;SOR=3.767;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr20	18433457	rs16979192	C	T	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=108;ReadPosRankSum=0.847;SC=ATCTTCACAGCGGGAGACCTT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=18433465;WS=18433447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr20	18434306	rs76713485	C	T	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.95;ReadPosRankSum=0.674;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr20	18446024	rs6111974	C	A	2365.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.303;HP=2;HapScore=1;MGOF=76;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.565;NF=18;NR=85;PP=2475;ReadPosRankSum=-0.011;SC=CTCTCTCTCTCTATATATATA;SOR=2.247;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=111;TCF=20;TCR=91;TR=103;WE=18446032;WS=18446014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,81:0.94:86
chr20	18446050	rs111987137	A	ATGTGCACTTATAGC	3695.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=35;PP=2900;SC=ATAAATTCCAATGTACACAAA;SOR=4.921;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=1;TCR=59;TR=35;WE=18446058;WS=18446040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr20	18448079	rs1474974	C	A	1703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=8;PP=1316;SC=TCCACTGGTTCCCCGGGTTCC;SOR=2.917;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=52;TCF=44;TCR=8;TR=50;WE=18448087;WS=18448069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr20	18453663	rs6111979	G	T	93.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=3;PP=65;ReadPosRankSum=-0.431;SC=TATCATCCCTGCCTCCTATGA;SOR=0.368;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=4;WE=18453671;WS=18453653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,4:0.67:6
chr20	18460614	rs6035056	A	T	1918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=7;PP=1438;SC=CTGTTCCAAAATATAGGTGTT;SOR=3.647;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=48;TCR=7;TR=55;WE=18460622;WS=18460604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr20	18461237	rs57962043	GT	G	738.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.359;NF=0;NR=35;PP=519;ReadPosRankSum=-1.414;SC=GACCCACATTGTTTTTTTTTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=35;WE=18461245;WS=18461227;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,35:0.95:37
chr20	18462421	rs1055171	A	G	3101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=77;PP=2551;SC=TCCCTCCCACAGGTTTGGTCC;SOR=3.080;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=17;TCR=77;TR=94;WE=18462429;WS=18462411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr20	18462492	rs4813332	A	G	867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=25;PP=738;SC=TTGACTGCCCACGGGTGCAAG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=18462500;WS=18462482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr20	18462518	rs6111983	C	G	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=1;NR=14;PP=460;SC=CATTAAGAAACAGAGCAAGCA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=18462526;WS=18462508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
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chr20	18470664	rs3748450	A	G	927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=25;PP=755;SC=ATCTTTCAGTACCCATGGATA;SOR=2.985;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=30;WE=18470672;WS=18470654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr20	18470980	rs2424217	A	G	6947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=143;NR=60;PP=2965;SC=TTTACAACCTAAACAGACAGC;SOR=1.796;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=203;TCF=143;TCR=60;TR=203;WE=18470988;WS=18470970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,212:1.00:212
chr20	18477614	rs2247746	A	G	1056.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.764;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=12;PP=855;ReadPosRankSum=-0.551;SC=GGGCTTTGCTAGAGGGGATTA;SOR=0.410;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=163;TCF=129;TCR=34;TR=49;WE=18477622;WS=18477604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,48:0.29:166
chr20	18477870	rs2247757	T	A	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.028;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=361;ReadPosRankSum=-2.122;SC=CCCAGCCTGCTCCCGCAGGGA;SOR=0.093;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=70;TCF=3;TCR=67;TR=24;WE=18477878;WS=18477860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,23:0.33:70
chr20	18505403	rs3762200	G	C	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=311;ReadPosRankSum=-1.310;SC=GCCCAGGCTGGAGTTCAGTGG;SOR=1.085;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=14;WE=18505411;WS=18505393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,14:0.58:24
chr20	18506616	rs911115	T	C	1518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.75;SOR=2.935;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr20	18506616	.	TG	CA,CG	724	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=2,7;NR=7,34;PP=84,724;QD=15.274208318;SC=ATCATACAAATGTGCTCTCAG;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=9,41;WE=18506625;WS=18506606;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.21:42
chr20	18506617	rs1555353	G	A	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=1.788;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.20;ReadPosRankSum=-0.695;SOR=0.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,12:0.27:44
chr20	18506677	rs1109030	C	T	426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=350;ReadPosRankSum=0.256;SC=CTAAGTCAACCGTCTGTGTTA;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=15;WE=18506685;WS=18506667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr20	18511456	rs6081189	A	G	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.587;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.222;NF=12;NR=30;PP=1002;ReadPosRankSum=-1.779;SC=AGGTACGGTAAACTTTTTTTT;SOR=0.293;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=42;WE=18511466;WS=18511446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,38:0.93:41
chr20	18511458	rs57738665	C	CT	1413.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.006;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5337;FS=2.561;HP=14;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;MQRankSum=0.219;NF=4;NR=14;PP=194;ReadPosRankSum=-1.711;SC=GTACGGTAAACTTTTTTTTTT;SOR=0.311;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=50;TCF=9;TCR=41;TR=18;WE=18511466;WS=18511446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,39:0.93:42
chr20	18511504	rs3762201	T	C	87.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.244;NF=0;NR=5;PP=48;ReadPosRankSum=-0.835;SC=CAGGCTGGTCTCAAACTCCTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=5;WE=18511512;WS=18511494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr20	18522933	rs2273525	C	T	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.296;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=661;ReadPosRankSum=-0.985;SC=GGCCTCTCATCCTACAGCACA;SOR=0.210;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=33;WE=18522941;WS=18522923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,35:0.64:55
chr20	18523864	rs2295557	C	T	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=180;ReadPosRankSum=-0.328;SC=TTCTGCTTTACTTTCGAGAAG;SOR=0.746;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=10;WE=18523872;WS=18523854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr20	18526675	.	C	T	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=561;ReadPosRankSum=0.953;SC=TCTATATCCTCAGGTAAGTAA;SOR=0.929;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=27;WE=18526683;WS=18526665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,31:0.76:41
chr20	18535982	rs1555363	A	G	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=672;SC=GAATAACATTACTGGGCCGGA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=18535990;WS=18535972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr20	18548293	rs11475009	TC	T	1315.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.634;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=4.258;NF=11;NR=35;PP=1300;ReadPosRankSum=-0.168;SC=CGATGAGAGTTCCCCGGGGGT;SOR=0.605;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=147;TCF=35;TCR=112;TR=46;WE=18548301;WS=18548283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,56:0.34:163
chr20	18548411	rs6035077	T	G	954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.799;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=33;PP=791;ReadPosRankSum=-2.466;SC=AGAACTAGACTCCAGGAATTA;SOR=1.436;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=0;TCR=49;TR=33;WE=18548419;WS=18548401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,33:0.65:51
chr20	18549848	rs201159385	C	CT	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.52;ReadPosRankSum=-2.761;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr20	18576602	rs140517016	G	A	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.911;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=1;PP=822;ReadPosRankSum=-0.651;SC=AGTGTGTTGGGGGGCTTGTGA;SOR=1.880;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=48;TCF=46;TCR=2;TR=33;WE=18576610;WS=18576592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,33:0.70:47
chr20	18576912	rs1884875	C	G	1136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=32;PP=945;SC=CATCCAGGAACGGGTCTTTGG;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=18576920;WS=18576902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr20	18608945	rs3818220	G	C	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=216;ReadPosRankSum=-2.221;SC=GTCCCTGGAAGAGTCCTCGGT;SOR=1.112;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=10;WE=18608953;WS=18608935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr20	18806046	rs6136525	C	T	2014.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=32;PP=1411;ReadPosRankSum=2.055;SC=GTTAGCTCAGCGATAACAATA;SOR=0.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=33;TCR=32;TR=64;WE=18806054;WS=18806036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,70:0.99:71
chr20	18810705	rs6136530	C	T	5951.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=76;NR=104;PP=2965;SC=TTTGCTTGGACCATGAAGGAA;SOR=1.066;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=76;TCR=104;TR=180;WE=18810713;WS=18810695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr20	19261623	rs1569767	G	A	701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.792;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=14;PP=483;ReadPosRankSum=1.041;SC=CATGGACCTCGTAGGGGAAGA;SOR=0.406;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=118;TCF=76;TCR=42;TR=33;WE=19261631;WS=19261613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,35:0.29:119
chr20	19560555	rs11087288	GA	G	4773.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=26;PP=2967;SC=GATGACAGAAGACATTATCAA;SOR=2.342;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=75;TCR=26;TR=101;WE=19560563;WS=19560545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr20	19560664	rs3790261	G	A	4017.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=88;PP=2965;SC=TGTTCTATGCGCTGGCCATTG;SOR=1.936;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=38;TCR=89;TR=126;WE=19560672;WS=19560654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr20	19634732	rs3790278	G	A	1385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.644;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.260;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=29;PP=1059;ReadPosRankSum=-0.645;SC=CCTGGTGCCTGCTGAGGGATT;SOR=1.168;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=18;TCR=29;TR=46;WE=19634740;WS=19634722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,47:0.98:48
chr20	19634747	rs3790279	T	C	1530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.724;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=30;PP=1157;ReadPosRankSum=0.366;SC=GGGATTCTATTTACTACACGC;SOR=1.390;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=49;TCF=18;TCR=31;TR=47;WE=19634755;WS=19634737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,50:0.96:52
chr20	19646436	.	CGTGT	C,CGT	820.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=59.71;QD=30.40;SOR=6.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,14,13:0.52,0.48:27
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chr20	19654454	rs1406971	A	G	439.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=604;ReadPosRankSum=0.901;SC=GAGTCACTGTAATTTTGATTA;SOR=1.022;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=14;WE=19654462;WS=19654442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr20	19673767	rs6106120	T	C	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,2:0.29:7
chr20	19673771	rs6112526	A	G	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.82;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,2:0.29:7
chr20	19673862	rs11481303	A	AT	153.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=93;ReadPosRankSum=-0.518;SC=GTTCTTTGTTATTTTTTTTTT;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=8;WE=19673870;WS=19673852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr20	19677615	rs113059140	AAGGGAGGGAGGG	A	588.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=3.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.94;MQRankSum=0.911;QD=34.63;ReadPosRankSum=1.188;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,15:0.88:17
chr20	19867275	.	TGC	T	308.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-0.380;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=18.279;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQRankSum=-1.876;QD=7.92;ReadPosRankSum=-1.965;SOR=4.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,14:0.36:39
chr20	19867278	.	TAGC	T	292.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-2.156;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=16.907;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.29;MQRankSum=-2.128;QD=6.36;ReadPosRankSum=-3.299;SOR=3.960;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,14:0.30:46
chr20	19941538	rs199562	A	T	492.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.608;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=451;ReadPosRankSum=0.164;SC=AGCTCTGGTTATGAGATGGGC;SOR=0.275;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=17;WE=19941546;WS=19941528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr20	19945493	rs6046489	T	C	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=209;ReadPosRankSum=-1.037;SC=CGGTAGTTTGTTTGAGAGTAC;SOR=0.793;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=10;WE=19945501;WS=19945483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr20	19951660	rs3803982	C	T	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.912;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=32;PP=778;ReadPosRankSum=-0.106;SC=TACATTGCTCCGTCAATCTCT;SOR=0.350;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=50;TCF=2;TCR=48;TR=34;WE=19951668;WS=19951650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,34:0.68:50
chr20	19955673	rs200780805	C	G	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FS=5.471;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.34;ReadPosRankSum=-0.637;SOR=1.290;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,34:0.27:126
chr20	19955713	rs149398614	G	C	2861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.652;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=45;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.533;SC=ACGTAGCTCTGCCTGGAACGA;SOR=0.799;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=148;TCF=82;TCR=66;TR=104;WE=19955722;WS=19955703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,106:0.69:153
chr20	19955714	rs201486809	C	T	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.371;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=23;PP=1749;ReadPosRankSum=1.996;SC=CGTAGCTCTGCCTGGAACGAA;SOR=0.554;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=148;TCF=80;TCR=68;TR=46;WE=19955722;WS=19955703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,49:0.32:153
chr20	19970705	rs2076584	C	T	969.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=10;PP=722;ReadPosRankSum=-1.036;SC=TCAAGGGGCACGTGGAGGCCA;SOR=0.608;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=91;TCF=67;TCR=24;TR=39;WE=19970713;WS=19970695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,40:0.43:94
chr20	19970888	rs35151304	G	A	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.189;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.167;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=25;PP=610;ReadPosRankSum=0.545;SC=TGTATTCGCCGGAAAAGAAGG;SOR=1.214;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=109;TCF=37;TCR=72;TR=34;WE=19970896;WS=19970878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,34:0.31:110
chr20	19970918	rs186712522	C	A	500.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.032;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=386;ReadPosRankSum=1.807;SC=TGCTGCGGGTCTGCAAGCTCA;SOR=0.944;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=79;TCF=23;TCR=56;TR=24;WE=19970926;WS=19970908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,24:0.30:79
chr20	20003196	rs74802177	A	C	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.013;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=175;ReadPosRankSum=-0.623;SC=AAATGAAAGGAAAACAGAGGA;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=8;WE=20003204;WS=20003186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chr20	20018882	rs11329914	TA	T	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQRankSum=1.539;QD=1.16;ReadPosRankSum=0.258;SOR=0.090;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,11:0.22:49
chr20	20050397	rs200183	G	A	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.724;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=23;PP=1365;ReadPosRankSum=0.334;SC=AGATTTTCTCGTTCTTGTCTG;SOR=0.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=79;TCR=39;TR=69;WE=20050405;WS=20050387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,73:0.60:122
chr20	20056038	rs11482118	T	TA	466.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.181;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.878;NF=11;NR=4;PP=541;ReadPosRankSum=1.271;SC=TTAGAACAATTAAGCACAATT;SOR=0.093;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=15;WE=20056046;WS=20056028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr20	20056082	rs8126258	A	C	1051.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.800;NF=28;NR=7;PP=863;ReadPosRankSum=-0.654;SC=CTGACATCCCAAATTTATTTC;SOR=0.735;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=45;TCR=11;TR=35;WE=20056090;WS=20056072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,36:0.63:57
chr20	20056402	rs6035543	A	G	508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=360;ReadPosRankSum=0.229;SC=TCATTTGGATATCTTTATAGT;SOR=0.957;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=17;WE=20056410;WS=20056392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr20	20071362	rs57605712	A	T	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=219;ReadPosRankSum=0.510;SC=AAAAAGAAGGAAAGTTGATAT;SOR=0.990;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=11;WE=20071370;WS=20071352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr20	20071634	rs6046614	T	C	2288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.763;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=60;PP=1848;ReadPosRankSum=-0.785;SC=AGTGACTGATTCATGTGGGAA;SOR=0.954;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=123;TCF=34;TCR=89;TR=82;WE=20071642;WS=20071624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,82:0.67:122
chr20	20139951	rs11475376	GC	G	2255.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.36;NF=42;NR=11;PP=2348;SC=TTGCTCCAGAGCTTGGACTCT;SOR=2.794;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=53;WE=20139959;WS=20139941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr20	20140196	rs2179823	T	C	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=501;SC=TCCCTGCCTGTCTCCACCAGT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=20140204;WS=20140186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr20	20144772	rs6081901	G	A	2140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=32;PP=1684;SC=GGCATCGCTCGTACTGCCTGA;SOR=0.904;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=38;TCR=32;TR=70;WE=20144780;WS=20144762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
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chr20	20152372	rs11696933	A	G	651.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=5.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=1;PP=485;ReadPosRankSum=-0.137;SC=ACATTTTGCTAACTGTGTTTC;SOR=0.267;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=71;TCF=69;TCR=2;TR=25;WE=20152380;WS=20152362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,26:0.36:73
chr20	20152462	rs996197	A	C	1126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.061;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=22;PP=799;ReadPosRankSum=0.414;SC=GCATCACCAGAGTGTCAAAGG;SOR=0.937;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=144;TCF=75;TCR=69;TR=52;WE=20152470;WS=20152452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,53:0.36:148
chr20	20152581	rs2328500	G	A	2217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=63;PP=1868;SC=ACAGGGAAGGGTGGAATGAGA;SOR=5.136;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=4;TCR=63;TR=67;WE=20152589;WS=20152571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr20	20168497	rs2179825	A	G	1029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=0;PP=860;SC=AGTGTGATATATTACAATTCT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=20168505;WS=20168487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr20	20243489	rs59345711	C	G	289.89	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.9992;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=237;ReadPosRankSum=1.662;SC=GATTGTATCTCGGGACAGAAA;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=10;WE=20243497;WS=20243479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chr20	20243558	rs34200155	A	G	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=617;ReadPosRankSum=-0.106;SC=TCACCACTTTATCTATTATCA;SOR=0.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=28;WE=20243566;WS=20243548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,27:0.68:40
chr20	20257759	rs17310726	G	A	1074.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.148;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=3;PP=806;ReadPosRankSum=0.333;SC=TTTGACTAAGGTTTTTTGGTT;SOR=1.595;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=52;TCF=47;TCR=5;TR=37;WE=20257767;WS=20257749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,39:0.72:54
chr20	20257958	rs2424317	C	T	537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.412;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=23;PP=411;ReadPosRankSum=0.573;SC=CGGTGGAGAGCGCCGTGGCGG;SOR=1.885;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=97;TCF=29;TCR=68;TR=28;WE=20257966;WS=20257948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,28:0.29:96
chr20	20269687	rs6035596	C	T	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=335;ReadPosRankSum=-0.099;SC=AAGGCTCCTCCGTACCTCAAT;SOR=0.446;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=16;WE=20269695;WS=20269677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,17:0.81:21
chr20	20270816	rs59405436	C	A	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=2;PP=749;ReadPosRankSum=-1.214;SC=GTTAGTGGTACTTTAGTGTGA;SOR=0.349;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=47;TCF=45;TCR=2;TR=32;WE=20270824;WS=20270806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,32:0.68:47
chr20	20348962	rs111558392	C	T	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.175;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=16;PP=362;ReadPosRankSum=-0.512;SC=CGCCCGTTTCCTACCGGGTCC;SOR=0.386;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=66;TCF=21;TCR=45;TR=25;WE=20348970;WS=20348952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,29:0.41:70
chr20	20350516	rs6137007	T	G	1515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=43;PP=1325;SC=CGCCCTGCACTCCCCGAACCC;SOR=3.958;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=5;TCR=43;TR=48;WE=20350524;WS=20350506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr20	20377421	rs11426947	A	AC	11271.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=368;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.24;QD=31.84;SOR=1.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,354:1.00:354
chr20	20493550	rs45484900	T	C	2007.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=49;PP=1413;ReadPosRankSum=0.317;SC=ATTTCTTCCATTGGGTGCTAA;SOR=0.669;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=238;TCF=87;TCR=151;TR=78;WE=20493558;WS=20493540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:162,84:0.34:246
chr20	20609964	.	A	AAC	573.27	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.638;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;MQRankSum=-0.553;NF=12;NR=1;PP=531;ReadPosRankSum=0.781;SC=AAGAACTTGTAACACACACAC;SOR=2.376;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=13;WE=20609972;WS=20609954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,25:0.89:28
chr20	21106714	rs5840900	C	CG	523.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=499;ReadPosRankSum=-0.349;SC=CCCGGCCGAACGGCCACCCAG;SOR=0.874;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=32;TCF=18;TCR=14;TR=14;WE=21106722;WS=21106704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr20	21117240	rs11476720	GT	G	134.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.98;ReadPosRankSum=-0.980;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr20	21126194	rs6047271	C	G	857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.224;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=3;PP=729;ReadPosRankSum=0.610;SC=ATCAAACTTTCTTTATATTTA;SOR=2.179;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=30;WE=21126202;WS=21126184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,29:0.73:40
chr20	21142454	rs11482592	A	AC	1024.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=12.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-1.376;QD=13.31;ReadPosRankSum=0.472;SOR=3.624;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,48:0.62:77
chr20	21142523	rs4815025	C	G	3924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.804;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=47;PP=2962;ReadPosRankSum=0.802;SC=TTGCAGTGCACGAGGGGATTA;SOR=0.940;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=191;TCF=122;TCR=69;TR=136;WE=21142531;WS=21142513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,140:0.70:201
chr20	21142813	rs2236178	T	C	4661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.492;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=103;NR=75;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.444;SC=GGTGAGAAAATGCCAGTCACA;SOR=0.602;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=278;TCF=162;TCR=116;TR=178;WE=21142821;WS=21142803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,184:0.65:285
chr20	21186161	rs11087346	A	AG	4960.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=38;PP=2936;SC=AGACGTACCGAGGCACAGGTG;SOR=1.914;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=130;TCF=88;TCR=42;TR=115;WE=21186169;WS=21186151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr20	21186296	rs11321878	TA	T	438.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=10.382;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQRankSum=2.174;QD=6.36;ReadPosRankSum=1.064;SOR=0.035;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,35:0.51:69
chr20	21227314	rs6047326	C	T	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=331;SC=AGTTTTCTCACTGTTTTATGG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=21227322;WS=21227304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr20	21302885	rs202835	G	A	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=0;PP=232;SC=CACTAACGTCGTATAAAAATG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=21302893;WS=21302875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr20	21312288	rs202837	A	G	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=14;PP=939;SC=CTTACTTACCAATATTTGATT;SOR=1.445;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=39;WE=21312296;WS=21312278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr20	21314079	rs202840	T	C	1107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=0;PP=950;SC=ACTTGTGATATTAAAATGGAT;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=21314087;WS=21314069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr20	21319828	rs202844	A	G	1898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=42;PP=1493;SC=AGTAGGACTTAGTCAGGGACG;SOR=2.428;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=56;TCF=13;TCR=43;TR=55;WE=21319836;WS=21319818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr20	21321294	rs202845	C	T	992.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=29;NR=0;PP=854;SC=GCCCTTCTTTCCTTTCTGTCA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=21321302;WS=21321284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr20	21328715	rs11087351	GT	G	1109.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=0;PP=903;SC=TCTAATTTTTGTTTTTTTTAA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=39;WE=21328723;WS=21328705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr20	22562674	rs1212275	T	C	8237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.18;SOR=0.897;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr20	23017294	rs4988478	C	T	2408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.532;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=64;PP=1888;ReadPosRankSum=0.149;SC=CTGAGGAGCCCTTCCCCTACC;SOR=0.526;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=214;TCF=66;TCR=148;TR=96;WE=23017302;WS=23017284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,98:0.45:216
chr20	23064810	rs11087413	C	T	2771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=17;PP=2318;ReadPosRankSum=0.769;SC=AAACCTGGGCCTGCTCTTGCT;SOR=0.692;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=166;TCF=140;TCR=26;TR=99;WE=23064818;WS=23064800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,99:0.58:170
chr20	23065209	rs3746731	G	A	4800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=335;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.364;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=110;NR=61;PP=2962;ReadPosRankSum=0.147;SC=CAGACGCCTGGGGACCCACTG;SOR=0.609;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=327;TCF=213;TCR=114;TR=171;WE=23065217;WS=23065199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:157,176:0.53:333
chr20	23065342	rs3746732	A	G	5913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=419;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.427;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=146;PP=2962;ReadPosRankSum=-2.855;SC=CTGTTGCAGCACGGGGCACGG;SOR=0.473;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=410;TCF=147;TCR=263;TR=238;WE=23065350;WS=23065332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,242:0.58:414
chr20	23066338	rs6048539	G	C	2658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-6.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=299;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.259;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=59;PP=1950;ReadPosRankSum=0.999;SC=GGCTCCCACAGGGGCCCTCAG;SOR=0.450;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=287;TCF=129;TCR=158;TR=116;WE=23066346;WS=23066328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:176,121:0.41:297
chr20	23345844	rs6048760	A	C	5974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=100;NR=86;PP=2965;SC=GAGATGGAGCAGGTTTCCAAA;SOR=0.870;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=187;TCF=100;TCR=87;TR=186;WE=23345852;WS=23345834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr20	23347553	rs999072	C	T	772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=624;SC=TTGGAGTAAACGATTTTTGCA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=23347561;WS=23347543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr20	23349607	rs3833333	CA	C	3851.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.238;NF=12;NR=129;PP=2704;ReadPosRankSum=-0.832;SC=TTAGTTTGGCCAAAAAAAAAA;SOR=2.934;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=159;TCF=15;TCR=144;TR=141;WE=23349615;WS=23349597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,151:0.99:152
chr20	23350270	.	C	G	1701.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.249;ClippingRankSum=0.000;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.876;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=28;PP=1333;ReadPosRankSum=1.244;SC=TCACCCAGCTCAACGCCCTCC;SOR=0.853;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=193;TCF=117;TCR=76;TR=72;WE=23350278;WS=23350260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,72:0.37:195
chr20	23358233	rs6083099	C	T	2270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=61;PP=1790;SC=TACTAACTTTCTTCATCATTT;SOR=8.410;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=0;TCR=61;TR=61;WE=23358241;WS=23358223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr20	23360171	rs2224074	G	C	1781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=41;PP=1489;SC=AGTTCTGTAAGATGAAGTCCC;SOR=2.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=14;TCR=41;TR=55;WE=23360179;WS=23360161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr20	23401904	rs200080949	ACCCC	A	6388.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQ=60.21;NF=47;NR=46;PP=2294;SC=AAGTACGGAGACCCCCCCCCC;SOR=1.132;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=116;TCF=54;TCR=62;TR=93;WE=23401915;WS=23401894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr20	23424613	rs3746736	T	C	7929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=252;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=194;NR=49;PP=2965;ReadPosRankSum=1.263;SC=GAAGATTGGCTGGACCAAATG;SOR=1.473;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=244;TCF=195;TCR=49;TR=243;WE=23424621;WS=23424603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,250:1.00:251
chr20	23472391	rs2983288	A	G	5545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=66;PP=2965;SC=AGAATGAGACAGGGGTGCTGA;SOR=1.378;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=186;TCF=120;TCR=66;TR=186;WE=23472399;WS=23472381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chr20	23528536	rs6076084	T	C	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=44;PP=1258;SC=GGGCTTGGGATGCAGAAGCTT;SOR=2.267;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=16;TCR=44;TR=60;WE=23528544;WS=23528526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr20	23528662	rs6083145	G	A	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=281;SC=GACTTTCAGGGTGATCTGTGG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=23528670;WS=23528652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr20	23529377	rs3004129	G	A	2466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=20;PP=1799;SC=ACCTGTGTCCGCACCACACCC;SOR=1.952;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=78;TCF=58;TCR=20;TR=75;WE=23529385;WS=23529367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr20	23529418	rs6083147	G	C	3148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=34;PP=2563;SC=ATCCAGGAGGGAAGCTGGTGT;SOR=1.274;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=62;TCR=34;TR=96;WE=23529426;WS=23529408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr20	23530941	rs1028560	A	G	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=3;PP=677;SC=TAGACTACAAATGGTGAACCA;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=23530949;WS=23530931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr20	23531276	rs1028561	G	A	2671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=66;PP=2239;SC=CCTGCTCGGCGGCAGACTCCA;SOR=3.202;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=13;TCR=66;TR=79;WE=23531284;WS=23531266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr20	23546639	rs2295564	T	G	6138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=136;NR=40;PP=2965;SC=TTCTTGGAAATGGCAGTTGTC;SOR=2.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=136;TCR=40;TR=176;WE=23546647;WS=23546629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,184:1.00:184
chr20	23546871	rs2208284	T	C	2446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=67;PP=2121;SC=GGAGATCTTCTTTAGATTGGG;SOR=8.497;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=68;TCF=0;TCR=68;TR=67;WE=23546879;WS=23546861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
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chr20	23549166	rs6083172	C	A	1375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=39;PP=1106;SC=CAGACCCAGCCCTTAATCTTA;SOR=5.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=41;WE=23549174;WS=23549156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr20	23584116	rs726217	G	A	1062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=5;PP=844;ReadPosRankSum=1.317;SC=TAAGGCACAAGCAGGGCAGCC;SOR=0.535;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=99;TCF=87;TCR=12;TR=40;WE=23584124;WS=23584106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,41:0.40:103
chr20	23586184	rs2983639	T	C	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.636;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=417;ReadPosRankSum=0.381;SC=AGACTAGACATCTTGGTCCCT;SOR=1.308;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=53;TCF=47;TCR=6;TR=22;WE=23586192;WS=23586174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr20	23586360	rs2983640	G	A	2412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.033;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=40;PP=1984;ReadPosRankSum=1.858;SC=ACTGTGGCGAGGAACATAGGA;SOR=0.798;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=220;TCF=125;TCR=95;TR=97;WE=23586368;WS=23586350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,99:0.43:231
chr20	23586531	.	C	A	677.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.859;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=461;ReadPosRankSum=-0.205;SC=CTTGCCTTTGCCCTTCAGATC;SOR=0.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=0;TCR=59;TR=24;WE=23586539;WS=23586521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,27:0.45:60
chr20	23586547	rs62207039	C	T	900.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=652;ReadPosRankSum=1.681;SC=AGATCCCTGGCGTCCACTGGA;SOR=1.314;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=29;WE=23586555;WS=23586537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,32:0.63:51
chr20	23615819	.	T	TCA	998.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.493;ClippingRankSum=0.000;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.115;NF=31;NR=1;PP=1066;ReadPosRankSum=1.772;SC=AACATGTGCATCACACACACA;SOR=0.272;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=94;TCF=89;TCR=5;TR=32;WE=23615828;WS=23615809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,38:0.52:73
chr20	23618395	rs6138024	T	C	729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=13;PP=556;SC=GGCCTCCCACTAGGCGCGGCG;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=20;WE=23618403;WS=23618385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr20	23618488	rs1055084	G	A	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.099;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=327;ReadPosRankSum=-0.353;SC=GGGCGCGCAGGGGCCCGGCCA;SOR=1.219;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=25;TCF=14;TCR=11;TR=17;WE=23618496;WS=23618478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr20	23666690	rs2282378	C	G	2573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.394;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.965;NF=13;NR=87;PP=2228;ReadPosRankSum=-2.458;SC=TGAGATGTCACAGCCTGGGTG;SOR=1.946;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=207;TCF=39;TCR=168;TR=100;WE=23666698;WS=23666680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,94:0.47:200
chr20	23669630	rs7267397	A	G	1246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.587;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.361;NF=5;NR=36;PP=936;ReadPosRankSum=0.519;SC=GCAGAGCACAAAGCTGGAGCT;SOR=1.165;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=77;TCF=12;TCR=65;TR=41;WE=23669638;WS=23669620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,44:0.55:80
chr20	23728342	rs2982	G	A	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.516;NF=7;NR=0;PP=84;ReadPosRankSum=0.457;SC=GTCTCTTGGCGCAGGCACATG;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=7;WE=23728350;WS=23728332;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr20	23728612	rs142422717	G	C	1769.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.877;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.994;NF=8;NR=69;PP=1664;ReadPosRankSum=0.240;SC=TGAGATGTCAGAGCCTGGGTG;SOR=1.659;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=196;TCF=30;TCR=166;TR=77;WE=23728620;WS=23728602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,68:0.37:184
chr20	23729722	rs3188314	G	T	16716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=536;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=369;NR=209;PP=2965;SC=TACATATGGTGCGGCCCACCT;SOR=1.405;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=578;TCF=369;TCR=209;TR=578;WE=23729730;WS=23729712;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,535:1.00:535
chr20	23731412	rs2070856	G	A	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.560;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=523;ReadPosRankSum=-0.750;SC=GATGCCACCCGGGATTATCCT;SOR=0.645;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=117;TCF=58;TCR=59;TR=34;WE=23731434;WS=23731402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,37:0.30:124
chr20	23731426	rs13045477	C	T	4343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=65;PP=2962;SC=TTATCCTATCCTCCTCCTTGG;SOR=1.022;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=50;TCR=65;TR=115;WE=23731434;WS=23731402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr20	23731494	rs6076122	A	G	1888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=44;PP=1465;SC=GTACTCAGATACTGGGCCATG;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=54;WE=23731502;WS=23731484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr20	23731560	rs6076123	C	T	1162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=31;PP=961;SC=GGTGAGAGCCCGAGGCAGGGA;SOR=4.235;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=23731568;WS=23731550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr20	23804864	rs67845471	C	T	2075.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.823;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=70;PP=1740;ReadPosRankSum=0.473;SC=CTCACCCACCCCTGCTGAGTC;SOR=2.219;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=119;TCF=1;TCR=118;TR=70;WE=23804872;WS=23804854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,72:0.59:123
chr20	23805832	rs6036548	G	A	4867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=147;NR=6;PP=2965;SC=CCTGGGACCCGCATCAGGAAC;SOR=6.316;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=154;TCF=147;TCR=7;TR=153;WE=23805840;WS=23805822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr20	23806008	rs6106729	C	T	3872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-7.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.868;NF=43;NR=111;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.360;SC=CCCATCAGTTCATGCACTCAC;SOR=0.729;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=263;TCF=71;TCR=192;TR=154;WE=23806016;WS=23805998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,151:0.58:260
chr20	23806929	rs58314206	A	C	2049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=8.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.398;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=3;PP=1674;ReadPosRankSum=-1.079;SC=TGAAGGCCATAAGCAGAGAGT;SOR=1.674;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=120;TCF=114;TCR=6;TR=69;WE=23806937;WS=23806919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,70:0.57:123
chr20	23807028	rs4407312	A	C	11857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=204;NR=161;PP=2965;SC=GGCAACAAACAAGGCTGGGAC;SOR=0.967;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=365;TCF=204;TCR=161;TR=365;WE=23807036;WS=23807018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,376:1.00:376
chr20	23807308	rs6106731	G	C	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=315;ReadPosRankSum=-0.535;SC=GGTCTCCTCGGAGGCAGAGCA;SOR=0.580;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=14;WE=23807316;WS=23807298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr20	23807360	rs6106732	G	A	302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=8;PP=214;ReadPosRankSum=0.414;SC=AGCCTGAGGCGGGGATCCCAG;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=11;WE=23807368;WS=23807350;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
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chr20	23860178	rs1799841	A	G	3877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=61;PP=2965;SC=TCCAGGGCACACTGCACACTC;SOR=0.787;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=68;TCR=61;TR=129;WE=23860186;WS=23860168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr20	24524218	rs4815274	C	G	2350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=59;PP=1975;SC=CTGGAGGTCACAGGATGTGTT;SOR=4.112;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=7;TCR=59;TR=66;WE=24524226;WS=24524208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr20	24524245	rs4813519	A	G	1722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=49;PP=1508;SC=AGGCCCTCTAAGAATGTGTGA;SOR=5.630;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=51;TCF=2;TCR=49;TR=51;WE=24524253;WS=24524235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr20	24565707	.	G	A	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.918;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=217;ReadPosRankSum=-0.516;SC=CCCAGCCGAGGAGGAGAAGCA;SOR=1.112;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=11;WE=24565715;WS=24565697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr20	24645939	rs2892217	G	A	3486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=89;NR=43;PP=2693;ReadPosRankSum=-0.299;SC=TGCTTGTTCCGACTTGCTTAC;SOR=0.709;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=242;TCF=161;TCR=81;TR=132;WE=24645947;WS=24645929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,135:0.55:245
chr20	24930085	rs227653	G	A	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=9;PP=848;ReadPosRankSum=-0.498;SC=CATGCTGCCTGAGAAGGCACT;SOR=0.826;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=83;TCF=64;TCR=19;TR=43;WE=24930093;WS=24930075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,42:0.50:84
chr20	24930388	.	T	A	294.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.698;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=242;ReadPosRankSum=1.382;SC=TGCAGCTACCTTTGGGGGTAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=13;WE=24930396;WS=24930378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr20	24939590	rs1056033	G	C	1355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.603;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=15;PP=1054;ReadPosRankSum=0.927;SC=AATATATGCTGGAGGTGGAAA;SOR=1.040;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=111;TCF=74;TCR=37;TR=51;WE=24939598;WS=24939580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,53:0.47:112
chr20	24939764	rs45556041	C	T	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.488;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=19;PP=488;ReadPosRankSum=-0.013;SC=ACCGTCACCACGTCTCTAACG;SOR=0.163;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=23;WE=24939772;WS=24939754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr20	24944771	.	G	A	296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.339;ClippingRankSum=0.000;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.775;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=228;ReadPosRankSum=-0.767;SC=CCCATGACAGGGCAGCCCCAC;SOR=1.352;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=12;WE=24944779;WS=24944761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,12:0.41:29
chr20	24944933	rs761368	T	C	2327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=7;PP=1909;SC=CTGGATGGCCTGGCTGAACTG;SOR=4.205;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=64;TCR=7;TR=71;WE=24944941;WS=24944923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr20	24945079	rs10534910	AGGC	A	4031.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.040;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=31;PP=2945;ReadPosRankSum=0.135;SC=CATTTCAAATAGGCAAGGTGC;SOR=0.787;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=206;TCF=123;TCR=83;TR=83;WE=24945089;WS=24945069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,107:0.45:237
chr20	24950373	rs2064404	A	C	921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=26;PP=782;SC=TATGGGCCTGAAGAAGGTGAC;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=29;WE=24950381;WS=24950363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr20	24954162	rs66649227	AG	A	621.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.843;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.948;NF=17;NR=0;PP=663;ReadPosRankSum=-1.268;SC=TCCATCTACTAGATGGTCAGA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=17;WE=24954170;WS=24954152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr20	24959382	rs11087491	C	G	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=9.938;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.57;ReadPosRankSum=1.130;SOR=3.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr20	24959385	rs6083703	A	C	613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=15.580;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.57;ReadPosRankSum=1.372;SOR=4.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr20	24959386	rs56312312	C	A	117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.580;HP=2;HapScore=4;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=3;PP=556;ReadPosRankSum=-0.822;SC=TCCCCCCCCACCCAAGCTTAG;SOR=0.008;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=9;WE=24959394;WS=24959372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,8:0.33:24
chr20	24973383	rs6138456	A	G	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=114;ReadPosRankSum=1.903;SC=GCCGGCTCAGACTCCAGGCCC;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=7;WE=24973391;WS=24973373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr20	24987438	rs6083718	C	T	1714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=3;PP=1369;SC=TGGTTCTCACCGCCCCAACCA;SOR=4.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=44;TCR=3;TR=46;WE=24987446;WS=24987428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr20	24993414	rs6132785	T	C	1473.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=6.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=11;PP=1281;ReadPosRankSum=0.371;SC=CATGGAGGTGTAGGAGTGAAG;SOR=0.761;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=128;TCF=101;TCR=27;TR=56;WE=24993422;WS=24993404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,56:0.42:132
chr20	24994289	rs6050249	C	T	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.067;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=335;ReadPosRankSum=0.382;SC=CTGCCCTCCACGACGCTGCCC;SOR=2.726;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=45;TCF=13;TCR=32;TR=17;WE=24994297;WS=24994279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr20	25004071	rs4813543	G	T	1959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=4;PP=1559;SC=ATATGACCTCGCCTCAAACTG;SOR=4.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=57;TCF=53;TCR=4;TR=57;WE=25004079;WS=25004061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr20	25027526	rs6083730	G	A	7941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.027;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=130;PP=2965;ReadPosRankSum=0.170;SC=TAAGAAATGCGTGCTGTATAG;SOR=0.119;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=255;TCF=125;TCR=130;TR=253;WE=25027534;WS=25027516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,259:0.99:261
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chr20	25027692	rs6115015	G	A	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=32;PP=853;ReadPosRankSum=0.853;SC=AGCATCACTCGTCTGCCTCCA;SOR=5.728;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=32;WE=25027700;WS=25027682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
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chr20	25176296	rs6083773	A	C	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=9;PP=877;SC=CCGCCTGCGCATGCGCGGCTG;SOR=2.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=24;TCR=9;TR=33;WE=25176304;WS=25176286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr20	25187213	rs2076559	G	A	7411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.660;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=152;NR=75;PP=2965;ReadPosRankSum=0.458;SC=AGAAAAACGAGCTACATTTTT;SOR=1.387;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=229;TCF=153;TCR=76;TR=227;WE=25187221;WS=25187203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,230:1.00:231
chr20	25187575	rs11699392	A	G	2627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=6;PP=2226;SC=TGAGGCTCAAATGAAGCTTCT;SOR=4.062;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=68;TCR=6;TR=73;WE=25187583;WS=25187565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr20	25190598	rs1007707	A	G	3757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=107;PP=2965;SC=GTTCAACTGCAGAATGTGTTC;SOR=5.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=5;TCR=107;TR=112;WE=25190606;WS=25190588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr20	25193863	rs2076560	T	C	3329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=73;NR=29;PP=2640;SC=TATGCTGCACTTGACAGACCC;SOR=1.970;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=73;TCR=29;TR=102;WE=25193871;WS=25193853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr20	25193949	rs2076561	G	A	4199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=65;PP=2965;SC=AGGACATTCCGTTCGACTTCT;SOR=0.849;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=66;TCR=65;TR=131;WE=25193957;WS=25193939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr20	25195394	rs6050445	C	T	148.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=87;SC=CAGATTTTTTCGTTCTTCTCC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=25195402;WS=25195384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr20	25195509	rs6050446	A	G	2543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=21;PP=2082;SC=TTAGGTGAAAAAAGTATTTAA;SOR=2.073;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=55;TCR=21;TR=76;WE=25195517;WS=25195499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr20	25197982	rs4815394	T	C	2239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=4;PP=1957;SC=ATTGGCTCCTTATTGCCTGCT;SOR=5.074;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=62;TCR=4;TR=66;WE=25197990;WS=25197972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr20	25257215	rs2254046	G	A	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=1;PP=564;ReadPosRankSum=-0.040;SC=AGGCTGGGCCGGGGAGAGGCA;SOR=0.952;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=50;TCF=48;TCR=2;TR=28;WE=25257223;WS=25257205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,29:0.56:52
chr20	25257462	rs2424699	G	A	3018.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=22.092;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=103;PP=2416;ReadPosRankSum=-0.216;SC=CTCGCCCACAGCCTTTACCGC;SOR=1.957;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=239;TCF=48;TCR=191;TR=120;WE=25257470;WS=25257452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,121:0.51:239
chr20	25258916	rs11466827	G	GCCCTGGGACTGGGTCATGGGGCATGTGCC	1063.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.75;ReadPosRankSum=-0.619;SOR=0.395;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr20	25259200	rs2261109	T	C	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.265;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=24;PP=589;ReadPosRankSum=0.101;SC=AGTGGAATGGTACATGCCCCT;SOR=0.202;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=28;WE=25259208;WS=25259190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,29:0.57:51
chr20	25259807	rs2261115	G	A	1228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.989;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=33;PP=927;ReadPosRankSum=0.410;SC=GGAAAAGGGCGGCACCTCCCC;SOR=1.155;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=108;TCF=30;TCR=78;TR=44;WE=25259815;WS=25259797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,47:0.42:113
chr20	25260931	rs2227890	A	G	3115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=283;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.914;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=63;PP=2253;ReadPosRankSum=0.003;SC=AGACCTGTGCATACACCAACC;SOR=0.765;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=264;TCF=139;TCR=125;TR=136;WE=25260939;WS=25260921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:137,140:0.51:277
chr20	25261784	rs2261747	G	A	2749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.924;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.815;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=84;PP=2109;ReadPosRankSum=-0.171;SC=GGCCAGCTCTGTCTGACACCC;SOR=1.153;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=199;TCF=53;TCR=146;TR=109;WE=25261792;WS=25261774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,110:0.55:199
chr20	25262536	rs10582106	TCTC	T	400.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.237;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.193;NF=7;NR=3;PP=354;ReadPosRankSum=1.914;SC=GTCACTCTGTTCTCCTTAGAA;SOR=0.024;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=26;TCF=22;TCR=4;TR=10;WE=25262546;WS=25262526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,12:0.44:27
chr20	25262789	rs2261790	T	C	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.828;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=283;ReadPosRankSum=-1.246;SC=TGGAGGTGAGTCCCGGGCCCC;SOR=2.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=14;WE=25262797;WS=25262779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,13:0.39:33
chr20	25263648	rs2145126	G	A	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=248;ReadPosRankSum=0.449;SC=AGGGGCTGCTGGGGTAACCCT;SOR=0.420;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=11;WE=25263656;WS=25263638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr20	25264664	rs2257705	T	C	843.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.535;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=1;PP=680;ReadPosRankSum=-0.512;SC=ACAGGGCACTTGAAGCAGGAA;SOR=0.693;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=63;TCF=60;TCR=3;TR=30;WE=25264672;WS=25264654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,30:0.50:60
chr20	25264814	rs2227892	T	C	2037.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=58;PP=1491;ReadPosRankSum=-1.417;SC=CCATGTTCGATGTGCATGTGA;SOR=0.710;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=66;TCR=114;TR=92;WE=25264822;WS=25264804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,92:0.50:183
chr20	25264910	rs2257712	T	C	453.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.385;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=334;ReadPosRankSum=-1.025;SC=ATCACCTGCATGACCGCGCTG;SOR=0.228;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=50;TCF=3;TCR=47;TR=22;WE=25264918;WS=25264900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr20	25268920	rs3002702	T	C	1929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.214;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=29;PP=1538;ReadPosRankSum=0.293;SC=TGTGCCACTGTCACCCGTGTC;SOR=0.796;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=166;TCF=101;TCR=65;TR=75;WE=25268928;WS=25268910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,76:0.44:172
chr20	25270339	rs2257991	T	C	1219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.166;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=0;PP=944;ReadPosRankSum=-1.051;SC=GCAGGAAGAATTGTAGCAAAA;SOR=2.958;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=91;TCF=89;TCR=2;TR=44;WE=25270347;WS=25270329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,46:0.50:92
chr20	25271086	rs2257432	T	C	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=3;PP=634;ReadPosRankSum=0.285;SC=AAGGCATTTTTGTGCTAAAAA;SOR=0.531;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=49;TCR=5;TR=29;WE=25271094;WS=25271076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,31:0.53:58
chr20	25271326	rs2258066	C	T	1316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.728;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=43;PP=1060;ReadPosRankSum=1.485;SC=GTACTGGCCCCGGGCCTTTCA;SOR=0.370;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=94;TCF=11;TCR=83;TR=50;WE=25271334;WS=25271316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,51:0.53:96
chr20	25273362	rs2281562	G	A	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=33;PP=716;ReadPosRankSum=-0.608;SC=GTGTGCTAGGGTCAGTGCCCA;SOR=0.634;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=69;TCF=8;TCR=61;TR=37;WE=25273370;WS=25273352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
chr20	25274951	rs13042337	G	A	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=10.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.14;ReadPosRankSum=1.009;SOR=0.138;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,40:0.56:72
chr20	25274951	.	GGT	AGG	1506	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=9;NR=25;PP=1506;QD=45.8667022018;SC=TCCCTGGTTGGGTGGCTGGGA;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=66;TCF=14;TCR=52;TR=34;WE=25274961;WS=25274941;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:32,34:0.52:66
chr20	25274953	rs13043183	T	G	1521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.868;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=11.168;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.43;ReadPosRankSum=0.695;SOR=0.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,40:0.56:71
chr20	25275553	rs16436	GTTAGTT	G	652.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=575;ReadPosRankSum=0.000;SC=CTGCCTTTGGGTTAGTTTTAG;SOR=0.504;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=13;WE=25275566;WS=25275543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr20	25275843	rs2258719	C	T	467.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=356;ReadPosRankSum=-0.184;SC=AGACTTAAGACGGCAAATGGA;SOR=1.143;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=17;WE=25275851;WS=25275833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,18:0.60:30
chr20	25276297	rs1130694	G	A	2330.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.044;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=29;PP=1785;ReadPosRankSum=-2.254;SC=AGGTGGACCAGCTGTACCGGG;SOR=1.100;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=148;TCF=91;TCR=57;TR=82;WE=25276305;WS=25276287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,85:0.57:149
chr20	25276343	rs2258728	G	A	2846.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.130;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=49;PP=2123;ReadPosRankSum=1.308;SC=GGGAGCAGCTGGGTGGGTCCA;SOR=0.825;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=184;TCF=95;TCR=89;TR=103;WE=25276351;WS=25276333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,111:0.58:193
chr20	25281398	rs2424708	C	T	579.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=469;ReadPosRankSum=-0.168;SC=GCCGGCCCCCCGGGGCTTCAG;SOR=0.396;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=53;TCR=0;TR=22;WE=25281406;WS=25281388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr20	25282944	rs10966	A	G	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.342;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=5;PP=170;ReadPosRankSum=-0.336;SC=GAACTTTGAAATCTCGGAAGC;SOR=0.446;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=37;TCF=16;TCR=21;TR=11;WE=25282952;WS=25282934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr20	25284343	rs2260197	T	C	1669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=45;PP=1127;ReadPosRankSum=0.087;SC=GGCAGGGATCTGGGTTCAGGG;SOR=0.697;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=46;TCR=81;TR=70;WE=25284351;WS=25284333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,74:0.54:137
chr20	25288505	rs884613	C	T	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=3.802;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=13.81;ReadPosRankSum=-0.079;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr20	25288632	rs6107027	G	A	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.822;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=11;PP=556;ReadPosRankSum=-0.504;SC=TAGCTTCTTCGCGGATATTAG;SOR=0.339;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=51;TCF=32;TCR=19;TR=26;WE=25288640;WS=25288622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,26:0.47:55
chr20	25295787	rs2297496	T	C	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=466;ReadPosRankSum=-1.358;SC=AGATGCCAACTGCCACTGCAG;SOR=0.726;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=0;TCR=60;TR=28;WE=25295795;WS=25295777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr20	25301022	rs2274890	G	A	649.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.345;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=23;PP=529;ReadPosRankSum=-1.154;SC=GCGACTGCACGTGGTGTTACT;SOR=2.833;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=42;TCF=5;TCR=37;TR=24;WE=25301030;WS=25301012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,24:0.57:42
chr20	25320228	rs6050544	T	A	3652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=7.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.619;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=38;PP=2852;ReadPosRankSum=-0.315;SC=TTGAAAGACATAGAAATAGCT;SOR=0.929;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=250;TCF=167;TCR=83;TR=129;WE=25320236;WS=25320218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,135:0.51:263
chr20	25371112	rs139848340	GGCCCCC	G	625.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=62.13;MQRankSum=-0.795;QD=32.93;ReadPosRankSum=2.295;SOR=0.352;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
chr20	25371125	rs77202707	C	G	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.13;MQRankSum=0.624;QD=34.78;ReadPosRankSum=2.061;SOR=0.420;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,17:0.89:19
chr20	25371378	rs145380090	G	GGCCTCCGCC	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.921;NF=1;NR=2;PP=747;ReadPosRankSum=1.930;SC=GGCGCCCGCTGGCCTGCGCCG;SOR=0.799;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=3;WE=25371386;WS=25371368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr20	25398790	rs6076347	G	A	1854.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.132;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=45;PP=1505;ReadPosRankSum=-0.605;SC=ATATGGTAGCGTCTTGCCAAA;SOR=0.915;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=197;TCF=93;TCR=104;TR=80;WE=25398798;WS=25398780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,79:0.40:197
chr20	25398876	rs4815425	G	C	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.942;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=31;PP=710;ReadPosRankSum=0.561;SC=AAATGCTAAAGTTCTGGCATT;SOR=0.527;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=116;TCF=22;TCR=94;TR=39;WE=25398884;WS=25398866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,40:0.34:119
chr20	25422483	rs3764694	A	C	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=342;ReadPosRankSum=1.606;SC=TGGAATAGCAAAATAAATATC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=14;WE=25422491;WS=25422473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr20	25426693	rs5841057	CA	C	1975.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.219;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.07;MQRankSum=1.148;NF=22;NR=30;PP=2072;ReadPosRankSum=0.510;SC=CTCTCTCCACCACTCCCTTCA;SOR=0.396;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=120;TCF=40;TCR=80;TR=52;WE=25426701;WS=25426683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,60:0.44:137
chr20	25436466	rs12481409	C	T	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.017;NF=2;NR=41;PP=930;ReadPosRankSum=0.316;SC=TGGTGGCTCACGCCTCTAATC;SOR=1.022;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=84;TCF=5;TCR=79;TR=43;WE=25436474;WS=25436456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,42:0.49:85
chr20	25442097	rs6107047	G	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=256;ReadPosRankSum=1.930;SC=CGTTGGCACTGCGGTGATGCT;SOR=0.631;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=13;WE=25442105;WS=25442087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,14:0.48:29
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chr20	25447896	rs404394	A	G	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=281;ReadPosRankSum=-0.050;SC=CCTGGGGGCCAGTCAGCAACT;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=20;WE=25447904;WS=25447886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,21:0.40:53
chr20	25447931	rs404148	A	G	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=6.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.279;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=1;PP=881;ReadPosRankSum=0.738;SC=TTAGAAGAATATTCTCTACTT;SOR=1.755;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=90;TCF=85;TCR=5;TR=41;WE=25447939;WS=25447921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,42:0.45:93
chr20	25456888	rs437635	A	G	2105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.118;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=59;PP=1671;ReadPosRankSum=0.803;SC=CAACCTCCACACTGTGCTTGT;SOR=1.220;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=176;TCF=55;TCR=121;TR=81;WE=25456896;WS=25456878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,84:0.47:180
chr20	25457049	rs68078266	GCTCCCA	G	3301.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.083;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.101;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.021;NF=42;NR=20;PP=2942;ReadPosRankSum=0.212;SC=CTCAGGGGTGGCTCCCACATC;SOR=1.103;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=135;TCF=85;TCR=50;TR=62;WE=25457062;WS=25457039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,86:0.56:154
chr20	25459919	rs84816	G	A	1325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=41;PP=998;ReadPosRankSum=1.424;SC=ACAGAAACACGAAGCTGCCTG;SOR=0.772;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=85;TCF=9;TCR=76;TR=45;WE=25459927;WS=25459909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,48:0.56:85
chr20	25470056	rs431579	T	C	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=418;ReadPosRankSum=-1.837;SC=GCCCAGCTTCTGCCAACACCA;SOR=0.900;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=63;TCF=2;TCR=61;TR=26;WE=25470064;WS=25470046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,29:0.44:66
chr20	25479058	rs400357	A	G	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=4;PP=32;ReadPosRankSum=1.470;SC=TCCCTCCCTGATCCAGGGCCT;SOR=0.260;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=5;WE=25479066;WS=25479048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr20	25493446	rs111851591	G	T	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.195;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=447;ReadPosRankSum=-0.971;SC=TGGGCAGCTGGGGTGGGAGAG;SOR=0.179;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=20;WE=25493454;WS=25493436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,23:0.48:48
chr20	25520827	rs11472175	A	AAC	5031.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=84;PP=2930;SC=GATAAAAAGCAACAGTTTCTC;SOR=3.160;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=107;TCF=11;TCR=96;TR=92;WE=25520835;WS=25520817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr20	25755526	rs112684378	C	T	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.44;BaseQRankSum=-1.665;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=39;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.321;NF=2;NR=3;PP=20;ReadPosRankSum=0.018;SC=CCATGCTGCCCGCTGGTCAGC;SOR=0.458;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=13;TCF=5;TCR=8;TR=5;WE=25755534;WS=25755521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr20	25755558	rs113169583	G	T	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.016;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.73;MQRankSum=0.987;QD=6.41;ReadPosRankSum=-0.638;SOR=1.112;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
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chr20	25756020	rs139676733	CA	C	63.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.13;MQRankSum=-4.875;QD=1.00;ReadPosRankSum=1.323;SOR=0.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:53,11:0.17:64
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chr20	25829386	rs74835374	A	G	941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FS=1.759;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.19;MQRankSum=-6.635;QD=5.74;ReadPosRankSum=-1.901;SOR=0.459;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,31:0.19:164
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chr20	25900162	rs6037279	C	A	2575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.695;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.575;NF=61;NR=33;PP=1669;ReadPosRankSum=1.453;SC=ATCCAGCAACCGCCAACAACT;SOR=1.219;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=180;TCF=108;TCR=72;TR=94;WE=25900174;WS=25900152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,92:0.67:137
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chr20	25900262	rs76621451	G	A	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=7.831;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.22;MQRankSum=-4.647;QD=3.51;ReadPosRankSum=-0.723;SOR=1.264;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,22:0.18:123
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chr20	25900286	rs76626696	G	T	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.76;MQRankSum=-6.106;QD=4.60;ReadPosRankSum=-0.741;SOR=0.596;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,17:0.17:102
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chr20	26094483	rs146324498	CAT	C	4429.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=342;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.504;HP=7;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-12.990;NF=93;NR=17;PP=2973;ReadPosRankSum=-0.018;SC=ACACAAAAAACATGTGCAATT;SOR=1.772;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=321;TCF=258;TCR=63;TR=110;WE=26094493;WS=26094465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:215,127:0.37:342
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chr20	26094605	rs150462295	G	A	4008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=272;ExcessHet=3.0103;FS=2.231;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.81;MQRankSum=-8.133;QD=14.74;ReadPosRankSum=-0.793;SOR=0.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:161,111:0.41:272
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chr20	26094638	rs76011113	C	T	1997.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-11.419;NF=0;NR=76;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.653;SC=GTAAAGAAGTCCTCACCAGAC;SOR=1.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=185;TCF=1;TCR=184;TR=76;WE=26094668;WS=26094628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,73:0.42:172
chr20	26094651	rs77014314	T	C	1944.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-8.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.46;MQRankSum=-10.181;QD=14.20;ReadPosRankSum=0.872;SOR=1.092;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,56:0.41:137
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chr20	26094689	rs79312112	A	C	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-7.281;NF=0;NR=25;PP=553;ReadPosRankSum=1.003;SC=TTCTAGGAAAACATCTAAACA;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=0;TCR=59;TR=25;WE=26094697;WS=26094679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,26:0.43:61
chr20	29625745	rs73621455	A	T	1430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.49;MQRankSum=-2.739;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.261;SOR=1.481;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,46:0.47:97
chr20	29625746	rs76804580	C	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.53;MQRankSum=-1.651;QD=0.81;ReadPosRankSum=0.743;SOR=0.099;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:87,13:0.13:100
chr20	29625788	rs4635596	C	T	2958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=9.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.67;MQRankSum=-5.865;QD=12.92;ReadPosRankSum=1.461;SOR=1.290;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:127,102:0.45:229
chr20	29625838	rs62198353	C	A	13097.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=-2.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=577;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.249;HP=1;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-18.474;NF=325;NR=155;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.339;SC=ATTTTCTCTCCGTTTTTAACT;SOR=0.357;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=656;TCF=462;TCR=194;TR=480;WE=29625846;WS=29625828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,403:0.70:575
chr20	29625845	.	A	C	679.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.527;ClippingRankSum=0.000;DP=613;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.79;MQRankSum=-4.932;QD=1.11;ReadPosRankSum=1.231;SOR=0.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:541,70:0.11:611
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chr20	29625867	rs148671283	G	A	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=645;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.33;MQRankSum=-5.411;QD=0.66;ReadPosRankSum=2.147;SOR=0.579;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:588,55:0.09:643
chr20	29625873	rs78003242	A	C	563.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=632;ExcessHet=3.0103;FS=2.904;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.56;MQRankSum=-6.017;QD=0.89;ReadPosRankSum=3.230;SOR=0.454;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:549,81:0.13:630
chr20	29625876	rs73611718	C	T	4894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.37;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=638;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.879;HP=1;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-9.246;NF=140;NR=125;PP=2962;ReadPosRankSum=4.411;SC=TGTACAGAATCGCCCTGAAAT;SOR=0.404;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=750;TCF=445;TCR=305;TR=265;WE=29625884;WS=29625844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:466,170:0.27:636
chr20	29625924	.	A	ACTT	608.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.409;ClippingRankSum=0.000;DP=359;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.64;MQRankSum=-7.183;QD=1.74;ReadPosRankSum=1.829;SOR=0.635;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:312,38:0.11:350
chr20	29625928	.	G	A	665.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.038;ClippingRankSum=0.000;DP=326;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.24;MQRankSum=-8.223;QD=2.04;ReadPosRankSum=-0.508;SOR=0.636;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:287,39:0.12:326
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chr20	29632714	rs76788819	CT	AG	3915.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=600;ExcessHet=3.0103;FS=4.901;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.75;MQRankSum=-4.429;QD=6.55;ReadPosRankSum=-2.911;SOR=1.264;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:471,127:0.21:598
chr20	29632726	rs138922778	CTATT	C	2018.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=529;ExcessHet=3.0103;FS=11.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.06;MQRankSum=-6.837;QD=4.30;ReadPosRankSum=-2.724;SOR=1.988;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:386,84:0.18:470
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chr20	29652236	rs62206786	G	C	11185.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=9.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=385;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.768;HP=3;HapScore=1;MGOF=63;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-6.315;NF=49;NR=307;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.441;SC=CTGCAACCACGTTTCTACAGG;SOR=0.895;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=479;TCF=72;TCR=407;TR=356;WE=29652244;WS=29652225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,318:0.83:381
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chr20	29965028	.	G	C	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.528;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=549;ReadPosRankSum=1.058;SC=CAGAGAGCTTGAGAATGGTAA;SOR=0.634;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=13;WE=29965036;WS=29965004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,15:0.48:31
chr20	29966114	rs6579041	C	T	1510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.483;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=6;PP=1162;ReadPosRankSum=-0.020;SC=CCATCCCAACCAAGGCAGTAC;SOR=0.775;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=105;TCF=92;TCR=13;TR=51;WE=29966122;WS=29966104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,56:0.49:115
chr20	29966275	rs2223527	G	A	4344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=107;PP=2965;SC=AAAAACATCCGCGTTCCAGCA;SOR=2.902;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=133;TCF=25;TCR=108;TR=132;WE=29966283;WS=29966265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr20	29966362	rs2206383	A	C	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=47;PP=1383;SC=AACTGAGAGCAACCCAAGTTG;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=0;TCR=47;TR=47;WE=29966370;WS=29966352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr20	29977156	rs2295500	G	A	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=289;ReadPosRankSum=1.360;SC=AGTGAGTAATGCCAGACCCAG;SOR=0.446;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=16;WE=29977164;WS=29977146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chr20	29978115	rs6120073	G	A	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=4.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=384;ReadPosRankSum=-0.039;SC=CAAACCTCCCGAAGCTGCAGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=19;WE=29978123;WS=29978105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr20	29978216	rs2206381	T	C	3055.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=51;NR=42;PP=2569;SC=CCGAGAGAGGTTCACGTTACC;SOR=0.924;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=51;TCR=42;TR=93;WE=29978224;WS=29978206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr20	30037783	rs2273468	C	T	2313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.671;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=25;PP=1740;ReadPosRankSum=-0.067;SC=AAATCCGGAGCCTACTTGTTA;SOR=1.061;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=167;TCF=111;TCR=56;TR=86;WE=30037791;WS=30037773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,91:0.52:175
chr20	30226690	rs45557936	G	A	1167.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.209;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=873;ReadPosRankSum=-1.204;SC=AGGGCATGAGGGTGACCTTGA;SOR=0.295;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=75;TCF=57;TCR=18;TR=44;WE=30226698;WS=30226680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,46:0.57:80
chr20	30226764	rs6088857	G	C	1620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=28;PP=1253;ReadPosRankSum=-2.248;SC=TGGCCCTGCGGTTTGGGGGCA;SOR=0.665;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=53;TCR=44;TR=61;WE=30226772;WS=30226754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,62:0.63:99
chr20	30227639	rs6088858	A	G	141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.979;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=97;ReadPosRankSum=-1.058;SC=GATTACAGGCATGAGCCACCA;SOR=0.090;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=8;WE=30227647;WS=30227629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr20	30232452	rs6120970	C	T	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.409;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=0;PP=738;ReadPosRankSum=-0.538;SC=ATACTTCAACCCTGGAGTATC;SOR=1.954;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=56;TCR=1;TR=31;WE=30232460;WS=30232442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,31:0.54:57
chr20	30232504	rs7269866	G	A	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.603;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.018;NF=49;NR=7;PP=1081;ReadPosRankSum=0.769;SC=GCTACAGGGTGGCTGGAGACC;SOR=0.370;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=117;TCF=105;TCR=12;TR=56;WE=30232512;WS=30232494;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,56:0.48:116
chr20	30347832	rs6060930	A	G	1785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.736;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.822;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=21;PP=1296;ReadPosRankSum=-0.270;SC=CTTGCTGATCAGACAATGATG;SOR=1.226;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=196;TCF=137;TCR=59;TR=86;WE=30347840;WS=30347822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,87:0.44:199
chr20	30354417	rs13044019	G	A	2339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.211;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=29;PP=1697;ReadPosRankSum=0.021;SC=AATCCATTCCGTCAAATGCTT;SOR=0.571;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=197;TCF=138;TCR=59;TR=93;WE=30354425;WS=30354407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,97:0.49:200
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chr20	30363853	.	G	T	174	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=0.9999;HP=21;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=20;MQ=56.47;NF=3;NR=7;PP=174;QD=20.8771212547;SC=CTTGGTAGGTGTTTTTTTTTT;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=22;TCF=4;TCR=18;TR=10;WE=30363861;WS=30363843;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:12,10:0.45:22
chr20	30381758	rs1062794	G	C	2025.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.069;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=46;PP=1594;ReadPosRankSum=1.641;SC=GCCCTTTCTCGTTTGATTCTC;SOR=0.368;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=153;TCF=55;TCR=98;TR=79;WE=30381766;WS=30381748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,81:0.51:158
chr20	30382108	rs6060952	T	G	734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.096;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=547;ReadPosRankSum=-0.877;SC=TTTGAAAGGTTTCCTTCCTTA;SOR=1.734;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=24;WE=30382116;WS=30382098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr20	30382315	rs3203770	A	G	1058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=29;PP=802;ReadPosRankSum=-1.077;SC=AGACTGACAGAAGAGGTGCTC;SOR=0.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=20;TCR=67;TR=38;WE=30382323;WS=30382305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,41:0.43:95
chr20	30385192	rs6058463	C	T	1456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.270;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.518;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=5;PP=1165;ReadPosRankSum=0.056;SC=ATCTGACTGACTTTCTCTCTA;SOR=1.519;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=90;TCF=80;TCR=10;TR=53;WE=30385200;WS=30385182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,55:0.57:97
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chr20	30409584	rs35574032	G	C	237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.745;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=188;ReadPosRankSum=-1.040;SC=CTGGGGCCAGGGGGAGGGAAG;SOR=1.467;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=14;WE=30409592;WS=30409574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
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chr20	30419051	rs4518038	A	G	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.915;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=280;ReadPosRankSum=-1.684;SC=CACCTCCCCTATCCCTCAGTC;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=15;WE=30419059;WS=30419041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr20	30421459	rs6089093	C	T	1352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.213;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=20;PP=962;ReadPosRankSum=0.585;SC=GCTGCTCAGACACCCTGCAGC;SOR=0.520;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=134;TCF=85;TCR=49;TR=52;WE=30421467;WS=30421449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,59:0.41:143
chr20	30433139	rs6089096	G	A	2062.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.521;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=35;PP=1591;ReadPosRankSum=-0.044;SC=TGAGTGACAGGTTGTGGCGGA;SOR=0.658;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=175;TCF=86;TCR=89;TR=79;WE=30433147;WS=30433129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,80:0.45:177
chr20	30433352	rs6121246	C	T	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=5.981;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.738;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=583;ReadPosRankSum=0.112;SC=GCATGCTGGCCGGGCTGCCAG;SOR=1.440;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=55;TCF=6;TCR=49;TR=26;WE=30433360;WS=30433342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,29:0.50:58
chr20	30436088	rs8118150	G	A	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.610;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=3;PP=611;ReadPosRankSum=0.418;SC=GTGGAAGGCCGCGATCCACCT;SOR=0.280;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=27;WE=30436096;WS=30436078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,27:0.73:37
chr20	30437522	rs3746599	A	G	1253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.839;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=14;PP=1019;ReadPosRankSum=-0.490;SC=GCGCTGGGCAATGGGTCGGGG;SOR=1.292;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=74;TCF=48;TCR=26;TR=45;WE=30437530;WS=30437512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,46:0.63:73
chr20	30449325	rs947310	C	G	551.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.998;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=17;PP=450;ReadPosRankSum=1.214;SC=AGGCGCTGCACGGTTCCCTCG;SOR=0.302;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=53;TCF=11;TCR=42;TR=23;WE=30449333;WS=30449315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr20	30449516	.	G	GC	155	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=22;MQ=60.0;NF=1;NR=3;PP=155;QD=47.0;SC=GTCAAGGCCGGCGCGGGGCGG;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=4;WE=30449524;WS=30449506;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,4:0.80:5
chr20	30451844	rs6087786	C	T	839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.104;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=24;PP=649;ReadPosRankSum=0.455;SC=GGAGTTGTTCCGCCCCCACCC;SOR=1.104;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=69;TCF=23;TCR=46;TR=33;WE=30451852;WS=30451834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr20	30467826	.	C	G	122	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;FR=0.5000;HP=11;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=26;MQ=58.06;NF=0;NR=8;PP=122;QD=19.5964015684;SC=GGCGGGGGGGCGGGGTGGGTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=5;TCR=12;TR=8;WE=30467834;WS=30467816;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr20	30513702	rs61745444	C	T	5046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=438;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.994;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=118;PP=2962;ReadPosRankSum=0.297;SC=CCTGGCTCTACCGGGATGGCT;SOR=1.092;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=424;TCF=186;TCR=238;TR=194;WE=30513710;WS=30513692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:234,201:0.46:435
chr20	30527065	rs6061043	T	C	4080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=356;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.174;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.98;MQRankSum=-1.041;NF=90;NR=76;PP=2962;ReadPosRankSum=1.727;SC=CCAACACACATCTCGGTATGT;SOR=0.895;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=343;TCF=176;TCR=167;TR=166;WE=30527073;WS=30527055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:184,168:0.48:352
chr20	30584710	rs61750849	C	T	5080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=473;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=109;NR=105;PP=2962;ReadPosRankSum=0.560;SC=GAGAACGCCGCGCTCACCGGC;SOR=0.696;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=472;TCF=238;TCR=234;TR=214;WE=30584718;WS=30584700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:258,214:0.45:472
chr20	30661297	rs2297304	G	A	2950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=72;PP=2270;SC=CCTCTGAAGTGCTTTGCGCAG;SOR=2.376;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=21;TCR=73;TR=93;WE=30661305;WS=30661287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr20	30746248	rs6061195	T	C	3233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=74;PP=2454;SC=TCTCGTTCTGTGGCAGCATCC;SOR=1.469;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=115;TCF=41;TCR=74;TR=115;WE=30746256;WS=30746238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr20	30753270	rs14316	T	C	2433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=57;PP=1926;SC=ACGGCCAAGCTTGCTCCGTCC;SOR=2.334;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=17;TCR=57;TR=74;WE=30753278;WS=30753260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr20	30777336	rs3813922	G	T	7607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=114;PP=2965;ReadPosRankSum=0.934;SC=CTGGAAGTAGGGGTTGCTCCA;SOR=0.262;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=239;TCF=125;TCR=114;TR=235;WE=30777344;WS=30777326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,243:1.00:244
chr20	30777761	.	C	A	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.413;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=39;PP=995;ReadPosRankSum=-0.366;SC=AGATGGCGCCCTCCTCCTTGT;SOR=0.760;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=109;TCF=24;TCR=85;TR=50;WE=30777769;WS=30777751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,50:0.46:109
chr20	30777800	rs11907716	T	C	2139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=61;PP=1671;ReadPosRankSum=0.968;SC=CGCTGGCTCCTGCCCGAGTCC;SOR=1.559;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=75;TCF=13;TCR=62;TR=74;WE=30777808;WS=30777790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,76:0.99:77
chr20	30777860	rs11907235	A	G	1396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=30;PP=1049;SC=GGACCCGGCCATTTTCCAGGC;SOR=1.708;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=44;WE=30777868;WS=30777850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr20	30795819	rs1923095	T	C	3322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=38;PP=2556;SC=CGGGGATGCCTGCGGGCTCCT;SOR=1.505;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=70;TCR=38;TR=108;WE=30795827;WS=30795809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr20	30915461	rs1129012	T	C	5059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.529;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=98;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.297;SC=AGGCCCGATATAGGGTGAGAA;SOR=1.148;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=159;TCF=60;TCR=99;TR=156;WE=30915469;WS=30915451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,162:0.98:165
chr20	30919183	rs1029116	A	G	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=22;PP=638;SC=AGAGACTAGCAAAAAGCTGCA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=30919191;WS=30919173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr20	31022959	rs6058694	T	C	5089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=50;PP=2965;SC=GGTCCCATTCTGTCTCTAGTG;SOR=1.744;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=160;TCF=110;TCR=50;TR=159;WE=31022967;WS=31022949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
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chr20	31035129	rs1737887	A	G	6024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=69;NR=120;PP=2965;SC=GCGCCTTGTCAGGGGAGCCCC;SOR=1.393;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=189;TCF=69;TCR=120;TR=189;WE=31035137;WS=31035119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr20	31035726	rs144443155	A	AGTT	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=116;SC=GCCCACTGTGAGTTGGGCACT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=3;WE=31035734;WS=31035716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr20	31099311	rs159428	T	C	2136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=46;PP=1617;SC=GCGGGCCTGTTGCCCACATGG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=24;TCR=46;TR=70;WE=31099319;WS=31099301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr20	31189411	rs2029086	A	G	1963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=8;PP=1585;SC=AGGGAGCATGAAGCACCTTGC;SOR=3.370;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=49;TCR=8;TR=57;WE=31189419;WS=31189401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr20	31196471	rs8114375	A	G	12480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=417;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=135;NR=269;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.719;SC=AGCTCTGTGCAGCCTCCCTGC;SOR=1.154;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=409;TCF=137;TCR=272;TR=404;WE=31196479;WS=31196461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,410:0.99:415
chr20	31238627	rs7272020	C	T	1385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.520;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=32;PP=990;ReadPosRankSum=1.380;SC=TCCTCCTTCCCGCCCCACCGC;SOR=1.017;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=96;TCF=45;TCR=51;TR=52;WE=31238635;WS=31238617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,54:0.55:98
chr20	31291161	rs9421	C	T	1066.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=3;PP=829;ReadPosRankSum=0.877;SC=GGAACGGGGCCAGGGGAGATG;SOR=0.878;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=81;TCF=74;TCR=7;TR=39;WE=31291169;WS=31291151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,39:0.48:81
chr20	31292298	rs59379723	CA	C	184.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=15.289;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.43;ReadPosRankSum=0.955;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr20	31294655	rs28548540	A	G	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=2.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=338;ReadPosRankSum=-1.247;SC=GACCTAAAGGACAAAAGGAAC;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=17;WE=31294663;WS=31294645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr20	31350238	rs139762513	C	T	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.758;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=36;ReadPosRankSum=0.920;SC=CTCGCAGCAGCTGCTCCCGGC;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=4;WE=31350246;WS=31350228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr20	31367948	rs6058885	C	T	1971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.636;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=26;PP=1400;ReadPosRankSum=1.623;SC=AGCCTCCAAGCTTGGTGAGGG;SOR=1.004;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=174;TCF=113;TCR=61;TR=80;WE=31367956;WS=31367938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,82:0.46:179
chr20	31374259	rs2424913	C	T	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.295;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=4;PP=838;ReadPosRankSum=-0.913;SC=CGCCAGACCCCAGGCCTCCAG;SOR=0.531;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=84;TCF=76;TCR=8;TR=38;WE=31374267;WS=31374249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,39:0.46:85
chr20	31374520	rs2424914	A	G	1914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.586;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.412;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=63;PP=1665;ReadPosRankSum=1.363;SC=TGTGGCTGGTAGATAATCTGT;SOR=0.923;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=180;TCF=43;TCR=137;TR=83;WE=31374528;WS=31374510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,76:0.44:171
chr20	31376490	rs4911260	T	C	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=124;ReadPosRankSum=0.031;SC=GCGATCCCCCTGCCTCGGTCT;SOR=0.283;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=9;WE=31376498;WS=31376486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr20	31381229	rs993419	G	A	705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.044;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=651;ReadPosRankSum=1.145;SC=CGCCGAGATCGCACCACTGCA;SOR=0.030;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=63;TCF=60;TCR=3;TR=28;WE=31381237;WS=31381223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,28:0.44:64
chr20	31381507	rs73112162	T	G	1201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.256;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.110;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=41;PP=878;ReadPosRankSum=1.854;SC=TCTTGAAAAGTCAATCTGAAC;SOR=1.719;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=83;TCF=1;TCR=82;TR=41;WE=31381515;WS=31381497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,45:0.51:88
chr20	31386347	rs6058891	T	C	1569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.307;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=41;PP=1262;ReadPosRankSum=-0.349;SC=CCTGGAGCTGTTACATGTGTC;SOR=1.470;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=100;TCF=34;TCR=66;TR=56;WE=31386355;WS=31386337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,57:0.56:102
chr20	31386449	rs2424922	T	C	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.436;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=18;PP=335;ReadPosRankSum=-0.732;SC=GGCTTGAATATGTAAGCCACA;SOR=1.632;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=62;TCF=27;TCR=35;TR=27;WE=31386457;WS=31386439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,26:0.42:62
chr20	31387954	rs1997797	C	G	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.293;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=6;PP=568;ReadPosRankSum=0.666;SC=CTCTGGCCCCCACAGGCTACC;SOR=0.826;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=74;TCF=59;TCR=15;TR=35;WE=31387962;WS=31387944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,35:0.47:75
chr20	31388461	.	C	T	81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=59.53;NF=6;NR=0;PP=81;QD=19.2952020912;SC=GTTGGGGTTTCTCCATGTTGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=6;WE=31388469;WS=31388460;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr20	31388636	rs2424928	T	C	2505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.302;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=44;PP=1993;ReadPosRankSum=-1.073;SC=GTCTCTCTCTTTCAGATTGAA;SOR=0.770;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=182;TCF=91;TCR=91;TR=98;WE=31388644;WS=31388626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,98:0.53:185
chr20	31389009	rs2065576	C	T	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.120;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=3;PP=439;ReadPosRankSum=-0.659;SC=TGGGAACCTGCTGGTCTCAGG;SOR=1.284;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=57;TCF=48;TCR=9;TR=26;WE=31389017;WS=31388999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,26:0.46:57
chr20	31414020	rs3092521	CT	C	72.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.10;MQRankSum=2.152;QD=3.03;ReadPosRankSum=0.595;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr20	31427694	rs55860691	C	T	1137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=32;PP=908;ReadPosRankSum=-0.265;SC=ACGTGAGTCACCTCGGGGGAT;SOR=0.776;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=22;TCR=64;TR=43;WE=31427702;WS=31427684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,44:0.49:89
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chr20	31466347	rs13037174	C	T	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=3;PP=470;SC=GACGGAGTCTCGCTCTGTCGC;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=17;WE=31466355;WS=31466337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
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chr20	31480961	rs2377734	C	T	4277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=38;PP=2965;ReadPosRankSum=1.578;SC=CAACCTCTTCCGTCTCCATCT;SOR=0.788;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=127;TCF=89;TCR=38;TR=125;WE=31480969;WS=31480951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,132:0.99:133
chr20	31484417	rs11167186	T	A	2845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.064;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=76;PP=2264;ReadPosRankSum=1.210;SC=AAAGTGGATTTACTCCCTGGG;SOR=0.602;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=236;TCF=74;TCR=162;TR=113;WE=31484425;WS=31484407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:126,115:0.48:241
chr20	31486206	rs6058948	A	G	1288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=0;PP=952;SC=ATCTCTGGGCACCTCCAGTCC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=41;WE=31486214;WS=31486196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr20	31494382	rs6120033	G	A	2005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=36;PP=1550;SC=TCAGTGCTGCGTTTAAGGAAA;SOR=0.849;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=66;TCF=30;TCR=36;TR=66;WE=31494390;WS=31494372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr20	31495977	rs17370942	C	T	1529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=5;PP=1164;ReadPosRankSum=1.287;SC=CTTGGACGGACGATGTGCCCT;SOR=0.732;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=82;TCR=8;TR=54;WE=31495985;WS=31495967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,57:0.61:93
chr20	31500491	.	G	A	1593.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.259;ClippingRankSum=0.000;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.172;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=19;PP=1264;ReadPosRankSum=-0.961;SC=GGTGATTTTCGTCATCCAGAG;SOR=0.354;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=114;TCF=84;TCR=30;TR=64;WE=31500499;WS=31500481;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,63:0.57:110
chr20	31505189	rs13043425	C	T	3203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.672;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=94;NR=17;PP=2590;ReadPosRankSum=-0.789;SC=GGCCAAGTACCGGAACCAGTT;SOR=0.782;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=216;TCF=182;TCR=34;TR=111;WE=31505197;WS=31505179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,115:0.52:222
chr20	31505292	rs13037781	C	T	12652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=405;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=167;NR=221;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.710;SC=AGGAGCCCCTCGCCCTTGCAG;SOR=0.709;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=391;TCF=169;TCR=222;TR=388;WE=31505300;WS=31505282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,402:1.00:403
chr20	31518298	rs6058961	A	G	4181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.033;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=26;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.940;SC=TCCCTCCATGAGAATGGAGGC;SOR=2.593;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=104;TCR=27;TR=128;WE=31518306;WS=31518288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,129:0.98:131
chr20	31549424	rs11167189	G	A	3660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=93;PP=2865;ReadPosRankSum=-0.105;SC=GAGGTGCTCCGCTGTCTTCTC;SOR=1.329;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=114;TCF=19;TCR=95;TR=112;WE=31549432;WS=31549414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,118:0.98:120
chr20	31571485	rs6087436	C	T	1045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=5;PP=868;ReadPosRankSum=-0.727;SC=CCTGGGCACCCGGAATGGGAT;SOR=1.666;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=32;WE=31571493;WS=31571475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chr20	31573528	rs2274343	A	C	2989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=77;NR=12;PP=2409;SC=AGCTCCCTGCAGGGGAGTGCT;SOR=3.684;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=77;TCR=12;TR=89;WE=31573536;WS=31573518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr20	31573769	rs13040459	T	G	1358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=40;PP=1142;SC=ATCCCACCTTTGATCCCCTGT;SOR=3.767;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=44;WE=31573777;WS=31573759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr20	31590530	rs41305793	T	G	1858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=46;PP=1584;SC=TGCAGAGACCTAGGGAGCACC;SOR=2.753;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=57;TCF=10;TCR=47;TR=56;WE=31590538;WS=31590520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr20	31592242	rs6088062	C	T	1304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=34;PP=1118;SC=TGAAAAGTGCCAAGTGGAATC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=8;TCR=34;TR=42;WE=31592250;WS=31592232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr20	31596472	rs6088066	A	T	5064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=61;PP=2965;SC=CGACTCAACAAGGCAGCATTG;SOR=1.301;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=161;TCF=100;TCR=61;TR=161;WE=31596480;WS=31596462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,164:1.00:164
chr20	31603405	rs35897534	TAA	T	237.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=2.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.51;ReadPosRankSum=-0.560;SOR=1.214;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,10:0.40:25
chr20	31608250	rs6057703	C	A	3101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.191;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.481;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=53;PP=2347;ReadPosRankSum=0.448;SC=TCTTCTGTGCCATGGGTCCAT;SOR=0.711;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=220;TCF=115;TCR=105;TR=109;WE=31608258;WS=31608240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,116:0.51:229
chr20	31608300	rs73254524	G	A	2670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=49;PP=2034;ReadPosRankSum=0.623;SC=GAGCCTGGGCGTAGGGAGGTG;SOR=0.731;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=231;TCF=117;TCR=114;TR=104;WE=31608308;WS=31608290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,108:0.45:238
chr20	31609433	rs13043556	T	C	1270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=3;PP=910;ReadPosRankSum=-1.079;SC=GCATCCATCTTCCAGATGCCT;SOR=0.855;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=80;TCF=74;TCR=6;TR=41;WE=31609441;WS=31609423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,45:0.54:84
chr20	31609581	rs17124003	C	T	2604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=58;PP=1913;ReadPosRankSum=-0.083;SC=TCCACTATGTCGCCCCTGAGA;SOR=0.680;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=200;TCF=81;TCR=119;TR=100;WE=31609589;WS=31609571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,104:0.51:204
chr20	31649781	rs398444	T	C	1621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=57;PP=1369;SC=CCGGGCCTGCTGACCGGCCTT;SOR=6.770;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=58;TCF=1;TCR=57;TR=58;WE=31649789;WS=31649771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
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chr20	31656837	rs2424938	G	A	1543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=45;PP=1290;SC=GGGGGTGACTGTCTCCAGGAC;SOR=4.892;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=48;WE=31656845;WS=31656827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr20	31660489	rs11700200	T	C	4661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=106;NR=47;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.073;SC=TCCCCACCAATGTACCTTTGT;SOR=1.135;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=157;TCF=109;TCR=48;TR=153;WE=31660497;WS=31660479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,157:0.98:160
chr20	31661650	rs7267265	G	A	1093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.186;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=30;PP=931;ReadPosRankSum=-0.712;SC=CCTGTATCTCGGTATCTCCTG;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=33;WE=31661658;WS=31661640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr20	31671209	rs13036385	G	C	5158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=104;NR=56;PP=2965;SC=TTCCATGTCCGAGGACCCCCC;SOR=1.363;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=104;TCR=56;TR=160;WE=31671217;WS=31671199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr20	31671599	rs4339026	A	G	2533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=43;PP=1949;SC=CTCCTTGGTGATGGAGGACTT;SOR=0.876;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=78;TCF=35;TCR=43;TR=77;WE=31671607;WS=31671589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr20	31671663	rs2424945	T	C	1877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=39;PP=1416;SC=TCCTCAGCACTGTGCAAGGCA;SOR=1.402;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=22;TCR=39;TR=61;WE=31671671;WS=31671653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr20	31671693	rs3926669	C	T	1671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=36;PP=1295;SC=AAGGAGGGGACGGGTTCTCCC;SOR=1.938;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=51;WE=31671701;WS=31671683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr20	31671766	rs1547004	G	A	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=24;PP=696;SC=GTTGCCGGAGGGAAGGTCTTC;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=31671774;WS=31671756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr20	31677476	rs6057722	T	C	1206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=41;PP=952;SC=GCCCTTGAAGTGAGGAGTGGC;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=42;WE=31677484;WS=31677466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr20	31678534	rs2070326	T	C	2555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=41;PP=1981;SC=TCTGGGGATATTGGGAAGTGT;SOR=0.850;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=76;TCF=35;TCR=41;TR=75;WE=31678542;WS=31678524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr20	31680234	rs2070327	C	T	1093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=7;PP=879;SC=TTCTCCCTCCCTGTGACCCCT;SOR=2.517;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=25;TCR=7;TR=32;WE=31680242;WS=31680224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr20	31682778	rs2024934	C	A	1165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=37;NR=3;PP=1071;SC=AGGGGTCTTTCAGGGAGAGAA;SOR=4.407;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=40;WE=31682786;WS=31682768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr20	31685405	rs13041016	C	T	1242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=0;PP=1119;SC=GTCCATCTGGCCTGGTGCCTG;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=42;WE=31685413;WS=31685395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr20	31688241	rs11699009	T	C	3293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.174;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=48;PP=2520;ReadPosRankSum=-0.828;SC=GGACACAGAATTCTTGGCCTC;SOR=0.373;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=104;TCF=54;TCR=50;TR=102;WE=31688249;WS=31688231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,107:0.99:108
chr20	31688260	rs11696307	C	T	3052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=52;PP=2255;ReadPosRankSum=1.394;SC=TCATTTTCCACAGAAGGAGAT;SOR=0.294;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=41;TCR=53;TR=93;WE=31688268;WS=31688250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr20	31688330	rs11696310	C	T	1941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=44;PP=1409;SC=GGGGTCCTGACGGTGCTGGTG;SOR=2.494;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=11;TCR=44;TR=55;WE=31688338;WS=31688320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr20	31692669	.	C	G	1381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.871;ClippingRankSum=0.000;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=26;PP=1044;ReadPosRankSum=-0.209;SC=CATTCATGCCCGCAATGAACG;SOR=0.734;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=67;TCR=53;TR=59;WE=31692677;WS=31692659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,60:0.48:125
chr20	31805550	rs41312280	C	T	1052.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=7.271;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=36;PP=834;ReadPosRankSum=0.287;SC=ACTGCTAACCCGCTGGGTGAC;SOR=0.180;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=80;TCF=1;TCR=79;TR=37;WE=31805558;WS=31805540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,40:0.48:84
chr20	31811551	rs725914	C	T	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=2;PP=1308;SC=CCCAGGCCTCCGAATCCCAAG;SOR=5.376;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=44;TCR=2;TR=46;WE=31811559;WS=31811541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr20	31812923	rs3818222	G	A	1999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=25;PP=1764;SC=TAACAACATCGTAAAGATGTG;SOR=0.976;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=34;TCR=25;TR=59;WE=31812931;WS=31812913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr20	31814348	rs1570033	G	A	7180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.887;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=150;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.810;SC=CCGAGGGTTAGGGCATATATC;SOR=1.534;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=214;TCF=64;TCR=150;TR=213;WE=31814356;WS=31814338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,227:1.00:228
chr20	31825436	rs58831055	A	AG	2814.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=2;PP=2936;ReadPosRankSum=-0.168;SC=CCCAGGTGTCAGGGCAGGTGG;SOR=4.502;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=89;TCF=86;TCR=3;TR=79;WE=31825444;WS=31825426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,86:0.98:88
chr20	31825704	.	ATGTGTGTGTGTGTGTG	A	1758	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=19;MQ=60.65;NF=3;NR=10;PP=1758;QD=135.461538462;SC=GTATGTGTGCATGTGTGTGTG;SbPval=0.04;Source=Platypus;TC=52;TCF=3;TCR=49;TR=13;WE=31825727;WS=31825694;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:39,13:0.25:52
chr20	31825797	.	G	A	811	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=29;MQ=60.25;NF=20;NR=12;PP=811;QD=26.4303503921;SC=CTGGATGGGGGAGGGGGCCTG;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=32;WE=31825805;WS=31825796;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,32:0.94:34
chr20	31826027	rs6059183	T	C	5214.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=116;PP=2965;SC=TTGAGTGAGTTGTCCTAAAAT;SOR=1.519;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=176;TCF=60;TCR=116;TR=176;WE=31826035;WS=31826017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr20	31826088	rs36225274	GGCAGTGACCCTGAA	G	2867.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=50;PP=2935;SC=GCCAGCCCCAGGCAGTGACCC;SOR=3.737;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=61;TCF=6;TCR=55;TR=55;WE=31826109;WS=31826078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr20	31826130	rs6141898	G	T	1573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=90;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=41;PP=930;SC=GCGAGGGAGCGGCCTGAAGAT;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=42;WE=31826138;WS=31826120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
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chr20	31828265	rs6059187	A	G	2139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=39;PP=1298;SC=TGGAAAGCTGAGACAATGAGA;SOR=3.033;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=8;TCR=39;TR=47;WE=31828273;WS=31828244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr20	31828336	.	A	AGATGGATG	184.94	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.96;QD=46.24;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr20	31954819	rs368904466	TA	T	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=3.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.04;MQRankSum=1.415;QD=0.57;ReadPosRankSum=-0.433;SOR=1.456;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,12:0.18:66
chr20	31954890	rs291674	C	G	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=39;PP=1149;SC=GCACAGAGGGCGACCATGTTC;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=39;WE=31954898;WS=31954880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr20	31975090	.	G	A	681	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=59.38;NF=25;NR=0;PP=681;QD=28.6308485019;SC=TGTGAAAGGAGGAAGAGGCTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=31975098;WS=31975089;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr20	31981849	rs291700	T	C	8536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=140;NR=142;PP=2965;ReadPosRankSum=0.691;SC=TGATAGAGCATGTGACAAGGA;SOR=0.455;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=287;TCF=143;TCR=144;TR=282;WE=31981857;WS=31981839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,297:0.98:302
chr20	32000351	rs291694	A	G	1546.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=25;NR=21;PP=1298;SC=CGGAAGAGAGAGAGGGATAGG;SOR=0.976;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=25;TCR=21;TR=46;WE=32000359;WS=32000341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr20	32245546	rs13037669	T	C	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=297;SC=AGGAGACAAGTCCTGGTCTTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=32245554;WS=32245537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr20	32247256	rs139441010	AC	A	1436.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.713;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.470;NF=26;NR=21;PP=1441;ReadPosRankSum=-1.612;SC=ATTCATGAGCACCCCCAGACA;SOR=0.829;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=102;TCF=56;TCR=46;TR=47;WE=32247264;WS=32247246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,56:0.49:115
chr20	32308157	rs41287068	A	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.773;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=154;ReadPosRankSum=-0.977;SC=TGCATGGAAGACCAATCAGAG;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=8;WE=32308165;WS=32308147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr20	32376748	rs34260449	C	T	1466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.653;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=44;PP=1192;ReadPosRankSum=0.122;SC=TGTTGATCCACGAGCCCTTCA;SOR=0.793;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=151;TCF=49;TCR=102;TR=63;WE=32376756;WS=32376738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,62:0.41:153
chr20	32379263	rs2626551	T	C	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.940;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=442;ReadPosRankSum=-1.327;SC=AGCTGCAGGCTGGGGCCGAGG;SOR=0.549;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=74;TCF=23;TCR=51;TR=34;WE=32379271;WS=32379253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,32:0.43:74
chr20	32664864	rs10649600	C	CCAG	3395.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=7;PP=2983;SC=GGAGGTGGCGCCGGCGGCGGC;SOR=4.119;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=70;TCF=63;TCR=7;TR=63;WE=32664872;WS=32664854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr20	32856838	rs36093428	C	A	1173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.955;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=28;PP=853;ReadPosRankSum=-0.519;SC=CCCGGACCCCCCTATCTGCGC;SOR=0.402;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=140;TCF=82;TCR=58;TR=53;WE=32856846;WS=32856828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,53:0.38:138
chr20	32891200	rs819146	G	T	4737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=104;PP=2965;SC=TATCTTCCTCGCACTTGCATA;SOR=2.012;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=41;TCR=104;TR=145;WE=32891208;WS=32891190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr20	32996689	rs3761147	G	T	1408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.69;ReadPosRankSum=-2.784;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:57,54:0.49:111
chr20	33029886	.	C	G	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.029;ClippingRankSum=0.000;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.435;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=6;PP=853;ReadPosRankSum=-2.113;SC=TTTGTATCATCTTTCTAAACT;SOR=0.163;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=95;TCF=86;TCR=9;TR=43;WE=33029894;WS=33029876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,44:0.44:99
chr20	33037336	rs3736762	C	T	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.648;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=430;ReadPosRankSum=-0.718;SC=TTTTTGTTCTCTTCCAATTGT;SOR=0.754;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=10;TCR=37;TR=23;WE=33037344;WS=33037326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr20	33050107	rs73103130	G	A	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=468;ReadPosRankSum=-1.500;SC=TTAGCAAGGAGTGGAAGTCTT;SOR=0.260;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=23;WE=33050115;WS=33050097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr20	33053985	rs11480899	A	AT	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.417;NF=9;NR=0;PP=196;ReadPosRankSum=-0.312;SC=TGATCATGTGATTTTTTCCCC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=9;WE=33053993;WS=33053975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr20	33057954	rs6059856	G	C	2548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.020;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.073;NF=17;NR=74;PP=2080;ReadPosRankSum=1.299;SC=TCTCTGTACTGCCTTAACTTT;SOR=1.535;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=196;TCF=51;TCR=145;TR=91;WE=33057962;WS=33057944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,93:0.47:198
chr20	33057974	rs10716089	CT	C	5574.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.184;NF=11;NR=125;PP=2951;ReadPosRankSum=-1.267;SC=TGTTGTGTTGCTTTATATTAC;SOR=1.968;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=147;TCF=12;TCR=135;TR=136;WE=33057982;WS=33057964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,159:0.99:160
chr20	33059478	.	G	GGT	427.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=-0.000;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.76;MQRankSum=-0.660;QD=38.88;ReadPosRankSum=-1.335;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr20	33068563	rs6059861	A	T	479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.715;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=360;ReadPosRankSum=1.048;SC=CATGTAATTTATTAAAATATA;SOR=1.911;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=17;WE=33068571;WS=33068553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,18:0.51:35
chr20	33095417	rs118176813	G	C	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=0;PP=523;ReadPosRankSum=0.451;SC=TGCTTCTATAGTAGTGTATAA;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=56;TCR=1;TR=26;WE=33095425;WS=33095407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,26:0.46:56
chr20	33104592	rs2424993	G	C	4983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=51;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.245;SC=GGCAACCCTGGCAACGTTTCC;SOR=0.928;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=99;TCR=53;TR=147;WE=33104600;WS=33104582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,155:0.98:158
chr20	33117533	rs111373342	CA	C	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQRankSum=-0.611;QD=1.85;ReadPosRankSum=0.821;SOR=0.936;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,8:0.28:29
chr20	33147737	rs6059915	C	G	1451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=39;PP=1151;SC=GGGAGTCGGGCGGCCCCGGTC;SOR=3.912;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=44;WE=33147745;WS=33147727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr20	33148861	rs6059916	T	G	2333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=52;PP=1788;SC=CTGGCAGGTGTTGTTGGAAGA;SOR=2.062;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=17;TCR=52;TR=69;WE=33148869;WS=33148851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr20	33150503	rs6059918	C	T	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.174;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=280;ReadPosRankSum=0.606;SC=TGCCTGGGGCCCAGATCACTG;SOR=1.845;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=13;WE=33150511;WS=33150493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,14:0.52:27
chr20	33169495	rs11467128	AAGAG	A	1144.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=1.008;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.33;MQRankSum=1.471;QD=18.17;ReadPosRankSum=-0.183;SOR=0.531;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,31:0.49:63
chr20	33297810	rs369052205	G	GC	382.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;QD=38.27;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr20	33297811	rs2378257	A	C	421.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.25;QD=42.18;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr20	33326876	rs6060025	A	G	1480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=38;PP=1241;SC=GGAACATGTCAGGGAAGGGAA;SOR=3.033;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=44;WE=33326884;WS=33326866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr20	33334540	rs910872	T	C	2049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=4;PP=1697;SC=ATTGTTTCCTTGAAGACATGG;SOR=4.909;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=57;TCF=53;TCR=4;TR=57;WE=33334548;WS=33334530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr20	33337751	rs3787220	T	C	8763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=291;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=138;NR=142;PP=2965;SC=CTTGCATGTTTGGAGTTGGTC;SOR=0.728;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=281;TCF=139;TCR=142;TR=280;WE=33337759;WS=33337741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,289:1.00:289
chr20	33342439	rs1884432	T	C	1408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=2;PP=1138;SC=CCAAGACTTATTACTTATCTG;SOR=5.330;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=42;WE=33342447;WS=33342429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr20	33342477	rs6087625	G	A	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=6;PP=620;ReadPosRankSum=-1.080;SC=TCAAGTCTACGACACAATGCT;SOR=0.580;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=55;TCF=44;TCR=11;TR=30;WE=33342485;WS=33342467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,32:0.55:58
chr20	33346556	rs11468960	ATC	A	1096.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.919;NF=15;NR=8;PP=859;ReadPosRankSum=-0.882;SC=TTTTATAATGATCTGTGCAGA;SOR=0.640;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=54;TCF=37;TCR=17;TR=23;WE=33346565;WS=33346546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,30:0.46:65
chr20	33356511	rs2295353	C	T	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=392;ReadPosRankSum=0.881;SC=AGTTTACCACCAGAAAAATGG;SOR=0.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=19;WE=33356519;WS=33356501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr20	33364584	rs6060043	C	T	2850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=41;PP=2206;SC=AGGCAATGAACGGAAAGCCGT;SOR=0.947;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=48;TCR=41;TR=89;WE=33364592;WS=33364574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr20	33364655	rs6120723	C	T	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=520;ReadPosRankSum=0.559;SC=ATAGAATAGGCTCATGCCTAT;SOR=0.576;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=24;WE=33364663;WS=33364645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,26:0.55:47
chr20	33370266	rs6060048	T	C	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.093;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=11;PP=196;ReadPosRankSum=1.149;SC=CAACAATGTATAATTCATAGT;SOR=0.283;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=13;WE=33370274;WS=33370256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,13:0.37:35
chr20	33462842	rs45606744	A	G	483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.331;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=7;PP=377;ReadPosRankSum=0.163;SC=TTCAGGCCTCAGAATCACTCT;SOR=0.404;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=44;TCF=31;TCR=13;TR=22;WE=33462850;WS=33462832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr20	33470694	rs4911163	C	T	2009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.615;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=47;PP=1401;ReadPosRankSum=-0.672;SC=GGAAAATCTTCATTGAGTGGA;SOR=0.591;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=155;TCF=53;TCR=102;TR=74;WE=33470702;WS=33470684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,79:0.50:158
chr20	33500245	rs3787214	C	A	151.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=86;ReadPosRankSum=1.501;SC=CACACCACCACACCCAGCTAA;SOR=1.179;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=5;WE=33500253;WS=33500235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,6:0.60:10
chr20	33500378	rs2378294	G	A	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.119;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=14;PP=501;ReadPosRankSum=0.932;SC=GAGCCACCGCGCCTGGCCAAT;SOR=0.922;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=19;TCR=25;TR=25;WE=33500386;WS=33500368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr20	33509275	rs3818273	G	A	2053.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.689;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=47;PP=1651;ReadPosRankSum=0.080;SC=AGTGAGTGAAGGGTACAGAAG;SOR=0.834;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=183;TCF=92;TCR=91;TR=82;WE=33509283;WS=33509265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,83:0.44:190
chr20	33509523	rs2273683	C	T	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=1.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=16;PP=881;ReadPosRankSum=1.695;SC=GTTCTGGGGCCCCTTGGGAGT;SOR=0.723;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=89;TCF=53;TCR=36;TR=41;WE=33509531;WS=33509513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,40:0.45:89
chr20	33533736	rs734111	A	C	796.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.218;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=3;PP=550;ReadPosRankSum=0.058;SC=CTGGCCCCCCAATGCTTCACT;SOR=0.148;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=46;TCF=42;TCR=4;TR=26;WE=33533744;WS=33533726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr20	33572941	rs2425007	A	G	7029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=149;PP=2965;SC=CTGTGAGTCAACCCCCTGCGG;SOR=1.706;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=218;TCF=69;TCR=149;TR=218;WE=33572949;WS=33572931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr20	33572979	rs3746448	C	T	1639.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.782;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=55;PP=1293;ReadPosRankSum=-0.619;SC=GGCCTGAGCCCGGTCACCCCA;SOR=1.239;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=119;TCF=14;TCR=105;TR=61;WE=33572987;WS=33572969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,62:0.51:122
chr20	33574022	rs2425008	G	C	2750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=66;PP=1950;SC=GTACGATGAAGGGGGTGGGAG;SOR=1.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=33;TCR=67;TR=98;WE=33574030;WS=33574012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr20	33574765	rs3746446	T	C	3845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.990;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=341;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.409;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=109;PP=2659;ReadPosRankSum=-1.014;SC=ACAACATGAATGATGGGGAGG;SOR=0.723;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=322;TCF=110;TCR=212;TR=164;WE=33574773;WS=33574755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,172:0.51:338
chr20	33575347	rs3053708	C	CAT	4719.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=14;PP=2957;SC=TTACCCCACTCGTGCCCTGCC;SOR=3.464;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=102;TCF=87;TCR=15;TR=91;WE=33575355;WS=33575337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
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chr20	33581955	rs2425012	G	A	2636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.991;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.117;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=36;PP=1942;ReadPosRankSum=2.253;SC=CTAGGGATGCGCTGTTCACCA;SOR=1.039;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=238;TCF=144;TCR=94;TR=107;WE=33581963;WS=33581945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:139,111:0.44:250
chr20	33583033	rs10536288	CAAA	C	143	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=0;PP=95;SC=AGAGCACAGCCAAACTTTGCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=33583045;WS=33583031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr20	33583037	rs61501849	C	G	152.03	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=0;PP=40;SC=CACAGCCAAACTTTGCTACAG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=33583045;WS=33583031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr20	33583114	rs2425014	T	C	483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=406;SC=TCCCCCAACCTGGCCCCGTTC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=33583122;WS=33583104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr20	33583331	rs2425015	A	G	6418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=101;NR=91;PP=2965;SC=TGATGACCTGAAGCTGACACT;SOR=0.820;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=192;TCF=101;TCR=91;TR=192;WE=33583339;WS=33583321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr20	33584289	rs3746438	C	T	1697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.792;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=37;PP=1265;ReadPosRankSum=-0.890;SC=GCGCGCTGACCAAGGCCAAGC;SOR=1.050;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=119;TCF=57;TCR=62;TR=64;WE=33584297;WS=33584279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,66:0.54:123
chr20	33584822	rs11167250	T	TG	386.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=5;PP=458;SC=GGGGGCGTTATGGGGTCCCAG;SOR=1.179;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=12;TCF=7;TCR=5;TR=12;WE=33584830;WS=33584812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr20	33584864	rs11167251	C	CT	781.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=4;PP=660;SC=CCTGTGCTGGCCACCCACTCT;SOR=2.200;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=16;WE=33584872;WS=33584854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr20	33586193	rs3746436	C	T	2426.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.501;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=54;PP=1902;ReadPosRankSum=0.821;SC=CGGACGCAAGCACGCAGCGTG;SOR=0.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=211;TCF=88;TCR=123;TR=93;WE=33586201;WS=33586183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,99:0.45:221
chr20	33587198	rs3746435	G	C	1548.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=45;PP=1227;ReadPosRankSum=0.538;SC=GGGAGAACAAGAACCTGCAGG;SOR=0.649;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=142;TCF=40;TCR=102;TR=63;WE=33587206;WS=33587188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,62:0.44:140
chr20	33587553	rs369393561	TCC	T	1125.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.843;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.765;NF=13;NR=18;PP=883;ReadPosRankSum=3.060;SC=CCACTGGCCATCCCCCCCCCC;SOR=0.648;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=60;TCF=27;TCR=33;TR=31;WE=33587572;WS=33587543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,36:0.86:42
chr20	33587565	.	A	C	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.566;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=20.381;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.69;MQRankSum=-0.725;QD=1.24;ReadPosRankSum=-3.652;SOR=4.167;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,7:0.16:45
chr20	33588698	rs67885143	TGAGGCTGGGCAAGGGCTGTGGG	T	1865.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.802;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=5.486;NF=1;NR=25;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.037;SC=ATCACTGATGTGAGGCTGGGC;SOR=0.826;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=82;TCF=14;TCR=68;TR=26;WE=33588727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,53:0.49:108
chr20	33589107	rs36003887	G	A	2064.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.576;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=40;PP=1454;ReadPosRankSum=1.043;SC=AGGCCCTTAAGGGCGTGCGCA;SOR=0.791;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=154;TCF=73;TCR=81;TR=75;WE=33589115;WS=33589097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,83:0.51:164
chr20	33590096	rs4911167	A	G	1654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=44;PP=1324;SC=TGCTGCCTTCAGCCTTCCCTG;SOR=3.830;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=6;TCR=44;TR=50;WE=33590104;WS=33590086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr20	33591197	rs11481073	A	AG	6532.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=108;NR=60;PP=2936;SC=CACCCCCTTGAGGGTGGGGCA;SOR=1.573;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=188;TCF=121;TCR=67;TR=168;WE=33591205;WS=33591187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chr20	33592248	rs752448	C	T	2305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.592;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=32;PP=1682;ReadPosRankSum=-0.597;SC=GTGTGTCTGCCGGGGCCTCTC;SOR=0.796;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=169;TCF=107;TCR=62;TR=90;WE=33592256;WS=33592238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,92:0.55:168
chr20	33592427	.	C	T	1284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=7.026;ClippingRankSum=0.000;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.455;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=40;PP=971;ReadPosRankSum=0.479;SC=GTGGCTGGGTCGCCCAGGCCT;SOR=0.382;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=88;TCF=8;TCR=80;TR=45;WE=33592435;WS=33592417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,48:0.52:93
chr20	33592474	rs752449	A	G	1379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=40;PP=1149;SC=CTCTGAAGCTAGGAGCTCATC;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=40;WE=33592482;WS=33592464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr20	33593457	rs3746431	T	C	4539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=53;PP=2965;SC=CCAGCATTCTTACCCTGCATG;SOR=1.187;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=82;TCR=53;TR=135;WE=33593465;WS=33593447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr20	33593674	rs3746430	T	C	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=26;PP=794;SC=CCCGGGGGGATAGTCACTACA;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=33593682;WS=33593664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr20	33594226	rs6060151	G	T	4797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=119;NR=28;PP=2965;SC=CAGAGCCCTGGGTTAACTTTA;SOR=2.833;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=148;TCF=120;TCR=28;TR=147;WE=33594234;WS=33594216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr20	33595300	rs2273636	C	T	1809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=1;PP=1396;SC=GACACAGCAACGCGTGGGCTG;SOR=6.630;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=50;TCR=1;TR=51;WE=33595308;WS=33595290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr20	33600740	rs1885117	C	T	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.060;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=2;PP=563;ReadPosRankSum=1.036;SC=AGGTCAGGGACCAGACAAGGA;SOR=0.117;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=61;TCF=58;TCR=3;TR=29;WE=33600748;WS=33600730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,32:0.49:65
chr20	33604042	rs3736802	T	C	1835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=7.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=57;PP=1488;ReadPosRankSum=-1.564;SC=TCAGGACAAGTATCAGTACTG;SOR=0.602;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=130;TCF=19;TCR=111;TR=67;WE=33604050;WS=33604032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,67:0.50:133
chr20	33632600	rs3803938	C	T	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=314;SC=CCCTTACATACGGGGCTTAGT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=33632608;WS=33632590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
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chr20	33642732	rs4911462	G	T	4045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.46;SOR=1.533;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr20	33642737	rs4911463	G	A	4202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.71;SOR=1.203;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr20	33657126	rs1998233	G	A	3847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=40;PP=2905;SC=AGTCAAAAATGTAAGTATTTG;SOR=1.572;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=120;TCF=80;TCR=40;TR=119;WE=33657134;WS=33657116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr20	33703607	rs3746429	C	T	2780.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.021;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=49;PP=2040;ReadPosRankSum=-0.255;SC=GTGATCACCGCGTCGAAGGTG;SOR=0.782;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=224;TCF=124;TCR=100;TR=112;WE=33703615;WS=33703597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:114,115:0.50:229
chr20	33706187	rs6088722	T	C	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=299;SC=AGGAACTAATTCTAGCTCTAC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=33706195;WS=33706177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr20	33711624	rs6120838	T	A	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=400;SC=GATGGAGCCTTGTAGAGGGGA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=33711632;WS=33711614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr20	33713963	rs2295885	T	C	409.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=341;SC=ACTCAAGCAATTAACAAAGTA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=33713983;WS=33713953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr20	33713975	rs2295886	A	C	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=473;SC=AACAAAGTACATTATTTGACT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=33713983;WS=33713953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr20	33714187	rs2295887	G	A	1101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=23;PP=850;SC=CTCTGCAGTGGGGGAGATGGG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=10;TCR=23;TR=33;WE=33714195;WS=33714177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr20	33730387	rs6120849	C	T	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=317;ReadPosRankSum=0.910;SC=CCACTTAAGACCTCCAGTTTC;SOR=0.693;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=15;WE=33730395;WS=33730377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr20	33734905	rs945959	G	C	7257.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=125;PP=2965;SC=GGAAAGGACCGGGTTCACGCT;SOR=0.814;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=240;TCF=114;TCR=126;TR=239;WE=33734913;WS=33734895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr20	33762489	rs2069948	C	T	9821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=333;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.008;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=202;NR=118;PP=2965;ReadPosRankSum=0.982;SC=CAGGCTGAAGCTGACTCTGCC;SOR=1.356;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=324;TCF=204;TCR=120;TR=320;WE=33762497;WS=33762479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,327:0.99:331
chr20	33763951	rs2069952	C	T	2578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=23;PP=2172;SC=AGTCCCCTGACCCTGACTGTC;SOR=2.038;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=64;TCR=23;TR=87;WE=33763959;WS=33763941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr20	33764632	rs9574	C	G	3156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=74;PP=2482;SC=CTCCAGCCCCCTCAGAAGGGG;SOR=1.925;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=102;TCF=27;TCR=75;TR=101;WE=33764640;WS=33764622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr20	33857544	rs2275274	C	T	590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.74;ReadPosRankSum=-0.892;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,22:0.40:55
chr20	33857711	rs2254207	A	C	2030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.201;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=54;PP=1543;ReadPosRankSum=-0.671;SC=GGTAATGTAGACTGTGCTGTG;SOR=1.775;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=156;TCF=56;TCR=100;TR=72;WE=33857719;WS=33857701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,76:0.47:160
chr20	33859264	rs6058220	T	G	768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-6.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.390;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=6;PP=584;ReadPosRankSum=-0.176;SC=CAACTCTAACTGGGCCAAGGG;SOR=0.294;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=59;TCF=51;TCR=8;TR=35;WE=33859272;WS=33859254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,35:0.60:58
chr20	33867248	rs2297789	A	T	1113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.224;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.189;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=29;PP=864;ReadPosRankSum=1.440;SC=ATGCTCTCACACTCGAGAAGC;SOR=1.842;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=78;TCF=24;TCR=54;TR=38;WE=33867256;WS=33867238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,40:0.49:81
chr20	33867697	rs619865	A	G	2149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=11;PP=1798;SC=AACACTAGGCAAAAGGATCTG;SOR=3.611;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=65;TCR=11;TR=76;WE=33867705;WS=33867687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr20	33867924	rs2250205	G	A	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=33;PP=861;ReadPosRankSum=-1.324;SC=TCTGTCTCCTGTCAATCAAAG;SOR=0.752;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=93;TCF=25;TCR=68;TR=46;WE=33867932;WS=33867914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,48:0.51:94
chr20	33868702	rs2425043	T	C	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.365;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=428;ReadPosRankSum=0.499;SC=AGGATACCACTCAGCCCAGCC;SOR=0.495;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=38;TCF=7;TCR=31;TR=20;WE=33868710;WS=33868692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr20	33872311	rs2275275	G	C	2347.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.278;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.508;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=75;PP=1838;ReadPosRankSum=-0.428;SC=GGCGGCGGAGGCGGGAGTTCA;SOR=0.335;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=181;TCF=17;TCR=164;TR=85;WE=33872319;WS=33872301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,88:0.48:185
chr20	33874720	rs2425049	C	T	3439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=266;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.791;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=79;PP=2708;ReadPosRankSum=0.678;SC=ATCTGGTGCCCGTCTGGCAGG;SOR=1.018;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=259;TCF=112;TCR=147;TR=131;WE=33874728;WS=33874710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,133:0.51:263
chr20	33879478	rs2425050	A	G	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.939;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=2;PP=576;ReadPosRankSum=-0.469;SC=ATAGTGCCAGAGGTGCTGGTC;SOR=0.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=52;TCF=48;TCR=4;TR=26;WE=33879486;WS=33879468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr20	33880146	rs111916968	T	A	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5006;FS=6.532;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=177;ReadPosRankSum=0.140;SC=GCAGGGCCCATGGCCCGCACG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=8;WE=33880154;WS=33880136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr20	33894463	rs878639	A	G	2853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=75;NR=25;PP=2241;SC=GGAAAGGGTCACTCACCTGTT;SOR=2.147;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=75;TCR=25;TR=100;WE=33894471;WS=33894453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
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chr20	34054609	rs224354	G	C	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.623;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.16;ReadPosRankSum=-0.699;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
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chr20	34055453	rs5841213	AG	A	217.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=261;ReadPosRankSum=-0.224;SC=AGGGACAGGCAGGGGGAGGTG;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=9;WE=34055461;WS=34055443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr20	34061578	rs224361	T	C	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=413;ReadPosRankSum=-0.023;SC=AAAAAAGTTTTGCACTAGAAA;SOR=0.509;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=20;WE=34061586;WS=34061568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,21:0.45:47
chr20	34062642	rs224362	C	T	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.648;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=22;PP=1038;ReadPosRankSum=0.685;SC=ATGAGAGCAACGTTTTGGAAA;SOR=0.483;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=97;TCF=56;TCR=41;TR=49;WE=34062650;WS=34062632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,49:0.50:98
chr20	34062710	rs224363	C	T	1379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.385;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=28;PP=911;ReadPosRankSum=0.533;SC=CAGGGATATACCTTCATCTTT;SOR=0.311;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=98;TCF=37;TCR=61;TR=50;WE=34062718;WS=34062700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,57:0.53:107
chr20	34079200	rs224373	A	G	2477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=43;PP=1884;SC=GGGAGTAGGGAAGAAAGGGGC;SOR=1.068;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=77;TCF=32;TCR=45;TR=75;WE=34079208;WS=34079190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr20	34090519	rs3748433	G	A	2659.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.159;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=48;PP=2051;ReadPosRankSum=-0.706;SC=GAGACTCTGCGGGGACAAATC;SOR=0.581;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=173;TCF=83;TCR=90;TR=93;WE=34090527;WS=34090509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,97:0.54:181
chr20	34096725	rs2236165	A	G	354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=248;ReadPosRankSum=-1.101;SC=CTCTGCTCCAACCACAGAGCC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=13;WE=34096733;WS=34096715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr20	34099165	rs72173955	CT	C	226.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=5.460;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=2.735;QD=2.16;ReadPosRankSum=0.926;SOR=0.248;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,32:0.30:105
chr20	34116282	rs7261862	T	C	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.017;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=19;PP=676;ReadPosRankSum=-0.116;SC=TCCATCACCTTATCACTTAGA;SOR=0.356;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=102;TCF=41;TCR=61;TR=36;WE=34116290;WS=34116272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,41:0.38:108
chr20	34142257	rs60267524	C	T	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.917;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=140;ReadPosRankSum=0.723;SC=ATTGGGTCTCCTCTGACCTGG;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=8;WE=34142265;WS=34142247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr20	34142287	rs17092784	G	A	71.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=49;ReadPosRankSum=-2.352;SC=GACTGTAAAAGGTCTGGGATG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=4;WE=34142295;WS=34142277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr20	34142670	rs73283830	T	G	243.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=156;ReadPosRankSum=-1.168;SC=CTGGCTGTCCTTAAGCAGGAC;SOR=0.622;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=11;WE=34142678;WS=34142660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr20	34144107	rs224420	T	C	4167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=103;PP=2965;SC=TCCTGCATTTTGTTCCGTCAG;SOR=2.173;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=136;TCF=33;TCR=103;TR=136;WE=34144115;WS=34144097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr20	34144699	.	C	G	1245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.673;ClippingRankSum=0.000;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.105;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=6;PP=886;ReadPosRankSum=-1.292;SC=TGGCTGGAGCCAGGTCCTAGC;SOR=0.174;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=124;TCF=113;TCR=11;TR=53;WE=34144707;WS=34144689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,56:0.44:126
chr20	34148012	rs41293070	C	T	4874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=360;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.244;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=100;PP=2962;ReadPosRankSum=1.047;SC=GCTCACCTCCCGCTCCGTGGG;SOR=0.824;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=346;TCF=162;TCR=184;TR=180;WE=34148020;WS=34148002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,186:0.52:358
chr20	34164422	rs1557202	T	C	5740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=79;NR=85;PP=2965;SC=AATTCTTCCTTCAGGGACCTG;SOR=0.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=79;TCR=85;TR=164;WE=34164430;WS=34164412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,174:1.00:174
chr20	34170035	rs6060486	C	G	4566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=83;PP=2965;SC=GACTCCACACCTTGCCCAGCC;SOR=1.022;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=145;TCF=62;TCR=83;TR=145;WE=34170043;WS=34170025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr20	34170174	rs6119628	C	A	5189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.114;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=84;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.771;SC=AAATGGGCACCCGGATGTTGG;SOR=0.318;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=79;TCR=85;TR=162;WE=34170182;WS=34170164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,169:0.99:170
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chr20	34171253	rs189786037	C	T	1214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.098;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=38;PP=896;ReadPosRankSum=-1.020;SC=GCATGCCATGCGAACACCCCT;SOR=0.737;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=93;TCF=11;TCR=82;TR=42;WE=34171261;WS=34171243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,47:0.47:99
chr20	34173046	rs1536147	C	T	10198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=184;NR=141;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.832;SC=GTCCCCTCACCGTGAGCATTA;SOR=0.354;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=326;TCF=185;TCR=141;TR=325;WE=34173054;WS=34173036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,325:1.00:326
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chr20	34208516	rs2425067	C	T	737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=4;PP=596;SC=ATTGAATACACAGAAGATCCT;SOR=2.925;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=34208524;WS=34208506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr20	34320202	rs11479445	TA	T	264.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=15;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=8;PP=95;SC=TAATCATACTTAAAAAAAAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=8;WE=34320210;WS=34320192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr20	34328274	rs1538426	G	A	1058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=1;PP=882;SC=TTATAAGACTGTTAGAAGATT;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=32;TCR=1;TR=33;WE=34328282;WS=34328264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr20	34328952	.	C	T	129	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;FR=0.5000;HP=25;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=28;MQ=48.18;NF=0;NR=9;PP=129;QD=18.1968013941;SC=AAACATTTTTCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=9;WE=34328960;WS=34328942;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:18,9:0.33:27
chr20	34563779	rs73095587	T	C	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=266;ReadPosRankSum=-0.090;SC=CTGCCCACCATGGTGGTCCAG;SOR=0.544;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=14;WE=34563787;WS=34563769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr20	34775551	rs2247688	A	G	2714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.350;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=44;PP=2158;ReadPosRankSum=0.904;SC=GCAGGACTAAACCTGGGCCTT;SOR=0.832;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=178;TCF=89;TCR=89;TR=100;WE=34775559;WS=34775541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,102:0.56:181
chr20	34776563	rs2425184	C	G	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5103;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.085;NF=1;NR=3;PP=101;ReadPosRankSum=-1.383;SC=CACACACACACAGAGAGAGAG;SOR=1.179;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=4;WE=34776571;WS=34776553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr20	34807956	rs181238315	C	T	350.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=280;ReadPosRankSum=0.126;SC=TCCCACACGGCGTTGACAGCC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=14;WE=34807964;WS=34807946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr20	34832601	rs35283785	CCT	C	1858.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.990;NF=30;NR=13;PP=1768;ReadPosRankSum=1.682;SC=AATCACTTCTCCTCTCTGCAC;SOR=0.678;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=92;TCF=62;TCR=30;TR=43;WE=34832610;WS=34832591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,51:0.52:99
chr20	34858360	rs2425206	T	C	381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=288;SC=CAGGCGTGAGTCACCGCACCT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=34858368;WS=34858358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr20	35060043	rs117830646	C	T	982.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=1;PP=863;ReadPosRankSum=-0.027;SC=TGTCTTCTCTCCCTAGGATAG;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=71;TCF=69;TCR=2;TR=37;WE=35060051;WS=35060033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,35:0.50:70
chr20	35064912	rs1275393	G	A	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=7;PP=167;SC=TGCTTCTTGAGAGAACCCCTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=35064920;WS=35064902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr20	35068018	rs1275396	A	G	1037.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=0;PP=864;SC=ACAGTCAAATACAAGCTGGTG;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=35068026;WS=35068008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr20	35070963	rs150906645	C	T	1816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.311;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.072;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=3;PP=1575;ReadPosRankSum=1.378;SC=GAGTGAGCCTCCCATCCCTGG;SOR=0.251;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=125;TCF=121;TCR=4;TR=66;WE=35070971;WS=35070953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,64:0.52:122
chr20	35090820	rs1275391	C	G	3109.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=12;PP=2439;SC=CTGAAGGCCCCCCTTTGAGCC;SOR=4.117;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=93;TCR=12;TR=105;WE=35090828;WS=35090810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr20	35288971	rs6028627	A	T	124.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.484;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.55;MQRankSum=0.349;QD=8.91;ReadPosRankSum=-0.003;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr20	35441225	rs145513467	G	A	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.918;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=29;PP=799;ReadPosRankSum=1.391;SC=CTCCCATTCCGGCAGGTCCCT;SOR=0.509;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=80;TCF=25;TCR=55;TR=43;WE=35441233;WS=35441215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,46:0.56:82
chr20	35444579	.	G	C	1768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.810;ClippingRankSum=0.000;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.302;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=38;PP=1354;ReadPosRankSum=-2.023;SC=GGTCCCCATAGAGCGAGCGGT;SOR=0.809;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=142;TCF=64;TCR=78;TR=67;WE=35444587;WS=35444569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,68:0.47:145
chr20	35444829	.	G	C	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.955;ClippingRankSum=-0.000;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=3.090;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.89;ReadPosRankSum=-1.264;SOR=0.132;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr20	35445880	.	G	C	714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=0.000;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=6.540;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.73;MQRankSum=-1.724;QD=9.53;ReadPosRankSum=-1.262;SOR=1.522;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:45,30:0.40:75
chr20	35467713	rs1146250	G	A	5937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=135;NR=56;PP=2965;SC=TGCGCAGCCGGTACTGCAGGA;SOR=1.963;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=192;TCF=136;TCR=56;TR=191;WE=35467721;WS=35467703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr20	35491033	rs1291099	A	G	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=9;PP=775;SC=GACCCCTGCGACCTCCCTTTC;SOR=1.536;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=28;TCF=19;TCR=9;TR=28;WE=35491041;WS=35491023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr20	35491551	rs6029806	A	G	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=15;PP=579;SC=CCGTGAGGAGAACGCGGCGCT;SOR=1.519;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=7;TCR=15;TR=22;WE=35491559;WS=35491541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr20	35504769	.	C	T	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.263;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=86;ReadPosRankSum=1.364;SC=AGGACTGACTCAGGAACATGG;SOR=0.293;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=6;WE=35504777;WS=35504759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr20	35507542	rs3748459	G	A	2318.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.073;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=60;PP=1882;ReadPosRankSum=-0.386;SC=TGTACCGGCGGATGGAGGGCT;SOR=0.516;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=175;TCF=52;TCR=123;TR=88;WE=35507550;WS=35507532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,88:0.50:175
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chr20	35710283	rs62206488	A	T	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.557;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=674;ReadPosRankSum=-0.031;SC=ATCTGAGAGGAGACTCACCAG;SOR=0.373;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=67;TCF=48;TCR=19;TR=38;WE=35710291;WS=35710273;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,42:0.59:71
chr20	35710453	rs1892205	T	C	415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=327;ReadPosRankSum=1.116;SC=GCACAGAGCATGTGTCTCTAT;SOR=0.758;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=62;TCF=14;TCR=48;TR=23;WE=35710461;WS=35710443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,22:0.35:62
chr20	35738841	rs1744759	G	C	3754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=75;PP=2965;SC=TGGGGTCAGAGACTCTATCAG;SOR=1.368;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=117;TCF=42;TCR=75;TR=117;WE=35738849;WS=35738831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr20	35740794	rs1744760	T	C	3488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.280;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=82;PP=2536;ReadPosRankSum=1.203;SC=GTACACTTCTTGGGGCAGCTT;SOR=0.784;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=337;TCF=147;TCR=190;TR=139;WE=35740802;WS=35740784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,151:0.43:350
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chr20	35748039	rs138010782	G	GAAAGA,GAAAGAAAAGAAAAGAAAAGA	5834.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.81;QD=67.85;SOR=2.915;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,59,27:0.69,0.31:86
chr20	35748894	rs1624888	C	G	5667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=98;NR=71;PP=2965;SC=AGCTTCTAAACAATGAGTCTT;SOR=1.078;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=169;TCF=98;TCR=71;TR=169;WE=35748902;WS=35748884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chr20	35749079	rs8120336	T	A	601.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=21;PP=543;ReadPosRankSum=-0.386;SC=CAGAGGGCATTGTCTCAGGGC;SOR=0.264;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=22;WE=35749087;WS=35749069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr20	35766102	rs16986445	G	A	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.949;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=439;ReadPosRankSum=-1.399;SC=TGTATACTGTGTCTTCTCCAC;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=53;TCR=2;TR=22;WE=35766110;WS=35766092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,23:0.41:56
chr20	35766337	rs8115854	A	G	2319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.037;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=62;PP=1693;ReadPosRankSum=0.691;SC=CTGATTATGGATAACTGGGCA;SOR=0.515;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=179;TCF=52;TCR=127;TR=90;WE=35766345;WS=35766327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,94:0.51:184
chr20	35769592	rs1744769	T	C	3760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=72;PP=2542;SC=CTGTATTTTTTGCCAAAGTTA;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=50;TCR=72;TR=122;WE=35769600;WS=35769582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr20	35769647	rs1780680	G	T	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.531;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.355;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=810;ReadPosRankSum=0.910;SC=ATGTTTCAGGGTTTTCAGGGT;SOR=0.211;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=67;TCF=11;TCR=56;TR=36;WE=35769655;WS=35769637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,39:0.53:74
chr20	35783494	rs1615246	T	C	1133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.677;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.943;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=7;PP=827;ReadPosRankSum=-1.259;SC=GGATAGGCACTTCAGAACTTG;SOR=0.530;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=106;TCF=88;TCR=18;TR=44;WE=35783502;WS=35783484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,47:0.42:113
chr20	35786188	rs1780687	A	C	1418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=3;PP=1097;SC=ACCACTGAATACTTCCACATT;SOR=4.073;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=37;WE=35786196;WS=35786178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
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chr20	35787473	rs1744775	A	G	1860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.836;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=52;PP=1507;ReadPosRankSum=1.090;SC=AGCAAGCTGGAAAGACGGTTT;SOR=0.755;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=150;TCF=38;TCR=112;TR=68;WE=35787481;WS=35787463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,70:0.45:156
chr20	35807790	rs11467214	G	GCTTATAGACAGGGCCCCGCGGCCGGCACT	4071.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.32;QD=66.75;SOR=1.292;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr20	35812526	rs16986470	C	A	1303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.995;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=9;PP=942;ReadPosRankSum=0.142;SC=ATCATTGGGACTGTGTATAGC;SOR=0.512;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=92;TCF=76;TCR=16;TR=44;WE=35812534;WS=35812516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,49:0.51:96
chr20	35826683	rs2076399	T	G	1239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=0;PP=1005;SC=ACTAAATTCATGTAGCTCATT;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=35826691;WS=35826673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr20	35827028	rs146714866	A	ATT	409.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=324;SC=CATTCCTGTGATTTTTTTTTT;SOR=3.611;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=12;WE=35827036;WS=35827018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr20	35827682	rs2076398	G	T	585.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=461;ReadPosRankSum=0.825;SC=GGTCCTATCCGAAGAGGGCTC;SOR=3.258;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=19;WE=35827690;WS=35827672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr20	35828696	rs6032013	A	G	708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=2;PP=562;SC=CCGGCTGCCCAGCTAATTTTT;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=22;TCR=2;TR=24;WE=35828704;WS=35828686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr20	35828757	.	ATT	A	2331.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;ClippingRankSum=0.000;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.308;NF=64;NR=1;PP=1125;SC=GCCGGTTGTAATTTTTTTTTT;SOR=4.863;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=82;TCF=79;TCR=3;TR=65;WE=35828766;WS=35828747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,69:0.99:70
chr20	35835657	rs11698281	C	T	2167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=15;PP=1660;SC=GAAACAGCTGCATTTCGCATT;SOR=2.303;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=49;TCR=15;TR=64;WE=35835665;WS=35835647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr20	35835889	rs1079657	A	G	2781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=54;PP=2101;SC=CCCTCTGATTATCATTCCTAG;SOR=1.664;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=26;TCR=55;TR=80;WE=35835897;WS=35835879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr20	35838372	rs2272950	T	A	1783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=0;PP=1562;SC=TTGCAACCTATAGATAAAGCA;SOR=7.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=51;WE=35838380;WS=35838362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr20	35838591	rs2050091	T	C	3793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=76;PP=2965;SC=CATATTTTGGTGGGGCGCTGA;SOR=1.232;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=50;TCR=76;TR=126;WE=35838599;WS=35838581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr20	35838756	rs3817885	G	A	882.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=24;PP=746;SC=TTCATTCTCTGTTTCTAGTTG;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=35838764;WS=35838746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr20	35852395	rs2076397	A	C	4261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=115;PP=2965;SC=CCACCTGATCACTCAGGGAGC;SOR=5.977;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=121;TCF=5;TCR=116;TR=120;WE=35852403;WS=35852385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr20	35852450	rs2076396	G	C	2038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=56;PP=1670;SC=ACTGAGCCCTGCAGGCATCAG;SOR=8.189;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=0;TCR=57;TR=56;WE=35852458;WS=35852440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr20	35865054	rs4608	C	T	6414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=138;PP=2965;SC=CCTGGCCATCCTGGGCAGTGT;SOR=1.887;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=196;TCF=58;TCR=138;TR=196;WE=35865062;WS=35865044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,200:1.00:200
chr20	35869619	rs2050093	C	T	2183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=13;PP=1645;SC=GGGAGAGTACCTTAGTCTCTC;SOR=2.799;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=49;TCR=13;TR=62;WE=35869627;WS=35869609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr20	36030939	rs1885257	G	C	4841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=76;PP=2965;SC=GCAAAGTGGCGGACTTTGGGC;SOR=0.807;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=160;TCF=83;TCR=77;TR=159;WE=36030947;WS=36030929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr20	36031097	rs2145792	A	G	4497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=83;NR=50;PP=2965;SC=TGCTTATCTAACAGAGCGGTC;SOR=1.211;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=83;TCR=50;TR=133;WE=36031105;WS=36031087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr20	36150582	rs149299117	C	CA	111.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=3.757;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=0.959;QD=5.88;ReadPosRankSum=1.373;SOR=0.105;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr20	36150591	rs34619095	A	AT	372.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=3.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=-0.820;QD=13.80;ReadPosRankSum=-0.049;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,15:0.56:27
chr20	36150600	rs5841264	T	TA	1236.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.05;QD=35.34;SOR=5.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr20	36375071	rs2297154	T	C	4327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=90;PP=2965;SC=CTGTTACTCTTTCTCCTGTCT;SOR=1.875;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=36;TCR=90;TR=126;WE=36375079;WS=36375061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr20	36488508	rs3833308	TCTCA	T	4987.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=71;PP=2970;SC=TTAGGTGGACTCTCACTCAGG;SOR=1.828;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=109;TCF=26;TCR=83;TR=94;WE=36488519;WS=36488498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr20	36488911	rs1474623	G	T	518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=406;SC=GTCAGAATACGGAAGACTAGC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=36488919;WS=36488901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr20	36500313	rs717599	C	A	3448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-7.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=318;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.408;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=67;PP=2546;ReadPosRankSum=0.935;SC=CTGACTCTATCTTTGTCCCCC;SOR=0.645;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=303;TCF=159;TCR=144;TR=141;WE=36500321;WS=36500303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:170,147:0.46:317
chr20	36531978	rs6021782	G	T	369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=291;ReadPosRankSum=-0.342;SC=CAGTCGTGGCGGGCATCCCGG;SOR=0.859;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=14;WE=36531986;WS=36531968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr20	36572310	rs11365082	AC	A	696.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FS=24.354;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.10;ReadPosRankSum=3.061;SOR=0.431;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,42:0.49:86
chr20	36572321	.	CGACTCTTCTTCT	C	30.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.792;ClippingRankSum=0.000;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=67.477;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.19;ReadPosRankSum=-5.483;SOR=5.890;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,18:0.11:161
chr20	36615416	rs6022212	A	G	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-5.179;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=260;ReadPosRankSum=2.062;SC=AGCAAATGCCATGCCATGCAA;SOR=0.588;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=17;WE=36615424;WS=36615406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr20	36678416	rs6097507	A	G	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.925;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=32;PP=626;ReadPosRankSum=-1.684;SC=TCACTGTGTGATGAACTCATT;SOR=0.105;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=79;TCF=1;TCR=78;TR=33;WE=36678424;WS=36678406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,32:0.41:79
chr20	36685915	rs2256288	T	C	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.657;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=41;PP=1267;ReadPosRankSum=-0.072;SC=TCAAATTTATTACTTTCTCTT;SOR=0.773;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=47;TCR=83;TR=64;WE=36685923;WS=36685905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,66:0.49:134
chr20	36761057	rs41274712	C	T	2183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.730;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.684;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=39;PP=1737;ReadPosRankSum=-0.847;SC=ACTGTGGCTCCAGGGTTCCCA;SOR=0.357;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=173;TCF=102;TCR=71;TR=83;WE=36761065;WS=36761047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,84:0.49:173
chr20	36793501	rs2067027	A	G	4499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=355;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.662;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=104;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.127;SC=TGCTCTCCAAATCAGGACTTA;SOR=1.133;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=343;TCF=150;TCR=193;TR=172;WE=36793509;WS=36793491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:173,178:0.51:351
chr20	36793529	rs2076380	G	A	4365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.902;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=94;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.954;SC=AGCTCCCACCGGGTCCTGACC;SOR=0.589;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=304;TCF=123;TCR=181;TR=161;WE=36793537;WS=36793519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,165:0.53:313
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chr20	36841914	rs3746471	G	A	2949.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.121;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=45;PP=2433;ReadPosRankSum=0.389;SC=AGGAGCATCCGGATCTCCTCA;SOR=0.606;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=193;TCF=109;TCR=84;TR=105;WE=36841922;WS=36841904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,107:0.55:194
chr20	36845738	rs760998	C	T	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.117;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=38;PP=1548;ReadPosRankSum=1.034;SC=TGGGTCAGCTCAGCCTGGAAG;SOR=0.281;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=148;TCF=86;TCR=62;TR=78;WE=36845746;WS=36845728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,76:0.51:148
chr20	36919616	rs6014601	G	A	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=3;PP=972;SC=GTTTCCCACAGTGTGTCCCCG;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=35;WE=36919624;WS=36919606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr20	36919758	rs10446011	A	G	5184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=84;PP=2965;SC=CAGACAAGACAGGAGACTGGA;SOR=0.762;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=175;TCF=91;TCR=84;TR=175;WE=36919766;WS=36919748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr20	36932551	rs1341022	G	C	3959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.115;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.376;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=39;PP=2965;ReadPosRankSum=0.729;SC=CATTTCCCCAGCCGACTCTTT;SOR=1.209;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=116;TCF=75;TCR=41;TR=114;WE=36932559;WS=36932541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,125:0.99:126
chr20	36932660	rs1341023	C	T	3478.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=82;PP=2694;SC=CCGAGATGGGCGTCCCTGATG;SOR=2.107;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=111;TCF=29;TCR=82;TR=110;WE=36932668;WS=36932650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr20	36932676	rs1341024	G	C	2622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=72;PP=1949;SC=TGATGGTGCTGGTCGCCATAG;SOR=2.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=19;TCR=72;TR=91;WE=36932684;WS=36932666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr20	36937246	rs2066252	G	A	922.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=6.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.076;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=0;PP=750;ReadPosRankSum=0.262;SC=GGTGGGGGACGAGTCTGCATT;SOR=1.705;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=66;TCF=65;TCR=1;TR=33;WE=36937254;WS=36937236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,34:0.51:67
chr20	36938730	.	T	C	541	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=19;NR=1;PP=541;QD=28.7885606274;SC=GACTCTCCCATTCGGCTGCTA;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=36938738;WS=36938729;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr20	36946848	rs4358188	G	A	2036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.916;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=58;PP=1622;ReadPosRankSum=1.623;SC=TGTATCCTCCGAGCTGCAACC;SOR=1.433;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=146;TCF=34;TCR=112;TR=71;WE=36946856;WS=36946838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,74:0.49:152
chr20	36953097	rs5741806	C	T	1343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.691;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=16;PP=915;ReadPosRankSum=1.055;SC=GTCAGCCTCTCACCCCGATAC;SOR=0.244;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=117;TCF=89;TCR=28;TR=54;WE=36953105;WS=36953087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,57:0.48:119
chr20	36959318	rs5743533	G	A	1579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=1;PP=1380;SC=GCTGTGACCCGTGGAAGGGGA;SOR=6.399;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=49;WE=36959326;WS=36959308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr20	36959353	rs5743534	A	G	2879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=9;PP=2413;SC=GGAAAACCAGACAGTATCCAC;SOR=4.150;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=77;TCR=9;TR=86;WE=36959361;WS=36959343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr20	36959566	rs2425357	A	G	2583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=60;PP=2037;SC=TCATAGGCTCAAGGCATTATT;SOR=2.670;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=17;TCR=60;TR=77;WE=36959574;WS=36959556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr20	36959732	rs6127771	C	T	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=275;SC=TCCAGACCTTCCCCACCTGAG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=36959740;WS=36959722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr20	36965617	rs1131847	A	G	2021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=51;PP=1592;SC=GCTGTCAGCCACACCTGTTCC;SOR=2.799;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=13;TCR=51;TR=64;WE=36965625;WS=36965607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr20	36982904	.	C	T	287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.243;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=252;ReadPosRankSum=-1.653;SC=ATCCAGCGCTCAGCCTGGCCT;SOR=0.622;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=12;WE=36982912;WS=36982894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr20	37005457	.	C	T	1392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.204;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.588;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=30;PP=1053;ReadPosRankSum=0.873;SC=CTGCCTCCACCCTCCTCCTCT;SOR=0.895;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=96;TCF=40;TCR=56;TR=49;WE=37005465;WS=37005447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,52:0.50:103
chr20	37055875	rs707578	T	C	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=1;PP=1003;SC=AAGCATGATGTCCCCCCGCAC;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=35;WE=37055883;WS=37055865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr20	37062583	rs788347	T	C	6528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.252;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=101;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.842;SC=CGCGATTTCTTTCCCTGCACT;SOR=0.416;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=199;TCF=98;TCR=101;TR=197;WE=37062591;WS=37062573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,202:1.00:203
chr20	37186862	.	G	T	585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.766;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.112;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=464;ReadPosRankSum=-0.180;SC=ATTAAACCATGAGCAAGTATT;SOR=0.089;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=22;WE=37186870;WS=37186852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,22:0.50:44
chr20	37187110	rs144540357	A	AT	291.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=1.785;QD=6.21;ReadPosRankSum=0.429;SOR=0.732;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,18:0.38:47
chr20	37230486	rs6070740	C	A	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr20	37272589	rs419162	G	A	1224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=38;PP=1039;SC=CCCTCTGGGTGCAGCTGCCGT;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=0;TCR=38;TR=38;WE=37272597;WS=37272579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr20	37274559	rs11426603	C	CA	2176.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=1;PP=2568;SC=GTCCCGTGTCCAACAAATGCA;SOR=6.901;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=65;TCF=64;TCR=1;TR=59;WE=37274567;WS=37274549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr20	37274861	rs117796	A	G	1271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=29;PP=865;SC=ACAGGTGGAGAAGGGCCGAGG;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=37274869;WS=37274851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr20	37277153	rs220527	G	T	1656.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=5;PP=1378;SC=TCCTTATGCTGCTTCTCCCCA;SOR=4.091;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=43;TCR=5;TR=48;WE=37277161;WS=37277143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr20	37277271	rs220526	C	T	5236.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.33;SOR=1.063;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr20	37278612	rs220522	T	A	2714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=73;PP=2308;SC=ATTCCAAGGCTTCCTTTTCTG;SOR=3.690;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=11;TCR=73;TR=84;WE=37278620;WS=37278602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr20	37278823	rs220521	T	C	1025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=6;PP=832;SC=CCCTCCACCCTCCAGCCCTCC;SOR=2.694;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=30;WE=37278831;WS=37278813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr20	37278946	rs220520	T	C	4604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=35;PP=2965;SC=AAAAATGCAGTACCTTTATCA;SOR=2.270;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=137;TCF=102;TCR=35;TR=137;WE=37278954;WS=37278936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr20	37279255	rs220519	C	T	2282.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=28;PP=1767;SC=AATATGTAAACGTAATTGTTT;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=40;TCR=28;TR=68;WE=37279263;WS=37279245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr20	37377139	rs2254105	C	T	174.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=0;PP=139;SC=CGAACGTGTTCCCGTTCCGCG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=37377147;WS=37377129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr20	37378982	rs67064795	A	AGT	3193.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=62;PP=2957;SC=AGCAAGTACTAGCCTGTGAAC;SOR=5.255;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=72;TCF=2;TCR=70;TR=63;WE=37378990;WS=37378972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr20	37383517	rs2757520	C	G	2610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=1;PP=2163;SC=CAGGCGTGAGCCCCTGCGCCC;SOR=7.249;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=71;TCF=70;TCR=1;TR=71;WE=37383525;WS=37383507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr20	37383640	rs2748663	T	C	8869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.877;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=174;NR=117;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.092;SC=ATGAGAATAATGTCCACAAGA;SOR=0.206;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=295;TCF=177;TCR=118;TR=291;WE=37383648;WS=37383630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,300:0.99:302
chr20	37383841	rs2757521	C	T	819.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=30;PP=677;ReadPosRankSum=2.001;SC=CAGGGACGGGCGCCCTTCCGT;SOR=0.223;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=62;TCF=1;TCR=61;TR=31;WE=37383849;WS=37383831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,31:0.51:61
chr20	37394795	rs3215704	AT	A	1757.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.286;NF=47;NR=0;PP=1950;ReadPosRankSum=-1.259;SC=AACTATTGGGATTAAGAAACG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=50;TCR=0;TR=47;WE=37394803;WS=37394785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chr20	37395112	rs2243520	A	G	2454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=70;PP=2131;SC=AGGCACTTGAAAATGCATCTC;SOR=5.728;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=72;TCF=2;TCR=70;TR=72;WE=37395120;WS=37395102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr20	37396120	rs2245231	A	G	4989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=57;PP=2965;SC=CCCAAAGGACATTCAGGAAAT;SOR=1.375;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=165;TCF=108;TCR=57;TR=164;WE=37396128;WS=37396110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr20	37396262	rs2245237	A	G	3602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=86;PP=2771;SC=CGAGTAGTCAATTATTTTGAA;SOR=3.180;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=17;TCR=86;TR=103;WE=37396270;WS=37396252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr20	37524409	.	A	ACTTCCTTCTTTCTCTCCTCCCTTCCTCC	1004.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.014;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=1.747;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.09;ReadPosRankSum=-0.787;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,24:0.48:50
chr20	37534582	rs12626105	A	G	1322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.580;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=20;PP=1054;ReadPosRankSum=-1.693;SC=TGATCCCCTGAGGAATGCTCA;SOR=0.461;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=106;TCF=68;TCR=38;TR=51;WE=37534590;WS=37534572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,52:0.48:108
chr20	37534665	rs4812332	C	T	1992.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.238;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=37;PP=1521;ReadPosRankSum=-1.210;SC=TCCTCCTGGACCATGGAGTGC;SOR=0.818;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=153;TCF=81;TCR=72;TR=80;WE=37534673;WS=37534655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,82:0.52:159
chr20	37547374	rs4812336	G	A	464.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.724;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=350;ReadPosRankSum=1.632;SC=CAGCCCAACAGCCCTGGCTGG;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=18;WE=37547382;WS=37547364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr20	37555116	rs3752290	G	C	2629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.211;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=72;PP=1985;ReadPosRankSum=0.146;SC=CCTGGACGAGGTGCCCGCCGC;SOR=0.998;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=203;TCF=67;TCR=136;TR=103;WE=37555124;WS=37555106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,106:0.51:208
chr20	37570725	rs3752293	C	T	1618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.199;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=25;PP=1191;ReadPosRankSum=-1.106;SC=CTCTCAATTTCTGGATATGTG;SOR=0.302;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=128;TCF=82;TCR=46;TR=59;WE=37570733;WS=37570715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,63:0.48:132
chr20	37580130	rs4300896	A	C	632.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=476;ReadPosRankSum=-1.841;SC=AGTGAGTAAAACAAAATTGCT;SOR=0.283;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=22;WE=37580138;WS=37580121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr20	37591184	rs974561	G	C	443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-5.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=815;ReadPosRankSum=-0.785;SC=GCCTCTGTGCGGGGGGAGCTC;SOR=0.573;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=20;WE=37591206;WS=37591174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,22:0.47:47
chr20	37591198	rs974560	C	T	557.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=18;PP=815;ReadPosRankSum=-1.556;SC=GGAGCTCTGGCTCAGGCTCCC;SOR=0.606;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=42;TCF=2;TCR=40;TR=19;WE=37591206;WS=37591174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr20	37601243	rs16987712	A	G	3058.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.927;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=38;PP=2301;ReadPosRankSum=1.302;SC=ATTATCAGACAGTGGTGATTG;SOR=0.916;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=254;TCF=174;TCR=80;TR=133;WE=37601251;WS=37601233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,136:0.52:263
chr20	37620888	rs4812348	G	C	946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=0;PP=733;ReadPosRankSum=-0.180;SC=GTTTACTTTTGATGCAAAGTG;SOR=0.504;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=71;TCR=1;TR=32;WE=37620896;WS=37620878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,34:0.45:76
chr20	37621180	rs68173814	A	G	803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.108;NF=0;NR=31;PP=670;ReadPosRankSum=-0.404;SC=GAAAATTAAAATCATCCATAA;SOR=0.558;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=0;TCR=65;TR=31;WE=37621188;WS=37621170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,31:0.46:67
chr20	37630606	rs3764701	A	T	525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.175;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=418;ReadPosRankSum=0.438;SC=TTGTGTCCCTAGTCATTGGTC;SOR=0.310;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=21;WE=37630614;WS=37630596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr20	37634704	rs3829696	T	C	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=0;PP=582;ReadPosRankSum=1.211;SC=ATGTTGGAAATGTTAAATCTT;SOR=0.395;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=73;TCF=73;TCR=0;TR=30;WE=37634712;WS=37634694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,31:0.41:76
chr20	37635027	rs3752298	T	C	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=271;ReadPosRankSum=0.129;SC=TAAGGGTTTTTGACTTTCTTA;SOR=0.826;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=16;WE=37635035;WS=37635017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
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chr20	39609426	rs4812473	C	T	3125.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=47;PP=2571;SC=TGCGCTCTCCCTCTTCCAAGC;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=50;TCR=47;TR=96;WE=39609434;WS=39609416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr20	39634704	rs73257868	G	A	3676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=63;PP=2731;SC=TCGGCCATGCGGGAAACGAGG;SOR=0.888;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=116;TCF=53;TCR=63;TR=116;WE=39634712;WS=39634694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr20	39704995	rs6072262	G	A	6212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=158;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.823;SC=ACCTTTGAAAGCAGATATCTT;SOR=1.723;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=195;TCF=36;TCR=159;TR=194;WE=39705003;WS=39704985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,199:1.00:200
chr20	39743905	rs6072275	G	A	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=5;PP=957;SC=GGATGTATGCGTGTTCCTTGT;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=38;WE=39743913;WS=39743895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr20	39788855	rs2076148	A	G	3162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=85;PP=2710;SC=AACCTTAGCCAGGCCTCTAAG;SOR=4.152;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=10;TCR=85;TR=95;WE=39788863;WS=39788845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr20	39792063	rs2228246	A	G	2820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=46;PP=2140;SC=GTTCATGCTCAGCTTCCTCCG;SOR=0.734;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=98;TCF=50;TCR=48;TR=95;WE=39792071;WS=39792053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr20	39794489	rs6124323	G	A	4910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=112;PP=2965;SC=ATGCAGATGCGTATGTTCAGT;SOR=2.118;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=40;TCR=112;TR=152;WE=39794497;WS=39794479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr20	39797465	rs753381	T	C	1492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=30;PP=1119;SC=CTGACCTTCATCAAGAGCGCC;SOR=1.981;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=13;TCR=30;TR=43;WE=39797473;WS=39797455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr20	39813729	rs2664537	G	A	5544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=108;PP=2965;SC=CCCAGCAGCCGGGCATGGGAA;SOR=1.412;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=59;TCR=108;TR=167;WE=39813737;WS=39813719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chr20	39830122	rs2235367	A	G	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=10;PP=297;SC=TTTCGAGTACAATCCAGAGAA;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=39830130;WS=39830112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr20	39832628	rs17265513	T	C	6445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=115;PP=2965;SC=CATGGCTGCATTGTACGTTGG;SOR=1.106;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=189;TCF=74;TCR=115;TR=189;WE=39832636;WS=39832618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,199:1.00:199
chr20	39985847	rs6072350	T	C	1434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=34;PP=1083;SC=CACCCAGCTGTGGGAAGGGGA;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=12;TCR=34;TR=46;WE=39985855;WS=39985837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr20	39986085	rs12625565	A	C	3869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=61;PP=2867;ReadPosRankSum=1.470;SC=ACAAAATCCAACTGTGAGTGC;SOR=0.287;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=51;TCR=63;TR=112;WE=39986093;WS=39986075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,125:0.99:126
chr20	39990614	rs2235592	C	T	4148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=86;NR=46;PP=2965;SC=TGCCACGAGGCTGTCCAGGAT;SOR=1.458;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=87;TCR=46;TR=132;WE=39990622;WS=39990604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr20	39990700	rs41278104	T	C	7857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=144;NR=98;PP=2965;SC=GCTCTGTCTGTACAAGGGGCC;SOR=1.093;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=242;TCF=144;TCR=98;TR=242;WE=39990708;WS=39990690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr20	39991144	rs41307177	A	G	3560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=45;PP=2891;SC=CCCGGCCATCAAGGCTCTGGT;SOR=1.198;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=117;TCF=72;TCR=45;TR=117;WE=39991152;WS=39991134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr20	39991171	rs61739307	G	A	4079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=50;PP=2965;SC=TCCGGCTGGCGGCCTGACCCT;SOR=1.214;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=126;TCF=76;TCR=50;TR=126;WE=39991179;WS=39991161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
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chr20	40045573	rs742433	G	C	112.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=82;ReadPosRankSum=-0.262;SC=ACTTTATAAGGCTTAAAATAA;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=40045581;WS=40045563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr20	40066117	rs2179452	T	A	1655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.071;NF=0;NR=58;PP=1335;ReadPosRankSum=1.330;SC=ACATTCACATTACTTTTATTA;SOR=1.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=128;TCF=1;TCR=127;TR=58;WE=40066125;WS=40066107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,61:0.46:133
chr20	40076397	rs909883	C	T	605.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.453;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.167;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=8;PP=441;ReadPosRankSum=0.228;SC=TCTGGGACACCGGTCCTGGGC;SOR=0.076;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=22;WE=40076405;WS=40076387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,23:0.53:43
chr20	40076509	rs909882	T	C	2004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.182;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=22;PP=1560;ReadPosRankSum=0.103;SC=ATGTTAAGTTTCATTTGCTTT;SOR=0.950;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=152;TCF=106;TCR=46;TR=79;WE=40076517;WS=40076499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,80:0.50:160
chr20	40084399	rs3746540	T	C	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.031;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=2;PP=97;ReadPosRankSum=0.174;SC=CATTTTTTTTTCTCTCCCACC;SOR=0.023;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=6;WE=40084407;WS=40084389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,6:0.38:16
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chr20	40128041	rs368951249	G	A	1759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.986;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=54;PP=1547;ReadPosRankSum=-1.373;SC=TGGAACCACAGAATCCAAGAA;SOR=1.363;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=112;TCF=18;TCR=94;TR=64;WE=40128049;WS=40128031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,62:0.54:115
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chr20	40863182	rs6030076	C	A	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=0;PP=539;SC=TACACTGATACCTATCCCCTG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=40863190;WS=40863172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr20	40910951	rs41308707	G	A	424.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=366;ReadPosRankSum=0.562;SC=TCTATTTTACGCACTGTGCTA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=16;WE=40910959;WS=40910941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr20	41306488	rs111229158	G	GA,GAA	842.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=61.01;QD=30.10;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,13,15:0.46,0.54:28
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chr20	41818289	rs2867655	C	G	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=6;PP=312;SC=CACTCACCTGCGGCGCTCTGA;SOR=1.022;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=6;TCR=6;TR=12;WE=41818297;WS=41818279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr20	42087079	rs147967864	C	G	60.88	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.5164;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.51;MQRankSum=-0.319;NF=0;NR=2;PP=37;ReadPosRankSum=1.150;SC=AGCTCTGCGGCGAGCGCGTGA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=42087087;WS=42087069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr20	42088658	rs117222808	A	C	2495.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.720;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=43;PP=1989;ReadPosRankSum=-0.430;SC=GAGTCTGACCAATCTTGTCTT;SOR=0.644;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=208;TCF=100;TCR=108;TR=93;WE=42088666;WS=42088648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,99:0.46:214
chr20	42088708	rs61733949	G	A	2624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.433;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.678;NF=35;NR=62;PP=2145;ReadPosRankSum=-2.595;SC=TAACCTATGCGGATGCCCACA;SOR=1.099;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=175;TCF=70;TCR=105;TR=97;WE=42088716;WS=42088698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,97:0.54:180
chr20	42089511	rs2235611	T	C	8083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=161;NR=84;PP=2965;SC=CCCGATCCCCTAAAGAAAATG;SOR=1.581;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=245;TCF=161;TCR=84;TR=245;WE=42089519;WS=42089501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr20	42089804	rs117799664	G	C	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.787;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.661;NF=0;NR=14;PP=417;ReadPosRankSum=0.431;SC=GGAATCTCTTGAAAACAGGGG;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=14;WE=42089812;WS=42089794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,14:0.64:22
chr20	42143457	rs78935921	C	T	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.270;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=471;ReadPosRankSum=-0.253;SC=GGGCCCTGTGCGGGTGGGGCG;SOR=1.981;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=22;WE=42143465;WS=42143447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,22:0.56:39
chr20	42163768	rs2071968	C	G	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=313;ReadPosRankSum=-1.328;SC=AGCAGTGCTTCTGGCTACCCC;SOR=0.346;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=1;TCR=42;TR=16;WE=42163776;WS=42163758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,17:0.39:44
chr20	42169854	rs117851581	A	G	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=286;ReadPosRankSum=0.781;SC=TACTGCAAGGATCCTAACACA;SOR=0.354;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=15;WE=42169862;WS=42169844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,14:0.39:36
chr20	42195554	rs112275291	G	GGGAC	98.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.308;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.090;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.908;NF=4;NR=0;PP=151;ReadPosRankSum=1.104;SC=GAGGGAGGGAGGGAGGCGGGC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=4;WE=42195562;WS=42195544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr20	42195863	rs4812721	G	C	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=170;ReadPosRankSum=0.652;SC=ATTCAAGACTGTCTGCCATCT;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=8;WE=42195871;WS=42195853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr20	42196550	rs2067061	T	G	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.211;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.894;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=9;PP=665;ReadPosRankSum=-0.980;SC=TCATGTTTCTTCTCAGGTCCT;SOR=0.805;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=80;TCF=57;TCR=23;TR=34;WE=42196558;WS=42196540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,35:0.42:83
chr20	42196738	rs6017119	C	G	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=491;ReadPosRankSum=-0.192;SC=GGTCCATGGGCCTGGGTGCAG;SOR=1.244;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=21;WE=42196746;WS=42196728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,21:0.62:34
chr20	42199704	rs11467250	GGTGT	G	219.06	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.366;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=31.29;ReadPosRankSum=0.366;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,6:0.86:7
chr20	42199925	rs3127060	G	A	214.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=4;PP=175;SC=CATGTACATAGGGGGCAGGGG;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=42199933;WS=42199915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr20	42205061	rs763227	G	A	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=579;ReadPosRankSum=0.962;SC=CATGGGGCTCGCAGCTTCCTG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=25;WE=42205069;WS=42205051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr20	42208522	rs2301483	T	G	964.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=0;PP=803;ReadPosRankSum=-1.294;SC=GCCAGTTGCTTGTGGAGCTCT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=69;TCF=68;TCR=1;TR=35;WE=42208530;WS=42208512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,35:0.49:71
chr20	42225114	rs2664519	G	A	1584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=14;PP=1183;ReadPosRankSum=-0.510;SC=TAAATGGAGTGAAACTGTGGA;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=122;TCF=93;TCR=29;TR=60;WE=42225122;WS=42225104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,63:0.50:126
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chr20	42249398	rs1555348	C	T	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.200;NF=24;NR=2;PP=623;ReadPosRankSum=0.824;SC=TTTAATCTTTCTTCCTTTATC;SOR=0.656;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=26;WE=42249406;WS=42249388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr20	42249479	rs11483104	C	CT	1078.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=1.013;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.16;MQRankSum=1.705;QD=8.56;ReadPosRankSum=1.217;SOR=0.950;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,52:0.41:126
chr20	42264502	rs6031007	G	A	1567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.903;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=23;PP=1158;ReadPosRankSum=0.014;SC=ACACAGTGTGGTCAGTTAGAC;SOR=0.972;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=152;TCF=88;TCR=64;TR=60;WE=42264510;WS=42264492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,64:0.40:160
chr20	42264726	rs2273523	T	C	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=284;ReadPosRankSum=1.670;SC=AGGCATTCGCTGTGGTCCCTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=17;WE=42264734;WS=42264716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr20	42265700	rs6065638	T	C	438.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.584;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=301;ReadPosRankSum=0.911;SC=TTAGTTATGATTTTGGACAAG;SOR=1.708;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=14;WE=42265708;WS=42265690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr20	42265966	rs6031008	G	A	246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.408;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=9;PP=194;ReadPosRankSum=-0.825;SC=GCAATGGTGCGATCTCGGCTC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=9;WE=42265974;WS=42265956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr20	42275499	rs393115	G	T	1642.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-8.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=1;PP=1234;ReadPosRankSum=-0.074;SC=AATCTCTAAAGTCCAAAGCAC;SOR=0.617;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=122;TCF=120;TCR=2;TR=56;WE=42275507;WS=42275489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,61:0.48:127
chr20	42302201	rs826949	C	T	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=381;ReadPosRankSum=-1.143;SC=CATTTGAGTCCAGGAGTTCAA;SOR=0.339;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=41;TCF=38;TCR=3;TR=19;WE=42302209;WS=42302191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,21:0.50:42
chr20	42302371	rs826950	C	T	2469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.220;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=42;PP=1918;ReadPosRankSum=1.278;SC=GTGGGCTGGCCGCTGCCTACA;SOR=0.583;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=165;TCF=90;TCR=75;TR=91;WE=42302379;WS=42302361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,93:0.56:167
chr20	42310509	rs442143	T	C	408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-5.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.618;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=20;PP=272;ReadPosRankSum=0.459;SC=AGTACAGTCCTGCTGTGGCCC;SOR=0.151;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=63;TCF=5;TCR=58;TR=23;WE=42310517;WS=42310499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,23:0.37:63
chr20	42328639	rs285162	T	C	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.691;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=39;PP=902;ReadPosRankSum=-0.233;SC=TCCTCATCCCTGCTGTGGGTT;SOR=0.116;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=103;TCF=25;TCR=78;TR=57;WE=42328647;WS=42328629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,56:0.55:102
chr20	42328749	rs285163	A	G	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=291;ReadPosRankSum=-1.654;SC=CTTCTCTCTCAGGCCCACATC;SOR=1.292;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=13;WE=42328757;WS=42328739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr20	42343987	rs185837127	C	T	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=515;ReadPosRankSum=-0.643;SC=GGGCTGAGTGCTGGCCATCCC;SOR=0.650;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=47;TCF=4;TCR=43;TR=24;WE=42343995;WS=42343977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr20	42543679	rs141484893	T	G	84.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=2;PP=47;SC=CGGAGTCACCTGGCAGCTCGG;SOR=0.693;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=2;TCR=2;TR=4;WE=42543687;WS=42543669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr20	42694558	rs199841880	C	CCCG	1337.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.350;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=1245;ReadPosRankSum=-0.608;SC=TCAGTGCGTCCCCGCCGCCGC;SOR=0.823;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=86;TCF=16;TCR=70;TR=25;WE=42694566;WS=42694548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,34:0.50:68
chr20	42745115	rs6073336	T	G	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-0.707;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=314;ReadPosRankSum=-0.203;SC=CGAGCCTCATTCATGGGCTCA;SOR=0.569;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=38;TCF=8;TCR=30;TR=18;WE=42745123;WS=42745105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr20	42814890	rs75804573	G	A	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.033;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=420;ReadPosRankSum=0.908;SC=ATTGCCGGTCGCCTTTCCCAC;SOR=2.007;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=21;WE=42814898;WS=42814880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr20	42814931	rs6031442	T	C	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.618;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=2;PP=906;ReadPosRankSum=-0.650;SC=CCTCCCTGGCTCCACCCCACC;SOR=1.609;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=83;TCF=76;TCR=7;TR=41;WE=42814939;WS=42814921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,40:0.48:83
chr20	42815190	rs1883790	G	A	3577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.754;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=97;PP=2838;ReadPosRankSum=0.708;SC=TGGGCCAGGTGTAGACACCTG;SOR=0.547;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=293;TCF=87;TCR=206;TR=142;WE=42815198;WS=42815180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,143:0.48:296
chr20	42891809	rs2293	C	G	985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.902;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=1;PP=783;ReadPosRankSum=-0.828;SC=TTGTGTAAGGCAGGTGATGGG;SOR=2.584;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=63;TCF=58;TCR=5;TR=34;WE=42891817;WS=42891799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,35:0.56:63
chr20	42892151	rs4810415	C	G	344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=4.626;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=268;ReadPosRankSum=-0.540;SC=CTGCTGCCCTCGGGCCTCAGT;SOR=0.770;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=13;WE=42892159;WS=42892141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr20	42907542	rs1884607	A	G	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-2.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=215;ReadPosRankSum=0.965;SC=GGAGAGAAGCAAGTGTGTGTG;SOR=0.324;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=13;WE=42907550;WS=42907536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr20	42908142	rs12479863	A	G	1800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=8.814;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=8;PP=1499;ReadPosRankSum=0.090;SC=CCACGGCTCTACTAAAAGAGA;SOR=0.731;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=130;TCF=113;TCR=17;TR=62;WE=42908150;WS=42908132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,64:0.48:133
chr20	42939693	rs148377517	C	T	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.862;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=20;PP=1186;ReadPosRankSum=-0.011;SC=AGCCCGCCAGCATGGAGGCCA;SOR=0.442;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=97;TCF=66;TCR=31;TR=59;WE=42939701;WS=42939683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,61:0.60:101
chr20	42939750	rs6073401	T	C	4779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=81;NR=64;PP=2965;SC=GCACCAGCGTTCCCCGCAACA;SOR=1.003;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=81;TCR=64;TR=145;WE=42939758;WS=42939740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
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chr20	42972275	rs4812826	G	A	1003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=25;PP=767;SC=TCACCAAAGAGGCATATTCCT;SOR=3.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=42972283;WS=42972265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr20	42973935	rs11697359	T	C	1440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.660;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.891;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=15;PP=1054;ReadPosRankSum=-0.952;SC=GGCTGGGCTGTGCCATCCACA;SOR=0.434;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=102;TCF=76;TCR=26;TR=55;WE=42973943;WS=42973925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,59:0.56:105
chr20	42979444	rs11699154	G	A	1149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.170;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.783;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=30;PP=846;ReadPosRankSum=-0.145;SC=TTTTCTCTGGGCTTTGGTGCG;SOR=0.584;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=100;TCF=30;TCR=70;TR=44;WE=42979452;WS=42979434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,47:0.44:108
chr20	42979553	rs11699172	G	A	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.106;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=382;ReadPosRankSum=0.071;SC=ACCCCCTGTTGAATTTTCCCT;SOR=0.117;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=18;WE=42979561;WS=42979543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,19:0.54:35
chr20	43029945	.	G	A	936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.367;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.929;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=2;PP=707;ReadPosRankSum=1.925;SC=GTGGGAGGGCGGAGGGCGGGG;SOR=1.539;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=57;TCF=52;TCR=5;TR=33;WE=43029953;WS=43029935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,34:0.58:59
chr20	43034660	rs736824	T	C	99.85	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5081;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=60;ReadPosRankSum=1.383;SC=TGACATTCTGTTCTTCCTGAA;SOR=0.941;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=5;WE=43034668;WS=43034650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chr20	43034693	rs745975	C	T	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=1;PP=128;ReadPosRankSum=-0.282;SC=TCTCTCCTGGCGCAGACACGT;SOR=0.859;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=7;WE=43034701;WS=43034683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,7:0.78:9
chr20	43036649	rs8121034	A	G	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.639;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.256;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=2;PP=102;ReadPosRankSum=-1.020;SC=ACAAGACCCCAGACCCATCCT;SOR=0.105;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=8;WE=43036657;WS=43036639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr20	43036691	rs8122476	T	G	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.925;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=227;ReadPosRankSum=0.456;SC=GAGCACAACATTTATTAAGGT;SOR=0.138;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=12;WE=43036699;WS=43036681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr20	43052570	rs2273618	T	C	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=-0.689;SC=CCTTGTGTGATACAAGTCAGG;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=5;WE=43052578;WS=43052560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,5:0.24:21
chr20	43058018	rs3746574	T	C	327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=3.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=256;ReadPosRankSum=1.629;SC=GATTATCTGGTTTAATTAATT;SOR=1.154;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=13;WE=43058026;WS=43058008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr20	43058096	rs3746575	C	G	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.798;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=14;PP=978;ReadPosRankSum=1.713;SC=CTTTCCCGGGCCTCTTCATTT;SOR=0.596;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=76;TCR=29;TR=50;WE=43058104;WS=43058086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,51:0.48:106
chr20	43090929	rs11482024	T	TA	617.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=495;ReadPosRankSum=0.625;SC=CACTCTAGTTTAAAAAAAAAT;SOR=5.058;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=23;WE=43090937;WS=43090919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,24:0.96:25
chr20	43133584	rs41303811	T	G	2358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.172;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=45;PP=1706;ReadPosRankSum=-1.080;SC=GGGCTGACTTTCCAAAATGCA;SOR=0.550;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=173;TCF=92;TCR=81;TR=87;WE=43133592;WS=43133574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,93:0.50:185
chr20	43150507	rs138443833	T	TC	458.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.043;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=2;PP=583;ReadPosRankSum=-0.237;SC=TCGAGGCCTTTCCCCGCAAAC;SOR=0.148;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=18;WE=43150515;WS=43150497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr20	43150755	rs11699411	G	A	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=34;PP=768;ReadPosRankSum=-0.333;SC=CCCACCGTCCGCGACCGGAGC;SOR=0.593;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=7;TCR=62;TR=38;WE=43150763;WS=43150745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,39:0.53:73
chr20	43246794	.	GTCCAGC	G	2084	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=30;NR=4;PP=2084;QD=62.0294117647;SC=CACCACCTCAGTCCAGCTCCA;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=34;WE=43246816;WS=43246784;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,34:0.83:41
chr20	43246801	rs11468454	TCCAGC	T	1914.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.55;SOR=3.516;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr20	43246807	rs11477624	TC	T	1914.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.55;SOR=3.516;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr20	43246808	.	C	T	1267	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=36;NR=6;PP=1267;QD=30.9945526797;SC=AGCTCCAGCTCGTCTTGCTCC;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=42;WE=43246816;WS=43246784;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr20	43248853	rs45567037	T	C	231.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=156;ReadPosRankSum=1.525;SC=TGCCCAAGAATGGAAGGGCAT;SOR=1.609;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=9;WE=43248861;WS=43248847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr20	43249591	rs6031678	C	T	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.968;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.472;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=10;NR=0;PP=205;ReadPosRankSum=-0.483;SC=TTCCAGGCCCCGGACTGGACC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=10;WE=43249599;WS=43249581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
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chr20	43252915	rs244076	T	C	2974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=58;PP=2320;SC=GGTCAATGGCTACCACGGTCT;SOR=1.420;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=33;TCR=59;TR=91;WE=43252923;WS=43252905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
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chr20	43264927	rs394105	C	T	1586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=28;PP=1206;SC=CATGCAGTTCCACCTGCAAGG;SOR=0.994;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=22;TCR=28;TR=50;WE=43264935;WS=43264917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr20	43343903	rs1980801	A	T	774.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.07;QD=43.04;SOR=3.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr20	43343905	rs1980802	C	T	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.07;QD=45.54;SOR=3.500;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr20	43343908	rs1980803	G	A	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=1.848;QD=28.69;ReadPosRankSum=-0.789;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,15:0.75:20
chr20	43343921	rs71197575	CGT	C	136.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.206;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=-1.584;QD=5.94;ReadPosRankSum=-0.878;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr20	43343930	rs1980804	T	G	993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.75;SOR=3.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr20	43348735	rs2296530	C	A	2121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.592;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=32;PP=1722;ReadPosRankSum=-0.517;SC=GACCCGGTGGCCGGGGGGCCC;SOR=0.776;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=164;TCF=100;TCR=64;TR=85;WE=43348743;WS=43348725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,83:0.51:162
chr20	43530234	rs4931	A	C	2770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=45;PP=2341;SC=AGGCTGAGCGATATGATGATA;SOR=0.987;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=35;TCR=45;TR=80;WE=43530242;WS=43530224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr20	43534903	rs16989481	G	A	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=34;PP=1058;SC=AATCATCCCTGTCTGCAGTGA;SOR=4.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=38;WE=43534911;WS=43534893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr20	43535169	rs45467003	G	A	419.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=21;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=369;SC=AAAAAAAAAAGAGAATCGTAC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=43535177;WS=43535159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr20	43538733	rs2072727	T	C	2715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=79;NR=3;PP=2280;SC=AGCGCGGGGCTGCTGGGTGAC;SOR=6.043;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=82;TCF=79;TCR=3;TR=82;WE=43538741;WS=43538723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr20	43547537	rs2072728	A	G	1994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=4;PP=1607;SC=CCAGTGTGTCATGTCCACAGC;SOR=5.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=66;TCR=4;TR=70;WE=43547545;WS=43547527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr20	43550045	rs2425686	A	T	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=4;PP=786;SC=CCCCTCGGCCACCCAAAGTGC;SOR=3.477;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=43550053;WS=43550040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr20	43567442	rs6073572	T	C	1968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.957;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=41;PP=1539;ReadPosRankSum=-0.726;SC=TGTAAGGAAATAGGCAGGGAC;SOR=0.436;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=142;TCF=56;TCR=86;TR=73;WE=43567450;WS=43567432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,77:0.51:150
chr20	43577620	rs2234206	C	G	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.859;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=393;ReadPosRankSum=-0.486;SC=CTACAATCCTCTCTCCCAGAG;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=16;WE=43577628;WS=43577610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,17:0.71:24
chr20	43577644	rs1884440	C	T	277.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=253;ReadPosRankSum=0.333;SC=TCCTCCCCTGCTGTAAATCAT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=10;WE=43577652;WS=43577634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,11:0.79:14
chr20	43588802	rs2234200	A	G	648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=531;ReadPosRankSum=-1.164;SC=TGGTTGCGGGAGTTGGAGGAG;SOR=0.551;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=52;TCF=50;TCR=2;TR=24;WE=43588810;WS=43588792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,24:0.46:52
chr20	43588833	rs2234199	G	C	994.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=1;PP=734;ReadPosRankSum=-0.646;SC=GGTGAGATGGGGGCCGGGGTC;SOR=0.596;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=75;TCF=73;TCR=2;TR=34;WE=43588841;WS=43588823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,37:0.47:78
chr20	43589041	rs2234197	G	A	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=35;PP=930;ReadPosRankSum=-1.716;SC=CACACCTTCCGGGCGCAAGCG;SOR=0.557;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=78;TCF=13;TCR=65;TR=43;WE=43589049;WS=43589031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,44:0.54:81
chr20	43600673	rs6130717	C	G	1876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=3;PP=1552;ReadPosRankSum=-0.601;SC=TGTTCTAGTTCCTAGCAAATA;SOR=3.841;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=54;TCR=3;TR=55;WE=43600681;WS=43600663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr20	43623658	rs6017460	C	T	1027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=33;NR=3;PP=1028;SC=TTCTTTTTTTCTCTGTAGACT;SOR=3.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=33;TCR=3;TR=36;WE=43623666;WS=43623648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr20	43629135	rs17420378	G	A	5210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=62;PP=2965;SC=GCAGCGGGAAGTGGACCAGGA;SOR=1.186;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=152;TCF=90;TCR=62;TR=152;WE=43629143;WS=43629125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,161:1.00:161
chr20	43636460	.	A	G	1782.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.340;ClippingRankSum=0.000;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=26;PP=1319;ReadPosRankSum=0.984;SC=GGTTTGATGCATAAATATATT;SOR=0.705;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=174;TCF=116;TCR=58;TR=81;WE=43636468;WS=43636450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,83:0.47:177
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chr20	43727367	rs34643859	T	C	910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.645;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=22;PP=608;ReadPosRankSum=1.159;SC=CGCTGAGGAGTTCCCGGGCTT;SOR=1.285;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=30;WE=43727375;WS=43727357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,35:0.54:65
chr20	43727443	rs35456522	G	C	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=7;PP=186;ReadPosRankSum=-0.669;SC=GTTGGAGGCTGTGTGTGAAGC;SOR=0.160;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=9;WE=43727451;WS=43727433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr20	43728070	rs6073643	T	C	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=43;PP=1063;ReadPosRankSum=1.552;SC=TGACCTTGAATCTTGACTCTC;SOR=0.573;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=92;TCF=0;TCR=92;TR=43;WE=43728078;WS=43728060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,43:0.47:92
chr20	43739119	rs17422688	G	A	1451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.449;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=21;PP=1078;ReadPosRankSum=0.143;SC=GAGTCCTTGTGACACAGGTGG;SOR=1.618;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=173;TCF=99;TCR=74;TR=65;WE=43739127;WS=43739109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,65:0.37:178
chr20	43743530	rs137896112	ACG	A	80.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.389;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FS=2.769;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.49;ReadPosRankSum=0.884;SOR=1.109;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:145,20:0.12:165
chr20	43743532	rs11700134	G	A	1251.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=3.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.59;ReadPosRankSum=2.117;SOR=0.672;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:108,57:0.35:165
chr20	43743532	.	GCG	ACA	1541	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=28;MQ=59.93;NF=48;NR=10;PP=1541;QD=27.4908254287;SC=ACACACACACGCGCACACACA;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=187;TCF=147;TCR=40;TR=58;WE=43743542;WS=43743520;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:129,58:0.31:187
chr20	43743534	rs11700135	G	A	5526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=33.50;ReadPosRankSum=-0.864;SOR=0.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,161:0.98:165
chr20	43752737	rs34841068	G	C	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=8;PP=364;ReadPosRankSum=1.271;SC=CTGGGAGGCAGGTCTCCTTAC;SOR=0.767;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=59;TCF=33;TCR=26;TR=21;WE=43752745;WS=43752727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,21:0.34:61
chr20	43803613	rs17333103	C	T	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.521;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=36;PP=838;ReadPosRankSum=-0.317;SC=ATCGCTGGGACGCTGGTTCTA;SOR=1.528;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=101;TCF=27;TCR=74;TR=45;WE=43803621;WS=43803603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,46:0.46:101
chr20	43803708	rs17333180	C	A	155.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=114;ReadPosRankSum=0.136;SC=ACACCCTGGGCCAGGACAGGG;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=8;WE=43803716;WS=43803698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chr20	43803725	rs1983649	T	A	422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=334;ReadPosRankSum=0.589;SC=AGGGAGCACTTCTGAAGCAGT;SOR=0.458;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=17;WE=43803733;WS=43803715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,17:0.74:23
chr20	43804522	rs2664581	A	C	2266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.969;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=34;PP=1761;ReadPosRankSum=0.643;SC=AGGTCAAGACACTGTCAAAGG;SOR=0.541;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=157;TCF=94;TCR=63;TR=79;WE=43804530;WS=43804512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,84:0.51:164
chr20	43804789	rs34885285	C	A	881.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=18.00;ReadPosRankSum=1.348;SOR=0.653;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,24:0.49:49
chr20	43804797	rs17424474	C	A	924.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.212;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=19.68;ReadPosRankSum=0.960;SOR=0.259;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,25:0.53:47
chr20	43835683	rs2233882	T	A	1858.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.322;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.656;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=34;PP=1361;ReadPosRankSum=0.107;SC=CAGACAAGGTTTTCCAAGCAA;SOR=0.521;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=159;TCF=78;TCR=81;TR=72;WE=43835691;WS=43835673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,78:0.46:171
chr20	43835822	rs2233883	T	C	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.703;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=32;PP=1187;ReadPosRankSum=1.723;SC=GCTAATAATCTAAGATTATTT;SOR=0.492;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=99;TCF=37;TCR=62;TR=53;WE=43835830;WS=43835812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,54:0.55:99
chr20	43836173	rs2301366	T	A	4044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.358;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.888;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.333;NF=65;NR=88;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.307;SC=TCATGACCAGTCCCGAAAAAG;SOR=0.623;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=291;TCF=123;TCR=168;TR=153;WE=43836181;WS=43836163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,158:0.53:299
chr20	43850143	rs2233895	T	A	856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.440;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=689;ReadPosRankSum=0.126;SC=AAAGCTACTTTAAAAAAATGG;SOR=1.003;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=76;TCF=39;TCR=37;TR=35;WE=43850151;WS=43850133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,34:0.44:77
chr20	43850400	rs2233896	C	A	3090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.795;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.343;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=54;PP=2521;ReadPosRankSum=-1.755;SC=TCCACATGGACAAAAGGGCCA;SOR=0.821;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=231;TCF=119;TCR=112;TR=117;WE=43850408;WS=43850390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,118:0.50:238
chr20	43850525	rs2233898	A	G	2936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.329;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=55;PP=2433;ReadPosRankSum=0.370;SC=AAAGTCAGCAATATGATTTGA;SOR=0.552;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=206;TCF=98;TCR=108;TR=107;WE=43850533;WS=43850515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,108:0.51:212
chr20	43851094	rs2233901	G	A	6600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=480;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.873;NF=110;NR=125;PP=2962;ReadPosRankSum=0.199;SC=AAAAATCTCAGTCAAGATCAA;SOR=0.711;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=458;TCF=218;TCR=240;TR=235;WE=43851102;WS=43851084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:228,249:0.52:477
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chr20	43926536	rs2227274	G	T	1181.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.787;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=13;PP=904;ReadPosRankSum=0.294;SC=GAGAGGAGGAGCCCCGAGAGA;SOR=0.783;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=76;TCR=30;TR=46;WE=43926544;WS=43926526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,51:0.45:113
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chr20	43936990	rs142741580	A	AGGGGAAGT	615.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=665;ReadPosRankSum=-0.101;SC=GCGGGTGGGGAGGGGAAGTGC;SOR=0.468;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=10;WE=43936998;WS=43936980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr20	43940112	rs2743327	C	G	2278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=12;PP=1854;SC=AAAAGCGTTGCGGGGAGCGGG;SOR=3.040;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=55;TCR=12;TR=67;WE=43940120;WS=43940102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr20	43944958	rs2741500	G	T	1080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.343;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=22;PP=798;ReadPosRankSum=-0.597;SC=CGGTCACTCCGGTGCCTCTCA;SOR=0.322;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=80;TCF=31;TCR=49;TR=39;WE=43944966;WS=43944948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,41:0.50:82
chr20	43964407	rs2072791	G	C	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=267;ReadPosRankSum=-1.182;SC=CGCCTGCCCAGCACACCTTCC;SOR=0.387;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=12;WE=43964415;WS=43964397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr20	43964707	rs3830725	C	CT	458.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.018;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.189;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=576;ReadPosRankSum=-0.484;SC=CACTCTACCTCTAACTCACCG;SOR=1.609;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=14;WE=43964715;WS=43964697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr20	43976807	rs2078423	C	T	2081.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=41;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=7;PP=1393;SC=CCCGTGACCCCGGAGCAAAGT;SOR=3.171;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=41;TCR=7;TR=48;WE=43976815;WS=43976797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr20	43976869	rs5841587	C	CT	4115.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=11;PP=2974;SC=AGCGTACCCCCGATCTGCCCC;SOR=3.841;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=75;TCR=11;TR=86;WE=43976892;WS=43976859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr20	43976875	rs5841588	GC	G	4339.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=12;PP=1562;SC=CCCCCGATCTGCCCCCCCCCA;SOR=3.303;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=107;TCF=84;TCR=23;TR=87;WE=43976892;WS=43976859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr20	43976991	rs2228384	A	G	6455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=80;NR=120;PP=2965;SC=CCTACGAAGAACAGCAGCAGC;SOR=1.201;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=200;TCF=80;TCR=120;TR=200;WE=43976999;WS=43976981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr20	43995410	rs6032142	C	T	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=157;ReadPosRankSum=0.976;SC=ACACTTATCTCGTCACTTCTG;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=8;WE=43995418;WS=43995400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,8:0.44:18
chr20	44002665	rs2231626	C	G	3312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.99;NF=11;NR=86;PP=2831;SC=CCAGCAGAAACCTCGGTGTTA;SOR=4.003;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=11;TCR=86;TR=97;WE=44002673;WS=44002655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr20	44004155	rs10546815	CATT	C	1545.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.334;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.852;NF=2;NR=29;PP=1235;ReadPosRankSum=-0.416;SC=TGGAACTCTTCATTATTTTGT;SOR=2.115;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=56;TCF=7;TCR=49;TR=31;WE=44004165;WS=44004145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,40:0.60:67
chr20	44005936	rs2231616	C	T	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=542;ReadPosRankSum=0.666;SC=TTGGATCCGGCGGTTTGAGCT;SOR=0.773;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=63;TCF=34;TCR=29;TR=30;WE=44005944;WS=44005926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,31:0.46:67
chr20	44006078	rs2231614	C	G	375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.823;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.351;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=317;ReadPosRankSum=0.532;SC=AGCCAAGGGCCGGCCTGCTGG;SOR=1.127;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=16;WE=44006086;WS=44006068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,16:0.38:42
chr20	44034985	rs2743259	G	C	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.482;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=7;PP=851;ReadPosRankSum=-0.161;SC=CCGCGGGTCTGCGCGGGGCGG;SOR=0.267;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=85;TCF=73;TCR=12;TR=38;WE=44034993;WS=44034975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,37:0.45:83
chr20	44038574	rs1127497	A	G	3504.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=75;NR=29;PP=2813;SC=CTGGGCAGGGATGGACAACCA;SOR=1.970;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=75;TCR=29;TR=104;WE=44038582;WS=44038564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr20	44048065	rs3092108	C	CG	11066.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=388;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=116;NR=187;PP=2972;SC=CAGCCGGGGGCGGGGGGTGTA;SOR=1.043;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=370;TCF=145;TCR=225;TR=303;WE=44048073;WS=44048055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,349:1.00:349
chr20	44049916	rs3092450	T	TC	563.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=18;NR=0;PP=686;SC=GCAGGGCTGTTCCCCATCTAC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=18;WE=44049924;WS=44049906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr20	44052992	rs13217	G	A	4172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.644;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=59;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.918;SC=CCGAGTACACGCCAGATCCTA;SOR=0.985;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=348;TCF=216;TCR=132;TR=170;WE=44053000;WS=44052982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,172:0.48:355
chr20	44053069	rs2741566	T	C	10809.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=330;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=119;NR=204;PP=2965;SC=GACCTACCCTTTCTGCTGCTT;SOR=1.291;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=323;TCF=119;TCR=204;TR=323;WE=44053077;WS=44053059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr20	44054349	rs707577	T	C	7343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=154;PP=2965;SC=CCGTGTGCTATGGCTCCTTCT;SOR=1.317;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=248;TCF=94;TCR=154;TR=248;WE=44054357;WS=44054339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,258:1.00:258
chr20	44098294	rs2072956	C	G	131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-3.548;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=94;ReadPosRankSum=-1.005;SC=CCGCGGTGCCCGCAAAGCCCT;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=8;WE=44098302;WS=44098288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr20	44238741	rs2245898	T	G	3842.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=23;PP=2965;SC=GGGATCTTTGTTCCAGAAGCT;SOR=2.853;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=94;TCR=23;TR=117;WE=44238749;WS=44238731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr20	44259490	rs1487323	G	A	6633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=126;NR=79;PP=2965;SC=TTTATTTACCGTTCTATTCTC;SOR=1.289;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=205;TCF=126;TCR=79;TR=205;WE=44259498;WS=44259480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr20	44259673	rs1487322	G	T	2900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=70;PP=2339;SC=AGAGTGGGCTGGGATGTGCAT;SOR=3.284;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=12;TCR=70;TR=82;WE=44259681;WS=44259663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr20	44314609	rs232729	A	G	3908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=91;NR=24;PP=2965;SC=AACCAGGACAAGCAGCAGAGT;SOR=2.717;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=91;TCR=24;TR=115;WE=44314617;WS=44314599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr20	44331043	rs6032445	C	T	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=284;SC=ATCTGGGCCTCAGGTTTTTAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=44331051;WS=44331033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr20	44333052	rs980984	A	G	1486.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=1;PP=1309;SC=CCTGTTGGTGAGGCCCTTCTC;SOR=6.138;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=43;TCF=42;TCR=1;TR=43;WE=44333060;WS=44333042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr20	44333326	rs11361717	CT	C	497.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.63;MQRankSum=0.516;QD=17.78;ReadPosRankSum=1.436;SOR=4.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr20	44334394	rs232291	A	C	1444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=0;PP=1284;SC=GGCAAGAGAAATGAGCTTCAT;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=43;WE=44334402;WS=44334384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr20	44334588	rs232290	C	G	7704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=95;NR=151;PP=2965;SC=GATTTGGTCTCGCCTTCCTCA;SOR=1.188;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=248;TCF=97;TCR=151;TR=246;WE=44334596;WS=44334578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,244:1.00:244
chr20	44350931	rs232262	C	G	5402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=132;NR=27;PP=2965;SC=TAGGTGAGCTCAACCGTCTCA;SOR=3.008;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=161;TCF=133;TCR=28;TR=159;WE=44350939;WS=44350921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr20	44352620	rs6017667	G	A	7770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.914;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=112;PP=2965;ReadPosRankSum=1.609;SC=TGTCTTCTCCGGCTGTAATGG;SOR=0.779;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=235;TCF=122;TCR=113;TR=233;WE=44352628;WS=44352610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,242:0.99:244
chr20	44352740	rs1487317	G	A	4263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=96;PP=2965;SC=GGTAGTAAAAGAAGAGGTTTT;SOR=2.470;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=26;TCR=96;TR=122;WE=44352748;WS=44352730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr20	44354087	rs6032473	G	C	2319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=0;PP=1820;SC=CACATACTAAGCAATGATTAA;SOR=7.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=64;TCR=0;TR=64;WE=44354095;WS=44354077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr20	44354372	rs6032474	G	A	3284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=96;PP=2630;SC=TTTCCATAATGCTTTAAGCTT;SOR=6.033;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=100;TCF=3;TCR=97;TR=99;WE=44354380;WS=44354362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr20	44354387	rs232259	A	C	2921.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=78;PP=2434;SC=AAGCTTCCATATGTTTGCTAT;SOR=7.428;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=79;TCF=1;TCR=78;TR=79;WE=44354395;WS=44354377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr20	44470648	rs370136124	CT	C	108.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=4.828;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.95;MQRankSum=2.711;QD=1.26;ReadPosRankSum=-1.460;SOR=1.515;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:65,21:0.24:86
chr20	44578776	rs6065910	A	G	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;SC=CTGCTACTGTACCCAGTGGTG;SOR=1.656;SbPval=0.54;Source=Platypus;TCF=16;WE=44578784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr20	44582187	rs73128528	A	T	923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=2;PP=779;SC=ACCTCCTGAGAAGGGTAGACT;SOR=4.479;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=28;WE=44582195;WS=44582185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr20	44586781	rs139689930	G	T	267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=184;ReadPosRankSum=-0.374;SC=TCTGCCCCTGGGTTCAAGTGA;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=9;WE=44586789;WS=44586771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,10:0.62:16
chr20	44588109	rs3746507	G	A	2309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=66;PP=1889;SC=AAGTCTGCCCGTCCCTAGCCT;SOR=4.033;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=8;TCR=66;TR=74;WE=44588117;WS=44588099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr20	44594228	rs3746513	G	A	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=420;SC=GGCCACTCCTGACCCACCCAC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=44594236;WS=44594218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr20	44594575	rs17448653	C	T	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=298;ReadPosRankSum=-1.077;SC=GCTGACTTGGCGTTCCTGCCC;SOR=0.484;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=14;WE=44594583;WS=44594565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr20	44596207	rs6032606	C	G	4606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=64;PP=2965;SC=TTCCTCTTGGCTCTTGGTGGA;SOR=0.930;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=80;TCR=64;TR=144;WE=44596215;WS=44596197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr20	44599839	rs6017715	G	C	2501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=20;PP=1924;SC=CCGTCCAGCCGGGTCCATACC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=59;TCR=20;TR=79;WE=44599847;WS=44599829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr20	44638781	rs3918251	A	G	152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.326;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=97;ReadPosRankSum=-0.384;SC=CGGGGAGGCCAGGTCTGGCTC;SOR=0.542;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=8;WE=44638789;WS=44638771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,8:0.38:21
chr20	44639511	rs3918253	C	T	2829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.466;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=25;PP=2188;ReadPosRankSum=-0.269;SC=AGCGCACAATCTGCGCAGCAG;SOR=1.109;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=212;TCF=155;TCR=57;TR=104;WE=44639519;WS=44639501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,109:0.50:219
chr20	44639692	rs2274755	G	T	3316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.728;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=66;PP=2594;ReadPosRankSum=-0.759;SC=GGGCGTCGGTGAGATTCTGAG;SOR=0.740;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=250;TCF=124;TCR=126;TR=125;WE=44639700;WS=44639682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,129:0.50:258
chr20	44640225	rs17576	A	G	2468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.432;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=66;PP=1966;ReadPosRankSum=-1.042;SC=CTCTACACCCAGGACGGCAAT;SOR=0.648;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=306;TCF=136;TCR=170;TR=119;WE=44640233;WS=44640215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,116:0.38:305
chr20	44640959	rs3918256	G	A	4531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=304;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.390;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=82;NR=91;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.258;SC=CAAGGTAGGCGTGGTCCCGCG;SOR=0.598;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=300;TCF=139;TCR=161;TR=173;WE=44640967;WS=44640949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:127,175:0.58:302
chr20	44642406	rs2250889	G	C	1238.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=35;PP=829;SC=TTTGAGGAGCGGCTCTCCAAG;SOR=2.935;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=41;WE=44642414;WS=44642396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
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chr20	44645010	rs20544	C	T	2140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-5.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.996;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=54;PP=1619;ReadPosRankSum=-0.038;SC=AGGACTAGGGCTCCCGTCCTG;SOR=0.189;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=129;TCF=32;TCR=97;TR=78;WE=44645018;WS=44645000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,86:0.61:141
chr20	44650318	rs10432735	A	T	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=2;PP=122;ReadPosRankSum=-1.368;SC=GGGTTGGGGGATCCGCTCTTT;SOR=0.892;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=7;WE=44650326;WS=44650308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr20	44663475	rs11699481	T	C	707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=585;ReadPosRankSum=-1.438;SC=AGCCCCATTTTCCCAATGCGC;SOR=0.733;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=25;WE=44663483;WS=44663465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr20	44665889	rs147042920	T	C	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.518;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=414;ReadPosRankSum=0.796;SC=AGATTCTCCCTGCAGCTGGTG;SOR=1.911;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=58;TCF=43;TCR=15;TR=25;WE=44665897;WS=44665879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,24:0.44:55
chr20	44675136	rs3848727	T	C	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=17;PP=494;SC=CCAATCCTCATCTTACTCCAG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=44675144;WS=44675126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr20	44678348	rs6032635	G	A	3312.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=63;NR=36;PP=2469;SC=AGCTGAAGGCGGGGAAGGGCC;SOR=1.232;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=63;TCR=36;TR=99;WE=44678356;WS=44678338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr20	44680493	rs17344810	G	A	4146.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=94;PP=2965;SC=ATCATCAGACGTGGAGGAACT;SOR=1.954;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=37;TCR=94;TR=131;WE=44680501;WS=44680483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr20	44681510	rs55947855	G	A	3147.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=88;NR=8;PP=2629;SC=AGTGCTGGCTGCCAGGAGCCC;SOR=4.615;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=96;TCF=88;TCR=8;TR=96;WE=44681518;WS=44681500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr20	44693897	rs17450969	G	A	2451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=63;PP=1954;ReadPosRankSum=-0.802;SC=CCAGGTGAGCGACCAACTCCA;SOR=1.739;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=75;TCF=11;TCR=64;TR=74;WE=44693905;WS=44693887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,78:0.99:79
chr20	44746982	rs1883832	T	C	1607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=7;PP=1269;SC=CTCACCTCGCTATGGTTCGTC;SOR=3.171;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=46;WE=44746990;WS=44746972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr20	44757407	rs3765459	G	A	5054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=82;PP=2965;SC=GCACTGACCCGCCGTCTGGGA;SOR=0.766;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=81;TCR=84;TR=163;WE=44757415;WS=44757397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr20	44806643	rs34603854	G	A	1886.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.571;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=30;PP=1521;ReadPosRankSum=1.886;SC=TGAGGGAGGCGGCCATGACAA;SOR=1.093;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=162;TCF=92;TCR=70;TR=76;WE=44806651;WS=44806633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,76:0.45:168
chr20	44806727	rs35585191	G	A	2199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-6.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.588;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=46;PP=1644;ReadPosRankSum=1.630;SC=GCGTGCCTGTGCTGCTCAGTG;SOR=0.648;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=175;TCF=89;TCR=86;TR=88;WE=44806735;WS=44806717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,89:0.50:179
chr20	44806875	rs2281335	G	A	1337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=39;PP=1042;ReadPosRankSum=-0.317;SC=ACTTGGGGCCGGGGGTCAGCA;SOR=0.709;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=96;TCF=20;TCR=76;TR=49;WE=44806883;WS=44806865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,51:0.53:97
chr20	44839322	rs2425785	G	C	401.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=238;ReadPosRankSum=-0.778;SC=AGGGGCGGCAGGGATGTTTGG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=16;WE=44839330;WS=44839312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,19:0.50:38
chr20	44856463	rs733379	G	A	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-2.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=234;ReadPosRankSum=-0.744;SC=TTCTGGTGGCGCAAGTGTGAC;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=12;WE=44856471;WS=44856453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,13:0.54:24
chr20	44979641	rs4810503	TA	GC	1354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=26;PP=713;SC=ATCAAGATCTTACTGAAATCC;SOR=4.680;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=27;WE=44979650;WS=44979631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr20	44985307	rs911435	T	G	2686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=59;PP=2102;SC=ACAGGACAGCTTGGGAGGTCC;SOR=1.775;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=24;TCR=59;TR=83;WE=44985315;WS=44985297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr20	44996182	rs2257495	A	G	4587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=75;PP=2965;SC=CACTGAGGCCATCAATCCAGA;SOR=0.861;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=165;TCF=90;TCR=75;TR=165;WE=44996190;WS=44996172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr20	44996254	rs2297058	C	A	1264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=36;PP=923;ReadPosRankSum=-1.837;SC=AGCAGGAGATCCTGCCAAGGT;SOR=0.719;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=101;TCF=27;TCR=74;TR=50;WE=44996262;WS=44996244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,52:0.50:103
chr20	44997702	rs2297055	C	T	134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.268;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=6;PP=94;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GCATCATCACCAAACATGCTG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=6;WE=44997710;WS=44997692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr20	44998791	rs2261964	C	T	4091.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=115;NR=12;PP=2965;SC=CAATGTTATACACTATACGAT;SOR=4.390;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=116;TCR=12;TR=127;WE=44998799;WS=44998781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr20	44999028	rs3818608	T	C	3873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=361;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=95;NR=72;PP=2868;ReadPosRankSum=0.746;SC=CCACCACCAATGGCACTCTCC;SOR=0.685;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=354;TCF=203;TCR=151;TR=167;WE=44999036;WS=44999018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:189,167:0.47:356
chr20	44999277	rs2297054	A	G	906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.268;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=33;PP=767;ReadPosRankSum=0.151;SC=CTCAGCCCCAAACTCCAAGGG;SOR=1.169;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=79;TCF=1;TCR=78;TR=33;WE=44999285;WS=44999267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,34:0.42:81
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chr20	45003326	rs2261213	A	G	2071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=56;PP=1711;SC=GTCTCCGTGTATGCAGGGACC;SOR=3.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=7;TCR=56;TR=63;WE=45003334;WS=45003316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
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chr20	45005430	rs6094286	T	C	1821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.301;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.864;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=50;PP=1388;ReadPosRankSum=0.161;SC=TGTCCTTCAATTTCCCTACTC;SOR=1.417;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=162;TCF=61;TCR=101;TR=71;WE=45005438;WS=45005420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,70:0.43:164
chr20	45023247	rs2274676	T	C	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.002;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.406;NF=2;NR=24;PP=594;ReadPosRankSum=0.208;SC=TTTGAAGAGTTTGAAGACAGA;SOR=0.160;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=26;WE=45023255;WS=45023237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr20	45023286	rs2274675	C	T	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.303;NF=0;NR=19;PP=447;ReadPosRankSum=-0.043;SC=ATGAAACTACCTGGTTTGAAT;SOR=1.214;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=19;WE=45023294;WS=45023276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,19:0.61:31
chr20	45188971	rs910062	C	A	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=316;ReadPosRankSum=-0.696;SC=GGACACAGACCCAGGTCGGTA;SOR=1.524;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=16;WE=45188979;WS=45188961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,17:0.47:36
chr20	45192253	rs59207395	G	GA	742.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=4.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=3.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=-0.890;QD=20.63;ReadPosRankSum=-0.952;SOR=0.250;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
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chr20	45192254	rs35374760	G	GAGAGAGA	679.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.63;MQRankSum=0.000;QD=18.37;ReadPosRankSum=-0.027;SOR=0.409;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr20	45204266	rs1880898	G	A	1929.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=26;PP=1463;ReadPosRankSum=0.243;SC=TGATGTTCCAGGGCACTGTCT;SOR=0.722;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=118;TCF=75;TCR=43;TR=72;WE=45204274;WS=45204256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,74:0.62:120
chr20	45318042	rs2664523	G	A	1417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.984;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.905;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=29;PP=1066;ReadPosRankSum=0.778;SC=TAGTAGCTCTGGCCGCCGCCA;SOR=0.313;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=128;TCF=76;TCR=52;TR=63;WE=45318050;WS=45318032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,62:0.49:126
chr20	45318069	rs2664574	C	G	1968.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.869;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.139;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=46;PP=1530;ReadPosRankSum=-0.418;SC=CTCGGCGCAACAGCTCCAACC;SOR=0.904;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=163;TCF=79;TCR=84;TR=79;WE=45318077;WS=45318059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,80:0.48:167
chr20	45354291	rs2235491	G	A	2655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.544;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.226;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=55;PP=1929;ReadPosRankSum=1.073;SC=GGGAGGTGAGGCCCCCAAGCT;SOR=0.344;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=195;TCF=79;TCR=116;TR=99;WE=45354299;WS=45354281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,105:0.52:203
chr20	45358145	rs2425906	T	G	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.853;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=777;ReadPosRankSum=-0.632;SC=GCTGACAGGGTGGGTCTGGGG;SOR=1.396;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=54;TCF=24;TCR=30;TR=36;WE=45358153;WS=45358135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,36:0.68:53
chr20	45358223	rs2425907	C	T	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=402;ReadPosRankSum=-0.753;SC=CTTTTGCAAGCGGGCATTCCT;SOR=0.515;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=18;WE=45358231;WS=45358213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,17:0.57:30
chr20	45629941	rs3746492	G	A	2772.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=2;PP=2230;ReadPosRankSum=-0.870;SC=AGCATCTGTGGTGGAGAAAGC;SOR=4.640;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=82;TCF=80;TCR=2;TR=81;WE=45629949;WS=45629931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr20	45630157	rs6094549	T	G	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.145;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=28;PP=648;ReadPosRankSum=0.390;SC=CCACCTTTTCTTCTTTCTTGG;SOR=0.472;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=85;TCF=14;TCR=71;TR=34;WE=45630165;WS=45630147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,34:0.38:89
chr20	45795744	rs3091782	T	C	1004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.349;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=34;PP=785;ReadPosRankSum=-0.469;SC=GCATCCCTTATGACTCTTGGC;SOR=1.288;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=96;TCF=34;TCR=62;TR=48;WE=45795752;WS=45795734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,47:0.49:95
chr20	45795855	rs3092020	A	G	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=89;ReadPosRankSum=0.896;SC=TACTGGCTTCAAACAACACAC;SOR=0.648;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=6;WE=45795863;WS=45795845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr20	45797883	rs3091653	C	T	2296.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.207;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=57;PP=1644;ReadPosRankSum=0.224;SC=CATTGATTGACTGATTGATTA;SOR=0.564;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=178;TCF=58;TCR=120;TR=86;WE=45797891;WS=45797873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,94:0.49:191
chr20	45797954	rs3091593	T	A	855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.931;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=32;PP=698;ReadPosRankSum=-1.144;SC=AAGGACAAGGTGTGCCTGCCT;SOR=2.570;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=76;TCF=8;TCR=68;TR=33;WE=45797962;WS=45797944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,33:0.43:77
chr20	45798014	rs3091985	C	G	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=407;ReadPosRankSum=0.816;SC=TCACAACTAGCCGGGTGTGGT;SOR=0.976;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=18;WE=45798022;WS=45798004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr20	45801319	rs3827049	T	A	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.880;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=1;PP=190;ReadPosRankSum=-0.044;SC=TGCACCCCCCTGCACTAACAC;SOR=0.593;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=9;WE=45801327;WS=45801309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
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chr20	45816594	rs3818012	G	A	284.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=3.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.468;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=226;ReadPosRankSum=0.541;SC=AAGTCCCCACGTGCTAGACTT;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=11;WE=45816602;WS=45816584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
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chr20	45816649	rs3818014	C	T	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=8.152;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=21.45;ReadPosRankSum=-0.430;SOR=2.137;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,27:0.56:48
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chr20	45856045	rs1124178	A	G	1761.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=41;PP=1390;SC=GAGAGTGAGCATCTTCAAAAG;SOR=1.903;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=17;TCR=41;TR=58;WE=45856053;WS=45856035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr20	45891189	rs2294560	T	C	1150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.856;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=31;PP=926;ReadPosRankSum=-0.720;SC=AAGTATGGCATTGTTAAAAGA;SOR=0.922;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=85;TCF=25;TCR=60;TR=42;WE=45891197;WS=45891179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,43:0.48:89
chr20	45905651	rs3746485	T	C	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.87;ReadPosRankSum=0.880;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,10:0.42:24
chr20	45923383	rs2076402	G	T	4059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=8.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=325;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.457;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=28;PP=2962;ReadPosRankSum=0.005;SC=TCATTTACGCGTATACCAAGA;SOR=0.530;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=311;TCF=257;TCR=54;TR=149;WE=45923391;WS=45923373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,154:0.48:321
chr20	45923539	rs6066270	C	T	2487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-8.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.025;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=84;PP=1890;ReadPosRankSum=0.489;SC=AAGTCAAAGTCATACATAAAC;SOR=1.116;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=184;TCF=17;TCR=167;TR=91;WE=45923547;WS=45923529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,96:0.49:194
chr20	46267950	rs4810648	C	T	3773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=100;PP=2965;SC=AGTATGGGTACGTTATTTCTA;SOR=3.481;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=116;TCF=16;TCR=100;TR=116;WE=46267958;WS=46267940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr20	46287012	rs444271	C	G	2196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=0;PP=1896;SC=CTGGCCAATACCACAGGTCTG;SOR=8.287;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=62;TCR=0;TR=62;WE=46287020;WS=46287002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr20	46288566	rs2294891	T	G	2922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=64;PP=2347;SC=TGCTTTTTTGTCACAATCCCA;SOR=2.520;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=19;TCR=65;TR=83;WE=46288574;WS=46288556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr20	46292149	rs2235734	T	G	1196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=4;PP=1018;SC=AGAAGTTTCTTGAACCCCTGG;SOR=3.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=36;WE=46292157;WS=46292139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr20	46294725	rs2076545	C	T	6813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=110;PP=2965;SC=TCACGTGTGGCTCGGAGGTGG;SOR=0.800;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=209;TCF=99;TCR=110;TR=209;WE=46294733;WS=46294715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr20	46294864	rs13044281	A	G	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.633;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=26.194;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.08;MQRankSum=1.325;QD=1.34;ReadPosRankSum=-3.425;SOR=2.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,22:0.15:151
chr20	46305112	rs11906661	C	T	79.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=0;PP=57;SC=GGGCACCACACGGCAGCAAAG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=46305120;WS=46305105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr20	46313135	rs2297586	C	T	2035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=10;PP=1598;SC=GCTGGGGGTTCGGAGCCACGC;SOR=3.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=49;TCR=10;TR=59;WE=46313143;WS=46313125;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr20	46365571	rs3810526	A	G	7871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.733;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.019;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=127;NR=136;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.077;SC=CGTACTTGCCAGTGAGGATGG;SOR=0.120;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=265;TCF=127;TCR=138;TR=263;WE=46365579;WS=46365561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,267:0.99:269
chr20	46365636	rs56218501	C	T	2655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.112;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=72;PP=2142;ReadPosRankSum=1.658;SC=ATGAAGTGCGCCCCGCCCTGC;SOR=0.602;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=215;TCF=68;TCR=147;TR=108;WE=46365644;WS=46365626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,105:0.48:217
chr20	47251366	rs74442232	G	T	2322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=56;PP=1783;ReadPosRankSum=1.022;SC=CTGCCCCAGGGTTTCCTATCA;SOR=0.690;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=164;TCF=58;TCR=106;TR=86;WE=47251374;WS=47251356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,90:0.53:169
chr20	47253150	rs2664521	T	C	4336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=83;PP=2965;SC=AGCAGCTGCTTGGAGAAGGTG;SOR=1.218;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=58;TCR=83;TR=141;WE=47253158;WS=47253140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr20	47256300	rs6019339	C	T	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.415;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=515;ReadPosRankSum=0.405;SC=CCCTGCCCACCGACCTTCCAC;SOR=0.408;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=52;TCF=45;TCR=7;TR=25;WE=47256308;WS=47256290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,27:0.47:57
chr20	47260936	rs6019344	A	G	2702.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=216;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.674;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=55;PP=2057;ReadPosRankSum=-0.392;SC=GGCCGCTGCCACTCCACTCAC;SOR=0.414;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=208;TCF=111;TCR=97;TR=109;WE=47260944;WS=47260926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,112:0.53:213
chr20	47262549	rs6012504	C	T	1760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.213;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=33;PP=1408;ReadPosRankSum=-0.053;SC=GCCAAGGATGCGTCGCAGGAC;SOR=0.460;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=124;TCF=57;TCR=67;TR=66;WE=47262557;WS=47262539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,67:0.53:126
chr20	47269874	rs742643	C	T	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.305;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=6;PP=448;ReadPosRankSum=-1.358;SC=ACTTCTTTGACGGCCCCGGTT;SOR=0.242;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=26;WE=47269882;WS=47269864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,27:0.51:53
chr20	47272963	rs3091871	G	GC	11135.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=137;NR=109;PP=2975;SC=GGCCTCCAGGGCTGGACCCCG;SOR=1.314;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=257;TCF=140;TCR=117;TR=246;WE=47272971;WS=47272953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,300:1.00:300
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chr20	47361519	rs3746816	T	C	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=219;ReadPosRankSum=0.816;SC=AAGCCCACTTTTCAAAAACTA;SOR=0.823;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=12;WE=47361527;WS=47361509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr20	47361708	rs41283562	G	A	1368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.829;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=31;PP=993;ReadPosRankSum=-0.794;SC=AGAGGCCAGAGGACAGCGTTA;SOR=0.184;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=86;TCF=25;TCR=61;TR=48;WE=47361716;WS=47361698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,50:0.56:89
chr20	47364613	rs59338851	G	A	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=299;ReadPosRankSum=-1.465;SC=ACTCCCACACGGTCACCAGGG;SOR=0.693;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=2;TCR=27;TR=14;WE=47364621;WS=47364603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,15:0.50:30
chr20	47569112	rs2295030	C	A	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=0;PP=445;SC=GCAGAGCCATCTTACAATTTA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=47569120;WS=47569103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr20	47585642	rs3764683	T	C	3221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;NF=91;NR=14;PP=2873;SC=GGACTACAGGTGGGTGCCACC;SOR=3.442;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=105;TCF=91;TCR=14;TR=105;WE=47585650;WS=47585632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr20	47589122	rs2273102	T	C	1142.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=39;PP=902;SC=TTTTAGAGGATGACCAACTTA;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=40;WE=47589130;WS=47589112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr20	47604825	rs4810905	G	A	3799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=90;NR=26;PP=2965;SC=TTGATGTCTCGAATTTTTTTC;SOR=2.507;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=116;TCF=90;TCR=26;TR=116;WE=47604833;WS=47604815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr20	47614665	rs3764681	G	A	1489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=6;PP=1169;SC=CCAAAGTGCTGAGATTACAGG;SOR=3.306;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=40;TCR=6;TR=46;WE=47614673;WS=47614655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr20	47615074	rs60107724	TA	T	402.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=20;PP=266;SC=CCATTCCTGTTAAAAAAAAAA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=20;WE=47615082;WS=47615064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr20	47621554	rs4810910	G	A	2101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=5;PP=1700;SC=AGAGACCCACGTCGGTCATTA;SOR=4.615;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=62;TCF=57;TCR=5;TR=62;WE=47621562;WS=47621544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr20	47628368	rs371203595	ATG	A	138.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FS=13.441;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.06;MQRankSum=2.809;QD=0.86;ReadPosRankSum=-1.159;SOR=0.073;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,21:0.13:161
chr20	47632754	rs1473718	A	G	3630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=35;PP=2965;SC=CCAGGAGTGTACAAGAATGCC;SOR=1.695;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=77;TCR=35;TR=112;WE=47632762;WS=47632744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr20	47634006	rs11086275	A	AT	5211.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.487;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=123;PP=2983;ReadPosRankSum=0.695;SC=CACATTGATTATTTTTTTTCT;SOR=1.209;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=207;TCF=34;TCR=173;TR=152;WE=47634022;WS=47633996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,181:0.99:182
chr20	47639464	rs2426106	G	C	1465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=1;PP=1267;SC=CCAGCCTGGAGAACGTAGTGA;SOR=6.229;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=44;WE=47639472;WS=47639454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr20	47648454	rs3091900	CA	C	1354.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;MQRankSum=0.256;NF=58;NR=0;PP=871;ReadPosRankSum=1.594;SC=GACCCTGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=89;TCF=88;TCR=1;TR=58;WE=47648462;WS=47648444;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,61:0.98:62
chr20	47675176	rs2064853	T	A	1795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.65;SOR=3.651;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr20	47682893	rs2246266	C	T	9428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=153;NR=126;PP=2965;SC=TAATCTTTTCCTCTCCTAGTT;SOR=0.937;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=280;TCF=153;TCR=127;TR=279;WE=47682901;WS=47682883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr20	47683568	rs60161542	CAAAAAAAAAAA	C	917.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=10.792;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.24;MQRankSum=-0.454;QD=38.24;ReadPosRankSum=-0.380;SOR=6.273;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,22:0.92:24
chr20	47683895	rs56145535	G	C	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=552;ReadPosRankSum=0.085;SC=TTAAGAGAATGCTTTGAAAGC;SOR=4.712;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=20;WE=47683903;WS=47683885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr20	47691445	rs3092153	C	T	1958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=53;PP=1633;SC=TAAGGTGGTTCTCTTTCTAGT;SOR=3.407;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=9;TCR=54;TR=62;WE=47691453;WS=47691435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr20	47731593	rs143306903	G	A	933.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.815;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=33;PP=779;ReadPosRankSum=1.607;SC=AGTAAAATACGCAAGGAGAGT;SOR=2.008;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=65;TCF=14;TCR=51;TR=38;WE=47731613;WS=47731583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,36:0.55:65
chr20	47731605	rs62210399	T	G	1606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=42;PP=1676;SC=AAGGAGAGTGTGTGTACTTAT;SOR=3.126;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=8;TCR=43;TR=50;WE=47731613;WS=47731583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr20	47770443	rs72347383	CA	C	1927.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FS=9.785;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.79;MQRankSum=-0.588;QD=26.41;ReadPosRankSum=0.820;SOR=0.068;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:10,63:0.86:73
chr20	47770461	rs2273652	A	C	4587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.551;HP=18;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=-0.262;NF=103;NR=44;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.983;SC=AAAAAAAAAAAACACATACCT;SOR=0.287;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=156;TCF=111;TCR=45;TR=147;WE=47770469;WS=47770451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,150:0.98:153
chr20	47839653	rs2273146	C	T	1508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-4.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=45;PP=1250;ReadPosRankSum=1.188;SC=CGGGGCATGGCTGGGGCAGGC;SOR=0.776;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=115;TCF=23;TCR=92;TR=56;WE=47839661;WS=47839643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,57:0.50:115
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chr20	47852822	rs238152	G	A	2397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.881;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=49;PP=1820;ReadPosRankSum=-3.147;SC=TTGCCTCTTCGCACCCCCCTT;SOR=0.671;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=234;TCF=115;TCR=119;TR=102;WE=47852830;WS=47852812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,104:0.43:240
chr20	47856037	rs238156	T	G	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=335;ReadPosRankSum=1.301;SC=GGTGTGGGGGTTGCATTAGAT;SOR=0.906;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=16;WE=47856045;WS=47856027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr20	47859015	rs238204	A	G	1657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=1;PP=1324;ReadPosRankSum=-1.217;SC=ACAGAATGAAAATAGTCTTTG;SOR=0.238;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=106;TCF=105;TCR=1;TR=52;WE=47859023;WS=47859005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,57:0.51:111
chr20	47859254	rs71186444	CTTTTTTTTTTTTTT	C	3427.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=22;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=6.941;NF=0;NR=44;PP=2997;ReadPosRankSum=4.753;SC=CCTTGGTATTCTTTTTTTTTT;SOR=0.845;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=117;TCF=3;TCR=114;TR=44;WE=47859275;WS=47859240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,85:0.70:121
chr20	47863409	rs144647523	ATT	A	1594.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.680;HP=13;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.009;NF=2;NR=52;PP=556;ReadPosRankSum=0.857;SC=AAAAAGAATGATTTTTTTTTT;SOR=0.298;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=152;TCF=6;TCR=146;TR=54;WE=47863418;WS=47863399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,58:0.48:120
chr20	47865372	rs238208	G	A	3697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.484;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=43;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.974;SC=TCTGAACACAGCTGCACACAG;SOR=0.643;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=267;TCF=186;TCR=81;TR=136;WE=47865380;WS=47865362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,137:0.51:269
chr20	47865509	rs238209	G	A	4860.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=382;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.371;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.969;NF=79;NR=96;PP=2962;ReadPosRankSum=1.516;SC=CCGAGGAATGGTTTTGGGCAC;SOR=0.727;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=359;TCF=164;TCR=195;TR=175;WE=47865517;WS=47865499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:185,195:0.51:380
chr20	47866411	rs6063378	G	A	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.393;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=306;ReadPosRankSum=-0.657;SC=GTTAGTCATTGTGTGCTTCAT;SOR=1.578;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=29;TCF=3;TCR=26;TR=15;WE=47866419;WS=47866401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr20	47869191	rs6122777	G	A	904.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=3;PP=625;ReadPosRankSum=0.000;SC=TCTTTTGCTGGCAACTGGCAG;SOR=0.446;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=59;TCF=54;TCR=5;TR=28;WE=47869199;WS=47869181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,33:0.51:65
chr20	47872327	rs238220	A	G	2086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.776;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.262;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=30;PP=1636;ReadPosRankSum=-2.353;SC=TGGGTTGGCTAGATGTGGAAC;SOR=0.812;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=151;TCF=93;TCR=58;TR=77;WE=47872335;WS=47872317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,81:0.51:159
chr20	47872377	rs238221	C	G	1866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=42;PP=1363;ReadPosRankSum=-0.376;SC=TGAGGTCCAGCTGCCAAACAT;SOR=0.689;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=133;TCF=51;TCR=82;TR=66;WE=47872385;WS=47872367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,73:0.52:141
chr20	47874239	rs11295162	CT	C	907.86	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.592;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.69;MQRankSum=-1.851;QD=10.20;ReadPosRankSum=-0.265;SOR=1.508;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,66:0.74:89
chr20	47881581	rs6063380	A	C	42.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.935;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=25;ReadPosRankSum=-0.086;SC=GCAGAGCAGTAAAGTGTAGCA;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=3;WE=47881589;WS=47881571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr20	47882893	rs238178	T	A	990.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.87;ReadPosRankSum=-0.877;SOR=1.449;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,36:0.47:77
chr20	47886684	rs57950	G	A	1504.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.372;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=26;PP=1217;ReadPosRankSum=0.204;SC=GGGTAAAGTCGTATCTGCCCC;SOR=0.560;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=133;TCF=76;TCR=57;TR=60;WE=47886692;WS=47886674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,62:0.45:137
chr20	47892270	rs238191	T	C	1098.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=7;PP=986;ReadPosRankSum=-1.436;SC=ATTTCCTTCTTTTATTACTAG;SOR=0.754;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=84;TCF=70;TCR=14;TR=44;WE=47892278;WS=47892260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,41:0.51:80
chr20	47942184	.	G	A	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.5;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=59.29;NF=153;NR=48;PP=2962;QD=20;SC=CTGTTGTGAGGATTAAATGAA;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=514;TCF=385;TCR=129;TR=201;WE=47942192;WS=47942174;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:313,201:0.39:514
chr20	47942184	.	G	GATTAAATGAAGTCATGTATGGGACTTGCTTGGTTTAGCATCCAAAGCACAATGAACGGGGTTATTAGATGGATGTTGTGAGAATTAAATGAAGTCATGTATGGGACTTGCTTGGTTTAGCATCCAAAGCACAATGAACAGGGTTATTAGATGGATGTTGTGAGA	18606.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.877;ClippingRankSum=0.000;DP=353;ExcessHet=3.0103;FS=70.933;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=54.41;ReadPosRankSum=-6.866;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:311,31:0.09:342
chr20	47948677	rs1972189	G	A	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.322;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.195;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=48;ReadPosRankSum=-0.156;SC=GTCTTGCTCTGTTGCCCAGGC;SOR=0.027;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=5;WE=47948685;WS=47948667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,5:0.42:12
chr20	47951040	rs200288022	CTTTT	C,CTTT	990.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=16;HapScore=3;MGOF=7;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=5,5;NR=21,21;PP=142,339;ReadPosRankSum=1.194;SC=CGCGCCTGGCCTTTTTTTTTT;SOR=0.465;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=56;TCF=7;TCR=49;TR=26,26;WE=47951052;WS=47951030;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.66,0.31:35
chr20	47951126	.	G	T	230	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=16;HapScore=2;MGOF=12;MMLQ=29;MQ=51.95;NF=0;NR=7;PP=230;QD=37.8244589353;SC=TTTTTTTTTTGTGGCAAATCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=47951134;WS=47951116;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,7:0.70:10
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chr20	47956706	.	TA	T	480.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.223;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.51;ReadPosRankSum=-0.615;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
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chr20	48184654	.	C	CGCGGGGCTGGCGGGGCTG	226.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.37;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr20	48259034	rs2235855	A	G	2705.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=28;PP=2009;ReadPosRankSum=0.869;SC=GCAAACTGCAAGCGCTGGCGC;SOR=0.722;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=206;TCF=143;TCR=63;TR=96;WE=48259042;WS=48259024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,105:0.48:220
chr20	48273299	rs4810968	T	C	4564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=17;NR=110;PP=2965;SC=TAAAAAAACATACCACATAGC;SOR=3.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=17;TCR=110;TR=127;WE=48273307;WS=48273289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
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chr20	48301146	rs6512586	G	A	2246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=43;PP=1732;ReadPosRankSum=1.149;SC=ACATATCAAGGACATAAGCAC;SOR=0.672;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=207;TCF=101;TCR=106;TR=85;WE=48301154;WS=48301136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,92:0.43:216
chr20	48330030	rs12329570	G	C	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.518;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=5;PP=1081;ReadPosRankSum=0.044;SC=CTCCCGGCCGGGGCCCCTTAG;SOR=0.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=90;TCR=10;TR=49;WE=48330038;WS=48330020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,49:0.52:95
chr20	48330045	rs117026282	G	A	1297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.341;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=10;PP=1188;ReadPosRankSum=-1.421;SC=CCTTAGGGAGGGGCGGGGATT;SOR=0.397;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=122;TCF=103;TCR=19;TR=56;WE=48330053;WS=48330035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,52:0.45:116
chr20	48429508	rs58677849	GG	CC	3498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=52;PP=2947;SC=TTTCCCGGGCGGCGGAGGCGG;SOR=1.966;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=75;TCF=21;TCR=54;TR=73;WE=48429517;WS=48429498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr20	48431765	rs73910322	C	T	257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=196;ReadPosRankSum=0.849;SC=TCTGCCATCCCGTGTCTGTGT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=9;WE=48431773;WS=48431755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,10:0.50:20
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chr20	48479356	rs3092598	TATGA	T	1376.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=0;PP=1291;SC=TGAATGATGGTATGAATGAAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=26;WE=48479367;WS=48479351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr20	48491258	rs542234	T	G	9753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=308;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=180;NR=119;PP=2965;SC=TGGCCATCCTTTTCTCAGGCA;SOR=1.156;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=300;TCF=181;TCR=119;TR=299;WE=48491266;WS=48491248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,305:1.00:305
chr20	48494650	rs6020100	A	G	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=27;PP=764;SC=TTTGTAGATCAATAAACACAT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=27;WE=48494658;WS=48494640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr20	48500762	.	CACACACACACACACACG	C	40.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.69;QD=20.12;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr20	48561893	rs4810993	A	G	1407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=6;PP=1222;SC=TCACTAACTTATGGGCTCTGA;SOR=3.365;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=44;WE=48561901;WS=48561883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr20	48562083	rs11473738	G	GTTGGACACC	3113.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=26;PP=2381;SC=ATACAAAGAGGTTGCATGCCC;SOR=1.681;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=59;TCF=15;TCR=44;TR=36;WE=48562091;WS=48562071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
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chr20	48599480	rs6020172	C	T	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.691;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=16.34;ReadPosRankSum=-1.834;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
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chr20	48600631	rs4647958	T	C	2845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.686;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=44;PP=2201;ReadPosRankSum=0.025;SC=TCTACTTCAGTCTCTTCCTTG;SOR=0.935;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=238;TCF=122;TCR=116;TR=106;WE=48600639;WS=48600621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:141,112:0.44:253
chr20	48600809	rs1063210	G	A	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=36;PP=847;ReadPosRankSum=0.366;SC=GAAGCCACACGCTGCCCTGCG;SOR=0.668;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=10;TCR=75;TR=41;WE=48600817;WS=48600799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,42:0.49:85
chr20	48600924	rs4647957	C	T	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.659;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=263;ReadPosRankSum=0.075;SC=CCGTTGCTCTCTCTGGCAGCT;SOR=3.209;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=12;WE=48600932;WS=48600914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr20	48701351	.	CT	C	342.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.807;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=19.140;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.16;ReadPosRankSum=1.273;SOR=3.992;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,25:0.60:42
chr20	48713049	rs6012831	G	A	3459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=31;PP=2699;SC=GCATCAGAGGGGGTTCAAATA;SOR=1.739;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=74;TCR=31;TR=105;WE=48713057;WS=48713039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr20	48729677	rs126907	C	G	2155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=43;PP=1762;SC=TTGCGTCGCTCTTGCTTGAAG;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=68;WE=48729685;WS=48729667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr20	48746189	rs6122878	C	T	2116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.477;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=49;PP=1705;ReadPosRankSum=-0.852;SC=TGATAGCTGTCGGGTCAATGT;SOR=0.962;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=169;TCF=67;TCR=102;TR=79;WE=48746197;WS=48746179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,83:0.46:180
chr20	48747697	rs55894522	T	C	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.617;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=202;ReadPosRankSum=0.925;SC=CCAAGACTCATGTGCTTGGAG;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=13;WE=48747705;WS=48747687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,13:0.57:23
chr20	48770159	rs232733	T	C	1132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=35;PP=968;SC=CCCGGCCAGTTCTCGGCGCCC;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=36;WE=48770167;WS=48770149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr20	48892144	rs11086306	GT	G	4468.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.870;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.92;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=48;PP=2552;ReadPosRankSum=-1.188;SC=TTGTGAAACAGTTTTTTTTTT;SOR=1.527;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=165;TCF=101;TCR=64;TR=134;WE=48892152;WS=48892134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,177:0.99:178
chr20	48892374	rs17789629	C	A	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-4.204;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=505;ReadPosRankSum=-1.765;SC=CAAGGGCTTCCTCTGGCCACA;SOR=1.121;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=23;WE=48892382;WS=48892364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,23:0.77:30
chr20	48894756	rs3088220	C	T	2836.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.171;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.090;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=23;PP=2249;ReadPosRankSum=0.370;SC=GACCCAAGCCCTTCCTTCTGC;SOR=0.325;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=180;TCF=146;TCR=34;TR=103;WE=48894764;WS=48894746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,104:0.57:183
chr20	48894872	rs3761180	T	C	6805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=168;PP=2965;SC=ATTAAAACTGTGGGCCAGCCC;SOR=1.668;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=241;TCF=73;TCR=168;TR=241;WE=48894880;WS=48894862;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,247:1.00:247
chr20	49181345	rs16995294	T	A	1225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=1;PP=1037;ReadPosRankSum=-0.695;SC=AAAATCCCAGTCGCCCCATAC;SOR=0.233;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=85;TCF=84;TCR=1;TR=44;WE=49181353;WS=49181335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,43:0.51:84
chr20	49191228	rs1885177	A	C	6087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=8.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=460;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.501;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=131;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.425;SC=TCAGGCGGCTACTGGTTCACA;SOR=0.529;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=446;TCF=174;TCR=272;TR=224;WE=49191236;WS=49191218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:224,232:0.51:456
chr20	49194866	rs3215684	A	AT	2638.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.251;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.506;NF=70;NR=1;PP=2837;ReadPosRankSum=2.040;SC=TTAGAGGTAGAGAGTGGAAGG;SOR=0.180;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=163;TCF=162;TCR=1;TR=71;WE=49194874;WS=49194856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,79:0.47:167
chr20	49210953	rs914458	G	C	412.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-4.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=324;ReadPosRankSum=-0.779;SC=AGCTGAGAAAGCTCCTCCGTC;SOR=0.356;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=17;WE=49210961;WS=49210943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr20	49211311	rs6091179	C	T	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=329;ReadPosRankSum=-2.363;SC=GACAAGGACCCGAAAGGTTTC;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=15;WE=49211319;WS=49211301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,17:0.50:34
chr20	49212038	rs367962532	G	A	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.612;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=24;PP=691;ReadPosRankSum=-0.318;SC=GGGGAGGCCAGTTTCTGGGAA;SOR=0.346;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=70;TCF=20;TCR=50;TR=36;WE=49212046;WS=49212028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,37:0.51:72
chr20	49214156	rs6020624	A	G	1636.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.993;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=31;PP=1194;ReadPosRankSum=0.863;SC=CAGCTCATCCAGGGCGAAGTC;SOR=0.545;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=150;TCF=87;TCR=63;TR=69;WE=49214164;WS=49214146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,73:0.46:158
chr20	49225953	rs73615305	A	G	1423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=6.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=51;PP=1198;ReadPosRankSum=-1.291;SC=AGGGCCTCTAACCATCCCTGC;SOR=1.101;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=84;TCF=0;TCR=84;TR=51;WE=49225961;WS=49225943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,50:0.59:85
chr20	49227294	rs4811083	T	C	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=2;PP=1453;SC=CTGATCCCTGTTTCGAGGGCA;SOR=5.549;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=50;TCF=48;TCR=2;TR=50;WE=49227302;WS=49227284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr20	49227544	rs144167038	G	GGGCTTAGTGCCGGGCC	5615.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=28;PP=2966;SC=TCAGAGAATGGGGCCCCTCAC;SOR=1.630;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=87;TCF=20;TCR=67;TR=40;WE=49227552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr20	49236478	rs6122953	G	A	1785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.855;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=7;PP=1328;ReadPosRankSum=0.973;SC=AGGAGGCGAGGTAGAGGAATG;SOR=1.332;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=130;TCF=109;TCR=21;TR=63;WE=49236486;WS=49236468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,67:0.50:133
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chr20	49507892	rs761240	T	G	1555.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=0;PP=1310;SC=TCACACTGGATATCAGAGTTC;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=42;WE=49507900;WS=49507886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
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chr20	49621149	rs6122993	T	C	4701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=101;NR=54;PP=2965;SC=TGCGACGGCCTGCGGCGGCGC;SOR=1.534;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=155;TCF=101;TCR=54;TR=155;WE=49621157;WS=49621139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr20	49621399	rs4811110	G	C	2327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=75;PP=1815;SC=AGGAAAGGAGGGCAGAAGCTC;SOR=5.549;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=4;TCR=75;TR=79;WE=49621407;WS=49621389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
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chr20	50051642	rs112935631	G	A	431.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=313;ReadPosRankSum=-1.117;SC=AAGTTACCCGGCTAGGAGCAG;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=16;WE=50051650;WS=50051632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr20	50052427	rs139515557	T	C	512.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-5.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=420;ReadPosRankSum=-1.514;SC=TGTGTCAATATGTGCACGTGT;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=24;WE=50052435;WS=50052417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,23:0.55:42
chr20	50071258	rs228840	A	G	812.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=670;ReadPosRankSum=0.399;SC=TCACTGTGATAAGGGGAGATG;SOR=0.661;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=57;TCF=0;TCR=57;TR=29;WE=50071266;WS=50071248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr20	50092027	rs6013193	T	G	1899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=15;PP=1470;SC=GCTCCAAGGGTATCTCCAGGA;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=47;TCR=15;TR=62;WE=50092035;WS=50092017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr20	50092287	rs6021231	T	C	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=3;NR=28;PP=856;SC=TCATGGGCAGTAGAGAGACTA;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=31;WE=50092295;WS=50092277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr20	50133431	rs41307211	G	A	2119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.964;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=37;PP=1677;ReadPosRankSum=0.920;SC=TCCGCAGCTCGTAAGAGCCTG;SOR=0.821;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=140;TCF=74;TCR=66;TR=83;WE=50133439;WS=50133421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,84:0.59:143
chr20	50140627	rs3746420	G	C	2057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.312;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=57;PP=1789;ReadPosRankSum=-0.677;SC=GTGGGCTGGCGACCTTATGTG;SOR=0.641;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=148;TCF=42;TCR=106;TR=78;WE=50140635;WS=50140617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,76:0.51:148
chr20	50178965	rs2869427	G	C	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.046;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=181;ReadPosRankSum=2.018;SC=CCTGTGCGCCGAGGGCGAGCG;SOR=0.481;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=11;WE=50178973;WS=50178955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr20	50223975	rs2273090	G	T	1183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=5;PP=926;ReadPosRankSum=-0.673;SC=TTTCAGATTCGTTTCTTCTCT;SOR=1.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=33;WE=50223983;WS=50223965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chr20	50224161	rs2273089	C	T	1744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.174;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=40;PP=1374;ReadPosRankSum=-0.754;SC=GCCGGTTTCGCGGGGGGCTCA;SOR=1.244;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=54;TCF=13;TCR=41;TR=53;WE=50224169;WS=50224151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,56:0.98:57
chr20	50224206	rs3818004	G	A	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=29;PP=932;SC=TTATTCTCCCGCTAACGAGAT;SOR=2.964;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=6;TCR=29;TR=35;WE=50224214;WS=50224196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr20	50225206	rs3827032	G	A	4660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=130;PP=2965;SC=TGGCTGACGCGATAGGAGCTA;SOR=5.610;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=5;TCR=130;TR=135;WE=50225214;WS=50225196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr20	50225235	rs6021312	G	A	3007.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=85;PP=2521;ReadPosRankSum=1.149;SC=GCCAGCCTCCGGCACCCAAGT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=86;TCF=0;TCR=86;TR=85;WE=50225243;WS=50225225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
chr20	50230462	rs2235863	A	G	5563.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.177;NF=33;NR=129;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.455;SC=CATTGTAGGAAATCTTTGAAG;SOR=0.638;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=165;TCF=33;TCR=132;TR=162;WE=50230470;WS=50230452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,170:0.98:173
chr20	50238545	rs2235862	A	G	2511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=60;NR=25;PP=2037;SC=GGGCCCACTCAAGGTTAGGAG;SOR=1.845;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=60;TCR=25;TR=85;WE=50238553;WS=50238535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
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chr20	50244098	rs2426317	T	C	2847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=19;PP=2307;SC=GGGAGGCAGGTGGGGCTGCAA;SOR=2.712;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=74;TCR=19;TR=92;WE=50244106;WS=50244088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
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chr20	50287736	rs2255341	C	T	4069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.339;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=61;PP=2962;ReadPosRankSum=0.051;SC=CGGGGATTTTCGAGTCCCTTC;SOR=0.793;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=309;TCF=182;TCR=127;TR=152;WE=50287744;WS=50287726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,160:0.50:323
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chr20	50287925	rs2255358	A	G	2517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=72;PP=2097;SC=GCACACTGCCAGAGCTGAACG;SOR=8.635;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=0;TCR=72;TR=72;WE=50287933;WS=50287915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr20	50290654	rs6091346	T	C	6031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=143;NR=49;PP=2965;SC=GAGAAGAAGATGTCACGGCAG;SOR=2.243;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=192;TCF=143;TCR=49;TR=192;WE=50290662;WS=50290644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr20	50292763	rs375890632	G	A	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.659;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=67.385;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.93;MQRankSum=-3.524;QD=3.47;ReadPosRankSum=-2.220;SOR=6.671;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,51:0.40:126
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chr20	50310466	rs6021389	T	C	1631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.873;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.107;NF=43;NR=27;PP=1129;ReadPosRankSum=0.468;SC=TGCCATCCCATGCCTGGCCCC;SOR=0.981;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=150;TCF=87;TCR=63;TR=70;WE=50310474;WS=50310456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,71:0.46:156
chr20	50310483	rs143733288	A	ATC	2704.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.024;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.07;MQRankSum=1.088;NF=25;NR=32;PP=2575;ReadPosRankSum=0.866;SC=CCCCCCAGGTATGAGTTTGAG;SOR=0.800;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=128;TCF=52;TCR=76;TR=57;WE=50310491;WS=50310473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,71:0.46:153
chr20	50310709	rs6013259	G	A	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.983;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=32;PP=697;ReadPosRankSum=-0.164;SC=TCTGGGCAGCGTCTGCTCTGG;SOR=0.948;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=71;TCF=5;TCR=66;TR=34;WE=50310717;WS=50310699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,34:0.48:71
chr20	50314200	rs1205690	A	G	466.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=383;ReadPosRankSum=-0.310;SC=TTCAACCGCTACAGAGGCCGT;SOR=0.811;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=17;WE=50314208;WS=50314190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,18:0.53:34
chr20	50329416	rs1205698	T	C	2891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=78;NR=11;PP=2432;SC=TTCCCACACCTGCGGCCCGGG;SOR=3.816;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=78;TCR=11;TR=89;WE=50329424;WS=50329406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr20	50329704	rs1205699	G	A	1985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=2;NR=56;PP=1617;SC=CAGGAAAGGCGAGAGGTCACT;SOR=5.960;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=58;TCF=2;TCR=56;TR=58;WE=50329712;WS=50329694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr20	50342285	rs1205708	A	G	1483.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=6;PP=1168;ReadPosRankSum=0.074;SC=CCAGATGCCTAAGTGAGAGAA;SOR=0.608;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=90;TCR=11;TR=52;WE=50342293;WS=50342275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,53:0.52:102
chr20	50342555	rs1205709	C	T	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=56;PP=1681;SC=TGAATAACATCTAAAAACATT;SOR=5.856;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=58;TCF=2;TCR=56;TR=58;WE=50342563;WS=50342545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr20	50401355	rs58347405	G	A	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.707;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=10;PP=224;ReadPosRankSum=0.931;SC=GACTTACAGCGGGGTTATGCC;SOR=1.112;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=10;WE=50401363;WS=50401345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr20	50406742	.	G	A	2729.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.666;ClippingRankSum=0.000;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=46;PP=2270;ReadPosRankSum=2.306;SC=ATGAGTCGTTGGTCAAGCCAT;SOR=0.673;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=203;TCF=108;TCR=95;TR=101;WE=50406750;WS=50406732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,103:0.50:205
chr20	50407162	rs6021437	T	C	3131.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.039;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.441;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-3.860;NF=73;NR=57;PP=2295;ReadPosRankSum=0.696;SC=TCTTAATGGATGTGTTGGTTC;SOR=0.649;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=271;TCF=154;TCR=117;TR=130;WE=50407170;WS=50407152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,132:0.48:277
chr20	50407502	rs6126344	A	C	2045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.876;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=41;PP=1512;ReadPosRankSum=0.613;SC=CCCAGGCTGCAGGTCACCGGG;SOR=0.655;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=168;TCF=86;TCR=82;TR=84;WE=50407510;WS=50407492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,86:0.51:170
chr20	50408482	rs6013281	A	G	5028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=81;PP=2965;SC=GCAAGGTCACATTAGTGTTGG;SOR=0.742;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=164;TCF=83;TCR=81;TR=164;WE=50408490;WS=50408472;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
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chr20	50668746	rs201746789	CTTTATATTTATATA	C	410.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.908;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.77;MQRankSum=0.603;QD=34.23;ReadPosRankSum=-1.161;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,11:0.92:12
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chr20	50734238	rs67904269	T	C	2656.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.180;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=42;PP=1792;ReadPosRankSum=1.155;SC=AAGTGCAGCATGGGTGTGGAC;SOR=0.990;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=191;TCF=111;TCR=80;TR=107;WE=50734246;WS=50734228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,112:0.57:195
chr20	50734367	rs2180366	T	C	290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=208;ReadPosRankSum=-0.345;SC=CCTCTGCTTGTTCTGTCACTC;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=12;WE=50734375;WS=50734357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
chr20	50768672	rs3838014	GT	G	620.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.797;NF=23;NR=3;PP=509;ReadPosRankSum=-0.970;SC=CACTCCTTTTGTTTTTTTAAG;SOR=0.493;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=86;TCF=74;TCR=12;TR=26;WE=50768680;WS=50768662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,32:0.39:82
chr20	50769183	rs3746415	G	A	5163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=324;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.563;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=103;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.121;SC=TCACTGCAGCGGCGGCAGCCT;SOR=0.835;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=316;TCF=154;TCR=162;TR=189;WE=50769191;WS=50769173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,194:0.60:322
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chr20	50769549	rs3746413	A	G	2132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.091;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=51;PP=1646;ReadPosRankSum=-0.555;SC=CCATGTCCCCATGGAACTTCT;SOR=0.584;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=201;TCF=91;TCR=110;TR=95;WE=50769557;WS=50769539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,94:0.46:203
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chr20	50771635	rs1555328	C	A	161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=147;ReadPosRankSum=1.996;SC=ATAGTTATTACAGAGAAAAAA;SOR=0.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=6;WE=50771643;WS=50771625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
chr20	50775605	rs6021760	G	C	1717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-5.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=12;PP=1320;ReadPosRankSum=1.093;SC=GATCCCCAGGGAAATCTGAAA;SOR=0.754;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=89;TCR=21;TR=64;WE=50775613;WS=50775595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,66:0.57:115
chr20	50777026	rs3818198	A	G	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.465;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=22;PP=479;ReadPosRankSum=-0.425;SC=AGAATATTCCAAAAACCCTAA;SOR=0.194;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=59;TCF=3;TCR=56;TR=24;WE=50777034;WS=50777016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,26:0.42:62
chr20	50781298	rs72411807	T	TAA	2023.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.528;HP=11;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-1.164;NF=54;NR=3;PP=730;ReadPosRankSum=0.564;SC=ATTGGCAACCTAAAAAAAAAA;SOR=0.192;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=195;TCF=180;TCR=15;TR=57;WE=50781306;WS=50781288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,73:0.46:160
chr20	50781725	rs6021770	G	A	2246.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.105;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=55;PP=1763;ReadPosRankSum=-0.218;SC=AAAGGACATCGGTGGGACACT;SOR=1.004;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=198;TCF=75;TCR=123;TR=80;WE=50781733;WS=50781715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,87:0.41:211
chr20	50782102	rs2038429	T	C	1671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.896;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=51;PP=1300;ReadPosRankSum=-0.743;SC=GGAAAGAAAATTCTTACTGGA;SOR=2.020;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=107;TCF=7;TCR=100;TR=53;WE=50782110;WS=50782092;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,58:0.50:115
chr20	50782303	rs6021771	A	G	781.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.992;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=581;ReadPosRankSum=-0.026;SC=GTAGTTTGGAACACATCCATG;SOR=0.360;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=25;WE=50782311;WS=50782293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,27:0.59:46
chr20	50782343	rs6021772	C	A	1256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.549;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=7;PP=890;ReadPosRankSum=1.242;SC=TGAGGAGGAGCCCTGGAGCCT;SOR=1.270;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=90;TCF=72;TCR=18;TR=45;WE=50782351;WS=50782333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,49:0.52:94
chr20	50782608	rs2273472	G	T	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.650;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=34;PP=785;ReadPosRankSum=-0.848;SC=ATAAATGCCCGCTAGCTATGG;SOR=0.268;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=76;TCF=6;TCR=70;TR=38;WE=50782616;WS=50782598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,39:0.49:79
chr20	51870849	rs739870	T	C	2698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.181;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=50;PP=2089;ReadPosRankSum=-0.725;SC=GCGACTCCTTTGATTCCCTCC;SOR=0.781;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=194;TCF=100;TCR=94;TR=107;WE=51870857;WS=51870839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,108:0.53:202
chr20	52185814	rs4602270	C	A	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.120;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=257;ReadPosRankSum=0.309;SC=CTAAGGAAAACAACATTTTTT;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=12;WE=52185822;WS=52185804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr20	52188399	rs139374346	G	GA	689.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.460;HP=10;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.526;NF=1;NR=29;PP=403;ReadPosRankSum=-1.671;SC=TTTCCTGATTGAAAAAAAAAA;SOR=0.025;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=2;TCR=79;TR=30;WE=52188407;WS=52188389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,34:0.47:72
chr20	52557934	rs74179252	G	GGT	515.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.96;MQRankSum=-2.675;QD=19.84;ReadPosRankSum=0.840;SOR=0.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,19:0.73:26
chr20	52557950	.	T	TGTGTGTGTGCGCGCGC	470	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=23;MQ=59.27;NF=24;NR=3;PP=470;QD=17.5925925926;SC=TGTGTGTGTGTGTGTGTGCGC;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=27;WE=52557966;WS=52557940;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,27:0.77:35
chr20	52557958	.	CG	TG	439	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MMLQ=23;MQ=59.59;NF=22,22;NR=3,7;PP=200,439;QD=9.4;SC=TGTGTGTGTGCGCGTGTGTGT;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=25,29;WE=52557966;WS=52557940;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:8,29:0.78:37
chr20	52557958	.	CG	CGCGCGCGTGTGTGTG	1916.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22,22;NR=3,7;PP=200,439;SC=TGTGTGTGTGCGCGTGTGTGT;SOR=3.675;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=25,29;WE=52557966;WS=52557940;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:34
chr20	52561469	rs1055246	A	G	5170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.152;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=120;NR=33;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.137;SC=GTTTACTTGGATTTGCCAACT;SOR=2.665;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=155;TCF=121;TCR=34;TR=153;WE=52561477;WS=52561459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,161:0.99:163
chr20	52561702	rs4811486	C	T	1724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=49;PP=1438;SC=TGCCCGGGTTCGATACCCAGT;SOR=6.518;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=50;TCF=1;TCR=49;TR=50;WE=52561710;WS=52561692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr20	52592140	rs11474654	G	GTA,GTATA	1338.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0,0;NR=32,32;PP=721,579;ReadPosRankSum=0.543;SC=AATGAAAACGGTATATATATA;SOR=5.084;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=0;TCR=62;TR=32,32;WE=52592148;WS=52592130;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.51,0.44:39
chr20	52645534	rs466264	T	C	1901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=52;PP=1374;SC=ACATAAACAGTGGTTATTCAG;SOR=2.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=12;TCR=52;TR=64;WE=52645542;WS=52645524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr20	52674537	.	AT	A	85.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.177;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.45;ReadPosRankSum=0.476;SOR=0.573;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr20	52674615	rs465184	A	G	1257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.856;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.891;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=11;PP=1041;ReadPosRankSum=0.819;SC=TTCCCAGAGTAGCACTGACCT;SOR=0.580;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=101;TCF=80;TCR=21;TR=48;WE=52674623;WS=52674605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,49:0.48:103
chr20	52675188	rs394732	G	T	535.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.061;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=407;ReadPosRankSum=0.772;SC=TACACTACCTGGTAAGTCTCT;SOR=2.712;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=19;WE=52675196;WS=52675178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr20	52675259	rs2020975	G	T	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.835;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.250;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=723;ReadPosRankSum=-1.188;SC=GTTACCCATTGCTCCTATAAT;SOR=1.085;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=59;TCF=35;TCR=24;TR=32;WE=52675267;WS=52675249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,32:0.55:58
chr20	52684837	rs3787551	G	T	916.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.038;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=653;ReadPosRankSum=1.189;SC=CTTAGAGCTCGCTCTCATAGT;SOR=0.952;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=83;TCF=61;TCR=22;TR=32;WE=52684845;WS=52684827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,35:0.41:85
chr20	52685084	rs290446	T	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=51;ReadPosRankSum=0.245;SC=TCACACACATTGTCTCCTTTT;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=6;WE=52685092;WS=52685074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr20	52774579	rs1570670	A	G	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=4.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=476;ReadPosRankSum=-0.687;SC=TGCAAAGTGTATCTTCCAAGG;SOR=0.586;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=23;WE=52774587;WS=52774569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,24:0.47:51
chr20	52774601	rs2274130	A	G	991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=5.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.746;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=2;PP=723;ReadPosRankSum=0.392;SC=TTTGTAAGGTATAGAATATAC;SOR=1.513;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=68;TCF=62;TCR=6;TR=34;WE=52774609;WS=52774591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,36:0.51:70
chr20	52774903	rs2274132	G	A	316.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=250;ReadPosRankSum=-0.888;SC=TCTTGAGTTAGTTAAAACCCC;SOR=0.368;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=12;WE=52774911;WS=52774893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chr20	52775528	rs2296239	C	T	3884.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=363;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.380;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=76;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.915;SC=CTTTTAAATACGGCATATTCC;SOR=0.646;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=337;TCF=164;TCR=173;TR=152;WE=52775536;WS=52775518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:199,160:0.45:359
chr20	52775728	rs2296240	A	G	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=538;ReadPosRankSum=-0.543;SC=TATTAGCTGAAAAAAAGGTGA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=23;WE=52775736;WS=52775718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,24:0.55:44
chr20	52779082	.	C	T	356	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=17;NR=0;PP=356;QD=22.9865419145;SC=GGCACCGTGGCATAGATGCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=17;WE=52779090;WS=52779072;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:11,17:0.61:28
chr20	52786073	rs4809960	T	C	2161.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.832;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=13;PP=1612;ReadPosRankSum=-0.072;SC=AAAAGAGCCATGTTTTATCCG;SOR=0.481;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=161;TCF=140;TCR=21;TR=85;WE=52786081;WS=52786063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,86:0.51:169
chr20	52786219	rs2296241	G	A	3429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.630;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=91;PP=2743;ReadPosRankSum=0.113;SC=CCATAAAATCGGCCAAGACCT;SOR=1.016;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=245;TCF=75;TCR=170;TR=125;WE=52786227;WS=52786209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,130:0.51:254
chr20	52788314	rs2259735	T	C	1164.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.331;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=38;PP=810;ReadPosRankSum=-0.125;SC=AAACAAACACTGAGAATCATG;SOR=0.607;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=21;TCR=68;TR=50;WE=52788322;WS=52788304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,49:0.55:89
chr20	52789743	rs2248137	C	G	728.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=547;ReadPosRankSum=-1.282;SC=GGGGACCCTCCCTGCCCAGAC;SOR=0.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=54;TCR=8;TR=30;WE=52789751;WS=52789733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,32:0.51:63
chr20	52831705	rs1964861	G	C	409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-5.263;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.074;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=281;ReadPosRankSum=1.868;SC=TACAAATTAAGGTCTTATTCT;SOR=0.059;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=40;TCF=38;TCR=2;TR=17;WE=52831713;WS=52831695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr20	52840743	rs11472518	C	CTT	2502.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.614;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=5.390;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.17;MQRankSum=1.553;QD=23.17;ReadPosRankSum=-0.936;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:11,97:0.90:108
chr20	52841011	rs13039589	A	G	609.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-5.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=445;ReadPosRankSum=0.540;SC=TAGTTGGGGTAGGCAAAAACA;SOR=0.902;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=20;WE=52841019;WS=52841001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,22:0.55:40
chr20	53259964	rs6064099	G	C	1714.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.564;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=17;PP=1420;ReadPosRankSum=0.124;SC=CCCCAGTGTTGCTGACGCACA;SOR=1.571;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=127;TCF=82;TCR=45;TR=63;WE=53259972;WS=53259954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,64:0.49:130
chr20	54578843	rs422330	C	G	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-6.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=1;PP=402;ReadPosRankSum=-1.060;SC=TCCCCATTTCCCAATCGGACC;SOR=0.223;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=24;WE=54578851;WS=54578833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,25:0.51:49
chr20	54823779	rs13044293	G	T	2743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=18;PP=2205;SC=AAACTCTAAGGCCAGATTGAA;SOR=2.557;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=67;TCR=18;TR=85;WE=54823787;WS=54823769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr20	54823805	rs3746619	C	A	1317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.878;HP=1;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=8;PP=951;ReadPosRankSum=-0.371;SC=ATCCAAAAGACGTATCTGGAG;SOR=1.368;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=122;TCF=94;TCR=28;TR=48;WE=54823813;WS=54823795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,52:0.42:125
chr20	54824029	rs3827103	G	A	4950.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=391;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.098;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=105;NR=84;PP=2962;ReadPosRankSum=0.328;SC=CAAGCCCGAGGTTTTCCTGTC;SOR=0.887;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=379;TCF=200;TCR=179;TR=189;WE=54824037;WS=54824019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:191,196:0.51:387
chr20	54935064	rs76529327	G	T	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-5.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=423;ReadPosRankSum=-0.920;SC=CACCTTCCCAGCAAGAGTTTG;SOR=0.648;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=38;TCR=0;TR=19;WE=54935072;WS=54935054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr20	54935242	rs17362677	A	T	2954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=285;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.435;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=64;PP=2035;ReadPosRankSum=0.223;SC=CTCCAGTCCGACAGGTGGCAC;SOR=0.644;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=278;TCF=130;TCR=148;TR=121;WE=54935250;WS=54935232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,126:0.44:284
chr20	54940356	rs17362970	T	C	927.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-4.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=34;PP=632;ReadPosRankSum=0.721;SC=TGTTTTTTACTGTCATGTAAG;SOR=0.651;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=11;TCR=63;TR=40;WE=54940364;WS=54940346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,43:0.53:81
chr20	54940427	rs111968423	A	G	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.811;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=3.080;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=-1.083;QD=14.31;ReadPosRankSum=0.940;SOR=2.049;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr20	54940436	rs60905780	G	C	382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=-1.004;QD=17.40;ReadPosRankSum=1.552;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,10:0.45:22
chr20	54940952	rs113828299	G	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.929;NF=6;NR=0;PP=61;ReadPosRankSum=-0.645;SC=CTCCCACCTCGGCCTCCCAAA;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=6;WE=54940960;WS=54940942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr20	54940961	.	AAGTGCTAGGATTACAGGCGTGAGCCACTGCACCTGGCCACTAAGACTTTTATTCATTCAGCTACTTCATTACATTTTTTAAAATACTGTAAATCTTAT	A	345.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.971;ClippingRankSum=0.000;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=14.253;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.86;MQRankSum=-2.437;QD=3.06;ReadPosRankSum=-0.113;SOR=2.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:97,16:0.14:113
chr20	54941087	rs16979815	C	T	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FS=15.824;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-1.907;QD=4.19;ReadPosRankSum=-0.984;SOR=2.472;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,22:0.21:104
chr20	54941124	rs6099114	T	C	725.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.080;HP=6;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.212;NF=23;NR=10;PP=580;ReadPosRankSum=1.197;SC=TCTTCCCCCCTAGTGGTGTGG;SOR=1.743;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=109;TCF=60;TCR=49;TR=33;WE=54941132;WS=54941114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,33:0.29:114
chr20	54941140	rs6099115	C	T	829.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.130;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.109;NF=22;NR=15;PP=659;ReadPosRankSum=1.098;SC=TGTGGACATGCCTGCAATCCT;SOR=1.051;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=100;TCF=52;TCR=48;TR=37;WE=54941148;WS=54941130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,37:0.35:105
chr20	54945783	rs10485805	A	G	1030.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.716;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.978;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.406;NF=11;NR=31;PP=827;ReadPosRankSum=0.574;SC=GCTAACAATCATTAAAGAGTC;SOR=0.479;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=84;TCF=21;TCR=63;TR=42;WE=54945791;WS=54945773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,42:0.50:84
chr20	54956707	rs6024840	A	G	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=139;ReadPosRankSum=-0.380;SC=CAAACTCTTCATGTAAAACCA;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=8;WE=54956715;WS=54956697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr20	54959296	rs2298016	G	C	894.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.811;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=699;ReadPosRankSum=1.436;SC=TAGTAGAACAGTACAGAACTT;SOR=0.492;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=80;TCF=31;TCR=49;TR=34;WE=54959304;WS=54959286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,36:0.42:85
chr20	54961463	rs1047972	T	C	3371.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=20;PP=2730;SC=TGCAAAGGAATGCGCTGGGAA;SOR=2.812;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=81;TCR=20;TR=100;WE=54961471;WS=54961453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr20	54961541	rs2273535	A	T	2923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.456;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.051;NF=74;NR=49;PP=2292;ReadPosRankSum=0.232;SC=TGACAAGGAAATTGCTGAGTC;SOR=0.752;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=259;TCF=156;TCR=103;TR=123;WE=54961549;WS=54961531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,125:0.47:265
chr20	54963149	rs67542863	C	CGACAAGACCAACCTCCATGTGGGTTTATAAATGTGAATGAGATTACAGATTATTCAATTTA	5496.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=134.07;SOR=1.666;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr20	54974424	rs2426617	C	A	3215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=77;PP=2729;SC=GTATGTGAGACGTTGATGTTA;SOR=2.833;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=95;TCF=18;TCR=77;TR=95;WE=54974432;WS=54974414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr20	55012154	rs8117984	G	C	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=3.399;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.22;ReadPosRankSum=-1.955;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr20	55012160	rs77539228	A	T	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=3.493;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.70;ReadPosRankSum=-1.001;SOR=0.139;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,17:0.45:38
chr20	55012318	rs911159	G	A	3177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.812;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=53;PP=2334;ReadPosRankSum=-1.219;SC=AGCAACACGTGCCAGAAAGCG;SOR=1.022;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=250;TCF=136;TCR=114;TR=126;WE=55012326;WS=55012308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,131:0.51:259
chr20	55025512	rs6024884	C	G	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.394;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=3;PP=675;ReadPosRankSum=-0.131;SC=TCTACCATTACAGCATCATGA;SOR=0.473;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=46;TCF=42;TCR=4;TR=29;WE=55025520;WS=55025502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,30:0.62:48
chr20	55025762	rs6069753	G	A	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.369;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=28;PP=813;ReadPosRankSum=1.315;SC=GCTAAGGTGCGGTGTTATGAA;SOR=0.431;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=66;TCF=15;TCR=51;TR=37;WE=55025770;WS=55025752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,39:0.56:70
chr20	55048496	rs11471796	T	TGAG	2613.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.071;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.323;NF=9;NR=36;PP=2489;ReadPosRankSum=-0.098;SC=TAAGTGATTTTGAGAATTTTG;SOR=1.981;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=54;TCF=10;TCR=44;TR=45;WE=55048504;WS=55048486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,61:0.97:63
chr20	55070268	rs34552628	A	T	1926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.851;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.475;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=20;PP=1585;ReadPosRankSum=1.582;SC=CTTTACATCCATCATGAACAT;SOR=0.408;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=149;TCF=112;TCR=37;TR=70;WE=55070276;WS=55070258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,72:0.47:152
chr20	55070539	rs3827107	G	C	455.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=344;ReadPosRankSum=1.186;SC=AGTGCTTTTGGGGGTGGGAGC;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=17;WE=55070547;WS=55070529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr20	55071639	rs6069763	A	G	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=5;PP=1062;SC=CAATCAATCTATCTGCTGCTG;SOR=3.500;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=37;WE=55071647;WS=55071629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
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chr20	55748206	rs2148328	G	A	2388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=22;PP=1927;SC=TGGTGGCCCCGCAGCCTGCCC;SOR=1.802;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=53;TCR=22;TR=75;WE=55748214;WS=55748196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
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chr20	55918014	rs2236330	A	G	339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=252;SC=CACGACTAACATAAGTGTTGT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=55918022;WS=55918004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr20	55929881	rs4811837	T	C	6798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=127;PP=2965;SC=ATGTAAGTGCTCCTTAAATAC;SOR=1.355;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=202;TCF=75;TCR=127;TR=202;WE=55929889;WS=55929871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr20	56064099	rs116593113	TT	CC	2186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=6;PP=2420;SC=GTTATTTTTCTTCAGCGAGGC;SOR=3.442;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=49;TCF=41;TCR=8;TR=43;WE=56064108;WS=56064089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr20	56064132	rs62204252	C	T	1262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.499;HP=2;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.063;NF=40;NR=6;PP=949;ReadPosRankSum=1.436;SC=AGTGCCCGTACGGCTCTCACT;SOR=1.211;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=90;TCF=76;TCR=14;TR=46;WE=56064140;WS=56064122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,48:0.53:91
chr20	56064157	rs6128051	C	T	3891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.509;NF=92;NR=28;PP=2965;ReadPosRankSum=0.842;SC=CCGGCGCTGTCTCTATGGAGC;SOR=0.785;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=122;TCF=94;TCR=28;TR=120;WE=56064165;WS=56064147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,122:0.98:124
chr20	56064267	rs6099656	T	C	2844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.681;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=81;PP=2085;ReadPosRankSum=-0.794;SC=CTGTGCAAGATGTCTACGATA;SOR=1.773;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=98;TCF=15;TCR=83;TR=96;WE=56064275;WS=56064257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,101:0.99:102
chr20	56071399	rs62204254	C	T	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=537;SC=CCAACATCATCCTTCCTGTAC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=56071407;WS=56071389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr20	56071416	rs62204255	C	A	114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=2.625;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=48;ReadPosRankSum=-0.712;SC=GTACAGCCTGCGGAACTATGA;SOR=0.551;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=4;WE=56071424;WS=56071406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr20	56075580	rs6099660	C	T	621.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=434;SC=GCTGGTGTACCGGCAGAGCAG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=56075588;WS=56075570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr20	56078690	rs6128059	G	A	2057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=50;PP=1564;SC=CACACAAGGCGAGTGAGATGG;SOR=3.947;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=59;TCF=8;TCR=51;TR=58;WE=56078698;WS=56078680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr20	56083606	rs55924405	T	C	2493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.459;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=79;NR=7;PP=2028;ReadPosRankSum=1.514;SC=GACACTGTCCTCCTGAGATAG;SOR=1.267;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=158;TCF=141;TCR=17;TR=86;WE=56083614;WS=56083596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,88:0.55:159
chr20	56136536	rs1042521	A	G	4803.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=95;PP=2965;SC=TGGACAGCCTACCCCAGGCAG;SOR=1.546;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=144;TCF=49;TCR=95;TR=144;WE=56136544;WS=56136526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr20	56137798	rs1062600	G	A	3090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.15;SOR=1.512;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr20	56137807	rs1042523	A	G	3317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.65;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr20	56137834	rs1062601	A	G	2864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=37;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=38;PP=2214;SC=TGACGGATTCACCCTACGTGG;SOR=1.145;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=59;TCR=39;TR=96;WE=56137842;WS=56137824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr20	56137895	rs707555	G	C	3522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=58;PP=2743;SC=CCTGGAAGCAGTGGGCGATGG;SOR=0.804;Source=Platypus;TCR=59;TR=107;WE=56137903;WS=56137885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr20	56138040	rs2070755	G	C	4001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=40;PP=2965;SC=GGACCCCCAAGCAGGGCCCTG;SOR=1.590;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=82;TCR=40;TR=122;WE=56138048;WS=56138030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr20	56139403	rs2070756	T	C	8156.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=276;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.238;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=147;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.903;SC=TAGCTTCAGGTGTCACCATCA;SOR=0.402;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=273;TCF=126;TCR=147;TR=272;WE=56139411;WS=56139393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,273:1.00:274
chr20	56139967	rs1023049	C	T	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=81;ReadPosRankSum=1.024;SC=GCTTGGTGAACGCAAAACTAG;SOR=0.399;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=6;WE=56139975;WS=56139957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr20	56140980	rs1042531	T	G	434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.485;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=352;ReadPosRankSum=0.313;SC=CACCACACCGTGAGCAGATCT;SOR=2.059;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=16;WE=56140988;WS=56140970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
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chr20	56179586	rs6123710	G	A	4886.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=82;NR=71;PP=2965;SC=CCTAGCATGCGCCCACCCCCA;SOR=0.798;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=155;TCF=82;TCR=73;TR=153;WE=56179594;WS=56179576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
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chr20	56228019	rs8183538	G	C	1465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=6;PP=1179;ReadPosRankSum=-0.728;SC=AGCCCACACTGTTCCAGCCGC;SOR=2.215;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=44;WE=56228027;WS=56228009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
chr20	56265389	rs1556175	G	A	1923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.221;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=24;PP=1399;ReadPosRankSum=0.305;SC=ACTGCCACCCGCCCTGCATCA;SOR=0.684;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=148;TCF=103;TCR=45;TR=75;WE=56265397;WS=56265379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,79:0.52:152
chr20	56726107	rs6070358	C	T	11190.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=376;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=192;NR=175;PP=2965;SC=TGGGATCGGGCAACGCGGTGG;SOR=0.777;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=369;TCF=194;TCR=175;TR=367;WE=56726115;WS=56726097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,371:1.00:371
chr20	56728780	rs45572335	C	T	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=25;PP=456;ReadPosRankSum=0.436;SC=AACTAAAGAGCATGTTGTAGG;SOR=0.360;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=2;TCR=62;TR=26;WE=56728788;WS=56728770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,25:0.40:63
chr20	56793546	rs583987	A	G	1818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=8;PP=1417;SC=CGTTCCCACCAGGAGCTAATG;SOR=3.477;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=55;TCR=8;TR=63;WE=56793554;WS=56793536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr20	56793706	rs584855	G	A	4090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=71;PP=2965;SC=TGGTTCAGGCGGTGTGCAATG;SOR=0.929;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=128;TCF=57;TCR=71;TR=128;WE=56793714;WS=56793696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr20	56793764	rs1192511	G	A	3088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=68;PP=2323;SC=TGGAGGCCCCGTGCTGGAGCA;SOR=1.728;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=29;TCR=68;TR=97;WE=56793772;WS=56793754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr20	56796266	rs8122848	A	G	219.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.863;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=376;ReadPosRankSum=-0.349;SC=GGGGACCCTGACTGGTGGCTG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=8;WE=56796275;WS=56796256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chr20	56796267	rs521615	C	T	39.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=106;ReadPosRankSum=0.349;SC=GGGACCCTGACTGGTGGCTGA;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=3;WE=56796275;WS=56796256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,3:0.27:11
chr20	56796386	rs41275660	A	C	1376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.758;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=18;PP=965;ReadPosRankSum=0.265;SC=GCTTTCTACCAGAATTACCGT;SOR=0.611;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=107;TCF=73;TCR=34;TR=53;WE=56796394;WS=56796376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,57:0.51:111
chr20	56807969	rs3818744	A	G	1477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=41;PP=1213;SC=CAAAGAAGTCATTTCAGAATC;SOR=3.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=47;WE=56807977;WS=56807959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr20	56809652	rs619838	T	C	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.190;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=5;PP=388;ReadPosRankSum=1.263;SC=GTGCCCGCCATGACACATTAC;SOR=0.892;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=24;WE=56809660;WS=56809642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,24:0.43:56
chr20	56810446	rs633276	A	G	2476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=78;PP=2194;ReadPosRankSum=0.547;SC=AAAAACATCAAAAGAGCACAT;SOR=0.597;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=166;TCF=20;TCR=146;TR=89;WE=56810454;WS=56810436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,87:0.52:166
chr20	56810484	rs503900	C	T	1526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=7.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=56;PP=1301;ReadPosRankSum=0.888;SC=ATTTGAATTACGAATACTACT;SOR=0.712;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=113;TCF=6;TCR=107;TR=59;WE=56810492;WS=56810474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,56:0.50:111
chr20	56811400	rs474212	C	A	1436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.025;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.094;NF=0;NR=60;PP=984;ReadPosRankSum=1.007;SC=GGCAAAAAAACAAAATTATTG;SOR=5.926;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=0;TCR=62;TR=60;WE=56811408;WS=56811389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,57:0.97:59
chr20	56815878	rs514706	A	T	234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.792;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=154;ReadPosRankSum=0.335;SC=TTTTAAGTGCAAAGGAAAATT;SOR=0.481;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=9;WE=56815886;WS=56815868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chr20	56820702	rs595292	G	T	3807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=9;PP=2965;ReadPosRankSum=0.291;SC=CCTCTCAATGGGTATACAGTG;SOR=3.424;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=113;TCR=9;TR=120;WE=56820710;WS=56820692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,117:0.99:118
chr20	56820880	rs3746406	C	T	10003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=102;NR=205;PP=2965;SC=CTGCAAGCTACCAAGGACTTT;SOR=1.694;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=307;TCF=102;TCR=205;TR=307;WE=56820888;WS=56820870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,315:1.00:315
chr20	56821127	rs3746405	A	G	2381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=39;SC=AGCTTTGAGCAGGCGCTGGTC;SOR=0.846;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=74;TCF=35;TCR=39;TR=74;WE=56821135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr20	56822236	rs1541117	C	A	1104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=2;PP=930;SC=TTACTTTTTGCTTCTTTACAT;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=33;WE=56822244;WS=56822226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr20	56822536	rs4811972	G	A	1170.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=3;NR=31;PP=1003;SC=TGAAGGGGCCGAGGGACTGGA;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=34;WE=56822544;WS=56822526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr20	56823390	rs11471230	GTTTT	G	2683.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=66;PP=2162;SC=AGCAGAACCTGTTTTTTTTAT;SOR=3.855;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=91;TCF=7;TCR=84;TR=72;WE=56823401;WS=56823380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
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chr20	56846580	rs6015238	T	A	1685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.05;SOR=2.540;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr20	56861637	rs6026181	A	G	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=485;SC=GAATCGCAACATTGAGAATTC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=56861645;WS=56861627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr20	56934551	rs77740075	CT	C	488.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=9.294;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.41;MQRankSum=1.097;QD=8.28;ReadPosRankSum=-1.194;SOR=0.043;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,41:0.69:59
chr20	57009796	rs2234487	C	T	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-3.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=387;ReadPosRankSum=-1.183;SC=TTTTCAGTAACAATAATTTAA;SOR=1.101;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=17;WE=57009804;WS=57009786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,18:0.58:31
chr20	57011383	rs201039529	CTTTTTTTTTTTTTT	C	237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.63;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr20	57244493	rs2296524	G	A	1853.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=39;PP=1319;ReadPosRankSum=-0.706;SC=GGCACGCACAGTCAGGCTACC;SOR=0.660;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=179;TCF=90;TCR=89;TR=78;WE=57244501;WS=57244483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,79:0.44:180
chr20	57246480	rs11474130	T	TTTA	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.74;ReadPosRankSum=1.136;SOR=0.083;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,4:0.20:20
chr20	57266592	rs6128401	C	G	914.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.347;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=21;PP=652;ReadPosRankSum=-0.853;SC=GCTGAGCAGACAGACCTGGAG;SOR=0.425;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=59;TCF=16;TCR=43;TR=30;WE=57266600;WS=57266582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,34:0.52:65
chr20	57266700	rs6123822	T	C	744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.619;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=6;PP=531;ReadPosRankSum=-0.008;SC=GGAAAACCTCTCACACCACGC;SOR=0.377;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=24;WE=57266708;WS=57266690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,27:0.49:55
chr20	57266770	.	TCA	T	864.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.731;ClippingRankSum=0.000;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=66.823;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.58;MQRankSum=-5.761;QD=9.50;ReadPosRankSum=-4.318;SOR=6.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,39:0.43:91
chr20	57266781	rs6128402	C	T	753.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.886;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.897;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.199;NF=26;NR=13;PP=733;ReadPosRankSum=-0.442;SC=CATTTTTAGGCTGGTTATGAA;SOR=0.498;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=59;TCR=29;TR=39;WE=57266789;WS=57266771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,32:0.40:80
chr20	57266913	rs6123823	T	C	1913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=54;PP=1406;ReadPosRankSum=-0.854;SC=TTTAAATGACTCCTGGGTGGA;SOR=0.534;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=138;TCF=21;TCR=117;TR=65;WE=57266921;WS=57266903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,72:0.48:149
chr20	57267942	rs6092682	T	C	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=325;ReadPosRankSum=-0.601;SC=GGCCGGGGCGTGGGCCGGCAG;SOR=0.602;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=38;TCF=23;TCR=15;TR=19;WE=57267950;WS=57267932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,16:0.48:33
chr20	57268867	rs3746396	C	A	3647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.169;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=243;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.319;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=85;PP=2788;ReadPosRankSum=-2.855;SC=ACTACGCCACCGTGGCTGCCC;SOR=0.544;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=240;TCF=82;TCR=158;TR=134;WE=57268875;WS=57268857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,137:0.57:241
chr20	57268994	rs6100166	G	C	419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=321;ReadPosRankSum=0.037;SC=TGCTTCGAGAGGAGGCAGCCA;SOR=0.302;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=18;WE=57269002;WS=57268984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,19:0.56:34
chr20	57273545	rs6092683	G	A	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.977;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.540;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=3;PP=654;ReadPosRankSum=0.000;SC=TCTTTCTACAGGTGGCCGGTG;SOR=1.085;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=56;TCF=49;TCR=7;TR=30;WE=57273553;WS=57273540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,30:0.52:58
chr20	57273885	rs2296526	T	C	2461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=75;PP=1961;ReadPosRankSum=-0.426;SC=TGTCATAGACTCCCAGGAGAG;SOR=0.699;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=133;TCF=8;TCR=125;TR=80;WE=57273893;WS=57273875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,84:0.60:139
chr20	57274077	rs6092684	T	A	135.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.224;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.426;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=98;ReadPosRankSum=-1.753;SC=GAAATGAGAGTGTGTGGAGGG;SOR=2.272;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=15;TCF=9;TCR=6;TR=6;WE=57274085;WS=57274067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr20	57274151	rs2296528	G	C	398.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.868;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=324;ReadPosRankSum=-1.841;SC=TCCCCGACGCGGCACAGGCAG;SOR=2.948;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=34;TCR=3;TR=16;WE=57274159;WS=57274141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,16:0.41:39
chr20	57275949	rs6070554	A	C	1581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=4;PP=1312;SC=GGCAGGGAGCACCAGGCTCAG;SOR=4.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=47;WE=57275957;WS=57275939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr20	57280575	rs6100174	T	C	2146.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=188;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.351;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=51;PP=1567;ReadPosRankSum=-0.725;SC=ACGAATACAGTGGCTCCCGGA;SOR=0.953;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=184;TCF=86;TCR=98;TR=92;WE=57280583;WS=57280565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,93:0.50:185
chr20	57288744	rs1570894	G	A	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.248;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=7;PP=220;ReadPosRankSum=1.696;SC=GGAGCTGCCCGTCAAGCTTGG;SOR=0.260;SbPval=0.04;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=15;WE=57288752;WS=57288734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,15:0.33:46
chr20	57290347	rs6026468	C	G	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.480;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=304;ReadPosRankSum=1.548;SC=GGAGGGGGACCTGGGGAGGGA;SOR=1.284;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=18;WE=57290355;WS=57290337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr20	57292888	rs2426776	G	A	2278.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.482;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=58;PP=1590;ReadPosRankSum=-1.328;SC=TTTCCAGGTCGTGGCCACAGC;SOR=1.275;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=217;TCF=99;TCR=118;TR=95;WE=57292896;WS=57292878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,101:0.44:229
chr20	57293089	rs6026470	A	G	1898.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.146;HP=3;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.075;NF=52;NR=17;PP=1587;ReadPosRankSum=2.102;SC=GGCCTGGGAGAGGACCCAGAT;SOR=1.655;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=145;TCF=97;TCR=48;TR=69;WE=57293097;WS=57293079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,71:0.47:151
chr20	57293118	rs2426777	T	C	3558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.507;HP=2;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.077;NF=63;NR=23;PP=2962;ReadPosRankSum=0.105;SC=CCAGAACTGATGGAAAATCTC;SOR=1.651;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=181;TCF=115;TCR=66;TR=86;WE=57293132;WS=57293108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,88:0.47:188
chr20	57293124	rs10470038	A	AG	3727.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.443;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.926;HP=3;HapScore=3;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.731;NF=65;NR=26;PP=2966;ReadPosRankSum=-1.328;SC=CTGATGGAAAATCTCTCCCCA;SOR=1.798;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=183;TCF=111;TCR=72;TR=91;WE=57293132;WS=57293108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,98:0.49:199
chr20	57293350	rs12480759	G	T	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-6.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=39;PP=845;ReadPosRankSum=-0.294;SC=ATTCAGAAGGGACTGGGTGTT;SOR=0.719;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=81;TCF=6;TCR=75;TR=42;WE=57293358;WS=57293340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,42:0.51:83
chr20	57299030	rs201658287	GGAGGAGGAA	G	985.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=5.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.71;MQRankSum=2.660;QD=20.97;ReadPosRankSum=1.013;SOR=1.871;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,27:0.57:47
chr20	57415110	rs1800900	A	G	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=0;PP=443;ReadPosRankSum=1.155;SC=CTTCGGAGCCACTCTCTGCAG;SOR=0.572;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=56;TCR=0;TR=28;WE=57415118;WS=57415100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr20	57415995	rs1800905	A	G	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.865;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=51;PP=1162;ReadPosRankSum=-0.648;SC=GGAGCAGCGCAGGTGGAAAGG;SOR=0.403;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=137;TCF=28;TCR=109;TR=67;WE=57416003;WS=57415985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,68:0.48:142
chr20	57430477	rs73306256	C	G	599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=485;ReadPosRankSum=-0.124;SC=CTAGGGGCTCCGCAGTGGGAG;SOR=0.823;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=63;TCF=43;TCR=20;TR=30;WE=57430485;WS=57430467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,28:0.45:62
chr20	57474720	rs35714680	GCA	G	382.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=2;PP=310;SC=ACACACACACGCACACACATG;SOR=1.085;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=6;WE=57474729;WS=57474710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr20	57475191	rs13831	A	G	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=17;PP=509;SC=ACGAAAAATGAACTGAAATCC;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=20;WE=57475199;WS=57475181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr20	57478807	rs7121	C	T	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.418;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=43;PP=1248;ReadPosRankSum=0.551;SC=TGGACTACATCCTGAGTGTGA;SOR=0.502;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=123;TCF=39;TCR=84;TR=65;WE=57478815;WS=57478797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,65:0.51:127
chr20	57556295	rs151333	C	T	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.340;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=473;ReadPosRankSum=-0.807;SC=CCCGCCCGCCCGTCCCCGCCT;SOR=1.926;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=22;WE=57556303;WS=57556285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,22:0.54:41
chr20	57556488	rs3746703	C	T	1554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=45;PP=1208;ReadPosRankSum=0.732;SC=GCGGGCCGGCCCCACTCCCGG;SOR=0.807;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=98;TCF=24;TCR=74;TR=59;WE=57556496;WS=57556478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,61:0.62:99
chr20	57561416	rs6070683	T	G	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.61;MQRankSum=1.389;QD=11.24;ReadPosRankSum=1.205;SOR=1.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr20	57564070	rs2273360	C	T	3257.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.249;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=289;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.993;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=50;PP=2479;ReadPosRankSum=-0.045;SC=TGAACTTCACCGTTAAGGTAG;SOR=0.841;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=282;TCF=164;TCR=118;TR=127;WE=57564078;WS=57564060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,132:0.46:288
chr20	57564448	rs12479566	C	T	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=452;ReadPosRankSum=-1.512;SC=CCAGCGCACACTTACTCCACC;SOR=0.927;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=20;WE=57564456;WS=57564438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr20	57565943	rs163782	G	C	2895.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.795;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=37;PP=2219;ReadPosRankSum=-0.446;SC=TAGTAACGGGGTCTATGGTTT;SOR=0.547;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=214;TCF=148;TCR=66;TR=110;WE=57565951;WS=57565933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,113:0.52:219
chr20	57566637	rs149265	C	T	789.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=28;PP=665;ReadPosRankSum=-0.349;SC=TGTGTTTCTGCGTAGAGAAAG;SOR=0.729;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=28;WE=57566645;WS=57566627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,29:0.51:57
chr20	57569636	.	G	A	1091.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.833;ClippingRankSum=0.000;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=30.878;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.96;MQRankSum=-8.534;QD=7.63;ReadPosRankSum=-1.615;SOR=5.024;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,58:0.41:143
chr20	57569640	.	G	A	1045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.012;ClippingRankSum=0.000;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=27.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.78;MQRankSum=-9.986;QD=6.22;ReadPosRankSum=-5.314;SOR=4.522;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:116,52:0.31:168
chr20	57569860	rs1043219	C	G	1511.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-8.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=55;PP=1229;ReadPosRankSum=-1.216;SC=AGGTGGATGACTTCTTTACAA;SOR=0.572;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=118;TCF=0;TCR=118;TR=55;WE=57569868;WS=57569850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,57:0.47:122
chr20	57570568	rs13720	G	A	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=0;PP=537;ReadPosRankSum=0.122;SC=CGCAGCCAGTGCCACGCTGTC;SOR=0.929;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=25;WE=57570576;WS=57570558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,25:0.56:45
chr20	57571763	rs9760	A	G	4999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-8.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=399;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.064;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=100;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.181;SC=ACCCAGCCACAGAAACGACAT;SOR=0.571;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=385;TCF=184;TCR=201;TR=204;WE=57571771;WS=57571753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,210:0.53:393
chr20	57572675	rs163785	A	G	1725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=6;PP=1383;SC=GACCATTTGCATAGATTTCTG;SOR=4.209;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=57;TCR=6;TR=63;WE=57572683;WS=57572665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr20	57582279	rs200474697	T	TCGGCCC	235.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.404;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.522;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=285;ReadPosRankSum=1.192;SC=GGCCTCGGCCTCGGCCCAGCA;SOR=2.179;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=5;WE=57582287;WS=57582269;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,7:0.50:14
chr20	57594684	rs34524896	C	T	1366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.041;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=40;PP=1043;ReadPosRankSum=0.928;SC=TCCATAGAGGCGGACAACCAA;SOR=0.967;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=145;TCF=53;TCR=92;TR=61;WE=57594692;WS=57594674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,61:0.41:150
chr20	57597970	rs463312	AG	CC	3979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.200;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=50;PP=2944;ReadPosRankSum=1.847;SC=TCGGCCTTGCAGCTGGAGAGA;SOR=0.555;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=226;TCF=97;TCR=129;TR=91;WE=57597979;WS=57597960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,107:0.44:243
chr20	57599016	rs163777	T	G	4686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=44;PP=2965;SC=TGTCGGACACTGTGGTGGAGC;SOR=1.929;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=156;TCF=112;TCR=44;TR=156;WE=57599024;WS=57599006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
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chr20	57610059	rs151358	C	A	785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=619;ReadPosRankSum=1.346;SC=CCAACTGTCACGATCACTTCT;SOR=1.067;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=46;TCR=0;TR=27;WE=57610067;WS=57610057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr20	57612390	rs151359	C	G	1033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.993;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=22;PP=791;ReadPosRankSum=0.701;SC=CTTACCAAGTCTATCAATATT;SOR=0.138;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=63;TCF=18;TCR=45;TR=35;WE=57612398;WS=57612380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,37:0.56:66
chr20	57613373	rs151360	T	C	1611.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=1;PP=1214;ReadPosRankSum=-0.673;SC=CATTATACACTCATAATTCAA;SOR=0.281;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=103;TCF=102;TCR=1;TR=53;WE=57613381;WS=57613363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,57:0.54:106
chr20	57613704	rs61329417	CA	C	352.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.570;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=1.376;QD=11.02;ReadPosRankSum=0.511;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,26:0.81:32
chr20	57617698	rs8121266	T	G	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.070;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.357;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=4;PP=455;ReadPosRankSum=-1.867;SC=GCCTCGCCTCTACTCCAGGGC;SOR=1.705;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=66;TCF=53;TCR=13;TR=29;WE=57617706;WS=57617688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr20	57767013	rs150575356	C	T	1640.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.931;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=23;PP=1303;ReadPosRankSum=-0.513;SC=GGAAGCCGTGCGCCCTGCAGC;SOR=1.011;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=148;TCF=88;TCR=60;TR=65;WE=57767021;WS=57767003;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,65:0.44:147
chr20	57767043	rs259984	G	C	1804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=30;PP=1319;ReadPosRankSum=-0.513;SC=CGACGGCAGCGGAGAAGCCCT;SOR=0.671;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=168;TCF=98;TCR=70;TR=74;WE=57767051;WS=57767033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,77:0.45:171
chr20	57768399	rs442091	T	C	1987.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.079;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=46;PP=1549;ReadPosRankSum=-1.171;SC=ATGTAGAGGCTCCCAGGCCAG;SOR=0.915;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=145;TCF=55;TCR=90;TR=68;WE=57768407;WS=57768389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,72:0.47:152
chr20	57768657	rs41276962	T	C	1800.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.746;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=36;PP=1405;ReadPosRankSum=0.347;SC=AGGATGCCGATCCCGGGGAGG;SOR=0.658;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=154;TCF=76;TCR=78;TR=68;WE=57768665;WS=57768647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,72:0.46:156
chr20	57768743	rs56057707	C	T	1795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.751;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=27;PP=1439;ReadPosRankSum=1.859;SC=TTGGCTGCTGCTTCTGTTGCC;SOR=1.163;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=161;TCF=85;TCR=76;TR=72;WE=57768751;WS=57768733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,73:0.44:166
chr20	57769140	rs55786258	G	C	2011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=29;PP=1659;ReadPosRankSum=1.492;SC=GGGCACAGTTGGGGGGGGACA;SOR=0.748;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=157;TCF=98;TCR=59;TR=76;WE=57769148;WS=57769130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,78:0.50:156
chr20	57769854	rs454356	A	G	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.954;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=590;ReadPosRankSum=-1.099;SC=TTGAGAGAGCATGTTGTTATC;SOR=0.384;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=44;TCF=4;TCR=40;TR=26;WE=57769862;WS=57769844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr20	57828923	rs259957	A	C	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.15;MQRankSum=-0.967;QD=6.29;ReadPosRankSum=-0.000;SOR=0.307;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
chr20	57828925	rs200010948	T	C	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.611;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=-1.150;QD=4.72;ReadPosRankSum=0.619;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,2:0.25:8
chr20	57829301	rs259956	T	C	2873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.865;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=42;PP=2299;ReadPosRankSum=0.321;SC=CAGTGCTGAATCACGAGACCA;SOR=1.101;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=202;TCF=115;TCR=87;TR=106;WE=57829309;WS=57829291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,107:0.52:205
chr20	57829821	rs3041675	C	CTT	2335.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.867;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.975;NF=3;NR=47;PP=2207;ReadPosRankSum=0.036;SC=AACATGGTGTCTGGTCAAAAA;SOR=0.799;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=111;TCF=10;TCR=101;TR=50;WE=57829829;WS=57829811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,60:0.52:115
chr20	58330128	rs1182477	G	C	1320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=0;PP=1213;SC=AGAGGGGTGGGGGACCACCCA;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=39;WE=58330136;WS=58330118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr20	58342130	rs2426831	T	A	793.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=1;PP=643;SC=AGGTCACTGCTCTGTATGCTC;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=22;WE=58342138;WS=58342120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr20	58411441	rs2426849	T	C	483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=12;NR=1;PP=366;SC=TTTCTCTCCTTCCAATTTTGG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=58411449;WS=58411431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr20	58420336	rs1416388	G	A	2302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.782;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.198;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=31;PP=1783;ReadPosRankSum=-0.815;SC=ATTTGTTTCTGTGAATTTCAT;SOR=1.073;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=197;TCF=125;TCR=72;TR=95;WE=58420344;WS=58420326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:106,94:0.47:200
chr20	58425413	rs2865768	C	T	4157.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=49;PP=2965;SC=AAATCCTAATCGTACTATTAA;SOR=1.301;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=80;TCR=49;TR=129;WE=58425421;WS=58425403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr20	58468790	rs55798744	G	A	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.264;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=24;ReadPosRankSum=-0.381;SC=TTTCATAAACGTTATGCCCGT;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=4;WE=58468798;WS=58468780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr20	58497481	.	TA	T	56.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.038;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=8.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.07;ReadPosRankSum=0.423;SOR=2.208;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,11:0.21:53
chr20	58587841	rs910695	A	C	469.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-5.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=364;ReadPosRankSum=-0.714;SC=ATCACTATTCAGGGATTTTTC;SOR=0.984;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=21;WE=58587849;WS=58587831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,21:0.57:37
chr20	58644995	rs6071100	T	C	2720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=8;PP=2284;SC=GAGGCTCTTCTGGGGCCAGCC;SOR=4.281;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=76;TCR=8;TR=83;WE=58645003;WS=58644985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
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chr20	59431577	rs67384675	TACACACACAC	T	619.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.573;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=12.338;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.46;MQRankSum=-2.174;QD=7.21;ReadPosRankSum=-1.862;SOR=3.098;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,22:0.26:86
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chr20	60293919	rs2892179	C	A	9797.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=124;NR=173;PP=2965;SC=TTCACTGTTCCTGCTGTCAGG;SOR=1.068;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=297;TCF=124;TCR=173;TR=297;WE=60293927;WS=60293909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,310:1.00:310
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chr20	60485327	rs1776237	C	T	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=1;PP=285;SC=TGGGCTGACACGGTGTGTTCT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=60485335;WS=60485317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr20	60485627	rs2427240	C	T	2984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=71;PP=2313;SC=TCCGCACAGACCCCGTAACCA;SOR=2.761;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=18;TCR=71;TR=89;WE=60485635;WS=60485617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr20	60498832	rs11484270	A	AC	1715.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=47;PP=1883;SC=GTCCAGAAATACCCCATGAAA;SOR=6.593;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=1;TCR=59;TR=48;WE=60498840;WS=60498822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
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chr20	60509387	rs3827115	T	A,G	2208.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=60.00;QD=36.21;SOR=2.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:0,35,26:0.57,0.43:61
chr20	60509387	.	TG	AA,GG	1415	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000,0.5000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=6,4;NR=24,21;PP=1415,1186;QD=48.9489291621;SC=CTGCCGTGGGTGGGAGGCAGC;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=55;TCF=10;TCR=45;TR=30,25;WE=60509396;WS=60509377;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.55:55
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chr20	60511737	rs4925323	T	C	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.239;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=22.12;ReadPosRankSum=1.071;SOR=0.346;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,9:0.60:15
chr20	60512028	rs3761222	G	C	1233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.491;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.442;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=44;PP=1015;ReadPosRankSum=0.415;SC=GGACCGAAGTGAGAGCCGTGC;SOR=1.685;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=99;TCF=8;TCR=91;TR=46;WE=60512036;WS=60512018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,45:0.45:99
chr20	60572663	rs2296081	C	A	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.506;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=6;PP=876;ReadPosRankSum=-0.676;SC=TGGGCCCGATCGCTGCTAGTG;SOR=1.459;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=76;TCF=60;TCR=16;TR=40;WE=60572671;WS=60572653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,43:0.54:80
chr20	60573983	rs2296082	A	G	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=327;ReadPosRankSum=0.569;SC=TGAGCTCATCAGGTTGTGGCT;SOR=2.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=19;WE=60573991;WS=60573973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr20	60574216	rs2296083	C	T	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-4.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.422;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=37;PP=871;ReadPosRankSum=0.293;SC=GCCCAGCAAGCAAAGGGGTTG;SOR=1.518;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=91;TCF=23;TCR=68;TR=46;WE=60574224;WS=60574206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,47:0.52:91
chr20	60582540	rs2281735	T	A	1014.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=5.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.038;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=1;PP=798;ReadPosRankSum=-0.256;SC=GCACACTTGGTGCATCTGCGC;SOR=1.797;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=67;TCF=61;TCR=6;TR=35;WE=60582548;WS=60582530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,36:0.55:65
chr20	60584328	rs2296087	T	A	530.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=403;ReadPosRankSum=0.000;SC=AAAAGATACATATATTTCTTC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=18;WE=60584336;WS=60584318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,19:0.63:30
chr20	60640305	rs200074661	TGCCAGG	T	453.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=12;PP=482;SC=CCGGCGGGCTTGCCAGGGCCA;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=12;WE=60640318;WS=60640295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr20	60704117	rs4925345	A	G	1689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=48;PP=1335;SC=TTTCCTCCTGATTCAGAGGGC;SOR=5.670;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=49;WE=60704125;WS=60704107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr20	60708216	rs6089657	G	A	607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=543;ReadPosRankSum=0.906;SC=CAGAGCTGACGGGGCCGCCCC;SOR=1.308;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=22;WE=60708224;WS=60708206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
chr20	60712174	rs3078903	CAGCAGT	C	638.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.549;NF=5;NR=10;PP=737;ReadPosRankSum=-0.689;SC=AAGTATTAAGCAGCAGTAGCA;SOR=0.560;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=39;TCF=13;TCR=26;TR=15;WE=60712187;WS=60712164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr20	60712284	rs2057169	G	A	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.379;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=3;PP=635;ReadPosRankSum=-0.517;SC=GACGTATGGGGAGCCTCAGAA;SOR=0.555;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=66;TCF=60;TCR=6;TR=30;WE=60712292;WS=60712274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,33:0.46:71
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chr20	60712511	rs2281740	A	G	4032.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.643;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.362;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=111;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.138;SC=AGGAGCATTAACCACCTTTCC;SOR=1.035;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=316;TCF=99;TCR=217;TR=153;WE=60712519;WS=60712501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,155:0.48:321
chr20	60713311	rs7076	G	A	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.036;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=38;PP=898;ReadPosRankSum=-0.384;SC=CCAGGAACTCGCGCACTGACT;SOR=0.987;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=101;TCF=19;TCR=82;TR=46;WE=60713319;WS=60713301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,51:0.46:111
chr20	60713332	rs1135961	A	G	1102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.641;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=31;PP=748;ReadPosRankSum=-0.020;SC=TGGCACCCCGACCTATGGCAT;SOR=1.133;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=81;TCF=15;TCR=66;TR=37;WE=60713340;WS=60713322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,41:0.46:89
chr20	60718420	rs3746651	C	T	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=410;ReadPosRankSum=-0.360;SC=ACTCACGGCCCGCGCGCACCC;SOR=0.538;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=34;TCF=3;TCR=31;TR=19;WE=60718428;WS=60718410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,20:0.57:35
chr20	60733639	rs6142963	A	G	475.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=378;ReadPosRankSum=0.452;SC=CTCAACCTATATGAAAACTAG;SOR=0.301;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=17;WE=60733647;WS=60733635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr20	60733672	rs6062094	C	T	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.972;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.246;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=2;PP=383;ReadPosRankSum=1.572;SC=GGCTGTTCATCCCGAGGGTCA;SOR=0.283;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=19;WE=60733680;WS=60733662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,19:0.47:40
chr20	60735098	rs6121926	T	C	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.959;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=29;PP=828;ReadPosRankSum=0.792;SC=GGGCATGTCATCTCAGGTAGC;SOR=0.427;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=85;TCF=24;TCR=61;TR=42;WE=60735106;WS=60735088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,44:0.50:88
chr20	60739079	rs56285165	G	A	985.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=5;PP=1737;ReadPosRankSum=-0.266;SC=ATGACAGCGTGGGGTGTTCTC;SOR=0.679;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=52;TCR=8;TR=37;WE=60739100;WS=60739069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,38:0.60:63
chr20	60739092	rs61598322	C	T	1008.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.176;HP=3;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=9;PP=1737;ReadPosRankSum=-0.246;SC=GTGTTCTCCTCGGGTGGGTGA;SOR=0.441;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=65;TCF=51;TCR=14;TR=38;WE=60739100;WS=60739069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,39:0.57:68
chr20	60739353	rs146750123	GGGGCAAGGA	G	110.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.668;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=1337;ReadPosRankSum=-0.210;SC=AGCAGCTGCAGGGGCAAGGAG;SOR=1.270;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=5;WE=60739369;WS=60739343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr20	60740362	rs6142964	G	A	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=358;ReadPosRankSum=0.504;SC=GGTCCTGCCGGCTCTTGTTGC;SOR=0.756;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=16;WE=60740370;WS=60740360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,16:0.52:31
chr20	60740447	rs2295208	C	T	1371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.969;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=9;PP=1132;ReadPosRankSum=-0.752;SC=GCACAGCCTCCGCTGACTGTC;SOR=0.627;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=102;TCF=85;TCR=17;TR=50;WE=60740455;WS=60740437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,50:0.49:103
chr20	60740584	rs60919036	CTGCGTGCTGGGCTCG	CCGTGCTGGGCTCG,C	3252.73	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.084;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=30;PP=2954;ReadPosRankSum=0.650;SC=AGGAGCACGGCTGCGTGCTGG;SOR=1.125;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=128;TCF=21;TCR=107;TR=37;WE=60740608;WS=60740574;set=Intersection	GT:AF:DP	0/1:0.51:174
chr20	60740587	.	CGTGCTGGGCTCGA	C	3231.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.000;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=3.934;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.85;ReadPosRankSum=0.743;SOR=1.019;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:92,89:0.49:181
chr20	60740600	.	A	C	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=59.81;NF=11;NR=31;PP=2962;QD=20;SC=GCTGGGCTCGAGCGTAAGCGC;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=124;TCF=27;TCR=97;TR=42;WE=60740608;WS=60740574;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:82,42:0.34:124
chr20	60773041	rs6062140	G	C	1486.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.291;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=46;PP=1167;ReadPosRankSum=0.430;SC=GAGACTGCCGGACCTGGCCCT;SOR=1.013;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=89;TCF=10;TCR=79;TR=51;WE=60773049;WS=60773031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,53:0.56:94
chr20	60773684	rs4925355	C	T	1434.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.118;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=9;PP=1098;ReadPosRankSum=0.587;SC=GCCTGCTGTTCCCCAGGTCCC;SOR=1.026;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=96;TCF=78;TCR=18;TR=51;WE=60773692;WS=60773674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,53:0.54:99
chr20	60774035	rs6142990	A	G	1409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.852;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=46;PP=1102;ReadPosRankSum=0.233;SC=CCATCAGTACACTGCTGACTT;SOR=1.265;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=103;TCF=15;TCR=88;TR=51;WE=60774043;WS=60774025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,53:0.51:104
chr20	60776182	rs1054885	G	A	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=441;ReadPosRankSum=1.494;SC=GCAAACCTGGGTGTGAATTCG;SOR=0.556;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=21;WE=60776190;WS=60776172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr20	60792029	rs1739583	G	A	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=320;ReadPosRankSum=-1.145;SC=GGAATATTGGGCTGGGTGCGC;SOR=0.569;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=16;WE=60792037;WS=60792019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr20	60808026	rs6089695	C	T	1623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=29;PP=1157;ReadPosRankSum=-0.059;SC=AAACCCATGGCGCCACCCTCA;SOR=0.687;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=54;TCR=58;TR=56;WE=60808034;WS=60808016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,64:0.52:122
chr20	60831300	rs6089706	G	A	3393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=80;PP=2754;SC=AGAACCAACTGGGGACGTACT;SOR=2.746;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=20;TCR=80;TR=100;WE=60831308;WS=60831290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr20	60848248	rs6061476	G	T	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=433;SC=AACTGAAAACGCACACGGAAC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=60848256;WS=60848246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr20	60848348	rs2236526	C	T	536.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.365;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=4;PP=393;ReadPosRankSum=-0.010;SC=CCTGTCCCCCCCGTGGATTAT;SOR=0.428;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=43;TCR=9;TR=22;WE=60848356;WS=60848338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,23:0.43:53
chr20	60857034	rs2274938	G	A	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.054;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=521;ReadPosRankSum=0.599;SC=CTACGTGCATGAGACGCGGGT;SOR=2.108;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=2;TCR=53;TR=24;WE=60857042;WS=60857024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,25:0.45:55
chr20	60859381	rs4925225	A	G	2064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=46;PP=1499;SC=GATGAACCATATATTGTGGGT;SOR=2.070;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=66;TCF=18;TCR=48;TR=64;WE=60859389;WS=60859371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
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chr20	60859486	rs4925226	A	G	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=265;SC=AGGCTGGAGTACAGTGGTGCA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=60859494;WS=60859476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr20	60861782	rs2297592	A	G	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.395;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.508;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=31;PP=688;ReadPosRankSum=1.088;SC=GTGTCCCTCCATGGCCTGACG;SOR=1.426;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=68;TCF=6;TCR=62;TR=33;WE=60861790;WS=60861772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,33:0.45:73
chr20	60864390	rs3746657	C	T	491.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.496;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=342;ReadPosRankSum=0.829;SC=AACATGGGTGCGTCCACGCAG;SOR=0.337;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=60;TCF=9;TCR=51;TR=20;WE=60864398;WS=60864380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,22:0.35:62
chr20	60881330	rs2427273	G	A	8876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=163;NR=112;PP=2965;SC=TGCCTGGGGCGCTGGGGGCCA;SOR=1.098;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=275;TCF=163;TCR=112;TR=275;WE=60881338;WS=60881320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,290:1.00:290
chr20	60881643	rs2427274	T	C	2283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=39;NR=33;PP=1832;SC=GCGCAGGCAGTGCGGTGGGGC;SOR=0.864;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=39;TCR=33;TR=72;WE=60881651;WS=60881633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr20	60881780	rs2427275	T	C	5101.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=113;NR=40;PP=2965;SC=CAGCCGGCCTTGGAGGACTGG;SOR=2.144;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=153;TCF=113;TCR=40;TR=153;WE=60881788;WS=60881770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,159:1.00:159
chr20	60882277	rs2427277	C	T	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=2;PP=282;SC=ACCCGCCCCACGCCGCTCCTC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=60882285;WS=60882272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr20	60882888	rs2427278	A	G	4347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=95;PP=2965;SC=CAGCAAGGTAACGTGTGCTGT;SOR=2.215;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=34;TCR=95;TR=129;WE=60882896;WS=60882878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chr20	60883191	rs45576934	C	T	1178.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=34;PP=893;ReadPosRankSum=1.840;SC=CCGCAGACCGCGGATGAGATC;SOR=0.731;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=94;TCF=27;TCR=67;TR=46;WE=60883199;WS=60883181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,49:0.49:100
chr20	60883273	rs2236523	A	C	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=249;ReadPosRankSum=2.040;SC=CTGTGTGCTCAGGGAGTGGGC;SOR=1.436;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=17;WE=60883281;WS=60883263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,18:0.44:41
chr20	60885142	rs2379129	C	A	1903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.155;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=30;PP=1349;ReadPosRankSum=-1.345;SC=CAGGACCTGGCGGGGTAGGAA;SOR=0.876;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=126;TCF=68;TCR=58;TR=68;WE=60885150;WS=60885132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,74:0.56:132
chr20	60885428	rs41310032	C	A	2335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.328;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=27;PP=1853;ReadPosRankSum=-0.970;SC=CCTCCTGGAGCCCCCTGCCCT;SOR=1.702;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=173;TCF=102;TCR=71;TR=87;WE=60885436;WS=60885418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,89:0.51:175
chr20	60885448	rs944897	A	G	6655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=102;NR=76;PP=2965;SC=TGCCCTGCTGAGGCCTGGGAT;SOR=1.034;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=178;TCF=102;TCR=76;TR=178;WE=60885456;WS=60885438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr20	60886611	rs2297590	C	T	2869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=51;PP=2353;SC=GGCGGGCAGGCGGTCAGCAGC;SOR=1.014;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=38;TCR=51;TR=89;WE=60886619;WS=60886601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr20	60886987	rs944896	G	A	2444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.335;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=35;PP=1738;ReadPosRankSum=-0.186;SC=CCGTGGCATTGCTGTAGAAGG;SOR=0.441;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=195;TCF=131;TCR=64;TR=98;WE=60886995;WS=60886977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,103:0.51:202
chr20	60887581	rs944895	G	A	1608.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.623;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=43;PP=1303;ReadPosRankSum=0.101;SC=GGGAAGAGCCGTCGCAGGCTG;SOR=0.631;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=152;TCF=49;TCR=103;TR=64;WE=60887589;WS=60887571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,67:0.42:158
chr20	60888921	rs34102933	G	A	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.520;NF=0;NR=16;PP=333;ReadPosRankSum=-0.629;SC=GAGTGGGCACGGAGAGATGAG;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=16;WE=60888929;WS=60888911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr20	60889313	rs72487383	A	C	795.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.744;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=1;PP=607;ReadPosRankSum=-0.231;SC=CGAACGGGCAAGGGCCCTGCA;SOR=1.863;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=69;TCF=61;TCR=8;TR=30;WE=60889321;WS=60889303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,33:0.47:70
chr20	60890375	rs6062210	C	T	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.36;BaseQRankSum=3.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=81;ReadPosRankSum=-0.600;SC=CCCTATGGATCGTGTGAGACC;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=6;WE=60890383;WS=60890365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,9:0.41:22
chr20	60891288	rs2065578	A	G	891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=24;PP=727;SC=GTCTCAGCGTAGCCTCTGTTC;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=60891296;WS=60891278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr20	60892116	rs2236521	G	A	253.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=7;PP=135;ReadPosRankSum=-0.567;SC=GTGGGTAAGCGCAGACGCCCT;SOR=0.382;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=10;WE=60892124;WS=60892106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr20	60892526	rs2427281	A	G	4193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=83;NR=64;PP=2965;SC=TCCGAGCCCCATCCAGGCTGG;SOR=0.982;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=148;TCF=84;TCR=64;TR=147;WE=60892534;WS=60892516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr20	60892692	rs6062216	C	T	1662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=35;PP=1526;SC=GATGGGGTGGCGACAGGGGCC;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=17;TCR=35;TR=52;WE=60892700;WS=60892682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr20	60893458	rs73144993	A	G	510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-5.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.284;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=2;PP=374;ReadPosRankSum=-0.090;SC=GAGGGATTGCAGGGAGGAGGC;SOR=0.084;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=50;TCF=48;TCR=2;TR=25;WE=60893466;WS=60893448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr20	60893506	rs113604626	T	G	1319.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-6.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=5;PP=1002;ReadPosRankSum=1.364;SC=TCCGGGGTCCTCACCAGGGCT;SOR=0.769;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=117;TCF=107;TCR=10;TR=61;WE=60893514;WS=60893496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,61:0.52:118
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chr20	60895738	rs6089346	A	G	3567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=55;PP=2911;SC=GTGGGAGGCGAAAGGTGAAGG;SOR=0.808;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=48;TCR=55;TR=103;WE=60895746;WS=60895728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr20	60897071	rs2274936	A	G	3907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=62;PP=2806;SC=TGTTGAGGACACACCTTCACA;SOR=0.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=127;TCF=65;TCR=62;TR=127;WE=60897079;WS=60897061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr20	60897487	rs2274934	C	T	1223.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.741;HP=1;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=31;PP=2176;ReadPosRankSum=-0.689;SC=CCGCAGCCATCGAAACCAAAA;SOR=1.011;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=98;TCF=32;TCR=66;TR=44;WE=60897496;WS=60897477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,47:0.46:102
chr20	60897488	rs2274933	G	A	1422.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.772;HP=3;HapScore=4;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=33;PP=2632;ReadPosRankSum=0.981;SC=CGCAGCCATCGAAACCAAAAT;SOR=0.432;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=96;TCF=32;TCR=64;TR=52;WE=60897496;WS=60897477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,54:0.53:101
chr20	60897561	rs76706776	CC	GA	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.22;ReadPosRankSum=-0.228;SOR=1.012;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,32:0.64:50
chr20	60897570	rs71323580	C	G	1093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.31;ReadPosRankSum=0.369;SOR=0.656;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,27:0.60:45
chr20	60897772	rs6143021	T	C	45.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.292;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=25;ReadPosRankSum=-0.703;SC=GTGCCCGCTGTGGGGGTCGCA;SOR=0.307;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=3;WE=60897780;WS=60897762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr20	60897878	.	C	A	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-0.738;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=29;ReadPosRankSum=-0.847;SC=CCCCTAGGCACCCTCCTAAGC;SOR=1.022;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=3;WE=60897886;WS=60897868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr20	60898505	rs2379128	C	T	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.095;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.639;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=274;ReadPosRankSum=1.077;SC=CCCAGCCCGACGCCTACGGGT;SOR=1.085;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=15;WE=60898513;WS=60898495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,15:0.38:39
chr20	60899182	rs11698080	C	T	1661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=20;PP=1234;ReadPosRankSum=0.139;SC=ACACAGGGGGCGCTGGGGTCG;SOR=0.756;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=99;TCF=67;TCR=32;TR=62;WE=60899190;WS=60899172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,68:0.65:104
chr20	60899206	rs2427283	C	T	1096.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.534;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=841;ReadPosRankSum=-2.320;SC=CTGCTGCTCACGAAGCCAGCC;SOR=0.856;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=112;TCF=71;TCR=41;TR=44;WE=60899214;WS=60899196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,46:0.38:121
chr20	60899422	rs34599961	C	T	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=19;PP=1038;ReadPosRankSum=1.418;SC=GAAGTGCAGCCCCTGGTCTTC;SOR=0.671;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=81;TCF=46;TCR=35;TR=43;WE=60899430;WS=60899412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,43:0.52:82
chr20	60900481	rs2427284	A	G	5931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=58;PP=2965;SC=CCTGCGCAGGAAGACAGCCGA;SOR=1.687;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=182;TCF=124;TCR=58;TR=182;WE=60900489;WS=60900471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr20	60900579	rs2427285	C	A	9004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=155;NR=114;PP=2965;SC=CAGTGTTGCGCGTCTCCGTAT;SOR=1.068;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=270;TCF=156;TCR=114;TR=269;WE=60900587;WS=60900569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,279:1.00:279
chr20	60901875	rs45505291	G	A	3020.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.706;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=50;PP=2265;ReadPosRankSum=0.363;SC=GTGCCACTGCGCCACGCCCAC;SOR=0.386;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=216;TCF=131;TCR=85;TR=118;WE=60901883;WS=60901865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,120:0.55:220
chr20	60902214	rs944894	G	A	817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=9;PP=668;SC=GACAGACCCCGCTCCTGGCTC;SOR=1.220;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=25;WE=60902222;WS=60902204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr20	60902490	rs944892	C	T	11728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=377;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=212;NR=154;PP=2965;SC=TGGCTGCACACGGGTGGATGC;SOR=1.074;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=366;TCF=212;TCR=154;TR=366;WE=60902498;WS=60902480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,373:1.00:373
chr20	60902544	rs944891	A	C	13306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=424;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=171;NR=236;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.784;SC=CCCACCTAAGACCTCCCCGAG;SOR=0.751;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=408;TCF=172;TCR=236;TR=407;WE=60902552;WS=60902534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,417:1.00:418
chr20	60902883	rs4925375	C	T	1221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.366;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=20;PP=960;ReadPosRankSum=1.300;SC=CTGATGAGGCCGGAGGGAGAG;SOR=0.941;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=117;TCF=65;TCR=52;TR=49;WE=60902891;WS=60902873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,49:0.40:122
chr20	60903419	rs7262393	C	T	1607.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.593;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=35;PP=1222;ReadPosRankSum=-0.575;SC=GCTGGCACAGCAGGCAGTCGG;SOR=0.625;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=151;TCF=66;TCR=85;TR=64;WE=60903427;WS=60903409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,68:0.43:160
chr20	60904421	rs3065756	GCAGCC	G	981.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.829;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.962;NF=1;NR=21;PP=1054;ReadPosRankSum=0.677;SC=CCTGGCAGCAGCAGCCCAGCC;SOR=2.542;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=68;TCF=5;TCR=63;TR=22;WE=60904433;WS=60904411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,26:0.54:48
chr20	60904853	rs2427286	T	C	3883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=81;PP=2787;SC=CACCGGCCCTTGGGCACACGC;SOR=1.473;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=129;TCF=48;TCR=81;TR=128;WE=60904861;WS=60904843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr20	60905717	rs2095235	T	C	5049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=76;PP=2965;SC=GAGCCCCTGCTGCCCCCTGGA;SOR=0.801;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=165;TCF=89;TCR=76;TR=165;WE=60905725;WS=60905707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr20	60905878	rs3810548	A	G	3470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=51;PP=2757;SC=AGCTGGGGACATGGCTGGAGT;SOR=0.991;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=67;TCR=51;TR=118;WE=60905886;WS=60905868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
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chr20	60906269	rs35653162	C	T	253.89	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.552;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=-1.186;NF=0;NR=13;PP=385;ReadPosRankSum=-0.442;SC=GGGGTGCAGGCGGTACGATGG;SOR=0.350;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=60906285;WS=60906259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:16,10:0.38:26
chr20	60906277	.	T	TG	30	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5147;HP=7;HapScore=4;MGOF=4;MMLQ=23;MQ=52.66;NF=0;NR=3;PP=30;QD=17.0;SC=GGCGGTACGATGGGGGGGTGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=60906285;WS=60906259;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:5,3:0.38:8
chr20	60907446	rs2151513	T	C	3031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=62;PP=2527;SC=AGCGTGCCTGTTCGGCTGTGA;SOR=1.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=32;TCR=62;TR=94;WE=60907454;WS=60907436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr20	60907675	rs6142734	G	A	3782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=53;PP=2939;SC=GGGTGTGCACGGCCACGCCCA;SOR=0.885;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=118;TCF=65;TCR=53;TR=118;WE=60907683;WS=60907665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr20	60908882	rs12481057	G	A	141.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=141;SC=GGAAGGTGGCGGGGCTTGGGA;SOR=1.981;Source=Platypus;TCR=4;TR=5;WE=60908890;WS=60908872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr20	60908892	rs141833594	A	AGTGGG	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.85;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
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chr20	60908969	rs13042941	T	C	3519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.90;SOR=4.565;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr20	60909060	rs13038331	A	G	6161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=126;NR=95;PP=2965;SC=AGAAAAGGTCAGGGGAGGTCA;SOR=1.008;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=221;TCF=126;TCR=95;TR=221;WE=60909068;WS=60909050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,223:1.00:223
chr20	60909466	rs2379127	G	A	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=16;PP=655;SC=GCGGCCCCGGGTCTCCAGGGA;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=8;TCR=16;TR=24;WE=60909474;WS=60909456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr20	60909518	rs1105019	G	T	937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=4;PP=766;SC=GACACGGAGAGGCCCGGAGGA;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=60909526;WS=60909508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr20	60909786	.	G	GTCAGGGC	1057	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=27;MQ=61.41;NF=0;NR=16;PP=1057;QD=66.875;SC=ATGATGGAGAGTCAGGGCTCA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=16;WE=60909794;WS=60909776;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:17,16:0.48:33
chr20	60909809	.	C	CAGGGCTCAGGGCGAGGGCGAGGGCGAGGGCGAGGGCG	520.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.97;QD=52.07;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr20	60909832	.	T	C	132	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=28;MMLQ=23;MQ=57.87;NF=0;NR=9;PP=132;QD=18.5301347275;SC=AGGGCGAGGGTGAGGGCGCTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=9;WE=60909840;WS=60909822;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,9:0.50:18
chr20	60909974	rs12625368	T	C	1844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=4;PP=1552;SC=TCACCCGGGCTTCATGCTGCC;SOR=4.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=49;TCR=4;TR=53;WE=60909982;WS=60909964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr20	60910029	.	C	A	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.719;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=8;PP=1007;ReadPosRankSum=-0.097;SC=CCAGCATAAACCGAGGGGAGG;SOR=0.601;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=88;TCF=73;TCR=15;TR=46;WE=60910037;WS=60910019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,50:0.54:93
chr20	60911958	rs2890083	G	A	4293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-8.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=340;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.391;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=84;PP=2962;ReadPosRankSum=0.120;SC=CAGCACAGGTGCCTCTCATCC;SOR=0.390;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=326;TCF=178;TCR=148;TR=164;WE=60911966;WS=60911948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:165,173:0.51:338
chr20	60912117	rs3810550	C	T	1357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=8.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=47;PP=1046;ReadPosRankSum=0.373;SC=GTGTGACACACGTCTGAACAA;SOR=1.548;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=97;TCF=1;TCR=96;TR=47;WE=60912125;WS=60912107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,50:0.49:103
chr20	60912683	rs2427289	T	C	2211.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=17;PP=1833;SC=CGGGCACACATGTGTCACACC;SOR=2.082;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=54;TCR=17;TR=71;WE=60912691;WS=60912673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr20	60913127	rs8124907	A	G	1470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=36;PP=1083;ReadPosRankSum=-0.203;SC=AATGAGGTCCAGCAAACTCAG;SOR=0.676;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=183;TCF=89;TCR=94;TR=69;WE=60913135;WS=60913117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,70:0.38:183
chr20	60913495	rs2151512	T	C	1855.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=8.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.641;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=27;PP=1528;ReadPosRankSum=2.068;SC=CGAGCGCAGGTAGAGGTTGAG;SOR=0.229;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=148;TCF=101;TCR=47;TR=69;WE=60913503;WS=60913485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,69:0.47:148
chr20	60917294	rs4925380	G	A	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.482;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=350;ReadPosRankSum=0.030;SC=AGGAGGCAGAGGTTGAAGTGA;SOR=0.195;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=17;WE=60917302;WS=60917284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr20	60920545	rs6143034	T	C	57.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=0;PP=62;ReadPosRankSum=1.150;SC=TCACTGCAGCTTCGGCCTTCC;SOR=2.093;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=2;WE=60920553;WS=60920536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr20	60920624	rs4925385	A	G	391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=280;ReadPosRankSum=1.790;SC=CACTACACCCAGCTAATTTTT;SOR=0.693;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=35;TCF=33;TCR=2;TR=17;WE=60920632;WS=60920614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,18:0.50:36
chr20	60920700	rs6143035	T	C	1160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.705;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.956;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=9;PP=865;ReadPosRankSum=-1.481;SC=GGCTTTATGCTGACCTATATT;SOR=1.997;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=78;TCF=55;TCR=23;TR=43;WE=60920708;WS=60920690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,45:0.56:80
chr20	60920887	rs11204472	G	A	1218.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.791;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=16;PP=982;ReadPosRankSum=0.000;SC=CAATCTGGCCGGCTGGCAGCA;SOR=1.009;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=108;TCF=58;TCR=50;TR=44;WE=60920895;WS=60920877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,47:0.40:117
chr20	60921044	rs4925386	T	C	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.969;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=17;PP=475;ReadPosRankSum=-0.245;SC=CAGGATAACATGGTCCATCCC;SOR=0.906;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=60;TCF=24;TCR=36;TR=27;WE=60921052;WS=60921034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,28:0.44:64
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chr20	60921643	rs4925229	T	C	5766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=115;NR=66;PP=2965;SC=TTGACGCCGGTGGTGTGGTGC;SOR=1.358;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=182;TCF=115;TCR=67;TR=181;WE=60921651;WS=60921633;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
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chr20	60927412	rs624313	G	A	2670.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.738;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=56;PP=2009;ReadPosRankSum=-0.135;SC=AGTCCCTCTTGGAGGCTGCGG;SOR=0.339;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=179;TCF=78;TCR=101;TR=106;WE=60927420;WS=60927402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,109:0.59:185
chr20	60927431	rs2427295	G	A	1517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.944;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=45;PP=1179;ReadPosRankSum=0.584;SC=GGGGAATGGCGGGAGGGGAGG;SOR=1.514;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=155;TCF=54;TCR=101;TR=61;WE=60927439;WS=60927421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,63:0.39:161
chr20	60927475	rs2427296	G	A	995.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.260;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=36;PP=1824;ReadPosRankSum=-0.532;SC=GGGTCCCCGCGGTGCCCGGGC;SOR=2.346;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=101;TCF=14;TCR=87;TR=38;WE=60927490;WS=60927465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,40:0.38:106
chr20	60927482	rs482220	G	A	1696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.635;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=46;PP=2962;ReadPosRankSum=0.594;SC=CGCGGTGCCCGGGCCCCTTGA;SOR=0.264;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=94;TCF=16;TCR=78;TR=58;WE=60927490;WS=60927465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,61:0.62:99
chr20	60927538	rs623834	C	T	1130.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.616;HP=2;HapScore=3;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=28;PP=1277;ReadPosRankSum=0.138;SC=CAAGAGGCCGCGTGACAGAGA;SOR=2.093;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=48;TCF=3;TCR=45;TR=29;WE=60927559;WS=60927528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,32:0.63:51
chr20	60927551	rs482010	A	G	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.258;HP=3;HapScore=3;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=1277;ReadPosRankSum=0.106;SC=GACAGAGACCACAGCTCACTG;SOR=3.312;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=22;WE=60927559;WS=60927528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr20	60937597	rs477859	A	G	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.481;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=19;PP=480;ReadPosRankSum=-0.616;SC=TGCAGATGTCACAGTACTGGC;SOR=1.253;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=54;TCF=16;TCR=38;TR=25;WE=60937605;WS=60937587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,29:0.50:58
chr20	60941869	rs144826578	T	C	148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.833;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=110;ReadPosRankSum=0.241;SC=GGGTGCCTTCTTGGGCCCCCA;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=6;WE=60941877;WS=60941859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr20	60962624	rs755726	T	C	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.546;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.912;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=53;PP=1407;ReadPosRankSum=-2.294;SC=CTTTCATTCTTACCGCCCAAG;SOR=0.460;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=121;TCF=21;TCR=100;TR=65;WE=60962632;WS=60962614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,68:0.55:124
chr20	60963494	rs6089356	C	T	2555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.570;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=73;PP=1974;ReadPosRankSum=-0.618;SC=TTAACGTTGTCCTTTTCCCCT;SOR=0.602;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=223;TCF=55;TCR=168;TR=98;WE=60963502;WS=60963484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,101:0.45:226
chr20	60966318	rs6089219	G	T	3473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=56;PP=2902;SC=GATGAGCTGCGTCACGCCGCT;SOR=0.905;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=100;TCF=44;TCR=56;TR=100;WE=60966326;WS=60966308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr20	60968596	rs1570027	A	G	2625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.247;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.037;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=78;NR=41;PP=1926;ReadPosRankSum=-0.336;SC=GCAGCAGGCCATGGCTGTCAC;SOR=0.597;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=248;TCF=167;TCR=81;TR=119;WE=60968604;WS=60968586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,121:0.48:254
chr20	60969886	rs2427309	G	T	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=285;ReadPosRankSum=0.041;SC=GGGGGCAGCCGCACCTGGGGG;SOR=0.127;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=14;WE=60969894;WS=60969876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,14:0.44:32
chr20	60969929	rs2427310	C	G	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.129;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=426;ReadPosRankSum=-0.795;SC=TGGGCCTGGCCGAGACCAGGC;SOR=0.461;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=59;TCF=43;TCR=16;TR=30;WE=60969937;WS=60969919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,30:0.51:59
chr20	60970123	rs2427311	A	G	1962.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.794;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=41;PP=1567;ReadPosRankSum=1.847;SC=GGCTCAAGGTACTGCTGCTTC;SOR=0.920;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=153;TCF=73;TCR=80;TR=74;WE=60970131;WS=60970113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,76:0.49:156
chr20	60971327	rs748037	A	C	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=1;PP=1155;ReadPosRankSum=0.466;SC=CCGTGGGCTTATGGAGACCAC;SOR=1.179;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=102;TCF=99;TCR=3;TR=49;WE=60971335;WS=60971317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,49:0.49:99
chr20	60982118	rs184691263	G	C	106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.605;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.027;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=4;PP=71;ReadPosRankSum=-0.483;SC=GGGCGGCGGCGGGGGCTTCTC;SOR=1.329;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=15;TCF=6;TCR=9;TR=6;WE=60982126;WS=60982108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr20	60986019	rs2236200	A	C	2001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.923;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=29;PP=1551;ReadPosRankSum=0.128;SC=AGTGGCTGTCAGTTTCCTTCT;SOR=1.131;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=149;TCF=91;TCR=58;TR=83;WE=60986027;WS=60986009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,82:0.53:154
chr20	60989365	rs3810553	C	T	1269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=32;PP=983;ReadPosRankSum=-0.309;SC=AGGCGAAGGTCCTGCATGCCC;SOR=0.656;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=85;TCF=25;TCR=60;TR=46;WE=60989373;WS=60989355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,47:0.53:89
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chr20	60990170	rs911079	C	T	942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.642;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=672;ReadPosRankSum=2.118;SC=GTGGGGCAGGCGGGCACCTGT;SOR=0.912;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=96;TCF=44;TCR=52;TR=38;WE=60990178;WS=60990160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,41:0.41:101
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chr20	60992224	rs2427325	T	C	1199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=19;PP=852;ReadPosRankSum=0.092;SC=TGTCACCTCCTCCTCTCCTGA;SOR=0.639;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=83;TCF=45;TCR=38;TR=42;WE=60992232;WS=60992214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,46:0.52:89
chr20	60992402	rs6061521	G	A	142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.935;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=135;ReadPosRankSum=1.226;SC=CTAAAGTGGGGTCCTGTTCCA;SOR=2.655;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=7;WE=60992410;WS=60992392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr20	61039958	rs6061550	T	C	621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=8;PP=375;ReadPosRankSum=1.113;SC=CCTGGGGGCTTGGGGCCGTGG;SOR=0.628;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=54;TCF=35;TCR=19;TR=25;WE=61039966;WS=61039948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr20	61040125	rs113912772	G	C	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=4;PP=144;ReadPosRankSum=0.136;SC=AGCCTCTTAGGTCAGGAGCTC;SOR=0.527;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=7;WE=61040133;WS=61040115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr20	61040668	rs112618954	C	T	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.208;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=579;ReadPosRankSum=0.407;SC=TGTGGCCGGGCGTGGCTTCTT;SOR=0.925;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=59;TCF=30;TCR=29;TR=29;WE=61040676;WS=61040658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,29:0.49:59
chr20	61041653	rs6061244	G	C	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=31;PP=694;ReadPosRankSum=0.626;SC=CCGGGTGCGCGGCTGGAGCAG;SOR=0.573;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=67;TCF=10;TCR=57;TR=37;WE=61041661;WS=61041643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,37:0.56:66
chr20	61041687	rs6121610	C	T	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=26;PP=655;ReadPosRankSum=2.192;SC=AGACTCAGGTCGGCCTTGCGG;SOR=0.798;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=7;TCR=46;TR=30;WE=61041695;WS=61041677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,32:0.58:55
chr20	61048549	rs41305803	G	A	1980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.200;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=20;PP=1393;ReadPosRankSum=0.906;SC=GGCCGGTGCCGTCTCGGCGCC;SOR=0.509;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=106;TCR=41;TR=71;WE=61048557;WS=61048539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,81:0.52:157
chr20	61050379	rs6142775	T	G	1353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.740;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=16;PP=1044;ReadPosRankSum=-1.165;SC=GCGGTGGCTGTCTGCGCCCAG;SOR=0.787;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=84;TCR=37;TR=52;WE=61050387;WS=61050369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,53:0.43:122
chr20	61143364	rs12625668	T	C	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=2;PP=483;ReadPosRankSum=-0.308;SC=CAAGGGTCCATCTCAGGGTGT;SOR=0.396;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=48;TCF=45;TCR=3;TR=24;WE=61143372;WS=61143354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,24:0.52:46
chr20	61143487	rs3934574	T	C	6298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=120;NR=83;PP=2965;SC=AGACCCCGAATCCACGGCTGT;SOR=1.101;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=204;TCF=121;TCR=83;TR=203;WE=61143495;WS=61143477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr20	61143945	rs3934573	T	G	1568.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.48;SOR=6.138;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr20	61143945	.	TGGGCAG	GGGGCAC,GGGGCAG	795	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=59.71;NF=0,1;NR=10,41;PP=113,795;QD=16.6467874862;SC=GCCTCTGCGTTGGGCAGCCTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=10,42;WE=61143959;WS=61143935;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.24:42
chr20	61143951	rs45612436	G	C	221.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.190;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.28;ReadPosRankSum=-0.903;SOR=0.470;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,11:0.26:42
chr20	61150928	rs12624794	A	G	1776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=47;PP=1444;SC=GTCTGGCCTCAGGAGCAAGGA;SOR=3.422;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=8;TCR=47;TR=55;WE=61150936;WS=61150918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr20	61150959	rs116355995	G	A	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.035;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.123;HP=2;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=455;ReadPosRankSum=-0.822;SC=TCCCGGAGAAGGAGGAGGCTG;SOR=1.773;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=20;WE=61150967;WS=61150949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,20:0.51:39
chr20	61162267	rs6062251	T	C	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=16;PP=801;ReadPosRankSum=-1.384;SC=ACCCAGCAGGTGGCGCGGGGA;SOR=0.616;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=67;TCR=32;TR=48;WE=61162275;WS=61162257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,47:0.47:100
chr20	61162423	rs6062250	T	C	1071.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=36;PP=878;ReadPosRankSum=2.164;SC=AGCTGGGTGCTCCTGCTTGTT;SOR=0.821;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=83;TCF=8;TCR=75;TR=39;WE=61162431;WS=61162413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,39:0.47:83
chr20	61167632	rs11483745	G	GT	1044.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.711;HP=11;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=3.365;NF=38;NR=13;PP=641;ReadPosRankSum=-1.288;SC=CCTGCCCTGGGTTTTTTTTTT;SOR=0.332;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=130;TCF=99;TCR=31;TR=51;WE=61167640;WS=61167622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,54:0.49:110
chr20	61167828	.	G	A	2334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.050;ClippingRankSum=0.000;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.096;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=69;PP=1882;ReadPosRankSum=-0.435;SC=GGCTGGAGGCGATGCCAGTCC;SOR=1.632;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=153;TCF=31;TCR=122;TR=81;WE=61167836;WS=61167818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,85:0.54:158
chr20	61167883	rs6143064	G	A	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.144;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=31;PP=839;ReadPosRankSum=-0.042;SC=AGCCACTGCTGAAGGGACTCC;SOR=0.641;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=9;TCR=58;TR=36;WE=61167891;WS=61167873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,37:0.54:69
chr20	61167934	rs6143063	T	C	493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=377;ReadPosRankSum=1.187;SC=AACGGGTATCTAGGCCCACCC;SOR=1.105;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=17;WE=61167942;WS=61167924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,18:0.47:38
chr20	61273717	rs6122141	G	C	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-4.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=292;ReadPosRankSum=-1.060;SC=TGTGCCCTGGGGGGGAGGAGG;SOR=2.004;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=18;WE=61273725;WS=61273707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr20	61288038	rs1047099	G	A	2749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.244;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.165;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=67;PP=2256;ReadPosRankSum=0.777;SC=GGTGCGGTACGTCTCGGCCGG;SOR=1.049;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=234;TCF=99;TCR=135;TR=108;WE=61288046;WS=61288028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:132,109:0.45:241
chr20	61288355	rs3195701	G	T	1141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.912;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=937;ReadPosRankSum=0.896;SC=TGGGCACGGGGTCGCTGGTGT;SOR=0.187;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=96;TCF=27;TCR=69;TR=45;WE=61288363;WS=61288345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,49:0.49:100
chr20	61289958	rs2427369	G	A	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=40;NR=2;PP=1119;SC=TCCCAGGCACGGGGCCCCACA;SOR=5.084;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=42;WE=61289966;WS=61289948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr20	61292373	rs144381587	G	GAGCCCCC	702.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=426;SC=CCACCTCCGGGAGCCCCCAGC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=6;WE=61292381;WS=61292363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr20	61292625	rs112272922	G	A	1234.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-2.374;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.229;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=40;PP=957;ReadPosRankSum=1.413;SC=TCATGATGGGGACGCAGCCCC;SOR=0.462;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=95;TCF=10;TCR=85;TR=46;WE=61292633;WS=61292615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,47:0.48:98
chr20	61296268	rs2277774	A	G	2529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.857;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.523;NF=86;NR=32;PP=2064;ReadPosRankSum=1.504;SC=TCTTCTCCACACCCCCACCTC;SOR=0.356;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=236;TCF=184;TCR=52;TR=118;WE=61296276;WS=61296258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,115:0.48:238
chr20	61326380	rs2427394	C	T	6466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=124;NR=83;PP=2965;SC=TAGGATCCAGCCCTGAGCTTC;SOR=1.190;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=207;TCF=124;TCR=83;TR=207;WE=61326388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr20	61326636	rs13036933	G	A	1301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.691;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=42;PP=1028;ReadPosRankSum=1.841;SC=GGCAAAATCAGAGAAATAAGG;SOR=2.152;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=115;TCF=32;TCR=83;TR=50;WE=61326644;WS=61326626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,49:0.42:117
chr20	61326746	rs60990764	G	C	371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.191;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=297;ReadPosRankSum=1.383;SC=TTTCCCAGAGGCACACATGTG;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=13;WE=61326754;WS=61326736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,13:0.62:21
chr20	61331678	rs4809531	C	A	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.503;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.039;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=9;PP=928;ReadPosRankSum=-0.390;SC=CATCCTTAGCCCAAGGAGGAA;SOR=1.817;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=101;TCF=73;TCR=28;TR=46;WE=61331686;WS=61331668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,48:0.46:104
chr20	61341286	rs3746780	A	G	4820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.963;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=107;PP=2965;ReadPosRankSum=0.342;SC=GAGCCTCAGTAACCAGCCCCG;SOR=1.179;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=144;TCF=36;TCR=108;TR=143;WE=61341294;WS=61341276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,150:0.99:151
chr20	61389566	.	C	T	307	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=19;MMLQ=27;MQ=54.36;NF=16;NR=0;PP=307;QD=21.3607007842;SC=TGAGCCCACGCCTCTGTGCCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=16;WE=61389577;WS=61389555;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,16:0.76:21
chr20	61428423	rs11696245	A	C	2141.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.149;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.961;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=6;PP=2962;ReadPosRankSum=0.565;SC=CTTTCTCCTCACCGCTCACCG;SOR=0.841;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=131;TCF=112;TCR=19;TR=51;WE=61428432;WS=61428413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,55:0.43:129
chr20	61428424	.	C	CCGCT	2132.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.744;ClippingRankSum=0.000;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.045;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=6;PP=2971;ReadPosRankSum=0.793;SC=TTTCTCCTCACCGCTCACCGG;SOR=1.028;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=118;TCF=94;TCR=24;TR=38;WE=61428432;WS=61428413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,55:0.42:131
chr20	61431028	rs41279362	C	T	498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=5.680;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=428;ReadPosRankSum=-2.960;SC=GAGAAGCGGGCGAGGCACTGT;SOR=0.563;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=0;TCR=40;TR=18;WE=61431036;WS=61431018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,19:0.46:41
chr20	61438749	rs118013909	A	G	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.865;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.922;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=4;PP=832;ReadPosRankSum=1.398;SC=GGGCAGGAGAATGAGAGGGAG;SOR=0.076;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=80;TCF=75;TCR=5;TR=38;WE=61438757;WS=61438739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
chr20	61439696	rs41282978	C	G	2054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=56;PP=1524;ReadPosRankSum=0.621;SC=CTCACAACCACTGGCAGCCGG;SOR=0.643;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=175;TCF=53;TCR=122;TR=81;WE=61439716;WS=61439686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,84:0.46:181
chr20	61439708	rs760276	G	A	4396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=106;PP=2962;SC=GGCAGCCGGCGCTTCCATCCT;SOR=2.527;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=30;TCR=106;TR=136;WE=61439716;WS=61439686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr20	61441035	rs2277772	G	A	7032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.934;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=224;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.810;HP=5;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=154;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.720;SC=GGAGGATGGGGGGATGGGGGG;SOR=2.110;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=210;TCF=56;TCR=154;TR=209;WE=61441043;WS=61441025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,220:1.00:221
chr20	61441061	rs45585738	G	A	2440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=182;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.825;HP=4;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=75;PP=1931;ReadPosRankSum=1.534;SC=GAGGCCACAGGGGGAGGGCCC;SOR=0.804;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=173;TCF=23;TCR=150;TR=86;WE=61441069;WS=61441051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,90:0.50:179
chr20	61441797	rs2277771	A	G	2962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=25;PP=2235;SC=GCACCTGCCCAAGGTCTGGAA;SOR=1.935;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=68;TCR=26;TR=93;WE=61441805;WS=61441787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr20	61443547	rs2075776	A	G	3919.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=41;PP=2965;SC=GAGGGGCCCCAGCCATTGACC;SOR=1.914;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=137;TCF=96;TCR=41;TR=137;WE=61443555;WS=61443537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr20	61443636	rs13038939	G	A	2440.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.184;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=52;PP=1892;ReadPosRankSum=-0.333;SC=TGGGTGAGCTGGGCCTCGAGC;SOR=0.591;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=178;TCF=73;TCR=105;TR=90;WE=61443644;WS=61443626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,94:0.53:179
chr20	61443716	rs41309371	G	A	1019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.471;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=28;PP=850;ReadPosRankSum=2.668;SC=CCGGGGGTGCGGCAGAGTGCC;SOR=1.230;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=79;TCF=20;TCR=59;TR=36;WE=61443724;WS=61443706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,39:0.47:83
chr20	61444523	rs116876380	C	T	818.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.462;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.163;NF=16;NR=18;PP=670;ReadPosRankSum=-1.368;SC=GGGAGCCCATCGGAGACCCCA;SOR=0.141;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=64;TCF=23;TCR=41;TR=34;WE=61444531;WS=61444513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,34:0.54:63
chr20	61448590	rs373609557	C	T	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=30;ReadPosRankSum=1.440;SC=AGCCTCGACGCCCCCAGCCCG;SOR=2.776;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=3;WE=61448598;WS=61448580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,3:0.50:6
chr20	61448788	rs376438897	A	G	497.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=0;PP=395;ReadPosRankSum=0.438;SC=GCTCCGCCCGAGGCTTTGGGT;SOR=0.957;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=17;WE=61448796;WS=61448782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,18:0.56:32
chr20	61450444	rs117754949	G	A	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.071;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=5;PP=283;ReadPosRankSum=-2.040;SC=ACAGTAGGGGGGACCCAGGAG;SOR=0.139;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=50;TCF=41;TCR=9;TR=18;WE=61450452;WS=61450434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr20	61450680	rs200945571	TCC	T	634.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=512;ReadPosRankSum=0.638;SC=CATGCCCCACTCCCCGCTCCG;SOR=0.922;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=15;WE=61450689;WS=61450670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
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chr20	61453584	rs117816490	A	G	1762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.045;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=48;PP=1353;ReadPosRankSum=-0.216;SC=GACCCTCCCCATTCCCCCTCC;SOR=1.245;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=169;TCF=80;TCR=89;TR=77;WE=61453592;WS=61453574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,77:0.46:168
chr20	61457289	.	C	T	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.152;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=610;ReadPosRankSum=-0.999;SC=AAGCCCTGCACATATCTACCC;SOR=0.804;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=72;TCF=24;TCR=48;TR=34;WE=61457297;WS=61457279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,34:0.46:74
chr20	61459315	rs45628843	C	T	2811.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.603;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=220;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.282;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=55;PP=2091;ReadPosRankSum=1.307;SC=GTGGCCGGGCCAAGCGGAGAG;SOR=0.665;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=211;TCF=109;TCR=102;TR=109;WE=61459323;WS=61459305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:107,111:0.51:218
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chr20	61467800	rs760087	A	G	4217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.078;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.169;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=121;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.071;SC=TGCCGCCCCCATGCTGACGAA;SOR=0.553;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=314;TCF=81;TCR=233;TR=167;WE=61467808;WS=61467790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:151,168:0.53:319
chr20	61467898	rs910152	G	C	4591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=17;NR=117;PP=2965;SC=AGTCAGCCACGTGCACCGGCT;SOR=3.578;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=17;TCR=118;TR=134;WE=61467906;WS=61467888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr20	61468571	rs2294995	T	C	1248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.683;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.398;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=23;PP=928;ReadPosRankSum=-1.142;SC=GAGGACCCCCTGGATACCGCG;SOR=0.894;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=112;TCF=58;TCR=54;TR=50;WE=61468579;WS=61468561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,52:0.46:114
chr20	61469969	rs117657687	A	G	786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=583;ReadPosRankSum=1.697;SC=AAGGTTGATCAGACACCGCTG;SOR=0.703;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=75;TCF=39;TCR=36;TR=34;WE=61469977;WS=61469959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,35:0.45:78
chr20	61473270	rs58968380	G	GT	107.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.171;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=235;ReadPosRankSum=-0.193;SC=TGCAGAAGGCGTGCACAGGTC;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=5;WE=61473278;WS=61473260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr20	61512606	rs910148	T	C	4935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=101;NR=61;PP=2965;SC=CCGGTCTCAGTGGCCAGGCGC;SOR=1.398;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=163;TCF=101;TCR=62;TR=162;WE=61512614;WS=61512596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr20	61527480	rs755740	T	C	1637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=1;PP=1321;ReadPosRankSum=-0.195;SC=AGAAACGTCTTAGCTTTCCTG;SOR=0.614;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=121;TCF=119;TCR=2;TR=57;WE=61527488;WS=61527470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,58:0.48:121
chr20	61527563	rs2013097	T	C	3525.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=312;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.141;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=93;NR=56;PP=2472;ReadPosRankSum=0.338;SC=AATACTCCAATGCACCGACAC;SOR=0.892;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=301;TCF=179;TCR=122;TR=149;WE=61527571;WS=61527553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:156,153:0.50:309
chr20	61528074	rs910149	T	C	2823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.925;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.648;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=54;PP=2046;ReadPosRankSum=-0.900;SC=AGGCAGCCGTTGCCGCTGCAG;SOR=0.602;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=201;TCF=104;TCR=97;TR=106;WE=61528082;WS=61528064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,115:0.54:212
chr20	61528271	rs1883847	C	T	2948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.885;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=87;PP=2385;ReadPosRankSum=0.839;SC=TTGCCCACCGCGGAGCCTGGA;SOR=1.430;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=250;TCF=75;TCR=175;TR=114;WE=61528279;WS=61528261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,117:0.44:263
chr20	61528306	rs1883848	A	G	1983.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.360;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=63;PP=1517;ReadPosRankSum=2.112;SC=TGAGGCTGCCATGGCTGCCGC;SOR=0.846;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=184;TCF=42;TCR=142;TR=81;WE=61528314;WS=61528296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,86:0.44:196
chr20	61538390	rs11479019	GC	G	581.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.022;NF=23;NR=1;PP=597;ReadPosRankSum=1.648;SC=CCACGTGTGCGCCCCCCTACA;SOR=0.737;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=24;WE=61538398;WS=61538381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,24:0.51:47
chr20	61541028	rs2295001	C	G	3485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.454;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=14;PP=2761;ReadPosRankSum=1.034;SC=GCTGAATGCTCGTCTCAGCGG;SOR=1.149;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=242;TCF=207;TCR=35;TR=118;WE=61541036;WS=61541018;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,124:0.50:247
chr20	61542001	rs2295002	C	T	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=367;ReadPosRankSum=1.210;SC=TCTTTTTTGACAACTTGTTCA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=18;WE=61542009;WS=61541991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,20:0.54:37
chr20	61542239	rs34097003	C	T	6468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=514;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.752;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=135;NR=118;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.319;SC=TGTCCTGAGCCGCCTTTCCCT;SOR=0.561;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=507;TCF=284;TCR=223;TR=253;WE=61542247;WS=61542229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:259,250:0.49:509
chr20	61575188	rs11300197	CT	C	66.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.473;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.47;MQRankSum=0.792;QD=4.17;ReadPosRankSum=0.961;SOR=0.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr20	61577275	rs2427452	T	C	7454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=112;PP=2965;SC=CATCGTCAGCTGGCTCTGCCG;SOR=0.863;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=240;TCF=128;TCR=112;TR=239;WE=61577283;WS=61577265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
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chr20	61588745	rs2427457	C	T	4655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=53;PP=2965;ReadPosRankSum=1.869;SC=GGTGGTGCCCCTTGGTCCTGC;SOR=0.546;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=142;TCF=89;TCR=53;TR=140;WE=61588753;WS=61588735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,144:0.99:145
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chr20	61847068	rs6090310	C	G	615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.979;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.238;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=15;PP=524;ReadPosRankSum=1.088;SC=CCGGCCCCGACGCGCGGTCAC;SOR=0.473;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=44;TCF=14;TCR=30;TR=23;WE=61847076;WS=61847058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,23:0.52:44
chr20	61869223	rs6062855	T	C	1522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.300;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.154;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=25;PP=1176;ReadPosRankSum=0.926;SC=TGGGTGGGACTTGGCTGGGGC;SOR=0.531;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=138;TCF=82;TCR=56;TR=58;WE=61869231;WS=61869213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,61:0.43:142
chr20	61869607	rs6010878	C	A	1129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=4.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.629;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=3;PP=856;ReadPosRankSum=0.462;SC=GGCGTCTCCACAGCAGCCCTC;SOR=1.136;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=74;TCF=64;TCR=10;TR=37;WE=61869615;WS=61869597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,40:0.51:79
chr20	61869826	rs2273487	C	T	4267.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=347;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.296;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=83;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.650;SC=TGCTGGGCTCCTGGGTGAGCG;SOR=0.687;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=335;TCF=167;TCR=168;TR=159;WE=61869834;WS=61869816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,163:0.47:344
chr20	61870075	rs744590	C	T	1957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.430;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.107;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=40;PP=1603;ReadPosRankSum=0.392;SC=GTGACGGGCACGTGACAGGGT;SOR=0.499;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=143;TCF=60;TCR=83;TR=73;WE=61870083;WS=61870065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,74:0.50:148
chr20	61870167	rs744591	C	A	3016.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.408;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=33;PP=2342;ReadPosRankSum=0.361;SC=CCCCCAGTGCCAGGCCCCATT;SOR=0.898;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=237;TCF=163;TCR=74;TR=113;WE=61870175;WS=61870157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,116:0.49:239
chr20	61870220	rs744592	T	C	3699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=328;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.404;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=66;PP=2510;ReadPosRankSum=1.639;SC=GCCCATTGCCTGTCGCCATAC;SOR=0.742;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=324;TCF=183;TCR=141;TR=154;WE=61870228;WS=61870210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,160:0.49:327
chr20	61870465	rs1075557	A	G	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.342;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=20;PP=847;ReadPosRankSum=0.297;SC=GGGCCGGCCCAGCTTTCTCCT;SOR=0.254;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=99;TCF=65;TCR=34;TR=47;WE=61870473;WS=61870455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,50:0.50:101
chr20	61870605	rs3215649	T	TG	961.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.166;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.748;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=24;PP=1043;ReadPosRankSum=0.655;SC=CGGGACCCCCTGGGTGAGGGC;SOR=0.848;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=100;TCF=33;TCR=67;TR=31;WE=61870613;WS=61870595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,40:0.35:115
chr20	61870634	rs1075556	A	G	807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.672;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=20;PP=591;ReadPosRankSum=0.062;SC=GGGAGGGCTGAGGGACCCCGA;SOR=0.887;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=103;TCF=42;TCR=61;TR=32;WE=61870642;WS=61870624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,35:0.32:109
chr20	61872905	rs1047826	A	G	2851.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-7.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=290;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.510;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=40;PP=2139;ReadPosRankSum=-0.783;SC=GGGCTGGGGCAGCCACTGGGG;SOR=0.810;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=280;TCF=187;TCR=93;TR=126;WE=61872913;WS=61872895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,128:0.45:287
chr20	61873039	rs1047822	T	C	2102.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.509;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.614;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=66;PP=1641;ReadPosRankSum=0.120;SC=ACTGCCTCTCTCTGTGCCGGC;SOR=0.789;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=216;TCF=48;TCR=168;TR=84;WE=61873047;WS=61873029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:136,86:0.39:222
chr20	61873080	rs1047819	T	A	1308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.785;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=40;PP=977;ReadPosRankSum=1.668;SC=TTTGCTGACATCTCAGTGGGG;SOR=0.480;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=131;TCF=26;TCR=105;TR=51;WE=61873088;WS=61873070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,55:0.40:138
chr20	61875497	rs2236186	A	C	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.530;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=21;PP=480;ReadPosRankSum=0.043;SC=GGTGTCATTGAGGCGATGTGG;SOR=0.341;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=51;TCF=8;TCR=43;TR=26;WE=61875505;WS=61875487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr20	61878632	rs2236193	G	A	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.935;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=248;ReadPosRankSum=2.019;SC=GAGGCGGGGTGTCTCGGCCTG;SOR=0.077;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=17;WE=61878640;WS=61878622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr20	61878649	rs4809512	T	G	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.455;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.539;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=552;ReadPosRankSum=0.097;SC=CCTGATCCGATTCCTTCCCAC;SOR=0.148;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=25;WE=61878657;WS=61878639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,24:0.53:45
chr20	61878950	rs872808	A	C	1258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.493;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=29;PP=1006;ReadPosRankSum=1.069;SC=ATCTGCAGGCAACTGTGTAGG;SOR=1.158;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=127;TCF=57;TCR=70;TR=48;WE=61878958;WS=61878940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,49:0.37:131
chr20	61880169	rs1129659	T	G	3745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.444;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=70;PP=2803;ReadPosRankSum=-0.112;SC=GCACTCACCTTTAAGAGGCCA;SOR=0.620;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=267;TCF=134;TCR=133;TR=140;WE=61880177;WS=61880159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,147:0.53:275
chr20	61880274	rs2273497	A	G	1644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.338;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=51;PP=1250;ReadPosRankSum=0.642;SC=ATGGGGCGGCAGCTGAACACA;SOR=0.368;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=126;TCF=20;TCR=106;TR=63;WE=61880282;WS=61880264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,68:0.52:131
chr20	61881296	rs927081	A	G	1926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-4.067;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.333;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=25;PP=1417;ReadPosRankSum=0.117;SC=CCACCATGACATAGCGCAGCC;SOR=1.584;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=157;TCF=93;TCR=64;TR=80;WE=61881304;WS=61881286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,84:0.52:160
chr20	61885452	rs34203226	G	T	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=9;PP=282;ReadPosRankSum=1.531;SC=CCCGCCCGAAGGCTTCCGTCC;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=13;WE=61885460;WS=61885442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,13:0.72:18
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chr20	61912715	rs2236195	T	C	625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.542;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=27;PP=450;ReadPosRankSum=0.532;SC=TCACTGCCCCTGCCATGCCAC;SOR=2.368;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=67;TCF=14;TCR=53;TR=30;WE=61912723;WS=61912705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,30:0.45:67
chr20	61916379	rs13042357	C	T	2661.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=67;PP=1991;ReadPosRankSum=-0.577;SC=TGGGACTCAGCGAGGCCAAGC;SOR=0.697;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=211;TCF=76;TCR=135;TR=105;WE=61916387;WS=61916369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,108:0.51:213
chr20	61917241	rs6090342	A	G	3771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=83;NR=21;PP=2965;SC=TATGGAAACAACTTGGCCCAC;SOR=2.728;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=105;TCF=84;TCR=21;TR=104;WE=61917249;WS=61917231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr20	61918164	rs6062431	C	G	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.403;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.294;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=13;PP=835;ReadPosRankSum=1.300;SC=GCTGGCGCTGCTCTGCTGTTC;SOR=0.360;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=90;TCF=67;TCR=23;TR=43;WE=61918172;WS=61918154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,43:0.48:89
chr20	61941747	rs4809287	A	G	2529.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=25;PP=1857;SC=TGGTGGAGGGACCCGCCGCCT;SOR=1.581;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=50;TCR=25;TR=75;WE=61941755;WS=61941737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr20	61943113	rs34976669	A	T	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.104;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=297;ReadPosRankSum=2.164;SC=GAGTGCTCCAACCCCGGCTGC;SOR=2.985;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=12;WE=61943121;WS=61943103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr20	61946692	rs6090357	C	T	4577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=88;NR=57;PP=2965;SC=CCCTCCCCAGCGGTCTGTCAG;SOR=1.157;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=146;TCF=89;TCR=57;TR=145;WE=61946700;WS=61946682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chr20	61951326	rs11478836	CT	C	1566.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=32;NR=6;PP=1567;SC=CTGGCCTGGCCTTGGGGGCTC;SOR=3.467;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=38;WE=61951334;WS=61951316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr20	61951489	rs6089881	G	C	1998.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=44;PP=1583;SC=CACCCGCTGCGGGCTTCGTCA;SOR=1.542;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=23;TCR=44;TR=67;WE=61951497;WS=61951479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr20	61951789	rs6062891	C	T	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=28;PP=928;SC=GGTCACAGTGCCTGGGGTCAG;SOR=3.026;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=6;TCR=28;TR=34;WE=61951797;WS=61951779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr20	61952490	rs4809533	A	G	2700.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=73;PP=2199;SC=ACCAGGGAACACTGGCCAATG;SOR=4.281;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=8;TCR=74;TR=81;WE=61952498;WS=61952480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr20	61953365	rs1884821	T	C	1470.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=10;PP=1199;SC=TCCTCTACCTTGGTTGGGTAG;SOR=2.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=36;TCR=10;TR=46;WE=61953373;WS=61953355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr20	61956638	.	C	G	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.573;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=2;PP=149;ReadPosRankSum=2.158;SC=CCGGGCCACCCGGACAGATGG;SOR=0.610;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=12;WE=61956646;WS=61956628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr20	61956782	rs2314251	T	C	2303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=43;PP=1814;SC=CAGCCCATCTTCCCCCTCCAG;SOR=0.948;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=33;TCR=43;TR=76;WE=61956790;WS=61956772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr20	61960762	rs5842416	CTG	C	2984.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=6;PP=2718;SC=CAGGAGGCGCCTGTGTGGAGC;SOR=4.468;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=67;TCF=58;TCR=9;TR=55;WE=61960771;WS=61960752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr20	61981104	rs1044397	C	T	5096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=125;PP=2965;SC=GCGGGGGCGGCGCTTTGGTGC;SOR=2.605;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=160;TCF=35;TCR=125;TR=156;WE=61981112;WS=61981094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr20	61981134	rs1044396	G	A	4175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.469;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=95;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.271;SC=TGACCGTGGCGCTCGGGGACA;SOR=2.233;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=128;TCF=31;TCR=97;TR=125;WE=61981142;WS=61981124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,134:0.99:136
chr20	61981179	rs199783192	C	T	918.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.730;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=22;PP=718;ReadPosRankSum=1.128;SC=TGCATTTGCACGGAGAGGGCT;SOR=0.904;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=87;TCF=34;TCR=53;TR=34;WE=61981187;WS=61981169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,37:0.40:93
chr20	61981536	rs2229960	A	G	3736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=34;PP=2958;SC=CCAGGGGGACACAGAAGGACG;SOR=2.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=124;TCF=90;TCR=34;TR=124;WE=61981544;WS=61981526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr20	61981554	rs2229959	C	A	4716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=92;NR=55;PP=2965;SC=ACGGTGAGGGCGGGTGCAGGC;SOR=1.304;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=147;TCF=92;TCR=55;TR=147;WE=61981562;WS=61981544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr20	61982085	rs1044394	A	G	12224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=424;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=259;NR=152;PP=2965;SC=AGATCTCGGCACAGCACTCGT;SOR=1.344;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=412;TCF=260;TCR=152;TR=411;WE=61982093;WS=61982075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,422:1.00:422
chr20	61982124	rs1044393	A	G	14132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=497;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=279;NR=202;PP=2965;SC=TGCCCACGGCATCCACGATGA;SOR=1.034;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=482;TCF=280;TCR=202;TR=481;WE=61982132;WS=61982114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,493:1.00:493
chr20	61982496	rs13041103	T	C	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=509;SC=CACGCCCACATCCACGTCCAC;SOR=4.514;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=61982504;WS=61982486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr20	61990874	rs6090384	T	C	2144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=25;PP=1642;SC=TCAGTCACAGTGCACGATGGC;SOR=1.211;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=42;TCR=25;TR=67;WE=61990882;WS=61990864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr20	61992285	rs11698563	A	C	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=112;SC=GTGCGAGCGCAGCCTGTGCGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=61992293;WS=61992275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr20	61992547	rs6090387	G	C	389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=9;PP=231;SC=CTCTAGATGCGGGCGGCTCCC;SOR=1.244;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=14;WE=61992555;WS=61992537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr20	62005458	rs35318934	G	C	1808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=44;PP=1496;SC=CACAGATGCCGCCATCCGTCC;SOR=3.342;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=6;TCR=44;TR=50;WE=62005466;WS=62005448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr20	62038277	rs1801475	T	G	5316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=45;NR=120;PP=2965;SC=GTCCCGCAGGTTCCCCTCGGG;SOR=2.024;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=45;TCR=120;TR=165;WE=62038285;WS=62038267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr20	62038378	rs1801471	A	T	1824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.703;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=29;PP=1427;ReadPosRankSum=0.945;SC=GCTCGTGGGCAGGCGGCGGCG;SOR=0.835;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=114;TCF=60;TCR=54;TR=65;WE=62038386;WS=62038368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,65:0.57:115
chr20	62038757	rs3746364	C	T	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.622;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=31;PP=676;ReadPosRankSum=0.210;SC=GGCTGGGGTGCGAGGGCCCGT;SOR=0.334;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=78;TCF=11;TCR=67;TR=38;WE=62038765;WS=62038747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,41:0.51:81
chr20	62046496	rs112006486	C	CGACAGACA	10510.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=261;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=96;PP=2980;SC=CCACGGGAACCGACAGACAGA;SOR=1.115;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=181;TCF=50;TCR=131;TR=135;WE=62046504;WS=62046486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr20	62055417	rs6089910	G	A	3690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.800;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.594;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=46;PP=2925;ReadPosRankSum=-0.359;SC=AGTCACACACGGAAGCACACA;SOR=0.858;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=307;TCF=206;TCR=101;TR=148;WE=62055425;WS=62055407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:169,149:0.47:318
chr20	62074003	rs372494294	TCAC	T	129.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.057;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.97;ReadPosRankSum=-0.805;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr20	62074021	.	CCACCACCACCACCACCATCACCAT	C	37.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.43;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,2:0.50:4
chr20	62076743	rs6062939	C	A	1954.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.285;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=54;PP=1440;ReadPosRankSum=0.616;SC=GCTGAGGCCACCTTGAGGCCT;SOR=0.587;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=172;TCF=48;TCR=124;TR=78;WE=62076751;WS=62076733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,80:0.44:181
chr20	62119588	rs71799118	GC	G	862.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.07;QD=43.14;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr20	62119594	rs71792296	GC	G	935.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.02;QD=44.56;SOR=4.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr20	62119595	.	C	G	540	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MMLQ=23;MQ=61.34;NF=19;NR=1;PP=540;QD=28.7385606274;SC=GGGGCCCGGGCCCGGGGTTCG;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=20;WE=62119603;WS=62119580;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,20:0.95:21
chr20	62119615	rs2750402	A	G	1180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=2;PP=618;SC=GGAGCGCGGCACCGCCGGGGA;SOR=4.548;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=62119623;WS=62119605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr20	62121702	rs310607	A	G	3374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=29;PP=2727;SC=ACAGGCGTGAACCACTGCGCC;SOR=1.981;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=104;TCF=74;TCR=30;TR=103;WE=62121710;WS=62121692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr20	62121726	rs310608	T	C	1671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.598;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=19;PP=1204;ReadPosRankSum=0.195;SC=CCTGAGGGTCTGGTTTTCTCC;SOR=1.124;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=133;TCF=90;TCR=43;TR=68;WE=62121734;WS=62121716;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,67:0.52:130
chr20	62126185	rs310617	A	G	2621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=24;PP=2077;ReadPosRankSum=0.401;SC=GCATGTTGTCACCGTGCCAGC;SOR=0.706;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=199;TCF=158;TCR=41;TR=114;WE=62126193;WS=62126175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,115:0.57:201
chr20	62127121	rs310618	T	C	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.505;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.212;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=396;ReadPosRankSum=1.092;SC=CAGGAGACCCTACCATCCCAG;SOR=0.175;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=19;WE=62127129;WS=62127111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,21:0.48:44
chr20	62127521	rs310619	G	A	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=33;PP=773;ReadPosRankSum=-0.339;SC=GCTCTCCGTCGGGGTCCTGGG;SOR=0.865;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=0;TCR=61;TR=33;WE=62127529;WS=62127511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,33:0.54:61
chr20	62153311	rs1139147	G	C	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=5;PP=65;ReadPosRankSum=-1.341;SC=TCCCCACTCCGCATCCCTCGC;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=5;WE=62153319;WS=62153301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr20	62153517	rs139707650	AG	A	126.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-2.484;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=146;ReadPosRankSum=0.705;SC=AGCAGCCAGTAGCCCCGATGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=62153525;WS=62153507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr20	62162340	rs191090	T	C	2502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=65;PP=2103;SC=TGGGGAAGGGTTGGGGAGGCT;SOR=4.294;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=7;TCR=65;TR=72;WE=62162348;WS=62162330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr20	62172219	rs6122130	G	A	6249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=124;NR=76;PP=2965;SC=GCAGCGTGGCGAAGGAGGGCC;SOR=1.225;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=201;TCF=124;TCR=77;TR=200;WE=62172227;WS=62172209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
chr20	62173029	rs310656	A	G	283.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=264;SC=CGGTGAGGCCAGCGTCCACCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=62173037;WS=62173019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr20	62173562	rs56130722	G	T	6461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=131;NR=65;PP=2965;SC=GTTCCGTGACGATGTACACAG;SOR=1.597;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=196;TCF=131;TCR=65;TR=196;WE=62173570;WS=62173552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr20	62174724	rs4809309	G	A	4220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.026;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.522;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=57;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.736;SC=TGGCCTTGTAGTAGGTGAGCA;SOR=0.618;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=130;TCF=72;TCR=58;TR=129;WE=62174732;WS=62174714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,134:0.99:135
chr20	62187187	rs3746348	T	C	2572.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.325;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=42;PP=1922;ReadPosRankSum=1.089;SC=CGGACCTGAGTCCGCACCTGC;SOR=0.443;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=176;TCF=104;TCR=72;TR=94;WE=62187195;WS=62187177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,99:0.54:185
chr20	62187439	rs734750	T	C	2863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=265;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.562;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=83;PP=1997;ReadPosRankSum=1.270;SC=CTGAGCTGGATGCCCTGCTCC;SOR=0.579;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=257;TCF=89;TCR=168;TR=129;WE=62187447;WS=62187429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,131:0.50:264
chr20	62187807	rs141589815	C	T	3698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=305;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.409;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=61;PP=2962;ReadPosRankSum=0.376;SC=ATCCCCGTGGCTGCCTGCACC;SOR=1.073;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=302;TCF=160;TCR=142;TR=151;WE=62187815;WS=62187797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:152,151:0.50:303
chr20	62191321	rs3810477	A	G	2973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=39;PP=2200;SC=TGACAGCCACATTCACTTGGT;SOR=1.480;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=67;TCR=39;TR=106;WE=62191329;WS=62191311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr20	62191475	rs3810478	T	G	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.071;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=20;PP=633;ReadPosRankSum=-1.471;SC=GAGGCCCTGCTGCCGCTGCGC;SOR=0.838;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=74;TCF=38;TCR=36;TR=34;WE=62191483;WS=62191465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,33:0.43:76
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chr20	62193445	rs3810481	G	A	1823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.933;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=56;PP=1585;ReadPosRankSum=-0.504;SC=CTGAATGACCGTGAAAGGCTT;SOR=1.514;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=167;TCF=51;TCR=116;TR=72;WE=62193453;WS=62193435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:97,71:0.42:168
chr20	62194030	rs3810483	G	C	1805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.842;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=39;PP=1534;ReadPosRankSum=1.167;SC=TCCCAGTCCTGCGTCTGCCCG;SOR=0.337;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=127;TCF=42;TCR=85;TR=64;WE=62194038;WS=62194020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,64:0.48:134
chr20	62194103	rs3810484	A	G	1458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.969;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=1152;ReadPosRankSum=-1.297;SC=TGCTGGGCCCAGGGCGTGGGC;SOR=0.349;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=104;TCF=61;TCR=43;TR=58;WE=62194111;WS=62194093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,59:0.56:105
chr20	62194713	rs3810486	A	C	1038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.976;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=18;PP=724;ReadPosRankSum=-1.529;SC=CTCCACGGCCAGGGTGTGTGG;SOR=0.653;SbPval=0.17;Source=Platypus;TC=78;TCF=36;TCR=42;TR=43;WE=62194721;WS=62194703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,44:0.56:79
chr20	62195220	rs3827022	C	T	2570.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.543;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=52;PP=2107;ReadPosRankSum=-0.292;SC=CTGGTGGCCCCGGGCGCAGCG;SOR=0.649;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=185;TCF=83;TCR=102;TR=97;WE=62195228;WS=62195210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,97:0.54:181
chr20	62195672	rs3827023	C	T	2233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-7.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.411;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=51;PP=1699;ReadPosRankSum=0.822;SC=AGTCGGACCGCAGGCGGTGCC;SOR=0.974;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=172;TCF=83;TCR=89;TR=89;WE=62195680;WS=62195662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,89:0.51:174
chr20	62196033	rs3810487	C	T	1488.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.553;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=20;PP=1209;ReadPosRankSum=0.728;SC=CACCCCGTCCCTGGGCACGAA;SOR=0.932;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=115;TCF=74;TCR=41;TR=59;WE=62196041;WS=62196023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,57:0.50:114
chr20	62196182	rs3810488	G	C	2385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.486;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=34;PP=1644;ReadPosRankSum=0.286;SC=CTCGGCGGCCGGCAACCCGGC;SOR=0.732;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=236;TCF=148;TCR=88;TR=95;WE=62196190;WS=62196172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:140,103:0.42:243
chr20	62196807	rs310632	T	C	11201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=388;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=203;NR=168;PP=2965;SC=GGGCTCCGCGTGCAGCAGCTT;SOR=0.886;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=372;TCF=203;TCR=169;TR=371;WE=62196815;WS=62196797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,382:1.00:382
chr20	62196884	rs310633	A	G	4004.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=307;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.117;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=85;PP=2962;ReadPosRankSum=0.895;SC=GCCTGGCGACAGTGTCCAGCA;SOR=0.532;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=295;TCF=130;TCR=165;TR=157;WE=62196892;WS=62196874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:143,162:0.53:305
chr20	62198348	rs438363	C	T	5893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=437;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.891;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=148;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.366;SC=CCGGTCTGGGCTGCCCGCCAC;SOR=0.554;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=421;TCF=132;TCR=289;TR=222;WE=62198356;WS=62198338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:207,228:0.52:435
chr20	62198662	rs367440	A	G	1523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-5.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.060;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=31;PP=1073;ReadPosRankSum=-0.533;SC=CGTGCGAGGCATAGGCCAGCG;SOR=0.571;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=134;TCF=63;TCR=71;TR=66;WE=62198670;WS=62198652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,69:0.50:137
chr20	62199126	rs3810491	C	G	620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.388;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=22;PP=524;ReadPosRankSum=-0.508;SC=TGGTGTCCCTCCTGTCAGGAG;SOR=1.148;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=50;TCF=10;TCR=40;TR=26;WE=62199134;WS=62199116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,25:0.49:51
chr20	62200471	rs6089923	C	G	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.921;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=11;PP=403;ReadPosRankSum=-1.053;SC=GCTCCTGCTACCCCAGCTGCT;SOR=0.380;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=54;TCF=32;TCR=22;TR=21;WE=62200479;WS=62200461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,21:0.39:54
chr20	62200575	rs1741594	TG	CA	1408.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.876;HP=3;HapScore=2;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=18;PP=1620;ReadPosRankSum=-1.370;SC=AGTTGGTTGGTGAGATGGGGC;SOR=0.307;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=68;TCF=30;TCR=38;TR=37;WE=62200584;WS=62200565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,36:0.55:66
chr20	62200860	rs1757752	A	G	2621.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=271;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.063;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=54;PP=2116;ReadPosRankSum=1.825;SC=CGAACGAGGCAGCCTGCACAC;SOR=0.664;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=262;TCF=130;TCR=132;TR=114;WE=62200868;WS=62200850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:153,115:0.43:268
chr20	62202240	rs402211	A	G	140.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.656;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=107;ReadPosRankSum=1.594;SC=CAGGGAGGTCAGCAGGGCTAC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=7;WE=62202248;WS=62202230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr20	62202301	rs3746346	A	G	38.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.230;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=3.23;ReadPosRankSum=-1.046;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,3:0.25:12
chr20	62221364	rs2297427	G	A	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.350;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=202;ReadPosRankSum=-0.744;SC=CCAGCCCTGCGGCCTCTGCCC;SOR=0.180;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=10;WE=62221372;WS=62221355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,10:0.53:19
chr20	62221610	rs311496	T	C	2484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=6.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.348;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=36;PP=2021;ReadPosRankSum=0.755;SC=TGAGCAGCTGTAGCGGGCTGA;SOR=0.950;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=183;TCF=105;TCR=78;TR=93;WE=62221618;WS=62221600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,95:0.50:189
chr20	62221766	rs2297428	C	T	3447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=284;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.290;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=70;PP=2615;ReadPosRankSum=-0.495;SC=GCGGGGAGGCCGGGGAGCTGG;SOR=0.793;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=274;TCF=136;TCR=138;TR=133;WE=62221774;WS=62221756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:142,138:0.49:280
chr20	62223371	rs311494	A	G	1622.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-8.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.245;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=8;PP=1299;ReadPosRankSum=-0.627;SC=TGGTCTCAGCATACCTGCCAG;SOR=0.300;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=139;TCF=127;TCR=12;TR=74;WE=62223379;WS=62223361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,73:0.53:138
chr20	62224595	rs2236503	G	A	658.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.373;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=515;ReadPosRankSum=0.949;SC=AAGTGTACCTGCCTTATATTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=4;TCR=52;TR=26;WE=62224603;WS=62224585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr20	62227081	rs311489	A	G	2534.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=225;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.488;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=52;PP=1895;ReadPosRankSum=1.257;SC=AGACCTTGTCATGCTGGTAGA;SOR=0.749;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=218;TCF=111;TCR=107;TR=106;WE=62227089;WS=62227071;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,110:0.49:223
chr20	62227180	rs2282157	C	G	1490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.457;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=45;PP=1116;ReadPosRankSum=0.035;SC=GCACCTGGCCCGCCCACCCTG;SOR=0.422;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=101;TCF=12;TCR=89;TR=53;WE=62227188;WS=62227170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,57:0.53:107
chr20	62229244	rs2297430	T	C	3646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=292;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.446;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=86;PP=2756;ReadPosRankSum=0.729;SC=TGGGTCAAGCTTGGCCGGGAC;SOR=0.603;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=276;TCF=100;TCR=176;TR=138;WE=62229252;WS=62229234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:144,146:0.50:290
chr20	62229337	rs414897	G	A	1409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.232;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=46;PP=1167;ReadPosRankSum=-0.416;SC=GGCTCTGACCGGTGCAGGCCT;SOR=1.678;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=103;TCF=13;TCR=90;TR=50;WE=62229345;WS=62229327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,51:0.49:105
chr20	62234240	rs4809312	CA	TG	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.972;HP=1;HapScore=2;JOINED;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=1095;ReadPosRankSum=0.485;SC=AGGATGCACTCAGCACAGCTG;SOR=2.066;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=39;TCF=35;TCR=4;TR=21;WE=62234249;WS=62234230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,21:0.54:39
chr20	62234273	rs766915	A	G	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.463;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=3;PP=557;ReadPosRankSum=1.337;SC=AGTCACAGACACCATGAGGCC;SOR=0.970;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=60;TCF=54;TCR=6;TR=33;WE=62234281;WS=62234263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,34:0.56:61
chr20	62236148	rs6090471	T	C	4276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=90;PP=2965;SC=CGGCAGCTGCTGCCGCTGCAT;SOR=1.209;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=151;TCF=61;TCR=90;TR=151;WE=62236156;WS=62236138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chr20	62272658	rs2150910	T	C	263.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=4;PP=242;SC=GAACGTGTTCTGTCGCAGGAT;SOR=1.402;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=6;TCR=4;TR=10;WE=62272666;WS=62272648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr20	62273435	rs186744824	G	A	193.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.006;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=149;ReadPosRankSum=1.080;SC=CCCGCTCCGAGCTCCGCCCCG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=8;WE=62273443;WS=62273425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr20	62275492	rs6010985	G	C	637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=508;ReadPosRankSum=-0.017;SC=AGTTCAGAGAGACTGCCGGAG;SOR=0.749;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=36;TCF=29;TCR=7;TR=23;WE=62275500;WS=62275482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,23:0.62:37
chr20	62275844	rs6010986	T	C	2417.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.00;SOR=4.548;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr20	62275844	.	TC	CC,CT	575	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.11;FR=0.5000,0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=5,3;NR=58,23;PP=575,499;QD=9.67890813567;SC=CTTCCAGACGTCGGCACTGTC;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=5;TCR=59;TR=63,26;WE=62275853;WS=62275834;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.98:64
chr20	62275845	rs73135821	C	T	694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=4.825;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.98;ReadPosRankSum=0.587;SOR=0.151;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,27:0.47:58
chr20	62291008	rs6089953	A	G	2441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=68;PP=1995;SC=AGGTGGGGTCAGAGAGAGGAT;SOR=5.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=71;TCF=3;TCR=68;TR=71;WE=62291016;WS=62290998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr20	62293272	rs3848668	A	G	1941.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.577;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=39;PP=1426;ReadPosRankSum=0.982;SC=CAGGTCATCAACGAGCTTCGG;SOR=0.751;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=153;TCF=70;TCR=83;TR=72;WE=62293280;WS=62293262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,75:0.46:163
chr20	62294015	rs2297434	C	T	2121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.462;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=45;PP=1704;ReadPosRankSum=-0.135;SC=GCTCAGTGTCCGACAGGCGAG;SOR=0.227;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=141;TCF=48;TCR=93;TR=74;WE=62294023;WS=62294005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,79:0.53:148
chr20	62294062	rs12480249	G	A	1456.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.828;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=35;PP=1186;ReadPosRankSum=-0.841;SC=CTGCGCTCCCGCTGGGCTAGG;SOR=1.208;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=105;TCF=42;TCR=63;TR=55;WE=62294070;WS=62294052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,56:0.51:110
chr20	62294094	rs12481716	T	C	1619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.308;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.381;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=27;PP=1319;ReadPosRankSum=0.132;SC=ACTGGGGGACTGCAGGGGAGG;SOR=1.010;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=110;TCF=59;TCR=51;TR=62;WE=62294102;WS=62294084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,63:0.55:115
chr20	62294158	rs45523833	C	T	2038.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.289;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=31;PP=1506;ReadPosRankSum=-0.960;SC=GCTTCAGCTGCGCACTCTGCC;SOR=0.269;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=157;TCF=106;TCR=51;TR=79;WE=62294166;WS=62294148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,81:0.50:161
chr20	62297400	rs73920935	T	C	2628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.625;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=47;PP=1906;ReadPosRankSum=-0.944;SC=TCCTGGACATTGAGGACTTGG;SOR=0.813;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=218;TCF=120;TCR=98;TR=107;WE=62297408;WS=62297390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,109:0.49:222
chr20	62303794	rs6062300	G	A	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.550;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.80;ReadPosRankSum=-1.630;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,7:0.64:11
chr20	62304114	rs56010802	G	C	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=284;ReadPosRankSum=-1.074;SC=CACACCAGGAGCTTCTGCCAC;SOR=2.235;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=13;WE=62304122;WS=62304104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr20	62309554	rs41309367	C	T	2942.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.172;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=66;PP=2240;ReadPosRankSum=1.169;SC=TTGCCCTCCCCGCCTCCTTGC;SOR=0.837;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=240;TCF=101;TCR=139;TR=114;WE=62309562;WS=62309544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:129,117:0.48:246
chr20	62311377	rs41309933	G	A	666.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=0.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.028;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=513;ReadPosRankSum=-0.339;SC=TGGCAGTCAGGGCTCCCCTGG;SOR=0.138;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=43;TCF=16;TCR=27;TR=26;WE=62311385;WS=62311367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,26:0.59:44
chr20	62312299	rs2297440	T	C	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=13;PP=292;SC=CCCAGGGTGATGCTGGTGAGG;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=3;TCR=13;TR=16;WE=62312307;WS=62312289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr20	62316834	rs75451331	G	T	2338.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.539;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.203;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=51;PP=1713;ReadPosRankSum=1.582;SC=AAGTCGGGTGGCCTCAGGCTC;SOR=0.677;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=179;TCF=87;TCR=92;TR=93;WE=62316842;WS=62316824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,97:0.52:185
chr20	62319166	rs111622789	C	CTT	595.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.536;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=7;PP=621;ReadPosRankSum=2.173;SC=GGTGACACCTCTGACATCAGC;SOR=0.330;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=26;TCF=15;TCR=11;TR=14;WE=62319174;WS=62319156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,16:0.55:29
chr20	62319207	rs143664886	C	CGGG	798.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.714;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=6;PP=585;ReadPosRankSum=-0.928;SC=CCCCATGAGCCGGGTGCTGGG;SOR=0.493;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=17;WE=62319215;WS=62319197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,17:0.41:41
chr20	62319464	rs2738785	T	C	6891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=101;NR=104;PP=2965;SC=AGGCCTGAGGTCCTGAGCAGT;SOR=0.741;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=205;TCF=101;TCR=104;TR=205;WE=62319472;WS=62319454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,211:1.00:211
chr20	62319561	rs2777940	C	G	2371.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.199;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=59;PP=1774;ReadPosRankSum=-0.560;SC=CCAGCTGTGCCCATCCTGGAT;SOR=1.148;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=208;TCF=97;TCR=111;TR=98;WE=62319569;WS=62319551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,101:0.48:209
chr20	62319604	rs2777941	A	C	5900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=60;NR=121;PP=2965;SC=CTGGTAGGGAACCCTGCAGAC;SOR=1.597;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=181;TCF=60;TCR=121;TR=181;WE=62319612;WS=62319594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr20	62320968	rs6062302	T	C	5160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=100;PP=2965;SC=AGTTCCTGGATGAGATGAAGG;SOR=1.051;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=173;TCF=72;TCR=101;TR=172;WE=62320976;WS=62320958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr20	62321655	rs2236506	G	A	7865.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=256;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=116;NR=136;PP=2965;SC=AGATGCCAGCGCCGGCCCCCC;SOR=0.854;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=254;TCF=116;TCR=138;TR=252;WE=62321663;WS=62321645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,253:1.00:253
chr20	62322288	rs3208007	T	C	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=14;PP=475;SC=CGGGGAGCCCTGGCGAGGAGC;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=24;WE=62322296;WS=62322278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr20	62323006	rs2236507	G	C	3454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=36;PP=2588;SC=GGGCTCCTTGGGACCATCTTC;SOR=1.651;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=110;TCF=74;TCR=36;TR=109;WE=62323014;WS=62322996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr20	62326110	rs3208008	A	C	4587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=117;NR=24;PP=2965;SC=CTGGCAGCCAACCACAGTGGG;SOR=3.073;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=117;TCR=24;TR=141;WE=62326118;WS=62326100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,142:1.00:142
chr20	62328375	rs2738787	A	G	7712.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=95;NR=151;PP=2965;SC=GGAACTACCTAGAGCGCTGCC;SOR=1.197;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=246;TCF=95;TCR=151;TR=246;WE=62328383;WS=62328365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,245:1.00:245
chr20	62332436	rs2738788	A	G	903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=3;PP=713;SC=TCAGTGATGGAGGCAGTCTGC;SOR=3.767;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=62332444;WS=62332426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr20	62332638	rs374497353	A	AC	4923.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=73;PP=2936;SC=GTGAAGATTCACCTGGCCCTC;SOR=1.228;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=116;TCF=35;TCR=81;TR=106;WE=62332646;WS=62332628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,141:1.00:141
chr20	62337622	rs1291211	A	G	1538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=2;PP=1275;SC=GGTAAGGAAAACTGCTGAGGA;SOR=5.376;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=43;TCR=2;TR=45;WE=62337630;WS=62337612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr20	62340115	rs1291212	C	G	5443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=86;PP=2965;SC=GGAAGAGCAGCTTGTTGGCCG;SOR=0.777;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=81;TCR=86;TR=167;WE=62340123;WS=62340105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr20	62364885	rs6011068	T	A	9080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=296;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=186;NR=89;PP=2965;SC=GGTGGTTCCCTTCAGTGGCAC;SOR=1.504;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=275;TCF=186;TCR=89;TR=275;WE=62364893;WS=62364875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,288:1.00:288
chr20	62367377	rs2427535	A	G	3044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.98;NF=5;NR=84;PP=2550;SC=TGGGGCGTGCAGACACTGCTG;SOR=5.069;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=5;TCR=84;TR=89;WE=62367385;WS=62367367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr20	62369300	rs914559	C	G	2271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=25;PP=1676;SC=GTCCGCAGGGCACCGACCAGC;SOR=1.432;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=47;TCR=25;TR=72;WE=62369308;WS=62369290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr20	62369426	rs150938918	C	CGGGGCG	259.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.30;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr20	62369895	rs1151624	A	G	3993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=72;PP=2965;SC=GGGCCGGCAGATCCTCAGCAG;SOR=1.089;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=123;TCF=51;TCR=72;TR=123;WE=62369903;WS=62369885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr20	62370349	rs1056441	T	C	1444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=47;PP=1148;SC=GTCCCCGGGCTGCCAGCCCGT;SOR=3.872;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=5;TCR=47;TR=52;WE=62370357;WS=62370339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr20	62372706	rs4809221	G	A	1056.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=7;PP=829;SC=CCCGCACCCCGCCCCCATCTC;SOR=2.432;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=35;WE=62372714;WS=62372696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr20	62372813	rs2427536	G	A	3167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=44;PP=2420;SC=TGGGGGCCCCGGTTGCAGCCT;SOR=0.884;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=53;TCR=44;TR=97;WE=62372821;WS=62372803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr20	62373707	rs8957	G	T	2212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=37;PP=1878;SC=CAGAGCCTGAGCAGAGTGATG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=38;TCR=37;TR=75;WE=62373715;WS=62373697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr20	62374219	rs1151626	A	C	4708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=51;PP=2965;SC=ATGTCCTGTGACCCCCCGCAC;SOR=1.441;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=145;TCF=94;TCR=51;TR=144;WE=62374227;WS=62374209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr20	62374441	rs6742	T	C	1763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=52;PP=1575;SC=AGGGGCTGGCTTTCACCAGCT;SOR=6.479;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=53;TCF=1;TCR=52;TR=53;WE=62374449;WS=62374431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr20	62378364	rs12625387	C	T	3180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=227;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.163;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=48;PP=2430;ReadPosRankSum=-1.294;SC=CCTTGTCGTCCGCCAACAGCG;SOR=0.323;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=223;TCF=142;TCR=81;TR=118;WE=62378372;WS=62378354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,121:0.54:225
chr20	62407104	rs3827026	C	T	1490.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.894;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.725;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=20;PP=1145;ReadPosRankSum=0.866;SC=CGTCGGCCTTCAGCGACAGCA;SOR=1.106;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=103;TCF=62;TCR=41;TR=56;WE=62407112;WS=62407094;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,57:0.54:105
chr20	62488889	rs368004706	CT	C	71.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.35;ReadPosRankSum=-1.684;SOR=0.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,12:0.23:53
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chr20	62492922	rs2281534	T	A	1696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.394;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=20;PP=1316;ReadPosRankSum=-0.698;SC=GTGAAGGCGCTGGTGCGCGTG;SOR=0.971;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=128;TCF=86;TCR=42;TR=68;WE=62492930;WS=62492912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,69:0.53:130
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chr20	62494027	rs2236152	G	C	880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=676;ReadPosRankSum=0.762;SC=GCAGCTTGGCGCAGGAGGCCG;SOR=0.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=65;TCF=24;TCR=41;TR=33;WE=62494035;WS=62494017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,35:0.51:68
chr20	62496511	rs8122494	C	A	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=259;ReadPosRankSum=1.420;SC=CAGGACGGGCCAAGCGGCACT;SOR=0.197;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=13;WE=62496519;WS=62496501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,14:0.50:28
chr20	62496843	rs4809374	C	A	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.970;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=279;ReadPosRankSum=-1.592;SC=GGTCTCGGTTCACCCACCCCG;SOR=2.200;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=44;TCF=11;TCR=33;TR=16;WE=62496851;WS=62496833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
chr20	62504840	rs111933772	CA	C	232.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.39;MQRankSum=-0.841;QD=11.08;ReadPosRankSum=0.156;SOR=1.828;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr20	62517549	rs4809241	A	G	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=388;ReadPosRankSum=0.490;SC=TGGTTGCTGCATCTCAGGGAA;SOR=0.852;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=20;WE=62517557;WS=62517539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,21:0.46:46
chr20	62518729	rs3795156	A	G	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.418;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=333;ReadPosRankSum=-1.114;SC=GGTGCCCCCCATGAGGCCAAG;SOR=0.337;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=19;WE=62518737;WS=62518719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr20	62520671	rs6062569	T	C	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=5.340;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.06;ReadPosRankSum=0.365;SOR=1.646;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,16:0.36:45
chr20	62520674	rs6010690	G	T	587.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=5.497;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.78;ReadPosRankSum=0.097;SOR=1.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr20	62559964	rs817362	G	A	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=40;PP=1112;ReadPosRankSum=0.255;SC=TGTGTAATGTGCTCCTTATAG;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=42;WE=62559972;WS=62559954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr20	62570394	.	G	A	1615.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.873;ClippingRankSum=0.000;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.701;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=38;PP=1256;ReadPosRankSum=0.575;SC=GGACGGGGACGACCGTGTCCC;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=119;TCF=40;TCR=79;TR=57;WE=62570402;WS=62570384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,61:0.49:124
chr20	62571417	rs35264801	AG	A	717.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.889;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FS=4.885;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.58;MQRankSum=2.402;QD=6.24;ReadPosRankSum=3.065;SOR=0.469;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,42:0.37:115
chr20	62573064	rs817370	T	C	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.429;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=231;ReadPosRankSum=0.496;SC=CTCTTGGCTGTCCCGTCCCGC;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=12;WE=62573072;WS=62573054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr20	62578077	rs111264888	A	AT	924.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQ=61.29;NF=5;NR=20;PP=1100;SC=CCCACAGGGCACCCCCCCCAC;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=5;TCR=20;TR=25;WE=62578085;WS=62578067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr20	62594247	rs2275294	G	A	281.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=4;PP=223;ReadPosRankSum=-0.906;SC=CAGTGTGCTGGGGACATGGCT;SOR=0.760;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=11;WE=62594255;WS=62594237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,11:0.46:24
chr20	62697751	rs4809251	T	C	2832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=33;PP=2257;SC=CCTTGTGTTCTCCTCCAGTAG;SOR=1.270;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=57;TCR=33;TR=90;WE=62697759;WS=62697741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr20	62708218	.	C	A	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-4.148;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=6;PP=255;ReadPosRankSum=-1.141;SC=ACCTGCTTCTCAGCCTCATGC;SOR=0.481;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=16;WE=62708226;WS=62708208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr20	62714783	rs6010717	C	G	5967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=89;PP=2965;SC=CACTCTCAGTCGCCGTCACCG;SOR=0.737;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=183;TCF=94;TCR=89;TR=183;WE=62714791;WS=62714773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr20	62715089	rs4337532	G	A	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.657;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=5;PP=147;ReadPosRankSum=-0.131;SC=AGCGCGCGCCGAGCCCCGCCC;SOR=0.693;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=17;TCF=7;TCR=10;TR=8;WE=62715097;WS=62715079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr20	62715548	rs4431000	C	A	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.416;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.363;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=155;ReadPosRankSum=-1.860;SC=CCCTTGCGCCCGCCCTCCTTC;SOR=1.609;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=9;WE=62715556;WS=62715538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chr20	62724438	rs6010719	C	G	470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-0.741;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=326;ReadPosRankSum=-0.099;SC=TGTTTTTGACCCTGTCCAGGA;SOR=0.520;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=16;WE=62724446;WS=62724428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,18:0.45:40
chr20	62729577	rs2295448	C	T	3207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.472;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=51;PP=2591;ReadPosRankSum=-1.152;SC=TCTGGGCCCACGTGCCCTCCA;SOR=0.629;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=251;TCF=149;TCR=102;TR=124;WE=62729585;WS=62729567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,124:0.50:248
chr20	62737139	.	GGTGA	G	2971	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=26;MQ=57.07;NF=39;NR=4;PP=2971;QD=20;SC=GATGATGGGGGGTGATGATGG;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=98;TCF=84;TCR=14;TR=43;WE=62737172;WS=62737129;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:55,43:0.44:98
chr20	62737148	.	GGGC	G	2945	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=28;MQ=57.26;NF=38;NR=4;PP=2945;QD=20;SC=GGGTGATGATGGGCATGATGA;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=101;TCF=86;TCR=15;TR=42;WE=62737172;WS=62737129;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:59,42:0.42:101
chr20	62737164	.	G	A	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=28;MQ=59.37;NF=59;NR=14;PP=2962;QD=20;SC=GATGATGGGGGTGATGGTGCC;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=150;TCF=123;TCR=27;TR=73;WE=62737172;WS=62737129;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:77,73:0.49:150
chr20	62737318	rs13036542	G	A	2378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.197;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=59;PP=1905;ReadPosRankSum=0.561;SC=GTGGGGTCTGGGGCAGGTCCG;SOR=0.793;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=180;TCF=59;TCR=121;TR=86;WE=62737326;WS=62737308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,89:0.47:190
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chr20	62959363	rs111569474	G	C	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.96;QD=31.30;SOR=6.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
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chr21	9907416	.	C	T	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.337;ClippingRankSum=0.000;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.35;MQRankSum=-1.120;QD=6.90;ReadPosRankSum=0.343;SOR=0.074;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,9:0.20:44
chr21	9907503	.	C	A	137.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=-0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.61;MQRankSum=-1.465;QD=9.18;ReadPosRankSum=0.012;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr21	10793771	rs200837359	A	G	420.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-4.076;QD=7.01;ReadPosRankSum=3.721;SOR=0.097;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,14:0.23:60
chr21	10793776	rs368569117	GGAGTT	G	1776.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=3.864;QD=27.76;ReadPosRankSum=-3.132;SOR=1.963;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,46:0.72:64
chr21	10793781	rs113770789	T	G	576.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=-3.845;QD=9.01;ReadPosRankSum=2.504;SOR=0.151;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,18:0.28:64
chr21	10793789	.	GCAGAATGGAA	G	603.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.170;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=57;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.116;NF=47;NR=0;PP=2974;ReadPosRankSum=2.434;SC=GTTGAATGGAGCAGAATGGAA;SOR=0.349;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=83;TCF=82;TCR=1;TR=47;WE=10793807;WS=10793769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,20:0.24:85
chr21	10793822	rs143361187	G	T	980.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.41;MQRankSum=-2.508;QD=10.01;ReadPosRankSum=-0.963;SOR=0.289;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,27:0.28:98
chr21	10793825	rs139250106	T	A	1050.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.49;MQRankSum=-1.966;QD=10.51;ReadPosRankSum=-2.264;SOR=0.384;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:69,31:0.31:100
chr21	10793860	.	T	TGG	873.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.217;ClippingRankSum=0.000;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=2.681;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.38;MQRankSum=-4.662;QD=9.93;ReadPosRankSum=-3.225;SOR=0.301;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,27:0.31:88
chr21	10793861	rs28362110	A	G,AATGGAATGGAATGGAGTG	5958.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=52;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=127;NR=40;PP=2965;SC=GGAATGGAGTAGAATGGAATG;SOR=3.234;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=167;TCF=127;TCR=40;TR=167;WE=10793869;WS=10793851;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.66,0.34:93
chr21	10793885	rs200167075	A	T	1765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FS=13.396;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.30;MQRankSum=1.321;QD=8.92;ReadPosRankSum=1.537;SOR=1.647;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:143,55:0.28:198
chr21	10793891	rs28490105	T	G	8894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=127;NR=80;PP=2951;SC=GGACACGAATTGGATGGACTT;SOR=1.356;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=207;TCF=127;TCR=80;TR=207;WE=10793899;WS=10793875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr21	10793906	rs146787155	G	C	1457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.232;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FS=25.328;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.77;MQRankSum=-2.114;QD=6.51;ReadPosRankSum=2.604;SOR=2.208;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:176,48:0.21:224
chr21	10793912	rs200243265	A	G	1388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FS=25.480;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.73;MQRankSum=-1.788;QD=6.01;ReadPosRankSum=1.924;SOR=2.102;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:185,46:0.20:231
chr21	10793925	rs28641787	T	A	2618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.364;HP=1;HapScore=1;MGOF=77;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=4.241;NF=44;NR=53;PP=1517;ReadPosRankSum=-1.608;SC=TGGAATGGGATGTCCTCGAAT;SOR=0.834;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=262;TCF=119;TCR=143;TR=97;WE=10793933;WS=10793896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,102:0.44:230
chr21	10793961	.	T	TGAATGGAATGGACTC	2665.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.315;ClippingRankSum=0.000;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.907;HP=1;HapScore=2;MGOF=60;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=3.908;NF=2;NR=54;PP=2971;ReadPosRankSum=-0.347;SC=AGAATGCACTTGAATGGAATG;SOR=0.894;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=171;TCF=19;TCR=152;TR=56;WE=10793989;WS=10793936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,64:0.60:107
chr21	10793981	.	A	G	1865	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=60;MMLQ=24;MQ=59.06;NF=0;NR=35;PP=1865;QD=54.2791775013;SC=GGACTCGAACAGAATGGAATC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=126;TCF=10;TCR=116;TR=35;WE=10793989;WS=10793936;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:91,35:0.28:126
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chr21	10794022	rs28971978	A	G	2283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=73;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=77;PP=2962;SC=GAGTGTAATCAAACAGAATGG;SOR=6.837;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=78;TCF=0;TCR=78;TR=77;WE=10794030;WS=10793996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
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chr21	10862874	rs1807747	A	G	2774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.795;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-10.000;NF=66;NR=55;PP=2199;ReadPosRankSum=-1.145;SC=CACTGGGTGCACCAGGTCCAT;SOR=0.368;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=218;TCF=131;TCR=87;TR=121;WE=10862882;WS=10862864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,118:0.54:218
chr21	10862947	rs3883944	G	A	3311.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.283;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.311;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.987;NF=57;NR=62;PP=2559;ReadPosRankSum=-2.923;SC=GCTATGCACAGAAGTTCCAGG;SOR=0.330;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=240;TCF=132;TCR=108;TR=119;WE=10862955;WS=10862937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:124,125:0.50:249
chr21	10863087	rs28521368	T	G	6884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=143;PP=2965;SC=TCTTGAGAGTTTCAGAAACTG;SOR=1.948;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=210;TCF=66;TCR=144;TR=209;WE=10863095;WS=10863077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr21	10906915	rs169758	C	T	3545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=343;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.309;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.919;NF=80;NR=61;PP=2707;ReadPosRankSum=2.030;SC=TTAATCGGATCCAGCTACAAC;SOR=0.610;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=334;TCF=192;TCR=142;TR=141;WE=10906923;WS=10906905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:196,145:0.43:341
chr21	10906989	rs210498	C	T	3240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.441;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.812;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=101;PP=2556;ReadPosRankSum=1.461;SC=GATAAATTCTCCGTGCTTTTT;SOR=0.950;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=305;TCF=68;TCR=237;TR=126;WE=10906997;WS=10906979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:181,131:0.42:312
chr21	10910291	rs150480	C	T	5966.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FS=6.520;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.49;MQRankSum=0.254;QD=32.43;ReadPosRankSum=-0.892;SOR=2.533;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,183:0.99:184
chr21	10910311	rs9996	T	G	7766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=160;NR=89;PP=2965;SC=ACTCACCGAATAGAAAAACTG;SOR=1.491;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=249;TCF=160;TCR=89;TR=249;WE=10910319;WS=10910301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,235:1.00:235
chr21	10910347	rs150482	A	G	8340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=139;PP=2965;SC=ATACAGAGGTAGACCGTCGAA;SOR=0.716;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=261;TCF=121;TCR=140;TR=260;WE=10910355;WS=10910337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,259:1.00:259
chr21	10916293	rs150483	A	G	2387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=66;NR=14;PP=1749;SC=CTGTATATACAACTATGAGCA;SOR=3.206;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=80;TCF=66;TCR=14;TR=80;WE=10916301;WS=10916283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr21	10916322	rs210506	G	A	1256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.451;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.616;NF=31;NR=15;PP=868;ReadPosRankSum=-0.321;SC=CCAGAGTGGGGACATTGGCCC;SOR=0.952;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=121;TCF=77;TCR=44;TR=46;WE=10916330;WS=10916312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,51:0.41:124
chr21	10919948	rs303303	C	A	1369.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.244;NF=49;NR=1;PP=1110;ReadPosRankSum=-2.431;SC=CAGGGAGGGACTAAGGCCTGT;SOR=0.249;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=97;TCF=96;TCR=1;TR=50;WE=10919956;WS=10919938;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,51:0.52:98
chr21	10920018	rs303304	A	G	2678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.328;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.399;NF=78;NR=35;PP=1908;ReadPosRankSum=1.139;SC=AAATGAAACCAAATAACAGGT;SOR=0.866;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=230;TCF=155;TCR=75;TR=113;WE=10920026;WS=10920008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:122,120:0.50:242
chr21	10920098	rs212146	T	C	6626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=134;PP=2965;SC=GAAGGAGTTTTTACTCCCTGA;SOR=1.668;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=198;TCF=63;TCR=135;TR=197;WE=10920106;WS=10920088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chr21	10935044	rs625381	T	C	258.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=5.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.521;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-5.455;NF=0;NR=15;PP=276;ReadPosRankSum=-0.665;SC=GGCACCAACATAAGCTATTTC;SOR=1.248;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=3;TCR=48;TR=15;WE=10935052;WS=10935034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,12:0.26:47
chr21	10935116	rs625018	T	G	320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.34;QD=32.08;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr21	10941777	rs210520	C	T	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-6.632;NF=24;NR=0;PP=1154;ReadPosRankSum=0.240;SC=GGTATCAATCCATTATGATTT;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=24;WE=10941792;WS=10941767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,23:0.44:52
chr21	10941784	rs60630159	AT	A	559.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=8;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.216;NF=28;NR=0;PP=1171;ReadPosRankSum=-0.052;SC=ATCCATTATGATTTTTTTTCC;SOR=0.547;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=63;TCF=63;TCR=0;TR=28;WE=10941792;WS=10941767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr21	10942923	rs76723236	G	A	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.986;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.268;NF=18;NR=13;PP=629;ReadPosRankSum=0.012;SC=CCACTTACCCGCCTTCTTATC;SOR=0.973;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=73;TCF=36;TCR=37;TR=31;WE=10942931;WS=10942913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,30:0.39:76
chr21	10944828	rs146327494	CAAG	C	892.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.637;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.499;NF=2;NR=19;PP=814;ReadPosRankSum=1.957;SC=TTCCCCCCTGCAAGAAGAGAT;SOR=0.730;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=55;TCF=7;TCR=48;TR=21;WE=10944838;WS=10944818;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,25:0.43:58
chr21	10959806	rs212111	G	T	1235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.491;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.540;NF=19;NR=34;PP=974;ReadPosRankSum=0.817;SC=ACACACTTTAGCCACCAAAAA;SOR=0.481;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=122;TCF=40;TCR=82;TR=53;WE=10959819;WS=10959796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,53:0.43:122
chr21	10959881	rs212112	G	A	926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=31;PP=875;SC=TATTTGAATAGCAAGAATCCC;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=10959889;WS=10959871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
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chr21	10970017	rs468525	C	T	2087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.560;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=28;PP=2314;ReadPosRankSum=1.631;SC=ACCTTTCTTTCGCAGGTGCCT;SOR=0.428;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=98;TCF=41;TCR=57;TR=51;WE=10970025;WS=10969993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,56:0.52:108
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chr21	11058349	rs209032	T	G	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.942;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FS=1.259;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.18;MQRankSum=-0.951;QD=4.86;ReadPosRankSum=1.043;SOR=0.405;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:149,48:0.24:197
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chr21	11059799	rs74827812	C	T	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQRankSum=-0.654;QD=0.66;ReadPosRankSum=0.775;SOR=0.710;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,9:0.12:72
chr21	11059841	rs77547988	C	T	360.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.182;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=14.491;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.97;MQRankSum=-3.465;QD=2.78;ReadPosRankSum=-0.411;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:109,21:0.16:130
chr21	11059845	rs7364036	C	T	2292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.326;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.576;NF=50;NR=25;PP=2215;ReadPosRankSum=0.082;SC=ATTAGCCGGACGTGGTGGCAG;SOR=0.503;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=135;TCF=94;TCR=41;TR=75;WE=11059869;WS=11059831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,82:0.57:145
chr21	11059853	rs75278999	C	T	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=4.256;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.09;MQRankSum=-3.939;QD=3.37;ReadPosRankSum=-0.761;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:134,26:0.16:160
chr21	11059854	rs75079963	A	G	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=0.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.11;MQRankSum=-3.723;QD=6.60;ReadPosRankSum=-0.565;SOR=0.807;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:121,43:0.26:164
chr21	11059877	rs7364059	T	C	2786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.920;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.893;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.939;NF=50;NR=52;PP=2242;ReadPosRankSum=-0.388;SC=CCCAGCTACTTAGGAGGCTGA;SOR=0.541;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=173;TCF=89;TCR=84;TR=102;WE=11059885;WS=11059867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,104:0.59:177
chr21	11059951	rs75112368	T	C	368.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=1.455;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQRankSum=-3.006;QD=3.26;ReadPosRankSum=0.210;SOR=0.371;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,22:0.19:113
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chr21	11060013	rs2838200	T	C	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.03;MQRankSum=-5.679;QD=14.84;ReadPosRankSum=-1.030;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,25:0.50:50
chr21	11060026	rs57279991	G	A	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.49;MQRankSum=-1.771;QD=0.94;ReadPosRankSum=-1.006;SOR=0.021;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,4:0.11:37
chr21	11060029	rs112803135	A	AAAAAT	179.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.85;MQRankSum=-5.146;QD=5.62;ReadPosRankSum=1.549;SOR=0.097;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr21	11098576	rs74646875	G	C	49.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.62;MQRankSum=-5.504;QD=1.56;ReadPosRankSum=0.713;SOR=0.120;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,4:0.12:32
chr21	11098582	rs73891531	T	G	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.353;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.69;MQRankSum=-5.595;QD=1.42;ReadPosRankSum=1.215;SOR=0.252;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,4:0.12:33
chr21	11098597	rs73891533	A	G	40.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.94;MQRankSum=-5.944;QD=1.10;ReadPosRankSum=1.372;SOR=0.348;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,4:0.11:37
chr21	11098616	rs76377570	AT	GC	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.59;MQRankSum=-6.374;QD=2.77;ReadPosRankSum=-1.810;SOR=0.798;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,6:0.12:48
chr21	11098625	rs77191978	C	T	120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=2.406;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQRankSum=-6.771;QD=2.28;ReadPosRankSum=-1.669;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,7:0.13:53
chr21	11098664	rs75742769	A	G	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.255;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=4.103;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.52;MQRankSum=-6.258;QD=5.76;ReadPosRankSum=-1.703;SOR=0.304;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,16:0.20:79
chr21	11098673	.	GTACTCCTAC	G	618.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.111;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.73;MQRankSum=-5.832;QD=6.58;ReadPosRankSum=-2.626;SOR=0.661;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,21:0.22:94
chr21	11098674	rs1752238	T	C	1730.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.534;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.985;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=5.505;NF=43;NR=24;PP=2962;ReadPosRankSum=2.519;SC=ACTCAGGCTGTACTCCTACCA;SOR=0.952;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=71;TCF=45;TCR=26;TR=67;WE=11098712;WS=11098664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,64:0.75:85
chr21	11098685	.	CTCCAGCCGCCA	C	636.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.118;ClippingRankSum=0.000;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQRankSum=-6.123;QD=6.24;ReadPosRankSum=-1.555;SOR=0.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:81,21:0.21:102
chr21	11098704	rs74415742	A	G	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.84;MQRankSum=-5.471;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.868;SOR=0.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,25:0.25:102
chr21	11098723	rs73151874	T	C	1105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.753;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=7.176;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.66;MQRankSum=-4.999;QD=10.84;ReadPosRankSum=2.366;SOR=0.388;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:71,31:0.30:102
chr21	11098728	rs113315187	C	T	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.205;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=10.746;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.64;MQRankSum=-4.606;QD=11.55;ReadPosRankSum=1.762;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,34:0.34:100
chr21	11098827	rs79274499	C	T	207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.739;NF=0;NR=9;PP=154;ReadPosRankSum=0.277;SC=CCATCCAGAGCGAGACGAGCC;SOR=0.317;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=9;WE=11098835;WS=11098817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr21	14756438	rs3126400	T	C	1876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=0;PP=1555;SC=TACACACACATATATATATAT;SOR=8.222;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=61;TCF=61;TCR=0;TR=56;WE=14756446;WS=14756428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr21	14756479	rs373823676	G	GTATA,GTATATA	2962.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;NF=27,27;NR=11,11;PP=825,245;SC=GTGTGTGTGTGTATATATATA;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=74;TCF=52;TCR=22;TR=38,38;WE=14756487;WS=14756469;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.20,0.78:65
chr21	14757043	rs2257596	T	C	2154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=6.727;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.25;MQRankSum=-1.534;QD=30.35;ReadPosRankSum=0.259;SOR=0.468;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,69:0.97:71
chr21	14760151	rs2775777	T	C	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.98;QD=31.37;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr21	14766093	rs2775805	G	A	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=15;PP=500;SC=ATTTATTATCGGTCATAAGTA;SOR=1.828;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=21;WE=14766101;WS=14766083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr21	14780604	rs3117279	G	T	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=5;PP=398;SC=TATTTTCTGAGTTAACATATA;SOR=2.049;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=14780612;WS=14780594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	14917181	rs62215474	C	T	1908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.96;QD=31.29;SOR=0.865;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr21	15352253	rs56270809	A	C	149.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=119;SC=CTCCCAACCAACTGCTCTTGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=15352261;WS=15352243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr21	15373420	rs1297087	C	A	3398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=78;PP=2965;SC=GTTGATCTTACGGTAACATGC;SOR=1.947;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=45;TCR=78;TR=123;WE=15373428;WS=15373410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr21	15374334	.	TA	T	1402.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.428;ClippingRankSum=0.000;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.41;MQRankSum=-1.738;QD=22.62;ReadPosRankSum=-0.598;SOR=1.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,60:0.97:62
chr21	15516976	rs7283442	T	A	821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=8;PP=714;SC=TTAACATGAGTCTCTGGATCT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=15516984;WS=15516966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr21	15524843	rs57726121	A	G	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=2;PP=214;SC=GGGATACTGAAGAAAGCAAAC;SOR=1.802;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=15524851;WS=15524833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	15596772	rs409782	T	G	758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=14;PP=587;SC=TGAAGAAATGTTGGTGGGCAG;SOR=1.136;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=23;WE=15596780;WS=15596762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr21	15596882	rs410052	T	C	149.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=121;SC=GCATTTTATTTAGTATATAAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=15596890;WS=15596872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr21	15599118	rs2822443	A	G	1068.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=0;PP=913;SC=ACTCATGGCTATTGTATAATA;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=15599126;WS=15599108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr21	15599144	rs2822444	T	C	1509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=7;PP=1246;SC=AAACTGTTAATTTTTTTTCCT;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=49;WE=15599152;WS=15599134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr21	15599466	rs7280643	A	G	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=3;PP=559;SC=AAATGGACTCACCAACAACCA;SOR=2.670;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=25;WE=15599474;WS=15599456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr21	15646397	rs8129984	A	G	205.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=1;PP=162;SC=GCCAGCGGCCAGGCGCCCCGC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=15646405;WS=15646387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr21	15652069	rs2254297	A	G	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=6;PP=139;SC=CTCAAAGTGAATAGTTGTACA;SOR=2.093;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=15652077;WS=15652059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr21	15659778	rs1014538	C	T	139.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=109;SC=TAAAATAATGCAAAAATCAAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=15659786;WS=15659768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr21	15660716	rs1153305	G	A	1085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=2;PP=886;SC=ATTTTCTTTAGTTATGTAGGT;SOR=4.112;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=28;TCR=2;TR=30;WE=15660724;WS=15660706;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr21	15663777	rs34559607	A	AGTGT,AGTGTGT	1419.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=27;NF=19,19;NR=4,4;PP=223,621;SC=AACAGGTAAGAGTGTGTGTGT;SOR=3.180;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=40;TCF=30;TCR=10;TR=23,23;WE=15663785;WS=15663767;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.26,0.74:27
chr21	15671844	rs2822558	G	A	2153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=28;PP=1599;ReadPosRankSum=0.590;SC=GGACTTGACAGCAAACCTCAA;SOR=1.073;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=68;TCF=39;TCR=29;TR=66;WE=15671852;WS=15671834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,72:0.97:74
chr21	15748186	rs2822642	C	A	1201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=32;PP=1029;SC=AGGATGCGATCAAGTAATCTC;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=15748194;WS=15748176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr21	15755349	rs7281846	T	C	3785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=63;PP=2781;ReadPosRankSum=-0.772;SC=CAACCACCCCTGCCCACTCTG;SOR=0.512;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=71;TCR=65;TR=131;WE=15755357;WS=15755339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:5,136:0.96:141
chr21	15858480	rs3746825	A	G	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=29;PP=869;SC=AGCAACACAAAATCTTATTCA;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=15858488;WS=15858470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr21	15918714	rs12329657	A	G	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=292;SC=TTCCTCCTTCAGTCAGGATAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=15918722;WS=15918704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	15954528	rs2822785	G	A	3771.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=20;PP=2965;SC=GAGGAGCAGTGGTCCCAGGGT;SOR=2.953;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=94;TCR=20;TR=114;WE=15954536;WS=15954518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr21	15954660	rs2822787	T	C	5473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=66;NR=99;PP=2965;SC=AAGTTGCAGTTATTTAAAGTG;SOR=1.159;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=66;TCR=99;TR=165;WE=15954668;WS=15954650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,169:1.00:169
chr21	15964920	rs466913	C	G	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=17;PP=536;SC=CATTTGACTACATAAGTATCT;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=15964928;WS=15964910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr21	15966421	rs460852	T	A	1036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=30;PP=878;SC=GAAAAGGAAATAGAGACAACT;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=34;WE=15966429;WS=15966411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr21	15974409	rs456067	T	C	451.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=329;SC=AGAAAATCATTTTCATTTAGA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=15974417;WS=15974399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	15984864	rs1292581	G	T	1357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=10;PP=1096;ReadPosRankSum=-0.791;SC=TAGATTCACAGATCTAAAATG;SOR=1.140;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=43;TCF=33;TCR=10;TR=41;WE=15984872;WS=15984854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,45:0.98:46
chr21	15991786	rs1292586	C	G	187.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=124;SC=GACTCATTTACGATCAAGCAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=15991794;WS=15991776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr21	16340289	rs2229741	C	T	3223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=40;PP=2574;SC=GCATGCCAGACCCCTGATATG;SOR=1.103;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=58;TCR=40;TR=98;WE=16340297;WS=16340279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr21	17533027	rs34485071	C	T	2344.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.13;MQRankSum=-1.221;QD=42.63;ReadPosRankSum=1.208;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr21	17533030	rs13052116	C	T	2271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.91;MQRankSum=-0.379;QD=44.54;ReadPosRankSum=0.986;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr21	17533075	.	T	TTCTTTCTTC	1009.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.24;QD=43.90;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr21	17533255	rs34726086	G	A	1426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.807;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.168;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=28;PP=1209;ReadPosRankSum=-0.655;SC=CGTTATCCAAGATACTAGGGA;SOR=1.108;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=19;TCR=29;TR=46;WE=17533263;WS=17533245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,46:0.98:47
chr21	17560174	rs10629120	T	TTCCTTCCC	1841.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.48;QD=47.22;SOR=2.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr21	18814243	rs208893	T	C	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.910;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=453;ReadPosRankSum=-0.580;SC=TTCTACTGCTTCTGTTTTTTT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=17;WE=18814254;WS=18814233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr21	18814246	rs5842640	G	GT	520.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5002;FS=0.000;HP=13;HapScore=4;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=48;ReadPosRankSum=-0.717;SC=TACTGCTTCTGTTTTTTTTTT;SOR=4.294;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=4;WE=18814254;WS=18814233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,16:0.94:17
chr21	19165942	rs2824493	C	T	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=515;SC=TGCAGAAAGCCGGTGCTATGA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=19165950;WS=19165932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr21	19169155	rs1047978	G	C	3818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=74;PP=2965;SC=GTACTTGGGAGTCAAACTGTG;SOR=1.473;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=117;TCF=41;TCR=76;TR=115;WE=19169163;WS=19169145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr21	19190427	rs243556	C	T	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=1;PP=282;SC=TCATTGAAGACATTTTAGTTT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=19190435;WS=19190423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	19506651	rs2824646	G	A	1283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=5;PP=987;SC=ATAAACAGTGGTGACTTCACT;SOR=3.202;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=29;TCR=5;TR=34;WE=19506659;WS=19506641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr21	19506694	rs9977750	T	G	2675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=24;PP=1341;SC=TGGAGGTGTTTTAAGTCAAGC;SOR=0.865;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=29;TCR=24;TR=53;WE=19506702;WS=19506684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr21	19506715	rs2824647	C	T	2909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=32;PP=1537;SC=TGGCATCTCACTCTTGTAGGT;SOR=0.844;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=29;TCR=32;TR=61;WE=19506723;WS=19506705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr21	19666526	rs6517807	C	T	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.98;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr21	19666530	rs4395327	T	C	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.65;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr21	19666910	rs2824718	A	G	1632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=32;PP=1316;SC=ATGACAACATATTTACTTACA;SOR=1.358;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=51;WE=19666918;WS=19666900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr21	19670118	rs2824721	G	A	2005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=45;PP=1562;SC=CCATCGGTAGGGAAGATTGGC;SOR=2.265;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=13;TCR=45;TR=58;WE=19670126;WS=19670108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr21	19687376	rs2144203	G	A	1937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=1;PP=1540;SC=GGTCCTAATAGACACAGTTAT;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=53;TCF=52;TCR=1;TR=53;WE=19687384;WS=19687366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr21	19701421	rs68023548	GCT	G	745.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=3;PP=793;SC=ATTAAGAAACGCTCTTTCCAT;SOR=2.833;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=18;WE=19701430;WS=19701411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr21	19704296	rs1155847	C	T	897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=0;PP=678;SC=ACATGATAGGCGTACCCATGT;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=19704304;WS=19704286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr21	19726138	rs34162864	G	A	1277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=20;PP=966;SC=AACTTGGTTGGAAAAAATTCT;SOR=0.788;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=21;TCR=20;TR=41;WE=19726146;WS=19726128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr21	19744415	rs377458247	ATG	A	93.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.619;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.967;NF=4;NR=0;PP=165;ReadPosRankSum=1.242;SC=TGAGATTAGAATGTGTGTGTG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=4;WE=19744424;WS=19744405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr21	19756040	rs2824790	C	G	3357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=37;PP=2742;SC=TTTACATTTTCATCTGACACC;SOR=1.247;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=96;TCF=58;TCR=38;TR=95;WE=19756048;WS=19756030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr21	20058298	rs6517825	C	T	1773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=42;NR=11;PP=1368;SC=CCATTAGTAACAACGTTAAAA;SOR=2.387;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=53;WE=20058306;WS=20058288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr21	22643720	rs8127865	A	G	195.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.9999;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=5;PP=109;SC=TGCTCCTAGCAAATAGTACAG;SOR=2.584;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=6;WE=22643728;WS=22643710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr21	22652720	rs9306013	C	T	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=1;PP=339;SC=AAATGCATAACAAAGTAATAT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=22652728;WS=22652710;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	22653099	rs1012523	G	A	33.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr21	22656409	rs34246223	AT	A	432.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=328;SC=CTGTTACATAATTTTTTTTCT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=15;WE=22656417;WS=22656399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr21	22658544	rs111713483	TTTTGTGA	T	1152.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=1226;SC=GCAATGATACTTTTGTGATTT;SOR=5.211;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=20;WE=22658558;WS=22658534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr21	22696837	rs232467	C	G	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=25;PP=1003;SC=TATGCACCCCCCTCCCTCTGG;SOR=0.823;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=46;TCF=21;TCR=25;TR=46;WE=22696845;WS=22696827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr21	22696881	rs11334381	TG	T	1271.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=28;PP=1331;SC=GGAACAGTATTGGGGATCTTA;SOR=2.073;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=22696889;WS=22696871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr21	22881161	rs371861934	TAC	T	31.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.345;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.06;MQRankSum=-1.611;QD=3.97;ReadPosRankSum=-1.292;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chr21	26960189	rs2829806	T	G	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=655;SC=GCTTAACCAGTGTTTGTGGCA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=26960197;WS=26960179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr21	26961086	rs2829807	T	C	1556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=25;PP=1204;SC=TTGGTTGTTATTGGTTAATTT;SOR=0.732;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=25;TCR=25;TR=50;WE=26961094;WS=26961076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr21	26965100	rs2829809	C	A	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=4;PP=850;SC=AATTGGAAGACCTAGAACTTT;SOR=3.321;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=29;TCR=4;TR=33;WE=26965108;WS=26965090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr21	26965148	rs1135638	G	A	1445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=18;PP=1074;SC=GTAAAGACACGCCCTGGAATC;SOR=1.390;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=31;TCR=18;TR=49;WE=26965156;WS=26965138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr21	26965205	rs1057885	T	C	1319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=29;PP=1061;SC=GAACTGCTGATACTTCATACT;SOR=1.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=42;WE=26965213;WS=26965195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr21	26966317	rs13048408	A	G	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=367;SC=CAAAATATGTAAAAAGGTGTT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=26966325;WS=26966307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	26969703	rs1135618	T	C	149.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.64;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=1;PP=119;SC=CATGAGCATCTTTTGTGAAGG;SOR=1.022;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=26969711;WS=26969693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr21	26973663	rs140202502	A	ATATACT	4639.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=13;PP=2969;SC=ACAAAAAGACATATATGTATA;SOR=3.148;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=85;TCF=68;TCR=17;TR=69;WE=26973671;WS=26973653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr21	26976250	rs7278164	A	G	3366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=56;PP=2617;SC=GCTTAAATCTAGAAATTTAAA;SOR=1.094;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=95;TCF=39;TCR=56;TR=95;WE=26976258;WS=26976240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr21	26978950	rs3989369	A	G	2293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=54;PP=1780;SC=TGAGAAGCTGACGATGTTGCT;SOR=2.649;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=14;TCR=54;TR=68;WE=26978958;WS=26978940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr21	26979628	rs9653688	G	A	6248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=144;NR=61;PP=2965;SC=TGCCCCGCGGGACCTCCCCGG;SOR=1.875;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=205;TCF=144;TCR=61;TR=205;WE=26979636;WS=26979618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr21	27056250	rs8133602	A	G	1519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=26;PP=1143;SC=TCACAGCAGTAGAGTACCAAG;SOR=0.909;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=21;TCR=26;TR=47;WE=27056258;WS=27056240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr21	27078270	rs2276220	G	A	1433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=6;PP=1167;SC=ATATTTATGCGTAATTTATTT;SOR=3.209;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=36;TCR=6;TR=42;WE=27078278;WS=27078260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr21	27086413	rs6516687	G	A	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=446;SC=AACAGGATTTGTCTGCCTCTG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=27086421;WS=27086403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr21	27086916	rs8134513	C	A	729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=3;PP=519;SC=AATATGAATTCATATATTTAA;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=27086924;WS=27086906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr21	27141273	rs56048433	C	CATTT	1537.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=6;PP=1337;SC=TAAGAAGTCTCATTTTTTCTG;SOR=2.517;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=28;WE=27141281;WS=27141263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr21	27326859	rs2829997	G	A	1223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=5;PP=1083;SC=TCCTCTGGGGGAAAATACATG;SOR=3.202;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=39;TCF=34;TCR=5;TR=38;WE=27326867;WS=27326849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr21	27327100	rs417676	G	A	251.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=202;SC=ACGGAGTCTCGCTCTGTCGCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=27327108;WS=27327090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr21	27327862	rs2251337	G	C	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=1;PP=801;ReadPosRankSum=-0.796;SC=CGGAGAATGCGTGGGATCCTG;SOR=4.047;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=29;WE=27327870;WS=27327852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chr21	27328175	rs440666	T	C	1938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=45;PP=1453;SC=CATGTGAACGTACTGTGAGTC;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=8;TCR=45;TR=53;WE=27328183;WS=27328165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr21	27369481	rs2051504	C	T	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=299;SC=GTCAATGATGCTCTTAGCCCA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=27369489;WS=27369471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr21	27382362	rs11455808	A	AG	5051.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=74;PP=2957;SC=GGGAAGACTGACATGTACACC;SOR=1.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=106;TCF=29;TCR=77;TR=101;WE=27382370;WS=27382352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr21	27382417	rs2409166	C	G	2158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=58;PP=1808;SC=AGCAGGCAAACAACCTACAGA;SOR=6.027;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=60;TCF=2;TCR=58;TR=60;WE=27382425;WS=27382407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr21	27423561	rs2070655	G	T	1600.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=37;PP=1236;SC=GTGTTTCATTGTAAGAAAACT;SOR=1.893;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=50;WE=27423569;WS=27423551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr21	27945141	rs62216535	G	A	960.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=7;PP=728;SC=GTGACCCAAGGGCAGCCCCGA;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=30;WE=27945149;WS=27945131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr21	28210657	rs229042	T	C	1317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=21;PP=1124;SC=ATTATTTAGCTTAAAAACACA;SOR=0.741;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=21;TCR=21;TR=42;WE=28210665;WS=28210647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr21	28212760	rs436525	G	A	1877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=29;PP=1525;SC=TGGCTGCATCGGGGCAGTGTT;SOR=0.726;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=29;TCR=29;TR=58;WE=28212768;WS=28212750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr21	28215619	rs422381	T	C	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=219;SC=CCAGGCATGATTGATTATTTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=28215627;WS=28215609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr21	28215826	rs373460567	C	CACA	3224.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=38;PP=2930;SC=AAGCACTGCACAGAGAGAAGG;SOR=1.394;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=62;TCF=18;TCR=44;TR=54;WE=28215844;WS=28215816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr21	28215836	rs3838077	GC	G	2346.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=41;PP=2190;SC=CAGAGAGAAGGCCGTAGCAGG;SOR=1.609;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=15;TCR=41;TR=56;WE=28215844;WS=28215816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr21	28215987	rs417301	T	C	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=13;PP=601;SC=TCAGCCCGCCTGGGTCAGCCT;SOR=0.984;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=20;TCR=13;TR=33;WE=28215995;WS=28215977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr21	28216038	rs422803	C	A	1288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=22;PP=948;SC=GAACAGAGATCCTAGCGTAGC;SOR=1.127;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=16;TCR=22;TR=38;WE=28216046;WS=28216028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr21	28216066	rs370850	C	T	1340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=23;PP=1029;SC=GGTACCTTCCCAGGTCACCAT;SOR=0.990;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=19;TCR=23;TR=42;WE=28216074;WS=28216056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr21	28216240	rs451792	G	C	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=15;PP=495;SC=GCTCCAACTCGCTAAAGGTGG;SOR=2.200;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=20;WE=28216248;WS=28216230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr21	28216299	rs428616	T	C	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=364;SC=TGCTTTGCTTTAGTTTGCAGA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=28216307;WS=28216289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr21	28216445	rs408358	A	C	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=2;PP=293;SC=CGGACTTATGATCCTGCCTGC;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=28216453;WS=28216435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	28216595	rs428785	C	G	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=21;PP=1134;SC=GACCACTGAGCCCCTTCGTCC;SOR=0.741;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=43;TCF=22;TCR=21;TR=43;WE=28216603;WS=28216585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr21	28216692	rs445784	G	T	1388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=24;PP=1061;SC=ACGTGCCGCCGACGTCGCCCT;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=19;TCR=24;TR=43;WE=28216700;WS=28216682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr21	28217178	rs434857	T	G	2556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=41;PP=2010;SC=GCGTGGGTACTGGCCCAAAGC;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=46;TCR=41;TR=87;WE=28217186;WS=28217168;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr21	28217320	rs402007	C	G	1730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=46;PP=1402;SC=GAGCGAGGGACCTTTAGTTCG;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=6;TCR=46;TR=52;WE=28217328;WS=28217310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr21	28296324	rs151065	A	G	1586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=51;NR=7;PP=1307;SC=CGACTGCATCAGTGCTGAATC;SOR=3.729;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=51;TCR=7;TR=58;WE=28296332;WS=28296314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr21	28302355	rs226794	A	G	1431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=32;PP=1055;SC=ATTACTGTACAGCCTACATTC;SOR=1.473;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=16;TCR=32;TR=48;WE=28302363;WS=28302345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr21	28307173	rs162495	C	T	332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=10;PP=246;SC=GAGCACGAGGCACCCATGAAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=28307181;WS=28307163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	28326276	rs233894	G	A	357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=10;PP=307;SC=GCAAAAATTGGGCTCATTTAG;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=28326284;WS=28326266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr21	28338423	rs55933916	C	G	6711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=96;NR=111;PP=2965;SC=AGAGGAACCTCCGGCCGCCCG;SOR=0.841;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=209;TCF=98;TCR=111;TR=207;WE=28338431;WS=28338413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr21	30250555	rs2205446	T	C	1877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=14;PP=1492;SC=GAATAATCCTTTTGGTGAAAG;SOR=2.107;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=39;TCR=14;TR=53;WE=30250563;WS=30250545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr21	30250615	rs2205447	T	C	2758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=34;PP=2223;SC=CCGACCATTTTTGCCACCAGC;SOR=1.013;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=48;TCR=34;TR=82;WE=30250623;WS=30250605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr21	30250812	rs2205448	T	C	364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=273;SC=TCATCATTTTTTAGTGTGTAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=30250820;WS=30250802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	30254695	rs2254507	C	T	549.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=550;SC=AAAATTAGAACGTATTCAATA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=18;WE=30254703;WS=30254685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr21	30255347	rs61735765	C	A	233.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=3;PP=149;SC=GCTAGGAATGCAGATACTACA;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=30255355;WS=30255337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr21	30257418	rs1997605	G	A	914.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=1;PP=803;SC=TCATCTGCAAGTGGACCCCGC;SOR=5.283;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=28;WE=30257426;WS=30257408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr21	30257560	rs1997606	C	G	4903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.99;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr21	30257568	rs1997607	T	C	5111.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.07;SOR=1.047;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr21	30257729	rs2859734	A	G	722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=19;PP=561;SC=GCATGCCCTCACCCTCATGCG;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=30257737;WS=30257719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr21	30303388	rs58119493	GGTGT	G	820.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;NF=18;NR=0;PP=942;SC=ACATTGTGTAGGTGTGTGTGT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=18;WE=30303399;WS=30303378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr21	30303685	rs73190119	C	A	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=25;PP=684;SC=ACACTGATAACCACCAATTTT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=30303693;WS=30303675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr21	30315730	rs2274800	G	A	181.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=148;SC=AGAGCAGAAAGACCAATACTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=30315738;WS=30315720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr21	30316304	.	T	TTTAA,TTTAAGATTTAAGAA	547.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.14;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=3;PP=1835;SC=AACAATCAAATGTCATTTAAG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=3;WE=30316316;WS=30316294;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:13
chr21	30316305	rs3053575	G	GATTTAAGAAA	545.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.98;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr21	30316308	rs2026246	A	T	411.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.75;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr21	30319637	rs2832143	A	T	219.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=211;SC=GGTAACAGCCACTGTCTAACA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=30319645;WS=30319627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr21	30324644	rs2832145	T	G	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=13;PP=550;SC=AATAAAATGTTTAAACACTGG;SOR=1.051;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=10;TCR=13;TR=23;WE=30324652;WS=30324634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr21	30324755	rs2832146	G	A	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=6;PP=167;SC=TATCCAAAGAGCTGAGAGTTT;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=30324763;WS=30324745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr21	30325875	rs2243491	A	T	452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=382;SC=CTGAGAATATATGTCTGATAC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=30325883;WS=30325865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	30338293	rs5843357	G	GC	2013.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=36;PP=2008;SC=ATGGGGTTTTGTATGTTGCCC;SOR=2.746;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=44;TCF=6;TCR=38;TR=42;WE=30338301;WS=30338283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr21	30341891	rs2254796	A	G	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=20;PP=637;SC=CGAGGACTCTAAAGAGCTGGT;SOR=2.387;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=26;TCF=5;TCR=21;TR=25;WE=30341899;WS=30341881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr21	30357307	rs2245434	C	T	278.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=259;SC=CAGACATTTCCGGATATGCTA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=30357315;WS=30357297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr21	30391671	rs138840391	GAAAA	GA,G	428.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5020,0.4980;FS=0.000;HP=15;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;NF=1,1;NR=7,7;PP=84,18;SC=CGACCTACCGGAAAAAAAAAA;SOR=1.863;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=8,8;WE=30391682;WS=30391661;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:12
chr21	30400110	rs8133768	G	A	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=0;PP=482;SC=CATAATATACGTGGCTTAGTT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=30400118;WS=30400100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr21	30408670	rs2274802	A	T	2800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=47;PP=2229;SC=TCAGAAAACAAGCCAGCATTA;SOR=1.022;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=37;TCR=47;TR=84;WE=30408678;WS=30408660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr21	30442475	rs2183569	T	C	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.73;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr21	30442481	rs2183570	C	T	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.41;SOR=5.421;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	30464141	rs8132105	G	A	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=18;PP=503;SC=ACTCCCATCTGCTGAGTGCTT;SOR=2.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=30464149;WS=30464131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr21	30464623	rs147901306	A	AACTCCAGTTTATAGG	906.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=2900;SC=TCCAGATTTAAACCATTAACA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=9;WE=30464631;WS=30464613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr21	30464916	rs2832170	C	T	1256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=35;PP=1015;SC=AGTATTCCGTCCACTTTCTGG;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=0;TCR=35;TR=35;WE=30464924;WS=30464906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr21	30481371	rs2832181	G	T	3018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=18;PP=2292;SC=GTTGACATTCGTAACCTTCCT;SOR=2.546;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=68;TCR=18;TR=86;WE=30481379;WS=30481361;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr21	30481612	rs2832182	G	A	850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=24;PP=721;SC=TGCTTATTTTGTGCCCATTTA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=30481620;WS=30481602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr21	30532146	rs66780570	TA	T	863.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.344;NF=28;NR=4;PP=458;ReadPosRankSum=0.173;SC=GTTCTCACGTTAAAAAAAAAA;SOR=2.636;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=63;TCF=53;TCR=10;TR=32;WE=30532166;WS=30532136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,39:0.98:40
chr21	30532437	rs2832224	G	A	1724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=40;PP=1313;SC=AGGACCAGGGGCAATGGGCAG;SOR=2.712;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=52;TCF=11;TCR=41;TR=51;WE=30532445;WS=30532427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr21	30714776	rs388707	T	C	3340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=32;PP=2492;SC=CAACTCTGGGTGAGACAAAGC;SOR=1.835;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=75;TCR=32;TR=107;WE=30714784;WS=30714766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr21	30715275	rs425989	T	C	185.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=151;SC=TAGTTTACCATAAGGGAATTT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=30715283;WS=30715265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr21	30925853	.	C	CT	357.19	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;MQRankSum=0.965;NF=15;NR=2;PP=222;ReadPosRankSum=-0.506;SC=CTGGGCACATCTTTTTTTTTT;SOR=1.402;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=17;WE=30925861;WS=30925843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,22:0.88:25
chr21	31655212	rs1557291	A	C	999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=23;PP=767;SC=TACTGCAGACACCAGGATAGC;SOR=2.448;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=7;TCR=23;TR=30;WE=31655220;WS=31655202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr21	31802768	rs2226548	G	A	3191.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=47;PP=2541;SC=CTGGGAGCCCGCCAGCTGCCA;SOR=0.880;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=104;TCF=55;TCR=49;TR=102;WE=31802776;WS=31802758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr21	31803159	rs1539783	T	C	1287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=34;PP=1117;SC=TCCCAATATCTTTTTATTCTT;SOR=3.967;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=38;WE=31803167;WS=31803149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr21	31803210	rs1539784	C	T	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=375;SC=TGGCAGACTGCGAAATTAATG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=31803218;WS=31803200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr21	31812772	rs2832873	C	A	3078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=45;PP=2527;SC=TACCTGCCAACTGGGCTCCTC;SOR=0.736;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=89;TCF=44;TCR=45;TR=89;WE=31812780;WS=31812762;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr21	31869286	rs2298437	T	C	4299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=75;NR=57;PP=2965;SC=TGGGCGGCAGTAGCCATATCC;SOR=0.973;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=132;TCF=75;TCR=57;TR=132;WE=31869294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr21	31913981	rs5843453	AG	A	7460.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=65;PP=2976;SC=GTTTTTTAGTAGAATCCAGAG;SOR=1.172;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=143;TCF=76;TCR=67;TR=141;WE=31913989;WS=31913971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr21	31914000	rs1023364	T	A	7358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=63;PP=2965;SC=AGAATCCATATCCTTCACGGC;SOR=1.139;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=167;TCF=97;TCR=70;TR=160;WE=31914008;WS=31913990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,170:1.00:170
chr21	31964916	rs9305426	A	C	2571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=47;PP=2189;SC=GGCTTTGGCTATGGAGGCCTG;SOR=1.463;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=75;TCF=28;TCR=47;TR=74;WE=31964924;WS=31964906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr21	31973516	rs198915	T	A	1808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.832;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=34;PP=1509;ReadPosRankSum=0.937;SC=GGCTGTGGTCTTAGCGGCTAT;SOR=0.866;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=58;TCF=24;TCR=34;TR=57;WE=31973524;WS=31973506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,57:0.98:58
chr21	31973685	rs1961491	C	T	570.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=17;PP=454;ReadPosRankSum=1.524;SC=AAAATTTAGCCCACATTGCCA;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=17;WE=31973693;WS=31973675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,18:0.95:19
chr21	31992864	rs1702405	A	G	699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=1;PP=563;SC=ATATGAAACCAAACGGCCTCA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=31992872;WS=31992854;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr21	32201969	rs35359062	GA	G	2425.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=38;PP=2378;SC=TGGTCCCATAGAATAGGGTAT;SOR=1.112;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=59;TCF=20;TCR=39;TR=58;WE=32201977;WS=32201959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr21	32253629	rs71321355	C	T	2376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=39;PP=1917;SC=TGAAGTTCGCCGGTAACAGGT;SOR=0.927;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=32;TCR=39;TR=71;WE=32253637;WS=32253619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr21	32253966	rs71321356	T	C	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=24;PP=525;SC=CTGGTCTCCGTGGCTTCTTTG;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=32253974;WS=32253956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr21	32434766	rs2070405	C	T	1122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=16;PP=878;SC=CATCATTCACCAGATTTTGAC;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=20;TCR=16;TR=36;WE=32434774;WS=32434763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr21	32493031	rs762194	A	G	4020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=71;PP=2942;SC=CAGTGTCCCCACCACCGGGGG;SOR=1.066;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=56;TCR=71;TR=127;WE=32493039;WS=32493021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr21	32493204	rs2073371	G	A	1984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=46;PP=1563;SC=CATGCTTTACGTGAGATGAAA;SOR=1.999;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=62;TCF=16;TCR=46;TR=62;WE=32493212;WS=32493194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr21	32499473	rs2070410	A	G	2278.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=47;PP=1770;SC=CTCTGCATCTAAAGAAATTAA;SOR=1.852;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=67;TCF=20;TCR=47;TR=67;WE=32499481;WS=32499463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr21	32524852	rs9305453	A	G	1331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=10;PP=971;SC=CCTTAGGAACAGACCCCACTG;SOR=2.400;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=45;WE=32524860;WS=32524842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr21	32525302	rs723470	A	C	3302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=26;PP=2730;SC=TTTCAGTGTTACGCATGTCCC;SOR=2.189;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=73;TCR=26;TR=99;WE=32525310;WS=32525292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr21	32526525	rs12482307	C	T	1514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=20;PP=1164;SC=CACTCCTTTACGAGGCAGAGG;SOR=1.112;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=29;TCR=20;TR=49;WE=32526533;WS=32526515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr21	33073985	rs204734	T	C	172.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=137;SC=GAAAAGCAGATGTATTTTCTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=33073993;WS=33073975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr21	33312539	.	CT	C	50.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.153;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=6.539;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.67;ReadPosRankSum=0.101;SOR=0.064;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
chr21	33641152	rs8129993	A	G	112.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=0;PP=57;SC=AGACTAGAACACAGTAGTGGC;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=33641160;WS=33641149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr21	33641240	rs57672040	A	AT	573.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.613;NF=21;NR=1;PP=475;ReadPosRankSum=-0.870;SC=TGCCTGGCTAATTTTTTTTTT;SOR=3.528;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=22;WE=33641248;WS=33641230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr21	33690293	rs2070380	C	A	442.88	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.228;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=312;ReadPosRankSum=-0.854;SC=GTCAGCACTGCGGCACCCTGA;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=33690301;WS=33690283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr21	33691502	rs11402028	G	GC	873.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=4;PP=808;SC=GGCCAGAAGGGCCCCCTGGCG;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=29;TCF=23;TCR=6;TR=21;WE=33691510;WS=33691492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr21	33691754	rs958828	G	A	1715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=37;PP=1345;SC=CCTTCAATCCGCCACATCCTG;SOR=1.255;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=59;WE=33691762;WS=33691744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr21	33694224	rs3761342	C	G	3695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=52;PP=2811;SC=TGCCGCAGAACGCCAAACACC;SOR=0.746;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=55;TCR=52;TR=107;WE=33694232;WS=33694214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr21	33710001	rs13046776	C	A	483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=17;PP=409;SC=TTATTATTTTCTTTTCTTTTT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=33710009;WS=33709991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr21	33719695	rs2070378	C	T	5050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=84;PP=2965;SC=GGTGTCTTTCCTTCCCGGGGG;SOR=1.065;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=66;TCR=84;TR=150;WE=33719703;WS=33719685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr21	33721843	rs743306	T	C	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=26;PP=792;SC=GGTTCACAGCTACCAGGCAGT;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=33721851;WS=33721833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr21	33726201	rs2298363	C	T	730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.533;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=9.031;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=577;ReadPosRankSum=1.698;SC=ACAGACTAGCCGGCCAGGTGC;SOR=3.989;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=22;WE=33726209;WS=33726191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr21	33730013	rs7283283	T	C	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.16;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	33733447	.	G	GAGA	196.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.169;ClippingRankSum=-0.000;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=3.424;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.26;MQRankSum=-2.380;QD=17.88;ReadPosRankSum=-0.437;SOR=2.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr21	33733459	.	AAAAG	A	194.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.519;ClippingRankSum=-0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.76;MQRankSum=-2.076;QD=16.23;ReadPosRankSum=1.756;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr21	33733468	rs145739787	A	AG	426.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.00;QD=32.83;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,10:0.77:13
chr21	33740637	rs7276783	G	A	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=2;PP=751;SC=TCGGCCTCCCGAAGTGCTGGG;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=33740645;WS=33740627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr21	33749533	rs4816431	A	C	2352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=11;PP=1949;SC=AGCCTACGGGAACAGAGGCCA;SOR=3.321;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=59;TCR=11;TR=70;WE=33749541;WS=33749523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr21	33785343	rs76961987	G	A	2819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=58;PP=2189;SC=CTCCCTGGCTGTGTGCCCCCG;SOR=1.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=36;TCR=58;TR=94;WE=33785351;WS=33785333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr21	33840208	rs4816434	A	G	1432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=27;PP=1000;SC=GGACAGAATTAATAGAATATA;SOR=2.179;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=7;TCR=27;TR=34;WE=33840221;WS=33840198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr21	33840213	.	A	AATAT,AAT	1331.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.19;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;NF=2,2;NR=9,9;PP=345,103;SC=GAATTAATAGAATATATATAT;SOR=1.609;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=11,11;WE=33840221;WS=33840198;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:0.97:31
chr21	33840317	rs34740520	C	CATAT	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=473;SC=AATAAACTCCCGTGTGTGTGT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=6;WE=33840325;WS=33840307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr21	33867280	rs2096458	A	G	1347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=11;PP=1041;SC=GCTGTAGGCTATGTGGTGGCC;SOR=1.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=29;TCR=11;TR=40;WE=33867288;WS=33867270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr21	33887131	rs1129157	G	A	336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=248;SC=CAGCCCACCCGGAGAGAGCTG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=33887139;WS=33887121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	33997466	rs701730	A	G	787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=637;SC=TCTATTGACTACTTTTTTTTT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=33997474;WS=33997456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr21	34003928	rs71640263	A	AAGTATT	8236.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.031;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.243;NF=69;NR=57;PP=2966;ReadPosRankSum=1.715;SC=ACAGAACTCAAAACATTACTT;SOR=1.078;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=148;TCF=81;TCR=67;TR=126;WE=34003936;WS=34003918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,175:0.99:177
chr21	34011412	rs2230766	G	A	1124.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=28;PP=914;SC=TGAGGCTTCAGTGGTTCAGGA;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=34011420;WS=34011402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr21	34017857	rs2406	T	A	202.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=7;NR=0;PP=163;SC=TAGAAAAAACTGTAAAATCCA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=34017865;WS=34017847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr21	34018437	rs844978	C	T	1343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=36;PP=1109;ReadPosRankSum=0.653;SC=AAATAGTTAACGGGTTCATAC;SOR=2.124;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=42;WE=34018445;WS=34018427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr21	34050937	.	AAT	A	1568	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.25;NF=27;NR=5;PP=1568;QD=49.8125;SC=TAACAAATAAAATATAAAGTG;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=32;WE=34050950;WS=34050927;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,32:0.91:35
chr21	34050939	rs201012663	TA	T	1949.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.25;QD=44.31;SOR=3.467;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr21	34050941	rs150500694	TA	T	1949.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.24;QD=43.33;SOR=3.516;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr21	34050942	.	A	T	1062	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.2;NF=33;NR=6;PP=1062;QD=28.1223387833;SC=AATAAAATATAAAGTGCACAT;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=47;TCF=40;TCR=7;TR=39;WE=34050950;WS=34050927;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,39:0.83:47
chr21	34059207	rs844975	C	T	455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=1;PP=353;SC=CTGGAAGAATCTGATTACTGT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=34059215;WS=34059197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	34127438	rs5843565	TA	T	149.06	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.07;MQRankSum=-0.213;QD=11.47;ReadPosRankSum=-0.099;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,11:0.85:13
chr21	34128717	rs7279405	G	A	2284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=52;PP=1811;SC=GTGGAATACAGAGATGTCTGT;SOR=3.226;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=11;TCR=52;TR=63;WE=34128725;WS=34128707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr21	34157085	.	G	GT	398.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.02;QD=24.92;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	34166190	rs74617086	A	T	2087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.209;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=36;PP=1749;ReadPosRankSum=-0.844;SC=TATATGATTTAAAGGCTGAGT;SOR=0.416;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=68;TCF=32;TCR=36;TR=67;WE=34166198;WS=34166180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr21	34443156	rs17852427	C	T	154.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=5;PP=110;SC=CGGCTCCGTGCTGCTGGCGCC;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=34443164;WS=34443146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr21	34538065	rs11444667	C	CT	2355.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=35;PP=2167;SC=TGGCCTCCTTCTTGTATCCCC;SOR=0.980;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=50;WE=34538073;WS=34538055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr21	34540594	rs11379155	C	CT	810.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=1;PP=928;SC=TGCTATAGAGCTGGAATTTAT;SOR=4.892;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=21;WE=34540602;WS=34540584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr21	34542150	rs2834117	G	A	1500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=32;PP=1194;SC=TGGAGACAGGGCCCCAAGGAA;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=14;TCR=32;TR=46;WE=34542158;WS=34542140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr21	34602934	rs12482556	T	C	2159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=59;PP=1663;ReadPosRankSum=0.668;SC=GCTCACCAGCTGGGTGCTCAG;SOR=0.617;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=82;TCF=21;TCR=61;TR=79;WE=34602942;WS=34602924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,81:0.98:83
chr21	34614255	rs1051393	T	G	1152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.734;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=13;PP=868;ReadPosRankSum=0.960;SC=TGCCTTCATCTTCAGATCACT;SOR=0.922;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=42;WE=34614263;WS=34614245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr21	34624386	.	C	CATCTATCT,CATCT	986.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;AN=2;BRF=0.13;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=15,15;NR=1,1;PP=56,656;SC=AGACCCCATCCATCTATCTAT;SOR=3.716;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=16,16;WE=34624394;WS=34624376;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:20
chr21	34624917	rs2236757	A	G	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=14;NR=1;PP=425;SC=ATTAAGGCCTACCTCTAAATG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=34624925;WS=34624915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	34634878	rs1131668	G	A	344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=257;SC=GCAAGGTCTCGCTAAGGGCTG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=34634886;WS=34634868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	34635053	rs3216172	G	GT	2944.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=12;PP=2619;SC=AGAGCAAACAGTACAGCTGAT;SOR=2.939;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=67;TCF=55;TCR=12;TR=58;WE=34635087;WS=34635043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr21	34635065	rs9984273	C	T	2773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=11;PP=1764;SC=ACAGCTGATACGGACTCTCTC;SOR=2.869;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=68;TCF=56;TCR=12;TR=67;WE=34635087;WS=34635043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr21	34635079	rs34865572	CT	C	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=1.753;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.27;MQRankSum=-1.115;QD=0.69;ReadPosRankSum=-0.351;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,10:0.19:52
chr21	34660676	rs66527331	ACG	A	635.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.64;ReadPosRankSum=1.737;SOR=3.442;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr21	34660684	.	GCGCA	G	387	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=19;MMLQ=24;MQ=59.5;NF=0;NR=12;PP=387;QD=33.75;SC=ACACGCGCGCGCGCACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=12;WE=34660695;WS=34660674;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,12:0.48:25
chr21	34660686	.	G	A	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=28;MMLQ=24;MQ=59.49;NF=0;NR=12;PP=143;QD=14.8142677123;SC=ACGCGCGCGCGCACACACACA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=12;WE=34660695;WS=34660674;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:13,12:0.48:25
chr21	34660707	rs67118950	CACAG	C	60.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=86;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=412;ReadPosRankSum=-0.453;SC=CACACACACACACAGACACGC;SOR=0.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=14;WE=34660719;WS=34660697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,5:0.31:16
chr21	34660709	rs66834406	CAG	C	246.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=2.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.42;ReadPosRankSum=0.454;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr21	34666111	.	CAA	C	124	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=15;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=18;MQ=55.99;NF=8;NR=0;PP=124;QD=15.875;SC=GACTCGATCTCAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=8;WE=34666120;WS=34666108;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,8:0.53:15
chr21	34666376	rs1467845	A	G	1766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=41;PP=1439;SC=CTGCTGGCATAAGCTCTCACC;SOR=3.300;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=48;WE=34666384;WS=34666366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr21	34668747	rs3171425	A	G	3595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=60;PP=2837;SC=GGCAGCAAACAAGGGCCAAGA;SOR=0.856;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=113;TCF=53;TCR=60;TR=113;WE=34668755;WS=34668737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr21	34697197	.	G	GGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT	484.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.83;QD=60.59;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr21	34697264	rs2850015	T	C	1169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=9;PP=742;SC=GCAGCGCGTGTGCAGAGGGGC;SOR=2.133;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=23;TCR=9;TR=32;WE=34697272;WS=34697254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr21	34707808	rs2243592	T	G	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=6;PP=778;SC=TATAATGTTCTTATTTCTTGT;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=35;WE=34707816;WS=34707798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr21	34708061	rs2243594	A	G	697.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=18;PP=562;SC=TCTATTTTTTAGAAATGTTAC;SOR=3.816;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=20;WE=34708069;WS=34708051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr21	34721348	rs2834196	A	G	256.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=212;SC=TGGCAATTGTAAATACTTAAT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=34721356;WS=34721338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr21	34793706	rs2834214	C	T	1747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=2;PP=1451;SC=AATAAACCTGCGTTTTGAACA;SOR=5.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=54;TCF=52;TCR=2;TR=54;WE=34793714;WS=34793696;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr21	34799350	rs11910627	C	G	2910.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=73;PP=2388;SC=GCAAGAGCATCTTTCTTTTTT;SOR=2.511;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=21;TCR=73;TR=94;WE=34799358;WS=34799340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr21	34804966	rs1532	T	C	2295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=10;PP=1791;SC=CATTAACTGATGTTTGTGTTG;SOR=3.581;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=63;TCR=10;TR=73;WE=34804974;WS=34804956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr21	34805197	rs143248516	C	CT	227.50	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=16;MQRankSum=0.671;NF=1;NR=11;PP=202;ReadPosRankSum=-1.291;SC=GCACACATCTCTTTTTTTTTT;SOR=1.329;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=12;WE=34805205;WS=34805187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr21	34839533	rs743334	A	G	1087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=31;PP=927;SC=TGGGCTGGGTACAGAGGCTCA;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=2;TCR=31;TR=33;WE=34839541;WS=34839523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr21	34860749	rs139852262	CAATTA	C	3782.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=29;PP=2974;SC=AGGATGGGAACAATTAAATTA;SOR=1.329;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=42;TCR=36;TR=62;WE=34860761;WS=34860739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr21	34870990	rs62226457	G	A	2860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=65;PP=2405;SC=TACAAAGCCTGGAAGTTGGAA;SOR=2.007;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=90;TCF=25;TCR=65;TR=90;WE=34870998;WS=34870980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr21	34878450	rs2070390	A	T	1889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.73;QD=31.50;SOR=3.575;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr21	34883618	rs8971	T	C	4619.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=69;NR=81;PP=2965;SC=CTGCTGGATATCCCTCAGAAT;SOR=0.789;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=69;TCR=81;TR=150;WE=34883626;WS=34883608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chr21	34892896	rs2834232	C	T	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=569;SC=TAAACATCCACATTAGGGAAT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=34892904;WS=34892886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr21	34894623	rs2834234	T	C	928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=24;PP=706;SC=CACCTAAACGTCAGGGAAAAT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=34894631;WS=34894613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr21	34896962	rs1804385	C	G	200.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=173;SC=GACTGTATCACTCCCACAGAG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=34896970;WS=34896952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr21	34897113	rs8788	C	T	2350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=14;PP=1793;SC=CGAAAGCCGACGTCTTTCCTA;SOR=2.630;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=59;TCR=14;TR=72;WE=34897121;WS=34897103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr21	34900924	.	GA	AA	313	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000,1.0000;HP=20;HapScore=4;MGOF=2;MMLQ=18;MQ=62.52;NF=0,2;NR=24,25;PP=313,308;QD=14.4904671895;SC=CATTAAAAAAGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=24,27;WE=34900932;WS=34900914;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:17,24:0.59:41
chr21	34900924	.	GA	GAA	313	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000,1.0000;HP=20;HapScore=4;MGOF=2;MMLQ=18;MQ=62.52;NF=0,2;NR=24,25;PP=313,308;QD=14.4904671895;SC=CATTAAAAAAGAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=9;TCR=32;TR=24,27;WE=34900932;WS=34900914;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:12,27:0.69:39
chr21	34901062	.	T	TA	157.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=-0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=3.041;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=12.13;ReadPosRankSum=0.741;SOR=0.116;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,9:0.69:13
chr21	34915324	rs1041745	CG	GC	1162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=0;PP=1197;SC=CGAATTGGCCCGTGCGCCTCC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=22;WE=34915333;WS=34915314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr21	34924243	rs16990760	T	C	2009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=27;PP=1633;SC=GTACCCAAGATTCTGCTATGT;SOR=0.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=32;TCR=27;TR=59;WE=34924251;WS=34924233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr21	34925142	rs13433428	C	T	2464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=35;PP=1833;SC=GTGCCATCATCACCATCTGAA;SOR=0.744;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=38;TCR=35;TR=73;WE=34925150;WS=34925132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr21	34925689	rs61739710	G	A	5848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.386;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=90;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.792;SC=TAACTGTCCTGGAGCCTTCGG;SOR=0.268;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=194;TCF=104;TCR=90;TR=192;WE=34925697;WS=34925679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,190:0.99:191
chr21	34926260	rs13047599	C	T	5275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=82;NR=79;PP=2965;SC=GACTAAACAGCGCACAGTATT;SOR=0.777;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=165;TCF=84;TCR=81;TR=161;WE=34926268;WS=34926250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr21	34927291	rs150122403	T	C	3049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.647;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.818;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=64;PP=2603;ReadPosRankSum=-0.876;SC=GAAAGACAGTTAGAGCTCGAA;SOR=1.507;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=96;TCF=32;TCR=64;TR=95;WE=34927299;WS=34927281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,93:0.99:94
chr21	34927751	rs34040109	A	AT	1650.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=51;PP=1539;SC=TTAAACCTTAATTTTTTTCTG;SOR=5.892;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=1;TCR=63;TR=52;WE=34927759;WS=34927741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr21	34948684	rs34377180	G	GA	449.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=6;PP=454;SC=TTGAGAAATGGAGCCCTTACC;SOR=0.859;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=5;TCR=6;TR=11;WE=34948704;WS=34948674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	34948696	rs34373121	GA	G	524.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=6;PP=484;SC=GCCCTTACCAGACCCAATTGT;SOR=0.836;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=12;WE=34948704;WS=34948674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr21	34959776	rs7283856	G	A	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=2;PP=394;SC=CAAATCCTATGAAAAAAAAGT;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=16;WE=34959784;WS=34959766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	34968605	rs150787088	GTA	G	495.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=591;SC=ATTTTGCTAAGTATATGTCAA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=34968614;WS=34968595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr21	34985754	rs2276226	T	C	974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=6;PP=797;SC=ACAACACTTATGGTAGATTCA;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=26;TCR=6;TR=32;WE=34985762;WS=34985744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr21	35012719	rs6517185	GG	CT	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=28;PP=1655;SC=AGTTTGAATCGGGGCTTTCCT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=35012728;WS=35012709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr21	35124253	rs2834255	A	G	1320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=35;PP=1065;SC=GGTTAAGGCCATTACCTGATT;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=42;WE=35124261;WS=35124243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr21	35134084	rs11444980	G	GC	1459.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=5;PP=1544;SC=TTTTTACAAAGCCCTGCGGTA;SOR=3.209;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=38;WE=35134092;WS=35134074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr21	35174897	rs11390596	T	TA	1577.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=52;PP=1152;SC=TTGTGCTTTTTAAAAAAAAAG;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=60;TCF=0;TCR=60;TR=52;WE=35174905;WS=35174887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr21	35206880	rs2248321	A	G	1516.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=43;PP=1232;SC=CTAATGTGATATGGAATATGT;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=43;WE=35206888;WS=35206870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr21	35228953	rs9305535	A	G	1261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=2;PP=1089;SC=AGCCCTCAGGACCCAGCAGCC;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=39;WE=35228961;WS=35228943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr21	35230987	rs2073367	T	C	3806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=80;NR=35;PP=2965;SC=TCTGCATCTGTAGATTTTTCA;SOR=1.690;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=116;TCF=81;TCR=35;TR=115;WE=35230995;WS=35230977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr21	35237349	rs9984732	A	G	1449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=1;PP=1222;SC=AGTGGCCCTTAAGGCTGTGCC;SOR=6.091;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=42;WE=35237357;WS=35237339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr21	35237608	rs9976801	T	C	1404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=43;PP=1089;ReadPosRankSum=-0.723;SC=AGAAGACGGATGAGGCCCCAG;SOR=2.187;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=7;TCR=44;TR=50;WE=35237616;WS=35237598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr21	35239562	rs56279221	A	G	1360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.093;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=11;PP=1053;ReadPosRankSum=0.452;SC=CCTCGGTGTAAAGGGATGCCA;SOR=1.718;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=28;TCR=12;TR=39;WE=35239570;WS=35239552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chr21	35247611	rs2298681	G	A	1103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=2;PP=897;SC=TCACAGGCCCGCCCACATTGC;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=33;WE=35247619;WS=35247601;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr21	35247873	rs933130	C	G	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=13;PP=479;SC=CAGAGCCTCGCCTGCCAGCCT;SOR=1.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=6;TCR=13;TR=19;WE=35247881;WS=35247863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr21	35275955	rs9980730	G	A	4261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=83;PP=2965;SC=TACAAAAGAAGTAAGACTGGA;SOR=1.324;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=134;TCF=51;TCR=83;TR=134;WE=35275963;WS=35275945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr21	35446136	rs79607614	C	G	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=3;PP=53;SC=GCCGCGGGACCCCGGGCCTTC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=35446144;WS=35446126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr21	35467372	rs11295804	AC	A	819.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=0;PP=935;SC=AAAGACTTTGACCCTGCTGTG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=24;WE=35467380;WS=35467362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr21	35467472	rs11295803	AG	A	3622.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=23;PP=2965;SC=CTGTCATTGGAGCGCTATTAT;SOR=1.942;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=71;TCF=46;TCR=25;TR=69;WE=35467480;WS=35467462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr21	35467645	rs8129891	A	G	3162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=59;PP=2568;SC=GACCTGGGTAACAATTGGTGC;SOR=1.274;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=36;TCR=60;TR=95;WE=35467653;WS=35467635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr21	35469193	rs4817617	C	A	3635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=38;PP=2830;SC=GGAACCATACCAAATGCAAGA;SOR=1.432;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=106;TCF=68;TCR=38;TR=106;WE=35469201;WS=35469183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr21	35469708	rs35685523	G	GA	547.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=519;SC=GGTCTTTGGGGAAAAAAGTTA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=16;WE=35469716;WS=35469698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr21	35985895	rs915540	C	T	1302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=1;PP=1108;SC=AGGAAAAGGTCTGAAATGCTG;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=39;WE=35985903;WS=35985885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr21	36041978	rs7280973	A	G	279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=6;PP=205;SC=AGGTGCCCCAAGGAGGGGAGG;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=36041986;WS=36041968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr21	36042203	rs9680380	G	C	265.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=9;PP=265;SC=ACATAGAAGCGGAGGGCCCGG;SOR=2.303;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=12;WE=36042211;WS=36042193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr21	36080204	rs6517253	A	G	802.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=2;PP=586;SC=CCAGATTCTCACGGTGGCCCA;SOR=3.841;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=36080212;WS=36080194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr21	36080398	rs2070368	T	C	2059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.510;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.279;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=43;PP=1374;ReadPosRankSum=-0.718;SC=GTTCATAACTTGATTGTCACT;SOR=1.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=28;TCR=44;TR=70;WE=36080406;WS=36080388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,74:0.99:75
chr21	36080908	rs2834597	G	A	1075.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=0;PP=911;SC=TCATTTTTATGCCCAGAGAAA;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=36080916;WS=36080898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr21	36081626	rs3819041	C	G	2688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.994;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.742;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=27;PP=2201;ReadPosRankSum=-0.689;SC=GCAAACCTCTCTTTGTGATTT;SOR=1.754;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=86;TCF=58;TCR=28;TR=84;WE=36081634;WS=36081616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,84:0.98:86
chr21	36193871	rs2018329	T	C	227.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=1;PP=142;SC=CTGAGGGCTGTCATCTTTCTT;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=36193879;WS=36193861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr21	36206932	rs11702841	G	A	233.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.22;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr21	36410869	rs59976658	CCTCTCT	C	200.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=2;PP=267;SC=TGAATGCTGGCCTCTCTCTCT;SOR=2.833;SbPval=0.08;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=5;WE=36410882;WS=36410859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr21	36410906	rs62218495	C	G	108.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.49;QD=36.09;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr21	36410908	rs62218496	C	G	108.18	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.13;QD=36.06;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr21	36410910	rs8126848	C	G	456.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.13;QD=41.52;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
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chr21	37413946	rs2835243	C	T	510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=1;PP=428;SC=TCCTCCACAACATCAAGCGCA;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=37413954;WS=37413936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	37414194	rs11404455	C	CA	285.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=229;ReadPosRankSum=0.134;SC=TTTCTATATTCAAAAAAAAAA;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=14;WE=37414202;WS=37414184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr21	37414256	rs71330635	T	G	341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.98;NF=1;NR=10;PP=283;SC=CCTTCCCTTCTCAACTCACTT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=37414264;WS=37414246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	37425955	rs762360	C	T	3287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=81;PP=2514;ReadPosRankSum=1.829;SC=TAAATCCTACCATAACTTCAA;SOR=1.942;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=100;TCF=18;TCR=82;TR=99;WE=37425963;WS=37425945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,104:0.99:105
chr21	37425971	rs762361	C	T	2235.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=58;PP=1712;ReadPosRankSum=-0.972;SC=TTCAAGGTCCCAGAGATAACT;SOR=2.642;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=68;TCF=9;TCR=59;TR=67;WE=37425979;WS=37425961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,72:0.99:73
chr21	37429679	rs7282629	G	C	1905.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=36;PP=1462;SC=CGCAATGACTGACTTCTGTAT;SOR=1.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=23;TCR=36;TR=59;WE=37429687;WS=37429669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr21	37431265	rs2051395	G	T	1330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=39;PP=1171;SC=CTGTGGAAATGCTCAATCTAA;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=39;WE=37431273;WS=37431255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr21	37443155	.	T	TTG	927	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;FR=1.0000;HP=23;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=61.78;NF=27;NR=0;PP=927;QD=34.4444444444;SC=CACTAAGTTTTTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=27;WE=37443177;WS=37443145;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,27:0.93:29
chr21	37443156	rs113589610	T	TG	1333.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.78;QD=44.46;SOR=6.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr21	37443162	.	T	TG	1332.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.11;QD=45.96;SOR=6.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr21	37443169	.	T	G	1342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.04;QD=43.32;SOR=6.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr21	37443480	rs1005696	T	G	2517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=57;PP=2025;SC=TCTGTGCTTTTTCTCCTGCCA;SOR=1.966;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=76;TCF=19;TCR=57;TR=76;WE=37443488;WS=37443470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr21	37443565	rs1005695	G	C	831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=23;PP=674;SC=CCTCCCTGTCGCACTGGTCTT;SOR=3.611;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=37443573;WS=37443555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr21	37444697	rs2835266	G	A	5981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=125;PP=2965;SC=ACCTCTCTACGGGATTGTTGC;SOR=1.859;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=178;TCF=53;TCR=125;TR=178;WE=37444705;WS=37444687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr21	37507745	rs881711	C	T	2724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=43;PP=2043;SC=GGGGGCTCAACGTACTGGTCA;SOR=0.763;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=39;TCR=43;TR=82;WE=37507753;WS=37507735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr21	37509995	rs12626192	C	T	633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=537;SC=TCACCGACCTCGTTCTTAAAA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=37510003;WS=37509992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr21	37518582	rs17849671	G	A	2230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=22;PP=1856;SC=TGGGGGTCACGGTCTTATCGA;SOR=1.644;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=67;TCF=44;TCR=23;TR=66;WE=37518590;WS=37518572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr21	37518850	rs34911362	G	A	2435.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=59;PP=1900;SC=AATGTTGGTGGAATGAATGAA;SOR=3.581;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=71;TCF=10;TCR=61;TR=69;WE=37518858;WS=37518840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr21	37583804	rs2239568	C	T	4479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=94;NR=42;PP=2965;SC=GTTTTTATGACCATAAAGAGT;SOR=1.677;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=94;TCR=42;TR=136;WE=37583812;WS=37583794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chr21	37586877	rs2850079	T	C	3060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=57;PP=2352;SC=ATGCTGCTTCTATCCTATGCT;SOR=1.378;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=31;TCR=57;TR=88;WE=37586885;WS=37586867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr21	37599824	rs7280662	T	G	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=0;PP=35;SC=CAGCCTGGGCTACAGAGCAAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=37599832;WS=37599815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr21	37599849	.	AAAG	A	183.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=486;SC=TGTCAAAAAAAAAGAAAGAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=37599859;WS=37599839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr21	37609571	rs2835322	T	C	5449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=99;NR=86;PP=2965;SC=GGGTGGCTCGTGTGCTTTGGA;SOR=0.840;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=185;TCF=99;TCR=86;TR=185;WE=37609579;WS=37609561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,187:1.00:187
chr21	37617630	rs4817788	T	G	5082.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.781;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=86;PP=2965;ReadPosRankSum=0.462;SC=TACAAGCTCCTGCCACACGGA;SOR=0.232;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=172;TCF=85;TCR=87;TR=171;WE=37617638;WS=37617620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,174:0.99:175
chr21	37619931	rs5843755	A	AT	2182.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.317;NF=2;NR=78;PP=1048;ReadPosRankSum=0.609;SC=AAAAAGGTAAATTTTTTTTTT;SOR=3.383;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=125;TCF=3;TCR=122;TR=80;WE=37619939;WS=37619921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,88:0.98:90
chr21	37692507	rs62229372	C	T	3143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=53;PP=2415;SC=AGTCGTTCCGCCACCTCCCAG;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=106;TCF=51;TCR=55;TR=104;WE=37692515;WS=37692497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chr21	37728892	rs141327973	C	CTTGAA	791.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=2;PP=657;SC=AGAATTTTTTCTTGATTTTAT;SOR=3.383;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=13;WE=37728900;WS=37728882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr21	37729088	rs2835339	G	C	908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=21;PP=736;SC=AGAGTAAAGGGATTGTACAAT;SOR=2.753;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=37729096;WS=37729078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr21	37759957	rs62229404	C	T	2911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=47;PP=2211;ReadPosRankSum=0.358;SC=TCCAATCTTGCTCGTCATACC;SOR=0.826;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=93;TCF=45;TCR=48;TR=90;WE=37759965;WS=37759947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,94:0.98:96
chr21	37784070	rs218630	G	A	145.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=4;PP=115;SC=TCTGTCACCCGGGCTGGAGTG;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=37784078;WS=37784060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr21	38081562	rs2070647	T	G	2733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=32;NR=58;PP=2131;SC=TAGAGCGGCCTCGCCGGGGGA;SOR=1.346;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=32;TCR=58;TR=90;WE=38081570;WS=38081552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr21	38081577	rs2070648	C	G	3022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=58;PP=2345;SC=GGGGGAGGAGCGCAGCCGCCG;SOR=1.265;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=33;TCR=59;TR=91;WE=38081585;WS=38081567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr21	38113998	rs2070519	C	A	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=2;PP=584;SC=CTGAGGACTCCTGTCACCTTG;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=38114006;WS=38113988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr21	38126507	rs77014096	T	C	880.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=0;PP=686;SC=TCCAGATGCATGGGCACGGAC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=26;WE=38126515;WS=38126497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr21	38128707	rs9977769	G	A	785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=610;SC=AGCCAAGATCGTGCCACTGCA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=23;WE=38128715;WS=38128697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr21	38132172	rs2073420	C	T	3332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=70;PP=2703;ReadPosRankSum=0.980;SC=TTAATTAAGCCGTCACAGGAC;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=105;TCF=33;TCR=72;TR=103;WE=38132180;WS=38132162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,106:0.99:107
chr21	38302769	rs2073425	C	T	2122.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=50;PP=1598;SC=AAACTGAGGGCACTCACAGGC;SOR=2.269;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=17;TCR=50;TR=67;WE=38302777;WS=38302759;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr21	38338969	rs9980304	T	C	168.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=7;PP=129;SC=GAGCCCGCCTTGCCCGCCCGC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=38338977;WS=38338959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr21	38437763	rs7337	C	G	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=278;SC=AGAAGGTCAACTTACATTTTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=38437771;WS=38437753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr21	38444863	rs2507733	C	T	2015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=36;PP=1612;SC=ACAATCAGCGCCAGCGATGTG;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=25;TCR=36;TR=61;WE=38444871;WS=38444853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr21	38495185	rs11440324	G	GT	969.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=6;PP=1127;SC=TAAATTTGAGGTCCTTACTAT;SOR=2.303;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=25;WE=38495193;WS=38495175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr21	38495213	rs11440325	G	GA	858.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=45;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=9;PP=925;SC=AAGTAAATTTGAAATCTTTTA;SOR=1.781;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=15;TCR=9;TR=24;WE=38495221;WS=38495203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr21	38495270	rs11440326	A	AT	1301.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=18;PP=1474;SC=TGTGTGTGTGATGACTTTTAT;SOR=0.693;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=33;WE=38495278;WS=38495260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr21	38498585	rs12185849	G	C	148.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=5;PP=118;SC=AGAAAATATTGAATATTTATT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=38498593;WS=38498575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr21	38512956	rs1133001	A	G	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=15;PP=771;SC=TTGGAAAAGTATATTTGAAAA;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=14;TCR=15;TR=29;WE=38512964;WS=38512946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr21	38517021	rs1344047	G	A	2654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=53;PP=2048;ReadPosRankSum=-0.787;SC=ATCAGGAGGCGGAGAGGTAGG;SOR=0.973;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=74;TCF=20;TCR=54;TR=73;WE=38517029;WS=38517011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,80:0.99:81
chr21	38517058	rs764175	C	T	1558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=40;PP=1269;SC=CTCCCTTACACGCATTTCCCC;SOR=3.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=46;WE=38517066;WS=38517048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr21	38520031	rs372841981	AT	A	92.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.727;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.06;MQRankSum=-1.036;QD=5.80;ReadPosRankSum=0.880;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,9:0.56:16
chr21	38520091	rs9978203	C	T	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=287;SC=TGCAGTGGCACGATCTTGGCT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=38520099;WS=38520081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	38522618	rs2257091	G	T	355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=297;SC=AGGAAATACTGGGATGTGAGA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=38522626;WS=38522608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	38523266	rs3737540	C	A	532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=14;PP=416;SC=CTAAATTATGCCTTTTTAAAA;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=3;TCR=14;TR=17;WE=38523274;WS=38523256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr21	38525198	rs2051162	G	A	375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=4;PP=286;SC=CTAAGTTTATGTAATTGTGAA;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=38525206;WS=38525188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr21	38525356	rs1053808	T	C	651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=14;PP=535;SC=AATACAGCCATGCTTCTCAAA;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=24;WE=38525364;WS=38525346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr21	38525652	rs767998	T	G	950.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=27;PP=745;SC=CATTTTCATTTTCCTGCCATA;SOR=3.545;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=32;TCF=3;TCR=29;TR=30;WE=38525660;WS=38525642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr21	38528866	rs2835635	A	G	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=455;SC=GCAAACTATAATCAGCTGGCT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=38528880;WS=38528856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr21	38528872	rs10706050	TG	T	765.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=667;SC=TATAATCAGCTGGCTTTCAGA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=38528880;WS=38528856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr21	38531863	rs4817852	T	C	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=294;SC=GTTTCTAAACTACACTTGTGT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=38531871;WS=38531853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	38531921	rs1787365	C	A	784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=3;PP=591;SC=TAGTATGAGGCGTTATTTTAA;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=22;WE=38531929;WS=38531911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr21	38532058	rs34771928	TG	T	2209.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.85;NF=21;NR=29;PP=2008;SC=GTAAGTTACTTGGATCACTTG;SOR=0.725;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=51;TCF=21;TCR=30;TR=50;WE=38532076;WS=38532048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr21	38532068	rs113972351	G	GA	2065.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=27;PP=1910;SC=TGGATCACTTGAATCTTACGT;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=20;TCR=27;TR=47;WE=38532076;WS=38532048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr21	38532086	rs34586966	TG	T	2211.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=56;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=60.03;NF=20;NR=29;PP=2130;SC=CGTTCTAATCTGATGTTAAAC;SOR=0.841;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=50;TCF=20;TCR=30;TR=49;WE=38532094;WS=38532076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr21	38532192	rs34367119	A	AT	675.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=19;PP=846;SC=ACGTACTATTATTCATTAGAA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=19;WE=38532200;WS=38532182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr21	38532901	rs5843796	G	GT	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=0;PP=70;SC=CTTAATTTTAGTATACATTAG;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=38532918;WS=38532891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr21	38532904	rs5843798	T	TA	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.85;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr21	38532910	rs5843800	A	AG	128	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=168;SC=AGTATACATTAGTATTATTAA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=38532918;WS=38532891;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr21	38534228	rs11424055	A	AT	139	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=0;PP=64;SC=AATTTTAATGATTTTTCTCTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=2;WE=38534242;WS=38534218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr21	38534234	rs57522570	C	T	178.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=93;SC=AATGATTTTTCTCTTTAATGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=38534242;WS=38534218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr21	38539673	rs1793885	C	T	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr21	38539677	rs4988831	A	T	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr21	38539681	rs1793886	G	A	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr21	38539718	rs2000413	G	A	315.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=0;PP=231;SC=ACATGTTTACGGAAAGCATGG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=38539726;WS=38539708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr21	38539745	rs5843802	G	GA	474.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=4;PP=308;SC=ATCTAAATGGGAAAAAAAACT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=10;TCR=4;TR=14;WE=38539753;WS=38539735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr21	38539836	rs5843803	T	TA	1685.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=13;PP=1600;SC=AAGTGAATTTTATTTTTTGTT;SOR=1.493;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=22;TCR=13;TR=34;WE=38539852;WS=38539826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr21	38539844	rs2000415	G	A	1670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=13;PP=1005;SC=TTTATTTTTTGTTTTGCCCAC;SOR=1.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=24;TCR=13;TR=37;WE=38539852;WS=38539826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr21	38540089	rs2000416	T	A	232.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=159;SC=TTGTTGAAATTTGAGAAGGGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=38540097;WS=38540079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr21	38563725	rs2835655	G	A	833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=15;PP=615;SC=AGAAAGCAAAGGTAAGTTGTA;SOR=1.220;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=8;TCR=15;TR=23;WE=38563733;WS=38563715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr21	38564530	rs202143959	CT	C	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-0.444;QD=0.74;ReadPosRankSum=1.278;SOR=0.617;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,11:0.19:59
chr21	38567902	rs2835659	C	T	2799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.90;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr21	38567911	rs7280251	T	C	2957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.87;SOR=3.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr21	38568009	rs1053966	G	C	3935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=64;NR=49;PP=2965;SC=GTCTTCAGGCGACGATGGCCA;SOR=0.950;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=114;TCF=64;TCR=50;TR=113;WE=38568017;WS=38567999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr21	38568308	rs6579	C	T	2117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=51;PP=1755;SC=TTATTGAGCACCTGTCAGTGG;SOR=2.049;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=19;TCR=51;TR=70;WE=38568316;WS=38568298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr21	38570055	.	T	TA	309.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.758;ClippingRankSum=0.000;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=5.051;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.93;MQRankSum=0.567;QD=19.36;ReadPosRankSum=0.437;SOR=1.793;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,15:0.94:16
chr21	38574018	rs1053984	C	T	181.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=146;SC=GTTAATATCGCTGATATTAAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=38574026;WS=38574008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr21	38599934	rs11300896	TG	T	1640.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=6;PP=1714;SC=CCATGAGGGCTGGGAGGCGAG;SOR=3.306;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=43;WE=38599942;WS=38599924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr21	38600154	rs10716173	CG	C	407.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=464;SC=GCAGAGGCTGCGGGGTCCACA;SOR=2.833;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=13;WE=38600162;WS=38600144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr21	38792786	rs143066663	TGGG	T	1168.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=23;PP=956;SC=TAGCAGTTAGTGGGGGGAATT;SOR=3.690;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=25;WE=38792796;WS=38792776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr21	38850640	rs928763	G	A	1854.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=54;PP=1508;SC=CTATCTTGCAGTATGTCATTG;SOR=6.701;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=55;WE=38850648;WS=38850630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr21	38858805	.	G	C	1243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.479;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=6;PP=1068;ReadPosRankSum=0.688;SC=GCAAGAATGGGTTGCCATTAA;SOR=1.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=39;WE=38858813;WS=38858795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,39:0.98:40
chr21	38858938	rs55650427	G	A	1991.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=46;PP=1516;ReadPosRankSum=-0.736;SC=GGCAAACAGCGCAGTGTGCCC;SOR=0.979;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=17;TCR=47;TR=63;WE=38858946;WS=38858928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,66:0.99:67
chr21	38862862	rs67837743	C	T	615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=549;SC=TTGCGGTTTTCGCCATTGCAG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=38862870;WS=38862852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr21	38865507	rs2835772	C	G	1728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=45;PP=1342;SC=TTCATAATTTCTTTTTGTCTT;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=6;TCR=45;TR=51;WE=38865515;WS=38865497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr21	38997701	rs702859	G	A	3140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=63;PP=2537;SC=CGTAGAACCCGTCCTCCAGGG;SOR=1.345;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=37;TCR=63;TR=100;WE=38997709;WS=38997691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr21	39086965	rs2070995	T	C	3744.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=60;PP=2953;SC=TAATTCCCTCTGGGCATTTAT;SOR=0.793;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=64;TCR=60;TR=123;WE=39086973;WS=39086955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr21	39089242	rs3061015	ACT	A	2412.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=0;PP=2136;SC=CTTTATGGACACTCTGTTTTT;SOR=8.086;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=50;TCR=1;TR=45;WE=39089251;WS=39089232;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr21	39089582	rs857961	A	G	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=275;SC=CAAATACCAGAATAGGTGTTG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=39089590;WS=39089572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr21	39213020	rs2836016	G	A	896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=23;PP=752;SC=TCCTGGAGGTGAGAAGAAAAG;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=26;TCF=3;TCR=23;TR=26;WE=39213028;WS=39213010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr21	39671476	rs2230033	G	A	4113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=68;PP=2965;SC=TTAGAACCCGGTGAGCCCATT;SOR=0.824;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=58;TCR=68;TR=126;WE=39671484;WS=39671466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr21	39774634	.	C	A	23	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;FR=0.5001;HP=20;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=19;MQ=55.59;NF=0;NR=5;PP=23;QD=11.5542425094;SC=ACCTTTCTTACAAAAAAAAAA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=39774642;WS=39774624;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:8,5:0.38:13
chr21	39775373	rs2836373	A	G	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=320;SC=TCTGAAGCTCAGGTCATAAGA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=39775381;WS=39775363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr21	39818838	rs11701207	C	A	5009.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=96;PP=2965;SC=CCCTATGATGCCCTTTGTGAC;SOR=1.319;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=58;TCR=96;TR=154;WE=39818846;WS=39818828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,160:1.00:160
chr21	39822650	rs2211871	G	T	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=199;SC=TACACCACTTGTCACATTTTA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=39822658;WS=39822640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr21	39822906	rs9305648	G	C	2703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=57;PP=2226;SC=GTTTGTGTCTGTGAATGGAAT;SOR=2.362;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=18;TCR=57;TR=75;WE=39822914;WS=39822896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr21	39823349	rs2051165	T	C	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=22;PP=637;SC=GATGTGTTCATTGCAGGTGGA;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=39823357;WS=39823339;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr21	39870310	rs2836441	G	A	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=20;PP=600;SC=GCCATAATGCGATCAAGTTTA;SOR=4.003;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=22;TCF=2;TCR=20;TR=22;WE=39870318;WS=39870300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr21	40177784	.	T	C	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=9;NR=2;PP=289;SC=CACTCGGCCGTCCCTCCTTCC;SOR=3.258;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=40177792;WS=40177774;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr21	40250762	rs5843936	GA	G	3235.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=66;PP=2974;SC=TGGTGCAATTGAGAGGAAATT;SOR=4.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=68;TCF=2;TCR=66;TR=68;WE=40250774;WS=40250752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr21	40250766	rs1569306	G	A	3244.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=65;PP=2054;SC=GCAATTGAGAGGAAATTGCCC;SOR=4.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=2;TCR=65;TR=67;WE=40250774;WS=40250752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr21	40547387	rs9305670	A	G	513.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=1;PP=435;SC=ACTACAATTAATTTTTTACAA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=40547395;WS=40547377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr21	40552307	rs3171465	A	G	1813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=37;PP=1371;SC=TCCAGAGTTTAGCACAACCAA;SOR=1.781;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=54;TCF=17;TCR=37;TR=54;WE=40552315;WS=40552297;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr21	40571246	rs1041439	A	G	4114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=61;PP=2965;SC=CACTGGTAATAGTTGATTTTC;SOR=0.725;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=122;TCF=61;TCR=61;TR=121;WE=40571254;WS=40571236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr21	40574305	rs2183573	A	G	1181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=4;PP=961;SC=CTTTCTGATGATTCTGCTGAA;SOR=3.797;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=32;TCR=4;TR=36;WE=40574313;WS=40574295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr21	40574552	rs2150411	G	T	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=313;SC=CTAAATAGAAGTATATCATAT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=40574560;WS=40574542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr21	40584412	rs8132424	A	T	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=0;PP=53;SC=TCTCACTCTGATAATACAGTA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=40584420;WS=40584406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr21	40584598	rs6517529	C	T	1349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=21;NR=16;PP=980;SC=TTACTCTCCTCCTTCCAGAAG;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=37;WE=40584606;WS=40584588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr21	40585330	rs142696785	AAAGCCAACATTTTCTTCACTTT	A	952.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=1;PP=2573;SC=TTGGTACTACAAAGCCAACAT;SOR=2.737;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=7;WE=40585359;WS=40585320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr21	40587003	rs11434832	G	GC	245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=1;PP=265;SC=CACCATGTTGGTACGCTGGTC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=6;TCR=1;TR=7;WE=40587011;WS=40586993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr21	40587049	rs4818004	A	G	271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=2;PP=217;SC=GACGGCCTTCACTTCCCAAAG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=40587057;WS=40587039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr21	40597215	rs139986112	A	AAAG	1748.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=32;PP=1670;SC=TACAGATAAAAAAGCCAAAAG;SOR=7.428;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=32;WE=40597223;WS=40597205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr21	40600313	rs11702268	T	C	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=2;PP=552;SC=ATATCTCTTCTGGAATTTACA;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=20;WE=40600321;WS=40600303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr21	40604429	rs2836950	C	G	1794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=38;PP=1478;SC=CAAATTCTACCAAGGGGAAGA;SOR=2.066;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=15;TCR=38;TR=53;WE=40604437;WS=40604419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr21	40636354	.	TAA	T	46.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.241;ClippingRankSum=-0.000;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.67;ReadPosRankSum=1.200;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr21	40642189	rs6517532	C	T	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=2;PP=484;SC=ATTTGTTACACTGTACCAGAA;SOR=3.611;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=40642197;WS=40642179;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr21	40646230	rs56135543	CGA	C	194.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=1.741;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.15;MQRankSum=2.021;QD=3.30;ReadPosRankSum=-0.344;SOR=1.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,12:0.20:59
chr21	40648265	rs2836969	G	A	1123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=33;PP=946;SC=GTGTTGCTTAGCCCTGTCATT;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=36;WE=40648273;WS=40648255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr21	40650621	rs973521	G	A	2525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=10;PP=2041;SC=TCATTTAATAGATGTTTAAAA;SOR=3.352;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=73;TCF=62;TCR=11;TR=72;WE=40650635;WS=40650611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr21	40652040	rs2836971	A	C	2577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=10;PP=2213;SC=CTACATTAAAAAACAAAACCT;SOR=3.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=66;TCR=10;TR=76;WE=40652048;WS=40652030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr21	40670460	rs2056844	G	C	883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=7;PP=730;SC=CCGATGCGCTGGCAGATTTGC;SOR=2.147;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=20;TCR=7;TR=27;WE=40670468;WS=40670450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr21	40684641	rs2272578	C	G	123.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=4;PP=84;SC=ACGCAGCTATCCCCGGGCCGC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=40684649;WS=40684631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr21	40684975	rs35687055	C	T	233.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=3;PP=185;ReadPosRankSum=-0.549;SC=CCCGAGGGAGCGCGGGGACGG;SOR=0.693;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=10;WE=40684983;WS=40684965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr21	40685239	rs34240248	A	G	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.73;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr21	40685246	rs34436313	A	G	1718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.23;SOR=0.914;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr21	40685284	rs35182074	A	C	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=21;PP=628;SC=GGACGGGGCCAGGGGAGCCGG;SOR=0.941;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=35;TCF=12;TCR=23;TR=33;WE=40685292;WS=40685274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr21	40685515	.	G	GCGC	185.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=1;PP=101;SC=TCTCAGGCGCGCGCCGCCGCC;SOR=1.981;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=2;WE=40685523;WS=40685505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr21	40686020	rs35994303	C	T	4296.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=84;NR=52;PP=2965;SC=TTTCACGGACCGGTCGTCTGG;SOR=1.318;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=84;TCR=52;TR=136;WE=40686028;WS=40686010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chr21	40686078	rs9981301	G	C	3907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=65;PP=2965;SC=TTCGAGGACAGGAAAGCTTTT;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=67;TCR=65;TR=132;WE=40686086;WS=40686068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr21	40686327	rs4624474	T	C	2304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=48;PP=1768;SC=ACGGCTCGGCTGGATCCATCC;SOR=1.048;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=36;TCR=48;TR=84;WE=40686335;WS=40686317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr21	40715132	rs2070867	G	A	1410.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=37;PP=1057;SC=ACACGTTGTCGTTTTATTTAT;SOR=4.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=39;WE=40715140;WS=40715122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr21	40769017	rs1060180	G	T	571.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=421;SC=CTTTATGAGAGAGTCTTATAA;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=16;WE=40769025;WS=40769007;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr21	40799955	rs2837028	A	C	184.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=166;SC=TTCCTAATTTATTCTATAAAA;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=40799963;WS=40799945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr21	40823981	rs6517549	G	A	3551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=64;NR=45;PP=2965;SC=CGCATTCCCTGACAGGGGTGT;SOR=1.028;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=64;TCR=45;TR=109;WE=40823989;WS=40823971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr21	40847249	rs760284	T	G	1053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=28;PP=878;SC=AAATTAACATTACTTTAGTAC;SOR=3.545;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=4;TCR=28;TR=32;WE=40847257;WS=40847239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr21	40871810	rs9974333	T	C	784.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=13;PP=586;SC=AGTGAAGATGTGGGCAACCTC;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=14;TCR=13;TR=27;WE=40871818;WS=40871800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr21	40880881	rs138818478	CTTGAA	C	1087.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=6;PP=1026;SC=TTTAAACGTACTTGAATTATG;SOR=1.893;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=19;WE=40880893;WS=40880871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr21	40883671	rs3831201	G	GAGA	1154.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=7;PP=1114;SC=ACTGCAGAAGGAGAAGAGCCT;SOR=1.358;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=26;TCF=17;TCR=9;TR=22;WE=40883679;WS=40883661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr21	40969621	rs661650	C	T	1320.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=42;NR=0;PP=1131;SC=ATGGAAGAGGCGGGAGAGAGT;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=42;WE=40969629;WS=40969611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr21	40969826	rs662571	G	C	4518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=64;PP=2965;SC=CGTGGATCCTGCACCAGAGCT;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=127;TCF=63;TCR=64;TR=127;WE=40969834;WS=40969816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr21	41032740	rs3746887	T	C	3361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=48;PP=2431;SC=AAAGAGAGGATGGTGAAGGGA;SOR=0.841;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=103;TCF=55;TCR=48;TR=103;WE=41032748;WS=41032730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr21	41032804	rs734413	G	A	4031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.431;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=52;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.801;SC=CAGCGGAAACGAAAGAGGTGG;SOR=0.553;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=119;TCF=66;TCR=53;TR=118;WE=41032812;WS=41032794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,129:0.99:130
chr21	41447313	rs378877	C	T	278.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=10;PP=253;SC=TATTTATTTCCCTCCCTCTGC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=41447321;WS=41447303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr21	41514688	rs35155500	TA	T	1160.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=29;PP=1215;SC=AGCAAAGCAATAACCGAAAAA;SOR=4.112;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=30;WE=41514696;WS=41514678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr21	41516356	rs78292319	G	A	599.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=0;PP=586;SC=GGGAGCCCCGGGGCAGACCCG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=41516364;WS=41516346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr21	41725625	rs41395652	C	T	1367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=23;PP=952;SC=CATGGCTTTGCGATGGTCAAA;SOR=1.455;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=14;TCR=23;TR=37;WE=41725633;WS=41725615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr21	42218483	.	A	C	349	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;FR=0.9996;HP=13;HapScore=4;MGOF=8;MMLQ=17;MQ=60.78;NF=16;NR=3;PP=349;QD=20.1984848709;SC=GCCACCCCCCACCCCCCCGCC;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=25;TCF=20;TCR=5;TR=19;WE=42218499;WS=42218473;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,19:0.76:25
chr21	42539569	rs11316732	AC	A	690.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=12;NR=7;PP=449;SC=CCTCCGAGTCACCCCCGGAAG;SOR=1.708;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=26;TCF=14;TCR=12;TR=19;WE=42539577;WS=42539558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr21	42622657	rs960231	G	C	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=2;PP=815;SC=CATGGTTTCTGATGTGATCTT;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=42622665;WS=42622647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr21	42622786	rs1046210	C	T	1853.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=33;PP=1534;SC=ACCTGAGAGACGAGAACTCCA;SOR=0.899;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=25;TCR=33;TR=58;WE=42622794;WS=42622776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr21	42717662	rs417708	T	C	1406.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=34;PP=1093;SC=TGTATGAAGGTGGTAAGAAAA;SOR=1.565;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=17;TCR=34;TR=51;WE=42717670;WS=42717652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr21	42767733	rs440364	T	C	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=20;PP=606;SC=TCAGGAAAGCTCTGGAATTAG;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=42767741;WS=42767723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr21	42775180	rs459763	C	T	1591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=2;PP=1315;SC=CTCCTTTTTGCTTTTTTTGGT;SOR=5.507;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=47;TCF=45;TCR=2;TR=47;WE=42775188;WS=42775170;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr21	42775555	rs462161	A	G	3839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=39;PP=2965;SC=CTCCACCGAGAACTGGCTGGT;SOR=1.512;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=118;TCF=79;TCR=39;TR=118;WE=42775563;WS=42775545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr21	42803840	rs456657	C	T	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=1;PP=456;SC=CACTCTTCTACGCTCTGGGGA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=42803848;WS=42803830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr21	42803858	rs463856	A	G	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=0;PP=420;SC=GGACATCACCATGAACAACTA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=42803866;WS=42803848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr21	42808015	rs468207	A	G	2285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=65;PP=1907;SC=TACCACAGACAGGGTGGCTTA;SOR=6.214;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=67;TCF=2;TCR=65;TR=67;WE=42808023;WS=42808005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr21	42811825	rs75281064	A	T	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=488;SC=GGGATGGGGGAGTGGAGGGGT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=42811833;WS=42811815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr21	42811870	rs2838037	G	A	204.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=173;SC=TAGAGTAACCGTGAGTCCAGA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=42811878;WS=42811860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr21	42812891	rs467960	C	T	1043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=25;PP=831;SC=ATGTGGACATCGCCACCACAG;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=42812899;WS=42812881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr21	42813933	.	A	AGTGT	568.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.9990;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=604;SC=AGATGTGTGGAGTGTGTGTGT;SOR=4.047;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=12;WE=42813941;WS=42813923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr21	42817582	rs469288	A	G	348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=10;PP=260;SC=TTCCTTCTTCACTCCCCCAAG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=42817590;WS=42817572;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	42817930	rs469390	G	A	3243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=17;PP=2415;SC=TTGACAGAAAGTTAATGCCTT;SOR=2.788;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=77;TCR=17;TR=94;WE=42817938;WS=42817920;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr21	42818106	rs467773	C	T	1653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=1.616;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=45;PP=1346;ReadPosRankSum=0.642;SC=CTGCTACAACCGAATACCTGA;SOR=5.097;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=46;TCF=0;TCR=46;TR=45;WE=42818114;WS=42818096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,51:0.98:52
chr21	42818132	rs364199	A	G	1249.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=32;PP=1010;SC=GGTCATTTATAAACAGTAGAA;SOR=7.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=42818140;WS=42818122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr21	42879909	rs75603675	C	A	832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=13;PP=628;ReadPosRankSum=1.347;SC=CCCGCTTTCACCTCCGGGCGG;SOR=0.321;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=26;TCF=12;TCR=14;TR=25;WE=42879917;WS=42879899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chr21	43161022	rs7276592	C	T	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=3;PP=686;SC=GCCGCAGGAGCGTGGCGGCGG;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=29;WE=43161030;WS=43161012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr21	43161357	rs3746891	T	C	3158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=43;PP=2616;SC=TCTGAGGTCATGGCCTCCTTG;SOR=1.072;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=58;TCR=43;TR=101;WE=43161365;WS=43161347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr21	43161877	rs3746893	C	T	4828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=94;PP=2965;SC=TGATCTTCCGCGCCAGCAGGA;SOR=1.339;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=151;TCF=57;TCR=94;TR=151;WE=43161885;WS=43161867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr21	43161895	.	G	A	4367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=43;NR=91;PP=2965;SC=GGAGCTCCACGACACCCCGCA;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=135;TCF=43;TCR=92;TR=134;WE=43161903;WS=43161885;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr21	43162150	rs3746894	G	A	1817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=32;PP=1428;ReadPosRankSum=-0.741;SC=CGTCTGTGGTGCCCAGATCTG;SOR=0.280;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=60;TCF=27;TCR=33;TR=59;WE=43162158;WS=43162140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,60:0.98:61
chr21	43162200	rs3746895	T	C	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=12;NR=31;PP=1117;SC=TGGCTGCACATCCAGGGACGT;SOR=1.954;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=12;TCR=31;TR=43;WE=43162208;WS=43162190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr21	43162256	rs116559033	A	T	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=15;PP=463;SC=GAGGAGTGCCATGGCCTCCAG;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=17;WE=43162264;WS=43162246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr21	43164118	rs61744790	C	A	1587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.445;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=26;PP=1317;ReadPosRankSum=-0.865;SC=CCGAGGACACCCCCGAGAGCC;SOR=0.282;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=52;WE=43164126;WS=43164108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,53:0.98:54
chr21	43164319	rs73906243	G	A	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=14;PP=438;SC=ATGCAGAAGAGGGGGTGGGTG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=43164327;WS=43164309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	43164345	rs2277790	A	C	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=13;PP=403;SC=CCTGCCATAGACCGCATGGCC;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=43164353;WS=43164335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	43169357	rs2838114	C	G	2735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=56;PP=2163;SC=AGATGACGATCGCAAAGCTGG;SOR=1.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=25;TCR=56;TR=81;WE=43169365;WS=43169347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chr21	43176799	rs13049286	T	G	3559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=39;PP=2925;SC=CGTGGATGATTCGGAACCGGA;SOR=1.322;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=65;TCR=39;TR=104;WE=43176807;WS=43176789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr21	43176832	rs2277791	A	G	4873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=58;PP=2965;SC=ATGGCTCCGAAGCCAGCAGCT;SOR=1.255;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=148;TCF=90;TCR=58;TR=148;WE=43176840;WS=43176822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chr21	43221483	rs3850706	A	G	1915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=17;PP=1630;SC=TGCGGCTGCGAGGGTGGCAAG;SOR=1.863;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=59;TCF=42;TCR=17;TR=59;WE=43221491;WS=43221473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr21	43221826	rs2236696	T	C	2968.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=51;PP=2351;SC=TGATGTTGGTTAAGCCGACTG;SOR=0.874;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=95;TCF=43;TCR=52;TR=94;WE=43221834;WS=43221816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr21	43222779	rs2838128	A	G	1582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=0;PP=1366;SC=TACACTGTGTATAGTAAAAAG;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=45;WE=43222787;WS=43222769;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr21	43224683	rs2298687	A	G	1273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=27;PP=863;SC=CTGGGGCCCCATGCTGCTCAC;SOR=1.414;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=41;WE=43224691;WS=43224673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr21	43230742	.	C	T	3053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.954;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.014;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=76;PP=2553;ReadPosRankSum=-1.230;SC=ACGCAGGTCACTAGTGCAGCC;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=21;TCR=77;TR=96;WE=43230750;WS=43230732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,97:0.98:99
chr21	43236252	rs28657504	A	G	1426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=41;PP=1194;SC=CTGGGGGCCCATGCCCGAGAC;SOR=4.758;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=43;WE=43236260;WS=43236242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr21	43236292	rs189533533	C	T	823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=23;PP=684;SC=GCGGCCCGTGCGGTACTGGTG;SOR=3.611;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=43236300;WS=43236282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr21	43239972	rs28477638	A	G	3161.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=53;NR=53;PP=2364;SC=ACTCGCGGACATTGTCGTGCA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=53;TCR=53;TR=106;WE=43239980;WS=43239962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr21	43246506	rs149845763	C	T	1634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=46;PP=1428;SC=TTCCAGCGCACGGGAGGACAG;SOR=4.493;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=50;TCF=4;TCR=46;TR=50;WE=43246514;WS=43246496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr21	43254463	rs2839388	A	G	2290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=0;PP=1936;SC=CCCATGTGCGACAGCCCTGGT;SOR=8.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=65;TCR=0;TR=65;WE=43254471;WS=43254453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr21	43255509	rs2839392	C	T	4275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=59;PP=2965;SC=ATCCGTACCGCACAGCGGCCG;SOR=1.082;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=138;TCF=79;TCR=59;TR=138;WE=43255517;WS=43255499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr21	43256892	rs73359695	G	A	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=20;PP=523;SC=GAGGGAATGCGCCCGGGCGTC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=43256900;WS=43256882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr21	43258000	rs8127003	T	C	1155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=1;PP=818;SC=GCTGCCAGCATTGTCTGTCCA;SOR=5.784;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=30;WE=43258008;WS=43257990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr21	43259641	rs151209295	G	A	973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=1;PP=774;SC=GAGTTTTCCCGCCCCGCCCTC;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=43259649;WS=43259631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr21	43259709	rs4920145	C	T	3035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=5;PP=2642;ReadPosRankSum=-0.057;SC=CGCAGGCACTCATCCCCGGGA;SOR=3.215;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=89;TCR=5;TR=91;WE=43259717;WS=43259699;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,92:0.98:94
chr21	43281650	rs181240699	C	G	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=343;SC=TCTGCCCCCCCCCAATCCCCA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=43281658;WS=43281640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr21	43298954	rs202107842	C	CG	289.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.97;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr21	43315057	rs2839411	C	T	1709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=41;PP=1376;SC=CCCACCTCCACGAGCAACACC;SOR=3.258;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=50;TCF=8;TCR=42;TR=49;WE=43315065;WS=43315047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr21	43319534	rs511247	A	C	1390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.256;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=35;PP=1124;ReadPosRankSum=0.052;SC=TTTGAAAAGAACTGAAAAGCA;SOR=2.110;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=49;TCF=13;TCR=36;TR=47;WE=43319542;WS=43319524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,46:0.96:48
chr21	43319605	rs2839416	T	G	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=1;NR=18;PP=519;SC=GTGGGCCTCATAGAAGGCGCT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=43319613;WS=43319595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr21	43325742	rs35279709	CA	C	1848.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=6;PP=1939;SC=CAACTTTTTCCAAATTCTGAA;SOR=3.872;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=51;TCF=45;TCR=6;TR=49;WE=43325750;WS=43325732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr21	43327856	rs3746906	A	G	1092.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=14;PP=857;SC=GCTGCTTCTTAAATAAGTCCA;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=19;TCR=14;TR=33;WE=43327864;WS=43327846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr21	43332605	rs201192263	T	TA	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.55;QD=40.86;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr21	43332608	rs11387062	T	TA	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.55;QD=40.86;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr21	43332611	rs11387061	T	TA	367.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.55;QD=40.86;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr21	43332623	rs2026283	A	G	321.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.68;QD=40.22;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr21	43334669	rs3746907	G	C	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=0;PP=540;SC=GGGGCTGGAAGAGCCCCTCCA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=43334677;WS=43334659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr21	43334896	rs3746908	A	G	1773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=40;PP=1353;SC=GGAAGTAGCCACTGGACTCCT;SOR=1.688;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=17;TCR=40;TR=57;WE=43334904;WS=43334886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr21	43362513	rs3746910	C	G	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
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chr21	43496381	rs220286	G	T	1940.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.612;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=53;PP=1612;ReadPosRankSum=-0.921;SC=GCTGGGCTGGGGCGGGGCCAC;SOR=2.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=9;TCR=54;TR=62;WE=43496389;WS=43496371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr21	43504228	rs7278485	T	C	3775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=69;NR=58;PP=2762;SC=CGTCAAGACCTGGGGCCTGCC;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=69;TCR=58;TR=127;WE=43504236;WS=43504218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr21	43505436	rs73371577	G	A	1846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=21;PP=1351;SC=CTGGTACAACGTCACCATACT;SOR=1.421;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=56;WE=43505444;WS=43505426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr21	43530897	rs220125	G	A	1993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=3;PP=1507;SC=GGGATGCAGAGCAGTCCTGCT;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=54;TCF=51;TCR=3;TR=54;WE=43530905;WS=43530887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr21	43531008	rs220126	T	C	3933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=58;PP=2965;SC=GTGAGCCCCATGGGCGGTGGA;SOR=1.011;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=80;TCR=58;TR=137;WE=43531016;WS=43530998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr21	43531403	rs220127	C	G	534.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=7;PP=451;SC=CCCCAGCCAGCGGAGCACCAG;SOR=1.244;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=17;WE=43531411;WS=43531393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	43531553	rs220128	A	C	4997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=121;NR=31;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.739;SC=CCCGAAGGCTACTGGGTCAAC;SOR=1.572;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=154;TCF=123;TCR=31;TR=152;WE=43531561;WS=43531543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,155:0.99:156
chr21	43531632	rs220129	T	C	6356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=92;PP=2965;SC=GGAAACTCCATCATGGAGCCA;SOR=0.755;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=188;TCF=96;TCR=92;TR=186;WE=43531640;WS=43531622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,198:1.00:198
chr21	43531848	rs220131	C	T	2677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=67;PP=2243;SC=TGCATGGGGACTAGGACTAAT;SOR=3.098;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=14;TCR=67;TR=81;WE=43531856;WS=43531838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr21	43536031	.	C	G	8698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.000;DP=288;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=152;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=0.802;SC=GTCAGGTACTCAGAATCCTTT;SOR=0.595;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=266;TCF=154;TCR=112;TR=263;WE=43536039;WS=43536021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,278:0.99:281
chr21	43539293	rs220146	G	A	1337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.990;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=9;PP=1082;ReadPosRankSum=1.256;SC=AGTCGTCAGCGTCACCAACGG;SOR=2.584;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=43;WE=43539301;WS=43539283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,43:0.96:45
chr21	43539523	rs220147	C	T	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=18;PP=511;SC=TGAAAGATGTCGTGTTGTGCC;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=43539531;WS=43539513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr21	43541478	rs113281382	C	CGTGT	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=366;SC=TGTGGGTGCACGTGTGTGTGT;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=6;WE=43541486;WS=43541468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr21	43546705	rs220157	T	C	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=26;PP=668;SC=TTCCTTGAGATGGAATATACA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=43546713;WS=43546695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr21	43547788	rs220158	T	C	1989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=15;PP=1608;SC=TCAGCTGCCCTGTGCCCAACA;SOR=2.376;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=64;TCF=49;TCR=15;TR=63;WE=43547796;WS=43547778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr21	43548239	rs2839470	T	C	1556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=32;PP=1203;SC=CTTGCCATGATACCTAGTGCT;SOR=2.352;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=43;WE=43548247;WS=43548229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr21	43549794	rs7275646	C	T	3004.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=7;PP=2350;ReadPosRankSum=0.172;SC=ATTAATTTGACGTTTCTCTTC;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=87;TCR=7;TR=91;WE=43549816;WS=43549784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,97:0.97:100
chr21	43557559	rs3819141	T	A	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=4;PP=532;SC=GTGAGCCTCCTCATGCAGAAG;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=22;WE=43557567;WS=43557549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr21	43557698	rs3819142	A	C	1654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=26;PP=1218;SC=AATCCAGTCCAACAACTTCAG;SOR=1.036;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=48;TCF=21;TCR=27;TR=47;WE=43557706;WS=43557688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr21	43557735	.	CGCAGGCTGACAGGAAGGTGGGTGCGGAGTGGGGTGGGAGGT	C	526.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.98;SOR=2.712;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr21	43557759	.	C	T	619	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=3;HapScore=1;MGOF=37;MMLQ=28;MQ=58.38;NF=4;NR=19;PP=619;QD=28.4248353281;SC=AAGGTGGGTGCGGAGTGGGGT;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=4;TCR=19;TR=23;WE=43557767;WS=43557749;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr21	43557791	.	A	G	261	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=35;MMLQ=28;MQ=56.32;NF=1;NR=11;PP=261;QD=24.6476010456;SC=GCTGACAGGAAGGTGGGTGTG;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=12;WE=43557799;WS=43557781;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr21	43708431	rs2234720	G	GC	1683.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=41;PP=1737;SC=CGGTAAGGCTGCCCGCATCTT;SOR=3.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=2;TCR=45;TR=43;WE=43708439;WS=43708421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr21	43710052	rs4148137	C	T	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=2;PP=478;SC=CTAAGACGTGCTGTCACAGAG;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=43710060;WS=43710042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr21	43710096	rs2234721	G	T	1105.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=3;PP=881;SC=GCCGCATCCGGGTTGTTCTCT;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=32;WE=43710104;WS=43710086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr21	43720512	rs72117495	CAT	C	1885.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5776;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=1;PP=1262;SC=TGGACACACACATACACACAC;SOR=6.091;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=43;TCF=42;TCR=1;TR=42;WE=43720533;WS=43720500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr21	43720525	rs1023156	A	G	2237.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=61.36;NF=45;NR=9;PP=1471;SC=ACACACACATACACACACATA;SOR=3.383;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=46;TCR=9;TR=54;WE=43720533;WS=43720500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr21	43766560	rs225334	G	A	3961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=77;NR=50;PP=2965;SC=ATTTCATGAAGTATGAAGCTG;SOR=1.152;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=127;TCF=77;TCR=50;TR=127;WE=43766568;WS=43766550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr21	43769909	rs34333540	G	A	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=1;PP=287;SC=GGCCTCCTCCGGCCCCTGCTC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=43769917;WS=43769899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr21	43770926	rs5844113	CT	C	358.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=197;SC=TATGGTTGTGCTTTTTTTTTT;SOR=4.174;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=13;WE=43770934;WS=43770916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	43786512	rs225358	C	T	1408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=8;PP=1095;SC=GGAAGAAGCACGCCTTACCTG;SOR=2.786;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=37;TCR=8;TR=45;WE=43786520;WS=43786502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr21	43796913	rs1078272	T	A	378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=297;SC=CTCTGGTGTGTCGCAACAGCG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=43796921;WS=43796903;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr21	43803412	rs8129105	T	C	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=18;PP=424;SC=TCACTGCCCCTGCTCCCAGAG;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=43803420;WS=43803402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr21	43805637	rs2839501	C	T	1469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=24;PP=1231;SC=TATCTGAACTCACATAGCTGC;SOR=0.780;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=20;TCR=24;TR=44;WE=43805645;WS=43805627;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr21	43805656	rs8130564	T	C	1420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=29;PP=1158;SC=GCAAGCACATTGGAAAGACAG;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=17;TCR=29;TR=46;WE=43805664;WS=43805646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr21	43852146	rs58639264	A	G	428.82	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=399;ReadPosRankSum=-0.742;SC=GAGAGCTGCCATTGGTGCAAG;SOR=2.948;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=17;WE=43852168;WS=43852136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr21	43852160	rs2839512	A	G	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.474;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=541;ReadPosRankSum=-1.123;SC=GTGCAAGTCCAGTGAGTTGGA;SOR=3.352;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=21;WE=43852168;WS=43852136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chr21	43852232	rs13052676	C	T	1737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.274;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=18;PP=1314;ReadPosRankSum=0.895;SC=CAAGGAAGAGCGTGCTGGTGG;SOR=1.810;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=45;TCR=19;TR=63;WE=43852240;WS=43852222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,63:0.98:64
chr21	43852355	rs2839513	T	C	2172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=43;PP=1766;SC=ACACTGTAGATCTAACCAATG;SOR=1.385;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=26;TCR=43;TR=69;WE=43852363;WS=43852345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr21	43854985	rs17114925	A	C	2517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=32;PP=1913;ReadPosRankSum=-0.740;SC=GCAGTCTGCCAAGACGGAGTC;SOR=0.278;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=74;TCF=42;TCR=32;TR=73;WE=43854993;WS=43854975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,79:0.99:80
chr21	43862466	rs2254368	G	A	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=1;PP=543;SC=TGATTTAGACGTGTGTGTGAC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=43862474;WS=43862456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr21	43863521	rs868092	A	G	1850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=43;PP=1587;SC=ACACCTGTCCACAGGACAGTA;SOR=1.536;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=21;TCR=43;TR=64;WE=43863529;WS=43863511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr21	43864519	rs4920104	G	A	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=2;PP=723;SC=CTTCTAGCCCGGGGGTCTCGC;SOR=4.407;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=27;WE=43864527;WS=43864514;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr21	43867059	rs3827232	C	T	637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=0;PP=540;SC=CCTGGGCAGTCGCAGACCCTC;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=19;TCR=0;TR=19;WE=43867067;WS=43867049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr21	43892775	rs11203205	G	A	158.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=2;PP=113;SC=GAGCAGTGGCGCGATCTCCAC;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=43892783;WS=43892765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr21	43897355	rs11702140	C	T	225.41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5041;FS=9.542;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.593;NF=11;NR=0;PP=283;ReadPosRankSum=-1.593;SC=GGGGGTGCCCCACACCCTCTG;SOR=4.398;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=11;WE=43897363;WS=43897345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr21	43905887	rs2839536	C	T	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=26;PP=823;SC=TGCCCGTCTCCGCGTATAAAT;SOR=2.694;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=32;WE=43905895;WS=43905877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr21	43906351	rs2839537	G	C	2679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=79;NR=2;PP=2379;SC=AGAAAGATTGGACCTGCCTGG;SOR=6.518;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=81;TCF=79;TCR=2;TR=81;WE=43906359;WS=43906341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr21	43916339	rs1573413	G	A	1490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=36;PP=1277;SC=GCCTCTAGCAGGTGGGTAGCA;SOR=2.935;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=8;TCR=36;TR=44;WE=43916347;WS=43916329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr21	43938673	rs4919990	T	C	1050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=26;PP=893;SC=AGGTGAGGGCTACTGTGCAGG;SOR=2.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=32;WE=43938681;WS=43938663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr21	43955427	rs228056	A	G	144.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=85;SC=GAAACTGAACAGAAAATGCAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=43955435;WS=43955417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr21	43959770	rs228063	A	G	2904.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=39;PP=2489;SC=AAGGGTTTGGATCCGTGGCTC;SOR=0.809;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=47;TCR=39;TR=86;WE=43959778;WS=43959760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr21	43959908	rs58348531	TC	T	741.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=60.93;NF=0;NR=22;PP=832;SC=ACAAAGTCCTTCCCTTTCTCT;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=22;WE=43959916;WS=43959898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr21	43963401	rs228074	T	C	174.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=1;PP=139;SC=TCGCGAGTCCTGCATGGCACA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=43963409;WS=43963391;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr21	43963759	rs228075	A	G	652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=417;SC=GAGGCCTCGGATTTCCCTGCC;SOR=4.712;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=43963767;WS=43963749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr21	43967126	rs228082	G	A	649.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=0;PP=571;SC=CGGTGCTCCCGTGTTGCCCTG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=43967134;WS=43967116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr21	43984126	rs7282730	C	T	583.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=18;PP=475;SC=AGGGTCAGGCCGTCACCTGGG;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=43984134;WS=43984116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr21	43985016	rs915874	G	A	663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=20;PP=558;SC=TGACAAGCCCGCTTCATTCCC;SOR=3.352;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=23;WE=43985024;WS=43985006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr21	43985955	rs228104	G	A	2411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=25;PP=1830;SC=CTTCTCCACCGTCAGCAAGAT;SOR=1.581;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=52;TCR=25;TR=77;WE=43985963;WS=43985945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr21	43986117	rs36113965	T	TC	2520.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.250;NF=9;NR=47;PP=2412;ReadPosRankSum=1.452;SC=GCTAAAATTGTCCGTGTCCTC;SOR=0.756;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=63;TCF=9;TCR=54;TR=56;WE=43986125;WS=43986107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr21	43986175	rs4919992	C	T	1054.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=29;PP=865;SC=CTCCCCAGTGCGAGGCTTGCC;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=43986183;WS=43986165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr21	43987325	rs9977293	C	T	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.63;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr21	43987329	rs9979646	G	C	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.69;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr21	43988437	rs7280392	G	A	5044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.287;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=71;PP=2965;ReadPosRankSum=1.329;SC=ATGCTGTGGCGATAACTGCAC;SOR=0.445;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=149;TCF=77;TCR=72;TR=147;WE=43988445;WS=43988427;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,161:0.99:162
chr21	43999983	rs453592	T	C	1636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=29;PP=1166;SC=ATCTGCCTTCTGCACCTGGCT;SOR=1.009;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=23;TCR=29;TR=52;WE=43999991;WS=43999973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr21	44000052	rs380152	A	G	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=23;PP=703;SC=CTTCACTCTCACTTTTTCTTT;SOR=3.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=27;WE=44000071;WS=44000042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr21	44000063	rs380161	T	G	961.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=25;PP=716;SC=CTTTTTCTTTTCTAATAAATA;SOR=3.912;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=3;TCR=25;TR=28;WE=44000071;WS=44000042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr21	44000078	rs453647	T	C	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=26;PP=639;SC=TAAATACCTCTGGATGGGTTA;SOR=3.407;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=30;WE=44000086;WS=44000068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr21	44000366	rs388907	A	G	955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=4;PP=795;SC=GGCTCCCCATAGGATTTGCAC;SOR=2.910;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=24;TCR=4;TR=28;WE=44000374;WS=44000356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr21	44152138	rs71320554	C	T	2978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=43;PP=2412;SC=ACATCTTTTCCTCTTGTCCGT;SOR=0.878;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=50;TCR=43;TR=92;WE=44152146;WS=44152128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr21	44163839	rs6586344	A	G	1548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=17;PP=1105;SC=GAGATCCTCCACATTCGTCCG;SOR=1.371;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=52;TCF=35;TCR=17;TR=51;WE=44163847;WS=44163829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr21	44173971	.	CAA	C	416.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.470;ClippingRankSum=0.000;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=18.341;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQRankSum=0.622;QD=13.02;ReadPosRankSum=-0.382;SOR=3.605;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,19:0.59:32
chr21	44174275	rs4919999	T	C	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=32.73;SOR=4.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr21	44178992	rs11702144	A	G	367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=282;SC=GAGGGGGAGAACCCACCTCCT;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=44179000;WS=44178982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr21	44180443	rs13047953	C	T	4475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=91;NR=52;PP=2965;SC=CGCAGTTCTGCGTCCACGACA;SOR=1.355;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=92;TCR=52;TR=143;WE=44180451;WS=44180433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr21	44180866	rs55905735	ACC	A	1203.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=0;PP=934;SC=ACCCAATTCCACCCCCCCTCA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=31;WE=44180875;WS=44180856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr21	44189376	rs34742413	C	T	728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=19;PP=541;SC=GACACACACTCATGCACACAC;SOR=3.352;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=44189384;WS=44189366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr21	44270402	rs6586251	C	G	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=16;PP=537;SC=GAACATGGGACTCGGCCACCA;SOR=1.931;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=22;WE=44270410;WS=44270392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr21	44273858	rs15736	G	A	3512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=63;PP=2690;ReadPosRankSum=-1.089;SC=TAGACCACAGGAGTGCTTGCC;SOR=1.209;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=44;TCR=64;TR=106;WE=44273866;WS=44273848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,112:0.98:114
chr21	44274845	rs1107831	A	G	3078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.895;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=70;PP=2574;ReadPosRankSum=0.900;SC=CCCACATATCAAGGAAGAGGA;SOR=1.855;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=103;TCF=32;TCR=71;TR=101;WE=44274853;WS=44274835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,101:0.98:103
chr21	44275945	rs62215012	G	A	1517.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=37;PP=1214;SC=CCGTCAGGTAGGGTGACAGAG;SOR=2.985;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=44;WE=44275953;WS=44275935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr21	44279668	rs149300976	C	CCAGGGGCCAGCGATCCA	277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=55.55;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr21	44293744	rs2248490	C	G	2421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=33;PP=1912;SC=AGCTGCCAGACTTGGAGAAGG;SOR=0.801;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=39;TCR=33;TR=72;WE=44293752;WS=44293734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr21	44296933	rs71332377	AT	A	1792.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.272;NF=1;NR=66;PP=2995;ReadPosRankSum=-1.043;SC=GAAATAACAAATTTTTTTTTT;SOR=5.838;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=101;TCF=1;TCR=100;TR=67;WE=44296943;WS=44296923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,74:0.99:75
chr21	44296935	rs116944707	T	A	1801.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.31;MQRankSum=0.272;QD=24.02;ReadPosRankSum=-1.042;SOR=5.838;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,74:0.99:75
chr21	44323590	rs4148973	T	G	1222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=24;PP=997;SC=CTTCATCCTCTTCCAGCTCCT;SOR=1.552;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=15;TCR=24;TR=39;WE=44323598;WS=44323580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr21	44324365	rs10595	G	A	1217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=34;PP=1015;SC=CGCGCCAGGGGACGACCGAGG;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=3;TCR=34;TR=37;WE=44324373;WS=44324355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr21	44327015	rs2839604	G	A	1642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=41;PP=1269;SC=CTCTTTAAATGAGACATCGTT;SOR=2.628;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=10;TCR=41;TR=51;WE=44327023;WS=44327005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr21	44328830	rs4148976	A	G	293.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=0;PP=244;SC=AAGCGCCTGTATGTGAGCCAA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=44328838;WS=44328820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr21	44371114	rs451887	T	C	1757.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=48;PP=1462;SC=TGTGATATTATTCATAATATC;SOR=7.864;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=0;TCR=48;TR=48;WE=44371122;WS=44371104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr21	44424689	rs3216136	G	GA	774.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=24;PP=729;SC=TTCGTGTTCAGAAAAAAAGCC;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=24;WE=44424697;WS=44424679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr21	44430325	rs234781	T	C	2633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=77;PP=2060;SC=ATCCAGAAACTGATAATTTAG;SOR=3.234;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=15;TCR=77;TR=92;WE=44430333;WS=44430315;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr21	44445185	rs234719	C	T	580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=17;PP=470;ReadPosRankSum=-0.685;SC=CCAACTGAGACGGGGTCTTGC;SOR=1.708;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=19;WE=44445193;WS=44445175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr21	44448763	rs170916	G	C	3121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=7;PP=2567;ReadPosRankSum=-0.751;SC=TCCTGTATAGGGTCTTTACGA;SOR=3.486;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=94;TCF=87;TCR=7;TR=93;WE=44448783;WS=44448753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,96:0.99:97
chr21	44448775	rs234728	G	A	3984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=107;NR=12;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.182;SC=TCTTTACGAAGGCTGTTTTCA;SOR=1.942;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=121;TCF=109;TCR=12;TR=119;WE=44448783;WS=44448753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,123:0.98:125
chr21	44449095	rs234729	G	A	805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=21;PP=656;SC=TGGTGAACGAGAGTGCGTGGT;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=22;WE=44449103;WS=44449085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr21	44449917	rs234733	G	A	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=4;PP=531;SC=TAGGTCAAACGAGCAAACAGC;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=17;TCR=4;TR=21;WE=44449925;WS=44449907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr21	44452424	rs141407897	T	TTCCCTCACCACCCTCCGTCTCTTCG	731.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.77;QD=45.73;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	44452455	rs378528	T	C	233.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=4;PP=92;SC=CTTCGGCTGCTTGCTCTTTAG;SOR=2.833;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=44452463;WS=44452445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr21	44475877	rs8132811	C	T	2664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=10;PP=2210;ReadPosRankSum=-0.805;SC=TCTTGGGGGCCGTGCCGTCTC;SOR=2.435;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=79;TCF=69;TCR=10;TR=78;WE=44475885;WS=44475867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,80:0.99:81
chr21	44476759	rs234701	A	G	116.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=110;SC=TGGGAGGCCCAGGCATAAAGA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=44476767;WS=44476753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr21	44485350	rs234706	G	A	3332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=63;PP=2653;SC=CGGTGGTGTCGTAGTGAGCCA;SOR=1.279;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=40;TCR=63;TR=103;WE=44485358;WS=44485340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr21	44486271	rs234707	G	T	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=5;PP=622;SC=CTGCAGCTCAGCCATCCCCCC;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=44486279;WS=44486262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr21	44486324	rs234708	T	C	1314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=10;PP=982;SC=CAGCCAGCCCTGGCCACCCCC;SOR=2.303;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=29;TCR=10;TR=39;WE=44486332;WS=44486314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr21	44487891	rs234713	G	A	4272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=84;PP=2965;SC=AACTCACTTGGCCTTGGTCAT;SOR=1.393;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=131;TCF=45;TCR=86;TR=129;WE=44487899;WS=44487881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chr21	44488033	rs234714	T	C	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=22;PP=650;ReadPosRankSum=-0.883;SC=TCCCTCCACGTTCTTGAGCCT;SOR=3.611;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=23;WE=44488041;WS=44488023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,24:0.96:25
chr21	44488755	rs5844149	G	GA	159.92	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.589;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=14;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.140;NF=2;NR=7;PP=113;ReadPosRankSum=1.593;SC=AATTATTCAGGAAAAAAAAAA;SOR=0.446;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=9;WE=44488763;WS=44488745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,8:0.89:9
chr21	44579990	rs68189421	G	A	589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=58;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=396;SC=CACTATAGATGTACCACACAC;SOR=4.514;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=44579998;WS=44579980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr21	44580019	rs143864709	AACACACACC	A	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=7;PP=1297;SC=CCACCTATACAACACACACCA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=44580035;WS=44580009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr21	44589215	rs872331	C	T	2471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=49;NR=26;PP=1899;SC=TGAACATGGACGTGACCATCC;SOR=1.468;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=49;TCR=26;TR=75;WE=44589223;WS=44589205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr21	44590059	rs870137	C	T	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=2;PP=25;SC=TAGGCATCAACGCCAGGGTGC;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=44590067;WS=44590049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr21	44837551	rs430552	G	A	3240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.01;SOR=1.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr21	44837555	rs430554	G	A	3413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.33;SOR=1.936;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr21	44839654	rs229346	A	G	298.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=2;PP=208;SC=CCTGGGACCCACTGCCCACGC;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=44839662;WS=44839647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr21	44846016	rs3746951	C	T	3667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=70;PP=2885;SC=TGGCCCTGACCCTGGCCCGCG;SOR=1.085;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=118;TCF=48;TCR=70;TR=118;WE=44846024;WS=44846006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr21	45053011	rs7277539	A	G	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=0;PP=680;SC=ATATACGATAAGTATTCAATA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=45053019;WS=45053001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr21	45089877	rs2838344	G	A	801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=19;PP=712;SC=TCATGCTCCCGGGTTCTTGCT;SOR=2.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=45089885;WS=45089867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr21	45092095	rs11909064	G	C	522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=0;PP=499;SC=ACCTTCCCACGAGCGGAAGTG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=45092103;WS=45092085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	45092257	rs2251253	T	A	2566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=41;NR=38;PP=1895;SC=GTAAGTCCTGTTGTTTCTTCT;SOR=0.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=79;TCF=41;TCR=38;TR=79;WE=45092265;WS=45092247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr21	45096206	rs2155722	G	A	2551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=49;PP=1946;SC=AAATTGCTGCGAAGACGAAGG;SOR=1.264;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=29;TCR=49;TR=78;WE=45096214;WS=45096196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr21	45107285	rs2838348	C	G	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=1;PP=528;SC=GAACTTTCCTCGTGGTAGAAT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=45107293;WS=45107275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr21	45107518	rs7279959	A	G	2595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=60;PP=1977;ReadPosRankSum=-0.741;SC=GTGCAGCCCCATCCCTGGAAC;SOR=1.042;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=82;TCF=21;TCR=61;TR=81;WE=45107526;WS=45107508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,87:0.99:88
chr21	45107562	rs9306160	T	C	1943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=45;PP=1528;ReadPosRankSum=-0.878;SC=GCCTCTGGGCTGAAAGCCCTG;SOR=1.005;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=64;TCF=17;TCR=47;TR=62;WE=45107570;WS=45107552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,67:0.99:68
chr21	45111512	.	A	AT	313	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=8;HapScore=2;MGOF=6;MMLQ=26;MQ=59.61;NF=0;NR=9;PP=313;QD=37.2222222222;SC=CCATTTCTTTATTTTTATTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=9;WE=45111520;WS=45111502;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,9:0.60:15
chr21	45153751	rs13050307	A	G	170.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=2;PP=98;SC=CCAGACACACAAGGCCCTGCC;SOR=1.609;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=45153759;WS=45153749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr21	45168884	rs11539534	G	A	3227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=34;PP=2554;SC=AGTACGTCCCGGAGGACCTCC;SOR=1.499;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=103;TCF=69;TCR=34;TR=102;WE=45168892;WS=45168874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr21	45168923	rs61737062	G	A	3943.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=70;PP=2952;SC=AAGTGGTGCCGCTTGCAGACA;SOR=0.925;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=59;TCR=70;TR=129;WE=45168931;WS=45168913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr21	45170285	rs1106797	A	G	2241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=48;NR=21;PP=1679;SC=GGGGATGGGGATTTCCAGAGC;SOR=1.778;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=70;TCF=48;TCR=22;TR=69;WE=45170293;WS=45170275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr21	45175958	rs7527	T	C	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=21;PP=573;SC=CCCCGCCGCTTGCCCGTGACA;SOR=1.460;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=45175966;WS=45175948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr21	45210932	rs2276246	G	A	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=27;PP=1032;ReadPosRankSum=-0.871;SC=TTAGGAAACCGTCAAGGTTCG;SOR=0.399;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=46;TCF=18;TCR=28;TR=45;WE=45210940;WS=45210922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,46:0.98:47
chr21	45214953	rs2838370	G	T	856.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=0;PP=731;SC=TGCTGGGGCCGGCAGAGGTCA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=26;TCR=0;TR=25;WE=45214961;WS=45214943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr21	45215046	rs2838371	T	C	3883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.64;SOR=1.504;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr21	45215051	rs2838372	A	G	4053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.59;SOR=1.305;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr21	45217456	rs2070537	G	A	3578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=79;NR=28;PP=2794;SC=CCGACGGGGCGGTGGAGCTGG;SOR=1.971;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=79;TCR=28;TR=107;WE=45217464;WS=45217446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr21	45217559	rs2838378	T	C	4911.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=103;PP=2965;SC=TCTGCAGAATTGCTGCCCGGA;SOR=1.254;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=62;TCR=103;TR=165;WE=45217567;WS=45217549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr21	45220570	rs731935	T	C	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=17;PP=608;SC=TGGGTGCCTTTGCCTTGTCCT;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=25;WE=45220578;WS=45220560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr21	45220626	rs3216106	A	AC	496.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=4;PP=581;SC=GGACCCTGAGACCGTCCCCAG;SOR=1.473;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=17;TCF=12;TCR=5;TR=14;WE=45220634;WS=45220616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr21	45220787	rs2329576	A	G	3020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=33;PP=2418;SC=GGCACTGACAATGGCACCACC;SOR=1.346;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=58;TCR=33;TR=91;WE=45220795;WS=45220777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr21	45222058	rs4818868	A	G	303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=225;SC=ACACATTGTCAGGAGGTGGTG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=45222066;WS=45222056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	45514141	rs11287102	TG	T	604.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=3;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=11;PP=419;SC=TTTGGGAGGGTGGGGGTGAAA;SOR=2.303;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=12;WE=45514157;WS=45514131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	45514149	rs9941801	A	G	613.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=3;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.59;NF=2;NR=12;PP=369;SC=GGTGGGGGTGAAAAAATGAAA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=45514157;WS=45514131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	45514168	rs4819371	C	T	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=12;PP=336;SC=AAGATGGCATCATGTTCTTTA;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=2;TCR=12;TR=14;WE=45514176;WS=45514158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	45514188	rs4818879	A	G	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=209;SC=ATAATCTGAAAAACTGAATAG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=45514196;WS=45514178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr21	45527112	rs72257518	GCTC	G	907.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=3;PP=790;SC=GGGCGACGCAGCTCCTCCTGC;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=17;WE=45527122;WS=45527102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr21	45527460	rs2850153	G	A	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=21;PP=706;SC=CTGCGCGCCCGTGGCCTCGGG;SOR=4.332;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=45527468;WS=45527450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr21	45528919	rs2020945	G	A	3223.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=58;PP=2547;SC=TTTTACCTGCGATGGAAATTC;SOR=1.081;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=40;TCR=58;TR=98;WE=45528927;WS=45528909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr21	45534032	rs2243999	C	T	2350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=44;PP=1746;SC=GGGGTAGCTGCGCGGTGGTGA;SOR=1.150;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=28;TCR=44;TR=72;WE=45534040;WS=45534022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr21	45538512	rs5844173	TG	T	669.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=6;PP=753;SC=AGTGAATTGTTGGAGTCTGGT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=20;TCF=14;TCR=6;TR=19;WE=45538520;WS=45538502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr21	45538647	rs756553	T	C	3061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=33;PP=2317;SC=TCTGCAGCATTTCAGATCAGA;SOR=1.378;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=57;TCR=33;TR=90;WE=45538655;WS=45538637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr21	45538725	rs756554	C	A	2714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=50;PP=2029;SC=GTTTGTCCCCCGCCTGGGTGG;SOR=1.165;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=30;TCR=50;TR=80;WE=45538733;WS=45538715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr21	45538782	rs756555	A	T	1521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=35;PP=1171;SC=GGCTACAGGCATACTTGACAG;SOR=3.258;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=42;WE=45538790;WS=45538772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr21	45539240	rs2855652	G	C	642.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=3;PP=542;SC=GCCTGAGCCGGGTACCCCAGC;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=45539248;WS=45539230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr21	45539426	rs2071142	G	A	1474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=32;PP=1288;SC=TCCCCGTCCCGTTGGCCTCTG;SOR=1.765;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=51;TCF=19;TCR=32;TR=50;WE=45539434;WS=45539416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr21	45540143	rs2855653	G	A	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=1;PP=569;SC=AGCATCTTAGGTGGGGCGGCA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=20;WE=45540151;WS=45540133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr21	45540207	rs2850157	C	T	2179.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=9;PP=1802;SC=GGTCTGCCCCCGCCCCTCCTG;SOR=3.578;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=66;TCF=57;TCR=9;TR=66;WE=45540215;WS=45540197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr21	45540919	rs2071143	A	G	3970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=79;PP=2941;SC=GGGACAAGACAGTGCGCCTAT;SOR=1.284;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=126;TCF=46;TCR=80;TR=125;WE=45540927;WS=45540909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr21	45544594	rs2187313	T	C	3022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=71;PP=2399;SC=CAACCTGTCTTTGGACGCCAT;SOR=2.229;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=21;TCR=71;TR=92;WE=45544602;WS=45544584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr21	45550460	rs11311220	TC	T	66.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=0;PP=44;SC=GCATTGACCATCCCCTGTGTG;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=2;WE=45550468;WS=45550450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr21	45553430	rs2187314	A	C	1540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=44;NR=0;PP=1191;SC=CCCACCGGCGAACTCACTGGA;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=44;WE=45553438;WS=45553420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr21	45553476	rs968713	A	C	2720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=62;NR=21;PP=1898;SC=GGCTCCGCCCAGAAGGCTGCG;SOR=2.102;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=62;TCR=21;TR=83;WE=45553484;WS=45553466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr21	45553596	rs968714	T	C	3117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=66;PP=2533;SC=GCTGTGAGGGTCCTGGTGGCC;SOR=1.633;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=31;TCR=66;TR=97;WE=45553604;WS=45553586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr21	45560331	rs2838492	C	G	775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=24;PP=645;SC=CTCACAGCTGCTTTTCTTGTT;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=25;WE=45560339;WS=45560321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr21	45561039	rs1059813	T	C	7302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.450;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=123;NR=98;PP=2965;ReadPosRankSum=1.708;SC=TGTCTCCCCATCCACAGTCAC;SOR=0.556;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=222;TCF=123;TCR=99;TR=221;WE=45561047;WS=45561029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,238:1.00:239
chr21	45564575	rs2838496	G	C	338.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=280;SC=CCAGGAGCGAGTTCTCCTCTT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=45564583;WS=45564565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	45565473	rs7676	C	T	1424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=33;PP=1137;SC=AAATTGCAGCCCCTCAGCCCC;SOR=1.880;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=12;TCR=33;TR=45;WE=45565481;WS=45565463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr21	45642818	.	A	T	1119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=0.000;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=5.429;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.33;ReadPosRankSum=-1.172;SOR=3.477;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,45:0.94:48
chr21	45648992	rs7278940	T	C	3083.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=44;PP=2263;SC=CAGGCAGACGTCGGTTTTCTC;SOR=0.775;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=50;TCR=44;TR=94;WE=45649000;WS=45648982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr21	45649494	rs7278772	A	G	1020.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.342;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5055;FS=2.695;HP=4;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=676;ReadPosRankSum=1.504;SC=GCCCGGACCCACTCCGGACAC;SOR=0.283;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=41;TCF=18;TCR=23;TR=33;WE=45649502;WS=45649484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,36:0.95:38
chr21	45649543	rs4818891	G	C	686.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.612;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.498;NF=4;NR=14;PP=348;ReadPosRankSum=0.014;SC=ACCCGCCCTGGACACCCCACG;SOR=1.485;SbPval=0.04;Source=Platypus;TC=47;TCF=24;TCR=23;TR=18;WE=45649551;WS=45649533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,22:0.51:43
chr21	45649666	rs4511811	G	A	2150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=21;PP=1763;SC=GGAGCGCGGGGGTCTAGCACT;SOR=1.751;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=46;TCR=21;TR=67;WE=45649674;WS=45649656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr21	45649778	rs4568033	A	G	3247.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=53;PP=2489;SC=AGGAAATGCCATGCGCACCAT;SOR=0.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=53;TCR=53;TR=106;WE=45649786;WS=45649768;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr21	45649848	rs13052840	T	C	3869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=59;PP=2965;SC=CTTTTGCCTTTTGAAAGTTTT;SOR=0.743;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=56;TCR=59;TR=115;WE=45649856;WS=45649838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr21	45650009	rs2236668	T	C	1202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=40;PP=979;SC=GCAGCAGCGATGGGGGGTGTC;SOR=4.271;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=43;WE=45650017;WS=45649999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr21	45651413	rs3746962	A	G	879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=23;PP=681;SC=AAGTGTTGCAAGGAAGTATTT;SOR=4.332;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=45651421;WS=45651403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr21	45655124	rs2070557	A	T	641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=3;PP=508;SC=ACTGTCGGGCACAGCTCAGCA;SOR=3.160;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=45655132;WS=45655114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr21	45656774	rs11558819	C	T	1926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=8;PP=1604;SC=GTAACCTCAACGCTCAAAACC;SOR=3.575;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=51;TCR=8;TR=59;WE=45656782;WS=45656764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr21	45658474	rs56124762	A	G	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=5;NR=10;PP=352;SC=GAGGTAGTTAAGCCCATCACA;SOR=1.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=45658482;WS=45658464;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr21	45674406	.	C	T	1551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=11;PP=1248;SC=CCCCTGCTGCCGCCTCCTTGC;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=45;WE=45674414;WS=45674396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr21	45708277	rs878081	C	T	3590.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=63;PP=2725;ReadPosRankSum=0.944;SC=CCATGTCCTCCGGGGACGTCC;SOR=0.416;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=45;TCR=64;TR=108;WE=45708285;WS=45708267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,115:0.99:116
chr21	45710107	rs1003854	T	C	1064.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=27;PP=843;SC=AGACAGTATTTTTTTCCTGAT;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=45710115;WS=45710097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr21	45712357	rs5844181	AC	A	253.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=258;SC=AGGCTGGGCCACCCCCTCCTG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=45712365;WS=45712347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr21	45712977	rs1800521	T	C	827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=19;PP=625;SC=ACCTGCCGGCTCCGCCTTCTG;SOR=1.697;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=45712985;WS=45712967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr21	45717550	rs1133779	T	C	1495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=39;PP=1321;SC=ACACCTTCGATGGCATCCTGC;SOR=1.791;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=17;TCR=39;TR=56;WE=45717558;WS=45717540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr21	45724055	rs8134520	G	A	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=14;PP=637;SC=CATTGTCTCCGGGCGTCAAAG;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=13;TCR=14;TR=27;WE=45724063;WS=45724045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr21	45725055	rs55730776	CA	TG	679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.49;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	45725064	rs34642010	C	T	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.05;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr21	45725715	rs9975113	A	G	1162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=14;PP=828;SC=CCGCTGGGACAGACTGTTTCT;SOR=1.075;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=37;WE=45725723;WS=45725705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr21	45725857	rs9977591	TC	CT	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;JOINED;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=17;PP=1102;SC=GCAGTGCTGTTCCCTGGGTGG;SOR=3.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=20;WE=45725866;WS=45725847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr21	45725910	rs67861360	C	T	377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=10;PP=286;SC=CATCTCATTGCGGAGGAAGGA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=45725918;WS=45725900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr21	45726480	rs2070568	T	G	428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=0;PP=362;SC=AGGCCTCCCCTACCCCCTGTC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=45726488;WS=45726470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	45726504	rs55966702	A	G	299.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=4;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=3;PP=117;SC=TGAGATGGGGAGGGTGTCCAG;SOR=1.609;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=17;TCF=7;TCR=10;TR=10;WE=45726512;WS=45726489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr21	45726694	rs2070569	CC	GT	1087.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=15;PP=1200;SC=GAGGCGCATGCCGAGGTGTGT;SOR=2.494;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=20;WE=45726703;WS=45726684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr21	45726790	rs2070571	T	C	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=12;PP=370;SC=GAGGGGGAGCTTGGGGCCAGG;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=45726798;WS=45726780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr21	45755791	.	C	T	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=39;PP=1111;SC=AACCCACTTCCGGGGCCTGAG;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=41;WE=45755799;WS=45755781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr21	45789011	rs34543751	A	AG	851.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=1;PP=948;SC=CCTGGGTGTCAGGTGCCCCTC;SOR=5.058;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=22;WE=45789019;WS=45789001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr21	45797484	.	C	T	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=110;SC=CAGGGTCTTGCCCCCCACCTC;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=45797492;WS=45797474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr21	45817620	rs1785436	T	C	1344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=9;PP=1132;SC=GTGGCTCCTCTGGTCCCCAGA;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=45;WE=45817628;WS=45817610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr21	45821529	rs9974831	T	C	2061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=1;PP=1778;SC=CTGGCCCTGGTGGTCACTGTC;SOR=6.837;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=62;TCF=61;TCR=1;TR=62;WE=45821537;WS=45821519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr21	45821794	rs1785437	C	T	2443.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=70;PP=2043;SC=CAGCCCCACCCGCTTTTCCAC;SOR=5.811;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=73;TCF=3;TCR=70;TR=73;WE=45821802;WS=45821784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr21	45825975	rs1614122	G	A	1327.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=1;NR=35;PP=1088;SC=GGTGGGCCTCGGGGAGGGCAG;SOR=5.943;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=36;WE=45825983;WS=45825965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr21	45826434	rs1785454	C	T	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=4;PP=356;SC=CAGTGAGCATCGGGGGCCAGG;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=12;TCR=4;TR=16;WE=45826442;WS=45826424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	45826462	rs1618355	C	A	777.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=8;PP=633;SC=AGCCCACACACTCTCTGTCCT;SOR=1.697;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=27;WE=45826470;WS=45826452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr21	45826744	rs1785439	A	G	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr21	45834025	rs915779	T	C	1300.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=43;PP=1039;SC=GCAGTGGCCATGCTGTCTCCA;SOR=5.421;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=45;TCF=2;TCR=43;TR=45;WE=45834033;WS=45834015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr21	45837790	rs1785452	T	C	2878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=10;PP=2237;SC=CTCGAGGTGTTGCTTTCTCCT;SOR=3.767;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=73;TCR=10;TR=83;WE=45837798;WS=45837780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr21	45843707	rs35058894	TGAG	T	187.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=159;SC=AGGAGGGCTCTGAGGAGTGAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=4;WE=45843717;WS=45843697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr21	45844601	rs13050999	C	T	800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=6;PP=639;SC=TGGTGTCTCACTTTCAAAGGG;SOR=2.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=19;TCR=6;TR=25;WE=45844609;WS=45844591;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr21	45844751	rs9978351	A	G	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=18;PP=604;SC=CAGACAGCCCAAGCCCTGCAC;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=45844759;WS=45844741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr21	45845807	rs762428	C	T	193.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=4;PP=144;SC=ATCCTGGCTCCCAGCCACTGC;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=3;TCR=4;TR=7;WE=45845815;WS=45845797;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr21	45854925	rs41277556	G	A	560.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=2;PP=441;SC=GGCTCCTGACGCCCGCTGTCC;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=45854933;WS=45854915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr21	45942111	rs233230	A	G	1230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=34;PP=1008;SC=ACCCACGAGGACAAGGCCAAC;SOR=4.977;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=36;WE=45942119;WS=45942101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr21	45959195	rs233316	G	A	963.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=-1.544;NF=20;NR=12;PP=703;ReadPosRankSum=-1.234;SC=TCAGCAGGCCGGGCGGGAGCA;SOR=1.244;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=32;WE=45959203;WS=45959185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,34:0.94:36
chr21	45959312	rs233317	C	T	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=14;PP=955;SC=GCAGGCGGGCCGGCATACAGG;SOR=1.387;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=39;WE=45959320;WS=45959302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr21	45959386	rs233318	G	A	2306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=8;PP=1919;SC=AAGCCGGCTGGCAGCTAGACT;SOR=3.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=69;TCF=61;TCR=8;TR=69;WE=45959394;WS=45959376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr21	45959556	.	A	ATG	5251.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.80;QD=46.07;SOR=1.356;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr21	45959557	.	ATC	TGA	2937	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=59.8;NF=35;NR=57;PP=2937;QD=20;SC=ATGAAGAGGAATCCTCAGAGC;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=100;TCF=37;TCR=63;TR=92;WE=45959567;WS=45959547;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:8,92:0.92:100
chr21	45959557	.	ATC	A	5251.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=115;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.80;QD=45.67;SOR=1.219;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr21	45959918	rs233320	G	A	828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=10;PP=687;SC=GCAGGGGGCCGGGGCGCAGCA;SOR=1.220;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=26;WE=45959926;WS=45959908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr21	45970812	rs2329834	G	A	2707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.717;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=42;PP=2169;ReadPosRankSum=1.219;SC=CTGCTGACACGGGGAGGAGGT;SOR=0.242;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=45;TCR=42;TR=86;WE=45970820;WS=45970802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
chr21	45971380	rs6147532	A	AGTGAGTGAGTGT	297.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=1022;SC=GAGGTGTGTGAGTGAGTGAGT;SOR=2.833;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=8;WE=45971388;WS=45971370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr21	45978488	rs12483390	G	A	1057.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=11;NR=16;PP=595;SC=GGGCCGGGGCGCAGCAGCTGG;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=27;WE=45978511;WS=45978478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr21	45978499	rs377549	T	G	1048.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=51.18;QD=47.67;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr21	45978503	rs435424	G	A	1053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.32;QD=42.15;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr21	45993746	rs200779717	C	T	448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=10.132;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.94;MQRankSum=0.105;QD=23.62;ReadPosRankSum=0.000;SOR=3.236;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,16:0.84:19
chr21	46012240	rs543542	A	G	266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.99;QD=26.68;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr21	46020473	rs113686885	C	CTCAT	1688.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=6;PP=1960;SC=GACTCACTCACTCACTCACTC;SOR=3.202;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=43;TCF=35;TCR=8;TR=38;WE=46020481;WS=46020463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr21	46020527	rs1211103	C	T	2445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=35;PP=1897;SC=CCAGCATGGCCGCGTCCACTA;SOR=0.968;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=83;TCF=48;TCR=35;TR=83;WE=46020535;WS=46020517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr21	46020655	rs36208679	CCTGCTGCGCCCCCAG	C	404.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.86;QD=40.47;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr21	46021088	rs388827	C	T	532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=24.829;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=0.000;QD=18.37;ReadPosRankSum=0.445;SOR=0.740;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,20:0.69:29
chr21	46021179	rs363877	C	A	2159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=14;PP=1812;SC=GTCTAGCTGCCAGCCGGCTTG;SOR=2.833;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=55;TCR=14;TR=68;WE=46021187;WS=46021169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr21	46021205	rs389167	C	T	3131.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=25;PP=2519;SC=CCTCCTCCCCCTGCCAGCAGG;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=98;TCF=72;TCR=26;TR=97;WE=46021213;WS=46021195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr21	46021370	rs437149	T	C	4239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=69;PP=2343;SC=GCTGTGTGCCTGTCTGCTCTG;SOR=1.855;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=32;TCR=69;TR=101;WE=46021378;WS=46021360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr21	46021390	rs446817	G	C	4099.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=68;PP=2712;SC=GGGGCTTCCAGTTCATGCTGC;SOR=2.044;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=97;TCF=29;TCR=68;TR=97;WE=46021398;WS=46021380;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr21	46021481	rs437334	T	C	2524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=29;PP=1350;SC=TCTGCCGCCCTGTGTGCAGGC;SOR=0.726;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=27;TCR=29;TR=56;WE=46021502;WS=46021471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr21	46021494	rs369720	A	G	2848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=34;PP=1605;SC=GTGCAGGCCCACCTGCTGCGT;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=33;TCR=34;TR=67;WE=46021502;WS=46021471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr21	46021607	rs370092	A	G	3100.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=48;PP=2380;SC=GCTCCCGCCCAGCCTGCTGTG;SOR=0.936;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=57;TCR=48;TR=105;WE=46021615;WS=46021597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr21	46021759	rs659638	A	G	769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=24;PP=706;SC=TGCAGTGGACATCAGTGGTCA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=46021767;WS=46021749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr21	46032094	rs411254	A	G	2144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.01;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=30;PP=1583;SC=GACGTGGGCCATGTCAGCCGA;SOR=1.223;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=77;TCF=47;TCR=30;TR=77;WE=46032102;WS=46032084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr21	46066862	.	G	A	3661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=48;PP=2868;SC=CACCTGCTCTGAGGATTCCTC;SOR=0.941;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=109;TCF=61;TCR=48;TR=109;WE=46066870;WS=46066852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr21	46191256	rs4818975	C	A	1654.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=1;PP=1076;SC=TGCTGAGCTGCTTGGCGGTGT;SOR=6.043;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=39;WE=46191278;WS=46191246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr21	46191270	rs11569	C	T	1651.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=36;NR=2;PP=977;SC=GCGGTGTGTGCGCGCCTGTGC;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=36;TCR=2;TR=38;WE=46191278;WS=46191246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr21	46197450	rs2294157	C	T	603.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=14;PP=424;SC=AGGCCGGGTGCGGTGGCTCAC;SOR=2.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=46197458;WS=46197440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr21	46199286	rs375243003	TG	T	109.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.229;HP=14;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.728;NF=0;NR=7;PP=63;ReadPosRankSum=-0.319;SC=GGAGCTGGGGTGGGGGGGGGG;SOR=3.383;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=7;WE=46199294;WS=46199276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr21	46221494	rs28728356	G	C	483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=409;SC=GGACCCACAGGGGGGCTCACG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=46221502;WS=46221484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr21	46226786	rs1051331	A	G	2158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=27;PP=1710;SC=TTCCGCAGACACCTTTGTGGT;SOR=1.257;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=44;TCR=27;TR=71;WE=46226794;WS=46226776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr21	46271452	rs235314	C	T	2948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=43;PP=2410;ReadPosRankSum=1.814;SC=GGCTGCGGAGCGTGCACCTCA;SOR=0.361;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=104;TCF=61;TCR=43;TR=101;WE=46271460;WS=46271442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,100:0.99:101
chr21	46271660	rs235315	A	G	280.31	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=228;ReadPosRankSum=-0.840;SC=AACAACGGGCATTGTAAGCAG;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=10;WE=46271668;WS=46271650;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,10:0.91:11
chr21	46275047	rs235317	A	C	994.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=5;PP=793;SC=ATCTCAGGCCACACTGGCACT;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=30;WE=46275055;WS=46275037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr21	46280968	.	C	T	1230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=3;PP=1024;SC=CCACCCGCCTCCGCCTCCCAA;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=35;WE=46280976;WS=46280958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr21	46281314	rs235276	T	C	1271.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=36;PP=1097;SC=AACCTCCCCCTCAACGCCTCA;SOR=5.031;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=38;TCF=2;TCR=36;TR=38;WE=46281322;WS=46281304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr21	46293692	rs235373	T	C	1094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=22;PP=523;SC=CCTCGCCATCTGCCCCGCCCC;SOR=4.332;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=46293706;WS=46293682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr21	46293698	rs11388069	G	GC	1021.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=18;PP=750;SC=CATCTGCCCCGCCCCTCGCCA;SOR=3.816;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=46293706;WS=46293682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr21	46306161	.	C	T	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;FR=1.0000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=27;MQ=60.0;NF=7;NR=0;PP=143;QD=25.3958875067;SC=ATTTTGAGGGCGGAAAATAAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=46306169;WS=46306160;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr21	46306472	rs235375	C	G	1062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=26;PP=824;SC=GGCAGCCCCCCCAGGGTCCCA;SOR=2.899;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=32;WE=46306480;WS=46306462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr21	46311813	rs235326	A	G	3096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.680;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=38;PP=2373;ReadPosRankSum=-0.994;SC=ACTGGGGAAGAACCTGCACGG;SOR=0.738;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=91;TCF=51;TCR=40;TR=89;WE=46311821;WS=46311803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,97:0.99:98
chr21	46313442	rs2230529	G	T	1885.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=38;PP=1432;SC=GATCCAGGAAGACCCTGGAGG;SOR=1.366;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=25;TCR=38;TR=63;WE=46313450;WS=46313432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr21	46314907	rs235330	T	A	2374.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=37;PP=1820;SC=TCTTAATGAGTTGGACCACAT;SOR=0.774;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=35;TCR=37;TR=72;WE=46314915;WS=46314897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr21	46315022	rs2838725	C	T	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=28;PP=827;SC=ACCTGTGCCACGGCATCTCCA;SOR=4.680;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=46315030;WS=46315012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr21	46315091	rs2838726	C	T	429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=317;SC=CGGTCCTCAACGCAGTTTTGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=46315099;WS=46315081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	46321659	rs55865320	C	A	2767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=64;PP=2268;SC=CTGCAGGGCACATGGAGGGGC;SOR=2.275;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=20;TCR=64;TR=84;WE=46321667;WS=46321649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr21	46328099	rs760462	T	C	1036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=33;PP=819;SC=AGCCGCTCCCTGTGGGACGCA;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=34;WE=46328107;WS=46328089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr21	46330674	rs11088969	C	A	2093.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=52;PP=1602;SC=CCAGGGCGAGCAGTGGGGGGC;SOR=3.160;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=11;TCR=52;TR=63;WE=46330682;WS=46330664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr21	46354055	rs9974172	A	G	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=0;PP=553;SC=TTGGGCTGGCACCCAGGGCCT;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=25;WE=46354063;WS=46354045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr21	46355531	rs11088970	A	G	2519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.309;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=31;PP=1910;ReadPosRankSum=1.138;SC=AGAGTGCAACATGTCACCTAC;SOR=1.174;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=87;TCF=55;TCR=32;TR=86;WE=46355539;WS=46355521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,88:0.99:89
chr21	46355710	rs11088971	A	G	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=13;NR=37;PP=1287;SC=CAGGATCCTCACGCGTGCCGC;SOR=2.124;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=50;WE=46355718;WS=46355700;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr21	46355833	rs11701737	A	G	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=16;PP=427;SC=GGAGAAGCAGACCTGAGTTTT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=46355841;WS=46355823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	46357365	rs4818991	A	G	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=6;PP=340;SC=GGAGGTCACCATTACAATGAG;SOR=1.244;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=14;WE=46357373;WS=46357355;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	46359427	rs12482042	A	G	1427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=15;PP=1046;SC=AAGACCAGCCAGACAACACAG;SOR=1.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=50;WE=46359435;WS=46359417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr21	46554604	.	ATT	A	751.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.061;ClippingRankSum=0.000;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.20;MQRankSum=0.000;QD=8.95;ReadPosRankSum=2.202;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,36:0.43:84
chr21	46572572	rs420085	A	G	3587.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=45;PP=2522;SC=CTTTTTCAGCATCATGGGGCG;SOR=1.224;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=117;TCF=72;TCR=45;TR=115;WE=46572580;WS=46572562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr21	46602483	rs373179300	CT	C	53.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=1.502;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.31;MQRankSum=2.887;QD=0.98;ReadPosRankSum=-1.884;SOR=1.140;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,11:0.20:55
chr21	46602686	rs56350820	A	G	1337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=37;PP=1097;SC=TAGTAAACAAATAAGGACAGG;SOR=5.186;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=39;WE=46602694;WS=46602676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr21	46641968	rs1051367	G	A	4695.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=58;NR=83;PP=2965;SC=AGATTACCAAGCCCAACGTGT;SOR=1.201;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=141;TCF=58;TCR=83;TR=141;WE=46641976;WS=46641958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr21	46685592	rs1006887	C	G	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=16;PP=507;SC=GGAGAACTGGCGTCACAGAGG;SOR=2.030;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=46685600;WS=46685582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr21	46825200	.	C	CGGCTGCGGGGGCTGCGG	97.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=48.62;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr21	46825213	.	C	CCT	98.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=0;NR=2;PP=89;SC=CTGCGGGGGTCGCGGGGGTCG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=46825221;WS=46825203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr21	46875564	rs914230	T	C	4801.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=114;NR=39;PP=2965;SC=ACACCAGCCATGCAGCTACCA;SOR=2.098;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=154;TCF=115;TCR=39;TR=153;WE=46875572;WS=46875554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr21	46898243	rs13046486	C	G	2422.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=21;PP=1902;ReadPosRankSum=1.680;SC=ACACCCAGGGCGACCCCGGTG;SOR=0.753;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=73;TCF=52;TCR=21;TR=72;WE=46898251;WS=46898233;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,76:0.99:77
chr21	46910574	rs71240730	G	GGGTCTCT	862.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=788;SC=GCCCACTCCCGGAGCGCCAGG;SOR=3.716;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=13;WE=46910582;WS=46910564;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr21	46910654	rs71334070	TAAAG	T	2451.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.393;NF=27;NR=15;PP=1947;SC=GGTCGGGAAATAAAGAACCCC;SOR=0.859;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=46;TCF=30;TCR=16;TR=42;WE=46910665;WS=46910644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,58:0.98:59
chr21	46924425	rs149296338	CGGCCCCCCA	C	1059.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.88;QD=40.76;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr21	46951556	rs12659	A	G	3431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=87;PP=2804;SC=CGCCTGGGCCAGGATTCATGC;SOR=3.035;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=20;TCR=87;TR=107;WE=46951564;WS=46951546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr21	46952094	rs914231	T	C	2552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=88;PP=2076;SC=CCCCACCAGGTGTTAGCAATG;SOR=5.784;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=92;TCF=4;TCR=88;TR=92;WE=46952102;WS=46952084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr21	46954343	rs2330184	T	C	2039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=9;PP=1721;SC=GGGCACAGGTTCTGCCCACAG;SOR=3.407;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=54;TCR=9;TR=63;WE=46954351;WS=46954333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr21	46957794	rs1051266	T	C	1935.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=33;PP=1366;SC=GCACACGAGGTGCCGCCAGGA;SOR=0.723;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=31;TCR=33;TR=64;WE=46957802;WS=46957784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr21	46957916	rs1131596	G	A	434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=308;SC=CGAAGGTGACGCTGTGCCTGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=46957924;WS=46957906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	46957982	rs13052294	G	A	268.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=7;PP=191;SC=TCCCTACCCCGCAAAACGAGG;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=46957990;WS=46957972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr21	47350587	rs407651	C	T	375.41	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.068;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=262;ReadPosRankSum=-0.578;SC=TGGCTGTGGCCAGAGAGAGCG;SOR=1.061;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=12;WE=47350595;WS=47350577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr21	47404397	rs3746993	A	G	5574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=141;PP=2965;SC=AGTGGCCCCCAGCCTCCTGCC;SOR=2.795;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=174;TCF=33;TCR=141;TR=174;WE=47404405;WS=47404387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr21	47406421	rs741956	G	A	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=16;PP=1069;SC=GAGGTCTCACGCTGCCCTCTC;SOR=1.075;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=39;WE=47406429;WS=47406411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr21	47406612	rs754507	C	A	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.675;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=18;PP=463;ReadPosRankSum=-0.540;SC=AGGCACCGGCCCCCCCCGGCA;SOR=1.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=23;WE=47406620;WS=47406602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr21	47409113	rs8129814	C	T	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=24;PP=724;SC=GACTAGGCCTCGGAAACTTCC;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=26;WE=47409121;WS=47409103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr21	47409503	rs2277814	A	G	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=3;PP=740;SC=GTGTCTCACCATCTCCTCCTG;SOR=4.294;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=32;TCR=3;TR=35;WE=47409511;WS=47409493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr21	47409580	rs34495634	C	A	3165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=28;PP=2324;SC=CGTGCCCCCCCTTTCCTGGCC;SOR=1.925;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=70;TCR=28;TR=98;WE=47409588;WS=47409570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chr21	47410378	.	GAATGGGGCGA	G	2966	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=2;HapScore=4;MGOF=5;MMLQ=22;MQ=57.68;NF=0;NR=12;PP=2966;QD=20;SC=GGACGAGGAGGAATGGGGCGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=12;WE=47410431;WS=47410363;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr21	47410423	.	AC	A	1517	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;FR=0.5000;HP=3;HapScore=4;MGOF=3;MMLQ=28;MQ=57.05;NF=0;NR=13;PP=1517;QD=120.463915375;SC=CGTGAAGGTGACCCGGGGAGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=13;WE=47410431;WS=47410363;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:12,13:0.52:25
chr21	47410626	rs1980981	T	G	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=11;PP=651;SC=AGTCTGACAGTTGATTGGCCT;SOR=0.846;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=13;TCR=11;TR=24;WE=47410634;WS=47410616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr21	47410931	rs1980982	T	C	2674.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=35;PP=2049;SC=GAGACCCCGGTGCCTTTGGAC;SOR=1.141;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=89;TCF=53;TCR=36;TR=88;WE=47410939;WS=47410921;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr21	47412751	rs2850173	A	C	1027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=21;PP=789;SC=GGAGCTGGGAACCACCCCAGG;SOR=1.751;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=47412759;WS=47412741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr21	47417303	rs2839077	T	C	2397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=40;PP=1667;ReadPosRankSum=-0.670;SC=GTGAGGCCTGTGGTCCAACGT;SOR=0.252;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=41;TCR=40;TR=80;WE=47417311;WS=47417293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,85:0.99:86
chr21	47417432	rs3216137	A	AG	861.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=16;PP=814;SC=CCGCCCACCCAGGGGGGCCTG;SOR=2.066;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=29;TCF=10;TCR=19;TR=25;WE=47417440;WS=47417422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr21	47417578	rs2276255	A	G	1608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=29;PP=1195;SC=TCACCATGCTAAGCCTGCTCC;SOR=0.931;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=24;TCR=29;TR=53;WE=47417586;WS=47417568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr21	47417975	rs3737437	A	G	810.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=3;PP=710;SC=GGCCTGTGCCAGCCAGTGGGT;SOR=4.548;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=32;WE=47417983;WS=47417965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr21	47418234	rs11700844	G	C	1021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=10;PP=891;SC=GTCAGCTCAGGCCCTTCCGCT;SOR=1.542;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=34;WE=47418242;WS=47418224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr21	47418728	rs141212516	C	CT	1621.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=5;PP=1813;SC=CCTCTCTTATCTTTATTTTTT;SOR=3.745;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=53;TCF=43;TCR=10;TR=44;WE=47418736;WS=47418718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr21	47419012	rs4819179	C	T	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=12;PP=397;SC=ACGGGGCCAGCGCGCAGATGC;SOR=2.049;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=47419020;WS=47419002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	47419697	rs8131101	C	T	1586.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=36;PP=1286;SC=CTCCTGTAGACGCTGCTCACG;SOR=2.004;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=13;TCR=36;TR=49;WE=47419705;WS=47419687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
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chr21	47422639	rs2236485	A	G	1360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=33;PP=1006;SC=GCATGGGGCCACCCGGGCAGT;SOR=2.636;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=41;TCF=7;TCR=34;TR=40;WE=47422647;WS=47422629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr21	47422712	rs2236488	C	T	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=19;PP=564;SC=TAGGTGCACGCGGGGCCGCCC;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=47422720;WS=47422702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr21	47423133	rs2236489	C	G	1717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=38;PP=1286;SC=TCTGAGAGGACGGGGCTCTGG;SOR=2.480;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=10;TCR=38;TR=48;WE=47423141;WS=47423123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr21	47423389	rs1053312	G	A	2442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=38;PP=1884;SC=ACCACCAAGCGCTTCGCCAAG;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=38;TCR=38;TR=76;WE=47423397;WS=47423379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr21	47423507	rs1053315	G	A	2987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=41;PP=2197;SC=CAGAGCGGGCGTCGCTGCAGT;SOR=0.914;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=92;TCF=51;TCR=41;TR=92;WE=47423515;WS=47423497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr21	47423636	rs1053320	C	T	3502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.125;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=56;NR=57;PP=2965;ReadPosRankSum=0.879;SC=AGGCCTCGTCCGGCGCTGCCA;SOR=0.335;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=114;TCF=57;TCR=57;TR=113;WE=47423644;WS=47423626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,114:0.99:115
chr21	47542654	rs5844253	G	GC	1400.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=11;PP=1568;SC=TTCAGGCTTTGCAAAAAAACC;SOR=1.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=36;WE=47542662;WS=47542644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr21	47552103	rs11554669	G	T	2823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=41;PP=2239;SC=ACAACCTCACGGCCATCCACG;SOR=0.812;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=46;TCR=41;TR=87;WE=47552111;WS=47552093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr21	47557074	rs9284510	A	G	1665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=19;PP=1403;SC=CACTGCCCACAGCCAGTCGGC;SOR=1.651;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=38;TCR=19;TR=57;WE=47557082;WS=47557064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr21	47558586	rs60525628	A	G	1411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.61;QD=44.12;SOR=1.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr21	47558591	rs62214031	A	G	1456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.62;QD=44.14;SOR=1.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr21	47558601	rs373803401	A	G	1392.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.60;QD=44.93;SOR=2.093;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr21	47558994	rs1980983	A	G	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=379;SC=TATAGCCCTTAGCATCAGGCT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=47559002;WS=47558984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr21	47566090	rs80225292	G	A	574.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=1;PP=474;SC=GGACTCAGCCGGGTCTCCACG;SOR=4.407;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=17;WE=47566098;WS=47566080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr21	47566345	rs3746999	G	A	878.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=27;PP=811;SC=CCCCTGCCCCGAGCACACAGG;SOR=5.211;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=47566353;WS=47566335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr21	47570266	rs55761347	G	A	2494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=19;PP=2128;SC=AGATCGGCTCGCCCCTCACAG;SOR=2.395;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=59;TCR=19;TR=78;WE=47570274;WS=47570256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr21	47571383	rs34248722	C	CA	1011.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=2;PP=991;SC=GTGCCCCATCCCCACCGACCT;SOR=4.255;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=24;WE=47571391;WS=47571373;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr21	47571845	rs61729391	C	T	1044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=11;PP=762;SC=CCCGGATGGCCGGCAGGGTCC;SOR=1.418;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=20;TCR=11;TR=31;WE=47571853;WS=47571835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr21	47581219	rs10188	C	T	997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=6;PP=824;SC=TCCGGGGGGACGCGCAGGAGG;SOR=2.899;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=47581227;WS=47581209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr21	47581423	rs14378	C	T	3051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=51;PP=2478;SC=GGCCGGGCTGCTGTGCAGGGG;SOR=0.866;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=47;TCR=51;TR=98;WE=47581431;WS=47581413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr21	47581835	rs113710653	C	T	1620.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=15;PP=1237;SC=CGCACCTGCTCGATCTTCTCG;SOR=1.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=35;TCR=15;TR=50;WE=47581843;WS=47581825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr21	47581949	rs113146399	C	T	2365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=35;NR=38;PP=1780;SC=ACCACGCGCGCGTCCTTCTCG;SOR=0.887;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=35;TCR=38;TR=73;WE=47581957;WS=47581939;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr21	47627245	rs2839144	C	A	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=0;PP=409;SC=CCTGGCCGGACTGTGTGCTGG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=47627253;WS=47627235;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	47630550	rs2839146	C	T	1609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=16;PP=1300;SC=TGCGTGGGCTCACGTGCACAG;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=37;TCR=16;TR=53;WE=47630558;WS=47630540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr21	47635302	rs5844259	T	TC	295.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=7;PP=348;SC=GACTTGCCCTTCCCAGGGTTT;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=9;WE=47635310;WS=47635292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr21	47635577	rs2839152	C	T	1618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=13;PP=1312;SC=GCTGCCCTGCCGGCCCCTCAG;SOR=2.124;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=36;TCR=13;TR=49;WE=47635585;WS=47635567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr21	47635713	rs11701729	G	A	3076.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=56;PP=2422;SC=AGCTCCTGGTGGGGGCAGTGT;SOR=1.156;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=94;TCF=38;TCR=56;TR=94;WE=47635721;WS=47635703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr21	47635856	rs2839153	C	G	453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=414;SC=GACCCCGAGGCCACATGAAGG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=47635864;WS=47635846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr21	47641996	rs2280959	C	G	598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=468;SC=TGCTAAAATGCCTTAACCTGA;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=47642004;WS=47641986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr21	47642016	rs2280958	C	T	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=391;SC=ACATAACATGCCAACACAGGA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=47642024;WS=47642006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	47642397	rs2280955	C	T	536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=454;SC=GCCCACTCCCCGCCTGCTAGT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=47642405;WS=47642387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr21	47647618	rs10550493	GAA	G	2689.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.414;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.361;NF=23;NR=35;PP=1041;ReadPosRankSum=-0.788;SC=CAAAGAGATCGAAAAAAAAAA;SOR=0.245;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=77;TCF=33;TCR=44;TR=58;WE=47647628;WS=47647608;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,81:0.99:82
chr21	47650214	.	GT	G	329	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=9;NR=0;PP=329;QD=42.0034333189;SC=TAAATCACCCGTTAAGTCAGA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=47650222;WS=47650213;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr21	47669648	rs2330353	T	A	1678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=45;PP=1400;SC=GCACCTGGCCTGTGCCAGGCA;SOR=3.528;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=7;TCR=45;TR=52;WE=47669656;WS=47669638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr21	47671690	rs2839984	A	G	709.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=634;SC=AGAAGAAAGAAAAATATCACA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=47671698;WS=47671680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr21	47676711	rs2839173	G	A	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=315;SC=ACCTGGTGCAGGAGATGCCCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=47676719;WS=47676701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr21	47676934	rs2839174	T	C	1254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=19;PP=822;SC=CACAGAGTGTTTTCAGGGTCT;SOR=0.843;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=16;TCR=19;TR=35;WE=47676942;WS=47676924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr21	47678774	rs2839178	A	G	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=6;PP=1117;SC=TACAGAAACTAATAGCTCATA;SOR=3.033;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=37;TCR=6;TR=43;WE=47678782;WS=47678764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr21	47681127	rs2839180	T	C	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=262;SC=GCATCGTGGCTAGGGTCAGTT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=10;WE=47681135;WS=47681117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr21	47686152	rs2839182	C	T	1552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=34;PP=1020;SC=AGTGCCCTGCCGAGTACTGCA;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=35;WE=47686160;WS=47686142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr21	47686174	rs4818831	T	C	1414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=31;PP=790;SC=GCCCCTTGGGTGTCACCACAG;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=47686182;WS=47686164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr21	47687144	rs2839183	G	A	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=309;SC=CATGGCCAGCGTGGGGCACAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=47687152;WS=47687134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr21	47697650	rs17182664	A	G	988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=22;PP=796;SC=TAAACACCACACTGAGGGCCC;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=10;TCR=22;TR=32;WE=47697658;WS=47697640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr21	47703649	rs11702450	G	A	1678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=40;PP=1244;SC=AGTCAGGGATGTTCTTGCACT;SOR=3.300;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=48;TCF=7;TCR=41;TR=47;WE=47703657;WS=47703639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr21	47704896	rs9975588	G	A	2377.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.086;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.210;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=39;PP=1879;ReadPosRankSum=1.034;SC=CAGCACAGATGAACTTGAAGG;SOR=0.555;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=74;TCF=34;TCR=40;TR=71;WE=47704904;WS=47704886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,75:0.96:78
chr21	47716230	rs1888539	T	C	1053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=28;PP=840;SC=ACCCTCCATCTTGACCGCCCC;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=47716238;WS=47716220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr21	47717350	rs2839206	C	G	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=168;SC=GGGCGGCCGGCTTCCCCCAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=47717358;WS=47717348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr21	47717616	rs8651	G	A	1686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=33;PP=1257;SC=GGTCGCACACGAATAAATAAC;SOR=1.445;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=51;WE=47717624;WS=47717606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr21	47717686	rs2839207	G	A	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=22;PP=739;SC=GGTATTTTTCGTTATTGTAAA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=7;TCR=22;TR=29;WE=47717694;WS=47717676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr21	47722391	rs1556337	A	G	1121.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=27;NR=5;PP=857;SC=GCTGGGGGCTAAGCCTACCTG;SOR=2.833;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=32;WE=47722399;WS=47722381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr21	47722578	rs1974171	G	C	1186.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=28;PP=877;SC=CCAGAGAACAGGTGTGTCTGT;SOR=1.721;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=13;TCR=28;TR=41;WE=47722586;WS=47722568;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr21	47735469	rs117451772	G	A	1731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=30;PP=1372;SC=TTCCTGGAGGGAAGAACCTGC;SOR=1.118;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=21;TCR=30;TR=51;WE=47735477;WS=47735459;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr21	47744037	rs3842460	CG	C	503.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=1;PP=455;SC=ACAGTTGTCGCGGGGGGAGGG;SOR=3.383;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=15;WE=47744045;WS=47744027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr21	47754471	rs58106867	G	A	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-0.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.099;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.242;NF=6;NR=2;PP=72;ReadPosRankSum=-3.218;SC=CCAGAACAGCGTGGGATGTTC;SOR=1.844;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=37;TCF=21;TCR=16;TR=8;WE=47754479;WS=47754461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,8:0.22:37
chr21	47766139	rs9982233	T	C	1159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=36;PP=895;SC=CGGCGGGGCCTGCACAGGCTC;SOR=4.565;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=39;TCF=2;TCR=37;TR=38;WE=47766147;WS=47766129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr21	47766650	rs2839217	G	A	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=3;PP=367;SC=CCTTTTCTCCGCCGCAGGCCG;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=11;TCR=3;TR=14;WE=47766658;WS=47766640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr21	47773103	rs2249057	C	A	5094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=97;NR=63;PP=2965;SC=AGCATGAGTCCGAACTGGAGC;SOR=1.172;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=160;TCF=97;TCR=63;TR=160;WE=47773111;WS=47773093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chr21	47777063	rs2839223	G	A	2748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=44;PP=2078;SC=AATTTGTATGGGAAGTTGCAG;SOR=0.863;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=81;TCF=37;TCR=44;TR=81;WE=47777071;WS=47777053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr21	47777222	rs2839224	A	G	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=17;PP=484;SC=AGTGCTGTACATGGCACATTT;SOR=4.407;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=47777230;WS=47777212;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr21	47783796	rs8131546	T	C	1173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=34;PP=878;SC=GGGAGCTTGCTGCGCTCCACG;SOR=2.356;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=9;TCR=34;TR=43;WE=47783804;WS=47783786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr21	47786449	rs9637173	T	A	1900.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=8;PP=1459;SC=GCAAGGGTCATTGCTTCCTGA;SOR=3.296;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=47;TCR=8;TR=55;WE=47786457;WS=47786439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr21	47786494	rs2839226	C	T	2375.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=24;PP=1856;SC=ACTTTGTTGCCGCAGGTTTTT;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=46;TCR=24;TR=70;WE=47786502;WS=47786484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr21	47786817	rs2839228	C	G	1986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=20;PP=1516;SC=CCTGTTACCTCTCTGAATTTC;SOR=1.255;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=55;WE=47786825;WS=47786807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr21	47787002	rs6518289	T	C	2016.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=57;PP=1481;SC=CGAACCGAAGTGAGCACAGAG;SOR=2.964;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=12;TCR=57;TR=69;WE=47787010;WS=47786992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr21	47811272	rs3737438	C	T	358.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=10;PP=258;SC=CAGCCACGGACGCCGAGGCCA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=12;WE=47811280;WS=47811262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr21	47832989	rs4300932	G	A	324.53	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=2.349;NF=0;NR=13;PP=303;ReadPosRankSum=-0.974;SC=GGGAAGGCACGAGGCCCACCC;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=13;WE=47832997;WS=47832979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,12:0.92:13
chr21	47845992	rs11702810	T	C	264.79	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=67.24;MQRankSum=3.745;QD=18.91;ReadPosRankSum=-0.277;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr21	47850405	rs2839257	C	T	236.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=3;PP=187;SC=GATTGTTCTGCGATGTCTCCA;SOR=1.402;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=47850413;WS=47850395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr21	47850484	rs2070426	G	C	288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=4;PP=205;SC=AGAGTGAGCAGGGGAAGGGGC;SOR=1.085;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=9;TCF=5;TCR=4;TR=9;WE=47850492;WS=47850474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr21	47851753	rs2073376	A	G	2582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=61;NR=24;PP=1989;SC=GCTCTGCTGCAGAAGCTGAAG;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=61;TCR=24;TR=85;WE=47851761;WS=47851743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr21	47852085	rs35147998	G	A	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=26;PP=709;ReadPosRankSum=1.303;SC=GAGCCCAGCGGCTGCGGAGCA;SOR=2.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=29;WE=47852093;WS=47852075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chr21	47852151	rs5844270	A	AG	325.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=6;PP=239;SC=CTGCCGGCGGACGTCCACACC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=47852159;WS=47852141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr21	47856106	rs2236616	C	A	648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=20;PP=540;SC=CTTGCAGCCACCCCTCTGTCC;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=47856114;WS=47856096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr21	47860764	rs2839260	T	C	1703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=0;PP=1459;SC=TTTTTTTCTTTTAGATGGAAA;SOR=7.824;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=49;WE=47860772;WS=47860754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr21	47862624	rs2839262	A	G	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=18;PP=497;SC=ATTCCGTCAGAGCAGTCGTCC;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=47862632;WS=47862614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr21	47864560	rs143709505	CTTT	C	386.75	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.49;MQRankSum=0.641;QD=24.17;ReadPosRankSum=1.488;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,13:0.81:16
chr21	47910659	rs9976530	A	G	1067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=31;PP=949;SC=GGCAGTGGGGAAGGTGGACGG;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=47910667;WS=47910649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr21	47916823	rs150329133	AC	A	1367.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=0;PP=1742;SC=CTGAAAACAAACAAAAACATG;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=40;TCR=0;TR=40;WE=47916831;WS=47916813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr21	47917047	rs11315869	CT	C	3065.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=84;PP=2373;SC=TCAAGTGTGGCTTTTTTTTGA;SOR=2.142;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=126;TCF=24;TCR=102;TR=104;WE=47917055;WS=47917037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chr21	47959731	rs117443865	C	G	2033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=4;PP=1664;SC=TGTCCAGCCACCCCTTCCCTG;SOR=4.840;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=52;TCR=4;TR=56;WE=47959739;WS=47959721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr21	47959976	rs142952810	G	GCTGTGC	1550.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=1527;SC=TTATCCTGGAGCTGTGCCTGT;SOR=2.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=3;TCR=39;TR=23;WE=47959984;WS=47959966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr21	47966016	rs4818845	C	G	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=588;SC=GACCTCCCTGCCCATCACCCT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=47966024;WS=47966006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr21	47966810	rs2839318	G	C	1333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=7;PP=1080;ReadPosRankSum=-0.561;SC=GAGTCTTGACGCACACCCTTT;SOR=1.358;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=42;TCF=35;TCR=7;TR=41;WE=47966818;WS=47966800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,42:0.98:43
chr21	47969793	rs17302700	C	T	3567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=61;PP=2874;SC=GAGCCGTGTGCTGCAGGTGGG;SOR=0.927;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=47;TCR=62;TR=108;WE=47969801;WS=47969783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr21	47969962	rs79100421	T	C	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=20;PP=590;SC=GCTGTATGTATTTACGGGATA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=47969970;WS=47969952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr21	47971539	rs2255526	G	A	2080.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=18;PP=1578;SC=GAGTTCCCCCGTTTCTAGAGG;SOR=1.897;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=48;TCR=18;TR=66;WE=47971547;WS=47971529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr21	47978321	rs34920477	G	GC	2891.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=25;PP=2832;SC=GGTGCCTGGGGCTGCGGTTCT;SOR=1.609;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=63;TCF=37;TCR=26;TR=62;WE=47978329;WS=47978311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr21	47978421	rs2839323	G	A	2922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.476;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=55;PP=2251;ReadPosRankSum=-0.732;SC=TCCTTCTCTGGGCCTTTGATA;SOR=0.459;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=91;TCF=35;TCR=56;TR=90;WE=47978429;WS=47978411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,94:0.99:95
chr21	47980570	rs2070429	A	G	2326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=18;PP=1884;SC=ATGCAGCTGTACCTGTAGAAA;SOR=2.368;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=55;TCR=18;TR=73;WE=47980578;WS=47980560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr21	47980760	rs2839324	T	G	1189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=30;PP=1010;SC=AAACCAGGTCTGCACTGACTA;SOR=2.362;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=9;TCR=30;TR=39;WE=47980768;WS=47980750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr21	47983657	rs762253	G	A	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=1;PP=1110;SC=GACCTGACATGAGCACATCAG;SOR=5.943;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=39;WE=47983665;WS=47983647;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr21	47986633	rs3819044	C	A	2010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=55;PP=1628;SC=CACGTGGTCCCTCCAGCCCTT;SOR=3.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=8;TCR=55;TR=63;WE=47986641;WS=47986623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr21	48063476	rs10854485	C	G	398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=6;PP=310;SC=GCAGTGAGGCCGGTCTCCTGC;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=14;WE=48063484;WS=48063466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr22	17054103	rs4008588	G	A	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.972;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.197;NF=1;NR=10;PP=199;ReadPosRankSum=-1.714;SC=AGCTAGTACAGGTAAAATAAT;SOR=2.348;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=27;TCF=6;TCR=21;TR=11;WE=17054111;WS=17054093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,10:0.34:29
chr22	17054291	rs73159808	T	C	956.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.001;NF=30;NR=10;PP=830;ReadPosRankSum=-0.326;SC=CTGAACCTGATTTGTTTTTTT;SOR=0.716;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=105;TCF=78;TCR=27;TR=40;WE=17054299;WS=17054281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,39:0.38:103
chr22	17054332	rs143558414	T	C	760.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=3.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.700;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.057;NF=18;NR=18;PP=691;ReadPosRankSum=2.007;SC=ATATGAACAATATTTGGATAA;SOR=0.512;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=111;TCF=50;TCR=61;TR=36;WE=17054340;WS=17054322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,34:0.33:103
chr22	17055458	rs35893428	G	A	3452.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.651;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.962;NF=61;NR=72;PP=2901;ReadPosRankSum=-0.216;SC=TAGGCAAGTCGAGGCAATGGA;SOR=0.711;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=193;TCF=87;TCR=106;TR=133;WE=17055466;WS=17055448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,126:0.69:183
chr22	17060409	rs147992329	TTTTG	T	529.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.460;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.239;NF=0;NR=10;PP=689;ReadPosRankSum=-1.976;SC=AGAATCAGTTTTTTGTTTGAT;SOR=0.596;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=10;WE=17060427;WS=17060399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr22	17060419	rs142683207	T	C	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.239;NF=0;NR=10;PP=679;ReadPosRankSum=-1.429;SC=TTTTGTTTGATTACATCTACA;SOR=0.596;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=10;WE=17060427;WS=17060399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,15:0.42:36
chr22	17063359	rs2006108	A	G	2615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.40;QD=35.35;SOR=8.635;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr22	17072483	rs2236639	A	G	5295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.60;QD=30.09;SOR=1.927;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr22	17073066	rs5747988	A	G	5569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=131;NR=65;PP=2965;SC=GAGGCAGGCCAGCCTTCAGCA;SOR=1.563;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=198;TCF=133;TCR=65;TR=196;WE=17073074;WS=17073056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr22	17073475	rs2070503	C	T	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.153;NF=0;NR=5;PP=71;ReadPosRankSum=0.473;SC=CCGTGGGTTGCAGAGATGCTC;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=5;WE=17073483;WS=17073465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr22	17156061	rs8142573	A	G	1687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.703;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.006;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.453;NF=52;NR=12;PP=1419;ReadPosRankSum=-1.467;SC=TTTCTTTTAAAAGAGTGCATT;SOR=0.997;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=78;TCR=18;TR=64;WE=17156069;WS=17156051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,62:0.65:96
chr22	17178601	rs116224412	G	A	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.818;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=2.248;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.60;MQRankSum=-2.847;QD=2.41;ReadPosRankSum=-0.717;SOR=0.215;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr22	17326914	rs165927	G	A	2468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=30;PP=1886;SC=TGGAAGACTCGGTGGAGAAGG;SOR=1.165;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=44;TCR=30;TR=74;WE=17326922;WS=17326904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr22	17327068	rs165588	A	G	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=29;PP=844;SC=CCGGGCACTGACCAAGCTCCC;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=17327076;WS=17327058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr22	17565888	rs13053694	C	A	3628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.774;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=43;PP=2798;ReadPosRankSum=0.851;SC=CAAAGTGGAGCCGACTCGAAC;SOR=0.495;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=112;TCF=69;TCR=43;TR=111;WE=17565896;WS=17565878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,115:0.99:116
chr22	17565932	rs917864	T	C	4063.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=59;NR=68;PP=2965;SC=AGAACGTTCGTTCGCTGCGTC;SOR=0.876;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=59;TCR=68;TR=127;WE=17565940;WS=17565922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr22	17565974	rs917865	G	C	3097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=72;PP=2488;SC=CGCGACGCCAGCCGGGCCATG;SOR=2.208;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=25;TCR=72;TR=97;WE=17565982;WS=17565964;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr22	17566206	rs2270241	G	T	592.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=11;PP=448;SC=GGGACTACGCGCCCGGGCTGG;SOR=1.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=16;WE=17566214;WS=17566196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr22	17566229	rs2270242	T	A	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=10;PP=389;SC=AGGCAGGAAGTCCGCGCCGCG;SOR=1.739;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=5;TCR=10;TR=15;WE=17566237;WS=17566219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr22	17582776	rs17807076	C	T	483.81	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=411;ReadPosRankSum=-0.825;SC=GGGCCACCTGCGGACAGGCTC;SOR=2.948;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=16;WE=17582784;WS=17582766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
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chr22	17586609	rs144979983	GT	G	1344.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=19;PP=1277;SC=CCAGCCCGGGGTGGGGGGTGA;SOR=2.376;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=27;TCF=7;TCR=20;TR=26;WE=17586622;WS=17586573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr22	17586614	rs35078252	G	C	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=19;SC=CCGGGGTGGGGGGTGAGACCA;SOR=2.376;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=7;TCR=19;TR=26;WE=17586622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr22	17586631	rs4819959	G	A	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=53;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=11;PP=581;SC=ACCATGGTTTGTCGTGGTGGG;SOR=0.859;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=21;WE=17586639;WS=17586621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr22	17586715	rs56736183	ATCAC	A	1016.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=9;PP=1017;SC=GCCCCGCCGCATCACTCACGC;SOR=1.270;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=11;TCR=10;TR=19;WE=17586726;WS=17586705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr22	17589209	rs879577	C	T	1154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.550;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.241;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=12;PP=986;ReadPosRankSum=-1.883;SC=GGCCTGCCTGCGGCTGACCTG;SOR=1.438;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=71;TCF=48;TCR=23;TR=44;WE=17589217;WS=17589199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,44:0.62:71
chr22	17589567	rs879575	C	T	5273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.437;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=278;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.730;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.634;NF=99;NR=94;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.708;SC=TGAACATGATCCTCCCGGACT;SOR=0.480;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=273;TCF=146;TCR=127;TR=193;WE=17589575;WS=17589557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,194:0.71:274
chr22	17590269	rs4819555	C	T	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.755;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=26;PP=1238;ReadPosRankSum=-1.783;SC=TCTTCCTCCCCGTGGACCCCG;SOR=0.342;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=75;TCF=43;TCR=32;TR=57;WE=17590277;WS=17590259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,57:0.76:75
chr22	17590744	rs1468488	T	C	1660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.705;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=32;PP=1266;ReadPosRankSum=-1.748;SC=AGATCCCAGCTTTGAGAGAGG;SOR=0.406;Source=Platypus;TCF=44;TR=61;WE=17590752;WS=17590734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,62:0.58:106
chr22	17600148	rs9605220	A	G	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=3;PP=580;SC=GGTGCAGAAGAACACCCTGGC;SOR=3.056;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=20;WE=17600156;WS=17600138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr22	17600977	rs5994165	G	A	2476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.919;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.427;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=38;PP=1931;ReadPosRankSum=1.164;SC=CCGTGGTGCCGAAGGGCGCGC;SOR=0.535;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=142;TCF=87;TCR=55;TR=93;WE=17600985;WS=17600967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,94:0.65:144
chr22	17601466	rs75243280	T	C	1722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=50;PP=1488;SC=GGCGCCGACCTCTGCGGCCGG;SOR=6.518;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=51;TCF=1;TCR=50;TR=51;WE=17601474;WS=17601456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr22	17602839	rs5992629	G	A	2879.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=73;NR=21;PP=2399;SC=CCCTGGGGTCGCGAGCCATCT;SOR=2.546;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=94;TCF=73;TCR=21;TR=94;WE=17602847;WS=17602829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr22	17603477	rs5748871	A	G	1041.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=4;PP=923;SC=TTGCAGCGTGATAACACCATG;SOR=3.126;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=17603485;WS=17603467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr22	17623880	rs34058953	G	GC	638.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.103;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.973;NF=16;NR=3;PP=642;ReadPosRankSum=-0.417;SC=TGACTCCAAGGCCCCTTGCTG;SOR=1.085;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=19;WE=17623888;WS=17623870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
chr22	17640045	rs7287672	G	A	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.123;HP=2;HapScore=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=5;PP=216;ReadPosRankSum=-0.038;SC=TAGCACCTGCGGGCGGGGCGG;SOR=0.744;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=21;TCF=10;TCR=11;TR=12;WE=17640053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,12:0.57:21
chr22	17640399	rs148919630	G	GGGC	562.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.838;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.781;NF=0;NR=14;PP=632;ReadPosRankSum=0.883;SC=GGCACGGCCTGGGCGGCGGCG;SOR=1.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=14;WE=17640407;WS=17640389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,15:0.68:22
chr22	17662679	rs41282461	C	T	179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.951;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=1;PP=141;ReadPosRankSum=-0.976;SC=TGGAAGGAGGCGGGGGACCTG;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=8;WE=17662687;WS=17662669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr22	17662699	rs58754958	A	G	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.915;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=193;ReadPosRankSum=-0.181;SC=GGGAGGACACAGGACACTCAC;SOR=1.445;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=20;TCF=18;TCR=2;TR=12;WE=17662707;WS=17662689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,12:0.52:23
chr22	17662793	rs7289170	A	G	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.987;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=9;PP=485;ReadPosRankSum=-0.261;SC=CATAGAAATCATAGGACAAGC;SOR=1.410;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=30;WE=17662801;WS=17662783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr22	17662917	rs3764846	G	C	1106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.280;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=25;PP=849;ReadPosRankSum=0.581;SC=CAGCACCTGCGCAATAGGAGG;SOR=0.732;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=21;TCR=37;TR=39;WE=17662925;WS=17662907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,41:0.68:60
chr22	17669151	rs2231496	C	T	814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=4;PP=690;SC=TAGGCTCTAACCCTGAGGCAT;SOR=3.014;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=25;WE=17669159;WS=17669141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr22	17671133	rs2286348	C	G	1533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=39;PP=1135;ReadPosRankSum=-0.268;SC=TATCAAAGACCCTTGCTGGCT;SOR=0.732;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=84;TCF=24;TCR=60;TR=54;WE=17671141;WS=17671123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,59:0.66:90
chr22	17680306	rs144627322	T	TCCTCCCTCCCCTCCTCTATCCTCTTCC	1122.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=70.17;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr22	17680519	rs17807317	A	C	834.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.972;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.677;NF=8;NR=27;PP=677;ReadPosRankSum=0.156;SC=TGGGATCGCCATTTGAGGTGG;SOR=0.486;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=22;TCR=79;TR=35;WE=17680527;WS=17680509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,35:0.33:107
chr22	17680584	rs35963312	TAGG	T	1376.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.698;NF=2;NR=26;PP=1193;ReadPosRankSum=0.763;SC=GCGACGAACTTAGGAGCCCTG;SOR=0.547;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=44;TCF=3;TCR=41;TR=28;WE=17680594;WS=17680574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,35:0.70:50
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chr22	17690430	rs7289141	C	G	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=14;PP=594;ReadPosRankSum=0.165;SC=GCCGCCCCCCCAGCCGCATCA;SOR=0.551;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=40;TCF=20;TCR=20;TR=29;WE=17690438;WS=17690420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,30:0.73:41
chr22	17956064	.	G	C	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.084;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=28;ReadPosRankSum=-2.211;SC=GATTAGCCTTGGATCTCGCAA;SOR=0.247;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=19;TCR=3;TR=5;WE=17956072;WS=17956054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr22	17956759	rs4819593	C	G	3162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=76;PP=2613;SC=CATTTCTTGCCCCAAGAACTA;SOR=2.448;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=99;TCF=23;TCR=76;TR=99;WE=17956767;WS=17956749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr22	17978600	rs7284169	G	C	923.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.359;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.402;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=38;PP=586;ReadPosRankSum=-1.029;SC=TTCAGTGTTAGGGCATGATAG;SOR=1.957;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=157;TCF=54;TCR=103;TR=46;WE=17978608;WS=17978590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:119,52:0.30:171
chr22	17990852	rs5747211	G	A	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.177;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.006;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=12;PP=684;ReadPosRankSum=-0.186;SC=TAGGGAAAACGTCCACAGCGC;SOR=0.377;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=128;TCF=95;TCR=33;TR=40;WE=17990860;WS=17990842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:92,43:0.32:135
chr22	18004617	rs73389192	G	A	31.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.27;ReadPosRankSum=-0.603;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
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chr22	18018604	rs2300687	A	C	594.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=5.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.771;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=2;PP=456;ReadPosRankSum=-0.543;SC=AATTCTCATTATCTCTCTGTC;SOR=2.407;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=60;TCF=47;TCR=13;TR=22;WE=18018612;WS=18018594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,23:0.36:64
chr22	18022858	rs2268777	G	T	54.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=31;ReadPosRankSum=1.465;SC=GTCTTGCTCTGTCGCCCAGGC;SOR=0.495;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=3;WE=18022866;WS=18022848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr22	18027817	.	CTTT	C	36.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.859;ClippingRankSum=0.000;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.36;ReadPosRankSum=1.497;SOR=0.634;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,8:0.30:27
chr22	18030096	rs66840782	TA	T	368.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.054;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=1.422;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=-0.593;QD=6.96;ReadPosRankSum=0.822;SOR=1.085;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,32:0.60:53
chr22	18032459	rs201209827	GTTTTTTTTTTTTTTT	G	1964.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.218;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=3.874;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQRankSum=1.943;QD=33.30;ReadPosRankSum=0.509;SOR=2.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,53:0.90:59
chr22	18064010	rs140144096	CGT	C	1538.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.906;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=2.914;NF=23;NR=15;PP=1482;ReadPosRankSum=-0.293;SC=AGGCAGCGCGCGTGAGCCTGG;SOR=0.549;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=68;TCF=40;TCR=28;TR=38;WE=18064019;WS=18064000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,42:0.58:73
chr22	18082669	rs5992075	A	G	466.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=394;SC=TCCATCCTGGACAACAGAGTG;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=18082677;WS=18082659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr22	18082708	rs5992076	A	C	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.52;ReadPosRankSum=-0.080;SOR=0.260;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,11:0.34:32
chr22	18084001	rs5747254	T	G	2321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=47;PP=1804;ReadPosRankSum=-0.892;SC=AGTCGGCTCATAACCCACTGT;SOR=0.635;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=24;TCR=48;TR=71;WE=18084009;WS=18083991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chr22	18084033	rs3747023	C	T	1867.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=45;PP=1510;SC=TGGCTCATGCCCAGCTGCCTC;SOR=2.342;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=13;TCR=45;TR=58;WE=18084041;WS=18084023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr22	18095734	rs5992080	C	G	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.393;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=194;ReadPosRankSum=1.924;SC=ATCCTCCTCCCTTGGCCTCCC;SOR=0.038;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=44;TCF=1;TCR=43;TR=13;WE=18095742;WS=18095724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr22	18096199	rs17809319	G	A	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=21;PP=544;ReadPosRankSum=-0.327;SC=ATATAAAACAGAAAATTTATT;SOR=0.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=25;WE=18096207;WS=18096189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,25:0.78:32
chr22	18111431	rs7751	T	C	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.993;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=685;ReadPosRankSum=-0.276;SC=CGGTGAACAGTAGGCTCGAGT;SOR=1.338;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=152;TCF=86;TCR=66;TR=44;WE=18111439;WS=18111421;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,45:0.28:160
chr22	18171650	rs5013026	C	T	454.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.332;NF=14;NR=1;PP=337;ReadPosRankSum=0.924;SC=TCTCCTGCCTCAGCCTCCTGA;SOR=0.582;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=15;WE=18171658;WS=18171640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr22	18178859	rs2257083	C	T	2437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=9;PP=2143;SC=TCTGGAAATACAGAATTTTCC;SOR=4.351;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=71;TCR=9;TR=80;WE=18178867;WS=18178849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr22	18179100	rs12160637	T	C	245.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.222;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=213;ReadPosRankSum=-0.114;SC=CAAATCTATGTTAAGGGGATA;SOR=0.160;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=11;WE=18179108;WS=18179090;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr22	18209613	rs4488761	A	G	1823.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-5.336;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.672;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=37;PP=1432;ReadPosRankSum=-1.335;SC=TGTCACTGTCAGCTAGCCAGA;SOR=0.774;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=123;TCF=61;TCR=62;TR=74;WE=18209621;WS=18209603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,75:0.60:125
chr22	18210073	.	G	A	3721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.186;ClippingRankSum=0.000;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.163;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=81;NR=46;PP=2821;ReadPosRankSum=-0.647;SC=GCTGCTGAGTGAGAAGGAGAT;SOR=1.043;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=198;TCF=121;TCR=77;TR=127;WE=18210081;WS=18210063;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,135:0.65:208
chr22	18210154	.	G	A	5529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.208;ClippingRankSum=0.000;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.561;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=87;PP=2962;ReadPosRankSum=0.735;SC=GCCGCCGTCTGAGGGCAAGTC;SOR=0.428;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=301;TCF=176;TCR=125;TR=201;WE=18210162;WS=18210144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,209:0.67:311
chr22	18218441	rs4819624	A	C	403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=317;ReadPosRankSum=1.416;SC=CAGTAGAGCAAAGCTGGGGTT;SOR=0.906;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=17;WE=18218449;WS=18218431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,17:0.36:47
chr22	18218464	rs181382	T	C	1217.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=29;PP=651;SC=TGCAAAAACATGTTCTCCAGA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=18218483;WS=18218454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr22	18218475	rs181383	C	G	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=22;PP=599;SC=GTTCTCCAGACCCCTGAAGTC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=18218483;WS=18218454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr22	18222263	rs181390	A	G	1981.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.950;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=50;PP=1423;ReadPosRankSum=0.067;SC=ATCTGTGTTCAGGCAGGGGCG;SOR=1.331;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=105;TCF=44;TCR=61;TR=78;WE=18222271;WS=18222253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,80:0.74:108
chr22	18222350	rs4819464	G	A	288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=207;ReadPosRankSum=1.805;SC=GGACAGGTCCGCGATGGGACA;SOR=0.776;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=12;WE=18222358;WS=18222340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr22	18222868	rs147461488	GGCCACGCTCAACT	G	1019.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.699;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.069;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=5;PP=2933;ReadPosRankSum=0.874;SC=GCTCCATGAAGGCCACGCTCA;SOR=1.411;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=73;TCF=48;TCR=25;TR=20;WE=18222888;WS=18222858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,29:0.35:83
chr22	18233000	rs181405	G	A	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.805;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.478;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=23;PP=690;ReadPosRankSum=0.106;SC=AGGACCCCTCGGGAGGACGAC;SOR=1.442;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=60;TCF=26;TCR=34;TR=35;WE=18233008;WS=18232990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,38:0.56:68
chr22	18257138	rs443912	T	G	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.840;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.258;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=264;ReadPosRankSum=-0.079;SC=GGGGCGCGGGTGCACTCACCA;SOR=0.469;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=37;TCF=23;TCR=14;TR=17;WE=18257146;WS=18257128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,17:0.43:40
chr22	18291791	rs423710	C	G	735.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.035;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=531;ReadPosRankSum=-0.744;SC=AGGGGAAACACAGGAGTTGCC;SOR=0.531;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=79;TCF=15;TCR=64;TR=27;WE=18291799;WS=18291781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,30:0.36:83
chr22	18293502	rs61739631	C	T	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.593;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=483;ReadPosRankSum=-0.760;SC=GCTCCTCCTGCTTGGCCTGTC;SOR=0.578;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=79;TCF=52;TCR=27;TR=26;WE=18293510;WS=18293492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,27:0.33:82
chr22	18293650	rs436590	A	G	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.820;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=11;PP=253;ReadPosRankSum=-1.473;SC=CAGCAGGCCAACAGGGGCCTG;SOR=0.237;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=47;TCF=7;TCR=40;TR=14;WE=18293658;WS=18293640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,14:0.30:46
chr22	18325378	rs2895998	G	C	1553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=2.822;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.529;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=25;PP=1104;ReadPosRankSum=0.620;SC=CCGCAGCACCGCTGCTCAGAG;SOR=1.066;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=171;TCF=91;TCR=80;TR=63;WE=18325386;WS=18325368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:117,68:0.37:185
chr22	18325541	rs61626259	T	C	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=15;PP=322;ReadPosRankSum=-0.271;SC=TCGTCGGCGATCTTGGCCGGA;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=50;TCF=5;TCR=45;TR=17;WE=18325549;WS=18325531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,17:0.33:52
chr22	18369783	rs202048445	G	A	256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.373;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.38;MQRankSum=-3.811;QD=11.16;ReadPosRankSum=1.553;SOR=0.275;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr22	18369788	rs199528893	T	A	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.95;MQRankSum=-4.108;QD=8.16;ReadPosRankSum=1.882;SOR=0.188;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chr22	18369797	.	G	A	211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.703;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.12;MQRankSum=-4.824;QD=5.43;ReadPosRankSum=-0.904;SOR=0.099;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,9:0.23:39
chr22	18369802	.	G	A	202.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.980;ClippingRankSum=0.000;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.96;MQRankSum=-5.577;QD=4.61;ReadPosRankSum=-2.678;SOR=0.074;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,9:0.20:44
chr22	18370066	rs4819472	C	A	3471.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=51;PP=2778;SC=CTTTGCAGCCCATCAAGAGAC;SOR=0.750;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=101;TCF=50;TCR=51;TR=101;WE=18370074;WS=18370056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr22	18463608	rs8140977	C	T	1732.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=4;PP=1450;ReadPosRankSum=-0.906;SC=TGTGCTGGCCCGTCACCCTCA;SOR=2.910;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=49;TCR=4;TR=51;WE=18463616;WS=18463598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,54:0.98:55
chr22	18463747	rs5992941	T	C	3711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=66;PP=2795;SC=ATTGGTCCCCTCCAGACACTG;SOR=1.046;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=117;TCF=51;TCR=66;TR=117;WE=18463755;WS=18463737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr22	18562888	rs464541	C	T	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=748;SC=CCCTCCAGATCGGATTCTTTC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=18562896;WS=18562878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr22	18571008	rs464385	G	A	524.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.435;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=364;ReadPosRankSum=-1.787;SC=ACCCTACTTCGGCTGGTCGCG;SOR=0.250;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=65;TCF=15;TCR=50;TR=22;WE=18571016;WS=18570998;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,24:0.35:69
chr22	18775018	.	C	T	73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.41;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=43.29;NF=2;NR=0;PP=73;QD=53.8856062736;SC=TCTGCACCCACGCCCCAAGTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=2;WE=18775040;WS=18775008;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,2:0.12:16
chr22	18894001	rs200505686	CGCGGGCGGG	C	2840.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.336;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=2.619;NF=26;NR=23;PP=2973;ReadPosRankSum=2.516;SC=TGCCCAGGTACGCGGGCGGGG;SOR=1.011;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=106;TCF=53;TCR=53;TR=49;WE=18894017;WS=18893991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,74:0.60:123
chr22	18896087	rs73155293	T	C	1048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.313;NF=37;NR=0;PP=899;ReadPosRankSum=-1.065;SC=TAATCCCAAGTGCATGGCTCA;SOR=2.078;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=37;WE=18896095;WS=18896077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,36:0.73:49
chr22	18896169	rs426065	C	T	749.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.986;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FS=1.035;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.78;MQRankSum=1.404;QD=7.07;ReadPosRankSum=-0.524;SOR=0.840;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,32:0.30:106
chr22	18896189	rs425576	T	C	959.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=41.07;MQRankSum=0.720;QD=6.95;ReadPosRankSum=-1.096;SOR=0.727;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:98,40:0.29:138
chr22	18897416	rs436638	C	T	246.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=3;PP=206;SC=CCCGCCTGCCCCCTCCAGCTG;SOR=1.179;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=5;TCR=3;TR=8;WE=18897424;WS=18897406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr22	18898289	rs441862	G	C	1290.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.464;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=951;ReadPosRankSum=1.455;SC=GGAGAGGCCTGGGTGTGGTGA;SOR=0.366;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=68;TCF=44;TCR=24;TR=49;WE=18898297;WS=18898279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,49:0.73:67
chr22	18898523	rs41277586	C	T	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.526;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.519;NF=14;NR=15;PP=463;ReadPosRankSum=-1.831;SC=CTGGCTTCTACGTGACCACCA;SOR=0.328;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=100;TCF=37;TCR=63;TR=29;WE=18898531;WS=18898513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,29:0.29:99
chr22	18898874	.	G	A	344	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=30;MQ=55.53;NF=0;NR=12;PP=344;QD=31.5642677123;SC=TGGGGGCAGAGGCTCAGATTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=12;WE=18898882;WS=18898864;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,12:0.57:21
chr22	18898908	.	A	G	110	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MMLQ=29;MQ=55.96;NF=0;NR=7;PP=110;QD=20.6816017925;SC=TGGGGGCAGAAGCTCAGATTC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=7;WE=18898916;WS=18898898;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:14,7:0.33:21
chr22	18899016	rs428224	G	A	595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=9;PP=448;SC=GGGCCTGGGGGTCACTCTGGC;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=11;TCR=9;TR=20;WE=18899024;WS=18899006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr22	18900669	rs383964	A	G	860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=2;PP=722;SC=GCTGGAGGCTAAGGGTGTGCT;SOR=4.255;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=18900677;WS=18900659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr22	18900750	rs372055	G	A	276.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.561;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.245;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.650;NF=10;NR=4;PP=193;ReadPosRankSum=-0.598;SC=AGCCACAGCAGCTGCCGCTCC;SOR=0.094;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=54;TCF=45;TCR=9;TR=14;WE=18900758;WS=18900740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,14:0.27:52
chr22	18901004	rs450046	C	T	4502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=92;PP=2965;SC=AAAGTACACCCGGTGGTCAGC;SOR=1.659;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=140;TCF=47;TCR=93;TR=139;WE=18901012;WS=18900994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr22	18901090	rs385440	A	G	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=36;PP=1057;SC=CACTGTCCCCAGTGCAGGGAT;SOR=5.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=37;WE=18901098;WS=18901080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr22	18904414	rs455072	A	G	1071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.70;QD=29.77;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr22	18904606	rs375115	T	G	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=14;PP=369;SC=GATCCATCCATTGAGCTGGCT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=18904614;WS=18904596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr22	18905978	rs16983466	G	A	542.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.895;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.408;NF=6;NR=15;PP=436;ReadPosRankSum=0.164;SC=CCAGCTCCACGTCCAGGGTCA;SOR=1.469;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=28;TCF=9;TCR=19;TR=21;WE=18905986;WS=18905968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr22	18907405	rs9618419	G	T	622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=16;PP=451;SC=CCAGCCCACAGGAACCCTCTC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=18907413;WS=18907395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr22	18908875	rs1808320	A	G	124.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;MQ=51.58;NF=2;NR=3;PP=84;SC=GGGACTACCAAGTGCTTGGAC;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=5;WE=18908883;WS=18908865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr22	18910284	rs5844366	AC	A	1236.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=43;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=2;PP=1417;SC=CACGGTGCCCACCCCCTCACA;SOR=5.084;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=39;WE=18910292;WS=18910274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr22	18910301	rs2008904	A	G	2227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.09;QD=45.46;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr22	18910307	rs2008903	G	A	2264.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.14;QD=43.55;SOR=5.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr22	18910450	rs3216765	CA	C	4172.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.09;NF=32;NR=69;PP=2973;SC=ACTGCAGCTGCAAACGCAGGC;SOR=1.131;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=108;TCF=35;TCR=73;TR=101;WE=18910458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr22	18910545	rs2277834	C	T	3310.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=68;NR=32;PP=2813;SC=GGCATGGGCACCTGTGTTTTT;SOR=1.586;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=102;TCF=69;TCR=33;TR=100;WE=18910553;WS=18910535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr22	18910756	rs2008878	C	G	2430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=64;PP=2013;SC=GCGCAGGGTGCGACAGGGAGG;SOR=3.640;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=75;TCF=10;TCR=65;TR=74;WE=18910764;WS=18910746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr22	18910825	rs201928442	TC	T	726.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=671;SC=GCCCATGAAGTCCTTGCACAT;SOR=4.294;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=17;WE=18910836;WS=18910815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr22	18910828	rs1807172	T	G	735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=445;SC=CATGAAGTCCTTGCACATGGC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=18910836;WS=18910815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr22	18912678	rs4819756	A	G	5426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=70;NR=99;PP=2965;SC=CCGAAGGCCCAGTGGGCCTGG;SOR=1.141;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=169;TCF=70;TCR=99;TR=169;WE=18912686;WS=18912668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr22	18918760	rs67625420	T	C	2135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=53;PP=1736;SC=AACTCTCCTTTCCCAGCAAGG;SOR=3.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=6;TCR=53;TR=59;WE=18918768;WS=18918750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr22	18923524	rs3815653	G	A	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=1;PP=50;SC=TGCACCCCGCGCACCTGCTCG;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=18923532;WS=18923522;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr22	18923585	rs1808323	C	G	128.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=2;PP=89;SC=CCAGCAGGCTCCGCGCCAGCT;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=18923593;WS=18923575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr22	18923848	.	TCCCGC	T	43	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9990;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MMLQ=18;MQ=60.0;NF=1;NR=0;PP=43;QD=52.0;SC=GCGCTGTTGGTCCCGCCCCGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=1;WE=18923860;WS=18923838;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,1:0.33:3
chr22	19026613	rs2072123	A	G	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=14;PP=479;ReadPosRankSum=2.497;SC=GCTGACCTCCACAGGCTCAAA;SOR=0.703;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=26;WE=19026621;WS=19026603;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,26:0.67:39
chr22	19028476	rs2073775	T	C	3028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FS=15.272;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.04;ReadPosRankSum=1.083;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,74:0.66:112
chr22	19028480	rs2073774	T	C	3046.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.673;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=13.813;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.27;ReadPosRankSum=0.702;SOR=2.630;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,77:0.66:116
chr22	19034079	rs715539	A	T	562.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=419;ReadPosRankSum=-0.287;SC=GGGTGGCAAGAGTAGACACTC;SOR=1.230;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=20;WE=19034087;WS=19034069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr22	19034240	rs2012929	A	G	1024.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-2.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=27;PP=745;ReadPosRankSum=-1.244;SC=GCCACAGGGCAGGCAGAGCAG;SOR=0.758;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=39;WE=19034248;WS=19034230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,41:0.71:58
chr22	19036232	rs17743444	A	G	602.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.093;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=480;ReadPosRankSum=-0.208;SC=CCACACTGCCAAAAAAGGTAG;SOR=1.402;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=22;WE=19036240;WS=19036222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,22:0.63:35
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chr22	19048449	rs2238740	G	A	2236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.242;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=36;PP=1655;ReadPosRankSum=-0.029;SC=TATGTACCATGGTATCACTCA;SOR=0.646;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=75;TCR=56;TR=83;WE=19048457;WS=19048439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,86:0.64:135
chr22	19050599	rs111427599	T	TCCATGTC	2514.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.780;NF=38;NR=1;PP=2393;ReadPosRankSum=-0.820;SC=GCTCACCCACTCCCTGCACAG;SOR=0.839;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=78;TCF=74;TCR=4;TR=39;WE=19050607;WS=19050589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,56:0.64:88
chr22	19050635	rs5993488	G	A	3023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.927;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.930;NF=86;NR=18;PP=2387;ReadPosRankSum=-0.365;SC=GGCAGCACTGGGTAAGAGGGA;SOR=0.523;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=145;TCF=122;TCR=23;TR=104;WE=19050643;WS=19050625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,107:0.70:152
chr22	19050878	rs9617765	A	G	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.416;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.708;NF=0;NR=30;PP=717;ReadPosRankSum=-0.259;SC=TTTTTGAGACAGAGTCTCGCT;SOR=2.660;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=30;WE=19050886;WS=19050868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,30:0.64:47
chr22	19076797	rs73158837	C	A	4145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=258;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.118;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=111;NR=43;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.202;SC=ACAGCACACACCTCCACCCCT;SOR=0.596;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=245;TCF=178;TCR=67;TR=154;WE=19076805;WS=19076787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,161:0.63:254
chr22	19077049	rs2800960	C	T	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=31;PP=1048;SC=TGGCAGTAGGCCAGCAAACCA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=31;WE=19077057;WS=19077039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr22	19109609	rs62223868	A	C	402.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.167;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=333;ReadPosRankSum=-1.016;SC=CTCGCCGCCCAGCCCCCACAC;SOR=0.527;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=26;TCR=3;TR=17;WE=19109617;WS=19109599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr22	19109747	.	G	GGCTGCGTGACCCC	2964	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=59.19;NF=3;NR=7;PP=2964;QD=20;SC=TCCCCGGGGCGGCTGGAAGGC;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=37;TCF=11;TCR=26;TR=10;WE=19109772;WS=19109737;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:27,10:0.27:37
chr22	19109751	.	G	GCGT	1272.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=2.522;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.68;MQRankSum=-1.593;QD=25.45;ReadPosRankSum=-0.280;SOR=0.356;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,31:0.62:50
chr22	19109753	.	A	G	1417	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MMLQ=24;MQ=58.74;NF=4;NR=13;PP=1417;QD=85.3983066204;SC=GGGCGGCTGGAAGGCCGGACC;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=35;TCF=11;TCR=24;TR=17;WE=19109772;WS=19109737;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:18,17:0.49:35
chr22	19109753	.	A	ACCCCGCTGGG	1314.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.377;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQRankSum=-1.621;QD=26.83;ReadPosRankSum=-0.298;SOR=0.593;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,30:0.61:49
chr22	19109764	rs11550626	A	G	799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-2.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.748;NF=4;NR=16;PP=1534;ReadPosRankSum=0.785;SC=AGGCCGGACCAGGCCGGACTG;SOR=0.906;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=20;WE=19109772;WS=19109737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,22:0.58:38
chr22	19109812	rs11550627	A	G	400.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=59;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=294;ReadPosRankSum=-0.712;SC=GGTCAGGCGGAGCTGAACCTG;SOR=1.270;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=15;WE=19109820;WS=19109802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr22	19118701	rs3747050	T	C	3242.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.947;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=49;PP=2531;ReadPosRankSum=-0.467;SC=GACCCTGTTCTCCCTCAGCCC;SOR=0.672;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=95;TCR=72;TR=113;WE=19118709;WS=19118691;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,118:0.69:171
chr22	19119545	rs45604134	C	T	2876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.199;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.018;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.97;MQRankSum=1.401;NF=53;NR=45;PP=2272;ReadPosRankSum=0.322;SC=TCATGGTCTGCGGCTCCATGC;SOR=0.621;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=150;TCF=76;TCR=74;TR=98;WE=19119553;WS=19119535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,102:0.66:155
chr22	19119686	rs1052756	C	T	4224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-5.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.016;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=72;PP=2962;ReadPosRankSum=0.284;SC=CCGACGTCAGCCAGCGGCTCC;SOR=0.504;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=235;TCF=130;TCR=105;TR=152;WE=19119694;WS=19119676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:85,159:0.65:244
chr22	19119751	rs1052763	C	T	4470.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.099;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.023;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=87;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.137;SC=CCCAAAGCCACGTCTTCTGCC;SOR=0.747;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=252;TCF=124;TCR=128;TR=159;WE=19119759;WS=19119741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,167:0.64:262
chr22	19119938	rs1052773	G	A	4873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.695;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.467;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=99;PP=2962;ReadPosRankSum=0.354;SC=AGACCTCCAGGGCCAAAGACC;SOR=0.661;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=266;TCF=113;TCR=153;TR=173;WE=19119946;WS=19119928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,177:0.65:271
chr22	19122498	rs2240110	C	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=90;ReadPosRankSum=-0.065;SC=TGCCTCCACACGGTCAGGGCA;SOR=0.323;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=7;WE=19122506;WS=19122488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr22	19122665	rs2240111	C	T	1334.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.291;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=30;PP=984;ReadPosRankSum=0.385;SC=GACCCAGCCGCTCCCTGCGGC;SOR=1.175;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=67;TCF=25;TCR=42;TR=46;WE=19122673;WS=19122655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,51:0.71:72
chr22	19125136	rs3765612	G	A	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.371;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=493;ReadPosRankSum=-0.024;SC=GCTCCCAGCAGGCCCGAGGCA;SOR=3.300;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=20;WE=19125144;WS=19125126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,22:0.71:31
chr22	19126631	rs2298273	T	C	573.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=443;ReadPosRankSum=-1.765;SC=GGCAGCCCTGTCCAACCTGGC;SOR=2.925;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=19;WE=19126639;WS=19126621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr22	19132061	rs2298274	C	T	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.467;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=32;PP=756;ReadPosRankSum=0.990;SC=GCTTGCTCGTCGCAGCCCCAG;SOR=0.530;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=137;TCF=45;TCR=92;TR=50;WE=19132069;WS=19132051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,52:0.37:141
chr22	19137658	rs34341950	G	A	103.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=2;PP=51;SC=GGGCTCTGGCGACCGGCGGGC;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=19137666;WS=19137648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr22	19163577	rs35359423	C	CAT	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=477;SC=GCACTGGAATCGTGAGACAAA;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=9;WE=19163585;WS=19163567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr22	19172006	rs1018764	T	C	3293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=47;PP=2381;SC=TCTCCCCCGCTGGCATGCTGC;SOR=1.035;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=112;TCF=65;TCR=47;TR=112;WE=19172014;WS=19171996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chr22	19184095	rs1061325	T	C	2964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=19;NR=80;PP=2173;SC=TCAGTGAACATGCCCATGTGG;SOR=2.942;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=99;TCF=19;TCR=80;TR=99;WE=19184103;WS=19184085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr22	19187375	rs9605957	G	A	1916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=48;PP=1534;SC=GGGCAAGCGTGAGGGTCCCCA;SOR=2.760;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=60;TCF=11;TCR=49;TR=59;WE=19187383;WS=19187365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr22	19187427	rs2236759	C	G	962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=29;PP=873;SC=ACAAGGCACACAGTTGCAAAT;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=19187435;WS=19187417;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr22	19189003	rs11386977	A	AC	4096.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=59;PP=2936;SC=GCGGTCTCCAACTACGGATAA;SOR=0.846;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=93;TCF=33;TCR=60;TR=92;WE=19189011;WS=19188993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr22	19197896	rs698423	T	C	3800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=72;PP=2855;SC=CCTCATACAGTGCGCTGCTGA;SOR=1.005;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=126;TCF=54;TCR=72;TR=126;WE=19197904;WS=19197886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chr22	19211665	rs9604935	C	T	868.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=26;PP=740;SC=GATGACCCTGCTCCACTCTCC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=19211673;WS=19211655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr22	19217613	rs2800963	C	T	711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.63;QD=41.87;SOR=5.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr22	19217617	rs113338080	C	T	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.72;QD=45.98;SOR=5.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr22	19217621	rs9306213	G	T	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.83;QD=40.14;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr22	19220648	rs807458	G	T	1542.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=0;PP=1269;SC=TCAACCACACGTGAGTAATCT;SOR=7.658;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=43;TCR=0;TR=43;WE=19220656;WS=19220638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr22	19318622	rs1210690	T	C	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=323;SC=AGCAGCATGGTGCCTGCAGCA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=19318630;WS=19318612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr22	19344404	rs199687182	GC	G	600.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.356;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.176;NF=17;NR=2;PP=662;ReadPosRankSum=-0.728;SC=CCCTGTGCCTGCCTCTCACCA;SOR=0.760;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=44;TCF=39;TCR=5;TR=19;WE=19344412;WS=19344394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,21:0.44:48
chr22	19349590	rs916594	G	C	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=407;SC=TGCCTCAAAAGTAAAGGAGAA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=19349598;WS=19349580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr22	19419093	rs8140291	A	G	1413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=45;PP=1220;SC=CTCCCGCGCCACCCGCCCTCC;SOR=7.614;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=45;WE=19419101;WS=19419083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr22	19455376	rs5746742	C	T	920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=4;PP=853;SC=AGAAGAACTCCGCTTATTTGA;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=25;TCR=4;TR=29;WE=19455384;WS=19455366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr22	19455836	rs756658	A	G	1625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=34;PP=1323;SC=ATAGTCACTCACTGTACTTCC;SOR=1.791;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=16;TCR=34;TR=50;WE=19455844;WS=19455826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr22	19455871	rs756657	A	C	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=26;PP=756;SC=GCAAATTATAAGGCCCTGCGT;SOR=2.649;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=6;TCR=26;TR=32;WE=19455879;WS=19455861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr22	19458224	rs5993648	C	T	163.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=2;PP=120;SC=TTTGGCCTTCCGAAGTGCTGG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=19458232;WS=19458214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	19462466	rs5746744	C	G	144.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=2;PP=114;SC=ATGCCCTCCACGGACAATTCA;SOR=1.022;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=5;TCF=3;TCR=2;TR=5;WE=19462474;WS=19462456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr22	19467652	rs5748232	T	C	4946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=98;NR=61;PP=2965;SC=CGGGTCGCCGTGTTCAGCCGG;SOR=1.214;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=159;TCF=98;TCR=61;TR=159;WE=19467660;WS=19467642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,163:1.00:163
chr22	19468655	rs5993650	C	T	792.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=23;PP=643;SC=ATAGATTAAGCGTGTATTTAA;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=23;WE=19468663;WS=19468645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr22	19470493	.	CT	C	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.138;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=2.948;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.20;ReadPosRankSum=0.045;SOR=0.157;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr22	19471609	rs737858	A	G	2015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=54;PP=1647;SC=CTGCCAGGCCAAGGTGTACTG;SOR=5.318;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=3;TCR=55;TR=57;WE=19471617;WS=19471599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr22	19492692	rs8136840	C	G	319.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=1;PP=234;SC=CACACCCCCCCGCTCCATCCA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=19492700;WS=19492689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	19495967	rs2073736	G	A	957.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=1;PP=835;SC=GGGCCTGTGAGGGACATTAGC;SOR=5.353;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=29;WE=19495975;WS=19495957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr22	19504318	rs2073733	G	A	6229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=120;NR=78;PP=2965;SC=CCTGGCCCCCGACATGTCTTG;SOR=1.139;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=198;TCF=120;TCR=78;TR=198;WE=19504326;WS=19504308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr22	19504470	rs2073732	T	C	6833.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=71;NR=132;PP=2965;SC=TTTGAGGCTATTGCAGGCCCT;SOR=1.456;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=71;TCR=132;TR=203;WE=19504478;WS=19504460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,209:1.00:209
chr22	19506456	rs2073760	G	T	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=26;PP=856;SC=GTTCTGCAGGGGTGGCTGCAG;SOR=2.038;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=10;TCR=26;TR=36;WE=19506464;WS=19506446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr22	19511925	rs885985	G	A	2929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=59;PP=2282;SC=CGCACCTCCTGGGTCTGCCAG;SOR=1.485;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=92;TCF=33;TCR=59;TR=92;WE=19511933;WS=19511915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr22	19747082	rs737868	G	C	468.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.594;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=3;PP=345;ReadPosRankSum=1.343;SC=TGGTTGCAGCGGAGGCGGCGG;SOR=0.155;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=57;TCF=52;TCR=5;TR=20;WE=19747090;WS=19747072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr22	19750773	rs41298814	T	C	5107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=72;PP=2965;SC=GGCGGATGTTTCCCACCTTCC;SOR=0.957;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=164;TCF=91;TCR=73;TR=162;WE=19750781;WS=19750763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr22	19752007	rs41298826	T	C	1313.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=39;PP=1134;SC=CCTGCGAGGCTAGAGGCTGAG;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=0;TCR=39;TR=39;WE=19752015;WS=19751997;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr22	19753449	rs41298840	A	G	1778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=53;PP=1560;SC=GGCCCGGCGCACTGCCGCTCA;SOR=4.029;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=5;TCR=53;TR=58;WE=19753457;WS=19753439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr22	19753848	rs72646966	A	G	157.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=3;PP=122;SC=AGGGCCTCGCATGGGGCGTCG;SOR=0.693;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=19753856;WS=19753838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	19754091	rs72646967	A	C	877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=5;PP=690;SC=CAGTCCCCCGAACCCCGAGCT;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=23;TCR=5;TR=28;WE=19754099;WS=19754081;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr22	19776019	rs2073768	G	A	2001.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.713;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=9;PP=1591;ReadPosRankSum=0.169;SC=GGCCTCGGACGGCCAGGGCTC;SOR=0.065;SbPval=0.25;Source=Platypus;TC=98;TCF=89;TCR=9;TR=73;WE=19776027;WS=19776009;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,73:0.75:97
chr22	19776159	rs3214094	T	TG	3876.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.504;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.667;NF=24;NR=69;PP=2933;ReadPosRankSum=1.056;SC=CCTTGAGGTTTCAGGCCAAGG;SOR=1.154;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=139;TCF=41;TCR=98;TR=93;WE=19776167;WS=19776149;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,108:0.70:154
chr22	19789541	rs2073770	A	C	1049.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.476;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=2;PP=828;ReadPosRankSum=0.258;SC=GCCTGCTGCCAGTCCAGGCTC;SOR=2.278;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=65;TCF=58;TCR=7;TR=37;WE=19789549;WS=19789531;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,38:0.57:67
chr22	19794366	rs737860	C	A	1692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=41;PP=1367;SC=GCGATTAGCCCGGGCTGCTGT;SOR=4.450;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=4;TCR=41;TR=45;WE=19794374;WS=19794356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr22	19867771	rs1139795	C	T	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.93;ReadPosRankSum=0.654;SOR=0.762;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:79,27:0.25:106
chr22	19867914	rs13054713	C	A	394.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.528;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FS=0.989;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.11;ReadPosRankSum=1.736;SOR=0.543;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:75,21:0.22:96
chr22	19868218	rs1139793	A	G	3240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=81;PP=2508;SC=CATGATCGCTATGGGTGTCAG;SOR=2.562;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=21;TCR=81;TR=102;WE=19868226;WS=19868208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chr22	19868255	rs34827823	AG	A	431.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.188;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.464;NF=0;NR=20;PP=425;ReadPosRankSum=0.880;SC=GGGAAGGCACAGGGGGGCCAC;SOR=0.214;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=70;TCF=2;TCR=68;TR=20;WE=19868263;WS=19868245;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,21:0.33:64
chr22	19871097	rs13057374	C	G	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-3.251;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.764;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=166;ReadPosRankSum=0.461;SC=GCAGTGGCTCCTGCCTGTAAT;SOR=2.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=10;WE=19871105;WS=19871087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,10:0.36:28
chr22	19882630	rs5993856	G	A	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=3.560;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=0.611;QD=5.38;ReadPosRankSum=0.633;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,36:0.26:138
chr22	19882984	rs5992495	T	G	1561.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.579;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=35;PP=1257;ReadPosRankSum=-1.630;SC=CCGGTGGTGCTGTCCTCCCAG;SOR=0.713;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=164;TCF=80;TCR=84;TR=69;WE=19882992;WS=19882974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,70:0.42:166
chr22	19885548	rs12169091	G	T	606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.633;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=7;PP=445;ReadPosRankSum=-0.566;SC=GGGAGCTGGGGCCTCCAGCAC;SOR=0.327;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=72;TCF=58;TCR=14;TR=29;WE=19885556;WS=19885538;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,29:0.40:72
chr22	19886797	rs8142006	G	A	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.522;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.899;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=19;PP=406;ReadPosRankSum=-1.726;SC=AAATCGCCTGGTGGTGAAGGG;SOR=3.198;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=19;WE=19886805;WS=19886787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr22	19898659	rs149796774	GC	G	83.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=99;ReadPosRankSum=-0.916;SC=TCACTATATTGCCCAGGCTGA;SOR=0.148;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=5;WE=19898667;WS=19898656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr22	19898837	rs885987	A	G	762.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.835;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=17;PP=519;ReadPosRankSum=-1.184;SC=CACAGGCTCTAAGGGTCCAGT;SOR=0.499;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=81;TCF=33;TCR=48;TR=31;WE=19898845;WS=19898827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,33:0.40:83
chr22	19905802	rs756661	G	A	340.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=12;PP=286;ReadPosRankSum=-0.173;SC=AGGGCCTCACGATGGACTATT;SOR=0.593;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=47;TCF=12;TCR=35;TR=16;WE=19905810;WS=19905792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,15:0.33:46
chr22	19906306	rs3747067	C	G	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=1.756;SC=GAGGGCTCATCGAGGATAAGC;SOR=0.412;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=4;WE=19906314;WS=19906296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr22	19906511	rs11541479	G	A	465.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.710;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=374;ReadPosRankSum=0.824;SC=AGGTGCCGCCGAGGCCCCACC;SOR=1.500;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=59;TCF=13;TCR=46;TR=22;WE=19906519;WS=19906501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,21:0.36:58
chr22	19907118	rs5748470	G	A	727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=23;PP=584;ReadPosRankSum=2.339;SC=TTCCCAGCTGGGCGGCTGGAA;SOR=0.673;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=100;TCF=34;TCR=66;TR=34;WE=19907126;WS=19907108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,33:0.33:99
chr22	19907192	rs5748471	A	G	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.13;ReadPosRankSum=-0.582;SOR=0.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,16:0.24:66
chr22	19921003	rs5746847	T	C	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.394;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=187;ReadPosRankSum=0.265;SC=GCAGGGCCCTTGTTAGGTCAT;SOR=0.396;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=10;TCR=49;TR=17;WE=19921011;WS=19920993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,20:0.31:65
chr22	19950235	rs4633	C	T	2148.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.176;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=34;PP=1626;ReadPosRankSum=-1.259;SC=TCCTGAACCACGTGCTGCAGC;SOR=0.845;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=133;TCF=69;TCR=64;TR=79;WE=19950243;WS=19950225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,84:0.60:140
chr22	19950428	rs2239393	A	G	229.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=11;PP=178;ReadPosRankSum=-2.413;SC=TTATCACCCCATTTCCAGGGG;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=11;WE=19950436;WS=19950418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,11:0.29:38
chr22	19951207	rs4818	C	G	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FS=2.484;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.14;ReadPosRankSum=0.201;SOR=0.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,37:0.24:152
chr22	19951271	rs4680	G	A	2872.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.386;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=59;PP=2139;ReadPosRankSum=-0.459;SC=TTTCGCTGGCGTGAAGGACAA;SOR=0.854;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=149;TCF=66;TCR=83;TR=104;WE=19951279;WS=19951261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,109:0.70:156
chr22	19954916	rs61143203	AT	A	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=1.139;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.40;ReadPosRankSum=0.540;SOR=0.951;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,19:0.18:104
chr22	19956262	rs362204	G	GC	1447.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=41;PP=1326;SC=GGCCCTGACTGCCCCCCCGGC;SOR=4.047;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=51;TCF=4;TCR=47;TR=44;WE=19956270;WS=19956252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr22	19958669	rs165849	G	A	9159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=242;NR=32;PP=2965;SC=TGCAGGCAGCGGAGACTAACA;SOR=3.993;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=275;TCF=243;TCR=32;TR=274;WE=19958677;WS=19958659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,280:1.00:280
chr22	19959366	rs165824	G	A	1989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=51;NR=9;PP=1531;SC=CCCTAGACACGGGGCCTCACC;SOR=3.442;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=51;TCR=9;TR=60;WE=19959374;WS=19959356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr22	19959473	rs165815	C	T	5329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.085;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=80;PP=2965;ReadPosRankSum=1.653;SC=CCGCTCCCTCCGGTCCACCGT;SOR=0.297;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=170;TCF=89;TCR=81;TR=168;WE=19959481;WS=19959463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,174:0.99:175
chr22	19959955	rs2073744	A	G	4681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=126;PP=2965;SC=GGAGGAGGAGACGGGCTGCAT;SOR=5.640;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=132;TCF=6;TCR=126;TR=132;WE=19959963;WS=19959945;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr22	19960029	.	GCTCT	G	1164.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.436;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.667;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.509;NF=2;NR=25;PP=1279;ReadPosRankSum=0.124;SC=AGCCCTAGAGGCTCTCTGTCA;SOR=0.167;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=27;WE=19960040;WS=19960019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,31:0.66:47
chr22	19960184	rs71313931	C	G	835.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=2.551;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.89;ReadPosRankSum=-0.162;SOR=0.216;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,30:0.75:40
chr22	19960188	rs2518823	T	C	1653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=2;PP=647;SC=CTCCTTCACCTTCACCCAAGG;SOR=4.461;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=38;WE=19960206;WS=19960174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr22	19960198	rs71313932	G	C	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=2.521;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.95;ReadPosRankSum=-0.486;SOR=0.229;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,36:0.75:48
chr22	19964418	rs2240718	T	G	2013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=43;PP=1600;SC=CCACCAGGGGTACAAGAAGAG;SOR=1.926;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=18;TCR=43;TR=61;WE=19964426;WS=19964408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr22	19968971	rs2073748	G	A	1429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-0.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=27;PP=1154;ReadPosRankSum=0.296;SC=ACCAGGGCCTGGGCCAAGGGG;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=73;TCF=33;TCR=40;TR=49;WE=19968979;WS=19968961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,50:0.68:74
chr22	19969075	rs2073747	A	G	3503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=49;PP=2850;SC=AGCCACCCCCACTGCTGAGGT;SOR=1.034;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=116;TCF=67;TCR=49;TR=116;WE=19969083;WS=19969065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr22	19969106	rs2240717	A	G	2009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.345;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.605;HP=3;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=46;PP=1565;ReadPosRankSum=-0.211;SC=GAGTGTGGCCACTGGGCCACC;SOR=0.725;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=131;TCF=66;TCR=65;TR=78;WE=19969114;WS=19969096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,81:0.60:135
chr22	19969400	rs9606202	G	A	861.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.432;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.911;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=9;PP=670;ReadPosRankSum=-2.324;SC=CTGCAGGTGGGACAGCTGCAG;SOR=0.852;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=80;TCF=54;TCR=26;TR=32;WE=19969408;WS=19969390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,33:0.41:80
chr22	19974583	rs7284393	A	G	1291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.602;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=31;PP=866;ReadPosRankSum=0.015;SC=CCCCAAGCCAACTTCCCTCCA;SOR=1.584;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=78;TCF=29;TCR=49;TR=45;WE=19974591;WS=19974573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,49:0.58:85
chr22	19974654	rs7292055	G	A	652.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.649;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.748;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=20;PP=472;ReadPosRankSum=0.402;SC=AGCAGCGGGGGAGGCGGTGGC;SOR=2.093;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=41;TCF=12;TCR=29;TR=25;WE=19974662;WS=19974644;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr22	19978022	rs4819527	C	T	1624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-5.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.761;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=6;PP=1309;ReadPosRankSum=0.348;SC=AATAAGCGAGCGCATGCTGGC;SOR=0.360;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=80;TCF=73;TCR=7;TR=57;WE=19978030;WS=19978012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,58:0.72:81
chr22	20020589	rs189301510	C	T	232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.314;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=164;ReadPosRankSum=-0.478;SC=GGAGGTGAAGCTGGCAGGGGG;SOR=0.483;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=12;WE=20020597;WS=20020579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,12:0.27:45
chr22	20039867	rs3804046	C	T	259.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.253;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.6272;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=179;ReadPosRankSum=-0.385;SC=AGCCGCATGTCGAACGTCCTC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=20039875;WS=20039857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr22	20043700	rs113449283	A	G	1041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.902;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=22;PP=811;ReadPosRankSum=-0.486;SC=GCACCTGGACACTTCAGAGAG;SOR=0.443;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=77;TCF=36;TCR=41;TR=44;WE=20043708;WS=20043690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,43:0.56:77
chr22	20049244	rs2286481	C	T	163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=0.640;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=6;PP=114;ReadPosRankSum=-0.427;SC=GCCCCAGTGTCCCGCCACCAG;SOR=0.569;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=8;WE=20049252;WS=20049234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,8:0.47:17
chr22	20073147	rs2302497	T	C	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=4;NR=0;PP=81;SC=GGCTTTTAACTTGGTACCAGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=20073155;WS=20073138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	20079603	rs11089328	A	G	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=7.084;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.57;ReadPosRankSum=0.813;SOR=2.904;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,17:0.55:31
chr22	20080447	rs2286925	G	A	1188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.581;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=38;PP=1030;ReadPosRankSum=0.253;SC=TGCTTGCTTGGGTGTCAAAGA;SOR=0.288;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=55;TCF=3;TCR=52;TR=41;WE=20080455;WS=20080437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,39:0.72:54
chr22	20096314	rs146291827	G	GCGCCTACCTTGCCAGACCCTGGGCA	1481.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=0;PP=1136;SC=GACCCTGGGCGCGCCTGCCTT;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=11;WE=20096322;WS=20096304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr22	20100596	rs1633445	T	C	5318.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=80;NR=94;PP=2965;SC=AGCCACCCCATGTGTCCTCGT;SOR=0.808;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=80;TCR=94;TR=174;WE=20100604;WS=20100586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
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chr22	20104301	rs395446	T	C	819.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=21;NR=7;PP=727;SC=TTTCCTCCCCTATCGCACCTG;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=22;TCR=7;TR=28;WE=20104309;WS=20104291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr22	20110246	.	C	CTGTGTGTG	139	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;FR=1.0000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MMLQ=18;MQ=59.96;NF=0;NR=3;PP=139;QD=47.3333333333;SC=CGAGGGGGTGCTGTGTGTGTG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=3;WE=20110254;WS=20110236;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:15,3:0.17:18
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chr22	20116906	rs175168	C	T	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.103;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=18;PP=1415;ReadPosRankSum=1.943;SC=GAAGGCCCCTCGGAATGGCTG;SOR=1.071;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=93;TCF=67;TCR=26;TR=66;WE=20116914;WS=20116896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,67:0.71:94
chr22	20127554	rs175174	A	G	1993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.795;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=18;PP=1539;ReadPosRankSum=0.416;SC=GGTTGGGAGGAGGTTTGTCCA;SOR=0.944;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=107;TCF=77;TCR=30;TR=68;WE=20127562;WS=20127544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,72:0.65:111
chr22	20132972	rs175179	A	G	105.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.18;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr22	20136108	rs175180	C	T	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=308;ReadPosRankSum=-0.797;SC=GTCGCCTGGCCTCCTTGCTGG;SOR=0.990;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=13;WE=20136116;WS=20136105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr22	20136606	rs73877146	T	C	712.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.123;NF=23;NR=4;PP=608;ReadPosRankSum=0.855;SC=CGATGCCCCCTGCCCTGGACC;SOR=0.556;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=44;TCF=38;TCR=6;TR=27;WE=20136614;WS=20136596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr22	20255020	rs854929	T	C	1824.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=0;PP=1619;SC=CTGCAGATGGTGGGCGTTGCT;SOR=8.015;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=54;TCR=0;TR=54;WE=20255028;WS=20255010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr22	20379066	rs56006201	C	T	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.78;QD=20.37;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr22	20385706	rs79640249	G	T	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=1.275;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.77;MQRankSum=-0.281;QD=5.86;ReadPosRankSum=0.256;SOR=0.385;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,17:0.34:50
chr22	20385739	rs146242498	TTGTC	T	846.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=47.43;MQRankSum=-3.268;QD=13.03;ReadPosRankSum=-0.227;SOR=0.648;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,24:0.37:65
chr22	20718734	rs45554431	G	A	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.016;NF=0;NR=19;PP=437;ReadPosRankSum=1.722;SC=CCTGACCCACGGCCAGTGGGC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=0;TCR=33;TR=19;WE=20718742;WS=20718724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr22	20729978	.	G	A	236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.605;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=-0.000;QD=19.73;ReadPosRankSum=-0.538;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,9:0.75:12
chr22	20743771	rs361766	C	T	2088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=70;NR=1;PP=1918;ReadPosRankSum=1.567;SC=GCGCCTGGGGCATGACTGCCC;SOR=5.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=74;TCF=73;TCR=1;TR=71;WE=20743779;WS=20743761;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,68:0.99:69
chr22	20745201	rs362125	A	G	1788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=52;PP=1523;SC=ACAGTGAGGCACACACACACA;SOR=5.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=55;TCF=3;TCR=52;TR=55;WE=20745209;WS=20745191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr22	20753861	.	C	CT	84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;FR=0.9998;HP=13;HapScore=2;MGOF=14;MMLQ=21;MQ=62.36;NF=5;NR=0;PP=84;QD=17.8;SC=TTTACATGTCCTTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=5;WE=20753869;WS=20753851;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:3,5:0.62:8
chr22	20754039	rs361860	G	A	309.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.468;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.211;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=218;ReadPosRankSum=-1.364;SC=CACCCCACCCGGCCTTGCTAT;SOR=3.601;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=11;WE=20754047;WS=20754029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr22	20779604	rs7286419	T	G	736.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=21;NR=1;PP=565;SC=GCGTGGGAGGTGTGGGGTGGC;SOR=4.804;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=22;WE=20779612;WS=20779594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr22	20779768	rs874101	G	C	1790.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=33;NR=22;PP=1453;SC=GGTCTCAGGCGCGGGCAAGTC;SOR=1.101;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=33;TCR=22;TR=55;WE=20779776;WS=20779758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr22	20779822	rs874100	G	C	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=2.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.49;ReadPosRankSum=1.203;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,37:0.65:57
chr22	20779946	rs759612	C	G	951.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.26;SOR=1.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr22	20779946	.	CG	GC	1155	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=5;NR=14;PP=1155;QD=63.6035723612;SC=TTGCCGCGCACGTCAGCGGCC;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=19;WE=20779955;WS=20779936;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:1,19:0.95:20
chr22	20779947	rs759611	G	C	951.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.26;SOR=1.931;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr22	20779973	rs5844418	C	CG	916.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=12;PP=1008;SC=GAGGCAGCCTCGGCGCGCTTC;SOR=0.941;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=13;TCR=13;TR=24;WE=20779981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr22	20780024	rs5844420	G	GC	1797.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=6;PP=1406;SC=AGAGGCCGGGGCGCGGCGCGC;SOR=3.145;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=34;TCF=28;TCR=6;TR=33;WE=20780039;WS=20780014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr22	20780029	rs370015834	G	GC	1878.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.97;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr22	20780031	rs2329378	G	C	1887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.90;SOR=3.417;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr22	20780091	rs759610	C	G	3936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.33;SOR=2.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr22	20780097	rs759609	G	C	3979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.34;SOR=2.110;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr22	20783485	rs5997411	C	A	2274.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-6.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=379;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.546;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=60;PP=1507;ReadPosRankSum=0.037;SC=GGTGTTTCTCCCAGATACCCC;SOR=0.728;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=365;TCF=186;TCR=179;TR=112;WE=20783493;WS=20783475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:260,116:0.31:376
chr22	20791821	rs9619753	G	A	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-2.248;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.199;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=76;ReadPosRankSum=-2.148;SC=CCACACCACTGCCCAGAGCGT;SOR=0.260;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=7;WE=20791829;WS=20791811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr22	20795757	rs1153427	C	T	1047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=4;PP=760;SC=TTCCTGGGGACGCAGCTTGGG;SOR=3.675;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=32;WE=20795765;WS=20795747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr22	20811930	rs362087	C	A	343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=285;SC=CTCATGGGGCCTCATCAATGC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=20811938;WS=20811925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr22	20843885	rs165613	T	G	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=459;SC=CTCCCCAATTTTAAAAAGAGA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=20843893;WS=20843875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr22	20844156	.	C	G	359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.816;ClippingRankSum=0.000;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.21;ReadPosRankSum=-0.611;SOR=0.795;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,18:0.26:69
chr22	20862646	rs5750324	T	G	5537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=106;PP=2965;SC=TCAGAGGAACTCTAGCCCCTC;SOR=1.185;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=180;TCF=74;TCR=106;TR=180;WE=20862654;WS=20862636;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr22	20891259	rs2269830	C	A	253.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=2;PP=194;SC=TTCCCATATGCCTCTCCTGGA;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=7;TCR=2;TR=9;WE=20891267;WS=20891257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr22	20891545	rs4821915	A	G	1647.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=42;PP=1216;SC=AGAGGAGAGCATCACAGACTC;SOR=3.611;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=49;TCF=6;TCR=43;TR=48;WE=20891553;WS=20891535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr22	20891568	rs2269831	G	A	1305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=35;PP=1021;SC=GAACCCCTCTGTTGGGTGTCC;SOR=4.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=39;WE=20891576;WS=20891558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr22	20907480	.	G	A	1991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.027;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.230;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=48;PP=1594;ReadPosRankSum=-0.931;SC=TTTCCCTTTTGAGTTAAAGTT;SOR=0.397;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=98;TCF=30;TCR=68;TR=71;WE=20907488;WS=20907470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,71:0.72:99
chr22	21034809	rs28668558	G	A	69.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-0.486;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.618;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.119;NF=6;NR=0;PP=69;ReadPosRankSum=-0.279;SC=GAATCAAAGAGCTCCTCAACC;SOR=2.546;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=6;WE=21034817;WS=21034799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr22	21064356	rs5760149	A	C	1430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=46;PP=1405;SC=AGTCCTGTGGACTGGCTGATG;SOR=5.283;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=49;TCF=2;TCR=47;TR=48;WE=21064364;WS=21064346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr22	21064387	rs5760150	C	T	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=42.49;MQRankSum=-1.062;QD=5.04;ReadPosRankSum=0.673;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,5:0.28:18
chr22	21066789	rs5996654	A	G	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=17;PP=533;SC=GGAAGGCCAGAGTGGACTCAT;SOR=3.056;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=21066797;WS=21066779;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr22	21066897	rs1135929	G	A	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=24.43;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr22	21066930	rs2629351	T	C	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=35.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr22	21068878	rs2329478	C	T	5378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=102;PP=2965;SC=CGCACGCGGACGCGTGGAAGT;SOR=1.134;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=167;TCF=65;TCR=102;TR=167;WE=21068886;WS=21068868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr22	21073122	rs1807692	G	A	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=11;PP=372;SC=TGCCAAGGAAGCAAAGAGGCT;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=15;WE=21073130;WS=21073112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr22	21075537	rs5751800	A	C	1155.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=8;PP=872;SC=GGTGCTTGGCAGTGCACTGAA;SOR=2.242;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=36;TCF=28;TCR=8;TR=36;WE=21075545;WS=21075527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr22	21079909	rs5751806	A	G	1956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=44;SC=GGAGATGGGCACAGTGGCTCA;SOR=1.503;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=22;TCR=44;TR=66;WE=21079917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr22	21080721	rs11462205	T	TG	1766.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=11;PP=1912;SC=GGGCACAAGCTGGTGTGGAAC;SOR=2.494;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=47;TCF=36;TCR=11;TR=46;WE=21080729;WS=21080711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr22	21081964	rs4820583	C	T	1567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=5;PP=1336;SC=AGTTGCCAAGCGGCTGTTTTT;SOR=4.133;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=47;TCF=42;TCR=5;TR=47;WE=21081972;WS=21081954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr22	21088146	rs17819969	C	G	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=295;SC=GAGGGAGCCCCGGACCCAGTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=21088154;WS=21088136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	21107153	rs2329583	T	C	1823.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=12;PP=1434;SC=GAAGTTTATATACATACACAC;SOR=2.644;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=57;WE=21107161;WS=21107143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr22	21118918	rs165764	T	G	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=0;PP=369;SC=GGTGTTACTATACGTGGTGTC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=21118926;WS=21118908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr22	21141300	rs4675	T	C	2491.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=55;PP=1966;SC=TCTACGAGCATCGCACCAGCT;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=18;TCR=55;TR=73;WE=21141308;WS=21141290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr22	21147293	rs165793	A	G	2226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=1;PP=1784;SC=GGAGTGAAGGATGTGCCATGG;SOR=6.123;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=60;TCF=59;TCR=1;TR=60;WE=21147301;WS=21147283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr22	21150340	rs165924	T	C	203.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=0;PP=164;SC=ACAAAGAAAGTGCCATATTCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=21150348;WS=21150330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	21152730	rs165682	T	C	149.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=88;SC=GGTTTTCACTTCCCCCCTTAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=21152738;WS=21152728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr22	21153590	rs165758	C	T	596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=443;SC=CAGAAGCGCCCTAGCAACAGT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=21153598;WS=21153580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	21154174	rs78526724	C	T	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=130;ReadPosRankSum=1.273;SC=TTTTCTTCCCCCCAAATTGGA;SOR=0.610;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=9;WE=21154182;WS=21154164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr22	21167605	rs362114	G	GACA	2913.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=6;PP=2668;SC=CAATTTTACTGACATATCCAT;SOR=3.647;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=55;TCF=47;TCR=8;TR=47;WE=21167613;WS=21167595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr22	21167787	rs165854	G	A	2071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=54;PP=1639;SC=CATCGGGCAAGCAGGAGGCTG;SOR=3.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=7;TCR=54;TR=61;WE=21167795;WS=21167777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr22	21174312	rs165691	C	A	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=506;SC=TGAAGGTTCACAATAAGCCAC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=21174320;WS=21174302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr22	21178484	rs165733	C	G	1364.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=1;PP=970;SC=GGTCTGCTGTCAACAGGATGA;SOR=5.549;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=21178492;WS=21178474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr22	21188732	rs165729	C	A	1273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=0;PP=1017;SC=CAGTTGTTTCCCAGCCAGGAG;SOR=5.943;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=36;TCR=0;TR=36;WE=21188740;WS=21188722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr22	21241854	rs165877	T	C	431.79	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=334;ReadPosRankSum=-0.552;SC=GTGGGTGCAGTCCCCCCAGGC;SOR=4.047;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=13;WE=21241862;WS=21241844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,14:0.93:15
chr22	21311531	rs81027	C	T	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=526;ReadPosRankSum=-0.357;SC=TTACCTGGGGCTGGGGAGGTG;SOR=0.385;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=25;WE=21311539;WS=21311521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,27:0.82:33
chr22	21311721	rs178251	T	G	2134.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.553;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=33;PP=1764;ReadPosRankSum=-1.499;SC=TTTACTCATGTCCCCGCATCG;SOR=0.976;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=113;TCF=62;TCR=51;TR=77;WE=21311729;WS=21311711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,78:0.67:116
chr22	21322325	rs11334069	TC	T	2859.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-1.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=6.383;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.74;MQRankSum=0.349;QD=28.60;ReadPosRankSum=0.434;SOR=2.464;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,99:0.99:100
chr22	21322351	rs178254	T	C	2859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=53;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=82;PP=2519;SC=CTGCACTCGGTAGGCCTCCGA;SOR=6.593;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=84;TCF=2;TCR=82;TR=84;WE=21322359;WS=21322341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr22	21322376	rs74610147	TC	GG	2851.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.17;QD=46.00;SOR=8.287;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr22	21322380	rs71317868	A	G	2716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.18;QD=45.28;SOR=8.222;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr22	21322383	rs432390	A	G	2671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.19;QD=46.06;SOR=8.155;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr22	21322409	rs2097674	C	A	680.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.02;BaseQRankSum=5.377;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=78;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.077;NF=0;NR=25;PP=564;ReadPosRankSum=0.098;SC=AATACGCTGCCGCCAGGAGGG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=0;TCR=44;TR=25;WE=21322417;WS=21322399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,24:0.56:43
chr22	21327834	rs178265	C	G	677.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=18;PP=638;SC=TGCCTGGGAGCGGGGATCAGG;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=21;WE=21327842;WS=21327824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr22	21329123	rs733455	A	G	535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=468;SC=GGGTGGGGCAAGTAGGGACCC;SOR=4.294;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=21329131;WS=21329113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr22	21330787	rs7285694	C	T	1273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.241;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=28;PP=1062;ReadPosRankSum=1.109;SC=TGAGGCTGGCCCGAGGCCGCA;SOR=0.560;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=192;TCF=101;TCR=91;TR=58;WE=21330795;WS=21330777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:134,57:0.30:191
chr22	21331043	rs178269	A	T	4225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=53;PP=2965;SC=GCGTGGGTCGAGCCCTCATGA;SOR=1.078;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=128;TCF=75;TCR=53;TR=127;WE=21331051;WS=21331033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr22	21331918	rs178275	C	G	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=263;ReadPosRankSum=-0.681;SC=CAAGCGCATGCTGTAGGGTGT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=14;WE=21331926;WS=21331908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,13:0.31:42
chr22	21331950	rs178276	C	G	2366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=1;PP=1974;SC=ACGCAGAAGGCAGGGACAGGG;SOR=7.054;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=66;TCF=65;TCR=1;TR=66;WE=21331958;WS=21331940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr22	21332122	rs178277	G	A	1786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.319;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=19.746;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=41;PP=1382;ReadPosRankSum=-0.044;SC=AGTGGCAGGAGGTTCAGGTCA;SOR=0.678;SbPval=0.14;Source=Platypus;TC=227;TCF=128;TCR=99;TR=74;WE=21332130;WS=21332112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,75:0.33:229
chr22	21334873	rs13057408	G	C	518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.883;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.510;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=452;ReadPosRankSum=1.247;SC=TCACCCTCTGGGAGAGAGCTC;SOR=2.303;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=25;TCF=23;TCR=2;TR=18;WE=21334881;WS=21334863;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,18:0.75:24
chr22	21334924	rs105034	G	C	326.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.011;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=179;ReadPosRankSum=1.367;SC=GGGAGGCTATGAGACAGGGGC;SOR=0.533;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=51;TCF=41;TCR=10;TR=13;WE=21334932;WS=21334914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,15:0.29:52
chr22	21335259	rs178278	C	A	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.586;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=12;PP=515;ReadPosRankSum=-0.580;SC=TGTCTTGACCCCTCCTCCCCT;SOR=1.003;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=131;TCF=83;TCR=48;TR=38;WE=21335267;WS=21335249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,39:0.30:132
chr22	21337266	rs178280	G	A	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.38;BaseQRankSum=-2.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=1.170;SC=TTCCTTGGGTGCCCCCCAGGA;SOR=0.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=4;WE=21337274;WS=21337256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr22	21337415	rs178281	C	G	1325.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=26;PP=1020;SC=GGACCAGGTACGGAGAAGTAC;SOR=1.312;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=42;TCF=16;TCR=26;TR=41;WE=21337423;WS=21337405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr22	21340088	rs178287	T	C	2124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.691;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=25;PP=1623;ReadPosRankSum=0.838;SC=CACTGCAGAGTAGACCTGGCT;SOR=0.470;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=115;TCF=79;TCR=36;TR=75;WE=21340096;WS=21340078;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,79:0.66:120
chr22	21343982	rs138025454	TGGGGAGCCAGGGCGCAGGTAGAGGAGGTGAGGGGCAC	T	459.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.19;MQRankSum=0.552;QD=13.93;ReadPosRankSum=-0.435;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr22	21343992	.	GGGCGCA	G	282.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=0.097;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.640;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=-0.723;QD=8.08;ReadPosRankSum=0.609;SOR=0.280;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr22	21344001	.	TAGAGGAGGTGAGGGGCACGGGGAGCCAGGGC	T	282.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.722;ClippingRankSum=0.000;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=1.591;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.14;MQRankSum=-0.634;QD=7.85;ReadPosRankSum=-0.363;SOR=0.336;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr22	21344002	.	A	G	327	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=34;MMLQ=29;MQ=55.37;NF=8;NR=15;PP=327;QD=15.7291831542;SC=GGGCGCAGGTAGAGGAGGTGA;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=23;WE=21344010;WS=21343985;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,23:0.92:25
chr22	21344018	.	AC	GT	397	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=23;MMLQ=24;MQ=54.81;NF=1;NR=6;PP=397;QD=64.3525535517;SC=GGTGAGGGGCACGGGGAGCCA;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=7;WE=21344040;WS=21344008;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr22	21344884	rs2073989	C	T	458.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.475;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=377;ReadPosRankSum=-0.408;SC=ATATGAAGAACGCCTCTTGCA;SOR=0.960;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=67;TCF=9;TCR=58;TR=20;WE=21344892;WS=21344874;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,21:0.30:69
chr22	21344905	rs178290	A	G	1831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=49;PP=1514;SC=CCTGGTGGCCATGGTAACCAT;SOR=3.767;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=7;TCR=49;TR=56;WE=21344913;WS=21344895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr22	21344920	rs17820542	G	C	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=5.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=294;ReadPosRankSum=1.011;SC=AACCATCCTTGTGAGCTCTGC;SOR=0.661;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=14;WE=21344928;WS=21344910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,15:0.31:48
chr22	21346485	rs112544	T	C	931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=1;PP=748;SC=CTCATGCCCATGTGTCTCCCC;SOR=5.421;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=29;WE=21346493;WS=21346475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr22	21346719	rs756876	A	C	1558.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=5.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=236;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.429;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=49;PP=1198;ReadPosRankSum=-1.787;SC=TGTGATCAACACCTCTCACAC;SOR=1.179;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=227;TCF=78;TCR=149;TR=67;WE=21346727;WS=21346709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,70:0.30:233
chr22	21348084	rs178291	T	C	1528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=33;PP=1190;SC=CTGCTGTGCCTGGGCAGTGGG;SOR=1.524;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=18;TCR=33;TR=51;WE=21348092;WS=21348074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr22	21349037	rs178292	A	G	4132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=78;NR=58;PP=2965;SC=GGGTCAGCGCAATCAGGGTTG;SOR=0.965;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=78;TCR=58;TR=136;WE=21349045;WS=21349027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr22	21349579	rs178293	C	T	2498.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.703;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=27;PP=1911;ReadPosRankSum=-0.081;SC=GCACCTCTTTCGGGCTAGGAT;SOR=1.139;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=136;TCF=93;TCR=43;TR=92;WE=21349587;WS=21349569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,94:0.67:140
chr22	21349676	rs412470	TC	AT	4105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.750;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.621;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=57;PP=2944;ReadPosRankSum=0.877;SC=TTCCCCCAGCTCTCCCTGGGG;SOR=0.796;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=151;TCF=59;TCR=92;TR=88;WE=21349685;WS=21349666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,103:0.64:160
chr22	21350461	rs178294	A	G	967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=28;PP=794;SC=CACCCACCTCAGGTGGCTTTG;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=21350469;WS=21350451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr22	21350880	rs178295	T	C	1132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.574;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=0;PP=982;ReadPosRankSum=-0.671;SC=TTGGAGAGCATGCTGGCGTGG;SOR=2.880;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=58;TCR=1;TR=39;WE=21350888;WS=21350870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,40:0.67:60
chr22	21350936	rs11704198	G	A	1042.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.032;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=8;PP=761;ReadPosRankSum=-1.135;SC=TCCCTGGGAGGGTGCGGGCGG;SOR=0.437;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=124;TCF=103;TCR=21;TR=44;WE=21350944;WS=21350926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,45:0.35:127
chr22	21354970	rs426938	C	G	1433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.415;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.097;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=22;PP=1226;ReadPosRankSum=0.601;SC=CTGACTTCAGCGGGGCCAGGT;SOR=1.201;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=159;TCF=93;TCR=66;TR=62;WE=21354978;WS=21354960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,61:0.38:159
chr22	21355501	rs56113960	G	A	674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FS=1.881;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.27;ReadPosRankSum=0.544;SOR=0.454;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,34:0.27:128
chr22	21356538	rs368989	A	T	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.188;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=33;PP=702;ReadPosRankSum=-0.466;SC=CGAGTTTCTGACGCGCCCGCG;SOR=0.997;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=95;TCF=11;TCR=84;TR=37;WE=21356546;WS=21356528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,37:0.38:97
chr22	21357006	rs4822808	C	T	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.697;NF=7;NR=7;PP=237;ReadPosRankSum=-0.333;SC=CGGCTCACTGCAAACTCCGCC;SOR=0.693;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=34;TCF=19;TCR=15;TR=14;WE=21357014;WS=21356996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,16:0.44:36
chr22	21365743	rs389623	G	A	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.59;MQRankSum=-0.812;QD=3.86;ReadPosRankSum=1.085;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,2:0.22:9
chr22	21365744	rs389624	G	T	34.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.200;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.59;MQRankSum=-0.812;QD=3.86;ReadPosRankSum=1.085;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,2:0.22:9
chr22	21365759	rs146547300	G	A	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.189;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=40.00;MQRankSum=-0.000;QD=7.54;ReadPosRankSum=-0.792;SOR=0.495;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,3:0.43:7
chr22	21369676	rs3893495	G	C	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.11;MQRankSum=-2.898;QD=3.13;ReadPosRankSum=0.906;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,4:0.29:14
chr22	21372405	rs2073598	G	T	9899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=102;NR=203;PP=2965;SC=CAGCCCCAGGGGGCCACCCGT;SOR=1.508;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=305;TCF=102;TCR=203;TR=305;WE=21372413;WS=21372395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,323:1.00:323
chr22	21372467	rs2073599	C	G	4691.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=126;PP=2965;SC=TGCTCGGTGTCCCCCAGGCAC;SOR=4.514;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=138;TCF=12;TCR=126;TR=138;WE=21372475;WS=21372457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr22	21377071	rs9613540	C	T	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.488;HP=4;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=320;ReadPosRankSum=0.750;SC=CCAGTGCCCCCAGCAGGGTGG;SOR=1.516;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=38;TCF=9;TCR=29;TR=17;WE=21377079;WS=21377061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,16:0.47:34
chr22	21377301	rs1548411	C	A	2866.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.539;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=45;PP=2243;ReadPosRankSum=1.568;SC=GTTGGTGCCCCGTGGAGAGTG;SOR=0.905;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=136;TCF=73;TCR=63;TR=100;WE=21377309;WS=21377291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,105:0.74:142
chr22	21377650	rs2277838	G	A	4844.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=306;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.514;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=124;PP=2962;ReadPosRankSum=1.251;SC=CCCGTGTTCCGCATTGGGGAC;SOR=0.937;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=299;TCF=90;TCR=209;TR=173;WE=21377658;WS=21377640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,178:0.59:301
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chr22	21385843	rs2072549	G	A	3493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.470;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.836;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=72;PP=2853;ReadPosRankSum=-0.558;SC=GCATAGCATAGGGCTGCCAGC;SOR=1.114;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=176;TCF=74;TCR=102;TR=119;WE=21385851;WS=21385833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,122:0.68:179
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chr22	21947467	rs2266963	C	G	144.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.111;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.447;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=5;PP=91;ReadPosRankSum=0.312;SC=GAGTCCTGAGCTTTGCAGATC;SOR=0.223;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=7;WE=21947475;WS=21947457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
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chr22	21983260	rs2298429	A	G	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.876;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=11;PP=437;ReadPosRankSum=-0.034;SC=GCGGAGGGACAGAGGCAGCTA;SOR=0.502;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=52;TCR=32;TR=28;WE=21983268;WS=21983250;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,30:0.34:87
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chr22	21996599	rs367932168	C	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.180;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5001;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=1;PP=116;ReadPosRankSum=-1.242;SC=GCCCCTGGGCCCGAGGGGCTG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=6;WE=21996607;WS=21996589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,6:0.75:8
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chr22	22036832	rs1669112	T	C	752.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.085;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=39;PP=560;ReadPosRankSum=-2.019;SC=GTCCCCTGCCTGCCTGCCCCA;SOR=0.538;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=124;TCF=14;TCR=110;TR=45;WE=22036840;WS=22036822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,42:0.34:125
chr22	22041438	rs436496	C	T	840.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.231;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=27;PP=677;ReadPosRankSum=1.060;SC=TGCCCTGTGTCCTTCCTAGGG;SOR=1.179;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=45;TCF=5;TCR=40;TR=30;WE=22041446;WS=22041428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,30:0.67:45
chr22	22042079	rs741617	G	T	580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.494;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=24;PP=505;ReadPosRankSum=-0.642;SC=CGGGGGCTGGGTGGGCTTGTC;SOR=0.676;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=66;TCF=5;TCR=61;TR=26;WE=22042087;WS=22042069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,24:0.36:66
chr22	22042918	rs2278118	C	T	373.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=290;ReadPosRankSum=0.831;SC=CTGCCCCAGGCTGGGCTCAGC;SOR=0.263;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=48;TCF=45;TCR=3;TR=18;WE=22042926;WS=22042908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,17:0.35:48
chr22	22048770	rs2070504	C	G	116.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=2.625;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=89;ReadPosRankSum=1.180;SC=TGCCCAAGGACCACCAGGCCA;SOR=0.120;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=5;WE=22048778;WS=22048760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
chr22	22048862	rs5999098	C	T	710.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.952;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=5;PP=512;ReadPosRankSum=0.875;SC=CGCAGACCCACCTCTGTCTCC;SOR=1.877;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=26;WE=22048870;WS=22048852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,29:0.62:47
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chr22	22055280	rs710172	A	G	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.755;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.098;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=0;PP=1176;ReadPosRankSum=-0.122;SC=GAGATGGCCGAGAGTGTCAAG;SOR=2.644;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=57;TCR=1;TR=45;WE=22055288;WS=22055270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,47:0.78:60
chr22	22055394	rs1860	A	G	2943.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.147;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.710;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=58;PP=2225;ReadPosRankSum=0.417;SC=AACAGCATTCAAAGGAGAAGG;SOR=0.532;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=172;TCF=87;TCR=85;TR=112;WE=22055402;WS=22055384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,114:0.66:173
chr22	22055581	rs861816	C	A	217.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.754;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=243;ReadPosRankSum=3.004;SC=TTGGCAAAAACCCCCCCCAAG;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=14;WE=22055589;WS=22055571;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,11:0.55:20
chr22	22057997	rs147967901	C	CGGG	211.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.008;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-2.282;QD=5.88;ReadPosRankSum=-0.729;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,8:0.22:36
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chr22	22058355	rs2236643	A	G	1387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.961;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=15;PP=1042;ReadPosRankSum=0.199;SC=CGGAGCTGCAAGCTGTTTTTC;SOR=0.708;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=64;TCF=41;TCR=23;TR=44;WE=22058363;WS=22058345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,47:0.69:68
chr22	22058586	rs861813	T	C	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.944;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.590;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=222;ReadPosRankSum=1.030;SC=AGTTCAGATGTGCTCACGCTG;SOR=0.260;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=40;TCF=7;TCR=33;TR=17;WE=22058594;WS=22058576;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,18:0.43:42
chr22	22162126	rs3729910	A	G	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.433;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=199;ReadPosRankSum=1.668;SC=TGACATTATCATAAGCAGAGC;SOR=1.022;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=15;WE=22162134;WS=22162116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,16:0.37:43
chr22	22287862	rs2027789	G	A	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.938;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.738;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=16;PP=597;ReadPosRankSum=-0.620;SC=GGCGGGCAGCGTTGGTGTGCA;SOR=0.828;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=58;TCR=51;TR=34;WE=22287870;WS=22287852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,38:0.32:117
chr22	22287964	rs2027790	T	C	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=21;PP=512;ReadPosRankSum=0.452;SC=GGTGGGGATGTGGTGGGAGTC;SOR=0.735;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=91;TCF=37;TCR=54;TR=36;WE=22287972;WS=22287954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,39:0.40:97
chr22	22288309	rs94194	T	C	53.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.674;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=1;PP=30;ReadPosRankSum=0.842;SC=TCAGCCTTGGTGGGCAGCTCT;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=3;WE=22288317;WS=22288299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,3:0.60:5
chr22	22312315	rs71316717	C	T	484.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=10.230;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.66;MQRankSum=-3.131;QD=7.46;ReadPosRankSum=0.538;SOR=2.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,23:0.35:65
chr22	22312350	rs2187583	GG	CC	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.903;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=1.829;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.40;MQRankSum=-2.975;QD=7.39;ReadPosRankSum=-0.935;SOR=1.110;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,11:0.26:43
chr22	22313829	rs239918	A	C	522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=398;ReadPosRankSum=0.479;SC=GGTGTCACTGACCTGGCCTAC;SOR=0.246;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=18;WE=22313837;WS=22313819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,19:0.53:36
chr22	22319757	rs71197632	AG	A	1312.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.326;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.717;NF=14;NR=21;PP=1312;ReadPosRankSum=-0.612;SC=CCTGGAAGACAGGACAGTCAA;SOR=0.507;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=35;WE=22319765;WS=22319747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,41:0.68:60
chr22	22330082	rs239927	T	C	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.73;ReadPosRankSum=0.920;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,10:0.20:49
chr22	22453239	rs12484854	C	T	1374.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.532;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.918;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=22;PP=971;ReadPosRankSum=0.187;SC=GACTCTATCCCTGGGGGACCA;SOR=1.050;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=156;TCF=79;TCR=77;TR=53;WE=22453247;WS=22453229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,58:0.35:167
chr22	22453513	rs9611014	C	A	2329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.632;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.334;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.721;NF=44;NR=58;PP=1731;ReadPosRankSum=-1.097;SC=GGTCCCTGATCGCTTCTCTGG;SOR=1.036;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=303;TCF=142;TCR=161;TR=102;WE=22453521;WS=22453503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:208,106:0.34:314
chr22	22516635	.	A	G	1755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.148;ClippingRankSum=0.000;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.432;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=21;PP=1342;ReadPosRankSum=0.497;SC=CTCCTCCTCCACTGCACAGGT;SOR=0.896;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=139;TCF=95;TCR=44;TR=73;WE=22516643;WS=22516625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,75:0.53:141
chr22	22517026	rs738885	T	C	1791.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=211;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.532;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=59.96;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=37;PP=1446;ReadPosRankSum=-0.771;SC=AACCTCCAGTTTGAGGATGAG;SOR=0.510;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=196;TCF=87;TCR=109;TR=69;WE=22517034;WS=22517016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:133,73:0.35:206
chr22	22517136	rs737840	C	G	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.072;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=24;PP=555;ReadPosRankSum=-0.194;SC=GGCTATTGTTCAGTGACAATT;SOR=0.063;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=79;TCF=4;TCR=75;TR=27;WE=22517144;WS=22517126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,30:0.35:85
chr22	22517162	rs737841	T	A	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=181;ReadPosRankSum=0.654;SC=TTTTAAAACATTTTCTGTATG;SOR=0.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=1;TCR=40;TR=12;WE=22517170;WS=22517152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,13:0.29:45
chr22	22569448	rs5750741	T	A	7788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=113;NR=121;PP=2965;SC=AACAGCAACATTGTTGGCAAC;SOR=0.752;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=234;TCF=113;TCR=121;TR=234;WE=22569456;WS=22569438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,241:1.00:241
chr22	22569554	rs6001413	C	A	6448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=128;PP=2965;SC=CAGAGAGATTCTCTGCATCCA;SOR=1.465;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=203;TCF=75;TCR=128;TR=203;WE=22569562;WS=22569544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr22	22569640	rs6001415	T	G	2767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=70;PP=2277;SC=TGCTCAGCATTGGACAGCAGC;SOR=3.056;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=14;TCR=70;TR=84;WE=22569648;WS=22569630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr22	22578443	rs76789895	GG	CC	43.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=45.05;MQRankSum=-1.834;QD=7.29;ReadPosRankSum=1.501;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,2:0.33:6
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chr22	22681765	rs3819309	G	A	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.035;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-7.183;NF=39;NR=28;PP=1065;ReadPosRankSum=-1.520;SC=GTGACTGGATGCAGATCGAGG;SOR=0.537;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=162;TCF=98;TCR=64;TR=67;WE=22681773;WS=22681755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,66:0.41:160
chr22	22697490	rs6519245	C	A	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=1;PP=649;SC=ATGTCCCTGCCCACTTCTTCA;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=22697498;WS=22697480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
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chr22	22707275	rs5995854	C	A	896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=44;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=3;PP=753;SC=GTGGGGTAAGCGGCTGTGTCC;SOR=4.332;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=27;WE=22707283;WS=22707265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr22	22707299	rs34503659	A	C	1837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.46;QD=43.76;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
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chr22	22707429	rs73153802	T	C	6673.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=132;NR=61;PP=2965;SC=TTGGTTTCTGTCTTAAAGCCT;SOR=1.765;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=194;TCF=133;TCR=61;TR=193;WE=22707460;WS=22707419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr22	22707443	rs75417423	T	A	7254.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=147;NR=69;PP=2965;SC=AAAGCCTATATATGCCTGTGT;SOR=1.674;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=216;TCF=147;TCR=69;TR=216;WE=22707460;WS=22707419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,226:1.00:226
chr22	22707452	rs113847228	G	GT	8022.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=107;NR=79;PP=2973;SC=ATATGCCTGTGTTCCAGGTTC;SOR=1.339;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=194;TCF=110;TCR=84;TR=186;WE=22707460;WS=22707419;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,231:1.00:231
chr22	22707473	rs74549497	C	G	7505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.779;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=65;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.320;NF=138;NR=98;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.141;SC=CCTCTCGCAGCCTGTGCTGAC;SOR=0.395;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=238;TCF=139;TCR=99;TR=236;WE=22707481;WS=22707463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,242:1.00:243
chr22	22707555	rs79612806	A	G	6388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.56;QD=44.37;SOR=2.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
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chr22	22707621	rs118041409	G	A	1199.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.39;QD=33.33;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
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chr22	22707696	rs73880635	G	C	2460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.70;QD=32.81;SOR=1.771;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr22	22707713	rs73880637	G	T	3134.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.55;QD=33.35;SOR=2.737;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr22	22707728	rs148013584	C	T	3722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.51;QD=34.79;SOR=3.549;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr22	22707782	rs76446997	T	C	5306.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=61;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=120;NR=47;PP=2965;SC=CAGTGCTTCTTACAGTGACAC;SOR=2.137;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=167;TCF=120;TCR=47;TR=167;WE=22707790;WS=22707772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr22	22707814	rs116843465	A	G	7573.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.05;QD=45.35;SOR=1.004;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chr22	22707820	rs115740254	T	C	7922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.03;QD=43.77;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,181:1.00:181
chr22	22707835	rs66941350	G	GT	6673.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=53;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=113;PP=2936;SC=CCTGATCTGGGTCTTGTTCTG;SOR=1.294;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=152;TCF=37;TCR=115;TR=149;WE=22707843;WS=22707825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,182:1.00:182
chr22	22712021	rs10674947	C	CCGGG	411.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.995;NF=13;NR=1;PP=1043;ReadPosRankSum=1.517;SC=GGTCAAAAACCGGGGGGATCT;SOR=0.207;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=14;WE=22712036;WS=22712011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr22	22712028	rs56355304	A	G	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.937;HP=6;HapScore=3;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.626;NF=12;NR=1;PP=1033;ReadPosRankSum=1.146;SC=AACCGGGGGGATCTGATTTGC;SOR=0.162;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=13;WE=22712036;WS=22712011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,13:0.30:44
chr22	22712261	rs3753077	C	T	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=1.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.52;MQRankSum=-6.970;QD=6.19;ReadPosRankSum=-0.369;SOR=0.950;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,26:0.28:94
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chr22	22724135	rs11324703	GT	G	376.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.09;MQRankSum=1.764;QD=3.46;ReadPosRankSum=-0.860;SOR=0.746;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,27:0.25:109
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chr22	22735736	rs448848	A	G	1136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.310;NF=11;NR=38;PP=881;ReadPosRankSum=-0.221;SC=CCAGGCCAATAGGGAACTGAG;SOR=0.683;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=129;TCF=30;TCR=99;TR=49;WE=22735744;WS=22735726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,48:0.37:130
chr22	22758488	rs407401	A	T	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=1;PP=615;SC=ATTTGCATGGATGGACCCTCC;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=22758496;WS=22758478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr22	22758721	rs426552	C	T	1608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.419;NF=40;NR=26;PP=1698;ReadPosRankSum=-0.761;SC=CAAGAATCACCGTGTCTGTGT;SOR=1.044;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=68;TCF=41;TCR=27;TR=66;WE=22758729;WS=22758711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,50:0.98:51
chr22	22782394	rs165704	A	G	10643.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=120;NR=195;PP=2965;SC=CACAGATGGGAAAGTGGGACA;SOR=1.291;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=315;TCF=120;TCR=195;TR=315;WE=22782402;WS=22782384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,326:1.00:326
chr22	22782477	rs5751064	T	C	2494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.617;NF=7;NR=76;PP=2024;ReadPosRankSum=-1.346;SC=AGGCACAAACTACATTTGGAA;SOR=0.580;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=117;TCF=9;TCR=108;TR=83;WE=22782485;WS=22782467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,84:0.71:118
chr22	22786294	.	C	T	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.219;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.206;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQ=59.96;MQRankSum=0.763;NF=20;NR=2;PP=407;ReadPosRankSum=-0.511;SC=AGCTCAGCTTCAGCTGCGGGT;SOR=1.257;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=65;TCF=56;TCR=9;TR=22;WE=22786302;WS=22786284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,23:0.35:66
chr22	22786410	rs165657	C	T	2595.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.178;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.424;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=36;ReadPosRankSum=0.911;SC=AGAGAGAGGCCCTGGGAAGCC;SOR=0.987;Source=Platypus;TCF=57;WE=22786418;WS=22786400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,92:0.73:126
chr22	22842206	rs11109	T	C	2709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.237;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.601;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=33;PP=2161;ReadPosRankSum=-0.854;SC=GAGGTTCCAGTGACACTTGAA;SOR=1.244;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=152;TCF=96;TCR=56;TR=102;WE=22842214;WS=22842196;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,101:0.66:154
chr22	22842957	rs2236729	T	G	3105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.194;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=68;PP=2522;ReadPosRankSum=1.788;SC=CAATTCATTTTCCCTATCAAG;SOR=0.922;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=156;TCF=58;TCR=98;TR=106;WE=22842965;WS=22842947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,109:0.67:162
chr22	22843118	rs2236730	C	T	1792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=4.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.681;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=39;PP=1449;ReadPosRankSum=-1.499;SC=CTGAAGGGAACGAAGCTGAAG;SOR=0.891;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=95;TCF=38;TCR=57;TR=63;WE=22843126;WS=22843108;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,65:0.64:101
chr22	22868211	rs361558	G	A	378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=277;ReadPosRankSum=-0.513;SC=ATGTCACTGTGAAAAACAACC;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=13;WE=22868219;WS=22868201;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,14:0.67:21
chr22	22868493	rs361666	G	T	3657.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.900;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.78;ReadPosRankSum=-0.083;SOR=0.728;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,93:0.53:176
chr22	22868497	rs361762	G	C	3671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.74;ReadPosRankSum=-0.088;SOR=0.665;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,94:0.53:177
chr22	22868773	rs361737	G	A	2382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.107;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=7.850;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.63;MQRankSum=-6.218;QD=28.03;ReadPosRankSum=0.021;SOR=0.969;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,59:0.69:85
chr22	22868776	rs362173	G	A	2382.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.827;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=9.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=49.36;MQRankSum=-6.490;QD=28.37;ReadPosRankSum=0.176;SOR=1.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,58:0.69:84
chr22	22869123	rs362003	T	C	5300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=0.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=321;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.169;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-4.540;NF=105;NR=92;PP=2962;ReadPosRankSum=1.043;SC=TAGTAAAAGTTGCTAAGTAAC;SOR=0.535;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=305;TCF=167;TCR=138;TR=197;WE=22869131;WS=22869113;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,207:0.65:320
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chr22	22869538	rs361611	A	G	3928.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.55;ReadPosRankSum=-0.009;SOR=0.702;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,97:0.61:160
chr22	22869545	rs361580	T	G	4089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.05;ReadPosRankSum=-0.739;SOR=0.675;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,98:0.62:157
chr22	22869548	rs362011	T	C	4033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.082;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=0.604;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.05;ReadPosRankSum=-1.413;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,102:0.63:161
chr22	22869649	rs361721	G	C	2798.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.045;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=50;PP=2072;ReadPosRankSum=0.217;SC=ACAGAGAAACGGGCATGATGG;SOR=0.700;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=163;TCF=83;TCR=80;TR=105;WE=22869657;WS=22869639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,109:0.66:166
chr22	22869742	rs361959	C	A	3478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.582;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=80;NR=39;PP=2823;ReadPosRankSum=0.673;SC=TTCTTCTTGACTTTGAGCCTG;SOR=0.890;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=201;TCF=133;TCR=68;TR=119;WE=22869750;WS=22869732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,123:0.60:205
chr22	22890492	rs13604	G	A	3953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=75;NR=40;PP=2965;SC=CACCCAGCTAGTTAGGCATGA;SOR=1.323;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=75;TCR=40;TR=115;WE=22890500;WS=22890482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr22	22890752	rs17497512	A	G	4280.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=75;PP=2965;SC=AGACTCTGCAAGGCAGATATG;SOR=1.078;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=129;TCF=53;TCR=76;TR=128;WE=22890760;WS=22890742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr22	22890792	rs17497547	T	C	2985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=52;PP=2359;SC=AGCTTAAGGTTGTAAGCTGGG;SOR=0.820;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=44;TCR=52;TR=96;WE=22890800;WS=22890782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr22	22899424	.	G	A	121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.716;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=138;ReadPosRankSum=-1.284;SC=AAATACTGCTGAGGAAACTGA;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=8;WE=22899432;WS=22899414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr22	22901979	rs11370405	C	CG	326.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.12;QD=36.30;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr22	22930770	rs6002909	A	G	4976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=69;PP=2965;SC=CCTCTGAGCTAATGCTTGGTC;SOR=0.706;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=145;TCF=74;TCR=71;TR=143;WE=22930778;WS=22930760;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,149:1.00:149
chr22	22989256	rs2904923	A	G	3652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=46;PP=2917;SC=CCGGTCAGCGAGATCCTGTTC;SOR=1.421;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=128;TCF=82;TCR=46;TR=127;WE=22989264;WS=22989246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chr22	23010943	rs406876	G	A	1069.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.225;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.610;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=24;PP=903;ReadPosRankSum=1.115;SC=CTGGCAATGCGTCCTTTGTCC;SOR=0.779;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=173;TCF=88;TCR=85;TR=51;WE=23010951;WS=23010933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:128,51:0.28:179
chr22	23011077	.	CA	C	5308.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.674;ClippingRankSum=0.000;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=53;PP=2976;ReadPosRankSum=1.387;SC=GATGTACTGGCAAAAAAATAT;SOR=0.720;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=198;TCF=89;TCR=109;TR=106;WE=23011094;WS=23011067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,135:0.59:228
chr22	23011086	.	A	T	5647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=6.459;ClippingRankSum=0.000;DP=245;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.008;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=62;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.535;SC=GCAAAAAAATATGCTCGGTGG;SOR=0.676;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=227;TCF=118;TCR=109;TR=135;WE=23011094;WS=23011067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,149:0.61:244
chr22	23029263	rs443102	T	C	6407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=83;PP=2965;SC=TCTCCCCCTCTTCACTCTCTG;SOR=1.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=198;TCF=113;TCR=85;TR=195;WE=23029271;WS=23029253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr22	23029374	rs451369	G	A	7168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=135;PP=2965;SC=AAGCCCAGACGCAGCCTCTGG;SOR=1.240;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=221;TCF=86;TCR=135;TR=221;WE=23029382;WS=23029364;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,229:1.00:229
chr22	23029526	rs3205084	G	C	907.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FS=12.524;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-0.667;QD=5.37;ReadPosRankSum=-0.612;SOR=1.006;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,45:0.27:169
chr22	23029698	rs443756	T	C	7938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=136;NR=126;PP=2965;SC=AGGCAGAAGATGAGGCTGACT;SOR=0.778;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=262;TCF=136;TCR=126;TR=262;WE=23029706;WS=23029688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,267:1.00:267
chr22	23029846	rs200665672	T	C	439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.708;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=2.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.53;MQRankSum=-7.045;QD=4.63;ReadPosRankSum=-1.558;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,22:0.23:95
chr22	23029871	.	C	T	156.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.147;ClippingRankSum=0.000;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.44;MQRankSum=-6.789;QD=2.75;ReadPosRankSum=1.117;SOR=0.032;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,8:0.14:57
chr22	23029876	.	C	T	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.126;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQRankSum=-6.704;QD=3.43;ReadPosRankSum=0.334;SOR=0.041;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:43,8:0.16:51
chr22	23040362	rs5996349	A	G	366.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.849;NF=12;NR=2;PP=288;ReadPosRankSum=-1.439;SC=CTCTGAGGCAAAGGGGATAAG;SOR=0.420;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=14;WE=23040370;WS=23040352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,14:0.54:26
chr22	23040389	rs6003229	G	C	703.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.730;HP=2;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.681;NF=24;NR=2;PP=568;ReadPosRankSum=-2.454;SC=CTGGGGCAGGGCCAGTGCTGG;SOR=0.269;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=39;TCF=37;TCR=2;TR=26;WE=23040397;WS=23040379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,26:0.65:40
chr22	23040462	rs1312	T	C	2126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.496;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.080;NF=59;NR=21;PP=1608;ReadPosRankSum=-0.492;SC=TGCTCCTCACTCTCCTCACTC;SOR=1.492;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=113;TCF=78;TCR=35;TR=80;WE=23040470;WS=23040452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,82:0.72:114
chr22	23040765	rs61732325	G	C	1946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.582;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=3.166;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.90;MQRankSum=-3.644;QD=24.96;ReadPosRankSum=-1.224;SOR=0.857;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,50:0.64:78
chr22	23040765	.	GGG	CGT	2363	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=52.98;NF=20;NR=30;PP=2363;QD=48.3293574972;SC=TGATTTATGAGGGCAGTAAGC;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=77;TCF=35;TCR=42;TR=50;WE=23040775;WS=23040755;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:27,50:0.65:77
chr22	23040767	rs5751516	G	T	1946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=6.054;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.96;MQRankSum=-3.717;QD=24.64;ReadPosRankSum=-1.315;SOR=0.747;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,50:0.63:79
chr22	23055329	rs35555516	C	CTCAT	286.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=5.883;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.80;MQRankSum=0.000;QD=9.25;ReadPosRankSum=-0.158;SOR=0.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,8:0.26:31
chr22	23055331	rs1972840	T	C	653.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.901;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=1;PP=782;ReadPosRankSum=1.179;SC=ACCTCTCTCTTATTTATTTAT;SOR=2.998;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=44;TCF=42;TCR=2;TR=33;WE=23055339;WS=23055319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,23:0.68:34
chr22	23055421	rs1985790	G	A	2816.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=4.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=151;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=29;PP=2211;ReadPosRankSum=0.847;SC=AGCCACCCTCGGTGTCAGTGG;SOR=0.671;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=147;TCF=105;TCR=42;TR=101;WE=23055429;WS=23055411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,103:0.68:151
chr22	23055440	rs1008910	C	A	6936.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=112;NR=67;PP=2965;SC=GGCCCCAGGACAGACGGCCAG;SOR=1.242;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=112;TCR=67;TR=179;WE=23055448;WS=23055430;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,183:1.00:183
chr22	23055533	rs4446155	G	A	3430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=11.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.05;MQRankSum=-3.647;QD=24.68;ReadPosRankSum=-0.195;SOR=1.149;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,88:0.63:139
chr22	23055539	rs1985791	G	T	3295.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FS=13.045;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.98;MQRankSum=-3.198;QD=24.60;ReadPosRankSum=-0.282;SOR=1.122;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,83:0.62:134
chr22	23055752	rs2304533	C	T	1202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.95;NF=0;NR=37;PP=1044;SC=CCCTCTTGCTCCAGCCCCGGG;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=37;WE=23055760;WS=23055742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr22	23063645	rs11090173	T	G	2938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=67;PP=2473;SC=CCATCTCACATTGACACAGAC;SOR=1.942;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=25;TCR=67;TR=92;WE=23063653;WS=23063635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr22	23077555	rs4822296	T	C	3985.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=70;PP=2965;SC=TACTGCAGCTTATATACAAGC;SOR=1.059;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=56;TCR=70;TR=126;WE=23077563;WS=23077545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
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chr22	23089759	rs2040563	A	T	5570.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.99;NF=125;NR=39;PP=2965;SC=CTGGTTTGAGAGACATCTCTC;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=125;TCR=40;TR=164;WE=23089767;WS=23089749;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr22	23089826	rs1978004	G	A	9858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=316;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=162;NR=136;PP=2965;SC=GACTGCCCCCGAAAGCCTGAG;SOR=0.800;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=299;TCF=163;TCR=136;TR=298;WE=23089834;WS=23089816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,314:1.00:314
chr22	23089857	rs2040564	G	A	13136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=298;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.06;QD=44.23;SOR=0.799;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,297:1.00:297
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chr22	23089941	rs3087123	ACT	A	6709.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=167;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=95;PP=2969;SC=CCCCCTCCTCACTCTCTGCAC;SOR=1.379;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=153;TCF=49;TCR=104;TR=139;WE=23089950;WS=23089931;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chr22	23090423	rs34605189	G	C	2850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.30;QD=34.77;SOR=4.255;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
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chr22	23090468	rs58198190	C	T	1026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.50;QD=41.07;SOR=3.528;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr22	23090475	rs58580735	T	C	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.05;QD=43.71;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	23101247	rs4822303	GC	AT	1805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.72;QD=44.04;SOR=1.845;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr22	23101280	rs1894244	C	T	2768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=54;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=21;PP=1681;SC=GCACAGGTGACGCCTCCAGGG;SOR=2.119;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=64;TCF=43;TCR=21;TR=64;WE=23101288;WS=23101270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr22	23101301	rs4822305	A	G	3291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=51;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=27;PP=1844;SC=AAGGGGCTTCAGGGACCTCTG;SOR=1.788;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=52;TCR=27;TR=79;WE=23101309;WS=23101291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr22	23101347	rs1894245	G	A	2665.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=32;PP=2095;SC=CAGGCTCACCGGGGCCCAGCA;SOR=1.286;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=83;TCF=51;TCR=32;TR=82;WE=23101355;WS=23101337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr22	23101523	rs3737543	G	A	2181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=38;PP=1970;SC=GGTACCAACAGCACCCAGGCA;SOR=0.814;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=72;TCF=34;TCR=38;TR=72;WE=23101531;WS=23101513;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr22	23101559	rs4134484	G	T	2578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=39;PP=2171;SC=TGATTTATGAGGTCAGTAATC;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=41;TCR=39;TR=80;WE=23101567;WS=23101549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr22	23114239	rs8138758	T	C	1920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=6;PP=1531;SC=CATCATGGGCTGTTCTCTCCA;SOR=4.139;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=59;TCF=53;TCR=6;TR=59;WE=23114247;WS=23114229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr22	23114285	rs8138785	T	C	3713.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=95;NR=23;PP=2965;SC=GGAACCTGCCTAGCCTGGGCC;SOR=2.833;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=120;TCF=96;TCR=24;TR=118;WE=23114293;WS=23114275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr22	23114327	rs6003299	T	C	7112.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=97;NR=67;PP=2965;SC=GCCTCAGCCATGGCCTGGACC;SOR=1.186;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=165;TCF=98;TCR=67;TR=164;WE=23114335;WS=23114317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr22	23114350	rs5996382	A	G	7532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=87;PP=2965;SC=TCTCCTCCTCAGCCTCCTCGC;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=177;TCF=90;TCR=87;TR=177;WE=23114358;WS=23114340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,178:1.00:178
chr22	23114993	rs2073451	G	A	7383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=123;NR=120;PP=2965;SC=AGGGAACACCGCCACCCTAAC;SOR=0.709;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=244;TCF=123;TCR=121;TR=243;WE=23115001;WS=23114983;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,246:1.00:246
chr22	23135588	rs2016511	G	A	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.136;NF=0;NR=14;PP=329;ReadPosRankSum=1.128;SC=CCCTGTGCAAGGGGCTTCCTG;SOR=1.931;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=14;WE=23135596;WS=23135578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr22	23154582	rs1065464	G	C	930.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FS=5.587;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=0.000;QD=6.00;ReadPosRankSum=-0.095;SOR=0.538;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:113,42:0.27:155
chr22	23161843	rs72002333	TCC	T	440.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.575;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.307;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=290;ReadPosRankSum=0.886;SC=GTGCTCATGGTCCCCTGAGGA;SOR=2.212;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=45;TCF=33;TCR=12;TR=10;WE=23161852;WS=23161833;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,14:0.28:50
chr22	23165340	rs5996397	C	G	646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.739;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.689;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=10;PP=565;ReadPosRankSum=0.580;SC=CTCCTCCTCACCCTCCTCACT;SOR=0.337;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=69;TCF=48;TCR=21;TR=28;WE=23165348;WS=23165330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,27:0.40:68
chr22	23165839	rs5844528	G	GC	2907.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=52;PP=2966;SC=GGGCTCTCAGGCCCCTTCTTG;SOR=1.295;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=81;TCF=24;TCR=57;TR=74;WE=23165847;WS=23165829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr22	23223070	rs378183	G	A	568.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.039;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.233;NF=7;NR=17;PP=399;ReadPosRankSum=5.389;SC=CAGGGCCCCCGCCTGTGGTGG;SOR=0.525;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=76;TCF=19;TCR=57;TR=24;WE=23223078;WS=23223060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,25:0.32:77
chr22	23235845	.	G	A	399.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.280;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=1.713;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.76;ReadPosRankSum=-1.820;SOR=0.958;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,21:0.25:84
chr22	23241620	rs462915	A	G	556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.130;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.118;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.319;NF=19;NR=0;PP=421;ReadPosRankSum=2.415;SC=TCCTGCTGTGAGTCACAGGAC;SOR=2.391;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=19;WE=23241628;WS=23241610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,20:0.49:41
chr22	23241705	rs62218846	G	A	189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=8.317;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.65;MQRankSum=-7.385;QD=1.58;ReadPosRankSum=0.192;SOR=2.018;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,17:0.14:120
chr22	23241753	rs202036213	T	TA	454.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=1.899;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.91;MQRankSum=-11.704;QD=2.93;ReadPosRankSum=0.100;SOR=1.027;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:133,22:0.14:155
chr22	23247025	rs2009423	G	A	251.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.253;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=9.548;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.17;MQRankSum=0.804;QD=2.01;ReadPosRankSum=-0.948;SOR=0.101;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:106,19:0.15:125
chr22	23247028	rs464478	A	G	2203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=6.307;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.011;NF=71;NR=9;PP=1816;ReadPosRankSum=1.571;SC=TCTGTGGGTTAAGTGTGGGGG;SOR=0.782;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=132;TCF=117;TCR=15;TR=80;WE=23247036;WS=23247015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,78:0.61:128
chr22	23247082	rs2009433	C	G,T	3457.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=263;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;MQRankSum=3.080;NF=66,61;NR=32,31;PP=2110,1840;ReadPosRankSum=0.230;SC=GGACCACTGGCCCCAGCTTCC;SOR=0.657;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=255;TCF=173;TCR=82;TR=98,92;WE=23247090;WS=23247072;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.38,0.37:260
chr22	23248758	rs1059142	G	A	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.013;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=44.09;MQRankSum=0.654;QD=17.20;ReadPosRankSum=-0.266;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr22	23248839	rs7117	A	T	46.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.090;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=3.332;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.03;MQRankSum=1.180;QD=5.20;ReadPosRankSum=-0.751;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr22	23256464	rs463185	G	C	7225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=132;PP=2965;SC=GTGAGGGGACGGAGCTGACCG;SOR=0.924;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=241;TCF=109;TCR=132;TR=241;WE=23256472;WS=23256454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,248:1.00:248
chr22	23260278	rs59884698	CGG	C	2468.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=10;PP=1856;SC=GGTTGGGGGGCGGGGTGGCCT;SOR=2.958;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=49;TCF=39;TCR=10;TR=45;WE=23260287;WS=23260268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr22	23260507	rs410521	T	A	864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=20;PP=730;SC=CTGGCCCCAATTTCCTCCAGC;SOR=1.863;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=8;TCR=20;TR=28;WE=23260515;WS=23260497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr22	23262162	rs375081	C	A	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=54;SC=ATCCTCAGTCCACCAGAAACC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=23262170;WS=23262152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	23263602	rs373405	C	T	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=24;PP=1283;SC=CAGCTGACCGCCCTCGGTAAG;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=28;TCR=24;TR=52;WE=23263610;WS=23263592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr22	23438101	.	C	T	3678.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-7.698;ClippingRankSum=0.000;DP=551;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=77;NR=89;PP=2719;ReadPosRankSum=-1.924;SC=AGCCCCTCATCATCTACAATG;SOR=0.666;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=534;TCF=244;TCR=290;TR=166;WE=23438109;WS=23438091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:376,170:0.31:546
chr22	23478695	rs9612240	C	T	509.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.149;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=18;PP=410;ReadPosRankSum=-0.024;SC=TATCAGGTCCCTGGTCAGGGA;SOR=0.195;SbPval=0.24;Source=Platypus;TC=62;TCF=5;TCR=57;TR=21;WE=23478703;WS=23478685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,21:0.33:64
chr22	23479758	rs34504974	G	GT	364.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.372;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=1.266;NF=3;NR=14;PP=261;ReadPosRankSum=0.575;SC=CTTTCCTGCTGTTTTTTTTCC;SOR=1.465;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=17;WE=23479766;WS=23479748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,20:0.40:50
chr22	23480962	rs5759598	T	G	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.973;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=107;ReadPosRankSum=2.331;SC=GCAGCTCAAGTGCATCCACCC;SOR=0.047;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=7;WE=23480970;WS=23480952;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr22	23481133	rs10568631	GA	G	1194.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FS=6.401;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.87;MQRankSum=0.939;QD=7.11;ReadPosRankSum=2.029;SOR=1.332;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:85,83:0.49:168
chr22	23482460	rs4822360	A	G	529.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.464;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=417;ReadPosRankSum=0.607;SC=AGGTCACACAAGGCCATGAGG;SOR=0.199;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=47;TCF=45;TCR=2;TR=20;WE=23482468;WS=23482450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,20:0.43:47
chr22	23482718	rs4822361	C	T	186.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.996;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=114;ReadPosRankSum=-0.783;SC=TACTTCTCATCTGATCCTCCA;SOR=0.976;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=7;WE=23482726;WS=23482708;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,8:0.36:22
chr22	23482744	rs4822362	C	A	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=32;ReadPosRankSum=-0.761;SC=TGAGGGCAGGCAAATGGGTAT;SOR=1.071;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=4;WE=23482752;WS=23482734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,5:0.26:19
chr22	23492236	rs9612248	C	T	628.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.840;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=11;PP=451;ReadPosRankSum=-1.342;SC=GTCCGTCTGTCTGTCTCTTTG;SOR=0.883;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=100;TCF=59;TCR=41;TR=29;WE=23492244;WS=23492226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,30:0.30:100
chr22	23494833	rs5759603	T	G	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.080;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=13;PP=221;ReadPosRankSum=0.973;SC=GGAACTGCTGTGCCTCAGCCT;SOR=2.636;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=5;TCR=36;TR=13;WE=23494841;WS=23494823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,14:0.33:43
chr22	23494904	rs2301555	T	G	101.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.090;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=73;ReadPosRankSum=-0.500;SC=TGGGCAGAAATTGTGGCGTCC;SOR=0.269;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=6;WE=23494912;WS=23494894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,6:0.25:24
chr22	23501286	rs2246716	T	G	507.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.076;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=401;ReadPosRankSum=1.119;SC=GGCAGCTGCCTATCCCCCTGG;SOR=1.040;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=79;TCF=48;TCR=31;TR=24;WE=23501294;WS=23501276;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,25:0.31:80
chr22	23502987	rs9612252	A	G	216.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=4.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=20;ReadPosRankSum=1.223;SC=AGGGTAGGCTAGCCTGGCTTT;SOR=0.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=4;WE=23502995;WS=23502977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,9:0.35:26
chr22	23503008	rs9612253	T	C	109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.43;ReadPosRankSum=0.562;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,7:0.22:32
chr22	23503170	rs5759612	A	G	801.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.946;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=20;PP=485;ReadPosRankSum=0.058;SC=CCAGGTCGGCAATGGAGACCT;SOR=0.538;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=124;TCF=70;TCR=54;TR=37;WE=23503178;WS=23503160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,41:0.32:130
chr22	23503205	rs5759613	G	C	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=6.624;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.88;ReadPosRankSum=-0.693;SOR=1.230;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,44:0.28:158
chr22	23503266	rs5759614	G	A	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FS=3.683;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.23;ReadPosRankSum=0.316;SOR=0.386;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:110,36:0.25:146
chr22	23503319	rs5759615	A	G	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.004;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=7.597;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.75;ReadPosRankSum=1.186;SOR=1.960;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,19:0.24:80
chr22	23503533	rs5759617	G	T	47.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.54;ReadPosRankSum=0.903;SOR=0.259;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,5:0.16:31
chr22	23503569	rs10775764	T	C	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=1.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.811;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=312;ReadPosRankSum=-0.331;SC=ATTCAGGCCTTGAACAGCAGG;SOR=0.162;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=7;WE=23503588;WS=23503559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,7:0.21:33
chr22	23503580	rs9608085	C	T	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.631;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.450;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=312;ReadPosRankSum=0.140;SC=GAACAGCAGGCCCAGAAGCTT;SOR=1.562;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=38;TCR=4;TR=10;WE=23503588;WS=23503559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,10:0.21:48
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chr22	23503756	rs737818	G	A	407.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.653;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.293;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=14;PP=275;ReadPosRankSum=1.458;SC=TGCTAACTGGGGCCTGCGTGG;SOR=0.458;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=60;TCF=11;TCR=49;TR=17;WE=23503764;WS=23503746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,19:0.28:69
chr22	23503819	rs737819	T	C	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=77;ReadPosRankSum=2.090;SC=GACTGTGGTGTGGAGACTGGA;SOR=1.096;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=2;TCR=24;TR=7;WE=23503827;WS=23503809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,7:0.28:25
chr22	23504862	rs5759619	C	T	2100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=297;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.652;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=50;PP=1577;ReadPosRankSum=1.274;SC=AGCCCCAGGCCCCTGTCACCT;SOR=0.712;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=286;TCF=149;TCR=137;TR=94;WE=23504870;WS=23504852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:197,97:0.33:294
chr22	23504916	rs5759620	G	A	1286.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=239;ExcessHet=3.0103;FS=3.503;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.45;ReadPosRankSum=0.179;SOR=0.959;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:173,63:0.27:236
chr22	23504959	rs5759621	C	T	1204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=183;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=39;PP=936;ReadPosRankSum=0.685;SC=ATCAGTACTGCTCTCCTAGGG;SOR=0.653;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=176;TCF=49;TCR=127;TR=54;WE=23504967;WS=23504949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,56:0.31:181
chr22	23505084	rs5751594	G	C	313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.246;HP=6;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=203;ReadPosRankSum=-0.496;SC=ATTTTTTGTAGTTTTTTATAT;SOR=0.223;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=14;WE=23505092;WS=23505074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,15:0.34:44
chr22	23523073	.	G	GC	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=61;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=0;PP=130;SC=CCGGGGCCGGGCTGGCGAGGC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=23523090;WS=23523070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	23523082	rs199698427	G	GC	143	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=61;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=4;NR=0;PP=168;SC=GGCTGGCGAGGCGCCGCGCCG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=23523090;WS=23523070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	23540609	rs4822371	A	G	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=2.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.470;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=10;PP=296;ReadPosRankSum=1.109;SC=AAGGTTGGTGACCCCCAAAGA;SOR=0.368;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=55;TCF=21;TCR=34;TR=18;WE=23540617;WS=23540599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,18:0.32:56
chr22	23585132	rs1004040	A	G	457.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.945;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=338;ReadPosRankSum=-0.103;SC=CCTGGTGACAACATCTCTCCA;SOR=1.304;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=46;TCF=4;TCR=42;TR=18;WE=23585140;WS=23585122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,19:0.37:51
chr22	23596756	rs11435513	G	GC	891.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.228;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.406;NF=5;NR=30;PP=706;ReadPosRankSum=-2.073;SC=GTGGACCCACGCCCCCCCTCA;SOR=1.679;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=123;TCF=27;TCR=96;TR=35;WE=23596764;WS=23596746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,42:0.34:123
chr22	23610878	rs9612268	G	A	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=88;ReadPosRankSum=-0.478;SC=TGCGCAGACCGAAGGAGCAGC;SOR=0.963;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=6;WE=23610886;WS=23610868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chr22	23613539	rs9608093	A	G	173.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-4.962;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=-0.165;SC=CATCCAGGGCATCCTGCGTGC;SOR=0.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=48;TCF=47;TCR=1;TR=12;WE=23613547;WS=23613529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,12:0.26:47
chr22	23626081	rs8139664	G	A	149.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=107;ReadPosRankSum=1.301;SC=GGGTCAACCTGCTCCTGCTGG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=6;WE=23626089;WS=23626076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,7:0.37:19
chr22	23627369	rs140504	A	G	1086.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=29;PP=865;SC=CAGATCAAGAATGACATCCAG;SOR=4.743;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=31;WE=23627377;WS=23627359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr22	23627441	rs131675	T	C	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=12;PP=316;SC=GTGGCAGCAGTCCCCGCACAC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=23627449;WS=23627431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr22	23629552	rs5759681	T	C	122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.993;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=90;ReadPosRankSum=-0.127;SC=TTCACTTGGATGCGCCCCACT;SOR=0.392;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=8;WE=23629560;WS=23629542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,8:0.40:20
chr22	23631639	rs11090228	T	C	660.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.349;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=3;PP=558;ReadPosRankSum=0.660;SC=GGAGGTCCAGTGGGAGGGGCC;SOR=0.990;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=73;TCF=64;TCR=9;TR=29;WE=23631647;WS=23631629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,28:0.38:74
chr22	23631801	rs2227939	T	C	1177.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.431;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=1.376;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.11;MQRankSum=2.218;QD=6.13;ReadPosRankSum=-0.930;SOR=0.532;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:136,56:0.29:192
chr22	23631813	rs113087899	G	GC	1314.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FS=2.854;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.13;MQRankSum=2.239;QD=9.26;ReadPosRankSum=-0.827;SOR=1.030;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,41:0.29:142
chr22	23631823	rs62219796	T	C	1361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=145;ExcessHet=3.0103;FS=1.785;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.39;ReadPosRankSum=0.040;SOR=0.929;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,40:0.28:145
chr22	23632513	rs16802	A	G	993.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.324;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.564;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=15;PP=742;ReadPosRankSum=0.923;SC=GACCTCTTTGATCTCTTGCGC;SOR=1.415;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=115;TCF=66;TCR=49;TR=43;WE=23632521;WS=23632503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,43:0.37:116
chr22	23632621	rs9608101	G	C	899.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.701;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=708;ReadPosRankSum=-0.747;SC=GTTTGGGGAGGAGGGTTGCAG;SOR=0.986;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=102;TCF=41;TCR=61;TR=38;WE=23632629;WS=23632611;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,38:0.38:100
chr22	23632636	rs5759683	C	A	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=5.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.825;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=22;PP=611;ReadPosRankSum=-0.928;SC=TTGCAGCGGCCGAGCCAGGGT;SOR=1.362;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=87;TCF=34;TCR=53;TR=32;WE=23632644;WS=23632626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,33:0.38:88
chr22	23632665	rs131677	C	A	2038.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=51;PP=1692;SC=AGGAAGGACTCATCGGGCAGG;SOR=3.370;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=9;TCR=51;TR=60;WE=23632673;WS=23632655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr22	23634644	rs116494823	C	T	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=0.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.763;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=3;PP=255;ReadPosRankSum=-0.065;SC=TTTTCTGATTCTGCAAATAAC;SOR=0.264;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=47;TCF=39;TCR=8;TR=13;WE=23634652;WS=23634634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,13:0.28:47
chr22	23637200	rs2239666	T	C	591.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.352;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.777;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=431;ReadPosRankSum=0.417;SC=CCTTCTCCCTTGGGGCTGCAG;SOR=1.121;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=72;TCF=60;TCR=12;TR=24;WE=23637208;WS=23637190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,25:0.34:73
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chr22	23961742	rs5844566	G	GGCACCCATAA	2333.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=31;PP=2900;SC=CCAGCATGGAGGTATCACAGA;SOR=6.556;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=1;TCR=55;TR=31;WE=23961750;WS=23961732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr22	23962744	rs72559613	T	TTTC	9270.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=212;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=111;NR=47;PP=2970;SC=GCCAGCAAGTTTGTTTCTCAG;SOR=2.082;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=163;TCF=116;TCR=47;TR=158;WE=23962752;WS=23962732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
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chr22	23982727	rs28645846	A	G	8040.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.68;QD=44.67;SOR=0.911;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chr22	24034288	rs738786	A	G	3721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=60;PP=2801;SC=GCTGTGCTCCAGGGCCTTTGG;SOR=0.772;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=125;TCF=65;TCR=60;TR=125;WE=24034296;WS=24034278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr22	24035970	rs2070446	C	T	3207.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=34;PP=2499;SC=GGTGGTGCTCCACGAATGCTT;SOR=1.321;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=92;TCF=58;TCR=34;TR=92;WE=24035978;WS=24035960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr22	24038847	rs1007298	T	C	1547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=35;PP=1205;SC=CCCCAGAGAGTCCAGATGAGG;SOR=2.352;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=9;TCR=35;TR=44;WE=24038855;WS=24038837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr22	24039410	rs117585592	C	T	1078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.651;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=26;PP=757;ReadPosRankSum=-1.210;SC=AGGCTGGATTCGGCCATCCCG;SOR=0.763;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=60;TCR=79;TR=46;WE=24039418;WS=24039400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,49:0.34:143
chr22	24094836	rs2070452	C	T	297.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=258;ReadPosRankSum=-0.684;SC=CCCATTCCCCCGCACACTGCT;SOR=0.239;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=13;WE=24094844;WS=24094826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr22	24094912	rs4820566	T	C	815.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.043;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=590;ReadPosRankSum=0.087;SC=GCCAGGATCTTATGACCCTCA;SOR=0.161;SbPval=0.09;Source=Platypus;TC=115;TCF=81;TCR=34;TR=36;WE=24094920;WS=24094902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,37:0.32:117
chr22	24106674	rs140181	G	A	7212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=129;NR=91;PP=2965;SC=GGCCCTGTCCGGCCTCCCACC;SOR=1.052;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=221;TCF=130;TCR=91;TR=220;WE=24106682;WS=24106664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chr22	24108288	rs140182	C	G	3928.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=62;PP=2869;SC=TCCCCCTCCCCGCCTGAGTCG;SOR=0.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=129;TCF=67;TCR=62;TR=129;WE=24108296;WS=24108278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chr22	24108412	rs80027270	G	A	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=37;PP=1018;SC=GCCTGATCTCGTAGGCGCAGG;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=37;WE=24108420;WS=24108402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr22	24109550	rs131444	T	C	162.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=2;PP=118;SC=TCTCTTGGACTCGCTGCTCAC;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=24109558;WS=24109540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	24109774	rs179468	T	G	302.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=5;PP=234;SC=AGGGCGCGGCTGGGCGGCTGC;SOR=0.859;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=11;TCF=6;TCR=5;TR=11;WE=24109782;WS=24109764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr22	24121378	rs738792	C	T	3627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.393;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=60;PP=2803;ReadPosRankSum=0.532;SC=GCCTAGGACGCCCACCACCTC;SOR=0.275;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=114;TCF=52;TCR=62;TR=112;WE=24121386;WS=24121368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,117:0.99:118
chr22	24122499	rs9612427	G	A	205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.087;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=156;ReadPosRankSum=-0.000;SC=CTCAGCCATCGGGGGCTGTCC;SOR=1.445;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=8;WE=24122507;WS=24122489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr22	24125565	rs2877173	G	A	3465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=92;NR=16;PP=2902;SC=CCCAGTGTCCGCTCGCCCAGG;SOR=3.716;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=109;TCF=93;TCR=16;TR=108;WE=24125573;WS=24125555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chr22	24129553	rs55705149	GGC	G	694.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=20.43;ReadPosRankSum=0.252;SOR=1.418;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr22	24143502	rs738797	C	G	4678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=114;PP=2965;SC=CTCTCTGGCCCCTCAAGTGGA;SOR=2.740;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=141;TCF=27;TCR=114;TR=141;WE=24143510;WS=24143492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,147:1.00:147
chr22	24145395	rs5760030	A	G	2143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=8;PP=1887;SC=GGTTTGCAGAAGCCTGCTGTG;SOR=3.716;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=57;TCR=8;TR=65;WE=24145415;WS=24145385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr22	24145675	rs5751738	G	C	837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=21;PP=702;SC=GAACAGTCCCGTTTCCTGCCA;SOR=3.014;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=24145683;WS=24145665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr22	24158899	rs2070457	C	A	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.594;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=3;PP=770;ReadPosRankSum=1.247;SC=TGAGGGAGGCCGGTCCATGCC;SOR=0.363;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=112;TCF=105;TCR=7;TR=40;WE=24158907;WS=24158889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,38:0.35:109
chr22	24176959	rs35305666	CA	C	3628.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=33;PP=2951;SC=AGGCTCAGGGCAAGAGGCTCT;SOR=1.426;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=84;TCF=51;TCR=33;TR=82;WE=24176967;WS=24176949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chr22	24179724	rs2070462	G	C	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.259;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.762;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=2;PP=237;ReadPosRankSum=-0.566;SC=GCAGGAAGATGGGGATGGAGC;SOR=0.242;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=16;TCF=14;TCR=2;TR=11;WE=24179732;WS=24179722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
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chr22	24231164	rs116206518	G	A	166.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.598;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=42.687;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.58;MQRankSum=1.532;QD=4.39;ReadPosRankSum=-2.782;SOR=5.130;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr22	24237463	rs2070767	T	C	668.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.831;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=13;PP=403;ReadPosRankSum=0.569;SC=AGAGCCGGGATATTGGGGAGC;SOR=0.566;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=79;TCF=38;TCR=41;TR=28;WE=24237471;WS=24237453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,33:0.39:85
chr22	24340650	rs11343686	GT	G	258.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.687;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=8.857;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=0.000;QD=5.28;ReadPosRankSum=0.114;SOR=0.031;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,18:0.37:49
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chr22	24345691	rs140302	A	C	1162.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.98;QD=34.20;SOR=0.811;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
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chr22	24345843	.	AGG	GGA	238	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=29;MQ=48.97;NF=0;NR=5;PP=238;QD=58.2935749724;SC=TCAAGAAGAGAGGACTGAGGC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=5;WE=24345853;WS=24345833;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,5:0.45:11
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chr22	24376322	rs4630	G	A	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.16;ReadPosRankSum=0.488;SOR=0.616;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,16:0.22:72
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chr22	24379577	.	CT	C	59.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.085;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=6.721;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.54;MQRankSum=0.780;QD=1.27;ReadPosRankSum=-1.571;SOR=0.017;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,10:0.21:47
chr22	24383954	rs140313	C	T	1687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=5.804;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.612;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=49;PP=1261;ReadPosRankSum=-1.740;SC=TGGGGAGCCCCGACTCTTGGA;SOR=0.470;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=217;TCF=59;TCR=158;TR=71;WE=24383962;WS=24383944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,74:0.33:221
chr22	24452885	rs2070467	A	G	1646.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.672;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=48;PP=1321;ReadPosRankSum=-1.082;SC=TACACCATCAATAACATTTCT;SOR=0.277;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=76;TCF=8;TCR=68;TR=55;WE=24452893;WS=24452875;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,58:0.72:81
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chr22	24468386	rs17854874	G	A	1443.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=1.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.740;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=32;PP=1082;ReadPosRankSum=-1.160;SC=ATTCTACACCGGATCATCTGG;SOR=0.829;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=223;TCF=116;TCR=107;TR=70;WE=24468394;WS=24468376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,71:0.30:234
chr22	24472270	rs2283807	A	G	996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.556;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=32;PP=802;ReadPosRankSum=0.433;SC=CTGCCAGTGCAGGGCAGGGCT;SOR=0.405;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=58;TCF=8;TCR=50;TR=38;WE=24472278;WS=24472260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,38:0.64:59
chr22	24480503	rs4820581	G	A	4287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=113;NR=14;PP=2965;SC=TGAATGTGTTGCTAATCTGCC;SOR=3.912;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=127;TCF=113;TCR=14;TR=127;WE=24480511;WS=24480493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chr22	24492061	rs2236622	T	C	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.388;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=27;PP=714;ReadPosRankSum=-0.883;SC=TAGCACCCTTTAGGCGACCCC;SOR=0.729;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=58;TCF=12;TCR=46;TR=34;WE=24492069;WS=24492051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,35:0.58:60
chr22	24551909	rs915595	T	G	108.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=86;ReadPosRankSum=0.676;SC=CCGCTTCCAGTAGAGTGCCGG;SOR=0.275;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=7;WE=24551917;WS=24551899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,6:0.26:23
chr22	24561364	rs7293224	A	G	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.982;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.420;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=490;ReadPosRankSum=-1.526;SC=GCAGCCCCAAACAGGTGGTTA;SOR=0.370;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=77;TCF=67;TCR=10;TR=25;WE=24561372;WS=24561354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,25:0.33:76
chr22	24564477	rs17854875	C	T	717.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.173;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=12;PP=542;ReadPosRankSum=0.575;SC=TTGGGGCTGCCGCCCAGAGAC;SOR=0.745;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=61;TCR=37;TR=31;WE=24564485;WS=24564467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,32:0.32:101
chr22	24573435	rs41311137	G	A	2411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.842;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=23;PP=1878;ReadPosRankSum=-2.965;SC=GTGTGATGCGGCAGGCAGGAA;SOR=0.475;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=121;TCF=90;TCR=31;TR=85;WE=24573443;WS=24573425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,88:0.70:125
chr22	24579049	rs62231981	G	A	384.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.286;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.309;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.750;NF=16;NR=2;PP=353;ReadPosRankSum=1.388;SC=TGCTCCATGCGCTGTGGCGCC;SOR=1.306;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=49;TCF=40;TCR=9;TR=18;WE=24579057;WS=24579039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
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chr22	24717850	rs204710	A	G	5795.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=93;PP=2965;SC=ATCACCCCTGATAACCAGAGC;SOR=0.917;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=171;TCF=76;TCR=95;TR=168;WE=24717858;WS=24717840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chr22	24730587	rs5760351	C	T	191.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.551;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=86;ReadPosRankSum=-0.519;SC=CGGTTGTGTTCACTTACCTTA;SOR=1.296;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=8;WE=24730595;WS=24730577;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,10:0.26:39
chr22	24761373	.	GA	G	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.277;ClippingRankSum=0.000;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.22;MQRankSum=1.759;QD=2.62;ReadPosRankSum=-0.125;SOR=0.249;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,11:0.26:43
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chr22	24808435	rs743363	G	A	172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=129;ReadPosRankSum=1.375;SC=GAGGGTGGCCGGGCCTAGTGC;SOR=1.302;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=9;WE=24808443;WS=24808425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,8:0.42:19
chr22	24837301	rs5751876	T	C	792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.354;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.477;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=29;PP=599;ReadPosRankSum=-0.699;SC=CCAATGGCTATGCCCTGGGGC;SOR=1.592;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=111;TCF=37;TCR=74;TR=38;WE=24837309;WS=24837291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:75,39:0.34:114
chr22	24891292	rs2070474	C	G	105.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.439;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.368;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=40;ReadPosRankSum=-0.160;SC=GGGCGCCTGACCGGGCCTGGG;SOR=0.020;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=4;WE=24891300;WS=24891282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,6:0.23:26
chr22	24898310	rs2232866	C	T	2215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.667;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=295;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.904;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=51;PP=1739;ReadPosRankSum=2.033;SC=GAAAGTTCTCCGTCCACATCA;SOR=0.468;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=289;TCF=135;TCR=154;TR=103;WE=24898318;WS=24898300;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:193,100:0.34:293
chr22	24917852	rs2232868	G	A	538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.562;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.393;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=7;PP=344;ReadPosRankSum=-0.657;SC=TGGCTGACTCGCCTCTCGGCC;SOR=0.078;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=33;TCF=25;TCR=8;TR=20;WE=24917860;WS=24917842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr22	24921558	rs5996713	C	T	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.264;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.706;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=479;ReadPosRankSum=1.233;SC=TCACTGTCAACGAGCCTTCCT;SOR=1.828;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=21;WE=24921566;WS=24921548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,25:0.78:32
chr22	24936970	rs9704	A	G	1406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.323;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=42;PP=1108;ReadPosRankSum=-0.393;SC=CTATTCTAACAATTTTACCAG;SOR=0.940;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=212;TCF=93;TCR=119;TR=69;WE=24936978;WS=24936960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,69:0.32:216
chr22	24938908	rs8139822	A	G	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.180;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=190;ReadPosRankSum=-1.910;SC=GGGCCAGGGCATCCTGAGCGG;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=13;WE=24938916;WS=24938898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
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chr22	24944782	rs1003580	A	G	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.901;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=8;PP=278;ReadPosRankSum=-0.325;SC=AGCCCCAACCAAAGATAGCTA;SOR=0.811;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=96;TCF=66;TCR=30;TR=27;WE=24944790;WS=24944772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,28:0.29:97
chr22	24953479	rs11427005	C	CT	971.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.554;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.489;NF=35;NR=2;PP=656;ReadPosRankSum=-1.171;SC=AGGAGCTGAGCTTTTTTTTTT;SOR=4.565;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=50;TCF=47;TCR=3;TR=37;WE=24953487;WS=24953469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,39:0.98:40
chr22	24953571	rs5760472	A	G	4267.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=112;NR=32;PP=2965;SC=GATGTGTGCCACATGCCTTTT;SOR=2.468;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=144;TCF=112;TCR=32;TR=144;WE=24953579;WS=24953561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr22	24964128	rs4597	T	C	808.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.267;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.681;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=18;PP=506;ReadPosRankSum=0.000;SC=GAAAAGCTGCTATTCTCAAGG;SOR=0.910;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=97;TCF=43;TCR=54;TR=30;WE=24964136;WS=24964118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,36:0.35:104
chr22	24981938	rs41277315	C	T	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.813;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.343;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=10;PP=405;ReadPosRankSum=1.571;SC=TGGCCCCGGCCGCACTGCCCT;SOR=0.389;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=57;TCF=35;TCR=22;TR=22;WE=24981946;WS=24981928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,22:0.38:58
chr22	25023893	rs201313233	G	A	1015.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.890;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.510;NF=21;NR=27;PP=792;ReadPosRankSum=1.676;SC=AGCTCTCCCAGCATCACCAAC;SOR=0.322;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=73;TCF=30;TCR=43;TR=48;WE=25023901;WS=25023883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,44:0.63:70
chr22	25124095	rs738827	C	T	4166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=37;PP=2965;SC=AAGAGAATCTCAAGTTTTATT;SOR=1.863;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=87;TCR=37;TR=124;WE=25124103;WS=25124085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr22	25124143	rs73152579	C	T	999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.763;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=175;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.71;ReadPosRankSum=1.953;SOR=0.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:126,49:0.28:175
chr22	25129964	rs5760612	A	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=0.366;SC=CAGGAAACCAACAACAACATT;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=4;WE=25129972;WS=25129954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr22	25145199	rs73152592	C	T	335.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.998;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=176;ReadPosRankSum=0.035;SC=TCTTCCCCCCCGGCCTCCTAA;SOR=0.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=11;WE=25145207;WS=25145195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,14:0.38:37
chr22	25145453	rs1892723	C	T	3128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=79;PP=2594;SC=AATTCTTTCACAATGCTATAA;SOR=3.329;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=16;TCR=79;TR=95;WE=25145461;WS=25145443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr22	25145471	rs1892722	A	G	2361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=60;PP=1965;SC=TAATCTTTACATATTTCATCT;SOR=3.581;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=11;TCR=60;TR=71;WE=25145479;WS=25145461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr22	25151638	rs6004259	T	C	2866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=83;NR=1;PP=2566;SC=ACTCTCTTAATACATGAGGAC;SOR=7.523;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=86;TCF=85;TCR=1;TR=84;WE=25151646;WS=25151628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr22	25151890	rs5760623	CA	AC	2310.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.89;QD=25.67;SOR=7.476;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr22	25158326	rs5751975	A	G	3195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=72;NR=36;PP=2489;SC=GTACAGGCACATATCTCTTGC;SOR=1.697;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=72;TCR=36;TR=108;WE=25158334;WS=25158316;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr22	25158597	rs738822	G	C	986.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=34;PP=791;SC=TAAAGGAAGAGGTGTGTTTGG;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=0;TCR=34;TR=34;WE=25158605;WS=25158587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr22	25246112	rs139670	G	A	305.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=216;ReadPosRankSum=0.787;SC=GCTTGCTAGCGGCAATATGGG;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=12;WE=25246120;WS=25246102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,13:0.38:34
chr22	25251500	rs117667552	C	T	2748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.320;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=50;PP=2074;ReadPosRankSum=0.155;SC=CTCTGTCTCCCGTCACTCTCT;SOR=0.553;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=149;TCF=69;TCR=80;TR=96;WE=25251508;WS=25251490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,103:0.65:158
chr22	25280313	.	G	C	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.000;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.715;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=408;ReadPosRankSum=-0.247;SC=CCTTCTCCTTGAGAGTTCCAA;SOR=3.056;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=17;WE=25280321;WS=25280303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,18:0.82:22
chr22	25282765	rs139719	T	C	1974.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=65;PP=1560;SC=GGCTGGGGAGTGCTGGTTCCA;SOR=4.558;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=71;TCF=6;TCR=65;TR=71;WE=25282773;WS=25282755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr22	25289335	rs3765480	G	C	85.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.073;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.226;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=77;ReadPosRankSum=1.792;SC=TTCCACGTTGGTCTGGCCCTC;SOR=0.122;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=33;TCF=30;TCR=3;TR=7;WE=25289343;WS=25289325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,6:0.19:32
chr22	25291095	rs5760713	C	A	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=0.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=0;PP=53;ReadPosRankSum=-0.402;SC=AATAGAGATGCAACTAGACTT;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=4;WE=25291103;WS=25291085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chr22	25624049	rs5760923	G	A	1728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=50;PP=1426;SC=ACCAGGAAGGGGCCCGCCCCT;SOR=7.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=0;TCR=51;TR=50;WE=25624057;WS=25624039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chr22	25625554	rs55700037	G	A	2844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=76;PP=2405;SC=ACGTAAGTGCGTTGCCAGCCC;SOR=2.993;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=91;TCF=15;TCR=76;TR=91;WE=25625562;WS=25625544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr22	25627604	rs8140949	G	A	1179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=4.988;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.84;MQRankSum=0.928;QD=5.93;ReadPosRankSum=1.028;SOR=0.393;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:140,59:0.30:199
chr22	25713933	rs133156	A	G	362.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=39.60;MQRankSum=1.468;QD=18.14;ReadPosRankSum=0.738;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr22	25714110	rs2064141	T	C	5510.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FS=1.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.81;MQRankSum=-0.258;QD=26.75;ReadPosRankSum=-0.023;SOR=0.862;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,133:0.65:206
chr22	25714113	rs2330574	A	G	5533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.567;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FS=2.456;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.87;MQRankSum=-0.254;QD=25.50;ReadPosRankSum=-0.062;SOR=0.896;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:77,140:0.65:217
chr22	25714218	rs2072869	A	T	3089.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=6.193;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.646;NF=49;NR=57;PP=2487;ReadPosRankSum=-0.532;SC=TGCCCCTCACACCCAGCAGGT;SOR=0.742;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=152;TCF=70;TCR=82;TR=106;WE=25714226;WS=25714208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,107:0.69:156
chr22	25715741	rs148363359	C	G	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.575;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.391;NF=8;NR=3;PP=147;ReadPosRankSum=0.890;SC=CAGGTCAGCCCAAGGCCACCC;SOR=0.069;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=30;TCF=25;TCR=5;TR=11;WE=25715749;WS=25715731;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr22	25716068	rs133162	C	G	1743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.70;SOR=2.024;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr22	25750814	rs141812512	C	CAGGGCA	1326.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.258;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=1487;ReadPosRankSum=0.590;SC=CTGGATGGGCCAGGGCCATGC;SOR=0.826;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=0;TCR=50;TR=23;WE=25750822;WS=25750804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,34:0.71:48
chr22	25753231	rs133194	G	A	1342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-6.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.583;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=9;PP=1031;ReadPosRankSum=-0.487;SC=CCTCGATCTTGTCTGTCTTGG;SOR=0.382;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=79;TCF=67;TCR=12;TR=50;WE=25753239;WS=25753221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,51:0.62:82
chr22	26159129	rs133884	C	CTT	750.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.635;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=17;PP=768;ReadPosRankSum=0.461;SC=CCATCACAAACTTTGAAGGGC;SOR=0.359;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=85;TCF=22;TCR=63;TR=22;WE=26159137;WS=26159119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,24:0.29:84
chr22	26159289	rs133885	G	A	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.027;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=12;PP=364;ReadPosRankSum=-0.500;SC=CTGGTCCGGGGGACTGAAAAA;SOR=0.666;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=59;TCF=30;TCR=29;TR=22;WE=26159297;WS=26159279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,21:0.34:62
chr22	26165065	rs201312229	G	C	2419.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.634;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=137;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=43;PP=1862;ReadPosRankSum=-1.817;SC=AGAAGGAAAAGATGGGGCAAC;SOR=0.674;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=131;TCF=65;TCR=66;TR=84;WE=26165073;WS=26165055;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,89:0.65:136
chr22	26166011	rs133903	C	A	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=465;SC=GAGAAACCCCCGTGTAAGGTA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=26166019;WS=26166001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr22	26166900	rs3859866	G	C	3342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=76;PP=2722;SC=TGAGACTTTGGATTGATGCTG;SOR=2.517;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=97;TCF=20;TCR=77;TR=96;WE=26166908;WS=26166890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr22	26173661	rs5761170	T	C	1710.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=26;PP=1349;SC=GGCCCTGGGCTGGAGTGGCGC;SOR=0.960;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=31;TCR=26;TR=57;WE=26173669;WS=26173651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr22	26177593	rs28729695	G	A	283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=17;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=1;PP=233;SC=AAAAAAAAAAGAGTGGATCAG;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=26177601;WS=26177584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr22	26181594	rs13053299	T	C	32.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.588;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.82;ReadPosRankSum=0.271;SOR=0.412;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr22	26193824	rs2877299	C	T	1855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=6;PP=1579;SC=AAATGACCCCCGCATTCCTTC;SOR=3.990;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=57;TCF=51;TCR=6;TR=56;WE=26193832;WS=26193814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr22	26193982	rs738642	C	G	2845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=52;PP=2265;SC=TGGAGATGCTCGGCATCTCAG;SOR=1.038;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=92;TCF=40;TCR=52;TR=91;WE=26193990;WS=26193972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr22	26194045	rs738643	T	C	1945.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=51;PP=1583;SC=ACCACCTGGGTGCGGCGGGGG;SOR=2.139;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=18;TCR=51;TR=69;WE=26194053;WS=26194035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr22	26194093	rs738644	G	A	1196.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=34;PP=1007;SC=GCTCACCTGGGAGGGCAGCTG;SOR=3.912;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=4;TCR=35;TR=38;WE=26194101;WS=26194083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chr22	26219412	rs5752226	T	C	1933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=0;PP=1672;SC=TCCTCTCGGGTGTTCATTCAC;SOR=8.121;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=58;TCR=0;TR=58;WE=26219420;WS=26219402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr22	26219605	rs4820658	G	A	4585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=264;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=105;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.113;SC=TGACGTTTGGGCCAAGCCGAT;SOR=0.681;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=252;TCF=96;TCR=156;TR=170;WE=26219613;WS=26219595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,177:0.68:260
chr22	26222505	rs2331162	G	A	1763.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=44;PP=1364;SC=TTGGCCTCTTGCAGGTGCACA;SOR=3.383;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=8;TCR=44;TR=52;WE=26222513;WS=26222495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr22	26228757	rs35045598	TA	T	616.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=578;ReadPosRankSum=0.627;SC=TGCCAAAATTTAAAAAAACGA;SOR=0.500;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=57;TCF=54;TCR=3;TR=26;WE=26228765;WS=26228747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,29:0.63:46
chr22	26228797	rs3859879	A	G	4102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.83;SOR=2.419;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr22	26228797	.	ATCCTCTCC	GTCCTCTCC,GTCCTCTCT	1407	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.14;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=79,44;NR=21,15;PP=697,1407;QD=7.31771212547;SC=GGTGATGGAAATCCTCTCCGC;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=79;TCR=21;TR=100,59;WE=26228813;WS=26228787;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:100
chr22	26228805	rs11090413	C	T	1726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FS=0.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=15.56;ReadPosRankSum=-0.635;SOR=0.595;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:46,65:0.59:111
chr22	26239850	rs5761268	C	A	2248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=60;PP=1788;SC=AGGTCCTGCACCAGTCAAAAA;SOR=4.174;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=6;TCR=60;TR=66;WE=26239858;WS=26239840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr22	26239906	rs5761269	A	G	930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=25;PP=706;SC=CATTGGAGGCACTGTGTTTTC;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=26239914;WS=26239896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr22	26239950	rs5761271	A	G	316.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=232;SC=ACTACAACACAGTGTGGGAGG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=26239958;WS=26239940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr22	26241928	rs2072011	G	A	44.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=0;PP=21;ReadPosRankSum=0.531;SC=GGGAGCAGCTGGGACACATGA;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=3;WE=26241936;WS=26241918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,3:0.33:9
chr22	26241994	rs2072012	T	C	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.284;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.236;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=2;PP=68;ReadPosRankSum=-0.924;SC=CTTGTTCCCTTTGCCACCACC;SOR=0.233;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=7;WE=26242002;WS=26241984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chr22	26247456	rs5996988	G	A	1293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.153;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=21;PP=1058;ReadPosRankSum=0.680;SC=ACCACATGGGGCTCACTCGCT;SOR=0.352;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=95;TCF=61;TCR=34;TR=54;WE=26247464;WS=26247446;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,53:0.56:94
chr22	26247607	rs6004798	C	T	957.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.770;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=35;PP=763;ReadPosRankSum=-0.399;SC=GGTTATTGGACATGTTCCAAG;SOR=0.722;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=72;TCF=4;TCR=68;TR=37;WE=26247615;WS=26247597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,37:0.51:73
chr22	26272244	rs35578357	C	T	248.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=5.787;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.08;ReadPosRankSum=-0.329;SOR=2.000;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,14:0.23:61
chr22	26273834	rs4822666	A	C	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.315;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.77;ReadPosRankSum=0.744;SOR=0.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,47:0.63:75
chr22	26273834	.	ACG	CCT	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=36;NR=7;PP=2944;QD=20;SC=ATTCCTCCTAACGGAAACTTT;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=73;TCF=59;TCR=14;TR=43;WE=26273858;WS=26273824;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:30,43:0.59:73
chr22	26273836	rs4822667	G	T	1857.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.428;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=24.77;ReadPosRankSum=0.777;SOR=0.668;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,47:0.63:75
chr22	26273850	rs695428	G	C	1403.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.973;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=12;PP=2962;ReadPosRankSum=0.767;SC=ACTTTGTGCCGTTTGCTCACT;SOR=0.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=81;TCF=60;TCR=21;TR=50;WE=26273858;WS=26273824;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,50:0.60:83
chr22	26273893	rs4822668	G	C	1585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=22;PP=1234;ReadPosRankSum=-0.482;SC=CTCTGGCCTGGAATGGTTTCT;SOR=0.695;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=92;TCF=55;TCR=37;TR=57;WE=26273901;WS=26273883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,59:0.61:96
chr22	26298754	rs2072016	G	A	1628.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=29;PP=1308;SC=GCTAAATCTCGGGAAACTGCA;SOR=0.892;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=23;TCR=29;TR=52;WE=26298762;WS=26298744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr22	26298874	rs2072017	T	C	323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=300;SC=TGGTGGCTGGTAAATTGATAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=26298882;WS=26298864;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr22	26317155	rs739284	A	G	1474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.87;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr22	26317155	.	ATTCCG	GTTCCA,GTTCCG	429	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=7,25;NR=5,11;PP=273,429;QD=27.2056562385;SC=AGGGAACCTGATTCCGGAAAA;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=12,36;WE=26317168;WS=26317145;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.33:36
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chr22	26342056	rs4820662	C	T	541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.87;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr22	26343805	rs2072007	A	G	1467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=23;PP=1180;SC=GTAGTGAATGAGACCTTGGTG;SOR=0.823;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=48;TCF=25;TCR=23;TR=48;WE=26343813;WS=26343795;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr22	26346311	rs10600754	AT	A	988.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.21;MQRankSum=0.305;QD=22.47;ReadPosRankSum=1.537;SOR=1.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,43:0.98:44
chr22	26346484	.	A	ATGTGTGTGTATGTGTGTG	897.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;NF=1;NR=16;PP=1275;SC=AACTAATAGGATGTGTGTGTG;SOR=3.611;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=17;WE=26346492;WS=26346474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr22	26388337	rs916425	C	T	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FS=5.819;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.79;ReadPosRankSum=0.229;SOR=1.240;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,41:0.29:142
chr22	26422292	rs41531549	G	C	584.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.381;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.229;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=478;ReadPosRankSum=1.621;SC=GAGTGCGGTAGGGATGGTATT;SOR=3.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=21;WE=26422300;WS=26422282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr22	26422980	rs2236005	A	G	3237.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=64;PP=2511;ReadPosRankSum=0.387;SC=TCGAAAACCCAATTCAGTTCC;SOR=0.724;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=201;TCF=99;TCR=102;TR=126;WE=26422988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,130:0.63:206
chr22	26688838	rs17304075	C	T	1516.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.701;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.409;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=31;PP=1072;ReadPosRankSum=0.955;SC=TTTGGCTGGACCGAAAGGAGA;SOR=0.546;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=237;TCF=139;TCR=98;TR=71;WE=26688846;WS=26688828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:167,73:0.30:240
chr22	26689105	rs17395296	G	A	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.851;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=21;PP=509;ReadPosRankSum=-0.768;SC=CCACCGAGCAGGCACCAGGTA;SOR=0.435;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=114;TCF=35;TCR=79;TR=33;WE=26689113;WS=26689095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:89,35:0.28:124
chr22	26690407	rs137204	T	C	233.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=191;ReadPosRankSum=1.357;SC=CCCAGGAGAGTACCTCACAGA;SOR=0.776;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=44;TCF=5;TCR=39;TR=13;WE=26690415;WS=26690397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,13:0.28:46
chr22	26702015	rs1210894	A	C	430.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.847;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=317;ReadPosRankSum=-1.045;SC=CTGAAAACACAAATGGGAGCC;SOR=2.025;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=66;TCF=55;TCR=11;TR=20;WE=26702023;WS=26702005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,20:0.30:67
chr22	26706500	rs35444510	C	CA	73.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.726;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.57;ReadPosRankSum=-0.561;SOR=0.064;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,9:0.19:47
chr22	26706826	rs666999	T	C	540.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.445;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=23;PP=394;ReadPosRankSum=1.431;SC=GGAGCTTCCCTTTCTCTTGTG;SOR=1.547;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=89;TCF=4;TCR=85;TR=23;WE=26706834;WS=26706816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,24:0.26:92
chr22	26736352	.	A	G	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.233;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=242;ReadPosRankSum=0.000;SC=GGGTTTATTGAATGCCCATTC;SOR=0.307;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=13;WE=26736360;WS=26736342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr22	26769234	rs1076660	T	G	208.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=2.898;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=162;ReadPosRankSum=-0.643;SC=CTTCTCTTGGTAACTTAGGAA;SOR=0.602;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=9;WE=26769242;WS=26769224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,9:0.47:19
chr22	26769464	rs5844691	G	GA	204.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.538;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.39;ReadPosRankSum=-1.489;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,14:0.37:38
chr22	26769539	rs1076661	A	C	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=2.965;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=53;ReadPosRankSum=-0.179;SC=TTATTTAGACACTTAAAAAAT;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=4;WE=26769547;WS=26769529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,4:0.36:11
chr22	26777795	rs482902	A	T	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=116;ReadPosRankSum=0.275;SC=ACAGACGGGCACAGTGGCATT;SOR=0.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=38;TCR=1;TR=9;WE=26777803;WS=26777785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,9:0.22:41
chr22	26829914	rs3747128	T	C	7760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=121;NR=136;PP=2965;SC=GCCAGTCCCCTGAGTGCGTGC;SOR=0.838;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=257;TCF=121;TCR=136;TR=257;WE=26829922;WS=26829904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,264:1.00:264
chr22	26830316	rs11705277	G	A	4747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=72;PP=2965;SC=GGAACTGTAGGAAGTGCCCAC;SOR=0.735;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=143;TCF=71;TCR=72;TR=143;WE=26830324;WS=26830306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr22	26830478	rs3788398	A	G	2441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=61;PP=2052;SC=GTATGTTGCAAGGACAGGGGT;SOR=3.086;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=11;TCR=61;TR=72;WE=26830486;WS=26830468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr22	26853905	rs1894704	C	A	2662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=60;PP=2127;SC=AGCGGCGATCCTGCGGGGTGG;SOR=1.749;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=86;TCF=26;TCR=60;TR=86;WE=26853913;WS=26853895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr22	26853980	rs1894705	T	C	989.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=30;PP=738;SC=AGTTACCTTCTGCCCTCCCAC;SOR=4.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=2;TCR=30;TR=32;WE=26853988;WS=26853970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr22	26854441	rs1894706	G	A	4260.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=61;PP=2965;SC=CGGTCGTAATGTGTGAAGTTG;SOR=0.910;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=136;TCF=75;TCR=61;TR=135;WE=26854449;WS=26854431;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,140:1.00:140
chr22	26854682	rs4822722	T	C	388.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=12;PP=281;SC=CAGTGCTTTGTGAGACCGAGG;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=26854690;WS=26854672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr22	26859942	rs5752330	C	T	3115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=27;PP=2436;SC=AGGGACAGCACCAGCCCTTTG;SOR=1.993;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=71;TCR=27;TR=97;WE=26859950;WS=26859932;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr22	26860269	rs2014410	G	C	4181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.593;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=79;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.417;SC=TGGTCTTCGAGCTGCTCTTGG;SOR=0.341;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=122;TCF=41;TCR=81;TR=120;WE=26860277;WS=26860259;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,129:0.98:131
chr22	26861545	rs3213583	A	G	1459.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=39;PP=1225;SC=TATGAACAGGACTTTCCCCTG;SOR=4.223;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=43;WE=26861553;WS=26861535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr22	26862153	rs739289	C	A	5639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=111;PP=2965;SC=CATAAAAGACCGCCGTTCTCA;SOR=1.708;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=163;TCF=52;TCR=111;TR=163;WE=26862161;WS=26862143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,173:1.00:173
chr22	26862212	rs713998	T	C	2670.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=69;PP=2228;SC=CGGGGCATCCTCTCCCGTAGG;SOR=4.202;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=8;TCR=69;TR=77;WE=26862220;WS=26862202;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr22	26864658	rs739290	A	G	4442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=86;PP=2965;SC=AATTTTAAAGATGCCTAACAG;SOR=1.362;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=137;TCF=51;TCR=86;TR=136;WE=26864666;WS=26864648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,144:1.00:144
chr22	26867490	rs5761549	G	A	605.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=1;NR=14;PP=420;SC=TGGAGCCTCCGGAGCTGCTGA;SOR=4.407;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=26867498;WS=26867480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	26877539	rs739291	C	T	980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=0;PP=953;SC=CGATGGCTCACGTGCTTGATT;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=33;WE=26877547;WS=26877529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr22	26879823	rs968425	C	A	350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=1;PP=219;SC=GATGACGTGCCGAGTGCGCCG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=26879831;WS=26879813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	26879946	rs66831137	GGAGGCGGCGCCCCGGGGGAGA	G	819.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.60;QD=39.03;SOR=0.990;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr22	26884039	rs4820682	G	A	3369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=83;NR=13;PP=2806;SC=ACAACTGAAGGCCCCTGTGGG;SOR=3.545;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=98;TCF=84;TCR=14;TR=96;WE=26884047;WS=26884029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr22	26886953	rs34878449	GT	G	3318.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.134;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.134;NF=109;NR=6;PP=2192;ReadPosRankSum=-0.867;SC=TAATCATGGTGTTTTTTTTTT;SOR=4.375;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=128;TCF=121;TCR=7;TR=115;WE=26886961;WS=26886943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,129:0.99:130
chr22	26887099	rs4820683	T	A	6297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=148;PP=2965;SC=AATTCTATCTTTCTTTACAGG;SOR=2.153;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=199;TCF=50;TCR=149;TR=198;WE=26887107;WS=26887089;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,201:1.00:201
chr22	26887829	rs1045523	A	G	284.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=4;PP=253;SC=GCATTGTCCCATTTTACATCC;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=7;TCR=4;TR=11;WE=26887837;WS=26887819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr22	26890682	rs11703192	C	T	960.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=0;PP=829;ReadPosRankSum=-0.359;SC=GGAATTGTACCTACAGTCAGG;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=51;TCF=51;TCR=0;TR=33;WE=26890690;WS=26890672;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,32:0.65:49
chr22	26892898	rs5761562	C	T	634.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=540;SC=ATTACACTGACTGGTTTCAAA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=26892906;WS=26892888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr22	26894985	rs2187956	C	T	3175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=51;PP=2673;SC=GGCTCTCCAGCCCTCCCTGCC;SOR=0.795;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=100;TCF=49;TCR=51;TR=99;WE=26894993;WS=26894975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr22	26895061	rs2157586	G	A	3418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=43;PP=2707;SC=GATTTTCCCAGCAACTCACTT;SOR=1.056;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=61;TCR=43;TR=104;WE=26895069;WS=26895051;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr22	26895337	rs1008530	G	A	7987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=254;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=135;NR=110;PP=2965;SC=TCTCCAGCTCGTGGAAGAGGT;SOR=0.920;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=246;TCF=136;TCR=110;TR=245;WE=26895345;WS=26895327;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,252:1.00:252
chr22	26924149	rs2283821	C	T	3977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=41;PP=2965;SC=CCAGAAGCAGCGGGAACCCCC;SOR=1.628;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=125;TCF=84;TCR=41;TR=125;WE=26924157;WS=26924139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chr22	26924312	rs2283822	C	T	2539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=65;PP=2159;SC=CTCAGCATCACTGAGTCATGC;SOR=3.287;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=13;TCR=65;TR=78;WE=26924320;WS=26924302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr22	26924336	rs2283823	C	T	1728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=47;PP=1438;SC=TGCTTATTCACGTAGTATTTA;SOR=3.872;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=6;TCR=47;TR=53;WE=26924344;WS=26924326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr22	26928446	rs4149482	C	T	1030.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=0;PP=852;SC=GGGGTTTCACCGTTTTGGTCA;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=26928454;WS=26928442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr22	26932150	rs3752523	G	A	5333.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=74;PP=2965;SC=CAGATGACCAGGAATTGAGAG;SOR=0.718;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=75;TCR=75;TR=149;WE=26932158;WS=26932140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chr22	26936897	rs12169509	G	A	2741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.696;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=39;PP=2217;ReadPosRankSum=0.259;SC=TACACAGGCAGGCACTTCTCC;SOR=0.593;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=133;TCF=78;TCR=55;TR=91;WE=26936905;WS=26936887;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,92:0.68:135
chr22	26937087	rs5761587	C	A	1513.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.710;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=259;ExcessHet=3.0103;FS=1.685;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.89;ReadPosRankSum=0.531;SOR=0.719;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:184,73:0.28:257
chr22	26937327	rs4822735	C	G	3115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=23;PP=2585;SC=CCTCGGGGTGCGCGTCCAGCA;SOR=2.179;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=67;TCR=23;TR=90;WE=26937335;WS=26937317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr22	26951317	rs28402932	A	G	151.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=4;PP=105;SC=GAATGCAATCATCGTGGAGTG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=26951325;WS=26951307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	27003957	rs147206089	G	A	1839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.462;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.058;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=36;PP=1383;ReadPosRankSum=-1.287;SC=ATCTCCCCGCGGAAGTTGGAC;SOR=0.791;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=226;TCF=124;TCR=102;TR=82;WE=27003965;WS=27003947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:148,84:0.36:232
chr22	27004089	rs5761626	A	C	2730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=78;PP=2352;ReadPosRankSum=1.840;SC=AGCCCTGAGGACAGTAGGAAA;SOR=3.792;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=5;TCR=79;TR=83;WE=27004097;WS=27004079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chr22	27021425	rs4276	A	G	4180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=42;PP=2965;SC=CCTCCTGCACACTCTACCCTC;SOR=1.973;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=104;TCR=42;TR=146;WE=27021433;WS=27021415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chr22	27021457	rs5761637	T	C	5934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=80;PP=2965;SC=GGGTGGGCTTTGAGCATGCTG;SOR=1.071;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=190;TCF=109;TCR=81;TR=189;WE=27021465;WS=27021447;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,196:1.00:196
chr22	28146735	rs45583937	G	A	94.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5727;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=93;ReadPosRankSum=0.524;SC=AACCCTTTCCGGTCCATATGC;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=5;WE=28146743;WS=28146733;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
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chr22	28293980	rs738451	G	C	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.911;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.711;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=15;PP=205;ReadPosRankSum=-0.273;SC=AAGGTGACCAGGTTCTAAGTC;SOR=0.313;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=54;TCF=7;TCR=47;TR=18;WE=28293988;WS=28293970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,18:0.33:54
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chr22	28316555	.	T	A	478.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.873;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=3.405;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.94;MQRankSum=-3.480;QD=14.51;ReadPosRankSum=-0.525;SOR=1.547;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,12:0.36:33
chr22	28316557	.	AGAAC	A	427.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.129;ClippingRankSum=0.000;DP=36;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.20;MQRankSum=-3.477;QD=11.88;ReadPosRankSum=-0.568;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chr22	28316591	rs75321888	T	TG	1958.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=11;PP=2180;SC=AGGCAGTCCCTGGAGTCACCG;SOR=2.753;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=53;TCF=40;TCR=13;TR=50;WE=28316599;WS=28316581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr22	28386620	rs470100	A	G	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.812;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.021;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=3;PP=60;ReadPosRankSum=1.327;SC=ACGGGCCGCCAGTCCAGCAGC;SOR=1.133;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=5;WE=28386628;WS=28386617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,6:0.40:15
chr22	28397275	rs55753016	C	T	119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.085;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=86;ReadPosRankSum=0.508;SC=GCTATGCCTTCGTAACACAGC;SOR=0.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=5;WE=28397283;WS=28397265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,5:0.56:9
chr22	28693496	rs5762549	T	C	92.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.620;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=1;PP=50;ReadPosRankSum=-1.560;SC=TTGCATATTATTCTCATTCAT;SOR=0.392;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=17;TCR=3;TR=6;WE=28693504;WS=28693486;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,6:0.30:20
chr22	29091037	rs5762749	G	C	816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=0;PP=668;SC=AAACACCATGGAATTTGGGAA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=29091045;WS=29091027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr22	29104940	rs374623367	CAA	C	4487.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.702;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=20;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.469;NF=64;NR=5;PP=956;ReadPosRankSum=0.154;SC=GCCTCCGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=3.935;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=172;TCF=133;TCR=39;TR=69;WE=29104967;WS=29104929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,98:0.96:102
chr22	29104955	rs5762756	A	C	7277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.45;MQRankSum=-0.342;QD=44.38;ReadPosRankSum=0.285;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,163:0.99:164
chr22	29104959	rs5762757	A	C	7346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.53;MQRankSum=-0.333;QD=42.71;ReadPosRankSum=0.957;SOR=1.424;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,171:0.99:172
chr22	29120400	rs17882607	A	C	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.980;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=2;PP=607;ReadPosRankSum=-0.516;SC=CCGTCTAAAAAAAAACAAAAC;SOR=0.169;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=47;TCF=45;TCR=2;TR=27;WE=29120408;WS=29120381;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr22	29137944	rs2236142	G	C	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.723;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.260;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=0;PP=700;ReadPosRankSum=0.281;SC=GTTTAGAAGGGAGAGCGGAAC;SOR=3.202;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=29;WE=29137952;WS=29137934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,33:0.70:47
chr22	29147293	rs73881132	A	G	282.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.406;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=213;ReadPosRankSum=-0.586;SC=TCTTTTCTTCACTTTCTTAAA;SOR=1.765;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=10;WE=29147301;WS=29147283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr22	29152965	rs5752790	G	A	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.15;ReadPosRankSum=0.253;SOR=0.193;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr22	29153122	.	G	T	133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.433;ClippingRankSum=0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=5;PP=84;ReadPosRankSum=0.540;SC=TTCAAATATAGAAGAAAAGAT;SOR=0.582;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=18;TCF=5;TCR=13;TR=7;WE=29153130;WS=29153112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,7:0.39:18
chr22	29169050	rs139091725	AGGGCGGGC	A	139	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=3;PP=242;SC=CGCAGGGCGCAGGGCGGGCGG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=29169065;WS=29169040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	29177200	rs2294431	C	T	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=39;PP=1089;ReadPosRankSum=2.066;SC=TTGCTGTTCTCTTGTAATAAC;SOR=0.534;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=60;TCF=3;TCR=57;TR=41;WE=29177208;WS=29177190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,45:0.69:65
chr22	29179739	rs2347447	C	A	260.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=211;SC=TCTCCTGATCCCCAGGCAATT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=29179747;WS=29179729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr22	29182070	rs17514713	G	C	564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.417;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.945;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=453;ReadPosRankSum=-0.585;SC=TGTATTTTATGTCTTAGGAGC;SOR=0.186;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=20;WE=29182078;WS=29182060;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr22	29191932	rs35873774	A	G	460.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=375;ReadPosRankSum=2.312;SC=AACCCCACCAAAAACTAACTT;SOR=0.425;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=15;WE=29191940;WS=29191922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,16:0.62:26
chr22	29195876	rs142137997	CT	C	2344.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.679;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.985;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.679;NF=36;NR=27;PP=2222;ReadPosRankSum=-1.414;SC=ATTCCCAGCCCTTTCAACAGC;SOR=0.505;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=94;TCF=55;TCR=39;TR=63;WE=29195884;WS=29195866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,77:0.75:102
chr22	29196494	rs5762809	C	T	614.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.664;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=19;PP=469;ReadPosRankSum=2.094;SC=GGGTTCGGCGCGGCTGCCACC;SOR=0.941;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=50;TCF=15;TCR=35;TR=26;WE=29196502;WS=29196484;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,26:0.51:51
chr22	29279991	rs1065497	C	T	1018.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=17;PP=722;SC=CCTACACCACCGGCCTCACGG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=34;TCF=17;TCR=17;TR=34;WE=29279999;WS=29279981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr22	29413785	rs4823005	A	G	317.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.700;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=215;ReadPosRankSum=1.934;SC=GTCAACCAGGATGAGTGCAGA;SOR=0.101;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=58;TCR=0;TR=14;WE=29413793;WS=29413775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,15:0.24:63
chr22	29414001	rs2347790	A	G	961.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.05;ReadPosRankSum=0.228;SOR=0.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,44:0.28:159
chr22	29439201	rs9613785	G	A	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.366;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=206;ReadPosRankSum=-1.614;SC=CAGGTATTCAGTGTTCCTTCC;SOR=1.392;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=45;TCF=34;TCR=11;TR=12;WE=29439209;WS=29439191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,13:0.30:44
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chr22	29446975	rs6005967	T	C	132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.759;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=9;PP=95;ReadPosRankSum=-0.465;SC=AGCAGGAGTTTCCATCAGGGT;SOR=2.564;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=8;TCR=33;TR=9;WE=29446983;WS=29446965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,9:0.21:42
chr22	29449477	rs2294239	A	G	474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=361;SC=GGCCTGCCACATGCTGGGGAC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=29449485;WS=29449467;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	29456467	rs41281607	T	C	629.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=1.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.870;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=5;PP=503;ReadPosRankSum=0.486;SC=ACTGATGAAGTTTCTTTTCCT;SOR=2.400;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=36;TCF=25;TCR=11;TR=23;WE=29456475;WS=29456457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr22	29456733	rs6005977	T	C	1675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=26;PP=1385;SC=TGAGAGCCGGTGAGTCCACAT;SOR=0.765;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=28;TCR=26;TR=54;WE=29456741;WS=29456723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr22	29469130	rs7292708	A	C	225.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=7;NR=1;PP=161;SC=TGGCGCCGCCAGCCGCCCGCC;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=29469138;WS=29469120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr22	29490497	rs134657	G	A	186.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=91;SC=ACAACTAGGGGAAGTCTTTTG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=29490505;WS=29490487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	29495079	rs134665	G	A	1085.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=30;PP=896;SC=CATCCTGGGCGAGGATTTTCA;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=29495087;WS=29495069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr22	29562853	rs132316	T	C	633.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.504;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=453;ReadPosRankSum=-0.630;SC=TCCAAGAGTTTGAGGCTGCAG;SOR=0.754;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=70;TCR=1;TR=23;WE=29562861;WS=29562843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,25:0.34:74
chr22	29562893	rs132317	G	C	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=1.861;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.81;ReadPosRankSum=0.145;SOR=0.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:73,26:0.26:99
chr22	29621128	rs743920	C	G	1222.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.459;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.388;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=10;PP=957;ReadPosRankSum=1.661;SC=TTAGTTGCAGCTTCCTCTGCC;SOR=1.259;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=91;TCF=66;TCR=25;TR=46;WE=29621136;WS=29621118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,47:0.49:95
chr22	29656389	rs2231398	G	T	1637.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.223;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.074;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=41;PP=1268;ReadPosRankSum=-0.066;SC=CAAGAAGCGAGGCCTGGATGC;SOR=1.100;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=84;TCF=27;TCR=57;TR=58;WE=29656397;WS=29656379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,61:0.69:88
chr22	29664423	rs2301291	G	A	745.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.298;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=28;PP=582;ReadPosRankSum=-0.268;SC=TGGCTGGGAAGACTGAGTGGA;SOR=1.477;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=120;TCF=27;TCR=93;TR=33;WE=29664431;WS=29664413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,34:0.27:125
chr22	29688632	rs3761426	T	G	948.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.968;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=21;PP=685;ReadPosRankSum=-0.071;SC=TGGCAGAACTTTAAACCACAG;SOR=0.510;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=114;TCF=63;TCR=51;TR=42;WE=29688640;WS=29688622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,44:0.37:118
chr22	29688751	.	CTTT	C	180.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.080;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.47;MQRankSum=-0.888;QD=11.30;ReadPosRankSum=-0.594;SOR=0.610;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,11:0.69:16
chr22	29692488	rs140065	G	T	405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=36.89;SOR=1.802;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr22	29692497	rs131190	G	T	335.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=55.96;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	29693990	rs3747142	A	G	709.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=26;PP=533;ReadPosRankSum=0.163;SC=AGTACACTTCATACCCTTGAG;SOR=0.692;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=122;TCF=42;TCR=80;TR=38;WE=29693998;WS=29693980;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,37:0.29:127
chr22	29695929	rs2518683	T	G	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.235;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.684;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=10;PP=456;ReadPosRankSum=-0.741;SC=TCCTCATGTCTCTAGGAAGCT;SOR=0.886;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=36;TCF=18;TCR=18;TR=24;WE=29695937;WS=29695919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,25:0.68:37
chr22	29707639	rs34777709	G	GC	1418.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=29;PP=1644;SC=ACGGCCTCCTGCCTGCGCAGC;SOR=2.476;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=36;TCF=7;TCR=29;TR=36;WE=29707647;WS=29707629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr22	29707955	rs9613860	A	T	739.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.262;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=1.584;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.21;ReadPosRankSum=-0.248;SOR=0.519;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:105,37:0.26:142
chr22	29711251	rs2519485	T	C	1965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=56;PP=1695;SC=GCCGGCGCTGTCGCTCCCCGC;SOR=5.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=58;TCF=2;TCR=56;TR=58;WE=29711259;WS=29711241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr22	29725893	rs2071578	T	C	1405.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=38;PP=1208;SC=AGAAGCAGAGTTTGGGGCTGT;SOR=5.994;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=39;WE=29725901;WS=29725883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr22	29727866	rs174765	C	T	655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=5.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.381;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=511;ReadPosRankSum=0.087;SC=GGCTGAGTGGCGCGTGGACCT;SOR=0.352;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=100;TCF=19;TCR=81;TR=30;WE=29727874;WS=29727856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,30:0.30:101
chr22	29727886	rs2857465	T	C	1970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=58;PP=1558;SC=TGGAGGGGGGTGGCGGGGGCC;SOR=2.964;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=72;TCF=13;TCR=59;TR=71;WE=29727894;WS=29727876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr22	29734797	rs6006098	G	A	143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=1.046;SC=CCTCTGGAAAGCCTTCCTAGG;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=19;TCR=1;TR=6;WE=29734805;WS=29734787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr22	29746253	rs737883	T	C	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=303;SC=ACCTTCCTCATCACAGTGGGA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=29746261;WS=29746243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	29833639	rs174718	C	G	773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=10;PP=687;SC=ACCAATAAAACGCCCTCATGT;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=16;TCR=10;TR=26;WE=29833647;WS=29833629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
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chr22	29837566	rs71324764	TTCC	T	8893.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=78;PP=2971;SC=AGCCAACAACTTCCTCCTCAT;SOR=1.033;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=185;TCF=97;TCR=88;TR=162;WE=29837576;WS=29837556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,202:1.00:202
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chr22	29885016	rs59371099	G	A	1648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.426;NF=21;NR=33;PP=1407;ReadPosRankSum=-0.626;SC=ACAGACAGAGGAGACCCAAGT;SOR=0.634;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=26;TCR=41;TR=54;WE=29885024;WS=29885006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,55:0.77:71
chr22	29885473	rs5763269	C	T	2057.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.167;NF=39;NR=45;PP=1550;ReadPosRankSum=1.136;SC=GCAAAGTCACCGGCTGAGGCC;SOR=0.677;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=244;TCF=114;TCR=130;TR=84;WE=29885481;WS=29885463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:154,87:0.36:241
chr22	29885567	rs147489453	A	AAAGTCCCCTGAGAAGGCC	5155.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.586;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=5.158;NF=25;NR=41;PP=2897;ReadPosRankSum=-0.493;SC=AGGAGGAAGCAAAGTCCCCTG;SOR=0.616;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=195;TCF=70;TCR=125;TR=66;WE=29885575;WS=29885557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,110:0.63:174
chr22	29885861	rs165923	T	C	5496.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=303;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.489;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.640;NF=107;NR=98;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.574;SC=AGGAAGAAGCTAAGTCCCCAG;SOR=0.734;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=307;TCF=155;TCR=152;TR=205;WE=29885869;WS=29885851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,199:0.66:301
chr22	29886413	rs165625	A	G	1200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.444;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.888;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.685;NF=19;NR=25;PP=954;ReadPosRankSum=-0.884;SC=AGACAGAGGTAGCCAAGAAGG;SOR=0.588;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=71;TCF=30;TCR=41;TR=44;WE=29886421;WS=29886403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,45:0.61:74
chr22	29886893	rs1061373	G	T	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.558;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=582;ReadPosRankSum=0.804;SC=CCTGCCCCCAGGCCCTCCCCA;SOR=0.317;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=26;WE=29886901;WS=29886883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,24:0.75:32
chr22	29904354	rs1049536	G	A	446.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-2.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=397;ReadPosRankSum=0.361;SC=TGTCTTTGGAGAATATCAAGA;SOR=0.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=18;WE=29904362;WS=29904344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr22	29904519	rs2283859	T	C	1655.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.594;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.518;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=26;PP=1312;ReadPosRankSum=1.749;SC=CCTAGAGAAATAGGAGAACGG;SOR=1.469;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=231;TCF=129;TCR=102;TR=75;WE=29904527;WS=29904509;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:161,75:0.32:236
chr22	29908072	rs1049534	C	T	411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.489;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.055;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=7;PP=331;ReadPosRankSum=0.226;SC=AGCTGGAAAACAGGTGGGATG;SOR=0.986;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=62;TCF=37;TCR=25;TR=19;WE=29908080;WS=29908062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,20:0.31:65
chr22	29908154	rs2007668	G	T	397.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.014;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=13;PP=276;ReadPosRankSum=0.064;SC=GGGGAAATGCGCAGTTCTAAG;SOR=1.270;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=18;WE=29908162;WS=29908144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,19:0.33:58
chr22	29913272	rs737976	C	T	765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.694;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=14;PP=514;ReadPosRankSum=-0.031;SC=TCATGGGCAACTGTCACCCAT;SOR=0.507;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=100;TCF=58;TCR=42;TR=31;WE=29913280;WS=29913262;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,35:0.34:104
chr22	29922042	rs71324775	CTACTAGG	C	631.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.219;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.782;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=1.053;NF=3;NR=12;PP=777;ReadPosRankSum=1.195;SC=GAAAAACTAACTACTAGGTAT;SOR=0.160;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=28;TCF=4;TCR=24;TR=15;WE=29922056;WS=29922032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,17:0.68:25
chr22	29924212	rs5763297	T	C	1768.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.113;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.199;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-1.363;NF=31;NR=47;ReadPosRankSum=-0.636;SC=GTCATAGCAATCTCCCCTTCC;SOR=0.919;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=218;TCF=94;TCR=124;TR=78;WE=29924220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,77:0.35:222
chr22	29925284	rs2302141	T	C	139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.102;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.551;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=8;PP=64;ReadPosRankSum=0.101;SC=TGCTAAGCAGTGTGAGTAGGC;SOR=1.296;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=8;WE=29925292;WS=29925274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,10:0.26:39
chr22	29938677	rs2240637	C	T	596.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-4.402;NF=22;NR=0;PP=483;ReadPosRankSum=-0.886;SC=TGCTTGAACCCGGGAGGTGGA;SOR=1.209;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=50;TCF=49;TCR=1;TR=22;WE=29938685;WS=29938667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,22:0.42:52
chr22	29957321	rs6361	G	A	531.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.522;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=429;ReadPosRankSum=-2.247;SC=GGCCTCATTCGCAGGCCCTGA;SOR=2.066;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=20;WE=29957329;WS=29957311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr22	29957911	rs469295	T	C	357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=280;ReadPosRankSum=0.951;SC=GATGACCTCCTCAAGGTTGGC;SOR=0.990;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=13;WE=29957919;WS=29957901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr22	29957944	rs468986	C	T	328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=6;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=262;ReadPosRankSum=-1.169;SC=ACGGGGGAGGCGGGGTGGCCT;SOR=1.911;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=17;TCF=2;TCR=15;TR=12;WE=29957952;WS=29957934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr22	29960335	rs456300	A	G	3574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.525;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=230;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.500;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=79;PP=2766;ReadPosRankSum=0.276;SC=CTGTATGGATAGAAATCTACC;SOR=0.738;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=223;TCF=94;TCR=129;TR=136;WE=29960343;WS=29960325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:88,140:0.61:228
chr22	29966083	rs456285	C	T	2200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.581;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.485;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=31;PP=1715;ReadPosRankSum=0.010;SC=GAGGATGTTCCGCAAATTTGC;SOR=1.086;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=110;TCF=62;TCR=48;TR=79;WE=29966091;WS=29966073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,82:0.71:116
chr22	30034994	rs5763378	G	T	926.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=720;ReadPosRankSum=-0.385;SC=AAAATTTAATGCACGCCTTGC;SOR=0.748;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=40;TCF=35;TCR=5;TR=30;WE=30035002;WS=30034984;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,32:0.74:43
chr22	30038107	rs73159068	C	T	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=234;ReadPosRankSum=-1.138;SC=CTCATTAGAACGCCGTGAGGC;SOR=0.471;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=47;TCF=40;TCR=7;TR=16;WE=30038115;WS=30038097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,17:0.34:50
chr22	30038152	rs2530664	A	C	541.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.688;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=8;PP=392;ReadPosRankSum=0.808;SC=CCTCACTTCCACTCACAGAGT;SOR=0.327;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=76;TCF=54;TCR=22;TR=24;WE=30038160;WS=30038142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,25:0.32:79
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chr22	30069207	rs13055076	C	T	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.272;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=13;PP=1046;ReadPosRankSum=0.382;SC=CAGATCTGGGCGGGAGAACAG;SOR=0.790;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=78;TCF=57;TCR=21;TR=50;WE=30069215;WS=30069197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,53:0.66:80
chr22	30077361	rs140086	G	A	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=1;PP=373;SC=CTTGTGGGCCGCAGAGCACCT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=30077369;WS=30077351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr22	30138533	rs148797464	G	A	1518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.834;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=38;PP=1224;ReadPosRankSum=-1.566;SC=GCAGGAAGTGGAAGCCACAGG;SOR=0.570;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=70;TCF=16;TCR=54;TR=50;WE=30138541;WS=30138523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,52:0.71:73
chr22	30405151	rs41157	T	C	3541.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=95;PP=2736;SC=CATTTTGCATTGCTCTTAAAT;SOR=2.379;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=125;TCF=30;TCR=95;TR=125;WE=30405159;WS=30405141;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr22	30412465	rs41164	T	C	1729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=43;NR=7;PP=1323;SC=AGCTGACTTATCAGAGTGTGC;SOR=3.611;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=50;WE=30412473;WS=30412455;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr22	30418161	rs41168	A	C	1509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=41;PP=1227;SC=GAGTGCCATCAATTTAACTGT;SOR=6.184;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=42;WE=30418169;WS=30418151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr22	30640595	rs929273	G	A	380.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=11;NR=1;PP=345;SC=AGGAAGTGGCGGGAGTCTGGG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=30640603;WS=30640585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	30660517	rs1476576	A	C	3167.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=70;PP=2631;SC=ACAGACAAGTAAGCCTTGAAA;SOR=2.405;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=89;TCF=19;TCR=70;TR=89;WE=30660525;WS=30660507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr22	30681797	rs6147585	T	TCTGCCCCAGCCCTTGGTGCTCCCC	4997.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.35;QD=64.07;SOR=1.966;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr22	30683285	rs5753058	C	G	4375.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=210;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.479;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=78;PP=2962;ReadPosRankSum=0.370;SC=ACCTGGGCCACAGCAGATGGC;SOR=0.394;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=199;TCF=82;TCR=117;TR=140;WE=30683293;WS=30683275;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,148:0.70:210
chr22	30685364	rs5763932	G	A	2988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.331;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=75;NR=35;PP=2418;ReadPosRankSum=-1.057;SC=TCCCGAACCCGGGCGCGCACC;SOR=0.951;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=156;TCF=103;TCR=53;TR=110;WE=30685372;WS=30685354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,112:0.71:158
chr22	30688659	rs4823086	C	T	1339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.187;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.452;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=40;PP=1090;ReadPosRankSum=-0.155;SC=TAGGGGCAGGCGGATGGATGG;SOR=1.163;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=89;TCF=22;TCR=67;TR=50;WE=30688667;WS=30688649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,52:0.58:90
chr22	30689998	rs11089442	G	A	1719.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=42;PP=1297;ReadPosRankSum=1.027;SC=CTGTCATATAGAGGAGCGGGT;SOR=0.674;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=200;TCF=82;TCR=118;TR=71;WE=30690006;WS=30689988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,73:0.35:208
chr22	30691631	rs2097919	G	A	2019.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.556;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=249;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.168;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=24;PP=1624;ReadPosRankSum=0.805;SC=TGGGGGCACCGAGCTTCTAAA;SOR=0.570;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=240;TCF=178;TCR=62;TR=89;WE=30691639;WS=30691621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:158,88:0.36:246
chr22	30700607	rs4823089	T	G	2370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.646;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.890;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=61;PP=1876;ReadPosRankSum=0.259;SC=CCTCCAGGGGTACTTCCTCCA;SOR=0.979;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=116;TCF=29;TCR=87;TR=80;WE=30700615;WS=30700597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,83:0.70:118
chr22	30714684	rs740219	A	C	6493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=107;NR=88;PP=2965;SC=TGAACCAAGCACTAATGATTT;SOR=0.849;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=195;TCF=107;TCR=88;TR=195;WE=30714692;WS=30714674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,205:1.00:205
chr22	30722669	.	C	A	3439.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.653;ClippingRankSum=0.000;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.667;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=96;NR=33;PP=2719;ReadPosRankSum=0.970;SC=CACGCGCCCTCGGCGCCCTGC;SOR=0.622;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=189;TCF=142;TCR=47;TR=129;WE=30722677;WS=30722659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,131:0.69:191
chr22	30730711	rs5749063	A	G	1261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.554;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=35;PP=949;ReadPosRankSum=-1.206;SC=GTGCCTTAGCATGGGGCAACC;SOR=1.291;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=89;TCF=35;TCR=54;TR=54;WE=30730719;WS=30730701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,53:0.59:90
chr22	30733111	rs2229807	C	A	1179.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.774;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=928;ReadPosRankSum=-1.373;SC=GTGGGGGATGCACAGGGGGCA;SOR=0.497;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=55;TCF=26;TCR=29;TR=40;WE=30733119;WS=30733101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,42:0.76:55
chr22	30733914	rs2074731	C	A	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.913;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=14;PP=420;ReadPosRankSum=0.507;SC=CCACAGATTACAGGAAGCCAA;SOR=0.882;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=80;TCF=33;TCR=47;TR=23;WE=30733922;WS=30733904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,25:0.30:83
chr22	30736559	rs13057861	G	A	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=5;PP=717;ReadPosRankSum=-0.519;SC=TGTAACAGACGGGCTTGCAAT;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=30;WE=30736567;WS=30736549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,31:0.76:41
chr22	30736835	rs56015505	G	A	494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=5.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.761;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=375;ReadPosRankSum=0.191;SC=ACTCAGAGAGGGGCTGAGGCC;SOR=1.868;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=75;TCF=10;TCR=65;TR=21;WE=30736843;WS=30736825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,22:0.29:77
chr22	30738161	rs9608885	C	T	1122.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.109;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=12;PP=848;ReadPosRankSum=0.604;SC=CCTGGCTCCCCATCTGGAGTC;SOR=0.363;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=148;TCF=119;TCR=29;TR=49;WE=30738169;WS=30738151;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,48:0.32:152
chr22	30738737	rs5753080	G	A	3876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=82;NR=33;PP=2965;SC=ACTGTTTTCAGACATAAAACA;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=115;TCF=82;TCR=33;TR=115;WE=30738745;WS=30738727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr22	30741230	rs67616715	CAGGGG	C	1385.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.487;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.883;NF=4;NR=27;PP=1377;ReadPosRankSum=0.404;SC=GAACAGGCTCCAGGGGAGGGG;SOR=1.118;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=8;TCR=58;TR=31;WE=30741242;WS=30741220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,36:0.58:62
chr22	30742623	rs740221	T	G	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=318;ReadPosRankSum=1.120;SC=AACCAGCCCATCCCTCAGCAG;SOR=1.287;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=16;WE=30742631;WS=30742613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
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chr22	30761940	rs740222	G	C	1379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.945;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=13;PP=1046;ReadPosRankSum=1.286;SC=CAGCAGCCACGTGGCTCTGGC;SOR=0.598;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=75;TCF=54;TCR=21;TR=47;WE=30761948;WS=30761930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,51:0.63:81
chr22	30762140	rs740223	G	A	2825.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.576;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.294;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=51;PP=2243;ReadPosRankSum=-1.631;SC=CTGTGACCTCGACATGGTGGC;SOR=0.576;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=159;TCF=84;TCR=75;TR=103;WE=30762148;WS=30762130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,104:0.65:161
chr22	30765502	rs5749080	G	A	2559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=4.744;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.657;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=62;PP=2087;ReadPosRankSum=-0.956;SC=CACAGGCTGCGGGGCCCTGCA;SOR=1.055;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=129;TCF=43;TCR=86;TR=90;WE=30765510;WS=30765492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,89:0.70:128
chr22	30767536	rs11705092	T	G	543.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-5.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=2;PP=419;ReadPosRankSum=-0.911;SC=GCGGCCCCTCTGCAGGCGATG;SOR=0.735;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=26;WE=30767544;WS=30767526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,26:0.62:42
chr22	30767729	rs1076298	A	G	1883.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.777;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=53;PP=1389;ReadPosRankSum=-1.642;SC=AAGGAGCCCCATCATAGGCCC;SOR=0.565;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=117;TCF=35;TCR=82;TR=76;WE=30767737;WS=30767719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,78:0.65:120
chr22	30767781	rs1076299	C	T	935.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=31;PP=722;ReadPosRankSum=-0.651;SC=GGATGAGCATCGTCCATCTCT;SOR=0.679;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=56;TCF=3;TCR=53;TR=33;WE=30767789;WS=30767771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,35:0.60:58
chr22	30769476	rs3840093	CA	C	466.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.625;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.845;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.828;NF=13;NR=2;PP=513;ReadPosRankSum=-0.378;SC=ACACACACCCCAGGGGGGTAG;SOR=1.547;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=26;TCF=19;TCR=7;TR=15;WE=30769484;WS=30769466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,16:0.50:32
chr22	30769901	rs4820838	G	C	1323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.46;ReadPosRankSum=1.701;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,34:0.65:52
chr22	30769906	rs4820839	T	C	1313.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.370;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=25.26;ReadPosRankSum=2.208;SOR=0.627;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,34:0.65:52
chr22	30770157	rs4820840	T	C	428.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-1.158;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.744;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=4;PP=339;ReadPosRankSum=-0.418;SC=GGCAGGACACTGGGGACTGCA;SOR=1.688;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=27;TCF=18;TCR=9;TR=15;WE=30770165;WS=30770147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,17:0.59:29
chr22	30770603	rs5749082	T	A	6304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=90;NR=108;PP=2965;SC=GGGCAAATCCTTTTGCAGAGC;SOR=0.873;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=198;TCF=90;TCR=108;TR=198;WE=30770611;WS=30770593;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chr22	30770626	rs5753105	G	C	3256.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.125;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=63;PP=2612;ReadPosRankSum=0.014;SC=GCAGGAAGATGTGCAGTTAGC;SOR=0.606;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=193;TCF=86;TCR=107;TR=116;WE=30770634;WS=30770616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,119:0.60:198
chr22	30771458	rs1002189	T	C	4482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=113;NR=43;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.085;SC=TCCTGTCCCATTGGGCACAGG;SOR=0.738;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=211;TCF=154;TCR=57;TR=156;WE=30771466;WS=30771448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,161:0.73:220
chr22	30771554	rs2015035	T	G	11175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=359;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=148;NR=197;PP=2965;SC=GCAAGTGCAGTCCAACGACAT;SOR=1.028;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=348;TCF=148;TCR=200;TR=345;WE=30771562;WS=30771544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,356:1.00:356
chr22	30774340	rs9619104	A	G	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=19;PP=525;SC=TTGAGAAGCCAGGCGCAGTGG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=30774348;WS=30774330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr22	30775675	rs35711436	G	A	794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=16;PP=623;ReadPosRankSum=-0.564;SC=AGAGTAGGCCGAGGGACCCCA;SOR=0.551;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=42;TCF=18;TCR=24;TR=29;WE=30775683;WS=30775665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,30:0.70:43
chr22	30775766	.	G	T	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.343;ClippingRankSum=0.000;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=6;PP=74;ReadPosRankSum=0.211;SC=ACACAGTCTCGGTGAAACTCG;SOR=0.719;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=23;TCF=6;TCR=17;TR=8;WE=30775774;WS=30775756;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr22	30776095	rs5749088	C	T	2299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.190;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=46;PP=1701;ReadPosRankSum=-0.321;SC=CAGGTCTCAGCACCCGGATCT;SOR=0.393;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=122;TCF=65;TCR=57;TR=87;WE=30776103;WS=30776085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,90:0.71:127
chr22	30781774	rs76749047	CA	C	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQRankSum=-0.674;QD=4.39;ReadPosRankSum=-0.269;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,6:0.50:12
chr22	30782731	rs12171261	G	A	736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.571;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.035;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=22;PP=567;ReadPosRankSum=-1.320;SC=CCTCCTGCTCGGCATCCACGA;SOR=0.406;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=100;TCF=29;TCR=71;TR=33;WE=30782739;WS=30782721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,34:0.33:102
chr22	30794719	rs11089447	C	T	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.42;ReadPosRankSum=0.899;SOR=0.837;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,16:0.32:50
chr22	30795484	rs5753124	G	C	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=0;PP=392;SC=GCCTGGGCGAGAGTGCGAGAC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=30795492;WS=30795474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr22	30795527	rs74278372	G	A	423.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.467;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=22.961;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=50.73;MQRankSum=-4.461;QD=14.13;ReadPosRankSum=0.271;SOR=5.170;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,16:0.53:30
chr22	30795531	.	C	A	414.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.452;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FS=12.305;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.36;MQRankSum=-4.737;QD=12.96;ReadPosRankSum=-1.696;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr22	30795535	.	G	A	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.024;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=10.782;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.01;MQRankSum=-5.335;QD=10.05;ReadPosRankSum=-2.644;SOR=3.111;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,10:0.29:35
chr22	30812549	rs5997642	C	G	2031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=51;PP=1691;SC=AGAAATCTAGCCTTGGAGACT;SOR=3.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=7;TCR=51;TR=58;WE=30812557;WS=30812539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr22	30820707	rs5994305	A	G	695.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=5;PP=510;ReadPosRankSum=-2.697;SC=CGGCACAGCTAGGATTTGAAC;SOR=0.735;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=75;TCF=61;TCR=14;TR=28;WE=30820715;WS=30820697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,29:0.38:77
chr22	30822920	rs5844906	T	TG	3346.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=68;PP=2965;SC=AAAGTCCCTGTGGACACTCCA;SOR=2.761;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=86;TCF=12;TCR=74;TR=77;WE=30822928;WS=30822910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr22	30823113	rs2072160	T	G	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.880;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=200;ReadPosRankSum=0.737;SC=TCGCAGGATTTTCTGCCTCTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=36;TCR=7;TR=12;WE=30823121;WS=30823103;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,12:0.27:44
chr22	30823196	rs5753130	T	C	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.233;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.689;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=13;PP=445;ReadPosRankSum=1.088;SC=CCAGGGTGACTGTGGCTGTGG;SOR=0.467;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=113;TCF=75;TCR=38;TR=36;WE=30823204;WS=30823186;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,37:0.31:118
chr22	30824755	rs13058535	G	A	724.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=529;ReadPosRankSum=-1.077;SC=ATGCTGAGTGGAAGTGGACCC;SOR=0.586;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=41;TCF=4;TCR=37;TR=26;WE=30824763;WS=30824745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,27:0.66:41
chr22	30857373	rs2240345	A	C	1592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=5.378;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.709;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=31;PP=1191;ReadPosRankSum=1.048;SC=TGGGTAGAACATCTGTCATCT;SOR=0.554;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=158;TCF=84;TCR=74;TR=60;WE=30857381;WS=30857363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,64:0.40:160
chr22	30857448	rs5749104	A	G	1674.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.860;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.136;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=36;PP=1238;ReadPosRankSum=-0.059;SC=TGTCCGCACCATCAGATGAGA;SOR=0.603;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=186;TCF=96;TCR=90;TR=73;WE=30857456;WS=30857438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:115,77:0.40:192
chr22	30862146	rs1047917	C	A	160.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=113;ReadPosRankSum=-0.553;SC=TAAGGCCAACCCTAGAAGTTA;SOR=0.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=8;WE=30862154;WS=30862136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,8:0.29:28
chr22	30862400	rs1057995	T	A	821.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.173;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=31;PP=665;ReadPosRankSum=0.190;SC=CCAAGAGAGATCCCTTCAGAG;SOR=1.813;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=104;TCF=24;TCR=80;TR=36;WE=30862408;WS=30862390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,37:0.35:107
chr22	30863163	rs5997653	C	T	269.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=203;ReadPosRankSum=0.318;SC=TTCTAGACCCCGACTCTGTCC;SOR=0.741;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=12;WE=30863171;WS=30863153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chr22	30864610	rs4820853	A	G	1671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.355;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.626;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=22;PP=1260;ReadPosRankSum=0.523;SC=AAGTGGCCCAATGATGTCATA;SOR=0.986;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=170;TCF=106;TCR=64;TR=64;WE=30864618;WS=30864600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:116,69:0.37:185
chr22	30864692	rs4820854	G	A	1757.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-5.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.166;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=38;PP=1273;ReadPosRankSum=-1.449;SC=ACCTGGGCATGAAAAGATGCA;SOR=0.824;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=178;TCF=85;TCR=93;TR=69;WE=30864700;WS=30864682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:112,74:0.40:186
chr22	30864792	rs2269962	C	T	788.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=27;PP=555;ReadPosRankSum=-0.787;SC=ATAAAAAGCACTGTCCCTCCC;SOR=0.619;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=90;TCF=13;TCR=77;TR=32;WE=30864800;WS=30864782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,34:0.35:96
chr22	30864817	rs2269963	A	G	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.407;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.882;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=20;PP=368;ReadPosRankSum=-0.727;SC=AGACAGTGCTATTGTCTCAGG;SOR=1.473;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=58;TCF=5;TCR=53;TR=21;WE=30864825;WS=30864807;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,22:0.35:62
chr22	30866471	rs35074129	A	G	597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=497;ReadPosRankSum=-3.397;SC=CCTGATCCCAACCTCTCCCAC;SOR=0.873;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=26;TCR=8;TR=21;WE=30866479;WS=30866461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,21:0.58:36
chr22	30867139	rs5997658	GC	TT	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-2.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.127;NF=14;NR=1;PP=759;ReadPosRankSum=-1.500;SC=AGGTGTGGTGGCACATGCCTG;SOR=0.818;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=15;WE=30867148;WS=30867129;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,18:0.72:25
chr22	30892078	rs34102711	T	C	346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.041;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=253;ReadPosRankSum=-1.119;SC=CAATAATACATTGAACATCTA;SOR=0.551;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=11;WE=30892086;WS=30892068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chr22	30927975	rs5749118	C	T	3835.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=87;PP=2965;SC=TTTCTCCACCCTCTTCCCCAG;SOR=2.021;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=32;TCR=88;TR=119;WE=30927983;WS=30927965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr22	30929905	rs4820864	A	G	1599.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.478;NF=44;NR=10;PP=1227;ReadPosRankSum=0.057;SC=TGGATGGATGAATGAATGAAT;SOR=0.831;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=67;TCR=15;TR=54;WE=30929913;WS=30929895;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,57:0.68:84
chr22	30930080	rs5753187	T	A	1413.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.966;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.104;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=40;PP=1176;ReadPosRankSum=-0.704;SC=CACTCCAGGCTTCTGGAGAGA;SOR=0.465;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=81;TCF=17;TCR=64;TR=52;WE=30930088;WS=30930070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,51:0.65:79
chr22	30930158	rs2899151	T	C	574.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.042;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=25;PP=456;ReadPosRankSum=1.416;SC=GTTCTTGACCTGGGGAGCCAC;SOR=2.448;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=25;WE=30930166;WS=30930148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,25:0.78:32
chr22	30934816	rs5753190	T	C	1901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.485;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=39;PP=1399;ReadPosRankSum=0.088;SC=ATCCTTACCTTGGAGCCAGCG;SOR=0.476;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=113;TCF=51;TCR=62;TR=73;WE=30934824;WS=30934806;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,74:0.63:117
chr22	30934887	rs5753191	G	A	1390.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.199;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=41;PP=1188;ReadPosRankSum=0.244;SC=TGTTCTCCCGGAACTGAGGAC;SOR=1.786;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=88;TCF=25;TCR=63;TR=52;WE=30934895;WS=30934877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,51:0.59:87
chr22	30953295	rs2267161	C	T	2205.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.723;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=45;PP=1633;ReadPosRankSum=0.183;SC=TAGGAGTACACCAGCAGCAGG;SOR=0.817;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=121;TCF=53;TCR=68;TR=80;WE=30953303;WS=30953285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,83:0.67:123
chr22	30981508	rs4820017	A	G	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=18;PP=487;SC=GCCCAAGCGGACAGACAGAGC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=30981516;WS=30981498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	30987861	rs737953	G	C	4139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=89;PP=2965;SC=CGCGTACAGGGAGCTCCACTT;SOR=1.953;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=34;TCR=90;TR=123;WE=30987869;WS=30987851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr22	30987933	rs17526668	T	A	2396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=50;PP=1939;SC=TGTCTGTTTGTGCGGGCTGCC;SOR=1.673;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=23;TCR=50;TR=73;WE=30987941;WS=30987923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr22	30987960	rs16988803	C	T	1688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=39;SC=GATGCCTGTACAAGTCCAGGG;SOR=2.137;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=13;TCR=39;TR=52;WE=30987968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
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chr22	31011557	rs2267163	T	C	7839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=118;NR=111;PP=2965;SC=GCCGGCTGACTTCCTCTCTCT;SOR=0.761;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=231;TCF=118;TCR=113;TR=229;WE=31011565;WS=31011547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr22	31011610	rs1801198	G	C	7222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.747;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=130;PP=2965;ReadPosRankSum=0.907;SC=TCCCCCATGCGTGGGGCAGAA;SOR=0.406;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=221;TCF=89;TCR=132;TR=218;WE=31011618;WS=31011600;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,225:1.00:226
chr22	31011882	rs4820021	A	T	1015.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=810;SC=TCAGCACAAGATTGTGGGTGT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=31011890;WS=31011872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chr22	31013419	rs9621049	C	T	2877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=62;PP=2225;SC=CAGTCCATCTCTGTTCTGGCC;SOR=1.855;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=88;TCF=25;TCR=63;TR=87;WE=31013427;WS=31013409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr22	31018777	rs2301956	G	A	934.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=0;PP=844;SC=TCGGGGGTCTGGAGGGGAAGG;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=31018785;WS=31018767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr22	31022262	rs72558392	G	T	511.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.65;SOR=2.670;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	31022272	rs2072194	G	A	544.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.91;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr22	31022301	rs12168392	G	A	572.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=29;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=3;PP=470;SC=CTTTGAGCAGGCTTTAGGGAG;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=15;TCR=3;TR=18;WE=31022309;WS=31022291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	31022590	rs12169610	C	T	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=19;PP=580;SC=AACAGGAACTCGCCTGACCCT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=31022598;WS=31022580;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr22	31032920	rs5997714	A	G	6715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=62;NR=151;PP=2965;SC=GCCACCACCCACTTCAGTTGG;SOR=1.904;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=214;TCF=63;TCR=151;TR=213;WE=31032928;WS=31032910;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,215:1.00:215
chr22	31060029	rs1005887	G	C	1060.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=30;PP=876;SC=AGCGAAGCACGAAGGCTGCGT;SOR=6.932;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=31060037;WS=31060019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr22	31061521	rs117531294	A	G	3126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=17;PP=2512;SC=CAGAAGTCTGAGGAGCCTTAA;SOR=2.906;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=76;TCR=17;TR=93;WE=31061529;WS=31061511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chr22	31089958	rs11383654	G	GA	917.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.69;MQRankSum=1.640;QD=17.32;ReadPosRankSum=-0.011;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:11,42:0.79:53
chr22	31266546	rs2301816	T	C	4413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.318;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.994;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=90;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.938;SC=AGCACGGCGCTGCACTCCAGC;SOR=0.946;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=150;TCF=60;TCR=90;TR=149;WE=31266554;WS=31266536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,152:0.99:153
chr22	31266777	rs4820909	T	C	433.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=359;SC=CCATTTCCTGTGGTTCCACGG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=31266785;WS=31266767;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr22	31285680	rs5749186	G	A	3270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=95;PP=2748;SC=TTTCCTGTGCGTGGATGAGCA;SOR=5.954;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=99;TCF=3;TCR=96;TR=98;WE=31285688;WS=31285670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chr22	31289580	.	G	A	3697.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-4.747;ClippingRankSum=0.000;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.942;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=104;NR=39;PP=2884;ReadPosRankSum=0.526;SC=GGGAGGGGGTGCATGGCCCGG;SOR=1.157;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=209;TCF=149;TCR=60;TR=143;WE=31289588;WS=31289570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,145:0.68:212
chr22	31301734	rs10625967	A	AGG	2093.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=4;PP=1663;SC=GCGACCCGGGAGGAGACACCG;SOR=4.712;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=48;TCF=43;TCR=5;TR=43;WE=31301742;WS=31301724;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr22	31302125	rs3804084	C	G	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=5.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.900;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=3;PP=299;ReadPosRankSum=-0.122;SC=GCCGCAGGGACGGATTCCGGG;SOR=1.179;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=50;TCF=37;TCR=13;TR=15;WE=31302133;WS=31302115;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,15:0.29:51
chr22	31302233	rs3804085	T	C	759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.227;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=17;PP=526;ReadPosRankSum=-0.618;SC=AGAGGCTGGATCCGCTGACCG;SOR=0.749;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=106;TCF=56;TCR=50;TR=34;WE=31302241;WS=31302223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,35:0.33:107
chr22	31318341	rs9609157	C	T	1415.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.357;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=2;PP=1160;ReadPosRankSum=2.707;SC=GAGCGTGTGGCGGGATTGCGG;SOR=0.656;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=87;TCR=3;TR=53;WE=31318349;WS=31318331;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,53:0.60:89
chr22	31329056	rs2074578	G	C	2472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=64;PP=2035;SC=GAAAACTAGCGTAGAGTCCCT;SOR=8.526;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=0;TCR=64;TR=64;WE=31329064;WS=31329046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr22	31329954	rs5753398	A	G	1635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=45;NR=0;PP=1350;SC=CTGCTGGTGGATGGTATAGAC;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=45;WE=31329962;WS=31329944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr22	31333631	rs3747151	T	C	56.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.464;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=2.810;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.53;ReadPosRankSum=1.163;SOR=0.158;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,6:0.16:37
chr22	31335724	rs1005252	T	A	1683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=34;PP=1360;SC=TGAGGGGAGGTGGCACTCTAG;SOR=1.802;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=49;TCF=15;TCR=34;TR=49;WE=31335732;WS=31335714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr22	31336149	rs739896	G	A	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.948;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.076;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=28;PP=620;ReadPosRankSum=-0.030;SC=AGAGTAGGGGGAGCTATGGCT;SOR=0.979;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=79;TCF=15;TCR=64;TR=33;WE=31336157;WS=31336139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,37:0.44:85
chr22	31342376	rs2072132	G	C	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=15;PP=690;ReadPosRankSum=0.141;SC=GGAAGAGGCAGGTCATGGTGT;SOR=0.730;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=113;TCF=70;TCR=43;TR=41;WE=31342384;WS=31342366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,42:0.35:121
chr22	31342594	rs5753403	C	T	1049.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=29;PP=807;SC=CCACAGCCCTCGTTCCCTCTC;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=0;TCR=29;TR=29;WE=31342602;WS=31342584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr22	31354653	rs737924	G	A	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.051;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.167;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=12;PP=390;ReadPosRankSum=-0.036;SC=GTTCAGCAAGGGCACCAAACA;SOR=0.119;SbPval=0.13;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=21;WE=31354661;WS=31354643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,20:0.38:53
chr22	31489575	rs62236130	G	A	552.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.786;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.819;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=445;ReadPosRankSum=-0.485;SC=TGTAGCCACCGTGGAGCCGGT;SOR=1.226;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=69;TCF=57;TCR=12;TR=24;WE=31489583;WS=31489565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,24:0.33:72
chr22	31491295	rs3205187	G	C	693.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=3;PP=573;SC=GCAGATGGAAGCAGAGCCAGC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=21;WE=31491303;WS=31491285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr22	31493460	rs5753458	T	C	287.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=12;PP=241;SC=GAGGCCGAGGTGGGCGGATCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=31493468;WS=31493450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr22	31494568	rs33991833	A	AC	1723.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=2;PP=1449;SC=GTGCTACAAGACCCCCCCTCC;SOR=5.283;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=59;TCF=55;TCR=4;TR=49;WE=31494576;WS=31494558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr22	31494866	rs4281997	G	T	1108.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=24;PP=885;SC=GGGGCGGGGCGTGATAGGCAG;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=33;TCF=8;TCR=25;TR=32;WE=31494874;WS=31494856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr22	31496837	rs13054770	C	A	356.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=4;PP=313;SC=CTGCCCCCGTCCCCCACCCCT;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=31496845;WS=31496827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr22	31497054	rs5753459	A	C	1387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=29;PP=1106;SC=CGCCGCCTCTACCACCTGCCC;SOR=1.721;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=13;TCR=29;TR=42;WE=31497062;WS=31497044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr22	31497110	rs35657209	G	T	782.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=22;PP=692;SC=GGTCCAGGGAGGCGGGTGGGG;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=31497118;WS=31497100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr22	31501788	rs11705137	T	C	1379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=25;PP=1174;SC=GGCTAGACTCTCAGCCTAGGC;SOR=1.347;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=14;TCR=25;TR=39;WE=31501796;WS=31501778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr22	31503560	rs13053829	C	T	190.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=6;PP=156;SC=CGTCTGGGCCCCCAGGCTGGC;SOR=2.584;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=31503568;WS=31503550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	31518824	rs8137317	A	T	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=303;SC=CTCAGCAGCCAGTTTGAAGGA;SOR=2.985;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=31518832;WS=31518814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr22	31521850	rs2240431	A	C	6314.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=96;NR=89;PP=2965;SC=GGCTTGGCACACAGAGTACAG;SOR=0.725;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=187;TCF=97;TCR=90;TR=185;WE=31521858;WS=31521840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,191:1.00:191
chr22	31522064	rs7284757	G	A	4043.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=97;PP=2965;SC=CTTCCAGGGTGGATGGTGTGC;SOR=2.476;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=124;TCF=27;TCR=97;TR=124;WE=31522072;WS=31522054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,127:1.00:127
chr22	31528932	rs2413027	A	T	482.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=1;PP=406;ReadPosRankSum=-0.756;SC=AGGGCTTGGTATTTATACTAG;SOR=1.179;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=18;WE=31528940;WS=31528922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr22	31529463	rs35342535	C	A	1036.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.544;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=14;PP=809;ReadPosRankSum=-0.485;SC=ATGGGAATACCTACCAGGTAC;SOR=1.133;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=148;TCF=96;TCR=52;TR=46;WE=31529471;WS=31529453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,45:0.30:148
chr22	31532568	rs757872	G	C	1052.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=7;PP=758;SC=AGAGGTCTCCGGATCCCTTCC;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=26;TCR=7;TR=33;WE=31532576;WS=31532558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr22	31532960	rs2232183	C	T	1172.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=2.181;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=26;PP=798;ReadPosRankSum=-0.416;SC=CTCGATTTCCCGGGGCCCAAT;SOR=0.718;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=73;TCF=27;TCR=46;TR=40;WE=31532968;WS=31532950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,45:0.57:79
chr22	31533967	rs2074739	G	A	1059.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.020;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=15;PP=774;ReadPosRankSum=-1.558;SC=GCACTGTGCCGTACATCCTAC;SOR=0.850;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=54;TCF=30;TCR=24;TR=35;WE=31533975;WS=31533957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,39:0.66:59
chr22	31536133	rs2232176	A	C	3026.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=36;PP=2372;SC=CAGCTACATGACTGCAGCCTC;SOR=1.265;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=55;TCR=36;TR=91;WE=31536141;WS=31536123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,94:1.00:94
chr22	31556103	rs5997893	A	G	608.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=16;PP=486;SC=TTAGAGCTTCAGCCATGGAAA;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=31556111;WS=31556093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr22	31583007	rs5997902	A	G	1152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=1;PP=1012;SC=GCAGAAATGGACAGTCAAGAG;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=35;WE=31583015;WS=31583004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr22	31600460	rs2413035	T	C	4089.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=26;NR=98;PP=2965;SC=TGTTTTCTCCTTTCTGTCTCT;SOR=2.741;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=124;TCF=26;TCR=98;TR=124;WE=31600468;WS=31600450;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chr22	31602139	rs3208937	A	G	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.07;QD=31.99;SOR=5.994;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr22	31602187	rs13158	C	T	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.75;QD=31.15;SOR=5.136;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	31658281	rs2073857	A	G	4176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=92;PP=2965;SC=AGATCCTCTGAGAAATCAGGC;SOR=1.936;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=129;TCF=37;TCR=92;TR=129;WE=31658289;WS=31658271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chr22	31663842	rs2228619	C	G	5116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=97;NR=59;PP=2965;SC=AGCTGAACCTCCTGACAGAGT;SOR=1.273;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=157;TCF=97;TCR=60;TR=156;WE=31663850;WS=31663832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr22	31664032	rs5997929	C	T	1890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=35;PP=1501;SC=TGAGCATACACAGGGAGGCTT;SOR=1.493;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=53;TCF=18;TCR=35;TR=53;WE=31664040;WS=31664022;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr22	31669267	rs2040532	A	G	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=1;PP=734;SC=GTTCACCTACAGCTGAGGAAG;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=32;WE=31669275;WS=31669257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr22	31669368	rs56177090	T	A	2163.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.434;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.915;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=24;PP=1713;ReadPosRankSum=-0.069;SC=TGGCTTAGATTGACCCTAGAC;SOR=0.529;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=111;TCF=80;TCR=31;TR=82;WE=31669376;WS=31669358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,83:0.74:112
chr22	31672676	rs59315359	G	A	138.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.20;QD=27.78;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr22	31672752	rs5997933	A	C	261.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=58.91;NF=6;NR=3;PP=264;SC=AGTGGCGGCCAAGGACCACGC;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=6;TCR=3;TR=9;WE=31672760;WS=31672742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr22	31679110	rs2040533	G	C	1468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=41;NR=4;PP=1275;SC=AAGGGGGGTGGTGCCCTCCTG;SOR=4.317;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=45;WE=31679118;WS=31679100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr22	31685458	rs5753543	G	A	7512.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=105;NR=132;PP=2965;SC=GAATCCCAACGAGGGCAGGGG;SOR=0.932;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=238;TCF=106;TCR=132;TR=237;WE=31685466;WS=31685448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr22	31687142	rs5753544	G	C	4982.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=67;NR=104;PP=2965;SC=CCAGCCCCGGGGCCGTCCCCC;SOR=1.219;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=171;TCF=67;TCR=104;TR=171;WE=31687150;WS=31687132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,171:1.00:171
chr22	31687313	rs4820044	A	G	3379.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=68;PP=2446;SC=CGGACACAGAATAGCGGGCAG;SOR=1.739;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=34;TCR=68;TR=102;WE=31687321;WS=31687303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chr22	31724972	rs131207	CA	C	1136.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=26;PP=1156;SC=CTCCTTCCCCCAACTCCTCTC;SOR=4.047;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=3;TCR=27;TR=29;WE=31724980;WS=31724962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr22	31795866	rs4820047	T	C	2407.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=65;PP=2075;SC=TCTGCCACGATTAGGAGTCCC;SOR=5.166;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=4;TCR=66;TR=69;WE=31795874;WS=31795856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr22	31838085	rs5997988	G	A	3354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=69;PP=2542;SC=TGGGTACAGAGCTGGATGACA;SOR=1.546;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=33;TCR=69;TR=102;WE=31838093;WS=31838075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr22	31844293	rs738658	A	C	5274.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=96;PP=2965;SC=TTAATGCATGACATTTCTTGC;SOR=1.284;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=159;TCF=63;TCR=96;TR=159;WE=31844301;WS=31844283;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr22	31844373	rs2012451	A	C	1840.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=58;PP=1459;SC=GTGCCCCAACAGTGGGCTATG;SOR=4.310;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=6;TCR=58;TR=64;WE=31844381;WS=31844363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chr22	31846079	rs144780466	C	CT	1276.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=3;PP=1232;SC=ACTTTGTCAACTTTTTTAGCC;SOR=4.664;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=42;TCF=39;TCR=3;TR=37;WE=31846087;WS=31846069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr22	31854370	rs4820048	A	G	1685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=1;PP=1395;SC=AAACCCCAAAAGCATCTAGCA;SOR=6.358;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=46;WE=31854378;WS=31854360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr22	31854434	rs11293411	AT	A	2610.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=25;PP=2279;SC=TTAACCACACATTTTTTAAGT;SOR=1.770;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=81;TCF=52;TCR=29;TR=71;WE=31854442;WS=31854424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chr22	31904170	rs2413054	A	G	1575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=16;PP=1305;SC=GAGCTGGCATATAGTTCAGAA;SOR=1.755;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=48;TCF=32;TCR=16;TR=48;WE=31904178;WS=31904160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr22	31926725	rs3818134	C	T	826.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=19;PP=641;SC=AGGCATTTGCCGGCCATTTTA;SOR=2.584;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=5;TCR=19;TR=24;WE=31926733;WS=31926715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr22	31971172	rs10657905	A	ATCT	1589.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=9;PP=1226;SC=TTTCCAGCTCATCTAACCTTA;SOR=1.739;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=30;TCF=20;TCR=10;TR=24;WE=31971180;WS=31971162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr22	31971258	rs5753700	T	C	1857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=23;PP=1395;SC=GCTCCAGATATACTTCTGTGA;SOR=1.197;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=35;TCR=23;TR=58;WE=31971266;WS=31971248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr22	31983287	rs112798271	A	ATTTGTTTTGT	7559.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=60;PP=2982;SC=ATGCCAATTTATTTGTTTTGT;SOR=2.084;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=175;TCF=31;TCR=144;TR=73;WE=31983295;WS=31983277;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr22	31998612	rs2006771	G	A	2297.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=33;PP=1786;SC=CACGCAGAGCGACAGCTTCTG;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=36;TCR=33;TR=69;WE=31998620;WS=31998602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr22	32001037	rs8142376	C	T	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=400;SC=GGGATGATCCCGGGTTCCTAG;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=32001045;WS=32001027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr22	32002294	rs5753723	T	C	947.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=2;PP=704;SC=TCTGCCTTCCTCGCACCCATG;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=26;WE=32002302;WS=32002284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr22	32010417	rs118063921	C	A	1707.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.444;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=52;NR=7;PP=1340;ReadPosRankSum=0.969;SC=GTGCATGGGGCCTGGGTCCCG;SOR=1.080;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=74;TCR=10;TR=59;WE=32010425;WS=32010407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,59:0.74:80
chr22	32081436	rs375258831	CAA	C,CA	865.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MQ=58.98;MQRankSum=-0.635;QD=15.46;ReadPosRankSum=-0.918;SOR=3.690;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/2:7,18,31:0.32,0.55:56
chr22	32097775	rs6518754	T	C	2256.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=73;PP=1756;SC=AGAAGAAAGATGGTCAAGCTG;SOR=4.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=80;TCF=7;TCR=73;TR=80;WE=32097783;WS=32097765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr22	32179850	rs138286	G	C	2981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=79;NR=7;PP=2573;SC=AACTGAAACTGTATATGGCAT;SOR=4.664;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=86;TCF=79;TCR=7;TR=86;WE=32179858;WS=32179840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr22	32435409	rs130262	G	C	509.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=4;PP=396;SC=CTGCTTCTCTGGGCTTTCCAC;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=32435417;WS=32435399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr22	32463875	rs135110	G	A	1152.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=2;PP=953;SC=TTTTTCTGCAGCAGCTGAGGG;SOR=4.804;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=33;WE=32463883;WS=32463865;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr22	32478972	rs131880	A	AG	2376.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.814;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.239;NF=55;NR=10;PP=2774;ReadPosRankSum=0.583;SC=GAAGGCCAGCAGAAGTAGAGG;SOR=0.222;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=106;TCF=92;TCR=14;TR=65;WE=32478980;WS=32478962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,73:0.67:109
chr22	32545637	rs9606913	A	T	57.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=5.238;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.23;ReadPosRankSum=1.841;SOR=2.219;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,8:0.17:47
chr22	32545849	rs58570639	C	CA	1653.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=36;PP=2138;SC=CACTTGGTGACGTAGAAAACA;SOR=2.531;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=48;TCF=9;TCR=39;TR=45;WE=32545857;WS=32545839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr22	32579550	rs136428	T	C	4494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=196;ExcessHet=3.0103;FS=4.229;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.824;QD=23.05;ReadPosRankSum=1.725;SOR=0.988;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,115:0.59:195
chr22	32579559	rs136429	A	G	4648.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.339;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=4.078;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.98;MQRankSum=-0.813;QD=22.90;ReadPosRankSum=0.029;SOR=0.973;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:82,121:0.60:203
chr22	32579676	rs136430	A	G	1880.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.530;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=57;PP=1502;ReadPosRankSum=-0.714;SC=AAGAATCACTATATTTATCAG;SOR=1.445;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=100;TCF=16;TCR=84;TR=66;WE=32579684;WS=32579666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,68:0.65:105
chr22	32579742	rs1297809	C	T	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.931;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=-0.695;QD=24.25;ReadPosRankSum=0.501;SOR=0.527;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,25:0.64:39
chr22	32579751	rs136431	C	G	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.885;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.45;MQRankSum=-0.741;QD=24.52;ReadPosRankSum=0.588;SOR=1.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:14,22:0.61:36
chr22	32586632	rs136466	C	T	353.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=296;ReadPosRankSum=0.362;SC=AGATTAAGTACAATCAAGAAA;SOR=0.399;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=22;TCF=21;TCR=1;TR=14;WE=32586640;WS=32586622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr22	32586854	rs136467	C	T	831.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.658;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=38.344;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-8.162;NF=2;NR=31;PP=718;ReadPosRankSum=-0.718;SC=TTAGGTGGAACTGAAGGAGCC;SOR=4.375;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=81;TCF=26;TCR=55;TR=33;WE=32586862;WS=32586844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,32:0.39:82
chr22	32586875	rs136468	G	A	1301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FS=9.123;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.13;MQRankSum=-9.429;QD=13.70;ReadPosRankSum=0.384;SOR=1.673;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:59,36:0.38:95
chr22	32586878	rs136469	A	G	1301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.638;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FS=12.642;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.07;MQRankSum=-9.430;QD=13.28;ReadPosRankSum=0.385;SOR=1.854;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:61,37:0.38:98
chr22	32586926	rs136470	T	C	1182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.732;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-7.084;NF=38;NR=22;PP=1338;ReadPosRankSum=0.134;SC=TGGGAACCACTTTCAGCATCA;SOR=0.557;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=134;TCF=80;TCR=54;TR=60;WE=32586934;WS=32586916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,44:0.40:111
chr22	32587023	rs55974778	C	G	4721.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.999;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FS=51.094;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.94;MQRankSum=-9.525;QD=20.35;ReadPosRankSum=-0.208;SOR=2.773;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:111,121:0.52:232
chr22	32587027	rs136472	G	C	4863.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.697;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=244;ExcessHet=3.0103;FS=28.858;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.70;MQRankSum=-9.515;QD=19.93;ReadPosRankSum=0.041;SOR=1.960;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:115,129:0.53:244
chr22	32587478	rs136473	T	C	671.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=24;PP=623;ReadPosRankSum=-0.670;SC=CTTCATGAGGTAACTTCCCTG;SOR=1.236;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=24;WE=32587486;WS=32587468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr22	32589023	rs136478	C	T	3485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-8.988;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.119;HP=2;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.085;NF=80;NR=60;PP=2962;ReadPosRankSum=1.112;SC=CATGGAAGAGCAACAGCAAAG;SOR=0.812;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=237;TCF=121;TCR=116;TR=140;WE=32589042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,138:0.58:238
chr22	32589034	rs136479	T	C	3946.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=7.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.599;HP=1;HapScore=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-5.415;NF=83;NR=62;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.755;SC=AACAGCAAAGTAGATCCTCCC;SOR=0.783;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=237;TCF=122;TCR=115;TR=145;WE=32589042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,142:0.60:237
chr22	32589090	rs8135276	C	T	3631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=238;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.003;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-10.845;NF=84;NR=70;PP=2962;ReadPosRankSum=2.151;SC=AGGCAGACGGCGCATCCACAC;SOR=0.625;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=255;TCF=140;TCR=115;TR=154;WE=32589098;WS=32589080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,138:0.58:237
chr22	32590449	rs108211	G	A	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=12;PP=277;ReadPosRankSum=0.000;SC=ACTGGGTCACGCCCTTCCACA;SOR=0.507;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=15;WE=32590457;WS=32590439;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr22	32590522	rs136484	T	C	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.450;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.674;NF=0;NR=4;PP=62;ReadPosRankSum=-0.405;SC=ACTGGTGATATATCTCCAGTT;SOR=0.693;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=32590530;WS=32590512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chr22	32598284	rs117710322	C	T	1012.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=1.759;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.103;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=7;PP=769;ReadPosRankSum=0.553;SC=AGACTCCACCCTGGAGCAATG;SOR=0.994;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=60;TCF=46;TCR=14;TR=34;WE=32598292;WS=32598274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,37:0.58:64
chr22	32617062	rs5998317	G	A	1480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.711;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.105;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=46;PP=1187;ReadPosRankSum=-1.321;SC=GTTTGCAATAGTATAATAGAA;SOR=2.066;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=71;TCF=10;TCR=61;TR=52;WE=32617070;WS=32617052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,54:0.73:74
chr22	32621619	rs2294208	C	T	2792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.596;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.087;HP=7;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=26;PP=2148;ReadPosRankSum=-0.434;SC=AGCAGGGAAACTTTTTTTCCA;SOR=0.339;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=146;TCF=111;TCR=35;TR=97;WE=32621627;WS=32621609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,104:0.65:159
chr22	32626908	rs2068209	G	A	417.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=0;PP=347;ReadPosRankSum=1.226;SC=CTCGAGGCCCGTCTTAGACAG;SOR=1.101;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=16;WE=32626916;WS=32626898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,16:0.59:27
chr22	32633505	rs5998328	G	T	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.621;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=84;ReadPosRankSum=0.748;SC=CCCTTGCCTTGCCCTGATTCA;SOR=0.892;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=5;WE=32633513;WS=32633495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,6:0.55:11
chr22	32753972	rs11912799	G	A	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.935;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.967;NF=19;NR=0;PP=343;ReadPosRankSum=-0.773;SC=AAATCTCTGAGGACGGGGGGT;SOR=0.504;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=62;TCF=61;TCR=1;TR=19;WE=32753980;WS=32753962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,16:0.28:58
chr22	32754036	rs11089557	G	A	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.132;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FS=6.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=52.86;MQRankSum=-6.541;QD=5.66;ReadPosRankSum=0.174;SOR=1.367;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,36:0.26:137
chr22	32754103	rs58637580	A	C	1142.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-5.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=248;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.165;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-13.785;NF=41;NR=29;PP=990;ReadPosRankSum=-0.019;SC=TTTCACCTCAAGGAAATTTTC;SOR=0.570;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=239;TCF=146;TCR=93;TR=70;WE=32754111;WS=32754093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,63:0.26:246
chr22	32754230	rs57676160	A	G	2978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FS=2.916;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.63;MQRankSum=-9.152;QD=11.55;ReadPosRankSum=0.897;SOR=0.881;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:173,85:0.33:258
chr22	32754230	.	ACC	GCT	2944	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;FR=0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MMLQ=24;MQ=51.93;NF=47;NR=39;PP=2944;QD=20;SC=GTGTGGATGCACCGTCTGCCT;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=265;TCF=136;TCR=129;TR=86;WE=32754240;WS=32754220;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:179,86:0.32:265
chr22	32754232	rs57606003	C	T	2978.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FS=4.510;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=55.06;MQRankSum=-9.970;QD=11.77;ReadPosRankSum=1.251;SOR=0.945;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:169,84:0.33:253
chr22	32754306	rs16987625	T	C	1556.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.377;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQ=59.25;MQRankSum=-4.863;NF=30;NR=45;PP=1190;ReadPosRankSum=-0.359;SC=TGCTGTTCCATGGTCTCTCAG;SOR=0.952;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=194;TCF=87;TCR=107;TR=75;WE=32754314;WS=32754296;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,73:0.37:198
chr22	32754500	rs5754006	C	G	1364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-5.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.541;NF=5;NR=37;PP=1983;ReadPosRankSum=-1.362;SC=GCAGTTGGCCCCTCATTCCAC;SOR=0.611;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=129;TCF=14;TCR=115;TR=42;WE=32754520;WS=32754490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,42:0.31:135
chr22	32754512	rs61625826	TG	T	1262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.921;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.483;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-3.538;NF=1;NR=31;PP=1984;ReadPosRankSum=-1.123;SC=TCATTCCACATGGGGATTAGC;SOR=0.408;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=107;TCF=6;TCR=101;TR=32;WE=32754520;WS=32754490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,37:0.32:115
chr22	32754561	rs5754007	C	G	387.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.137;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-6.202;NF=0;NR=16;PP=311;ReadPosRankSum=0.905;SC=TTCATCATCACATTCTCAGCC;SOR=0.263;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=16;WE=32754569;WS=32754551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,16:0.35:46
chr22	32756407	rs5749408	A	G	1207.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=9.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.226;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.973;NF=42;NR=35;PP=1474;ReadPosRankSum=-1.905;SC=GGCCGCCACTACTGGGAGGTG;SOR=0.561;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=252;TCF=150;TCR=102;TR=77;WE=32756415;WS=32756397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:172,56:0.25:228
chr22	32756555	rs136471	G	C	2136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.636;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=323;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.640;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-1.614;NF=48;NR=63;PP=1581;ReadPosRankSum=-0.311;SC=CTGCCAGCACGGTGCCGCTGA;SOR=0.541;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=325;TCF=130;TCR=195;TR=111;WE=32756563;WS=32756545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:216,105:0.33:321
chr22	32756703	rs73166367	C	T	183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FS=3.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.61;MQRankSum=-11.675;QD=0.88;ReadPosRankSum=-1.233;SOR=0.791;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:178,31:0.15:209
chr22	32756744	rs2076035	A	G	4165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.157;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.028;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=5.461;NF=71;NR=74;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.786;SC=ATGGTGATCAAGGTGTCTTGA;SOR=0.223;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=179;TCF=78;TCR=101;TR=145;WE=32756752;WS=32756734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,142:0.84:170
chr22	32756830	rs67352955	CA	C	704.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.081;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.819;HP=9;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=2.291;NF=7;NR=27;PP=410;ReadPosRankSum=-0.283;SC=GCCGCCACTGCAAAAAAAAAC;SOR=0.839;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=115;TCF=21;TCR=94;TR=34;WE=32756838;WS=32756820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,40:0.37:108
chr22	32756899	rs5749409	T	C	647.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.565;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.363;NF=6;NR=20;PP=432;ReadPosRankSum=0.349;SC=GTAAAAGCATTATACAGTCAT;SOR=0.387;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=75;TCF=13;TCR=62;TR=26;WE=32756907;WS=32756889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,28:0.36:78
chr22	32759025	rs5998440	G	C	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.507;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=6.863;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.07;ReadPosRankSum=0.432;SOR=0.220;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:68,23:0.25:91
chr22	32763635	rs72565573	CT	C	161.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=1.273;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.37;ReadPosRankSum=1.257;SOR=0.935;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,14:0.29:48
chr22	32763787	rs738267	T	C	174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-3.897;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=10;PP=96;ReadPosRankSum=-0.864;SC=TAGGGGCTCTTGGTAACCAAG;SOR=0.573;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=38;TCF=6;TCR=32;TR=12;WE=32763795;WS=32763777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,12:0.29:41
chr22	32764388	rs5998456	T	C	2964.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=38.01;SOR=5.031;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr22	32764388	.	TAACGCACCT	CAACGCACCC,CAACGCACCT	1781	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=26,72;NR=2,5;PP=656,1781;QD=25.3381383879;SC=CTAACACCTATAACGCACCTG;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=73;TCR=5;TR=28,77;WE=32764405;WS=32764378;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.36:78
chr22	32764397	rs5998457	T	C	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.306;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FS=1.629;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.03;ReadPosRankSum=1.361;SOR=0.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:72,37:0.34:109
chr22	32784051	rs11635	T	C	523.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=14;PP=444;ReadPosRankSum=-1.194;SC=GGCAGGTATTTACCACATCTG;SOR=0.660;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=83;TCF=41;TCR=42;TR=27;WE=32784059;WS=32784041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:57,26:0.31:83
chr22	32791003	rs2072818	A	C	270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.688;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=0;PP=95;ReadPosRankSum=-0.708;SC=ACAAACGTAGAGCTACGTACT;SOR=0.223;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=8;WE=32791011;WS=32790993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,12:0.32:37
chr22	32791355	rs8141075	G	C	575.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=446;ReadPosRankSum=-0.560;SC=TCACGTAAAGGACAAAAGCTG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=18;WE=32791363;WS=32791345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,19:0.83:23
chr22	32791929	rs3215463	GC	G	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.362;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.57;MQRankSum=-1.900;QD=1.75;ReadPosRankSum=1.537;SOR=0.641;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr22	32795641	rs5749426	C	T	804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.845;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=24;PP=643;ReadPosRankSum=0.459;SC=TGGGGTCAGCCTGCAGCATCC;SOR=0.569;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=98;TCF=29;TCR=69;TR=34;WE=32795649;WS=32795631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,35:0.34:104
chr22	32796247	rs737779	G	C	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.765;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=18;PP=595;ReadPosRankSum=1.524;SC=ATTTTAAGCTGTTTTCCCATC;SOR=0.557;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=109;TCF=49;TCR=60;TR=35;WE=32796255;WS=32796237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,35:0.31:113
chr22	32804313	rs5754073	G	A	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=39;PP=1113;SC=ACTGTATAACGTGAAGAGGTA;SOR=5.283;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=2;TCR=39;TR=41;WE=32804321;WS=32804303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr22	32804656	rs2076043	G	A	4929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.74;SOR=4.285;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chr22	32804656	.	GAATTATAAT	AAATTATAAC,AAATTATAAT	1783	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000,0.5000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=63,109;NR=6,11;PP=1783,962;QD=26.6154764473;SC=CAATATTTCAGAATTATAATT;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=120;TCF=109;TCR=11;TR=69,120;WE=32804673;WS=32804646;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.57:120
chr22	32804665	rs2076044	T	C	2357.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=135;ExcessHet=3.0103;FS=3.791;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.73;ReadPosRankSum=-0.803;SOR=1.350;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:48,85:0.64:133
chr22	32811952	rs5998478	A	G	244.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=1.306;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.08;ReadPosRankSum=-0.505;SOR=0.905;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,13:0.22:60
chr22	32813176	rs5844996	CT	C	369.27	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=0.202;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.65;MQRankSum=0.814;QD=13.68;ReadPosRankSum=1.286;SOR=3.180;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,23:0.85:27
chr22	32831540	rs2076050	C	T	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=216;ReadPosRankSum=-1.076;SC=ATGTTCACTCCACAATTCCCT;SOR=1.292;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=10;WE=32831548;WS=32831535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,12:0.63:19
chr22	32843436	rs4821063	C	T	220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.680;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=6;PP=115;ReadPosRankSum=0.610;SC=CCATTGTGAACTCCTACAGAG;SOR=0.113;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=7;WE=32843444;WS=32843426;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,9:0.43:21
chr22	32924733	rs135123	C	G	706.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.713;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=584;ReadPosRankSum=-0.099;SC=TTCGTCCACACCCCCATTCCT;SOR=1.819;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=24;WE=32924741;WS=32924723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,24:0.71:34
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chr22	33229804	rs11703156	G	A	764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.826;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=16;PP=609;ReadPosRankSum=0.408;SC=AGGCTCAAATGGGAAAATCCA;SOR=0.784;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=129;TCF=61;TCR=68;TR=36;WE=33229812;WS=33229794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:96,36:0.27:132
chr22	33229830	rs242076	A	G	2518.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.540;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.708;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=60;PP=1943;ReadPosRankSum=1.200;SC=AGCATTTAGCACTGATCATGC;SOR=0.789;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=135;TCF=50;TCR=85;TR=94;WE=33229838;WS=33229820;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,97:0.70:138
chr22	33253280	rs9862	T	C	1838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=35;PP=1467;SC=AGTACATCCATACGGAAGCTT;SOR=1.382;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=55;TCF=20;TCR=35;TR=55;WE=33253288;WS=33253270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr22	33832735	rs713740	A	G	115.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=58;SC=CCAGCATGCCAACAGATAGCC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=33832743;WS=33832725;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	34000230	rs695504	T	C	74.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.667;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=46;ReadPosRankSum=0.325;SC=AAAGTGGATTTTGTGCACTCA;SOR=0.269;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=4;WE=34000238;WS=34000226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr22	34000282	rs695258	C	G	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=0;PP=313;ReadPosRankSum=-1.431;SC=TCAGATTCTGCTGGCAAACAA;SOR=0.395;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=15;WE=34000290;WS=34000272;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr22	34022284	rs86487	G	A	1447.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.238;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.474;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=40;PP=1190;ReadPosRankSum=-0.019;SC=CATTGTATCCGGCGCAGACAA;SOR=1.182;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=85;TCF=21;TCR=64;TR=51;WE=34022292;WS=34022274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,51:0.60:85
chr22	35463162	rs361863	A	G	2263.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=21;PP=1847;SC=GAAGAAGCTGAGCCTGTCCTT;SOR=2.093;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=54;TCR=21;TR=75;WE=35463170;WS=35463152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chr22	35463179	rs361668	T	C	2652.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=57;NR=27;PP=1833;SC=CCTTCTCCATTGAGGCGATCC;SOR=1.775;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=87;TCF=58;TCR=29;TR=84;WE=35463187;WS=35463169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chr22	35478486	rs2899241	A	C	4678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=2.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=128;NR=10;PP=2965;ReadPosRankSum=1.000;SC=GGCCACTGACACAACTTGGAC;SOR=3.427;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=139;TCF=129;TCR=10;TR=138;WE=35478494;WS=35478476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,141:0.99:142
chr22	35478529	rs8140287	G	A	1803.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.742;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=255;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=29;PP=1381;ReadPosRankSum=0.744;SC=AAGAGCAAGCGGAGGGTTCGT;SOR=0.720;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=247;TCF=163;TCR=84;TR=86;WE=35478537;WS=35478519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:166,85:0.34:251
chr22	35478688	rs725267	C	T	1996.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-5.492;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.722;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=59;PP=1581;ReadPosRankSum=0.294;SC=CCTCAGCCCCCAGCCTCCATG;SOR=0.200;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=109;TCF=15;TCR=94;TR=71;WE=35478696;WS=35478678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,73:0.65:112
chr22	35481493	rs61735502	C	T	1839.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=202;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.091;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=36;PP=1428;ReadPosRankSum=1.645;SC=GCTCCTCCCACGAGCTGTTGT;SOR=0.436;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=195;TCF=107;TCR=88;TR=71;WE=35481501;WS=35481483;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,76:0.38:201
chr22	35481776	rs3810619	T	C	1738.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=48;PP=1480;SC=GGAAATCGATTTCACAATCCA;SOR=6.439;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=49;TCF=1;TCR=48;TR=49;WE=35481784;WS=35481766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr22	35660971	.	C	T	3404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.239;ClippingRankSum=0.000;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=42;PP=2509;ReadPosRankSum=1.608;SC=CTTATTCTGTCACCAAAGGAG;SOR=0.702;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=192;TCF=121;TCR=71;TR=115;WE=35660979;WS=35660961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,124:0.61:202
chr22	35684533	rs5750093	G	C	426.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=1.933;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=362;ReadPosRankSum=-1.018;SC=TCTCAGGATGGCGTAACATAG;SOR=2.448;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=13;WE=35684541;WS=35684523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr22	35695894	rs200751924	G	A	1546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=18.302;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=26;PP=1177;ReadPosRankSum=-1.295;SC=GCTGATTCCCGGGGTTGGTGG;SOR=0.100;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=91;TCF=58;TCR=33;TR=56;WE=35695902;WS=35695884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,59:0.63:94
chr22	35741820	rs133398	G	A	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=28;PP=698;ReadPosRankSum=0.245;SC=AGGAGGACCCGTTGTTCTCAC;SOR=0.729;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=108;TCF=35;TCR=73;TR=39;WE=35741828;WS=35741810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,41:0.37:111
chr22	35741863	rs133399	A	G	2153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=48;PP=1695;SC=GGGTAGACTTATATAGCATAT;SOR=2.139;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=19;TCR=48;TR=67;WE=35741871;WS=35741853;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr22	35742925	rs743810	T	G	1519.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.542;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.345;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=15;PP=1132;ReadPosRankSum=0.223;SC=CTTCCCAGGGTAATGATGCGG;SOR=0.404;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=73;TCF=52;TCR=21;TR=50;WE=35742933;WS=35742915;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,55:0.70:79
chr22	35743124	rs2071745	G	C	2476.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.340;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.327;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.751;NF=35;NR=53;PP=1817;ReadPosRankSum=-0.316;SC=CAGCTGAGGGGCCCCCGGGTC;SOR=0.281;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=142;TCF=51;TCR=91;TR=88;WE=35743132;WS=35743114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,94:0.63:149
chr22	35796652	rs743813	C	G	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=14;PP=362;SC=GCTCACACGCCTCTACCAGCC;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=35796660;WS=35796642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
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chr22	35799542	rs713618	C	T	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=38;PP=1194;SC=GAAGGTGGGTCGGAGGGCAGT;SOR=4.125;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=42;WE=35799550;WS=35799532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
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chr22	35810052	rs80433	T	C	2368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=66;PP=2075;SC=CTCTGGGTCCTCAGGACACCT;SOR=5.640;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=69;TCF=3;TCR=66;TR=69;WE=35810060;WS=35810042;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr22	35817257	rs2071743	G	A	213.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-2.216;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=161;ReadPosRankSum=2.961;SC=GGCTGGCTGGGGAGGAAGGGA;SOR=0.368;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=9;WE=35817265;WS=35817247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,9:0.39:23
chr22	35817553	rs2071744	C	T	1613.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.825;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.862;HP=3;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=44;PP=1298;ReadPosRankSum=1.856;SC=CAGTGTGTGTCTTGCTTCTCT;SOR=1.533;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=87;TCF=21;TCR=66;TR=55;WE=35817561;WS=35817543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,57:0.60:95
chr22	35817597	rs133431	C	A	2180.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=41;PP=1659;SC=TTCTTTTTGCCATAAGACCCC;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=22;TCR=41;TR=63;WE=35817605;WS=35817587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr22	36006923	rs35171458	G	GC	1156.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=1;PP=1414;SC=CCCAGGCTCTGCTCCTACCTC;SOR=5.549;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=30;WE=36006931;WS=36006913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr22	36007045	rs7292	G	A	4495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=75;NR=65;PP=2965;SC=CGGTGAGCACGGTGGCACCAT;SOR=0.838;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=141;TCF=76;TCR=65;TR=140;WE=36007053;WS=36007035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chr22	36007075	rs7293	C	T	4232.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=73;PP=2965;SC=AGTCCTCAGACGCCTTCATCT;SOR=0.895;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=131;TCF=58;TCR=73;TR=131;WE=36007083;WS=36007065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr22	36114047	rs4821438	C	T	3138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.42;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr22	36114054	rs2899256	C	T	2817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.45;SOR=4.209;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr22	36122517	rs17723764	T	C	8360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=260;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=161;PP=2965;SC=ACGAGTTGCTTACCAAGACCA;SOR=1.474;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=248;TCF=87;TCR=161;TR=247;WE=36122525;WS=36122507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,256:1.00:256
chr22	36123083	rs2076672	C	T	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=3.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.823;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=12;PP=390;ReadPosRankSum=0.757;SC=GGGGCAAGGACGGAGACAGCA;SOR=0.283;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=74;TCF=30;TCR=44;TR=24;WE=36123091;WS=36123073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,26:0.33:79
chr22	36140124	.	GTTT	G	997.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.374;ClippingRankSum=0.000;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=6.392;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.32;MQRankSum=1.646;QD=26.26;ReadPosRankSum=0.173;SOR=2.608;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,26:0.68:38
chr22	36157110	rs193238024	G	A	687.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=0;PP=540;ReadPosRankSum=-0.653;SC=AAGCAGGACAGGGCACTGGGA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=23;WE=36157118;WS=36157100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,24:0.73:33
chr22	36218874	rs57822436	CT	C	904.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.97;MQRankSum=0.079;QD=18.85;ReadPosRankSum=0.693;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,46:0.96:48
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chr22	36424450	rs9607299	A	C	80.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=3;PP=59;SC=GAGGCGGCTGATGCGGCTGGG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=36424458;WS=36424440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr22	36537725	rs61731692	G	A	2391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.635;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.611;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=55;PP=1782;ReadPosRankSum=0.179;SC=CTGATGATGTGTATGAGTGCT;SOR=0.390;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=131;TCF=39;TCR=92;TR=83;WE=36537733;WS=36537715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,90:0.64:140
chr22	36541448	rs9610409	G	C	380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.512;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=289;ReadPosRankSum=0.490;SC=GTGCCTGCCAGAGAAAACTAG;SOR=1.124;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=39;TCF=30;TCR=9;TR=16;WE=36541456;WS=36541438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,16:0.42:38
chr22	36541725	rs1807672	G	T	446.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=11;PP=344;SC=GGTGGTTCGAGGTTAATCCTC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=36541733;WS=36541715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr22	36545137	rs132642	A	T	3554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=43;PP=2749;SC=GAGACTTTCCATGGAGCTCTC;SOR=1.049;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=60;TCR=43;TR=103;WE=36545145;WS=36545127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chr22	36545780	rs7290574	C	T	945.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=3;PP=719;ReadPosRankSum=-1.171;SC=GACTGGGCTCCACTCCCTTAA;SOR=0.765;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=44;TCF=40;TCR=4;TR=30;WE=36545788;WS=36545770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,32:0.70:46
chr22	36545826	rs132644	T	C	1580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.756;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.947;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=13;PP=1076;ReadPosRankSum=1.124;SC=TACATGCTTATTGTAAATGAC;SOR=0.309;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=80;TCF=62;TCR=18;TR=54;WE=36545834;WS=36545816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,60:0.71:85
chr22	36556823	rs132653	G	T	2331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.929;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.548;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=38;PP=1819;ReadPosRankSum=-1.179;SC=CGTTCTCCAGGCTCTGAGATA;SOR=0.844;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=117;TCF=61;TCR=56;TR=82;WE=36556831;WS=36556813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,88:0.72:123
chr22	36587154	rs111781032	G	T	240.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.950;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=4;PP=174;ReadPosRankSum=-1.082;SC=ATGGATATGGGTGAGCTCATT;SOR=1.329;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=44;TCF=26;TCR=18;TR=13;WE=36587162;WS=36587144;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,13:0.30:44
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chr22	36587223	rs6000173	G	T	1359.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.343;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.110;HP=5;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=19;PP=1040;ReadPosRankSum=-0.334;SC=CTCGGATTTTGCCCCCTTGTG;SOR=0.431;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=74;TCF=47;TCR=27;TR=47;WE=36587231;WS=36587213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,49:0.65:75
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chr22	36587511	rs2227168	C	T	3736.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.760;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=237;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.605;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=65;PP=2784;ReadPosRankSum=-1.401;SC=TGTGATGTCACGCAGAATGTC;SOR=0.593;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=227;TCF=119;TCR=108;TR=134;WE=36587519;WS=36587501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,141:0.60:234
chr22	36587704	rs132700	T	C	1865.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.936;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=240;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.902;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=19;PP=1461;ReadPosRankSum=-0.762;SC=GGTGCCAACATAACGCCAATG;SOR=0.873;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=244;TCF=178;TCR=66;TR=81;WE=36587712;WS=36587694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:159,81:0.34:240
chr22	36587845	rs3075364	A	ACT	21072.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=492;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=133;NR=238;PP=2930;SC=ATTTGAGGAAACTTTCAAAAA;SOR=0.938;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=392;TCF=137;TCR=255;TR=371;WE=36587853;WS=36587835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,472:1.00:472
chr22	36587886	rs78582347	C	T	2842.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=380;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.013;HP=1;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.711;NF=33;NR=92;PP=2269;ReadPosRankSum=0.982;SC=CTTTTTGCTGCATGTCTTTGT;SOR=0.829;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=366;TCF=105;TCR=261;TR=125;WE=36587894;WS=36587876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:245,126:0.34:371
chr22	36587952	rs2227169	C	T	3077.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.870;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.708;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=97;PP=2507;ReadPosRankSum=-1.168;SC=GAGCATCTGCCTCTTCCCTGT;SOR=2.633;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=142;TCF=3;TCR=139;TR=98;WE=36587960;WS=36587942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,103:0.70:147
chr22	36591380	rs2007468	A	G	3731.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=56;PP=2807;SC=CCACACGCACAAATCTCTTCC;SOR=0.895;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=121;TCF=65;TCR=56;TR=121;WE=36591388;WS=36591370;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,128:1.00:128
chr22	36591475	rs77639244	G	A	352.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.065;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.724;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=13;PP=251;ReadPosRankSum=-0.825;SC=TCAGTGAAGCGTTTCTTTTCT;SOR=0.263;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=58;TCF=8;TCR=50;TR=16;WE=36591483;WS=36591465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,17:0.27:62
chr22	36597556	.	G	A	23	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=1;HapScore=2;MGOF=24;MMLQ=29;MQ=51.39;NF=2;NR=0;PP=23;QD=28.8856062736;SC=GCAGAGGGGCGTCTGGGCGCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=36597564;WS=36597546;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr22	36597611	rs132726	G	C	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.16;QD=35.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr22	36597616	rs132727	C	G	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=54.16;QD=35.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr22	36597877	rs132734	G	A	3955.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.47;SOR=0.763;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr22	36597881	rs132735	G	T	3979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.22;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chr22	36598049	rs80587	C	G	4760.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.41;QD=43.28;SOR=2.218;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chr22	36598058	rs132736	T	C	4556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.14;QD=45.57;SOR=2.655;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr22	36598187	rs132737	G	C	367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=10;PP=309;SC=CCGTTTTGCTGTGTCACCCAG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=36598195;WS=36598177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr22	36623731	rs132760	T	C	11365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=353;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=149;NR=193;PP=2965;SC=CGCCCAATGATATGCGGGGGT;SOR=1.011;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=343;TCF=149;TCR=194;TR=342;WE=36623739;WS=36623721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,351:1.00:351
chr22	36633107	rs5995267	C	A	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.515;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.226;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=4;PP=354;ReadPosRankSum=-1.219;SC=GGCCTCGGACCTGCCCAATAC;SOR=1.022;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=64;TCF=51;TCR=13;TR=23;WE=36633115;WS=36633097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,23:0.35:65
chr22	36633225	rs1557534	G	A	1210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.032;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.146;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=24;PP=891;ReadPosRankSum=1.610;SC=CTGCCCCTCAGGCTTGACTAG;SOR=0.400;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=149;TCF=87;TCR=62;TR=50;WE=36633233;WS=36633215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:99,53:0.35:152
chr22	36633564	rs916263	T	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.128;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.561;NF=5;NR=2;PP=66;ReadPosRankSum=1.039;SC=AAGTGATCCTTCTGCCTCAGC;SOR=0.631;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=27;TCF=17;TCR=10;TR=7;WE=36633572;WS=36633554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,7:0.27:26
chr22	36633744	rs114913627	G	A	919.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.315;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=25;PP=753;ReadPosRankSum=0.143;SC=GGCCTCAGCCGTGGCACTGCA;SOR=0.260;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=49;TCF=12;TCR=37;TR=35;WE=36633752;WS=36633734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,35:0.71:49
chr22	36633836	.	A	C	21	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;FR=0.5000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=1;NR=4;PP=21;QD=11.1542425094;SC=GATGCTCTGGACCCCACCTTC;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=5;WE=36633844;WS=36633826;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:19,5:0.21:24
chr22	36635444	rs136144	A	G	348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.34;BaseQRankSum=-4.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=45;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=203;ReadPosRankSum=-1.307;SC=GAGCTATTGCAAGAATAAGGA;SOR=0.997;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=13;WE=36635452;WS=36635434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,16:0.57:28
chr22	36635490	rs145265152	GGGATCTTCCTCT	G	949.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=1;PP=2934;ReadPosRankSum=-0.163;SC=AACTTACCAAGGGATCTTCCT;SOR=0.586;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=60;TCF=51;TCR=9;TR=15;WE=36635509;WS=36635480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,27:0.36:76
chr22	36635756	rs5756111	G	A	514.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=16;PP=392;ReadPosRankSum=0.228;SC=CCAGACATCCGGGTCCCTCTC;SOR=0.512;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=17;WE=36635764;WS=36635746;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr22	36657596	rs713929	A	G	1364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.261;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=250;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.538;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=25;PP=1002;ReadPosRankSum=1.075;SC=GCTGTTATGCACTCCCACACT;SOR=0.633;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=242;TCF=163;TCR=79;TR=74;WE=36657604;WS=36657586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:174,75:0.30:249
chr22	36657628	rs136163	T	G	1751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-7.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=302;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=49;NR=42;PP=1283;ReadPosRankSum=-1.964;SC=TTATCCTTTCTTCTTTCCAAC;SOR=0.718;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=289;TCF=158;TCR=131;TR=91;WE=36657636;WS=36657618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:205,95:0.32:300
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chr22	36661842	rs136177	G	A	1005.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.173;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=17;PP=771;ReadPosRankSum=0.548;SC=AGGTGGAGAGGGTTAATGAAC;SOR=0.750;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=129;TCF=62;TCR=67;TR=41;WE=36661850;WS=36661832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,43:0.33:130
chr22	36678782	rs115031369	C	T	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=2.003;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.996;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=25;PP=444;ReadPosRankSum=-0.270;SC=CCATCCCCGGCGCCTTTCCGG;SOR=0.394;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=132;TCF=36;TCR=96;TR=37;WE=36678790;WS=36678772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,35:0.25:139
chr22	36682707	rs13053731	G	A	2103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.971;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=19;PP=1560;ReadPosRankSum=0.479;SC=AAAGCCCCACGCTGCCACCTG;SOR=0.677;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=114;TCF=87;TCR=27;TR=76;WE=36682715;WS=36682697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,81:0.68:119
chr22	36684354	rs2269529	T	C	3979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.704;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=10.395;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.48;ReadPosRankSum=0.707;SOR=1.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,101:0.57:177
chr22	36684358	rs2269530	C	A	4044.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FS=5.446;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.60;ReadPosRankSum=-0.433;SOR=1.115;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:74,105:0.59:179
chr22	36684980	rs11549907	G	A	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.461;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.751;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=21;PP=636;ReadPosRankSum=1.388;SC=TCTCCAGCTCGTGGACCTGAG;SOR=0.610;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=46;TCR=58;TR=38;WE=36684988;WS=36684970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:68,38:0.36:106
chr22	36690120	rs56020676	T	C	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=5.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.359;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=362;ReadPosRankSum=1.524;SC=CGCGCCAGGGTCCTGGCGGAG;SOR=0.169;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=68;TCF=64;TCR=4;TR=20;WE=36690128;WS=36690110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,22:0.31:72
chr22	36691607	rs710181	A	C	1203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=11;PP=981;SC=CTGTTTTCAGAGCCTCTAGCT;SOR=1.923;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=37;WE=36691615;WS=36691597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr22	36691691	rs875725	T	C	586.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=2.904;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.178;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=13;PP=466;ReadPosRankSum=1.400;SC=CTTCCTGGAGTTCAGAGATCT;SOR=0.797;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=54;TCF=29;TCR=25;TR=22;WE=36691699;WS=36691681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,24:0.39:62
chr22	36695173	rs2187776	C	T	1067.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=32;PP=912;SC=GCCCGGAAATCTGGGGCTGAA;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=32;WE=36695181;WS=36695163;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr22	36695247	rs4821480	G	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.638;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=133;ReadPosRankSum=-2.037;SC=GGATAATTTTGAAAGGTCACG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=7;WE=36695255;WS=36695237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr22	36696087	rs6000235	C	T	358.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.790;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=292;ReadPosRankSum=0.823;SC=GCAGCAGCAGCGGGGAGCCAG;SOR=1.044;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=64;TCF=58;TCR=6;TR=20;WE=36696095;WS=36696077;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,19:0.29:65
chr22	36702149	rs8138016	G	A	1079.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=4.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.251;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=21;PP=768;ReadPosRankSum=0.335;SC=TAGAACAGTCGGAGAATAGTC;SOR=0.489;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=147;TCF=69;TCR=78;TR=44;WE=36702157;WS=36702139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,47:0.32:149
chr22	36705529	rs1557529	A	G	2816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=81;PP=2372;SC=AACCCCATGCATGGAAAAGTC;SOR=7.500;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=83;TCF=1;TCR=82;TR=82;WE=36705537;WS=36705519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr22	36708049	rs3842715	CTCCTGTGA	C	910.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.238;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=2;PP=2964;ReadPosRankSum=1.247;SC=GACTCCACCTCTCCTGTGAAG;SOR=2.753;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=27;TCF=25;TCR=2;TR=20;WE=36708064;WS=36708039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,23:0.79:29
chr22	36708084	rs2413396	C	T	988.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-3.826;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.763;HP=2;HapScore=1;MGOF=53;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=1;PP=1156;ReadPosRankSum=-0.317;SC=TCCCCGTGAGCGCTCCTCACC;SOR=3.509;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=36;WE=36708092;WS=36708074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,36:0.73:49
chr22	36710045	rs3752461	C	T	435.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=3.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=1;PP=351;ReadPosRankSum=2.163;SC=GGATCTCAGCCTTGGGGCTTC;SOR=0.527;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=13;WE=36710053;WS=36710035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,15:0.65:23
chr22	36712472	rs5756152	A	G	1794.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=6;PP=1500;SC=AGATCGATGCAGGACCATGAG;SOR=4.277;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=58;TCR=6;TR=64;WE=36712480;WS=36712462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr22	36722490	rs8136069	C	A	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=1.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=413;ReadPosRankSum=0.684;SC=ATGGGCCCAGCCTCTGCTTCA;SOR=0.811;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=33;TCF=31;TCR=2;TR=17;WE=36722498;WS=36722480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,20:0.53:38
chr22	36722534	rs8136336	G	A	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=3;PP=443;ReadPosRankSum=1.289;SC=AGCTGAAGCCGGGACCACTAA;SOR=0.522;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=48;TCR=6;TR=25;WE=36722542;WS=36722524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,27:0.46:59
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chr22	36744902	.	T	C	345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.250;ClippingRankSum=0.000;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.93;MQRankSum=-1.273;QD=23.05;ReadPosRankSum=-2.858;SOR=0.892;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,5:0.33:15
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chr22	36891858	rs5756219	C	A	4011.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.135;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=218;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.160;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=74;NR=75;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.228;SC=GTTCATCATTCTCGGACCTTC;SOR=0.619;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=211;TCF=105;TCR=106;TR=149;WE=36891866;WS=36891848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,153:0.71:216
chr22	36897517	rs73886816	T	C	517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=3.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.183;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=15;PP=331;ReadPosRankSum=0.842;SC=ATTTATTTAGTTAGTTTTGAG;SOR=1.697;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=35;TCF=4;TCR=31;TR=16;WE=36897525;WS=36897507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,19:0.49:39
chr22	36900271	rs2277841	T	C	6753.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=221;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=135;NR=79;PP=2965;SC=CTGGTTGGTGTTGGCTTCTTC;SOR=1.270;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=215;TCF=135;TCR=80;TR=214;WE=36900279;WS=36900261;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chr22	36900806	rs760718	A	G	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.862;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=32;PP=1120;ReadPosRankSum=0.140;SC=GTGGCTACAAAGAGGACGCTG;SOR=0.582;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=85;TCF=28;TCR=57;TR=49;WE=36900814;WS=36900796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,52:0.58:89
chr22	36907098	rs728785	T	C	3210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-4.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.580;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=68;PP=2267;ReadPosRankSum=-0.013;SC=TGTGATATGATGTTCACTTTC;SOR=0.796;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=182;TCF=85;TCR=97;TR=125;WE=36907106;WS=36907088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,131:0.69:190
chr22	36912970	rs73411756	C	T	98.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.839;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=5;PP=68;ReadPosRankSum=0.805;SC=GCTCTGAGCTCGCTGCCTGTT;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=5;WE=36912978;WS=36912960;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,5:0.36:14
chr22	36919447	rs2076084	C	T	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.555;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.37;ReadPosRankSum=-0.880;SOR=0.125;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,18:0.26:69
chr22	36921659	rs73886821	G	C	1444.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=214;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.771;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=20;PP=1235;ReadPosRankSum=-0.401;SC=TTAGAATAAAGAACAACTTTC;SOR=0.917;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=204;TCF=141;TCR=63;TR=68;WE=36921667;WS=36921649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:145,67:0.32:212
chr22	36922067	rs11558515	G	A	619.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.882;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=480;ReadPosRankSum=-0.160;SC=GATCTCCTTTGCTGAACGGCT;SOR=0.807;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=78;TCF=36;TCR=42;TR=28;WE=36922075;WS=36922057;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,28:0.37:76
chr22	37159819	rs739002	T	C	630.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.731;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.424;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=0;PP=484;ReadPosRankSum=-0.109;SC=GGCTGCTAAGTGGCAGGGCCA;SOR=2.683;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=35;TCR=1;TR=22;WE=37159827;WS=37159809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,23:0.64:36
chr22	37163232	.	A	G	1906.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.742;ClippingRankSum=0.000;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.001;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=17;PP=1517;ReadPosRankSum=1.128;SC=CGAAATGCTCAGCCAAGTCTA;SOR=1.147;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=114;TCF=85;TCR=29;TR=75;WE=37163240;WS=37163222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,77:0.66:116
chr22	37163329	rs1048012	C	T	2936.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.762;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=54;PP=2384;ReadPosRankSum=-0.203;SC=CTGAGTTCCCCTGGGTAAAGG;SOR=0.697;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=167;TCF=79;TCR=88;TR=104;WE=37163337;WS=37163319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,107:0.63:169
chr22	37196871	rs3484	G	A	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.576;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=5;PP=200;ReadPosRankSum=0.835;SC=GGAGGGTGGCGAGAGGGGCCG;SOR=1.236;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=55;TCF=35;TCR=20;TR=17;WE=37196879;WS=37196861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,19:0.34:56
chr22	37196971	rs2001063	C	A	592.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-0.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.004;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=16;PP=462;ReadPosRankSum=-0.336;SC=TTCTGCAGAACAAAATGACAA;SOR=0.993;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=74;TCF=34;TCR=40;TR=28;WE=37196979;WS=37196961;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,27:0.37:73
chr22	37207319	rs113051616	CTAAATAAATAAA	C	163.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.383;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=1;PP=927;ReadPosRankSum=0.674;SC=GAGACTGTCTCTAAATAAATA;SOR=0.330;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=5;WE=37207338;WS=37207309;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr22	37207667	rs34262500	T	A	280.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=9;PP=231;SC=TTTCTCTTCATCAGGTAGGTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=37207675;WS=37207657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr22	37266322	rs2075938	A	G	640.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=0;PP=543;SC=TAAACAACGCATTTCTGTTAT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=25;TCR=0;TR=24;WE=37266330;WS=37266312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr22	37267767	rs2072708	A	G	487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.150;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.366;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=19;PP=385;ReadPosRankSum=1.482;SC=CCCCGCCCCCACGCTGGCCAG;SOR=1.769;SbPval=0.92;Source=Platypus;TC=68;TCF=17;TCR=51;TR=22;WE=37267775;WS=37267757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,22:0.32:69
chr22	37268257	rs5756374	C	T	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.413;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=3;PP=213;ReadPosRankSum=-0.816;SC=CTTATTCTCCCCAAGCCTCAG;SOR=1.158;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=41;TCF=31;TCR=10;TR=14;WE=37268265;WS=37268247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr22	37268501	rs2072710	A	G	249.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=9;PP=189;ReadPosRankSum=-0.088;SC=GGTGAGATTGAAGGTGAGGTT;SOR=0.527;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=41;TCF=10;TCR=31;TR=12;WE=37268509;WS=37268491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,12:0.29:42
chr22	37268555	rs2072711	A	G	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=19;PP=639;SC=GTGGAAGTGCAATTGGAGGTG;SOR=2.215;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=37268563;WS=37268545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr22	37271882	rs2075939	T	C	9290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=329;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=109;NR=209;PP=2965;SC=CTACGACCACTGCCCCTCACA;SOR=1.559;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=318;TCF=109;TCR=209;TR=318;WE=37271890;WS=37271872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,324:1.00:324
chr22	37387461	rs6000523	C	T	81.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.593;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=2;PP=20;ReadPosRankSum=-0.197;SC=CCCTTAGAGCCAACACACCCT;SOR=0.730;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=18;TCF=6;TCR=12;TR=3;WE=37387469;WS=37387451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr22	37387505	rs9610625	C	A	499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.718;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.858;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=374;ReadPosRankSum=-0.378;SC=TCCCATCACCCGCAGCTCCTC;SOR=4.018;SbPval=0.98;Source=Platypus;TC=30;TCF=23;TCR=7;TR=17;WE=37387513;WS=37387495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
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chr22	37453452	rs710185	C	T	299.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.274;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.592;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=8;PP=151;ReadPosRankSum=-0.301;SC=CACCCAAGCACGTGTACCGCG;SOR=1.538;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=47;TCF=23;TCR=24;TR=12;WE=37453460;WS=37453442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,16:0.31:52
chr22	37462926	rs2235321	G	A	4247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FS=5.165;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.72;ReadPosRankSum=-1.237;SOR=0.395;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,108:0.68:159
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chr22	37464624	rs877908	T	C	1139.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.978;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.561;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=8;PP=851;ReadPosRankSum=-0.353;SC=GTTCTAATCTTTGCTCCAGTC;SOR=1.181;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=36;WE=37464632;WS=37464614;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,40:0.66:61
chr22	37465385	rs200434923	CTGGGG	C	447.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.493;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.951;NF=0;NR=12;PP=510;ReadPosRankSum=0.425;SC=GGAGGCCATGCTGGGGTGGGG;SOR=2.049;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=12;WE=37465397;WS=37465375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,12:0.75:16
chr22	37467270	rs5756504	C	T	206.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.714;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=163;ReadPosRankSum=-0.536;SC=CTCAGACTGGCCTATTGAGCA;SOR=0.283;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=8;WE=37467278;WS=37467260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr22	37469386	rs111916270	AGATG	A	1012.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.017;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.710;NF=21;NR=2;PP=1001;ReadPosRankSum=0.167;SC=GGAGACCAGAAGATGGATGGA;SOR=0.394;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=44;TCF=41;TCR=3;TR=23;WE=37469397;WS=37469376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,26:0.70:37
chr22	37469591	rs4820268	G	A	2184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=48;PP=1627;ReadPosRankSum=1.281;SC=ACTGCTCTTCGTCGCTGCCGT;SOR=0.641;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=111;TCF=40;TCR=71;TR=77;WE=37469599;WS=37469581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,81:0.70:115
chr22	37470536	rs2076086	C	T	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.830;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=6;PP=636;ReadPosRankSum=-0.037;SC=TTCCTGGGTGCTCATAATGGA;SOR=0.300;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=46;TCF=39;TCR=7;TR=32;WE=37470544;WS=37470526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,34:0.71:48
chr22	37470604	rs2072860	G	A	1638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.312;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=15;PP=1286;ReadPosRankSum=-0.469;SC=TGAGGAAGGAGAAGGGATGGG;SOR=0.157;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=90;TCF=70;TCR=20;TR=57;WE=37470612;WS=37470594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,59:0.65:91
chr22	37471064	.	C	G	938.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.775;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.142;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=0;PP=754;ReadPosRankSum=0.600;SC=CACTCTCTCTCTCCTTTTGTT;SOR=2.038;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=40;TCR=1;TR=29;WE=37471072;WS=37471054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,31:0.72:43
chr22	37471385	rs9610643	G	A	805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.122;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=24;PP=629;ReadPosRankSum=0.147;SC=TGCACAGACAGAGCAAGGACA;SOR=0.100;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=30;WE=37471393;WS=37471375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,30:0.75:40
chr22	37480797	rs2111833	C	T	763.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-3.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.064;HP=5;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=2;PP=624;ReadPosRankSum=-0.210;SC=GGGTTTGGGGCGAGTAGTAGC;SOR=1.635;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=57;TCF=52;TCR=5;TR=33;WE=37480805;WS=37480787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,33:0.59:56
chr22	37481041	rs2179229	G	C	1236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-1.291;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=42;PP=1057;ReadPosRankSum=0.929;SC=TCTGTAAAATGAGGACAGTAA;SOR=1.002;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=58;TCF=1;TCR=57;TR=43;WE=37481049;WS=37481031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,42:0.74:57
chr22	37485595	rs2235326	T	C	162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.055;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=3.654;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.61;ReadPosRankSum=-2.171;SOR=1.483;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr22	37485724	rs2235324	T	C	783.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.224;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=16;PP=568;ReadPosRankSum=0.997;SC=ATGAGGTCCTTGGGGCCCTGC;SOR=0.293;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=48;TCF=21;TCR=27;TR=31;WE=37485732;WS=37485714;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,32:0.65:49
chr22	37491545	rs2743824	T	C	3971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.347;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.519;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=97;NR=59;PP=2962;ReadPosRankSum=0.879;SC=TCAAGACAAATGCCAACTCAA;SOR=0.993;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=240;TCF=144;TCR=96;TR=156;WE=37491553;WS=37491535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:93,162:0.64:255
chr22	37491839	rs2543509	A	G	773.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.761;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=3;PP=337;ReadPosRankSum=0.058;SC=TGGGGGGCCCACCCTGACAGC;SOR=1.115;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=32;TCF=28;TCR=4;TR=21;WE=37491847;WS=37491836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,23:0.66:35
chr22	37492201	rs2743825	T	G	741.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.645;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.200;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=23;PP=532;ReadPosRankSum=-0.610;SC=CCCCTGCTCATGCACATCGAG;SOR=2.049;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=45;TCF=8;TCR=37;TR=26;WE=37492209;WS=37492191;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,28:0.60:47
chr22	37492585	rs5756512	C	T	972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=1.568;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.176;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=8;PP=784;ReadPosRankSum=-0.375;SC=TTAGTTTCCCCATTTGAAACA;SOR=0.117;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=50;TCF=41;TCR=9;TR=32;WE=37492593;WS=37492575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,34:0.67:51
chr22	37499692	rs5756515	A	G	1625.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.305;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=27.56;ReadPosRankSum=-1.963;SOR=0.869;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:17,42:0.71:59
chr22	37499699	rs5756516	C	T	1537.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.080;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.57;ReadPosRankSum=-1.227;SOR=0.756;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,36:0.69:52
chr22	37515071	.	C	T	145.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=0.000;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=1;PP=104;ReadPosRankSum=1.157;SC=ATCCATTCAACGAACAACCTG;SOR=0.425;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=8;WE=37515079;WS=37515061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,8:0.25:32
chr22	37528362	rs2072861	T	G	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=225;ReadPosRankSum=-1.524;SC=GCTACTAACCTGCCACCCCCT;SOR=0.495;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=13;WE=37528370;WS=37528352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
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chr22	37528606	rs2072862	G	A	306.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.379;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=167;ReadPosRankSum=-0.567;SC=GCACGGAGCCGCACCACATTT;SOR=2.419;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=10;WE=37528614;WS=37528596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,13:0.65:20
chr22	37532506	rs34577916	A	AC	136.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.642;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=17;MQRankSum=1.426;NF=1;NR=4;PP=60;ReadPosRankSum=-0.319;SC=GCATCACAGAACCCCCCCCCA;SOR=0.593;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=12;TCF=3;TCR=9;TR=5;WE=37532514;WS=37532496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr22	37533530	rs3218292	G	C	166.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.896;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.706;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=2;PP=137;ReadPosRankSum=-1.357;SC=CATCCACCTGGGGCTGAGGGG;SOR=0.092;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=9;WE=37533538;WS=37533520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr22	37539958	.	TGC	T	401	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=23;MQ=60.51;NF=9;NR=3;PP=401;QD=33.6666666667;SC=TGTGTGTGTGTGCGCGCATTC;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=17;TCF=14;TCR=3;TR=12;WE=37539967;WS=37539957;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,12:0.71:17
chr22	37580442	rs11089827	A	T	1580.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.077;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.085;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=41;PP=1228;ReadPosRankSum=0.783;SC=GCCGTCAGCCACCACAGCCTG;SOR=1.550;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=94;TCF=37;TCR=57;TR=61;WE=37580450;WS=37580432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,63:0.66:96
chr22	37581422	rs229526	G	C	1487.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-5.348;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.096;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=32;PP=1102;ReadPosRankSum=-0.559;SC=CTCCACCATAGGGATCTCACA;SOR=0.839;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=79;TCF=37;TCR=42;TR=58;WE=37581430;WS=37581412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,60:0.74:81
chr22	37581485	rs229527	C	A	1953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.754;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=39;PP=1507;ReadPosRankSum=-0.038;SC=GGCGGCTGTCCCCATGGTGAC;SOR=0.927;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=101;TCF=47;TCR=54;TR=71;WE=37581493;WS=37581475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,74:0.71:104
chr22	37602583	rs11406761	G	GC	2803.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=38;PP=2834;SC=CTTTCCCCAGGCCCTACAGGT;SOR=0.846;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=78;TCF=36;TCR=42;TR=66;WE=37602591;WS=37602573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr22	37622999	rs62235085	C	T	169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.930;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=7;PP=127;ReadPosRankSum=-0.519;SC=CCATACACCCCTCCCACGCCA;SOR=0.836;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=7;WE=37623007;WS=37622989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,7:0.54:13
chr22	37678551	rs3213556	A	G	2141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=50;NR=17;PP=1672;SC=GCCAGCCCGAACAGCAGCTGG;SOR=2.372;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=67;TCF=50;TCR=17;TR=67;WE=37678573;WS=37678541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr22	37678565	rs3213557	G	A	2355.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=22;PP=1867;SC=CAGCTGGGTCGGCAAGCGACA;SOR=2.043;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=52;TCR=22;TR=74;WE=37678573;WS=37678541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr22	37678814	rs5995410	C	T	687.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=519;SC=GGACACACAGCAGTAGCAAAG;SOR=3.912;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=37678822;WS=37678804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr22	37678837	rs5995411	C	T	547.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=14;PP=451;SC=GACGCTGTTTCCCCCTTCATA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=16;WE=37678845;WS=37678827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr22	37699377	rs2239822	T	C	5354.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.408;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=334;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.865;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=87;NR=125;PP=2962;ReadPosRankSum=1.446;SC=GGCCGCCTTTTGAGCGCTTTG;SOR=0.913;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=322;TCF=136;TCR=186;TR=212;WE=37699385;WS=37699367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,217:0.66:328
chr22	37700177	rs2284050	T	C	847.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=0.862;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=29.410;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=6;PP=693;ReadPosRankSum=0.456;SC=CTGGAAGTCTTCACAGAGGAG;SOR=2.636;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=44;TCF=29;TCR=15;TR=31;WE=37700185;WS=37700167;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,31:0.72:43
chr22	37707072	rs56378525	C	T	4048.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=4.317;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.518;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=62;PP=2962;ReadPosRankSum=1.016;SC=TCATCCTGACCGACAACTGCC;SOR=0.622;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=221;TCF=130;TCR=91;TR=147;WE=37707080;WS=37707062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:78,149:0.66:227
chr22	37707140	rs55662193	C	T	4106.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.201;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=226;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.330;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=73;NR=76;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.165;SC=CCCCTGCCCCCGCCTCTCCCC;SOR=0.484;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=212;TCF=102;TCR=110;TR=149;WE=37707148;WS=37707130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,154:0.70:221
chr22	37707982	rs76829506	G	A	168.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.531;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=5;NR=0;PP=74;ReadPosRankSum=2.531;SC=GGACACTAGCGTCTGGGCTTC;SOR=1.022;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=5;WE=37707990;WS=37707972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,7:0.58:12
chr22	37770066	rs8142615	G	T	4133.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.684;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=247;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.902;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=69;NR=81;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.182;SC=TGCGCACCTCGATATAGTTGC;SOR=0.861;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=240;TCF=114;TCR=126;TR=150;WE=37770074;WS=37770056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,151:0.61:246
chr22	37770357	rs7292751	A	G	4405.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.649;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=114;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.772;SC=TAACCATGCCAAAGAGGCAGC;SOR=0.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=205;TCF=49;TCR=156;TR=149;WE=37770365;WS=37770347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,155:0.71:217
chr22	37771158	rs2071857	G	A	2597.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.802;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.847;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=42;PP=2051;ReadPosRankSum=1.441;SC=TCACCACCTCGATGAGGTTGT;SOR=0.385;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=151;TCF=86;TCR=65;TR=90;WE=37771166;WS=37771148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,94:0.58:161
chr22	37888868	rs5756696	G	C	1930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=39;PP=1456;SC=ATACCAGCTCGTCGATACCCC;SOR=1.727;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=17;TCR=39;TR=56;WE=37888876;WS=37888858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr22	37902500	rs1997674	C	T	349.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-3.974;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=15;PP=231;ReadPosRankSum=-0.263;SC=CTATCACTTACTGAGCACTGT;SOR=0.486;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=58;TCF=1;TCR=57;TR=15;WE=37902508;WS=37902490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,16:0.27:59
chr22	37904957	rs932326	C	G	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.136;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=9;PP=593;ReadPosRankSum=0.656;SC=GACAAGTTCACCCAGGATTAT;SOR=0.724;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=112;TCF=83;TCR=29;TR=33;WE=37904965;WS=37904947;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:83,32:0.28:115
chr22	37906308	rs113275238	GCTCCTT	G	1867.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.613;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.726;NF=22;NR=12;PP=1682;ReadPosRankSum=-0.256;SC=ACATTGTCTGGCTCCTTCTCC;SOR=0.525;SbPval=0.36;Source=Platypus;TC=125;TCF=87;TCR=38;TR=34;WE=37906321;WS=37906298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,52:0.40:131
chr22	37964299	rs2281098	C	G	3533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=32;NR=80;PP=2708;SC=TCATGAGCCTCCCAGAAGCCC;SOR=2.012;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=112;TCF=32;TCR=80;TR=112;WE=37964307;WS=37964289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chr22	37964408	rs200195385	CCAGCGCCTGCTGCAAACCCCT	C	1530.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=24;NR=13;PP=2975;SC=TGCAAACCCCCCAGCGCCTGC;SOR=1.432;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=42;TCF=28;TCR=14;TR=37;WE=37964436;WS=37964398;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr22	38004832	.	C	CG	367.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.281;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=3.544;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.71;ReadPosRankSum=0.557;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,15:0.60:25
chr22	38010068	.	G	C	580	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=15;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=23;NR=0;PP=580;QD=26.7291831542;SC=CAGGAAGGCAGGGGGAGAGCT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=38010076;WS=38010067;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr22	38015671	rs8138728	T	C	2723.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=67;NR=17;PP=1980;SC=GCGTGAGCCATGGCCTCCGGC;SOR=2.859;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=67;TCR=17;TR=84;WE=38015679;WS=38015661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr22	38025375	rs2071766	T	C	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=1;PP=652;SC=CAGAAAGGGGTAGGGAGCCCC;SOR=4.892;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=23;WE=38025383;WS=38025365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr22	38039746	rs149928566	C	T	2195.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=55;PP=1790;SC=AAGGTGGAGACGCTGAAGGAG;SOR=2.867;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=70;TCF=13;TCR=57;TR=68;WE=38039754;WS=38039736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr22	38042972	rs145479470	G	C	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=16;PP=584;ReadPosRankSum=-0.913;SC=AGGAGGTTGGGGGGGAGGGGG;SOR=0.756;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=8;TCR=17;TR=24;WE=38042980;WS=38042962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chr22	38043444	rs3213528	C	A	4659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=63;NR=85;PP=2965;SC=CCACTCCCCCCCAGCCTGAAG;SOR=1.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=148;TCF=63;TCR=85;TR=148;WE=38043452;WS=38043434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chr22	38044497	rs62235997	C	T	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=38;PP=1174;SC=CCCATCCCAACTATCTGTTGT;SOR=4.271;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=4;TCR=38;TR=42;WE=38044505;WS=38044487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr22	38051999	rs12483880	C	T	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=9;PP=555;SC=TCTTCTCTTGCCGACATGTTT;SOR=1.022;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=12;TCR=9;TR=21;WE=38052007;WS=38051989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr22	38061520	rs62236667	C	G	2493.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=3;PP=2076;SC=CTGACGCTGTCCCTGCCGCCC;SOR=5.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=68;TCF=65;TCR=3;TR=68;WE=38061528;WS=38061510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr22	38072939	rs372904011	G	T	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.35;ReadPosRankSum=0.176;SOR=0.740;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:100,38:0.28:138
chr22	38074343	rs62236672	C	T	2506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=68;NR=11;PP=2022;SC=GAGCAGGTGGCATGGCCAGAG;SOR=3.258;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=80;TCF=69;TCR=11;TR=79;WE=38074351;WS=38074333;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr22	38074434	rs9622682	G	A	5627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.626;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=56;PP=2965;ReadPosRankSum=0.060;SC=CAGATTAGTCGGTCAGTGGGG;SOR=1.368;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=171;TCF=114;TCR=57;TR=170;WE=38074442;WS=38074424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,176:0.99:177
chr22	38084754	.	C	A	1339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=5.730;ClippingRankSum=0.000;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.037;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=0;PP=1054;ReadPosRankSum=-0.187;SC=ATGCGCTCCACGTCCACAGAG;SOR=2.381;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=72;TCF=71;TCR=1;TR=44;WE=38084762;WS=38084744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,46:0.61:76
chr22	38097359	rs12484441	C	G	1972.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-6.496;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.180;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=16;PP=1526;ReadPosRankSum=-0.678;SC=CTGCCCTGGCCTGACTCACCC;SOR=0.308;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=119;TCF=98;TCR=21;TR=83;WE=38097367;WS=38097349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,83:0.71:117
chr22	38119213	rs12628603	G	A	4160.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=91;NR=34;PP=2965;SC=GGGGGCCGGAGCGCAGGACAG;SOR=1.944;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=126;TCF=92;TCR=34;TR=125;WE=38119221;WS=38119203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chr22	38119754	rs67890459	TCAA	T	17607.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-1.234;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=428;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.473;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=-0.121;NF=131;NR=198;PP=2957;ReadPosRankSum=-1.138;SC=ACAGAACCACTCAACGAGAGA;SOR=0.567;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=353;TCF=139;TCR=214;TR=329;WE=38119764;WS=38119744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,395:1.00:396
chr22	38121152	rs9610841	C	A	10729.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=2.131;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=351;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=167;NR=169;PP=2965;ReadPosRankSum=1.320;SC=AACGAGACAACCCTGGAACCT;SOR=0.723;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=340;TCF=169;TCR=171;TR=336;WE=38121160;WS=38121142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,343:0.99:347
chr22	38121652	rs193043234	C	G	1878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-8.100;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=234;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.041;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=44;PP=1411;ReadPosRankSum=0.668;SC=TCTTCGCCCCCTCGCTATTTG;SOR=0.738;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=230;TCF=114;TCR=116;TR=85;WE=38121660;WS=38121642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,87:0.37:233
chr22	38122122	rs5756795	T	C	7307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=232;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=115;NR=106;PP=2965;SC=GCCATCCCTCTTCTTCCAGGA;SOR=0.783;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=221;TCF=115;TCR=106;TR=221;WE=38122130;WS=38122112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr22	38122448	rs739137	C	T	1918.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=48;PP=1452;SC=AGTGCAGCAGCGGGGGCCGCA;SOR=3.370;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=9;TCR=48;TR=57;WE=38122470;WS=38122438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr22	38122462	rs739138	A	G	1617.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=41;PP=1253;SC=GGCCGCACCCACAGCCCTGGC;SOR=3.745;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=47;WE=38122470;WS=38122438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr22	38129332	rs7284476	G	A	3767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.164;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=59;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.778;SC=GGGCCTTCCAGGCCCAGGACG;SOR=0.230;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=120;TCF=60;TCR=60;TR=119;WE=38129340;WS=38129322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,119:0.99:120
chr22	38130385	rs13054052	A	C	6376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=138;NR=57;PP=2965;SC=AGCCTCACCTACCCCCTCACC;SOR=1.811;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=195;TCF=138;TCR=57;TR=195;WE=38130393;WS=38130375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,197:1.00:197
chr22	38130472	rs8140958	T	C	6975.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=104;NR=127;PP=2965;SC=CCCTCATCCTTGGAGTCCTGA;SOR=0.888;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=231;TCF=104;TCR=127;TR=231;WE=38130480;WS=38130462;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,233:1.00:233
chr22	38142468	rs5756803	A	G	231.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=7;PP=205;SC=AGGCCGGGAGAAGGGCGACGA;SOR=2.833;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=38142476;WS=38142458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr22	38146585	rs4821704	C	T	2630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=45;NR=42;PP=2024;SC=TACAGAGCAGCGGGACAAACG;SOR=0.738;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=45;TCR=42;TR=87;WE=38146593;WS=38146575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
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chr22	38161835	rs3833924	T	TG	1054.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=20;PP=708;SC=GTATGGACCCTGGGGGGGGCA;SOR=1.179;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=39;TCF=12;TCR=27;TR=29;WE=38161843;WS=38161825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
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chr22	38204259	rs2071910	C	T	206.41	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.593;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.6715;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=7;PP=159;ReadPosRankSum=0.967;SC=GCGGCTCCTACACTCTTAGCT;SOR=1.609;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=8;WE=38204267;WS=38204249;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,8:0.89:9
chr22	38205894	rs2285177	T	C	1378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.628;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=3;PP=1084;ReadPosRankSum=0.844;SC=CTGTAGCTGTTGAATTTGGTG;SOR=0.613;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=70;TCF=66;TCR=4;TR=47;WE=38205902;WS=38205884;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,48:0.66:73
chr22	38205989	rs2285178	T	C	3033.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.092;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=52;PP=2045;ReadPosRankSum=-0.267;SC=GGCCTGCCCTTGCCCCACCTG;SOR=0.534;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=162;TCF=92;TCR=70;TR=113;WE=38205997;WS=38205979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,118:0.69:170
chr22	38209650	rs56265312	G	A	481.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.052;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=14;PP=316;ReadPosRankSum=-0.410;SC=CTCAGCCTCCGCCTGGGGAAG;SOR=1.030;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=80;TCF=33;TCR=47;TR=22;WE=38209658;WS=38209640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,24:0.30:79
chr22	38209773	.	T	TC	138.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.333;ClippingRankSum=0.000;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.78;ReadPosRankSum=0.637;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,9:0.31:29
chr22	38212068	rs739269	C	T	129.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.193;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=37;ReadPosRankSum=-0.590;SC=CCTGGCTCCCCTCTGCCTCTT;SOR=2.258;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=16;TCF=8;TCR=8;TR=4;WE=38212076;WS=38212058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr22	38212762	rs13911	A	G	449.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.665;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.529;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=16;PP=370;ReadPosRankSum=-1.358;SC=AGGTCCGCCTACTGCCACAGG;SOR=0.307;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=59;TCF=8;TCR=51;TR=20;WE=38212770;WS=38212752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,19:0.35:55
chr22	38220964	rs8138029	T	C	165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-2.985;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.392;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=3;NR=6;PP=84;ReadPosRankSum=-2.250;SC=TGCCCGTGGCTGTGGTGAGCC;SOR=0.175;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=17;TCF=4;TCR=13;TR=9;WE=38220972;WS=38220954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,9:0.53:17
chr22	38245262	rs6000907	C	G	307.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.334;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=2.984;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.90;ReadPosRankSum=-1.315;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:63,16:0.20:79
chr22	38251629	rs11551384	C	G	553.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.252;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.658;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.772;NF=9;NR=14;PP=331;ReadPosRankSum=1.128;SC=AGGCTGAAGCCATTGCTCCAC;SOR=0.352;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=66;TCF=20;TCR=46;TR=23;WE=38251637;WS=38251619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,26:0.36:73
chr22	38251686	rs2157472	T	C	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.131;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=12;PP=186;ReadPosRankSum=0.751;SC=GTGCACTGAGTGGAATCCAGT;SOR=0.164;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=50;TCF=13;TCR=37;TR=19;WE=38251694;WS=38251676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,20:0.37:54
chr22	38259110	rs61195610	CT	C	209.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.161;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FS=4.995;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=-1.340;QD=3.96;ReadPosRankSum=-0.123;SOR=1.585;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,24:0.45:53
chr22	38273749	rs9466	T	C	1873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=23;PP=1467;SC=CCATGCGTATTGATGAGAGCA;SOR=1.392;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=61;TCF=38;TCR=23;TR=61;WE=38273757;WS=38273739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chr22	38307909	rs6519091	T	C	3424.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=74;NR=34;PP=2858;SC=CGCCCCTATTTCCCAGTCACC;SOR=1.769;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=108;TCF=74;TCR=34;TR=108;WE=38307917;WS=38307899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chr22	38308048	rs3041723	ATGTG	A	1778.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=38;PP=2024;SC=GGCTCTGTGTATGTGTGTGTG;SOR=4.664;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=66;TCF=6;TCR=60;TR=40;WE=38308061;WS=38308038;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr22	38308291	rs1003689	C	T	750.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=3;PP=664;SC=GCTGAGGGGTCGCCCCCTAAC;SOR=4.003;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=24;WE=38308299;WS=38308281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr22	38323507	rs9610875	G	T	1838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=6;PP=1515;SC=GTCTGAGAGCGCCAGCCAGAC;SOR=3.690;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=56;TCF=50;TCR=6;TR=56;WE=38323515;WS=38323497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr22	38328597	rs34834842	A	G	772.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-2.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.730;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=19;PP=561;ReadPosRankSum=-0.208;SC=GAGGACATCCATGGAGAGATG;SOR=0.385;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=112;TCF=66;TCR=46;TR=39;WE=38328605;WS=38328587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:74,39:0.35:113
chr22	38379774	rs149435516	G	A	60.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=4;PP=29;ReadPosRankSum=0.205;SC=CCTCCGATAGGTCCTGCTCCT;SOR=0.839;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=30;TCF=11;TCR=19;TR=6;WE=38379782;WS=38379764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,6:0.19:31
chr22	38453679	rs5845366	A	AG	1420.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=1;PP=1631;SC=GTCCCGTATGAGGTGGTGGAG;SOR=6.043;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=38;TCF=37;TCR=1;TR=37;WE=38453687;WS=38453669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr22	38481516	rs9610902	G	A	841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=26;PP=696;SC=TCCTTGCCCCGCTTCATCTTT;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=38481524;WS=38481506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr22	38482352	rs66500630	GTGCGGGAGCGGGACTGGCCATCCCAGTACTCCGAGGGTGCTA	G	1397.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;NF=0;NR=2;PP=466;SC=CCGGCTTGGGGTGCGGGAGCG;SOR=1.284;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=2;TCR=3;TR=2;WE=38482401;WS=38482342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr22	38483155	rs142739979	T	TTCATGGGTG	2812.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=14;PP=2562;SC=GTTCCCGGGGTTCATGGGTGT;SOR=1.412;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=55;TCF=29;TCR=26;TR=37;WE=38483163;WS=38483145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr22	38485064	rs62235125	C	G	1508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=36;PP=1160;SC=CCCCGCGCCTCTCCCGGCCCT;SOR=1.848;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=51;WE=38485072;WS=38485054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr22	38485540	rs17856487	A	G	249.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=4;PP=176;SC=ATGTCCAGGCAGGTGGGCGTC;SOR=0.892;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=8;WE=38485548;WS=38485530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr22	38490056	rs4373009	C	T	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=35;PP=1070;SC=GGAAGCCAGTCGCAAAAGAGC;SOR=3.664;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=40;WE=38490064;WS=38490046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr22	38494005	rs147676763	CGGTCTCGCCCCGA	C	3095.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=1;PP=2936;SC=TCCCAGGGCCCGGTCTCGCCC;SOR=7.112;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=54;TCF=53;TCR=1;TR=51;WE=38494025;WS=38493995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chr22	38503847	rs6001006	C	T	5575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=91;PP=2965;SC=GGCCCTGGGGCCTGATACTCA;SOR=0.748;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=185;TCF=94;TCR=91;TR=184;WE=38503855;WS=38503837;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chr22	38504372	rs5750540	T	C	2686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=65;PP=1859;SC=GGGACAGGTCTGGTCCAGCCC;SOR=1.921;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=27;TCR=66;TR=92;WE=38504380;WS=38504362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr22	38505347	rs6001008	G	A	2107.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.91;SOR=3.080;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr22	38505356	rs6001009	A	G	2023.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.99;SOR=3.564;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr22	38506509	rs4820313	A	G	2496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=45;PP=2045;SC=TGGACCTGTAAAACTGGTCCA;SOR=0.908;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=36;TCR=45;TR=81;WE=38506517;WS=38506499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr22	38512402	rs11089863	G	A	2080.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.879;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.741;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=50;PP=1613;ReadPosRankSum=-0.297;SC=CTGGAGGAGTGTCAGATTGGT;SOR=1.347;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=98;TCF=33;TCR=65;TR=73;WE=38512410;WS=38512392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,76:0.75:102
chr22	38512562	rs12167576	G	A	421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.627;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.038;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=14;PP=339;ReadPosRankSum=-0.381;SC=CACTGCAGACGTTAGAAAAAG;SOR=2.546;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=15;WE=38512570;WS=38512552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr22	38530956	rs2272831	G	A	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=2.498;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=140;ReadPosRankSum=0.263;SC=TGCGGGGCCCGGCCCCCTGCC;SOR=0.223;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=10;WE=38530964;WS=38530946;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr22	38535946	rs12329956	G	A	958.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-4.297;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.185;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=5;PP=783;ReadPosRankSum=0.652;SC=CAGGAGAGCTGGAGCCCAGCA;SOR=0.914;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=71;TCF=60;TCR=11;TR=38;WE=38535954;WS=38535936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,38:0.54:70
chr22	38539041	rs4375	T	C	2831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=73;NR=6;PP=2195;SC=CACCTGAGCCTAGGGGCCCAA;SOR=4.615;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=73;TCR=6;TR=79;WE=38539049;WS=38539031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr22	38540837	rs149247706	CATAAAATAAA	C,CATAAA	1520.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;NF=18,18;NR=3,3;PP=558,712;SC=CATAACGTAACATAAAATAAA;SOR=3.056;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=33;TCF=28;TCR=5;TR=21,21;WE=38540854;WS=38540827;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.76,0.24:42
chr22	38543453	rs2284060	T	C	1804.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.735;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.544;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=47;PP=1260;ReadPosRankSum=-0.005;SC=GAGAGTGCGTTGATTAACAGT;SOR=1.083;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=124;TCF=55;TCR=69;TR=79;WE=38543461;WS=38543443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,78:0.61:127
chr22	38559448	rs731821	C	A	1877.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=5.758;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=6;PP=1640;ReadPosRankSum=1.028;SC=GCGTGGCACACCACCAGGCAT;SOR=0.924;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=98;TCF=89;TCR=9;TR=67;WE=38559456;WS=38559438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,65:0.65:100
chr22	38563972	rs132988	T	C	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.281;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=27;PP=1020;ReadPosRankSum=-0.661;SC=ACCTCCACACTTCTGCACGGC;SOR=0.583;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=162;TCF=87;TCR=75;TR=57;WE=38563980;WS=38563962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,57:0.35:165
chr22	38564041	rs9622746	C	G	2910.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.743;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.882;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=59;PP=2166;ReadPosRankSum=-0.385;SC=CTTCCAGACGCAGAGTAGCTC;SOR=0.473;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=165;TCF=63;TCR=102;TR=99;WE=38564049;WS=38564031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,106:0.62:170
chr22	38611045	rs76165778	C	A	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=10;PP=354;ReadPosRankSum=-0.798;SC=CTTGCAGCCCCCCAAACTGGG;SOR=0.557;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=59;TCF=28;TCR=31;TR=20;WE=38611053;WS=38611035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,21:0.34:62
chr22	38617333	rs2235265	T	C	147.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=248;ReadPosRankSum=-1.196;SC=CCTCTGGAAGTGACATGTGAG;SOR=0.340;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=5;WE=38617349;WS=38617323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,6:0.21:28
chr22	38617338	rs10545677	TGTGA	T	175.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.06;ReadPosRankSum=-1.546;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,7:0.24:29
chr22	38617723	rs2005968	G	A	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=0.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.576;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=23;PP=567;ReadPosRankSum=0.377;SC=GCGGCCTGCCGGGCAGGGAGC;SOR=0.399;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=65;TCF=13;TCR=52;TR=30;WE=38617731;WS=38617713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,30:0.46:65
chr22	38620702	rs59711879	C	G	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.537;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=49;ReadPosRankSum=0.079;SC=CCCAGCCGCACCTGTAGGATG;SOR=0.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=4;WE=38620710;WS=38620692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr22	38620907	rs60964283	G	T	598.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FS=1.736;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.25;ReadPosRankSum=0.506;SOR=0.487;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,30:0.26:114
chr22	38643800	rs35589210	C	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=5.047;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.83;ReadPosRankSum=1.434;SOR=1.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,21:0.25:85
chr22	38689984	rs5757022	T	A	244.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=0;PP=201;SC=GTCCTGGCTCTACAGAAGGGG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=38689992;WS=38689974;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr22	38699050	rs3830720	GAGGC	G	5488.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=94;PP=2973;SC=TCAGGGGTCAGAGGCAGGCAG;SOR=2.708;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=133;TCF=28;TCR=105;TR=116;WE=38699061;WS=38699040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chr22	38823136	rs196059	T	C	5045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=90;NR=75;PP=2965;SC=TGTGAAAACGTGAGTAGTCCA;SOR=0.805;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=166;TCF=90;TCR=76;TR=165;WE=38823144;WS=38823126;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
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chr22	38877461	rs12004	T	G	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=17;PP=340;ReadPosRankSum=-0.502;SC=TACTTGTATGTGACCAAAGGT;SOR=0.771;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=25;TCR=51;TR=26;WE=38877469;WS=38877451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,27:0.33:83
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chr22	39003495	rs5757169	G	A	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.698;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FS=2.888;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.74;ReadPosRankSum=-0.490;SOR=0.430;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,31:0.25:122
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chr22	39034867	rs5757193	G	A	1183.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.790;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.249;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=31;PP=849;ReadPosRankSum=-0.278;SC=AGTAACCACAGGGTCTGTCCA;SOR=0.388;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=164;TCF=53;TCR=111;TR=52;WE=39034875;WS=39034857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:118,54:0.31:172
chr22	39064209	rs2072795	G	A	158.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=123;ReadPosRankSum=0.723;SC=TGAATGGAAAGTGTGGTCCTC;SOR=0.202;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=9;WE=39064217;WS=39064199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,9:0.32:28
chr22	39064230	rs2072796	A	G	72.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.871;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=6;PP=52;ReadPosRankSum=0.000;SC=CAGAGGCATCAGTGCAGGAGG;SOR=0.132;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=6;WE=39064238;WS=39064220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chr22	39066820	rs3761454	C	T	180.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.019;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.069;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=132;ReadPosRankSum=0.464;SC=ATATTGTTGGCGGAAGAGGAG;SOR=1.432;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=10;WE=39066828;WS=39066810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,10:0.37:27
chr22	39069181	rs3747174	T	C	603.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.156;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.337;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=457;ReadPosRankSum=-0.032;SC=AGTCCACTGCTGAATCCCACT;SOR=1.792;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=72;TCF=56;TCR=16;TR=24;WE=39069189;WS=39069171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,25:0.34:73
chr22	39079920	rs368066955	AT	A	44.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.088;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.35;ReadPosRankSum=-0.047;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:13,6:0.32:19
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chr22	39126508	rs909564	A	G	693.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-6.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.294;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=3;PP=490;ReadPosRankSum=1.642;SC=AGGACCACGCAGCCTGCTCAC;SOR=1.424;SbPval=0.93;Source=Platypus;TC=119;TCF=100;TCR=19;TR=37;WE=39126516;WS=39126498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,38:0.32:120
chr22	39134715	rs1062687	T	C	748.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.543;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.825;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=14;PP=535;ReadPosRankSum=1.704;SC=CGGCGAAGCCTTGTGGCCCCT;SOR=0.645;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=100;TCF=48;TCR=52;TR=30;WE=39134723;WS=39134705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,32:0.31:102
chr22	39141600	rs138712	G	A	638.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.391;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.854;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=4;PP=512;ReadPosRankSum=0.286;SC=TGTGTGTACGGTGTGAGGCAG;SOR=0.174;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=74;TCF=67;TCR=7;TR=28;WE=39141608;WS=39141590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,27:0.37:73
chr22	39148483	rs2072798	G	A	291.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.138;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FS=1.211;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.63;ReadPosRankSum=1.079;SOR=0.951;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:47,16:0.25:63
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chr22	39151057	rs470107	CG	C	169.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=7.112;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.71;ReadPosRankSum=2.381;SOR=0.014;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:29,7:0.19:36
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chr22	39178701	rs760482	A	G	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.937;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=5.990;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.06;ReadPosRankSum=0.283;SOR=1.880;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:38,11:0.22:49
chr22	39222652	rs5757299	G	A	758.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.572;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.736;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=17;PP=501;ReadPosRankSum=0.189;SC=CGGTGAATGCGTAGAGCTCGG;SOR=0.604;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=116;TCF=60;TCR=56;TR=33;WE=39222660;WS=39222642;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,36:0.30:120
chr22	39224248	rs5757300	T	C	901.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.372;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.723;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=12;PP=718;ReadPosRankSum=-0.062;SC=GGCTCTGTCATCCTGAGGACC;SOR=0.800;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=143;TCF=100;TCR=43;TR=42;WE=39224256;WS=39224238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:103,43:0.29:146
chr22	39267312	rs1122771	C	T	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=1;PP=474;SC=TGGCTGAGGCCTGCCATCAGG;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=39267320;WS=39267302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
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chr22	39355717	rs5750717	G	A	159.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.513;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=5;PP=88;ReadPosRankSum=1.041;SC=ATCCGAATCCGGGCAGGGCCC;SOR=0.569;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=20;TCF=3;TCR=17;TR=6;WE=39355725;WS=39355707;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,7:0.35:20
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chr22	39381999	rs2076111	T	C	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=19.978;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.91;MQRankSum=-6.187;QD=3.07;ReadPosRankSum=0.747;SOR=2.548;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:62,16:0.21:78
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chr22	39387558	rs1065184	C	T	521.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.018;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.889;NF=23;NR=15;PP=633;ReadPosRankSum=-0.841;SC=TCTATGATTACGACCCCCTAT;SOR=0.935;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=114;TCF=58;TCR=56;TR=38;WE=39387566;WS=39387548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,28:0.30:93
chr22	39387655	rs34124580	G	T	199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=2.840;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.24;MQRankSum=0.161;QD=7.99;ReadPosRankSum=0.360;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,9:0.36:25
chr22	39413668	rs1969643	C	T	2496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=69;NR=9;PP=2039;SC=AATAAGGAAACGGCCCGGGGC;SOR=3.753;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=69;TCR=9;TR=78;WE=39413676;WS=39413658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr22	39414166	rs4820361	A	G	1224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=22;NR=19;PP=1052;SC=GGACCGGGCCAGCGCCCACTG;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=22;TCR=19;TR=41;WE=39414174;WS=39414156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr22	39414224	rs4821854	A	G	1979.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=49;NR=16;PP=1663;SC=GCCCAGGGCCAGGAGAGAGGC;SOR=2.338;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=49;TCR=16;TR=65;WE=39414232;WS=39414214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chr22	39419112	.	C	CTATTTATTTATTTATTTATT	222	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.75;QD=37.00;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	39448275	rs12157816	A	G	771.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=6.475;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=39.953;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.22;MQRankSum=-8.066;QD=4.59;ReadPosRankSum=-0.441;SOR=3.458;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:129,39:0.23:168
chr22	39496134	rs139290	G	C	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=1;PP=259;SC=GCCAAGATCGGGCCACTGCAC;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=39496142;WS=39496124;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr22	39496199	rs139291	T	C	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=2;PP=949;SC=AAGAGTTGGGTTTGAAAAGTG;SOR=4.235;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=33;WE=39496207;WS=39496189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr22	39496322	rs140936762	TAAC	T	3421.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=60.13;NF=17;NR=41;PP=2788;SC=GCTTACAGTTTAACAACAAGC;SOR=1.329;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=62;TCF=20;TCR=42;TR=58;WE=39496344;WS=39496312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr22	39496336	rs139293	G	T	2508.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=46;PP=2013;SC=AACAAGCGCCGCCTCAGAAGG;SOR=1.281;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=28;TCR=46;TR=74;WE=39496344;WS=39496312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr22	39496412	rs139294	G	C	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=23;PP=933;SC=CCACGCCCACGAGAGGCTACT;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=31;WE=39496420;WS=39496402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr22	39497181	rs9611092	T	A	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=390;SC=CCGCCCCCAGTCACATGACTC;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=39497189;WS=39497171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr22	39497404	rs139297	G	C	1240.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=11;NR=31;PP=849;SC=TCTGAACCTGGGCATCTTCGC;SOR=2.110;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=11;TCR=31;TR=42;WE=39497412;WS=39497394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr22	39497452	rs139298	A	G	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.99;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr22	39497452	.	AAG	GAC	472	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=1;HapScore=1;MGOF=19;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=4;NR=21;PP=472;QD=21.0187149945;SC=GCCCCAGCAGAAGGGGCTGCG;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=27;TCF=4;TCR=23;TR=25;WE=39497462;WS=39497442;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:2,25:0.93:27
chr22	39497454	rs139299	G	C	1231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.99;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr22	39497509	rs139300	A	G	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=11;PP=267;SC=GGGCTTCCCAAGTAGGAAAGA;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=12;WE=39497517;WS=39497499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	39497811	rs139301	A	G	857.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=1;PP=715;SC=AGAATTCCCCAGACAGAGCAA;SOR=5.486;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=31;WE=39497819;WS=39497802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr22	39498038	rs139302	G	C	3524.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=88;PP=2943;SC=GACGGCTTGAGAGGATAAAGG;SOR=2.501;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=112;TCF=24;TCR=88;TR=112;WE=39498046;WS=39498028;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chr22	39498373	rs139304	TA	T	609.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=671;SC=AGGCTGGTCTTAGAACTCTTG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=16;WE=39498381;WS=39498363;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr22	39498677	rs139305	A	C	537.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=16;PP=485;SC=TCTATTATTTACATCTTTATG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=39498685;WS=39498667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr22	39499575	rs139313	G	T	1141.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=30;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=31;NR=3;PP=962;SC=CAGGCCTTCTGGGCCCTTCTG;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=31;TCR=3;TR=34;WE=39499583;WS=39499565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr22	39499604	rs139314	T	C	1309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=32;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=7;PP=1103;SC=TCTTTTCTCTTCCTAATGATC;SOR=2.891;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=40;TCF=33;TCR=7;TR=38;WE=39499612;WS=39499594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chr22	39499653	rs139315	C	T	1920.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=13;PP=1555;SC=CTGTGGTGTCCCACCAGTTGG;SOR=2.468;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=42;TCR=13;TR=55;WE=39499661;WS=39499643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr22	39499763	rs139316	T	C	4444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=69;PP=2965;SC=ATCCCACTCATTATCAAGAAG;SOR=0.707;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=136;TCF=67;TCR=69;TR=136;WE=39499771;WS=39499753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,145:1.00:145
chr22	39499902	rs139317	C	T	1438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=38;PP=1272;SC=AGAAGACCTTCCTTTCCTCCT;SOR=5.283;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=40;WE=39499910;WS=39499892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr22	39626024	rs2239769	C	T	292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=230;ReadPosRankSum=1.730;SC=ATTTTTAAGACCGGCCCCTGC;SOR=0.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=13;WE=39626032;WS=39626014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,13:0.34:38
chr22	39626375	rs4821874	A	C	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=17;PP=456;SC=GTGGGGCAAAAGCTTTGGCCC;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=39626383;WS=39626365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	39629329	rs11704525	C	A	386.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.652;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=0;PP=339;ReadPosRankSum=-0.277;SC=GTGGGGGGAACGGGAGTTGTA;SOR=1.743;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=53;TCF=50;TCR=3;TR=18;WE=39629337;WS=39629319;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
chr22	39636899	rs150503603	G	GTCTC	423.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.523;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.797;HP=1;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-2.269;NF=1;NR=26;PP=327;ReadPosRankSum=-0.338;SC=TGCTCAGTCAGTCTCTCTCTC;SOR=0.061;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=61;TCF=3;TCR=58;TR=27;WE=39636908;WS=39636889;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,14:0.34:41
chr22	39636928	rs5757575	A	G	804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.25;QD=34.99;SOR=4.003;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr22	39636928	.	ACA	GCG	950	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MMLQ=23;MQ=62.04;NF=1;NR=32;PP=950;QD=30.4081174201;SC=TCAGATGCGCACACACACACA;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=1;TCR=36;TR=33;WE=39636955;WS=39636918;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:4,33:0.89:37
chr22	39636930	rs5757576	A	G	1841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.34;QD=46.04;SOR=4.514;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr22	39636944	rs138673005	ACACT	A	795.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=1;NR=28;PP=1314;SC=ACACACACACACACTCTCTCT;SOR=4.003;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=29;WE=39636955;WS=39636918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr22	39639853	rs1800817	G	T	4258.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=142;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=92;NR=46;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.769;SC=GGTCAGAAGGGGGGGGCGAAG;SOR=0.693;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=141;TCF=95;TCR=46;TR=138;WE=39639861;WS=39639843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,139:0.99:140
chr22	39709009	rs2014842	G	A	1792.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.801;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.730;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=26;PP=1441;ReadPosRankSum=1.239;SC=GAGAGGCAGTGGTCAGAGGTA;SOR=0.801;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=58;TCR=42;TR=62;WE=39709017;WS=39708999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,66:0.61:109
chr22	39709776	rs137620	T	C	1555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.783;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=21;PP=1198;ReadPosRankSum=3.488;SC=CAGGAGGGGATTGTCGTGCAG;SOR=0.686;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=167;TCF=111;TCR=56;TR=63;WE=39709784;WS=39709766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:109,66:0.38:175
chr22	39710244	rs137621	G	A	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.719;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.974;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=134;ReadPosRankSum=-0.363;SC=TAAGGCTGGGGCATTAGGGAC;SOR=1.234;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=34;TCF=14;TCR=20;TR=10;WE=39710252;WS=39710234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,12:0.32:38
chr22	39711351	rs2076125	A	G	3324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.696;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=20.211;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=88;PP=2611;ReadPosRankSum=1.273;SC=TTGCACAGCAACTCAAGCCAC;SOR=1.839;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=186;TCF=60;TCR=126;TR=117;WE=39711359;WS=39711341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,121:0.64:190
chr22	39712981	rs137623	A	G	2883.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=50;PP=2342;SC=CTTTTCCACCAGCAAGCGGAG;SOR=0.848;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=94;TCF=44;TCR=50;TR=94;WE=39712989;WS=39712971;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr22	39713105	rs470081	C	T	1553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=42;PP=1256;SC=CCTTTCTGCCCTGGGGAAGCC;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=7;TCR=42;TR=49;WE=39713113;WS=39713095;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr22	39713128	rs2072872	A	G	849.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=26;PP=652;ReadPosRankSum=0.999;SC=CTCAGTGATGAAGGAAATGGG;SOR=1.923;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=26;WE=39713136;WS=39713118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,28:0.72:39
chr22	39714490	rs6509	C	T	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=8.748;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-4.459;NF=5;NR=43;PP=891;ReadPosRankSum=1.020;SC=CCGGCTTGGACGGGTCATCCT;SOR=0.764;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=148;TCF=18;TCR=130;TR=48;WE=39714498;WS=39714480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,48:0.32:148
chr22	39714704	rs1569498	C	T	273.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.207;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=216;ReadPosRankSum=0.515;SC=AGAATCCTGACCAGACACCCA;SOR=0.960;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=11;WE=39714712;WS=39714694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,11:0.44:25
chr22	39714908	rs137625	A	G	1367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=14;PP=1127;SC=GCAGCTTTATATGCCAATTAG;SOR=1.609;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=29;TCR=14;TR=43;WE=39714916;WS=39714898;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr22	39715140	rs470082	C	T	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-3.185;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=208;ReadPosRankSum=-0.332;SC=CTCCAGAGGCCTTCGGAGTGC;SOR=0.373;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=13;WE=39715148;WS=39715130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,13:0.30:43
chr22	39746186	rs142884306	ACCGACC	A	2179.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=2;NR=42;PP=2284;SC=GCGCGCCCGGACCGACCCCGA;SOR=5.590;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=51;TCF=3;TCR=48;TR=44;WE=39746199;WS=39746176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr22	39770597	rs4821888	A	G	5335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=105;PP=2965;SC=CACAGAGTCTACAGAGGGCTG;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=158;TCF=53;TCR=105;TR=158;WE=39770605;WS=39770587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chr22	39770780	rs4820377	G	A	876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=22;PP=713;SC=GCAGGGGAGCGTGGATGGGAT;SOR=3.690;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=39770788;WS=39770770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr22	39777680	rs8135738	C	T	2821.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=73;NR=12;PP=2455;SC=TGTCCTTGTCCTCGCCGGCCT;SOR=3.535;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=73;TCR=12;TR=85;WE=39777688;WS=39777670;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr22	39777822	rs149306472	C	CCAA	7190.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=37;NR=82;PP=2924;SC=TACGTGGAGCCCACTGGGCCG;SOR=1.200;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=127;TCF=38;TCR=89;TR=119;WE=39777832;WS=39777812;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chr22	39795683	rs4821892	G	C	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=0;PP=387;SC=CCCTCTTCGGGCGTGGGGTGG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=39795691;WS=39795673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr22	39812986	rs6001585	C	A	1119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=32;PP=965;SC=GAGCAACAGGCGTTAGGGAGC;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=3;TCR=32;TR=35;WE=39812994;WS=39812976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr22	39882149	rs34708754	AT	A	39.27	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.000;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.61;ReadPosRankSum=0.366;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr22	39966856	rs3747178	C	T	2250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.670;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.789;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=23;PP=1773;ReadPosRankSum=0.565;SC=GCCCCCCATCCTCCCCGCCAG;SOR=0.586;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=86;TCR=34;TR=80;WE=39966864;WS=39966846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,82:0.67:122
chr22	39969767	rs5750851	T	C	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=13;PP=907;SC=CTCACCTCCATCCTCAGGTCA;SOR=1.788;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=26;TCR=13;TR=39;WE=39969775;WS=39969757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
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chr22	40055304	rs136850	T	C	616.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.521;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=503;ReadPosRankSum=0.225;SC=TCAGTGTTCATCTCTGTAAAA;SOR=1.542;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=23;WE=40055312;WS=40055294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,24:0.75:32
chr22	40055896	rs136851	T	C	1650.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.299;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.691;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=52;PP=1406;ReadPosRankSum=-1.118;SC=CCCCACAGGGTCTGCGAAAGA;SOR=0.268;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=80;TCF=7;TCR=73;TR=59;WE=40055904;WS=40055886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,57:0.71:80
chr22	40057273	rs136852	T	C	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.674;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=41;PP=936;ReadPosRankSum=1.240;SC=GAAAGAGCAGTGTCATGTCTC;SOR=0.895;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=15;TCR=51;TR=53;WE=40057281;WS=40057263;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,54:0.81:67
chr22	40058186	rs136853	A	G	1000.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.044;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=26;PP=835;ReadPosRankSum=0.594;SC=CGCCCACCACATTCATCACGG;SOR=0.538;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=65;TCF=23;TCR=42;TR=41;WE=40058194;WS=40058176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,41:0.65:63
chr22	40058999	rs136854	C	T	32.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.967;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=10.94;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,2:0.67:3
chr22	40061683	rs136855	A	G	3288.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.375;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=174;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.013;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=66;PP=2594;ReadPosRankSum=-0.828;SC=GGGAAAAGGAAGTCTCAGACA;SOR=1.078;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=166;TCF=72;TCR=94;TR=108;WE=40061691;WS=40061673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,115:0.66:174
chr22	40075400	rs2294369	G	A	461.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=14;PP=376;ReadPosRankSum=0.789;SC=GGCGGGCGGCGGGGGCGACAC;SOR=0.941;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=16;WE=40075408;WS=40075390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,16:0.67:24
chr22	40075473	rs7288746	T	C	88.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-2.100;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=4;PP=58;ReadPosRankSum=-0.944;SC=TGGAGAGGTGTGAGGGTCGCC;SOR=1.508;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=11;TCF=4;TCR=7;TR=5;WE=40075481;WS=40075463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chr22	40075733	rs56656729	C	A	1239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.239;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=19;PP=937;ReadPosRankSum=0.848;SC=CTAGGAGAACCTGTGGCTGGA;SOR=1.016;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=129;TCF=72;TCR=57;TR=49;WE=40075741;WS=40075723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,52:0.39:133
chr22	40161181	.	T	TTGTGTGTG	810.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.740;ClippingRankSum=0.000;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.24;MQRankSum=-1.195;QD=20.79;ReadPosRankSum=-0.318;SOR=0.321;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr22	40271614	rs137945	C	G	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.338;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=33.014;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-7.111;NF=3;NR=38;PP=939;ReadPosRankSum=-0.081;SC=AGAGAAAGCACCGAGGCTAGG;SOR=5.408;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=85;TCF=14;TCR=71;TR=41;WE=40271622;WS=40271604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,40:0.48:83
chr22	40364394	rs138009	C	G	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=17;PP=468;SC=CTGGACCCCCCCAAATGGCAG;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=17;WE=40364402;WS=40364384;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr22	40415140	rs2071771	C	T	175.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.310;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=7;NR=0;PP=133;ReadPosRankSum=-0.185;SC=GTGTAGACACCGTGTGCCTCA;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=7;WE=40415148;WS=40415130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,7:0.47:15
chr22	40417780	rs5995793	C	T	3199.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.328;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=71;PP=2440;ReadPosRankSum=1.082;SC=CCAGCCGAAACGGCATGGGAG;SOR=0.736;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=177;TCF=66;TCR=111;TR=113;WE=40417788;WS=40417770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:64,120:0.65:184
chr22	40417820	rs5995794	A	G	2421.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.456;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.434;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=56;PP=1785;ReadPosRankSum=-2.288;SC=CGCCCCCGCCAGGCGCTTCAG;SOR=0.541;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=140;TCF=50;TCR=90;TR=89;WE=40417828;WS=40417810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,95:0.65:147
chr22	40417943	rs41276305	G	A	654.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.354;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=17;PP=436;ReadPosRankSum=-0.051;SC=GAGGCCCAACGAGAATTCCAG;SOR=0.250;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=83;TCF=28;TCR=55;TR=29;WE=40417951;WS=40417933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,30:0.35:86
chr22	40545595	rs6001804	A	C	415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=0;PP=303;SC=AATCTCTTGAACCCAGGAGGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=40545603;WS=40545585;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr22	40545797	rs34190441	T	TA	522.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=2;NR=15;PP=651;SC=GTGTCAAAACTAAAAATTGTA;SOR=2.712;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=17;WE=40545805;WS=40545787;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr22	40545998	rs35899845	C	CA	1691.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=16;PP=1295;SC=TGAAAGCCAACAAAAAATTGA;SOR=2.833;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=54;TCF=38;TCR=16;TR=50;WE=40546006;WS=40545988;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr22	40546041	rs35629137	C	CA	2757.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.045;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=36;PP=2502;ReadPosRankSum=1.505;SC=AAAGTAGAGTCAAAAAGGTTT;SOR=0.281;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=73;TCF=33;TCR=40;TR=67;WE=40546049;WS=40546031;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,90:0.99:91
chr22	40546153	rs5995826	G	A	1221.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=32;PP=985;SC=AGGCCAAGGCGGGCAGATCAC;SOR=4.351;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=4;TCR=32;TR=36;WE=40546161;WS=40546143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr22	40574170	rs6001827	T	A	3228.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=78;NR=19;PP=2649;SC=CAATTTTTTTTAACCAATTGA;SOR=2.742;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=97;TCF=78;TCR=19;TR=97;WE=40574178;WS=40574160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr22	40666169	.	C	T	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.579;ClippingRankSum=0.000;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=9;PP=294;ReadPosRankSum=1.343;SC=ATGGTACTTCCGCTTGGGGTG;SOR=0.646;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=64;TCF=37;TCR=27;TR=21;WE=40666177;WS=40666159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,21:0.30:71
chr22	40673999	rs2413621	C	T	2345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.144;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=53;NR=26;PP=1831;ReadPosRankSum=-1.256;SC=TCTTTATTTTCCAGAGTCAGA;SOR=1.666;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=108;TCF=68;TCR=40;TR=79;WE=40674007;WS=40673989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,84:0.74:114
chr22	40677001	rs929070	T	C	581.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.266;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=451;ReadPosRankSum=-1.610;SC=ATTCCATCCTTGGTTATTGCT;SOR=0.527;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=31;TCF=30;TCR=1;TR=20;WE=40677009;WS=40676991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,20:0.65:31
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chr22	40697176	rs10617561	TGCA	T	828.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=1.405;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.742;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=2;PP=883;ReadPosRankSum=-0.260;SC=GTGAGTGCACTGCAGCAGCAG;SOR=2.449;SbPval=0.96;Source=Platypus;TC=66;TCF=51;TCR=15;TR=21;WE=40697186;WS=40697166;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,24:0.35:69
chr22	40697377	rs5995843	A	G	1764.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=6.479;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=52;PP=1412;ReadPosRankSum=-0.723;SC=TTAGAAATCTACCTCTCTAGG;SOR=0.727;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=102;TCF=15;TCR=87;TR=60;WE=40697385;WS=40697367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,63:0.59:107
chr22	40708679	rs2072858	T	C	2545.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=58;PP=2026;ReadPosRankSum=-0.823;SC=GCATCTCTTATATGTTCAACA;SOR=0.644;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=139;TCF=46;TCR=93;TR=88;WE=40708687;WS=40708669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,92:0.64:143
chr22	40746137	.	C	CT	96	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=15;HapScore=4;MGOF=6;MMLQ=28;MQ=60.08;NF=1;NR=3;PP=96;QD=25.0;SC=CACTATAGATCTTTTTTTTTT;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=4;WE=40746158;WS=40746127;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:20,4:0.17:24
chr22	40746150	.	T	C	45	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=13;HapScore=4;MGOF=6;MMLQ=30;MQ=60.16;NF=0;NR=3;PP=45;QD=26.5904041824;SC=TTTTTTTTTTTTGAGGCAGAG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=3;WE=40746158;WS=40746127;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,3:0.25:12
chr22	40754826	rs3830737	GTCTC	G	733.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=0.526;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.243;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=3;PP=791;ReadPosRankSum=1.092;SC=ATGATTTAAGGTCTCGGTCTG;SOR=0.933;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=49;TCF=37;TCR=12;TR=16;WE=40754837;WS=40754816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,21:0.36:58
chr22	40757228	rs8135371	A	C	1292.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=6.127;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.949;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=4;PP=1100;ReadPosRankSum=-0.188;SC=CCCAGACTCTACTGCACACTG;SOR=2.413;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=63;TCF=54;TCR=9;TR=42;WE=40757236;WS=40757218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,44:0.66:67
chr22	40759233	rs2068470	T	C	203.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-3.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.357;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=136;ReadPosRankSum=-1.689;SC=GAACTAGCTCTGTGGAATTCA;SOR=0.073;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=11;WE=40759241;WS=40759223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,11:0.37:30
chr22	40800518	rs760701	G	A	1494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=287;ExcessHet=3.0103;FS=1.621;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.26;ReadPosRankSum=-0.874;SOR=0.640;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:209,75:0.26:284
chr22	40800544	rs2235318	C	T	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.923;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FS=10.650;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.86;ReadPosRankSum=1.407;SOR=0.308;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:196,69:0.26:265
chr22	40801986	rs9607716	C	T	182.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.973;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=3;PP=54;ReadPosRankSum=-0.041;SC=GCCCCCTCCCCTCCTTTGCTC;SOR=0.593;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=31;TCF=18;TCR=13;TR=6;WE=40801994;WS=40801976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,9:0.26:35
chr22	40802739	rs143734853	G	A	437.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.809;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.114;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=9;PP=361;ReadPosRankSum=0.050;SC=AGTTCAGAGCGCGGGGGCTGC;SOR=1.038;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=71;TCF=38;TCR=33;TR=22;WE=40802747;WS=40802729;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,22:0.29:75
chr22	40803186	rs2018393	G	T	4414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=84;NR=45;PP=2965;SC=TGGTCACCATGGTTCTCTGGG;SOR=1.398;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=131;TCF=85;TCR=46;TR=129;WE=40803194;WS=40803176;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chr22	40803367	rs77222252	C	T	1794.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=3.014;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.133;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.782;NF=36;NR=31;PP=1195;ReadPosRankSum=-0.661;SC=CTACCAAACACGGCCCTAACT;SOR=0.606;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=190;TCF=106;TCR=84;TR=67;WE=40803375;WS=40803357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:121,76:0.39:197
chr22	40814500	rs878756	T	C	6090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=103;NR=102;PP=2965;SC=TTGATGAGGCTGGGGCCCTGA;SOR=0.703;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=205;TCF=103;TCR=102;TR=205;WE=40814508;WS=40814490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chr22	40814594	rs56211152	C	T	2859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.469;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=69;PP=2355;ReadPosRankSum=1.485;SC=ACGGGGGCCCCGGGGCCACAG;SOR=0.689;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=161;TCF=57;TCR=104;TR=107;WE=40814602;WS=40814584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,106:0.66:161
chr22	40814636	rs4821944	C	T	1127.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=4.344;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.431;HP=1;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=38;PP=899;ReadPosRankSum=-0.303;SC=TGGCTGGGGCCGCCAGGCTGG;SOR=0.964;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=150;TCF=43;TCR=107;TR=51;WE=40814644;WS=40814626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,51:0.34:151
chr22	40816749	rs2072856	G	A	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=4;PP=465;SC=CAGACCAGCGGGTCCTTAAAG;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=14;TCR=4;TR=18;WE=40816757;WS=40816745;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	41075543	rs133072	A	G	1329.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.613;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.525;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=33;PP=1158;ReadPosRankSum=0.235;SC=CCCCCTTCCCAACTGCGGGGC;SOR=1.195;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=97;TCF=45;TCR=52;TR=55;WE=41075551;WS=41075533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,53:0.57:93
chr22	41075695	rs133073	C	T	1833.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=3.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.725;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=36;PP=1483;ReadPosRankSum=-0.135;SC=CTGGTCCCAACGCCAGCAACA;SOR=0.742;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=110;TCF=54;TCR=56;TR=69;WE=41075703;WS=41075685;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,69:0.62:112
chr22	41172351	rs6002128	A	G	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=1;NR=18;PP=521;SC=GAGTGCTTCAAAAAAGCTAAA;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=41172359;WS=41172341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr22	41175285	.	C	A	37.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.520;ClippingRankSum=0.000;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.22;ReadPosRankSum=-1.208;SOR=0.425;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr22	41194909	rs138306	C	T	2220.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=1;PP=1921;SC=ATCATGCCATCGCACTCCAGC;SOR=6.994;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=67;TCF=66;TCR=1;TR=66;WE=41194917;WS=41194899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chr22	41194947	rs113368977	CA	C	58.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.275;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=3.429;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.19;MQRankSum=1.769;QD=0.62;ReadPosRankSum=-0.781;SOR=1.233;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:76,19:0.20:95
chr22	41195191	rs113851841	A	AGTGGCATGGTT	1175.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=13;PP=2957;SC=GCTGGAGTGCAGTGGTTTACG;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=0;TCR=27;TR=13;WE=41195199;WS=41195181;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr22	41210063	rs138323	T	A	147.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=117;SC=TTGACATAAGTAACTCCATCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=41210071;WS=41210053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
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chr22	41223190	rs710193	C	T	285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-3.061;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.452;NF=9;NR=0;PP=173;ReadPosRankSum=-0.168;SC=CCATTCCAGGCATTCCTCCGG;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=9;WE=41223198;WS=41223180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr22	41227086	rs138335	C	G	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=15;PP=546;SC=TTGTCTTGTACAAAAAGACCT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=41227094;WS=41227076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr22	41256802	rs103197	A	G	1378.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=35;PP=1164;SC=CTACAGGTGCACACCACCACA;SOR=3.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=5;TCR=35;TR=40;WE=41256810;WS=41256792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chr22	41303163	rs118098040	C	T	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=6.654;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.973;NF=1;NR=24;PP=489;ReadPosRankSum=-0.252;SC=CGGTGGCTCACGCCTGTATTC;SOR=0.476;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=71;TCF=2;TCR=69;TR=25;WE=41303171;WS=41303153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:49,25:0.34:74
chr22	41513094	rs2144342	G	T	212.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.908;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.771;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=112;ReadPosRankSum=0.718;SC=GAGTGAGGTTGGGAAATGACA;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=6;WE=41513102;WS=41513084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,8:0.67:12
chr22	41537234	rs6002267	G	T	3815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=91;PP=2965;SC=CTAGTAAGTGGTTTTTGTTAT;SOR=3.126;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=110;TCF=19;TCR=91;TR=110;WE=41537242;WS=41537224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chr22	41550954	rs4822011	C	T	1287.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-3.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=147;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=3;PP=1019;ReadPosRankSum=-1.114;SC=TAAAGTTCTTCTGCTTAATTG;SOR=0.527;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=139;TCF=131;TCR=8;TR=51;WE=41550962;WS=41550944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,52:0.36:146
chr22	41551039	rs20552	T	A	2610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-6.500;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=404;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.590;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=76;NR=46;PP=2024;ReadPosRankSum=0.118;SC=TGATGCCAACTTTGGAGGCAC;SOR=0.599;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=387;TCF=243;TCR=144;TR=122;WE=41551047;WS=41551029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:277,124:0.31:401
chr22	41564708	rs2294976	C	A	4093.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=241;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.628;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=72;NR=74;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.419;SC=GGTTCCCCCACCATCTCAATT;SOR=0.582;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=227;TCF=110;TCR=117;TR=146;WE=41564716;WS=41564698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:87,151:0.63:238
chr22	41568480	rs2076577	T	C	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.371;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=349;ReadPosRankSum=-1.180;SC=GAAATTCCTATATGTACATGC;SOR=0.267;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=62;TCF=60;TCR=2;TR=20;WE=41568488;WS=41568470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,21:0.36:59
chr22	41569609	rs2076578	C	T	577.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.666;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=0;PP=437;ReadPosRankSum=0.023;SC=TTCTTGTCTCCTTTGTGCTAC;SOR=0.232;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=65;TCF=65;TCR=0;TR=21;WE=41569617;WS=41569599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,23:0.33:69
chr22	41604353	rs139431	C	T	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=-1.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.9992;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=3;PP=225;ReadPosRankSum=1.397;SC=AGGCTGGTCTCAAACTCCTGG;SOR=0.527;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=12;WE=41604361;WS=41604343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr22	41604399	rs4820432	G	A	75.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.484;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.563;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=0;PP=31;ReadPosRankSum=-1.386;SC=CTCCCAAAGTGCTGGGATTAC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=16;TCR=6;TR=5;WE=41604407;WS=41604389;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr22	41604557	rs139432	G	A	73.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.981;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=48;ReadPosRankSum=1.437;SC=TAAATGACTTGCCCAAGGCCC;SOR=0.527;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=4;WE=41604565;WS=41604547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,4:0.44:9
chr22	41604618	rs75278755	A	T	63.81	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.150;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=15.95;ReadPosRankSum=-1.150;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,3:0.75:4
chr22	41605635	rs139437	T	C	1190.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=8.274;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=29.77;ReadPosRankSum=0.484;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,30:0.75:40
chr22	41605639	rs139438	C	T	1162.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.239;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=8.738;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.60;ReadPosRankSum=-0.576;SOR=3.420;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,29:0.76:38
chr22	41606030	rs139439	A	C	210.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-3.294;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=156;ReadPosRankSum=0.687;SC=AGAGCCATCCAGATGTAAAAG;SOR=1.061;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=10;WE=41606038;WS=41606020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,10:0.59:17
chr22	41609859	rs139450	T	C	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.951;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.339;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=59.98;MQRankSum=-0.761;NF=18;NR=8;PP=585;ReadPosRankSum=0.239;SC=TTTGAGGTGGTCATATCGGGT;SOR=0.450;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=42;TCF=31;TCR=11;TR=26;WE=41609867;WS=41609849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr22	41610024	rs139451	G	A	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-0.917;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.484;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=26;PP=722;ReadPosRankSum=-0.317;SC=TCTTGGCTAGGTTACAGGTGA;SOR=1.508;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=46;TCF=11;TCR=35;TR=33;WE=41610032;WS=41610014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,33:0.73:45
chr22	41612965	rs85220	T	G	404.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.901;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=287;ReadPosRankSum=-0.121;SC=CACTGGTGGATCAGGTATGGG;SOR=0.859;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=15;TCR=2;TR=15;WE=41612973;WS=41612962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,15:0.83:18
chr22	41617160	rs139471	T	TG	881.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=0;PP=842;ReadPosRankSum=0.162;SC=TCAGTGGAGGTTTGTCAGTCT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=24;WE=41617168;WS=41617150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,26:0.60:43
chr22	41617318	rs139472	G	C	2999.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.466;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.728;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=67;NR=39;PP=2442;ReadPosRankSum=-1.098;SC=TAACTGATGTGCCTCCTTCCG;SOR=0.911;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=171;TCF=105;TCR=66;TR=106;WE=41617326;WS=41617308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,110:0.61:179
chr22	41623351	rs56361238	A	G	2726.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-0.007;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=62;PP=2178;ReadPosRankSum=2.192;SC=TGGCCCTAAGAGGCTCTGACT;SOR=0.715;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=163;TCF=58;TCR=105;TR=95;WE=41623359;WS=41623341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,98:0.58:168
chr22	41645500	rs139500	TG	T	2920.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.685;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.338;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.717;NF=19;NR=76;PP=2232;ReadPosRankSum=0.398;SC=CAAAGTCACCTGGGGGGGCCC;SOR=0.437;SbPval=0.34;Source=Platypus;TC=160;TCF=28;TCR=132;TR=95;WE=41645508;WS=41645490;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,112:0.68:165
chr22	41645757	rs71948	C	G	1727.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.013;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=24;PP=1382;ReadPosRankSum=-2.968;SC=TGTGCACGAGCAGCCTGGTGA;SOR=1.069;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=97;TCF=54;TCR=43;TR=63;WE=41645765;WS=41645747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,64:0.63:102
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chr22	41673592	rs8139515	A	T	1300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.829;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.537;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=35;PP=957;ReadPosRankSum=-1.797;SC=TCTGGTCAAGAAGGGTCTTGA;SOR=0.343;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=71;TCF=19;TCR=52;TR=50;WE=41673600;WS=41673582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,52:0.72:72
chr22	41676559	rs35821769	C	CAGCT	190.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.740;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=0;PP=277;ReadPosRankSum=-0.505;SC=GGGAAAGCTGCAGCTATTCCC;SOR=0.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=6;WE=41676567;WS=41676549;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,6:0.43:14
chr22	41739370	rs1883828	T	C	1873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.022;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=17.539;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=10;PP=1433;ReadPosRankSum=-0.345;SC=CAGCCATCACTCTTCAATTCT;SOR=2.360;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=111;TCF=87;TCR=24;TR=65;WE=41739378;WS=41739360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,68:0.60:113
chr22	41745355	rs2281331	A	G	506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.895;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=19;PP=473;ReadPosRankSum=1.096;SC=GGTGAGGGGTAGGCGGCGCAG;SOR=1.071;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=21;WE=41745363;WS=41745345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,19:0.58:33
chr22	41829794	rs6609	C	G	958.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.32;QD=34.24;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chr22	41833116	rs202641	C	T	11425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=367;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=150;NR=198;PP=2965;SC=CATCTTCCACCGCCAGGCCAC;SOR=1.044;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=349;TCF=151;TCR=198;TR=348;WE=41833124;WS=41833106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,361:1.00:361
chr22	41863681	rs150112406	GGGGAAATATACTAGTCTCCT	G	2159.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.097;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.466;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=4.523;NF=4;NR=32;PP=2963;ReadPosRankSum=-0.382;SC=CTCCTGCCATGGGGAAATATA;SOR=0.506;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=81;TCF=6;TCR=75;TR=36;WE=41863708;WS=41863671;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,58:0.67:87
chr22	41864216	rs505533	A	C	3283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=29;NR=62;PP=2388;SC=GGAGAAGTACATCCTCGAGCT;SOR=1.681;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=29;TCR=63;TR=91;WE=41864224;WS=41864206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chr22	41865334	rs117369326	G	A	148.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=0.5341;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=6;PP=110;ReadPosRankSum=-0.366;SC=ACCCGTGCCCGCTTCTCTGGT;SOR=1.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=7;WE=41865342;WS=41865324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,6:0.86:7
chr22	41911525	rs1799932	C	T	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.241;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.064;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=10;PP=341;ReadPosRankSum=-1.039;SC=CCCCTGGGAGCTGAAGTGCCC;SOR=0.484;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=51;TCF=24;TCR=27;TR=21;WE=41911533;WS=41911515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr22	41939783	rs187799420	T	C	4499.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.327;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=267;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.519;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=117;NR=48;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.270;SC=TTTAGAATTGTGGAATCTAAC;SOR=0.623;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=256;TCF=185;TCR=71;TR=165;WE=41939791;WS=41939773;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:95,172:0.64:267
chr22	42016699	rs2267437	C	G	241.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.040;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=7.193;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.90;ReadPosRankSum=-0.945;SOR=0.061;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,13:0.21:62
chr22	42059768	rs132788	G	T	876.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.043;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.331;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.719;NF=6;NR=25;PP=699;ReadPosRankSum=-0.989;SC=TGAAGAGTGGGCTGAAGAAGC;SOR=2.428;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=39;TCF=10;TCR=29;TR=31;WE=42059776;WS=42059758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,32:0.78:41
chr22	42076381	rs5758405	C	A	2515.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=49;PP=1995;SC=ATGGGGGGGACATAAAAATAT;SOR=1.193;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=83;TCF=33;TCR=50;TR=82;WE=42076389;WS=42076371;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr22	42089623	rs739134	T	C	7028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=231;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=162;NR=61;PP=2965;SC=CCAGGAATCATGGGCCCAGAA;SOR=1.955;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=223;TCF=162;TCR=61;TR=223;WE=42089631;WS=42089613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,230:1.00:230
chr22	42109917	rs5758431	A	G	432.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=1;PP=364;SC=GCAAATCACTATCCTGCACTG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=42109925;WS=42109907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr22	42111896	rs9306355	A	T	1361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=5;PP=1001;ReadPosRankSum=-0.784;SC=CCAGTGGGGGAGCTGGACACT;SOR=2.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=41;TCR=5;TR=45;WE=42111904;WS=42111886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,48:0.98:49
chr22	42111917	rs116967103	A	T	908.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-5.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.428;HP=5;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=526;ReadPosRankSum=-1.875;SC=AAGCTAAAAAAGCTGATTGCT;SOR=0.112;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=70;TCF=60;TCR=10;TR=33;WE=42111925;WS=42111907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,39:0.51:77
chr22	42139054	rs5751147	G	A	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=4;PP=463;SC=TTGCCTTACCGTGAACCTGCT;SOR=1.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=42139062;WS=42139044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	42139078	rs5751148	A	G	764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=6;PP=593;SC=GTCTCTCTGGATGCAGGAAGG;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=17;TCR=6;TR=23;WE=42139086;WS=42139068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr22	42140792	rs56663311	G	A	241.84	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.21;QD=40.31;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	42140793	rs62236786	C	T	241.84	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.21;QD=40.31;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	42140798	rs56138604	G	A	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.45;QD=52.72;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr22	42140800	rs58323591	C	CTTTG	412.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=278;SC=CCGCGCCCGGCCTATGATTTT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=42140808;WS=42140785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr22	42148467	rs715498	G	A	3150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=79;NR=13;PP=2491;SC=CTAGACAGTGGTGGAGTACAT;SOR=3.189;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=92;TCF=79;TCR=13;TR=92;WE=42148475;WS=42148457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr22	42150146	rs1534932	C	T	1251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=30;PP=980;SC=AGTACAGCCACGAGATTTCTT;SOR=2.613;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=7;TCR=30;TR=37;WE=42150154;WS=42150136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
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chr22	42190309	rs738247	A	G	559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=498;ReadPosRankSum=1.662;SC=CAATAGGAGAAGGTCCTCTTG;SOR=0.557;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=28;TCF=27;TCR=1;TR=19;WE=42190317;WS=42190299;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,19:0.66:29
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chr22	42354487	rs149263017	G	GGAGA	80.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.030;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.25;ReadPosRankSum=-1.202;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,4:0.21:19
chr22	42388826	rs56234624	A	G	925.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=3.785;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.648;HP=5;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=28;PP=750;ReadPosRankSum=-0.587;SC=GTCACCATTTATTAAGCATCT;SOR=0.890;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=121;TCF=40;TCR=81;TR=40;WE=42388834;WS=42388816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:81,40:0.33:121
chr22	42388841	rs133299	G	A	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=22;PP=483;ReadPosRankSum=-0.598;SC=GCATCTATAGGTCAAGGCACT;SOR=0.769;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=98;TCF=25;TCR=73;TR=29;WE=42388849;WS=42388831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,30:0.30:100
chr22	42390209	rs7290907	G	A	682.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=4.839;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=7.734;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.55;ReadPosRankSum=1.029;SOR=1.561;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:123,27:0.18:150
chr22	42390225	rs7290655	C	G	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.091;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FS=8.364;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.40;ReadPosRankSum=-0.958;SOR=1.537;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,33:0.20:161
chr22	42392811	rs1062753	G	A	1494.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.657;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.418;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=32;PP=1049;ReadPosRankSum=-1.193;SC=TGGCACCCCTGAACCATGATC;SOR=0.458;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=190;TCF=110;TCR=80;TR=66;WE=42392819;WS=42392801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:130,69:0.35:199
chr22	42415224	.	CA	C	49.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.016;ClippingRankSum=0.000;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.71;MQRankSum=0.000;QD=0.71;ReadPosRankSum=0.702;SOR=0.338;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:56,14:0.20:70
chr22	42418185	rs133341	T	C	332.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.941;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=226;ReadPosRankSum=0.148;SC=GTTAATTGTTTAGTTGATATC;SOR=0.199;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=13;WE=42418193;WS=42418175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,14:0.31:45
chr22	42423110	rs2301521	G	C	571.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-3.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.701;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=393;ReadPosRankSum=-1.146;SC=CCAGGCCTCAGGAATCTACAG;SOR=0.631;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=106;TCF=53;TCR=53;TR=30;WE=42423118;WS=42423100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,31:0.27:113
chr22	42461918	rs2854827	G	A	669.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.856;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=19;PP=498;ReadPosRankSum=-0.474;SC=ATGTCGAGGGGAAGGCAGAGT;SOR=0.876;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=90;TCF=36;TCR=54;TR=29;WE=42461926;WS=42461908;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,30:0.32:93
chr22	42463366	rs133367	C	T	903.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=4.959;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.046;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=29;PP=686;ReadPosRankSum=0.270;SC=TATCTGACCCCGTCCCATTAA;SOR=0.499;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=14;TCR=80;TR=34;WE=42463374;WS=42463356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:62,37:0.37:99
chr22	42463689	rs133368	T	C	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=0;PP=177;ReadPosRankSum=-0.041;SC=ATCTCAATCATGTAAGTGAGC;SOR=0.207;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=11;WE=42463697;WS=42463679;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,11:0.31:35
chr22	42463814	rs133369	C	T	1344.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.123;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.984;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=25;PP=1013;ReadPosRankSum=-0.705;SC=GCTTGGGATCCGGCATCAGGC;SOR=0.958;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=159;TCF=81;TCR=78;TR=58;WE=42463822;WS=42463804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,59:0.37:161
chr22	42473860	rs1807493	C	G	953.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.840;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=25;PP=749;ReadPosRankSum=1.715;SC=GTTGAAGAAGCGGGCAGCAGG;SOR=1.802;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=65;TCF=25;TCR=40;TR=35;WE=42473868;WS=42473850;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,37:0.55:67
chr22	42474138	rs1807494	C	G	617.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.619;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.378;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=20;PP=447;ReadPosRankSum=0.233;SC=AAATGTTTACCCATTTCCAAG;SOR=1.807;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=36;TCF=5;TCR=31;TR=22;WE=42474146;WS=42474128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,23:0.61:38
chr22	42475703	rs2269524	T	G	325.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.31;BaseQRankSum=2.009;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.193;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=238;ReadPosRankSum=-0.912;SC=CGGGCGGCTTTCTTCCCGAGG;SOR=3.477;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=12;WE=42475711;WS=42475695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,13:0.52:25
chr22	42486723	rs1801311	G	A	4699.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.296;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=273;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.262;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=99;NR=74;PP=2962;ReadPosRankSum=1.339;SC=GGTAGAAGTAGCTTGGCGGAC;SOR=0.918;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=260;TCF=138;TCR=122;TR=173;WE=42486731;WS=42486713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:94,178:0.65:272
chr22	42523358	.	G	T	188.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-2.624;ClippingRankSum=0.000;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.961;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.640;NF=9;NR=2;PP=125;ReadPosRankSum=-0.533;SC=GGTGGCCAGGGTTCCTAGAGT;SOR=0.285;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=45;TCF=39;TCR=6;TR=11;WE=42523366;WS=42523348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,11:0.26:43
chr22	42523528	rs1058172	C	T	743.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.887;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FS=13.201;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.97;MQRankSum=0.145;QD=3.37;ReadPosRankSum=0.360;SOR=1.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:174,47:0.21:221
chr22	42523943	rs16947	A	G	974.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-4.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.854;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.849;NF=26;NR=22;PP=715;ReadPosRankSum=1.297;SC=ACCACTATGCACAGGTTCTCA;SOR=0.216;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=108;TCF=69;TCR=39;TR=48;WE=42523951;WS=42523933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,47:0.44:108
chr22	42524696	rs58440431	T	C	61.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.420;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.718;NF=4;NR=1;PP=65;ReadPosRankSum=-0.501;SC=AACCCATCTATGCAAATCCTG;SOR=0.551;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=5;WE=42524704;WS=42524686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,4:0.33:12
chr22	42524947	rs3892097	C	T	554.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.093;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.561;NF=18;NR=15;PP=652;ReadPosRankSum=-0.851;SC=AAGGGGCGTCCTGGGGGTGGG;SOR=0.730;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=79;TCF=46;TCR=33;TR=33;WE=42524955;WS=42524937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,23:0.39:59
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chr22	42525811	rs28371704	T	C	578.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=2.458;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.02;MQRankSum=-3.125;QD=8.15;ReadPosRankSum=0.560;SOR=1.642;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,19:0.27:71
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chr22	42526580	rs1080995	G	C	690.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.230;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.96;MQRankSum=-0.915;QD=11.14;ReadPosRankSum=0.942;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,20:0.32:62
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chr22	42526763	rs769258	C	T	751.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.895;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.549;NF=11;NR=18;PP=621;ReadPosRankSum=1.505;SC=GCCACTATCACGGCCAGGGGC;SOR=0.246;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=42;TCF=14;TCR=28;TR=29;WE=42526771;WS=42526753;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,29:0.67:43
chr22	42536263	rs1058174	G	A	55.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.691;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=-1.937;NF=4;NR=0;PP=21;ReadPosRankSum=0.749;SC=TGGCTAGGGAGCAGGCTGGGG;SOR=0.846;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=4;WE=42536271;WS=42536253;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,4:0.22:18
chr22	42536313	rs2743456	G	A	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.604;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.366;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.286;NF=11;NR=4;PP=264;ReadPosRankSum=0.759;SC=CACAAAGCTCGTAGGGGGATG;SOR=0.404;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=38;TCF=28;TCR=10;TR=15;WE=42536321;WS=42536303;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,17:0.44:39
chr22	42536700	rs185754367	G	A	1031.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FS=2.325;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=53.99;MQRankSum=0.043;QD=23.99;ReadPosRankSum=-0.603;SOR=1.730;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,39:0.91:43
chr22	42537023	rs2860372	T	C	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=24.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr22	42537404	rs2854741	G	C	480.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.281;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.942;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.518;NF=10;NR=8;PP=381;ReadPosRankSum=0.613;SC=ACTCTCCTTCGTCCTGTGTTG;SOR=0.555;SbPval=0.27;Source=Platypus;TC=72;TCF=32;TCR=40;TR=18;WE=42537412;WS=42537394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,23:0.29:78
chr22	42538029	rs1058167	A	G	662.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.764;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-5.251;NF=14;NR=22;PP=548;ReadPosRankSum=-0.129;SC=TGGGATGTGCAGGAGGACGGG;SOR=0.829;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=121;TCF=54;TCR=67;TR=36;WE=42538037;WS=42538019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,34:0.29:116
chr22	42538071	rs2267444	G	C	755.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.650;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.131;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.246;NF=6;NR=19;PP=879;ReadPosRankSum=-0.947;SC=CAGACAGAACGGGGTCTCAAT;SOR=1.035;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=95;TCF=28;TCR=67;TR=25;WE=42538092;WS=42538061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:69,26:0.27:95
chr22	42538084	rs2267446	C	T	634.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.640;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.850;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.694;NF=2;NR=17;PP=879;ReadPosRankSum=-0.141;SC=GTCTCAATCCCTCCTGTGCTC;SOR=1.851;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=74;TCF=17;TCR=57;TR=19;WE=42538092;WS=42538061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:54,20:0.27:74
chr22	42538508	rs3021082	A	G	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.803;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.04;MQRankSum=-1.923;QD=12.22;ReadPosRankSum=0.117;SOR=1.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr22	42538508	.	AG	GA	1421	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;FR=0.5000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=24;MQ=47.63;NF=13;NR=6;PP=1421;QD=77.6035723612;SC=CTCCTCCTTCAGTCCCTCCTG;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=61;TCF=40;TCR=21;TR=19;WE=42538522;WS=42538498;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:42,19:0.31:61
chr22	42538509	rs56023519	G	A	696.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=2.331;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.04;MQRankSum=-1.923;QD=12.22;ReadPosRankSum=0.251;SOR=1.040;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,20:0.35:57
chr22	42538514	.	T	TC	606.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-0.297;ClippingRankSum=0.000;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.115;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.888;NF=10;NR=6;PP=1441;ReadPosRankSum=1.894;SC=CTTCAGTCCCTCCTGAGCTAG;SOR=0.976;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=54;TCF=31;TCR=23;TR=16;WE=42538522;WS=42538498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,18:0.33:55
chr22	42538870	rs2982057	A	C	775.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.288;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FS=22.196;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQRankSum=-5.417;QD=5.04;ReadPosRankSum=-0.015;SOR=1.301;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:114,40:0.26:154
chr22	42538876	rs3020732	A	T	3113.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.629;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=22.591;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=5.316;NF=68;NR=46;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.190;SC=CGCGACAGGAACACCCCTGGG;SOR=0.874;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=154;TCF=81;TCR=73;TR=114;WE=42538893;WS=42538860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,116:0.75:155
chr22	42538885	rs2743460	G	T	740.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FS=17.662;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.36;MQRankSum=-4.963;QD=4.69;ReadPosRankSum=0.518;SOR=1.331;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:118,40:0.25:158
chr22	42546852	rs59390354	G	A	1328.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.356;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-2.235;NF=24;NR=31;PP=901;ReadPosRankSum=1.070;SC=CACGGCAGTGGTGCAGGGCAT;SOR=0.859;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=131;TCF=60;TCR=71;TR=55;WE=42546860;WS=42546842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:82,59:0.42:141
chr22	42606257	rs2070116	C	T	3169.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.671;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=172;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=63;PP=2597;ReadPosRankSum=0.794;SC=GCATAAAGGACGAGGCCGGGA;SOR=0.736;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=169;TCF=81;TCR=88;TR=120;WE=42606265;WS=42606247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,119:0.70:171
chr22	42609148	rs5758651	T	C	1120.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.106;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.323;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=21;PP=821;ReadPosRankSum=0.760;SC=GGAAAGCCACTGACATTTCGT;SOR=0.834;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=159;TCF=96;TCR=63;TR=54;WE=42609156;WS=42609138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,54:0.33:165
chr22	42781071	rs12484478	G	A	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-3.662;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=196;ReadPosRankSum=1.296;SC=GGGTGTCCCTGGGGGCCTTAC;SOR=1.061;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=12;WE=42781079;WS=42781061;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,11:0.58:19
chr22	42807314	rs2247576	T	C	124.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.985;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=1;PP=65;ReadPosRankSum=0.236;SC=TGTGAGCCACTGCGCCTGGCC;SOR=1.034;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=7;WE=42807322;WS=42807304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,7:0.30:23
chr22	42807351	rs2072863	C	T	385.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=3.420;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.041;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=4;PP=281;ReadPosRankSum=0.606;SC=ATCCAAAGTCCCAAACTGCCA;SOR=0.162;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=50;TCF=42;TCR=8;TR=16;WE=42807359;WS=42807341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,16:0.32:50
chr22	42896553	rs71311440	TGGGGC	T	635.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.499;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=5.693;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.82;ReadPosRankSum=-0.868;SOR=2.256;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,18:0.39:46
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chr22	42912029	rs3201001	G	T	361.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.108;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.389;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=4;PP=259;ReadPosRankSum=-0.874;SC=GAACTGGCTTGGGATGAAAAA;SOR=0.392;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=64;TCF=51;TCR=13;TR=17;WE=42912037;WS=42912019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,18:0.28:64
chr22	42912455	.	A	G	66.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.292;ClippingRankSum=-0.000;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=5.14;ReadPosRankSum=2.239;SOR=0.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr22	42912501	.	A	T	45	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=0;NR=4;PP=45;QD=19.9428031368;SC=GTATTTTGAGAAGAGACAGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=4;WE=42912509;WS=42912491;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:6,4:0.40:10
chr22	42915634	.	C	T	289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.934;ClippingRankSum=0.000;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.278;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.140;NF=7;NR=6;PP=196;ReadPosRankSum=0.276;SC=TGCGGCCGCTCCTGGGGACCC;SOR=0.181;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=47;TCF=32;TCR=15;TR=13;WE=42915642;WS=42915624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,14:0.30:47
chr22	42993786	rs11459339	C	CT	52.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.053;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=6.628;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.35;MQRankSum=-3.271;QD=1.51;ReadPosRankSum=-1.588;SOR=0.036;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,12:0.34:35
chr22	42998902	rs113513063	G	T	1694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-6.133;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=199;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.864;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=24;PP=1199;ReadPosRankSum=-0.631;SC=GGGGCTTCTGGGGCACCGTGG;SOR=0.847;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=188;TCF=117;TCR=71;TR=67;WE=42998910;WS=42998892;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:125,73:0.37:198
chr22	43010653	.	G	T	341.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=3.220;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.310;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=1;PP=257;ReadPosRankSum=-0.070;SC=GGGCCACGGCGGGGACGGCGG;SOR=0.157;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=30;TCF=29;TCR=1;TR=14;WE=43010661;WS=43010646;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,14:0.47:30
chr22	43024410	rs137139	C	T	806.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=4.409;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.532;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=29;PP=715;ReadPosRankSum=-0.489;SC=GGCCTTCTCCCGTGGAGCCCC;SOR=3.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=29;WE=43024418;WS=43024400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,28:0.78:36
chr22	43026792	rs5758820	A	G	659.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=0;PP=511;SC=TGCACAGGGCAGGAGCGGGAG;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=43026800;WS=43026782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr22	43027356	rs743889	G	A	5773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=179;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=81;NR=94;PP=2965;SC=GCCGGGCTCCGAATGGGCCCA;SOR=0.799;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=175;TCF=81;TCR=94;TR=175;WE=43027364;WS=43027346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,177:1.00:177
chr22	43032742	rs5996200	C	T	1346.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-5.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.283;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=3;PP=1046;ReadPosRankSum=0.905;SC=TGAGCCGCAGCGGGTACTTGA;SOR=1.672;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=184;TCF=163;TCR=21;TR=60;WE=43032750;WS=43032732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:123,61:0.33:184
chr22	43035849	rs59947151	CTT	C	1259.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.9996;FS=0.000;HP=14;HapScore=4;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;NF=37;NR=0;PP=545;SC=GCTTGATTCACTTTTTTTTTT;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=47;TCF=46;TCR=1;TR=37;WE=43035859;WS=43035839;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,40:0.98:41
chr22	43036356	.	CTTATTTAT	C	1023	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=59.8;NF=0;NR=8;PP=1023;QD=128.5;SC=GCGTGGTTCACTTATTTATTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=8;WE=43036371;WS=43036346;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:20,8:0.29:28
chr22	43088549	rs3747194	C	T	1121.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.461;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=6;PP=950;ReadPosRankSum=-0.295;SC=CCCTTAGCACCGGCCTCTGCC;SOR=1.195;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=58;TCF=48;TCR=10;TR=39;WE=43088557;WS=43088539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,39:0.67:58
chr22	43195147	rs1128013	A	G	4517.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=269;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.408;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=116;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.606;SC=TGGGCAGCACACTGGACAGGC;SOR=0.545;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=252;TCF=75;TCR=177;TR=167;WE=43195155;WS=43195137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:90,175:0.66:265
chr22	43203137	rs738535	C	T	1738.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.605;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.803;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=30;PP=1359;ReadPosRankSum=-1.829;SC=AGGAACTTGCCGACAGCCTCT;SOR=0.659;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=93;TCF=46;TCR=47;TR=60;WE=43203145;WS=43203127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,62:0.65:96
chr22	43206950	rs1018448	A	C	1170.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=3.953;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.593;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=30;PP=881;ReadPosRankSum=-0.686;SC=CGTCAAAGTAACTGTAGGAGC;SOR=1.230;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=63;TCF=14;TCR=49;TR=37;WE=43206958;WS=43206940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,42:0.62:68
chr22	43213631	rs147339109	C	CA	1244.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.579;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.895;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=46;NR=2;PP=798;ReadPosRankSum=-0.331;SC=TAATGAATAACAAAAAAAAAT;SOR=1.536;SbPval=0.91;Source=Platypus;TC=102;TCF=93;TCR=9;TR=48;WE=43213639;WS=43213621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,54:0.58:93
chr22	43218463	rs5758957	C	T	2132.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.672;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=51;PP=1595;ReadPosRankSum=0.559;SC=TTGAAAGCTTCTGTGACTACA;SOR=0.764;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=30;TCR=73;TR=72;WE=43218471;WS=43218453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,77:0.69:111
chr22	43219836	rs5751378	C	G	136.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=106;SC=ACTTTAGTTTCTCATCCAGAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=43219844;WS=43219826;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr22	43223095	rs10654612	C	CAT	823.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=18;PP=916;ReadPosRankSum=-0.584;SC=CTCAGTGCTACATCTTATCCA;SOR=0.527;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=20;WE=43223103;WS=43223085;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,21:0.75:28
chr22	43230140	rs2273142	C	G	627.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=3.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=0;PP=488;ReadPosRankSum=-0.071;SC=TATGTTTCAGCACTTCTTGTT;SOR=1.765;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=20;WE=43230148;WS=43230130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,21:0.70:30
chr22	43253986	rs3046483	C	CTT	334.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.43;BaseQRankSum=-1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5565;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=3;PP=250;ReadPosRankSum=-0.542;SC=GCGCCCGACTCTTTTTAATTC;SOR=1.609;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=8;TCF=4;TCR=4;TR=4;WE=43253994;WS=43253976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,10:0.83:12
chr22	43267336	rs3842298	T	TC	1012.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.121;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.880;HP=6;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=1.072;NF=35;NR=3;PP=1034;ReadPosRankSum=-0.256;SC=GCCGCCTCCGTCCCCCCGCTG;SOR=0.385;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=69;TCF=62;TCR=7;TR=38;WE=43267344;WS=43267326;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,39:0.65:60
chr22	43272085	rs5751396	G	C	733.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=4.036;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=1;PP=603;ReadPosRankSum=0.282;SC=AAAAAAGACCGCCCACAGCCT;SOR=0.874;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=26;WE=43272093;WS=43272075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,26:0.72:36
chr22	43272792	rs5751397	C	T	2045.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.578;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.719;HP=1;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=2;PP=1580;ReadPosRankSum=-0.326;SC=CTGCAGAGCTCCGTGCATTGC;SOR=2.861;SbPval=0.95;Source=Platypus;TC=104;TCF=96;TCR=8;TR=66;WE=43272800;WS=43272782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,71:0.64:111
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chr22	43275250	rs2073199	G	A	1471.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.058;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.678;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=46;PP=1174;ReadPosRankSum=0.396;SC=CTCAGTTCCTGCCCAGCGAGC;SOR=1.298;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=88;TCF=17;TCR=71;TR=55;WE=43275258;WS=43275240;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,57:0.64:89
chr22	43278162	rs4822217	T	C	932.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-3.457;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.821;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=17;PP=614;ReadPosRankSum=-2.706;SC=TCCAGGCTGATGAGCTCATGG;SOR=0.481;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=75;TCF=41;TCR=34;TR=36;WE=43278170;WS=43278152;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,41:0.51:81
chr22	43278220	rs2899365	C	T	1694.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.367;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.827;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=26;PP=1436;ReadPosRankSum=2.765;SC=TGGCCATGCCCGGCCCGTGAT;SOR=0.539;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=89;TCF=52;TCR=37;TR=60;WE=43278228;WS=43278210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,62:0.66:94
chr22	43280650	rs2273143	T	C	582.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.038;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=19;PP=440;ReadPosRankSum=1.418;SC=TCTCAGGCCTTCCCAGATTCC;SOR=1.179;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=34;TCF=2;TCR=32;TR=20;WE=43280658;WS=43280640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr22	43286876	rs5759012	A	G	998.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.012;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.874;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=7;PP=738;ReadPosRankSum=-1.046;SC=AGGAAGTCCTAGGTGCAGGAG;SOR=1.571;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=51;TCF=38;TCR=13;TR=33;WE=43286884;WS=43286866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,35:0.66:53
chr22	43289473	rs5759013	G	A	1378.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.610;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.241;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=1;PP=1134;ReadPosRankSum=-0.141;SC=CTTTCTCCACGAGCTGCCTCC;SOR=2.093;SbPval=0.77;Source=Platypus;TC=65;TCF=63;TCR=2;TR=48;WE=43289481;WS=43289463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,48:0.73:66
chr22	43435668	rs2072883	G	A	618.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=4.028;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=504;ReadPosRankSum=0.790;SC=AAGTGCCTTCGTTTATTTACA;SOR=0.540;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=34;TCF=33;TCR=1;TR=22;WE=43435676;WS=43435662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,22:0.65:34
chr22	43442599	rs5759111	T	C	873.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-5.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.363;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=29;PP=615;ReadPosRankSum=1.148;SC=GAAAGACCCATGTTCCTCACC;SOR=0.388;SbPval=0.38;Source=Platypus;TC=55;TCF=9;TCR=46;TR=36;WE=43442607;WS=43442589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,38:0.63:60
chr22	43455531	rs1132079	C	T	1211.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.436;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.254;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=25;PP=840;ReadPosRankSum=-0.218;SC=GGTTGTAGTCCTCCTGGTGAC;SOR=0.451;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=62;TCF=26;TCR=36;TR=44;WE=43455539;WS=43455521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,47:0.71:66
chr22	43455665	rs5759126	A	G	388.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=12;PP=287;ReadPosRankSum=0.726;SC=GCAAACATCCAGACCCCTGCC;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=13;WE=43455673;WS=43455655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,14:0.78:18
chr22	43459846	rs1052160	G	A	2270.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-5.064;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.953;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=15;PP=1899;ReadPosRankSum=-1.770;SC=CGACGTTGGTGAGATGAACGA;SOR=0.592;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=111;TCF=90;TCR=21;TR=80;WE=43459854;WS=43459836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,83:0.71:117
chr22	43520258	rs4988417	A	C	235.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.880;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.87;ReadPosRankSum=-0.981;SOR=1.270;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:10,7:0.41:17
chr22	43520263	rs2076079	A	G	238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.068;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=14.92;ReadPosRankSum=-1.105;SOR=1.426;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:9,7:0.44:16
chr22	43523921	rs4988434	A	ACT	349.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.690;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=278;ReadPosRankSum=-0.106;SC=GTGCCTTGACACTGGGGCTAT;SOR=3.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=7;WE=43523929;WS=43523911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,10:0.48:21
chr22	43524487	rs4988438	CCT	C	1018.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.074;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.119;NF=19;NR=5;PP=1017;ReadPosRankSum=0.482;SC=GTCCCCCCATCCTCTTTGTCT;SOR=0.877;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=57;TCF=45;TCR=12;TR=24;WE=43524496;WS=43524477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,28:0.46:61
chr22	43529029	rs7402	C	T	459.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-2.976;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=16.736;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=6;PP=358;ReadPosRankSum=-1.542;SC=AGGGGGTCATCGCATTTGAGC;SOR=0.036;SbPval=0.11;Source=Platypus;TC=55;TCF=47;TCR=8;TR=22;WE=43529037;WS=43529019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,21:0.36:58
chr22	43529314	rs13815	G	C	1718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=262;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.484;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=36;PP=1242;ReadPosRankSum=1.099;SC=GTATCTATGCGCGTGGACGTT;SOR=0.467;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=250;TCF=113;TCR=137;TR=73;WE=43529322;WS=43529304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:177,79:0.31:256
chr22	43529517	rs2066910	C	T	370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=2.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.301;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=310;ReadPosRankSum=0.021;SC=AGGTTTCAGCCGAGCAATGTC;SOR=0.263;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=31;TCF=3;TCR=28;TR=15;WE=43529525;WS=43529507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,15:0.47:32
chr22	43555194	rs3937387	C	G	845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-3.473;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.726;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=7;PP=594;ReadPosRankSum=-1.948;SC=ATGCCCTCACCCAGCCCTGTC;SOR=1.321;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=64;TCF=47;TCR=17;TR=35;WE=43555202;WS=43555184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,37:0.54:68
chr22	43558926	rs6971	A	G	1632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=21;PP=1249;SC=GCTGGCCTTCACGACCACACT;SOR=1.342;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=35;TCR=21;TR=56;WE=43558934;WS=43558916;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr22	43558972	rs6972	G	A	1061.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=2.366;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.043;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=25;PP=883;ReadPosRankSum=0.250;SC=CATGGCTGGCGTGGGGGACGG;SOR=0.764;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=72;TCF=35;TCR=37;TR=45;WE=43558980;WS=43558962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,46:0.64:72
chr22	43559137	rs6973	G	T	351.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-2.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=3;NR=10;PP=293;ReadPosRankSum=0.974;SC=CTTCAGAGGTGGCCCCACCTG;SOR=0.818;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=13;WE=43559145;WS=43559127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,14:0.61:23
chr22	43564963	rs138931	C	G	786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=22;PP=654;SC=TCAGAACAGCCTCTCAAGAGG;SOR=5.058;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=23;TCF=1;TCR=22;TR=23;WE=43564971;WS=43564953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr22	43564978	rs9623764	C	T	379.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=-1.847;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.368;HP=2;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=275;ReadPosRankSum=-0.954;SC=AAGAGGGGGTCTGCTGCCCCT;SOR=3.056;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=12;WE=43564986;WS=43564968;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,14:0.56:25
chr22	43565443	rs138932	C	T	838.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=5.101;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=33;NR=1;PP=691;ReadPosRankSum=1.321;SC=GGAGCAGCTCCTGCAGGCCCC;SOR=0.372;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=111;TCF=108;TCR=3;TR=34;WE=43565451;WS=43565433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:77,34:0.31:111
chr22	43565855	rs138933	C	T	731.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=3.021;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.834;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=23;PP=502;ReadPosRankSum=1.521;SC=GACTTTGCCACGCAGCTGTGA;SOR=0.565;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=100;TCF=27;TCR=73;TR=31;WE=43565863;WS=43565845;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,35:0.32:111
chr22	43568512	rs34074034	C	T	4528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.449;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=281;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.774;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=98;NR=72;PP=2962;ReadPosRankSum=-1.878;SC=ACCTTTCCCACGTCTTCTCGA;SOR=0.544;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=262;TCF=154;TCR=108;TR=170;WE=43568520;WS=43568502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:98,180:0.65:278
chr22	43569608	rs138938	C	A	626.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.163;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.448;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=8;PP=420;ReadPosRankSum=-0.173;SC=TGTAAGCCACCCTGCCCAGCC;SOR=0.384;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=57;TCF=41;TCR=16;TR=26;WE=43569616;WS=43569598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,27:0.46:59
chr22	43570068	rs762953	G	A	442.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=3.866;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=2;PP=356;ReadPosRankSum=-0.216;SC=CCTGCGGTCCGTGAAGACGGC;SOR=0.330;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=22;TCF=20;TCR=2;TR=15;WE=43570076;WS=43570058;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,16:0.70:23
chr22	43570463	rs2269525	A	G	1786.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=3.005;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.818;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=27;PP=1406;ReadPosRankSum=0.855;SC=AGTGCCTAGAAGCCCTGACTG;SOR=0.434;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=88;TCF=50;TCR=38;TR=58;WE=43570471;WS=43570453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,61:0.64:95
chr22	43570659	rs2269526	A	C	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.545;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.839;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=26;PP=672;ReadPosRankSum=-1.233;SC=CCCGGCTCCCAAGTGTCCAAG;SOR=0.368;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=44;TCF=7;TCR=37;TR=32;WE=43570667;WS=43570649;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,33:0.73:45
chr22	43572308	.	T	TGG	542.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-1.046;ClippingRankSum=0.000;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.599;HP=10;HapScore=3;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=4;PP=397;ReadPosRankSum=2.009;SC=GCCCAAGCAGTGGGGGGGGGC;SOR=1.981;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=68;TCF=59;TCR=9;TR=24;WE=43572316;WS=43572298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,16:0.46:35
chr22	43572354	rs11704935	C	T	859.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.426;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-1.504;NF=28;NR=9;PP=574;ReadPosRankSum=1.430;SC=GGGTGCACCACGGGGTTGATG;SOR=0.742;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=107;TCF=80;TCR=27;TR=37;WE=43572362;WS=43572344;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:70,39:0.36:109
chr22	43575616	rs4822261	G	A	631.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.824;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.157;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=1;PP=434;ReadPosRankSum=-0.468;SC=GGGTGGAGGAGGGCTGCACCT;SOR=1.681;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=21;WE=43575624;WS=43575606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,23:0.49:47
chr22	43575774	rs138945	A	C	3323.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=40.05;SOR=0.872;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr22	43575774	.	AG	CA,CG	982	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=27,42;NR=21,34;PP=982,393;QD=21.572247393;SC=CCAAGACATGAGTGCCCATCA;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=76;TCF=42;TCR=34;TR=48,76;WE=43575783;WS=43575764;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:0.63:76
chr22	43575775	.	G	A	1436.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.807;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=17.74;ReadPosRankSum=0.464;SOR=0.701;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,54:0.67:81
chr22	43576670	rs35518399	C	T	363.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=2.855;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=260;ReadPosRankSum=-0.177;SC=GCCCCTCACCCGGCCTGATGG;SOR=0.446;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=13;WE=43576678;WS=43576660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,14:0.42:33
chr22	43576880	rs11090144	C	A	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-3.558;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.585;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=14;PP=237;ReadPosRankSum=0.658;SC=GCAGCCCGGGCACCTGCTGCA;SOR=0.132;SbPval=0.23;Source=Platypus;TC=59;TCF=8;TCR=51;TR=18;WE=43576888;WS=43576870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,18:0.30:61
chr22	43576904	rs2071723	G	A	913.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.422;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.514;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=28;PP=687;ReadPosRankSum=-1.298;SC=GCTGGCGCGCGTGCTCCACAC;SOR=0.193;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=45;TCF=4;TCR=41;TR=32;WE=43576912;WS=43576894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,33:0.73:45
chr22	43579006	rs141712485	G	A	1109.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.724;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=17;PP=851;ReadPosRankSum=1.862;SC=GGGCTGCCTGGAGCCCGCTCT;SOR=0.574;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=119;TCF=77;TCR=42;TR=45;WE=43579014;WS=43578996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,46:0.37:125
chr22	43579049	rs13058467	T	C	1506.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.416;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.589;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=29;PP=1285;ReadPosRankSum=-0.861;SC=GCACAGCTCGTTCCCCGGGTT;SOR=0.631;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=157;TCF=83;TCR=74;TR=61;WE=43579057;WS=43579039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:104,62:0.37:166
chr22	43599917	rs138983	T	C	107.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.425;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.817;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=65;ReadPosRankSum=-0.725;SC=CCCAAGGTGGTGTGGAGGCCC;SOR=1.954;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=6;WE=43599925;WS=43599907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,7:0.32:22
chr22	43599991	rs13056939	C	T	355.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=0.279;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.448;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=4;PP=203;ReadPosRankSum=0.824;SC=CAGGCAGGGCCGCTCCCCCCG;SOR=0.240;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=65;TCF=55;TCR=10;TR=18;WE=43599999;WS=43599981;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,19:0.28:67
chr22	43600281	rs11703432	T	G	271.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.316;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=150;ReadPosRankSum=-0.689;SC=ACAGACCTTCTTTTGGTTTTA;SOR=0.307;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=31;TCF=2;TCR=29;TR=9;WE=43600289;WS=43600271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr22	43606143	rs5759217	C	T	3214.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.310;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=195;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.214;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=61;NR=62;PP=2453;ReadPosRankSum=-0.447;SC=TTGGGGGAGGCGCGATGTGCC;SOR=0.654;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=185;TCF=96;TCR=89;TR=123;WE=43606151;WS=43606133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,129:0.68:190
chr22	43610106	rs34893532	C	T	410.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.547;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.842;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=5;PP=362;ReadPosRankSum=-0.753;SC=CTCCACATTCCGACACGTTGC;SOR=0.242;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=79;TCF=65;TCR=14;TR=21;WE=43610114;WS=43610096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:59,20:0.25:79
chr22	43610207	rs138993	A	G	3849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=48;NR=70;PP=2965;SC=GGCATACATGACACACACTGG;SOR=1.082;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=119;TCF=48;TCR=71;TR=118;WE=43610215;WS=43610197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr22	43614223	rs9623782	C	G	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=4.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.218;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=2;PP=291;ReadPosRankSum=0.806;SC=CAAGGAAGGACAGAGTCAGCA;SOR=0.223;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=26;TCF=23;TCR=3;TR=14;WE=43614231;WS=43614217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,15:0.54:28
chr22	43614316	rs9620123	C	G	1805.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.194;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.848;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=18;PP=1417;ReadPosRankSum=0.212;SC=GCCCCTCCAGCGCCTTGGCTG;SOR=1.306;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=91;TCF=64;TCR=27;TR=66;WE=43614324;WS=43614306;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,68:0.72:95
chr22	43614588	rs5759218	A	G	429.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=1;HapScore=3;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=826;ReadPosRankSum=-0.583;SC=ACATTCTCACAACAGTCCTGG;SOR=2.613;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=1;TCR=24;TR=16;WE=43614609;WS=43614578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,15:0.62:24
chr22	43614601	rs5759219	C	T	381.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.229;HP=4;HapScore=3;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=835;ReadPosRankSum=-1.984;SC=AGTCCTGGGGCAAGGGGCCAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=14;WE=43614609;WS=43614578;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,14:0.70:20
chr22	43618632	rs139005	CG	C	1326.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=6;PP=1177;SC=ATGGACAGGCCGGGGGGGTTA;SOR=3.467;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=50;TCF=44;TCR=6;TR=43;WE=43618640;WS=43618622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr22	43619062	rs2071726	C	G	303.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.096;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=2;PP=203;ReadPosRankSum=-0.163;SC=GAGGAAGACCCCCCTGCCACA;SOR=0.485;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=45;TCF=40;TCR=5;TR=17;WE=43619070;WS=43619052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,17:0.37:46
chr22	43619200	rs6003114	G	A	2002.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.845;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.528;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=38;PP=1598;ReadPosRankSum=1.283;SC=AGGTCTTGGCGCGAGAAAGAC;SOR=0.515;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=116;TCF=60;TCR=56;TR=75;WE=43619208;WS=43619190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,77:0.64:120
chr22	43619404	rs6003115	C	G	337.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.401;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.884;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=243;ReadPosRankSum=0.669;SC=ATGCTGGGCCCAGACAGCTGG;SOR=1.911;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=16;TCF=2;TCR=14;TR=11;WE=43619412;WS=43619394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,12:0.71:17
chr22	43623353	rs129414	G	A	1545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=5;PP=1196;SC=GCAGGGGAGGGGCCAGCAGCA;SOR=3.912;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=36;TCR=5;TR=41;WE=43623361;WS=43623343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chr22	43623395	rs129415	C	G	2204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=19;PP=1657;SC=CAATCCTTCCCGTTCCAGTGG;SOR=2.185;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=54;TCR=19;TR=72;WE=43623403;WS=43623385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chr22	43625225	rs34045808	G	T	1976.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-5.153;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.632;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=48;PP=1477;ReadPosRankSum=-0.906;SC=AAAGTTGGGGGAGGAGTTTGA;SOR=1.305;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=116;TCF=49;TCR=67;TR=75;WE=43625233;WS=43625215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:41,78:0.66:119
chr22	43739290	rs7286357	C	T	90.90	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=1.282;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5129;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=2;PP=37;ReadPosRankSum=0.524;SC=CCCCGCTGGGCGTGCGGGCGT;SOR=0.223;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=3;WE=43739298;WS=43739280;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr22	43739395	rs7286392	A	G	172.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=4;PP=107;SC=CCGCCCAGCCAGCCCGGCTGA;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=43739403;WS=43739385;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	43813892	rs7288538	G	A	272.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.775;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=187;ReadPosRankSum=1.644;SC=ACGGAGCCAAGGTGCGTCTAG;SOR=1.473;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=9;WE=43813900;WS=43813882;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
chr22	43830845	rs9623837	G	C	971.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.585;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.921;HP=1;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=0;PP=1370;ReadPosRankSum=1.332;SC=TGGTGGATCTGAGCGGGATTG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=40;TCF=39;TCR=1;TR=29;WE=43830856;WS=43830835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,32:0.74:43
chr22	43830848	rs6519374	C	T	157.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-4.277;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.721;HP=4;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=446;ReadPosRankSum=0.150;SC=TGGATCTGAGCGGGATTGATG;SOR=0.017;SbPval=0.2;Source=Platypus;TC=44;TCF=43;TCR=1;TR=10;WE=43830856;WS=43830835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,10:0.21:47
chr22	43830900	rs62234091	C	T	3009.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=1.669;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.71;ReadPosRankSum=-1.531;SOR=0.359;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:23,75:0.77:98
chr22	43830910	rs62234092	C	T	3143.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.968;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FS=5.542;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.84;ReadPosRankSum=0.200;SOR=0.202;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:30,79:0.72:109
chr22	43830996	rs2413761	C	T	1824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-5.480;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=235;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.527;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=35;PP=1175;ReadPosRankSum=-1.144;SC=CTCCAGGCTACACCCGCTTCG;SOR=1.099;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=227;TCF=123;TCR=104;TR=85;WE=43831004;WS=43830986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:147,87:0.37:234
chr22	43831056	rs4331615	C	T	1538.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=5.451;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.602;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=40;PP=1104;ReadPosRankSum=-0.615;SC=AGATGCCGTACGGCGACGTGC;SOR=0.499;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=211;TCF=81;TCR=130;TR=68;WE=43831064;WS=43831046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:146,70:0.32:216
chr22	43898774	.	A	G	1117.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.110;ClippingRankSum=0.000;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.913;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=38;PP=934;ReadPosRankSum=0.318;SC=GCTAACTGCCATACACACCCT;SOR=1.877;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=57;TCF=2;TCR=55;TR=39;WE=43898782;WS=43898764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,40:0.70:57
chr22	43976396	rs9614382	G	A	2898.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=74;NR=7;PP=2325;SC=CTTCCTCACAGCCTCCTGTGG;SOR=4.357;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=74;TCR=7;TR=81;WE=43976404;WS=43976386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chr22	43976675	rs4823114	G	A	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=566;SC=TTCGCTGTACGTGCAGACATG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=21;WE=43976683;WS=43976665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr22	44004498	rs192370477	G	A	1759.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=5.126;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.551;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=44;PP=1403;ReadPosRankSum=-1.290;SC=ATCAGAATACGGTATTTAGGA;SOR=0.635;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=203;TCF=75;TCR=128;TR=69;WE=44004506;WS=44004488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:138,72:0.34:210
chr22	44079557	rs9614259	G	A	196.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-2.998;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=146;ReadPosRankSum=-0.705;SC=GTTGTTATTGGTCTTGTTCTG;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=8;WE=44079565;WS=44079547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr22	44083442	rs5764214	T	C	451.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.630;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=356;ReadPosRankSum=-0.982;SC=TTGATTTTAGTGGTGGCTTTA;SOR=0.904;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=31;TCF=8;TCR=23;TR=20;WE=44083450;WS=44083432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,20:0.59:34
chr22	44112845	rs5764234	C	T	1268.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=27;PP=902;SC=GATTCTCCAACGAGACCTCTG;SOR=1.845;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=11;TCR=27;TR=38;WE=44112853;WS=44112835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr22	44223635	.	CCA	C	108	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;FR=0.5000;HP=1;HapScore=3;MGOF=7;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=1;NR=3;PP=108;QD=27.75;SC=CGCTGCTTCACCACACACACA;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=4;WE=44223644;WS=44223625;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr22	44229492	rs138069	G	C	389.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.060;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.099;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=7;PP=199;ReadPosRankSum=-0.167;SC=CAGGGCACCCGGAGGACAGCT;SOR=0.307;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=46;TCF=29;TCR=17;TR=17;WE=44229500;WS=44229482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,20:0.39:51
chr22	44236005	rs4149443	G	A	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=2.716;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=15.911;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=160;ReadPosRankSum=-1.412;SC=AGGAAGGGGTGGGGTTCAGGG;SOR=4.400;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=5;TCR=11;TR=8;WE=44236013;WS=44235995;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr22	44258311	.	ACGCGCC	A	206.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=0.693;ClippingRankSum=-0.000;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=4;PP=190;ReadPosRankSum=-0.366;SC=CGCAGCCCGCACGCGCCCGCG;SOR=1.402;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=4;WE=44258324;WS=44258301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr22	44280412	rs5764011	G	T	154.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.663;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.585;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=8;PP=109;ReadPosRankSum=0.807;SC=GTGAGACAAGGGGTGTATGCC;SOR=0.018;SbPval=0.21;Source=Platypus;TC=39;TCF=1;TCR=38;TR=9;WE=44280420;WS=44280402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,9:0.22:41
chr22	44282276	rs739231	A	G	588.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.956;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.33;ReadPosRankSum=-0.045;SOR=0.735;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:138,39:0.22:177
chr22	44282307	rs739232	G	A	450.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.385;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FS=6.667;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.47;ReadPosRankSum=1.492;SOR=1.545;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,27:0.21:130
chr22	44283556	rs5764380	A	G	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.624;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.323;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=10;PP=448;ReadPosRankSum=-1.747;SC=GGCAAGGGTGAGATGGGCAAG;SOR=1.179;SbPval=0.79;Source=Platypus;TC=90;TCF=49;TCR=41;TR=26;WE=44283564;WS=44283546;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:67,27:0.29:94
chr22	44283676	.	G	GAC	724.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.747;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=2.519;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.08;ReadPosRankSum=-0.132;SOR=1.150;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,21:0.35:60
chr22	44283677	.	CAGGAG	C	718.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.342;ClippingRankSum=0.000;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=1.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.41;ReadPosRankSum=-0.205;SOR=1.011;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,21:0.33:63
chr22	44283687	rs143992164	GGCA	G	675.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.527;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.710;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=9;PP=905;ReadPosRankSum=1.010;SC=CAGGAGCCTGGGCAGGACCTT;SOR=1.550;SbPval=0.83;Source=Platypus;TC=48;TCF=13;TCR=35;TR=11;WE=44283697;WS=44283666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:38,18:0.32:56
chr22	44285667	rs713864	G	A	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-2.849;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.741;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=0;PP=149;ReadPosRankSum=0.422;SC=CGGGGTTCCAGAGTGCACTCA;SOR=1.942;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=25;TCR=3;TR=9;WE=44285675;WS=44285657;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,10:0.33:30
chr22	44285765	rs2017461	A	G	526.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.329;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.977;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=9;PP=379;ReadPosRankSum=-0.890;SC=AAGAGTCAGCAGGAACACAAC;SOR=0.467;SbPval=0.44;Source=Platypus;TC=93;TCF=65;TCR=28;TR=27;WE=44285773;WS=44285755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:66,28:0.30:94
chr22	44287062	rs2071884	A	G	343.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.292;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.608;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=13;PP=253;ReadPosRankSum=0.602;SC=GGGGCAGAGCATCCTGCAGCT;SOR=1.881;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=47;TCF=17;TCR=30;TR=17;WE=44287070;WS=44287052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:33,17:0.34:50
chr22	44323074	rs139047	G	A	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.303;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=16;PP=299;ReadPosRankSum=-1.052;SC=TCTGGACGTTGTCAAGTTAGA;SOR=0.482;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=56;TCF=6;TCR=50;TR=18;WE=44323082;WS=44323064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:39,18:0.32:57
chr22	44324676	rs139051	A	G	3213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=37;PP=2613;SC=GCTCTCGCCTATAACTTCTCT;SOR=1.329;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=96;TCF=59;TCR=37;TR=96;WE=44324684;WS=44324666;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr22	44341986	rs2294917	T	C	1370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.104;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=10;PP=1001;ReadPosRankSum=0.344;SC=GACTGCACACTGCAGCAGCGG;SOR=0.109;SbPval=0.37;Source=Platypus;TC=71;TCF=58;TCR=13;TR=47;WE=44341994;WS=44341976;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,50:0.69:72
chr22	44342116	rs2294918	A	G	2681.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.143;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.596;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=49;PP=2010;ReadPosRankSum=-0.412;SC=CTGCTCCCCCAAGGGCTGTCC;SOR=0.772;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=154;TCF=77;TCR=77;TR=100;WE=44342124;WS=44342106;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,104:0.63:164
chr22	44351351	rs2294920	T	C	528.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.964;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=3;PP=371;ReadPosRankSum=0.456;SC=TTTGTGGGAGTTGCCTTGACC;SOR=0.976;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=31;TCF=27;TCR=4;TR=18;WE=44351359;WS=44351341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,20:0.56:36
chr22	44364536	rs147871309	C	T	1799.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-0.215;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.035;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=9;PP=1428;ReadPosRankSum=-0.827;SC=CTACCAGCCTCGCCGTGTGGC;SOR=1.337;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=87;TCF=71;TCR=16;TR=57;WE=44364544;WS=44364526;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,62:0.68:91
chr22	44364594	rs5764434	C	T	3165.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-1.765;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.119;HP=7;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=65;NR=45;PP=2273;ReadPosRankSum=1.098;SC=CCTTGTTTTTCTTCCCCCATT;SOR=0.468;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=157;TCF=96;TCR=61;TR=110;WE=44364602;WS=44364584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,119:0.71:167
chr22	44364794	rs2273031	T	C	474.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-4.361;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=350;ReadPosRankSum=-0.119;SC=AGCAGAGCACTGCTCCCTGCT;SOR=1.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=21;WE=44364802;WS=44364784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,21:0.64:33
chr22	44368039	rs6006595	T	C	1734.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.888;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.845;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=22;PP=1343;ReadPosRankSum=-0.770;SC=CAGATTGCTTTTTGTCTTTTT;SOR=0.585;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=89;TCF=58;TCR=31;TR=59;WE=44368047;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,62:0.67:93
chr22	44368204	rs3177036	A	G	1260.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=33;PP=1020;ReadPosRankSum=0.285;SC=CCATGGTTGGAAACAATGAAG;SOR=0.665;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=62;TCF=15;TCR=47;TR=44;WE=44368212;WS=44368194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,45:0.71:63
chr22	44368728	rs34361615	A	AT	553.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.323;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FS=3.109;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.70;MQRankSum=-0.698;QD=8.03;ReadPosRankSum=1.180;SOR=1.306;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,32:0.46:69
chr22	44368741	rs932430	C	T	1029.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.245;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=4.568;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.74;MQRankSum=-1.785;QD=13.20;ReadPosRankSum=-0.880;SOR=1.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,38:0.49:78
chr22	44372069	rs2073084	G	A	3320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.087;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.833;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.769;NF=49;NR=74;PP=2718;ReadPosRankSum=-0.563;SC=TTTCGGTAACGGTTTCTCTTA;SOR=1.059;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=196;TCF=89;TCR=107;TR=123;WE=44372077;WS=44372059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,125:0.62:201
chr22	44372190	rs2073085	C	T	777.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=5.617;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.424;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=30;PP=639;ReadPosRankSum=1.913;SC=TCCACAGTGGCGGCCCCCACT;SOR=1.967;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=55;TCF=1;TCR=54;TR=30;WE=44372198;WS=44372180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,30:0.55:55
chr22	44372632	rs14315	C	T	1698.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.949;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.768;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=34;PP=1208;ReadPosRankSum=-0.083;SC=TCTTTCAGCACGCCATGGTCA;SOR=0.455;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=95;TCF=40;TCR=55;TR=62;WE=44372640;WS=44372622;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:34,66:0.66:100
chr22	44377442	rs4823182	A	G	1522.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.333;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=51;PP=2613;ReadPosRankSum=-1.354;SC=TTAGGAGAGCATAGTATTTCA;SOR=1.525;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=78;TCF=0;TCR=78;TR=51;WE=44377451;WS=44377432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,54:0.66:82
chr22	44377443	rs368680259	T	C	718.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=7.162;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=27;PP=1387;ReadPosRankSum=1.444;SC=TAGGAGAGCATAGTATTTCAA;SOR=0.253;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=77;TCF=0;TCR=77;TR=27;WE=44377451;WS=44377432;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:53,28:0.35:81
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chr22	44384881	rs16991288	G	C	912.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-1.172;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.879;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=6;PP=738;ReadPosRankSum=0.304;SC=CTCCAGCACTGTGTGGCGTTG;SOR=0.311;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=50;TCF=43;TCR=7;TR=34;WE=44384889;WS=44384871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:16,33:0.67:49
chr22	44395389	rs2281292	A	C	2184.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.772;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=32;PP=1726;ReadPosRankSum=0.672;SC=TCCGACAAACAAAAAATGTTC;SOR=0.682;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=120;TCF=68;TCR=52;TR=75;WE=44395397;WS=44395379;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,78:0.64:122
chr22	44395451	rs1007863	T	C	2041.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.952;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.315;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=38;PP=1490;ReadPosRankSum=0.406;SC=TTCCTGCAGCTGGGGCCTGTG;SOR=0.499;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=125;TCF=65;TCR=60;TR=78;WE=44395459;WS=44395441;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:48,81:0.63:129
chr22	44420156	rs112388263	T	A	172.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=138;SC=GCCCTCGGCCTCTCCCCGGGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=44420164;WS=44420146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	44489868	rs1983609	T	C	1345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-4.075;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.138;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=49;PP=1063;ReadPosRankSum=1.134;SC=CCCGCCCTGGTGGATGTTCAC;SOR=1.017;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=86;TCF=15;TCR=71;TR=58;WE=44489876;WS=44489858;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,57:0.67:85
chr22	44514809	rs5764541	C	T	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=303;SC=GCTGTGGTCCCGGTGGTGGCT;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=44514817;WS=44514799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr22	44515711	rs742550	G	A	228.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.285;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.783;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=4;PP=110;ReadPosRankSum=-0.452;SC=CGGAGATGCCGCAGGTTCTGA;SOR=0.212;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=9;WE=44515719;WS=44515701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,11:0.42:26
chr22	44515806	rs761166	G	C	208.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=7;PP=164;SC=GGCAAAGAACGGAAGAGCAGA;SOR=2.833;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=44515814;WS=44515796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr22	44527227	rs2281269	T	G	412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=1;PP=358;SC=TCACCATATTTGCCAGGCTGG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=13;TCR=1;TR=14;WE=44527235;WS=44527217;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr22	44535904	rs11270419	G	GCTTTCTGGCTGGCTCTGTCCCTCATCCTCCA	873.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=67.21;SOR=5.283;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr22	44559645	rs139079	C	T	546.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-1.139;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.999;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=1;PP=435;ReadPosRankSum=-0.965;SC=TGCAGAGGCTCGGTCCTGTCC;SOR=2.494;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=20;WE=44559653;WS=44559635;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,20:0.67:30
chr22	44559842	rs139081	A	G	2236.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.965;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.473;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=42;PP=1758;ReadPosRankSum=-0.824;SC=CCCCCGGGAGAGGTGCGCACG;SOR=0.521;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=129;TCF=63;TCR=66;TR=85;WE=44559850;WS=44559832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:45,85:0.65:130
chr22	44564297	rs139095	A	C	367.56	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.737;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=1;PP=274;ReadPosRankSum=-1.133;SC=AGCTCTCACAAAACCTGTGTG;SOR=2.448;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=12;WE=44564305;WS=44564287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chr22	44564407	rs139096	C	T	1152.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.913;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.737;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=11;PP=874;ReadPosRankSum=0.623;SC=ATGCTGGAGACGTGGCTTCTG;SOR=0.264;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=51;TCF=39;TCR=12;TR=42;WE=44564415;WS=44564397;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,43:0.81:53
chr22	44569142	rs139103	A	G	293.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-2.816;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=10;PP=238;ReadPosRankSum=0.606;SC=AGCGGCCAGGAGCACAGGCTG;SOR=0.481;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=11;WE=44569150;WS=44569132;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,11:0.65:17
chr22	44582499	rs79478	T	C	7858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=275;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=102;NR=160;PP=2965;SC=GGACACCATCTGTGGTCTTGC;SOR=1.292;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=262;TCF=102;TCR=160;TR=262;WE=44582507;WS=44582489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,271:1.00:271
chr22	44586522	rs2272942	C	T	882.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.396;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.703;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=30;PP=695;ReadPosRankSum=0.396;SC=CAACCAACGTCCAGGTGGAGG;SOR=0.874;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=120;TCF=31;TCR=89;TR=40;WE=44586530;WS=44586512;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:86,40:0.32:126
chr22	44589857	rs139142	T	G	1028.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-4.725;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=34;PP=765;ReadPosRankSum=-0.783;SC=TTGTCCCTCTTTCTGTCTGTC;SOR=0.379;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=63;TCF=1;TCR=62;TR=35;WE=44589865;WS=44589847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,38:0.58:65
chr22	44594476	rs139151	T	C	6532.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=172;NR=34;PP=2965;SC=TTCCATGTGATTGTCTCCAGT;SOR=3.303;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=206;TCF=172;TCR=34;TR=206;WE=44594484;WS=44594466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,206:1.00:206
chr22	44594584	rs139152	C	G	2141.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=317;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.470;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=63;PP=1701;ReadPosRankSum=-1.575;SC=ACCTCACTCCCAACTCTCCTG;SOR=0.797;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=311;TCF=125;TCR=186;TR=102;WE=44594592;WS=44594574;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:214,101:0.32:315
chr22	44602001	rs139185	G	T	90.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-3.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=0;PP=50;ReadPosRankSum=0.893;SC=ATTCAGAGGAGGACTGGCCAG;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=24;TCR=2;TR=6;WE=44602009;WS=44601991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,6:0.24:25
chr22	44602229	rs139186	A	C	1082.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.712;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.242;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=31;NR=21;PP=782;ReadPosRankSum=0.022;SC=GAGCACACTGAGGGTGCTCTA;SOR=1.026;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=145;TCF=76;TCR=69;TR=52;WE=44602237;WS=44602219;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:100,53:0.35:153
chr22	44645332	rs9614402	G	A	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.803;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.74;MQRankSum=-0.489;QD=14.47;ReadPosRankSum=-0.414;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,5:0.62:8
chr22	44645575	rs150968279	A	ATACAAGG	121.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.566;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=3;PP=176;ReadPosRankSum=-1.718;SC=TCTGGAGGAAATACAAGGAAA;SOR=0.941;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=3;WE=44645583;WS=44645565;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,4:0.57:7
chr22	44681612	rs135388	A	G	2395.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-3.893;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.703;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=32;NR=56;PP=1843;ReadPosRankSum=1.622;SC=ACTCCCAACAAGGCGGTGTAA;SOR=0.226;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=117;TCF=39;TCR=78;TR=88;WE=44681620;WS=44681602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,88:0.75:117
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chr22	44967767	rs138596	C	G	2215.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=2;PP=1803;SC=AGAGAAATAACGAGGCCCGAA;SOR=6.091;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=64;TCF=62;TCR=2;TR=64;WE=44967775;WS=44967757;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chr22	45075738	rs763213	T	C	1558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=39;PP=1188;SC=CCGGAAAAGATGCCGGCGCAG;SOR=2.024;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=15;TCR=39;TR=54;WE=45075746;WS=45075728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chr22	45126638	rs3761484	G	T	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=3;PP=637;SC=CTATTGGAAGGGGTCTCCGTG;SOR=3.611;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=26;WE=45126646;WS=45126628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr22	45126775	rs3761485	T	C	3676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=71;NR=43;PP=2927;SC=CACCCCTGGCTACTGCCCTTA;SOR=1.342;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=71;TCR=43;TR=114;WE=45126783;WS=45126765;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chr22	45127762	.	A	G	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.296;ClippingRankSum=0.000;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.155;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=22;PP=507;ReadPosRankSum=-0.496;SC=CCCTGGCCTCACTCTACAGAG;SOR=3.287;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=2;TCR=34;TR=22;WE=45127770;WS=45127752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,21:0.60:35
chr22	45128288	rs5764979	G	C	553.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=16;PP=501;SC=ACAGTGGGCAGAGGGTCGGGC;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=45128296;WS=45128278;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr22	45128449	rs5764980	G	T	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr22	45133238	rs3329	A	G	539.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.815;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=18;PP=413;ReadPosRankSum=2.538;SC=CGCCAGCCCTATCGGCCTCGT;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=18;WE=45133246;WS=45133228;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr22	45182207	rs739176	G	A	653.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=2;PP=515;SC=GTGGGTGCACGGCTGAGGTAG;SOR=3.258;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=45182215;WS=45182197;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr22	45198009	rs2239813	A	G	7084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=242;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=106;NR=125;PP=2965;SC=GCCGGATGCCACCCTCCCACG;SOR=0.872;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=231;TCF=106;TCR=125;TR=231;WE=45198017;WS=45197999;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,240:1.00:240
chr22	45204520	rs35386894	AT	A	650.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=16;PP=315;SC=GTTGGCACTCATTTTTTTTTT;SOR=2.066;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=23;TCF=3;TCR=20;TR=19;WE=45204528;WS=45204510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr22	45210666	rs2071758	G	A	2467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.229;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.592;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=61;PP=1882;ReadPosRankSum=-0.911;SC=AGAGGACCTCGCTGGGGTTGG;SOR=3.528;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=75;TCF=12;TCR=63;TR=72;WE=45210674;WS=45210656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,79:0.98:81
chr22	45218223	rs136662	C	T	3061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=24;PP=2451;SC=CCTAATCGTTCTTTATTCTCT;SOR=2.044;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=65;TCR=24;TR=89;WE=45218231;WS=45218213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chr22	45221423	rs3209476	A	T	1532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=2.796;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=171;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.807;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=28;PP=1128;ReadPosRankSum=-1.235;SC=CCAAGACACCACCGCCGCGGC;SOR=0.438;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=160;TCF=100;TCR=60;TR=64;WE=45221431;WS=45221413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:101,67:0.40:168
chr22	45243780	rs9626578	G	A	2114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.766;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.606;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.260;NF=54;NR=24;PP=1640;ReadPosRankSum=0.725;SC=CGTGGGCAGGGGAGTGTCATA;SOR=0.499;SbPval=0.4;Source=Platypus;TC=126;TCF=90;TCR=36;TR=78;WE=45243788;WS=45243770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:51,79:0.61:130
chr22	45244001	rs9626251	C	T	1312.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=5.034;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.830;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=40;PP=1014;ReadPosRankSum=-0.882;SC=GGCCTCAGAGCGGAGGCAGGG;SOR=0.189;SbPval=0.29;Source=Platypus;TC=71;TCF=8;TCR=63;TR=47;WE=45244009;WS=45243991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:23,48:0.68:71
chr22	45255527	rs4490294	A	C	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.511;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=1;PP=1169;ReadPosRankSum=0.135;SC=TGTCCTTCCTACACCCCTGTT;SOR=1.302;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=28;TCF=26;TCR=2;TR=16;WE=45255541;WS=45255517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,18:0.62:29
chr22	45255532	rs3216832	CCT	C	732.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.203;NF=17;NR=1;PP=1170;ReadPosRankSum=0.387;SC=TTCCTACACCCCTGTTCTCCT;SOR=1.214;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=34;TCF=32;TCR=2;TR=18;WE=45255541;WS=45255517;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,20:0.61:33
chr22	45255580	rs7510897	G	C	754.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=-1.874;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.314;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-2.188;NF=25;NR=1;PP=534;ReadPosRankSum=0.659;SC=GGCCCCTCTGGAGCTCAGCAG;SOR=2.368;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=47;TCF=43;TCR=4;TR=26;WE=45255588;WS=45255570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,28:0.58:48
chr22	45255630	rs61756769	T	C	2302.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.024;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.53;MQRankSum=-2.574;QD=24.76;ReadPosRankSum=-0.282;SOR=0.760;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,58:0.62:93
chr22	45255637	rs6007344	G	C	2393.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.62;MQRankSum=-2.552;QD=24.18;ReadPosRankSum=0.098;SOR=0.687;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:37,62:0.63:99
chr22	45255802	rs9614955	T	G	644.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=2.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.320;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.473;NF=0;NR=24;PP=558;ReadPosRankSum=1.203;SC=CTCCTTGCCCTGGGTCTGGGG;SOR=3.872;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=24;WE=45255810;WS=45255792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,23:0.77:30
chr22	45258012	.	C	T	133	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5008;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=5;NR=2;PP=133;QD=23.9673160782;SC=GGTGGCTGCACAGGGTCCCCA;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=7;WE=45258020;WS=45258011;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:3,7:0.70:10
chr22	45258053	rs8139133	C	T	372.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=-0.831;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=0;PP=298;ReadPosRankSum=0.719;SC=GTCCAGTGCTCCTCTCACTAC;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=13;WE=45258061;WS=45258043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,13:0.76:17
chr22	45258333	rs9614957	C	G	2174.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-6.833;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.538;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=27;PP=1647;ReadPosRankSum=-0.079;SC=CCGGAGGCACCTGGGGAGCAC;SOR=0.963;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=125;TCF=81;TCR=44;TR=84;WE=45258341;WS=45258323;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,87:0.69:127
chr22	45258495	rs8777	A	G	2744.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=160;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.453;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=75;PP=2123;ReadPosRankSum=0.296;SC=CACTCTGTATATTTCGAGCTA;SOR=0.856;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=158;TCF=43;TCR=115;TR=102;WE=45258503;WS=45258485;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:58,102:0.64:160
chr22	45279320	rs3747224	A	G	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=14;PP=373;SC=CACAAAAACCAGGCAGTGGTG;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=45279328;WS=45279310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr22	45309653	rs3213527	C	T	664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=565;SC=CCTCAGATGGCACCTGCAGAC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=22;WE=45309661;WS=45309643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr22	45316507	rs4823420	T	A	1201.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=39;PP=1189;SC=TTATGATTTTTAAAAAATCAC;SOR=6.043;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=43;WE=45316515;WS=45316497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr22	45577372	rs372438307	TCAAGTGGAACAGGAAAGAATTCTTGGCCAGTTTATTTA	TTGGAACAGGAAAGAATTCTTGGCCAGTTTATTTA,T	1917.73	.	AC=2,0;AF=1.00,0.00;ALERT;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=5;PP=2569;SC=TTGCCTGCTCTCAAGTGGAAC;SOR=3.467;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=5;WE=45577419;WS=45577362;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:44
chr22	45577377	rs376698610	TGGAACAGGAAAGAATTCTTGGCCAGTTTATTTAA	T	1917.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.58;SOR=3.467;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr22	45577411	.	A	T	167	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=26;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=167;QD=40.3542425094;SC=AGTTTATTTAAAAATCCAGTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=5;WE=45577419;WS=45577362;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:16,5:0.24:21
chr22	45579422	rs6006950	A	G	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=8;PP=514;SC=TTTTTCAGTTAGCACAAAATC;SOR=1.358;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=14;TCR=8;TR=22;WE=45579430;WS=45579412;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr22	45593661	rs55790105	C	T	1508.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-4.124;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=257;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.572;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=16;PP=1259;ReadPosRankSum=-0.849;SC=CCCACATCCGCCAGCATTACC;SOR=1.114;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=263;TCF=193;TCR=70;TR=76;WE=45593669;WS=45593651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:183,74:0.29:257
chr22	45595721	rs5765217	A	G	1635.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.589;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.003;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=35;NR=40;PP=1152;ReadPosRankSum=-0.431;SC=ACTGAAGGGCACGGGGACCCT;SOR=0.617;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=205;TCF=111;TCR=94;TR=75;WE=45595729;WS=45595711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:135,79:0.37:214
chr22	45598833	rs732373	C	T	1086.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=1.591;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.040;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=9;PP=903;ReadPosRankSum=-0.032;SC=GTGAACTTGACGGATGGGAGC;SOR=1.306;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=73;TCF=55;TCR=18;TR=43;WE=45598841;WS=45598823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:31,41:0.57:72
chr22	45603485	rs11705584	G	A	239.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.926;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.706;HP=1;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=2;PP=121;ReadPosRankSum=1.744;SC=GATTACAGGCGTGAGCCACCG;SOR=0.092;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=23;TCF=20;TCR=3;TR=8;WE=45603493;WS=45603475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,8:0.35:23
chr22	45603501	rs11703294	A	G	321.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-2.906;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.260;HP=3;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=116;ReadPosRankSum=0.777;SC=CACCGCGCCCAGCCTGGCTTT;SOR=0.076;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=9;WE=45603509;WS=45603491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,9:0.38:24
chr22	45603545	rs11705041	C	T	555.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-2.446;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=2;PP=473;ReadPosRankSum=-1.053;SC=CTGGGGGCCTCTGGTCCCGGT;SOR=0.899;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=52;TCF=46;TCR=6;TR=23;WE=45603553;WS=45603535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,22:0.41:54
chr22	45603638	rs11703323	A	G	887.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.472;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.839;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=23;PP=668;ReadPosRankSum=0.240;SC=GCACCCCCCAAAGGCAGAGCT;SOR=1.120;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=111;TCF=55;TCR=56;TR=38;WE=45603646;WS=45603628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:76,40:0.34:116
chr22	45622014	rs6007506	C	T	308.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-3.152;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=283;ReadPosRankSum=0.575;SC=AGAGAGCACGCGGCAGCCTCT;SOR=0.765;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=39;TCF=36;TCR=3;TR=17;WE=45622022;WS=45622004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,15:0.41:37
chr22	45680824	rs2255432	A	G	56.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=0;PP=59;SC=GTGCCCTGGCAGGGACAGGTC;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=45680832;WS=45680814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr22	45682975	rs2673087	A	G	369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=312;SC=AAGGATGATCAGGCATTTGAT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=45682983;WS=45682965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr22	45683246	rs2673088	C	T	3718.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=58;PP=2965;SC=CCTACCTGGTCAGGGTGGGTG;SOR=0.762;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=118;TCF=60;TCR=58;TR=118;WE=45683254;WS=45683236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chr22	45683304	rs1057353	G	C	3322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=51;PP=2636;SC=CCTCTGTAACGCACCCCTGTC;SOR=0.752;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=51;TCR=51;TR=102;WE=45683312;WS=45683294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chr22	45685002	rs1135360	A	G	610.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.220;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FS=5.384;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.52;ReadPosRankSum=0.337;SOR=1.248;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:103,32:0.24:135
chr22	45718922	rs34063912	C	CTG	470.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=1.928;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=19;MQRankSum=-0.688;NF=19;NR=0;PP=769;ReadPosRankSum=-1.133;SC=TCAGAGGGGACTGTGTGTGTG;SOR=1.609;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=45;TCR=0;TR=19;WE=45718930;WS=45718912;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,19:0.68:28
chr22	45723854	rs9615108	C	G	4779.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=62;NR=80;PP=2965;SC=GCGCCATGGTCCTGACCACCA;SOR=0.934;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=144;TCF=64;TCR=80;TR=142;WE=45723862;WS=45723844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,155:1.00:155
chr22	45723960	rs9614638	G	A	262.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FS=2.715;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=48.09;MQRankSum=-0.273;QD=5.47;ReadPosRankSum=-2.357;SOR=1.251;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,16:0.33:48
chr22	45726345	rs7285172	A	G	1104.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=0;PP=906;SC=TTTTGAAGGTATAAGTGTAAA;SOR=6.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=31;TCR=0;TR=31;WE=45726353;WS=45726335;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr22	45731182	rs738176	C	T	2661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=7;PP=2052;SC=CCGAGGAGGACGAGCTCTTGG;SOR=4.539;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=70;TCR=7;TR=77;WE=45731190;WS=45731172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chr22	45732328	rs11704481	G	A	3321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=81;PP=2767;SC=GAGCTGCCTCGGGTCTCTCTT;SOR=3.103;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=98;TCF=17;TCR=81;TR=98;WE=45732336;WS=45732318;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chr22	45736153	rs3827393	G	A	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=0;PP=615;SC=GGTTTTCAAAGTCTTCCGTAC;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=45736161;WS=45736143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr22	45736485	rs2064068	C	T	1926.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=53;PP=1527;SC=AGGAGGGTGACGCGGACACAT;SOR=5.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=55;TCF=2;TCR=53;TR=55;WE=45736493;WS=45736475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr22	45741537	rs56343022	T	G	604.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.442;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=5.318;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.30;ReadPosRankSum=2.042;SOR=1.751;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:40,25:0.38:65
chr22	45741543	rs5765260	G	C	2234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=49;PP=834;SC=AGTCTGGTCAGTTTAGGTGAC;SOR=3.334;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=9;TCR=49;TR=58;WE=45741551;WS=45741527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr22	45748284	rs11375006	C	CT	3755.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=33;PP=2966;SC=GGAAGGTCCCCTGGCTTCTGC;SOR=1.519;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=90;TCF=54;TCR=36;TR=86;WE=45748292;WS=45748274;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chr22	45748339	rs5765275	A	G	3499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=57;PP=2568;SC=ACCTGTGCACAGCAAACAGGA;SOR=0.744;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=110;TCF=53;TCR=57;TR=110;WE=45748347;WS=45748329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chr22	45749801	rs9614652	C	A	630.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=56.28;QD=26.28;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr22	45749983	rs5764698	G	T	5903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=80;NR=96;PP=2965;SC=TGCCTACACAGTCTGGCTTCC;SOR=0.904;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=177;TCF=81;TCR=96;TR=176;WE=45749991;WS=45749973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,186:1.00:186
chr22	45754517	rs5764701	G	T	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=0;PP=462;SC=AAAATGATTCGGTAAGATTTA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=45754525;WS=45754507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr22	45754558	rs5765281	A	G	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=3;PP=833;SC=GTGATAAACAACAGAAAGCTT;SOR=4.047;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=45754566;WS=45754548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chr22	45755666	rs1012493	C	T	10993.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=357;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=247;NR=92;PP=2965;SC=ACATATTTTACAGTCATTTGC;SOR=1.991;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=339;TCF=247;TCR=92;TR=339;WE=45755674;WS=45755656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,353:1.00:353
chr22	45757987	rs5764704	C	T	770.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=511;SC=TATGTGCTACCTGACCTTCCA;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=45757995;WS=45757977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr22	45758758	rs719925	T	C	2369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=36;PP=1781;SC=TACCCATTATTAATTACCTTC;SOR=0.772;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=71;TCF=35;TCR=36;TR=71;WE=45758766;WS=45758748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr22	45789642	rs136603	A	C	2636.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=66;PP=2040;SC=TCTTCATTAAATTCAGACATT;SOR=4.202;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=71;TCF=5;TCR=66;TR=71;WE=45789650;WS=45789632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chr22	45810278	rs59404993	A	AC	5354.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.351;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.256;NF=47;NR=82;PP=2936;ReadPosRankSum=1.697;SC=TAGACATGAAACTTTGGTGAG;SOR=0.385;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=50;TCR=85;TR=129;WE=45810286;WS=45810268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,145:0.99:146
chr22	45897997	rs3810631	T	C	2420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=71;NR=0;PP=2073;SC=CCCAGTGGCGTTCCTATGCGT;SOR=8.554;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=71;TCR=0;TR=71;WE=45898005;WS=45897987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr22	45898074	rs3810632	T	C	6044.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=190;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=140;NR=44;PP=2965;SC=ATAAATCTACTTGTGGTTCCA;SOR=2.445;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=184;TCF=140;TCR=44;TR=184;WE=45898082;WS=45898064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,189:1.00:189
chr22	45898117	rs3810633	T	C	8143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=270;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=151;NR=107;PP=2965;SC=CCCCGGTAGCTATGAATTCCT;SOR=1.099;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=259;TCF=151;TCR=108;TR=258;WE=45898138;WS=45898107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chr22	45898130	rs3810634	A	T	7807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=253;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=124;NR=117;PP=2965;SC=GAATTCCTATACAAGAGGCTC;SOR=0.750;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=242;TCF=124;TCR=118;TR=241;WE=45898138;WS=45898107;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,249:1.00:249
chr22	45898252	rs3810635	T	G	2501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=76;PP=2112;SC=ATTTTGGTTGTTTGTTGGCCT;SOR=7.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=77;TCF=1;TCR=76;TR=77;WE=45898260;WS=45898242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chr22	45913562	rs149891502	G	A	824.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.142;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.609;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=24;PP=707;ReadPosRankSum=0.085;SC=CGTTTCTGTGGAAGAGGGGAT;SOR=0.980;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=111;TCF=45;TCR=66;TR=38;WE=45913570;WS=45913552;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:73,39:0.35:112
chr22	45914461	rs7292978	G	A	1005.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=2;PP=805;SC=TGATGCTGTCGTCAAGACAGA;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=29;TCF=27;TCR=2;TR=29;WE=45914469;WS=45914451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr22	45923827	rs136730	A	G	2692.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=45;PP=2093;SC=CAGGTCTTCCAGGCATGCTGT;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=91;TCF=46;TCR=45;TR=91;WE=45923835;WS=45923817;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chr22	45924001	rs136731	T	TG	483.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=13;PP=499;SC=CATGTGATCGTGGGGCTGGCA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=13;WE=45924009;WS=45923991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr22	45929190	rs2071936	C	T	406.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=3.606;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=16;PP=354;ReadPosRankSum=-0.446;SC=TTCTCGTGTTCGCTGGAGTTT;SOR=1.828;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=16;WE=45929198;WS=45929180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,15:0.71:21
chr22	45929577	rs105199	T	C	2579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=18;PP=2130;SC=CACATTCCTTTCTAGGATGTA;SOR=2.272;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=75;TCF=57;TCR=18;TR=75;WE=45929585;WS=45929567;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr22	45929594	rs3216851	TG	T	1821.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.891;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.193;NF=41;NR=16;PP=1981;ReadPosRankSum=0.431;SC=TGTATTAGGATGGGTCGTTCT;SOR=0.742;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=99;TCF=70;TCR=29;TR=57;WE=45929602;WS=45929584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:42,61:0.59:103
chr22	45931262	rs2071938	C	T	1552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=45;PP=1289;SC=CCAGGAGGGGCCAGCGACCTA;SOR=6.316;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=46;TCF=1;TCR=45;TR=46;WE=45931270;WS=45931252;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chr22	45937061	rs136756	G	A	197.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=3.739;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.73;ReadPosRankSum=0.409;SOR=1.473;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,11:0.21:53
chr22	45937149	rs9682	C	T	862.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.458;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.763;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=15;NR=19;PP=518;ReadPosRankSum=-0.469;SC=CGTGCCCTATCGGGCATACAT;SOR=0.772;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=100;TCF=48;TCR=52;TR=34;WE=45937157;WS=45937139;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:65,38:0.37:103
chr22	45954029	rs2097484	G	A	301.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.335;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.314;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=191;ReadPosRankSum=0.850;SC=TGGAGACCACGGGCATTTGAG;SOR=1.802;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=10;WE=45954037;WS=45954019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:20,12:0.38:32
chr22	46088787	.	C	G	1606.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=0.054;ClippingRankSum=0.000;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.052;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=3;PP=1208;ReadPosRankSum=-1.000;SC=TGTCAGATTTCTCAGCTCTCC;SOR=1.493;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=71;TCF=66;TCR=5;TR=50;WE=46088795;WS=46088777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,54:0.71:76
chr22	46345714	rs10448591	C	T	314.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-4.084;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=0;PP=211;ReadPosRankSum=-0.481;SC=TGCAGAACAGCGGCCTAGGCT;SOR=0.582;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=14;WE=46345722;WS=46345704;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:36,15:0.29:51
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chr22	46368130	rs62226057	T	C	806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=15;PP=552;SC=TGGGCCGGCGTGCCTGGCGGG;SOR=0.906;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=27;WE=46368138;WS=46368120;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
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chr22	46685754	rs182313981	C	T	1564.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.057;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=277;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=37;PP=1074;ReadPosRankSum=-0.124;SC=CTGATTCACGCGGCCTTAAAC;SOR=0.677;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=264;TCF=133;TCR=131;TR=76;WE=46685762;WS=46685744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:192,79:0.29:271
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chr22	46722400	rs140054	T	C	4183.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=103;NR=32;PP=2965;SC=GCTGAGCGCATGGCGTGTGTC;SOR=2.122;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=135;TCF=103;TCR=32;TR=135;WE=46722408;WS=46722390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chr22	46724558	rs140053	T	C	6789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=215;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=119;NR=88;PP=2965;SC=AGAGACATTTTCTCATAAGTT;SOR=1.001;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=207;TCF=119;TCR=88;TR=207;WE=46724566;WS=46724548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,213:1.00:213
chr22	46752080	rs8135519	G	C	485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.04;BaseQRankSum=3.063;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=17;PP=464;ReadPosRankSum=0.777;SC=GTGTGCTCGGGTCACACAGCT;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=1;TCR=21;TR=18;WE=46752088;WS=46752070;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,16:0.80:20
chr22	46760086	rs35364389	C	T	3785.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=213;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.063;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=68;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.475;SC=CGGAGCCGGCCCTTCAGCGTC;SOR=0.437;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=207;TCF=109;TCR=98;TR=136;WE=46760094;WS=46760076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,139:0.66:211
chr22	46760481	rs9615351	C	G	1445.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.767;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.309;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=7;PP=1126;ReadPosRankSum=-1.095;SC=GGGGGGTACTCTCCACGGTGA;SOR=1.016;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=69;TCF=58;TCR=11;TR=48;WE=46760489;WS=46760471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:21,50:0.70:71
chr22	46760604	rs149673677	C	T	2493.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=1.410;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=143;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.496;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=54;PP=1869;ReadPosRankSum=0.058;SC=TCGGGCCAGCCGGCCGGAACG;SOR=1.129;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=131;TCF=56;TCR=75;TR=91;WE=46760612;WS=46760594;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,96:0.69:139
chr22	46760648	rs9626857	C	T	1770.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.870;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=53;PP=1528;ReadPosRankSum=-0.139;SC=GGCACGAGAGCGGTGCTCAGC;SOR=1.888;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=87;TCF=18;TCR=69;TR=63;WE=46760656;WS=46760638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,64:0.70:91
chr22	46760703	rs9627423	G	C	1054.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=4.289;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.333;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=32;PP=903;ReadPosRankSum=1.259;SC=AGAGCCATGGGTCTGGTGGCT;SOR=0.126;SbPval=0.32;Source=Platypus;TC=51;TCF=4;TCR=47;TR=36;WE=46760711;WS=46760693;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,36:0.68:53
chr22	46761497	rs12165943	C	G	1590.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.497;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.467;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=18;PP=1210;ReadPosRankSum=-0.346;SC=GGGATCCTTGCAGCTCCTGGG;SOR=1.649;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=86;TCF=53;TCR=33;TR=56;WE=46761505;WS=46761487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,59:0.66:89
chr22	46761730	rs5845745	GA	G	687.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=0.478;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=21;PP=732;ReadPosRankSum=-0.420;SC=GTATGTGGGGGAAAGGTGGTG;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=0;TCR=32;TR=21;WE=46761738;WS=46761720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,23:0.72:32
chr22	46762116	.	G	A	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=24;MQ=53.7;NF=11;NR=0;PP=2962;QD=20;SC=GGCGGGGAGGGAAGGTGCGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=11;WE=46762160;WS=46762106;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,11:0.79:14
chr22	46762126	.	GGCA	G	2963	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=23;MQ=55.96;NF=21;NR=0;PP=2963;QD=20;SC=GAAGGTGCGGGGCAGGGAGGG;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=21;WE=46762160;WS=46762106;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:2,21:0.91:23
chr22	46762146	.	GT	G	2948	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=23;MQ=58.91;NF=33;NR=1;PP=2948;QD=20;SC=GAAGTTGCGGGTGGGAAGAAG;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=34;WE=46762160;WS=46762106;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:3,34:0.92:37
chr22	46762152	.	A	G	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5041;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MMLQ=23;MQ=60.13;NF=43;NR=1;PP=2962;QD=20;SC=GCGGGTGGGAAGAAGGTGCGG;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=52;TCR=1;TR=44;WE=46762160;WS=46762106;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:9,44:0.83:53
chr22	46762214	rs73889254	T	G	1852.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=2.448;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.780;HP=4;HapScore=1;MGOF=25;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.930;NF=53;NR=18;PP=1482;ReadPosRankSum=0.149;SC=GGACACAGGTTGGGGTGGCAG;SOR=0.517;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=116;TCF=89;TCR=27;TR=71;WE=46762222;WS=46762204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:47,71:0.60:118
chr22	46762461	rs34100600	G	GC	561.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.645;NF=1;NR=21;PP=633;ReadPosRankSum=1.761;SC=CCCACGGCAAGCCCCCCACAC;SOR=1.061;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=35;TCF=1;TCR=34;TR=22;WE=46762469;WS=46762451;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,22:0.76:29
chr22	46763094	rs11912939	C	G	247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.661;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.008;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=6;PP=185;ReadPosRankSum=-0.413;SC=CACAGATGCGCATACAGCCTT;SOR=0.075;SbPval=0.28;Source=Platypus;TC=15;TCF=4;TCR=11;TR=10;WE=46763102;WS=46763084;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr22	46763490	rs7285194	A	G	364.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.287;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=11.809;HP=2;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=0;PP=505;ReadPosRankSum=-0.662;SC=CTGAGTCCTCACAGCCACAGG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=10;WE=46763510;WS=46763480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr22	46763502	rs11913988	G	A	533.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.348;HP=1;HapScore=4;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=2;PP=554;ReadPosRankSum=0.038;SC=AGCCACAGGAGGCCCCCACGC;SOR=2.303;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=22;TCF=18;TCR=4;TR=16;WE=46763510;WS=46763480;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,16:0.73:22
chr22	46763671	rs7285515	A	G	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=31;PP=1306;SC=AGCTCAGTGCATCGCGGTTCA;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=24;TCR=31;TR=55;WE=46763679;WS=46763661;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chr22	46765181	rs11273699	G	GTCAGGTCGCCGAC	7082.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=54;PP=2967;SC=GCCGATCAATGTCTTCTCTCT;SOR=1.874;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=133;TCF=26;TCR=107;TR=67;WE=46765189;WS=46765171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
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chr22	46859003	rs3788696	G	C	1119.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=5.056;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=34;PP=972;ReadPosRankSum=-0.687;SC=TTTCTTTTAAGTGGATCTCAC;SOR=0.976;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=47;TCF=1;TCR=46;TR=35;WE=46859011;WS=46858993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,36:0.73:49
chr22	46929359	rs5767248	C	G	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=1;PP=336;SC=GGGCCTAGGCCGGGCGCCCAC;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=15;WE=46929367;WS=46929352;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr22	46929692	rs4823561	A	G	10178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=346;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=199;NR=143;PP=2965;SC=GCCGGGATGCAGCCGATCACG;SOR=1.063;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=342;TCF=199;TCR=143;TR=342;WE=46929700;WS=46929682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,345:1.00:345
chr22	46930107	rs8141744	C	T	3532.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-4.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.692;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=64;NR=64;PP=2730;ReadPosRankSum=-0.045;SC=CCAAGATGGTCACCTGGATTT;SOR=0.637;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=209;TCF=102;TCR=107;TR=128;WE=46930115;WS=46930097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,132:0.61:216
chr22	46931077	rs4823850	G	C	2580.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=47;NR=31;PP=2056;SC=CATGGGGGGCGAGCCGTGGTC;SOR=1.124;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=47;TCR=31;TR=78;WE=46931085;WS=46931067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chr22	46931793	rs1009154	G	C	6438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=108;PP=2965;SC=CCTCCACCAGGAGCTGGTACT;SOR=1.053;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=190;TCF=82;TCR=108;TR=189;WE=46931801;WS=46931783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chr22	46931838	rs1009155	G	A	5766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=191;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=93;PP=2965;SC=CCGCCCGTGTGCTCACCACGC;SOR=0.714;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=183;TCF=89;TCR=94;TR=182;WE=46931846;WS=46931828;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chr22	47054016	rs56020728	C	T	1869.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.069;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.119;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=47;NR=21;PP=1420;ReadPosRankSum=1.369;SC=GCACCCCTGCCCCAGCATCCC;SOR=0.989;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=60;TCR=27;TR=68;WE=47054024;WS=47054006;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,69:0.80:86
chr22	47057191	rs2076707	C	T	4467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.90;QD=35.74;SOR=1.686;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chr22	47057191	.	CGGTCGC	TGGTCGC,TGGTCGT	1955	.	AC=1,0;AF=0.500,0.00;AN=2;BRF=0.15;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=27;MQ=59.91;NF=84,27;NR=38,6;PP=1955,394;QD=16.3096001028;SC=GTGCAGTACACGGTCGCGAGA;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=122;TCF=84;TCR=38;TR=122,33;WE=47057205;WS=47057181;set=Platypus	GT:AF:DP	0/1:1.00:122
chr22	47057197	rs2076708	C	T	708.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.477;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FS=10.056;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.90;MQRankSum=-1.530;QD=5.49;ReadPosRankSum=1.268;SOR=1.672;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,38:0.29:129
chr22	47058992	rs2542040	T	C	2203.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=23;PP=1626;SC=ACGAGCGGTTTGGGGAGTACG;SOR=1.577;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=69;TCF=46;TCR=23;TR=69;WE=47059000;WS=47058982;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chr22	47059597	rs2542035	A	G	1154.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=4;PP=770;SC=GTGCATGGCCATTCTGTGCAC;SOR=3.816;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=38;WE=47059605;WS=47059587;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr22	47059633	rs73469201	G	A	911.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.32;BaseQRankSum=4.052;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=4;PP=665;ReadPosRankSum=0.739;SC=CTGTTGAGACGTCCTCCCTGG;SOR=0.592;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=53;TCF=46;TCR=7;TR=30;WE=47059641;WS=47059623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,35:0.58:60
chr22	47064164	rs2748338	C	A	501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=13;PP=423;SC=CGCCGGCCTCCGCTGCTGCCT;SOR=3.126;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=2;TCR=13;TR=15;WE=47064172;WS=47064154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr22	47064665	rs9616088	C	T	1247.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=4.841;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.650;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=38;PP=990;ReadPosRankSum=0.863;SC=CTGCGGCGCCCGCCCGGCCTG;SOR=0.805;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=161;TCF=56;TCR=105;TR=55;WE=47064673;WS=47064655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,55:0.33:168
chr22	47064837	rs2076711	A	C	261.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-5.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=13;PP=153;ReadPosRankSum=-2.284;SC=CTGTAGCTTCAGGAGGAGGGA;SOR=0.223;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=43;TCF=2;TCR=41;TR=14;WE=47064845;WS=47064827;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:30,15:0.33:45
chr22	47066915	rs112121870	T	C	1220.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.029;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=20;PP=867;ReadPosRankSum=-0.240;SC=ATGGCATTCCTGGCTTATCGG;SOR=0.758;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=75;TCF=41;TCR=34;TR=45;WE=47066923;WS=47066905;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:28,49:0.64:77
chr22	47070432	rs2073275	G	C	150.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-0.548;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=1;PP=143;ReadPosRankSum=-0.585;SC=CTCACTGTGGGTGTGACGTGA;SOR=0.395;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=9;WE=47070440;WS=47070422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,8:0.24:33
chr22	47070550	rs55913893	T	A	1254.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.601;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.302;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=29;PP=901;ReadPosRankSum=0.433;SC=CCTTCTCCCATTAGTGTGCGA;SOR=1.473;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=66;TCF=27;TCR=39;TR=45;WE=47070558;WS=47070540;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:22,49:0.69:71
chr22	47071240	rs78249350	G	C	322.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=-1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=0;PP=283;ReadPosRankSum=1.461;SC=TTCTGTGTCTGCTGGGAAGGG;SOR=1.739;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=12;WE=47071248;WS=47071230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,12:0.50:24
chr22	47071291	.	C	T	331.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=3.485;ClippingRankSum=0.000;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=2;PP=263;ReadPosRankSum=1.033;SC=GAGGCAGCCCCGGGAGACCCC;SOR=0.634;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=32;TCF=27;TCR=5;TR=13;WE=47071299;WS=47071281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,13:0.41:32
chr22	47071531	rs2073276	T	C	4032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=15;NR=105;PP=2965;SC=CCCTATAGACTTCTGCCAGCC;SOR=3.740;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=15;TCR=105;TR=120;WE=47071539;WS=47071521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,124:1.00:124
chr22	47072477	rs2236028	G	A	64.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.471;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.40;ReadPosRankSum=1.189;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,5:0.19:27
chr22	47083010	rs2542014	T	C	5045.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.957;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=30.58;ReadPosRankSum=0.648;SOR=1.324;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:2,163:0.99:165
chr22	47083010	.	TGT	CGA	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=95;NR=55;PP=2947;QD=20;SC=TTTCCCAGTTTGTGAGCAGGA;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=157;TCF=97;TCR=60;TR=150;WE=47083020;WS=47083000;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,150:0.96:157
chr22	47083012	rs2748349	T	A	7469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.46;SOR=1.284;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chr22	47083172	.	CTGGACAGGGGCTGCAGTAAACCCCACGTGTCCCTCACTCAAAGCTGGCCCTGAGCACCGCTCT	C	629.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.044;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=10.50;ReadPosRankSum=-2.671;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,28:0.47:60
chr22	47083219	.	GC	G	542	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;FR=0.5000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=0;NR=5;PP=542;QD=118.206179974;SC=CTCAAAGCTGGCCCTGAGCAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=5;WE=47083243;WS=47083209;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chr22	47085924	rs35318967	G	A	1189.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=6.447;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.746;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=44;NR=2;PP=1009;ReadPosRankSum=-0.005;SC=GGACCTCCCCGTCGCAGTTCC;SOR=1.765;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=87;TCF=80;TCR=7;TR=46;WE=47085932;WS=47085914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:44,45:0.51:89
chr22	47089274	rs36211082	G	A	1285.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.116;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=9;PP=1007;ReadPosRankSum=0.032;SC=ACAGAAACCCGCACTCCAGCA;SOR=0.693;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=52;TCR=12;TR=47;WE=47089282;WS=47089264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:18,48:0.73:66
chr22	47091321	rs135676	C	T	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=3.587;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=7;PP=105;ReadPosRankSum=-0.601;SC=CTGCCTAAACCGTCTGCAGGA;SOR=0.859;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=7;WE=47091329;WS=47091311;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,6:0.33:18
chr22	47095172	rs5767329	C	G	3485.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=6.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=178;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.685;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=84;NR=29;PP=2649;ReadPosRankSum=-1.178;SC=AGTCGGGGCACGACCAGCGGG;SOR=0.803;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=124;TCR=43;TR=113;WE=47095180;WS=47095162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,121:0.69:176
chr22	47097450	rs135688	C	T	62.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.297;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.396;NF=4;NR=0;PP=34;ReadPosRankSum=-0.290;SC=GGCTGGAACACGCGACGGGGA;SOR=1.508;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=4;WE=47097458;WS=47097440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chr22	47097478	rs57459614	TG	T	234.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=1.006;NF=9;NR=1;PP=278;ReadPosRankSum=0.000;SC=GGGACAGGCCTGGGGGCGCAG;SOR=0.269;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=10;WE=47097486;WS=47097468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,10:0.56:18
chr22	47106800	rs135701	T	C	1197.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=1;PP=973;SC=CAGAGAGGAGTGTGTGACTGC;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=35;WE=47106808;WS=47106790;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chr22	47117029	.	G	A	263.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.218;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=9;PP=143;ReadPosRankSum=1.013;SC=AGAAATTCAGGCTGGGTGTGG;SOR=0.478;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=10;WE=47117037;WS=47117019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,12:0.33:36
chr22	47134147	.	G	GGCGGGCT	292.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.54;QD=36.59;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr22	47185415	rs801605	C	T	2559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.23;BaseQRankSum=-3.402;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=133;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.344;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=74;PP=2060;ReadPosRankSum=0.105;SC=GTTGTGCTTACCTTTGCCTCC;SOR=0.449;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=122;TCF=16;TCR=106;TR=86;WE=47185423;WS=47185405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,90:0.69:130
chr22	47274638	rs131869	C	T	2273.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=56;PP=1864;SC=CACCGCACCGCCCATCAGCGC;SOR=2.770;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=14;TCR=56;TR=70;WE=47274646;WS=47274628;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr22	47307828	rs34153333	A	AC	434.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.122;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.52;MQRankSum=0.000;QD=13.17;ReadPosRankSum=1.849;SOR=0.846;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,18:0.55:33
chr22	47311404	rs738935	A	T	1232.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-2.848;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.702;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=23;NR=20;PP=1019;ReadPosRankSum=-1.194;SC=TGCAGCTGCCAGTGGCACTAG;SOR=0.338;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=55;TCF=27;TCR=28;TR=43;WE=47311412;WS=47311394;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:12,43:0.78:55
chr22	47370033	rs73186541	G	A	425.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.846;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.597;HP=1;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=16;NR=1;PP=346;ReadPosRankSum=-0.101;SC=AAGTGATGAGGTGGAAGGCTG;SOR=0.064;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=46;TCF=45;TCR=1;TR=17;WE=47370041;WS=47370023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,17:0.35:49
chr22	47370060	rs4436	A	G	2464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=62;NR=6;PP=1876;SC=TCATTTAGCTAGACTGATGAG;SOR=4.294;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=63;TCR=6;TR=68;WE=47370068;WS=47370050;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chr22	47857537	rs130877	T	C	3327.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.490;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.849;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=59;NR=18;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.302;SC=TGTGTTCCCTTAGTTGCACCT;SOR=1.391;SbPval=0.75;Source=Platypus;TC=120;TCF=87;TCR=33;TR=77;WE=47857584;WS=47857527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:43,81:0.65:124
chr22	47857551	rs130878	T	G	4055.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.793;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.480;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=29;PP=2962;ReadPosRankSum=-0.732;SC=TGCACCTCTGTTCTTGAGCTT;SOR=0.871;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=144;TCF=98;TCR=46;TR=95;WE=47857584;WS=47857527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:50,98:0.66:148
chr22	47857563	rs142074671	G	T	4289.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.363;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.047;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-1.375;NF=67;NR=37;PP=2962;ReadPosRankSum=0.168;SC=CTTGAGCTTTGTGTCTTTCTG;SOR=0.977;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=157;TCF=97;TCR=60;TR=104;WE=47857584;WS=47857527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,106:0.66:161
chr22	47857576	rs130879	A	G	4087.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.536;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=162;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.943;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-3.748;NF=61;NR=39;PP=2962;ReadPosRankSum=1.317;SC=TCTTTCTGCAAAACTAAACCA;SOR=0.987;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=157;TCF=92;TCR=65;TR=100;WE=47857584;WS=47857527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:60,101:0.63:161
chr22	47857656	rs202008662	TTA	T	816.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-3.830;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FS=1.902;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.06;MQRankSum=5.714;QD=8.17;ReadPosRankSum=-1.326;SOR=0.471;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:66,34:0.34:100
chr22	47857658	rs130880	A	T	644.77	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=1.559;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.10;MQRankSum=-4.171;QD=7.59;ReadPosRankSum=1.721;SOR=0.695;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:44,41:0.48:85
chr22	47857659	rs130881	A	T	2082.73	.	AC=1;AF=0.500;ALERT;AN=2;BaseQRankSum=-1.092;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=61.09;MQRankSum=-4.670;QD=20.62;ReadPosRankSum=2.112;SOR=0.815;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,66:0.65:101
chr22	47859199	rs2294230	C	T	250.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=4.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=213;ReadPosRankSum=1.080;SC=CTCAGTGCCGCGGAGAAAAGA;SOR=0.590;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=14;TCR=37;TR=14;WE=47859207;WS=47859189;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:40,13:0.25:53
chr22	48023241	rs8137874	G	T	569.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-3.715;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.158;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=9;PP=368;ReadPosRankSum=0.000;SC=TGCAGAAGTGGGTCTGGCCCA;SOR=0.515;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=26;TCR=16;TR=23;WE=48023249;WS=48023231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,26:0.58:45
chr22	48940553	rs4823540	T	C	5983.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.319;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=86;NR=107;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.867;SC=CACTCCGGGCTGCGGGGAGGC;SOR=0.464;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=194;TCF=87;TCR=107;TR=193;WE=48940561;WS=48940543;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,203:1.00:204
chr22	48940644	rs9615919	C	T	4477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.694;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=97;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.909;SC=TGGGGTCCCACGCTGCCTCTG;SOR=0.913;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=138;TCF=39;TCR=99;TR=136;WE=48940652;WS=48940634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,146:0.99:147
chr22	48942566	rs739155	G	A	1393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=39;PP=1145;SC=TGCAGTTCTGGAAAGGCTCAC;SOR=6.138;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=40;TCF=1;TCR=39;TR=40;WE=48942574;WS=48942556;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr22	49042294	rs9617472	C	T	266.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.240;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=9;NR=1;PP=212;ReadPosRankSum=0.088;SC=GAAGCGGTCTCCCTGCCCTGT;SOR=0.527;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=15;TCF=14;TCR=1;TR=10;WE=49042302;WS=49042284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,10:0.67:15
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chr22	49246458	rs28384366	T	C	1531.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=41;NR=4;PP=1283;SC=CCTTGGGGTTTCTACATCCAT;SOR=4.271;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=41;TCR=4;TR=45;WE=49246466;WS=49246448;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr22	49246723	rs28394186	A	C	490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=18;PP=424;SC=GCCCAGCCAGAGCCCCCCACA;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=49246731;WS=49246713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	49246747	rs28556787	T	C	396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=12;PP=364;SC=TCGCAGCGGATAGCTAAAGAG;SOR=3.611;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=49246755;WS=49246737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	49246786	rs28635747	C	T	176.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=5;PP=141;SC=GCCTGGAGTCCGCCAAGAAGG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=49246794;WS=49246776;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	49667985	rs7289562	G	A	1811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=21;PP=1369;SC=GAAAGTCCCCGGGCAAACAGG;SOR=1.278;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=34;TCR=21;TR=55;WE=49667993;WS=49667975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr22	49668188	rs2688112	T	C	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=26;PP=669;SC=CCAGGCTAGATGCAATTTAGC;SOR=3.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=5;TCR=26;TR=31;WE=49668196;WS=49668178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr22	49834624	rs11705513	A	G	688.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-5.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=108;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=0;PP=530;ReadPosRankSum=0.087;SC=CCCTGTGAGCATCTTTCAGGG;SOR=0.721;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=105;TCF=104;TCR=1;TR=36;WE=49834632;WS=49834616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:72,36:0.33:108
chr22	49834747	rs1016809	C	T	12425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=395;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=216;NR=165;PP=2965;SC=CTAGTACCGTCTCCTTCTCCC;SOR=1.020;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=381;TCF=216;TCR=165;TR=381;WE=49834755;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,392:1.00:392
chr22	50014002	rs135877	A	G	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=1;PP=400;SC=CTGCTGTCCCAAGCTTGTCAC;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=18;TCR=1;TR=19;WE=50014010;WS=50013992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr22	50017234	rs916362	A	G	1991.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-2.722;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.661;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=53;PP=1479;ReadPosRankSum=0.150;SC=CACGTGCTGCAGAGCTCAGGG;SOR=0.582;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=139;TCF=44;TCR=95;TR=78;WE=50017242;WS=50017224;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,81:0.56:144
chr22	50018045	rs763128	G	A	2053.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=22;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=11;PP=1241;SC=AGTGATGCTCGGGGCTGCTGA;SOR=2.400;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=35;TCR=11;TR=46;WE=50018053;WS=50018035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chr22	50018069	rs2011097	A	G	2299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=12;PP=1559;SC=TTGTGGGGAGAGCACAGTGAT;SOR=2.644;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=40;TCR=12;TR=52;WE=50018077;WS=50018059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chr22	50018497	rs5770594	G	A	874.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-4.599;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.328;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=16;PP=640;ReadPosRankSum=-0.308;SC=TGCCTCTGATGACACCCACCT;SOR=0.958;SbPval=0.73;Source=Platypus;TC=146;TCF=83;TCR=63;TR=42;WE=50018505;WS=50018487;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:105,43:0.29:148
chr22	50018639	rs4524218	G	A	515.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.184;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=13;PP=909;ReadPosRankSum=0.425;SC=CCCTGACGCCGGGCTGACGGC;SOR=0.479;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=51;TCF=6;TCR=45;TR=15;WE=50018662;WS=50018629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,17:0.31:54
chr22	50018651	rs135879	C	T	520.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.602;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=2.684;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.70;ReadPosRankSum=-0.130;SOR=0.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,13:0.32:41
chr22	50018654	rs135880	T	A	463.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.828;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.04;ReadPosRankSum=-0.533;SOR=0.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:28,14:0.33:42
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chr22	50169157	rs138823	A	G	623.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-2.298;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.050;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=26;NR=2;PP=486;ReadPosRankSum=0.130;SC=GACGCTGCTCACCACAGGGAC;SOR=2.303;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=42;TCF=37;TCR=5;TR=28;WE=50169165;WS=50169147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,28:0.67:42
chr22	50169852	rs138824	G	A	1565.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.808;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.363;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=12;NR=42;PP=1185;ReadPosRankSum=1.484;SC=AGCAGGACACGGGGCACGCCC;SOR=0.278;SbPval=0.33;Source=Platypus;TC=81;TCF=15;TCR=66;TR=54;WE=50169860;WS=50169842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,57:0.68:84
chr22	50180951	rs138838	C	G	89.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.515;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=9.97;ReadPosRankSum=-0.549;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,6:0.67:9
chr22	50277835	rs910796	T	C	1774.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=2.265;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.669;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=28;PP=1427;ReadPosRankSum=-0.085;SC=AAAATGGCAGTGTGTCTGCCG;SOR=1.058;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=240;TCF=140;TCR=100;TR=78;WE=50277843;WS=50277825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:163,80:0.33:243
chr22	50277883	rs910797	A	G	1937.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-1.940;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=279;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.462;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=51;NR=41;PP=1430;ReadPosRankSum=-1.120;SC=TGCTTCCACCACAGCCTGCGG;SOR=0.728;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=272;TCF=148;TCR=124;TR=92;WE=50277891;WS=50277873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:182,94:0.34:276
chr22	50278438	rs910798	A	G	1095.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.922;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.970;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=30;PP=759;ReadPosRankSum=-0.426;SC=CCTCGTCTCCAGTAAAGCCGG;SOR=0.964;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=154;TCF=72;TCR=82;TR=51;WE=50278446;WS=50278428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:111,53:0.32:164
chr22	50278568	rs910799	A	G	1448.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-4.112;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=184;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.901;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=28;PP=1186;ReadPosRankSum=-0.299;SC=TTCCGATGACATAGGGGAGGC;SOR=0.955;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=177;TCF=91;TCR=86;TR=68;WE=50278576;WS=50278558;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:113,69:0.38:182
chr22	50278642	rs910800	C	T	1909.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.506;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.542;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=35;PP=1361;ReadPosRankSum=-1.547;SC=TTGAATCTGGCGCCATCTTCC;SOR=0.531;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=178;TCF=102;TCR=76;TR=76;WE=50278650;WS=50278632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:110,80:0.42:190
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chr22	50297888	rs3922872	T	C	2765.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-2.740;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.800;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=48;NR=67;PP=2034;ReadPosRankSum=1.106;SC=GCCACGTCAATGTGCAGAAGG;SOR=0.867;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=194;TCF=86;TCR=108;TR=115;WE=50297896;WS=50297878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:80,116:0.59:196
chr22	50301476	rs8135963	T	C	2238.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.320;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.499;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=37;NR=53;PP=1669;ReadPosRankSum=1.822;SC=TGAAGCCCAGTGCCAGCACCG;SOR=1.154;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=135;TCF=60;TCR=75;TR=90;WE=50301484;WS=50301466;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,92:0.67:138
chr22	50302850	rs4075331	A	G	392.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-4.033;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=22;MQRankSum=-0.671;NF=17;NR=1;PP=289;ReadPosRankSum=-1.305;SC=ATGTGGCTGCAGGTCCCACCC;SOR=0.512;SbPval=0.46;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=18;WE=50302858;WS=50302840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:10,18:0.64:28
chr22	50303515	rs9616367	A	C	1620.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.551;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.779;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=43;NR=18;PP=1112;ReadPosRankSum=-0.551;SC=AAATCCAGTTAGAAGCATCCC;SOR=1.118;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=106;TCF=70;TCR=36;TR=61;WE=50303523;WS=50303505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,65:0.59:111
chr22	50303530	rs9616204	T	C	2979.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=126;ExcessHet=3.0103;FS=5.897;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=23.65;ReadPosRankSum=0.263;SOR=1.277;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,74:0.59:126
chr22	50303533	rs9616368	C	G	2975.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FS=7.246;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=22.72;ReadPosRankSum=0.445;SOR=1.356;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,77:0.59:131
chr22	50306940	rs56377703	C	T	1114.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-4.678;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=0;PP=795;ReadPosRankSum=1.735;SC=TAACAGACAGCGTTCCTGGGC;SOR=2.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=49;TCF=49;TCR=0;TR=36;WE=50306948;WS=50306930;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:14,41:0.75:55
chr22	50306969	rs56248708	G	A	1856.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=5.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=6;PP=1431;ReadPosRankSum=-1.667;SC=CCGCGGCCTCGCTGAGGTCAC;SOR=1.112;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=78;TCF=71;TCR=7;TR=61;WE=50306977;WS=50306959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:19,65:0.77:84
chr22	50307184	rs11705497	G	T	3339.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.400;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=185;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.593;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=53;PP=2626;ReadPosRankSum=-0.836;SC=AGAAGGGCAGGTCAGTGCACC;SOR=0.746;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=173;TCF=88;TCR=85;TR=115;WE=50307192;WS=50307174;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:61,122:0.67:183
chr22	50312382	rs9616381	G	A	94.80	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;BaseQRankSum=-0.842;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=0.5064;FS=6.990;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=4;NR=0;PP=66;ReadPosRankSum=-0.000;SC=GCAGGACCTGGAGCTCCGGCT;SOR=3.229;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=4;WE=50312390;WS=50312372;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,4:0.80:5
chr22	50312630	rs58375955	A	G	264.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-2.066;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=8;PP=190;ReadPosRankSum=-1.082;SC=CCTTGGGCCCAGGGTCGCCCT;SOR=1.179;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=10;WE=50312638;WS=50312620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,10:0.71:14
chr22	50312801	rs145212257	ACCCTCGACCTGGGCTCG	A	598.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.858;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=2.920;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.92;ReadPosRankSum=0.142;SOR=1.734;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:26,17:0.40:43
chr22	50312869	rs28562884	T	C	1110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=14.031;HP=3;HapScore=2;MGOF=22;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=8;PP=858;ReadPosRankSum=0.816;SC=GGGCACTGTCTCCTCGCAGGG;SOR=2.228;SbPval=0.89;Source=Platypus;TC=74;TCF=53;TCR=21;TR=42;WE=50312877;WS=50312859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,44:0.58:76
chr22	50312979	rs9616382	C	T	1585.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.563;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.798;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=35;PP=1091;ReadPosRankSum=-0.586;SC=CCTGGAGCACCCCTGTGGGTC;SOR=0.603;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=88;TCF=33;TCR=55;TR=56;WE=50312987;WS=50312969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:37,61:0.62:98
chr22	50313014	rs9616383	T	C	1017.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.530;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.103;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=27;PP=771;ReadPosRankSum=0.007;SC=TCCTGGGAAGTCGTGTCCTGC;SOR=0.994;SbPval=0.8;Source=Platypus;TC=62;TCF=18;TCR=44;TR=35;WE=50313022;WS=50313004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:27,37:0.58:64
chr22	50313082	rs9616384	C	T	342.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=4.433;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=11;PP=248;ReadPosRankSum=0.257;SC=ACCAGTCACCCGTCCGAGTCA;SOR=0.693;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=12;WE=50313090;WS=50313072;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,13:0.50:26
chr22	50313124	rs9616385	C	T	225.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.920;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=8;PP=177;ReadPosRankSum=-0.882;SC=TAATGGCTGGCCCCTCTCTGG;SOR=0.184;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=9;WE=50313132;WS=50313114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,9:0.50:18
chr22	50313358	rs8137331	GG	CA	931.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=3.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;JOINED;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=3;PP=949;ReadPosRankSum=-0.409;SC=ACGGTGGGCCGGTGTGGGCCT;SOR=0.871;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=37;TCF=32;TCR=5;TR=22;WE=50313367;WS=50313348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:15,24:0.62:39
chr22	50313438	rs9616388	T	C	1224.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=1.440;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=29;NR=17;PP=962;ReadPosRankSum=0.696;SC=TCGAATGCAATCAGATGCTAG;SOR=0.610;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=73;TCF=46;TCR=27;TR=46;WE=50313446;WS=50313428;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,46:0.61:75
chr22	50315932	.	CG	C	2545.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.780;ClippingRankSum=0.000;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=2.936;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.25;MQRankSum=-1.089;QD=29.95;ReadPosRankSum=-0.925;SOR=0.387;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,69:0.81:85
chr22	50315933	.	G	C	340	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;FR=0.5000;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MMLQ=28;MQ=55.21;NF=15;NR=1;PP=340;QD=23.4232007842;SC=CGATTCTTACGCCCCTCAGCA;SbPval=0.97;Source=Platypus;TC=51;TCF=40;TCR=11;TR=16;WE=50315941;WS=50315923;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:35,16:0.31:51
chr22	50315936	.	CCTCAGCAGTCAGGACCGGCCTCTCCGATTCTTACCCG	C	2545.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=3.403;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=2.226;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.33;MQRankSum=-1.418;QD=26.52;ReadPosRankSum=-0.137;SOR=0.464;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:27,69:0.72:96
chr22	50315973	.	G	C	1387	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;FR=0.5000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=28;MQ=58.39;NF=37;NR=17;PP=1387;QD=26.3290965287;SC=ATTCTTACCCGCCTTGCTGTC;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=76;TCF=55;TCR=21;TR=54;WE=50315981;WS=50315963;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:22,54:0.71:76
chr22	50316369	rs9616209	C	T	868.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=2.789;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=26;PP=653;ReadPosRankSum=-0.185;SC=AGGAGCGGCCCGGGGGTGGAG;SOR=0.422;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=37;TCF=4;TCR=33;TR=30;WE=50316377;WS=50316359;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,32:0.82:39
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chr22	50316984	rs145727743	T	TCTGCACTCCGGGGC	3099.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.195;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=149;ExcessHet=3.0103;FS=0.718;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=26.95;ReadPosRankSum=-0.262;SOR=0.569;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,64:0.56:115
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chr22	50317145	rs73181164	A	G	1348.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-0.260;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.188;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=37;PP=1044;ReadPosRankSum=-3.783;SC=TTCAAGTCAGATGAAAAGAAA;SOR=0.489;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=72;TCF=15;TCR=57;TR=48;WE=50317153;WS=50317135;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:24,50:0.68:74
chr22	50317187	rs7410601	C	T	730.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=3.732;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.497;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=1;NR=26;PP=597;ReadPosRankSum=0.847;SC=CCCTGGAGAGCGCACCCTGCT;SOR=2.636;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=43;TCF=3;TCR=40;TR=27;WE=50317195;WS=50317177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,27:0.61:44
chr22	50318927	rs9616216	T	C	560.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.273;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=18;NR=1;PP=439;ReadPosRankSum=-1.611;SC=CCTTTCCTGATCTTTGCTCCT;SOR=0.804;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=19;WE=50318935;WS=50318917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,20:0.71:28
chr22	50318946	rs9616217	C	T	691.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.577;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=22;NR=1;PP=542;ReadPosRankSum=-1.434;SC=CTTTCTGTAACGTGACGTTTG;SOR=1.371;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=29;TCF=28;TCR=1;TR=23;WE=50318954;WS=50318936;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,24:0.80:30
chr22	50319079	rs11545762	T	G	2559.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-3.729;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=165;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.113;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=58;NR=42;PP=1828;ReadPosRankSum=0.948;SC=GGACGAGTGCTCACTAGCAGA;SOR=0.532;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=152;TCF=92;TCR=60;TR=100;WE=50319087;WS=50319069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:56,107:0.66:163
chr22	50319170	rs11545763	A	G	2479.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=2.313;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=60;PP=1939;ReadPosRankSum=-0.147;SC=GGCTTCGAAGAAACGGAAGAT;SOR=0.735;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=120;TCF=35;TCR=85;TR=85;WE=50319178;WS=50319160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,88:0.72:123
chr22	50319351	rs9627800	T	C	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.335;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.5013;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=27;MQRankSum=-0.000;NF=2;NR=7;PP=229;ReadPosRankSum=0.230;SC=GTGCATGACATCTCTGTGTGG;SOR=0.582;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=9;WE=50319359;WS=50319341;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chr22	50354932	.	C	G	893.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=0.948;ClippingRankSum=0.000;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=14;NR=16;PP=669;ReadPosRankSum=0.107;SC=CCTTGCGCCTCGCTTGGCCCG;SOR=0.544;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=17;TCR=20;TR=30;WE=50354940;WS=50354922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:7,31:0.82:38
chr22	50356274	rs28645887	C	T	1469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=2;PP=1164;SC=CCAGCAGGGACCTCGCCGTCT;SOR=5.376;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=42;TCF=40;TCR=2;TR=42;WE=50356282;WS=50356264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chr22	50356302	rs28691713	C	T	2398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=60;NR=8;PP=1902;SC=GGCTCTGCCTCTGTGGTGGGC;SOR=3.943;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=60;TCR=8;TR=68;WE=50356310;WS=50356292;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr22	50356555	rs4078443	T	C	2838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=62;PP=2372;SC=CTCGCCCTGCTTGGGCCCTCC;SOR=2.168;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=23;TCR=62;TR=85;WE=50356563;WS=50356545;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr22	50356693	rs4077129	T	C	2094.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=35;PP=1549;SC=GACGGGGGCGTCCCGGAGAGC;SOR=0.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=30;TCR=35;TR=65;WE=50356701;WS=50356683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr22	50356850	rs1801645	C	T	566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=12;PP=433;SC=CCCTGACTTTCTCCTGCGTGG;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=4;TCR=12;TR=16;WE=50356858;WS=50356840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	50436846	rs79102851	G	GTCC	580.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.243;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=8.30;ReadPosRankSum=-0.471;SOR=0.428;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,18:0.26:70
chr22	50437977	.	G	C	179.96	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.645;ClippingRankSum=-0.000;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.6351;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=0;NR=8;PP=110;ReadPosRankSum=1.036;SC=GGAGGGCGGGGGTGGTCTGGG;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=8;WE=50437985;WS=50437967;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chr22	50439194	rs9617090	C	T	110.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.105;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.77;ReadPosRankSum=-1.056;SOR=0.582;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:32,8:0.20:40
chr22	50439626	rs9617098	G	A	376.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.398;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=10.823;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=8;PP=314;ReadPosRankSum=-0.373;SC=ACATGGACACGGGGCGTGGCC;SOR=0.935;SbPval=0.19;Source=Platypus;TC=51;TCF=22;TCR=29;TR=19;WE=50439634;WS=50439616;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:32,18:0.36:50
chr22	50439641	.	G	T	600.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=-1.993;ClippingRankSum=0.000;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.037;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=16;PP=394;ReadPosRankSum=1.983;SC=GTGGCCGGCAGAAGCTGTTAA;SOR=1.849;SbPval=0.78;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=22;WE=50439649;WS=50439631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,23:0.57:40
chr22	50455066	rs117937837	A	G	433.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-3.778;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=12;PP=260;ReadPosRankSum=1.212;SC=CTGGCCACTCAGCAAGGCCAC;SOR=1.091;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=14;WE=50455074;WS=50455056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:9,17:0.65:26
chr22	50468907	rs738333	C	G	100.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.002;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=5.478;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=0;PP=64;ReadPosRankSum=-0.256;SC=GTCTTCAGGCCCCGCAGCACA;SOR=2.215;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=21;TCR=4;TR=7;WE=50468915;WS=50468897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,7:0.29:24
chr22	50471620	rs5845912	AC	A	875.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.380;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=4;PP=796;ReadPosRankSum=0.587;SC=CAGGTCGCCCACCGCACTGAC;SOR=0.567;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=81;TCF=66;TCR=15;TR=25;WE=50471628;WS=50471610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:63,32:0.34:95
chr22	50479856	rs9617137	A	C	59.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.857;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=2;PP=31;ReadPosRankSum=0.331;SC=GACAGACACCACAATACTCAA;SOR=0.569;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=17;TCF=10;TCR=7;TR=4;WE=50479864;WS=50479846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,4:0.24:17
chr22	50480108	rs9628315	C	T	1324.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=-0.709;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=8.893;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=36;NR=19;PP=1077;ReadPosRankSum=-0.090;SC=GTGAGGTCCTCCACGGCATCT;SOR=1.370;SbPval=0.84;Source=Platypus;TC=159;TCF=91;TCR=68;TR=55;WE=50480116;WS=50480098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:102,55:0.35:157
chr22	50483850	rs8138121	T	C	227.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.752;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FS=3.031;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.35;ReadPosRankSum=2.167;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:54,14:0.21:68
chr22	50483889	rs8137790	A	G	255.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.05;BaseQRankSum=-0.072;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=7.984;HP=3;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=10;PP=162;ReadPosRankSum=-0.695;SC=GGCCAGGGCCACGGAGGCTCC;SOR=0.067;SbPval=0.16;Source=Platypus;TC=40;TCF=6;TCR=34;TR=14;WE=50483897;WS=50483879;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:26,14:0.35:40
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chr22	50487567	rs137911	T	C	201.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=-2.594;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-0.000;NF=8;NR=0;PP=154;ReadPosRankSum=0.878;SC=GGCTTTGCCCTCGCCGGGCTG;SOR=1.802;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=8;WE=50487575;WS=50487557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:8,8:0.50:16
chr22	50488804	rs137913	CT	C	187.37	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.38;ReadPosRankSum=0.368;SOR=2.985;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,12:0.86:14
chr22	50493693	rs188314775	T	C	1023.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.810;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.287;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=23;PP=785;ReadPosRankSum=-0.062;SC=ACTGCCTTGCTATTTTGTATC;SOR=0.515;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=134;TCF=59;TCR=75;TR=44;WE=50493701;WS=50493683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:91,46:0.34:137
chr22	50512617	rs2038048	C	T	1391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-3.890;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=7;PP=1089;ReadPosRankSum=0.460;SC=CCCAGAGCGGCGGCGGGCGGG;SOR=0.879;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=78;TCF=67;TCR=11;TR=52;WE=50512625;WS=50512607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:25,54:0.68:79
chr22	50515677	rs6010166	C	T	333.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=2.151;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5021;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=30;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=1;PP=235;ReadPosRankSum=1.490;SC=CCCTCCTGGCCGGGGTTTCTG;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=11;WE=50515685;WS=50515667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,12:0.80:15
chr22	50516000	.	C	T	198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=3.588;ClippingRankSum=-0.000;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=-0.000;NF=1;NR=5;PP=101;ReadPosRankSum=1.181;SC=CAGCGTCCACCGGACCACCTC;SOR=0.283;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=6;WE=50516008;WS=50515990;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:6,8:0.57:14
chr22	50518723	rs79301	A	G	1789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=45;NR=18;PP=1474;SC=ACTGTCTGTCAGCCCCTCCGG;SOR=1.926;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=63;TCF=45;TCR=18;TR=63;WE=50518731;WS=50518713;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr22	50523433	rs137930	T	C	323.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=2.001;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=235;ReadPosRankSum=-0.156;SC=CTGAGGAAACTTCAATAAGTT;SOR=1.911;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=10;WE=50523441;WS=50523423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,11:0.73:15
chr22	50546788	rs138215	G	C	2354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.43;SOR=2.437;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chr22	50546797	rs138216	T	C	2181.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.78;SOR=2.348;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chr22	50547247	rs138217	A	G	585.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=16;PP=524;SC=TCTGGAGGGCACTTTGTATGA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=2;TCR=16;TR=18;WE=50547255;WS=50547237;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chr22	50555486	rs126241	G	C	134.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=0;PP=104;SC=CTAAAGATGAGTCTTAACTCT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=50555494;WS=50555476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr22	50555619	rs138222	C	T	1286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=18;PP=1017;SC=TCCTTTTGCTCTGTTTTTCCG;SOR=1.055;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=42;TCF=24;TCR=18;TR=42;WE=50555627;WS=50555609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr22	50564413	rs138242	A	G	72.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=2;NR=1;PP=51;SC=AGTAGAGATGAGGTTTCGCCG;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=50564421;WS=50564403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr22	50585626	.	A	G	168	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;FR=1.0000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=56.68;NF=1;NR=6;PP=168;QD=28.9673160782;SC=TCTCAGAGGCACTCTGTGCAG;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=50585634;WS=50585616;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	50587979	rs138270	T	G	899.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=8;PP=644;SC=TTTGCCAGTGTGTCAGAGGCA;SOR=1.942;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=19;TCR=8;TR=27;WE=50587987;WS=50587969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr22	50588131	rs138271	C	T	671.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=17;PP=484;SC=TGATGTCGGACATCAGTGGCC;SOR=2.400;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=50588139;WS=50588121;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr22	50598296	rs17781047	G	A	245.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=171;SC=ATCTAAAGGGGCAGAGGCTGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=50598304;WS=50598286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr22	50616806	rs5771206	A	G	187.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=150;SC=ACTGTGGGCTAGGCCTGGCCC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=50616814;WS=50616796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	50635627	rs5771095	C	T	467.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=27.52;SOR=1.739;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr22	50639473	rs5771225	T	C	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=1;PP=55;SC=CGGATGGCCGTATACAGGGCA;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=50639481;WS=50639463;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr22	50639528	rs5771226	T	C	173.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=4;NR=3;PP=207;SC=TGCCCCTCGGTCGCTGTTCCC;SOR=0.941;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=7;TCF=4;TCR=3;TR=7;WE=50639536;WS=50639518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	50639965	rs2272846	C	A	167.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=4;NR=2;PP=69;SC=TGCACGGCGACCGGCGAGCGC;SOR=0.941;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=4;TCR=2;TR=6;WE=50639973;WS=50639955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	50644969	rs2294399	G	A	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.46;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=3;NR=7;PP=274;SC=GGGGCCTTTCGGCCTGTCTAC;SOR=1.609;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=3;TCR=7;TR=10;WE=50644977;WS=50644959;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr22	50646936	rs5771102	G	C	1233.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=17;PP=896;SC=TCAGGTTTGGGCTGTTGACGC;SOR=0.843;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=20;TCR=17;TR=37;WE=50646944;WS=50646926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chr22	50654428	rs2294402	T	G	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=139;SC=CAGGGACAGATTCAGTCAGGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=50654436;WS=50654418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr22	50655098	rs2272851	A	G	150.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=2;NR=4;PP=108;SC=GCTACCTCCCAGACACCCTGG;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=2;TCR=4;TR=6;WE=50655106;WS=50655088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	50656096	rs2038050	A	G	2178.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=37;PP=1687;SC=CTCAGCCCCCACCCAGGAGAG;SOR=0.836;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=68;TCF=31;TCR=37;TR=68;WE=50656117;WS=50656086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chr22	50656109	rs55955211	A	C	2188.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=43;PP=1637;SC=CAGGAGAGAGAGCTGCAGACA;SOR=1.121;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=29;TCR=43;TR=72;WE=50656117;WS=50656086;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chr22	50657010	rs4838864	C	G	2036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=36;PP=1643;SC=TACTTGCTCACGCAGCCCTCG;SOR=1.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=25;TCR=36;TR=61;WE=50657018;WS=50657000;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr22	50658053	rs6537642	A	G	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=7;PP=664;SC=CTCCCTGCCAACAGCAACTGC;SOR=2.066;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=18;TCR=7;TR=25;WE=50658061;WS=50658043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr22	50658274	rs2272854	C	G	1219.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=11;PP=946;SC=GTCCCCACAACCAGCTTGTGC;SOR=1.609;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=36;TCF=24;TCR=12;TR=35;WE=50658282;WS=50658264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr22	50658424	rs11703226	T	C	1227.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=29;PP=879;SC=AGGTCCTCAGTGTCCCCGCTC;SOR=1.508;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=15;TCR=29;TR=44;WE=50658432;WS=50658414;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chr22	50658501	rs9617119	A	G	688.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=4;NR=16;PP=556;SC=TGGCGGGTACAGAGCCGAGCC;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=50658509;WS=50658491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr22	50658570	rs17248273	A	G	752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=4;PP=575;SC=CCTGGCTGACAAGGAGGCCTG;SOR=3.098;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=20;TCR=4;TR=24;WE=50658578;WS=50658560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr22	50664612	rs4838865	A	G	2645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=47;NR=40;PP=2044;SC=TGTCCAGTACAACTTATCTAA;SOR=0.859;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=88;TCF=47;TCR=41;TR=87;WE=50664620;WS=50664602;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chr22	50678571	rs5771109	T	C	107.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=81;SC=ACACACCCCATCCAAGGCCAC;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=50678579;WS=50678561;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	50682061	.	AAAG	A	429.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.557;ClippingRankSum=0.000;DP=24;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.59;MQRankSum=0.000;QD=23.87;ReadPosRankSum=-1.166;SOR=0.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chr22	50682865	rs5771270	G	A	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=19;PP=534;SC=ACAGGTCGTCGAACAGCTGCG;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=20;TCF=1;TCR=19;TR=20;WE=50682873;WS=50682855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr22	50684296	rs13058062	T	C	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=15;PP=731;SC=ACTGGTCCTTTCCCTCGTCCC;SOR=0.846;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=12;TCR=15;TR=27;WE=50684304;WS=50684286;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chr22	50685508	rs4838866	A	G	71.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=3;PP=50;SC=TCAGCCACACATCTTCTTACA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=50685516;WS=50685498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chr22	50688235	rs738334	T	C	725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=3;PP=502;SC=CCTCCTGCGCTGCCCCTTGCT;SOR=2.400;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=19;TCF=16;TCR=3;TR=19;WE=50688243;WS=50688225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr22	50688348	rs1555048	A	G	1682.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=27;PP=1254;SC=TGTTGAACACACAGAACCCGT;SOR=0.871;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=30;TCR=27;TR=57;WE=50688356;WS=50688338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr22	50689030	rs909688	A	G	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=16;PP=525;SC=CCTGGGATTCATGGTGGGAGT;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=5;TCR=16;TR=21;WE=50689038;WS=50689020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr22	50693479	rs5771281	A	G	223.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=113;SC=CAGGGCCCACAGGGTCCACAC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=50693487;WS=50693469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	50693521	rs5771282	C	T	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=259;SC=ACTCACGGGTCCACACAGGCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=10;WE=50693546;WS=50693511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr22	50693534	rs6010218	A	G	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.18;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr22	50693538	rs6010219	G	A	421.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.18;SOR=4.804;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr22	50693554	rs6010220	A	G	607.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=16;NR=2;PP=355;SC=CCCAACTCACAGGTCCACACA;SOR=3.383;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=18;TCF=16;TCR=2;TR=18;WE=50693562;WS=50693544;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr22	50694297	rs1129880	A	G	1097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=22;PP=837;SC=TGCAGCCCACAGACCAGATGT;SOR=1.432;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=35;TCF=13;TCR=22;TR=35;WE=50694305;WS=50694287;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr22	50695270	rs5771284	A	C	830.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=5;PP=714;SC=GTGGCTCAGCACCCAGACCCC;SOR=2.215;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=24;WE=50695278;WS=50695260;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr22	50696662	rs73187284	C	T	2148.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=30;PP=1589;SC=CAGCCCAGGTCGGCACTCACA;SOR=0.814;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=65;TCF=35;TCR=30;TR=64;WE=50696670;WS=50696652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr22	50699487	rs2272856	G	C	266.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=1;PP=198;SC=ACCCCCGCCCGGCCCCACAGC;SOR=4.174;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=50699495;WS=50699478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	50699668	rs2272857	A	G	1200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=19;PP=835;SC=CGGACTGGAAAGGCCGATACA;SOR=0.859;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=15;TCR=19;TR=34;WE=50699676;WS=50699658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr22	50703572	rs10626765	C	CAG	997.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=19;PP=997;SC=AGCCTCAGCACAGTCTGGGAG;SOR=3.352;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=20;WE=50703580;WS=50703562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr22	50704661	rs2076139	T	C	906.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=21;NR=5;PP=647;SC=TCACGTGTTCTGAGGAGATTT;SOR=2.546;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=21;TCR=5;TR=26;WE=50704669;WS=50704651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chr22	50705059	rs742185	A	G	2434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=39;PP=1819;SC=GGGCGAGGGGACCTCCATCAG;SOR=0.772;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=72;TCF=33;TCR=39;TR=72;WE=50705067;WS=50705049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr22	50705466	rs760748	A	G	1798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=27;NR=33;PP=1326;SC=GCGCCAGCCCAAAATCCAGGA;SOR=0.976;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=27;TCR=33;TR=60;WE=50705474;WS=50705456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr22	50708594	rs34355047	C	T	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=16;NR=1;PP=380;SC=ACCCCTTCTGCCCCGCCCCTA;SOR=5.549;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=50708602;WS=50708584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr22	50708731	rs9617050	A	G	187.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;NF=1;NR=5;PP=96;SC=TGTCCGGAGCAGCCGCCGCTC;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=50708739;WS=50708721;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chr22	50713866	rs1042979	G	C	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=7;PP=314;SC=TCAAATCACTGGAGACTCGAC;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=6;TCR=7;TR=13;WE=50713874;WS=50713856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr22	50714289	rs5771118	T	C	1683.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=29;NR=31;PP=1238;SC=GCACCCCACCTGCCCCCGCCC;SOR=0.726;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=60;TCF=29;TCR=31;TR=60;WE=50714297;WS=50714279;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chr22	50715029	rs5771119	T	C	1033.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=6;PP=880;SC=CGGGGAGGGCTGTGGGTGCGT;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=35;TCF=29;TCR=6;TR=34;WE=50715037;WS=50715019;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chr22	50715973	rs28637964	G	T	418.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=2;PP=334;SC=GCCTCCTGGGGACAGACCCAG;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=11;TCR=2;TR=13;WE=50715981;WS=50715963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr22	50716167	rs1127000	G	A	2365.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=43;PP=1761;SC=GGAGCGGTAAGCTGAGGCAGA;SOR=1.150;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=73;TCF=30;TCR=43;TR=73;WE=50716175;WS=50716157;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chr22	50717129	rs28718510	T	G	672.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=11;PP=498;SC=CGCCACTCTGTGGGAAGAGAC;SOR=1.230;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=19;TCF=8;TCR=11;TR=19;WE=50717137;WS=50717119;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr22	50717547	rs28633213	T	C	395.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=15;PP=318;SC=GCGGCACCCTTGGGCAGCAGG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=50717555;WS=50717537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr22	50718397	rs28611220	A	G	939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=5;PP=699;SC=AGTCTGCCTCATCCCTCAAGC;SOR=3.321;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=30;TCR=5;TR=35;WE=50718405;WS=50718387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr22	50719165	rs28540713	T	C	404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=2;PP=306;SC=GCCCGACGCCTGGCTCACATT;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=50719173;WS=50719155;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr22	50719251	rs11547734	A	G	1400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=42;NR=7;PP=1017;SC=GCCGCGGCTCAGGGATGTCCA;SOR=3.098;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=42;TCR=7;TR=49;WE=50719259;WS=50719241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chr22	50719976	rs111925803	C	T	2845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=48;PP=2219;SC=GCACCCCCCGCCAGTCCCCGC;SOR=0.782;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=41;TCR=48;TR=89;WE=50719984;WS=50719966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chr22	50720181	rs28442189	C	G	2210.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=29;NR=36;PP=1791;SC=CCTGGGGAGGCGGCAGTGGTC;SOR=0.880;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=65;TCF=29;TCR=36;TR=65;WE=50720189;WS=50720171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chr22	50720622	rs11547728	C	T	1980.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-1.438;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=37;PP=1455;ReadPosRankSum=1.229;SC=CCGTCATGGGCTGCAGGGATT;SOR=0.628;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=21;TCR=38;TR=58;WE=50720630;WS=50720612;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,64:0.98:65
chr22	50724172	rs56015849	A	AC	403.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=0;PP=276;SC=ACCGGCCGGCACCCCTCCCTC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=50724180;WS=50724162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr22	50724190	rs28604596	G	T	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=0;PP=320;SC=CTCCGCACCTGAGCCTGCCTG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=12;TCR=0;TR=12;WE=50724198;WS=50724180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	50724733	rs55709850	G	T	414.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=13;PP=406;SC=ACAGCAGAGGGGGAGGTGTCA;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=50724741;WS=50724723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chr22	50727921	rs28578714	T	C	1102.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=30;NR=4;PP=851;SC=GTCCGGGCCCTGCGAGAACAC;SOR=3.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=30;TCR=4;TR=34;WE=50727929;WS=50727911;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr22	50728062	rs28379706	T	C	2796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=48;PP=1934;SC=GCGTGCACCTTGTCCAGCGGG;SOR=0.799;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=92;TCF=44;TCR=48;TR=91;WE=50728070;WS=50728052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chr22	50757348	rs62241232	G	A	2234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=21;PP=1771;SC=GGTGAGGGCCGACCCACTCCT;SOR=1.852;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=50;TCR=21;TR=71;WE=50757356;WS=50757338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chr22	50853132	rs60172550	TC	T	40.70	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=20.35;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr22	50853134	rs115621755	C	T	49.74	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=24.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr22	50854317	rs6520165	T	C	82.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=1;PP=47;SC=ATGGTGGTCATCCTTTATCAT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=50854325;WS=50854314;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	50857140	rs7293044	G	A	132.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=26.58;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr22	50860565	rs9616844	G	A	351.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=0;PP=264;SC=CTGCTCTAGGGTTTCTTTTTG;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=50860573;WS=50860555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chr22	50870620	rs2076712	G	T	344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=5;PP=256;SC=GCCCTGCCCAGTCCAGGGATG;SOR=0.859;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=5;TCR=5;TR=10;WE=50870628;WS=50870610;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chr22	50876077	rs9306550	T	C	1748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=30;PP=1267;SC=CGGCTCTCCCTGCTGCTGAGC;SOR=0.831;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=59;TCF=28;TCR=31;TR=58;WE=50876085;WS=50876067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chr22	50876235	rs5770779	T	C	2530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=40;PP=2026;SC=GCAGTGGGCCTGGAGGAACGC;SOR=0.917;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=90;TCF=49;TCR=41;TR=88;WE=50876243;WS=50876225;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr22	50876357	rs5770890	C	G	1932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=48;PP=1561;SC=TGTGGGGTGCCGCCACCCTTT;SOR=2.621;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=60;TCF=12;TCR=48;TR=60;WE=50876365;WS=50876347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chr22	50877166	rs4824131	G	C	1334.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=24;PP=1061;SC=AGAAGGAAGCGCCCCCTGTGG;SOR=1.312;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=40;TCF=16;TCR=24;TR=40;WE=50877174;WS=50877156;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chr22	50879447	rs2273260	T	G	202.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=19;NF=0;NR=8;PP=169;SC=CAGAGGAGGCTGTCGGCAGGT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=50879455;WS=50879437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr22	50882752	rs59017944	CT	C	267.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=12;PP=189;SC=GTGATGCAATCTTTTTTTTTT;SOR=3.767;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=12;WE=50882760;WS=50882742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chr22	50900218	rs200977424	C	T	1293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=16;PP=1079;SC=CAACGGCCCCCGCAAACCTTC;SOR=1.151;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=39;WE=50900226;WS=50900208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr22	50925405	rs2232876	C	T	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.565;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.836;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=15;PP=469;ReadPosRankSum=1.285;SC=CAGCCACTCCCGCCCTCTTCT;SOR=2.225;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=20;WE=50925413;WS=50925395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chr22	50925672	rs2232878	T	C	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=2;PP=307;SC=GATGATGGCGTGGGAGAGGCT;SOR=3.126;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=14;TCF=12;TCR=2;TR=14;WE=50925680;WS=50925662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr22	50925914	rs56311845	GC	G	1139.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=11;NR=24;PP=1092;SC=TTGCCGTCCTGCCCCCCTTCT;SOR=1.609;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=36;TCF=11;TCR=25;TR=35;WE=50925922;WS=50925904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chr22	50926768	rs2232883	C	T	724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=13;PP=527;SC=TCGGGGAGCCCCAGGTAAGAG;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=8;TCR=13;TR=21;WE=50926776;WS=50926758;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chr22	50927415	.	C	T	111	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;FR=1.0000;HP=3;HapScore=2;MGOF=266;MMLQ=24;MQ=40.75;NF=5;NR=1;PP=111;QD=24.2952020912;SC=TGGTCATCGGCGACACCTTCC;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=50927423;WS=50927405;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chr22	50927447	.	CG	TG	2332	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;FR=0.5000,0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MMLQ=23;MQ=54.87;NF=9,11;NR=1,1;PP=2332,99;QD=235.6;SC=CATGGCCTCCCGTCCCTCCTG;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=10,12;WE=50927455;WS=50927437;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:10,12:0.55:22
chr22	50927447	rs139170143	CG	CGTCCCTCCTG	727.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9,11;NR=1,1;PP=2332,99;SC=CATGGCCTCCCGTCCCTCCTG;SOR=3.126;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=10,12;WE=50927455;WS=50927437;set=Intersection	GT:AF:DP	1/1:1.00:15
chr22	50941985	rs6009975	T	C	721.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=18;PP=607;SC=CTAGCAGGGCTTGCACAAATC;SOR=2.737;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=21;WE=50941993;WS=50941975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr22	50944163	rs128941	G	A	1413.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=22;PP=929;SC=TGGTCGTCCAGCAGCGCAGTG;SOR=0.818;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=21;TCR=23;TR=42;WE=50944171;WS=50944153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr22	50946965	rs131823	T	C	126.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=4;PP=88;SC=CGCCCCACCGTCTCCACGCCT;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=1;TCR=4;TR=5;WE=50946973;WS=50946955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr22	50957520	rs3091397	G	A	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=1;PP=193;SC=TCTGGGCTCCGTGACTAAAGC;SOR=3.258;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=7;TCR=1;TR=8;WE=50957528;WS=50957510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr22	50960101	rs131814	G	A	1836.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=32;PP=1412;SC=GGCATGAGGTGGGGGGGTGGG;SOR=0.960;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=55;WE=50960109;WS=50960091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chr22	50961169	rs131813	A	G	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=14;PP=862;SC=GGTTAGAGGGAGACGGGGAGG;SOR=0.749;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=15;TCR=14;TR=29;WE=50961177;WS=50961159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chr22	50961854	rs2782	T	C	445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=358;SC=AGGAGCCGTGTGTCTGCTCCT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=50961862;WS=50961844;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chr22	50962208	rs12148	T	G	1398.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=17;PP=1144;SC=CCTTGGGGCCTGCATTGTAGT;SOR=1.473;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=33;TCR=17;TR=50;WE=50962216;WS=50962198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr22	50962782	rs140523	C	G	970.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=9;PP=700;SC=AGGGAGGACCCGAGGCTTGAG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=22;TCR=9;TR=31;WE=50962790;WS=50962772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chr22	50964153	rs131805	T	C	567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=6;PP=411;SC=CCCTGGATCCTTCCGCTCCCG;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=11;TCR=6;TR=17;WE=50964161;WS=50964143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr22	50964862	rs131804	G	A	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=2;PP=204;SC=CAGCGCCCTGGGCCTGAGTCC;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=6;TCR=2;TR=8;WE=50964870;WS=50964852;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chr22	50965573	.	G	C	308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=0;PP=254;SC=CGCTTGCCCAGGGAAAGGCCA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=50965581;WS=50965563;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chr22	50966914	rs470119	T	C	756.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=10;PP=640;SC=CAACCTGGATTAATGACTGAT;SOR=1.270;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=15;TCR=10;TR=25;WE=50966922;WS=50966904;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr22	50988062	rs140519	G	T	2773.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.96;NF=37;NR=47;PP=2169;SC=GCGACATCGTGGCACTGGGGG;SOR=0.972;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=37;TCR=47;TR=84;WE=50988070;WS=50988052;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chr22	50988193	rs131779	A	G	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=25;NR=22;PP=1039;SC=GCCCCACTGCACTGCACCACC;SOR=0.952;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=25;TCR=22;TR=47;WE=50988201;WS=50988183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chr22	51009953	rs470117	C	T	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=20;PP=767;SC=TAGGAACTCTCGATGACCGCC;SOR=1.781;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=9;TCR=20;TR=29;WE=51009961;WS=51009943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chr22	51010788	rs131761	T	A	965.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=21;PP=772;SC=TGTCCAGAGGTGCCTGACCTG;SOR=1.839;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=9;TCR=21;TR=30;WE=51010796;WS=51010778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chr22	51011936	rs131760	T	C	1277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=6;PP=1016;SC=AGTCCCTTCCTAGAGGCCAAT;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=38;WE=51011944;WS=51011926;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chr22	51015210	rs140515	G	C	799.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=622;SC=TGCCTCTCCCGTCTAGCTCAG;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=51015218;WS=51015200;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chr22	51015481	rs131759	G	A	635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=18;PP=568;SC=AGAGGGGCAAGGGCTGCAGGG;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=51015489;WS=51015471;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chr22	51018579	rs140514	A	G	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=9;PP=516;SC=CAAGAGCCCTATGGGAACAGA;SOR=0.804;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=9;TCR=9;TR=18;WE=51018587;WS=51018569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chr22	51020668	rs86337	C	A	92.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=1;PP=48;SC=GGCGCTCACACCCCCCTCACC;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=51020676;WS=51020658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chr22	51042032	rs6010025	G	T	3735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.56;SOR=0.961;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chr22	51042032	.	GCC	TCG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;FR=1.0000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=42;NR=34;PP=2947;QD=20;SC=CCTCAGGACCGCCGTCATGTA;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=82;TCF=47;TCR=35;TR=76;WE=51042042;WS=51042022;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,76:0.93:82
chr22	51042034	rs6009938	C	G	3735.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.95;SOR=0.815;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chr22	51042513	rs140511	C	CG	835.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.79;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chr22	51043278	rs3219201	G	A	690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=8;PP=584;SC=TGGTGGATGAGCACACGCAGC;SOR=1.230;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=21;TCF=13;TCR=8;TR=21;WE=51043286;WS=51043268;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chr22	51045190	rs1140555	C	T	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=18;PP=570;SC=GAGGAGGGCCCGAGGTGGGAG;SOR=3.258;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=22;TCF=3;TCR=19;TR=21;WE=51045198;WS=51045180;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chr22	51045433	rs131736	C	T	751.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=23;PP=637;SC=AGAGTCTGACCGTCCCCGAGT;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=51045441;WS=51045423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr22	51045480	rs131735	G	A	122.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=5;PP=92;SC=GAGTCCAACCGCCCCCTGAGT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=51045488;WS=51045470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chr22	51048781	rs5770941	T	G	473.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=12;PP=397;SC=GGGTGCAGGGTTACGGAGGTG;SOR=2.448;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=51048789;WS=51048771;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chr22	51063987	rs762674	G	C	2201.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=27;PP=1689;SC=CGGGGGGAGGGATCCACGGGG;SOR=1.211;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=67;TCF=40;TCR=27;TR=67;WE=51063995;WS=51063977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chr22	51064141	rs762673	G	A	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=42;PP=1248;SC=ACGGGGCGGGGCAGGCCCCAA;SOR=4.047;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=6;TCR=42;TR=48;WE=51064149;WS=51064131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chr22	51064818	rs762672	T	C	231.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=8;PP=182;SC=GTGCCCAGCATGAGCCCGGCA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=1;TCR=8;TR=9;WE=51064826;WS=51064808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr22	51113001	.	CCG	C	47.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=23.85;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chr22	51117137	rs9616914	G	A	2294.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=1.094;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=40;NR=33;PP=1877;ReadPosRankSum=1.357;SC=GAGTGGAGTCGGGGAGGGGCA;SOR=0.326;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=75;TCF=42;TCR=33;TR=73;WE=51117145;WS=51117127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,72:0.99:73
chr22	51117580	rs9616915	T	C	1915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=26;PP=1447;SC=CAGCTGGGGATCACCGACGAG;SOR=0.933;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=33;TCR=26;TR=59;WE=51117588;WS=51117570;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chr22	51117841	.	T	C	2962	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.52;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=142;MMLQ=24;MQ=55.79;NF=2;NR=15;PP=2962;QD=20;SC=TGCACATCTGTGCCCTCTACA;SbPval=0.99;Source=Platypus;TC=66;TCF=26;TCR=40;TR=17;WE=51117849;WS=51117816;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:49,17:0.26:66
chr22	51133518	rs13055562	G	A	288.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=210;SC=TGGGAGGGTGGGGTGCCGGGA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=51133526;WS=51133508;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr22	51135545	rs9616818	T	C	260.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=3;PP=217;SC=AGTGGAGGAGTGAGAGCTCAG;SOR=2.093;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=10;WE=51135553;WS=51135535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chr22	51137249	rs1557620	T	C	762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=13;PP=540;SC=ACCCCACGGCTCCCCGGGCAG;SOR=1.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=22;TCF=9;TCR=13;TR=22;WE=51137257;WS=51137239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chr22	51182485	rs6009961	A	G	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.26;QD=32.89;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	2699968	rs2306737	A	G	984.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=2;PP=724;SC=AGACAATGGCAATCTATAAAC;SOR=4.863;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=32;TCF=30;TCR=2;TR=32;WE=2699976;WS=2699958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chrX	2700027	rs2306736	T	C	2548.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=25;PP=1946;SC=ATAGTCACGCTGATGAGCTTG;SOR=1.759;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=78;TCF=53;TCR=25;TR=78;WE=2700035;WS=2700017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chrX	2715425	rs4484858	A	G	1894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=43;PP=1467;SC=TGGGCATGCGATGGTGGGTGG;SOR=2.157;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=15;TCR=43;TR=58;WE=2715433;WS=2715415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chrX	2724760	rs3749988	T	C	1309.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=0;PP=1026;SC=GGCTATAGACTCAACTCTCGT;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=37;WE=2724768;WS=2724750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chrX	2726396	rs6567645	A	G	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=689;SC=GTATGTATATAAAGTAGCTCC;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=2726404;WS=2726386;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	2729540	rs11439714	T	TA	1222.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.494;HP=11;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.450;NF=4;NR=40;PP=780;ReadPosRankSum=0.681;SC=AAGCCTGATTTAAAAAAAAAA;SOR=1.727;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=53;TCF=5;TCR=48;TR=44;WE=2729548;WS=2729530;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,51:0.93:55
chrX	2732166	rs5939337	A	T	106.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=3;NR=1;PP=84;SC=TCTTTTTTTTAAAATAGATTT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=2732174;WS=2732160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	2732356	rs34201156	C	CT	502.92	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.254;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=26;MQRankSum=0.000;NF=8;NR=13;PP=359;ReadPosRankSum=1.814;SC=TTTAATAAGACTTTTTTTTTT;SOR=0.874;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=25;TCF=11;TCR=14;TR=21;WE=2732364;WS=2732346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:4,22:0.85:26
chrX	2748051	rs57068689	T	C	2000.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=51;NR=11;PP=1697;SC=GGGGTGACACTGGCGGGGCCT;SOR=3.021;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=62;TCF=51;TCR=11;TR=62;WE=2748059;WS=2748041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chrX	2748253	rs6642032	G	C	3290.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=77;PP=2683;SC=AGCTCAAGCTGCTTCAGTTCA;SOR=2.954;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=96;TCF=18;TCR=78;TR=95;WE=2748261;WS=2748243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chrX	2748292	rs6641656	C	G	2164.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=60;PP=1819;SC=GCTTGGGTGACAGATTGGTCT;SOR=6.901;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=62;TCF=1;TCR=61;TR=61;WE=2748300;WS=2748282;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chrX	2774478	rs5939132	A	G	2032.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=56;NR=15;PP=1445;SC=CACATCTCGCATTCTTGGAGT;SOR=2.568;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=71;TCF=56;TCR=15;TR=71;WE=2774486;WS=2774468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chrX	2777985	rs2306734	C	T	2626.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=52;PP=2187;SC=CAAGGCTCAGCGTCCAGCAGC;SOR=1.153;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=88;TCF=36;TCR=52;TR=87;WE=2777993;WS=2777975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chrX	2779570	rs2306735	A	G	650.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=7;PP=516;SC=CAGCTTTGCCACAGTGATGTG;SOR=1.708;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=22;WE=2779578;WS=2779560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	2832739	rs34494682	C	T	3311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.16;SOR=0.832;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chrX	2832742	rs211648	G	C	3370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.21;SOR=0.744;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chrX	2833506	rs211649	G	C	468.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=391;SC=TTTATTGCAAGTTGGTTCATA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=2833514;WS=2833496;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	2833856	rs211650	T	C	685.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=20;PP=548;SC=CCTTCTGAGTTCATCAGTGGG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=2833864;WS=2833846;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	2847133	rs3747394	A	G	438.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=5;PP=326;SC=TACATTTTGGAGACTACAAGG;SOR=1.329;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=14;TCF=9;TCR=5;TR=14;WE=2847141;WS=2847123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	2847157	rs3747395	C	G	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=7;PP=423;SC=CGGACACAACCACGCCCTTTA;SOR=1.179;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=11;TCR=7;TR=18;WE=2847165;WS=2847147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	2852951	rs11222	G	A	487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=5;PP=447;SC=GTCTCCAGATGTTGCCCAGCC;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=18;TCF=13;TCR=5;TR=18;WE=2852959;WS=2852941;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	2856155	rs35143646	C	T	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=15;NR=8;PP=562;SC=GGCACCTCGCCGCCCGCCAGC;SOR=1.721;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=15;TCR=8;TR=23;WE=2856163;WS=2856145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	2867413	rs17325750	C	T	2755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=26;PP=2094;SC=TGGGCTGCTCCGTGATGGTGT;SOR=1.582;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=78;TCF=52;TCR=26;TR=78;WE=2867421;WS=2867403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chrX	2871011	rs211640	G	C	644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=2;PP=514;SC=TATTTCTTGAGTATCTACTTT;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=2871019;WS=2871001;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	2877835	rs211636	G	A	337.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=223;SC=GGTGGCTCATGCCCATTATCT;SOR=2.670;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=2877843;WS=2877825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	2877876	rs211637	T	C	275.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=9;PP=195;SC=GTGGGAGCATTGCCTGAGCCC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=2877884;WS=2877866;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	2878296	rs5982940	T	C	311.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=34.83;QD=44.54;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	2878304	rs12836850	C	T	311.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=32.96;QD=38.97;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	2928170	rs77183343	C	T	1616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=0.907;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=35;PP=1362;ReadPosRankSum=-0.850;SC=CCTTCCTGACCGGCCGGTACC;SOR=0.544;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=56;WE=2928178;WS=2928160;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,52:0.98:53
chrX	2933233	rs142811205	G	A	2838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=36;PP=2249;SC=AAGTTCGCCCGCTGGTTCTCA;SOR=1.130;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=54;TCR=36;TR=90;WE=2933241;WS=2933223;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chrX	2942251	rs144609105	G	A	1376.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=35;PP=1157;SC=AGTCTCTATTGGCTTTGTGTT;SOR=3.056;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=7;TCR=35;TR=42;WE=2942259;WS=2942241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	2951348	rs61978642	A	G	1225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=33;PP=954;SC=TTTGGAAACCATGGCTGCAGC;SOR=3.967;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=36;TCF=3;TCR=33;TR=36;WE=2951356;WS=2951338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chrX	2951434	rs5939155	C	G	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=12;PP=348;SC=TGAGACCATGCGGACCACGTG;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=2951442;WS=2951424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	2976686	rs142158924	G	A	2036.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=53;PP=1614;SC=TTGAGGCCAGGAGTTCAAAAC;SOR=5.353;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=56;TCF=3;TCR=53;TR=56;WE=2976694;WS=2976676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chrX	2976715	rs139867250	G	A	1745.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=46;PP=1408;SC=GCAATATAGGGAGACCTTGTC;SOR=5.630;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=48;WE=2976723;WS=2976705;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chrX	2986061	.	CTT	C	843.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.068;ClippingRankSum=0.000;DP=42;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.32;MQRankSum=-0.350;QD=27.22;ReadPosRankSum=-1.517;SOR=5.486;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,30:0.97:31
chrX	2990320	rs201026706	C	CT	2535.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.198;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.221;NF=0;NR=87;PP=2118;ReadPosRankSum=0.288;SC=TTTGTTGGGACTTTTTTTTAA;SOR=5.464;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=113;TCF=1;TCR=112;TR=87;WE=2990328;WS=2990310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,92:0.98:94
chrX	2999141	rs5983001	G	A	783.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=639;SC=TCTTGGAAACGCTGTATTTTA;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=2999149;WS=2999131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	3002219	rs5983002	T	C	1295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=1;PP=998;SC=CTCACATGGTTTTTGCAATGT;SOR=5.084;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=37;WE=3002227;WS=3002209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chrX	3002687	rs5983003	A	G	1604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=32;PP=1212;SC=TGGTGAAGGAAGCGATTTCCT;SOR=1.565;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=15;TCR=32;TR=47;WE=3002695;WS=3002677;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chrX	3007480	rs2290453	G	T	2479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=69;NR=8;PP=2032;SC=CAAAACAATAGTTTTCACATT;SOR=4.147;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=77;TCF=69;TCR=8;TR=77;WE=3007488;WS=3007470;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chrX	3190121	rs200918211	CGT	C	58.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.399;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.859;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=0.000;NF=4;NR=1;PP=132;ReadPosRankSum=0.700;SC=GCTTAATGAGCGTGTGTGTGT;SOR=0.083;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=24;TCF=21;TCR=3;TR=5;WE=3190130;WS=3190111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,5:0.23:22
chrX	3573308	.	C	T	4428.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=2.047;ClippingRankSum=0.000;DP=141;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=54;NR=83;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.246;SC=TGCAGGTACTCGATGGCACAG;SOR=1.138;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=139;TCF=55;TCR=84;TR=137;WE=3573316;WS=3573298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,138:0.99:140
chrX	3736489	rs1133336	C	T	2277.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=17;PP=1774;SC=TCACCAACAGCGTATAAGCAA;SOR=2.271;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=52;TCR=17;TR=68;WE=3736497;WS=3736479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chrX	6975782	rs868756	C	G	3202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=68;NR=28;PP=2631;SC=CAGTTGATTACACAGAAGGAG;SOR=1.921;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=96;TCF=68;TCR=28;TR=96;WE=6975790;WS=6975772;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chrX	6995315	rs2379206	C	T	1498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=10;PP=1230;SC=GGAAGATGTCCGGGTCTGGCT;SOR=2.303;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=44;TCF=34;TCR=10;TR=44;WE=6995323;WS=6995305;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chrX	6995417	rs2379207	C	T	2768.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=47;NR=42;PP=2302;SC=TATCGAACGACGCGGACCCCG;SOR=0.784;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=89;TCF=47;TCR=42;TR=89;WE=6995425;WS=6995407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
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chrX	7023678	rs1131197	G	A	373.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=0;PP=340;SC=GAGCGCAGCCGTGGGGAACAC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=7023686;WS=7023668;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	7066051	rs1473666	A	C	2618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=22;PP=2105;SC=CCACGCCCACACAAGACCGCC;SOR=1.981;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=60;TCR=22;TR=82;WE=7066059;WS=7066041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chrX	7243304	rs4403552	G	A	2021.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=11;PP=1579;SC=CATTGAGCACGAAAGAGTCCA;SOR=2.833;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=50;TCR=11;TR=61;WE=7243312;WS=7243294;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chrX	7890215	rs1183732	C	T	938.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=18;PP=682;SC=ACTTGGGATTCTATAGACCCA;SOR=1.214;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=11;TCR=18;TR=29;WE=7890223;WS=7890205;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chrX	8270569	.	AAAAG	A	1435.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=79;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.37;QD=41.02;SOR=4.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chrX	8467201	.	A	AAG	3208.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=76;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.78;SOR=4.949;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chrX	8467239	rs372703313	AAAAG	A	4409.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=128;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.80;QD=43.23;SOR=2.397;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chrX	8475698	rs2098137	T	G	1234.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=38;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=1;PP=1172;SC=AATGAAAGAATAAAGAAAAAG;SOR=5.943;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=48;TCF=47;TCR=1;TR=46;WE=8475706;WS=8475688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chrX	8475724	rs202057305	C	CAAAGAAAGAAAAAG	3698.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.41;QD=68.50;SOR=3.342;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chrX	8501120	rs41303179	C	A	1324.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=32;PP=1078;SC=ATATGTCAGTCACATCCATTT;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=39;WE=8501128;WS=8501110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	8503641	rs809446	G	A	2251.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=26;PP=1889;SC=CGGAAGGCAGGATCTGGGACT;SOR=1.418;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=46;TCR=26;TR=72;WE=8503649;WS=8503631;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chrX	8504773	rs808120	G	T	896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=0;PP=794;SC=TGCTGACACCGTAGACCTAGA;SOR=6.593;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=24;WE=8504781;WS=8504763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	8504833	rs808119	C	T	1860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=5;PP=1518;SC=AGGCAGCCAACAGGCTTGTGG;SOR=4.066;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=52;TCR=5;TR=57;WE=8504841;WS=8504823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chrX	9661133	rs191596602	C	T	1520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=4;PP=1210;SC=CGAGCTGCTTCGGTGCTGCCG;SOR=3.958;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=44;TCF=40;TCR=4;TR=44;WE=9661141;WS=9661123;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chrX	9729001	rs12560076	G	A	311.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.34;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	9859098	rs6640543	A	G	2225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=45;NR=35;PP=1730;SC=CGGCCTCCCCATTCACCTCCA;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=80;TCF=45;TCR=35;TR=80;WE=9859106;WS=9859088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chrX	9859197	rs6640544	A	G	2123.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=42;PP=1563;SC=AGCCTTCTGCAGGGAGCGCAC;SOR=1.257;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=28;TCR=42;TR=70;WE=9859205;WS=9859187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chrX	9866085	rs2073943	T	C	492.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=3;PP=395;SC=GAAGTGGACGTGGGGTCTTAT;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=9866093;WS=9866075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	9866420	rs2073944	T	C	489.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=17;PP=421;SC=CATGGCTAGATGTCTGGCTTT;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=9866428;WS=9866410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	9914947	rs2073942	G	C	1596.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=37;PP=1146;SC=AGTGCTTATTGGACAGCCTTC;SOR=1.877;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=52;TCF=15;TCR=37;TR=52;WE=9914955;WS=9914937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chrX	9917545	rs17321225	C	T	931.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.276;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.046;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=11;NR=21;PP=754;ReadPosRankSum=-0.671;SC=CCTCACCATACGTCAGATTCT;SOR=1.051;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=33;TCF=12;TCR=21;TR=32;WE=9917553;WS=9917535;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chrX	9935526	rs5934730	G	T	5490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=108;NR=53;PP=2965;SC=AAGACACCTCGCTCTACCCCC;SOR=1.667;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=161;TCF=108;TCR=53;TR=161;WE=9935534;WS=9935516;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,167:1.00:167
chrX	9935844	rs5934731	C	T	3293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=52;PP=2723;SC=TCCAGAACTACGATGCCGTCA;SOR=0.884;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=99;TCF=47;TCR=52;TR=98;WE=9935852;WS=9935834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chrX	10062079	rs5934746	T	A	2322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=12;PP=1897;SC=TAATAAATAATGCAGCAGACC;SOR=2.964;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=69;TCF=56;TCR=13;TR=68;WE=10062087;WS=10062069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chrX	10062163	rs5934747	G	C	4841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=146;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=82;NR=58;PP=2965;SC=TTGTCTCATTGTGTTCCAGAG;SOR=1.148;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=140;TCF=82;TCR=58;TR=140;WE=10062171;WS=10062153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,146:1.00:146
chrX	10085674	rs6530368	T	C	3118.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=50;NR=63;PP=2277;SC=TCCCCGGGGATGGGGAAGGGC;SOR=0.881;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=113;TCF=50;TCR=63;TR=113;WE=10085682;WS=10085664;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,114:1.00:114
chrX	10109658	.	TA	T	160.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.734;ClippingRankSum=0.000;DP=37;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.74;ReadPosRankSum=0.731;SOR=0.117;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:16,12:0.43:28
chrX	10166198	rs2240019	A	C	448.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=13;PP=366;SC=TTTTACTTCTACTAACTCATT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=10166206;WS=10166188;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	11313027	rs946252	T	C	1864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=43;PP=1473;SC=AAAAATCTGCTCATAGTTGGT;SOR=2.794;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=55;TCF=11;TCR=44;TR=54;WE=11313035;WS=11313017;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chrX	11786839	rs2525868	T	C	1028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=21;PP=795;SC=ATGGTTCCTTTATTTGTGATT;SOR=2.093;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=29;WE=11786847;WS=11786829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chrX	12628049	rs2304604	T	C	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=23;PP=672;SC=TCTGCCACACTCTGCCAGAAT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=12628057;WS=12628039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	12633034	rs6654760	T	C	540.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=12;PP=426;SC=CCTGTTCTGCTTTGAAGGCTG;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=12633042;WS=12633024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	12722616	rs4469660	C	G	2499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=55;PP=2001;SC=TATCACATTTCCATCTTAAAA;SOR=2.103;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=20;TCR=55;TR=75;WE=12722624;WS=12722606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chrX	12725041	.	TC	T	87	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.16;FR=0.5000;HP=2;HapScore=3;MGOF=2;MMLQ=19;MQ=61.03;NF=1;NR=12;PP=87;QD=10.4639153746;SC=AGTGGTAATTTCTTTTTTTTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=15;TCR=21;TR=13;WE=12725049;WS=12725030;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:23,13:0.36:36
chrX	12828084	rs201390974	CAAAAG	C	253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=290;SC=TTTAAAAAAACAAAAGAAAAC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=7;WE=12828096;WS=12828074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	12837558	rs5935399	C	T	562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=0;PP=476;SC=GCTACATTCCCAAAATACAAC;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=12837566;WS=12837548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	12838934	rs917580	A	G	2193.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=43;PP=1866;SC=TACTGTCTATACACCAAAGGC;SOR=1.352;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=69;TCF=26;TCR=43;TR=69;WE=12838942;WS=12838924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chrX	12904662	rs5743780	G	A	3838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=75;PP=2965;SC=TCATCCAATTGGATCTGTCTT;SOR=1.757;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=37;TCR=75;TR=112;WE=12904670;WS=12904652;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chrX	12937513	rs2159377	C	T	5028.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=73;NR=80;PP=2965;SC=ATATCACAGACGGGGCATTCC;SOR=0.785;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=153;TCF=73;TCR=80;TR=153;WE=12937521;WS=12937503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chrX	12937804	rs5744080	C	T	7132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=229;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=122;NR=98;PP=2965;SC=CTCTTTCACACGTGCCACCCA;SOR=0.967;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=221;TCF=122;TCR=99;TR=220;WE=12937812;WS=12937794;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,228:1.00:228
chrX	12939112	rs2407992	G	C	5690.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=83;NR=86;PP=2965;SC=TTAATAGGCTGAAGCACATCC;SOR=0.716;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=170;TCF=84;TCR=86;TR=169;WE=12939120;WS=12939102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chrX	12939412	rs3747414	C	A	5430.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=93;NR=70;PP=2965;SC=TAAAAACAATCAACAAATCCG;SOR=0.987;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=163;TCF=93;TCR=70;TR=163;WE=12939420;WS=12939402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,168:1.00:168
chrX	12939928	rs2109135	T	C	3684.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=56;NR=54;PP=2846;SC=GGGATTGGGATCCGGGATTGG;SOR=0.818;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=110;TCF=56;TCR=54;TR=110;WE=12939936;WS=12939918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chrX	12994867	rs138495959	CT	C	101.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.692;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=5.09;ReadPosRankSum=1.228;SOR=0.467;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chrX	13337059	rs4830842	C	T	3158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=72;NR=21;PP=2526;SC=CTGTACTGTGCCTTCACTGAT;SOR=2.478;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=94;TCF=73;TCR=21;TR=93;WE=13337067;WS=13337049;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chrX	13337115	rs17322143	C	T	4116.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=58;PP=2965;SC=TTGTTGTTGGCCTTTCGTGTA;SOR=0.973;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=134;TCF=76;TCR=58;TR=134;WE=13337123;WS=13337105;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,135:1.00:135
chrX	13734539	rs2285633	T	C	871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=0;PP=749;SC=GAAACTTACATTTTCACCTGA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=27;TCF=27;TCR=0;TR=27;WE=13734547;WS=13734529;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chrX	13734919	rs35084098	C	CTTTG	499.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=266;SC=TGCTTTTATACTTTGTTATTG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=5;WE=13734927;WS=13734909;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	13758375	rs2238908	G	A	3261.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=79;PP=2678;SC=CGTCCAGTGTGACTCTCTGTG;SOR=2.595;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=101;TCF=22;TCR=79;TR=101;WE=13758383;WS=13758365;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chrX	13769593	rs3214141	GA	G	554.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=0;NR=22;PP=347;SC=TTTAGTGTTTGAAAAAAAAAA;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=1;TCR=25;TR=22;WE=13769601;WS=13769583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	13771576	rs3815049	A	G	1322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=17;PP=1047;SC=GTTTGGGGGGAAAATAAGCTG;SOR=1.127;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=25;TCR=17;TR=42;WE=13771584;WS=13771566;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	13775752	rs36052228	AT	A	241.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=16;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=20;NF=11;NR=0;PP=144;SC=AATGACTAGGATTTTTTTTTT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=11;WE=13775760;WS=13775742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	13779409	rs112117780	A	AT	303.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=0;NR=11;PP=193;SC=TTTTACTGGGATTTTTTTTTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=11;WE=13779417;WS=13779399;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	13803960	rs5978663	C	T	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=32;PP=1044;SC=ATAGCCGTTACGGGCAAGAAC;SOR=2.948;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=39;WE=13803968;WS=13803950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	13956749	.	G	GGCTGC	808.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=5;NR=7;PP=680;SC=GGCTTCTGCGGGCTGCGCTGC;SOR=1.292;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=12;WE=13956757;WS=13956739;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	14599230	rs2074210	A	G	449.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=1;PP=338;SC=AATCAGGGAGAAGAATGAGAG;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=14599238;WS=14599220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	14599572	rs2074211	A	G	1304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=34;PP=1087;SC=CCATTTCTCCACTAATGTAGA;SOR=4.021;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=38;TCF=4;TCR=34;TR=38;WE=14599580;WS=14599562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	14622665	.	AGTGTGTGT	A	281	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=0.9998;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=23;MQ=58.58;NF=1;NR=1;PP=281;QD=142.0;SC=GACAAACCAAAGTGTGTGTGT;SbPval=0.15;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=2;WE=14622680;WS=14622655;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:11,2:0.15:13
chrX	14625399	rs377596384	C	CT	540.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.412;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=3.142;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.62;MQRankSum=-0.853;QD=12.58;ReadPosRankSum=-2.229;SOR=2.038;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:12,31:0.72:43
chrX	14627144	rs2229963	T	C	892.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=-0.155;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=12;PP=674;ReadPosRankSum=-0.810;SC=TCAAGTTTCATCTGGAACGCC;SOR=0.481;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=33;TCF=21;TCR=12;TR=32;WE=14627152;WS=14627134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,34:0.97:35
chrX	14868806	rs2905223	A	G	611.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=3.250;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=18;PP=449;ReadPosRankSum=2.252;SC=TCTAAAAAAAAAAGTTTAAAT;SOR=0.399;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=28;TCF=6;TCR=22;TR=24;WE=14868814;WS=14868796;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,25:0.86:29
chrX	14930353	rs11400370	C	CT	615.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=21;NR=1;PP=470;SC=AATAGTTATCCTTTTTTTTTG;SOR=4.892;SbPval=0.76;Source=Platypus;TC=31;TCF=29;TCR=2;TR=22;WE=14930361;WS=14930343;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	15333842	rs4830529	T	A	198.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=101;SC=GTTACCGAGATCTCTGTAGGT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=15333850;WS=15333832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
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chrX	15552564	rs1877752	T	C	852.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=24;PP=578;SC=TAGGGAACCATGAAAGTAGGA;SOR=3.981;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=27;TCF=3;TCR=24;TR=27;WE=15552581;WS=15552554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chrX	15552573	rs34879154	G	GA	729.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=723;SC=ATGAAAGTAGGAAAAAATCCT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=22;WE=15552581;WS=15552554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	15554602	rs28505625	T	G	720.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=26;PP=681;SC=ATTTTTTATTTAAATATATGG;SOR=4.977;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=15554610;WS=15554592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	15591684	rs11340646	AT	A	99	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.160;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.66;MQRankSum=1.231;QD=9.00;ReadPosRankSum=0.230;SOR=2.494;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,9:0.82:11
chrX	15596143	rs113691336	C	CATAAG	1437.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=0;PP=1407;SC=ATATTTCCTACATAATAAATA;SOR=6.736;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=24;TCR=0;TR=23;WE=15596151;WS=15596133;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	15607650	rs971249	T	C	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=31;PP=948;SC=ACAAAATACATAGATTAGCCT;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=32;WE=15607658;WS=15607640;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	15610348	rs2285666	C	T	1024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=7;PP=914;SC=AATTAGTAGCCTACCTGGTTC;SOR=2.165;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=24;TCR=7;TR=31;WE=15610356;WS=15610338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chrX	15662935	rs5936000	T	C	1139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=0;PP=879;SC=TAATAAATAATTCATGTATGA;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=15662943;WS=15662925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chrX	15677300	.	CCT	C	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=1.724;ClippingRankSum=0.000;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=4;PP=84;ReadPosRankSum=-0.546;SC=AGTGGCTCTCCCTCTCTCTCT;SOR=0.105;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=1;TCR=20;TR=4;WE=15677309;WS=15677290;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,3:0.21:14
chrX	15706830	rs4060	C	A	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.40;QD=30.09;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	15711209	rs1996225	C	T	2185.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=2.686;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=9.390;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.498;NF=7;NR=70;PP=1783;ReadPosRankSum=-0.619;SC=CTTTAAATGACGTGTTGTATT;SOR=3.521;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=96;TCF=9;TCR=87;TR=77;WE=15711217;WS=15711199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,72:0.95:76
chrX	15792527	rs4364812	T	A	527.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.79;QD=32.99;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	15794764	rs5980183	G	A	283.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.44;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=7;NR=0;PP=152;SC=CCTGAGAACCGTCACCTCGGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=15794772;WS=15794754;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	15794815	rs5936050	G	A	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=17;NR=3;PP=548;SC=ATAATGACTCGGTTATCTCTT;SOR=2.737;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=21;TCF=18;TCR=3;TR=20;WE=15794823;WS=15794805;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	15808795	rs4830994	T	C	1172.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=30;PP=975;SC=TGGTGCGCGCTCTGGTGCCCT;SOR=2.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=6;TCR=30;TR=36;WE=15808803;WS=15808785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chrX	15822072	rs200821812	G	A	199.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.512;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=6.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.56;MQRankSum=-1.066;QD=5.40;ReadPosRankSum=-2.459;SOR=2.720;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,16:0.43:37
chrX	16168467	rs4986945	T	C	3500.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=38;PP=2698;SC=TCCAGGCCTCTCATGCCCTGA;SOR=1.423;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=102;TCF=64;TCR=38;TR=102;WE=16168475;WS=16168457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chrX	16168677	rs4986946	T	C	4888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=66;NR=86;PP=2965;SC=TCTACGTCATTCCACTGTCGA;SOR=1.056;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=154;TCF=67;TCR=87;TR=152;WE=16168685;WS=16168667;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chrX	16189670	rs12839379	G	A	340.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=282;SC=TGTCTACCGCGTGTTCCTTTG;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=16189678;WS=16189660;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	16608793	rs1527805	G	A	2678.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=72;NR=7;PP=2104;SC=CCTGTGAGGCGAGTCCTATAA;SOR=4.461;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=79;TCF=72;TCR=7;TR=79;WE=16608801;WS=16608783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chrX	16762002	rs4830562	A	G	1299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=35;PP=1019;SC=CATGGCCTCCATTATGTGCTC;SOR=4.073;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=38;WE=16762010;WS=16761992;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	16852327	rs3747367	A	C	545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=0;PP=455;SC=AGAAGGATGAAGCCTAACTCT;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=16852335;WS=16852317;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	16859628	rs5924530	G	A	2669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=27;PP=2237;SC=GGGCTCTTCAGACAGAAAGGA;SOR=1.445;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=80;TCF=53;TCR=27;TR=80;WE=16859636;WS=16859618;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chrX	16872015	rs11305571	AT	A	617.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.882;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.401;NF=1;NR=27;PP=394;ReadPosRankSum=0.465;SC=TAAGAGACTGATTTTTTTTTT;SOR=3.126;SbPval=0.72;Source=Platypus;TC=44;TCF=2;TCR=42;TR=28;WE=16872023;WS=16872005;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chrX	16873058	rs5924532	A	C	1396.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=9;PP=1114;SC=AAGAAATAATACCATGAAGGT;SOR=2.935;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=35;TCR=10;TR=44;WE=16873066;WS=16873048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chrX	16873108	rs150641871	GTT	G	856.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.656;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=4.985;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.14;MQRankSum=0.526;QD=22.55;ReadPosRankSum=-0.297;SOR=1.613;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:5,33:0.87:38
chrX	16876980	rs4828536	G	A	2427.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=63;PP=1929;SC=ATTCTAATGTGAGGAGAAAGA;SOR=4.265;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=7;TCR=63;TR=70;WE=16876988;WS=16876970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chrX	17070688	rs933946	G	A	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=12;PP=294;SC=GACTACAGGAGTGAATACAAC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=17070696;WS=17070678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	17092152	rs1346246	G	T	1765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=44;NR=7;PP=1414;SC=ACATTTACCTGTTGATGTGTT;SOR=3.570;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=44;TCR=7;TR=51;WE=17092160;WS=17092142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chrX	17157148	rs1946395	T	A	1506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=38;PP=1213;SC=AGCTTTTTTTTAATTTAATAG;SOR=3.516;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=5;TCR=38;TR=43;WE=17157156;WS=17157138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chrX	17167204	rs12557633	C	T	631.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=17;PP=461;SC=GAATCTATTCCGTGCATATTT;SOR=4.615;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=17167212;WS=17167194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	17705850	rs5901624	C	CT	4607.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=136;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=45;NR=53;PP=2971;SC=CGCCCTGTTTCTTGTCTTGCA;SOR=0.978;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=48;TCR=57;TR=98;WE=17705858;WS=17705840;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,133:1.00:133
chrX	17818823	.	C	T	2775.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=49;NR=35;PP=2252;SC=TGACCTTGGCCGCCTGGGACT;SOR=1.065;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=85;TCF=50;TCR=35;TR=84;WE=17818831;WS=17818813;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chrX	17819377	rs6527818	T	C	3360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=44;PP=2601;SC=CTCTGAGGCATCGGGATGGGG;SOR=1.002;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=62;TCR=44;TR=106;WE=17819385;WS=17819367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chrX	18582646	rs371996193	GAT	G	112.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.183;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.89;ReadPosRankSum=0.153;SOR=0.092;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:31,8:0.21:39
chrX	18597869	rs4825261	C	A	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=0;PP=523;SC=AAAAAAAGCTCTGTATTGGAT;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=18597877;WS=18597859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	18638204	rs3752484	T	A	173.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=5;PP=109;SC=CTTGACATTTTTGCACTGTAT;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=18638212;WS=18638194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	18671795	rs56396491	AT	GA	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=22;PP=1259;SC=TGTTGTTAAGATCAAAAACCA;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=22;WE=18671804;WS=18671785;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	18779721	rs2269584	A	G	838.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=19;PP=661;SC=CTAAATATTAACATTTTTCTT;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=6;TCR=19;TR=25;WE=18779729;WS=18779711;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	18844012	rs2273247	G	A	1218.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=31;PP=955;SC=TGTATGTTGGGGATACAAAAT;SOR=3.145;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=6;TCR=31;TR=37;WE=18844020;WS=18844002;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	18929128	rs11291764	CT	C	722.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.49;MQRankSum=2.185;QD=20.08;SOR=3.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,35:0.97:36
chrX	19041592	rs5909263	C	T	1281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=18;NR=15;PP=864;SC=ACAAAAAACACGTATACACAT;SOR=0.892;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=33;TCF=18;TCR=15;TR=33;WE=19041600;WS=19041582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	19058405	rs6633185	C	T	598.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=18;PP=506;SC=TAAAATTGTACTATATTAAGG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=18;WE=19058413;WS=19058395;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	19688957	.	CA	C	240.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.909;ClippingRankSum=0.000;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=1.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.67;MQRankSum=0.911;QD=3.05;ReadPosRankSum=1.673;SOR=0.439;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:50,29:0.37:79
chrX	20070824	rs41311495	G	A	1065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=20;PP=777;SC=GCCGTGCCACGTTCCAAAGTC;SOR=1.418;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=10;TCR=20;TR=30;WE=20070832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chrX	21534509	rs3838943	A	AC	338.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=425;SC=CAATTATGTGACTTTTTTTTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=21534517;WS=21534499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	21861434	rs3213451	A	G	2345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=58;PP=1915;SC=TGCTTTACCAATGGTATTCTT;SOR=2.463;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=75;TCF=17;TCR=58;TR=75;WE=21861442;WS=21861424;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chrX	21874560	rs730678	C	T	469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=1;PP=410;SC=CGTTCTTTTTCCCACGGTCTT;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=21874568;WS=21874550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	21875821	rs11339991	TA	T	285.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=226;SC=CTAAGAGTTTTAAAAAAAAAT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=21875829;WS=21875811;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	21985464	rs3747276	C	T	1455.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=23;PP=1026;SC=GTTCTTCATACCTGGTCACTT;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=45;TCF=22;TCR=23;TR=45;WE=21985472;WS=21985454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chrX	21990455	rs7051872	G	C	1084.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=3;PP=866;SC=AGGGATAGTTGGTATGGGAGA;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=32;TCF=29;TCR=3;TR=32;WE=21990463;WS=21990445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	22002711	rs2239674	A	G	1308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.820;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=41;PP=1074;ReadPosRankSum=-1.296;SC=CTGCCACTCAATGAGTGAACT;SOR=5.330;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=0;TCR=43;TR=41;WE=22002719;WS=22002701;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,42:0.95:44
chrX	22051034	rs178710	A	G	149.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=4;NR=0;PP=92;SC=AAGAGCAAGAAAGCCTTGGAT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=22051042;WS=22051025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	23398214	rs5926304	T	C	2930.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.618;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=46;PP=2397;ReadPosRankSum=1.819;SC=CCATCCTGTGTTGCTCTATGC;SOR=0.271;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=90;TCF=42;TCR=48;TR=88;WE=23398222;WS=23398204;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,89:0.99:90
chrX	23682877	rs477914	T	C	1787.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=45;PP=1486;SC=GCTGGCATCATCTTTTTCATC;SOR=2.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=9;TCR=45;TR=54;WE=23682885;WS=23682867;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chrX	23682929	rs478051	G	A	948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=27;PP=776;SC=AGAAAGCAGAGTATACAGTGG;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=23682937;WS=23682919;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chrX	23682976	rs476316	A	G	464.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=12;PP=370;SC=GGAAAGGGGAAATTTTCTATC;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=23682984;WS=23682966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	23723261	rs2270142	T	C	2372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=58;PP=1962;SC=AATTGTTTCCTCTAACAACTA;SOR=2.681;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=74;TCF=15;TCR=59;TR=73;WE=23723269;WS=23723251;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chrX	23761386	rs5925605	C	G	669.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=17;PP=510;SC=GCCCGGGAGCCGGACAGCGGT;SOR=2.737;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=21;TCF=4;TCR=17;TR=21;WE=23761394;WS=23761376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	23761448	rs5925902	C	A	274.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=7;PP=195;SC=CTGTGCCGGGCGGACCCTACC;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=8;TCF=1;TCR=7;TR=8;WE=23761456;WS=23761438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	23801311	rs11550721	C	T	447.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=1;PP=347;SC=AGTCGCGGGCCGACTGGTGTT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=12;TCR=1;TR=13;WE=23801319;WS=23801301;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	23801593	rs3764885	A	G	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=16;PP=435;SC=CGTTTCCCAGAGTGGGGTGAT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=23801601;WS=23801583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	23801702	rs3764884	G	C	179.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=1;PP=145;SC=GCCCCATTCCGTTCCCCTGAG;SOR=2.303;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=5;TCR=1;TR=6;WE=23801710;WS=23801692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	23928489	rs2707164	C	T	557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=6;PP=420;SC=ACAAAAAGTTCGCAGAGTACA;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=19;WE=23928497;WS=23928479;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	23934202	rs2520230	A	G	114.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=88;SC=TTCATTACCAATTCTTTACAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=23934210;WS=23934192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	23945611	rs2707144	G	T	849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=33.99;SOR=6.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	24073761	rs36018672	C	T	1828.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=36;NR=20;PP=1126;SC=CACTTTCACACGAAGTTATCA;SOR=1.609;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=36;TCR=20;TR=56;WE=24073769;WS=24073751;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chrX	24084241	rs150782745	G	GT	484.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.000;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FS=8.158;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.72;MQRankSum=0.875;QD=16.71;ReadPosRankSum=2.197;SOR=0.069;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,24:0.83:29
chrX	24226039	.	G	C	1559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=36;PP=1290;SC=GCCAGTGTTTGAAATAAGTAG;SOR=2.400;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=11;TCR=36;TR=47;WE=24226047;WS=24226029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chrX	24536954	.	GCA	G	140.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=0;PP=156;SC=ATGCACATGTGCACACACACA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=5;WE=24536963;WS=24536944;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	24580746	rs1882403	A	G	199.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=6;PP=160;SC=ACCTACACTCATACCACATCC;SOR=2.584;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=7;TCF=1;TCR=6;TR=7;WE=24580754;WS=24580736;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	24593453	rs3833417	GA	G	2048.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.768;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.319;NF=2;NR=76;PP=1295;ReadPosRankSum=0.440;SC=AAGTTTACAGGAAAAAAAAAA;SOR=1.958;SbPval=0.81;Source=Platypus;TC=98;TCF=4;TCR=94;TR=78;WE=24593462;WS=24593443;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,88:0.98:90
chrX	24593513	rs3747401	T	G	1501.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=45;PP=1260;SC=CACATTAAAGTTCATATTTTA;SOR=7.701;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=45;TCF=0;TCR=45;TR=45;WE=24593521;WS=24593503;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chrX	24751958	rs4058344	T	C	612.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=10;PP=438;SC=ATATGAAGCATCTGTTTGTTT;SOR=0.784;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=10;TCR=10;TR=20;WE=24751966;WS=24751948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	24766651	rs3764770	G	A	915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=26;PP=751;SC=GAGTAAACAGGATGCTGGGCA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=26;TCF=0;TCR=26;TR=26;WE=24766659;WS=24766641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chrX	27766045	rs5926895	A	G	2166.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQ=59.94;NF=50;NR=22;PP=1795;SC=TGTTGTCTTCACCATTGACCT;SOR=1.810;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=50;TCR=22;TR=72;WE=27766053;WS=27766035;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chrX	27839572	rs1368769	T	C	2510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=54;NR=20;PP=2163;SC=AAGGATGTTTTCCAGAGTTCA;SOR=2.124;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=54;TCR=20;TR=74;WE=27839580;WS=27839562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chrX	27839617	rs12557898	G	A	2798.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=20;PP=2306;SC=CATGGACTTCGGGAAGCCCAA;SOR=2.414;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=85;TCF=64;TCR=21;TR=84;WE=27839625;WS=27839607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chrX	29417510	rs4829347	C	A	342.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=313;SC=GATATTTTTACTCTCTAAAGA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=29417518;WS=29417500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	30236878	rs2529541	G	A	1245.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=20;PP=997;SC=CATTCCCCAGGAGCCTCAGAG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=18;TCR=20;TR=38;WE=30236886;WS=30236868;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	30254361	rs2071308	G	A	1505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=21;PP=1091;SC=GTGCAGTCTCGCACAGACCCT;SOR=0.693;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=44;TCF=23;TCR=21;TR=44;WE=30254369;WS=30254351;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chrX	30254376	rs2071309	T	C	1384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=18;PP=1010;SC=GACCCTCTAATCATGAAGACA;SOR=0.829;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=21;TCR=18;TR=39;WE=30254384;WS=30254366;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chrX	30254530	rs2071310	A	G	1353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=22;PP=1178;SC=TGGAGGTGGTATTTGGTGTTG;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=20;TCR=22;TR=42;WE=30254538;WS=30254520;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chrX	30261002	rs2071311	A	G	2153.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=38;NR=30;PP=1949;SC=AAGATCTGGTACAGGAAAAAT;SOR=1.000;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=38;TCR=30;TR=68;WE=30261010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chrX	30261158	rs2856733	G	C	5655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=176;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=86;NR=79;PP=2965;SC=ACTTCCCACTGCTTTATGAAG;SOR=0.787;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=86;TCR=79;TR=165;WE=30261166;WS=30261148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chrX	30323916	rs3788891	T	G	554.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.37;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=3;PP=365;SC=AATTAGCAGTTGACCACTTGG;SOR=2.179;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=10;TCR=3;TR=13;WE=30323924;WS=30323906;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	30326983	rs2269345	C	T	2948.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=31;PP=2415;SC=CGCCCCCTGGCCGTGCCTCGG;SOR=1.538;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=93;TCF=62;TCR=31;TR=93;WE=30326991;WS=30326973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chrX	30577846	rs887369	A	C	3815.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=74;PP=2965;SC=ACTCATTCAGAACTGCATTAG;SOR=1.402;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=114;TCF=40;TCR=74;TR=114;WE=30577854;WS=30577836;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,119:1.00:119
chrX	30671896	rs12854653	G	C	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=17;PP=504;SC=GGATGCCCCAGCCAGGCCTGG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=1;TCR=17;TR=18;WE=30671904;WS=30671886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	30709444	rs55895067	G	A	150.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=151;SC=TCTTTTTCCCGGATAATTGAG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=30709452;WS=30709434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	30712796	rs5927587	G	C	694.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=21;PP=599;SC=AACAGGAGAAGTTTTCAGCTT;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=30712804;WS=30712786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	30715827	rs2035432	C	T	6117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=31.86;SOR=0.921;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chrX	30725794	rs4617310	C	T	425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=341;SC=TACTATTAAACAACTTTTAGT;SOR=3.912;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=14;TCF=1;TCR=13;TR=14;WE=30725802;WS=30725784;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	30742592	rs75486718	GA	G	304.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=1;PP=179;SC=TCTTCTTAATGAAAAAAAAAA;SOR=2.985;SbPval=0.9;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=11;WE=30742600;WS=30742582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	30745790	rs5927596	A	T	862.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=25;PP=702;SC=GAAAATCAATAAAAGGTCTAA;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=25;TCF=0;TCR=25;TR=25;WE=30745798;WS=30745780;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chrX	30872602	rs5927629	A	G	3841.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=66;PP=2891;SC=TGTTGATTCCATGGAGATGGT;SOR=0.788;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=58;TCR=66;TR=124;WE=30872610;WS=30872592;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chrX	30877477	.	CCA	C	35.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.887;ClippingRankSum=-0.000;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=4.47;ReadPosRankSum=-1.029;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chrX	31165667	rs200534475	AAAAG	A	1679.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.37;QD=41.99;SOR=4.021;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	31191589	rs2404496	C	T	1289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=4;PP=1041;SC=TTTAAAATATCATAGGTTAGC;SOR=3.967;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=34;TCR=4;TR=37;WE=31191597;WS=31191579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chrX	31191845	.	C	T	1212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=36;PP=1001;SC=ATAATGTATACATTTAGTTGC;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=36;TCF=0;TCR=36;TR=36;WE=31191853;WS=31191835;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chrX	31224684	rs2293668	A	G	3762.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=87;NR=21;PP=2910;SC=TACAGCATTAATATACACGAC;SOR=2.697;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=108;TCF=87;TCR=21;TR=108;WE=31224692;WS=31224674;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chrX	31224881	rs2293667	G	A	1825.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=46;PP=1385;SC=GAAAAATAAAGGAGTAAAGTG;SOR=5.136;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=48;TCF=2;TCR=46;TR=48;WE=31224889;WS=31224871;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chrX	31496350	rs1800280	C	T	3397.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=53;NR=47;PP=2627;SC=TTGAAGTTCCCGGAGTCTTTC;SOR=0.711;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=100;TCF=53;TCR=47;TR=100;WE=31496358;WS=31496340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chrX	31697636	rs1801188	A	G	3329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=-0.995;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=118;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.009;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=55;PP=2410;ReadPosRankSum=0.824;SC=TTAACATTTCATTCAACTGTT;SOR=0.141;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=50;TCR=57;TR=105;WE=31697644;WS=31697626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,115:0.98:117
chrX	32360466	rs6527184	C	A	638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=19;PP=541;SC=TTGCAAGCAGCAAATACTTCT;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=19;WE=32360474;WS=32360456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	32361033	rs7891425	C	T	915.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=25;PP=770;SC=TCTTAAATCACTTTACATAGT;SOR=3.334;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=32361041;WS=32361023;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chrX	32363964	rs10626188	A	AAG	407.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=322;SC=TCTGATGACTAAGTCTGAAGC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=32363972;WS=32363954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	32459169	rs41303185	G	A	248.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=173;SC=CAAAGTACCAGTGCTGAGTGA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=32459177;WS=32459159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	32503194	rs228406	T	C	3846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=83;PP=2965;SC=AGGTTGAAGATCTGATAGCCG;SOR=1.857;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=119;TCF=36;TCR=83;TR=119;WE=32503202;WS=32503184;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chrX	34150150	rs190385471	A	G	2187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=31;PP=1823;SC=GACCTCTGAGAGATATTTTGG;SOR=0.818;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=33;TCR=31;TR=64;WE=34150158;WS=34150140;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chrX	37699960	.	AAT	A	98	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.0;FR=0.5000;HP=1;HapScore=2;MGOF=15;MMLQ=25;MQ=56.77;NF=0;NR=4;PP=98;QD=26.75;SC=ATTATCAGAGAATATATATAT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=4;WE=37699969;WS=37699950;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:11,4:0.27:15
chrX	37699976	.	TAC	T	114	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;FR=0.5000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=27;MQ=53.61;NF=0;NR=4;PP=114;QD=29.5;SC=TATATATATATACACACACAC;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=4;WE=37699985;WS=37699966;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	0/1:9,4:0.31:13
chrX	37701208	rs5964203	A	G	1059.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=25;PP=841;SC=TTGTTCAAAAAGAACAATTTT;SOR=2.517;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=37701216;WS=37701198;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	37883303	rs34578085	G	GA	943.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=20;PP=532;SC=AAGTTCTGTAGAAAAAAAAAT;SOR=1.085;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=4;TCR=20;TR=24;WE=37883311;WS=37883293;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chrX	38037479	rs5918489	A	T	1115.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=6;PP=972;SC=TCACAAGGCAAAAAGGAAAGT;SOR=3.383;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=32;TCR=6;TR=38;WE=38037487;WS=38037469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chrX	38079975	rs72249350	CGCA	C	2189.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=3;NR=42;PP=2243;SC=GGGCGGGACGCGCAGCAGCAG;SOR=3.745;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=61;TCF=5;TCR=56;TR=45;WE=38079985;WS=38079965;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chrX	38262808	rs2235125	G	A	847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=23;NR=1;PP=693;SC=TTTAACCTTAGTAATTGCTAC;SOR=4.174;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=24;TCF=23;TCR=1;TR=24;WE=38262816;WS=38262798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	38271377	rs3215429	A	AT	768.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=24;PP=808;SC=TGTAACATCTATTTTTTTCCA;SOR=5.136;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=32;TCF=1;TCR=31;TR=25;WE=38271385;WS=38271367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	38420765	rs3833408	TGCC	T	1328.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=61.04;QD=42.86;SOR=6.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chrX	38420987	rs6610150	G	C	660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=22;PP=493;SC=AATCAAATCTGGGACCCCTCT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=38420995;WS=38420977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	38535174	rs4826996	A	G	696.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=21;PP=585;SC=GGGCTTTTTTATTTCCATGAA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=0;TCR=21;TR=21;WE=38535182;WS=38535164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	39933339	rs5917933	A	G	5717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-1.208;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=100;NR=94;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.822;SC=GTGAGCTGCCATCTTTTCTGT;SOR=0.244;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=195;TCF=101;TCR=94;TR=194;WE=39933347;WS=39933329;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,197:0.99:198
chrX	40456961	rs3112299	G	C	1888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=52;PP=1590;SC=ATTAATTTCCGTCTTTTTAAA;SOR=4.731;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=56;TCF=4;TCR=52;TR=56;WE=40456969;WS=40456951;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chrX	40460183	.	T	TAA	146	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;FR=1.0000;HP=14;HapScore=2;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=61.78;NF=1;NR=5;PP=146;QD=25.1666666667;SC=TAACTTCTTATAAAAAAAAAA;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=6;WE=40460191;WS=40460173;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:7,6:0.46:13
chrX	40499403	rs4827221	C	T	234.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=1;PP=190;SC=GGCAACAAAGCAAGACTCCCA;SOR=2.833;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=8;WE=40499411;WS=40499393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	40506697	rs6610447	A	G	3200.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=35;PP=2666;SC=CGCAGCAGTAACAGGCAGTGG;SOR=1.431;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=101;TCF=66;TCR=35;TR=100;WE=40506705;WS=40506687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chrX	40514322	rs11266293	G	A	1404.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=12;NR=28;PP=1059;SC=ACTATTTTGAGGGGGAAAAAT;SOR=1.828;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=40514330;WS=40514312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chrX	40556492	rs5918029	C	G	601.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=14;PP=449;SC=TTATCTGTGCCCTATCGATTT;SOR=1.828;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=20;TCF=6;TCR=14;TR=20;WE=40556500;WS=40556482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	41043997	.	A	ATT	335.52	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.06;BaseQRankSum=2.357;ClippingRankSum=0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.7378;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=10;PP=392;ReadPosRankSum=1.426;SC=ACTAATTAGTATTTTAAGTGT;SOR=3.442;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=10;WE=41044005;WS=41043987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,10:0.91:11
chrX	41203119	rs2275944	G	A	3159.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=70;PP=2589;SC=AACTTTGTAGGTGGCCATTGA;SOR=2.054;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=95;TCF=25;TCR=70;TR=95;WE=41203127;WS=41203109;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,99:1.00:99
chrX	41554814	rs913602	T	C	1896.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=59;NR=0;PP=1656;SC=GTAGGAAAAATCTGAAGACAT;SOR=8.155;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=59;TCF=59;TCR=0;TR=59;WE=41554822;WS=41554804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chrX	41587218	rs1023065	T	C	1864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=36;PP=1480;SC=TTTTATTAGATAAAACATTCA;SOR=1.255;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=59;TCF=22;TCR=37;TR=58;WE=41587226;WS=41587208;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chrX	43627999	rs1799836	T	C	3897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=95;PP=2965;SC=ATAGCAAAAGTGACACCATCT;SOR=1.946;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=131;TCF=36;TCR=95;TR=131;WE=43628007;WS=43627989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chrX	43741616	rs1181251	G	C	1114.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=27;PP=949;SC=CCAGTCCTGCGTGCCAGCCAG;SOR=3.193;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=32;TCF=5;TCR=27;TR=32;WE=43741624;WS=43741606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	44202890	rs5902346	G	GC	2599.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=12;NR=47;PP=2863;SC=GCAGGCAGCGGCGCCTCCCGG;SOR=1.819;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=61;TCF=13;TCR=48;TR=59;WE=44202898;WS=44202880;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chrX	44833841	rs6611055	C	A	442.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=4;PP=348;SC=ATCTTGTTACCGTGTTTGTTA;SOR=1.911;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=11;TCR=4;TR=15;WE=44833849;WS=44833831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	44935924	rs10605935	CT	C	545.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=15;PP=316;SC=CTGATTATCCCTTTTTTTTTT;SOR=1.270;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=32;TCF=13;TCR=19;TR=24;WE=44935932;WS=44935914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	44938563	rs20539	G	A	4025.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=61;PP=2965;SC=AATATGCACAGTACCAGGCCT;SOR=0.709;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=122;TCF=61;TCR=61;TR=122;WE=44938571;WS=44938553;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,129:1.00:129
chrX	44970808	rs181547731	G	A	1627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=0.943;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=49;PP=1479;ReadPosRankSum=-0.744;SC=CCAACTGGACGGGAGAGAGTA;SOR=4.174;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=2;TCR=51;TR=51;WE=44970816;WS=44970798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,49:0.98:50
chrX	45011340	rs4824527	T	C	228.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=8;PP=145;SC=CGGTGGCTCATGCCTGTAATC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=45011348;WS=45011330;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	45016802	rs6521006	C	T	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=0;PP=251;SC=AGCCACAGCACTTTCACACTG;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=10;TCR=0;TR=10;WE=45016810;WS=45016792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	45017166	rs5952693	A	C	30.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=15.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chrX	45050973	rs4239958	C	T	431.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=363;SC=TTCACACCCCCTTCCCATGGC;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=45050981;WS=45050963;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	45051111	rs1132201	C	T	2897.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=58;NR=29;PP=2276;SC=GGCACAGATTCTCCTGTCTGA;SOR=1.460;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=87;TCF=58;TCR=29;TR=87;WE=45051119;WS=45051101;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chrX	46321944	rs11342771	CA	C	1521.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-0.090;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.464;HP=13;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=21;MQRankSum=-0.058;NF=40;NR=19;PP=788;ReadPosRankSum=2.073;SC=GACTCGGTCTCAAAAAAAAAA;SOR=0.231;SbPval=0.31;Source=Platypus;TC=83;TCF=60;TCR=23;TR=59;WE=46321953;WS=46321934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,71:0.95:75
chrX	46513260	rs370041978	CT	C	47.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=3.010;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.68;MQRankSum=-1.476;QD=2.27;ReadPosRankSum=-1.521;SOR=0.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,6:0.29:21
chrX	46737138	rs58164919	G	GGTGTGT	171.86	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.431;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.01;MQRankSum=-0.210;QD=28.64;ReadPosRankSum=-1.383;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,5:0.83:6
chrX	46893249	rs5906311	G	A	460.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=317;SC=GTTCCCCACAGCATTCAGACT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=46893257;WS=46893239;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	46944155	rs6611328	A	C	564.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=477;SC=GAGTTCGATAACTGCCTGGGC;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=46944163;WS=46944145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	46949403	rs6611330	C	T	2368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=63;PP=1803;SC=ATGTATTTTTCATTATTTGTC;SOR=4.323;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=70;TCF=6;TCR=64;TR=69;WE=46949411;WS=46949393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chrX	46951004	rs5906327	G	T	465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=361;SC=GAGAGCTCTCGGTTTGATTCT;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=46951012;WS=46950994;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	46952219	rs4480242	A	G	559.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=1;PP=432;SC=GTATATTACTACAAATCATAA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=46952227;WS=46952209;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	47036113	rs10641366	G	GTC	320.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.168;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.16;MQRankSum=-0.122;QD=21.38;ReadPosRankSum=0.000;SOR=3.126;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,13:0.87:15
chrX	47057647	rs4468050	A	G	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=9;PP=841;SC=TCCCGCCGCCATCCCTGGGAT;SOR=2.476;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=40;WE=47057655;WS=47057637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	47061018	rs4239964	C	G	1399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=30;PP=1184;SC=GGGTGAGCTGCGACCATGGGG;SOR=1.775;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=42;WE=47061026;WS=47061008;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chrX	47086347	rs6417923	G	A	2922.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=48;PP=2386;SC=GGAGACACACGGGGAGGACCT;SOR=0.906;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=88;TCF=39;TCR=49;TR=87;WE=47086355;WS=47086337;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
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chrX	47343254	rs2071778	C	T	2956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=44;PP=2318;SC=GGTCTTAACACCATTTTGCAT;SOR=0.883;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=40;TCR=44;TR=84;WE=47343262;WS=47343244;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chrX	47430611	rs377351122	GGT	G	251.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.549;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.77;MQRankSum=1.481;QD=12.59;ReadPosRankSum=-0.388;SOR=1.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:8,12:0.60:20
chrX	47487912	rs11436787	T	TG	3279.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=28;NR=37;PP=2957;SC=ATTGGAAGGCTGCATGGCCAA;SOR=0.715;SbPval=0.47;Source=Platypus;TC=70;TCF=29;TCR=41;TR=65;WE=47487920;WS=47487902;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chrX	47658046	rs723119	C	T	1908.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=42;NR=24;PP=1495;SC=CTACATTATACAGTCCACTGA;SOR=1.284;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=66;TCF=42;TCR=24;TR=66;WE=47658054;WS=47658036;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chrX	47662972	rs909713	T	G	3973.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=64;NR=51;PP=2965;SC=TCACTGCAAGTAATCAACACC;SOR=0.868;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=64;TCR=51;TR=115;WE=47662980;WS=47662962;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chrX	47663200	rs1207505	G	A	6837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=55.85;NF=98;NR=91;PP=2965;SC=CAGGACACCAGGGATATCATG;SOR=0.783;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=190;TCF=98;TCR=92;TR=189;WE=47663208;WS=47663190;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chrX	47695547	rs1207491	T	C	2907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=37;PP=2266;SC=TTAGTATTGGTACTACGTAGT;SOR=1.105;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=84;TCF=47;TCR=37;TR=84;WE=47695555;WS=47695537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chrX	47695742	rs35084954	CT	C	4320.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=44;PP=2951;SC=TCCTCCTCCCCTTGTGGTATG;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=105;TCF=54;TCR=51;TR=94;WE=47695750;WS=47695732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chrX	47755164	rs3949810	C	A	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=14;NR=0;PP=408;SC=CTCAGTTCCCCATGAAATGTG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=47755172;WS=47755154;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	47757758	rs5906510	T	G	2850.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=25;NR=64;PP=2336;SC=TCACTGGGAGTGGGCAGTCTC;SOR=1.890;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=89;TCF=25;TCR=64;TR=89;WE=47757766;WS=47757748;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chrX	47918205	rs501128	G	A	1168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=11;PP=947;SC=TACACTCATAGGGTTTCTCCC;SOR=1.308;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=21;TCR=11;TR=32;WE=47918213;WS=47918195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chrX	47919623	.	TAC	T	288	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=24;MQ=59.64;NF=5;NR=1;PP=288;QD=48.5;SC=GAAAATCAAATACACACACAC;SbPval=0.1;Source=Platypus;TC=15;TCF=7;TCR=8;TR=6;WE=47919632;WS=47919613;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,6:0.40:15
chrX	47920356	rs727079	A	G	2679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=59;PP=2099;SC=CAATCTGCTCATTCTGGTCAT;SOR=1.744;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=28;TCR=59;TR=87;WE=47920364;WS=47920346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chrX	47927449	rs2152823	G	A	367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.65;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	47927554	.	A	AGAAG	133.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.64;QD=26.77;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	48049666	rs5906557	C	T	3526.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=95;PP=2965;SC=GCACTCCCTTCGAATCATTTC;SOR=4.615;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=104;TCF=8;TCR=96;TR=103;WE=48049674;WS=48049656;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,108:1.00:108
chrX	48053521	rs4239967	T	C	3391.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=85;NR=18;PP=2761;SC=TGAAAAGCAGTTGCGCTTGAG;SOR=3.133;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=103;TCF=85;TCR=18;TR=103;WE=48053529;WS=48053511;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chrX	48054740	rs4824675	C	G	4764.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=43;PP=2965;SC=TGCATCTTCTCTGGTATTTGA;SOR=1.708;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=139;TCF=96;TCR=43;TR=138;WE=48054748;WS=48054730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chrX	48073924	rs4593689	T	C	2609.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=77;NR=2;PP=2214;SC=TTATCTGTCATCTTCACATTA;SOR=6.518;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=79;TCF=77;TCR=2;TR=79;WE=48073932;WS=48073914;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chrX	48164138	rs5906631	A	G	1502.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=17;PP=1294;SC=CAGTATCTCTATCCTCCCCTC;SOR=1.280;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=44;TCF=26;TCR=18;TR=43;WE=48164146;WS=48164128;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chrX	48320274	.	A	G	2575.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=52;PP=1943;SC=CGCCCTCCATATCAGACACAT;SOR=1.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=76;TCF=24;TCR=52;TR=76;WE=48320282;WS=48320264;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chrX	48320301	rs2293952	C	G	1859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=43;PP=1455;SC=TCCCAATGTCCAATATCCAGC;SOR=2.644;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=10;TCR=43;TR=53;WE=48320309;WS=48320291;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chrX	48326216	rs2293953	A	G	6035.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=103;NR=87;PP=2965;SC=GGGAAATCCTAACCCCTGATC;SOR=0.846;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=190;TCF=103;TCR=87;TR=190;WE=48326224;WS=48326206;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,194:1.00:194
chrX	48339985	rs2070991	C	T	4743.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=61;PP=2965;SC=GAGGAGGAAGCGGCAGTCATG;SOR=1.127;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=89;TCR=61;TR=150;WE=48339993;WS=48339975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chrX	48432791	rs2661105	T	C	349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=1;PP=291;SC=ACCACTCCGCTCCTGCTGGCC;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=10;TCR=1;TR=11;WE=48432799;WS=48432781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	48433499	rs2249583	C	G	2602.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=19;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=50;NR=29;PP=2026;SC=TCGCTATTTTCTCACATCTCC;SOR=1.416;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=79;TCF=50;TCR=29;TR=79;WE=48433507;WS=48433489;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,81:1.00:81
chrX	48433529	rs2249585	C	T	2873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=40;PP=2299;SC=CTCCTTCCTGCCACCATTCTT;SOR=0.887;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=46;TCR=40;TR=86;WE=48433537;WS=48433519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chrX	48435308	rs235830	G	A	967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=24;NR=1;PP=703;SC=TTTTTGATACGTAAGGTTTAT;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=25;TCF=24;TCR=1;TR=25;WE=48435316;WS=48435302;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chrX	48435928	rs235829	C	T	1454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=35;PP=1151;SC=GGAGCTGCACCGAAGCATCTT;SOR=2.511;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=10;TCR=35;TR=45;WE=48435936;WS=48435918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chrX	48460314	rs235842	A	G	3637.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=65;NR=50;PP=2749;SC=GGTGATGACCATGGCAGTGTC;SOR=0.831;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=115;TCF=65;TCR=50;TR=115;WE=48460322;WS=48460304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chrX	48460625	rs235841	G	C	1137.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=34;PP=901;SC=TCCTGGAGACGGAGGACCTGC;SOR=4.073;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=5;TCR=34;TR=39;WE=48460633;WS=48460615;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
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chrX	48681187	rs61735967	G	A	3776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=124;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=71;PP=2965;SC=AGATACTGGCGCAGCTTACGG;SOR=1.236;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=115;TCF=44;TCR=71;TR=115;WE=48681195;WS=48681177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chrX	48690416	rs6520383	G	T	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=5;PP=345;SC=GCTGGGCTGCGAGGGCGGCAG;SOR=1.473;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=15;TCF=10;TCR=5;TR=15;WE=48690424;WS=48690406;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	48751471	rs1128363	A	G	3289.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=53;PP=2697;SC=GGCCACAGTCAATGGTGGAGA;SOR=0.825;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=59;TCR=53;TR=112;WE=48751479;WS=48751461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chrX	48759204	rs741932	C	T	1765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=11;PP=1434;SC=TGCGGCCCCACAGCGGGCTCC;SOR=2.712;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=43;TCR=11;TR=54;WE=48759212;WS=48759194;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chrX	48760793	rs2239453	C	T	2847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=71;PP=2285;SC=GCTAGGCTGGCAGGCGGGTTT;SOR=3.284;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=85;TCF=14;TCR=71;TR=85;WE=48760801;WS=48760783;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chrX	48858802	rs28727466	G	A	440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=11;PP=338;SC=AAACCGACGAGTCAGGTGAAC;SOR=2.985;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=2;TCR=11;TR=13;WE=48858810;WS=48858792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	48898183	rs7056903	C	G	441.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=14;PP=359;SC=AGACAGAGAGCGGGGGAGAAC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=48898191;WS=48898173;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	48900900	rs4824738	T	G	791.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=22;PP=627;SC=GGGCGGCGTCTGGGAGATGGG;SOR=4.174;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=48900908;WS=48900890;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	48925467	.	C	G	58.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.799;ClippingRankSum=0.000;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=14.880;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.94;ReadPosRankSum=-2.181;SOR=3.592;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,5:0.25:20
chrX	49021256	rs5906744	A	G	5119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=63;NR=100;PP=2965;SC=GGTAAGGCACATAGTGCTCCG;SOR=1.267;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=164;TCF=63;TCR=101;TR=163;WE=49021264;WS=49021246;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,172:1.00:172
chrX	49021537	rs5905720	G	C	2887.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=52;PP=2413;SC=GGTCGGGGACGTCGTGCTCCA;SOR=1.259;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=85;TCF=33;TCR=52;TR=85;WE=49021545;WS=49021527;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,86:1.00:86
chrX	49022276	rs5953269	C	G	2566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.50;SOR=8.189;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chrX	49022286	rs72619037	C	G	3061.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=47.84;SOR=6.932;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chrX	49022291	.	GT	G	3312.73	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;BRF=0.15;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=40;NR=0;PP=1815;SC=CAGAACGCCTGTCAAGGGAGA;SOR=7.195;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=41;TCR=0;TR=40;WE=49022319;WS=49022266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chrX	49022293	rs75416104	C	G	3321.77	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.50;SOR=7.195;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,73:1.00:73
chrX	49022293	.	CAA	GAG	2529	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=29;MQ=60.0;NF=41;NR=0;PP=2529;QD=20;SC=GAACGCCTGTCAAGGGAGATT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=64;TCF=63;TCR=1;TR=41;WE=49022319;WS=49022266;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:23,41:0.64:64
chrX	49022295	rs138365388	A	G	3321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.89;SOR=7.223;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chrX	49022309	rs73634213	C	A	3962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.55;SOR=5.259;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chrX	49022309	.	CAA	AAG	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=71;NR=4;PP=2947;QD=20;SC=AGATTTCTCTCAAGGTCAGGG;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=81;TCF=77;TCR=4;TR=75;WE=49022319;WS=49022266;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:6,75:0.93:81
chrX	49022311	rs7880193	A	G	3962.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.03;SOR=5.000;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chrX	49022700	rs4824462	T	C	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=23;PP=784;SC=GGCAGCGCAGTTCGCTCAGGA;SOR=2.165;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=32;TCF=9;TCR=23;TR=32;WE=49022708;WS=49022690;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chrX	49069366	rs2071316	C	T	1806.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=18;PP=1502;SC=TAGGGTAATCCGGAGGGATGG;SOR=1.524;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=50;TCF=32;TCR=18;TR=50;WE=49069374;WS=49069356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chrX	49070813	rs2071317	G	A	901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=25;PP=779;SC=CTGGGCTGAGGCGAGTCTGGG;SOR=3.258;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=29;TCF=4;TCR=25;TR=29;WE=49070821;WS=49070803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	49071964	rs2075866	A	G	1578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=13;NR=39;PP=1116;SC=AGATGGGGCCATGGTCCTCTG;SOR=2.303;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=54;TCF=13;TCR=41;TR=52;WE=49071972;WS=49071954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chrX	49077583	rs2869212	G	A	848.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=14;PP=640;SC=GGGCTAAGGGGGATCACTACA;SOR=1.220;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=24;TCF=10;TCR=14;TR=24;WE=49077591;WS=49077573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	49081291	rs2235127	G	A	2292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=55;NR=13;PP=1815;ReadPosRankSum=0.901;SC=GCTGCATGGCGCCCACCTCCA;SOR=1.364;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=69;TCF=56;TCR=13;TR=68;WE=49081299;WS=49081281;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,73:0.99:74
chrX	49084492	rs6609854	C	T	2889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=60;NR=21;PP=2128;SC=TGTCTAGGTCCCTCACCCACT;SOR=2.200;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=60;TCR=21;TR=81;WE=49084500;WS=49084482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chrX	49087487	rs5905724	G	A	3039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=68;PP=2444;SC=CGGGAAGTCGGGGAGTTATTT;SOR=2.069;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=96;TCF=27;TCR=69;TR=95;WE=49087495;WS=49087477;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chrX	49093528	rs2294016	T	C	2562.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=0.104;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=26;PP=1968;ReadPosRankSum=-0.731;SC=ACTATTCCTGTGATCAAGCTG;SOR=0.765;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=61;TCR=26;TR=86;WE=49093536;WS=49093518;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,86:0.99:87
chrX	49098631	rs2294018	A	G	1722.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=50;PP=1418;SC=GGTGTCTGGGATGTGGGCGGG;SOR=4.731;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=3;TCR=50;TR=53;WE=49098639;WS=49098621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chrX	49103097	rs2294019	T	A	276.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=227;SC=GTGACTTGTCTGTATACTCTT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=49103105;WS=49103087;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	49103224	rs2294020	G	A	1276.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=5;PP=1043;SC=AGCGGCTGCAGAAGCAACTGA;SOR=3.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=38;WE=49103232;WS=49103214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chrX	49370511	rs35846904	A	AAAT	201.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=0;PP=131;SC=ACTCCATCTAAAATAATAATA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=3;WE=49370519;WS=49370501;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	49767832	rs456615	A	G	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=44.06;SOR=1.536;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	49767835	rs456617	A	G	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=43.44;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chrX	49767904	rs149259	A	G	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=12;PP=353;SC=AAGGGAGGTAAACCCTCTCTT;SOR=2.712;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=49767912;WS=49767894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	49773787	.	C	A	423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=323;SC=CTGTAGAGGGCACCTGTGGGA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=49773795;WS=49773777;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	50121146	rs11415594	A	AG	1417.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=18;PP=1393;SC=AATTTTGATAAGCCTGGTCTC;SOR=0.850;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=35;TCF=15;TCR=20;TR=31;WE=50121154;WS=50121136;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chrX	50341598	rs2295544	G	A	2932.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=64;PP=2288;SC=ACTGATTTGTGCCTGTAACCT;SOR=1.839;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=93;TCF=29;TCR=64;TR=93;WE=50341606;WS=50341588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chrX	50341675	rs2295543	G	C	942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=26;PP=797;SC=GGAAACTTGGGCAAGTCATGA;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=50341683;WS=50341665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chrX	51075841	rs2625875	A	G	78.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.059;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=22.270;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.60;MQRankSum=-6.437;QD=0.55;ReadPosRankSum=1.200;SOR=2.948;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:124,19:0.13:143
chrX	51239295	.	ATCCTCGAGGCAGCC	A	1961.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=14;NR=12;PP=2957;SC=TTTGCACTTCATCCTCGAGGC;SOR=1.280;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=47;TCF=24;TCR=23;TR=26;WE=51239316;WS=51239285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chrX	51644748	rs3199687	C	A	2503.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.454;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=34;PP=1892;ReadPosRankSum=1.389;SC=GGCCGAAGCCCGGGCTGAAGC;SOR=0.339;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=80;TCF=46;TCR=34;TR=79;WE=51644756;WS=51644738;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,82:0.99:83
chrX	52825471	rs2806837	A	G	1434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=12;PP=1080;SC=CTAGGTCTTCATCCTCCTGTG;SOR=2.124;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=34;TCR=12;TR=46;WE=52825479;WS=52825461;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chrX	52825546	rs2806838	C	G	2103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=30;PP=1522;SC=GGTCATTCTCCAGTTGATTTG;SOR=0.807;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=67;TCF=36;TCR=31;TR=66;WE=52825554;WS=52825536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chrX	52891492	rs114794367	T	C	136.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-2.383;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=4.523;HP=2;HapScore=2;MGOF=40;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-1.231;NF=5;NR=1;PP=55;ReadPosRankSum=0.835;SC=CCACCACACCTGGCCACCATT;SOR=0.061;SbPval=0.3;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=6;WE=52891500;WS=52891482;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:11,6:0.35:17
chrX	52891512	rs78471253	AC	TT	503.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.368;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FS=3.332;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.96;MQRankSum=-1.003;QD=17.99;ReadPosRankSum=0.601;SOR=0.153;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:15,13:0.46:28
chrX	52891523	rs75536354	G	T	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.967;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FS=3.136;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.97;MQRankSum=-0.972;QD=16.85;ReadPosRankSum=0.694;SOR=0.182;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:18,17:0.49:35
chrX	52891542	rs78672295	A	G	589.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=1.488;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=3.768;HP=5;HapScore=2;MGOF=49;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=1.216;NF=20;NR=1;PP=459;ReadPosRankSum=1.476;SC=ATGAACAAAAAATGTGCAAGA;SOR=0.116;SbPval=0.35;Source=Platypus;TC=49;TCF=48;TCR=1;TR=21;WE=52891550;WS=52891532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:29,21:0.42:50
chrX	52891565	rs79831867	A	G	756.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=3.728;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=50;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=1.310;NF=27;NR=1;PP=662;ReadPosRankSum=0.770;SC=TCTTTGGAGAAAGCTGCAAAA;SOR=0.627;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=73;TCF=71;TCR=2;TR=28;WE=52891573;WS=52891555;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:46,28:0.38:74
chrX	52891584	rs5943751	C	T,A	3308.77	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.200;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.200;NF=33,54;NR=3,6;PP=689,1498;ReadPosRankSum=1.321;SC=AAGTTTATTTCGATATTTTTA;SOR=2.896;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=97;TCF=88;TCR=9;TR=36,60;WE=52891592;WS=52891574;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.60,0.39:101
chrX	52891619	.	GT	G	1281.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-0.835;ClippingRankSum=0.000;DP=145;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=33;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQ=60.07;MQRankSum=1.299;NF=29;NR=11;PP=1270;ReadPosRankSum=0.718;SC=GATAAAAACAGTTTTGTGTTG;SOR=0.728;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=123;TCF=91;TCR=32;TR=40;WE=52891627;WS=52891609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:84,51:0.38:135
chrX	52891645	rs75808475	A	G	2345.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=163;ExcessHet=3.0103;FS=5.154;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.75;ReadPosRankSum=0.151;SOR=0.382;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:94,65:0.41:159
chrX	52891653	rs73206488	C	T	2380.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.413;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=2.865;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.26;ReadPosRankSum=0.401;SOR=0.496;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:101,66:0.40:167
chrX	52891732	rs201414570	G	A	2365.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.325;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=198;ExcessHet=3.0103;FS=1.209;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.01;ReadPosRankSum=0.004;SOR=0.837;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:130,67:0.34:197
chrX	52891736	rs75971120	G	T	2370.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.960;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=1.950;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.41;ReadPosRankSum=-0.146;SOR=0.883;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:125,66:0.35:191
chrX	52891738	rs79449844	CA	TG	2409.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.304;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=192;ExcessHet=3.0103;FS=1.247;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=12.62;ReadPosRankSum=0.685;SOR=0.834;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:128,63:0.33:191
chrX	52891818	rs73488230	G	A	505.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-3.214;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=20;PP=812;ReadPosRankSum=-0.485;SC=CATTCAGTTAGACCTCTGTAG;SOR=1.040;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=71;TCF=1;TCR=70;TR=20;WE=52891840;WS=52891808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:52,22:0.30:74
chrX	52891832	rs66491662	CT	C	262.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.844;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.87;ReadPosRankSum=0.931;SOR=0.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,13:0.24:54
chrX	52895579	.	GGT	G	686.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=12;PP=588;SC=TGGAACCAGGGGTGTGTGTGT;SOR=1.609;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=14;WE=52895588;WS=52895569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	53222043	rs146836963	A	AC	892.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=22;NR=6;PP=925;SC=AGGGATGGCCACCCCCCTACC;SOR=2.303;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=32;TCF=24;TCR=8;TR=28;WE=53222051;WS=53222033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	53225751	rs1536247	A	G	1145.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=39;NR=0;PP=929;SC=GGGGAGAGTCAATACAGTAAC;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=39;TCF=39;TCR=0;TR=39;WE=53225759;WS=53225741;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	53226026	rs143955805	T	C	1969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=53;PP=1540;SC=CCCTTCGGGCTGAGGGGGCCA;SOR=2.206;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=73;TCF=19;TCR=54;TR=72;WE=53226034;WS=53226016;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chrX	53228148	rs1977364	C	A	4847.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=68;PP=2965;SC=TCCAGAAAGGCCCATGCTCAC;SOR=0.830;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=150;TCF=81;TCR=69;TR=149;WE=53228156;WS=53228138;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chrX	53265835	rs2296541	T	C	239.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=6;PP=175;SC=GACCAGCCCTTGTCTCCCCCA;SOR=1.402;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=53265843;WS=53265825;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	53271147	rs2274307	T	G	475.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=15;PP=434;SC=GCTTCAGGCCTCCTGGCACCT;SOR=3.126;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=53271155;WS=53271137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	53280421	rs7886988	G	A	1006.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=21;PP=766;SC=AGGGAAGAATGGTGGAAGGTG;SOR=1.911;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=8;TCR=21;TR=29;WE=53280429;WS=53280411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chrX	53436232	rs1264008	G	T	1293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=18;PP=1080;SC=GAGTTACTCCGGCTGGTGAGA;SOR=0.850;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=20;TCR=18;TR=38;WE=53436240;WS=53436222;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chrX	53449336	rs11462431	A	AG	493.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=4;PP=494;SC=GGAACCCGTAAGGTCCGCGAC;SOR=1.765;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=9;TCR=4;TR=13;WE=53449344;WS=53449328;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	53563589	rs426298	A	G	703.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=16;PP=584;SC=GCAGGAGCCCACCAGCATCCT;SOR=1.426;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=7;TCR=16;TR=23;WE=53563597;WS=53563579;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	53607754	rs266786	A	C	681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=0.114;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=1;PP=603;ReadPosRankSum=0.158;SC=CCAGGCCACAAACTTAATATC;SOR=3.442;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=23;TCF=22;TCR=1;TR=22;WE=53607762;WS=53607744;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chrX	53622078	rs1244413	T	A	146.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=117;SC=CCATTTTAAGTAGTATAGGAA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=53622086;WS=53622068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	53652852	.	T	TGCCGGG	2755.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=69;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=24;NR=32;PP=2957;SC=CCGGGGCCGGTGCCGGGACTG;SOR=1.197;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=74;TCF=30;TCR=44;TR=56;WE=53652860;WS=53652842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chrX	53654244	.	G	A	903.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.465;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=0;PP=705;ReadPosRankSum=2.007;SC=TTTTGTTGCTGAAAGTATATA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=27;WE=53654252;WS=53654234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chrX	53654500	rs370583659	GTA	G	199.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.501;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FS=4.184;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.29;MQRankSum=2.791;QD=3.84;ReadPosRankSum=1.110;SOR=0.070;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:41,11:0.21:52
chrX	54107692	rs2516098	T	C	6241.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=167;NR=24;PP=2965;SC=TAGGCATTTTTCCAAGGAGGC;SOR=3.820;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=191;TCF=167;TCR=24;TR=191;WE=54107700;WS=54107682;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,190:1.00:190
chrX	54117740	rs2495797	C	A	1177.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=6;PP=952;SC=GGTACATGAACTCACCTTGAG;SOR=3.086;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=31;TCR=6;TR=37;WE=54117748;WS=54117730;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chrX	54161859	rs4826523	C	T	538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.36;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=425;SC=ATATATAGCCCTGACAGTCTA;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=54161867;WS=54161849;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	54209387	rs2495783	A	G	1644.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=27;NR=24;PP=1277;SC=ATGGTGCCGAATCGGCCCCGC;SOR=0.892;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=51;TCF=27;TCR=24;TR=51;WE=54209395;WS=54209377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chrX	54952989	rs75731260	CCT	C	1455.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=30;PP=1467;SC=AATTTCTGTCCCTGTCTCCTC;SOR=4.804;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=34;TCF=1;TCR=33;TR=31;WE=54952998;WS=54952979;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chrX	54953647	rs2273138	G	A	929.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=21;PP=699;SC=AGAGGGATGGGCATCCTGTGT;SOR=2.833;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=4;TCR=21;TR=25;WE=54953655;WS=54953637;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	55040109	rs199599529	A	C	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.992;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FS=25.005;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.07;ReadPosRankSum=0.264;SOR=4.977;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:24,13:0.35:37
chrX	55116466	rs1845444	C	G	1796.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=17;PP=1292;SC=GAGTGAGCTTCTAAGAGCAAG;SOR=1.287;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=31;TCR=17;TR=48;WE=55116474;WS=55116456;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chrX	55173732	rs11327722	TA	T	5842.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=62;PP=2951;SC=GGTCACACAGTAACACTGTCC;SOR=1.008;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=135;TCF=70;TCR=65;TR=129;WE=55173740;WS=55173722;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,158:1.00:158
chrX	55187103	rs17002436	T	C	477.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=356;SC=TAAAGGTCCATAGAACCCCAG;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=14;TCR=0;TR=14;WE=55187111;WS=55187099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	55246965	rs5914272	C	T	730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=7;PP=598;SC=GGACAGGTCCCGTGGCACAGT;SOR=1.802;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=24;TCF=17;TCR=7;TR=24;WE=55246973;WS=55246955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	55247030	rs5914273	C	G	632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=11;PP=510;SC=CCCCCAGGTCCTGATGCAGGC;SOR=0.693;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=22;TCF=11;TCR=11;TR=22;WE=55247038;WS=55247020;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	55248320	rs5914274	G	A	5816.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=186;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=129;PP=2965;SC=TGAAGGGAGAGTGGAGAATAA;SOR=2.000;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=176;TCF=47;TCR=129;TR=176;WE=55248328;WS=55248310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,185:1.00:185
chrX	55286887	rs3761559	G	T	1279.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=0;PP=1058;SC=ATTAGCAGTAGTGGTACCTCT;SOR=7.378;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=37;TCR=0;TR=37;WE=55286895;WS=55286877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chrX	55287031	rs3761560	T	G	4788.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=87;PP=2965;SC=TAGGACCATCTCCACGTTCAC;SOR=0.781;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=162;TCF=74;TCR=88;TR=161;WE=55287039;WS=55287021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,165:1.00:165
chrX	55289593	rs2148981	C	T	1567.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=40;NR=6;PP=1189;SC=CTTTCTATTGCTTTTTTCCTC;SOR=3.398;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=47;TCF=40;TCR=7;TR=46;WE=55289601;WS=55289583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chrX	55289774	rs4826381	T	C	2239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=47;PP=1897;SC=AGCTGGTCATTACTGGGCAGC;SOR=1.609;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=69;TCF=22;TCR=47;TR=68;WE=55289782;WS=55289764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chrX	55479299	rs11545211	G	A	3390.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=68;NR=42;PP=2460;SC=TCTTCTGGGGGCCCCGAGCAC;SOR=1.081;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=111;TCF=69;TCR=42;TR=110;WE=55479307;WS=55479289;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,113:1.00:113
chrX	55651001	rs2375465	T	C	1844.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=28;PP=1551;SC=GAGACTCGTGTCTTAGCCTTT;SOR=0.728;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=58;TCF=30;TCR=28;TR=58;WE=55651009;WS=55650991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chrX	55748820	rs1473761	A	G	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=578;SC=GAGGTTGGGGAATTTGTTATG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=55748828;WS=55748810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	55757744	rs5960480	T	G	254.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=210;SC=AGGCTATAAGTAGGAGTGATT;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=8;TCR=0;TR=8;WE=55757752;WS=55757734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	57313357	rs2516023	T	C	345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=1;PP=257;SC=TCTTAGGGGGTCCAAAGTTTG;SOR=3.442;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=9;TCR=1;TR=10;WE=57313365;WS=57313347;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	57318907	rs4030473	T	A	1933.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=5;PP=1572;SC=AAATGGCTGCTGACTAAAGTA;SOR=4.443;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=57;TCF=52;TCR=5;TR=57;WE=57318915;WS=57318897;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chrX	57405163	rs4826543	T	C	2299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=33;PP=1854;SC=CTATGTGCCGTTATGCTGAAG;SOR=0.750;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=66;TCF=33;TCR=33;TR=66;WE=57405171;WS=57405153;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chrX	57474943	rs1821118	A	T	1415.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=0;PP=1185;SC=TTGATATATGATATCATTCTG;SOR=7.569;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=42;WE=57474951;WS=57474933;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chrX	57475253	rs7059676	A	C	1436.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=37;PP=1106;SC=AGTTTTAAACATGCAGGTATA;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=37;TCF=0;TCR=37;TR=37;WE=57475261;WS=57475243;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	57515140	rs5915052	T	G	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=34;NR=6;PP=1105;SC=AAAAAATACGTTTTCAGGAAC;SOR=3.160;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=34;TCR=6;TR=40;WE=57515148;WS=57515130;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chrX	57618845	rs199513692	G	A	118.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.569;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.48;MQRankSum=-4.203;QD=4.75;ReadPosRankSum=-0.468;SOR=0.327;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:20,5:0.20:25
chrX	57618849	rs200267267	A	C	115.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.159;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.60;MQRankSum=-4.392;QD=4.29;ReadPosRankSum=0.229;SOR=0.368;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,5:0.19:27
chrX	57618870	rs189164178	G	A	304.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.049;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.542;HP=5;HapScore=2;MGOF=10;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=-2.190;NF=4;NR=4;PP=254;ReadPosRankSum=-1.737;SC=CTCCAGGGGGGCGAGAGCGGC;SOR=0.381;SbPval=0.41;Source=Platypus;TC=25;TCF=10;TCR=15;TR=8;WE=57618878;WS=57618860;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:17,11:0.39:28
chrX	57619648	rs1057328	G	T	4022.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=93;NR=64;PP=2965;SC=ACTTCGAACCGGAGAGGCCTT;SOR=0.998;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=158;TCF=94;TCR=64;TR=157;WE=57619656;WS=57619638;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chrX	63568813	rs146037591	C	T	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=383;SC=AGAAATGTGACTCTAAAGTCA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=63568821;WS=63568803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	65390966	rs5965106	C	A	881.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=6;PP=615;SC=ATATTTATTTCAGATATGTGA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=27;TCF=21;TCR=6;TR=27;WE=65390974;WS=65390956;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	65392181	rs5964495	T	C	1291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=28;NR=13;PP=1043;SC=TTATGACTCTTTTTCTTCTTT;SOR=1.501;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=28;TCR=13;TR=41;WE=65392189;WS=65392171;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	65393658	rs5918591	A	G	1875.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=42;PP=1494;SC=AGGTCCCAAGAATAAGCTATG;SOR=2.917;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=52;TCF=10;TCR=42;TR=52;WE=65393666;WS=65393648;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chrX	65408445	rs6624875	C	T	1496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=41;PP=1223;SC=ATCCACTGGGCCTAGTATTTG;SOR=6.184;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=1;TCR=41;TR=42;WE=65408453;WS=65408435;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chrX	65415174	rs2206203	T	G	1204.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=32;PP=1044;SC=GGCAGAATTATTTGCCATATG;SOR=2.891;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=39;TCF=7;TCR=32;TR=39;WE=65415182;WS=65415164;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chrX	65420609	rs1264215	A	G	385.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=11;PP=292;SC=GTGCCTTAGCAGCTGGCCCTA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=65420617;WS=65420599;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	65427040	rs806607	T	C	1013.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=22;NR=12;PP=848;SC=CCTCTAGTTATGGTTACATTT;SOR=1.418;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=34;WE=65427048;WS=65427030;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chrX	65427124	rs809363	A	G	1518.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=27;PP=1162;SC=CTGATGGTACATTCAGGATCC;SOR=0.767;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=53;TCF=26;TCR=27;TR=53;WE=65427132;WS=65427114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chrX	65822607	rs1385698	T	C	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=26;PP=812;SC=ACTGTGGGTGTATCTGCCTCC;SOR=3.912;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=28;TCF=2;TCR=26;TR=28;WE=65822615;WS=65822597;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	66765158	.	TGCAGCA	T	304.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=312;SC=TTGCTGCTGCTGCAGCAGCAG;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=4;TCR=26;TR=6;WE=66765171;WS=66765148;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	66765627	rs6152	G	A	5024.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-1.751;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=166;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=88;NR=61;PP=2965;ReadPosRankSum=1.812;SC=GAGCGAGGGAGGCCTCGGGGG;SOR=0.407;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=150;TCF=89;TCR=61;TR=149;WE=66765635;WS=66765617;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,160:0.99:161
chrX	66941597	rs1337076	T	G	386.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=1;PP=308;SC=TGGCGAGGGATGGCAATCAGA;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=66941605;WS=66941595;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	67331930	.	CAG	C	427.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=38.88;SOR=4.407;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	67331934	rs5918812	G	C	200.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.728;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=-0.000;QD=20.08;ReadPosRankSum=-0.493;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:2,8:0.80:10
chrX	67412906	rs1191948	G	A	2138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=48;PP=1572;SC=GGTACACTAGGGTCAATTCAG;SOR=2.636;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=61;TCF=13;TCR=48;TR=61;WE=67412914;WS=67412896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chrX	67429834	rs78913959	CTT	C,CT	634.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=13;HapScore=3;MGOF=3;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=23;NF=26,26;NR=1,1;PP=37,292;SC=TCAGTTTCTCCTTTTTTTTTT;SOR=5.283;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=40;TCF=37;TCR=3;TR=27,27;WE=67429855;WS=67429824;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.32,0.68:28
chrX	67431814	rs2225124	A	G	766.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=2;PP=610;SC=TATACTAAATATTTGTGATCC;SOR=4.003;SbPval=0.88;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=21;WE=67431822;WS=67431804;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	67719085	rs12843249	G	T	1119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=29;PP=912;SC=GGCCCTTCTTGTACCCGATGC;SOR=3.675;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=4;TCR=29;TR=33;WE=67719093;WS=67719075;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chrX	68428370	rs186632689	G	A	110.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=84;SC=CACAGTGCCCGGCCCAAAAGT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=68428378;WS=68428360;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	68749098	rs56145324	G	A	954.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=22;PP=680;SC=TAACAACAGGGGAGTCAGGTG;SOR=3.334;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=24;TCF=2;TCR=22;TR=24;WE=68749106;WS=68749088;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chrX	68749379	rs35383499	G	A	1341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=4;PP=1250;SC=TCAGCTCCCCGAGCACCCCAC;SOR=4.125;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=46;TCF=42;TCR=4;TR=46;WE=68749387;WS=68749369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	68837799	rs183491066	T	C	366.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=11;PP=308;SC=CATTGTAAAGTTGCCCTGAGC;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=68837807;WS=68837789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	68890027	.	G	GTTTTT	151.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.57;QD=30.38;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	68890047	.	C	T	128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.272;ClippingRankSum=-0.000;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=3.680;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.88;MQRankSum=-0.674;QD=16.10;ReadPosRankSum=-1.718;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:4,4:0.50:8
chrX	68890248	rs5936723	C	T	272.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=223;SC=TAACTGTTTGCGAACTTTTGA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=68890256;WS=68890238;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	68890298	rs5980833	C	G	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=8;PP=198;SC=CCCAAGACTTCGGAAGTTGTC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=68890306;WS=68890288;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	69080840	rs1203003	G	A	1383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=30;PP=1180;SC=CTGTTAAATGGACATTTATAT;SOR=1.900;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=12;TCR=30;TR=42;WE=69080848;WS=69080830;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	69250308	rs2296765	C	T	1895.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=32;PP=1276;SC=CTATCCTTCTCATCCTGCCAG;SOR=1.057;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=55;TCF=23;TCR=32;TR=55;WE=69250316;WS=69250298;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chrX	69262423	rs2296767	T	C	330.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=11;PP=307;SC=GGGAGCAAAGTAGCAGTAAGC;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=69262431;WS=69262413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	69262854	.	CTCT	C	214	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;FR=1.0000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MMLQ=28;MQ=60.0;NF=4;NR=0;PP=214;QD=60.0;SC=TCAAAACCCCCTCTTCTTCTT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=69262864;WS=69262853;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	69368853	rs650028	T	C	1051.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=35;PP=846;SC=CTGAGGTGGGTGGATCACCTG;SOR=5.838;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=36;TCF=1;TCR=35;TR=36;WE=69368861;WS=69368843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chrX	69397388	rs1199509	A	G	4173.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=45;PP=2965;SC=AGAAGTTTTGACCTTCTGGTT;SOR=1.452;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=122;TCF=77;TCR=45;TR=121;WE=69397396;WS=69397378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chrX	69397552	rs1199510	G	A	1065.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=1.146;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=30;PP=849;ReadPosRankSum=2.004;SC=AGCACATGGGGAACAAACCAA;SOR=5.610;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=31;TCF=0;TCR=31;TR=30;WE=69397560;WS=69397542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,32:0.97:33
chrX	69459945	rs1152194	C	T	1225.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=5;PP=987;SC=AAGAGGAGGTCCTAACACTTT;SOR=3.556;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=33;TCR=5;TR=38;WE=69459953;WS=69459935;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chrX	69478942	rs1152187	T	G	5281.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.905;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=169;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=66;NR=95;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.673;SC=GGTCCCTTTGTTGCTGGTTGT;SOR=0.429;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=162;TCF=66;TCR=96;TR=161;WE=69478950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,168:0.99:169
chrX	69502478	rs1713746	CA	TG	3288.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;JOINED;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=25;PP=2947;SC=ACATTTTTGCCACTCTTCTTG;SOR=1.061;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=63;TCF=37;TCR=26;TR=59;WE=69502487;WS=69502468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chrX	69504669	rs1199471	C	T	927.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=30;PP=790;SC=CCGCATCTCACAGCTACTGGG;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=69504677;WS=69504659;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chrX	69510335	rs1199470	C	T	1019.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=0;PP=871;SC=AGGGAATTCCCGTAAGAGTGG;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=30;WE=69510343;WS=69510325;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	69522428	rs1199448	C	T	543.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=17;PP=456;SC=TTCTCTAATTCAGGTATGAGA;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=17;WE=69522436;WS=69522418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	69561780	rs1199457	T	G	1858.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.529;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.300;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=32;PP=1439;ReadPosRankSum=-0.616;SC=AGGATCATTTTGGTAAGCCCC;SOR=0.485;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=61;TCF=29;TCR=32;TR=60;WE=69561788;WS=69561770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,61:0.98:62
chrX	69572242	rs1199428	G	A	133.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=74;SC=TTTTATAAGAGCTACACAATT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=69572250;WS=69572234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	69573639	rs1199429	C	T	2212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=46;PP=1682;SC=AACTGCAGCCCATTCAGTACC;SOR=1.643;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=68;TCF=22;TCR=46;TR=68;WE=69573647;WS=69573629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chrX	69639698	rs1886892	G	T	1158.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=21;PP=830;SC=TTATCTATGAGAGACCAGTAG;SOR=1.236;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=35;TCF=14;TCR=21;TR=35;WE=69639706;WS=69639688;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chrX	69645051	rs7892451	C	T	2174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=40;SC=GCTCTCTCTCCCAGGAAGAAA;SOR=1.376;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=64;TCF=24;TCR=40;TR=64;WE=69645059;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chrX	69668463	rs2281868	A	G	2495.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=48;PP=2001;SC=GAACCCTGAGACACTGAAGCA;SOR=1.252;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=79;TCF=30;TCR=49;TR=77;WE=69668471;WS=69668453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chrX	69672462	rs12850410	G	C	250.22	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.524;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=0.9784;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=-0.000;NF=6;NR=3;PP=199;ReadPosRankSum=1.036;SC=AGGGGAGAGAGAGAGGAGCTA;SOR=0.569;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=10;TCF=7;TCR=3;TR=9;WE=69672470;WS=69672452;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:1,9:0.90:10
chrX	69672655	rs12010766	T	C	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;BaseQRankSum=0.427;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=7;NR=17;PP=609;ReadPosRankSum=-0.883;SC=AGGGAGGGAGTCTCGCCCCTG;SOR=0.638;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=24;WE=69672663;WS=69672645;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,24:0.96:25
chrX	69673811	rs2274309	T	C	243.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.47;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=5;PP=170;SC=GGACCGGGACTAGACTTATCT;SOR=1.863;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=6;TCF=1;TCR=5;TR=6;WE=69673819;WS=69673801;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	69718314	rs1886890	C	T	1136.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;BaseQRankSum=0.771;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=13;PP=892;ReadPosRankSum=-0.635;SC=ACGGGGAGTACTGTACAGAAG;SOR=0.527;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=37;WE=69718322;WS=69718304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,38:0.97:39
chrX	69718533	rs3215810	CTCAT	C	322.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=0;NR=7;PP=335;SC=GAAGGCTTGACTCATGGCACA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=7;WE=69718544;WS=69718523;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	69749852	rs1536250	AT	GA	1321.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=23;PP=1479;SC=TAGTCTTTCTATAATCCAAGA;SOR=2.621;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=28;WE=69749861;WS=69749842;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	69774517	rs4844240	A	T	2292.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=50;NR=20;PP=1688;SC=TTGTTTCAAAAGTTTTAGTTT;SOR=1.981;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=70;TCF=50;TCR=20;TR=70;WE=69774525;WS=69774507;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chrX	69825109	rs17301881	A	G	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=1;PP=613;SC=GGAATTAGCCATTACAAACTT;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=69825117;WS=69825099;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	69826685	rs12014919	C	T	39.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=0;PP=22;SC=TTCCTGCTTACATATATATTA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=2;TCR=0;TR=2;WE=69826693;WS=69826675;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chrX	69827014	rs73216791	T	C	114.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=28.51;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	69898742	rs55853716	GA	G	282.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=3;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=25;NF=1;NR=13;PP=212;SC=TTGGTGAGCTGAAAAAAAAAA;SOR=3.611;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=14;WE=69898751;WS=69898732;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	69964084	rs5902674	G	GA	278.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=2;NR=9;PP=258;SC=CATTAAAAAGGAAAAAAAATA;SOR=2.494;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=12;TCF=2;TCR=10;TR=11;WE=69964092;WS=69964074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	70148927	rs5936605	T	A	2229.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=62;PP=1802;SC=AGTCCCTGCCTTTTTCACCTA;SOR=4.468;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=66;TCF=4;TCR=62;TR=66;WE=70148935;WS=70148917;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chrX	70149360	rs5936606	G	A	558.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=8;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=4;PP=403;SC=CAGCAAACCCGCACATTTAGG;SOR=1.981;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=13;TCR=4;TR=17;WE=70149368;WS=70149356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	70282696	rs34211894	A	G	1362.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=8;PP=1103;SC=CAGAGAACAAAGCCATACCTT;SOR=2.780;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=33;TCR=8;TR=41;WE=70282704;WS=70282686;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	70321631	rs5980742	T	G	2476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=25;NR=51;PP=2049;SC=CATAGCCTATTACCACTCCTA;SOR=1.640;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=76;TCF=25;TCR=51;TR=76;WE=70321639;WS=70321621;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chrX	70324157	rs1130009	C	T	2192.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.213;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=33;PP=1830;ReadPosRankSum=1.634;SC=CCGGGACACTCGCAGGGGGTT;SOR=0.247;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=35;TCR=33;TR=67;WE=70324165;WS=70324147;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,68:0.99:69
chrX	70324397	rs12857595	G	A	846.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=12;PP=721;SC=GGAGATATACGGAGAAGATGG;SOR=0.770;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=13;TCR=12;TR=25;WE=70324405;WS=70324387;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	70339498	rs12850852	C	T	1336.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=14;PP=1020;SC=CCTGTCTGCCCCTTCTTCCCA;SOR=1.455;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=39;TCF=25;TCR=14;TR=39;WE=70339506;WS=70339488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chrX	70340738	rs4844282	A	G	755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=29;NR=0;PP=668;SC=GATTACAGGCATGAGCCACCG;SOR=6.666;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=29;TCF=29;TCR=0;TR=29;WE=70340746;WS=70340728;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chrX	70341122	.	T	TACTTTATCTGCTTC	1604.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=4;PP=2900;SC=TCTTTTCATTTACTTTATCTG;SOR=3.912;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=24;TCF=19;TCR=5;TR=18;WE=70341130;WS=70341112;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	70341169	rs62609586	A	C	1711.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=60;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=9;PP=1431;SC=CTCCCCTGGTACCCATAGGAT;SOR=2.970;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=50;TCF=41;TCR=9;TR=50;WE=70341177;WS=70341159;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chrX	70342820	rs7053139	A	G	2752.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.798;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=42;NR=39;PP=2316;ReadPosRankSum=-0.895;SC=AGCAGAGCATATCTGCAGAAA;SOR=0.243;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=82;TCF=43;TCR=39;TR=81;WE=70342828;WS=70342810;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,82:0.99:83
chrX	70343621	rs12841977	A	G	2132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.82;QD=29.62;SOR=1.148;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chrX	70344331	rs59024650	G	C	877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=21;PP=612;SC=TTGCCTGGGGGAGGGGGGTAG;SOR=4.332;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=70344339;WS=70344321;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chrX	70344763	rs5030616	G	T	3909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=-0.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=8.186;HP=8;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=85;NR=54;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.765;SC=CTTTTGGCATGTTTTTTTGCC;SOR=0.080;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=145;TCF=90;TCR=55;TR=139;WE=70344771;WS=70344752;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:4,147:0.97:151
chrX	70345683	rs73214869	T	G	1042.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=25;PP=728;SC=AAACCTTTGCTTCACTGTCCC;SOR=2.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=31;TCF=6;TCR=25;TR=31;WE=70345691;WS=70345673;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chrX	70348344	rs5030618	G	A	990.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=17;PP=773;SC=GCAGGGGGCTGGTTGTGATCC;SOR=1.143;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=28;TCF=11;TCR=17;TR=28;WE=70348352;WS=70348334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	70349947	rs5030619	A	C	715.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;BaseQRankSum=-1.690;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=22;PP=598;ReadPosRankSum=-0.968;SC=TGCAAGACCCAGTGTTGAGTA;SOR=1.542;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=29;TCF=6;TCR=23;TR=28;WE=70349955;WS=70349937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chrX	70352417	rs10521349	T	C	876.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=18;PP=679;SC=TGGACCAAGATTGAGGGGTAG;SOR=1.609;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=25;TCF=7;TCR=18;TR=25;WE=70352425;WS=70352407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	70352516	rs12843026	A	G	331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.41;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=7;PP=244;SC=AAGAGTGGGCATGGCTGAGCA;SOR=2.494;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=2;TCR=7;TR=9;WE=70352524;WS=70352506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	70352617	.	CCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTT	C	370.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=15;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.07;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	70355258	rs34862123	CTT	C	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=7;PP=310;SC=GAGCAAATCACTTAACTTTCC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=70355267;WS=70355248;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	70361608	rs7056408	T	C	208.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=111;SC=GCCAAGATCATGCCACTGCAC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=70361616;WS=70361598;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	70361651	.	C	CA	164.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.08;BaseQRankSum=-0.660;ClippingRankSum=-0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=0.6735;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=23;MQRankSum=-0.349;NF=7;NR=1;PP=100;ReadPosRankSum=0.285;SC=GACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SOR=1.802;SbPval=0.94;Source=Platypus;TC=19;TCF=13;TCR=6;TR=8;WE=70361659;WS=70361641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:3,8:0.73:11
chrX	70361967	rs36072155	G	A	3384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=53;NR=50;PP=2484;SC=AGCTTTCCTCGTGCATACCCA;SOR=0.767;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=103;TCF=53;TCR=50;TR=103;WE=70361975;WS=70361957;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,110:1.00:110
chrX	70469182	rs2341539	G	A	2545.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=17;PP=2013;SC=AAAACATAACGGATACAATTG;SOR=2.720;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=74;TCF=57;TCR=17;TR=74;WE=70469190;WS=70469172;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chrX	70609368	rs151185299	T	TA	986.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.34;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=9;PP=609;SC=TTGTATTCAGTAAAAAAAAAA;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=34;TCF=23;TCR=11;TR=29;WE=70609376;WS=70609358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	70617443	rs5980760	A	G	778.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=23;PP=716;SC=AGTGATTCTCATGCCTCAACT;SOR=6.439;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=0;TCR=23;TR=23;WE=70617451;WS=70617433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	70774984	rs376605851	TTGTG	T	120	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=30.00;SOR=3.258;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	71349753	rs12397326	G	A	4702.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=0.203;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.407;HP=5;HapScore=1;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=36;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.424;SC=GCACAGGGGGGCGTCTTCGAA;SOR=0.422;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=153;TCF=117;TCR=36;TR=150;WE=71349761;WS=71349743;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,154:0.98:157
chrX	71349774	rs12393722	T	C	6299.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.970;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=205;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=136;NR=60;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.016;SC=CTTGGCGTTGTCCTAAACGAC;SOR=1.090;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=200;TCF=139;TCR=61;TR=196;WE=71349782;WS=71349764;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,200:0.99:203
chrX	71351443	rs62614085	A	G	1113.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=30;PP=892;SC=GGGAACTGGAACTACGGGCGG;SOR=5.610;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=31;TCF=1;TCR=30;TR=31;WE=71351451;WS=71351433;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	71352187	rs7471996	C	G	494.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=1;NR=12;PP=354;SC=AAGATAAAGACAGAGAGTTTA;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=13;TCF=1;TCR=12;TR=13;WE=71352195;WS=71352177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	71357093	rs6625949	G	A	969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=27;PP=855;SC=CACCACAGCTGATTCCCCAGT;SOR=6.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=28;TCF=1;TCR=27;TR=28;WE=71357101;WS=71357083;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chrX	71357160	rs6625950	G	T	305.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=280;SC=TGTGGTGATGGGGAACAGGAA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=71357168;WS=71357150;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	71363415	rs6624597	C	T	2832.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=26;NR=58;PP=2253;SC=CCGATAACCCCAGTACCTAAG;SOR=1.584;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=26;TCR=58;TR=84;WE=71363423;WS=71363405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chrX	71364479	rs11094247	A	C	3128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=83;PP=2654;SC=CTGTTCCAAAAACCAAGAACA;SOR=4.525;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=8;TCR=83;TR=91;WE=71364487;WS=71364469;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chrX	71379702	rs7884806	T	C	2655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=46;NR=38;PP=2170;SC=ATCATGATTATCTACTGGGAC;SOR=0.867;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=84;TCF=46;TCR=38;TR=84;WE=71379710;WS=71379692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chrX	71379853	rs7880917	C	T	1681.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=31;PP=1292;SC=GAAATGCCTCCGCTGAAGGCC;SOR=1.436;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=16;TCR=31;TR=47;WE=71379861;WS=71379843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chrX	71380152	rs7881332	C	T	941.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=25;PP=759;SC=TGGTGTGACCCGATATATGAT;SOR=4.479;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=27;TCF=2;TCR=25;TR=27;WE=71380160;WS=71380142;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chrX	71401607	rs6525589	G	A	582.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.29;QD=44.83;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	71401614	rs7058353	C	A	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.42;QD=42.92;SOR=1.244;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	71493691	rs7580	C	T	3901.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=56;PP=2965;SC=TGCCAGTCTCCAAATCAATCT;SOR=0.726;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=114;TCF=58;TCR=56;TR=113;WE=71493699;WS=71493681;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,120:1.00:120
chrX	71495344	rs3827426	C	T	2434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=21;PP=1858;SC=TATTTGGATACCATAGGGCTG;SOR=1.734;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=51;TCR=21;TR=72;WE=71495352;WS=71495334;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chrX	71495388	rs34563981	T	TCTA	4272.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=39;PP=2967;SC=ATTTAAAACTTCTTACCCATG;SOR=0.969;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=82;TCF=40;TCR=42;TR=74;WE=71495396;WS=71495378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chrX	71495869	rs3747303	A	G	1058.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=3;PP=940;SC=TTGGAAGTGGAGGACAGCTAG;SOR=3.981;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=30;TCF=27;TCR=3;TR=30;WE=71495877;WS=71495859;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chrX	71518799	rs5958780	G	T	3522.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=29;NR=78;PP=2735;SC=CTCAGACCAAGGCTTACACCA;SOR=2.100;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=29;TCR=78;TR=107;WE=71518807;WS=71518789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chrX	71521867	rs3012627	G	C	2303.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=42;PP=1887;SC=GTTTCTGCAGGTGCATACTAG;SOR=1.418;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=68;TCF=25;TCR=43;TR=67;WE=71521875;WS=71521857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chrX	71813191	rs200569284	C	CT	711.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.148;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.02;MQRankSum=0.073;QD=20.34;ReadPosRankSum=-1.327;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,32:0.91:35
chrX	71915583	rs138066694	G	A	113.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.43;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=0;PP=87;SC=GGGCTAAGAAGAGCAGGTACA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=4;TCR=0;TR=4;WE=71915591;WS=71915573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	71933512	.	TCACACACA	T,TCA	1424.73	.	AC=1,1;AF=0.500,0.500;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=0.000;DP=73;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=4.906;HP=1;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=24;MQRankSum=2.207;NF=20,20;NR=4,4;PP=1297,289;ReadPosRankSum=-0.694;SC=AAGGTCTCCGTCACACACACA;SOR=3.180;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=55;TCF=44;TCR=11;TR=24,24;WE=71933527;WS=71933502;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.30,0.63:43
chrX	73042268	.	AT	A	962.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.280;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=2.615;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=2.206;NF=12;NR=28;PP=831;ReadPosRankSum=0.504;SC=GAAGGCATGCATTTTTTTCCC;SOR=1.013;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=93;TCF=36;TCR=57;TR=40;WE=73042276;WS=73042258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:55,47:0.46:102
chrX	73071940	.	T	A	46.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.786;ClippingRankSum=0.000;DP=220;ExcessHet=3.0103;FS=119.108;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.83;MQRankSum=-2.848;QD=0.22;ReadPosRankSum=-2.586;SOR=7.784;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:164,50:0.23:214
chrX	73524039	.	G	C	481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=1;PP=466;SC=CGCCCAAAGCGGGGTTGCGCC;SOR=4.047;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=73524047;WS=73524029;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	74332585	rs4148838	G	GT	760.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-0.541;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=0;PP=553;ReadPosRankSum=1.062;SC=CAATTAATATGTTTTTTTTTT;SOR=4.235;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=33;TCF=33;TCR=0;TR=30;WE=74332593;WS=74332575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,32:0.91:35
chrX	74375871	rs1039123	G	C	618.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=17;NR=2;PP=443;SC=CCCGAGGTCAGGAGGGCAACC;SOR=3.716;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=17;TCR=2;TR=19;WE=74375879;WS=74375861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	74376420	rs5981325	C	T	2169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.02;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=13;PP=1748;SC=AACGAATCATCTCTTCGTGCG;SOR=2.833;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=55;TCR=13;TR=68;WE=74376428;WS=74376410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chrX	74494470	rs4892396	T	G	2939.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=18;NR=68;PP=2311;SC=CCATCATCCGTGACAAGTAAG;SOR=2.636;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=86;TCF=18;TCR=68;TR=86;WE=74494491;WS=74494460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chrX	74494483	rs5981831	A	G	2557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=61;PP=2051;SC=CAAGTAAGCCAAGAGCGGAAG;SOR=2.985;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=76;TCF=14;TCR=62;TR=75;WE=74494491;WS=74494460;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chrX	74511202	rs5981834	G	C	748.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=602;SC=TTATCAGATAGAAGATAATTA;SOR=4.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=74511210;WS=74511192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	74517585	rs41307373	C	T	279.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=9;PP=230;SC=AACTACAGAGCGTATTCCCTA;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=0;TCR=9;TR=9;WE=74517593;WS=74517575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	74523367	rs972561	A	G	140.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=125;SC=TAAAATAATTATCTTATGTAA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=74523375;WS=74523357;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	74598903	rs5937369	G	A	1423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=2;PP=1162;SC=CTCCCAAGCCGCCTTCTTAGC;SOR=5.283;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=43;TCF=41;TCR=2;TR=43;WE=74598911;WS=74598893;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chrX	74961968	rs5938183	G	A	1615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=52;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=30;PP=1151;SC=GTTCCTTATCGTTTCCATCAT;SOR=1.480;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=45;TCF=15;TCR=30;TR=45;WE=74961976;WS=74961958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chrX	75395172	rs2301863	T	C	878.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.553;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.9985;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=19;NR=0;PP=458;ReadPosRankSum=0.347;SC=TGATTTCATCTAGGATGTAGA;SOR=4.003;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=19;WE=75395180;WS=75395162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,21:0.91:23
chrX	75395187	rs2301862	C	T	1128.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-0.852;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=28;NR=0;PP=744;ReadPosRankSum=-1.224;SC=TGTAGACTGTCGACACTTCCT;SOR=4.680;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=30;TCR=0;TR=28;WE=75395195;WS=75395177;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:2,30:0.94:32
chrX	76139959	rs232961	C	T	180.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=6;PP=145;SC=TTTTTTAAGACGCATGTGTAG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=76139967;WS=76139949;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	76937963	rs3088074	G	C	3368.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.023;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=68;NR=32;PP=2715;ReadPosRankSum=0.660;SC=GTAAAACTCTGCTCTTTCCCA;SOR=0.707;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=101;TCF=69;TCR=32;TR=100;WE=76937971;WS=76937953;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,104:0.99:105
chrX	76940534	rs35268552	A	G	767.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=22;PP=647;SC=AATTTAATTCAAAATTGATAA;SOR=3.442;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=25;TCF=3;TCR=22;TR=25;WE=76940542;WS=76940524;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	77086467	.	TTTTTA	T	267.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=44;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.25;QD=38.25;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	77112934	.	C	T	1811.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.695;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.205;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=34;NR=28;PP=1410;ReadPosRankSum=-0.789;SC=TATGTATCACCCCGTTTGGGT;SOR=0.547;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=66;TCF=35;TCR=31;TR=62;WE=77112942;WS=77112924;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,62:0.95:65
chrX	77254265	.	G	GT	517.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=14;PP=552;SC=TTGTAACTATGTTATGATTCT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=19;TCF=0;TCR=19;TR=14;WE=77254273;WS=77254255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	77258788	.	G	A	813.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=3.968;ClippingRankSum=0.000;DP=65;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=6.796;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=2;NR=26;PP=591;ReadPosRankSum=0.645;SC=AACTTGGTAAGGTTCAGAGAA;SOR=0.070;SbPval=0.22;Source=Platypus;TC=63;TCF=2;TCR=61;TR=28;WE=77258796;WS=77258778;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:35,30:0.46:65
chrX	77268502	rs2227291	G	C	3456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=72;PP=2965;SC=TATTCTTCTAGTTGCAATGTA;SOR=1.655;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=104;TCF=32;TCR=72;TR=104;WE=77268510;WS=77268492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chrX	77276413	rs113968994	C	A	881.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.482;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=5;PP=800;ReadPosRankSum=-1.602;SC=GCTTCTTCTTCTTATTATTGT;SOR=1.765;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=31;TCF=26;TCR=5;TR=30;WE=77276421;WS=77276403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chrX	77295697	rs372964672	GCC	G	79.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=11;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=2;PP=32;SC=GTCTCTCTCTGCCCCCCCCCC;SOR=1.179;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=2;WE=77295706;WS=77295687;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrX	77296047	rs5913631	G	C	1645.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=11;PP=1208;SC=TCTCCTTTCAGTATATTCCAA;SOR=2.259;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=48;TCF=37;TCR=11;TR=48;WE=77296055;WS=77296037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chrX	77298857	rs4826245	G	A	1050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=13;PP=782;SC=CTTATCAAGAGAGACAGTCAA;SOR=1.308;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=34;TCF=21;TCR=13;TR=33;WE=77298865;WS=77298847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chrX	77528317	rs320995	G	A	2633.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=52;NR=29;PP=2016;SC=AATGCTTTCTGAATGTAGACA;SOR=1.501;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=52;TCR=29;TR=81;WE=77528325;WS=77528307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chrX	77913569	rs4077512	G	A	2389.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=44;PP=1900;SC=GTTGCTGGAGGCGCCAGGGAC;SOR=1.079;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=75;TCF=31;TCR=44;TR=75;WE=77913577;WS=77913559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chrX	78617053	rs1736662	A	G	1008.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=30;PP=893;SC=TAAAAGTGCAAGTTTGTTACT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=30;TCF=0;TCR=30;TR=30;WE=78617061;WS=78617043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	78617999	rs1751133	T	C	576.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=11;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=0;PP=455;SC=TTTGGACAAATTCATTATTTT;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=78618007;WS=78617989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	78618050	rs1751134	A	G	1469.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=9;PP=1211;SC=AAATGCTTATATAAAAATTTG;SOR=2.737;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=45;TCF=36;TCR=9;TR=45;WE=78618058;WS=78618040;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chrX	79698593	rs1113265	C	G	5096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=93;NR=56;PP=2965;SC=CCATGTTAGACTTCTACAGTG;SOR=1.294;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=150;TCF=94;TCR=56;TR=149;WE=79698601;WS=79698583;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,153:1.00:153
chrX	79937084	rs3122406	G	A	369.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=12;PP=306;SC=CCATATCTCTGTTATTTTATT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=0;TCR=12;TR=12;WE=79937092;WS=79937074;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	79942599	rs3029738	GTATA	G	499.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=9;PP=483;SC=CTGTATGTGTGTATATATATA;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=0;TCR=18;TR=9;WE=79942610;WS=79942589;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	79943569	rs3122407	T	C	3737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=120;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=71;PP=2887;SC=TTTACTCACCTTTCTTCCAGA;SOR=1.530;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=36;TCR=71;TR=107;WE=79943577;WS=79943559;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,117:1.00:117
chrX	79999796	rs58601634	T	TCAC	772.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=13;PP=763;SC=AAGCAGAAATTCACAATACCC;SOR=4.294;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=14;WE=79999804;WS=79999786;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	80064910	rs200402115	A	AC	1394.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;BaseQRankSum=0.909;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.776;NF=6;NR=39;PP=1258;ReadPosRankSum=0.559;SC=TTCCCTTAGCACCCCCCCACC;SOR=0.743;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=54;TCF=6;TCR=48;TR=45;WE=80064918;WS=80064900;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,50:0.94:53
chrX	82764040	rs5921978	A	G	3817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.94;QD=44.91;SOR=0.922;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chrX	82764040	.	AGG	GGC	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MMLQ=24;MQ=59.95;NF=45;NR=34;PP=2947;QD=20;SC=GCAGGTTCGAAGGCTTGCAGC;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=84;TCF=47;TCR=37;TR=79;WE=82764050;WS=82764030;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:5,79:0.94:84
chrX	82764042	rs5921979	G	C	3817.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=59.94;QD=45.45;SOR=1.013;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chrX	83119939	rs5922000	T	C	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=571;SC=TTGAATAGCCTAAAAACTTAG;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=83119947;WS=83119929;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	83124802	rs5968237	A	T	149.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=1;PP=119;SC=GATAGATTACATAAAAAAATA;SOR=1.981;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=83124810;WS=83124792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	83442983	.	CCCGCCGCCGCCG	C	885.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.870;ClippingRankSum=0.000;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=18;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=14;PP=2995;ReadPosRankSum=0.475;SC=ATTGAACTGGCCCGCCGCCGC;SOR=3.352;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=43;TCF=4;TCR=39;TR=14;WE=83443002;WS=83442973;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,21:0.95:22
chrX	83588660	rs5922965	A	G	63.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=1;PP=42;SC=GAATTAATGCAGAGCCTTAGA;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=83588668;WS=83588654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrX	84189813	rs6623210	A	G	3977.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=121;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=41;NR=78;PP=2965;SC=AGAATAGCTAAAGACTGGACT;SOR=1.552;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=120;TCF=41;TCR=79;TR=119;WE=84189821;WS=84189803;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,121:1.00:121
chrX	84534383	rs2227090	A	C	1348.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.302;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=28.10;ReadPosRankSum=2.110;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,44:0.92:48
chrX	85166221	.	A	AAT	317.74	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.806;ClippingRankSum=0.000;DP=12;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=56.40;MQRankSum=-0.224;QD=26.48;ReadPosRankSum=0.581;SOR=3.611;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:1,11:0.92:12
chrX	85906213	rs6623751	C	T	1171.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=28;PP=883;SC=TCTTACTGTTCTATTGTGGGG;SOR=2.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=35;TCF=7;TCR=28;TR=35;WE=85906221;WS=85906203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chrX	86869103	rs5924064	A	G	3047.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=80;PP=2397;SC=TAAATAAGAGATAATGAGTAC;SOR=3.935;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=91;TCF=11;TCR=80;TR=91;WE=86869111;WS=86869093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,95:1.00:95
chrX	86869348	rs5922464	C	A	845.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=2;PP=691;SC=AACAGACTCACTAGTGTTACA;SOR=3.528;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=21;TCR=2;TR=23;WE=86869356;WS=86869338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	86872866	rs5924069	G	T	701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=595;SC=AAAAAAAAATGTCAACTAGTT;SOR=4.712;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=86872874;WS=86872856;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	86887244	rs222084	C	T	1381.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=4;PP=1226;SC=ACCTCAGGACCAACAGTTGGC;SOR=4.073;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=43;TCF=39;TCR=4;TR=43;WE=86887252;WS=86887234;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	88008423	rs5940915	A	C	1248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=27;NR=6;PP=924;SC=AGGATGAGTTATCCTACTAAA;SOR=3.086;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=27;TCR=6;TR=33;WE=88008431;WS=88008413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chrX	88009322	rs5984613	A	G	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=14;PP=457;SC=TGGGAATTAAATTAAATTGGG;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=4;TCR=14;TR=18;WE=88009330;WS=88009312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	89177024	rs5983979	A	G	394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=0;PP=454;SC=TCCCAAACCTACCTTTGTCCT;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=16;TCR=0;TR=16;WE=89177032;WS=89177014;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	89177673	rs2290380	G	A	5610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=89;NR=85;PP=2965;SC=CAAGGTTTCTGTCACATCCCC;SOR=0.785;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=176;TCF=90;TCR=86;TR=174;WE=89177681;WS=89177663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chrX	91518011	rs5903000	CA	C	147.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=16.42;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	92927634	rs1045686	G	C	3474.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=104;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=54;PP=2828;SC=ATTTCTTTAGGAACTTCCTTT;SOR=0.900;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=101;TCF=47;TCR=54;TR=101;WE=92927642;WS=92927624;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chrX	95990839	rs20386	A	T	953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=14;PP=618;SC=GTTGCCTTTTAATTAAAATGG;SOR=0.811;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=30;TCF=16;TCR=14;TR=30;WE=95990847;WS=95990829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,34:1.00:34
chrX	95990883	rs5949989	A	G	624.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=16;PP=537;SC=TGTAAGATACAAAATGTCTGG;SOR=2.531;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=4;TCR=16;TR=20;WE=95990891;WS=95990873;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	96013128	rs2297827	C	T	3367.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=85;NR=15;PP=2735;SC=TTATCAATGCCCACAGTAAAT;SOR=3.281;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=85;TCR=15;TR=100;WE=96013136;WS=96013118;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chrX	96018052	rs11339405	GT	G	1119.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.39;QD=24.88;SOR=1.414;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chrX	96194483	.	G	GTGTGTATATATATATA	175.87	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=323;SC=ATATGTGTGTGTATGTATATA;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=96194491;WS=96194473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	96196880	rs1494130	A	G	224.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=159;SC=TTGTCCTAAGAAAGTGTAGTG;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=96196888;WS=96196870;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	96197175	rs5920973	G	A	625.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=15;PP=542;SC=ATTGTGTTTTGTGCCTTCTGT;SOR=2.093;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=5;TCR=15;TR=20;WE=96197183;WS=96197165;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	96200679	rs20368	A	G	361.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=303;SC=GAGGGCTTCTAAATGTTTCAT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=0;TCR=11;TR=11;WE=96200687;WS=96200669;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	96213213	rs5966792	T	C	514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=14;PP=438;SC=TGTGTACACATTGTATAATGT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=14;TCF=0;TCR=14;TR=14;WE=96213221;WS=96213203;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	96502572	.	G	T	676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=0;PP=541;SC=TTTATAAGCAGTAATTCAGAA;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=18;WE=96502580;WS=96502562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	99919733	rs2022475	G	A	741.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=19;NR=4;PP=563;SC=CCAGATAGTCGCACAAGCCAC;SOR=3.442;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=23;TCF=19;TCR=4;TR=23;WE=99919741;WS=99919723;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	99930886	rs10623103	T	TAC	313.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=338;SC=TACATGTTTGTACACATACAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=7;WE=99930900;WS=99930876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	99930892	rs4828041	T	C	344.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=350;SC=TTTGTACACATACACACACAC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=99930900;WS=99930876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	99936147	rs4828043	A	G	393.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=2;PP=299;SC=AACAGTGCTAACCAGTAGCCA;SOR=2.670;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=9;TCR=2;TR=11;WE=99936155;WS=99936137;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	99941705	rs2022039	T	C	1923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=26;PP=1617;SC=AGTGGATTAATAGTGTCCCGC;SOR=1.071;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=62;TCF=35;TCR=27;TR=61;WE=99941713;WS=99941695;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chrX	100075741	rs2859166	T	G	813.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=45.21;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	100075747	rs2859167	T	C	719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=42.34;SOR=4.294;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	100077193	rs2859168	C	T	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=1;PP=518;SC=AGCAGGAACCCTGTATGTGTG;SOR=4.407;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=18;TCF=17;TCR=1;TR=18;WE=100077201;WS=100077183;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	100087557	rs5921665	A	G	57.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=0;PP=36;SC=TCTAGAATACATGGATTTATA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=3;TCR=0;TR=3;WE=100087565;WS=100087551;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrX	100098355	rs148448908	TAAG	T	1157.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=16;PP=974;SC=TGAGCAAAAATAAGAATAAAT;SOR=1.101;SbPval=0.69;Source=Platypus;TC=22;TCF=6;TCR=16;TR=21;WE=100098365;WS=100098345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chrX	100105418	rs5921669	A	G	1786.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=44;PP=1499;SC=AACTCTAATGACGACAGGGAC;SOR=3.098;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=9;TCR=44;TR=53;WE=100105426;WS=100105408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chrX	100212525	rs6616208	T	C	1169.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=30;PP=898;SC=AAGCTGTTGGTTGAAATCATA;SOR=3.442;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=5;TCR=30;TR=35;WE=100212533;WS=100212515;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chrX	100242305	rs5921702	G	A	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=340;SC=CTCTTTGAATGAGAGTGACTG;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=100242313;WS=100242295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	100243459	rs3934462	G	T	2701.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=86;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=74;PP=2247;SC=CTAGGAGAATGAGAGCTCAGA;SOR=6.019;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=3;TCR=74;TR=77;WE=100243467;WS=100243449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chrX	100245606	rs6523438	A	G	4357.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=152;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=81;NR=64;PP=2965;SC=GATGGCATCCATTGAGAATGA;SOR=0.864;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=145;TCF=81;TCR=64;TR=145;WE=100245614;WS=100245596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,150:1.00:150
chrX	100265552	rs5921705	T	A	754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=17;NR=8;PP=566;SC=AATAGCCTGCTGTCTTCTAGG;SOR=1.609;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=17;TCR=8;TR=25;WE=100265560;WS=100265542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	100265713	rs7885599	T	C	1050.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.341;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.921;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=21;PP=813;ReadPosRankSum=-0.777;SC=AAACAGAACATAGCATCAGTT;SOR=0.956;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=35;TCF=14;TCR=21;TR=34;WE=100265721;WS=100265703;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chrX	100268841	rs5967226	C	T	76.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.6;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=30;NF=0;NR=2;PP=26;SC=CTTTGGGAGGCTGAGGTGGGA;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=100268849;WS=100268831;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrX	100275630	rs200657512	AGTTT	A	4374.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=70;PP=2977;SC=TAGGTGTGGTAGTTTGTTTGT;SOR=2.549;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=13;TCR=81;TR=81;WE=100275641;WS=100275620;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chrX	100357485	.	T	TAC	68.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=1;NR=2;PP=151;SC=TATATATATATACACACACAC;SOR=1.179;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=3;WE=100357493;WS=100357475;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrX	100400023	rs2295376	A	G	1440.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=0;PP=1087;SC=TTGCTACTCTATATCTGAATG;SOR=7.476;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=35;WE=100400031;WS=100400013;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	100547933	rs5951328	A	G	2347.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=33;PP=1718;SC=ACGGTCGACAAGAATTTGGGG;SOR=0.774;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=70;TCF=37;TCR=33;TR=70;WE=100547941;WS=100547923;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chrX	100604757	rs700	T	G	1997.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=1;PP=1684;SC=AGGGGCCTTTTTGTATTGAGT;SOR=6.701;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=55;TCF=54;TCR=1;TR=55;WE=100604765;WS=100604747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chrX	100609547	rs2071223	G	A	2339.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=11;PP=1861;SC=GATTAAAACTGTAACACCTAC;SOR=3.383;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=72;TCF=61;TCR=11;TR=72;WE=100609555;WS=100609537;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chrX	100615025	rs5951412	G	T	1117.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=0;PP=890;SC=TATATATATAGAGAGAGAGAG;SOR=7.168;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=35;TCF=35;TCR=0;TR=34;WE=100615033;WS=100615015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chrX	100615478	rs2855259	C	T	1174.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=34;NR=0;PP=940;SC=ATGCTGATCACGGGAATTATG;SOR=5.784;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=34;TCF=34;TCR=0;TR=34;WE=100615486;WS=100615468;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chrX	100617372	rs2071222	T	C	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=6;PP=316;SC=TCACATAGCTTGGAGAGCAGA;SOR=0.836;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=13;TCF=7;TCR=6;TR=13;WE=100617380;WS=100617362;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	100742551	rs2361298	G	A	1139.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=9;PP=899;SC=TGTTCTACCAGGGACTCGGTT;SOR=2.179;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=26;TCR=9;TR=35;WE=100742559;WS=100742541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chrX	100743037	rs963618	C	T	1120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=23;PP=974;SC=TTAGGGTGTACTGCCAAGAGA;SOR=1.308;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=37;TCF=13;TCR=24;TR=36;WE=100743045;WS=100743027;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chrX	100743546	rs6621080	C	T	1066.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=17;PP=846;SC=CTCTACCATACCTTGTTCGTG;SOR=0.804;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=33;TCF=16;TCR=17;TR=33;WE=100743554;WS=100743536;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chrX	100743826	rs5951332	A	G	3175.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=48;NR=45;PP=2314;SC=AAGTGGGCCTAGGGCTGAAGT;SOR=0.775;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=94;TCF=48;TCR=46;TR=93;WE=100743834;WS=100743816;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chrX	100745825	rs5951333	T	C	3002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=33;PP=2427;SC=TCTGCCCGGCTCCAGGCTGTG;SOR=1.305;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=57;TCR=33;TR=90;WE=100745833;WS=100745815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chrX	100748078	rs5991911	A	G	2952.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=42;NR=43;PP=2368;SC=TCCTGGGCTGACACTGGGGAC;SOR=0.738;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=85;TCF=42;TCR=43;TR=85;WE=100748086;WS=100748068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chrX	100749127	rs5951336	A	G	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=6;PP=713;SC=TGGGGCTGGGATTTGGTCCTG;SOR=2.303;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=26;TCF=20;TCR=6;TR=26;WE=100749135;WS=100749117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	100749585	rs3174476	C	T	2456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=31;NR=42;PP=2017;SC=AGTTTGCACACCAAAGTGAGG;SOR=1.022;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=74;TCF=31;TCR=43;TR=73;WE=100749593;WS=100749575;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chrX	100807909	rs6616255	A	G	2317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=11;PP=1901;SC=TGTCCCAGCTATACCATGGGC;SOR=3.073;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=69;TCF=57;TCR=12;TR=68;WE=100807917;WS=100807899;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chrX	100871148	rs35319186	T	C	829.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.79;QD=33.19;SOR=6.518;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	100880857	rs3205455	G	A	1664.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=32;PP=1230;SC=TTAATAAGAAGGAGAACAAAG;SOR=2.078;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=11;TCR=32;TR=43;WE=100880865;WS=100880847;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chrX	100911066	rs3850315	C	T	2120.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=27;PP=1664;SC=CAAGCAGGTGCTGGTAGTCAT;SOR=0.886;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=32;TCR=27;TR=59;WE=100911074;WS=100911056;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chrX	101097636	rs139562096	G	C	3187.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.955;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=-0.117;NF=86;NR=9;PP=2551;ReadPosRankSum=-1.309;SC=GCCTCCCAAAGTGTTGGGATT;SOR=3.077;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=97;TCF=87;TCR=10;TR=95;WE=101097644;WS=101097626;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,99:0.99:100
chrX	101138792	rs5944882	T	C	2827.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=40;NR=46;PP=1993;SC=CTGATGTTTCTGTTTATGACC;SOR=0.776;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=86;TCF=40;TCR=46;TR=86;WE=101138800;WS=101138782;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,98:1.00:98
chrX	101141776	rs67953349	AC	A	368.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=11;PP=413;SC=TTAGAACTGGACCAAAAATTT;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=11;WE=101141784;WS=101141766;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	101395780	rs11408120	T	TG	2494.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=12;NR=59;PP=2936;SC=GTTGTCCCCTTGGGCGAATGG;SOR=2.568;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=78;TCF=14;TCR=64;TR=71;WE=101395788;WS=101395770;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,74:1.00:74
chrX	101623586	.	ATGG	A	831.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=-0.250;ClippingRankSum=0.000;DP=62;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=57.50;MQRankSum=0.000;QD=36.16;ReadPosRankSum=1.435;SOR=0.399;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:1,22:0.96:23
chrX	102339606	rs1029305	T	C	1262.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=26;NR=11;PP=1020;SC=TTTCACTGGCTGGTACATTCC;SOR=1.981;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=37;TCF=26;TCR=11;TR=37;WE=102339614;WS=102339596;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	102471531	rs1064784	G	T	2335.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=63;PP=1870;SC=AGCCTTTTGGGGTTTACACTT;SOR=5.226;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=67;TCF=4;TCR=63;TR=67;WE=102471539;WS=102471521;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chrX	102564583	rs7557	A	G	2639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NR=49;PP=2069;SC=ACTGCCCGCAAACTATGACTC;SOR=1.358;SbPval=0.54;Source=Platypus;TCR=49;WE=102564591;WS=102564573;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,79:1.00:79
chrX	102565203	rs2246252	G	C	182.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=6;NR=0;PP=147;SC=TGCTAAGTGTGGGGGTGAAGG;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=102565211;WS=102565193;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	102831217	rs221946	C	T	281.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=232;SC=GTAAATATTTCAGGCTTTGTG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=102831225;WS=102831207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	102930960	rs874	A	G	1003.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=28;NR=0;PP=861;SC=AACAGAACGGAAAACAAACTG;SOR=6.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=28;TCR=0;TR=28;WE=102930968;WS=102930950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chrX	102962387	.	T	C	1239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=28;NR=15;PP=978;SC=CTGCAGGCAGTGGCCCAAGCC;SOR=1.556;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=28;TCR=15;TR=43;WE=102962395;WS=102962377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	102978965	rs12844618	T	G	1894.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;BaseQRankSum=-1.071;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=25;NR=31;PP=1527;ReadPosRankSum=1.939;SC=TCCAAATTCTTCCCCTTAACG;SOR=0.298;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=57;TCF=25;TCR=32;TR=56;WE=102978973;WS=102978955;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,59:0.98:60
chrX	102979486	rs4907817	T	C	2889.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=65;PP=2284;SC=GTCTTGGTGATGGAGCTGAAA;SOR=1.306;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=102;TCF=37;TCR=65;TR=102;WE=102979494;WS=102979476;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chrX	103031700	rs11371342	A	AG	433.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=62.28;QD=30.98;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	103036412	rs521895	A	G	776.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=24;PP=723;SC=TTGCCCACACAACTTCGTTAT;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=103036420;WS=103036402;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	103267865	rs553509	C	T	1429.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=33;PP=1099;SC=GCGGGCCAGGCGACCAGCCTC;SOR=2.636;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=42;TCF=9;TCR=33;TR=42;WE=103267873;WS=103267855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chrX	103268241	rs7885967	G	A	3230.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=48;NR=57;PP=2599;SC=ATGGCTCCACGTCTCGGGCCA;SOR=0.872;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=48;TCR=57;TR=105;WE=103268249;WS=103268231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,107:1.00:107
chrX	103274226	rs494006	A	G	181.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=3;PP=148;SC=GCAAAAAGTAAACAAATGTGA;SOR=1.329;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=6;TCF=3;TCR=3;TR=6;WE=103274234;WS=103274216;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	103294760	rs2301384	C	T	2514.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=37;NR=38;PP=2083;SC=GCAGGTTCACCAGGGCCTCAG;SOR=0.693;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=75;TCF=37;TCR=38;TR=75;WE=103294768;WS=103294750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,76:1.00:76
chrX	104464276	rs375033944	CA	C	5599.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=129;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQ=59.96;NF=57;NR=43;PP=2951;SC=CCACAACCTCCAACATCCCCT;SOR=1.082;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=101;TCF=57;TCR=44;TR=100;WE=104464289;WS=104464266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chrX	104464281	rs367644904	TC	T	5706.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=54;NR=46;PP=2966;SC=ACCTCCAACATCCCCTCTGCT;SOR=1.005;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=108;TCF=56;TCR=52;TR=100;WE=104464289;WS=104464266;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chrX	105153001	rs209372	A	G	2860.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=36;NR=45;PP=2310;SC=TGAAGGCTAAAGCCTCTAAAC;SOR=1.030;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=81;TCF=36;TCR=45;TR=81;WE=105153009;WS=105152991;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chrX	105179132	rs209095	C	T	2394.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=61;NR=9;PP=1984;SC=TAGTAATTTCCCTTATTATCT;SOR=3.706;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=70;TCF=61;TCR=9;TR=70;WE=105179140;WS=105179122;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chrX	106096987	rs34044365	A	G	40.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=0;NR=2;PP=23;SC=GCAAGTAGACATACAACTTAA;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=106096995;WS=106096977;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chrX	106184601	rs3835279	TGAGAGAGA	T,TGA,TGAGA	554.73	.	AC=1,1,0;AF=0.500,0.500,0.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000,0.5000;FS=0.000;HP=4;HapScore=4;MGOF=8;MLEAC=1,1;MLEAF=0.500,0.500;MMLQ=18;NF=10,10;NR=2,2;PP=83,154;SC=AAGGTGAGGGTGAGAGAGAGA;SOR=4.294;SbPval=0.43;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=12,12;WE=106184616;WS=106184591;set=Intersection	GT:AF:DP	1/2:0.35,0.65:17
chrX	106200202	rs6622126	G	A	3272.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=105;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=45;PP=2451;SC=GTCTTCATCAGTGAGTTCTTG;SOR=0.921;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=56;TCR=45;TR=101;WE=106200210;WS=106200192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,105:1.00:105
chrX	106313508	rs6622143	G	A	3135.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=101;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=38;NR=60;PP=2452;SC=GGCTGAAGATGTGAACACTGT;SOR=1.190;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=98;TCF=38;TCR=60;TR=98;WE=106313516;WS=106313498;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,101:1.00:101
chrX	106360086	rs6523920	C	A	85.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=3;PP=67;SC=CCATTACTGACCCCATTTATT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=106360094;WS=106360076;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	106362078	rs3216052	CT	C	597.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=16;PP=665;SC=GCGCGGCGGACTTCTAAGGGT;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=17;WE=106362086;WS=106362068;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	106396402	rs1298577	A	G	3519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=36;NR=72;PP=2672;SC=AGTTACTTACATCTCCACATG;SOR=1.569;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=109;TCF=37;TCR=72;TR=108;WE=106396410;WS=106396392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,116:1.00:116
chrX	106396455	rs1285590	A	G	2907.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=19;NR=68;PP=2208;SC=CACTCTGGTCACGCGTAGACT;SOR=2.687;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=19;TCR=68;TR=87;WE=106396463;WS=106396445;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chrX	106459810	rs5962806	T	G	292.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.54;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=149;SC=TGAGTTTTTTTATGGAAATCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=106459818;WS=106459800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	106462267	rs1954365	C	T	704.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=20;PP=568;SC=TAACATTTTACTTTTTACAAG;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=0;TCR=20;TR=20;WE=106462275;WS=106462257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	107405042	rs41300261	T	C	2176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=75;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=43;PP=1647;SC=AGGGGACTTATGTGTCATGCC;SOR=1.091;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=74;TCF=31;TCR=43;TR=74;WE=107405050;WS=107405032;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chrX	107413851	rs34466065	T	C	740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=0;PP=623;SC=TTGGGTCCTATTAATCCGGGG;SOR=6.358;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=23;TCF=23;TCR=0;TR=23;WE=107413859;WS=107413841;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	107415825	rs2881142	T	C	1198.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=34;PP=1028;SC=CCCTCTTACTTCCTCACCCCT;SOR=4.294;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=37;WE=107415833;WS=107415815;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chrX	107418281	rs2295914	C	T	1402.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=30;NR=13;PP=1052;SC=TATGAAGCCTCTCTTGAGCAT;SOR=1.880;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=43;TCF=30;TCR=13;TR=43;WE=107418289;WS=107418271;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chrX	107418906	rs4623610	A	G	3538.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=123;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=59;NR=53;PP=2459;SC=GAGTACCAGCACGTCCAGATG;SOR=0.776;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=112;TCF=59;TCR=53;TR=112;WE=107418914;WS=107418896;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,123:1.00:123
chrX	107423674	.	TACAC	T	2025.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.62;QD=42.20;SOR=6.358;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chrX	107430579	rs1266715	G	A	1956.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=10;NR=48;PP=1701;SC=TCTGACTACAGGAAAGAGGTA;SOR=3.037;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=10;TCR=48;TR=58;WE=107430587;WS=107430569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chrX	107433688	rs1042065	A	G	3490.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=69;NR=35;PP=2630;SC=GGGAACCCTGACTCTTTGTTG;SOR=1.487;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=104;TCF=69;TCR=35;TR=104;WE=107433696;WS=107433678;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chrX	107437848	rs1266719	G	C	2946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=94;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=28;PP=2235;SC=CCACTAAGTGGAAAGTATGAG;SOR=1.739;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=87;TCF=59;TCR=28;TR=87;WE=107437856;WS=107437838;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,93:1.00:93
chrX	107438119	rs1266720	G	T	454.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=6;PP=413;SC=GGCAAGGCACGGAATTTGACA;SOR=0.976;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=14;WE=107438127;WS=107438114;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	107448639	rs1266730	G	T	3808.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=127;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=61;PP=2817;SC=GCATATGGAAGGCAGACTGTA;SOR=0.826;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=117;TCF=56;TCR=61;TR=117;WE=107448647;WS=107448629;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chrX	107449938	rs1266731	G	C	1150.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=8;PP=849;SC=TCAAAAATTGGAAATGTTCCA;SOR=1.885;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=30;TCF=22;TCR=8;TR=30;WE=107449946;WS=107449928;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chrX	107450101	rs1266732	T	G	1301.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=38;PP=1102;SC=AAGGCTAGAGTTTATATCATT;SOR=4.514;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=41;TCF=3;TCR=38;TR=41;WE=107450109;WS=107450091;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	107455014	rs1266736	C	T	341.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=8;PP=312;SC=CACACACTTACAGTCTTTTTA;SOR=2.494;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=2;TCR=8;TR=10;WE=107455022;WS=107455004;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	107463090	rs201304389	CCCATATTGTATT	C	1448.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=20;PP=2966;SC=TACCCCCCTCCCCATATTGTA;SOR=4.743;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=21;WE=107463109;WS=107463080;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	107683501	rs59044748	T	TG	209.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=9;PP=177;SC=ACCTTTTTTTTGGGGGGGGGG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=9;WE=107683509;WS=107683491;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	108904729	rs839408	C	T	627.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=19;NR=1;PP=538;SC=TTTTGACTTACGAAACAAAAA;SOR=4.615;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=20;WE=108904737;WS=108904719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	108917757	rs5942830	T	C	859.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=23;PP=734;SC=AAACATGTTGTAATTCAAGTA;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=108917765;WS=108917747;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	108917773	rs5943413	A	G	716.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=19;PP=611;SC=AAGTATTAATAACAAATACAG;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=2;TCR=19;TR=21;WE=108917781;WS=108917763;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	109387928	rs946820	G	A	1699.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;BaseQRankSum=-1.721;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=57;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=50;NR=5;PP=1438;ReadPosRankSum=-0.816;SC=TGGGATTGCTGAAATATGGGT;SOR=2.948;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=51;TCR=5;TR=55;WE=109387936;WS=109387918;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,55:0.98:56
chrX	114082535	rs5946005	G	A	2635.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=11;PP=2068;SC=TTTGGATGACGTGTTCTTGTC;SOR=3.285;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=79;TCF=67;TCR=12;TR=78;WE=114082543;WS=114082525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chrX	114400318	rs4361922	T	G	528.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=6;PP=388;SC=TGTAAGAGTTTGCTAAAGACA;SOR=0.693;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=14;WE=114400326;WS=114400308;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	114425181	.	A	AGAGGCCGCTCGCCCAACGCCCACAGCG	7666.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DP=155;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=34;NR=39;PP=2603;SC=CGAGGAGTACAGAGGCCGCTC;SOR=0.985;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=100;TCF=45;TCR=55;TR=73;WE=114425189;WS=114425169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,138:1.00:138
chrX	114425400	rs12857270	G	A	4877.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=154;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=79;NR=73;PP=2965;SC=CGACTGCTGCGGAGGAGGAGG;SOR=0.801;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=152;TCF=79;TCR=73;TR=152;WE=114425408;WS=114425390;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,154:1.00:154
chrX	114426171	rs5946294	C	T	6591.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=209;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=94;NR=104;PP=2965;SC=CAGCGGAGGCCGCTCGCCTGA;SOR=0.783;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=199;TCF=95;TCR=104;TR=198;WE=114426179;WS=114426161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,207:1.00:207
chrX	114426917	rs4911809	C	T	4248.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=132;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=57;NR=73;PP=2965;SC=TCAAGAGTTACGGCCTGAGCG;SOR=1.000;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=130;TCF=57;TCR=73;TR=130;WE=114426925;WS=114426907;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chrX	114874220	rs7051609	G	A	551.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;BaseQRankSum=1.877;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=10;NR=8;PP=471;ReadPosRankSum=0.206;SC=TGTTATTTTAGCAACTAAAAT;SOR=0.395;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=19;TCF=10;TCR=9;TR=18;WE=114874228;WS=114874210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,17:0.94:18
chrX	114874505	rs5987764	C	T	689.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=14;PP=617;SC=TTAATAATTGCGAAGTCATGT;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=22;TCF=8;TCR=14;TR=22;WE=114874513;WS=114874495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	117695200	rs5909545	G	C	43.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=21.87;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chrX	117700141	rs2286977	A	G	1589.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=39;PP=1189;SC=TAGAAACAGCACAAGGTCAGA;SOR=3.442;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=7;TCR=39;TR=46;WE=117700149;WS=117700131;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chrX	117742356	rs5910394	C	T	2472.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=46;PP=1795;SC=CAAAAGCAGCCATAGACACAC;SOR=1.048;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=35;TCR=47;TR=81;WE=117742364;WS=117742346;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chrX	117810831	rs5957040	C	T	942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=28;PP=737;SC=AAAGAAAGAACAGGGGCTTTG;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=117810839;WS=117810821;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	117817266	rs4372173	C	T	1556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=6;NR=41;PP=1238;SC=TCAAAATGCACAACCTTAAAG;SOR=3.657;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=47;TCF=6;TCR=41;TR=47;WE=117817274;WS=117817256;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chrX	117874898	rs2246663	T	C	668.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=22;NR=0;PP=625;SC=TACTGTCTTGTCCTCTAGGAC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=22;TCR=0;TR=22;WE=117874906;WS=117874888;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	118108785	rs3813933	T	C	1614.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=20;PP=1181;SC=GCTTGCCCGCTGAGGTCAGCA;SOR=1.262;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=53;TCF=33;TCR=20;TR=53;WE=118108793;WS=118108775;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chrX	118124694	rs3827453	G	C	326.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=10;PP=272;SC=CCCCTTCCCAGAGACTGCATT;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=10;WE=118124702;WS=118124684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	118146810	rs5910481	C	T	1345.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=10;PP=1009;SC=AGCAGTTACACGAATACATTA;SOR=2.636;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=42;TCF=32;TCR=10;TR=42;WE=118146818;WS=118146800;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chrX	118281538	rs5910522	C	A	1138.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=22;PP=819;SC=CACTGCAGTGCCACAAAAGCA;SOR=1.329;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=34;TCF=12;TCR=22;TR=34;WE=118281546;WS=118281528;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	118281635	rs11405916	G	GC	97	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=4;PP=108;SC=CTAAGAGCTAGCCCTGGGCCA;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=118281643;WS=118281625;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	118284579	rs5957121	G	A	272.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=6;PP=194;SC=TGTGTCCCCCGACCTGCCGAG;SOR=2.093;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=118284587;WS=118284569;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	118514072	rs217941	A	G	3097.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=96;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=55;PP=2300;SC=CAGTGAAGGAAGAATGGAAGA;SOR=1.190;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=88;TCF=33;TCR=55;TR=88;WE=118514080;WS=118514062;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,96:1.00:96
chrX	118533366	rs217976	G	A	686.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=15;NR=7;PP=502;SC=GTCGGGGCTCGATGGCTACGT;SOR=1.519;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=15;TCR=7;TR=22;WE=118533374;WS=118533356;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	118544448	rs16274	T	C	539.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=15;PP=454;SC=TGACTGCTCATAAATACTGTG;SOR=2.712;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=19;TCF=3;TCR=16;TR=18;WE=118544456;WS=118544438;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	118560403	rs217997	G	C	379.56	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;BaseQRankSum=0.916;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=0;NR=12;PP=292;ReadPosRankSum=1.791;SC=AATAAGTACTGTCAATAATGC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=12;WE=118560411;WS=118560393;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,13:0.93:14
chrX	118587003	rs3810755	C	T	3293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=18;NR=79;PP=2473;SC=ACGAGAAAACCGAAGCCTAAA;SOR=2.899;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=98;TCF=18;TCR=80;TR=97;WE=118587011;WS=118586993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
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chrX	118678364	rs5910611	G	A	866.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=25;NR=1;PP=706;SC=TTTTCCCAAAGCCCTGGCCAA;SOR=5.136;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=26;TCF=25;TCR=1;TR=26;WE=118678372;WS=118678354;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	118699320	rs5910616	A	G	6971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=228;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=119;NR=90;PP=2965;SC=TTTCGGCATGATTCCCAAGAG;SOR=1.005;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=209;TCF=119;TCR=90;TR=209;WE=118699328;WS=118699310;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,225:1.00:225
chrX	118709567	rs139399184	T	TA	268.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=10;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=177;SC=CTTGCTTTCTTAAAAAAAAAA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=9;WE=118709575;WS=118709557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	118750410	.	C	G	2533.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=-1.621;ClippingRankSum=0.000;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.846;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=30;PP=2020;ReadPosRankSum=-0.830;SC=AGTTGTTTCTCTGAGGTTACA;SOR=0.861;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=76;TCF=45;TCR=31;TR=75;WE=118750418;WS=118750400;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,79:0.99:80
chrX	118754064	rs59071899	CA	C	316.94	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.125;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.41;ReadPosRankSum=-0.841;SOR=0.330;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,19:0.86:22
chrX	118758107	rs11338110	GT	G	579.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=1;NR=13;PP=200;SC=TTTATTATGGGTTTTTTTTTT;SOR=4.047;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=17;TCF=1;TCR=16;TR=14;WE=118758115;WS=118758097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	118758128	rs2782252	T	G	354.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.42;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	118827317	rs17261138	A	C	616.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=18;PP=482;SC=CTATGGCCAGACCAGTTCCAG;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=20;TCF=2;TCR=18;TR=20;WE=118827325;WS=118827307;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	118829467	rs4825665	G	T	1676.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=12;PP=1407;SC=ACTCCTCGCGGACTGAAGCTC;SOR=2.670;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=43;TCR=12;TR=55;WE=118829475;WS=118829457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chrX	118892888	rs2782222	G	C	353.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=8;NR=3;PP=267;SC=CGGCTCCTGCGGGGTGGCTGT;SOR=1.445;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=11;TCF=8;TCR=3;TR=11;WE=118892896;WS=118892878;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	118893054	rs2782223	C	A	2029.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=66;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=26;PP=1715;SC=GCTGCTGCTGCGGGGCGACCC;SOR=1.196;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=65;TCF=39;TCR=26;TR=65;WE=118893062;WS=118893044;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chrX	118893137	rs2782224	T	C	2001.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=9;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=31;NR=33;PP=1703;SC=TGGTACACGATTTCGCCCTAC;SOR=0.758;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=65;TCF=31;TCR=34;TR=64;WE=118893145;WS=118893127;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chrX	118893413	rs2782225	T	C	1967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=32;NR=32;PP=1471;SC=ACAACAGCAGTGGCACCACTG;SOR=0.723;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=64;TCF=32;TCR=32;TR=64;WE=118893421;WS=118893403;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chrX	118969075	rs2239963	A	C	291.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=9;PP=227;SC=TTATGTATGAATATATGCTCA;SOR=3.258;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=10;TCF=1;TCR=9;TR=10;WE=118969083;WS=118969065;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	118974507	rs2285552	A	C	3400.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=70;NR=35;PP=2644;SC=AGGGGTTTTCAACAAGTAACA;SOR=1.588;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=105;TCF=70;TCR=35;TR=105;WE=118974529;WS=118974497;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chrX	118977332	rs2496213	A	G	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=5;PP=113;SC=CATTATCTACAATACTGATTT;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=118977340;WS=118977322;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	118985598	rs2428212	C	T	1747.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=36;PP=1381;SC=TAAATGTACTCGCAGGTGTCT;SOR=1.697;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=51;TCF=15;TCR=36;TR=51;WE=118985606;WS=118985588;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chrX	119065893	rs194302	G	A	1800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=14;PP=1529;SC=ACACACTGCTGCTTACTTCAA;SOR=2.107;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=56;TCF=42;TCR=14;TR=56;WE=119065901;WS=119065883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chrX	119068419	rs199913043	G	A	300.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=-1.560;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=13.397;HP=24;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-2.751;NF=9;NR=0;PP=79;ReadPosRankSum=1.994;SC=AAAAAAAAAAGAAAAGAAATT;SOR=4.003;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=16;TCR=4;TR=9;WE=119068427;WS=119068409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:13,10:0.43:23
chrX	119068424	.	G	A	259.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.885;ClippingRankSum=0.000;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=11.487;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.36;MQRankSum=-3.179;QD=8.66;ReadPosRankSum=-0.431;SOR=3.383;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:21,9:0.30:30
chrX	119068427	.	ATTTTCCATAAT	A	175.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.171;ClippingRankSum=0.000;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=7.835;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.08;MQRankSum=-4.185;QD=4.29;ReadPosRankSum=-2.227;SOR=2.891;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:33,8:0.20:41
chrX	119070411	rs194307	T	A	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=13;PP=478;SC=AAGTACAAATTAAAAAATTAT;SOR=1.329;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=20;TCF=7;TCR=13;TR=20;WE=119070419;WS=119070401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	119070567	rs194308	A	T	344.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=4;PP=308;SC=CCCTTTTTTTAAAAATACCTT;SOR=1.802;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=8;TCR=4;TR=12;WE=119070575;WS=119070557;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	119210976	.	C	T	171.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.43;QD=28.64;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	119293039	.	AGGCGGAGAAGAAAAAGATGGC	A	584.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=45.81;QD=41.77;SOR=3.912;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	119387833	rs201958171	C	CTGA	5861.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=168;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=58;NR=37;PP=2988;SC=GTTACCGATTCTGATGATGAT;SOR=1.536;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=147;TCF=88;TCR=59;TR=95;WE=119387841;WS=119387823;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,126:1.00:126
chrX	119394904	rs3752341	G	T	519.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=14;PP=372;SC=AAAAGAAAACGTTAGTTTAGG;SOR=3.383;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=15;TCF=1;TCR=14;TR=15;WE=119394912;WS=119394894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	119504439	rs2075099	G	A	714.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=1;PP=563;SC=GAATAAGCAAGGACATACTGA;SOR=4.804;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=21;TCF=20;TCR=1;TR=21;WE=119504447;WS=119504429;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	119510144	rs3213723	C	G	552.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=1;PP=456;SC=CCTGAGGAAGCATGACTGGGA;SOR=4.294;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=17;TCF=16;TCR=1;TR=17;WE=119510152;WS=119510134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	120008979	rs871733	T	C	332.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=3;PP=286;SC=CCTCGCCTTCTGGGGCTGCAG;SOR=1.981;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=12;TCF=9;TCR=3;TR=12;WE=120008987;WS=120008969;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	122250996	rs6648942	G	T	5781.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=181;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=101;PP=2965;SC=TAAAGAGTATGTGGCCTTGTT;SOR=1.110;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=174;TCF=73;TCR=101;TR=174;WE=122251004;WS=122250986;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,180:1.00:180
chrX	122318386	rs58044961	A	AG	3308.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=82;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=52;PP=2957;SC=TTTTAGGCGTACATGGCCAGG;SOR=1.525;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=15;TCR=52;TR=67;WE=122318394;WS=122318376;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chrX	122336600	rs11452643	T	TG	1619.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=23;NR=18;PP=1616;SC=GTTCACCAGGTGGGCCCGCCA;SOR=1.112;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=48;TCF=28;TCR=20;TR=41;WE=122336608;WS=122336590;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chrX	122528803	rs550640	T	C	566.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=3;PP=337;SC=TCATGATCCTTTCAATGTCTT;SOR=2.303;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=12;TCR=3;TR=15;WE=122528811;WS=122528793;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	122537277	rs502434	T	C	1510.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=35;NR=12;PP=1087;SC=GCTACTGGAATGAGTATGAAA;SOR=2.124;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=47;TCF=35;TCR=12;TR=47;WE=122537285;WS=122537267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chrX	122537418	rs504096	C	T	1370.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=27;PP=939;SC=GCAAGACTTCCGTTTTCTGAA;SOR=2.147;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=37;TCF=9;TCR=28;TR=36;WE=122537426;WS=122537408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chrX	122616962	rs199682384	CT	C	342.14	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=1.784;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=13.69;ReadPosRankSum=-0.756;SOR=3.160;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:3,22:0.88:25
chrX	122758529	rs2072914	G	A	3452.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=79;PP=2644;SC=ACCTACAGGAGAAAAATGTTT;SOR=2.685;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=100;TCF=21;TCR=79;TR=100;WE=122758537;WS=122758519;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chrX	122765750	rs3764750	T	C	1226.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=37;PP=1116;SC=CCAAAGTGATTAAGAAGTCAT;SOR=5.784;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=38;TCF=1;TCR=37;TR=38;WE=122765758;WS=122765740;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chrX	122805421	rs2105889	C	A	1350.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=9;PP=1043;SC=TTGAGAACCTCGAACCAACCC;SOR=2.584;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=41;TCF=32;TCR=9;TR=41;WE=122805429;WS=122805411;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chrX	123040729	rs28382739	C	T	420.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=352;SC=TCATATCTCCCGGCACTTGTT;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=123040737;WS=123040719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	123041043	rs28382740	A	G	1981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=53;PP=1640;SC=CTAACTCTATAGTAGGCATGT;SOR=3.611;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=60;TCF=7;TCR=53;TR=60;WE=123041051;WS=123041033;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chrX	123195035	rs2297651	A	C	2317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=55;NR=13;PP=1877;SC=GGCTAGTATGATAATTGTCTA;SOR=2.737;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=68;TCF=55;TCR=13;TR=68;WE=123195043;WS=123195025;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chrX	123498120	rs12393085	C	T	657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=2;PP=526;SC=GGCTAATGTGCGTATTTGTGT;SOR=3.816;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=21;TCF=19;TCR=2;TR=21;WE=123498128;WS=123498110;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	123498355	rs55941348	C	A	967.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=17;PP=582;SC=ATTATTGAAGCGATACAGTTT;SOR=2.215;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=123498370;WS=123498345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	123498362	rs60637596	GT	G	958.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=4;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=12;PP=187;SC=AAGCGATACAGTTTTTTTTTT;SOR=2.303;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=3;TCR=18;TR=12;WE=123498370;WS=123498345;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	123498379	rs57958188	C	G	698.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=27;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=428;SC=TTTTTTGAGACAATCTCGCTC;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=123498387;WS=123498369;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	123538802	rs34194370	T	TAAAC	2455.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;BaseQRankSum=-1.226;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=76;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=2;PP=1302;ReadPosRankSum=-1.910;SC=GCTCTGCAGTTAAACAAACAA;SOR=2.376;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=70;TCF=66;TCR=4;TR=29;WE=123538810;WS=123538792;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:3,52:0.95:55
chrX	123587110	rs2223416	C	A	1641.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=44;NR=5;PP=1245;SC=CATTCTACCTCATTTCTACAT;SOR=3.872;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=49;TCF=44;TCR=5;TR=49;WE=123587118;WS=123587100;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chrX	123630812	rs73215108	C	A	569.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=561;SC=TTCATATTATCTTGCTTTTTG;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=123630820;WS=123630802;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	125298690	rs3761552	G	A	2758.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=89;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=55;NR=35;PP=2265;SC=AGCCTCTGCCGCAGGCAAGCT;SOR=1.116;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=90;TCF=55;TCR=35;TR=90;WE=125298698;WS=125298680;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chrX	125299188	rs12014937	T	G	3243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=52;NR=55;PP=2421;SC=GGGCATATACTGGGAGACCCA;SOR=0.729;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=107;TCF=52;TCR=55;TR=107;WE=125299196;WS=125299178;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chrX	125299467	rs10126452	G	T	2465.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=78;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=59;NR=19;PP=2024;SC=CGCAGCCCTGGTGGGCCTGGG;SOR=2.303;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=78;TCF=59;TCR=19;TR=78;WE=125299475;WS=125299457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,78:1.00:78
chrX	125953932	rs5931715	A	G	1864.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=35;PP=1458;SC=ACAGGGATGAATGGGTTGGAG;SOR=1.255;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=58;TCF=23;TCR=35;TR=58;WE=125953940;WS=125953922;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chrX	125955428	rs2269777	G	A	3027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=98;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=46;NR=48;PP=2373;SC=CTCCTCCTCCGATATTTGGTC;SOR=0.756;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=94;TCF=46;TCR=48;TR=94;WE=125955436;WS=125955418;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,97:1.00:97
chrX	125955644	rs2269776	A	T	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=18;PP=506;SC=ACTTGAAACCACGTACCCTCC;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=125955652;WS=125955634;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	127186074	rs138725538	C	T	1165.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=12;NR=26;PP=1013;SC=TGTCCCAAGACGGAGCTGATG;SOR=1.432;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=12;TCR=26;TR=38;WE=127186082;WS=127186064;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chrX	128630976	rs201352836	GCA	G	41.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.14;BaseQRankSum=1.006;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=24;MQRankSum=0.887;NF=0;NR=3;PP=142;ReadPosRankSum=-1.465;SC=ACACACACGTGCACACACACA;SOR=1.270;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=12;TCF=1;TCR=11;TR=3;WE=128630985;WS=128630966;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,3:0.38:8
chrX	128880614	rs3747343	T	C	1242.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=9;PP=958;SC=CCGAGATTCCTGCTGGAGGGC;SOR=2.191;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=40;TCF=31;TCR=9;TR=39;WE=128880622;WS=128880604;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	128885571	rs201428707	AAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAAGG	A	3092.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.28;QD=41.24;SOR=4.615;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,75:1.00:75
chrX	128889464	rs5932674	G	A	111.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=3;PP=85;SC=GAAGGTCCGAGGCCCCTAGCC;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=1;TCR=3;TR=4;WE=128889472;WS=128889454;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	128925156	rs5932684	T	G	213.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=143;SC=GTAAGAGAAATGAATGCTTAC;SOR=2.584;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=0;TCR=6;TR=6;WE=128925164;WS=128925146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	128948893	rs5932686	T	C	666.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=1.764;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=17;MQRankSum=-0.151;NF=1;NR=23;PP=608;ReadPosRankSum=0.827;SC=GTAAAAAATATAGGGTTTTTT;SOR=3.528;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=29;TCF=1;TCR=28;TR=24;WE=128948905;WS=128948883;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,23:0.96:24
chrX	128957640	rs2275605	T	C	2039.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=37;NR=29;PP=1402;SC=GCAATGTCCCTGTAGTTTTAC;SOR=1.042;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=37;TCR=29;TR=66;WE=128957648;WS=128957630;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,71:1.00:71
chrX	129147079	rs4830173	T	C	4408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=85;NR=51;PP=2965;SC=GGCTGAGGGCTTCTTGGTGCC;SOR=1.294;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=136;TCF=85;TCR=51;TR=136;WE=129147087;WS=129147069;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,132:1.00:132
chrX	129201179	rs2181440	C	T	2231.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=31;PP=1770;SC=CCCCTGTGACCGTGGGTGGCG;SOR=0.752;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=66;TCF=35;TCR=31;TR=66;WE=129201187;WS=129201169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chrX	129269980	rs209998	G	A	1657.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=42;NR=11;PP=1361;SC=CACAGGCTAGGGAGAATGAAT;SOR=2.628;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=42;TCR=11;TR=53;WE=129269988;WS=129269970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,53:1.00:53
chrX	129283520	rs1139851	A	G	2680.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.020;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=4.918;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=27;NR=61;PP=2190;ReadPosRankSum=-0.873;SC=ATCTTTTTTCATCCTCTTTCA;SOR=1.573;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=89;TCF=28;TCR=61;TR=88;WE=129283528;WS=129283510;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,89:0.99:90
chrX	129290699	rs189994	T	C	506.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=16;PP=427;SC=CGTTAAATGATCAAGAAAAAT;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=16;TCF=0;TCR=16;TR=16;WE=129290707;WS=129290689;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	129349295	rs209238	T	G	1577.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=31;PP=1232;SC=ACTTGTGAATTCCCCGACGAC;SOR=1.911;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=46;TCF=15;TCR=31;TR=46;WE=129349303;WS=129349285;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chrX	129354240	rs1160681	C	A	399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=0;PP=283;SC=AGATCTTATTCCTTCTATCCA;SOR=4.804;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=129354263;WS=129354230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	129354254	rs3081123	TAA	T	600.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=13;HapScore=3;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=14;NR=0;PP=272;SC=CTATCCATAATAAAAAAAAAA;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=18;TCF=18;TCR=0;TR=14;WE=129354263;WS=129354230;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	129370314	.	T	C	987.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=12;PP=808;SC=ATTAAGAACTTTTAAGACTCA;SOR=1.071;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=28;TCF=16;TCR=12;TR=28;WE=129370322;WS=129370304;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chrX	129790549	rs147492521	C	T	818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.397;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=3;PP=569;ReadPosRankSum=1.698;SC=ACAGAATTATCTTTACCTGAT;SOR=1.911;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=25;TCF=22;TCR=3;TR=24;WE=129790557;WS=129790539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,27:0.96:28
chrX	130217020	rs5932835	G	C	384.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=10;NR=2;PP=255;SC=TTCGCCCGCTGGGCAGAGCTC;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=130217028;WS=130217010;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	130416958	rs5932877	C	T	3733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=122;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=61;NR=56;PP=2812;SC=TCTTACCAGTCACCCAGATTT;SOR=0.795;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=117;TCF=61;TCR=56;TR=117;WE=130416966;WS=130416948;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,122:1.00:122
chrX	130420006	rs5930458	T	C	976.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=7;NR=26;PP=713;SC=TCCACAACTCTGGTTGAGGGT;SOR=2.649;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=7;TCR=26;TR=33;WE=130420014;WS=130419996;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chrX	130420415	rs4495600	T	C	1953.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=15;PP=1475;SC=ACTTACCTATTGATGTCATAC;SOR=2.265;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=59;TCF=44;TCR=15;TR=59;WE=130420423;WS=130420405;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chrX	130423543	rs6637830	G	C	1343.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=35;PP=1086;SC=TCACTGTATTGTGGGGGGGAG;SOR=3.056;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=41;TCF=6;TCR=35;TR=41;WE=130423551;WS=130423533;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	130678467	rs499030	A	G	4212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=0.452;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=71;NR=57;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.750;SC=ATGGCCCAGTATGTGTCTGCT;SOR=0.344;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=131;TCF=73;TCR=58;TR=128;WE=130678475;WS=130678457;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,128:0.99:129
chrX	130678596	rs17316625	C	G	5870.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.309;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=189;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=90;NR=83;PP=2965;ReadPosRankSum=0.014;SC=TTCTCTCCCTCATTAAGCTGA;SOR=0.793;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=175;TCF=91;TCR=84;TR=173;WE=130678604;WS=130678586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,187:0.99:189
chrX	130678844	rs655415	A	C	3423.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=107;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=52;NR=42;PP=2688;SC=TCCAAGTCCTACCCTGACCAG;SOR=0.994;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=94;TCF=52;TCR=42;TR=94;WE=130678852;WS=130678834;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,104:1.00:104
chrX	131189505	rs5933055	C	T	1924.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=33;NR=19;PP=1435;SC=TAGCAGACACCTGAAGTTCCA;SOR=1.316;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=52;TCF=33;TCR=19;TR=52;WE=131189513;WS=131189495;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,59:1.00:59
chrX	131212512	rs5977623	A	G	3168.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=65;NR=20;PP=2492;SC=CCTCTGCTCTAATTGGGGACC;SOR=2.252;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=86;TCF=66;TCR=20;TR=85;WE=131212520;WS=131212502;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,92:1.00:92
chrX	131212944	rs7051368	A	G	1128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=14;NR=22;PP=889;SC=CGTGCACTCCATTCACATTTT;SOR=1.121;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=36;TCF=14;TCR=22;TR=36;WE=131212952;WS=131212934;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chrX	131231257	rs2064650	G	A	2222.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=10;PP=1859;SC=TGATTCTTAAGTAACATCATG;SOR=3.160;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=67;TCF=57;TCR=10;TR=66;WE=131231265;WS=131231247;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,67:1.00:67
chrX	131231430	rs57806249	T	TAC	219.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=-0.205;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=21;MQRankSum=-0.464;NF=0;NR=11;PP=412;ReadPosRankSum=0.977;SC=CAGTTATAGGTACACACACAC;SOR=1.329;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=1;TCR=23;TR=11;WE=131231438;WS=131231420;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:5,9:0.64:14
chrX	131348510	rs41310444	A	G	383.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.39;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=10;PP=293;SC=GAAAAACATTATGCTGTTTGT;SOR=3.767;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=11;TCF=1;TCR=10;TR=11;WE=131348518;WS=131348500;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	131516423	rs5933151	T	C	604.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.07;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=22;PP=493;SC=ATCATAACGATGAATACATCA;SOR=6.273;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=22;TCF=0;TCR=22;TR=22;WE=131516431;WS=131516413;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	131518737	rs3736748	C	T	253.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=6;PP=168;SC=CTGTACACCACGCAGAAAAGC;SOR=1.085;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=10;TCF=4;TCR=6;TR=10;WE=131518745;WS=131518727;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	131803352	rs10550199	ATC	A	212.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=6;PP=243;SC=CCCCTGGCCAATCTCTCTCTC;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=6;WE=131803361;WS=131803342;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	132161673	rs41304540	C	T	1981.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=37;NR=21;PP=1570;SC=TCAAGAATTCCTCATTCATCT;SOR=1.392;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=58;TCF=37;TCR=21;TR=58;WE=132161681;WS=132161663;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chrX	133379551	rs2428577	C	T	5785.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=180;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=84;NR=81;PP=2965;SC=GAACAGAAATCTAAAAGAAGC;SOR=0.739;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=165;TCF=84;TCR=81;TR=165;WE=133379559;WS=133379541;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,176:1.00:176
chrX	133699960	rs1982	T	G	360.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=302;SC=GCTATAGGTTTCTCTTTCTCA;SOR=4.977;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=133699968;WS=133699950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrX	134025744	rs6529648	A	G	1176.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=35;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=32;PP=920;SC=AACACTGGCCACCACAGACCA;SOR=5.728;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=33;TCF=1;TCR=32;TR=33;WE=134025752;WS=134025734;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chrX	134155904	rs62599865	G	T	737.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=24;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=5;NR=18;PP=585;SC=GGCTGAGCTGGCACGAGAGGG;SOR=2.124;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=5;TCR=18;TR=23;WE=134155912;WS=134155894;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	134156121	rs2475853	G	C	1661.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=15;PP=1194;SC=CCAGAGCACCGGTCCCCAGGC;SOR=2.221;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=56;TCF=41;TCR=15;TR=56;WE=134156129;WS=134156111;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chrX	134185997	rs2498776	T	A	1012.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=23;NR=10;PP=857;SC=ATGTAGGAGCTCGTCTGCACG;SOR=1.681;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=33;TCF=23;TCR=10;TR=33;WE=134186005;WS=134185987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chrX	134421168	rs1129093	C	T	1969.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=36;PP=1515;SC=ATAAGCTACACGTATAAGGCT;SOR=1.329;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=57;TCF=21;TCR=36;TR=57;WE=134421176;WS=134421158;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chrX	134493747	rs4829778	A	T	1535.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=35;NR=13;PP=1154;SC=CTGTCCAAGAAATCAGCCTAA;SOR=1.702;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=48;WE=134493755;WS=134493737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,51:1.00:51
chrX	134703108	rs1937729	T	G	295.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=0;PP=246;SC=ATATATAATTTTGGTAAATAG;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=9;WE=134703116;WS=134703098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	134948034	rs2034920	A	G	1352.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=41;PP=1124;SC=TGCTGGTAACATTTCCTCCCA;SOR=7.523;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=41;TCF=0;TCR=41;TR=41;WE=134948042;WS=134948024;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,42:1.00:42
chrX	135055694	rs6635201	T	C	498.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=15;NR=1;PP=400;SC=CCCTTAGAAGTGCGCCCACAC;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=15;TCR=1;TR=16;WE=135055702;WS=135055684;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	135080623	rs370833071	C	CT	833.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;BaseQRankSum=-0.175;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;MQRankSum=0.359;NF=17;NR=12;PP=475;ReadPosRankSum=1.145;SC=AACAGTGTAACTTTTTTTTTT;SOR=1.483;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=43;TCF=26;TCR=17;TR=29;WE=135080631;WS=135080613;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,35:0.95:37
chrX	135326861	rs62640387	C	T	4734.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=153;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=39;NR=109;PP=2965;SC=TTTCTCTTTTCGCTCCTTCAG;SOR=1.965;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=149;TCF=39;TCR=110;TR=148;WE=135326869;WS=135326851;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,151:1.00:151
chrX	135390818	rs5930928	T	A	873.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=9;PP=661;SC=CTTTAAGCAATAGGAAAAAAC;SOR=1.302;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=25;TCF=16;TCR=9;TR=25;WE=135390826;WS=135390808;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chrX	135426693	rs4829829	A	G	3595.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=111;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=79;NR=28;PP=2945;SC=GCATACCTATATTTGCAACTG;SOR=2.197;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=107;TCF=79;TCR=28;TR=107;WE=135426701;WS=135426683;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chrX	135426968	rs5930931	C	A	3557.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=113;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=67;PP=2832;SC=TTTCAACCACCTACACCTTCT;SOR=1.315;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=106;TCF=39;TCR=67;TR=106;WE=135426976;WS=135426958;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,112:1.00:112
chrX	135429503	rs4829830	C	A	2708.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;BaseQRankSum=0.502;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=45;NR=42;PP=2168;ReadPosRankSum=-0.627;SC=GTTGATGAGACCACACCCTCA;SOR=0.272;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=89;TCF=47;TCR=42;TR=87;WE=135429511;WS=135429493;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,87:0.99:88
chrX	135430044	rs877761	T	C	5822.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=193;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=87;NR=98;PP=2965;SC=CTCCCAGGACTGTGGAAATGA;SOR=0.836;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=186;TCF=88;TCR=98;TR=185;WE=135430052;WS=135430034;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chrX	135430483	rs912002	T	C	8078.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.062;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=246;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=125;NR=112;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.821;SC=AACTAAATCTTCTAAAACAAT;SOR=0.265;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=238;TCF=126;TCR=112;TR=237;WE=135430491;WS=135430473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,244:1.00:245
chrX	135431236	rs5930932	T	C	5999.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;BaseQRankSum=0.118;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=187;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=102;NR=75;PP=2965;ReadPosRankSum=-1.174;SC=CACCAATTGCTTTTCTTCTAA;SOR=1.014;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=179;TCF=103;TCR=76;TR=177;WE=135431244;WS=135431226;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,184:0.99:186
chrX	135431358	rs5930933	C	T	6814.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=-1.832;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=217;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=2.993;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=91;NR=111;PP=2965;ReadPosRankSum=0.738;SC=CAACTCTACCCTCTTTGACAT;SOR=0.145;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=204;TCF=91;TCR=113;TR=202;WE=135431366;WS=135431348;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,212:0.99:214
chrX	135435475	rs5903915	AT	A	922.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=1;PP=646;SC=ACTAAAACTGATTTTTTTTTG;SOR=5.784;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=37;TCF=36;TCR=1;TR=33;WE=135435483;WS=135435465;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chrX	135438388	rs6635268	A	G	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.4;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=253;SC=ATGTAAGTCAATAGCTCTTCC;SOR=2.985;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=135438396;WS=135438378;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	135474420	rs1329546	C	A	2884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=34;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=65;NR=18;PP=2325;SC=CATTAACCACCTATGTTGTGA;SOR=2.494;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=83;TCF=65;TCR=18;TR=83;WE=135474428;WS=135474410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,89:1.00:89
chrX	135474444	rs34255702	AGAT	A	5089.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=0.197;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.198;NF=66;NR=26;PP=2967;ReadPosRankSum=1.541;SC=CCAGCATTTCAGATGATATGT;SOR=1.088;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=101;TCF=71;TCR=30;TR=92;WE=135474454;WS=135474434;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,116:0.99:117
chrX	135480126	rs5974595	T	C	1202.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=38;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=20;NR=18;PP=983;SC=CCTCCATTTTTCTGGGAGTTG;SOR=0.798;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=20;TCR=18;TR=38;WE=135480134;WS=135480116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	135496398	rs5930942	G	A	4800.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=156;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=100;NR=46;PP=2965;SC=AACTGTTGACGCCATCTCTCA;SOR=1.625;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=146;TCF=100;TCR=46;TR=146;WE=135496406;WS=135496388;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,152:1.00:152
chrX	135572223	rs3030366	A	ACT	2453.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=4;PP=2375;SC=CACTAAGGTCACTTCTCACCC;SOR=4.654;SbPval=0.67;Source=Platypus;TC=55;TCF=50;TCR=5;TR=51;WE=135572231;WS=135572213;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chrX	135574099	.	G	T	1111.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.799;ClippingRankSum=0.000;DP=84;ExcessHet=3.0103;FS=110.092;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.02;MQRankSum=-3.872;QD=13.24;ReadPosRankSum=-0.824;SOR=7.657;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:39,45:0.54:84
chrX	135574100	.	C	T	1099.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.548;ClippingRankSum=0.000;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=109.433;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.16;MQRankSum=-3.949;QD=12.50;ReadPosRankSum=-0.609;SOR=7.700;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:42,46:0.52:88
chrX	135574102	.	A	T	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.961;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=99.518;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.40;MQRankSum=-4.166;QD=11.36;ReadPosRankSum=-1.571;SOR=7.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:49,47:0.49:96
chrX	135574104	.	G	T	1090.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.062;ClippingRankSum=0.000;DP=99;ExcessHet=3.0103;FS=94.582;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.48;MQRankSum=-4.271;QD=11.02;ReadPosRankSum=-2.757;SOR=7.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:52,47:0.47:99
chrX	135574108	.	C	T	1081.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-5.322;ClippingRankSum=0.000;DP=102;ExcessHet=3.0103;FS=97.896;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.56;MQRankSum=-4.372;QD=10.61;ReadPosRankSum=-7.983;SOR=7.743;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,47:0.46:102
chrX	135582230	.	G	C	584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=9;NR=8;PP=452;SC=GAAGTTTCAAGAAACTGCTGC;SOR=0.693;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=18;TCF=10;TCR=8;TR=17;WE=135582238;WS=135582220;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	135593629	rs3027849	C	T	5622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=177;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=90;NR=77;PP=2965;SC=AAGATTTGGACGAGGAAGGTT;SOR=0.932;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=167;TCF=90;TCR=77;TR=167;WE=135593637;WS=135593619;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,175:1.00:175
chrX	135829842	rs585356	G	A	255.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=0;NR=9;PP=256;SC=CCAGCTCTCCGGAAAAAAAAA;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=10;TCF=0;TCR=10;TR=9;WE=135829850;WS=135829832;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	136112707	rs5931046	A	G	3103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.047;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=99;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=63;NR=28;PP=2625;ReadPosRankSum=0.515;SC=ACTGGGTGGGAGGCTCTCCGG;SOR=0.810;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=92;TCF=64;TCR=28;TR=91;WE=136112715;WS=136112697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,95:0.99:96
chrX	137749997	rs5976185	A	T	479.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=10;PP=322;SC=TCTGTTGTGAATCTATGTGGG;SOR=2.049;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=14;TCF=4;TCR=10;TR=14;WE=137750005;WS=137749987;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	138067202	rs34825181	A	G	4412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=138;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=93;NR=32;PP=2965;SC=TTCCTCCTGAAGAACTCAAAT;SOR=2.355;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=126;TCF=94;TCR=32;TR=125;WE=138067210;WS=138067192;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,137:1.00:137
chrX	138067368	rs5974786	G	A	2128.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=67;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=55;PP=1688;SC=TAAATGTTTCGCAGATTTACA;SOR=4.648;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=59;TCF=4;TCR=55;TR=59;WE=138067376;WS=138067358;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,65:1.00:65
chrX	138633280	rs6048	A	G	2530.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=79;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=57;NR=18;PP=2047;SC=CCGTGCTGAGACTGTTTTTCC;SOR=2.524;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=76;TCF=57;TCR=19;TR=75;WE=138633288;WS=138633270;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,77:1.00:77
chrX	138667452	rs5909018	C	T	971.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=28;PP=766;SC=ATGGATTAACCAATCTAATGT;SOR=6.869;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=28;TCF=0;TCR=28;TR=28;WE=138667460;WS=138667442;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrX	138679712	rs1051619	T	A	675.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=23;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=9;NR=14;PP=501;SC=ACAGAGCAGATCCTTCACAGT;SOR=1.426;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=23;TCF=9;TCR=14;TR=23;WE=138679720;WS=138679702;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,23:1.00:23
chrX	138689704	rs41300934	T	A	251.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=177;SC=AGGCTATAGGTTGGCCAGGCC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=138689712;WS=138689694;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	138697246	rs2076501	A	C	1096.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=34;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=4;NR=30;PP=972;SC=GAAATATTTTATGAAATGAGG;SOR=3.611;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=34;TCF=4;TCR=30;TR=34;WE=138697254;WS=138697236;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	138698652	rs68033160	GA	G	287.75	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=35.97;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	138698665	rs5909056	T	C	333.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=37.09;SOR=3.056;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	138713463	rs56186070	G	GT	1054.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=11;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=33;NR=0;PP=964;SC=GTTTTGTTTTGTTTTTTTCAA;SOR=7.276;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=42;TCF=42;TCR=0;TR=33;WE=138713471;WS=138713453;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,37:1.00:37
chrX	138724725	rs926563	G	A	1639.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=30;PP=1379;SC=TCAACGCAACGTTGATGAAAT;SOR=0.931;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=54;TCF=24;TCR=30;TR=54;WE=138724733;WS=138724715;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chrX	138724841	rs200847661	GA	G	34.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.160;ClippingRankSum=-0.000;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.95;MQRankSum=-0.674;QD=3.47;ReadPosRankSum=-1.333;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:5,5:0.50:10
chrX	138774209	rs4824861	C	T	1205.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=28;PP=963;SC=GTGCAGCCATCTGGGTTCTGG;SOR=1.730;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=40;TCF=12;TCR=28;TR=40;WE=138774217;WS=138774199;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,39:1.00:39
chrX	138811003	rs2094702	G	A	1243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=25;NR=13;PP=956;SC=AGTGTGTTGCGTATCAAGTAT;SOR=1.666;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=38;TCF=25;TCR=13;TR=38;WE=138811011;WS=138810993;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	138825675	rs1268015	T	C	444.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=370;SC=GAAAGTATTATAAAAACAGTA;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=138825683;WS=138825665;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	138882172	rs10717380	AC	A	582.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.369;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FS=19.276;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.28;MQRankSum=1.925;QD=8.57;ReadPosRankSum=1.451;SOR=1.269;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:35,33:0.49:68
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chrX	139298295	rs396467	C	T	50.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.881;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=170;ExcessHet=3.0103;FS=65.349;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=51.81;MQRankSum=-4.520;QD=0.30;ReadPosRankSum=-0.354;SOR=5.782;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:153,17:0.10:170
chrX	139795664	rs41304542	G	A	3481.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=109;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=94;NR=11;PP=2919;SC=TGTAAGTGTTGTCTATTATTA;SOR=4.057;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=105;TCF=94;TCR=11;TR=105;WE=139795672;WS=139795654;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chrX	140008385	rs5907732	G	T	667.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.03;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=5;NR=17;PP=549;SC=GGGAAGAGAAGGCTTATTGAT;SOR=2.303;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=22;TCF=5;TCR=17;TR=22;WE=140008393;WS=140008375;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	140008515	rs5907733	C	T	73.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=3;PP=53;SC=AGTGAATATACAGACTTTAAT;SOR=2.833;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=3;TCF=0;TCR=3;TR=3;WE=140008523;WS=140008505;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrX	140271268	rs2038375	G	C	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=25;PP=774;SC=GCGCACGGAGGCCTCGCAGGA;SOR=3.258;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=30;TCF=5;TCR=25;TR=29;WE=140271276;WS=140271258;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	140336584	rs140268038	T	G	6354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=144;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.40;QD=44.44;SOR=2.127;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,143:1.00:143
chrX	140336584	.	TGT	GGC	2947	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MMLQ=29;MQ=57.03;NF=32;NR=98;PP=2947;QD=20;SC=CTGGATTGTTTGTCCATTGTA;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=139;TCF=33;TCR=106;TR=130;WE=140336594;WS=140336574;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:9,130:0.94:139
chrX	140336586	rs145340261	T	C	6354.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=140;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=58.36;QD=45.72;SOR=2.122;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,139:1.00:139
chrX	140714231	rs2239834	A	G	2663.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=-1.424;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=97;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=35;PP=2108;ReadPosRankSum=0.497;SC=CCATTGCTACATTATCCCAAA;SOR=0.541;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=96;TCF=61;TCR=35;TR=95;WE=140714239;WS=140714221;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,95:0.99:96
chrX	140714251	rs2239835	A	G	2820.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=85;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=54;NR=30;PP=2355;SC=AGGTTACCGAAGAAGTAGGAG;SOR=1.423;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=84;TCF=54;TCR=30;TR=84;WE=140714259;WS=140714241;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chrX	140714769	rs2239837	A	G	2660.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=41.57;SOR=1.721;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chrX	140714777	rs2239838	G	C	2487.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=46.07;SOR=1.835;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chrX	140953078	rs1120947	A	G	77.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=25.76;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrX	140983031	rs176023	A	G	1027.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=8;HapScore=1;MGOF=24;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=33;NR=1;PP=788;SC=AGGAGGCCCCACCCCACGCTG;SOR=4.921;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=35;TCF=34;TCR=1;TR=34;WE=140983039;WS=140983021;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chrX	140983064	rs176024	G	A	1912.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=36;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=9;PP=1423;SC=GCCCTGGTCAGCCTTGGCAGG;SOR=2.910;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=57;TCF=48;TCR=9;TR=56;WE=140983072;WS=140983054;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chrX	140983103	rs176025	C	T	2725.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=35;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=56;NR=28;PP=2027;SC=CCGACTTGCACTGTGGGAGTC;SOR=1.455;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=84;TCF=56;TCR=28;TR=84;WE=140983111;WS=140983093;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,88:1.00:88
chrX	140983127	rs176026	G	A	2837.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=91;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=31;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=36;PP=2154;SC=AGGACCTGAAGCATTTTGCGA;SOR=1.105;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=51;TCR=36;TR=87;WE=140983135;WS=140983117;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chrX	140993264	rs176036	G	A	4740.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=158;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=112;NR=37;PP=2965;SC=CCTCAGAGTTGTCCTGAGGGG;SOR=2.288;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=150;TCF=113;TCR=37;TR=149;WE=140993272;WS=140993254;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,157:1.00:157
chrX	140993642	rs176037	C	T	3849.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=119;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=73;NR=49;PP=2965;SC=CCTGAGAGTACTCAAAGTCCT;SOR=1.085;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=122;TCF=73;TCR=49;TR=122;WE=140993650;WS=140993632;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,118:1.00:118
chrX	140993852	rs176038	C	G	4567.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.580;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=208;ExcessHet=3.0103;FS=13.403;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.39;MQRankSum=1.995;QD=22.28;ReadPosRankSum=-2.875;SOR=1.162;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:84,121:0.59:205
chrX	140993859	rs6634333	T	A	4411.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=5.209;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=201;ExcessHet=3.0103;FS=8.236;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=54.00;MQRankSum=1.138;QD=22.28;ReadPosRankSum=-0.846;SOR=1.053;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,112:0.57:198
chrX	140993864	rs34836042	T	C	4391.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.863;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=194;ExcessHet=3.0103;FS=7.179;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=53.77;MQRankSum=0.869;QD=22.76;ReadPosRankSum=0.571;SOR=0.997;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:86,107:0.55:193
chrX	140993905	rs176040	C	T	3071.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=72;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=46.90;QD=42.66;SOR=1.002;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,72:1.00:72
chrX	140993913	rs176041	C	G	1807.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.706;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=39;ExcessHet=3.0103;FS=6.145;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=43.88;MQRankSum=-0.398;QD=46.35;ReadPosRankSum=1.953;SOR=0.074;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:3,36:0.92:39
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chrX	140993947	rs148942485	T	C	485.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=59;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=55.69;QD=12.14;SOR=1.445;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	140994085	rs176046	C	G	2648.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BaseQRankSum=3.027;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=88;ExcessHet=3.0103;FS=8.756;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=50.88;MQRankSum=2.291;QD=30.10;ReadPosRankSum=-0.521;SOR=3.312;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:4,84:0.95:88
chrX	140994171	rs176047	C	G	6425.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=203;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=110;NR=102;PP=2965;SC=AGAGAACTCACAGTACTTTTG;SOR=0.873;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=212;TCF=110;TCR=102;TR=212;WE=140994179;WS=140994161;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,203:1.00:203
chrX	140994591	rs176048	C	G	6807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;BaseQRankSum=1.364;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.495;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-1.070;NF=106;NR=83;PP=2965;ReadPosRankSum=0.786;SC=AGAGAACTCACAGTACTTTTG;SOR=0.591;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=191;TCF=106;TCR=85;TR=189;WE=140994599;WS=140994581;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,198:0.99:199
chrX	141290865	rs3765272	C	T	2638.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=34;NR=48;PP=2183;SC=AATGGGCTCTCGGACCCCACA;SOR=1.151;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=82;TCF=34;TCR=48;TR=82;WE=141290873;WS=141290855;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,82:1.00:82
chrX	142121729	rs4825148	T	C	717.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=21;NR=0;PP=611;SC=CATTCCTTCTTATAAAGCCCC;SOR=6.184;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=142121737;WS=142121719;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	142122058	rs62601929	T	G	942.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=26;PP=727;SC=TCATCACCACTGATGGCGATG;SOR=5.353;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=142122066;WS=142122048;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chrX	142795049	.	C	T	1010.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=30;NR=1;PP=854;SC=GAGATATACACGGTCATCAGC;SOR=5.486;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=31;WE=142795057;WS=142795039;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chrX	142795225	rs3859898	G	A	1496.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=16;NR=39;PP=1473;SC=CCAGGTCTTCGTCCTCCTGTG;SOR=2.494;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=55;TCF=16;TCR=39;TR=55;WE=142795233;WS=142795215;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chrX	142803571	rs851092	A	G	482.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.24;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=0;PP=389;SC=GGCATTAAGCAGGTCCCCCAC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=142803579;WS=142803562;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	142967468	rs237520	T	G	4132.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=125;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=67;NR=56;PP=2965;SC=AGAATAAGTTTAGATATTTTG;SOR=0.882;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=123;TCF=67;TCR=56;TR=123;WE=142967476;WS=142967458;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,125:1.00:125
chrX	144904252	rs3810704	G	A	3456.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=106;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=46;NR=57;PP=2768;SC=AGATCCGAACGGGGGCATTCA;SOR=0.941;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=103;TCF=46;TCR=57;TR=103;WE=144904260;WS=144904242;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,106:1.00:106
chrX	144904882	rs2748588	T	C	3662.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=110;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=38;NR=70;PP=2965;SC=GTCCAACTCCTCGAGTGACTG;SOR=1.423;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=108;TCF=38;TCR=70;TR=108;WE=144904890;WS=144904872;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,109:1.00:109
chrX	144906432	.	C	A	4285.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DP=131;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=66;NR=58;PP=2965;SC=CAATCAGAACCGGACTACCTC;SOR=0.804;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=124;TCF=66;TCR=58;TR=124;WE=144906440;WS=144906422;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,131:1.00:131
chrX	145075633	rs5919984	T	C	372.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=12;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=0;PP=280;SC=CTCTGAAAAATAGGTATTTCC;SOR=5.136;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=11;WE=145075641;WS=145075623;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,12:1.00:12
chrX	146340338	rs36092315	CT	C	2310.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.06;QD=39.84;SOR=6.736;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chrX	146354025	rs5904728	GT	AC	2805.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;JOINED;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=4;NR=48;PP=2947;SC=GTAAGTGGCCGTTGGCATTTA;SOR=4.582;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=55;TCF=4;TCR=51;TR=52;WE=146354034;WS=146354015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chrX	147003564	rs1270092	T	C	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=15;PP=520;SC=GCTAATTCTATTCTTCATTTT;SOR=2.833;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=18;TCF=3;TCR=15;TR=18;WE=147003572;WS=147003554;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	147014960	rs4824232	C	T	295.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=6;PP=202;SC=TCTAAAAAGTCCCAAAGCTAG;SOR=1.609;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=9;TCF=3;TCR=6;TR=9;WE=147014968;WS=147014950;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	147015021	rs4824233	C	T	255.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=7;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=6;PP=242;SC=TAGTAATTCTCCATTTTGACT;SOR=1.863;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=8;TCF=2;TCR=6;TR=8;WE=147015029;WS=147015011;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	147026330	rs11293471	AC	A	209.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=0;PP=351;SC=GCTTCTGTTAACCCTCTTTTT;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=9;TCF=9;TCR=0;TR=8;WE=147026338;WS=147026320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	147719592	rs5980554	G	T	437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=26;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=5;PP=273;SC=TGTATGTCCTGCCATATCCTT;SOR=1.473;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=8;TCR=5;TR=13;WE=147719600;WS=147719582;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	147719619	rs5980555	C	A	497.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=6;PP=304;SC=CATAAAAGCACAATTATGATC;SOR=1.244;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=14;TCF=8;TCR=6;TR=14;WE=147719627;WS=147719609;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	147719672	rs5980556	T	C	579.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=21;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=9;PP=428;SC=TGTATTAGTCTATTATTGTAT;SOR=0.892;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=17;TCF=8;TCR=9;TR=17;WE=147719680;WS=147719662;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	147733265	rs5904246	G	GA	1000.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=12;PP=981;SC=CAAGGGAAGAGATTTTGCTTT;SOR=0.906;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=23;TCF=11;TCR=12;TR=23;WE=147733273;WS=147733255;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chrX	147891558	rs11117555	T	C	457.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=13;PP=353;SC=GGAATCCTGATATTCTACTTC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=0;TCR=13;TR=13;WE=147891566;WS=147891548;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	147919063	rs375432534	CAGTTA	C	1643.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=0;PP=1797;SC=AGTATTAGGTCAGTTAAGTTA;SOR=7.328;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=44;TCF=44;TCR=0;TR=35;WE=147919075;WS=147919053;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	147967552	rs41299108	G	T	923.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=29;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=1;NR=26;PP=783;SC=GGGATGAAGGGGGGAGCAGGA;SOR=5.283;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=27;TCF=1;TCR=26;TR=27;WE=147967560;WS=147967542;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,28:1.00:28
chrX	148035344	rs10608807	GAC	G	43.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.465;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=59.72;MQRankSum=1.319;QD=1.46;ReadPosRankSum=-1.130;SOR=0.052;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:25,5:0.17:30
chrX	148037055	rs16994868	G	C	1346.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=41;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=39;NR=2;PP=1170;SC=GCTTTTAGTAGTAGTCTCTGT;SOR=5.186;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=41;TCF=39;TCR=2;TR=41;WE=148037063;WS=148037045;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	148048207	rs111499310	CTT	C	603.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;QD=30.19;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	148055144	rs5980615	A	G	1765.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=55;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=16;NR=35;PP=1321;SC=TCAGGTGAATAGCCTTTCTGC;SOR=1.877;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=51;TCF=16;TCR=35;TR=51;WE=148055152;WS=148055134;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chrX	148062377	rs12688573	G	A	733.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.3;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=15;PP=572;SC=ATAGACCCCAGATATTTTGCA;SOR=2.303;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=21;TCF=6;TCR=15;TR=21;WE=148062385;WS=148062367;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	148062498	rs5936462	C	G	206.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=7;PP=167;SC=AAAAGATGTGCTTCAGAGTTA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=0;TCR=7;TR=7;WE=148062506;WS=148062488;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	148582350	rs139515077	CATT	C	537.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=0;PP=515;SC=TCTGTCAAAACATTATCACAA;SOR=5.283;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=12;WE=148582360;WS=148582340;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	148582549	rs1141608	G	A	2679.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=83;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=40;PP=2215;SC=GAGAATCATCGGTATGGTTAG;SOR=0.766;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=83;TCF=43;TCR=40;TR=83;WE=148582557;WS=148582539;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,83:1.00:83
chrX	148615567	.	T	TAGG	53.70	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=26.85;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chrX	148619841	.	CAG	C	266.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=44.63;QD=38.11;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	148622730	rs3747443	G	A	411.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=10;NR=6;PP=327;SC=GTCTCGGGGAGGCAGAGGACT;SOR=1.473;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=16;TCF=10;TCR=6;TR=16;WE=148622738;WS=148622720;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	148622745	rs3747442	T	A	476.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.05;DB;DP=17;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=6;PP=350;SC=AGGACTGTTCTTTCCTGTGGC;SOR=1.739;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=18;TCF=12;TCR=6;TR=18;WE=148622753;WS=148622735;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	148627384	rs145921071	A	G	461.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=14;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=32.98;SOR=0.976;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	148628490	.	A	T	218.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.85;QD=31.26;SOR=2.584;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	148713418	.	T	TCGCCGC	980.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=17;PP=1000;SC=GCCGTCGCCGTCGCCGCCGCC;SOR=3.258;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=31;TCF=4;TCR=27;TR=19;WE=148713426;WS=148713408;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	148794953	rs1970766	G	A	1077.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=7;NR=24;PP=933;SC=TCCAAGGCACGGTGGCCACAT;SOR=2.448;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=32;TCF=7;TCR=25;TR=31;WE=148794961;WS=148794943;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,32:1.00:32
chrX	148797348	rs2233048	C	T	4329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=95;NR=31;PP=2965;SC=GTAAGTAGGCCTTTGTTAGAT;SOR=2.035;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=127;TCF=96;TCR=31;TR=126;WE=148797356;WS=148797338;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,134:1.00:134
chrX	148798223	rs2233050	T	C	855.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=26;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=13;PP=761;SC=AGAGGCTCCTTACCCAAAATT;SOR=0.846;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=26;TCF=13;TCR=13;TR=26;WE=148798231;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	149013727	rs5983916	A	G	4349.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=150;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=89;NR=52;PP=2965;SC=TCTGGGAAGCATTGAGTGTGA;SOR=1.298;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=142;TCF=89;TCR=53;TR=141;WE=149013735;WS=149013717;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,148:1.00:148
chrX	149114389	.	G	A	217.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.08;QD=31.11;SOR=4.174;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	149613617	rs6526057	T	C	658.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=20;NR=0;PP=557;SC=AGGAATGTGGTTGACTCCACA;SOR=6.091;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=20;TCF=20;TCR=0;TR=20;WE=149613625;WS=149613607;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	149887056	rs526164	C	T	1871.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=20;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=0;PP=1524;SC=GTTTGGTGTCCTTTTTTTTTT;SOR=8.051;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=54;TCF=54;TCR=0;TR=51;WE=149887064;WS=149887046;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,55:1.00:55
chrX	149931106	rs16995747	C	T	1329.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=47;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=12;NR=32;PP=1138;SC=GTGTGGAGGGCCTACAGCGGG;SOR=2.007;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=44;TCF=12;TCR=32;TR=44;WE=149931114;WS=149931096;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chrX	150348228	rs1202874	C	T	561.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.38;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=3;PP=511;SC=CTCCCTCCCTCGATATGTTTT;SOR=2.833;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=16;TCF=13;TCR=3;TR=16;WE=150348236;WS=150348218;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	150349557	rs68058591	CCACCACTGGCCA	C	7307.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=173;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=51;NR=45;PP=2974;SC=CACCCTAAACCCACCACTGGC;SOR=1.367;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=106;TCF=57;TCR=49;TR=96;WE=150349576;WS=150349547;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,166:1.00:166
chrX	150349649	rs561077	A	G	7707.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=268;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=130;NR=131;PP=2965;SC=CCCTAAGCCCACTGCTGCTGA;SOR=0.723;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=261;TCF=130;TCR=131;TR=261;WE=150349657;WS=150349639;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,266:1.00:266
chrX	150349871	rs13440581	A	G	3581.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=116;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=26;NR=85;PP=2822;SC=TGTCGTGGTTATTGATGTTGA;SOR=2.407;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=111;TCF=26;TCR=85;TR=111;WE=150349879;WS=150349861;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chrX	150565330	rs176451	G	C	3863.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=130;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=74;NR=53;PP=2843;SC=GTCTCCTTGCGGCCCCCAGCT;SOR=1.005;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=127;TCF=74;TCR=53;TR=127;WE=150565338;WS=150565320;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,130:1.00:130
chrX	150565560	rs176452	G	T	610.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=1;NR=18;PP=544;SC=CCCCCGCGCCGGCAACAGCCC;SOR=4.514;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=19;TCF=1;TCR=18;TR=19;WE=150565568;WS=150565550;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	150789334	rs5904324	T	TA	1381.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=7;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=8;PP=1366;SC=TTAACACAGATAAAAAAGTTT;SOR=2.560;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=48;TCF=35;TCR=13;TR=39;WE=150789342;WS=150789324;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,47:1.00:47
chrX	150789950	rs945815	C	T	278.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=8;NR=1;PP=229;SC=TCTCTTTTTACTAGAAACACA;SOR=3.056;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=9;TCF=8;TCR=1;TR=9;WE=150789958;WS=150789940;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	150816952	rs12845316	A	G	655.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=19;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=21;NR=0;PP=619;SC=TGATACCTCAAAGATTAATGA;SOR=5.994;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=21;TCF=21;TCR=0;TR=21;WE=150816960;WS=150816942;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	150840185	rs6627174	T	C	2002.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=0.423;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=3.854;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=39;NR=26;PP=1520;ReadPosRankSum=1.632;SC=GTTTCTGTGGTTTATCTTTAT;SOR=0.873;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=66;TCF=39;TCR=27;TR=65;WE=150840193;WS=150840175;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,67:0.99:68
chrX	150844702	rs4553055	G	A	251.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.31;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=8;PP=185;SC=TTCAAGGTGCGTAAAGTCCCT;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=8;TCF=0;TCR=8;TR=8;WE=150844710;WS=150844692;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	150868799	rs4469605	C	G	891.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.330;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=5;NR=22;PP=670;ReadPosRankSum=0.119;SC=TTGCCTGACTCTTTTGGGGTC;SOR=1.371;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=28;TCF=5;TCR=23;TR=27;WE=150868807;WS=150868789;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,29:0.97:30
chrX	150869267	rs4323608	A	G	2769.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=25;NR=54;PP=2190;SC=GAGGCAGCGAACAGCCCCCAG;SOR=1.754;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=79;TCF=25;TCR=54;TR=79;WE=150869275;WS=150869257;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,84:1.00:84
chrX	150873651	rs3761541	G	T	462.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=0;PP=422;SC=ACTCTACTCCGTTATTTATCC;SOR=5.421;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=13;WE=150873659;WS=150873641;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,14:1.00:14
chrX	150907417	rs28650278	C	T	178.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=5;PP=112;SC=GTGGCTACCACTGCCCTCCTC;SOR=3.912;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=0;TCR=5;TR=5;WE=150907425;WS=150907407;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrX	150911107	rs12013494	G	A	1584.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=53;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=24;NR=29;PP=1273;SC=TCATCCGATTGCGCACAGGTC;SOR=0.941;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=54;TCF=24;TCR=30;TR=53;WE=150911115;WS=150911097;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,52:1.00:52
chrX	150911512	.	GT	AC	1045	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;FR=1.0000;HP=2;HapScore=1;MGOF=7;MMLQ=28;MQ=57.97;NF=17;NR=0;PP=1045;QD=64.6157573448;SC=ACATATATATGTATATATATA;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=150911521;WS=150911502;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,17:1.00:17
chrX	150912995	rs201215466	AGCATTG	A	621.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.32;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=0;NR=15;PP=861;SC=CTGCCTCTCCAGCATTGGCCT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=150913008;WS=150912985;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	151092126	rs1047246	C	G	2978.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=92;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQ=59.95;NF=31;NR=60;PP=2534;SC=GCTGCCCTGACCAGAGTCATC;SOR=1.533;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=91;TCF=31;TCR=60;TR=91;WE=151092134;WS=151092116;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chrX	151092220	rs1047248	A	G	2525.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=62;NR=22;PP=2174;SC=TGGTGGGTGCACAGGCTCCTA;SOR=2.275;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=85;TCF=63;TCR=22;TR=84;WE=151092228;WS=151092210;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,85:1.00:85
chrX	151092653	rs1047251	G	A	3206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=100;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=47;NR=50;PP=2587;SC=AGTGGACCCCGCCAGCAACAC;SOR=0.733;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=98;TCF=48;TCR=50;TR=97;WE=151092661;WS=151092643;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chrX	151142982	rs7341952	G	T	3804.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=117;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=107;NR=6;PP=2965;SC=GAGCCGTCCCGGCTCCCGGGG;SOR=5.513;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=113;TCF=107;TCR=6;TR=113;WE=151142990;WS=151142972;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,115:1.00:115
chrX	151303393	rs210586	C	T	3286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=102;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=47;NR=50;PP=2776;SC=TCTATGAAGACTATGCTTAGG;SOR=0.693;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=97;TCF=47;TCR=50;TR=97;WE=151303401;WS=151303383;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,100:1.00:100
chrX	151303596	rs210585	C	T	7062.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=219;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=120;PP=2965;SC=TTCATAATTTCTTATGACACT;SOR=0.995;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=213;TCF=93;TCR=120;TR=213;WE=151303604;WS=151303586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,217:1.00:217
chrX	151424488	rs60207108	G	GA	2764.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=95;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=75;PP=2974;SC=TGAAAAGAGAGAAAACAATGT;SOR=3.742;SbPval=0.82;Source=Platypus;TC=84;TCF=5;TCR=79;TR=78;WE=151424496;WS=151424478;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chrX	151514195	rs3830670	G	GA	919.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=23;PP=658;SC=GCAAGGAAAAGAAAAAAAATA;SOR=1.981;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=37;TCF=5;TCR=32;TR=26;WE=151514203;WS=151514185;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	151817912	rs4478723	C	G	236.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=29.60;SOR=2.833;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	151821277	rs3810651	T	A	3317.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=43;NR=58;PP=2651;SC=TGACAGTATTTTTCCTACCGA;SOR=0.973;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=101;TCF=43;TCR=58;TR=101;WE=151821285;WS=151821267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chrX	151899760	rs2515830	A	G	2144.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.861;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=60;NR=1;PP=1849;ReadPosRankSum=-0.885;SC=TGGGCCTCATATCACACGAGG;SOR=5.486;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=62;TCF=61;TCR=1;TR=61;WE=151899768;WS=151899750;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,62:0.98:63
chrX	151909156	rs2515848	A	G	3399.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;BaseQRankSum=1.819;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=-0.146;NF=33;NR=70;PP=2810;ReadPosRankSum=0.256;SC=AGACAACCCAAAAGGGAAAAG;SOR=1.566;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=105;TCF=34;TCR=71;TR=103;WE=151909164;WS=151909146;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:2,107:0.98:109
chrX	152018832	rs5969919	T	G	1308.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;BaseQRankSum=0.524;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=24;NR=15;PP=916;ReadPosRankSum=1.081;SC=CAGTGATCGGTGGCTCTGGAT;SOR=0.547;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=40;TCF=25;TCR=15;TR=39;WE=152018840;WS=152018822;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,44:0.98:45
chrX	152087420	rs16996799	C	T	1088.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=36;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=9;PP=827;SC=GACCTAAGGCCCAAAGGCAGA;SOR=1.885;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=34;TCF=24;TCR=10;TR=33;WE=152087428;WS=152087410;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,35:1.00:35
chrX	152091153	rs2071261	A	C	2046.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=51;NR=12;PP=1615;SC=TGGCAGTAGCATGCCATTGTC;SOR=2.869;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=63;TCF=51;TCR=12;TR=63;WE=152091161;WS=152091143;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chrX	152226542	rs6526155	T	C	2437.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=81;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=38;PP=2025;SC=AGTTTTGATGTGAGGCCTTCC;SOR=0.796;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=81;TCF=43;TCR=38;TR=81;WE=152226550;WS=152226532;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chrX	152482824	rs2233044	C	T	6728.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=222;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=83;NR=126;PP=2965;SC=GTGGGAAAGGCGGAGGCTCCC;SOR=1.137;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=214;TCF=87;TCR=127;TR=209;WE=152482832;WS=152482814;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,219:1.00:219
chrX	152609450	rs3213462	T	C	594.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=17;NR=0;PP=471;SC=TGCCCTGGCTTGTCATTCAGC;SOR=5.892;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=17;TCR=0;TR=17;WE=152609458;WS=152609440;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	152609668	rs3213463	T	C	1208.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=0.595;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=17;NR=24;PP=973;ReadPosRankSum=1.445;SC=GCCAGAGGCCTAGGTGAGCTG;SOR=0.394;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=42;TCF=17;TCR=25;TR=41;WE=152609676;WS=152609658;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chrX	152610051	rs1467880	A	T	937.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;BaseQRankSum=-1.119;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;MQRankSum=0.000;NF=30;NR=1;PP=816;ReadPosRankSum=-0.869;SC=TCACCTCTTGACCCTGGCATT;SOR=4.112;SbPval=0.62;Source=Platypus;TC=32;TCF=31;TCR=1;TR=31;WE=152610059;WS=152610041;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,31:0.97:32
chrX	152610108	rs1467881	G	C	2615.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=-1.720;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=84;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.819;HP=1;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=57;NR=19;PP=1941;ReadPosRankSum=-0.681;SC=AAAGACTGATGAGCCCTGGGA;SOR=2.134;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=77;TCF=57;TCR=20;TR=76;WE=152610116;WS=152610098;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,83:0.99:84
chrX	152610224	rs35024993	CGTGACCTCT	C	2169.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=31;PP=2957;SC=ATTATGGGAACGTGACCTCTG;SOR=3.398;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=40;TCF=2;TCR=38;TR=33;WE=152610240;WS=152610214;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chrX	152610294	rs1467882	A	G	556.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=149;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=17;PP=470;SC=GGGGCAGGGGACACATGGCTA;SOR=3.500;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=19;WE=152610302;WS=152610284;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	152610947	rs3213465	T	C	1095.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=0.246;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=12;PP=842;ReadPosRankSum=1.483;SC=CTCTGGCTGTTGCCATAACCA;SOR=0.462;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=34;TCF=22;TCR=12;TR=33;WE=152610955;WS=152610937;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,36:0.97:37
chrX	152610985	rs3213466	T	C	1184.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.28;BaseQRankSum=-1.676;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=21;NR=16;PP=860;ReadPosRankSum=-0.847;SC=CAGGCGTTCCTGTTTTAAATC;SOR=0.394;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=39;TCF=23;TCR=16;TR=37;WE=152610993;WS=152610975;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,41:0.98:42
chrX	152613112	rs7066295	C	T	4445.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=67;NR=69;PP=2965;SC=CCTACGCCTGCGGCCAGTGCG;SOR=0.753;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=137;TCF=68;TCR=69;TR=136;WE=152613120;WS=152613102;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chrX	152727446	rs3020966	T	A	242.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.29;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=7;NR=0;PP=169;SC=GAAAACCAGCTGTAGCCCAAC;SOR=4.407;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=7;TCF=7;TCR=0;TR=7;WE=152727454;WS=152727436;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrX	152727535	rs138590468	TA	T	759.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=9;HapScore=1;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=13;PP=515;SC=TCTTCAGATATAAAAAAAAGA;SOR=0.760;SbPval=0.65;Source=Platypus;TC=25;TCF=12;TCR=13;TR=24;WE=152727543;WS=152727525;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,29:1.00:29
chrX	152728155	rs2980032	T	C	3206.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=112;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=53;NR=53;PP=2298;SC=GAGCCCATCATGGCAGGCACC;SOR=0.711;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=106;TCF=53;TCR=53;TR=106;WE=152728163;WS=152728145;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,111:1.00:111
chrX	152736686	rs2980037	C	G	578.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=1;NR=17;PP=483;SC=CCTCTTTGCCCTCACCTAATG;SOR=3.611;SbPval=0.85;Source=Platypus;TC=19;TCF=2;TCR=17;TR=18;WE=152736694;WS=152736676;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,19:1.00:19
chrX	152752077	rs62594117	C	A	5090.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;BaseQRankSum=1.788;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=161;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=114;NR=42;PP=2965;ReadPosRankSum=0.656;SC=TGCCCCACCCCTCCCTTGCAG;SOR=1.029;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=159;TCF=117;TCR=42;TR=156;WE=152752085;WS=152752067;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,160:0.99:161
chrX	152770378	rs55857706	G	A	789.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=16;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=24;PP=635;SC=CTCAGGTGCAGCCTGAGAGCC;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=152770386;WS=152770368;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	152770402	rs2980053	A	G	520.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=2;MGOF=28;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=0;NR=15;PP=408;SC=TCTGAAGGGGACACATGCTGG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=0;TCR=15;TR=15;WE=152770410;WS=152770392;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	152771214	rs11363938	GA	G	224.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=5;NR=0;PP=203;SC=AGCATGGACTGAACCTCCTCG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=5;TCF=5;TCR=0;TR=5;WE=152771222;WS=152771207;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	152771509	rs1126499	C	T	4149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;BaseQRankSum=1.797;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=134;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=5.006;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=41;NR=88;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.766;SC=GAGTGTTCAGCGGGCTCCGGA;SOR=1.619;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=131;TCF=43;TCR=88;TR=129;WE=152771517;WS=152771499;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,132:0.99:133
chrX	152807425	rs762733	G	A	1359.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=43;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=37;PP=1092;SC=AAGGAAGCTCGGCTCCTGCTT;SOR=3.417;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=43;TCF=6;TCR=37;TR=43;WE=152807433;WS=152807415;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,43:1.00:43
chrX	152807665	rs2980012	A	G	1143.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=10;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=32;NR=0;PP=958;SC=GTTCCCCAGAAGGAGGAGGGC;SOR=7.054;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=32;TCF=32;TCR=0;TR=32;WE=152807673;WS=152807655;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	152807923	rs2980013	G	C	4622.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=164;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=43;NR=117;PP=2965;SC=GCCACCCTCCGGGCCAGCCTG;SOR=2.079;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=160;TCF=43;TCR=117;TR=160;WE=152807931;WS=152807913;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,162:1.00:162
chrX	152815089	rs3020949	A	G	4239.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=139;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=76;NR=57;PP=2965;SC=CCTACCTAGGAGACACCCACT;SOR=1.027;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=135;TCF=77;TCR=58;TR=133;WE=152815097;WS=152815079;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,136:1.00:136
chrX	152815886	rs2285035	C	T	505.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=15;PP=424;SC=TTCACAATATCATGCAACCGT;SOR=4.174;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=16;TCF=1;TCR=15;TR=16;WE=152815894;WS=152815876;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	152818435	rs2239682	G	A	6382.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=207;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=130;NR=68;PP=2965;SC=TGTGACCAGCGCTGTTCCTTG;SOR=1.496;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=199;TCF=131;TCR=68;TR=198;WE=152818443;WS=152818425;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,204:1.00:204
chrX	152821887	rs3020957	C	T	706.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=22;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=3;NR=21;PP=628;SC=GTAGCCGAGCCCCCACACCCC;SOR=3.258;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=24;TCF=3;TCR=21;TR=24;WE=152821895;WS=152821877;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,22:1.00:22
chrX	152823728	rs2269415	G	C	2307.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=68;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=20;NR=44;PP=1823;SC=TGGTGGCTGTGATCGTGGCCT;SOR=1.751;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=64;TCF=20;TCR=44;TR=64;WE=152823736;WS=152823718;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chrX	152825414	rs3020959	G	T	959.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=31;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=17;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=28;PP=761;SC=GGCTGGCCAGGGGCACCCGGG;SOR=4.615;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=30;TCF=2;TCR=28;TR=30;WE=152825422;WS=152825404;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chrX	152825433	rs2980018	A	G	831.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=24;PP=677;SC=GGAGGACTTCAGGACACTGTT;SOR=6.518;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=24;TCF=0;TCR=24;TR=24;WE=152825441;WS=152825423;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	152830322	rs4243536	A	G	1213.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=44;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=41;NR=1;PP=986;SC=GGGACCTTACACCAGGCAGAT;SOR=6.184;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=42;TCF=41;TCR=1;TR=42;WE=152830330;WS=152830312;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,44:1.00:44
chrX	152834736	rs6643626	T	C	1888.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=63;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=35;PP=1396;SC=GGTTGAGAACTATGAAGTACT;SOR=1.010;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=62;TCF=27;TCR=35;TR=62;WE=152834744;WS=152834726;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,63:1.00:63
chrX	152834891	rs6643736	G	C	322.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=2;NR=9;PP=298;SC=GCTGGCCTCAGTCAGGGCCCT;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=11;TCF=2;TCR=9;TR=11;WE=152834899;WS=152834881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	152938409	rs10542443	TAC	T	127.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.780;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FS=1.764;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=4.26;ReadPosRankSum=0.753;SOR=0.323;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:22,8:0.27:30
chrX	152954025	rs384573	A	G	199.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=6;NR=0;PP=160;SC=CGGCCCGCCGAGGCCATGGCG;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=152954033;WS=152954015;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	153008911	rs4898368	C	T	142.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=83;SC=GCCCCCGTGCCGTGCCCCTGA;SOR=1.981;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=153008919;WS=153008901;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	153009197	rs2229539	G	C	43.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.5;DB;DP=2;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=6;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=1;PP=54;SC=TGACACAACCGTCCCCGGCCC;SOR=0.693;SbPval=0.74;Source=Platypus;TC=2;TCF=1;TCR=1;TR=2;WE=153009205;WS=153009187;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chrX	153034752	rs2266877	C	T	499.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.35;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=3;NR=12;PP=378;SC=CTAGGGCCAACGGGTGGTGTG;SOR=2.584;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=15;TCF=3;TCR=12;TR=15;WE=153034760;WS=153034742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	153035798	rs2266879	G	A	2719.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=35;NR=47;PP=1935;SC=CCCAGACCACGTCACTGTGCC;SOR=0.990;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=82;TCF=35;TCR=47;TR=82;WE=153035806;WS=153035788;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chrX	153037275	rs6643644	C	T	304.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=10;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=2;PP=250;SC=CAGAGTGGAGCGTGGGTGCGG;SOR=2.303;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=10;TCF=8;TCR=2;TR=10;WE=153037283;WS=153037265;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,10:1.00:10
chrX	153037594	rs11156607	C	G	2632.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=80;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=57;NR=21;PP=2116;SC=GCTGTCCCCTCCGTCCCTGAG;SOR=2.026;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=79;TCF=58;TCR=21;TR=78;WE=153037602;WS=153037584;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,80:1.00:80
chrX	153037808	rs2266882	G	A	2119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.16;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=11;NR=57;PP=1722;SC=AAGGACAGGCGCCTAGTAAGG;SOR=3.040;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=70;TCF=11;TCR=59;TR=68;WE=153037816;WS=153037798;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,69:1.00:69
chrX	153037999	rs2266883	G	C	408.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=11;NR=1;PP=340;SC=GAGCAGTGAGGGCAGGGGTGG;SOR=2.833;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=12;TCF=11;TCR=1;TR=12;WE=153038007;WS=153037989;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	153038516	rs5945161	C	G	988.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.1;DB;DP=32;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=11;NR=19;PP=809;SC=CACTCCCATACGCCTCAGTGG;SOR=1.402;SbPval=0.64;Source=Platypus;TC=31;TCF=12;TCR=19;TR=30;WE=153038524;WS=153038506;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,31:1.00:31
chrX	153038661	rs2266885	G	C	1453.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=46;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=19;PP=1172;SC=GCCGAGATGAGAGACCCCACT;SOR=1.085;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=46;TCF=27;TCR=19;TR=46;WE=153038669;WS=153038651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,46:1.00:46
chrX	153039502	rs6643791	G	C	1606.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=20;NR=35;PP=1295;SC=TCAGCCGCGAGGGGCCTGCCC;SOR=1.342;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=56;TCF=20;TCR=36;TR=55;WE=153039510;WS=153039492;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chrX	153039615	rs1543781	A	G	1818.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=30;NR=31;PP=1417;SC=GGGGGCCAGCAGCTTAGGCTC;SOR=0.693;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=61;TCF=30;TCR=31;TR=61;WE=153039623;WS=153039605;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chrX	153041544	rs5987155	T	C	1079.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=40;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=26;PP=852;SC=AGCAGCGAGATGCAGCGCGTG;SOR=2.554;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=35;TCF=9;TCR=26;TR=35;WE=153041552;WS=153041534;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,38:1.00:38
chrX	153042237	rs1894294	G	A	146.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=6;NR=0;PP=147;SC=AGGCGAGGCAGGGCAGGGCGG;SOR=3.611;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=6;TCF=6;TCR=0;TR=6;WE=153042245;WS=153042229;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrX	153042419	rs34966902	G	A	2916.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=67;NR=20;PP=2364;SC=TGGCCCAGAGGTGCCCCTTGG;SOR=2.435;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=87;TCF=67;TCR=20;TR=87;WE=153042427;WS=153042409;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,91:1.00:91
chrX	153047809	rs1981439	A	G	521.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=16;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=16;PP=442;SC=CCCCGCCCCCAGGTAACTGTG;SOR=5.670;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=17;TCF=0;TCR=17;TR=16;WE=153047817;WS=153047799;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,16:1.00:16
chrX	153048647	rs201302475	GT	G	949.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=39.57;SOR=1.051;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,24:1.00:24
chrX	153048657	rs2314343	A	C	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.773;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=11.38;ReadPosRankSum=-0.797;SOR=0.773;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:6,12:0.67:18
chrX	153052661	rs2269482	A	G	807.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.09;DB;DP=25;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=23;PP=672;SC=ACAGTCAGCCAGAGGGACGGG;SOR=4.174;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=25;TCF=2;TCR=23;TR=25;WE=153052669;WS=153052651;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,25:1.00:25
chrX	153073752	rs3761532	T	C	2839.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.27;DB;DP=93;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=69;NR=13;PP=2181;SC=AGGTGGCCTGTCCTCTCTGGA;SOR=3.160;SbPval=0.52;Source=Platypus;TC=82;TCF=69;TCR=13;TR=82;WE=153073760;WS=153073742;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,90:1.00:90
chrX	153149708	rs77883713	G	GC	2648.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=42;PP=2450;SC=ACTGCCCATCGTGGGATCCTG;SOR=2.546;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=53;TCF=10;TCR=43;TR=51;WE=153149723;WS=153149698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,60:1.00:60
chrX	153149715	rs6643650	C	G	2536.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=40;PP=1483;SC=ATCGTGGGATCCTGAGCGCCT;SOR=2.428;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=53;TCF=13;TCR=40;TR=53;WE=153149723;WS=153149698;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,57:1.00:57
chrX	153151277	rs56026845	C	G	869.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=21;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=9;NR=9;PP=388;SC=CATCTGGGGCCCCGCAGGTTA;SOR=0.784;SbPval=0.39;Source=Platypus;TC=21;TCF=9;TCR=12;TR=18;WE=153151292;WS=153151267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,21:1.00:21
chrX	153151280	rs143464562	G	GCC	905.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=20;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=9;PP=640;SC=CTGGGGCCCCGCAGGTTACCC;SOR=0.892;SbPval=0.71;Source=Platypus;TC=14;TCF=5;TCR=9;TR=13;WE=153151292;WS=153151267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,20:1.00:20
chrX	153151284	rs199975679	GT	G	772.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.04;DB;DP=18;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=4;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=9;PP=504;SC=GGCCCCGCAGGTTACCCCTCA;SOR=1.493;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=13;TCF=4;TCR=9;TR=13;WE=153151292;WS=153151267;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,18:1.00:18
chrX	153151423	.	G	GCGGC	81	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;FR=0.9998;HP=2;HapScore=2;MGOF=20;MMLQ=24;MQ=60.0;NF=0;NR=2;PP=81;QD=62.0;SC=ACCGGGCCGGGACTCCCTGGT;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=2;TCF=0;TCR=2;TR=2;WE=153151431;WS=153151413;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chrX	153170447	rs55712963	G	GC	243.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=4;NR=1;PP=209;SC=TACTGCCACCGACACGTGCAC;SOR=2.584;SbPval=0.66;Source=Platypus;TC=5;TCF=4;TCR=1;TR=5;WE=153170455;WS=153170437;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	153170980	rs56689668	T	G	909.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=5;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=23;NR=3;PP=734;SC=CCCGACTCCTTCCCAGCTGTG;SOR=3.690;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=27;TCF=24;TCR=3;TR=26;WE=153170988;WS=153170970;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chrX	153174819	rs11394527	T	TG	6837.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=197;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=93;NR=72;PP=2936;SC=CCACTCCCACTGGCCAAAGCC;SOR=1.354;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=170;TCF=97;TCR=73;TR=165;WE=153174827;WS=153174809;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,192:1.00:192
chrX	153174867	rs11405331	T	TG	6694.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=206;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=18;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=55;NR=105;PP=2967;SC=AGCACACGTGTGGCCCCCTGA;SOR=1.037;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=161;TCF=56;TCR=105;TR=160;WE=153174875;WS=153174857;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,193:1.00:193
chrX	153175053	rs56015121	G	GC	935.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=27;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=2;NR=21;PP=1097;SC=AGGGCCAGCAGCTCCGCGCCA;SOR=4.255;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=23;TCF=2;TCR=21;TR=23;WE=153175061;WS=153175043;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,26:1.00:26
chrX	153178459	rs5904376	G	GC	1339.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=13;NR=23;PP=1398;SC=CAGGGCCCCAGCCCTCAGGGA;SOR=0.954;SbPval=0.48;Source=Platypus;TC=41;TCF=14;TCR=27;TR=36;WE=153178467;WS=153178449;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	153186412	rs34153599	A	AG	1741.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;DB;DP=51;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=22;NR=23;PP=1924;SC=CTAGGGAGAGAGGCCTTTGCC;SOR=0.693;SbPval=0.49;Source=Platypus;TC=47;TCF=22;TCR=25;TR=45;WE=153186420;WS=153186401;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,50:1.00:50
chrX	153186484	rs11428457	T	TC	1275.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.12;DB;DP=48;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=6;HapScore=1;MGOF=12;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=19;NR=23;PP=1394;SC=GCGGTGTTCCTCCCCACTGTG;SOR=0.693;SbPval=0.59;Source=Platypus;TC=46;TCF=21;TCR=25;TR=42;WE=153186492;WS=153186474;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,40:1.00:40
chrX	153208197	rs11372702	T	TG	263.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=5;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=8;NR=0;PP=280;SC=CTTCCCCAGGTGGGACATCCC;SOR=4.615;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=11;TCF=11;TCR=0;TR=8;WE=153208205;WS=153208195;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,9:1.00:9
chrX	153210179	rs146096296	T	TG	2236.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=77;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=9;NR=55;PP=2414;SC=CCGCTGGGCCTGGGGCGGGGC;SOR=2.584;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=70;TCF=10;TCR=60;TR=64;WE=153210207;WS=153210169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,70:1.00:70
chrX	153210193	.	G	C	2755.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DP=62;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=6;NR=35;PP=1071;SC=GCGGGGCTTTGAGCCCGACCC;SOR=3.187;SbPval=0.45;Source=Platypus;TC=46;TCF=6;TCR=40;TR=41;WE=153210207;WS=153210169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,62:1.00:62
chrX	153210195	.	G	GGC	2915.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DP=58;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=26;NF=3;NR=33;PP=1745;SC=GGGGCTTTGAGCCCGACCCCC;SOR=3.037;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=38;TCF=3;TCR=35;TR=36;WE=153210207;WS=153210169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,58:1.00:58
chrX	153210199	rs377619070	GA	G	2516.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.22;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=2;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=2;NR=33;PP=1570;SC=CTTTGAGCCCGACCCCCGCAC;SOR=3.342;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=37;TCF=2;TCR=35;TR=35;WE=153210207;WS=153210169;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chrX	153215839	rs3027875	G	A	1412.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=50;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=24;NR=21;PP=1023;SC=GGCTGGGCCCGCAGTACACCC;SOR=0.866;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=47;TCF=25;TCR=22;TR=45;WE=153215847;WS=153215829;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,48:1.00:48
chrX	153277889	rs2239673	C	T	387.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=13;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=10;NR=2;PP=280;SC=GGCTGCCCCACGCCCTCAGCG;SOR=2.833;SbPval=0.61;Source=Platypus;TC=12;TCF=10;TCR=2;TR=12;WE=153277897;WS=153277886;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,13:1.00:13
chrX	153278829	rs1059703	G	A	1434.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.19;DB;DP=49;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=22;NF=24;NR=23;PP=1008;SC=GGCGGCCTCCGAATGCCCGGG;SOR=0.733;SbPval=0.58;Source=Platypus;TC=48;TCF=24;TCR=24;TR=47;WE=153278837;WS=153278819;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,49:1.00:49
chrX	153279858	rs5945174	G	A	1011.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=33;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=1;NR=29;PP=764;SC=ATGGGGTCTCGCTTTGTTGGC;SOR=7.054;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=30;TCF=1;TCR=29;TR=30;WE=153279866;WS=153279848;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,33:1.00:33
chrX	153284192	rs1059702	A	G	2331.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.13;DB;DP=70;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=10;NR=57;PP=2012;SC=GCAAAACGGAAAGGGGCGGGC;SOR=3.393;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=67;TCF=10;TCR=57;TR=67;WE=153284200;WS=153284182;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,68:1.00:68
chrX	153284483	rs1059701	G	A	1724.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=54;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=36;NR=16;PP=1325;SC=CAGGGCTTGGGACCAGGCCGA;SOR=1.567;SbPval=0.6;Source=Platypus;TC=53;TCF=36;TCR=17;TR=52;WE=153284491;WS=153284473;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,54:1.00:54
chrX	153416484	.	A	G	42.74	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=2;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=21.37;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,2:1.00:2
chrX	153577719	rs7063300	G	A	1270.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.11;DB;DP=42;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=27;NR=16;PP=1082;SC=CCGGGGGCCCGGGTTGCCCAC;SOR=1.347;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=44;TCF=28;TCR=16;TR=43;WE=153577727;WS=153577709;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,41:1.00:41
chrX	153581291	.	GCCTAGGGGATGGATACCCCTGAGCCTCGGTGCTATGCACAGTGCTCCCGCCCCAGCTGGTGGGCAGCCACTGCCTA	G	244.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.253;ClippingRankSum=0.000;DP=150;ExcessHet=3.0103;FS=25.310;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.65;ReadPosRankSum=-0.569;SOR=4.511;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:132,16:0.11:148
chrX	153581571	.	CCCTGGACACAGGGCATGGCTGTCAGTCAGGGAGGGCATGGCTCCCCACAGGCTGCCTCCTTTCTGAACCCCCTGGACCCTTCAGCCGCTTA	C	1098.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.382;ClippingRankSum=0.000;DP=365;ExcessHet=3.0103;FS=6.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.05;ReadPosRankSum=-0.594;SOR=1.144;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:300,60:0.17:360
chrX	153581751	.	C	A	1198.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-7.810;ClippingRankSum=0.000;DP=204;ExcessHet=3.0103;FS=12.153;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=6.02;ReadPosRankSum=-0.919;SOR=0.934;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:141,58:0.29:199
chrX	153581822	.	TCACCTGGTGGGGACAGGCCAGCCATCAGTGTGCGTCCAGCCATGGGAGACCATGCCCACCCTGCCACCCGTTTCTGTCACTGCTCCCAGTGCCACC	T	1563.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.340;ClippingRankSum=0.000;DP=219;ExcessHet=3.0103;FS=5.942;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.70;ReadPosRankSum=-1.466;SOR=0.779;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:154,49:0.24:203
chrX	153581964	.	C	T	1078.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.25;BaseQRankSum=-4.197;ClippingRankSum=0.000;DP=115;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.714;HP=2;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=20;NR=20;PP=786;ReadPosRankSum=1.583;SC=ACGTGCTGTTCATTGTACTTG;SOR=0.593;SbPval=0.42;Source=Platypus;TC=110;TCF=51;TCR=59;TR=40;WE=153581972;WS=153581954;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:71,44:0.38:115
chrX	153582096	.	C	CCTCTCCTGCATCCTTGGTGTTGACGGTGAAGGTGGCAGGCTTGT	858.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.635;ClippingRankSum=0.000;DP=66;ExcessHet=3.0103;FS=10.853;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=14.31;ReadPosRankSum=-0.937;SOR=0.124;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:36,24:0.40:60
chrX	153582570	.	C	A	1083.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.26;BaseQRankSum=2.588;ClippingRankSum=0.000;DP=159;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=1.356;HP=1;HapScore=1;MGOF=7;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=38;NR=30;PP=1117;ReadPosRankSum=1.377;SC=AGGCCAGCCTCGCTGGGTGCA;SOR=0.564;SbPval=0.26;Source=Platypus;TC=171;TCF=82;TCR=89;TR=68;WE=153582578;WS=153582560;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:108,50:0.32:158
chrX	153582658	.	CCCTGTGGGGCAGTGGGGCTGAGGTCAGGGCAGCTCATTGGCACAGTCTGGCCTCCTTGGCTCCCGAGCTCCTTCCCAAGTCCCCACTCA	C	1871.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.952;ClippingRankSum=0.000;DP=211;ExcessHet=3.0103;FS=1.251;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=9.75;ReadPosRankSum=0.276;SOR=0.835;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:137,55:0.29:192
chrX	153582791	.	C	T	624.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.33;BaseQRankSum=-5.595;ClippingRankSum=0.000;DP=114;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=0.782;HP=3;HapScore=1;MGOF=23;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=13;NR=27;PP=937;ReadPosRankSum=1.742;SC=ATGACAAGGTCAAAGGGCCTC;SOR=0.812;SbPval=0.87;Source=Platypus;TC=115;TCF=49;TCR=66;TR=40;WE=153582799;WS=153582781;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:79,32:0.29:111
chrX	153583387	.	C	A	1845.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.3;BaseQRankSum=-6.208;ClippingRankSum=0.000;DP=200;ExcessHet=3.0103;FR=0.5000;FS=12.393;HP=1;HapScore=1;MGOF=15;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MMLQ=28;MQRankSum=0.000;NF=6;NR=52;PP=1490;ReadPosRankSum=-0.561;SC=GCCTTAGTGTCCACAGTGATC;SOR=0.232;SbPval=0.86;Source=Platypus;TC=174;TCF=27;TCR=147;TR=58;WE=153583395;WS=153583377;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	0/1:120,78:0.39:198
chrX	153585916	.	C	A	2126.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-6.423;ClippingRankSum=0.000;DP=273;ExcessHet=3.0103;FS=4.235;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=7.85;ReadPosRankSum=-1.608;SOR=0.887;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:173,98:0.36:271
chrX	153586723	.	GCTGTGAGGGATTGGTGTTGTGAGCAGTCAGACAGGTTCTCAGCATCCAGCCTGGGCCACTCCCCACAGGCAGCAGGCCCTGCCTCTTAC	G	1257.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.966;ClippingRankSum=0.000;DP=350;ExcessHet=3.0103;FS=29.679;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.79;ReadPosRankSum=-0.599;SOR=2.295;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:281,51:0.15:332
chrX	153586863	.	T	TCCGTGCATCACGTCAGGGGTACAGGGTATCCTGAGACG	468.73	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=1.355;ClippingRankSum=0.000;DP=125;ExcessHet=3.0103;FS=24.789;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=3.84;ReadPosRankSum=-1.353;SOR=4.389;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:102,20:0.16:122
chrX	153629155	rs12012747	A	G	2149.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=64;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=39.86;QD=33.59;SOR=1.402;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,64:1.00:64
chrX	153633359	rs1130929	G	C	4119.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.17;BaseQRankSum=1.769;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=148;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;MQRankSum=0.000;NF=62;NR=80;PP=2965;ReadPosRankSum=-0.781;SC=GAAGCAGGAGGGGGATGGCGC;SOR=0.342;SbPval=0.5;Source=Platypus;TC=143;TCF=62;TCR=81;TR=142;WE=153633367;WS=153633349;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:1,146:0.99:147
chrX	153637305	rs2070807	T	C	1480.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=45;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=44;NR=1;PP=1267;SC=CCAGAGAGAGTGACGGTTCCT;SOR=6.229;SbPval=0.63;Source=Platypus;TC=45;TCF=44;TCR=1;TR=45;WE=153637313;WS=153637295;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,45:1.00:45
chrX	153640406	rs62617809	C	T	4946.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.14;DB;DP=157;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=81;NR=69;PP=2965;SC=AGCGCCTGACCTCTCCTTCCC;SOR=0.887;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=150;TCF=81;TCR=69;TR=150;WE=153640414;WS=153640396;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,156:1.00:156
chrX	153657083	rs28497482	A	G	1730.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DB;DP=56;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=23;NF=26;NR=28;PP=1337;SC=TGGGGCCGCGATGCGCCCAGG;SOR=0.922;SbPval=0.56;Source=Platypus;TC=54;TCF=26;TCR=28;TR=54;WE=153657091;WS=153657073;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,56:1.00:56
chrX	153660041	rs11156577	C	T	82.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=3;NR=1;PP=65;SC=CACACAGTTGCGCTCCACCAT;SOR=1.609;SbPval=0.68;Source=Platypus;TC=4;TCF=3;TCR=1;TR=4;WE=153660049;WS=153660037;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	153668022	rs370252579	CA	C	126.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.0;DB;DP=9;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=2;MGOF=3;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=25;NF=7;NR=0;PP=107;SC=GACTCCATCTCAAAAAAAAAA;SOR=4.174;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=13;TCF=13;TCR=0;TR=7;WE=153668030;WS=153668012;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrX	153668172	rs68141802	A	G	890.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=28;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=27;NF=20;NR=8;PP=828;SC=AAAAAGGGTGAAGAGGTTAAC;SOR=1.781;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=28;TCF=20;TCR=8;TR=28;WE=153668180;WS=153668162;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,27:1.00:27
chrX	153670935	.	C	G	2754.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.21;DP=87;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=49;PP=2068;SC=TCAAAGACATCTACAAACGCA;SOR=1.286;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=81;TCF=32;TCR=49;TR=81;WE=153670943;WS=153670925;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,87:1.00:87
chrX	153736694	.	T	G	119	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BRF=0.07;FR=0.5000;HP=16;HapScore=2;MGOF=1;MMLQ=23;MQ=60.0;NF=4;NR=7;PP=119;QD=13.9792011407;SC=TGGGGGGGGGTGGGGGGGACG;SbPval=0.02;Source=Platypus;TC=29;TCF=21;TCR=8;TR=11;WE=153736702;WS=153736684;set=Platypus	GT:AD:AF:DP	1/0:18,11:0.38:29
chrX	153906394	rs202200929	G	A	52.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-4.435;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=48.026;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.60;ReadPosRankSum=-2.081;SOR=6.011;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:67,21:0.24:88
chrX	153984215	rs201754562	C	A	215.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.837;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=60;ExcessHet=3.0103;FS=121.116;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=57.72;MQRankSum=0.539;QD=3.72;ReadPosRankSum=-2.378;SOR=4.970;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:34,24:0.41:58
chrX	153984230	rs200499770	G	A	67.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-3.079;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=71;ExcessHet=3.0103;FS=59.776;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=58.27;MQRankSum=-2.473;QD=0.98;ReadPosRankSum=-3.460;SOR=5.890;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:51,18:0.26:69
chrX	153994596	rs2728532	G	T	1189.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.18;DB;DP=37;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=13;NR=20;PP=932;SC=ACAGTGGTACGCTGGATCCCA;SOR=1.061;SbPval=0.57;Source=Platypus;TC=33;TCF=13;TCR=20;TR=33;WE=153994604;WS=153994586;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,36:1.00:36
chrX	154009617	rs11318110	AG	A	1944.73	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=74;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=12;HapScore=1;MGOF=4;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=16;NF=21;NR=36;PP=1279;SC=GGCGGCGGGGAGGGGGGGGAA;SOR=0.886;SbPval=0.54;Source=Platypus;TC=63;TCF=23;TCR=40;TR=57;WE=154009625;WS=154009606;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,66:1.00:66
chrX	154020114	rs1126762	C	A	3293.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.2;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=1;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=31;NR=69;PP=2566;SC=TCAGCTTCAGCGTGATTCCCT;SOR=1.825;SbPval=0.53;Source=Platypus;TC=100;TCF=31;TCR=69;TR=100;WE=154020122;WS=154020104;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,103:1.00:103
chrX	154051891	rs6643620	G	A	2103.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.23;DB;DP=61;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=2;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=56;NR=0;PP=1735;SC=AGAAAATGAAGGCAAAGGATG;SOR=8.255;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=56;TCF=56;TCR=0;TR=56;WE=154051899;WS=154051881;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,61:1.00:61
chrX	154301853	.	T	C	88.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.33;DP=4;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=24;NF=0;NR=4;PP=62;SC=TCACTAGGAATGGGACCTAAT;SOR=3.258;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=4;TCF=0;TCR=4;TR=4;WE=154301861;WS=154301843;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrX	154456747	rs572013	A	G	3286.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.15;DB;DP=103;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=3;HapScore=1;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=32;NR=67;PP=2585;SC=TACCGATAAAATGTGTCTGTG;SOR=1.656;SbPval=0.51;Source=Platypus;TC=100;TCF=32;TCR=68;TR=99;WE=154456755;WS=154456737;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,102:1.00:102
chrX	154736591	.	G	A	103.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.154;ClippingRankSum=0.000;DP=96;ExcessHet=3.0103;FS=4.315;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.08;ReadPosRankSum=-0.200;SOR=1.498;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:83,13:0.14:96
chrX	154736602	.	CT	TG	204.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.163;ClippingRankSum=0.000;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=4.287;JOINED;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.03;ReadPosRankSum=-0.168;SOR=1.345;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:89,12:0.12:101
chrX	154736611	.	T	C	226.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.332;ClippingRankSum=0.000;DP=101;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=2.25;ReadPosRankSum=-0.120;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,11:0.11:101
chrX	154736624	.	G	A	77.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.358;ClippingRankSum=0.000;DP=109;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.72;ReadPosRankSum=-0.680;SOR=0.566;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:95,13:0.12:108
chrX	154736635	.	C	G	125.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.334;ClippingRankSum=0.000;DP=103;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.23;ReadPosRankSum=-0.648;SOR=0.704;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:91,11:0.11:102
chrX	154736644	.	C	T	96.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.501;ClippingRankSum=0.000;DP=100;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.98;ReadPosRankSum=0.390;SOR=0.818;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:90,9:0.09:99
chrX	154736669	.	C	T	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-1.735;ClippingRankSum=0.000;DP=90;ExcessHet=3.0103;FS=5.805;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.91;ReadPosRankSum=-0.020;SOR=1.863;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:80,9:0.10:89
chrX	154736675	.	A	G	70.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=2.085;ClippingRankSum=0.000;DP=87;ExcessHet=3.0103;FS=3.706;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=0.82;ReadPosRankSum=0.640;SOR=1.639;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:78,8:0.09:86
chrX	154736702	.	C	T	76.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=0.622;ClippingRankSum=0.000;DP=74;ExcessHet=3.0103;FS=3.663;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.05;ReadPosRankSum=-0.201;SOR=1.461;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:64,9:0.12:73
chrX	154736714	rs199989202	C	T	80.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-0.564;ClippingRankSum=0.000;DB;DP=65;ExcessHet=3.0103;FS=1.783;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.24;ReadPosRankSum=0.445;SOR=1.289;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:58,7:0.11:65
chrX	154736719	.	C	G	83.77	.	AC=1;AF=0.500;AN=2;BaseQRankSum=-2.713;ClippingRankSum=0.000;DP=61;ExcessHet=3.0103;FS=1.836;MLEAC=1;MLEAF=0.500;MQ=60.00;MQRankSum=0.000;QD=1.37;ReadPosRankSum=1.054;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	0/1:55,6:0.10:61
chrX	154774663	rs2305517	G	A	483.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.06;DB;DP=15;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=1;HapScore=2;MGOF=14;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=28;NF=15;NR=0;PP=408;SC=TTCTTACCACGATTTTATCAT;SOR=5.549;SbPval=1.0;Source=Platypus;TC=15;TCF=15;TCR=0;TR=15;WE=154774671;WS=154774653;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,15:1.00:15
chrX	154774707	rs2305518	C	T	884.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.08;DB;DP=30;ExcessHet=3.0103;FR=1.0000;FS=0.000;HP=4;HapScore=1;MGOF=13;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=24;NR=6;PP=697;SC=CCAAAGCAAACATTTCTTACC;SOR=2.621;SbPval=0.55;Source=Platypus;TC=30;TCF=24;TCR=6;TR=30;WE=154774715;WS=154774697;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,30:1.00:30
chrY	4982426	.	A	C	55.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;BRF=0.25;DP=3;ExcessHet=3.0103;FR=0.9998;FS=0.000;HP=2;HapScore=2;MGOF=0;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MMLQ=29;NF=2;NR=1;PP=24;SC=TATTTTGAGGACTTTTTTTTT;SOR=1.179;SbPval=0.7;Source=Platypus;TC=3;TCF=2;TCR=1;TR=3;WE=4982434;WS=4982416;set=Intersection	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrY	13310559	.	T	C	107.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=40.00;QD=35.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrY	13310567	rs80348613	T	C	141.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.75;QD=35.26;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrY	13310578	rs200185916	C	T	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.08;QD=40.97;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrY	13310581	rs201255328	GG	CA	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.08;QD=40.97;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrY	13310602	rs200323052	G	A	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.30;QD=41.47;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrY	13310606	rs201423743	TG	CA	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.30;QD=41.47;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrY	13310610	rs74510459	A	C	331.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.30;QD=41.47;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrY	13310621	rs74943081	CC	AA	463.77	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=11;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;JOINED;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=41.58;QD=42.16;SOR=0.859;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,11:1.00:11
chrY	13310679	rs75367388	A	G	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=38.73;QD=39.38;SOR=1.022;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrY	13310683	rs78176760	T	C	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.42;QD=47.80;SOR=0.693;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrY	13310688	.	TG	T	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=34.63;QD=38.80;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrY	13310691	.	TC	T	232.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=34.63;QD=38.80;SOR=1.329;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrY	13310719	rs79308907	G	A	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=35.49;QD=39.38;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrY	13310721	rs62599741	C	A	196.90	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=5;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=35.49;QD=39.38;SOR=1.981;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,5:1.00:5
chrY	13310740	rs75526384	G	A	171.84	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=6;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=37.86;QD=28.64;SOR=2.303;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,6:1.00:6
chrY	13310768	rs79431658	G	C	321.78	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=8;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=42.32;QD=40.22;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,8:1.00:8
chrY	13310775	rs79927335	A	G	286.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=43.79;QD=40.97;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrY	13310784	rs75891039	T	G	245.80	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DB;DP=7;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.69;QD=35.11;SOR=0.941;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,7:1.00:7
chrY	14475367	.	CT	C	65.25	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=1;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=60.00;QD=65.25;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,1:1.00:1
chrY	14475374	.	C	A	74.28	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=3;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=52.99;QD=24.76;SOR=1.179;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,3:1.00:3
chrY	14475389	.	G	A	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.77;QD=38.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrY	14475392	.	C	T	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=48.77;QD=38.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrY	14475426	.	C	T	152.03	.	AC=2;AF=1.00;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.72;QD=38.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrY	14475428	.	C	T	152.03	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.72;QD=38.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
chrY	14475429	.	A	G	152.03	.	AC=2;AF=1.00;ALERT;AN=2;DP=4;ExcessHet=3.0103;FS=0.000;MLEAC=2;MLEAF=1.000;MQ=49.72;QD=38.01;SOR=1.609;set=HC	GT:AD:AF:DP	1/1:0,4:1.00:4
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